Identifier	'5' seq	'3' seq	'5' strand	'5' chr	'5' coord	'3' strand	'3' chr	'3' coord	Del len	'5' SPC	'5' corr chr	'5' corr coord	'3' SPC	'3' corr chr	'3' corr coord
ATTTGAATAAATAGTANTACTTAAGGCATAAGCTCAATATTGAATGATTAAATTTCATACGTATCGCTTTCTAAA:1	ATTTGAATAAATAGTANTACTT	TTCATACGTATCGCTTTCTAAA	+	chr2R	18964950	+	chr2R	18965026	76	+	chr2R	18964950	+	chr2R	18965026
TAAGTTTCCCAGCCCAACATACATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCCCGAACGCCAA:1	TAAGTTTCCCAGCCCAACATAC	CATTGACCTCCCCGAACGCCAA	+	chr2R	24490149	+	chr2R	24488252	1897	+	chr2R	24490149	+	chr2R	24488252
TAATTTTCTATAGATCAATTACAACTCAGACGNACAAAATCCGTCCGTAAAAATTGGTACTGCACANACTCAA:1	TAATTTTCTATAGATCAATTAC	AATTGGTACTGCACANACTCAA	-	chr2R	9782697	-	chr2R	9782619	78	+	chr2R	9782619	+	chr2R	9782697
AATCTAAAAGCAAGCAATTAAGTTGCATACCTTTCAAATTGAGTACAATTGCTAATTTGTTTTCAGTGCAAA:1	AATCTAAAAGCAAGCAATTAAG	GCTAATTTGTTTTCAGTGCAAA	-	chr2R	22756712	-	chr2R	22756631	81	+	chr2R	22756631	+	chr2R	22756712
GCTCCAATTTTTTATGGCAAATTACCCAGCCGCATGTGTGGATGGCTGGGGGGCATTGGGGCGTGGCTTTGGTCG:1	GCTCCAATTTTTTATGGCAAAT	CATTGGGGCGTGGCTTTGGTCG	+	chr2L	11614050	+	chr2L	11615545	1495	+	chr2L	11614050	+	chr2L	11615545
TCCATTAATGCATCGTATATTAAATTGAATGCAAACTTTGAATCATCACTCCGATTAGTCANCCTTAGTTTCAG:1	TCCATTAATGCATCGTATATTA	GATTAGTCANCCTTAGTTTCAG	+	chr2R	19680860	+	chr2R	19680936	76	+	chr2R	19680860	+	chr2R	19680936
TAAATTGATAATTGCATTTGCTTTTATAGAATTCTCGTATTAATTTATATATACAAAATGTATTTACATTTACAC:1	TAAATTGATAATTGCATTTGCT	CAAAATGTATTTACATTTACAC	+	chr3R	20209822	+	chr3R	20209908	86	+	chr3R	20209822	+	chr3R	20209908
TTCCATGATTTTGTATTATTTATTTTATGTTCGTAAACGATGTTGTATTCAAGTGCTGCCGTTTTTTTCATTACT:1	TTCCATGATTTTGTATTATTTA	TGCTGCCGTTTTTTTCATTACT	+	chr2R	12093964	+	chr2R	12094077	113	+	chr2R	12093964	+	chr2R	12094077
CGCCAGGACACACAATTCCCCCGTGGCATGCAAGCCCATAAGTTCCAGCAAATACAACTCTCACCATTCACATTA:1	CGCCAGGACACACAATTCCCCC	ACAACTCTCACCATTCACATTA	-	chr3R	20118132	-	chr3R	20118046	86	+	chr3R	20118046	+	chr3R	20118132
GAATCAGGGAGTCCTTACAAAGCTATCACTCACACACAAGAGCAATACCGTTCACAGTTCGGGTTGTCAAGCCCC:1	GAATCAGGGAGTCCTTACAAAG	ACAGTTCGGGTTGTCAAGCCCC	+	chr3L	20436930	+	chr3L	14539487	5897443	+	chr3L	20436930	+	chr3L	14539487
CTTGAACACACGCTTTGAAACTATTTCAACTATTATTTTCCCCAGTGCAACGTGTGCAGAAGATAAATTTCTTTA:1	CTTGAACACACGCTTTGAAACT	GTGCAGAAGATAAATTTCTTTA	+	chrX	5203001	+	chrX	725415	4477586	+	chrX	5203001	+	chrX	725415
TTTCAATTTGTTAGTAATTTTAGCTTAAATTAAACTTAACAAAAATATGATATTAAAAAATATCCCATACTTGCG:1	TTTCAATTTGTTAGTAATTTTA	TAAAAAATATCCCATACTTGCG	+	chr3L	7202855	+	chr3L	11206365	4003510	+	chr3L	7202855	+	chr3L	11206365
GAATGCAGAATAATTATTATTTTGCCACCCGAGTGGGGCTGTAATGCGAAGGCTTCTCCCAATTTGCAAGTTCTT:1	GAATGCAGAATAATTATTATTT	TTCTCCCAATTTGCAAGTTCTT	-	chr3R	27800132	-	chr3R	27799754	378	+	chr3R	27799754	+	chr3R	27800132
TTTGAAGCAATAGAAACACTTGTTAGTTAGCACACTTTTGGAATATCATTAACTTATGACGATCGATGGCAATTA:1	TTTGAAGCAATAGAAACACTTG	TTATGACGATCGATGGCAATTA	-	chr2R	19301049	-	chr2R	19300966	83	+	chr2R	19300966	+	chr2R	19301049
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACAACTGGACTGGACCTGGCCAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	CAACTGGACTGGACCTGGCCAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	20753406	1154129	+	chr3R	21907535	+	chr3R	20753406
GCTTTTACAAATATGCTGTAATCGAGAGATCTATTTCAGAGTTTCAAATTANTACTGTTCCTTTTTTTT:1	GCTTTTACAAATATGCTGTAAT	ATTANTACTGTTCCTTTTTTTT	+	chrX	3589494	+	chrX	3589574	80	+	chrX	3589494	+	chrX	3589574
AAACAGGTTTTAAAGTACTAAACCAAAGAAAATAATAAATAATAAAAAAATATAAAGCCACATATGTGCATTGTA:1	AAACAGGTTTTAAAGTACTAAA	AAAGCCACATATGTGCATTGTA	+	chr3R	21464411	+	chr3R	21464497	86	+	chr3R	21464411	+	chr3R	21464497
ATCTTAACATTATCAAAAGTTTAACATTAACGTTNACGAGGATGAGTACCAGAATACCGGACAGGCGACGGCAT:1	ATCTTAACATTATCAAAAGTTT	AATACCGGACAGGCGACGGCAT	+	chrX	12134883	+	chrX	12194151	59268	+	chrX	12134883	+	chrX	12194151
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907536
AGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAAC:1	AGCAAACAAGGTAAGAGTAAGG	TTAATTTCTCTTTAAGTCAAAC	+	chr2R	13136848	+	chr2R	13141646	4798	+	chr2R	13136848	+	chr2R	13141646
TAATTACANTTCAATTTAACTGAAAATACAACATCACNNNNTTAATGCAAGTTTCAGGAAANGGGAGTGGGGCTT:1	TAATTACANTTCAATTTAACTG	TCAGGAAANGGGAGTGGGGCTT	+	chrX	9593666	+	chrX	272037	9321629	+	chrX	9593666	+	chrX	272037
GTGGACAGTTTAGGTTATGCCAATAAGTGCTGTGTTATCGTTCAGCCGCCCCCAATATATGTAGGCCAGAATAAA:1	GTGGACAGTTTAGGTTATGCCA	AATATATGTAGGCCAGAATAAA	-	chrX	5272907	-	chrX	5272820	87	+	chrX	5272820	+	chrX	5272907
AAATACAGTGGCGTCATGCAGTCTCATTTCCTTACCTGATTAAATACCCCCGAAATTGTGCTGCACATTGAC:1	AAATACAGTGGCGTCATGCAGT	CGAAATTGTGCTGCACATTGAC	-	chr2L	9007816	-	chr2L	9000309	7507	+	chr2L	9000309	+	chr2L	9007816
TTCCGCTACCGCATTCCACACCCGCCTAAACGTGGGAGAACAGCAGANACAATAAAACATGCACATATGCGCCCA:1	TTCCGCTACCGCATTCCACACC	AAAACATGCACATATGCGCCCA	+	chr2R	21593604	+	chr2R	21594314	710	+	chr2R	21593604	+	chr2R	21594314
GTTTAAAATCTGCAAAATCTGTTCTAAACACTGCGCCCTTATATGACACTTGTCTTAGGGCGAGCGCCCACTGT:1	GTTTAAAATCTGCAAAATCTGT	TCTTAGGGCGAGCGCCCACTGT	-	chr3R	6408143	-	chr3R	6408013	130	+	chr3R	6408013	+	chr3R	6408143
GCTCGCACGTGCGACGCTTNCGAAAAAAAAATTGAAAATATATATATACATATATTGCGAAGAGAGGGGCCCAGC:1	GCTCGCACGTGCGACGCTTNCG	ATTGCGAAGAGAGGGGCCCAGC	-	chr2L	7984074	-	chr2L	7977099	6975	+	chr2L	7977099	+	chr2L	7984074
CCATCAAGTGGAGATCCGCTGATCAGGGCTTTGCATAACTACAAGAACANAAGACTGAGGCATCTCAATTTGTGG:1	CCATCAAGTGGAGATCCGCTGA	ACTGAGGCATCTCAATTTGTGG	+	chr3R	25832717	+	chr3R	25841899	9182	+	chr3R	25832717	+	chr3R	25841899
ACTGTTATCTAAATAATTTGGGAAACTAATAATGAATAAGCAAAGGCCTACCTACTATTATAATCCTTTTTTTGC:1	ACTGTTATCTAAATAATTTGGG	ACTATTATAATCCTTTTTTTGC	-	chr2R	23346630	-	chr2R	23346554	76	+	chr2R	23346554	+	chr2R	23346630
ACGACCGGTTTCCCAGTCGCTACAGAGATGCTTCTCTTGGCTCATCTCACCTGGGT:1	ACGACCGGTTTCCCAGTCGCTA	TCTTGGCTCATCTCACCTGGGT	-	chr3L	14316845	-	chr3L	14312050	4795	+	chr3L	14312050	+	chr3L	14316845
TCTTCCCTTTTAATTCCTCAGTTTGATGGCGCAAAGGAGTGCAGGCGACCAAGTCTTAGAGGGATTTTCCTCTTC:1	TCTTCCCTTTTAATTCCTCAGT	TCTTAGAGGGATTTTCCTCTTC	-	chr2L	10479479	-	chr2L	10479397	82	+	chr2L	10479397	+	chr2L	10479479
TATTATTTACGATGACTTAGCCCTGCATTCCCAGCATTCAACAGCGTATCAAATATTTAGACCTATGTCTCC:1	TATTATTTACGATGACTTAGCC	AAATATTTAGACCTATGTCTCC	+	chr3R	5891698	+	chr3R	5892001	303	+	chr3R	5891698	+	chr3R	5892001
AGACCCGCAGTGGATCTAGTGGGCTGTGTGGGAACCGGTGCCCGTTGCACGGAGCTCGTTGCAGGTGG:1	AGACCCGCAGTGGATCTAGTGG	GCACGGAGCTCGTTGCAGGTGG	-	chr2R	12417559	-	chr2R	12417486	73	+	chr2R	12417486	+	chr2R	12417559
TACTATAAGTACTAACAAGTGCTTCAAGCTAACTGTTTTAAGTTTGACTACGAACCATTAACCTTTAACTTACCG:1	TACTATAAGTACTAACAAGTGC	ACCATTAACCTTTAACTTACCG	+	chr3R	8917903	+	chr3R	8917983	80	+	chr3R	8917903	+	chr3R	8917983
ATTCAATATGTAATACAGTCCTCATTCTCAACAAGGATATCGAGTTGATATAGTTGTATCTTAAGGATGTTTAAG:1	ATTCAATATGTAATACAGTCCT	TTGTATCTTAAGGATGTTTAAG	+	chr3R	7030707	+	chr3R	7030783	76	+	chr3R	7030707	+	chr3R	7030783
ATTTTTCCATTTGATGTACATTTTTTGTGATGAACATTTTTTTCGTGCAACCTTATAGTTTCCCCTTNTCAGACA:1	ATTTTTCCATTTGATGTACATT	TATAGTTTCCCCTTNTCAGACA	+	chr3R	22881194	+	chr3R	22884900	3706	+	chr3R	22881194	+	chr3R	22884900
GTNGATAAGAGCACACAAACAGAGAGATAGCGACNTNGCCGAGTGGCAAACATTTGGCTTCTAAG:1	GTNGATAAGAGCACACAAACAG	TGGCAAACATTTGGCTTCTAAG	-	chr3R	19135076	-	chr3R	21250500	2115424	+	chr3R	21250500	+	chr3R	19135076
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
AAATCGAGCTAGAGTGCTGAATTTTTCTCCCAACATCTCCGCTCTACCTGCACCTGCTGTTCCCAACTGTTT:1	AAATCGAGCTAGAGTGCTGAAT	CACCTGCTGTTCCCAACTGTTT	+	chr2R	8657755	+	chr2R	8657829	74	+	chr2R	8657755	+	chr2R	8657829
ACTTAAAATTGAGTACAATCATGAACCAGCAATCTATCGTACTAGTGTAGCAAACAGCTGTGCGAAACGAATAG:1	ACTTAAAATTGAGTACAATCAT	AACAGCTGTGCGAAACGAATAG	-	chr2L	22550155	-	chr2L	22548931	1224	+	chr2L	22548931	+	chr2L	22550155
CTGAAAAGAAATAAAAGTCGACTGGCTGACGGGATTT:1	CTGAAAAGAAATAAAAGTCGAC	AGTCGACTGGCTGACGGGATTT	+	chr2R	21260098	+	chr2R	21260156	58	+	chr2R	21260098	+	chr2R	21260156
TTTTGAAGATACTCCTTTTTAAAAAAATGGTTCATTTTTAAATGTGAAAAACACATATTTATTTTGCTGGCCTGT:1	TTTTGAAGATACTCCTTTTTAA	CATATTTATTTTGCTGGCCTGT	-	chr3R	25465135	-	chr3R	25465058	77	+	chr3R	25465058	+	chr3R	25465135
CTTCCCACTTGGCCAGGACGAAGATTAGCTGCATGCCAGCCATGATTTATGCCGTAGTCCGGGTGAAAGTCAGAG:1	CTTCCCACTTGGCCAGGACGAA	GTAGTCCGGGTGAAAGTCAGAG	-	chr3L	5476270	-	chr3L	5476189	81	+	chr3L	5476189	+	chr3L	5476270
CAATGAACTCCAAACGTAGGCAGCTCCACAGGAGCGGATGGTGGGCCGTTGGGTGGATTTGGGGGTGGCTTTTGT:1	CAATGAACTCCAAACGTAGGCA	TGGATTTGGGGGTGGCTTTTGT	-	chr2R	6101938	-	chr2R	6096740	5198	+	chr2R	6096740	+	chr2R	6101938
GAGGAAGCGAACCGAAGGCGTAGACAGCTGAGTTGGGCTGATATCGTATCTGCTAGATCTCTGGACTTTGCTTTG:1	GAGGAAGCGAACCGAAGGCGTA	TAGATCTCTGGACTTTGCTTTG	-	chr3R	16394493	-	chr3R	16393786	707	+	chr3R	16393786	+	chr3R	16394493
GCCATTAGGCGTAACAAATTTTCACAGGCGCAGGAAAAATGTTGAAATTTATAAGATTTTAGCGCCAAAAAATG:1	GCCATTAGGCGTAACAAATTTT	AAGATTTTAGCGCCAAAAAATG	-	chrX	2899921	-	chrX	8060763	5160842	+	chrX	8060763	+	chrX	2899921
GCAAGGGCAAAAGCAAAGGCAACGGCAAAGGATCAGAGGTAAGACGGCAAGTACTGGAAATAA:1	GCAAGGGCAAAAGCAAAGGCAA	AGACGGCAAGTACTGGAAATAA	+	chr3R	25152783	+	chr3R	16393202	8759581	+	chr3R	25152783	+	chr3R	16393202
ATCGCTTTCGGTACCGGAGATGTAGTCATCTGCTAGTTGGGCTGCTTTCAGATCCA:1	ATCGCTTTCGGTACCGGAGATG	AGTTGGGCTGCTTTCAGATCCA	-	chr3L	1310991	-	chr3L	1315870	4879	+	chr3L	1315870	+	chr3L	1310991
AAGTCCATCGGAAGAATCCAAAAAAGTTGCCGCACCTCAAGTTCAGCCCGCTCCACATGTTGATTCAA:1	AAGTCCATCGGAAGAATCCAAA	CCCGCTCCACATGTTGATTCAA	+	chr2L	18699229	+	chr2L	18699299	70	+	chr2L	18699229	+	chr2L	18699299
GGACAAGGACGTGGACGTGGACGTGGAT:1	GGACAAGGACGTGGACGTGGAC	GGACGTGGACGTGGACGTGGAT	-	chrX	19051718	-	chrX	20741232	1689514	+	chrX	20741232	+	chrX	19051718
GATTGGCCGCTGCTGCGTCATCTGATCAAATTTAACTACTATCATCGGGGCTTTTTGGCACAACAACTTATT:1	GATTGGCCGCTGCTGCGTCATC	CTTTTTGGCACAACAACTTATT	-	chr2R	8723019	-	chr2R	8722781	238	+	chr2R	8722781	+	chr2R	8723019
GTGTGTTTNTGGCCCTGCGTGCAGCTTGCAAAAACNAGCAAGGTCCAAAAACAACCTGAGTGTGAGAAATGAAAT:1	GTGTGTTTNTGGCCCTGCGTGC	ACCTGAGTGTGAGAAATGAAAT	-	chr3R	28415825	-	chr3R	28415740	85	+	chr3R	28415740	+	chr3R	28415825
GGGCTTTTTTGTTATTGTTGTTTTTTTTTTTACTTT:1	GGGCTTTTTTGTTATTGTTGTT	TTGTTGTTTTTTTTTTTACTTT	+	chr2L	9587332	+	chr2L	4198733	5388599	+	chr2L	9587332	+	chr2L	4198733
ATTTGCTCGTCGTGTGGTTGTTGTTGCAGTTACACACTAAATTACAGTCAATTACATTGGG:1	ATTTGCTCGTCGTGTGGTTGTT	AATTACAGTCAATTACATTGGG	-	chr2L	702940	-	chr2L	702878	62	+	chr2L	702878	+	chr2L	702940
CATGTGGGACATGCAAATGTAATGTCCAGAATGTGTAAGCTTTATATATTCTGCTGATAATTTCACATTTCTATA:1	CATGTGGGACATGCAAATGTAA	CTGATAATTTCACATTTCTATA	+	chr2L	16867029	+	chr2L	16867124	95	+	chr2L	16867029	+	chr2L	16867124
TGTCACACTGTGCAGCAATATTTATGAAAGCCGCCTCAATCCCGCCCAGAAGATCGGCCTGCTCCGTGCGGCGAC:1	TGTCACACTGTGCAGCAATATT	TCGGCCTGCTCCGTGCGGCGAC	+	chr2L	6772007	+	chr2L	6772094	87	+	chr2L	6772007	+	chr2L	6772094
AACCAGACCATAATACCATTTTTTATTATGGGAATTATTGTTTAAAGCTGATATCGTGGTATTATTATTCCTATC:1	AACCAGACCATAATACCATTTT	TCGTGGTATTATTATTCCTATC	-	chr2R	16571996	-	chr2R	16571901	95	+	chr2R	16571901	+	chr2R	16571996
TTTTAATTTTCTTTCCATCATGTTCACCACCCACCAAAATGTGCAGCATCCTGAATAAAATACCAACNAAATACG:1	TTTTAATTTTCTTTCCATCATG	AATAAAATACCAACNAAATACG	-	chr3L	22124905	-	chr3L	22124822	83	+	chr3L	22124822	+	chr3L	22124905
TTGATCGATTCCATGGCATTTTGTTTGGAAAAGTTGCAAACTTCGCTTGCAGTATTGCTGCATAGACGGGCTAAA:1	TTGATCGATTCCATGGCATTTT	ATTGCTGCATAGACGGGCTAAA	+	chrX	19755541	+	chrX	19755632	91	+	chrX	19755541	+	chrX	19755632
GTTTAAGAAATCAAATTAATTAACCCAATTAAATGAGAATAATGAGAGAGCCTATTATAAATTAAGTATTTCTCC:1	GTTTAAGAAATCAAATTAATTA	ATTATAAATTAAGTATTTCTCC	+	chr2R	7067611	+	chr2R	7067695	84	+	chr2R	7067611	+	chr2R	7067695
CTCGTCTTTCGTGGGCGAGAAGGCAAATCAGATAAGCACTTAACACCTGCTCACCTGCTCAACAACAGTGG:1	CTCGTCTTTCGTGGGCGAGAAG	CTCACCTGCTCAACAACAGTGG	-	chr2R	13286385	-	chr2R	11489847	1796538	+	chr2R	11489847	+	chr2R	13286385
TGCATTGTCATTGAATTGTGAGGGGAATGGCATTCGCTGATTACGCTGCACATTAATTTAACCATTCCATTCTGG:1	TGCATTGTCATTGAATTGTGAG	TAATTTAACCATTCCATTCTGG	-	chr3R	6610211	-	chr3R	6610059	152	+	chr3R	6610059	+	chr3R	6610211
TATTTGGCGTGCAGTTCGCAATGCAAAGCGGGCACTTATCCGGTCGACTGAAGCCAACAGCTCAGATTTTGGTG:1	TATTTGGCGTGCAGTTCGCAAT	GCCAACAGCTCAGATTTTGGTG	+	chr3R	7589815	+	chr3R	7589935	120	+	chr3R	7589815	+	chr3R	7589935
CGCTGTCACAGAAGTGAGCAGGAGGAAAATGGGGAGAAAGAATAAGAGCGCAAATAAAAACGGTAGACGGCGA:1	CGCTGTCACAGAAGTGAGCAGG	AAATAAAAACGGTAGACGGCGA	-	chr3L	5027017	-	chr3L	2622386	2404631	+	chr3L	2622386	+	chr3L	5027017
CTACCTCCGTCTCCAATCAGTTCAATTAAATTTGTGAATTTGATTNATAAAACCCTGCA:1	CTACCTCCGTCTCCAATCAGTT	ATTTGATTNATAAAACCCTGCA	+	chr3L	18450855	+	chr3L	20551962	2101107	+	chr3L	18450855	+	chr3L	20551962
CTAGAAAGCCAACCACAATCAATTAGCATTATTTNTAAGTCGCAAGGATTGAAGTGCTTGCATTTGAATAATTTA:1	CTAGAAAGCCAACCACAATCAA	GTGCTTGCATTTGAATAATTTA	-	chr2L	10600515	-	chr2L	10592853	7662	+	chr2L	10592853	+	chr2L	10600515
TTACACATTTCTTTTTTTTTTGAATATGCAAAACATAAGTTAGTCATGCTTGCACAAGGGTTAAGAGTTCACAC:1	TTACACATTTCTTTTTTTTTTG	CACAAGGGTTAAGAGTTCACAC	+	chr2L	4161672	+	chr2L	3792187	369485	+	chr2L	4161672	+	chr2L	3792187
ATACACAAAATGCAGGCGAGGAGAACGAACAGGGAAATCACAACAATTGACAGCAAAGTCTTTAAACGGCAAACG:1	ATACACAAAATGCAGGCGAGGA	CAAAGTCTTTAAACGGCAAACG	+	chr3L	11365060	+	chr3L	8850854	2514206	+	chr3L	11365060	+	chr3L	8850854
TGTATACCCTTAATCTATTAGCTTNATAGATTTTATCTATGANTTNATTTANGATNTTGCCAAAGGAAAACGATG:1	TGTATACCCTTAATCTATTAGC	ATNTTGCCAAAGGAAAACGATG	+	chr3R	15864058	+	chr3R	15864222	164	+	chr3R	15864058	+	chr3R	15864222
AATTACAATGAAAATCCGTTTAGAGGGGAAAACAGCTGGAAATCAATGAGAGCTAAACAAAACAGCTTCCAAAAA:1	AATTACAATGAAAATCCGTTTA	TAAACAAAACAGCTTCCAAAAA	-	chr2R	21886218	-	chr2R	21886139	79	+	chr2R	21886139	+	chr2R	21886218
AATGAACGCACTTCCGTTGCAATTGTCGGGGTCTTAGAACTCTAAACAACAATTGGGTGGGGTTTTTGAAAGGAT:1	AATGAACGCACTTCCGTTGCAA	TGGGTGGGGTTTTTGAAAGGAT	+	chr3R	9605090	+	chr3R	9605202	112	+	chr3R	9605090	+	chr3R	9605202
ATGCCGCTGAGCGAGGTGTGATGGAAATTCAATTTACACAGCATTNAATATGGCAAAAATGNGGCAGCGTTGTTG:1	ATGCCGCTGAGCGAGGTGTGAT	CAAAAATGNGGCAGCGTTGTTG	+	chr3R	19320671	+	chr3R	18960325	360346	+	chr3R	19320671	+	chr3R	18960325
TGGGACTATAAATTCAGGTTTTATTCCTGTTTATGTGGGCCAAATTTAATAAGTGCCACACGGTGAAT:1	TGGGACTATAAATTCAGGTTTT	TAATAAGTGCCACACGGTGAAT	-	chr2L	16508025	-	chr2L	16507944	81	+	chr2L	16507944	+	chr2L	16508025
GCCACACCAACTCANTTAAAAAGTCATAAAGCAAACTTAAAGTTATGAATTTTTAAAGTTTCTGATTTATTTTCA:1	GCCACACCAACTCANTTAAAAA	TAAAGTTTCTGATTTATTTTCA	-	chr3R	8393557	-	chr3R	12849974	4456417	+	chr3R	12849974	+	chr3R	8393557
GATATCCTTTATTTTATTCCCAAGATCAGTTTTTACCTCTCTGCGCTGCGTGGACGACGACGCTATAGCC:1	GATATCCTTTATTTTATTCCCA	CGTGGACGACGACGCTATAGCC	+	chr2R	13905624	+	chr2R	13907601	1977	+	chr2R	13905624	+	chr2R	13907601
GGGATCTCACACACTCTTCGCAAATGCCGCGACCTTAAATTGCAGACACACCAAATGTGATTACATACACGCAAA:1	GGGATCTCACACACTCTTCGCA	AATGTGATTACATACACGCAAA	+	chr2L	18923752	+	chr2L	1865796	17057956	+	chr2L	18923752	+	chr2L	1865796
GCAATCAATTATGAGTTCAATGCTATTGCCAACCCAATGAGCACCNAAATACCTACCATTTNCACCAAAGGGCAG:1	GCAATCAATTATGAGTTCAATG	TACCATTTNCACCAAAGGGCAG	+	chr2R	22072710	+	chr2R	22072795	85	+	chr2R	22072710	+	chr2R	22072795
TGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTATACCAAATAA:1	TGAGAGCCAGTACATTGCAGAC	CTTCATCCATTATACCAAATAA	-	chr3R	19449473	-	chr3R	19448578	895	+	chr3R	19448578	+	chr3R	19449473
CACACCGAATACCAAATCTTCCCCACACAACTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	CACACCGAATACCAAATCTTCC	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	24180940	+	chr3R	21907535	2273405	+	chr3R	24180940	+	chr3R	21907535
ATTTTAATGTAGGTGCTTAAATAATGGTTGCATCAAGCTTTCAAGCACAACCGATTGCTCTTTTTGCTTGAAAA:1	ATTTTAATGTAGGTGCTTAAAT	GATTGCTCTTTTTGCTTGAAAA	-	chr3R	6640008	-	chr3R	6639931	77	+	chr3R	6639931	+	chr3R	6640008
CACATCCACGCTTGCTGAATATGTCCGGCGCAGTCGTAACTTACAATCGTTACCGATTTTAGCATAGGCAAACAA:1	CACATCCACGCTTGCTGAATAT	CGATTTTAGCATAGGCAAACAA	-	chr3R	26565671	-	chr3R	26558359	7312	+	chr3R	26558359	+	chr3R	26565671
CACAAAGGTTTTCGGTATTAAATACACAATGCCTCGCCCTGTGAAAAATTACGTGAGTTTTTTTTTTTGCAAA:1	CACAAAGGTTTTCGGTATTAAA	CGTGAGTTTTTTTTTTTGCAAA	+	chr3L	4825576	+	chr3L	4825656	80	+	chr3L	4825576	+	chr3L	4825656
GTGCAAAGGTGTGAAATTGTTGTNGCTCTTGATTGGATATCTGTGTTTCATCAGGGGGCACTGTGG:1	GTGCAAAGGTGTGAAATTGTTG	GTTTCATCAGGGGGCACTGTGG	-	chr3R	31696313	-	chr3R	31691556	4757	+	chr3R	31691556	+	chr3R	31696313
GACTATGCAGTTTTAATCTTGGATATACCAGTTAAGATGTAAGAAATGTGAAATATACAAATTTTTANGTTGTTA:1	GACTATGCAGTTTTAATCTTGG	TATACAAATTTTTANGTTGTTA	+	chr3R	20594483	+	chr3R	20594573	90	+	chr3R	20594483	+	chr3R	20594573
ATTGTAAAATGTGTCACGGCATCTAGTCGCGCATAGAATTGGCGAATATTTTATNCTAAAGAGGCGAAAATGGAA:1	ATTGTAAAATGTGTCACGGCAT	TNCTAAAGAGGCGAAAATGGAA	-	chr2L	19871646	-	chr2L	19871559	87	+	chr2L	19871559	+	chr2L	19871646
CCCAAATCCCCACCCACCACACTCCATCCCTTCCCTTAATTTGCACTTCTTTCCTGCCACCCAACCCAGCCATG:1	CCCAAATCCCCACCCACCACAC	CCTGCCACCCAACCCAGCCATG	+	chr3R	15948590	+	chr3R	27761423	11812833	+	chr3R	15948590	+	chr3R	27761423
GTGAGCGAGCGGTGGCTTTAAAGTTTGAACTAACTTGGTGCACAAAAAATGTTACTCTTTGTTGATATCTCCTAG:1	GTGAGCGAGCGGTGGCTTTAAA	ACTCTTTGTTGATATCTCCTAG	-	chr3L	5960251	-	chr3L	575436	5384815	+	chr3L	575436	+	chr3L	5960251
CAAAAAAAATTTCCAACTAAGATATCTTGCTTTATCTTTCTTATGCTCTNGATTTCGCCGACTCCCTTTGATTCG:1	CAAAAAAAATTTCCAACTAAGA	TTCGCCGACTCCCTTTGATTCG	+	chr3R	27254828	+	chr3R	20526630	6728198	+	chr3R	27254828	+	chr3R	20526630
CATTTCACGGATGTATATGTGCAACGAAAAGTAAATAAATTTAACAAAATGGAAAGCTAAAATTATTTNCTCAG:1	CATTTCACGGATGTATATGTGC	AAAGCTAAAATTATTTNCTCAG	-	chr3R	7396151	-	chr3R	7396057	94	+	chr3R	7396057	+	chr3R	7396151
ACCCACACAGAAACGCCTTGGGCCGGCCCATCCCATTTAAATTGAATTTCCCGG:1	ACCCACACAGAAACGCCTTGGG	CCATTTAAATTGAATTTCCCGG	-	chr3L	10436534	-	chr3L	10865549	429015	+	chr3L	10865549	+	chr3L	10436534
ATAACACAATGAACTCCAAACGTAGGCAGCTCCACAGGAGCGGATGGTGGGCCGTTGGGGGGATTTGGGGG:1	ATAACACAATGAACTCCAAACG	GGCCGTTGGGGGGATTTGGGGG	-	chr2R	6101944	-	chr2R	6096750	5194	+	chr2R	6096750	+	chr2R	6101944
TGATAACTCTCTTTTCCCAGTGTAATAAGTGTGCTTTTGTATAGAAACCTAAAACACCTAAGCAACACTTTTCGA:1	TGATAACTCTCTTTTCCCAGTG	ACACCTAAGCAACACTTTTCGA	-	chr3R	27644372	-	chr3R	27644280	92	+	chr3R	27644280	+	chr3R	27644372
CTTGACAGTAAATGCGTTTTATTGCGATCANNNTNTTAGATGTATTGATGGGGAGGATTTGCTCGGGGTTTGGTT:1	CTTGACAGTAAATGCGTTTTAT	AGGATTTGCTCGGGGTTTGGTT	-	chr3L	7441053	-	chr3L	28007121	20566068	+	chr3L	28007121	+	chr3L	7441053
GAATTCAAGCCGGAGTCAATGGTTGTATATCGCATGCATAAATTATCGTAACTGTAACAGTCGCGCATGTTTCAG:1	GAATTCAAGCCGGAGTCAATGG	GTAACAGTCGCGCATGTTTCAG	+	chr2L	9973743	+	chr2L	9980862	7119	+	chr2L	9973743	+	chr2L	9980862
GATATAAGGATATCTGCGTAAGATAAGCAAGATTATGTGAAATTACTTAAACCAAATTCTAATATTTAGCTACA:1	GATATAAGGATATCTGCGTAAG	CAAATTCTAATATTTAGCTACA	+	chr2R	21906288	+	chr2R	21906388	100	+	chr2R	21906288	+	chr2R	21906388
GAAAAACNCTATTTAAATAGTCTAAGTACATAAATAATTTGCTTTGATGTGAAAAATAAGACCATGAGAGACATA:1	GAAAAACNCTATTTAAATAGTC	AAATAAGACCATGAGAGACATA	+	chrX	17349876	+	chrX	17350068	192	+	chrX	17349876	+	chrX	17350068
ATACATAAAAGCCGCTCAATTATCTGTTGGCCCTCATATATCTATGTACATATTTTAGGTATTTCCTGCATGTGT:1	ATACATAAAAGCCGCTCAATTA	TTTAGGTATTTCCTGCATGTGT	+	chr2L	20005883	+	chr2L	20010959	5076	+	chr2L	20005883	+	chr2L	20010959
CATTGTTTGCTCGCAGGCCCATCGAGTTCTCACGCCAGGATCGTCGTCAAGGATCGCTCCTTCCATTCACACCA:1	CATTGTTTGCTCGCAGGCCCAT	ATCGCTCCTTCCATTCACACCA	+	chr2R	24147067	+	chr2R	24154644	7577	+	chr2R	24147067	+	chr2R	24154644
TATTTTTTGTTTGTCGCTTTGTGCACTGCTGTGGTTTTTTTCCGTTCAGCCCTCTCTTTGTCATTTCCTTTTGGA:1	TATTTTTTGTTTGTCGCTTTGT	CTCTTTGTCATTTCCTTTTGGA	+	chr2L	9907621	+	chr2L	16151776	6244155	+	chr2L	9907621	+	chr2L	16151776
ATCTGTTGAGTGAGCAGAACATCGTTGAGCAACGATGGCGATGGTGG:1	ATCTGTTGAGTGAGCAGAACAT	TGAGCAACGATGGCGATGGTGG	-	chr3L	3808413	-	chr3L	1642260	2166153	+	chr3L	1642260	+	chr3L	3808413
ACTTAAGTNGAATTTGATTTGTATTTTGCACATACATCATTATCTTCATTTAGGTTTTATAATTTATATTTATGT:1	ACTTAAGTNGAATTTGATTTGT	GTTTTATAATTTATATTTATGT	-	chr2R	23859288	-	chr2R	10553404	13305884	+	chr2R	10553404	+	chr2R	23859288
CTTATTTACCATTTCAATACCATAAGCAATACACAAACAGAAATTGTTTCAAACTTAAAGATTCTGATTATTTCT:1	CTTATTTACCATTTCAATACCA	CTTAAAGATTCTGATTATTTCT	-	chr2L	4184821	-	chr2L	4184502	319	+	chr2L	4184502	+	chr2L	4184821
CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAGGGACCCAACAAATTGTTGTGTG:1	CACAAACACAAACACAAACACA	GGACCCAACAAATTGTTGTGTG	-	chr2L	16071771	-	chr2L	8587314	7484457	+	chr2L	8587314	+	chr2L	16071771
CATCGTTATTAAAGCGAAAGCCCTTATCAAGAAAAAGCTATCGTTTCAGTCGTTTACCACAGTCATGCCAAT:1	CATCGTTATTAAAGCGAAAGCC	CGTTTACCACAGTCATGCCAAT	-	chrX	2221086	-	chrX	147595	2073491	+	chrX	147595	+	chrX	2221086
AATATTTATCTACGCTAATTTCCCTGCTTAACTTGGGCAAGTGCCGGGAAATTTTCGCCGCTCGCGTGCCAG:1	AATATTTATCTACGCTAATTTC	ATTTTCGCCGCTCGCGTGCCAG	-	chr3R	31310147	-	chr3R	31310074	73	+	chr3R	31310074	+	chr3R	31310147
GCAAAAACTTTTTTTTTTTGAAGGGGGCAAGAAGTAGCTAAAGCACGGGCCAAGCAAAAGCACCAGCAGCAGG:1	GCAAAAACTTTTTTTTTTTGAA	AAGCAAAAGCACCAGCAGCAGG	+	chr2R	13028931	+	chr2R	20422437	7393506	+	chr2R	13028931	+	chr2R	20422437
ACCGAACTAGCGCCCAATGTGATTCGCACCAGCAGCGAGGGATTACCCCATTTCGCACTTCCCGACCTCGCG:1	ACCGAACTAGCGCCCAATGTGA	TTTCGCACTTCCCGACCTCGCG	+	chr2R	24763627	+	chr2R	24765600	1973	+	chr2R	24763627	+	chr2R	24765600
TTGATTAAAACTATTCGTAGTGCTAAAGCATTTTTTTGTAGACATAAATTTCCTTGTGAATAGCTGGCACCTG:1	TTGATTAAAACTATTCGTAGTG	CCTTGTGAATAGCTGGCACCTG	+	chr3L	3254116	+	chr3L	3254205	89	+	chr3L	3254116	+	chr3L	3254205
CGAGAAAAAGAAGGTCGCCTATAAGATTTGATAAAACTTTCTCAAAGNTTTGAGTATAATANAGTCATTTTCCAC:1	CGAGAAAAAGAAGGTCGCCTAT	GTATAATANAGTCATTTTCCAC	-	chr3R	7021805	-	chr3R	7021698	107	+	chr3R	7021698	+	chr3R	7021805
ATATAGAGAAAAATTTTGCAATTACGTCTAGTAAATTATTTACAGTGTCCCAGGGCAGTGGGCCGGCGAATAAA:1	ATATAGAGAAAAATTTTGCAAT	GGGCAGTGGGCCGGCGAATAAA	+	chr3L	2987731	+	chr3L	2987992	261	+	chr3L	2987731	+	chr3L	2987992
ATTTAAGCTGTGGACCGCGTACTGATAAGTCGAATCAGAATCAGACAAAGCGGTATGCTGCG:1	ATTTAAGCTGTGGACCGCGTAC	TCAGACAAAGCGGTATGCTGCG	+	chr3L	22909054	+	chr3L	22909132	78	+	chr3L	22909054	+	chr3L	22909132
AACGCCTTTCAGTTCTCATACACAGCCNTTCAACTTGAAAGTTACNGACTCGACCAGTTT:1	AACGCCTTTCAGTTCTCATACA	AAGTTACNGACTCGACCAGTTT	-	chr3R	25796463	-	chr3R	25796399	64	+	chr3R	25796399	+	chr3R	25796463
TAGGCAACATGAACATGAGTTCACAAAATAATTCATAATGATTTTATAATAGAAAACTTATCAGTACATTCTCAA:1	TAGGCAACATGAACATGAGTTC	AAACTTATCAGTACATTCTCAA	-	chr2L	7447894	-	chr2L	7447799	95	+	chr2L	7447799	+	chr2L	7447894
CTGTTCTCCTGTTGGTGGGGCTGATGGTGTGATGCTTTTTTCCACTTACATTTTCTTCAAGTTGAAAAGCGACAG:1	CTGTTCTCCTGTTGGTGGGGCT	TCTTCAAGTTGAAAAGCGACAG	-	chr3R	20217785	-	chr3R	10039803	10177982	+	chr3R	10039803	+	chr3R	20217785
GCCATCTCAACTTCACTGCCAATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCGCATAATCTCGGTTCCTGGGCCTTGGCATCAT:1	GCCATCTCAACTTCACTGCCAA	GGTTCCTGGGCCTTGGCATCAT	-	chr2L	8588645	-	chr2L	8588554	91	+	chr2L	8588554	+	chr2L	8588645
TGTCGCATTTCTCACTGCCGCGAACATAAATATGTATAACACAAATATGAAAAGTCGGCGGGGCGAAAAGAAAAC:1	TGTCGCATTTCTCACTGCCGCG	GTCGGCGGGGCGAAAAGAAAAC	+	chrX	14818778	+	chrX	14823982	5204	+	chrX	14818778	+	chrX	14823982
GACTACTCTTCATCCATGAGTTCCTGACTNGGATTTTCTTGCAATAGGAAAAGAGTTATANTAACAGATCTCGTA:1	GACTACTCTTCATCCATGAGTT	AGTTATANTAACAGATCTCGTA	-	chr2R	11909666	-	chr2R	11909793	127	+	chr2R	11909793	+	chr2R	11909666
TTTGTATCNCTGCAGCTGTTTCTCTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTCTGCCAAAGGATTTAAGCTTTA:1	TTTGTATCNCTGCAGCTGTTTC	CTGCCAAAGGATTTAAGCTTTA	-	chr2R	12824535	-	chr2R	12819470	5065	+	chr2R	12819470	+	chr2R	12824535
ATTTTTGCATTTTAATCACTTATTAATGAACTTAAAATTAAATTTAATTNAATTTCGCTTTTAAACTTACACCCT:1	ATTTTTGCATTTTAATCACTTA	TTCGCTTTTAAACTTACACCCT	+	chr2R	13532528	+	chr2R	13532644	116	+	chr2R	13532528	+	chr2R	13532644
GCTTATTTAACATTTGTTTATTGAATACTTTTCNACAAACCTGTTTATTTAAAGTTTCTTTTGTACC:1	GCTTATTTAACATTTGTTTATT	TATTTAAAGTTTCTTTTGTACC	+	chr3R	28345659	+	chr3R	28345727	68	+	chr3R	28345659	+	chr3R	28345727
TATATTTTCGGAACGCATCAATTTGCAAAGTGCATGCCTTTTTAGTTTAAATTGTTAAAGAGCTTGTGACATTTG:1	TATATTTTCGGAACGCATCAAT	GTTAAAGAGCTTGTGACATTTG	-	chr3R	29449439	-	chr3R	29449361	78	+	chr3R	29449361	+	chr3R	29449439
CTACCTTAGCTTCCTTACCTTCTCATGTTTTAATTATAAAGTGTCGAATTCCTAAGATTCCACTTGGCTTTGTAT:1	CTACCTTAGCTTCCTTACCTTC	AAGATTCCACTTGGCTTTGTAT	-	chrX	15423444	-	chrX	15421933	1511	+	chrX	15421933	+	chrX	15423444
AAGGCGCTGACTGGAAATGTCCCTTAATGTTCACTAAAAAGGGTCNACGATTTCAACTGCCNCTTCCCGTTTCAC:1	AAGGCGCTGACTGGAAATGTCC	CAACTGCCNCTTCCCGTTTCAC	-	chr3L	22611728	-	chr3L	22611854	126	+	chr3L	22611854	+	chr3L	22611728
TGAGTCAGTTGTTGAGGCAAGCCAATCATTAGTCACTGCAACGCCCAGGCGGCCCG:1	TGAGTCAGTTGTTGAGGCAAGC	ACTGCAACGCCCAGGCGGCCCG	-	chr3R	26235571	-	chr3R	26235508	63	+	chr3R	26235508	+	chr3R	26235571
CGCAGTCGTAACTTACAATCGTTACCGATTTTAGCATAGGCAAACAAATTTAGTGGCCC:1	CGCAGTCGTAACTTACAATCGT	AGGCAAACAAATTTAGTGGCCC	-	chr3R	26565643	-	chr3R	26558347	7296	+	chr3R	26558347	+	chr3R	26565643
CTGCGAGCATAGGCAGCAGCAGCGACACAGTATAATTAGGTTTGCCTTCTGTGTTCGAAACT:1	CTGCGAGCATAGGCAGCAGCAG	TTTGCCTTCTGTGTTCGAAACT	+	chr3L	24021300	+	chr3L	24022444	1144	+	chr3L	24021300	+	chr3L	24022444
AGCCNACTTGTTTGGCACTTTTNTTGCNAGTGAGTTCCCNAATGTCCCCGATTTCCCAGTCAAACATTATATTTG:1	AGCCNACTTGTTTGGCACTTTT	TCCCAGTCAAACATTATATTTG	+	chr3L	7285471	+	chr3L	7285549	78	+	chr3L	7285471	+	chr3L	7285549
ATCACCAATATTTACCACTTCGAGTTCTTGTCCCCGTTCCACTTTCCGCCGCCCCATAGCTTTTTGCTACTTTT:1	ATCACCAATATTTACCACTTCG	CCCATAGCTTTTTGCTACTTTT	-	chr3L	4341460	-	chr3L	13593862	9252402	+	chr3L	13593862	+	chr3L	4341460
TACCTACACCAGTTCGCAGTGCAACAGCCAGGACCATGACCAACATGTTCATGGCATCTGC:1	TACCTACACCAGTTCGCAGTGC	CCAACATGTTCATGGCATCTGC	+	chr2R	8472556	+	chr2R	8470461	2095	+	chr2R	8472556	+	chr2R	8470461
AAAAAAGTGTTAATAACACTAATTTGTCTGCGGTCAAATGAAGCATTAAAGCACTGG:1	AAAAAAGTGTTAATAACACTAA	AAATGAAGCATTAAAGCACTGG	-	chr3L	18275959	-	chr3L	6120338	12155621	+	chr3L	6120338	+	chr3L	18275959
ATGGCCGGAGAATGAGGANCTTGAGGCCAACTGGGAGCATTTGGCTGGGAGCCTTTCAATT:1	ATGGCCGGAGAATGAGGANCTT	TTTGGCTGGGAGCCTTTCAATT	-	chr2L	7138407	-	chr2L	5243313	1895094	+	chr2L	5243313	+	chr2L	7138407
TACAGACACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTAGATGCAGATGCAAGACGGCAAATGGCAGAGG:1	TACAGACACATGTGTGTGTGTG	GCAAGACGGCAAATGGCAGAGG	+	chr3R	28653069	+	chr3R	13972139	14680930	+	chr3R	28653069	+	chr3R	13972139
CTCTCTCTCTACCAACCGTGTTTCAATCGGAAAAGTGGGTGTGCCAAG:1	CTCTCTCTCTACCAACCGTGTT	TCGGAAAAGTGGGTGTGCCAAG	-	chr3R	17236568	-	chr3R	14685837	2550731	+	chr3R	14685837	+	chr3R	17236568
ACTGCAACAACCAACCAACCGAAAACGAAAGAAATGGTACTGGGTCATTGTACCTCTCAACCAAAAA:1	ACTGCAACAACCAACCAACCGA	CATTGTACCTCTCAACCAAAAA	-	chr3L	22833291	-	chr3L	12452367	10380924	+	chr3L	12452367	+	chr3L	22833291
ATCCTTTTTCCTTCCTGGTAACCTGGCCGGAACGGAAATCAGGTCATCAAA:1	ATCCTTTTTCCTTCCTGGTAAC	GAACGGAAATCAGGTCATCAAA	-	chr3R	14207248	-	chr3R	23003005	8795757	+	chr3R	23003005	+	chr3R	14207248
GAATTGTTTGTTCTGTCCATGGGCAGACACCGAGACTGCAATTCTTTATTTCGTGGCT:1	GAATTGTTTGTTCTGTCCATGG	TGCAATTCTTTATTTCGTGGCT	+	chr2L	632722	+	chr2L	632785	63	+	chr2L	632722	+	chr2L	632785
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATTGGTCTTAAACAACGAAA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	CAATTGGTCTTAAACAACGAAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	24511959	2604425	+	chr3R	21907534	+	chr3R	24511959
AACAATCACAAACTCTTCAGATTTAGAGATTACCTAAAAATATTACCTTACAAATAATTGCTACTTACATTGTTT:1	AACAATCACAAACTCTTCAGAT	ATAATTGCTACTTACATTGTTT	+	chr2L	22212163	+	chr2L	22212710	547	+	chr2L	22212163	+	chr2L	22212710
AGCAGGTGTAGGATCCTGTAAGTTCTGATTTTTGTTTTAAGAATAAGATATTCTACAATTATACTCGTACAATTT:1	AGCAGGTGTAGGATCCTGTAAG	TACAATTATACTCGTACAATTT	+	chr2R	13566284	+	chr2R	13566364	80	+	chr2R	13566284	+	chr2R	13566364
CCTATTTAGTGCCACAATCAATGTGAACTCTCGTTTTTTAACATAGCTTTAGAATTTATATTTTTTATTTGCATT:1	CCTATTTAGTGCCACAATCAAT	ATTTATATTTTTTATTTGCATT	-	chr3L	14724898	-	chr3L	14724814	84	+	chr3L	14724814	+	chr3L	14724898
TGTTGATTTTGTGCGATGTTCAATTTATTTTGTAACCAATATCTGAAAAA:1	TGTTGATTTTGTGCGATGTTCA	TTTGTAACCAATATCTGAAAAA	-	chr3L	12538931	-	chr3L	15883132	3344201	+	chr3L	15883132	+	chr3L	12538931
ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACTATCCAATCAAACACACCTACACATCCACAT:1	ACACAAACACAAACACAAACAC	AAACACACCTACACATCCACAT	-	chrX	9845361	-	chrX	11952511	2107150	+	chrX	11952511	+	chrX	9845361
TCTGATGTATATGAACGCGTGTGACGCCCTCGCGCGCCTCTGATTCTCAAATATATATATAGAGATATATGCCGC:1	TCTGATGTATATGAACGCGTGT	TATATATAGAGATATATGCCGC	-	chrX	10772771	-	chrX	10772688	83	+	chrX	10772688	+	chrX	10772771
CATGCAACAGAAAACTTGGGACACCTTGGGCACCTGGATAGTCAAGGG:1	CATGCAACAGAAAACTTGGGAC	TGGGCACCTGGATAGTCAAGGG	+	chr2L	18988149	+	chr2L	19561035	572886	+	chr2L	18988149	+	chr2L	19561035
AATTTTCATTTAAAAATAAACATTACTTAGCCTGAGGTAACGATTTATAGCCCTAACGACTAGCGANAGTGCACA:1	AATTTTCATTTAAAAATAAACA	TAACGACTAGCGANAGTGCACA	-	chr2R	10066498	-	chr2R	7899535	2166963	+	chr2R	7899535	+	chr2R	10066498
AAAGCAGGAATATTCTAGCTAGAGGCATTTCTGGTCTCCAGTTTTCCAAATTGGAGAGAGCATTTGCAG:1	AAAGCAGGAATATTCTAGCTAG	AAATTGGAGAGAGCATTTGCAG	+	chr3R	20167802	+	chr3R	20167874	72	+	chr3R	20167802	+	chr3R	20167874
TATCGATATCTAAATTGATATTTCCTCTTTGGCCCAACCGAGGGAAAAGTTAGTCCACAAAAATGTTCAAGCAAA:1	TATCGATATCTAAATTGATATT	TCCACAAAAATGTTCAAGCAAA	+	chrX	12635193	+	chrX	17545343	4910150	+	chrX	12635193	+	chrX	17545343
AAGTGTCACGAGTGTTCCACTATGTTTGCCTGTTTGTTTGTTAGCTGGCCCAC:1	AAGTGTCACGAGTGTTCCACTA	GTTTGTTTGTTAGCTGGCCCAC	-	chr3L	7841713	-	chr3L	22546497	14704784	+	chr3L	22546497	+	chr3L	7841713
ACCCTTAAGAAGGCACTGGCATCTGTTGAATCTCGTAGCATAAACAACCATAAGGATTTGTTTATGGCCAGGC:1	ACCCTTAAGAAGGCACTGGCAT	AAGGATTTGTTTATGGCCAGGC	-	chr3R	8618726	-	chr3R	8618648	78	+	chr3R	8618648	+	chr3R	8618726
AACTACCAAAATAAAACACTAAAAACACAATAAAACACAAATTCTACAAAAATCGAGGACTCCAGCTGATGGTGA:1	AACTACCAAAATAAAACACTAA	CGAGGACTCCAGCTGATGGTGA	-	chr2R	10079888	-	chr2R	15310303	5230415	+	chr2R	15310303	+	chr2R	10079888
GTCAGATTGGTGGTACGAAAACTCCGGGAGTTNAATTTTCATTCAAGAGAGTAGCTAAAACCACAANCTTATG:1	GTCAGATTGGTGGTACGAAAAC	TAGCTAAAACCACAANCTTATG	+	chr3R	31435383	+	chr3R	31435533	150	+	chr3R	31435383	+	chr3R	31435533
AAAAGAAGAGGCACAAAATGCAAGCACCGATTAGATGCTTGGTTTTAGAGTAATGTTATAAAGTAACAGGTTTGA:1	AAAAGAAGAGGCACAAAATGCA	TGTTATAAAGTAACAGGTTTGA	-	chr2L	23395438	-	chr2L	23394900	538	+	chr2L	23394900	+	chr2L	23395438
GCTTTGTGTGTCTGCCGTTGTTAGCATCTTGTTCCACTAGGCTAAATCAGAAAAATCGATATCTTATTAATGAGA:1	GCTTTGTGTGTCTGCCGTTGTT	AATCGATATCTTATTAATGAGA	-	chr2R	17260761	-	chr2R	17260574	187	+	chr2R	17260574	+	chr2R	17260761
AAATAATCATTAAATATCAGATGTACAAGCGGGAGCGTCAATATACAAATGTCTGCCGCAAGAGGGCGCCCAC:1	AAATAATCATTAAATATCAGAT	TCTGCCGCAAGAGGGCGCCCAC	+	chr2R	21238955	+	chr2R	21239037	82	+	chr2R	21238955	+	chr2R	21239037
AAATTAATAAAGGACCAGATAACANAGAATGGCAACGAATTTNTTNTCAAANCATNTAGAAGGACAATGAGGCAC:1	AAATTAATAAAGGACCAGATAA	ATNTAGAAGGACAATGAGGCAC	+	chr2L	16633331	+	chr2L	6850905	9782426	+	chr2L	16633331	+	chr2L	6850905
AAAATCAAACGCGCTGTCATTGAGCTTTTGTTTTGCACTTATTTGAGACTTTGGACTGCAAATAGACAAACGTG:1	AAAATCAAACGCGCTGTCATTG	GGACTGCAAATAGACAAACGTG	-	chr3L	752037	-	chr3L	15456923	14704886	+	chr3L	15456923	+	chr3L	752037
GCTCAACAAAGGGGGCCGGGCCGAGGAGGCTTGATTACGGGCAAGGTATGAGCGGGAAATAAACGCAACGATGGG:1	GCTCAACAAAGGGGGCCGGGCC	GGGAAATAAACGCAACGATGGG	+	chr3R	23548091	+	chr3R	23548396	305	+	chr3R	23548091	+	chr3R	23548396
ATTTAATTATTTAATTATTAACATTTATTTAGTGCATTCATCATTATAGCATTCTCAAGAAAATTATAA:1	ATTTAATTATTTAATTATTAAC	AGCATTCTCAAGAAAATTATAA	+	chr2R	11154286	+	chr2R	23645189	12490903	+	chr2R	11154286	+	chr2R	23645189
ATATTACAACAATTTGCATAAAGCCTGTTACTGTTACGATTTCGAGANGACGGCGATTCCAACAG:1	ATATTACAACAATTTGCATAAA	GAGANGACGGCGATTCCAACAG	-	chr3L	14296471	-	chr3L	14295995	476	+	chr3L	14295995	+	chr3L	14296471
TTGTTTCTTTGTGAATAATATCTCAGCATCTGAACTTGCAAAAAGAAAATAATTTGGTCATAACTGAACTTAAAC:1	TTGTTTCTTTGTGAATAATATC	TTGGTCATAACTGAACTTAAAC	+	chr2L	1570708	+	chr2L	1573580	2872	+	chr2L	1570708	+	chr2L	1573580
CATAACGCTGGTAATTGCCATATACCATGCACCATGCACCATTCCATACCATGCAAATGTGGGTTAAATTGTTTT:2	CATAACGCTGGTAATTGCCATA	CAAATGTGGGTTAAATTGTTTT	-	chr3R	27542029	-	chr3R	27541948	81	+	chr3R	27541948	+	chr3R	27542029
GATTCACATGAAATATGTTCGACTGGGTTGTTGAACAATGCCAAATGACGAATGACGCATTATTCCCGACATCGA:1	GATTCACATGAAATATGTTCGA	GACGCATTATTCCCGACATCGA	-	chr2L	8789384	-	chr2L	8789308	76	+	chr2L	8789308	+	chr2L	8789384
CTCTTCCCCCGATCGAGATATATATGTATATACGTAGACATACGACATAGAGATCGATTGGNTTACGCATGTGC:1	CTCTTCCCCCGATCGAGATATA	ATCGATTGGNTTACGCATGTGC	+	chr2R	11415549	+	chr2R	11418697	3148	+	chr2R	11415549	+	chr2R	11418697
AAAAACCGTATTAAAACATGCTATATAATATACTACACTGAAGCTCTNTAAACGAAGTACGACTGTAAAAGCAAA:1	AAAAACCGTATTAAAACATGCT	GAAGTACGACTGTAAAAGCAAA	+	chr2R	22723262	+	chr2R	22723338	76	+	chr2R	22723262	+	chr2R	22723338
CTGCAGACCGCGTTTGAACTCGCGAAGCTGACGCTTTTCCTGACCTGCGTATCTTCGCTAGG:1	CTGCAGACCGCGTTTGAACTCG	TGACCTGCGTATCTTCGCTAGG	+	chr3R	15361112	+	chr3R	21891778	6530666	+	chr3R	15361112	+	chr3R	21891778
TAGCTGTGCAGTTCTTGACTGTGGCAAAGAGAACAAGCATTCCAGAATATTAGTTAACTTATGTCAAAGAGAATT:1	TAGCTGTGCAGTTCTTGACTGT	TTAACTTATGTCAAAGAGAATT	+	chr3R	11694724	+	chr3R	11694817	93	+	chr3R	11694724	+	chr3R	11694817
CGCTCATGNCCTGGCACCTTTTAAAAACTAACTAANATATTTAATGGAAATCATTGTTATTATGGATATT:1	CGCTCATGNCCTGGCACCTTTT	AATCATTGTTATTATGGATATT	-	chr2L	764656	-	chr2L	764561	95	+	chr2L	764561	+	chr2L	764656
GCTTAATTGCGCCTTATAATAACTAATTTTGGTTAATTTANATAAACCACTTTTGAATGGGTGAATCANTTTT:1	GCTTAATTGCGCCTTATAATAA	TTTGAATGGGTGAATCANTTTT	+	chr2R	14911703	+	chr2R	14911824	121	+	chr2R	14911703	+	chr2R	14911824
ATCAGATTCTTCGGATTCAGCAGCCAAATCCCGTGCTGAGGATTTCCATTTGAGATGGAAAATAGACGGGGGAGG:1	ATCAGATTCTTCGGATTCAGCA	GATGGAAAATAGACGGGGGAGG	+	chr2L	597290	+	chr2L	597172	118	+	chr2L	597290	+	chr2L	597172
ATGGGAATCGCTAGCGAGGACGTGTGCATATGCCTACCCGGGAAAAGCGGGAAAAACTGCTGGGACTATCGCAGA:1	ATGGGAATCGCTAGCGAGGACG	AAACTGCTGGGACTATCGCAGA	-	chr3R	14916237	-	chr3R	10457610	4458627	+	chr3R	10457610	+	chr3R	14916237
TGTTTGTGGGTTGAGTTGGGTATGCCATGCTCGCCAGAAAACTGAACTGAACCGACAAGACTGTTGCGCGCAG:1	TGTTTGTGGGTTGAGTTGGGTA	CCGACAAGACTGTTGCGCGCAG	-	chr3L	9907970	-	chr3L	9907895	75	+	chr3L	9907895	+	chr3L	9907970
TACAGACTTATATCCATAAGGGGTGATTCAAAGCAACTATAACTTACATTAGTTATAAGTTAGGCTATACATTTT:1	TACAGACTTATATCCATAAGGG	TATAAGTTAGGCTATACATTTT	-	chr2L	4037890	-	chr2L	4037803	87	+	chr2L	4037803	+	chr2L	4037890
TTTCTGTCTTTGTAGCTCGCTACGAATGTCGCTGATTTACTAATCACTTCTCNACGCACTTGACCTTTTTAT:1	TTTCTGTCTTTGTAGCTCGCTA	TCNACGCACTTGACCTTTTTAT	+	chr2R	7608427	+	chr2R	7613627	5200	+	chr2R	7608427	+	chr2R	7613627
GATAAGAAAGCTTTTGAGCTTGACTTCAGCTACATATAACAGAGAATTTTTCATTTCCTCGTTAAATATTCATAT:1	GATAAGAAAGCTTTTGAGCTTG	TTTCCTCGTTAAATATTCATAT	+	chr2R	22941822	+	chr2R	22941901	79	+	chr2R	22941822	+	chr2R	22941901
TAACTTGAATGTGTGTGTGTAAGTAAGTAACCACCAACTCTGTGGCAGAGTTGTTTGGCCAACTT:1	TAACTTGAATGTGTGTGTGTAA	GGCAGAGTTGTTTGGCCAACTT	+	chr2R	14467322	+	chr2R	14476464	9142	+	chr2R	14467322	+	chr2R	14476464
ACTTAAGCTGCCTCCTTACCCTTGTTTTTTTCTCCAACCCTTGGGCTGCCTTTGCCCTCGTTTTTGTCGCCAAG:1	ACTTAAGCTGCCTCCTTACCCT	TGCCCTCGTTTTTGTCGCCAAG	+	chr3R	4063810	+	chr3R	4069089	5279	+	chr3R	4063810	+	chr3R	4069089
GTGGAGGTGGAAAATTTTGGGCGGGAAATGATGTTGAATCGGTACGAGTTCCAGAGCCGACTAAACGAATTTAGA:1	GTGGAGGTGGAAAATTTTGGGC	GAGCCGACTAAACGAATTTAGA	-	chr2R	13360781	-	chr2R	18187077	4826296	+	chr2R	18187077	+	chr2R	13360781
AAGAAAAGACCGGACCCAGAAAAGTCCATTNNNGNGTTTTTTTTTTGACGCTCTTCGCTGAATTTCATGAATGAA:1	AAGAAAAGACCGGACCCAGAAA	TTCGCTGAATTTCATGAATGAA	-	chr3L	3451012	-	chr3L	3450924	88	+	chr3L	3450924	+	chr3L	3451012
GGCATGCGAAAGCATCCAGAAAAAAGAAGGTGAAATAGAAATTTTTGAAGGTCAATTCTGTTTTTACGCACCCAT:1	GGCATGCGAAAGCATCCAGAAA	AATTCTGTTTTTACGCACCCAT	+	chr3L	140192	+	chr3L	140312	120	+	chr3L	140192	+	chr3L	140312
TGGACCAGAGCTCCATGCCATTCGATCGACATTTTCAGACTTAATTTAACTTTTAAATGCATACGCATACGCTAC:1	TGGACCAGAGCTCCATGCCATT	TAAATGCATACGCATACGCTAC	+	chr2R	7869204	+	chr2R	7873990	4786	+	chr2R	7869204	+	chr2R	7873990
CATTTCACCGACCGACTTTTGAGTTCCTTTTAGCTTCTGATAAGGCCATTATGATAAGGCCAAAGTTAACAAA:1	CATTTCACCGACCGACTTTTGA	TGATAAGGCCAAAGTTAACAAA	-	chr3R	14070217	-	chr3R	14070138	79	+	chr3R	14070138	+	chr3R	14070217
CTACACTGCAAGAAACTTTGCCACACCACTAAGACAGAGAAACCAGACAGCTGATAAAGACAGTTTGACAGGCAA:1	CTACACTGCAAGAAACTTTGCC	ATAAAGACAGTTTGACAGGCAA	+	chrX	9179919	+	chrX	5364503	3815416	+	chrX	9179919	+	chrX	5364503
TTTCAATACCATAAGCAATACACAAACAGAAATTGTTNCAAACTTNAAGATTCTGATTATTTCTTC:1	TTTCAATACCATAAGCAATACA	TNAAGATTCTGATTATTTCTTC	-	chr2L	4184810	-	chr2L	4184500	310	+	chr2L	4184500	+	chr2L	4184810
CGGATGCAAATGCATTCANCTCTTCCTCGCCTTCTGCGTAANTATNTTTGTTGCTTAAAATGTTGCTCTTTGGAC:1	CGGATGCAAATGCATTCANCTC	CTTAAAATGTTGCTCTTTGGAC	+	chrX	417873	+	chrX	11653532	11235659	+	chrX	417873	+	chrX	11653532
TTAAAAGTATAAGCGGACTTTTAATACATGGATTTGTATACTATTGTTTAGGTCTTCAGTTTAATGGACAGGATA:1	TTAAAAGTATAAGCGGACTTTT	CTTCAGTTTAATGGACAGGATA	-	chr2L	5507299	-	chr2L	18907647	13400348	+	chr2L	18907647	+	chr2L	5507299
AATTTCGAACACAATTCANTCAACATTCAACATGCGTGTTTCCNTTNCGNTCGCTGGTATTGGTCACTTCCGGGG:1	AATTTCGAACACAATTCANTCA	CTGGTATTGGTCACTTCCGGGG	-	chr3L	5507868	-	chr3L	12888444	7380576	+	chr3L	12888444	+	chr3L	5507868
ATTGTGTGCCAGAAGTTTTTACTCTTCGACTGGTTAATTTGTCATGTTGCAAAATGTATATAAGTATGTTTGGTT:1	ATTGTGTGCCAGAAGTTTTTAC	ATGTATATAAGTATGTTTGGTT	+	chr2R	9510667	+	chr2R	9510783	116	+	chr2R	9510667	+	chr2R	9510783
TTTGGATTTTAATAAGTTTAGCTTTCGAAAATATGCACAATAATGTTGTTTCGTTCGTTGGCAACTTCATAACTT:1	TTTGGATTTTAATAAGTTTAGC	TTCGTTGGCAACTTCATAACTT	-	chrX	22701815	-	chrX	22697518	4297	+	chrX	22697518	+	chrX	22701815
CTTTGAAATGCCCTGTGGCCGAAAGAGAGGGGAAATGGCAC:1	CTTTGAAATGCCCTGTGGCCGA	CGAAAGAGAGGGGAAATGGCAC	-	chr3L	4716353	-	chr3L	17973059	13256706	+	chr3L	17973059	+	chr3L	4716353
CCGAACTTAACAGGCTACNTGTTTTCTATGAATTTCTTACTNTGTNGAGCCTCCTAGAGGCAAGGAGCACCCA:1	CCGAACTTAACAGGCTACNTGT	TCCTAGAGGCAAGGAGCACCCA	-	chr3R	30482955	-	chr3R	30480489	2466	+	chr3R	30480489	+	chr3R	30482955
AGTAATCAAGGTAAAGCAATCCCCACAATGGCCGGCAAAAAAAATGANAA:1	AGTAATCAAGGTAAAGCAATCC	TGGCCGGCAAAAAAAATGANAA	+	chr3R	5975774	+	chr3R	8894487	2918713	+	chr3R	5975774	+	chr3R	8894487
TGGAATAACTCTATACTCTACACTCGAGCAATGGCAATTTGCGTCGGTACGAATTTCACATTAGCCCCATGACAT:1	TGGAATAACTCTATACTCTACA	TTTCACATTAGCCCCATGACAT	-	chr3L	9918998	-	chr3L	9918903	95	+	chr3L	9918903	+	chr3L	9918998
TTTGTCTGATTCTGATTCGACTTATCAGTACGCGGTCCACAGCTTAAATTAAATCCATTACTGCAATGTAATCCG:1	TTTGTCTGATTCTGATTCGACT	TCCATTACTGCAATGTAATCCG	-	chr3L	22909119	-	chr3L	22909028	91	+	chr3L	22909028	+	chr3L	22909119
CCAATTAGCAGGGTATTCACAAAAAGGCACTTGGCTTACACCCCGTTTTTGGCTTTGGTTTTGGTCGTTTTGCA:1	CCAATTAGCAGGGTATTCACAA	CTTTGGTTTTGGTCGTTTTGCA	-	chr2R	21546870	-	chr2R	21546790	80	+	chr2R	21546790	+	chr2R	21546870
AATATGAAGGAGGAAAAGTAACGATGAAATAATAAAAAGGAATCAATTCAAATTTAAATATTTGAGCGCGCGTA:1	AATATGAAGGAGGAAAAGTAAC	TTTAAATATTTGAGCGCGCGTA	-	chr2R	6499310	-	chr2R	6494549	4761	+	chr2R	6494549	+	chr2R	6499310
ATTGGTAAAGCGACAAGGACGCGGAAGAGAAAAGNGGTGGGAGAAATGGGGTCTAAATCAGAACTGATAGAGC:1	ATTGGTAAAGCGACAAGGACGC	TCTAAATCAGAACTGATAGAGC	-	chr2R	11610270	-	chr2R	16448470	4838200	+	chr2R	16448470	+	chr2R	11610270
CAGCACAAATGGGTGCGTAAAAACAGAATTGACCTTCAAAAATTTCTATTTCACCTTCTTTTTTCTGGATGCTT:1	CAGCACAAATGGGTGCGTAAAA	ACCTTCTTTTTTCTGGATGCTT	-	chr3L	140320	-	chr3L	140201	119	+	chr3L	140201	+	chr3L	140320
ATCGCAGCACTAAAATCAATATCAATACCAATCCTTTCAAAAACCCCACNCAATTGTTGTTTAAAGTTCTAAGA:1	ATCGCAGCACTAAAATCAATAT	ATTGTTGTTTAAAGTTCTAAGA	-	chr3R	9605232	-	chr3R	9605121	111	+	chr3R	9605121	+	chr3R	9605232
TCATGTGATTATTTGGGCAAGCAATAAAAGAAAATGCTATTCCGTCTATGAGTTGCCTACAA:1	TCATGTGATTATTTGGGCAAGC	TCCGTCTATGAGTTGCCTACAA	-	chrX	1163392	-	chrX	1163327	65	+	chrX	1163327	+	chrX	1163392
CAGTGCCAAATGCCAAATTAAGATTGCTCGGTTGCGCTCACGCGATTTTCTCGTTGGCCAATTGGCACGCCCATT:1	CAGTGCCAAATGCCAAATTAAG	TTGGCCAATTGGCACGCCCATT	-	chr2R	23636800	-	chr2R	23636722	78	+	chr2R	23636722	+	chr2R	23636800
GTCCCCACTGACCACTGTCCACTCGCAATTCCAGAAAATATACATGCCATGGCCGCTCAGTACGGTAAAGTGTCA:1	GTCCCCACTGACCACTGTCCAC	CGCTCAGTACGGTAAAGTGTCA	+	chr2L	15369351	+	chr2L	6593376	8775975	+	chr2L	15369351	+	chr2L	6593376
ATGCAAAGCGCCATGTCAACAAAACAGCCTCGCAACACACAAAAGTTATACTATTATTCTATTAAAAAGAATATA:1	ATGCAAAGCGCCATGTCAACAA	TTATTCTATTAAAAAGAATATA	-	chr3R	9960649	-	chr3R	14824611	4863962	+	chr3R	14824611	+	chr3R	9960649
CACAGGCTATCAAAACTTTTGACGCTCAACTTGGNAGCAGCACCAGGAATCCGAGTTCAGGAGGGGCATTGTTGT:1	CACAGGCTATCAAAACTTTTGA	AGTTCAGGAGGGGCATTGTTGT	-	chr3L	19209440	-	chr3L	19208066	1374	+	chr3L	19208066	+	chr3L	19209440
TTACCACCACCTGATTATTTTGAACTTATATATACAGTACAGTGTTGAAAAGCAACCAGTTTGAACTTTGGACCG:1	TTACCACCACCTGATTATTTTG	AACCAGTTTGAACTTTGGACCG	+	chr2R	9605847	+	chr2R	9605954	107	+	chr2R	9605847	+	chr2R	9605954
ATGGCGGCTCAAACAAACGAGCCTCTTGTTGGGGTATGTCACTGGTTGTGGGCTTTTTGGGGGGGGGGGAAAAA:1	ATGGCGGCTCAAACAAACGAGC	CTTTTTGGGGGGGGGGGAAAAA	-	chr2R	9014253	-	chr2R	11732376	2718123	+	chr2R	11732376	+	chr2R	9014253
CACGCAACGCGGCGTATACCATCGAGAACGAGCGCGAAACGTAGAGATTTTGATAAACAGCTCCAAAAT:1	CACGCAACGCGGCGTATACCAT	TTTTGATAAACAGCTCCAAAAT	+	chr2L	18078288	+	chr2L	18078368	80	+	chr2L	18078288	+	chr2L	18078368
CAGACATTTGTATATTGACGCACCCGCTTGTACATCTGATATTTAATGATTATTTGTTTGTCTGTT:1	CAGACATTTGTATATTGACGCA	AATGATTATTTGTTTGTCTGTT	-	chr2R	21239019	-	chr2R	21238944	75	+	chr2R	21238944	+	chr2R	21239019
CAAAGGTGCAAAAGGGAAACCAAAAGCGAAAACTTGGCGACGAGGCAAACTGACATCCCATTTGTGANTCTGTG:1	CAAAGGTGCAAAAGGGAAACCA	ACATCCCATTTGTGANTCTGTG	-	chrX	12210137	-	chrX	11508326	701811	+	chrX	11508326	+	chrX	12210137
TAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACACAACACCTGGTACCGGGGCTT:1	TAATAGAACTGCTTACAAAACT	ACAACACCTGGTACCGGGGCTT	+	chr2L	18925253	+	chr2L	18925342	89	+	chr2L	18925253	+	chr2L	18925342
ATCTCTACTATCCATTTGAAAATCCTATCTACAGATTTATAATCTAAACTGATCCCGATTTCTTGCCGTGCTGCT:1	ATCTCTACTATCCATTTGAAAA	CCCGATTTCTTGCCGTGCTGCT	+	chr3L	110218	+	chr3L	119385	9167	+	chr3L	110218	+	chr3L	119385
ATTATCTTTATCTCTCACNCGACTGGCTGGCTGCATTACCANTCCNCCGCTGTGTCTGCGCAAAAAAAA:1	ATTATCTTTATCTCTCACNCGA	CGCTGTGTCTGCGCAAAAAAAA	-	chr3R	11865388	-	chr3R	11865315	73	+	chr3R	11865315	+	chr3R	11865388
AAATCACATAATTTTGATGTTTCAATCGACGATTGATTTTGCCATGCTTTCGATTGCCCTTTTCGGAAGGGTTTG:1	AAATCACATAATTTTGATGTTT	TTGCCCTTTTCGGAAGGGTTTG	+	chr3R	5919644	+	chr3R	5919786	142	+	chr3R	5919644	+	chr3R	5919786
AAGACAAATATAATGTTTGANTGGGAAATCGGNGACATTGGGNAACTCACTGGCAATAAAAGTGCCAAACAAGTT:1	AAGACAAATATAATGTTTGANT	CAATAAAAGTGCCAAACAAGTT	-	chr3L	7285553	-	chr3L	7285475	78	+	chr3L	7285475	+	chr3L	7285553
ACATTGTAAGGTCTGTCCTCGAGTTCTGAGACCCTCTTGTGAACTCTGATCTACGAACATTAAGTTCATGGCAAA:1	ACATTGTAAGGTCTGTCCTCGA	CGAACATTAAGTTCATGGCAAA	-	chr2L	4166492	-	chr2L	4166409	83	+	chr2L	4166409	+	chr2L	4166492
TTATTTTAGTAAATGACTCCATTTCTGCCTTCGTTTTTCAAATCAAGGTCAATCGCAACAGAG:1	TTATTTTAGTAAATGACTCCAT	ATCAAGGTCAATCGCAACAGAG	+	chr2R	6493503	+	chr2R	6493387	116	+	chr2R	6493503	+	chr2R	6493387
AAAATATTTGCAAAAATAATCCCCCAAAATATATGCATACACATTGGTTTATAATGAAAATATTCGTTTTCCTCA:1	AAAATATTTGCAAAAATAATCC	ATGAAAATATTCGTTTTCCTCA	-	chr3R	20273004	-	chr3R	20266533	6471	+	chr3R	20266533	+	chr3R	20273004
AGAAAAATACAATCCGTTGTTGTATTTACAAAAAAAAATAAATTTA:1	AGAAAAATACAATCCGTTGTTG	TTTACAAAAAAAAATAAATTTA	+	chr3L	14258027	+	chr3L	15467802	1209775	+	chr3L	14258027	+	chr3L	15467802
ATTCGGGACTGCGGCAAGGACACATACATATATATCGCCAGCGCTCATTTTGGCACCCTCAAAAGTGGA:1	ATTCGGGACTGCGGCAAGGACA	TTTTGGCACCCTCAAAAGTGGA	+	chr2L	11680334	+	chr2L	11680447	113	+	chr2L	11680334	+	chr2L	11680447
ACTTTTCGAAGCCAATGGATTTTTTGTAATTCCTTGATTCAACTACCGGTG:1	ACTTTTCGAAGCCAATGGATTT	TTCCTTGATTCAACTACCGGTG	-	chrX	494695	-	chrX	494627	68	+	chrX	494627	+	chrX	494695
CCTTGCGCCGATGTCTGGCNTTTTGAATTCACCTCGCGCGGTGACCAACGGGTAAGGCGAAGATTCTGACATTT:1	CCTTGCGCCGATGTCTGGCNTT	TAAGGCGAAGATTCTGACATTT	+	chr3R	6837087	+	chr3R	19791433	12954346	+	chr3R	6837087	+	chr3R	19791433
ATNTGGATTAGCAGCGGAGCAGCGGACAAGCTGCNTNAAACGGATTGTACTCAACCAACCGCAAA:1	ATNTGGATTAGCAGCGGAGCAG	ATTGTACTCAACCAACCGCAAA	-	chr3R	23291354	-	chr3R	23291278	76	+	chr3R	23291278	+	chr3R	23291354
GTGAGCAATGACCTTAGTTATTAAGTATGATTTAAGCTTCAAATAAAAGTAAATATATTTCTTCTTTGTACGACG:1	GTGAGCAATGACCTTAGTTATT	TATATTTCTTCTTTGTACGACG	+	chr2R	22185677	+	chr2R	22185776	99	+	chr2R	22185677	+	chr2R	22185776
TGTTGTGGCTAAAACAAAAAAGATTTGTTTAATAGTTTCGCAACATGAAAAAATCAACAGCATTCCACACG:1	TGTTGTGGCTAAAACAAAAAAG	AAAATCAACAGCATTCCACACG	-	chr2R	14922246	-	chr2R	14922174	72	+	chr2R	14922174	+	chr2R	14922246
ATAGTGTTGTAAATTTGGTTACCTATATATATTACTTATACAATTCTAGCTTTTTTTTAATTTTTGTTTCGGTAC:1	ATAGTGTTGTAAATTTGGTTAC	TTTTTAATTTTTGTTTCGGTAC	+	chr2L	15586437	+	chr2L	15593489	7052	+	chr2L	15586437	+	chr2L	15593489
CAGGGAAGTCCATCGGAAGAATCCAAAAAAGTTGCCGCACCTCAAGTTCAGCCCGCTCCACATGTTGATTCAAG:1	CAGGGAAGTCCATCGGAAGAAT	CCGCTCCACATGTTGATTCAAG	+	chr2L	18699224	+	chr2L	18699300	76	+	chr2L	18699224	+	chr2L	18699300
TGACACGCCGCCTGAAGAGCACTTCATCTGCGGGCGAAAAAGGGCCACACACTTGGAACTTTTAGATCCTGCCAG:1	TGACACGCCGCCTGAAGAGCAC	TGGAACTTTTAGATCCTGCCAG	-	chr3R	31699824	-	chr3R	31699742	82	+	chr3R	31699742	+	chr3R	31699824
ATGGAAAGTGCTGGTTCGACGTAAATTTAACATAATTTATATACTTTTTGAACAACGTTTTAAATACTCTCTGC:1	ATGGAAAGTGCTGGTTCGACGT	CAACGTTTTAAATACTCTCTGC	+	chr3L	15024055	+	chr3L	15024133	78	+	chr3L	15024055	+	chr3L	15024133
ACTAAAACATAAGGAAAAAAGCGTGAAACTAGGCAAAAGGGATGCCGAAAGCTGGCTCAAAGGCAGGTGGCATGG:1	ACTAAAACATAAGGAAAAAAGC	GGCTCAAAGGCAGGTGGCATGG	+	chr3L	20930973	+	chr3L	17207872	3723101	+	chr3L	20930973	+	chr3L	17207872
CCCATGGTTTTTTTTTTTCCGCTGCTTTTCCTTTTACCTGTGCTTTAGTTAGACGAACCAAAAAAAACAAAAAAC:1	CCCATGGTTTTTTTTTTTCCGC	CGAACCAAAAAAAACAAAAAAC	+	chr2L	1077383	+	chr2L	4113035	3035652	+	chr2L	1077383	+	chr2L	4113035
CGACTAGATCATGTAGATNCACTCTTATCCAAACGGCTTCAAAGGCATTCCCCGGGTGTGGAGGGCATCAAANCG:1	CGACTAGATCATGTAGATNCAC	GGGTGTGGAGGGCATCAAANCG	-	chr2L	6185525	-	chr2L	6185447	78	+	chr2L	6185447	+	chr2L	6185525
AAGCAAGAACTAATTTTCCAAACAATTAAATCCGAACTGTCCAACGTTGTTGGCCAATTTGGGAATTAATTGCCA:1	AAGCAAGAACTAATTTTCCAAA	CCAATTTGGGAATTAATTGCCA	-	chr2R	22579702	-	chr2R	22579616	86	+	chr2R	22579616	+	chr2R	22579702
GTTGTAATTCAAAACCAAACAAAACCGTCGAGGAATCAAAAGGCAAAGCGATGGCAAATTA:1	GTTGTAATTCAAAACCAAACAA	AAGGCAAAGCGATGGCAAATTA	+	chr2R	8015677	+	chr2R	8017686	2009	+	chr2R	8015677	+	chr2R	8017686
TTATTATATTAACATGTGGTTGCTTATAGATTGATGGATTGATATTGATAAATGAGAGGGGGCTTAATTTGCTCT:1	TTATTATATTAACATGTGGTTG	GAGAGGGGGCTTAATTTGCTCT	+	chr2L	19608609	+	chr2L	19608700	91	+	chr2L	19608609	+	chr2L	19608700
CATTTAACTCGGGTATTTTGGTATTTTTGCGAGTGCTGTGGAATGTCGTTTATATAGTATCGATGCCATTCTGGA:1	CATTTAACTCGGGTATTTTGGT	ATAGTATCGATGCCATTCTGGA	+	chr2L	18028478	+	chr2L	18028569	91	+	chr2L	18028478	+	chr2L	18028569
CATGCAACGGAATTCTTGAGGAGCATACAAAAGCATTTGAAAACAAAATAAAAAATAATAACTTTTTGCCAT:1	CATGCAACGGAATTCTTGAGGA	AAAAATAATAACTTTTTGCCAT	-	chr2L	13600644	-	chr2L	13600387	257	+	chr2L	13600387	+	chr2L	13600644
TGAGAAGGACCAACAAGAAGTTTCAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAANGAAATTGCCA:1	TGAGAAGGACCAACAAGAAGTT	CAGCTTAAAAANGAAATTGCCA	+	chr3R	19447719	+	chr3R	19448950	1231	+	chr3R	19447719	+	chr3R	19448950
AAATACTTAACCACTTTAATTCAGTTCGTTCGCTTTATTTTCGGTAAATACTTCCGCTT:1	AAATACTTAACCACTTTAATTC	TTTTCGGTAAATACTTCCGCTT	+	chr3R	7655037	+	chr3R	7655103	66	+	chr3R	7655037	+	chr3R	7655103
AAAATGCCCACCACTTAGGGGTGTGTGTATTGAGAGCAAGAGTCCGTCCCTCCAGAGCTGTCAAATTGCG:1	AAAATGCCCACCACTTAGGGGT	CCTCCAGAGCTGTCAAATTGCG	+	chr3L	2573315	+	chr3L	2573402	87	+	chr3L	2573315	+	chr3L	2573402
GTTTTTCAATTGGATTTTCTTTGAATTCATAGTTGGAACTTTTGAATGATGTATTAAACTTGATTTCACTTGGAT:1	GTTTTTCAATTGGATTTTCTTT	TTAAACTTGATTTCACTTGGAT	+	chrX	3881286	+	chrX	3881425	139	+	chrX	3881286	+	chrX	3881425
GCTGGCCGCGGGGCAGGGTCCTGGGAAAAGGACGATCCCAAATTAATTATCACTCTCAACAGCATTTTGGGGGA:1	GCTGGCCGCGGGGCAGGGTCCT	CTCTCAACAGCATTTTGGGGGA	-	chr3R	25669191	-	chr3R	25669098	93	+	chr3R	25669098	+	chr3R	25669191
AAGCTATAAAAAAAAAGCTATAAATAAAAGGCCATATACATA:1	AAGCTATAAAAAAAAAGCTATA	TAAATAAAAGGCCATATACATA	+	chr2R	20226128	+	chr2R	8790024	11436104	+	chr2R	20226128	+	chr2R	8790024
ATGCGCATTTCAACTCAAATTGCTGCTGTTAATGCTGCTGCTGCTGCAGTGGATTAAAAGCCATAAAAAGCGAAA:1	ATGCGCATTTCAACTCAAATTG	TTAAAAGCCATAAAAAGCGAAA	-	chrX	8232238	-	chrX	8232161	77	+	chrX	8232161	+	chrX	8232238
GGAATACGAGGATGAAGACAAGTTCAAGGAAGCCCTCAGAATACACCGCCAATAAAAATATATTTAAGGCTATCC:1	GGAATACGAGGATGAAGACAAG	AAAAATATATTTAAGGCTATCC	+	chr2L	19557854	+	chr2L	19557940	86	+	chr2L	19557854	+	chr2L	19557940
AACACAAACAATTTCTNTAACCTNTATTGCTTTNCATTNTTAAATATATTTTACTTAACTTT:1	AACACAAACAATTTCTNTAACC	TAAATATATTTTACTTAACTTT	+	chrX	21038143	+	chrX	3050704	17987439	+	chrX	21038143	+	chrX	3050704
AACAAAAAGGGAAGCCATATTCGCCAAATCGAAGAATATATACCCTTGAAATTGTTAAATACATAAAANATGGAA:1	AACAAAAAGGGAAGCCATATTC	GTTAAATACATAAAANATGGAA	-	chr3R	27868274	-	chr3R	27862969	5305	+	chr3R	27862969	+	chr3R	27868274
AAAGCAGTTAAAAACTCGCGTATACGCCATGTTGTCAACTGGTTGGGCAGCAAAAAAACATAGCACACTTTTAAG:1	AAAGCAGTTAAAAACTCGCGTA	AAAAACATAGCACACTTTTAAG	+	chr3R	26642749	+	chr3R	26643143	394	+	chr3R	26642749	+	chr3R	26643143
CTCTGTAGCGACTGCTTTGATTGGAAGTGAGTCATTAACCAGTCTGAATTACCAATAATATTCCATTCGAAATCT:1	CTCTGTAGCGACTGCTTTGATT	AATAATATTCCATTCGAAATCT	+	chr3R	31069654	+	chr3R	31069749	95	+	chr3R	31069654	+	chr3R	31069749
ATATTAGAGGGATGCGTTTCGAACCTCTCTGTCTCTGTAATTTTTGATTAATGGATATCCGAAAGTTCAA:1	ATATTAGAGGGATGCGTTTCGA	TAATGGATATCCGAAAGTTCAA	+	chr3L	11943517	+	chr3L	11943613	96	+	chr3L	11943517	+	chr3L	11943613
CTATCATTTTTTGGCATTTTATTAGACACTATAATTTCTGATTCTGTCCCATTTATTCTTCGAGCCGNTTTCTTA:1	CTATCATTTTTTGGCATTTTAT	TATTCTTCGAGCCGNTTTCTTA	-	chr2L	10692906	-	chr2L	10692808	98	+	chr2L	10692808	+	chr2L	10692906
CTACTAGTATCATTATCTATTTGTCTTGGTTAGTGTAGAGAGGTGGAAACAGGTAAATCAATCACACGCATTATG:1	CTACTAGTATCATTATCTATTT	TAAATCAATCACACGCATTATG	-	chr3L	4433521	-	chr3L	2217868	2215653	+	chr3L	2217868	+	chr3L	4433521
ACTGGTGTAACTTAACTTTTTCCTGGCTGCTGATTGATTGGCTGAGTTTT:1	ACTGGTGTAACTTAACTTTTTC	GCTGATTGATTGGCTGAGTTTT	-	chr2R	13749553	-	chr2R	13749432	121	+	chr2R	13749432	+	chr2R	13749553
TACGTGTCCAAGATAAGCTCGTCATGAGGATGAGGATGCAGTGGCAACTTTTCCTCCACTCGACACTCCACCAC:1	TACGTGTCCAAGATAAGCTCGT	CCTCCACTCGACACTCCACCAC	-	chr3L	5826231	-	chr3L	5826148	83	+	chr3L	5826148	+	chr3L	5826231
CTTTCGCTAGTCGTTAGGGCTACAAATCGTTACCTCAGGCNAAGTAATGTTTATTTTTAAATGAAAAT:1	CTTTCGCTAGTCGTTAGGGCTA	ATGTTTATTTTTAAATGAAAAT	+	chr2R	7899541	+	chr2R	10066497	2166956	+	chr2R	7899541	+	chr2R	10066497
TGCATAGCGGCAGGCGCAAAGTGTGATGAAGCTTTTGCGGAAAAAGGGG:1	TGCATAGCGGCAGGCGCAAAGT	GAAGCTTTTGCGGAAAAAGGGG	+	chr3L	21749348	+	chr3L	21754482	5134	+	chr3L	21749348	+	chr3L	21754482
GTTACCAGTTACCAGTTACCAGTTTCCACTCCGATTTCCGGAAATTATAATGGTGTTTTTCNGTTCTGTGGCAT:1	GTTACCAGTTACCAGTTACCAG	GTGTTTTTCNGTTCTGTGGCAT	-	chr3L	5087947	-	chr3L	27979702	22891755	+	chr3L	27979702	+	chr3L	5087947
TGTTTCGGCGACAAGGAGTTACGGTGGGGATACGGTAAGAGCTCTATCTGTCTGTCCCACAAACA:1	TGTTTCGGCGACAAGGAGTTAC	CTATCTGTCTGTCCCACAAACA	-	chrX	14114177	-	chrX	14105036	9141	+	chrX	14105036	+	chrX	14114177
CTGGATTATCCTCTGACTTGACATGATTCCATTCAGAATTTTTTAATTTCCGAATGATCTTACTTTGACCACTGT:1	CTGGATTATCCTCTGACTTGAC	ATGATCTTACTTTGACCACTGT	-	chr3R	19446454	-	chr3R	19446374	80	+	chr3R	19446374	+	chr3R	19446454
CAAAAGGGGTAATAGTTTGACTTCATGTTGGAACTCCATTTTAAGAACATTGACCAGTCTTACAGTCANAGATAC:1	CAAAAGGGGTAATAGTTTGACT	CCAGTCTTACAGTCANAGATAC	+	chr2L	14694257	+	chr2L	14694381	124	+	chr2L	14694257	+	chr2L	14694381
ATAAAATTTTTGGTCGCGTATTGGACCAATGCTAATCTGACGGCGGGAAGAAAGGAGATTATTTCAAGCCCATCC:1	ATAAAATTTTTGGTCGCGTATT	GGAGATTATTTCAAGCCCATCC	-	chr3R	27858249	-	chr3R	27856766	1483	+	chr3R	27856766	+	chr3R	27858249
TATCTATGCAGCGTGGATACACAAAGGAAGATAGCGAGATTGGACAGGGATTCCTCAGGTAAGTCCGACACC:1	TATCTATGCAGCGTGGATACAC	TTCCTCAGGTAAGTCCGACACC	+	chrX	17282893	+	chrX	17282968	75	+	chrX	17282893	+	chrX	17282968
GAAGAACAATTCCGTTTAGTCACCTATTACCTTATTGATTCATATACAAATTTAGAACTCAAATCA:1	GAAGAACAATTCCGTTTAGTCA	TACAAATTTAGAACTCAAATCA	-	chr3R	28181109	-	chr3R	28173688	7421	+	chr3R	28173688	+	chr3R	28181109
TTATTAGAGTGCGAAAACAGTCATCGAGAGTGAACATGGGNTAGTCGATCAAACGCAGCTCAAGTATANGA:1	TTATTAGAGTGCGAAAACAGTC	CAAACGCAGCTCAAGTATANGA	+	chr2R	5421629	+	chr2R	5421543	86	+	chr2R	5421629	+	chr2R	5421543
CTGCAATCTGTACTTCATCTGCTTGGCCATCACTTTTTTACTGAATGTCAAGTAATGGCCACTTTTCTCTGGCTT:1	CTGCAATCTGTACTTCATCTGC	AATGGCCACTTTTCTCTGGCTT	+	chr3R	10401897	+	chr3R	10402087	190	+	chr3R	10401897	+	chr3R	10402087
TTCACCGCTTATCCGCTTGCCCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTTTC:1	TTCACCGCTTATCCGCTTGCCC	AATCGGGGTTATATCGCCTTTC	+	chrX	670271	+	chrX	670347	76	+	chrX	670271	+	chrX	670347
CATGAGAAAATATTTGCAAAAATAATCCCCCAAAATATATGCATACACATTGGTTTATAATGAAAATATTCGTTT:1	CATGAGAAAATATTTGCAAAAA	TTTATAATGAAAATATTCGTTT	-	chr3R	20273010	-	chr3R	20266539	6471	+	chr3R	20266539	+	chr3R	20273010
TTTCTCCCGTTTAAATAAAGATTATTATCAGCTTTGTTCCTTCCGATTTGGATAAGTAAATTTCGTTTACTTAAC:1	TTTCTCCCGTTTAAATAAAGAT	AAGTAAATTTCGTTTACTTAAC	+	chrX	10401396	+	chrX	10401477	81	+	chrX	10401396	+	chrX	10401477
TTCTTTTGGTCAGCGGCCNTTTGCATGAAAGCGAAAGTGAAAANGAAAANGGCTTTCGGCATCGAAAAGACCGCG:1	TTCTTTTGGTCAGCGGCCNTTT	TTTCGGCATCGAAAAGACCGCG	-	chr3R	28739361	-	chr3R	30092677	1353316	+	chr3R	30092677	+	chr3R	28739361
AACACACCAAAATCTGAGNTGTTGGCTTCAGTCGACCGGATAANTGCCCNCTTTGCATTGCGAACTGCACGCCAA:1	AACACACCAAAATCTGAGNTGT	TGCATTGCGAACTGCACGCCAA	-	chr3R	7589939	-	chr3R	7589818	121	+	chr3R	7589818	+	chr3R	7589939
AACTTCATTTTACATTAGTTTATTTGGACATATATACACTAATTAAAAATCGATGCCTATGAAAATGCGATGAAA:1	AACTTCATTTTACATTAGTTTA	TGCCTATGAAAATGCGATGAAA	+	chrX	20493913	+	chrX	20494074	161	+	chrX	20493913	+	chrX	20494074
TACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCG:1	TACTTTGCTTGGAACTTTAGCT	GTTGGCCATCATTCATGGGCCG	+	chr3L	16184130	+	chr3L	16188949	4819	+	chr3L	16184130	+	chr3L	16188949
GCCGTATTATCTTGTTTTCGGTTTCAGCTCTCCGCTCTTTTNGCCCGATGTTTGCTGCATTGTTTCTTCATTTT:1	GCCGTATTATCTTGTTTTCGGT	TGCTGCATTGTTTCTTCATTTT	+	chr2R	8738171	+	chr2R	12256301	3518130	+	chr2R	8738171	+	chr2R	12256301
GTGCAAGTCGACGGGTGTTATATAATAAATGTTCCCTTTTTTCCAGATTCCACTCATATTTATGCTAATAAAACA:1	GTGCAAGTCGACGGGTGTTATA	TCATATTTATGCTAATAAAACA	-	chr3L	149487	-	chr3L	5002587	4853100	+	chr3L	5002587	+	chr3L	149487
TTTACTATGTATATGTTGAACTGAATATGTACATAAGTGAAACAATTTACAACCGAAAGATTACAAAAAATATAT:1	TTTACTATGTATATGTTGAACT	CGAAAGATTACAAAAAATATAT	-	chr3L	20484361	-	chr3L	20476762	7599	+	chr3L	20476762	+	chr3L	20484361
GTTTGCATTCAACGAGTCTGATGAATGGCCATTTGAAGTAAGCGGCAATTGCACAAGCAGCTTAAGG:1	GTTTGCATTCAACGAGTCTGAT	CAATTGCACAAGCAGCTTAAGG	+	chr3L	12933103	+	chr3L	12933179	76	+	chr3L	12933103	+	chr3L	12933179
GACTAAGCAATGAAGATGGCATAGGCTTGAGCATGGGGCGGAGTGTTTGTTTGGAATCTGAACCCATCCATGTAA:1	GACTAAGCAATGAAGATGGCAT	GAATCTGAACCCATCCATGTAA	+	chr3R	5076504	+	chr3R	9606176	4529672	+	chr3R	5076504	+	chr3R	9606176
TTTGGCGCTTATGATCTTGCGTTATTCGANGCATTTCTTTCCGTGTCTCTATCTGCTATT:1	TTTGGCGCTTATGATCTTGCGT	TTCCGTGTCTCTATCTGCTATT	-	chr2L	11292463	-	chr2L	11292396	67	+	chr2L	11292396	+	chr2L	11292463
AAACCAAACAAGTACAGAGCACACTTCTTTGTCTAAGGAACAAACAAGTATAATTCCTACATTTTCAAAGTTAGA:1	AAACCAAACAAGTACAGAGCAC	TTCCTACATTTTCAAAGTTAGA	+	chrX	16059684	+	chrX	16059761	77	+	chrX	16059684	+	chrX	16059761
CGATGTTGCATGAGAAATTTCTCGTGAGCCGGGAGCTGCAAACGGAGCTTGCATGCGTGGATATACTGATACT:1	CGATGTTGCATGAGAAATTTCT	CATGCGTGGATATACTGATACT	-	chr2R	5812247	-	chr2R	5812172	75	+	chr2R	5812172	+	chr2R	5812247
ATGGATGAAGATGATAGAGAGCAATTCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTA:1	ATGGATGAAGATGATAGAGAGC	TCAAAAGTCCGTCTGCAATGTA	+	chr3R	19448590	+	chr3R	19449463	873	+	chr3R	19448590	+	chr3R	19449463
AAAATACGTTATTCCCGTTTATGTTGGCTGAGGCTCCAGGCATGGAGATGGGGCATGAACACATGCG:1	AAAATACGTTATTCCCGTTTAT	AGATGGGGCATGAACACATGCG	-	chr3R	29287747	-	chr3R	29287672	75	+	chr3R	29287672	+	chr3R	29287747
TAGGCTTGATGGATTTAAAAGGTTCAAAGGTTTTGACTACATATTTTAGAAAAATAAAAAGATGCCGATGCTGA:1	TAGGCTTGATGGATTTAAAAGG	AATAAAAAGATGCCGATGCTGA	+	chr3L	642482	+	chr3L	642572	90	+	chr3L	642482	+	chr3L	642572
TTATTACAGACTTATATCCATAAGGGGTGATTCAAAGCAACTATNACTTACATTAGTTATAAGTTAGGCTATA:1	TTATTACAGACTTATATCCATA	ATTAGTTATAAGTTAGGCTATA	-	chr2L	4037894	-	chr2L	4037809	85	+	chr2L	4037809	+	chr2L	4037894
ACCAAACATACTTATATACATTTTGCAACATGACAAATTAACCAGTCGAAGAGTAAAAACTTCTGGCACACAATC:1	ACCAAACATACTTATATACATT	TAAAAACTTCTGGCACACAATC	-	chr2R	9510782	-	chr2R	9510666	116	+	chr2R	9510666	+	chr2R	9510782
TGAGTGGGCGACGGTGGGTGGCTTTGGAGGTTAACTACTTTTCATGAGCTTAATTTTAAATTGAGG:1	TGAGTGGGCGACGGTGGGTGGC	TGAGCTTAATTTTAAATTGAGG	+	chr2R	21738295	+	chr2R	21747446	9151	+	chr2R	21738295	+	chr2R	21747446
TGCTGACTNTTCGTTCAGGAACGAGATCTGATTTANACCGCCACACCACTCGATTTACGATATATGTTTCCCT:1	TGCTGACTNTTCGTTCAGGAAC	GATTTACGATATATGTTTCCCT	-	chrX	21243053	-	chrX	21242965	88	+	chrX	21242965	+	chrX	21243053
GTGTGGTTAAGTGACAGCGAAGGAGTAAGCAGAATGGTC:1	GTGTGGTTAAGTGACAGCGAAG	CGAAGGAGTAAGCAGAATGGTC	+	chr3R	24072120	+	chr3R	24072522	402	+	chr3R	24072120	+	chr3R	24072522
GGACAACACATATGACATGCTTATAGCCATAATCACTTTAATTGGGTGCGAAAACTAAAGTGTTTGCAAATAGCA:1	GGACAACACATATGACATGCTT	ACTAAAGTGTTTGCAAATAGCA	+	chr2L	13701895	+	chr2L	13701975	80	+	chr2L	13701895	+	chr2L	13701975
CATACACACATTTTTTGCTCTTGTCTCTTTCCGAAAACTTTTCGTCTCACTTTGTTTCGCCAAGTTGCCATGTCA:1	CATACACACATTTTTTGCTCTT	GTTTCGCCAAGTTGCCATGTCA	+	chr2L	12759233	+	chr2L	12759328	95	+	chr2L	12759233	+	chr2L	12759328
GCTGCTGTTGCTGCTACTGATTTTCCCCAGCAATTGTAGCAATTTCATTAAATCATATCATAAACTCCAAAAAAA:1	GCTGCTGTTGCTGCTACTGATT	CATATCATAAACTCCAAAAAAA	-	chr3R	24726367	-	chr3R	6929401	17796966	+	chr3R	6929401	+	chr3R	24726367
ACATAAGCCGCAACGCCACGAAAAGGAAATGCCGATGATAAGAGGGCGAAAGCGGAAACGGAAGTCANAGAA:1	ACATAAGCCGCAACGCCACGAA	AGCGGAAACGGAAGTCANAGAA	-	chr2L	3397500	-	chr2L	3397361	139	+	chr2L	3397361	+	chr2L	3397500
AATAGTAAATGATAACAAAATCGTACAAAAGTATTACTTACTTTTCCAGTTTGTTTCTATGCACTANAAACGTAC:1	AATAGTAAATGATAACAAAATC	TTTCTATGCACTANAAACGTAC	-	chr2R	10198304	-	chr2R	10198221	83	+	chr2R	10198221	+	chr2R	10198304
AGGCTCAAATCCCAGTACGTGTCCAAGATAAGCTCGTCATGAGGATGAGGATGCAGTGGCAACTTTTCCTCC:1	AGGCTCAAATCCCAGTACGTGT	ATGCAGTGGCAACTTTTCCTCC	-	chr3L	5826246	-	chr3L	5826165	81	+	chr3L	5826165	+	chr3L	5826246
CTCAAATGGCACACAAAACGCTCGTATTACATAGCTAACGAGTCCTGCCGGTCGGATAACAATGGAGCGTTACTT:1	CTCAAATGGCACACAAAACGCT	GGATAACAATGGAGCGTTACTT	+	chr2R	17141250	+	chr2R	17964124	822874	+	chr2R	17141250	+	chr2R	17964124
AGTAAGGCCAAAAGGACGAATGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATGCTCC:1	AGTAAGGCCAAAAGGACGAATG	CGCAGGACGAAGGACATGCTCC	-	chr2L	15852137	-	chr2L	15852074	63	+	chr2L	15852074	+	chr2L	15852137
GTGCCGGATTAAGCTTCACTTGTGAGCCACCATTGCGATGACTATTCTCGTGCGCACTC:1	GTGCCGGATTAAGCTTCACTTG	ATGACTATTCTCGTGCGCACTC	+	chrX	15413066	+	chrX	15417352	4286	+	chrX	15413066	+	chrX	15417352
AACTACTTTTAAGCTTACACTACCCACCCATTTTAATTGTTAAGCTCCAGAT:1	AACTACTTTTAAGCTTACACTA	TTTTAATTGTTAAGCTCCAGAT	-	chr3R	15608685	-	chr3R	15601186	7499	+	chr3R	15601186	+	chr3R	15608685
GAATCCTCGACGGCACTGGAGGGAAAAAAGAATGAAAACACATTAGAAATGGCCAGTGGTCCCAGTGTCCCCGC:1	GAATCCTCGACGGCACTGGAGG	CCAGTGGTCCCAGTGTCCCCGC	+	chr3R	27789098	+	chr3R	27789174	76	+	chr3R	27789098	+	chr3R	27789174
CACACTTAACCCCCTTTTTTAAGCGCCCTTCCTGGCTCCATTTTATCCCCTTTATTTTCGCAGCACCCCCACAAA:1	CACACTTAACCCCCTTTTTTAA	ATTTTCGCAGCACCCCCACAAA	-	chrX	12303263	-	chrX	12301957	1306	+	chrX	12301957	+	chrX	12303263
CTTTCTCCTTTCTTTTAAGAGCTTTGTGTTTCCCGTTTTCCAAATTTTAGAACTGTGGATATGGTTGCATT:1	CTTTCTCCTTTCTTTTAAGAGC	GAACTGTGGATATGGTTGCATT	-	chr3R	5627135	-	chr3R	5627023	112	+	chr3R	5627023	+	chr3R	5627135
TGGANGCCACACCGTGGTACAANTTCGNGGATTGCTACTNATAGCTTTTGGAGCAATAAAGTAACTTCTTTAGTG:1	TGGANGCCACACCGTGGTACAA	CAATAAAGTAACTTCTTTAGTG	+	chr2L	6021632	+	chr2L	6021710	78	+	chr2L	6021632	+	chr2L	6021710
TTAGTGATTTATAGATTTGCCCAAAGTCTTAAGNACTATGAATATATAGAAGGTGTCNTT:1	TTAGTGATTTATAGATTTGCCC	TGAATATATAGAAGGTGTCNTT	+	chr2R	21754697	+	chr2R	21754778	81	+	chr2R	21754697	+	chr2R	21754778
ACTGGATGCTGTGCAGAGAGGAAGGAACCAACGGCAACCAAATATATCCATAATGAAGTTGTAAAAATTGCAAAA:1	ACTGGATGCTGTGCAGAGAGGA	TGAAGTTGTAAAAATTGCAAAA	-	chr3R	10994365	-	chr3R	10994286	79	+	chr3R	10994286	+	chr3R	10994365
CATTGAAATGCCCACAGACCCCACTCATCGACTCACCAACTCACCAGCTCACCGACTCACCTGTTTGGCCTGGTT:1	CATTGAAATGCCCACAGACCCC	GACTCACCTGTTTGGCCTGGTT	-	chr3R	29966148	-	chr3R	29966071	77	+	chr3R	29966071	+	chr3R	29966148
TATATGAATAACGTATCTTATGGATTCTCAACTTGTGAACAAAATTCTTTGGGGTTGTTT:1	TATATGAATAACGTATCTTATG	ACAAAATTCTTTGGGGTTGTTT	-	chr3L	16869667	-	chr3L	16869599	68	+	chr3L	16869599	+	chr3L	16869667
ACACATTTACACACACACACACTCGCGCACGGATGGGGATCTGTTGGTATGGGTGACCATG:1	ACACATTTACACACACACACAC	TCTGTTGGTATGGGTGACCATG	-	chr2L	12374994	-	chr2L	13098552	723558	+	chr2L	13098552	+	chr2L	12374994
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
CGATTCAATTAAAATTAGGTTAGTCCTCCTCTACGTCTTGATTAGGCATTTATTGAAAAATTAAGGACGGCT:1	CGATTCAATTAAAATTAGGTTA	TATTGAAAAATTAAGGACGGCT	+	chr2R	4634164	+	chr2R	4634240	76	+	chr2R	4634164	+	chr2R	4634240
CGACATATTCACTTAGGCNCACTTAAATATCTCATTAATTTNACTNAATTTTCCAATTGTAATCATTAACTAGCG:1	CGACATATTCACTTAGGCNCAC	CAATTGTAATCATTAACTAGCG	+	chr3R	16991762	+	chr3R	16996007	4245	+	chr3R	16991762	+	chr3R	16996007
CAATTTCATTTCTCACACTCAGGTTGTTTTTGGACCTTGCTTGTTTTTGCAAGCTGCACGCAGGGCCATAAACAC:1	CAATTTCATTTCTCACACTCAG	CTGCACGCAGGGCCATAAACAC	+	chr3R	28415738	+	chr3R	28415823	85	+	chr3R	28415738	+	chr3R	28415823
ACTCATTAGTTGTCGTTGTCGACCNTCTACCTTAGTTAGTGGNGCNTGTTGNGGGNTTTTCCACCGGGGAAAAGG:1	ACTCATTAGTTGTCGTTGTCGA	GGNTTTTCCACCGGGGAAAAGG	-	chr2R	21902700	-	chr2R	21902623	77	+	chr2R	21902623	+	chr2R	21902700
CATTACTTAACTGTTATGTGCACCGCAAGGTAGCACACACACACACACACACTTTTCTACACAGATACTTC:1	CATTACTTAACTGTTATGTGCA	CACTTTTCTACACAGATACTTC	-	chr2L	15995114	-	chr2L	16378643	383529	+	chr2L	16378643	+	chr2L	15995114
GTTTGGTACTTTCCGGGTACGATTTCGAGCTAAATTATTGTTATACTTATAGTTTCTCTAAGACATGTCG:1	GTTTGGTACTTTCCGGGTACGA	ATAGTTTCTCTAAGACATGTCG	-	chr3R	5746277	-	chr3R	5746041	236	+	chr3R	5746041	+	chr3R	5746277
ATTGCTGTACTTCAAATAGCTATTATCGATCTCGGTATGAGCTCTCGACCCTTGGGAAAATTATTCTAAGGGG:1	ATTGCTGTACTTCAAATAGCTA	TTGGGAAAATTATTCTAAGGGG	+	chr2R	3291953	+	chr2R	3915120	623167	+	chr2R	3291953	+	chr2R	3915120
GATTGATGTGCCGAAATGTTTAAATCATAATTAAAAGCATTTATTAGCTTGTGTAACACTTAATGCGGCAGGAAA:1	GATTGATGTGCCGAAATGTTTA	TAACACTTAATGCGGCAGGAAA	+	chr3R	31413114	+	chr3R	31418314	5200	+	chr3R	31413114	+	chr3R	31418314
AAAGTGGCCCGAGTGCCGAAAAAGAGTAAACTTTGCCTATGCGCTTTCTCCATTCAGCGTGTCCATTTTGCAAA:1	AAAGTGGCCCGAGTGCCGAAAA	TTCAGCGTGTCCATTTTGCAAA	+	chr3L	5683271	+	chr3L	5683357	86	+	chr3L	5683271	+	chr3L	5683357
GTTCGCAGAACGATTGGTGGCCAAACCGGGTGATGCGCTTGCATTTAGTGGATCGAATTATTCAATTTGAAAATG:1	GTTCGCAGAACGATTGGTGGCC	CGAATTATTCAATTTGAAAATG	+	chr3R	29050114	+	chr3R	31797528	2747414	+	chr3R	29050114	+	chr3R	31797528
ATCCCGTATTTCAATTAAGGGCGAAAAAATTCGCTCAATTAAACGACAGCGAGTC:1	ATCCCGTATTTCAATTAAGGGC	CTCAATTAAACGACAGCGAGTC	-	chr2R	10796814	-	chr2R	10796735	79	+	chr2R	10796735	+	chr2R	10796814
CTCCTATATTTATATTATTTAGTGATTTGCCTAAGTTGTAAACGTGGTACAGCCTAGTATAGTATGGTACATGC:1	CTCCTATATTTATATTATTTAG	CCTAGTATAGTATGGTACATGC	-	chr3R	5823573	-	chr3R	5822407	1166	+	chr3R	5822407	+	chr3R	5823573
GTGATGTTAGGATACATGATTTATGGGCCTTTCGGTTAAGCCGCCTGCTTATCGGTAAGACCCTCAGAATTAC:1	GTGATGTTAGGATACATGATTT	TCGGTAAGACCCTCAGAATTAC	-	chr2L	20069623	-	chr2L	20069545	78	+	chr2L	20069545	+	chr2L	20069623
GGGAGGTTCAGCAGCCCCCAAAAGTATGCTACACAAAATTTTGCATGTGATAAAGTGTGGAGCGCCATCTGTTAG:1	GGGAGGTTCAGCAGCCCCCAAA	AGTGTGGAGCGCCATCTGTTAG	+	chrX	1518040	+	chrX	1523442	5402	+	chrX	1518040	+	chrX	1523442
GAAGATTGGAGGTATCCCACATCCCTTTTGTATTGCTTGGATTTATTGTCAGTAGACATCTTAATTTACCGT:1	GAAGATTGGAGGTATCCCACAT	AGTAGACATCTTAATTTACCGT	+	chr2R	5463163	+	chr2R	5463478	315	+	chr2R	5463163	+	chr2R	5463478
TGGACAACTTAAACAGTAAATGGTATGGCAATTAAGCCGAAAATATTTATAAAACTATTAAATCATAAAAAACAT:1	TGGACAACTTAAACAGTAAATG	ACTATTAAATCATAAAAAACAT	+	chr3R	32045599	+	chr3R	32045680	81	+	chr3R	32045599	+	chr3R	32045680
CTAAATGATATTTATATTTTGCCCATAAATAGAATATATACTACAGAATATGTCATAATGTGACCAAAAAATAGA:1	CTAAATGATATTTATATTTTGC	CATAATGTGACCAAAAAATAGA	-	chr3R	27731017	-	chr3R	27725575	5442	+	chr3R	27725575	+	chr3R	27731017
TGAAATGCCAAATTATTTGCAGGGCAGCGTCTAGGAATTGGCTGCGCAA:1	TGAAATGCCAAATTATTTGCAG	CGTCTAGGAATTGGCTGCGCAA	+	chr3R	25236214	+	chr3R	25236327	113	+	chr3R	25236214	+	chr3R	25236327
GCCAATCAACTTCGAATCTTCGAATACTTCACACCCACACATGGAACACATAATTTTATTAACTAGTCACTGAAA:1	GCCAATCAACTTCGAATCTTCG	TTTTATTAACTAGTCACTGAAA	-	chr3L	24089542	-	chr3L	9156732	14932810	+	chr3L	9156732	+	chr3L	24089542
ATCACAAATCATGGAACTNGAGCATTAAAGAGCCTGTTTGGNGACNTGAAGCTGATAGCAAAAAGAGCTTCGTG:1	ATCACAAATCATGGAACTNGAG	TGATAGCAAAAAGAGCTTCGTG	+	chr2R	6247828	+	chr2R	6247905	77	+	chr2R	6247828	+	chr2R	6247905
ACAATCATTTCACTCGTGTTGCTCAAACATTTTTTCATCGGTTTTTTTTTGTTT:1	ACAATCATTTCACTCGTGTTGC	TTTCATCGGTTTTTTTTTGTTT	-	chr2L	2471373	-	chr2L	13638240	11166867	+	chr2L	13638240	+	chr2L	2471373
ACACCAGCAACACAGCCAGTCGTCGGGCCAATAATTGAGGTCAGCAGCCATGGAGGATTTC:1	ACACCAGCAACACAGCCAGTCG	GTCAGCAGCCATGGAGGATTTC	-	chr3L	2446852	-	chr3L	2446765	87	+	chr3L	2446765	+	chr3L	2446852
AATTAGATCATTACGTATGATCATCATATATGAATTGGGCCCAAATGACATTATCTAACCAACTTATCGTACATA:1	AATTAGATCATTACGTATGATC	TCTAACCAACTTATCGTACATA	+	chr3L	8716255	+	chr3L	8716336	81	+	chr3L	8716255	+	chr3L	8716336
GTTCCCCAACAAACAAATTTTTGATATAGGATTCACTCGTAGACTTACTCACGTACTTTATTCAATTATCTCCG:1	GTTCCCCAACAAACAAATTTTT	GTACTTTATTCAATTATCTCCG	-	chr2L	737937	-	chr2L	18984658	18246721	+	chr2L	18984658	+	chr2L	737937
CAAAAACTNCTGAGCAAAGTTGCTACAAGTCGAAGNGAACAAAAAAATGCGAGCAACTGAAGAAACAGCAGCATC:1	CAAAAACTNCTGAGCAAAGTTG	CAACTGAAGAAACAGCAGCATC	-	chr2L	16425693	-	chr2L	3756839	12668854	+	chr2L	3756839	+	chr2L	16425693
TTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAA:1	TTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCT	CATTTTATTTTAATTATTTTAA	-	chr2R	5627612	-	chr2R	5581422	46190	+	chr2R	5581422	+	chr2R	5627612
GTAATAAATTATTATAGAGAAAATTCACAAAACGCATAACCCACTTAGTCTGTTTTCCACGAAAAAAAAAATTAT:1	GTAATAAATTATTATAGAGAAA	TTTCCACGAAAAAAAAAATTAT	-	chr3L	18205838	-	chr3L	8411792	9794046	+	chr3L	8411792	+	chr3L	18205838
ACCCACTTAACTGGGCAAATCTCGGTCATCGGATCCACAGGCCA:1	ACCCACTTAACTGGGCAAATCT	CGGTCATCGGATCCACAGGCCA	+	chr3L	11383994	+	chr3L	11384042	48	+	chr3L	11383994	+	chr3L	11384042
TGATTTCTAGAAAATCACATTAACTGCAATTCACTTTTTCAACATTATTTTTCATGTTTTCCATTCGGTTACAT:1	TGATTTCTAGAAAATCACATTA	CATGTTTTCCATTCGGTTACAT	+	chr3L	16443854	+	chr3L	16446193	2339	+	chr3L	16443854	+	chr3L	16446193
TAGAAAATCACATTAACTGCAANTCACTTTTTCAACATTATTTTTCATGTTTTCCATTCGGTTACATACTTGGCT:1	TAGAAAATCACATTAACTGCAA	CCATTCGGTTACATACTTGGCT	+	chr3L	16443861	+	chr3L	16446201	2340	+	chr3L	16443861	+	chr3L	16446201
CGGAATAAATCAAAGCGTTTGGTTCCCGGCTGAAATGGGTAAGCAAACATCCTGCAATGCC:1	CGGAATAAATCAAAGCGTTTGG	TAAGCAAACATCCTGCAATGCC	+	chr2R	17319118	+	chr2R	17319349	231	+	chr2R	17319118	+	chr2R	17319349
AGAACGAAAGCCACAGACGCACACACATGNGACCCCAATAAAAACCAATTTATGAAGCATNCTTCTCAGGGCAAT:1	AGAACGAAAGCCACAGACGCAC	GAAGCATNCTTCTCAGGGCAAT	-	chr2R	22351478	-	chr2R	22349694	1784	+	chr2R	22349694	+	chr2R	22351478
GAAAGCGCATTTAAAAACGTACTGCAAATATTAACAAACCTTTGATGAAGAAGGTCAAAATAA:1	GAAAGCGCATTTAAAAACGTAC	TTGATGAAGAAGGTCAAAATAA	+	chr2L	20422932	+	chr2L	21573378	1150446	+	chr2L	20422932	+	chr2L	21573378
CATCAATTTAAAGCTCAAGGTTTGCTGTCTGCACAGTGGGTCGTTGCCAATACAATAAGACGACAGNTTGGATAC:1	CATCAATTTAAAGCTCAAGGTT	AATAAGACGACAGNTTGGATAC	-	chr3R	31878746	-	chr3R	31878647	99	+	chr3R	31878647	+	chr3R	31878746
ATACCAGTCAACCTCCTATGATCCCAAAACCTCATCACTGACTGCTTAGTGAGATAACCCAAATTCTGCATAACT:1	ATACCAGTCAACCTCCTATGAT	ATAACCCAAATTCTGCATAACT	-	chr3R	31522801	-	chr3R	31522470	331	+	chr3R	31522470	+	chr3R	31522801
TCCAATCATCCATCCCAGTCAGCCCATCCGAGCAAAAGACCTTTTTTTATTATGAATAAGCCGAAATAAACAATT:1	TCCAATCATCCATCCCAGTCAG	GAATAAGCCGAAATAAACAATT	+	chr3R	4408417	+	chr3R	4412721	4304	+	chr3R	4408417	+	chr3R	4412721
CAGGATCTTCATTGCGGTGCTGTATAGTTAATCTGAATCACGAACTGAAATCGTTTTTTTCTGGCA:1	CAGGATCTTCATTGCGGTGCTG	CTGAAATCGTTTTTTTCTGGCA	-	chr2R	11672205	-	chr2R	11675993	3788	+	chr2R	11675993	+	chr2R	11672205
AGATAGCGCAGAAATGAAAAAAATATAGAAAAGGGAAGGCAGCACAGACNACAAGAGGCCCTGTCAGTGTGACCA:1	AGATAGCGCAGAAATGAAAAAA	AGAGGCCCTGTCAGTGTGACCA	+	chr2R	6739736	+	chr2R	8631788	1892052	+	chr2R	6739736	+	chr2R	8631788
AAAAAATACAATACCGTTTAAAAATATATTTAAATTTNATAAAGTNGTTATAAAACATGCA:1	AAAAAATACAATACCGTTTAAA	TAAAGTNGTTATAAAACATGCA	+	chrX	16809143	+	chrX	16812123	2980	+	chrX	16809143	+	chrX	16812123
GGGTTATGTTTTATGGCTCAAAAACCCCAAAAACCAAACAACGGATTCCATCACTTAACTTGAGCTGATTGACCA:1	GGGTTATGTTTTATGGCTCAAA	CTTAACTTGAGCTGATTGACCA	+	chr3L	5388211	+	chr3L	5388535	324	+	chr3L	5388211	+	chr3L	5388535
ATTTTCGAGATGCATTCAGTCATAATGTGAATGGTGAGAGTTGTATTTGCTGGAACTTATGGGCTTGCATGCCA:1	ATTTTCGAGATGCATTCAGTCA	GAACTTATGGGCTTGCATGCCA	+	chr3R	20118024	+	chr3R	20118109	85	+	chr3R	20118024	+	chr3R	20118109
AAACAGACTACCTCTATGGATTTATATATTAGATGTGTGGCTAAAAGGAAAGGTGTATTGAACTGTGAAAATTTG:1	AAACAGACTACCTCTATGGATT	TGTATTGAACTGTGAAAATTTG	+	chr3L	10035216	+	chr3L	10035303	87	+	chr3L	10035216	+	chr3L	10035303
CTCGTTTCTCCAAGCCGATAACGCGCTCATCCTCAGCCAGAATTGTGGCATAAATAAA:1	CTCGTTTCTCCAAGCCGATAAC	CCAGAATTGTGGCATAAATAAA	-	chr3R	6167095	-	chr3R	6158529	8566	+	chr3R	6158529	+	chr3R	6167095
GTATAAAATAGTTATATGAGGATATATTGAATTAATATACATTAATTGCAACAGATTAGGTGTGCGTTAAAATG:1	GTATAAAATAGTTATATGAGGA	AGATTAGGTGTGCGTTAAAATG	-	chr3L	11083624	-	chr3L	11083527	97	+	chr3L	11083527	+	chr3L	11083624
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATNAGATG:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	TGAGATGAGATGAGATNAGATG	+	chr3L	22908067	+	chr3L	9307797	13600270	+	chr3L	22908067	+	chr3L	9307797
TACACCCAATTAAGCTGCTTGTAAAGCTAAATAGAAAATCTTTTCGTCTTAAGCTTTATTAATTATACATGAGAC:1	TACACCCAATTAAGCTGCTTGT	CTTTATTAATTATACATGAGAC	-	chr2R	12186120	-	chr2R	12186025	95	+	chr2R	12186025	+	chr2R	12186120
GGAGNAGACGAAACGAACCTGGNGTGTNTGAAAAGGACANTGGAGTCATTGGTCGGCAAAGGTGGTCCCTGGTCG:1	GGAGNAGACGAAACGAACCTGG	CGGCAAAGGTGGTCCCTGGTCG	+	chr2R	5634134	+	chr2R	5534839	99295	+	chr2R	5634134	+	chr2R	5534839
CAAGACATGATTACTCCTNGGAGCCCTGGGAATTATNATATNGTCNGGTGTTTTGTCTAAGACATTAGTTTAACC:1	CAAGACATGATTACTCCTNGGA	TGTCTAAGACATTAGTTTAACC	+	chr3R	5169557	+	chr3R	5169636	79	+	chr3R	5169557	+	chr3R	5169636
AATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATATAATTTATAATTTTGAGATAGATTCCTATCACATAATGACGG:1	AATTAGAAGAAAATATGAAGAA	GATTCCTATCACATAATGACGG	+	chr3R	19448612	+	chr3R	19449226	614	+	chr3R	19448612	+	chr3R	19449226
CTAACTATACACATTTACGATATACGTTCGTACCATATATATACTGTGAAATTCTC:1	CTAACTATACACATTTACGATA	ATATATATACTGTGAAATTCTC	+	chr3R	24076938	+	chr3R	24078386	1448	+	chr3R	24076938	+	chr3R	24078386
TGGCGGGAAATGTATTCCTACGAATGCGGTTTTCCACTCTCTTTTTTGTCATATAGGGAAAATTGGTGGGTGTT:1	TGGCGGGAAATGTATTCCTACG	ATAGGGAAAATTGGTGGGTGTT	-	chr3R	16709028	-	chr3R	16708945	83	+	chr3R	16708945	+	chr3R	16709028
AATACTGGTTACTATGTTTATTAAAATCAGTTTCTGTACTGTAAACAAAATTTGCCGGTACAC:1	AATACTGGTTACTATGTTTATT	TAAACAAAATTTGCCGGTACAC	+	chr3L	2168797	+	chr3L	2168876	79	+	chr3L	2168797	+	chr3L	2168876
TTTGAAATTGCAAGTGGTTTTTCGCCGATCTTTTCGAAAAAGAGAAATGGTTCCCCCAACTGGCTTGACCTGTG:1	TTTGAAATTGCAAGTGGTTTTT	CCCCCAACTGGCTTGACCTGTG	+	chrX	11839037	+	chrX	11839284	247	+	chrX	11839037	+	chrX	11839284
TAGTTCTATGGATTCCATNGTCCTTTTCGCTTGCATGCATGTATGTATATGTGAGCATGTGAGTGAAACG:1	TAGTTCTATGGATTCCATNGTC	ATGTGAGCATGTGAGTGAAACG	+	chr3R	5338420	+	chr3R	5343592	5172	+	chr3R	5338420	+	chr3R	5343592
TTGTAAAGTTGTTCTTCTAGAGTTGCTGATTCATTGGTTTGTTCAAATAGTTCAAATGCAGACACTTGTTGCAAA:1	TTGTAAAGTTGTTCTTCTAGAG	AAATGCAGACACTTGTTGCAAA	-	chr3L	695405	-	chr3L	695173	232	+	chr3L	695173	+	chr3L	695405
TATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCT:1	TATTTATTTTGCTTTCCATCCA	TGTTTAGCCCACAGTGGAGCCT	+	chr3L	16971244	+	chr3L	16971296	52	+	chr3L	16971244	+	chr3L	16971296
AAAATCTCTGCACACTTTTAGACACCGAACTTAACAGGCTACGTGTTTTCTATGAATTTCTTACTGTGTGGAGCC:1	AAAATCTCTGCACACTTTTAGA	GAATTTCTTACTGTGTGGAGCC	-	chr3R	30482979	-	chr3R	30480511	2468	+	chr3R	30480511	+	chr3R	30482979
TGAAAGCCAAACAGAGCCAGCCGGGATGGGACCGAAAGCCAGAAACNAAAGCACAACAAA:1	TGAAAGCCAAACAGAGCCAGCC	CCAGAAACNAAAGCACAACAAA	+	chr2L	17191897	+	chr2L	17191967	70	+	chr2L	17191897	+	chr2L	17191967
AATGATTGTCGAATGCAATATTCTAGACTGGATTTTTAATATACTGACCACTAAATAAACTTTTT:1	AATGATTGTCGAATGCAATATT	CTGACCACTAAATAAACTTTTT	+	chr3L	7444044	+	chr3L	7444133	89	+	chr3L	7444044	+	chr3L	7444133
AAAGGTGAGAGGTTGTGGCACATTCGGACACATTCGCAATCCTGCTGCTGGTTCATAAGTGCCCCGTCAGCAGTT:1	AAAGGTGAGAGGTTGTGGCACA	CATAAGTGCCCCGTCAGCAGTT	-	chr3R	13120855	-	chr3R	13120778	77	+	chr3R	13120778	+	chr3R	13120855
AAGCTAAANAGTTTCTGCATTTTAAAGCAGGGTCCAAAAGTTGAAAGATGATGGTCTCTTCATCGATCTTCTTGA:1	AAGCTAAANAGTTTCTGCATTT	GTCTCTTCATCGATCTTCTTGA	+	chr3L	13552791	+	chr3L	2128273	11424518	+	chr3L	13552791	+	chr3L	2128273
GAGCAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGATAAGTACTGCCAATAAGAA:1	GAGCAGGAGAAGGAGAAGGAGA	GGATAAGTACTGCCAATAAGAA	+	chr2L	656128	+	chr2L	5212675	4556547	+	chr2L	656128	+	chr2L	5212675
TCATTGCGATATTTCAGTTTTAATTTTCTTTCCATCATGCTCACCACCCACCAAAATGTGCAGCATCCTGAATAA:1	TCATTGCGATATTTCAGTTTTA	AAATGTGCAGCATCCTGAATAA	-	chr3L	22124922	-	chr3L	22124839	83	+	chr3L	22124839	+	chr3L	22124922
ATAATCGATATACACCCCTAATCAATATATGGTAGAAGTACTATGTTTCAAAGGATATGTATTTTATCTTTGATT:1	ATAATCGATATACACCCCTAAT	GATATGTATTTTATCTTTGATT	-	chrX	16498241	-	chrX	16492664	5577	+	chrX	16492664	+	chrX	16498241
TCAAAACTCAATTCTTAAGAAGAGAATATTTGCAAATCCATTATAAAAGTTGATGTTATTTTTAAAAACGTTGG:1	TCAAAACTCAATTCTTAAGAAG	ATGTTATTTTTAAAAACGTTGG	+	chr2R	7459285	+	chr2R	7459372	87	+	chr2R	7459285	+	chr2R	7459372
TTACAACTTTTGCCGACAGCCATTTATTATTGATGTCCGCATGCTGAAGTCCCAGCAAATTACAGCCGCCGCCT:1	TTACAACTTTTGCCGACAGCCA	CAGCAAATTACAGCCGCCGCCT	+	chr2R	9212726	+	chr2R	9213211	485	+	chr2R	9212726	+	chr2R	9213211
ATACAATTAACGAAAGTGGCGCACCTAGGTAAATAACATGAAGAACCAGAGGGTAGTGATGCGGGGAGGGGGAAC:1	ATACAATTAACGAAAGTGGCGC	TAGTGATGCGGGGAGGGGGAAC	+	chr3R	20449092	+	chr3R	24264775	3815683	+	chr3R	20449092	+	chr3R	24264775
AGGTGAGTTATTCATANATAGGCNTTAATATATNATATNATTCATATTCATATTTCCCAGCTNGATACTTT:1	AGGTGAGTTATTCATANATAGG	ATATTTCCCAGCTNGATACTTT	+	chr3R	14067151	+	chr3R	14067226	75	+	chr3R	14067151	+	chr3R	14067226
AAGATAATATTCAACAGATTATTTTGGAGCCTGTCTCATTGAAGGTCATGAATGTGCAAGTTTTTGAATAACTTT:1	AAGATAATATTCAACAGATTAT	GTGCAAGTTTTTGAATAACTTT	-	chr2L	8044207	-	chr2L	8044128	79	+	chr2L	8044128	+	chr2L	8044207
CTTCATTCGAGAGCAGGCCAAATACCACATAGAAACAATAAAAAGTACGAAAAACAACNTTTACAGCAATACTCT:1	CTTCATTCGAGAGCAGGCCAAA	ACAACNTTTACAGCAATACTCT	-	chr2L	3178387	-	chr2L	21626852	18448465	+	chr2L	21626852	+	chr2L	3178387
CCAGATCGNCCTTCAGCTTGGCCACCTCGCTTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACG:1	CCAGATCGNCCTTCAGCTTGGC	CTCTCTCTCTCTCTCTTTCACG	+	chrX	614584	+	chrX	9023563	8408979	+	chrX	614584	+	chrX	9023563
TTGTTATTGTTTTTCCAGTCTGCTGATTGACAATGACGTGCCATTGATTGGCGAAAGGAGCGGGAAATGTTCCA:1	TTGTTATTGTTTTTCCAGTCTG	GAAAGGAGCGGGAAATGTTCCA	+	chr2L	2100386	+	chr2L	2109536	9150	+	chr2L	2100386	+	chr2L	2109536
GCGGCAAAAGCAATTAGCCGACTGCAGGAGTGGTTGGAGTNTGGGAAATAACTTTGCCACTGTCGCAGNGAA:1	GCGGCAAAAGCAATTAGCCGAC	ACTTTGCCACTGTCGCAGNGAA	+	chr2R	16072531	+	chr2R	9469715	6602816	+	chr2R	16072531	+	chr2R	9469715
TTTAAATTNTCATAATTTATTGTAGGAGCGCACAAATAAGGCTGAAGTCGAGCAAACATTCCTAAACATTGCATA:1	TTTAAATTNTCATAATTTATTG	AAACATTCCTAAACATTGCATA	+	chr3L	2493845	+	chr3L	2493933	88	+	chr3L	2493845	+	chr3L	2493933
ACATAGAACACACAAAATATTACAACAATTTGCATAAAGCCTGTTACTGTTACGATTTCGAGACGACGGCGA:1	ACATAGAACACACAAAATATTA	TACGATTTCGAGACGACGGCGA	-	chr3L	14296487	-	chr3L	14296004	483	+	chr3L	14296004	+	chr3L	14296487
TCTTGAAATATTAGGCATTCNATTGCTAAGTCNAATTAAGATNCACCCTAAAAGCATTTTTATGCTTCGTCTCCA:1	TCTTGAAATATTAGGCATTCNA	GCATTTTTATGCTTCGTCTCCA	+	chr3L	15643617	+	chr3L	15643904	287	+	chr3L	15643617	+	chr3L	15643904
GTTTAGGTGCTACGGGGGGCGGAATATTTACCACGAGGCTGTTTTTGCGCCTT:1	GTTTAGGTGCTACGGGGGGCGG	CACGAGGCTGTTTTTGCGCCTT	-	chr3R	6596258	-	chr3R	6596118	140	+	chr3R	6596118	+	chr3R	6596258
CTCAGTTTGGTTCAATTTTAATTAATTAGGACATTTTCCAAGGGTTG:1	CTCAGTTTGGTTCAATTTTAAT	TTAGGACATTTTCCAAGGGTTG	-	chr3R	11361393	-	chr3R	26836300	15474907	+	chr3R	26836300	+	chr3R	11361393
CTATATAAACGACATTCCACAGCACTCGCAAAAATACCAAAATACCCGAGTTAAATGACCGAAACTGTGGCACA:1	CTATATAAACGACATTCCACAG	AAATGACCGAAACTGTGGCACA	-	chr2L	18028551	-	chr2L	18028461	90	+	chr2L	18028461	+	chr2L	18028551
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGAAATAAATGATCTACTCAAATGCTTG:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	AAATGATCTACTCAAATGCTTG	+	chr3L	22908067	+	chr3L	15114243	7793824	+	chr3L	22908067	+	chr3L	15114243
AGCTCCAGAAATACTTTGCTATGGTTGAATGCTCCACTGCCTCACGACAGCTTGATTTG:1	AGCTCCAGAAATACTTTGCTAT	TGCCTCACGACAGCTTGATTTG	+	chr3R	12893480	+	chr3R	12893542	62	+	chr3R	12893480	+	chr3R	12893542
CAGTCATTTTCCCATATCCCACTTGGCAGCTGAGCAAAATGGAGCGCGCAAAATGCTTTTGCATGCTGGGTGC:1	CAGTCATTTTCCCATATCCCAC	AATGCTTTTGCATGCTGGGTGC	+	chrX	5798886	+	chrX	5799046	160	+	chrX	5798886	+	chrX	5799046
GAGCGGACAATCGGACACTCGTATTCAAAGCAGCTACTTGGCCAGTCGAGCTTATGCCAAATTAAAAACGCATTC:1	GAGCGGACAATCGGACACTCGT	ATGCCAAATTAAAAACGCATTC	+	chr3R	27370119	+	chr3R	27370325	206	+	chr3R	27370119	+	chr3R	27370325
CATTGGAATGTGCTCGAAATCAAAACAATGCTGCCACATCGGATCGAAANACTGCTACCAAAAAAAATTAATACA:1	CATTGGAATGTGCTCGAAATCA	GCTACCAAAAAAAATTAATACA	-	chr2R	5240312	-	chr2R	5240236	76	+	chr2R	5240236	+	chr2R	5240312
GACGTGGCCGATGACGAGTTGAAGTGAGTTCACTTAATTAATTAACCCATTCTTATCGTAAGACTTTTAATATTA:1	GACGTGGCCGATGACGAGTTGA	TATCGTAAGACTTTTAATATTA	+	chr3L	8791278	+	chr3L	8796698	5420	+	chr3L	8791278	+	chr3L	8796698
CTTTGTTGNTGTTTCTACTTTGTTTTCTCGATTTGGTTGCTTAGTTGTTTAGTTGCTGGACCCTA:1	CTTTGTTGNTGTTTCTACTTTG	GTTGTTTAGTTGCTGGACCCTA	+	chrX	13860824	+	chrX	5768877	8091947	+	chrX	13860824	+	chrX	5768877
TGGTAGCAACGAAAAATTCAATAAAAGTCCGGTTCGTTTCAATTTTTCTAGCTAATGATTTGGTTTCCGCTCTG:1	TGGTAGCAACGAAAAATTCAAT	TAATGATTTGGTTTCCGCTCTG	-	chr2L	17880102	-	chr2L	17880016	86	+	chr2L	17880016	+	chr2L	17880102
AAACTCATGTCTAGATTGCACTGCAGATACATTTAACAAATATTTAAACACAAGAAATTCACTTGCAGATCGTAT:1	AAACTCATGTCTAGATTGCACT	GAAATTCACTTGCAGATCGTAT	+	chr2L	8271623	+	chr2L	8271699	76	+	chr2L	8271623	+	chr2L	8271699
ATCTTAGGTAATTCCGGTGAATTCTATAGTATTCATATTCATTCTATAGTATTCGCGAAATCGCCGAGGTCTATC:1	ATCTTAGGTAATTCCGGTGAAT	CGCGAAATCGCCGAGGTCTATC	+	chr3R	13053028	+	chr3R	13045792	7236	+	chr3R	13053028	+	chr3R	13045792
CGAAAAATATACAAATATGTGTAATCGTCGAACAAACAAGACACGAGCTTGCGAAATTGGAATCGCTGTAGTGTC:1	CGAAAAATATACAAATATGTGT	AAATTGGAATCGCTGTAGTGTC	-	chr3R	26542168	-	chr3R	26542077	91	+	chr3R	26542077	+	chr3R	26542168
CATTTTTGTCTTGTTTTTAATACAAGGACTAACGTTTGCCTTGGATTTAGCGTGCTGCAAATCCGTTAATTGCCT:1	CATTTTTGTCTTGTTTTTAATA	GCTGCAAATCCGTTAATTGCCT	-	chr2L	15264394	-	chr2L	7214080	8050314	+	chr2L	7214080	+	chr2L	15264394
GCGATTAATTACGGCATACTTTCGGGCGGACACCGAACTCACCTGCTGCGTTGAGCTGAGACCAGGTTGCTG:1	GCGATTAATTACGGCATACTTT	TTGAGCTGAGACCAGGTTGCTG	-	chr3R	6206520	-	chr3R	6206306	214	+	chr3R	6206306	+	chr3R	6206520
TCTAATTGCCATTAAATGTACTTCTGCGGGAAGTTGGCTCGCAGGGAGCCTCGTCCACTGCCACTGGCCAACAGA:1	TCTAATTGCCATTAAATGTACT	TCCACTGCCACTGGCCAACAGA	+	chr2R	23718458	+	chr2R	23718317	141	+	chr2R	23718458	+	chr2R	23718317
TATGCTTATTACTTTGATGTAAGACTTAATGTAATGTGCATTTTAAAAGTGAGGAGATAAGTTGTTCNAAGAATT:1	TATGCTTATTACTTTGATGTAA	GAGATAAGTTGTTCNAAGAATT	+	chr3R	7320441	+	chr3R	7320529	88	+	chr3R	7320441	+	chr3R	7320529
GTGCCACATAAAAATGGCATTTTGACATGGCCACCGGGTGAGCATTATGAATGCNTGCCATG:1	GTGCCACATAAAAATGGCATTT	AGCATTATGAATGCNTGCCATG	-	chr3R	17348828	-	chr3R	17348752	76	+	chr3R	17348752	+	chr3R	17348828
AGATCCACGTGCNGAGCATAGAAACTAGCCNTNGTGACNGATAAGAGTGCAGGCAAAAAAAATAAAATAACAAA:1	AGATCCACGTGCNGAGCATAGA	GCAAAAAAAATAAAATAACAAA	+	chr3L	1189645	+	chr3L	1189730	85	+	chr3L	1189645	+	chr3L	1189730
ACCGCGAAAGACATTTATTGTATCCTTAGCGCGGCTGACAGACGCGTGCTGAGACGATGATG:1	ACCGCGAAAGACATTTATTGTA	GACGCGTGCTGAGACGATGATG	-	chr2L	2299246	-	chr2L	2294054	5192	+	chr2L	2294054	+	chr2L	2299246
GTTCATCGTCGACCTCAATGCGACAAGGTGACCGCCCCGTCAGCTATT:1	GTTCATCGTCGACCTCAATGCG	GGTGACCGCCCCGTCAGCTATT	+	chr3R	32042653	+	chr3R	6902782	25139871	+	chr3R	32042653	+	chr3R	6902782
AGTGTGCCAGTTAATTAGTTTTCAGACTCATTTCAGTTCTGTATTTGNTTCTTAAGCACAAACCGGTNTACATGA:1	AGTGTGCCAGTTAATTAGTTTT	AAGCACAAACCGGTNTACATGA	+	chr2R	22118451	+	chr2R	22118529	78	+	chr2R	22118451	+	chr2R	22118529
GACGATGTCCTTAAGCTGCTTGTGCAATTGCCGCTTACTTCAAATGGCCATTCATCAGACTCGTTGAATGCAA:1	GACGATGTCCTTAAGCTGCTTG	TCATCAGACTCGTTGAATGCAA	-	chr3L	12933187	-	chr3L	12933105	82	+	chr3L	12933105	+	chr3L	12933187
TGACAGCAACTGCAAACCCCTTTGCCCCATTCATTCATTTCATTCATTCCGATGGAGCCCATTCATTTTCCTTAC:1	TGACAGCAACTGCAAACCCCTT	GGAGCCCATTCATTTTCCTTAC	-	chrX	9923175	-	chrX	3916083	6007092	+	chrX	3916083	+	chrX	9923175
TGTTGAAATTCTGAAAAACAGATATTAAAATTCATCAATTACTTACTATAAGAGTGCAATAGCG:1	TGTTGAAATTCTGAAAAACAGA	TTACTATAAGAGTGCAATAGCG	+	chr3R	19248903	+	chr3R	19248972	69	+	chr3R	19248903	+	chr3R	19248972
CGTTTTTCAATTGGATTTTCTTTGAATTCATAGTTGGAACTTTTGAATGATGTATTAAACTTGATT:1	CGTTTTTCAATTGGATTTTCTT	GAATGATGTATTAAACTTGATT	+	chrX	3881285	+	chrX	3881415	130	+	chrX	3881285	+	chrX	3881415
GCAACAACGGCCACATGAAATGTAACCAGAATCGAGTGCAGTCGATGNACCCCATAGGAATGGAT:1	GCAACAACGGCCACATGAAATG	GATGNACCCCATAGGAATGGAT	+	chr2L	12647730	+	chr2L	12647802	72	+	chr2L	12647730	+	chr2L	12647802
AAGGGGTGGGGCAGGGAGGGTCCTTAAGCTGATTCTGGTGCTGCTGCTGTATGGTAAATAGCTTTCGATTGCATG:1	AAGGGGTGGGGCAGGGAGGGTC	GTAAATAGCTTTCGATTGCATG	+	chr3L	22085509	+	chr3L	61325	22024184	+	chr3L	22085509	+	chr3L	61325
AAGGAGTGATGCATTAAAAACAGGTGTTAGTTAACGTTAGTAATTATGGGTGGGTGGGTGTGTGTAGTGAAC:1	AAGGAGTGATGCATTAAAAACA	TGGGTGGGTGTGTGTAGTGAAC	-	chr3R	26601020	-	chr3R	26600938	82	+	chr3R	26600938	+	chr3R	26601020
AATTTAAATTAAATCGAAAAAAAAAATACATTTATAATTTAACCTTCCAGTTACCTCGTACTTCTTTTGCTCTC:1	AATTTAAATTAAATCGAAAAAA	ACCTCGTACTTCTTTTGCTCTC	+	chr2L	12728945	+	chr2L	12729187	242	+	chr2L	12728945	+	chr2L	12729187
GGTGGATCTCGTGTGGTTTCTATATTCTATTTGAGACTTGCTCGCTTTCGTTATATACTAGCTTATATACATC:1	GGTGGATCTCGTGTGGTTTCTA	TATATACTAGCTTATATACATC	-	chr3R	30032253	-	chr3R	30032176	77	+	chr3R	30032176	+	chr3R	30032253
CTTCGTTATAAAAAACAGCCTCCTTGACCTGCTCCTTCTCCTTGACCGTGCGCATCTTCTTCTGTGCATTGAG:1	CTTCGTTATAAAAAACAGCCTC	GCATCTTCTTCTGTGCATTGAG	-	chr3L	17243898	-	chr3L	15500368	1743530	+	chr3L	15500368	+	chr3L	17243898
CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1	CACAAACACAAACACAAACACA	CAACACAACACAACACAACACA	-	chr2L	16071771	-	chr2L	16217660	145889	+	chr2L	16217660	+	chr2L	16071771
GCCCATTCACCTGGCGGATGTTCATAGACCATTGGATTAATTCGATACGAT:1	GCCCATTCACCTGGCGGATGTT	CATTGGATTAATTCGATACGAT	-	chr3L	9797337	-	chr3L	9797270	67	+	chr3L	9797270	+	chr3L	9797337
TGTCAAGTGCAGAACATTAATCATCCGACACCTCTAGCAACTTTGGCTGCATTTCTGGCACCGCGGAAGAGTAAC:1	TGTCAAGTGCAGAACATTAATC	TCTGGCACCGCGGAAGAGTAAC	-	chr3R	27043782	-	chr3R	27043688	94	+	chr3R	27043688	+	chr3R	27043782
GAGTATGGCCCAACCCCCACCACTGACCATCCAGATCCATAACACCTCCGCGCGTCCACTCGAACAATCCAC:1	GAGTATGGCCCAACCCCCACCA	CGCGTCCACTCGAACAATCCAC	+	chr2L	8857999	+	chr2L	8858074	75	+	chr2L	8857999	+	chr2L	8858074
CTCACTTTNTACCCCCACCCATACACCTACTACTTTCNNNNTCAATAAGGCGTATTGAAACNAACCCCATTGGTA:1	CTCACTTTNTACCCCCACCCAT	ATTGAAACNAACCCCATTGGTA	+	chr3L	8105854	+	chr3L	22886477	14780623	+	chr3L	8105854	+	chr3L	22886477
CTTTAGCCACTTCGCCCCCGCTTTTCAGTGACCCGCTGACCTACCGCAAATATTTATTGTTTGACAATTTTTATT:1	CTTTAGCCACTTCGCCCCCGCT	TTATTGTTTGACAATTTTTATT	+	chr3R	28792877	+	chr3R	28797972	5095	+	chr3R	28792877	+	chr3R	28797972
GTTAAGGAAAAAACCAGAGGGGGGGGGGCTGGTCTGGGCTAATGCC:1	GTTAAGGAAAAAACCAGAGGGG	GGGGCTGGTCTGGGCTAATGCC	-	chrX	7803448	-	chrX	13705090	5901642	+	chrX	13705090	+	chrX	7803448
ATACAAAAATTAAGCAAATAATAAGAATTAATAATATAAAATATACTATTTGTCAAGATAATAAAAATTGGGATT:1	ATACAAAAATTAAGCAAATAAT	CAAGATAATAAAAATTGGGATT	-	chr2L	17228699	-	chr2L	17044933	183766	+	chr2L	17044933	+	chr2L	17228699
ATTTTTAATAAATAACTCAAAATTATTTTTTCTCATTTTTCCCTTTTTTTAAATATGTTTCTGCAACCATTAAAA:1	ATTTTTAATAAATAACTCAAAA	TATGTTTCTGCAACCATTAAAA	+	chr3L	11241787	+	chr3L	11241869	82	+	chr3L	11241787	+	chr3L	11241869
AATGGGATTTATATCGAAACATACTTAAACATTAGAACACACATTAGNACATAATTGTATATATACGAGTATAGA:1	AATGGGATTTATATCGAAACAT	ATTGTATATATACGAGTATAGA	-	chr3L	10584384	-	chr3L	10584297	87	+	chr3L	10584297	+	chr3L	10584384
TTGCCATATCATCATTCTCAGTATTCTCAGCCTGCGGTTAACTGAGCACGACCACAAACATCACAAAAACACCAC:1	TTGCCATATCATCATTCTCAGT	ACAAACATCACAAAAACACCAC	+	chrX	20780577	+	chrX	12726198	8054379	+	chrX	20780577	+	chrX	12726198
TGCCATTTCCGATGGGCTCTTATTATTATCCGTAATCCGATGTCCGACGTAGAACGGCGCAGACGCGACTGATGC:1	TGCCATTTCCGATGGGCTCTTA	ACGGCGCAGACGCGACTGATGC	+	chr3R	12392897	+	chr3R	12392997	100	+	chr3R	12392897	+	chr3R	12392997
GGCAAAGCATCCTAAAAAATGCCTAATAAACCGAAAGCTAGAACATA:1	GGCAAAGCATCCTAAAAAATGC	ATAAACCGAAAGCTAGAACATA	+	chr2R	16657429	+	chr2R	13449373	3208056	+	chr2R	16657429	+	chr2R	13449373
CTAGTTTCGCCCCCAACGAGGCAATAATAATAAANTCCTTTCTCTCTTCTCTTTCACACATTCTCACCACTTGAA:1	CTAGTTTCGCCCCCAACGAGGC	TCACACATTCTCACCACTTGAA	+	chrX	1725360	+	chrX	4293260	2567900	+	chrX	1725360	+	chrX	4293260
CCAATTATTGTTAATATNTTGCATGAATTTCCAAACTCATCGACCATCCTGCGGCATGTGCACAGTAGCTCCGT:1	CCAATTATTGTTAATATNTTGC	GGCATGTGCACAGTAGCTCCGT	+	chr2L	14831216	+	chr2L	3793936	11037280	+	chr2L	14831216	+	chr2L	3793936
TCGATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACATATAAATAATGCCCAGAACATGCCGCATAC:1	TCGATACGCATTTACGGACGTA	ATGCCCAGAACATGCCGCATAC	+	chr3L	21765381	+	chr3L	21765456	75	+	chr3L	21765381	+	chr3L	21765456
GCAACTGCCAGACCGGAACAGGTAGAAAACTTTCAAAGACCAAATGTTGATTTCGCATTTAATTATAGATTGTG:1	GCAACTGCCAGACCGGAACAGG	TCGCATTTAATTATAGATTGTG	+	chr2L	9287340	+	chr2L	9287436	96	+	chr2L	9287340	+	chr2L	9287436
TGCTGCCTTTCGAATTGCCAAGAAGCTAGCCAAGCTGGGTGGTCAATTCAGTGCATCCACT:1	TGCTGCCTTTCGAATTGCCAAG	TGGTCAATTCAGTGCATCCACT	-	chr2L	19712790	-	chr2L	19712720	70	+	chr2L	19712720	+	chr2L	19712790
CCTTAAAGTTCCTTTTGCTGCCGCTGACAGTCCTCGAAAATGTGG:1	CCTTAAAGTTCCTTTTGCTGCC	CTGACAGTCCTCGAAAATGTGG	+	chrX	21045405	+	chrX	21040457	4948	+	chrX	21045405	+	chrX	21040457
ACTGGGAACGTACATATGTACATACATATATCCCATCCATCTATATGCCCAGCGCAGTCACGTCCCGCC:1	ACTGGGAACGTACATATGTACA	CCCAGCGCAGTCACGTCCCGCC	-	chr3L	409745	-	chr3L	402698	7047	+	chr3L	402698	+	chr3L	409745
AGGACCAACAAGAAGTTTTAAAAAGTGAATATTTNCATACGCTC:1	AGGACCAACAAGAAGTTTTAAA	AAGTGAATATTTNCATACGCTC	+	chr3R	19447724	+	chr3R	19447875	151	+	chr3R	19447724	+	chr3R	19447875
ATGTACGCTAACTTACTATTTTAGCAGCTGATTNGCCAATATGCCTCCGGTGAG:1	ATGTACGCTAACTTACTATTTT	TNGCCAATATGCCTCCGGTGAG	+	chr3R	4753277	+	chr3R	4757559	4282	+	chr3R	4753277	+	chr3R	4757559
CAATTAAGCCTTTAGTCAATGCCTCTTGATTGAGCTGTGGAGGCCGTGGGCGAACCTTTTTTGATTATGATTGG:1	CAATTAAGCCTTTAGTCAATGC	AACCTTTTTTGATTATGATTGG	+	chr2L	12963816	+	chr2L	12963917	101	+	chr2L	12963816	+	chr2L	12963917
GCCACTGCCATTCACAATGGGGCCATCATTTCCTTGTGATGTTTTCGATTTTCTTCGCATACA:1	GCCACTGCCATTCACAATGGGG	TTTTCGATTTTCTTCGCATACA	-	chr3L	2538778	-	chr3L	9673299	7134521	+	chr3L	9673299	+	chr3L	2538778
AAAACTACTAAAGCAGCTCATAGCAAAGCTATTGCGTTGCTTATAGATTTTAGACTAGAACATCCACACATCAA:1	AAAACTACTAAAGCAGCTCATA	GACTAGAACATCCACACATCAA	+	chr3L	10600469	+	chr3L	10600550	81	+	chr3L	10600469	+	chr3L	10600550
AACGAATCCATAAGTATAGACATATTGAGTACCCATCAAAATGATGTACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1	AACGAATCCATAAGTATAGACA	AGTGACGTATTTGGGTGGTCCA	+	chr3R	11977414	+	chr3R	846554	11130860	+	chr3R	11977414	+	chr3R	846554
TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTTTGTTTGTGTTTGTGTT:1	TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT	TGTTTTTGTTTGTGTTTGTGTT	-	chr3L	11777678	-	chr3L	7749471	4028207	+	chr3L	7749471	+	chr3L	11777678
TATTTCTCACCACTGGTATTTCAACAGGGCAGTTCAGATTACGAGTACACCGCGAATCCTTCTTTCCAATCGTT:1	TATTTCTCACCACTGGTATTTC	CGAATCCTTCTTTCCAATCGTT	+	chr2R	24303891	+	chr2R	24303974	83	+	chr2R	24303891	+	chr2R	24303974
TCCAAATTCAGCCCAACGCAAAGTTATGAATGAAAACGAAGCGTTACACAAATAGAAATTGCTCTGCGGAGCGGG:1	TCCAAATTCAGCCCAACGCAAA	AGAAATTGCTCTGCGGAGCGGG	+	chr2R	18590876	+	chr2R	18600028	9152	+	chr2R	18590876	+	chr2R	18600028
AAAAACCGTATTAAAACATGCTATATAATATACTACACTGAAGCTCTTTAAACGAAGTACGACTGTAAAAGCAAA:1	AAAAACCGTATTAAAACATGCT	GAAGTACGACTGTAAAAGCAAA	+	chr2R	22723262	+	chr2R	22723338	76	+	chr2R	22723262	+	chr2R	22723338
CACTATCCTAATGTGGTCCACATGCCAAGACAACGGATAGTAGTAATTTTGGATAGGCCTGCACCCCAGCGAAAA:1	CACTATCCTAATGTGGTCCACA	TAGGCCTGCACCCCAGCGAAAA	-	chrX	680939	-	chrX	680856	83	+	chrX	680856	+	chrX	680939
CGCCTCCTCCTCCACCGTCCACAACCAACAATCCACCAACTACACCTACACCACGGACA:1	CGCCTCCTCCTCCACCGTCCAC	AACTACACCTACACCACGGACA	+	chr2R	7296988	+	chr2R	12375513	5078525	+	chr2R	7296988	+	chr2R	12375513
GAATGTGAATGCTTCTTTCTGTGAGTCTACAATTTGGCGCGCTTAAGGTAATCCTTGTAGGTAACATCACGC:1	GAATGTGAATGCTTCTTTCTGT	ATCCTTGTAGGTAACATCACGC	+	chr2L	6426886	+	chr2L	6445143	18257	+	chr2L	6426886	+	chr2L	6445143
TGTTGTAAATTCCAATCAAGTGGTTGCGGTCTAATCAATACCTAGAGCCACTTGTTTGTTCGT:1	TGTTGTAAATTCCAATCAAGTG	CTAGAGCCACTTGTTTGTTCGT	+	chr3R	4913754	+	chr3R	4913833	79	+	chr3R	4913754	+	chr3R	4913833
ACTTTTCTCGGATTTCAGCCAAGAAGAAGACGTNGGCTAGGAACAAGAACAAGAAGANGGCGA:1	ACTTTTCTCGGATTTCAGCCAA	AACAAGAACAAGAAGANGGCGA	+	chr2R	24727895	+	chr2R	24735391	7496	+	chr2R	24727895	+	chr2R	24735391
GAGCATGANAAACATTTTGCATGCATAGACATGCAGCNNNNGGATGCAGACATGAGAGTATNCCAGGAGAAATCA:1	GAGCATGANAAACATTTTGCAT	GAGAGTATNCCAGGAGAAATCA	+	chr3R	15031705	+	chr3R	816818	14214887	+	chr3R	15031705	+	chr3R	816818
AGATAAACCAAACGTGAAACCGCGACACAAATCAAACCACCTCAANAAACGGAGAGTGTTGNGAGGAATTTTC:1	AGATAAACCAAACGTGAAACCG	GAGAGTGTTGNGAGGAATTTTC	-	chr2L	13762927	-	chr2L	13761818	1109	+	chr2L	13761818	+	chr2L	13762927
CATCAGCTGTGTGCAAATAGCAACTGAGCAGCTTAACCCATTTCCACTGTTGGCCCTTTGTTATGAACCCCGCCA:1	CATCAGCTGTGTGCAAATAGCA	CCCTTTGTTATGAACCCCGCCA	+	chr3R	23073659	+	chr3R	23073748	89	+	chr3R	23073659	+	chr3R	23073748
TGGAAATTAACTTTCTTATTGTCTGAAGAACAATTCCGTTTAGTCACCTATTACCTTATTGATTCATATACAAAT:1	TGGAAATTAACTTTCTTATTGT	CCTTATTGATTCATATACAAAT	-	chr3R	28181133	-	chr3R	28173703	7430	+	chr3R	28173703	+	chr3R	28181133
CTGCCAGTTGTTTTCGCTAAGGGATTCGCCTGGGTCCCACATACATATGTACATATGTCTAAATACATGTACCG:1	CTGCCAGTTGTTTTCGCTAAGG	ATATGTCTAAATACATGTACCG	+	chr3R	23335434	+	chr3R	23335511	77	+	chr3R	23335434	+	chr3R	23335511
GTTTAAATTGGCAACTTTTACAAGTCGCCNCCTTAAAACTTCAGTTATAACGCTGTAAAANTTGTTAGATACACA:1	GTTTAAATTGGCAACTTTTACA	TGTAAAANTTGTTAGATACACA	+	chr2L	12176232	+	chr2L	12176313	81	+	chr2L	12176232	+	chr2L	12176313
TCTGATCAGCTTATCTGCAATGCCCCTCCCAAATAAAGTCAGCATAATTGATTTGTCTAATGCAGCACGGCATGT:1	TCTGATCAGCTTATCTGCAATG	TGTCTAATGCAGCACGGCATGT	-	chr3R	19815116	-	chr3R	19815037	79	+	chr3R	19815037	+	chr3R	19815116
AATGCGCCGGCAAAAGTATGCTACGAAAAAGTTGCTGTCGAAACGGAACTGGAAAACCATGATAATGTCCTTGC:1	AATGCGCCGGCAAAAGTATGCT	AAAACCATGATAATGTCCTTGC	-	chrX	20378812	-	chrX	20377346	1466	+	chrX	20377346	+	chrX	20378812
TCTGATGTGGATTTATTGCAGAGACGGAATTCCTCTTATTTAGAGATAGTATTTTCAGAAAGTCAATCACAATTG:1	TCTGATGTGGATTTATTGCAGA	TTCAGAAAGTCAATCACAATTG	-	chr2L	263455	-	chr2L	263309	146	+	chr2L	263309	+	chr2L	263455
GACGTTGAAACAAAATTTGTACAACTACATATATATAGGCATAACATTTTTTACGTATTTCCCTTAAATATATAT:1	GACGTTGAAACAAAATTTGTAC	CGTATTTCCCTTAAATATATAT	+	chrX	16815383	+	chrX	16815459	76	+	chrX	16815383	+	chrX	16815459
ATAAGCAACCTTAATCCGTGTACCGGCAAANNNTNTTTACAGTACAGAAACTGATTTTAATGAACATAGTAACCA:1	ATAAGCAACCTTAATCCGTGTA	ATTTTAATGAACATAGTAACCA	-	chr3L	2168893	-	chr3L	2168802	91	+	chr3L	2168802	+	chr3L	2168893
GGGTCTCTAATTTGCTTACGAAAAAGGCTCAGCTTGATCACTGAACTTTTGTTGAGTTCAATTAAGCTGTCGTCA:1	GGGTCTCTAATTTGCTTACGAA	GAGTTCAATTAAGCTGTCGTCA	-	chr2R	13590010	-	chr2R	13590109	99	+	chr2R	13590109	+	chr2R	13590010
GCCGCATTTGTGTGAAGTTTCCGATAAATTCATGCACCAGACCAACCNCTCGAAAATAGCAAATTCGNGACTTGG:1	GCCGCATTTGTGTGAAGTTTCC	AAATAGCAAATTCGNGACTTGG	+	chr3L	2479033	+	chr3L	2479130	97	+	chr3L	2479033	+	chr3L	2479130
CCTTGTTACCAAAATACACATGCTAATTTAAAGTAACTTGAGATTTCACTCAAAGCTTTTCTCTCTGTACATTTA:1	CCTTGTTACCAAAATACACATG	AGCTTTTCTCTCTGTACATTTA	+	chr3L	17537041	+	chr3L	17537122	81	+	chr3L	17537041	+	chr3L	17537122
TCTGTTTGCATTTCTAGCAATTGATAAAAATATTTCTTTTGGCAAATGCTTATGATAAACATGTTGTAAAGTGT:1	TCTGTTTGCATTTCTAGCAATT	TGATAAACATGTTGTAAAGTGT	+	chr3L	5104505	+	chr3L	5124638	20133	+	chr3L	5104505	+	chr3L	5124638
TTTTCACCGCTTATCCGCTTGCCCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTTTCAG:1	TTTTCACCGCTTATCCGCTTGC	TCGGGGTTATATCGCCTTTCAG	+	chrX	670269	+	chrX	670349	80	+	chrX	670269	+	chrX	670349
GTGGTTGCATTACATCAATATATGCCCTTCGTCATGTGTACTTTTGAAGACTTGTTTTACGCCTAAAGGCT:1	GTGGTTGCATTACATCAATATA	ACTTGTTTTACGCCTAAAGGCT	-	chr2R	8484058	-	chr2R	8483986	72	+	chr2R	8483986	+	chr2R	8484058
TTCAACTATTGGTTTTTTAATTCACAATATTCTGCTTATTCTGCTGATTAGTTGGAATTGTGTTTGTTTGCACGG:1	TTCAACTATTGGTTTTTTAATT	GGAATTGTGTTTGTTTGCACGG	+	chr2L	18573524	+	chr2L	18573823	299	+	chr2L	18573524	+	chr2L	18573823
GTATAATGTGTGTATCCAATTTGTGCTTTGATTAGCATAAAATGCGGTACGTGTTTTGGTTTGGCTGAAAAACGT:1	GTATAATGTGTGTATCCAATTT	TTTTGGTTTGGCTGAAAAACGT	+	chr2L	12067163	+	chr2L	9370241	2696922	+	chr2L	12067163	+	chr2L	9370241
GCCTTAAGCTCCCTGTTATCACCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTCGGAGGGAGGATGGAATCTCCTGCAG:1	GCCTTAAGCTCCCTGTTATCAC	GGGAGGATGGAATCTCCTGCAG	-	chr3L	22572174	-	chr3L	22572099	75	+	chr3L	22572099	+	chr3L	22572174
CGATCCACAGAAACACAAACATAGCTATGTACATTTGCATTTGCAATCTTCACCTTATTCGGCACTTCAATAGTA:1	CGATCCACAGAAACACAAACAT	CTTATTCGGCACTTCAATAGTA	-	chrX	441082	-	chrX	441004	78	+	chrX	441004	+	chrX	441082
CCTACGAGAAACATAACCAGCAAGCATAAACTATTTTATCGCCTCTGGCATCTATGGCCAGCGGTTAGCGCCGGC:1	CCTACGAGAAACATAACCAGCA	ATGGCCAGCGGTTAGCGCCGGC	-	chr2L	7113887	-	chr2L	7113663	224	+	chr2L	7113663	+	chr2L	7113887
TATTACAAAATGTTGTGAGAATTGATCATCATAACCAATCATACCACNTTACATACTGCATACGATGNTCTTCAA:1	TATTACAAAATGTTGTGAGAAT	TACTGCATACGATGNTCTTCAA	+	chrX	19185563	+	chrX	19185659	96	+	chrX	19185563	+	chrX	19185659
AGTGGCGAGAGGGTTGGATCAGCAGAAGTTTTTAGTTTTACATTTTTATTTGCTGATAAATGATTGGACTAATTA:1	AGTGGCGAGAGGGTTGGATCAG	TGATAAATGATTGGACTAATTA	+	chr2R	11068554	+	chr2R	10489309	579245	+	chr2R	11068554	+	chr2R	10489309
ACAATTTAATTGAGTATCTCTGTAGTGTAAGAAATGTTTTTGTATTCGCTTAACTTATTGAGCATTTGTATTGCA:1	ACAATTTAATTGAGTATCTCTG	CTTATTGAGCATTTGTATTGCA	+	chr2L	12693865	+	chr2L	12693942	77	+	chr2L	12693865	+	chr2L	12693942
AAAATATTTTAGTGTTATTCTTTATTAAGGAAAGAATGCCGACTTCTCTGATGGGGAGTCCACCTGNCTGCCTCT:1	AAAATATTTTAGTGTTATTCTT	GGGAGTCCACCTGNCTGCCTCT	+	chr2R	8455898	+	chr2R	8454955	943	+	chr2R	8455898	+	chr2R	8454955
GGCAGTGGAAAGTTGGGCTTTGTGCCTGGACGCTGCTACCNCCCGATTTATAGAATATTTTTTCC:1	GGCAGTGGAAAGTTGGGCTTTG	CGATTTATAGAATATTTTTTCC	-	chr3R	27719509	-	chr3R	28570427	850918	+	chr3R	28570427	+	chr3R	27719509
CCCATAAACATTTGGTGATCCCGACGTTACCGCAGTTTTTATCGGAGTCNACAACTCGGTCTTGTTATTGTTTCA:1	CCCATAAACATTTGGTGATCCC	ACTCGGTCTTGTTATTGTTTCA	+	chr2R	529354	+	chr2R	537979	8625	+	chr2R	529354	+	chr2R	537979
AATTTTTCTGATGATATACCTTTTTTTAAAAATATATATTCTTATATAAATCATCCTACATTTACATCGATGTC:1	AATTTTTCTGATGATATACCTT	ATCCTACATTTACATCGATGTC	+	chr3L	15874461	+	chr3L	15874573	112	+	chr3L	15874461	+	chr3L	15874573
CTGACAACATCTCAAAACGAAACGAAAAGCATGACCAAAAAAAACGGTAACACACCGCAGCTTTGGGTT:1	CTGACAACATCTCAAAACGAAA	TAACACACCGCAGCTTTGGGTT	-	chr2R	16429781	-	chr2R	4322005	12107776	+	chr2R	4322005	+	chr2R	16429781
CATTGTTGAGTTATGTTTCTTCCGATCCCACACGCCACCCACTGAGCACCCTGACCTCTACGCCCACTNACC:1	CATTGTTGAGTTATGTTTCTTC	CTGACCTCTACGCCCACTNACC	+	chr2R	10671271	+	chr2R	10671346	75	+	chr2R	10671271	+	chr2R	10671346
GCAGTCCGTCACCAGACAGACATTGTGGCACTGGACAAAAACAGCAAGTTTCTTTAGCTTTGATAGTCAAACTCA:1	GCAGTCCGTCACCAGACAGACA	TTAGCTTTGATAGTCAAACTCA	-	chrX	20505654	-	chrX	20504133	1521	+	chrX	20504133	+	chrX	20505654
AAAGGGTTGAGAAATTAGTTGAGAGTACCATGTGTGGTTTGGTCTTAACTGTGAATTTAATCAACTTCTTGATT:1	AAAGGGTTGAGAAATTAGTTGA	GAATTTAATCAACTTCTTGATT	-	chr2R	10411918	-	chr2R	10411837	81	+	chr2R	10411837	+	chr2R	10411918
AAAACATATTGTAAATGGTGAAAGTACTGTCGCCCTCTTATTTCGGTGGTTCCAGTGCAGTATTAGGCTTAA:1	AAAACATATTGTAAATGGTGAA	TCCAGTGCAGTATTAGGCTTAA	-	chr3R	31881398	-	chr3R	31881317	81	+	chr3R	31881317	+	chr3R	31881398
CGTAACGCTCCTTAGGAATCGTCGTTTGCTTACCGGCGAAAAGTG:1	CGTAACGCTCCTTAGGAATCGT	GTTTGCTTACCGGCGAAAAGTG	-	chr2R	18408235	-	chr2R	18407307	928	+	chr2R	18407307	+	chr2R	18408235
TATTTTCCGCATTTAATTTGTTGCCTGCGACGGTTGGGTGGCTTTCACGGAGTTAGTATAAGGAGCAACGCAAAG:1	TATTTTCCGCATTTAATTTGTT	TAGTATAAGGAGCAACGCAAAG	+	chr2L	14121800	+	chr2L	14121882	82	+	chr2L	14121800	+	chr2L	14121882
AACGCGATTGGAAACCGAAAAAGAACGAAACAAACCCAAATTACAAAATGTACACAAATACAAACTCACGAAAAT:1	AACGCGATTGGAAACCGAAAAA	ACAAATACAAACTCACGAAAAT	-	chr2R	19566619	-	chr2R	14770486	4796133	+	chr2R	14770486	+	chr2R	19566619
GAATAATCCTTGGAGAGTTCACTGAAAACCATCCAGAATGGAATGGAAGCCAGTTAGGGGATTACTTTCGG:1	GAATAATCCTTGGAGAGTTCAC	CCAGTTAGGGGATTACTTTCGG	-	chrX	20499251	-	chrX	20499172	79	+	chrX	20499172	+	chrX	20499251
AATTTAAAAAAGTCGAATTTAATGCATAGCTGAGTGTGTGGTTCTTATGAAAAACTTGT:1	AATTTAAAAAAGTCGAATTTAA	GTGGTTCTTATGAAAAACTTGT	+	chr3R	4606770	+	chr3R	4607103	333	+	chr3R	4606770	+	chr3R	4607103
GAATCAAACACAATAAAAAAAGTTAAAAGGTTAAAACAGGACAGTATGCCAGTTTTGGTATTTAGCCAATTGGAG:1	GAATCAAACACAATAAAAAAAG	TTTGGTATTTAGCCAATTGGAG	+	chr2L	19189987	+	chr2L	19190141	154	+	chr2L	19189987	+	chr2L	19190141
TTTTACTTTCAAGTCATCGCGGTGGACTCAGTGAAAAAGTAAATATATACGAGATTCGCTCTGTTTTTGTCTAAT:1	TTTTACTTTCAAGTCATCGCGG	ATTCGCTCTGTTTTTGTCTAAT	-	chr2L	18394081	-	chr2L	18394001	80	+	chr2L	18394001	+	chr2L	18394081
AATTGGGTGAATGTATATCTTGACATTTATCAGAAAAGGCAGGAGCACCAAATCGGATANG:1	AATTGGGTGAATGTATATCTTG	CAGGAGCACCAAATCGGATANG	+	chr3R	23967229	+	chr3R	23967783	554	+	chr3R	23967229	+	chr3R	23967783
GTAAGCATCAATGGGTTAAGTGAATGAGGCATCCGCATGTATGTACATACATAGACATTCGCGGACTAGCTTGAT:1	GTAAGCATCAATGGGTTAAGTG	GACATTCGCGGACTAGCTTGAT	-	chr3R	5927822	-	chr3R	5927582	240	+	chr3R	5927582	+	chr3R	5927822
CAGCAATATATATTGTATNAACAGCCAGTACATGGGCCACANTTGNTTGACTCTGCAACAAAAGCAATTA:1	CAGCAATATATATTGTATNAAC	GACTCTGCAACAAAAGCAATTA	-	chr3L	26695032	-	chr3L	26694957	75	+	chr3L	26694957	+	chr3L	26695032
AAAGATATACAACTTTTTGNTTTCAAAGAAAACATTTTAAACATAAAATTTAAACATTAATTAGGTATAGGACAA:1	AAAGATATACAACTTTTTGNTT	ACATTAATTAGGTATAGGACAA	-	chr2L	9008803	-	chr2L	9008722	81	+	chr2L	9008722	+	chr2L	9008803
GTGAGTGGGCGTGGCACCGGATGGGAAATGGGAATATGCAGCTAATACATTTATGAAACGAAACGAAACCGAAA:1	GTGAGTGGGCGTGGCACCGGAT	ATGAAACGAAACGAAACCGAAA	+	chr3L	5699806	+	chr3L	10350502	4650696	+	chr3L	5699806	+	chr3L	10350502
AAGAAAGTCCAAGACGCCGTTTAGCGCGTTTATAAGTTGAACTCAGTGGCAAAAGGGCAGGCAGCAAATGACAAG:1	AAGAAAGTCCAAGACGCCGTTT	AGGGCAGGCAGCAAATGACAAG	+	chr2L	10499574	+	chr2L	10499673	99	+	chr2L	10499574	+	chr2L	10499673
AAAACGTTTTGACATTTTATACGCACTTTGGTGGATGGTGGAATCAAGATAAAAAGGGTTCACAACAGGGCG:1	AAAACGTTTTGACATTTTATAC	AAAAAGGGTTCACAACAGGGCG	+	chr2L	19374512	+	chr2L	19374618	106	+	chr2L	19374512	+	chr2L	19374618
CATATGTTGTATGGAAAGAGACAGTAAATTGCTGTCTACATTGTAAGTGGGTCAAACATT:1	CATATGTTGTATGGAAAGAGAC	CATTGTAAGTGGGTCAAACATT	+	chrX	13236894	+	chrX	13236964	70	+	chrX	13236894	+	chrX	13236964
TTAAAGCGATTGTAACGGTAGAAATTATTCGTACCATGAACATGTCATTAGCCGACTGGCAAACATCTTAGTTAT:1	TTAAAGCGATTGTAACGGTAGA	GACTGGCAAACATCTTAGTTAT	-	chr2L	13152326	-	chr2L	13152248	78	+	chr2L	13152248	+	chr2L	13152326
AACTACAGAATACAAAAAGAATATATGTATATATGTATAAAAAAAAGAGAGNTGGCACAAGTCGGGGAA:1	AACTACAGAATACAAAAAGAAT	AGAGNTGGCACAAGTCGGGGAA	+	chrX	17792977	+	chrX	17796267	3290	+	chrX	17792977	+	chrX	17796267
CCTGCATATGAAAATATGACCAAAAAGTTTACGAGTTTTTTGTTGTGCTTCACGCCTTTAAGCTGACAGATACAG:1	CCTGCATATGAAAATATGACCA	GCCTTTAAGCTGACAGATACAG	-	chr3L	14141848	-	chr3L	14141758	90	+	chr3L	14141758	+	chr3L	14141848
GAACGAATAGGGGGCTTCAATCGAGGAGGAGTCTGTGCATACGACATTGCGATCAAATTTCTGTTTTGGAGCACG:1	GAACGAATAGGGGGCTTCAATC	CAAATTTCTGTTTTGGAGCACG	+	chr3L	2631064	+	chr3L	2631174	110	+	chr3L	2631064	+	chr3L	2631174
AAACTAATTTGGGACACGAAACACTGGAAGAATTGAATTGAATTCAAAATGAATTGAAATAAAGTTATATCGCGT:1	AAACTAATTTGGGACACGAAAC	TTGAAATAAAGTTATATCGCGT	-	chr3R	8576348	-	chr3R	8576177	171	+	chr3R	8576177	+	chr3R	8576348
AATGCTACGAACAAATTTCGNATATTTCTTTCNGGTGCACACNCATATATCAAAGACGTGTAAATATGACTTTA:1	AATGCTACGAACAAATTTCGNA	AAGACGTGTAAATATGACTTTA	-	chr3L	21156948	-	chr3L	21151865	5083	+	chr3L	21151865	+	chr3L	21156948
AGCAACGGNACATGCACTTTAAGTGAAGTCGTCAAGTNNNNAAGTCGTGTGGCGTAGGACTNAGATTATATCCCG:1	AGCAACGGNACATGCACTTTAA	GTAGGACTNAGATTATATCCCG	+	chr3R	28486278	+	chr3R	28484361	1917	+	chr3R	28486278	+	chr3R	28484361
CTTTGTTGTATCTAAAGTATTCAACAAGCTTAATAGTAACTATGTGCTATAAAGGACAAGAAGCAACTGAAAAGG:1	CTTTGTTGTATCTAAAGTATTC	GGACAAGAAGCAACTGAAAAGG	+	chr3R	21518263	+	chr3R	21518347	84	+	chr3R	21518263	+	chr3R	21518347
AACGGTGTGCTTGAGATGGAATGGACGACTTAAATTCAACTACAATCTATTGTATTATA:1	AACGGTGTGCTTGAGATGGAAT	AACTACAATCTATTGTATTATA	-	chr3L	698285	-	chr3L	698128	157	+	chr3L	698128	+	chr3L	698285
ACAGATTCCGGCAATATCTTCACACTCTTTTCCTGCTACACAGAGCATTATTTCTATCATATCATGAAATTTGAA:1	ACAGATTCCGGCAATATCTTCA	CTATCATATCATGAAATTTGAA	+	chr2R	21363143	+	chr2R	21363241	98	+	chr2R	21363143	+	chr2R	21363241
CAAATCAGACAATCTATAGGTAACTATAATTTTCCAAAGAAATTTTCTTACCGCTGGTTTCTTCTTTNTATAGAA:1	CAAATCAGACAATCTATAGGTA	CTGGTTTCTTCTTTNTATAGAA	-	chr3L	1195602	-	chr3L	1195398	204	+	chr3L	1195398	+	chr3L	1195602
GAGTGCATTCTATTCGCCACATTAGAAGCCAAGCCCAAGTGGAAAATGGAAAATCCATGCTTCGT:1	GAGTGCATTCTATTCGCCACAT	AAATGGAAAATCCATGCTTCGT	+	chr3R	22428592	+	chr3R	22428658	66	+	chr3R	22428592	+	chr3R	22428658
ATAATATAAAATATAATCAAAATAGCCTTTGGGAAAGACCAAATAGTTATGTAATCNGAAAAT:1	ATAATATAAAATATAATCAAAA	AATAGTTATGTAATCNGAAAAT	+	chr2L	2171247	+	chr2L	18689624	16518377	+	chr2L	2171247	+	chr2L	18689624
AATTCCTCGAATTGTAAAATGTGTCACGGCATCTAGTCGCGCATAGAATTGGCGAATATTTTATGCTAAAGAGGC:2	AATTCCTCGAATTGTAAAATGT	GAATATTTTATGCTAAAGAGGC	-	chr2L	19871656	-	chr2L	19871569	87	+	chr2L	19871569	+	chr2L	19871656
GCGTTATGTGCTTTGTTTAATTGTTGACTCTGAATCAGGCCTACAAATCCATCAACTTCTGTTCACCTTTTCCCA:1	GCGTTATGTGCTTTGTTTAATT	AACTTCTGTTCACCTTTTCCCA	+	chr3L	8148072	+	chr3L	8148280	208	+	chr3L	8148072	+	chr3L	8148280
TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTNGTGTTGTGTTGTGTGCAGGTCTCCCCTTAAATGCAACAAAGATGGGAT:1	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	TTAAATGCAACAAAGATGGGAT	+	chr2L	16217660	+	chr2L	3351554	12866106	+	chr2L	16217660	+	chr2L	3351554
GTGTAAGAATATGAACTCGACTCTTTTGAACAATTTTATGCACAANATTT:1	GTGTAAGAATATGAACTCGACT	AACAATTTTATGCACAANATTT	-	chr3L	22726512	-	chr3L	22726451	61	+	chr3L	22726451	+	chr3L	22726512
GAATACCCATGATTAGGCAGTGGCAAAAAAAGGATTATAATAGTAGGTAGGCCTTTGCTTATTCATTATTAGTTT:1	GAATACCCATGATTAGGCAGTG	TTTGCTTATTCATTATTAGTTT	+	chr2R	23346532	+	chr2R	23346608	76	+	chr2R	23346532	+	chr2R	23346608
TAATAAAAATGAGTAAAGGAAAACACAAACAAAACCCGAGTCGACATAAGGGTAAACACGATTCAATAAAATTAC:1	TAATAAAAATGAGTAAAGGAAA	AAACACGATTCAATAAAATTAC	+	chr2R	22525755	+	chr2R	22529310	3555	+	chr2R	22525755	+	chr2R	22529310
AGCCAAGAAGAAGACGTTGGCTAGGAACAAGAACAAGAAGATGGCGAGGNAGCAGAGGGAGGGGAAGCGGGACAG:1	AGCCAAGAAGAAGACGTTGGCT	AGAGGGAGGGGAAGCGGGACAG	+	chr2R	24727911	+	chr2R	24735419	7508	+	chr2R	24727911	+	chr2R	24735419
AAAACCATCTCTGACCCATAACTTTGATCGCGTTAATGTCCAAGTGCACCCCCTGTG:1	AAAACCATCTCTGACCCATAAC	ATGTCCAAGTGCACCCCCTGTG	-	chr3R	9926593	-	chr3R	9926524	69	+	chr3R	9926524	+	chr3R	9926593
TTTGAAAAGCACTTAACAAGTTTTGTGTGCCTACATCGTACATATGTNTATATATGCTGCTGTTGGANTAGATG:1	TTTGAAAAGCACTTAACAAGTT	TATGCTGCTGTTGGANTAGATG	+	chr2R	17784027	+	chr2R	17784267	240	+	chr2R	17784027	+	chr2R	17784267
ACGCAGTGGGCAGCGGTCAGCACATAGCGACTGTTGATCAGTGAGCCCGCACAACCCGTTCGTTG:1	ACGCAGTGGGCAGCGGTCAGCA	AGCCCGCACAACCCGTTCGTTG	-	chr3R	23685189	-	chr3R	23684713	476	+	chr3R	23684713	+	chr3R	23685189
ATGTTGATAATAAATCGCATTCCAGATGGCGTAGAATAATAGATTAAGTAACTAAGCCATGATTAATCCAATCCA:1	ATGTTGATAATAAATCGCATTC	AAGCCATGATTAATCCAATCCA	-	chr2L	5989125	-	chr2L	5989049	76	+	chr2L	5989049	+	chr2L	5989125
CGCCCTGAAACAATGGCAACACCTGCGTAATGCCCTGGCCCACCCGAAAAACTTATCAAAAACTTTCACGTTCA:1	CGCCCTGAAACAATGGCAACAC	TTATCAAAAACTTTCACGTTCA	-	chr3L	14132705	-	chr3L	6636645	7496060	+	chr3L	6636645	+	chr3L	14132705
ATGAACCTGGCTACAAGGCACCTTTCTCGATCACATTGAGATATCACAAGAAGTTCACCGGACTTAGCAATATGC:1	ATGAACCTGGCTACAAGGCACC	TTCACCGGACTTAGCAATATGC	-	chr3R	29237522	-	chr3R	29239430	1908	+	chr3R	29239430	+	chr3R	29237522
ATGCATTAATATGAATAATTTAATTTTAGCAGCTCCGGAAGCGG:1	ATGCATTAATATGAATAATTTA	ATTTTAGCAGCTCCGGAAGCGG	+	chr3L	6450755	+	chr3L	6450958	203	+	chr3L	6450755	+	chr3L	6450958
CTTTGCTATGGTTGAATGCTCCACTGCCTCACGACAGCTTGATTTGTTGGCAGTTGGCATACAATTGACATTT:1	CTTTGCTATGGTTGAATGCTCC	AGTTGGCATACAATTGACATTT	+	chr3R	12893493	+	chr3R	12893569	76	+	chr3R	12893493	+	chr3R	12893569
CAGCACACATACCGCGTATCCTCTGGCCCCCAAATAACNCCGCAATTAACATCCAATACTCTGAACTCCTCTATT:1	CAGCACACATACCGCGTATCCT	CAATACTCTGAACTCCTCTATT	-	chr3L	15458835	-	chr3L	6253146	9205689	+	chr3L	6253146	+	chr3L	15458835
ATCCCCAGTGGGTGCTCCTTGCCTCTAGGAGGCTCCACACAGTAAGAAATTCATAGAAAACACGTAGNCTGTTAA:1	ATCCCCAGTGGGTGCTCCTTGC	TAGAAAACACGTAGNCTGTTAA	+	chr3R	30480481	+	chr3R	30482949	2468	+	chr3R	30480481	+	chr3R	30482949
ATTTTTAAATAAATCGCAACCTCAAACAACATAAATTGATCAACATTTTCCCGTAACATTTGCATTNCTTTTC:1	ATTTTTAAATAAATCGCAACCT	CGTAACATTTGCATTNCTTTTC	-	chr2L	18304077	-	chr2L	18303988	89	+	chr2L	18303988	+	chr2L	18304077
ATTCCTTTTGGTTTATGTGATTTTCGTAGAAAGTAGTTCCTTATTAAGTATTAATGAACTCGACTAATTTCTCT:1	ATTCCTTTTGGTTTATGTGATT	AATGAACTCGACTAATTTCTCT	+	chr2R	11179271	+	chr2R	11179356	85	+	chr2R	11179271	+	chr2R	11179356
AGGTGAGCAGTAGTCTGCCCACCAGCAAANAAGAGAGAGACGCCTAATTAAGTTTCCCACNGGCCAGCTCCTTTT:1	AGGTGAGCAGTAGTCTGCCCAC	TTCCCACNGGCCAGCTCCTTTT	-	chr2L	14227795	-	chr2L	18651240	4423445	+	chr2L	18651240	+	chr2L	14227795
GAATCAAGTATCTGTTACTTCTCCATTGAAATTGAAACTACTAGGACATAGATTAAAATGCAAACGCCTGTCAGT:1	GAATCAAGTATCTGTTACTTCT	TAAAATGCAAACGCCTGTCAGT	+	chr2L	19703560	+	chr2L	19712696	9136	+	chr2L	19703560	+	chr2L	19712696
TGCCGAAATGTTTAAATCATAATTAAAAGCATTTATTAGCTTGTGTAACACTTAATGCGGCAGGAAAAGAGA:1	TGCCGAAATGTTTAAATCATAA	CTTAATGCGGCAGGAAAAGAGA	+	chr3R	31413122	+	chr3R	31418319	5197	+	chr3R	31413122	+	chr3R	31418319
ATGAATTTTTCACTTAGTATTAGTATGCGTTTTATGTAGTCACCGGGAAAATACGATTTTTAAAAAGGTTCCTAA:1	ATGAATTTTTCACTTAGTATTA	CGATTTTTAAAAAGGTTCCTAA	-	chr2L	18079916	-	chr2L	18079830	86	+	chr2L	18079830	+	chr2L	18079916
AGCAAATAAGTGCAGGGATCGGGTCGGGGTATGTGGATGCGATTGTTATGTGATGAATGAAGAAAAAAGGAAG:1	AGCAAATAAGTGCAGGGATCGG	GATGAATGAAGAAAAAAGGAAG	+	chr2L	11267054	+	chr2L	15995878	4728824	+	chr2L	11267054	+	chr2L	15995878
TAGGCAACTCATAGACGGAATAGCATTTTCTTTTATTGCTTGCCCAAATAATCACATGATAAACCCACAAAGAAG:1	TAGGCAACTCATAGACGGAATA	ACATGATAAACCCACAAAGAAG	+	chrX	1163330	+	chrX	1163408	78	+	chrX	1163330	+	chrX	1163408
GCGAAAAAATTGCAAATTGATACGAAAAAAATGCAACCTTAGCCACAGATCCTAACCCG:1	GCGAAAAAATTGCAAATTGATA	CTTAGCCACAGATCCTAACCCG	-	chr2R	25200517	-	chr2R	8420630	16779887	+	chr2R	8420630	+	chr2R	25200517
GTGGCCTTTCGACTTTCGGTCCAATCATGCCCATTGTGTGTGGGGATGTGGGATGGGTGG:1	GTGGCCTTTCGACTTTCGGTCC	TGTGGGGATGTGGGATGGGTGG	+	chrX	4861921	+	chrX	10334584	5472663	+	chrX	4861921	+	chrX	10334584
AATGTAAAATATGTTGCCTTCATTGGTATACAAATCATAATTTGTCAAGCGCTAGC:1	AATGTAAAATATGTTGCCTTCA	TCATAATTTGTCAAGCGCTAGC	+	chr2L	1022280	+	chr2L	5447373	4425093	+	chr2L	1022280	+	chr2L	5447373
AANTACTGGTATCAGTTGAAGAAACTGGCTAAAANTNCTTAATGATTCCAACTAAAATGTGTTTATAAAATTA:1	AANTACTGGTATCAGTTGAAGA	CTAAAATGTGTTTATAAAATTA	+	chr3R	26770242	+	chr3R	26770317	75	+	chr3R	26770242	+	chr3R	26770317
AATAAGATAGGTCAGCAATGATTGTGGCGGGGGGGGGGG:1	AATAAGATAGGTCAGCAATGAT	ATGATTGTGGCGGGGGGGGGGG	+	chr3L	5988761	+	chr3L	1170619	4818142	+	chr3L	5988761	+	chr3L	1170619
TGAGCGGCGAGAAGAAGCAGCAGCAGTTGAGCCGTCGAGCCGTCGAGGAA:1	TGAGCGGCGAGAAGAAGCAGCA	GAGCCGTCGAGCCGTCGAGGAA	-	chrX	19884167	-	chrX	19884116	51	+	chrX	19884116	+	chrX	19884167
AATGCGTCATTCGTCATTTGGCATTGTTCAACAACCCAGTCGAACATATTTCATGTGAATCGCCCCCGAGTACCT:1	AATGCGTCATTCGTCATTTGGC	TGTGAATCGCCCCCGAGTACCT	+	chr2L	8789322	+	chr2L	8789398	76	+	chr2L	8789322	+	chr2L	8789398
ATGTAGGCTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTCTCCAATTTAGTCTTTTGATAGCCAAGACTTCTG:1	ATGTAGGCTACATTTTTGCTGC	CTTTTGATAGCCAAGACTTCTG	-	chr3R	11846288	-	chr3R	11841098	5190	+	chr3R	11841098	+	chr3R	11846288
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAACAATGGAACAGCANACAAAACAACAGAAAATATAATACCGAATTGAAGTT:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	AATATAATACCGAATTGAAGTT	+	chr3L	22908066	+	chr3L	2896955	20011111	+	chr3L	22908066	+	chr3L	2896955
AANGTTCTTTCAACAAGTTTGTGCCTTAAGTCTTNCNATTGTCTGCAAAATCAACCTCGAACTTCGTGCCATCT:1	AANGTTCTTTCAACAAGTTTGT	AACCTCGAACTTCGTGCCATCT	-	chr2L	4609145	-	chr2L	4601705	7440	+	chr2L	4601705	+	chr2L	4609145
GAACTAGCGCCCAATGTGATTCGCACCAGCAGCGACGGATTACCCCATTTCGCACTTCCCGACCTC:1	GAACTAGCGCCCAATGTGATTC	CCATTTCGCACTTCCCGACCTC	+	chr2R	24763630	+	chr2R	24765597	1967	+	chr2R	24763630	+	chr2R	24765597
ACCATTTGCAAACGGCATTGCAAACAATTCAATAATTATGGACTGAGAACGGTAGTGAAAACTTCCCCGAGGCG:1	ACCATTTGCAAACGGCATTGCA	TAGTGAAAACTTCCCCGAGGCG	-	chr3R	24732495	-	chr3R	24730118	2377	+	chr3R	24730118	+	chr3R	24732495
TAACAAGCAGCGCAGCAGTCGTGGAAAGCGGTGGAAAATGGGCGGGGAGNGAAGCGATGGTGAACAAA:1	TAACAAGCAGCGCAGCAGTCGT	GAGNGAAGCGATGGTGAACAAA	+	chr3L	5316962	+	chr3L	5317040	78	+	chr3L	5316962	+	chr3L	5317040
GACATATGTCTAAATATTTGATACGCTGTTGAATGCTGGGAATGCAGGGCTAAGTCATCGTAAATAATAAAAATA:1	GACATATGTCTAAATATTTGAT	GTCATCGTAAATAATAAAAATA	-	chr3R	5891998	-	chr3R	5891692	306	+	chr3R	5891692	+	chr3R	5891998
GTTTCCATTTTCGCCTCTTTAGCATAAAATATTCGCCAATTCTATGCGCGACTAGATGCCGTGACACATTTTACA:1	GTTTCCATTTTCGCCTCTTTAG	AGATGCCGTGACACATTTTACA	+	chr2L	19871557	+	chr2L	19871644	87	+	chr2L	19871557	+	chr2L	19871644
CTTCCAGTCTTTCTTCAGTCTACCGATCCTCCAGTCTTGTGCATATTGCCCAGCACCCTTAGCTCCTCCAGTTTC:1	CTTCCAGTCTTTCTTCAGTCTA	CACCCTTAGCTCCTCCAGTTTC	-	chrX	7543848	-	chrX	6195007	1348841	+	chrX	6195007	+	chrX	7543848
AGGAGAAAGGGAGAAAAAAAGGGATAACGTATGCTTCTGTGGTTTTTAAATTGGCAAAATATGTTCAAAATTGAT:1	AGGAGAAAGGGAGAAAAAAAGG	GCAAAATATGTTCAAAATTGAT	-	chr3L	18101772	-	chr3L	11960150	6141622	+	chr3L	11960150	+	chr3L	18101772
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534
TGAGCATTGTAAGCAATACTATAGTTTTGAGTTGATTAAGTTCTGGAAGTTGGTTTTTT:1	TGAGCATTGTAAGCAATACTAT	AAGTTCTGGAAGTTGGTTTTTT	+	chr3R	29079397	+	chr3R	29080753	1356	+	chr3R	29079397	+	chr3R	29080753
CAATGGAAATATGGGAAAATACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGTGT:1	CAATGGAAATATGGGAAAATAC	CTTCATCTGTTGATGTGAGTGT	-	chrX	20942218	-	chrX	20940749	1469	+	chrX	20940749	+	chrX	20942218
ATATTCTAGCTAGAGGCATTTCTGGTCTCCAGTTTTCCAAATTGGAGAGAGCATTTGCAGTTCG:1	ATATTCTAGCTAGAGGCATTTC	TGGAGAGAGCATTTGCAGTTCG	+	chr3R	20167811	+	chr3R	20167878	67	+	chr3R	20167811	+	chr3R	20167878
TAGTTTCGCCATTGGGTATTTGCCGAAAAACTTTGCAATCCAACAGAAGACTCTATACACAAGTCAGCAGGG:1	TAGTTTCGCCATTGGGTATTTG	CTCTATACACAAGTCAGCAGGG	-	chr2L	795376	-	chr2L	795269	107	+	chr2L	795269	+	chr2L	795376
ATACACAAAGTAAGCATCAATGGGTTAAGTGAATGAGGCATCCGCATGTATGTACATACATAGACATTCGCGGAC:1	ATACACAAAGTAAGCATCAATG	ACATACATAGACATTCGCGGAC	-	chr3R	5927831	-	chr3R	5927591	240	+	chr3R	5927591	+	chr3R	5927831
CGATTCAACGGATTATTTTAGTAAATGACTCCATTTCTGCCTTCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAACAGAG:1	CGATTCAACGGATTATTTTAGT	ATCAAGTTCAATCGCAACAGAG	+	chr2R	6493491	+	chr2R	6493387	104	+	chr2R	6493491	+	chr2R	6493387
GCGGCCTATTTATAAAATGTCTAGAATGGCAAAAACAATTAAATTAAATTTTGCTACGTAAATCTGGCATATTTT:1	GCGGCCTATTTATAAAATGTCT	CTACGTAAATCTGGCATATTTT	+	chr3R	7404957	+	chr3R	7405033	76	+	chr3R	7404957	+	chr3R	7405033
AGAAAATTACCGAATTTCGGAACAATTCGTTTTGACTAACAAGAAATCCTATGCTTCCTCGCTGATCTCGACAA:1	AGAAAATTACCGAATTTCGGAA	GCTTCCTCGCTGATCTCGACAA	-	chr3R	30012640	-	chr3R	30017945	5305	+	chr3R	30017945	+	chr3R	30012640
AATTTAATNGATTACCTCACTAAGATTTTCAGTTGGCCATGTTCCACTGCACTTGCACTT:1	AATTTAATNGATTACCTCACTA	ATGTTCCACTGCACTTGCACTT	-	chr3L	18232343	-	chr3L	12880053	5352290	+	chr3L	12880053	+	chr3L	18232343
TTTGTTCATGCGCACTCGCACTGCTCGCGCGTTTGCGTGTGTTTGTGTGCGTGTGTGAGCAA:1	TTTGTTCATGCGCACTCGCACT	GTTTGTGTGCGTGTGTGAGCAA	+	chr3R	23201272	+	chr3R	24625902	1424630	+	chr3R	23201272	+	chr3R	24625902
ATTGTAACTTTATTTTTTTTTTACTTTATTTACTTATAATATGTATAATAATTCCAAAATTTAATTTACTGAGA:1	ATTGTAACTTTATTTTTTTTTT	TCCAAAATTTAATTTACTGAGA	-	chr2L	2008978	-	chr2L	15912081	13903103	+	chr2L	15912081	+	chr2L	2008978
ATATTTTTGTTAAAACAACACTTTTTTTTCGAGTGCCCAAAGTGTGTGTGTTGGGGGTCCTGTGCCAGGGCGTTG:1	ATATTTTTGTTAAAACAACACT	GGGGTCCTGTGCCAGGGCGTTG	+	chrX	3190207	+	chrX	12361676	9171469	+	chrX	3190207	+	chrX	12361676
AAAGTATAAGAATTTAATCTCATCGAAAACAACCGAAAAATTCATTTTGATAGTTTTTATTTTTTGAAACCAAAC:1	AAAGTATAAGAATTTAATCTCA	TTTTTATTTTTTGAAACCAAAC	+	chr3R	26510503	+	chr3R	26519564	9061	+	chr3R	26510503	+	chr3R	26519564
AGGCATTATGTACACATATATGGATAGACTACTATGAAATATTATA:1	AGGCATTATGTACACATATATG	TAGACTACTATGAAATATTATA	-	chr2L	11309118	-	chr2L	11309039	79	+	chr2L	11309039	+	chr2L	11309118
CTTTCGAACATAATTTAGTTTTGCGTACCCCTCGCCCGGTATCTTTTGCATCAGCATCACGCACATGAATATTAA:1	CTTTCGAACATAATTTAGTTTT	GCATCACGCACATGAATATTAA	-	chr3L	10198705	-	chr3L	10198627	78	+	chr3L	10198627	+	chr3L	10198705
TTTTTTGAGTTCTGAAAGCATGATCAGACCTACCGGGCAAACCATTTACNTTACGAAAGCAGACTTCGGTCTTCA:1	TTTTTTGAGTTCTGAAAGCATG	CGAAAGCAGACTTCGGTCTTCA	+	chr3L	3814870	+	chr3L	3814956	86	+	chr3L	3814870	+	chr3L	3814956
ACTATTCCAGCTCAAGCTCCAAAAATAACGCCGACATGGTCGTGTCAGTGTCTATCTCAGTTGCGAGGTTGG:1	ACTATTCCAGCTCAAGCTCCAA	TCTATCTCAGTTGCGAGGTTGG	-	chr3R	12165343	-	chr3R	22740813	10575470	+	chr3R	22740813	+	chr3R	12165343
AAGCTCAATACGATTAGGAAGCGAGCAGGAGCTAAGGACCTGGGGGAATCTCCTTGCCCACTGCTAAGCTGGTTC:1	AAGCTCAATACGATTAGGAAGC	TTGCCCACTGCTAAGCTGGTTC	-	chr2R	16962331	-	chr2R	16962254	77	+	chr2R	16962254	+	chr2R	16962331
AGCATTACCATAACGTTTGTAGGCCATAGAGAGTAGAGAGAAGCAATGATCATATCTGCCGCAGAAGAGTATAAA:1	AGCATTACCATAACGTTTGTAG	ATCTGCCGCAGAAGAGTATAAA	+	chr2L	1156859	+	chr2L	1156964	105	+	chr2L	1156859	+	chr2L	1156964
TGCATAATTGTGCTTTTACGTGTTTTAGCAAAAAATCAAAAAGAACTATGTAAGATTTCGATGGGGAACCGAT:1	TGCATAATTGTGCTTTTACGTG	AAGATTTCGATGGGGAACCGAT	+	chr3R	28479164	+	chr3R	28479245	81	+	chr3R	28479164	+	chr3R	28479245
AAGGCACAGTTCGGTGAANCAAGTGGTGGGGGGGGAAAAGTGAGGCGAAATGAGTGCCAAGAACACATTTCANAT:1	AAGGCACAGTTCGGTGAANCAA	GTGCCAAGAACACATTTCANAT	-	chr2R	19331328	-	chr2R	19331248	80	+	chr2R	19331248	+	chr2R	19331328
GCCAGCCAGCAATATTGCGATTGGTCTTTATCTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAAAATGTTGA:1	GCCAGCCAGCAATATTGCGATT	GGGGGAGATGTGAAAATGTTGA	-	chr2L	5897695	-	chr2L	5897613	82	+	chr2L	5897613	+	chr2L	5897695
ACATACTTAAACATCCTTAAGATACAACTATATCAACTCGATATCCTTGTTGAGAATGAGGACTGTATTACANAT:1	ACATACTTAAACATCCTTAAGA	GAATGAGGACTGTATTACANAT	-	chr3R	7030788	-	chr3R	7030712	76	+	chr3R	7030712	+	chr3R	7030788
TGCTTCTACAAGTGCTGCATGCATCGAAGGATAGCGACAGACAGGCGACAGGGCAAGGCCGGAACACG:1	TGCTTCTACAAGTGCTGCATGC	GACAGGGCAAGGCCGGAACACG	+	chr3R	28421687	+	chr3R	28421768	81	+	chr3R	28421687	+	chr3R	28421768
CAACTCAACTCAACTCAACTCGACTCGACGCAAGTCGGCAGACAACG:1	CAACTCAACTCAACTCAACTCG	CGACGCAAGTCGGCAGACAACG	-	chrX	6512418	-	chrX	8943600	2431182	+	chrX	8943600	+	chrX	6512418
TGTAAATTCCATTTTAATAATGCGGTGACAGTGGGCGTGAGTTTCGCCGTTCTTTCCTGGGTGTCCGGTTCATTT:1	TGTAAATTCCATTTTAATAATG	TTCCTGGGTGTCCGGTTCATTT	+	chr3R	19193014	+	chr3R	19197318	4304	+	chr3R	19193014	+	chr3R	19197318
CAACAATGACGCCGCAGTCTCGCATATTGTTCGGCCTCAGCTTCGACTGGAGCTCTTTTT:1	CAACAATGACGCCGCAGTCTCG	AGCTTCGACTGGAGCTCTTTTT	+	chr2R	9129569	+	chr2R	9129641	72	+	chr2R	9129569	+	chr2R	9129641
AGGAGCANGATCCGGAGGAGGCCCGCAAATCTTTATGCCNGCTGGACTGCAGAGTGANACATGTCGGCAGCATAG:1	AGGAGCANGATCCGGAGGAGGC	GTGANACATGTCGGCAGCATAG	+	chr3R	6381305	+	chr3R	30674457	24293152	+	chr3R	6381305	+	chr3R	30674457
CGCGGAAAAGTCGGCCAATGAATGGAAACGAGGGCAAAAGGAAAAGCGGGTAAGATGTGGGGCATCCAAAGTGAA:1	CGCGGAAAAGTCGGCCAATGAA	GATGTGGGGCATCCAAAGTGAA	-	chrX	20042891	-	chrX	3311926	16730965	+	chrX	3311926	+	chrX	20042891
GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGCG:1	GACAAAGACAAAGACAAAGACA	AGACAAAGACAAAGACAAAGCG	+	chrX	16983077	+	chrX	1053122	15929955	+	chrX	16983077	+	chrX	1053122
GTCAGATCTCCGAGGGGAGTGGATTCCTCGGCCCTAATCAAAAAGGTTC:1	GTCAGATCTCCGAGGGGAGTGG	TCGGCCCTAATCAAAAAGGTTC	-	chr3L	1711077	-	chr3L	1711021	56	+	chr3L	1711021	+	chr3L	1711077
GATTTTGTATTTCCCATGTAACCTTTTTTAAAATTGATCTATTGAT:1	GATTTTGTATTTCCCATGTAAC	TTTTTAAAATTGATCTATTGAT	+	chr2L	8003057	+	chr2L	8003110	53	+	chr2L	8003057	+	chr2L	8003110
AGAAATTCTGTCGTTCTCACAAATTGTGCGTGGTAAATAAAGGCAAACTAATTCAGCCATTGCATTTGTGA:1	AGAAATTCTGTCGTTCTCACAA	AATTCAGCCATTGCATTTGTGA	-	chr2R	18992182	-	chr2R	18992045	137	+	chr2R	18992045	+	chr2R	18992182
GTAGAGCTAGTGTAGCTCATGCTCAAACGAGTATATTAATCTGTTATCAAATCGCCTTTGACCGAAATATAACTA:1	GTAGAGCTAGTGTAGCTCATGC	GCCTTTGACCGAAATATAACTA	+	chr2L	6503386	+	chr2L	6503467	81	+	chr2L	6503386	+	chr2L	6503467
GCTTGGCAATGGTGCTTCCAATTCTCAGAGCGAGGCACTTCTTG:1	GCTTGGCAATGGTGCTTCCAAT	TCTCAGAGCGAGGCACTTCTTG	-	chr2R	18538027	-	chr2R	18533416	4611	+	chr2R	18533416	+	chr2R	18538027
AGCTGAATGGCAACAGTACACCCAACAAGTCGCGAAAAACAATCCATACGTGGAGATAAGACCCGCATATCT:1	AGCTGAATGGCAACAGTACACC	TGGAGATAAGACCCGCATATCT	-	chr2L	21099713	-	chr2L	8385783	12713930	+	chr2L	8385783	+	chr2L	21099713
AATTCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTCATCGTTGATCGCTACCATTG:1	AATTCGTGACTTTAAATATTTA	TCATCGTTGATCGCTACCATTG	-	chrX	17629768	-	chrX	17633080	3312	+	chrX	17633080	+	chrX	17629768
AATAATTTCATTCGGCTATTAGTACATACACACAGGTATTGATAACTCTGAAGCATAACATCTTGAATAAAATTT:1	AATAATTTCATTCGGCTATTAG	CATAACATCTTGAATAAAATTT	-	chr2R	24351506	-	chr2R	24351425	81	+	chr2R	24351425	+	chr2R	24351506
GAGCGCGAAAACTTTTCAGTCCTTCAAAAAAAGTTGCTGTTGAGACTGCCAGCGGAAGCGGAAACGTTTT:1	GAGCGCGAAAACTTTTCAGTCC	CCAGCGGAAGCGGAAACGTTTT	-	chr3R	28107093	-	chr3R	28107016	77	+	chr3R	28107016	+	chr3R	28107093
ACAGCTGTTTGCTACACTAGTACGATAGATTGCTGGTTCATGATTGTACTCAATTTTAAGTGTCTTTAC:1	ACAGCTGTTTGCTACACTAGTA	ACTCAATTTTAAGTGTCTTTAC	+	chr2L	22548944	+	chr2L	22550163	1219	+	chr2L	22548944	+	chr2L	22550163
CGGGCAATAGGGAGAAAGCAAAGCGATAAATTAAAGTGCTTACANATGGATTGTGTAGTGAGGTATTTA:1	CGGGCAATAGGGAGAAAGCAAA	GGATTGTGTAGTGAGGTATTTA	+	chr2L	4192058	+	chr2L	21742528	17550470	+	chr2L	4192058	+	chr2L	21742528
TCGCTTGACGTTTTTTTATTTTTTTTTTGGT:1	TCGCTTGACGTTTTTTTATTTT	GTTTTTTTATTTTTTTTTTGGT	-	chr3R	10972675	-	chr3R	13892084	2919409	+	chr3R	13892084	+	chr3R	10972675
TACCAACTATAAATAAGAAATGGTGGATTGGTTTTAAATGAAATGCGAAAATACAGTGCCACAGCTGGAAAAGAA:1	TACCAACTATAAATAAGAAATG	CAGTGCCACAGCTGGAAAAGAA	-	chr3L	11703255	-	chr3L	11703175	80	+	chr3L	11703175	+	chr3L	11703255
TCACATTNTGCAAAATGGAGTTATAAAAATAGACGGTCTNCACTAACAAAACTGAAANACCACTACCAACTACAA:1	TCACATTNTGCAAAATGGAGTT	GAAANACCACTACCAACTACAA	+	chr3R	19444770	+	chr3R	18973870	470900	+	chr3R	19444770	+	chr3R	18973870
GTTGCGTTGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	GTTGCGTTGCGTTGTGTTGTGT	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	9084340	+	chr2L	16217660	7133320	+	chr2L	9084340	+	chr2L	16217660
CTATAAGGTTCCAAAACATAATATATGTATGAAATCTTTGAAACTTGGACTTAAAATAACTAACAGGTCTAACCT:1	CTATAAGGTTCCAAAACATAAT	AAATAACTAACAGGTCTAACCT	+	chrX	18429525	+	chrX	18434836	5311	+	chrX	18429525	+	chrX	18434836
GCAACATTCACTGCAATTGCAGTTTAAATGGCTTTTGGTCATTTACCTTTTGGCGCTGCGTGAGTTT:1	GCAACATTCACTGCAATTGCAG	CCTTTTGGCGCTGCGTGAGTTT	+	chr3L	1581175	+	chr3L	1581501	326	+	chr3L	1581175	+	chr3L	1581501
TTCATGTATGGCATTGTCCTCGTCATGCTTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGGTTGGATGTGTTTGGCCAA:1	TTCATGTATGGCATTGTCCTCG	CTGGTTGGATGTGTTTGGCCAA	+	chr3R	18766796	+	chr3R	18766874	78	+	chr3R	18766796	+	chr3R	18766874
CTTAACAGGCTACGTGTTTTCTATGAATTTCTTACTGTGTGGAGCCTCCTAGAGGCAAGGAGCACCCACTGGG:1	CTTAACAGGCTACGTGTTTTCT	GAGGCAAGGAGCACCCACTGGG	-	chr3R	30482950	-	chr3R	30480484	2466	+	chr3R	30480484	+	chr3R	30482950
TGCTCGTCGTGTGGTTGTTGTTGCAGTTACACACTAAATTACAGTCAATTACATTGGGGGGAAAGAGAGAAAAGG:1	TGCTCGTCGTGTGGTTGTTGTT	TTGGGGGGAAAGAGAGAAAAGG	-	chr2L	702937	-	chr2L	702861	76	+	chr2L	702861	+	chr2L	702937
CAAAAGTCAATGACTGTTGTTCGGGGGAGGGAAGATATATGGTAATGTGATATTGGGTCCAAGTACTCGGCACA:1	CAAAAGTCAATGACTGTTGTTC	TTGGGTCCAAGTACTCGGCACA	-	chr2R	18582012	-	chr2R	18575825	6187	+	chr2R	18575825	+	chr2R	18582012
AAAACAGCGTGAGAGGGGGGAAAATGTTCGAACTGCCCCCGGTTAAATAATGAAAAATTGAAAAAAAGAAGAACG:1	AAAACAGCGTGAGAGGGGGGAA	AAAATTGAAAAAAAGAAGAACG	-	chr3L	11258555	-	chr3L	6841820	4416735	+	chr3L	6841820	+	chr3L	11258555
AGCGAAGAAATCACAATAAATAATGCAAACGGACAAGGCGACAACTAAATTAATAACGAGAAAACAACCGCAAGA:1	AGCGAAGAAATCACAATAAATA	TAACGAGAAAACAACCGCAAGA	+	chr3R	5809112	+	chr3R	5809353	241	+	chr3R	5809112	+	chr3R	5809353
ATCCATATAACTTTTTATGTTCAATTGATTCAGGAGAATTTTTGGATATCAGAATATTGCTCATTTGATTTCCGC:1	ATCCATATAACTTTTTATGTTC	ATATTGCTCATTTGATTTCCGC	+	chr3R	26370353	+	chr3R	26370438	85	+	chr3R	26370353	+	chr3R	26370438
TGCATTGTCATTGAATTGTGAGGGGAATGGCATTCGCTGATTACGCTGCACATTAATTTAACCATTCCATTCTG:1	TGCATTGTCATTGAATTGTGAG	TTAATTTAACCATTCCATTCTG	-	chr3R	6610211	-	chr3R	6610060	151	+	chr3R	6610060	+	chr3R	6610211
ACTCCTTGGCCTTCCTTGAACCCTATGTCCGGTCACATTATGCCGANATGGTATTTTAAA:1	ACTCCTTGGCCTTCCTTGAACC	TATGCCGANATGGTATTTTAAA	+	chrX	20275366	+	chrX	20275847	481	+	chrX	20275366	+	chrX	20275847
ATTAAACGTAAACTACACAAGGATATGCAGGGGTCCTGG:1	ATTAAACGTAAACTACACAAGG	CAAGGATATGCAGGGGTCCTGG	-	chr3R	11765333	-	chr3R	10123813	1641520	+	chr3R	10123813	+	chr3R	11765333
AAACAAACAAACCAAGAAAATCGCAATTGAGAAAGGTCCAGAGTCTGAAGATCC:1	AAACAAACAAACCAAGAAAATC	AAGGTCCAGAGTCTGAAGATCC	-	chr3L	14735502	-	chr3L	13116413	1619089	+	chr3L	13116413	+	chr3L	14735502
CGAAAAAAGAAAAAGGTAAATGTGTTTAAAAACTATGTAAAAGGTCATTTCCAGCCGGGGGAGAGCTCTGTTACA:1	CGAAAAAAGAAAAAGGTAAATG	GCCGGGGGAGAGCTCTGTTACA	+	chr3L	14417546	+	chr3L	14417637	91	+	chr3L	14417546	+	chr3L	14417637
TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	28831802	-	chr3R	21907535	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
TATTTCAATCTCTTGCGGTTGTTTTTTCGTTTTTAATTTAGTTGTCGCCTTGTCCGTTTGCATTTTTTATTGTG:1	TATTTCAATCTCTTGCGGTTGT	TCCGTTTGCATTTTTTATTGTG	-	chr3R	5809363	-	chr3R	5809123	240	+	chr3R	5809123	+	chr3R	5809363
AANCAAAATCAAGCTGCCAAGCCAAGTGAAACACNANATGATAGGAAGAGGATGTCGCTGGAATGGT:1	AANCAAAATCAAGCTGCCAAGC	AAGAGGATGTCGCTGGAATGGT	+	chr2R	11009848	+	chr2R	11019014	9166	+	chr2R	11009848	+	chr2R	11019014
CCATCGAGTTTGCATTGAACTTAAACAACAAGACCCACAACCAAGATCCAAGACTCCAAACTCTAGACTCCGCGA:1	CCATCGAGTTTGCATTGAACTT	CTCCAAACTCTAGACTCCGCGA	-	chrX	19176295	-	chrX	19176211	84	+	chrX	19176211	+	chrX	19176295
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCAACGAGTCCCGAAGATTACCCACTGT:1	ACACAACACAACACAACACAAC	AGTCCCGAAGATTACCCACTGT	+	chr3R	21907534	+	chr3R	30179072	8271538	+	chr3R	21907534	+	chr3R	30179072
GACCAGCTAACCACGCTCCTGGAATACCACCCAGACCGCCAATAACTTTTCTGATAATATCTGGGAATCACCCGG:1	GACCAGCTAACCACGCTCCTGG	ATAATATCTGGGAATCACCCGG	+	chr3R	15073733	+	chr3R	31632319	16558586	+	chr3R	15073733	+	chr3R	31632319
AGCAGCAACAACAGCAACAGCAGCAACAACATCGGCAAACACGAGCAAATTACGTTCATTTCATAATC:1	AGCAGCAACAACAGCAACAGCA	AAATTACGTTCATTTCATAATC	-	chr2R	15767475	-	chr2R	8590098	7177377	+	chr2R	8590098	+	chr2R	15767475
CAACCGATTAGTTACCGCCTTAGACAATGCGTTCACTAGGCTAAGAAGCTAGACG:1	CAACCGATTAGTTACCGCCTTA	CACTAGGCTAAGAAGCTAGACG	-	chr3R	29032833	-	chr3R	29032776	57	+	chr3R	29032776	+	chr3R	29032833
CATTGGGCAAGGAGATTCCCCCAGGTCCTTAGCTCCTGCTCGCTTCCTAATCGTATTGAGCTTATACATTTTCCA:1	CATTGGGCAAGGAGATTCCCCC	TATTGAGCTTATACATTTTCCA	+	chr2R	16962266	+	chr2R	16962343	77	+	chr2R	16962266	+	chr2R	16962343
TCAATTCGCAGCCCTCTCTAATTGATTTAGCATTGCTTTCTCCTGCAAATATCTGGTTGCTTCTACCTACATATA:1	TCAATTCGCAGCCCTCTCTAAT	TGGTTGCTTCTACCTACATATA	-	chrX	547900	-	chrX	547656	244	+	chrX	547656	+	chrX	547900
CGCTGACGNAGGGAGTTACGAAATTTACGATGGAGNAATATGGGCAAAATAACAGCGGGAATGATAGTGGTGTGG:1	CGCTGACGNAGGGAGTTACGAA	AGCGGGAATGATAGTGGTGTGG	-	chrX	12275636	-	chrX	2529534	9746102	+	chrX	2529534	+	chrX	12275636
AAGCCTAGAGAAAGATGATACATATGTTCTTTATACACACTATTAAGAATGTAATAACTAAGTAAATAGTACTTT:1	AAGCCTAGAGAAAGATGATACA	ATAACTAAGTAAATAGTACTTT	-	chr3R	18501685	-	chr3R	18501604	81	+	chr3R	18501604	+	chr3R	18501685
GAAAGATCTCTCTTTATTAGAAATTTTAAATAATATATCTCACTAGCGTTTAAGATAAGTTTCCAAAAGTGTAGG:1	GAAAGATCTCTCTTTATTAGAA	GATAAGTTTCCAAAAGTGTAGG	+	chr3L	16450021	+	chr3L	16450106	85	+	chr3L	16450021	+	chr3L	16450106
CATTAAATTTATATATATTACGTGAAATTACTAGTTGTTTCTCTGTATCCAAGTCTTTTGTGTGTTTGTATCTAT:1	CATTAAATTTATATATATTACG	TCTTTTGTGTGTTTGTATCTAT	-	chrX	16533889	-	chrX	16533809	80	+	chrX	16533809	+	chrX	16533889
AGCTCAAATTCANTCACAGCCTGAACCAAGNANATGTTNACAATGTCAGCAAGCTAGTTACCCACAAT:1	AGCTCAAATTCANTCACAGCCT	CAGCAAGCTAGTTACCCACAAT	+	chr2L	10644374	+	chr2L	10642028	2346	+	chr2L	10644374	+	chr2L	10642028
CTCATCGCCCATCAAGTGNAGATCCGCTGATCAGGGCTTTGNATANCTACAAGAACATAAGACTGAGG:1	CTCATCGCCCATCAAGTGNAGA	CTACAAGAACATAAGACTGAGG	+	chr3R	25832709	+	chr3R	25841884	9175	+	chr3R	25832709	+	chr3R	25841884
CAATCAACCCCAGCTCTAATACGTAGCTGCAAAAAGCAGACCTATGTCACAGAACAAAAACCAAAAAGCAA:1	CAATCAACCCCAGCTCTAATAC	CAGAACAAAAACCAAAAAGCAA	+	chr3R	23874873	+	chr3R	17484575	6390298	+	chr3R	23874873	+	chr3R	17484575
TTTTATGCTTATTACTTTGATGTAAGATTTAATGTAATGTGCATTTTAAAAGTGAGGAGATAAGTTGTTCTAAGA:1	TTTTATGCTTATTACTTTGATG	GAGGAGATAAGTTGTTCTAAGA	+	chr3R	7320438	+	chr3R	7320526	88	+	chr3R	7320438	+	chr3R	7320526
CTTCAGTTAAGTAAGAGTGTATGCAAACAATAGAAAAGACTTAGAAAAATAATTTTAAAAAAAAATNATTTTGCA:1	CTTCAGTTAAGTAAGAGTGTAT	TTTAAAAAAAAATNATTTTGCA	-	chr2L	7872968	-	chr2L	5842869	2030099	+	chr2L	5842869	+	chr2L	7872968
CATGNATTCTCCCGAGAATATCNATGCNGAGAATATCCANGGAAGTGTCTTTAGATCGCGGACGGCATGG:1	CATGNATTCTCCCGAGAATATC	CTTTAGATCGCGGACGGCATGG	+	chr2R	4602848	+	chr2R	4603198	350	+	chr2R	4602848	+	chr2R	4603198
ATATATATTTTTGGGACACTTTTCAAGGTTCGAGGCACTTCATTGAACTCTCTTCTGTCGTCTTTCTTTCTTCCA:2	ATATATATTTTTGGGACACTTT	TCTGTCGTCTTTCTTTCTTCCA	-	chr2L	19147397	-	chr2L	19147282	115	+	chr2L	19147282	+	chr2L	19147397
GAGAGAGCAACTCCTATGCCAACATAAATGGTATCAGAGCACGCCTTGGCCAAAAAGA:1	GAGAGAGCAACTCCTATGCCAA	GAGCACGCCTTGGCCAAAAAGA	+	chr2L	10120219	+	chr2L	147891	9972328	+	chr2L	10120219	+	chr2L	147891
TGTGCCAAAGAAAGTAAACCCTTAAAAACTAAAGATGATGACAGTATATGGAGATGCTGATCAATCTCTTTGTAC:2	TGTGCCAAAGAAAGTAAACCCT	ATGCTGATCAATCTCTTTGTAC	-	chr3R	6484160	-	chr3R	6484067	93	+	chr3R	6484067	+	chr3R	6484160
GGAACCTATAGACTATAACCACTGCCATNAACCACTTTTATCATGGCCCAACAATTCTGGCCATCCTTATTTCGA:1	GGAACCTATAGACTATAACCAC	ATTCTGGCCATCCTTATTTCGA	+	chr2L	13622143	+	chr2L	13622242	99	+	chr2L	13622143	+	chr2L	13622242
CCTTATTTAACTTAAGGCTTGCCAAGTGGGGATATCAATATCTCATTCGGAACCGTT:1	CCTTATTTAACTTAAGGCTTGC	CAATATCTCATTCGGAACCGTT	+	chrX	22660587	+	chrX	22660653	66	+	chrX	22660587	+	chrX	22660653
GCATATCCGTTGGCCAGAAGAATGTTTGTGTATATGTAGGCAGCCCANGAATGTTTAACAAGCTACCNGAGG:1	GCATATCCGTTGGCCAGAAGAA	ATGTTTAACAAGCTACCNGAGG	-	chr3R	24426540	-	chr3R	24426286	254	+	chr3R	24426286	+	chr3R	24426540
TTGCATTTGCAGTTGCATNAATAGTTTGGCCAATCATTTGGGCNAGGTTNTTGTATTTAATTCAACTAGCAGGAC:1	TTGCATTTGCAGTTGCATNAAT	TATTTAATTCAACTAGCAGGAC	-	chr3R	14253792	-	chr3R	14253713	79	+	chr3R	14253713	+	chr3R	14253792
AGGAGACGAGAGAACTTGCAATGAGAGAATACAAATAGCTTGAAAAGAGTTTAATGATTTG:1	AGGAGACGAGAGAACTTGCAAT	TTGAAAAGAGTTTAATGATTTG	+	chr3R	3267455	+	chr3R	3267260	195	+	chr3R	3267455	+	chr3R	3267260
GGCGAAAGAGCGAGGAAGGAGGGGGACACAAAAACACACACACACACGCACTTACTAAACCCCAGCGACACACA:1	GGCGAAAGAGCGAGGAAGGAGG	TACTAAACCCCAGCGACACACA	+	chr3L	4133959	+	chr3L	9949917	5815958	+	chr3L	4133959	+	chr3L	9949917
GAAAATGCCCACCACTTAGGGGTGTGTGTANNNANAGCAAGAGTCCGTCCCTCCAGAGCTGTCAAATTGCGATCC:1	GAAAATGCCCACCACTTAGGGG	CAGAGCTGTCAAATTGCGATCC	+	chr3L	2573314	+	chr3L	2573406	92	+	chr3L	2573314	+	chr3L	2573406
AGCAAGAGCAGCACATGCAACACATCCCCCGGTGAGCACGTGTCGTGCGCTTGACCACAAAATGTTGCATGT:1	AGCAAGAGCAGCACATGCAACA	TTGACCACAAAATGTTGCATGT	-	chr3R	17227314	-	chr3R	26242109	9014795	+	chr3R	26242109	+	chr3R	17227314
GAACGAAAACAGTTGGGAACAGCAGGTGCAGGTAGAGCGGAGATGTTGGGAGAAAAATTCAGCTCTCTAGCTCGA:1	GAACGAAAACAGTTGGGAACAG	AAAATTCAGCTCTCTAGCTCGA	-	chr2R	8657835	-	chr2R	8657758	77	+	chr2R	8657758	+	chr2R	8657835
GTTCAGCAGGTAATCATCGCCAAAATTGTTGTGGGGCGAGCTGAATCGAAGTGCTTTTTTTTATTAATGTTGTAC:1	GTTCAGCAGGTAATCATCGCCA	CTTTTTTTTATTAATGTTGTAC	+	chrX	17630116	+	chrX	17632229	2113	+	chrX	17630116	+	chrX	17632229
ATCATCAGGATGCAGTTGACGAGAATTGTGGTGATGATGCNTAGGGAAAATCTAAGGAAGAAGTGGAA:1	ATCATCAGGATGCAGTTGACGA	AAAATCTAAGGAAGAAGTGGAA	+	chrX	16513748	+	chrX	10999850	5513898	+	chrX	16513748	+	chrX	10999850
GTAAAATTTATGCAATTATTAATTTAACACTCCTGCAACACTGCCCTGTTTTCAAGGCCTATGATAAAGGTAAAG:1	GTAAAATTTATGCAATTATTAA	AAGGCCTATGATAAAGGTAAAG	+	chr3R	7050345	+	chr3R	27481432	20431087	+	chr3R	7050345	+	chr3R	27481432
ACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAGCACAACACAACACAACACAACACAACAC:1	ACACAACACAACACACCACAAC	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
CGTATTTATTAAGACAGGTTCTTCTACAGAATCACCTCCAGTCATTAGGTCATCCATATAGAA:1	CGTATTTATTAAGACAGGTTCT	TCATTAGGTCATCCATATAGAA	-	chr3R	19446594	-	chr3R	19445608	986	+	chr3R	19445608	+	chr3R	19446594
ACTCATCTGCGTTGCGTGTTTTTATAGTCAGCGATTGTGGCATCGACATTGCGTCATC:1	ACTCATCTGCGTTGCGTGTTTT	GTGGCATCGACATTGCGTCATC	-	chr3L	18360183	-	chr3L	6036764	12323419	+	chr3L	6036764	+	chr3L	18360183
TAATGTTCAGGCTAGATTAATCATGATAAATAATACTAGGGCTGTGAATCTATATCATAAGGCTTTGGTACCGTA:1	TAATGTTCAGGCTAGATTAATC	ATCATAAGGCTTTGGTACCGTA	-	chrX	20962439	-	chrX	20956997	5442	+	chrX	20956997	+	chrX	20962439
ATTGCCTTTTTCCCCATTCTGTTTGCATTTCTAGCAATTGATAAAAATATTTCTTTTGGCAAATGCTTATGATAA:1	ATTGCCTTTTTCCCCATTCTGT	TTTTGGCAAATGCTTATGATAA	+	chr3L	5104488	+	chr3L	5124622	20134	+	chr3L	5104488	+	chr3L	5124622
TATAGCTANATTCCTGGTTTTCCTAACACATTTTTGANNNNAGTGAAATATTTTTTTCAACNTACATATGACATA:1	TATAGCTANATTCCTGGTTTTC	TTTTCAACNTACATATGACATA	-	chr3R	13974612	-	chr3R	13974535	77	+	chr3R	13974535	+	chr3R	13974612
CTTCCTTTGAGGCCGCTGATGATGACGGTGCGGAGTTGCTCATGTCCCAATCCC:1	CTTCCTTTGAGGCCGCTGATGA	GAGTTGCTCATGTCCCAATCCC	-	chr3L	3566026	-	chr3L	3565971	55	+	chr3L	3565971	+	chr3L	3566026
TGGCGAAATATTTGCTTATCAACCGAAAAAGGGTGATAACACTTTGATTAATATAAGCGAGCTAAATGGAAAGG:1	TGGCGAAATATTTGCTTATCAA	ATAAGCGAGCTAAATGGAAAGG	+	chr2R	23243274	+	chr2R	23243361	87	+	chr2R	23243274	+	chr2R	23243361
ATGGTTACCCCAACGCGGGCTAACGTGGCCAGACATTAACAAGGAAGAATCTTTGGAAACTAGGAAGCAGCTGCG:1	ATGGTTACCCCAACGCGGGCTA	TGGAAACTAGGAAGCAGCTGCG	+	chr3R	26782667	+	chr3R	31555377	4772710	+	chr3R	26782667	+	chr3R	31555377
CAATGCCACCCAAAAATCCAGCCCCCCCATCCATGCACATTTCGATTTCAAATCAAAATGACAACGA:1	CAATGCCACCCAAAAATCCAGC	TTTCAAATCAAAATGACAACGA	-	chr2R	17163719	-	chr2R	10921743	6241976	+	chr2R	10921743	+	chr2R	17163719
AAAGTCGAATGAAAATGCAATTTTCAAAAGCAAAACAAACAATTGTTGATATGCTGCCAAAGAGAG:1	AAAGTCGAATGAAAATGCAATT	GTTGATATGCTGCCAAAGAGAG	-	chr2L	4068871	-	chr2L	4066055	2816	+	chr2L	4066055	+	chr2L	4068871
AACTAAAACTATAACTTTGATATAGTTAAAGCAAATATAAATATATGAATTAAAGCAAATTTTCGAATATGCTTT:1	AACTAAAACTATAACTTTGATA	AGCAAATTTTCGAATATGCTTT	-	chr3R	14898595	-	chr3R	14898475	120	+	chr3R	14898475	+	chr3R	14898595
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGA:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	GAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGA	+	chr3L	22908067	+	chr3L	19220634	3687433	+	chr3L	22908067	+	chr3L	19220634
CAATTTTCGGACGAAATTGAAATTTTAATAAACATTTTGGCGCCTTGTGATAATATTTACTTTTACAACTATTTA:2	CAATTTTCGGACGAAATTGAAA	TATTTACTTTTACAACTATTTA	-	chr3L	482364	-	chr3L	482285	79	+	chr3L	482285	+	chr3L	482364
AATACTTGCTAANTGAAAAAGTGAAAAACANGNACAAANAGAAAGTACCCAACGATCGGTTTCAGTTGTTCAT:1	AATACTTGCTAANTGAAAAAGT	ACGATCGGTTTCAGTTGTTCAT	+	chr3L	9344210	+	chr3L	9344286	76	+	chr3L	9344210	+	chr3L	9344286
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534
TTCTTTAAACTGTCATCCCTTATACCATTTCGTCATCATGATTTGTATCATGAGCGATGATGCTGTTTCCATAGC:1	TTCTTTAAACTGTCATCCCTTA	GCGATGATGCTGTTTCCATAGC	-	chr2R	19779934	-	chr2R	19776611	3323	+	chr2R	19776611	+	chr2R	19779934
TGTTTTAATAAATATATGTATGTATATAAACACCCTATTTGCATAAATAAAATCGGTTGAACATTCCGTTT:1	TGTTTTAATAAATATATGTATG	AAATCGGTTGAACATTCCGTTT	+	chrX	6445331	+	chrX	6451085	5754	+	chrX	6445331	+	chrX	6451085
CATACGTATGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGCATTTATGTATATGCAAAAGTAAT:1	CATACGTATGTGTGTGTGTGTG	TTTATGTATATGCAAAAGTAAT	+	chrX	15483496	+	chrX	13898738	1584758	+	chrX	15483496	+	chrX	13898738
CGATTGCCCGAAAAAATGAGTCTTGGAGAATCTGTCAAAGTTGCAACTGCAGCAGCCTTCAAA:1	CGATTGCCCGAAAAAATGAGTC	TGCAACTGCAGCAGCCTTCAAA	+	chr3L	4430170	+	chr3L	14396236	9966066	+	chr3L	4430170	+	chr3L	14396236
TACATGATGAACGTTCCATCCCAGAGTCTGACTCTTAAATATATATGNAGCCAGATAAATANTAATCTCAGGAGA:1	TACATGATGAACGTTCCATCCC	GATAAATANTAATCTCAGGAGA	-	chr2R	5909733	-	chr2R	5902174	7559	+	chr2R	5902174	+	chr2R	5909733
ACACGTTTGGCACATCGAACCCAAGCCCCACCCACCCTAAACACACGCACACACACACACACAAGTA:1	ACACGTTTGGCACATCGAACCC	CGCACACACACACACACAAGTA	+	chr3L	5221372	+	chr3L	4363755	857617	+	chr3L	5221372	+	chr3L	4363755
TATAAAAATAAATATAAGCTAATTTACCTAATCCCATCAATCCAATTACACACTTCACATACTGTCCTCTAAT:1	TATAAAAATAAATATAAGCTAA	ACTTCACATACTGTCCTCTAAT	+	chr3L	21634948	+	chr3L	19371767	2263181	+	chr3L	21634948	+	chr3L	19371767
CGTTTATATTTACACCCCCCTTACTCACCCACTGCTGCAGCTCACGAAACGTGCTCGGCATGCTCGAGTGAGG:1	CGTTTATATTTACACCCCCCTT	TGCTCGGCATGCTCGAGTGAGG	+	chr2R	18880365	+	chr2R	18880448	83	+	chr2R	18880365	+	chr2R	18880448
AATTTTATTCAAGAACTTATAATAGTTATAGATAGTTACTACCAACTAGAGTCATTTATCATGCCAAATTTCCCG:1	AATTTTATTCAAGAACTTATAA	ATTTATCATGCCAAATTTCCCG	+	chr3L	13477036	+	chr3L	13477113	77	+	chr3L	13477036	+	chr3L	13477113
ACCCATAGATGGCGAAAGGACCCAGGAACAGCGGGCACGAGCCAGAGTCTGTAAGTAAAGGGTTGATATGGG:1	ACCCATAGATGGCGAAAGGACC	GTAAGTAAAGGGTTGATATGGG	+	chr3R	11922758	+	chr3R	15218702	3295944	+	chr3R	11922758	+	chr3R	15218702
CAAGTCAATTTCCAGTTGGCAAACTTCTTGTAGAGGATTTCACAGAGTTCTCAGT:1	CAAGTCAATTTCCAGTTGGCAA	AGGATTTCACAGAGTTCTCAGT	-	chrX	21247995	-	chrX	21247903	92	+	chrX	21247903	+	chrX	21247995
CGTCATTGCGCCACCAAGCTCTGATATGAACTGATTGCATATTGCAGTGATTAAATTTACAGAGAAACAAATAAT:1	CGTCATTGCGCCACCAAGCTCT	AATTTACAGAGAAACAAATAAT	-	chr2R	15700365	-	chr2R	15700250	115	+	chr2R	15700250	+	chr2R	15700365
GAGCTCATAAAAGTTCTGGCCACCAGGCCCATATACATATATATATGTATGCAGATCGCTGCCTGCACTAATTGG:1	GAGCTCATAAAAGTTCTGGCCA	GATCGCTGCCTGCACTAATTGG	+	chr2L	17911971	+	chr2L	17914149	2178	+	chr2L	17911971	+	chr2L	17914149
GACTCCACTCGACTTCACCTGGCAGGCAGGCAGGCTCCCCAGGATTTTCCTTGGAAAATGGCACAAAAGT:1	GACTCCACTCGACTTCACCTGG	CCTTGGAAAATGGCACAAAAGT	+	chr2R	23175045	+	chr2R	23175117	72	+	chr2R	23175045	+	chr2R	23175117
GGATAGCACTTCACACCGACTTCAGGCTAGAGTTTATGCATTATCAAGACAGTTTGAGTGAGAGATGGGGAA:1	GGATAGCACTTCACACCGACTT	AGTTTGAGTGAGAGATGGGGAA	+	chr3R	25431956	+	chr3R	25432043	87	+	chr3R	25431956	+	chr3R	25432043
GCTCATTTCGATCTTAAAAACCATAGAATATTGATTTTTGGTATATTATTTCGAAGTCAAAATATGATAATTTAG:1	GCTCATTTCGATCTTAAAAACC	AAGTCAAAATATGATAATTTAG	-	chr2R	10318629	-	chr2R	10318543	86	+	chr2R	10318543	+	chr2R	10318629
AGTCACATAATAATTAACAACTTCATTAAAAACCATGACAACAAAGTCAAAGACTTTGGCCGGCTAGAAATCATC:1	AGTCACATAATAATTAACAACT	CTTTGGCCGGCTAGAAATCATC	-	chr3L	27369447	-	chr3L	27368902	545	+	chr3L	27368902	+	chr3L	27369447
CACATATACACTGAGAAAACTTTTAAGTATCTTTTAATATTAATTCAAATCAAAACAGCTTCTAACATGCAGTTG:1	CACATATACACTGAGAAAACTT	AACAGCTTCTAACATGCAGTTG	+	chr2R	18926530	+	chr2R	18926617	87	+	chr2R	18926530	+	chr2R	18926617
GGTGCAAATCGATGTTTTTTTTGTGTGCACTTTCCCAGTGCCTTGGAGGCTTCTACAATCGTCCAAGTGTATAG:1	GGTGCAAATCGATGTTTTTTTT	CTACAATCGTCCAAGTGTATAG	+	chr3R	27679961	+	chr3R	27680083	122	+	chr3R	27679961	+	chr3R	27680083
TGCTAGTTGAATTAAATACAACAACCTGGCCCAAATGATTGGCCAAACTATTGATGCAACTGCAAATGCAA:1	TGCTAGTTGAATTAAATACAAC	ATTGATGCAACTGCAAATGCAA	+	chr3R	14253717	+	chr3R	14253792	75	+	chr3R	14253717	+	chr3R	14253792
ACAGTTGCTTTCAGAGGTTTCTTTTATATTTATGTGAACATAGGAAATGAGCTAACTTTGATCGCCCAAGTCCTA:1	ACAGTTGCTTTCAGAGGTTTCT	AACTTTGATCGCCCAAGTCCTA	-	chr2R	13817778	-	chr2R	13817660	118	+	chr2R	13817660	+	chr2R	13817778
TTTCGAATNAGTCTCAAATCGAGTCATTGCGGCAGNGATGCGAATCGCCAGCACTGAAAAAAAGTATCTTAGCC:1	TTTCGAATNAGTCTCAAATCGA	ACTGAAAAAAAGTATCTTAGCC	+	chr3R	10595712	+	chr3R	13861915	3266203	+	chr3R	10595712	+	chr3R	13861915
AGAGATTAGAGCTCAGATCTGCGTAGTAGGCCATGACAAAGCGCAGATCGCTGGACGACGCATTTGTTAGTCAG:1	AGAGATTAGAGCTCAGATCTGC	GGACGACGCATTTGTTAGTCAG	+	chr3L	1463416	+	chr3L	1463496	80	+	chr3L	1463416	+	chr3L	1463496
GTCCTGAATAATGCAGAGACTCCCGATTCCATATCTTCTAAATGTGTGCTTGCTGATGGTGTCCACGTTCCAGG:1	GTCCTGAATAATGCAGAGACTC	CTGATGGTGTCCACGTTCCAGG	-	chr3L	9263983	-	chr3L	1796260	7467723	+	chr3L	1796260	+	chr3L	9263983
AATAAGTTAAGCGAATACAAAAACATTTCTTACACTACAGAGATACTCAATTAAATTGTAAATTTTAATCTCTAT:1	AATAAGTTAAGCGAATACAAAA	AATTGTAAATTTTAATCTCTAT	-	chr2L	12693926	-	chr2L	12693849	77	+	chr2L	12693849	+	chr2L	12693926
ATCCATAATAACAATGATTTCCATTAAATATTTTAGTTAGTTTTTAAAAGGTGCCAGGCCATGAGCNTTCTAATT:1	ATCCATAATAACAATGATTTCC	CCAGGCCATGAGCNTTCTAATT	+	chr2L	764564	+	chr2L	764664	100	+	chr2L	764564	+	chr2L	764664
AAAAAATNATGTTAAATTGTTCGTCACGTACGCAAATTGNAGCAACAACAAAAGTAANATAAAAAAGTTTTCCCC:1	AAAAAATNATGTTAAATTGTTC	GTAANATAAAAAAGTTTTCCCC	+	chr3L	11253294	+	chr3L	19687869	8434575	+	chr3L	11253294	+	chr3L	19687869
ATGTTTCAAGCTCTGATAACTGATAACAGAGGGTCAGTTTTCATTACAATACTCGCAGGAAATCATTACAACAT:1	ATGTTTCAAGCTCTGATAACTG	TCGCAGGAAATCATTACAACAT	+	chr3R	23626347	+	chr3R	23626445	98	+	chr3R	23626347	+	chr3R	23626445
ATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCA:1	ATTTGAGAGCCAGTACATTGCA	TGCTCTCTATCATCTTCATCCA	-	chr3R	19449476	-	chr3R	19448591	885	+	chr3R	19448591	+	chr3R	19449476
GGTTTATACACACATAGCTATATATGTGTCAGCTCGTTGCGACTGGCCA:1	GGTTTATACACACATAGCTATA	GTCAGCTCGTTGCGACTGGCCA	-	chr3L	20283466	-	chr3L	20283412	54	+	chr3L	20283412	+	chr3L	20283466
TAAAAAGAAAATAAACACGAAAATACAAATATTAAAAACAAGAAAAATCAAAGTGGCAGAGTTGCCACCCGGCGA:1	TAAAAAGAAAATAAACACGAAA	TGGCAGAGTTGCCACCCGGCGA	-	chrX	5769061	-	chrX	10619202	4850141	+	chrX	10619202	+	chrX	5769061
CTAGAGAGCTGAATTTTTNTCCCAACATCTCCGCTCTACCTGCNCCTGCNGTTCCCAACTGTTTTCGTT:1	CTAGAGAGCTGAATTTTTNTCC	GCNGTTCCCAACTGTTTTCGTT	+	chr2R	8657763	+	chr2R	8657834	71	+	chr2R	8657763	+	chr2R	8657834
TTCTGGCACCCCATCGCGAAGTCGTAAGACTCCTGGCAAAGTGCCGCGAATGAGCTTCCATC:1	TTCTGGCACCCCATCGCGAAGT	GTGCCGCGAATGAGCTTCCATC	-	chr3R	31531161	-	chr3R	31530847	314	+	chr3R	31530847	+	chr3R	31531161
TATGGGGCAAGTCAAATAAGGTTATCCACAAAATGCGAGGAATGCGAGC:1	TATGGGGCAAGTCAAATAAGGT	ACAAAATGCGAGGAATGCGAGC	+	chr3R	12568523	+	chr3R	12568577	54	+	chr3R	12568523	+	chr3R	12568577
ATCCGGCAATAATAAAAACTTATTTCAAAGTTTGTGAATTTGTCAAATATATTATATTGTAGTTATAAATTATAG:1	ATCCGGCAATAATAAAAACTTA	ATATTGTAGTTATAAATTATAG	-	chr3R	13625800	-	chr3R	13625719	81	+	chr3R	13625719	+	chr3R	13625800
AACACAAGCCATGTTCGGCAAACATCGTGTTGACGGACAGAGGTAATTTGCCAGTACCAAAAACGAAAGTGAAAG:1	AACACAAGCCATGTTCGGCAAA	GTACCAAAAACGAAAGTGAAAG	-	chr2R	7101707	-	chr2R	7101612	95	+	chr2R	7101612	+	chr2R	7101707
ACCAAGTATGTCAGGTGCTGGAATCAGAAGACCTTCATTGAGAGTTGTACACCGGGGGAAATTTTCAGAT:1	ACCAAGTATGTCAGGTGCTGGA	ACACCGGGGGAAATTTTCAGAT	+	chr3L	9076935	+	chr3L	9084490	7555	+	chr3L	9076935	+	chr3L	9084490
CGACTGATTTCCATAATTATTTAATTTCCTTTTTTCTGAAATTGAAANCAAGTACCGAAAGGCAGGACCAAAAAC:1	CGACTGATTTCCATAATTATTT	ACCGAAAGGCAGGACCAAAAAC	-	chr2L	14369248	-	chr2L	14369132	116	+	chr2L	14369132	+	chr2L	14369248
GTTGTGTATTGATTGAAATACTCATTATTTTATNGCAAACTGAAAGCCTTTCT:1	GTTGTGTATTGATTGAAATACT	ATNGCAAACTGAAAGCCTTTCT	+	chr3R	30262598	+	chr3R	30262673	75	+	chr3R	30262598	+	chr3R	30262673
AACTAGGAGTTGGCTGGAACGCCCAGGATACTCCGCTGGATGTGGCCAATCGCAA:1	AACTAGGAGTTGGCTGGAACGC	CGCTGGATGTGGCCAATCGCAA	+	chr3R	21761143	+	chr3R	21768515	7372	+	chr3R	21761143	+	chr3R	21768515
GGGATCCCCGGTAACGGATTGCGTGTTGATTGTTTTGAATAAATTTCAACTTCAAAGATGGTTTCCTTTTGAAG:1	GGGATCCCCGGTAACGGATTGC	CAAAGATGGTTTCCTTTTGAAG	-	chr2R	15133577	-	chr2R	15133499	78	+	chr2R	15133499	+	chr2R	15133577
CTGGTGAAATGCGAAACTCTCATTAATCACGAAATCAATGCAATTTACCTTGCATTAAATGAGGCACAGCATGGC:1	CTGGTGAAATGCGAAACTCTCA	ATTAAATGAGGCACAGCATGGC	-	chr3R	6739292	-	chr3R	6737505	1787	+	chr3R	6737505	+	chr3R	6739292
AGTCAGAGGATAATCCAGCATAATAATAATCTTTGGGGGAAAGGTGCGAAATGGCTAGCCGACCCAAAAGA:1	AGTCAGAGGATAATCCAGCATA	AATGGCTAGCCGACCCAAAAGA	+	chr3R	19446458	+	chr3R	19446545	87	+	chr3R	19446458	+	chr3R	19446545
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACGAGACGAGACCGAAAGGGAAAAAAACACTTTA:1	CACAACACAACACAACACAACA	CGAAAGGGAAAAAAACACTTTA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	9620986	12286549	+	chr3R	21907535	+	chr3R	9620986
ATCTGTAGTTTGGGAATACACGAAATATCATTTCACTTGAAAGTCCCGCATTTCACCTAACAGAGTGGTTAAATA:1	ATCTGTAGTTTGGGAATACACG	CACCTAACAGAGTGGTTAAATA	+	chrX	3986883	+	chrX	3994516	7633	+	chrX	3986883	+	chrX	3994516
ATGAGAATAATTTCAATTTAAAATACCATTTCGGCATAATGTGACCGGACATAGGGTTCAAGGAAGGCCAAGGA:1	ATGAGAATAATTTCAATTTAAA	AGGGTTCAAGGAAGGCCAAGGA	-	chrX	20275863	-	chrX	20275368	495	+	chrX	20275368	+	chrX	20275863
TGCAAACGAGATTAATTGATGAGACAGGGAAACCGAAGCCCAAATGGGCAATGCCAAAGCCCCCAATCT:1	TGCAAACGAGATTAATTGATGA	GCAATGCCAAAGCCCCCAATCT	+	chr2L	14803902	+	chr2L	14809099	5197	+	chr2L	14803902	+	chr2L	14809099
CAACACCACCCACATAAATTCCAAGTACATGCCGAACTAAAATCTCAGCTAGCCGCTCTGTGGTCACTGCAAA:1	CAACACCACCCACATAAATTCC	GCCGCTCTGTGGTCACTGCAAA	-	chr2R	23129935	-	chr2R	9325963	13803972	+	chr2R	9325963	+	chr2R	23129935
TTAGCAAAAGAAAAACTGAAAATCACATAATTTTGATGTTTCAATCGACGATTGATTTTGCCATGCTTTCGATT:1	TTAGCAAAAGAAAAACTGAAAA	TGATTTTGCCATGCTTTCGATT	+	chr3R	5919625	+	chr3R	5919766	141	+	chr3R	5919625	+	chr3R	5919766
CTGTTGCACGCGAAAAACTTTGCGATAACCAAGCTACTCACTCACTCACTCCATTTTCAGATACAACATCTCCTG:1	CTGTTGCACGCGAAAAACTTTG	TTTTCAGATACAACATCTCCTG	-	chr3R	27779361	-	chr3R	27779281	80	+	chr3R	27779281	+	chr3R	27779361
AGCGTTCAATTTAACTTCGTATCACTGACTACCCGCGGAGCCGAGAAACCTTTGTACATGGTGTGATTTTAATGG:1	AGCGTTCAATTTAACTTCGTAT	GTACATGGTGTGATTTTAATGG	-	chrX	806880	-	chrX	806784	96	+	chrX	806784	+	chrX	806880
GAGAAATGCAAGTTTCAATTAAGATATTTCAATCGAGAGTGTGATGANATTAAAGTAGAGGATAGAANAATATTT:1	GAGAAATGCAAGTTTCAATTAA	AGTAGAGGATAGAANAATATTT	-	chr2L	19674021	-	chr2L	19652587	21434	+	chr2L	19652587	+	chr2L	19674021
ATATCAATGGGTGAAAATCTCCTCCGCACTCCGCATCCGCACACCGNCCGCCACCAACAGNGTTGCAACATATG:1	ATATCAATGGGTGAAAATCTCC	ACCAACAGNGTTGCAACATATG	+	chr3L	13657769	+	chr3L	13657862	93	+	chr3L	13657769	+	chr3L	13657862
CATTTTTGATGGGTTTCAATGCGCCCCCTGCAGCTGTCAGCATGTCGTTAACACAGCCAAATGGCTAGAAA:1	CATTTTTGATGGGTTTCAATGC	AACACAGCCAAATGGCTAGAAA	-	chr2R	5841773	-	chr2R	21359778	15518005	+	chr2R	21359778	+	chr2R	5841773
CACAAATTATTTGCAGCTNATCAGCGCGTTGGCCGTTGTCCNTTANTATGGGCATTTTGTTTTGTTTTGTTTGTT:1	CACAAATTATTTGCAGCTNATC	ATTTTGTTTTGTTTTGTTTGTT	+	chr3R	29353642	+	chr3R	9027899	20325743	+	chr3R	29353642	+	chr3R	9027899
CTAATTAACATTGTCCTGTTCGCCAACTTGGGATCGGCCATCGCAGCGCCACGCCCCCACCAATTAACCATAATT:1	CTAATTAACATTGTCCTGTTCG	CCCCCACCAATTAACCATAATT	-	chr2R	5791899	-	chr2R	15421305	9629406	+	chr2R	15421305	+	chr2R	5791899
ATCGAGAACGGCACAACATACAAAGGCAAACAAATTGGCGAAGAAGGCACAAAATGTTATTGCAACAAGGAGCA:1	ATCGAGAACGGCACAACATACA	AATGTTATTGCAACAAGGAGCA	+	chr2R	22644771	+	chr2R	20678395	1966376	+	chr2R	22644771	+	chr2R	20678395
AACAAGTATTTAAACAAACAAGGCGGAAACACATAAACAAAATTCCATAAGGGAGGCATTTTCCATTAAGCCTG:1	AACAAGTATTTAAACAAACAAG	GAGGCATTTTCCATTAAGCCTG	+	chr2L	7493674	+	chr2L	7493884	210	+	chr2L	7493674	+	chr2L	7493884
CTTGGAGCTTCTCAGGATTAGGTGACTCACATATGTGAATACGTCCATTGTTGTGCCGTCTTCATAAGCACCGCC:1	CTTGGAGCTTCTCAGGATTAGG	TGCCGTCTTCATAAGCACCGCC	+	chr3L	23693453	+	chr3L	27365710	3672257	+	chr3L	23693453	+	chr3L	27365710
CTTGTTTATGTGCATCTTACATGACATTGGATACTAAAAATGTTCATACGCAAGTAATGAGTAATCCAAGCCATT:1	CTTGTTTATGTGCATCTTACAT	GTAATGAGTAATCCAAGCCATT	+	chr2L	11413303	+	chr2L	11413427	124	+	chr2L	11413303	+	chr2L	11413427
TATTGGCACTTAAAAAATTAATTGAAATTAATTGCCAATTAAACAACTGTATTGCTGGGCCACAGAAAAATGCTT:1	TATTGGCACTTAAAAAATTAAT	GCTGGGCCACAGAAAAATGCTT	-	chr2L	4154506	-	chr2L	4154315	191	+	chr2L	4154315	+	chr2L	4154506
GCGAAGGTGTAAATGATTCTTAAGCAAAAACTTAGGNCACTGGGGGAAGCTTGAAAAACAAACATCTTAAAATT:1	GCGAAGGTGTAAATGATTCTTA	GAAAAACAAACATCTTAAAATT	+	chr2L	3497856	+	chr2L	3497933	77	+	chr2L	3497856	+	chr2L	3497933
TGTTTCTGTGCGGGGGAGTTTTACGGCAGATGCTTANAACTACGTTTTATTTTCATTTTGTAAGAATTGAGCGA:1	TGTTTCTGTGCGGGGGAGTTTT	TCATTTTGTAAGAATTGAGCGA	+	chr2L	4293999	+	chr2L	4294090	91	+	chr2L	4293999	+	chr2L	4294090
TATGTTGGGTCCTCCGGACTCCTTGCAGCCATNTCTTTTTCCCCCAAAGCTGTTTCTTGCTTTTT:1	TATGTTGGGTCCTCCGGACTCC	CCAAAGCTGTTTCTTGCTTTTT	+	chr3R	19953972	+	chr3R	19954039	67	+	chr3R	19953972	+	chr3R	19954039
TTTGTATTTTTAATTTTCAATTAATTT:1	TTTGTATTTTTAATTTTCAATT	ATTTTTAATTTTCAATTAATTT	+	chrX	13554887	+	chrX	17531055	3976168	+	chrX	13554887	+	chrX	17531055
TATGTCGGCACTGGGATCAAGCATGTACCACTGATCGAGCCTAGCCCTCTCACAGCACTTCCCAGTTCTCTGCTT:1	TATGTCGGCACTGGGATCAAGC	AGCACTTCCCAGTTCTCTGCTT	+	chr3L	27390699	+	chr3L	27390778	79	+	chr3L	27390699	+	chr3L	27390778
TTGTTTGATTCAATTATCTCTTTCAATTGTTGTTTCGAAGTGTAGCAAAGCCAAGGACTAAACTTAAGTACTTTT:1	TTGTTTGATTCAATTATCTCTT	AGGACTAAACTTAAGTACTTTT	-	chr2L	9733667	-	chr2L	9733575	92	+	chr2L	9733575	+	chr2L	9733667
AATGGCAAACGCAATGCATACTCATATTATAACTTTTCCATCTTCCATCAATCTTGTTGGCGAGTAATTA:1	AATGGCAAACGCAATGCATACT	CAATCTTGTTGGCGAGTAATTA	+	chr3L	21799964	+	chr3L	21800044	80	+	chr3L	21799964	+	chr3L	21800044
AAGTGTATTCTAGGTCTTGAGTTGTCCGCCCAGCTGTCCTTCCTTCATTCGGTGTGATTTTGTTGTTGGCTTC:1	AAGTGTATTCTAGGTCTTGAGT	GTGTGATTTTGTTGTTGGCTTC	-	chr3L	3257287	-	chr3L	3257112	175	+	chr3L	3257112	+	chr3L	3257287
TCATGCTGCCCAGGGACTTCATAAAGTCCTGAAGCTGACAAAGAGCGCATAATTGCCGGGACTTGATTGAATTTC:1	TCATGCTGCCCAGGGACTTCAT	TGCCGGGACTTGATTGAATTTC	+	chr3L	19082056	+	chr3L	19082158	102	+	chr3L	19082056	+	chr3L	19082158
CAGTACCCTTCGGCCCCTTGCAGACANCAATTTCATGCACTAGCCGCATGCCAAAATGGGGCAGAATGTCTGGCG:1	CAGTACCCTTCGGCCCCTTGCA	AAATGGGGCAGAATGTCTGGCG	-	chr2R	21932324	-	chr2R	21932246	78	+	chr2R	21932246	+	chr2R	21932324
ATTGCTGCTAATCAGAAAAAAATTATTGCCCCGTTAAATGCTTGAATATATAATGACTGCCTCTCATTCTCTGTC:1	ATTGCTGCTAATCAGAAAAAAA	TGACTGCCTCTCATTCTCTGTC	+	chrX	22383294	+	chrX	22383375	81	+	chrX	22383294	+	chrX	22383375
ACATGGCGAAATCATGGTGCACAAATTAATTTTCATAGTATATTTTTTATGCGCTTAT:1	ACATGGCGAAATCATGGTGCAC	AGTATATTTTTTATGCGCTTAT	+	chr2L	13481468	+	chr2L	13482058	590	+	chr2L	13481468	+	chr2L	13482058
GTTTGACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTGTGGTTGTCTGCCGAATAGCNTTACTCTT:1	GTTTGACTTAAAGAGAAATTAA	TCTGCCGAATAGCNTTACTCTT	-	chr2R	13141646	-	chr2R	13136860	4786	+	chr2R	13136860	+	chr2R	13141646
ATCCGAAAGCCGTCAATCTTTCGATCAGCCGCACAATGGGTTACATTTCACGTTTGTTTTGCAGTAATTTCATTA:1	ATCCGAAAGCCGTCAATCTTTC	TTGTTTTGCAGTAATTTCATTA	+	chr2L	2826569	+	chr2L	2826654	85	+	chr2L	2826569	+	chr2L	2826654
TGCTGTCTGCAGTGCCAGCTCAACGTTCCACGGTTTCAGTCCAAAGTTTTGCTTTGCGGCAAATAAGCAGAAAA:1	TGCTGTCTGCAGTGCCAGCTCA	TTTGCGGCAAATAAGCAGAAAA	+	chr3R	12804813	+	chr3R	12805195	382	+	chr3R	12804813	+	chr3R	12805195
ACTGAAATAACAAATGTGTAAGAGGAGGAAAAGCCAGGGAAAAACTAGGGAATAGCATAGTGGGCAGCTGCAACA:1	ACTGAAATAACAAATGTGTAAG	AGCATAGTGGGCAGCTGCAACA	+	chr3L	9219244	+	chr3L	9219916	672	+	chr3L	9219244	+	chr3L	9219916
ATTTATAGTTGCTATTAGGCTTATAAAGCACATAAAATTTATCCGTATTCACCTTATTCCGCTCCTGTTGGCAAT:1	ATTTATAGTTGCTATTAGGCTT	TTATTCCGCTCCTGTTGGCAAT	-	chr2L	11399605	-	chr2L	11399528	77	+	chr2L	11399528	+	chr2L	11399605
GCATTTGCAAACAGGTCAATAAACATCAAAGAAATATCATCAGAAGTGTTTCGCTTTAACTCGAGACTCCGGACA:1	GCATTTGCAAACAGGTCAATAA	CTTTAACTCGAGACTCCGGACA	+	chr2R	11066461	+	chr2R	11066539	78	+	chr2R	11066461	+	chr2R	11066539
AATCAAATCATTTTAAATCTCATTACCAATTTAAGGGTAAATCCAATCTGTCGCATATGATCGTTGATATGCCGC:1	AATCAAATCATTTTAAATCTCA	CATATGATCGTTGATATGCCGC	+	chrX	3620470	+	chrX	3620569	99	+	chrX	3620470	+	chrX	3620569
GTTCATTTTACACGTATATACACATTTATATGTACAATACATATGTGTATACTCATATCATCATGACATG:1	GTTCATTTTACACGTATATACA	ATACTCATATCATCATGACATG	+	chrX	318485	+	chrX	323566	5081	+	chrX	318485	+	chrX	323566
TGGAAAGCGACAAATGCGGTCAACAAAGAACGGGAAACCCTCGACGGACACAAAAGGCTAGCAAAGCGATTCGG:1	TGGAAAGCGACAAATGCGGTCA	AAAGGCTAGCAAAGCGATTCGG	-	chr3L	19124490	-	chr3L	19117044	7446	+	chr3L	19117044	+	chr3L	19124490
GTCGCCGGGCACATCATTAGCCGCATCCTCGTCCTCGCATTGCATTTTAAACTCACGTTTAAAGGGAA:1	GTCGCCGGGCACATCATTAGCC	TTAAACTCACGTTTAAAGGGAA	+	chr3R	16142688	+	chr3R	29043250	12900562	+	chr3R	16142688	+	chr3R	29043250
GTAAGTTCTCAAGTCTGGAAAAAAAGGGATGGTTTATAAATCAGAGGGTCCTTTTTCTCAGCTGCCACCGATGC:1	GTAAGTTCTCAAGTCTGGAAAA	TTTTCTCAGCTGCCACCGATGC	+	chr2L	10153236	+	chr2L	10153314	78	+	chr2L	10153236	+	chr2L	10153314
CAGTTCAGATATATGTATGTACTTCAATGACTTTCATCATGTGAAATGTGTAATTATATTGATTCAAAGTAAAA:1	CAGTTCAGATATATGTATGTAC	ATTATATTGATTCAAAGTAAAA	+	chr2L	19437530	+	chr2L	19437621	91	+	chr2L	19437530	+	chr2L	19437621
TAGGCGAACATGTGCGTGCGGTTGTGAGCGTGTTTTTGGGGCCAATTGGGCCAGAATATCCCGAAAAATA:1	TAGGCGAACATGTGCGTGCGGT	GGCCAGAATATCCCGAAAAATA	+	chr3R	16931433	+	chr3R	22941682	6010249	+	chr3R	16931433	+	chr3R	22941682
GGTTCCGAATGAGATATTGATATCCCCACTTGGCAAGCCTTAAGTTAAATAAGGTAAGCCCAGCTTAGTGCTGT:1	GGTTCCGAATGAGATATTGATA	GGTAAGCCCAGCTTAGTGCTGT	-	chrX	22660650	-	chrX	22660567	83	+	chrX	22660567	+	chrX	22660650
CCGGAAAANAGTTTTCCTAGGCAAGCGTAAAACAANTTCAACTTGAAAATGACTTCCGCTGGAAAAGTGAAAAG:1	CCGGAAAANAGTTTTCCTAGGC	CTTCCGCTGGAAAAGTGAAAAG	-	chr3R	12251889	-	chr3R	19821539	7569650	+	chr3R	19821539	+	chr3R	12251889
AGAAAATAACCAAGTCAAAAAAATTCCCTCTGGTAATTAGCTTTAAAAGTGCTAGTCGTATCCTTTGTTTTCATT:1	AGAAAATAACCAAGTCAAAAAA	AGTCGTATCCTTTGTTTTCATT	-	chrX	3502253	-	chrX	3493094	9159	+	chrX	3493094	+	chrX	3502253
TTTATTATAAGGCAATCTGGCCACTCACATTTTATTGCGACCATCATTCTGAGAATCCGTGCTGATGCCGATTTA:1	TTTATTATAAGGCAATCTGGCC	AATCCGTGCTGATGCCGATTTA	-	chr3L	19206879	-	chr3L	19206799	80	+	chr3L	19206799	+	chr3L	19206879
GTTCGGCATTCTTGGAATCTCGCGTCTTTGCTATGCTATGCTGCAGCATAGCGCTAAGGAAAACAGCAAGAAGA:1	GTTCGGCATTCTTGGAATCTCG	GCTAAGGAAAACAGCAAGAAGA	-	chr2L	16281433	-	chr2L	16280263	1170	+	chr2L	16280263	+	chr2L	16281433
GCGCTCCTTATCTGAGAGTGCTTTCTCTTTTTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGGGCACATTATTTCTTATGGCATCC:1	GCGCTCCTTATCTGAGAGTGCT	CACATTATTTCTTATGGCATCC	-	chr2L	17729344	-	chr2L	17727877	1467	+	chr2L	17727877	+	chr2L	17729344
AGTTTAAAATAATATTTCAAAACAAAATGATGAAATAAGAGTTTTCAAGCACATTGATATTTTGAATATTTAGTT:1	AGTTTAAAATAATATTTCAAAA	TTGATATTTTGAATATTTAGTT	-	chr3L	4908057	-	chr3L	4907981	76	+	chr3L	4907981	+	chr3L	4908057
TATTTAAATGTGCTTGCCGAACAAAAGAAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA:1	TATTTAAATGTGCTTGCCGAAC	AACAGCAGCAGCAGCAGCAGCA	+	chr2R	20302401	+	chr2R	10614678	9687723	+	chr2R	20302401	+	chr2R	10614678
GCAGAATANACACTGCGCGTCATCAGATTAGCGCCCCCAAATGCAGTTTTGAATTTAATTTAGGCCATGGGAAGA:1	GCAGAATANACACTGCGCGTCA	TTTAATTTAGGCCATGGGAAGA	+	chr2L	21396618	+	chr2L	21396853	235	+	chr2L	21396618	+	chr2L	21396853
TGAAGGGATTCACTCGCAGAAAATTCGTTTTGTTATCAAAAAAACAGATATTCTAATAAATTGTACTGTGACAAT:1	TGAAGGGATTCACTCGCAGAAA	TAATAAATTGTACTGTGACAAT	+	chr3L	5987040	+	chr3L	5987121	81	+	chr3L	5987040	+	chr3L	5987121
GTGTTGCAGACGCCCAAAAAGTGCAGCCGCCCAAAAGTGAGTATGTGTAAAGGTTAATAGCTATAC:1	GTGTTGCAGACGCCCAAAAAGT	GTGTAAAGGTTAATAGCTATAC	+	chr3L	9740192	+	chr3L	9740385	193	+	chr3L	9740192	+	chr3L	9740385
GACCATGACAGATGGAACTGAACCCAACTCGGTCATGGCATAT:1	GACCATGACAGATGGAACTGAA	ACCCAACTCGGTCATGGCATAT	-	chr3R	22185227	-	chr3R	22185162	65	+	chr3R	22185162	+	chr3R	22185227
ATTGACAAGATAAAACCGTACACAACACACAATTGGTGCCAAGCAGGCCACAGAGA:1	ATTGACAAGATAAAACCGTACA	GGTGCCAAGCAGGCCACAGAGA	+	chr3R	16179097	+	chr3R	16179201	104	+	chr3R	16179097	+	chr3R	16179201
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:3	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534
GCGGAGCGAGGAAATTACAGATGATATATATATATGTATATCACATTAGACAAACTATCCGCCATGCGACTGTTT:1	GCGGAGCGAGGAAATTACAGAT	ACTATCCGCCATGCGACTGTTT	+	chr2R	23819142	+	chr2R	23819237	95	+	chr2R	23819142	+	chr2R	23819237
GTGCCCTANGAAAGTTCTTTCAACAAGTTTGTGCCTTAAGTCTTTCGATTGTCTGCAAAATCAACCTCGAACTT:1	GTGCCCTANGAAAGTTCTTTCA	CTGCAAAATCAACCTCGAACTT	-	chr2L	4609155	-	chr2L	4601715	7440	+	chr2L	4601715	+	chr2L	4609155
ATGTTAATATCTTTTTTAGTGCATGATTCATATTTATTTCTAATATGAGATGTGTAAACCTGTGAAATTACATAG:1	ATGTTAATATCTTTTTTAGTGC	GTAAACCTGTGAAATTACATAG	-	chr3R	8099735	-	chr3R	8094430	5305	+	chr3R	8094430	+	chr3R	8099735
ACAACTTCATTAAAAACCNTGACAACAAAGTCAAAGACTTTNGCCNGCTAGAAATCATCAGAGAAATCGAA:1	ACAACTTCATTAAAAACCNTGA	AGAAATCATCAGAGAAATCGAA	-	chr3L	27369431	-	chr3L	27368890	541	+	chr3L	27368890	+	chr3L	27369431
TAATATTTATTATAAACATCTTGCAGTCTAAGTTAACACAAATATGTAAATCTATGCAGCTAACATTCCCGTTTC:1	TAATATTTATTATAAACATCTT	ATGCAGCTAACATTCCCGTTTC	+	chr2L	11665867	+	chr2L	11665945	78	+	chr2L	11665867	+	chr2L	11665945
ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAACGAACGCCTTCGATGGGCGGACC:1	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	GAACGCCTTCGATGGGCGGACC	-	chrX	7978952	-	chrX	6462077	1516875	+	chrX	6462077	+	chrX	7978952
ACACATGCATAGGAAAGTGTNACAAGGCCGCTNACTGACAGTNACATCAGCCACAACAACAACAAACAGCTGGCA:1	ACACATGCATAGGAAAGTGTNA	CAACAACAACAAACAGCTGGCA	-	chr2L	4156804	-	chr2L	2946528	1210276	+	chr2L	2946528	+	chr2L	4156804
CCACTATCACTTACATGTGCTTTCCAGCCCCTGAGATAATTTGAAATAAGCTTATGATGATATAGTCGTCAG:1	CCACTATCACTTACATGTGCTT	CTTATGATGATATAGTCGTCAG	-	chr3R	5001977	-	chr3R	5001512	465	+	chr3R	5001512	+	chr3R	5001977
ATAGCGATAAAAATTAGCAAGACAAACAATAGAACGAAGAGCAATAGNTCATAGGGTCTGAAACGCTTCTATAAA:1	ATAGCGATAAAAATTAGCAAGA	GGGTCTGAAACGCTTCTATAAA	+	chr3L	23127749	+	chr3L	23127936	187	+	chr3L	23127749	+	chr3L	23127936
ATCTCCTCTGCGAAAATATAGGAGCAGAATTTCTCAATTACGTTCTAAA:1	ATCTCCTCTGCGAAAATATAGG	AATTTCTCAATTACGTTCTAAA	+	chr2L	1486267	+	chr2L	8632453	7146186	+	chr2L	1486267	+	chr2L	8632453
GTAAATTTCAAGGTGTGTNTGACTAAGCCGTCAACAATTTCNGGGNTCCACGATTTGTTGTTGTCACAA:1	GTAAATTTCAAGGTGTGTNTGA	CCACGATTTGTTGTTGTCACAA	+	chr3R	15293184	+	chr3R	24105549	8812365	+	chr3R	15293184	+	chr3R	24105549
GCACTTAAATCGGAAAAATACATCTCAATAAAGATGTCTGTGTAGCTAGCTCAACGATGATGATGATGCATTGAA:1	GCACTTAAATCGGAAAAATACA	ACGATGATGATGATGCATTGAA	+	chr2R	23427777	+	chr2R	23427919	142	+	chr2R	23427777	+	chr2R	23427919
TTGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	TTGTGGTGTGTTGTGTTGTGTT	TGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	28831801	-	chr3R	21907535	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
CGGCATATGAGCTGTGGGCTGCAGCTGGTGCGGAATAGGATACATGGGACACAGATGGAGCG:1	CGGCATATGAGCTGTGGGCTGC	TACATGGGACACAGATGGAGCG	-	chrX	14189978	-	chrX	14189896	82	+	chrX	14189896	+	chrX	14189978
GAAACATGGCATTAGTCGCCATTTGTTTGCAGGCTCCGCCCCGCCAGNCGAGGTCACATTTNATTCACATATTTT:1	GAAACATGGCATTAGTCGCCAT	TCACATTTNATTCACATATTTT	+	chr2R	7153161	+	chr2R	7153247	86	+	chr2R	7153161	+	chr2R	7153247
GTTGCCATTTCCGATGGGCTCTTATTATTATCCGTAATCCGATGTCCGACGTAGAACGGCGCAGACGCGACTGAT:1	GTTGCCATTTCCGATGGGCTCT	GAACGGCGCAGACGCGACTGAT	+	chr3R	12392895	+	chr3R	12392995	100	+	chr3R	12392895	+	chr3R	12392995
AAACAAAAAAGATTTGTTTAATAGTTTCGCAACATGAAAAAATCAACAGCATTCCACACGGTTTAGCCCTTATTT:1	AAACAAAAAAGATTTGTTTAAT	CCACACGGTTTAGCCCTTATTT	-	chr2R	14922235	-	chr2R	14922159	76	+	chr2R	14922159	+	chr2R	14922235
ATTGATGGAAAATGTATAAGATGGGGGCATAACATCACAGCTTTCTTTGGTAAATAAATTGGGGGAAGTCTGTTT:1	ATTGATGGAAAATGTATAAGAT	ATAAATTGGGGGAAGTCTGTTT	+	chr3L	3310306	+	chr3L	3310385	79	+	chr3L	3310306	+	chr3L	3310385
CTGCAGCCTCCACTTTGATGAGGATTGCTTNNNANGCTCCAGGGTAAAAAGGTGGGCAGTGCCATCGCTTCGCT:1	CTGCAGCCTCCACTTTGATGAG	TGGGCAGTGCCATCGCTTCGCT	-	chr2L	19740848	-	chr2L	19737380	3468	+	chr2L	19737380	+	chr2L	19740848
TGGATGGATGGATGGATGGTCTTCAATGTTTTTGCAGTCGCCAAAATTGCGCAAAACCCAGCTTTTGTTG:1	TGGATGGATGGATGGATGGTCT	GCGCAAAACCCAGCTTTTGTTG	+	chr2L	636864	+	chr2L	2829592	2192728	+	chr2L	636864	+	chr2L	2829592
GGCAGGACATTACATGGACGGATGGAGTAATGTGGGAATGTCCTGCAGGCTTCTGTCTGTGGTCTAANCTGCTCT:1	GGCAGGACATTACATGGACGGA	TGTCTGTGGTCTAANCTGCTCT	+	chr3L	12919290	+	chr3L	12924763	5473	+	chr3L	12919290	+	chr3L	12924763
AAGAAGAACGGTTAGAGTTACAATTCTTAAGAGAGAAATTTGAGATTTAATATATATTTTATTAAATTTAAATTA:1	AAGAAGAACGGTTAGAGTTACA	ATATTTTATTAAATTTAAATTA	+	chr3L	21776681	+	chr3L	21776768	87	+	chr3L	21776681	+	chr3L	21776768
GAACNAACTCAATTCGAAGTCGNCTAANCTAACAATAACNCACTCTGCGGCGCATCAATTTTACATCCATCCATA:1	GAACNAACTCAATTCGAAGTCG	ATCAATTTTACATCCATCCATA	+	chr2L	2358676	+	chr2L	19632914	17274238	+	chr2L	2358676	+	chr2L	19632914
GTCAAAGGAATTTATTTTNAGATTTATCTATAGCCGCCGGTGANATTCANCCTCTGGGGGGGGAATGACGCCAGC:1	GTCAAAGGAATTTATTTTNAGA	CTGGGGGGGGAATGACGCCAGC	-	chr2L	14613743	-	chr2L	14613442	301	+	chr2L	14613442	+	chr2L	14613743
CACCGTCCTCCTACACGAGCTCAGTGAGNTATCACATTCCATATTCAGACAATTTTTT:1	CACCGTCCTCCTACACGAGCTC	TTCCATATTCAGACAATTTTTT	-	chrX	19659727	-	chrX	13057299	6602428	+	chrX	13057299	+	chrX	19659727
AGGATCTCAAAATGGTCAGCNAGGAGGCCNGCAGGGAGGCTCCCAGGAAGG:1	AGGATCTCAAAATGGTCAGCNA	NGCAGGGAGGCTCCCAGGAAGG	+	chr2L	773687	+	chr2L	776663	2976	+	chr2L	773687	+	chr2L	776663
AACCTTGAATGAACGGGCAAATAAAACAGACGGTCTATGAAACGCAC:1	AACCTTGAATGAACGGGCAAAT	ACAGACGGTCTATGAAACGCAC	-	chr2R	25061422	-	chr2R	25061367	55	+	chr2R	25061367	+	chr2R	25061422
TATAATTGTAGAATATCTTATTCTTAAAACAAAAATCAGAACTTACAGGATCCTACACCTGCTCACCACCCATAT:1	TATAATTGTAGAATATCTTATT	TACACCTGCTCACCACCCATAT	-	chr2R	13566352	-	chr2R	13566272	80	+	chr2R	13566272	+	chr2R	13566352
AGAGTGATGATGATGTTGCTGCTGGCAGACCAAACGGCGGGGCT:1	AGAGTGATGATGATGTTGCTGC	TGGCAGACCAAACGGCGGGGCT	+	chr3R	31910834	+	chr3R	17782809	14128025	+	chr3R	31910834	+	chr3R	17782809
TTTATTTAAGTATAAACGNTTAATGTTCGGTTGCATTGCAANTTTNAAGCTGCACACTTTATTTTATGGATAGTA:1	TTTATTTAAGTATAAACGNTTA	ACACTTTATTTTATGGATAGTA	-	chr3R	27492496	-	chr3R	27492409	87	+	chr3R	27492409	+	chr3R	27492496
CCACCCTTCTCTTTGCCTTTCTCCTGCTCATGCACGCACCCACACAACGCACAGCAAAAACAATTGCAGACGACG:1	CCACCCTTCTCTTTGCCTTTCT	GCAAAAACAATTGCAGACGACG	+	chr3L	14178925	+	chr3L	5224674	8954251	+	chr3L	14178925	+	chr3L	5224674
TGGCCAAAGTGTGAAAACTGAAACCCATTTACGCAGGAAGCTGCTTTAAACTTAGCTGTCAACTTCAATTACTTT:1	TGGCCAAAGTGTGAAAACTGAA	AGCTGTCAACTTCAATTACTTT	+	chr3R	27041833	+	chr3R	27041923	90	+	chr3R	27041833	+	chr3R	27041923
TAGAGTCCAAACCTCGACCCGCCTGTAACTTTGACTGCACACGCATCGCCCCTCTTCCACGGACACTCACCTGAC:1	TAGAGTCCAAACCTCGACCCGC	CTTCCACGGACACTCACCTGAC	-	chr3L	6353488	-	chr3L	6353408	80	+	chr3L	6353408	+	chr3L	6353488
GGGAACTCATGACAGATGCACCTGCAACCTGCATCTTTTTTCATTACTCCTTTT:1	GGGAACTCATGACAGATGCACC	ATCTTTTTTCATTACTCCTTTT	+	chr3L	1109653	+	chr3L	1109720	67	+	chr3L	1109653	+	chr3L	1109720
GATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAA:1	GATTAGCTCTAACCTCACACGA	AACTTGACAAAAAATCCGCTAA	-	chr2L	22684595	-	chr2L	22679823	4772	+	chr2L	22679823	+	chr2L	22684595
AAATATGCATGCAAATAAGTGGCAGCCAAATCTGGTATCCAGCTAACAAGATGTCCCGAAAATTCGGCTCCACT:1	AAATATGCATGCAAATAAGTGG	GTCCCGAAAATTCGGCTCCACT	-	chr2L	325223	-	chr2L	325147	76	+	chr2L	325147	+	chr2L	325223
AAAAACAAACTTGAATGGCATAAAAAAAAAAGGAACAGAGGCATCTCTGGCAGAATTCCCTTCCATTCCG:1	AAAAACAAACTTGAATGGCATA	GGCAGAATTCCCTTCCATTCCG	+	chrX	604396	+	chrX	16689704	16085308	+	chrX	604396	+	chrX	16689704
GCCTGAATAATTTATATGATTCCTTTCTTTTAGTTGATTTAGTTGCCACAAACTTATTTGACTTACGATTGCT:1	GCCTGAATAATTTATATGATTC	ACTTATTTGACTTACGATTGCT	-	chr3R	9236563	-	chr3R	27235431	17998868	+	chr3R	27235431	+	chr3R	9236563
GGTGCGTTGAGCTTGCGGAGCTCTGGCTGGGCTTTTTTATTTTTCTTTTTTT:1	GGTGCGTTGAGCTTGCGGAGCT	GCTTTTTTATTTTTCTTTTTTT	-	chr3R	13739192	-	chr3R	22011222	8272030	+	chr3R	22011222	+	chr3R	13739192
TAAAGAAGTTACTTTATTGCTCCAAAAGCTATCAGTAGCAATCCTCAAAGTTGTACCACGGTGTGGCNTCCAC:1	TAAAGAAGTTACTTTATTGCTC	TGTACCACGGTGTGGCNTCCAC	-	chr2L	6021707	-	chr2L	6021631	76	+	chr2L	6021631	+	chr2L	6021707
TCAGTATGNAAAATGTAAGGGGTCTTCACCATGTCCTNNNNTGGAAATTTAAAGTTTTGTCNAGCATTAAAAGTT:1	TCAGTATGNAAAATGTAAGGGG	GTTTTGTCNAGCATTAAAAGTT	+	chr3L	22169484	+	chr3L	22169577	93	+	chr3L	22169484	+	chr3L	22169577
ATTTGACTCCTATAATTATCATCATTACTGAGNCTTGAATACTACGTTCAGTGCATACTCACTCTGNCGCCAT:1	ATTTGACTCCTATAATTATCAT	TGCATACTCACTCTGNCGCCAT	+	chr3L	21847436	+	chr3L	21847530	94	+	chr3L	21847436	+	chr3L	21847530
TAGGATTAGGGCACACATTTACTAAATGAAAGAAATGAGCTTAAAATTCAACCATATTATAAACATTCCTTAAAA:1	TAGGATTAGGGCACACATTTAC	ATATTATAAACATTCCTTAAAA	-	chr3R	12763213	-	chr3R	12763136	77	+	chr3R	12763136	+	chr3R	12763213
GATTAATTTGATAAAGGTGACAAGAAATTTGTCAGCTCAAAATATTTGCCTGTTGCTCCAATCTCCAAGTACA:1	GATTAATTTGATAAAGGTGACA	GTTGCTCCAATCTCCAAGTACA	-	chr2L	19304342	-	chr2L	19304242	100	+	chr2L	19304242	+	chr2L	19304342
AAAAAGTGTGGCAAGTGTNCATATGTGTCGCAAAGAATTCCNGGGNAAAACACTTTTCTTCTCAGTTTATACCCT:1	AAAAAGTGTGGCAAGTGTNCAT	TTTTCTTCTCAGTTTATACCCT	+	chr3L	9443539	+	chr3L	9445330	1791	+	chr3L	9443539	+	chr3L	9445330
TGTATATGACAGAGCGCAACAACGGCCACATGAAATGTAACCAGAATCGAGTGCAGTCGATGAACCCCATA:1	TGTATATGACAGAGCGCAACAA	AGTGCAGTCGATGAACCCCATA	+	chr2L	12647715	+	chr2L	12647793	78	+	chr2L	12647715	+	chr2L	12647793
CCTCTAGTGAAGTCTATTTCTCCCTGTCCANNNANTGTATTTACAAACAAAAAGGCCAGAGGTCCATGAAGGTGG:1	CCTCTAGTGAAGTCTATTTCTC	GGCCAGAGGTCCATGAAGGTGG	-	chr2L	12565468	-	chr2L	12558339	7129	+	chr2L	12558339	+	chr2L	12565468
TGTACCTATTGTGCCAACANCCCATATACGTCCCATCACCTATTTGCTGCATGCCACCATTTAAGCCCATTTCAG:1	TGTACCTATTGTGCCAACANCC	CCACCATTTAAGCCCATTTCAG	-	chr3R	7657217	-	chr3R	22524046	14866829	+	chr3R	22524046	+	chr3R	7657217
GGATGAGAATTGTCATCCTGCAAGATGGCATAAGGGGAATGATGATAAGGTCCGGGTGGCTAAA:1	GGATGAGAATTGTCATCCTGCA	TGATAAGGTCCGGGTGGCTAAA	+	chr3R	19447962	+	chr3R	19448028	66	+	chr3R	19447962	+	chr3R	19448028
AAATACTACATACAAGGCAAAAGTTTTTTAAAAAAAGGTTTAACAAATGGCTTATTTGAATGAATGTTTAATTG:1	AAATACTACATACAAGGCAAAA	TATTTGAATGAATGTTTAATTG	+	chr3L	18047715	+	chr3L	18056770	9055	+	chr3L	18047715	+	chr3L	18056770
ACAACTTAAAACTTTAAGATTTGTATAGTTTTCGAAGNGAAAATTNGCCGTAATCCTTTGTTAGGTTT:1	ACAACTTAAAACTTTAAGATTT	GCCGTAATCCTTTGTTAGGTTT	-	chr2L	13893706	-	chr2L	13892850	856	+	chr2L	13892850	+	chr2L	13893706
AAAACAAAACAAAACAAACCAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAANACAAAACAAAACAAAACAGAACACAAC:1	AAAACAAAACAAAACAAACCAA	ACAAAACAAAACAGAACACAAC	-	chr3R	23527770	-	chr3R	15417176	8110594	+	chr3R	15417176	+	chr3R	23527770
TATGTACATATATGCCATATACATATATACATATTCTACATGTGCAACGAGCTCTTTAAGCCGGGC:1	TATGTACATATATGCCATATAC	CAACGAGCTCTTTAAGCCGGGC	+	chrX	12224631	+	chrX	8832032	3392599	+	chrX	12224631	+	chrX	8832032
AGCCACACACACACACGCACACACACACACACACTATAGAAATTCACTTTGAT:1	AGCCACACACACACACGCACAC	CACTATAGAAATTCACTTTGAT	-	chr2L	8081816	-	chr2L	1692688	6389128	+	chr2L	1692688	+	chr2L	8081816
ACTGGAGGGCAAAAAGAATGAAAACACATTAGAAATGGCCAGTGGTCCCAGTGTCCCCGCTGTCCAC:1	ACTGGAGGGCAAAAAGAATGAA	TCCCAGTGTCCCCGCTGTCCAC	+	chr3R	27789112	+	chr3R	27789181	69	+	chr3R	27789112	+	chr3R	27789181
TTGAGTGTCGGGACTTTCCATGATAAAAAGTCAGGCTTGGCCAGCTGTCCC:1	TTGAGTGTCGGGACTTTCCATG	GTCAGGCTTGGCCAGCTGTCCC	+	chr2L	21381220	+	chr2L	21381299	79	+	chr2L	21381220	+	chr2L	21381299
TGTGAATATGGCTTCCAAAACCGCAGCCCAGAAACAAAACACGAAATCGTTGGTAGCAATACCAATAG:1	TGTGAATATGGCTTCCAAAACC	TCGTTGGTAGCAATACCAATAG	-	chr3L	4342507	-	chr3L	4342435	72	+	chr3L	4342435	+	chr3L	4342507
TTTTGTTTTGCTTAAACAAATAAGTTTGTTTACCAAAGTTCAGGCTGAGTGCGCTTCTTTGGGATTTATTTTTAC:1	TTTTGTTTTGCTTAAACAAATA	CTTCTTTGGGATTTATTTTTAC	+	chr2L	13887811	+	chr2L	14194789	306978	+	chr2L	13887811	+	chr2L	14194789
GACAAATAAAAAGCCAAAACTACAAAAACCAACCCCAAAAAATGTCANTGTCAATACCCATNTAATAAGTGAGTG:1	GACAAATAAAAAGCCAAAACTA	ATACCCATNTAATAAGTGAGTG	-	chr3R	11831610	-	chr3R	4602556	7229054	+	chr3R	4602556	+	chr3R	11831610
AGCACATCACTTTGCCTTTAACTTGAATGTGTGTGTGTAAGTAAGTAACCACCAACTCTGTGGCAGAGATGTTTG:1	AGCACATCACTTTGCCTTTAAC	AACTCTGTGGCAGAGATGTTTG	+	chr2R	14467304	+	chr2R	14476456	9152	+	chr2R	14467304	+	chr2R	14476456
CAACATCANCCACATCTATTGGAGCAGAAGGAACCNACTGAACCCAACCCAAGCTAGAGTACACTCAACAAAATA:1	CAACATCANCCACATCTATTGG	CTAGAGTACACTCAACAAAATA	+	chr2L	15468796	+	chr2L	15468881	85	+	chr2L	15468796	+	chr2L	15468881
TGACAACACTTTTGATAGACCATGACAGATGGAACTGAACCCAACTCGGTCATGGCATATTAAACCATCGCAAAT:1	TGACAACACTTTTGATAGACCA	GGCATATTAAACCATCGCAAAT	-	chr3R	22185244	-	chr3R	22185147	97	+	chr3R	22185147	+	chr3R	22185244
TTTCTTGGATTCCGAAGAAAGCTCTTCCCAAATCCCTATTCTAAAGTGAAGAATACCAGTATTTACAAAATAATT:1	TTTCTTGGATTCCGAAGAAAGC	TACCAGTATTTACAAAATAATT	-	chr2L	15453533	-	chr2L	15446064	7469	+	chr2L	15446064	+	chr2L	15453533
CCAACTTTTGGGGCGAATGTTTTTTGCCTAACACAAGCCATGTTCGGNAAACATCGTGTTGACGGACAGAGGTAA:1	CCAACTTTTGGGGCGAATGTTT	TCGTGTTGACGGACAGAGGTAA	-	chr2R	7101736	-	chr2R	7101641	95	+	chr2R	7101641	+	chr2R	7101736
TAAACTTACGTCAACTTTAAAGCATCTGACAGCAACTCAAATGCGATTGTTACGAAGAGCAACTC:1	TAAACTTACGTCAACTTTAAAG	CGATTGTTACGAAGAGCAACTC	-	chr2R	5491853	-	chr2R	5491722	131	+	chr2R	5491722	+	chr2R	5491853
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907536
CTTCTAGCGCTGTCTCATTTCCACTGGCTTTTTGCTCAGGGGCCAA:1	CTTCTAGCGCTGTCTCATTTCC	TGGCTTTTTGCTCAGGGGCCAA	-	chrX	22956694	-	chrX	6457421	16499273	+	chrX	6457421	+	chrX	22956694
TTGTCCACTTTGATGTGTTTGCGCAGCCAATTCCTAGACGCTGCCCTGCAAATAATTTGGCATTTCNATTTTGAG:1	TTGTCCACTTTGATGTGTTTGC	AATTTGGCATTTCNATTTTGAG	-	chr3R	25236345	-	chr3R	25236206	139	+	chr3R	25236206	+	chr3R	25236345
CTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAAACAACTGACTGACACCGTTAGCCANAAACTCAAT:1	CTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCC	CACCGTTAGCCANAAACTCAAT	-	chr2L	11086645	-	chr2L	7003796	4082849	+	chr2L	7003796	+	chr2L	11086645
AAGCAGGTCAAGTGCCACCGTGCCAAAGGTCAGCTTAAAGCACCTCAAATTCACATTTCTTTCTGACGTNGGCTT:1	AAGCAGGTCAAGTGCCACCGTG	CATTTCTTTCTGACGTNGGCTT	-	chr3R	19140741	-	chr3R	19140293	448	+	chr3R	19140293	+	chr3R	19140741
GCCACTATATAGCTCCGATGAAAGATAGCTACTNTTGCCATTATGACCACATTCTC:1	GCCACTATATAGCTCCGATGAA	TTGCCATTATGACCACATTCTC	-	chr2R	24899573	-	chr2R	14171454	10728119	+	chr2R	14171454	+	chr2R	24899573
TCTGCTGGTGATCCTTTGCACTCTCGACAGGCATTTGCTGATGCACTTGATGCAATTAACTCATCCNGGGTCAG:1	TCTGCTGGTGATCCTTTGCACT	CAATTAACTCATCCNGGGTCAG	-	chr3L	15621571	-	chr3L	6069383	9552188	+	chr3L	6069383	+	chr3L	15621571
AATGTAATTGACTGTANTTTAGTNTGTAACTGCNACAANAACCACACGACGAGCAAATTATGNTGTCTTTTTC:1	AATGTAATTGACTGTANTTTAG	AGCAAATTATGNTGTCTTTTTC	+	chr2L	702881	+	chr2L	702955	74	+	chr2L	702881	+	chr2L	702955
GGTCTAACTTTGGTGTCATTTTCAGCTTGGCCGGCGTTTAACCGCTCCACCACACCCCACCCCATTCATTGCCA:1	GGTCTAACTTTGGTGTCATTTT	CACCCCACCCCATTCATTGCCA	+	chr3R	19483494	+	chr3R	29621723	10138229	+	chr3R	19483494	+	chr3R	29621723
ATAACAAATATCGGGGTAGGGAACTGCCAGAAAGCTGGAAAGGGTATGCAAAGCGATTTGC:1	ATAACAAATATCGGGGTAGGGA	AAGGGTATGCAAAGCGATTTGC	-	chr3R	30077010	-	chr3R	4675429	25401581	+	chr3R	4675429	+	chr3R	30077010
TGAGTTTCATTTGGTGTATCACAGTTTTAATTGCTTTTGTTGCAGAGTCAAACAATTGTGGCCCATGTACTGGCT:1	TGAGTTTCATTTGGTGTATCAC	AATTGTGGCCCATGTACTGGCT	+	chr3L	26694930	+	chr3L	26695010	80	+	chr3L	26694930	+	chr3L	26695010
GTTGCAAAGGGAGGAGAAGTTAATGAAAAAGGTCNAAAAAGTTGATCCACATTGATCCGCCGACATCAAAGTCAG:1	GTTGCAAAGGGAGGAGAAGTTA	GATCCGCCGACATCAAAGTCAG	+	chr2R	13666826	+	chr2R	23312378	9645552	+	chr2R	13666826	+	chr2R	23312378
GGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGTGCCGTTG:1	GGATATAATCTCAGTCCTACGC	ACTTAAAGTGCATGTGCCGTTG	-	chr3R	28484359	-	chr3R	28486280	1921	+	chr3R	28486280	+	chr3R	28484359
TACAATCAGATTGAGAAGAGCTTCGTGCTCCATTTAGAGATCTTACATAGACAAATAAATTTAAAATTTTAAGCT:1	TACAATCAGATTGAGAAGAGCT	AATAAATTTAAAATTTTAAGCT	-	chr2R	13647103	-	chr2R	2770382	10876721	+	chr2R	2770382	+	chr2R	13647103
TTCAATATAAATCCTCTCTTTTGTGTTCGCTGACGTAATGGCATGTACTCGATCGCAATGCATTAACCTTCACCC:1	TTCAATATAAATCCTCTCTTTT	CGCAATGCATTAACCTTCACCC	-	chrX	22983028	-	chrX	22982845	183	+	chrX	22982845	+	chrX	22983028
AAATGTAAATAAAGTTTAAAAAAAAAATAACTTAATATGGGTCGAATGGGCGTACTCACTTCGAGTTGAAGTCAT:1	AAATGTAAATAAAGTTTAAAAA	ACTCACTTCGAGTTGAAGTCAT	+	chr2R	12643795	+	chr2R	12643871	76	+	chr2R	12643795	+	chr2R	12643871
AGTATAAGAATTTAATCTCATCGAAAACAACCGAAAAATTCATTTTGATAGTTTTTATTTTTTGAAACCAAAACA:1	AGTATAAGAATTTAATCTCATC	TTTATTTTTTGAAACCAAAACA	+	chr3R	26510505	+	chr3R	26519566	9061	+	chr3R	26510505	+	chr3R	26519566
AGCCTCCCATAACCCGCAATGTAACTTAATATTCGCAATTCGTATTTGCAATTTAAGATGTAGTACTAAATACTG:1	AGCCTCCCATAACCCGCAATGT	TAAGATGTAGTACTAAATACTG	-	chr2L	4819627	-	chr2L	4819504	123	+	chr2L	4819504	+	chr2L	4819627
TTTTTAAGTAAATTTAAGGATATATATATATATTTACAAAAAAGTACATCATATTTTTACTGCAACACACATA:1	TTTTTAAGTAAATTTAAGGATA	TATTTTTACTGCAACACACATA	-	chr2R	9734166	-	chr2R	9726617	7549	+	chr2R	9726617	+	chr2R	9734166
GCCCTGTGTGCGCTCCCCCTTCTCCATCGAATGCAAAGATTCTGACTCATTTTAACGCTTGCCCTAATGATACTA:1	GCCCTGTGTGCGCTCCCCCTTC	AACGCTTGCCCTAATGATACTA	-	chrX	16176283	-	chrX	16176206	77	+	chrX	16176206	+	chrX	16176283
AATCCCTCTAAGACTTGGTCGCCTGCACTCCTTTGCGCCATCAAACTGAGGAATTAAAA:1	AATCCCTCTAAGACTTGGTCGC	CCATCAAACTGAGGAATTAAAA	+	chr2L	10479406	+	chr2L	10479472	66	+	chr2L	10479406	+	chr2L	10479472
CTTCGTTNGAAAACTGGTCAGCTTCGTTGGGGTTT:1	CTTCGTTNGAAAACTGGTCAGC	CTGGTCAGCTTCGTTGGGGTTT	-	chrX	8424228	-	chrX	8423935	293	+	chrX	8423935	+	chrX	8424228
AGTGCAGAAAAAGAGTAAACTTTGCATATGCGCTTTCTCCATTCAGCGTGTCCATTTTGCAAATTTCACAGAC:1	AGTGCAGAAAAAGAGTAAACTT	CCATTTTGCAAATTTCACAGAC	+	chr3L	5683282	+	chr3L	5683367	85	+	chr3L	5683282	+	chr3L	5683367
AAAGTGTGACTTNGAAACGCTCTGTTGAAANTNTCTGANTTATTCAACATGTCATTGGGACTTATTAGCTTCGA:1	AAAGTGTGACTTNGAAACGCTC	CATTGGGACTTATTAGCTTCGA	-	chr2R	11672947	-	chr2R	11676376	3429	+	chr2R	11676376	+	chr2R	11672947
ATAGAAGAAATTCGAAATACTTGTATATGAGTTAATAACACGCAATATCATTGAACTCTTTACACTCCTGTCAAA:1	ATAGAAGAAATTCGAAATACTT	AACTCTTTACACTCCTGTCAAA	+	chr3R	20419290	+	chr3R	17626104	2793186	+	chr3R	20419290	+	chr3R	17626104
CCTGAGACACATAAATGTTGGTAGGTAGCTCCCTGAGATTAGGGCTCATCTTATCGGAAGGAGAACAGCTG:1	CCTGAGACACATAAATGTTGGT	CTTATCGGAAGGAGAACAGCTG	-	chr3L	21172966	-	chr3L	21172867	99	+	chr3L	21172867	+	chr3L	21172966
AGAAAGAAAGCTTCCTTTTANATACGTGCAAGNTCCAAGTTGNGTTTGTGTGATTCTGCGTGTGTGTGTGTGCAT:1	AGAAAGAAAGCTTCCTTTTANA	TTCTGCGTGTGTGTGTGTGCAT	-	chr3L	5247771	-	chr3L	17169930	11922159	+	chr3L	17169930	+	chr3L	5247771
CGATAGGCGGCAGGCCAAGTCCAAGAAGGCGGGCCGTAAACTTTTGCATATCAATAAATTTT:1	CGATAGGCGGCAGGCCAAGTCC	CTTTTGCATATCAATAAATTTT	+	chr2L	14068621	+	chr2L	14068688	67	+	chr2L	14068621	+	chr2L	14068688
TCAGCGAATGGAACAATGCCAGTTCCGTATTAATGTCGTACTGTAAGATTTCAGTTCATTTAATT:1	TCAGCGAATGGAACAATGCCAG	TAAGATTTCAGTTCATTTAATT	+	chrX	10361736	+	chrX	10361823	87	+	chrX	10361736	+	chrX	10361823
TATAAATTTAATTCCACCTTAGCAAATTCATGGCGGCCTGTAAAAATTTTATTGCATATTTGCAGGCGCGAAAA:1	TATAAATTTAATTCCACCTTAG	TGCATATTTGCAGGCGCGAAAA	-	chr2R	11024948	-	chr2R	11019883	5065	+	chr2R	11019883	+	chr2R	11024948
GAAAGCCAAACAGAGCCAGCCGGGATGGGACCGAAAGCCAGAAACAAAAGCACAACAA:1	GAAAGCCAAACAGAGCCAGCCG	GCCAGAAACAAAAGCACAACAA	+	chr2L	17191898	+	chr2L	17191966	68	+	chr2L	17191898	+	chr2L	17191966
AAATTCAGCGAAGAGCGTCAAAAAAAAAACACGAGAATGGACTTTTCTGGGTCCGGTCTT:1	AAATTCAGCGAAGAGCGTCAAA	GGACTTTTCTGGGTCCGGTCTT	+	chr3L	3450934	+	chr3L	3451007	73	+	chr3L	3450934	+	chr3L	3451007
ACTCAGTAACCACCTGAAGCCGGTCTAGACACTTTTGNCACATCTNCATCTGTCTGCCATTAAA:1	ACTCAGTAACCACCTGAAGCCG	TCTNCATCTGTCTGCCATTAAA	+	chr2L	16618616	+	chr2L	16618699	83	+	chr2L	16618616	+	chr2L	16618699
ATTCAGACCGATATCGAGATTTGTTGTGCTTTTTCGATTGGTTGGTCCAGTTTGCATCTGCTCCTGATCCAAT:1	ATTCAGACCGATATCGAGATTT	TTGCATCTGCTCCTGATCCAAT	+	chrX	12570851	+	chrX	16631382	4060531	+	chrX	12570851	+	chrX	16631382
CAACATTATTTAGGCACCCATGCATTCGGGCAAAGACAATTTCGCAGTCACCGCCCCGAAAGTTTGCATTT:1	CAACATTATTTAGGCACCCATG	ACCGCCCCGAAAGTTTGCATTT	-	chr3L	18328424	-	chr3L	18328300	124	+	chr3L	18328300	+	chr3L	18328424
CGATCTCAGTCAATATTTGTTTTAGTTAGGATAACCAAAAACTTTTTTGCATATTACACAGAAAACTAAGGGGAC:1	CGATCTCAGTCAATATTTGTTT	TTACACAGAAAACTAAGGGGAC	-	chr2L	17825136	-	chr2L	17819932	5204	+	chr2L	17819932	+	chr2L	17825136
GGACCCGCATTTAAATTTCACTAGTGGAATTCCGTAGGTGCAATGAGCAGGAATAATTGCGTCCTGTTCGAGCAC:1	GGACCCGCATTTAAATTTCACT	TAATTGCGTCCTGTTCGAGCAC	-	chr2R	8813978	-	chr2R	22818631	14004653	+	chr2R	22818631	+	chr2R	8813978
AGTTGAAGACTCAACGCCTTTCAGTTCTCATACACAGCCATTCAACTTGAAAGTTACAGACTCGACC:1	AGTTGAAGACTCAACGCCTTTC	CTTGAAAGTTACAGACTCGACC	-	chr3R	25796475	-	chr3R	25796404	71	+	chr3R	25796404	+	chr3R	25796475
CAGTAATTCTGGTAAAACCTTAAAACGACACATTTAGTAAATGAACTAAAATATGAGGAATGGGA:1	CAGTAATTCTGGTAAAACCTTA	AACTAAAATATGAGGAATGGGA	+	chr2L	16447838	+	chr2L	16447907	69	+	chr2L	16447838	+	chr2L	16447907
TTTCAGTGACATTCACCAAAAGCTGAAGAGCCCAGACTCATCTCCATCCTGTCAGATAAGCAACCATACTGAAG:1	TTTCAGTGACATTCACCAAAAG	CAGATAAGCAACCATACTGAAG	-	chr3L	18677991	-	chr3L	18677897	94	+	chr3L	18677897	+	chr3L	18677991
GAGTCCGAAGTCCTTGGAGGAGTAGAAGCCCAGTTTCAGTGCTTGGTGGGAATGTCAAAGAGTGGAGAGCTCTGA:1	GAGTCCGAAGTCCTTGGAGGAG	GTCAAAGAGTGGAGAGCTCTGA	+	chr2R	20031016	+	chr2R	20031109	93	+	chr2R	20031016	+	chr2R	20031109
ATTAATATATAAATTCGTGACAACGAAAAACGAAAACTATCGTAGTAGCATTGAAACATATAGTGTCAAATTTAG:1	ATTAATATATAAATTCGTGACA	AAACATATAGTGTCAAATTTAG	+	chr2R	13432968	+	chr2R	13433044	76	+	chr2R	13432968	+	chr2R	13433044
CATAAACTTGGACCACAAATCATCACCGGAACCGGAACAAAAGTTATGAATGAATGCGGAACTGAACTACCAAGG:2	CATAAACTTGGACCACAAATCA	ATGCGGAACTGAACTACCAAGG	-	chrX	6101043	-	chrX	6100912	131	+	chrX	6100912	+	chrX	6101043
CTGCAAAGTTGGTTCAAAAACTATATATTAAGTGATTAAAATTCTTTTTGAAATAATATTATTAAATNTCTAGAG:1	CTGCAAAGTTGGTTCAAAAACT	TAATATTATTAAATNTCTAGAG	-	chrX	11799119	-	chrX	11799033	86	+	chrX	11799033	+	chrX	11799119
GGCAACACAACAGCACACAATTGCACGGGCCCAAGGGNACAGGACNAACAAGGTTCAGGT:1	GGCAACACAACAGCACACAATT	ACAGGACNAACAAGGTTCAGGT	-	chr2L	10864476	-	chr2L	10862877	1599	+	chr2L	10862877	+	chr2L	10864476
CTCCCTAGTTTGATTCAAACCTGAACGTGTTCCATTCCTCTTCAGAAATTTTGCATCGAATTCGTGCTGTTAG:1	CTCCCTAGTTTGATTCAAACCT	TGCATCGAATTCGTGCTGTTAG	-	chr2L	17260976	-	chr2L	17260895	81	+	chr2L	17260895	+	chr2L	17260976
AGGTAATCCTCAGTGGTGGCAGTATGGTAGATATGACGCACCA:1	AGGTAATCCTCAGTGGTGGCAG	GTATGGTAGATATGACGCACCA	-	chr3R	13311045	-	chr3R	13313575	2530	+	chr3R	13313575	+	chr3R	13311045
AAAACGAAATGCTAATGGCCAGTTGATATGGCGCGCAATTGCCCAACTTTAGATTTCACCACCCAAGTTAC:1	AAAACGAAATGCTAATGGCCAG	TAGATTTCACCACCCAAGTTAC	+	chr3L	19217110	+	chr3L	19218024	914	+	chr3L	19217110	+	chr3L	19218024
ATCGTTTGACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTGTGGTTGTCTGCCGAATAGCCTTACTCTT:1	ATCGTTTGACTTAAAGAGAAAT	TCTGCCGAATAGCCTTACTCTT	-	chr2R	13141649	-	chr2R	13136860	4789	+	chr2R	13136860	+	chr2R	13141649
GTTAAAAANTAAAACTGAAATCAAGTCGAGTCGTGAACTGCGAAGCGACACCATCAACACATTCCAGAAGTGGGA:1	GTTAAAAANTAAAACTGAAATC	TCAACACATTCCAGAAGTGGGA	-	chr3L	9104283	-	chr3L	2118856	6985427	+	chr3L	2118856	+	chr3L	9104283
CAAACATTTACCAATGCTTATTAAAAACTATAGGAAAGCACTTCCGCTANGGGTCTCCTTCTGCAACTCCGATG:1	CAAACATTTACCAATGCTTATT	GTCTCCTTCTGCAACTCCGATG	-	chr3R	7932865	-	chr3R	10762410	2829545	+	chr3R	10762410	+	chr3R	7932865
ACTGTGAGTGCCGCATTGAGAGATGTCATGGGGCTAATGTGAAATTCGTACCGACGCAAATTGCCATTGCTCGA:1	ACTGTGAGTGCCGCATTGAGAG	GACGCAAATTGCCATTGCTCGA	+	chr3L	9918881	+	chr3L	9918975	94	+	chr3L	9918881	+	chr3L	9918975
GACCCAGCACACTCAATGCATAATAGCCATACATTATGATGTGCACGAAGGAGTTTA:1	GACCCAGCACACTCAATGCATA	ATGATGTGCACGAAGGAGTTTA	+	chr3L	11100909	+	chr3L	11102261	1352	+	chr3L	11100909	+	chr3L	11102261
AAACAAAAAATAAAAAAAAAGCGCAGGATTCCGAGAAGGAGGGCGCTTCGTAGGGGGGCGTGG:1	AAACAAAAAATAAAAAAAAAGC	GGCGCTTCGTAGGGGGGCGTGG	-	chr3L	14564170	-	chr3L	10510636	4053534	+	chr3L	10510636	+	chr3L	14564170
GAAGTCTATTTTAAGCTTAATCAAATCTATTGTTGTGTCGGCACAAAGGACTTAAGTAGCTAAA:1	GAAGTCTATTTTAAGCTTAATC	ACAAAGGACTTAAGTAGCTAAA	+	chr3R	15691315	+	chr3R	15691391	76	+	chr3R	15691315	+	chr3R	15691391
ATGCATTATTTAACCACTCTGTTAGGTGAAATGCGGGACTTTCAAGTGAAATGATATTTCGTGTATTCCCA:1	ATGCATTATTTAACCACTCTGT	AATGATATTTCGTGTATTCCCA	-	chrX	3994522	-	chrX	3986893	7629	+	chrX	3986893	+	chrX	3994522
ATTTGAATGATCAGAATCAGACGAAGGACGAAGTTTATGGGTGAGTATCAACGGTCTACA:1	ATTTGAATGATCAGAATCAGAC	GGGTGAGTATCAACGGTCTACA	-	chr3R	15933613	-	chr3R	8686134	7247479	+	chr3R	8686134	+	chr3R	15933613
CTCGAACAACCAGTCAGCGAGCGAACGGGCACCGCCCACCGAAAGGGCAGCCGGAAAACCCCACCTCGTGG:1	CTCGAACAACCAGTCAGCGAGC	GCCGGAAAACCCCACCTCGTGG	-	chr3L	17107445	-	chr3L	17107360	85	+	chr3L	17107360	+	chr3L	17107445
ACTTAACTCTTTGCTTCACATTAAATCCTGCAAGATTGCCGGTGCCGTTTTGCCGTTTCTGCTGCCACGTTGTT:1	ACTTAACTCTTTGCTTCACATT	CCGTTTCTGCTGCCACGTTGTT	-	chrX	16202792	-	chrX	1116732	15086060	+	chrX	1116732	+	chrX	16202792
GGCGAGACAGCTTTTGTGCTGAGAAAACAGGAAAGTGACAAGATGTCATATGATCAAAAGAACGTTATAACTCT:1	GGCGAGACAGCTTTTGTGCTGA	ATCAAAAGAACGTTATAACTCT	+	chrX	21258852	+	chrX	21258951	99	+	chrX	21258852	+	chrX	21258951
TAAAAAAAGCTCAGGAAGAAATTAGAAGGTAGTTAATGTGACAGTGGAAATAATTTATTAAATCTGACGTCGGT:1	TAAAAAAAGCTCAGGAAGAAAT	ATTTATTAAATCTGACGTCGGT	+	chrX	1158042	+	chrX	4542586	3384544	+	chrX	1158042	+	chrX	4542586
TTCAACGAACAATTGCAAGGCTATCTCTAAAGCTATATGTCCATAAAAATGTCTCGTAAGTTACAAAGGCAA:1	TTCAACGAACAATTGCAAGGCT	GTCTCGTAAGTTACAAAGGCAA	+	chr3L	3269117	+	chr3L	3269205	88	+	chr3L	3269117	+	chr3L	3269205
CGAACACCCAAACCCGAACCCCCAAACTTAAACCACCG:1	CGAACACCCAAACCCGAACCCC	AACCCCCAAACTTAAACCACCG	-	chrX	3441196	-	chrX	20379092	16937896	+	chrX	20379092	+	chrX	3441196
TTCTATCTTTCTTTCTCTCCCCAAACTGCAAAGCTGCTCACCTTCTATATCTTTTATTTACAAATTGGTATCTTT:1	TTCTATCTTTCTTTCTCTCCCC	TTATTTACAAATTGGTATCTTT	-	chr2L	17556361	-	chr2L	8863738	8692623	+	chr2L	8863738	+	chr2L	17556361
CAACGTCTTGGGCAAATAATGTCTGAGCCAAAAAAAAGCGGTCTGAATTTTTGTGTAAAACAACTGGAAAAGGC:1	CAACGTCTTGGGCAAATAATGT	GTGTAAAACAACTGGAAAAGGC	-	chr2R	11092068	-	chr2R	11091990	78	+	chr2R	11091990	+	chr2R	11092068
GATTCACCAACATGAATGAGCATAGTTCACGGTGAGTTTGGGTTTTCGCCAGGATTCCGAGGCTTTCGATAAGG:1	GATTCACCAACATGAATGAGCA	GATTCCGAGGCTTTCGATAAGG	+	chr3L	11796591	+	chr3L	11796669	78	+	chr3L	11796591	+	chr3L	11796669
TTAGGATACATGATTTATGGGCCTTTCGGTTAAGCCGCCTGCTTATCGGTAAGACCCTCAGATTTACGAGTTGTG:1	TTAGGATACATGATTTATGGGC	ACCCTCAGATTTACGAGTTGTG	-	chr2L	20069617	-	chr2L	20069537	80	+	chr2L	20069537	+	chr2L	20069617
AGTCTTTTTGGCTTTTGAAAGCCATGATTTTGTTTTTACTTTCTAACAGCTCAAGCCCAAATTTCTATTTTTCTT:1	AGTCTTTTTGGCTTTTGAAAGC	AGCCCAAATTTCTATTTTTCTT	-	chr3R	17461291	-	chr3R	17461209	82	+	chr3R	17461209	+	chr3R	17461291
TGGCGGCTAAATGGAGAAGATGGCGGCAGAGTGAGTATGCANTGAACGTAGTATTCAAGTCTCAGTAATGATGAT:1	TGGCGGCTAAATGGAGAAGATG	TTCAAGTCTCAGTAATGATGAT	-	chr3L	21847549	-	chr3L	21847453	96	+	chr3L	21847453	+	chr3L	21847549
GCTCCGAACTTANGCCGCAAAATCGATAGANTNGTATGNCCGCACCGCACTGTTGTTGGTATCGCGACTGGC:1	GCTCCGAACTTANGCCGCAAAA	TGTTGTTGGTATCGCGACTGGC	+	chr3L	16855989	+	chr3L	18748687	1892698	+	chr3L	16855989	+	chr3L	18748687
CAGAGTGGGTTAGTCGCTGGGCTAAGCCGGAGCCCCGGGCTTTGTTCGCTCCCCGGGCTTTGTTCTCCGTGCCAA:1	CAGAGTGGGTTAGTCGCTGGGC	CGGGCTTTGTTCTCCGTGCCAA	-	chr3R	28182887	-	chr3R	28182687	200	+	chr3R	28182687	+	chr3R	28182887
AAAGTCATTAATCATGCAATTTTTACGAGGTGGGAAATTATTCATACAACGTTCGAAGTTTGTCAGGTTCTTTGC:1	AAAGTCATTAATCATGCAATTT	CGAAGTTTGTCAGGTTCTTTGC	-	chr2L	18496780	-	chr2L	18496698	82	+	chr2L	18496698	+	chr2L	18496780
TTAAAATTGTGTAGGTGGGCTTTCAATTGATCACTGATAATAGCCATGCTATTATACGAGTNGACGAATTAAAGG:1	TTAAAATTGTGTAGGTGGGCTT	ATACGAGTNGACGAATTAAAGG	-	chr4	81943	-	chr4	76500	5443	+	chr4	76500	+	chr4	81943
GTTGACAAGATAGCGGGACTCTGCGCTTTGACTTACGTGATGGGTGGTGTTCCTAAGGGTGCTTG:1	GTTGACAAGATAGCGGGACTCT	GTGGTGTTCCTAAGGGTGCTTG	-	chr2R	7254939	-	chr2R	7254834	105	+	chr2R	7254834	+	chr2R	7254939
TGAAAAGTACTTTTGATTTTAATGTTGAGCTAGCAGTATCTTTAATANCAATATAAAAGTGNTCAAGCGAATGTT:1	TGAAAAGTACTTTTGATTTTAA	TAAAAGTGNTCAAGCGAATGTT	+	chr2R	18675170	+	chr2R	18675248	78	+	chr2R	18675170	+	chr2R	18675248
TAGAAAGCGATACGTATGAAATTTAATCANTCAATATTGAGCTTATGCCTTAAGTACTACNATTTATTCAAATCC:1	TAGAAAGCGATACGTATGAAAT	GTACTACNATTTATTCAAATCC	-	chr2R	18965024	-	chr2R	18964948	76	+	chr2R	18964948	+	chr2R	18965024
TAAAGATTATTATCAGCTTNGTTCCTTCCGATTTGGATAAGTAAATTTCGTTTACTTAACATTTCCATTTCCAAG:1	TAAAGATTATTATCAGCTTNGT	ACTTAACATTTCCATTTCCAAG	+	chrX	10401411	+	chrX	10401492	81	+	chrX	10401411	+	chrX	10401492
ATATAATTTAAATTATATCTTTCTTTCATAAGGAGCACAAGCCTTGAAATAACTTACATACCTATTACTTATTTT:1	ATATAATTTAAATTATATCTTT	TTACATACCTATTACTTATTTT	-	chr2R	6729398	-	chr2R	19505464	12776066	+	chr2R	19505464	+	chr2R	6729398
CTCACTTTATCTCGGCACTCCGGCAATGTTTCGTTAAGCTCAAATATAAAGTCAGATAAACTCTGTGAACAAC:1	CTCACTTTATCTCGGCACTCCG	TCAGATAAACTCTGTGAACAAC	-	chr3R	16073556	-	chr3R	16073454	102	+	chr3R	16073454	+	chr3R	16073556
ATCCCAAGTAACTAAGTAAATTCCACGGCAATGAAGTGTAAAAATAACA:1	ATCCCAAGTAACTAAGTAAATT	GCAATGAAGTGTAAAAATAACA	-	chr3L	27287503	-	chr3L	9519392	17768111	+	chr3L	9519392	+	chr3L	27287503
GATATCATACTTGATTAAAACCTCCCACTGNNNTNAGAAAACTTATTCCAAACATATCTTGCATCTTTATGAAAG:1	GATATCATACTTGATTAAAACC	ATATCTTGCATCTTTATGAAAG	+	chr3L	10866379	+	chr3L	10274252	592127	+	chr3L	10866379	+	chr3L	10274252
ACTTAACCACCCAGAATTACATTATCAAACAAGTTCTTTATCATTTGTTNATGGGCACTTGAATGTATAATTAT:1	ACTTAACCACCCAGAATTACAT	GGGCACTTGAATGTATAATTAT	-	chr3R	4984413	-	chr3R	4984322	91	+	chr3R	4984322	+	chr3R	4984413
GTAATAAGTGTGCTTTTGTATAGAAACCTAAAACACCTAAGCAACACTTTTCGAGATCNCA:1	GTAATAAGTGTGCTTTTGTATA	AGCAACACTTTTCGAGATCNCA	-	chr3R	27644351	-	chr3R	27644273	78	+	chr3R	27644273	+	chr3R	27644351
CAAAGTATACTATTTTCGAAAAATTAGGTAAATTTCAGTAAAAGATTTGTCTTTTGTCGCTGGACACTGGAACAC:1	CAAAGTATACTATTTTCGAAAA	TTGTCGCTGGACACTGGAACAC	+	chr3R	9574258	+	chr3R	13584807	4010549	+	chr3R	9574258	+	chr3R	13584807
TCCCGCACAAAGGGCAAGCCAAAAACTTCACACACCAGCAAATGGCAATTGGGCCCAGGCATATATGTATGGG:1	TCCCGCACAAAGGGCAAGCCAA	GGCCCAGGCATATATGTATGGG	-	chr3R	28132578	-	chr3R	28132498	80	+	chr3R	28132498	+	chr3R	28132578
CTTTGCAGTGCCAGGATCTGGGCTGTATTAAGTGTCACATACATATACATATATATACAGAAATATTCTATGGCA:1	CTTTGCAGTGCCAGGATCTGGG	TATACAGAAATATTCTATGGCA	-	chr3L	16861154	-	chr3L	16861052	102	+	chr3L	16861052	+	chr3L	16861154
TAAAATATGAATNTTTTCTTTACTTCAATCTGAAAGAGTAAAGTACGTTTGTGTGTTTTTGCGTTT:1	TAAAATATGAATNTTTTCTTTA	ACGTTTGTGTGTTTTTGCGTTT	-	chr2L	14931690	-	chr2L	14931602	88	+	chr2L	14931602	+	chr2L	14931690
ATGCATACATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATACATCACTCGAACTTGATAAACAAACA:1	ATGCATACATATATGTATGTAT	ACTCGAACTTGATAAACAAACA	-	chr2L	15018298	-	chr2L	6086064	8932234	+	chr2L	6086064	+	chr2L	15018298
GTTTTTTTATTTTTTTTTTTATCATGAGCGTTCCGGGGATTCCGATTGC:1	GTTTTTTTATTTTTTTTTTTAT	GCGTTCCGGGGATTCCGATTGC	-	chrX	2007363	-	chrX	7470092	5462729	+	chrX	7470092	+	chrX	2007363
TTACAGATCAGATTTTATTGCATANTTTTGGGGTCCAGTTAGNAANAGCCANAATNGTACTTTCCCAAGCTATCT:1	TTACAGATCAGATTTTATTGCA	ATNGTACTTTCCCAAGCTATCT	-	chr2R	9183236	-	chr2R	9183154	82	+	chr2R	9183154	+	chr2R	9183236
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAAAAAACAAAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	AACACAACACAAAAAAACAAAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	20177845	1729691	+	chr3R	21907536	+	chr3R	20177845
GGAATTGGATAGTTGTACTTTTTCGGAAAAACAGAAGTTAAAGCGATTATCATCCGATTACACAAAACTAAACCT:1	GGAATTGGATAGTTGTACTTTT	CCGATTACACAAAACTAAACCT	+	chr3L	20781397	+	chr3L	20781483	86	+	chr3L	20781397	+	chr3L	20781483
AACGAATTCGAAATGTGTGCTTTTTTTTTTCTCCTCCTCTCTGCCGCATTTCTCCTTTTC:1	AACGAATTCGAAATGTGTGCTT	CTCTGCCGCATTTCTCCTTTTC	+	chrX	5221906	+	chrX	3027218	2194688	+	chrX	5221906	+	chrX	3027218
TGCTTGGTGGTGCAGGAGCTGTTCACCCATGCCGTCCGCGATCTAAAGACACTTCCATGGATATTCTCGGC:1	TGCTTGGTGGTGCAGGAGCTGT	CACTTCCATGGATATTCTCGGC	-	chr2R	4603224	-	chr2R	4602873	351	+	chr2R	4602873	+	chr2R	4603224
GATGGACATCGGCGCCACCGCTGGTTTTACTAGCCTTTCTAGCTTTAAATCTCCGATATTACATA:1	GATGGACATCGGCGCCACCGCT	TTTAAATCTCCGATATTACATA	-	chr2L	22192621	-	chr2L	22192237	384	+	chr2L	22192237	+	chr2L	22192621
ATATTTGAGCACTGTATTACATTTGTCATCCCTATAAATGTTTGAAAACGCATTTGCCCCCTACTCATAATTAG:1	ATATTTGAGCACTGTATTACAT	TTTGCCCCCTACTCATAATTAG	+	chr2R	18358422	+	chr2R	18372633	14211	+	chr2R	18358422	+	chr2R	18372633
TTCAAGGAAATAAAGGTACGCCTACTTTACATTAGGTGCAGCTGCTATTTCCTACCAGACCCGTCCTGACCGA:1	TTCAAGGAAATAAAGGTACGCC	CTACCAGACCCGTCCTGACCGA	+	chr2R	12479146	+	chr2R	12479233	87	+	chr2R	12479146	+	chr2R	12479233
ACTCGCTGTCTTTTCCAAATGATCACCACAATTTTTGCCCATCGTGTTACCTTCTACCAACGCGATTACTGCGTC:1	ACTCGCTGTCTTTTCCAAATGA	CTACCAACGCGATTACTGCGTC	-	chr3L	14245688	-	chr3L	14245594	94	+	chr3L	14245594	+	chr3L	14245688
GTGGAAGGATTGCAGTGTGATTGGGCTCGAGGGCAGGCAGCCGCAGGAGCACATCCTTTCGTTTCCGCCGACA:1	GTGGAAGGATTGCAGTGTGATT	CATCCTTTCGTTTCCGCCGACA	-	chr2L	9804776	-	chr2L	19953509	10148733	+	chr2L	19953509	+	chr2L	9804776
GTGCAATACAAATGCTCAATAAGTTAAGCGAATACAAAAACATTTCTTACACTACAGAGATACTCAATTAAATTG:1	GTGCAATACAAATGCTCAATAA	ACAGAGATACTCAATTAAATTG	-	chr2L	12693943	-	chr2L	12693866	77	+	chr2L	12693866	+	chr2L	12693943
AACATGAAAATTCAATGCCAATGCCGAAATAAGTGAAAAATATATGAAATAAGGATTAAGCCTTATCCGTCTCAC:1	AACATGAAAATTCAATGCCAAT	GATTAAGCCTTATCCGTCTCAC	-	chr2R	22969326	-	chr2R	22971576	2250	+	chr2R	22971576	+	chr2R	22969326
TAATCTTTTTGGGGCAACTTTAAAAGTGAGAATGTAAATGATTCTTAAATTTCAAACTTATCTG:1	TAATCTTTTTGGGGCAACTTTA	TCTTAAATTTCAAACTTATCTG	+	chr2R	7196600	+	chr2R	7201364	4764	+	chr2R	7196600	+	chr2R	7201364
TTTCTGCTTTTCTTTTATGCCCGCACATGTGTGTGCTTGCAACTCTTTCGTCTGGCATCTANCGCACTGCTCTT:1	TTTCTGCTTTTCTTTTATGCCC	TGGCATCTANCGCACTGCTCTT	-	chr3R	27148123	-	chr3R	27140514	7609	+	chr3R	27140514	+	chr3R	27148123
GATTAGCATTTACACCTAATTTAATGCATCCCAAATGACACTTCAACTCGCTT:1	GATTAGCATTTACACCTAATTT	CAAATGACACTTCAACTCGCTT	-	chrX	4176980	-	chrX	4176633	347	+	chrX	4176633	+	chrX	4176980
CAAGCCGCCATCGTCAACGTCTTGGGCAAATAATGTCTGAGCCAAAAAAAAGCGGTCTGAATTTTTGTGT:1	CAAGCCGCCATCGTCAACGTCT	AAAGCGGTCTGAATTTTTGTGT	-	chr2R	11092082	-	chr2R	11092008	74	+	chr2R	11092008	+	chr2R	11092082
TCAGTATTTAGTACTACATCTTAAATTGCAAATACGAATTGCGAATATTAAGTTACATTGCGGGTTATGGGAGG:1	TCAGTATTTAGTACTACATCTT	TTACATTGCGGGTTATGGGAGG	+	chr2L	4819503	+	chr2L	4819625	122	+	chr2L	4819503	+	chr2L	4819625
ATCAACTCCTTAGCATGTAGTCAACATAAATTGAAAAACANTTAGNAGTAAAAAATAACATCANATTG:1	ATCAACTCCTTAGCATGTAGTC	AGTAAAAAATAACATCANATTG	-	chr2L	10836415	-	chr2L	10836341	74	+	chr2L	10836341	+	chr2L	10836415
ACGGAAAGGAAAGTATGTGGCAGTGTTCAGTGGGAGGACTGACTTATTCCTCCGACATATTGGTTCC:1	ACGGAAAGGAAAGTATGTGGCA	ATTCCTCCGACATATTGGTTCC	-	chr3R	5399935	-	chr3R	5399862	73	+	chr3R	5399862	+	chr3R	5399935
CTTCAGCTTAAGTTTCCGCAAGAGGGGAATTTGCCCGGCCACAAGGCCTTGCCAAGTGTAACTGAGATCCTAA:1	CTTCAGCTTAAGTTTCCGCAAG	CCAAGTGTAACTGAGATCCTAA	-	chr2R	24724704	-	chr2R	24724218	486	+	chr2R	24724218	+	chr2R	24724704
TTAAGGAACTCTTCCTTTGTCAAGATTTTGCATGCTTCTTTTTTTTTTCCACTTACCTTGAAGATAAACTGTCCC:1	TTAAGGAACTCTTCCTTTGTCA	TACCTTGAAGATAAACTGTCCC	-	chr2L	9156654	-	chr2L	9156576	78	+	chr2L	9156576	+	chr2L	9156654
GCCACCTGGTAGCAGTCAAACAAAACCGCACACACAGCGGGAGTTTCTGTGCCCGCGCTGGACATACTGGAACTG:1	GCCACCTGGTAGCAGTCAAACA	CGCGCTGGACATACTGGAACTG	-	chr2R	13359613	-	chr2R	9113509	4246104	+	chr2R	9113509	+	chr2R	13359613
CAACAACTNCAATAAAACAAAACACCCATCCAGTTGCCCCTTGCTGGGAATCTACAATAGATAGGAATTGCTCAC:1	CAACAACTNCAATAAAACAAAA	ACAATAGATAGGAATTGCTCAC	+	chr2L	16750745	+	chr2L	16750826	81	+	chr2L	16750745	+	chr2L	16750826
ATCAGATGATATTGTTGATCAAAAGATACAAATATTATTCTACCATTCGCTTGGCAGTGGCTAACACGAATTA:1	ATCAGATGATATTGTTGATCAA	TGGCAGTGGCTAACACGAATTA	-	chr2L	4363014	-	chr2L	12634544	8271530	+	chr2L	12634544	+	chr2L	4363014
TTAAATTGGTCTTTCGCTTATTATCAGATTTGTTTATAAAAAAATTAAAAAACTTCCTAAAACTATATAC:1	TTAAATTGGTCTTTCGCTTATT	AAAACTTCCTAAAACTATATAC	+	chr2R	13547087	+	chr2R	13547277	190	+	chr2R	13547087	+	chr2R	13547277
ACGCTACCACCACACACACACACACGACCT:1	ACGCTACCACCACACACACACA	ACCACACACACACACACGACCT	-	chr3R	9886872	-	chr3R	12860996	2974124	+	chr3R	12860996	+	chr3R	9886872
ACTGTGAAGCAGGCATAAACCACCCAACCACCCAACCACCACCC:1	ACTGTGAAGCAGGCATAAACCA	CCCAACCACCCAACCACCACCC	-	chr3L	10046788	-	chr3L	15379602	5332814	+	chr3L	15379602	+	chr3L	10046788
TCCCAAGGTTTTTGCAAATTTTAAGTAAAGAAGAGTAAAAATTAACGAAGATTACCAATGTGATACTAAATACG:1	TCCCAAGGTTTTTGCAAATTTT	TACCAATGTGATACTAAATACG	+	chr2R	22290099	+	chr2R	22290182	83	+	chr2R	22290099	+	chr2R	22290182
ATNTGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAANCTTTTG:1	ATNTGCAACATTTTTTATATGT	TTTCTGCTTCACAAANCTTTTG	+	chr3R	8707383	+	chr3R	8709792	2409	+	chr3R	8707383	+	chr3R	8709792
ATCGAATGTTTCGGACCCGTTTTATTGTCGCCAGCGCAGTAAATTGCCAAGTGCCCAAACTCAAGCAGCAGCTG:1	ATCGAATGTTTCGGACCCGTTT	GCCCAAACTCAAGCAGCAGCTG	+	chr3R	30473693	+	chr3R	30473808	115	+	chr3R	30473693	+	chr3R	30473808
TGCTAAAAGACTTGTCGATGGCAACTGCAATTTTGCTCGCTAATAGAA:1	TGCTAAAAGACTTGTCGATGGC	GCAATTTTGCTCGCTAATAGAA	+	chr3R	24199771	+	chr3R	24199824	53	+	chr3R	24199771	+	chr3R	24199824
GCGAGGACTGAAAACGCAATTGACTTTTACCTGGTTTTCGAATGAGAGTNCGATTTGCGTGTTACGTGGGGTTAT:1	GCGAGGACTGAAAACGCAATTG	TTTGCGTGTTACGTGGGGTTAT	+	chr3L	22570433	+	chr3L	22570577	144	+	chr3L	22570433	+	chr3L	22570577
CAAGGTCCNGCTCAAAATGTTCGACCATGGCCTGGNCATTGAGAAGTTCCACATTGTCGAGCCTCTCTTTTTGTG:1	CAAGGTCCNGCTCAAAATGTTC	TTGTCGAGCCTCTCTTTTTGTG	+	chr2L	8373148	+	chr2L	7603565	769583	+	chr2L	8373148	+	chr2L	7603565
GGATTGATGTGCCGAAATGTTTAAATCATAATTAAAAGCATTTATTAGCTTGTGTAACACTTAATGCGGCAGGAA:1	GGATTGATGTGCCGAAATGTTT	GTAACACTTAATGCGGCAGGAA	+	chr3R	31413113	+	chr3R	31418313	5200	+	chr3R	31413113	+	chr3R	31418313
AATGACATTTGCCATGAACTTAATGTTCGTAGATCAGAGTTCACAAGAGGGTCTCAGACCTCGA:1	AATGACATTTGCCATGAACTTA	ACAAGAGGGTCTCAGACCTCGA	+	chr2L	4166402	+	chr2L	4166474	72	+	chr2L	4166402	+	chr2L	4166474
ATCCTATTCAGCTCAAGAGCTCCAGAGATTATGTTCTTAATACAGCGCTGTACAACGTAAGNGCTGGCATTTTAC:1	ATCCTATTCAGCTCAAGAGCTC	AACGTAAGNGCTGGCATTTTAC	+	chr2L	13515116	+	chr2L	10993432	2521684	+	chr2L	13515116	+	chr2L	10993432
ATATTGATTTGGGTTTAATTAAAGCTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTTACTCAAAGTGAAAC:1	ATATTGATTTGGGTTTAATTAA	TTTCTTTTACTCAAAGTGAAAC	-	chr3R	28763914	-	chr3R	28758305	5609	+	chr3R	28758305	+	chr3R	28763914
TCGCTGTCGTTTAATTGAGCGAATTTTTTCGCCCTTAATTGAAATACGGGATAATGACTCCAAAAAGCTTCCAG:1	TCGCTGTCGTTTAATTGAGCGA	AATGACTCCAAAAAGCTTCCAG	+	chr2R	10796738	+	chr2R	10796836	98	+	chr2R	10796738	+	chr2R	10796836
TCTGAATTAATACAATTTTTCAAATAAATTATATATATCAAATAAAAAGCATATTTTTCCAGTGCATCGCCCTCC:2	TCTGAATTAATACAATTTTTCA	TTTTTCCAGTGCATCGCCCTCC	-	chr3R	13606883	-	chr3R	13606736	147	+	chr3R	13606736	+	chr3R	13606883
CGGCGAAATTAATGGCACAGACAGCTACATTTTTTTTTTTGCAACCAC:1	CGGCGAAATTAATGGCACAGAC	ACATTTTTTTTTTTGCAACCAC	+	chr3L	9929695	+	chr3L	9938447	8752	+	chr3L	9929695	+	chr3L	9938447
TCTTTATGTAACGCAACTTCCTGGGGGGAATCCACCCGACAATAT:1	TCTTTATGTAACGCAACTTCCT	GGGGGAATCCACCCGACAATAT	+	chr3L	17843196	+	chr3L	12894070	4949126	+	chr3L	17843196	+	chr3L	12894070
TTTAGGATAGCTTCATTCAATCCTTGACCTTAAGTCATTTGACAAGCCCCACCGTCATTTGAATAAAATGCG:1	TTTAGGATAGCTTCATTCAATC	ACCGTCATTTGAATAAAATGCG	+	chr2L	8167166	+	chr2L	8167254	88	+	chr2L	8167166	+	chr2L	8167254
GTCGGGTAAATAGTGCTTCACTCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTC:1	GTCGGGTAAATAGTGCTTCACT	TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTC	+	chr3R	11323130	+	chr3R	9418243	1904887	+	chr3R	11323130	+	chr3R	9418243
TGTGCCATGTACCCACTGCATTGTTTTCCCTTTTCGGTCGTTATAATTGCGG:1	TGTGCCATGTACCCACTGCATT	TTTTCGGTCGTTATAATTGCGG	-	chr3R	8417888	-	chr3R	18517035	10099147	+	chr3R	18517035	+	chr3R	8417888
TATAAGAAATATGTGCTATATTTTATAGAAGGTTTCCCCCTTTCCCATGACAACATTATGTCCAA:1	TATAAGAAATATGTGCTATATT	CCCATGACAACATTATGTCCAA	-	chr2L	7867674	-	chr2L	7867590	84	+	chr2L	7867590	+	chr2L	7867674
ATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCT:1	ATTCTTAAACGTACTTCTAAAC	GAATGCGATCGCCTTTTCTTCT	+	chr2R	9871038	+	chr2R	9871524	486	+	chr2R	9871038	+	chr2R	9871524
GTCTGCCATTTTTAAATGCTTTTCCCTTTCTCTCCACTTTGAACGAATGCGAAATTCGCCATTCCCAGGCTG:1	GTCTGCCATTTTTAAATGCTTT	GAAATTCGCCATTCCCAGGCTG	-	chr2L	15193083	-	chr2L	15984188	791105	+	chr2L	15984188	+	chr2L	15193083
CTTCATAAGGCGGAGCTGCACTGAGAAAAAAACAATCTTTCATTTCACCATTTTCACAGCAAATTTGGGTATTTT:1	CTTCATAAGGCGGAGCTGCACT	TCACAGCAAATTTGGGTATTTT	-	chr3L	12014012	-	chr3L	12013921	91	+	chr3L	12013921	+	chr3L	12014012
ATTTTGAACATTTTTTAAATATTAATTACACTTGGGTATGAACTAAATTTTCTAATCTTGTTGCATACTTTTGTA:1	ATTTTGAACATTTTTTAAATAT	AATCTTGTTGCATACTTTTGTA	-	chr3R	29655758	-	chr3R	29655679	79	+	chr3R	29655679	+	chr3R	29655758
GGGGCCTCAAATTATGATTATCGATTTGACCCTTGGAAGTTGGTACTGTGGCAGGCACTTGGAATTCTAGCTG:1	GGGGCCTCAAATTATGATTATC	CAGGCACTTGGAATTCTAGCTG	+	chr3R	13067783	+	chr3R	5804242	7263541	+	chr3R	13067783	+	chr3R	5804242
AAAATAGTTTTAGAGAAGTGCGTTTTATGAGGCCCACGCAGACAGCGGCGCCACACGAAAATGTGTTAANGTG:1	AAAATAGTTTTAGAGAAGTGCG	CACACGAAAATGTGTTAANGTG	-	chr2R	7141437	-	chr2R	7139947	1490	+	chr2R	7139947	+	chr2R	7141437
AAAAAGTTAGAACAATGGGATGCTNCAAGTTGAAAACTACCCNGTNGATTGNCATNGGTAATAGTCGGTCGGGAG:1	AAAAAGTTAGAACAATGGGATG	ATNGGTAATAGTCGGTCGGGAG	-	chr3R	5897343	-	chr3R	5896984	359	+	chr3R	5896984	+	chr3R	5897343
ATACTTTATGCCGCATAATGTTGCCCCATTATGCATCCATCCGGAAGNAATTTCTTTTTATTATTATGTCTTTTT:1	ATACTTTATGCCGCATAATGTT	CTTTTTATTATTATGTCTTTTT	-	chr2R	22574251	-	chr2R	22574171	80	+	chr2R	22574171	+	chr2R	22574251
AAATAAAATATATAAAAAAATGTTGCATAGCGGCAGGCGCAAAGTGTGATGAAGCTTTTGCGGAAAAA:1	AAATAAAATATATAAAAAAATG	TGATGAAGCTTTTGCGGAAAAA	+	chr3L	21749325	+	chr3L	21754478	5153	+	chr3L	21749325	+	chr3L	21754478
TGTTATCTTTTGGCCAACAANGAAGTTTAAAANCAATCCGATNGGTGTGTGGTCATTAATTTGTTACTCAGTGAT:1	TGTTATCTTTTGGCCAACAANG	CATTAATTTGTTACTCAGTGAT	+	chr3R	10066751	+	chr3R	10067949	1198	+	chr3R	10066751	+	chr3R	10067949
AGATTTCTTTCACAGCTCTTCGGCTGCTCCTTCTGCAAAATAAACGATTTAATTTGGACAGAATTAATGGCACA:1	AGATTTCTTTCACAGCTCTTCG	TTTGGACAGAATTAATGGCACA	-	chr2R	6795024	-	chr2R	6794927	97	+	chr2R	6794927	+	chr2R	6795024
GACTTGGAAACAATGATTACTGAATGAAATGTACGGAAATGTGAGAATGCGTTAAAGAATGATGGTCGACATG:1	GACTTGGAAACAATGATTACTG	TTAAAGAATGATGGTCGACATG	-	chrX	18933217	-	chrX	688629	18244588	+	chrX	688629	+	chrX	18933217
CTCGAGCAATGGCAATTTGCGTCGGTACGAATTTCACATTAGCCCCAT:1	CTCGAGCAATGGCAATTTGCGT	ACGAATTTCACATTAGCCCCAT	-	chr3L	9918976	-	chr3L	9918908	68	+	chr3L	9918908	+	chr3L	9918976
GGTAAGGAAGGTCGTCGAATCCTCGGTCAGTGGGCGTTGGGTTAAGCCAAGATTTATAAAGCCAACAGAAACACG:1	GGTAAGGAAGGTCGTCGAATCC	TTATAAAGCCAACAGAAACACG	+	chrX	5690988	+	chrX	6926112	1235124	+	chrX	5690988	+	chrX	6926112
TAAATTATCTACACATTTAGNCACACGCATTANCCACCACAANGGCCAGGAGTATATACGATATAGTAGTT:1	TAAATTATCTACACATTTAGNC	GAGTATATACGATATAGTAGTT	+	chr3R	28103333	+	chr3R	28103422	89	+	chr3R	28103333	+	chr3R	28103422
GTCTGGAAAACCTCAAATGATAATTTGCATTGTGTCANTAACAACNAAGCAAACATTTGCAATCAAATNTGAT:1	GTCTGGAAAACCTCAAATGATA	AACATTTGCAATCAAATNTGAT	+	chr3L	7886530	+	chr3L	7889046	2516	+	chr3L	7886530	+	chr3L	7889046
TTGACCTGAATTGATCATTTCAATAATTGTTGGTGTTCCACATTCCACAAGACAAAGGCAATGCCTCATAAACG:1	TTGACCTGAATTGATCATTTCA	CAAAGGCAATGCCTCATAAACG	-	chr2L	14180147	-	chr2L	14180072	75	+	chr2L	14180072	+	chr2L	14180147
CAACGCAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	CAACGCAACGCAACACAACACA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	8339246	+	chr3R	21907535	13568289	+	chr3R	8339246	+	chr3R	21907535
CACAACACACAGTACAACATACCGCAATATTAATCATACCACATACATTAAGCAATACGCAGGNCCACCCTACCC:1	CACAACACACAGTACAACATAC	AATACGCAGGNCCACCCTACCC	-	chr3L	12371204	-	chr3L	12371105	99	+	chr3L	12371105	+	chr3L	12371204
GTGGCCTCACTATTTCTCTGTTTGCCCTCGACTTTTGAACTAAGTGAATGCCCGCTCCTGCGAAGGCACA:1	GTGGCCTCACTATTTCTCTGTT	TGCCCGCTCCTGCGAAGGCACA	+	chr2L	968805	+	chr2L	968879	74	+	chr2L	968805	+	chr2L	968879
TGCCCCTCCTGAACTCGGATTCCTGGTGCTGCTACCAAGTTGAGCGTCAAAAGTTTTGATAGCCTGTGAGCTGCC:1	TGCCCCTCCTGAACTCGGATTC	TTTTGATAGCCTGTGAGCTGCC	+	chr3L	19208073	+	chr3L	19209447	1374	+	chr3L	19208073	+	chr3L	19209447
GTGCAATTTCTATTTGTGTAACGCTTCGTTTTCATTCATAACTTTGCGTTGGGCTGAATTTGAATCGGGAAATG:1	GTGCAATTTCTATTTGTGTAAC	GCTGAATTTGAATCGGGAAATG	-	chr2R	18600017	-	chr2R	18590866	9151	+	chr2R	18590866	+	chr2R	18600017
CTTCAGTCTTGAAACTTTTCAAAATGCAAAGTTAAAGATCCTTTCAGCCAGCAGCACTTGGAAAGTTGCAATTGT:1	CTTCAGTCTTGAAACTTTTCAA	GCACTTGGAAAGTTGCAATTGT	-	chr2L	11568857	-	chr2L	11563653	5204	+	chr2L	11563653	+	chr2L	11568857
GCAGCGAAAATGAAGGTGAGCACTTTGAAAATTATTCNCAAACATNTCGGGTAGACAAAAATGCATACNAAAG:1	GCAGCGAAAATGAAGGTGAGCA	TAGACAAAAATGCATACNAAAG	-	chr3L	2534704	-	chr3L	2534623	81	+	chr3L	2534623	+	chr3L	2534704
AGCAAGACATTTAATTTAACACTTTTTATGATATATATCTCTAGACCTTAGAAATTAGCATTGAGCCTAATANAA:1	AGCAAGACATTTAATTTAACAC	ATTAGCATTGAGCCTAATANAA	-	chr3L	8772151	-	chr3L	8772073	78	+	chr3L	8772073	+	chr3L	8772151
CTCTTTTTCACCGCTTATCCGCTTGCNCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTT:1	CTCTTTTTCACCGCTTATCCGC	AAAATCGGGGTTATATCGCCTT	+	chrX	670265	+	chrX	670345	80	+	chrX	670265	+	chrX	670345
CAATAGTATTTAAATAGTTAATAGGGAAACATTTAGTTGCCAAAACAATAAGATGACCCTTTATGTTGTTCAAGT:1	CAATAGTATTTAAATAGTTAAT	TGACCCTTTATGTTGTTCAAGT	-	chr2R	6978822	-	chr2R	6978639	183	+	chr2R	6978639	+	chr2R	6978822
CAAAAGTTAGAAAGTATGGATGCAAGTATGCAAATATCAATGAANATGCACACAAATGACAATTGATTAAT:1	CAAAAGTTAGAAAGTATGGATG	ACACAAATGACAATTGATTAAT	-	chr2R	6178246	-	chr2R	6178124	122	+	chr2R	6178124	+	chr2R	6178246
CCGTCCATTTTTCAGCATATACTGAAATGTGAAGACAGCTAAGCGNGCT:1	CCGTCCATTTTTCAGCATATAC	TGTGAAGACAGCTAAGCGNGCT	-	chr3R	20687398	-	chr3R	20686989	409	+	chr3R	20686989	+	chr3R	20687398
TTAATTACTCGGCCAGCAGTAACTAGTACCTCCACCTCCTTCCCGTACACCACCCGCCATAATTCTAATGT:1	TTAATTACTCGGCCAGCAGTAA	CCACCCGCCATAATTCTAATGT	-	chr2L	11332159	-	chr2L	11332057	102	+	chr2L	11332057	+	chr2L	11332159
TTCTTGTCTAAAAAGATCGATATTTTTTGTAATCCCAATTTCTCCATGTCTATTGCAGACGAGCTGCGCCTGGTC:1	TTCTTGTCTAAAAAGATCGATA	TGCAGACGAGCTGCGCCTGGTC	+	chr3L	9270627	+	chr3L	9278382	7755	+	chr3L	9270627	+	chr3L	9278382
CGAAAGTTCATGTGCATCTAACAACAACACAAAGTAACAGCCTGACATCCACCCTAATTTCCAAAGATATGTATG:1	CGAAAGTTCATGTGCATCTAAC	CTAATTTCCAAAGATATGTATG	-	chr3R	7169311	-	chr3R	31031711	23862400	+	chr3R	31031711	+	chr3R	7169311
CATAGGCCCGGCTTTAACCATTAACATTTCAGGGGAGAAGCTATTGCTGCTATCATCATCTCCTGCATTTG:1	CATAGGCCCGGCTTTAACCATT	CTATCATCATCTCCTGCATTTG	+	chr2R	16722132	+	chr2R	16722371	239	+	chr2R	16722132	+	chr2R	16722371
CGCTTCCCCTCCCTCTGCTTCCTCGCCATCTTCTTGTTCTTGTTCCTAGCCAACGGCTTCTTCTT:1	CGCTTCCCCTCCCTCTGCTTCC	TCCTAGCCAACGGCTTCTTCTT	-	chr2R	24735413	-	chr2R	24727915	7498	+	chr2R	24727915	+	chr2R	24735413
TTATGAAAGCAGTTTGGGGGAGGTCACGTTGGCCAGACCTTATGCCCGCCGAGATGGGCCTGGAGTTAT:1	TTATGAAAGCAGTTTGGGGGAG	GCCGAGATGGGCCTGGAGTTAT	+	chr2L	1808940	+	chr2L	22162346	20353406	+	chr2L	1808940	+	chr2L	22162346
TGTTGCTGCCGTGATGTTGCAGCAGTAGCAGGATAATGG:1	TGTTGCTGCCGTGATGTTGCAG	TGCAGCAGTAGCAGGATAATGG	+	chr3R	5088821	+	chr3R	16239251	11150430	+	chr3R	5088821	+	chr3R	16239251
CCAAACGCCACCATACAGCTAATGTACNCTACCATAAACGCCCACTCCGAGAAAAGCCTAGAAAATNAAACTAAA:1	CCAAACGCCACCATACAGCTAA	AAGCCTAGAAAATNAAACTAAA	+	chr2R	14681643	+	chr2R	14681725	82	+	chr2R	14681643	+	chr2R	14681725
CAAGAAAATAGCATCATTTTAGAGTGCATATGTGTGGAGAAAAATTTGTNAAATAGATGTATTTCAAATGTTTTT:1	CAAGAAAATAGCATCATTTTAG	TAGATGTATTTCAAATGTTTTT	-	chr3L	16941524	-	chr3L	16941423	101	+	chr3L	16941423	+	chr3L	16941524
ATGAGTGCGAATGTCTACGGCGAAAAAGGAGCCTGCGCTCCAAGGATCCCAAGTTTTCGTCC:1	ATGAGTGCGAATGTCTACGGCG	CAAGGATCCCAAGTTTTCGTCC	-	chr2L	10163797	-	chr2L	10156340	7457	+	chr2L	10156340	+	chr2L	10163797
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCACACCACACAAACTCACAAACAAACACAA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	ACAAACTCACAAACAAACACAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	26659334	4751800	+	chr3R	21907534	+	chr3R	26659334
ATATTTTAAAATAAGAAGAGTACAAATATAACCATAAATTATTAAAGCCCGACAGTTTCACAGCCAAAATGCTTT:1	ATATTTTAAAATAAGAAGAGTA	AGTTTCACAGCCAAAATGCTTT	+	chr3R	7396387	+	chr3R	7396490	103	+	chr3R	7396387	+	chr3R	7396490
TACAATGTAAGTTTTTAATAACTGTAGAATTCGAAAACTGTAATATTCGAATTAATCTATAATTCTAATGTGAAA:1	TACAATGTAAGTTTTTAATAAC	AATCTATAATTCTAATGTGAAA	+	chr3R	15059474	+	chr3R	15059561	87	+	chr3R	15059474	+	chr3R	15059561
AATCTTGTGGATCTGAGATAGTATNGATTAGTCGCAATTCAANATNCGTGTNCAANTCTTGCCACTCAAGGCTAA:1	AATCTTGTGGATCTGAGATAGT	AANTCTTGCCACTCAAGGCTAA	+	chr3R	15594670	+	chr3R	15594753	83	+	chr3R	15594670	+	chr3R	15594753
TTTGGCTTTAAGCTATTTTTCGATAAAGAGACCATTTGTTAAAGTTATTCTGTTGCAATTGACGGGCTATAAGTA:1	TTTGGCTTTAAGCTATTTTTCG	TGCAATTGACGGGCTATAAGTA	-	chr3R	22248560	-	chr3R	22239500	9060	+	chr3R	22239500	+	chr3R	22248560
GTGAAGGCGAAGAAGACTAAGATATTAATGAAAAATACATTTTTTTTTTGTGATGACTGTTTAGATAT:1	GTGAAGGCGAAGAAGACTAAGA	TTTGTGATGACTGTTTAGATAT	-	chr2L	17639138	-	chr2L	4743194	12895944	+	chr2L	4743194	+	chr2L	17639138
CCATAAGCAGCTTAATCCGATGATTTGATGGATCATCAAATGAATATTACGGGTCAGATAGCGTGTGGGATAGTA:1	CCATAAGCAGCTTAATCCGATG	TCAGATAGCGTGTGGGATAGTA	+	chrX	2578820	+	chrX	2578912	92	+	chrX	2578820	+	chrX	2578912
TTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCTATGTGTTGGTGATGAGCAGAGCGGGCTAAAATGTTAGAAA:1	TTTTCCAGACTGCATTCAACTG	GAGCGGGCTAAAATGTTAGAAA	+	chr3L	19182412	+	chr3L	19182492	80	+	chr3L	19182412	+	chr3L	19182492
GATGGGTTATTCATTTGATAGTTGTATAGTAATCAAATATTACATTTAAATTAAGAACC:1	GATGGGTTATTCATTTGATAGT	TATTACATTTAAATTAAGAACC	+	chr3L	1454990	+	chr3L	1455058	68	+	chr3L	1454990	+	chr3L	1455058
TTATTTGATTTTCGTAGATTCTCAGTTAAATCATTTTAAAAACTGAACGCTTAGAATGTGAATATGTTTGACTAA:1	TTATTTGATTTTCGTAGATTCT	GAATGTGAATATGTTTGACTAA	-	chr2L	8538253	-	chr2L	8538177	76	+	chr2L	8538177	+	chr2L	8538253
CAAAAAGTAATCCGATGTCAGCTTTTAAAAATATTATTCCTATTAAAAATGGTAAAAAGTGGTATTGAAAACCAA:1	CAAAAAGTAATCCGATGTCAGC	AAAAAGTGGTATTGAAAACCAA	-	chr2R	22124400	-	chr2R	22124311	89	+	chr2R	22124311	+	chr2R	22124400
AGAGGGTAAAGGAATTTAGCAAGAGAATCGAAACAATAGGAGAAAAAAAGAAACAGAGAATAAACGGACGCAACA:1	AGAGGGTAAAGGAATTTAGCAA	CAGAGAATAAACGGACGCAACA	+	chrX	6312084	+	chrX	18321137	12009053	+	chrX	6312084	+	chrX	18321137
TAACATAGTTATTGTTGTTCNGCTCTAGTAAGNTAGCAGTTGNTGTTGTTTTCGGGGGTTTAGCATGCGGCAA:1	TAACATAGTTATTGTTGTTCNG	TCGGGGGTTTAGCATGCGGCAA	-	chrX	15482922	-	chrX	15483229	307	+	chrX	15483229	+	chrX	15482922
ACCTAACAAATCCTTGATGACAAATCCCTACATAACCGGGGAAACTCTGACCGTTGCTGATTTTTGCTGTCAATC:1	ACCTAACAAATCCTTGATGACA	TTGCTGATTTTTGCTGTCAATC	+	chr2R	18402531	+	chr2R	18402619	88	+	chr2R	18402531	+	chr2R	18402619
CGTTAGGCGTAAAACAAGTCTTCAAAAGTACACATGACGAAGGGTATATATTGATGTAATGCA:1	CGTTAGGCGTAAAACAAGTCTT	GGGTATATATTGATGTAATGCA	+	chr2R	8483989	+	chr2R	8484053	64	+	chr2R	8483989	+	chr2R	8484053
ATTACATGATTATTTCGTATTTTGTATTTTTATTATATCAAGTTCAAACGAATCTAATGGCATTTGCATAATTGC:1	ATTACATGATTATTTCGTATTT	CTAATGGCATTTGCATAATTGC	-	chrX	3842574	-	chrX	3842333	241	+	chrX	3842333	+	chrX	3842574
ACAAATGTCAGTTTAAGAGCTTTGTTCCAATGCGTTAATAAAATATTNTTCCGACATCATTATCGCAGTGTGCAA:1	ACAAATGTCAGTTTAAGAGCTT	ACATCATTATCGCAGTGTGCAA	-	chr3R	18812184	-	chr3R	18812106	78	+	chr3R	18812106	+	chr3R	18812184
TTGAAACTGATGCGATGGCAAATAAAAAACGAATCGATTACGCAAGGCGACTAAAAGTTGAATTTATTAAACGA:1	TTGAAACTGATGCGATGGCAAA	AAAAGTTGAATTTATTAAACGA	-	chr2R	14541513	-	chr2R	14541257	256	+	chr2R	14541257	+	chr2R	14541513
CGGGATGTGGGCAGGGTTCGACCCATCATCAAATCAATGAGCGGCCTGATATAAGGGAGGAGCATAGTTCTTCTG:1	CGGGATGTGGGCAGGGTTCGAC	AGGGAGGAGCATAGTTCTTCTG	-	chr3R	28597576	-	chr3R	28597499	77	+	chr3R	28597499	+	chr3R	28597576
CCATGTGCACGGTGATGAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCTCTGTCACTTGAAGTAAAGAGGAGGT:1	CCATGTGCACGGTGATGAGGAG	TCACTTGAAGTAAAGAGGAGGT	+	chrX	2189438	+	chrX	2189514	76	+	chrX	2189438	+	chrX	2189514
AGTGCACTAAAATTAGTATACGATGGCAGTGCTATTAATCTGAACACAACTGAGCTGT:1	AGTGCACTAAAATTAGTATACG	AATCTGAACACAACTGAGCTGT	+	chr3R	25239253	+	chr3R	25239347	94	+	chr3R	25239253	+	chr3R	25239347
CAGATCTTGCGATACGCTGAGAGAAATTAATTGAAAGTAAATAAAAA:1	CAGATCTTGCGATACGCTGAGA	ATTAATTGAAAGTAAATAAAAA	-	chr3R	17814493	-	chr3R	27369717	9555224	+	chr3R	27369717	+	chr3R	17814493
CACCAGCAACACAGCCAGTCGTCGGGCCAATAATTGAGGTCAGCAGCCATGGAGGATTTCA:1	CACCAGCAACACAGCCAGTCGT	TCAGCAGCCATGGAGGATTTCA	-	chr3L	2446851	-	chr3L	2446764	87	+	chr3L	2446764	+	chr3L	2446851
CAGTTAACTCGATTTATTTAGATTTATGGCCTTGGTCCCCGAAATAAATGACCGCCTGCTAAGCA:1	CAGTTAACTCGATTTATTTAGA	ATAAATGACCGCCTGCTAAGCA	-	chr2R	8403012	-	chr2R	8398241	4771	+	chr2R	8398241	+	chr2R	8403012
TCTGTCGGCGAAGCTGAAATCTTCTTTTCAAGACAGTTGCGAGATAAACGAAACCTCTTTCTAATTACAAAGTAA:1	TCTGTCGGCGAAGCTGAAATCT	CCTCTTTCTAATTACAAAGTAA	-	chr3R	30299944	-	chr3R	29817845	482099	+	chr3R	29817845	+	chr3R	30299944
ACTATGCTTATACCCNGGAAGAGTGTGGAAATTCAAGACAGTTGTTTGGTGGAGCAAAAATTGTTTAGC:1	ACTATGCTTATACCCNGGAAGA	GGTGGAGCAAAAATTGTTTAGC	+	chr2L	18478811	+	chr2L	18480236	1425	+	chr2L	18478811	+	chr2L	18480236
ATTGAGCTATACAATAAATTTCTTACAGCAGAACGCATTTAATTTAAATTTCCATAAGTTCTAGTTTCCCCTCTC:1	ATTGAGCTATACAATAAATTTC	ATAAGTTCTAGTTTCCCCTCTC	+	chr3L	19365925	+	chr3L	19366022	97	+	chr3L	19365925	+	chr3L	19366022
GCAAAAGCAGAACTCATTTAGCTTTGTTTTAAGCACTCACATATGCATATGCATAATCACAACGTTTTTTTCGTA:1	GCAAAAGCAGAACTCATTTAGC	TAATCACAACGTTTTTTTCGTA	+	chr3R	22335848	+	chr3R	22335934	86	+	chr3R	22335848	+	chr3R	22335934
TCTCTTTTCCCAGTGTAATAAGTGTGCTTTTGTATAGAAACCTAAAACACCTAAGCAACACTTTTCGAGATCTCA:1	TCTCTTTTCCCAGTGTAATAAG	AGCAACACTTTTCGAGATCTCA	-	chr3R	27644365	-	chr3R	27644273	92	+	chr3R	27644273	+	chr3R	27644365
GTCTTTATTAGGTTCTCTGATTGATTTTTTAACCGTTCGTCGCTCGGCTTTTTATTCGGCTGCCGTTCAAGTGTT:1	GTCTTTATTAGGTTCTCTGATT	ATTCGGCTGCCGTTCAAGTGTT	+	chr2L	8091614	+	chr2L	1967792	6123822	+	chr2L	8091614	+	chr2L	1967792
ACATTTCCTCCTTAGGGTTCTTTTCGTTTTAATTCAGTTAATTTAAGACTTTTCCCATAATTTCCGTTTGCTATA:1	ACATTTCCTCCTTAGGGTTCTT	CCCATAATTTCCGTTTGCTATA	+	chr3L	5490326	+	chr3L	5490544	218	+	chr3L	5490326	+	chr3L	5490544
TGCGACTGCTGGTGCAACTGTCAAATCTTCCATGAAGATATAACTCACTGCCGGTCCAATGAGTCGTCGTCTC:1	TGCGACTGCTGGTGCAACTGTC	CGGTCCAATGAGTCGTCGTCTC	-	chrX	15274890	-	chrX	15273725	1165	+	chrX	15273725	+	chrX	15274890
CTCATCTCCGCCAAGCAGTTTCCCCATGGTAAATACCTCAACTTAATACCTAACTTCACAGAAGAATGATTTCCG:1	CTCATCTCCGCCAAGCAGTTTC	CTTCACAGAAGAATGATTTCCG	-	chr2L	10945349	-	chr2L	10945090	259	+	chr2L	10945090	+	chr2L	10945349
ATTCAAATGAGAAGCTCACATCAAATGGCTTGGAAAATATGTTATCTCGCTTTTTGCGGTCTTACTTATATATA:1	ATTCAAATGAGAAGCTCACATC	TTTGCGGTCTTACTTATATATA	-	chrX	14680948	-	chrX	416452	14264496	+	chrX	416452	+	chrX	14680948
GGAGGAAAAGTTGCCACTGCATCCTCATCCTCATGACGAGCTTATCTTGGACACGTACTGG:1	GGAGGAAAAGTTGCCACTGCAT	GCTTATCTTGGACACGTACTGG	+	chr3L	5826165	+	chr3L	5826235	70	+	chr3L	5826165	+	chr3L	5826235
AATTAAGCTCATGAAAAGTAGTTAACCTCCAAAGCCACCCACCGTCGCCCACTCACCCACCCCAATTTCCCAAAA:1	AATTAAGCTCATGAAAAGTAGT	CACCCACCCCAATTTCCCAAAA	-	chr2R	21747435	-	chr2R	21738275	9160	+	chr2R	21738275	+	chr2R	21747435
ATTTCCAACTTAGGACATGGTGAAGACCCCTTACATTTTGCATACTGATAATGGGGCCATCGTGTGGGAATCAG:1	ATTTCCAACTTAGGACATGGTG	GGGGCCATCGTGTGGGAATCAG	-	chr3L	22169550	-	chr3L	22169458	92	+	chr3L	22169458	+	chr3L	22169550
TAAGTCAATTTGCATAGGTCCACACCCTCTGACCCTCTGTTTTCCCCATCCCAGCCAAGGACAACAACTGGAGGA:1	TAAGTCAATTTGCATAGGTCCA	GCCAAGGACAACAACTGGAGGA	-	chr3L	19378678	-	chr3L	19378290	388	+	chr3L	19378290	+	chr3L	19378678
CTACGCATGTTTTTACCCCAGAATCTTATCAACCTTAATTCGCAGCCACATACACACACACGCCTTAGACAAACA:1	CTACGCATGTTTTTACCCCAGA	ACACACACGCCTTAGACAAACA	+	chr3L	13074057	+	chr3L	13074190	133	+	chr3L	13074057	+	chr3L	13074190
AGTGTGCATATCGAAATGATACAGATCAACACGCAATTGGAGTAAGAAATACAAAAACAAATTGAACTTAACTAA:1	AGTGTGCATATCGAAATGATAC	AAAACAAATTGAACTTAACTAA	-	chr2R	14979842	-	chr2R	14979766	76	+	chr2R	14979766	+	chr2R	14979842
GTCATTCAAAACACTCACCATAATTTGAAACACCGTATAATTCTCCACCCCAAATGGCGTCGTCGC:1	GTCATTCAAAACACTCACCATA	CCACCCCAAATGGCGTCGTCGC	-	chr2L	17985110	-	chr2L	11488550	6496560	+	chr2L	11488550	+	chr2L	17985110
AAATCGGAAAACAAAAATACTCGACAACATCAAGCAGAACCCCAGCTAAAGAAGCGATAAAAAGGAGATAAAACG:1	AAATCGGAAAACAAAAATACTC	GCGATAAAAAGGAGATAAAACG	+	chr3R	21824582	+	chr3R	13482174	8342408	+	chr3R	21824582	+	chr3R	13482174
TCCCCGGTGGAAAATCCCCCAACAGGCCCCACTAACTAAGGTAGACGGTCGACAACGACAACTAATGAGTTCATA:1	TCCCCGGTGGAAAATCCCCCAA	AACGACAACTAATGAGTTCATA	+	chr2R	21902628	+	chr2R	21902705	77	+	chr2R	21902628	+	chr2R	21902705
ATGCTTATTTGTTGTTTATCTGTGTAAAGCATCTCTGTGACACTTTCAGGCCACGGCGGACTTG:1	ATGCTTATTTGTTGTTTATCTG	CTTTCAGGCCACGGCGGACTTG	-	chr2L	10956167	-	chr2L	10946963	9204	+	chr2L	10946963	+	chr2L	10956167
CCATGAAGCTGGAAACTGAATAAATAAATGTACAAGATAACACGATGTGGTTATCATAGAAACTTGGAAAACTAA:1	CCATGAAGCTGGAAACTGAATA	TCATAGAAACTTGGAAAACTAA	+	chr3R	17823231	+	chr3R	17823308	77	+	chr3R	17823231	+	chr3R	17823308
GTCATATTGAAAAAAAATTGCTTTCAAATTGGGCCAAGTCGGCAACCGAAAAAGGAGGTGGAATTAGAGGCGG:1	GTCATATTGAAAAAAAATTGCT	AAGGAGGTGGAATTAGAGGCGG	+	chrX	4858529	+	chrX	7408524	2549995	+	chrX	4858529	+	chrX	7408524
TTCTGTTGTTCCTTTTTCCTACCATAGTACCATACCATACCATACCGTAACCAATCATAGTATCCTTATCGC:1	TTCTGTTGTTCCTTTTTCCTAC	CCAATCATAGTATCCTTATCGC	+	chrX	6618470	+	chrX	6618545	75	+	chrX	6618470	+	chrX	6618545
CGCAACCTGGGAAATTGATAAGAATATGAAAAAGATGATATCGAGTCT:1	CGCAACCTGGGAAATTGATAAG	TGAAAAAGATGATATCGAGTCT	+	chr3R	26661303	+	chr3R	19444935	7216368	+	chr3R	26661303	+	chr3R	19444935
CAACATANCCATTTTTACATTAACTTATAGACAGCTACTNCAAAATAAAAAGATTTGNTTATATTTGCTTCGCAG:1	CAACATANCCATTTTTACATTA	TTTGNTTATATTTGCTTCGCAG	+	chr2L	13215396	+	chr2L	13215671	275	+	chr2L	13215396	+	chr2L	13215671
ACTAGAGCACAGCAGGGCACTGCAAAAAAAAATGGTGGCATGGTGTGTAGAAGGGGAATGGGATTTCAGGAAGAG:1	ACTAGAGCACAGCAGGGCACTG	GGGAATGGGATTTCAGGAAGAG	-	chr2R	18727251	-	chr2R	18727078	173	+	chr2R	18727078	+	chr2R	18727251
AGACTACCTGATCCACTACACCTGCGAGAACAAACTGGTCTTTCGAGCGGTACTGGCACGTCATTCCGTAGCCAA:1	AGACTACCTGATCCACTACACC	TGGCACGTCATTCCGTAGCCAA	-	chr2R	9841886	-	chr2R	10254461	412575	+	chr2R	10254461	+	chr2R	9841886
ATGGAAATATTTAAATTTTCCCTATATATACATTCCCTTTTCAGATTCGTTCGTCCGCCTGACTTACTAAAGTCA:1	ATGGAAATATTTAAATTTTCCC	TCCGCCTGACTTACTAAAGTCA	-	chr3L	20148393	-	chr3L	20148303	90	+	chr3L	20148303	+	chr3L	20148393
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACACAACACAACACAACACAACACACCACAAC:1	ACACAACACAACACAACACAAC	ACACAACACAACACACCACAAC	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831802	6924268	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831802
ATGTGCAAAACAAGTGCATAATTGCAATTACGCAATCCTTTCGGAGACGAAAAGGATTAAGTTTGTGGAGTGTCC:1	ATGTGCAAAACAAGTGCATAAT	GGATTAAGTTTGTGGAGTGTCC	+	chr3R	29324349	+	chr3R	29324428	79	+	chr3R	29324349	+	chr3R	29324428
CAGAACATAAATATTTTCTGCGTCGACATCGGGAATATTTTTGCTAGCGAAACAGCATTCAGCCAGAATGA:1	CAGAACATAAATATTTTCTGCG	AAACAGCATTCAGCCAGAATGA	+	chr2L	20568672	+	chr2L	20569058	386	+	chr2L	20568672	+	chr2L	20569058
GTTTTTGTCTAATATAAAATGTTATTACATGTGTTTGCGTTTCTTATTAAGGTATACTTTTAGACTGTCCTAAA:1	GTTTTTGTCTAATATAAAATGT	TATACTTTTAGACTGTCCTAAA	-	chr2R	17169543	-	chr2R	17169304	239	+	chr2R	17169304	+	chr2R	17169543
GGCGAAATGAAATGAAATGAAATGCCAAACAAAGGACACAAAATGCACCTTGGGTCGATGCACTGAATCCCAAAG:1	GGCGAAATGAAATGAAATGAAA	GTCGATGCACTGAATCCCAAAG	-	chr3R	30981330	-	chr3R	10793878	20187452	+	chr3R	10793878	+	chr3R	30981330
GCAACTATATTGAAAAAAACTGAAAAACTAAAACTATAACTTTGATATAGTTAAAGCAAATATAAATATATGAAT:1	GCAACTATATTGAAAAAAACTG	AAGCAAATATAAATATATGAAT	-	chr3R	14898620	-	chr3R	14898500	120	+	chr3R	14898500	+	chr3R	14898620
GTTTTGAAAATGATAAATTAAACGTAATGGATTTGTATGCCTATCTCATTACAATGGGATTCCTTTAAG:1	GTTTTGAAAATGATAAATTAAA	ATTACAATGGGATTCCTTTAAG	-	chr3R	5648977	-	chr3R	10533331	4884354	+	chr3R	10533331	+	chr3R	5648977
CTGAAAATCGTTAGAGAATNCATGATCCGAGGACTTGCATCTGTATTTTGTATGCGGTGTTGC:1	CTGAAAATCGTTAGAGAATNCA	TGTATTTTGTATGCGGTGTTGC	-	chr3R	30263494	-	chr3R	20765566	9497928	+	chr3R	20765566	+	chr3R	30263494
ACATTAACTAAGGCATGGGAGTGAATCCCAAAGAACGCATTAGCCTCCCTTTTGGCCCACTTCTTTTGCCATTTC:1	ACATTAACTAAGGCATGGGAGT	GGCCCACTTCTTTTGCCATTTC	+	chr2L	9303540	+	chr2L	9303620	80	+	chr2L	9303540	+	chr2L	9303620
TAAATAATGGTTGCATCAAGCTTTCAAGCACAACCGATTGCTCTTTTTGCTTGAAAACCGGAGTGCCGAATTCAA:1	TAAATAATGGTTGCATCAAGCT	AAAACCGGAGTGCCGAATTCAA	-	chr3R	6639991	-	chr3R	6639913	78	+	chr3R	6639913	+	chr3R	6639991
GTCTGAGCTTCACATTATCAATTATTGGTCATATCGCATGGCTACTGTTAGTAGTAGTTTATCTGGCTTAAG:1	GTCTGAGCTTCACATTATCAAT	GTAGTAGTTTATCTGGCTTAAG	-	chr3R	29256365	-	chr3R	29256288	77	+	chr3R	29256288	+	chr3R	29256365
TGTATCACCACATCAGTATCCTGGCACATGNNNTNCGCGGGCACTGTCAGTCATTTGTACCGTTTTAACTTGGTA:1	TGTATCACCACATCAGTATCCT	TTTGTACCGTTTTAACTTGGTA	+	chrX	12350800	+	chrX	12350881	81	+	chrX	12350800	+	chrX	12350881
CATTAAATAGTTGTAAAAGTAAATATTATCACNAGGCGCCAAAATGTTTATTAAAATTTCAATTTCNTCCGAAA:1	CATTAAATAGTTGTAAAAGTAA	AAAATTTCAATTTCNTCCGAAA	+	chr3L	482282	+	chr3L	482360	78	+	chr3L	482282	+	chr3L	482360
AAGAAGCACTAAATACAAATAGTTTAAAAGAGATTTAAAAAGCCAGACTTTCTGAGCACTTCTCAATTTTTGGCA:1	AAGAAGCACTAAATACAAATAG	GAGCACTTCTCAATTTTTGGCA	+	chr3R	22900919	+	chr3R	22900995	76	+	chr3R	22900919	+	chr3R	22900995
GTCCTGCCACTTTTGTAGTCTTAAATGGTGGGGACTGCGCTGCTATGTGA:1	GTCCTGCCACTTTTGTAGTCTT	TGGGGACTGCGCTGCTATGTGA	+	chr2R	552785	+	chr2R	553978	1193	+	chr2R	552785	+	chr2R	553978
TCTTAGAAGGTAAATTTTGGAAGTCTTTCTCTCACCTCCAACTGTTGTTGCTGCCTATCAGTTGATGCCAG:1	TCTTAGAAGGTAAATTTTGGAA	GCTGCCTATCAGTTGATGCCAG	-	chrX	9390850	-	chrX	9390775	75	+	chrX	9390775	+	chrX	9390850
GCAGCTTCGGGCTGACCCCATCACGCTGCCACGCCCCTACCATTCAGGCNACATTGTTGCCAAAGCTTTTTA:1	GCAGCTTCGGGCTGACCCCATC	ACATTGTTGCCAAAGCTTTTTA	-	chr2L	17283895	-	chr2L	12951261	4332634	+	chr2L	12951261	+	chr2L	17283895
ACGCGCATATTTAGCCAGCACAATTTTGGGGCAAACTGCTGCATATTCCATGAAGATGGAGTTGGATTCCGCT:1	ACGCGCATATTTAGCCAGCACA	GAAGATGGAGTTGGATTCCGCT	+	chrX	7784244	+	chrX	7784544	300	+	chrX	7784244	+	chrX	7784544
TCCTCTGACCATCCGAATTCTCCCTACACCACCACAATCATCACCGCAGGCAAAGTTAAAGCCAAAACCTG:1	TCCTCTGACCATCCGAATTCTC	GCAAAGTTAAAGCCAAAACCTG	-	chr3R	4444264	-	chr3R	15437625	10993361	+	chr3R	15437625	+	chr3R	4444264
AGTTCTCGAGGCCCCGAAGCGTTGACCCGAAAAAAGTAGAACACACATTGTCANAGGGATTATGGGCGG:1	AGTTCTCGAGGCCCCGAAGCGT	TTGTCANAGGGATTATGGGCGG	+	chr3L	5926327	+	chr3L	5926511	184	+	chr3L	5926327	+	chr3L	5926511
CTGCACACTTTTAGACACCGAACTTAACAGGCTACGTGTTTTCTATGAATTTCTTACTGTGTGGAGCCTCCT:1	CTGCACACTTTTAGACACCGAA	TTCTTACTGTGTGGAGCCTCCT	-	chr3R	30482972	-	chr3R	30480507	2465	+	chr3R	30480507	+	chr3R	30482972
GGTATTTCAACAGGGCAGTTCAGATTACGAGTACACCGCGAATCCTTCTTTCCAATCGTTTCAGTCAATTCCCTC:1	GGTATTTCAACAGGGCAGTTCA	AATCGTTTCAGTCAATTCCCTC	+	chr2R	24303905	+	chr2R	24303989	84	+	chr2R	24303905	+	chr2R	24303989
CATCCTGTTTTCGGGGGCGGACATCGCATAGCTTCCAAATGATTGGCAACGCAATTATTCCAGCAATCCGAGTCA:1	CATCCTGTTTTCGGGGGCGGAC	ATTATTCCAGCAATCCGAGTCA	+	chr3L	17327616	+	chr3L	17327705	89	+	chr3L	17327616	+	chr3L	17327705
GGCAATGGAAATATTTCTAATGTACAAAGTCTGTTGAGTGTGCTTA:1	GGCAATGGAAATATTTCTAATG	CAAAGTCTGTTGAGTGTGCTTA	+	chrX	12168169	+	chrX	12173582	5413	+	chrX	12168169	+	chrX	12173582
AAACAATTTAACCCACATTTGCATGGTATGGAATGGTGCATGGTGCATGGTATATGGCAATTACCAGCGTTATG:1	AAACAATTTAACCCACATTTGC	TATGGCAATTACCAGCGTTATG	+	chr3R	27541949	+	chr3R	27542029	80	+	chr3R	27541949	+	chr3R	27542029
ATTTATTGTTTATAAGAATTCTTGCTCCAACACGACATGTTTTTTTTTGGATTTTCTATTTCAATAGCAAAANAT:1	ATTTATTGTTTATAAGAATTCT	TTCTATTTCAATAGCAAAANAT	+	chr2R	8203772	+	chr2R	8203864	92	+	chr2R	8203772	+	chr2R	8203864
GTGAATCTAAGCTTATATGTAAATATTTTTCAGTGCCCTTCTTTTTTTTTGCGATTTTTGTTTATGTGCCAAACT:1	GTGAATCTAAGCTTATATGTAA	ATTTTTGTTTATGTGCCAAACT	-	chrX	13838353	-	chrX	17560884	3722531	+	chrX	17560884	+	chrX	13838353
CTATTTGTTGTTGCAAGTGCCATGCAAGCATAACCTAACCTCAATGATGCGCGCAAGCACGTGCACGTCCTCG:1	CTATTTGTTGTTGCAAGTGCCA	CGCAAGCACGTGCACGTCCTCG	+	chrX	6562820	+	chrX	6571300	8480	+	chrX	6562820	+	chrX	6571300
CGAAGTAGTGAATCTTGTGGATCTGAGATAGTATTGATTAGTCGCAATTCAATATACGTGTTCAATTCTTGCCAC:1	CGAAGTAGTGAATCTTGTGGAT	ATACGTGTTCAATTCTTGCCAC	+	chr3R	15594660	+	chr3R	15594743	83	+	chr3R	15594660	+	chr3R	15594743
AAAAGTGGCAATTAAATAAAAGCAATTCGTTATTACATTTTTACCATTTATGAGCTTCGAAATGCCATAAAGCTA:1	AAAAGTGGCAATTAAATAAAAG	GCTTCGAAATGCCATAAAGCTA	+	chr3L	17636112	+	chr3L	17636260	148	+	chr3L	17636112	+	chr3L	17636260
GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACACA:1	GACAAAGACAAAGACAAAGACA	CAAAGACAAAGACAAAGACACA	+	chrX	16983077	+	chrX	19404963	2421886	+	chrX	16983077	+	chrX	19404963
AGACCAAAACACTTGTTAATGGGCACAGCGGGTGGCTGTGGACCATTAGGGGCATTACACTTGGAAATTAACTCT:1	AGACCAAAACACTTGTTAATGG	ATTACACTTGGAAATTAACTCT	-	chr3L	1925183	-	chr3L	1925096	87	+	chr3L	1925096	+	chr3L	1925183
AGTTATGAAGTTGCCAACGAACGAAACAACATTATTGTGCATATTTTCGACAGCTAAACTTATTAAAATCCAAAA:1	AGTTATGAAGTTGCCAACGAAC	CTAAACTTATTAAAATCCAAAA	+	chrX	22697519	+	chrX	22701816	4297	+	chrX	22697519	+	chrX	22701816
CGAAGCAAGTGCGGAAAAGTGAAAAAATGTGCCAATGGGAATGGTTGGGACCACTGTTGTCCTGTAATTAAATA:1	CGAAGCAAGTGCGGAAAAGTGA	ACTGTTGTCCTGTAATTAAATA	+	chrX	10550860	+	chrX	10552326	1466	+	chrX	10550860	+	chrX	10552326
GGAATATTAATAAAGTACTGCCTTAGCTGTGGATGTTGGATTCGATGTT:1	GGAATATTAATAAAGTACTGCC	TGTGGATGTTGGATTCGATGTT	-	chr3R	27654142	-	chr3R	10176805	17477337	+	chr3R	10176805	+	chr3R	27654142
CCAACTTCGTCATAAAATATAATCTTGTTTGAGCAACCAAACCAAACAGAAGTCGAATATATGTACATATGTATT:1	CCAACTTCGTCATAAAATATAA	CGAATATATGTACATATGTATT	-	chrX	11341944	-	chrX	11341859	85	+	chrX	11341859	+	chrX	11341944
TTAGGGAAATACTCACCGTGTGGGTTTCACTGTACTTCTATGTCAACAGACATTTTGGCTTTACATATCCCGTTT:1	TTAGGGAAATACTCACCGTGTG	TTTGGCTTTACATATCCCGTTT	+	chr3R	19302193	+	chr3R	19302294	101	+	chr3R	19302193	+	chr3R	19302294
CGAAGCGATGGCACTGCCCACCTTTTTACCCTGGAGCCTACAAAGCAATCCTCATCANA:1	CGAAGCGATGGCACTGCCCACC	CTACAAAGCAATCCTCATCANA	+	chr2L	19737382	+	chr2L	19740835	3453	+	chr2L	19737382	+	chr2L	19740835
ATACACAAAGTAAGCATCAATGGGTTAAGTGAATGAGGCATCCGCATGTATGTACATACATAGACATNCGCGGAC:1	ATACACAAAGTAAGCATCAATG	ACATACATAGACATNCGCGGAC	-	chr3R	5927831	-	chr3R	5927591	240	+	chr3R	5927591	+	chr3R	5927831
ACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:5	ACACAAACACAAACACAACACA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907535	8214507	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907535
GGTCTTTCCCAAAGGCTATTTTGATTATATTTTATATTATATTTATATTTTC:1	GGTCTTTCCCAAAGGCTATTTT	TTTATATTATATTTATATTTTC	-	chr2L	18689601	-	chr2L	17545009	1144592	+	chr2L	17545009	+	chr2L	18689601
AGTTGACCATAAGCTTTTGCTGAAATTTTCATGCTTCAACTTTCTTGCTGTTGCTTTCTTCGTGTCTCC:1	AGTTGACCATAAGCTTTTGCTG	CTGTTGCTTTCTTCGTGTCTCC	-	chr3L	940907	-	chr3L	939792	1115	+	chr3L	939792	+	chr3L	940907
CCCCACCTGCCTCCGTGGNCATGGGAATTATCTGCGCCAGTTGCTCGCCTGGATAAAG:1	CCCCACCTGCCTCCGTGGNCAT	CCAGTTGCTCGCCTGGATAAAG	+	chr3R	4881472	+	chr3R	27234797	22353325	+	chr3R	4881472	+	chr3R	27234797
AGCACGGCCCTTGGCTTGGAGCACTCACAGTTTTTACAAGCTGCTAATGTGGGGCCCGACTTTTGTTGGTT:1	AGCACGGCCCTTGGCTTGGAGC	TGGGGCCCGACTTTTGTTGGTT	-	chr3L	14723049	-	chr3L	14721210	1839	+	chr3L	14721210	+	chr3L	14723049
GGAGNAGTCCCAATTTCTATGCNAATTNAGGGCTATTTCNCACGAGAAATGCTTAAATCTTGAAATGGGTTGGGG:1	GGAGNAGTCCCAATTTCTATGC	TAAATCTTGAAATGGGTTGGGG	-	chr3R	8080358	-	chr3R	8080262	96	+	chr3R	8080262	+	chr3R	8080358
ACAGCTAATTGGCTTTATTTGTTTTAATAATTCCACGGCCAATCGAAAGGG:1	ACAGCTAATTGGCTTTATTTGT	ATTCCACGGCCAATCGAAAGGG	+	chr3R	13878266	+	chr3R	13878341	75	+	chr3R	13878266	+	chr3R	13878341
TATTTAAGTACTCATTAAGTGTTTGAAATTGAATCGCAGTTTAGTTTTTCCCGTGTACTGCACTC:1	TATTTAAGTACTCATTAAGTGT	GTTTTTCCCGTGTACTGCACTC	-	chrX	8092375	-	chrX	8092300	75	+	chrX	8092300	+	chrX	8092375
TGTTATCCTGAAAACAAAGTGGATTTTCGAAAGTGGAAAGCGACAAATGCGGTCAACAAAGAACGGGAAACCCTC:1	TGTTATCCTGAAAACAAAGTGG	CAACAAAGAACGGGAAACCCTC	-	chr3L	19124523	-	chr3L	19117076	7447	+	chr3L	19117076	+	chr3L	19124523
CAAAATCAATACACATTAACTAAGGCATGGGAGTGAATCCCAAAGAACGCATTAGCCTCNCTTTTGGCCC:1	CAAAATCAATACACATTAACTA	GCATTAGCCTCNCTTTTGGCCC	+	chr2L	9303528	+	chr2L	9303603	75	+	chr2L	9303528	+	chr2L	9303603
ACCCAATATAAAATATCAAAGGGTTTAGATTTTTAGAGTGACAAGATTGCATTTGATTAT:1	ACCCAATATAAAATATCAAAGG	TGACAAGATTGCATTTGATTAT	+	chr3L	4901160	+	chr3L	4907335	6175	+	chr3L	4901160	+	chr3L	4907335
CATCAGTCAACAGAACAAAAAAGGGGAAAAAATGAAACTTAACAAATTGAAAACAATTGATCAGCAAGAACAGA:1	CATCAGTCAACAGAACAAAAAA	ACAATTGATCAGCAAGAACAGA	-	chr2R	11433583	-	chr2R	20602184	9168601	+	chr2R	20602184	+	chr2R	11433583
AAAAAGATTTCATTACGTATGTATGTGTGNATGTGGGCGCTCCCTCCTCTCTCTCACTCTNCTTGGCTTCGTTTT:1	AAAAAGATTTCATTACGTATGT	TCACTCTNCTTGGCTTCGTTTT	-	chr3R	17927327	-	chr3R	17925860	1467	+	chr3R	17925860	+	chr3R	17927327
GATTGCANGCAGTGCCAACCTAATATAAATATATGTACANATCAAATTGTCAGAATTNCGGCATATAATCTACAT:1	GATTGCANGCAGTGCCAACCTA	AATTNCGGCATATAATCTACAT	-	chrX	11640479	-	chrX	11633425	7054	+	chrX	11633425	+	chrX	11640479
ATTTCTGATTGTAAGTGTAATAAAATAGGTGAAGTAAATATTTGGTTTGTGAAGAAAACAAAGATAATATTTGAA:1	ATTTCTGATTGTAAGTGTAATA	GAAAACAAAGATAATATTTGAA	+	chr3L	2908180	+	chr3L	2908281	101	+	chr3L	2908180	+	chr3L	2908281
GACAAGTGTAAGTAAGGCCAAAAGGACGAATGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATGCTCCTTTTTTGTTGG:1	GACAAGTGTAAGTAAGGCCAAA	GGACATGCTCCTTTTTTGTTGG	-	chr2L	15852147	-	chr2L	15852063	84	+	chr2L	15852063	+	chr2L	15852147
CCCCAGACAGGAGTCAAATAATTAATGGCCAACTGGGGGGAAAAAAAAACAAGAGATGAAAATTGCGCGGTGGC:1	CCCCAGACAGGAGTCAAATAAT	GAGATGAAAATTGCGCGGTGGC	+	chr2R	15799947	+	chr2R	9053039	6746908	+	chr2R	15799947	+	chr2R	9053039
AAGCAGCGGCCAGTGAAAAGGTTTAGGGCGGGTTTTCCAACAGCAACAGCAAATGTTTTATATGTTGCTAT:1	AAGCAGCGGCCAGTGAAAAGGT	CAAATGTTTTATATGTTGCTAT	-	chr3R	11043227	-	chr3R	11043125	102	+	chr3R	11043125	+	chr3R	11043227
GTGAAATGCGGGACTTTCAAGTGANATGATATTTCGTGTATTNCCNAACTANAGANTCCGTTGCCATTTCCCGC:1	GTGAAATGCGGGACTTTCAAGT	AGANTCCGTTGCCATTTCCCGC	-	chrX	3994497	-	chrX	3986865	7632	+	chrX	3986865	+	chrX	3994497
GCACTATGCTTTCTTACTAGTTCTATGGATTCCATAGTCCTTTTCGCTTGCATGCATGTATGTATATGTGAGCA:1	GCACTATGCTTTCTTACTAGTT	TGCATGTATGTATATGTGAGCA	+	chr3R	5338403	+	chr3R	5343579	5176	+	chr3R	5338403	+	chr3R	5343579
ATTAGACTAGAATTCATTACATATAGAGTTTTACTCTATAAAGTACGAAAAGTACTTTACATATTTTTGATATTA:1	ATTAGACTAGAATTCATTACAT	ACTTTACATATTTTTGATATTA	-	chrX	16686196	-	chrX	16685959	237	+	chrX	16685959	+	chrX	16686196
ACGACACTACATTAGCCTTATAGCAATTAACAAGGCTTTCCCTTTCGACTGTCTAAGCCCAATTACAGTCTGCCA:1	ACGACACTACATTAGCCTTATA	TAAGCCCAATTACAGTCTGCCA	+	chr3R	21330879	+	chr3R	21330970	91	+	chr3R	21330879	+	chr3R	21330970
GGCGACGGCAACGCTTAGGGCTAAAACAAAAGCGGATTTCGTCCA:1	GGCGACGGCAACGCTTAGGGCT	AAACAAAAGCGGATTTCGTCCA	-	chr2R	24334442	-	chr2R	22279361	2055081	+	chr2R	22279361	+	chr2R	24334442
GTGGCAGTCTGGAAAACCTCAAATGATAATTTGCATTGTGGCAATAACAACAAAGCAAAAATTTGCAATCAAA:1	GTGGCAGTCTGGAAAACCTCAA	AAAGCAAAAATTTGCAATCAAA	+	chr3L	7886524	+	chr3L	7889040	2516	+	chr3L	7886524	+	chr3L	7889040
GATAATCCCTGACACCGTCCATTTTTCAGCATATACTGAAATGTGAAGACAGCTAAGCGGGCTGCCGACTCAG:1	GATAATCCCTGACACCGTCCAT	GCTAAGCGGGCTGCCGACTCAG	-	chr3R	20687412	-	chr3R	20686979	433	+	chr3R	20686979	+	chr3R	20687412
CAGTTTTCTCCATTAAATAGTTGTAAAAGTAAATATTATCACAAGGCGCCAAAATGTTTATTAAAATTTCAATT:1	CAGTTTTCTCCATTAAATAGTT	AATGTTTATTAAAATTTCAATT	+	chr3L	482272	+	chr3L	482350	78	+	chr3L	482272	+	chr3L	482350
TCATAAGCCATGCCTAAAAAAGTACCTAAATCTCCGTTCGCCTGCCACCATAGCTGTTGGAATTTTGT:1	TCATAAGCCATGCCTAAAAAAG	ACCATAGCTGTTGGAATTTTGT	+	chr3R	29299596	+	chr3R	22047638	7251958	+	chr3R	29299596	+	chr3R	22047638
TTCTTGCCGCCTTACGTGGCGTATACGTAATGGGCCAGCAACTAAAGGTAATGTGATTCCATGTTTATGCATGTA:1	TTCTTGCCGCCTTACGTGGCGT	TGATTCCATGTTTATGCATGTA	-	chr2L	11538942	-	chr2L	11538857	85	+	chr2L	11538857	+	chr2L	11538942
TTGTGAGGGGAATGGCATTCGCTGATTACGCTGCACATTAATTTAACCATTCCATTCTGGCATTTTANTACGC:1	TTGTGAGGGGAATGGCATTCGC	CCATTCTGGCATTTTANTACGC	-	chr3R	6610196	-	chr3R	6610046	150	+	chr3R	6610046	+	chr3R	6610196
TATCCCTGCAGCTGTTTCTCTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTCTGCCAAAGGATTTAAGCTTTAAGCCGCGCTTTA:1	TATCCCTGCAGCTGTTTCTCTT	TTAAGCTTTAAGCCGCGCTTTA	-	chr2R	12824531	-	chr2R	12819458	5073	+	chr2R	12819458	+	chr2R	12824531
GCCGTCACGTTAGTGTAAAGTTTTGAATCGTGTTCATTAGGCGGT:1	GCCGTCACGTTAGTGTAAAGTT	TGAATCGTGTTCATTAGGCGGT	+	chr3R	23241302	+	chr3R	23241355	53	+	chr3R	23241302	+	chr3R	23241355
ATGGCTTTAGCTACGATTACACTTTTCAATAGAACCAACTGATGCCTTCAGCTTAAGTGGAACCAGATTTTCAGG:1	ATGGCTTTAGCTACGATTACAC	TAAGTGGAACCAGATTTTCAGG	+	chr2R	23061772	+	chr2R	23061848	76	+	chr2R	23061772	+	chr2R	23061848
CATCAAAGCCTGATTGATTTTGAATGTTTGTTTTCGGAAAAAAAATTCCGGGCTTTTGGCTGGCATTCAAAAGCG:1	CATCAAAGCCTGATTGATTTTG	TTTTGGCTGGCATTCAAAAGCG	-	chr3R	19750142	-	chr3R	19750062	80	+	chr3R	19750062	+	chr3R	19750142
TACTTGAATGATTTGAACGCCAGCGACTTGAGTAGCTGGCAAGGAAAGTTTCCTAGACAACTCCTTCAGGTTCG:1	TACTTGAATGATTTGAACGCCA	CTAGACAACTCCTTCAGGTTCG	+	chr3L	12285330	+	chr3L	12285530	200	+	chr3L	12285330	+	chr3L	12285530
TCGCCCAAAGCTTTTTCTAAAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCAAACAAGTCTAAGCGCACAC:1	TCGCCCAAAGCTTTTTCTAAAA	CCAAACAAGTCTAAGCGCACAC	-	chr2L	1227604	-	chr2L	1220138	7466	+	chr2L	1220138	+	chr2L	1227604
TGGCAGCTGAGAAAAAGGACCCTCTGATTTATAAACCATCCCTTTTTNTCCAAACTTGAGAACTTACNCTCTATG:1	TGGCAGCTGAGAAAAAGGACCC	ACTTGAGAACTTACNCTCTATG	-	chr2L	10153307	-	chr2L	10153228	79	+	chr2L	10153228	+	chr2L	10153307
AACACATATATGTTTTACATTTATAAATCACATTGCAATTTTCAACTTGCATGTTTCGATTTAAGCCACTGTGC:1	AACACATATATGTTTTACATTT	GTTTCGATTTAAGCCACTGTGC	+	chr3L	10003167	+	chr3L	10003263	96	+	chr3L	10003167	+	chr3L	10003263
CGATAAACGAAAAGTAGCTAGAGCGAAAATTGCAGCCATTTATGTACAAAAGTGCTCACGATAAAGAAATGTTAC:1	CGATAAACGAAAAGTAGCTAGA	GCTCACGATAAAGAAATGTTAC	+	chr3L	25995917	+	chr3L	25995998	81	+	chr3L	25995917	+	chr3L	25995998
GGAGTCTCCACAGGTGCGACCTGAGGAACATCCAGTGAGCAGATTACCTCGTACGGTTCTAGGGATTATGCAAT:1	GGAGTCTCCACAGGTGCGACCT	ACGGTTCTAGGGATTATGCAAT	+	chrX	2303336	+	chrX	2303432	96	+	chrX	2303336	+	chrX	2303432
TTTCCTTGTCGTGCTCCACCTTCTGTGTACCATTTTTGTTTTTCATGGCCTTGTTT:1	TTTCCTTGTCGTGCTCCACCTT	TTTGTTTTTCATGGCCTTGTTT	+	chr3R	19903867	+	chr3R	15953339	3950528	+	chr3R	19903867	+	chr3R	15953339
GAACGCCTGCATATTTCACAATCGCTACTCAGGCAGGGCAGGACTAGTGGTCTAGTCCAGAGGACAAATCAATTA:1	GAACGCCTGCATATTTCACAAT	AGTCCAGAGGACAAATCAATTA	+	chr3R	23572772	+	chr3R	23572892	120	+	chr3R	23572772	+	chr3R	23572892
TGATGGATCATCAAATGAATATTACGGGTCAGATAGTGTGTGGGATAGTATTCAACACACGAAGATAGTGGGA:1	TGATGGATCATCAAATGAATAT	TCAACACACGAAGATAGTGGGA	+	chrX	2578845	+	chrX	2578935	90	+	chrX	2578845	+	chrX	2578935
GATGGCATNACAAGGAAATGCACCACACTTCTTTTACATCGTCTATTGACTATTTCGGGCAAATATTGGTCA:1	GATGGCATNACAAGGAAATGCA	TATTTCGGGCAAATATTGGTCA	-	chr2L	22694028	-	chr2L	22693944	84	+	chr2L	22693944	+	chr2L	22694028
ACGGCAAGATTATTTGTTTGGTTGCAGTGCCACTTCAGGTAAATNATATTTTTAGGAAATCGACTTAAC:1	ACGGCAAGATTATTTGTTTGGT	ATTTTTAGGAAATCGACTTAAC	+	chr3R	6670596	+	chr3R	6670699	103	+	chr3R	6670596	+	chr3R	6670699
AATCAAATNCTTGAGCTCACTTAAAAATGCAAAAACCNNNNTCCGTAGGCCAATTTGTATANTGGTATTAAAAAA:1	AATCAAATNCTTGAGCTCACTT	TTTGTATANTGGTATTAAAAAA	-	chr2R	23184379	-	chr2R	23184294	85	+	chr2R	23184294	+	chr2R	23184379
TACCACTTTATGTAAAGGATAGAGACTTATCTTTTTATATATTACTAATTTCTTGTGGGGGCAGATAGGTGTA:1	TACCACTTTATGTAAAGGATAG	CTTGTGGGGGCAGATAGGTGTA	+	chr3R	19908274	+	chr3R	19908356	82	+	chr3R	19908274	+	chr3R	19908356
GCACCACGTTGAGCAACTCAGTTTGGCTTCCGGAGATTCGGGCTTAA:1	GCACCACGTTGAGCAACTCAGT	GCTTCCGGAGATTCGGGCTTAA	+	chr3R	5757551	+	chr3R	17779021	12021470	+	chr3R	5757551	+	chr3R	17779021
AGCCGATTTTCAATTCAAATAAGGAGAGTAATTGGATCTCATATATAGAGTGCTTTTCTTTTTAAGAGTGCATT:1	AGCCGATTTTCAATTCAAATAA	CTTTTCTTTTTAAGAGTGCATT	-	chr2L	19441160	-	chr2L	19441084	76	+	chr2L	19441084	+	chr2L	19441160
GGGTTCCAACGATTAGTATCATTTGGAATAAAGCATATGTCGATGATAGAGGTGAATGAGTGAAAAGTGTACTCA:1	GGGTTCCAACGATTAGTATCAT	GAATGAGTGAAAAGTGTACTCA	+	chr2L	10532009	+	chr2L	18381359	7849350	+	chr2L	10532009	+	chr2L	18381359
TTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCGTCGTCGCCTGGGA:1	TTTTTGTCTACCCGAAATGTTT	TTCGCTGCGTCGTCGCCTGGGA	+	chr3L	2534635	+	chr3L	2534718	83	+	chr3L	2534635	+	chr3L	2534718
TGATGGATCATCAAATGAATATTACGGGTCAGATAGTGTGNGGGATAGTATTCAACACACGAAGATTG:1	TGATGGATCATCAAATGAATAT	AGTATTCAACACACGAAGATTG	+	chrX	2578845	+	chrX	2578930	85	+	chrX	2578845	+	chrX	2578930
GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGGTTTGGGTTT:1	GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGT	GTTTGTGTTTGGGTTTGGGTTT	+	chrX	9845361	+	chrX	8382094	1463267	+	chrX	9845361	+	chrX	8382094
TTTAAGAACGAAAGCCACAGACGCACACACATGGGACCCCAATAAAAACNAATTTA:1	TTTAAGAACGAAAGCCACAGAC	GACCCCAATAAAAACNAATTTA	-	chr2R	22351482	-	chr2R	22349717	1765	+	chr2R	22349717	+	chr2R	22351482
ATATGAGCTGTGGGCTGCAGCTGGTGCGGAATAGGATGCATGGGACACAGATGGAGCGGCGTAG:1	ATATGAGCTGTGGGCTGCAGCT	GGACACAGATGGAGCGGCGTAG	-	chrX	14189974	-	chrX	14189890	84	+	chrX	14189890	+	chrX	14189974
GAATAAATTACATTTAACGGCTTATTTTAAATGCTACCCATGGANTACTCTTTACTAAAGGTCTAAAAAATAT:1	GAATAAATTACATTTAACGGCT	TTACTAAAGGTCTAAAAAATAT	-	chr2R	8525184	-	chr2R	8525109	75	+	chr2R	8525109	+	chr2R	8525184
TACCACGGATTACATTGCAGTAATGGATTTAATTTAAGCTGTGGACCGCGTACTGATAAGTCGAATCAGAATCAG:1	TACCACGGATTACATTGCAGTA	TGATAAGTCGAATCAGAATCAG	+	chr3L	22909023	+	chr3L	22909114	91	+	chr3L	22909023	+	chr3L	22909114
GGAAAATTTACTGAAACAAAGTCAACACGAATTTGCTAACTCGCTAAAAACTTCNAGTTGAC:1	GGAAAATTTACTGAAACAAAGT	TCGCTAAAAACTTCNAGTTGAC	+	chr2L	2305132	+	chr2L	2305214	82	+	chr2L	2305132	+	chr2L	2305214
AGCCGCAGCACCTTCTTCATAATCAGCATCAACAAAGCATGCAGGAACGACGCCATCAGCAGCTGCTGCAATAGG:1	AGCCGCAGCACCTTCTTCATAA	CATCAGCAGCTGCTGCAATAGG	-	chr4	552333	-	chr4	200585	351748	+	chr4	200585	+	chr4	552333
TAAGCAGTTCGCGATTTGAATTTGGCGTCGTTCTCTTTTTGGTTTTCATTTCTTCCTTTTTT:1	TAAGCAGTTCGCGATTTGAATT	GGTTTTCATTTCTTCCTTTTTT	-	chr2R	17241716	-	chr2R	17236525	5191	+	chr2R	17236525	+	chr2R	17241716
ACTGCTCCAGCTCCAGCACCAGCTCGAGCTCCAGCACC:1	ACTGCTCCAGCTCCAGCACCAG	CACCAGCTCGAGCTCCAGCACC	-	chr2R	23856234	-	chr2R	11041860	12814374	+	chr2R	11041860	+	chr2R	23856234
ACTATGCTTTCTTACTAGTTCTATGGATTCCATANTCCTTTTCGCTTGCATGCATGTATGTATATGTGAGCATGT:1	ACTATGCTTTCTTACTAGTTCT	ATGTATGTATATGTGAGCATGT	+	chr3R	5338405	+	chr3R	5343582	5177	+	chr3R	5338405	+	chr3R	5343582
TAGACCCCATTCAACCCTNAATAGGCTGCTATTGGCATGATGANGTGTCNTGAAATTTAATCAATTTATTTGA:1	TAGACCCCATTCAACCCTNAAT	GAAATTTAATCAATTTATTTGA	-	chr2R	14536367	-	chr2R	14536239	128	+	chr2R	14536239	+	chr2R	14536367
ATCTAGCCCGAACTGGTGGAGCCTCTTCTCCTGGCTTGAGTGAAGAGTGGTGACCCAAGTGTCGGCATCTTTTCG:1	ATCTAGCCCGAACTGGTGGAGC	CCCAAGTGTCGGCATCTTTTCG	-	chrX	1127599	-	chrX	1127292	307	+	chrX	1127292	+	chrX	1127599
ATGAAGGAACGCCAACTACCCAACTCGACTCGGTAATTATTTACACCAACTTGGACGGTCATAAATCAACGCATT:1	ATGAAGGAACGCCAACTACCCA	GACGGTCATAAATCAACGCATT	-	chr3R	14799895	-	chr3R	19104608	4304713	+	chr3R	19104608	+	chr3R	14799895
AAAAGGATGCGTTTGGGTAATTTCAGCCAGGGCGAAAGATATACGGCCCTC:1	AAAAGGATGCGTTTGGGTAATT	GGGCGAAAGATATACGGCCCTC	+	chr2L	1993230	+	chr2L	1993292	62	+	chr2L	1993230	+	chr2L	1993292
CACATCACACCAACCAAGGGGTATAAGTTCTTCCTATAAATCACATAATCAGGCTGGGCCAAGCCTTATAG:1	CACATCACACCAACCAAGGGGT	CAGGCTGGGCCAAGCCTTATAG	+	chr2R	13769002	+	chr2R	13769097	95	+	chr2R	13769002	+	chr2R	13769097
TTATATATATTTTTGAATCATGGAAAGAGTAAATAGTGAATACGTACGATAATTGATTTGATAGTTATTATATAT:1	TTATATATATTTTTGAATCATG	TGATTTGATAGTTATTATATAT	-	chrX	667753	-	chrX	667669	84	+	chrX	667669	+	chrX	667753
ATAAATTTTAGGGCGAACTTTGCGTTTTTCGGTGGGTCATTCGCTGCAACGGTTTTT:1	ATAAATTTTAGGGCGAACTTTG	GTCATTCGCTGCAACGGTTTTT	+	chrX	14643357	+	chrX	18779185	4135828	+	chrX	14643357	+	chrX	18779185
CTCCACAAACTTAATCCTTTTCGTCTCCGAAAGGATTGCGTAATTGCAATTATGCACTTGTTTTGCACATCTCAG:1	CTCCACAAACTTAATCCTTTTC	GCACTTGTTTTGCACATCTCAG	-	chr3R	29324423	-	chr3R	29324344	79	+	chr3R	29324344	+	chr3R	29324423
AGCCAACTGGGACCGCCGAGCCTCACAGTCTTTTGTCCTTAAATGGACAGTTGTTAAGTGCTTAAANTATGCATG:1	AGCCAACTGGGACCGCCGAGCC	TTAAGTGCTTAAANTATGCATG	+	chr3L	16875811	+	chr3L	16875922	111	+	chr3L	16875811	+	chr3L	16875922
AAATTTGTTTGCCTATGCTAAAATCGGTAACGATTGTAAGTTACGACTGCGCCGGACATATGCAGCAA:1	AAATTTGTTTGCCTATGCTAAA	CTGCGCCGGACATATGCAGCAA	+	chr3R	26558355	+	chr3R	26565660	7305	+	chr3R	26558355	+	chr3R	26565660
TATTGAAGTAAGCTTACAAAATATTCGCATAGCGAAGCTGACAAAAAGTAAAATATATCNCTTTGGT:1	TATTGAAGTAAGCTTACAAAAT	AAGTAAAATATATCNCTTTGGT	+	chr3L	18408757	+	chr3L	18408835	78	+	chr3L	18408757	+	chr3L	18408835
CTTTTTGAGCTAATAATAAAGTTTTTGTGAAGGGCCTCCGGTAGACGNAAGTATTGATTTTAAAGAACTAGTTTT:1	CTTTTTGAGCTAATAATAAAGT	TTGATTTTAAAGAACTAGTTTT	-	chr3L	17744451	-	chr3L	17726705	17746	+	chr3L	17726705	+	chr3L	17744451
GCCATGTGCAACCCGAAAACTTTTGCTAATTTCTCTATAATTGGGGGCTGAAAACAAAAACCCCCTGTGAGGGCT:1	GCCATGTGCAACCCGAAAACTT	ACAAAAACCCCCTGTGAGGGCT	+	chr2L	12284050	+	chr2L	12284140	90	+	chr2L	12284050	+	chr2L	12284140
TAATTGGAGAAAAGCCCTGTGTCATGATAATTGGCCAGCACTTC:1	TAATTGGAGAAAAGCCCTGTGT	CATGATAATTGGCCAGCACTTC	-	chr2R	14071363	-	chr2R	17186299	3114936	+	chr2R	17186299	+	chr2R	14071363
GCCCAGCAAACCATCAGANGATTAACATAAGCCGTTTAAGTTCNGTTTTNATTTTACTCATTTAGTTCAAGTATT:1	GCCCAGCAAACCATCAGANGAT	TTACTCATTTAGTTCAAGTATT	-	chr2L	22675020	-	chr2L	9251578	13423442	+	chr2L	9251578	+	chr2L	22675020
TGGTCCAAAAATTGATGAAGAAATATTAACAAGAATGTGAATTATTTCATATTG:1	TGGTCCAAAAATTGATGAAGAA	GAATGTGAATTATTTCATATTG	+	chr2L	12332555	+	chr2L	22025329	9692774	+	chr2L	12332555	+	chr2L	22025329
CAATATGTCATATTTTTAGTCATTTAAAAATCGCTATAAATATAAAATATATGCTTAGGGAAATACCATGTAAGT:1	CAATATGTCATATTTTTAGTCA	CTTAGGGAAATACCATGTAAGT	-	chr3L	15466218	-	chr3L	15466122	96	+	chr3L	15466122	+	chr3L	15466218
GGCTAAAAACAACTGGAAAAGGTAAAAAAGTTGCAGTTTCAACGCTAAAATGACCCTGAATATTCGGCGAT:1	GGCTAAAAACAACTGGAAAAGG	ATGACCCTGAATATTCGGCGAT	-	chr3R	29739750	-	chr3R	29738287	1463	+	chr3R	29738287	+	chr3R	29739750
AGTGGTATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGCCACACATCCATTCTGGGGTCCTCACTGCGGATG:1	AGTGGTATATGGACACCATAAG	TCTGGGGTCCTCACTGCGGATG	-	chr3L	11865858	-	chr3L	11864563	1295	+	chr3L	11864563	+	chr3L	11865858
GACTTAACAATTCACGCAACGGAAACGATAAACCGAGGCCCACAGATCCCGAGCATAGAGCAAGTATCTTTCCCT:1	GACTTAACAATTCACGCAACGG	CATAGAGCAAGTATCTTTCCCT	-	chrX	17680980	-	chrX	17680903	77	+	chrX	17680903	+	chrX	17680980
ATTAAATAATAACTAATAGTTGGGCTAAAACTGTGGTTTTGGTACTNCGAATTCTTTCTA:1	ATTAAATAATAACTAATAGTTG	TTGGTACTNCGAATTCTTTCTA	-	chr2L	9264458	-	chr2L	9264373	85	+	chr2L	9264373	+	chr2L	9264458
GTGATTTTCTAGTTTCCTTGAGTGAAGCATATAGTGCTTAGATCCGAAAAAAAAGTTAAGCCACACGCCTCAGTG:1	GTGATTTTCTAGTTTCCTTGAG	AGTTAAGCCACACGCCTCAGTG	-	chr3R	21472100	-	chr3R	21472019	81	+	chr3R	21472019	+	chr3R	21472100
GGAGCCATTGTCTCAAAAGTATTCACGAAGAAAATAGTTCAAAATCCCACTTTCGATGAAGAACCTACGAATATG:1	GGAGCCATTGTCTCAAAAGTAT	CGATGAAGAACCTACGAATATG	+	chr3R	22234701	+	chr3R	22236020	1319	+	chr3R	22234701	+	chr3R	22236020
TTTTAGGGTGGATCTTAATTCGACTTAGCAATTGAATGCCTAATATTTCAAGATAAGANAATAA:1	TTTTAGGGTGGATCTTAATTCG	ATATTTCAAGATAAGANAATAA	-	chr3L	15643882	-	chr3L	15643606	276	+	chr3L	15643606	+	chr3L	15643882
ATAATACTTTAAATGCTANGAACAAATTTCGTATATTTCTTTCNGGTGCNCACACATATATCAAAGACGTGTAAA:1	ATAATACTTTAAATGCTANGAA	ACATATATCAAAGACGTGTAAA	-	chr3L	21156959	-	chr3L	21151875	5084	+	chr3L	21151875	+	chr3L	21156959
TTGTGTTGTGTTGCGTTGGGTTGTGTTGTGTTGTGTAGTGTTGT:1	TTGTGTTGTGTTGCGTTGGGTT	GTGTTGTGTTGTGTAGTGTTGT	+	chrX	16237418	+	chrX	10759278	5478140	+	chrX	16237418	+	chrX	10759278
TANAATTGCCAGGGATCCACCTAAAACGTTATTGNTNTGTACGAAGCATGCTCACACCTTCTCCAAAAAACAAAA:1	TANAATTGCCAGGGATCCACCT	ACACCTTCTCCAAAAAACAAAA	-	chr3R	30687006	-	chr3R	30679537	7469	+	chr3R	30679537	+	chr3R	30687006
ATGTACTCTAAGAACCTTGAAAAATGATTTTGAATTAGTTATACGAACGGGGAAATACCCTTAGGTGTTACTAAA:1	ATGTACTCTAAGAACCTTGAAA	AATACCCTTAGGTGTTACTAAA	-	chr3L	3619512	-	chr3L	3619418	94	+	chr3L	3619418	+	chr3L	3619512
TAACCCAANGTAACTACGTGTTCTTGGGACTCATCAACTACATGTAGTATATTTCGTCCATCTCAGAAGCTCTAT:1	TAACCCAANGTAACTACGTGTT	TCGTCCATCTCAGAAGCTCTAT	+	chr3R	21784861	+	chr3R	21784959	98	+	chr3R	21784861	+	chr3R	21784959
GTATAATTTATGAGTTCAANTGATAAATTGTAGACCCCAGCAACAACAAAAACAAAAACAGCCCAACAACCCAAA:1	GTATAATTTATGAGTTCAANTG	AAAAACAGCCCAACAACCCAAA	+	chr2L	2336584	+	chr2L	15056468	12719884	+	chr2L	2336584	+	chr2L	15056468
TTGTTGCCTCGCCTTTGCTAATTGTTCGCCATGCACTCGAGACTTTGTAGTG:1	TTGTTGCCTCGCCTTTGCTAAT	ATGCACTCGAGACTTTGTAGTG	-	chr3L	3281931	-	chr3L	3281458	473	+	chr3L	3281458	+	chr3L	3281931
CAGTGGGCACAGTGGTTCCGCGTCGAGATCCTTAATGGAAGGGGTTAATTCAAGTTGAATTGGTAACTAGATTAC:1	CAGTGGGCACAGTGGTTCCGCG	GTTGAATTGGTAACTAGATTAC	-	chr2L	21023986	-	chr2L	21020309	3677	+	chr2L	21020309	+	chr2L	21023986
TTAATCCTTTCAGCAGCGATTCACAAATGCAATGGCTGAATTAGTTTGCCTTTATTTACCACGCACAATTTGTGA:1	TTAATCCTTTCAGCAGCGATTC	ATTTACCACGCACAATTTGTGA	+	chr2R	18992025	+	chr2R	18992166	141	+	chr2R	18992025	+	chr2R	18992166
TGTATCTGTCAGCTTAAAGGCGTGAAGCACAACAAAAAACTCNTAAACTTTTTGGTCATATTTTCATATGCAGG:1	TGTATCTGTCAGCTTAAAGGCG	TGGTCATATTTTCATATGCAGG	+	chr3L	14141759	+	chr3L	14141848	89	+	chr3L	14141759	+	chr3L	14141848
TGCAATCCGGATCCTGTGAATTCAAGCCGGAGTCAATGGTTGTATATCGCATGCATAAATTATCGTAACTGTAAC:1	TGCAATCCGGATCCTGTGAATT	CATAAATTATCGTAACTGTAAC	+	chr2L	9973726	+	chr2L	9980845	7119	+	chr2L	9973726	+	chr2L	9980845
CCAAAAGCTAAGCGTGGTTTNTATTACTTATTNTTCTGCGTTNGTGATTATTTTGTATTTTTTATT:1	CCAAAAGCTAAGCGTGGTTTNT	TGATTATTTTGTATTTTTTATT	+	chrX	5787257	+	chrX	13272631	7485374	+	chrX	5787257	+	chrX	13272631
GTTATTGTTCTATTGAGCTTAAAATATTTGGAAAGATCTTGTCTCAACTTTTATTGGGAAATAAAGTTGTAAATT:1	GTTATTGTTCTATTGAGCTTAA	TTGGGAAATAAAGTTGTAAATT	+	chr2L	16958107	+	chr2L	16962895	4788	+	chr2L	16958107	+	chr2L	16962895
TGNATTCCGCCACTTTTAAACAGGTACTTATGCANGNCTCCTTTTGCAGGCCATTTAGGAATGGCCCATATATCT:1	TGNATTCCGCCACTTTTAAACA	TTTAGGAATGGCCCATATATCT	-	chr2L	5836718	-	chr2L	5827710	9008	+	chr2L	5827710	+	chr2L	5836718
CAAGTGTGCGCTTTGGTCAGATACCTAAACACCGCCGTGTGGGTACAGCCAATATCTTACATACTCTGCGCCCT:1	CAAGTGTGCGCTTTGGTCAGAT	TATCTTACATACTCTGCGCCCT	+	chr2L	14778816	+	chr2L	14779103	287	+	chr2L	14778816	+	chr2L	14779103
AACCAAAGGGTATTTAGGAAGTATATATATTTTTTTTTATAATAGACTTAACCCCAAGGTGCATTGCGGTTAGTC:1	AACCAAAGGGTATTTAGGAAGT	CCAAGGTGCATTGCGGTTAGTC	+	chr2R	18862462	+	chr2R	18862539	77	+	chr2R	18862462	+	chr2R	18862539
AAATATATGCAGTTTTAAAGCCCTCTCTATTGCACTTCCCTAGTTTTCCCCGAAAC:1	AAATATATGCAGTTTTAAAGCC	CTTCCCTAGTTTTCCCCGAAAC	-	chr3L	3606616	-	chr3L	3601324	5292	+	chr3L	3601324	+	chr3L	3606616
AGATCTGTTTGGGGCGTACTCTTCGCCATGTGCGGTGGTC:1	AGATCTGTTTGGGGCGTACTCT	CTCTTCGCCATGTGCGGTGGTC	+	chr3R	29854861	+	chr3R	29854906	45	+	chr3R	29854861	+	chr3R	29854906
AACGGTAATAAAATGACTCAACTACATACTTATGAAAAAGTCAAATTCAATTCAAAAGGTAAAAACTCTTTTAAA:1	AACGGTAATAAAATGACTCAAC	AAAAGGTAAAAACTCTTTTAAA	+	chr3R	13994314	+	chr3R	13994569	255	+	chr3R	13994314	+	chr3R	13994569
CACGTAACACGCAAATCGGACTCTCATTCGAAAACCAGGTAAAANTCAATTGCGTTTTCAGTCCTC:1	CACGTAACACGCAAATCGGACT	NTCAATTGCGTTTTCAGTCCTC	-	chr3L	22570570	-	chr3L	22570435	135	+	chr3L	22570435	+	chr3L	22570570
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGGAAAATAGAAAACTGAGGGAACAGANTGGAAAAGTGGTGAAATGTATTTG:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	GAAAAGTGGTGAAATGTATTTG	+	chr3L	22908067	+	chr3L	15768869	7139198	+	chr3L	22908067	+	chr3L	15768869
ACCTAAAACGTTATTGATATGTACGAAGCATGCTCACACCTTCTCCAAAAAACAAAAAAACAGAAGAAAACTCCT:1	ACCTAAAACGTTATTGATATGT	AAAAAAACAGAAGAAAACTCCT	-	chr3R	30686988	-	chr3R	30679519	7469	+	chr3R	30679519	+	chr3R	30686988
GACTGAGCTACAGTTTCAGTTCCGACTTACTACCTTTTTTTATCTCGACGTACATGGCCAGCTTGACTATGCTAG:1	GACTGAGCTACAGTTTCAGTTC	ATGGCCAGCTTGACTATGCTAG	+	chr2L	20576221	+	chr2L	20583689	7468	+	chr2L	20576221	+	chr2L	20583689
GAAACAAGTGACATGCCTCAGGGATTGGACCTTTTGTTGAAGGGAGAGACAAGAGCTCCNGGCAACCA:1	GAAACAAGTGACATGCCTCAGG	AGACAAGAGCTCCNGGCAACCA	+	chr3L	7332469	+	chr3L	7332539	70	+	chr3L	7332469	+	chr3L	7332539
TCCCTACCGCAATGTGAACATATTGCATATTTTGTTTGTGCCTCATGCGTGTCACATGCTCGAATCGATGGGTTT:1	TCCCTACCGCAATGTGAACATA	ACATGCTCGAATCGATGGGTTT	-	chr2L	14554261	-	chr2L	14554184	77	+	chr2L	14554184	+	chr2L	14554261
ACACACCTGACGACTATATCATCATAAGCTTATTTCAAATTATCTCAGGGGCTGGAAAGCACATGTAAGTGAT:1	ACACACCTGACGACTATATCAT	CTGGAAAGCACATGTAAGTGAT	+	chr3R	5001506	+	chr3R	5001972	466	+	chr3R	5001506	+	chr3R	5001972
AATCGTGTAATAGGGCTTAAGCGAGTTGTATGAGTATCTTGATATACACACTTTGCTGTTAGGTGATTCTAGCA:1	AATCGTGTAATAGGGCTTAAGC	TTGCTGTTAGGTGATTCTAGCA	+	chr2R	17176355	+	chr2R	17182544	6189	+	chr2R	17176355	+	chr2R	17182544
GGTGTAACAAAAAGTGGGCAACTTTGCTAAATTGCCAGGGCAGTGG:2	GGTGTAACAAAAAGTGGGCAAC	TGCTAAATTGCCAGGGCAGTGG	+	chr2L	14564227	+	chr2L	14564274	47	+	chr2L	14564227	+	chr2L	14564274
AACTGATTCAAATATCCAGGTAAAAGTNGGNNTTGTTAGGTTGGAAGGTNTNAGTAAGCTTCAAATATAACATAG:1	AACTGATTCAAATATCCAGGTA	GTAAGCTTCAAATATAACATAG	-	chr3L	18781113	-	chr3L	18772432	8681	+	chr3L	18772432	+	chr3L	18781113
TACTAAAGATAACTGTACGACATTTAAAATCTATATAGTTTTTAAAATCCTTCTTTTGCAACTGTTAATAAAATT:1	TACTAAAGATAACTGTACGACA	TTTTGCAACTGTTAATAAAATT	-	chr3L	17789941	-	chr3L	17789865	76	+	chr3L	17789865	+	chr3L	17789941
TAAACTTAAGCTTAGTAAGTATAAAAAGTAAAAGTATCGAGCTGGGAAATATGAATATGAATCATATAATATAT:1	TAAACTTAAGCTTAGTAAGTAT	GAATATGAATCATATAATATAT	-	chr3R	14067256	-	chr3R	29581616	15514360	+	chr3R	29581616	+	chr3R	14067256
AAGCATCCGAGTCGAGTCCNAAGTCCTTGGAGGAGTAGAAGCCCAGTTTCAGTGCTTGGTGGGAATGTAAAAGAG:1	AAGCATCCGAGTCGAGTCCNAA	GCTTGGTGGGAATGTAAAAGAG	+	chr2R	20031003	+	chr2R	20031096	93	+	chr2R	20031003	+	chr2R	20031096
CATCAAAAAGTGCAAGGGTAAGTGGCAATGTGCACGGTGATGAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCT:1	CATCAAAAAGTGCAAGGGTAAG	CCTCTTACTCCAAGGGGGATCT	+	chrX	2189413	+	chrX	2189489	76	+	chrX	2189413	+	chrX	2189489
GAGTNCGGAATTGGTGGAAACCNCGCCNACGGAGGCTTCNCGTGGTACTCGCCCGAGGG:1	GAGTNCGGAATTGGTGGAAACC	TCNCGTGGTACTCGCCCGAGGG	+	chr3L	10892171	+	chr3L	10890408	1763	+	chr3L	10892171	+	chr3L	10890408
TAATTAAAAGAATTTCGTTTAATAAATTCAACTTTTAGTCGCCTTGCGTAATCGATTCGNTTT:1	TAATTAAAAGAATTTCGTTTAA	CCTTGCGTAATCGATTCGNTTT	+	chr2R	14541243	+	chr2R	14541488	245	+	chr2R	14541243	+	chr2R	14541488
TTTCATTTGCCGACTGACCACCCCTGCAGCTGAGTTGGCAATTAAGCGAGTTAAAATACTTCTTTCTTTTGGCTT:1	TTTCATTTGCCGACTGACCACC	AAATACTTCTTTCTTTTGGCTT	-	chr3R	16411555	-	chr3R	16411477	78	+	chr3R	16411477	+	chr3R	16411555
GTAGGTGACCTGGTGACCCAGCTTCTGGACCGTATAATCCTCCGCTTGGCTGATCTCCGAATCCGTACA:1	GTAGGTGACCTGGTGACCCAGC	GGCTGATCTCCGAATCCGTACA	-	chr3L	9342729	-	chr3L	17851478	8508749	+	chr3L	17851478	+	chr3L	9342729
AAGGTCTCTAAGGATAAGTCGATTTGTGTGTCTGTGTGTGCGTGTAAACATCGTGCGCGTGCCACAATT:1	AAGGTCTCTAAGGATAAGTCGA	ACATCGTGCGCGTGCCACAATT	+	chr3L	13001744	+	chr3L	18513054	5511310	+	chr3L	13001744	+	chr3L	18513054
AATTCAAATTTCACATCTTTCCACATGGGTTATCAACCATTTTGGTTGGGTATAGTTTCGT:1	AATTCAAATTTCACATCTTTCC	TTTTGGTTGGGTATAGTTTCGT	+	chr3L	25343655	+	chr3L	25346408	2753	+	chr3L	25343655	+	chr3L	25346408
AAATCGCGTCCTTATGCTTTTCCGATCTGGTAGCCCTGGTCTGTCCTGAGCGTTTAGCCG:1	AAATCGCGTCCTTATGCTTTTC	GTCTGTCCTGAGCGTTTAGCCG	-	chr2R	8518779	-	chr2R	12066188	3547409	+	chr2R	12066188	+	chr2R	8518779
AAGATTTTCTCGAACTGCAGACCACATACCTATGNATGTGGGCATTCTTCTGTTCATTCGGTCCATTCTGTATTC:1	AAGATTTTCTCGAACTGCAGAC	TCATTCGGTCCATTCTGTATTC	-	chr3R	12314358	-	chr3R	12314244	114	+	chr3R	12314244	+	chr3R	12314358
AACGTGCAAAAAAAAAAGGAGGAANACATAGCAGGGGAAAAGNGANAAAAANCTGNGCAAACAATAGAAAAATTG:1	AACGTGCAAAAAAAAAAGGAGG	TGNGCAAACAATAGAAAAATTG	-	chr3L	11327804	-	chr3L	14810996	3483192	+	chr3L	14810996	+	chr3L	11327804
CTTAAAACAAACAAAAAAAAAAACNAGAGAGAGAGAGAAAACNGANCGGATNAGGNAAATGGCATTAGATTGGTT:1	CTTAAAACAAACAAAAAAAAAA	GGNAAATGGCATTAGATTGGTT	+	chrX	13776729	+	chrX	11954377	1822352	+	chrX	13776729	+	chrX	11954377
GCATATTAGTGGTCCAAGAAGGAGAGCAAACAGTGGGGCTGGCGAT:1	GCATATTAGTGGTCCAAGAAGG	AGCAAACAGTGGGGCTGGCGAT	-	chr3L	10417315	-	chr3L	10414972	2343	+	chr3L	10414972	+	chr3L	10417315
GTCCACTTTGATGTGTTTNCGCAGCCAATTCCTAGACGCTGCCNCGCAANTAATTTGGCATTTCAATTTTGAGTT:1	GTCCACTTTGATGTGTTTNCGC	TTTGGCATTTCAATTTTGAGTT	-	chr3R	25236343	-	chr3R	25236204	139	+	chr3R	25236204	+	chr3R	25236343
ATGTGATGTCCGAGTTCGAACAACGGAAACAGATTTATTCATTCATCG:1	ATGTGATGTCCGAGTTCGAACA	AAACAGATTTATTCATTCATCG	-	chr2R	9052784	-	chr2R	9052730	54	+	chr2R	9052730	+	chr2R	9052784
TAACAATTTGTATCGAAATGAAGCGAAGATTCCATGAGATTCTCCTCCTCATTAAATAGGGTATTTGCAGCTCTT:1	TAACAATTTGTATCGAAATGAA	AAATAGGGTATTTGCAGCTCTT	-	chr3L	19528029	-	chr3L	19527950	79	+	chr3L	19527950	+	chr3L	19528029
GCACCAGATAGTAGCGCAGATAGCCACCCAGGGCATCGTATAGATATTTGGATAGGTTCTGCGCAGAGCGGGCG:1	GCACCAGATAGTAGCGCAGATA	TAGGTTCTGCGCAGAGCGGGCG	-	chr3R	27234321	-	chr3R	27240640	6319	+	chr3R	27240640	+	chr3R	27234321
CCATGCCGTCCGCGATCTAAAGACACTTCCATGGATATTCTCGGCAT:1	CCATGCCGTCCGCGATCTAAAG	CTTCCATGGATATTCTCGGCAT	-	chr2R	4603198	-	chr2R	4602871	327	+	chr2R	4602871	+	chr2R	4603198
GTNTGTATGTATATCTTTGTGCTCTGGGCAAATANTNTGACCGAAAATTTATTGAACATTTCCTTGGCTGAGCAA:1	GTNTGTATGTATATCTTTGTGC	GAACATTTCCTTGGCTGAGCAA	-	chrX	10343662	-	chrX	10343470	192	+	chrX	10343470	+	chrX	10343662
TTGGACAGGCGTCGCTTCTTGAAGCTCAGCACGTGCTCCTTCTCCTTGCGCTGCTG:1	TTGGACAGGCGTCGCTTCTTGA	GCTCCTTCTCCTTGCGCTGCTG	+	chr2R	22566199	+	chr2R	11587794	10978405	+	chr2R	22566199	+	chr2R	11587794
AACACGCTGCCAATACAAACAACACACAACTAAAAATCACAAGAAAAAAAATAAAAAATAAAAACAATTGC:1	AACACGCTGCCAATACAAACAA	AATAAAAAATAAAAACAATTGC	-	chr3R	30295519	-	chr3R	9001383	21294136	+	chr3R	9001383	+	chr3R	30295519
AAATGCCCACAGACCCCACTCATCGACTCACCAACTCACCAGCTCACCGACTCACCTGTTTGGCCTGGGTTATG:1	AAATGCCCACAGACCCCACTCA	CACCTGTTTGGCCTGGGTTATG	-	chr3R	29966143	-	chr3R	29966067	76	+	chr3R	29966067	+	chr3R	29966143
ATTGCCTAAGAATTGATACCAATTGTGTTAGACATTCGGCTGCTGATATTTTACCAGCCGCAGAATATT:1	ATTGCCTAAGAATTGATACCAA	ATTTTACCAGCCGCAGAATATT	+	chr3L	15085074	+	chr3L	15086234	1160	+	chr3L	15085074	+	chr3L	15086234
TAGCCAATAAATACACATGTCTCAGCTTGCTTTGAAATATATATATATATTTACATACTATACTATTCTCTCAAC:1	TAGCCAATAAATACACATGTCT	CATACTATACTATTCTCTCAAC	+	chrX	6171594	+	chrX	6179027	7433	+	chrX	6171594	+	chrX	6179027
ACAGTTACAAGGGCCCAAGATGGCAGCAGGACAAGGAATGTAGGATCGANAGGTAGGATGAAAAGGGNAGGGTGC:1	ACAGTTACAAGGGCCCAAGATG	TAGGATGAAAAGGGNAGGGTGC	-	chr3L	13532984	-	chr3L	13525188	7796	+	chr3L	13525188	+	chr3L	13532984
ATAGGGAAAAATGGTGAAAAGCAGGAAAAGTAGGAAAAGCAGAAGAAGCGAAAAAAAAGTTGCCAAGCCTCATAA:1	ATAGGGAAAAATGGTGAAAAGC	AAAAAGTTGCCAAGCCTCATAA	-	chrX	20575262	-	chrX	20575184	78	+	chrX	20575184	+	chrX	20575262
AAACAGTAAAAACATTTACTTGAAGATTATAATTATAAAGTTATATACGCTCATGTAATAATCATTGTGAGGTAC:1	AAACAGTAAAAACATTTACTTG	TGTAATAATCATTGTGAGGTAC	-	chr3L	18092909	-	chr3L	18092794	115	+	chr3L	18092794	+	chr3L	18092909
GGAAAACAACAAAGCTATAGCCTATGCTATGCAACTCAACCGGTGNGTTGT:1	GGAAAACAACAAAGCTATAGCC	TGCAACTCAACCGGTGNGTTGT	-	chr3R	28256371	-	chr3R	28255983	388	+	chr3R	28255983	+	chr3R	28256371
AATCGGAATCGAACATCTACCAACCACCATCCAAGATACACTCCCCTTTGATTTGGCGGAGTATCCTGTTCCGTG:1	AATCGGAATCGAACATCTACCA	TGGCGGAGTATCCTGTTCCGTG	-	chr3L	7600638	-	chr3L	19534461	11933823	+	chr3L	19534461	+	chr3L	7600638
AAAGAAGCTTACAAATAATCAGAACCAAAAACGATGAAGAATCTTGCACTCATATCAAGGGCTCACTGTTTCTGT:1	AAAGAAGCTTACAAATAATCAG	ATCAAGGGCTCACTGTTTCTGT	+	chrX	19500727	+	chrX	19500814	87	+	chrX	19500727	+	chrX	19500814
AAGAATGAGGAGCACATCCCGACATGTTTGCCCAGACGACAAACATAATAATTGCTGCAATTTAGCCACCACCAG:1	AAGAATGAGGAGCACATCCCGA	GCTGCAATTTAGCCACCACCAG	+	chr3L	21408487	+	chr3L	21408565	78	+	chr3L	21408487	+	chr3L	21408565
ATGCATGCGCTCGATGAGCTCATCGCCTAGGATAGATCTTTCCACCGCCTTTCGTGCTCTATTATTTTCACTCTC:1	ATGCATGCGCTCGATGAGCTCA	GTGCTCTATTATTTTCACTCTC	-	chr3R	19860048	-	chr3R	19859967	81	+	chr3R	19859967	+	chr3R	19860048
AGGAAGAGGAAAATCCCTCTAAGACTTGGTCGCCTGCACTCCTTTGCGCCATCAAACTGAGGAATTAAAAGGGAA:1	AGGAAGAGGAAAATCCCTCTAA	AAACTGAGGAATTAAAAGGGAA	+	chr2L	10479395	+	chr2L	10479477	82	+	chr2L	10479395	+	chr2L	10479477
AATGTTGCCCCATTATGCATCCATCCGGAAGAAATTTCTTTTTATTATTATGTCNTTTT:1	AATGTTGCCCCATTATGCATCC	CTTTTTATTATTATGTCNTTTT	-	chr2R	22574235	-	chr2R	22574171	64	+	chr2R	22574171	+	chr2R	22574235
TAAACCTCTTAAGAGAAGGAAATACCATAAGATTACCAATGTATATATTCATTTGTATATCCT:1	TAAACCTCTTAAGAGAAGGAAA	TATATATTCATTTGTATATCCT	+	chr2L	4923256	+	chr2L	4923335	79	+	chr2L	4923256	+	chr2L	4923335
CAACCACAATCCCAACAACAACCACAGATTCAACCACNACTACAANAGAATCGACAACTTCCAA:1	CAACCACAATCCCAACAACAAC	CAANAGAATCGACAACTTCCAA	+	chr3L	5483179	+	chr3L	5483074	105	+	chr3L	5483179	+	chr3L	5483074
GAGGGAAAAGTTTGTGTGGCTTATTTTTCGGTTACAAATCAAATACAAGGGATTAGGAGGGGCGGAATGGATGG:1	GAGGGAAAAGTTTGTGTGGCTT	TTAGGAGGGGCGGAATGGATGG	-	chr3R	26733047	-	chr3R	6994247	19738800	+	chr3R	6994247	+	chr3R	26733047
ATAATTGGTATAAACAATGTGTCTGAATATAAATGTTGCCTATATTATTGGTCAGCAAAATATTCCTCCCTGGCA:1	ATAATTGGTATAAACAATGTGT	AGCAAAATATTCCTCCCTGGCA	-	chrX	23003560	-	chrX	22996326	7234	+	chrX	22996326	+	chrX	23003560
ACCCAGTACCTCGGCGAAGATCAGGATNAGNNTCATGCCCACAAAAAGGNGNGATGATGTATTGACTGAGCTGAA:1	ACCCAGTACCTCGGCGAAGATC	ATGATGTATTGACTGAGCTGAA	-	chr3L	11473821	-	chr3L	2676616	8797205	+	chr3L	2676616	+	chr3L	11473821
CATTATTTTATTGTTGAACTTGTGCGGGCGATAAGAGGGGCTGGAGG:1	CATTATTTTATTGTTGAACTTG	GGGCGATAAGAGGGGCTGGAGG	-	chr3R	21150159	-	chr3R	21141706	8453	+	chr3R	21141706	+	chr3R	21150159
TACCACTCACAAAATAATACAAAAATCTATATACTACTCCCACATTTTCCACACCCACGGCAGAATAAATAAA:1	TACCACTCACAAAATAATACAA	CACCCACGGCAGAATAAATAAA	+	chr2L	202725	+	chr2L	18247816	18045091	+	chr2L	202725	+	chr2L	18247816
AGTTAAAAACTCGCGTATACGCCATGTTGTCAACTGGTTGGGCAGCAAAAAAACATAGCACACTTTTAAGCTTGA:1	AGTTAAAAACTCGCGTATACGC	CATAGCACACTTTTAAGCTTGA	+	chr3R	26642754	+	chr3R	26643148	394	+	chr3R	26642754	+	chr3R	26643148
CAGCATTAATATTTTGCCAGCAAGGCGAAAACGCGGTGGCTGCTTAAATTGTTTAATATCGCTCACAAGTTGCGG:1	CAGCATTAATATTTTGCCAGCA	TAATATCGCTCACAAGTTGCGG	-	chr2R	15276895	-	chr2R	15276808	87	+	chr2R	15276808	+	chr2R	15276895
CGAGCACGTCGTACAAAGAAGAAATATATTTACTTTTATTTGAAGCTTAAATCATACTTAATAACTAAGGTCATT:1	CGAGCACGTCGTACAAAGAAGA	ATACTTAATAACTAAGGTCATT	-	chr2R	22185782	-	chr2R	22185683	99	+	chr2R	22185683	+	chr2R	22185782
CTCTGCGTTGCTCCGTTTTTCACTTGCATTGATCGTCCTTGCATGTCCTCTTCGACACT:1	CTCTGCGTTGCTCCGTTTTTCA	CTTGCATGTCCTCTTCGACACT	-	chr3R	2541717	-	chr3R	2534164	7553	+	chr3R	2534164	+	chr3R	2541717
GTTCATCTTATCAGCCACAAGTTAGGGTAGCTGACTCGCAGAAATCTTGATAAGTAACAGGTAATCACGGAAGTA:1	GTTCATCTTATCAGCCACAAGT	GTAACAGGTAATCACGGAAGTA	-	chr2R	8714797	-	chr2R	8714710	87	+	chr2R	8714710	+	chr2R	8714797
TGTGGGGCACGGGATGTGGGCAGGGTTCGACCCATCATCAAATCAATGAGCGGCCTGATATAAGGGAGGAGCA:1	TGTGGGGCACGGGATGTGGGCA	GGCCTGATATAAGGGAGGAGCA	-	chr3R	28597585	-	chr3R	28597510	75	+	chr3R	28597510	+	chr3R	28597585
CATGCGAAACGAAAATAGAAAACAGAAAGCAAATATATTTAACCGTGTTCTGGCCTCTCACTTTACGGCAGC:1	CATGCGAAACGAAAATAGAAAA	TGGCCTCTCACTTTACGGCAGC	+	chr3R	15432305	+	chr3R	9879525	5552780	+	chr3R	15432305	+	chr3R	9879525
CAAAGCTAAAGANACTTGCTGTTTTTGTCCAGTGCCACAATGTCTGTCTGGTGACGG:1	CAAAGCTAAAGANACTTGCTGT	CACAATGTCTGTCTGGTGACGG	+	chrX	20504146	+	chrX	20505649	1503	+	chrX	20504146	+	chrX	20505649
AATAAGGTGAAGATTGCAAANGCAAATGTACANAGCTATGTTNGTGTTTCTGTGGATCGATACCTAATGAAATGT:1	AATAAGGTGAAGATTGCAAANG	GGATCGATACCTAATGAAATGT	+	chrX	441020	+	chrX	441098	78	+	chrX	441020	+	chrX	441098
TATATTTGAAATCGTTTGTTTTGAAGCCAGACGGACGCAGAAATTGCTGTTTATTTTTTAATGAAAGCATTTTA:1	TATATTTGAAATCGTTTGTTTT	ATTTTTTAATGAAAGCATTTTA	-	chr3L	27266898	-	chr3L	27266795	103	+	chr3L	27266795	+	chr3L	27266898
ATGTGTCAAATTGATAAAGAAAGTTTACGGAAGATTTTCATTAGTGTGTGAGGCACAACAGAAATTCTAAAATTC:1	ATGTGTCAAATTGATAAAGAAA	CACAACAGAAATTCTAAAATTC	+	chrY	104707	+	chrY	104813	106	+	chrY	104707	+	chrY	104813
ACTCCAAATGATGATGCGATGTTGATTTAATTGGCATGATNATGTGGCATTCGCGATGCAT:1	ACTCCAAATGATGATGCGATGT	TNATGTGGCATTCGCGATGCAT	+	chrX	12038103	+	chrX	12038283	180	+	chrX	12038103	+	chrX	12038283
GCTGACTTTTACCCATTGTAAGTGTCGTTTATTGACTTGCGATTATCGCAGTGTCACTT:1	GCTGACTTTTACCCATTGTAAG	TGCGATTATCGCAGTGTCACTT	-	chr3R	18891912	-	chr3R	18891845	67	+	chr3R	18891845	+	chr3R	18891912
GCTGCTTGAGTTTGGGCACTTGGCAATTTACTGCGCTGGCGACAATAAAACGGGTCCGAAACATTCGATGA:1	GCTGCTTGAGTTTGGGCACTTG	ACGGGTCCGAAACATTCGATGA	-	chr3R	30473803	-	chr3R	30473691	112	+	chr3R	30473691	+	chr3R	30473803
TCGAGGACGTGCACGTGCTTGCGCGCATCATTGAGGTTAGGTTATGCTTGCATGGCACTTGCAACAAAAAATA:1	TCGAGGACGTGCACGTGCTTGC	ATGGCACTTGCAACAAAAAATA	-	chrX	6571301	-	chrX	6562821	8480	+	chrX	6562821	+	chrX	6571301
AAATTATCAGTTTGCAAGTCCAAAACGGGCATAAATCATAGATCGATNTGAATTACATACATTCATCCTCGCACT:1	AAATTATCAGTTTGCAAGTCCA	TACATACATTCATCCTCGCACT	+	chr3R	15452289	+	chr3R	15452366	77	+	chr3R	15452289	+	chr3R	15452366
ATTTGACCATTATAACATTTGCTTTTAATTCATATTGCATTGATAGAAATTCGAAAAACTTTGCGTTCTATTTAT:1	ATTTGACCATTATAACATTTGC	AAAAACTTTGCGTTCTATTTAT	+	chr3L	11105299	+	chr3L	11107010	1711	+	chr3L	11105299	+	chr3L	11107010
AGTTGCAGCAGAATGTTGCAGGGGATAATNTTGCCACAAGCCTTCGAACGTCCCTCTTGCNGCGC:1	AGTTGCAGCAGAATGTTGCAGG	TCGAACGTCCCTCTTGCNGCGC	-	chr2R	19797523	-	chr2R	7114251	12683272	+	chr2R	7114251	+	chr2R	19797523
TATAACTATAGAAAATATATAGACATTTTTAAAAAATTAAAAAGAAACCCCATCTCCGTGACAATGTTTATTTCA:1	TATAACTATAGAAAATATATAG	CTCCGTGACAATGTTTATTTCA	+	chr2R	12334891	+	chr2R	12334969	78	+	chr2R	12334891	+	chr2R	12334969
GTTGCTGTGGTGCTATGTGTGTATATCTTTCTTTTTTCTTGGTCTCTGCTTTGACTTTTATTTATTGTTTTGCTT:1	GTTGCTGTGGTGCTATGTGTGT	ACTTTTATTTATTGTTTTGCTT	-	chr2R	21452341	-	chr2R	10777292	10675049	+	chr2R	10777292	+	chr2R	21452341
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACAAAACACA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	CAACACAACAAAACAAAACACA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	17389054	4518480	+	chr3R	21907534	+	chr3R	17389054
TAACGCGCAATCCTATTACGACAGTAATATGTAAGTAAAAGGTTTTCAATCTTTTTAGAATTCAGCTGCAGAAC:1	TAACGCGCAATCCTATTACGAC	TTTTAGAATTCAGCTGCAGAAC	+	chr3L	21872434	+	chr3L	21872512	78	+	chr3L	21872434	+	chr3L	21872512
CTCCACCTGCAACGAGCTCCGTGCAACGGGCACCGGTTCCCACACAGCCCACTAG:1	CTCCACCTGCAACGAGCTCCGT	CGGTTCCCACACAGCCCACTAG	+	chr2R	12417484	+	chr2R	12417544	60	+	chr2R	12417484	+	chr2R	12417544
ATTTTCGAGGGGTTGGTCTGGTGCATGAATTTATCGGAAACTTCACACAAATGCGGCGAATTGCT:1	ATTTTCGAGGGGTTGGTCTGGT	CACACAAATGCGGCGAATTGCT	-	chr3L	2479112	-	chr3L	2479025	87	+	chr3L	2479025	+	chr3L	2479112
TTTTGTCAGTTGTCTGAAAATTGTTGTTTTTTGTTGGAAATTGCGGTTAATTGAATTCACTGAACTGGGGTCACA:1	TTTTGTCAGTTGTCTGAAAATT	AATTCACTGAACTGGGGTCACA	+	chr2L	13616899	+	chr2L	13617012	113	+	chr2L	13616899	+	chr2L	13617012
CAGTTTCACGATTTTAACTGGCTTGAAATGTGTTGCTAAAAATTAAATGTTGTTTGAAATCATGCAAACATTA:1	CAGTTTCACGATTTTAACTGGC	GTTTGAAATCATGCAAACATTA	+	chr3R	19490464	+	chr3R	19490551	87	+	chr3R	19490464	+	chr3R	19490551
TGAAAATGGCGCGTCGAAAAACAGAAGCTTGCCAAGTACAATTCGCGAGGGGCGAAGGTCGGTCATAGATTCA:1	TGAAAATGGCGCGTCGAAAAAC	GCGAAGGTCGGTCATAGATTCA	+	chr3R	17091811	+	chr3R	8615567	8476244	+	chr3R	17091811	+	chr3R	8615567
AAGTATGCTCAGGAATAATAATAATGTCTTGATCTGAACTTTTTAAATTTTCTCATTATTTTCTGCGCCAAAAAA:1	AAGTATGCTCAGGAATAATAAT	CATTATTTTCTGCGCCAAAAAA	+	chr3R	29332295	+	chr3R	29332372	77	+	chr3R	29332295	+	chr3R	29332372
CGACCGACTTTTGAGTTCCTTTTAGCTTCTGATAAGGCCATTATGATAAGGCCAAAGTTAACAAAGGTTACAGCG:1	CGACCGACTTTTGAGTTCCTTT	AAAGTTAACAAAGGTTACAGCG	-	chr3R	14070209	-	chr3R	14070128	81	+	chr3R	14070128	+	chr3R	14070209
TAAGTTTCTGCTTTTCTTTTATGCCCGCACATGTGTGTGCTTGCAA:1	TAAGTTTCTGCTTTTCTTTTAT	CCGCACATGTGTGTGCTTGCAA	-	chr3R	27148127	-	chr3R	27140546	7581	+	chr3R	27140546	+	chr3R	27148127
AAGACAAGACAAGACAAGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACA:1	AAGACAAGACAAGACAAGACAG	CAGGACAGGACAGGACAGGACA	-	chr2L	21768291	-	chr2L	19024097	2744194	+	chr2L	19024097	+	chr2L	21768291
TGTGTGCGTGTGTCCCTGAGTGTGTGTACGGCTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGT:1	TGTGTGCGTGTGTCCCTGAGTG	CTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGT	-	chrX	10183073	-	chrX	2457420	7725653	+	chrX	2457420	+	chrX	10183073
TGCCAATCATTTGGAAGCTATGCGATGTCCGCCCCCGAAAACGGGATGCATAACTTCCTATCCACA:1	TGCCAATCATTTGGAAGCTATG	GATGCATAACTTCCTATCCACA	-	chr3L	17327678	-	chr3L	17327598	80	+	chr3L	17327598	+	chr3L	17327678
TGGAAAGGGAAGGGAACGAAAGTTTCGAAGATATCCCTTTGAGCTCCGTTTAAACCGACGAGCAGCCGATTAACT:1	TGGAAAGGGAAGGGAACGAAAG	ACCGACGAGCAGCCGATTAACT	+	chr2R	23243375	+	chr2R	23243460	85	+	chr2R	23243375	+	chr2R	23243460
ATAAACTTTGCTCGATTTTTTTGCATGAAATTTNAATTTTCCACCTGCAACTAAAACNACTT:1	ATAAACTTTGCTCGATTTTTTT	CCACCTGCAACTAAAACNACTT	+	chr2R	17982940	+	chr2R	17983012	72	+	chr2R	17982940	+	chr2R	17983012
CAAGACCGNTCTCAGACTTTGAAGCTCTGAAAGCCAAGTCCCAAGTCTGCGATTCAGATTTTGACTGAGACACCG:1	CAAGACCGNTCTCAGACTTTGA	TCAGATTTTGACTGAGACACCG	+	chr2L	14621383	+	chr2L	14621483	100	+	chr2L	14621383	+	chr2L	14621483
CGGCTCAGCTCGGTTTGGCTCGTTTCGGATTGGNTTGCTTTGGTTTCTGGATTT:1	CGGCTCAGCTCGGTTTGGCTCG	GNTTGCTTTGGTTTCTGGATTT	+	chr3R	19079505	+	chr3R	7926489	11153016	+	chr3R	19079505	+	chr3R	7926489
CAGTAACGCAAAATGCCAAATTTTAATCGTCTTAACATTATTCGAGGTAAATGAAGCTTTACAAATGTTACAAAT:1	CAGTAACGCAAAATGCCAAATT	AAGCTTTACAAATGTTACAAAT	-	chr3L	23101995	-	chr3L	23101892	103	+	chr3L	23101892	+	chr3L	23101995
AATGTTTCCACAGAATGCATGCCAAATATTTAATTAGGTTTGCTAACTGNTATACGTATAATTTATTAACATCTA:1	AATGTTTCCACAGAATGCATGC	ACGTATAATTTATTAACATCTA	+	chr2L	16134621	+	chr2L	16134721	100	+	chr2L	16134621	+	chr2L	16134721
TTATTTTATTGTTGTATGGAAGTAAAATGAAAGTGGGGCCTTTTGTTGGCAGCTCTTTAAAGGAAGAAAATCTCT:1	TTATTTTATTGTTGTATGGAAG	TCTTTAAAGGAAGAAAATCTCT	+	chr2L	686935	+	chr2L	695975	9040	+	chr2L	686935	+	chr2L	695975
AAGTGCTTATGTGCAGTGCTTTTCAGTACCAATGAAAGCTTTCCGACCAACTAGCGTTCAATTTCGTTCAGTGCA:1	AAGTGCTTATGTGCAGTGCTTT	GCGTTCAATTTCGTTCAGTGCA	+	chrX	3408997	+	chrX	3409074	77	+	chrX	3408997	+	chrX	3409074
GGTGTTTTATGGAGCGTTGTCCTTGTTTGTCCTCTTTGTTTATCAATCTCACTCTTTTGTCAGTCGCCTTTATTT:1	GGTGTTTTATGGAGCGTTGTCC	CTTTTGTCAGTCGCCTTTATTT	-	chr3R	8356053	-	chr3R	8355970	83	+	chr3R	8355970	+	chr3R	8356053
ACCATTGCCTTTACATTTATNCAGCGCTCAACNAGTTTATTANCGCCAGACTCCACTGCCCTTAGTATATCAATA:1	ACCATTGCCTTTACATTTATNC	CACTGCCCTTAGTATATCAATA	+	chrX	3880462	+	chrX	3880548	86	+	chrX	3880462	+	chrX	3880548
TGGAACCGCAGTGCGCTTCTTTGCATCAATGCAATCCCTTAATTGCACTTTAAAATCTTTTACATGCAGCTTGT:1	TGGAACCGCAGTGCGCTTCTTT	AAATCTTTTACATGCAGCTTGT	+	chr3R	31805136	+	chr3R	31805211	75	+	chr3R	31805136	+	chr3R	31805211
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAAC:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACACAACACAACACACCACAAC	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
AGTTGTTTAGAGTGTATTATACGATATTTTCTCCTATAAACACAACCTAAATAAAGAGTATCGCGCTAAGCTTCT:1	AGTTGTTTAGAGTGTATTATAC	AAGAGTATCGCGCTAAGCTTCT	-	chr3R	6890392	-	chr3R	6890206	186	+	chr3R	6890206	+	chr3R	6890392
TATATGTTTGGAAAAAAATATATATAAATAGGGATTGGAAACAAAATATATCTGCTTTAATATAAATTCATTTAT:1	TATATGTTTGGAAAAAAATATA	GCTTTAATATAAATTCATTTAT	-	chr3L	11678196	-	chr3L	11678109	87	+	chr3L	11678109	+	chr3L	11678196
GAGCAGCAATTGCAAAACCGTCATTGCGCCACCAAGCTCTGATATGAACTGATTGCATATTGCAGTGATTAA:1	GAGCAGCAATTGCAAAACCGTC	GATTGCATATTGCAGTGATTAA	-	chr2R	15700383	-	chr2R	15700271	112	+	chr2R	15700271	+	chr2R	15700383
GTAATTAAAGCGAAAAACTGCAATGCATAAACTTAAAGGCAGATGAAAAGCACATTTTGTTCACCCACAGCTATT:1	GTAATTAAAGCGAAAAACTGCA	ATTTTGTTCACCCACAGCTATT	+	chr2L	9297392	+	chr2L	9297469	77	+	chr2L	9297392	+	chr2L	9297469
GTAACGTTAGTTACTATAACTTAACGAAACCATTATTATGTAACTACAAGAAAGGGAAACCCATGCATTATCCAT:1	GTAACGTTAGTTACTATAACTT	GGGAAACCCATGCATTATCCAT	-	chr3R	19094620	-	chr3R	21958670	2864050	+	chr3R	21958670	+	chr3R	19094620
AGTTCGCAACCCTTTTTTTCACACCTTTTCCCAGTTTTCTGCTTGGACAGCTGCTTTTCCACACATGTACAGGTT:1	AGTTCGCAACCCTTTTTTTCAC	CTTTTCCACACATGTACAGGTT	-	chr2L	17120232	-	chr2L	4042987	13077245	+	chr2L	4042987	+	chr2L	17120232
GATTTCATTACGTATGTATGTGTGCATGTGGGCGCTCCCTCCTCTCTCTCACTCTCCT:1	GATTTCATTACGTATGTATGTG	CCCTCCTCTCTCTCACTCTCCT	-	chr3R	17927322	-	chr3R	17925872	1450	+	chr3R	17925872	+	chr3R	17927322
TGAATTGTCCATTTTAGATTGGGGGCTTTGGCATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTCCCTGTCTCATCAATTAATC:1	TGAATTGTCCATTTTAGATTGG	TTCCCTGTCTCATCAATTAATC	-	chr2L	14809114	-	chr2L	14803911	5203	+	chr2L	14803911	+	chr2L	14809114
CTCCTGACGCCCGCGTCCTTTTTATCAGCTTCGCGAGGATTAACCCTCTAACTTTTTTCGATTTTTCAGGCTTT:1	CTCCTGACGCCCGCGTCCTTTT	TTTTTTCGATTTTTCAGGCTTT	-	chr3R	28035590	-	chr3R	28035514	76	+	chr3R	28035514	+	chr3R	28035590
GGCTAAGATTTCCTATAAGTAAATCTAAATACGAATCTACACAAAATTAAATGTATCTCAGTGAAATNCACTGGC:1	GGCTAAGATTTCCTATAAGTAA	TATCTCAGTGAAATNCACTGGC	+	chr3L	11846414	+	chr3L	11846522	108	+	chr3L	11846414	+	chr3L	11846522
GGTGTGTGTTTTTTTCAAAATTTTTGGGGTCATTTTGAGCCTCAGTTGTCCTGGTTGCCTTCCTTCCTCTCTGC:1	GGTGTGTGTTTTTTTCAAAATT	GGTTGCCTTCCTTCCTCTCTGC	+	chrX	10790780	+	chrX	960063	9830717	+	chrX	10790780	+	chrX	960063
CATTCGCCCTTGTAATCCTCNAGTGGATGCAANGGATGTCGCNGCCGGGAGACAAACCGATTTTCTTGCGAGAAG:1	CATTCGCCCTTGTAATCCTCNA	AAACCGATTTTCTTGCGAGAAG	-	chr2L	3403773	-	chr2L	3403579	194	+	chr2L	3403579	+	chr2L	3403773
ATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTTCCTGTCTCATCAATTAATCTCGTTTGCAGCGTTTACTCAAATCAAT:1	ATTGCCCATTTGGGCTTCGGTT	TGCAGCGTTTACTCAAATCAAT	-	chr2L	14809082	-	chr2L	14803884	5198	+	chr2L	14803884	+	chr2L	14809082
CGTATCCTTTAAATGTTTTTTGGCCACGATTTTTTGAACATTTTAATTCACTAAGCAGGTGAGCTGCACAC:1	CGTATCCTTTAAATGTTTTTTG	ACTAAGCAGGTGAGCTGCACAC	-	chr3R	19447273	-	chr3R	19446264	1009	+	chr3R	19446264	+	chr3R	19447273
AAGTGGGCAGCAGTCCTGGCGACATTGCTTCACACTGCTATTTCGTCCTCGGCACTCTTTCATTCCGAACTCAAT:1	AAGTGGGCAGCAGTCCTGGCGA	ACTCTTTCATTCCGAACTCAAT	-	chr2L	2667723	-	chr2L	2667644	79	+	chr2L	2667644	+	chr2L	2667723
CTTGCCTCTGTGGGCTTTCCTGCTGGGCTGCTCGTACAGCCAGTTACTTGACCAAA:1	CTTGCCTCTGTGGGCTTTCCTG	TACAGCCAGTTACTTGACCAAA	+	chr2L	18243707	+	chr2L	18244323	616	+	chr2L	18243707	+	chr2L	18244323
GAAAAAGCCGGGCGGCGGTAAACGCAAGAAGAACAAGAAGGGCGGCAAGCGCAGGGGCAATGTGGGAATTTGG:1	GAAAAAGCCGGGCGGCGGTAAA	CAGGGGCAATGTGGGAATTTGG	+	chr3L	3287761	+	chr3L	6368386	3080625	+	chr3L	3287761	+	chr3L	6368386
GTTATTGTTATTGTTATTTTTATTTTTGTACTCTTTACGTAAAACAGGTTTGCTAAATTTA:1	GTTATTGTTATTGTTATTTTTA	TAAAACAGGTTTGCTAAATTTA	-	chrX	12273461	-	chrX	4930407	7343054	+	chrX	4930407	+	chrX	12273461
CTTGTGGATTTGGTCCTTTACTCCACTTCCTCTGCTTTCTTTTTGCAGCGTTTCGGTTGGGACATCAGCTGCTC:1	CTTGTGGATTTGGTCCTTTACT	TCGGTTGGGACATCAGCTGCTC	+	chr3R	4861566	+	chr3R	4861646	80	+	chr3R	4861566	+	chr3R	4861646
GCCGTGCTGCATTAGACAAATCAATTATGCTGACTTTATTTGGGAGGGGCATTGCAGATAAGCTGATCAG:1	GCCGTGCTGCATTAGACAAATC	GCATTGCAGATAAGCTGATCAG	+	chr3R	19815041	+	chr3R	19815115	74	+	chr3R	19815041	+	chr3R	19815115
CAATGCGGTCAAAGGTAGCAAAACCACAAAACTGTGTNCCAGAAGNAGAACCTTTTCAAGT:1	CAATGCGGTCAAAGGTAGCAAA	CAGAAGNAGAACCTTTTCAAGT	-	chr2L	15031810	-	chr2L	15031584	226	+	chr2L	15031584	+	chr2L	15031810
GAGAGAGGGGAAGAGGGGCCTAGAAAGAGAAAGGGGAACAGGGCACGAGAAAGANAGGGCTGGACTCGCACAGAG:1	GAGAGAGGGGAAGAGGGGCCTA	ANAGGGCTGGACTCGCACAGAG	+	chr2R	23437236	+	chr2R	23437313	77	+	chr2R	23437236	+	chr2R	23437313
AAAAATTGGCAAGACAAATAAAATAAAATGAAAATTCTATCATCTGTTGCTTCCGGGCAATGCAAATGTGATT:1	AAAAATTGGCAAGACAAATAAA	TCCGGGCAATGCAAATGTGATT	+	chr3L	23127757	+	chr3L	19781635	3346122	+	chr3L	23127757	+	chr3L	19781635
TTACTTAATAACTTTTCAAAACTGTTCAGTATATATGTATATATTTGCATTACCTACATATATATGTATATATTA:1	TTACTTAATAACTTTTCAAAAC	CTACATATATATGTATATATTA	-	chr2R	6959757	-	chr2R	6952177	7580	+	chr2R	6952177	+	chr2R	6959757
GAATTGGGCTTGGTTTTAGGGTTTGTGGGTCATGGATCGGGGTTCCGTGCGTATACATGCGATTGTACCCATCAA:1	GAATTGGGCTTGGTTTTAGGGT	TACATGCGATTGTACCCATCAA	-	chr2R	10388097	-	chr2R	10388000	97	+	chr2R	10388000	+	chr2R	10388097
ACACGTGGTTGCTCACATNGGCCAGCCTGTAGACATGCTGGNAGANGAACAAAAAGGTAACTAAAAAAAAAATA:1	ACACGTGGTTGCTCACATNGGC	AAAGGTAACTAAAAAAAAAATA	-	chrX	16890494	-	chrX	16868772	21722	+	chrX	16868772	+	chrX	16890494
AGCTTCTGAAGGCGAGCACAGGGCTATCGCCCGCAAAGTGACTTGTAAACATTTTAGCAA:1	AGCTTCTGAAGGCGAGCACAGG	TGACTTGTAAACATTTTAGCAA	+	chr3R	29550283	+	chr3R	29550349	66	+	chr3R	29550283	+	chr3R	29550349
ATTGCTGGCTAAGTTTAGCATGCATGCCGAAGAGACCGTAAATATTTTAAAGCCAGATGCCAAACTGTTGCATAC:1	ATTGCTGGCTAAGTTTAGCATG	CAGATGCCAAACTGTTGCATAC	-	chr3R	28255866	-	chr3R	28253356	2510	+	chr3R	28253356	+	chr3R	28255866
CTCCAACCGAAATGAAAATACACAAATTCACACGAATACCAAACAAACTTCATTTTTAGCTGTGAAAGTTTCTCG:1	CTCCAACCGAAATGAAAATACA	TTTTAGCTGTGAAAGTTTCTCG	+	chr3R	23981542	+	chr3R	18693667	5287875	+	chr3R	23981542	+	chr3R	18693667
AAGAAGACGTTGGCTAGGAACAAGAACAAGAAGATGGCGAGGAAGCAGA:1	AAGAAGACGTTGGCTAGGAACA	AAGAAGATGGCGAGGAAGCAGA	+	chr2R	24727918	+	chr2R	24735400	7482	+	chr2R	24727918	+	chr2R	24735400
GAATACTATCCCACACACTATCTGACCCGTAATATTCATTTGATGATCCATCAAATCATCGGATTAAGCTGCTT:1	GAATACTATCCCACACACTATC	AAATCATCGGATTAAGCTGCTT	-	chrX	2578915	-	chrX	2578824	91	+	chrX	2578824	+	chrX	2578915
CAAGACCGAGTTGTAGACTCCGATAAAAACTGCGGTAACGTCGGGATCACCAAATGTTTATGGGAAGACAACCTA:1	CAAGACCGAGTTGTAGACTCCG	ATGTTTATGGGAAGACAACCTA	-	chr2R	537968	-	chr2R	529343	8625	+	chr2R	529343	+	chr2R	537968
AGTGCAGTGCAAATAATAATAACCCCACGTAACACGCAAATCGGACTCTNATTCGAAAAACAGGTAAAAGTCAAT:1	AGTGCAGTGCAAATAATAATAA	CGAAAAACAGGTAAAAGTCAAT	-	chr3L	22570595	-	chr3L	22570451	144	+	chr3L	22570451	+	chr3L	22570595
AAAAATCGCGTCCTTATGCTTTTCCGATCTGGTAGCCCTGGTCTGTCCT:1	AAAAATCGCGTCCTTATGCTTT	TCTGGTAGCCCTGGTCTGTCCT	-	chr2R	8518781	-	chr2R	12066201	3547420	+	chr2R	12066201	+	chr2R	8518781
TACGGCTTAACAGTGTTCTAACAGCACGAATTCGATGCAAAATTTCTGAAGAGGAATGGAACACGTTCAGGTTTG:1	TACGGCTTAACAGTGTTCTAAC	GAATGGAACACGTTCAGGTTTG	+	chr2L	17260878	+	chr2L	17260961	83	+	chr2L	17260878	+	chr2L	17260961
TGTAATAATGCATTTTAGTTCCTAATAGAAGGCACAAACATAATAGTGAAAGCTACTGCATACACTCATTACA:1	TGTAATAATGCATTTTAGTTCC	GCTACTGCATACACTCATTACA	-	chr3R	17895431	-	chr3R	17895344	87	+	chr3R	17895344	+	chr3R	17895431
GGGGCCACTCGATGGAACTTCAACAGCAGGCGACGAAATGTTTTGGTTTTGTTAATTCATTTTAGTATTAATTTG:1	GGGGCCACTCGATGGAACTTCA	AATTCATTTTAGTATTAATTTG	+	chr3L	9811026	+	chr3L	3958421	5852605	+	chr3L	9811026	+	chr3L	3958421
AACAGCGGCTCACAGGGCATACATCCTAGTCAGAGGCAATCGACGCAATTAAAATTTCTTANGG:1	AACAGCGGCTCACAGGGCATAC	ACGCAATTAAAATTTCTTANGG	-	chr3R	13376377	-	chr3R	13376299	78	+	chr3R	13376299	+	chr3R	13376377
TGCGAGATTACGCTGCGTCTTCGTGCCCGTGGACGTGACCTCCGAGAAGGAT:1	TGCGAGATTACGCTGCGTCTTC	GGACGTGACCTCCGAGAAGGAT	+	chrX	16399220	+	chrX	18092113	1692893	+	chrX	16399220	+	chrX	18092113
AGGCATATAATGCATTATGTATACGTCAGGTGAAAAGAAGTCATTTTGAGATTGTTTCCAGTGCATACTTTTAGA:1	AGGCATATAATGCATTATGTAT	GTTTCCAGTGCATACTTTTAGA	-	chr3R	28302555	-	chr3R	28302113	442	+	chr3R	28302113	+	chr3R	28302555
TGTCTATTCAGACGAGAACTGATACGGGCCAAAACACAGAGTGTGGCCAAGTTGGGCATAATGCGGAAGCTAAAA:1	TGTCTATTCAGACGAGAACTGA	GGGCATAATGCGGAAGCTAAAA	+	chr3R	13195957	+	chr3R	13196052	95	+	chr3R	13195957	+	chr3R	13196052
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACCCAAAANTCCCAAACCTCACNTGAAGAACACACA:1	CACAACACAACACAACACAACA	AACCTCACNTGAAGAACACACA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	3566575	18340960	+	chr3R	21907535	+	chr3R	3566575
CTTTTAGTGATTTATCTTATCAGTATTGGGCACGATCACTTTCGGCTCTAAGGCGGAGAAAAGGGCTTAAAGAC:1	CTTTTAGTGATTTATCTTATCA	GCGGAGAAAAGGGCTTAAAGAC	+	chr2L	3649805	+	chr2L	3655006	5201	+	chr2L	3649805	+	chr2L	3655006
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACNNNANACCACACAACACAACACAACACAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	CACACAACACAACACAACACAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801
TCTAGGAGGCTCCACACAGTAAGAAATTCATAGAAAACACGTAGCCTGTTAAGTTCGGTGTCTAAAAGTGTGCAG:1	TCTAGGAGGCTCCACACAGTAA	TTCGGTGTCTAAAAGTGTGCAG	+	chr3R	30480504	+	chr3R	30482972	2468	+	chr3R	30480504	+	chr3R	30482972
AAAGGACCTTTTGTATTCATGGACTGTAGTAAAGAAAGAGGGCACATCGAAAGTCAGAAGGGTCGTCAAGCAATC:1	AAAGGACCTTTTGTATTCATGG	TCAGAAGGGTCGTCAAGCAATC	+	chr3R	4759744	+	chr3R	4761241	1497	+	chr3R	4759744	+	chr3R	4761241
AATAATATTAATAATAATATTTATTCTCATAA:1	AATAATATTAATAATAATATTT	ATAATAATATTTATTCTCATAA	-	chr2R	23272304	-	chr2R	22558144	714160	+	chr2R	22558144	+	chr2R	23272304
AAATGACTGCAGTGGTAGCCAATTTGAGGAGTGTACATGCATAAACANGGAATCACATTACNTTTAGTTGCTGGC:1	AAATGACTGCAGTGGTAGCCAA	CACATTACNTTTAGTTGCTGGC	+	chr2L	11538824	+	chr2L	11538909	85	+	chr2L	11538824	+	chr2L	11538909
TCAGAAGTCTTGGCTATCAAAAGATTAAATTGGAGACCCCGAAGGCA:1	TCAGAAGTCTTGGCTATCAAAA	TAAATTGGAGACCCCGAAGGCA	+	chr3R	11841097	+	chr3R	11846260	5163	+	chr3R	11841097	+	chr3R	11846260
GTGATTACCTGTTACTTATCAAGATTTCTGCAAGTCAGCTACCCTAACTTGTGGCTGATAAGATGAACTATA:1	GTGATTACCTGTTACTTATCAA	GTGGCTGATAAGATGAACTATA	+	chr2R	8714717	+	chr2R	8714801	84	+	chr2R	8714717	+	chr2R	8714801
AAATAATGTATCTTACGACTACAGCAACACACACACACACACCACACACACGTGCGCGTGTTGAAGAGGACAGGC:1	AAATAATGTATCTTACGACTAC	GCGCGTGTTGAAGAGGACAGGC	-	chr3R	27565172	-	chr3R	27338027	227145	+	chr3R	27338027	+	chr3R	27565172
AACTGGACACCAAACGAGTTTTGTCGCACTCGCACACACCCGCAAAATTCTCCCTCAGTTGCATCGCACAGACGT:1	AACTGGACACCAAACGAGTTTT	CTCAGTTGCATCGCACAGACGT	+	chr2R	6500961	+	chr2R	6501056	95	+	chr2R	6500961	+	chr2R	6501056
TTACCATACTATACTAGGCTGTACCACGTTTACAACTTAGGCAAATCACTAAATAAT:1	TTACCATACTATACTAGGCTGT	CTTAGGCAAATCACTAAATAAT	+	chr3R	5822411	+	chr3R	5823560	1149	+	chr3R	5822411	+	chr3R	5823560
TCGCATTAACTATTTTCGGTGCCGTATTAGAGGCGAAAGCACTGACTATTGCTATACTATTCTTGCGTAGTTTTC:1	TCGCATTAACTATTTTCGGTGC	ATACTATTCTTGCGTAGTTTTC	+	chr3R	8441996	+	chr3R	20574425	12132429	+	chr3R	8441996	+	chr3R	20574425
AGCTTAAAGCACCTCAAATTCACATTTCTTTCTGACGTCGGCTTTTTGTGGGTTTTGCTGGGATGGTTGGCTGG:1	AGCTTAAAGCACCTCAAATTCA	TTTTGCTGGGATGGTTGGCTGG	-	chr3R	19140710	-	chr3R	19140263	447	+	chr3R	19140263	+	chr3R	19140710
GATAAGACCGATGCAGCTACCGGGACCTTCCGAAACCTGGACCTCCAAAGCCGGGACGTCCAAAGACAG:1	GATAAGACCGATGCAGCTACCG	AAGCCGGGACGTCCAAAGACAG	+	chr2L	9361165	+	chr2L	5958275	3402890	+	chr2L	9361165	+	chr2L	5958275
CAATGCAACAAAATGAGATCGTATTTGGCCCTCCAAATCCAGCAATTAGGCTTGGATAATTAGTCTGTATTAAAT:1	CAATGCAACAAAATGAGATCGT	GGATAATTAGTCTGTATTAAAT	+	chr3R	21734878	+	chr3R	21734954	76	+	chr3R	21734878	+	chr3R	21734954
ACACACATATTATGGTTTGATCACTCGCTCTCACTCCCTATTCTGAGCATGGTTATACCATATACTGGACAT:1	ACACACATATTATGGTTTGATC	GGTTATACCATATACTGGACAT	-	chr2R	24489803	-	chr2R	24489695	108	+	chr2R	24489695	+	chr2R	24489803
GTGCTGACCTTGTTTGATTTAAGGTTGTGGCCCTGTCCATTCCCATTCCCATCCTCGTTTCTGGCCCATTGAGTG:1	GTGCTGACCTTGTTTGATTTAA	CTCGTTTCTGGCCCATTGAGTG	+	chr3L	11740141	+	chr3L	11740239	98	+	chr3L	11740141	+	chr3L	11740239
ATNATAATGGGACCACCTTTGCCGACCACTGAATCCNCTGT:1	ATNATAATGGGACCACCTTTGC	TGCCGACCACTGAATCCNCTGT	-	chr2R	1233384	-	chr2R	2747072	1513688	+	chr2R	2747072	+	chr2R	1233384
ATCTTGAACTTGCAGTACGACAACTGCGACAANCCTTGTTTGCCAGGCCGCGATGCAGTTCCTCCTNTTCCT:1	ATCTTGAACTTGCAGTACGACA	CGATGCAGTTCCTCCTNTTCCT	+	chr3L	1627324	+	chr3L	1627017	307	+	chr3L	1627324	+	chr3L	1627017
GCCAATTATGACGACAGCTTAATTGAACTCAACAAAAGTTCAGTGATCAAGCTGAGCCTTTTTCG:1	GCCAATTATGACGACAGCTTAA	TGATCAAGCTGAGCCTTTTTCG	+	chr2R	13590101	+	chr2R	13589992	109	+	chr2R	13590101	+	chr2R	13589992
CACAACACAACACAACACANCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAA:2	CACAACACAACACAACACANCA	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
ATTAAAAAATTTGTAGCCATTCGGCTGTCCATGAAGGTTGAATTGTGGGGCAGAAAA:1	ATTAAAAAATTTGTAGCCATTC	GGTTGAATTGTGGGGCAGAAAA	-	chr2L	11947107	-	chr2L	11947017	90	+	chr2L	11947017	+	chr2L	11947107
GCGCCGCATGTACATGCTACCAATTGATACGACAATAGCAATAATCTCCTCGTCACGGGCAATGTGGCATACTT:1	GCGCCGCATGTACATGCTACCA	TCACGGGCAATGTGGCATACTT	-	chrX	8922762	-	chrX	8922329	433	+	chrX	8922329	+	chrX	8922762
GTCGGCACAGTTCCACAGTCCCCAAAACGCTTACGGATTGNCTAAGTGCCATTGAAG:1	GTCGGCACAGTTCCACAGTCCC	GATTGNCTAAGTGCCATTGAAG	+	chr3L	13478371	+	chr3L	21227899	7749528	+	chr3L	13478371	+	chr3L	21227899
ACAGCCGCCCCGAGTTTATGGTCGTTTTATTTATTAGAAATATTTCCAAGGTTTGTTTTTGTTTTTGGTTTTT:1	ACAGCCGCCCCGAGTTTATGGT	TTTGTTTTTGTTTTTGGTTTTT	-	chr3R	6289028	-	chr3R	9171250	2882222	+	chr3R	9171250	+	chr3R	6289028
TTCTTTTGTGTCAAATACGAAGTTCTTTCACTTTTAAGACGTCTTCACGTTTATCAAAATTTGACTCACAAAATG:1	TTCTTTTGTGTCAAATACGAAG	TCAAAATTTGACTCACAAAATG	+	chr3R	25436495	+	chr3R	25436589	94	+	chr3R	25436495	+	chr3R	25436589
ATTTAAGAATAAAAACCAAAGGCAGGCGAAATAAACATAAAAACCAAAGGCGACGCACACAACTTGTTGCAAACT:1	ATTTAAGAATAAAAACCAAAGG	CGCACACAACTTGTTGCAAACT	-	chr2L	6165630	-	chr2L	4034557	2131073	+	chr2L	4034557	+	chr2L	6165630
GTTCCATTGGGTAAAGTGGATGGTTTGTGGGAGAAATCATTCACGGAATAGGCGACCAGGTAGGTGGAG:1	GTTCCATTGGGTAAAGTGGATG	ATAGGCGACCAGGTAGGTGGAG	+	chr3R	29237264	+	chr3R	29239279	2015	+	chr3R	29237264	+	chr3R	29239279
GCCGTTTGCATTCAACGAGTCTGATGAATGGCCATTTGAAGTAAGCGGCAATTGCACAAGCAGCTTAAGGACATC:1	GCCGTTTGCATTCAACGAGTCT	GCACAAGCAGCTTAAGGACATC	+	chr3L	12933100	+	chr3L	12933184	84	+	chr3L	12933100	+	chr3L	12933184
TATTACGAGATCTGTTAGTATAACTCTTTTCCTATTGCAAGAAAATCCGAGTCAGGAACTCATGGATGAAGAGTA:1	TATTACGAGATCTGTTAGTATA	AGGAACTCATGGATGAAGAGTA	+	chr2R	11909790	+	chr2R	11909663	127	+	chr2R	11909790	+	chr2R	11909663
AATTTTAAAACATTAAGTCCAGAAAAGACAATTACGTAAACAAAAATTTTGTAAGGGTTCTATTGCTAAATGTTT:1	AATTTTAAAACATTAAGTCCAG	AGGGTTCTATTGCTAAATGTTT	-	chrX	14782825	-	chrX	14778028	4797	+	chrX	14778028	+	chrX	14782825
GGTTAAACTATTTCGCTTTAAAAACATTACAAATAATATTCCATCGGA:1	GGTTAAACTATTTCGCTTTAAA	TTACAAATAATATTCCATCGGA	-	chr2L	15081001	-	chr2L	15080935	66	+	chr2L	15080935	+	chr2L	15081001
AAAGCCAGTGCAGAATTCTGGCAGCTCGTCAGCCGGCTTATCATTTAAATGGAGGGAAGTTGGCTTTAAAGGCAA:1	AAAGCCAGTGCAGAATTCTGGC	GGGAAGTTGGCTTTAAAGGCAA	-	chr2R	14393980	-	chr2R	14393895	85	+	chr2R	14393895	+	chr2R	14393980
TCCCATGTAACCTTTTTTAAAATTGATCTATTGATATTTCATACGAAATATAAAACTTAAGTTCAGCGGTTAGTT:1	TCCCATGTAACCTTTTTTAAAA	AACTTAAGTTCAGCGGTTAGTT	+	chr2L	8003068	+	chr2L	8003150	82	+	chr2L	8003068	+	chr2L	8003150
GTTCCAGTAAATTTCAGTATGTACACGTTCCATGCCAGTTGCAAATGATTACCCACTTTTTACATTATTTCCCCA:1	GTTCCAGTAAATTTCAGTATGT	CACTTTTTACATTATTTCCCCA	-	chr3L	14792604	-	chr3L	18329841	3537237	+	chr3L	18329841	+	chr3L	14792604
ATAACAAAGACTCACGTAGTTTGATTGTGCGCCGCTGCCAAGGCAACAAAATGGAATTGGCGATGGG:1	ATAACAAAGACTCACGTAGTTT	ACAAAATGGAATTGGCGATGGG	-	chrX	15264001	-	chrX	15263646	355	+	chrX	15263646	+	chrX	15264001
CAACAACAAGCCCAAATAACAAAGATCAGTTGACTGAGAANAAAAGGCGCACAATTCAGCTGGATTTT:1	CAACAACAAGCCCAAATAACAA	GCGCACAATTCAGCTGGATTTT	-	chr3L	11144917	-	chr3L	16152517	5007600	+	chr3L	16152517	+	chr3L	11144917
TAAGAAAACCTCTAAAACTTCCAACGCACTTTTNGGTTGAATTCCTTGGATCTTTTGNTCT:1	TAAGAAAACCTCTAAAACTTCC	AATTCCTTGGATCTTTTGNTCT	-	chr2R	21753575	-	chr2R	21753104	471	+	chr2R	21753104	+	chr2R	21753575
TGTTGGCTAATCTGCTTTTTTATTTGTATTCACAATTTCCCTTATTATTCCGCGATATGAAAAATCATTTAATG:1	TGTTGGCTAATCTGCTTTTTTA	CGATATGAAAAATCATTTAATG	-	chr3R	6121404	-	chr3R	6121187	217	+	chr3R	6121187	+	chr3R	6121404
AGAGATTTCCCCTGCAGTCCCTCCTTAAAATCCAAAGCCCAAACAATGGGCAGACATTACGCGAACCGAAACAC:1	AGAGATTTCCCCTGCAGTCCCT	GACATTACGCGAACCGAAACAC	-	chr3R	22433200	-	chr3R	22433101	99	+	chr3R	22433101	+	chr3R	22433200
CCCGGCACTTGACGCGTGGTGTGTGTGAGTATATATGTGTGTGTGTGCGTGTGCGATCCGC:1	CCCGGCACTTGACGCGTGGTGT	TGTGTGTGCGTGTGCGATCCGC	+	chr2R	10948047	+	chr2R	10955584	7537	+	chr2R	10948047	+	chr2R	10955584
ATATAATAAATAAAGTCGCCAAAAGATGAAGAAGATTGTAGATTTATCTGATT:1	ATATAATAAATAAAGTCGCCAA	AAGATTGTAGATTTATCTGATT	-	chr2R	13220625	-	chr2R	13220548	77	+	chr2R	13220548	+	chr2R	13220625
CATCATGGTTTTGTCCCTGGGTTTGCCTTACTTCAATTATTCTCCTGATTACTAATTTCGGAAAATAAGTTTTCT:1	CATCATGGTTTTGTCCCTGGGT	AATTTCGGAAAATAAGTTTTCT	+	chr2R	6691145	+	chr2R	6691224	79	+	chr2R	6691145	+	chr2R	6691224
TGACTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGCTT:1	TGACTTTGTCTTTGTCTTTGTC	GTCTTTGTCTTTGTCTTTGCTT	-	chrX	16983077	-	chrX	19404960	2421883	+	chrX	19404960	+	chrX	16983077
AGCGGGGACACTGGGACCACTGGCCATTTCTAATGTGTTTTCATTCTTTTTTCCCTCCAGTGCCGCCGAGGAT:1	AGCGGGGACACTGGGACCACTG	TCCCTCCAGTGCCGCCGAGGAT	-	chr3R	27789175	-	chr3R	27789100	75	+	chr3R	27789100	+	chr3R	27789175
CGGTATTTGCGATTGTTCCCAGGCTGGGAACTTACTGATTTGTATACGTCTCGTTTTGTTAATAC:1	CGGTATTTGCGATTGTTCCCAG	ATACGTCTCGTTTTGTTAATAC	-	chrY	833205	-	chrY	833139	66	+	chrY	833139	+	chrY	833205
TTTTACAAATTGCTAATTCTATTGCTCATCTTTTAGGAGTAATANACAAACCACTTAAATATCTTATGTTCCGNA:1	TTTTACAAATTGCTAATTCTAT	CTTAAATATCTTATGTTCCGNA	+	chr3L	18528660	+	chr3L	18537821	9161	+	chr3L	18528660	+	chr3L	18537821
TCGCACAGCTGTTTGCTACACTAGTACGATAGATTGCTGGTTCATGATTGTACTCAATTTTAAGTGTCTTTACTG:1	TCGCACAGCTGTTTGCTACACT	TCAATTTTAAGTGTCTTTACTG	+	chr2L	22548940	+	chr2L	22550165	1225	+	chr2L	22548940	+	chr2L	22550165
CAATGATGTATGTGGCCTTGCATATAGATTATATATGGCTGCCAAACCACAAACGACA:1	CAATGATGTATGTGGCCTTGCA	GGCTGCCAAACCACAAACGACA	-	chr2L	18107880	-	chr2L	18107813	67	+	chr2L	18107813	+	chr2L	18107880
TCNAACTACCATATCAGATACATATGTATGTACANANCTCTCATGGGAATCATCGGGAAAAAACTCGACCTTCGT:1	TCNAACTACCATATCAGATACA	CGGGAAAAAACTCGACCTTCGT	+	chrX	22987124	+	chrX	22989783	2659	+	chrX	22987124	+	chrX	22989783
GCTTTCCAAGGAGGCTCCCAATATGAAAAGTTTAAATACTGATGATGTTCACGGCAGACAANAAACAAACAGCAG:1	GCTTTCCAAGGAGGCTCCCAAT	GCAGACAANAAACAAACAGCAG	-	chr3R	10979748	-	chr3R	10979666	82	+	chr3R	10979666	+	chr3R	10979748
ACATGCCGTGCTGCATTAGACAAATCAATTATGCTGACTTTATTTGGNAGGGGCATTGCAGATAAGCTGATCAG:1	ACATGCCGTGCTGCATTAGACA	GCATTGCAGATAAGCTGATCAG	+	chr3R	19815037	+	chr3R	19815115	78	+	chr3R	19815037	+	chr3R	19815115
GATCTCGCTTGTAAAGGGTTTCCTAGTTTCACTCAAAAAATGTTGCAAATGTTATATTAAATTTCTCNCAGTGCA:1	GATCTCGCTTGTAAAGGGTTTC	ATATTAAATTTCTCNCAGTGCA	+	chr2R	14803479	+	chr2R	14803559	80	+	chr2R	14803479	+	chr2R	14803559
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:2	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534
TTCTCACATAACTCATAGATACTATGGCTTGTACTCAGATACCAAGTAAACAGATATTCATACCTCAAAGCACTT:1	TTCTCACATAACTCATAGATAC	ATATTCATACCTCAAAGCACTT	+	chrX	6003280	+	chrX	6003361	81	+	chrX	6003280	+	chrX	6003361
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGGCGAGGAGAGGAGAGGAGGGG:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	GGCGAGGAGAGGAGAGGAGGGG	+	chr3L	22908066	+	chr3L	19220636	3687430	+	chr3L	22908066	+	chr3L	19220636
AATATTATTAATCAGCAAAACTTCTAAAAGTGATTGTTGTATGGAAATATCTTATTATCTTATTAATTAAAACGG:1	AATATTATTAATCAGCAAAACT	ATTATCTTATTAATTAAAACGG	-	chr3L	18753630	-	chr3L	18753548	82	+	chr3L	18753548	+	chr3L	18753630
CTCTGGATATTTCATAAGCTGCATGAGCTAAGCGTGATTGTCATCTTCGTCAACCATTGCTTGCCGATACGGATT:1	CTCTGGATATTTCATAAGCTGC	CCATTGCTTGCCGATACGGATT	+	chr3L	24282182	+	chr3L	24282266	84	+	chr3L	24282182	+	chr3L	24282266
AAAAGGTTTAGGGCGGGTTTTCNAACAGCAACAGCAAATGTTTTATATGTTGCTATGAATTTTAGTTGTTGTTGG:1	AAAAGGTTTAGGGCGGGTTTTC	TATGAATTTTAGTTGTTGTTGG	-	chr3R	11043212	-	chr3R	11043106	106	+	chr3R	11043106	+	chr3R	11043212
GGAAGAAATGAAAACCAAAAAGAGAACGACGCCAAATTCAAATCGCGAACTGCTTACAAATGAACAACAAATGA:1	GGAAGAAATGAAAACCAAAAAG	CTTACAAATGAACAACAAATGA	+	chr2R	17236531	+	chr2R	17241734	5203	+	chr2R	17236531	+	chr2R	17241734
TATACCCTTTGAAAGAGTGATTACTACCTTTAACATTTTGTTGTGGATGCTGCCACCTGTGCGAA:1	TATACCCTTTGAAAGAGTGATT	TGGATGCTGCCACCTGTGCGAA	+	chr2L	1322053	+	chr2L	1322132	79	+	chr2L	1322053	+	chr2L	1322132
CTAATACGCCACGTATTACGTTGTGTGTCAAAAAGTACGCAATAGTAATTTGAATTTTAAGACTTGGATTTTCCA:1	CTAATACGCCACGTATTACGTT	ATTTTAAGACTTGGATTTTCCA	+	chr3L	10739867	+	chr3L	10739976	109	+	chr3L	10739867	+	chr3L	10739976
TAATTTTGCTTTTAAGTTAACCAAGAGGATAACACGATATTTAAATGCTTTACCAAGAAAACAAATAACTTG:1	TAATTTTGCTTTTAAGTTAACC	TACCAAGAAAACAAATAACTTG	+	chr2R	12565596	+	chr2R	12565963	367	+	chr2R	12565596	+	chr2R	12565963
ACGCTGCCAAAACGTTTCCGCTTCCGCTGGCAGTCTCCACAGCAACCTTTTTTGAAGGACTGAAAAGT:1	ACGCTGCCAAAACGTTTCCGCT	CTTTTTTGAAGGACTGAAAAGT	+	chr3R	28107008	+	chr3R	28107083	75	+	chr3R	28107008	+	chr3R	28107083
ACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGA:1	ACACACACTCTCACACGGACAA	TGCACTTCATCTGTTGATGTGA	-	chrX	20942198	-	chrX	20940753	1445	+	chrX	20940753	+	chrX	20942198
TGAAGATCTAATTCAAATACATTATGACCAGGCTTGACCCACCAACCTCCATCGATGANATTC:1	TGAAGATCTAATTCAAATACAT	CCAACCTCCATCGATGANATTC	-	chr3R	9601584	-	chr3R	9601478	106	+	chr3R	9601478	+	chr3R	9601584
TTGTGATTTGTTGACGTTTTTCAATTGGATTTTCTTTGAATTCATAGTTGGAACTTTTGAATGATGTATTAAACT:1	TTGTGATTTGTTGACGTTTTTC	CTTTTGAATGATGTATTAAACT	+	chrX	3881271	+	chrX	3881410	139	+	chrX	3881271	+	chrX	3881410
TTCGCTTTGCTCCACGCCAAAGCCAAAAAAAGCATATAAAAAAGAGGAATTTTAATTACCGACTGGGGGCAAC:1	TTCGCTTTGCTCCACGCCAAAG	TTAATTACCGACTGGGGGCAAC	+	chr3L	2977648	+	chr3L	18988604	16010956	+	chr3L	2977648	+	chr3L	18988604
TCTTTACTACGAATGGGATTGGGGGCTCCTTTTAGGTCTCCGCTTTGGTATTGTTTTGGACNGCAGCCTCCATGT:1	TCTTTACTACGAATGGGATTGG	TTTTGGACNGCAGCCTCCATGT	-	chr3R	23533207	-	chr3R	19504656	4028551	+	chr3R	19504656	+	chr3R	23533207
AGATGAGGCATAGCCGCTTTTCAAAAATAATCACATTTTTCATTTGCTCTCAGCTATTCCGACATCTTGCCAAAT:1	AGATGAGGCATAGCCGCTTTTC	CTATTCCGACATCTTGCCAAAT	+	chrX	8993324	+	chrX	8993400	76	+	chrX	8993324	+	chrX	8993400
CGCCTGTGTTTGTGTTTGTTCACGCGCGCGTGCCTCTCAAGTTCAAATTGCTCTCTCGCG:1	CGCCTGTGTTTGTGTTTGTTCA	AAGTTCAAATTGCTCTCTCGCG	+	chr3L	21014940	+	chr3L	21023406	8466	+	chr3L	21014940	+	chr3L	21023406
AAATGAAANGCGCTAGAGGGCGCTGTCGCCTTTGTATATAAAACTATCAAGTTCGAGTTTTTTAGACGCATCACC:1	AAATGAAANGCGCTAGAGGGCG	CGAGTTTTTTAGACGCATCACC	+	chr2R	15375358	+	chr2R	15376175	817	+	chr2R	15375358	+	chr2R	15376175
AAAGTTGGATTAAATATCATACATATATATTTTATAAACTGAAAAATGGTAAAGCAAAGCGAGACTGTCACGG:1	AAAGTTGGATTAAATATCATAC	AAGCAAAGCGAGACTGTCACGG	+	chr2L	4661857	+	chr2L	4669435	7578	+	chr2L	4661857	+	chr2L	4669435
GTCGCAAAACCATCTCTGACCCATAACTTTGATCGCGTTAATGTCCAAGTGCACCCCCTGTGCGGC:1	GTCGCAAAACCATCTCTGACCC	CCAAGTGCACCCCCTGTGCGGC	-	chr3R	9926598	-	chr3R	9926520	78	+	chr3R	9926520	+	chr3R	9926598
CGAGTTAAACACGCGTATTAGTTCTGGCAATACCACATCCAATTTGTATATATCGTGCCCGGGGCTTTATGTCGA:1	CGAGTTAAACACGCGTATTAGT	CGTGCCCGGGGCTTTATGTCGA	-	chr2L	12736780	-	chr2L	12736704	76	+	chr2L	12736704	+	chr2L	12736780
TTTGCAGTCAAGTTTAGTNACTTGCTTTTGTTTCTGTTCAGTTNACAAANGCACACACTGTTTACACTCACTTTC:1	TTTGCAGTCAAGTTTAGTNACT	CACACTGTTTACACTCACTTTC	-	chr2L	16870522	-	chr2L	16870123	399	+	chr2L	16870123	+	chr2L	16870522
AAAAAGATATGCACCCTACCCTTTTCATCCTACCTATCGATCCTACATTCCTTGTCCTGCTGCCATCNTGGGC:1	AAAAAGATATGCACCCTACCCT	TTGTCCTGCTGCCATCNTGGGC	+	chr3L	13525178	+	chr3L	13532972	7794	+	chr3L	13525178	+	chr3L	13532972
TCGCTTTTCTTTTACATCTCTCGTCTTTGTTGTTTACGTTCCCCATGCTCCCCTCCGATGGATGCGACGTTT:1	TCGCTTTTCTTTTACATCTCTC	CCCTCCGATGGATGCGACGTTT	+	chr2L	20352560	+	chr2L	20352650	90	+	chr2L	20352560	+	chr2L	20352650
TGAGCGGCGAGAAGAAGCAGCAGCAGTTGAGCCGTCGAGCCGTCGAGGAAAACGCTGGAAAAAGACCAGCAGATG:1	TGAGCGGCGAGAAGAAGCAGCA	GCTGGAAAAAGACCAGCAGATG	-	chrX	19884167	-	chrX	19884091	76	+	chrX	19884091	+	chrX	19884167
CTTCTCCAATCATCCATCCCAGTCAGCCCATCCGAGCAAAAGACCTTTTTTTATTATGAATAAGCCGAAATACAC:1	CTTCTCCAATCATCCATCCCAG	TTATGAATAAGCCGAAATACAC	+	chr3R	4408413	+	chr3R	4412717	4304	+	chr3R	4408413	+	chr3R	4412717
CCTACATATGCGATCGCAAGTCGCGCACCCTGCTCACAGCGCCCTATCATGTATAGTCCGACAATTCTGTCACCA:1	CCTACATATGCGATCGCAAGTC	TAGTCCGACAATTCTGTCACCA	+	chr3L	7363627	+	chr3L	7355720	7907	+	chr3L	7363627	+	chr3L	7355720
GTGCTGGCTGAAGGAGCAGAAGGCAGAAGGAGCAGGAGGAGCAGA:1	GTGCTGGCTGAAGGAGCAGAAG	CAGAAGGAGCAGGAGGAGCAGA	-	chr3L	1981971	-	chr3L	22707931	20725960	+	chr3L	22707931	+	chr3L	1981971
CGCGGGCTTTAAACCACTTTTTTTTTTGTCTT:1	CGCGGGCTTTAAACCACTTTTT	AAACCACTTTTTTTTTTGTCTT	+	chr2R	21253767	+	chr2R	22981729	1727962	+	chr2R	21253767	+	chr2R	22981729
ATGTGTAAGAGGAGGAAAAGCCAGGGAAAAACTAGGGAATNGCATAGTGGGCAGCTGCAACAGCTGGTNCCCG:1	ATGTGTAAGAGGAGGAAAAGCC	CAGCTGCAACAGCTGGTNCCCG	+	chr3L	9219257	+	chr3L	9219927	670	+	chr3L	9219257	+	chr3L	9219927
CTCCTTAATGGACAGATATTAGACCTTCAGGTAGGCAGTCCCTGTAGGCGTGGGACAGCACTACGANCTGGTGA:1	CTCCTTAATGGACAGATATTAG	GGACAGCACTACGANCTGGTGA	-	chr2R	3384158	-	chr2R	3384083	75	+	chr2R	3384083	+	chr2R	3384158
ATCAAGGANTCCCATTTTGGACTCTCTCGACCGGTNAAAACAAATTGTGAAACATTAAGAAACAAAACCATATTT:1	ATCAAGGANTCCCATTTTGGAC	ATTAAGAAACAAAACCATATTT	+	chr2L	9382018	+	chr2L	7293924	2088094	+	chr2L	9382018	+	chr2L	7293924
TAATTAATCTATATAAAGTGTGCTTCTAAAAGTTCGTAATATAAGGTAGTTTTCTTAGCAAAAGTCCTTTT:1	TAATTAATCTATATAAAGTGTG	TTTTCTTAGCAAAAGTCCTTTT	-	chr3L	12578156	-	chr3L	12578072	84	+	chr3L	12578072	+	chr3L	12578156
ATTGGTTTTTGAACATTGGTTTTTAGAAGCATATCATATAAAATTGGATATATTAATTAGCGTTTANACAAACTA:1	ATTGGTTTTTGAACATTGGTTT	TAATTAGCGTTTANACAAACTA	+	chr3L	10298687	+	chr3L	10298774	87	+	chr3L	10298687	+	chr3L	10298774
GCGTTCCACTGTTGTTTCACGTACAGTCAGCACCCCCTATTTTCTCCCAGTGCTGCGCGCTCTTGTTCCCGCT:1	GCGTTCCACTGTTGTTTCACGT	GCTGCGCGCTCTTGTTCCCGCT	+	chr2L	19163370	+	chr2L	19163449	79	+	chr2L	19163370	+	chr2L	19163449
CGAAACAAGTGACATGCCTCAGGGATTGGACCTTTTGTTGAAGGGAGAGACAAGAGCTCCAGGCAACCAAACTCC:1	CGAAACAAGTGACATGCCTCAG	GAGCTCCAGGCAACCAAACTCC	+	chr3L	7332468	+	chr3L	7332545	77	+	chr3L	7332468	+	chr3L	7332545
GTTCTGTTTTGTGTTTCCCGATGCTTTTCCCAGTTGCTGAGTTATGATG:1	GTTCTGTTTTGTGTTTCCCGAT	TCCCAGTTGCTGAGTTATGATG	+	chr2L	3891920	+	chr2L	3891979	59	+	chr2L	3891920	+	chr2L	3891979
AGAGCTCTCCACTCTTTGACATTCCCACCAAGCACTGAAACTGGGCTTCTACTCCTCCAAGGACTTCG:1	AGAGCTCTCCACTCTTTGACAT	TTCTACTCCTCCAAGGACTTCG	-	chr2R	20031107	-	chr2R	20031021	86	+	chr2R	20031021	+	chr2R	20031107
GAAAACGGTGCGCAAAAGTCATGTAAAACCACACGCAGCAAACAACACANTGGATACCCAGCTTTCGGCCGGTCG:1	GAAAACGGTGCGCAAAAGTCAT	ATACCCAGCTTTCGGCCGGTCG	-	chr3L	3288216	-	chr3L	1217356	2070860	+	chr3L	1217356	+	chr3L	3288216
TAGCAGACAGCCAGCAGACTGGTGAGAGTTGAATCGAGTTGAGTCGAGTCGAGTGGTATGCAGTCCAGTTGAGTC:1	TAGCAGACAGCCAGCAGACTGG	TGGTATGCAGTCCAGTTGAGTC	+	chr2R	19715854	+	chr2R	19723323	7469	+	chr2R	19715854	+	chr2R	19723323
CAAGGATCCTGGTAAAAGTGAAAATTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	CAAGGATCCTGGTAAAAGTGAA	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	6596040	+	chr2L	16217660	9621620	+	chr2L	6596040	+	chr2L	16217660
TTTGGGATTATATGGGGTGTACTAGAAGTGTAGGTGTAGAAGTGGGGTGTACTTGCGTGTGCTTGGATGTTGTAA:1	TTTGGGATTATATGGGGTGTAC	TGCGTGTGCTTGGATGTTGTAA	-	chr2L	702626	-	chr2L	702515	111	+	chr2L	702515	+	chr2L	702626
TATTAGCATATGTTAGTGTGCCTTCGCAGGAGCGGGCATTCACTTAGTTCAAAAGTCGAGGGCAAACAGAGAAAT:1	TATTAGCATATGTTAGTGTGCC	AGTCGAGGGCAAACAGAGAAAT	-	chr2L	968895	-	chr2L	968816	79	+	chr2L	968816	+	chr2L	968895
AGGAGAAACGGCAGCAGTTAGTGTCCTGAAAGGAGTGCGTTCTGGGAAAATCAAGCTGCTCCTCCAGCTCCACC:1	AGGAGAAACGGCAGCAGTTAGT	AAGCTGCTCCTCCAGCTCCACC	+	chr3L	18966674	+	chr3L	12713967	6252707	+	chr3L	18966674	+	chr3L	12713967
TAAATAATGCAAACGGACAAGGCGACAACTAAATTAATAACGAGAAANCAACCGCAAGAGATTGAAATACTCTTG:1	TAAATAATGCAAACGGACAAGG	GCAAGAGATTGAAATACTCTTG	+	chr3R	5809128	+	chr3R	5809369	241	+	chr3R	5809128	+	chr3R	5809369
CACCGCCGCACACAATCGCACAACAAAGAACATTCGAATTGATTACCTAAGTTAACCCACTTTA:1	CACCGCCGCACACAATCGCACA	TTACCTAAGTTAACCCACTTTA	-	chr3R	24490184	-	chr3R	30105491	5615307	+	chr3R	30105491	+	chr3R	24490184
AACTGTCCAAAGTGCATTNGTCCTGATCCTTTTCCCTTAAANTTCNTTTTGCTGCCGCTGACAGTCCTCGAAA:1	AACTGTCCAAAGTGCATTNGTC	CTGCCGCTGACAGTCCTCGAAA	+	chrX	21045371	+	chrX	21040451	4920	+	chrX	21045371	+	chrX	21040451
AGACGCTTCTCCGTCAGCTGCGAGCAATTGGAGCTGGAAGCGAGAATNCAGCCCCCCCCCCCGCCCCCCCACC:1	AGACGCTTCTCCGTCAGCTGCG	CCCCCCCCCCCGCCCCCCCACC	+	chr3R	15965648	+	chr3R	30336004	14370356	+	chr3R	15965648	+	chr3R	30336004
CATTAGTGACGAAAATCGAACAACCGAGCTAAAAACTAACAACGATTCAGGATGACGACGATGTCGAAAGAAGGA:1	CATTAGTGACGAAAATCGAACA	GACGACGATGTCGAAAGAAGGA	-	chr3L	13615180	-	chr3L	13615082	98	+	chr3L	13615082	+	chr3L	13615180
TGTATCCTTTTTCAACTGCATGTGTGTGTGT:1	TGTATCCTTTTTCAACTGCATG	TTTCAACTGCATGTGTGTGTGT	+	chr3L	11000787	+	chr3L	17507094	6506307	+	chr3L	11000787	+	chr3L	17507094
GCCTTGGTACGACAGTCTAAACTTTTACATACATATATGTATGTAGTTTTGGACAACACATTGAGATATGTGGCG:1	GCCTTGGTACGACAGTCTAAAC	CAACACATTGAGATATGTGGCG	-	chr3L	22996848	-	chr3L	22989874	6974	+	chr3L	22989874	+	chr3L	22996848
AATACTAGAAAAATTCCTTTAAGACCAACCTTCATCCATTTTTGTCCTCGCTCAGTTTTGTACTTTTCGCTTTAT:1	AATACTAGAAAAATTCCTTTAA	AGTTTTGTACTTTTCGCTTTAT	-	chr3L	10085633	-	chr3L	2908718	7176915	+	chr3L	2908718	+	chr3L	10085633
GCATGCCAACGAATTTAAGTGCCAGAATGCGTTTTTAGAAAAAGCTTTGGGCGAGCGAACTATAAAACTAATTAC:1	GCATGCCAACGAATTTAAGTGC	AGCGAACTATAAAACTAATTAC	+	chr2L	1220159	+	chr2L	1227625	7466	+	chr2L	1220159	+	chr2L	1227625
CCAGACAGACCGTTCCCCCGGCTAAATTCGATCCGGAAATGCGCAGTTTTTAGTGAAGTGCATGCCATTTTGAA:1	CCAGACAGACCGTTCCCCCGGC	GTGAAGTGCATGCCATTTTGAA	+	chr2R	6587719	+	chr2R	15105366	8517647	+	chr2R	6587719	+	chr2R	15105366
TGCTTATACCCTGGAAGAGTGTGGAAATTCAAGACAGTTGTTTGGTGGAGCAACAATTGTTTAGCTG:1	TGCTTATACCCTGGAAGAGTGT	TGGAGCAACAATTGTTTAGCTG	+	chr2L	18478815	+	chr2L	18480238	1423	+	chr2L	18478815	+	chr2L	18480238
AATATTTAAGTTTAAAAATTTATCAATTGGNNNTNCGAACTGCTTTGTCATAAGTTCTCTAACCTTTGGCACTCG:1	AATATTTAAGTTTAAAAATTTA	GTTCTCTAACCTTTGGCACTCG	-	chr2L	14890413	-	chr2L	14889988	425	+	chr2L	14889988	+	chr2L	14890413
TATGAGTAAATCTAGTATGCAAATCTAAGTTTAAACAAAGGTAACAAATTAAAGCAATCTATTAAGTTGTTAAG:1	TATGAGTAAATCTAGTATGCAA	AGCAATCTATTAAGTTGTTAAG	-	chrX	10550440	-	chrX	10550363	77	+	chrX	10550363	+	chrX	10550440
AATCAACATTATTTAGGCACCCATGCATTCGGGCAAAGACAATTNCGCAGTCACCGCCC:1	AATCAACATTATTTAGGCACCC	GACAATTNCGCAGTCACCGCCC	-	chr3L	18328427	-	chr3L	18328315	112	+	chr3L	18328315	+	chr3L	18328427
GTGCCAGGNAGTACACCGCTGCGTATACCAAAGGGCTCGGGTCGTTACG:1	GTGCCAGGNAGTACACCGCTGC	CCAAAGGGCTCGGGTCGTTACG	-	chr2L	10916659	-	chr2L	10916557	102	+	chr2L	10916557	+	chr2L	10916659
CTATTCTNATTGCACTGGAAAAAAATATACATCCTTAAACTCATACTCATACAGACATATTACCTCTCCTATCC:1	CTATTCTNATTGCACTGGAAAA	AGACATATTACCTCTCCTATCC	-	chr2R	20434181	-	chr2R	20434103	78	+	chr2R	20434103	+	chr2R	20434181
CATAATCCCTCTGACAATGTGTGTTCTACTTTTTTCGGGTCAACGCTTCGGGGCCTCGAGAACTGANCATTAGCC:1	CATAATCCCTCTGACAATGTGT	CCTCGAGAACTGANCATTAGCC	-	chr3L	5926506	-	chr3L	5926316	190	+	chr3L	5926316	+	chr3L	5926506
TTTATTCTGAGTGTACTCNTTTGCAATCTAAAATTCATAAAATNAAAGTNGAGCTTATCACCACCTTTTTCAACA:1	TTTATTCTGAGTGTACTCNTTT	CTTATCACCACCTTTTTCAACA	-	chr3R	8955897	-	chr3R	19036234	10080337	+	chr3R	19036234	+	chr3R	8955897
AACAAAGTGAGACGAAAAGTTTTCGGAAAGAGACAAGAGCAAAAAATGTGTGTATGTGTGTACCCAGGGTGCATC:1	AACAAAGTGAGACGAAAAGTTT	ATGTGTGTACCCAGGGTGCATC	-	chr2L	12759309	-	chr2L	12759214	95	+	chr2L	12759214	+	chr2L	12759309
TTGCTTTTAATTCACTCATTTAATTCAATATTACTATTAAAATACTATTTTTCTTGATCTGTACCTATTTGTT:1	TTGCTTTTAATTCACTCATTTA	TCTTGATCTGTACCTATTTGTT	+	chrX	19060425	+	chrX	19065207	4782	+	chrX	19060425	+	chrX	19065207
TACGATAGCGGTAAGTCACGCAAACAGTGGTAATGATCAGTATGAGGTAATGTTCGGGTCTTTAGGCAAATAAAT:1	TACGATAGCGGTAAGTCACGCA	TCGGGTCTTTAGGCAAATAAAT	+	chr2R	11472660	+	chr2R	11473857	1197	+	chr2R	11472660	+	chr2R	11473857
TGGCAGACTGTTTCACACCTACACACGTGTGCGTTTATGACATTGATAGCTGAAGCCGAAACCCAAGGATTAAT:1	TGGCAGACTGTTTCACACCTAC	AAGCCGAAACCCAAGGATTAAT	-	chr3R	31026597	-	chr3R	31026517	80	+	chr3R	31026517	+	chr3R	31026597
GGCTCCCATTCAGTTCTCGAGGAATTCAGGAAATGGGTTTTCAGCTAGGGAAATTCGATACTACTCCGGGCATTG:1	GGCTCCCATTCAGTTCTCGAGG	TTCGATACTACTCCGGGCATTG	-	chr3R	26885798	-	chr3R	26885698	100	+	chr3R	26885698	+	chr3R	26885798
CAACACTTGCAATTTGTAAGCTTAAATTTTGTAAATCAACAAGAGTTCAACTTGAATAAATCATATTTTAAACTG:1	CAACACTTGCAATTTGTAAGCT	GAATAAATCATATTTTAAACTG	+	chr2R	14018185	+	chr2R	14018269	84	+	chr2R	14018185	+	chr2R	14018269
AATTTGCCNAAAAGTGGGCAACGAAGTGGGCGGAGAAATGGATGGGCAGCCCGTCTATCTGGGGGCATGCA:1	AATTTGCCNAAAAGTGGGCAAC	CCCGTCTATCTGGGGGCATGCA	-	chr3R	6024472	-	chr3R	6015995	8477	+	chr3R	6015995	+	chr3R	6024472
GTCCTGAAGCCGGTGGTCGACAGTTCCTCTGTCTTGTTGTACGGCGATGGAAA:1	GTCCTGAAGCCGGTGGTCGACA	TCTTGTTGTACGGCGATGGAAA	-	chrX	23339369	-	chrX	14048445	9290924	+	chrX	14048445	+	chrX	23339369
GCTTAATTCCACAAAATGATTCCATGAAGCTGGAAACTGAATAAATAAATGTACAAGATAACACGATGTGGTTA:1	GCTTAATTCCACAAAATGATTC	ACAAGATAACACGATGTGGTTA	+	chr3R	17823210	+	chr3R	17823286	76	+	chr3R	17823210	+	chr3R	17823286
CTGCAGCANCGACAAAGTTCGTGTGCCGGCGTCTCCTGCAGAACAAGCCGCAAAAGATGTGGAAATTGAGGAACT:1	CTGCAGCANCGACAAAGTTCGT	AAGATGTGGAAATTGAGGAACT	-	chr2R	10637985	-	chr2R	24779638	14141653	+	chr2R	24779638	+	chr2R	10637985
AGCAGGTAGATGGTACCATGCTTCCATGCCATCTATATATTTGTTCCCCCAAAAGAGACCGGGTTTT:1	AGCAGGTAGATGGTACCATGCT	CCCCCAAAAGAGACCGGGTTTT	-	chrX	4613644	-	chrX	4613562	82	+	chrX	4613562	+	chrX	4613644
TTTGTCTCTTTTACCACTTTTTTTTCTCTGTTCAATTTTGTTTCTCGTGCGTAATAATATAATACGAAATATTTA:1	TTTGTCTCTTTTACCACTTTTT	ATAATATAATACGAAATATTTA	-	chr3R	15464864	-	chr3R	15464774	90	+	chr3R	15464774	+	chr3R	15464864
TATCGAAAGCCTCGGAATCCTGGCGAAAACCCAAACTCACCGTGAACTATGCTCATTCATGTTGGTGAATCCCA:1	TATCGAAAGCCTCGGAATCCTG	TCATTCATGTTGGTGAATCCCA	-	chr3L	11796666	-	chr3L	11796588	78	+	chr3L	11796588	+	chr3L	11796666
TACATATATTTCGGAAATATCTAACTATTTAATTTTAAGGCATATGTTAAATCACAATTATATAATAATCAACAT:1	TACATATATTTCGGAAATATCT	ACAATTATATAATAATCAACAT	+	chr3L	12089111	+	chr3L	12089191	80	+	chr3L	12089111	+	chr3L	12089191
AGTGCTTCCTTTGAGGCCGCTGATGATGACGATGCGGAGTTGCTCATGTCCCAATCC:1	AGTGCTTCCTTTGAGGCCGCTG	GGAGTTGCTCATGTCCCAATCC	-	chr3L	3566030	-	chr3L	3565972	58	+	chr3L	3565972	+	chr3L	3566030
AAAGTACAGGTTAACGAAAGCGAATGATAACGAGCGACTTAAGAGAGTACAAGAGAAAGCCTGCGAAAGAGGAGA:1	AAAGTACAGGTTAACGAAAGCG	AGAAAGCCTGCGAAAGAGGAGA	-	chr2R	5473484	-	chr2R	5473389	95	+	chr2R	5473389	+	chr2R	5473484
CTCTAGTCATGAAAAAAAAAAATTTGCATTTTTTTTTTT:1	CTCTAGTCATGAAAAAAAAAAA	AAAAATTTGCATTTTTTTTTTT	+	chrX	12649345	+	chrX	20760310	8110965	+	chrX	12649345	+	chrX	20760310
CTGCTTATAGGCGCGTGTGGTTAAGTGACAGCGAAGGAGTAAGCAGAATGGTCGGATGGCTGGTTGGATCTCCCA:1	CTGCTTATAGGCGCGTGTGGTT	GGATGGCTGGTTGGATCTCCCA	+	chr3R	24072106	+	chr3R	24072544	438	+	chr3R	24072106	+	chr3R	24072544
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATATTCAACAAAATATTCACAATACATATTTATTTGA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	TTCACAATACATATTTATTTGA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	8559528	13348008	+	chr3R	21907536	+	chr3R	8559528
ATTACAACTCAGACGAACAAAATCCGTCCGTAAAAATTGGTACTGCACATACTCAACTATTTTTTATGAACGAAA:1	ATTACAACTCAGACGAACAAAA	CAACTATTTTTTATGAACGAAA	-	chr2R	9782680	-	chr2R	9782600	80	+	chr2R	9782600	+	chr2R	9782680
AGAATGGCCAAGAAAGTCNAAGACGCCGTTTAGCGCGTTTATAAGTTGAACTCAGTGGCAAAAGGGCAGGCA:1	AGAATGGCCAAGAAAGTCNAAG	CTCAGTGGCAAAAGGGCAGGCA	+	chr2L	10499565	+	chr2L	10499661	96	+	chr2L	10499565	+	chr2L	10499661
AAAATTTAAAATCTTGTTTTATACTACAACTAAATTTTTTTGCATATAAAATAGCCAAAATGACC:1	AAAATTTAAAATCTTGTTTTAT	ATATAAAATAGCCAAAATGACC	-	chr2L	19763053	-	chr2L	19762821	232	+	chr2L	19762821	+	chr2L	19763053
AGGAGATGTTGTATCTGAAAATGGAGTGAGTGAGTGAGTAGCTTGGTTATCGCAAAGTTTTTCGCGTGCAACAG:1	AGGAGATGTTGTATCTGAAAAT	CAAAGTTTTTCGCGTGCAACAG	+	chr3R	27779282	+	chr3R	27779361	79	+	chr3R	27779282	+	chr3R	27779361
ATTGCTTTGTAGGCTCCAGGGTAAAAAGGTGGGCAGTGCCATCGCTTCGCT:1	ATTGCTTTGTAGGCTCCAGGGT	TGGGCAGTGCCATCGCTTCGCT	-	chr2L	19740825	-	chr2L	19737380	3445	+	chr2L	19737380	+	chr2L	19740825
CATGCCAGCCAGTAATATTGCGATTGGTCTTTATNTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAAAATGTT:1	CATGCCAGCCAGTAATATTGCG	TTGGGGGAGATGTGAAAATGTT	-	chr2L	5897698	-	chr2L	5897615	83	+	chr2L	5897615	+	chr2L	5897698
TTATATAATTAGAAAACCTGCAAACAAAAAAAACCGTATTAAAACATNCTATATAATATACNACACTGAAGCTCT:1	TTATATAATTAGAAAACCTGCA	TAATATACNACACTGAAGCTCT	+	chr2R	22723234	+	chr2R	22723310	76	+	chr2R	22723234	+	chr2R	22723310
CGCCTCCAGCCCCTCTTATCGCCCGCACAAGTTCAACAATAAAATAATGACTGTCGTTCGGTCGGGCAAAACAAA:1	CGCCTCCAGCCCCTCTTATCGC	TCGTTCGGTCGGGCAAAACAAA	+	chr3R	21141704	+	chr3R	21150185	8481	+	chr3R	21141704	+	chr3R	21150185
AAAATAAATTGCATTTACCATACTATACTAGGCTGTACCACGATTACAACTTAGGCAAATCACNAAATAATATAA:1	AAAATAAATTGCATTTACCATA	GGCAAATCACNAAATAATATAA	+	chr3R	5822397	+	chr3R	5823564	1167	+	chr3R	5822397	+	chr3R	5823564
TCTAATGAAACTCAAGGCAGCCCGCAGCTAAGAAGAACCCCAAAAGTGTGAATCACAAAAGNTTGGGCCACT:1	TCTAATGAAACTCAAGGCAGCC	AATCACAAAAGNTTGGGCCACT	-	chr3R	25576957	-	chr3R	25576861	96	+	chr3R	25576861	+	chr3R	25576957
CGGTCAACTTATTCCATTTCGTTTATTTCCAGGCCGCAAAGCAAACGACGGCTTAGGCAATTTTCAATCCTCGAA:1	CGGTCAACTTATTCCATTTCGT	TAGGCAATTTTCAATCCTCGAA	+	chr2L	18883864	+	chr2L	18883946	82	+	chr2L	18883864	+	chr2L	18883946
GACCAAAAAAAAGAAAAAAATAACGGAGCCGCACGCTAATTGAACTCGANTATGAAAGTTACCATCAGTTCAA:1	GACCAAAAAAAAGAAAAAAATA	ATGAAAGTTACCATCAGTTCAA	-	chrX	17553118	-	chrX	10279881	7273237	+	chrX	10279881	+	chrX	17553118
GCTGCTTGTGCAATTGCCGCTTACTTCAAACGGCCATTCATCAGACTCGTTGAATGCAAACGGCAAANAAAT:1	GCTGCTTGTGCAATTGCCGCTT	TGAATGCAAACGGCAAANAAAT	-	chr3L	12933173	-	chr3L	12933092	81	+	chr3L	12933092	+	chr3L	12933173
GTTGTAGAGCATCTATTGCTTAAAACGAGTTTTAAACGCACAGCGTAAGACGACGAGATCCTCTCTTCGAAATCT:1	GTTGTAGAGCATCTATTGCTTA	CGAGATCCTCTCTTCGAAATCT	-	chr3L	16494522	-	chr3L	16494005	517	+	chr3L	16494005	+	chr3L	16494522
GTTATACATGTGTTGAATTTACTTATCAAAGCATGGGTTCATTTCACATATAGATATTTACCTGGAATATAATGC:1	GTTATACATGTGTTGAATTTAC	ATATTTACCTGGAATATAATGC	+	chr3L	10694924	+	chr3L	10695016	92	+	chr3L	10694924	+	chr3L	10695016
CAGAGAAAGGAGAAATTGAGAAGAGAACCGGAGAACAGTGCCAATGAGGGAACAATGTCGA:1	CAGAGAAAGGAGAAATTGAGAA	GCCAATGAGGGAACAATGTCGA	-	chr2L	18246075	-	chr2L	20680694	2434619	+	chr2L	20680694	+	chr2L	18246075
GGCAAGCATTCATAATGCTCACCCGGTGGCCATGTCAAAATGCCATTTTTATGTGGCACACGCGCTGC:1	GGCAAGCATTCATAATGCTCAC	TTTTATGTGGCACACGCGCTGC	+	chr3R	17348755	+	chr3R	17348837	82	+	chr3R	17348755	+	chr3R	17348837
GTGGGCTGCTTGGCCTATAAAGGCTTTCAACGAGCAGAAAAGCACTTCAATTGCGGGGCGTACGAGAT:1	GTGGGCTGCTTGGCCTATAAAG	TCAATTGCGGGGCGTACGAGAT	+	chr3L	21886397	+	chr3L	21886473	76	+	chr3L	21886397	+	chr3L	21886473
AATGCAAAACCATTTCATTTGCCGACTGACCACCCCTGCAGCTGAGTTGGCAATTAAGCGAGTTAAAATACTTCT:1	AATGCAAAACCATTTCATTTGC	TTAAGCGAGTTAAAATACTTCT	-	chr3R	16411567	-	chr3R	16411489	78	+	chr3R	16411489	+	chr3R	16411567
ATTTAATTTTAATTAACATCTTAATGAGTGCATCCAATTATACTTGTTTAGACCAGATGCGGTGCCCAGAGAAAG:1	ATTTAATTTTAATTAACATCTT	CAGATGCGGTGCCCAGAGAAAG	-	chr3L	17790885	-	chr3L	17790620	265	+	chr3L	17790620	+	chr3L	17790885
GTTCGAGGTGTCTTTGTGTGTGTGGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	GTTCGAGGTGTCTTTGTGTGTG	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	28085829	-	chr3R	21907535	6178294	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28085829
AAATTAACTTTCTTATTGTCTGAAGAACAATTCCGTTTAGTCACCTATTACCTTATTGATTCATATACAAATTTA:1	AAATTAACTTTCTTATTGTCTG	TATTGATTCATATACAAATTTA	-	chr3R	28181130	-	chr3R	28173700	7430	+	chr3R	28173700	+	chr3R	28181130
TATTTGTTAATAATTAGATCATTACGTATGATCATCATATATGAATTGGGCCCAAACGACATTAT:1	TATTTGTTAATAATTAGATCAT	AATTGGGCCCAAACGACATTAT	+	chr3L	8716244	+	chr3L	8716315	71	+	chr3L	8716244	+	chr3L	8716315
TTATCTTGCATAGTAAGGTACATAATTACTCAGTGATTAGTAATTCCGACTCACCTAGGAAATATTGCCGGAAAG:1	TTATCTTGCATAGTAAGGTACA	CCTAGGAAATATTGCCGGAAAG	-	chr3L	17510839	-	chr3L	17510755	84	+	chr3L	17510755	+	chr3L	17510839
TGTCGCAAAACCATCTCTGACCCATAACTTTGATCGCGTTAATGTCCAAGTGCACCCCCTGTG:1	TGTCGCAAAACCATCTCTGACC	ATGTCCAAGTGCACCCCCTGTG	-	chr3R	9926599	-	chr3R	9926524	75	+	chr3R	9926524	+	chr3R	9926599
GAACGGGAAAATATCTCAGCGAGTGCCTCTGGGCGCATAATCGAAAGTTCTTCAAAATGCATGTCAGCGGAAGAT:1	GAACGGGAAAATATCTCAGCGA	AAAATGCATGTCAGCGGAAGAT	-	chr3R	7681488	-	chr3R	7680857	631	+	chr3R	7680857	+	chr3R	7681488
ACTAAACTCCATACGCTACGAAGGGCATTCCATTATCGCTACTGATTATTATTTGGTGGCAAGTCGGCGAAAA:1	ACTAAACTCCATACGCTACGAA	TTTGGTGGCAAGTCGGCGAAAA	+	chr3R	18041759	+	chr3R	18041834	75	+	chr3R	18041759	+	chr3R	18041834
TCCATGTAATGCTCCTCCTTATCGAGGCGGATTTTTGCGATAATGGAGAGTGCAAAATCGAGCACAAGCG:1	TCCATGTAATGCTCCTCCTTAT	AGTGCAAAATCGAGCACAAGCG	-	chr2R	11675082	-	chr2R	11675007	75	+	chr2R	11675007	+	chr2R	11675082
CAAATCGGCACACTTGCCTGCCCAATGGCTAAAATATTTAATTATTTTGGTCTTTGTTTATTTATCTTTCTTGCG:1	CAAATCGGCACACTTGCCTGCC	TTGTTTATTTATCTTTCTTGCG	-	chr3R	8763451	-	chr3R	21049856	12286405	+	chr3R	21049856	+	chr3R	8763451
TTATTAAATACTTTACTTTACATCGTTTGTATCAGCTTATAATCCAGGGGGAACTATCCGTCGCTTC:1	TTATTAAATACTTTACTTTACA	AGGGGGAACTATCCGTCGCTTC	+	chr3R	8706935	+	chr3R	6032335	2674600	+	chr3R	8706935	+	chr3R	6032335
CTTCAGAAGTCGAGGAATTTCCCGATAATGCATATGTAAATAGCGCTCGGAATCGATTTCTTCTACAAAAATAAA:1	CTTCAGAAGTCGAGGAATTTCC	CGATTTCTTCTACAAAAATAAA	+	chr2R	17281958	+	chr2R	17282040	82	+	chr2R	17281958	+	chr2R	17282040
TATGAGGCCCACGCAGACAGCGGCGCCACACGAAAATGTGTTA:1	TATGAGGCCCACGCAGACAGCG	GGCGCCACACGAAAATGTGTTA	-	chr2R	7141412	-	chr2R	7139952	1460	+	chr2R	7139952	+	chr2R	7141412
ATTATATCTTTAAGCAAATTCCACCTTCTTCCCATCGAATTCCTTG:1	ATTATATCTTTAAGCAAATTCC	CTTCTTCCCATCGAATTCCTTG	-	chrX	11762322	-	chrX	11762267	55	+	chrX	11762267	+	chrX	11762322
ACAACAATCAGATAAATCTACAATCTTCTTCATCTTTTGGCGACTTTATTTATTATATTAATTGTTNCCATGTCC:1	ACAACAATCAGATAAATCTACA	TATATTAATTGTTNCCATGTCC	+	chr2R	13220543	+	chr2R	13220642	99	+	chr2R	13220543	+	chr2R	13220642
ATGCATTAGCTGAGGGCACACGAACACAAACTTTTTGCTGCACTTTTGCTGCATACACGTATAAATAAAATACAC:1	ATGCATTAGCTGAGGGCACACG	TACACGTATAAATAAAATACAC	-	chr3L	9266174	-	chr3L	9166910	99264	+	chr3L	9166910	+	chr3L	9266174
CTGCTTAAGGAATATCTATTTTTTAAAATGTAAATGCACATTACCAACTCTTACATTGCCATAATTTAGCCACTT:1	CTGCTTAAGGAATATCTATTTT	CATTGCCATAATTTAGCCACTT	+	chr3L	15878432	+	chr3L	10541684	5336748	+	chr3L	15878432	+	chr3L	10541684
CGGGTATGATATTCTGGAGCGATGTTGCAACCCNGAGTATTTACAAAGCGCCCAT:1	CGGGTATGATATTCTGGAGCGA	NGAGTATTTACAAAGCGCCCAT	-	chr3R	25745578	-	chr3R	25707381	38197	+	chr3R	25707381	+	chr3R	25745578
TTTATCGCGTTTTTTCTTTTACATATCAAAACTCCAATTATACATTTTTAGT:1	TTTATCGCGTTTTTTCTTTTAC	ACTCCAATTATACATTTTTAGT	+	chr2R	7408405	+	chr2R	11588270	4179865	+	chr2R	7408405	+	chr2R	11588270
ATTGATATATGTAAAACTTTCTCGTTAAAATAAGCCTAAAACGAGAA:1	ATTGATATATGTAAAACTTTCT	TAAAATAAGCCTAAAACGAGAA	-	chr3L	19981283	-	chr3L	19981231	52	+	chr3L	19981231	+	chr3L	19981283
CATAATGCTCTTAGTCAACTGCATATTCTATGTAATGTCATCCAAGTCAATATTAAATTGNAGCAATTAAATA:1	CATAATGCTCTTAGTCAACTGC	ATTAAATTGNAGCAATTAAATA	-	chr2R	24637004	-	chr2R	24636920	84	+	chr2R	24636920	+	chr2R	24637004
ATCATGGTTTTGTCCCTGGGTTTGCCTTACTTCAATTATTCTCCTGATTACTAATTTCGGAAAATAAGTTTTC:1	ATCATGGTTTTGTCCCTGGGTT	TAATTTCGGAAAATAAGTTTTC	+	chr2R	6691146	+	chr2R	6691223	77	+	chr2R	6691146	+	chr2R	6691223
TTTCGTTTCTGGNATTTTTTGCTGCCATTTNANCAGACNCTCTGGGCTTGGGGCATTTTTAGTTTTCAGCGCAG:1	TTTCGTTTCTGGNATTTTTTGC	GCATTTTTAGTTTTCAGCGCAG	-	chr3R	28990098	-	chr3R	28989924	174	+	chr3R	28989924	+	chr3R	28990098
AGGGAAAAATGGTGAAAAGCAGGAAAAGTAGGAAAATGATGAGATAAAAACTGTTGTG:1	AGGGAAAAATGGTGAAAAGCAG	TGATGAGATAAAAACTGTTGTG	-	chrX	20575260	-	chrX	16062349	4512911	+	chrX	16062349	+	chrX	20575260
AGATGTTTGCCAGTCGGCTAATGACATGTTCATGGCACGAATAATTTATACCGTTACA:1	AGATGTTTGCCAGTCGGCTAAT	ACGAATAATTTATACCGTTACA	+	chr2L	13152255	+	chr2L	13152316	61	+	chr2L	13152255	+	chr2L	13152316
CTTCAGCGAAGCAATCAAGTCCAAAAAGCAAGCGAACTCACTAACATCGGCCTGCAGACGTTGGTCGCAGACCAG:1	CTTCAGCGAAGCAATCAAGTCC	GCAGACGTTGGTCGCAGACCAG	-	chr3L	27728766	-	chr3L	27727659	1107	+	chr3L	27727659	+	chr3L	27728766
TATATTTTATATAATAAAACGAAGCTTTTTGCTGCTGCATTTTCTC:1	TATATTTTATATAATAAAACGA	CTTTTTGCTGCTGCATTTTCTC	+	chrX	15277665	+	chrX	15277721	56	+	chrX	15277665	+	chrX	15277721
AAATTGGAGCATATCGAAGTTTTTTATTTTTCTTATTTTTCGTTATTTAT:1	AAATTGGAGCATATCGAAGTTT	TTTCTTATTTTTCGTTATTTAT	+	chr3L	15144140	+	chr3L	18124533	2980393	+	chr3L	15144140	+	chr3L	18124533
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGACGGGGCAAACAAGCAGTATAAACAAACACTATA:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	AGCAGTATAAACAAACACTATA	+	chr3L	22908067	+	chr3L	22938572	30505	+	chr3L	22908067	+	chr3L	22938572
CTGTTAGCTTCCTTCAGCTCTGCGCAGCTTCAGCTGATAAGGCCA:1	CTGTTAGCTTCCTTCAGCTCTG	GCAGCTTCAGCTGATAAGGCCA	+	chr3R	1867172	+	chr3R	1954893	87721	+	chr3R	1867172	+	chr3R	1954893
AGCAGCAACAGCAACAGCAGCAACAGCAACAACAACATCAAGCGGAAGGCAGCAACAGCAGCAGCAACAA:1	AGCAGCAACAGCAACAGCAGCA	GCAGCAACAGCAGCAGCAACAA	-	chr3L	18058401	-	chr3L	14125926	3932475	+	chr3L	14125926	+	chr3L	18058401
ATCCTTAAAGTGGGTGGCAAGACTGGAAAGAAGTTCAAAGGCATCCGCGAGGGCGGCATTTCTTCGCTTCAAAAT:1	ATCCTTAAAGTGGGTGGCAAGA	CGGCATTTCTTCGCTTCAAAAT	+	chr3R	6381037	+	chr3R	23294530	16913493	+	chr3R	6381037	+	chr3R	23294530
CAGCGTAGAAGCAGAGAACTGGGAAGTGCTGTGAGAGGGCTAGGCTCGATCAGTGGTACATGCTTGATCCCAGTG:1	CAGCGTAGAAGCAGAGAACTGG	TGGTACATGCTTGATCCCAGTG	-	chr3L	27390786	-	chr3L	27390707	79	+	chr3L	27390707	+	chr3L	27390786
TATTTTTTCACTTTTATCACAAATCATGGAACTCGAGCATTAAAGAGCCTGTTTGGTGACTTGAAGCTGATAGC:1	TATTTTTTCACTTTTATCACAA	TTGGTGACTTGAAGCTGATAGC	+	chr2R	6247813	+	chr2R	6247890	77	+	chr2R	6247813	+	chr2R	6247890
TGTGACAAGGCCAACTAATTTGTACACTTCACTCGAGNAACCGAANGACAGTTGGCATAAAAATAAGANAAT:1	TGTGACAAGGCCAACTAATTTG	GTTGGCATAAAAATAAGANAAT	-	chr2L	12941318	-	chr2L	12933854	7464	+	chr2L	12933854	+	chr2L	12941318
CAACAAAAATCCACTGAAGCGGGCGTGGGCGCAGCAATTGTTGCTGCTGCTGGGGCATCCAAAATGCCAGAGAT:1	CAACAAAAATCCACTGAAGCGG	GGGCATCCAAAATGCCAGAGAT	-	chr3L	5572267	-	chr3L	5572158	109	+	chr3L	5572158	+	chr3L	5572267
CGGCAGCTTTTCGCGCCTGCAAATATGCAATAAAATTTTTACAGGCCGCCATGAATTTGCTAAGGTGGAATTAAA:1	CGGCAGCTTTTCGCGCCTGCAA	AATTTGCTAAGGTGGAATTAAA	+	chr2R	11019876	+	chr2R	11024942	5066	+	chr2R	11019876	+	chr2R	11024942
AAAATTGGTCCAAAGCAAGAATTAATTTTCCAAACACTTANATCCNAACTGTCCAACGTTGTTNGCCAATTTG:1	AAAATTGGTCCAAAGCAAGAAT	TCCAACGTTGTTNGCCAATTTG	-	chr2R	22579714	-	chr2R	22579630	84	+	chr2R	22579630	+	chr2R	22579714
AGTACCTGCCTTTGGTGCAAAAGGATGCGTTTGGGGAATTTCAGCCAGGGCGAAAGATATACGGCC:1	AGTACCTGCCTTTGGTGCAAAA	CCAGGGCGAAAGATATACGGCC	+	chr2L	1993212	+	chr2L	1993289	77	+	chr2L	1993212	+	chr2L	1993289
GTCGATCATAGGTTCTAGTTTTCTTGGCCTTTTTTTTAGATTTCTTTT:1	GTCGATCATAGGTTCTAGTTTT	GCCTTTTTTTTAGATTTCTTTT	-	chr2R	25198315	-	chr2R	16885005	8313310	+	chr2R	16885005	+	chr2R	25198315
GGACAACGAAATAAATTTCAATTGACTGAACCTTGTTTGCTTGTTTTGAAAAGCCAAAACCAATTAGCTTTG:1	GGACAACGAAATAAATTTCAAT	AAGCCAAAACCAATTAGCTTTG	-	chr3L	932621	-	chr3L	925198	7423	+	chr3L	925198	+	chr3L	932621
TCTCTCTGGTGCCATCATTTAAGTAACATAACATAATTTAAGTAACACACACTCGTGTAGGCTGTGTACTCTT:1	TCTCTCTGGTGCCATCATTTAA	CTCGTGTAGGCTGTGTACTCTT	+	chr2L	13032513	+	chr2L	13032607	94	+	chr2L	13032513	+	chr2L	13032607
GGGGGGGGGTTGCAAGGCACAAGTG:1	GGGGGGGGGTTGCAAGGCACAA	GGGGGGTTGCAAGGCACAAGTG	+	chrX	5806466	+	chrX	13926702	8120236	+	chrX	5806466	+	chrX	13926702
AAAGTTTGTAACCCGGCACTTGACGCGTGGTGTGTGTGAGTATATATGTGTGTGTGTGCGTGT:1	AAAGTTTGTAACCCGGCACTTG	ATATATGTGTGTGTGTGCGTGT	+	chr2R	10948036	+	chr2R	10955575	7539	+	chr2R	10948036	+	chr2R	10955575
AGTTGGCATAAACTTTAAANTGGGCATTCTCGGCGATAAATTAAAAAGAAAATAAAAAAA:1	AGTTGGCATAAACTTTAAANTG	AATTAAAAAGAAAATAAAAAAA	+	chr3R	11609785	+	chr3R	25515016	13905231	+	chr3R	11609785	+	chr3R	25515016
AATAAGCTACAAGTGTAGATATATATTATAACAACTAAATCATATTGTTAAATAATAATAGAACAACATAATATA:1	AATAAGCTACAAGTGTAGATAT	AATAATAGAACAACATAATATA	-	chr3R	20205717	-	chr3R	20205595	122	+	chr3R	20205595	+	chr3R	20205717
TGAGCGTTAAAGTCCGTATCGCAGATCTTGTATGATGATATTTTTCCTGGGCAGTAAATTATAAGTTGATGCGGG:1	TGAGCGTTAAAGTCCGTATCGC	GTAAATTATAAGTTGATGCGGG	-	chrX	9975809	-	chrX	9975730	79	+	chrX	9975730	+	chrX	9975809
GGTTGACAAGATAGCGGGACTCTGCGCTTTGACTTACGTGATGGGTGGTGTTCCTAAGGGTGCTTGGGCGTCGGG:1	GGTTGACAAGATAGCGGGACTC	CTAAGGGTGCTTGGGCGTCGGG	-	chr2R	7254940	-	chr2R	7254825	115	+	chr2R	7254825	+	chr2R	7254940
CATGCAAAAGCATTTTGCGCGCTCCATTTTGCTCAGCTGCCAAGTGGGAAATGGGAAAATGACTGAGGAAAAAAG:1	CATGCAAAAGCATTTTGCGCGC	GGAAAATGACTGAGGAAAAAAG	-	chrX	5799038	-	chrX	5798876	162	+	chrX	5798876	+	chrX	5799038
ATAAAGCGAAGACAAAGGAACGACAATCCTCGCTGTAATTACACAGAAGGCCTGAGTGAGTGCAAGGGAACCAG:1	ATAAAGCGAAGACAAAGGAACG	TGAGTGAGTGCAAGGGAACCAG	-	chr3L	1163929	-	chr3L	15372660	14208731	+	chr3L	15372660	+	chr3L	1163929
ATCTGTTCACCCGGACAGNCACGCATCCCAAAAAGTATGACNCGANCAGGGCCCAAAAAAAAGAAATAAAAAATA:1	ATCTGTTCACCCGGACAGNCAC	CAAAAAAAAGAAATAAAAAATA	-	chrX	16645568	-	chrX	12028807	4616761	+	chrX	12028807	+	chrX	16645568
ATTGCGGGTCTTGGATACGAAAGTAGTTTCCCAGTTTCATATATTCGAGCTTATCTATGGTCCTGCATAAAAA:1	ATTGCGGGTCTTGGATACGAAA	TATCTATGGTCCTGCATAAAAA	-	chr3R	22843227	-	chr3R	22843153	74	+	chr3R	22843153	+	chr3R	22843227
TATAGTGGTTAGCTGGATAAACTTCCTAGCAAAAAAGTCGTTCCTCAAAGTTTTTTATTTCGAGAAGCTTTATAC:1	TATAGTGGTTAGCTGGATAAAC	TTTATTTCGAGAAGCTTTATAC	-	chr2L	21745355	-	chr2L	21745265	90	+	chr2L	21745265	+	chr2L	21745355
GCAAAGAGCTGGACCGCATCGAGAGCGAGGTGATTAAGAAAGAAAGTGTNTGGTGGGGAACAGGGCTAAAACAA:1	GCAAAGAGCTGGACCGCATCGA	GTGGGGAACAGGGCTAAAACAA	+	chr3L	1796206	+	chr3L	18628129	16831923	+	chr3L	1796206	+	chr3L	18628129
AAACATTGAGTTCTAAACTTACGTCAACTTTAAAGCATCTGACAGCAACTCAAATGCGATTGTTACGAAGAGCAA:1	AAACATTGAGTTCTAAACTTAC	ATGCGATTGTTACGAAGAGCAA	-	chr2R	5491866	-	chr2R	5491725	141	+	chr2R	5491725	+	chr2R	5491866
AAAATTTTCTTTNGTTGAGTGTTTCAATATNTNTGAAGNTTCCATGGAAGACAGCAGCTACTGTGACTGATTGA:1	AAAATTTTCTTTNGTTGAGTGT	AGCAGCTACTGTGACTGATTGA	+	chr2R	11537229	+	chr2R	11537305	76	+	chr2R	11537229	+	chr2R	11537305
TGGTACAAAAGAAACTTTAAATAAACAGGTTTGTAGAAAAGTATTCNATAAACAAATGTT:1	TGGTACAAAAGAAACTTTAAAT	AAGTATTCNATAAACAAATGTT	-	chr3R	28345728	-	chr3R	28345667	61	+	chr3R	28345667	+	chr3R	28345728
AGCCGCTAATGAATTATTTACTGCCCATTTGGCCGTCCTCGCCGAGTCGGGGGATATATGTCTATATATGATGGG:1	AGCCGCTAATGAATTATTTACT	ATATATGTCTATATATGATGGG	-	chr3R	17591757	-	chr3R	17591321	436	+	chr3R	17591321	+	chr3R	17591757
TGATAACGATTGTTATATTCGTAGATCTGGTCTGNACTGCGTCTCCAGGTTCCAGAACTTGATCTGCGTGTCCTT:1	TGATAACGATTGTTATATTCGT	AGAACTTGATCTGCGTGTCCTT	-	chr3R	28884636	-	chr3R	18284320	10600316	+	chr3R	18284320	+	chr3R	28884636
ATCATGATNACCACGACGATCGGGCAAATAGTAAAAAACGAAACCGATCTAGTGATATTTTCGATGTGGAAACTA:1	ATCATGATNACCACGACGATCG	GATATTTTCGATGTGGAAACTA	-	chr3R	13716305	-	chr3R	25482653	11766348	+	chr3R	25482653	+	chr3R	13716305
CGCTAAAACTTGGAAAGGAACAACCATAACNATTCCTCGTCACCTACCCCTTCTTAAAAAATATTATAGAAATT:1	CGCTAAAACTTGGAAAGGAACA	CTTAAAAAATATTATAGAAATT	-	chr3R	13318913	-	chr3R	13314126	4787	+	chr3R	13314126	+	chr3R	13318913
TAAATAATTGGCTAAAATCAAAGCTTTGTACAATGGTTATTTAGTTATATTCTTTTATGTGAAGCAGNCGTGTG:1	TAAATAATTGGCTAAAATCAAA	TTTTATGTGAAGCAGNCGTGTG	+	chr3L	9415156	+	chr3L	9415242	86	+	chr3L	9415156	+	chr3L	9415242
TTATTCATCACCGGTATATGAGGGATAATACAATAAATTCCGAACTAAATAAACACTTTTTTGCT:1	TTATTCATCACCGGTATATGAG	ACTAAATAAACACTTTTTTGCT	-	chr2R	14897815	-	chr2R	14889217	8598	+	chr2R	14889217	+	chr2R	14897815
AGTCTGCCGAACGGCGAATGCAGAATAATTATTATTTTGCCACCCGAGTGGGGCTGTAATGCGAAGNCTTCT:1	AGTCTGCCGAACGGCGAATGCA	GGGCTGTAATGCGAAGNCTTCT	-	chr3R	27800147	-	chr3R	27799772	375	+	chr3R	27799772	+	chr3R	27800147
GATGGTGGTCTTAGCTTTGTGTGTCTGCCGTTGTTAGCATCTTGTTCCACTAGGCTAAATCAGAAAAATCGA:2	GATGGTGGTCTTAGCTTTGTGT	TAGGCTAAATCAGAAAAATCGA	-	chr2R	17260774	-	chr2R	17260590	184	+	chr2R	17260590	+	chr2R	17260774
ATATTTTCATTATAAACCAATGTGTATGCATATATTTTGGGGGANTATTTTTGCAAATATTTTCTCATGCCGAA:1	ATATTTTCATTATAAACCAATG	GCAAATATTTTCTCATGCCGAA	+	chr3R	20266545	+	chr3R	20273015	6470	+	chr3R	20266545	+	chr3R	20273015
GTAGCACGCTACTCCTTTTGCTTTTCCCGGCAAAGGACTGAATTTATGACTCTGGGAGAGGGCTTGTGTAA:1	GTAGCACGCTACTCCTTTTGCT	CTCTGGGAGAGGGCTTGTGTAA	-	chr3R	16762526	-	chr3R	16756339	6187	+	chr3R	16756339	+	chr3R	16762526
AGAGTCAACATGTCGTATGCGCAATAAATGTCATCAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	AGAGTCAACATGTCGTATGCGC	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	19594159	+	chr2L	16217660	3376499	+	chr2L	19594159	+	chr2L	16217660
GTAGCAAAATAGTGGGCCCAAAGTTTTGCACACTGCGATAATGATGTCGGAAGAATATTTTATTAACGCATTGGA:2	GTAGCAAAATAGTGGGCCCAAA	AATATTTTATTAACGCATTGGA	+	chr3R	18812081	+	chr3R	18812159	78	+	chr3R	18812081	+	chr3R	18812159
AATGAGATTGTCATAAACTGCGACCGTACGATGAGGCCAAATAATGAGTATAGCAATCAATGCGTTAGAAGATGA:1	AATGAGATTGTCATAAACTGCG	CAATCAATGCGTTAGAAGATGA	-	chrX	9509673	-	chrX	9508155	1518	+	chrX	9508155	+	chrX	9509673
AATCTGCTTGCAAGTTGGAAAATTATTAAAGTTTAGCTTAAAAAAAAAACAGAAGTTATCTAATAAAATTATGCG:1	AATCTGCTTGCAAGTTGGAAAA	AGTTATCTAATAAAATTATGCG	-	chr3L	13740141	-	chr3L	13740049	92	+	chr3L	13740049	+	chr3L	13740141
CAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCA:1	CAAGGTAAGAGTAAGGCTATTC	TCTCTTTAAGTCAAACGATTCA	+	chr2R	13136854	+	chr2R	13141652	4798	+	chr2R	13136854	+	chr2R	13141652
TCTCCTGCTCCTCCTGCTCCTCCTGCTCC:1	TCTCCTGCTCCTCCTGCTCCTC	CTCCTCCTGCTCCTCCTGCTCC	-	chrX	18032334	-	chrX	6360370	11671964	+	chrX	6360370	+	chrX	18032334
TACACAAGCATGTGATAATCCCTTTTGTGAATCCGCCGGTCAATTGCCCAGGGCGTTG:1	TACACAAGCATGTGATAATCCC	CGGTCAATTGCCCAGGGCGTTG	-	chr2L	16333878	-	chr2L	16334196	318	+	chr2L	16334196	+	chr2L	16333878
TGGCTGTAGAACCTCGTCCTGCTGCTGGTTTTTCCTCCGTTT:1	TGGCTGTAGAACCTCGTCCTGC	GCTGCTGGTTTTTCCTCCGTTT	-	chrX	10970704	-	chrX	8653840	2316864	+	chrX	8653840	+	chrX	10970704
ATCTGCTAATTCCACTTGCCTTAATTAATATTTACAAACTATGCAGTAGTCAGTTCAAAGGCCTCTATTGCCTTA:1	ATCTGCTAATTCCACTTGCCTT	TTCAAAGGCCTCTATTGCCTTA	+	chr2L	2932465	+	chr2L	2932922	457	+	chr2L	2932465	+	chr2L	2932922
AGGACCGGGGATTAAGCGGGTTCCTTCCGCAACAGTAGGGCTCCTGCGGAACAGCGACAGGTACTGGCATGGTT:1	AGGACCGGGGATTAAGCGGGTT	AGCGACAGGTACTGGCATGGTT	+	chrX	2399854	+	chrX	2408206	8352	+	chrX	2399854	+	chrX	2408206
ATTACTCGGCCAGCAGTAACTAGTACCTCCACCTCCTTCCCGTACACCACCCGCC:1	ATTACTCGGCCAGCAGTAACTA	TCCTTCCCGTACACCACCCGCC	-	chr2L	11332156	-	chr2L	11332070	86	+	chr2L	11332070	+	chr2L	11332156
TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTG	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
AGACATTCCCTAACATTAACAATATATTAAAAAAATAGTAGATATTAACATACAGTTTTGCGGCGAATTCGATCT:1	AGACATTCCCTAACATTAACAA	AGTTTTGCGGCGAATTCGATCT	-	chr3R	5846972	-	chr3R	5846896	76	+	chr3R	5846896	+	chr3R	5846972
AAAAATCATAAACCATAATACACATGCACATCGGCTTTAAGCCTAATTAGTTAAGTAAAGGATATGTGATAGTCG:1	AAAAATCATAAACCATAATACA	AGTAAAGGATATGTGATAGTCG	+	chr2R	6948110	+	chr2R	6948186	76	+	chr2R	6948110	+	chr2R	6948186
AATAATATTATGTATGTATAAATCACTGAAAACTTGCCTTTGGGTGCAGTGCCCCTCTGAAGATTGACACTGGC:1	AATAATATTATGTATGTATAAA	CCCTCTGAAGATTGACACTGGC	+	chr3R	24810033	+	chr3R	25292678	482645	+	chr3R	24810033	+	chr3R	25292678
ATCACCAGCAATTTTCGGACGAAATTGAAATTTTAATAAACATTTTGGCGCCTTGTGATAATATTTACTCTTACA:1	ATCACCAGCAATTTTCGGACGA	TGTGATAATATTTACTCTTACA	-	chr3L	482372	-	chr3L	482293	79	+	chr3L	482293	+	chr3L	482372
GCCAGGATGATGAGGAGCGGGGAAATGAATATTCGAAATTGCAGT:1	GCCAGGATGATGAGGAGCGGGG	AATGAATATTCGAAATTGCAGT	+	chr3L	1415808	+	chr3L	1415860	52	+	chr3L	1415808	+	chr3L	1415860
CTTGAAGTTTTTAGCGAGTTAGCAAATTCGTGTTGACTTTGTTTCAG:1	CTTGAAGTTTTTAGCGAGTTAG	ATTCGTGTTGACTTTGTTTCAG	-	chr2L	2305209	-	chr2L	2305142	67	+	chr2L	2305142	+	chr2L	2305209
TTGCTAAAATGTTTACAAGTCACTTTGCGGGCGATATCCCTGTGCTCGCCTTCAGAAGCTTCCAAACTCTAG:1	TTGCTAAAATGTTTACAAGTCA	TTCAGAAGCTTCCAAACTCTAG	-	chr3R	29550349	-	chr3R	29550271	78	+	chr3R	29550271	+	chr3R	29550349
TTATTTGTATGTATTTATTTTGCTGGCTCCGGTTTTGTGGTCCATATATTCGTAGTAGAAANTATTTTTGCCAGT:1	TTATTTGTATGTATTTATTTTG	AGTAGAAANTATTTTTGCCAGT	-	chr3L	15209151	-	chr3L	15209065	86	+	chr3L	15209065	+	chr3L	15209151
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTAGGATTACAGACTTATATGTAGCCCTCTGTTCTTAACTCCGA:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	AGCCCTCTGTTCTTAACTCCGA	-	chr3R	21907534	-	chr3R	18015841	3891693	+	chr3R	18015841	+	chr3R	21907534
ATTCAATTTGGAGTAACTTGGGTGGTGAAAACTAAAGTTGGGCAATTGCGCGCCATATCAACTGGCCATTAGCAT:1	ATTCAATTTGGAGTAACTTGGG	CATATCAACTGGCCATTAGCAT	-	chr3L	19218036	-	chr3L	19217118	918	+	chr3L	19217118	+	chr3L	19218036
ACAAACAGCGACAAGTGTAAGTAAGGCCAAAAGGACGAATGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATGCTCCT:1	ACAAACAGCGACAAGTGTAAGT	GCAGGACGAAGGACATGCTCCT	-	chr2L	15852156	-	chr2L	15852073	83	+	chr2L	15852073	+	chr2L	15852156
GGACAGGGTGGCCGTGGCACAACGGAAAGCGGCGGATCGGATCATATATCGTTGGACAACGGAATAAGTTCCTCG:1	GGACAGGGTGGCCGTGGCACAA	GGACAACGGAATAAGTTCCTCG	-	chr3L	25331740	-	chr3L	25331649	91	+	chr3L	25331649	+	chr3L	25331740
TGATGGAAAATTATAATGAGCGGCGAGAAGAAGCAGCAGCAGTTGAGCCGTCGAGCCGGCGAG:1	TGATGGAAAATTATAATGAGCG	GTTGAGCCGTCGAGCCGGCGAG	-	chrX	19884183	-	chrX	19884119	64	+	chrX	19884119	+	chrX	19884183
ATGGCCATAAACAACAACAACAACAACAAAAACAGGANCAGCAGANGACCATGTTGCAGCCACCAC:1	ATGGCCATAAACAACAACAACA	ANGACCATGTTGCAGCCACCAC	-	chr3R	31374655	-	chr3R	28295746	3078909	+	chr3R	28295746	+	chr3R	31374655
AAAAGGACTCTTTTTATTTGTTTTGCGATTACAAAATAGTATAAAACCTTAGACAAATAGGCCTTTTAAGTATAT:1	AAAAGGACTCTTTTTATTTGTT	CAAATAGGCCTTTTAAGTATAT	+	chr3L	17909686	+	chr3L	3193642	14716044	+	chr3L	17909686	+	chr3L	3193642
TAATATGGTTGAATTTTAAGCTCATTTCTTTCATTTAGTAAATGTGTGCCCTAATCCTATTTTAAACNAAAAGAT:1	TAATATGGTTGAATTTTAAGCT	ATCCTATTTTAAACNAAAAGAT	+	chr3R	12763152	+	chr3R	12763229	77	+	chr3R	12763152	+	chr3R	12763229
CACCTACATGGCATCATTNACATGCCACAAAAATCCAGATTTTATTTGCTGTTTTCCTCTTACACATATGATNTT:1	CACCTACATGGCATCATTNACA	TTCCTCTTACACATATGATNTT	-	chr3L	5495389	-	chr3L	5570471	75082	+	chr3L	5570471	+	chr3L	5495389
AATGCTTTTTTTTTGGGGGGGGTTAGAGGTGATGATTTCAATTGCGTTTGCCACTGCAGAGGTGAAACATCTAT:1	AATGCTTTTTTTTTGGGGGGGG	ACTGCAGAGGTGAAACATCTAT	-	chrX	2671982	-	chrX	9014998	6343016	+	chrX	9014998	+	chrX	2671982
ATATGAACCTATAGATTCTTGTAGCTGCCGTATGTCTGCCCCTCGCTGTCCAAGATCCTTTGCCGATCCTCC:1	ATATGAACCTATAGATTCTTGT	CAAGATCCTTTGCCGATCCTCC	-	chrX	16539673	-	chrX	16539600	73	+	chrX	16539600	+	chrX	16539673
ACGCCCGATACATAGTGTCGAAGCGGGGCCTGAATGTCCAAAGATCTCCTGTAACTGGCAGAAAA:1	ACGCCCGATACATAGTGTCGAA	ATCTCCTGTAACTGGCAGAAAA	-	chrY	975878	-	chrY	975808	70	+	chrY	975808	+	chrY	975878
ATCCGTCAGCTTAGCCAATTAAATATAATCGATTATAAATTATTGGGAATCTCTCGTGTGGCTGGACAACTTAAA:1	ATCCGTCAGCTTAGCCAATTAA	TCGTGTGGCTGGACAACTTAAA	+	chr2L	13057263	+	chr2L	13057414	151	+	chr2L	13057263	+	chr2L	13057414
ATGGATCGGGACTTCCTAAGATCTCCAAATAAATCGCTATATAAAGATACCAAAAACACGCATCGCGACATTTCG:1	ATGGATCGGGACTTCCTAAGAT	AAACACGCATCGCGACATTTCG	+	chr3R	27215173	+	chr3R	27215249	76	+	chr3R	27215173	+	chr3R	27215249
ACCTGCCTGAAAAGAGAAGTAAGGGAAGTAAGCAGGCCACTCACTCTGCGAATGGGAAAACACTGTCTAACACAG:1	ACCTGCCTGAAAAGAGAAGTAA	GGGAAAACACTGTCTAACACAG	+	chr3R	19559504	+	chr3R	19559582	78	+	chr3R	19559504	+	chr3R	19559582
GGTCAACTTATTCCATTTNGTTTATTTCCAGACCGCAAAGCNAACNACGGTTTAGGCAATTTTCAATCCTCGAAA:1	GGTCAACTTATTCCATTTNGTT	AGGCAATTTTCAATCCTCGAAA	+	chr2L	18883865	+	chr2L	18883947	82	+	chr2L	18883865	+	chr2L	18883947
ATTAAAATTAGGTTAGTCCTCCTCTACGTCTTGATTAGGCATTTATTGAAAAATTAAGGACGGCTG:1	ATTAAAATTAGGTTAGTCCTCC	ATTGAAAAATTAAGGACGGCTG	+	chr2R	4634171	+	chr2R	4634241	70	+	chr2R	4634171	+	chr2R	4634241
TAAATTTAATAAGTCTATTAGTTTATCTTCTTTGTAAATGCCATTCGTGGTTTCTATGGTTTACCCCTCAGCAAC:1	TAAATTTAATAAGTCTATTAGT	CTATGGTTTACCCCTCAGCAAC	+	chr3L	21082212	+	chr3L	21082290	78	+	chr3L	21082212	+	chr3L	21082290
TTCAGCCAAGAAGAAGACGTTGGCTAGGAACAAGAACAAGAAGATGGCGAGGAAGCAGAGGGAGGGGAAGC:1	TTCAGCCAAGAAGAAGACGTTG	AGGAAGCAGAGGGAGGGGAAGC	+	chr2R	24727908	+	chr2R	24735412	7504	+	chr2R	24727908	+	chr2R	24735412
TGCAATACAAATGCTCAATAAGTTAAGCGAATACAAAAACATTTCTTACACTACAGAGATACTCAATTAAATTG:1	TGCAATACAAATGCTCAATAAG	ACAGAGATACTCAATTAAATTG	-	chr2L	12693942	-	chr2L	12693866	76	+	chr2L	12693866	+	chr2L	12693942
ACATTGCTTCACACTGCTATTTCGTCCTCGGCACTCTTTCATTCCGAACTCAATACGGTTTCTTCGTTCATGCAG:1	ACATTGCTTCACACTGCTATTT	TACGGTTTCTTCGTTCATGCAG	-	chr2L	2667702	-	chr2L	2667623	79	+	chr2L	2667623	+	chr2L	2667702
AAGTAGAAGTGGAGCTGGCCAAAAGTGTCCAAAATCAAGCGGAACTGCACCCTTTTCCTATCAATGAGGGAGAG:1	AAGTAGAAGTGGAGCTGGCCAA	TTTTCCTATCAATGAGGGAGAG	+	chr3L	4491905	+	chr3L	4491988	83	+	chr3L	4491905	+	chr3L	4491988
TTTGAATCCTATATTATTTCTTATGGTTTTTATTGGTTTTTGTATTGGTTTATTTCTGCTCCTTTTCTTCTTTGC:1	TTTGAATCCTATATTATTTCTT	TTCTGCTCCTTTTCTTCTTTGC	-	chrX	8807304	-	chrX	16541103	7733799	+	chrX	16541103	+	chrX	8807304
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT:2	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13693028	8214506	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907534
GGTAACAGCAACCATTAATTAGATAGGCCGCAAATTAGTGGAACATATTCCGCACATATAGAACTGTACACAGG:1	GGTAACAGCAACCATTAATTAG	CACATATAGAACTGTACACAGG	-	chr2L	20981495	-	chr2L	20976681	4814	+	chr2L	20976681	+	chr2L	20981495
ACAAATTAAAAAACTACTAAAGCAGCTCATAGCAAAGCTATTGCGTTGCTTATACATTTTAGACTAGAACATCCA:1	ACAAATTAAAAAACTACTAAAG	ACATTTTAGACTAGAACATCCA	+	chr3L	10600460	+	chr3L	10600542	82	+	chr3L	10600460	+	chr3L	10600542
TGGCTACAAAGAATGCTGTTGAGCATAGCTATATGTACTATATGTATATACATATATGGTACACTATATTTGTAT:1	TGGCTACAAAGAATGCTGTTGA	ATATGGTACACTATATTTGTAT	+	chr3R	27875706	+	chr3R	27882761	7055	+	chr3R	27875706	+	chr3R	27882761
ATGGGGTGGCTGAAAAAAAAAAGTAAGTAGAAAATACACAGAGAGAGAGAGAGA:1	ATGGGGTGGCTGAAAAAAAAAA	AATACACAGAGAGAGAGAGAGA	+	chrX	5192797	+	chrX	11768996	6576199	+	chrX	5192797	+	chrX	11768996
TGCATTTCTAAATATTTTGATAAAATCTTTAATATCTTAGCCTCACTTTTTGGTTTCAGTGTATTAATAATT:1	TGCATTTCTAAATATTTTGATA	TGGTTTCAGTGTATTAATAATT	-	chr3R	26292205	-	chr3R	26292128	77	+	chr3R	26292128	+	chr3R	26292205
TTCTGGCAAGTCTGCCGTGGCCTGAAAGTGTCACAGAGATGCTTTACACAGATAAACAACAAATAAGNATTGTTT:1	TTCTGGCAAGTCTGCCGTGGCC	AAACAACAAATAAGNATTGTTT	+	chr2L	10946957	+	chr2L	10956172	9215	+	chr2L	10946957	+	chr2L	10956172
AAATACTCTATATAGGTGATTTCCAATCAGGAATCCCTTTCACTATGTAACCAGAAGGCATATTTAAGCTTAATG:1	AAATACTCTATATAGGTGATTT	GAAGGCATATTTAAGCTTAATG	-	chr3R	24974999	-	chr3R	24974920	79	+	chr3R	24974920	+	chr3R	24974999
AAAAAAATCAGAAAAAACACACACATCCTTAGAGNGCGACACTCAAGGCTTTTATTCCGTTCACGTGCAACAAAT:1	AAAAAAATCAGAAAAAACACAC	ATTCCGTTCACGTGCAACAAAT	-	chr3R	28938587	-	chr3R	7826737	21111850	+	chr3R	7826737	+	chr3R	28938587
AAGAGGCCGACGCTTGTTCATTTCATTTGCGTTGGCTGGTTTTGCCGAGTGTGGGGCTTTT:1	AAGAGGCCGACGCTTGTTCATT	TTTTGCCGAGTGTGGGGCTTTT	+	chr2L	4805100	+	chr2L	4805165	65	+	chr2L	4805100	+	chr2L	4805165
GTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTT:1	GTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC	CTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTT	+	chrX	12649912	+	chrX	1052509	11597403	+	chrX	12649912	+	chrX	1052509
TAAACATAGATGGCTAGATGTCGCACTCGGTCGGACCGCCCAATGAGAACTTTATGCATATAT:1	TAAACATAGATGGCTAGATGTC	AATGAGAACTTTATGCATATAT	+	chr3L	22703029	+	chr3L	22703123	94	+	chr3L	22703029	+	chr3L	22703123
GCAGTTGATAAGAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATAAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTAC:1	GCAGTTGATAAGAGGATATCTA	ATTCCCAAAAGATTAAAAGTAC	+	chr3L	14468463	+	chr3L	14473669	5206	+	chr3L	14468463	+	chr3L	14473669
ATTTCGCAAATAATTCCAACGAAGACTATTGCCTTTGACAACAAATGATTAAAATCCAATTGCTTGAAAGCCT:1	ATTTCGCAAATAATTCCAACGA	AAATCCAATTGCTTGAAAGCCT	-	chrX	10308718	-	chrX	10308644	74	+	chrX	10308644	+	chrX	10308718
GATGCGCTGAGTGAGCATTGCTAACAATATAATGAAATAATATGATATATATATAATATGAAATATAATATAATA:1	GATGCGCTGAGTGAGCATTGCT	TAATATGAAATATAATATAATA	-	chr2L	19298976	-	chr2L	6798948	12500028	+	chr2L	6798948	+	chr2L	19298976
GTCGAAATAAGGATGGCCANAATTGTTGGGCCATGATAAAAGTGGTTTATGG:1	GTCGAAATAAGGATGGCCANAA	CCATGATAAAAGTGGTTTATGG	-	chr2L	13622243	-	chr2L	13622167	76	+	chr2L	13622167	+	chr2L	13622243
CGGTGGAAAATCCCCCAACAGGCCCCACTAACTAAGGTAGACGGTCGACAACGACAACTAATGAGTTCCTAATTT:1	CGGTGGAAAATCCCCCAACAGG	ACAACTAATGAGTTCCTAATTT	+	chr2R	21902632	+	chr2R	21902709	77	+	chr2R	21902632	+	chr2R	21902709
TTAATCCGTGTACCGGCAAATTTTGTTTACAGTACAGAAACTGATTTTANTGAACATAGTAACCAGTATTGCTAT:1	TTAATCCGTGTACCGGCAAATT	ACATAGTAACCAGTATTGCTAT	-	chr3L	2168883	-	chr3L	2168792	91	+	chr3L	2168792	+	chr3L	2168883
ACTTAAGTTAAAATTGGAGACAATTTACAGAGCTGACGGCCATTTAACTGTAAATCATTTTGGCTTGCATTTGG:1	ACTTAAGTTAAAATTGGAGACA	AATCATTTTGGCTTGCATTTGG	+	chr3R	18179784	+	chr3R	15148984	3030800	+	chr3R	18179784	+	chr3R	15148984
TAATAGCCTGACTGTTGCAGCTTTTGCAGGAAATGTGAAAATAACGTTACGAAACTTTTTCGTTGCAATA:1	TAATAGCCTGACTGTTGCAGCT	ACGAAACTTTTTCGTTGCAATA	-	chr3R	10587259	-	chr3R	21955724	11368465	+	chr3R	21955724	+	chr3R	10587259
TATTTAACAATAATGTCTCATTTTTCTTTGCAGTGTACTTTAAAAAATACGAGGGCATATGTAAATTGAAACG:1	TATTTAACAATAATGTCTCATT	AGGGCATATGTAAATTGAAACG	-	chr3R	12733940	-	chr3R	12733862	78	+	chr3R	12733862	+	chr3R	12733940
CGCTGAGCTCAATCAGGAAANTGGCCAAAAGCNGCGGCATTCNTTAAGAATTTAAATCGCACATAATTAAGGCTC:1	CGCTGAGCTCAATCAGGAAANT	AAATCGCACATAATTAAGGCTC	-	chr3L	7725191	-	chr3L	16014777	8289586	+	chr3L	16014777	+	chr3L	7725191
GGATTTATATCGAAACATACTTAAACATTAGAACACACATTAGAACATAATTGTATATATACGAGTANAGAGATA:1	GGATTTATATCGAAACATACTT	TATATATACGAGTANAGAGATA	-	chr3L	10584380	-	chr3L	10584293	87	+	chr3L	10584293	+	chr3L	10584380
AATCGCAGGAACACTTAGCGACATGTCTTAGAGAAACTATAAGTATAACAATAATTTAGCTCGAAATCGTACCCG:1	AATCGCAGGAACACTTAGCGAC	ATTTAGCTCGAAATCGTACCCG	+	chr3R	5746023	+	chr3R	5746264	241	+	chr3R	5746023	+	chr3R	5746264
AATAAACAAAAGCGAAAANTCAACACAATTGGCTGGAAACGNCAGNCACAAAATACGAAAAAAAATACGAAAA:1	AATAAACAAAAGCGAAAANTCA	AATACGAAAAAAAATACGAAAA	-	chr3R	21960738	-	chr3R	1363683	20597055	+	chr3R	1363683	+	chr3R	21960738
CGCCGCGTTTCTTCAAGCAGGTAGATGGTACNATGCTTCCATGCCATCTATATATTTGTTCCCCCNAAAGAGAC:1	CGCCGCGTTTCTTCAAGCAGGT	TATTTGTTCCCCCNAAAGAGAC	-	chrX	4613659	-	chrX	4613570	89	+	chrX	4613570	+	chrX	4613659
GAAACAACCAAAAAAAACACAGTTTGGTAANNNCNAACGAACGAACCGAGACGAGCTGAACAGAACGCAAACAGG:1	GAAACAACCAAAAAAAACACAG	AGCTGAACAGAACGCAAACAGG	-	chr3L	13533241	-	chr3L	22797348	9264107	+	chr3L	22797348	+	chr3L	13533241
GTTGCTGTTGCTGCAAATNGGTGGGAAAATGCTAGCTGTATNTA:1	GTTGCTGTTGCTGCAAATNGGT	GGGAAAATGCTAGCTGTATNTA	+	chr2L	18727277	+	chr2L	14887885	3839392	+	chr2L	18727277	+	chr2L	14887885
ATTTGAGCCGTATTTAATTGTTGAAATATTCCCCCTTAGCAGCTTNCTGACGTCGTCTTAG:1	ATTTGAGCCGTATTTAATTGTT	CAGCTTNCTGACGTCGTCTTAG	+	chr3R	20916307	+	chr3R	20916376	69	+	chr3R	20916307	+	chr3R	20916376
AAATTGGGGGCACAGCATGCAGTCCGTCCGAGCAAATAAATTAAAAAAAAACCATTAAAAAATGAATAAAGGAAC:1	AAATTGGGGGCACAGCATGCAG	ATTAAAAAATGAATAAAGGAAC	-	chr3R	19570811	-	chr3R	19570643	168	+	chr3R	19570643	+	chr3R	19570811
CGCCATTGGGTATTTGCCGAAACACTTTGCAATCCAACAGAAGACTCTATACACAAGTCCGNAGGGATCAAG:1	CGCCATTGGGTATTTGCCGAAA	ACACAAGTCCGNAGGGATCAAG	-	chr2L	795370	-	chr2L	795263	107	+	chr2L	795263	+	chr2L	795370
TATAATATTAATTTATTATTCAGTTTTGAGCAATGATTTCAAATCTGAAGGTTGTAGCAAATCCTTGNTTCTTT:1	TATAATATTAATTTATTATTCA	TGTAGCAAATCCTTGNTTCTTT	-	chrX	14806867	-	chrX	14806780	87	+	chrX	14806780	+	chrX	14806867
ACAAAATCCAACCAGAAAAACAAGACTGCAAAACTCCTTTAGCC:1	ACAAAATCCAACCAGAAAAACA	AGACTGCAAAACTCCTTTAGCC	+	chr2R	18571781	+	chr2R	19143395	571614	+	chr2R	18571781	+	chr2R	19143395
TTTTCCCTCTACTGTTTTAATATAAATTTGCATTCCCCCGCATGCTATGCAAATAAAAGTGGGGAAAAT:1	TTTTCCCTCTACTGTTTTAATA	TGCAAATAAAAGTGGGGAAAAT	+	chr2R	15186200	+	chr2R	15186278	78	+	chr2R	15186200	+	chr2R	15186278
TCTTGGGCTGCCTACATATACACAAACATTCTTCTGGCCAACGGATATGNCATGAATATGCGTCCAGAAAACCT:1	TCTTGGGCTGCCTACATATACA	TGAATATGCGTCCAGAAAACCT	+	chr3R	24426308	+	chr3R	24426564	256	+	chr3R	24426308	+	chr3R	24426564
TTTGAAAGTTAACTGCCATATGCCAGAGCTTCTTATCTAGATATGCATATGTATATATATACTACATAATAGTCA:1	TTTGAAAGTTAACTGCCATATG	TATATATACTACATAATAGTCA	+	chr3L	7377315	+	chr3L	7380420	3105	+	chr3L	7377315	+	chr3L	7380420
AATGCAGCGACCCGCGCTGGTGAATAGCGCCTGAAATGAGCCTACAAAGCTGTCAATTTTAATAAATTATTGCAC:1	AATGCAGCGACCCGCGCTGGTG	CAATTTTAATAAATTATTGCAC	+	chr2L	7343328	+	chr2L	7350444	7116	+	chr2L	7343328	+	chr2L	7350444
AAGCAATGTTACTGTCAAAAATGTATTCCTTTTTATGGGGCTCCT:1	AAGCAATGTTACTGTCAAAAAT	TATTCCTTTTTATGGGGCTCCT	+	chr3R	24094145	+	chr3R	4327907	19766238	+	chr3R	24094145	+	chr3R	4327907
TGGACATCATTTTTTCAACTGAGCAAACCGAGCAGCATCATCTTGACTGGACTGAACTGGACAAACAATAATGA:1	TGGACATCATTTTTTCAACTGA	TGAACTGGACAAACAATAATGA	-	chrX	6397648	-	chrX	6392884	4764	+	chrX	6392884	+	chrX	6397648
TACATTTTGGTACATATGTATTTACCAATTTCCAATTATATTTTCTGTCGACTCAAAGAGTTTTCCGAATATGAC:1	TACATTTTGGTACATATGTATT	CAAAGAGTTTTCCGAATATGAC	+	chr2L	12322476	+	chr2L	12322627	151	+	chr2L	12322476	+	chr2L	12322627
CTACATGATAAACGTTCCATCCCAGAGTCTGACTCTTAAATATATATGTAGCCAGATAAATAATAATCTCAG:1	CTACATGATAAACGTTCCATCC	GCCAGATAAATAATAATCTCAG	-	chr2R	5909734	-	chr2R	5902178	7556	+	chr2R	5902178	+	chr2R	5909734
ATATTCATAGTTCTTAAGACTTTGGGCAAATCTATAAATCACTAAATGGAAAATNTATTTT:1	ATATTCATAGTTCTTAAGACTT	CACTAAATGGAAAATNTATTTT	-	chr2R	21754763	-	chr2R	21754681	82	+	chr2R	21754681	+	chr2R	21754763
GAAATCAATTTTTTACGATTTGATCTTGACCGCTCACGATNCATTGCGATGCTTGTGTGTGGG:1	GAAATCAATTTTTTACGATTTG	CATTGCGATGCTTGTGTGTGGG	+	chr2L	712417	+	chr2L	17947369	17234952	+	chr2L	712417	+	chr2L	17947369
CTACTGTTTTAATTGGTTTAAAACAATAAGCAATAAACATATTATGGATTAGTGCTTTTAGATTTATATTTTTAC:1	CTACTGTTTTAATTGGTTTAAA	GCTTTTAGATTTATATTTTTAC	-	chr3R	20114743	-	chr3R	20109537	5206	+	chr3R	20109537	+	chr3R	20114743
TTCTTTCCATCATGTTCACCACCCACCAAAATGTGCAGCAACCTGAATAAAATACCAACGAAATACGCGTGAAAA:1	TTCTTTCCATCATGTTCACCAC	ACCAACGAAATACGCGTGAAAA	-	chr3L	22124897	-	chr3L	22124814	83	+	chr3L	22124814	+	chr3L	22124897
GCTCGGAGTTTAAATCTTNCTCTGCCCTCTGCTGTTGCAATTGCTTCTGCAACTGCTCCTGTTGCCGCCATCNGC:1	GCTCGGAGTTTAAATCTTNCTC	TGCTCCTGTTGCCGCCATCNGC	-	chr2L	7866177	-	chr2L	13993396	6127219	+	chr2L	13993396	+	chr2L	7866177
GAAACTTATGACGGAAAGCCAGAGAAAAGTGGCCATTACTTGACATTCAGTAAAAAAGTGATGGCCAAGCAG:1	GAAACTTATGACGGAAAGCCAG	TAAAAAAGTGATGGCCAAGCAG	-	chr3R	10402102	-	chr3R	10401915	187	+	chr3R	10401915	+	chr3R	10402102
GAAGCAAGCAGTTGGGGGCACAGGAAGCTCACAGACACATGAACACATACACACCAACACACATACACACAGACA:1	GAAGCAAGCAGTTGGGGGCACA	CCAACACACATACACACAGACA	-	chrX	11229070	-	chrX	10249288	979782	+	chrX	10249288	+	chrX	11229070
GCCGAATCGTGACTTTAATACACCTTTAAACAGTGTTTCAGTGTAACAGTGTTACAAGACATAAGTAATTTGTGA:1	GCCGAATCGTGACTTTAATACA	ACAAGACATAAGTAATTTGTGA	+	chr3L	15511304	+	chr3L	15511384	80	+	chr3L	15511304	+	chr3L	15511384
GCAACTTCTCCTCGAGTGAGATGAAGGGGTTCNTACCCCGCGACTCCGACTTCTCTTGACCGAC:1	GCAACTTCTCCTCGAGTGAGAT	ACTCCGACTTCTCTTGACCGAC	-	chr2R	10688797	-	chr2R	10688651	146	+	chr2R	10688651	+	chr2R	10688797
CTTTAACAAGCACACGTTCCGATAATATCTGTCAAATGCACAAATACTTAAATATGTACATTGTTCCATTTTGCA:1	CTTTAACAAGCACACGTTCCGA	ATGTACATTGTTCCATTTTGCA	+	chr2L	17951945	+	chr2L	17953412	1467	+	chr2L	17951945	+	chr2L	17953412
ACAAAATATTATGACGTCCACTATCACTTACATGTGCTTTCCAGCCCCTGAGATAATTTGAAATAAGCTTATGAT:1	ACAAAATATTATGACGTCCACT	TAATTTGAAATAAGCTTATGAT	-	chr3R	5001994	-	chr3R	5001526	468	+	chr3R	5001526	+	chr3R	5001994
CCGACGTCAGAAAGAAATGTGAATTTGAGGTGCTTTAAGCTGAC:1	CCGACGTCAGAAAGAAATGTGA	ATTTGAGGTGCTTTAAGCTGAC	+	chr3R	19140296	+	chr3R	19140713	417	+	chr3R	19140296	+	chr3R	19140713
ATTGCATATTTAGGGGCGCACTTCCATTGACTGCATAACTTTGGT:1	ATTGCATATTTAGGGGCGCACT	CCATTGACTGCATAACTTTGGT	-	chr2R	9945636	-	chr2R	9945470	166	+	chr2R	9945470	+	chr2R	9945636
GCGGCCTCGCGTCTCCAGCGTTCCTTTGGGGCCTTTGTCGTCGTTTGCTTTGTGCAACTGATTCGCTTCTTTCGT:1	GCGGCCTCGCGTCTCCAGCGTT	GCAACTGATTCGCTTCTTTCGT	+	chr2L	17522755	+	chr2L	9189056	8333699	+	chr2L	17522755	+	chr2L	9189056
TATTTTGTATTTATATGAATTTTATACCTAGATACCTATCTGCTAGATTCTAGATACATTGTGATANATATTTA:1	TATTTTGTATTTATATGAATTT	GATACATTGTGATANATATTTA	-	chr2L	5501530	-	chr2L	5501455	75	+	chr2L	5501455	+	chr2L	5501530
CGATTCACNTGAAATATGTTCGACTGGGTTGTTGAACNNNNCCAAATGACGAATGACGCATNATTCCCGACATCG:1	CGATTCACNTGAAATATGTTCG	TGACGCATNATTCCCGACATCG	-	chr2L	8789385	-	chr2L	8789309	76	+	chr2L	8789309	+	chr2L	8789385
GTAACAGATCATTGATTAATAAAGTAACCATTTAAATACATATTATTAATAACGCCACTTTCGGTGG:1	GTAACAGATCATTGATTAATAA	TTAATAACGCCACTTTCGGTGG	+	chr3L	1154163	+	chr3L	1163305	9142	+	chr3L	1154163	+	chr3L	1163305
ATCGGAAGAATCCAAAAAAGTTGCCGCACCTCAAGTTCAGCCCGTTCCACATGTTGATTCAAGCCCTCAAGCAA:1	ATCGGAAGAATCCAAAAAAGTT	GTTGATTCAAGCCCTCAAGCAA	+	chr2L	18699235	+	chr2L	18699311	76	+	chr2L	18699235	+	chr2L	18699311
TACTTTCTTGCCGTGATATTGTGGTTTCTGCCCTTTAGAAGAGTTCTTTGTTGATTGCTGATTGATTGGTG:1	TACTTTCTTGCCGTGATATTGT	GTTGATTGCTGATTGATTGGTG	-	chr3L	16969663	-	chr3L	16969441	222	+	chr3L	16969441	+	chr3L	16969663
CGGTTTTAGGTCCAATTACGGGTCTAATGANNNCNTCTAGTAAGTTTTCTTAATTCTGAGCTAAAAAGTTCTTTG:1	CGGTTTTAGGTCCAATTACGGG	TTCTGAGCTAAAAAGTTCTTTG	+	chr3L	23182836	+	chr3L	23182912	76	+	chr3L	23182836	+	chr3L	23182912
GCAGGACGNAGCACCGTAAGAACCACTGAACCACANAACAATGCAAAACAATACAAATGTACTCAGTTTTGCGCC:1	GCAGGACGNAGCACCGTAAGAA	CAAATGTACTCAGTTTTGCGCC	-	chr3L	13868073	-	chr3L	13102414	765659	+	chr3L	13102414	+	chr3L	13868073
GCTTGGGCAGTTCCCCGCCGCCGGCTAGAGCTGCAGATCCGGAGTCAGTTTCTGGGG:1	GCTTGGGCAGTTCCCCGCCGCC	GATCCGGAGTCAGTTTCTGGGG	-	chr3R	31558381	-	chr3R	15745457	15812924	+	chr3R	15745457	+	chr3R	31558381
GGAAAATGGTCGAGAAAATNCAGCAGCAAAAAGCTTCGTGTTATTATATAAAATATATGGTATACATGGGAATTA:1	GGAAAATGGTCGAGAAAATNCA	TATATGGTATACATGGGAATTA	-	chrX	15277732	-	chrX	15277647	85	+	chrX	15277647	+	chrX	15277732
GCAATACGATCATCAATAAAACATTGCTCACATATTTTTTTGCAGT:1	GCAATACGATCATCAATAAAAC	TGCTCACATATTTTTTTGCAGT	+	chr2L	1619454	+	chr2L	15282415	13662961	+	chr2L	1619454	+	chr2L	15282415
GAGTGGAATCGAGTGGTGGAGCCCGAAGTCCAGAGACATTCGATAATTAAAAGGCAGCGCACGCGGGAAGGCAAA:1	GAGTGGAATCGAGTGGTGGAGC	GCAGCGCACGCGGGAAGGCAAA	-	chrX	13006999	-	chrX	13006852	147	+	chrX	13006852	+	chrX	13006999
GTACTCACAGCCAGTCTCCTCCTCCTATCGGTGATAGGCGTCGACTTTTGCCCCCACCC:1	GTACTCACAGCCAGTCTCCTCC	GCGTCGACTTTTGCCCCCACCC	+	chr3R	5654648	+	chr3R	5654208	440	+	chr3R	5654648	+	chr3R	5654208
TTGTATCAACAGCCAGTACACGGGCCACAATTNTTTGACTCTGCAACAAAAGCAATTAAAACT:1	TTGTATCAACAGCCAGTACACG	TGCAACAAAAGCAATTAAAACT	-	chr3L	26695020	-	chr3L	26694952	68	+	chr3L	26694952	+	chr3L	26695020
GTTTTTGGTAAAGCGTTATGACAAATGATTTTTAAATCGACGAGCCACTCATTTTAGCTATATAACGGTTATCTG:1	GTTTTTGGTAAAGCGTTATGAC	TTAGCTATATAACGGTTATCTG	-	chr2R	6161400	-	chr2R	6161321	79	+	chr2R	6161321	+	chr2R	6161400
GTTGTGTTGTGTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1	GTTGTGTTGTGTTTGTGTTGTG	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	-	chr3R	15286987	-	chr3R	21907536	6620549	+	chr3R	21907536	+	chr3R	15286987
ACTTATGTATGCCCCTATATACTGGGAACGTACATATGTACATACATATATCCCATCCATCTATATGCNCAGCGC:1	ACTTATGTATGCCCCTATATAC	CATCCATCTATATGCNCAGCGC	-	chr3L	409765	-	chr3L	402712	7053	+	chr3L	402712	+	chr3L	409765
GTTGACAGCAGGAAACTGGTAGATAATGCCGATTCCCTTTGCTGGCGCAAGTTCTTTGTGTTTG:1	GTTGACAGCAGGAAACTGGTAG	TGGCGCAAGTTCTTTGTGTTTG	-	chr3R	28686655	-	chr3R	18893959	9792696	+	chr3R	18893959	+	chr3R	28686655
CGCTCTTGGATTTTGAGCTCTTAGCACATGATGTGCCAAGTATCTAGGCGTGTCAGCACAAATAAAAAACATAT:1	CGCTCTTGGATTTTGAGCTCTT	TCAGCACAAATAAAAAACATAT	-	chr3R	26907495	-	chr3R	26907401	94	+	chr3R	26907401	+	chr3R	26907495
TAATCTTTATAGACCCTCAATCCTGACATTCTGATTTACACAATCACCACCCATTGCTGCACCGATTCGGAAGG:1	TAATCTTTATAGACCCTCAATC	ATTGCTGCACCGATTCGGAAGG	-	chr2L	19587921	-	chr2L	19587825	96	+	chr2L	19587825	+	chr2L	19587921
ATGTAGGCTTCATGGTGGGGCGCGATGCCGAGGCGCTGTGATCGTAATGGG:1	ATGTAGGCTTCATGGTGGGGCG	GAGGCGCTGTGATCGTAATGGG	+	chr2R	6748173	+	chr2R	11397874	4649701	+	chr2R	6748173	+	chr2R	11397874
ATGAGGCTCGACACATTTTGTGGTTTATGAGGCAGCNTGGGGTGGCAATGTTTATGCTTTT:1	ATGAGGCTCGACACATTTTGTG	GGGTGGCAATGTTTATGCTTTT	-	chr2L	16633525	-	chr2L	5820797	10812728	+	chr2L	5820797	+	chr2L	16633525
ATTTAATTGAGCTATACAATAAATTTCTTACAGCAGAACGCATTTAATTTAAATTTCCATAAGTTCTAGTT:1	ATTTAATTGAGCTATACAATAA	TAAATTTCCATAAGTTCTAGTT	+	chr3L	19365920	+	chr3L	19366013	93	+	chr3L	19365920	+	chr3L	19366013
TAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACACAACACCTGGTACCGGGGCTTCGG:1	TAATAGAACTGCTTACAAAACT	ACACCTGGTACCGGGGCTTCGG	+	chr2L	18925253	+	chr2L	18925345	92	+	chr2L	18925253	+	chr2L	18925345
TGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTTTCTTTGTCTTTGTCTTTTTCTTTGTTTTTGTCTTTTTTTTTTGTTTTTT:1	TGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTC	TTGTCTTTTTTTTTTGTTTTTT	-	chrX	16983077	-	chrX	16924198	58879	+	chrX	16924198	+	chrX	16983077
ATTATTACAGCGTTTGTTCTGCACATTAAGTTTTGATCTCCGAAAAAGACAGACATG:1	ATTATTACAGCGTTTGTTCTGC	ATCTCCGAAAAAGACAGACATG	-	chr2L	22497637	-	chr2L	22490519	7118	+	chr2L	22490519	+	chr2L	22497637
AATAAATCATTACCCAAAAATCATTATACACATACTAAATTAGTTTTCCGTGTAATCTTCTTTCGAGGATTCG:1	AATAAATCATTACCCAAAAATC	GTAATCTTCTTTCGAGGATTCG	-	chr2L	7765921	-	chr2L	7765845	76	+	chr2L	7765845	+	chr2L	7765921
CGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAGAGATGCAGAAACGCCTGCGCGACGAG:1	CGGCTTGTGGAACACATGGATG	GCAGAAACGCCTGCGCGACGAG	+	chr2R	12190120	+	chr2R	12187504	2616	+	chr2R	12190120	+	chr2R	12187504
AATGGTTGGCAATTGGCAAATTCTGTGCAATTTTCTATCGCCTCCCGCAAAACCCCGCGTTTTAATTAAATCCTC:1	AATGGTTGGCAATTGGCAAATT	CCCGCGTTTTAATTAAATCCTC	+	chrX	20085862	+	chrX	9028459	11057403	+	chrX	20085862	+	chrX	9028459
CACACCAGCGCACATCCACGAAAAAATAACGTAGAATCGACCAACACAGGACCGAGACGAGACGAGACAAGACAA:1	CACACCAGCGCACATCCACGAA	GAGACGAGACGAGACAAGACAA	+	chr3R	9577439	+	chr3R	19291850	9714411	+	chr3R	9577439	+	chr3R	19291850
CGAGTGGCAAAGTCTAGCCCAAAAGCAAGCTCAAATAAATAAAAGATAGTTCTGAAAGAGGGGATGCTGTCTTTG:1	CGAGTGGCAAAGTCTAGCCCAA	GAAAGAGGGGATGCTGTCTTTG	-	chr3L	19863623	-	chr3L	19861835	1788	+	chr3L	19861835	+	chr3L	19863623
GTTTTAATTGCCGTCCGCGCTAAAATTGAAAGAAAAAATATCAATATATTTTATGGAGAAATTCTCCAAAAGAAA:1	GTTTTAATTGCCGTCCGCGCTA	TGGAGAAATTCTCCAAAAGAAA	+	chr3R	10545725	+	chr3R	19445455	8899730	+	chr3R	10545725	+	chr3R	19445455
GTGCCAGTACCACAACCACAACTACAGATGCCACCACGACCACAACGACCACCGCCTCGTCTTCGGANACCACTA:1	GTGCCAGTACCACAACCACAAC	GCCTCGTCTTCGGANACCACTA	+	chr3L	11564806	+	chr3L	11572431	7625	+	chr3L	11564806	+	chr3L	11572431
AATAAAAGTGAGAATCGAAAACCGAATGGATGCTGATATATAGAAAAACATTTCGATTAGTATGACAATTTTCTG:1	AATAAAAGTGAGAATCGAAAAC	CGATTAGTATGACAATTTTCTG	+	chr2R	10364329	+	chr2R	5196579	5167750	+	chr2R	10364329	+	chr2R	5196579
ATCATTATTTAAATTTCTTCTTCTGTTTCTCGATCGTTTGCTGGATTCGNATATATCCGATGATGTGCAGTGCAT:1	ATCATTATTTAAATTTCTTCTT	TATCCGATGATGTGCAGTGCAT	-	chr3L	19644329	-	chr3L	7729928	11914401	+	chr3L	7729928	+	chr3L	19644329
GGAAAATGGAATATGCCTTTGCATGGGTTAGCTAATCTCGCAGCTTATTCCGTTTTTAATTAAAAGTGACGACA:1	GGAAAATGGAATATGCCTTTGC	TTTTTAATTAAAAGTGACGACA	+	chr2R	23784485	+	chr2R	23784562	77	+	chr2R	23784485	+	chr2R	23784562
TATAAACAATGTGTCTGAATATAAATGTTGCCTATATTATTGGTCAGCAAAATATTCCTCCCTGGCATGCGAGAG:1	TATAAACAATGTGTCTGAATAT	ATTCCTCCCTGGCATGCGAGAG	-	chrX	23003552	-	chrX	22996318	7234	+	chrX	22996318	+	chrX	23003552
CAGTAAACAGTAAACAATTCGATTTGGTCAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCCACAG:1	CAGTAAACAGTAAACAATTCGA	AGCCCAGCAGGAAAGCCCACAG	-	chr2L	18244345	-	chr2L	18243714	631	+	chr2L	18243714	+	chr2L	18244345
AGAGGATAATCCAGCAGATTTAGCATCCAGGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTTTAATAGCA:1	AGAGGATAATCCAGCAGATTTA	AAAACTTATACGTTTAATAGCA	+	chr3R	19446462	+	chr3R	19446678	216	+	chr3R	19446462	+	chr3R	19446678
AGAGGGTANGTTCTCAAGTTTGGAAAAAAAGGGATGGTTTATAAATCAGAGGGTCCTTTTTCTCAGCTGCCACCG:1	AGAGGGTANGTTCTCAAGTTTG	TCCTTTTTCTCAGCTGCCACCG	+	chr2L	10153231	+	chr2L	10153310	79	+	chr2L	10153231	+	chr2L	10153310
GTCTTATGTTCTTGTAGTTATGCAAAGCCCTGATCAGCGGATCTCCACTTGATGGGCGATGAGTGGCGCCGG:1	GTCTTATGTTCTTGTAGTTATG	GATGGGCGATGAGTGGCGCCGG	-	chr3R	25841879	-	chr3R	25832700	9179	+	chr3R	25832700	+	chr3R	25841879
GGCACATGCACTTTAAGTGAAGTCGTCAAGTCNTCAAGTCGTGTGGCGTAGGACTGAGATTATATCNCGAAATG:1	GGCACATGCACTTTAAGTGAAG	ACTGAGATTATATCNCGAAATG	+	chr3R	28486284	+	chr3R	28484366	1918	+	chr3R	28486284	+	chr3R	28484366
TCTCACACTCAGGTTGTTTTTGGACCTTGCNNNTNTTTGCAAGCTGCACGCAGGGCCATA:1	TCTCACACTCAGGTTGTTTTTG	GCAAGCTGCACGCAGGGCCATA	+	chr3R	28415748	+	chr3R	28415818	70	+	chr3R	28415748	+	chr3R	28415818
GAAATATCCATAGAAAAAACTTGGATGAACGGGCAAATAAAACAGACNGTCTATGAAACGCNTTTAACTTGCATT:1	GAAATATCCATAGAAAAAACTT	TGAAACGCNTTTAACTTGCATT	-	chr2R	25061438	-	chr2R	25061355	83	+	chr2R	25061355	+	chr2R	25061438
TTCAACTAGCTCAATTTATTAAGCAAACTTCATTTTGTTTTGTAGTACACCTTA:1	TTCAACTAGCTCAATTTATTAA	TTTTGTTTTGTAGTACACCTTA	+	chrX	20668292	+	chrX	13848591	6819701	+	chrX	20668292	+	chrX	13848591
GCAAATGAAAATGATTTNAGCAAATCAACACGTTTTTGTTNTGCNCCCACACGCACTCACACACAAATTTGAAG:1	GCAAATGAAAATGATTTNAGCA	GCACTCACACACAAATTTGAAG	-	chrX	707187	-	chrX	706824	363	+	chrX	706824	+	chrX	707187
ATAAAAATTAAAAAGTTGTAGCCCAAAAACGTCAGATAAGGCGGCCAGAAGTCATAGAGTGAGGAGGGCCATGGG:1	ATAAAAATTAAAAAGTTGTAGC	ATAGAGTGAGGAGGGCCATGGG	+	chr2R	17210556	+	chr2R	14950338	2260218	+	chr2R	17210556	+	chr2R	14950338
ATACACACTCACTGGCACTTGTGTGCCAGCTAACGGCGTTGACGCCAAGGAATGAACCTGG:1	ATACACACTCACTGGCACTTGT	TGACGCCAAGGAATGAACCTGG	-	chr3L	21701276	-	chr3L	21701170	106	+	chr3L	21701170	+	chr3L	21701276
ACATACTACATACATACATACATACATAANCATGTACACCTTGTGTGCACGCCAACCAGANCGGTGAGCAGCCA:1	ACATACTACATACATACATACA	CAACCAGANCGGTGAGCAGCCA	-	chrX	13789381	-	chrX	4000080	9789301	+	chrX	4000080	+	chrX	13789381
AAAAAAAAAAACAACACACACAGCGGCGTTGGAAACTACTTGAAA:1	AAAAAAAAAAACAACACACACA	CGGCGTTGGAAACTACTTGAAA	-	chr3L	21009750	-	chr3L	973211	20036539	+	chr3L	973211	+	chr3L	21009750
TGATAGTAAAATGAAAGAAATTATATTATAGAATATAGTGTAGTATGATTTTGGTAGATATTTATTTTAGTGCAC:1	TGATAGTAAAATGAAAGAAATT	GTAGATATTTATTTTAGTGCAC	-	chr3L	11018655	-	chr3L	11018569	86	+	chr3L	11018569	+	chr3L	11018655
ACGCGCATGCAGAGGTAAAGGTATGTGTCAGGCATATGCATATATATATATATATCTTATAAATTAGAG:1	ACGCGCATGCAGAGGTAAAGGT	ATATATATCTTATAAATTAGAG	+	chr2R	7862240	+	chr2R	7867348	5108	+	chr2R	7862240	+	chr2R	7867348
TAGTGTGCTTGCTGATTTAATTACTGTTTCNNNANGCAGCGATTTATTCATCGCCCATTACATACATATACCCGA:1	TAGTGTGCTTGCTGATTTAATT	CCCATTACATACATATACCCGA	-	chr3R	13510629	-	chr3R	29303798	15793169	+	chr3R	29303798	+	chr3R	13510629
TACGAAATCAGCTTACCCCACATGAGCCATCTCAAGATGAAGCGAGTGTTTATCCATATGCTCAGGAAAACTC:1	TACGAAATCAGCTTACCCCACA	ATCCATATGCTCAGGAAAACTC	-	chr3R	8613724	-	chr3R	8613619	105	+	chr3R	8613619	+	chr3R	8613724
TTATTATGCATTTTAATATCTAGGNCACAAACAAATATAAATNTCNGACAGNGTANAGGCCTGAAAAGTTGAAAC:1	TTATTATGCATTTTAATATCTA	TANAGGCCTGAAAAGTTGAAAC	+	chr2L	1615403	+	chr2L	1615485	82	+	chr2L	1615403	+	chr2L	1615485
AGAAGGAACGTTGTTCAGTATTTTTTCGTGCCTTTCCTTTTTTGATTTCCTTTTTGTGGGCTTCTTGATGCCCTC:1	AGAAGGAACGTTGTTCAGTATT	TTGTGGGCTTCTTGATGCCCTC	-	chr3L	10645682	-	chr3L	18902550	8256868	+	chr3L	18902550	+	chr3L	10645682
GGCATAATTGTGTATTTCGGCTTATTCATAATAAAAAAAGGTCTTNTGCTCG:1	GGCATAATTGTGTATTTCGGCT	ATAAAAAAAGGTCTTNTGCTCG	-	chr3R	4412726	-	chr3R	4408445	4281	+	chr3R	4408445	+	chr3R	4412726
TTTAAATTACAAAATTTACAAGCCGTGAAACGGGTGTAAAAAGCAGGGTTCGCGGAGAGAAATGATGTTGT:1	TTTAAATTACAAAATTTACAAG	TCGCGGAGAGAAATGATGTTGT	+	chr2L	7470251	+	chr2L	19884894	12414643	+	chr2L	7470251	+	chr2L	19884894
GACATTTATTTCAATTGCAAATTGAAATACATATTTCGACCGCATCTGTTGATATAACGTTTTTCCTGTACGCAC:1	GACATTTATTTCAATTGCAAAT	ATAACGTTTTTCCTGTACGCAC	+	chr2R	18500386	+	chr2R	18500469	83	+	chr2R	18500386	+	chr2R	18500469
GGGAAAATGCTTTTCCTCTTAATCGTTTTCCCCCTAAATTAACCTAGGAAATGAATACTTGTAACCGCTTTCTG:1	GGGAAAATGCTTTTCCTCTTAA	GAATACTTGTAACCGCTTTCTG	+	chr3R	11379243	+	chr3R	11388397	9154	+	chr3R	11379243	+	chr3R	11388397
ATTTATGCACACCCTTAAGTGGTTTAGAACCTCCTTCATATAGGATTATTGATTACTTCTCTTT:1	ATTTATGCACACCCTTAAGTGG	GGATTATTGATTACTTCTCTTT	+	chr2R	14934476	+	chr2R	14934553	77	+	chr2R	14934476	+	chr2R	14934553
TAAGCAGGCTGGCTAACTATACACATTTACGATATACGTTCGTACCATATATATACTGTGAAATTATCAGCCAG:1	TAAGCAGGCTGGCTAACTATAC	ATACTGTGAAATTATCAGCCAG	+	chr3R	24076926	+	chr3R	24078392	1466	+	chr3R	24076926	+	chr3R	24078392
TATTATAACAAAAAATATAGTCAATATCAAATTATAGACACTTTCAGAATATTTTTGCTA:1	TATTATAACAAAAAATATAGTC	CACTTTCAGAATATTTTTGCTA	+	chr2L	1261142	+	chr2L	1261209	67	+	chr2L	1261142	+	chr2L	1261209
ACCGTCCTGTGCAAAAGTACTGCCTGACACACACAAGAAGTGCAAAAGACAAACGAGGGTCACCCCTTTAAGTGA:1	ACCGTCCTGTGCAAAAGTACTG	CGAGGGTCACCCCTTTAAGTGA	-	chr2L	4127216	-	chr2L	4994783	867567	+	chr2L	4994783	+	chr2L	4127216
AGTCAGGCAGCCAGGCAGCCAGCCACCCAGTTGGCCTGGCAGGACAGGAGGA:1	AGTCAGGCAGCCAGGCAGCCAG	TTGGCCTGGCAGGACAGGAGGA	-	chr2R	21276707	-	chr2R	12493117	8783590	+	chr2R	12493117	+	chr2R	21276707
CAGAGACAGAAGCCCGTTGTCTCTGGTGGAAAAGTGGAGGTGGGAAATAGCAAAGGGGTGGGAAAATGTGGTGG:1	CAGAGACAGAAGCCCGTTGTCT	AAGGGGTGGGAAAATGTGGTGG	-	chr2R	12503866	-	chr2R	12501705	2161	+	chr2R	12501705	+	chr2R	12503866
AGCGACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATGGTGAT:1	AGCGACGCCTAAAAAGCGGCAA	CTGTCACAAATTTGATGGTGAT	-	chr2R	17277648	-	chr2R	17277241	407	+	chr2R	17277241	+	chr2R	17277648
TAAGTAATTTATTTAGATTTAGAAGGGACTCTTTTATATATACATTTAAAACAAAGGTTTTCCCTAANTTTCGAC:1	TAAGTAATTTATTTAGATTTAG	AAGGTTTTCCCTAANTTTCGAC	+	chr2L	922475	+	chr2L	922556	81	+	chr2L	922475	+	chr2L	922556
GTGGGTGTTATATACTTATATACATTTTAATTGCTATAAATGGACTGAAGTTATT:1	GTGGGTGTTATATACTTATATA	CTATAAATGGACTGAAGTTATT	+	chr2L	12739189	+	chr2L	12743950	4761	+	chr2L	12739189	+	chr2L	12743950
CATTTCGTAACAATTAATATACCACCATGTCATTAGCCAAATTGCTCAAACAATCGGCTAAAAACTAATTACTT:1	CATTTCGTAACAATTAATATAC	ATCGGCTAAAAACTAATTACTT	-	chr3R	21843904	-	chr3R	21843802	102	+	chr3R	21843802	+	chr3R	21843904
ATGTTCACCAGCACCTTGGATAAAGTTCTCCANATCCTGAGGTAAAGCTTTAGGTTGTTCATCAATNTGCAT:1	ATGTTCACCAGCACCTTGGATA	TAGGTTGTTCATCAATNTGCAT	+	chr3R	11167019	+	chr3R	11165190	1829	+	chr3R	11167019	+	chr3R	11165190
ATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAGAGACCCCGAAATGGTG:1	ATGCTTAGCCATCTCGTACAGG	TTTGAGAGACCCCGAAATGGTG	-	chr2R	12187474	-	chr2R	12190090	2616	+	chr2R	12190090	+	chr2R	12187474
AAGCATTTTGCGCGCTCCATTTTGCTCAGCTGCCAAGTGGGAAATGGGAATATGACTGA:1	AAGCATTTTGCGCGCTCCATTT	TGGGAAATGGGAATATGACTGA	-	chrX	5799031	-	chrX	5798885	146	+	chrX	5798885	+	chrX	5799031
GTGAGAAAACATTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTG:1	GTGAGAAAACATTTCGGGATAT	CTTGACGACTTCACTTAAAGTG	-	chr3R	28484375	-	chr3R	28486292	1917	+	chr3R	28486292	+	chr3R	28484375
TTGGCAAATTATGGCAGCCACAAGTTTGCANNNTNTTTGGGAAAAGCTTGAGGGCGGAGGGGGGGGGGGAGGGGC:1	TTGGCAAATTATGGCAGCCACA	GCGGAGGGGGGGGGGGAGGGGC	+	chr3R	22755285	+	chr3R	17518604	5236681	+	chr3R	22755285	+	chr3R	17518604
AATTCTAGAAAACTATAATCCTATAAAAAAAACTATAAAACTAAATTAACCCCATTATCTCAATTAATCCTCC:1	AATTCTAGAAAACTATAATCCT	CCATTATCTCAATTAATCCTCC	+	chr3R	6828039	+	chr3R	6828113	74	+	chr3R	6828039	+	chr3R	6828113
GCTGTCAGATTGGTGGTACGAAAACTCCGGGAGTTGAATTTTCATTCAAGAGAGNAGCTA:1	GCTGTCAGATTGGTGGTACGAA	TTTTCATTCAAGAGAGNAGCTA	+	chr3R	31435380	+	chr3R	31435517	137	+	chr3R	31435380	+	chr3R	31435517
ATGCTAGCAACGGCACATGCACTTTAAGTGAAGTCGTCAAGTCGTCAAGTCGTGTGGCGTGGGACTGAGATTA:1	ATGCTAGCAACGGCACATGCAC	GTGTGGCGTGGGACTGAGATTA	+	chr3R	28486273	+	chr3R	28484354	1919	+	chr3R	28486273	+	chr3R	28484354
CATGAACTCCATTTTATANTTATCAAAACAACAAAGTAGGGATGTCCCTTTGACCCAAACACCCCGAGCTCTNTT:1	CATGAACTCCATTTTATANTTA	CCCAAACACCCCGAGCTCTNTT	+	chr3L	5537045	+	chr3L	13347660	7810615	+	chr3L	5537045	+	chr3L	13347660
TTGTTCATCCTTGACACAGACGCGTGCAATAATGGTGCACGCGCGGTGCTGAGTCTACATCAACTCGGCCAAA:1	TTGTTCATCCTTGACACAGACG	AGTCTACATCAACTCGGCCAAA	-	chr3L	24176119	-	chr3L	24168793	7326	+	chr3L	24168793	+	chr3L	24176119
AATTTTTTATGCATTTTGTGAGGTGTAACTAGAATGGCACTTATTATTATTCTTTATATTTTTATTTCCCAGC:1	AATTTTTTATGCATTTTGTGAG	CTTTATATTTTTATTTCCCAGC	-	chr2L	20500490	-	chr2L	20500412	78	+	chr2L	20500412	+	chr2L	20500490
CGTGGCCAGCTGGCGAGGCGTGAGTCTCGGGGGATACCTTGGCTAGATTGGCCCTCTGGCCGCGAACTCTTCGAG:1	CGTGGCCAGCTGGCGAGGCGTG	CTCTGGCCGCGAACTCTTCGAG	+	chr3L	8481782	+	chr3L	8490941	9159	+	chr3L	8481782	+	chr3L	8490941
GCATTCATGGCGGAATTTAACCCGTGTGCCAGTAGTTCAGATTACTGGCAATTTATAATATAGAAATTTGTTCAA:1	GCATTCATGGCGGAATTTAACC	TATAATATAGAAATTTGTTCAA	-	chr3L	7508784	-	chr3L	7508700	84	+	chr3L	7508700	+	chr3L	7508784
TAGCCGTAAGCTCTAGAANTAAGTTTATGTCCGAAAAGGCCCATCAAAGTCGCTGGCAAGGTCAAGAGGAGTNTC:1	TAGCCGTAAGCTCTAGAANTAA	TGGCAAGGTCAAGAGGAGTNTC	+	chr3R	6484804	+	chr3R	24837265	18352461	+	chr3R	6484804	+	chr3R	24837265
ATTATTCATTTAGCTGCCTGCCGAACTCATTGCTGATACCACTAACTTACTTGCATACAAGACG:1	ATTATTCATTTAGCTGCCTGCC	TAACTTACTTGCATACAAGACG	-	chr3R	4681919	-	chr3R	4681850	69	+	chr3R	4681850	+	chr3R	4681919
CTCTTTGCACTGAAAACAAATTAGCAATTGTACTCAATTTGAAAGGTATGCAACTTAATTGCTTGCTTTTAGAT:1	CTCTTTGCACTGAAAACAAATT	ACTTAATTGCTTGCTTTTAGAT	+	chr2R	22756628	+	chr2R	22756711	83	+	chr2R	22756628	+	chr2R	22756711
ATACGAAATCAGCTTACCCCACATGAGCCATCTCAAGATGAAGCGAGTGTTTATCCATATGCTCAGGAAAACTCG:1	ATACGAAATCAGCTTACCCCAC	TCCATATGCTCAGGAAAACTCG	-	chr3R	8613725	-	chr3R	8613618	107	+	chr3R	8613618	+	chr3R	8613725
TGGAACCGCAGTGCGCTTCTTTGCATCAATGCAATCCCTTAATCGCACTNTAAAATCTTTTACATGCAGCTTGTT:1	TGGAACCGCAGTGCGCTTCTTT	AATCTTTTACATGCAGCTTGTT	+	chr3R	31805136	+	chr3R	31805212	76	+	chr3R	31805136	+	chr3R	31805212
AACGATGAAATAGTGCAGCTTTATGAGTAATATTTATCATCACCAATAGACAGATAATAGAATGCAACATATGTA:1	AACGATGAAATAGTGCAGCTTT	ATAATAGAATGCAACATATGTA	+	chrX	18832273	+	chrX	18832365	92	+	chrX	18832273	+	chrX	18832365
GTTGCGTTGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	GTTGCGTTGCGTTGTGTTGTGT	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	9084340	+	chr2L	16217660	7133320	+	chr2L	9084340	+	chr2L	16217660
CAGATAAGTGCCGAAAAAGGTTTACAACTTTTGCCGCCAGCCATTTATTATTGATGTCCGCATGCTG:1	CAGATAAGTGCCGAAAAAGGTT	TATTATTGATGTCCGCATGCTG	+	chr2R	9212705	+	chr2R	9213183	478	+	chr2R	9212705	+	chr2R	9213183
TGAAATTAAATGAAATGCGAGCTCGGTGCTGGCATAATCCTTTCAAAATATATTCATGGTAGAGCCGGCGAATG:1	TGAAATTAAATGAAATGCGAGC	TTCATGGTAGAGCCGGCGAATG	+	chr3R	13079921	+	chr3R	13080002	81	+	chr3R	13079921	+	chr3R	13080002
ATCTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACNAGCCGGCGCTGCTTTTGAGNGACCCCG:1	ATCTCTGGATGCTTAGCCATCT	GCGCTGCTTTTGAGNGACCCCG	-	chr2R	12187482	-	chr2R	12190098	2616	+	chr2R	12190098	+	chr2R	12187482
GACTGGAAATGTCCCTTAATGTTCACTAAAAAGGGTCAACGATTTCAACTGCCCCTTCCCGTTTCACGGTTG:1	GACTGGAAATGTCCCTTAATGT	GCCCCTTCCCGTTTCACGGTTG	-	chr3L	22611720	-	chr3L	22611849	129	+	chr3L	22611849	+	chr3L	22611720
TGAAACATGAATGATAGTCTATATAGTAAGTAAGTTAGTGCTGCCTGTAATACGTGTCTTTCCTGTCGATTT:1	TGAAACATGAATGATAGTCTAT	TACGTGTCTTTCCTGTCGATTT	-	chr2L	12487970	-	chr2L	12487892	78	+	chr2L	12487892	+	chr2L	12487970
TCTTCGAGCCAGCTTCCTTTTGCCTTTTGGCCATATGTACATATATGTGTGTAACGGTAATAAAAGTATGCGACG:1	TCTTCGAGCCAGCTTCCTTTTG	ACGGTAATAAAAGTATGCGACG	-	chr3L	9581008	-	chr3L	9575930	5078	+	chr3L	9575930	+	chr3L	9581008
GTAATTAAAGCGAAAAACTGCAATGCATAAACTTAAAGGCAGATGAAAAGCACATTTTGTTCACCCACNGCTATT:1	GTAATTAAAGCGAAAAACTGCA	ATTTTGTTCACCCACNGCTATT	+	chr2L	9297392	+	chr2L	9297469	77	+	chr2L	9297392	+	chr2L	9297469
CTATGGATTCCATAGTCCTTTTCGCTTGCATGCATGTATGTATATGTGAGCATGTGAGTGANACGTGCACACACA:1	CTATGGATTCCATAGTCCTTTT	GTGAGTGANACGTGCACACACA	+	chr3R	5338425	+	chr3R	5343602	5177	+	chr3R	5338425	+	chr3R	5343602
CCCGACCACAGGACCTGCGANTTGGCTCACATACCTTCCCTCAAGTGCTNTATTTGGCAACAAAAAATGTTTGGA:1	CCCGACCACAGGACCTGCGANT	TTGGCAACAAAAAATGTTTGGA	+	chr2L	21907811	+	chr2L	17891256	4016555	+	chr2L	21907811	+	chr2L	17891256
ACTTGACGCGTGGTGTGTGTGAGTATATATGTGTGTGTGTGCGTGTGC:1	ACTTGACGCGTGGTGTGTGTGA	ATATGTGTGTGTGTGCGTGTGC	+	chr2R	10948053	+	chr2R	10955577	7524	+	chr2R	10948053	+	chr2R	10955577
AAACTGTTTGTAATTTTCATAAAATTTTTGGTCGCGTATTGGACCAATGCTAATCTGACGGCGGGAAGAAAGG:1	AAACTGTTTGTAATTTTCATAA	AATCTGACGGCGGGAAGAAAGG	-	chr3R	27858267	-	chr3R	27856786	1481	+	chr3R	27856786	+	chr3R	27858267
CATGGACTGGATCTGAAAGCAGCCCAACTAGCAGATGACTACATCTCCGGTACCGAAAGCGATAACGATGG:1	CATGGACTGGATCTGAAAGCAG	GTACCGAAAGCGATAACGATGG	+	chr3L	1315863	+	chr3L	1310999	4864	+	chr3L	1315863	+	chr3L	1310999
TAAATTAAGACAAATTCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTCATCGTTGATCGCCACCATTGGCGCA:1	TAAATTAAGACAAATTCGTGAC	GTTGATCGCCACCATTGGCGCA	-	chrX	17629780	-	chrX	17633075	3295	+	chrX	17633075	+	chrX	17629780
CTCGCGTATTCGGTTCCTGGGATAAGTGCCTGTAAAATAAATGGGTTTGTATCGTTCGTCAGTCATCAGTTCTT:1	CTCGCGTATTCGGTTCCTGGGA	CGTTCGTCAGTCATCAGTTCTT	-	chr2L	22546075	-	chr2L	22545980	95	+	chr2L	22545980	+	chr2L	22546075
AATGATAACGAGCGACTTAAGAGAGTACAAGAGAAAGCCTGCGAAAGAGNAGAGCTTAGATAATGGAGATAT:1	AATGATAACGAGCGACTTAAGA	AGAGCTTAGATAATGGAGATAT	-	chr2R	5473462	-	chr2R	5473370	92	+	chr2R	5473370	+	chr2R	5473462
TCATTACTCACCGCACAGNAAAGCCTTCCCCGGTTGAATTGTTNATGCGNAATAATTTGGTCCACTTCAATTTCC:1	TCATTACTCACCGCACAGNAAA	AATTTGGTCCACTTCAATTTCC	-	chr3R	13380808	-	chr3R	13380720	88	+	chr3R	13380720	+	chr3R	13380808
GAACAACATAAAGGATCATCTTATTGTTTTGGCAACTAAATGTTTCCCTATTAACTATTTAAATACTATTGTATT:1	GAACAACATAAAGGATCATCTT	ACTATTTAAATACTATTGTATT	+	chr2R	6978643	+	chr2R	6978826	183	+	chr2R	6978643	+	chr2R	6978826
ATGCGAAAGTGTGAGATTCAGTACGTTACTTAACTTTTCTAAAGATATTATGAAAATATCGAAGTAAAAAATATA:1	ATGCGAAAGTGTGAGATTCAGT	AAATATCGAAGTAAAAAATATA	-	chr3L	19814775	-	chr3L	14384316	5430459	+	chr3L	14384316	+	chr3L	19814775
GCCATTTCAGCCAAAAATCAGCATCCGCATAATTATACGAGAAAACCGAAAGGAAATTAAATAATCCGCAAAATG:1	GCCATTTCAGCCAAAAATCAGC	AAATTAAATAATCCGCAAAATG	+	chr3R	7729464	+	chr3R	7737402	7938	+	chr3R	7729464	+	chr3R	7737402
GACCTTTGCGTGTTAATGGCTTAAATGTTGGTATTCGGAATTGTAATGAGGGTTG:1	GACCTTTGCGTGTTAATGGCTT	TTCGGAATTGTAATGAGGGTTG	-	chr3R	27871162	-	chr3R	27871081	81	+	chr3R	27871081	+	chr3R	27871162
TCTTGTACAACATTAATAAAAAAAAGCACTTCGATTCAGCTCGCCCCACAACAATTTTGACGATGATTACCTGCT:1	TCTTGTACAACATTAATAAAAA	ATTTTGACGATGATTACCTGCT	-	chrX	17632233	-	chrX	17630120	2113	+	chrX	17630120	+	chrX	17632233
ATGCGAAACTCTCATTAATCACGAAATCAATGCAATTTACCTTGCAT:1	ATGCGAAACTCTCATTAATCAC	ATCAATGCAATTTACCTTGCAT	-	chr3R	6739284	-	chr3R	6737525	1759	+	chr3R	6737525	+	chr3R	6739284
CACGCTCCATTCAGCAAATTGGTCTGGTATTTCTAGTTGGTTGGCTTTCTTAGGGTATTTTAT:1	CACGCTCCATTCAGCAAATTGG	TGGCTTTCTTAGGGTATTTTAT	-	chr3R	6447513	-	chr3R	16287557	9840044	+	chr3R	16287557	+	chr3R	6447513
TATGGTATATGGCCAGAAGGAGGGCGTGCGATACATGGTCCAGGTAGACACATGACGAA:1	TATGGTATATGGCCAGAAGGAG	GTCCAGGTAGACACATGACGAA	-	chr2R	15127803	-	chr2R	15119338	8465	+	chr2R	15119338	+	chr2R	15127803
TTGCTTTTCATTGTTTTAGTGTTTTTGCGATTTTGAGCTGTGCGCGTGCCGCATTCAACGTGATGCTGAATTGA:1	TTGCTTTTCATTGTTTTAGTGT	ATTCAACGTGATGCTGAATTGA	+	chrX	6335220	+	chrX	6337729	2509	+	chrX	6335220	+	chrX	6337729
CTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCCTNNNTNTGTGCTTGTATGTATTTGTTTGCTGGTGGCTTTGATTTGG:1	CTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	TTTGCTGGTGGCTTTGATTTGG	-	chrX	7978952	-	chrX	20920338	12941386	+	chrX	20920338	+	chrX	7978952
TGAAGTGTTAAAGACATGTAAAGAAAATCGTTTGTGCCAATGTTNAAGCGGGGACTTCCTCTGCGTGCCAC:1	TGAAGTGTTAAAGACATGTAAA	GGGGACTTCCTCTGCGTGCCAC	+	chr2L	20393802	+	chr2L	20393964	162	+	chr2L	20393802	+	chr2L	20393964
AAAGTTTTGGACCTACACTGCGAAAGGTCTTAACAATTTCCATTGTCATTTATCATTTTTTTTTTACATTTACTT:1	AAAGTTTTGGACCTACACTGCG	CATTTTTTTTTTACATTTACTT	+	chrX	17195207	+	chrX	17200293	5086	+	chrX	17195207	+	chrX	17200293
CTACCATGTCGATTCTGGTCACACTCTTTAACTTTGCTTAACTTTGCCAACTCGCCCTGTAGCTGAGAGGACTCT:1	CTACCATGTCGATTCTGGTCAC	GCCCTGTAGCTGAGAGGACTCT	+	chr3R	25555548	+	chr3R	25555627	79	+	chr3R	25555548	+	chr3R	25555627
AAATCACACAACTTTGCAGACAAGGGAACCCCCAAGAGTCGGGCTTTGGGCTCGGTGCACTGGGAAAAACGTTTT:1	AAATCACACAACTTTGCAGACA	GGTGCACTGGGAAAAACGTTTT	+	chr2R	19957456	+	chr2R	19962658	5202	+	chr2R	19957456	+	chr2R	19962658
AAAAAATGGAAAAAAGGATTAACAAATACAATGGCCAAACAACTTGAGGCTTAAAACTGTACACTACAAAAC:1	AAAAAATGGAAAAAAGGATTAA	TTAAAACTGTACACTACAAAAC	+	chr3L	15313516	+	chr3L	15742193	428677	+	chr3L	15313516	+	chr3L	15742193
AGCTTTTATTCAAAGCAATTCACGTATATTTAGGTTGTTTATTAGGTTTTAAATTGTGTTTATTTAGGTTTAAAT:1	AGCTTTTATTCAAAGCAATTCA	TTGTGTTTATTTAGGTTTAAAT	-	chr3R	9860118	-	chr3R	9860004	114	+	chr3R	9860004	+	chr3R	9860118
TACGTTATTCCCGTTTATGTTGGCTGAGGCTCCAGGCATGGAGATGGGGCATGAACACATGCGGAGCCAG:1	TACGTTATTCCCGTTTATGTTG	GCATGAACACATGCGGAGCCAG	-	chr3R	29287743	-	chr3R	29287665	78	+	chr3R	29287665	+	chr3R	29287743
ATGACCAACTAGCTTTTTGTGTCGTCATCCTTACTCCCACCCACCCTGTGAATGTGGG:1	ATGACCAACTAGCTTTTTGTGT	CCACCCACCCTGTGAATGTGGG	-	chrX	2146754	-	chrX	2146678	76	+	chrX	2146678	+	chrX	2146754
GGTAAATTTTGGAAGTCTTTCTCTCACCTCCAANTGTTGTTGCTGCCTATCAGTTG:1	GGTAAATTTTGGAAGTCTTTCT	TGTTGTTGCTGCCTATCAGTTG	-	chrX	9390842	-	chrX	9390782	60	+	chrX	9390782	+	chrX	9390842
TACTGGTAATAAACTGACAAAAATGTTGGTAGTTTCAGAAATTTGTTTATATTCCTTTACCTCATATCGTTTNTT:1	TACTGGTAATAAACTGACAAAA	CCTTTACCTCATATCGTTTNTT	-	chr3R	14384727	-	chr3R	14384637	90	+	chr3R	14384637	+	chr3R	14384727
CGCAAATTGAGGCGAATAAACAAAAACTGGAGACGCGCTAAAATTGAATTCTGCTCCGTTG:1	CGCAAATTGAGGCGAATAAACA	AAAATTGAATTCTGCTCCGTTG	+	chr2R	23522347	+	chr2R	18265732	5256615	+	chr2R	23522347	+	chr2R	18265732
ATACGGGCCAAAACACNGAGTGTNGCCAAGTTGNGCATNATGCGGAAGCTAAAAAAAC:1	ATACGGGCCAAAACACNGAGTG	ATNATGCGGAAGCTAAAAAAAC	+	chr3R	13195978	+	chr3R	13196056	78	+	chr3R	13195978	+	chr3R	13196056
TAATGAGTTTGATCACTGNATGGGCTAGACTTTTCTATACANGCGNACTCGAATACACTCGCATAAAAATATGTA:1	TAATGAGTTTGATCACTGNATG	TACACTCGCATAAAAATATGTA	-	chr3R	5452454	-	chr3R	5445994	6460	+	chr3R	5445994	+	chr3R	5452454
AAGCCGTATCGTCAATTGAAACGATAAGTCCACCATTTTCAACTGAGCATTTTCCATCTGAGCACTGTGAATCGG:1	AAGCCGTATCGTCAATTGAAAC	CCATCTGAGCACTGTGAATCGG	+	chr2R	7642338	+	chr2R	7642505	167	+	chr2R	7642338	+	chr2R	7642505
TAATCCTATGCAATCCTATGTAAAGTGTAAACTAATTCCAACTAGCCTAACTAGATTTTATGCGCTTNGATGTAC:1	TAATCCTATGCAATCCTATGTA	GATTTTATGCGCTTNGATGTAC	-	chr3L	22447301	-	chr3L	22447210	91	+	chr3L	22447210	+	chr3L	22447301
GTTTCTGCATCTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAG:1	GTTTCTGCATCTCTGGATGCTT	ACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAG	-	chr2R	12187490	-	chr2R	12190106	2616	+	chr2R	12190106	+	chr2R	12187490
GATATACCAATCCATTCCTAATCTTCGAAACTGCCATCACAAGCTAAACAAGGGCACACGCAGAGTGGTAAAG:1	GATATACCAATCCATTCCTAAT	GGGCACACGCAGAGTGGTAAAG	-	chr2R	23630195	-	chr2R	7987060	15643135	+	chr2R	7987060	+	chr2R	23630195
GGACACGAAACACTGGAAGAATTGAATTGAATTCAAAATGAATTGAAATAAAGTTATATCGCGTATACGCAACGG:1	GGACACGAAACACTGGAAGAAT	TTATATCGCGTATACGCAACGG	-	chr3R	8576337	-	chr3R	8576166	171	+	chr3R	8576166	+	chr3R	8576337
CATCGAGAGCACACTTAGACCTTAGACCATTTCTCNTTGAGGTCTGCGACATTTCGGAA:1	CATCGAGAGCACACTTAGACCT	TGAGGTCTGCGACATTTCGGAA	+	chr2L	19469200	+	chr2L	19469269	69	+	chr2L	19469200	+	chr2L	19469269
GTCCCTGTTTAGGTAAACNATGTCTGGAAGGTCCAGGAAGGTGTGACCCTTCCACCGCTCCAGGTG:1	GTCCCTGTTTAGGTAAACNATG	GACCCTTCCACCGCTCCAGGTG	+	chr2L	6655544	+	chr2L	6655897	353	+	chr2L	6655544	+	chr2L	6655897
GAACACGGGACCAGGCGACGCTATCGAAGGCACGCCATGAAGAATTCCAATAGATGTTAAGTAACACGAAACGCA:1	GAACACGGGACCAGGCGACGCT	ATGTTAAGTAACACGAAACGCA	-	chr3L	875774	-	chr3L	875687	87	+	chr3L	875687	+	chr3L	875774
TAAATTGGTTAAAAGTTAATCCGCAAATTTATGACATGCCAACAGCCATTTTGGCTGACACGCGTGTGCGTTAGG:1	TAAATTGGTTAAAAGTTAATCC	GCTGACACGCGTGTGCGTTAGG	+	chr3R	15517598	+	chr3R	15517681	83	+	chr3R	15517598	+	chr3R	15517681
TTAGTCGTGTCTGCGGTCGGCTCTCTTGATCTCTTGGCCAATTCGCCAAGCAGCAGCGTGTTGCAAATGCAAAGC:1	TTAGTCGTGTCTGCGGTCGGCT	CAGCGTGTTGCAAATGCAAAGC	+	chr2L	6472657	+	chr2L	6472762	105	+	chr2L	6472657	+	chr2L	6472762
GCAATTTTATTATCATTTGCTGGGGGGGCTGGCCGGAAAGGAGCTATGAGGCGCTACCAGCGAAAGGGAGACGGT:1	GCAATTTTATTATCATTTGCTG	CTACCAGCGAAAGGGAGACGGT	-	chr3R	30288564	-	chr3R	16527026	13761538	+	chr3R	16527026	+	chr3R	30288564
AGATTTATGGCCTTGGTCCCCGAAATAAATGACCGCCTGCTAAGCATGTGCCACTTGCCACTCGGCGCTCA:1	AGATTTATGGCCTTGGTCCCCG	GCCACTTGCCACTCGGCGCTCA	-	chr2R	8402993	-	chr2R	8398216	4777	+	chr2R	8398216	+	chr2R	8402993
ATCGAAACAGGTGTTTAAATTGCATTCAAAGATGTACCATCTTGCACCATCATAATTTACGTAATATTTAACTTG:1	ATCGAAACAGGTGTTTAAATTG	AATTTACGTAATATTTAACTTG	+	chr3R	17553354	+	chr3R	17553430	76	+	chr3R	17553354	+	chr3R	17553430
TTTGCCAGNATGCCAGCGGGCTTCTGTTTATGACANATCTAGAGGCGACAGGTGGAGGAGATCTGTCAAATGCAG:1	TTTGCCAGNATGCCAGCGGGCT	GGAGGAGATCTGTCAAATGCAG	-	chr2R	24655164	-	chr2R	24647607	7557	+	chr2R	24647607	+	chr2R	24655164
TGGGATTACGTATGTGCTTTGCATTTGACTGCCCATTGATGAGAGATGTGCCATTGTGTTGCCAGGCCAAGTCT:1	TGGGATTACGTATGTGCTTTGC	ATTGTGTTGCCAGGCCAAGTCT	-	chr3R	23629537	-	chr3R	23629462	75	+	chr3R	23629462	+	chr3R	23629537
CACCAATCAATCAGCAATCAACAAAGAACTCTTCTAAAGGGCAGAAACCACAATATCACGGCAAGAAAGTAAACA:1	CACCAATCAATCAGCAATCAAC	TATCACGGCAAGAAAGTAAACA	+	chr3L	16969441	+	chr3L	16969667	226	+	chr3L	16969441	+	chr3L	16969667
TTCAAAAATGTTTAAAATGACACGACTATTGTAAAAAACGTGAATCACTAAATGTAAATTCATATATAATTCACT:1	TTCAAAAATGTTTAAAATGACA	GTAAATTCATATATAATTCACT	-	chr3L	20122922	-	chr3L	20113665	9257	+	chr3L	20113665	+	chr3L	20122922
ATCCACAAGCTAGCAATTCTGCGAATAAGCGTTATCGTATNTAACNTAAAATCTTTTAAATAA:1	ATCCACAAGCTAGCAATTCTGC	TAACNTAAAATCTTTTAAATAA	+	chr3R	29760374	+	chr3R	29761563	1189	+	chr3R	29760374	+	chr3R	29761563
GCTATGGAAAAGCTCGGGTGTTAGAGTGGGAGATATGCTGATTTCACA:1	GCTATGGAAAAGCTCGGGTGTT	TGGGAGATATGCTGATTTCACA	+	chrX	5485944	+	chrX	8709331	3223387	+	chrX	5485944	+	chrX	8709331
AAAAAAAAAATGCGCTTTGAACCTGACAAATGGAAGAAGAAAGCCAGAAAGGGCGACCAATCAATTTTATGACAA:1	AAAAAAAAAATGCGCTTTGAAC	CGACCAATCAATTTTATGACAA	+	chr3R	30317325	+	chr3R	30324917	7592	+	chr3R	30317325	+	chr3R	30324917
TTTGTTTTGATTTTTTGTGAAATAGACGATACAGTGCCGCCCTTTTTTTTGCAAAAATAGTACGGAAAGTGAAA:1	TTTGTTTTGATTTTTTGTGAAA	AAAAATAGTACGGAAAGTGAAA	-	chr2L	2800563	-	chr2L	2800486	77	+	chr2L	2800486	+	chr2L	2800563
ATAGACAGTTAGCATAGACATTTAAAAATGAATTTCTTTCAAACTCAAACTGAGATTCATTGGCAACAGCGCTT:1	ATAGACAGTTAGCATAGACATT	AGATTCATTGGCAACAGCGCTT	-	chr3R	29775183	-	chr3R	27643063	2132120	+	chr3R	27643063	+	chr3R	29775183
CATTTGAGTCATTCCTGCTGAATTCCATGTGGTGTGCTTTTGTTTTGTGTATGCATATTTGCCCAATTGGTGGCA:1	CATTTGAGTCATTCCTGCTGAA	CATATTTGCCCAATTGGTGGCA	+	chr2L	15068915	+	chr2L	15068994	79	+	chr2L	15068915	+	chr2L	15068994
ATTTCCCCTGCAGTCCCTCCTTAAAATCCAAAGCCCAAACAATGGGCAGACATTACGCGAACCGAAACACCAACA:1	ATTTCCCCTGCAGTCCCTCCTT	TACGCGAACCGAAACACCAACA	-	chr3R	22433196	-	chr3R	22433096	100	+	chr3R	22433096	+	chr3R	22433196
TAGATATAAACCAAATGTACGCTAACTTACTATTTTAGCAGCTGATTAGCCAATATGCCTCCGGTGAGCACGCCA:1	TAGATATAAACCAAATGTACGC	TATGCCTCCGGTGAGCACGCCA	+	chr3R	4753263	+	chr3R	4757566	4303	+	chr3R	4753263	+	chr3R	4757566
CATTAACATCAAACAGAAACTGGTCAAAGTTCAGGAGGAACTAAAGCTGGGTAGAGGCAGAGATTCTCTTACGCA:1	CATTAACATCAAACAGAAACTG	GAGGCAGAGATTCTCTTACGCA	+	chr2R	12805889	+	chr2R	7184790	5621099	+	chr2R	12805889	+	chr2R	7184790
GAGAATACAATTGAAATACATCATAAAATGACTGATATGGCACTTCCTTGTCTTTAAAATCTAACTAAAAACTT:1	GAGAATACAATTGAAATACATC	TTTAAAATCTAACTAAAAACTT	-	chr2L	7218483	-	chr2L	7218406	77	+	chr2L	7218406	+	chr2L	7218483
TAACATTAATTTTGCTTTTAAGTTAACCAAGAGGATAACACGATATTTAAATGCTTTACCAAGAAAACAAATAAC:1	TAACATTAATTTTGCTTTTAAG	CTTTACCAAGAAAACAAATAAC	+	chr2R	12565590	+	chr2R	12565960	370	+	chr2R	12565590	+	chr2R	12565960
TATCAAAAGTTGAGAATTTGAACAATAACTATCTCTCTGTTTAAGCTTAAGTTGAATGTGGAGACTGCTGCTTCG:1	TATCAAAAGTTGAGAATTTGAA	GAATGTGGAGACTGCTGCTTCG	-	chr2L	21284554	-	chr2L	21284081	473	+	chr2L	21284081	+	chr2L	21284554
TTCCACCACCCAATTCTCTGTGTTTTTTCCGTGTGCGCCATTTTGTCAGAGCATAAATTACNACTTCAGGTGTAG:1	TTCCACCACCCAATTCTCTGTG	TAAATTACNACTTCAGGTGTAG	+	chr3L	3475085	+	chr3L	3475529	444	+	chr3L	3475085	+	chr3L	3475529
CCAACTCCATCTTCATGGAATATGCAGNAGNNTGCCCCAAAATTGTGCTNGNTAAATATGCGCGTGCCACGCCCT:1	CCAACTCCATCTTCATGGAATA	AAATATGCGCGTGCCACGCCCT	-	chrX	7784536	-	chrX	7784234	302	+	chrX	7784234	+	chrX	7784536
GGACCACCAATATTATGTTCGAGTACGATGCAAAGGGACATCCCATTAATGCTGCCTTCATCGATTTCCAGTTTA:1	GGACCACCAATATTATGTTCGA	GCCTTCATCGATTTCCAGTTTA	+	chr3R	25272656	+	chr3R	25268067	4589	+	chr3R	25272656	+	chr3R	25268067
TATCACTGCAATTTCGAATATTCATTTCCCCGCTCCTCATCATCCTGGCGAACGAAATCAGTGCTGGGCTCATTT:1	TATCACTGCAATTTCGAATATT	GAAATCAGTGCTGGGCTCATTT	-	chr3L	1415864	-	chr3L	1415782	82	+	chr3L	1415782	+	chr3L	1415864
GCCTCTTCAGAGGTTCTTTCAGCACTTGAACTGACATAAAATCAACTTGGACTGCCTGGTTTCATTCACCAGA:1	GCCTCTTCAGAGGTTCTTTCAG	CTGCCTGGTTTCATTCACCAGA	+	chr3R	6794238	+	chr3R	6794636	398	+	chr3R	6794238	+	chr3R	6794636
ACAACCAGTCAGCGAGCGAACGGGCACCGCCCACCGAAAGGGCAGCCGCAAAACCCCACC:1	ACAACCAGTCAGCGAGCGAACG	AGGGCAGCCGCAAAACCCCACC	-	chr3L	17107440	-	chr3L	17107366	74	+	chr3L	17107366	+	chr3L	17107440
ACTTGTTAAATAGTAGTGGTATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGCCACACATCCATTCTGGGGT:1	ACTTGTTAAATAGTAGTGGTAT	AGCCACACATCCATTCTGGGGT	-	chr3L	11865872	-	chr3L	11864577	1295	+	chr3L	11864577	+	chr3L	11865872
AAATTGGTGAAATGGAAAAGCTGTCCTTTGGATATGTTAATTCTTNTTGCCCATTTCTCTT:1	AAATTGGTGAAATGGAAAAGCT	ATTCTTNTTGCCCATTTCTCTT	+	chrX	14986022	+	chrX	12277797	2708225	+	chrX	14986022	+	chrX	12277797
TTGGTCATCCGATGTTTGTACCTTTCTCCTAGCTTTTCGTGATATAGGGATGTTAGCTATGTTTCCTATGT:1	TTGGTCATCCGATGTTTGTACC	ATGTTAGCTATGTTTCCTATGT	-	chrX	18122909	-	chrX	18122837	72	+	chrX	18122837	+	chrX	18122909
CTTATCTTTTTATATATTACTAATTTCTTGTGGGGGCAGATAGGTGTAGGCTTTGCAACTTCATATACCCATTAC:1	CTTATCTTTTTATATATTACTA	TGCAACTTCATATACCCATTAC	+	chr3R	19908299	+	chr3R	19908383	84	+	chr3R	19908299	+	chr3R	19908383
AATCAAGTGGTGGGGGGGGAAAAGTGAGGCGAAANGAGTGCCAAGAACACATTTCAAATTCACATGATTTTTCTC:1	AATCAAGTGGTGGGGGGGGAAA	TCAAATTCACATGATTTTTCTC	-	chr2R	19331312	-	chr2R	19331232	80	+	chr2R	19331232	+	chr2R	19331312
AATAGAATTAGAGCACATGGCTGCAAAGGCAGCTCATCGTTCGGTACAGAGTGTTGGAAAAGCAAACCGAAGAAA:1	AATAGAATTAGAGCACATGGCT	TTGGAAAAGCAAACCGAAGAAA	+	chr2R	16737166	+	chr2R	16737266	100	+	chr2R	16737166	+	chr2R	16737266
TCACATTTGATTTTTAAGAATTACCAAATACTTATATATATGTGTCACGTATATGTCACAATCTTTCATTTAATT:1	TCACATTTGATTTTTAAGAATT	TGTCACAATCTTTCATTTAATT	+	chr2L	22776421	+	chr2L	22778210	1789	+	chr2L	22776421	+	chr2L	22778210
GTCTAACATTCGCATTTGCTGCGAATCACTCTTCCACTTACCCACAGGAGACATTAGTTGAAGAACTGAAGCAGA:1	GTCTAACATTCGCATTTGCTGC	TTAGTTGAAGAACTGAAGCAGA	-	chr2R	7677873	-	chr2R	7677707	166	+	chr2R	7677707	+	chr2R	7677873
GGAGGGATATATACATACATATACATACATNNNCNTACATATATATAAATATATATGTAGGGGATGGATCAGG:1	GGAGGGATATATACATACATAT	TATATGTAGGGGATGGATCAGG	+	chr3R	4359492	+	chr3R	15506044	11146552	+	chr3R	4359492	+	chr3R	15506044
AGCTGGGAGGGAAAATAACTAAGATGTTTGCCAGTCGGCTAATGACATGTTCATGGTACGAATAATTTCTACCG:1	AGCTGGGAGGGAAAATAACTAA	ATGGTACGAATAATTTCTACCG	+	chr2L	13152234	+	chr2L	13152311	77	+	chr2L	13152234	+	chr2L	13152311
ACGGAAAAAGTTGGGATACTGTCAGTGTGCACTCAATGGGTAAGCTCACATTATTGAATAGATTTTGCGGAAGGC:1	ACGGAAAAAGTTGGGATACTGT	TTGAATAGATTTTGCGGAAGGC	+	chr3R	6598332	+	chr3R	6598522	190	+	chr3R	6598332	+	chr3R	6598522
ATAATAAGAAAACCTCTAAAACTTCCAACGCACTTTTTGGTTGAATTCCTTGGATCTTTTGTTCTTTGG:1	ATAATAAGAAAACCTCTAAAAC	CCTTGGATCTTTTGTTCTTTGG	-	chr2R	21753579	-	chr2R	21753100	479	+	chr2R	21753100	+	chr2R	21753579
CGATACAGTGCCGCCATTTATATGGCAAAAATAGTACGGAAAGTGAAACTTGG:1	CGATACAGTGCCGCCATTTATA	TAGTACGGAAAGTGAAACTTGG	-	chr2L	2800537	-	chr2L	2800481	56	+	chr2L	2800481	+	chr2L	2800537
GGGTCAACAAAAAACTAAAGCAAAGAAGAAAAGGAGCAGAAATAAACCAATACAAAAACCAATAAAAACCATAAG:1	GGGTCAACAAAAAACTAAAGCA	AAAAACCAATAAAAACCATAAG	+	chrX	16541084	+	chrX	8807285	7733799	+	chrX	16541084	+	chrX	8807285
TTTCCCACCCCTTTGCTATTTTCCACCTCCACTTTTCCACCAGAGACAACGGGCTTCTGTCTCTGTCTTT:1	TTTCCCACCCCTTTGCTATTTT	ACGGGCTTCTGTCTCTGTCTTT	+	chr2R	12501714	+	chr2R	12503871	2157	+	chr2R	12501714	+	chr2R	12503871
CCCAATATTAGAAAATAACCAAGTCAAAAAAATTCCCTCTGGTAATTAGCTTTAAAAGTGCTAGTCGTATCCTTT:1	CCCAATATTAGAAAATAACCAA	AAAAGTGCTAGTCGTATCCTTT	-	chrX	3502262	-	chrX	3493103	9159	+	chrX	3493103	+	chrX	3502262
TACGGCTAGGTTTTGTAAAAGAATAATTCAATTTTTAAGTTCACCTTGCGACTTGACTCCTCTGGAACTTTTCAG:1	TACGGCTAGGTTTTGTAAAAGA	TGACTCCTCTGGAACTTTTCAG	+	chr2L	20079892	+	chr2L	20080015	123	+	chr2L	20079892	+	chr2L	20080015
CGTAACCGGCTTAGGTGCAGTAGTCGCAGTCTTGTTGTGCAGAATTTTTCAGCGCCAAAGTGGAGGAAAGTG:1	CGTAACCGGCTTAGGTGCAGTA	AGCGCCAAAGTGGAGGAAAGTG	-	chr3R	23820728	-	chr3R	23820647	81	+	chr3R	23820647	+	chr3R	23820728
ACCAAGTTTTATCTATAAAAAACATATTTATTCTAGTCTACAATATCAAAGGTTTTCCTAAAGCAATCTTCACTG:1	ACCAAGTTTTATCTATAAAAAA	TTTCCTAAAGCAATCTTCACTG	-	chr3L	2581993	-	chr3L	2581899	94	+	chr3L	2581899	+	chr3L	2581993
AAGAAGTAGACATTCGTCGGAATATGTGTATTTCACACGAAAAGCAGNCATTTAAGGTGATNAATATTAATGTTT:1	AAGAAGTAGACATTCGTCGGAA	AAGGTGATNAATATTAATGTTT	-	chr3L	3763838	-	chr3L	3763757	81	+	chr3L	3763757	+	chr3L	3763838
ACCAAAATTAACCGAAACGAAAATTGTGAGCCGGAGCATAAAAGCAAGAANGAGGCA:1	ACCAAAATTAACCGAAACGAAA	GCATAAAAGCAAGAANGAGGCA	-	chr3L	17253905	-	chr3L	22923970	5670065	+	chr3L	22923970	+	chr3L	17253905
TCATTAATNATTAAACACGCAGATGAACCAGTTGAAANNNNTTCATACTAATCGTTTTGCGNGGACTGTCATGGA:1	TCATTAATNATTAAACACGCAG	GTTTTGCGNGGACTGTCATGGA	+	chrX	3597558	+	chrX	3619726	22168	+	chrX	3597558	+	chrX	3619726
CAGCCTCCAATTTTCCCTATATGACAAAAAAGAGAGTGGAAAACCGCATTCGTAGGAATACATTTCCCGCCATA:1	CAGCCTCCAATTTTCCCTATAT	TAGGAATACATTTCCCGCCATA	+	chr3R	16708947	+	chr3R	16709030	83	+	chr3R	16708947	+	chr3R	16709030
ACACAACTTTGCAGACAAGGGAACCCCCAAGAGTCGGGCTTTGGGCTCGGTGC:1	ACACAACTTTGCAGACAAGGGA	AGTCGGGCTTTGGGCTCGGTGC	+	chr2R	19957461	+	chr2R	19962641	5180	+	chr2R	19957461	+	chr2R	19962641
GTCAAGAGGTGCCACAGTTTNTTATTTTCTTCNACAATGCAGNCTCGTGGAGCGGTGTGAATCCCCATTTA:1	GTCAAGAGGTGCCACAGTTTNT	GAGCGGTGTGAATCCCCATTTA	+	chr3R	7226459	+	chr3R	25656101	18429642	+	chr3R	7226459	+	chr3R	25656101
AGCAATCCCCATAAGTATGGCTCAAGAAATGTTAAAGGGCGCTGGATACGACCTACTAAACTTCCTGGTCTGATT:1	AGCAATCCCCATAAGTATGGCT	TACTAAACTTCCTGGTCTGATT	-	chr3R	16357966	-	chr3R	16357878	88	+	chr3R	16357878	+	chr3R	16357966
AACTAGTCTGAGCTTCACATTATCAATTATTGGTCATATCGCATGGCTACTGTTAGTAGTAGTTTATCTGGCTTA:1	AACTAGTCTGAGCTTCACATTA	TAGTAGTAGTTTATCTGGCTTA	-	chr3R	29256370	-	chr3R	29256290	80	+	chr3R	29256290	+	chr3R	29256370
TTGCGTTCATTGGAATCTCGAAAAGATTGGATTGTGAACCAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAAGGCTGATATGT:1	TTGCGTTCATTGGAATCTCGAA	ATGTATAAGAAGGCTGATATGT	-	chr3L	11108787	-	chr3L	27392398	16283611	+	chr3L	27392398	+	chr3L	11108787
CAAATGGCAGCTGATATCTTCACAAGTNCANNGATGCTATTTATGTGCTNANTTACACGAAAGGTGTTGACCCCT:1	CAAATGGCAGCTGATATCTTCA	TACACGAAAGGTGTTGACCCCT	-	chr2R	5874371	-	chr2R	5869295	5076	+	chr2R	5869295	+	chr2R	5874371
ATTCACTTCCTCGTCGTGTGTATTCAAATTGCTCATCCGAAATAACAAGAGAAAATTTAAATGCAAACAAAAAAG:1	ATTCACTTCCTCGTCGTGTGTA	AATTTAAATGCAAACAAAAAAG	+	chr2L	9147959	+	chr2L	9148101	142	+	chr2L	9147959	+	chr2L	9148101
CATTTTCTTTGTTGCCCAGGCCAAATAAGTCTAATGTTTTTCGTATCTATTGTGTATAGTGTGTGTGCCCTTTAA:1	CATTTTCTTTGTTGCCCAGGCC	GTATAGTGTGTGTGCCCTTTAA	-	chr3R	4290143	-	chr3R	26154380	21864237	+	chr3R	26154380	+	chr3R	4290143
ATAACAAAGACTCACGTAGTTTGATTGTGCGCCGCTGCCAAGGCAACAAAATGGAATTGGCGATGGGTAACAGCA:1	ATAACAAAGACTCACGTAGTTT	GAATTGGCGATGGGTAACAGCA	-	chrX	15264001	-	chrX	15263638	363	+	chrX	15263638	+	chrX	15264001
GTCCAGCAAATCGAACCGCTCGTTGGACAAACAGAAACTTTTCCAGCCGCGTTT:1	GTCCAGCAAATCGAACCGCTCG	AGAAACTTTTCCAGCCGCGTTT	-	chrX	14877993	-	chrX	544719	14333274	+	chrX	544719	+	chrX	14877993
AATTATAATAAGTTCTTGTCTAAAAAGATCGATATTTTTTGTAATCCCAATTTCTCCATGTGTATTGCAGACGAG:1	AATTATAATAAGTTCTTGTCTA	CTCCATGTGTATTGCAGACGAG	+	chr3L	9270615	+	chr3L	9278370	7755	+	chr3L	9270615	+	chr3L	9278370
GCCCAGACNTTGCCACGCCCCCTTAACCCTTTGACTGCGCCCGCCTCCGCGCAATTTACAGGTTAACATGGGAA:1	GCCCAGACNTTGCCACGCCCCC	AATTTACAGGTTAACATGGGAA	-	chrX	17557447	-	chrX	17556949	498	+	chrX	17556949	+	chrX	17557447
AGCTGGCCTTATCAGCTGAAGCTGCGCAGAGCTGAAGGAAGCTAACAGC:1	AGCTGGCCTTATCAGCTGAAGC	AGAGCTGAAGGAAGCTAACAGC	-	chr3R	1954896	-	chr3R	1867171	87725	+	chr3R	1867171	+	chr3R	1954896
TTTACACCTAATTTAATGCATCCCAAATGACACTTCAACTCGCTTACACTTGAATACGCATGCCACGTCCAGAGG:1	TTTACACCTAATTTAATGCATC	ATACGCATGCCACGTCCAGAGG	-	chrX	4176972	-	chrX	4176603	369	+	chrX	4176603	+	chrX	4176972
GAACGTCCTTGCNGCACTCCATTTTGCTTTNGNTTCTGNTTCGCCTGCTGCTGCTGCTGCT:1	GAACGTCCTTGCNGCACTCCAT	TTCGCCTGCTGCTGCTGCTGCT	-	chrX	7999557	-	chrX	13887020	5887463	+	chrX	13887020	+	chrX	7999557
GGCGACACAACTATCAGGACCAGGCCCATGCCCATGCCCATGCCCACACCGAAGTTACTCATGAGTCAGATAG:1	GGCGACACAACTATCAGGACCA	AAGTTACTCATGAGTCAGATAG	+	chr3R	12102884	+	chr3R	12102977	93	+	chr3R	12102884	+	chr3R	12102977
TGAANCGAAACTGGAGATGCGGNCGGANGAAGGATAGCCNAGCTATATACTCCGATTACGGTTACCACGCA:1	TGAANCGAAACTGGAGATGCGG	CTCCGATTACGGTTACCACGCA	+	chr3R	17765733	+	chr3R	17765812	79	+	chr3R	17765733	+	chr3R	17765812
GGGGTATATAGAATAACANGTGTCTGCCAAGCACAAAACGTNACGNAACGAAAGACTTAGGACACGAACCTGGCA:1	GGGGTATATAGAATAACANGTG	GACTTAGGACACGAACCTGGCA	-	chr3L	7311186	-	chr3L	20614776	13303590	+	chr3L	20614776	+	chr3L	7311186
ATAAATTCAATTATGTGTTATAGAAAACTTTGTTTATCTCCTTGTCGTCTATACACTTAGCCAAATTNCGCGCG:1	ATAAATTCAATTATGTGTTATA	ACACTTAGCCAAATTNCGCGCG	+	chr3L	7101350	+	chr3L	7101442	92	+	chr3L	7101350	+	chr3L	7101442
CGCACGAACACACAGATACAGCACTCGCAGAAGAATTCCAATTTATTTATGCGCAAACATTGTTTCC:1	CGCACGAACACACAGATACAGC	TTTATGCGCAAACATTGTTTCC	-	chrX	1944467	-	chrX	19010723	17066256	+	chrX	19010723	+	chrX	1944467
AAATAATGAAAGAAAAACAAAAAAACAAAAAAAACGCGTTGTAGAGATTCCACGATTTTCCAATTCTCCCCTGTA:1	AAATAATGAAAGAAAAACAAAA	GATTTTCCAATTCTCCCCTGTA	+	chrX	18374408	+	chrX	18374489	81	+	chrX	18374408	+	chrX	18374489
GGACTTAGNGGCAGCCAGGTGGACTCCCCATCAGAGAAGTCGGCATTCTTTCCTTAATAAAGAATAACACAAAAA:1	GGACTTAGNGGCAGCCAGGTGG	TTAATAAAGAATAACACAAAAA	-	chr2R	8454961	-	chr2R	8455904	943	+	chr2R	8455904	+	chr2R	8454961
AAGAATGAATTCATAACAGAGTGTCCGAATACAGAAATAAAGCCAAAACCACGCCTGGGGGTCACCGCAATTGCA:1	AAGAATGAATTCATAACAGAGT	CCTGGGGGTCACCGCAATTGCA	+	chr3R	12000376	+	chr3R	24408206	12407830	+	chr3R	12000376	+	chr3R	24408206
ACCAAAATACACATGCTAATTTAAAGTAACTTGAGATTTCACTCAAAGCTTTTCTCTCTGTACATTTAATTATTG:1	ACCAAAATACACATGCTAATTT	CTCTCTGTACATTTAATTATTG	+	chr3L	17537048	+	chr3L	17537129	81	+	chr3L	17537048	+	chr3L	17537129
TGTCTGGATTCTGTGGAAGTTTGCACAGTTCAATGCTTTTGGAGCAAAAACTCCATCTGAATGCGCCCCA:1	TGTCTGGATTCTGTGGAAGTTT	AACTCCATCTGAATGCGCCCCA	-	chr3R	4981822	-	chr3R	4981750	72	+	chr3R	4981750	+	chr3R	4981822
TTCACATCTCCCCCAATGCTACACCCATTTGCGAGATAAAGACCAATCGCAATATTACTGGCTGGCATGTGGAAA:1	TTCACATCTCCCCCAATGCTAC	ATTACTGGCTGGCATGTGGAAA	+	chr2L	5897621	+	chr2L	5897704	83	+	chr2L	5897621	+	chr2L	5897704
TTATGCTTATTACTTTGATGTAAGATTTAATGTAATGTGCATTTTAAAAGTGAGGAGATAAGTTGTTCTAAGAAT:1	TTATGCTTATTACTTTGATGTA	GGAGATAAGTTGTTCTAAGAAT	+	chr3R	7320440	+	chr3R	7320528	88	+	chr3R	7320440	+	chr3R	7320528
ACATCCGCAACATCAAATGTGCAACTGTTGGCGCCCCGCTAT:1	ACATCCGCAACATCAAATGTGC	GCAACTGTTGGCGCCCCGCTAT	-	chrX	10795877	-	chrX	10795763	114	+	chrX	10795763	+	chrX	10795877
CACTAGTACCAGGTTTTTCGAGTGATATGGCTCAGTTCCCATCATGGGATTGCACGAAAAGCTGCGAAAG:1	CACTAGTACCAGGTTTTTCGAG	ATTGCACGAAAAGCTGCGAAAG	-	chr3R	5278186	-	chr3R	5278110	76	+	chr3R	5278110	+	chr3R	5278186
CCATCCTCTTCAGATACANTAGCATTTTTAATGTTTGTTTTNCGTNATACATATATATTGGGCCAGATGCTTGTG:1	CCATCCTCTTCAGATACANTAG	TATATTGGGCCAGATGCTTGTG	-	chr3R	10210147	-	chr3R	19371353	9161206	+	chr3R	19371353	+	chr3R	10210147
ACTGTATTGAAATACTGTGTGCCCACTTTCATAAACACCTTTTGATTGTAACTCGATGTTTGGCCGGTTCT:1	ACTGTATTGAAATACTGTGTGC	AACTCGATGTTTGGCCGGTTCT	-	chr3R	7104032	-	chr3R	7103937	95	+	chr3R	7103937	+	chr3R	7104032
ACAGGGGGTGCACTTGGACATTAACGCGATCAAAGTTATGGGTCAGAGATGGTTTTGCGACAGTGGTGCTTCGAT:1	ACAGGGGGTGCACTTGGACATT	TTTGCGACAGTGGTGCTTCGAT	+	chr3R	9926525	+	chr3R	9926612	87	+	chr3R	9926525	+	chr3R	9926612
TCCAATCCATTGGAGCTTTTTGCTCTGTGCGCTTTTCGCTTTTTACTCTCAGTCGCCAAGTTGGCCAGTGCGTTT:1	TCCAATCCATTGGAGCTTTTTG	CGCCAAGTTGGCCAGTGCGTTT	-	chr3L	8285601	-	chr3L	8285494	107	+	chr3L	8285494	+	chr3L	8285601
TCCGGGCAATTTCACTTGTCCAAGAAAGCAACTCGAAGATGCTGATGGTGCCGAATAC:1	TCCGGGCAATTTCACTTGTCCA	AGATGCTGATGGTGCCGAATAC	+	chr2L	19559404	+	chr2L	19559463	59	+	chr2L	19559404	+	chr2L	19559463
CAATGCCGAAATAAGTGAAAAATATATGAAATAAGGATTAAGCCTTATCCGTCTCACAAATTCATTGGCCTTTA:1	CAATGCCGAAATAAGTGAAAAA	CTCACAAATTCATTGGCCTTTA	-	chr2R	22969308	-	chr2R	22971559	2251	+	chr2R	22971559	+	chr2R	22969308
ACAGTGGTTCCGCGTCGAGATCCTTAATGGAAGGGGTTAATTCAAGTTGAATTGGTAACTAGATTACCCCAAAA:1	ACAGTGGTTCCGCGTCGAGATC	TGGTAACTAGATTACCCCAAAA	-	chr2L	21023978	-	chr2L	21020302	3676	+	chr2L	21020302	+	chr2L	21023978
ATTGCAGTTGGGACAAACTTGAAAAACATTTGCACTGAGGCATCATAAATCAAGCCGGGAGCCAACTGAAAATAA:1	ATTGCAGTTGGGACAAACTTGA	GCCGGGAGCCAACTGAAAATAA	+	chr3R	18152018	+	chr3R	13125655	5026363	+	chr3R	18152018	+	chr3R	13125655
TGGTTACTAAACCAAAGCTGCGGTGTGTTACCGTTTTTTTTGGTCATGCTTT:1	TGGTTACTAAACCAAAGCTGCG	CCGTTTTTTTTGGTCATGCTTT	+	chr2R	4321997	+	chr2R	16429757	12107760	+	chr2R	4321997	+	chr2R	16429757
AATAATTGTTAAGAAGTACATATGTAAAAAATCAATTCAATTTCTTTTGAGTGCCACTTGCTTGTANATATAATT:1	AATAATTGTTAAGAAGTACATA	CCACTTGCTTGTANATATAATT	-	chr2R	11538401	-	chr2R	11538301	100	+	chr2R	11538301	+	chr2R	11538401
TAACTGTTTCGCTCTTTTTTTTTTT:1	TAACTGTTTCGCTCTTTTTTTT	CTGTTTCGCTCTTTTTTTTTTT	+	chr2L	12603147	+	chr2L	17392439	4789292	+	chr2L	12603147	+	chr2L	17392439
TGTGTTCACATGTATCGAACGAACATGTAAAATGTGTATGCTGAGGAGTTAAATCAGCACAATTTAAGTTTCAAC:1	TGTGTTCACATGTATCGAACGA	TCAGCACAATTTAAGTTTCAAC	-	chr3L	4607371	-	chr3L	4607280	91	+	chr3L	4607280	+	chr3L	4607371
TTTTGAGCCTCCACTGTATANTAATTTTTTGGNATATGTCAANATTTAGAGCTCTCCGAT:1	TTTTGAGCCTCCACTGTATANT	TCAANATTTAGAGCTCTCCGAT	+	chr3L	21100757	+	chr3L	7297819	13802938	+	chr3L	21100757	+	chr3L	7297819
ACTTGGGTCACCACTCTTCACTCAAGCCAGGAGAAGAGGCTCCACCAGTTCGGGCTAGATCTGCTGGCGGAGA:1	ACTTGGGTCACCACTCTTCACT	GGGCTAGATCTGCTGGCGGAGA	+	chrX	1127307	+	chrX	1127612	305	+	chrX	1127307	+	chrX	1127612
CTGAGAAAAACACTATTTNAATAGTCTAAGTACATAAATAANTTGNTTTGATGTGAAAAATAAGACCATGAGAG:1	CTGAGAAAAACACTATTTNAAT	GTGAAAAATAAGACCATGAGAG	+	chrX	17349872	+	chrX	17350063	191	+	chrX	17349872	+	chrX	17350063
TCAAGTCAATTTGCAGTTGGCAAACTTCTTGTAGAGGATTTCACAGAGTTCCCAGTGTCATTTCTTTCCACATTT:1	TCAAGTCAATTTGCAGTTGGCA	AGTGTCATTTCTTTCCACATTT	-	chrX	21247996	-	chrX	21247884	112	+	chrX	21247884	+	chrX	21247996
ATGCCAAAATGCTAAGCGAAATGAAGCAAAATAATAATCATAAAAAAGATACTACGATTTTTAAAATCTCTATA:1	ATGCCAAAATGCTAAGCGAAAT	TACGATTTTTAAAATCTCTATA	-	chr3L	17128784	-	chr3L	3743659	13385125	+	chr3L	3743659	+	chr3L	17128784
TGTCTCTACTTAATCTTGAGAGGATTTTTTTTTTGAGGAACAAGAAACAAGG:1	TGTCTCTACTTAATCTTGAGAG	TTTTGAGGAACAAGAAACAAGG	+	chr3R	31265310	+	chr3R	31265432	122	+	chr3R	31265310	+	chr3R	31265432
TTCACTACACACACCCACCCACCCATAATTACTAACGTTAACTAACACCTGTTTTTAATGCATCACTCCTTTTG:1	TTCACTACACACACCCACCCAC	TTTTAATGCATCACTCCTTTTG	+	chr3R	26600939	+	chr3R	26601023	84	+	chr3R	26600939	+	chr3R	26601023
ACCATGGTTCCGTGAGAAATATCCACAATATGTGAAGGCTCTCGCCCAGAATCAGAATCGGGT:1	ACCATGGTTCCGTGAGAAATAT	TCGCCCAGAATCAGAATCGGGT	+	chr2L	8966389	+	chr2L	8964010	2379	+	chr2L	8966389	+	chr2L	8964010
CTACTTCGAGCACTTTTCCTGCNCTTTGGCTCACAAACAGCAGGAGAAATGTTAACGGCAGCGGGAAACGTGGG:1	CTACTTCGAGCACTTTTCCTGC	TAACGGCAGCGGGAAACGTGGG	-	chr2L	12341709	-	chr2L	1263681	11078028	+	chr2L	1263681	+	chr2L	12341709
TTAGTTATTTTAAGTCCAAGTTTCAAAGATTTCATACATATATTATGTTTTGGAACCTTATAGTGAATGTATTC:1	TTAGTTATTTTAAGTCCAAGTT	GAACCTTATAGTGAATGTATTC	-	chrX	18434824	-	chrX	18429514	5310	+	chrX	18429514	+	chrX	18434824
TTTCCTGGGATTACGTATGTGCTTTGCATTTGACTGCCCATTGATGAGAGATGTGCCATTGTGTTGCCAGGCCAA:1	TTTCCTGGGATTACGTATGTGC	TGCCATTGTGTTGCCAGGCCAA	-	chr3R	23629542	-	chr3R	23629466	76	+	chr3R	23629466	+	chr3R	23629542
TGACGAAGCGCACCGCCATTCTATACTCAGTATTCCAGAAGAGCCCAGCNCAGCAGTCCATTAAGACTAAAAATT:1	TGACGAAGCGCACCGCCATTCT	CAGTCCATTAAGACTAAAAATT	-	chrX	19461242	-	chrX	19461146	96	+	chrX	19461146	+	chrX	19461242
TACGCCGCTCCATCTGTGTCCCATGCACCCTATTCCGCACCAGCTGCAGCCCACAGCT:1	TACGCCGCTCCATCTGTGTCCC	GCACCAGCTGCAGCCCACAGCT	+	chrX	14189891	+	chrX	14189969	78	+	chrX	14189891	+	chrX	14189969
AACTTCCAAAACAACTACCACAGAATCAACCACAATCCCAACAACAACCNCAGAATCAACTACAGCTTCAACCAC:1	AACTTCCAAAACAACTACCACA	AATCAACTACAGCTTCAACCAC	+	chr3L	5483087	+	chr3L	5483206	119	+	chr3L	5483087	+	chr3L	5483206
TAGCACCCATTATTCCAGGCATTAAGGAATACATTTATTAAAATTGATCTAGTGTTTCCGAAAAT:1	TAGCACCCATTATTCCAGGCAT	TTGATCTAGTGTTTCCGAAAAT	-	chr2R	20247570	-	chr2R	20250446	2876	+	chr2R	20250446	+	chr2R	20247570
TTCTATAGGAAATAAATTCAGTCCATTTATAGCAATTAAAATGTATATAAGTATATAACACCCACCTGAATC:1	TTCTATAGGAAATAAATTCAGT	GTATATAACACCCACCTGAATC	-	chr2L	12743960	-	chr2L	12739182	4778	+	chr2L	12739182	+	chr2L	12743960
CTTCTCAGTTACGAGTCGTAAAATCAGCTGTGCTAACGTGGCTCTGTCAACACATGGCCA:1	CTTCTCAGTTACGAGTCGTAAA	TGGCTCTGTCAACACATGGCCA	-	chr3L	16515095	-	chr3L	16515032	63	+	chr3L	16515032	+	chr3L	16515095
TATGTGACCGTCATAGCCGTAAAATATCCAACCTTCTTCCATTTCTTTTCCACCTATATAAATAGCTGACAGG:1	TATGTGACCGTCATAGCCGTAA	ACCTATATAAATAGCTGACAGG	+	chr3R	10231805	+	chr3R	10237380	5575	+	chr3R	10231805	+	chr3R	10237380
ATAAAACAAAAATTTTTCAAGAGAGTATAACAATTCCAAAATACTATGAAATTTNCGGATTT:1	ATAAAACAAAAATTTTTCAAGA	ATACTATGAAATTTNCGGATTT	+	chr2L	14642595	+	chr2L	14651745	9150	+	chr2L	14642595	+	chr2L	14651745
TCATGTTAATAATATTAAAAGTCTTACGATAAGAATGGGTTAATTAATTAAGTGAACTCACTTCAACTCGTCAT:1	TCATGTTAATAATATTAAAAGT	TGAACTCACTTCAACTCGTCAT	-	chr3L	8796707	-	chr3L	8791288	5419	+	chr3L	8791288	+	chr3L	8796707
GAAAAGAAAAAACAAAAAAAAAAGAGGCAGGCCTGTCTGGGAATCGGACATTGTATCGAGGAGTTGGGG:1	GAAAAGAAAAAACAAAAAAAAA	ACATTGTATCGAGGAGTTGGGG	-	chrX	16561436	-	chrX	13406372	3155064	+	chrX	13406372	+	chrX	16561436
CACCACACCATGGACCTCCGCACCACGAACACCATCATCATGGACCACCACACCAC:1	CACCACACCATGGACCTCCGCA	TCATCATGGACCACCACACCAC	+	chr2L	1200283	+	chr2L	1200407	124	+	chr2L	1200283	+	chr2L	1200407
TGATTTCAGCAAATCAACACGTTTTTGTTATGCCCCCACACGCACTCACACACAAATTTGAAGGTGCTAGTGG:1	TGATTTCAGCAAATCAACACGT	ACAAATTTGAAGGTGCTAGTGG	-	chrX	707176	-	chrX	706814	362	+	chrX	706814	+	chrX	707176
CGTCCCTCTTCCCCATTTTTTTTCTT:1	CGTCCCTCTTCCCCATTTTTTT	CCTCTTCCCCATTTTTTTTCTT	+	chr3R	28168446	+	chr3R	22189219	5979227	+	chr3R	28168446	+	chr3R	22189219
TCCGGTTTTAGGGTCAATTTAGGCAAGCTTTACGTAATTTGGGAAACTTTTCATAATCCAAAACCAAACCTTTTT:1	TCCGGTTTTAGGGTCAATTTAG	TAATCCAAAACCAAACCTTTTT	-	chrX	16700630	-	chrX	16700548	82	+	chrX	16700548	+	chrX	16700630
CGATTTGGTCAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCCACAGAGGCAAGAAA:1	CGATTTGGTCAAGTAACTGGCT	GAAAGCCCACAGAGGCAAGAAA	-	chr2L	18244326	-	chr2L	18243704	622	+	chr2L	18243704	+	chr2L	18244326
CGCAGAGAACGAGAACGAATGGTAGTGGTACTGGAGAATGAAAGACAAACAAACATGAGGATCTTGCTCCAGA:1	CGCAGAGAACGAGAACGAATGG	AACATGAGGATCTTGCTCCAGA	-	chr3R	26816665	-	chr3R	15990954	10825711	+	chr3R	15990954	+	chr3R	26816665
ATACATTTGGGCCCTCAAAAAACAGCCACCAATTTTCCCTATATGACAAAAAAGAGAGTGGAAAACCGCATTCG:1	ATACATTTGGGCCCTCAAAAAA	AGAGAGTGGAAAACCGCATTCG	+	chr3R	16708925	+	chr3R	16709008	83	+	chr3R	16708925	+	chr3R	16709008
AAATGTTTTTTGGCCACGATTTTTTGAACATTTTAATTCACTAAGCAGGAGAGATGCACACAGCTCGAGTTTGGG:1	AAATGTTTTTTGGCCACGATTT	ATGCACACAGCTCGAGTTTGGG	-	chr3R	19447263	-	chr3R	19446250	1013	+	chr3R	19446250	+	chr3R	19447263
GCAATTGTATACATTATTTCGTGCCTATTCCATTATGGTTTTTGCCTGAGTGGCT:1	GCAATTGTATACATTATTTCGT	TATGGTTTTTGCCTGAGTGGCT	+	chrX	3893781	+	chrX	3893849	68	+	chrX	3893781	+	chrX	3893849
GTAAATGTAAATTCCATTTTAATAATGCGGTGACAGTGGGCGTGAGTTTNGCCGTT:1	GTAAATGTAAATTCCATTTTAA	AGTGGGCGTGAGTTTNGCCGTT	+	chr3R	19193009	+	chr3R	19197294	4285	+	chr3R	19193009	+	chr3R	19197294
CAAGAGTACACAGCCTACACGAGTGTGTGTTACTTAAATTNTGTTATGTTACTTAAATGATGGCACC:1	CAAGAGTACACAGCCTACACGA	ATGTTACTTAAATGATGGCACC	-	chr2L	13032608	-	chr2L	13032520	88	+	chr2L	13032520	+	chr2L	13032608
AATTCACCGTGTGGCACTTATTAAATTTGGCCCANATAAACAGGAATAAAACCTGAATTTATAATCCCAATAAT:1	AATTCACCGTGTGGCACTTATT	CTGAATTTATAATCCCAATAAT	+	chr2L	16507943	+	chr2L	16508030	87	+	chr2L	16507943	+	chr2L	16508030
TGTTTAAATATTNGTATATTTGAGCACTGTNTNACATTNGTCATCCCTATAAATGTTTGAAAACGCATTTGCCC:1	TGTTTAAATATTNGTATATTTG	ATGTTTGAAAACGCATTTGCCC	+	chr2R	18358407	+	chr2R	18372618	14211	+	chr2R	18358407	+	chr2R	18372618
TGCCGAGCATAGAAACTAGCCATTGTGACTGATAAGAGTGCAGGCAAAAAAAATAAAATAACAAATCAGATAGAC:1	TGCCGAGCATAGAAACTAGCCA	TAAAATAACAAATCAGATAGAC	+	chr3L	1189654	+	chr3L	1189740	86	+	chr3L	1189654	+	chr3L	1189740
GTTGAAAATAGCCCAAAATCAGTCTAGCCGCTCGCCGATTTCGCGGTAAAAAAAAATAAAAAGGAATGAAGAAAT:1	GTTGAAAATAGCCCAAAATCAG	AAATAAAAAGGAATGAAGAAAT	+	chrX	6684106	+	chrX	7782990	1098884	+	chrX	6684106	+	chrX	7782990
ATGCAAATTTGAAACTGAATCCGGACCATTTCGCGATTCTATTCAAAGAGTGCCTGTGGATTTGAATGCTCCACG:1	ATGCAAATTTGAAACTGAATCC	CTGTGGATTTGAATGCTCCACG	-	chr3R	5150939	-	chr3R	7385115	2234176	+	chr3R	7385115	+	chr3R	5150939
TGATAAGCGTGCACCACTTGACGGACAACTATGCGGAGTCCTGGAACTCGTCCTGATTAATGGCTGATGCTTGCC:1	TGATAAGCGTGCACCACTTGAC	TGATTAATGGCTGATGCTTGCC	+	chr2R	8277653	+	chr2R	8277748	95	+	chr2R	8277653	+	chr2R	8277748
GTCTTTTTCGAGATGTATAAGAAAGAATCCGATGTATTTTGTATGAAATTCATTACAATGCATACTATGTTAGTC:1	GTCTTTTTCGAGATGTATAAGA	TACAATGCATACTATGTTAGTC	+	chr3R	29244708	+	chr3R	29244787	79	+	chr3R	29244708	+	chr3R	29244787
TCAACGTGNTTATCGGAGACATTAAACAGCCCCCAAGTGATTGGACACATTTAGACCTATTTA:1	TCAACGTGNTTATCGGAGACAT	TGGACACATTTAGACCTATTTA	+	chr3R	4485578	+	chr3R	14382060	9896482	+	chr3R	4485578	+	chr3R	14382060
TTAGTTACAAGAAGTCTCTGTGAAAGTATCTATGCATATTGTACTTACCAATAAAGAACCANACATGAGCTCG:1	TTAGTTACAAGAAGTCTCTGTG	TAAAGAACCANACATGAGCTCG	-	chr2L	15026118	-	chr2L	15026039	79	+	chr2L	15026039	+	chr2L	15026118
TATTGGGAGCTTACGACGCCTTTAAGGGATGACTTACACATCCACGAACCGGAAATCATGGAGAGTGACAGCG:1	TATTGGGAGCTTACGACGCCTT	GAAATCATGGAGAGTGACAGCG	+	chr3L	19025572	+	chr3L	1941651	17083921	+	chr3L	19025572	+	chr3L	1941651
AGACTAAGACGATGGATGGAGTGGGTGCATCAATAAATAAACTTGATTANTGCTTTGTTTGTAAAGCTAGTTCG:1	AGACTAAGACGATGGATGGAGT	CTTTGTTTGTAAAGCTAGTTCG	-	chrX	12375610	-	chrX	12375513	97	+	chrX	12375513	+	chrX	12375610
ATGTAAATGAAACGGTTCCGAATGAGATATTGATATCCCCACTTGGCAGGCCTTAAGTTAAATAAGGTA:1	ATGTAAATGAAACGGTTCCGAA	AGGCCTTAAGTTAAATAAGGTA	-	chrX	22660663	-	chrX	22660585	78	+	chrX	22660585	+	chrX	22660663
TTCAAAGGGAAAATGGGTAGGAAAAGCCAGGCAAAACCAGTGGGAGTNGCACCTCTGGAAACAGTGTCAGGAGGG:1	TTCAAAGGGAAAATGGGTAGGA	TCTGGAAACAGTGTCAGGAGGG	+	chr3L	10311732	+	chr3L	27284436	16972704	+	chr3L	10311732	+	chr3L	27284436
AGCAGCCACCCACTTTTCTCCTTCGGCCAGAGAATAAAAATGAATTTCCTTGCTCTTTGGAGATTCGCGTCCCAA:1	AGCAGCCACCCACTTTTCTCCT	TCTTTGGAGATTCGCGTCCCAA	-	chr2R	24243874	-	chr2R	24243772	102	+	chr2R	24243772	+	chr2R	24243874
TCAGCACTTGAACTGACATAAAATCAACTTGGACTGCCTGGTTTCATTCACCAGATCCAGAGACCGACTGAATG:1	TCAGCACTTGAACTGACATAAA	AGATCCAGAGACCGACTGAATG	+	chr3R	6794256	+	chr3R	6794655	399	+	chr3R	6794256	+	chr3R	6794655
ACTATTACACGATATACAGTAGATATAAAGAGCCGCATATCCACACCGCCACAGTCACACACTTTGCTCGTGGCT:1	ACTATTACACGATATACAGTAG	GTCACACACTTTGCTCGTGGCT	+	chrX	8423605	+	chrX	10801472	2377867	+	chrX	8423605	+	chrX	10801472
GAAAAGTACTTTTGATTTTAATTTTGAGCTAGCAGTATCTTTAA:1	GAAAAGTACTTTTGATTTTAAT	TTTGAGCTAGCAGTATCTTTAA	+	chr2R	18675171	+	chr2R	18675218	47	+	chr2R	18675171	+	chr2R	18675218
TGGACTTACCCCGACCAGTGGGGTGAGTCAGTTGTTGAGGCAAGCCAATCATTAGTCACTGCAACGCCCAGGCGG:1	TGGACTTACCCCGACCAGTGGG	AGTCACTGCAACGCCCAGGCGG	-	chr3R	26235594	-	chr3R	26235512	82	+	chr3R	26235512	+	chr3R	26235594
CGAACTTGACATGCTGCCAAAGTTGAAGCGGAAAACCAGCAAGTGACTCAGCTACACTGCGCGAAAATATTTATG:1	CGAACTTGACATGCTGCCAAAG	ACACTGCGCGAAAATATTTATG	+	chr3R	22797766	+	chr3R	22797852	86	+	chr3R	22797766	+	chr3R	22797852
CAAATATGAAGGCTGGGTATTATTACTGGTCCATTTTTCTATCTTTTCCATCCGGATGTCCTTATTTGCTGACAC:1	CAAATATGAAGGCTGGGTATTA	GGATGTCCTTATTTGCTGACAC	+	chr2R	8524090	+	chr2R	8524172	82	+	chr2R	8524090	+	chr2R	8524172
TTAAAAATACATTTTACTAGACAAAATTTGTTGACTAAAAGAATCCAAACAGGTCTTAAGTTTTCAAAAAAAAAA:1	TTAAAAATACATTTTACTAGAC	TCTTAAGTTTTCAAAAAAAAAA	+	chr3L	3530719	+	chr3L	3530797	78	+	chr3L	3530719	+	chr3L	3530797
TTATTACTCCAGCACACTTAACTGTCTTAACTGCCTTNGCAGCAGNGGTGGAAGCTTCCAGCAGG:1	TTATTACTCCAGCACACTTAAC	AGNGGTGGAAGCTTCCAGCAGG	-	chr3L	17579157	-	chr3L	17578901	256	+	chr3L	17578901	+	chr3L	17579157
TTTTCTCCTACTATTCTATTCTTCATAATTACGCTGCTATGCTGTTGGCATAGATCAACGCAAACACATCAAGCA:1	TTTTCTCCTACTATTCTATTCT	ATCAACGCAAACACATCAAGCA	+	chr2R	25101290	+	chr2R	25101392	102	+	chr2R	25101290	+	chr2R	25101392
TTAGCCTGTGGGGATATTAGTAGTTAGTGGTCAACAGGACCACAATGGTCTATGTGTACTACTATTATTATTTAC:1	TTAGCCTGTGGGGATATTAGTA	GTGTACTACTATTATTATTTAC	+	chr2R	5237372	+	chr2R	5237454	82	+	chr2R	5237372	+	chr2R	5237454
ACCAGAAGATTCCCTCAAAAAAGTGAACAGAGAAATTCCAAATTTTTCATTTCAGAAAGGCAGAAAGGGATTTCA:1	ACCAGAAGATTCCCTCAAAAAA	AGAAAGGCAGAAAGGGATTTCA	+	chr3R	19101790	+	chr3R	19101901	111	+	chr3R	19101790	+	chr3R	19101901
GACAGTCGCTTTTCCTTTGAAGCCGCCGAAGCCCAGCAGCCACGACTTCTTGGCCACGACTTCACAGCCA:1	GACAGTCGCTTTTCCTTTGAAG	CTTGGCCACGACTTCACAGCCA	-	chr2R	20432585	-	chr2R	20432494	91	+	chr2R	20432494	+	chr2R	20432585
ATTANTTCCGCTTGTAAACGCCNCAATNCGTCCACGTTTNCTAAGCTCTGCATAATTACTGTAATTATGTTGTTT:1	ATTANTTCCGCTTGTAAACGCC	AATTACTGTAATTATGTTGTTT	+	chr2R	20541109	+	chr2R	19914491	626618	+	chr2R	20541109	+	chr2R	19914491
TTTCCGGGCAGCTGGAGTATTGGGTCCAGGCTCACAACTTTCATTGCTTTGGATACTATA:1	TTTCCGGGCAGCTGGAGTATTG	TTTCATTGCTTTGGATACTATA	-	chr3L	18682649	-	chr3L	18682864	215	+	chr3L	18682864	+	chr3L	18682649
CACCGAGCGGATCGCACANGCACACACACACATATATACTCAANCACACNACGCGTCAAGTGACGGGTTACAAA:1	CACCGAGCGGATCGCACANGCA	GCGTCAAGTGACGGGTTACAAA	-	chr2R	10955590	-	chr2R	10948040	7550	+	chr2R	10948040	+	chr2R	10955590
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGTG:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TGTGGTGTTGTGTGGTGTGGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	13104419	8803116	+	chr3R	13104419	+	chr3R	21907535
GAAAATACAGAAAAGTACGGGAAAAAAAAATACTTTGTATATACTGGGGAGCAACAAAAAGGTTTACCAAGGGGA:1	GAAAATACAGAAAAGTACGGGA	ACAAAAAGGTTTACCAAGGGGA	-	chr3L	19155072	-	chr3L	3095803	16059269	+	chr3L	3095803	+	chr3L	19155072
ACACGCTCTCCGGAACCCATTACTGCAACGATTTGCAAAGTTTTCGGCTAAACGAAAACAATTTGAGATGGCAG:1	ACACGCTCTCCGGAACCCATTA	CGAAAACAATTTGAGATGGCAG	-	chrX	21509242	-	chrX	6073682	15435560	+	chrX	6073682	+	chrX	21509242
AATATATGCATAAAGTTCTCATTGGGCGGTCCGACCGAGTGCGACATCTAGCCATCTATGTTTACTTTG:1	AATATATGCATAAAGTTCTCAT	CTAGCCATCTATGTTTACTTTG	-	chr3L	22703124	-	chr3L	22703024	100	+	chr3L	22703024	+	chr3L	22703124
AAAAGAGACGCCGCTTATCAACGCTAAAAAGAAAAAAAAAATGGCAAAGTTTGCCGAATGTGTTTCTCT:1	AAAAGAGACGCCGCTTATCAAC	AGTTTGCCGAATGTGTTTCTCT	+	chr3R	29215383	+	chr3R	15198461	14016922	+	chr3R	29215383	+	chr3R	15198461
AATGCCATAAACTTATATAACATCATTTTTAAAGTTTAATNACGTTTTATCAATAATTCATTGCTGTTNTTT:1	AATGCCATAAACTTATATAACA	CAATAATTCATTGCTGTTNTTT	-	chr2L	21286696	-	chr2L	21286621	75	+	chr2L	21286621	+	chr2L	21286696
ACTCTAGCTTGGGTTGGGTTCAGTGGGTTCCTTCTGCTCCAATAGATGT:1	ACTCTAGCTTGGGTTGGGTTCA	TTCCTTCTGCTCCAATAGATGT	-	chr2L	15468866	-	chr2L	15468807	59	+	chr2L	15468807	+	chr2L	15468866
AGCATATCTGCGACTACGATGGAATCAGAATCAGAATCAGAATAGAAAAATAGTAACAACATGGGAGNAATTGGC:1	AGCATATCTGCGACTACGATGG	TAACAACATGGGAGNAATTGGC	+	chr2L	2713371	+	chr2L	2713455	84	+	chr2L	2713371	+	chr2L	2713455
TAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGTGCCGTTGCTACCATAA:1	TAATCTCAGTCCTACGCCACAC	GCATGTGCCGTTGCTACCATAA	-	chr3R	28484354	-	chr3R	28486271	1917	+	chr3R	28486271	+	chr3R	28484354
CAACTTCCAAAACAACTACCACAGAATCAACCACAATCCCAACAACAACCACAGAATCAACTACAGCTTCAACC:1	CAACTTCCAAAACAACTACCAC	AGAATCAACTACAGCTTCAACC	+	chr3L	5483086	+	chr3L	5483204	118	+	chr3L	5483086	+	chr3L	5483204
GATTTATAATATACATAAGTAACGATTTTGCTTTGACTACGGTGTTTTCTTTTTTTAATGTGGATTTCTTTT:1	GATTTATAATATACATAAGTAA	TTTTTTAATGTGGATTTCTTTT	-	chr2L	8109013	-	chr2L	8108920	93	+	chr2L	8108920	+	chr2L	8109013
GGCAGCAGCTCCGCCTCGCAGCTCTTCAGCTTGGCCACCTCACGCACTTTTCTGGAATATATGGGTGTGTTGTGG:1	GGCAGCAGCTCCGCCTCGCAGC	GGAATATATGGGTGTGTTGTGG	-	chr3R	19177563	-	chr3R	21835078	2657515	+	chr3R	21835078	+	chr3R	19177563
ATGATTTATGGGCCTTTCGGTTAAGCCGCCTGCTTATCGGTAAGACCCTCAGATTTACGAGTTGTGTATATCGTC:1	ATGATTTATGGGCCTTTCGGTT	TTTACGAGTTGTGTATATCGTC	-	chr2L	20069608	-	chr2L	20069528	80	+	chr2L	20069528	+	chr2L	20069608
ATTCTTTAATGGCTTTTAGGGATTTCAAGATTTTACCGTCGTTGTCCCATTCTTCCCCTGTAAAATATGT:1	ATTCTTTAATGGCTTTTAGGGA	ATTCTTCCCCTGTAAAATATGT	+	chr3L	3484422	+	chr3L	3484494	72	+	chr3L	3484422	+	chr3L	3484494
AAAAAGCAAAGAAATTACTGGTGTAACTTAACTTTTTCCTGGCTGCTGATTGATTGGCTGAGTTTTCCCCGCTTT:1	AAAAAGCAAAGAAATTACTGGT	TTGGCTGAGTTTTCCCCGCTTT	-	chr2R	13749569	-	chr2R	13749423	146	+	chr2R	13749423	+	chr2R	13749569
AAACTAAAAATGCCCCAAGCCCAGAGAGTCTGCTAAAATGGCAGCAAAAAATACCAGA:1	AAACTAAAAATGCCCCAAGCCC	AATGGCAGCAAAAAATACCAGA	+	chr3R	28989933	+	chr3R	28990091	158	+	chr3R	28989933	+	chr3R	28990091
TCACTTTTTATGCTTCAGTATTTTTTTCAGGCAAAGAAAACTCGAGGGTTGCGGATGACACAGTGAANTCAAAG:1	TCACTTTTTATGCTTCAGTATT	GGATGACACAGTGAANTCAAAG	-	chr3R	28091908	-	chr3R	28091821	87	+	chr3R	28091821	+	chr3R	28091908
CGGCTTCGATTTTAATNTGTTCTNAAATGATTTNTTTTNTTCTGCTTTGTTTTTGTATTTATNTTCTTTATT:1	CGGCTTCGATTTTAATNTGTTC	TTTTGTATTTATNTTCTTTATT	+	chr3R	1917070	+	chr3R	2526153	609083	+	chr3R	1917070	+	chr3R	2526153
AAATTTAATAAAATATATATTAAATCTCAAATTTCTCTCTTAAGAATTGTAACTCTAACCGTTCTTCTTATGTTT:1	AAATTTAATAAAATATATATTA	TCTAACCGTTCTTCTTATGTTT	-	chr3L	21776762	-	chr3L	21776675	87	+	chr3L	21776675	+	chr3L	21776762
AAAGGTGTGGGAAATAGTTCTAAAGCTAAAGTTACTAGCCAAACTCAGTCAAGCGTCGGCTTTCTTTCGTTAAAT:2	AAAGGTGTGGGAAATAGTTCTA	CGTCGGCTTTCTTTCGTTAAAT	+	chr3L	22569598	+	chr3L	22569696	98	+	chr3L	22569598	+	chr3L	22569696
TAAATGATTAGATAAACATTCTTTTTTTAATCAAACGAATTTCACATAAGTGCGAAAAATTCTT:1	TAAATGATTAGATAAACATTCT	CACATAAGTGCGAAAAATTCTT	-	chr3L	6065092	-	chr3L	6065026	66	+	chr3L	6065026	+	chr3L	6065092
TTCTTTAGTTGAGTGTTTCAATATTTTTGAAGGTTCCATGGAAGACAGCAGCTACTGTGACTGATTGATTTGTT:1	TTCTTTAGTTGAGTGTTTCAAT	TACTGTGACTGATTGATTTGTT	+	chr2R	11537235	+	chr2R	11537311	76	+	chr2R	11537235	+	chr2R	11537311
TATGGTAAGCATATATATCGGTTTTGCTATTTTCACCACATTATATCTACAAAATACATATTATAGAATCCCT:1	TATGGTAAGCATATATATCGGT	AAATACATATTATAGAATCCCT	-	chr2L	2571632	-	chr2L	2565561	6071	+	chr2L	2565561	+	chr2L	2571632
GTTGAGATTATTTTAATGTATAATATGCTTGATATTTATTTTTATTTTCCTTTCGAGGATCGAGTGGGTTTTTTT:1	GTTGAGATTATTTTAATGTATA	CGAGGATCGAGTGGGTTTTTTT	-	chr3L	21619866	-	chr3L	19406723	2213143	+	chr3L	19406723	+	chr3L	21619866
ACACGAAGAAAGCAACAGCAAGAAAGTTGAAGCATGAAAATTTCAGCAAAAGCTTATGGTCAACTGATTGATAT:1	ACACGAAGAAAGCAACAGCAAG	CTTATGGTCAACTGATTGATAT	+	chr3L	939796	+	chr3L	940916	1120	+	chr3L	939796	+	chr3L	940916
GAGTTATAATTCTAACTTATAAGCAAAAGTTGTAATATCTAATTTGATAGGACCATGTTTATAGACGATTGT:1	GAGTTATAATTCTAACTTATAA	GACCATGTTTATAGACGATTGT	+	chr3R	18269015	+	chr3R	18269147	132	+	chr3R	18269015	+	chr3R	18269147
TAATTAACGTAAATTTAAGGATAATTACCTGAACTGATAGCTTTCATAATGGCGTACTG:1	TAATTAACGTAAATTTAAGGAT	TAGCTTTCATAATGGCGTACTG	+	chr3R	20771731	+	chr3R	20771796	65	+	chr3R	20771731	+	chr3R	20771796
CCTCGCTGTTTATTATTAAAAAATTTGTAGCCATTCGGCTGTCCATGAAGGTTGAATTGTGGGGCAG:1	CCTCGCTGTTTATTATTAAAAA	TGAAGGTTGAATTGTGGGGCAG	-	chr2L	11947121	-	chr2L	11947021	100	+	chr2L	11947021	+	chr2L	11947121
TGGGGACTAGAGCACAGCAGGGCACTGCAAAAAAAAATGGTGGCATGGTGTGTAGAAGGGGAATGGGANTTCAGG:1	TGGGGACTAGAGCACAGCAGGG	AGAAGGGGAATGGGANTTCAGG	-	chr2R	18727256	-	chr2R	18727083	173	+	chr2R	18727083	+	chr2R	18727256
GCCCAACAATATTTATTGCCAAAAACAAAAGCAAAACAATATTAATT:1	GCCCAACAATATTTATTGCCAA	CAAAAGCAAAACAATATTAATT	+	chr3L	11632636	+	chr3L	21821262	10188626	+	chr3L	11632636	+	chr3L	21821262
TGTGGACTATCAAAAAGGTTAGTCCTTTCTATGAACTATCCTTGATTTTCGCTAGACTTTTCCCGAAGTGTTTTT:1	TGTGGACTATCAAAAAGGTTAG	AGACTTTTCCCGAAGTGTTTTT	+	chr3R	22860168	+	chr3R	22860260	92	+	chr3R	22860168	+	chr3R	22860260
AGCACGTCGTACAAAGAAGAAATATATTTACTTTTATTTGAAGCTTAAATCATACTTAATAACTAAGGTCATTG:1	AGCACGTCGTACAAAGAAGAAA	TACTTAATAACTAAGGTCATTG	-	chr2R	22185780	-	chr2R	22185682	98	+	chr2R	22185682	+	chr2R	22185780
AACTCTAGATCTCTACTCTTCAAACATTACGTTTTATTGAAATTTTCATCTAATTTTTAAATTTG:1	AACTCTAGATCTCTACTCTTCA	TTTCATCTAATTTTTAAATTTG	-	chr3R	23360271	-	chr3R	23360205	66	+	chr3R	23360205	+	chr3R	23360271
GTTAATAATTAGATCATTACGTATGATCATCATATATGAATTGGGCCNAAATGAC:1	GTTAATAATTAGATCATTACGT	ATATGAATTGGGCCNAAATGAC	+	chr3L	8716249	+	chr3L	8716310	61	+	chr3L	8716249	+	chr3L	8716310
TTTGAAGCAATTTATAATGTTTTATATGACAGATATTTTTAAGTATTCTGTGCAAATTACAATTCC:1	TTTGAAGCAATTTATAATGTTT	ATTCTGTGCAAATTACAATTCC	+	chrX	14416338	+	chrX	14421096	4758	+	chrX	14416338	+	chrX	14421096
TACAACGANTCCAATTAAAACCCGGTATATATTTANATATGTACCTTGCCTCCGAACTGTGAAATTCCGCTAGAA:1	TACAACGANTCCAATTAAAACC	GAACTGTGAAATTCCGCTAGAA	+	chr2L	10105313	+	chr2L	10105389	76	+	chr2L	10105313	+	chr2L	10105389
CACGAACGAATCTGGCTTTCCATTATGACCGTAATACTGTCAAAAACAAGCACACAATAATTATAATGATGATCA:1	CACGAACGAATCTGGCTTTCCA	ACAATAATTATAATGATGATCA	+	chr3R	9319600	+	chr3R	9320035	435	+	chr3R	9319600	+	chr3R	9320035
ATTACACACTTTTAAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATT:1	ATTACACACTTTTAAATTAAAA	AGGCACGAAACACCCTTTAATT	+	chr2R	5581406	+	chr2R	5627614	46208	+	chr2R	5581406	+	chr2R	5627614
TTACTAAATCTCTGTTTATCTTGCCAAATGGTACTTGAACCACAGAATCGATGCCGCCGCGGGGGCTCAGA:1	TTACTAAATCTCTGTTTATCTT	GATGCCGCCGCGGGGGCTCAGA	+	chr3L	17516992	+	chr3L	17524546	7554	+	chr3L	17516992	+	chr3L	17524546
CACGACACGAAAAATGACGCCAATTCACCTCTTGCCAAATATTTTTGCCAGCTTGGTCCACAGTTTTTTGTTTCC:1	CACGACACGAAAAATGACGCCA	TGGTCCACAGTTTTTTGTTTCC	+	chr2L	21220065	+	chr2L	18173449	3046616	+	chr2L	21220065	+	chr2L	18173449
AGCTCTCGAGTACACAACNGAAGGAGGATCTGGAGTACCTTCGCGAGATCA:1	AGCTCTCGAGTACACAACNGAA	CTGGAGTACCTTCGCGAGATCA	-	chr2L	8774820	-	chr2L	8779594	4774	+	chr2L	8779594	+	chr2L	8774820
CTAATTTCACAATAAAAACAAAAAAAAAAGGAGCATATTAAAGTATA:1	CTAATTTCACAATAAAAACAAA	AAAAGGAGCATATTAAAGTATA	-	chr3L	17133474	-	chr3L	23602285	6468811	+	chr3L	23602285	+	chr3L	17133474
TCGGACTTCCATTTCAGACGGACCTCGTCTTATCAGACGCGCGCGGAAGCTGCTCGTGTGCAGACG:1	TCGGACTTCCATTTCAGACGGA	GGAAGCTGCTCGTGTGCAGACG	+	chr3L	858011	+	chr3L	866483	8472	+	chr3L	858011	+	chr3L	866483
GTAACAAAAGAGAGACACAGCTTAACATTACGNCCATAAATTAACGCAAACAGGACAATGGAATAGNTTGTAT:1	GTAACAAAAGAGAGACACAGCT	AGGACAATGGAATAGNTTGTAT	+	chr3L	21319554	+	chr3L	21319642	88	+	chr3L	21319554	+	chr3L	21319642
ATCCTTGGAGAGTTCACTGAAAACCATCCAGAATGGAATGGAAGCCANTTAGGGGATTACTTTCGGGNTTCGT:1	ATCCTTGGAGAGTTCACTGAAA	GGGGATTACTTTCGGGNTTCGT	-	chrX	20499246	-	chrX	20499165	81	+	chrX	20499165	+	chrX	20499246
TAGTTTCGCCATTGGGTATTTGCCGAAACACTTTGCAATCCAACAGAAGACTCTATACACAAGTCCGCAGGGATG:1	TAGTTTCGCCATTGGGTATTTG	TATACACAAGTCCGCAGGGATG	-	chr2L	795376	-	chr2L	795266	110	+	chr2L	795266	+	chr2L	795376
TTCCATTCCACAGGTGGAGGATCTGCTTCGCCGGCACGAGGAAAGAGACACTTTTTACTCAGT:1	TTCCATTCCACAGGTGGAGGAT	AAAGAGACACTTTTTACTCAGT	+	chr3L	3364788	+	chr3L	17900605	14535817	+	chr3L	3364788	+	chr3L	17900605
CATAAATTCAATTATGTGTTATAGAAAACTTTGTTTATCTCCTTGTCGTCTATACACTTAGCCAAATTGCGCGCG:1	CATAAATTCAATTATGTGTTAT	ACACTTAGCCAAATTGCGCGCG	+	chr3L	7101349	+	chr3L	7101442	93	+	chr3L	7101349	+	chr3L	7101442
TTATTATCTTGATTTAATCAAAGCATAAAAAAAGCGCAGGATAACTAGGATAACCTTTATGAAAAAGCACCTATT:1	TTATTATCTTGATTTAATCAAA	CCTTTATGAAAAAGCACCTATT	+	chr3L	20143083	+	chr3L	20143163	80	+	chr3L	20143083	+	chr3L	20143163
AAAATGTTGCATAGCGGCAGGCGCAAAGTGTGATGAAGCTTTTGCGGAAAAAGGGGAGTTTCGGATGGGCGGGCG:1	AAAATGTTGCATAGCGGCAGGC	GGGAGTTTCGGATGGGCGGGCG	+	chr3L	21749341	+	chr3L	21754501	5160	+	chr3L	21749341	+	chr3L	21754501
CGGTGGCATTAAAAATAATTGACGACCGGTTTCCCAGTCGCTACAGAGATGCTTCTCTTGGCTCATCTCACCTGG:1	CGGTGGCATTAAAAATAATTGA	TCTCTTGGCTCATCTCACCTGG	-	chr3L	14316866	-	chr3L	14312052	4814	+	chr3L	14312052	+	chr3L	14316866
CTCTGACTTTAGCATTTTGGCCAACCGGTCAAGGTGAAAGTTGCGCCACTTGCACTCCTTTCCTCCACCTTTCAC:1	CTCTGACTTTAGCATTTTGGCC	ACTCCTTTCCTCCACCTTTCAC	+	chr3R	19109374	+	chr3R	28707030	9597656	+	chr3R	19109374	+	chr3R	28707030
TTTATTCAAAGCAATTCACGTATATTTAGGTTGTTTATTAGGTTTNAAATTGTGTTTATTTNGGTTTAAATTGTC:1	TTTATTCAAAGCAATTCACGTA	GTTTATTTNGGTTTAAATTGTC	-	chr3R	9860114	-	chr3R	9860000	114	+	chr3R	9860000	+	chr3R	9860114
ATAGAGATAGAATATTATCCTGCTTAAAACCTATCCATTATTTCTAAAACCAAACGTTTGCCATCCAAATTCAAT:1	ATAGAGATAGAATATTATCCTG	ACGTTTGCCATCCAAATTCAAT	-	chr3L	16867633	-	chr3L	16867555	78	+	chr3L	16867555	+	chr3L	16867633
ATGCTGGCAATGCCATAGATTTCGAAGAGAGGATCTCGTCGTCTTACGCTGTGCGTTTTA:1	ATGCTGGCAATGCCATAGATTT	TCGTCTTACGCTGTGCGTTTTA	+	chr3L	16493989	+	chr3L	16494491	502	+	chr3L	16493989	+	chr3L	16494491
ATTAATTACGGCATACTTTCGGGCGGAAACCGAACTCACCTGCTGAGTTGAGCTGAGACCAGGTTGCTGTACGGA:1	ATTAATTACGGCATACTTTCGG	TGAGACCAGGTTGCTGTACGGA	-	chr3R	6206517	-	chr3R	6206300	217	+	chr3R	6206300	+	chr3R	6206517
AGCCGAAAGATGGAAGCTCANTCGCGGCACTTNGCCAGGAGTNTTACGACNTCGCGATGGGGTGCCAGAAGTGAA:1	AGCCGAAAGATGGAAGCTCANT	GCGATGGGGTGCCAGAAGTGAA	+	chr3R	31530839	+	chr3R	31531166	327	+	chr3R	31530839	+	chr3R	31531166
TGAATATATAAGGTTTATTTTAAAGTTAATACTCTGAAGGTAACTTTAAAAGTCACTCTTTCATGATATCAAATT:1	TGAATATATAAGGTTTATTTTA	CACTCTTTCATGATATCAAATT	+	chr3L	10518580	+	chr3L	10518715	135	+	chr3L	10518580	+	chr3L	10518715
ATACTTTCTGTCAGCGGCTTTGATTGCCAAAGGGCATTAAGTAGGATGGGTAGTTTTTCCGCCTAATTAGGATAT:1	ATACTTTCTGTCAGCGGCTTTG	TTTTTCCGCCTAATTAGGATAT	+	chr3R	20060643	+	chr3R	20060726	83	+	chr3R	20060643	+	chr3R	20060726
CTGATAGTAAAATGAAAGAAATTATATTATAGAATATAGTGTAGTATGATTTTGGTAGATATTTATTTTAGTGC:1	CTGATAGTAAAATGAAAGAAAT	TGGTAGATATTTATTTTAGTGC	-	chr3L	11018656	-	chr3L	11018571	85	+	chr3L	11018571	+	chr3L	11018656
CGGTGCTTTTCTCTTGGTAAAATGCGGTTAAAACGAAAAACAACCAGGGTGTGTGGCACAATTCAAAAAC:1	CGGTGCTTTTCTCTTGGTAAAA	GTGTGTGGCACAATTCAAAAAC	+	chr2L	16270389	+	chr2L	16270464	75	+	chr2L	16270389	+	chr2L	16270464
TAATGGGGTCCAACAAGTCAGGATTGTCTTTCGCTATGCCTCCGAAGAGTCACACTTAAAAGAGAGTCCTGTAAT:1	TAATGGGGTCCAACAAGTCAGG	ACTTAAAAGAGAGTCCTGTAAT	+	chrX	20670958	+	chrX	20671056	98	+	chrX	20670958	+	chrX	20671056
TCTATGGGTGTACGTGGTTTTCTTTCGCTCAATATGTGTGTGTATTTTAAATGTTTTGTGTATTTAATTCGGCTG:1	TCTATGGGTGTACGTGGTTTTC	TTTTGTGTATTTAATTCGGCTG	-	chrX	16480011	-	chrX	6629512	9850499	+	chrX	6629512	+	chrX	16480011
GACAGCTAAAAGTAATTAACTCATTCATTAATCCTCATTAATTCGTTTTGCATTCCCTTTAATTGCAGGTACTCC:1	GACAGCTAAAAGTAATTAACTC	TCCCTTTAATTGCAGGTACTCC	-	chr3R	26952000	-	chr3R	26951892	108	+	chr3R	26951892	+	chr3R	26952000
GATCGAGTACATGCCATTACGTCAGCGAACACANAAGAGAGGATTTATATTGAAACT:1	GATCGAGTACATGCCATTACGT	AGAGAGGATTTATATTGAAACT	+	chrX	22982866	+	chrX	22983031	165	+	chrX	22982866	+	chrX	22983031
AGCAGACCCCAAATGAAGGGCTAAAGCAGTACTTACGATATAGAATTTTCAATACTCTATTGATTAAGTGAAGAG:1	AGCAGACCCCAAATGAAGGGCT	ACTCTATTGATTAAGTGAAGAG	+	chr3L	6373019	+	chr3L	6373254	235	+	chr3L	6373019	+	chr3L	6373254
GACTCCTTTCACTTTTGTTCTCCGTGCTACAGGATGCTCCACATCGAAGGACCTACGTGTCAACACGAAGACATT:1	GACTCCTTTCACTTTTGTTCTC	TACGTGTCAACACGAAGACATT	+	chrX	20105302	+	chrX	20105199	103	+	chrX	20105302	+	chrX	20105199
TATATTTCATATGTTGCAAACATTCAGCAAGGCAACCAACTAATCGTCTGACGTCACTTGTCCTTGACGGGGTG:1	TATATTTCATATGTTGCAAACA	GTCACTTGTCCTTGACGGGGTG	+	chr2L	20518738	+	chr2L	20720361	201623	+	chr2L	20518738	+	chr2L	20720361
CGTCGAGTGCATTCGCAGTGCTTCCCAGGTGTTTCTTCTTTCGTTTTTTTTTTGTTT:1	CGTCGAGTGCATTCGCAGTGCT	TTCTTTCGTTTTTTTTTTGTTT	-	chrX	8497023	-	chrX	12869728	4372705	+	chrX	12869728	+	chrX	8497023
TTTCCTCAGTCATTTTCCCATTTCCCACTTGGCAGCTGAGCAAAATGGAGCGCGCAAAATGCTTTTGCATGCTGG:1	TTTCCTCAGTCATTTTCCCATT	GCAAAATGCTTTTGCATGCTGG	+	chrX	5798880	+	chrX	5799042	162	+	chrX	5798880	+	chrX	5799042
GAAAGTGGCCGCCGGCAATTGCCTTCGATCGGGAATGCAACAAGGATATCACCTTCGATGCGGATGGCC:1	GAAAGTGGCCGCCGGCAATTGC	ATCACCTTCGATGCGGATGGCC	-	chr3R	12396859	-	chr3R	12403831	6972	+	chr3R	12403831	+	chr3R	12396859
GCCTAGGTGTAAGTGTTGCGTAGTTGCCGCTGGCAATGGAATGCTAATGGAAAATGCGTAT:1	GCCTAGGTGTAAGTGTTGCGTA	AATGCTAATGGAAAATGCGTAT	+	chr3L	10553196	+	chr3L	4963345	5589851	+	chr3L	10553196	+	chr3L	4963345
TATAAACAAAGCTTTTGATTCATCAGCCGGCAGACAGACAGACAAATACAATGGGCATTTCGTTGANATT:1	TATAAACAAAGCTTTTGATTCA	CAATGGGCATTTCGTTGANATT	-	chr2R	21507284	-	chr2R	21507213	71	+	chr2R	21507213	+	chr2R	21507284
TGTACGTAAAATTCTGATATTTTTCTTACTAAAAATCAAGAAGATTTTTTTTTATTGGTTTTGGCATTTT:1	TGTACGTAAAATTCTGATATTT	TTTTTATTGGTTTTGGCATTTT	+	chrX	6897578	+	chrX	6897651	73	+	chrX	6897578	+	chrX	6897651
TTTAAGGAATGTTTATAATATGGTTGAATTTTAAGCTCATTTCTTTCATTTAGTAAATGTGTGCCCTAATCCTAT:1	TTTAAGGAATGTTTATAATATG	TAAATGTGTGCCCTAATCCTAT	+	chr3R	12763137	+	chr3R	12763214	77	+	chr3R	12763137	+	chr3R	12763214
GGTCATGATGTGTTCACGGTGTGTTCTCAAAAATCATTAGATTCATTTGTATAGTACTTAGAAATTAGTAATAAT:1	GGTCATGATGTGTTCACGGTGT	GTACTTAGAAATTAGTAATAAT	-	chr3R	21321626	-	chr3R	21321530	96	+	chr3R	21321530	+	chr3R	21321626
AAAGTCTTTCATTTGAGGTTTAAACTCTTTGAAAACGTGGAAACCTTAGGTTTATTGCTATGGAAAGCTTAGTTA:1	AAAGTCTTTCATTTGAGGTTTA	ATTGCTATGGAAAGCTTAGTTA	+	chr2R	12548550	+	chr2R	12548627	77	+	chr2R	12548550	+	chr2R	12548627
AATCTTGTACAACATTAATAAAAAAAAGCACTTCGATTCAGCTCGCCCCACAACAATTTTGACGATGATTACCTG:1	AATCTTGTACAACATTAATAAA	CAATTTTGACGATGATTACCTG	-	chrX	17632235	-	chrX	17630122	2113	+	chrX	17630122	+	chrX	17632235
TGAATATAATTTTTGCATTTTAATCACTTATTAATGAACTTAAAATTAAATTTAATTAAATTTCGCTTTTAAAC:1	TGAATATAATTTTTGCATTTTA	TAATTAAATTTCGCTTTTAAAC	+	chr2R	13532520	+	chr2R	13532635	115	+	chr2R	13532520	+	chr2R	13532635
ATTTCATTTGATTTGACACCTATAATTATCATCATTACTGAGACTTGAATACTACGTTCAGTGCATACTCACTCT:1	ATTTCATTTGATTTGACACCTA	ACGTTCAGTGCATACTCACTCT	+	chr3L	21847426	+	chr3L	21847522	96	+	chr3L	21847426	+	chr3L	21847522
CATGATTCATATTTATTTCTAATATGAAATGTGTAAACCTGTGAAATTACATAGTATTCTAGAGAACTGGCAGA:1	CATGATTCATATTTATTTCTAA	AGTATTCTAGAGAACTGGCAGA	-	chr3R	8099714	-	chr3R	8094410	5304	+	chr3R	8094410	+	chr3R	8099714
TGTGCTTTGCATTTGACTGCCCATTGATGAGAGATGTGCCATTGTGTTGCCAGGCCAAGTCTCTTCAGCTGAGTT:1	TGTGCTTTGCATTTGACTGCCC	GCCAAGTCTCTTCAGCTGAGTT	-	chr3R	23629525	-	chr3R	23629449	76	+	chr3R	23629449	+	chr3R	23629525
AGTCGTCGAGTTATGGGGCCAACAAAGGTGGAGGAGGAGGAGGATGAGGTGAAGAAGGAGCTGAGCTGGAGGAG:1	AGTCGTCGAGTTATGGGGCCAA	AGAAGGAGCTGAGCTGGAGGAG	+	chr3R	22892341	+	chr3R	29035888	6143547	+	chr3R	22892341	+	chr3R	29035888
AATAATATTAAAAGTCTTACGATAAGAATGGGTTAATTAATTAAGTGAACTCACTTCAACTCGTCGTCG:1	AATAATATTAAAAGTCTTACGA	AACTCACTTCAACTCGTCGTCG	-	chr3L	8796700	-	chr3L	8791286	5414	+	chr3L	8791286	+	chr3L	8796700
AAAACATATACTCGTACATTTGGCAAACATTACACAAAAATAAATAAA:1	AAAACATATACTCGTACATTTG	ACATTACACAAAAATAAATAAA	+	chrX	19127622	+	chrX	13787311	5340311	+	chrX	19127622	+	chrX	13787311
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAAC:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACACCACAAC	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
AAGCGCTGTCACTGCCGCTGTCGTACCGATTTCTGGGAGGAAAATTGGAAAATTGCAACGGCAATAAAAAGAATA:1	AAGCGCTGTCACTGCCGCTGTC	TGCAACGGCAATAAAAAGAATA	+	chr3R	23086139	+	chr3R	23086270	131	+	chr3R	23086139	+	chr3R	23086270
AGTCGCCTTGAAAACATTGAAAGAGTNCGNGGGGGAGCGAGGGCGGGCGCAACCGCAGCANAAGCAGGCCGACCC:1	AGTCGCCTTGAAAACATTGAAA	CGCAGCANAAGCAGGCCGACCC	-	chr3L	3069890	-	chr3L	3061307	8583	+	chr3L	3061307	+	chr3L	3069890
TTAAGGTTGTATTTTTAAAGGTAGGAAATCAAATTAGTTAGTTCCACTAACTAATCCGAAACTACGCCGATTAG:1	TTAAGGTTGTATTTTTAAAGGT	AATCCGAAACTACGCCGATTAG	+	chr3L	19369858	+	chr3L	19369939	81	+	chr3L	19369858	+	chr3L	19369939
CTAGATTGACCAGCAAAGCAGTGAAGAGGAGGAAGCTGATCAACAGTGAGGGCAATGGCTTGTAGAATGTTCCC:1	CTAGATTGACCAGCAAAGCAGT	CAATGGCTTGTAGAATGTTCCC	-	chr3R	18397051	-	chr3R	19612088	1215037	+	chr3R	19612088	+	chr3R	18397051
TGCAGTTCGCAATGCAAAGCGGGCACTTATCCGGTCGACTGAAG:1	TGCAGTTCGCAATGCAAAGCGG	GCACTTATCCGGTCGACTGAAG	+	chr3R	7589824	+	chr3R	7589914	90	+	chr3R	7589824	+	chr3R	7589914
CATGGAATGATGATTTTGNGACACTTCGCAAAATAAATAAATTNCTTATNTGTAGCGACGATTTGCGGTAATTTT:1	CATGGAATGATGATTTTGNGAC	AGCGACGATTTGCGGTAATTTT	+	chr3L	3576804	+	chr3L	3576885	81	+	chr3L	3576804	+	chr3L	3576885
AAGAATGTAGCCTTTTAAAGGTTAAAGGTATTTTAGCATATGGGAGCNAATAGATAGATAGGGTATTNTATTTTG:1	AAGAATGTAGCCTTTTAAAGGT	ATAGATAGGGTATTNTATTTTG	+	chr3L	11334176	+	chr3L	11334262	86	+	chr3L	11334176	+	chr3L	11334262
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
CTTTGATGAGGATTGCTTTGNAGGCTCCAGGGNAAAAAGGTGNGCAGTGCCATCGCTTCGCTTGAGAAGGGAGC:1	CTTTGATGAGGATTGCTTTGNA	TCGCTTCGCTTGAGAAGGGAGC	-	chr2L	19740836	-	chr2L	19737368	3468	+	chr2L	19737368	+	chr2L	19740836
GACAAATTCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTCATCGTTGA:1	GACAAATTCGTGACTTTAAATA	TTTACATAGTAGTCATCGTTGA	-	chrX	17629772	-	chrX	17633092	3320	+	chrX	17633092	+	chrX	17629772
AAATATGTAACTATTTATTTAATTTCACCAGTATTAGAGTGCTCTCCACATTGCAAATGTTCAGTGAAGAATTTT:1	AAATATGTAACTATTTATTTAA	CAAATGTTCAGTGAAGAATTTT	-	chr3R	15892761	-	chr3R	15892680	81	+	chr3R	15892680	+	chr3R	15892761
GCGTGCACCACTTGACGGACAACTATGCGGAGTCCTGGAACTCGTCCTGATTAATGGCTGATGCTTGCCAA:1	GCGTGCACCACTTGACGGACAA	ATTAATGGCTGATGCTTGCCAA	+	chr2R	8277659	+	chr2R	8277750	91	+	chr2R	8277659	+	chr2R	8277750
GAAGTCTTATTAATAAATCTAATATTCCGGTTAACTTGACTGACTTCTAAGAATCCTATTTTACATAAAACAAA:1	GAAGTCTTATTAATAAATCTAA	ATCCTATTTTACATAAAACAAA	+	chr3L	105849	+	chr3L	12026224	11920375	+	chr3L	105849	+	chr3L	12026224
GGTCAAAGGCCATAAAAGTCGATATACATTGGTGCATATACATGTATNTATGTACATACCTGGGCGCNGACTCTG:1	GGTCAAAGGCCATAAAAGTCGA	ACATACCTGGGCGCNGACTCTG	+	chrX	295882	+	chrX	303502	7620	+	chrX	295882	+	chrX	303502
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAGTTGTGAGAGGGGGGGAGAGTAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	TTGTGAGAGGGGGGGAGAGTAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	11118641	10788895	+	chr3R	21907536	+	chr3R	11118641
ACATTGTTTTTCACCATTTTCTACCCGGCCAAAACTCAATTTCCGCTGAATTAAGTTTTTATGTGCGATAAAAAA:1	ACATTGTTTTTCACCATTTTCT	AGTTTTTATGTGCGATAAAAAA	+	chr2R	18380652	+	chr2R	18380728	76	+	chr2R	18380652	+	chr2R	18380728
AAATGCCGCACAAAAAGCAGAGGTCTGCGTATAAAATCTAGAGCAAAATTAAAGCTNGCAGGCGTTGAAG:1	AAATGCCGCACAAAAAGCAGAG	TTAAAGCTNGCAGGCGTTGAAG	+	chrX	8948783	+	chrX	8956288	7505	+	chrX	8948783	+	chrX	8956288
GCCACTGCCACAAATGCCCTGCTTAAAGCCCAGATAAGCATAATTCGTGCCTTCTTTCTGTCTCTGNGAAACCAA:1	GCCACTGCCACAAATGCCCTGC	CTTTCTGTCTCTGNGAAACCAA	+	chr2L	14341075	+	chr2L	14335547	5528	+	chr2L	14341075	+	chr2L	14335547
ACAGTAAAAACATTTACTTGGAGATTATAATTATAAAGTTATATACGCTCATGTAATAATAATTGTGAGGTAC:1	ACAGTAAAAACATTTACTTGGA	TGTAATAATAATTGTGAGGTAC	-	chr3L	18092907	-	chr3L	18092794	113	+	chr3L	18092794	+	chr3L	18092907
TGTGCCCTTTCAAATACTGAAAAGTATCTCTACTATTTCAGTCATATTTGAATACGATATTTAATTATATTTTAA:1	TGTGCCCTTTCAAATACTGAAA	ACGATATTTAATTATATTTTAA	+	chr3R	13194113	+	chr3R	13194702	589	+	chr3R	13194113	+	chr3R	13194702
CACGATTCCTCTTTCGGAAACATCCCATGACTTTATTTTGTGGTTAAGCTTGTCCGACGAGTCCTTTGTATTC:1	CACGATTCCTCTTTCGGAAACA	GTCCGACGAGTCCTTTGTATTC	-	chr3R	29876014	-	chr3R	12975271	16900743	+	chr3R	12975271	+	chr3R	29876014
TGGCATTTCGAAGCTCATAAATGGTAAAAATGTAATAACGAATTGCTTTTATTTAATTGCCACTTTTATAAACA:1	TGGCATTTCGAAGCTCATAAAT	TTAATTGCCACTTTTATAAACA	-	chr3L	17636252	-	chr3L	17636105	147	+	chr3L	17636105	+	chr3L	17636252
TATGATCTTAAAGCAAGATATCATATAGGTTTATTTCTCCTCAAAAGTAATCGCCTGAACTTGCCAATCGTC:1	TATGATCTTAAAGCAAGATATC	TCGCCTGAACTTGCCAATCGTC	-	chr2R	17161567	-	chr2R	17161363	204	+	chr2R	17161363	+	chr2R	17161567
AAACTGAAATTTTAATTAATTCTGAGATGTGCAAAACAAGTGCATAATTGCAATTACGCAATCCTTTCGGAGACG:1	AAACTGAAATTTTAATTAATTC	TTACGCAATCCTTTCGGAGACG	+	chr3R	29324323	+	chr3R	29324402	79	+	chr3R	29324323	+	chr3R	29324402
TCAGAAGTCGAGGAATTTCCCGATAATGCATATGTAAATAGCGCTCGGAATCGATTTCTTCTACAAAAATAAATA:1	TCAGAAGTCGAGGAATTTCCCG	ATTTCTTCTACAAAAATAAATA	+	chr2R	17281960	+	chr2R	17282042	82	+	chr2R	17281960	+	chr2R	17282042
AGTTGCAAGCACACACATGTGCGGGCATAAAAGAAAAGCAGAAACTTAAGACGTCTGTGTGGATTTTCCGTTTCG:1	AGTTGCAAGCACACACATGTGC	TCTGTGTGGATTTTCCGTTTCG	+	chr3R	27140544	+	chr3R	27148154	7610	+	chr3R	27140544	+	chr3R	27148154
GAGTATATATATATGTATATATATATGCGTTTCTCTTACCTTTGGAGTCGAATGGCACCAATTTGCAGTCGTCG:1	GAGTATATATATATGTATATAT	TGGCACCAATTTGCAGTCGTCG	+	chrX	13675846	+	chrX	16771578	3095732	+	chrX	13675846	+	chrX	16771578
TCTACCAATACAGAAAAGTTGGGTGAGTTCTCAAAAACTTTTTCATTACACTTATTTCATGTGTTTAAATTGAAT:1	TCTACCAATACAGAAAAGTTGG	ATTTCATGTGTTTAAATTGAAT	-	chr3R	4896398	-	chr3R	4896305	93	+	chr3R	4896305	+	chr3R	4896398
TCCTTTTCCAAATCAACTTAGCTACCTATNGGCTATATCACTTCCTGTAGTTTTTGTCA:1	TCCTTTTCCAAATCAACTTAGC	TCACTTCCTGTAGTTTTTGTCA	-	chr2L	6544465	-	chr2L	6544389	76	+	chr2L	6544389	+	chr2L	6544465
CAACGAAAATACGACTTTTGTATCAAATTGCATAATTTGCGTGAGCAACCGCCGTTGGCAGCCTCAAGGGAA:1	CAACGAAAATACGACTTTTGTA	GCCGTTGGCAGCCTCAAGGGAA	+	chr3L	20604939	+	chr3L	18455824	2149115	+	chr3L	20604939	+	chr3L	18455824
ACGTAAACAAATATGTATTTAAATAAATATAAATTGAAACCACGATCTGTATAAACACTTGGCAAGCACAGTT:1	ACGTAAACAAATATGTATTTAA	TAAACACTTGGCAAGCACAGTT	-	chr2L	408049	-	chr2L	407970	79	+	chr2L	407970	+	chr2L	408049
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACANCACAACACAACACAACACACCACAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
CGTTGGCGACAACTTTGCATTCCCCTTGACGAAGAAACATTTATTTTTTAATTTGACTTTGCCTGGCTTTTCACC:1	CGTTGGCGACAACTTTGCATTC	TGACTTTGCCTGGCTTTTCACC	+	chr2L	15105541	+	chr2L	9083534	6022007	+	chr2L	15105541	+	chr2L	9083534
GACCAATATTCTGGCTGCTTGGGCTCTCTGGCGGAGGATCGGGATCGGAGATTTGGGAGAAGTAGCTGGCCAG:1	GACCAATATTCTGGCTGCTTGG	TTTGGGAGAAGTAGCTGGCCAG	+	chr3L	19426764	+	chr3L	19426840	76	+	chr3L	19426764	+	chr3L	19426840
ATAAGCTGCTTAAGTGACACCAGCAACACAGCCAGTCGTCGGGCCAATAATTGAGGTCAGCAGCCATGGAGG:1	ATAAGCTGCTTAAGTGACACCA	TTGAGGTCAGCAGCCATGGAGG	-	chr3L	2446868	-	chr3L	2446770	98	+	chr3L	2446770	+	chr3L	2446868
CTTATGTATTATGTGCTCGCCGTACATGCGCAAAATTCCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	CTTATGTATTATGTGCTCGCCG	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	6414044	+	chr3R	21907535	15493491	+	chr3R	6414044	+	chr3R	21907535
GTATGTATTTTGATCTTGCAGTTTTACCAATTTTCAAGTTCGAATAGTTTATCATTGCCACAAAAAANAGTTAAC:1	GTATGTATTTTGATCTTGCAGT	ATTGCCACAAAAAANAGTTAAC	-	chrX	16681736	-	chrX	16681660	76	+	chrX	16681660	+	chrX	16681736
GGTCATTTGGCCTAACCTTTCGGCACGCCCACACAGTCCACAAGTATTTTATATCTTGTCCTGGCGTCTCCTTT:1	GGTCATTTGGCCTAACCTTTCG	ATCTTGTCCTGGCGTCTCCTTT	+	chr3R	30294792	+	chr3R	31090989	796197	+	chr3R	30294792	+	chr3R	31090989
AGTGCAGAATTCTGGCAGCTCGTCAGCCGGCTTATCATTTAAATGGTGGGAAGTTGGCTTTAAAGGCAATCGCAA:1	AGTGCAGAATTCTGGCAGCTCG	TTGGCTTTAAAGGCAATCGCAA	-	chr2R	14393974	-	chr2R	14393889	85	+	chr2R	14393889	+	chr2R	14393974
AGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACCGGAACAACCTTGATAAATTAAGACTCATTGATTGAAGAAGGCG:1	AGAAGAAAATATGAAGAATTTG	GACTCATTGATTGAAGAAGGCG	+	chr3R	19448616	+	chr3R	19448848	232	+	chr3R	19448616	+	chr3R	19448848
GTTCACCGTTTAGCGATATAGCACAACAATTTTAGTTCTACAACTGCTCTCGTGACGTAACGCGACGACGACTGG:1	GTTCACCGTTTAGCGATATAGC	GACGTAACGCGACGACGACTGG	+	chr3L	9130556	+	chr3L	9134317	3761	+	chr3L	9130556	+	chr3L	9134317
CACCATAATCTAAAAAACATTACTTTAACTGCGCCTTTTTTTCAGTTTCAAAATGAAAAACTTTCCCGTG:1	CACCATAATCTAAAAAACATTA	CAAAATGAAAAACTTTCCCGTG	-	chrX	16651024	-	chrX	16650952	72	+	chrX	16650952	+	chrX	16651024
CAAACACTTTTGTATATATGTATATCCAGTGCTAAAAGCNTGAAAACTACTATTATCTTGAGCATT:1	CAAACACTTTTGTATATATGTA	AACTACTATTATCTTGAGCATT	-	chr3L	2684042	-	chr3L	2683975	67	+	chr3L	2683975	+	chr3L	2684042
CCAATAAGCAGGACACGTNGGAACACAGCGTCGAGGTGTGTCAAAACGCCCAATTCCCTGAATGCCCACAGANGT:1	CCAATAAGCAGGACACGTNGGA	TTCCCTGAATGCCCACAGANGT	+	chr3L	22665026	+	chr3L	22665113	87	+	chr3L	22665026	+	chr3L	22665113
AATAATACGAGTTACTCGGTAAGGGTAACAGGCAGAAGGAAGCATTTCGGACGAACTAGAGTTGCCTACT:1	AATAATACGAGTTACTCGGTAA	GGACGAACTAGAGTTGCCTACT	+	chr3L	23205452	+	chr3L	23205677	225	+	chr3L	23205452	+	chr3L	23205677
GTATTCAAAGCAGCTACTTGGCCAGTCGAGCTTATGCCAAATTAAAAACGCATTCAT:1	GTATTCAAAGCAGCTACTTGGC	GCCAAATTAAAAACGCATTCAT	+	chr3R	27370139	+	chr3R	27370327	188	+	chr3R	27370139	+	chr3R	27370327
ACCAGCCAAGACTCGAGAGCCCAAGAGCTGAAAACCAGACCACAAATGCTAATCAGCGATGCTTTATGATTTTCG:1	ACCAGCCAAGACTCGAGAGCCC	CAGCGATGCTTTATGATTTTCG	-	chr3R	27470725	-	chr3R	27470063	662	+	chr3R	27470063	+	chr3R	27470725
GAATGGCCATTTGAAGTAAGCGGCAATTGCACAAGCAGCTTAAGGACATCGTCGTTTGTCAACTGGAG:1	GAATGGCCATTTGAAGTAAGCG	CATCGTCGTTTGTCAACTGGAG	+	chr3L	12933125	+	chr3L	12933202	77	+	chr3L	12933125	+	chr3L	12933202
CTGTTTCTCAAATGCGATCTTCAATGAGTCATAAAAATAGCCGGAGCAACAGGAGCAGCAGGAGCTGGAGCAGCT:1	CTGTTTCTCAAATGCGATCTTC	AGCAGCAGGAGCTGGAGCAGCT	+	chr3R	10602092	+	chr3R	17211850	6609758	+	chr3R	10602092	+	chr3R	17211850
AAAAGAGAGCAAATTGAAATTGCGATGGTAATNGCGGCATATAAAACGATTTCAAGCTGAATTTATNTTTATAT:1	AAAAGAGAGCAAATTGAAATTG	CAAGCTGAATTTATNTTTATAT	+	chr2R	22767589	+	chr2R	22767673	84	+	chr2R	22767589	+	chr2R	22767673
TCATNACCAATTTAAGGGTAAANCCAANCTGTCGCATATNATCGTTGATATGCCGCACTTTTGCCATGAATATAA:1	TCATNACCAATTTAAGGGTAAA	CGCACTTTTGCCATGAATATAA	+	chrX	3620489	+	chrX	3620588	99	+	chrX	3620489	+	chrX	3620588
TAATGAAATGTTAATACTTTCAATATATGGTCATAAAATAGATTTTCACTTTAGACCAGAAATGAAGACCAGCTG:1	TAATGAAATGTTAATACTTTCA	GACCAGAAATGAAGACCAGCTG	+	chr3R	15646794	+	chr3R	15646877	83	+	chr3R	15646794	+	chr3R	15646877
GAATACTTAAAAATATCTGTCATATAAAACATTATAAATTGCTTCAAAAAAAATTTATTTTAAAAGTCCATA:1	GAATACTTAAAAATATCTGTCA	AAATTTATTTTAAAAGTCCATA	-	chrX	14421078	-	chrX	14416314	4764	+	chrX	14416314	+	chrX	14421078
CTCTTTCCCTCTGCTCGAATCCTTATTAAATCCTTATTAAACTCGATTGTAATTTCACACGCCGCAAAGTGATT:1	CTCTTTCCCTCTGCTCGAATCC	TTTCACACGCCGCAAAGTGATT	-	chr3R	5093359	-	chr3R	29181954	24088595	+	chr3R	29181954	+	chr3R	5093359
GCCATTTATGTACAAAAGTGCTCACGATAAAGAAATGTTACCGATCACGTCGGGGTCAGCAAATGTTNAGGCAA:1	GCCATTTATGTACAAAAGTGCT	GGGTCAGCAAATGTTNAGGCAA	+	chr3L	25995951	+	chr3L	25996031	80	+	chr3L	25995951	+	chr3L	25996031
AGTCGAAAATTATGCAAAAAAAAAAAGGAAAACAAAACTGAAATTAACAAAAAAAAAATAAAGGCAAGAAGGAAA:1	AGTCGAAAATTATGCAAAAAAA	AAAAATAAAGGCAAGAAGGAAA	+	chr3L	7879858	+	chr3L	19229915	11350057	+	chr3L	7879858	+	chr3L	19229915
TTAGTTTTATAGTTCGCTCGCCCAAAGCTTTTTCTAAAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCA:1	TTAGTTTTATAGTTCGCTCGCC	ACTTAAATTCGTTGGCATGCCA	-	chr2L	1227621	-	chr2L	1220157	7464	+	chr2L	1220157	+	chr2L	1227621
GACCCGCGCTGATGAATAGCGCCTGAAATGAGCCTACAAAGCTGTCAATTTTAATAAATTATTGCACGGCAAAAA:1	GACCCGCGCTGATGAATAGCGC	ATAAATTATTGCACGGCAAAAA	+	chr2L	7343336	+	chr2L	7350452	7116	+	chr2L	7343336	+	chr2L	7350452
AGTGATTTGCCTAAGTTGTAAACGTGGTACAGCCTAGTATAGTATGGTAAATGCAATTTATTTTTATTTAGAATA:1	AGTGATTTGCCTAAGTTGTAAA	CAATTTATTTTTATTTAGAATA	-	chr3R	5823553	-	chr3R	5822386	1167	+	chr3R	5822386	+	chr3R	5823553
GTGTCCAAGGCGAAGGTTGTCTGTATATATGCTGGCATTTTAGGGCCTTTTCTGCCCCTGCTAATTCCTCAGTG:1	GTGTCCAAGGCGAAGGTTGTCT	TGCCCCTGCTAATTCCTCAGTG	+	chrX	906727	+	chrX	908515	1788	+	chrX	906727	+	chrX	908515
AGTAAATGAAGCTAATTAATAGATTTCCATGGTGCTAGAATATCATATTGTAAGCAGAAATATATTTTTTGAAGT:1	AGTAAATGAAGCTAATTAATAG	GCAGAAATATATTTTTTGAAGT	-	chr2L	5378523	-	chr2L	5378444	79	+	chr2L	5378444	+	chr2L	5378523
ACAGTGCCCGCGAATCGCATGTGCCAGGATACTGATGTGGTGATACAGCGATGCATATGTGAATTCGGTTAGCCG:1	ACAGTGCCCGCGAATCGCATGT	CATATGTGAATTCGGTTAGCCG	-	chrX	12350853	-	chrX	12350772	81	+	chrX	12350772	+	chrX	12350853
GTAATATTGCGATTGGTCTTTATCTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAAAATGTTGATGTTATGCT:1	GTAATATTGCGATTGGTCTTTA	GTGAAAATGTTGATGTTATGCT	-	chr2L	5897687	-	chr2L	5897604	83	+	chr2L	5897604	+	chr2L	5897687
TCGGACTTACCTGAGGAATCCCTGTCCAATCTCGCTATCTTCCTTTGTGTGTCCACGCTGCATAGATAATGTCA:1	TCGGACTTACCTGAGGAATCCC	CCACGCTGCATAGATAATGTCA	-	chrX	17282964	-	chrX	17282887	77	+	chrX	17282887	+	chrX	17282964
AATCAGGACGAGTTCCAGGACTCCGCATAGTTGTCCGTCAAGTGGTGCACGCTTATCAC:1	AATCAGGACGAGTTCCAGGACT	TCAAGTGGTGCACGCTTATCAC	-	chr2R	8277731	-	chr2R	8277652	79	+	chr2R	8277652	+	chr2R	8277731
TTTGGTTNTCTTAAAGCGATTGTAACGGTAGAAATTATTNGTACCATGAACATGTCANTAGCCGACTGGCAAACA:1	TTTGGTTNTCTTAAAGCGATTG	GTCANTAGCCGACTGGCAAACA	-	chr2L	13152336	-	chr2L	13152258	78	+	chr2L	13152258	+	chr2L	13152336
AGGACAATAACCGGCACAACAACCACATCAATGCCCAGTACACTTTCACGCCCGAAGAAAGCTAGAAATTGGCAA:1	AGGACAATAACCGGCACAACAA	GAAGAAAGCTAGAAATTGGCAA	-	chr3R	23075888	-	chr3R	22223222	852666	+	chr3R	22223222	+	chr3R	23075888
CAAATAGAATTTCAAATACATAAAGTGCTGAATTTACAATCTTGAGTGAGCTTACATAACTGCCTTCTCCACAAG:1	CAAATAGAATTTCAAATACATA	ACATAACTGCCTTCTCCACAAG	-	chr2L	1164355	-	chr2L	1164269	86	+	chr2L	1164269	+	chr2L	1164355
ATTGTTAATTGTTAATTGTTAATTGTTAANTGTTAATTGTTTATTGTTTTTTGTTT:1	ATTGTTAATTGTTAATTGTTAA	AATTGTTTATTGTTTTTTGTTT	-	chr3L	14671950	-	chr3L	9974939	4697011	+	chr3L	9974939	+	chr3L	14671950
ATATGAACGCGTGTGACGCCCTCGCGCGCCTCTGATTCTCAAATATATATATAGAGATATAT:1	ATATGAACGCGTGTGACGCCCT	AAATATATATATAGAGATATAT	-	chrX	10772763	-	chrX	10772693	70	+	chrX	10772693	+	chrX	10772763
TGTTAAGACAGGGGGGGGGGGTTGGGGGTTGGG:1	TGTTAAGACAGGGGGGGGGGGT	GGGGGGGGGGTTGGGGGTTGGG	+	chrX	21019707	+	chrX	5027267	15992440	+	chrX	21019707	+	chrX	5027267
TCCGAGCGCTATTTACATATGCATTATCGGGAAATTCCTCGACTTCTGAAGCAATGGAAAAACTTGCGACATTTT:1	TCCGAGCGCTATTTACATATGC	ATGGAAAAACTTGCGACATTTT	-	chr2R	17282016	-	chr2R	17281934	82	+	chr2R	17281934	+	chr2R	17282016
AACGAATCGCCTTAGAAATAATTTATGCAACTTCGACTAACCGACTGTTCTATTAATATGATCGCTTAAAGCACC:1	AACGAATCGCCTTAGAAATAAT	TAATATGATCGCTTAAAGCACC	+	chr3R	20841991	+	chr3R	19265829	1576162	+	chr3R	20841991	+	chr3R	19265829
ATTTTTCAAATAAATTATATATATCAAATAAAAAGCATATTTTTCCAGTGCATCGCCCTCCTTGAGCAACCGTT:1	ATTTTTCAAATAAATTATATAT	TCGCCCTCCTTGAGCAACCGTT	-	chr3R	13606869	-	chr3R	13606723	146	+	chr3R	13606723	+	chr3R	13606869
AATGNTTCAATAGTTTAATTTCNAATTNCCATGCAAATANACGAGTCGGAGTCGAATGGTAAGCAGGATGGCTT:1	AATGNTTCAATAGTTTAATTTC	CGAATGGTAAGCAGGATGGCTT	+	chr3L	22554437	+	chr3L	22554512	75	+	chr3L	22554437	+	chr3L	22554512
CGATGGGCTATCAAACCTAAGAAAATTGCCAGTGATGGAAATTTTCATCTCTAACAGCGAGTTTGGTTTTCC:1	CGATGGGCTATCAAACCTAAGA	CTAACAGCGAGTTTGGTTTTCC	+	chr2R	9807462	+	chr2R	9807603	141	+	chr2R	9807462	+	chr2R	9807603
ATCCATGCAATACTTAGTATCGCACTGGTAGTTTTAATAGGTCAAAAACAAATGTCAGGTATGTAACANATTTT:1	ATCCATGCAATACTTAGTATCG	TGTCAGGTATGTAACANATTTT	-	chr3R	14923803	-	chr3R	14923727	76	+	chr3R	14923727	+	chr3R	14923803
AGCAATCAATATTGAGAGCAAGAGTTAAGCAAGCTGTCGGTGTTCATCACAATTTTTGCTTTTTTTTGTTTTTG:1	AGCAATCAATATTGAGAGCAAG	TTTTTGCTTTTTTTTGTTTTTG	+	chrX	5056697	+	chrX	18399188	13342491	+	chrX	5056697	+	chrX	18399188
CGAAATACCGCAAGGCTGCAATCGCCCTATCGATAGTTATATGTATGTATGTAGAATTTGACAGAAATTT:1	CGAAATACCGCAAGGCTGCAAT	ATGTAGAATTTGACAGAAATTT	-	chr2R	6696700	-	chr2R	6696622	78	+	chr2R	6696622	+	chr2R	6696700
TACTGTCTNCATTTCCATGTTTTCGTTAGCCAGGCAATAGAATGAATATGAAACAACCTTTATTAACTGTTG:1	TACTGTCTNCATTTCCATGTTT	AAACAACCTTTATTAACTGTTG	+	chr2L	1699100	+	chr2L	1699187	87	+	chr2L	1699100	+	chr2L	1699187
AAATATATTTTTTTATAAATATCTTAATCGGGTTT:1	AAATATATTTTTTTATAAATAT	TATAAATATCTTAATCGGGTTT	+	chr3L	12058079	+	chr3L	6116753	5941326	+	chr3L	12058079	+	chr3L	6116753
CGGCTGATGAGACGACAGTTTTTACGCAGTGCTGGGGAACTTCATTTCACACTTTAACTTAAGGGTTCTTTAACA:1	CGGCTGATGAGACGACAGTTTT	TTAACTTAAGGGTTCTTTAACA	+	chr3R	30583689	+	chr3R	30583765	76	+	chr3R	30583689	+	chr3R	30583765
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACGCAACGCAACACAACACA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	CAACGCAACGCAACACAACACA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	8339246	13568288	+	chr3R	21907534	+	chr3R	8339246
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAACACA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACACAAACACAAACACAACACA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	13693028	8214507	+	chr3R	21907535	+	chr3R	13693028
TTTTTTTTTTTGTTCGAAATATAAATTTTTTATTATTATCTATTTCCTT:1	TTTTTTTTTTTGTTCGAAATAT	TTTTATTATTATCTATTTCCTT	+	chrX	16195324	+	chrX	19510802	3315478	+	chrX	16195324	+	chrX	19510802
GATTCTTCGGATTCAGCAGCCAAATCCCGTGCTGAGGATTTCCATTTGAGATGGAAAATAGACGGGGGAGGGGCG:1	GATTCTTCGGATTCAGCAGCCA	GAAAATAGACGGGGGAGGGGCG	+	chr2L	597294	+	chr2L	597176	118	+	chr2L	597294	+	chr2L	597176
GGCTCCCATAAGTATGCAACAGTTTGGCATCTGGCTTTAAAATATTTACGGTCTCTTCGGCATGCATG:1	GGCTCCCATAAGTATGCAACAG	TACGGTCTCTTCGGCATGCATG	+	chr3R	28253345	+	chr3R	28255848	2503	+	chr3R	28253345	+	chr3R	28255848
CAAACCGAATTAAAGAAAGAAAGTATAAAATAAAATACATAATCTCACAACTCAGCCAATCTTCTTTAATTTATA:1	CAAACCGAATTAAAGAAAGAAA	AGCCAATCTTCTTTAATTTATA	+	chrX	20915067	+	chrX	20915238	171	+	chrX	20915067	+	chrX	20915238
TATTAATGCTATTAAGCGCAAAAAGTTATACAAAGAAGAAGATCATAGATTAAGCCACCATTGTACGAATCACTC:1	TATTAATGCTATTAAGCGCAAA	GCCACCATTGTACGAATCACTC	+	chr3R	29590391	+	chr3R	29590484	93	+	chr3R	29590391	+	chr3R	29590484
ACGAGGTGCAGCGGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTC:1	ACGAGGTGCAGCGGTCTGTGTG	TGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTC	-	chr3R	3019954	-	chr3R	22996106	19976152	+	chr3R	22996106	+	chr3R	3019954
ACGACGTTTAGCGTCGATTACTGTTAGACTAAGTGTCCCATTGAGCCAAGTGCCGCCAAAAAAACAA:1	ACGACGTTTAGCGTCGATTACT	CCAAGTGCCGCCAAAAAAACAA	-	chrX	16818691	-	chrX	16623365	195326	+	chrX	16623365	+	chrX	16818691
TCGAAGGCAAGGTACATATATAAATATATACCGGGTTTTAATTGGATTCGTTGTAGTCGGTGGGAAATT:1	TCGAAGGCAAGGTACATATATA	TCGTTGTAGTCGGTGGGAAATT	-	chr2L	10105369	-	chr2L	10105299	70	+	chr2L	10105299	+	chr2L	10105369
TTTTGTCTAATATAAAATGTTATTACATGTGTTTGCGTTTCTTATTAAGNTATACTTTTAGACTGTCCTAAAGTA:1	TTTTGTCTAATATAAAATGTTA	ACTTTTAGACTGTCCTAAAGTA	-	chr2R	17169541	-	chr2R	17169301	240	+	chr2R	17169301	+	chr2R	17169541
TACTGGGAACGTACATATGTACATACATATATCCCATCCATCTATATGCCCAGCGCAGTCACGTCCCGC:1	TACTGGGAACGTACATATGTAC	GCCCAGCGCAGTCACGTCCCGC	-	chr3L	409746	-	chr3L	402699	7047	+	chr3L	402699	+	chr3L	409746
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGCGCATGCTGAATGTCTTTGACGCATTTGAGACGTTACGCATGTTT:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	ATTTGAGACGTTACGCATGTTT	+	chr3L	22908067	+	chr3L	22693808	214259	+	chr3L	22908067	+	chr3L	22693808
AGTGTTCTTGAAAACAGGATACTTTGATGATAAGTGGAACATGTACCAAGGCATCCAGAATGTCATTGTTAAGTT:1	AGTGTTCTTGAAAACAGGATAC	TCCAGAATGTCATTGTTAAGTT	+	chr2R	12363402	+	chr2R	12363834	432	+	chr2R	12363402	+	chr2R	12363834
TTCTGTATGAGTTCTTTGTNTTAGAGCCCTAGCGCACATGTATGTATATACATTAGAATATAACTCTTTTAATTC:1	TTCTGTATGAGTTCTTTGTNTT	TAGAATATAACTCTTTTAATTC	-	chr2L	22583782	-	chr2L	22581993	1789	+	chr2L	22581993	+	chr2L	22583782
AATTAATTTTAAAGCAAATAGTTAATGATATGTTTCTTTTACTTTACTTTACTTACAAATAAATTATACA:1	AATTAATTTTAAAGCAAATAGT	TTACTTACAAATAAATTATACA	+	chr3L	11187724	+	chr3L	11187800	76	+	chr3L	11187724	+	chr3L	11187800
CAAATAGGCCTTTTAAGTATATAACTAAGATCGAGACGCATTCATTCGTTCCTGTACAATTTTTGTCAGGTCTTC:1	CAAATAGGCCTTTTAAGTATAT	GTACAATTTTTGTCAGGTCTTC	+	chr3L	3193642	+	chr3L	17909778	14716136	+	chr3L	3193642	+	chr3L	17909778
GCNTATGCAACATGGCCATGTGTTGACAGAGCCANGNTAGCACAGCTGATTTTACGACTCGTAACTGAGAAGGG:1	GCNTATGCAACATGGCCATGTG	TACGACTCGTAACTGAGAAGGG	+	chr3L	16515020	+	chr3L	16515097	77	+	chr3L	16515020	+	chr3L	16515097
ATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGG:1	ATTGTACTTTGCTTGGAACTTT	ATTAGTTGGCCATCATTCATGG	+	chr3L	16184126	+	chr3L	16188945	4819	+	chr3L	16184126	+	chr3L	16188945
AAGGAAAACAAAAAACACACTAGCTTTTTCAAAAAGCTTCCGTTTGTTGGCCAACGGCCTTCCATTTTGCAACTT:1	AAGGAAAACAAAAAACACACTA	ACGGCCTTCCATTTTGCAACTT	+	chr2L	12188285	+	chr2L	12188872	587	+	chr2L	12188285	+	chr2L	12188872
ACGAGGTGTAATATAATTTTATAATTTATGATTTATAAAGTACCTTCTTATCACTGTGCATTGCAATTCATTTC:1	ACGAGGTGTAATATAATTTTAT	ACTGTGCATTGCAATTCATTTC	+	chr3L	10032567	+	chr3L	10032653	86	+	chr3L	10032567	+	chr3L	10032653
TAGGATTGCAACAAAATATAAGACAGGATGCTTAAAAGCACTTGAAACATATAACTATTTTGACCACTTGAGAAA:1	TAGGATTGCAACAAAATATAAG	ACTATTTTGACCACTTGAGAAA	+	chrX	6009243	+	chrX	6009583	340	+	chrX	6009243	+	chrX	6009583
CTCGAAAGCAATACTTGGACATATATTAGACGATTTGATTTTAAATGAAAGCTGTCAATCAAGCTGACTTCGCG:1	CTCGAAAGCAATACTTGGACAT	TGTCAATCAAGCTGACTTCGCG	-	chr2L	6988162	-	chr2L	6987880	282	+	chr2L	6987880	+	chr2L	6988162
TTGTGAAAACAACATTTTAGGCCTCGACTATAGGTTCTATAAGGGTGCATTTACTTGACACCGAGGCATGTTGG:1	TTGTGAAAACAACATTTTAGGC	ACTTGACACCGAGGCATGTTGG	+	chr2L	22011934	+	chr2L	22012014	80	+	chr2L	22011934	+	chr2L	22012014
TGATAATTTGGAAATACAATTCGCTCAGTGTAGNAAAATAAACCTNACCTAGACGAAGACANATGATGACAATCA:1	TGATAATTTGGAAATACAATTC	CGAAGACANATGATGACAATCA	-	chr3L	4098605	-	chr3L	4098401	204	+	chr3L	4098401	+	chr3L	4098605
ATCGGAAAAAAAAGTTGTTTCTGGATTAATACCAAAATAAGAAAATCCCATTCAAAGGTGCCAAGAAAGCGAAGA:1	ATCGGAAAAAAAAGTTGTTTCT	AAAGGTGCCAAGAAAGCGAAGA	+	chr2L	7663074	+	chr2L	7595946	67128	+	chr2L	7663074	+	chr2L	7595946
TGTATTTCCTTGGAGCCGTTTCATTATATTCCACTGAATATTTTATGCA:1	TGTATTTCCTTGGAGCCGTTTC	ATTCCACTGAATATTTTATGCA	+	chr3R	10745453	+	chr3R	10745514	61	+	chr3R	10745453	+	chr3R	10745514
AATTGCTATTCGTATTGAATTCGCTTTTTAGCAAAGTAATTGCACAAATTATGAGATCTGCTAATATTCTTAAAT:1	AATTGCTATTCGTATTGAATTC	AGATCTGCTAATATTCTTAAAT	+	chr3R	18922806	+	chr3R	18922882	76	+	chr3R	18922806	+	chr3R	18922882
TAACAATTAAATGCTAAACTAAATATTCATATTAAAAATCCATAATATTAGTGAGTTTTCAAAATACTTATAATA:1	TAACAATTAAATGCTAAACTAA	AGTTTTCAAAATACTTATAATA	+	chr3L	11389365	+	chr3L	11389443	78	+	chr3L	11389365	+	chr3L	11389443
TTCACATGCCGGGCACGCACATCTGATTCCCATACAATACATACCCCAAGACCCCTGAGTAATTGATAGCCGTAC:1	TTCACATGCCGGGCACGCACAT	CCTGAGTAATTGATAGCCGTAC	+	chr3R	26651532	+	chr3R	26651617	85	+	chr3R	26651532	+	chr3R	26651617
GGTTTCACTTTAAACTAATTTGGGACACGAAACACTGGAAGAATTGAATTGAATTCAAAATGAATTGNAATAAAG:1	GGTTTCACTTTAAACTAATTTG	TTCAAAATGAATTGNAATAAAG	-	chr3R	8576359	-	chr3R	8576188	171	+	chr3R	8576188	+	chr3R	8576359
TAATAAATTAAGAATACTTTTGTTACCTTAAGCATATCGATATGCCTCACTCCA:1	TAATAAATTAAGAATACTTTTG	CATATCGATATGCCTCACTCCA	+	chr3R	29319853	+	chr3R	29320151	298	+	chr3R	29319853	+	chr3R	29320151
ATTTTCGTGCGACGCAGACCAGCGAAACTTCGTGCTTGAAATTAATCAGTGTGTGTCCGTTGTTCTCCAGGC:1	ATTTTCGTGCGACGCAGACCAG	GTGTGTCCGTTGTTCTCCAGGC	-	chr2R	17745299	-	chr2R	20910150	3164851	+	chr2R	20910150	+	chr2R	17745299
GAGCAGCTTAGACCACAGACAGAAGCCTGCAGGACATTCCCACATTACTCC:1	GAGCAGCTTAGACCACAGACAG	CAGGACATTCCCACATTACTCC	-	chr3L	12924762	-	chr3L	12919313	5449	+	chr3L	12919313	+	chr3L	12924762
TGACATAAAATCAACTTGGACTGCCTGGTTTCATTCACCAGATCCAGAGACCGACTGAATGGGCTCAGTTGAGTT:1	TGACATAAAATCAACTTGGACT	ACTGAATGGGCTCAGTTGAGTT	+	chr3R	6794269	+	chr3R	6794669	400	+	chr3R	6794269	+	chr3R	6794669
AGATTAATATTANCACATTAAGAGAGCGAANATTTCTGGGAGA:1	AGATTAATATTANCACATTAAG	GAGAGCGAANATTTCTGGGAGA	-	chr2L	5345152	-	chr2L	5342804	2348	+	chr2L	5342804	+	chr2L	5345152
TTAGACGGAAATGGTCCCTCCGCCATCTGTTTGAATATACTCGCAGAGAGTAGTGGGTGTTTGCTTTAATG:1	TTAGACGGAAATGGTCCCTCCG	GTAGTGGGTGTTTGCTTTAATG	-	chr2R	24707918	-	chr2R	24707843	75	+	chr2R	24707843	+	chr2R	24707918
CAAAAAAACATGCAACAAATTACAAAAAAAAAAAGAAACAGAAAGAAAATATTTAATAAGTCACCGAAGATGACG:1	CAAAAAAACATGCAACAAATTA	TAATAAGTCACCGAAGATGACG	+	chr2R	15183426	+	chr2R	21776852	6593426	+	chr2R	15183426	+	chr2R	21776852
GTATCACCACATCAGTATCCTGGCACATGCGATTCGCGGGCACTGTCAGTCATTTGTACCGTTTTAACTTGG:1	GTATCACCACATCAGTATCCTG	CATTTGTACCGTTTTAACTTGG	+	chrX	12350801	+	chrX	12350879	78	+	chrX	12350801	+	chrX	12350879
AAATGCTTCAGTCTGGTTGCTTATCTGACAGGATGGAGATGAGTCTGGGCTCTTCAGCTTTTGGTGAATGTCAC:1	AAATGCTTCAGTCTGGTTGCTT	TTCAGCTTTTGGTGAATGTCAC	+	chr3L	18677892	+	chr3L	18677986	94	+	chr3L	18677892	+	chr3L	18677986
GTTTCCGGTTCAGACCGCNGAGCATGTAAGTATGCTACCATTTNGTAACNCTTCTATAAAATTGCTGCCTGCATT:1	GTTTCCGGTTCAGACCGCNGAG	CTATAAAATTGCTGCCTGCATT	+	chr3R	8403009	+	chr3R	8412175	9166	+	chr3R	8403009	+	chr3R	8412175
ACAACTAAAATTTATTGATATGCAAAAGTTTACGGCCCGCCTTCTTGGACTTGGCCTGCCGCC:1	ACAACTAAAATTTATTGATATG	TTCTTGGACTTGGCCTGCCGCC	-	chr2L	14068694	-	chr2L	14068626	68	+	chr2L	14068626	+	chr2L	14068694
ATAATTTTAGCTTTCCATTTTGTTAAATTTATTTACTTTTCGTTGCACATATACATACGTGAAATGGAGAAAGCC:1	ATAATTTTAGCTTTCCATTTTG	CATACGTGAAATGGAGAAAGCC	+	chr3R	7396065	+	chr3R	7396160	95	+	chr3R	7396065	+	chr3R	7396160
TATTTGCCGTTTGCATNCAACGANTCTGATGAANGGCCNTTTGAAGTAAGCGGCAATTGCACNAGCAGCTT:1	TATTTGCCGTTTGCATNCAACG	GCGGCAATTGCACNAGCAGCTT	+	chr3L	12933095	+	chr3L	12933175	80	+	chr3L	12933095	+	chr3L	12933175
CAACACACACGCACACACAGGATGAGGGGCGGGGGAGGTGAGCCATTGTGAG:1	CAACACACACGCACACACAGGA	GGGGGAGGTGAGCCATTGTGAG	+	chr3L	1746591	+	chr3L	10855453	9108862	+	chr3L	1746591	+	chr3L	10855453
GCAGAATGTGACTTAATAAAACACTCACATCTTANCGACAACATTTTCACAACAAGAAAAAACAGAGGTCAAGTG:1	GCAGAATGTGACTTAATAAAAC	AAGAAAAAACAGAGGTCAAGTG	-	chr2R	11254977	-	chr2R	11254889	88	+	chr2R	11254889	+	chr2R	11254977
AGTGGAGGAAAAGTTGCCACTGCATCCTCANNNTNATGACGAGCTTATCTTGGACACGTACTGGGATTTGAGCCT:1	AGTGGAGGAAAAGTTGCCACTG	ACACGTACTGGGATTTGAGCCT	+	chr3L	5826162	+	chr3L	5826246	84	+	chr3L	5826162	+	chr3L	5826246
AGTTTGGAGTCTTGGATCTTGGTTGTGGGTCTTGTTGTTTAAGTTCAATGCAAACTCGATGGGTGACCAAATTGG:1	AGTTTGGAGTCTTGGATCTTGG	ACTCGATGGGTGACCAAATTGG	+	chrX	19176224	+	chrX	19176308	84	+	chrX	19176224	+	chrX	19176308
TCCCAGCCCAACATACATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCCCGAACGCCAATCCCCAAG:1	TCCCAGCCCAACATACATACCT	TCCCCGAACGCCAATCCCCAAG	+	chr2R	24490155	+	chr2R	24488260	1895	+	chr2R	24490155	+	chr2R	24488260
GTAGGTTGAAAGATTCTGTACTTGGGAGATAGAGAATGATGACGAGGATGCTGAAGTCGAGGAAATCGAAGAAGA:1	GTAGGTTGAAAGATTCTGTACT	AAGTCGAGGAAATCGAAGAAGA	+	chr3R	10043695	+	chr3R	18362688	8318993	+	chr3R	10043695	+	chr3R	18362688
TACTCATGCATGTATTATACTGGGGCGGCCATTGCACTGCGTCCCTCTGGGTCCCAAATTAATGCCGACTTTGG:1	TACTCATGCATGTATTATACTG	CCCAAATTAATGCCGACTTTGG	-	chr3R	8546395	-	chr3R	30854868	22308473	+	chr3R	30854868	+	chr3R	8546395
GTAACATCAGGCTCGCCGCAGCAGNAATTCAAACTTGAAGAGNGTNGCAAGNGTANCGATTACCGACGCGCTATG:1	GTAACATCAGGCTCGCCGCAGC	TANCGATTACCGACGCGCTATG	+	chr2L	5783127	+	chr2L	5783246	119	+	chr2L	5783127	+	chr2L	5783246
AACTGTTGCACGCGAAAAACTTTGCGATAACCAAGCTACTCACTCACTNACTCCATTTTCAGATACAACATCTCC:1	AACTGTTGCACGCGAAAAACTT	CATTTTCAGATACAACATCTCC	-	chr3R	27779363	-	chr3R	27779283	80	+	chr3R	27779283	+	chr3R	27779363
AAACGATTTTTAATGACATTTGCCATGAACTTAATGTTCGTACATCAGAGTTCACAAGAGGGTCTCAGAACTCGA:1	AAACGATTTTTAATGACATTTG	ACAAGAGGGTCTCAGAACTCGA	+	chr2L	4166391	+	chr2L	4166474	83	+	chr2L	4166391	+	chr2L	4166474
AATATAAATCCTCTCTTTTGTGTTCGCTGACGTAATGGCATGTACTCGATCGCAATGCATTAACCTTCACCCT:1	AATATAAATCCTCTCTTTTGTG	GCAATGCATTAACCTTCACCCT	-	chrX	22983025	-	chrX	22982844	181	+	chrX	22982844	+	chrX	22983025
CTCTGTGGCCTGCTTGGCACCAATTGTGTGTTGTGTACGGTTTTATCTTGTCAATTCATTTAGTTGACTGACTG:1	CTCTGTGGCCTGCTTGGCACCA	AATTCATTTAGTTGACTGACTG	-	chr3R	16179200	-	chr3R	16179078	122	+	chr3R	16179078	+	chr3R	16179200
TATTGAAATAGAAAATCCAAAAAAAAACATGTCGTGTTGGAGCAAGAATTCTTATAAACAATAAATACTTTGCTA:1	TATTGAAATAGAAAATCCAAAA	ATAAACAATAAATACTTTGCTA	-	chr2R	8203855	-	chr2R	8203763	92	+	chr2R	8203763	+	chr2R	8203855
TGGCGCCTGTGCGCTCAATTTAGAAAATGAGGGATCGACCTCCATAGGCTCTGGTG:1	TGGCGCCTGTGCGCTCAATTTA	TCGACCTCCATAGGCTCTGGTG	+	chr2R	14720331	+	chr2R	4183273	10537058	+	chr2R	14720331	+	chr2R	4183273
GTCGGCCGAGGAGGAGGAAACCGTTAACGAAACGAGGTCGAGACAAAATNACAAAAATAACAATAAAAAGCCAT:1	GTCGGCCGAGGAGGAGGAAACC	AAAAATAACAATAAAAAGCCAT	+	chr2L	18391127	+	chr2L	16533691	1857436	+	chr2L	18391127	+	chr2L	16533691
TCGAGATCAGCGAGGAAGCATAGGATTTCTTGTTAGTCAAAACGAATTGTTCCGAAATTCGGTAATTTTCTCTC:1	TCGAGATCAGCGAGGAAGCATA	CGAAATTCGGTAATTTTCTCTC	+	chr3R	30017948	+	chr3R	30012643	5305	+	chr3R	30017948	+	chr3R	30012643
GCCAACAGACACGCACATGCATAAAAAAAAACCCAGTTAATAGGATCGTATCTGCCAAAGGACTTAGTTTAAAG:1	GCCAACAGACACGCACATGCAT	TGCCAAAGGACTTAGTTTAAAG	+	chr3R	6533126	+	chr3R	23330049	16796923	+	chr3R	6533126	+	chr3R	23330049
GGACATGGGAACAATTAATATAATNAATAAAGTCGCCAAAAGNTGNAGAAGNTTGNAGATTTATCTGATTGTTGT:1	GGACATGGGAACAATTAATATA	TGNAGATTTATCTGATTGTTGT	-	chr2R	13220642	-	chr2R	13220543	99	+	chr2R	13220543	+	chr2R	13220642
GTTTTTCAAGAACAAAGTGAAGTCGCTGCAGTACCGTTTTTGGGGGAAAGAGTCAATTTTTGGCAATATTTTGAA:1	GTTTTTCAAGAACAAAGTGAAG	CAATTTTTGGCAATATTTTGAA	+	chr2R	8864878	+	chr2R	8865111	233	+	chr2R	8864878	+	chr2R	8865111
AAAGGACTTTTAAGCAACTAAAAAAACTCATCGTCAAATTTTCTGCACTCACAGCAGAACCCTGATTGGTTAACT:1	AAAGGACTTTTAAGCAACTAAA	GCAGAACCCTGATTGGTTAACT	-	chr2L	19558641	-	chr2L	19558537	104	+	chr2L	19558537	+	chr2L	19558641
TGCTTAAACAAAAAATATTGCAGGATTGCGTAGTTGAAGGACAGTCCAAGCACATTTTTTCAAGAGTTCAAAAT:1	TGCTTAAACAAAAAATATTGCA	CATTTTTTCAAGAGTTCAAAAT	+	chr3R	14608477	+	chr3R	14608568	91	+	chr3R	14608477	+	chr3R	14608568
TTAAACAAGATACAGTGCTCTATAATATTTCATAGTAGTCTATCCATATATGTGTACATAATGCCTCCAATT:1	TTAAACAAGATACAGTGCTCTA	TGTGTACATAATGCCTCCAATT	+	chr2L	11309019	+	chr2L	11309124	105	+	chr2L	11309019	+	chr2L	11309124
AGTATCAGTATATCCACGCATGCAAGCTCCGTTTGCAGCTCCCGGCTCACGAGAAATTTCTCATGCAACATCGAG:1	AGTATCAGTATATCCACGCATG	AAATTTCTCATGCAACATCGAG	+	chr2R	5812172	+	chr2R	5812249	77	+	chr2R	5812172	+	chr2R	5812249
GAGAAACTTTCTCAAAGAAATTATTCCTATTGAAATGTCCACCCGGGGGNAACTCAAATCAAAACCGAACATGGG:1	GAGAAACTTTCTCAAAGAAATT	TCAAATCAAAACCGAACATGGG	-	chr2R	17805999	-	chr2R	2903488	14902511	+	chr2R	2903488	+	chr2R	17805999
CATCATATTTGCCATAATCTGAGCGCATCCCCAAGCACAAGACAATGGCATATGTTCATACAGTTGAGCTCATCA:1	CATCATATTTGCCATAATCTGA	GTTCATACAGTTGAGCTCATCA	-	chr2L	15396242	-	chr2L	15396157	85	+	chr2L	15396157	+	chr2L	15396242
GTCTTAAGAGTTTGATCGTTAAGTGTGGACTGTGTGTATATGCATTAAATAATTCAATAATTTACATTAACCAA:1	GTCTTAAGAGTTTGATCGTTAA	TTCAATAATTTACATTAACCAA	+	chr2R	13607002	+	chr2R	10740204	2866798	+	chr2R	13607002	+	chr2R	10740204
TAAGGCAACAAAGGGCTGTAAAGAGGGGGAAATGAAAAAATGAAATAGTTGAAATGCACATTGAACTTGTTAAGT:1	TAAGGCAACAAAGGGCTGTAAA	ATGCACATTGAACTTGTTAAGT	-	chrX	17502439	-	chrX	17502359	80	+	chrX	17502359	+	chrX	17502439
GATTGGAGCAACAGGCAAATATTTTGAGCTGACAAATTTCTTGTCACCTTTATCAAATTAATCTTGAAGGAAT:1	GATTGGAGCAACAGGCAAATAT	ATCAAATTAATCTTGAAGGAAT	+	chr2L	19304252	+	chr2L	19304352	100	+	chr2L	19304252	+	chr2L	19304352
ATTCTTTATAATATCAAGATGTTTAAANGANNATCCAAATAAGTGTTGGNTNAGGAACAGTGGTATAACTACTGG:1	ATTCTTTATAATATCAAGATGT	GGAACAGTGGTATAACTACTGG	+	chr3L	14867639	+	chr3L	14867723	84	+	chr3L	14867639	+	chr3L	14867723
AACGTGTCCAGGTGGATACGCATCATTCCGCCAGCCACAGCGGTGCTCTTCTTCGTTTTTCCGATTCTTTTTTT:1	AACGTGTCCAGGTGGATACGCA	TCGTTTTTCCGATTCTTTTTTT	+	chr2R	23439929	+	chr2R	12400739	11039190	+	chr2R	23439929	+	chr2R	12400739
TAATGGACATACAAAAGTATGGTTCAANTANNCTATGTATAATTTAAAANCNCAAGTTTTGGATGGCGACCCGT:1	TAATGGACATACAAAAGTATGG	CAAGTTTTGGATGGCGACCCGT	+	chr3L	22137547	+	chr3L	22137623	76	+	chr3L	22137547	+	chr3L	22137623
GCTTGTGTCATCGAAGCCGCTTCACAAAAAGATGATACATCCGTAAACAAGTTGGGCAACCGGAAATTTATGTTT:1	GCTTGTGTCATCGAAGCCGCTT	GGGCAACCGGAAATTTATGTTT	-	chr2R	15755317	-	chr2R	15755234	83	+	chr2R	15755234	+	chr2R	15755317
ATTTAGAAACATAACATATAAGTCAATAGGAATTGTAGCGCAAGAATAACACAAACCAGCGACGACGTCGGCGTA:1	ATTTAGAAACATAACATATAAG	AACCAGCGACGACGTCGGCGTA	+	chr3R	7832983	+	chr3R	16534094	8701111	+	chr3R	7832983	+	chr3R	16534094
CCACGCAGGCATCCATAGGAAAGTATGCAGGCAATACGAGAATGTAATAACAATGGCAAATCGGAACACTCGATC:1	CCACGCAGGCATCCATAGGAAA	TGGCAAATCGGAACACTCGATC	-	chr2L	17543717	-	chr2L	17543624	93	+	chr2L	17543624	+	chr2L	17543717
TTCTGGTTGTCAAAATGTATAAGCTTGGACAATTGTAATGTAGTCAAAGAAGTGATGTGGTACGAGATCTCGCTG:1	TTCTGGTTGTCAAAATGTATAA	GATGTGGTACGAGATCTCGCTG	+	chr3L	1104009	+	chr3L	1104200	191	+	chr3L	1104009	+	chr3L	1104200
TTAAAGAAGTTAAAATTTTATAAGCCCAAAATATTGACGATAAGTCGTGTCAGCAATCGTCGTCTCCCCGAGCA:1	TTAAAGAAGTTAAAATTTTATA	GCAATCGTCGTCTCCCCGAGCA	+	chr3R	23508417	+	chr3R	5893150	17615267	+	chr3R	23508417	+	chr3R	5893150
TTCGGACGATTAAATATTTAATATTAGTTTCTAATACACCCTTGTCCCCTGGCCAATAAACATCTGCGGTTTGCA:1	TTCGGACGATTAAATATTTAAT	CAATAAACATCTGCGGTTTGCA	-	chr2R	11208032	-	chr2R	11207839	193	+	chr2R	11207839	+	chr2R	11208032
TCTATTCAGACGAGAACTGATACGGGCCAAAACACAGAGTGTGGCCAAGTTGGGCATAATGCGGAAGCTAAAAAA:1	TCTATTCAGACGAGAACTGATA	GCATAATGCGGAAGCTAAAAAA	+	chr3R	13195959	+	chr3R	13196054	95	+	chr3R	13195959	+	chr3R	13196054
TGCGTCGAGGATAAGAAAAGAAAGCAGATGGTGCTTCTGATAGAGCAGGTGCAACAGCCCACAACGGCAGCGACG:1	TGCGTCGAGGATAAGAAAAGAA	ACAGCCCACAACGGCAGCGACG	+	chr3R	30124976	+	chr3R	30125052	76	+	chr3R	30124976	+	chr3R	30125052
TAATGAAAAACTACATGGCTGCATTAGCATAGCATTATGTGGCAATTTAAATGAGCATAACCGGCGGATA:1	TAATGAAAAACTACATGGCTGC	AAATGAGCATAACCGGCGGATA	+	chr2R	13249597	+	chr2R	13249681	84	+	chr2R	13249597	+	chr2R	13249681
TACCATTCTTCATGTATGGCATTGTCCTCGTCATGCTTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGGTTGGATGTGT:1	TACCATTCTTCATGTATGGCAT	TATTTGGCCTGGTTGGATGTGT	+	chr3R	18766788	+	chr3R	18766866	78	+	chr3R	18766788	+	chr3R	18766866
TCGAGCTGAACTCCAGTCAAACTGTACTTTAAAAGAAAGAAAACATGG:1	TCGAGCTGAACTCCAGTCAAAC	CTTTAAAAGAAAGAAAACATGG	+	chr2R	24353453	+	chr2R	24361788	8335	+	chr2R	24353453	+	chr2R	24361788
CTAGAAAGGTGTGCTGTGCTTTTTGCAATTGGTCTCAGGTCCATTGGAAGGCCAACTTGAGCTGACCAAG:1	CTAGAAAGGTGTGCTGTGCTTT	AGGCCAACTTGAGCTGACCAAG	+	chrX	6118733	+	chrX	6118810	77	+	chrX	6118733	+	chrX	6118810
TGATCTATTCATAAGCCAAACTCATTTCCATGTCGCTCAGACATTCTTTCTTTCAACTTATGCATTTTATTAAA:1	TGATCTATTCATAAGCCAAACT	TCAACTTATGCATTTTATTAAA	+	chr2L	16354776	+	chr2L	16354867	91	+	chr2L	16354776	+	chr2L	16354867
GAAAAGACATGCACTGTGAAACGGGCGCCGGAAACGGAAATTCGCTGGGGAATCGCTGCAATT:1	GAAAAGACATGCACTGTGAAAC	TCGCTGGGGAATCGCTGCAATT	+	chr2L	4478123	+	chr2L	12316335	7838212	+	chr2L	4478123	+	chr2L	12316335
ACTGAATTTTTTATGCATTTTGTGAGGTGTAACTAGAATGGCACTTATTATT:1	ACTGAATTTTTTATGCATTTTG	AACTAGAATGGCACTTATTATT	-	chr2L	20500494	-	chr2L	20500437	57	+	chr2L	20500437	+	chr2L	20500494
TTTCCACATGCCAGCCAGTAATATTGCGATTGGTCTTTANCTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAA:1	TTTCCACATGCCAGCCAGTAAT	GTAGCATTGGGGGAGATGTGAA	-	chr2L	5897704	-	chr2L	5897621	83	+	chr2L	5897621	+	chr2L	5897704
TGTCCATGGGCAGACACCGAGACTGCAATTCTTTATTTCGTGGCTTGGTATTTTTGACAACT:1	TGTCCATGGGCAGACACCGAGA	TGGCTTGGTATTTTTGACAACT	+	chr2L	632735	+	chr2L	632802	67	+	chr2L	632735	+	chr2L	632802
TAACTAATCACCAACTTCAAGTTAAGCCCCTTGCTCAGTTTTATTTCCGCTTCTTGTT:1	TAACTAATCACCAACTTCAAGT	AGTTTTATTTCCGCTTCTTGTT	+	chr3R	19428692	+	chr3R	20888267	1459575	+	chr3R	19428692	+	chr3R	20888267
CAATCAGTTGACCATAAGCTTTTGCTGAAATTTTCATGCTTCAACTTTCTTGCTGTTGCTTTCTTCGTGTCTC:1	CAATCAGTTGACCATAAGCTTT	GCTGTTGCTTTCTTCGTGTCTC	-	chr3L	940912	-	chr3L	939793	1119	+	chr3L	939793	+	chr3L	940912
GAGGGCACTGAGCTATTGGGCAAAAGGGGGCAGCATGGCACGCTCACAACTTTGGATCTCCNACTTGCAGTGA:1	GAGGGCACTGAGCTATTGGGCA	TTGGATCTCCNACTTGCAGTGA	-	chr3L	7929214	-	chr3L	16640083	8710869	+	chr3L	16640083	+	chr3L	7929214
CCAAGTCGCGAATTTGCTATTTTCGAGGGGTTGGTCTGGTGCATGAATTTATCGGAAACTTCACACAAATGCGGC:1	CCAAGTCGCGAATTTGCTATTT	GGAAACTTCACACAAATGCGGC	-	chr3L	2479130	-	chr3L	2479033	97	+	chr3L	2479033	+	chr3L	2479130
GCTTACAAATAATCAGAACCAAAAACGATGAAGAATCTTGCACTCATATCAAGGGCTCACTGTTTCTGTAAAGCG:1	GCTTACAAATAATCAGAACCAA	GGCTCACTGTTTCTGTAAAGCG	+	chrX	19500733	+	chrX	19500820	87	+	chrX	19500733	+	chrX	19500820
GAATCTGTTGCCTTCANCTGCGTNAAAAAGGTTNTCGGNCTTATCAGTAATGGGAA:1	GAATCTGTTGCCTTCANCTGCG	TCGGNCTTATCAGTAATGGGAA	+	chr2R	21909929	+	chr2R	12483907	9426022	+	chr2R	21909929	+	chr2R	12483907
GCCATGCGGTTGAACGAGTGNTTTCATCTTATCTTCCAGCTTCCATCACACTTCACTTACATGCTCTTTAACATG:1	GCCATGCGGTTGAACGAGTGNT	CACTTACATGCTCTTTAACATG	+	chr3L	12318760	+	chr3L	15730892	3412132	+	chr3L	12318760	+	chr3L	15730892
TTGGAAATAATGAAATACGAAATCAGCTTACCCCACATGAGCCATCTCAAGATGAAGCGAGTGTTTATCCATATG:1	TTGGAAATAATGAAATACGAAA	GAAGCGAGTGTTTATCCATATG	-	chr3R	8613739	-	chr3R	8613632	107	+	chr3R	8613632	+	chr3R	8613739
GACATCCGTTGTTTTTTACCTCCGCTTTTTACAACAGCAACTACAATAAAAATGGTATTCAACGCTCACTCCC:1	GACATCCGTTGTTTTTTACCTC	ATGGTATTCAACGCTCACTCCC	-	chr3R	26138631	-	chr3R	833410	25305221	+	chr3R	833410	+	chr3R	26138631
GAACACTGGGGCTGGGACTACAACCTGCGCCAATCCAAATGCATGTTTCTACATATATATATATATAAAAATTAA:1	GAACACTGGGGCTGGGACTACA	TATATATATATATAAAAATTAA	-	chr2L	16332879	-	chr2L	7025063	9307816	+	chr2L	7025063	+	chr2L	16332879
CAAAATTACTATAGAAAGCTAACGACTTTTGGATGCCAGTTACTTGGCATCAATAGAAATTGGCAAGAAACAATA:1	CAAAATTACTATAGAAAGCTAA	TAGAAATTGGCAAGAAACAATA	+	chr2L	19121045	+	chr2L	19121123	78	+	chr2L	19121045	+	chr2L	19121123
GATATGGTAAGATTTAACTAAACACTCAACCAAGAAACAAATCAGCCGCTTTAAGTCGCTGATATTCATTCATTT:1	GATATGGTAAGATTTAACTAAA	AGTCGCTGATATTCATTCATTT	-	chr2L	1329935	-	chr2L	16847284	15517349	+	chr2L	16847284	+	chr2L	1329935
ATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATGACAAATGNAATACAGTGCTCAAATATACAAATATTTAAACAAATAGGC:1	ATGCGTTTTCAAACATTTATAG	ACAAATATTTAAACAAATAGGC	-	chr2R	18372612	-	chr2R	18358400	14212	+	chr2R	18358400	+	chr2R	18372612
CATATATGAGACACATATCAGCAAACTAATCCCTTACCTTCCGACCCATTTGGTGCTCTTCTAGATCTGCTCGA:1	CATATATGAGACACATATCAGC	GTGCTCTTCTAGATCTGCTCGA	-	chr3L	13007774	-	chr3L	13007696	78	+	chr3L	13007696	+	chr3L	13007774
GTCCTCTGGACTAGACCACTAGTCCTGCCCTGCCTGAGTAGCGATTGTGAAATATGCAGGCGTTCGGAG:1	GTCCTCTGGACTAGACCACTAG	TGAAATATGCAGGCGTTCGGAG	-	chr3R	23572882	-	chr3R	23572768	114	+	chr3R	23572768	+	chr3R	23572882
ATAGAATTTCCGTGTTAATTTGGTCAAAATAATAAAATCAGTTGTCNAGATTGTCGTCTANGCACGCCTG:1	ATAGAATTTCCGTGTTAATTTG	GATTGTCGTCTANGCACGCCTG	-	chr3L	23016078	-	chr3L	16062128	6953950	+	chr3L	16062128	+	chr3L	23016078
AGTTAGGCGGAGTCCTGGTGCGTGTTCTGGGATTGGAGTCCTTGCTGCGTTTGCGACAGTTTGCTG:1	AGTTAGGCGGAGTCCTGGTGCG	CTGCGTTTGCGACAGTTTGCTG	-	chr2L	11223572	-	chr2L	11635362	411790	+	chr2L	11635362	+	chr2L	11223572
TTGTTTTGTCTTGTCTTGTTTTGTCCTGTCTTGTTTTATCTTGTCTTTTTTT:1	TTGTTTTGTCTTGTCTTGTTTT	TTGTTTTATCTTGTCTTTTTTT	-	chrX	2912172	-	chrX	14985240	12073068	+	chrX	14985240	+	chrX	2912172
CGGTTAAGCTCGAGGAGTNTCCACAGGTGCGACCTGAGGAACATCCAGTGAGCAGATTACCTCGTACGGTTCTAG:1	CGGTTAAGCTCGAGGAGTNTCC	AGATTACCTCGTACGGTTCTAG	+	chrX	2303323	+	chrX	2303420	97	+	chrX	2303323	+	chrX	2303420
AATATTCAGATGCAAGTGNGAGTGCGAGGAAGTTGCTGTTTNGAANTTAACCCAATAATAAACGGCAATCAGCG:1	AATATTCAGATGCAAGTGNGAG	CAATAATAAACGGCAATCAGCG	+	chr3L	7883745	+	chr3L	7883901	156	+	chr3L	7883745	+	chr3L	7883901
TCCTGTCTGGCCAATGCCAATAATGCACATTTCTTGCAGCGTTCGGAGGCTCGCGGTACTCTCTCCTAATCCTTC:1	TCCTGTCTGGCCAATGCCAATA	CGGTACTCTCTCCTAATCCTTC	+	chr3L	21905346	+	chr3L	21905426	80	+	chr3L	21905346	+	chr3L	21905426
TTTAGCTTTCGAAAATATGCACAATAATGTTGTTTCGTTCGTTGGCAACTTCATAACTTTTAATTAACTGGACG:1	TTTAGCTTTCGAAAATATGCAC	ATAACTTTTAATTAACTGGACG	-	chrX	22701799	-	chrX	22697503	4296	+	chrX	22697503	+	chrX	22701799
ATTTTGTAGAAGCCAATCCATCATTGTCGCGTCAACTTCATTTAAACGGAAATATTTCGCAGATTTCTC:1	ATTTTGTAGAAGCCAATCCATC	GGAAATATTTCGCAGATTTCTC	+	chr2R	15752874	+	chr2R	15752947	73	+	chr2R	15752874	+	chr2R	15752947
ATCCTCCTTTAAAAAGGTTAATTGNGTCGTCCTAATGTCTTAGTAAGCGGCTTAAATCACAGGTGAAACTTGGGG:1	ATCCTCCTTTAAAAAGGTTAAT	AAATCACAGGTGAAACTTGGGG	+	chr2L	3273207	+	chr2L	18816681	15543474	+	chr2L	3273207	+	chr2L	18816681
CGCACCGGCCATAAACTTGGACCACAAATCATCACCGGAACCGGAACAAAAGTTATGAATGAATGCGGAACTGAA:1	CGCACCGGCCATAAACTTGGAC	TATGAATGAATGCGGAACTGAA	-	chrX	6101052	-	chrX	6100921	131	+	chrX	6100921	+	chrX	6101052
CATAAACATAATTCTAGAAAACTATAATCCTATAAAAAAAACTATAAAACTAAATTAACCCCATTATCTCAATTA:1	CATAAACATAATTCTAGAAAAC	ATTAACCCCATTATCTCAATTA	+	chr3R	6828030	+	chr3R	6828106	76	+	chr3R	6828030	+	chr3R	6828106
CTTTCAGATCCACAAGAACCCCTAGCCATGACCCCTGAGAGACCCTCTGCCATCCGTAGGAATGTCTGTAAGAT:1	CTTTCAGATCCACAAGAACCCC	TCCGTAGGAATGTCTGTAAGAT	-	chr3R	21640774	-	chr3R	21640667	107	+	chr3R	21640667	+	chr3R	21640774
CTGCCATGTGCCCCACTATACTTTATGCCGNNNANTGTTGCCCCATTATGCATCCATCCGGAAGAAATTTCTTT:1	CTGCCATGTGCCCCACTATACT	TCCATCCGGAAGAAATTTCTTT	-	chr2R	22574268	-	chr2R	22574189	79	+	chr2R	22574189	+	chr2R	22574268
AGACTCCGATAAAAACTGCGGTAACGTCGGGATCACCAAATGTTTATGGNAAGACAACCTATATGCCAGCCTTAG:1	AGACTCCGATAAAAACTGCGGT	ACAACCTATATGCCAGCCTTAG	-	chr2R	537954	-	chr2R	529329	8625	+	chr2R	529329	+	chr2R	537954
CAGCATAAATTCAATTATGTGTTATAGAAAACTTTGTTTATCTCCTNGTCGTCTATACACTT:1	CAGCATAAATTCAATTATGTGT	TCTCCTNGTCGTCTATACACTT	+	chr3L	7101346	+	chr3L	7101426	80	+	chr3L	7101346	+	chr3L	7101426
GAAAGTATGTGGCAGTGTNCAGTGGGAGGACTGACTTATTCCTNCGACANATTGGTTCCGTCCGTCCATTGTT:1	GAAAGTATGTGGCAGTGTNCAG	TTGGTTCCGTCCGTCCATTGTT	-	chr3R	5399927	-	chr3R	5399848	79	+	chr3R	5399848	+	chr3R	5399927
GCTACAGTTGCATTCGATTACGGCCAGCATGCCNAGGATGCATTTCCAGATG:1	GCTACAGTTGCATTCGATTACG	GCCNAGGATGCATTTCCAGATG	-	chr3R	17350901	-	chr3R	17350808	93	+	chr3R	17350808	+	chr3R	17350901
ACGCGAGCAGCCCACATACATATATATGTACATACATATGTGCACATACATACGTATTTGTAATGGCTTT:1	ACGCGAGCAGCCCACATACATA	CATACGTATTTGTAATGGCTTT	+	chrX	4157918	+	chrX	4164966	7048	+	chrX	4157918	+	chrX	4164966
GAAAAAANCTGAAAAACTAAAACTATAACTTTGATATAGNTAAAGCAAATATAAATANATGAATTAAAGCAAATT:1	GAAAAAANCTGAAAAACTAAAA	AATANATGAATTAAAGCAAATT	-	chr3R	14898609	-	chr3R	14898489	120	+	chr3R	14898489	+	chr3R	14898609
AACAAATACACCAGCTGCAAAGAAACAAGAGCAAAACGGTTGCTGGCGAANGTAGTAGGGGGGGGG:1	AACAAATACACCAGCTGCAAAG	GGCGAANGTAGTAGGGGGGGGG	-	chr3R	28932883	-	chr3R	18797279	10135604	+	chr3R	18797279	+	chr3R	28932883
CAAACATTTATCATTTCTAGTATAAAGTTTTCAAATTAAAGCTTATA:1	CAAACATTTATCATTTCTAGTA	AGTTTTCAAATTAAAGCTTATA	-	chr2L	11828513	-	chr2L	11828465	48	+	chr2L	11828465	+	chr2L	11828513
ACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACANAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	ACACAAACACAAACACAACACA	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907534	8214506	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907534
TGGACTTGGTCTGGTACTTCTTGTCTGGTTCTTTACCGTTTGGTTAAAGTTTT:1	TGGACTTGGTCTGGTACTTCTT	TTTACCGTTTGGTTAAAGTTTT	+	chr3L	4227045	+	chr3L	26022030	21794985	+	chr3L	4227045	+	chr3L	26022030
TTACTATCATTCACAGGACGATGGCTTAGTTCTGGGATACCCGGTTTTGGTCCTGAGTCCTGCTGCGCCTG:1	TTACTATCATTCACAGGACGAT	GTCCTGAGTCCTGCTGCGCCTG	+	chr3L	7033088	+	chr3L	7033182	94	+	chr3L	7033088	+	chr3L	7033182
AAAGTTTTCGGTATCCCCTATGCCCTTCCTCTTAGANCAACAGACTACAACCACAACTTTAAATCCCCAAGCCTG:1	AAAGTTTTCGGTATCCCCTATG	CAACTTTAAATCCCCAAGCCTG	+	chr3L	18154084	+	chr3L	18154168	84	+	chr3L	18154084	+	chr3L	18154168
AAAGAAAAACACCATTTGCCATGGATATGCTAATNGCAGG:1	AAAGAAAAACACCATTTGCCAT	CCATGGATATGCTAATNGCAGG	+	chr3R	19139872	+	chr3R	19136409	3463	+	chr3R	19139872	+	chr3R	19136409
GTATGAGTATCTTGATATACACACTTTGCTGTTAGGTGATTCTAGCACAATTTGTTCTGAAGTTTAAATACCATT:1	GTATGAGTATCTTGATATACAC	GTTCTGAAGTTTAAATACCATT	+	chr2R	17176382	+	chr2R	17182572	6190	+	chr2R	17176382	+	chr2R	17182572
TGAGACGTAATTAGAAGGAGCCAACTTGGTGAGCAGGATGGGAGGGGAATTGGCCACTTGAAATG:1	TGAGACGTAATTAGAAGGAGCC	GGGGAATTGGCCACTTGAAATG	+	chr3L	22577642	+	chr3L	22582420	4778	+	chr3L	22577642	+	chr3L	22582420
GTTTTATTATTTTATTATTTTTATTATTTTTATTATT:1	GTTTTATTATTTTATTATTTTT	TATTTTTATTATTTTTATTATT	-	chr2R	9367415	-	chr2R	3262650	6104765	+	chr2R	3262650	+	chr2R	9367415
TTAAACTTTCTTCCTGTTTTAGGATATTAGATATTAGATATTAGATAGTTAGTGAAAGCGATTAAGTTTGGGTTT:1	TTAAACTTTCTTCCTGTTTTAG	GAAAGCGATTAAGTTTGGGTTT	-	chr2L	15249709	-	chr2L	15249605	104	+	chr2L	15249605	+	chr2L	15249709
AACAGGGCAGTTCAGATTACGAGTACACCGCGAATCCTTCTTTCCAATCGTTTCAGTCAATTCCCTCTGTAGC:1	AACAGGGCAGTTCAGATTACGA	TTCAGTCAATTCCCTCTGTAGC	+	chr2R	24303913	+	chr2R	24303995	82	+	chr2R	24303913	+	chr2R	24303995
TGTCCATATAGGCGACAAGTACATATACATATATCTGTCCATATCCCCCAGTATAATATATATGTATATACAGCT:1	TGTCCATATAGGCGACAAGTAC	TAATATATATGTATATACAGCT	+	chrX	9638037	+	chrX	9638140	103	+	chrX	9638037	+	chrX	9638140
ATATATATTTTTGGGACACTTTTCAAGGTTCGAGGCACTTCATTGAACTCTCTTCTGTCGTCTTTCTTTCTT:1	ATATATATTTTTGGGACACTTT	TCTTCTGTCGTCTTTCTTTCTT	-	chr2L	19147397	-	chr2L	19147285	112	+	chr2L	19147285	+	chr2L	19147397
GACGAAACCGCCCGATGTGCGACTAACTAACTTTTAAAATTAAATACTTAAAAGCAAGCCCAGCAAGCCGAGAGC:1	GACGAAACCGCCCGATGTGCGA	GCAAGCCCAGCAAGCCGAGAGC	+	chr2R	10298929	+	chr2R	10735819	436890	+	chr2R	10298929	+	chr2R	10735819
ACTTTATATCTAAGCTAAAAACTAAGTATTTCATTATTCATTTAATTGTAAATATTATGCAAACCCAATCCCCTC:1	ACTTTATATCTAAGCTAAAAAC	ATTATGCAAACCCAATCCCCTC	+	chr2R	20337201	+	chr2R	20337290	89	+	chr2R	20337201	+	chr2R	20337290
TGAAATGCGGGACTTTCAAGTGAAATGATATTTCGTGTATTCCCAAACTACAGATTCCGTTGCCATTTCCCGCCT:1	TGAAATGCGGGACTTTCAAGTG	ATTCCGTTGCCATTTCCCGCCT	-	chrX	3994496	-	chrX	3986863	7633	+	chrX	3986863	+	chrX	3994496
GCTACCACCAATCTGGCANCACTGCAAAACCGATCTGAAAANATANTTTTACGCAAGTCTAACTGGCATTTAAAT:1	GCTACCACCAATCTGGCANCAC	CAAGTCTAACTGGCATTTAAAT	+	chrX	16371791	+	chrX	16371965	174	+	chrX	16371791	+	chrX	16371965
GCCACTATATAAAATTAATTTTAAAAGCAAGCAATCAAAATGCCCAGACATCCCACAACACAACACAACACAACA:1	GCCACTATATAAAATTAATTTT	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	25577184	+	chr3R	21907535	3669649	+	chr3R	25577184	+	chr3R	21907535
AATGCTCTCTGTTTTCCCTTTTCTACGTTCGCCTGCGTGTGTGTGTG:1	AATGCTCTCTGTTTTCCCTTTT	CGTTCGCCTGCGTGTGTGTGTG	-	chrX	5608931	-	chrX	19030979	13422048	+	chrX	19030979	+	chrX	5608931
AGAGAAACGACAAACGAGGACGAGCCAAGCTCGGGGCCTGAATGTGCGGTCGGCGCTGAGTTTCTGTA:1	AGAGAAACGACAAACGAGGACG	CGGTCGGCGCTGAGTTTCTGTA	+	chr3L	15333731	+	chr3L	11280942	4052789	+	chr3L	15333731	+	chr3L	11280942
GTGCGTGTTGGCCTGTTAATAAGCTGGCCAACTACTATATCGTATATACTCCTGGCCATTGTGGTGGCTAATGCG:1	GTGCGTGTTGGCCTGTTAATAA	GGCCATTGTGGTGGCTAATGCG	-	chr3R	28103451	-	chr3R	28103358	93	+	chr3R	28103358	+	chr3R	28103451
ATTATGGGAATTATTGTTTAAAGCTGATATCGTGGTATTATTATTCCTATCTTTTTTGACATGTTAACAAGATTT:1	ATTATGGGAATTATTGTTTAAA	TTTTGACATGTTAACAAGATTT	-	chr2R	16571972	-	chr2R	16571877	95	+	chr2R	16571877	+	chr2R	16571972
GGTGGGGAGTGGGAAAAGTGCCCGACAAGCTGATAAAATGTTGTCAACAGCTTGGGTTAAAGTTAAACGGGGTCA:1	GGTGGGGAGTGGGAAAAGTGCC	GGGTTAAAGTTAAACGGGGTCA	+	chr3L	21973188	+	chr3L	18788521	3184667	+	chr3L	21973188	+	chr3L	18788521
TTACATTTTATGACTACAACGAAATTGTATACACTTTCCCTTCGATTAGCTGCATAATGTGC:1	TTACATTTTATGACTACAACGA	TTCGATTAGCTGCATAATGTGC	+	chrX	14813767	+	chrX	14813832	65	+	chrX	14813767	+	chrX	14813832
ATTAATTTTTTATTATAAAACGAGTATATTTGGCTTGAGGGCGAACGTTTTCACTTCACATGTTCAAGTATTCTT:1	ATTAATTTTTTATTATAAAACG	CTTCACATGTTCAAGTATTCTT	+	chr3R	29009956	+	chr3R	29010062	106	+	chr3R	29009956	+	chr3R	29010062
TTTTAGCACGTAATTGACGTCCTTGCGATTCTTAATCAATTGGAAAAGTCTACAGGAAAATCAGCTGGTTTTCGG:1	TTTTAGCACGTAATTGACGTCC	AGGAAAATCAGCTGGTTTTCGG	-	chr2R	17561108	-	chr2R	19032678	1471570	+	chr2R	19032678	+	chr2R	17561108
AACAAGCCCAATTGGGTGAACAAAATCCCAAAACCTGGGATTAATTTATTTATTGCAATTGACCTGCCCAGCCAA:1	AACAAGCCCAATTGGGTGAACA	TGCAATTGACCTGCCCAGCCAA	+	chr3L	22544415	+	chr3L	22544492	77	+	chr3L	22544415	+	chr3L	22544492
GCCTGGGGAAAACCACTAGCACCTTCAAATTTGTGTGTGAGTGCGTGTGGGGGCATAACAAAAACGTGTTGATT:1	GCCTGGGGAAAACCACTAGCAC	GCATAACAAAAACGTGTTGATT	+	chrX	706802	+	chrX	707165	363	+	chrX	706802	+	chrX	707165
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAATGAACTACATATAATAGGCGG:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	ATGAACTACATATAATAGGCGG	+	chr3L	22908066	+	chr3L	1593193	21314873	+	chr3L	22908066	+	chr3L	1593193
ATTACAGGACTCTCTTTTAAGTGTGACTCATCGGNGGCATAGCGAAAGACAATCCTGACTTGTTGGACCCCATTA:1	ATTACAGGACTCTCTTTTAAGT	CCTGACTTGTTGGACCCCATTA	-	chrX	20671056	-	chrX	20670958	98	+	chrX	20670958	+	chrX	20671056
GATTGAACTTGATTTGAAAAACGAAGGCAGAAATGGAGTCATTTACTAAAATAATCCGTTGAATCGTACAGTA:1	GATTGAACTTGATTTGAAAAAC	TAATCCGTTGAATCGTACAGTA	-	chr2R	6493378	-	chr2R	6493484	106	+	chr2R	6493484	+	chr2R	6493378
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:3	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907536
TCTACTGCATTCCTTCAAGATTAATTTGATAAAGGTGACAAGAAATTTGTCAGCTCAAAATATTTGCCTGTTGCT:1	TCTACTGCATTCCTTCAAGATT	CTCAAAATATTTGCCTGTTGCT	-	chr2L	19304360	-	chr2L	19304258	102	+	chr2L	19304258	+	chr2L	19304360
GGCTTGCTGAATCCATTGGACACACCGCACCATCTCCGTCAACAGAGCACGCCGCTGGCAAAACGCCTGCAGCA:1	GGCTTGCTGAATCCATTGGACA	CGCTGGCAAAACGCCTGCAGCA	+	chr2R	10027448	+	chr2R	23836359	13808911	+	chr2R	10027448	+	chr2R	23836359
GCAACCCGAAAACTTTTGCTAATTTCTCTATAATTGGGGGCTGAAAACAAAAACCACCTGTGAGGGCTTTTCAA:1	GCAACCCGAAAACTTTTGCTAA	ACCACCTGTGAGGGCTTTTCAA	+	chr2L	12284057	+	chr2L	12284146	89	+	chr2L	12284057	+	chr2L	12284146
TAAAGGAATTCATTTTATTGGAGATATTAAATTTGATACCGTGGGTTCCGCTTAATAGTTTTTTTGCACTTAGA:1	TAAAGGAATTCATTTTATTGGA	TAATAGTTTTTTTGCACTTAGA	+	chr3R	16260842	+	chr3R	16260921	79	+	chr3R	16260842	+	chr3R	16260921
CCACATGAAAAATAATTGCTTTCTTGAGAACCATTTAGGAAGCACGTGCCGTTTTGTCGGCNAAAAGCGAATTCA:1	CCACATGAAAAATAATTGCTTT	TTGTCGGCNAAAAGCGAATTCA	-	chr3L	19901251	-	chr3L	3749620	16151631	+	chr3L	3749620	+	chr3L	19901251
GAAAATTATACAGTCAATTAGAGCTTGGGGTGTGGGTCCACTTACCTTCAGCATGTACTCCGGTGGCTCCGGCAC:1	GAAAATTATACAGTCAATTAGA	TGTACTCCGGTGGCTCCGGCAC	+	chr3R	27705392	+	chr3R	27705472	80	+	chr3R	27705392	+	chr3R	27705472
TGGGGAAAATGAACACTGGCAGTGGGGGGGGCAGGG:1	TGGGGAAAATGAACACTGGCAG	ACTGGCAGTGGGGGGGGCAGGG	+	chr3L	337507	+	chr3L	3633001	3295494	+	chr3L	337507	+	chr3L	3633001
GGGAACGGGGTCAGGACAACAGCTCCGCTCATACACTTACCTTGTTTATGCATACAAACGGGCAGTTATTCT:1	GGGAACGGGGTCAGGACAACAG	CATACAAACGGGCAGTTATTCT	+	chr2L	21939476	+	chr2L	13439628	8499848	+	chr2L	21939476	+	chr2L	13439628
TGCAGTTCGATGCCATGAAGTCGACTCAGGGTCTCTGCTGTTTGGTGACCTTATCTCTGGGGCCTGGAATTT:1	TGCAGTTCGATGCCATGAAGTC	TTATCTCTGGGGCCTGGAATTT	+	chr2L	12820837	+	chr2L	3570954	9249883	+	chr2L	12820837	+	chr2L	3570954
GAGCTTTTGCGTGTCTTTGAGGGATGGATGTCTCTATGGATGGTTGGATAGAGAGCAGGAGTCCTATGGGGGGGG:1	GAGCTTTTGCGTGTCTTTGAGG	AGCAGGAGTCCTATGGGGGGGG	+	chr3R	16193503	+	chr3R	16193640	137	+	chr3R	16193503	+	chr3R	16193640
AAAAAAAAACATGTCGTGTTGGAGCAAGAATTCTTATAAACAATAAATACTTTGCTAACTGATTACACCGACAGT:1	AAAAAAAAACATGTCGTGTTGG	GCTAACTGATTACACCGACAGT	-	chr2R	8203836	-	chr2R	8203745	91	+	chr2R	8203745	+	chr2R	8203836
GANTTCGGAAGCAATTTTGGCACCAAAGTGAACANCNATGAAGGCGGGAAAAAGCAGTAGTACTCCATAGTAG:1	GANTTCGGAAGCAATTTTGGCA	AAGCAGTAGTACTCCATAGTAG	+	chr3R	28571191	+	chr3R	28571283	92	+	chr3R	28571191	+	chr3R	28571283
GTTCTCAAAAATCATTAGATTCATTTGTATAGTACTTAGAAATTAGTAATAATTTATCTTAGAAGTTCTTT:1	GTTCTCAAAAATCATTAGATTC	TAATTTATCTTAGAAGTTCTTT	-	chr3R	21321604	-	chr3R	21321512	92	+	chr3R	21321512	+	chr3R	21321604
CACAGGATGCAGAGTATTTAGTATGTGTTGTATGCAACATCGTTCATTCTGATTGATTCATACTAAAAGATG:1	CACAGGATGCAGAGTATTTAGT	GATTGATTCATACTAAAAGATG	+	chr3L	933932	+	chr3L	934032	100	+	chr3L	933932	+	chr3L	934032
AAAACATTTTGCGGTTGAAGGCAGTTAGCCAAATAAANGTACAACNAGATAAACAAGCTGCTC:1	AAAACATTTTGCGGTTGAAGGC	CAACNAGATAAACAAGCTGCTC	+	chrX	4731834	+	chrX	4736915	5081	+	chrX	4731834	+	chrX	4736915
CGNGATCCAAAACAAAGCATCGTACATCAGTCGANGNCAAAAGGAAAGAGAGGGGTACTAAAACTTCCAGCCGAG:1	CGNGATCCAAAACAAAGCATCG	GGTACTAAAACTTCCAGCCGAG	-	chrX	5485369	-	chrX	5485293	76	+	chrX	5485293	+	chrX	5485369
TTGGGTTTTTTGGCGCAGAAAATAATGAGAAAATTTAAAAAGTTCAGNTCAAGACATTATNATTATTCCTGAGCA:1	TTGGGTTTTTTGGCGCAGAAAA	ACATTATNATTATTCCTGAGCA	-	chr3R	29332377	-	chr3R	29332300	77	+	chr3R	29332300	+	chr3R	29332377
GAAACGGAAAATCCACACAGACGTCTTAAGTTTCNGCTTTTCTTTTATGCCCGCACATGTGTGTGCTTGCAACTC:1	GAAACGGAAAATCCACACAGAC	CACATGTGTGTGCTTGCAACTC	-	chr3R	27148153	-	chr3R	27140543	7610	+	chr3R	27140543	+	chr3R	27148153
AATTTGAAAATACTCTTATAAAGTGCACTATTATGAATTATCTTTTGCTTTCTTTGCACTTCACACATTTCTT:1	AATTTGAAAATACTCTTATAAA	CTTTGCACTTCACACATTTCTT	+	chrX	4586120	+	chrX	4586481	361	+	chrX	4586120	+	chrX	4586481
CAAAGCAATTTTTTACCATAAACACCAGGGTGTTTTAGGCCAGANTTTTAGGCCTGAAATTGGATGAGTATAT:1	CAAAGCAATTTTTTACCATAAA	GCCTGAAATTGGATGAGTATAT	+	chr2L	18522081	+	chr2L	18522209	128	+	chr2L	18522081	+	chr2L	18522209
GTAGAAAGGTAGAAAGGGGGAGAAAAGCGTGGAAAAAGAGCGAAAAGCCAAAGCGGATTTCCATAAGCAGGCGG:1	GTAGAAAGGTAGAAAGGGGGAG	GCGGATTTCCATAAGCAGGCGG	+	chr2L	3577796	+	chr2L	12777994	9200198	+	chr2L	3577796	+	chr2L	12777994
CACACTCACACTCTTTGAAGGGGCATCGGACAACCGAAATCTGCGGGTGTGTGTGTGTTTGGCCGTANGGTTGA:1	CACACTCACACTCTTTGAAGGG	GTGTGTTTGGCCGTANGGTTGA	+	chrX	551423	+	chrX	558984	7561	+	chrX	551423	+	chrX	558984
ATTGGAAGACCGCCGTTGTTTTTTTGGATCAAACCA:1	ATTGGAAGACCGCCGTTGTTTT	GTTGTTTTTTTGGATCAAACCA	-	chr3R	20859268	-	chr3R	20854517	4751	+	chr3R	20854517	+	chr3R	20859268
ATAAAACGGGGCAATGGAAATATTTCTAATGTACAAAGTCTGTTGAGTGTGCTTAACTTGGCTTTGTTGTGCGTG:1	ATAAAACGGGGCAATGGAAATA	TAACTTGGCTTTGTTGTGCGTG	+	chrX	12168160	+	chrX	12173602	5442	+	chrX	12168160	+	chrX	12173602
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13693028	8214506	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907534
AACTCACCGGTTGAGTTGCATAGCATAGGCTATAGCTTTGNTGTTTTCCATTTAGTAACTGCCAC:1	AACTCACCGGTTGAGTTGCATA	TTTTCCATTTAGTAACTGCCAC	+	chr3R	28255985	+	chr3R	28256387	402	+	chr3R	28255985	+	chr3R	28256387
AGCACCTTTTAAGTGCCCCCCTTCCATCAACTGCCACAATTAGCCTTTTTGATTACCAATAAATACAATCAATGA:1	AGCACCTTTTAAGTGCCCCCCT	TACCAATAAATACAATCAATGA	-	chr2L	15000879	-	chr2L	15001005	126	+	chr2L	15001005	+	chr2L	15000879
TTTTGCTGTCCTGCTACTTTTGTAGTCTTAAATGGTGGGGACTGCGCTGCTATGTGATAGACACCCANCGGACTC:1	TTTTGCTGTCCTGCTACTTTTG	GTGATAGACACCCANCGGACTC	+	chr2R	552778	+	chr2R	553996	1218	+	chr2R	552778	+	chr2R	553996
ACCCACATTTGCATGGTATGGAATGGTGCATGGTGCATGGTATATGGCAATTACCAGCGTTATGACGTGGA:1	ACCCACATTTGCATGGTATGGA	ATTACCAGCGTTATGACGTGGA	+	chr3R	27541959	+	chr3R	27542036	77	+	chr3R	27541959	+	chr3R	27542036
TATAATTGTGATTTAACATATGCCTTAAAATTAAATAGTTAGATATTTCCGAAATATATGTAAATATGTATTACA:1	TATAATTGTGATTTAACATATG	ATATATGTAAATATGTATTACA	-	chr3L	12089178	-	chr3L	12089098	80	+	chr3L	12089098	+	chr3L	12089178
CGTGTGTTTTAAGCCCCGCAGTATACATATATGTCTATGATCATGATCTATATGTGCTCGGCGTAACAATTGCAT:1	CGTGTGTTTTAAGCCCCGCAGT	GTGCTCGGCGTAACAATTGCAT	-	chr3L	16621846	-	chr3L	16616518	5328	+	chr3L	16616518	+	chr3L	16621846
TTGGCTCCTCACGGCTCCGCTGTCCTTTTTCAGCGCCAGCTGTTACCAAATAANAATTTTTGGTGGCATC:1	TTGGCTCCTCACGGCTCCGCTG	AATAANAATTTTTGGTGGCATC	+	chrX	8371157	+	chrX	8371314	157	+	chrX	8371157	+	chrX	8371314
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGCGTTGTGCTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
AAAGTGCACTAANATTAGTATACGATGGCANTNCTATTNATCTGAACACAACTGTGCTGTCACTCATTGCGAA:1	AAAGTGCACTAANATTAGTATA	CTGTGCTGTCACTCATTGCGAA	+	chr3R	25239251	+	chr3R	25239360	109	+	chr3R	25239251	+	chr3R	25239360
TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGAGACAGAAAACAGTTACAGTTAC:1	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	GACAGAAAACAGTTACAGTTAC	+	chr2L	16217660	+	chr2L	9806144	6411516	+	chr2L	16217660	+	chr2L	9806144
ATCACTAGAAATGTGTATTTCTTTTGGCGTTTCAAACAAATTTTCTCAGGAAAAGATTCAAATAACACATAATTA:1	ATCACTAGAAATGTGTATTTCT	AGATTCAAATAACACATAATTA	+	chr2R	11467671	+	chr2R	17167367	5699696	+	chr2R	11467671	+	chr2R	17167367
GGAAAATTGACAGCACCGGCACACCAGCTGTCTTCAGTGACAAGCTGTCGTGAAATTGAAAGGGGAA:1	GGAAAATTGACAGCACCGGCAC	TGTCGTGAAATTGAAAGGGGAA	-	chr3R	15811743	-	chr3R	15811510	233	+	chr3R	15811510	+	chr3R	15811743
TGTGCGGCCGTCCCTCCAGTGTCATCACCATCGACTGCCGCCCGTCCTTGGCACCCACCACTGACCGACCCAGCC:1	TGTGCGGCCGTCCCTCCAGTGT	CCCACCACTGACCGACCCAGCC	-	chr2R	10266614	-	chr2R	10266523	91	+	chr2R	10266523	+	chr2R	10266614
GTATAATTATATATTTCTGAATAGAACTTCAGCTTCTATCAAAATATAACTTTATTCAGCCAAAAATAGTTTATT:1	GTATAATTATATATTTCTGAAT	ATTCAGCCAAAAATAGTTTATT	-	chr3R	6646649	-	chr3R	6646564	85	+	chr3R	6646564	+	chr3R	6646649
CATCTCCCAAAGACAGATCAATTCTCGAAGCATTCGCTAAGCTGGACTTCTCCCGTTGGGTTGTCAAGGAGGTGT:1	CATCTCCCAAAGACAGATCAAT	CGTTGGGTTGTCAAGGAGGTGT	+	chr2R	4656788	+	chr2R	4656892	104	+	chr2R	4656788	+	chr2R	4656892
AANTCCGATACGCTTAGAGCCGAAACCTGCGAAANGNGCGAACAAAATCCAAACAAAAGCGAGAGTTCCATCGA:1	AANTCCGATACGCTTAGAGCCG	ACAAAAGCGAGAGTTCCATCGA	+	chr2L	17000149	+	chr2L	17000270	121	+	chr2L	17000149	+	chr2L	17000270
ACCATGGCACCGCCGTTCTGATAATGACAATGGAGCACAAACCGGGTGGTTTTGGCCTTGGGCCTCCAAGTGGGG:1	ACCATGGCACCGCCGTTCTGAT	GGCCTTGGGCCTCCAAGTGGGG	+	chr2L	10102171	+	chr2L	10102262	91	+	chr2L	10102171	+	chr2L	10102262
GCTTCCAAAACCGCAGCACAGAAACAAAACACGAAATCGTTGGTAGCAATACCAATNGCAGTA:1	GCTTCCAAAACCGCAGCACAGA	GGTAGCAATACCAATNGCAGTA	-	chr3L	4342497	-	chr3L	4342430	67	+	chr3L	4342430	+	chr3L	4342497
TACAGCTTTGACTCCTCCATTCCCGTCTAGCTTCTTAGCCTAGTGAACGCATTGTCTAAGGCGGGAACTAAT:1	TACAGCTTTGACTCCTCCATTC	ATTGTCTAAGGCGGGAACTAAT	+	chr3R	29032753	+	chr3R	29032827	74	+	chr3R	29032753	+	chr3R	29032827
GCTAATAAATGCTTTTAATTATGATTTAAACATTTCGGCACATCAATCCGCCCCGAGGAGAATCACGAATTCTGA:1	GCTAATAAATGCTTTTAATTAT	CGAGGAGAATCACGAATTCTGA	-	chr3R	31418287	-	chr3R	31413087	5200	+	chr3R	31413087	+	chr3R	31418287
GCGGGAAAAGCTGAAAATAGGGGGGCGGCCAGTGGGCGGGGCAGGAGGTG:1	GCGGGAAAAGCTGAAAATAGGG	CCAGTGGGCGGGGCAGGAGGTG	-	chr2R	16398157	-	chr2R	17721544	1323387	+	chr2R	17721544	+	chr2R	16398157
TAATAGACTGTTTGTCGAGATCAGCGAGGAAGCATAGGATTTCTTGTTAGTCAAAACGAATTGTTCCGAAATTC:1	TAATAGACTGTTTGTCGAGATC	AAAACGAATTGTTCCGAAATTC	+	chr3R	30017934	+	chr3R	30012629	5305	+	chr3R	30017934	+	chr3R	30012629
AAATAAATAGTAATAAATGTGCTGGGAAATGCATTAATAGGCTAAGCAAATGCGCGCATTAATTATTCCATCNAC:1	AAATAAATAGTAATAAATGTGC	GCGCATTAATTATTCCATCNAC	-	chr2L	8731524	-	chr2L	8723147	8377	+	chr2L	8723147	+	chr2L	8731524
GTAAAACCTCATGACGAACACAAGAAGAAACTCAATTGGATATTATATATATATTATATCATAGACAGATTTAAT:1	GTAAAACCTCATGACGAACACA	TTATATCATAGACAGATTTAAT	+	chr3L	12034888	+	chr3L	12034965	77	+	chr3L	12034888	+	chr3L	12034965
TGACGAGAAAAAGTGTGGTTCATGTGTTACATGGTCATGTTTTTCATCTCTATTCTCGCTCTTTTGTGGCGTTAT:1	TGACGAGAAAAAGTGTGGTTCA	TCTCGCTCTTTTGTGGCGTTAT	+	chr3R	1443452	+	chr3R	1443528	76	+	chr3R	1443452	+	chr3R	1443528
ACAGGCAGCACTAACTTACTTACTATATAGACTATCATTCATGTTTCACGTGCTAATCGTGTAAGTGG:1	ACAGGCAGCACTAACTTACTTA	CACGTGCTAATCGTGTAAGTGG	+	chr2L	12487916	+	chr2L	12487990	74	+	chr2L	12487916	+	chr2L	12487990
AGAAGCATGCTACATATTTTACGAAATAACGTATACGTATTTCAGCCCAAAAGCAGTAAGCATTTTTTTTCGCCA:1	AGAAGCATGCTACATATTTTAC	CAGTAAGCATTTTTTTTCGCCA	-	chrX	21087186	-	chrX	21086157	1029	+	chrX	21086157	+	chrX	21087186
TTTTAAATTATAATACAAAGTTGTGTCAGAGAATATCTTATATATATNATATTCGTTGGTAATTTTNATAAGAAA:1	TTTTAAATTATAATACAAAGTT	CGTTGGTAATTTTNATAAGAAA	+	chr3R	21108048	+	chr3R	21108309	261	+	chr3R	21108048	+	chr3R	21108309
TTTTGTCGGTTTCAGCGCCTAGACTGGCGCTGGAGCTTTCTTCAGTGGTGCT:1	TTTTGTCGGTTTCAGCGCCTAG	TGGAGCTTTCTTCAGTGGTGCT	-	chrX	10035527	-	chrX	10035464	63	+	chrX	10035464	+	chrX	10035527
CGCCACTCATCGCCCATCATGTGGAGATCCGCTGATCAGGGCTTTGCATAACTACAAGAACATAAGA:1	CGCCACTCATCGCCCATCATGT	GCATAACTACAAGAACATAAGA	+	chr3R	25832704	+	chr3R	25841878	9174	+	chr3R	25832704	+	chr3R	25841878
TGACAGGGCTGTTCCATCTCACTCACTCATTTATCGTGACTTCACTGTACTAATCCTGGCTCTCTCC:1	TGACAGGGCTGTTCCATCTCAC	TGTACTAATCCTGGCTCTCTCC	+	chr2L	4028819	+	chr2L	12271553	8242734	+	chr2L	4028819	+	chr2L	12271553
CGAAAAGGTGCCACTGCCCATTCCCCATCCGGTCGCCGTTCAGGTGCCCAACGTCAAGTCCCAGACATGTTCACA:1	CGAAAAGGTGCCACTGCCCATT	TCAAGTCCCAGACATGTTCACA	+	chr2L	9656917	+	chr2L	11176345	1519428	+	chr2L	9656917	+	chr2L	11176345
AAAATAAGAGAACGAAGAAGTGAAGAGTGAAGAGGAGGGGCTCCGCAATTCACAGTAGCCCGGGAAGTTCAGAGA:1	AAAATAAGAGAACGAAGAAGTG	AGTAGCCCGGGAAGTTCAGAGA	-	chr2L	18002275	-	chr2L	18002112	163	+	chr2L	18002112	+	chr2L	18002275
TAAATAGTNATGCGTTATATACAAATACAAAATCTNCAATTATAGTCGGTTGTGCAATGCATTTTC:1	TAAATAGTNATGCGTTATATAC	GTCGGTTGTGCAATGCATTTTC	-	chr2R	8331346	-	chr2R	8330869	477	+	chr2R	8330869	+	chr2R	8331346
ACATGTATGGGGCATCGGACTGGGAGGGAACCATGCGGGCGTGACTAATTAGCCATGCGATGTTGGGGATG:1	ACATGTATGGGGCATCGGACTG	TAGCCATGCGATGTTGGGGATG	+	chr3L	1347176	+	chr3L	1347257	81	+	chr3L	1347176	+	chr3L	1347257
CACCACACGAAAGTGTGACACATTTCGGTCAAATCTTGTCGCCCACACTAATAAAATAGCTACATAGTTAATCCA:1	CACCACACGAAAGTGTGACACA	AAATAGCTACATAGTTAATCCA	+	chrX	16946519	+	chrX	22581095	5634576	+	chrX	16946519	+	chrX	22581095
TAACATAGATTGGGGTTTCACATGATTGCTGGTTTAACATTACTGTTGCAGGCCCGTAACATTGCCTGGAATGT:1	TAACATAGATTGGGGTTTCACA	CCCGTAACATTGCCTGGAATGT	+	chr2L	17327918	+	chr2L	17328003	85	+	chr2L	17327918	+	chr2L	17328003
TGAACATTTTTTAAATATTAATTACACTTGGGTATGAACTAAATTTTCTAATCTTGTTGCATACTTTTGTACACT:1	TGAACATTTTTTAAATATTAAT	TTGTTGCATACTTTTGTACACT	-	chr3R	29655754	-	chr3R	29655675	79	+	chr3R	29655675	+	chr3R	29655754
CAATTTGCGCACTATGTATTTCCTTGGAGCCGTTTCATTATATTCCACTGAATATTTTATGCATGACGA:1	CAATTTGCGCACTATGTATTTC	CTGAATATTTTATGCATGACGA	+	chr3R	10745439	+	chr3R	10745520	81	+	chr3R	10745439	+	chr3R	10745520
TTTTGTCGCCAAGACTAAGCCACCCGATAAAGTNAACAAAACCTCCAATTGG:1	TTTTGTCGCCAAGACTAAGCCA	AGTNAACAAAACCTCCAATTGG	+	chr3R	4069098	+	chr3R	4063862	5236	+	chr3R	4069098	+	chr3R	4063862
ATTACATAATAATTATATTCATTTTATATGCTTGCTTGTTTGTTTTAAATTAAATACACATTTTCAGTGAAATA:1	ATTACATAATAATTATATTCAT	AATACACATTTTCAGTGAAATA	+	chr3L	705923	+	chr3L	706018	95	+	chr3L	705923	+	chr3L	706018
ACGAGAAACATAACCAGCAAGCATAAACTATTTTATCGCCTCTGGCATTTATGGCCAGCGTTTAGCGCCGGCGTT:1	ACGAGAAACATAACCAGCAAGC	GCCAGCGTTTAGCGCCGGCGTT	-	chr2L	7113884	-	chr2L	7113660	224	+	chr2L	7113660	+	chr2L	7113884
TGGACGATGCTCATGCTACTCCTCCTCCTCCTCCNCCGCATCAGCTCACCGCATTGGCAATTAGTGATTGCTGTC:1	TGGACGATGCTCATGCTACTCC	TTGGCAATTAGTGATTGCTGTC	+	chr3R	22355614	+	chr3R	6506845	15848769	+	chr3R	22355614	+	chr3R	6506845
TATTGTATATGTTATCCAAGTACGCTTTAGTATTCATTTCGGTTAGAACTTTTTCGTTTTATCGCAGTGCATTG:1	TATTGTATATGTTATCCAAGTA	TTCGTTTTATCGCAGTGCATTG	-	chr3L	4209910	-	chr3L	4209833	77	+	chr3L	4209833	+	chr3L	4209910
AGTTCGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTCCTGGGCGTAATAGTTTTCAAATG:1	AGTTCGACTTATTTCCGATTTA	TGGGCGTAATAGTTTTCAAATG	-	chr3R	25828303	-	chr3R	25828548	245	+	chr3R	25828548	+	chr3R	25828303
CGTGTGTTATATCTAACTTTTTTAAGTGCATCAATCGCGATAATGTGGGCCTTTTCCCCACTGTCAGCA:1	CGTGTGTTATATCTAACTTTTT	GGCCTTTTCCCCACTGTCAGCA	-	chr3L	2674875	-	chr3L	2674800	75	+	chr3L	2674800	+	chr3L	2674875
AATGCTTGACAAAACTTTAAATTTCCAACTTAGGACATGGTGAAGACCCCTTACATTTTGCATACTGATAATGGG:1	AATGCTTGACAAAACTTTAAAT	CATTTTGCATACTGATAATGGG	-	chr3L	22169570	-	chr3L	22169477	93	+	chr3L	22169477	+	chr3L	22169570
TAATGGCCGACAAGAATTTTCTATTAGCGAGCAAAATTGCAGTTGCCATCGACAAGTCTTTTAGC:1	TAATGGCCGACAAGAATTTTCT	TGCCATCGACAAGTCTTTTAGC	-	chr3R	24199842	-	chr3R	24199772	70	+	chr3R	24199772	+	chr3R	24199842
AATGGCATAACCATTAGATCTCAGCGCTTGATTAACCCTTATTAGTACCCATTCAACACGTAATTACTCCACAAA:1	AATGGCATAACCATTAGATCTC	CAACACGTAATTACTCCACAAA	-	chr2L	8461595	-	chr2L	8452424	9171	+	chr2L	8452424	+	chr2L	8461595
GCTAAAATGTGAAAATGTATAACAAATATATTAGCATTGAACACATGATTAAATATGAAAACTATGCAACTG:1	GCTAAAATGTGAAAATGTATAA	AAATATGAAAACTATGCAACTG	-	chr2R	23190119	-	chr2R	23190042	77	+	chr2R	23190042	+	chr2R	23190119
TTCCTGAAATCCCATTCCCCTTCTACACACCATGCCACCATTTTTTTTTGCAGTGCCCTGCTGTGCTCTAGTC:1	TTCCTGAAATCCCATTCCCCTT	AGTGCCCTGCTGTGCTCTAGTC	+	chr2R	18727081	+	chr2R	18727252	171	+	chr2R	18727081	+	chr2R	18727252
AAAATGTATATTACTAACAATACCTGTGCTAAAAAGCAATATCTATATTCGCTTTTTTAATTATCGTAACGACAG:1	AAAATGTATATTACTAACAATA	TTTTTAATTATCGTAACGACAG	+	chr2L	10515365	+	chr2L	10515458	93	+	chr2L	10515365	+	chr2L	10515458
GTCACGGCAAGATTATTTGTTTGGTTGCAGTGCCACTTCAGGTAAATTATATTTTTAGGAAATCGACTTAAAAAT:1	GTCACGGCAAGATTATTTGTTT	TTTAGGAAATCGACTTAAAAAT	+	chr3R	6670593	+	chr3R	6670702	109	+	chr3R	6670593	+	chr3R	6670702
TAAACAATTCGATTTGGTCAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCCACAGAGGCAAGAAAA:1	TAAACAATTCGATTTGGTCAAG	AAAGCCCACAGAGGCAAGAAAA	-	chr2L	18244335	-	chr2L	18243703	632	+	chr2L	18243703	+	chr2L	18244335
CAAATGTANCTAATAAAACTCCACTCTTGCCATATNCCCAATATAAAGCCACTACTTAAGCGCACAAAACCGATC:1	CAAATGTANCTAATAAAACTCC	ACTTAAGCGCACAAAACCGATC	+	chr2L	7336896	+	chr2L	7336979	83	+	chr2L	7336896	+	chr2L	7336979
CTGGGCTCTGCTCATGAATGGGGGAGGGGGGCTTGTGATGGGGTGTTCCTG:1	CTGGGCTCTGCTCATGAATGGG	GGCTTGTGATGGGGTGTTCCTG	+	chr3L	13946489	+	chr3L	5704166	8242323	+	chr3L	13946489	+	chr3L	5704166
TAAAGTGCTCATTTATTGTGTTCAAAACAAAAAACAAAGAATATATCAGATTTGCTTACATTTTATTAAAACTTA:1	TAAAGTGCTCATTTATTGTGTT	GCTTACATTTTATTAAAACTTA	+	chr2L	10209861	+	chr2L	10209938	77	+	chr2L	10209861	+	chr2L	10209938
TCTTCACAAATTACTTATGTCTTGTAACACTGTTACACTGAAACACTGTTTAAAGGTGTATTAAAGTCACGATTC:1	TCTTCACAAATTACTTATGTCT	AGGTGTATTAAAGTCACGATTC	-	chr3L	15511387	-	chr3L	15511307	80	+	chr3L	15511307	+	chr3L	15511387
TTTCAGTTCCGACTTACTACCTTTTTTTATCTCGACGTACATGGCCAGCTTGACTATGCTAGGGATTCGGA:1	TTTCAGTTCCGACTTACTACCT	TTGACTATGCTAGGGATTCGGA	+	chr2L	20576234	+	chr2L	20583698	7464	+	chr2L	20576234	+	chr2L	20583698
CAGCAAAAGGATGTGTAAGATGATGATATTCAAACGAAGAAACCAAACAGAGACCCAAGACCCAAATCGAAT:1	CAGCAAAAGGATGTGTAAGATG	AGACCCAAGACCCAAATCGAAT	+	chr2R	11851951	+	chr2R	7061044	4790907	+	chr2R	11851951	+	chr2R	7061044
CAGCGATGGCCCTTTTCGTATTCGTATTCGTATTATTTTGCTTTATGCCTTACATATGTATGGTGTTGTTTTGCT:1	CAGCGATGGCCCTTTTCGTATT	ATATGTATGGTGTTGTTTTGCT	+	chrX	16455997	+	chrX	4438186	12017811	+	chrX	16455997	+	chrX	4438186
AATTTATATGTTTTAATTTTTTAAAATATCTTTTTGAACTCGTGGCCCAACCCACATTATGTCGTTCAAACTTT:1	AATTTATATGTTTTAATTTTTT	CACATTATGTCGTTCAAACTTT	-	chr3R	19445474	-	chr3R	19445291	183	+	chr3R	19445291	+	chr3R	19445474
AAAATGGCCCAACTTAGTCGAACAAGTCGGATATGTAGGAAACCCGAAACCCAATTATTTCTAATCAAGA:1	AAAATGGCCCAACTTAGTCGAA	ACCCAATTATTTCTAATCAAGA	-	chr2L	5633712	-	chr2L	5633631	81	+	chr2L	5633631	+	chr2L	5633712
TAATTAATAGATTTCCATGGTGCTAGAATATCATATTGTAAGCAGAAATATATTTTTTGAAGTTTTATTTAATCA:1	TAATTAATAGATTTCCATGGTG	TTTTTGAAGTTTTATTTAATCA	-	chr2L	5378511	-	chr2L	5378432	79	+	chr2L	5378432	+	chr2L	5378511
ATGAAAAGCAGGAATATTCTAGCTAGAGGCATTTCTGGTCTCCAGTTTTCCAAATTGGAGAGAGCATTTGCAGTT:1	ATGAAAAGCAGGAATATTCTAG	ATTGGAGAGAGCATTTGCAGTT	+	chr3R	20167798	+	chr3R	20167876	78	+	chr3R	20167798	+	chr3R	20167876
CTCAGGTTGTTTTTGGACNTTGCTTGTTTTTGCAAGCTGCACGCAGGGCTA:1	CTCAGGTTGTTTTTGGACNTTG	TTGCAAGCTGCACGCAGGGCTA	+	chr3R	28415755	+	chr3R	28415816	61	+	chr3R	28415755	+	chr3R	28415816
TTTTGTCCACTTTGATGTGTTTGCGCAGCCAATTCCTAGACGCTGCCCTGCAAATAATTTGGCATTTCAATTTTG:1	TTTTGTCCACTTTGATGTGTTT	ATAATTTGGCATTTCAATTTTG	-	chr3R	25236347	-	chr3R	25236208	139	+	chr3R	25236208	+	chr3R	25236347
CTGGCAACACCGGTGGAGAGCCATGCCAATCGCGTAGGCCTGGTAATCCAATCCGGAAACACCTGAAAAATCA:1	CTGGCAACACCGGTGGAGAGCC	TCCGGAAACACCTGAAAAATCA	+	chr3R	22619675	+	chr3R	12220975	10398700	+	chr3R	22619675	+	chr3R	12220975
AATATCTATTGTGAAAACAACATTTTAGGCCTCGACTATAGGTTCTATAAGGGTGCATTTACTTGACACCGAGGC:1	AATATCTATTGTGAAAACAACA	TGCATTTACTTGACACCGAGGC	+	chr2L	22011926	+	chr2L	22012007	81	+	chr2L	22011926	+	chr2L	22012007
AGCACATACTTGTGTGCAGTTACTATCGAGGCGACTTGGACAAGTTCCTCCTCTGGCGGAGTGGCCATATGCAA:1	AGCACATACTTGTGTGCAGTTA	CTGGCGGAGTGGCCATATGCAA	+	chr3R	28478432	+	chr3R	28478512	80	+	chr3R	28478432	+	chr3R	28478512
CGAACGGGAAAATATCTCAGCGAGTGCCTCTGGGCGCATAATCGAAAGTTCTTCAAAATGCATGTCNGCGGAA:1	CGAACGGGAAAATATCTCAGCG	TTCAAAATGCATGTCNGCGGAA	-	chr3R	7681489	-	chr3R	7680860	629	+	chr3R	7680860	+	chr3R	7681489
TGATCCGGCCTCTCTATTCTATCGCATTCTGCTAACTGCTATATCTGATATATAAACTGTTTTTAAAT:1	TGATCCGGCCTCTCTATTCTAT	GATATATAAACTGTTTTTAAAT	+	chr3R	30183230	+	chr3R	30183332	102	+	chr3R	30183230	+	chr3R	30183332
GCAAAGGGGGTGGGGAAGGTTGGTGGGCAAGTAGAATTGGGGACGTGAGCAGCAGATACATGCGAAGTGGTTGCG:1	GCAAAGGGGGTGGGGAAGGTTG	AGATACATGCGAAGTGGTTGCG	+	chr2R	20523044	+	chr2R	20523155	111	+	chr2R	20523044	+	chr2R	20523155
GATTTCGAATGGAATATTATTGGTAATTCAGACTGGTTAATGACTCACTTCCAATCAA:1	GATTTCGAATGGAATATTATTG	TTAATGACTCACTTCCAATCAA	-	chr3R	31069748	-	chr3R	31069670	78	+	chr3R	31069670	+	chr3R	31069748
GCTCCCCCCATGTTTCAAGCTCTGATAACTGATAACAGAGGGTCAGTTTTCATTACAATACTCGCAGGAAATCA:1	GCTCCCCCCATGTTTCAAGCTC	TTACAATACTCGCAGGAAATCA	+	chr3R	23626338	+	chr3R	23626436	98	+	chr3R	23626338	+	chr3R	23626436
AGCCAACAAAAAAGGAGCATGTCCTTCGTCCTGCGACCCAACTTACATTCGTCCTTTT:1	AGCCAACAAAAAAGGAGCATGT	CCCAACTTACATTCGTCCTTTT	+	chr2L	15852061	+	chr2L	15852128	67	+	chr2L	15852061	+	chr2L	15852128
TAGGTAAGCAAAGGCTCCACTGTGGGCTAAACAAACGATGGATGGAAAGCAAAATAAATATTGGTTTTT:1	TAGGTAAGCAAAGGCTCCACTG	AGCAAAATAAATATTGGTTTTT	-	chr3L	16971307	-	chr3L	16971235	72	+	chr3L	16971235	+	chr3L	16971307
GCATTTCTGATTAGAGAAACTGAAAATTTCCCCCGGTGTACAACTCTCAATGNAGGTCTGCTGATTCCAGCACCT:1	GCATTTCTGATTAGAGAAACTG	AGGTCTGCTGATTCCAGCACCT	-	chr3L	9084507	-	chr3L	9076947	7560	+	chr3L	9076947	+	chr3L	9084507
CCAAAAANGTATGCTACGCTTTGTGGTTCCCACGCCGCGNGCAATATGATAAATAGANTGTGCAGCTGTTGTTG:1	CCAAAAANGTATGCTACGCTTT	ATAGANTGTGCAGCTGTTGTTG	-	chr3R	29407912	-	chr3R	29406627	1285	+	chr3R	29406627	+	chr3R	29407912
CCTTCGATCGGGAATGCANCAAGGATATCACCTTCGATGTGNATGNCCAGAAAGTCGAGGGCAAGAAGGGCGA:1	CCTTCGATCGGGAATGCANCAA	AAGTCGAGGGCAAGAAGGGCGA	-	chr3R	12396838	-	chr3R	12403806	6968	+	chr3R	12403806	+	chr3R	12396838
GTTTGGGTTTTTCGCCCCGCGAGACAGCTCAATCCTCTTGGACTCATTTGCGAATG:1	GTTTGGGTTTTTCGCCCCGCGA	CTCTTGGACTCATTTGCGAATG	-	chr3R	15565943	-	chr3R	22214681	6648738	+	chr3R	22214681	+	chr3R	15565943
GAATGTTAATCTTTCACAATAATGAAATGCGCAATATAATTGTGAAAAATTGACAACCGAATCGTNAATGTCAA:1	GAATGTTAATCTTTCACAATAA	ACAACCGAATCGTNAATGTCAA	-	chr3R	23162010	-	chr3R	23161914	96	+	chr3R	23161914	+	chr3R	23162010
CTTTGTGAATTGATACAAATCGTTCAAGCCTTTTTATTTATGCTAATTTCCGGGGACCCTTTGAGTACAGCAGC:1	CTTTGTGAATTGATACAAATCG	GGGACCCTTTGAGTACAGCAGC	+	chrX	864749	+	chrX	11012275	10147526	+	chrX	864749	+	chrX	11012275
AGCTACTTGAATATCTCGCTTAATTGAAATCCCTTTCTGCCTTTCTGAAATGAAAAATTTGGAATTTCTCTG:1	AGCTACTTGAATATCTCGCTTA	TGAAAAATTTGGAATTTCTCTG	-	chr3R	19101925	-	chr3R	19101817	108	+	chr3R	19101817	+	chr3R	19101925
TGTAAGAGCAGCCTTGCAGCTTTGTGGGCGGAAGGAGTTGGTAAACAGGATCCTAGCGGAAGCAATACACG:1	TGTAAGAGCAGCCTTGCAGCTT	ATCCTAGCGGAAGCAATACACG	+	chr3R	19473438	+	chr3R	30632086	11158648	+	chr3R	19473438	+	chr3R	30632086
CCATTGGCTACAAAAAGTNTGGCAAGACTCTTCCCCCGATCGANATATANATGTATATACGTAGACATACGACA:1	CCATTGGCTACAAAAAGTNTGG	GTATATACGTAGACATACGACA	+	chr2R	11415522	+	chr2R	11418670	3148	+	chr2R	11415522	+	chr2R	11418670
AGGAAACACATTTAATATCTACGCATAAAAATAAAAGTCTGGCAGCCGTACAGCTCAAGGAGACAGAACCGTG:1	AGGAAACACATTTAATATCTAC	AGCTCAAGGAGACAGAACCGTG	-	chr3R	11512586	-	chr3R	28836896	17324310	+	chr3R	28836896	+	chr3R	11512586
AAGCTGAGCCCGAAGTAAAGGCTCCTGGTCAATTATGCCAAAAATCGCAAGTAAATGTNTCTTACA:1	AAGCTGAGCCCGAAGTAAAGGC	TCGCAAGTAAATGTNTCTTACA	+	chr2L	5693227	+	chr2L	5692167	1060	+	chr2L	5693227	+	chr2L	5692167
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTCGTGTTCGTGTTTGTGTTTGTTTTTGTGTT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTTTGTGTTTGTTTTTGTGTT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	26659337	4751803	+	chr3R	26659337	+	chr3R	21907534
AGATGGATCGGGACTTCCTAAGATCTCCAAATAAATCGCTATATAAAGATACCAAAAACACGCATCGCGACATTT:1	AGATGGATCGGGACTTCCTAAG	AAAAACACGCATCGCGACATTT	+	chr3R	27215171	+	chr3R	27215247	76	+	chr3R	27215171	+	chr3R	27215247
TGTGGAAAAGACTGGATTTAAGGATGTGCAGAACTAACTCTTATCCTCCGACGGCCACTCCATGTAATTCTTAAA:1	TGTGGAAAAGACTGGATTTAAG	GCCACTCCATGTAATTCTTAAA	-	chr3R	29386697	-	chr3R	29386615	82	+	chr3R	29386615	+	chr3R	29386697
ATTGCAGTTCAGTCTTAATTTGAGAGATTTTCTCTCTAGAATCTCTCGGCTGAAAATCTCCTCATTTGTGCT:1	ATTGCAGTTCAGTCTTAATTTG	TGAAAATCTCCTCATTTGTGCT	-	chr3L	15335029	-	chr3L	3825416	11509613	+	chr3L	3825416	+	chr3L	15335029
GAAAATCATAAAGCATCGCTGATTAGCATTTGTGGTCTGGTTTTCAGCTNTTGGGCTCTCGAGTCTTGGCTGG:1	GAAAATCATAAAGCATCGCTGA	TGGGCTCTCGAGTCTTGGCTGG	+	chr3R	27470064	+	chr3R	27470724	660	+	chr3R	27470064	+	chr3R	27470724
CAGACCAATGCTTAGACTGTACATATGAACATATGTATTGCATTCCTTGTAGACTATTTGCTCTATAAGTAGTTA:1	CAGACCAATGCTTAGACTGTAC	CTATTTGCTCTATAAGTAGTTA	+	chr3R	12748990	+	chr3R	12749083	93	+	chr3R	12748990	+	chr3R	12749083
GCTGCACTGGGAAAAAAAAAGGGAATAAGGCATGCAATTTTTCCTCAGCNTTAAAGCATGGAATTCTCTTTAAAA:1	GCTGCACTGGGAAAAAAAAAGG	AAGCATGGAATTCTCTTTAAAA	+	chr3L	2481596	+	chr3L	2615858	134262	+	chr3L	2481596	+	chr3L	2615858
GACATAAAAATAGACACGAAGTACTGAAACAATAACTCGAGGCGGCGAGAAGGTATCGAGGGGACTCCCCATCG:1	GACATAAAAATAGACACGAAGT	GTATCGAGGGGACTCCCCATCG	+	chr3R	7814503	+	chr3R	19761704	11947201	+	chr3R	7814503	+	chr3R	19761704
CTTCAACCNACATTTTCGTTTCCTCACACAAACCAACAGCAGCAACAAGTAAAAATACTCTTTGAAACAATTATA:1	CTTCAACCNACATTTTCGTTTC	AATACTCTTTGAAACAATTATA	+	chr3L	10874587	+	chr3L	20755213	9880626	+	chr3L	10874587	+	chr3L	20755213
AAAAAATGTATGTATGTATATATGAAAAAAGTGGGAAGTGTCGCAGCATGAGATTAATTACAAAATCCATTGC:1	AAAAAATGTATGTATGTATATA	GATTAATTACAAAATCCATTGC	+	chrX	22857451	+	chrX	16243409	6614042	+	chrX	22857451	+	chrX	16243409
AATCTGTGAGGGATCCCCGGTAACGGATTGCGTGTTGATTGTTTTGAATAAATTTCAACTTCAAAGATGGTTTCC:1	AATCTGTGAGGGATCCCCGGTA	TTCAACTTCAAAGATGGTTTCC	-	chr2R	15133586	-	chr2R	15133507	79	+	chr2R	15133507	+	chr2R	15133586
ATAACTCATACGATTTATTGCTTCTAATGTTAATGATGTTTGAATGTTTGCCATACAGACTAAAAAAAGCAAGAC:1	ATAACTCATACGATTTATTGCT	TACAGACTAAAAAAAGCAAGAC	-	chr3L	9390992	-	chr3L	9390862	130	+	chr3L	9390862	+	chr3L	9390992
TCCCTCCCNTGGTATATTTGTACACGTGAACACGCAGAGATTTACTCGTTTGGTTTGTGTTTTTAAAAGGCCAA:1	TCCCTCCCNTGGTATATTTGTA	GTTTGTGTTTTTAAAAGGCCAA	+	chr3R	28068495	+	chr3R	28073936	5441	+	chr3R	28068495	+	chr3R	28073936
AAATTTAAAAAAATTCTAAAATTCTTAGTGTAACTTATATG:1	AAATTTAAAAAAATTCTAAAAT	AATTCTTAGTGTAACTTATATG	-	chr3L	14397328	-	chr3L	20907142	6509814	+	chr3L	20907142	+	chr3L	14397328
TGTGTGTGTGTGTTTTCGTGTGTGTTACTAAATTAATCGGCAGAGGATTCGCTTGCTG:1	TGTGTGTGTGTGTTTTCGTGTG	TCGGCAGAGGATTCGCTTGCTG	-	chr3L	7911703	-	chr3L	6485842	1425861	+	chr3L	6485842	+	chr3L	7911703
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACGCAAC:1	CAACACAACACAACACAACACA	ACACAACACAACGCAACGCAAC	-	chr2L	16217660	-	chr2L	9084340	7133320	+	chr2L	9084340	+	chr2L	16217660
AGGAAGTGGCCTCGGGGATTGGGACATGAGCAACTCCGCATCGTCATCATCAGCGGCCTCAAAGGAAGCACTCA:1	AGGAAGTGGCCTCGGGGATTGG	GCGGCCTCAAAGGAAGCACTCA	+	chr3L	3565957	+	chr3L	3566032	75	+	chr3L	3565957	+	chr3L	3566032
ATAATACCTCTAAGCTATACTAAAAGTGAACCACGCGTCGAGAAACCTGGGCGACTATTTAGTTGGGTTCGTCGG:1	ATAATACCTCTAAGCTATACTA	ACTATTTAGTTGGGTTCGTCGG	+	chrX	10885733	+	chrX	10885852	119	+	chrX	10885733	+	chrX	10885852
CGTTTAATGTCTGTTTTTTTTTTGTGGTTTTT:1	CGTTTAATGTCTGTTTTTTTTT	CTGTTTTTTTTTTGTGGTTTTT	-	chr2L	16524593	-	chr2L	8115957	8408636	+	chr2L	8115957	+	chr2L	16524593
ACTCCGCATACCACTTTTCTCGGANTTCAGCCAAGAAGAAGANGTNGGCTANGAANAAGAACAAGAAGATGGCGA:1	ACTCCGCATACCACTTTTCTCG	AANAAGAACAAGAAGATGGCGA	+	chr2R	24727883	+	chr2R	24735391	7508	+	chr2R	24727883	+	chr2R	24735391
TGTTCTATTTCGCTTGCTGAATTGCTAAACATTTGAAGTAAGTGTCCTTATTATGACCCACCTATATAGCCATTA:1	TGTTCTATTTCGCTTGCTGAAT	TGACCCACCTATATAGCCATTA	+	chr3L	14592854	+	chr3L	18418665	3825811	+	chr3L	14592854	+	chr3L	18418665
TGGTAAAAACTTTAATTGNTTTGGCCGCTGATAAATTTACTTTNACTAANTGATGGCTTAAATGAGTCGTGCCTG:1	TGGTAAAAACTTTAATTGNTTT	TGGCTTAAATGAGTCGTGCCTG	-	chr3L	5225915	-	chr3L	5225584	331	+	chr3L	5225584	+	chr3L	5225915
TTGAGGAAATACCTCAAATTAAACTTAGATGCAACTTATTGAACGNCAAAATGCATTAGGCNGATACCTGT:1	TTGAGGAAATACCTCAAATTAA	AATGCATTAGGCNGATACCTGT	-	chr3L	15260094	-	chr3L	15259104	990	+	chr3L	15259104	+	chr3L	15260094
CGAAAACCTTGATGAATTTTGAATACGAAAAACANCGTGCGGACGTGTGGACGTGCGAGTACTCTACCTAATCCA:1	CGAAAACCTTGATGAATTTTGA	TGCGAGTACTCTACCTAATCCA	+	chr2L	21196182	+	chr2L	21196308	126	+	chr2L	21196182	+	chr2L	21196308
ATTGAGAGTAGTTTTTGATGCTTCNGCACAGATTCACGGCNTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATATGNTGCA:1	ATTGAGAGTAGTTTTTGATGCT	CTCCGAAAAAGCATATGNTGCA	+	chr3R	19445247	+	chr3R	19446144	897	+	chr3R	19445247	+	chr3R	19446144
ATGACCAGTTGAAAAGTTAGCACTAGTTATGGGCATATTTTCACTGATTTACTGTTGAGTAATTAGTTTGAAATC:1	ATGACCAGTTGAAAAGTTAGCA	GTTGAGTAATTAGTTTGAAATC	-	chr2L	3108973	-	chr2L	3108896	77	+	chr2L	3108896	+	chr2L	3108973
CGGGGAGGCAATTGTAAAANGGTCAGACCATGAGCTAAGCCATTAGTCGGCGCGGAGTTGTGGCCCAAATATAGG:1	CGGGGAGGCAATTGTAAAANGG	GGAGTTGTGGCCCAAATATAGG	+	chr2L	14773170	+	chr2L	20477394	5704224	+	chr2L	14773170	+	chr2L	20477394
AGCGCCGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAGAGATGCAGAAAAGCCTGCGCG:1	AGCGCCGGCTTGTGGAACACAT	GAGATGCAGAAAAGCCTGCGCG	+	chr2R	12190115	+	chr2R	12187499	2616	+	chr2R	12190115	+	chr2R	12187499
GTATACGTATTATTGTGTTGACATTTTCGGCATGGTCAGGNGGGGAGTACAGTTT:1	GTATACGTATTATTGTGTTGAC	GGTCAGGNGGGGAGTACAGTTT	-	chr3L	5916014	-	chr3L	10763065	4847051	+	chr3L	10763065	+	chr3L	5916014
TAATAAGATATCGATTTTTCTGATTTAGCCTAGTGGAACAAGATGCTAACAACGGCAGACACACAAA:1	TAATAAGATATCGATTTTTCTG	CTAACAACGGCAGACACACAAA	+	chr2R	17260580	+	chr2R	17260759	179	+	chr2R	17260580	+	chr2R	17260759
AAAAGAACAGCGAAGAAGACGACTTGGATATATTCCTAAAAACAAAATATAGAAACATCCCGCCATTACTCTTTT:1	AAAAGAACAGCGAAGAAGACGA	AACATCCCGCCATTACTCTTTT	+	chr2L	22700810	+	chr2L	12653895	10046915	+	chr2L	22700810	+	chr2L	12653895
AAATCAGNTTACCCCACATGAGCCATCTCAAGATGAAGCNAGTGTTTATCCATATGCNCAGGAAAACTCGGCACG:1	AAATCAGNTTACCCCACATGAG	ATGCNCAGGAAAACTCGGCACG	-	chr3R	8613720	-	chr3R	8613613	107	+	chr3R	8613613	+	chr3R	8613720
GACATTTGCCATGAACTTAATGTTCGTAGATCAGAGTTCACAAGAGGGTCTCAGAACTCGAGGACAGACCTTACA:1	GACATTTGCCATGAACTTAATG	GAACTCGAGGACAGACCTTACA	+	chr2L	4166405	+	chr2L	4166488	83	+	chr2L	4166405	+	chr2L	4166488
GTTGAGCCTCATGCAGTTCTGCCGTTTCTACCATTTCGCAGCNTCGGGAAGGGCATTAAACTAGCAGCTCGGCG:1	GTTGAGCCTCATGCAGTTCTGC	GCATTAAACTAGCAGCTCGGCG	-	chr3R	31940932	-	chr3R	12777829	19163103	+	chr3R	12777829	+	chr3R	31940932
CGTCATTTACGCGTCGTTTTTTGGTGTGCTAGCCGCCGAATCATGTGTTAATTTTTTAATAGCATTTCATAAATA:1	CGTCATTTACGCGTCGTTTTTT	TTTTAATAGCATTTCATAAATA	-	chr3R	18781776	-	chr3R	18781700	76	+	chr3R	18781700	+	chr3R	18781776
GGCTTACTTTCGATTCGAGATCCTTTAATATGTTTTTTGGGGAGGCTTCACACGATGCCAAAATAGTTGGTGTCT:1	GGCTTACTTTCGATTCGAGATC	GATGCCAAAATAGTTGGTGTCT	-	chr3L	14981399	-	chr3L	7892466	7088933	+	chr3L	7892466	+	chr3L	14981399
GCCTTTGTTTGCCCAACCAAATGCCTGTGTGGAAGCGGCGAAGAAACCCAATGCCGATGCACGTTCNATGGCTGC:1	GCCTTTGTTTGCCCAACCAAAT	CCGATGCACGTTCNATGGCTGC	-	chrX	16690537	-	chrX	16690458	79	+	chrX	16690458	+	chrX	16690537
ATATTCAAACTTTAAATTGAATTTACTTTAGTAGTGTAGAAAAGTTCTTGAGTTGATTAAAATTAAACTTATATT:1	ATATTCAAACTTTAAATTGAAT	TGATTAAAATTAAACTTATATT	+	chr3L	9639046	+	chr3L	9639131	85	+	chr3L	9639046	+	chr3L	9639131
AACGTTAANTAATTTAATATTAATTTAAGGTATTACTNNNNCTAAAGTCTTATCTTATGCCNCACCTGCTGTTTG:1	AACGTTAANTAATTTAATATTA	CTTATGCCNCACCTGCTGTTTG	+	chr2R	24383831	+	chr2R	24383912	81	+	chr2R	24383831	+	chr2R	24383912
CAAAGGCAGCAAAACCACAAAACTGTGTCCCAGAAGAAGAACCTTTTCAAGTGACCCAG:1	CAAAGGCAGCAAAACCACAAAA	AGAACCTTTTCAAGTGACCCAG	-	chr2L	15031801	-	chr2L	15031577	224	+	chr2L	15031577	+	chr2L	15031801
CCGCCGGTTATGCTCATTTAAATTGCCNCANNATGCTATGCTAATGCAGNCNTGTAGTTTTTCATTATATTTAC:1	CCGCCGGTTATGCTCATTTAAA	TGTAGTTTTTCATTATATTTAC	-	chr2R	13249678	-	chr2R	13249590	88	+	chr2R	13249590	+	chr2R	13249678
AATTACTTTTGATTAATGAAGCACACGGGCTAAGGTCGA:1	AATTACTTTTGATTAATGAAGC	GAAGCACACGGGCTAAGGTCGA	-	chr3R	25689236	-	chr3R	25689164	72	+	chr3R	25689164	+	chr3R	25689236
CTCTAAGACATTCATATGTTTTTCGTTACAATTTGATATCATGAAAGAGTGACTTTTAAAGTTACCTTCAGAGTA:1	CTCTAAGACATTCATATGTTTT	TTTTAAAGTTACCTTCAGAGTA	-	chr3L	10518744	-	chr3L	10518609	135	+	chr3L	10518609	+	chr3L	10518744
CTGTTATAAATTCCGTCGAATCCTGAAGCTTTAATGGAGTCAGAATTACGTGGCGAAAGGAGGTATGGAATGAAG:1	CTGTTATAAATTCCGTCGAATC	CGAAAGGAGGTATGGAATGAAG	+	chr2R	5639656	+	chr2R	1880785	3758871	+	chr2R	5639656	+	chr2R	1880785
AAAATTGGTCCAAAGCAAGAATTAATTTTCCAAACAATTAAATCCGAACTGTCCAACGTTGTTGGCCAATTTGGG:1	AAAATTGGTCCAAAGCAAGAAT	CAACGTTGTTGGCCAATTTGGG	-	chr2R	22579714	-	chr2R	22579628	86	+	chr2R	22579628	+	chr2R	22579714
TCGCCGTTTGAAGTGCGAAATGCGTAGCACATGCATGCGCTCGATGAGCTCATCGCCTAGGATAGATCTTTCCAC:1	TCGCCGTTTGAAGTGCGAAATG	CGCCTAGGATAGATCTTTCCAC	-	chr3R	19860078	-	chr3R	19859997	81	+	chr3R	19859997	+	chr3R	19860078
GTACAAACACAGATCTTAAGCCAGATAAACTACTACTAACAGTAGCCATGCGATATGACCAATAATTGATAATG:1	GTACAAACACAGATCTTAAGCC	ATATGACCAATAATTGATAATG	+	chr3R	29256274	+	chr3R	29256353	79	+	chr3R	29256274	+	chr3R	29256353
TCTCCCAGATTAATACGGATATAGAAATGGTCGGGATCAGTTCGTGTGCACTTA:1	TCTCCCAGATTAATACGGATAT	GGGATCAGTTCGTGTGCACTTA	+	chr2R	21944502	+	chr2R	9582517	12361985	+	chr2R	21944502	+	chr2R	9582517
AGCCCATAATGAGCAATCCATCTGCGGCAACACCCGCACGTAGTTTAGTNAAACAGCAGTCAGTTACTCCTGAC:1	AGCCCATAATGAGCAATCCATC	ACAGCAGTCAGTTACTCCTGAC	-	chrX	17782687	-	chrX	17782599	88	+	chrX	17782599	+	chrX	17782687
TACATGTGTTCTTAGAAATGCGAGTATGCCTTTACATACAAGTGTATTGCATTTTTTCCTGTGTACCGTGAACT:1	TACATGTGTTCTTAGAAATGCG	TTTTTCCTGTGTACCGTGAACT	+	chrX	13943284	+	chrX	13943374	90	+	chrX	13943284	+	chrX	13943374
ACGTGGCATATATGCCCCATATGCTGCCCCAAGATCGGTTTCGCATTTATGCGGAGTGGAAATTCCCNGCGAG:1	ACGTGGCATATATGCCCCATAT	CGGAGTGGAAATTCCCNGCGAG	+	chrX	20331958	+	chrX	20332052	94	+	chrX	20331958	+	chrX	20332052
GACATTCGGGACTGCGGCAAGGACACATACATATATATCGCCAGCGCTCATTTTGGCACCCTCAAACGTGGAAA:1	GACATTCGGGACTGCGGCAAGG	TTGGCACCCTCAAACGTGGAAA	+	chr2L	11680331	+	chr2L	11680449	118	+	chr2L	11680331	+	chr2L	11680449
AATGAAATGTGTCTACTCATTTCAAATTGTTTCACAGCGAAGCTCAATCCTATTATTAAATCGACGTTTTATTTT:1	AATGAAATGTGTCTACTCATTT	TATTAAATCGACGTTTTATTTT	-	chr3R	6656142	-	chr3R	6655823	319	+	chr3R	6655823	+	chr3R	6656142
CCCTATATATACATTCCCNTTTCAGATTCGTTCGTCCGCCTGACTTACTAAAGTCAAACCAAAGTGATTGTGNAA:1	CCCTATATATACATTCCCNTTT	TCAAACCAAAGTGATTGTGNAA	-	chr3L	20148374	-	chr3L	20148284	90	+	chr3L	20148284	+	chr3L	20148374
AGACCAACTAATCACCGTTGACAGCAGGGCGAATGAAACACACACTGAACTGGACGCGGGGAGGGGTGTTGAAT:1	AGACCAACTAATCACCGTTGAC	GACGCGGGGAGGGGTGTTGAAT	+	chr3R	15157925	+	chr3R	14426611	731314	+	chr3R	15157925	+	chr3R	14426611
ATGCTGCAGTTGCTGAGGGGTAAACCATAGAAACCACGAATGGCATTTACAAAGAAGATAAACTAATAGACTTA:1	ATGCTGCAGTTGCTGAGGGGTA	AGAAGATAAACTAATAGACTTA	-	chr3L	21082298	-	chr3L	21082221	77	+	chr3L	21082221	+	chr3L	21082298
TTGGTGTGGCCACAGTGGGCGGGTGAGTATTTCANATTTGCTTCTAAATAGAAACCTCATTCTAAACTAAATTAA:1	TTGGTGTGGCCACAGTGGGCGG	ACCTCATTCTAAACTAAATTAA	+	chrX	5345409	+	chrX	5345520	111	+	chrX	5345409	+	chrX	5345520
GGTTGCTGCTGTTGCTGCTGCAGCCCACAATGATGTGTGGNTTGGGTCTGCTGTTTTTGAAAAGAAGTNTCGG:1	GGTTGCTGCTGTTGCTGCTGCA	TGTTTTTGAAAAGAAGTNTCGG	-	chr2L	2367864	-	chr2L	1673394	694470	+	chr2L	1673394	+	chr2L	2367864
AAGTGCAATGGTTACAGTTTCACGATTTTAACTGGCTTGAAATGTGTTGCTAAAAATTAAATGTTGTTTGAAATC:1	AAGTGCAATGGTTACAGTTTCA	AAATTAAATGTTGTTTGAAATC	+	chr3R	19490450	+	chr3R	19490539	89	+	chr3R	19490450	+	chr3R	19490539
TGTGAATATGGCTTCCAAAACCGCAGCACAGAAACAAAAAACGAAATCGTTGGTAGCAATAC:1	TGTGAATATGGCTTCCAAAACC	ACGAAATCGTTGGTAGCAATAC	-	chr3L	4342507	-	chr3L	4342441	66	+	chr3L	4342441	+	chr3L	4342507
TCTTTTTTTTTGTTTTTGGGTTTTGCAGCAACGAGGAGGCTGCACTTGAAGCGAAAATAGAAAAGCGCTATTCA:1	TCTTTTTTTTTGTTTTTGGGTT	GAAAATAGAAAAGCGCTATTCA	-	chr3L	13703854	-	chr3L	2429056	11274798	+	chr3L	2429056	+	chr3L	13703854
ACACATATATGTTTTACATTTATAAATCACATTGCAATTTTCAACTTGCATGTTTCGATTTAAGCCACTGTGCCT:1	ACACATATATGTTTTACATTTA	TTCGATTTAAGCCACTGTGCCT	+	chr3L	10003168	+	chr3L	10003265	97	+	chr3L	10003168	+	chr3L	10003265
TCTTAATTTAAATGTAATATTTGATTACTATACAACTATCAAATGAATAACCCATCAATAATTATAANTAGCCTG:1	TCTTAATTTAAATGTAATATTT	ATCAATAATTATAANTAGCCTG	-	chr3L	1455055	-	chr3L	1454971	84	+	chr3L	1454971	+	chr3L	1455055
AGACTCCCGACCGTTGTCAGCACTTGTGAGCTGAAACACAGCAAGATGTTTTGTGCTGGTATGCGACAGCA:1	AGACTCCCGACCGTTGTCAGCA	TTTGTGCTGGTATGCGACAGCA	-	chr3R	20870348	-	chr3R	20870267	81	+	chr3R	20870267	+	chr3R	20870348
CATCTGTCATAGGTACGTNAAAACCTATTAATTTCCTAAGGNCATNTTTTTCGTAGTTTCAGTACTTTTTCATTG:1	CATCTGTCATAGGTACGTNAAA	TAGTTTCAGTACTTTTTCATTG	-	chr3R	4489408	-	chr3R	18007501	13518093	+	chr3R	18007501	+	chr3R	4489408
AAATGAATTATAGTAACCAAAGCAATGAAAGTTGNGAGCCTGGACCCAATACTCCAGCTGCCCGGAACCCCCGAA:1	AAATGAATTATAGTAACCAAAG	CCAGCTGCCCGGAACCCCCGAA	+	chr3L	18682856	+	chr3L	18682656	200	+	chr3L	18682856	+	chr3L	18682656
AATAAAAAGAAAAAAAAGTTGACTTACCCTCGCACTCATTGGGCACACAGGCG:1	AATAAAAAGAAAAAAAAGTTGA	GCACTCATTGGGCACACAGGCG	+	chr3L	7961198	+	chr3L	12068683	4107485	+	chr3L	7961198	+	chr3L	12068683
CAAGAAAACCAACAAATTTCTCAACAAAAAGCCCTGTATCGCACCGAATAACCCGAGAAGCGGGCTTAAGTTGAG:1	CAAGAAAACCAACAAATTTCTC	CGAGAAGCGGGCTTAAGTTGAG	-	chr2L	18427970	-	chr2L	10826456	7601514	+	chr2L	10826456	+	chr2L	18427970
TCTCGTCTAAAACTTGGGGGCGTAGCAGGGTGCTTTTGCCTAAATGTGTTTTTC:1	TCTCGTCTAAAACTTGGGGGCG	CTTTTGCCTAAATGTGTTTTTC	+	chr3R	31279382	+	chr3R	8623621	22655761	+	chr3R	31279382	+	chr3R	8623621
GTCCTCCAAAAGCCCCCATTTGCCTTTTTACGCTTGCTGAGCCAGATAATTAAGATTTCATATAAGTGACGCTTC:1	GTCCTCCAAAAGCCCCCATTTG	GATTTCATATAAGTGACGCTTC	-	chr3L	19857704	-	chr3L	19848514	9190	+	chr3L	19848514	+	chr3L	19857704
TGTGAATCCTAATTTCAAACGTCCAAATCATAGGATGATAATAGGATAAGCCAAATTAAATTACAGAGTATCACA:1	TGTGAATCCTAATTTCAAACGT	AATTAAATTACAGAGTATCACA	+	chr3R	26374847	+	chr3R	26374949	102	+	chr3R	26374847	+	chr3R	26374949
TGTGACCGAAGGAGATGCCTCCGGAGGAGCAGCAGCAGCATCAGCA:1	TGTGACCGAAGGAGATGCCTCC	AGGAGCAGCAGCAGCATCAGCA	+	chr2L	12309258	+	chr2L	3417020	8892238	+	chr2L	12309258	+	chr2L	3417020
ATCGAAGCTTCCGTAANCTCGGANTCCTTGTTGNGCAGNACCTTCATCACCTCCTC:1	ATCGAAGCTTCCGTAANCTCGG	GCAGNACCTTCATCACCTCCTC	-	chr3R	19134036	-	chr3R	19136571	2535	+	chr3R	19136571	+	chr3R	19134036
TATAATCCACATACTTGGTTCCTAAGAAACTTGTTAAATCGAAAATTAATTAAAAACGTGTTGCTGAGAACGTGG:1	TATAATCCACATACTTGGTTCC	AAACGTGTTGCTGAGAACGTGG	-	chr2R	19714780	-	chr2R	19714704	76	+	chr2R	19714704	+	chr2R	19714780
TTATGTGACCGTCATAGCNGTAAAATATCCAACCTTCTTCCNTTTNTTTTCCACCTATATAAATAGCTGACAGGA:1	TTATGTGACCGTCATAGCNGTA	CCTATATAAATAGCTGACAGGA	+	chr3R	10231804	+	chr3R	10237381	5577	+	chr3R	10231804	+	chr3R	10237381
ATTTGCCTCCGTTTTTTGGCNCGTAGAAANCTTCATCTTGCCCTTTTAA:1	ATTTGCCTCCGTTTTTTGGCNC	AANCTTCATCTTGCCCTTTTAA	-	chr3L	16600363	-	chr3L	16608023	7660	+	chr3L	16608023	+	chr3L	16600363
AACTTATTTAGCTACGCCCTAAGCCTAGGCAATNTTATCAATACGATCGTTGAA:1	AACTTATTTAGCTACGCCCTAA	TNTTATCAATACGATCGTTGAA	+	chr2R	13580516	+	chr2R	13580845	329	+	chr2R	13580516	+	chr2R	13580845
CTGGTGGCTGAAAATTCGAGAGTTTGTGGCCAAGTAAACACGCCCAACATTTGAATTGGGCCACAGGGA:1	CTGGTGGCTGAAAATTCGAGAG	CATTTGAATTGGGCCACAGGGA	+	chrX	5469620	+	chrX	5469783	163	+	chrX	5469620	+	chrX	5469783
TTGTNTCCATGTGTTTGTTTGANTTCTNGCACTCAAGAANCTGAAATAGTGATATAGAGGTTTTGT:1	TTGTNTCCATGTGTTTGTTTGA	AATAGTGATATAGAGGTTTTGT	-	chr2L	12239381	-	chr2L	8634170	3605211	+	chr2L	8634170	+	chr2L	12239381
TGCACCATCAGATACTTCTCATATCGCAAACGTCCATCAAATAATAATAGGAGCATAAAGAGTA:1	TGCACCATCAGATACTTCTCAT	AATAATAGGAGCATAAAGAGTA	+	chr3L	20710773	+	chr3L	20710839	66	+	chr3L	20710773	+	chr3L	20710839
ATAGCATAACTTTTGCCCAAATGAGTTTTATTGCTAATTTATAAAAAGAAGCAAAAATTTGTGTGATCGTTGTAT:1	ATAGCATAACTTTTGCCCAAAT	AAAATTTGTGTGATCGTTGTAT	-	chr3L	14565867	-	chr3L	14565776	91	+	chr3L	14565776	+	chr3L	14565867
CTACATGATGAACGTTCCATCCCAGAGTCTGACTCTTAAATATATATGTAGCCAGATAAATAATAATATCAGGAG:1	CTACATGATGAACGTTCCATCC	AGATAAATAATAATATCAGGAG	-	chr2R	5909734	-	chr2R	5902175	7559	+	chr2R	5902175	+	chr2R	5909734
AAAAAAACAAAAAAAGGGGCAGTCAAGCGGTAAAGCACA:1	AAAAAAACAAAAAAAGGGGCAG	GGCAGTCAAGCGGTAAAGCACA	-	chrX	20148789	-	chrX	8543259	11605530	+	chrX	8543259	+	chrX	20148789
TTGAAAGTGATTGCTAAGCTTAAAGTTTAGATATTACATTCCGCTTTATATAATTGTTTCCAATAATAATAAGAG:1	TTGAAAGTGATTGCTAAGCTTA	TTGTTTCCAATAATAATAAGAG	+	chr3L	8782128	+	chr3L	8782254	126	+	chr3L	8782128	+	chr3L	8782254
GGGCAGTTNAGATTACGAGTACACCGCGAATCCTTNTTTCCAATCGTTTCAGTCAATTCCCTCTGTAGCCTACGC:1	GGGCAGTTNAGATTACGAGTAC	CAATTCCCTCTGTAGCCTACGC	+	chr2R	24303917	+	chr2R	24304001	84	+	chr2R	24303917	+	chr2R	24304001
TCAAAAATGTTCCACTAGCTGCAATTGTTTGCTTTGGCGTGAACCGAGTTTTAGGATTCGCATGTTTGCAACACT:1	TCAAAAATGTTCCACTAGCTGC	GGATTCGCATGTTTGCAACACT	-	chr3L	9310530	-	chr3L	8678591	631939	+	chr3L	8678591	+	chr3L	9310530
TCGCACATGAATATCAATTGGTTCGCTCGACGAACCATATATATATAATATATATTTTAAGCAGTTAATTTCTAT:1	TCGCACATGAATATCAATTGGT	ATTTTAAGCAGTTAATTTCTAT	-	chr3R	12094506	-	chr3R	12094317	189	+	chr3R	12094317	+	chr3R	12094506
CCCAGACCCGCATCAACTTATAATTTACTGCCCAGGAAAAATATCATCATACAAGATCTGCGATACGGA:1	CCCAGACCCGCATCAACTTATA	CATACAAGATCTGCGATACGGA	+	chrX	9975724	+	chrX	9975797	73	+	chrX	9975724	+	chrX	9975797
TCTGNTACTTCTCCATTGAAATNGAAANTACTAGGACATNGATTAAAATGCAAACGCCTGTCAGTGGAGTGGA:1	TCTGNTACTTCTCCATTGAAAT	AAACGCCTGTCAGTGGAGTGGA	+	chr2L	19703570	+	chr2L	19712704	9134	+	chr2L	19703570	+	chr2L	19712704
TTCCTCAACTCAATGGCCAAACTAATATTTAATGCATATGCCGAATGGGCATTTATTGGTTTATTAGATTGGC:1	TTCCTCAACTCAATGGCCAAAC	TTTATTGGTTTATTAGATTGGC	+	chr3R	11957870	+	chr3R	11958151	281	+	chr3R	11957870	+	chr3R	11958151
TCCCTCTGAGTTCCTACCCAACGCAATGCACCATGGGAGTCG:1	TCCCTCTGAGTTCCTACCCAAC	ACGCAATGCACCATGGGAGTCG	-	chr3L	25514836	-	chr3L	25514721	115	+	chr3L	25514721	+	chr3L	25514836
TGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCAT:1	TGATTGTACTTTGCTTGGAACT	CTATTAGTTGGCCATCATTCAT	+	chr3L	16184124	+	chr3L	16188943	4819	+	chr3L	16184124	+	chr3L	16188943
CATATTCGTATTATCCACTTTGTGGACTATTGGGTTGTGCGGTTGCATTGTGCAGATTTGCGTCGCGCCATAAA:1	CATATTCGTATTATCCACTTTG	CAGATTTGCGTCGCGCCATAAA	+	chr3L	5030799	+	chr3L	5030874	75	+	chr3L	5030799	+	chr3L	5030874
TTGAACTGNTTTTAAAAACCTTTGGTTTCTGACTTTTNNNNACATCATCCTTAAAGCAACANAATGCACCGACT:1	TTGAACTGNTTTTAAAAACCTT	AAAGCAACANAATGCACCGACT	-	chr2L	15355795	-	chr2L	15355718	77	+	chr2L	15355718	+	chr2L	15355795
TCTGTTTTCAAGTTTTTNATAAACAAAGCTTTTGATTCATCAGCCGGCAGACAGACAGACAAATACAATGGGCA:1	TCTGTTTTCAAGTTTTTNATAA	AGACAGACAAATACAATGGGCA	-	chr2R	21507301	-	chr2R	21507226	75	+	chr2R	21507226	+	chr2R	21507301
ATGCACTTGTCCGAATGTGAATGCTTCTTTCTGTGAGTCTACAATTTNGCGCGCTTAAGGTAATCCTTGTAGGTA:1	ATGCACTTGTCCGAATGTGAAT	CTTAAGGTAATCCTTGTAGGTA	+	chr2L	6426874	+	chr2L	6445134	18260	+	chr2L	6426874	+	chr2L	6445134
ATGTGCAACTGTGCCGTGCCTCCCCGCATCACATCTTCGTAGTAATGCCACCCACACAAATAAAGTCGCGTAATG:1	ATGTGCAACTGTGCCGTGCCTC	ACACAAATAAAGTCGCGTAATG	+	chr2R	22589344	+	chr2R	13368549	9220795	+	chr2R	22589344	+	chr2R	13368549
AATCGGACACTCGTATTCAAAGCAGCTACTTGGCCAGTCGAGCTTATGCCAAATTAAAAACGCATTCATTTTACC:1	AATCGGACACTCGTATTCAAAG	TTAAAAACGCATTCATTTTACC	+	chr3R	27370127	+	chr3R	27370333	206	+	chr3R	27370127	+	chr3R	27370333
GGGGGCTTCAATCGAGGAGGAGTCTGTGCATACGACATTGNGATCAAATTTCTGTTTTGGAGCACGGANTTC:1	GGGGGCTTCAATCGAGGAGGAG	TCTGTTTTGGAGCACGGANTTC	+	chr3L	2631073	+	chr3L	2631180	107	+	chr3L	2631073	+	chr3L	2631180
AGTTAGCGAAGTTCAACTNTATGGCGCCAAAAACTCTGGGTTCGGAATAAAGGCCATAGATTCCGTGAAACCNAG:1	AGTTAGCGAAGTTCAACTNTAT	CCATAGATTCCGTGAAACCNAG	-	chrX	19318590	-	chrX	19318455	135	+	chrX	19318455	+	chrX	19318590
TGTTGGTGTTGCTATTGTTATAATCTGTGTTTAACTGAGCACT:1	TGTTGGTGTTGCTATTGTTATA	AATCTGTGTTTAACTGAGCACT	+	chr3R	25514809	+	chr3R	27648827	2134018	+	chr3R	25514809	+	chr3R	27648827
TTTGACTCGTTGCCGTAATTTTATAAACACATTTTAGTTGGAATCATTAAGCATTTTTAGCCAGTTTCTTCAAC:1	TTTGACTCGTTGCCGTAATTTT	ATTTTTAGCCAGTTTCTTCAAC	-	chr3R	26770332	-	chr3R	26770256	76	+	chr3R	26770256	+	chr3R	26770332
AGTTGTCATTCCATNCAACATTCACTGCAATTGCAGTTTAAATGGCTTTTGGTCATTTACCTTT:1	AGTTGTCATTCCATNCAACATT	TGGCTTTTGGTCATTTACCTTT	+	chr3L	1581161	+	chr3L	1581484	323	+	chr3L	1581161	+	chr3L	1581484
TGTTNTCCGTGCTACAGGATGCTCCACATCGAAGGACCTAGGTGTCAACACGAAGACATTGAGCACATTGAGCTG:1	TGTTNTCCGTGCTACAGGATGC	AGACATTGAGCACATTGAGCTG	+	chrX	20105317	+	chrX	20105214	103	+	chrX	20105317	+	chrX	20105214
TTGTGTATTCACCTGGTATTTATTGGCCCTTTATCTTTTTTTACTTATAGTTCTAATCTAATGAACCTACAAC:1	TTGTGTATTCACCTGGTATTTA	TCTAATCTAATGAACCTACAAC	-	chr3L	11340058	-	chr3L	11339978	80	+	chr3L	11339978	+	chr3L	11340058
AACCAAGTTTTATCTATAAAAAACATATTTATTCTAGTCTACAATATCAAAGGTTTTCCTAAAGCAATCTTCACT:1	AACCAAGTTTTATCTATAAAAA	TTTTCCTAAAGCAATCTTCACT	-	chr3L	2581994	-	chr3L	2581900	94	+	chr3L	2581900	+	chr3L	2581994
GACGGATGGAGTAATGTGGGAATGTCCTGCAGGCTTC:1	GACGGATGGAGTAATGTGGGAA	GTGGGAATGTCCTGCAGGCTTC	+	chr3L	12919306	+	chr3L	12924741	5435	+	chr3L	12919306	+	chr3L	12924741
CTTGCCGATTCATTTCGTTTCCTTTGGGGTTTCTTCATTCCCCTTTTTTTTATTTTTTTTTGGTCACTTGCGGC:1	CTTGCCGATTCATTTCGTTTCC	TTTTTTTTTGGTCACTTGCGGC	+	chr2L	17227873	+	chr2L	17227950	77	+	chr2L	17227873	+	chr2L	17227950
CTGAAAGTAGGCAATAAAAATTGTCAAACAATAAATATTTGCGGTAGGTCAGCGGGTCACTGAAAAGCGGGGGCG:1	CTGAAAGTAGGCAATAAAAATT	GGGTCACTGAAAAGCGGGGGCG	-	chr3R	28797984	-	chr3R	28792889	5095	+	chr3R	28792889	+	chr3R	28797984
CTGGCTTAGTACATTGACTTTCATGAGGCGTACATGCGGTTAATCTACATGCTACCTTTCCAC:1	CTGGCTTAGTACATTGACTTTC	AATCTACATGCTACCTTTCCAC	-	chr2R	8681604	-	chr2R	18697236	10015632	+	chr2R	18697236	+	chr2R	8681604
ATATACAACTTTTTGTTTTCAAAGAAAACATTTTAAACATAAAATTTAAACATTAATTAGGTATAGGACAAATAA:1	ATATACAACTTTTTGTTTTCAA	TAATTAGGTATAGGACAAATAA	-	chr2L	9008799	-	chr2L	9008718	81	+	chr2L	9008718	+	chr2L	9008799
TACATATATATAAATATAAAAGTATATACGAGGTATATTGATTTGTGTTGGTGGTAACCAGGTATATACCCCCTC:1	TACATATATATAAATATAAAAG	GTAACCAGGTATATACCCCCTC	-	chrX	17181798	-	chrX	5336355	11845443	+	chrX	5336355	+	chrX	17181798
CGGTTTTGCCATTTTGTTTGTTTTTGAATTGGGCCACACACCCTGGTTGTTTTTCGTTTTAACCGCATTTTAC:1	CGGTTTTGCCATTTTGTTTGTT	TTTCGTTTTAACCGCATTTTAC	-	chr2L	16270483	-	chr2L	16270405	78	+	chr2L	16270405	+	chr2L	16270483
AGTCGGTATGGCAAATAAAGTTCATCACATTTCCACTGAATTATCATTAGATTATAATTCAGTTAAACTAT:1	AGTCGGTATGGCAAATAAAGTT	GATTATAATTCAGTTAAACTAT	+	chrX	9126779	+	chrX	9126920	141	+	chrX	9126779	+	chrX	9126920
TTTGAGTATCTACCTTTGTACACTATTCAAAAAAAATTTGTTGTTCAAATGGTCAACAAAGTTGCTGACTGCGTT:1	TTTGAGTATCTACCTTTGTACA	CAACAAAGTTGCTGACTGCGTT	+	chrX	21480560	+	chrX	21480890	330	+	chrX	21480560	+	chrX	21480890
CAAAGTGTGAAAACTGAAACCCATTTACGCAGGAAGCTGCTTTAAACTTAGCTGTCAACT:1	CAAAGTGTGAAAACTGAAACCC	GCTTTAAACTTAGCTGTCAACT	+	chr3R	27041837	+	chr3R	27041912	75	+	chr3R	27041837	+	chr3R	27041912
ATACCAAAAATTTATTTACTTTACACTATACCTTACATTTGCAGATTTATAAAGCCTATTTTTGGGCAGTCAATG:1	ATACCAAAAATTTATTTACTTT	GCCTATTTTTGGGCAGTCAATG	-	chr3L	9572258	-	chr3L	9571910	348	+	chr3L	9571910	+	chr3L	9572258
GATTTTAAGCCAGAGTCCTTTCACTGTGGTNGCTCTCGTATTTTGCGAATGGAAGCTTAATATTTTCACCATTTT:1	GATTTTAAGCCAGAGTCCTTTC	AGCTTAATATTTTCACCATTTT	+	chr2L	5595821	+	chr2L	20712691	15116870	+	chr2L	5595821	+	chr2L	20712691
ATAACATAACATAGAGAATTAATTAGAGAACCACTGCGCATGGTGGTTGAGCAATCAGATCGCTTAACACAGGTC:1	ATAACATAACATAGAGAATTAA	ATCAGATCGCTTAACACAGGTC	-	chr2L	15887851	-	chr2L	15887718	133	+	chr2L	15887718	+	chr2L	15887851
ATGTAACAAGCACCTGGAGTGCATAATCACACCATGTTGAGCGTCACCCNTGCGGAAGTTGCTAAAGGATGGAAA:1	ATGTAACAAGCACCTGGAGTGC	GGAAGTTGCTAAAGGATGGAAA	-	chrX	18122806	-	chrX	17021510	1101296	+	chrX	17021510	+	chrX	18122806
TATATATATATATCTTCGCCTCTTTTGTGTCCACAGCCC:1	TATATATATATATCTTCGCCTC	GCCTCTTTTGTGTCCACAGCCC	+	chr3L	5382864	+	chr3L	6503003	1120139	+	chr3L	5382864	+	chr3L	6503003
CAATTGAAACTTGCGTAACATTTTAGTTTAGCGCATAATCACTTTAACACAGAAGACGCAAAAAAGTAGGCAAT:1	CAATTGAAACTTGCGTAACATT	AAGACGCAAAAAAGTAGGCAAT	-	chrX	7134430	-	chrX	7125272	9158	+	chrX	7125272	+	chrX	7134430
GAGGAGTTGTCATTCCATGCAACATTCACTGCAATTGCAGTTTAAATGGCTTTTGGTCATTTACCTTTTGGCGCT:1	GAGGAGTTGTCATTCCATGCAA	TGGTCATTTACCTTTTGGCGCT	+	chr3L	1581157	+	chr3L	1581491	334	+	chr3L	1581157	+	chr3L	1581491
GGTACATACAAATATAGTGTACCATATATGTATATACATATAGTACATATAGCTATGCTTAACAGCATTCTTTGT:1	GGTACATACAAATATAGTGTAC	TATGCTTAACAGCATTCTTTGT	-	chr3R	27882766	-	chr3R	27875711	7055	+	chr3R	27875711	+	chr3R	27882766
TGAAAGTTGCAATCTAAAAATAGCATACCTTTAGGGGTTCTTCGCTTCCAATCAAACAACCGAAACTTTTTCACA:1	TGAAAGTTGCAATCTAAAAATA	AAACAACCGAAACTTTTTCACA	+	chrX	5338707	+	chrX	5339960	1253	+	chrX	5338707	+	chrX	5339960
GTTATTTTCTTATCTTGAAATATTAGGCATTCAATTGCTAAGTCGAATTAAGATCCACCCTAAAAGCATTTTTAT:1	GTTATTTTCTTATCTTGAAATA	TCCACCCTAAAAGCATTTTTAT	+	chr3L	15643605	+	chr3L	15643892	287	+	chr3L	15643605	+	chr3L	15643892
TATGGATATATTTGGTTGCCGTTGGTTCCTTCCTCTCTGCACAGCATCCCGTAATAAA:1	TATGGATATATTTGGTTGCCGT	CTGCACAGCATCCCGTAATAAA	+	chr3R	10994309	+	chr3R	10994371	62	+	chr3R	10994309	+	chr3R	10994371
ATAGCCGAAAAATAAGGGCTAAACCGCGCGGAATGCTGTTGATTTTTTCATGTTGCGAAACTATTAAACAAA:1	ATAGCCGAAAAATAAGGGCTAA	TGTTGCGAAACTATTAAACAAA	+	chr2R	14922150	+	chr2R	14922223	73	+	chr2R	14922150	+	chr2R	14922223
TGACCTAGTCCCGAGGAANTTATTCCGTTGTCCATCGATATATNATCCGNACCACCGCTTTCCGCTGTGCCACGG:1	TGACCTAGTCCCGAGGAANTTA	ACCGCTTTCCGCTGTGCCACGG	+	chr3L	25331638	+	chr3L	25331729	91	+	chr3L	25331638	+	chr3L	25331729
CTCTGGGCACCGCATCTGGTCTAAACAAGTATAANTGGATGCACTCATTAAGATGTTAATTAAAATTAAATGTCG:1	CTCTGGGCACCGCATCTGGTCT	TGTTAATTAAAATTAAATGTCG	+	chr3L	17790624	+	chr3L	17790889	265	+	chr3L	17790624	+	chr3L	17790889
ATGGTCAGTTCTCGAGGCCCCGAAGCGTTGACCCGAAAAAAGTAGAACACACATTGTCAGAGGGATTATGGGCG:1	ATGGTCAGTTCTCGAGGCCCCG	ATTGTCAGAGGGATTATGGGCG	+	chr3L	5926321	+	chr3L	5926510	189	+	chr3L	5926321	+	chr3L	5926510
CATGGCTTTTTGCCTTTGAGTCCCACCAATCCCATCCGCCCACTTTGCCCGGGG:1	CATGGCTTTTTGCCTTTGAGTC	CATCCGCCCACTTTGCCCGGGG	+	chr3R	20055137	+	chr3R	22994618	2939481	+	chr3R	20055137	+	chr3R	22994618
GTTGAGCATAGCTATATGTACTATATGTATATACATATATGGTACACTAT:1	GTTGAGCATAGCTATATGTACT	ATATACATATATGGTACACTAT	+	chr3R	27875723	+	chr3R	27882753	7030	+	chr3R	27875723	+	chr3R	27882753
AGGCAATGCCGCCTGAGTGTGTGCAATAAATCTCCTTATGAAAATTTTAAAAGCCGCCAAACTATGCACCCGACT:1	AGGCAATGCCGCCTGAGTGTGT	CCGCCAAACTATGCACCCGACT	-	chr2L	9108394	-	chr2L	9108311	83	+	chr2L	9108311	+	chr2L	9108394
GTACAATTTTTTGAAGCTCTATCTATCTAGTCTGNAAGTATGTATTTAAGTTAACTAGATTACACTTATTTGCTT:1	GTACAATTTTTTGAAGCTCTAT	ACTAGATTACACTTATTTGCTT	+	chr3L	18301365	+	chr3L	18301454	89	+	chr3L	18301365	+	chr3L	18301454
ACTCATACGGGCTTACATTTGGGGGTAAAGTACAATTACANTGTANTTTACCAAAGTCAGTTANAACCGATTT:1	ACTCATACGGGCTTACATTTGG	CAAAGTCAGTTANAACCGATTT	+	chr3R	13603075	+	chr3R	13603164	89	+	chr3R	13603075	+	chr3R	13603164
CACACACACACACACTTACCCATTCGACCGCCACAAGCACATA:1	CACACACACACACACTTACCCA	ATTCGACCGCCACAAGCACATA	+	chr2R	13282526	+	chr2R	23591902	10309376	+	chr2R	13282526	+	chr2R	23591902
GAAGCTCTGGCGGAGATTACACCCAAGTAAGTGGTTGGAATTGCTCTTTCTGAGCAATGAATTTTGAGCAGCACT:1	GAAGCTCTGGCGGAGATTACAC	GCAATGAATTTTGAGCAGCACT	-	chr3R	23945021	-	chr3R	23944936	85	+	chr3R	23944936	+	chr3R	23945021
GGTTATCGGTATCAGCTTTGNTGAAAGTGGAANGTCTACCTTNGGTGCGGCTAAAAATAAAAGCTTAGATAGTG:1	GGTTATCGGTATCAGCTTTGNT	AAAAATAAAAGCTTAGATAGTG	+	chr3R	19774006	+	chr3R	17943511	1830495	+	chr3R	19774006	+	chr3R	17943511
TTGCAAANGAATATACAATTGAATAAGGTCTTATTATATNTCCATTTATTATCGTCGNCTCCGAGGTGATCACAG:1	TTGCAAANGAATATACAATTGA	GTCGNCTCCGAGGTGATCACAG	+	chr3L	19422892	+	chr3L	19477638	54746	+	chr3L	19422892	+	chr3L	19477638
ATCCGTGGATATCCCGCCCGCAGAAAAGGTTAGTGCTGAAACCCCGGATGCCATAGTTA:1	ATCCGTGGATATCCCGCCCGCA	GAAACCCCGGATGCCATAGTTA	+	chrY	98074	+	chrY	3567307	3469233	+	chrY	98074	+	chrY	3567307
ATGGAATGTAATTTTATTTACTTACGCATTCAGTGTAAATAAAATCAGCTGCGAAATGAGTGGGAAAAGCAAGGA:1	ATGGAATGTAATTTTATTTACT	AAATGAGTGGGAAAAGCAAGGA	-	chr2L	16086884	-	chr2L	16086692	192	+	chr2L	16086692	+	chr2L	16086884
ACCGCTTATCCGCTTGCCCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTTTCAGTATGG:1	ACCGCTTATCCGCTTGCCCAGT	GTTATATCGCCTTTCAGTATGG	+	chrX	670274	+	chrX	670354	80	+	chrX	670274	+	chrX	670354
GGCTTACCATAAAGTGATGAATGATCCCAATGGAGGTTTGTTCGGTGCCCGATTTACAGCGCGGGGAGAATGAAA:1	GGCTTACCATAAAGTGATGAAT	TTACAGCGCGGGGAGAATGAAA	+	chr3R	9268857	+	chr3R	27391023	18122166	+	chr3R	9268857	+	chr3R	27391023
GCCTAATTATTTTTAAAAACATTTGAAATACATCTATTTTACAAATTTTTCTCCACACATATGCACTCTAAAA:1	GCCTAATTATTTTTAAAAACAT	TCCACACATATGCACTCTAAAA	+	chr3L	16941409	+	chr3L	16941508	99	+	chr3L	16941409	+	chr3L	16941508
CGCGGATAGCTCAGCTCAACAAAGGGGGCCGGGCCGAGGAGGCTTGATTACGGGCAAGGTATGAGCGGGAAATA:1	CGCGGATAGCTCAGCTCAACAA	GGCAAGGTATGAGCGGGAAATA	+	chr3R	23548078	+	chr3R	23548382	304	+	chr3R	23548078	+	chr3R	23548382
GAATGCCAGAATGACACCTCTATAGGTTTTAAGTCAGATTTCTATATATATTTTTTTTCCAACTTACCGCCATCA:1	GAATGCCAGAATGACACCTCTA	TTTTTCCAACTTACCGCCATCA	-	chrX	12295405	-	chrX	12295329	76	+	chrX	12295329	+	chrX	12295405
GTTCGAACTTTGCTGAACTGGGTGGACTTTTGGTTGGGTGAAAGGTCAAAGTATCAACTAGCATGGCGATGGCAT:1	GTTCGAACTTTGCTGAACTGGG	TCAACTAGCATGGCGATGGCAT	+	chr3L	3912493	+	chr3L	3713487	199006	+	chr3L	3912493	+	chr3L	3713487
CAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:5	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
TGTCTATTACTCCTAAAANATGAGCAATAGAATTAGCAATTNGTANAAAATGTTATGGCATACAATGCAAGATGA:1	TGTCTATTACTCCTAAAANATG	TATGGCATACAATGCAAGATGA	-	chr3L	18537794	-	chr3L	18528633	9161	+	chr3L	18528633	+	chr3L	18537794
ATGGTTCGCGTCTCTGGTNAGTTAGACGTTATTTTAGTTTGNGCCNAAAAGTAATTTGTTTTTAAAAAAAACTAA:1	ATGGTTCGCGTCTCTGGTNAGT	ATTTGTTTTTAAAAAAAACTAA	+	chr2L	4454553	+	chr2L	21619974	17165421	+	chr2L	4454553	+	chr2L	21619974
AAAAAAAAAAGAACGCAGAAGAAATACCAGGGGGGAGCACAAAAAACTGGGCGGCAGACTCGTAAAAATCAACGA:1	AAAAAAAAAAGAACGCAGAAGA	GCAGACTCGTAAAAATCAACGA	-	chr2R	15598688	-	chr2R	15598597	91	+	chr2R	15598597	+	chr2R	15598688
AAACAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAACATCCAAAACAGCAGCAGCAACAACAGCAGC:1	AAACAGCAGCAGCAGCAACAAC	CAGCAGCAGCAACAACAGCAGC	-	chr2R	22111948	-	chr2R	13181444	8930504	+	chr2R	13181444	+	chr2R	22111948
AAAAGCGTAAATAAATTACGCAAAAGGTGCCAAGTGGCTGC:1	AAAAGCGTAAATAAATTACGCA	GCAAAAGGTGCCAAGTGGCTGC	-	chr2R	12000270	-	chr2R	19217087	7216817	+	chr2R	19217087	+	chr2R	12000270
TTTGACTATAAACATGCTATTATTTTGATTATTTTTTATTACTTATACGTCTGGTGTGCCCACTCATTGATTGAA:1	TTTGACTATAAACATGCTATTA	GTGTGCCCACTCATTGATTGAA	-	chr3L	5327482	-	chr3L	5327390	92	+	chr3L	5327390	+	chr3L	5327482
ATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGA:1	ATTTATTATGCATTTTAATATC	GTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGA	+	chr2L	1615401	+	chr2L	1615482	81	+	chr2L	1615401	+	chr2L	1615482
AACCATACGGCCAAACACACACACACCCGCAGATTTCGGTTGTCCGATGCCCCTTCAAAGAGTGTGAGTGTGTTT:1	AACCATACGGCCAAACACACAC	TTCAAAGAGTGTGAGTGTGTTT	-	chrX	558982	-	chrX	551420	7562	+	chrX	551420	+	chrX	558982
TTTGCTCACATTGGCAGGTNAAAATACGATTGCCAAACAATA:1	TTTGCTCACATTGGCAGGTNAA	AAAATACGATTGCCAAACAATA	+	chr3L	10092535	+	chr3L	4591803	5500732	+	chr3L	10092535	+	chr3L	4591803
GGAAAATCCCTCTAAGACTTGGTCGCCTGCACTCCTTTGCGCCATCAAACTGAGGAATTAAAAGGGAAGATAGGC:1	GGAAAATCCCTCTAAGACTTGG	GGAATTAAAAGGGAAGATAGGC	+	chr2L	10479402	+	chr2L	10479484	82	+	chr2L	10479402	+	chr2L	10479484
GCAACAAACAAATCAACAGTTTTGATAGGTTCGAAATATATTTCCTCATTTTGTTTAAAACGGGCACATTAACAT:1	GCAACAAACAAATCAACAGTTT	TTTAAAACGGGCACATTAACAT	+	chrX	21575553	+	chrX	21575632	79	+	chrX	21575553	+	chrX	21575632
TTTAATGCAAGGTAAATTGCATTGATTTCGTGATTAATGAGAGTTTCGCATTTCANC:1	TTTAATGCAAGGTAAATTGCAT	AATGAGAGTTTCGCATTTCANC	+	chr3R	6737521	+	chr3R	6739290	1769	+	chr3R	6737521	+	chr3R	6739290
AGAAGTTAACATCTACAATGACGAAAGNACNNTTGGAAATACTTCAGCTNANGAATTCGCGTTTCGAATGATCAT:1	AGAAGTTAACATCTACAATGAC	AATTCGCGTTTCGAATGATCAT	-	chr2L	9222749	-	chr2L	9217962	4787	+	chr2L	9217962	+	chr2L	9222749
ACGTAAATGGAGTGGGCGAGGCATGATGAGGTGGGGGGAAAAAATAGGAAAATAGTCCGACAGCTAGATGA:1	ACGTAAATGGAGTGGGCGAGGC	AAATAGTCCGACAGCTAGATGA	+	chr2L	8286324	+	chr2L	8286407	83	+	chr2L	8286324	+	chr2L	8286407
TTTACTGGTAATAAACTGACAAAAATGTTGGTAGTTTCAGAAATTTGTTTATATTCCTTTACCTCATATCGTTTT:1	TTTACTGGTAATAAACTGACAA	TTCCTTTACCTCATATCGTTTT	-	chr3R	14384729	-	chr3R	14384639	90	+	chr3R	14384639	+	chr3R	14384729
AAGCACGCCCAATGATAGAGAGAGACAGCGAGTGAGAGAGAGAGGGGGAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	AAGCACGCCCAATGATAGAGAG	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	-	chrX	8326736	-	chrX	12649915	4323179	+	chrX	12649915	+	chrX	8326736
ACATTTAAGTGATCGATTCTTTTGCTANAANNATAAATAATTACGCGTANCNCATACTAAACAAATTAACTATT:1	ACATTTAAGTGATCGATTCTTT	CATACTAAACAAATTAACTATT	+	chr2R	99631	+	chr2R	165813	66182	+	chr2R	99631	+	chr2R	165813
TTTTTTTTGGGGGGGCGGAGGAGTGGAACACCGA:1	TTTTTTTTGGGGGGGCGGAGGA	GGGCGGAGGAGTGGAACACCGA	-	chr2R	23622429	-	chr2R	21905947	1716482	+	chr2R	21905947	+	chr2R	23622429
TATCACTTCACAGGATGCNGAGTATTTAGTATGTGTTGTATNCAANATCGTTCATTCTGATTGATTCATACTAA:1	TATCACTTCACAGGATGCNGAG	CATTCTGATTGATTCATACTAA	+	chr3L	933924	+	chr3L	934026	102	+	chr3L	933924	+	chr3L	934026
AATTTAATGATTCGTTATCATGAAAAGAAGAAAAGAAGTCATTAGGGCTTTGCGCCTAAGCCCGGGCTAATGAAA:1	AATTTAATGATTCGTTATCATG	GCCTAAGCCCGGGCTAATGAAA	+	chr3R	14168314	+	chr3R	14168846	532	+	chr3R	14168314	+	chr3R	14168846
TCGTGAAGAGTCCTCTCAGCTACAGGGCGAGTTGGCAAAGTTAAGCAAAGTTAAAGAGTGTGACCAGAATCG:1	TCGTGAAGAGTCCTCTCAGCTA	TTAAAGAGTGTGACCAGAATCG	-	chr3R	25555633	-	chr3R	25555557	76	+	chr3R	25555557	+	chr3R	25555633
TTTTGCGATTTTGAGCTGTGCGCGTGCCGCATTCAACGTGATGCTGAATTGAACATTTATTGAACAATTTCCAGT:1	TTTTGCGATTTTGAGCTGTGCG	CATTTATTGAACAATTTCCAGT	+	chrX	6335242	+	chrX	6337752	2510	+	chrX	6335242	+	chrX	6337752
TCATATATTCTAAATAAAAATAAATTGCATTTACCATACTATACTAGGCTGTACCACGTTTACAACTTAGGCA:1	TCATATATTCTAAATAAAAATA	TACCACGTTTACAACTTAGGCA	+	chr3R	5822381	+	chr3R	5823546	1165	+	chr3R	5822381	+	chr3R	5823546
TCACCGAAAGAGAAGGGTGNAAAAACCAGAGTACCATGTTCAATGCCAAACCATCAGGTAAATAAAGAGGTAAAA:1	TCACCGAAAGAGAAGGGTGNAA	TCAGGTAAATAAAGAGGTAAAA	+	chr3R	14024212	+	chr3R	23636832	9612620	+	chr3R	14024212	+	chr3R	23636832
TTGGCAATTGCAAATGCAAAACCATTTCATTTGCCGACTGACCACCCCTGCAGCTGAGTTGGCAATTAAGCGAG:1	TTGGCAATTGCAAATGCAAAAC	GCTGAGTTGGCAATTAAGCGAG	-	chr3R	16411579	-	chr3R	16411502	77	+	chr3R	16411502	+	chr3R	16411579
CCGACAGATTCCGGCAATATCTTCACACTCTTTTCCTGCTACACAGAGCATTATTTCTATCATATCANGAAATTT:1	CCGACAGATTCCGGCAATATCT	TTTCTATCATATCANGAAATTT	+	chr2R	21363140	+	chr2R	21363238	98	+	chr2R	21363140	+	chr2R	21363238
TGCATGCTTTCGGGCGTGTGCAGCATGCTGTCCTTTTACACAAACACTCGCACACACAGACACTGG:1	TGCATGCTTTCGGGCGTGTGCA	CACTCGCACACACAGACACTGG	-	chrX	19472718	-	chrX	19472157	561	+	chrX	19472157	+	chrX	19472718
TTTCCCCGGAATTCTTTGCGACACATATGTACACTTGCCACACTTTTTGGTGTTGTAATTATATCTTTCGGATCA:1	TTTCCCCGGAATTCTTTGCGAC	TGTAATTATATCTTTCGGATCA	-	chr3L	9445303	-	chr3L	9443512	1791	+	chr3L	9443512	+	chr3L	9445303
AACGAGTTTTAAACGCACAGCGTAAGACGACGAGATCCTCTCTTCGAAATCTATGGCATTGCCAGCATCAAAAC:1	AACGAGTTTTAAACGCACAGCG	ATGGCATTGCCAGCATCAAAAC	-	chr3L	16494499	-	chr3L	16493983	516	+	chr3L	16493983	+	chr3L	16494499
AAACAAACAAGTTTACAAAATTGCTAGCCAAAGGAAAATACAAGCAAAAGCCGAGTTAAATCAAACTGCAAACTG:1	AAACAAACAAGTTTACAAAATT	AGTTAAATCAAACTGCAAACTG	-	chr3R	22055212	-	chr3R	22055118	94	+	chr3R	22055118	+	chr3R	22055212
ATGCATACAAGTTCTAATAGTTGACCAGCTTAACTGCTTGACTAGCTTAAAATTGTTTTCATATATCTCAAAG:1	ATGCATACAAGTTCTAATAGTT	ATTGTTTTCATATATCTCAAAG	+	chr2R	6168197	+	chr2R	6168277	80	+	chr2R	6168197	+	chr2R	6168277
TTTTAAAAATGTCATCAAACAGTTTTACAAACTGAAATGGGCGATGGCTAAAATGGCCGAGAAGAAACACAAATA:1	TTTTAAAAATGTCATCAAACAG	TGGCCGAGAAGAAACACAAATA	+	chr3R	6523341	+	chr3R	6523717	376	+	chr3R	6523341	+	chr3R	6523717
CAAATCTAAGTTTAAACAAAGGTAACAAATTAAAGCAATCTATTAAGTTGTTAAGCCATCTATCTANATATCTTA:1	CAAATCTAAGTTTAAACAAAGG	AGCCATCTATCTANATATCTTA	-	chrX	10550421	-	chrX	10550343	78	+	chrX	10550343	+	chrX	10550421
CATTTTCTATGGTATAAACCATTTTCTCTCAGTGTGGGGTCATATGGGTACGTGTTGTTGTTGTTTTGNGCTCT:1	CATTTTCTATGGTATAAACCAT	TGTTGTTGTTGTTTTGNGCTCT	+	chr3L	5365335	+	chr3L	5365410	75	+	chr3L	5365335	+	chr3L	5365410
GCTGTCGGAAAACTCAAAGTCCGAAATGCACAGTCATCTTATTCAAGAGAGTGGAAATCAAATGGAATATTTTAA:1	GCTGTCGGAAAACTCAAAGTCC	GAAATCAAATGGAATATTTTAA	+	chr3L	12980552	+	chr3L	12980640	88	+	chr3L	12980552	+	chr3L	12980640
AAAAATCAGCAACGGTCAGAGTTTCCCCGGTTATGTAGGGATTTGTCATCAAGGATTTGTTAGGTGAGTATTTC:1	AAAAATCAGCAACGGTCAGAGT	GGATTTGTTAGGTGAGTATTTC	-	chr2R	18402609	-	chr2R	18402522	87	+	chr2R	18402522	+	chr2R	18402609
AACCTCTTCGGGCGGCACTTNTTTTTTGCGCTTATCTCCTCCTGCTGCCGCTTCTAATCAATCTC:1	AACCTCTTCGGGCGGCACTTNT	GCTGCCGCTTCTAATCAATCTC	+	chr3R	5155550	+	chr3R	5155646	96	+	chr3R	5155550	+	chr3R	5155646
GTTGGCGAGATAATCACACAATTTTCAATGGCCGAAACACTGTACTATCTCATCCTACGCAATCCATCCAGTCAG:1	GTTGGCGAGATAATCACACAAT	CCTACGCAATCCATCCAGTCAG	-	chrX	9576139	-	chrX	9575815	324	+	chrX	9575815	+	chrX	9576139
CACAAGTGTCAAGGGCCAGCGAAGAAAAACCAAGAAAGATATAATGTATAAGTACGCGATTGGGCACAAAGAAAG:1	CACAAGTGTCAAGGGCCAGCGA	ACGCGATTGGGCACAAAGAAAG	-	chr3L	2308137	-	chr3L	2308031	106	+	chr3L	2308031	+	chr3L	2308137
TCGAAACGGGGACTTCCCGAAAAGGTAATAAGCAGTAATATTAACGTCTTTCTATGTAAGTTAAAGTATGTTTAT:1	TCGAAACGGGGACTTCCCGAAA	ATGTAAGTTAAAGTATGTTTAT	+	chr3R	15132074	+	chr3R	15135134	3060	+	chr3R	15132074	+	chr3R	15135134
TGATCATGTTTGACTTTGATTTTTAATTGTTGTTGAGTTTGAATACGACTTCGATCTGCAGCTTGATCTCGATT:1	TGATCATGTTTGACTTTGATTT	GATCTGCAGCTTGATCTCGATT	+	chr3R	8154302	+	chr3R	8154386	84	+	chr3R	8154302	+	chr3R	8154386
GAAGTATTCGAATATTTCTGAAATGAAATAAATGTTTAAAAAGTAATCGAAATGTAATTGACCGTAAATATATA:1	GAAGTATTCGAATATTTCTGAA	TGTAATTGACCGTAAATATATA	-	chr3L	4170232	-	chr3L	4170155	77	+	chr3L	4170155	+	chr3L	4170232
TGTATTTCCTTGGAGCCGTTTCATTATATTCCACTGAATATTTTATGCATGACGAACCGGGCAATGCAACCC:1	TGTATTTCCTTGGAGCCGTTTC	GACGAACCGGGCAATGCAACCC	+	chr3R	10745453	+	chr3R	10745537	84	+	chr3R	10745453	+	chr3R	10745537
TCGTCGCCATCATCATCGCCGTCTCAAGTGTGCACTTGCAAGTGAAAACAGCGAGAAGAAATACTAAAAAAAAAA:1	TCGTCGCCATCATCATCGCCGT	AGAAGAAATACTAAAAAAAAAA	-	chr3L	10424552	-	chr3L	6811771	3612781	+	chr3L	6811771	+	chr3L	10424552
AGTGTTCGCAAATACGCAAAAAACGTATGCGCACTTGAC:1	AGTGTTCGCAAATACGCAAAAA	AAAAAACGTATGCGCACTTGAC	+	chr3L	3037023	+	chr3L	22256576	19219553	+	chr3L	3037023	+	chr3L	22256576
CTACAACAGAATCGACAACTTCCAAAACAACTACCACAGAATCAACCACAATCCCAACAACAACCACAGAAT:1	CTACAACAGAATCGACAACTTC	ATCCCAACAACAACCACAGAAT	+	chr3L	5483071	+	chr3L	5483187	116	+	chr3L	5483071	+	chr3L	5483187
GATAATAAATCGCATTCCAGATGGCGTAGAATAATAGATTAAGTAACTAAGCCATGATTAATCCAATCCAGTTG:1	GATAATAAATCGCATTCCAGAT	CATGATTAATCCAATCCAGTTG	-	chr2L	5989120	-	chr2L	5989045	75	+	chr2L	5989045	+	chr2L	5989120
GCGTATACGCCCTGTGATTAGACATTCGTCATTTTAAGAGCACTAACTAAACCCGACTTATAGTCATTTCAACTG:1	GCGTATACGCCCTGTGATTAGA	CGACTTATAGTCATTTCAACTG	-	chrX	14861951	-	chrX	14862165	214	+	chrX	14862165	+	chrX	14861951
GCAATCGGAGGTCCTTGCNTTGGACGTGACGCAGTAATCGCGTNGGTAGNAGGTAACACGATGGGCAAAAATTG:1	GCAATCGGAGGTCCTTGCNTTG	GTAACACGATGGGCAAAAATTG	+	chr3L	14245567	+	chr3L	14245660	93	+	chr3L	14245567	+	chr3L	14245660
CGCAGTCANAATGTAAATATTTCACAAGGCAAATTTTNNNNGTATACTAACAAATACTATTNTCATATGGATTTT:1	CGCAGTCANAATGTAAATATTT	ATACTATTNTCATATGGATTTT	+	chr3R	6175182	+	chr3R	6182454	7272	+	chr3R	6175182	+	chr3R	6182454
CATTAACTACTTTTAAGCTTACACTACCCACCCATTTTAATTGTTAAGCTCCAGATGGCCTGGGG:1	CATTAACTACTTTTAAGCTTAC	TTAAGCTCCAGATGGCCTGGGG	-	chr3R	15608689	-	chr3R	15601177	7512	+	chr3R	15601177	+	chr3R	15608689
GGCACACAGAGAGAAAAACTCGAGAGGCACTTAGTACACTCATCTAACATTTTCCATAGGC:1	GGCACACAGAGAGAAAAACTCG	TCATCTAACATTTTCCATAGGC	+	chr2R	11102888	+	chr2R	11102956	68	+	chr2R	11102888	+	chr2R	11102956
CTGAGCTTGAGATACATGTTTCCGAATTAATTGTCCTACAGTCTTTAGGTTAAAAGATTTTCCTTTCGNCAAAT:1	CTGAGCTTGAGATACATGTTTC	AAAGATTTTCCTTTCGNCAAAT	-	chr2L	18412832	-	chr2L	18408049	4783	+	chr2L	18408049	+	chr2L	18412832
CATCTCCCAAAGACAGATCAATTCTCGAAGCATTCGCTAAGCTGGACTTCTCCCGTTGGGTTGTCAAGGAGGTG:1	CATCTCCCAAAGACAGATCAAT	CCGTTGGGTTGTCAAGGAGGTG	+	chr2R	4656788	+	chr2R	4656891	103	+	chr2R	4656788	+	chr2R	4656891
TGATTTGCCTAAGTTGTAAACGTGGTACAGCCTAGTATAGTATGGTAAATGCAATTTATTTTTATTTNGAATAT:1	TGATTTGCCTAAGTTGTAAACG	AATTTATTTTTATTTNGAATAT	-	chr3R	5823551	-	chr3R	5822385	1166	+	chr3R	5822385	+	chr3R	5823551
GAATAGAAATTAACTGCTTAAAATATATATTATCTATATATGGTTCGTCGAGCGAACCAATTGATATTCATGTGC:1	GAATAGAAATTAACTGCTTAAA	GAACCAATTGATATTCATGTGC	+	chr3R	12094315	+	chr3R	12094504	189	+	chr3R	12094315	+	chr3R	12094504
AGTGGAGTTAATTACTTGGCTAAACAGCTTCTTCACTCGCTTTAAAATTTAACTAGAATAGGATATANCCACTTT:1	AGTGGAGTTAATTACTTGGCTA	TAGAATAGGATATANCCACTTT	-	chr3R	24011753	-	chr3R	24011670	83	+	chr3R	24011670	+	chr3R	24011753
AAAGGTGAGGGCACGTGCAAATCGACACCGACACAGTGTCCTTAGGTTCGAGGACCACGTTGCTGCACCTACACC:1	AAAGGTGAGGGCACGTGCAAAT	ACCACGTTGCTGCACCTACACC	+	chr3R	28744429	+	chr3R	28744524	95	+	chr3R	28744429	+	chr3R	28744524
TTATTAGTCAATGTGAGTCACAAAGATAAAATTTTCTCAAAGATAAAATAAGT:1	TTATTAGTCAATGTGAGTCACA	TTTTCTCAAAGATAAAATAAGT	-	chr2L	17511776	-	chr2L	17511656	120	+	chr2L	17511656	+	chr2L	17511776
ATAGTACTTTTAGCAAATGAATGTNAAATGGAGATTCCTTTCNCCNTTGTGNTTANAAGCAATATAGTTTTCTGT:1	ATAGTACTTTTAGCAAATGAAT	TANAAGCAATATAGTTTTCTGT	+	chr3L	14462892	+	chr3L	14462980	88	+	chr3L	14462892	+	chr3L	14462980
TTTCGATATCGCATGGGGGGCTTCCCCATTTACAACTCTCGAGGGGAGATTTCTTAAGGTCCTCGAGTCACTCG:1	TTTCGATATCGCATGGGGGGCT	CTTAAGGTCCTCGAGTCACTCG	-	chr3L	12304167	-	chr3L	12304092	75	+	chr3L	12304092	+	chr3L	12304167
CTTTTTTAGCTGCGGGCCACAAATGAAATCTGCAAACACAACCCATGTGTGAGAAATTGCTGTTTGTTTTATGCA:1	CTTTTTTAGCTGCGGGCCACAA	AAATTGCTGTTTGTTTTATGCA	-	chr2L	730876	-	chr2L	730785	91	+	chr2L	730785	+	chr2L	730876
ATGTCGCCCGTGCATTTGTTTCGAGTGAAGGTGATGTACTCGCGCAGCTCATG:1	ATGTCGCCCGTGCATTTGTTTC	TGATGTACTCGCGCAGCTCATG	+	chr2R	7615531	+	chr2R	12196571	4581040	+	chr2R	7615531	+	chr2R	12196571
TATATATATCAAATAAAAAGCATATTTTTCCAGTGCATCGCCCTCCTTGAGCAACCGTTTTCCACCCACTA:1	TATATATATCAAATAAAAAGCA	AGCAACCGTTTTCCACCCACTA	-	chr3R	13606854	-	chr3R	13606711	143	+	chr3R	13606711	+	chr3R	13606854
AATTGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCAGTGTAAAAATTGACAATGGCTTATGGCCTTCCTAATTGGCTAGCAAA:1	AATTGTTTTGACAATTGGCGTG	GCCTTCCTAATTGGCTAGCAAA	+	chr2L	10580803	+	chr2L	10580884	81	+	chr2L	10580803	+	chr2L	10580884
AACTCCAGCTCCAGAATGGCCAAGAAAGTCCAAGACGCCGTTTAGCGCGTTTATAAGTTGAACTCAGTGGCAAAA:1	AACTCCAGCTCCAGAATGGCCA	TAAGTTGAACTCAGTGGCAAAA	+	chr2L	10499553	+	chr2L	10499652	99	+	chr2L	10499553	+	chr2L	10499652
AGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAAAGATCTCCAAGCGGGCGGAGAAAGTG:1	AGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAA	CTCCAAGCGGGCGGAGAAAGTG	-	chrX	4617442	-	chrX	1004183	3613259	+	chrX	1004183	+	chrX	4617442
GTAAAAATACTAACTTCAAANGGTAAAAGAGCNTCTAGACTTNAACCTAACAAAACCAGTTTTTTTTTTCTCGTA:1	GTAAAAATACTAACTTCAAANG	AACCAGTTTTTTTTTTCTCGTA	-	chr3R	18610733	-	chr3R	18606501	4232	+	chr3R	18606501	+	chr3R	18610733
ATATTTTTAAATGAAAATTGATTCAAACACATTTTCTATTTAAAATAAACATTTTCCGACTCATGGAACTCAAAT:1	ATATTTTTAAATGAAAATTGAT	TTCCGACTCATGGAACTCAAAT	+	chr3L	14555938	+	chr3L	14556020	82	+	chr3L	14555938	+	chr3L	14556020
GACAAGGCCAACTAATTTGTACACTTCACTCGAGAAACCGAACGACAGTTGGCATAAAAATAAGACAATGTTCAA:1	GACAAGGCCAACTAATTTGTAC	ATAAAAATAAGACAATGTTCAA	-	chr2L	12941315	-	chr2L	12933848	7467	+	chr2L	12933848	+	chr2L	12941315
GGAATGTAATTTTATTTACTTACGCATTCAGTGTAAATAAAATCAGCTGNGAAATGAGTGGGAAAAGCAAGGATA:1	GGAATGTAATTTTATTTACTTA	ATGAGTGGGAAAAGCAAGGATA	-	chr2L	16086882	-	chr2L	16086690	192	+	chr2L	16086690	+	chr2L	16086882
ACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAATACAAATACTCGATTCGACAACGAACCTTTCACAATTGGCC:1	ACAAAACAAAACAAAACAAAAC	AACGAACCTTTCACAATTGGCC	+	chr3R	29013340	+	chr3R	18755535	10257805	+	chr3R	29013340	+	chr3R	18755535
ATCCAGAAAGATGAACTACAATCCAAATCACGCATATGCCTAACGGNTAAGTTTTTGAAGTCTGCAACGCTGACG:1	ATCCAGAAAGATGAACTACAAT	TTTGAAGTCTGCAACGCTGACG	+	chr3R	26717968	+	chr3R	31884756	5166788	+	chr3R	26717968	+	chr3R	31884756
ACATTTGGCANCGCTTTTGGCCGAGAGTCTGACTGTGTCGTTCTGCAGTTCCCCGGGATA:1	ACATTTGGCANCGCTTTTGGCC	CGTTCTGCAGTTCCCCGGGATA	-	chr2L	14899172	-	chr2L	20462774	5563602	+	chr2L	20462774	+	chr2L	14899172
ATAGGGAAAGGAAACAAAGGACAGCAAAAAATCAAGAAGAAGTCGGACAAAAAAGAACCAGAGCAAGTCTCCNT:1	ATAGGGAAAGGAAACAAAGGAC	AAGAACCAGAGCAAGTCTCCNT	-	chr3R	23850827	-	chr3R	29278194	5427367	+	chr3R	29278194	+	chr3R	23850827
ACTTAACAAGTTCAATGTGCATTTCAACTATTTCATTTTTTCATTTCCCCCTCTTTACAGCCCTTTGTTGCCTT:1	ACTTAACAAGTTCAATGTGCAT	CTTTACAGCCCTTTGTTGCCTT	+	chrX	17502359	+	chrX	17502438	79	+	chrX	17502359	+	chrX	17502438
ATATAAAAAGCAAAGAAATTACTGGTGTAACTTAACTTTTTCCTGGCTGCTGATTGATTGGCTGAGTTTTCCCCG:1	ATATAAAAAGCAAAGAAATTAC	TTGATTGGCTGAGTTTTCCCCG	-	chr2R	13749573	-	chr2R	13749427	146	+	chr2R	13749427	+	chr2R	13749573
CCCAAAGTGCACTAAAATTAGTATACGATGGCAGTGCTATTAATCTGAACACAACTGTGCTGTCACTCATTGCGA:1	CCCAAAGTGCACTAAAATTAGT	ACTGTGCTGTCACTCATTGCGA	+	chr3R	25239248	+	chr3R	25239359	111	+	chr3R	25239248	+	chr3R	25239359
TTCAGCACTTGAACTGACATAAAATCAACTTGGACTGCCTGGTTTCATTCACCAGATCCAGAGACCGACTGAATG:1	TTCAGCACTTGAACTGACATAA	AGATCCAGAGACCGACTGAATG	+	chr3R	6794255	+	chr3R	6794655	400	+	chr3R	6794255	+	chr3R	6794655
CAGTTTAGGCAAGAGANAAAGTGNCTTACGAATNCAAANGTCCGTCTGCAATGTACTGGCTC:1	CAGTTTAGGCAAGAGANAAAGT	TCCGTCTGCAATGTACTGGCTC	+	chr3R	19446814	+	chr3R	19449470	2656	+	chr3R	19446814	+	chr3R	19449470
GAGGAAAAGCCAGGGAAAAACTAGGGAATAGCATAGTGGGCAGCTGCAACAGCTGGTTCCCGTTTGTGTTCTGCT:1	GAGGAAAAGCCAGGGAAAAACT	TGGTTCCCGTTTGTGTTCTGCT	+	chr3L	9219268	+	chr3L	9219940	672	+	chr3L	9219268	+	chr3L	9219940
TGACTTTTACCTGGTTTTCGAATGAGAGTCCGATTTGCGTGTTACGTGGGGTTATTATTATTTGCACTGCACT:1	TGACTTTTACCTGGTTTTCGAA	TTATTATTATTTGCACTGCACT	+	chr3L	22570453	+	chr3L	22570595	142	+	chr3L	22570453	+	chr3L	22570595
AAAACAAAGATGAAGCACTACATCCCCCATTTCGCTAGCTATTACACTTGAATGCCTTATTTGTCATTGACCGGG:1	AAAACAAAGATGAAGCACTACA	GCCTTATTTGTCATTGACCGGG	-	chrX	835396	-	chrX	827604	7792	+	chrX	827604	+	chrX	835396
GTTCGCGTTTTATATGAACTCTGGCCGAGACGGGGAAGTGGCCATCAAAACGGAGAAATCCTCAATATATATTCG:1	GTTCGCGTTTTATATGAACTCT	AGAAATCCTCAATATATATTCG	-	chr2R	12797676	-	chr2R	12789313	8363	+	chr2R	12789313	+	chr2R	12797676
GACGCCTAAAAAGCGGCAACGTAAAATTTCAAAAACGTAATTTTTTATGCTGTCACAAATTTGATGGTGATGGT:1	GACGCCTAAAAAGCGGCAACGT	TCACAAATTTGATGGTGATGGT	-	chr2R	17277645	-	chr2R	17277238	407	+	chr2R	17277238	+	chr2R	17277645
GCGGCACANCGGGTGTTGCTTCCGCTGGGTTTGGGGTGGCCTTACATAAAAACTCGATGGGAACGGGAAGGG:1	GCGGCACANCGGGTGTTGCTTC	AACTCGATGGGAACGGGAAGGG	-	chrX	1962840	-	chrX	1954903	7937	+	chrX	1954903	+	chrX	1962840
CATGCAATTTTAAACTCAATTAAAAGTTTTNNNCNNTAGACATACACTGTCTGTGATTAAGCCGGGCCCAAAAAC:1	CATGCAATTTTAAACTCAATTA	TGATTAAGCCGGGCCCAAAAAC	-	chr3R	9811449	-	chr3R	9811371	78	+	chr3R	9811371	+	chr3R	9811449
TTTTGTCATCCTTGAAAGGACCTTTTGTATTCATGGACTGTAGTAAAGAAAGAGGGCACATCGAAAGTCAGAAGG:1	TTTTGTCATCCTTGAAAGGACC	GGGCACATCGAAAGTCAGAAGG	+	chr3R	4759730	+	chr3R	4761227	1497	+	chr3R	4759730	+	chr3R	4761227
AACAAACGGAAGCTTTTTGANAAAGCTAGTGTGTTTTTTGTTTTCCTTCTTTTGTCGTGTGTATCCGACACGTA:1	AACAAACGGAAGCTTTTTGANA	TGTCGTGTGTATCCGACACGTA	-	chr2L	12188845	-	chr2L	17380093	5191248	+	chr2L	17380093	+	chr2L	12188845
ATCATTGANGGTAATGGTTTAAAAGCTCGAGCAAGNCCCCTAGCTAGCGGTATTGAAGGATGTAACCCCTAAGAG:1	ATCATTGANGGTAATGGTTTAA	TGAAGGATGTAACCCCTAAGAG	+	chr3R	7677928	+	chr3R	7678041	113	+	chr3R	7677928	+	chr3R	7678041
TTGTTTGGCTAGGAGTTTTGTGTTCTTTTTTTGTTTTCCAACTTCAGACCGAGTGCCTATCTCTCTCGTGTCTG:1	TTGTTTGGCTAGGAGTTTTGTG	GTGCCTATCTCTCTCGTGTCTG	+	chrX	11036371	+	chrX	11036485	114	+	chrX	11036371	+	chrX	11036485
TATAGAATATCTGTTAAGCACATTTAAATATAATATAATACATTTTAAGATTGCGATTATTACATTTAAATAACT:1	TATAGAATATCTGTTAAGCACA	CGATTATTACATTTAAATAACT	-	chr2L	11781240	-	chr2L	11781162	78	+	chr2L	11781162	+	chr2L	11781240
TAATGTTCGGTTGCATTGCAAATTTAAAGCTGCCCACTTTATTTTATGGATAGTACTTGGTTTCTATGTATACA:1	TAATGTTCGGTTGCATTGCAAA	GTACTTGGTTTCTATGTATACA	-	chr3R	27492476	-	chr3R	27492390	86	+	chr3R	27492390	+	chr3R	27492476
TTTCCCTTAAAGTTCCTTNTGCTGCCGCTGACAGTCCTCGAAAATGTGGTCCAGCTTGAAAATGTACG:1	TTTCCCTTAAAGTTCCTTNTGC	TGGTCCAGCTTGAAAATGTACG	+	chrX	21045401	+	chrX	21040476	4925	+	chrX	21045401	+	chrX	21040476
CAAAGTTATTTACGATTAACTCAACGGATTTATGTGTAGATGACGTGTTTAGGCTGACTTGTCTTGCAAAAAGTT:1	CAAAGTTATTTACGATTAACTC	CTGACTTGTCTTGCAAAAAGTT	+	chr2R	24008418	+	chr2R	24008504	86	+	chr2R	24008418	+	chr2R	24008504
TTTGATGTNTCGCAAAGTCAGAATTTGATTTACAANTGGCACTAGAATTTGAATTCATAAATCCATGTTGCCCAG:1	TTTGATGTNTCGCAAAGTCAGA	TTCATAAATCCATGTTGCCCAG	-	chr2L	1829025	-	chr2L	1828948	77	+	chr2L	1828948	+	chr2L	1829025
AGAGAGAAAAACTCGAGAGGCACTTAGTACACTCATCTAACATTTTCCATAGGCTTATTAATCAAATAATAATA:1	AGAGAGAAAAACTCGAGAGGCA	GCTTATTAATCAAATAATAATA	+	chr2R	11102895	+	chr2R	11102976	81	+	chr2R	11102895	+	chr2R	11102976
GAGGGCGGCGCGTGGTAGGAGTATAGGGAGAGCCGGGGAAATGACATGCAAACAGCAGCTAACAGACA:1	GAGGGCGGCGCGTGGTAGGAGT	TGCAAACAGCAGCTAACAGACA	-	chr3L	4970606	-	chr3L	20050646	15080040	+	chr3L	20050646	+	chr3L	4970606
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
CTTCATCATAGTGAAGTTCGCCTGTGGCCACAAGCCCACCCATTCACTCAAATATTCCAGG:1	CTTCATCATAGTGAAGTTCGCC	CCATTCACTCAAATATTCCAGG	+	chr3R	17118662	+	chr3R	9204530	7914132	+	chr3R	17118662	+	chr3R	9204530
TTTTAGTGCATGATTCATATTTATTTCTAATATGAGATGTGTAAACCTGTGAAATTACATAGTATTCTGGAGAA:1	TTTTAGTGCATGATTCATATTT	AATTACATAGTATTCTGGAGAA	-	chr3R	8099722	-	chr3R	8094418	5304	+	chr3R	8094418	+	chr3R	8099722
GGCGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGAGTGTATGTATCTGTATCTGTATCTCTGATTTTATTTTCGTT:1	GGCGAGTGAGTGAGTGAGTGAG	TATCTCTGATTTTATTTTCGTT	+	chr3R	26543272	+	chr3R	12702322	13840950	+	chr3R	26543272	+	chr3R	12702322
TGAATATGCACACACTGGATATATAAATATTATATATTATAACTTGGATAGAACCAAGTTTTTTAACGCGATGGC:1	TGAATATGCACACACTGGATAT	CCAAGTTTTTTAACGCGATGGC	+	chr2R	6547955	+	chr2R	6548118	163	+	chr2R	6547955	+	chr2R	6548118
CAGAAATGCAGCCAAAGTTGCTAGAGGTGTCGGATGATTAATGTTCTGCACTTGACACGACTTTTTCATTTGTC:1	CAGAAATGCAGCCAAAGTTGCT	TGACACGACTTTTTCATTTGTC	+	chr3R	27043706	+	chr3R	27043799	93	+	chr3R	27043706	+	chr3R	27043799
GCCAGCTGCTAAGCTATTTTCAAGTTGCAAAGAAGCTGCACTGCAAACTTATTCAGCACCTTAAAGCTTAAGTAC:1	GCCAGCTGCTAAGCTATTTTCA	CAGCACCTTAAAGCTTAAGTAC	+	chrX	11299008	+	chrX	306323	10992685	+	chrX	11299008	+	chrX	306323
ATGTCATCCGACATTTTTNCCCGCCTGCGTGTGAGTGTGTGT:1	ATGTCATCCGACATTTTTNCCC	CCGCCTGCGTGTGAGTGTGTGT	+	chrX	19103970	+	chrX	18214940	889030	+	chrX	19103970	+	chrX	18214940
ACACTTGGGACTGGATGTGCGGCACTGAATTGCTGAATGCGCTAGCCACCGGTCAACACAACCTACTTATCGCGC:1	ACACTTGGGACTGGATGTGCGG	CAACACAACCTACTTATCGCGC	+	chr3R	23497971	+	chr3R	23498055	84	+	chr3R	23497971	+	chr3R	23498055
TCAGGAGCTGAACAAAAGTTTGCAGGATGAGAGCGGTGGTGAGCTGAATATTGTTTTCATCCGATGCC:1	TCAGGAGCTGAACAAAAGTTTG	AATATTGTTTTCATCCGATGCC	-	chr2R	10790246	-	chr2R	10790165	81	+	chr2R	10790165	+	chr2R	10790246
GGACAAGGGCGGTAATATCAGTTGGCCACAGCCACAAATGGATGCTCACAAATGGATTTTTTTTTATATCTTAA:1	GGACAAGGGCGGTAATATCAGT	TGGATTTTTTTTTATATCTTAA	-	chr3L	17492800	-	chr3L	17492492	308	+	chr3L	17492492	+	chr3L	17492800
ACACACACACACACACACACATTGCCGTCACTAAGGAAGGGTATGCNCATAT:1	ACACACACACACACACACACAT	CTAAGGAAGGGTATGCNCATAT	+	chrX	7978952	+	chrX	2004778	5974174	+	chrX	7978952	+	chrX	2004778
GGTAACCGAGGTTTATACACACATAGCTATATATGTGTCAGCTCGTTGCGACTGGCCATCCTTGGCCATTGGTT:1	GGTAACCGAGGTTTATACACAC	TGGCCATCCTTGGCCATTGGTT	-	chr3L	20283475	-	chr3L	20283396	79	+	chr3L	20283396	+	chr3L	20283475
CCAGAACAGGACTCCATTCCGTTGGCCAGCCAGTCAAAGGAACAACTTCCACAAGTGGGGTCGGGGTTGGCCATA:1	CCAGAACAGGACTCCATTCCGT	AGTGGGGTCGGGGTTGGCCATA	+	chr2L	10633354	+	chr2L	10633441	87	+	chr2L	10633354	+	chr2L	10633441
AATTAACAAGAATGAGGAGCACATCCCGACATGTTTGCCCAGACGACAAACATAATAATTGCTGCAATTTAGCCA:1	AATTAACAAGAATGAGGAGCAC	AATAATTGCTGCAATTTAGCCA	+	chr3L	21408480	+	chr3L	21408558	78	+	chr3L	21408480	+	chr3L	21408558
ACCGATTGCACTTGAGCTGTAAGTAGATTTTGATATGTGGTGTAACATTGTGCATTTATATGAAGTCTCGAATTT:1	ACCGATTGCACTTGAGCTGTAA	ATTTATATGAAGTCTCGAATTT	+	chr3R	9886320	+	chr3R	2899420	6986900	+	chr3R	9886320	+	chr3R	2899420
TCGATGCCGTCACAGGAATGCATCGCGAATGCCACATCATCATGCCAATTAAATCAACATCGCATCATCATTTG:1	TCGATGCCGTCACAGGAATGCA	ATCAACATCGCATCATCATTTG	-	chrX	12038300	-	chrX	12038107	193	+	chrX	12038107	+	chrX	12038300
CGAGGACCTTAAGAAATCTCCCCTCGAGAGTTGTAAATGGGGAAACCCCCCATGCGATATCGAAAATCAAACTCG:1	CGAGGACCTTAAGAAATCTCCC	GCGATATCGAAAATCAAACTCG	+	chr3L	12304101	+	chr3L	12304177	76	+	chr3L	12304101	+	chr3L	12304177
CGTTGCTGCTGCCGGTCTTCCTTTTGCGGCCTTGCTGCTCCGCTTTTCTTTTATTTTTTTTGTT:1	CGTTGCTGCTGCCGGTCTTCCT	CTTTTCTTTTATTTTTTTTGTT	-	chr2L	4269221	-	chr2L	12493576	8224355	+	chr2L	12493576	+	chr2L	4269221
CAGAAAATGTTCGATTAAATCAAACAGAGTCCACCGCCTCATCCCGTCCCACCACCACACACACTGGTGTGCCCC:1	CAGAAAATGTTCGATTAAATCA	ACCACACACACTGGTGTGCCCC	-	chrX	18667649	-	chrX	16518424	2149225	+	chrX	16518424	+	chrX	18667649
CAGAAGCACGTTTGCCATCATAACTCAGCAACTGGGAAAAGCATCGGNAAACACAAAACAGAACCCANAAACAGG:1	CAGAAGCACGTTTGCCATCATA	CAAAACAGAACCCANAAACAGG	-	chr2L	3891994	-	chr2L	3891909	85	+	chr2L	3891909	+	chr2L	3891994
TTTCAATTAAAATGCCAAAACGAAATGCTAATGGCCAGTTGATATGGCGCGCAATTGCCCAACTTTNGTTTTCA:1	TTTCAATTAAAATGCCAAAACG	AATTGCCCAACTTTNGTTTTCA	+	chr3L	19217094	+	chr3L	19218011	917	+	chr3L	19217094	+	chr3L	19218011
CTACTAGGGGGAAGAATTCTTGGAGCTTAGGAAAATGTGCGAAGATCGCAGTAANGCGCACTGGCAGTAA:1	CTACTAGGGGGAAGAATTCTTG	CAGTAANGCGCACTGGCAGTAA	-	chr3L	19425220	-	chr3L	12429854	6995366	+	chr3L	12429854	+	chr3L	19425220
ATATTAACTTTTAAAATATGGCAGAATGTTCAGCACGTTATCTAGCAATTTTAAAAACAAAGCAAATGTTTTAC:1	ATATTAACTTTTAAAATATGGC	AAAAACAAAGCAAATGTTTTAC	-	chr3L	19253888	-	chr3L	19253812	76	+	chr3L	19253812	+	chr3L	19253888
GGCTTAACCACTAACTTAAACTAGACGTAAATACAAAAGCTTGACCAAATACAAATCATCTATGTTATGAA:1	GGCTTAACCACTAACTTAAACT	TACAAATCATCTATGTTATGAA	+	chr2R	11344156	+	chr2R	11344248	92	+	chr2R	11344156	+	chr2R	11344248
CAAATAAAATGGGGGAAATGCGGGAAAAGCTGGTGGAAATTAAGATCAATTTAAAGGGTATTTAAGGATCAACCA:1	CAAATAAAATGGGGGAAATGCG	AAGGGTATTTAAGGATCAACCA	-	chr2R	16936878	-	chr2R	11797885	5138993	+	chr2R	11797885	+	chr2R	16936878
ATAGACAAAATAAAAATAAACCCTGGGCATAATAAACAAAAGAGGAGGCCACTTTCCTTTCCCTTTCAACCATCT:1	ATAGACAAAATAAAAATAAACC	TTCCTTTCCCTTTCAACCATCT	+	chr3L	19564982	+	chr3L	19565076	94	+	chr3L	19564982	+	chr3L	19565076
ATGAAACTGCTGGGAAAATAGGGGAAAATGCTAGAGAAATGGTGAAGGGCGAAAGGGTAGCAG:1	ATGAAACTGCTGGGAAAATAGG	GTGAAGGGCGAAAGGGTAGCAG	-	chr2L	4418413	-	chr2L	18730114	14311701	+	chr2L	18730114	+	chr2L	4418413
GAGCTGTTGGCTTCAGTCGACCGGATAAGTGCCCGCTTTGCATTGCGAACTGCACGCCAAATAATCTTAGTTTTA:1	GAGCTGTTGGCTTCAGTCGACC	ACGCCAAATAATCTTAGTTTTA	-	chr3R	7589924	-	chr3R	7589803	121	+	chr3R	7589803	+	chr3R	7589924
GACATATTGTACACTCAAATAAGGTACTTGACAGCTTTTTAAAGTGGAATTTTAGCAATGTATCTGNTGGATTG:1	GACATATTGTACACTCAAATAA	TAGCAATGTATCTGNTGGATTG	+	chr2L	5605648	+	chr2L	5605741	93	+	chr2L	5605648	+	chr2L	5605741
CAGCAAGGCAATCAAACATTCACAGCCTAAGCTTCCCGATATCTAGACGTTTCTACTTTTCGATAA:1	CAGCAAGGCAATCAAACATTCA	AGACGTTTCTACTTTTCGATAA	+	chr2L	21285653	+	chr2L	21285742	89	+	chr2L	21285653	+	chr2L	21285742
AGATGCACATATATACACAAACATATATACGTCGTATCTCCATACGCGGGTAAGAGATAAATAACGTTAAGGACA:1	AGATGCACATATATACACAAAC	GAGATAAATAACGTTAAGGACA	-	chr2R	25104921	-	chr2R	25104796	125	+	chr2R	25104796	+	chr2R	25104921
GGCGGACTGCGGTTGGGGTTACGGTGCAGCCTCCAGTTTTTGCTTTCTGCCTGCAGTTCATAATGTTATTCCACA:1	GGCGGACTGCGGTTGGGGTTAC	CAGTTCATAATGTTATTCCACA	-	chr2R	16168919	-	chr2R	11004863	5164056	+	chr2R	11004863	+	chr2R	16168919
GACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTGTGGTTGTCTGCCGAATAGCCTTACTCTTACCTTGTTTGCTGC:1	GACTTAAAGAGAAATTAAATGT	TTACTCTTACCTTGTTTGCTGC	-	chr2R	13141642	-	chr2R	13136846	4796	+	chr2R	13136846	+	chr2R	13141642
CTCTGGCAGTAACTGCGCCCACGCTGGCAACCAAAACAAACCACTCGACCGGAATTGAATTGAAAAATTGCGACG:1	CTCTGGCAGTAACTGCGCCCAC	ATTGAATTGAAAAATTGCGACG	+	chr3R	17737161	+	chr3R	19766266	2029105	+	chr3R	17737161	+	chr3R	19766266
GTTCGAGGNTGATTTTGCAGACAATCGAAAGACTTNAGGCACAAACTTGTTGAAAGAACTTTCCTAGGGCACGA:1	GTTCGAGGNTGATTTTGCAGAC	AAAGAACTTTCCTAGGGCACGA	+	chr2L	4601717	+	chr2L	4609157	7440	+	chr2L	4601717	+	chr2L	4609157
TGATTTAAGGCGCAAAGCGTCGTCATTATGATTATCANCGTTATANCATTATATAAATCAGNATGTCTTTGGATC:1	TGATTTAAGGCGCAAAGCGTCG	TAAATCAGNATGTCTTTGGATC	+	chr2L	19776660	+	chr2L	19776740	80	+	chr2L	19776660	+	chr2L	19776740
GTCTGCTCGACGGCCTCGTTTTTGCTGTTCTGCCACTTTTGTAGTCTTAAATGGTGGGGACTGCGCTGCTATGTG:1	GTCTGCTCGACGGCCTCGTTTT	GTGGGGACTGCGCTGCTATGTG	+	chr2R	552759	+	chr2R	553977	1218	+	chr2R	552759	+	chr2R	553977
ATATGGGGGCGTAAGAGAGAGGGAGCGAGCTGGCAGACAGACGACAAACAAAGAAACTGAGGCGATGTGCAGAAC:1	ATATGGGGGCGTAAGAGAGAGG	AAACTGAGGCGATGTGCAGAAC	-	chrX	15358794	-	chrX	20388040	5029246	+	chrX	20388040	+	chrX	15358794
TTTATTTCATTTTATTTTTGTTA:1	TTTATTTCATTTTATTTTTGTT	TTATTTCATTTTATTTTTGTTA	+	chr3L	19038704	+	chr3L	7847442	11191262	+	chr3L	19038704	+	chr3L	7847442
CATATGGTTTTGTGTTACATAATGGTGCATATCTAAGAAATGGATGGAACAGGATGACGTTGTGATGAAAT:1	CATATGGTTTTGTGTTACATAA	CAGGATGACGTTGTGATGAAAT	+	chr2L	16174118	+	chr2L	11663362	4510756	+	chr2L	16174118	+	chr2L	11663362
AATCGTTCTGCATAGAAGCTCATCTCACATGGCCATTGAGAAGCATCGATTGTTTCCATGACTGCAGACTCTGA:1	AATCGTTCTGCATAGAAGCTCA	TTTCCATGACTGCAGACTCTGA	-	chr3R	8997477	-	chr3R	8997388	89	+	chr3R	8997388	+	chr3R	8997477
TGTGTGTGTGTGTGTGCGTGGCATTGTGACACCNAACCAGTCAAATCTAATGGGATTACGAAAGAGTTCGGCGCA:1	TGTGTGTGTGTGTGTGCGTGGC	GATTACGAAAGAGTTCGGCGCA	-	chr3R	6881261	-	chr3R	17473044	10591783	+	chr3R	17473044	+	chr3R	6881261
TTGTCACAACTATTGGATGTGAAGGGAGTGGGGTATTTTTNGGGACTTGGGAAAATAATTATTCAATGNTTGA:1	TTGTCACAACTATTGGATGTGA	AAAATAATTATTCAATGNTTGA	+	chr3R	26013856	+	chr3R	26013934	78	+	chr3R	26013856	+	chr3R	26013934
TGGCATAGCAAACACATCTCCGCAATAATACTTATATATGTACATACGTATTAATACACT:1	TGGCATAGCAAACACATCTCCG	TGTACATACGTATTAATACACT	-	chr2R	9157790	-	chr2R	9151335	6455	+	chr2R	9151335	+	chr2R	9157790
ATGGTTATCAATCAAGGAAGCATTTGGCAGACACTGCAGTCAAAGTTCGGACATGGTAAATGATATGGCCTAAAA:1	ATGGTTATCAATCAAGGAAGCA	TGGTAAATGATATGGCCTAAAA	-	chr2L	11720988	-	chr2L	11713520	7468	+	chr2L	11713520	+	chr2L	11720988
GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATGCCGTATTAATCCAGCTAACCAACCGATAATTCGAATCGCTC:1	GTAAACAGTTTCTTGACAAACT	CAACCGATAATTCGAATCGCTC	+	chrX	15019096	+	chrX	17838045	2818949	+	chrX	15019096	+	chrX	17838045
GTTGCGAGGTAGTGTGTACATCTGGAATTTTGGCAGC:1	GTTGCGAGGTAGTGTGTACATC	GTACATCTGGAATTTTGGCAGC	-	chr2R	4519953	-	chr2R	3382716	1137237	+	chr2R	3382716	+	chr2R	4519953
GGTAGATATATGGCTTCCTTCTTCCAACTTTCTCCGCTTATTAGGCGAACATGTGCGTGCGGTTGTGAGCGTGT:1	GGTAGATATATGGCTTCCTTCT	GTGCGTGCGGTTGTGAGCGTGT	+	chr3R	22941615	+	chr3R	5912375	17029240	+	chr3R	22941615	+	chr3R	5912375
AATGAAAATGCAATTTTCAAAAGCAAAACAAACAATTGTTGATATGCTGCCAAAGAGAGAAAGGGGCCGCAGCCG:1	AATGAAAATGCAATTTTCAAAA	AGAGAGAAAGGGGCCGCAGCCG	-	chr2L	4068864	-	chr2L	4066039	2825	+	chr2L	4066039	+	chr2L	4068864
GTAGCCCNGACGTATCATAAAAAACATGACATTTATTACNGTCTATTAGCGACGAGGNCGCCGAGTTCGAGGAG:1	GTAGCCCNGACGTATCATAAAA	CGAGGNCGCCGAGTTCGAGGAG	-	chr2R	25242272	-	chr2R	19447490	5794782	+	chr2R	19447490	+	chr2R	25242272
GTCATTTGCGTATCCTCAAACAGCGAATAAAAATNAATAGAAGCAGACAGTGGCAACATGACTAAAAAGATGTGA:1	GTCATTTGCGTATCCTCAAACA	CAACATGACTAAAAAGATGTGA	-	chr3R	10491328	-	chr3R	7297864	3193464	+	chr3R	7297864	+	chr3R	10491328
TTTTTTGGAGAAGGTGTGAGCATGCTTCGTACATATCAATAACGTTTTAGGTGGATCCCTGGCAATTTNACCCAG:1	TTTTTTGGAGAAGGTGTGAGCA	GATCCCTGGCAATTTNACCCAG	+	chr3R	30679542	+	chr3R	30687011	7469	+	chr3R	30679542	+	chr3R	30687011
AGGGGGAAAAGCAACAAATATGCTTAATAAGTAAACAAGGGGATGAGATGGAAGGCACTCCACTCCAATTGAAG:1	AGGGGGAAAAGCAACAAATATG	AGGCACTCCACTCCAATTGAAG	+	chr2R	18341057	+	chr2R	6537687	11803370	+	chr2R	18341057	+	chr2R	6537687
GTGCACTATCAAAGCACTTGGAAAAGAGCCCGCTGGCACGTGTCTAACCTCAAATATCAAACGAATTCAATAAG:1	GTGCACTATCAAAGCACTTGGA	AATATCAAACGAATTCAATAAG	-	chr2R	12359023	-	chr2R	8148783	4210240	+	chr2R	8148783	+	chr2R	12359023
CACTTTTAAACGAAGTTGNATAATGAAGTATTTGTGTAAGTNAACNAATTTAAAAACAAATAGAGAAAAAATAAT:1	CACTTTTAAACGAAGTTGNATA	AAACAAATAGAGAAAAAATAAT	-	chr2L	20837975	-	chr2L	2484993	18352982	+	chr2L	2484993	+	chr2L	20837975
TTAAAAAAAAACTGATCGTTTTTGTTTATCAACTTTTACCACGCG:1	TTAAAAAAAAACTGATCGTTTT	GTTTATCAACTTTTACCACGCG	-	chr2R	12227035	-	chr2R	13542775	1315740	+	chr2R	13542775	+	chr2R	12227035
AATTATATCGTTGTACAAATATATAAATATGTATATCACGTAGCTTACTGACACGATATTTG:1	AATTATATCGTTGTACAAATAT	TAGCTTACTGACACGATATTTG	-	chr3R	18485438	-	chr3R	18485351	87	+	chr3R	18485351	+	chr3R	18485438
TGAGCACCTGAATGGCATCAACGACACATACAGCGCGATTCCG:1	TGAGCACCTGAATGGCATCAAC	CGACACATACAGCGCGATTCCG	-	chr3R	29236126	-	chr3R	29245829	9703	+	chr3R	29245829	+	chr3R	29236126
CTGCATTATGTAAACCCCTTTGCCTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGAGTTGGCTGAATTGCGGTTGCTAGCCAG:1	CTGCATTATGTAAACCCCTTTG	CTGAATTGCGGTTGCTAGCCAG	-	chr2R	15541128	-	chr2R	20964590	5423462	+	chr2R	20964590	+	chr2R	15541128
AGCTCACAGGCTATCAAAACTTTTGACGCTCAACTTGGTAGCAGCACCAGGAATCCGAGTTCAGGAGGGGCATTG:1	AGCTCACAGGCTATCAAAACTT	TCCGAGTTCAGGAGGGGCATTG	-	chr3L	19209444	-	chr3L	19208070	1374	+	chr3L	19208070	+	chr3L	19209444
TAACGATGAAATAATAAANAGGAATCAATTCAAATTTAAATATNTGAGCNCGNCTACCATCAGCTACAGACGGAA:1	TAACGATGAAATAATAAANAGG	CTACCATCAGCTACAGACGGAA	-	chr2R	6499292	-	chr2R	6494530	4762	+	chr2R	6494530	+	chr2R	6499292
GCTTAGCATTGGGCAAGGAGATACCCCCAGGTCCTTAGCTCCTGCTCGCTTCCTAATCGTATTGAGCTTATACAT:1	GCTTAGCATTGGGCAAGGAGAT	TAATCGTATTGAGCTTATACAT	+	chr2R	16962260	+	chr2R	16962337	77	+	chr2R	16962260	+	chr2R	16962337
GCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTT:1	GCTCTAACCTCACACGAAGAAC	GACAAAAAATCCGCTAATCGTT	-	chr2L	22684590	-	chr2L	22679818	4772	+	chr2L	22679818	+	chr2L	22684590
CAGCTTAGCATTGGGCAAGGAGATTCCCCCAGGTCCNTAGCTCCTGCTCGCTTCCTAATCGTATTGAGCTTAT:1	CAGCTTAGCATTGGGCAAGGAG	TTCCTAATCGTATTGAGCTTAT	+	chr2R	16962258	+	chr2R	16962333	75	+	chr2R	16962258	+	chr2R	16962333
AAGTCTTCCTCTGGCCAAAATAGTTTTTTTCGCCGATTGCCAATTTTATTAAGGGGTGCCGCTTAGANTTTGT:1	AAGTCTTCCTCTGGCCAAAATA	AGGGGTGCCGCTTAGANTTTGT	-	chr3R	28775158	-	chr3R	28775021	137	+	chr3R	28775021	+	chr3R	28775158
TAGTAAGACAGCATAAAAAAAAAACATGAAATATTTTGAAATGAGGCAAGCCCTAAAGTCTAATGACTGGGCTGA:1	TAGTAAGACAGCATAAAAAAAA	TAAAGTCTAATGACTGGGCTGA	-	chr3L	6827159	-	chr3L	10547402	3720243	+	chr3L	10547402	+	chr3L	6827159
AAATAAACAATGTTCAATTAACACTCACACTTTATTGATTACCAAGTTTACGGGTTTCCCAACATCAAAGATCTT:1	AAATAAACAATGTTCAATTAAC	GTTTCCCAACATCAAAGATCTT	-	chr2L	10495527	-	chr2L	10495441	86	+	chr2L	10495441	+	chr2L	10495527
GTTCTCCAAATTCGGGGTAATCAATCAAAGGCTTTCTATGTACACCGAAATTTAACGCCTTGGCTTGCTTTATTA:1	GTTCTCCAAATTCGGGGTAATC	AACGCCTTGGCTTGCTTTATTA	-	chr2L	14799339	-	chr2L	14799187	152	+	chr2L	14799187	+	chr2L	14799339
TTATATATTCATATAAATGCGAACTATTCAGATAAACATTACAGATCCTCTGAGCTACGATTACCANCTGACCGA:1	TTATATATTCATATAAATGCGA	GCTACGATTACCANCTGACCGA	-	chr3R	18379958	-	chr3R	18379652	306	+	chr3R	18379652	+	chr3R	18379958
TCTGCAATTCTGTCCATTCCATTCTGCTCAATTGTGTTTATTTGCGCGAACTTATGGCGCTAAAGGCAAGTCCTG:1	TCTGCAATTCTGTCCATTCCAT	ATGGCGCTAAAGGCAAGTCCTG	+	chr2L	13321902	+	chr2L	13321991	89	+	chr2L	13321902	+	chr2L	13321991
AACTTTGTCCAGCATAAATTCAATTATGTGTTATAGAAAACTTTGTTTATCTCCTTNTCGTCTATACAC:1	AACTTTGTCCAGCATAAATTCA	TATCTCCTTNTCGTCTATACAC	+	chr3L	7101337	+	chr3L	7101424	87	+	chr3L	7101337	+	chr3L	7101424
AGAATTATGTATTTGTTAGTCCTTTAAAGAAGAAAAAAGAAGAAGAAGACAATCTTGTAAAACTAATTACGTCAG:1	AGAATTATGTATTTGTTAGTCC	CTTGTAAAACTAATTACGTCAG	+	chr3R	26153044	+	chr3R	26153129	85	+	chr3R	26153044	+	chr3R	26153129
GATATTTTTTGTAATCCCAATTTCTCCATGTGTATTGCAGACGAGCNGCGCCT:1	GATATTTTTTGTAATCCCAATT	GTATTGCAGACGAGCNGCGCCT	+	chr3L	9270645	+	chr3L	9278378	7733	+	chr3L	9270645	+	chr3L	9278378
GAATAAAGACAAAATACTTGAACTAAATGAGTAAAATGAAAACTGAACTTAAACGGCTTATGTTAATCCTCTGAT:1	GAATAAAGACAAAATACTTGAA	CGGCTTATGTTAATCCTCTGAT	+	chr2L	9251566	+	chr2L	22675008	13423442	+	chr2L	9251566	+	chr2L	22675008
GTTGATGATGGTGAAACTTTCGCAGCTTTTCGTGCAATCCCATGATGGGAACTGAGCCATATCACTCGAAAAAC:1	GTTGATGATGGTGAAACTTTCG	TGAGCCATATCACTCGAAAAAC	+	chr3R	5278094	+	chr3R	5278174	80	+	chr3R	5278094	+	chr3R	5278174
GCTCTTTGCGTTTTTCAAGCCAATTTCCACTGTTTTTCTTTCCTCGCAATTCACATAAAGACATAAATCCCAAAG:1	GCTCTTTGCGTTTTTCAAGCCA	CATAAAGACATAAATCCCAAAG	-	chr3L	17420627	-	chr3L	16885488	535139	+	chr3L	16885488	+	chr3L	17420627
GTACTTCTTGGTCGGCACAAACTTCTTTTGGGTTTCGAGTGCGGTGCGTGAGTTTTGTATGTGTTTGCCATTT:1	GTACTTCTTGGTCGGCACAAAC	GTTTTGTATGTGTTTGCCATTT	-	chr3R	19040327	-	chr3R	8881555	10158772	+	chr3R	8881555	+	chr3R	19040327
AAGGAAAATAAATTGACCTGAATTGATCATTTCAATAATTGTTGGTGTTCCACATTCCACAAGACAAAGGCAATG:1	AAGGAAAATAAATTGACCTGAA	ATTCCACAAGACAAAGGCAATG	-	chr2L	14180159	-	chr2L	14180083	76	+	chr2L	14180083	+	chr2L	14180159
ATCGTAATAGATATTTTTAAATGTATTGATTAAAGAATATAGAAAATATTTTGGTAAGCTGTAGGGTATTTTCGG:1	ATCGTAATAGATATTTTTAAAT	GTAAGCTGTAGGGTATTTTCGG	-	chrX	15248357	-	chrX	15248281	76	+	chrX	15248281	+	chrX	15248357
TACGAGTGGAGGGCCTTTCGAAATCCGGATTGCCTATCAGTAAAAGGTGCTGTTTATATACAATTGCGTTTCCA:1	TACGAGTGGAGGGCCTTTCGAA	TTTATATACAATTGCGTTTCCA	+	chr3R	19227231	+	chr3R	19225047	2184	+	chr3R	19227231	+	chr3R	19225047
AGTCAAATCAGACAATCTATAGGTAACTATAATTTTCCAAAGAAATTTTCTTACCGCTGGTTTCTTCTTTGTATA:1	AGTCAAATCAGACAATCTATAG	CCGCTGGTTTCTTCTTTGTATA	-	chr3L	1195605	-	chr3L	1195401	204	+	chr3L	1195401	+	chr3L	1195605
ATGATTTATGGGCCTTTCGGTTAAGCCGCCTGCTTATCGGTAAGACCCTCAGATTTACGAGTTGTGTAT:1	ATGATTTATGGGCCTTTCGGTT	CTCAGATTTACGAGTTGTGTAT	-	chr2L	20069608	-	chr2L	20069534	74	+	chr2L	20069534	+	chr2L	20069608
GAGGAAATATGCACTGGCCGCAGGCTGGATAGGTACACCGCCAGTAAGAAATGCCACAAGAATGCATTCCCTTTT:1	GAGGAAATATGCACTGGCCGCA	CCACAAGAATGCATTCCCTTTT	+	chr3R	6891264	+	chr3R	6891340	76	+	chr3R	6891264	+	chr3R	6891340
ACTTTAATGCCACAAANAATAAGNGGAAATGCCNGAGCNGTGCTCGCACCGACCGATTCGAGNCAACT:1	ACTTTAATGCCACAAANAATAA	CACCGACCGATTCGAGNCAACT	-	chr3L	8238875	-	chr3L	7263361	975514	+	chr3L	7263361	+	chr3L	8238875
TGATTGATNGAATCCGTATGCAACAATTGGACAGTNGACCAGTGTGGGCAAGTGGCAGGGACGCAAAA:1	TGATTGATNGAATCCGTATGCA	GGCAAGTGGCAGGGACGCAAAA	-	chr3R	27619826	-	chr3R	27619718	108	+	chr3R	27619718	+	chr3R	27619826
TATAACAACTAAATCATATTGTTAAATAATAATAGAACAACATAATNTAACAAGAAAATTAAA:1	TATAACAACTAAATCATATTGT	ATAATNTAACAAGAAAATTAAA	-	chr3R	20205691	-	chr3R	20205581	110	+	chr3R	20205581	+	chr3R	20205691
ACAAAAAATATAGTCAATATCAAATTATAGACACTTTCAGAATATTTTTGCTAGTTCTTATAGGATGTGTAACGT:1	ACAAAAAATATAGTCAATATCA	GTTCTTATAGGATGTGTAACGT	+	chr2L	1261149	+	chr2L	1261231	82	+	chr2L	1261149	+	chr2L	1261231
TTAAGCGCTGCGTCTTCCAATCGTTTGTAACTATTGCCGTCCCAGTTAGTGCAAAGCTTTAAATAGGNAAGTTTT:1	TTAAGCGCTGCGTCTTCCAATC	AAGCTTTAAATAGGNAAGTTTT	-	chr2L	1711690	-	chr2L	1711366	324	+	chr2L	1711366	+	chr2L	1711690
ATATGAGCTACTTTTTCCACACTAACCTAAGTTGNTTGCACGTTAAAATAATCAATAAAAAGGTTGTAAAATATT:1	ATATGAGCTACTTTTTCCACAC	AATAAAAAGGTTGTAAAATATT	+	chr2L	10918633	+	chr2L	16945188	6026555	+	chr2L	10918633	+	chr2L	16945188
AAATACTTGTAAAATATGTAAAACCGGCTCATATCAGCAGAACGTGCTGACCAAAAAGAATTCTTTANATACTG:1	AAATACTTGTAAAATATGTAAA	AAAAAGAATTCTTTANATACTG	-	chr2L	19784479	-	chr2L	19784307	172	+	chr2L	19784307	+	chr2L	19784479
AAGTTAGGAACCTTTTTAANAATCGTATTTTCCCGGTGAATACATAAAACGCATACTAATACTAAGTGAAAAAT:1	AAGTTAGGAACCTTTTTAANAA	ATACTAATACTAAGTGAAAAAT	+	chr2L	18079827	+	chr2L	18079912	85	+	chr2L	18079827	+	chr2L	18079912
CGTGTACCGGCAAATTTTGTTTACAGTACAGAAACTGATTTTAATGAACATAGTAACCAGTATTGCTATTT:1	CGTGTACCGGCAAATTTTGTTT	ATAGTAACCAGTATTGCTATTT	-	chr3L	2168877	-	chr3L	2168790	87	+	chr3L	2168790	+	chr3L	2168877
TTACCAAAATACAGATGAATTTTCGACGGCGATGTAGACTGGCAATATTGCCGGGGGCCCTATTTCGTCATAT:1	TTACCAAAATACAGATGAATTT	CGGGGGCCCTATTTCGTCATAT	-	chrX	22870979	-	chrX	22870890	89	+	chrX	22870890	+	chrX	22870979
CTAGAATATCTATTGTGAAAACAACACTTTAGGCCTCGACTATAGGTTCTATAAGGGTGCATTTACTTGACACCG:1	CTAGAATATCTATTGTGAAAAC	AGGGTGCATTTACTTGACACCG	+	chr2L	22011922	+	chr2L	22012003	81	+	chr2L	22011922	+	chr2L	22012003
GTTATACTCAGGGCCATAAACAAAGTTTAAACCTAGACATGCATACATCCTTAAGTAACTTTTAGTTCNATCCTA:1	GTTATACTCAGGGCCATAAACA	AGTAACTTTTAGTTCNATCCTA	-	chr3R	18078236	-	chr3R	18078157	79	+	chr3R	18078157	+	chr3R	18078236
GGATTTCGATTTGGTCAAAATCTTTCGATTGACCATTTAAGTAATTAAATTTAATAGCATTATTTTCAAA:1	GGATTTCGATTTGGTCAAAATC	ATTTAATAGCATTATTTTCAAA	+	chr3R	18559511	+	chr3R	18559654	143	+	chr3R	18559511	+	chr3R	18559654
CTCCTGAGAGTTTCCAAGCCCCACCCCATATCAGTACTACCCGACACAACGAAACCCAAGAAAACGA:1	CTCCTGAGAGTTTCCAAGCCCC	ACAACGAAACCCAAGAAAACGA	-	chr3L	2825811	-	chr3L	2052910	772901	+	chr3L	2052910	+	chr3L	2825811
CCGTAATTTTATAAACACATTTTAGTTGGAATCATTAAGCATTTTTAGCCAGTTTCTTCAACTGATACCAGTAAT:1	CCGTAATTTTATAAACACATTT	TTCTTCAACTGATACCAGTAAT	-	chr3R	26770320	-	chr3R	26770243	77	+	chr3R	26770243	+	chr3R	26770320
GTTGTGTACATATGTATTGTATATATATTTCCCAATGAATTGAACGCCAAATATTTACAACTTCGTCTGGTCTAT:1	GTTGTGTACATATGTATTGTAT	TTTACAACTTCGTCTGGTCTAT	+	chrX	14411277	+	chrX	14411355	78	+	chrX	14411277	+	chrX	14411355
ATCAAAAAAGGTTCGCCCACGACCTCCACAGCTCAATNAAGAGGCNTTGACTAAAGGCTT:1	ATCAAAAAAGGTTCGCCCACGA	AAGAGGCNTTGACTAAAGGCTT	-	chr2L	12963908	-	chr2L	12963821	87	+	chr2L	12963821	+	chr2L	12963908
ACTATTTCGTCCTCAACCACCGTAGTTGTGAATGAAGGGATATCCTCCTTCTCCTTCTTACCTAGACAAGACA:1	ACTATTTCGTCCTCAACCACCG	TCCTTCTTACCTAGACAAGACA	+	chr3L	2058780	+	chr3L	20655088	18596308	+	chr3L	2058780	+	chr3L	20655088
ATTTAACAGTGATAATCTGGAATTGAAGCAATACAATAAAAAAAAAGGGATGAACAATTATACAGGNAAAATTGA:1	ATTTAACAGTGATAATCTGGAA	ACAATTATACAGGNAAAATTGA	-	chr3L	7503536	-	chr3L	7498759	4777	+	chr3L	7498759	+	chr3L	7503536
ACCACTGGTATTTCAACAGGGCAGTTCAGATTACGAGTACACCGCGAATCCTTCTTTCCAATCGTTTCAGTCAAT:2	ACCACTGGTATTTCAACAGGGC	CTTTCCAATCGTTTCAGTCAAT	+	chr2R	24303899	+	chr2R	24303983	84	+	chr2R	24303899	+	chr2R	24303983
CACTTGTCCAAGAAAGCAACTCGAAGATGCTGATGGTGCCGAATACGGAG:1	CACTTGTCCAAGAAAGCAACTC	GCTGATGGTGCCGAATACGGAG	+	chr2L	19559416	+	chr2L	19559467	51	+	chr2L	19559416	+	chr2L	19559467
AATTCGTTTGCTCACTTTATCTCGGCANTCNNGCAATGTTTCGTTAAGCNCNAATATAAAGTCAGATAAACTCT:1	AATTCGTTTGCTCACTTTATCT	AATATAAAGTCAGATAAACTCT	-	chr3R	16073566	-	chr3R	16073463	103	+	chr3R	16073463	+	chr3R	16073566
CTTAAAAGAGGAACATGTTGATAATAAATCGCATTCCAGATGGCGTAGAATAATAGATTAAGTAACNAAGCCAT:1	CTTAAAAGAGGAACATGTTGAT	ATAGATTAAGTAACNAAGCCAT	-	chr2L	5989139	-	chr2L	5989064	75	+	chr2L	5989064	+	chr2L	5989139
ACTTCATAAATGTTAGTCTTACTTTTGTTAACTTAGTCTTATTTTCGTGTTCTAAAAAGGTAGTGTTTAGTGA:1	ACTTCATAAATGTTAGTCTTAC	CTAAAAAGGTAGTGTTTAGTGA	-	chr2R	10313421	-	chr2R	10313329	92	+	chr2R	10313329	+	chr2R	10313421
CACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	CACACAACACAACACAACACAA	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534	6924267	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534
TGGTATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGCCACGCATCCATTCTGGGGTCCTCACTGCGG:1	TGGTATATGGACACCATAAGGC	CATTCTGGGGTCCTCACTGCGG	-	chr3L	11865856	-	chr3L	11864566	1290	+	chr3L	11864566	+	chr3L	11865856
ATGGCATTGTCCTCGTCATGCNTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGGTTGGATGTGTTTGGCCAAGTGGC:1	ATGGCATTGTCCTCGTCATGCN	TGGATGTGTTTGGCCAAGTGGC	+	chr3R	18766803	+	chr3R	18766879	76	+	chr3R	18766803	+	chr3R	18766879
GGCCACTTAACAGCTCGTAAAGCCAAAGGCCGTCACACCTAATAAATATTGTAATTGTNAAATA:1	GGCCACTTAACAGCTCGTAAAG	TAAATATTGTAATTGTNAAATA	+	chrX	4763268	+	chrX	4763745	477	+	chrX	4763268	+	chrX	4763745
GTGGATACCTGTGCAATAATTGCTGCCTACTTTACGGCCAATAAAATCGCAACGCCTTG:1	GTGGATACCTGTGCAATAATTG	CCAATAAAATCGCAACGCCTTG	-	chr3R	28534808	-	chr3R	12565869	15968939	+	chr3R	12565869	+	chr3R	28534808
TTTGATTTCATAAGAACATATCTAGCCTTGATATATATATGAAAATAATTTACTTCACTTCGTTCTGGATCCACT:1	TTTGATTTCATAAGAACATATC	TTCACTTCGTTCTGGATCCACT	-	chr2L	20601866	-	chr2L	20601788	78	+	chr2L	20601788	+	chr2L	20601866
CTTGTGTGTTAAGTTAGCCACGGCTTCCTTAGAAGTTTCCATTGTCTGGTGCAGGAAG:1	CTTGTGTGTTAAGTTAGCCACG	TTCCATTGTCTGGTGCAGGAAG	+	chr3L	15069795	+	chr3L	15069929	134	+	chr3L	15069795	+	chr3L	15069929
CGGATGCAGCATTGCGTGGCAATTACACAAGCCCTCTCCCAGAGTCATAAATTCAGTCCTTTGCCGGGAAAAGCA:1	CGGATGCAGCATTGCGTGGCAA	CAGTCCTTTGCCGGGAAAAGCA	+	chr3R	16756317	+	chr3R	16762508	6191	+	chr3R	16756317	+	chr3R	16762508
GCTTTGGCGTGGACGGATGGACAGCCATCAAAGCAGACATGAAAACAAGTACAAAAAAAAAACAGATAAACCAAA:1	GCTTTGGCGTGGACGGATGGAC	AAAAAAAAACAGATAAACCAAA	+	chr3R	30564327	+	chr3R	30564410	83	+	chr3R	30564327	+	chr3R	30564410
ACAGATTGTCATGTATTCGAATAAAGATGTGGTTAAATGTGAATATATTTTTTTATTTTGCTACCATTTTTAATC:1	ACAGATTGTCATGTATTCGAAT	TATTTTGCTACCATTTTTAATC	-	chrX	11555312	-	chrX	22740834	11185522	+	chrX	22740834	+	chrX	11555312
TTCCAAGTGTAATGCCCCTAATGGTCCACAGCCACCCGCTGTGCCCATTAACAAGTGTTTTGGTCTAATGCATTT:1	TTCCAAGTGTAATGCCCCTAAT	AGTGTTTTGGTCTAATGCATTT	+	chr3L	1925105	+	chr3L	1925192	87	+	chr3L	1925105	+	chr3L	1925192
AAACTTAAAAAGGACGAAAAATAATGTCAAGAGTGTGGGTTTGAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCGAGAACG:1	AAACTTAAAAAGGACGAAAAAT	TGTGTGTGTGTGGGCGAGAACG	-	chr3R	10920661	-	chr3R	30805913	19885252	+	chr3R	30805913	+	chr3R	10920661
TTCAGGCCTTAACCTGTCAGGTCAATAAATCAAAATCAAGCTGCCAAGCCAAGTGAAACACAAGATGATAGGAAG:1	TTCAGGCCTTAACCTGTCAGGT	TGAAACACAAGATGATAGGAAG	+	chr2R	11009821	+	chr2R	11018995	9174	+	chr2R	11009821	+	chr2R	11018995
TGAAATAAAAAATAAAATAAAAGCCGAATAAATGTCGAAGATGTCGCCGCCCGTGCTGTACTACCTGCCGCCCAG:1	TGAAATAAAAAATAAAATAAAA	TGCTGTACTACCTGCCGCCCAG	+	chr3R	8915736	+	chr3R	12384423	3468687	+	chr3R	8915736	+	chr3R	12384423
CGCAAAACACGAATACCCAACTCAAAGNCANNCAGTGGGTCACACATNTNANGAGCCAACTCTGAACGGAGGGCA:1	CGCAAAACACGAATACCCAACT	AGCCAACTCTGAACGGAGGGCA	-	chr3R	18068814	-	chr3R	7623736	10445078	+	chr3R	7623736	+	chr3R	18068814
TCATACTCTCACATGCATCTTTGTTAGAAGGATCGCTATTTTTATGGGGCCGCATAATGAAAACGCGAACGCGAT:1	TCATACTCTCACATGCATCTTT	ATAATGAAAACGCGAACGCGAT	-	chr3L	23040835	-	chr3L	2219217	20821618	+	chr3L	2219217	+	chr3L	23040835
GAAATTGATTGTATTTAATTTAAGTTTAAGTGGTTATGGGTTTTACTTACATTTACATATGTATAT:1	GAAATTGATTGTATTTAATTTA	ACTTACATTTACATATGTATAT	+	chr3L	8634923	+	chr3L	12063638	3428715	+	chr3L	8634923	+	chr3L	12063638
GAAGAATTGAATGAGTTGTGGCCCCATCTCCAATTCCTTCTCTTTCGAAAC:1	GAAGAATTGAATGAGTTGTGGC	CCAATTCCTTCTCTTTCGAAAC	+	chrX	7299597	+	chrX	13516715	6217118	+	chrX	7299597	+	chrX	13516715
CAGCGCAGCAACAATAACAAAAACAGAAACCGTCAGCGTAAGGACAACACCGCGTGTTTGCTGTCAG:1	CAGCGCAGCAACAATAACAAAA	AACACCGCGTGTTTGCTGTCAG	+	chr3L	1432118	+	chr3L	1432200	82	+	chr3L	1432118	+	chr3L	1432200
ATGAGGCATAGCCGCTTTNCAAAAATAATCACATTTTTCATNTGCNCTCAGCTATTCCGACATCTTGCCACATTC:1	ATGAGGCATAGCCGCTTTNCAA	ATTCCGACATCTTGCCACATTC	+	chrX	8993326	+	chrX	8993402	76	+	chrX	8993326	+	chrX	8993402
CGGCATATGAGCTGTGGGCTGCAGCTGGTGCGGAATAGGATGCATGGGACACAGATGGAGCGGCGTAGG:1	CGGCATATGAGCTGTGGGCTGC	GACACAGATGGAGCGGCGTAGG	-	chrX	14189978	-	chrX	14189889	89	+	chrX	14189889	+	chrX	14189978
TGTATATAGAATATATATATATATGAGAATATATATCCCATATATATGGGAATTTAAAAAAACATTGGATGCCAA:1	TGTATATAGAATATATATATAT	TTAAAAAAACATTGGATGCCAA	-	chrX	19367514	-	chrX	2974015	16393499	+	chrX	2974015	+	chrX	19367514
CACCCATCAAATTAGAAAAATATGTGCACTTAAATATTCTTGATTTAGATCCAAGTACACCCACAGNCACCAGCA:1	CACCCATCAAATTAGAAAAATA	AGTACACCCACAGNCACCAGCA	+	chr2R	15330238	+	chr2R	15330372	134	+	chr2R	15330238	+	chr2R	15330372
CCAATGTCGAAACTTATTACCTTGACTGGGGTGCTAACATATAATAATATAGTATAATCAATGCAAATTATTGCA:1	CCAATGTCGAAACTTATTACCT	ATAATCAATGCAAATTATTGCA	-	chrX	3058292	-	chrX	3058051	241	+	chrX	3058051	+	chrX	3058292
GAAATAAAACAACAAATTTGACCTGCGAGCATAGGCAGCAGCAGCGACACAGTATAATTAGGTTTGCCTTCTGTG:1	GAAATAAAACAACAAATTTGAC	ATAATTAGGTTTGCCTTCTGTG	+	chr3L	24021278	+	chr3L	24022435	1157	+	chr3L	24021278	+	chr3L	24022435
AGGGTAACTGAAATAATAATATATAAAACGCAATCAATTATGAGTTCAATGCTATTGCCAACCCAATGAGCACCC:1	AGGGTAACTGAAATAATAATAT	ATTGCCAACCCAATGAGCACCC	+	chr2R	22072681	+	chr2R	22072766	85	+	chr2R	22072681	+	chr2R	22072766
ACTGATTTCCATAATTATTTAATTTCCTTTTTTCTGAAATTGAAAACAAGTACCGAAAGGCAGGACCACAAACTG:1	ACTGATTTCCATAATTATTTAA	CGAAAGGCAGGACCACAAACTG	-	chr2L	14369246	-	chr2L	14369130	116	+	chr2L	14369130	+	chr2L	14369246
TTCCTCGAACTTTTTGGTTCTGCTAACTTCGGCTTAGACTGATGAGTTGTCCTTTT:1	TTCCTCGAACTTTTTGGTTCTG	TAGACTGATGAGTTGTCCTTTT	-	chr3L	20266556	-	chr3L	20266420	136	+	chr3L	20266420	+	chr3L	20266556
TAGCAGATTTCAACTTGTTGCACGCACATCCTTACCTAAATGTAATATACATATGGGAGCTAGGGCACTAGGCCC:1	TAGCAGATTTCAACTTGTTGCA	TGGGAGCTAGGGCACTAGGCCC	+	chr2R	9374839	+	chr2R	9375444	605	+	chr2R	9374839	+	chr2R	9375444
ATACGTATGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGCATTTATGTATATGCAAAAGTAATTG:1	ATACGTATGTGTGTGTGTGTGT	TATGTATATGCAAAAGTAATTG	+	chrX	15483497	+	chrX	13898740	1584757	+	chrX	15483497	+	chrX	13898740
CAATTACAATATTTATTAGGTGTGACGGCCTTTGGCTTTACGAGCTGTTAAGTGGCCACCAAGACGAACGGCAAT:1	CAATTACAATATTTATTAGGTG	GGCCACCAAGACGAACGGCAAT	-	chrX	4763738	-	chrX	4763250	488	+	chrX	4763250	+	chrX	4763738
AGGGNGCCAAAATGAGCGCTGGNGATANATATGTATGTGNCCTTGCCGCAGTCCCGAATGTCCTGGCCG:1	AGGGNGCCAAAATGAGCGCTGG	GCAGTCCCGAATGTCCTGGCCG	-	chr2L	11680437	-	chr2L	11680324	113	+	chr2L	11680324	+	chr2L	11680437
TTCGGAAGCCAAATGTCAAATGATGTACCTAGACTACTACTACCTAGATCTGTAGTCGTGAACTGTNCATTATCG:1	TTCGGAAGCCAAATGTCAAATG	AGTCGTGAACTGTNCATTATCG	-	chr3R	26385503	-	chr3R	26376343	9160	+	chr3R	26376343	+	chr3R	26385503
CATTCTTAGCATGTTTGTTTGTGGTTTGCCTTTGTTTTTGTTTATCGCCAATC:1	CATTCTTAGCATGTTTGTTTGT	TTGTTTTTGTTTATCGCCAATC	-	chr3L	1374514	-	chr3L	1374459	55	+	chr3L	1374459	+	chr3L	1374514
GGCATACTTTCGGGCGGAAACCGAACTCACCTGCTGAGTTGAGCTGAGACCAGGTTGCTGTACGGAGCATAC:1	GGCATACTTTCGGGCGGAAACC	CAGGTTGCTGTACGGAGCATAC	-	chr3R	6206508	-	chr3R	6206294	214	+	chr3R	6206294	+	chr3R	6206508
ATTATCTATGCAGCGTGGACACACAAAGGAAGATAGCGAGATTGGACAGGGATTCCTCAGGTAAGTCCGACACCA:1	ATTATCTATGCAGCGTGGACAC	TCCTCAGGTAAGTCCGACACCA	+	chrX	17282891	+	chrX	17282969	78	+	chrX	17282891	+	chrX	17282969
AGAGGAAATATGCACTGGCCGCAGGCTGGATAGGTACACCGCCAGTAAGAAATGCCACAAGAATGCATTCCCTTT:1	AGAGGAAATATGCACTGGCCGC	GCCACAAGAATGCATTCCCTTT	+	chr3R	6891263	+	chr3R	6891339	76	+	chr3R	6891263	+	chr3R	6891339
CGCCTTCATGGTCAAAGTCTTCGTAGTGCGAGTTTCTGCTGCTCACCAAGCACTCCCCTTTTGAACTCCGCAG:1	CGCCTTCATGGTCAAAGTCTTC	ACTCCCCTTTTGAACTCCGCAG	+	chr2R	24947398	+	chr2R	14026095	10921303	+	chr2R	24947398	+	chr2R	14026095
GAAGCCATATTCGCCAAATCGAAGAATATATACCCTTGAAATTGTTAAATACATAAAAAATGGAAG:1	GAAGCCATATTCGCCAAATCGA	TTAAATACATAAAAAATGGAAG	-	chr3R	27868264	-	chr3R	27862968	5296	+	chr3R	27862968	+	chr3R	27868264
TGCATTTAAAAGTGGTCGTATCTCTTAATCTTTTTGGGGCAACTTTAAAAGTGAGAATGTAAATGATTCTTAAAT:1	TGCATTTAAAAGTGGTCGTATC	AGAATGTAAATGATTCTTAAAT	+	chr2R	7196575	+	chr2R	7201350	4775	+	chr2R	7196575	+	chr2R	7201350
TGCTGTTCTCCCACGTTTAGGCGGGTGTGGAATGCGGTAGCGGAAAAGGACA:1	TGCTGTTCTCCCACGTTTAGGC	AATGCGGTAGCGGAAAAGGACA	-	chr2R	21594284	-	chr2R	21593597	687	+	chr2R	21593597	+	chr2R	21594284
TAATATTTAATGAAGTGTCACAATTATAATATATTCTTGTAATCAATGTTTATATTATGTAAATCAGCTGTCGCT:1	TAATATTTAATGAAGTGTCACA	ATTATGTAAATCAGCTGTCGCT	+	chr2L	20303184	+	chr2L	20310652	7468	+	chr2L	20303184	+	chr2L	20310652
GATCTTGCAGTTTTACCAATTTTCAAGTTCGAATAGTTTATCATTGCCACAAAAAACAGTTAACTANAGATTAAA:1	GATCTTGCAGTTTTACCAATTT	AAACAGTTAACTANAGATTAAA	-	chrX	16681725	-	chrX	16681649	76	+	chrX	16681649	+	chrX	16681725
CAGCGCGTGTGCCACATANAAATGGCATTTTGACATGGCCANCGGNTGAGCATTATGAATGCTTGCCATGAT:1	CAGCGCGTGTGCCACATANAAA	CATTATGAATGCTTGCCATGAT	-	chr3R	17348836	-	chr3R	17348750	86	+	chr3R	17348750	+	chr3R	17348836
ACTCATACGATTTATTGCTTCTAATGTTAATGATGTTTGAATGTTTGCCATACAGACTAAAAAAAGCAAGACCCG:1	ACTCATACGATTTATTGCTTCT	AGACTAAAAAAAGCAAGACCCG	-	chr3L	9390989	-	chr3L	9390859	130	+	chr3L	9390859	+	chr3L	9390989
CACACGACAAAATACAACGANACTCGGGCTTGNGTTTTCCGCNGACAAGCTGCGTGCGGCGGAAGTG:1	CACACGACAAAATACAACGANA	CAAGCTGCGTGCGGCGGAAGTG	-	chr3R	19414772	-	chr3R	21860970	2446198	+	chr3R	21860970	+	chr3R	19414772
TTAGCTGCCTGCCGAACTCATTGCTGATACCACTAACTTACTTGCATACAAGACGCCAAGACAAAGACTTGGGG:1	TTAGCTGCCTGCCGAACTCATT	ACGCCAAGACAAAGACTTGGGG	-	chr3R	4681910	-	chr3R	4681831	79	+	chr3R	4681831	+	chr3R	4681910
TATTAACACATTTCGGTGGTGTTTCGGTGGCTGGNGACAGGAAGAAAATTATAAAATCAACCGTCATATAGAAAA:1	TATTAACACATTTCGGTGGTGT	AAATCAACCGTCATATAGAAAA	+	chr2L	21113018	+	chr2L	21926935	813917	+	chr2L	21113018	+	chr2L	21926935
GCGAAAATTCTAACAAACATTGAGAGAATTTTAAAGGTCAGGTATAAACTCTATATGGAAATTTTANATTACAGG:1	GCGAAAATTCTAACAAACATTG	TATGGAAATTTTANATTACAGG	-	chr2L	19824511	-	chr2L	19824428	83	+	chr2L	19824428	+	chr2L	19824511
TAATTTCAATGAAACTTTTCAAGTTGAAAAGATAGTAATGCTCTCCTGCTTAACAAAATCACTGCGAATAAAATC:1	TAATTTCAATGAAACTTTTCAA	CAAAATCACTGCGAATAAAATC	+	chr2L	4060178	+	chr2L	4060254	76	+	chr2L	4060178	+	chr2L	4060254
ATACTCTACACTCGAGCAATGGCAATTTGCGTCGGTACGAATTTCACATTAGCCCCATGACATCTCTCAATGCGG:1	ATACTCTACACTCGAGCAATGG	CCCATGACATCTCTCAATGCGG	-	chr3L	9918986	-	chr3L	9918891	95	+	chr3L	9918891	+	chr3L	9918986
ACTTTGACTGCACACGCATCGCCCCTCTTCCACGGACACTCACCTGANGGAGTCGGCAAACTTTTGCATAATAAA:1	ACTTTGACTGCACACGCATCGC	CGGCAAACTTTTGCATAATAAA	-	chr3L	6353461	-	chr3L	6353381	80	+	chr3L	6353381	+	chr3L	6353461
ACCAGACACACACACCAGCACCGGTTCAAGCCAATGGGCAATCAAAATCATAACTTATTTGCATACATACGA:1	ACCAGACACACACACCAGCACC	TAACTTATTTGCATACATACGA	-	chr2R	23024769	-	chr2R	24705879	1681110	+	chr2R	24705879	+	chr2R	23024769
CTAAATACAAGGACAATCATATCANTCTAATCATGTGATGCATTGAGTGTTTGTTATGCTTCTACT:1	CTAAATACAAGGACAATCATAT	GAGTGTTTGTTATGCTTCTACT	-	chr2R	18143151	-	chr2R	18142921	230	+	chr2R	18142921	+	chr2R	18143151
GGTCATAACAAAGGGCCAACAGTGGAAATGGGTTAAGCTGCTCAGTTGCT:1	GGTCATAACAAAGGGCCAACAG	TGGGTTAAGCTGCTCAGTTGCT	-	chr3R	23073741	-	chr3R	23073677	64	+	chr3R	23073677	+	chr3R	23073741
GGGATTAGCCGACGGAGCAGNTGATGTCCCAANCGAAACGCTNCAAAAAGAAAGCAGAGGAAGGGGAGTAAA:1	GGGATTAGCCGACGGAGCAGNT	AAAGCAGAGGAAGGGGAGTAAA	-	chr3R	4861660	-	chr3R	4861582	78	+	chr3R	4861582	+	chr3R	4861660
CTTTCAAAAACCCCACCCAATTGTTGTTTAAAGTTCTAAGACCCCGACAATTGCAACGGAAGTGCGTTCATTATT:1	CTTTCAAAAACCCCACCCAATT	CAACGGAAGTGCGTTCATTATT	-	chr3R	9605199	-	chr3R	9605087	112	+	chr3R	9605087	+	chr3R	9605199
TTGTTGCTTGTGTCATCGAAGCCGCTTCACAAAAAGATGATACATCCGTNAACAAGTTGGGCAACCGGAAATTTA:1	TTGTTGCTTGTGTCATCGAAGC	AAGTTGGGCAACCGGAAATTTA	-	chr2R	15755322	-	chr2R	15755239	83	+	chr2R	15755239	+	chr2R	15755322
TTTCTTACAATAATGCATTTGATTTCATAAGAACATATCTAGCCTTGATATATATATGAAAATAATTTACTTCAC:1	TTTCTTACAATAATGCATTTGA	ATATGAAAATAATTTACTTCAC	-	chr2L	20601883	-	chr2L	20601805	78	+	chr2L	20601805	+	chr2L	20601883
CCTTATGACGATATTTCCATACACATATGTATATGAATATATATATATTTCTTGGCCGTTTTCCAGATTATTT:1	CCTTATGACGATATTTCCATAC	TTGGCCGTTTTCCAGATTATTT	+	chr2R	6194690	+	chr2R	6194771	81	+	chr2R	6194690	+	chr2R	6194771
AGCCCAATATTAGAAAATAACCAAGTCAAAAAAATTCCCTCTGGTAATTAGCTTTAAAAGTGCTAGTCGTAT:1	AGCCCAATATTAGAAAATAACC	GCTTTAAAAGTGCTAGTCGTAT	-	chrX	3502264	-	chrX	3493108	9156	+	chrX	3493108	+	chrX	3502264
AAATTGATATATGTAAAACTTTCTCGTTAAAATAAGCCTAAAACNAGAAAATTTCTTGCCGTGCTCGCTTACT:1	AAATTGATATATGTAAAACTTT	TTTCTTGCCGTGCTCGCTTACT	-	chr3L	19981285	-	chr3L	19981207	78	+	chr3L	19981207	+	chr3L	19981285
AAGGTCAAAAAGCCACTTTTAAACACGATTCGACTATACTTATTATAGTATATAGATAGTATGTTATATAGAT:1	AAGGTCAAAAAGCCACTTTTAA	ATAGATAGTATGTTATATAGAT	-	chr2R	14514601	-	chr2R	14514494	107	+	chr2R	14514494	+	chr2R	14514601
AAGCGGAAACGGAAACGANAACGAAAACGGAAGACGTGTAGNGNANATGCACACAACCAAGCAAGATTACTACAG:1	AAGCGGAAACGGAAACGANAAC	CAACCAAGCAAGATTACTACAG	+	chr3R	11801051	+	chr3R	9464457	2336594	+	chr3R	11801051	+	chr3R	9464457
CTGTTATAAATTCCGTCGAATCCTGAAGCTTTAATGGAGTCAGAATGGCGAAAGGAGGTATGGAATGAAGTA:1	CTGTTATAAATTCCGTCGAATC	AAAGGAGGTATGGAATGAAGTA	+	chr2R	5639656	+	chr2R	1880787	3758869	+	chr2R	5639656	+	chr2R	1880787
CTACGAATGCGGTTTTCCACTCTCTTTTTTGTCATATAGGGAAAATTGGTGGCT:1	CTACGAATGCGGTTTTCCACTC	CATATAGGGAAAATTGGTGGCT	-	chr3R	16709011	-	chr3R	16708948	63	+	chr3R	16708948	+	chr3R	16709011
TGCAAATATTTCATCTAAATTTCATCATCGATTATGGCGAATTAAATAAACAAATTAAATTTTATTTTGCAGT:1	TGCAAATATTTCATCTAAATTT	AAATTAAATTTTATTTTGCAGT	+	chr3L	11849357	+	chr3L	11849455	98	+	chr3L	11849357	+	chr3L	11849455
GTTTAATAGAAACTAGAGTTAGGTTCTTTTATTTATATTGGTGTTTAGGCTTGGGCTTCGTTTAGCTATTTTATT:1	GTTTAATAGAAACTAGAGTTAG	GGCTTCGTTTAGCTATTTTATT	+	chr3R	14058436	+	chr3R	27563305	13504869	+	chr3R	14058436	+	chr3R	27563305
TCTCGTAGTTTTTCGTGCCCAAAAAAGTATGCTACGCTTTGTGGTTCCCACGCAGCGTGCAATATGATAAATAGA:1	TCTCGTAGTTTTTCGTGCCCAA	AGCGTGCAATATGATAAATAGA	-	chr3R	29407930	-	chr3R	29406644	1286	+	chr3R	29406644	+	chr3R	29407930
AGCGAAGACGAATACCATTGCACAGAAAAAAAAACAAAACAAAATATAATTAAATTTGGGCATTTGTAAAGGGAA:1	AGCGAAGACGAATACCATTGCA	ATTTGGGCATTTGTAAAGGGAA	-	chr3R	26968993	-	chr3R	19628775	7340218	+	chr3R	19628775	+	chr3R	26968993
TATTCAATGTCCATTTCGGACTATGAATCACTTTATAACTCTCCGCAAACTTAACCTGTACTCGGATGTATTAAT:1	TATTCAATGTCCATTTCGGACT	ACCTGTACTCGGATGTATTAAT	+	chrY	1618829	+	chrY	381074	1237755	+	chrY	1618829	+	chrY	381074
AGACCGCGTTTTTTTTTTAATTTTTGTACTTTTTTATTTCGTTTTTTTTTCTCTTTTTTTT:1	AGACCGCGTTTTTTTTTTAATT	CGTTTTTTTTTCTCTTTTTTTT	-	chrX	12397818	-	chrX	8517637	3880181	+	chrX	8517637	+	chrX	12397818
AAGCAATTTTTTACCATAAACACCAGGGTGTTTTAGGCCAGAGTTTTAGGCCTGAAATTGGATGATTATATTTTC:1	AAGCAATTTTTTACCATAAACA	GAAATTGGATGATTATATTTTC	+	chr2L	18522083	+	chr2L	18522213	130	+	chr2L	18522083	+	chr2L	18522213
CTTATGCTNTTCCGATCTGGTAGCCCTGGTCTGTCC:1	CTTATGCTNTTCCGATCTGGTA	ATCTGGTAGCCCTGGTCTGTCC	-	chr2R	8518769	-	chr2R	12066202	3547433	+	chr2R	12066202	+	chr2R	8518769
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGTGGAAAACACTCCCTCTGTGTTTGTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	AACACTCCCTCTGTGTTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	9107921	12799613	+	chr3R	9107921	+	chr3R	21907534
CAAATAAGGTGAGTAATTGGATCTCATATATAGAGTGCTTTTCTTTTTAAGAGTGCATTTCTGAGTGTGTAGCGC:1	CAAATAAGGTGAGTAATTGGAT	TGCATTTCTGAGTGTGTAGCGC	-	chr2L	19441145	-	chr2L	19441068	77	+	chr2L	19441068	+	chr2L	19441145
AGATTCATTCAAGTAGTGCGGCATTTATTAAATCGGAAATAAGTCGAACTTTAAT:1	AGATTCATTCAAGTAGTGCGGC	CGGAAATAAGTCGAACTTTAAT	+	chr3R	25828572	+	chr3R	25828308	264	+	chr3R	25828572	+	chr3R	25828308
CTCAATCAGCTTAGCCAAATCAACACAACTTCAGTGACAAAATGCAGATGCCTTAACAAGAGACCGGTTTACACA:1	CTCAATCAGCTTAGCCAAATCA	TAACAAGAGACCGGTTTACACA	+	chr2L	6990271	+	chr2L	5760627	1229644	+	chr2L	6990271	+	chr2L	5760627
GCCCATTTACATTTTACGCANGGCATTATNATTATTTCTTTTTTTTTT:1	GCCCATTTACATTTTACGCANG	TATNATTATTTCTTTTTTTTTT	+	chrX	16647076	+	chrX	8979425	7667651	+	chrX	16647076	+	chrX	8979425
ACTATTTGCATAGCATACTTTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGGTATAAAATTAAAAAACTCGAA:1	ACTATTTGCATAGCATACTTTT	GTATAAAATTAAAAAACTCGAA	+	chrX	7845728	+	chrX	7847219	1491	+	chrX	7845728	+	chrX	7847219
AATGTGTTCTTGGCACTCATTTCGCCTCACTTTTCCCCCCCCACCACTTGATTCAC:1	AATGTGTTCTTGGCACTCATTT	CCCCCCCCACCACTTGATTCAC	+	chr2R	19331254	+	chr2R	19331315	61	+	chr2R	19331254	+	chr2R	19331315
CCTCCCATTCCATTACCACCCATTCCACCCATTCCTCCCATCCCACCTGGACCCATTCCATTACCACCCATACCG:1	CCTCCCATTCCATTACCACCCA	CATTCCATTACCACCCATACCG	-	chr2L	17287164	-	chr2L	17287054	110	+	chr2L	17287054	+	chr2L	17287164
AAGCCAATTAATAGACATATTGTAAATGGTTGCCATTGAAACGGCAGNTTTGTAAAGACAAGTTCGCNCAG:1	AAGCCAATTAATAGACATATTG	TTGTAAAGACAAGTTCGCNCAG	-	chr3L	22624649	-	chr3L	22617201	7448	+	chr3L	22617201	+	chr3L	22624649
TCCACCTGCAACGAGCTCCGTGCAACGGGCACCGGTTCCCACACAGCCCACTAGATCCACTNCGGGTCTATTGAA:1	TCCACCTGCAACGAGCTCCGTG	GATCCACTNCGGGTCTATTGAA	+	chr2R	12417485	+	chr2R	12417565	80	+	chr2R	12417485	+	chr2R	12417565
GAAGAAAATTTAACAAGCGAGTTCTGCGTTTAATTGTTTGCATGATGAATGATGTATTATTATTTGTANTTTG:1	GAAGAAAATTTAACAAGCGAGT	ATGTATTATTATTTGTANTTTG	-	chr3L	4915062	-	chr3L	4914818	244	+	chr3L	4914818	+	chr3L	4915062
CTACTGTGCTCAAAGTTTCCGAGGCCCACTTCCCTGCCATCGCTAAACTNCCGACGCTTGTTTAAACATTTTACG:1	CTACTGTGCTCAAAGTTTCCGA	ACGCTTGTTTAAACATTTTACG	-	chr3L	21518836	-	chr3L	14366259	7152577	+	chr3L	14366259	+	chr3L	21518836
TTATACTTTCTGTCAGCGGCTTTGATTGCCAAAGGGCATTAAGTAGGATGGGTAGTTTTTCCGCCTAATTAGG:1	TTATACTTTCTGTCAGCGGCTT	GTAGTTTTTCCGCCTAATTAGG	+	chr3R	20060641	+	chr3R	20060722	81	+	chr3R	20060641	+	chr3R	20060722
AAGACTCGAGAGCCCAAGAGCTGAAAACCAGACCACAAATGCTAATCAGCGATGCTTTATGATTTTCNGTATAT:1	AAGACTCGAGAGCCCAAGAGCT	TGCTTTATGATTTTCNGTATAT	-	chr3R	27470718	-	chr3R	27470057	661	+	chr3R	27470057	+	chr3R	27470718
AAATAAAATATATAAAAAAATGTTGCATAGCGGCAGGCGCAAAGTGTGATGAAGCTTTTGCGGAAANAGGGGAGT:1	AAATAAAATATATAAAAAAATG	GCTTTTGCGGAAANAGGGGAGT	+	chr3L	21749325	+	chr3L	21754485	5160	+	chr3L	21749325	+	chr3L	21754485
CATATGTATTGTATATATATTTCCCAATGAATTGAACGCCAAATATTTACAACTTCGTCTGGTCTATGTTGCATA:1	CATATGTATTGTATATATATTT	TTCGTCTGGTCTATGTTGCATA	+	chrX	14411285	+	chrX	14411363	78	+	chrX	14411285	+	chrX	14411363
GTACGCCACATTATTCCTCACACAATCGCCGTGGGGGCCAGAGTATGCCAGTATGGGGAACATGTTTGCTATC:1	GTACGCCACATTATTCCTCACA	TATGGGGAACATGTTTGCTATC	-	chr2R	16290512	-	chr2R	5843148	10447364	+	chr2R	5843148	+	chr2R	16290512
CTTCCCAGTTTCCTCGACTGCCTGACAGCCGCGCACTCATATTCAGACTCCCCGGGAACATATACATGTACGTCA:1	CTTCCCAGTTTCCTCGACTGCC	GGGAACATATACATGTACGTCA	-	chr3R	5142854	-	chr3R	32013778	26870924	+	chr3R	32013778	+	chr3R	5142854
TTATGTATGTAAAGCAAACTCAATTGAATTAAATCAGTTGCCATCAGAGCACTTAAACGGGTAAATANAGTTGT:1	TTATGTATGTAAAGCAAACTCA	TTAAACGGGTAAATANAGTTGT	-	chr2L	14378750	-	chr2L	14378672	78	+	chr2L	14378672	+	chr2L	14378750
GCAGCTAATCGAAGGGAAAGTGTATACAATTTCGTTGTAGTCATAAAATGTAATTAATTAACTTAAAGTGATGAT:1	GCAGCTAATCGAAGGGAAAGTG	TTAATTAACTTAAAGTGATGAT	-	chrX	14813823	-	chrX	14813745	78	+	chrX	14813745	+	chrX	14813823
GGCGGGCGAACGGGAAAATATCTCAGCGAGGGCCTCTGGGCGCATAATCGAAAGTTCTTCAAAATGCATG:1	GGCGGGCGAACGGGAAAATATC	CGAAAGTTCTTCAAAATGCATG	-	chr3R	7681495	-	chr3R	7680869	626	+	chr3R	7680869	+	chr3R	7681495
AGATTCAAGGGGGAAAATGGAATATGCCTTTGCATGGGTTAGCTAATCTCGCAGCTTATTCCGTTTTTAATTA:1	AGATTCAAGGGGGAAAATGGAA	CAGCTTATTCCGTTTTTAATTA	+	chr2R	23784474	+	chr2R	23784550	76	+	chr2R	23784474	+	chr2R	23784550
GCCATAAACAACAACCATACTGCAGTTACTCCAATAACAACTGAAACAACACGTAACTAGCACTTAAGAAAACCC:1	GCCATAAACAACAACCATACTG	TAACTAGCACTTAAGAAAACCC	+	chr3L	1885991	+	chr3L	16807067	14921076	+	chr3L	1885991	+	chr3L	16807067
TATTATTTTATTTATTACTTTTTANAACTCACCCATCTCGATNAGNGGTATNTACNGTAGCCAGACCTTATTTA:1	TATTATTTTATTTATTACTTTT	TACNGTAGCCAGACCTTATTTA	-	chr3L	20584792	-	chr3L	17313323	3271469	+	chr3L	17313323	+	chr3L	20584792
CCCAAATCAAAAACAGCCAATGCCAAAATGAAAATCGAGGGGCGGAGCCCCGGTGAGCTGGTCAGCATTTCAG:1	CCCAAATCAAAAACAGCCAATG	GGTGAGCTGGTCAGCATTTCAG	+	chr3L	6773661	+	chr3L	7299502	525841	+	chr3L	6773661	+	chr3L	7299502
CTGTACGAAGTAACAAGAATTTTATGAAATAATTTAAGCCTTATACCT:1	CTGTACGAAGTAACAAGAATTT	AAATAATTTAAGCCTTATACCT	+	chr3R	16246555	+	chr3R	16246604	49	+	chr3R	16246555	+	chr3R	16246604
TTAGCTGCCAAAATTCCAGATGTANACACTACCTCGCAACGTNGTNAAGATNTAGNTCGCTCGAACTTCGCTGT:1	TTAGCTGCCAAAATTCCAGATG	TAGNTCGCTCGAACTTCGCTGT	+	chr2R	3382713	+	chr2R	4519987	1137274	+	chr2R	3382713	+	chr2R	4519987
CAATAGTTGGATTCCAGGACCAAGTCCTGCCTCTCCACCCAAATTCCACNCCCTGCTGGGCGATGGTCGTTGAGA:1	CAATAGTTGGATTCCAGGACCA	TGCTGGGCGATGGTCGTTGAGA	-	chr3L	19358529	-	chr3L	12936796	6421733	+	chr3L	12936796	+	chr3L	19358529
CCCACCACGAGAACAACACAATGAAAACAGCAACGCACTCATAATTGCTGGA:1	CCCACCACGAGAACAACACAAT	CAACGCACTCATAATTGCTGGA	+	chr2L	13894151	+	chr2L	1144789	12749362	+	chr2L	13894151	+	chr2L	1144789
CTAACAACTCGTAGCATTGCAGCTGCCAGATGTGGTAAGAATAGGGATGGGGATTGCTATTCACCGGCCAGCTG:1	CTAACAACTCGTAGCATTGCAG	ATTGCTATTCACCGGCCAGCTG	+	chr2R	8790654	+	chr2R	12786633	3995979	+	chr2R	8790654	+	chr2R	12786633
TATTATAATTAGATTATTGTGTTGTATTTTCTTGCAAGAAACGGGAANGGGGTATCTTATANTCGCATTTTAAAT:1	TATTATAATTAGATTATTGTGT	ATCTTATANTCGCATTTTAAAT	+	chr2L	18659941	+	chr2L	18660025	84	+	chr2L	18659941	+	chr2L	18660025
GGGTAACTTGCCAAAATATAGAGTGACGATGACATTCCCGTTTTCAAGATTTATTGCTAGACGGGGAAAATGTT:1	GGGTAACTTGCCAAAATATAGA	ATTGCTAGACGGGGAAAATGTT	+	chr3R	19447170	+	chr3R	19447390	220	+	chr3R	19447170	+	chr3R	19447390
TGTACTATNATTTTTTGGCATTTTATTAGACACTATAATTTCTGATTCTGTCCCATTTATTCTTCGAGCCGTTT:1	TGTACTATNATTTTTTGGCATT	CCATTTATTCTTCGAGCCGTTT	-	chr2L	10692910	-	chr2L	10692813	97	+	chr2L	10692813	+	chr2L	10692910
TGAAGTGTCGCAATGGGATAATTAAGCTTTNNNTNCCGTTTTGGCCTTTGTTTCATCTTGTTT:1	TGAAGTGTCGCAATGGGATAAT	TGGCCTTTGTTTCATCTTGTTT	+	chr2L	17067128	+	chr2L	21030937	3963809	+	chr2L	17067128	+	chr2L	21030937
AAGCAGTCAGTTCCTGTTGCAAACAGGACTGTAAACTCTCGCAAATTAAGCGGCGCGGGATGGAGGATGCCATAA:1	AAGCAGTCAGTTCCTGTTGCAA	CGCGGGATGGAGGATGCCATAA	-	chr3R	30072609	-	chr3R	30073048	439	+	chr3R	30073048	+	chr3R	30072609
AAAAGATTTGATTAATAGTTTCGCAACATGAAAAAATCAACAGCATTCCACACGGTTTAGCCCTTATTTTTCG:1	AAAAGATTTGATTAATAGTTTC	ACGGTTTAGCCCTTATTTTTCG	-	chr2R	14922229	-	chr2R	14922155	74	+	chr2R	14922155	+	chr2R	14922229
TATTAGGCATATTTCGTTTACTTGTGGAGAAGGCAGTTATGTAAGCTCACTCAAGATTGTAAATTCAGCACTTTA:1	TATTAGGCATATTTCGTTTACT	AGATTGTAAATTCAGCACTTTA	+	chr2L	1164249	+	chr2L	1164335	86	+	chr2L	1164249	+	chr2L	1164335
CCCACAAATATTTATTGTATGAATCGCTAGAGCCAATGGTATTTATGCTAAATTACACATTAAAACATTATTTGT:1	CCCACAAATATTTATTGTATGA	TACACATTAAAACATTATTTGT	-	chr3R	24761028	-	chr3R	14333567	10427461	+	chr3R	14333567	+	chr3R	24761028
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACGAGAC:1	ACACAACACAACACAACACAAC	ACAACACAACACAACACGAGAC	+	chr3R	21907534	+	chr3R	9620954	12286580	+	chr3R	21907534	+	chr3R	9620954
AACATGCGCGACTGTTACAGTTACGATAATTTATGCATGCGATATACAACCATTGACTCCGGCTT:1	AACATGCGCGACTGTTACAGTT	ATACAACCATTGACTCCGGCTT	-	chr2L	9980858	-	chr2L	9973749	7109	+	chr2L	9973749	+	chr2L	9980858
ATCCGACTCATGTTTTTCTTTTATTAAATTTGCTGGCTATTCAATCTCTAAATATGGGAACACCACTTGCCAAA:1	ATCCGACTCATGTTTTTCTTTT	TATGGGAACACCACTTGCCAAA	+	chr3L	1905374	+	chr3L	1905467	93	+	chr3L	1905374	+	chr3L	1905467
ACGAAAGAACAAGAATTTCGAAATGGGATNGGTTTTTGGATGGTTTTCTTGGTGGGCGTTNGTGTCGTCGCTTCC:1	ACGAAAGAACAAGAATTTCGAA	GGGCGTTNGTGTCGTCGCTTCC	-	chr3L	9976556	-	chr3L	16792661	6816105	+	chr3L	16792661	+	chr3L	9976556
GTCGTATCCAAACTGTCGTCTTATTGGATTGGCAACGACCCACTGTGC:1	GTCGTATCCAAACTGTCGTCTT	GATTGGCAACGACCCACTGTGC	+	chr3R	31878644	+	chr3R	31878716	72	+	chr3R	31878644	+	chr3R	31878716
TGCCACTTGCCCACACTGGTCGACTGTCCAATTGTTGCATACGGATTCAATCAATCAATTATGCAACT:1	TGCCACTTGCCCACACTGGTCG	TCAATCAATCAATTATGCAACT	+	chr3R	27619729	+	chr3R	27619837	108	+	chr3R	27619729	+	chr3R	27619837
CAATTAATGAAAATAAACAGCCGCGGGCCAGACAACAACAACAACAACAACAGCAGCAACAACAACAACACGACT:1	CAATTAATGAAAATAAACAGCC	CAGCAACAACAACAACACGACT	-	chr3R	18123955	-	chr3R	25662092	7538137	+	chr3R	25662092	+	chr3R	18123955
TGCCATGACCGAGTTGGGTTCAGTTCCATCTGTCATGGTCTATCAAAAGTGTTGTCACTTCACAGCTGTCTGAGC:1	TGCCATGACCGAGTTGGGTTCA	GTCACTTCACAGCTGTCTGAGC	+	chr3R	22185165	+	chr3R	22185262	97	+	chr3R	22185165	+	chr3R	22185262
GTAAGAAGTCAAAGACCAAGTAACGGCAAACCAGAGAAAGTCAAAAGTGCGTCGTTGG:1	GTAAGAAGTCAAAGACCAAGTA	AAAGTCAAAAGTGCGTCGTTGG	-	chr3R	13339177	-	chr3R	26786888	13447711	+	chr3R	26786888	+	chr3R	13339177
ACAAGTTGGGCATCAATTAGTGCTGGGTTGTGTTGAAAGGGAAAAATTCGCTATCACAAGTTTCAAAAAATACA:1	ACAAGTTGGGCATCAATTAGTG	ATCACAAGTTTCAAAAAATACA	+	chr3R	30254142	+	chr3R	20212342	10041800	+	chr3R	30254142	+	chr3R	20212342
ATAAGTGCAGAGCAAACACTTTTGTATATATGTATATCCAGTGCTAAAAGCTTGAAAACTACTATTATCTTGAGC:1	ATAAGTGCAGAGCAAACACTTT	GAAAACTACTATTATCTTGAGC	-	chr3L	2684054	-	chr3L	2683978	76	+	chr3L	2683978	+	chr3L	2684054
ATATTCCACAATGTTCAAATACGTACGTTCATCAGAAAG:1	ATATTCCACAATGTTCAAATAC	AATACGTACGTTCATCAGAAAG	+	chr3L	19487944	+	chr3L	19478291	9653	+	chr3L	19487944	+	chr3L	19478291
AATAAACTTTTTTAGAAAAATTCCATCTTCTATGGAACGCTGTAGCTCAGCTAAGATCAGG:1	AATAAACTTTTTTAGAAAAATT	CTGTAGCTCAGCTAAGATCAGG	-	chr2R	6178780	-	chr2R	6178707	73	+	chr2R	6178707	+	chr2R	6178780
TTTCGGCGATCAAAAATTAATGTGCAGACCAAACGTTGTAATAATGCGTAGAA:1	TTTCGGCGATCAAAAATTAATG	AACGTTGTAATAATGCGTAGAA	+	chr2L	22490531	+	chr2L	22497645	7114	+	chr2L	22490531	+	chr2L	22497645
TGAATAAACCCCTGGCTGTTAACAGTGTATGCACCATTATTATCCGATCTTCATTTCGAATTGGCACCGGAATAA:1	TGAATAAACCCCTGGCTGTTAA	TTTCGAATTGGCACCGGAATAA	-	chr3R	19449052	-	chr3R	19449143	91	+	chr3R	19449143	+	chr3R	19449052
GCAGCGCGTGTGCCACATAAAAATGGCATTTTGACATGGCCACCGGGTGAGCATTATGAATGCTTGNCATGAT:1	GCAGCGCGTGTGCCACATAAAA	CATTATGAATGCTTGNCATGAT	-	chr3R	17348837	-	chr3R	17348750	87	+	chr3R	17348750	+	chr3R	17348837
AATAAATCTGTTTCCGTTGTTCGAACTCGGACATCACATGTATGCTCGCATTGGGCGGTCAAAATGAAAA:1	AATAAATCTGTTTCCGTTGTTC	CATTGGGCGGTCAAAATGAAAA	+	chr2R	9052739	+	chr2R	9052815	76	+	chr2R	9052739	+	chr2R	9052815
AACCAGAGAAAAGGCTCATGTGTTGTACTTTTGATCAAATTTATTTGTANAATCTAAACCTCTCTTTGTTCAT:1	AACCAGAGAAAAGGCTCATGTG	ATCTAAACCTCTCTTTGTTCAT	-	chr3R	24906799	-	chr3R	24906722	77	+	chr3R	24906722	+	chr3R	24906799
ATAAAAATTCAACTAAGTTATAAATTAGATTGCAATAAGCTGTGATTTATGCATTTTCTGTTCCTCTTTGTTTAG:1	ATAAAAATTCAACTAAGTTATA	TTTTCTGTTCCTCTTTGTTTAG	+	chr3R	5353767	+	chr3R	30894793	25541026	+	chr3R	5353767	+	chr3R	30894793
AGTTCAATGGTGACAGAATTGTCGGACTATACATGATAGGGCGCTGTGAGCAGGGTGCGCGAC:1	AGTTCAATGGTGACAGAATTGT	CGCTGTGAGCAGGGTGCGCGAC	-	chr3L	7355727	-	chr3L	7363646	7919	+	chr3L	7363646	+	chr3L	7355727
AATCTACCTTGAGCAAACAAATGCAAGGCAGTTGTGTTTTCGTATCTACGGAGAAGAGGAGCAAACACGGT:1	AATCTACCTTGAGCAAACAAAT	GGAGAAGAGGAGCAAACACGGT	+	chr3L	2812338	+	chr3L	2812416	78	+	chr3L	2812338	+	chr3L	2812416
GACAAAAGAGTGAGATTGATAAACAAAGAGGACAAACAAGGACAACGCTCCATAAAACACCAGCCAATACACAAC:1	GACAAAAGAGTGAGATTGATAA	AAAACACCAGCCAATACACAAC	+	chr3R	8355984	+	chr3R	8356067	83	+	chr3R	8355984	+	chr3R	8356067
GGGGTTTTTCTTTTTTTTTTGTATCGAAAACTGNAAAAACACACGTCATCGAAAA:1	GGGGTTTTTCTTTTTTTTTTGT	NAAAAACACACGTCATCGAAAA	+	chr2L	13999546	+	chr2L	3483769	10515777	+	chr2L	13999546	+	chr2L	3483769
TANCACATTTCCTCCTTAGGGTTCTTTTCGTTTTNANTCAGTTAATTTAAGACTTTTCCCATAATTTCCGTTTG:1	TANCACATTTCCTCCTTAGGGT	CTTTTCCCATAATTTCCGTTTG	+	chr3L	5490322	+	chr3L	5490539	217	+	chr3L	5490322	+	chr3L	5490539
TAATAGTCAATTCGCATAGTTCTGTAAACAGTTTCCAGTTTTTAGAGATAACATTTCTTGATTGTGGCA:1	TAATAGTCAATTCGCATAGTTC	ATAACATTTCTTGATTGTGGCA	-	chr3R	30850347	-	chr3R	30850261	86	+	chr3R	30850261	+	chr3R	30850347
CTATGTGACGCTTTATGGCGTACGGTGCANGGCTGGCAGCGACAACGTTGCGTATGAGCANCTTT:1	CTATGTGACGCTTTATGGCGTA	AACGTTGCGTATGAGCANCTTT	-	chr2R	10167190	-	chr2R	10167124	66	+	chr2R	10167124	+	chr2R	10167190
GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTTTTTGTGTTGTGTTG:1	GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGT	TGTTTGTTTTTGTGTTGTGTTG	+	chrX	9845361	+	chrX	12395139	2549778	+	chrX	9845361	+	chrX	12395139
CGAGCAGCCCACATACATATATATGTACATACATATGTGCACATACATACGTATTTGTAATGGCTTTAAGTCTTG:1	CGAGCAGCCCACATACATATAT	TTTGTAATGGCTTTAAGTCTTG	+	chrX	4157921	+	chrX	4164974	7053	+	chrX	4157921	+	chrX	4164974
AAAATGTGTCACGGCATCTAGTCGNGCATAGAATTGGCGAATNTTNTATGCNAAANAGGCGAAAATGGAAACCCC:1	AAAATGTGTCACGGCATCTAGT	AANAGGCGAAAATGGAAACCCC	-	chr2L	19871641	-	chr2L	19871554	87	+	chr2L	19871554	+	chr2L	19871641
GGCTTGAGCTGTTAGAAAGTAAAAACAAAATCATGGCTTTCAAAAGCCAAAAAGACTGCAAAACTTTTATGGCTT:1	GGCTTGAGCTGTTAGAAAGTAA	GACTGCAAAACTTTTATGGCTT	+	chr3R	17461227	+	chr3R	17461309	82	+	chr3R	17461227	+	chr3R	17461309
ATTTCAGTCGAGAACTTACAGTTTTTTTTTATTATTTATTATAATGCTATTTGTTTTAATTTTGAGTTAGATTTT:1	ATTTCAGTCGAGAACTTACAGT	TTTTAATTTTGAGTTAGATTTT	+	chrX	12511346	+	chrX	12511430	84	+	chrX	12511346	+	chrX	12511430
GAGAAGGCAGTTATGTAAGCTCACTCAAGATTGTAAATTCAGCACTTTATGTATTTGAAATTCTATTTGGCGCCA:1	GAGAAGGCAGTTATGTAAGCTC	TTTGAAATTCTATTTGGCGCCA	+	chr2L	1164275	+	chr2L	1164361	86	+	chr2L	1164275	+	chr2L	1164361
AGGCTTGGCAAAAAGATATGCACCCTACCCTTTTCATCCTACCTATCGATCCTACATTCCTNGTCCTGCTGCCA:1	AGGCTTGGCAAAAAGATATGCA	TACATTCCTNGTCCTGCTGCCA	+	chr3L	13525169	+	chr3L	13532964	7795	+	chr3L	13525169	+	chr3L	13532964
TGTTTTGAAAAGCACTTAACAAGTTTTGTGTGCCTACATCGTACATATGTGTATATATGCTGCTGTTGGAATAGA:1	TGTTTTGAAAAGCACTTAACAA	TATATGCTGCTGTTGGAATAGA	+	chr2R	17784024	+	chr2R	17784265	241	+	chr2R	17784024	+	chr2R	17784265
GGGACAGCTGGCCAAGCCTGACTTTTTATCATGGAAAGTCCCGACACTCANGCTCGCATGACTTGACTTACTCTT:1	GGGACAGCTGGCCAAGCCTGAC	TCGCATGACTTGACTTACTCTT	-	chr2L	21381299	-	chr2L	21381196	103	+	chr2L	21381196	+	chr2L	21381299
AATATTTAATAGCGCTCCGAGCCTCGTTCCCAAGCCATTCTTCATGTCGCGCAGAAATGAGACATTTTATGGTCT:1	AATATTTAATAGCGCTCCGAGC	GAAATGAGACATTTTATGGTCT	-	chr3R	6575307	-	chr3R	6575172	135	+	chr3R	6575172	+	chr3R	6575307
TTTGATTTCCCCCAAAATGCTGTTGAGAGTGATAATTAATTTGGGATCGTCCTTTTCCCAGGACCCTGCCCCGCG:1	TTTGATTTCCCCCAAAATGCTG	TTTCCCAGGACCCTGCCCCGCG	+	chr3R	25669091	+	chr3R	25669185	94	+	chr3R	25669091	+	chr3R	25669185
CTTACGCATACATTATAACTGTTGCGACGATGTTGGCCGGGCGTGCTGCACTCTTTCCGTGCCCCCAATTTGG:1	CTTACGCATACATTATAACTGT	TCTTTCCGTGCCCCCAATTTGG	-	chr2R	25250467	-	chr2R	13660429	11590038	+	chr2R	13660429	+	chr2R	25250467
GACCCAATAACAATGCCAGGCACCAGGCACCAATCGACCATCGACCATCCATATTCCAGTCTCATTGTCAACTTT:1	GACCCAATAACAATGCCAGGCA	TTCCAGTCTCATTGTCAACTTT	+	chr2L	9202077	+	chr2L	9202153	76	+	chr2L	9202077	+	chr2L	9202153
AAGGTAATGTTTGCATGATTTCAAACAACATTTAATTTTTAGCAACACATTTCAAGCCAGTTAAAATCGTGAAAC:1	AAGGTAATGTTTGCATGATTTC	AAGCCAGTTAAAATCGTGAAAC	-	chr3R	19490555	-	chr3R	19490466	89	+	chr3R	19490466	+	chr3R	19490555
ATCTATTGGCCAAGGCTTTTCCAGTTGCCAGTTCCTAGCCCCCACCAAACACTTCGATATATCCACACGTTTCG:1	ATCTATTGGCCAAGGCTTTTCC	TTCGATATATCCACACGTTTCG	-	chr3L	10417668	-	chr3L	10417592	76	+	chr3L	10417592	+	chr3L	10417668
AGAGCGTNCTTTTAAAAACATGTTTCAACATTTTAAGCCNCCTTTTCTGAAGAAGAANAAAGGGACAAAGTGCAA:1	AGAGCGTNCTTTTAAAAACATG	AGAANAAAGGGACAAAGTGCAA	+	chr2R	10017659	+	chr2R	10017738	79	+	chr2R	10017659	+	chr2R	10017738
GGAAAATTTCAAAATTTTTAAGTGGGTTGGAGCTAACTAAAGAACTGAACTAATAATCAAA:1	GGAAAATTTCAAAATTTTTAAG	AAGAACTGAACTAATAATCAAA	-	chr3R	22013147	-	chr3R	22013079	68	+	chr3R	22013079	+	chr3R	22013147
AAGGNATTAAAACAACAACTTTNTAGTNACGACCACCACNTTATTTTCGTTTTGTGGTTTTTT:1	AAGGNATTAAAACAACAACTTT	TATTTTCGTTTTGTGGTTTTTT	+	chr3R	9461060	+	chr3R	4348093	5112967	+	chr3R	9461060	+	chr3R	4348093
CAAAATCAGAACGCACGTGTAACAGATCATTGATTAATAAAGTAACCATTTAAATACATATTATTAATAACGCCA:1	CAAAATCAGAACGCACGTGTAA	ATACATATTATTAATAACGCCA	+	chr3L	1154145	+	chr3L	1163295	9150	+	chr3L	1154145	+	chr3L	1163295
TTTGAGCAAGCATAAAATACATTTTTCAAACTGTCCGGATAATCGATTCCAAATCAATCGAACTATTGGCAC:1	TTTGAGCAAGCATAAAATACAT	AAATCAATCGAACTATTGGCAC	+	chr3L	12052729	+	chr3L	12052815	86	+	chr3L	12052729	+	chr3L	12052815
CAGAAGAAGAAAGCACGAATATAAATCGAAATGCGGTCGCGCAATTCTTTAAG:1	CAGAAGAAGAAAGCACGAATAT	TGCGGTCGCGCAATTCTTTAAG	+	chr3R	13435410	+	chr3R	13435563	153	+	chr3R	13435410	+	chr3R	13435563
CTTCATGGATCGCACCGAGCGGCACCACGACGTAGGGCACTTTTTGAGAATTTGGTTCGAATTGCCCGATTGGCG:1	CTTCATGGATCGCACCGAGCGG	GGTTCGAATTGCCCGATTGGCG	-	chr2R	22758220	-	chr2R	11886223	10871997	+	chr2R	11886223	+	chr2R	22758220
AAGACATGATTACTCCTTGNAGCCCTGGGAATTATCATATGGTCGGGTGTTTTGTCTAAGACATTAGTCTAACCT:1	AAGACATGATTACTCCTTGNAG	GTCTAAGACATTAGTCTAACCT	+	chr3R	5169558	+	chr3R	5169637	79	+	chr3R	5169558	+	chr3R	5169637
GCGCGGATTGCGATTGTGATTGTGGCAAAAAGGGATAAAGAGGTAAAGGACCATATGTGAGAGATATACCCACAT:1	GCGCGGATTGCGATTGTGATTG	TATGTGAGAGATATACCCACAT	+	chr2L	12130701	+	chr2L	18280896	6150195	+	chr2L	12130701	+	chr2L	18280896
TGTTGAGTTATGTTTCTTCCGATCCCACACGCCACCCACTGAGCACCCTGACCTCTACGCCCACTAACCAACCTC:1	TGTTGAGTTATGTTTCTTCCGA	TCTACGCCCACTAACCAACCTC	+	chr2R	10671274	+	chr2R	10671352	78	+	chr2R	10671274	+	chr2R	10671352
GTTTCTTCCGATCCCACACCCCACCCACTGAGCACCCTGACCTCTACG:1	GTTTCTTCCGATCCCACACCCC	ACTGAGCACCCTGACCTCTACG	+	chr2R	10671285	+	chr2R	10671336	51	+	chr2R	10671285	+	chr2R	10671336
TTATTGGGAATAAGAAGTTTGTGCCAAAGAAAGTAAACCCTTAAAAACTAAAGATGATGNCAGTATATGGA:1	TTATTGGGAATAAGAAGTTTGT	AAAGATGATGNCAGTATATGGA	-	chr3R	6484179	-	chr3R	6484090	89	+	chr3R	6484090	+	chr3R	6484179
GTTTTAGTTTTAAATTCATTTGTCTTCATGTGTTTGCGGATGATATCGGTGCGCTAGACAAATGGATAGATGTGG:1	GTTTTAGTTTTAAATTCATTTG	CTAGACAAATGGATAGATGTGG	-	chr3R	27952135	-	chr3R	16652058	11300077	+	chr3R	16652058	+	chr3R	27952135
CAAAAACGGGGTGTAAGCCAAGTGCCTTTTTGTGAATACCCTGCTAANTGGCA:1	CAAAAACGGGGTGTAAGCCAAG	GTGAATACCCTGCTAANTGGCA	+	chr2R	21546813	+	chr2R	21546872	59	+	chr2R	21546813	+	chr2R	21546872
ATGTTTGCNACACTCCAAGCGCGCTTTGTCTCCTTGACTTTCACCTGCATACTGTGGAGAAAGATAGAGATTTCG:1	ATGTTTGCNACACTCCAAGCGC	GTGGAGAAAGATAGAGATTTCG	+	chrX	1055546	+	chrX	1055961	415	+	chrX	1055546	+	chrX	1055961
CCGAACACCTGAACCTTGTTCGTCCTGTGCCCTTGGGCCCGTGCAATTGTGTGCTGTTGTGTTGCCTTTGTGG:1	CCGAACACCTGAACCTTGTTCG	TGCTGTTGTGTTGCCTTTGTGG	+	chr2L	10862871	+	chr2L	10864483	1612	+	chr2L	10862871	+	chr2L	10864483
GCTCACATTCGCTTTTTTTTCTTTTTT:1	GCTCACATTCGCTTTTTTTTCT	CATTCGCTTTTTTTTCTTTTTT	+	chr3L	17064343	+	chr3L	11477882	5586461	+	chr3L	17064343	+	chr3L	11477882
TACTATTCTATTCTTCATAATTACGCTGCTATGCTGTTGGCATAGATCAACGCAAACACATCAAGCACATATAGA:1	TACTATTCTATTCTTCATAATT	AAACACATCAAGCACATATAGA	+	chr2R	25101298	+	chr2R	25101400	102	+	chr2R	25101298	+	chr2R	25101400
CAACGCAACGCAACACAACACAACACAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	CAACGCAACGCAACACAACACA	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	8339246	+	chr3R	21907534	13568288	+	chr3R	8339246	+	chr3R	21907534
TTATGCTAGCAATGCTAAAACAAACTCTACGCACTCACTTTACATTTGACATTTTTAAGTTATACTTTTTTTTA:1	TTATGCTAGCAATGCTAAAACA	TTTTAAGTTATACTTTTTTTTA	+	chr2L	13842165	+	chr2L	13842248	83	+	chr2L	13842165	+	chr2L	13842248
AGAATCATTTACATTCTCACTTTTAAAGTTGCCCCAAAAAGATTANGAGATACGACCACTTNTAAATGCATTTCA:1	AGAATCATTTACATTCTCACTT	GACCACTTNTAAATGCATTTCA	-	chr2R	7201345	-	chr2R	7196570	4775	+	chr2R	7196570	+	chr2R	7201345
TAATAAAACACTCACATCTTAGCGACAACATTTTCACAACAAGAAAAAACAGAGGTCAAGTGATAAAGCCCAT:1	TAATAAAACACTCACATCTTAG	GAGGTCAAGTGATAAAGCCCAT	-	chr2R	11254964	-	chr2R	11254878	86	+	chr2R	11254878	+	chr2R	11254964
ATTGCCACATTTTGCCTTCACTTTTTATCATTTTTCCTGGAAGAGATTCCAG:1	ATTGCCACATTTTGCCTTCACT	TTTTTCCTGGAAGAGATTCCAG	-	chr3R	30546684	-	chr3R	8559002	21987682	+	chr3R	8559002	+	chr3R	30546684
AGCTGCGGGCCACAAATGAAATCTGCAAACACAACCCATGTGTGAGAAATTGCTGTTTGTTTTATGCCAATGATC:1	AGCTGCGGGCCACAAATGAAAT	TGTTTGTTTTATGCCAATGATC	-	chr2L	730869	-	chr2L	730778	91	+	chr2L	730778	+	chr2L	730869
TGTTGGTAATTAAAGTACAATTAAAAGAACATTCTCTTACCAATTAGTAATAAGAGCAACAAGACGTTAAGTAAT:1	TGTTGGTAATTAAAGTACAATT	GAGCAACAAGACGTTAAGTAAT	-	chr3L	3902557	-	chr3L	3902469	88	+	chr3L	3902469	+	chr3L	3902557
AACATATTGCATATTTTGTTTGTGCCTCATGCGTGTCACATGCTCGAATCGATGGGTTTTGTGCAAGGCCTGACT:1	AACATATTGCATATTTTGTTTG	GGGTTTTGTGCAAGGCCTGACT	-	chr2L	14554245	-	chr2L	14554168	77	+	chr2L	14554168	+	chr2L	14554245
GGGAACTAAGTAAATACTGAGTTTTCTGCTCCTTGCTCTATAAAAATAGTTGAAAGCATTTCCCGAAAAAGAACA:1	GGGAACTAAGTAAATACTGAGT	AAGCATTTCCCGAAAAAGAACA	+	chr2R	23186587	+	chr2R	23186665	78	+	chr2R	23186587	+	chr2R	23186665
TTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTATTGTTTT:1	TTGTATTGTATTGTATTGTATT	TTGTATTGTATTTTATTGTTTT	+	chr3L	21448026	+	chr3L	4341333	17106693	+	chr3L	21448026	+	chr3L	4341333
GAGTTCTGCGTTTAATTGTTTGCATGATGAATGATGTATTATAATTTGTAATTTGTAATTTGCATTGTGCAGGGT:1	GAGTTCTGCGTTTAATTGTTTG	TGTAATTTGCATTGTGCAGGGT	-	chr3L	4915044	-	chr3L	4914798	246	+	chr3L	4914798	+	chr3L	4915044
ATATGACAAGATAAAATGCCAAAAAAAATCAGAGCGAATGGGAAG:1	ATATGACAAGATAAAATGCCAA	AAAAATCAGAGCGAATGGGAAG	-	chr3R	22994647	-	chr3R	18821942	4172705	+	chr3R	18821942	+	chr3R	22994647
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGACAAGACAAGACAAGACANGACAAGATCAACCAGGTGCCACAGG:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	AAGATCAACCAGGTGCCACAGG	+	chr3L	22908066	+	chr3L	15113827	7794239	+	chr3L	22908066	+	chr3L	15113827
ATAATTAAGCGAGAGAGAGGAAAAAAAAACAACCTAAAAATTCTCGACCTTGTTTTAAAGCACCAAGTGTACACG:1	ATAATTAAGCGAGAGAGAGGAA	TTTAAAGCACCAAGTGTACACG	+	chrX	16781525	+	chrX	5718348	11063177	+	chrX	16781525	+	chrX	5718348
GCCTTCGCGGGGAATGGGTCTTCTCGTCCACCTCCCACCTCCATCTCCTTCACATCCTCATCC:1	GCCTTCGCGGGGAATGGGTCTT	CATCTCCTTCACATCCTCATCC	-	chrX	19992496	-	chrX	19992432	64	+	chrX	19992432	+	chrX	19992496
TTTGATTGATAAAAATCTCTTCCAATGAGTGGAAGACAGGATACANATGTGACT:1	TTTGATTGATAAAAATCTCTTC	AAGACAGGATACANATGTGACT	+	chr3R	25424696	+	chr3R	25424753	57	+	chr3R	25424696	+	chr3R	25424753
TATCAGTTACGAATCCCGAAAGTAATCCCCTAACTGGCTTCCATTCCATTCTGGATGGTTTTCAGTGAAATCTC:1	TATCAGTTACGAATCCCGAAAG	GGATGGTTTTCAGTGAAATCTC	+	chrX	20499157	+	chrX	20499239	82	+	chrX	20499157	+	chrX	20499239
ATTACACTGGCGTCTAGAATTATGTGCCACGGCTGACAACTGACTGTGCAATCAATTA:1	ATTACACTGGCGTCTAGAATTA	CAACTGACTGTGCAATCAATTA	-	chr3L	16818029	-	chr3L	16817906	123	+	chr3L	16817906	+	chr3L	16818029
ATAATAAGAAAACCTCTAAAACTTCCAACGCACTTTTTGGTTGAATTCCTTGGATCTTTTGTTCTTTGGCTATAG:1	ATAATAAGAAAACCTCTAAAAC	ATCTTTTGTTCTTTGGCTATAG	-	chr2R	21753579	-	chr2R	21753094	485	+	chr2R	21753094	+	chr2R	21753579
GGAGGAATCCCCGAAACTAAGAAGTAGACATTCGTCTGAATATGTGTATTTCACACGAAAAGCAGCCATTTAAG:1	GGAGGAATCCCCGAAACTAAGA	ACACGAAAAGCAGCCATTTAAG	-	chr3L	3763856	-	chr3L	3763776	80	+	chr3L	3763776	+	chr3L	3763856
TTCAGGCATTTTGGGGTAATCTAGTTACCAATNCAACTTGNATTAACCCCTTCCATTCAGGAT:1	TTCAGGCATTTTGGGGTAATCT	ATTAACCCCTTCCATTCAGGAT	+	chr2L	21020294	+	chr2L	21023959	3665	+	chr2L	21020294	+	chr2L	21023959
CATGCTCACGTTGAACTTTTTGACGTTTAAGAGAATGAAAAGGAAATTATCNTCCCATTGAAATCAAGGATATGG:1	CATGCTCACGTTGAACTTTTTG	CCCATTGAAATCAAGGATATGG	-	chr2L	17693087	-	chr2L	17692973	114	+	chr2L	17692973	+	chr2L	17693087
GCCTGCCGCCTCTCATAAATTGCGCAAATTCCTCTTGCGAGGAATGGTGGTGAAGAGGTGTTGGGTG:1	GCCTGCCGCCTCTCATAAATTG	GGTGGTGAAGAGGTGTTGGGTG	+	chr3L	8203549	+	chr3L	8203618	69	+	chr3L	8203549	+	chr3L	8203618
GAAGAGAATTTCCCCTAGCCAAGCTCACACTTAACCCCCTTTTTTAAGCGCCCTTCCTGGCTCCATTTTA:1	GAAGAGAATTTCCCCTAGCCAA	CGCCCTTCCTGGCTCCATTTTA	-	chrX	12303288	-	chrX	12301987	1301	+	chrX	12301987	+	chrX	12303288
TATCAATTAAAAAGTTTTTTTTAAGGTTATTTGAATAACTCTTAAAGCGCTTCTACTTTTCAGTCCCTA:1	TATCAATTAAAAAGTTTTTTTT	CGCTTCTACTTTTCAGTCCCTA	+	chr2L	16537715	+	chr2L	19688633	3150918	+	chr2L	16537715	+	chr2L	19688633
TCTTCGTGTGTTGAATACTATCCCACACACTATCTGACCCGTAATATTCATTTGATGATNCATCAAATCA:1	TCTTCGTGTGTTGAATACTATC	CATTTGATGATNCATCAAATCA	-	chrX	2578927	-	chrX	2578840	87	+	chrX	2578840	+	chrX	2578927
AAAAAAGTCGGAGTTTATTTCCGTTATATGCACTGTTGTTCGCCTAATATTATTTTTTT:1	AAAAAAGTCGGAGTTTATTTCC	GTTCGCCTAATATTATTTTTTT	-	chr3R	20165869	-	chr3R	20156715	9154	+	chr3R	20156715	+	chr3R	20165869
GCCCATAAATAATTAAAGTTCGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTCNTGGGCG:1	GCCCATAAATAATTAAAGTTCG	ACTTGAATGAATCTCNTGGGCG	-	chr3R	25828319	-	chr3R	25828564	245	+	chr3R	25828564	+	chr3R	25828319
CGATGCTCNAATCGCCACATATCCACTTCCTGTTTNCTCCTCAGCTCAAAAGATCCCACGCTCGCAATTTTCAAA:1	CGATGCTCNAATCGCCACATAT	TCCCACGCTCGCAATTTTCAAA	+	chr3L	15078083	+	chr3L	16200378	1122295	+	chr3L	15078083	+	chr3L	16200378
AATCGATGGGCTATCAAACCTAAGAAAATTGCCANTGATGGAAATTTTCATCTCTAACAGCGAGTTTGGTTTTCC:1	AATCGATGGGCTATCAAACCTA	CTAACAGCGAGTTTGGTTTTCC	+	chr2R	9807459	+	chr2R	9807603	144	+	chr2R	9807459	+	chr2R	9807603
GCCTGAAATGAGCCTACAAAGCTGTCAATTTTAATAANTTATTGCNCGGCAAAAAAAGACGAGGAAAANGAGGA:1	GCCTGAAATGAGCCTACAAAGC	AAAAAGACGAGGAAAANGAGGA	+	chr2L	7343356	+	chr2L	7350470	7114	+	chr2L	7343356	+	chr2L	7350470
TTAATTGTTGTTTTTTTTTTCTTATTAAAT:1	TTAATTGTTGTTTTTTTTTTCT	TGTTTTTTTTTTCTTATTAAAT	+	chrX	11103410	+	chrX	13872385	2768975	+	chrX	11103410	+	chrX	13872385
CTGACATTTGAGTATCTACCTTTGTACACTATTCAAAAAAAATTTGTTGTTCAAATGGTCAACAAAGTTGCTG:1	CTGACATTTGAGTATCTACCTT	CAAATGGTCAACAAAGTTGCTG	+	chrX	21480554	+	chrX	21480882	328	+	chrX	21480554	+	chrX	21480882
TTAATTTATGCATAACTGATCGAATAATACAATAATAATAATACAATAAAATCTTATCATTTATAGAATTATTCA:1	TTAATTTATGCATAACTGATCG	TTATCATTTATAGAATTATTCA	+	chr4	718967	+	chr4	945741	226774	+	chr4	718967	+	chr4	945741
TATCTTCACAAGTTCATTGATGCTATTTATGTGCTGATTTACACGANAGGTGTTGACCCC:1	TATCTTCACAAGTTCATTGATG	TTACACGANAGGTGTTGACCCC	-	chr2R	5874357	-	chr2R	5869296	5061	+	chr2R	5869296	+	chr2R	5874357
CTTCCATTTCAGACGGACCTCGTCTTATCAGACGCGCGCGGAAGCTGCTCGTGTGCAGACG:1	CTTCCATTTCAGACGGACCTCG	GGAAGCTGCTCGTGTGCAGACG	+	chr3L	858016	+	chr3L	866483	8467	+	chr3L	858016	+	chr3L	866483
TCCANTGCAGTAAATATCAGTANAATANTGTATGAAACANGGTAAGTGATATTGTACGACACACTGAGAGAACTC:1	TCCANTGCAGTAAATATCAGTA	GTACGACACACTGAGAGAACTC	+	chr2R	19536485	+	chr2R	19536567	82	+	chr2R	19536485	+	chr2R	19536567
ATAAAATGCCAGAATGGAATGGTTAAATTAATGTGCAGCGTAATCAGCGAATGCCATTCCCCTCACAATTCAATG:1	ATAAAATGCCAGAATGGAATGG	CCATTCCCCTCACAATTCAATG	+	chr3R	6610051	+	chr3R	6610203	152	+	chr3R	6610051	+	chr3R	6610203
CATGTGGTCGTGCTCGTGGAGCTGCGCCGGACGGTCAGGAACCGAACTCTACGGAACGTAAACATGGTTAG:1	CATGTGGTCGTGCTCGTGGAGC	TACGGAACGTAAACATGGTTAG	+	chr2L	10652253	+	chr2L	6467341	4184912	+	chr2L	10652253	+	chr2L	6467341
ACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACACAACACAACACAACACAACA:1	ACACAAACACAAACACAACACA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907535	8214507	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907535
TGATCCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCAGAAACATATAAAAAATGTTGCATATTTTTGGGCATGCGGGAAA:1	TGATCCTGCCTGCGCAAAAGTT	ATATTTTTGGGCATGCGGGAAA	-	chr3R	8709806	-	chr3R	8707365	2441	+	chr3R	8707365	+	chr3R	8709806
TTCACTTCCAAAACCCAATTTACCTTAGGGTTAATATCAGAGATAGCTGACCTGAATT:1	TTCACTTCCAAAACCCAATTTA	TCAGAGATAGCTGACCTGAATT	+	chr3R	4012515	+	chr3R	4012587	72	+	chr3R	4012515	+	chr3R	4012587
GAGAACAAGTTACTGGGCTCTGGACAGCTGATGGCCAGTGGATCCGATGACCGAGATTTGCCCAGTTNAGTGGG:1	GAGAACAAGTTACTGGGCTCTG	GAGATTTGCCCAGTTNAGTGGG	-	chr3L	11384073	-	chr3L	11383995	78	+	chr3L	11383995	+	chr3L	11384073
CAAATAATTCCAACGAAGACTATTGCCTTTGACAACAAATGATTAAANTCCAATTGCTTGANAGCCTACACTTTG:1	CAAATAATTCCAACGAAGACTA	TTGCTTGANAGCCTACACTTTG	-	chrX	10308712	-	chrX	10308636	76	+	chrX	10308636	+	chrX	10308712
GTGCAACTATGTTGTATATGAAGTACGTGATGNGTGCGTTGATATATCGTAGTATGNCAAATAT:1	GTGCAACTATGTTGTATATGAA	TATATCGTAGTATGNCAAATAT	-	chr2L	19560276	-	chr2L	19560035	241	+	chr2L	19560035	+	chr2L	19560276
GGCATCNGACTGGGAGGGAACCATGCGGGCGTGACTAATTAGCCANGCGATGTTGGTG:1	GGCATCNGACTGGGAGGGAACC	AATTAGCCANGCGATGTTGGTG	+	chr3L	1347186	+	chr3L	1347254	68	+	chr3L	1347186	+	chr3L	1347254
GAAAACAATAAATTGTTTATGATACAGTCTAGATTGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAAC:1	GAAAACAATAAATTGTTTATGA	AAATTCTTTATGATTACGAAAC	+	chr3R	19448494	+	chr3R	19448821	327	+	chr3R	19448494	+	chr3R	19448821
AATTTCGGAACAATTCGTTTTGACTAACAAGAAATCCTATGCTTCCTCGCTGATCTCGACAAACAGTCTATTAG:1	AATTTCGGAACAATTCGTTTTG	ATCTCGACAAACAGTCTATTAG	-	chr3R	30012628	-	chr3R	30017933	5305	+	chr3R	30017933	+	chr3R	30012628
TTTGTTATTATTTTCCCTCTACTGTTTTAATATAAATTTGCATTCCCCCGCATGCTATGCAAATAAAAGTGGGG:1	TTTGTTATTATTTTCCCTCTAC	TGCTATGCAAATAAAAGTGGGG	+	chr2R	15186190	+	chr2R	15186273	83	+	chr2R	15186190	+	chr2R	15186273
GGGAGCAGGAGCAGAGTACACTGGAGCTGGAGCGGGAGCAGCGTAAACTGGAGCCGGAGCTGG:1	GGGAGCAGGAGCAGAGTACACT	CGTAAACTGGAGCCGGAGCTGG	+	chrX	10215219	+	chrX	10215314	95	+	chrX	10215219	+	chrX	10215314
AGGAGGGAGCGCCCACATGCACACATACATACGTAATGAAATCTTTTTGGCAAGGCACACG:1	AGGAGGGAGCGCCCACATGCAC	AATCTTTTTGGCAAGGCACACG	+	chr3R	17925887	+	chr3R	17927340	1453	+	chr3R	17925887	+	chr3R	17927340
GAAAGGTTTCTGGGAAAAAGTATTTTTTAAGGNTATCTGATTATATTATTTTCAACCATCTTTGAANGAGTATT:1	GAAAGGTTTCTGGGAAAAAGTA	CAACCATCTTTGAANGAGTATT	+	chr3L	5910038	+	chr3L	5910278	240	+	chr3L	5910038	+	chr3L	5910278
TTTAAGTGGTGTCAAAAAGTATGCTACCATAGATAGCGGTCATTTATTGCATACNTCTAGGCGCT:1	TTTAAGTGGTGTCAAAAAGTAT	TTATTGCATACNTCTAGGCGCT	-	chr3R	31270988	-	chr3R	31270916	72	+	chr3R	31270916	+	chr3R	31270988
AACCGTTTGTTCGAGTTAGCGAAGTTCAACTGTATGGCGCCAAAAACTCTGGGTTCGGAATAAAGGCCATAGATT:1	AACCGTTTGTTCGAGTTAGCGA	TTCGGAATAAAGGCCATAGATT	-	chrX	19318603	-	chrX	19318468	135	+	chrX	19318468	+	chrX	19318603
ATATTTAATTGATTTTTTACCTCCAGCCGCCCAATCACCGGTTG:1	ATATTTAATTGATTTTTTACCT	CCAGCCGCCCAATCACCGGTTG	+	chr3L	14130320	+	chr3L	4242140	9888180	+	chr3L	14130320	+	chr3L	4242140
TTTGTTTTTTCATATTTTTTTTTTGTTAATTTTTCCCCCCCTTTTTTAGTAG:1	TTTGTTTTTTCATATTTTTTTT	TTTTCCCCCCCTTTTTTAGTAG	+	chr2L	18937438	+	chr2L	19948085	1010647	+	chr2L	18937438	+	chr2L	19948085
CAGAGGAGAATCATTACTCACCGCACAGGCAAGCCTTCCCCGGTTGAATTGTTCATGCGTAATAATTTGGTCCAC:1	CAGAGGAGAATCATTACTCACC	CATGCGTAATAATTTGGTCCAC	-	chr3R	13380818	-	chr3R	13380730	88	+	chr3R	13380730	+	chr3R	13380818
GTAGCAACTGGGACTGGTCTCCGATGACTATTGTCAGAAAATACATCTT:1	GTAGCAACTGGGACTGGTCTCC	CTATTGTCAGAAAATACATCTT	-	chr3L	20183391	-	chr3L	20183446	55	+	chr3L	20183446	+	chr3L	20183391
AATCGCTCGTTGAGAAGGGGAATTCTAAAAAAACTGAATCAAAAAAGCAAATCGGAGCAGTTGATGGACTTAACT:1	AATCGCTCGTTGAGAAGGGGAA	GGAGCAGTTGATGGACTTAACT	+	chr2R	18219646	+	chr2R	18219728	82	+	chr2R	18219646	+	chr2R	18219728
CTGGGTGTCTATCACATAGCAGCGCAGTCCCCACCATTTAAGACTACAAAAGTGGCAGG:1	CTGGGTGTCTATCACATAGCAG	TTAAGACTACAAAAGTGGCAGG	-	chr2R	553989	-	chr2R	552787	1202	+	chr2R	552787	+	chr2R	553989
TTTATAATTATATATATTAAAGAAAACTACTTTAGTTTGATTTTTGCTTGATTTTAAGTATCTTTTGGAAGAGTA:1	TTTATAATTATATATATTAAAG	TTAAGTATCTTTTGGAAGAGTA	-	chr2R	21200957	-	chr2R	22520728	1319771	+	chr2R	22520728	+	chr2R	21200957
GAATTAATGTGAAAAATAGAAATGTAGTTAAATTTATGTCAAAANATACAATATAATAACATGTGTTGTTAAAG:1	GAATTAATGTGAAAAATAGAAA	ATAATAACATGTGTTGTTAAAG	-	chr2L	10495371	-	chr2L	10495295	76	+	chr2L	10495295	+	chr2L	10495371
GCAACCCACAAACCAAAAACAACAAAAATAATTCGCACACACACACACATGGAAAATATTGAAAATTTGAATGAG:1	GCAACCCACAAACCAAAAACAA	AAATATTGAAAATTTGAATGAG	+	chrX	7194616	+	chrX	20332308	13137692	+	chrX	7194616	+	chrX	20332308
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGGCCCACCGATCCGCCA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACAACGGCCCACCGATCCGCCA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	25152235	3244699	+	chr3R	21907536	+	chr3R	25152235
TGTCAGGTGCTGGAATCAGCAGACCTTCATTGAGAGTTGTACACCGGGGGAAATTTTCA:1	TGTCAGGTGCTGGAATCAGCAG	TGTACACCGGGGGAAATTTTCA	+	chr3L	9076943	+	chr3L	9084487	7544	+	chr3L	9076943	+	chr3L	9084487
GCAGAAAAAATTTTATGATCCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCAGAAACATATAAAAAATGTTGCATATTTT:1	GCAGAAAAAATTTTATGATCCT	TATAAAAAATGTTGCATATTTT	-	chr3R	8709821	-	chr3R	8707380	2441	+	chr3R	8707380	+	chr3R	8709821
AATTTATTAGGATAGTGCCCTAATCTTTTTGTGTACTAAAGCACCGTCAGNATATGTT:1	AATTTATTAGGATAGTGCCCTA	TAAAGCACCGTCAGNATATGTT	-	chr3L	18359695	-	chr3L	18359620	75	+	chr3L	18359620	+	chr3L	18359695
GAGCTGGAGGACATCCGGCGNCTCGACCGCTTNAAGGAGCCTNCCGCCTTTGGCCC:1	GAGCTGGAGGACATCCGGCGNC	AGGAGCCTNCCGCCTTTGGCCC	-	chrX	16558567	-	chrX	16567132	8565	+	chrX	16567132	+	chrX	16558567
CGACGGCAGACGACGGATGACGGACGGCGGACTGTTCAACAAA:1	CGACGGCAGACGACGGATGACG	GGACGGCGGACTGTTCAACAAA	+	chr3R	20450356	+	chr3R	6626106	13824250	+	chr3R	20450356	+	chr3R	6626106
CAATTTTCGGACGAAATTGAAATTTTAATANACATTTTGGCGCCTTGTGATAATATTTACTTTTACAACTATTT:1	CAATTTTCGGACGAAATTGAAA	ATATTTACTTTTACAACTATTT	-	chr3L	482364	-	chr3L	482286	78	+	chr3L	482286	+	chr3L	482364
GAAACGGGAATGTTAGCTGCATAGATTTACATATTTGTGTTAACTTAGACTGCAAGATGTTTATAATAAATATTA:1	GAAACGGGAATGTTAGCTGCAT	AAGATGTTTATAATAAATATTA	-	chr2L	11665945	-	chr2L	11665867	78	+	chr2L	11665867	+	chr2L	11665945
CAATGCACCGCCGTCTACACACACACGCACATGTGTGTGTGTGTGTGCGGGAAAA:1	CAATGCACCGCCGTCTACACAC	TGTGTGTGTGTGTGCGGGAAAA	-	chr3R	10963268	-	chr3R	14909264	3945996	+	chr3R	14909264	+	chr3R	10963268
CACTAAAGCTTTAAAGATTGCTTTTAGCNATTCCCCAACCACCTGCAGCCACGCGACTATTCCTTTATTATCCA:1	CACTAAAGCTTTAAAGATTGCT	GCGACTATTCCTTTATTATCCA	+	chr2L	8336962	+	chr2L	8337040	78	+	chr2L	8336962	+	chr2L	8337040
CACGCAGATGAACCAGTTGAAATAGTTTCATACTAATCGTTTTGCGAGGACTGTCATGGATTACCTGCACCATAC:1	CACGCAGATGAACCAGTTGAAA	TCATGGATTACCTGCACCATAC	+	chrX	3597573	+	chrX	3619741	22168	+	chrX	3597573	+	chrX	3619741
CTAACTACGGCCAGTTTTTGTTCGTTCTATCTTACTCCCCTTTGCCCTACAGAGNTTTATGTGTAATTCCAATG:1	CTAACTACGGCCAGTTTTTGTT	AGNTTTATGTGTAATTCCAATG	+	chr2L	9391566	+	chr2L	9391732	166	+	chr2L	9391566	+	chr2L	9391732
ACAGGGGAGAATTGGAAAATCGTGGAATCTCTACAACGCGTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTCTTTCATTATTT:1	ACAGGGGAGAATTGGAAAATCG	TTTTGTTTTTCTTTCATTATTT	-	chrX	18374488	-	chrX	18374408	80	+	chrX	18374408	+	chrX	18374488
GATAACGTTACCTTCACTAAATTCAAAAAAGTCATAGAGCGAGCTTTGTAATTAAAATTGTAAAAATTTTATAAG:1	GATAACGTTACCTTCACTAAAT	AAAATTGTAAAAATTTTATAAG	+	chr3L	22865988	+	chr3L	22867121	1133	+	chr3L	22865988	+	chr3L	22867121
AAAATCCGAGGGCAAAATCCGATGCAGAAAAAAATAAAAAATAAATAAGGAAACGTTGATGAGTTTGTGGTTGG:1	AAAATCCGAGGGCAAAATCCGA	ACGTTGATGAGTTTGTGGTTGG	+	chr2R	10168360	+	chr2R	10168436	76	+	chr2R	10168360	+	chr2R	10168436
TTTTTTCGGTGTTCCTGCAATTCAACTTTCNNNTNTTCAATTCAACCTGCTGATATTTGCACGGAATTCCAAAAA:1	TTTTTTCGGTGTTCCTGCAATT	TATTTGCACGGAATTCCAAAAA	+	chr2R	11667389	+	chr2R	11667483	94	+	chr2R	11667389	+	chr2R	11667483
CTAACGAGTGCGCCAATCGAAAGATGAAGGGTTCATGGTGCGGATCATTGAGAGACAGGTTGAGCA:1	CTAACGAGTGCGCCAATCGAAA	TCATTGAGAGACAGGTTGAGCA	+	chrX	18643873	+	chrX	6554124	12089749	+	chrX	18643873	+	chrX	6554124
GACAAAAGGAGTAATGAAAANAGATGCAAGTTNCAGGTGCATNTGTCATGAGTTCCCTCCACACTGCATACTCAT:1	GACAAAAGGAGTAATGAAAANA	TCCCTCCACACTGCATACTCAT	-	chr3L	1109723	-	chr3L	1109635	88	+	chr3L	1109635	+	chr3L	1109723
CATCTATTGCTTAAAACGAGTTTTAAACGCACAGCGTAAGACGACGAGATCCTCTCTTCGAAATCTATGGCATTG:1	CATCTATTGCTTAAAACGAGTT	CTCTTCGAAATCTATGGCATTG	-	chr3L	16494513	-	chr3L	16493996	517	+	chr3L	16493996	+	chr3L	16494513
AGCTATAGAAGTAGTAGTATATGTATACTTATGTTTAATGATTTTATATATAGCTTTATTTATTTGTTGAATATT:1	AGCTATAGAAGTAGTAGTATAT	CTTTATTTATTTGTTGAATATT	+	chr2R	12602825	+	chr2R	12602909	84	+	chr2R	12602825	+	chr2R	12602909
CAACTCTCTAAATTCAAATTTCACATCTTTCCACATGGGTTATCAACCATTTTGGTTGGGTATAGTTTCGTTTTT:1	CAACTCTCTAAATTCAAATTTC	GGTTGGGTATAGTTTCGTTTTT	+	chr3L	25343645	+	chr3L	25346412	2767	+	chr3L	25343645	+	chr3L	25346412
TTCCCCGGTTATGTAGGGATTTGTCATCAAGGATTTGTTAGGTGAGTATTTCACATGCGCTTA:1	TTCCCCGGTTATGTAGGGATTT	GTGAGTATTTCACATGCGCTTA	-	chr2R	18402587	-	chr2R	18402511	76	+	chr2R	18402511	+	chr2R	18402587
ATGCAATTGTCGGGGGTTGTTTTCACACACCCGTAGCACAAAAACAAAGACACACTAAAAGCTCCCGCCAGAAAT:1	ATGCAATTGTCGGGGGTTGTTT	ACTAAAAGCTCCCGCCAGAAAT	+	chr3L	18756890	+	chr3L	6302440	12454450	+	chr3L	18756890	+	chr3L	6302440
TTTTGATAAAATTTGATGAAAAACCTTGTTACCAAAATACACATGCTAATTTAAAGTAACTTGAGATTTCACTCA:1	TTTTGATAAAATTTGATGAAAA	AAGTAACTTGAGATTTCACTCA	+	chr3L	17537018	+	chr3L	17537099	81	+	chr3L	17537018	+	chr3L	17537099
TGTGGGCACCATGCCAATGGAGCCCCTGACCCTGGAGCAGAACCATCTANTCATCGCCAGCGTTCAG:1	TGTGGGCACCATGCCAATGGAG	TCTANTCATCGCCAGCGTTCAG	+	chr3R	31373839	+	chr3R	15226189	16147650	+	chr3R	31373839	+	chr3R	15226189
TAAANGAACGTGGTTGGCGTGGNCTGGNAGGTGAGCTTGNGGCTGGGAAGAGAGGATGCGAGTGGGAATCAACAA:1	TAAANGAACGTGGTTGGCGTGG	GGATGCGAGTGGGAATCAACAA	+	chr2R	18436701	+	chr2R	22032697	3595996	+	chr2R	18436701	+	chr2R	22032697
GCCATTGATTTATCAAATAAAATTTATGATTTTCTGGCGCACAAGCATTGATTGCTATTACGAGTCAGCAACGAA:1	GCCATTGATTTATCAAATAAAA	GCTATTACGAGTCAGCAACGAA	+	chr2R	18031135	+	chr2R	3132830	14898305	+	chr2R	18031135	+	chr2R	3132830
TCCGTTCCCCTGAAAATCTGGTTCCACTTAAGCTGAAGGCATCAGTTGGTTCTATTGAAAAGTGTAATCGTAGCT:1	TCCGTTCCCCTGAAAATCTGGT	ATTGAAAAGTGTAATCGTAGCT	-	chr2R	23061856	-	chr2R	23061780	76	+	chr2R	23061780	+	chr2R	23061856
GATTTTGTTTTGATTTCCCCCAAAATGCTGTTGAGAGTGATAATTAATTTGGGATCGTCAT:1	GATTTTGTTTTGATTTCCCCCA	ATAATTAATTTGGGATCGTCAT	+	chr3R	25669083	+	chr3R	25669163	80	+	chr3R	25669083	+	chr3R	25669163
TACTTAGCTTTGATGGCTAAAATGATACTCTTTAAAATAAATTATTTTAAGGGATCAGAGAAGTTCGCGCGATGT:1	TACTTAGCTTTGATGGCTAAAA	ATCAGAGAAGTTCGCGCGATGT	-	chr2L	12905563	-	chr2L	12905479	84	+	chr2L	12905479	+	chr2L	12905563
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
ATCAACCATGTGCAATCCGCATGCCTTGTCCATGTGAATGGGTCGCCCACATATACACT:1	ATCAACCATGTGCAATCCGCAT	ATGGGTCGCCCACATATACACT	+	chr3L	5310383	+	chr3L	5310494	111	+	chr3L	5310383	+	chr3L	5310494
TTAACAAGCGAGTTCTGCGTTTAATTGTTTGCATGATGAATGATGTATTATTATTTGTAATTTGTAATTTGCATT:1	TTAACAAGCGAGTTCTGCGTTT	TTTGTAATTTGTAATTTGCATT	-	chr3L	4915053	-	chr3L	4914807	246	+	chr3L	4914807	+	chr3L	4915053
TTTTCCCTCATCAGCAGCAGGGGCAAAGATTTGTGGAATAACTTCAGAATTTAATTATATTATTCGGCTTATACA:1	TTTTCCCTCATCAGCAGCAGGG	ATTATATTATTCGGCTTATACA	+	chr3R	21481390	+	chr3R	21481481	91	+	chr3R	21481390	+	chr3R	21481481
CATTGTGCATCGCGACATCAAGCCGCAAAATGTTCTTATTTCTCTNCCAGACG:1	CATTGTGCATCGCGACATCAAG	GTTCTTATTTCTCTNCCAGACG	-	chr3R	18733985	-	chr3R	19855776	1121791	+	chr3R	19855776	+	chr3R	18733985
ATTAAATCTTAAATTAAATGTAGCTTTCAATGCACATAACATGGTTTTTTTCTTCTGACCAAGATTTTGTATAG:1	ATTAAATCTTAAATTAAATGTA	TTCTGACCAAGATTTTGTATAG	+	chr2L	11224061	+	chr2L	11224171	110	+	chr2L	11224061	+	chr2L	11224171
TGTTTGAATGCGACCCCAAAGAAAAGACCGGACCCAGAAAAGTCCATTCTCGTGTTTTTTTTTTGACGCTCTTC:1	TGTTTGAATGCGACCCCAAAGA	TGTTTTTTTTTTGACGCTCTTC	-	chr3L	3451030	-	chr3L	3450943	87	+	chr3L	3450943	+	chr3L	3451030
ATTGGGAGAAGCCTTCGCATTACAGCCCCACTCGGGTGGCAAAATAATAATTATTCTGCATTCGCCGTNCGGCA:1	ATTGGGAGAAGCCTTCGCATTA	ATTCTGCATTCGCCGTNCGGCA	+	chr3R	27799766	+	chr3R	27800143	377	+	chr3R	27799766	+	chr3R	27800143
ACTTATGAGCCCTGTGTGCGCTCCCCCTTCTCCATCGAATGCAAAGTTTCTGACTCATTTTCACGCTTGCCCTAA:1	ACTTATGAGCCCTGTGTGCGCT	CTCATTTTCACGCTTGCCCTAA	-	chrX	16176291	-	chrX	16176214	77	+	chrX	16176214	+	chrX	16176291
TGGGCCATGTGGGGCACGGGATGTGGGNAGGGTTCGACCCATCATCAAATCAATGAGCGGCCTGATATAAGGGA:1	TGGGCCATGTGGGGCACGGGAT	ATGAGCGGCCTGATATAAGGGA	-	chr3R	28597592	-	chr3R	28597516	76	+	chr3R	28597516	+	chr3R	28597592
GATGCATGACCTCCCTGCCATCCTGCTACCCCTTGTTGCGCCCGCTTGTTTAGTTTTTTGCGCAATT:1	GATGCATGACCTCCCTGCCATC	TTGTTTAGTTTTTTGCGCAATT	+	chr3R	11325356	+	chr3R	11325443	87	+	chr3R	11325356	+	chr3R	11325443
TGATTTGACACCTATAATTATCATCATTACTGAGACTTGAATACTACGTTCAGTGCATACTCACTCTGCCGCCAT:1	TGATTTGACACCTATAATTATC	TGCATACTCACTCTGCCGCCAT	+	chr3L	21847434	+	chr3L	21847530	96	+	chr3L	21847434	+	chr3L	21847530
AATGAGCAGAGATAGGTGGAAAAACTGTGCAGTGAAGAGAGACTAGTGGAATCACAGTTCGATGTTGGCATGCAA:1	AATGAGCAGAGATAGGTGGAAA	ACAGTTCGATGTTGGCATGCAA	+	chr3R	26568319	+	chr3R	17878027	8690292	+	chr3R	26568319	+	chr3R	17878027
GTCTTAGTGTGCGTGCGAAAATTGGGAAAAGCGAAGGCAGCCAACTACACATTTAGTGTTTATTTCGTATTTATT:1	GTCTTAGTGTGCGTGCGAAAAT	TAGTGTTTATTTCGTATTTATT	-	chr3L	8315198	-	chr3L	11477433	3162235	+	chr3L	11477433	+	chr3L	8315198
AGTAAGTGCTGCTCAAAATTCATTGCTCAGAAAGAGCAATTCCAACCACTTACTTGGGTGTAATCTCCNCCAGA:1	AGTAAGTGCTGCTCAAAATTCA	CTTGGGTGTAATCTCCNCCAGA	+	chr3R	23944932	+	chr3R	23945016	84	+	chr3R	23944932	+	chr3R	23945016
GTCTTCGTGTTGACACCTAGGTCCTTCGATGTGGAGCATCCTGTAGCACGGAGAACAAAAGTGAAAGGAG:1	GTCTTCGTGTTGACACCTAGGT	CGGAGAACAAAAGTGAAAGGAG	-	chrX	20105196	-	chrX	20105304	108	+	chrX	20105304	+	chrX	20105196
ATCANCTCCTAAGAAATTCGTTNTCTTNACATTTTTTCCNTTCTTTTCANATAGTATTGCTAATCGCCCTGCTGG:1	ATCANCTCCTAAGAAATTCGTT	GTATTGCTAATCGCCCTGCTGG	+	chrX	12896172	+	chrX	5022200	7873972	+	chrX	12896172	+	chrX	5022200
TAAATGAAAGTTCCAACTAGCGACACACGATATTTCTTGCGGGGTAAAAGCTATTTCAATACAATTAGATGCTAG:1	TAAATGAAAGTTCCAACTAGCG	TTTCAATACAATTAGATGCTAG	+	chr2L	5027959	+	chr2L	5028043	84	+	chr2L	5027959	+	chr2L	5028043
CTTCTGTTGTTCCTTTTTCCTACCATAGTACCATACCATACCATACCGTAACCAATCATAGTATCCNTATCG:1	CTTCTGTTGTTCCTTTTTCCTA	ACCAATCATAGTATCCNTATCG	+	chrX	6618469	+	chrX	6618544	75	+	chrX	6618469	+	chrX	6618544
TAAACGATTTTTAATGACATTTGCCATGAACTTAATGTTCGTAGATCAGAGTTCACAAGAGGGTCTCAGAAC:1	TAAACGATTTTTAATGACATTT	GTTCACAAGAGGGTCTCAGAAC	+	chr2L	4166390	+	chr2L	4166470	80	+	chr2L	4166390	+	chr2L	4166470
TGTTTCACGTACAGTCAGCACCCCCTATTTTCTCCCAGTGCTGCGCGCTCTTGTTCCCGA:1	TGTTTCACGTACAGTCAGCACC	TGCTGCGCGCTCTTGTTCCCGA	+	chr2L	19163382	+	chr2L	19163448	66	+	chr2L	19163382	+	chr2L	19163448
ACTAAATCAACTTCTGCCNCGATGCCCCACCTTTGTGCTATGTNACCAGNAGCATTCTGGCAGGACAAAAGATAA:1	ACTAAATCAACTTCTGCCNCGA	ATTCTGGCAGGACAAAAGATAA	+	chr3L	17210270	+	chr3L	17210389	119	+	chr3L	17210270	+	chr3L	17210389
TTTGTGCGGTAATGATCTNTGTCAAAGGTCAAATCAAACAANGGANATCCTAGAACCATAACCAACAAACCCTAA:1	TTTGTGCGGTAATGATCTNTGT	AACCATAACCAACAAACCCTAA	-	chr2L	9385241	-	chr2L	9385151	90	+	chr2L	9385151	+	chr2L	9385241
CAACAATAATAACAACAATAATGGNGAGCATAAGCAGTCGAGNTANACATCNGGANCACCGACACCCACAACGC:1	CAACAATAATAACAACAATAAT	GGANCACCGACACCCACAACGC	+	chr2L	15358406	+	chr2L	5937165	9421241	+	chr2L	15358406	+	chr2L	5937165
GAAACTGAGCTCCTTTGTCTGTGTGCGTTTGCCGGCTCGCTTT:1	GAAACTGAGCTCCTTTGTCTGT	TGTGCGTTTGCCGGCTCGCTTT	-	chr2R	22504736	-	chr2R	12293212	10211524	+	chr2R	12293212	+	chr2R	22504736
AGTTCGTTGGGTTTGGCATCGGATCAGATCATCTTGTTTTGTTAGGAGTATATCGTTCATAAAAGAAACACA:1	AGTTCGTTGGGTTTGGCATCGG	TATCGTTCATAAAAGAAACACA	-	chr3L	13335635	-	chr3L	13335538	97	+	chr3L	13335538	+	chr3L	13335635
TAATGGGAAGGACGGCGAGTTTACACAATCTCCCTCAACCAGCAACTCAAATGGGAACCGAGCATTAACGACAAA:2	TAATGGGAAGGACGGCGAGTTT	GGAACCGAGCATTAACGACAAA	+	chr3R	10727672	+	chr3R	10727752	80	+	chr3R	10727672	+	chr3R	10727752
AAGCCATATTGATGGAAAATGTATAAGATGGGGGCATAACATCACAGCTTTCTTTGGTAAATAAATTGGGGGAA:1	AAGCCATATTGATGGAAAATGT	TTTGGTAAATAAATTGGGGGAA	+	chr3L	3310299	+	chr3L	3310377	78	+	chr3L	3310299	+	chr3L	3310377
AGGTGGTTGTGGGACAGACAGATAGAGCTCTTACCGTATCNCCACCGTAACTCCTTGTCGCCGAAACACACAG:1	AGGTGGTTGTGGGACAGACAGA	TCCTTGTCGCCGAAACACACAG	+	chrX	14105033	+	chrX	14114182	9149	+	chrX	14105033	+	chrX	14114182
ATCGTCGAAGGTGAAAATGTACTTTGGATAGACTCAGCGGCCTTCTGACCAACGGTAC:1	ATCGTCGAAGGTGAAAATGTAC	GCGGCCTTCTGACCAACGGTAC	-	chr2L	802277	-	chr2L	7889660	7087383	+	chr2L	7889660	+	chr2L	802277
GTTTAAATTAGTTTTTGTTTTTTGTTTTCAGTCTTACCGAATGTTTGTTT:1	GTTTAAATTAGTTTTTGTTTTT	CAGTCTTACCGAATGTTTGTTT	+	chr2R	18381444	+	chr2R	24586899	6205455	+	chr2R	18381444	+	chr2R	24586899
TTGATTGAAAGCCAAACAGAGCCAGCCGGGATGGGACCGAAAGCCAGAAACAAAAGCACAACAAAAGCCCTCGTT:1	TTGATTGAAAGCCAAACAGAGC	AAGCACAACAAAAGCCCTCGTT	+	chr2L	17191892	+	chr2L	17191977	85	+	chr2L	17191892	+	chr2L	17191977
GAAGTTATGCATCCTGTTTTCGGGGGCGGACATCGCATAGCTTCCAAATGATTGGCAACGCAATTATTCCAGCAA:1	GAAGTTATGCATCCTGTTTTCG	GGCAACGCAATTATTCCAGCAA	+	chr3L	17327607	+	chr3L	17327696	89	+	chr3L	17327607	+	chr3L	17327696
CAGATGATTGACCTAAATTATCGTTGGAAAAACCTAACAAAGGATTACGGCTAATTTTCACTTCGAAAACTATAC:1	CAGATGATTGACCTAAATTATC	ATTTTCACTTCGAAAACTATAC	+	chr2L	13892821	+	chr2L	13893684	863	+	chr2L	13892821	+	chr2L	13893684
AGGCTTAACCACTAACTTANACTAGACGTAAATACAAAAGCTTGACCAAATACAAATCATCTATGTTATGAATGG:1	AGGCTTAACCACTAACTTANAC	AAATCATCTATGTTATGAATGG	+	chr2R	11344155	+	chr2R	11344251	96	+	chr2R	11344155	+	chr2R	11344251
AGCATTGGTCACGGAGCAGACTCGGTTTTTAAATAAATATATTTTTTTTTGTTTAATT:1	AGCATTGGTCACGGAGCAGACT	ATATATTTTTTTTTGTTTAATT	+	chr3L	225117	+	chr3L	5973502	5748385	+	chr3L	225117	+	chr3L	5973502
CCAATACCTCGCTTTTGGCCGCTTCCGCTGCCGTCGCGTNTTTTTGGNCATCCAGAAAAGGAAGCAATTAAAATG:1	CCAATACCTCGCTTTTGGCCGC	AGAAAAGGAAGCAATTAAAATG	-	chr3R	31245875	-	chr3R	31245788	87	+	chr3R	31245788	+	chr3R	31245875
CCTTTACATTGTTGAGTTATGTTTCTTCCGATCCCACACGCCACCCACTGAGCACCCTGACCTCTACGCCCACTA:1	CCTTTACATTGTTGAGTTATGT	ACCCTGACCTCTACGCCCACTA	+	chr2R	10671265	+	chr2R	10671343	78	+	chr2R	10671265	+	chr2R	10671343
GAACATANGATATTTAAGTGGTTTGTCTATTACTCCTAANAGATGAGCAATAGAATTNGCAATTTGTAAAAAATG:1	GAACATANGATATTTAAGTGGT	AATTNGCAATTTGTAAAAAATG	-	chr3L	18537817	-	chr3L	18528656	9161	+	chr3L	18528656	+	chr3L	18537817
GTATTTACTTCAAATGCTAGAAAGATTATTTTATTTTAAAAAACAGGTTTAGTGGCCCCATCAAACTTTACAC:1	GTATTTACTTCAAATGCTAGAA	GTGGCCCCATCAAACTTTACAC	-	chr3L	11758028	-	chr3L	11757933	95	+	chr3L	11757933	+	chr3L	11758028
AGGTCAATTTCGATTGGTACGAGCAAATAATAGTNAATATACATTCATTATTTTCATTAGATTTTAAACTAACTT:1	AGGTCAATTTCGATTGGTACGA	TCATTAGATTTTAAACTAACTT	-	chr3R	21919083	-	chr3R	21919003	80	+	chr3R	21919003	+	chr3R	21919083
GCCCAGATACCCAGGACCCCTGCCACGCCCCCATTTATCAGCTAACNAAATTAAGCATTTTC:1	GCCCAGATACCCAGGACCCCTG	GCTAACNAAATTAAGCATTTTC	+	chrX	3287205	+	chrX	3286875	330	+	chrX	3287205	+	chrX	3286875
CTAAAATAGTGGCGTAATATCGTAATGATATCACGATTAAATGATTTCGATAATAGCATAAATAAATAAATATAT:1	CTAAAATAGTGGCGTAATATCG	TAGCATAAATAAATAAATATAT	-	chr2L	6130870	-	chr2L	6130785	85	+	chr2L	6130785	+	chr2L	6130870
CCCCACCATAGGACTCCTGCTCTCTATCCAACCATCCATAGAGACATCCATCCCTCAAAGACACGCAAAAGCTCT:1	CCCCACCATAGGACTCCTGCTC	CTCAAAGACACGCAAAAGCTCT	-	chr3R	16193639	-	chr3R	16193502	137	+	chr3R	16193502	+	chr3R	16193639
ACAAAGATNAAGCACTACATCCCCCATTTCGCTAGNTATTACACTTGAATGCCTTATTTGTCATTGACCGGGCA:1	ACAAAGATNAAGCACTACATCC	CTTATTTGTCATTGACCGGGCA	-	chrX	835393	-	chrX	827602	7791	+	chrX	827602	+	chrX	835393
TATTACGCATGAACAATTCAACCGGGGAAGGCTTTCCTGTGCGGTGAGTAATGATTCTCCCCTGGTCGAAATAGA:1	TATTACGCATGAACAATTCAAC	ATTCTCCCCTGGTCGAAATAGA	+	chr3R	13380741	+	chr3R	13380829	88	+	chr3R	13380741	+	chr3R	13380829
GTAATGTCTGAGAAGCGAACCAGCTGGGTACGCCACGAAGCCACAAGAAACTGCAATCAATCGAGGGGCAATGG:1	GTAATGTCTGAGAAGCGAACCA	GCAATCAATCGAGGGGCAATGG	+	chr3R	9947963	+	chr3R	9948079	116	+	chr3R	9947963	+	chr3R	9948079
ATTGGGTGTTGAATGTGTAACTTTTCATACCCAAGATTCGCAGATTTTANTTGGTTGACCTACCTTAATTGTGAT:1	ATTGGGTGTTGAATGTGTAACT	GTTGACCTACCTTAATTGTGAT	+	chr3L	20487672	+	chr3L	20488123	451	+	chr3L	20487672	+	chr3L	20488123
GCACTTGTTGCCTCGCCTTTGCTAATTGTTCGCCATGCACTCGAGACTTTGTAGAGGCTT:1	GCACTTGTTGCCTCGCCTTTGC	ACTCGAGACTTTGTAGAGGCTT	-	chr3L	3281935	-	chr3L	3281454	481	+	chr3L	3281454	+	chr3L	3281935
TTTACTATCAATCAATGGGTTGCATCACTTTCAACACAGCACAAAAATCCAAATAAAAAGCCCTCCACTTTCGAA:1	TTTACTATCAATCAATGGGTTG	TAAAAAGCCCTCCACTTTCGAA	-	chr3R	13306525	-	chr3R	13306138	387	+	chr3R	13306138	+	chr3R	13306525
TATTTTACCTCCCATTTTAAGAACGAAAGCCACAGACGCACACACATGGGACCCCAATAAAAACCAATTTATGAA:1	TATTTTACCTCCCATTTTAAGA	CCAATAAAAACCAATTTATGAA	-	chr2R	22351497	-	chr2R	22349713	1784	+	chr2R	22349713	+	chr2R	22351497
AATCACACACACGGACACACACGCACACACTTACAC:1	AATCACACACACGGACACACAC	ACACACACGCACACACTTACAC	+	chr3R	30518712	+	chr3R	27477998	3040714	+	chr3R	30518712	+	chr3R	27477998
GTGATAATCTGGAATTGAAGCAATACAATAAAAACAAAGGGATGAACACTTATACAGGAAAA:1	GTGATAATCTGGAATTGAAGCA	GATGAACACTTATACAGGAAAA	-	chr3L	7503528	-	chr3L	7498764	4764	+	chr3L	7498764	+	chr3L	7503528
AAGCTGCCAGCTTGGCAAGTTCAAGGTCTAACCTTATCACAAGCCAGTGAGAAAACTTACCCAGGTGGGCTGAAA:1	AAGCTGCCAGCTTGGCAAGTTC	AACTTACCCAGGTGGGCTGAAA	-	chr3L	18896915	-	chr3L	18896780	135	+	chr3L	18896780	+	chr3L	18896915
GGCCAAGTTAATGCGCTGGGCAAACAACGNACATAAAACTGGACACGACGATATCGAAATNGAGCAAGGACTGCT:1	GGCCAAGTTAATGCGCTGGGCA	TCGAAATNGAGCAAGGACTGCT	+	chr3L	20954085	+	chr3L	6666572	14287513	+	chr3L	20954085	+	chr3L	6666572
CATACGCANCGTTGTCGCTGCCAGCCATGCACCGTNCGCCATAAAGCGTCCCATAGTGCGACTCGGGTTACGTAA:1	CATACGCANCGTTGTCGCTGCC	TAGTGCGACTCGGGTTACGTAA	+	chr2R	10167133	+	chr2R	10167209	76	+	chr2R	10167133	+	chr2R	10167209
ATATACATTGATTAAAACTATTCGTAGTGCTAAAGCATTTTTTTGCAGACATAAATTTCCTTGTGAATAGCTGGC:1	ATATACATTGATTAAAACTATT	AATTTCCTTGTGAATAGCTGGC	+	chr3L	3254109	+	chr3L	3254200	91	+	chr3L	3254109	+	chr3L	3254200
GCTTCACCTGGAATTCCGTGCTCCAAAACAGAAATTTGATCGCAATGTCGTATGCACAGACTCCTCCTCGATTGA:1	GCTTCACCTGGAATTCCGTGCT	GCACAGACTCCTCCTCGATTGA	-	chr3L	2631190	-	chr3L	2631080	110	+	chr3L	2631080	+	chr3L	2631190
CAAAAGCTAAAGAAAAAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAGCGGAAAAATTTGTTTTAATATTTCAGTTACGCT:1	CAAAAGCTAAAGAAAAAAAAAA	GTTTTAATATTTCAGTTACGCT	+	chr2L	7487737	+	chr2L	11979734	4491997	+	chr2L	7487737	+	chr2L	11979734
CGCCGTCGCACGTAATTTCAATTCATTCATAGACGATGTGGAGCACATGGGCACATGGGCCGTGGGG:1	CGCCGTCGCACGTAATTTCAAT	CATGGGCACATGGGCCGTGGGG	-	chr3R	23315634	-	chr3R	7877312	15438322	+	chr3R	7877312	+	chr3R	23315634
ATCTAGGCTTCTGGTTGTCAAAATGTATAAGCTTGGACAATTGTAATGTAGTCAAAGAAGTGATGTGGTACGAG:1	ATCTAGGCTTCTGGTTGTCAAA	CAAAGAAGTGATGTGGTACGAG	+	chr3L	1104001	+	chr3L	1104191	190	+	chr3L	1104001	+	chr3L	1104191
ATAATGTTACACTATTTTTCCTGCTTTTCAATCGACTATAAAATTACAACTATAATTTACTGTTANCGTACTAAT:1	ATAATGTTACACTATTTTTCCT	AATTTACTGTTANCGTACTAAT	+	chr3L	14486169	+	chr3L	14486246	77	+	chr3L	14486169	+	chr3L	14486246
GAGCAAGCAGCCAATATTAGTTAGGACAATTGCCATAATTGAGGATCTGTTATCGTGTCTATTTTTTA:1	GAGCAAGCAGCCAATATTAGTT	CTGTTATCGTGTCTATTTTTTA	-	chr2R	1087142	-	chr2R	1082373	4769	+	chr2R	1082373	+	chr2R	1087142
CTTATTACTGCTAAAAGACTTGTCGATGGCAACTGCAATTTTGCTCGCT:1	CTTATTACTGCTAAAAGACTTG	GGCAACTGCAATTTTGCTCGCT	+	chr3R	24199763	+	chr3R	24199817	54	+	chr3R	24199763	+	chr3R	24199817
TATTCCCTCAACTTTTGCAAGTTCTTGCCCAGCAAAAGACATGAAAGGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	TATTCCCTCAACTTTTGCAAGT	GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	-	chrX	13486748	-	chrX	12649915	836833	+	chrX	12649915	+	chrX	13486748
TATTTCTGCAAATGGATTTCAAGTTTCGCTCTGTAGCGAAGTAGTTGGCCTTATCAAAGCGCTTTCACTTTGCTT:1	TATTTCTGCAAATGGATTTCAA	TCAAAGCGCTTTCACTTTGCTT	-	chr3R	32005589	-	chr3R	31997911	7678	+	chr3R	31997911	+	chr3R	32005589
GTAAGAGGAACTGTTCTATGTTTGTTAGTACCTCTTTTGGAAGACATGAAGTAACTGA:1	GTAAGAGGAACTGTTCTATGTT	TTGGAAGACATGAAGTAACTGA	+	chr3R	26444469	+	chr3R	25892972	551497	+	chr3R	26444469	+	chr3R	25892972
TATAAATAAATATTCCTAAATTAACTTTTTATAAACTTAGGTTAGGTCATAAACTTTTCTAAATAACGAAAAGCA:1	TATAAATAAATATTCCTAAATT	CTTTTCTAAATAACGAAAAGCA	-	chr3R	22061548	-	chr3R	28390469	6328921	+	chr3R	28390469	+	chr3R	22061548
CGNGTCTATTCAGACGAGAACTGATACGGGCCAANANACAGAGTGTGGCCAAGTTGGGCATAATGCGGAAGCTAA:1	CGNGTCTATTCAGACGAGAACT	TTGGGCATAATGCGGAAGCTAA	+	chr3R	13195955	+	chr3R	13196050	95	+	chr3R	13195955	+	chr3R	13196050
GCAATCCTATTACGACAGTAATATGTAAGTAAAAGGTTTTCAATCTTTTTAGAATTCAGCTGCAGAACTTGTAAA:1	GCAATCCTATTACGACAGTAAT	ATTCAGCTGCAGAACTTGTAAA	+	chr3L	21872440	+	chr3L	21872519	79	+	chr3L	21872440	+	chr3L	21872519
AAATGTTTTTCGAGGATTGAAAATTGCCTAAACCGTCGTTTGCTTTGCGGTCTGGAAATNAACGAAA:1	AAATGTTTTTCGAGGATTGAAA	TGCGGTCTGGAAATNAACGAAA	-	chr2L	18883954	-	chr2L	18883880	74	+	chr2L	18883880	+	chr2L	18883954
TANCATGTGGTCAGCATCGGCATCTTTTTATTTTNCNAAAATATGTAGTCAAAACCTTTGAACCTTTTAAATCCA:1	TANCATGTGGTCAGCATCGGCA	ACCTTTGAACCTTTTAAATCCA	-	chr3L	642582	-	chr3L	642491	91	+	chr3L	642491	+	chr3L	642582
GCCGGCTTATCATTTAAATGGAGGGAAGTTGGCTTTAAAGGCAATCGCAAAGCGTCCTATTTCGTGGCTTAG:1	GCCGGCTTATCATTTAAATGGA	AGCGTCCTATTTCGTGGCTTAG	-	chr2R	14393949	-	chr2R	14393867	82	+	chr2R	14393867	+	chr2R	14393949
TTGTTGCCATTGTTGCTGCTGCTTCTGCTGCTGTTGCCGTTGTTTGTTGGGATCCATAAATTTTAATATTAATG:1	TTGTTGCCATTGTTGCTGCTGC	TCCATAAATTTTAATATTAATG	-	chr2L	8579399	-	chr2L	2530112	6049287	+	chr2L	2530112	+	chr2L	8579399
AAAACATGCATCACAAAACGAGCCAGAACACAAAAAACACGGA:1	AAAACATGCATCACAAAACGAG	GCCAGAACACAAAAAACACGGA	-	chr2L	1266337	-	chr2L	3476850	2210513	+	chr2L	3476850	+	chr2L	1266337
CCACATGCCCAAAAATATGCAACATTTTTTATATGTTTCTGCTTCACAAAACTTTTGCGCAGGCAGGATCATAAA:1	CCACATGCCCAAAAATATGCAA	TTTGCGCAGGCAGGATCATAAA	+	chr3R	8707369	+	chr3R	8709810	2441	+	chr3R	8707369	+	chr3R	8709810
TGACCTGCGAGCATAGGCAGCAGCAGCGACACAGTATAATTAGGTTTGCCTTCTGTGTTCGAAACTTTTAAAGAA:1	TGACCTGCGAGCATAGGCAGCA	TGTGTTCGAAACTTTTAAAGAA	+	chr3L	24021296	+	chr3L	24022453	1157	+	chr3L	24021296	+	chr3L	24022453
AAGCAGCCAATATTAGTTAGGACAATTGCCATNATTGAGGATCTGTTATCGTGTCTATTT:1	AAGCAGCCAATATTAGTTAGGA	GGATCTGTTATCGTGTCTATTT	-	chr2R	1087138	-	chr2R	1082377	4761	+	chr2R	1082377	+	chr2R	1087138
CTGTATGGGTATTTACAATTATTAACGTGTATGACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	CTGTATGGGTATTTACAATTAT	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	10905244	+	chr3R	21907534	11002290	+	chr3R	10905244	+	chr3R	21907534
ACCGTAACCAAAGAAAACCACACGAACTTTGGCTGGAAAATCGATTCATGTTCCTGTCCGCCGTTCAG:1	ACCGTAACCAAAGAAAACCACA	CATGTTCCTGTCCGCCGTTCAG	-	chrX	7390028	-	chrX	19764898	12374870	+	chrX	19764898	+	chrX	7390028
GCATAACATCGATGGACACTCATACTGCCTGGATGAGCATGGCAATAACACAAACTAAATGGAAACTACGTTCG:1	GCATAACATCGATGGACACTCA	AACTAAATGGAAACTACGTTCG	+	chrX	14636465	+	chrX	14641905	5440	+	chrX	14636465	+	chrX	14641905
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTTGTTGTATTGTGT:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	GTTGTGTTTTGTTGTATTGTGT	-	chr3R	21907535	-	chr3R	21853669	53866	+	chr3R	21853669	+	chr3R	21907535
TCATTTCGTTTAGAAACAAGCAGACGAACTTTGGACAAATGCTTGTGACAAGTCTTGAAAATGGGTTCGT:1	TCATTTCGTTTAGAAACAAGCA	CAAGTCTTGAAAATGGGTTCGT	-	chr2L	15044798	-	chr2L	15044727	71	+	chr2L	15044727	+	chr2L	15044798
AGCTGTTTCCACAATGGGGCGCATTCAGATGGAGTTTTTGCTCCAAAAGCATTGAACTGTGCAAACTTCCACAGA:1	AGCTGTTTCCACAATGGGGCGC	GAACTGTGCAAACTTCCACAGA	+	chr3R	4981736	+	chr3R	4981813	77	+	chr3R	4981736	+	chr3R	4981813
TTTAATTATATAAATTTTTTATTTATCAATTAATCAAGAAAAGTTACTATTAGCACGTTCGCCCCACTTACATCC:1	TTTAATTATATAAATTTTTTAT	CACGTTCGCCCCACTTACATCC	-	chr2L	12835693	-	chr2L	12835584	109	+	chr2L	12835584	+	chr2L	12835693
AGAACTCAAAACATTTAAGGGCTATACCAATATAATTTTGAGCAATTGTTGTAAGGTTAATTTGAAGTTCATACG:1	AGAACTCAAAACATTTAAGGGC	AGGTTAATTTGAAGTTCATACG	-	chr3L	9502214	-	chr3L	9501731	483	+	chr3L	9501731	+	chr3L	9502214
TTATAATTTACTGCCCAGGAAAAATATCATCATACAAGATCTGCGATACGGACTTTAACGCTCATAATTGAAAC:1	TTATAATTTACTGCCCAGGAAA	CTTTAACGCTCATAATTGAAAC	+	chrX	9975741	+	chrX	9975819	78	+	chrX	9975741	+	chrX	9975819
TTTAAACTCCTTTAAGTCAATTTGCATAGGTCCACACCCTCTGACCCTCTGTTTTCCCCATCCCAGCCACGGAC:1	TTTAAACTCCTTTAAGTCAATT	TTTCCCCATCCCAGCCACGGAC	-	chr3L	19378690	-	chr3L	19378303	387	+	chr3L	19378303	+	chr3L	19378690
TGAAAAAGTGAAAAACAAGAACAAACAGAAAGTACCCAACGATCGGTTTCAGTTGTTCATATAAAGCGATCGGAG:1	TGAAAAAGTGAAAAACAAGAAC	TGTTCATATAAAGCGATCGGAG	+	chr3L	9344223	+	chr3L	9344301	78	+	chr3L	9344223	+	chr3L	9344301
GGCGAGCTGCTGCCGGGAAAACTAGTGAATGCAAAATGAGTTTG:1	GGCGAGCTGCTGCCGGGAAAAC	TAGTGAATGCAAAATGAGTTTG	-	chrX	16585178	-	chrX	3646574	12938604	+	chrX	3646574	+	chrX	16585178
ATAGACAACAAAAAAATAACGCTGCTAATAAACTTTCGGGCATAAAAATCGCACTGCAAATTTACCACACGAC:1	ATAGACAACAAAAAAATAACGC	CACTGCAAATTTACCACACGAC	+	chr3L	19008848	+	chr3L	19009184	336	+	chr3L	19008848	+	chr3L	19009184
GGGGGGATAAACTCACGCAGCGCCAAAAGGTAAANGACCAAAAGCCATTTAAACTGCAATTGCAGTGAATGTTGC:1	GGGGGGATAAACTCACGCAGCG	CTGCAATTGCAGTGAATGTTGC	-	chr3L	1581509	-	chr3L	1581175	334	+	chr3L	1581175	+	chr3L	1581509
TGGTATGCGCCTTTCGTGGTTTATTATTACNNNCNTCCACTTTTTTCTTTTCACCCATTTCCCAAAAAGAAAACA:1	TGGTATGCGCCTTTCGTGGTTT	CCCATTTCCCAAAAAGAAAACA	-	chr3L	3561126	-	chr3L	17166933	13605807	+	chr3L	17166933	+	chr3L	3561126
CTTGCCTTGAATTTATATATGCAGCAAATGAGCTGTCATAATTAATTGAGCCATCATCAGGCCAGCGAAG:1	CTTGCCTTGAATTTATATATGC	AGCCATCATCAGGCCAGCGAAG	+	chr2R	7625157	+	chr2R	7625251	94	+	chr2R	7625157	+	chr2R	7625251
CTAGTATCATTAGGGCAAGCGTTAAAATGAGTCAGAAACTTTGCATTCGATGGAGAAGGGGGAGCGCACACAGGG:1	CTAGTATCATTAGGGCAAGCGT	AGAAGGGGGAGCGCACACAGGG	+	chrX	16176205	+	chrX	16176282	77	+	chrX	16176205	+	chrX	16176282
TTATTTGGTGATTGGTCCATTGCAACTNAANNGTGTAATGTTACACATTNGNCTAAATCAAAAGAACTTTATTT:1	TTATTTGGTGATTGGTCCATTG	CTAAATCAAAAGAACTTTATTT	+	chrX	1051097	+	chrX	1051174	77	+	chrX	1051097	+	chrX	1051174
AGAGCAACNACGCTTGACGGCACAATCGGAGCTAATTTGGTCCAGAAAACTGTAGTCATCAAGAAAAACTTCGAT:1	AGAGCAACNACGCTTGACGGCA	AGTCATCAAGAAAAACTTCGAT	-	chr3R	28697300	-	chr3R	4595609	24101691	+	chr3R	4595609	+	chr3R	28697300
ACCGATTGGGAACTGTCCGCACCACTCCCCTAAAACTAATTATAATATTTTCGCCTTTTGCGATCGCGACCTA:1	ACCGATTGGGAACTGTCCGCAC	CGCCTTTTGCGATCGCGACCTA	+	chr3L	21407009	+	chr3L	21407086	77	+	chr3L	21407009	+	chr3L	21407086
GAGTGCCTGGCGAACAATTAGCAAAGGCGAGGCAACAAG:1	GAGTGCCTGGCGAACAATTAGC	TTAGCAAAGGCGAGGCAACAAG	+	chr3L	3281472	+	chr3L	3281932	460	+	chr3L	3281472	+	chr3L	3281932
GCCATAATCTGAGCGCATCCCCAAGCACAAGACAATGGCATATGTTCATACAGTTGAGCTCATCATTTTGAGAA:1	GCCATAATCTGAGCGCATCCCC	GTTGAGCTCATCATTTTGAGAA	-	chr2L	15396232	-	chr2L	15396148	84	+	chr2L	15396148	+	chr2L	15396232
CAATGCAACCGCACAACCCAATAGTCCACAAAGTGGATAATACGAATATGTGGATATTTTTGGTCACGTTTGAAT:1	CAATGCAACCGCACAACCCAAT	ATATTTTTGGTCACGTTTGAAT	-	chr3L	5030850	-	chr3L	5030774	76	+	chr3L	5030774	+	chr3L	5030850
CGAATTCACGTGTGCGTTTGTCTCCGCTCCTTTGCGAGTGTGTGTGTGGGTGCAGGACGAAGGACATGTTGCTGA:1	CGAATTCACGTGTGCGTTTGTC	AGGACGAAGGACATGTTGCTGA	-	chr3R	5140499	-	chr3R	5140410	89	+	chr3R	5140410	+	chr3R	5140499
CACAAACACACACACACACACATGCTTGCACTCACTAGCACACACCTAGAGAGAGACACTTGAATATTAATGAG:1	CACAAACACACACACACACACA	GAGACACTTGAATATTAATGAG	+	chrX	7978947	+	chrX	12721294	4742347	+	chrX	7978947	+	chrX	12721294
TTTTAAGTCGATTTCCTAAAAATATAATTTACCTGAAGTGGCACTGCAACCAAACAAATAATCTTGCCGTGACCT:1	TTTTAAGTCGATTTCCTAAAAA	ACAAATAATCTTGCCGTGACCT	-	chr3R	6670700	-	chr3R	6670591	109	+	chr3R	6670591	+	chr3R	6670700
AAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGG:1	AAATAATTAAAATAAAATGTCC	TTTTGCCTCAAAATTGTAGAGG	+	chr2R	5581425	+	chr2R	5627634	46209	+	chr2R	5581425	+	chr2R	5627634
AATGATGGCCAGCATGATCTTCTCACCCTTCGTCGGATACGGATTCTTTTTGTGCTCACTCAGCCAGG:1	AATGATGGCCAGCATGATCTTC	TTTTTGTGCTCACTCAGCCAGG	-	chr3L	12594306	-	chr3L	12618413	24107	+	chr3L	12618413	+	chr3L	12594306
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTTTTTGTTGTTGTTTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	GTGTTTTTTTGTTGTTGTTTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	27448390	5540856	+	chr3R	27448390	+	chr3R	21907534
AAGAGAAAGCATGTGTTTCTTTCGATTAAAAATGTTATTTTTTTAATTGTTATGTTTTCGTTTAGAAACGTG:1	AAGAGAAAGCATGTGTTTCTTT	TATGTTTTCGTTTAGAAACGTG	+	chrX	21328148	+	chrX	21328256	108	+	chrX	21328148	+	chrX	21328256
TGTGCGCTTCCATTTTACGGACCGCAACCACTTCGCATGTATCTGCTGCTCACGTCCCCAATTCTACTTGCCCAC:1	TGTGCGCTTCCATTTTACGGAC	GTCCCCAATTCTACTTGCCCAC	-	chr2R	20523177	-	chr2R	20523066	111	+	chr2R	20523066	+	chr2R	20523177
AAATAACTAACCAATTTTCATATAAAAACGGCATAACGTGTTAATTTCTTACTCCCAATGCTATTTTGGTTTGGA:1	AAATAACTAACCAATTTTCATA	CCCAATGCTATTTTGGTTTGGA	-	chr3R	16921939	-	chr3R	16921855	84	+	chr3R	16921855	+	chr3R	16921939
ACACTTTTCGAAGCCAATGGATTTTTTGTAATTCCTTGATTCAACTACCGGTGGGCATCACTGAAGAGCAGAAAG:1	ACACTTTTCGAAGCCAATGGAT	GGCATCACTGAAGAGCAGAAAG	-	chrX	494697	-	chrX	494605	92	+	chrX	494605	+	chrX	494697
TTCTCGAAGCATTCGCTAAGCTGGACTTCTCCCGTTGGGTTGTCAAGGAGGTGTACA:1	TTCTCGAAGCATTCGCTAAGCT	TGGGTTGTCAAGGAGGTGTACA	+	chr2R	4656809	+	chr2R	4656895	86	+	chr2R	4656809	+	chr2R	4656895
AAATTATACGAAATATTCGAGCTCAGTTTTATATCCGCGGCGACTTTGTGCCTTNTTTTT:1	AAATTATACGAAATATTCGAGC	GGCGACTTTGTGCCTTNTTTTT	+	chr3R	30747576	+	chr3R	30747637	61	+	chr3R	30747576	+	chr3R	30747637
CTTCGTTTATAATGATTTAATTGATGGGTACNATCGCATGTATACGCACGGAACCCCGATCCATGACCCACAAAC:1	CTTCGTTTATAATGATTTAATT	CCCCGATCCATGACCCACAAAC	+	chr2R	10387980	+	chr2R	10388077	97	+	chr2R	10387980	+	chr2R	10388077
GAGAGGGGGGTCCGGTACCACCCAGGAAAATCACGATGACGATGATAATAAAAAACTTCAGGAGCAGGCA:1	GAGAGGGGGGTCCGGTACCACC	TAAAAAACTTCAGGAGCAGGCA	-	chr3L	19173500	-	chr3L	14697763	4475737	+	chr3L	14697763	+	chr3L	19173500
CACCACAAATCCTCCCTTCGAATATACTCAAAGCATTGCAGACTATGAGTATCTGAATCAGTACACACCTGCTG:1	CACCACAAATCCTCCCTTCGAA	CTGAATCAGTACACACCTGCTG	+	chr2R	18791419	+	chr2R	18791519	100	+	chr2R	18791419	+	chr2R	18791519
ATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAG:1	ATGCTTAGCCATCTCGTACAGG	ACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAG	-	chr2R	12187474	-	chr2R	12190106	2632	+	chr2R	12190106	+	chr2R	12187474
CAATGAAGGACCAGTCAGTGAGCATCAGAAACGTCAATCTTTAGTTGNCAAAGGCTTCTGGCAAGAGCTTT:1	CAATGAAGGACCAGTCAGTGAG	AAAGGCTTCTGGCAAGAGCTTT	-	chr3L	25842564	-	chr3L	25842482	82	+	chr3L	25842482	+	chr3L	25842564
ATCAATCAGTTGACCATAAGCTTTTGCTGAAATTTTCATGCTTCAACTTTCTTGCTGTTGCTTTCTTCGTGTCTC:1	ATCAATCAGTTGACCATAAGCT	GCTGTTGCTTTCTTCGTGTCTC	-	chr3L	940914	-	chr3L	939793	1121	+	chr3L	939793	+	chr3L	940914
AAAAAAAACGGTGGAAAAACAGATATGGAAGTNCCGCTGTGTGACGATGACGATGACGTA:1	AAAAAAAACGGTGGAAAAACAG	GTGTGACGATGACGATGACGTA	+	chr3R	22186469	+	chr3R	31346365	9159896	+	chr3R	22186469	+	chr3R	31346365
AAGAGTATGCCCACCTGANAGGTGTACAAACACACAGGTAGNCAGNTTTTGGTAACAGCGTGTGTGCGTGTGTG:1	AAGAGTATGCCCACCTGANAGG	TAACAGCGTGTGTGCGTGTGTG	-	chr3R	13820072	-	chr3R	6405578	7414494	+	chr3R	6405578	+	chr3R	13820072
CGCGTGTGGTTAAGTGACAGNGAAGGAGTNAGCAGAATGGTCGGATGGCTG:1	CGCGTGTGGTTAAGTGACAGNG	NAGCAGAATGGTCGGATGGCTG	+	chr3R	24072117	+	chr3R	24072531	414	+	chr3R	24072117	+	chr3R	24072531
ATCTTGTCACTCTAAAAATCTAAACCCTTTGATACTTTATATTGGGTCTAGCTTGAAAATAGCTAGTATTTCCGC:1	ATCTTGTCACTCTAAAAATCTA	TGAAAATAGCTAGTATTTCCGC	-	chr3L	4907322	-	chr3L	4901132	6190	+	chr3L	4901132	+	chr3L	4907322
AAAATAAATAAAATTATCNCTTCAATTGCATCATTTACCGAATNAACATNGACATTATTTATATTTGTGGAAATT:1	AAAATAAATAAAATTATCNCTT	ATTATTTATATTTGTGGAAATT	+	chr3R	28552788	+	chr3R	28553141	353	+	chr3R	28552788	+	chr3R	28553141
GTGGGGGGAAAAAACTACAACAACAGGGGCATAAATGAGAACTCAAGTAGAACGTTTACA:1	GTGGGGGGAAAAAACTACAACA	GAACTCAAGTAGAACGTTTACA	-	chr2R	18351966	-	chr2R	8065777	10286189	+	chr2R	8065777	+	chr2R	18351966
CTCACAGTTTTTACAAGCTGCTACTGTGGGGCCCGACTTTTGTTGGTTTTCTGTTCGGCGCAACCGTGTGAATG:1	CTCACAGTTTTTACAAGCTGCT	GTTCGGCGCAACCGTGTGAATG	-	chr3L	14723026	-	chr3L	14721184	1842	+	chr3L	14721184	+	chr3L	14723026
GGGGAAAACCACTAGCACCTTCAAATTTGTGTGTGAGTGCGTGTGGGGGCATAACAAAAACGTGTTGATTTGCTG:1	GGGGAAAACCACTAGCACCTTC	ACAAAAACGTGTTGATTTGCTG	+	chrX	706806	+	chrX	707170	364	+	chrX	706806	+	chrX	707170
TTTATTGCCTGGACTTTCTTGTGCGACAGGAAAACTGTGTTCGTATCCTATAAATAAGAATTCTGATAGGTTTG:1	TTTATTGCCTGGACTTTCTTGT	AATAAGAATTCTGATAGGTTTG	+	chrX	20144856	+	chrX	20145025	169	+	chrX	20144856	+	chrX	20145025
AACGACTGNAGGTCCGACACCCACTCCCCATAGTTNTCAGTCACGAACTAGCCATAAAATTAGCACAGAGGCCTT:1	AACGACTGNAGGTCCGACACCC	ATAAAATTAGCACAGAGGCCTT	+	chr3L	17340363	+	chr3L	15711605	1628758	+	chr3L	17340363	+	chr3L	15711605
TCATCTATTGCATTAGAGCTTATTAGCCATGAACCGAGTACAGAAGAATATGTTAATTACTTTGTATTGCTTTCA:1	TCATCTATTGCATTAGAGCTTA	TAATTACTTTGTATTGCTTTCA	+	chr3R	19340396	+	chr3R	19340473	77	+	chr3R	19340396	+	chr3R	19340473
TACCTAAGGACCCCAGGCCATCTGGAGCTTAACAATTAAAATGGGTGGGTAGTGTAAGCTTAAAAGTAGTTAAT:1	TACCTAAGGACCCCAGGCCATC	TGTAAGCTTAAAAGTAGTTAAT	+	chr3R	15601167	+	chr3R	15608688	7521	+	chr3R	15601167	+	chr3R	15608688
TAATACCTCTAAGCTATACTAAAAGTGAACCACGCGTCGAGAAACCTGGNCGACTATTTAGGTGGGTTCGTCGGC:1	TAATACCTCTAAGCTATACTAA	CTATTTAGGTGGGTTCGTCGGC	+	chrX	10885734	+	chrX	10885853	119	+	chrX	10885734	+	chrX	10885853
ATTTGAANTGCGGTTTGCGGATGGAAACAGTTTCACTTCNTTCTGATCAAGTGTTTGNGGGCCAAGTGCAACAGA:1	ATTTGAANTGCGGTTTGCGGAT	TTTGNGGGCCAAGTGCAACAGA	+	chrX	14812281	+	chrX	9640401	5171880	+	chrX	14812281	+	chrX	9640401
AAGCTGTAAACATAACCAGATTAGNAACCTATTCCTATAAACNCTNTCATTNCATNGAATTTTCTAGTCTGCCAT:1	AAGCTGTAAACATAACCAGATT	ATNGAATTTTCTAGTCTGCCAT	+	chr2L	976889	+	chr2L	984525	7636	+	chr2L	976889	+	chr2L	984525
TATGTGCTTTCAATGTACATTTCAGCCGAGAACTTACAGTTTTTTTTTATTATTTATTATAATGCTATTTGTTTT:1	TATGTGCTTTCAATGTACATTT	TTATTATAATGCTATTTGTTTT	+	chrX	12511328	+	chrX	12511412	84	+	chrX	12511328	+	chrX	12511412
AAGTTGTTGTGCCNAAAAGCCCCGATGATAGTAGTTAAATTTGATCAGATGACGCAGCAGCGGCCAA:1	AAGTTGTTGTGCCNAAAAGCCC	CAGATGACGCAGCAGCGGCCAA	+	chr2R	8722784	+	chr2R	8723017	233	+	chr2R	8722784	+	chr2R	8723017
ACCCAATTTGAATTTTAACTTTTTTCTATCTATCTTATCTTCTTCTATCATTAAGCGCAATTTACTTATTATCAA:1	ACCCAATTTGAATTTTAACTTT	AGCGCAATTTACTTATTATCAA	+	chr3R	18107137	+	chr3R	18107220	83	+	chr3R	18107137	+	chr3R	18107220
TGTGTTGCATGTGCTGCTCTTGCTGGTCATGTTCCGTCCAACGGGTCGTATGGGTGATCTGTTCAGGCCGCATT:1	TGTGTTGCATGTGCTGCTCTTG	GGTGATCTGTTCAGGCCGCATT	+	chr3R	17227312	+	chr3R	26242192	9014880	+	chr3R	17227312	+	chr3R	26242192
ATATGTGCTTAGTGGAATGGCGTCGCCAAAATGCAATCAAAGCAATGCGATGGGTAGCACTGTAGTCGAATCTGG:1	ATATGTGCTTAGTGGAATGGCG	GTAGCACTGTAGTCGAATCTGG	+	chrX	15525064	+	chrX	6749611	8775453	+	chrX	15525064	+	chrX	6749611
TTTTGCCTGCACTCTTATCAGTCACAATNGCTAGTTTCTATGCTCGGCACGTGGATCTGTTTATTTGCACTGA:1	TTTTGCCTGCACTCTTATCAGT	TGGATCTGTTTATTTGCACTGA	-	chr3L	1189714	-	chr3L	1189630	84	+	chr3L	1189630	+	chr3L	1189714
GCCTCGTTGAAAGCGACAANCAACTCAGCAAGCAACCAAAGCGCGGTCGCAAGACAAACAAGATACAGAAAATAC:1	GCCTCGTTGAAAGCGACAANCA	ACAAACAAGATACAGAAAATAC	+	chr3L	2927847	+	chr3L	2936124	8277	+	chr3L	2927847	+	chr3L	2936124
TGACAATCAAAGGACTCACCAAAAACTCAACACAATATCTTCGTTCGGTACCG:1	TGACAATCAAAGGACTCACCAA	ACAATATCTTCGTTCGGTACCG	+	chr2R	16932452	+	chr2R	10056566	6875886	+	chr2R	16932452	+	chr2R	10056566
CAGATTGTTGTTAAAAAGTTACTTGAAATCAACATTTAATGAAAAATACAATTAAATTGAACTGAGCTTAGATTT:1	CAGATTGTTGTTAAAAAGTTAC	AAATTGAACTGAGCTTAGATTT	+	chr3L	20849284	+	chr3L	20849363	79	+	chr3L	20849284	+	chr3L	20849363
TACCAAATACCAGTACAGATAAGACCTTATTGTCAAGCGGATGGGATGAAGCTTAACAATTTTTATGNCGACGTC:1	TACCAAATACCAGTACAGATAA	TAACAATTTTTATGNCGACGTC	+	chr2L	16060997	+	chr2L	16060386	611	+	chr2L	16060997	+	chr2L	16060386
TTGTGCAAAATAAAATCGTNATATAAATTCGACCAGATATCAAAAATGGTTTGCTTATCCGTATAATCATCTTTT:1	TTGTGCAAAATAAAATCGTNAT	CTTATCCGTATAATCATCTTTT	+	chr3R	14635155	+	chr3R	14635231	76	+	chr3R	14635155	+	chr3R	14635231
AAACTATTAAAGTATAGTTAAAGAAGAAGAAAGTTAATTACATTTTCNAATTCATAATATCATAAATNTAGCAAT:1	AAACTATTAAAGTATAGTTAAA	ATAATATCATAAATNTAGCAAT	-	chrX	17992292	-	chrX	10130903	7861389	+	chrX	10130903	+	chrX	17992292
TAATTGTGCTTTTACGTGTTTTAGCAAAAAATCAAAAAGAACTATGTAAGATTTCGATGGGGAACCGATAATGCT:1	TAATTGTGCTTTTACGTGTTTT	TCGATGGGGAACCGATAATGCT	+	chr3R	28479168	+	chr3R	28479251	83	+	chr3R	28479168	+	chr3R	28479251
TTGCCTAACACAAGCCANGTTCGGCAAACATCGTGTTGACNGACNGAGGTAATTTGCCAGCACCAAAAACGAAA:1	TTGCCTAACACAAGCCANGTTC	TTTGCCAGCACCAAAAACGAAA	-	chr2R	7101713	-	chr2R	7101619	94	+	chr2R	7101619	+	chr2R	7101713
TTTTTAGAAAAATTCCATCTTCTATGGAACGCTGTAGCTCAGCTAAGATCAGGCATAATAAGCTAAAANGTCT:1	TTTTTAGAAAAATTCCATCTTC	GGCATAATAAGCTAAAANGTCT	-	chr2R	6178772	-	chr2R	6178687	85	+	chr2R	6178687	+	chr2R	6178772
AAGTAAGCCCAAAAGATACACCCTTCATTATTCGCATTGTNTGGCACGCATCGTTTTTTGTTTTTT:1	AAGTAAGCCCAAAAGATACACC	CACGCATCGTTTTTTGTTTTTT	-	chr3L	16360069	-	chr3L	16359992	77	+	chr3L	16359992	+	chr3L	16360069
TAATGCATTTGATTTCATAAGAACATATCTAGCCTTGATATATATATGAAAATAATTTACTTCACTTCNTTCTGG:1	TAATGCATTTGATTTCATAAGA	AATTTACTTCACTTCNTTCTGG	-	chr2L	20601873	-	chr2L	20601795	78	+	chr2L	20601795	+	chr2L	20601873
TAACAATAATGTCTCATTTTTCTTTGCAGTGTACTTTAAAAAATACGAGGGCATATGTAAATTGAAACGAAAGGA:1	TAACAATAATGTCTCATTTTTC	TATGTAAATTGAAACGAAAGGA	-	chr3R	12733936	-	chr3R	12733856	80	+	chr3R	12733856	+	chr3R	12733936
GAGCATAATGGAAAATTTGCCATGCGAGTTCCTGCCAGTTCACCACCAACATGGTTAATCCCACAAATTTAATTT:1	GAGCATAATGGAAAATTTGCCA	GTTAATCCCACAAATTTAATTT	+	chr3R	11295429	+	chr3R	5244543	6050886	+	chr3R	11295429	+	chr3R	5244543
TAACTTGAGTTGTGGGCTTGATGTAAATTAGATAATAATTTTAGGGCGAGCAAGTACTTTTTAACGGACTTTTTG:1	TAACTTGAGTTGTGGGCTTGAT	GTACTTTTTAACGGACTTTTTG	-	chr2R	13439273	-	chr2R	13439135	138	+	chr2R	13439135	+	chr2R	13439273
ATGGGATGAACAATGTTAGTATTTAATTAATTTTATGATTNCGCCNTGATTTCTGAACAACTANTTATA:1	ATGGGATGAACAATGTTAGTAT	GATTTCTGAACAACTANTTATA	+	chrX	20041566	+	chrX	20041640	74	+	chrX	20041566	+	chrX	20041640
CTTGCCCGAATGCATTAATAATGGCAACATNTTGTTGACAAACTCAATCAATATGTATTGACCTGCTTTTCGCCT:1	CTTGCCCGAATGCATTAATAAT	TGTATTGACCTGCTTTTCGCCT	-	chr2R	15772774	-	chr2R	9665934	6106840	+	chr2R	9665934	+	chr2R	15772774
ATACTTTTCGCGCCCAGTGTGTTTCGCAGCCGTAAGCCAGCAATTTGGCGCACAAGAGCGTTT:1	ATACTTTTCGCGCCCAGTGTGT	AATTTGGCGCACAAGAGCGTTT	-	chr3R	29412091	-	chr3R	29412024	67	+	chr3R	29412024	+	chr3R	29412091
AATCAATCAGTCGAAAATGATTTAATTGTTTGCCAGTAGCTATTGTGACGGGAATAGTTGCGGAGAAATT:1	AATCAATCAGTCGAAAATGATT	CGGGAATAGTTGCGGAGAAATT	+	chr3R	19702323	+	chr3R	19702400	77	+	chr3R	19702323	+	chr3R	19702400
AAGCCGGTTACTTCGGTTGAAGCTTTAAACTTATCAAATAGGATAGCAATAAGCATTTTTAAATAAATTGGTGTG:1	AAGCCGGTTACTTCGGTTGAAG	CATTTTTAAATAAATTGGTGTG	-	chr2L	5765035	-	chr2L	5764927	108	+	chr2L	5764927	+	chr2L	5765035
TACATATATACACACACACACACACACACAGACGCACAAGCCGTACCCTTACACCCACACACTTTCAATTG:1	TACATATATACACACACACACA	TACACCCACACACTTTCAATTG	+	chr2R	14870612	+	chr2R	15436967	566355	+	chr2R	14870612	+	chr2R	15436967
AAAGCTAATTGGTTTTGGCTTTTCAAAACAAGCAAACAAGGTTCAGTCAATTGAAATTTATTTCGTTGTCCAGGG:1	AAAGCTAATTGGTTTTGGCTTT	AAATTTATTTCGTTGTCCAGGG	+	chr3L	925199	+	chr3L	932625	7426	+	chr3L	925199	+	chr3L	932625
AAATCGGTGAGCCAACGCCGAAGCCGGAGGGGCTTTTGTTGGTCGCCAAATCCCTCTAGCCGATGTCAGATGGTC:1	AAATCGGTGAGCCAACGCCGAA	CTCTAGCCGATGTCAGATGGTC	+	chr3L	12284904	+	chr3L	12285058	154	+	chr3L	12284904	+	chr3L	12285058
GCCAGCGGCCATTTGTGGGTGGCAACGAAACGGATTGAGGAGCAAAAGGTGGGGAGATGGACGTGGAACTGGG:1	GCCAGCGGCCATTTGTGGGTGG	GGGAGATGGACGTGGAACTGGG	+	chr3R	6979361	+	chr3R	4745207	2234154	+	chr3R	6979361	+	chr3R	4745207
AGCTCCAGCAACGCAAATAGCATCACTAACAACAATCCAATAATTTCATATCGACTGCCAATAATTCGGATCCCA:1	AGCTCCAGCAACGCAAATAGCA	ACTGCCAATAATTCGGATCCCA	-	chr2R	5641140	-	chr2R	24700642	19059502	+	chr2R	24700642	+	chr2R	5641140
TGGTTATCAATCAAGGAAGCATTTGGCAGACACNGCAGTCAAAGTTCGGACATGGTA:1	TGGTTATCAATCAAGGAAGCAT	CAGTCAAAGTTCGGACATGGTA	-	chr2L	11720987	-	chr2L	11713537	7450	+	chr2L	11713537	+	chr2L	11720987
AACAAACGAGCAGCGAAAATACGTTTATTTTTGATTTAGTTTGTTTGGTATTTATTATCTAATATCCATTGAGAT:1	AACAAACGAGCAGCGAAAATAC	ATTATCTAATATCCATTGAGAT	-	chrX	20386916	-	chrX	20386830	86	+	chrX	20386830	+	chrX	20386916
AAGAGAGTGAGTTCAAAGGTGAGGGCACGTGCAAATCGACACCGACACAGTGTCCTTAGGTTCGAGGACCACGTT:1	AAGAGAGTGAGTTCAAAGGTGA	CCTTAGGTTCGAGGACCACGTT	+	chr3R	28744415	+	chr3R	28744510	95	+	chr3R	28744415	+	chr3R	28744510
AATAGCCGGCTAATAAACCTATGCAAACAGAAATATTTTGGTTAAATTCTCTATGGTCCTCAGTCCTTTTTAGTT:1	AATAGCCGGCTAATAAACCTAT	TGGTCCTCAGTCCTTTTTAGTT	-	chr3L	9854946	-	chr3L	10077227	222281	+	chr3L	10077227	+	chr3L	9854946
GTGAAACCAAAACGGCAACCCCAAAGGAAATATGACCAGGAAAGTGAAAACACAGAGCGCCACAAATAAGCACGA:1	GTGAAACCAAAACGGCAACCCC	AGAGCGCCACAAATAAGCACGA	-	chr2R	21499556	-	chr2R	12531837	8967719	+	chr2R	12531837	+	chr2R	21499556
CATGGCCATCTGGTCATCTGTTTGCCTTGAAAGGGAATTCAAAAGGCCGTGAAAGAAATGTGCCGCCAACA:1	CATGGCCATCTGGTCATCTGTT	TGAAAGAAATGTGCCGCCAACA	+	chr3R	13945871	+	chr3R	13946190	319	+	chr3R	13945871	+	chr3R	13946190
GGTTGTAGAGCATCTATTGCTTAAAACGAGTTTTAAACGCACAGCGTAAGACGACGAGATCCTCTCTTCGAAATC:1	GGTTGTAGAGCATCTATTGCTT	ACGAGATCCTCTCTTCGAAATC	-	chr3L	16494523	-	chr3L	16494006	517	+	chr3L	16494006	+	chr3L	16494523
ATGAGTAAAACTTTCCTATTTAAAGCTTTGCACTAACTGGGACGGCAATAGTTACAAACGATTGGAAGACGCA:1	ATGAGTAAAACTTTCCTATTTA	TTACAAACGATTGGAAGACGCA	+	chr2L	1711360	+	chr2L	1711682	322	+	chr2L	1711360	+	chr2L	1711682
GCACGTGTTGCGCCGTCCGAGCTGCGCGCGCTCTCTTTTCTCCGCATTTGGGG:1	GCACGTGTTGCGCCGTCCGAGC	TCTCTTTTCTCCGCATTTGGGG	-	chr3R	26117415	-	chr3R	26108854	8561	+	chr3R	26108854	+	chr3R	26117415
TAAAGCTTAAATCCTTTGGCAGACACACACACACGCACACAAAGAGA:1	TAAAGCTTAAATCCTTTGGCAG	CACACACACGCACACAAAGAGA	+	chr2R	12819470	+	chr2R	12824515	5045	+	chr2R	12819470	+	chr2R	12824515
CTGTAGTTCCCATGTTGTCTAAGTTAAGTAATGACAATCCAAGANAATGGTCTAAGAATTTAGGACAAGTTC:1	CTGTAGTTCCCATGTTGTCTAA	TCTAAGAATTTAGGACAAGTTC	+	chr3L	25628503	+	chr3L	25633271	4768	+	chr3L	25628503	+	chr3L	25633271
CATTTTCAGTTGTTTTCATTTTACTAAAAGTACTATATAATTTTTAATACTATTATATTTCTTTAATATTCTTCC:1	CATTTTCAGTTGTTTTCATTTT	TATATTTCTTTAATATTCTTCC	+	chr3L	8225826	+	chr3L	8225905	79	+	chr3L	8225826	+	chr3L	8225905
TTAAAAATGTCATCAAACAGTTTTACAAACTGAAATGGGCGATGGCTAAAATGGCCGAGAAGAAACACCAATAA:1	TTAAAAATGTCATCAAACAGTT	GGCCGAGAAGAAACACCAATAA	+	chr3R	6523343	+	chr3R	6523718	375	+	chr3R	6523343	+	chr3R	6523718
AGATATCTCATGCCATTCGAACCTTAGCTACTTGAATGATTTGAACGCCAGCGACTTGAGTAGCTGGCAAGG:1	AGATATCTCATGCCATTCGAAC	GCGACTTGAGTAGCTGGCAAGG	+	chr3L	12285302	+	chr3L	12285500	198	+	chr3L	12285302	+	chr3L	12285500
TTAACGTTCTTTTTACTACTGTAATGGCAACCAAATGGTTGTAGAAACTTCATATT:1	TTAACGTTCTTTTTACTACTGT	ATGGTTGTAGAAACTTCATATT	+	chr3R	25725862	+	chr3R	25735003	9141	+	chr3R	25725862	+	chr3R	25735003
GCACACTTNTAGACACCGAACTTAACAGGCTACGTGTTTTCTATGAATTTCTTACTGTGTGGAGCCTCCTAGAG:1	GCACACTTNTAGACACCGAACT	TACTGTGTGGAGCCTCCTAGAG	-	chr3R	30482970	-	chr3R	30480503	2467	+	chr3R	30480503	+	chr3R	30482970
AGCACCAGGGTCTCATCGCTACCATGATGAACGATCTCAACAACGCCGTCGAGAAGGCATTGCACCTNGACTC:1	AGCACCAGGGTCTCATCGCTAC	AGAAGGCATTGCACCTNGACTC	-	chr3R	30627714	-	chr3R	30627636	78	+	chr3R	30627636	+	chr3R	30627714
TTTTGCTCNCTCGTTACGCAAGCACTCGTTACGCAGAGATCTCCGCATGGCCCAAA:1	TTTTGCTCNCTCGTTACGCAAG	AGAGATCTCCGCATGGCCCAAA	+	chrX	1845756	+	chrX	1845837	81	+	chrX	1845756	+	chrX	1845837
AACTGCTGTGACGAGAAAAAGTGTGGTTCATGTGTTACATGGTCATGTTTTTCATCTCTATTCTCGCTCT:1	AACTGCTGTGACGAGAAAAAGT	TTTTCATCTCTATTCTCGCTCT	+	chr3R	1443444	+	chr3R	1443515	71	+	chr3R	1443444	+	chr3R	1443515
TAAAAAACTCATTGTTTGAAGTGATTCCCCTCTGGATCTTCATTGACATTTAAGAAGTATTTCCAAANAAGCTAG:1	TAAAAAACTCATTGTTTGAAGT	GAAGTATTTCCAAANAAGCTAG	-	chr3L	3294238	-	chr3L	3294147	91	+	chr3L	3294147	+	chr3L	3294238
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACAACACAACACGAGACGAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACACAACACAACACGAGACGAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	9620957	12286578	+	chr3R	21907535	+	chr3R	9620957
AATGAAAGTTCCAACTAGCGACACACGATATTTCTTGCGGGGTAAAAGCTATTTCAATACAATTAGATGCTA:1	AATGAAAGTTCCAACTAGCGAC	ATTTCAATACAATTAGATGCTA	+	chr2L	5027961	+	chr2L	5028042	81	+	chr2L	5027961	+	chr2L	5028042
ATTGCTTAAAAAATAACACAAAAAACATAATAGTCAAGTTCAANAGAGTTCACAGGATGGCACAGG:1	ATTGCTTAAAAAATAACACAAA	AGAGTTCACAGGATGGCACAGG	+	chrX	14183428	+	chrX	14183499	71	+	chrX	14183428	+	chrX	14183499
CAGACTTTNAAGCTCTGAAAGCCAAGTCCCAAGTCNGCGATTCAGATTTTGACTGAGACACCGATGTGGAGCTTG:1	CAGACTTTNAAGCTCTGAAAGC	TGAGACACCGATGTGGAGCTTG	+	chr2L	14621395	+	chr2L	14621495	100	+	chr2L	14621395	+	chr2L	14621495
AGAACAAAAACTGGATTAATGCAAACAGAAACGTCGAAATTATGAGGATGCACGTAAGAGGATCGGATCCATGCC:1	AGAACAAAAACTGGATTAATGC	GTAAGAGGATCGGATCCATGCC	+	chr3L	12012328	+	chr3L	12012407	79	+	chr3L	12012328	+	chr3L	12012407
AGCTGCCCTCGCAAAGCTGCTGCGCACGCCCCCTGCTGCAAGGATGCACTCGTCCAGGATCCCACTCGTGTGTG:1	AGCTGCCCTCGCAAAGCTGCTG	TCCAGGATCCCACTCGTGTGTG	+	chr3L	11901589	+	chr3L	11901718	129	+	chr3L	11901589	+	chr3L	11901718
GACTCTCAATCTCAATGCACTCTCAGCTGCTGCAACAAGTTATTTTTGTCCAAGTCATCGATTGCATGGCAGCTT:1	GACTCTCAATCTCAATGCACTC	GTCATCGATTGCATGGCAGCTT	-	chr3L	3259724	-	chr3L	3259629	95	+	chr3L	3259629	+	chr3L	3259724
ACATCTCTCCTTAATTATTAGATAATAAAATATTCTCTTAATATTAAACAATACAATTTATAACGGATAAACTTA:1	ACATCTCTCCTTAATTATTAGA	CAATTTATAACGGATAAACTTA	+	chr3L	6405687	+	chr3L	6432151	26464	+	chr3L	6405687	+	chr3L	6432151
TATTATAATTAGATTATTGTGTTGTATTTTCTTGCAAGAAACGGGAACGGGGGATCTTATAGTCGCATTTTAAAT:1	TATTATAATTAGATTATTGTGT	ATCTTATAGTCGCATTTTAAAT	+	chr2L	18659941	+	chr2L	18660025	84	+	chr2L	18659941	+	chr2L	18660025
TGGCCAGCTACTTCTCCCAATTCTCCGATTCCGATCCTCCGCCAGAGAGCCCAAGCATCCAGAATATTGGTACGC:1	TGGCCAGCTACTTCTCCCAATT	AGCATCCAGAATATTGGTACGC	-	chr3L	19426839	-	chr3L	19426761	78	+	chr3L	19426761	+	chr3L	19426839
CAAAGAACTGTTGAAAAATCCGTAAATTTCATAGTATTTTGGAATTGTTATACTCTCTTGAAAAATTTTTGTTTT:1	CAAAGAACTGTTGAAAAATCCG	TCTCTTGAAAAATTTTTGTTTT	-	chr2L	14651760	-	chr2L	14642597	9163	+	chr2L	14642597	+	chr2L	14651760
TATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGCCACACATCCATTCTGGGGTCCTCACTGCGG:1	TATATGGACACCATAAGGCATA	CATTCTGGGGTCCTCACTGCGG	-	chr3L	11865853	-	chr3L	11864566	1287	+	chr3L	11864566	+	chr3L	11865853
GGCATCAACTGATAGGCANCAACAACAGTTGGAGGTGAGAGAAAGACTTCCAAAAT:1	GGCATCAACTGATAGGCANCAA	GTGAGAGAAAGACTTCCAAAAT	+	chrX	9390777	+	chrX	9390837	60	+	chrX	9390777	+	chrX	9390837
TAAGATTTTCTCGAACTGCAGACCACATACCTATGGATGTGGGCATTCTTCTGTTCATTCGG:1	TAAGATTTTCTCGAACTGCAGA	GGGCATTCTTCTGTTCATTCGG	-	chr3R	12314359	-	chr3R	12314258	101	+	chr3R	12314258	+	chr3R	12314359
CATTAACTTATAGACAGCTACTACAAAATAAAAAGATTTGTTTATATTTGCTTCGCAGACAAAAACANCAACTAC:1	CATTAACTTATAGACAGCTACT	CGCAGACAAAAACANCAACTAC	+	chr2L	13215413	+	chr2L	13215688	275	+	chr2L	13215413	+	chr2L	13215688
TAGCCGCAAGGCAGCGGGGCATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAGGGATAAACCTAATGCGAAACT:1	TAGCCGCAAGGCAGCGGGGCAT	GGGATAAACCTAATGCGAAACT	+	chr3R	14257804	+	chr3R	19447039	5189235	+	chr3R	14257804	+	chr3R	19447039
CTACGATTCTTCCCATTTCTTCATCTGCCTTTTGCAGCCCAGCTGCATTTTACACTACGTTCTTCGCTCGAGAG:1	CTACGATTCTTCCCATTTCTTC	CACTACGTTCTTCGCTCGAGAG	-	chrX	14300895	-	chrX	14300818	77	+	chrX	14300818	+	chrX	14300895
TCTTACGGATAACTTAGTATAACGTTTTACTTTGTCTTTAGTAGTTCTTATTCATTTTATTCGCTCACTATTTAA:1	TCTTACGGATAACTTAGTATAA	ATTTTATTCGCTCACTATTTAA	+	chrX	18320498	+	chrX	18320630	132	+	chrX	18320498	+	chrX	18320630
ATTTTCAAGTTCGAATAGTTTATCATTGCCACAAAAAACAGTTAACTAAAGATTAAATACACTAGAGCTGGCATA:1	ATTTTCAAGTTCGAATAGTTTA	TAAATACACTAGAGCTGGCATA	-	chrX	16681707	-	chrX	16681631	76	+	chrX	16681631	+	chrX	16681707
TGCTTCGGAAATGGATTTATTGATTTATGATATTTAGTCAAATCATTTAAAAACTTGCATCACTAACGGGTATTT:1	TGCTTCGGAAATGGATTTATTG	CTTGCATCACTAACGGGTATTT	+	chrX	16906663	+	chrX	16906750	87	+	chrX	16906663	+	chrX	16906750
GACGATGATTATGGAAAAAATAATGATCGGGAACAAGAGCGCGCAGCACTGGGAGAAAATAGGGGGTGCTGACTG:1	GACGATGATTATGGAAAAAATA	AGAAAATAGGGGGTGCTGACTG	-	chr2L	19163474	-	chr2L	19163393	81	+	chr2L	19163393	+	chr2L	19163474
ATACAGTGGCGTCATGCAGTTTCATTTCCTTACCTGATTAAATACCCCCGAAATTGTGCTGCACATNGACCCAC:1	ATACAGTGGCGTCATGCAGTTT	ATTGTGCTGCACATNGACCCAC	-	chr2L	9007814	-	chr2L	9000305	7509	+	chr2L	9000305	+	chr2L	9007814
TTGTCTGATGTTGTCCCTGTTTAGGTAAACTATGTCTGGAAGGTCCAGGAAGGTGTGACCCTTCCACCGCTCCA:1	TTGTCTGATGTTGTCCCTGTTT	GTGTGACCCTTCCACCGCTCCA	+	chr2L	6655532	+	chr2L	6655893	361	+	chr2L	6655532	+	chr2L	6655893
TTAGATATTACATTCCGCTTTATATAATTGTTTCCAATAATAATAAGAGATGCAGTATGATTTCTCTGCGTGTCT:1	TTAGATATTACATTCCGCTTTA	AGTATGATTTCTCTGCGTGTCT	+	chr3L	8782154	+	chr3L	8782280	126	+	chr3L	8782154	+	chr3L	8782280
TGAACCGAAAAGCTGGATGGGAACGGCAATGGTGATGGCGATGGCGATGGCGATGGGGGG:1	TGAACCGAAAAGCTGGATGGGA	CGATGGCGATGGCGATGGGGGG	-	chr2R	15160493	-	chr2R	12444346	2716147	+	chr2R	12444346	+	chr2R	15160493
TAATTGCGGGTCTTGGATACGAAAGTAGGTTCCCAGTTTCATATATTCGAGCTTATCTATGGTCCTGCATAAAAA:1	TAATTGCGGGTCTTGGATACGA	TATCTATGGTCCTGCATAAAAA	-	chr3R	22843229	-	chr3R	22843153	76	+	chr3R	22843153	+	chr3R	22843229
CTCCCATAAGTATGCAACAGTTTGGCATCTGGCTTTAAAATATTTACGGTCTCTTCGGCATGCATGCTAAACTTA:1	CTCCCATAAGTATGCAACAGTT	TTCGGCATGCATGCTAAACTTA	+	chr3R	28253347	+	chr3R	28255857	2510	+	chr3R	28253347	+	chr3R	28255857
ATAGAATTGTTCAACACTCAGAAGCAAGTGCATTGTTTTACAAAGAGAACAAATGAAAAGGTAAGAAAAGCGATA:1	ATAGAATTGTTCAACACTCAGA	TGAAAAGGTAAGAAAAGCGATA	-	chr3L	606975	-	chr3L	606899	76	+	chr3L	606899	+	chr3L	606975
TTCAACTCNAAGTGAGTACGCCCATTCGACCCATATTNNNNTATTTTTTTTTTAAACTTTANTTACATTTGAAAG:1	TTCAACTCNAAGTGAGTACGCC	AAACTTTANTTACATTTGAAAG	-	chr2R	12643866	-	chr2R	12643790	76	+	chr2R	12643790	+	chr2R	12643866
ATTTCACAATTCATTTTAACATAATTAAACACAAAGCCCATATGCTATCTGTTCGAAAACGTATTTAATATATTT:1	ATTTCACAATTCATTTTAACAT	CGAAAACGTATTTAATATATTT	-	chr2R	21963299	-	chr2R	21963214	85	+	chr2R	21963214	+	chr2R	21963299
GGTTGCAACCGTGCCCCAAAAGTCTAAGGCTGCGAGCCATTAAATTGGCATAACGTGCATGACGTGCACGGCACG:1	GGTTGCAACCGTGCCCCAAAAG	CGTGCATGACGTGCACGGCACG	+	chr2R	13610213	+	chr2R	20889033	7278820	+	chr2R	13610213	+	chr2R	20889033
GATTGATTTATGTTATAATTACAAAAGCCAGACGCATATTAGTGGTCCAAGAAGGAGAGCAAACAGTGGGGCTGG:1	GATTGATTTATGTTATAATTAC	GGAGAGCAAACAGTGGGGCTGG	-	chr3L	10417348	-	chr3L	10414976	2372	+	chr3L	10414976	+	chr3L	10417348
TAATATGTTTATTGCTTATTGTTTTAAACCAATTAAAACAGTAGGGGAACAACACTGATTGTTAGAAAAGCTGAC:1	TAATATGTTTATTGCTTATTGT	ACTGATTGTTAGAAAAGCTGAC	+	chr3R	20109568	+	chr3R	20114774	5206	+	chr3R	20109568	+	chr3R	20114774
CCAATGTGGGGTCTTTAAATCCTATGCTCACGACGGAAGCATTTTTGGTACCCCTATTTTCAACCAANAAGATTC:1	CCAATGTGGGGTCTTTAAATCC	CTATTTTCAACCAANAAGATTC	-	chr3R	10531977	-	chr3R	10531896	81	+	chr3R	10531896	+	chr3R	10531977
GAGTTGACATGCGTATCATCAATTCGAGCNTATTCCTTTCTTATCTTTCTTATGAGGGACNAAAGTGCAGCAGCA:1	GAGTTGACATGCGTATCATCAA	GAGGGACNAAAGTGCAGCAGCA	-	chrX	22585891	-	chrX	22645240	59349	+	chrX	22645240	+	chrX	22585891
GTGGGTGAGTGGGCGACGGTGGGTGGCTTTGGAGGTTAACTACTTTTCATGAGCTTAATTTTAAATTGAGGCTG:1	GTGGGTGAGTGGGCGACGGTGG	GCTTAATTTTAAATTGAGGCTG	+	chr2R	21738290	+	chr2R	21747449	9159	+	chr2R	21738290	+	chr2R	21747449
CACAGTGGGCGGGTGAGTATTTCACATTTGCTTCTAAATAGAAACCTCATTCTAAACTAAATTAAGAGTATTTA:1	CACAGTGGGCGGGTGAGTATTT	TAAACTAAATTAAGAGTATTTA	+	chrX	5345419	+	chrX	5345529	110	+	chrX	5345419	+	chrX	5345529
GATGAGGAGGAGAGCGACAGCGGATCCGAAGAAGAGATGGCTTGAATCAACGCTTACTTTGATTTGATAGATG:1	GATGAGGAGGAGAGCGACAGCG	GCTTACTTTGATTTGATAGATG	+	chr2R	10827335	+	chr2R	10827421	86	+	chr2R	10827335	+	chr2R	10827421
CAGCATCTTCGGTGCACTTAAAAAATAGAATGCCAAAGTAGAAAATTAGAAAATCTTTAAGA:1	CAGCATCTTCGGTGCACTTAAA	GAAAATTAGAAAATCTTTAAGA	+	chr3R	5908058	+	chr3R	5908127	69	+	chr3R	5908058	+	chr3R	5908127
CTCACCCACTGCTGCAGCTCACGAAACGTGCTCGGCATGCTCGAGGGAGGCAAACCAATTAAAATTTC:1	CTCACCCACTGCTGCAGCTCAC	GAGGCAAACCAATTAAAATTTC	+	chr2R	18880388	+	chr2R	18880466	78	+	chr2R	18880388	+	chr2R	18880466
TGGAGTGCGCTGAGTTTAAAAGGTGAGAAGATGAGAACATGGCGCATCGACAGCCACTAATCA:1	TGGAGTGCGCTGAGTTTAAAAG	GCGCATCGACAGCCACTAATCA	-	chr2L	15391466	-	chr2L	15391394	72	+	chr2L	15391394	+	chr2L	15391466
GAACAGCACTTTTAAATTANTGAGTGTGAAGCCTTTAACTTTTGCACTTTGTTTCATTTAACTCTCAAAGCTCGT:1	GAACAGCACTTTTAAATTANTG	TCATTTAACTCTCAAAGCTCGT	+	chr3R	26410272	+	chr3R	5077143	21333129	+	chr3R	26410272	+	chr3R	5077143
TTGGTCACATTATGACATATTCTGTATTATATATTCTATTTATGGGCAAAATATAAATATCATTTAGCCATTTTT:1	TTGGTCACATTATGACATATTC	TAAATATCATTTAGCCATTTTT	+	chr3R	27725583	+	chr3R	27731025	5442	+	chr3R	27725583	+	chr3R	27731025
ATGTCTGCGCCGCAAAATGTGCTTGTGCTTGGGATCCAAAAAAACGCTGCTTCCGGTCGAATGATGAATGATCG:1	ATGTCTGCGCCGCAAAATGTGC	CCGGTCGAATGATGAATGATCG	+	chrX	8180077	+	chrX	5078174	3101903	+	chrX	8180077	+	chrX	5078174
CGCTATCGTCAAGTTCTAGTTCCTCTAAATTGGTGCATATGGTTCTTAGACACATGATCTATTATTTCGCCCCCC:1	CGCTATCGTCAAGTTCTAGTTC	ATGATCTATTATTTCGCCCCCC	-	chr3L	2407793	-	chr3L	733933	1673860	+	chr3L	733933	+	chr3L	2407793
CAATGACAAATAAGGCATTCAAGTGTAATAGCTAGCGAAATGGGGGATGTAGTGCTTCATCTTTGTTTTTC:1	CAATGACAAATAAGGCATTCAA	TAGTGCTTCATCTTTGTTTTTC	+	chrX	827610	+	chrX	835398	7788	+	chrX	827610	+	chrX	835398
ATGTCAAGTGCACAGAGTAGGAAAGGGGAGNGCGTAACTTAAAAATCAGACAGCCAAACGCCCACACGCAGAAAG:1	ATGTCAAGTGCACAGAGTAGGA	CCAAACGCCCACACGCAGAAAG	+	chrX	3052752	+	chrX	3052869	117	+	chrX	3052752	+	chrX	3052869
TGTCTCAAAAGTATTCACGAAGAAAATAGTTCAAAATCCCACTTTCGATGAAGAACCTACGAATATGTTTGTTA:1	TGTCTCAAAAGTATTCACGAAG	GAACCTACGAATATGTTTGTTA	+	chr3R	22234709	+	chr3R	22236027	1318	+	chr3R	22234709	+	chr3R	22236027
GAGCACTGCTTAAACAAAAAATATTGCAGGATTGCGTAGTTGAAGGACAGTCCAAGCACATTTTTTCAAGAGTTC:1	GAGCACTGCTTAAACAAAAAAT	AAGCACATTTTTTCAAGAGTTC	+	chr3R	14608471	+	chr3R	14608563	92	+	chr3R	14608471	+	chr3R	14608563
GAACTCCAGGCGGAGAAGTGCAAACAAAGCAGACCCCAAATGAAGGGCTAAAGCAGTACTTACGATATAGAATTT:1	GAACTCCAGGCGGAGAAGTGCA	CAGTACTTACGATATAGAATTT	+	chr3L	6372992	+	chr3L	6373227	235	+	chr3L	6372992	+	chr3L	6373227
TCTCCTTTCGATTCTTACGAAAACGCGACTATCGCAGTTTCCCACACGCTTATATGTAAGTATAAACCTATCCAC:1	TCTCCTTTCGATTCTTACGAAA	ATGTAAGTATAAACCTATCCAC	+	chr3L	15840463	+	chr3L	15840548	85	+	chr3L	15840463	+	chr3L	15840548
CTCAACATTTGCTGACCCCGACGTGATCGGTAACATTTCTTTATCGTGAGCACTTTTGTACATAAATGGCTGCAA:1	CTCAACATTTGCTGACCCCGAC	TTTTGTACATAAATGGCTGCAA	-	chr3L	25996027	-	chr3L	25995946	81	+	chr3L	25995946	+	chr3L	25996027
TCATTCTGTAGTTTTTACTTCAAAGACATCGATTGTGGTAACCATAATTCACTGTAACCAACGAACTTGGTCCGC:1	TCATTCTGTAGTTTTTACTTCA	GTAACCAACGAACTTGGTCCGC	+	chr3R	17531905	+	chr3R	17531982	77	+	chr3R	17531905	+	chr3R	17531982
GCCAATCAATCAGCAGCCAGGAAAAAGTTAAGTTACACCAGTAATTTCTTTGCTTTTTATAT:1	GCCAATCAATCAGCAGCCAGGA	GTAATTTCTTTGCTTTTTATAT	+	chr2R	13749440	+	chr2R	13749573	133	+	chr2R	13749440	+	chr2R	13749573
AAAAACAGTTTATATATCAGATATAGCAGTTAGCAGAATGCGATAGAATAGAGAGGCCGGATCAATANAAAAAAT:1	AAAAACAGTTTATATATCAGAT	AGGCCGGATCAATANAAAAAAT	-	chr3R	30183328	-	chr3R	30183219	109	+	chr3R	30183219	+	chr3R	30183328
CTATATGTCACTCGCTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAATTTGGCCGAACAATTTCG:1	CTATATGTCACTCGCTTAAATC	TGAATTTGGCCGAACAATTTCG	-	chr2R	22775396	-	chr2R	22774977	419	+	chr2R	22774977	+	chr2R	22775396
ATCTTAGCTGTCTTTCGAGCTATGGAAGTTTGAAAAGTATCAACTGTTCGCTGGGGAATGGGATTCGAATGGGGT:1	ATCTTAGCTGTCTTTCGAGCTA	GGGAATGGGATTCGAATGGGGT	-	chr2L	5084788	-	chr2L	827130	4257658	+	chr2L	827130	+	chr2L	5084788
AACGATAGCGGAGCTTATATACTCCCATCGAAGATCTGCTGCACAGCCAAGGAGCAATCGGCATTGGCATTTGG:1	AACGATAGCGGAGCTTATATAC	AGCAATCGGCATTGGCATTTGG	-	chrX	5683192	-	chrX	5683006	186	+	chrX	5683006	+	chrX	5683192
ACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACNAAACAA:1	ACAAAACAAAACAAAACAAAAC	AAAACAAAACAAAACNAAACAA	+	chr3R	29013340	+	chr3R	29351537	338197	+	chr3R	29013340	+	chr3R	29351537
TAGAAGGTCAGTAAGAAGAATTACAACGGTTTTATTTGTTTATAACTTTAATAATAACTTTAACTTAACTTTAAC:1	TAGAAGGTCAGTAAGAAGAATT	ATAACTTTAACTTAACTTTAAC	-	chr3R	8991664	-	chr3R	18835819	9844155	+	chr3R	18835819	+	chr3R	8991664
TTTAGATTTATGGCCTTGGTCCCCGAAATAAATGACCGCCTGCTAAGCATGTGCCACTTGCCACTC:1	TTTAGATTTATGGCCTTGGTCC	AAGCATGTGCCACTTGCCACTC	-	chr2R	8402996	-	chr2R	8398224	4772	+	chr2R	8398224	+	chr2R	8402996
ATACGAGGTGTAATATAATTTTATAATTTATGATTTATAAAGTACCTTCTTATCACTGTGCATTGCAATTCATTT:1	ATACGAGGTGTAATATAATTTT	CACTGTGCATTGCAATTCATTT	+	chr3L	10032565	+	chr3L	10032652	87	+	chr3L	10032565	+	chr3L	10032652
CACAAAAGAAGATACAAAATCAGAACGCACGTGTAACAGATCATTGATTAATAAAGTAACCATTTAAATACATAT:1	CACAAAAGAAGATACAAAATCA	AAGTAACCATTTAAATACATAT	+	chr3L	1154131	+	chr3L	1163281	9150	+	chr3L	1154131	+	chr3L	1163281
CGACTTTGTTGCCAATGTTGAAGGCTTAAGCCTAATACTGCACTGGGACCACCGAAATAAGAGGGCGACAGTAC:1	CGACTTTGTTGCCAATGTTGAA	CGAAATAAGAGGGCGACAGTAC	+	chr3R	31881292	+	chr3R	31881375	83	+	chr3R	31881292	+	chr3R	31881375
ACACACACACACACCAAATGCTGAAAAATCGCTGGGAGAGCCTGTAGTGAATGCAACCGCTCGCAATTAGTGAGT:1	ACACACACACACACCAAATGCT	CAACCGCTCGCAATTAGTGAGT	+	chrX	6638388	+	chrX	3873998	2764390	+	chrX	6638388	+	chrX	3873998
TTTTATGACGCCCCTAGGCTATTTCATCCATCCTGTATCTTGAATCAACTCAACTTGCTGCTGATCGCAACAATA:1	TTTTATGACGCCCCTAGGCTAT	CTTGCTGCTGATCGCAACAATA	-	chr3R	9898892	-	chr3R	9898803	89	+	chr3R	9898803	+	chr3R	9898892
GCAGGCAAAAAGTAATCCGATGTCAGCTTTTAAAAATATTATTCCTATTAAAAATGTTAAAAAGTGGTATTGAAA:1	GCAGGCAAAAAGTAATCCGATG	ATGTTAAAAAGTGGTATTGAAA	-	chr2R	22124405	-	chr2R	22124316	89	+	chr2R	22124316	+	chr2R	22124405
TTCGTATTTTCTTTTTTTTTTGCCTTGG:1	TTCGTATTTTCTTTTTTTTTTG	TTTTCTTTTTTTTTTGCCTTGG	+	chrX	8841451	+	chrX	15247541	6406090	+	chrX	8841451	+	chrX	15247541
GGCTAAACCGTGTGGAATGCTGTTGATTTTTTCATGTTGCGAAACTATTAAACAAATCTTTTTTGTTTTAGCCAC:1	GGCTAAACCGTGTGGAATGCTG	AAATCTTTTTTGTTTTAGCCAC	+	chr2R	14922166	+	chr2R	14922242	76	+	chr2R	14922166	+	chr2R	14922242
AGGATATGGAGGATTCTAGGCCTTCCAGATATTATCCGCTTATTTATGGTCCGGCCAATGCAATGTGAGTCCAGG:1	AGGATATGGAGGATTCTAGGCC	GCCAATGCAATGTGAGTCCAGG	-	chr3R	30698403	-	chr3R	10210227	20488176	+	chr3R	10210227	+	chr3R	30698403
TGAAAGCGCGTCTCGTGTCGTTTTTTTTTTCATTATTTTTTTT:1	TGAAAGCGCGTCTCGTGTCGTT	TTTTTTTTTCATTATTTTTTTT	+	chr3R	15409536	+	chr3R	18128422	2718886	+	chr3R	15409536	+	chr3R	18128422
ATTTTTACATTAACTTATAGACAGCTACTACAAAATAAAAAGATTTGTTTATATTTGCTTCGCAGACAAAAACAT:1	ATTTTTACATTAACTTATAGAC	TTTGCTTCGCAGACAAAAACAT	+	chr2L	13215406	+	chr2L	13215681	275	+	chr2L	13215406	+	chr2L	13215681
TCAACCAACTCAAAATTGAAATGCCAAATTATTTGCAGGGCAGCGTCTAGGAATTGGCTGCGCAAACACATCAAA:1	TCAACCAACTCAAAATTGAAAT	TTGGCTGCGCAAACACATCAAA	+	chr3R	25236198	+	chr3R	25236337	139	+	chr3R	25236198	+	chr3R	25236337
ATCGCATCGCACCGCATCGCTTAGCCGAGGTCCTNCAGGCAACAGCCAATTAATAAG:1	ATCGCATCGCACCGCATCGCTT	CAGGCAACAGCCAATTAATAAG	-	chrX	8332067	-	chrX	16670952	8338885	+	chrX	16670952	+	chrX	8332067
AAGAGCGATTATACATGGAAATCAATCACTGATTTAAACGTTATATTGAACTTACTAATTTTCCGACNGCAACTT:1	AAGAGCGATTATACATGGAAAT	ACTAATTTTCCGACNGCAACTT	+	chr3R	23888107	+	chr3R	23888193	86	+	chr3R	23888107	+	chr3R	23888193
TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:2	TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTG	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
TAAGCAGGCAATGCCGCCTGAGTGTGTGCAATAAATCTCCTTATGAAAATTTTAAAAGCCGCAAAAC:1	TAAGCAGGCAATGCCGCCTGAG	AAAATTTTAAAAGCCGCAAAAC	-	chr2L	9108399	-	chr2L	9108324	75	+	chr2L	9108324	+	chr2L	9108399
GGGGCCACTATCCTAATGTGGTCCACATGCCAAGACAACGGATAGTAGTAATTTTGGATAGGCCTGCACCCCAGC:1	GGGGCCACTATCCTAATGTGGT	TTGGATAGGCCTGCACCCCAGC	-	chrX	680944	-	chrX	680861	83	+	chrX	680861	+	chrX	680944
ATTTTATTCCCTCAACTTTTGCAAGTTCTTGCCCAGCAAAAGACATGAAAGGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	ATTTTATTCCCTCAACTTTTGC	GGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	-	chrX	13486752	-	chrX	12649915	836837	+	chrX	12649915	+	chrX	13486752
GCTGAATAATTCAAACCTAATTTGTGGGCTTTTATTTAAAGAAAAAAAATGGAGGCATTCGCAAATAATTTAAG:1	GCTGAATAATTCAAACCTAATT	AGGCATTCGCAAATAATTTAAG	+	chr3L	10153980	+	chr3L	3035268	7118712	+	chr3L	10153980	+	chr3L	3035268
TATTTCATTCATCCAAACACTGCATTTATAACGGTCTCTGTTGTAGAATGGCAACTCTAACCNTGAGGCAACTTG:1	TATTTCATTCATCCAAACACTG	ACTCTAACCNTGAGGCAACTTG	+	chr3L	6220936	+	chr3L	6230088	9152	+	chr3L	6220936	+	chr3L	6230088
GCAAAAGCATTTTGCGCGCTCCATTTTGCTCANCTGCCAAGTGGGAAATGGGAAAATGACTGAGGA:1	GCAAAAGCATTTTGCGCGCTCC	GAAATGGGAAAATGACTGAGGA	-	chrX	5799035	-	chrX	5798882	153	+	chrX	5798882	+	chrX	5799035
CANCTGCCGACGCATAATTATAAAAATGTTGCTCNTNCGCCGCNTGTGTTCGCCAGCTGCAGCGCTGGGGG:1	CANCTGCCGACGCATAATTATA	TCGCCAGCTGCAGCGCTGGGGG	-	chrX	11291800	-	chrX	11291722	78	+	chrX	11291722	+	chrX	11291800
ATTGTTGGTACTAATCAACAACAACTACAATAAAACAAAACACCCATCCAGTTGCCCCTTGCTGGGAATCTACA:1	ATTGTTGGTACTAATCAACAAC	TGCCCCTTGCTGGGAATCTACA	+	chr2L	16750727	+	chr2L	16750807	80	+	chr2L	16750727	+	chr2L	16750807
TCCGCCGGGGCGGCGTTCGGCCAATCTATTTCGGCTTAAAGTCACCCCCTTGCCACAGTTTTCTTATTTAATAGT:1	TCCGCCGGGGCGGCGTTCGGCC	CACAGTTTTCTTATTTAATAGT	+	chr2L	15226372	+	chr2L	15226448	76	+	chr2L	15226372	+	chr2L	15226448
GCACTTCACTTTGCGTTGGCAGCCTCAAGTCANATACTTAACCACTTTAATTCAGTTCGTTCGCTTNATTTTC:1	GCACTTCACTTTGCGTTGGCAG	TCAGTTCGTTCGCTTNATTTTC	+	chr3R	7655006	+	chr3R	7655086	80	+	chr3R	7655006	+	chr3R	7655086
ACATTTAAAATCTATATAGTTTTTAAAATCCTTCTTTTGCAACTGTTAATAAAATTAAAGATTT:1	ACATTTAAAATCTATATAGTTT	CTGTTAATAAAATTAAAGATTT	-	chr3L	17789922	-	chr3L	17789857	65	+	chr3L	17789857	+	chr3L	17789922
GCAGCTGGAATACACAGTTTTGAGTAACTGGAGGTCAAGTTGATTGCCTGTGCCGCGCACATAAAGTAC:1	GCAGCTGGAATACACAGTTTTG	CTGTGCCGCGCACATAAAGTAC	-	chr3L	7811762	-	chr3L	23854973	16043211	+	chr3L	23854973	+	chr3L	7811762
ATCTAAAAGTTCCAAGTGTGTGGCCCTTTTTCGCCCGCAGATGAAGTGCTCTTCAGGCGGCGTGTCAACGACTCT:1	ATCTAAAAGTTCCAAGTGTGTG	CAGGCGGCGTGTCAACGACTCT	+	chr3R	31699750	+	chr3R	31699832	82	+	chr3R	31699750	+	chr3R	31699832
CTGAGCACAATTCCCAGACAAAGTCGCTGGGCAAACAAACGGCGGATCAGGCCAAAGGAGACGAATTAAGCTG:1	CTGAGCACAATTCCCAGACAAA	CCAAAGGAGACGAATTAAGCTG	-	chr2R	7077764	-	chr2R	13117584	6039820	+	chr2R	13117584	+	chr2R	7077764
ACTGATACGGGCCAAAACACAGAGTGTGGCCAAGTTGGGCATAATGCGGNAGCTAAAAAAACTGTTGCATACTTT:1	ACTGATACGGGCCAAAACACAG	TAAAAAAACTGTTGCATACTTT	+	chr3R	13195974	+	chr3R	13196069	95	+	chr3R	13195974	+	chr3R	13196069
ATTTATTTAGATTTATGGCCTTGGTCCCCGAAATAAATGACCGCCTGCTAAG:1	ATTTATTTAGATTTATGGCCTT	AAATAAATGACCGCCTGCTAAG	-	chr2R	8403001	-	chr2R	8398243	4758	+	chr2R	8398243	+	chr2R	8403001
GGACACCTGAACNCAGTCACCATTGTAAACNANGCCAANATCATCGTCATTGATGGCACCATGACCATCATAG:1	GGACACCTGAACNCAGTCACCA	GATGGCACCATGACCATCATAG	+	chr2R	488304	+	chr2R	4155663	3667359	+	chr2R	488304	+	chr2R	4155663
GATAGCGGTAAGTCACGCAAACAGTGGTAATGATCAGTATGAGGTAATGTTCGGGTCTTTA:1	GATAGCGGTAAGTCACGCAAAC	TGAGGTAATGTTCGGGTCTTTA	+	chr2R	11472663	+	chr2R	11473846	1183	+	chr2R	11472663	+	chr2R	11473846
AATAAATGTGCCCTTTCAAATACTGAAAAGTATCTCTACTATTTCAGTCATATTTGAATACGATATTTAATTATA:1	AATAAATGTGCCCTTTCAAATA	TTGAATACGATATTTAATTATA	+	chr3R	13194107	+	chr3R	13194696	589	+	chr3R	13194107	+	chr3R	13194696
ACGTTATTCCCGTTTATGTTGGCTGAGGCTCCAGGCATGGAGATGGGGCATGAACACATGCGGAGACAGAGAG:1	ACGTTATTCCCGTTTATGTTGG	GAACACATGCGGAGACAGAGAG	-	chr3R	29287742	-	chr3R	29287661	81	+	chr3R	29287661	+	chr3R	29287742
AATGGCATTAGACAAGAATANTTCATTTTAATNTGCCATTTTNTAATATTTTCATATTATTTGTTTTATTT:1	AATGGCATTAGACAAGAATANT	TTTCATATTATTTGTTTTATTT	+	chr2L	6388000	+	chr2L	17357452	10969452	+	chr2L	6388000	+	chr2L	17357452
TGGTATTTCAACAGGGCAGTTCAGATTACGAGTACACCGCGAATCCTTCTTTCCAATCGNTTCAGTCA:1	TGGTATTTCAACAGGGCAGTTC	TTCTTTCCAATCGNTTCAGTCA	+	chr2R	24303904	+	chr2R	24303981	77	+	chr2R	24303904	+	chr2R	24303981
GGTTAATGAACTTCTACACTCGGTGGGGGNTTTTTTTGGCCGCCGGGATATTGCT:1	GGTTAATGAACTTCTACACTCG	TTTTGGCCGCCGGGATATTGCT	-	chr2L	1911083	-	chr2L	2303749	392666	+	chr2L	2303749	+	chr2L	1911083
ATTCGAAGAATTTGATAAGCCCCTCTTGCTGTCTCGTTTTCTCTACTTTG:1	ATTCGAAGAATTTGATAAGCCC	CTGTCTCGTTTTCTCTACTTTG	-	chr3R	31624793	-	chr3R	1916734	29708059	+	chr3R	1916734	+	chr3R	31624793
ACAATATCGATCCGAATCCCTAGCATAGTCAAGCTGGCCATGTACGTCGAGATAAAAAAAGGTAGTAAG:1	ACAATATCGATCCGAATCCCTA	CGAGATAAAAAAAGGTAGTAAG	-	chr2L	20583708	-	chr2L	20576246	7462	+	chr2L	20576246	+	chr2L	20583708
ACCCACATTTGCATGGTATGGAATGGTGCATGGTGCATGGTATATGGCAATTACNAGCGTTATGACG:1	ACCCACATTTGCATGGTATGGA	GGCAATTACNAGCGTTATGACG	+	chr3R	27541959	+	chr3R	27542032	73	+	chr3R	27541959	+	chr3R	27542032
CTCCTAGAAAGTGCAGTTCAAAGTTTTACCCCTTCTCAGTGCTTTNTCAAACATCAAAGCGNGCGAAACTCATCG:1	CTCCTAGAAAGTGCAGTTCAAA	TCAAAGCGNGCGAAACTCATCG	-	chr3R	31426972	-	chr3R	31426880	92	+	chr3R	31426880	+	chr3R	31426972
TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGGTT:1	TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTG	TGTTTGTGTTTGTGTTTGGGTT	-	chrX	7978935	-	chrX	4805472	3173463	+	chrX	4805472	+	chrX	7978935
AACACATATGACATGCTTATAGCCATAATCACTTTAATTGGGTGCGAAAACTAAAGTGTTTGCAAATAGCAAGGA:1	AACACATATGACATGCTTATAG	AAGTGTTTGCAAATAGCAAGGA	+	chr2L	13701899	+	chr2L	13701979	80	+	chr2L	13701899	+	chr2L	13701979
TATTCATGCAGTGGCACTTGTATATGGACACCGAGTGCCCGCTGCCCG:1	TATTCATGCAGTGGCACTTGTA	GACACCGAGTGCCCGCTGCCCG	+	chrX	11312094	+	chrX	11319420	7326	+	chrX	11312094	+	chrX	11319420
TAAGGAGCTATTAACGAGAGGTGCATGCGGAAGCAGAGACTTTAATGTTACGCATAGATCCAACCGAATTCTATG:1	TAAGGAGCTATTAACGAGAGGT	ATAGATCCAACCGAATTCTATG	+	chr3R	31831564	+	chr3R	31831643	79	+	chr3R	31831564	+	chr3R	31831643
AATATTTGGTCAGTTAGGAAACGAGACATTTTGCTTTTGTCTTGAATTGATACTTTTAGCAAATAACACACAGTG:1	AATATTTGGTCAGTTAGGAAAC	TTTTAGCAAATAACACACAGTG	+	chr3R	26998328	+	chr3R	26998415	87	+	chr3R	26998328	+	chr3R	26998415
AGTTGGAAAGAAAACATCNACAAATTTGCAAAATCTTAACTTTNCTGAANCTGATCAAAAATATATTTATAAGTT:1	AGTTGGAAAGAAAACATCNACA	ATCAAAAATATATTTATAAGTT	+	chr3L	21458350	+	chr3L	21458445	95	+	chr3L	21458350	+	chr3L	21458445
GAAAACATNTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACNNNNCTTGACGACTTGACGACTTCNCTTAAAGTGCATG:1	GAAAACATNTCGGGATATAATC	ACGACTTCNCTTAAAGTGCATG	-	chr3R	28484371	-	chr3R	28486288	1917	+	chr3R	28486288	+	chr3R	28484371
GATATGCNGAGACAAGACAAATTAAAATATGTCTTGCAGNCACAAGATATAACTGAANAAAGAACAAAAACAGC:1	GATATGCNGAGACAAGACAAAT	CTGAANAAAGAACAAAAACAGC	-	chr3R	27351390	-	chr3R	27342810	8580	+	chr3R	27342810	+	chr3R	27351390
AAATGTATAAACACATATATGTTTTACATTTATAAATCACATTGCAATTTTCAACTTGCATGTTTCGATTTA:1	AAATGTATAAACACATATATGT	TCAACTTGCATGTTTCGATTTA	+	chr3L	10003158	+	chr3L	10003252	94	+	chr3L	10003158	+	chr3L	10003252
AAAGCGATGGAGGAGAAGCACTACAAAATAATCCAACGCAAAGAGAGGTGCCCGGGCGGGGATTAAATCAGT:1	AAAGCGATGGAGGAGAAGCACT	CCCGGGCGGGGATTAAATCAGT	+	chr3R	12214355	+	chr3R	12214443	88	+	chr3R	12214355	+	chr3R	12214443
ATTAGCTAAGAGGGACGCATTTCCGTTTCCGGTGCTGGTGCGCAAAGTGNGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1	ATTAGCTAAGAGGGACGCATTT	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	-	chr3R	24181067	-	chr3R	21907536	2273531	+	chr3R	21907536	+	chr3R	24181067
CAAGACTACCTATTCTTGAATGATCTGGGTATGGAGCTGACTGTGAAGACTGCATCACGATCGCATNTCTTT:1	CAAGACTACCTATTCTTGAATG	TGCATCACGATCGCATNTCTTT	+	chr3L	22555772	+	chr3L	22563239	7467	+	chr3L	22555772	+	chr3L	22563239
CAGAGACACAAGCAACTCATACCTCAAAGCAAAAGAACCAGCAATCTGCTCAATCAAGTGTGTGAACTGGAG:1	CAGAGACACAAGCAACTCATAC	CAATCAAGTGTGTGAACTGGAG	-	chr3R	26623529	-	chr3R	12970959	13652570	+	chr3R	12970959	+	chr3R	26623529
ATCGTTTATTCAAAAGAATTACATTGGCAAAAAAGCCAACTTTTAAAGAACATTTGTAGAAAATCTTGCACTCAA:1	ATCGTTTATTCAAAAGAATTAC	TTGTAGAAAATCTTGCACTCAA	+	chrX	21565436	+	chrX	21565514	78	+	chrX	21565436	+	chrX	21565514
ACATAATTAGCCACTGAGANAACCGCGAAGTGTAAAGTGCAAAAATGCGTTAATTTGTTATTGGTTAATCGAAAA:1	ACATAATTAGCCACTGAGANAA	TTTGTTATTGGTTAATCGAAAA	-	chr3L	5272909	-	chr3L	16734383	11461474	+	chr3L	16734383	+	chr3L	5272909
TTTCTGCTGCCTTTCGAATTGCCAAGAAGCTAGCCAAGCTGGGTGGTCAATTCAGTGCATCCACTCCACTGACAG:1	TTTCTGCTGCCTTTCGAATTGC	AGTGCATCCACTCCACTGACAG	-	chr2L	19712794	-	chr2L	19712710	84	+	chr2L	19712710	+	chr2L	19712794
CGACCAATATAGAATTCCNTAAAAATAGTGAGAGATGAAGCNGGANTTTCATCTATTTATTTTGACATCGA:1	CGACCAATATAGAATTCCNTAA	CATCTATTTATTTTGACATCGA	-	chr2R	22512022	-	chr2R	22511939	83	+	chr2R	22511939	+	chr2R	22512022
GTAGCGTATCCTTTTGCCAAAACAAAAACTCTTAACTTATCTATTAATGAGAATGCTC:1	GTAGCGTATCCTTTTGCCAAAA	TTATCTATTAATGAGAATGCTC	-	chrX	9338036	-	chrX	9337961	75	+	chrX	9337961	+	chrX	9338036
CCTGTCGAAAAACGAGACCTGAGACATATTTTCAGAGCTACATGNTTCATATGCACTTTATTCAAGTGCGG:1	CCTGTCGAAAAACGAGACCTGA	TATGCACTTTATTCAAGTGCGG	-	chr3R	31643047	-	chr3R	31642806	241	+	chr3R	31642806	+	chr3R	31643047
AAATTATTTTCGCCTTCTCCTGCTACTCCCGTTGCTCCTGCTGTTTTGACAGAGAGTGGGGCCAGAGGGGCTGCT:1	AAATTATTTTCGCCTTCTCCTG	GAGTGGGGCCAGAGGGGCTGCT	-	chr2R	8853045	-	chr2R	6503098	2349947	+	chr2R	6503098	+	chr2R	8853045
GAATTTCACAGTATATATATGGTACGAACGTATATCGTAAATGTGTATAGTTAGCCAGCNTGCTTATATAAT:1	GAATTTCACAGTATATATATGG	TTAGCCAGCNTGCTTATATAAT	-	chr3R	24078384	-	chr3R	24076920	1464	+	chr3R	24076920	+	chr3R	24078384
CAAATTTAACAACTTTAGGGGTCCCATTAATGTTTCCTAAATTGAAATTTAACCANCAAACTGCCGGTCAGTTTT:1	CAAATTTAACAACTTTAGGGGT	CANCAAACTGCCGGTCAGTTTT	-	chr2R	21924862	-	chr2R	21924747	115	+	chr2R	21924747	+	chr2R	21924862
TGGGATTACGTATGTGCTTTGCATTTGACTGCCCATTGATGAGAGATGTGCCATTGTGTTGCAAGGCCAAGTCT:1	TGGGATTACGTATGTGCTTTGC	ATTGTGTTGCAAGGCCAAGTCT	-	chr3R	23629537	-	chr3R	23629462	75	+	chr3R	23629462	+	chr3R	23629537
TTATTGTTTTTCCAGTCTGCNGATTGACAATGNCGTGCCATTNATTGGCGAAAGGAGCGGGAAATGTTCCACACA:1	TTATTGTTTTTCCAGTCTGCNG	GGAGCGGGAAATGTTCCACACA	+	chr2L	2100389	+	chr2L	2109540	9151	+	chr2L	2100389	+	chr2L	2109540
ATTAAGGTAGGTCAACCANTTAAAATCTGCGAACATTGGGTATNAAAAGNTACACATTCAACACACAATATTTAT:1	ATTAAGGTAGGTCAACCANTTA	ACATTCAACACACAATATTTAT	-	chr3L	20488117	-	chr3L	20487666	451	+	chr3L	20487666	+	chr3L	20488117
ATCCATGCTAACACTCTAAACAGCCAAGTGGATCCCCCAGTTCCGATTTAAC:1	ATCCATGCTAACACTCTAAACA	GATCCCCCAGTTCCGATTTAAC	-	chr2L	8895662	-	chr2L	8814061	81601	+	chr2L	8814061	+	chr2L	8895662
GTGATACCCTAAAACTCGATCTCGCATTTTCATTGTCCTCTTCTCATTTGTTCAGCCG:1	GTGATACCCTAAAACTCGATCT	CCTCTTCTCATTTGTTCAGCCG	+	chrX	10206975	+	chrX	18541009	8334034	+	chrX	10206975	+	chrX	18541009
TCTAACGGTGCAAAGGTGTGAAATTGTTGTTGCTCTTGATTGGATATCTGTGTTTCATCAGGTGGCACTGTGGCG:1	TCTAACGGTGCAAAGGTGTGAA	TTCATCAGGTGGCACTGTGGCG	-	chr3R	31696320	-	chr3R	31691554	4766	+	chr3R	31691554	+	chr3R	31696320
TTGGTAAATGCTATGTCAGAAACACAAAAACTGCATCTCGCACACACGCACGCCAAAGTAGGCGACAAGGAGAAG:1	TTGGTAAATGCTATGTCAGAAA	CAAAGTAGGCGACAAGGAGAAG	-	chr2L	16050180	-	chr2L	21773080	5722900	+	chr2L	21773080	+	chr2L	16050180
CAAGCCGGAGGTGCACTTCGCCAAGTACCGNNNTNCCGAGGACGCTGCCAACGCCCAGAGAGCCATTCAGGG:1	CAAGCCGGAGGTGCACTTCGCC	ACGCCCAGAGAGCCATTCAGGG	-	chr3R	26692865	-	chr3R	26628124	64741	+	chr3R	26628124	+	chr3R	26692865
GGCTGCTTGGTGACGAAGGACCAAGGACCAAGGAGGAGCAAACGGAGAAACCAAAGAAGAACAATCTAAGGTGAT:1	GGCTGCTTGGTGACGAAGGACC	AAGAAGAACAATCTAAGGTGAT	-	chrX	8013364	-	chrX	8013252	112	+	chrX	8013252	+	chrX	8013364
GTGTGCATGGGCAGCAGCNAAAAAGCGGACCAAAAAGAAACAANGAAATNAGCATTTTATTACTCTGAATTCATA:1	GTGTGCATGGGCAGCAGCNAAA	ATTTTATTACTCTGAATTCATA	+	chr3L	25147893	+	chr3L	22605456	2542437	+	chr3L	25147893	+	chr3L	22605456
TGCATCCATCCGCACGCTACCCTAGTCTTAATCACCTGACCGTGTGTGGAGGAATCTAGATACTTA:1	TGCATCCATCCGCACGCTACCC	TGTGGAGGAATCTAGATACTTA	+	chr3R	28604831	+	chr3R	28604900	69	+	chr3R	28604831	+	chr3R	28604900
CTGTCAGATTGGTGGTACNAAAACTCCGGGAGTTGAATTTTCANTCAAGNGAGTAGCTAAAACCACAATCTTATG:1	CTGTCAGATTGGTGGTACNAAA	TAGCTAAAACCACAATCTTATG	+	chr3R	31435381	+	chr3R	31435533	152	+	chr3R	31435381	+	chr3R	31435533
CGCAGCCCACCCATTAAATTGAGATTAAATGAGTGCCAAAGCACCAAAAACCGGCCGATAACCGGACGCCATCG:1	CGCAGCCCACCCATTAAATTGA	GGCCGATAACCGGACGCCATCG	-	chr3R	11250531	-	chr3R	18068551	6818020	+	chr3R	18068551	+	chr3R	11250531
TGGTCCTTTACTCCACTTCCTCTGCTTTCTTTTTGCAGCGTTTCGGTTGGGACATCAGCTGCTC:1	TGGTCCTTTACTCCACTTCCTC	TCGGTTGGGACATCAGCTGCTC	+	chr3R	4861576	+	chr3R	4861646	70	+	chr3R	4861576	+	chr3R	4861646
CCGAAAGCCGTCAATCTTTCGATCAGCCGCACAATGGGATACATTTCACGTTTGTTTTGCAGTAATTTCATTACG:1	CCGAAAGCCGTCAATCTTTCGA	GTTTTGCAGTAATTTCATTACG	+	chr2L	2826571	+	chr2L	2826656	85	+	chr2L	2826571	+	chr2L	2826656
AAAACAGTCATCGAGAGTGAACATGGGGTAGTCGATCAAACGCAGCTCAAGTATAGGACGGTGCGTGCTGCCAG:1	AAAACAGTCATCGAGAGTGAAC	ATAGGACGGTGCGTGCTGCCAG	+	chr2R	5421642	+	chr2R	5421559	83	+	chr2R	5421642	+	chr2R	5421559
TACCACTTTATGTAAAGGATAGAGACTTATCTTTTTATATATTACTAATTTCTTGTGGGGGCAGATAGGTGTAG:1	TACCACTTTATGTAAAGGATAG	TTGTGGGGGCAGATAGGTGTAG	+	chr3R	19908274	+	chr3R	19908357	83	+	chr3R	19908274	+	chr3R	19908357
ATGCCGGCAAAAAACGAAACTATACCCAACCAAAATGGTTGATAACACATGTGGAAAGATGTGAAATNTGAATTT:1	ATGCCGGCAAAAAACGAAACTA	GAAAGATGTGAAATNTGAATTT	-	chr3L	25346421	-	chr3L	25343654	2767	+	chr3L	25343654	+	chr3L	25346421
GTTAAATGTGTGTCGTTTTTATAAGCATTGCATAAATTTCCGCCC:1	GTTAAATGTGTGTCGTTTTTAT	AGCATTGCATAAATTTCCGCCC	-	chrX	3126490	-	chrX	4506997	1380507	+	chrX	4506997	+	chrX	3126490
ACTTTATTGCTCCAAAAGCTATCAGTAGCAATCCTCGAAGTTGTACCACGGTGTGGCATCCACATC:1	ACTTTATTGCTCCAAAAGCTAT	ACCACGGTGTGGCATCCACATC	-	chr2L	6021697	-	chr2L	6021628	69	+	chr2L	6021628	+	chr2L	6021697
GGAGTGTTTTCATATATGTTTAGCTTTGAGCTCTTGCTAAATAGAGATACTAAGATTAATGCTTTTCCGTTCCTT:1	GGAGTGTTTTCATATATGTTTA	GATTAATGCTTTTCCGTTCCTT	-	chr3L	11744142	-	chr3L	11744034	108	+	chr3L	11744034	+	chr3L	11744142
AGAATGTANCTAACACTTTGCCAGTGCAAGCGCCTTGNNNNTGTGATTTGTGGTCTTTTCANGAACAGGAAGTAG:1	AGAATGTANCTAACACTTTGCC	TCTTTTCANGAACAGGAAGTAG	+	chrX	2977103	+	chrX	21107403	18130300	+	chrX	2977103	+	chrX	21107403
CTAATGGANGAGTACTTCGATTTTGGTGCTTTTTCNCTAGGTGCTTAGTGGGTGGTTGGCTGAAGCGGGCATTG:1	CTAATGGANGAGTACTTCGATT	TGGTTGGCTGAAGCGGGCATTG	-	chrX	5031532	-	chrX	3697299	1334233	+	chrX	3697299	+	chrX	5031532
CAAAAAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAAAAAAATGTCGAAGGAAACTTAAATTGTTAAAGCCCA:1	CAAAAAGCTCTACAGTCATTAG	AAACTTAAATTGTTAAAGCCCA	+	chr2L	9393524	+	chr2L	9396491	2967	+	chr2L	9393524	+	chr2L	9396491
GCCCACTCGAACTGTCACATTCTAGATGACCCCAGTAGCGATATCCATCCAGTATCG:1	GCCCACTCGAACTGTCACATTC	TAGCGATATCCATCCAGTATCG	+	chr2L	2031321	+	chr2L	22760237	20728916	+	chr2L	2031321	+	chr2L	22760237
GCGAAATATTTGCTTATCAACCGAAAAAGGGTGATAACACTTTGATTAATATAAGCGAGCTA:1	GCGAAATATTTGCTTATCAACC	TTTGATTAATATAAGCGAGCTA	+	chr2R	23243276	+	chr2R	23243351	75	+	chr2R	23243276	+	chr2R	23243351
CAATGGGCTATGTGAACAACGGATTTGGATTGGGGACAGGAAATTGGAATTCCGTTGGCAG:1	CAATGGGCTATGTGAACAACGG	GAAATTGGAATTCCGTTGGCAG	+	chrX	12045112	+	chrX	15523689	3478577	+	chrX	12045112	+	chrX	15523689
TTAGCTGGCATTTTCAGAACTCGTGTTTCTCAGTGTGGCAATTTACATCCGTTTCGGCCATTTCAAAAATATATT:1	TTAGCTGGCATTTTCAGAACTC	TCGGCCATTTCAAAAATATATT	+	chr2R	22360391	+	chr2R	22360824	433	+	chr2R	22360391	+	chr2R	22360824
AGATCTAAATATTAACATATTTACTTTACCAAATCAACTAAAATAAAGTCAATTAAATTGCAAGCACTGATGAAA:1	AGATCTAAATATTAACATATTT	TAAATTGCAAGCACTGATGAAA	-	chr3L	10214824	-	chr3L	10214737	87	+	chr3L	10214737	+	chr3L	10214824
GTCATCAAGTCTTTTGTCGATTTCTTTCCACACATTTACAGCTTTGTCCTGTCTCGAAAAAGGATAAGACGAGCG:1	GTCATCAAGTCTTTTGTCGATT	TCGAAAAAGGATAAGACGAGCG	-	chrX	16060008	-	chrX	14675272	1384736	+	chrX	14675272	+	chrX	16060008
AATGGGGNCCAACAAGTCAGGATTGTCTTTCGCTATGCCNCCGAAGAGTCACACTTANAAGAGAGTCCTGTAATG:1	AATGGGGNCCAACAAGTCAGGA	CTTANAAGAGAGTCCTGTAATG	+	chrX	20670959	+	chrX	20671057	98	+	chrX	20670959	+	chrX	20671057
ATTCATTTATGCTAAGCTAATTGCAGCTAANNNGNTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	ATTCATTTATGCTAAGCTAATT	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	11049235	-	chr3R	21907535	10858300	+	chr3R	21907535	+	chr3R	11049235
TCAGTTTTGCGGACGTTCTTTGCAAAAAAGGTTTTAGATCGGTTTGTTAATAGATAACACACACAAAAAAAACAT:1	TCAGTTTTGCGGACGTTCTTTG	ATAACACACACAAAAAAAACAT	+	chrX	22481785	+	chrX	15107470	7374315	+	chrX	22481785	+	chrX	15107470
AGCGATCACCGACGCATCTCTGACGCAGTGCAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGNGAGAGAG:1	AGCGATCACCGACGCATCTCTG	AGAGAGAGAGAGAGNGAGAGAG	-	chrX	15593782	-	chrX	12649915	2943867	+	chrX	12649915	+	chrX	15593782
GTAAACGCTGACGAAAACAATTTGAAAATGAAGGTAGCAAAATGATGTCTTCGATGAGGTCGGCAAACAAACGTC:1	GTAAACGCTGACGAAAACAATT	ATGAGGTCGGCAAACAAACGTC	+	chr2R	12915324	+	chr2R	20091620	7176296	+	chr2R	12915324	+	chr2R	20091620
AGGCAAGAGAGTGAGTTCAAAGGTGAGGGCACGTGCAAATCGACACCGACACAGTGTCCTTAGGTTCGAGGACCA:1	AGGCAAGAGAGTGAGTTCAAAG	GTGTCCTTAGGTTCGAGGACCA	+	chr3R	28744411	+	chr3R	28744506	95	+	chr3R	28744411	+	chr3R	28744506
CCTGTATTTGTCTAATAAATTTATAGACTATGTTTAAACCTTAAGTTATACAATAATAGTTTAATTAGGAATTTT:1	CCTGTATTTGTCTAATAAATTT	TAATAGTTTAATTAGGAATTTT	-	chr3R	8340308	-	chr3R	8340213	95	+	chr3R	8340213	+	chr3R	8340308
TTACAAATATGCTGTAATCGAGAGATCTATTTCAGAGTTTCAAATTNATACTGTTCCTTT:1	TTACAAATATGCTGTAATCGAG	TTCAAATTNATACTGTTCCTTT	+	chrX	3589498	+	chrX	3589569	71	+	chrX	3589498	+	chrX	3589569
TCTCGGATTTCAGCCAAGAAGAAGACGTTGGCTAGGAACAAGAACAAGAAGATGGCGANGAAGCA:1	TCTCGGATTTCAGCCAAGAAGA	ACAAGAAGATGGCGANGAAGCA	+	chr2R	24727900	+	chr2R	24735398	7498	+	chr2R	24727900	+	chr2R	24735398
ATTTGGTCCGACTTCGCTCCACCTTTACCGTAAAATTTTACTGAGCTCTTCTTTAAAGCTCATAAAATGTGTAAG:1	ATTTGGTCCGACTTCGCTCCAC	TAAAGCTCATAAAATGTGTAAG	-	chr2L	9290870	-	chr2L	9290793	77	+	chr2L	9290793	+	chr2L	9290870
TTCGCCTTCGCGGGGAATGGGTCTTCTCGTCCACCTCCCACCTCCATCTCCTTCACATCCTCATCC:1	TTCGCCTTCGCGGGGAATGGGT	CATCTCCTTCACATCCTCATCC	-	chrX	19992499	-	chrX	19992432	67	+	chrX	19992432	+	chrX	19992499
AAGTTGAACTCTTGTTGATTTACAAAATTTAAGCTTACAAATTGCAAGTGTTGTAAAACGCGATAGTTAACTG:1	AAGTTGAACTCTTGTTGATTTA	TGTAAAACGCGATAGTTAACTG	-	chr2R	14018247	-	chr2R	14018165	82	+	chr2R	14018165	+	chr2R	14018247
AGGGGCTTAGACTTAACAATTCACGCAACGGAAACGATAAACCGAGGACCACAGATCCCGANCATAGAGCAAGTA:1	AGGGGCTTAGACTTAACAATTC	GATCCCGANCATAGAGCAAGTA	-	chrX	17680989	-	chrX	17680912	77	+	chrX	17680912	+	chrX	17680989
AGTTGAATCGCCCCTGTGTNAGTTTTTGTAACTGTGTGTGTGTGTTTGGGGCAA:1	AGTTGAATCGCCCCTGTGTNAG	TGTGTGTGTGTGTTTGGGGCAA	+	chr3R	20784581	+	chr3R	13251849	7532732	+	chr3R	20784581	+	chr3R	13251849
GTAAACGACTTTAGAAGAATACTTACACTGAGTGCTAGCCGTGATCCGTGTCACGGAG:1	GTAAACGACTTTAGAAGAATAC	AGCCGTGATCCGTGTCACGGAG	+	chr2R	24320203	+	chr2R	24320290	87	+	chr2R	24320203	+	chr2R	24320290
TTAATTCACATTCGAATCGAAATGTTATTTTATTTATTTGGCGTATTNGTTTAATTTCGAGNAATTTGGTTTCGA:1	TTAATTCACATTCGAATCGAAA	ATTTCGAGNAATTTGGTTTCGA	-	chr3R	13835709	-	chr3R	13835617	92	+	chr3R	13835617	+	chr3R	13835709
CCACCTAGAGTTTGGAAGCTTCTGAAGGCGAGCACAGGGATATCGCCCGCAAAGTGACTTGTAAACATTTTAGCA:1	CCACCTAGAGTTTGGAAGCTTC	GTGACTTGTAAACATTTTAGCA	+	chr3R	29550267	+	chr3R	29550348	81	+	chr3R	29550267	+	chr3R	29550348
TTTAATTTTGCTCTAGATTTTATACGCAGACCTCTGCTTTTTGTGCGGCATTTAAGTTCAATTAAAAATATTCTT:1	TTTAATTTTGCTCTAGATTTTA	AAGTTCAATTAAAAATATTCTT	-	chrX	8956271	-	chrX	8948761	7510	+	chrX	8948761	+	chrX	8956271
AATTGGGACCCGAATCTCCAAAGAGCAAGGAAATTCATTTTTATTCTCTGGCCGAAGGAGAAAAGTGGGGGGC:1	AATTGGGACCCGAATCTCCAAA	CCGAAGGAGAAAAGTGGGGGGC	+	chr2R	24243770	+	chr2R	24243870	100	+	chr2R	24243770	+	chr2R	24243870
CATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTCCCTGTCTCATCAATTAATCTCGTTTGCAGCGTTTACTCAAATCA:1	CATTGCCCATTTGGGCTTCGGT	TTTGCAGCGTTTACTCAAATCA	-	chr2L	14809083	-	chr2L	14803886	5197	+	chr2L	14803886	+	chr2L	14809083
CTGTTTCTGATCGAGTGGCCTCGTTCTGCTCACACGTCCAGGTGAGTGTGAGTGTGTGCGCGTGTGTGTGAGG:1	CTGTTTCTGATCGAGTGGCCTC	GTGTGTGCGCGTGTGTGTGAGG	-	chr3R	13812783	-	chr3R	30098292	16285509	+	chr3R	30098292	+	chr3R	13812783
CTCCTACTATTCTATTCTTCATAATTACGCTGCTATGCTGTTGGCATAGATCAACGCAAACACATCAAGCACATA:1	CTCCTACTATTCTATTCTTCAT	ACGCAAACACATCAAGCACATA	+	chr2R	25101294	+	chr2R	25101396	102	+	chr2R	25101294	+	chr2R	25101396
TATGCCCTATATTGGCGAGACAGCTTTTGTCCTGNGAAAACAGGAAAGGGACAAGATGTCATATGATCAAAAGAA:1	TATGCCCTATATTGGCGAGACA	AGATGTCATATGATCAAAAGAA	+	chrX	21258839	+	chrX	21258939	100	+	chrX	21258839	+	chrX	21258939
GGTCCGATATACAGTCAAAGACATCGAACGCCAGATCGCAGCTTTCACCTTTCTTGGGCAGCTCCCTGCG:1	GGTCCGATATACAGTCAAAGAC	CTTTCTTGGGCAGCTCCCTGCG	-	chr3L	16954880	-	chr3L	16945732	9148	+	chr3L	16945732	+	chr3L	16954880
AATTAGTTGTTCAGAAATCATGTCGAAATCATAAAATTAATTAAATANTAACATTGTTCATCCCATTNTCAGGAT:1	AATTAGTTGTTCAGAAATCATG	TTGTTCATCCCATTNTCAGGAT	-	chrX	20041637	-	chrX	20041557	80	+	chrX	20041557	+	chrX	20041637
TGGTGGTTGGTATTTTAAGTACCTTTTGGTATATATGTAACGAAATTTCAAATGGTATATTCCAAACAGTGCAA:1	TGGTGGTTGGTATTTTAAGTAC	TGGTATATTCCAAACAGTGCAA	-	chrX	2617513	-	chrX	2610397	7116	+	chrX	2610397	+	chrX	2617513
GCTCCACCCATTTCAGCTGCCACTCCCACCCGCCTCCCCTCCC:1	GCTCCACCCATTTCAGCTGCCA	ACTCCCACCCGCCTCCCCTCCC	-	chrX	5437018	-	chrX	5061370	375648	+	chrX	5061370	+	chrX	5437018
GATGATGGGCACCATCACGCTGCTAAAGATAGTTATAAAACTGCGTGATGTCCAACTGAAAGCCACGAGTCAAG:1	GATGATGGGCACCATCACGCTG	CAACTGAAAGCCACGAGTCAAG	+	chr3L	14282599	+	chr3L	14282678	79	+	chr3L	14282599	+	chr3L	14282678
TGCCAACTGTCGTTCGGTTTCTCGAGTGAAGTGTACAAATTAGTTGGCCTTGTCACA:1	TGCCAACTGTCGTTCGGTTTCT	CAAATTAGTTGGCCTTGTCACA	+	chr2L	12933869	+	chr2L	12941318	7449	+	chr2L	12933869	+	chr2L	12941318
GTCGGAGTTTATTTCCGTTATATGCACTGTTGTTCTCCTAATATTATTTTT:1	GTCGGAGTTTATTTCCGTTATA	TTGTTCTCCTAATATTATTTTT	-	chr3R	20165863	-	chr3R	20156717	9146	+	chr3R	20156717	+	chr3R	20165863
TGCAAAAGAATAAGAAAGAAATTGATTTGAATTCATAAAGGGAAATATAAAAATTCTGCGCAATTTATTACTAAT:1	TGCAAAAGAATAAGAAAGAAAT	TTCTGCGCAATTTATTACTAAT	+	chr2L	2007851	+	chr2L	2007959	108	+	chr2L	2007851	+	chr2L	2007959
ATGAATGTATGTAATTCAAATCGATCTATGATTTATGCCCGTTTTGGACTTGCAAACTGATAATTTGCAGTTG:1	ATGAATGTATGTAATTCAAATC	GCAAACTGATAATTTGCAGTTG	-	chr3R	15452357	-	chr3R	15452282	75	+	chr3R	15452282	+	chr3R	15452357
CATGCATGGCAGCCCAATGAAAAATTAACGTAATNATGCAAATTGTTTTATCATTAAATTCTTGGCCGTCCCC:1	CATGCATGGCAGCCCAATGAAA	CATTAAATTCTTGGCCGTCCCC	+	chrX	4476069	+	chrX	7400647	2924578	+	chrX	4476069	+	chrX	7400647
CATTGCGTNGCAATTACACAAGCCCTCTCCCAGAGTCNNNNATTCAGTCCTTTGCCGGGAANAGCAAAAGGAGTA:1	CATTGCGTNGCAATTACACAAG	GCCGGGAANAGCAAAAGGAGTA	+	chr3R	16756326	+	chr3R	16762517	6191	+	chr3R	16756326	+	chr3R	16762517
GTCTGTTGTCTGCCGGACCCTTTTGTGCTCGCGTGTGAAATCAAACTCGATGCAAGGCAACGCGATGCATT:1	GTCTGTTGTCTGCCGGACCCTT	ATGCAAGGCAACGCGATGCATT	-	chr3R	18819696	-	chr3R	18568768	250928	+	chr3R	18568768	+	chr3R	18819696
AATTCGCTCAGTGTAGAAAAATAAACCTGACCTAGACGAAGGCAAATGATGACAATCAGCTTTTCCCCCTGC:1	AATTCGCTCAGTGTAGAAAAAT	GACAATCAGCTTTTCCCCCTGC	-	chr3L	4098588	-	chr3L	4098387	201	+	chr3L	4098387	+	chr3L	4098588
CGTGTTACNCGCCTATAACAAAGACTCACGTAGTTNGATTGTGCGCCGCTGCCAAGGCAACAAAATGGAATTG:1	CGTGTTACNCGCCTATAACAAA	CCAAGGCAACAAAATGGAATTG	-	chrX	15264015	-	chrX	15263654	361	+	chrX	15263654	+	chrX	15264015
GGTACATCAACAACATTAATCTGCAGAACGAACATTTGTTTTGTAGATTTATAATTTTTCAAAACATACAATCGC:1	GGTACATCAACAACATTAATCT	ATTTTTCAAAACATACAATCGC	-	chr3R	16066344	-	chr3R	18913601	2847257	+	chr3R	18913601	+	chr3R	16066344
AAAAATTAAAAAAAATATATATATNTTTTTTTTTGGTTAC:1	AAAAATTAAAAAAAATATATAT	ATATATNTTTTTTTTTGGTTAC	-	chr2R	1761224	-	chr2R	20184637	18423413	+	chr2R	20184637	+	chr2R	1761224
TGAGCCCCCGCGGCGGCATCGATTCTGTGGTTCAAGTTCCATTTGGAAAGATAAACAGAGATTTAGTAAGAAACG:1	TGAGCCCCCGCGGCGGCATCGA	AACAGAGATTTAGTAAGAAACG	-	chr3L	17524544	-	chr3L	17516986	7558	+	chr3L	17516986	+	chr3L	17524544
CAAACAAACAAACAAACAAGCAACGAAAGCGTGAGGCAATNTATTNTGACATTTGGGCGCTGA:1	CAAACAAACAAACAAACAAGCA	TATTNTGACATTTGGGCGCTGA	-	chrX	21262657	-	chrX	21571461	308804	+	chrX	21571461	+	chrX	21262657
ATTATCAATGCCAAATTATTTTAACATACAATTTCAAAATTGCTTTACTATCTCGGACAAAATATAGGCAAATTT:1	ATTATCAATGCCAAATTATTTT	CGGACAAAATATAGGCAAATTT	+	chr3L	18868988	+	chr3L	18869069	81	+	chr3L	18868988	+	chr3L	18869069
ATGTGGTCCACATGCCAAGACAACGGATAGTAGTAATTTTGGATAGGCCTGCACCCCAGCGAAAAACGATACTTG:1	ATGTGGTCCACATGCCAAGACA	CCCCAGCGAAAAACGATACTTG	-	chrX	680929	-	chrX	680846	83	+	chrX	680846	+	chrX	680929
ATTCATGCCGCCCAGTGACCCAAAATGTATACATGTATACATGTATGTANATATTGCACAGCCATGGCCACTTGA:1	ATTCATGCCGCCCAGTGACCCA	TTGCACAGCCATGGCCACTTGA	-	chr2R	17626936	-	chr2R	17626858	78	+	chr2R	17626858	+	chr2R	17626936
ACTCCCAGGTTCNATGCATCATCATCATCGNTNAGCTANCTACACAGACATCTTTATTGAGATGTATTTTT:1	ACTCCCAGGTTCNATGCATCAT	ATCTTTATTGAGATGTATTTTT	-	chr2R	23427928	-	chr2R	23427790	138	+	chr2R	23427790	+	chr2R	23427928
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTGTG:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	GTTGTGTTGTGTTTGTGTTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	15286987	6620548	+	chr3R	15286987	+	chr3R	21907535
CATTGCCCGGTTCGTCATGCATAAAATATTCAGTGGAATATAATGAAACGGCTCCAAGGAAATACATAGTGCGCA:1	CATTGCCCGGTTCGTCATGCAT	CCAAGGAAATACATAGTGCGCA	-	chr3R	10745531	-	chr3R	10745444	87	+	chr3R	10745444	+	chr3R	10745531
TTCACATGAAATATGTTCGACTGGGTTGTTGATCAATGCCAAATGACGAATGACGCAT:1	TTCACATGAAATATGTTCGACT	TGCCAAATGACGAATGACGCAT	-	chr2L	8789382	-	chr2L	8789323	59	+	chr2L	8789323	+	chr2L	8789382
GAGTTAGCGGAATTCTTTATGCTTCTACCCATTACTCACTCTGTCCGTATGTTTTCGGGAACTATGAACGCTTAA:1	GAGTTAGCGGAATTCTTTATGC	TTCGGGAACTATGAACGCTTAA	+	chrX	16245963	+	chrX	16246070	107	+	chrX	16245963	+	chrX	16246070
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGAT:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	ATGAGATGAGATGAGATGAGAT	+	chr3L	22908066	+	chr3L	9307796	13600270	+	chr3L	22908066	+	chr3L	9307796
CAAAAGGTTTTGATATTTTTTCATATTTTTGTGAATTTTTTAATTCATTATACCCGTTGCTCGTAAAGTAAAAGG:1	CAAAAGGTTTTGATATTTTTTC	CCGTTGCTCGTAAAGTAAAAGG	-	chrX	22902347	-	chrX	17283665	5618682	+	chrX	17283665	+	chrX	22902347
TTTTTCTTTTGATTTGGGTTGAGAATACAATTGAAATACATCATAAAATGACTGATATGGCACTTCCNTGTCTTT:1	TTTTTCTTTTGATTTGGGTTGA	GATATGGCACTTCCNTGTCTTT	-	chr2L	7218503	-	chr2L	7218425	78	+	chr2L	7218425	+	chr2L	7218503
TGCGCTGAAAACTAAAAATGCCCCAAGCCCAGAGAGTCTGCTAAAATGGCAGCAAAAAA:1	TGCGCTGAAAACTAAAAATGCC	CTGCTAAAATGGCAGCAAAAAA	+	chr3R	28989925	+	chr3R	28990084	159	+	chr3R	28989925	+	chr3R	28990084
TTATGACANGCCAACAGCCATTTTGGCTGACACGCGTGTGCGTTAG:1	TTATGACANGCCAACAGCCATT	GGCTGACACGCGTGTGCGTTAG	+	chr3R	15517626	+	chr3R	15517680	54	+	chr3R	15517626	+	chr3R	15517680
TATTGTTTTTCCAGTCTGCTGATTGACAATGACGTGCCATTGATTGGCGAAAGGAGCGGGAAATGTTC:1	TATTGTTTTTCCAGTCTGCTGA	GCGAAAGGAGCGGGAAATGTTC	+	chr2L	2100390	+	chr2L	2109534	9144	+	chr2L	2100390	+	chr2L	2109534
TGGTAATAAACTGACAAAAATGTTGGTAGTTTNAGAAATTTGTTTATATTCCTTTACCTCATATCGNTTTTTTTT:1	TGGTAATAAACTGACAAAAATG	TTACCTCATATCGNTTTTTTTT	-	chr3R	14384724	-	chr3R	14384634	90	+	chr3R	14384634	+	chr3R	14384724
CGTCGCATACTTTGATTACNGTTACACACATATATGTACATATGGCCAAAAGGCAAAAGGAAGCTGGCTCGAAGA:1	CGTCGCATACTTTGATTACNGT	CAAAAGGAAGCTGGCTCGAAGA	+	chr3L	9575930	+	chr3L	9581008	5078	+	chr3L	9575930	+	chr3L	9581008
CGCAAGCAAATACTCAAGAAAATGTCAAAAAGTGAAGCTGCAAACAAAACAAAACAAAACAAAACANAACAAAAC:1	CGCAAGCAAATACTCAAGAAAA	ACAAAACAAAACANAACAAAAC	+	chr3R	18861833	+	chr3R	29013340	10151507	+	chr3R	18861833	+	chr3R	29013340
TGCATATATCGACCGGCATTTTGCTGTCCTCGTAATTGTTCTCTGTTAAAAAACTGCAACTCAACTGCGTTGT:1	TGCATATATCGACCGGCATTTT	AACTGCAACTCAACTGCGTTGT	+	chr2R	7529059	+	chr2R	7529144	85	+	chr2R	7529059	+	chr2R	7529144
CAAGGTAAATTGCATTGATTTCGTGATTAATGAGAGTTTCGCATTTCACC:1	CAAGGTAAATTGCATTGATTTC	AATGAGAGTTTCGCATTTCACC	+	chr3R	6737528	+	chr3R	6739290	1762	+	chr3R	6737528	+	chr3R	6739290
TTGGCAACTCACTCAGGGTTGCTTGCATTAACTACTTTTAAGCTTACACTACCCACCCATTTTAATTGTTAAGCT:1	TTGGCAACTCACTCAGGGTTGC	CACCCATTTTAATTGTTAAGCT	-	chr3R	15608714	-	chr3R	15601192	7522	+	chr3R	15601192	+	chr3R	15608714
GAGGCATTTCTGGTCTCCAGTTTTCCAAATTGGAGAGAGCATTTGCAGTTCGTATATCACATTTGCGATGGAGTG:1	GAGGCATTTCTGGTCTCCAGTT	ATATCACATTTGCGATGGAGTG	+	chr3R	20167823	+	chr3R	20167901	78	+	chr3R	20167823	+	chr3R	20167901
TGTCCCGTCAACTTCATTTAAACGGAAATATTTCGCAGATTTCTCTGTGCGCAGCCCAGATCTTGTGNACTCA:1	TGTCCCGTCAACTTCATTTAAA	CAGCCCAGATCTTGTGNACTCA	+	chr2R	15752898	+	chr2R	15752975	77	+	chr2R	15752898	+	chr2R	15752975
AGTTATCAACATAGTTGAGCCAAACAAGATGTTTGCTGCCGGGTGCTGAAA:1	AGTTATCAACATAGTTGAGCCA	TGTTTGCTGCCGGGTGCTGAAA	+	chr2L	877111	+	chr2L	877164	53	+	chr2L	877111	+	chr2L	877164
GCTATAGCATGTGGAATCCACATTGAGTGAAGAGCCATATATTCTCGGCTTTGGCCGGTGTGTGGGGCTTAAAA:1	GCTATAGCATGTGGAATCCACA	GGCCGGTGTGTGGGGCTTAAAA	-	chr2L	16148953	-	chr2L	16148870	83	+	chr2L	16148870	+	chr2L	16148953
CCAAGTATCGTTTTTCGCTGGGGTGCAGGCNNNTNCAAAATTACTACTATCCGTTGTCTTGGCATGTGGACCACA:1	CCAAGTATCGTTTTTCGCTGGG	TTGTCTTGGCATGTGGACCACA	+	chrX	680845	+	chrX	680928	83	+	chrX	680845	+	chrX	680928
AAAAGGGTCTTTTGTTTGTCTAAGGCGTGTNNNTNTATGTGGCTGCGAATTAAGGTTGATAAGATTCTGGGGTAA:1	AAAAGGGTCTTTTGTTTGTCTA	GGTTGATAAGATTCTGGGGTAA	-	chr3L	13074202	-	chr3L	13074069	133	+	chr3L	13074069	+	chr3L	13074202
GTTTTGTTGTTTTAAATAGTTTCTATGTAAACTGGAGACTTAAGTGCTATCCATCTAGTGGAACTTNAATATCAT:1	GTTTTGTTGTTTTAAATAGTTT	TCTAGTGGAACTTNAATATCAT	-	chr2R	22836591	-	chr2R	22834453	2138	+	chr2R	22834453	+	chr2R	22836591
CCAACAATTCATTTGCATTTTCACAAAATACTTTAAAAGATTTCGCCTTTTTTCTTGATGCTTTTAAATGGGTTT:1	CCAACAATTCATTTGCATTTTC	CTTGATGCTTTTAAATGGGTTT	+	chr3L	9561363	+	chr3L	9561441	78	+	chr3L	9561363	+	chr3L	9561441
ATGACCCCATTTAATCAACGCTAAGCCCGTCTCGTCCCCTCCCCCTCGTTGACCGACAGAATGATAATTTGTTTG:1	ATGACCCCATTTAATCAACGCT	CGACAGAATGATAATTTGTTTG	+	chr3R	29971255	+	chr3R	29971342	87	+	chr3R	29971255	+	chr3R	29971342
GGAAAAACTTTGCCGGTGNAAATCATCGCAACGCAACGAAANTGCNGAGAAATTTCACCAACTTGTAAAACA:1	GGAAAAACTTTGCCGGTGNAAA	AATTTCACCAACTTGTAAAACA	+	chr2L	20559874	+	chr2L	3116907	17442967	+	chr2L	20559874	+	chr2L	3116907
TCCAACACCTTACATTTTATAATGTTTTTGGTAAAGCGTTATGACAAATGATTTTTAAATCGACGAGCCACTNAT:1	TCCAACACCTTACATTTTATAA	TTTAAATCGACGAGCCACTNAT	-	chr2R	6161423	-	chr2R	6161344	79	+	chr2R	6161344	+	chr2R	6161423
AAAAGCTCGCTTTTCAGCCNAGACTTTATGTTGCTTTCTTTGCTTTTCCTTTAGTCAGCTTCTTGTGAAGCTTTC:1	AAAAGCTCGCTTTTCAGCCNAG	GTCAGCTTCTTGTGAAGCTTTC	+	chr3L	8372236	+	chr3L	18484744	10112508	+	chr3L	8372236	+	chr3L	18484744
CAAGACAATGTTTTTAATTTAAGACTAAAGACCAAGAAATGTTGCCATAAAAATGATTTAA:1	CAAGACAATGTTTTTAATTTAA	TGTTGCCATAAAAATGATTTAA	+	chr2L	5800583	+	chr2L	9118482	3317899	+	chr2L	5800583	+	chr2L	9118482
CTATCGAAATTTCGAATTTCAAAACCAAGTGTTGTAGTCAGACGATCAAATTATATTTTTTTTTTTCTAAAAAAC:1	CTATCGAAATTTCGAATTTCAA	TATTTTTTTTTTTCTAAAAAAC	+	chr2L	6109298	+	chr2L	21683447	15574149	+	chr2L	6109298	+	chr2L	21683447
GAGAAGTTGTTGGTATTGTCACAATCGGACCGCCGGGATTCCAACCTGAAGGTTTTGTCTTTTGAGTAGTGCT:1	GAGAAGTTGTTGGTATTGTCAC	GTTTTGTCTTTTGAGTAGTGCT	+	chr3L	15654853	+	chr3L	15655297	444	+	chr3L	15654853	+	chr3L	15655297
CTATGCTTTCTTACTAGTTCTATGGATTCCATAGTCCTTTTCGCTTGCATGCATGTATGTATATGTGAGCATGT:1	CTATGCTTTCTTACTAGTTCTA	ATGTATGTATATGTGAGCATGT	+	chr3R	5338406	+	chr3R	5343582	5176	+	chr3R	5338406	+	chr3R	5343582
ATGTTTGCACAGCAGCAAAAACATCGAGCAGAACAACACCAGCAAAAGTAAAACAATAAGGTGGGTAAAGAAAG:1	ATGTTTGCACAGCAGCAAAAAC	ACAATAAGGTGGGTAAAGAAAG	+	chr3R	14939194	+	chr3R	28637228	13698034	+	chr3R	14939194	+	chr3R	28637228
AGCATTTTTAAGTGTGATTTACTTCTGACAGCTAAAAGTAATTAACTCATTCATTAATCCTCATTAATTCGTTTT:1	AGCATTTTTAAGTGTGATTTAC	TTAATCCTCATTAATTCGTTTT	-	chr3R	26952026	-	chr3R	26951918	108	+	chr3R	26951918	+	chr3R	26952026
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831801
GTTTTTTGAACGAGCACGTCGTACAAAGAAGAAATATATTTACTTTTATTTGAAGCTTCAATCATAC:1	GTTTTTTGAACGAGCACGTCGT	TTATTTGAAGCTTCAATCATAC	-	chr2R	22185792	-	chr2R	22185701	91	+	chr2R	22185701	+	chr2R	22185792
ATTTCCAAGTGTAATGCCCCTAATGGTCCACAGCCACCCGCTGTGCCCATTAACAAGTGTTTTGGTNTAATGCA:1	ATTTCCAAGTGTAATGCCCCTA	ACAAGTGTTTTGGTNTAATGCA	+	chr3L	1925103	+	chr3L	1925189	86	+	chr3L	1925103	+	chr3L	1925189
TTAAAGCTGACNACAAAAAAAAAAGTATTCTTATGTTAAACATATGGTGAGAGGGGTGATGTTTGATGNTTGAGG:1	TTAAAGCTGACNACAAAAAAAA	GGGTGATGTTTGATGNTTGAGG	+	chrX	19136565	+	chrX	19143485	6920	+	chrX	19136565	+	chrX	19143485
CTNTACCAAAATGCAGAAAAAACTGTAACAACTTGGNTGTCGATGAAGACAAATGNAAGA:1	CTNTACCAAAATGCAGAAAAAA	GTCGATGAAGACAAATGNAAGA	-	chr3R	30829058	-	chr3R	28405994	2423064	+	chr3R	28405994	+	chr3R	30829058
GTGTTTGTGTTTGTTTTTGTGTTTGTGTTTGGGTTTGGGTTT:1	GTGTTTGTGTTTGTTTTTGTGT	GTTTGTGTTTGGGTTTGGGTTT	+	chrX	9845361	+	chrX	8382094	1463267	+	chrX	9845361	+	chrX	8382094
TTTTGATTAATATATAGTTGGCTCAGATCAGGTTGCTTGTATAAAGTAAAGTATAAATGATTCTTCCATAATGGA:1	TTTTGATTAATATATAGTTGGC	TAAATGATTCTTCCATAATGGA	+	chr3L	21868576	+	chr3L	21868666	90	+	chr3L	21868576	+	chr3L	21868666
GCCTGGTTTTTGTTTATGTGCTGCTGTTCGCAGACAGTTTAGTTCTTACTACAGCCTTATTTAAAACAGTATTA:1	GCCTGGTTTTTGTTTATGTGCT	AGCCTTATTTAAAACAGTATTA	-	chr2L	15078163	-	chr2L	15078076	87	+	chr2L	15078076	+	chr2L	15078163
GGTGCTCATTGGGTTGGCAATAGCATTGAACTCATAATTGATTGCGTTTTATATATTATTATTTCATTTACCCTG:1	GGTGCTCATTGGGTTGGCAATA	TATTATTATTTCATTTACCCTG	-	chr2R	22072765	-	chr2R	22072680	85	+	chr2R	22072680	+	chr2R	22072765
AATCTATGGCCTTTATTCCGAACCCAGAGTTTTTGGCGCCATACAGTTGAACTTCGCTAACTCGAACAAACGGGT:1	AATCTATGGCCTTTATTCCGAA	TCGCTAACTCGAACAAACGGGT	+	chrX	19318468	+	chrX	19318603	135	+	chrX	19318468	+	chrX	19318603
CTNGGGACTGGATGTGCGGCACTGAATTGCTGAANGNGCTAGCCACCGGTCAACACAACCTACTTACCGCGCTGG:1	CTNGGGACTGGATGTGCGGCAC	CACAACCTACTTACCGCGCTGG	+	chr3R	23497974	+	chr3R	23498058	84	+	chr3R	23497974	+	chr3R	23498058
AGGTCATGCAACACGGGTGAGTGGAAAGTGTGGAAAGTGGAGGCAGCTTGGCAG:1	AGGTCATGCAACACGGGTGAGT	GAAAGTGGAGGCAGCTTGGCAG	+	chr2R	12492123	+	chr2R	12492188	65	+	chr2R	12492123	+	chr2R	12492188
TATATTTTTTTTATTTTAAGTGTGTATAGAATTTATAGAAT:1	TATATTTTTTTTATTTTAAGTG	GTGTGTATAGAATTTATAGAAT	+	chr3R	1835243	+	chr3R	19494491	17659248	+	chr3R	1835243	+	chr3R	19494491
GTCGCATACTTTGATTACCGTTACACACATATATGTACATCTGGCCAAAAGGCAAAAGGCAGC:1	GTCGCATACTTTGATTACCGTT	TGGCCAAAAGGCAAAAGGCAGC	+	chr3L	9575931	+	chr3L	9580997	5066	+	chr3L	9575931	+	chr3L	9580997
TGTGTAAGCTATACATAATTAATTTTATATGGATATCATAGCCTAATAGTTCTATGAATATNTTACAGAAATAA:1	TGTGTAAGCTATACATAATTAA	TATGAATATNTTACAGAAATAA	-	chr3L	18436178	-	chr3L	18436081	97	+	chr3L	18436081	+	chr3L	18436178
GGTACAATTTAAATAAGCTGCCAGGCGGATGTGGTAGGATCGCAGGTGAAAAGTCGAGGCTGCAAGGTAA:1	GGTACAATTTAAATAAGCTGCC	AAAAGTCGAGGCTGCAAGGTAA	-	chr3L	3962553	-	chr3L	14860452	10897899	+	chr3L	14860452	+	chr3L	3962553
CAGGAGCANCAACTATGCGGATTATGCCCAATTAGNCACGCATCCCACCGATTCGTTGCTTAGGGCAGCGCAGAC:1	CAGGAGCANCAACTATGCGGAT	CGTTGCTTAGGGCAGCGCAGAC	-	chrX	2293984	-	chrX	323772	1970212	+	chrX	323772	+	chrX	2293984
GGCGACATTGCTTCACACTGCTATTTCGTCCTCGGCACTCTTTCATTCCGAACTCAATACGGTTTCTTCGCTC:1	GGCGACATTGCTTCACACTGCT	ACTCAATACGGTTTCTTCGCTC	-	chr2L	2667706	-	chr2L	2667629	77	+	chr2L	2667629	+	chr2L	2667706
CGAGACTCTCGAGAGACCTCAGGAAAATAAAAAAATACCGGGGGCAACACGGGAAAGCCAGGGGGGAGGGGGCG:1	CGAGACTCTCGAGAGACCTCAG	GAAAGCCAGGGGGGAGGGGGCG	+	chrX	3709712	+	chrX	3709787	75	+	chrX	3709712	+	chrX	3709787
GCAATGGTACGTACGTCTGTGCGATGCAACTGAGGGAGAATTTTGCGGGTGTGTGCGAGGGCGACAAAACTCGT:1	GCAATGGTACGTACGTCTGTGC	GTGCGAGGGCGACAAAACTCGT	-	chr2R	6501068	-	chr2R	6500974	94	+	chr2R	6500974	+	chr2R	6501068
ACAACAACAACAAGGACAACAAGGACCAATGGGGGCCTTAAGGACCCCCAGAGGAGG:1	ACAACAACAACAAGGACAACAA	CCTTAAGGACCCCCAGAGGAGG	-	chrX	12571974	-	chrX	3312619	9259355	+	chrX	3312619	+	chrX	12571974
CAAATACTTTTAAATAGTTTGTTTCTTAGATGAAAATCCCGTGTGCACTATAGTTATCCAAATTATTATTTAACT:1	CAAATACTTTTAAATAGTTTGT	TTATCCAAATTATTATTTAACT	+	chr2L	3073029	+	chr2L	3078232	5203	+	chr2L	3073029	+	chr2L	3078232
CTCAATTGTGTTTATTTGCGCGAACTTATGGCGCTAAAGGCAAGTCCTGAGCGCTGAGTGCCCACTCACACAGGA:2	CTCAATTGTGTTTATTTGCGCG	CTGAGTGCCCACTCACACAGGA	+	chr2L	13321928	+	chr2L	13322017	89	+	chr2L	13321928	+	chr2L	13322017
ATTTCCATGGTTGTTGTTGTTTTTTTT:1	ATTTCCATGGTTGTTGTTGTTT	CATGGTTGTTGTTGTTTTTTTT	+	chr2R	11004519	+	chr2R	17356488	6351969	+	chr2R	11004519	+	chr2R	17356488
TGGTAGCAACGGCACATGCACTTTAAGTGAAGTCGTCAAGTCGTCAAGTCGTGTGGCGTAGGACTGAGATTATA:1	TGGTAGCAACGGCACATGCACT	GTGGCGTAGGACTGAGATTATA	+	chr3R	28486274	+	chr3R	28484356	1918	+	chr3R	28486274	+	chr3R	28484356
TTTCATTTCCTTACCTGATTAAATACCCCCGAAATTGTCCTGCACATTGACCCACTTGAGTTCATTTGAAAGTTG:1	TTTCATTTCCTTACCTGATTAA	ACTTGAGTTCATTTGAAAGTTG	-	chr2L	9007795	-	chr2L	9000285	7510	+	chr2L	9000285	+	chr2L	9007795
AATAAATACCAAACAAACTAAATCAAAAATAAACGTATTTTCGCTGCTCGTTTGTTCA:1	AATAAATACCAAACAAACTAAA	ATTTTCGCTGCTCGTTTGTTCA	+	chrX	20386849	+	chrX	20386918	69	+	chrX	20386849	+	chrX	20386918
TATACTCGGAATATCTACATATAAATAATGCCCAGAACATGCCGCATACACACACTTGAACTGTGGACCAAAAAG:1	TATACTCGGAATATCTACATAT	ACTTGAACTGTGGACCAAAAAG	+	chr3L	21765401	+	chr3L	21765482	81	+	chr3L	21765401	+	chr3L	21765482
TAACTCATATTTGGGCCGAGGCCAATTGTCTGATTTTGGCTAAAAGTTAAATGGTATAAACTAAGCATTGTAT:1	TAACTCATATTTGGGCCGAGGC	TGGTATAAACTAAGCATTGTAT	-	chr3R	18214683	-	chr3R	4904879	13309804	+	chr3R	4904879	+	chr3R	18214683
TTCGCCTCAAAGCAACGCCCATATAATTTTGGCTTAACATAAAAGAAATGAAATCAGCAGAAAATTCAATGAGCA:1	TTCGCCTCAAAGCAACGCCCAT	TCAGCAGAAAATTCAATGAGCA	+	chr2L	17352499	+	chr2L	8746306	8606193	+	chr2L	17352499	+	chr2L	8746306
TATGCGTAACATTAAAGTNTCTGCTTCCGCATGCACCTCTCGTNAATAGNTCCTTAGGTCGGTGACGTATGA:1	TATGCGTAACATTAAAGTNTCT	TCCTTAGGTCGGTGACGTATGA	-	chr3R	31831624	-	chr3R	31831548	76	+	chr3R	31831548	+	chr3R	31831624
AACAACATTTCTCTGTAGANTTTCAGGTAAAACGGAGTGATGCATATATTTGTTCCTTGGAAATAAAATAAGAAA:1	AACAACATTTCTCTGTAGANTT	TCCTTGGAAATAAAATAAGAAA	+	chr3L	17991570	+	chr3L	17991648	78	+	chr3L	17991570	+	chr3L	17991648
CAGAAATAAGTTGTTGTGCCAAAAAGCCCCGATGATAGTAGTTAAATTTGATCAGATGACG:1	CAGAAATAAGTTGTTGTGCCAA	AGTTAAATTTGATCAGATGACG	+	chr2R	8722777	+	chr2R	8723004	227	+	chr2R	8722777	+	chr2R	8723004
TTTAGTGTTTTTGCGATTTTGAGCTGTGCGCGTGCCGCATTCAACGTGATGCTGAATTGAACATTTATTGAACAA:1	TTTAGTGTTTTTGCGATTTTGA	GAATTGAACATTTATTGAACAA	+	chrX	6335234	+	chrX	6337744	2510	+	chrX	6335234	+	chrX	6337744
GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATGCCGTATTAATCCAGCTAACCAACCGATAATTCGAATC:1	GTGTGTAAACAGTTTCTTGACA	TAACCAACCGATAATTCGAATC	+	chrX	15019092	+	chrX	17838041	2818949	+	chrX	15019092	+	chrX	17838041
CGCAGCGAGCGAAGGAACTTGGGGCACATTTCCGCTGAATAACTCCTCCTCAGCCAGACACAACTAACAAAAATA:1	CGCAGCGAGCGAAGGAACTTGG	CCAGACACAACTAACAAAAATA	+	chr2R	22040155	+	chr2R	21258674	781481	+	chr2R	22040155	+	chr2R	21258674
CACATTTTAAATAAAACAATATTTTCATTCATTGTAGCAAAAAATNCATAAAAAAAAA:1	CACATTTTAAATAAAACAATAT	GCAAAAAATNCATAAAAAAAAA	+	chr3L	7733221	+	chr3L	3088736	4644485	+	chr3L	7733221	+	chr3L	3088736
ACCGCTGTTATGCAAATTTANAAAAATGGATTNAAAGATAAGNGTTCGTAAAAACATTACCTAAAAAGGTTTTA:1	ACCGCTGTTATGCAAATTTANA	AACATTACCTAAAAAGGTTTTA	+	chr3R	14180827	+	chr3R	14185591	4764	+	chr3R	14180827	+	chr3R	14185591
GGTTTGACAAAATCATTTAGCAATTTACTTGGGATTTATGAAATAAGGCTAGACAATATAAGAAATAAAAGGAAC:1	GGTTTGACAAAATCATTTAGCA	CAATATAAGAAATAAAAGGAAC	+	chr3R	15868951	+	chr3R	15869031	80	+	chr3R	15868951	+	chr3R	15869031
TTCCACGACATACTTTGTTTCAAACTTTTAATTTNTCTTTAATTTTAATGCACTTTTCAATCCCTGCACTATATA:1	TTCCACGACATACTTTGTTTCA	TTTTCAATCCCTGCACTATATA	+	chr3L	19544234	+	chr3L	19544310	76	+	chr3L	19544234	+	chr3L	19544310
GGAGAACAAAGCCCGGGGAGCGAACAAAGCCCGGGGCTCCGGCTTAGCCCAGCGACTAA:1	GGAGAACAAAGCCCGGGGAGCG	TCCGGCTTAGCCCAGCGACTAA	+	chr3R	28182694	+	chr3R	28182878	184	+	chr3R	28182694	+	chr3R	28182878
AGCTCGAAGAGTTCGCGGCCAGAAGGCCAATCTAGCCAAGGTATCCACCGAGA:1	AGCTCGAAGAGTTCGCGGCCAG	CTAGCCAAGGTATCCACCGAGA	-	chr3L	8490943	-	chr3L	8481806	9137	+	chr3L	8481806	+	chr3L	8490943
ATGAAACTACCTCAACGGGGGCATTGTTCCTGCTAAAAAATACCCTGTAATTAAATTCCTTTAAATGAAATAAT:1	ATGAAACTACCTCAACGGGGGC	AAATTCCTTTAAATGAAATAAT	+	chrX	12990761	+	chrX	12991049	288	+	chrX	12990761	+	chrX	12991049
GATGAAATGGGAAAATATGGCCAAATATGCCAAAGAACGGACTTGTTG:1	GATGAAATGGGAAAATATGGCC	ATGCCAAAGAACGGACTTGTTG	-	chr3R	12344206	-	chr3R	12344156	50	+	chr3R	12344156	+	chr3R	12344206
AGTGCTCGGTTATCGTTGTCCCCTACATCATCAGTAAAAAGCAGAAATACAATTTAATGCTCTTAAAACTAATG:1	AGTGCTCGGTTATCGTTGTCCC	TTTAATGCTCTTAAAACTAATG	-	chrX	20828829	-	chrX	8385956	12442873	+	chrX	8385956	+	chrX	20828829
TAATTGCGTTGCCAATCATTTGGAAGCTATGCGATGTCCGCCCCCGAAAACAGGATGCATAACTTCCTATCCACA:1	TAATTGCGTTGCCAATCATTTG	GATGCATAACTTCCTATCCACA	-	chr3L	17327687	-	chr3L	17327598	89	+	chr3L	17327598	+	chr3L	17327687
CGAGCGAGCAAGTCATGTGTGTGCACTTTAGATGTCTGGAACTGGTCTAGGCCCATTCAATCAAGTCAAGCCACG:1	CGAGCGAGCAAGTCATGTGTGT	CATTCAATCAAGTCAAGCCACG	+	chr3R	22968815	+	chr3R	24480194	1511379	+	chr3R	22968815	+	chr3R	24480194
GTATTTCTGGGTGTGCACTTCAGTCAATGAAAATGGCCCCCC:1	GTATTTCTGGGTGTGCACTTCA	CAGTCAATGAAAATGGCCCCCC	+	chrX	20774597	+	chrX	20774645	48	+	chrX	20774597	+	chrX	20774645
TTCTCAATTATGTCGATGGAATAATTAATGCGCGCATTTGCTTAGCCTATTAATGCATTTCCCAGCACATTTATT:1	TTCTCAATTATGTCGATGGAAT	TGCATTTCCCAGCACATTTATT	+	chr2L	8723136	+	chr2L	8731513	8377	+	chr2L	8723136	+	chr2L	8731513
ACAGCAACGAGGAGTCGTTGCCGGCCCCAAGTGCCATAAAGTTTATTTAAACAAATTGCCGATTTTATATGTG:1	ACAGCAACGAGGAGTCGTTGCC	CAAATTGCCGATTTTATATGTG	+	chr3R	12920163	+	chr3R	12925364	5201	+	chr3R	12920163	+	chr3R	12925364
GACCGCAAGTGTAAGAAACAAGTCACGCACTTTTCCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCAGTTCGCCAAAGTGCCCGTG:1	GACCGCAAGTGTAAGAAACAAG	CCAGTTCGCCAAAGTGCCCGTG	+	chr3R	5573178	+	chr3R	5573263	85	+	chr3R	5573178	+	chr3R	5573263
CGCAATCAATTATGAGTTCAATGCTATTGCCAACCCAATGAGCACCCAAATACCTACCA:1	CGCAATCAATTATGAGTTCAAT	ATGAGCACCCAAATACCTACCA	+	chr2R	22072709	+	chr2R	22072778	69	+	chr2R	22072709	+	chr2R	22072778
TTAATGTACAAAAAATCAATTTAATTTAAATTAAGAAGAAAGAAATAATCGACTTAAGAGAGTATTT:1	TTAATGTACAAAAAATCAATTT	TAATCGACTTAAGAGAGTATTT	-	chr2L	19002531	-	chr2L	14573307	4429224	+	chr2L	14573307	+	chr2L	19002531
GTTGGGGAACAAGTGCACNTTGTTGTTGTGGATCTAGGAGTAGTCGTCGTTGGGGG:1	GTTGGGGAACAAGTGCACNTTG	TAGGAGTAGTCGTCGTTGGGGG	-	chr2L	4938863	-	chr2L	4940605	1742	+	chr2L	4940605	+	chr2L	4938863
ACTATACCATTCTTCATGTATGGCATTGTCCTCGTCATGCTTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGGTTGGAT:1	ACTATACCATTCTTCATGTATG	GCTTTATTTGGCCTGGTTGGAT	+	chr3R	18766784	+	chr3R	18766862	78	+	chr3R	18766784	+	chr3R	18766862
GATTGAGTGAAGGAAACCCTTTCGATTGGCCGTGGAATTATTAAAACAAATAAAGCCAATTAGCTG:1	GATTGAGTGAAGGAAACCCTTT	AACAAATAAAGCCAATTAGCTG	-	chr3R	13878357	-	chr3R	13878267	90	+	chr3R	13878267	+	chr3R	13878357
AAACGCAACAAAAAAGGAAAAAGCTACGAAATATGTGTTTCTTGTGCGATCTGTG:1	AAACGCAACAAAAAAGGAAAAA	TGTGTTTCTTGTGCGATCTGTG	-	chr3L	3401524	-	chr3L	7582970	4181446	+	chr3L	7582970	+	chr3L	3401524
TCGCTCGTTGAGAAGGGGNATTCTAAAAAAACTGAATCAAAAANGCAAANCGGAGCAGTTGATGGACTTAACTGC:1	TCGCTCGTTGAGAAGGGGNATT	AGCAGTTGATGGACTTAACTGC	+	chr2R	18219648	+	chr2R	18219730	82	+	chr2R	18219648	+	chr2R	18219730
ACGTAGCTTAAGAGCTTCATTCCCCCCAATACACACACACACACACACACTAACCCACACTCACATACACATACG:1	ACGTAGCTTAAGAGCTTCATTC	CCCACACTCACATACACATACG	-	chr2L	12765705	-	chr2L	17095665	4329960	+	chr2L	17095665	+	chr2L	12765705
GGTGAGTGGGTGACTTAACTTAGGCAATGATAAGCGATGGGGTGAGTGGTGGGGGATTGTGAGCGAAAAACAAA:1	GGTGAGTGGGTGACTTAACTTA	GGGATTGTGAGCGAAAAACAAA	+	chr2R	8948597	+	chr2R	18556490	9607893	+	chr2R	8948597	+	chr2R	18556490
TTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTGCTTACCTACGAATATCTTTGTTGCAC:1	TTATTTTGCTTTCCATCCATCG	CCTACGAATATCTTTGTTGCAC	+	chr3L	16971247	+	chr3L	16971325	78	+	chr3L	16971247	+	chr3L	16971325
ATAGATTAAAATGCAAACGCCTGTCAGTGGAGTGGATGCACTGAATTGACCACCCAGCTTGGCTAGCTTCT:1	ATAGATTAAAATGCAAACGCCT	CCACCCAGCTTGGCTAGCTTCT	+	chr2L	19712690	+	chr2L	19712770	80	+	chr2L	19712690	+	chr2L	19712770
ATGACATTTCATCGAGATTGCCCAACTATAAATAACAAAAGGGGGCTGCGAAGCAACGACACAGTTTTTAT:1	ATGACATTTCATCGAGATTGCC	GAAGCAACGACACAGTTTTTAT	-	chr2L	19502563	-	chr2L	17846356	1656207	+	chr2L	17846356	+	chr2L	19502563
GGCCAAGGTGAGAATTTTAAGCAAATGTGTNNNGNGAATATATCGAGGGGGCAACTGCAAGCAGTTGCTTTG:1	GGCCAAGGTGAGAATTTTAAGC	GCAACTGCAAGCAGTTGCTTTG	+	chr3L	19230393	+	chr3L	5991794	13238599	+	chr3L	19230393	+	chr3L	5991794
ATCTGCGTTTCGTGTTACTTAACATCTATTGGAATTCTTCATGGCGTGCCTTCGATAGCGTCGCCTGGTCCCGTG:1	ATCTGCGTTTCGTGTTACTTAA	GATAGCGTCGCCTGGTCCCGTG	+	chr3L	875684	+	chr3L	875771	87	+	chr3L	875684	+	chr3L	875771
TGCTTCCCAAGATTGTGGGGTTTTTCCAATGCCATCGAACTTTGAGGNCTGCGGATTCTAATTGCTTNTCAATT:1	TGCTTCCCAAGATTGTGGGGTT	GGATTCTAATTGCTTNTCAATT	-	chrX	12277272	-	chrX	12277182	90	+	chrX	12277182	+	chrX	12277272
AGTCAGCCAAAGGCACCGCAGCCAAAATGAGCTAGGGATGGCAAAGCGAGGAGACTAGAGATGACTTTCAAGCAG:1	AGTCAGCCAAAGGCACCGCAGC	ACTAGAGATGACTTTCAAGCAG	+	chr3L	5983832	+	chr3L	5983953	121	+	chr3L	5983832	+	chr3L	5983953
GATTAAAATTTACAATTTAATTGAGTATCTCTGTAGTGTAAGAAATGTTTTTGTATTCGCTTAACTTATTGA:1	GATTAAAATTTACAATTTAATT	TTGTATTCGCTTAACTTATTGA	+	chr2L	12693854	+	chr2L	12693928	74	+	chr2L	12693854	+	chr2L	12693928
ATTGATTTGCCTCACTCGAGCATGCCGAGCACGTTTCGTGAGCTGCAGCGGTGGGTGAGTAAGGGGGGTGTAAAT:1	ATTGATTTGCCTCACTCGAGCA	GGTGAGTAAGGGGGGTGTAAAT	-	chr2R	18880457	-	chr2R	18880372	85	+	chr2R	18880372	+	chr2R	18880457
CCCAAGCTGACTCGCCGATAAGGCGATGGGTTATAAAAACTATTCGCTACAG:1	CCCAAGCTGACTCGCCGATAAG	TTATAAAAACTATTCGCTACAG	+	chr2R	21910434	+	chr2R	21910503	69	+	chr2R	21910434	+	chr2R	21910503
CATCGAGTTTTTATGTAAGGCCACCCCAAACCCAGCGGAAGCAACACCCGCTGTGCCGCCACCA:1	CATCGAGTTTTTATGTAAGGCC	AACACCCGCTGTGCCGCCACCA	+	chrX	1954916	+	chrX	1962845	7929	+	chrX	1954916	+	chrX	1962845
CATATGGAGTGTTTTCATATATGTTTAGCTTTGAGCTCTTGCTAAATAGAGATACTAAGATTAATGCTTTTCCGT:1	CATATGGAGTGTTTTCATATAT	ACTAAGATTAATGCTTTTCCGT	-	chr3L	11744147	-	chr3L	11744039	108	+	chr3L	11744039	+	chr3L	11744147
TGNCACTATAGCCAAAGAACAAAAGATCCAAGGANTNCAACCAAAAAGTGCNTTGGAAGTTTTAGAGGTTTTCTT:1	TGNCACTATAGCCAAAGAACAA	TGGAAGTTTTAGAGGTTTTCTT	+	chr2R	21753089	+	chr2R	21753574	485	+	chr2R	21753089	+	chr2R	21753574
CTTTGGACGTGACGCAGTAATCGCGTTGGTNNNANGTAACACGATGGGCAAAAATTGTGGTGATCATTTGGAAA:1	CTTTGGACGTGACGCAGTAATC	AATTGTGGTGATCATTTGGAAA	+	chr3L	14245584	+	chr3L	14245677	93	+	chr3L	14245584	+	chr3L	14245677
CGGGGAAAACTAGGGAAGTGCAATAGAGAGGGCTTTAAAACTGCA:1	CGGGGAAAACTAGGGAAGTGCA	TAGAGAGGGCTTTAAAACTGCA	+	chr3L	3601328	+	chr3L	3606609	5281	+	chr3L	3601328	+	chr3L	3606609
TTTTTTATCGCTTTGTTCTATTTGGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	TTTTTTATCGCTTTGTTCTATT	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	12276886	+	chr2L	16217660	3940774	+	chr2L	12276886	+	chr2L	16217660
CTATTTTGATGTTTGCCATGCAACCGACAGCCACGTGTTTTTAGGCCTAGGGAAAGGACGTGGAAAGGA:1	CTATTTTGATGTTTGCCATGCA	TAGGGAAAGGACGTGGAAAGGA	-	chr3L	20021929	-	chr3L	5935927	14086002	+	chr3L	5935927	+	chr3L	20021929
CCCGGTCAACTTATTCCACTTCGTTTATTTCCAGACCGCAAAGCAAACGACGGTTTAGGCAATTTTCAATCCTCG:1	CCCGGTCAACTTATTCCACTTC	TTTAGGCAATTTTCAATCCTCG	+	chr2L	18883862	+	chr2L	18883944	82	+	chr2L	18883862	+	chr2L	18883944
AAAGAGAAACTTGGAGGGATTTCCACTAGAGCGTGTGATAAAATCAGTTGGTCAATCTGAGTTCACCATTCCAAG:1	AAAGAGAAACTTGGAGGGATTT	AATCTGAGTTCACCATTCCAAG	+	chrX	20312897	+	chrX	20312975	78	+	chrX	20312897	+	chrX	20312975
GAAAAGGGACAACAATTCCAACAAAAATCTGGAAAAAGGCCCGCTGGCTTCTGCA:1	GAAAAGGGACAACAATTCCAAC	AAAAGGCCCGCTGGCTTCTGCA	-	chr2R	22607103	-	chr2R	10653590	11953513	+	chr2R	10653590	+	chr2R	22607103
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13693028	8214506	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907534
ACCGGAAAATTGACAGCACCGGCACACCAGCTGTCTTCAGTGACAAGCTGTCGGGAAATTGAAAGGGGAATGA:1	ACCGGAAAATTGACAGCACCGG	CGGGAAATTGAAAGGGGAATGA	-	chr3R	15811746	-	chr3R	15811507	239	+	chr3R	15811507	+	chr3R	15811746
GGCGAAAAAAAAAGACGAAGAAAAAAGTACAATAAAAGCAAGAAAATCATGAAAGGCAAGAAAAGCGCGACGAA:1	GGCGAAAAAAAAAGACGAAGAA	AAGGCAAGAAAAGCGCGACGAA	+	chrX	4089305	+	chrX	8808585	4719280	+	chrX	4089305	+	chrX	8808585
AACTGCGCCAACAAGTAAGCGAACTGGAAGCGCTGCGCACACGCGATCAATCTGAATTGGAAGCACTGCGTCA:1	AACTGCGCCAACAAGTAAGCGA	CTGAATTGGAAGCACTGCGTCA	-	chrX	3958078	-	chrX	3957901	177	+	chrX	3957901	+	chrX	3958078
GCTGTTTTTGTTCTTTATTCAGTTATATCTTGTGCCTGCAAGACATATTTTAATTTGTCTTNTCTCCGCATAT:1	GCTGTTTTTGTTCTTTATTCAG	AATTTGTCTTNTCTCCGCATAT	+	chr3R	27342810	+	chr3R	27351389	8579	+	chr3R	27342810	+	chr3R	27351389
CGCAAATCCTTTTGCTGACAGTGGGGAAANGGCCCACATTATCGCGATTGATGCACTTAANAAAGTTAGATATAA:1	CGCAAATCCTTTTGCTGACAGT	CACTTAANAAAGTTAGATATAA	+	chr3L	2674788	+	chr3L	2674869	81	+	chr3L	2674788	+	chr3L	2674869
CTTTCATTNATGTTTTTGTATTGCGTTAGCTAAATAANNNNAGTCGAGCCGCTATCTTTCGNCCAACTCTTTC:1	CTTTCATTNATGTTTTTGTATT	CTATCTTTCGNCCAACTCTTTC	-	chr3L	3368778	-	chr3L	13922694	10553916	+	chr3L	13922694	+	chr3L	3368778
TTTCGAGGTCCTGTCGAAAAACGAGACCTGAGACATATTTTCAGAGCTACATGTTTCA:1	TTTCGAGGTCCTGTCGAAAAAC	ATTTTCAGAGCTACATGTTTCA	-	chr3R	31643056	-	chr3R	31642828	228	+	chr3R	31642828	+	chr3R	31643056
ATGGGGGNATGCTGGGGCGCCACCCGCACCCAAATCGTANTTTACCAATTTCATTATNAACTTTGATAGAAATCA:1	ATGGGGGNATGCTGGGGCGCCA	TTATNAACTTTGATAGAAATCA	-	chr3R	8471162	-	chr3R	26097984	17626822	+	chr3R	26097984	+	chr3R	8471162
CATTGAACCGCCCATAATCCCTCTGACAATGTGTGTTCTACTTTTTTCGGGTCAACGCTTCGGGGCCTCGAGAAC:1	CATTGAACCGCCCATAATCCCT	AACGCTTCGGGGCCTCGAGAAC	-	chr3L	5926518	-	chr3L	5926328	190	+	chr3L	5926328	+	chr3L	5926518
ATGTCTACTGACAATAAATCCAAGCAATACAAAAGGGATGTGGGATACCTCCAATCTTCTGGCAATGAGTCAA:1	ATGTCTACTGACAATAAATCCA	CAATCTTCTGGCAATGAGTCAA	-	chr2R	5463465	-	chr2R	5463149	316	+	chr2R	5463149	+	chr2R	5463465
AGCCAAAAAGTGAACGCAACAACTACAAAGACCAAGATACACAATGAGAAAAAAAAGACTTGCCAAAACTAAAGA:1	AGCCAAAAAGTGAACGCAACAA	AAAGACTTGCCAAAACTAAAGA	+	chrX	4150618	+	chrX	12445469	8294851	+	chrX	4150618	+	chrX	12445469
CCCAGACACAGAGACGGATAGTCGAAAGCATCCTGAGATCTAGACAG:1	CCCAGACACAGAGACGGATAGT	AAGCATCCTGAGATCTAGACAG	+	chr3R	5629030	+	chr3R	12036362	6407332	+	chr3R	5629030	+	chr3R	12036362
ATATNATTTCGGAGTTCTCAAANCGGANGATCTGCAGATNTTNGCTCCGCTTTCAAGGATTCATCTCCAGACTGA:1	ATATNATTTCGGAGTTCTCAAA	CAAGGATTCATCTCCAGACTGA	-	chr2L	19541734	-	chr2L	19541649	85	+	chr2L	19541649	+	chr2L	19541734
TAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTGTGGTTGTCTGCCGAATAGCCTTACTCTTACCTTGTTTGCTGCATTTGG:1	TAAAGAGAAATTAAATGTTAAA	TTACCTTGTTTGCTGCATTTGG	-	chr2R	13141638	-	chr2R	13136840	4798	+	chr2R	13136840	+	chr2R	13141638
TACCTCCATCAGATAATTTTTGTTTGCTCTTTAATGTAATCACGTGGCCGGGCTGCAGCGAACACCAT:1	TACCTCCATCAGATAATTTTTG	GCCGGGCTGCAGCGAACACCAT	-	chr3R	20787532	-	chr3R	20787448	84	+	chr3R	20787448	+	chr3R	20787532
AAGCAACCAAGCACCCAAGTACCCCTCACCGCGGTTTTTCCAG:1	AAGCAACCAAGCACCCAAGTAC	CCCCTCACCGCGGTTTTTCCAG	+	chrX	15740084	+	chrX	11785407	3954677	+	chrX	15740084	+	chrX	11785407
AAATAATCCCCCAAAATATATGCATACACATTGGTTTATAATGAAAATATTCGTTTTC:1	AAATAATCCCCCAAAATATATG	TATAATGAAAATATTCGTTTTC	-	chr3R	20272991	-	chr3R	20266537	6454	+	chr3R	20266537	+	chr3R	20272991
ATTAAATCAATAATAATAAACAATCTTACATACACATACACTGCTGTGCGTTGTACGCACATGTGG:1	ATTAAATCAATAATAATAAACA	TGTGCGTTGTACGCACATGTGG	+	chr3R	22873109	+	chr3R	27400044	4526935	+	chr3R	22873109	+	chr3R	27400044
AGGCGTTTCTGCATCTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTT:1	AGGCGTTTCTGCATCTCTGGAT	TTCCACAAGCCGGCGCTGCTTT	-	chr2R	12187494	-	chr2R	12190110	2616	+	chr2R	12190110	+	chr2R	12187494
GCTGGAAAGCAATTTAGCAAGTGTCAAAAACTCCGAATCCCGGCTGTGTNAACAATGAAA:1	GCTGGAAAGCAATTTAGCAAGT	CCCGGCTGTGTNAACAATGAAA	-	chr3R	5948750	-	chr3R	5948671	79	+	chr3R	5948671	+	chr3R	5948750
CTTGCTGGGGTCGTGGGAAAATCCTGCCCAGCCGAACACCTGAACCTTGTTCGTCCTGTGCCCTTGGGCCCGTGC:1	CTTGCTGGGGTCGTGGGAAAAT	TCCTGTGCCCTTGGGCCCGTGC	+	chr2L	10862840	+	chr2L	10864454	1614	+	chr2L	10862840	+	chr2L	10864454
CAGCGCCGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAGA:1	CAGCGCCGGCTTGTGGAACACA	ACGAGATGGCTAAGCATCCAGA	+	chr2R	12190114	+	chr2R	12187479	2635	+	chr2R	12190114	+	chr2R	12187479
CTTACCAAATGTCAGTCAAATTAAAATACCCGCAGTCGGGGTAGAAAAAGGTCAAAAAGCCAAGAGATTGAAATA:1	CTTACCAAATGTCAGTCAAATT	AAAAAGCCAAGAGATTGAAATA	+	chr3R	8081149	+	chr3R	8081227	78	+	chr3R	8081149	+	chr3R	8081227
TATTGCATGCTATTTGGCCTGCATGGCGGAACATTTATTACGCCGGCCTATTGTTTAGGGCCCGCTGAACCATTC:1	TATTGCATGCTATTTGGCCTGC	TTTAGGGCCCGCTGAACCATTC	-	chr2L	19697249	-	chr2L	19697156	93	+	chr2L	19697156	+	chr2L	19697249
ATAGAAATGTCAAAAGAAATTAGCAAGAAACCAAAGGCAATCAAAGCTATTTAAGTTTTAGGAAACACATATTTG:1	ATAGAAATGTCAAAAGAAATTA	AGTTTTAGGAAACACATATTTG	-	chr3L	12004800	-	chr3L	2173028	9831772	+	chr3L	2173028	+	chr3L	12004800
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:2	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831802	6924268	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907534
TGTTTCTTCCGATCCCACACGCCACCCACTGAGCACCCTGACCTCTACGC:1	TGTTTCTTCCGATCCCACACGC	CTGAGCACCCTGACCTCTACGC	+	chr2R	10671284	+	chr2R	10671337	53	+	chr2R	10671284	+	chr2R	10671337
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAAC:2	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACACCACAAC	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
GAACTTGNCCTAAATTCTTAGACCATAATCTTGGATTGTCATTACNTAACTTAGACAA:1	GAACTTGNCCTAAATTCTTAGA	TGTCATTACNTAACTTAGACAA	-	chr3L	25633271	-	chr3L	25628517	4754	+	chr3L	25628517	+	chr3L	25633271
AAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATATATCATTTTTTTTGCGGAGCGAAAGGCTGCCTT:1	AAATTAATTAGTTACTAATGCG	TTGCGGAGCGAAAGGCTGCCTT	-	chr2L	22724120	-	chr2L	22724029	91	+	chr2L	22724029	+	chr2L	22724120
ACCTGGTTGTTGAAACTCTCNAGAATTCTGGTNTGGCTGCCGNAATCCTCCAGTACTCTGGC:1	ACCTGGTTGTTGAAACTCTCNA	CGNAATCCTCCAGTACTCTGGC	-	chr2R	17138274	-	chr2R	17138204	70	+	chr2R	17138204	+	chr2R	17138274
AGGGAAATACCATGTAAGTAAATTTACTTGTCTTTAGTCTGTTTCTTCCTTCTGAGCAA:1	AGGGAAATACCATGTAAGTAAA	TCTGTTTCTTCCTTCTGAGCAA	-	chr3L	15466119	-	chr3L	15466053	66	+	chr3L	15466053	+	chr3L	15466119
AATCGCGATGCGGATGAGCCAATCCAGGACATCTATCATCTCGAGGCGATCTGGCCAAGAGCCGTGAGGCTGC:1	AATCGCGATGCGGATGAGCCAA	TGGCCAAGAGCCGTGAGGCTGC	+	chr3L	6280111	+	chr3L	6279425	686	+	chr3L	6280111	+	chr3L	6279425
GAGAGAGGCATGTCTGTCTTTTTCGGCGATCTAAACTTAATGTGCAGAATAAACGTTGTAATAA:1	GAGAGAGGCATGTCTGTCTTTT	TGCAGAATAAACGTTGTAATAA	+	chr2L	22490511	+	chr2L	22497636	7125	+	chr2L	22490511	+	chr2L	22497636
GATGTGCCAAGTATCTAGGCGTGTCAGCACAAATAAAAAACATATAATCGA:1	GATGTGCCAAGTATCTAGGCGT	CAAATAAAAAACATATAATCGA	-	chr3R	26907466	-	chr3R	26907395	71	+	chr3R	26907395	+	chr3R	26907466
TATATATTAATTTTTTTAGTGTCACATAAATACCTCTATTTCTCCAACACAGACAGGACCCACGATGGTCGAAGG:1	TATATATTAATTTTTTTAGTGT	CAGGACCCACGATGGTCGAAGG	+	chr3L	24324463	+	chr3L	12898126	11426337	+	chr3L	24324463	+	chr3L	12898126
TTAGCTTCAGTTTGTCCTGTCACTTGTNGTNNTGGCCTTTAGCTTGTTTNGNCTCGTCTGTTCACTTTGCTGCGG:1	TTAGCTTCAGTTTGTCCTGTCA	TCGTCTGTTCACTTTGCTGCGG	+	chr3R	17845215	+	chr3R	17845292	77	+	chr3R	17845215	+	chr3R	17845292
TCAAATGGAATGCCAGCTTCAGCTTCAGCTTCCTCTCCGCTCATTTTTACATCGCCTGTT:1	TCAAATGGAATGCCAGCTTCAG	GCTCATTTTTACATCGCCTGTT	+	chrX	8219398	+	chrX	8219486	88	+	chrX	8219398	+	chrX	8219486
TTTACTTTTTAAGGGCTTCCTTTGATTAGGCGCTCTGGGTGTTTGCATAAAGTTAATTAA:1	TTTACTTTTTAAGGGCTTCCTT	GTGTTTGCATAAAGTTAATTAA	-	chr2R	19077806	-	chr2R	17355034	1722772	+	chr2R	17355034	+	chr2R	19077806
TATCCTTTATTTTATTCCCAAGATCAGTTTTTACCTCTCTGCGCTGCGTGGACGACGACTCTATAGCCGGCGGCA:1	TATCCTTTATTTTATTCCCAAG	GACGACTCTATAGCCGGCGGCA	+	chr2R	13905626	+	chr2R	13907608	1982	+	chr2R	13905626	+	chr2R	13907608
CAACTTGGCAGCAGTCAACACACAAAAGCCCAAAGGACTAAGGACCCGTTGTCATATCGCGCCAGCAACGCCC:1	CAACTTGGCAGCAGTCAACACA	TCATATCGCGCCAGCAACGCCC	-	chr3R	8501014	-	chr3R	7610570	890444	+	chr3R	7610570	+	chr3R	8501014
ACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1	ACACAACACAACACACCACAAC	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
AAGTCTTACGATAAGAATGGGTTAACTAATTAAGTGAACTCACTTCAACTCGT:1	AAGTCTTACGATAAGAATGGGT	AAGTGAACTCACTTCAACTCGT	-	chr3L	8796689	-	chr3L	8791291	5398	+	chr3L	8791291	+	chr3L	8796689
AGAACTATAGTTCATCTTATCAGCCACAAGTTAGGGTAGCTAACTTGCAGAAATCTTGATAAGTAACAGGTAATC:1	AGAACTATAGTTCATCTTATCA	TCTTGATAAGTAACAGGTAATC	-	chr2R	8714806	-	chr2R	8714719	87	+	chr2R	8714719	+	chr2R	8714806
TTATATTTTAAAATAAGAAGAGTACAAATATAACCATAAATTATTAANGCCCGACAGTTTCACAGCCNAAATGCT:1	TTATATTTTAAAATAAGAAGAG	ACAGTTTCACAGCCNAAATGCT	+	chr3R	7396385	+	chr3R	7396488	103	+	chr3R	7396385	+	chr3R	7396488
ATTTCACCCAAGGCTGAGCCGCCATCGCCATTCACACAACTATTCGCAGTTAAGCCGTCCAAGGCCATCTGCATT:1	ATTTCACCCAAGGCTGAGCCGC	GCCGTCCAAGGCCATCTGCATT	-	chr3L	19137748	-	chr3L	19137629	119	+	chr3L	19137629	+	chr3L	19137748
GAGGCATTTCATTTAGAAAANTCTCTTGTAGCNAAACGGCAGNATTCATTTTTCACGGAAACATTCCAATGGCAA:1	GAGGCATTTCATTTAGAAAANT	CACGGAAACATTCCAATGGCAA	+	chr2L	5153860	+	chr2L	1556351	3597509	+	chr2L	5153860	+	chr2L	1556351
CCCATGCCGTCCGCGATCTAAAGACACTTCCATGGATATTCTCGGCA:1	CCCATGCCGTCCGCGATCTAAA	ACTTCCATGGATATTCTCGGCA	-	chr2R	4603199	-	chr2R	4602872	327	+	chr2R	4602872	+	chr2R	4603199
GTTATCAATCAATAATAACAATAAAGGGGTGGAAAGAAAAAATATACTGAAAAAATGAGCGAAATCAATTATGCA:1	GTTATCAATCAATAATAACAAT	AATGAGCGAAATCAATTATGCA	-	chr2L	12735839	-	chr2L	12731072	4767	+	chr2L	12731072	+	chr2L	12735839
TATTTTATAGAAGGTTTCTCCCTTTCCCATGACAACATTATGTCCAANTGATG:1	TATTTTATAGAAGGTTTCTCCC	ACAACATTATGTCCAANTGATG	-	chr2L	7867656	-	chr2L	7867584	72	+	chr2L	7867584	+	chr2L	7867656
AACAAATCGACAGGAAAGACACGTATTACAGGCAGCACTAACTTACTTACTATATAGACTATCATTNATGTTTC:1	AACAAATCGACAGGAAAGACAC	TATAGACTATCATTNATGTTTC	+	chr2L	12487889	+	chr2L	12487969	80	+	chr2L	12487889	+	chr2L	12487969
TTCCCCTCTATTTTTGTAATCAGCAGTTTAGCTCAACAATGGTAGCATATGAGGGCAGAACTCTAAACTGATAA:1	TTCCCCTCTATTTTTGTAATCA	GGGCAGAACTCTAAACTGATAA	-	chr2R	21721683	-	chr2R	21721596	87	+	chr2R	21721596	+	chr2R	21721683
AACCGAGATTCTCACGCCTCTTGTATATAAATGGGTATTGTATATATATATCAGTTTTACTCCCATTTCCCCACA:1	AACCGAGATTCTCACGCCTCTT	GTTTTACTCCCATTTCCCCACA	-	chr3L	1741121	-	chr3L	1740876	245	+	chr3L	1740876	+	chr3L	1741121
CAGCTAAAAGTAATTAACTCATTCATTAATCCTCATTAATTCGTTTTGCATTCCCTTTAATTGCAGGTACTCCGA:1	CAGCTAAAAGTAATTAACTCAT	CCTTTAATTGCAGGTACTCCGA	-	chr3R	26951998	-	chr3R	26951890	108	+	chr3R	26951890	+	chr3R	26951998
TGTTAATAATGGACATACAAAAGTATGGTTCAATTAGCCTATGTATAATTTAAAAGCCCAAGTTTTGGATGGCGA:1	TGTTAATAATGGACATACAAAA	AAGCCCAAGTTTTGGATGGCGA	+	chr3L	22137541	+	chr3L	22137618	77	+	chr3L	22137541	+	chr3L	22137618
TGGCTGCTCGCATATTTTTGTGGCTAACAATCCCTTTTTTGTTTTTTTCTTTATTTT:1	TGGCTGCTCGCATATTTTTGTG	TTTTTGTTTTTTTCTTTATTTT	+	chr3R	8949918	+	chr3R	24609964	15660046	+	chr3R	8949918	+	chr3R	24609964
CAAGTATTTAAACAAACAAGGCGGAAACACATAAACAAAATTCCATAAGGGAGGCATTTTCCATTAAGCCTGTCA:1	CAAGTATTTAAACAAACAAGGC	GCATTTTCCATTAAGCCTGTCA	+	chr2L	7493676	+	chr2L	7493887	211	+	chr2L	7493676	+	chr2L	7493887
TATATTTCAATCTCTTGGCTTTTTGACCTTTTTCTACCCCGACTNCGGGTATTTTAATTTGACTGACATTT:1	TATATTTCAATCTCTTGGCTTT	TATTTTAATTTGACTGACATTT	-	chr3R	8081229	-	chr3R	8081155	74	+	chr3R	8081155	+	chr3R	8081229
TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	28831802	-	chr3R	21907535	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
CTTANATTGTCAAAGAGCGTTTNCTGANAAATTGTTTCANAGTTCAAAGTTTTCCACAAATCTTCAGGGAGTTTC:1	CTTANATTGTCAAAGAGCGTTT	CCACAAATCTTCAGGGAGTTTC	+	chr3L	17580598	+	chr3L	17580774	176	+	chr3L	17580598	+	chr3L	17580774
GGCAGCAGTCCTGGCGACATTGCTTCACACTGCTATTTCGTCCTCGGCACTCTTTCATTCCGAACTCAATACGGT:1	GGCAGCAGTCCTGGCGACATTG	TTCATTCCGAACTCAATACGGT	-	chr2L	2667718	-	chr2L	2667639	79	+	chr2L	2667639	+	chr2L	2667718
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
TACATAAAATCCAACAATTCAGAACTTACTCTTGACAACATTAATATTTTCAACAATATCATTTTATTATCATTT:1	TACATAAAATCCAACAATTCAG	CAATATCATTTTATTATCATTT	-	chr3R	3590117	-	chr3R	25693608	22103491	+	chr3R	25693608	+	chr3R	3590117
ATGGAGTACTACTGCTTTTTCCCGCTTTCATGGTNGTTCACTTTGGTGCCCAAATTGCTTCCGAAATCAACCAGA:1	ATGGAGTACTACTGCTTTTTCC	ATTGCTTCCGAAATCAACCAGA	-	chr3R	28571278	-	chr3R	28571184	94	+	chr3R	28571184	+	chr3R	28571278
ACAGACGCTTGCCACACAGGGCATTCCCGCCATCCGTCCTGATTCTGTGGCACTCTTCTG:1	ACAGACGCTTGCCACACAGGGC	CTGATTCTGTGGCACTCTTCTG	+	chr2R	12540490	+	chr2R	12540558	68	+	chr2R	12540490	+	chr2R	12540558
CTGGGAAAGTCTTGATCTATAGTTTACCTGGCTACTTGAGATCGTTGCGTGGCAAGTTGAGGTGGTGGTTGGG:1	CTGGGAAAGTCTTGATCTATAG	GCAAGTTGAGGTGGTGGTTGGG	-	chr3L	5592294	-	chr3L	571609	5020685	+	chr3L	571609	+	chr3L	5592294
AACGAAGCGTCACTTATATGAAATCTTAATTATCTGGCTCAGCAAGCGTAAAAAGGCAAATGGGGGCTTTTGGAG:1	AACGAAGCGTCACTTATATGAA	AGGCAAATGGGGGCTTTTGGAG	+	chr3L	19848511	+	chr3L	19857701	9190	+	chr3L	19848511	+	chr3L	19857701
TGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTGTCTTTTCTTNTCTTGTCTTGTCTTGTCTTGGCTTTTGTTTTCTTTTCTTT:1	TGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTC	TGGCTTTTGTTTTCTTTTCTTT	-	chrX	16983077	-	chrX	8781997	8201080	+	chrX	8781997	+	chrX	16983077
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTNGTGTTGGGTTGAGTTGTGGTGTGGTGTGTTGTGGTGTG:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TGGTGTGGTGTGTTGTGGTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	27505848	5598313	+	chr3R	27505848	+	chr3R	21907535
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTATTGTTGCCATATCGCTGCAT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TATTGTTGCCATATCGCTGCAT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	13014521	8893015	+	chr3R	13014521	+	chr3R	21907536
AAGATATATAATACTTACATAAAAGCGGTGAAATTTTATTTCCGGTGCAGCAACGTGCCTCGATTTGTTGCTTTT:1	AAGATATATAATACTTACATAA	CGTGCCTCGATTTGTTGCTTTT	+	chr2R	10563277	+	chr2R	10563375	98	+	chr2R	10563277	+	chr2R	10563375
AACTATTTGCACAGCCGCTGAGTGTTGATTGGTTGAGTGATACAGAAGTACAATATCCATGAGTCGAA:1	AACTATTTGCACAGCCGCTGAG	AGTACAATATCCATGAGTCGAA	-	chr3L	10099190	-	chr3L	10099112	78	+	chr3L	10099112	+	chr3L	10099190
GCTCGCCCAAAGCTTTTTCTAAAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCAAACAA:1	GCTCGCCCAAAGCTTTTTCTAA	AATTCGTTGGCATGCCAAACAA	-	chr2L	1227606	-	chr2L	1220152	7454	+	chr2L	1220152	+	chr2L	1227606
GGTTTCTTGAAACGCCCAGTAAGTGGAAATTTTCNTACCCATGTCTGTTGATATGCCGCCGTATTGTGTTAAATC:1	GGTTTCTTGAAACGCCCAGTAA	TGCCGCCGTATTGTGTTAAATC	+	chr3R	9341160	+	chr3R	16725271	7384111	+	chr3R	9341160	+	chr3R	16725271
ATATGTAATATCGGAGATTTAAAGCTANNAAGGCTAGTAAAACCAGCAGTGGCGCCGATGTCC:1	ATATGTAATATCGGAGATTTAA	ACCAGCAGTGGCGCCGATGTCC	+	chr2L	22192236	+	chr2L	22192618	382	+	chr2L	22192236	+	chr2L	22192618
ACCACAAATCTGCGGGTCATAAGCCGCTCCTTGGGAGCTTACGAGTC:1	ACCACAAATCTGCGGGTCATAA	GCTCCTTGGGAGCTTACGAGTC	+	chr3L	15878704	+	chr3L	15878757	53	+	chr3L	15878704	+	chr3L	15878757
AGTTATATCGCCAGCCCCACTGTTTGCTCTCCTTCTTGGACCACTAATANGCGTCTGGCTTTTGTAATTATAACA:1	AGTTATATCGCCAGCCCCACTG	TCTGGCTTTTGTAATTATAACA	+	chr3L	10414966	+	chr3L	10417338	2372	+	chr3L	10414966	+	chr3L	10417338
TCGCACGTNCGACGCTTGCGAAAAAAAAATTGAAANTATATATATACATATATTGCGAAGAGAGGGGCCCAGCCA:1	TCGCACGTNCGACGCTTGCGAA	TGCGAAGAGAGGGGCCCAGCCA	-	chr2L	7984072	-	chr2L	7977097	6975	+	chr2L	7977097	+	chr2L	7984072
AGGTAAATAGCAATGTATTGTANCAAAAGAATTGCACATTGCCAAACTGAACCAAAATAATACATTTAAATATCA:1	AGGTAAATAGCAATGTATTGTA	AAAATAATACATTTAAATATCA	+	chrX	3513781	+	chrX	3513864	83	+	chrX	3513781	+	chrX	3513864
AGAACGCAGCATACCGCTTTGTCTGATTCTGATTCGACTTATCAGTACGCGGTCCACAGCTTAAATTAAATCCAT:1	AGAACGCAGCATACCGCTTTGT	CCACAGCTTAAATTAAATCCAT	-	chr3L	22909136	-	chr3L	22909045	91	+	chr3L	22909045	+	chr3L	22909136
AAATGTTAGATGAGTGTACTAAGTGCCTCTCGAGTTTTTCTCTCTGTGTGCCTGTCCCNAAGCCGA:1	AAATGTTAGATGAGTGTACTAA	TGTGTGCCTGTCCCNAAGCCGA	-	chr2R	11102947	-	chr2R	11102874	73	+	chr2R	11102874	+	chr2R	11102947
TTCTTAATNTAATGTTAAATATATCTTACCAAATANCAAACTTTTATACCATCAAATTTTAACAAGTTTTGGATA:1	TTCTTAATNTAATGTTAAATAT	AAATTTTAACAAGTTTTGGATA	+	chr3R	4764659	+	chr3R	18869488	14104829	+	chr3R	4764659	+	chr3R	18869488
ATTTGGCATTGTTCAACAACCCAGTCGAACATATTTCATGTGAATCGCCCCCGAGTACCTGAGCCTCAAAACTGA:1	ATTTGGCATTGTTCAACAACCC	AGTACCTGAGCCTCAAAACTGA	+	chr2L	8789337	+	chr2L	8789413	76	+	chr2L	8789337	+	chr2L	8789413
GGGTTATATTTTCAAATGCCAGAAGCTCTTATGCATTTGGTTTTTTAACTAAAGTATTTGGTTTTATNTTGCGA:1	GGGTTATATTTTCAAATGCCAG	AGTATTTGGTTTTATNTTGCGA	-	chr2R	14399025	-	chr2R	14394237	4788	+	chr2R	14394237	+	chr2R	14399025
ATACATTTCTGCAGCACAGACGCCGCGCAGTAAAAAAAAAAAGTGCATGCAATGCACTGGGTTTCTAAGCTGCT:1	ATACATTTCTGCAGCACAGACG	TGCACTGGGTTTCTAAGCTGCT	+	chr3L	10654136	+	chr3L	10654222	86	+	chr3L	10654136	+	chr3L	10654222
GGCTTATACTTTTGTTGGTTGAACAACGTTTTATTTGATTTCATTTCTCTCTTTCATTATTTATAATTAGGAAAA:1	GGCTTATACTTTTGTTGGTTGA	TCATTATTTATAATTAGGAAAA	+	chr3R	18618275	+	chr3R	18618360	85	+	chr3R	18618275	+	chr3R	18618360
CCCGGGTAGCCCAGACGTGTGCCACGCCCCTCCAAACGTTTCCGCCCACCGAAACTCTGGCCCGCATTTTATTTC:1	CCCGGGTAGCCCAGACGTGTGC	ACTCTGGCCCGCATTTTATTTC	-	chr3L	5372223	-	chr3L	16641267	11269044	+	chr3L	16641267	+	chr3L	5372223
TTTGACCCAAAAATGTCAGCGGGACATGAATTATCACTCCCGCCAATGCCAGCCGTCGCCAAAACGAGGGGAGG:1	TTTGACCCAAAAATGTCAGCGG	CCGTCGCCAAAACGAGGGGAGG	-	chr2L	6882996	-	chr2L	6876806	6190	+	chr2L	6876806	+	chr2L	6882996
GGCGTCTAGAATTATGTGCCACGGCTGACAACTGACTGTGCAATCAATTAGCGAATCGCATGTGG:1	GGCGTCTAGAATTATGTGCCAC	TCAATTAGCGAATCGCATGTGG	-	chr3L	16818021	-	chr3L	16817891	130	+	chr3L	16817891	+	chr3L	16818021
TTCGTCCAACGATGAGGTGTCGAGGGTGAGTGGTAGAGTTTGAATAAATACAGTTTTAGAAATTGTAAAAATCA:1	TTCGTCCAACGATGAGGTGTCG	GTTTTAGAAATTGTAAAAATCA	+	chr3R	14194430	+	chr3R	14203578	9148	+	chr3R	14194430	+	chr3R	14203578
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831802	6924268	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907534
TTTCCACGNCATAACGCTGGTAATTGCCATATACCNTGCACCATGCACCATTCCATACCATGCAAATNTGGGTTA:1	TTTCCACGNCATAACGCTGGTA	CATACCATGCAAATNTGGGTTA	-	chr3R	27542038	-	chr3R	27541957	81	+	chr3R	27541957	+	chr3R	27542038
GCTCTTAGTCAACTGCATATTCTATGTAATGTCATCCAAGTCAATATTAAATTGAAGCAATTAAATATAGAAAA:1	GCTCTTAGTCAACTGCATATTC	TGAAGCAATTAAATATAGAAAA	-	chr2R	24636998	-	chr2R	24636913	85	+	chr2R	24636913	+	chr2R	24636998
TATCCCTTTCTCATCCTCTGAGCCTGTCCTTTTCCGCTACCGCATTCCACACCCGCCTAAACGTGGGAGAACAGC:1	TATCCCTTTCTCATCCTCTGAG	CGCCTAAACGTGGGAGAACAGC	+	chr2R	21593573	+	chr2R	21594283	710	+	chr2R	21593573	+	chr2R	21594283
CCACTCACCCAGTTATATAACCCCACAGAATTTCCTTCACTTCCTTTTCCGCGCAATGCCCGTGGACATACTT:1	CCACTCACCCAGTTATATAACC	CGCAATGCCCGTGGACATACTT	-	chr3L	9111947	-	chr3L	19547185	10435238	+	chr3L	19547185	+	chr3L	9111947
GTAGCAGATGATGAACAGCTAGTAGAGAACTAAGAGCGGTTTCGAGCNGGGAGAGTTGTATNATATCATCGACAA:1	GTAGCAGATGATGAACAGCTAG	AGTTGTATNATATCATCGACAA	+	chr3R	5397954	+	chr3R	4127734	1270220	+	chr3R	5397954	+	chr3R	4127734
TATATGTGTATATGTATATGTATATGCAATAGGCAACTAAAACCACCCCAGGCCCCTCCCTCGATTCCCACCA:1	TATATGTGTATATGTATATGTA	GCCCCTCCCTCGATTCCCACCA	-	chrX	22752001	-	chrX	18927426	3824575	+	chrX	18927426	+	chrX	22752001
CTCTTGTGAACTCTGATCTACGAACATTAAGTTCATGGCAAATGTCATTAAAAATCGTTTAACGAAACCTAAAG:1	CTCTTGTGAACTCTGATCTACG	AATCGTTTAACGAAACCTAAAG	-	chr2L	4166459	-	chr2L	4166377	82	+	chr2L	4166377	+	chr2L	4166459
GTGTTTTTTATGTTATTTGAATATGATTAGCCGCCCAGATACGAAGCAAACATGTCTGGGGATGGACGTGGAAAT:1	GTGTTTTTTATGTTATTTGAAT	GTCTGGGGATGGACGTGGAAAT	+	chr2L	2271574	+	chr2L	7332332	5060758	+	chr2L	2271574	+	chr2L	7332332
GCTAATTAGATTAAGGTTGAAGGACTTCTTGGCCTCCAGATATTTTATTCTATATTAATGATATGAATATGAACA:1	GCTAATTAGATTAAGGTTGAAG	ATTAATGATATGAATATGAACA	+	chr3L	3889134	+	chr3L	3889217	83	+	chr3L	3889134	+	chr3L	3889217
CATGCACATTATGCAGCTAATCGAAGGGAAAGTGTATACAATTTCGTTGTAGTCATAAAATGTAATTAATTAACT:1	CATGCACATTATGCAGCTAATC	CATAAAATGTAATTAATTAACT	-	chrX	14813835	-	chrX	14813757	78	+	chrX	14813757	+	chrX	14813835
TAACTGGAGTTGAAGCAACTCAATTTGGCGAAAGGAAAATCTTTTAACCTAAAGACTGTAGGACAATNAATTC:1	TAACTGGAGTTGAAGCAACTCA	AAGACTGTAGGACAATNAATTC	+	chr2L	18408027	+	chr2L	18412809	4782	+	chr2L	18408027	+	chr2L	18412809
TAAAATACTATAAATGCTTTTCCCTTGACAATATTGACTTTCCATTTTCCACAATAATTTCTTGTCATGCCCAC:1	TAAAATACTATAAATGCTTTTC	AATAATTTCTTGTCATGCCCAC	-	chr2R	9329019	-	chr2R	9328918	101	+	chr2R	9328918	+	chr2R	9329019
AGGGTCCGAGAGGGCTCATTCCCATCAATGTGGTTGATCCACCCGAGCCGAAAGAGGAAGAACAACCGAGCAGGA:1	AGGGTCCGAGAGGGCTCATTCC	GAGGAAGAACAACCGAGCAGGA	+	chr3R	5104165	+	chr3R	5104436	271	+	chr3R	5104165	+	chr3R	5104436
GTATCACTTGCTCATCAGGAAAAAATAAGAGAACGAAGAAGTGAAGAGTGAAGAGGAGGGGCTCCGCAATTCAC:1	GTATCACTTGCTCATCAGGAAA	GAGGAGGGGCTCCGCAATTCAC	-	chr2L	18002296	-	chr2L	18002134	162	+	chr2L	18002134	+	chr2L	18002296
TTAATACATCATTCAAAAGTTCCAACTATGAATTCAAAGAAAATCCAATTGAAAAACGTCAACAAATCACAAGAC:1	TTAATACATCATTCAAAAGTTC	AAACGTCAACAAATCACAAGAC	-	chrX	3881407	-	chrX	3881268	139	+	chrX	3881268	+	chrX	3881407
GGCATTGACAGCATGCAGGATAACACACACACACATCCACTCAAACTCACACACAGACGCAGACTCACACACACA:1	GGCATTGACAGCATGCAGGATA	CAGACGCAGACTCACACACACA	-	chr2R	13400074	-	chr2R	20911323	7511249	+	chr2R	20911323	+	chr2R	13400074
AGAATTGAACACGTATATTGAATTGCGACTAATCAATACTATCTCAGATCCACAAGATTCACTACTTCGTACTAA:1	AGAATTGAACACGTATATTGAA	AAGATTCACTACTTCGTACTAA	-	chr3R	15594737	-	chr3R	15594654	83	+	chr3R	15594654	+	chr3R	15594737
GTNGCACGTTCACTACACACACCCACCCACCCATNANTACTAACGTTAACTAACACCTGTTTTTAATGCATCACT:1	GTNGCACGTTCACTACACACAC	CACCTGTTTTTAATGCATCACT	+	chr3R	26600931	+	chr3R	26601016	85	+	chr3R	26600931	+	chr3R	26601016
TACGCTCTATTCTTTTCCACAAATATTAAAATATTAAGTTCTGCTTTCAAATGGAACGTTGAATAATATTCTGCT:1	TACGCTCTATTCTTTTCCACAA	GAACGTTGAATAATATTCTGCT	+	chrX	3297273	+	chrX	3297362	89	+	chrX	3297273	+	chrX	3297362
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGGGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907536
TGATTTGCCTAAGTTGTAAACGTGGTACAGCCTAGTATAGTATGGTAAATGCAATTTATTTTTATTTA:1	TGATTTGCCTAAGTTGTAAACG	AAATGCAATTTATTTTTATTTA	-	chr3R	5823551	-	chr3R	5822391	1160	+	chr3R	5822391	+	chr3R	5823551
AGTTTTCTGCTTGAAAGTCATCTCTAGTCTCCTCACTTTGCCATCCCTAGCTCATTTTGGCTG:1	AGTTTTCTGCTTGAAAGTCATC	CATCCCTAGCTCATTTTGGCTG	-	chr3L	5983959	-	chr3L	5983850	109	+	chr3L	5983850	+	chr3L	5983959
AATCCATTGCAGTAAATATCAGTATAATACTGTATGAAACATGGTAAGTGATATTGTACGACACACTGAGA:1	AATCCATTGCAGTAAATATCAG	GATATTGTACGACACACTGAGA	+	chr2R	19536483	+	chr2R	19536561	78	+	chr2R	19536483	+	chr2R	19536561
TTGCATGGGGGAGATCATGTGACCTGACAACAGCGACGCGACATTTCACTTGAGCAGGCTGCCAAAAACCAATGA:1	TTGCATGGGGGAGATCATGTGA	GCAGGCTGCCAAAAACCAATGA	+	chr3L	9061142	+	chr3L	9061250	108	+	chr3L	9061142	+	chr3L	9061250
TAATCGCCAAACAATTTCATTTCTCACACTCAGGTTGTTTTTGGACCTTGCTTGTTTTTGCAAGCTGNACGCAGG:1	TAATCGCCAAACAATTTCATTT	GTTTTTGCAAGCTGNACGCAGG	+	chr3R	28415727	+	chr3R	28415812	85	+	chr3R	28415727	+	chr3R	28415812
ACATTCCTACGGATGGCAGAGGGTCTCTCAGGGGTCATGGCTAGGGGTTCTTGNGGATCT:1	ACATTCCTACGGATGGCAGAGG	GGCTAGGGGTTCTTGNGGATCT	+	chr3R	21640676	+	chr3R	21640769	93	+	chr3R	21640676	+	chr3R	21640769
GGTGGGTTTTGTTTGGNCGCATANCAACAACCCNTTGCNTCGATTGATAGCCGTAAGCA:1	GGTGGGTTTTGTTTGGNCGCAT	CNTCGATTGATAGCCGTAAGCA	-	chrX	5834983	-	chrX	12959700	7124717	+	chrX	12959700	+	chrX	5834983
GCCCTCTTGCGGCAGACATTTGTATATTGACGCACCCGCTTGTACATCTGATATTTAATGATTATTTGTTTGT:1	GCCCTCTTGCGGCAGACATTTG	TATTTAATGATTATTTGTTTGT	-	chr2R	21239031	-	chr2R	21238949	82	+	chr2R	21238949	+	chr2R	21239031
AATCCGCGCAATTCAGATAGCGAAGGCAACAAACAGAAACAAAAAAAAAAGAAGGAGAAAGGCCGAGGAGGGGC:1	AATCCGCGCAATTCAGATAGCG	AGGAGAAAGGCCGAGGAGGGGC	-	chr2L	2900842	-	chr2L	8786232	5885390	+	chr2L	8786232	+	chr2L	2900842
GTATGCTACGAAAAAGTTGCTGTCGAAACGGAACTGGAAAACCATGAAAATGTCCTTGCCAGCTAAATGCCACT:1	GTATGCTACGAAAAAGTTGCTG	TCCTTGCCAGCTAAATGCCACT	-	chrX	20378797	-	chrX	20377331	1466	+	chrX	20377331	+	chrX	20378797
GCACATTGATCAACGGAAAGGAAAGTATGTGGCAGTGTTCAGTGGGAGGACTGACTTATTCCTCCGACATATTGG:1	GCACATTGATCAACGGAAAGGA	ACTTATTCCTCCGACATATTGG	-	chr3R	5399947	-	chr3R	5399866	81	+	chr3R	5399866	+	chr3R	5399947
AAGAACTCAACAAGGCAGTGCAAAGTTTAAAACACATCAAGTATTTATTGTCTCAGCGAGAGAGACAAATCAAAG:1	AAGAACTCAACAAGGCAGTGCA	CAGCGAGAGAGACAAATCAAAG	+	chr2L	194344	+	chr2L	18307306	18112962	+	chr2L	194344	+	chr2L	18307306
ACACACCTGACGACTATATCATCATAAGCTTATTTCAAATTATCTCAGGGGCTGGAAAGCACATGTAAGTGA:1	ACACACCTGACGACTATATCAT	GCTGGAAAGCACATGTAAGTGA	+	chr3R	5001506	+	chr3R	5001971	465	+	chr3R	5001506	+	chr3R	5001971
GCAATGTATTGTAGCAAAAGAATTGCACATTGCCAAACTGAACCAAAATAATACATTTAAAT:1	GCAATGTATTGTAGCAAAAGAA	AACCAAAATAATACATTTAAAT	+	chrX	3513790	+	chrX	3513860	70	+	chrX	3513790	+	chrX	3513860
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTAGAGTAAGTTAATTGCAAAATGAGCTGGAGTCGGCT:1	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	GCAAAATGAGCTGGAGTCGGCT	-	chrX	12649914	-	chrX	6918035	5731879	+	chrX	6918035	+	chrX	12649914
GATTAACAGTGGTCAAAGTAAGATCATTCGGAAATTAAAAAATACTGAATGGAATCATGTCAAGTCAGAGGATAA:1	GATTAACAGTGGTCAAAGTAAG	ATCATGTCAAGTCAGAGGATAA	+	chr3R	19446369	+	chr3R	19446449	80	+	chr3R	19446369	+	chr3R	19446449
CAGTCCTGGCGACATTGCTTCACACTGCTATTTCGTCCTCGGCACTCTTTCATTCCGAACTCAATACNGTTTCT:1	CAGTCCTGGCGACATTGCTTCA	TTCCGAACTCAATACNGTTTCT	-	chr2L	2667713	-	chr2L	2667635	78	+	chr2L	2667635	+	chr2L	2667713
CAAATTTCACATCTTTCCACATGGGTTATCAACCATTTTGGTTG:1	CAAATTTCACATCTTTCCACAT	GGGTTATCAACCATTTTGGTTG	+	chr3L	25343659	+	chr3L	25346395	2736	+	chr3L	25343659	+	chr3L	25346395
TGATAATTGCAAATGCATTTTCTTTTATCCCTATTTGTTATTAATTAAAATGCAATTTACTCTTTAATTGATTTT:1	TGATAATTGCAAATGCATTTTC	AATTTACTCTTTAATTGATTTT	+	chr2R	22037796	+	chr2R	22037878	82	+	chr2R	22037796	+	chr2R	22037878
ACCCCGTGCTATGCTTTCCATACAGCAGCAATTGGAATAGCAACAACAGAGCAAAAGCAAAAGCAAAAGCAAAGC:1	ACCCCGTGCTATGCTTTCCATA	AAAGCAAAAGCAAAAGCAAAGC	+	chr3L	5956522	+	chr3L	4797440	1159082	+	chr3L	5956522	+	chr3L	4797440
GGGAAGTGCGAAATGGGGTAATCCCTCGCTGCTGGTGCGACTCACATT:1	GGGAAGTGCGAAATGGGGTAAT	CGCTGCTGGTGCGACTCACATT	-	chr2R	24765591	-	chr2R	24763642	1949	+	chr2R	24763642	+	chr2R	24765591
TTTTAGCCATATTTTAGGCCNTATCATTTACCNTGTCCGAACNTTGACTGCAGTGTCTGCCAAATGCTTCCTTGA:1	TTTTAGCCATATTTTAGGCCNT	TGTCTGCCAAATGCTTCCTTGA	+	chr2L	11713509	+	chr2L	11720977	7468	+	chr2L	11713509	+	chr2L	11720977
CTGTTTTTCCAAAATTTGGTCATCAAATAATCATTTATTTTGCCACAACATTAAAAATAATTGTCAGAATATGGA:1	CTGTTTTTCCAAAATTTGGTCA	AAAATAATTGTCAGAATATGGA	+	chrX	19242812	+	chrX	13057298	6185514	+	chrX	19242812	+	chrX	13057298
GGAGTATTATTATTTTAATGTATTATTAATGCTTAATGTAATGTAGATGGTAACTGACCAGCAGCGAATGGAAC:1	GGAGTATTATTATTTTAATGTA	ACTGACCAGCAGCGAATGGAAC	-	chr3L	4094302	-	chr3L	4094226	76	+	chr3L	4094226	+	chr3L	4094302
GTGCTGCAAAATGCGCGATTACAGCCAAACGCCTACCAATACTGCAACAGCAGCAGCAGCAGCGACAACAACATC:1	GTGCTGCAAAATGCGCGATTAC	CAGCAGCAGCGACAACAACATC	-	chr2L	13369170	-	chr2L	13513154	143984	+	chr2L	13513154	+	chr2L	13369170
AAGGAGCTCTACGCTGGAGATAAGCGAAGTGAGTTGTTTTGATTGCTAANACAGTCTTCGCTAATCTTTTATTTT:1	AAGGAGCTCTACGCTGGAGATA	GTCTTCGCTAATCTTTTATTTT	+	chr3R	20066569	+	chr3R	20066805	236	+	chr3R	20066569	+	chr3R	20066805
GAAGCGTCGGCAAAAGTGCAAAAGATATTGACAATACCGTTCGCTGAATGCAAATGTGACAGCCAGCGAGA:1	GAAGCGTCGGCAAAAGTGCAAA	GCAAATGTGACAGCCAGCGAGA	-	chr3L	2456673	-	chr3L	2447521	9152	+	chr3L	2447521	+	chr3L	2456673
AAGAAGAACAGGGTCTTATTAACAAATCCGATTGAAAGGTGATGCAAATCTTAGTTGGCATTATTTTAAAGTGTA:1	AAGAAGAACAGGGTCTTATTAA	GTTGGCATTATTTTAAAGTGTA	+	chr2L	16226210	+	chr2L	16226297	87	+	chr2L	16226210	+	chr2L	16226297
TTGAGTGTTTCAATATTTTTGAAGGTTCCATGGAAGACAGCAGCTACTGTGACTGATTGATTTGTT:1	TTGAGTGTTTCAATATTTTTGA	TACTGTGACTGATTGATTTGTT	+	chr2R	11537243	+	chr2R	11537311	68	+	chr2R	11537243	+	chr2R	11537311
AGAATATCTATCTTTTAGTCGAACGACACAATATCACACGGTTCCATTGTATTTTTAGCAGTATAAATACAAGAA:1	AGAATATCTATCTTTTAGTCGA	TTTAGCAGTATAAATACAAGAA	+	chrX	18645035	+	chrX	18645133	98	+	chrX	18645035	+	chrX	18645133
ACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1	ACACAACACAACACACCACAAC	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
CGTAAACTGTTCTTTTATNAAAAAACATTGCATTTGGTGTGTGNCAATGNTTTACATGGAATTTTTATCACTCTT:1	CGTAAACTGTTCTTTTATNAAA	ACATGGAATTTTTATCACTCTT	+	chr3R	7914035	+	chr3R	29832991	21918956	+	chr3R	7914035	+	chr3R	29832991
TCGTACATATATATATGTACATATTTATGTATGTTTGAACAATACTCTGAACTGT:1	TCGTACATATATATATGTACAT	TTTGAACAATACTCTGAACTGT	+	chr3L	19642235	+	chr3L	12178773	7463462	+	chr3L	19642235	+	chr3L	12178773
CATGTTTCAAGCTCTGATAACTGATAACAGAGGGTCAGTTTTCATTACAATACTCGCAG:1	CATGTTTCAAGCTCTGATAACT	GTTTTCATTACAATACTCGCAG	+	chr3R	23626346	+	chr3R	23626429	83	+	chr3R	23626346	+	chr3R	23626429
ATTACTCCCAAGTAAGTGGTTGGAATTGCTCTTTCTGAGCAATGAATTTTGAGCAGCACTTACTTTTAGTAAACA:1	ATTACTCCCAAGTAAGTGGTTG	CAGCACTTACTTTTAGTAAACA	-	chr3R	23945006	-	chr3R	23944921	85	+	chr3R	23944921	+	chr3R	23945006
AATGCCCACTCCCAGTACTACTACAACAATGAGACGGGCGC:1	AATGCCCACTCCCAGTACTACT	ACTACAACAATGAGACGGGCGC	+	chr2L	1176178	+	chr2L	1181091	4913	+	chr2L	1176178	+	chr2L	1181091
ATTTAAAGATTCAATATGCGCTACGCCTTATTTGATCTCTCGCCGCTGTGCCTCTTTATCATGCATCTTCAATTT:1	ATTTAAAGATTCAATATGCGCT	CTTTATCATGCATCTTCAATTT	-	chrX	22898211	-	chrX	11814886	11083325	+	chrX	11814886	+	chrX	22898211
TGCGCAGACACAGCAGGGGAGTGGTAATGCAGCCAGCCAGTCGGGTGAGAGATAAAGATAATGTATGCGGCAT:1	TGCGCAGACACAGCAGGGGAGT	ATAAAGATAATGTATGCGGCAT	+	chr3R	11865322	+	chr3R	11865399	77	+	chr3R	11865322	+	chr3R	11865399
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCAAGGATGTCTGACAATAAATACAATCCCGCCTGGCA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ATAAATACAATCCCGCCTGGCA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	27048239	5140704	+	chr3R	21907535	+	chr3R	27048239
TGTATAAGATGGGGGCATAACATCACAGCTTTCTTTGGTAAATAAATTGGGGGAAGTCTGTTTCGCCGACTACTG:1	TGTATAAGATGGGGGCATAACA	AAGTCTGTTTCGCCGACTACTG	+	chr3L	3310318	+	chr3L	3310397	79	+	chr3L	3310318	+	chr3L	3310397
CGAAAATATGCACAATAATGTTGTTTCGTTCGTTGGCAACTTCATAACTTTTAATTAAC:1	CGAAAATATGCACAATAATGTT	AACTTCATAACTTTTAATTAAC	-	chrX	22701790	-	chrX	22697509	4281	+	chrX	22697509	+	chrX	22701790
CGCACCACTCCCCTAAAACTAATTATAATATTTTCGCCTTTTGCGATCG:1	CGCACCACTCCCCTAAAACTAA	ATATTTTCGCCTTTTGCGATCG	+	chr3L	21407026	+	chr3L	21407079	53	+	chr3L	21407026	+	chr3L	21407079
AAAGACACTTGCATGCCAACATCGAACTGTGATTCCACTAGTCTCTCTTCACTGCACAGTTTTTCCACCTATCTC:1	AAAGACACTTGCATGCCAACAT	GCACAGTTTTTCCACCTATCTC	-	chr3R	17878035	-	chr3R	26568327	8690292	+	chr3R	26568327	+	chr3R	17878035
ACTCAACACTTTATATAAGTCAAGATCTCACATAAATTCATCTTATTTTTTGCCTCAGTGCAGGCAAGTTGAGTT:1	ACTCAACACTTTATATAAGTCA	CTCAGTGCAGGCAAGTTGAGTT	+	chr3L	2795731	+	chr3L	2795854	123	+	chr3L	2795731	+	chr3L	2795854
GGGTGACTAATGATGTCAACATTTTCTGTTTTCTCTCTTTCGAACAGCAATCATAAGTACATCAGTTATACCCAC:1	GGGTGACTAATGATGTCAACAT	TAAGTACATCAGTTATACCCAC	+	chr3L	13929608	+	chr3L	13929786	178	+	chr3L	13929608	+	chr3L	13929786
TAGATTCTCAGTTAAATCATTTTAAAAACTGAACGCTTAGAATGTGAATATGTTTGACTAAGCGATCCCAGTCCC:1	TAGATTCTCAGTTAAATCATTT	TTGACTAAGCGATCCCAGTCCC	-	chr2L	8538239	-	chr2L	8538163	76	+	chr2L	8538163	+	chr2L	8538239
CGCGATATAACTTTATTTCAATTCATTTTGAATTCAATTCAATTCTTCCAGTGTTTCGTNTCCCAAATTAGT:1	CGCGATATAACTTTATTTCAAT	GTGTTTCGTNTCCCAAATTAGT	+	chr3R	8576178	+	chr3R	8576346	168	+	chr3R	8576178	+	chr3R	8576346
CCAAGCTGACTCGCCGATAAGGCGATGGGTTATAAAAACTATTCGCTACAGCTTGT:1	CCAAGCTGACTCGCCGATAAGG	AAAACTATTCGCTACAGCTTGT	+	chr2R	21910435	+	chr2R	21910508	73	+	chr2R	21910435	+	chr2R	21910508
GAGTGCCGCATTGAGAGANGTCATGGGGCTAATGTGAAATTNGTANCGACGCAAATTGCCATTGCTCGAG:1	GAGTGCCGCATTGAGAGANGTC	ACGCAAATTGCCATTGCTCGAG	+	chr3L	9918886	+	chr3L	9918976	90	+	chr3L	9918886	+	chr3L	9918976
ATTGCCGGCCTAGAGCCTCGATGTCAAAATAAATAGATGAAAATCCCGCTTCATCTCTCACTATTTTTATGGAAT:1	ATTGCCGGCCTAGAGCCTCGAT	TCTCTCACTATTTTTATGGAAT	+	chr2R	22511922	+	chr2R	22512009	87	+	chr2R	22511922	+	chr2R	22512009
TGCAATACGCAAAAGTAAGAACATTGAGGCAAATCCGTGCAATTCGAGCAGCAGGTTGATCAGTTCGCCTTTTA:1	TGCAATACGCAAAAGTAAGAAC	AGGTTGATCAGTTCGCCTTTTA	+	chr3L	20376526	+	chr3L	2139920	18236606	+	chr3L	20376526	+	chr3L	2139920
ACAATTAGGTTTAACAAAATCGAGAACTTATGAACAATTTTCTACATCTAGAGATTTTTATGGCAGAAAAGTGAT:1	ACAATTAGGTTTAACAAAATCG	ATTTTTATGGCAGAAAAGTGAT	+	chr3R	27496600	+	chr3R	27496705	105	+	chr3R	27496600	+	chr3R	27496705
GCCATAAANTCGGGATTTTCTCACCTGAAACACAANGCGCCTGACTTAGCTTTGAAAAAAAAGCTAAGAACTTCC:1	GCCATAAANTCGGGATTTTCTC	GAAAAAAAAGCTAAGAACTTCC	-	chr3L	16162713	-	chr3L	16162629	84	+	chr3L	16162629	+	chr3L	16162713
GAGAATGAGAGACAGTCATTATATATTGAGGACTCTTTTTGAGCCGGCC:1	GAGAATGAGAGACAGTCATTAT	GAGGACTCTTTTTGAGCCGGCC	-	chrX	22383371	-	chrX	22383057	314	+	chrX	22383057	+	chrX	22383371
AAGTTGAAATGGGTACTGTGAAAATATACTGTGTGAAATATTTGAATTTCAAGTTTGCGCGAAAAACTTTCT:1	AAGTTGAAATGGGTACTGTGAA	AAGTTTGCGCGAAAAACTTTCT	+	chr2L	2533535	+	chr2L	2533782	247	+	chr2L	2533535	+	chr2L	2533782
TAAGGGATTGCTTGGCAAAACAAAAAAAAAACGAAAAGGAAACGGATAAAAAGTCCA:1	TAAGGGATTGCTTGGCAAAACA	AAGGAAACGGATAAAAAGTCCA	-	chrX	15426548	-	chrX	14518597	907951	+	chrX	14518597	+	chrX	15426548
AGTCCCCATCGCCATAATATCATTCCCCGAGCCGGAAGCATTGGTTAGTCAAAGGTTCACGTTCTTTTAAGGTTG:1	AGTCCCCATCGCCATAATATCA	GGTTCACGTTCTTTTAAGGTTG	-	chrX	1694185	-	chrX	17611480	15917295	+	chrX	17611480	+	chrX	1694185
AAATCAAATGCTTCAGTATGGTTGCTTATCTGACAGGATGGAGATGAGTCTGGGCTCTTCAGCTTTTGGTGAATG:1	AAATCAAATGCTTCAGTATGGT	GCTCTTCAGCTTTTGGTGAATG	+	chr3L	18677887	+	chr3L	18677982	95	+	chr3L	18677887	+	chr3L	18677982
ATTGAGGAAATACCTCAAATTAAACTTAGATGCAACTTATTGAACGGNAA:1	ATTGAGGAAATACCTCAAATTA	GATGCAACTTATTGAACGGNAA	-	chr3L	15260095	-	chr3L	15259126	969	+	chr3L	15259126	+	chr3L	15260095
CATGGATTCTCCCGAGAATATCCATGCCGAGAATATCCATGGAAGTGTCTTTAGATCGCGGCCGGCATGGGTGA:1	CATGGATTCTCCCGAGAATATC	AGATCGCGGCCGGCATGGGTGA	+	chr2R	4602848	+	chr2R	4603202	354	+	chr2R	4602848	+	chr2R	4603202
AGCAATATGAACAGCAGATGCATAGCGAACAAATTTTCACAGTTCACTACACCTTTCCTTTTAGCCACACATCTA:1	AGCAATATGAACAGCAGATGCA	TTTCCTTTTAGCCACACATCTA	-	chr3L	10035332	-	chr3L	10035245	87	+	chr3L	10035245	+	chr3L	10035332
TTTCGGCGCAGCCAATCTAATAAACCAATAAATGCCCATTCGGCATATGCATTAAATATTAGTTTGGCCATTGA:1	TTTCGGCGCAGCCAATCTAATA	TAAATATTAGTTTGGCCATTGA	-	chr3R	11958161	-	chr3R	11957879	282	+	chr3R	11957879	+	chr3R	11958161
TAGATTGTTCTTCTTTGGTTTCTCCGTTTGCTCCTCCTTGGTCCTTGGTCCTTCGTCACCAAGCAGCCAGCA:1	TAGATTGTTCTTCTTTGGTTTC	CTTCGTCACCAAGCAGCCAGCA	+	chrX	8013259	+	chrX	8013368	109	+	chrX	8013259	+	chrX	8013368
GCCCATGGCGCCGGAGACAACTGCGGAACAGTTTAAGCAGCAGCAGCAACAACATTCTTCGCAAAATCATCAGG:1	GCCCATGGCGCCGGAGACAACT	CATTCTTCGCAAAATCATCAGG	+	chr2R	12333013	+	chr2R	10649374	1683639	+	chr2R	12333013	+	chr2R	10649374
AGGATTACGTCACTTGCCGCCGCGTCCCCATCGACACGGAGACTGACCCTCGGGCATCAGCT:1	AGGATTACGTCACTTGCCGCCG	GACTGACCCTCGGGCATCAGCT	-	chr3L	15899792	-	chr3L	15899238	554	+	chr3L	15899238	+	chr3L	15899792
CATTTGAGTCATTCCTGCTGAATTCCATGTGGTGTGCTTTNGCTTNGTGTATGCATATTTGCCNAATTGG:1	CATTTGAGTCATTCCTGCTGAA	GTATGCATATTTGCCNAATTGG	+	chr2L	15068915	+	chr2L	15068989	74	+	chr2L	15068915	+	chr2L	15068989
TACATGCATAAACATGGAATCACATTACCTTTAGTTGCTGGCCCATTACGT:1	TACATGCATAAACATGGAATCA	TTTAGTTGCTGGCCCATTACGT	+	chr2L	11538857	+	chr2L	11538918	61	+	chr2L	11538857	+	chr2L	11538918
GCACATACTTGTGTGCAGTTACTATCGAGGCGACTTGGAAAAGTTCCTCCTCTGGC:1	GCACATACTTGTGTGCAGTTAC	TTGGAAAAGTTCCTCCTCTGGC	+	chr3R	28478433	+	chr3R	28478495	62	+	chr3R	28478433	+	chr3R	28478495
GAACTGAAACCAACCCAACCTGACCTGACCCAAACCAATCCAGCCAGTAAAATTGAGACGGCAGCCAAAGTCGA:1	GAACTGAAACCAACCCAACCTG	TTGAGACGGCAGCCAAAGTCGA	-	chr3R	16253912	-	chr3R	17845093	1591181	+	chr3R	17845093	+	chr3R	16253912
TTCACCGTTTAGCGATATNGCACAACAATTTTAGTTCTACAACNGCTCTNGTGACGTAACGCGACGACGACTGG:1	TTCACCGTTTAGCGATATNGCA	GACGTAACGCGACGACGACTGG	+	chr3L	9130557	+	chr3L	9134317	3760	+	chr3L	9130557	+	chr3L	9134317
AAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCAG:1	AAGGTAAGAGTAAGGCTATTCG	CTCTTTAAGTCAAACGATTCAG	+	chr2R	13136855	+	chr2R	13141653	4798	+	chr2R	13136855	+	chr2R	13141653
GCCCTAATGTATGCAGCATTTTTCGACCAACTTAAAGCACGCAAAAGCATAGGAAGAAAATGAATCTGTTATTG:1	GCCCTAATGTATGCAGCATTTT	GAAGAAAATGAATCTGTTATTG	+	chr3L	12874946	+	chr3L	12877237	2291	+	chr3L	12874946	+	chr3L	12877237
CAGCCGGCTTATCATTTAAATGGAGGGAAGTTGGCTTTAAAGGCAATCGCAAAGCGTCCTATTTCGTGGCTTAG:1	CAGCCGGCTTATCATTTAAATG	AGCGTCCTATTTCGTGGCTTAG	-	chr2R	14393951	-	chr2R	14393867	84	+	chr2R	14393867	+	chr2R	14393951
AAAAAATAACGCTGCTAATAAACTTTCGGGCATAAAAATCGCACTGCAAATTTACCACACGACCCGAAAGTAGGC:1	AAAAAATAACGCTGCTAATAAA	ACCACACGACCCGAAAGTAGGC	+	chr3L	19008858	+	chr3L	19009196	338	+	chr3L	19008858	+	chr3L	19009196
CAATGGGGGCTTAATCTATGATCTTCTTCTTTGTATAACTTTTTGCGCTTAATANCAT:1	CAATGGGGGCTTAATCTATGAT	AACTTTTTGCGCTTAATANCAT	-	chr3R	29590472	-	chr3R	29590396	76	+	chr3R	29590396	+	chr3R	29590472
ATATAAATTATGTTTAAATTGTTGTGTATTGATTGAAATACTCATTATTTTATAGCAAACTCAAAGCCTTTCTGG:1	ATATAAATTATGTTTAAATTGT	AGCAAACTCAAAGCCTTTCTGG	+	chr3R	30262578	+	chr3R	30262675	97	+	chr3R	30262578	+	chr3R	30262675
GAAACGTCAAAGTCCGTTCTTTTTATTATTTTT:1	GAAACGTCAAAGTCCGTTCTTT	GTCCGTTCTTTTTATTATTTTT	-	chr3R	20369312	-	chr3R	24001163	3631851	+	chr3R	24001163	+	chr3R	20369312
ATTTATTGCTTCTAATGTTAATGATGTTTGAATGTTTGCCATACAGACTAAAAAAAGCAAGACCCGTATGATGC:1	ATTTATTGCTTCTAATGTTAAT	AAAAGCAAGACCCGTATGATGC	-	chr3L	9390980	-	chr3L	9390851	129	+	chr3L	9390851	+	chr3L	9390980
CGTAAATCTATTGGCCAAGGCTTTTCCAGTTGCCAGTTCCTAGCCCCCACCAAAAACTTCGATATATCCACACG:1	CGTAAATCTATTGGCCAAGGCT	AAAACTTCGATATATCCACACG	-	chr3L	10417673	-	chr3L	10417597	76	+	chr3L	10417597	+	chr3L	10417673
GGAGGAGAAGCACTACAAAATAATCCAACGCAAAGAGAGGTGCCCGGGCGGTGATTAAATCAGTTAAGAGACAT:1	GGAGGAGAAGCACTACAAAATA	GATTAAATCAGTTAAGAGACAT	+	chr3R	12214363	+	chr3R	12214453	90	+	chr3R	12214363	+	chr3R	12214453
AATTGCTGGGCCTGGAACTAAGGTTTCAGGGCCGAGAGTACGATAGCTCAGTGTTGACGCATGTATCGTCT:1	AATTGCTGGGCCTGGAACTAAG	AGTGTTGACGCATGTATCGTCT	+	chr2L	21819361	+	chr2L	21819445	84	+	chr2L	21819361	+	chr2L	21819445
GAGGAAAATGTCTGGCAAATGTCATCTGAAAAATTTAAAAGGGTTCAGTAAATAAATTACTCAATTGCTAT:1	GAGGAAAATGTCTGGCAAATGT	AAATAAATTACTCAATTGCTAT	-	chr2R	23258421	-	chr2R	9816959	13441462	+	chr2R	9816959	+	chr2R	23258421
GTCTGCAGTTCAATTCATAATTATTTTCTAAACGAATTCAGTTTTTCCCTAGTGTAATTACATGCGTTCATACA:1	GTCTGCAGTTCAATTCATAATT	TGTAATTACATGCGTTCATACA	-	chr2L	207069	-	chr2L	14021184	13814115	+	chr2L	14021184	+	chr2L	207069
TGTACATACATGTACATGTGTTTTGCTCACTCGTTACGCAAGCACTCGTTACGCAGAGATCTCCGCATNGCCCAA:1	TGTACATACATGTACATGTGTT	CAGAGATCTCCGCATNGCCCAA	+	chrX	1845736	+	chrX	1845836	100	+	chrX	1845736	+	chrX	1845836
TTAAGACATTCCCTAACATTAACAATATATTAAAAAAATAGTAGATATTAACATACAGTTTTGCGGCGAATTCG:1	TTAAGACATTCCCTAACATTAA	ATACAGTTTTGCGGCGAATTCG	-	chr3R	5846975	-	chr3R	5846900	75	+	chr3R	5846900	+	chr3R	5846975
ATATGCCACACATGATTGGCATTGCGATGCAGTGNGGGGTGGCAGGTGAAAGGGCGAAAAAGTCGTAATACTCGG:1	ATATGCCACACATGATTGGCAT	GCGAAAAAGTCGTAATACTCGG	+	chr3R	20185341	+	chr3R	5473180	14712161	+	chr3R	20185341	+	chr3R	5473180
TATTGAACGACTTCATAAATGTTAGTCTTACTTTTGTTAACTTAGTCTTATTTTCGTGTTCTAAAAAGGTAGTGT:1	TATTGAACGACTTCATAAATGT	TCGTGTTCTAAAAAGGTAGTGT	-	chr2R	10313430	-	chr2R	10313336	94	+	chr2R	10313336	+	chr2R	10313430
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGCAGTAAGGGAATGGGGAAGTCAAGGAAAAAGCGGAAGTGGGCGGATTTT:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	AAAGCGGAAGTGGGCGGATTTT	+	chr3L	22908067	+	chr3L	9124469	13783598	+	chr3L	22908067	+	chr3L	9124469
CGAACCCATTTTCAAGACTTGTCACAAGCATTTGTCCAAAGTTCGTTTGCTTGTTTCTAAACGAAATGNACTTAA:1	CGAACCCATTTTCAAGACTTGT	TTTCTAAACGAAATGNACTTAA	+	chr2L	15044728	+	chr2L	15044804	76	+	chr2L	15044728	+	chr2L	15044804
TGATGAAAACAGGGCCGTGCAGGTTGTCCACCAATTGCGGATGGGGTGGAACTT:1	TGATGAAAACAGGGCCGTGCAG	AATTGCGGATGGGGTGGAACTT	-	chr2L	2028426	-	chr2L	10402043	8373617	+	chr2L	10402043	+	chr2L	2028426
GCGACTGTAGATTGCAGTTTNCAGATTGCCATNCCGCTCTGTNCAGCTCTCCATACCTTGCTCG:1	GCGACTGTAGATTGCAGTTTNC	NCAGCTCTCCATACCTTGCTCG	+	chrX	5439486	+	chrX	12346816	6907330	+	chrX	5439486	+	chrX	12346816
GAGCTAAATGGAAAGGGAAGGGAACGAAAGTTTCGAAGATATCCCTTTGAGCTCCGTTTAAACCGACGAGCAGCC:1	GAGCTAAATGGAAAGGGAAGGG	CCGTTTAAACCGACGAGCAGCC	+	chr2R	23243367	+	chr2R	23243452	85	+	chr2R	23243367	+	chr2R	23243452
GGCTTAATTTGCATAAACAAGTTCACGGAATGGATTTGGATATGGAGGANTTTCACAACCGTTTGTACGTAGTCA:1	GGCTTAATTTGCATAAACAAGT	CACAACCGTTTGTACGTAGTCA	-	chr3R	30496572	-	chr3R	19499617	10996955	+	chr3R	19499617	+	chr3R	30496572
CAAGAGCCGCCTCCACTCGACTTCCACCCAACACCTCTTCACCACCATTCCTCGCAAGAGGAATTTGCGCAATTT:1	CAAGAGCCGCCTCCACTCGACT	GCAAGAGGAATTTGCGCAATTT	-	chr3L	8203642	-	chr3L	8203565	77	+	chr3L	8203565	+	chr3L	8203642
AAAACTACAGGAAGTGATATAGCCTATAGGTAGCTAAGTTGATTTGGAAAAGGAAACTTATTCTTCTACAGTA:1	AAAACTACAGGAAGTGATATAG	GGAAACTTATTCTTCTACAGTA	+	chr2L	6544394	+	chr2L	6544484	90	+	chr2L	6544394	+	chr2L	6544484
AATATTAGGCGAACAACAGNGCATATAACGGACATAAACTCCGACTTTTTTGCGTATATAAATTTGTGTATTTTT:1	AATATTAGGCGAACAACAGNGC	GTATATAAATTTGTGTATTTTT	+	chr3R	20156723	+	chr3R	20165893	9170	+	chr3R	20156723	+	chr3R	20165893
GGGAGGGAGAGGAAACTACTGTGAGAGAGAGTGAAATATATATATAAAGGTGGGTCATGAATTCATCGAAGTCT:1	GGGAGGGAGAGGAAACTACTGT	GGTCATGAATTCATCGAAGTCT	-	chr2R	20961446	-	chr2R	14880843	6080603	+	chr2R	14880843	+	chr2R	20961446
ATAATGTAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACACAACACCTGGTAGCGGGGCTT:1	ATAATGTAATAGAACTGCTTAC	ACAACACCTGGTAGCGGGGCTT	+	chr2L	18925247	+	chr2L	18925342	95	+	chr2L	18925247	+	chr2L	18925342
GAAACCAATGCCGAAGGATATGTATGGGTAGAGCTCAAGTGTGGCAANAAATTGCAGGTGGCCTCATNCTACTC:1	GAAACCAATGCCGAAGGATATG	TGCAGGTGGCCTCATNCTACTC	+	chr3L	4622182	+	chr3L	13559140	8936958	+	chr3L	4622182	+	chr3L	13559140
TTTCACTTTTAAGACGTCTTCACGTTTATCAAAATTTGACTCACAACATGGCAGGGCTGGGAATCCAGAGTCAA:1	TTTCACTTTTAAGACGTCTTCA	AGGGCTGGGAATCCAGAGTCAA	+	chr3R	25436520	+	chr3R	25436613	93	+	chr3R	25436520	+	chr3R	25436613
GACTGACCAATCAGAAAAACAAATTCACCGTGGAGAACGGGATCGTCATGTCAACC:1	GACTGACCAATCAGAAAAACAA	GAACGGGATCGTCATGTCAACC	-	chr3R	17105489	-	chr3R	9965006	7140483	+	chr3R	9965006	+	chr3R	17105489
TATCCCGATCTACAATTCCTGGCAATCCTGGACTACATGTTTTNTGTTTTGATTTTGGAATTAAAGCATTGCGTT:1	TATCCCGATCTACAATTCCTGG	TTTGGAATTAAAGCATTGCGTT	+	chrX	2045038	+	chrX	2045115	77	+	chrX	2045038	+	chrX	2045115
ATTTAAAATTAAGCTCATGAAAAGTAGTTAACCTCCAAAGCCACCCACCGTCGCCCACTCACCCACCCAAATT:1	ATTTAAAATTAAGCTCATGAAA	CGCCCACTCACCCACCCAAATT	-	chr2R	21747441	-	chr2R	21738283	9158	+	chr2R	21738283	+	chr2R	21747441
AAAACATATGTGTAAAATGCAAATTAAACAAAATTACAATAAAAACGAAATTCCGTTTTCAGCCTCAAATAAGCA:1	AAAACATATGTGTAAAATGCAA	CGTTTTCAGCCTCAAATAAGCA	-	chr3R	20066316	-	chr3R	20066126	190	+	chr3R	20066126	+	chr3R	20066316
GCTTATGCTGAGAAGTAANCAAAAGGCGTCTCTGCTTGTAGTTTCCATAGGGGAGTTAAGTAGACTTTTGTGNT:1	GCTTATGCTGAGAAGTAANCAA	GAGTTAAGTAGACTTTTGTGNT	+	chr2L	602812	+	chr2L	2941708	2338896	+	chr2L	602812	+	chr2L	2941708
AGACTGGAACGTCTGAAGGGTAAATGTATGTACGAGGATGTATAG:1	AGACTGGAACGTCTGAAGGGTA	ATGTATGTACGAGGATGTATAG	-	chrX	2665532	-	chrX	2664416	1116	+	chrX	2664416	+	chrX	2665532
ATAAATATNGCAGACAATAAATCTAGATTCTTTTTTTAATTGCATGTTTGGTATTATATAACTAAACGATATT:1	ATAAATATNGCAGACAATAAAT	TATTATATAACTAAACGATATT	+	chr3R	22509597	+	chr3R	17188562	5321035	+	chr3R	22509597	+	chr3R	17188562
AAGCCACTACAAAGTCTCGAGTGCATGGCGAACAATTAGCAAAGGCGAGGCAACAAGTGCAAGAAGGCACTACCA:1	AAGCCACTACAAAGTCTCGAGT	CAAGTGCAAGAAGGCACTACCA	+	chr3L	3281454	+	chr3L	3281950	496	+	chr3L	3281454	+	chr3L	3281950
TTTCTCGCCGCCTCGCTTTGCCTCACCTGTAAAGCGT:1	TTTCTCGCCGCCTCGCTTTGCC	CTTTGCCTCACCTGTAAAGCGT	-	chr2L	6186568	-	chr2L	14112190	7925622	+	chr2L	14112190	+	chr2L	6186568
CACCGCCTATAGTGCGATGGTTTCGGGCCAACAACAGGCATGCAAAAAACAAAAGGCAGAAAGCGTGTCCTGACT:1	CACCGCCTATAGTGCGATGGTT	AGGCAGAAAGCGTGTCCTGACT	+	chr3R	17521574	+	chr3R	17521734	160	+	chr3R	17521574	+	chr3R	17521734
TATAAAACGAGTATATTTGGCTTGAGGGCGAACGTTTTCACTTCACATGTTCAAGTATTCTTTTCTCAGTCTTCA:1	TATAAAACGAGTATATTTGGCT	AGTATTCTTTTCTCAGTCTTCA	+	chr3R	29009969	+	chr3R	29010075	106	+	chr3R	29009969	+	chr3R	29010075
GGCGAGAGAGCTCCCACCTTATCGCCTGGTAGAGATCAGAAAGTCTGTGATTTCAGCCGTACGATACGATCGG:1	GGCGAGAGAGCTCCCACCTTAT	TTCAGCCGTACGATACGATCGG	+	chr3R	19287296	+	chr3R	28617858	9330562	+	chr3R	19287296	+	chr3R	28617858
CTAAACTTACGTCAACTTTAAAGCATCTGACAGCAACTCAAATGCGATTGTTACGAAGAGCAACTCTGGAGAG:1	CTAAACTTACGTCAACTTTAAA	TACGAAGAGCAACTCTGGAGAG	-	chr2R	5491854	-	chr2R	5491715	139	+	chr2R	5491715	+	chr2R	5491854
AAATGAATTTAATTTCTATATACTCAGTAGCTCTTTTAACTTTGAGCACGAGAACTTAACCCGTTTTT:1	AAATGAATTTAATTTCTATATA	CACGAGAACTTAACCCGTTTTT	+	chr3R	14975327	+	chr3R	18456419	3481092	+	chr3R	14975327	+	chr3R	18456419
GTTTTGGTGCTGTACTTGGTGGAACATTTGGTTTATTCATNCATTTGTTGCACT:1	GTTTTGGTGCTGTACTTGGTGG	TTATTCATNCATTTGTTGCACT	+	chr3R	5175533	+	chr3R	19182738	14007205	+	chr3R	5175533	+	chr3R	19182738
ATATCCACATATTCGTATTATCCACTTTGTGGACTATTGGGTTGTGCGGTTGCATTGTGCAGATTTGCGTCGCGC:1	ATATCCACATATTCGTATTATC	ATTGTGCAGATTTGCGTCGCGC	+	chr3L	5030792	+	chr3L	5030868	76	+	chr3L	5030792	+	chr3L	5030868
ATACGTGCAACACTGAAACAGCATAGGTTGTGTGCCACACAAGGAAATGTGAAAGAAACAAACATATGTTA:1	ATACGTGCAACACTGAAACAGC	TGAAAGAAACAAACATATGTTA	+	chr2R	12897473	+	chr2R	12897560	87	+	chr2R	12897473	+	chr2R	12897560
GTTANTAGCCTCCCCACGCGAANAACANCCCTAACGTGANCCACGGAAATAGTGAAGTAAATAGGAACTGCAAAG:1	GTTANTAGCCTCCCCACGCGAA	GAAGTAAATAGGAACTGCAAAG	+	chr2L	10344417	+	chr2L	14262449	3918032	+	chr2L	10344417	+	chr2L	14262449
CAGCTTAGCATTGGGCAAGGAGATTCCNCCAGGTCCTTAGCTCCTGCTCGCTTCCTAATCGTATTGAGCTTATAC:1	CAGCTTAGCATTGGGCAAGGAG	CCTAATCGTATTGAGCTTATAC	+	chr2R	16962258	+	chr2R	16962335	77	+	chr2R	16962258	+	chr2R	16962335
CCAAATTCGGGGTAATCAATCAAAGGCTTTCTATGTACACCGAAATTTAACGCCTTGGCTTGCTTTATTA:1	CCAAATTCGGGGTAATCAATCA	AACGCCTTGGCTTGCTTTATTA	-	chr2L	14799334	-	chr2L	14799187	147	+	chr2L	14799187	+	chr2L	14799334
TGTGTGTGTGTGTCTGTGTGGGTGTGTGTGCAGGTGTTAAAGCTCTAAACAAAAATCAACT:1	TGTGTGTGTGTGTCTGTGTGGG	AAGCTCTAAACAAAAATCAACT	-	chrX	6148333	-	chrX	12825104	6676771	+	chrX	12825104	+	chrX	6148333
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCACACAACACAACACAACACAA:2	ACAACACAACACAACACAACAC	CACACAACACAACACAACACAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801
ATCAATGCTATTGCCTACTGTTTAGAATGAGAAGCGCTGGGATGAGAAACTACAAGACTACTAATCGTTCTCCAT:1	ATCAATGCTATTGCCTACTGTT	AAGACTACTAATCGTTCTCCAT	+	chrY	2761745	+	chrY	2761833	88	+	chrY	2761745	+	chrY	2761833
CCAACACTCTGTACCGAACGATGAGCTGCCTTTGCAGCCATGTGCTCTAATTCTATTTTTGCAGTTTAATGAAGT:1	CCAACACTCTGTACCGAACGAT	TATTTTTGCAGTTTAATGAAGT	-	chr2R	16737248	-	chr2R	16737148	100	+	chr2R	16737148	+	chr2R	16737248
TCATAACATAGATGATTTGTATTTGGTCAAGCTTTTGTATTTACGTCTAGTTTAAGTTAGTGGTTAAGCCTAAAG:1	TCATAACATAGATGATTTGTAT	AAGTTAGTGGTTAAGCCTAAAG	-	chr2R	11344247	-	chr2R	11344151	96	+	chr2R	11344151	+	chr2R	11344247
AACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACNAAACAA:3	AACAAAACAAAACAAAACAAAA	AAAACAAAACAAAACNAAACAA	+	chr3R	29013339	+	chr3R	29351537	338198	+	chr3R	29013339	+	chr3R	29351537
TTCAAAGCGTATATTTTAAGCTTTTTAATATAGTGTTTAACATTAATGTTATTGC:1	TTCAAAGCGTATATTTTAAGCT	TGTTTAACATTAATGTTATTGC	-	chr3L	21315316	-	chr3L	21306177	9139	+	chr3L	21306177	+	chr3L	21315316
AACCATGTGCAATCCGCATGCCTTGTCCATGTGAATGGGTCGCCCACATATACACTTTCAATAGC:1	AACCATGTGCAATCCGCATGCC	CCACATATACACTTTCAATAGC	+	chr3L	5310386	+	chr3L	5310503	117	+	chr3L	5310386	+	chr3L	5310503
TTGGCAAAGGGGGTGGGGAAGGTTGGTGGGCAAGTAGAATTGGGGACGTGAGCAGCAGATACATNCGAAGTGGT:1	TTGGCAAAGGGGGTGGGGAAGG	CAGCAGATACATNCGAAGTGGT	+	chr2R	20523041	+	chr2R	20523151	110	+	chr2R	20523041	+	chr2R	20523151
AGACCATAAAATGTCTCATTTCTGCGCGACATGAAGAATGGCTTGGGAACGAGGCTCGGAGCGCTATTAAATA:1	AGACCATAAAATGTCTCATTTC	AGGCTCGGAGCGCTATTAAATA	+	chr3R	6575172	+	chr3R	6575305	133	+	chr3R	6575172	+	chr3R	6575305
CGTAGTAGGCCATGACAAAGCGCAGATCGCTGGACGACGCATTTGTTAGTCAGTGGCATTGNCAAGAAGTGCTGG:1	CGTAGTAGGCCATGACAAAGCG	TGGCATTGNCAAGAAGTGCTGG	+	chr3L	1463437	+	chr3L	1463518	81	+	chr3L	1463437	+	chr3L	1463518
ACCTCAAGTGCCCTCTTCAAGGACCACAGATAGACGGCGGCTACACATCCTTTTGTACTTCCTGCGCCCGCGGGA:1	ACCTCAAGTGCCCTCTTCAAGG	TGTACTTCCTGCGCCCGCGGGA	-	chr3L	13752904	-	chr3L	13752807	97	+	chr3L	13752807	+	chr3L	13752904
AAGCAGTTAAAAACTCGCNTATACGCCATGTTGTCAACTGGTTGGGCAGCAAAAAAACATAGCACACTTTTANGC:1	AAGCAGTTAAAAACTCGCNTAT	AAAACATAGCACACTTTTANGC	+	chr3R	26642750	+	chr3R	26643144	394	+	chr3R	26642750	+	chr3R	26643144
TATGTTTGAGCATAAGTANCATTTCATTTCAATAAATCCAGNTCGNAACTCCATGAAAAGTTTATCTTACTAAAC:1	TATGTTTGAGCATAAGTANCAT	TGAAAAGTTTATCTTACTAAAC	-	chrX	10691185	-	chrX	10686048	5137	+	chrX	10686048	+	chrX	10691185
AACGCAACGCTGCTGGCTGGCAACAAGTACATAATGGATTGTAAATATCTGACACCTGCTCCTAAACCAGATCCC:1	AACGCAACGCTGCTGGCTGGCA	ACCTGCTCCTAAACCAGATCCC	-	chr3L	7406125	-	chr3L	9062308	1656183	+	chr3L	9062308	+	chr3L	7406125
GATTAAAATTGTCTAAATTGTTACTTTCCCACTTTCACATTGTGACGTATTTATGGATATCAAGTGCCACAATT:1	GATTAAAATTGTCTAAATTGTT	ATGGATATCAAGTGCCACAATT	+	chr2L	21305930	+	chr2L	11388629	9917301	+	chr2L	21305930	+	chr2L	11388629
TATATGAATAACGTATCTTATGGATTCTCAACTTGTGAACAAAATTCTTTGGGGTTGGTTCGTCAGCATAATGA:1	TATATGAATAACGTATCTTATG	GGTTGGTTCGTCAGCATAATGA	-	chr3L	16869667	-	chr3L	16869585	82	+	chr3L	16869585	+	chr3L	16869667
AGNTAATTCCGGTGAATTCTATAGTATTCATATTNANTCTATAGTATTCGCGAAATCGTCGAGGTCTATCTGGGT:1	AGNTAATTCCGGTGAATTCTAT	AATCGTCGAGGTCTATCTGGGT	+	chr3R	13053033	+	chr3R	13045797	7236	+	chr3R	13053033	+	chr3R	13045797
CAAATCCCAGTACGTGTCCAAGATAAGCTCGTCATGAGGATGAGGATGCAGTGGCAACTTTTCCTCCACTC:1	CAAATCCCAGTACGTGTCCAAG	AGTGGCAACTTTTCCTCCACTC	-	chr3L	5826241	-	chr3L	5826161	80	+	chr3L	5826161	+	chr3L	5826241
TTAAAGTCCGTATCGCAGATCTTGTATGATGATATTTTTCCTGGGCAGTAAATTATAANTTG:1	TTAAAGTCCGTATCGCAGATCT	CTGGGCAGTAAATTATAANTTG	-	chrX	9975803	-	chrX	9975737	66	+	chrX	9975737	+	chrX	9975803
GCTGTTTGAAGTGCGGTCGCTTTTGGGTCAGCGGCTGGGGGGGGGAAGGGGGGGGGG:1	GCTGTTTGAAGTGCGGTCGCTT	TGGGGGGGGGAAGGGGGGGGGG	-	chrX	5284398	-	chrX	14815009	9530611	+	chrX	14815009	+	chrX	5284398
TTTAAAATCTATATAGTTTTTAAAATCCTTCTTTTGCAACTGTTAATAAAATTAAAGATTTAAGTTTTTATTTT:1	TTTAAAATCTATATAGTTTTTA	TAAAGATTTAAGTTTTTATTTT	-	chr3L	17789919	-	chr3L	17789844	75	+	chr3L	17789844	+	chr3L	17789919
TCGAGCAATGGCAATTTGCGTCGGTACGAATTTCACATTAGCCCCATGACATCTCTCAATGCGGCACTCACAGTG:1	TCGAGCAATGGCAATTTGCGTC	TCTCAATGCGGCACTCACAGTG	-	chr3L	9918975	-	chr3L	9918880	95	+	chr3L	9918880	+	chr3L	9918975
CCAACCAGGCCAAATAAAGCAAGTNTGACAAAAGCATGACGANGANAATGCNATANATGAAGAATGGTATAGTTA:1	CCAACCAGGCCAAATAAAGCAA	TANATGAAGAATGGTATAGTTA	-	chr3R	18766860	-	chr3R	18766782	78	+	chr3R	18766782	+	chr3R	18766860
AAAGCTCGCACGTGCGACGCTTGCGAAAAAAAAAATTGAAAATATATATATACATATATTGCGAAGAGAGGGGC:1	AAAGCTCGCACGTGCGACGCTT	CATATATTGCGAAGAGAGGGGC	-	chr2L	7984077	-	chr2L	7977104	6973	+	chr2L	7977104	+	chr2L	7984077
AAACTATATCACTTTCCTTTGTTGTCGTAAAAAACCAATATCAGCAAAACCAATTTCAGTTGCGATACAGTGATT:1	AAACTATATCACTTTCCTTTGT	TTTCAGTTGCGATACAGTGATT	+	chr2L	1557147	+	chr2L	1557272	125	+	chr2L	1557147	+	chr2L	1557272
TACAATACAATACAATACAACACCACTCCACTAGCTCCCCTTGTCAGTCAAGTGCAGCAGGGAAATCCTCCCCC:1	TACAATACAATACAATACAACA	TGCAGCAGGGAAATCCTCCCCC	-	chrX	12946234	-	chrX	2285469	10660765	+	chrX	2285469	+	chrX	12946234
AAATACCAGTACAGATAAGACCTTATTGTCAAGCGGATGGGATGAAGCTTAACAATTTTTATGGCGACGTCCCAT:1	AAATACCAGTACAGATAAGACC	AATTTTTATGGCGACGTCCCAT	+	chr2L	16061001	+	chr2L	16060390	611	+	chr2L	16061001	+	chr2L	16060390
ATTTTTTTAAGTGCACCATCAGATACTTCTCATATCGCAAACGTCCATCAAATAATAATAGGAGCATAAAGAGTA:1	ATTTTTTTAAGTGCACCATCAG	AATAATAGGAGCATAAAGAGTA	+	chr3L	20710762	+	chr3L	20710839	77	+	chr3L	20710762	+	chr3L	20710839
AAGTCTATTGTCGCGTTCCCTGCTAACAGAAGGTGCATAATCCTCACATATATCATACCAACTATCTATGAGCTA:1	AAGTCTATTGTCGCGTTCCCTG	CATACCAACTATCTATGAGCTA	-	chr2R	8161043	-	chr2R	8160953	90	+	chr2R	8160953	+	chr2R	8161043
TACTGGTTTTTGTTTTTGAAGATGTCCCTTGCCCCTTGTCTGCGTGGATGCCACAAATATTTGTGTTTGTGTTTG:1	TACTGGTTTTTGTTTTTGAAGA	CAAATATTTGTGTTTGTGTTTG	-	chr2R	8654081	-	chr2R	8653994	87	+	chr2R	8653994	+	chr2R	8654081
AGAAAAATTCCATCTTCTATGGAACGCTGTAGCTCAGCTAAGATCANGCATAATA:1	AGAAAAATTCCATCTTCTATGG	TCAGCTAAGATCANGCATAATA	-	chr2R	6178767	-	chr2R	6178700	67	+	chr2R	6178700	+	chr2R	6178767
AAGTGGTTGGCACTAAACGCTGGGCTGATAAAACGATTGCCCCCAGACGATGTCCGTCTTGTTTATGCCAATAAT:1	AAGTGGTTGGCACTAAACGCTG	CCGTCTTGTTTATGCCAATAAT	-	chr3R	22453215	-	chr3R	22450575	2640	+	chr3R	22450575	+	chr3R	22453215
TGGACACCATCTATGCCATTGAGGATGTGAGTATTCAAGCAAACCGGAACCACACAGAAATGTAAGAAAATTTTT:1	TGGACACCATCTATGCCATTGA	ACAGAAATGTAAGAAAATTTTT	+	chr2L	877846	+	chr2L	877927	81	+	chr2L	877846	+	chr2L	877927
TCAGGGATTGGACCTTTTGTTGAAGGGAGAGACAAGAGCTCCAGGCAACCAAACTCCGATTGAACCGCAGC:1	TCAGGGATTGGACCTTTTGTTG	CAAACTCCGATTGAACCGCAGC	+	chr3L	7332486	+	chr3L	7332559	73	+	chr3L	7332486	+	chr3L	7332559
TGCGAAAAAAAAAACTCACGTAATTTTTCACAGNGCGAGGCATTGTGTATTTAATACCGAAAAACTTTGTGGG:1	TGCGAAAAAAAAAACTCACGTA	TAATACCGAAAAACTTTGTGGG	-	chr3L	4825654	-	chr3L	4825574	80	+	chr3L	4825574	+	chr3L	4825654
TATGAACTCTGGCCGAGACGGGGAAGTGGCCATCAAAACGGAGAAATCCTCAATATATATTCGGGCAAACG:1	TATGAACTCTGGCCGAGACGGG	TCAATATATATTCGGGCAAACG	-	chr2R	12797664	-	chr2R	12789305	8359	+	chr2R	12789305	+	chr2R	12797664
CAGAATTGCAACAATACGAGTACAAGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATATGTGTGGCAAGTGCCAAGGAGG:1	CAGAATTGCAACAATACGAGTA	TGTGTGGCAAGTGCCAAGGAGG	+	chrX	21414375	+	chrX	21414448	73	+	chrX	21414375	+	chrX	21414448
TTGTGTTATTCTTTATTAAGGAAAGAATGCCGACTTCTCTGATGGGGAGTCCACCTGGCTGCCTCTAAGTCCCG:1	TTGTGTTATTCTTTATTAAGGA	ACCTGGCTGCCTCTAAGTCCCG	+	chr2R	8455907	+	chr2R	8454963	944	+	chr2R	8455907	+	chr2R	8454963
AATAGCCGGCAAATACATATCTACTAGAATCTAAAATTACTTAGCGCNTCATCGATATTGAGTGTGGNTATAAAT:1	AATAGCCGGCAAATACATATCT	GATATTGAGTGTGGNTATAAAT	-	chr2R	8603347	-	chr2R	8603156	191	+	chr2R	8603156	+	chr2R	8603347
GACGCCATGCCTCGGAATAATCTTGTTTGTGAATGAAGTTAATTAATTTAGATGTCAAG:1	GACGCCATGCCTCGGAATAATC	GTTAATTAATTTAGATGTCAAG	-	chrX	15741143	-	chrX	15740913	230	+	chrX	15740913	+	chrX	15741143
GAACAGAAGAGAATTTCCCCTAGCCAAGCTCACACTTAACCCCCTNTTTTAAGCGCCCTTCNTGGCTCCATTTTA:1	GAACAGAAGAGAATTTCCCCTA	CGCCCTTCNTGGCTCCATTTTA	-	chrX	12303293	-	chrX	12301987	1306	+	chrX	12301987	+	chrX	12303293
GGAGAAACTTTTTCTGCTGCACTGTTGCACCCAACCACACACACACGCAGATCTATTGTAAAATATGTAAGAAAG:1	GGAGAAACTTTTTCTGCTGCAC	TATTGTAAAATATGTAAGAAAG	-	chr2R	22988397	-	chr2R	22988316	81	+	chr2R	22988316	+	chr2R	22988397
ATGCCCTCTATTGCAGGCAAAAAGTAATCCGATGTCAGCTTTTAAAAATATTATTCCTATTAAAAATGGTAAAAA:1	ATGCCCTCTATTGCAGGCAAAA	TTCCTATTAAAAATGGTAAAAA	-	chr2R	22124417	-	chr2R	22124328	89	+	chr2R	22124328	+	chr2R	22124417
ATAAACTGGACAACACATATGACATGCTTATAGCCATAATCACTTTAATTGGGTGCGAAAACTAAAGTGTTTG:1	ATAAACTGGACAACACATATGA	GGTGCGAAAACTAAAGTGTTTG	+	chr2L	13701888	+	chr2L	13701966	78	+	chr2L	13701888	+	chr2L	13701966
ATATTAAATTAAATTAATTGACTGTATACTGTATCTAAATGAATAAATGTATAACAAATATTTAAAT:1	ATATTAAATTAAATTAATTGAC	AATGTATAACAAATATTTAAAT	+	chr3R	13659747	+	chr3R	13659845	98	+	chr3R	13659747	+	chr3R	13659845
CAAGATGTAGCCCCAAAANAAACTGGAGAGAATGTACGACTTCTCTGACTCCG:1	CAAGATGTAGCCCCAAAANAAA	ATGTACGACTTCTCTGACTCCG	-	chr2R	22835230	-	chr2R	22837929	2699	+	chr2R	22837929	+	chr2R	22835230
CGATAGACCTACGCACACAGNCTCATGATTTCNCTCGCTCTTNACTTTCAATTGGAGGCTCGTTTTGT:1	CGATAGACCTACGCACACAGNC	TTCAATTGGAGGCTCGTTTTGT	+	chr2R	10423742	+	chr2R	10418080	5662	+	chr2R	10423742	+	chr2R	10418080
GCCTNAGACTAAGTCGAAGTTGNAAAANTGTACAAACAANCCGAATGAAAACTAAGATTTCCCACTCAATTGCCA:1	GCCTNAGACTAAGTCGAAGTTG	AAGATTTCCCACTCAATTGCCA	-	chr3R	6371240	-	chr3R	25542784	19171544	+	chr3R	25542784	+	chr3R	6371240
AAATCCCTTTCTGCCTTTCTGAAATGAAAAATTTGGAATTTCTCTGTTCACTT:1	AAATCCCTTTCTGCCTTTCTGA	TTTGGAATTTCTCTGTTCACTT	-	chr3R	19101899	-	chr3R	19101810	89	+	chr3R	19101810	+	chr3R	19101899
GAATTTCAGCTCGATGTTCGACCTTAGCCCGTGTGCTTCATTAATCAAAAGTAATTTTCCGCCTTTCACAGCAGT:1	GAATTTCAGCTCGATGTTCGAC	ATTTTCCGCCTTTCACAGCAGT	+	chr3R	25689147	+	chr3R	25689255	108	+	chr3R	25689147	+	chr3R	25689255
TGGTCAATCAGCTCAAGTTAAGTGATGGAATCCGTTGTTTGGTTTTTGGGGTTTTTGAGCCATAAAACATAACCC:1	TGGTCAATCAGCTCAAGTTAAG	TTTGAGCCATAAAACATAACCC	-	chr3L	5388535	-	chr3L	5388211	324	+	chr3L	5388211	+	chr3L	5388535
AACTTTTCCTTTGCTGCTCTCTTTCGGCCACTTGNTTTATTTTTTAAGGAGAAACCACTGGATTATAGTTGAATA:1	AACTTTTCCTTTGCTGCTCTCT	ACCACTGGATTATAGTTGAATA	+	chr2R	8069414	+	chr2R	6760955	1308459	+	chr2R	8069414	+	chr2R	6760955
TGGATGCCTTGGTACATGTTCCACTTATCATCAAAGTATCCTGTTTTCAAGAACACTCATACTCACTTTATCAAT:1	TGGATGCCTTGGTACATGTTCC	CACTCATACTCACTTTATCAAT	-	chr2R	12363816	-	chr2R	12363384	432	+	chr2R	12363384	+	chr2R	12363816
AACCAAACATACTTATATACATTTTGCAACATGACAAATTAACCAGTCGAAGAGTAAAAACTTCTGGCACACAAT:1	AACCAAACATACTTATATACAT	GTAAAAACTTCTGGCACACAAT	-	chr2R	9510783	-	chr2R	9510667	116	+	chr2R	9510667	+	chr2R	9510783
AGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGATGGAGATGGNGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAG:1	AGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAG	GGAGATGGAGATGGAGATGGAG	+	chr3L	19220633	+	chr3L	18417066	803567	+	chr3L	19220633	+	chr3L	18417066
ATCCTCCTCCGCAGCCCCATCTAATGTGCCTAAAACAACAACCCTCCGCCCGCCGGCCACCTTACT:1	ATCCTCCTCCGCAGCCCCATCT	TCCGCCCGCCGGCCACCTTACT	+	chr3R	28907757	+	chr3R	20658125	8249632	+	chr3R	28907757	+	chr3R	20658125
ATTTAAATAGAGTATATTCACAATTTTTGCATCTACAAATCTCCGAACCGCAGCCATAAATCAAAAGTTTGTTCA:1	ATTTAAATAGAGTATATTCACA	CCATAAATCAAAAGTTTGTTCA	-	chr2L	21614464	-	chr2L	17246942	4367522	+	chr2L	17246942	+	chr2L	21614464
AAAGGACTCTTTTTATTTGTTTTGCGATTACAAAATAGTATAAAACCTTAGACAAATAGGCCTTTTAAGTATATA:1	AAAGGACTCTTTTTATTTGTTT	AAATAGGCCTTTTAAGTATATA	+	chr3L	17909687	+	chr3L	3193643	14716044	+	chr3L	17909687	+	chr3L	3193643
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:4	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
CAGAAAGCTGCAGGAAAACAGGCGCGGATAATACCACTTGCTGTATATACCTGGTAAGCC:1	CAGAAAGCTGCAGGAAAACAGG	TGCTGTATATACCTGGTAAGCC	+	chrX	20641210	+	chrX	20641306	96	+	chrX	20641210	+	chrX	20641306
AGTAAGGTACATAATTACTCAGTGATTAGTAATTCCGACTCACCTAGGAAATATTGCCGGAAAGTGTCCGCATCG:1	AGTAAGGTACATAATTACTCAG	TTGCCGGAAAGTGTCCGCATCG	-	chr3L	17510828	-	chr3L	17510744	84	+	chr3L	17510744	+	chr3L	17510828
AATAGAAATTCTGTCGTTCTCACAAATTGTGCGTGGGAAATAAAGGCAAACTAATTCAGCCATTGCATTTGTG:1	AATAGAAATTCTGTCGTTCTCA	TAATTCAGCCATTGCATTTGTG	-	chr2R	18992185	-	chr2R	18992046	139	+	chr2R	18992046	+	chr2R	18992185
AATTTCCTGACAAGTGTAGATCCAATCTAGTTATATCGCCAGCCCCACTGTTTGCTCTCCTTCTTGGACCACTAA:1	AATTTCCTGACAAGTGTAGATC	GCTCTCCTTCTTGGACCACTAA	+	chr3L	10414938	+	chr3L	10417310	2372	+	chr3L	10414938	+	chr3L	10417310
ATTTAAATGCGCGCATTTATTCACTTATAAATGCTACAACTACAACTTGACATTCTAAAACTCACCAACCAGACC:1	ATTTAAATGCGCGCATTTATTC	TCTAAAACTCACCAACCAGACC	-	chr3R	20373136	-	chr3R	13639435	6733701	+	chr3R	13639435	+	chr3R	20373136
TGTTAGCTTCCTTCAGCTCTGCGCAGCTTCAGCTGATAAGGCCAGCTGGTGGGGCAGAGGG:1	TGTTAGCTTCCTTCAGCTCTGC	GGCCAGCTGGTGGGGCAGAGGG	+	chr3R	1867173	+	chr3R	1954910	87737	+	chr3R	1867173	+	chr3R	1954910
TCGAAAGTGGAGGGCTTTTTATTTGGATTTTTGTGCTGTGTTGAAAGTGATGCAACCCATTGATTGATAGTAAAT:1	TCGAAAGTGGAGGGCTTTTTAT	AACCCATTGATTGATAGTAAAT	+	chr3R	13306139	+	chr3R	13306526	387	+	chr3R	13306139	+	chr3R	13306526
GCCAAAAGGACGAATGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATGCTCCTTTTTTGTTGGCTCATTAAAAGGCAAG:1	GCCAAAAGGACGAATGTAAGTT	TGTTGGCTCATTAAAAGGCAAG	-	chr2L	15852131	-	chr2L	15852047	84	+	chr2L	15852047	+	chr2L	15852131
AAAATATATTAAATACGTTTTCGAACAGATAGCATATGGGCTTTGTGTTTAATTATGTTAAAATGAATTGTGAAA:1	AAAATATATTAAATACGTTTTC	TATGTTAAAATGAATTGTGAAA	+	chr2R	21963213	+	chr2R	21963298	85	+	chr2R	21963213	+	chr2R	21963298
TAGTCCGGGCTTAAATTTCCGATTAATAAAGTGAAATCATGACAATATAGTCACAATAATTAAATAACTTATTAA:1	TAGTCCGGGCTTAAATTTCCGA	CAATAATTAAATAACTTATTAA	+	chrX	21358076	+	chrX	21358156	80	+	chrX	21358076	+	chrX	21358156
GTCTATCAGTAATCTGTTTCTTGGGCTAGATGANAAGCCAGTCCTCAGGGGAGGCAGCTCAGAAAAAATTAA:1	GTCTATCAGTAATCTGTTTCTT	GAGGCAGCTCAGAAAAAATTAA	+	chr3R	32022331	+	chr3R	32022430	99	+	chr3R	32022331	+	chr3R	32022430
TTACATTCCTTCAATTTATTTGCATTACTATTTTTGTAATAGTTAAAAAATCTTCAAAATTAACAGAAATTTTTT:1	TTACATTCCTTCAATTTATTTG	TCAAAATTAACAGAAATTTTTT	+	chr3R	13067135	+	chr3R	13067211	76	+	chr3R	13067135	+	chr3R	13067211
TTACTGCGTCATTTTTACTAGTAATAAATATTTTTATAATATGCCATCTCTTGTTCCTATGCTCCCACTTAGAAT:1	TTACTGCGTCATTTTTACTAGT	TTCCTATGCTCCCACTTAGAAT	-	chr2L	8687197	-	chr2L	8687093	104	+	chr2L	8687093	+	chr2L	8687197
AATAGAAAGCTCAGTCTGGAGATGGATCCTTGAAAGCGGAGCTAATATCTGCAGATCGTCCGATTTGAGAACTCC:1	AATAGAAAGCTCAGTCTGGAGA	GATCGTCCGATTTGAGAACTCC	+	chr2L	19541639	+	chr2L	19541724	85	+	chr2L	19541639	+	chr2L	19541724
GAAGAAGAAAGCACGAATATAAATCGAAATGCGGTCGCGCAATTCTTTAAGTTTAGTACAAGCAACTAAACTA:1	GAAGAAGAAAGCACGAATATAA	TTTAGTACAAGCAACTAAACTA	+	chr3R	13435412	+	chr3R	13435585	173	+	chr3R	13435412	+	chr3R	13435585
GTCGTAAAAGTCTTTGATTTGAGTTTAGCACTTCAGTCTAACGTTATGAATCCTAGGAATGGATTCATGAAGGCA:1	GTCGTAAAAGTCTTTGATTTGA	TAGGAATGGATTCATGAAGGCA	-	chr3L	22985392	-	chr3L	22985309	83	+	chr3L	22985309	+	chr3L	22985392
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACNCAACACAACACAACACAAAACAACACAAACACACACAAAA:1	CAACACAACACAACACAACACA	AACAACACAAACACACACAAAA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	12608228	3609432	+	chr2L	12608228	+	chr2L	16217660
GTTTTGGAAGTTATTTAATGTATACATGATGCCTTTTATTTTCCGATTTCTGATAACTCATCCTTCAATAAATA:1	GTTTTGGAAGTTATTTAATGTA	ATAACTCATCCTTCAATAAATA	+	chr2L	16434120	+	chr2L	16434201	81	+	chr2L	16434120	+	chr2L	16434201
GTTAAATGTTTTCTTTTTTTCGAGGTCNTTNNACCCACTTCCCACGCATNCNAAACATGAGCCCACGGAATAT:1	GTTAAATGTTTTCTTTTTTTCG	NAAACATGAGCCCACGGAATAT	+	chr2L	6295847	+	chr2L	11084509	4788662	+	chr2L	6295847	+	chr2L	11084509
AATATATTGTAAATTCAAAATATGAAGTGTAACGCACTTCCTTTAAATACCCAAATTGTTTATCAAATCTAGCCG:1	AATATATTGTAAATTCAAAATA	AATTGTTTATCAAATCTAGCCG	+	chr3L	23030195	+	chr3L	14661520	8368675	+	chr3L	23030195	+	chr3L	14661520
AGAACAGGCGAACAAGAGTAGCACCAACACNCACACACACACACACAGCAACACCCACAGAAGGAACAACAACAA:1	AGAACAGGCGAACAAGAGTAGC	CCCACAGAAGGAACAACAACAA	-	chrX	13443491	-	chrX	13443414	77	+	chrX	13443414	+	chrX	13443491
GCTGAATAAAGTTATATTTTGATAGAAGCTGAAGTTCTATTCAGAAATATATAATTATACAAATGAAATGTACGA:1	GCTGAATAAAGTTATATTTTGA	ATTATACAAATGAAATGTACGA	+	chr3R	6646579	+	chr3R	6646664	85	+	chr3R	6646579	+	chr3R	6646664
AGTAAGGCCAAAAGGACGATTGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATGCTCCTTTTTTGTTGGCTCATTAA:1	AGTAAGGCCAAAAGGACGATTG	TCCTTTTTTGTTGGCTCATTAA	-	chr2L	15852137	-	chr2L	15852055	82	+	chr2L	15852055	+	chr2L	15852137
AGAGGCAATAAAGCAAAACACATAAGCCGCAACGCCACGAAAAGGAAATGCCGATGATAAGAGGGCGAAAGCGGA:1	AGAGGCAATAAAGCAAAACACA	ATGATAAGAGGGCGAAAGCGGA	-	chr2L	3397519	-	chr2L	3397377	142	+	chr2L	3397377	+	chr2L	3397519
GTAGAAATTGAGACAAGATTGTCGAGTTGCCAAAAGTTGAGAAATGATATTTTGTTTGGGCTTCATATATATAAT:1	GTAGAAATTGAGACAAGATTGT	GTTTGGGCTTCATATATATAAT	+	chr3L	8243846	+	chr3L	8243929	83	+	chr3L	8243846	+	chr3L	8243929
AAATTTATGACATGCCAACAGCCATTTTGGCTGACACGCGTGTGCGTTAGGCTTTCCCGCCTCTTTTCATTTTC:1	AAATTTATGACATGCCAACAGC	TTTCCCGCCTCTTTTCATTTTC	+	chr3R	15517622	+	chr3R	15517704	82	+	chr3R	15517622	+	chr3R	15517704
ATTGCAGATTGCAGAATCAAAGAAATACATTAAAACGTTACACAAACCGAAGCAACACCAGTTCGATGTAGGTCC:1	ATTGCAGATTGCAGAATCAAAG	AACACCAGTTCGATGTAGGTCC	-	chr2L	8321456	-	chr2L	2349069	5972387	+	chr2L	2349069	+	chr2L	8321456
GTTCCAAAACAAAAACCACAAGAACAACTTGCTCCAATTTCGCATC:1	GTTCCAAAACAAAAACCACAAG	CAACTTGCTCCAATTTCGCATC	+	chr3L	5194398	+	chr3L	5194445	47	+	chr3L	5194398	+	chr3L	5194445
CCCTCTCNCACTTTTCTGCCCCACAATTCAACCTTCATGNACAGCCGAATGGCTACANATTTTTTAATAATAAA:1	CCCTCTCNCACTTTTCTGCCCC	CTACANATTTTTTAATAATAAA	+	chr2L	11947006	+	chr2L	11947113	107	+	chr2L	11947006	+	chr2L	11947113
ATCCAAGCAATACAAAAGGGATGTGGGATACCTCCAATCTTCTGGCAATGAGTCAAAATACGGCTGG:1	ATCCAAGCAATACAAAAGGGAT	CAATGAGTCAAAATACGGCTGG	-	chr2R	5463448	-	chr2R	5463138	310	+	chr2R	5463138	+	chr2R	5463448
ATTCAATAAAGCCTGAAAAATCGAAAAAAGCTAGAGGGTTAATCCTCGCGAAGCTGATA:1	ATTCAATAAAGCCTGAAAAATC	GTTAATCCTCGCGAAGCTGATA	+	chr3R	28035507	+	chr3R	28035568	61	+	chr3R	28035507	+	chr3R	28035568
ATTGCGANTGGTCTTTATCTCGCAAATGGGTGTAGCATTNGGGGAGATGTGAAAATGNTGATGTTATGCTTGATT:1	ATTGCGANTGGTCTTTATCTCG	AATGNTGATGTTATGCTTGATT	-	chr2L	5897682	-	chr2L	5897599	83	+	chr2L	5897599	+	chr2L	5897682
GACAGAATTGTCGGACTATACATGATAGGGCGCTGTGAGCAGGGTGCG:1	GACAGAATTGTCGGACTATACA	AGGGCGCTGTGAGCAGGGTGCG	-	chr3L	7355716	-	chr3L	7363650	7934	+	chr3L	7363650	+	chr3L	7355716
AGAGGCCGATGGTCCGGGTGGGGGTGTTTTTGTTTTGTGATCGGTGGAAAAAATTTCAATTTGCTATCCGGATGG:1	AGAGGCCGATGGTCCGGGTGGG	TTTCAATTTGCTATCCGGATGG	-	chr3R	22971340	-	chr3R	22971246	94	+	chr3R	22971246	+	chr3R	22971340
CGTGGGGTTCTGGCCCATTGACCGCAAGTGTAAGAAACAAGTCACGCACTTTTCCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCA:1	CGTGGGGTTCTGGCCCATTGAC	CCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCA	+	chr3R	5573159	+	chr3R	5573244	85	+	chr3R	5573159	+	chr3R	5573244
TAATATAAATATTTAATTTTAAAAGGGTGTTATGTATGATACGCAATCTATTAATGTTCAGAGTAGGAGATTGC:1	TAATATAAATATTTAATTTTAA	AATGTTCAGAGTAGGAGATTGC	-	chr3L	19001426	-	chr3L	10505277	8496149	+	chr3L	10505277	+	chr3L	19001426
CCAGCTGATGATCTCTGGCATTTTGGATGCCCCAGCAGCAGCAACAATTGCTGCGCCCACGCCCGCTTCAGTGG:1	CCAGCTGATGATCTCTGGCATT	GCGCCCACGCCCGCTTCAGTGG	+	chr3L	5572148	+	chr3L	5572257	109	+	chr3L	5572148	+	chr3L	5572257
GTGAATACCCTTTTTTATATGAAAAATTCAAAGATCTTAAAAGGAAATGAGACATTTTCAGGCATGCCTATGTT:1	GTGAATACCCTTTTTTATATGA	CATTTTCAGGCATGCCTATGTT	+	chr3L	7104071	+	chr3L	7104174	103	+	chr3L	7104071	+	chr3L	7104174
AACGGATAAACTTTGCTCGATTTTTTTGCATGAAATTTCAATTTTCCACCTGCAACTAAAACCAC:1	AACGGATAAACTTTGCTCGATT	TTCCACCTGCAACTAAAACCAC	+	chr2R	17982935	+	chr2R	17983010	75	+	chr2R	17982935	+	chr2R	17983010
TATCTAGAAAGGTGTGCTGTGCTTTTTGCAATTGGTCTCAGGTCCATTGGAAGGCCAACTTGAACTGACCAAG:1	TATCTAGAAAGGTGTGCTGTGC	AGGCCAACTTGAACTGACCAAG	+	chrX	6118730	+	chrX	6118810	80	+	chrX	6118730	+	chrX	6118810
GCTCCTTTTGTGCGATTTNTCCAGCCGACATTTTTGAACAGNTTGNAGTTGTATTATTATTTTAATAGAAAGAAA:1	GCTCCTTTTGTGCGATTTNTCC	TTATTATTTTAATAGAAAGAAA	-	chr2R	25102723	-	chr2R	25102554	169	+	chr2R	25102554	+	chr2R	25102723
AAACATAACCAGATTAGAAACCTATTCCTATAAACTCTATCATTGCATTGAATTTTCTAGTCTGCCATTACTTAC:1	AAACATAACCAGATTAGAAACC	TTTCTAGTCTGCCATTACTTAC	+	chr2L	976896	+	chr2L	984532	7636	+	chr2L	976896	+	chr2L	984532
TCCAAGCCCAAGGCCGTGACAAAGCGAAAAGGAAGCAGGAGTCCAAGAAAGTCCTCTTAAAAATTCATAGATTTG:1	TCCAAGCCCAAGGCCGTGACAA	CTCTTAAAAATTCATAGATTTG	+	chrX	17010974	+	chrX	17011061	87	+	chrX	17010974	+	chrX	17011061
GTCAGTACGTCCCCAAAAAANTTTTTTATNTCTTTTTGTATATGTGTGTGTG:1	GTCAGTACGTCCCCAAAAAANT	TCTTTTTGTATATGTGTGTGTG	+	chrX	12917811	+	chrX	6855839	6061972	+	chrX	12917811	+	chrX	6855839
ACACGTATTACAGGCAGCACTAACTTACTTACTATATAGACTATCATTCATGTTTCACGTGCTAATCGTGTAAG:1	ACACGTATTACAGGCAGCACTA	TTTCACGTGCTAATCGTGTAAG	+	chr2L	12487907	+	chr2L	12487987	80	+	chr2L	12487907	+	chr2L	12487987
TCGAGATCAGCGAGGAAGCATAGGATTTCTTGTTAGTCAAAACGAATTGTTCCGAAATTCGGTAATTTT:1	TCGAGATCAGCGAGGAAGCATA	TGTTCCGAAATTCGGTAATTTT	+	chr3R	30017948	+	chr3R	30012638	5310	+	chr3R	30017948	+	chr3R	30012638
CATTTAAATACTTTCTCTAAATATAAAAAATTTCATCCATTGATTAACAAACCATTTTGATTAACAATAGTACAC:1	CATTTAAATACTTTCTCTAAAT	ATTTTGATTAACAATAGTACAC	+	chr2L	6298594	+	chr2L	659561	5639033	+	chr2L	6298594	+	chr2L	659561
TTCGGTTCGCGTAATGTCTGCCCATTGTTTTGGCTTTGGATTTTAAGGAGGGACTGCAGGGGAAATCTCTGTGTT:1	TTCGGTTCGCGTAATGTCTGCC	CTGCAGGGGAAATCTCTGTGTT	+	chr3R	22433105	+	chr3R	22433205	100	+	chr3R	22433105	+	chr3R	22433205
TAAAATATCATCACTTTAAGTTAATTAATTACATTTTATGACTACAACGAAATTGTATACACTTTCCCTTCGA:1	TAAAATATCATCACTTTAAGTT	ATTGTATACACTTTCCCTTCGA	+	chrX	14813739	+	chrX	14813815	76	+	chrX	14813739	+	chrX	14813815
TTTTGGGGGAACAAATATATAGATGGCATGGAAGCATGGTACCATCTACCTGCTTGAAGAAACGCGGCGCG:1	TTTTGGGGGAACAAATATATAG	CTGCTTGAAGAAACGCGGCGCG	+	chrX	4613575	+	chrX	4613661	86	+	chrX	4613575	+	chrX	4613661
GCCATGTGTTGACAGAGCCACGTTAGCACAGCTGATTTTACGACTCGTAACTGAG:1	GCCATGTGTTGACAGAGCCACG	GATTTTACGACTCGTAACTGAG	+	chr3L	16515034	+	chr3L	16515092	58	+	chr3L	16515034	+	chr3L	16515092
AAGTGCCCACACGTGATCGGCTCCTGATAGCGACAACAAACTAATGACCAAAAGTCCCACTGAGCAAGGACCGGC:1	AAGTGCCCACACGTGATCGGCT	GTCCCACTGAGCAAGGACCGGC	-	chr3L	22001436	-	chr3L	22001357	79	+	chr3L	22001357	+	chr3L	22001436
CTGGATGCCTTGGTACATGTTCCACTTATCATCAAAGTATCCTGTTTTCAAGAACACTCATACTCACTTTATC:1	CTGGATGCCTTGGTACATGTTC	GAACACTCATACTCACTTTATC	-	chr2R	12363817	-	chr2R	12363387	430	+	chr2R	12363387	+	chr2R	12363817
CTAGGATGTTGTAATGATTTNCTGCGAGTATTNTAATGAAAANTGACCCTCTGTTATCAGTTATCAGAGCTTGTA:1	CTAGGATGTTGTAATGATTTNC	TTATCAGTTATCAGAGCTTGTA	-	chr3R	23626450	-	chr3R	23626351	99	+	chr3R	23626351	+	chr3R	23626450
GCTTTTGNATGCATTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGANTAATTTTCAAAGTGCTCNCCTTCATTTTCGCTG:1	GCTTTTGNATGCATTTTTGTCT	GTGCTCNCCTTCATTTTCGCTG	+	chr3L	2534622	+	chr3L	2534703	81	+	chr3L	2534622	+	chr3L	2534703
CAGGTAGATGGTACCATGCTTCCATGCCATCTATNTATTTGTTCCCCCAAAAGAGACCGGGATTTATGATTATG:1	CAGGTAGATGGTACCATGCTTC	GAGACCGGGATTTATGATTATG	-	chrX	4613642	-	chrX	4613553	89	+	chrX	4613553	+	chrX	4613642
TTTCGTTGCATACTGTTATGCAACATTTTAAATTATTTTCGCATAGTTTNAATTTGTATATTGTCAATATGACTG:1	TTTCGTTGCATACTGTTATGCA	TTGTATATTGTCAATATGACTG	-	chr3R	19187773	-	chr3R	21573206	2385433	+	chr3R	21573206	+	chr3R	19187773
GCTTATTACTTTGATGTAAGATTTAATGTAATGTGCATTTAAAAAGTGAGGAGATAA:1	GCTTATTACTTTGATGTAAGAT	CATTTAAAAAGTGAGGAGATAA	+	chr3R	7320444	+	chr3R	7320514	70	+	chr3R	7320444	+	chr3R	7320514
GTCAAATCCATTAACCTGATATTTCCTTTTTCCATTTATTCCTTTGCTGGAGCGTATGCAAATATTCACTTTT:1	GTCAAATCCATTAACCTGATAT	GCGTATGCAAATATTCACTTTT	-	chr3R	30665381	-	chr3R	19447873	11217508	+	chr3R	19447873	+	chr3R	30665381
CATAAATAATAATGTTTCCTATGCGCCGCCCGACTTTCCTCCGACCGCCCCCATTTGTGCATTGCGACTTCATTG:1	CATAAATAATAATGTTTCCTAT	TTTGTGCATTGCGACTTCATTG	+	chr2R	24155676	+	chr2R	11783367	12372309	+	chr2R	24155676	+	chr2R	11783367
CGAAGAGTGCTCCACCTGCATATTGAGATTACATGACATGAATGCAAATCCCTTATAATTATCAGCTG:1	CGAAGAGTGCTCCACCTGCATA	AATCCCTTATAATTATCAGCTG	+	chr3L	18118223	+	chr3L	18118294	71	+	chr3L	18118223	+	chr3L	18118294
ATCGGAAATACAAATGCACATTTTCAGCTTTGAATTTTTTCTGTTTAACATCGAGGTCGGAAATTTAAGAGGAG:1	ATCGGAAATACAAATGCACATT	GAGGTCGGAAATTTAAGAGGAG	-	chr2L	20984700	-	chr2L	20984620	80	+	chr2L	20984620	+	chr2L	20984700
TGATGCGTCGAGGATAAGAAAAGAAAGCAGATGGTGCNTCTGATANAGCAGGTGCAACAGCCCA:1	TGATGCGTCGAGGATAAGAAAA	ATANAGCAGGTGCAACAGCCCA	+	chr3R	30124973	+	chr3R	30125038	65	+	chr3R	30124973	+	chr3R	30125038
AGAGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGAAATTATTTAAAGCCATTAGTTAAATTGAAAGACAGCGC:1	AGAGATGGCCAAAAGCTGCTAA	TAGTTAAATTGAAAGACAGCGC	-	chrX	19109312	-	chrX	19109128	184	+	chrX	19109128	+	chrX	19109312
AATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCNTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGNATACTTTTCAGAG:1	AATATATGTATAGTAGTAGTAG	ATTTAAAGNATACTTTTCAGAG	-	chr2R	15005077	-	chr2R	15004749	328	+	chr2R	15004749	+	chr2R	15005077
GCGTCACGCCGCGAGATGCGTTATCACACAATGCACTCGAGGAAGTTGGTCTATTGTTTTG:1	GCGTCACGCCGCGAGATGCGTT	AGGAAGTTGGTCTATTGTTTTG	-	chr3R	25031474	-	chr3R	11608810	13422664	+	chr3R	11608810	+	chr3R	25031474
GCTTGCATTTAATATAAACTTGTGTTTNAANNCATATTAGTTTGGATTANANTCAATGGGCCTAACATTAAAATA:1	GCTTGCATTTAATATAAACTTG	CAATGGGCCTAACATTAAAATA	-	chr3R	7974397	-	chr3R	7973335	1062	+	chr3R	7973335	+	chr3R	7974397
CCCCATTCTGTTTGCATTTCTAGCAATTGATAAAAATATTTCTTTTGGCAAATGCTTATGATAAACATGTTGTAA:1	CCCCATTCTGTTTGCATTTCTA	GCTTATGATAAACATGTTGTAA	+	chr3L	5104499	+	chr3L	5124633	20134	+	chr3L	5104499	+	chr3L	5124633
ACTAACGTNAACTAACACCTGTTTTTAATGCATCACTNNNNTTGGCCTGGCTCACATCTCANTTCACCCGTCAAG:1	ACTAACGTNAACTAACACCTGT	ACATCTCANTTCACCCGTCAAG	+	chr3R	26600969	+	chr3R	26601054	85	+	chr3R	26600969	+	chr3R	26601054
CGGAAAAATACATCTCAATAAAGATGTCTGTGTAGCTAGCTCAACGATGATGATGATGCATTGAACCTGGGAGTG:1	CGGAAAAATACATCTCAATAAA	TGATGCATTGAACCTGGGAGTG	+	chr2R	23427787	+	chr2R	23427929	142	+	chr2R	23427787	+	chr2R	23427929
GCCAAGACTCGAGAGCCCAAGAGCTGAAAACCAGACCACAAATGCTAATCAGCGATGCTTTATGATTTTCGGTAT:1	GCCAAGACTCGAGAGCCCAAGA	GATGCTTTATGATTTTCGGTAT	-	chr3R	27470721	-	chr3R	27470059	662	+	chr3R	27470059	+	chr3R	27470721
TTTAATAATGTAATAAGTAATATAATTTAACAGTGATAATCTGGAATTGAAGCAATACAATAAAAAAAAAGGGAT:1	TTTAATAATGTAATAAGTAATA	AATACAATAAAAAAAAAGGGAT	-	chr3L	7503560	-	chr3L	7498783	4777	+	chr3L	7498783	+	chr3L	7503560
TGTTACAAACTTTCTAGCCATCTATTTGCTATATCAAATATCCTCTGTACGAAACCTCATTTGCAAACACATAAT:1	TGTTACAAACTTTCTAGCCATC	ACCTCATTTGCAAACACATAAT	+	chr3R	9108877	+	chr3R	9108953	76	+	chr3R	9108877	+	chr3R	9108953
CCCAAAAAAGTATGCTACGCTTTGTGGTTCCCACGCAGCGTGCAATATGAT:1	CCCAAAAAAGTATGCTACGCTT	CCCACGCAGCGTGCAATATGAT	-	chr3R	29407913	-	chr3R	29406651	1262	+	chr3R	29406651	+	chr3R	29407913
CAAAAAGTCTGGCAAGACTCTTCCCCCGATCGAGATATATATGTATATACGTAGACATACGACATAGAGATCGA:1	CAAAAAGTCTGGCAAGACTCTT	AGACATACGACATAGAGATCGA	+	chr2R	11415532	+	chr2R	11418680	3148	+	chr2R	11415532	+	chr2R	11418680
ACGGATGCCCTTTAATCCATTGTTATTCGCTGGGTGGCAATCGCAATGAATGTTGTT:1	ACGGATGCCCTTTAATCCATTG	GGCAATCGCAATGAATGTTGTT	-	chr3R	6964701	-	chr3R	6964620	81	+	chr3R	6964620	+	chr3R	6964701
CCTAGAAAGTGCAGTTCAAAGTTTTACCCCTTCTCAGTGCTTTCTCAAACATCAAAGCGAGCGAAACTC:1	CCTAGAAAGTGCAGTTCAAAGT	AACATCAAAGCGAGCGAAACTC	-	chr3R	31426970	-	chr3R	31426884	86	+	chr3R	31426884	+	chr3R	31426970
TATTAGTTTATCTTCTTTGTAAATGCCATTCGTGGTTTCTATGGTTTACCCCTCAGC:1	TATTAGTTTATCTTCTTTGTAA	TTTCTATGGTTTACCCCTCAGC	+	chr3L	21082227	+	chr3L	21082287	60	+	chr3L	21082227	+	chr3L	21082287
AACCATAACCATTTCCTTCTCGACAATCCCCCAACGGCTAACACATTTATGGCCAG:1	AACCATAACCATTTCCTTCTCG	CGGCTAACACATTTATGGCCAG	-	chrX	20897580	-	chrX	19096043	1801537	+	chrX	19096043	+	chrX	20897580
AAAATTGACAGCACCGGCACACCAGCTGTCTTCAGTGACAAGCTGTCGGGAAATTGAAAGGGGAATGATCACCAG:1	AAAATTGACAGCACCGGCACAC	TTGAAAGGGGAATGATCACCAG	-	chr3R	15811741	-	chr3R	15811500	241	+	chr3R	15811500	+	chr3R	15811741
CAGCACCTTCCCTACCCTNTATATGTACATGCATACATACANACANAGCCAAATTTAACTCTCTGCTCTCCAATT:1	CAGCACCTTCCCTACCCTNTAT	TTTAACTCTCTGCTCTCCAATT	+	chr3R	8090571	+	chr3R	8094048	3477	+	chr3R	8090571	+	chr3R	8094048
CATCGCCCATCAAGTGGAGNTCCGCTGATCAGGGCTTTGCATAACTACAAGAACATAAGACTGAGGCAACTCAAT:1	CATCGCCCATCAAGTGGAGNTC	CATAAGACTGAGGCAACTCAAT	+	chr3R	25832711	+	chr3R	25841893	9182	+	chr3R	25832711	+	chr3R	25841893
CATGTATGGCATTGTCCTCGTCATGCTTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGGTTGGATGTGTTTGGCCAAG:1	CATGTATGGCATTGTCCTCGTC	TGGTTGGATGTGTTTGGCCAAG	+	chr3R	18766798	+	chr3R	18766875	77	+	chr3R	18766798	+	chr3R	18766875
CATACATACATACATACATATATATACTTTTATGGATGAGGGGTTTGCGAGGGGATTAACCCAAATAGCGTGGGA:1	CATACATACATACATACATATA	GATTAACCCAAATAGCGTGGGA	+	chr2L	17474695	+	chr2L	12779681	4695014	+	chr2L	17474695	+	chr2L	12779681
AATGCCCAAACGTGTTCCTTTTTAGTATGTATGTATATCTTTGTGCTCTGGGCAAATATTTTGACCGAAAATTTA:1	AATGCCCAAACGTGTTCCTTTT	AAATATTTTGACCGAAAATTTA	-	chrX	10343686	-	chrX	10343494	192	+	chrX	10343494	+	chrX	10343686
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACCCAACTAACAACACAACCGAAGCA:1	CACAACACAACACAACACAACA	AACTAACAACACAACCGAAGCA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	26887753	4980218	+	chr3R	21907535	+	chr3R	26887753
GCNGAACAGGCGCTCACAAGGGGATATCTACATANGNAACATTGCAATTCTCAATGAATTGGGAATAGTAGATAG:1	GCNGAACAGGCGCTCACAAGGG	ATGAATTGGGAATAGTAGATAG	-	chr3L	13338395	-	chr3L	13338299	96	+	chr3L	13338299	+	chr3L	13338395
TTTTGTGTAAATGTAAATACATTTTGTATATATAAATTAATACGAGAATTCTATAAAAGCAAATGCANTTATCAA:1	TTTTGTGTAAATGTAAATACAT	TAAAAGCAAATGCANTTATCAA	-	chr3R	20209912	-	chr3R	20209826	86	+	chr3R	20209826	+	chr3R	20209912
TATAAGCCNTAAAATCTCTTTTACTGCGAATCAAGGGATTCCTGAGGGTATTGTAAAGTCCGCCAAAGTGCTGTA:1	TATAAGCCNTAAAATCTCTTTT	TAAAGTCCGCCAAAGTGCTGTA	+	chr3L	6621780	+	chr3L	6621936	156	+	chr3L	6621780	+	chr3L	6621936
GCGATGAATTGTATGCAAAGCGGATAAGACAGATAAATTGAAAACGAAACACAAACACAAACACAAACACAAACA:1	GCGATGAATTGTATGCAAAGCG	AACACAAACACAAACACAAACA	+	chr3L	1600269	+	chr3L	11777678	10177409	+	chr3L	1600269	+	chr3L	11777678
AACTATGCTCCTCCCTTATATCAGGCCGCTCATTGATTTGATGATGGGTCGAACCCTGCCCACATCCCGTGC:1	AACTATGCTCCTCCCTTATATC	GAACCCTGCCCACATCCCGTGC	+	chr3R	28597505	+	chr3R	28597579	74	+	chr3R	28597505	+	chr3R	28597579
TGCATGAAATTGTTGTCTGCAAGGGGCCGAAGGGTACTGGCGCAATGGCATTATTACTGGAGTCTGAAACAACT:1	TGCATGAAATTGTTGTCTGCAA	ATTACTGGAGTCTGAAACAACT	+	chr2R	21932282	+	chr2R	21932359	77	+	chr2R	21932282	+	chr2R	21932359
GGTTTTAGGGTTTGTGGGTCATGGATCGGGGTTCCGTGCGTATACATGCNATTGTACCCATCAATTAAATCATTA:1	GGTTTTAGGGTTTGTGGGTCAT	GTACCCATCAATTAAATCATTA	-	chr2R	10388086	-	chr2R	10387989	97	+	chr2R	10387989	+	chr2R	10388086
GTCAGTATGGCAGGATACCCGCCCCCTGATATATCCACGCTGCACCTGCAGCTTAAATTTGCAATTTTTCCCGCC:1	GTCAGTATGGCAGGATACCCGC	TAAATTTGCAATTTTTCCCGCC	+	chr3L	21186079	+	chr3L	21186155	76	+	chr3L	21186079	+	chr3L	21186155
CACAACGTAGGAGACCTGATGATGCAAAGATGCCTCCTTTCTTGGTCTCNGTTTGCATTTAAGACTTTCCGAG:1	CACAACGTAGGAGACCTGATGA	TTTGCATTTAAGACTTTCCGAG	+	chr3R	4644057	+	chr3R	13247148	8603091	+	chr3R	4644057	+	chr3R	13247148
GGTTTTAGGGTCAATTTAGGCAAGCTTTACGTAATTTGGGAAACTTTTCATAATCCAAAACCAA:1	GGTTTTAGGGTCAATTTAGGCA	ACTTTTCATAATCCAAAACCAA	-	chrX	16700627	-	chrX	16700556	71	+	chrX	16700556	+	chrX	16700627
CTACACAACTTTTGCAAGCCCCAAATCGCAAAATCCCAGGCACGTGAAAAGCTATTAAAATGGCGCCAAGGCGTC:1	CTACACAACTTTTGCAAGCCCC	ATTAAAATGGCGCCAAGGCGTC	-	chr2R	15582748	-	chr2R	19028145	3445397	+	chr2R	19028145	+	chr2R	15582748
AGACACAATGTCTTCAAAGTGTATAGTTTAAAACTACATGCGAAACAGCTTGTTTTTATCAGTGTACTCCAGATA:1	AGACACAATGTCTTCAAAGTGT	TTTTATCAGTGTACTCCAGATA	-	chr2R	18308409	-	chr2R	18308303	106	+	chr2R	18308303	+	chr2R	18308409
TACTTAATTGTTGGTAATTAAAGTACAATTAAAAGAACATTCTCTTACCAATTAGTAATAAGAGCAACAAGACG:1	TACTTAATTGTTGGTAATTAAA	TAGTAATAAGAGCAACAAGACG	-	chr3L	3902565	-	chr3L	3902478	87	+	chr3L	3902478	+	chr3L	3902565
CTTATAAAAACTGGGAAAGAGCCGAGATTAAAAATGACAAACAANTCAAGCCAGAAATCTTGTTCAAAATT:1	CTTATAAAAACTGGGAAAGAGC	GCCAGAAATCTTGTTCAAAATT	-	chrX	14633191	-	chrX	17039908	2406717	+	chrX	17039908	+	chrX	14633191
TTACAGTTACGATAATTTATGCATGCGATATACAACCATTGACTCCGGCTTGAATTCACAGGATCCGG:1	TTACAGTTACGATAATTTATGC	GGCTTGAATTCACAGGATCCGG	-	chr2L	9980844	-	chr2L	9973732	7112	+	chr2L	9973732	+	chr2L	9980844
CGCGTACTGTATATACTCGTACATATGACTTTGACCCACCGCACCGCCCTGGAAGGATCTCAATCTGCTGCTGC:1	CGCGTACTGTATATACTCGTAC	AAGGATCTCAATCTGCTGCTGC	-	chr3R	10775197	-	chr3R	26628487	15853290	+	chr3R	26628487	+	chr3R	10775197
AATGTTTAATAATTTTTATAATAGCCCACAGTTGCTAGTGACGAGTATATGTAT:1	AATGTTTAATAATTTTTATAAT	TGCTAGTGACGAGTATATGTAT	+	chr3L	6386256	+	chr3L	6386322	66	+	chr3L	6386256	+	chr3L	6386322
ATCTTGACGTTTATCAGAAAAGGCAGGAGCACCAAATCGGATACGGAATCCACCGAAC:1	ATCTTGACGTTTATCAGAAAAG	TCGGATACGGAATCCACCGAAC	+	chr3R	23967245	+	chr3R	23967796	551	+	chr3R	23967245	+	chr3R	23967796
TTGACGGAAACGAAAGAAATGAAATACTAGGTGTAAATAATGGGTATATTTTAATATCCGTTATTTGTGGGCTA:1	TTGACGGAAACGAAAGAAATGA	AATATCCGTTATTTGTGGGCTA	-	chr2R	7217611	-	chr2R	7209864	7747	+	chr2R	7209864	+	chr2R	7217611
CGTACGCCCCGCAATTGAAATGCTTTTCTGCTCGTTGAAAGCCTTTATAGGCCAAGC:1	CGTACGCCCCGCAATTGAAATG	TGAAAGCCTTTATAGGCCAAGC	-	chr3L	21886469	-	chr3L	21886404	65	+	chr3L	21886404	+	chr3L	21886469
TACGAAATTGATTGTATTTAATTTAAGTTTAAGTGGTTATGGGATTTACTTACATTTACATATGTATAT:1	TACGAAATTGATTGTATTTAAT	ACTTACATTTACATATGTATAT	+	chr3L	8634920	+	chr3L	12063638	3428718	+	chr3L	8634920	+	chr3L	12063638
CATATCTTGGCTTAGGCCTCATTAACCTGCTAAAGATCTCCATGGCACTGGGCGAGATAAGAGAAACGTGAGTCA:1	CATATCTTGGCTTAGGCCTCAT	GAGATAAGAGAAACGTGAGTCA	-	chrX	2531877	-	chrX	1379723	1152154	+	chrX	1379723	+	chrX	2531877
TATGCTACGAAAAAGTTGCTGTCGAAACGGAACTGGAAAACCATGAAAATGTCCTTGCCAGCTAAATGCCACTCT:1	TATGCTACGAAAAAGTTGCTGT	CTTGCCAGCTAAATGCCACTCT	-	chrX	20378796	-	chrX	20377329	1467	+	chrX	20377329	+	chrX	20378796
AAAAATATCTAAAAACAATAACTTAACTTAGTTTATAAAAAAAAGCCCAAAAGTAAATAGCTGAA:1	AAAAATATCTAAAAACAATAAC	AGCCCAAAAGTAAATAGCTGAA	-	chr3R	1062546	-	chr3R	1062398	148	+	chr3R	1062398	+	chr3R	1062546
AAAACATTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGT:1	AAAACATTTCGGGATATAATCT	CGACTTCACTTAAAGTGCATGT	-	chr3R	28484370	-	chr3R	28486287	1917	+	chr3R	28486287	+	chr3R	28484370
ATCCTCATAATTTCGACGTTTCTGTTTTCATTAATCCAGTTTTTGTTCTAACTCT:1	ATCCTCATAATTTCGACGTTTC	ATCCAGTTTTTGTTCTAACTCT	-	chr3L	12012381	-	chr3L	12012322	59	+	chr3L	12012322	+	chr3L	12012381
GCATGATGGAGCTACCGGGCTCGTTCTCCGGCAGCGAGAGCNCACCCAAACCGCAAC:1	GCATGATGGAGCTACCGGGCTC	GAGAGCNCACCCAAACCGCAAC	-	chrX	6683124	-	chrX	6681151	1973	+	chrX	6681151	+	chrX	6683124
CAACAAAATGGCTTAGTGCCACAGAATTTACCCATTTCATATTGCGTCNTTTTCAGCGGTGTTT:1	CAACAAAATGGCTTAGTGCCAC	TGCGTCNTTTTCAGCGGTGTTT	-	chrX	11769699	-	chrX	17586809	5817110	+	chrX	17586809	+	chrX	11769699
ACATACATATATCACATAGGAAACATAGCTAACATCCCTATATCACGAAAAGCTAGGAGAAAGGTACA:1	ACATACATATATCACATAGGAA	GAAAAGCTAGGAGAAAGGTACA	+	chrX	18122824	+	chrX	18122893	69	+	chrX	18122824	+	chrX	18122893
CTTATTTTAAGCAATAGAATCGTAAAGTTCTCAACACAAAAATTCTTGCATACTTTTGCTGTCACTACTAATTG:1	CTTATTTTAAGCAATAGAATCG	CTTTTGCTGTCACTACTAATTG	-	chr2R	17152280	-	chr2R	17147250	5030	+	chr2R	17147250	+	chr2R	17152280
GTTTGCCAGTCGGCTAATGACATGTTCATGGTACGAATAATTTCTACCGTTACAATCGCTTTAAGACAACCAAAT:1	GTTTGCCAGTCGGCTAATGACA	AATCGCTTTAAGACAACCAAAT	+	chr2L	13152259	+	chr2L	13152337	78	+	chr2L	13152259	+	chr2L	13152337
TGGACCACATTTTCGAGGACTGTCAGCGGCAGCAAAAGGAACTTTAAGGGAAAAGGATCAGGACGAATGCACTTT:1	TGGACCACATTTTCGAGGACTG	AGGATCAGGACGAATGCACTTT	-	chrX	21040461	-	chrX	21045379	4918	+	chrX	21045379	+	chrX	21040461
AAGCTTTTATCTTTGGGCCAGCCAGGCGATGTGAGTATATCTTAATCATCATAAACCGCAATCATCAGACATTGA:1	AAGCTTTTATCTTTGGGCCAGC	AACCGCAATCATCAGACATTGA	+	chr2R	19049867	+	chr2R	13804479	5245388	+	chr2R	19049867	+	chr2R	13804479
AGCAAAGGACCCTAGCACACACACACACACACACACTCGCATTCAGAAATGTGCACAACAAAACGCATCGAAACA:1	AGCAAAGGACCCTAGCACACAC	CACAACAAAACGCATCGAAACA	-	chr2R	22790980	-	chr2R	22265128	525852	+	chr2R	22265128	+	chr2R	22790980
GACATAGACAGGGGACATNGGCACGACTATTCGCTGCTAGANAAANATAAAAAATTAAAAAAAAAA:1	GACATAGACAGGGGACATNGGC	ANATAAAAAATTAAAAAAAAAA	+	chr3L	8860855	+	chr3L	10874883	2014028	+	chr3L	8860855	+	chr3L	10874883
CGAGGCAATAAGGCTGCAATGGCTATTTGGCAACTGGGAGCTTGGGTACTTGTGATTAGCGGCCCTAGAGA:1	CGAGGCAATAAGGCTGCAATGG	TTGTGATTAGCGGCCCTAGAGA	+	chr2R	9832852	+	chr2R	9832937	85	+	chr2R	9832852	+	chr2R	9832937
TTGGTACGCATTTCTGATTAGAGAAACTGAAAATTTCCCCCGGTGTACAACTCTCAATGAAGGTCTGCTGATTC:1	TTGGTACGCATTTCTGATTAGA	CTCAATGAAGGTCTGCTGATTC	-	chr3L	9084514	-	chr3L	9076955	7559	+	chr3L	9076955	+	chr3L	9084514
TTAGCACTAGTTATGGGCATATTTTCACTGATTTACTGTTGAGTAATTAGTTTGAAATCATAACTAATGG:1	TTAGCACTAGTTATGGGCATAT	AGTTTGAAATCATAACTAATGG	-	chr2L	3108957	-	chr2L	3108885	72	+	chr2L	3108885	+	chr2L	3108957
ATNAATTATATATATGAAGCCCAAACAAAATATCNTNTCTCAACTTTTGGCAACTCGACAATCTTGTCTCAATTT:1	ATNAATTATATATATGAAGCCC	CTCGACAATCTTGTCTCAATTT	-	chr3L	8243933	-	chr3L	8243850	83	+	chr3L	8243850	+	chr3L	8243933
TGTTGCAACTGCTGCTGCTGCTGCTGCAATTGANGCCTTCCGAGGAGGAGC:1	TGTTGCAACTGCTGCTGCTGCT	TTGANGCCTTCCGAGGAGGAGC	+	chr3R	21987958	+	chr3R	12532042	9455916	+	chr3R	21987958	+	chr3R	12532042
ATGACTGAATCTAACAAGCTNCATGTAAAAGANTTTAAAGTGNAATTAAGGGATTGCATTGATGCAAAGAAGCGC:1	ATGACTGAATCTAACAAGCTNC	TTGCATTGATGCAAAGAAGCGC	-	chr3R	31805224	-	chr3R	31805148	76	+	chr3R	31805148	+	chr3R	31805224
CGCTTGATCACTTTTATATTGATATTAAAGATNCTGCTAGCTCAAAATTAAAATCAAAAGTACTTTNCAAGTTC:1	CGCTTGATCACTTTTATATTGA	ATCAAAAGTACTTTNCAAGTTC	-	chr2R	18675242	-	chr2R	18675165	77	+	chr2R	18675165	+	chr2R	18675242
AACCAAATATTTACTTCACCTATTTTATTACACTTACAATCAGAANTT:1	AACCAAATATTTACTTCACCTA	ATTACACTTACAATCAGAANTT	-	chr3L	2908253	-	chr3L	2908179	74	+	chr3L	2908179	+	chr3L	2908253
TGTTGGTGTAACAAAAAGTGGGCAACTTTGCTAAATTGCCAGGGCAGT:1	TGTTGGTGTAACAAAAAGTGGG	TTTGCTAAATTGCCAGGGCAGT	+	chr2L	14564223	+	chr2L	14564272	49	+	chr2L	14564223	+	chr2L	14564272
ACGTGTGTCCGCCCCTTATTTTTTGCTTTTCCTTTTGCGTTTCGGGCTTTTGTG:1	ACGTGTGTCCGCCCCTTATTTT	TTTTGCGTTTCGGGCTTTTGTG	+	chr3L	808962	+	chr3L	9499739	8690777	+	chr3L	808962	+	chr3L	9499739
CGGTATCAAAAGTTGAGAATTTGAACAATAACTATCTCTCTGTTTAAGCTTAAGTTGAATGTGGAGACTGCTGCT:1	CGGTATCAAAAGTTGAGAATTT	GTTGAATGTGGAGACTGCTGCT	-	chr2L	21284557	-	chr2L	21284084	473	+	chr2L	21284084	+	chr2L	21284557
ATCTGGAGCTTAACAATTAAAATGGGTGGGTAGTGTAAGCTTAAAAGTAGTTAATGCAAGCAACCCTGAGTGAGT:1	ATCTGGAGCTTAACAATTAAAA	ATGCAAGCAACCCTGAGTGAGT	+	chr3R	15601186	+	chr3R	15608708	7522	+	chr3R	15601186	+	chr3R	15608708
CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAGCACAAGCNCAAACACNCACACAAACACAAACACA:1	CACAAACACAAACACAAACACA	CACNCACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16071771	-	chr2L	10176024	5895747	+	chr2L	10176024	+	chr2L	16071771
GTCGTGTCTATTACGTACTAAATTATTGTGTTGGAGGCACTACAACGTTTA:1	GTCGTGTCTATTACGTACTAAA	GTTGGAGGCACTACAACGTTTA	+	chr2R	14651958	+	chr2R	12123800	2528158	+	chr2R	14651958	+	chr2R	12123800
ATGGCCCCCAAATATTTTCGCGTCGTTTTCGCCTTTTTTTTT:1	ATGGCCCCCAAATATTTTCGCG	CGTCGTTTTCGCCTTTTTTTTT	-	chr3R	23496798	-	chr3R	31938173	8441375	+	chr3R	31938173	+	chr3R	23496798
GGCCCTACGTGCACGTCGTGAACTGCTGCCGGAACGGTAACAACCTCCAAAACATCCTTTCC:1	GGCCCTACGTGCACGTCGTGAA	CAACCTCCAAAACATCCTTTCC	+	chr2R	7495821	+	chr2R	4580535	2915286	+	chr2R	7495821	+	chr2R	4580535
ATCCCTAAGTCCGCTCAAGTGTCCCGTAAGGGCTTCAAGAAGCTCCAGGAACAGCGCGTCGCCCTCAAGGTTG:1	ATCCCTAAGTCCGCTCAAGTGT	CAGCGCGTCGCCCTCAAGGTTG	+	chr2L	17306494	+	chr2L	16780682	525812	+	chr2L	17306494	+	chr2L	16780682
ACACATGAGCCGAGAAATGAGCGTACCCATAAATTTGACTTTAATTTGAATTCATTTTACGAGAGTATTGAGCTG:1	ACACATGAGCCGAGAAATGAGC	ATTTTACGAGAGTATTGAGCTG	+	chr3L	8639227	+	chr3L	10217014	1577787	+	chr3L	8639227	+	chr3L	10217014
AACAAACATGAGGTGGTTGCAAAAAAAAAAATGTAGCTGTCTGTGGCATTAATTTCGCCGCTCAATTAT:1	AACAAACATGAGGTGGTTGCAA	ATTAATTTCGCCGCTCAATTAT	-	chr3L	9938459	-	chr3L	9929686	8773	+	chr3L	9929686	+	chr3L	9938459
GACGATTGCGATTGCTAATGTCCCTAAAATGGGGGAAAATAAAGGATGGTTCTGGGGGGGATTTCGCTGATGGCT:1	GACGATTGCGATTGCTAATGTC	GGGGGGGATTTCGCTGATGGCT	-	chr3R	7321216	-	chr3R	31095926	23774710	+	chr3R	31095926	+	chr3R	7321216
TGGCCCAGAGTGGGTTAGTCNCTGGGCTAAGCNGGAGCCCAGNGCTTTGTTCGCTCCCCGGGCTTTGTTCTCCGG:1	TGGCCCAGAGTGGGTTAGTCNC	CTCCCCGGGCTTTGTTCTCCGG	-	chr3R	28182892	-	chr3R	28182692	200	+	chr3R	28182692	+	chr3R	28182892
ATGGGATGAACAATGTTAGTATTTAATTAATTTTATGATTTCGACATGATTTCTGAACAACTAATTATACATCAC:1	ATGGGATGAACAATGTTAGTAT	TGAACAACTAATTATACATCAC	+	chrX	20041566	+	chrX	20041646	80	+	chrX	20041566	+	chrX	20041646
GTGAAATTGATATAGTATGGGAAGTTAATTAAGAAGGAGAAGTCGTCGAAGAAGGCTATTTACACANTTAATTG:1	GTGAAATTGATATAGTATGGGA	AGGCTATTTACACANTTAATTG	+	chr3R	8879814	+	chr3R	26205702	17325888	+	chr3R	8879814	+	chr3R	26205702
TTCAATTAGACCTGTGTAAATATTTTTTCGGGGCAGCTGCTGCAAATNAGAATGAGTGCAGCCTG:1	TTCAATTAGACCTGTGTAAATA	AAATNAGAATGAGTGCAGCCTG	-	chr2L	17281099	-	chr2L	17281032	67	+	chr2L	17281032	+	chr2L	17281099
TTATTTGTTGTTTATCTGTGTAAAGCATCTCTGTGACACTTTCAGGCCACGGCAGACTTGCCAGAAGGGACGGCA:1	TTATTTGTTGTTTATCTGTGTA	AGACTTGCCAGAAGGGACGGCA	-	chr2L	10956163	-	chr2L	10946948	9215	+	chr2L	10946948	+	chr2L	10956163
TTGTAAGTTAGGGGTTGGTCACGAGCGCGGTATTCTGTATGCTGGGTGCTAAGTCATCGCATCAGTAAGAGAGAC:1	TTGTAAGTTAGGGGTTGGTCAC	TCATCGCATCAGTAAGAGAGAC	+	chr4	671633	+	chr4	680216	8583	+	chr4	671633	+	chr4	680216
GTTTAAAATCTGCAAAATCTGTTCTAAACACTGCGCCCTTATATGACACTTGTCTTAGGGCGAGCGCCCACT:1	GTTTAAAATCTGCAAAATCTGT	TGTCTTAGGGCGAGCGCCCACT	-	chr3R	6408143	-	chr3R	6408015	128	+	chr3R	6408015	+	chr3R	6408143
ACCCGCAGTCGGGGTAGAAAAAGGTCAAAAAGCCAAGAGATTGAAATATAGAAAAGGCGAC:1	ACCCGCAGTCGGGGTAGAAAAA	ATTGAAATATAGAAAAGGCGAC	+	chr3R	8081176	+	chr3R	8081240	64	+	chr3R	8081176	+	chr3R	8081240
GAAAATATTTTGAAAATAATTCAAAAAATATTTTTTACCTTTTTTTGGGTCCATGTTAAACTTTTTACGGCCAA:1	GAAAATATTTTGAAAATAATTC	ATGTTAAACTTTTTACGGCCAA	+	chr2L	21743777	+	chr2L	21743853	76	+	chr2L	21743777	+	chr2L	21743853
GAAGCGATGGCACTGCCCACCTTTTTACCCTGGAGCCTACAAAGCAATCCTCATCAAAG:1	GAAGCGATGGCACTGCCCACCT	TACAAAGCAATCCTCATCAAAG	+	chr2L	19737383	+	chr2L	19740836	3453	+	chr2L	19737383	+	chr2L	19740836
GTCATTATTCAATGCTAGGCATTATCTGGTTTTAATGTTTGTTACGTNCGGACATCTTCATNTCGCAGGATCTTT:1	GTCATTATTCAATGCTAGGCAT	ATCTTCATNTCGCAGGATCTTT	-	chr2R	2508136	-	chr2R	2498989	9147	+	chr2R	2498989	+	chr2R	2508136
GCACTACAAAATAATCCAACGCAAAGAGAGGTGCCCGGGCGGTGATTAAATCAGTTAA:1	GCACTACAAAATAATCCAACGC	GGGCGGTGATTAAATCAGTTAA	+	chr3R	12214372	+	chr3R	12214446	74	+	chr3R	12214372	+	chr3R	12214446
CAAATTGAGATGCCTCAGTCTTATGTTCTTGTAGTTATGCAAAGCCCTGNTCAGCGGATCTCCACTTGATGGGC:1	CAAATTGAGATGCCTCAGTCTT	AGCGGATCTCCACTTGATGGGC	-	chr3R	25841896	-	chr3R	25832715	9181	+	chr3R	25832715	+	chr3R	25841896
CTGGGAAGTCTCAGTTTCAAGGCAGCACCAAACAACCAACCCACCCACANGTTCATTAATCATTACCAAAAGCTG:1	CTGGGAAGTCTCAGTTTCAAGG	CATTAATCATTACCAAAAGCTG	+	chr2L	13322297	+	chr2L	17101795	3779498	+	chr2L	13322297	+	chr2L	17101795
GAAATAGAACTAACAAAGCCAAGCAACTTAAAAGTTACAACCAGTAAATNATTTAATTTATGAAAATGTAAGATA:1	GAAATAGAACTAACAAAGCCAA	TAATTTATGAAAATGTAAGATA	+	chr2L	10852181	+	chr2L	10852270	89	+	chr2L	10852181	+	chr2L	10852270
CAGAGATAACTTTCGAGCATATCTCAATGTTTGCCTGCCTCAATGGCCTGGCTTTCATCTAAATAAATTACTCGA:1	CAGAGATAACTTTCGAGCATAT	TTCATCTAAATAAATTACTCGA	+	chr3R	27494338	+	chr3R	27494457	119	+	chr3R	27494338	+	chr3R	27494457
CGAGGGCGNGGCAATCTGAGCAAGATCTGAAATCGGTNNNNCCCTAATGATGATGAGTTCTNATGAGTAGCTGG:1	CGAGGGCGNGGCAATCTGAGCA	ATGAGTTCTNATGAGTAGCTGG	-	chr3R	13863770	-	chr3R	13863683	87	+	chr3R	13863683	+	chr3R	13863770
CANTGTCTTCGTGTTGACACCTAGGTCCTTCGATGTNGAGCATCCTGTAGC:1	CANTGTCTTCGTGTTGACACCT	TCGATGTNGAGCATCCTGTAGC	-	chrX	20105200	-	chrX	20105327	127	+	chrX	20105327	+	chrX	20105200
TGGTAGGTATTTGGGTGCTCATTGGGTTGGCAATAGCATTGAACTCATAATTGATTGCGTTTTATATATTATTAT:1	TGGTAGGTATTTGGGTGCTCAT	ATTGCGTTTTATATATTATTAT	-	chr2R	22072778	-	chr2R	22072693	85	+	chr2R	22072693	+	chr2R	22072778
CACGAAGCCCAGGAAAAAATCTTCACCAGCAACAAGACTCCACTGCCG:1	CACGAAGCCCAGGAAAAAATCT	CAGCAACAAGACTCCACTGCCG	+	chr2R	14132463	+	chr2R	15602441	1469978	+	chr2R	14132463	+	chr2R	15602441
AGTTATGAGCAACTATGACAAACGTCACTGAGAATACTTATATTCTCCTTCTACTTATGCTTATTTTATTTTAAT:1	AGTTATGAGCAACTATGACAAA	CTTATGCTTATTTTATTTTAAT	-	chr3L	10913422	-	chr3L	9953101	960321	+	chr3L	9953101	+	chr3L	10913422
GTTGCACGTTAAATGTTGCCAGCTTTTCGCTTAAGTGCAATGGGAAATGCGACAGCTGCAGCTAGAAAATTTA:1	GTTGCACGTTAAATGTTGCCAG	ACAGCTGCAGCTAGAAAATTTA	-	chr3R	9382943	-	chr3R	9382820	123	+	chr3R	9382820	+	chr3R	9382943
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTGAAGTCGCCAC:1	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	GAGAGAGAGTTGAAGTCGCCAC	-	chrX	12649915	-	chrX	855339	11794576	+	chrX	855339	+	chrX	12649915
TTATTTAAGTACTCATTAAGTGTTTGAAATTGAATCGCAGTTTAGTTTTTCCCGTGTACTGCACTCAGCAATCTC:1	TTATTTAAGTACTCATTAAGTG	GTGTACTGCACTCAGCAATCTC	-	chrX	8092376	-	chrX	8092291	85	+	chrX	8092291	+	chrX	8092376
TGGAAGTAAACATTATTTTATTGGCACTTAAAAAATTAATTGAAATTAATTGCCAATTAAACAACTGTATTGCTG:1	TGGAAGTAAACATTATTTTATT	CAATTAAACAACTGTATTGCTG	-	chr2L	4154524	-	chr2L	4154333	191	+	chr2L	4154333	+	chr2L	4154524
GGAACGTAGATGGTTTTGCTTCTGCGAGGGGGTNAAATGTTAAGGCATGTCGAGAGGTCAAAAGAGTTAATTTTT:1	GGAACGTAGATGGTTTTGCTTC	GAGGTCAAAAGAGTTAATTTTT	+	chrX	7479421	+	chrX	4439911	3039510	+	chrX	7479421	+	chrX	4439911
ATTGGTGGCATCGGGAAAGTGGGTATCATTAATCAGTTGAGCATATGTTNGTACCATTGCAGCGTAACTCGAGCA:1	ATTGGTGGCATCGGGAAAGTGG	CCATTGCAGCGTAACTCGAGCA	+	chr2R	19334650	+	chr2R	19334726	76	+	chr2R	19334650	+	chr2R	19334726
TAATATCCAGAATCAATAGTAATTAACCTTAATCGTTATTCATTTTTTGTCAGTTGCCTGTTGTCTTACGAGTGT:1	TAATATCCAGAATCAATAGTAA	TTGCCTGTTGTCTTACGAGTGT	+	chr2L	19345019	+	chr2L	19357228	12209	+	chr2L	19345019	+	chr2L	19357228
AGCCAAGACTCGAGAGCCCAAGAGCTGAAAACCAGACCACAAATGCTAATCAGCGATGCTTTATGATTTTCGGTA:1	AGCCAAGACTCGAGAGCCCAAG	CGATGCTTTATGATTTTCGGTA	-	chr3R	27470722	-	chr3R	27470060	662	+	chr3R	27470060	+	chr3R	27470722
TACAATATCATCAAGTTGGTCTCTTATGAATCTTTGCGACATTTCAGTCGCAATCGTACTCATAGGCTTCAAGC:1	TACAATATCATCAAGTTGGTCT	ATCGTACTCATAGGCTTCAAGC	-	chr2R	6712694	-	chr2R	6712598	96	+	chr2R	6712598	+	chr2R	6712694
ACACTAAAGTACTATTTACTTAGTTATTACATTCNTAATAGTGTGTATAAAGAACATATGTATCATCTTTCTCTA:1	ACACTAAAGTACTATTTACTTA	ACATATGTATCATCTTTCTCTA	+	chr3R	18501599	+	chr3R	18501680	81	+	chr3R	18501599	+	chr3R	18501680
TTATCTAGATATGCATATGTATATATATACTACATAATAGTCATACCCATGGGGAAACCTCTTACTTCTCGGCT:1	TTATCTAGATATGCATATGTAT	GGAAACCTCTTACTTCTCGGCT	+	chr3L	7377347	+	chr3L	7380451	3104	+	chr3L	7377347	+	chr3L	7380451
TTATTCAAAAGAATTACATTGGCAAAAAAGCCAACTTTTAAAGAACATTTGTAGAAAATCTTGCACTCAAAA:1	TTATTCAAAAGAATTACATTGG	GTAGAAAATCTTGCACTCAAAA	+	chrX	21565441	+	chrX	21565516	75	+	chrX	21565441	+	chrX	21565516
GCATGCAACAATGGACGGACGGAACCAATATGTCGGAGGAATAAGTCAGTCCTCCCACTGAACACTGCCACATA:1	GCATGCAACAATGGACGGACGG	TCCCACTGAACACTGCCACATA	+	chr3R	5399842	+	chr3R	5399922	80	+	chr3R	5399842	+	chr3R	5399922
TCTCATTTGACATTTTTCTTATTCATTCAACCATTCCATATGCAAATGGAAATGCCTTCAAAAAGTGATTTGCCC:1	TCTCATTTGACATTTTTCTTAT	GCCTTCAAAAAGTGATTTGCCC	-	chrX	18688383	-	chrX	18688260	123	+	chrX	18688260	+	chrX	18688383
GTGGTTTGTCTATTACTCCTAAAAGATGAGCAATAGAATTAGCAATTTGTAAAAAA:1	GTGGTTTGTCTATTACTCCTAA	AGAATTAGCAATTTGTAAAAAA	-	chr3L	18537800	-	chr3L	18528658	9142	+	chr3L	18528658	+	chr3L	18537800
CTTTTGTATGCATTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCG:1	CTTTTGTATGCATTTTTGTCTA	GCTCACCTTCATTTTCGCTGCG	+	chr3L	2534623	+	chr3L	2534705	82	+	chr3L	2534623	+	chr3L	2534705
ATTGTCTTNCAGAAGATTTGAAAACTTGCATTTGTTTCGGTTTCTGTTAATGAGATCAAAGGAGTTGAAC:1	ATTGTCTTNCAGAAGATTTGAA	AATGAGATCAAAGGAGTTGAAC	-	chr3R	15626228	-	chr3R	15618759	7469	+	chr3R	15618759	+	chr3R	15626228
AAAGCGTATAACAGACAAGCAGTGAAAACAAGACAATGAAATGGATAATAATGATAGAAAAAATACTCTAAGAAA:1	AAAGCGTATAACAGACAAGCAG	ATAGAAAAAATACTCTAAGAAA	-	chr2L	17863703	-	chr2L	17863622	81	+	chr2L	17863622	+	chr2L	17863703
TTAACAACAAATTACATAACATCCAGGGCTTGGGCGTGGATTTCTTGTAGGTGGATTGCTAAGGCCTTGAGCTCT:1	TTAACAACAAATTACATAACAT	GATTGCTAAGGCCTTGAGCTCT	-	chrX	17584528	-	chrX	10534693	7049835	+	chrX	10534693	+	chrX	17584528
CAACACAACACAACACAACACAACACAACANNNCNCAACACAACACAACACAACACAACACAAAACACAACAACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAACACAAAACACAACAACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	4152252	12065408	+	chr2L	4152252	+	chr2L	16217660
ATTAAGCTTAAATATGCCTTCTGGTTACATAGTGAAAGGGATTCCTGATTGGAAATCACCTATATAGAGTATTTG:1	ATTAAGCTTAAATATGCCTTCT	AATCACCTATATAGAGTATTTG	+	chr3R	24974921	+	chr3R	24975000	79	+	chr3R	24974921	+	chr3R	24975000
AAAACATATAAATGTTACCAAACCGAATTAAAGAAAGAAAGTATAAAATAAAATACATAATCTCACAACTCAGCC:1	AAAACATATAAATGTTACCAAA	TACATAATCTCACAACTCAGCC	+	chrX	20915049	+	chrX	20915220	171	+	chrX	20915049	+	chrX	20915220
AATTTAAAGAAATAAGGAATTTCCCTTATAGGTTTTTTTGTGTTATGTTAAATTTGTTGAATAAGACAATTAAAG:1	AATTTAAAGAAATAAGGAATTT	TTGTTGAATAAGACAATTAAAG	-	chr2R	10257280	-	chr2R	10257189	91	+	chr2R	10257189	+	chr2R	10257280
TTTGCGCANACACAGCAGGGGAGTGGTAATGCAGCCAGCCAGTCGGGTGAGAGATAAAGATAATGTATGCGGCAT:1	TTTGCGCANACACAGCAGGGGA	ATAAAGATAATGTATGCGGCAT	+	chr3R	11865320	+	chr3R	11865399	79	+	chr3R	11865320	+	chr3R	11865399
TTAGTTTCTTACAATAATGCATTTGATTTCATAAGAACATATCTAGCCTTGATATATATATGAAAATAATTTACT:1	TTAGTTTCTTACAATAATGCAT	ATATATATGAAAATAATTTACT	-	chr2L	20601887	-	chr2L	20601809	78	+	chr2L	20601809	+	chr2L	20601887
TATTGGAACATTTTCCCCGTCTAGCAATAAATCTTGAAAACGGGAATGTCATCGTCACTCTATATTTTGGCA:1	TATTGGAACATTTTCCCCGTCT	ATCGTCACTCTATATTTTGGCA	-	chr3R	19447396	-	chr3R	19447178	218	+	chr3R	19447178	+	chr3R	19447396
GGCAAGGACATTTTCATGGTTTTCCAGTTCCGTTTCGACAGCAACTTTTTCGTAGCATACTTTTGCCGGCGCATT:1	GGCAAGGACATTTTCATGGTTT	AGCATACTTTTGCCGGCGCATT	+	chrX	20377345	+	chrX	20378812	1467	+	chrX	20377345	+	chrX	20378812
CGATCAGCNTGTATGATAGCCGTAAGAAATTTTAANTGCGTCGATTGCCTCTGACTAGGATGTATGCCCTGTGAG:1	CGATCAGCNTGTATGATAGCCG	ACTAGGATGTATGCCCTGTGAG	+	chr3R	13376280	+	chr3R	13376369	89	+	chr3R	13376280	+	chr3R	13376369
TTAAAAGCCGTTTTAAATCATAATGTAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACACA:1	TTAAAAGCCGTTTTAAATCATA	TTGATGATGCTGAAATTACACA	+	chr2L	18925228	+	chr2L	18925323	95	+	chr2L	18925228	+	chr2L	18925323
TTTCTTTCAGCTATTTACTTTTGNGCTTTTTTTTATAAACTAAGTTAAGTTATTGTTTTTAGATATTTTTAAAGC:1	TTTCTTTCAGCTATTTACTTTT	TGTTTTTAGATATTTTTAAAGC	+	chr3R	1062393	+	chr3R	1062551	158	+	chr3R	1062393	+	chr3R	1062551
AAAGCGCCTGACTTAGCTTTGAAAAAAAAGCTAAGAACTTCCCAGAAGAGCTTTATCTTTTCTGCTCTATCGGAG:1	AAAGCGCCTGACTTAGCTTTGA	TATCTTTTCTGCTCTATCGGAG	-	chr3L	16162680	-	chr3L	16162596	84	+	chr3L	16162596	+	chr3L	16162680
ACAAATTTCTTGTGTCAACTTGAAGTTTTTAGCGAGTTAGCAAATTCGTGTTGACTTTGTTTCAGTAAATTTTCC:1	ACAAATTTCTTGTGTCAACTTG	ACTTTGTTTCAGTAAATTTTCC	-	chr2L	2305227	-	chr2L	2305132	95	+	chr2L	2305132	+	chr2L	2305227
GAACCGCTTGGAGAACGGTCAAGCCAAGAAGAGGAAACTGTACGTGATCACCGTTCTTTAAGGGTGTGAGATTCT:1	GAACCGCTTGGAGAACGGTCAA	TTCTTTAAGGGTGTGAGATTCT	-	chr3L	8055254	-	chr3L	4112961	3942293	+	chr3L	4112961	+	chr3L	8055254
ATCAGAGGACACAACGATATCGCATATTAACTTACATATTGTTTTCGCAGACATTCTTGACATTCAAGGCAAACG:1	ATCAGAGGACACAACGATATCG	TTCTTGACATTCAAGGCAAACG	-	chr2R	21188298	-	chr2R	21188217	81	+	chr2R	21188217	+	chr2R	21188298
AAGATTATTACCAGCTTTGTTCCTTCCGATTTGGATAAGTAAATTTCGTTTACTTAACATTTCCATTTCCAAGCG:1	AAGATTATTACCAGCTTTGTTC	TTAACATTTCCATTTCCAAGCG	+	chrX	10401413	+	chrX	10401494	81	+	chrX	10401413	+	chrX	10401494
GCTTAAAGTTTAGATATTACATTCCGCTTTATATAATTGTTTCCAATAATAATAAGAGATGCAGTATGATTTCTC:1	GCTTAAAGTTTAGATATTACAT	AAGAGATGCAGTATGATTTCTC	+	chr3L	8782145	+	chr3L	8782271	126	+	chr3L	8782145	+	chr3L	8782271
TAGCGCCTTTCCGCGGGCTGTGGTTCAAACCTTTGATACCCGATTCCGAAGCTATTACTGTCCACGGGATATTG:1	TAGCGCCTTTCCGCGGGCTGTG	TATTACTGTCCACGGGATATTG	+	chr2R	9368148	+	chr2R	9368223	75	+	chr2R	9368148	+	chr2R	9368223
ACACAATACAATGACGACAGTTTGCAAGGACATTTCCCATTTCAGGCCAACGG:1	ACACAATACAATGACGACAGTT	ATTTCCCATTTCAGGCCAACGG	+	chrX	10581428	+	chrX	12537002	1955574	+	chrX	10581428	+	chrX	12537002
AAATCATGTCGAAATCATAAAATTAATTAAATACTAACATTGTTCATCCCATTTTCAGGATACTATCAAGCACTT:1	AAATCATGTCGAAATCATAAAA	TTCAGGATACTATCAAGCACTT	-	chrX	20041623	-	chrX	20041543	80	+	chrX	20041543	+	chrX	20041623
GATCAATTCAGCCAAATATCACTCATACGCCANGTATACTACCTAGCAGCTAAGTAAGCTTTT:1	GATCAATTCAGCCAAATATCAC	CCTAGCAGCTAAGTAAGCTTTT	-	chr2L	4183918	-	chr2L	4181297	2621	+	chr2L	4181297	+	chr2L	4183918
AAGTTTCCCAGCCCAACATNCATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCCCGAACGCCAATCCCCAAGCCCAAAT:1	AAGTTTCCCAGCCCAACATNCA	ACGCCAATCCCCAAGCCCAAAT	+	chr2R	24490150	+	chr2R	24488267	1883	+	chr2R	24490150	+	chr2R	24488267
GTAAATTAAAATTTTACTTATTATAAAAGGAAAGAGCCTATATAGATATATAGCTCGAAAATATTATTCAGGAAT:1	GTAAATTAAAATTTTACTTATT	CTCGAAAATATTATTCAGGAAT	-	chr3L	13884477	-	chr3L	13884386	91	+	chr3L	13884386	+	chr3L	13884477
ATTCTATATGCTTTGGTAGTAAAAGAAACTCCTGGTAAGTAATGAATTTAAAATATAATTTAAATATGATATTC:1	ATTCTATATGCTTTGGTAGTAA	ATATAATTTAAATATGATATTC	+	chr2R	7434898	+	chr2R	7439198	4300	+	chr2R	7434898	+	chr2R	7439198
ATTCACCTATAAAAGCTTTTTAATATTCGTACCTTTTGCATTTATCAACTTATCAGTTCACGATCAATTTCATTC:1	ATTCACCTATAAAAGCTTTTTA	CAGTTCACGATCAATTTCATTC	+	chr3R	15925512	+	chr3R	21595984	5670472	+	chr3R	15925512	+	chr3R	21595984
TTAAAGCTTTGCACTAACTGGGACGGCAATAGTTACAAACGATTGGAAGACGCAGCGCTTAACCGTGGTGTGGTG:1	TTAAAGCTTTGCACTAACTGGG	AGCGCTTAACCGTGGTGTGGTG	+	chr2L	1711379	+	chr2L	1711703	324	+	chr2L	1711379	+	chr2L	1711703
AGTTTGCAGGATGAGAGCGGTGGTGAGCTGAATATTGTTTTCATCCGATGCCAGATGGATTTCCGCAGATTTTAT:1	AGTTTGCAGGATGAGAGCGGTG	GATGGATTTCCGCAGATTTTAT	-	chr2R	10790230	-	chr2R	10790142	88	+	chr2R	10790142	+	chr2R	10790230
GNAAAAAGCGCAATTGTTTGGAGGCGAACTCACATTCTTAGCAAACAGTCTATACAAAGCTAAAAGTGCTAATAT:1	GNAAAAAGCGCAATTGTTTGGA	ACAAAGCTAAAAGTGCTAATAT	-	chrX	2041196	-	chrX	20471909	18430713	+	chrX	20471909	+	chrX	2041196
AGTTGTAAGTTAGGGGTTGGTCACGAGCGCGGTATTCTGTATGCTGGGTGCTAAGTCATCGCATCANTAAGAGAG:1	AGTTGTAAGTTAGGGGTTGGTC	AGTCATCGCATCANTAAGAGAG	+	chr4	671631	+	chr4	680214	8583	+	chr4	671631	+	chr4	680214
GTGTTTTTTCCGTGTGCGCCATTTTGTCAGAGCATAAATTACAACTTCAGGTGTAGTTTTGNAGGAGGAGAAAGG:1	GTGTTTTTTCCGTGTGCGCCAT	TAGTTTTGNAGGAGGAGAAAGG	+	chr3L	3475104	+	chr3L	3475548	444	+	chr3L	3475104	+	chr3L	3475548
AATTGTTGCATACTTTTGGACATCTCTATATACCCTATAGATGTTGTGTAGTGTACATTCCTCCCAGNTCTCCA:1	AATTGTTGCATACTTTTGGACA	GTACATTCCTCCCAGNTCTCCA	+	chr3L	2139222	+	chr3L	2139302	80	+	chr3L	2139222	+	chr3L	2139302
CAACACAACACAACACAACACACACACACGGCATATTTGTTCGAGTTCGCTTATCGCAGAGCCAGCAGCATGCAA:1	CAACACAACACAACACAACACA	TCGCAGAGCCAGCAGCATGCAA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16639419	421759	+	chr2L	16639419	+	chr2L	16217660
GACCACGCAACGCGGCGTATACCANCGAGAACGAGCGCGAAANGTNGAGATNTTGNTAAACAGCTCCAAAATGGT:1	GACCACGCAACGCGGCGTATAC	TGNTAAACAGCTCCAAAATGGT	+	chr2L	18078285	+	chr2L	18078371	86	+	chr2L	18078285	+	chr2L	18078371
ATCCATTTATTGGGTTATCTTAATGGGGCANNNTNGAGGAATATATAAACCCAAATGTACAATACTAACAAAAGA:1	ATCCATTTATTGGGTTATCTTA	AATGTACAATACTAACAAAAGA	-	chrX	2357401	-	chrX	5638079	3280678	+	chrX	5638079	+	chrX	2357401
CATGCTCAACCCTCTAGTGAAGTCTATTTCTCCCTGTCCACAAAATGTATTTACAAACAAAAAGGCCAGAGGTCC:1	CATGCTCAACCCTCTAGTGAAG	CAAACAAAAAGGCCAGAGGTCC	-	chr2L	12565478	-	chr2L	12558349	7129	+	chr2L	12558349	+	chr2L	12565478
AGAAAACCGATTGCTCGCATGAATTCTAAAATTTTGTTTTTGTATTTTGTTTGAAATATGTTGTGCGTAATGG:1	AGAAAACCGATTGCTCGCATGA	TGAAATATGTTGTGCGTAATGG	-	chr2R	12320994	-	chr2R	12320736	258	+	chr2R	12320736	+	chr2R	12320994
CACTTGCAGTAACAGGGTCTTGAAAATTCCATGCCCCCGCACACAGTCGCACATGCACATCCACATCACACAT:1	CACTTGCAGTAACAGGGTCTTG	CATGCACATCCACATCACACAT	-	chr3L	8824817	-	chr3L	19245484	10420667	+	chr3L	19245484	+	chr3L	8824817
GAAAGAGACGGGGCGAAGCAAGTGTAAAAGAGAAGTGACATAACCACGAACCTTGAATTTTGTGCGTTCTATCTT:1	GAAAGAGACGGGGCGAAGCAAG	TGAATTTTGTGCGTTCTATCTT	+	chr3R	23319038	+	chr3R	25547959	2228921	+	chr3R	23319038	+	chr3R	25547959
CACTTTAAACTAATTTGGGACACGAAACACTGGAAGAATTGAATTGAATTCAAAATGAATTGAAATAAAGTTATA:1	CACTTTAAACTAATTTGGGACA	AATGAATTGAAATAAAGTTATA	-	chr3R	8576354	-	chr3R	8576183	171	+	chr3R	8576183	+	chr3R	8576354
GCCCAGCAGACACCACAGNCGTATCCAACTCCATTAGACCTACAACACCAATTA:1	GCCCAGCAGACACCACAGNCGT	ATTAGACCTACAACACCAATTA	-	chr2R	9880163	-	chr2R	1879042	8001121	+	chr2R	1879042	+	chr2R	9880163
AGAAAGCCGACGCTTGACNGAGTTTGGCTAGGAACTTTAGCNTTANAACTATTTCCCACACCTTTTTTCCAACTA:1	AGAAAGCCGACGCTTGACNGAG	TCCCACACCTTTTTTCCAACTA	-	chr3L	22569686	-	chr3L	22569588	98	+	chr3L	22569588	+	chr3L	22569686
ACTACAATATATATGTACATATTAGTATACCAACTCGGCTT:1	ACTACAATATATATGTACATAT	TATTAGTATACCAACTCGGCTT	-	chr3L	3186739	-	chr3L	11350458	8163719	+	chr3L	11350458	+	chr3L	3186739
CATGCAGTNGAAAGGGATCGCAATGTGCAGGAACGCGATTGCCCTGCAGCAAACATTGAGTAACATAACTGCCT:1	CATGCAGTNGAAAGGGATCGCA	ACATTGAGTAACATAACTGCCT	-	chr3R	6073439	-	chr3R	5755465	317974	+	chr3R	5755465	+	chr3R	6073439
CGACGAAGGGTGAGAAGATCATGCTNGCCATCAT:1	CGACGAAGGGTGAGAAGATCAT	AGAAGATCATGCTNGCCATCAT	+	chr3L	12618446	+	chr3L	12594305	24141	+	chr3L	12618446	+	chr3L	12594305
CGAGAGAGTGAATAGCTGTGGGTGAACAAAATGTGCTTTTCATCTGCCTTTAAGTTTATGCATTGCAGTTTTTC:1	CGAGAGAGTGAATAGCTGTGGG	AGTTTATGCATTGCAGTTTTTC	-	chr2L	9297479	-	chr2L	9297403	76	+	chr2L	9297403	+	chr2L	9297479
CTGACCAAAATTCATGCTTTTCCATCACATACAAAATTACNTCGCTGCGATTTTGAACGAAAATTCTT:1	CTGACCAAAATTCATGCTTTTC	GCGATTTTGAACGAAAATTCTT	-	chr3L	7926009	-	chr3L	7916845	9164	+	chr3L	7916845	+	chr3L	7926009
AAATTATCATAATTTATTGTAGGAGCGCACAAATAAGGCTGAAGTCGAGCAAACATTCCTAAACATTGCATAA:1	AAATTATCATAATTTATTGTAG	AACATTCCTAAACATTGCATAA	+	chr3L	2493848	+	chr3L	2493934	86	+	chr3L	2493848	+	chr3L	2493934
TTTTGCGCNAGAACTTGCAAATTGGGAGAAGCCTTNGCATTACAGCCCCACTCGGGTGGCAAAATAATAATTA:1	TTTTGCGCNAGAACTTGCAAAT	TCGGGTGGCAAAATAATAATTA	+	chr3R	27799746	+	chr3R	27800122	376	+	chr3R	27799746	+	chr3R	27800122
GCCAGCAGACCGCCGGGAATGTGGGTGACAATGTAACCGATACAGAATTGAGATACAAAGATACAGATACGAAAT:1	GCCAGCAGACCGCCGGGAATGT	TACAAAGATACAGATACGAAAT	-	chr2L	12032210	-	chr2L	7956083	4076127	+	chr2L	7956083	+	chr2L	12032210
TTCCTACTNAAGTCAATCTTAAAATAAAAATAGCCAGTAAAAAATCTATTTTATAATAACTTAATCAATTATTTA:1	TTCCTACTNAAGTCAATCTTAA	TAATAACTTAATCAATTATTTA	-	chr2L	10294761	-	chr2L	10294676	85	+	chr2L	10294676	+	chr2L	10294761
CAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTATCTGGGTATCTCTGAGATACAATG:1	CAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	TGGGTATCTCTGAGATACAATG	-	chr3R	30098296	-	chr3R	18994293	11104003	+	chr3R	18994293	+	chr3R	30098296
TTACAGTTTCACGATTTTAACTGGCTTGAAATGTGTTGCTAAAAATTAAATGTTGTTTGAAATCATGCAAACATT:1	TTACAGTTTCACGATTTTAACT	TGTTTGAAATCATGCAAACATT	+	chr3R	19490461	+	chr3R	19490550	89	+	chr3R	19490461	+	chr3R	19490550
CTTAGGGATATTCCTTTAAGCATGCGAAANTCGATGAATTTGCCATTGGAAATGAAGATGNCGACTACGCCATGA:1	CTTAGGGATATTCCTTTAAGCA	GAAGATGNCGACTACGCCATGA	+	chr2R	20124213	+	chr2R	22114241	1990028	+	chr2R	20124213	+	chr2R	22114241
GCGCAATANTATTTGCTGAGCATTAATTGTGGAGANGAAATTTGGGTTCGAGAGATTCACTGGTTTCTCCAAAGC:1	GCGCAATANTATTTGCTGAGCA	GATTCACTGGTTTCTCCAAAGC	+	chr3R	16671246	+	chr3R	16671325	79	+	chr3R	16671246	+	chr3R	16671325
AATTGTTTGAATTGCTACCGGCAAGGCGCCACTTACACTTACACCTGCCCCGGCAACGGTG:1	AATTGTTTGAATTGCTACCGGC	TACACCTGCCCCGGCAACGGTG	+	chr2R	15065650	+	chr2R	15065714	64	+	chr2R	15065650	+	chr2R	15065714
AAATGGTTTTGTAAGTAATCGTATTGTCTTGGTTTGCCTTTCCGTTCAGTTTTTATGCGCAATTTCACATTGAAC:1	AAATGGTTTTGTAAGTAATCGT	TATGCGCAATTTCACATTGAAC	-	chr3R	8270719	-	chr3R	12361226	4090507	+	chr3R	12361226	+	chr3R	8270719
GAAGTGGAGCTGGCCAAAAGTGTCCAAAATCAAGCGGAACTGCACCCTTTTCCTATCAATGAGGGAGAGATGAGG:1	GAAGTGGAGCTGGCCAAAAGTG	TATCAATGAGGGAGAGATGAGG	+	chr3L	4491910	+	chr3L	4491994	84	+	chr3L	4491910	+	chr3L	4491994
TATGTGACGCTTTATGGCGTACGGTGCATGGCTGGCAGCGACAACGTTGCGTATGAGCAACTTTGAATAATTAA:1	TATGTGACGCTTTATGGCGTAC	ATGAGCAACTTTGAATAATTAA	-	chr2R	10167189	-	chr2R	10167114	75	+	chr2R	10167114	+	chr2R	10167189
TTGCATAATCATCCTAAATGTAAATCAAATGTTANGTTTTTTTTGCTGTGTGCCAAAAAACGCAGCCGTCCCCAA:1	TTGCATAATCATCCTAAATGTA	CAAAAAACGCAGCCGTCCCCAA	-	chr2R	9361403	-	chr2R	9352254	9149	+	chr2R	9352254	+	chr2R	9361403
AGGGTACCTTCTATCGACTACGCCCCGTGGCCATGTCACGCACTCCCACACACTCGGATAACTCTACA:1	AGGGTACCTTCTATCGACTACG	CACACACTCGGATAACTCTACA	+	chr3L	15006045	+	chr3L	15006194	149	+	chr3L	15006045	+	chr3L	15006194
AAAGTCCTGTCTGTACAGTAGTTGTCGTACCCAATAAAATTTGTTTAAAGAAATATAGAAATCCACAATATATAT:1	AAAGTCCTGTCTGTACAGTAGT	TATAGAAATCCACAATATATAT	+	chr2L	6799544	+	chr2L	6799632	88	+	chr2L	6799544	+	chr2L	6799632
TATATTTCTTGTTATTACTCAAATATCAAAAGTAATGTGGNATTGTATTATGTTAAAGGTAGTAGTTC:1	TATATTTCTTGTTATTACTCAA	ATTATGTTAAAGGTAGTAGTTC	+	chrX	18574824	+	chrX	18574897	73	+	chrX	18574824	+	chrX	18574897
ATTATATTTTAAAACAGTTAATTGCAACTGTAATTGGTTTTAAATATTGATAATTCGTTTCCTTTTTCATTAAAA:1	ATTATATTTTAAAACAGTTAAT	TTCGTTTCCTTTTTCATTAAAA	-	chrX	19339842	-	chrX	19339766	76	+	chrX	19339766	+	chrX	19339842
TAAAACAAAATACGCAACACCGATTATTTCACTCGATTTTCCACTG:1	TAAAACAAAATACGCAACACCG	TATTTCACTCGATTTTCCACTG	+	chr2R	10016660	+	chr2R	21160211	11143551	+	chr2R	10016660	+	chr2R	21160211
TTTTTTTAATTGAAAAATTATACAAAAATTAGAAGGAAAAATTAATCAATTCTGAGATTGCTTCCCTATTGCTAA:1	TTTTTTTAATTGAAAAATTATA	GAGATTGCTTCCCTATTGCTAA	-	chr3L	16345726	-	chr3L	14961903	1383823	+	chr3L	14961903	+	chr3L	16345726
GTATTGCCAATAATCTATTTCAAACAAAGGCCAGCCACAAATATGAACGAAATAAAAAGCAACAACACAAGTTCA:1	GTATTGCCAATAATCTATTTCA	AAAAAGCAACAACACAAGTTCA	-	chr3R	13829179	-	chr3R	29769756	15940577	+	chr3R	29769756	+	chr3R	13829179
AAACTGATNGAAATCGAGATCAAGCTGCAGATCGAAGNNNNATTCAAACTCAACAACAATTNAAAATCAAAGTCA:1	AAACTGATNGAAATCGAGATCA	CAACAATTNAAAATCAAAGTCA	-	chr3R	8154397	-	chr3R	8154312	85	+	chr3R	8154312	+	chr3R	8154397
AAATAACCAAGTCAAAAAAATTCCCTCTGGTAATTAGCTTTAAAAGTGCTAGTCGTATCCTTTGTTTNCATTT:1	AAATAACCAAGTCAAAAAAATT	GTCGTATCCTTTGTTTNCATTT	-	chrX	3502250	-	chrX	3493093	9157	+	chrX	3493093	+	chrX	3502250
CGAAGCGCTTCGGCAGAAAAACAAAACCTAAAAAAAAACTTTGAGCTGATAAGGAGGGGCCGATTAGGTAGAG:1	CGAAGCGCTTCGGCAGAAAAAC	AGGAGGGGCCGATTAGGTAGAG	-	chr2L	19612871	-	chr2L	15490284	4122587	+	chr2L	15490284	+	chr2L	19612871
GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAATGG:1	GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA	AAAAGAAAAGAAAAGAAAATGG	-	chr3L	15253229	-	chr3L	5158772	10094457	+	chr3L	5158772	+	chr3L	15253229
AATAATTAAAGTTCGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTCCTGGGCGTAATAGTT:1	AATAATTAAAGTTCGACTTATT	GAATCTCCTGGGCGTAATAGTT	-	chr3R	25828312	-	chr3R	25828556	244	+	chr3R	25828556	+	chr3R	25828312
TAAATTGAAATAGAAATTTGTGTTAGTTAGTAGTTAGACCTTCAAGCCACTAAAAAGTTCAACTAGGACTAAGA:1	TAAATTGAAATAGAAATTTGTG	AAAAGTTCAACTAGGACTAAGA	+	chr3L	14725619	+	chr3L	14728612	2993	+	chr3L	14725619	+	chr3L	14728612
GGGATNAAACGCTATAGAGCCCAGTTGGAAAGCACTTTAAAAAGTCGATTACTCTTTTAGATCTAAACGCAATCT:1	GGGATNAAACGCTATAGAGCCC	CTTTTAGATCTAAACGCAATCT	-	chr3L	14206733	-	chr3L	14206645	88	+	chr3L	14206645	+	chr3L	14206733
CGAAAAACTGCAATGCATAAACTTAAAGGCAGATGAAAAGCACATTTTGTTCACCCACAGCTATTCACTCTCTCG:1	CGAAAAACTGCAATGCATAAAC	CCCACAGCTATTCACTCTCTCG	+	chr2L	9297402	+	chr2L	9297479	77	+	chr2L	9297402	+	chr2L	9297479
ACTTTTCTGCCCCACAATTCAACCTTCATGGACAGCCGAATGGCTACAAATTTTTTAATAATAAACAGCGAGGAG:1	ACTTTTCTGCCCCACAATTCAA	TTTAATAATAAACAGCGAGGAG	+	chr2L	11947015	+	chr2L	11947123	108	+	chr2L	11947015	+	chr2L	11947123
TTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGATTTCAAAAACCTAACATTTCTAGCCAGACAACAAAT:1	TTCAATTTGAGAGCCAGTACAT	CATTTCTAGCCAGACAACAAAT	-	chr3R	19449480	-	chr3R	28223384	8773904	+	chr3R	28223384	+	chr3R	19449480
TTAATAAAATTTATTTGTATGCACTGGAACGACGTCGTCAGTCAGCTGGCTCCATCCGAAGCCCCAA:1	TTAATAAAATTTATTTGTATGC	CTGGCTCCATCCGAAGCCCCAA	-	chr2R	11485218	-	chr2R	11485144	74	+	chr2R	11485144	+	chr2R	11485218
AAATATTTCCAGCAATTTGTCTCTACTTAATCTTGAGAGGATTTTTTTTTTGAGGAACAAGAAACAAGGACGC:1	AAATATTTCCAGCAATTTGTCT	GAGGAACAAGAAACAAGGACGC	+	chr3R	31265293	+	chr3R	31265436	143	+	chr3R	31265293	+	chr3R	31265436
ACAACAATNTTAGTTCTACAACTGCTCTCGTGACGTAACGCGACGACGACTGGTGGGACTGAGTGGAAAACACA:1	ACAACAATNTTAGTTCTACAAC	GTGGGACTGAGTGGAAAACACA	+	chr3L	9130578	+	chr3L	9134338	3760	+	chr3L	9130578	+	chr3L	9134338
ACTATCACCAGATACAAAGGCCATGAAAACAGTAACCAACCAAGAATCAAGACCTCGAAAAGCGAGGCGAACAAC:1	ACTATCACCAGATACAAAGGCC	CTCGAAAAGCGAGGCGAACAAC	-	chr3L	14815435	-	chr3L	2669220	12146215	+	chr3L	2669220	+	chr3L	14815435
CGATGCCGTCACAGGAATGCATCGCGAATGCCACATCATCATGCCAATTAAATCAACATCGCATAATCATTTGGA:1	CGATGCCGTCACAGGAATGCAT	CAACATCGCATAATCATTTGGA	-	chrX	12038299	-	chrX	12038105	194	+	chrX	12038105	+	chrX	12038299
GAACTGCAGACCACATACCTATGGATGTGGGCATTCTTCTGTTCATTCGGTCC:1	GAACTGCAGACCACATACCTAT	CATTCTTCTGTTCATTCGGTCC	-	chr3R	12314347	-	chr3R	12314255	92	+	chr3R	12314255	+	chr3R	12314347
CACAGCCATCTATCTAAACAAAACTTAGACATTGTATTGTTTTTGATTTTTATTGCTATTTATTGCTATCTTGTT:1	CACAGCCATCTATCTAAACAAA	TGCTATTTATTGCTATCTTGTT	-	chr2R	7684670	-	chr2R	1597384	6087286	+	chr2R	1597384	+	chr2R	7684670
CTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT:2	CTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCT	CTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT	+	chr2L	19024096	+	chr2L	21768291	2744195	+	chr2L	19024096	+	chr2L	21768291
TTAGCAATCATTGTAATTTAGACTTCTTCTTTTGATAAGTTACAATTTGGCAGGTGCATACCCATANTTGCTT:1	TTAGCAATCATTGTAATTTAGA	AGGTGCATACCCATANTTGCTT	-	chr3L	5504641	-	chr3L	5504565	76	+	chr3L	5504565	+	chr3L	5504641
AAATCGCATTCCAGATGGCGTAGAATAATAGATTAAGTAACTAAGCCATGATTAATCCAATCCAGTTGGCTGCAA:1	AAATCGCATTCCAGATGGCGTA	AATCCAATCCAGTTGGCTGCAA	-	chr2L	5989114	-	chr2L	5989038	76	+	chr2L	5989038	+	chr2L	5989114
GAGATACATGTTTCCGAATTAATTGTCCTACAGTCTTTAGGTTAAAAGATTTTCCTTTCGCCAAATTGAGTTGCT:1	GAGATACATGTTTCCGAATTAA	CCTTTCGCCAAATTGAGTTGCT	-	chr2L	18412824	-	chr2L	18408040	4784	+	chr2L	18408040	+	chr2L	18412824
TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTGTGTTTGTGTTT:1	TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT	GTTTTTGTTTGTGTTTGTGTTT	-	chr3L	11777678	-	chr3L	7749470	4028208	+	chr3L	7749470	+	chr3L	11777678
CCTTAAAAAGTATCGTGAAAGGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTNAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTT:1	CCTTAAAAAGTATCGTGAAAGG	AAGGAATCGTTGTACTCTGTTT	-	chr2L	15957495	-	chr2L	15956030	1465	+	chr2L	15956030	+	chr2L	15957495
TGATGTGATGCTGATGCAGCGCTTTACATGTATGGTGACACTTTCGTTTGTAGCAAGGGT:1	TGATGTGATGCTGATGCAGCGC	CACTTTCGTTTGTAGCAAGGGT	-	chr3R	13858359	-	chr3R	8434030	5424329	+	chr3R	8434030	+	chr3R	13858359
TTTGGTAGCAGTGTTTCGATCCGATGTGG:1	TTTGGTAGCAGTGTTTCGATCC	GCAGTGTTTCGATCCGATGTGG	+	chr2R	5240249	+	chr2R	5240279	30	+	chr2R	5240249	+	chr2R	5240279
TTAAGAACAATGAAGGACCAGTCAGTGAGCATCAGAAACGTCAATCTTTAGTTGGCNAAGGC:1	TTAAGAACAATGAAGGACCAGT	TCAATCTTTAGTTGGCNAAGGC	-	chr3L	25842571	-	chr3L	25842498	73	+	chr3L	25842498	+	chr3L	25842571
ATACCAGCNCAAAACATCTTGCTGTGTTTCAGCTCACAAGTGCTGACAACGGTCGGGAGTCTGTTAAAAATGTAT:1	ATACCAGCNCAAAACATCTTGC	CGGGAGTCTGTTAAAAATGTAT	+	chr3R	20870276	+	chr3R	20870361	85	+	chr3R	20870276	+	chr3R	20870361
GATTTTATATATACATATNTCAACATTATATCCGCATTAAANCATNGCAACCGTTAACTGTCATTAATGCCATTA:1	GATTTTATATATACATATNTCA	TTAACTGTCATTAATGCCATTA	+	chr2L	16505013	+	chr2L	16505123	110	+	chr2L	16505013	+	chr2L	16505123
AGAGCGAAAATTGCAGCCATTTATGTACAAAAGTGCTCACGATAAAGAAATGTTACCGATCACGTCGGGGTCAG:1	AGAGCGAAAATTGCAGCCATTT	TTACCGATCACGTCGGGGTCAG	+	chr3L	25995936	+	chr3L	25996016	80	+	chr3L	25995936	+	chr3L	25996016
TTATATTTACCAAGAAGTAATAATATTAATAATATTAATTTCCCTGTTACTTTAATAATATAAAATCTTGAAATA:1	TTATATTTACCAAGAAGTAATA	AATAATATAAAATCTTGAAATA	+	chr3R	21725683	+	chr3R	21725819	136	+	chr3R	21725683	+	chr3R	21725819
ATATCAAATGTGGCAAAAACATATGTACATATGTATGGATAGAATACCTTTGGAATCGCACATTGCGCGAATGTG:1	ATATCAAATGTGGCAAAAACAT	AATCGCACATTGCGCGAATGTG	-	chrX	5103845	-	chrX	5096280	7565	+	chrX	5096280	+	chrX	5103845
ACAAGCGTGTCTGTTATTAACATTTTAATTTAACGTGTTGAGCTGGAGTNGTTCTTTGTGAGAAT:1	ACAAGCGTGTCTGTTATTAACA	TGGAGTNGTTCTTTGTGAGAAT	-	chr2R	23946925	-	chr2R	21993918	1953007	+	chr2R	21993918	+	chr2R	23946925
ACTGCAAGTGTATGCACTGGGAGAAAAAGTAGCGGTATATGTAGTCATCTATAAGTGAGAGTTATTAGCCT:1	ACTGCAAGTGTATGCACTGGGA	TATAAGTGAGAGTTATTAGCCT	+	chr3R	29277114	+	chr3R	29277190	76	+	chr3R	29277114	+	chr3R	29277190
AAAGAGGAGCATGTTGATAATAAATCGCATTCCAGATGGCGTAGAATAATAGATTAAGTAACTAAGCCATGATTA:1	AAAGAGGAGCATGTTGATAATA	TTAAGTAACTAAGCCATGATTA	-	chr2L	5989135	-	chr2L	5989059	76	+	chr2L	5989059	+	chr2L	5989135
AGTATACATAAAATACCCTAAATAAATACAATAGTATTTAAATAGTTAATAGGGAAACATTTAGTTGCCAAAACA:1	AGTATACATAAAATACCCTAAA	GAAACATTTAGTTGCCAAAACA	-	chr2R	6978850	-	chr2R	6978667	183	+	chr2R	6978667	+	chr2R	6978850
ATTGCTGCTAATCAGAAAAAAATTATTGCCCCGTNAAATGCTTGAATATATAATGACTGCCTCTCATTCTCTGT:1	ATTGCTGCTAATCAGAAAAAAA	ATGACTGCCTCTCATTCTCTGT	+	chrX	22383294	+	chrX	22383374	80	+	chrX	22383294	+	chrX	22383374
AAAACAAATCGCTTAATGCTTCACGGCCTTNNNANCCCACCACGCTGTTCAACACCCACCACGCCGACAAATACA:1	AAAACAAATCGCTTAATGCTTC	ACCCACCACGCCGACAAATACA	+	chrX	12478733	+	chrX	13775383	1296650	+	chrX	12478733	+	chrX	13775383
ACTACATCTTAAATTGCAAATACGAATTGCGAATATTAAGTTACATTGCGGGTT:1	ACTACATCTTAAATTGCAAATA	ATATTAAGTTACATTGCGGGTT	+	chr2L	4819515	+	chr2L	4819617	102	+	chr2L	4819515	+	chr2L	4819617
CGACGATGGGTCTTGTACCGGTAGCCATCAT:1	CGACGATGGGTCTTGTACCGGT	GTCTTGTACCGGTAGCCATCAT	-	chr3L	4481005	-	chr3L	4480585	420	+	chr3L	4480585	+	chr3L	4481005
CACAAACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACGCAACACAA:1	CACAAACACAAACACAAACACA	AACACAACGCAACGCAACACAA	-	chr2L	16071771	-	chr2L	9084336	6987435	+	chr2L	9084336	+	chr2L	16071771
ACCCTCATTACAATTCCGAATACCAACATTTAAGCCATTAACACG:1	ACCCTCATTACAATTCCGAATA	CAACATTTAAGCCATTAACACG	+	chr3R	27871083	+	chr3R	27871154	71	+	chr3R	27871083	+	chr3R	27871154
AAAACCTGGTTGACTGGACTAACTTTTGACAAAATGTCGACAAAAAAACGTTCACGTTTCAAAAGAAACTGATGC:1	AAAACCTGGTTGACTGGACTAA	ACGTTTCAAAAGAAACTGATGC	+	chrX	12245691	+	chrX	12245773	82	+	chrX	12245691	+	chrX	12245773
AAAAATAAGAGAACGAAGAAGTGAAGAGTGAAGAGGAGGGGCTCCGCNATTCACAGTAGCCCGGGAAGTTCAGAT:1	AAAAATAAGAGAACGAAGAAGT	CAGTAGCCCGGGAAGTTCAGAT	-	chr2L	18002276	-	chr2L	18002113	163	+	chr2L	18002113	+	chr2L	18002276
CAATTTTTTACCATAAACACCAGGGTGTTTTAGGCCAGAGTTTTAGGNCTGAAATTGGATGATTATANTTTCCC:1	CAATTTTTTACCATAAACACCA	AATTGGATGATTATANTTTCCC	+	chr2L	18522086	+	chr2L	18522215	129	+	chr2L	18522086	+	chr2L	18522215
TATTCGCACCCGATCCGTTCTTTTGTGTTATTTCTTTCTT:1	TATTCGCACCCGATCCGTTCTT	TCTTTTGTGTTATTTCTTTCTT	-	chr2R	24768585	-	chr2R	19820880	4947705	+	chr2R	19820880	+	chr2R	24768585
CCAATGAACGTGCCTCGGATATGGGACAGTTTATCTTCAAGGTAAGTGGAAAAAAAAAAGAAGCATGCAAAATCT:1	CCAATGAACGTGCCTCGGATAT	AAAAAAGAAGCATGCAAAATCT	+	chr2L	9156554	+	chr2L	9156632	78	+	chr2L	9156554	+	chr2L	9156632
AAAGAGAGCAAGCCAGGAAAAGTGCGTGACTTGTTTCTTACACTTGCGGTCAATGGGCCAGAACACCACGGGTG:1	AAAGAGAGCAAGCCAGGAAAAG	ATGGGCCAGAACACCACGGGTG	-	chr3R	5573239	-	chr3R	5573155	84	+	chr3R	5573155	+	chr3R	5573239
TCTTAAATTTAAAAATATATTATGAATTCTGAAAAATTATGAAAAAAAATTATTTAGACAGTCTCTTTCTCGT:1	TCTTAAATTTAAAAATATATTA	ATTTAGACAGTCTCTTTCTCGT	+	chr3R	25637267	+	chr3R	25637368	101	+	chr3R	25637267	+	chr3R	25637368
GATAGCTTAGCTTTATGGCATTTCGAAGCTCATAAATGGTAAAAATGTAATAACGAATTGCTTTTATTT:1	GATAGCTTAGCTTTATGGCATT	TAATAACGAATTGCTTTTATTT	-	chr3L	17636267	-	chr3L	17636125	142	+	chr3L	17636125	+	chr3L	17636267
CTCCTTAAACGCCCTGGCCAGCAGAAGTTGAATGNCCTCAATGACTTGGCTCCCCTTGTCCAATCCAGCTACCCA:1	CTCCTTAAACGCCCTGGCCAGC	CCTTGTCCAATCCAGCTACCCA	+	chr3L	21721707	+	chr3L	14594875	7126832	+	chr3L	21721707	+	chr3L	14594875
AACCAGGCATAAAACTTTACTTACTTGCAGTAAGTTTCAATTTTAACGTCTTAAAGATATACCAATNTAAAAAG:1	AACCAGGCATAAAACTTTACTT	AAAGATATACCAATNTAAAAAG	-	chr2L	17419385	-	chr2L	17419310	75	+	chr2L	17419310	+	chr2L	17419385
GCAAACCAATCCGAAACGAGCCAAACCGAGCTGAGCCG:1	GCAAACCAATCCGAAACGAGCC	CGAGCCAAACCGAGCTGAGCCG	-	chr3R	7926473	-	chr3R	19079505	11153032	+	chr3R	19079505	+	chr3R	7926473
ATATTTATGAATGTATTTCTTGTTCATTTAGCAAAGAAATGTAAATTTCACATCAATCACGTGAATCAAAATGTT:1	ATATTTATGAATGTATTTCTTG	CAATCACGTGAATCAAAATGTT	-	chr3R	25490072	-	chr3R	18473157	7016915	+	chr3R	18473157	+	chr3R	25490072
AATATATATTTTTATGTGANCGTCATAGCCGTAAAATATCCAACCTTCTTCCATTTCTTTTCCACCTATATAAAT:1	AATATATATTTTTATGTGANCG	TTTCTTTTCCACCTATATAAAT	+	chr3R	10231793	+	chr3R	10237370	5577	+	chr3R	10231793	+	chr3R	10237370
GATCGAGTGTTCCGATTTGCCATTTTTATTACATTCTCGTATTGCCTGCATACTTTNCTATG:1	GATCGAGTGTTCCGATTTGCCA	ATTGCCTGCATACTTTNCTATG	+	chr2L	17543624	+	chr2L	17543704	80	+	chr2L	17543624	+	chr2L	17543704
GCCGCTTGATTTCACTCACGCAGACTCATTGGCCATCCGTCGAAATTTGACAAA:1	GCCGCTTGATTTCACTCACGCA	CCATCCGTCGAAATTTGACAAA	+	chr3R	31313211	+	chr3R	31313577	366	+	chr3R	31313211	+	chr3R	31313577
CTAAATAACGAGGTGGGCTCTTCTTGTGGTGGCTCCTCT:1	CTAAATAACGAGGTGGGCTCTT	CTCTTCTTGTGGTGGCTCCTCT	-	chr2L	20348474	-	chr2L	2455486	17892988	+	chr2L	2455486	+	chr2L	20348474
AGNAGATCATGCTGGCCATCATTACCAAGATGACNCNCACCCAGGTGTCCACTTGGTTTGCCAATGCACGTCGT:1	AGNAGATCATGCTGGCCATCAT	TTGGTTTGCCAATGCACGTCGT	+	chr3L	12594305	+	chr3L	12618510	24205	+	chr3L	12594305	+	chr3L	12618510
CTCACACACACACACACAACTCGCATACTCACACACAAGACTAATGGGCGCTTGTACGCACACATGTACACAT:1	CTCACACACACACACACAACTC	TTGTACGCACACATGTACACAT	+	chr3L	16708712	+	chr3L	19437524	2728812	+	chr3L	16708712	+	chr3L	19437524
GCATACAAATTAGTTTCGACAGCAAATTTGACTAACAATTTTGTTTTTCTTTTCTTGCAGGTATGTAACGCTTAG:1	GCATACAAATTAGTTTCGACAG	CTTGCAGGTATGTAACGCTTAG	-	chr2L	17692265	-	chr2L	17687520	4745	+	chr2L	17687520	+	chr2L	17692265
GTTAGAAGCTGTTTTGATTTGAATTAATATTAAAAGATACTTAAAAGTTTTCTCAGTGTATATGTGTTATTAAC:1	GTTAGAAGCTGTTTTGATTTGA	TCAGTGTATATGTGTTATTAAC	-	chr2R	18926608	-	chr2R	18926522	86	+	chr2R	18926522	+	chr2R	18926608
TGAACTCCAGCTCCAGAATGGCCAAGAAAGTCCAAGACGCCGTTTAGCGCGTTTATAAGTTGAACTCAGTGGCAA:1	TGAACTCCAGCTCCAGAATGGC	TATAAGTTGAACTCAGTGGCAA	+	chr2L	10499551	+	chr2L	10499650	99	+	chr2L	10499551	+	chr2L	10499650
TATTAACCAAACATACTTATATACATTTTGCAACATGACAAATTAACCAGTCGAAGAGTAAAAACTTCTGGCACA:1	TATTAACCAAACATACTTATAT	AAGAGTAAAAACTTCTGGCACA	-	chr2R	9510787	-	chr2R	9510671	116	+	chr2R	9510671	+	chr2R	9510787
AANCATTCAATATTGAGCTTATGCCTTAAGTACTNCNATTTATTCAAATCCAAGTTCAAATTTTAATTGCTTTC:1	AANCATTCAATATTGAGCTTAT	AGTTCAAATTTTAATTGCTTTC	-	chr2R	18965000	-	chr2R	18964925	75	+	chr2R	18964925	+	chr2R	18965000
GGGTACGAAAATCCAAATAGGTTTCTCAAGTGGTCAAAATAGTTNTATGTTTCAAGTGCTTTTAAGNATCCTG:1	GGGTACGAAAATCCAAATAGGT	TCAAGTGCTTTTAAGNATCCTG	-	chrX	6009604	-	chrX	6009266	338	+	chrX	6009266	+	chrX	6009604
GATATATATACATATGTATACATATACATATGTATACGGATTGTTTTGGTTTGCGATTT:1	GATATATATACATATGTATACA	GGATTGTTTTGGTTTGCGATTT	-	chr2L	94950	-	chr2L	9925624	9830674	+	chr2L	9925624	+	chr2L	94950
ACCAGATTGCCAAACCACTGGTGTGCCAACTCATGAGCCACC:1	ACCAGATTGCCAAACCACTGGT	GTGTGCCAACTCATGAGCCACC	+	chr3R	29236967	+	chr3R	29247245	10278	+	chr3R	29236967	+	chr3R	29247245
ATATCTAGAAAGGTGTGCTGTGCTTTTTGCAATTGGTCTCAGGTCCATTGGAAGGCCAACTTGAACTGACCAAGC:1	ATATCTAGAAAGGTGTGCTGTG	GGCCAACTTGAACTGACCAAGC	+	chrX	6118729	+	chrX	6118811	82	+	chrX	6118729	+	chrX	6118811
GTTTGTTCTGTCCATGGGCAGACACCGAGACTGCAATTCTTTATTTCGTGGCTTGGTATTTTTGACAA:1	GTTTGTTCTGTCCATGGGCAGA	CGTGGCTTGGTATTTTTGACAA	+	chr2L	632727	+	chr2L	632800	73	+	chr2L	632727	+	chr2L	632800
TTTCGCCTCTTTAGCATAAAATATTCGCCAATTCTATGCGCGACTAGATGCCGTGACACATTTTACNATTCGAGG:1	TTTCGCCTCTTTAGCATAAAAT	TGACACATTTTACNATTCGAGG	+	chr2L	19871565	+	chr2L	19871652	87	+	chr2L	19871565	+	chr2L	19871652
TTGAAAGGACCTTTTGTATTCATGGACTGTAGTAAAGAAAGAGGGCACATCGAAAGTCNG:1	TTGAAAGGACCTTTTGTATTCA	AAGAGGGCACATCGAAAGTCNG	+	chr3R	4759741	+	chr3R	4761223	1482	+	chr3R	4759741	+	chr3R	4761223
CTGAATATGTCCGGCGCAGTCGTAACTTACAATCGTTACCGATTTTAGCATAGGCAAACAAATTTAGTGGCCCCC:1	CTGAATATGTCCGGCGCAGTCG	GCAAACAAATTTAGTGGCCCCC	-	chr3R	26565657	-	chr3R	26558345	7312	+	chr3R	26558345	+	chr3R	26565657
ATTTCCCATGTAACCTTTTTTAAAATTGATCTATTGATATTTCATACGAAATATAAAACTTAAGTTCAGCG:1	ATTTCCCATGTAACCTTTTTTA	AATATAAAACTTAAGTTCAGCG	+	chr2L	8003065	+	chr2L	8003143	78	+	chr2L	8003065	+	chr2L	8003143
GGTAATATTTTTATTGATAGTGTATAATAAAACCCAGAGTACATGACNCCTTTTTTTCTTCNAGTGTTTTAACAT:1	GGTAATATTTTTATTGATAGTG	TTTTCTTCNAGTGTTTTAACAT	-	chr2R	10186047	-	chr2R	10176880	9167	+	chr2R	10176880	+	chr2R	10186047
GAGCCAAAGTCACTCANAAGGATNGCAGGTGCCNCAAGNACACTCCAAATGTAAGCTTCAAANAACTTATG:1	GAGCCAAAGTCACTCANAAGGA	TGTAAGCTTCAAANAACTTATG	-	chr3L	4740582	-	chr3L	16244854	11504272	+	chr3L	16244854	+	chr3L	4740582
TCAACTGCATATTCTATGTAATGTCATCCAAGTCAATATTAAATTGAAGCAATTAAATATAGAACACTTATCCAG:1	TCAACTGCATATTCTATGTAAT	TAAATATAGAACACTTATCCAG	-	chr2R	24636990	-	chr2R	24636904	86	+	chr2R	24636904	+	chr2R	24636990
GGAAAGGAACCAAGTTTTTGTTATTTATTTAAGATGCCTGAAATCAGTCTTTTAAGTTGGCAAGTGTGCTCCAGT:1	GGAAAGGAACCAAGTTTTTGTT	AAGTTGGCAAGTGTGCTCCAGT	+	chr2L	1611205	+	chr2L	1611294	89	+	chr2L	1611205	+	chr2L	1611294
CTGTGTTAAGCGATCTGATTGCTCAACCACCATGNGCAGTGGTTCTCTAATTAATTCTCTATGTTATGTTATATT:1	CTGTGTTAAGCGATCTGATTGC	ATTCTCTATGTTATGTTATATT	+	chr2L	15887721	+	chr2L	15887854	133	+	chr2L	15887721	+	chr2L	15887854
TAGCTGTGCAGTTCTTGACTGTGGCAAAGAGAACAAGCATTCCAGAATATTAGTTAACTTATGTCAAAGAGAAT:1	TAGCTGTGCAGTTCTTGACTGT	GTTAACTTATGTCAAAGAGAAT	+	chr3R	11694724	+	chr3R	11694816	92	+	chr3R	11694724	+	chr3R	11694816
TGAGTCAGGGTACGAAAATCCAAATAGGTTTCTCAAGTGGTCAAAATAGTTATATGTTTCAAGTGCTTTCAAG:1	TGAGTCAGGGTACGAAAATCCA	ATATGTTTCAAGTGCTTTCAAG	-	chrX	6009611	-	chrX	6009273	338	+	chrX	6009273	+	chrX	6009611
CGAGTCGAGTCCGAAGTCCTTGGAGGAGTAGAAGCCCAGTTTCAGTGCTTGGTGGGAATGTCAAAGAGTGGAGAG:1	CGAGTCGAGTCCGAAGTCCTTG	GGGAATGTCAAAGAGTGGAGAG	+	chr2R	20031010	+	chr2R	20031103	93	+	chr2R	20031010	+	chr2R	20031103
CATATGTGGCTTTATATTTTTTTATTATTTATTATTTTCTTTGGTTTAGTACTTTAAAACCTGTTTAAAAACGAA:1	CATATGTGGCTTTATATTTTTT	TTAAAACCTGTTTAAAAACGAA	-	chr3R	21464488	-	chr3R	21464402	86	+	chr3R	21464402	+	chr3R	21464488
AAAATACAATAAATGTGAATATACATATTTCATTTGAAACGAATACGCTGCTTTCAAAAGCCATTTTTAAATTCA:1	AAAATACAATAAATGTGAATAT	TCAAAAGCCATTTTTAAATTCA	-	chr2R	6584860	-	chr2R	6579774	5086	+	chr2R	6579774	+	chr2R	6584860
GTGATGAAGGTGCTGCCCAANAAGGATTCCGANTTTACGGAANCTTCGATGAAGAACGTTCCCTATCCGCGTGC:1	GTGATGAAGGTGCTGCCCAANA	AGAACGTTCCCTATCCGCGTGC	+	chr3R	19136577	+	chr3R	19134060	2517	+	chr3R	19136577	+	chr3R	19134060
TTTGAACTGCTTTTAAAAACCTTTGGTTTCTGACTTTTTCGAACATCATCCTTAAAGCAACACAATNCACCGACT:1	TTTGAACTGCTTTTAAAAACCT	AAAGCAACACAATNCACCGACT	-	chr2L	15355796	-	chr2L	15355718	78	+	chr2L	15355718	+	chr2L	15355796
ATAGTTCCATATAAACCTAGTGAAATTATTCTTATATAAATAGTTTGAGAACTAGTCATTAAACTTGNACTTTA:1	ATAGTTCCATATAAACCTAGTG	TAGTCATTAAACTTGNACTTTA	-	chr2L	13913703	-	chr2L	13913591	112	+	chr2L	13913591	+	chr2L	13913703
TTTATATTTTACTTATTTTTGTTCTCGTTGATTCTGCTGCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTCATT:1	TTTATATTTTACTTATTTTTGT	TTTTTTTTTCTTTTTTTTCATT	+	chr2L	2924556	+	chr2L	12026384	9101828	+	chr2L	2924556	+	chr2L	12026384
ATAAATCCACCGCAAAGCCGCTGCGTTGGTTGACCCAAAAAAAAAAATAGGTGAAGGGACTTGGAGGAGCGG:1	ATAAATCCACCGCAAAGCCGCT	GTGAAGGGACTTGGAGGAGCGG	+	chrX	8391715	+	chrX	8391791	76	+	chrX	8391715	+	chrX	8391791
CACGTTTCATCGGATCTCATTACGCATCCGGAGTACGATACCGGTAACTTGCACAACGACATCGCCCTGAT:1	CACGTTTCATCGGATCTCATTA	TGCACAACGACATCGCCCTGAT	+	chr3L	6052662	+	chr3L	6052743	81	+	chr3L	6052662	+	chr3L	6052743
CACTCTCCTCTACTCCAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGNTGCATACTTTTTG:1	CACTCTCCTCTACTCCAGAATG	GTATTATGNTGCATACTTTTTG	-	chr2L	12863179	-	chr2L	12861712	1467	+	chr2L	12861712	+	chr2L	12863179
CAATAAAATTCCAAATATTTATTTCTTACTGTGTGTATGGATGATGATGTCGCAGCCCGAACTGATAACATTTG:1	CAATAAAATTCCAAATATTTAT	CAGCCCGAACTGATAACATTTG	-	chr3L	10381398	-	chr3L	10381320	78	+	chr3L	10381320	+	chr3L	10381398
GATCATTTAAACAGCTGCCCTCGCTGCATTTCGCACAAACAAACAAAAACAACGCAAGCCGGCTGGAAGGCCTA:1	GATCATTTAAACAGCTGCCCTC	CGCAAGCCGGCTGGAAGGCCTA	+	chr2R	20251325	+	chr2R	15129097	5122228	+	chr2R	20251325	+	chr2R	15129097
TTTTATTGTGAATTTAGTTCGCAGTACATGTTTCCAATATCATTTAAAAATTTAAAATTGATTAAATTTGTTAA:1	TTTTATTGTGAATTTAGTTCGC	TAAAATTGATTAAATTTGTTAA	-	chr2L	11702720	-	chr2L	11702627	93	+	chr2L	11702627	+	chr2L	11702720
GTGAAAAGGTGAAAATTTTTGAAAAATATATGNTTACCTTACGAAAAAAACCTTGATATTTGCCAANAACTGTA:1	GTGAAAAGGTGAAAATTTTTGA	TTGATATTTGCCAANAACTGTA	-	chr2L	14334019	-	chr2L	14333920	99	+	chr2L	14333920	+	chr2L	14334019
AGCGCCGCCGAATAAAAACAACCGCAGATACAGATATGTTCGGTACATCCGGAATCGGGGAAACCCAG:1	AGCGCCGCCGAATAAAAACAAC	ATCCGGAATCGGGGAAACCCAG	+	chr3L	1117243	+	chr3L	24304069	23186826	+	chr3L	1117243	+	chr3L	24304069
ACGAATGGCATCGACATGNACTCGCTGCTCAAGGGGCTGAGCCNAACAANTTTCTGCCTTTTAATGCCCTTT:1	ACGAATGGCATCGACATGNACT	TTTCTGCCTTTTAATGCCCTTT	+	chr2R	24051839	+	chr2R	19040517	5011322	+	chr2R	24051839	+	chr2R	19040517
AAAATCGCGTCCTTATGCTTTTCCGATCTGGTAGCCCTGGTCTGTCCTGAGCGTTTAGCCGAGTTCACNACCATC:1	AAAATCGCGTCCTTATGCTTTT	TTTAGCCGAGTTCACNACCATC	-	chr2R	8518780	-	chr2R	12066174	3547394	+	chr2R	12066174	+	chr2R	8518780
GTTTTTCCACTTCCATGTCCATCTATGTTCATAACTTTCTTCTCTCTCGCGCTCTGCGCTCGCTTCTGCCATAAA:1	GTTTTTCCACTTCCATGTCCAT	CTGCGCTCGCTTCTGCCATAAA	+	chr2L	18478240	+	chr2L	19263640	785400	+	chr2L	18478240	+	chr2L	19263640
AATGGTCAGTTCTCGAGGCCCCGAAGCGTTGACCCGAAAAAAGTAGAACACACATTGTCAGAGGGANTATGG:1	AATGGTCAGTTCTCGAGGCCCC	CACATTGTCAGAGGGANTATGG	+	chr3L	5926320	+	chr3L	5926507	187	+	chr3L	5926320	+	chr3L	5926507
ATAAGTGCCGAAAAAGGTTTACAACTTTTGCCGACAGCCATTTATTATTGATGTCCGCATGCTGAANTCCCAGC:1	ATAAGTGCCGAAAAAGGTTTAC	GTCCGCATGCTGAANTCCCAGC	+	chr2R	9212708	+	chr2R	9213193	485	+	chr2R	9212708	+	chr2R	9213193
TAGAAGGGACTCTTTTATATATACATTTAAAACAAAGGTTTTCCCTAATTTTCGACGGATAATCAA:1	TAGAAGGGACTCTTTTATATAT	CTAATTTTCGACGGATAATCAA	+	chr2L	922494	+	chr2L	922566	72	+	chr2L	922494	+	chr2L	922566
TCTCTCAAAAGCAGCGCCGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAGAGATGCAG:1	TCTCTCAAAAGCAGCGCCGGCT	GGCTAAGCATCCAGAGATGCAG	+	chr2R	12190103	+	chr2R	12187486	2617	+	chr2R	12190103	+	chr2R	12187486
ACATATCATCATGGCACTTACCTTAGTGACNNNANATATATCCTCTCGCTGGTGACCACACCCACTGCGAACGTG:1	ACATATCATCATGGCACTTACC	GACCACACCCACTGCGAACGTG	+	chr3L	12499300	+	chr3L	6441161	6058139	+	chr3L	12499300	+	chr3L	6441161
TGNATTTGCCGGATTAATAAAACAGCAGTTAGTTNGNCTTAGGTCACAGTCAGCGGTCAACAGCTATGGACTT:1	TGNATTTGCCGGATTAATAAAA	AGCGGTCAACAGCTATGGACTT	-	chr3R	4610725	-	chr3R	4609563	1162	+	chr3R	4609563	+	chr3R	4610725
CTCGCGTATTCGGTTCCTGGGATAAGTGCCTGTAAAATAAATGGGTTTGTATCGTTCGTCAGTCATCAGTTCT:1	CTCGCGTATTCGGTTCCTGGGA	TCGTTCGTCAGTCATCAGTTCT	-	chr2L	22546075	-	chr2L	22545981	94	+	chr2L	22545981	+	chr2L	22546075
TATATATATATGTATATATNTATATATATATCATCGATTAAAGACTATCACAGGCGGGGGGGGG:1	TATATATATATGTATATATNTA	GACTATCACAGGCGGGGGGGGG	-	chrX	4486485	-	chrX	9182057	4695572	+	chrX	9182057	+	chrX	4486485
TTAGTGTGCCACTTTGCCAGTAAGCTAACACACACACACACACACACAAATGTTCAAAGAGAAAGGACCAAGGAG:1	TTAGTGTGCCACTTTGCCAGTA	TCAAAGAGAAAGGACCAAGGAG	+	chrX	21016363	+	chrX	21016450	87	+	chrX	21016363	+	chrX	21016450
AAGCTTAAATATGCCTTCTGGTTACATAGTGAAAGGGATTCCTGATTGGAAATCACCTATATAGAGTATTTGAGT:1	AAGCTTAAATATGCCTTCTGGT	CACCTATATAGAGTATTTGAGT	+	chr3R	24974924	+	chr3R	24975003	79	+	chr3R	24974924	+	chr3R	24975003
AGAGCGAGACGGCGCGAGAGAGCAATTTGAACTTGAGAGGCACGCGCGCGTGAACAAACACAAACACAGGCG:1	AGAGCGAGACGGCGCGAGAGAG	TGAACAAACACAAACACAGGCG	-	chr3L	21023418	-	chr3L	21014940	8478	+	chr3L	21014940	+	chr3L	21023418
GATGTGTACATCGAAGCGCATAAAATCTAGTTAGGCTAGTTGGAATTNGTTTACACTTTACNTAGGATTGCATAG:1	GATGTGTACATCGAAGCGCATA	CACTTTACNTAGGATTGCATAG	+	chr3L	22447205	+	chr3L	22447296	91	+	chr3L	22447205	+	chr3L	22447296
CAACGCTTGTCAGCAGCCGTCTCTTTCGCGAGGCCTTCGCAAAA:1	CAACGCTTGTCAGCAGCCGTCT	CTTTCGCGAGGCCTTCGCAAAA	-	chr2R	8658308	-	chr2R	8658263	45	+	chr2R	8658263	+	chr2R	8658308
TACTGCTAAAAGACTTGTCGATGGCAACTGCAATTTTGCTCGCTAATAGAAAATTCTTGTCGGCCATTAGGCTTT:1	TACTGCTAAAAGACTTGTCGAT	TTCTTGTCGGCCATTAGGCTTT	+	chr3R	24199768	+	chr3R	24199848	80	+	chr3R	24199768	+	chr3R	24199848
AATGGTCGAACTTAGGACGTATATATTCTATATTTTAATATTAATACTGTGTGAGATGACTTAACAGGTCGATT:1	AATGGTCGAACTTAGGACGTAT	GAGATGACTTAACAGGTCGATT	-	chr3R	19716308	-	chr3R	19716232	76	+	chr3R	19716232	+	chr3R	19716308
GGAAGGATGTGCAAGGATATGGCACACACCACCGCATGTGTGTGTGTGTGTGCGATATGTG:1	GGAAGGATGTGCAAGGATATGG	GTGTGTGTGTGTGCGATATGTG	+	chr3R	29650454	+	chr3R	11327843	18322611	+	chr3R	29650454	+	chr3R	11327843
TTAACTATCGCGTTTTACAACACTTGCAATTTGTAAGCTTAAATTTTGTAAATCAACAAGAGTTCAACTTGAATA:1	TTAACTATCGCGTTTTACAACA	CAACAAGAGTTCAACTTGAATA	+	chr2R	14018168	+	chr2R	14018252	84	+	chr2R	14018168	+	chr2R	14018252
CTACTCTCTGCGAGTATATTCAAACAGATGGCGGAGGGACCATTTCCGTCTAATTAGCATTTTGAGCCAG:1	CTACTCTCTGCGAGTATATTCA	TCTAATTAGCATTTTGAGCCAG	+	chr2R	24707861	+	chr2R	24707935	74	+	chr2R	24707861	+	chr2R	24707935
CTGACACTGTTTATTTATTTAGCTTTTGCCAAAGTGTTCTTCAGGCCATGAACTAGTTTCGCGTAATTTTATTTG:1	CTGACACTGTTTATTTATTTAG	TAGTTTCGCGTAATTTTATTTG	-	chr3R	27981298	-	chr3R	24096629	3884669	+	chr3R	24096629	+	chr3R	27981298
GTTTGTGCACAGAGAGAAAATTGAGAAATATTATGTTATTAATATTCCGACAGCAGGCAAAGATTTAAGATGCTT:1	GTTTGTGCACAGAGAGAAAATT	CAGGCAAAGATTTAAGATGCTT	-	chr3R	26811045	-	chr3R	26810560	485	+	chr3R	26810560	+	chr3R	26811045
CACAACCGCAGGCACACACACACACACACACCCGCACACA:1	CACAACCGCAGGCACACACACA	CACACACACACACCCGCACACA	-	chr3R	5912368	-	chr3R	5908569	3799	+	chr3R	5908569	+	chr3R	5912368
GCATACGCTTCATCAGCAGCAGCAGCTTCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACGAAACAAGGAAAAAGACAA:1	GCATACGCTTCATCAGCAGCAG	AACGAAACAAGGAAAAAGACAA	-	chr3L	11115238	-	chr3L	21105697	9990459	+	chr3L	21105697	+	chr3L	11115238
TGTTTCAAGCCACTACAAAGTCTCGAGTGCATGGCGAACAATTAGCAAAGGCGAGGCAACAAGTGCAAGAAGGCA:1	TGTTTCAAGCCACTACAAAGTC	AGGCAACAAGTGCAAGAAGGCA	+	chr3L	3281448	+	chr3L	3281944	496	+	chr3L	3281448	+	chr3L	3281944
AAAAAGCCCCACATTTCTACTAAATTAAAAGAAGGTGTGAATGAATGGCCTTTGTTCGCATTGATTTTCCTCT:1	AAAAAGCCCCACATTTCTACTA	TTGTTCGCATTGATTTTCCTCT	-	chr2R	10206336	-	chr2R	21675321	11468985	+	chr2R	21675321	+	chr2R	10206336
CTGGATGGNTTGCGTAGGATGAGATAGTACAGCGTNTCGGCCATTGAAAATTGTGTGATTATCTCGCCAACTCTT:1	CTGGATGGNTTGCGTAGGATGA	TGTGATTATCTCGCCAACTCTT	+	chrX	9575819	+	chrX	9576143	324	+	chrX	9575819	+	chrX	9576143
TGTAATTGAATTTTTCACGGCGAATTGTTGGTTNGTATTTTTCTTGTTTCCGGC:1	TGTAATTGAATTTTTCACGGCG	TNGTATTTTTCTTGTTTCCGGC	+	chr2R	17992130	+	chr2R	17992185	55	+	chr2R	17992130	+	chr2R	17992185
TCATTAGGTATCGATCCACAGAAACACAAACATAGCTATGTACATTTGCATTTGCAATCTTCACCTTATTCGGCA:1	TCATTAGGTATCGATCCACAGA	GCAATCTTCACCTTATTCGGCA	-	chrX	441093	-	chrX	441015	78	+	chrX	441015	+	chrX	441093
TGATGGTGGTGATAGCTCTAAGAGCAATGGAAAGGTAGGACTCAGACTGGTTTTGGAAACAAAGATTATTACTT:1	TGATGGTGGTGATAGCTCTAAG	TTGGAAACAAAGATTATTACTT	+	chrX	19593956	+	chrX	19594040	84	+	chrX	19593956	+	chrX	19594040
GAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTACCANATCACATT:1	GAGGATATCTAAAAGCTATTTT	ATTAAAAGTACCANATCACATT	+	chr3L	14468474	+	chr3L	14473680	5206	+	chr3L	14468474	+	chr3L	14473680
GCCAGTACCCTTCGGCCCCTTGCAGACAACAATTTCATGCACTAGCCGCATGCC:1	GCCAGTACCCTTCGGCCCCTTG	TTTCATGCACTAGCCGCATGCC	-	chr2R	21932326	-	chr2R	21932269	57	+	chr2R	21932269	+	chr2R	21932326
ATTTCAGCCAAATGTTCACTGATCAAACCTCTTCGGGCGGCACTTTTTTTTTGCGCTTATCTCCTCCTGCTGCC:1	ATTTCAGCCAAATGTTCACTGA	GCGCTTATCTCCTCCTGCTGCC	+	chr3R	5155525	+	chr3R	5155630	105	+	chr3R	5155525	+	chr3R	5155630
GGCTGATTGGCCGCTGCTGCGTCATCTNATNNAATTTAACTACTATCATNGNGGCTTTTTGGCACAACAACTTAT:1	GGCTGATTGGCCGCTGCTGCGT	GCTTTTTGGCACAACAACTTAT	-	chr2R	8723023	-	chr2R	8722782	241	+	chr2R	8722782	+	chr2R	8723023
GTGGCCTCAGGGCCGGTGACGTAGATTAGCAGTAAACAATGGTTCACGATACTTTAAATGCTTCTCATTTTAAAT:1	GTGGCCTCAGGGCCGGTGACGT	TTAAATGCTTCTCATTTTAAAT	-	chr3R	6845432	-	chr3R	6845174	258	+	chr3R	6845174	+	chr3R	6845432
ATTATATACACAGTTAAATTTAACTTTTTTAAATNAGCGAGATTTATAGCTCGGTTTCTTTCCGACTCGACCTT:1	ATTATATACACAGTTAAATTTA	GGTTTCTTTCCGACTCGACCTT	+	chr2R	16614853	+	chr2R	12666102	3948751	+	chr2R	16614853	+	chr2R	12666102
ATCAGACCAGGAAGTTTAGTAGGTCGTATCCAGCGCCCTTTAACATTTCTTGAGCCATACTTATGGGGATTGCTC:1	ATCAGACCAGGAAGTTTAGTAG	GCCATACTTATGGGGATTGCTC	+	chr3R	16357879	+	chr3R	16357967	88	+	chr3R	16357879	+	chr3R	16357967
ACAAAGCAATTTTTTACCATAAACACCAGGGTGTTTTAGGCCAGAGTTTTAGGCCTGAAATTGGATGATTATAT:1	ACAAAGCAATTTTTTACCATAA	GCCTGAAATTGGATGATTATAT	+	chr2L	18522080	+	chr2L	18522209	129	+	chr2L	18522080	+	chr2L	18522209
CAATTTGCCACCAATTGGGCAAATATGCATACACAAAACAAAAGCACACCACATGGAATTCAGCAGGAATGACT:1	CAATTTGCCACCAATTGGGCAA	ATGGAATTCAGCAGGAATGACT	-	chr2L	15068999	-	chr2L	15068921	78	+	chr2L	15068921	+	chr2L	15068999
GAGACGACCCACAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1	GAGACGACCCACAAAAAAAAAA	CAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA	-	chrX	8702759	-	chrX	13284570	4581811	+	chrX	13284570	+	chrX	8702759
GATTTTTTTGCATGAAATTTCAATTTTCCACCTGCAACTAAAACCACTTTTTTTCACCACTCATCGATGCGAACT:1	GATTTTTTTGCATGAAATTTCA	TCACCACTCATCGATGCGAACT	+	chr2R	17982953	+	chr2R	17983038	85	+	chr2R	17982953	+	chr2R	17983038
AGTTGAATTAAATACAACAACCTGGCCCAAATGATTGGCCAAACTATTGATGCAACTGCAACTGCAACTGCATAC:1	AGTTGAATTAAATACAACAACC	AACTGCAACTGCAACTGCATAC	+	chr3R	14253721	+	chr3R	14253800	79	+	chr3R	14253721	+	chr3R	14253800
ATTCATAAAAAGTTCTCATTCAACGAAATCAGTGCGTAATACGTAATACGTAATATATCAGTCACAATGGAAACA:1	ATTCATAAAAAGTTCTCATTCA	TATATCAGTCACAATGGAAACA	+	chr3R	10732332	+	chr3R	10733204	872	+	chr3R	10732332	+	chr3R	10733204
AACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAGAACGAGATANCCAGGA:1	AACAAAACAAAACAAAACAAAA	CAAAAGAACGAGATANCCAGGA	+	chr3R	29013339	+	chr3R	29628928	615589	+	chr3R	29013339	+	chr3R	29628928
ATAAAAGTTTAAGGCCAAGAAAGTGTGTAACAATGAAGTTGTACTAATTCATTAAACTCAGAATTCAAACTTAA:1	ATAAAAGTTTAAGGCCAAGAAA	TAAACTCAGAATTCAAACTTAA	+	chr3L	19481396	+	chr3L	8784951	10696445	+	chr3L	19481396	+	chr3L	8784951
TGTCGTTATAGGGGGGAGAGCAATAGCCACTCCTCC:1	TGTCGTTATAGGGGGGAGAGCA	GGAGAGCAATAGCCACTCCTCC	+	chrX	22382687	+	chrX	22260223	122464	+	chrX	22382687	+	chrX	22260223
CAGAATATCGCCAACAATGCCAATCAATTCAACTCCTCCTCCTACTCCTTCTGGTGGCAAGATCTGCAGATCCAC:1	CAGAATATCGCCAACAATGCCA	GTGGCAAGATCTGCAGATCCAC	-	chr3L	18763929	-	chr3L	22151958	3388029	+	chr3L	22151958	+	chr3L	18763929
AGGCGGGAAATGGCAACGGAATCTGTAGTTTGGGAATACACGAAATATCATTTCACTTGAAAGTCCCGCATTTC:1	AGGCGGGAAATGGCAACGGAAT	TCACTTGAAAGTCCCGCATTTC	+	chrX	3986863	+	chrX	3994495	7632	+	chrX	3986863	+	chrX	3994495
ACTTTTATATTATCATTTCTTATTGTCTATCCAGTGCTAAGCTATTAATATCAAAAGGAGCTCTATTTT:1	ACTTTTATATTATCATTTCTTA	ATATCAAAAGGAGCTCTATTTT	+	chr3L	17144187	+	chr3L	17144265	78	+	chr3L	17144187	+	chr3L	17144265
AACTTTCGCAGCTTTTCGTGCAATCCCATGATGGGAACTGAGCCATATCACTCGAAAAACCTGGTACTAGTGT:1	AACTTTCGCAGCTTTTCGTGCA	TCGAAAAACCTGGTACTAGTGT	+	chr3R	5278108	+	chr3R	5278187	79	+	chr3R	5278108	+	chr3R	5278187
GGTAAAATTCGAATACGATGTAACTGGAAGCCGTCTCCAATGACTTTGGCGATGTGTTG:1	GGTAAAATTCGAATACGATGTA	CAATGACTTTGGCGATGTGTTG	+	chrX	12094060	+	chrX	12094136	76	+	chrX	12094060	+	chrX	12094136
TCTCCAAAATAGATTCATTCATTCGAAGAACCCACCCAGAAAAACCACACCGTCCACAAGTCGATAAAGACGTC:1	TCTCCAAAATAGATTCATTCAT	TCCACAAGTCGATAAAGACGTC	-	chr3L	3058368	-	chr3L	17303241	14244873	+	chr3L	17303241	+	chr3L	3058368
CTGAACTCTTCGCTTCGACTCTTCGGAATCAAAGGGAAAACGGCGAAAAGTCG:1	CTGAACTCTTCGCTTCGACTCT	AAGGGAAAACGGCGAAAAGTCG	-	chr3L	1914554	-	chr3L	15773065	13858511	+	chr3L	15773065	+	chr3L	1914554
TAGTGGGCGTAGAGGTCAGGGTGCTCAGTGGGTGGCGTGTGGGATCGGAAGAAACATAACTCAACAATGTAAAGG:1	TAGTGGGCGTAGAGGTCAGGGT	ACATAACTCAACAATGTAAAGG	-	chr2R	10671343	-	chr2R	10671265	78	+	chr2R	10671265	+	chr2R	10671343
GCCTAATTATTTTTAAAAACATTTGAAATANATCTATTTTACAAATTTTTCTCCACACATATGCACTCTAAAATG:1	GCCTAATTATTTTTAAAAACAT	CACACATATGCACTCTAAAATG	+	chr3L	16941409	+	chr3L	16941510	101	+	chr3L	16941409	+	chr3L	16941510
TGGCGTATGTTTATTTATAACTATATATATACTNTTTCAAAACAGTTTCTAGCTTTANTGAGT:1	TGGCGTATGTTTATTTATAACT	ACAGTTTCTAGCTTTANTGAGT	+	chr3R	31074257	+	chr3R	31081843	7586	+	chr3R	31074257	+	chr3R	31081843
TTGTGTGTGCACAATTCGTGCTTCATCGTCCTCATCTTCGTTCCGC:1	TTGTGTGTGCACAATTCGTGCT	ATCGTCCTCATCTTCGTTCCGC	-	chrX	778217	-	chrX	778156	61	+	chrX	778156	+	chrX	778217
TGTTTGTAATTTTCATAAAATTTTTGGTCGCGTATTGGACCAATGCTAATCTGACGGCGGGAAGAAAGGAGATTA:1	TGTTTGTAATTTTCATAAAATT	ACGGCGGGAAGAAAGGAGATTA	-	chr3R	27858263	-	chr3R	27856780	1483	+	chr3R	27856780	+	chr3R	27858263
CGCATAAATATTGGGTGTTGAATGTGCAACTTTTCATACCCAAGATTCNCAGATTTTAATTGGTTGACCTACCTT:1	CGCATAAATATTGGGTGTTGAA	TTTTAATTGGTTGACCTACCTT	+	chr3L	20487663	+	chr3L	20488114	451	+	chr3L	20487663	+	chr3L	20488114
GCNCCCACCGCCCTGCTTATCAGTTTAGAGTTCTNCNCTCATATGNTACCATTGTTGAGCTAAACTGCTGATNA:1	GCNCCCACCGCCCTGCTTATCA	TGTTGAGCTAAACTGCTGATNA	+	chr2R	21721580	+	chr2R	21721667	87	+	chr2R	21721580	+	chr2R	21721667
TTGTGTATTTCGGCTTATTCATAATAAAAAAAGGTCTTTTGCTCGGATGGGCTGACTGGGATGGATGATTGGAG:1	TTGTGTATTTCGGCTTATTCAT	TGACTGGGATGGATGATTGGAG	-	chr3R	4412719	-	chr3R	4408416	4303	+	chr3R	4408416	+	chr3R	4412719
AATATATTATTCAGACTTTATTATTTATATATTCTGCTGTNTATATAGCCACTCACCGCAATTTTTGTACCTTTT:1	AATATATTATTCAGACTTTATT	CACCGCAATTTTTGTACCTTTT	+	chr3L	17730858	+	chr3L	17738188	7330	+	chr3L	17730858	+	chr3L	17738188
GCACCGAGCCCAAAGCCCGACTCTTGGGGGTTCCCTTGTCTGCAAAGTTNTGTGATTTATTTGGGCGGCTCGG:1	GCACCGAGCCCAAAGCCCGACT	GTGATTTATTTGGGCGGCTCGG	-	chr2R	19962641	-	chr2R	19957441	5200	+	chr2R	19957441	+	chr2R	19962641
CGAATACAAAAATTCAATAAAGCCTGAAAAATCGAAAAAAGCTAGAGGGTTAATCCTCGCGAAGCTGATAAAAAG:1	CGAATACAAAAATTCAATAAAG	TCCTCGCGAAGCTGATAAAAAG	+	chr3R	28035496	+	chr3R	28035573	77	+	chr3R	28035496	+	chr3R	28035573
GCTAATAATCAACCACCACTTTTCCACGCTCTGCCCGTTGCGGTTTGAAT:1	GCTAATAATCAACCACCACTTT	CTCTGCCCGTTGCGGTTTGAAT	+	chr3R	26641664	+	chr3R	26641726	62	+	chr3R	26641664	+	chr3R	26641726
TTTCATCGTGCTTTTCATGTAACTCTTCATCTTTTTTGGCTTCAACANTGGTTTCCTTATCTGTGGGNACGAAC:1	TTTCATCGTGCTTTTCATGTAA	TTCCTTATCTGTGGGNACGAAC	-	chr2L	1294345	-	chr2L	1294265	80	+	chr2L	1294265	+	chr2L	1294345
ACATATTTTTCAGCTTATTTAATCTTATTCAGCTTATTTATTTAACGAATATAAAAATTTCAACGATTAAGTTA:1	ACATATTTTTCAGCTTATTTAA	AAAAATTTCAACGATTAAGTTA	-	chr3L	18784484	-	chr3L	18784396	88	+	chr3L	18784396	+	chr3L	18784484
GCAGATGAGTAGTATTGTGTGGTTTGTCCATACCATCATCAAGGCTGCGCCAGATGGTTCG:1	GCAGATGAGTAGTATTGTGTGG	CAAGGCTGCGCCAGATGGTTCG	+	chr3L	19269831	+	chr3L	19270021	190	+	chr3L	19269831	+	chr3L	19270021
GGAGTCTTGGATCTTGGTTGTGGGTCTTGTTGTTTAAGTTCAATGCAAACTCGATGGGGGACCAAATTGGGAGG:1	GGAGTCTTGGATCTTGGTTGTG	GATGGGGGACCAAATTGGGAGG	+	chrX	19176229	+	chrX	19176312	83	+	chrX	19176229	+	chrX	19176312
TGCATATTGAGATTACATGACATGAATGCAAATCCCTTATAATTATCAGCTGGAATCTT:1	TGCATATTGAGATTACATGACA	TATAATTATCAGCTGGAATCTT	+	chr3L	18118239	+	chr3L	18118301	62	+	chr3L	18118239	+	chr3L	18118301
AAGCTAATTTAAATATGAAAAACATTTCCNATTTCCTGTGCCCAAGTGCCCCAACATAAANAAAAAAACAGAGAA:1	AAGCTAATTTAAATATGAAAAA	ACATAAANAAAAAAACAGAGAA	+	chrX	3326726	+	chrX	7372818	4046092	+	chrX	3326726	+	chrX	7372818
CATATAGCAAAAAAGAGGGCTGATTATGAGGACGACGACGACGACGATGATGAGCGAATATGGCCAAGTGCACTA:1	CATATAGCAAAAAAGAGGGCTG	GCGAATATGGCCAAGTGCACTA	+	chr3L	1673589	+	chr3L	1673672	83	+	chr3L	1673589	+	chr3L	1673672
CACATATACACCTACATATATTTATGAAAAGGTAACCAGCAGAGAAACAAAGGCAAACGACACTTGAAAAGACAT:1	CACATATACACCTACATATATT	CAAACGACACTTGAAAAGACAT	-	chr2R	6131704	-	chr2R	14834274	8702570	+	chr2R	14834274	+	chr2R	6131704
TACTTTTTTGAGTTCTGAAAGCATGATCAGACCTACCGGGCAAACCATTTACTTTACGAAAGCAGACTTCGG:1	TACTTTTTTGAGTTCTGAAAGC	ACTTTACGAAAGCAGACTTCGG	+	chr3L	3814867	+	chr3L	3814950	83	+	chr3L	3814867	+	chr3L	3814950
CTGCGTTTGTGCCATTAAAGTCGGACCCGATTTCGGGTCAAATTATAAATTTGATCACATTAGGACATATTAAAA:1	CTGCGTTTGTGCCATTAAAGTC	ATCACATTAGGACATATTAAAA	-	chr3R	10905127	-	chr3R	10904923	204	+	chr3R	10904923	+	chr3R	10905127
AATTAATGCTTGGATACTAAATGCCAGTGATCACTGCTCAGGTTGTTTGGAGGGTTTTATGCTCGT:1	AATTAATGCTTGGATACTAAAT	GTTTGGAGGGTTTTATGCTCGT	-	chr3L	16749294	-	chr3L	16749227	67	+	chr3L	16749227	+	chr3L	16749294
TAACAAAAATAGCCAAGAAGCCAACACTGGGCAAATTGTTGCTCTTTTANATACACGAAATTACATAAGTTTTTA:1	TAACAAAAATAGCCAAGAAGCC	CACGAAATTACATAAGTTTTTA	-	chr3L	14458817	-	chr3L	17059364	2600547	+	chr3L	17059364	+	chr3L	14458817
CGATTAATTACGGCATACTTTCGGGCGGAAACCGAACTCACCTGCTGAGTTGAGCTGAGA:1	CGATTAATTACGGCATACTTTC	CACCTGCTGAGTTGAGCTGAGA	-	chr3R	6206519	-	chr3R	6206317	202	+	chr3R	6206317	+	chr3R	6206519
TTAGACATTCTTCGCGACCATTTCCCCAACTCCGGACATTCAGCT:1	TTAGACATTCTTCGCGACCATT	CCCCAACTCCGGACATTCAGCT	+	chr3R	7923807	+	chr3R	25817718	17893911	+	chr3R	7923807	+	chr3R	25817718
AAAGGCGACCCTCGGTCCGTCACCCGCATCCACGAGTCTCATTTAAAAGTCATAATGTCTAATAGAAAACGAAAA:1	AAAGGCGACCCTCGGTCCGTCA	AATGTCTAATAGAAAACGAAAA	-	chrX	3031051	-	chrX	3030892	159	+	chrX	3030892	+	chrX	3031051
TCTACCTATTGGTTGAACATGAATAACATTTTTAATTGCTTATCAAANTATTTCTGTGAATNTTCACAGTCATAA:1	TCTACCTATTGGTTGAACATGA	CTGTGAATNTTCACAGTCATAA	+	chrX	18218040	+	chrX	18218156	116	+	chrX	18218040	+	chrX	18218156
CGCGTTTCTCCGAAGAATAATATATATGTAATAGCTATAACGTTTCTTNGTTTGATTGTGAGTTGTGTATGCGAA:1	CGCGTTTCTCCGAAGAATAATA	GATTGTGAGTTGTGTATGCGAA	-	chr2R	7822143	-	chr2R	7815674	6469	+	chr2R	7815674	+	chr2R	7822143
CAACAATGGACGGACGGAACCAATATGTCGGAGGAATAAGTCAGTCCNCCCACTGAACACTGCCACATACTTTCC:1	CAACAATGGACGGACGGAACCA	TGAACACTGCCACATACTTTCC	+	chr3R	5399847	+	chr3R	5399928	81	+	chr3R	5399847	+	chr3R	5399928
GAAAGAAATGAAATACTAGGTGTAAATAATGGGTATATTTTAATATCCGTTATTTGTGGGCTAAAGGGTATTC:1	GAAAGAAATGAAATACTAGGTG	ATTTGTGGGCTAAAGGGTATTC	-	chr2R	7217600	-	chr2R	7209854	7746	+	chr2R	7209854	+	chr2R	7217600
ATATGCAGTTTTAAAGCCCTCTCTATTGCACTTCCCTAGTTTTCCCCGAAACTCAGTGGATTGCATTTGCCAAAT:1	ATATGCAGTTTTAAAGCCCTCT	CAGTGGATTGCATTTGCCAAAT	-	chr3L	3606612	-	chr3L	3601301	5311	+	chr3L	3601301	+	chr3L	3606612
TTTTCTTGGATTCCGAAGAAAGCTCTTCCCAAATCCCTATTCTAAAGTGAAGAATACAAGTATTTACAA:1	TTTTCTTGGATTCCGAAGAAAG	TGAAGAATACAAGTATTTACAA	-	chr2L	15453534	-	chr2L	15446071	7463	+	chr2L	15446071	+	chr2L	15453534
CAAATTATATGCTGCGGCTGAGTAAAACGAAACCAGCGGCAAAACGCTGACAGATAAACAAACAGGTTGGGA:1	CAAATTATATGCTGCGGCTGAG	CAGATAAACAAACAGGTTGGGA	+	chr3R	30830565	+	chr3R	30830645	80	+	chr3R	30830565	+	chr3R	30830645
GTAGGAAAAAAGAAATAAATAATGTTTATGTGTGTGTGTGTGGGGGGCTAAGACATTGATTATTGATTA:1	GTAGGAAAAAAGAAATAAATAA	CTAAGACATTGATTATTGATTA	+	chr3R	20139123	+	chr3R	10057449	10081674	+	chr3R	20139123	+	chr3R	10057449
AGTTTCTGCTTTTCTTTTATGCCCGCACATGTGTGTGCTTGCAACTCTTTCGTCTGGCATCTACCGCACTGCTCT:1	AGTTTCTGCTTTTCTTTTATGC	CTGGCATCTACCGCACTGCTCT	-	chr3R	27148125	-	chr3R	27140515	7610	+	chr3R	27140515	+	chr3R	27148125
GTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTTTGTTTTTTGTTTTATGTT:1	GTTTTATGTTTTATGTTTTATG	TTTTTGTTTTTTGTTTTATGTT	-	chr2R	11463556	-	chr2R	1320198	10143358	+	chr2R	1320198	+	chr2R	11463556
AGATGGCCAAAAGCTGCTAACGGCTCACTGCGGGAAATTATTTAAAGCCATTAGTTAAATTGAAAGACAGCGCAA:1	AGATGGCCAAAAGCTGCTAACG	GTTAAATTGAAAGACAGCGCAA	-	chrX	19109310	-	chrX	19109126	184	+	chrX	19109126	+	chrX	19109310
TGATCAGAGAGAAAATTACCGAATTTCGGAACAATTCGTTTTGACTAACAAGAAATCCTATGCTTCCTCGCTGA:1	TGATCAGAGAGAAAATTACCGA	AAATCCTATGCTTCCTCGCTGA	-	chr3R	30012649	-	chr3R	30017954	5305	+	chr3R	30017954	+	chr3R	30012649
GTCCACCTAGAGTTTGGAAGCTTCTGAAGGCGAGCACAGGGATATCGCCCGCAAAGTGACTTGTAAACATTT:1	GTCCACCTAGAGTTTGGAAGCT	GCAAAGTGACTTGTAAACATTT	+	chr3R	29550265	+	chr3R	29550343	78	+	chr3R	29550265	+	chr3R	29550343
TTACATGGATAAACCAAGTTTTATCTATAAAAAACATATTTATTCTAGTCTACAATATCAAAGGTTTTCCTAAAG:1	TTACATGGATAAACCAAGTTTT	AATATCAAAGGTTTTCCTAAAG	-	chr3L	2582005	-	chr3L	2581911	94	+	chr3L	2581911	+	chr3L	2582005
TGACATGCATTTTGAAGAACTTTCGATTATGCGCCCAGAGGCACTCGCTGAGATATTTTCCCGTTCGCCCGCCAC:1	TGACATGCATTTTGAAGAACTT	TATTTTCCCGTTCGCCCGCCAC	+	chr3R	7680866	+	chr3R	7681497	631	+	chr3R	7680866	+	chr3R	7681497
ACAAAAGGGAGGCCTAAACTTTTGGCCCGGCAAATTAACATGCGGGACGTGGC:1	ACAAAAGGGAGGCCTAAACTTT	AAATTAACATGCGGGACGTGGC	-	chr3R	22847020	-	chr3R	22846821	199	+	chr3R	22846821	+	chr3R	22847020
AAAGTGCANGGGTAAGTGGCCATGTGCACGGTGATNAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCTCTGTCA:1	AAAGTGCANGGGTAAGTGGCCA	ACTCCAAGGGGGATCTCTGTCA	+	chrX	2189419	+	chrX	2189495	76	+	chrX	2189419	+	chrX	2189495
GCCAATTTCGCTTTTTGGACTGGATGGGTGGCCTGAAAACAGGGGAAAACCGG:1	GCCAATTTCGCTTTTTGGACTG	CCTGAAAACAGGGGAAAACCGG	-	chr3R	24446237	-	chr3R	10565946	13880291	+	chr3R	10565946	+	chr3R	24446237
ACACCGCGCCGTGCATATTAATTACTCGGCCAGCAGTAACTAGTACCTCCACCTCCTTCCCGTACACCACCC:1	ACACCGCGCCGTGCATATTAAT	ACCTCCTTCCCGTACACCACCC	-	chr2L	11332176	-	chr2L	11332073	103	+	chr2L	11332073	+	chr2L	11332176
TGTAATATTACGAATATGCATTGCAAGATGGTGAATTAGCATTCGAATATAGTTGGTGTTGTGGGTTAAACCACA:1	TGTAATATTACGAATATGCATT	TGGTGTTGTGGGTTAAACCACA	-	chr3L	10055313	-	chr3L	4470850	5584463	+	chr3L	4470850	+	chr3L	10055313
AACTTATTTAGCTACGCCCTAAGCCTAGGCAATATTATCAATACGATCGTTGAAAACCCAANACCCGAAAGTATG:1	AACTTATTTAGCTACGCCCTAA	AAACCCAANACCCGAAAGTATG	+	chr2R	13580516	+	chr2R	13580866	350	+	chr2R	13580516	+	chr2R	13580866
GTGGACAATAAATATAACAAAATCTAGAACTGTTGACAGATATTTGAAGGATCCAAAGGTATATGGAAATAACG:1	GTGGACAATAAATATAACAAAA	CCAAAGGTATATGGAAATAACG	-	chr3L	24009850	-	chr3L	24009669	181	+	chr3L	24009669	+	chr3L	24009850
GCCCTCATGTGGATGTGTATGATTGACTTTGAAAGTGTTTGAATAATTANCCTGTTTTTTTCTAGCTAACCCTGG:1	GCCCTCATGTGGATGTGTATGA	GTTTTTTTCTAGCTAACCCTGG	+	chr3L	7985374	+	chr3L	7987702	2328	+	chr3L	7985374	+	chr3L	7987702
GTGTAGTTAATTTTTTCGGATTTTATTCGAATTGATTAAATAAATTGTTCTTAAGGTAAATCAGAAGCT:1	GTGTAGTTAATTTTTTCGGATT	TTCTTAAGGTAAATCAGAAGCT	+	chr2L	3165656	+	chr2L	20883599	17717943	+	chr2L	3165656	+	chr2L	20883599
GGCCGGTGNCAATTAATTCCCAAATTGGCCAACAACGTTGGACAGTTCGGATTTAATTGTTAGGAAAATTAATTC:1	GGCCGGTGNCAATTAATTCCCA	TAATTGTTAGGAAAATTAATTC	+	chr2R	22579610	+	chr2R	22579696	86	+	chr2R	22579610	+	chr2R	22579696
ATTTAGCAAACGCTGAAGCATACTGCACCCCATTCAGTCACCAGAGACT:1	ATTTAGCAAACGCTGAAGCATA	CCCCATTCAGTCACCAGAGACT	-	chr2R	14955350	-	chr2R	14955226	124	+	chr2R	14955226	+	chr2R	14955350
AAAGCTATCTAATAAATAACGCCCAATTGGCGCTCAATATCCCTGATATGATTTTGATTAATTTTTTTCTTTTTT:1	AAAGCTATCTAATAAATAACGC	TTGATTAATTTTTTTCTTTTTT	-	chr3R	22333752	-	chr3R	21707142	626610	+	chr3R	21707142	+	chr3R	22333752
TAGAGTTACAATTCTTAAGAGAGAAATTTGAGATTTAATATATATTTTATTAAATTTAAATTACTGAATTATTT:1	TAGAGTTACAATTCTTAAGAGA	AATTTAAATTACTGAATTATTT	+	chr3L	21776693	+	chr3L	21776779	86	+	chr3L	21776693	+	chr3L	21776779
ATTTACCATGTCCGAACTTTGACTGCAGTGTCTGCCAAATGCTTCCTTGATTGATAACCATGGGGCGANTGTGTA:1	ATTTACCATGTCCGAACTTTGA	ATAACCATGGGGCGANTGTGTA	+	chr2L	11713534	+	chr2L	11721002	7468	+	chr2L	11713534	+	chr2L	11721002
TGAAATGGACTTATTAGTTATGGACGAGTCATTAAAAGCGCTGTCACTGCCGCTGTCGTACCGATTTCTGGGAGG:1	TGAAATGGACTTATTAGTTATG	TGTCGTACCGATTTCTGGGAGG	+	chr3R	23086104	+	chr3R	23086235	131	+	chr3R	23086104	+	chr3R	23086235
AACTAAACCAAATTATTANACAGGCTGAACTGAAGGCCAAANGATNATTCAATATGAACTGTGGCTGCGGCATTA:1	AACTAAACCAAATTATTANACA	ATGAACTGTGGCTGCGGCATTA	-	chrX	5442125	-	chrX	5442017	108	+	chrX	5442017	+	chrX	5442125
TATAATTGCGAACTATTCAGATAAACATTACAGATCCTCTGAGCTACGATTACCACCTGACCGAACATTGTTCG:1	TATAATTGCGAACTATTCAGAT	CCACCTGACCGAACATTGTTCG	-	chr3R	18379947	-	chr3R	18379642	305	+	chr3R	18379642	+	chr3R	18379947
CCGTAGAATAGGAATTCCGATGTCAGGGGCTCGTCCTCAGTTCAGTTCAGTTC:1	CCGTAGAATAGGAATTCCGATG	CGTCCTCAGTTCAGTTCAGTTC	+	chr2R	16452217	+	chr2R	10265047	6187170	+	chr2R	16452217	+	chr2R	10265047
ACTCACTCATCCGCAGTGAGGACCCCAGAATGGATGTGTGGCTTTGCTATAGTTGTATGCCTTATGGTGTCCATA:1	ACTCACTCATCCGCAGTGAGGA	TGTATGCCTTATGGTGTCCATA	+	chr3L	11864556	+	chr3L	11865851	1295	+	chr3L	11864556	+	chr3L	11865851
CAGCAACATATTTGTTAAATTTCATTTTTTCAATAATTTTTAAATTCTTAGAAGAATAATTACTTTTTTATCAAG:1	CAGCAACATATTTGTTAAATTT	GAATAATTACTTTTTTATCAAG	+	chr2L	20602745	+	chr2L	20602833	88	+	chr2L	20602745	+	chr2L	20602833
CGTGTCTATTCAGATGAGAACTGATACGGGCCAAAACACAGAGTGTGGCCAAGTTGGGCATAATGCGGAAGCTAA:1	CGTGTCTATTCAGATGAGAACT	TTGGGCATAATGCGGAAGCTAA	+	chr3R	13195955	+	chr3R	13196050	95	+	chr3R	13195955	+	chr3R	13196050
CAAACGCAACACCGACCAAAACCAAATGAAAAACCAAACACAGCACACTTGAACCTATAAGCGTGGAGCCAAAGT:1	CAAACGCAACACCGACCAAAAC	CCTATAAGCGTGGAGCCAAAGT	-	chr2R	5641054	-	chr2R	14671785	9030731	+	chr2R	14671785	+	chr2R	5641054
CACAGAGCACGCTTTTGAGATAACACCAAATGGAATACACCGAATAACGACAACGAAACACAGATACAACAATCA:1	CACAGAGCACGCTTTTGAGATA	CGAAACACAGATACAACAATCA	-	chr3L	9341114	-	chr3L	12675745	3334631	+	chr3L	12675745	+	chr3L	9341114
AGGAGCTCTCGAGCGAAGAACGTAGTGTAAAATGCAGCTGGGCTGCAAAAGGCAGATGAAGAAATGNGAAGAAT:1	AGGAGCTCTCGAGCGAAGAACG	CAGATGAAGAAATGNGAAGAAT	+	chrX	14300813	+	chrX	14300890	77	+	chrX	14300813	+	chrX	14300890
GCCTTTTTATATATATATTTTTTTACTTTTTTTTATTTTTTCTGAACCAGCATTCGTTTAGCTCTCAAGTGAC:1	GCCTTTTTATATATATATTTTT	ATTCGTTTAGCTCTCAAGTGAC	+	chr3R	10125568	+	chr3R	19996291	9870723	+	chr3R	10125568	+	chr3R	19996291
AGATGGCCACCGTTGCCGGGGCAGGTGTAAGTGTAAGTGGCGCCTTGCCGGTAGCAATTCAAACAGTTTGCAATA:1	AGATGGCCACCGTTGCCGGGGC	GCAATTCAAACAGTTTGCAATA	-	chr2R	15065721	-	chr2R	15065643	78	+	chr2R	15065643	+	chr2R	15065721
AACGCGACGATGGGTCTTGTACCGGTAGCCATCATCGGCCAGCTCAT:1	AACGCGACGATGGGTCTTGTAC	TAGCCATCATCGGCCAGCTCAT	-	chr3L	4481009	-	chr3L	4480573	436	+	chr3L	4480573	+	chr3L	4481009
CACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAANACAACACAACACANCACAACACAACA:2	CACACAACACAACACAACACAA	CACAACACANCACAACACAACA	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
GATATGCAATTTTAAATTATCCCCAACCAGCCAGNATTGCCAAAAAATTTCCAACCGGACGCAGTTGGTCAGCTA:1	GATATGCAATTTTAAATTATCC	ACCGGACGCAGTTGGTCAGCTA	+	chrX	17431271	+	chrX	14096159	3335112	+	chrX	17431271	+	chrX	14096159
AGATTNTTGCAGAACTGCAACGCCATTGTATTAAATAATTCCTGATTAGCATCACCTTCTCTCTCTTCGATGCTC:1	AGATTNTTGCAGAACTGCAACG	ACCTTCTCTCTCTTCGATGCTC	+	chr2L	3878953	+	chr2L	13878142	9999189	+	chr2L	3878953	+	chr2L	13878142
CTAGATATGGTATAAGCCCATATGGCTNTATGTAGGTAGAAGCAACCAGATATTTGCAGGAGAAAGCAATGCTAA:1	CTAGATATGGTATAAGCCCATA	TTGCAGGAGAAAGCAATGCTAA	+	chrX	547630	+	chrX	547874	244	+	chrX	547630	+	chrX	547874
ACCAAAGTAGTGAAAAAAATCATACACCTAATTTAAGTAGCTNTNACTTACATGTTGTTATATTCTATAT:1	ACCAAAGTAGTGAAAAAAATCA	TACATGTTGTTATATTCTATAT	-	chr3R	22798014	-	chr3R	22797923	91	+	chr3R	22797923	+	chr3R	22798014
GCACTAAATAAATACACCAATGCTCAAGATAANAGTAGTTTTCAAGCTTTTAGCACTGGATATACANATATACA:1	GCACTAAATAAATACACCAATG	GCACTGGATATACANATATACA	+	chr3L	2683957	+	chr3L	2684032	75	+	chr3L	2683957	+	chr3L	2684032
GTGGAAATGCAAATTGCAAATGAGCGGGATNNNANGTGTGTTTCTCGAATGCAGATTTGCAAGGTGGCCAGGCG:1	GTGGAAATGCAAATTGCAAATG	AGATTTGCAAGGTGGCCAGGCG	+	chr3R	23614472	+	chr3R	15708884	7905588	+	chr3R	23614472	+	chr3R	15708884
AAGCTCGAAGAGTTCGCGGCCAGAAGGCCAATCTAGCCAAGGTATCCACCGAGACTCACGCCTCG:1	AAGCTCGAAGAGTTCGCGGCCA	ATCCACCGAGACTCACGCCTCG	-	chr3L	8490944	-	chr3L	8481795	9149	+	chr3L	8481795	+	chr3L	8490944
GTTACTCAGCTTAAGGGGACGGAGAAATTCAATGGCTCTTATAAACTCCTAGAACTTCGTCNTCAGCTCGAATC:1	GTTACTCAGCTTAAGGGGACGG	AACTTCGTCNTCAGCTCGAATC	-	chr2L	12197303	-	chr2L	12196791	512	+	chr2L	12196791	+	chr2L	12197303
ATACAACAAAATAGAAAAACAAAAAAAAAACCAAATAA:1	ATACAACAAAATAGAAAAACAA	AAACAAAAAAAAAACCAAATAA	-	chr2R	14013261	-	chr2R	18458572	4445311	+	chr2R	18458572	+	chr2R	14013261
CACTACTTCTTCTCCACTTCCATCCATGACGAGCTCCGCCTAAACAATCATCCAGAGCTG:1	CACTACTTCTTCTCCACTTCCA	CCTAAACAATCATCCAGAGCTG	+	chr3R	25269542	+	chr3R	25268158	1384	+	chr3R	25269542	+	chr3R	25268158
CTCATATATATATTTTTTTTTTTGTTGTTGGGTTTCTTTTTTAGCACTATTTAGAACTTGAACAGCAAAAAAAAG:1	CTCATATATATATTTTTTTTTT	GAACTTGAACAGCAAAAAAAAG	-	chrX	17472168	-	chrX	530757	16941411	+	chrX	530757	+	chrX	17472168
CGCCAAAAGGTAAATGACCAAAAGCCACTTAAACTGCAATTGCAGTGAATGTTGCATGGAATGACAACTCCTCC:1	CGCCAAAAGGTAAATGACCAAA	TGCATGGAATGACAACTCCTCC	-	chr3L	1581489	-	chr3L	1581156	333	+	chr3L	1581156	+	chr3L	1581489
TCTGAATTCCTCTGTTTGGTAGATTATTGCTCGCTGTTAAATATTTTATAATTTTTATGCGATTTGAGTAAATCA:1	TCTGAATTCCTCTGTTTGGTAG	TTTATGCGATTTGAGTAAATCA	+	chr3L	5251862	+	chr3L	5251941	79	+	chr3L	5251862	+	chr3L	5251941
TCTCTGGAAGTAAACATTATTTTATTGGCACTTAAAAAATTAATTGAAATTAATTGCCAATTAAACAACTGTATT:1	TCTCTGGAAGTAAACATTATTT	TTGCCAATTAAACAACTGTATT	-	chr2L	4154528	-	chr2L	4154337	191	+	chr2L	4154337	+	chr2L	4154528
CAGTACGTGTCCAAGATAAGCTCGTCATGAGGATGAGGATGCAGTGGCAACTTTTCCTCCACTCGACACTCCA:1	CAGTACGTGTCCAAGATAAGCT	TTTTCCTCCACTCGACACTCCA	-	chr3L	5826234	-	chr3L	5826152	82	+	chr3L	5826152	+	chr3L	5826234
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACATGAAAACAGCTAAACTAAGAGAAAACTAAATAAAA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	ACTAAGAGAAAACTAAATAAAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	2301831	19605703	+	chr3R	21907534	+	chr3R	2301831
CAACACTCGTAAGACAACAGGCAACTGACAAAAAATGAATAACGATTAAGGTTAATTACTATTGATTCTGGATAT:1	CAACACTCGTAAGACAACAGGC	AATTACTATTGATTCTGGATAT	-	chr2L	19357230	-	chr2L	19345021	12209	+	chr2L	19345021	+	chr2L	19357230
TACTTTTTTGCGTCTTCTGTGTTAAAGTGATTATGCGCTAAACTAAAATGTTACGCAAGTTTCAATTGAGTTAAT:1	TACTTTTTTGCGTCTTCTGTGT	CGCAAGTTTCAATTGAGTTAAT	+	chrX	7125278	+	chrX	7134437	9159	+	chrX	7125278	+	chrX	7134437
CACCAACCAAGGGGTATAAGTTCTTCCTATAAATCACATAATCAGGCTGGGCCAAGCCTTATAGGAAATGCGTG:1	CACCAACCAAGGGGTATAAGTT	CAAGCCTTATAGGAAATGCGTG	+	chr2R	13769009	+	chr2R	13769107	98	+	chr2R	13769009	+	chr2R	13769107
ATTTTTTCAGAGTTATTCCAAATGTATTGGGTGTGCATGTTGAATTTTCCACGCCCAGTGACCTTTAAGCTGTTT:1	ATTTTTTCAGAGTTATTCCAAA	CCCAGTGACCTTTAAGCTGTTT	-	chr3R	28284412	-	chr3R	28286946	2534	+	chr3R	28286946	+	chr3R	28284412
TGGGATCTCGAAAAGTGTTGCTTAGGTGTTTTAGGTTTCTATACAAAAGCACACTTATTACACTGGGAAAAGAGA:1	TGGGATCTCGAAAAGTGTTGCT	CTTATTACACTGGGAAAAGAGA	+	chr3R	27644273	+	chr3R	27644365	92	+	chr3R	27644273	+	chr3R	27644365
TCTGGGTGGCAGGACCATTGTTCTGAATTTCCAAATGAAAATACAACTTTGCGTTTGTTTTTCAGCTTTTTGTGG:1	TCTGGGTGGCAGGACCATTGTT	TTTGTTTTTCAGCTTTTTGTGG	-	chrX	14462398	-	chrX	14123692	338706	+	chrX	14123692	+	chrX	14462398
AGGGGTCAACACCTTTCGTGTAAATCAGCACATAAATAGCNTNAANGAACTTGTGAAGATATCNGCTGCCA:1	AGGGGTCAACACCTTTCGTGTA	CTTGTGAAGATATCNGCTGCCA	+	chr2R	5869295	+	chr2R	5874367	5072	+	chr2R	5869295	+	chr2R	5874367
TGTTACACAAGCTAATAAATGCTTTTAATTATGATTTAAACATTTCGGCACATCAATCCGCCCCGAGGAGACTCA:1	TGTTACACAAGCTAATAAATGC	CAATCCGCCCCGAGGAGACTCA	-	chr3R	31418297	-	chr3R	31413097	5200	+	chr3R	31413097	+	chr3R	31418297
GAAAGAAGTATTTTAACTCGCTTAATTGCCAACTCAGCTGCAGGGGGNGTCAGTCGGCAAATGAAATGGTTTTG:1	GAAAGAAGTATTTTAACTCGCT	GTCGGCAAATGAAATGGTTTTG	+	chr3R	16411486	+	chr3R	16411563	77	+	chr3R	16411486	+	chr3R	16411563
GTTTTTAATTTGGCATAAGCTCGACTGGCCAAGTAGCTGCTTTGAATACNAGTGTCCG:1	GTTTTTAATTTGGCATAAGCTC	CTGCTTTGAATACNAGTGTCCG	-	chr3R	27370319	-	chr3R	27370130	189	+	chr3R	27370130	+	chr3R	27370319
AAACCAAATATTTACTTCACCTATTTTATTACACTTACAATCAGAAATTCCTGTAGGAATGAAAGAATTCA:1	AAACCAAATATTTACTTCACCT	CCTGTAGGAATGAAAGAATTCA	-	chr3L	2908254	-	chr3L	2908157	97	+	chr3L	2908157	+	chr3L	2908254
TACAACTGGAAATGTGTTCTTAAATTTTGCTTATGATTTGCCAATAACTCGGCATTTAAAATGGACATATTTCCA:1	TACAACTGGAAATGTGTTCTTA	ATTTAAAATGGACATATTTCCA	-	chr2R	18713315	-	chr2R	18713238	77	+	chr2R	18713238	+	chr2R	18713315
TGTAAATGTTTGCTGTCAAGATAAGCATAACACAGCGTGTTATGCCCCACCTTTCGCCAGATAAGGAGTAAGGGG:1	TGTAAATGTTTGCTGTCAAGAT	TCGCCAGATAAGGAGTAAGGGG	+	chr3L	22610598	+	chr3L	22610694	96	+	chr3L	22610598	+	chr3L	22610694
GTTATAGGATAAGCCTAGAGAAAGATGATACATATGTTCTTTATACACACTATTAAGAATGTAATAACTAAGTAA:1	GTTATAGGATAAGCCTAGAGAA	TAAGAATGTAATAACTAAGTAA	-	chr3R	18501695	-	chr3R	18501614	81	+	chr3R	18501614	+	chr3R	18501695
GCCGAAATTTTGACGCTTTATGAGCGGTCCCTTTAGTGCTGTGTGTGGGCTCAGACTTGGACGAATCGAAT:1	GCCGAAATTTTGACGCTTTATG	CTCAGACTTGGACGAATCGAAT	+	chr3L	429178	+	chr3L	429081	97	+	chr3L	429178	+	chr3L	429081
TCATCATAAGCTTATTTCAAATTATCTCAGGGGCTGGAAAGCACATGTAAGTGATA:1	TCATCATAAGCTTATTTCAAAT	TGGAAAGCACATGTAAGTGATA	+	chr3R	5001524	+	chr3R	5001973	449	+	chr3R	5001524	+	chr3R	5001973
TTCAACTTTTCAGGCCTCTACACTGTCAGAAATTTATATTTGTTTGTGTCCTAGATATTAAAATGCATAATAAAT:1	TTCAACTTTTCAGGCCTCTACA	GATATTAAAATGCATAATAAAT	-	chr2L	1615483	-	chr2L	1615401	82	+	chr2L	1615401	+	chr2L	1615483
ATAAACAATTTGGCAGTGGCCAGCCATCAATGCACGATGAATTTCNATTTAAATTGCGGCTNATTTGGACAATAA:1	ATAAACAATTTGGCAGTGGCCA	TTGCGGCTNATTTGGACAATAA	+	chr3L	10654996	+	chr3L	10655076	80	+	chr3L	10654996	+	chr3L	10655076
TTGACTTCATGTTGGAGCTCCATTTTAAGAACANTGACCAGTCTTACAGTCAAAGATNCAAAA:1	TTGACTTCATGTTGGAGCTCCA	TCTTACAGTCAAAGATNCAAAA	+	chr2L	14694273	+	chr2L	14694385	112	+	chr2L	14694273	+	chr2L	14694385
TTAAATACACATTCGCCCCATGGTTATCAATCAAGGAAGCATTTGGCAGACACTGCAGTCAAAGTTCGGACATG:1	TTAAATACACATTCGCCCCATG	CTGCAGTCAAAGTTCGGACATG	-	chr2L	11721007	-	chr2L	11713540	7467	+	chr2L	11713540	+	chr2L	11721007
CACATTTGCATTCAGCGAACNGTATTGTCAATNTCTTTTGCANTTTTGCCGACGCTTCGTGCCGTGAAATTTAT:1	CACATTTGCATTCAGCGAACNG	CGCTTCGTGCCGTGAAATTTAT	+	chr3L	2447534	+	chr3L	2456689	9155	+	chr3L	2447534	+	chr3L	2456689
AAACAATGCTTATTTGTTNTTTATCTGTGTAAAGCATCTCTNTGANACTTTCAGGCCACGGCAGACTTGCCAGAA:1	AAACAATGCTTATTTGTTNTTT	GGCCACGGCAGACTTGCCAGAA	-	chr2L	10956172	-	chr2L	10946957	9215	+	chr2L	10946957	+	chr2L	10956172
AAACTGAAAAGTTCCAGAGGAGTCAAGTCGCAAGGTGAACTTAAAAATTGAATTATTCTTTTACAAAACCTAGCC:1	AAACTGAAAAGTTCCAGAGGAG	TATTCTTTTACAAAACCTAGCC	-	chr2L	20080018	-	chr2L	20079895	123	+	chr2L	20079895	+	chr2L	20080018
GATTTGATTCAGGCTCTGTTCATCTTAATATTTGTGCGACAAAGGAATATTACATATCTATTACTTTTTCAAACA:1	GATTTGATTCAGGCTCTGTTCA	ATATCTATTACTTTTTCAAACA	+	chr2L	7041287	+	chr2L	7041376	89	+	chr2L	7041287	+	chr2L	7041376
ATTTACTTCAAATGCTAGAAAGATTATTTTATTTTAAAAAACAGGTTTAGTGGCCCCATCAAACTTTACACCGCG:1	ATTTACTTCAAATGCTAGAAAG	CCCCATCAAACTTTACACCGCG	-	chr3L	11758026	-	chr3L	11757929	97	+	chr3L	11757929	+	chr3L	11758026
GGTTTCCTAGTTTCACTCAAAAAATGTTGCAAATGTTATATTAAATTTCTCACAGTGCACTTAGGCACAAATAT:1	GGTTTCCTAGTTTCACTCAAAA	CAGTGCACTTAGGCACAAATAT	+	chr2R	14803495	+	chr2R	14803574	79	+	chr2R	14803495	+	chr2R	14803574
TAGAGAATAACACTCCGGCACCGGGTGATTATCATCCCGAAAAG:1	TAGAGAATAACACTCCGGCACC	GGGTGATTATCATCCCGAAAAG	-	chr2L	8248937	-	chr2L	8249410	473	+	chr2L	8249410	+	chr2L	8248937
ATAAATAATATTTAATTGAANTTAAGACCCCTNTTGAAATCANACGCCTCTGACCGGAGGGTCCGTGCCATAGAT:1	ATAAATAATATTTAATTGAANT	CCGGAGGGTCCGTGCCATAGAT	+	chr2L	5061922	+	chr2L	1315594	3746328	+	chr2L	5061922	+	chr2L	1315594
GTTCGGCCAATTAAAGTGAGGCCAAGACAAACGAATGCGAACACGANTGAAATGGAAATCNGCCCTGCGGTTTG:1	GTTCGGCCAATTAAAGTGAGGC	TGGAAATCNGCCCTGCGGTTTG	+	chrX	13515708	+	chrX	13515956	248	+	chrX	13515708	+	chrX	13515956
ATCTGCTCGGTCCTCTGCCCCATTTGCGCCCCCTGAGCCCCGGAACCACCC:1	ATCTGCTCGGTCCTCTGCCCCA	CCCCTGAGCCCCGGAACCACCC	-	chr3R	22870862	-	chr3R	13805211	9065651	+	chr3R	13805211	+	chr3R	22870862
ATATGAAGCCCAAACAAAATATCATTTCTCAACTTTTGGCAACTCGACAATCTTGTCTCAATTTCTACTGCATAT:1	ATATGAAGCCCAAACAAAATAT	TGTCTCAATTTCTACTGCATAT	-	chr3L	8243922	-	chr3L	8243839	83	+	chr3L	8243839	+	chr3L	8243922
ACATTAAAGTCTCTGCTTCCGCATGCACCTCTCGTTAATAGCTCCTTAGGTCGGTGACGTATGAAAGCTGTG:1	ACATTAAAGTCTCTGCTTCCGC	TCGGTGACGTATGAAAGCTGTG	-	chr3R	31831616	-	chr3R	31831540	76	+	chr3R	31831540	+	chr3R	31831616
GCATTGATTGCAGCAAAAAGACCGAAAAACGAACAGGGAAAAAATCGCAGT:1	GCATTGATTGCAGCAAAAAGAC	CGAACAGGGAAAAAATCGCAGT	-	chrX	14206134	-	chrX	3691231	10514903	+	chrX	3691231	+	chrX	14206134
ATAAAAAAAATGGGAATGAAGAAACCCCAAATGAAACGAAATGAATCGGNAAGGTGAGAAAAGTGCGGCACCTC:1	ATAAAAAAAATGGGAATGAAGA	GGTGAGAAAAGTGCGGCACCTC	-	chr2L	17227929	-	chr2L	17227852	77	+	chr2L	17227852	+	chr2L	17227929
ATTTAAAGNATACTTTCTGGCGTCTGTCGGCACAGNTGGAAAACCACAGCTGGAAAACCTGCGGCGAACT:1	ATTTAAAGNATACTTTCTGGCG	GCTGGAAAACCTGCGGCGAACT	-	chr3R	14247900	-	chr3R	14246409	1491	+	chr3R	14246409	+	chr3R	14247900
CAAAATGTGTTAGGCTTGGCAAAAAGATATGCACCCTACCCTTTTCATCCTACCTATCGATCCTACANTCCTTGT:1	CAAAATGTGTTAGGCTTGGCAA	CTATCGATCCTACANTCCTTGT	+	chr3L	13525158	+	chr3L	13532954	7796	+	chr3L	13525158	+	chr3L	13532954
ATTTTTGAACAGGTTGCAGTTGTATTATTATTTTAATAGAAAGAAATCAACGGAAATATTAAAACGGTCCGTGGC:1	ATTTTTGAACAGGTTGCAGTTG	AAATATTAAAACGGTCCGTGGC	-	chr2R	25102694	-	chr2R	25102525	169	+	chr2R	25102525	+	chr2R	25102694
AAACTTTTTTAGAAAAATTCCATCTTCTATGGAACGCTGTAGCTCAGCTAAGATCAGGCATAATAAGCTAAAAGG:1	AAACTTTTTTAGAAAAATTCCA	TCAGGCATAATAAGCTAAAAGG	-	chr2R	6178777	-	chr2R	6178690	87	+	chr2R	6178690	+	chr2R	6178777
GCAGGCAATACGAGAATGTAATAAAAATGGCAAATCGGAACACTCGATCGTTAAATACCCTAATTATAATA:1	GCAGGCAATACGAGAATGTAAT	GTTAAATACCCTAATTATAATA	-	chr2L	17543691	-	chr2L	17543602	89	+	chr2L	17543602	+	chr2L	17543691
AAAATAAAAACATAAAAAAATAAAAATAGAGAAGAAAAGACGGGCTCAGAACGTGCGATTCATTTGGACTCTTTG:1	AAAATAAAAACATAAAAAAATA	TGCGATTCATTTGGACTCTTTG	+	chr2R	21280689	+	chr2R	16577743	4702946	+	chr2R	21280689	+	chr2R	16577743
GAAAAGTGAAAAAATGTGCCAATGGGAATGGTTGGGACCACTGTTGTCCTGTAATTAAATAATGCCATTGCTGCT:1	GAAAAGTGAAAAAATGTGCCAA	ATTAAATAATGCCATTGCTGCT	+	chrX	10550873	+	chrX	10552340	1467	+	chrX	10550873	+	chrX	10552340
GTAATAAACAAGAAGTCACCAAGATTGAAACCGTTGAGGAGGACGACAAGCAACCCGAAACGACGGT:1	GTAATAAACAAGAAGTCACCAA	ACAAGCAACCCGAAACGACGGT	-	chr3L	2069713	-	chr3L	2065621	4092	+	chr3L	2065621	+	chr3L	2069713
GACCGCAAGTGTAAGAAACAAGTCACGCACTTTTCCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCAGTTCGCCA:1	GACCGCAAGTGTAAGAAACAAG	GCTCTCTTTTCCCAGTTCGCCA	+	chr3R	5573178	+	chr3R	5573252	74	+	chr3R	5573178	+	chr3R	5573252
AGAGGCCGCTTTTTCATTTTTGCCCGCTCCGCAGAGCAATTTCTATTTGTGTAACGCTTCGTTTTCATTCATAA:1	AGAGGCCGCTTTTTCATTTTTG	AACGCTTCGTTTTCATTCATAA	-	chr2R	18600050	-	chr2R	18590899	9151	+	chr2R	18590899	+	chr2R	18600050
AAATGGTTCGATATCCTTTATTTTATTCCCAAGATCAGTTTTTACCTCTCTGCGCTGCGTGGACGACGACTCTAT:1	AAATGGTTCGATATCCTTTATT	GCTGCGTGGACGACGACTCTAT	+	chr2R	13905615	+	chr2R	13907597	1982	+	chr2R	13905615	+	chr2R	13907597
CTTTACTAAAGATAACTGTACGACATTTAAAATCTATATAGTTTTTAAAATCCTTCTTTTGCAACTGTTAATAA:1	CTTTACTAAAGATAACTGTACG	CTTCTTTTGCAACTGTTAATAA	-	chr3L	17789944	-	chr3L	17789869	75	+	chr3L	17789869	+	chr3L	17789944
GAAACAGCATCATCGCTCATGATACAAATCATGATGACGAAATGGTATAAGGGATGACAGTTTAAAGAAAAATGA:1	GAAACAGCATCATCGCTCATGA	ATGACAGTTTAAAGAAAAATGA	+	chr2R	19776617	+	chr2R	19779940	3323	+	chr2R	19776617	+	chr2R	19779940
ACAAGTCGGCGATGCAAGTGGGAAAAACATCTTTGAACATTCTTCTGNGTTGGAATTAAATATAAAA:1	ACAAGTCGGCGATGCAAGTGGG	TGNGTTGGAATTAAATATAAAA	+	chr2R	25141666	+	chr2R	25159348	17682	+	chr2R	25141666	+	chr2R	25159348
ATCTCGGTACATGTATTTAGACATATGTACATATGTATGTGGGACCCAGGCGAATCCCTT:1	ATCTCGGTACATGTATTTAGAC	GTGGGACCCAGGCGAATCCCTT	-	chr3R	23335515	-	chr3R	23335452	63	+	chr3R	23335452	+	chr3R	23335515
GCAGCACTATATATGTATGAAGCCAATTAATAGACATATTGTAAATGGTTGCCATTGAAACGGCAGATTTGTAAA:1	GCAGCACTATATATGTATGAAG	ATTGAAACGGCAGATTTGTAAA	-	chr3L	22624668	-	chr3L	22617216	7452	+	chr3L	22617216	+	chr3L	22624668
TTAGCAGATGGAAAACTAATATGTGGCAAAAAGTTTCCTTAGGCATCCACAACAAATTAATTGTTCAACCCAGCT:1	TTAGCAGATGGAAAACTAATAT	AAATTAATTGTTCAACCCAGCT	+	chr2R	22366904	+	chr2R	22366528	376	+	chr2R	22366904	+	chr2R	22366528
TAAGCGGGTTCCTTCCGCAACAGTAGGGCTCCTGCGGAACAGCGACAGGTAC:1	TAAGCGGGTTCCTTCCGCAACA	CCTGCGGAACAGCGACAGGTAC	+	chrX	2399866	+	chrX	2408196	8330	+	chrX	2399866	+	chrX	2408196
TTCAACATATATACTCATTGCATTTTAGTCGTANAAGAAAAGAAGCAGA:1	TTCAACATATATACTCATTGCA	GTCGTANAAGAAAAGAAGCAGA	-	chr3R	31971491	-	chr3R	31971440	51	+	chr3R	31971440	+	chr3R	31971491
CAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACCCCATGTCCACCGACGCCCACTCATTGACACTCAGAGAAAA:1	CAACACAACACAACACAACACA	ACTCATTGACACTCAGAGAAAA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	5585477	10632183	+	chr2L	5585477	+	chr2L	16217660
TTTTGGCAGCCTGCTCAAGTGAAATGTCGCGTCGCTGTTGTCAGGTCACATGATCTCCCCCATGCAAAGTTTATT:1	TTTTGGCAGCCTGCTCAAGTGA	TCTCCCCCATGCAAAGTTTATT	-	chr3L	9061242	-	chr3L	9061134	108	+	chr3L	9061134	+	chr3L	9061242
GTCCCAAAAGCTTCCCAAGTTCACCAACAGCCTTAAGCTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTCG:1	GTCCCAAAAGCTTCCCAAGTTC	AAAGCTGACCGAAAGCTCCTCG	-	chr3L	22572203	-	chr3L	22572123	80	+	chr3L	22572123	+	chr3L	22572203
CAAATAAATTCAAACGTGACCAAAAATATCCACATATTCGTATTATCCACTTTGTGGACTATTGGGTTGTGCGG:1	CAAATAAATTCAAACGTGACCA	TGTGGACTATTGGGTTGTGCGG	+	chr3L	5030767	+	chr3L	5030842	75	+	chr3L	5030767	+	chr3L	5030842
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCACACAACACAACACAACACAA:3	CACAACACAACACAACACAACA	CACACAACACAACACAACACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
CCATGGTGCCATGGTGCCATGATGCCATGATGCCACGATTCCGCTGCCTGGCTGCACAAGTCTCCTTAATGACAA:1	CCATGGTGCCATGGTGCCATGA	GCACAAGTCTCCTTAATGACAA	+	chr2R	24658489	+	chr2R	23730308	928181	+	chr2R	24658489	+	chr2R	23730308
AAATTCATCATCGTCTCAGCACGCGTCTGTCAGCCGCGCTAAGGATACAATAAATGTCTTTCGCGGTCGCCGTTC:1	AAATTCATCATCGTCTCAGCAC	ATGTCTTTCGCGGTCGCCGTTC	+	chr2L	2294049	+	chr2L	2299254	5205	+	chr2L	2294049	+	chr2L	2299254
GCCCAATGTGGGGTCTTTCAATCCTATGCTCACGACGGAAGCATTTTTGGTACCCCTATTTTCAACCAAAAAGAT:1	GCCCAATGTGGGGTCTTTCAAT	CCCTATTTTCAACCAAAAAGAT	-	chr3R	10531979	-	chr3R	10531898	81	+	chr3R	10531898	+	chr3R	10531979
GATGAAGCCATCGATGATATATCACTGCAATTTCGAATATTCATTTCCCCGCTCCTCATCATCCTGGCGAACGA:1	GATGAAGCCATCGATGATATAT	TCCTCATCATCCTGGCGAACGA	-	chr3L	1415883	-	chr3L	1415802	81	+	chr3L	1415802	+	chr3L	1415883
GAGATGGGCGAGAGCAGGCTATGCAAATATTTGCTGATTGTTGATTNCGCCCCGAATTTGCCGAATTTTTAACA:1	GAGATGGGCGAGAGCAGGCTAT	CGAATTTGCCGAATTTTTAACA	+	chr2L	10862646	+	chr2L	9605614	1257032	+	chr2L	10862646	+	chr2L	9605614
ATGGAGAATCCAAACCGGACCATGCATACTTTCTCAATTATACAAAGTTGTGCAAGTA:1	ATGGAGAATCCAAACCGGACCA	ATTATACAAAGTTGTGCAAGTA	+	chr3L	10337515	+	chr3L	22838877	12501362	+	chr3L	10337515	+	chr3L	22838877
CAGGAGCACCAGGGTCTCATCGCTACCATGATGAACGATCTCAACAACGCCGTCGAGAAGGCATTGCACCTGGAC:1	CAGGAGCACCAGGGTCTCATCG	CGAGAAGGCATTGCACCTGGAC	-	chr3R	30627718	-	chr3R	30627638	80	+	chr3R	30627638	+	chr3R	30627718
GACGTAGAAGGGAAACAGCCAGTGAGTGTCGAAGAGGACATACAAGGACGATCAATGCAAGTGAAAAA:1	GACGTAGAAGGGAAACAGCCAG	GACGATCAATGCAAGTGAAAAA	+	chr3R	2534140	+	chr3R	2541702	7562	+	chr3R	2534140	+	chr3R	2541702
GAAAGTATTTTGCGGTTGGTTGAGTACAATCCGTTTTAGGCAGCTTCTCCGCTGCTCCGCTGCTAATCCACACCT:1	GAAAGTATTTTGCGGTTGGTTG	GCTCCGCTGCTAATCCACACCT	+	chr3R	23291270	+	chr3R	23291356	86	+	chr3R	23291270	+	chr3R	23291356
CTAGCTTTTTGTGTCGTCATCCTTACTCCCACCCACCCTGTGAATGTGGGAATTCGCACAACCTGTCACGCAACT:1	CTAGCTTTTTGTGTCGTCATCC	TCGCACAACCTGTCACGCAACT	-	chrX	2146746	-	chrX	2146654	92	+	chrX	2146654	+	chrX	2146746
TTATAATACAAAGTTGTGTCAGAGAATATCTTATATATATAATATTCGTTGGTAATTTTGATAAGAAAAGTAATT:1	TTATAATACAAAGTTGTGTCAG	AATTTTGATAAGAAAAGTAATT	+	chr3R	21108055	+	chr3R	21108316	261	+	chr3R	21108055	+	chr3R	21108316
AGTATGCAACAGTTTTTTTAGCTTCCGCATTATGCCCAACTTGGCCACACTCTGTGTTTTGGCCCGTANCAGTTC:1	AGTATGCAACAGTTTTTTTAGC	GTGTTTTGGCCCGTANCAGTTC	-	chr3R	13196067	-	chr3R	13195972	95	+	chr3R	13195972	+	chr3R	13196067
CCTGGCGGATGTTCATAGACCATTGGATTAATTCGATACGATA:1	CCTGGCGGATGTTCATAGACCA	ATTGGATTAATTCGATACGATA	-	chr3L	9797328	-	chr3L	9797269	59	+	chr3L	9797269	+	chr3L	9797328
AGTAAATCAAATAAAAAGCGTAATAAAATATTTAAGATCCTAAAATCCATACACTGTAAGCACAAACCTCTATCT:1	AGTAAATCAAATAAAAAGCGTA	CTGTAAGCACAAACCTCTATCT	+	chrX	17782222	+	chrX	17782320	98	+	chrX	17782222	+	chrX	17782320
AAATAGTGAGAGATGAAGCGGGATTTTCATCTATTTATTTTGACATCGAGGCTCTAGGCCGGCAATTAAATGT:1	AAATAGTGAGAGATGAAGCGGG	CTCTAGGCCGGCAATTAAATGT	-	chr2R	22512000	-	chr2R	22511915	85	+	chr2R	22511915	+	chr2R	22512000
GCATTCAGTCATAATGTGAATGGTGAGAGTTGTATTTGCTGGAACTTATGGGCTTGCATGCCACGGGGGAATTGT:1	GCATTCAGTCATAATGTGAATG	TTGCATGCCACGGGGGAATTGT	+	chr3R	20118035	+	chr3R	20118121	86	+	chr3R	20118035	+	chr3R	20118121
AAATCTTACATAGTTCTTTTTGATTTTTTGCTAAAACACGTAAAAGCACAATTATGCATACGTCCATCATTAC:1	AAATCTTACATAGTTCTTTTTG	TTATGCATACGTCCATCATTAC	-	chr3R	28479230	-	chr3R	28479149	81	+	chr3R	28479149	+	chr3R	28479230
AAAGTGATATACATTTGGGGCGAACTAAGCCCTTATCCTTTTTATTTCCAACACTATATTTTATGCATATAATTA:1	AAAGTGATATACATTTGGGGCG	CTATATTTTATGCATATAATTA	-	chr3R	30170863	-	chr3R	30170776	87	+	chr3R	30170776	+	chr3R	30170863
CAACTATTTTAACGGTCTTTAGGCTCCCATTCAGTTCTCGAGGAATTCAGGAAATGGGTTTTCAGCTAGGGAAA:1	CAACTATTTTAACGGTCTTTAG	AATGGGTTTTCAGCTAGGGAAA	-	chr3R	26885819	-	chr3R	26885720	99	+	chr3R	26885720	+	chr3R	26885819
TCAGTAAGATAAACTTTTCATGGAGTTCCGATCTGGATTTATTGAAATGAAATGTTACTTATGCTCAAACATAT:1	TCAGTAAGATAAACTTTTCATG	TGTTACTTATGCTCAAACATAT	+	chrX	10686050	+	chrX	10691186	5136	+	chrX	10686050	+	chrX	10691186
AATTAAAAACGGAATAAGCTGCGAGATTAGCTAACCCATGCAAAGGCATATTCCATTTTCCCCCTTGAA:1	AATTAAAAACGGAATAAGCTGC	ATATTCCATTTTCCCCCTTGAA	-	chr2R	23784549	-	chr2R	23784477	72	+	chr2R	23784477	+	chr2R	23784549
AGTTTCTAGCTCGAAACTACACAAGCCCAACGAGTTGTTCTGCTATTTTCATTTTTACTTACCAAATTCTTATC:1	AGTTTCTAGCTCGAAACTACAC	TTTTACTTACCAAATTCTTATC	+	chr3R	5297079	+	chr3R	29257006	23959927	+	chr3R	5297079	+	chr3R	29257006
TAGTTATGATTTCAAACTAATTACTCAACAGTAAATCAGTGAAAATATGCCCATAACTAGTGCTAACTNTTCAAC:1	TAGTTATGATTTCAAACTAATT	TAACTAGTGCTAACTNTTCAAC	+	chr2L	3108889	+	chr2L	3108966	77	+	chr2L	3108889	+	chr2L	3108966
CTTTTCTCCTACTATTCTATTCTTCATAATTACGCTGCTATGCTGTTGGCATAGATCAACGNAAACACATCAAGC:1	CTTTTCTCCTACTATTCTATTC	GATCAACGNAAACACATCAAGC	+	chr2R	25101289	+	chr2R	25101391	102	+	chr2R	25101289	+	chr2R	25101391
TAACAATGATTTCCATTAAATATTTTAGTTAGTTTTTAAAAGGTGCCAGGCCATGAGCGTTCTAATTGGTTATCT:1	TAACAATGATTTCCATTAAATA	TGAGCGTTCTAATTGGTTATCT	+	chr2L	764572	+	chr2L	764672	100	+	chr2L	764572	+	chr2L	764672
TGTTTGATTTGAGTTCTAAATTTGTATATGAATCAATAAGGTAATAGGTGACTAAACGGAATTGTTCTTCAGACA:1	TGTTTGATTTGAGTTCTAAATT	AAACGGAATTGTTCTTCAGACA	+	chr3R	28173684	+	chr3R	28181114	7430	+	chr3R	28173684	+	chr3R	28181114
CTCCTCCACTCCTCCACTCCTCCATCTGCCACATGTAGTANTCAACCCCTTGTGCGGGGGGAGAT:1	CTCCTCCACTCCTCCACTCCTC	AACCCCTTGTGCGGGGGGAGAT	-	chr3L	19661437	-	chr3L	4999640	14661797	+	chr3L	4999640	+	chr3L	19661437
GTGCAGTTCATTAGCGAAGGTAAACAATCAATATTGTAATGCAACGATTGCATTCAAAATCCATCCATTTATCC:1	GTGCAGTTCATTAGCGAAGGTA	TTCAAAATCCATCCATTTATCC	-	chrX	12532804	-	chrX	12532659	145	+	chrX	12532659	+	chrX	12532804
GCTTTGATGTTTGAGAAAGCACTGAGAAGGGGTAAAACTTTGAACTGCACTTTCTAGGAGAAAGTACTAA:1	GCTTTGATGTTTGAGAAAGCAC	ACTTTCTAGGAGAAAGTACTAA	+	chr3R	31426895	+	chr3R	31426982	87	+	chr3R	31426895	+	chr3R	31426982
ATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTAT:1	ATTGTTTATTGTTTATTGTTTA	TTGTTTATTGTTTATTTTTTAT	-	chr3R	7773344	-	chr3R	7094694	678650	+	chr3R	7094694	+	chr3R	7773344
CAGGCTTAATGGAAAATGCCTCCCTTATGGAATTTTGTTTATGTGTTTCCGCCTTGTTTGTTTAAATACTTGTTA:1	CAGGCTTAATGGAAAATGCCTC	TTGTTTGTTTAAATACTTGTTA	-	chr2L	7493884	-	chr2L	7493673	211	+	chr2L	7493673	+	chr2L	7493884
AGACACGAAGAAAGCAACNGCAAGAAAGTTGAAGCATGAAANTTTNAGCAAAAGCTTATGGTCAACTGATTGATA:1	AGACACGAAGAAAGCAACNGCA	GCTTATGGTCAACTGATTGATA	+	chr3L	939794	+	chr3L	940915	1121	+	chr3L	939794	+	chr3L	940915
GTTGCGGCTGCTTGTTTGCAGCGTCTCAAGTTGCATTT:1	GTTGCGGCTGCTTGTTTGCAGC	TGCAGCGTCTCAAGTTGCATTT	-	chr2R	11534578	-	chr2R	11766575	231997	+	chr2R	11766575	+	chr2R	11534578
TCTCCCCCGAGGGTATTCCCGTCCGCATTGATTTTCCACCCATTTTCCA:1	TCTCCCCCGAGGGTATTCCCGT	TTGATTTTCCACCCATTTTCCA	-	chr3L	7086285	-	chr3L	12236475	5150190	+	chr3L	12236475	+	chr3L	7086285
CATATATGCCCCATATGCTGCCCCAAGATCGGTTTTGCATTTATGCGGAGTGGAAATTCCCAGAGA:1	CATATATGCCCCATATGCTGCC	GCGGAGTGGAAATTCCCAGAGA	+	chrX	20331964	+	chrX	20332051	87	+	chrX	20331964	+	chrX	20332051
TAAATACAAATCTAGCTTATATTACAAAGTATCTAATATAAAGAACATAGTGACGAAGCGCGTCTCAATCAAATC:1	TAAATACAAATCTAGCTTATAT	CGAAGCGCGTCTCAATCAAATC	+	chr3R	13828853	+	chr3R	13828939	86	+	chr3R	13828853	+	chr3R	13828939
ATTTCCCAAGATTTGTATAATAGTTTTCCCCCCATAAATTGAGTTAATT:1	ATTTCCCAAGATTTGTATAATA	CCCCCCATAAATTGAGTTAATT	-	chrX	17534684	-	chrX	8640101	8894583	+	chrX	8640101	+	chrX	17534684
TAAAGGAATAGTCGCGTGGCTGCAGGTGGTTGGGGAATTGCTAAAAGCAATCTTTAAAGCTTTAGTGGATCTTT:1	TAAAGGAATAGTCGCGTGGCTG	TTTAAAGCTTTAGTGGATCTTT	-	chr2L	8337033	-	chr2L	8336955	78	+	chr2L	8336955	+	chr2L	8337033
CTACTATANCGTATATACTCCTGGCCATTGTGGTGNCTAATGCGTGTGCCTAAATGTGTAGATAATTTATGCGTG:1	CTACTATANCGTATATACTCCT	ATGTGTAGATAATTTATGCGTG	-	chr3R	28103420	-	chr3R	28103327	93	+	chr3R	28103327	+	chr3R	28103420
TGAGATGTGAGCCAGGCCAAAAGGAGTGATGCATTAAAAACAGGTGTTAGTTAACGTTAGTAATTATGGGTGGGT:1	TGAGATGTGAGCCAGGCCAAAA	ACGTTAGTAATTATGGGTGGGT	-	chr3R	26601040	-	chr3R	26600955	85	+	chr3R	26600955	+	chr3R	26601040
ATATATATATATATACATTTGTGGTGGGTTTTTGGAAACGTACTGCGTGCAAAACTATATTCTATGANTTTCCAT:1	ATATATATATATATACATTTGT	ACTATATTCTATGANTTTCCAT	-	chr3L	11521337	-	chr3L	2355689	9165648	+	chr3L	2355689	+	chr3L	11521337
CGCGATTTTCCCAAGGAAATTTTTAAGAATTTCCAATGATCATTCTTGCTTTGGCCCATTCGAAACGGAGTCCTC:1	CGCGATTTTCCCAAGGAAATTT	GCCCATTCGAAACGGAGTCCTC	-	chrX	10107329	-	chrX	6734850	3372479	+	chrX	6734850	+	chrX	10107329
AAGGAACTCAGCTGAAGAGACTTGGCCTGGCAACACAATGGCACATCTCTCATCAATGGGCAGTCAAATGCAAAG:1	AAGGAACTCAGCTGAAGAGACT	CAATGGGCAGTCAAATGCAAAG	+	chr3R	23629445	+	chr3R	23629521	76	+	chr3R	23629445	+	chr3R	23629521
AATATGTACATATATAATATAAATAATCGGTTTTTTTTTATCAAT:1	AATATGTACATATATAATATAA	TAATCGGTTTTTTTTTATCAAT	+	chr3L	18879477	+	chr3L	6116764	12762713	+	chr3L	18879477	+	chr3L	6116764
TATATAGTTTTAGGAAGTTTTTTAATTTTTTTATAAACAAATCTGATAATAAGCGAAAGACCAATTTAAACTCTC:1	TATATAGTTTTAGGAAGTTTTT	CGAAAGACCAATTTAAACTCTC	-	chr2R	13547276	-	chr2R	13547081	195	+	chr2R	13547081	+	chr2R	13547276
CTAGCTTGGGTTGGGTTCAGGGGGTTCCTTNNNCNCCAATAGATGTGGATGATGTTGCG:1	CTAGCTTGGGTTGGGTTCAGGG	AATAGATGTGGATGATGTTGCG	-	chr2L	15468863	-	chr2L	15468794	69	+	chr2L	15468794	+	chr2L	15468863
TTAAAGTTTAGATATTACATTCCGCTTTATATAATTGTTTCCAATAATAATAAGAGATGCAGTATGATTT:1	TTAAAGTTTAGATATTACATTC	AATAAGAGATGCAGTATGATTT	+	chr3L	8782147	+	chr3L	8782268	121	+	chr3L	8782147	+	chr3L	8782268
ATAATTTATGTATGATATTTGTTCCTGCTCGATTCCATTGAATGCGATTGTAATTAGGGATTAAATAAGATTACA:1	ATAATTTATGTATGATATTTGT	TTAGGGATTAAATAAGATTACA	-	chr2L	2634629	-	chr2L	2634529	100	+	chr2L	2634529	+	chr2L	2634629
ATAANTGCAGGCGCGGGAAAATNGCTTNTTCACTTCATTNGATGGACAAACAAAAATCCGAAAATAACGCAAATG:1	ATAANTGCAGGCGCGGGAAAAT	AAATCCGAAAATAACGCAAATG	+	chr2R	16929761	+	chr2R	6701040	10228721	+	chr2R	16929761	+	chr2R	6701040
CAGGTGGCAGCTGCTGCGATGCCATAATGGGCACTTGAACAGTGGACAGAAGGGAGGTGAAGTCCTG:1	CAGGTGGCAGCTGCTGCGATGC	ACAGAAGGGAGGTGAAGTCCTG	+	chr3L	2854492	+	chr3L	2854562	70	+	chr3L	2854492	+	chr3L	2854562
TGAAGCGATGCCTTGGGATTTGGGATATATTTTAAAGAATTTAACTATTGTTAAATTCATGTCAACTTTAATATA:1	TGAAGCGATGCCTTGGGATTTG	AATTCATGTCAACTTTAATATA	+	chr2R	15898894	+	chr2R	15898992	98	+	chr2R	15898894	+	chr2R	15898992
TGTGGCAAAAAAACACTTGCTAGGAGGTCAGGAGACCGAGGATGCATCCGGCTGCCGCCGCNGAGTCT:1	TGTGGCAAAAAAACACTTGCTA	TCCGGCTGCCGCCGCNGAGTCT	-	chr2L	1036464	-	chr2L	1036011	453	+	chr2L	1036011	+	chr2L	1036464
TGGGGCATCGGACTGGGAGGGAACCATGCGGGCGTGACTAATTAGCNATGCGATGT:1	TGGGGCATCGGACTGGGAGGGA	TGACTAATTAGCNATGCGATGT	+	chr3L	1347183	+	chr3L	1347249	66	+	chr3L	1347183	+	chr3L	1347249
AANCTAATAATGAATAAGCAAAGGCCTACCTACTNTNATAATCCTTTTTTTGCCACTGCCTAATCATGGGTATTC:1	AANCTAATAATGAATAAGCAAA	CACTGCCTAATCATGGGTATTC	-	chr2R	23346608	-	chr2R	23346532	76	+	chr2R	23346532	+	chr2R	23346608
GGCTTTTCTCGGAGTGGGCGTTTATGGTAGGGTANATTAGCTGTATGGTGGCGTT:1	GGCTTTTCTCGGAGTGGGCGTT	ANATTAGCTGTATGGTGGCGTT	-	chr2R	14681708	-	chr2R	14681646	62	+	chr2R	14681646	+	chr2R	14681708
AACAAAACATTAAGTAGTTTTTTTGACAAGAACTCACATTAAAGTGTTTATTATCAATTTAAAACTTTTAATCA:1	AACAAAACATTAAGTAGTTTTT	ATCAATTTAAAACTTTTAATCA	+	chrX	14981733	+	chrX	14981811	78	+	chrX	14981733	+	chrX	14981811
TTAATTGGAATTTCCATGTATAAATACATAATTGTATGTGCATACCACTTAATTTAATGCGTCGTTCNATGACTT:1	TTAATTGGAATTTCCATGTATA	TTAATGCGTCGTTCNATGACTT	-	chrX	20037731	-	chrX	20037652	79	+	chrX	20037652	+	chrX	20037731
CCTTTCAAATACTGAAAAGTATCTCTACTATTTCAGTCATATTTGAATACGATATTTAATTATATTTT:1	CCTTTCAAATACTGAAAAGTAT	ATACGATATTTAATTATATTTT	+	chr3R	13194118	+	chr3R	13194700	582	+	chr3R	13194118	+	chr3R	13194700
CACTGACACATGGCCACATGGTTCCACACTNNNANACAAACACCCGAATCCTCGACGCCGGGTGGCTGGGAAGGA:1	CACTGACACATGGCCACATGGT	GACGCCGGGTGGCTGGGAAGGA	-	chr2R	16055035	-	chr2R	16054952	83	+	chr2R	16054952	+	chr2R	16055035
GGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGA:1	GGAACGATTAGCGGATTTTTTG	TCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGA	+	chr2L	22679816	+	chr2L	22684588	4772	+	chr2L	22679816	+	chr2L	22684588
AAGAAGAAGACGTTGGCTAGGAACAAGAACAAGANGATGGCGAGGAAGC:1	AAGAAGAAGACGTTGGCTAGGA	AACAAGANGATGGCGAGGAAGC	+	chr2R	24727915	+	chr2R	24735397	7482	+	chr2R	24727915	+	chr2R	24735397
CAATCGGAGTTTGGTTGCCTGGAGCTCTTGTCTCTCCCTTCAACAAAACGTCCAATCCCTGAGGCATGTCAC:1	CAATCGGAGTTTGGTTGCCTGG	TCCAATCCCTGAGGCATGTCAC	-	chr3L	7332550	-	chr3L	7332476	74	+	chr3L	7332476	+	chr3L	7332550
AAAGCCAAACAGAGCCAGCCGGGATGGGACCGAAAGCCAGAAACAAAAGCACAACAAAAGCCCTCGTTTAGAACA:1	AAAGCCAAACAGAGCCAGCCGG	ACAAAAGCCCTCGTTTAGAACA	+	chr2L	17191899	+	chr2L	17191984	85	+	chr2L	17191899	+	chr2L	17191984
GTATAATATAAATACAAATAAATTTCGCACATAACTTGGCGTGAATCAAACTAAACNGTCAC:1	GTATAATATAAATACAAATAAA	GTGAATCAAACTAAACNGTCAC	+	chr2R	21159013	+	chr2R	21159082	69	+	chr2R	21159013	+	chr2R	21159082
TAACTAAGATGTTTGCCAGTCGGCTAATGACATGTTCATGGTACGAATAATTTCTACCGTTACAATCGCTTTA:1	TAACTAAGATGTTTGCCAGTCG	TTCTACCGTTACAATCGCTTTA	+	chr2L	13152249	+	chr2L	13152325	76	+	chr2L	13152249	+	chr2L	13152325
TGACTGGGAAATCGGGGACATTGGGGAACTCACTGGCAATAAAAGCGCCAAACAAGTTGGCTTAATTAATTT:1	TGACTGGGAAATCGGGGACATT	AACAAGTTGGCTTAATTAATTT	-	chr3L	7285536	-	chr3L	7285461	75	+	chr3L	7285461	+	chr3L	7285536
CCTGTCGAAAAACGAGACNTGAGACATATTTTCAGAGCTACATGTTTCATATGCACTTTATTCAAGTGCGGANGA:1	CCTGTCGAAAAACGAGACNTGA	CACTTTATTCAAGTGCGGANGA	-	chr3R	31643047	-	chr3R	31642802	245	+	chr3R	31642802	+	chr3R	31643047
ATAATAATAATAAAAAAAAGGACCCCCTTCCCACTAAAAACCTGAAGAGAGGCATGAAACCCGGTTTGATTGGCT:1	ATAATAATAATAAAAAAAAGGA	ATGAAACCCGGTTTGATTGGCT	+	chr3R	23304670	+	chr3R	26881381	3576711	+	chr3R	23304670	+	chr3R	26881381
TCAAATTATAATCATCGTTCAGCATTGTAATCGCACCTATCATCCATCACTCTTAAACCGAAAACTATAAATTAA:1	TCAAATTATAATCATCGTTCAG	TAAACCGAAAACTATAAATTAA	-	chr3R	5306614	-	chr3R	30455072	25148458	+	chr3R	30455072	+	chr3R	5306614
TTCTTGAAGAATTGCTGCAACTTTCCCAAAAAGCAACTCCATTACAAGGCACCTATAAAGCTTTCGCCTTAAATG:1	TTCTTGAAGAATTGCTGCAACT	TATAAAGCTTTCGCCTTAAATG	+	chr2R	15149185	+	chr2R	15149264	79	+	chr2R	15149185	+	chr2R	15149264
CTCCTACTATTCCTAATCCTAATTTTCCCTTCTGCGAGACTCCCAAACCAACTGCTCTTCGCATTCTNTGGCAG:1	CTCCTACTATTCCTAATCCTAA	TGCTCTTCGCATTCTNTGGCAG	+	chrX	1641901	+	chrX	2833910	1192009	+	chrX	1641901	+	chrX	2833910
TACATACATGTGAGCATGGCAGCCACACAAAGGATCGGCACAGAAACAAGGACCCATCTGAAGGCAGAGGAG:1	TACATACATGTGAGCATGGCAG	GACCCATCTGAAGGCAGAGGAG	+	chr2R	11064536	+	chr2R	20970197	9905661	+	chr2R	11064536	+	chr2R	20970197
TAATTTGATTGATTGAATGAAGCTGGTGAATGGCACTTATTTCGTTATTTTGCACTTTGCACACGATCATTGT:1	TAATTTGATTGATTGAATGAAG	GCACTTTGCACACGATCATTGT	+	chr3L	17635098	+	chr3L	17388683	246415	+	chr3L	17635098	+	chr3L	17388683
CAGCTGCGTTTGTGCCATTAAAGTCGGACCCGATTTCGGGTCAAATTATAAATTTGATCACATTAGGACATATTA:1	CAGCTGCGTTTGTGCCATTAAA	TTGATCACATTAGGACATATTA	-	chr3R	10905130	-	chr3R	10904926	204	+	chr3R	10904926	+	chr3R	10905130
GGGTAAGTGGCCATGTGCACGGTGATGAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCTCTGTCACTTGAAGTA:1	GGGTAAGTGGCCATGTGCACGG	GGGATCTCTGTCACTTGAAGTA	+	chrX	2189428	+	chrX	2189504	76	+	chrX	2189428	+	chrX	2189504
CACAACTACAACAGAATCGACAACTTCCAAAACAACTACCACAGAATCAACCACAATCCCAACAACAACCACAGA:1	CACAACTACAACAGAATCGACA	CAATCCCAACAACAACCACAGA	+	chr3L	5483066	+	chr3L	5483185	119	+	chr3L	5483066	+	chr3L	5483185
AAAAAAAAGAATAAAAAATACACTCCGCTGACCATAAAATATTGATGGCAAATATTTATACAAATAAAATCGAA:1	AAAAAAAAGAATAAAAAATACA	TATTTATACAAATAAAATCGAA	+	chrX	1852999	+	chrX	6544599	4691600	+	chrX	1852999	+	chrX	6544599
AACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	AACACAACACAACACACCACAA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
GCAACATTCTGCTTTAAANATCTCTTCTTTTCCTCTTATTTTTTTGCACATCTTAACTCTCTTTTATTCGAGNGT:1	GCAACATTCTGCTTTAAANATC	TAACTCTCTTTTATTCGAGNGT	+	chr3L	14255671	+	chr3L	12178849	2076822	+	chr3L	14255671	+	chr3L	12178849
ATGAAATACCATTTAAAGCGTATAATCGGCGACACTAAATAGTTTTATTAAAGGATGAGAATTGTCNTCCTGCA:1	ATGAAATACCATTTAAAGCGTA	GGATGAGAATTGTCNTCCTGCA	+	chr3R	19447600	+	chr3R	19447962	362	+	chr3R	19447600	+	chr3R	19447962
AGTTGGCTCAGATCAGGTTGCTTGTATAAAGTAAAGTATAAATGATTCTTCCATAATGGAACACCTGCAGGGAAA:1	AGTTGGCTCAGATCAGGTTGCT	TAATGGAACACCTGCAGGGAAA	+	chr3L	21868591	+	chr3L	21868681	90	+	chr3L	21868591	+	chr3L	21868681
GGCGCAACAACGGTTAAAAGTTAATACGAAAGGGATGGGCGGGGAGAGGGTAGAAAGAGGGGGCGCGAAAGG:1	GGCGCAACAACGGTTAAAAGTT	TAGAAAGAGGGGGCGCGAAAGG	+	chrX	10022126	+	chrX	16579549	6557423	+	chrX	10022126	+	chrX	16579549
GATTTTTATTTTCTTCTCCCGGCAGTGAAAAAGCAAGGGGTTAACACTTAAAGGTTGGAAAATTATAAATGAAAA:1	GATTTTTATTTTCTTCTCCCGG	GTTGGAAAATTATAAATGAAAA	-	chr2L	12264749	-	chr2L	12264658	91	+	chr2L	12264658	+	chr2L	12264749
CAGTCAGCACCCCCTATTTTCTCCCAGTGCTGCGCGCTCTTGTTCCCGATCATTATTTTTTCCATAA:1	CAGTCAGCACCCCCTATTTTCT	CCGATCATTATTTTTTCCATAA	+	chr2L	19163393	+	chr2L	19163466	73	+	chr2L	19163393	+	chr2L	19163466
GTCGTTTTGTTTTTTGTTTTGAAAT:1	GTCGTTTTGTTTTTTGTTTTGA	GTTTTGTTTTTTGTTTTGAAAT	+	chr2L	11528973	+	chr2L	7958905	3570068	+	chr2L	11528973	+	chr2L	7958905
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGAGTGGGACTCTTTGGGTCAATACGAACG:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	ACTCTTTGGGTCAATACGAACG	+	chr3L	22908067	+	chr3L	11242934	11665133	+	chr3L	22908067	+	chr3L	11242934
ATCTGAGCCCCCGCGGCGGCATCGATTCTGTGGTTCAAGTACCATTTGGCAAGATAAACAGAGATTTAGTAAGAA:1	ATCTGAGCCCCCGCGGCGGCAT	ATAAACAGAGATTTAGTAAGAA	-	chr3L	17524547	-	chr3L	17516989	7558	+	chr3L	17516989	+	chr3L	17524547
GGTTAAGATATCAGCTTTTATAGCATTAAATCAATGTCTTTCAAATTATCGAGTGTAAGAACTCAGAGAAGAAA:1	GGTTAAGATATCAGCTTTTATA	GTGTAAGAACTCAGAGAAGAAA	-	chr2R	10922865	-	chr2R	10922780	85	+	chr2R	10922780	+	chr2R	10922865
TATGGCCTACTATATACTCTACCAATACAGAAAAGTTGGGTGAGTTCTCAAAAACTTTTTCATTACACTTATTTC:1	TATGGCCTACTATATACTCTAC	ACTTTTTCATTACACTTATTTC	-	chr3R	4896415	-	chr3R	4896322	93	+	chr3R	4896322	+	chr3R	4896415
TTATAATGTTTTTGGTAAAGCGTTATGACAAATGATTTTTNAATCNACGAGCCACTCATTTTA:1	TTATAATGTTTTTGGTAAAGCG	AATCNACGAGCCACTCATTTTA	-	chr2R	6161407	-	chr2R	6161340	67	+	chr2R	6161340	+	chr2R	6161407
GTATCGCTCAAAAACATGTTGTGTCGTATAATATAAATTTTCTATAGTGTCTTAAAATATATACAAATATTTTT:1	GTATCGCTCAAAAACATGTTGT	TAAAATATATACAAATATTTTT	-	chr3R	15160671	-	chr3R	15160574	97	+	chr3R	15160574	+	chr3R	15160671
ACTATGTTCGTTTTGCGCATAAATCTGTTTCCACAGAATTCGGTTATTTGGTTCCAATTAGGCGTTTAAGGAGCT:1	ACTATGTTCGTTTTGCGCATAA	CCAATTAGGCGTTTAAGGAGCT	-	chr2R	19207496	-	chr2R	9952211	9255285	+	chr2R	9952211	+	chr2R	19207496
CCCCACCAGAAAGCTTTCATGGCACCCTTACTTTTCTGATGACAATTNCCACAAACGACATTAATCTNTATTCAG:1	CCCCACCAGAAAGCTTTCATGG	AACGACATTAATCTNTATTCAG	+	chr2L	11696885	+	chr2L	11696970	85	+	chr2L	11696885	+	chr2L	11696970
GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAACACACAGAAAAGTACCACAGAAATACA:1	GACAAAGACAAAGACAAAGACA	AGAAAAGTACCACAGAAATACA	+	chrX	16983077	+	chrX	15508148	1474929	+	chrX	16983077	+	chrX	15508148
CAATAAATTAAGACAAATTCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTCATCGTTGATCGCCACCA:1	CAATAAATTAAGACAAATTCGT	TAGTCATCGTTGATCGCCACCA	-	chrX	17629783	-	chrX	17633083	3300	+	chrX	17633083	+	chrX	17629783
CATTTCATTTGCCGACTGACCACCCCTGCAGCTGAGTTGGCAATTAAGCGAGTTAAAATACTTCTTTCTTTTGGC:1	CATTTCATTTGCCGACTGACCA	TAAAATACTTCTTTCTTTTGGC	-	chr3R	16411557	-	chr3R	16411479	78	+	chr3R	16411479	+	chr3R	16411557
TCAAGACTTTCTCCTTTCTTTTAAGAGCTTTGTGTTTCCCGTTTTCCAAATTTTAGAACTGTGGATATGG:1	TCAAGACTTTCTCCTTTCTTTT	AATTTTAGAACTGTGGATATGG	-	chr3R	5627141	-	chr3R	5627030	111	+	chr3R	5627030	+	chr3R	5627141
TTCGATTTGGTCAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCTACAGAGGCAAGTAAAGCGGAAAGAA:1	TTCGATTTGGTCAAGTAACTGG	GAGGCAAGTAAAGCGGAAAGAA	-	chr2L	18244328	-	chr2L	18243693	635	+	chr2L	18243693	+	chr2L	18244328
TCCCAAACTCGAGCTGTGNGCATCTCACCTGCTTAGTGAATNAAANTGTTCAAAAAATCGTGGCCAAAAAACATT:1	TCCCAAACTCGAGCTGTGNGCA	AAAATCGTGGCCAAAAAACATT	+	chr3R	19446249	+	chr3R	19447262	1013	+	chr3R	19446249	+	chr3R	19447262
GCGCTCGCCGTTCGACACGATCAAGAACAAAAATCAAATACTCATACAAAAC:1	GCGCTCGCCGTTCGACACGATC	AAATCAAATACTCATACAAAAC	-	chr3L	6818854	-	chr3L	453624	6365230	+	chr3L	453624	+	chr3L	6818854
AGAAGAGGTCTGCTTAAGATAAGCAGGAGTGTATTCAGCGGGCTGATAAGAGCTGGAATCGACACCAGGAGCTAC:1	AGAAGAGGTCTGCTTAAGATAA	TGGAATCGACACCAGGAGCTAC	-	chrX	14170464	-	chrX	14170057	407	+	chrX	14170057	+	chrX	14170464
GACGTCCACTATCACTTACATGTGCTTTCCAGCCCCTGAGATAATTTGAAATAAGCTTATGATGATATAGT:1	GACGTCCACTATCACTTACATG	AATAAGCTTATGATGATATAGT	-	chr3R	5001982	-	chr3R	5001518	464	+	chr3R	5001518	+	chr3R	5001982
TCATATAAAAACGGCATAACGTGTTAATTTCTTACTCCCAATGCTATTTTGGTTTGGAAAGAAATCACTATTTTG:1	TCATATAAAAACGGCATAACGT	TTGGAAAGAAATCACTATTTTG	-	chr3R	16921922	-	chr3R	16921838	84	+	chr3R	16921838	+	chr3R	16921922
ATTAATAGATAAGTTAAGAGTTTTTGTTTTGGCAAAAGGATACGCTACGATGGGCGCCGNGTCCTTGATGTT:1	ATTAATAGATAAGTTAAGAGTT	TGGGCGCCGNGTCCTTGATGTT	+	chrX	9337971	+	chrX	9338060	89	+	chrX	9337971	+	chrX	9338060
AAAGTATTGATCCTGATGTACGTCCTTTTACCATCATAACCTCTTATTAACGATGCCTTCTATTAAC:1	AAAGTATTGATCCTGATGTACG	ATTAACGATGCCTTCTATTAAC	+	chr3L	22522716	+	chr3L	22522785	69	+	chr3L	22522716	+	chr3L	22522785
TGGCNGCACTGGAAAAAACATGNTACTNGAAGATATACTNGCTATTTTGTCGTTTAAAATATATATCGGTTAAA:1	TGGCNGCACTGGAAAAAACATG	TTTAAAATATATATCGGTTAAA	-	chr3L	20504064	-	chr3L	20499698	4366	+	chr3L	20499698	+	chr3L	20504064
ACAAAAACNGAGCGAATCTCGTATATATTTACTTTTTNNNNGAGTCCACCGCGATGACTTGNAAGTAAAATACAA:1	ACAAAAACNGAGCGAATCTCGT	ATGACTTGNAAGTAAAATACAA	+	chr2L	18394006	+	chr2L	18394086	80	+	chr2L	18394006	+	chr2L	18394086
TATGGTTCTAGCATCGAAAAACCTAAGGCTTCTTTCTTAAAATATCCCATATACATTTTCCATTTTTAAACACAT:1	TATGGTTCTAGCATCGAAAAAC	CATTTTCCATTTTTAAACACAT	-	chr3L	14320750	-	chr3L	14320673	77	+	chr3L	14320673	+	chr3L	14320750
AGGGGTTACATCCTTCAANACCGCTAGCTAGGGGGCTTGCTNGAGNTTTTAAACCATTACAATCAATGATTATA:1	AGGGGTTACATCCTTCAANACC	ACCATTACAATCAATGATTATA	-	chr3R	7678036	-	chr3R	7677924	112	+	chr3R	7677924	+	chr3R	7678036
CGTATCGCTCAAAAACATGTTGTGTCGTATAATATAAATTTTCTATAGTGTCTTAAAATATATACAAANATTTTT:1	CGTATCGCTCAAAAACATGTTG	TAAAATATATACAAANATTTTT	-	chr3R	15160672	-	chr3R	15160574	98	+	chr3R	15160574	+	chr3R	15160672
GTGTGGGTGGTCCGGAAAGGGTAATCCCTTTGCCCACCAGCACACACGCGCAGGCAAACAAACATTAAACGTTAT:1	GTGTGGGTGGTCCGGAAAGGGT	GCAAACAAACATTAAACGTTAT	+	chr3L	19460157	+	chr3L	22651172	3191015	+	chr3L	19460157	+	chr3L	22651172
GATGTAAAAAATCCAAAGGAAAAGAAACCATTGTAGCCACACAATAGAAATAAACAATCCTGCTGTATAACATTA:1	GATGTAAAAAATCCAAAGGAAA	ACAATCCTGCTGTATAACATTA	+	chr3R	19444847	+	chr3R	19379702	65145	+	chr3R	19444847	+	chr3R	19379702
CATTTCCTCCTTAGGGTTCTTTTCGTTTTAATTCAGTTAATTTAAGACTTTTCCCATAATTTCCGTTTGCTATAT:1	CATTTCCTCCTTAGGGTTCTTT	CCATAATTTCCGTTTGCTATAT	+	chr3L	5490327	+	chr3L	5490545	218	+	chr3L	5490327	+	chr3L	5490545
TGCTGTTTTTGTTCTTTATTCAGTTATATCTTGTGCCTGCAAGACATATTTTAATTTGTCTTGTCTCCGCATATC:1	TGCTGTTTTTGTTCTTTATTCA	ATTTGTCTTGTCTCCGCATATC	+	chr3R	27342809	+	chr3R	27351390	8581	+	chr3R	27342809	+	chr3R	27351390
CACCTTTTCTCATTGATACCTCAATGGGTATTCACAATTCTAAGTTCNTTCAATTCCGCTGNCCCCCGTCTA:1	CACCTTTTCTCATTGATACCTC	CAATTCCGCTGNCCCCCGTCTA	+	chr2L	4700132	+	chr2L	12488138	7788006	+	chr2L	4700132	+	chr2L	12488138
GAAAAGGTTATATATATTTTTGAATCATGGAAAGAGTAAATAGTGAATACGTACGATAATTGATTTGATAGTTAT:1	GAAAAGGTTATATATATTTTTG	CGATAATTGATTTGATAGTTAT	-	chrX	667760	-	chrX	667676	84	+	chrX	667676	+	chrX	667760
CAAACATTTTAATTGCTTCCTTTTCTGGATGGCCAAAAAGACGCGAAGGCAGCGGAAGCGGGCAAAAGCG:1	CAAACATTTTAATTGCTTCCTT	GCAGCGGAAGCGGGCAAAAGCG	+	chr3R	31245784	+	chr3R	31245866	82	+	chr3R	31245784	+	chr3R	31245866
TGAGGAGGAAGGTATACGGCTTACCAGGTATATACAGCAAGTGGTATTATCCGCGCCTGTTTTCCTGCAGCT:1	TGAGGAGGAAGGTATACGGCTT	CCGCGCCTGTTTTCCTGCAGCT	-	chrX	20641323	-	chrX	20641215	108	+	chrX	20641215	+	chrX	20641323
CTGTGTACACCTCCTTGACAACCCAACGGGAGAAGTCCAGCTTAGCGAATGCTTCGAGAATTGATCTGTCTTTGG:1	CTGTGTACACCTCCTTGACAAC	TCGAGAATTGATCTGTCTTTGG	-	chr2R	4656898	-	chr2R	4656794	104	+	chr2R	4656794	+	chr2R	4656898
GAAGTTCAAAAGCTTTAAAAATCTTAATAANNNTNAGTTCAATATCCTGTTGCGGTGGACTTACATCGATGTTGA:1	GAAGTTCAAAAGCTTTAAAAAT	GGTGGACTTACATCGATGTTGA	-	chr2L	17158843	-	chr2L	17158740	103	+	chr2L	17158740	+	chr2L	17158843
CCAGGCAATGTTACGGGCCTGCAACAGTAATGTTAAACCAGCAATCATGTGAAACCCCAATCTATGTTAAATTCT:1	CCAGGCAATGTTACGGGCCTGC	ACCCCAATCTATGTTAAATTCT	-	chr2L	17327998	-	chr2L	17327912	86	+	chr2L	17327912	+	chr2L	17327998
ACATGATAAATTTGCAAAAATTACAAAATTTGGTGAAACANCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAA:1	ACATGATAAATTTGCAAAAATT	NCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAA	+	chr2R	8388955	+	chr2R	10614679	2225724	+	chr2R	8388955	+	chr2R	10614679
CCATAGAATATTTCTGTATATATATGTATATGTATGTGACACTTAATACAGCCCAGATCCTGGCACTGCAA:1	CCATAGAATATTTCTGTATATA	AGCCCAGATCCTGGCACTGCAA	+	chr3L	16861054	+	chr3L	16861152	98	+	chr3L	16861054	+	chr3L	16861152
AAAGCCAGTCACAAAAAACCAAAAACATAAATCAGGCAGCAGCAGCAGCGCATCAAAAAAGCGAGCTTGCAGGAT:1	AAAGCCAGTCACAAAAAACCAA	CAAAAAAGCGAGCTTGCAGGAT	-	chr2L	2798770	-	chr2L	14352874	11554104	+	chr2L	14352874	+	chr2L	2798770
TATTTTTTGCTGCCATTTTAGCAGACTCTCTGGGCTTGGGGCATTTTTAGTTTTCAGCGCAGCATACGGTTATTT:1	TATTTTTTGCTGCCATTTTAGC	TCAGCGCAGCATACGGTTATTT	-	chr3R	28990086	-	chr3R	28989911	175	+	chr3R	28989911	+	chr3R	28990086
AATTGTAGATTTTGTATTTGTATATAACGCATGACTATTTATGAAAATATTTTGTATGTTATGCTATCGATTT:1	AATTGTAGATTTTGTATTTGTA	TTGTATGTTATGCTATCGATTT	+	chr2R	8330894	+	chr2R	8331378	484	+	chr2R	8330894	+	chr2R	8331378
GCAGGAAAACAAGGGGAAAACAATTGCCCAGCAGCCAACAATTTGATGGAGTTTCATTGTGGCAACAGTTTGAGA:1	GCAGGAAAACAAGGGGAAAACA	TCATTGTGGCAACAGTTTGAGA	-	chr3L	11244371	-	chr3L	3525880	7718491	+	chr3L	3525880	+	chr3L	11244371
CATTTAAGTGACATTCGCAATGCAATAAATTGAACATTTTATTGTGGAACTCTATCGCTAGTTTCTTNGGTCTTA:1	CATTTAAGTGACATTCGCAATG	ATCGCTAGTTTCTTNGGTCTTA	+	chr2R	24177236	+	chr2R	24184721	7485	+	chr2R	24177236	+	chr2R	24184721
TATGACAACCACACACACACTTTTAGCGAACCACTTAAGAGCAGTTTTTGTAGCATTTATCCAAAATTCTCATTG:1	TATGACAACCACACACACACTT	CATTTATCCAAAATTCTCATTG	+	chr2R	19565272	+	chr2R	9299815	10265457	+	chr2R	19565272	+	chr2R	9299815
AATCCTATGCAATCCTATGTAAAGTGTAAACTAATTCCAACTAGCCTAACTAGATTTTATGCGCTTCGACGTACA:1	AATCCTATGCAATCCTATGTAA	ATTTTATGCGCTTCGACGTACA	-	chr3L	22447300	-	chr3L	22447209	91	+	chr3L	22447209	+	chr3L	22447300
CAAAAAAAAGTTTCGCATGCCAATNCGACAATTGACACTGCAGCGAATGTGTCAAAGAAGAATTGTTGGGGGGG:1	CAAAAAAAAGTTTCGCATGCCA	CAAAGAAGAATTGTTGGGGGGG	+	chr3L	17691047	+	chr3L	16073550	1617497	+	chr3L	17691047	+	chr3L	16073550
TGGTATAAAACTTTACATTTAGAGGTTGCCCAATTTTCTCATACTTTTTATATTTGCATACATTTCGCCCAGAT:1	TGGTATAAAACTTTACATTTAG	TTTGCATACATTTCGCCCAGAT	+	chr3R	32048904	+	chr3R	19382236	12666668	+	chr3R	32048904	+	chr3R	19382236
GAATTTCTTATTAACGCGCAATCCTATTACGACAGTAATATGTAAGCAAAAGGTTTTCAATCTTTTTAGAATTCA:1	GAATTTCTTATTAACGCGCAAT	TTTTCAATCTTTTTAGAATTCA	+	chr3L	21872423	+	chr3L	21872502	79	+	chr3L	21872423	+	chr3L	21872502
TTATAACATTTGCTTTTAATTCATATTGCATTGATAGAAATTCGAAAAACTTTGCGTTCTATTTATCCACGACG:1	TTATAACATTTGCTTTTAATTC	TGCGTTCTATTTATCCACGACG	+	chr3L	11105308	+	chr3L	11107018	1710	+	chr3L	11105308	+	chr3L	11107018
TATAATAACTAATACATCAGATTTGAAAACCCATCGATCCCAGCGGCAAATTAGCCACTGCAACGCCCCACCCAT:1	TATAATAACTAATACATCAGAT	GCCACTGCAACGCCCCACCCAT	+	chrX	9172738	+	chrX	9749531	576793	+	chrX	9172738	+	chrX	9749531
CATAACACCAAATTTTTAAACAAANACCAAATTGAGAATTGANTGNGAATTNCGTNTTTGATACATAATCGCCAA:1	CATAACACCAAATTTTTAAACA	GTNTTTGATACATAATCGCCAA	+	chrX	1200057	+	chrX	1200135	78	+	chrX	1200057	+	chrX	1200135
GTAGGCCCAATGACGTCAGCCCATTAAGTCGAAATAAAAAGGCAAAAAAACAAAAAATTCTGTAAAAGGGAACAC:1	GTAGGCCCAATGACGTCAGCCC	AAAATTCTGTAAAAGGGAACAC	-	chrX	16619173	-	chrX	13740955	2878218	+	chrX	13740955	+	chrX	16619173
ATATAATATTTTTTTTTTATATTATCAAAGATAAAGGCCAAACTAGTTAGATAACCGATATTACGTTCTGTAT:1	ATATAATATTTTTTTTTTATAT	TAACCGATATTACGTTCTGTAT	-	chrX	17225774	-	chrX	16205276	1020498	+	chrX	16205276	+	chrX	17225774
GATTCTGGGCTGAATTGTCATGCAATTTTGTATGCGAATGCATAATTGAGGAGCAAATTGCTGAGCGCTTCCCAG:1	GATTCTGGGCTGAATTGTCATG	CAAATTGCTGAGCGCTTCCCAG	-	chr3L	7150951	-	chr3L	7150875	76	+	chr3L	7150875	+	chr3L	7150951
AAAGTAATTGAAGTTGACAGCTAAGTTTAAAGCAGCTTCCTGCGTAAATGGGTTTCAGTTTTCACACTTTGGCCA:1	AAAGTAATTGAAGTTGACAGCT	TTCAGTTTTCACACTTTGGCCA	-	chr3R	27041923	-	chr3R	27041833	90	+	chr3R	27041833	+	chr3R	27041923
CAACTAAACCTTACAGCACTTTGGCGGACTTTACAATACCCTCAGGAATNCCTTNATTCGCAGTAAAAGAGATTT:1	CAACTAAACCTTACAGCACTTT	TNATTCGCAGTAAAAGAGATTT	-	chr3L	6621947	-	chr3L	6621791	156	+	chr3L	6621791	+	chr3L	6621947
GGCCGACAAACATTTTGCATTTATTGTTGGTTGCGATGCAGTAAGAACTTACGCCTTCAC:1	GGCCGACAAACATTTTGCATTT	CAGTAAGAACTTACGCCTTCAC	+	chr2R	8290688	+	chr2R	8531830	241142	+	chr2R	8290688	+	chr2R	8531830
ATTTATTGGCCCTTTATCTTTGTTCACTTATAGCTCTAATCTAATGANCCTACAACGCCCCATATTTTTCAAAG:1	ATTTATTGGCCCTTTATCTTTG	CAACGCCCCATATTTTTCAAAG	-	chr3L	11340041	-	chr3L	11339960	81	+	chr3L	11339960	+	chr3L	11340041
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATGGCAGCCAGCAAGTCCCAGATCGAGGAGCT:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	GCAAGTCCCAGATCGAGGAGCT	+	chr3L	22908067	+	chr3L	15975468	6932599	+	chr3L	22908067	+	chr3L	15975468
GAGCTAGAGAGCTGAATTTTTCTCCCAACATCTCCGCTCTACCTGCACCTGCTGTTCCCAACTGTTTTCGTTCTT:1	GAGCTAGAGAGCTGAATTTTTC	GTTCCCAACTGTTTTCGTTCTT	+	chr2R	8657760	+	chr2R	8657837	77	+	chr2R	8657760	+	chr2R	8657837
TAATCACCGCCCGGGCACCTCTCTTTGCGTTGGATTATTTTGTAGTGCTTCTCCTCCATCGCTTTTTGGCTCTTT:1	TAATCACCGCCCGGGCACCTCT	CTCCATCGCTTTTTGGCTCTTT	-	chr3R	12214436	-	chr3R	12214345	91	+	chr3R	12214345	+	chr3R	12214436
CTTTACGTATTTGTCATGCGNCACGCTCGNCAAGACGATGATGATGATGACC:1	CTTTACGTATTTGTCATGCGNC	CAAGACGATGATGATGATGACC	-	chr3L	4754624	-	chr3L	4754464	160	+	chr3L	4754464	+	chr3L	4754624
TTAGGGTTATATTTTCAAATGCCAGAAGCTCTTATGCATTTGGTTTTTTAACTAAAGTATTTGGTTTTATGTTGC:1	TTAGGGTTATATTTTCAAATGC	AAAGTATTTGGTTTTATGTTGC	-	chr2R	14399028	-	chr2R	14394239	4789	+	chr2R	14394239	+	chr2R	14399028
TGTGGGAATTAGAGCGAAATCGCTTCACCTACACCGAAGGTTCAAGGGCTGTAGTAGTGACACAAGT:1	TGTGGGAATTAGAGCGAAATCG	GGGCTGTAGTAGTGACACAAGT	-	chr3L	15579145	-	chr3L	1738110	13841035	+	chr3L	1738110	+	chr3L	15579145
ATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTGGAGTAGAGGAGAGTGGTG:1	ATAATACCAGAAATTTGTGTAA	TCTGGAGTAGAGGAGAGTGGTG	+	chr2L	12861727	+	chr2L	12863182	1455	+	chr2L	12861727	+	chr2L	12863182
CGCCTATAGAAAACTGGTTTGCTTTTGACTCTCTCATTAGAGGTTTATATATATATATTGCTTTAAGATTTATCT:1	CGCCTATAGAAAACTGGTTTGC	TATATTGCTTTAAGATTTATCT	+	chr2L	14984382	+	chr2L	14991984	7602	+	chr2L	14984382	+	chr2L	14991984
ATATATTATTTAAAAAATAAAATAAAAATTACATGTTCAATAATATTTAAAAATAATAATTTTATGATTTATAA:1	ATATATTATTTAAAAAATAAAA	ATAATAATTTTATGATTTATAA	+	chr3L	8226721	+	chr3L	8226819	98	+	chr3L	8226721	+	chr3L	8226819
TTTCCAAATGATCACCACAATTTTTGCCCATCGTGTTACCTTCTACCTACGCGATTACTGCGTCACGTCCAAA:1	TTTCCAAATGATCACCACAATT	CGATTACTGCGTCACGTCCAAA	-	chr3L	14245677	-	chr3L	14245585	92	+	chr3L	14245585	+	chr3L	14245677
CGAAAAACGACATTGCCGCAGCGAGGAAAAGCGCGACAGAGGA:1	CGAAAAACGACATTGCCGCAGC	CGAGGAAAAGCGCGACAGAGGA	+	chr3L	279264	+	chr3L	18064648	17785384	+	chr3L	279264	+	chr3L	18064648
GCTGTGTTAGACAGTGTTTTCCCATTCGCAGAGTGAGTGGCCTGCTTACTTCCCTTACTTCTCTTTTCAGGCAG:1	GCTGTGTTAGACAGTGTTTTCC	CCTTACTTCTCTTTTCAGGCAG	-	chr3R	19559583	-	chr3R	19559506	77	+	chr3R	19559506	+	chr3R	19559583
CAATTTAAACTCGATTTTCCCTTACGGATTCGGCAACNCACATTTNTTGTGTATGGAAATTGAATTCGNGTCA:1	CAATTTAAACTCGATTTTCCCT	TATGGAAATTGAATTCGNGTCA	-	chrX	16644860	-	chrX	1500177	15144683	+	chrX	1500177	+	chrX	16644860
CCCCCCTGAGCAGCCTTGCCACGCCCTCCTGCCGTGGGTTACTTGAAGG:1	CCCCCCTGAGCAGCCTTGCCAC	CCTGCCGTGGGTTACTTGAAGG	-	chr3L	4000570	-	chr3L	4000395	175	+	chr3L	4000395	+	chr3L	4000570
GGACATTGCCAAGGTAAGTGTTGCTTGCCAACTGNTTTGTACAAACGATCGCTGCGTAACACTAATAAGTGTGTG:1	GGACATTGCCAAGGTAAGTGTT	GCGTAACACTAATAAGTGTGTG	+	chr2R	9075933	+	chr2R	9076068	135	+	chr2R	9075933	+	chr2R	9076068
GACAGTACAATATATATACANTATACAAAATGNTGGCGTCTCNTGGCCTTTGACGCTCGCTTAGCTTCCATT:1	GACAGTACAATATATATACANT	TGACGCTCGCTTAGCTTCCATT	+	chr3R	14252344	+	chr3R	30536804	16284460	+	chr3R	14252344	+	chr3R	30536804
TTAGAAAGCGTAACGTATTGTTGTTTGACCGTAACGACCCGAGCCCTTTGGTATACGCAGCGGTGTACTACCTG:1	TTAGAAAGCGTAACGTATTGTT	ATACGCAGCGGTGTACTACCTG	+	chr2L	10916528	+	chr2L	10916655	127	+	chr2L	10916528	+	chr2L	10916655
GTTGCACCACAGACTCTGCACATCTATTCCAGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCGTCACTCTATATTTTGGCAA:1	GTTGCACCACAGACTCTGCACA	TCGTCACTCTATATTTTGGCAA	-	chr3R	9285516	-	chr3R	19447177	10161661	+	chr3R	19447177	+	chr3R	9285516
AGCGCCGAGACTTTTATTTGGTGATTGGTCCATTGCAACTTAAGTGTGTAATGTT:1	AGCGCCGAGACTTTTATTTGGT	TGCAACTTAAGTGTGTAATGTT	+	chrX	1051084	+	chrX	1051142	58	+	chrX	1051084	+	chrX	1051142
GAGAGTACCGCGAGCCTCCGAACGCTGCAAGAAATGTGCATTATTGGCATTGGCCAGACAGGATGGGCTGAGAA:1	GAGAGTACCGCGAGCCTCCGAA	GCCAGACAGGATGGGCTGAGAA	-	chr3L	21905414	-	chr3L	21905335	79	+	chr3L	21905335	+	chr3L	21905414
ATCATAATATACAATTTCAAGGAAGAAATTTTCGGTTTCCCCCTAATAGAATGTTTTGAATGGAAACTACCCATT:1	ATCATAATATACAATTTCAAGG	TTTTGAATGGAAACTACCCATT	-	chr2L	6458689	-	chr2L	6458608	81	+	chr2L	6458608	+	chr2L	6458689
CACACACTTACCACATTTCCATCCCCCACCGGAAGACGCAGATGACAAGCCACAACCAGTAATTGAAGATATATC:1	CACACACTTACCACATTTCCAT	AACCAGTAATTGAAGATATATC	-	chr3L	18456640	-	chr3L	2057472	16399168	+	chr3L	2057472	+	chr3L	18456640
AGTTTAAAAATTTATCAATTGGATTTGCGAACTGCTTTGTCATAAGTTCTCTAACCTTTGGCACTCGCAACTTT:1	AGTTTAAAAATTTATCAATTGG	AACCTTTGGCACTCGCAACTTT	-	chr2L	14890405	-	chr2L	14889981	424	+	chr2L	14889981	+	chr2L	14890405
TATCCACATATTCGTATTATCCACTTTGTGGACTATTGGGTTGTGCGGTNACATTGTGCAGATTTGCGTCGCGC:1	TATCCACATATTCGTATTATCC	ATTGTGCAGATTTGCGTCGCGC	+	chr3L	5030793	+	chr3L	5030868	75	+	chr3L	5030793	+	chr3L	5030868
TTGGCATTTAAGTAGCTTATTTAAAGAAAAACACCATTTGCCATGGATATGCTAATGGCAGGAGTTG:1	TTGGCATTTAAGTAGCTTATTT	GATATGCTAATGGCAGGAGTTG	+	chr3R	19139808	+	chr3R	19136414	3394	+	chr3R	19139808	+	chr3R	19136414
CAGCTGTTCACATAGTGACGAAGCGCACCGCCATTCTATACTCAGTATTCCAGAAGAGCCCAGCACAGCAGTCC:1	CAGCTGTTCACATAGTGACGAA	GAAGAGCCCAGCACAGCAGTCC	-	chrX	19461257	-	chrX	19461162	95	+	chrX	19461162	+	chrX	19461257
ACCAGCAGCAGATGGAGTAAAGTAATAGAAAAAAAAAATCCATAGCATATGCA:1	ACCAGCAGCAGATGGAGTAAAG	AAAAAAATCCATAGCATATGCA	+	chr2L	17247178	+	chr2L	7135184	10111994	+	chr2L	17247178	+	chr2L	7135184
ATTTCGATCTTAAAAACCATAGAATATTGATTTTTGGTATATTATTTCGAAGTCAAAATATGATAATTTAGGGAT:1	ATTTCGATCTTAAAAACCATAG	CAAAATATGATAATTTAGGGAT	-	chr2R	10318625	-	chr2R	10318539	86	+	chr2R	10318539	+	chr2R	10318625
GGCATTTAGCTGGCAAGGACATTTTCATGGTTTTCCAGTTCCGTTTCGACAGCAACTTTTTCGTAGCATACTTTT:1	GGCATTTAGCTGGCAAGGACAT	AACTTTTTCGTAGCATACTTTT	+	chrX	20377334	+	chrX	20378801	1467	+	chrX	20377334	+	chrX	20378801
TGGAAAAGCTGCGGGCCTTTAATCTCTGTATGTGTGTGTGTAAGTGCGTTTGTGACGCAAAATTAAACGGAAGAA:1	TGGAAAAGCTGCGGGCCTTTAA	GACGCAAAATTAAACGGAAGAA	+	chrX	5434468	+	chrX	8057733	2623265	+	chrX	5434468	+	chrX	8057733
CAATGCCACTGACTAACAAATGCGTCGTCCAGCGATCTGCGCTTTGTCATGGCCTACTACGCAGATCT:1	CAATGCCACTGACTAACAAATG	TCATGGCCTACTACGCAGATCT	-	chr3L	1463504	-	chr3L	1463430	74	+	chr3L	1463430	+	chr3L	1463504
ATACAAATTGTATGCAAATATTCCTTTTCACCGCTGGCCAGACAGCCAACAAAAACACAACCAACATCATCAGGA:1	ATACAAATTGTATGCAAATATT	AACACAACCAACATCATCAGGA	+	chr3R	17854770	+	chr3R	17854848	78	+	chr3R	17854770	+	chr3R	17854848
GTAAATGTTTTCAAGTGTGTGTGTAAATGAAGGGATTATATAAAGTCGATCACCGAACAAAGCTTTGTA:1	GTAAATGTTTTCAAGTGTGTGT	GATCACCGAACAAAGCTTTGTA	-	chr3R	20907437	-	chr3R	17878172	3029265	+	chr3R	17878172	+	chr3R	20907437
CATCATGTGAATAAAAACATCTTGGGCAACAAAAAAACAGCAAATGATAAAAGATGAATGAAAATTTGCATAATG:1	CATCATGTGAATAAAAACATCT	ATGAATGAAAATTTGCATAATG	+	chr3L	14060151	+	chr3L	5549903	8510248	+	chr3L	14060151	+	chr3L	5549903
CACTTCCTAATGAGCTGATCGAGTCCAGTCTTTGGTCTCATGTTCTTGACAATCTTCAAGAGAACAAATCGCAC:1	CACTTCCTAATGAGCTGATCGA	TCTTCAAGAGAACAAATCGCAC	-	chr3L	24948771	-	chr3L	25934975	986204	+	chr3L	25934975	+	chr3L	24948771
AACTTCCGCAAATATCTGGAGTACACTGATAAAAACAAGCTGTTTCGCATGTAGTTTTAAACTATACACTTT:1	AACTTCCGCAAATATCTGGAGT	GTAGTTTTAAACTATACACTTT	+	chr2R	18308291	+	chr2R	18308394	103	+	chr2R	18308291	+	chr2R	18308394
AACTTTAAATTGAATTTACTTTAGTAGTGTAGAAAAGTTCTTGAGTTGATTAAAATTAAACTTATATTGCGTTG:1	AACTTTAAATTGAATTTACTTT	AAATTAAACTTATATTGCGTTG	+	chr3L	9639053	+	chr3L	9639137	84	+	chr3L	9639053	+	chr3L	9639137
AAATACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGTGTGCTGGTAATTGCTAAT:1	AAATACACACACTCTCACACGG	GAGTGTGCTGGTAATTGCTAAT	-	chrX	20942202	-	chrX	20940733	1469	+	chrX	20940733	+	chrX	20942202
CTCTTTGAACACACCTTCATCGTAGATGGTCACACAATAGTCCAGGGAATCCACCCGATGCCGGACGAACCCTT:1	CTCTTTGAACACACCTTCATCG	ACCCGATGCCGGACGAACCCTT	+	chr2R	21834829	+	chr2R	24853190	3018361	+	chr2R	21834829	+	chr2R	24853190
CCACTTGGCACAAACACACGCACATACACTGGAACTCGGAAACTTTTACNGTCAACGTGTTGAGACCACTTGAAA:1	CCACTTGGCACAAACACACGCA	AACGTGTTGAGACCACTTGAAA	+	chr3L	11119642	+	chr3L	5194838	5924804	+	chr3L	11119642	+	chr3L	5194838
GGCACAGCCGAACGGCCAANACAAACAACAACATTGCCATAATGATTCCGATCTTGGACATTCCCGATGTCGC:1	GGCACAGCCGAACGGCCAANAC	TCTTGGACATTCCCGATGTCGC	-	chr3R	26459030	-	chr3R	19448164	7010866	+	chr3R	19448164	+	chr3R	26459030
GGTCACCGAAAGTTGATTGAGGAAATACCTCAAATTAAACTTAGATGCAACTTATTGAACGGCAAAATGCATT:1	GGTCACCGAAAGTTGATTGAGG	TTATTGAACGGCAAAATGCATT	-	chr3L	15260110	-	chr3L	15259118	992	+	chr3L	15259118	+	chr3L	15260110
ATAACCTAACCTCAATGATGCGCGCAAGCACGTGCACGTCCTCGATTAACCGTTAACTGAGCGCGTGCTC:1	ATAACCTAACCTCAATGATGCG	ACCGTTAACTGAGCGCGTGCTC	+	chrX	6562849	+	chrX	6571326	8477	+	chrX	6562849	+	chrX	6571326
TAGTCCCAAAAGCTTCCCAAGTTCACCAACAGCCTTAAGCTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTC:1	TAGTCCCAAAAGCTTCCCAAGT	CAAAGCTGACCGAAAGCTCCTC	-	chr3L	22572205	-	chr3L	22572124	81	+	chr3L	22572124	+	chr3L	22572205
GACGCTTGCCACACAGGGNATTCCCGCCATCCGTCCTGATTCTGTGGCACTCTTCTGGCACCCAGCTCATCCNCT:1	GACGCTTGCCACACAGGGNATT	TCTGGCACCCAGCTCATCCNCT	+	chr2R	12540493	+	chr2R	12540576	83	+	chr2R	12540493	+	chr2R	12540576
TTACATTTTCACCGATTTGCCTTCGCAATGGATTATTTGGACTATCTATGCGCAGCAAGTGCAAAAAAGGGAATT:1	TTACATTTTCACCGATTTGCCT	AGCAAGTGCAAAAAAGGGAATT	+	chrX	5883828	+	chrX	5884069	241	+	chrX	5883828	+	chrX	5884069
ATAATTAACGTAAATTTAAGGATAATTACCTGAACTGATAGCTTTCATAATGGCGTACTGG:1	ATAATTAACGTAAATTTAAGGA	AGCTTTCATAATGGCGTACTGG	+	chr3R	20771730	+	chr3R	20771797	67	+	chr3R	20771730	+	chr3R	20771797
ATTTTTGTGTAAATGTAAATACATTTTGTATATATAAATTAATACGAGAATTCTATAAAAGCAAATGCAATTATC:1	ATTTTTGTGTAAATGTAAATAC	TATAAAAGCAAATGCAATTATC	-	chr3R	20209914	-	chr3R	20209828	86	+	chr3R	20209828	+	chr3R	20209914
ATATGGTAAGATACTTTGGATTGTTTGAGGTGCAGTTAAGTTCTCAGCTTTTGGTTTCGCTCAGTGTNTTTCGAA:1	ATATGGTAAGATACTTTGGATT	GTTTCGCTCAGTGTNTTTCGAA	-	chrX	8085661	-	chrX	8085575	86	+	chrX	8085575	+	chrX	8085661
CATCAGCACCAGCAGCAAAAGAACACGATTGTAAGCACAGGTGGAAGATGTTTCAGACGCGTTTTGATCAAGCAA:1	CATCAGCACCAGCAGCAAAAGA	CAGACGCGTTTTGATCAAGCAA	-	chr3L	4065930	-	chr3L	11130755	7064825	+	chr3L	11130755	+	chr3L	4065930
GGTATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCANGTTCGCCA:1	GGTATATCTTAGTTTCTCTGGT	CGTGTATTCCCCANGTTCGCCA	-	chr2R	15005056	-	chr2R	15004727	329	+	chr2R	15004727	+	chr2R	15005056
TATACAGTTTAGCAGATAGCAACGGACCATGGAAATTGAAACTAAAGAATCTATCTTCGAAGTGTCGTAAGAT:1	TATACAGTTTAGCAGATAGCAA	TATCTTCGAAGTGTCGTAAGAT	+	chr2L	7405781	+	chr2L	7405859	78	+	chr2L	7405781	+	chr2L	7405859
GAGGGGGCAGTCGAACTTGTTTCGCCTCAACAAGTATTTCCCTATTTACTGTTAAGAACAGCTGG:1	GAGGGGGCAGTCGAACTTGTTT	ATTTACTGTTAAGAACAGCTGG	+	chr3R	21239953	+	chr3R	21240019	66	+	chr3R	21239953	+	chr3R	21240019
AGCCTTAAAATCTCTTTTACTGCGAATCAAGGGATTCCTGAGGGTATTGTAAAGTCCGCCAAAGTGCTGTAA:1	AGCCTTAAAATCTCTTTTACTG	AAAGTCCGCCAAAGTGCTGTAA	+	chr3L	6621784	+	chr3L	6621937	153	+	chr3L	6621784	+	chr3L	6621937
TGATCTTGCAGTTTTACCAATTTTCAAGTTCGAATAGTTTATCATTGCCACAAAAAACAGTTAACTAAAGATTA:1	TGATCTTGCAGTTTTACCAATT	AAAAACAGTTAACTAAAGATTA	-	chrX	16681726	-	chrX	16681651	75	+	chrX	16681651	+	chrX	16681726
ATCTTAATTATTATGCATTTAATTAAATGGGCCTTCAGTCCGAGGAGCGAGGGGCTTGTAAAATAATTTGAAAA:1	ATCTTAATTATTATGCATTTAA	GGCTTGTAAAATAATTTGAAAA	+	chr3R	12135508	+	chr3R	12135746	238	+	chr3R	12135508	+	chr3R	12135746
AACTCATACGATTTATTGCTTCTAATGTTAATGATGTTTGAATGTTTGCCATACAGACTAAAAAAAGCAAGACCC:1	AACTCATACGATTTATTGCTTC	CAGACTAAAAAAAGCAAGACCC	-	chr3L	9390990	-	chr3L	9390860	130	+	chr3L	9390860	+	chr3L	9390990
CTCCTCGCACCAGTCGCGAAGCTGTTTCTCAANGGCAACCACATCCACAGTAATGG:1	CTCCTCGCACCAGTCGCGAAGC	GCAACCACATCCACAGTAATGG	-	chr3R	23092884	-	chr3R	23098707	5823	+	chr3R	23098707	+	chr3R	23092884
GTATGCATTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCGTCG:1	GTATGCATTTTTGTCTACCCGA	CACCTTCATTTTCGCTGCGTCG	+	chr3L	2534628	+	chr3L	2534708	80	+	chr3L	2534628	+	chr3L	2534708
ATTGCAATAAAATACAGGACTTGACTGGATTCCGCCACTTTTAAACAGGTACTTATGCATGCCTCCTTTTGCAG:1	ATTGCAATAAAATACAGGACTT	TTATGCATGCCTCCTTTTGCAG	-	chr2L	5836743	-	chr2L	5827736	9007	+	chr2L	5827736	+	chr2L	5836743
CTCAAATAATCGTAGTCATTCACCCATGTAGGTGTTTCAACCATACTACCTTTTTTTGAAGCTAATGGCATTA:1	CTCAAATAATCGTAGTCATTCA	TTTTTTGAAGCTAATGGCATTA	-	chr3R	5073501	-	chr3R	5067986	5515	+	chr3R	5067986	+	chr3R	5073501
ATTTATGCGACGGGGAAAAAAATCGACTACCAGGAAGAGGACGAAACAAAAAAAGATGCTGTTTGGGAAAAAGAA:1	ATTTATGCGACGGGGAAAAAAA	AGATGCTGTTTGGGAAAAAGAA	+	chr2L	17576577	+	chr2L	19822402	2245825	+	chr2L	17576577	+	chr2L	19822402
GTTAGGTCAAGCTATAGAAGTAGTAGTATATGTATACTTATGTTTAATGATTTTATATATAGCTTTATTTATTTG:1	GTTAGGTCAAGCTATAGAAGTA	TATATATAGCTTTATTTATTTG	+	chr2R	12602816	+	chr2R	12602900	84	+	chr2R	12602816	+	chr2R	12602900
CCAAGGCGAAGGTTGTCTGTATATATGCTGGCATTTTAGGGCCTTTTCTGCCCCTGCTAATTCCTCCGTGTACC:1	CCAAGGCGAAGGTTGTCTGTAT	CCTGCTAATTCCTCCGTGTACC	+	chrX	906731	+	chrX	908519	1788	+	chrX	906731	+	chrX	908519
CAACAACAACCACAACGACAACAACAACGACCAGCGACAACAACAACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	CAACAACAACCACAACGACAAC	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	5060863	+	chr3R	21907534	16846671	+	chr3R	5060863	+	chr3R	21907534
TAAACTAATGTACTTTTTTAGTTTTGGCAACGAGATGCAAAGTTGCANGGAAAACTTCCAATTCACGNTAAAATA:1	TAAACTAATGTACTTTTTTAGT	ACTTCCAATTCACGNTAAAATA	+	chr2L	4735063	+	chr2L	4735146	83	+	chr2L	4735063	+	chr2L	4735146
GGAAAAAGCAAAGAAATCGATTCGAAATTCGAAGAGCTGCAGCTTTTGCGGATCCTTTAGTATGTACCAATAAAT:1	GGAAAAAGCAAAGAAATCGATT	CCTTTAGTATGTACCAATAAAT	+	chr2R	11557464	+	chr2R	24388473	12831009	+	chr2R	11557464	+	chr2R	24388473
TTTAAATATTTTTTATACATTTATTCATTTAGATACAGTATACAGTCAATTAATTTAATTTAATATTACAACTTA:1	TTTAAATATTTTTTATACATTT	TTTAATTTAATATTACAACTTA	-	chr3R	13659844	-	chr3R	13659738	106	+	chr3R	13659738	+	chr3R	13659844
TTTCGAAGCCAATGGATTTTTTGTAATTCCTTGATTCAACTACCGGTGGGCATCACTGAAGAGCAGAAAGGAGC:1	TTTCGAAGCCAATGGATTTTTT	TCACTGAAGAGCAGAAAGGAGC	-	chrX	494692	-	chrX	494601	91	+	chrX	494601	+	chrX	494692
CTACTCTTGCACAGGCAAATGTAAGAATGAAAACGAAACGAAACGAAAGCGAAAAGTTGCACACAAAACTCTATC:1	CTACTCTTGCACAGGCAAATGT	AAGTTGCACACAAAACTCTATC	+	chr3L	5659415	+	chr3L	2216475	3442940	+	chr3L	5659415	+	chr3L	2216475
AATAATTTCAATTTAAAATACCATTTCGGCATAATGTGACCGGACATAGGGTTCAAGGAAGGCCAAGGAGTGTGG:1	AATAATTTCAATTTAAAATACC	CAAGGAAGGCCAAGGAGTGTGG	-	chrX	20275858	-	chrX	20275362	496	+	chrX	20275362	+	chrX	20275858
TCAAGCGATGGCACAAAAAACAAAACCAAAAGGGGGACTACCTTTTCTTNTGCCCTCGTGCCACATTGCAATGGA:1	TCAAGCGATGGCACAAAAAACA	CCTCGTGCCACATTGCAATGGA	+	chr2R	12504162	+	chr2R	12504239	77	+	chr2R	12504162	+	chr2R	12504239
AAAATGAGAACAGCAATTCGCCGCATTTGTGTGAAGTTTCCGATAAATTCATGCACCAGACCAACCCCTCGAAAA:1	AAAATGAGAACAGCAATTCGCC	CACCAGACCAACCCCTCGAAAA	+	chr3L	2479014	+	chr3L	2479111	97	+	chr3L	2479014	+	chr3L	2479111
CGAAAAAATATGTGAATTAAATGTGACCTCGTCTGGCGGGGCGGAGCCTGCAAACAAATTGCGACTAATGCCATG:1	CGAAAAAATATGTGAATTAAAT	ACAAATTGCGACTAATGCCATG	-	chr2R	7153251	-	chr2R	7153165	86	+	chr2R	7153165	+	chr2R	7153251
TGGGAATATTCAGTGATGACTAAATTTACACTCTTGCTCAAACTATCTTAAAGTGAATTTAAAACCCCAAAGTAA:1	TGGGAATATTCAGTGATGACTA	TGAATTTAAAACCCCAAAGTAA	+	chr3L	3872295	+	chr3L	3872388	93	+	chr3L	3872295	+	chr3L	3872388
GTCCTAATGGAATTTATTTGATGCAGAGGTCAAATATGGAAAATCTGCCCTACGATATCCTATGAAAACTACTG:1	GTCCTAATGGAATTTATTTGAT	CGATATCCTATGAAAACTACTG	+	chr2L	19560859	+	chr2L	19560938	79	+	chr2L	19560859	+	chr2L	19560938
TGATGTACTGCTCGGCTTTCTCTGCCTGTCTATACTTATATATATCTTATATATATCTTATNTATCTGTATTTG:1	TGATGTACTGCTCGGCTTTCTC	ATATCTTATNTATCTGTATTTG	+	chr2L	12781807	+	chr2L	12789249	7442	+	chr2L	12781807	+	chr2L	12789249
GTTACTACACAAAATTTGTCAAAGCAAAGAAAAGCGCACGAAGTGAANACTTGAACATAATGAAATGAAAACAAA:1	GTTACTACACAAAATTTGTCAA	AACATAATGAAATGAAAACAAA	+	chr2L	2868415	+	chr2L	14910645	12042230	+	chr2L	2868415	+	chr2L	14910645
TGTCACTGAAGACAGCTGGTGTGCCGGTGCTGTCAATTTTCCGGTGGCAGGTTTTTGGTTATTGCG:1	TGTCACTGAAGACAGCTGGTGT	TGGCAGGTTTTTGGTTATTGCG	+	chr3R	15811535	+	chr3R	15811767	232	+	chr3R	15811535	+	chr3R	15811767
ATGCGTTTTTAATTTGGCATAAGCTCGACTGGCCAAGTAGCTGCTTTGAATACGAGTGTCCGATTGT:1	ATGCGTTTTTAATTTGGCATAA	TTGAATACGAGTGTCCGATTGT	-	chr3R	27370323	-	chr3R	27370125	198	+	chr3R	27370125	+	chr3R	27370323
GATGATGCGACAATCGATAGTGTTGATACTACCGCAAGGAAAACAAACGG:1	GATGATGCGACAATCGATAGTG	CTACCGCAAGGAAAACAAACGG	-	chrX	3863302	-	chrX	3863244	58	+	chrX	3863244	+	chrX	3863302
CCCATCGCGAAGTCGTAAGACTCCTGGCAAAGTGCCGCGAATGAGCTTCCATCT:1	CCCATCGCGAAGTCGTAAGACT	TGCCGCGAATGAGCTTCCATCT	-	chr3R	31531152	-	chr3R	31530846	306	+	chr3R	31530846	+	chr3R	31531152
CAGGTGGCGTAGGTGCAAATGCATCAACANATCCCAACTGAGTGGAATGCTTTTGCAGGCNCTCACAAAAACGCC:1	CAGGTGGCGTAGGTGCAAATGC	TGCAGGCNCTCACAAAAACGCC	+	chr3R	14862070	+	chr3R	11448921	3413149	+	chr3R	14862070	+	chr3R	11448921
TGTTGTTTGTGAAATTCATTTCAATTCCATTGCCCGCCCACACTGCGTACGTGGAAGGGCTCAAATTGTGGGAGG:1	TGTTGTTTGTGAAATTCATTTC	GAAGGGCTCAAATTGTGGGAGG	+	chr3R	6475193	+	chr3R	6475292	99	+	chr3R	6475193	+	chr3R	6475292
ACCATTTGTTTTATGTAAAATAGGATTCTTAGAAGTCAGTCAAGTTAACCGGAATATTAGATTTATTAATAAGA:1	ACCATTTGTTTTATGTAAAATA	AATATTAGATTTATTAATAAGA	-	chr3L	12026228	-	chr3L	105853	11920375	+	chr3L	105853	+	chr3L	12026228
AAGCTTTTGCTGAAATTTTCATGCTTCAACNNNCNTGCTGTTGCTTTCTTCGTGTCTCCATTGTTTCTGGCTT:1	AAGCTTTTGCTGAAATTTTCAT	GTGTCTCCATTGTTTCTGGCTT	-	chr3L	940897	-	chr3L	939778	1119	+	chr3L	939778	+	chr3L	940897
CCCTTTTCTCTATCATGTCATATAAGACCAAAAGTTCAAATCGCTCTATTCTCGG:1	CCCTTTTCTCTATCATGTCATA	GTTCAAATCGCTCTATTCTCGG	+	chr3L	15910194	+	chr3L	18817702	2907508	+	chr3L	15910194	+	chr3L	18817702
AAAATCTTTAAAAGAGTTNGAACAAAAACTGGATTAATGCAAANAGAAANGTCGAAATTATGAGGATGCACGTAA:1	AAAATCTTTAAAAGAGTTNGAA	GAAATTATGAGGATGCACGTAA	+	chr3L	12012310	+	chr3L	12012389	79	+	chr3L	12012310	+	chr3L	12012389
CTATAAACCAACCTTGTAGATACCCCGCCCCGCCCCCACCACTACCACAAAAACCATACAAATGTCGATATGCT:1	CTATAAACCAACCTTGTAGATA	ACCATACAAATGTCGATATGCT	+	chr3R	12301880	+	chr3R	14860765	2558885	+	chr3R	12301880	+	chr3R	14860765
CAGCATGGTTTCACAATATCCAAACATTTATCATTTCTAGTATAAAGTTTTCAAATTAAAGCTTATATTGTTAAT:1	CAGCATGGTTTCACAATATCCA	AATTAAAGCTTATATTGTTAAT	-	chr2L	11828533	-	chr2L	11828457	76	+	chr2L	11828457	+	chr2L	11828533
AACATATATCAAAAAGCATCGGATTGGAATGAACACTAAAAACCATTTAATATATTTTATACGGTANGACCATA:1	AACATATATCAAAAAGCATCGG	TATTTTATACGGTANGACCATA	-	chr3L	22105873	-	chr3L	22099688	6185	+	chr3L	22099688	+	chr3L	22105873
CAACACCGACAACAACAAGCACAACAACAACGGAACAACCCGAACTGGACTATCCTCCCACCACTGCTTG:1	CAACACCGACAACAACAAGCAC	ACTATCCTCCCACCACTGCTTG	+	chrX	10034052	+	chrX	6182377	3851675	+	chrX	10034052	+	chrX	6182377
CAAGCTCGTGGCCATCATTGTTGTTTGCCCTTTACGGGGGCATTTTATTGGGTTTATTTTTTTT:1	CAAGCTCGTGGCCATCATTGTT	TTTTATTGGGTTTATTTTTTTT	-	chr2R	6246430	-	chr2R	18500744	12254314	+	chr2R	18500744	+	chr2R	6246430
ATGAATATTTTGAATATTCANTATTTAGATATNGATTGGGGTNAATACAACTGAATGTTTGTATGGGATGAACTT:1	ATGAATATTTTGAATATTCANT	AATGTTTGTATGGGATGAACTT	+	chrX	129593	+	chrX	12001904	11872311	+	chrX	129593	+	chrX	12001904
TGCTCCAGCAAAACACCCGTATCTCAACCAATTCCAAAGGACGGGCCAAAGGGTTTTTGTAGCTGGGCTCGCGAA:1	TGCTCCAGCAAAACACCCGTAT	TTTTTGTAGCTGGGCTCGCGAA	-	chr2L	14210771	-	chr2L	2003573	12207198	+	chr2L	2003573	+	chr2L	14210771
GCTTCACCTGGAATTCCGTGCTCCAAAACAGAAATTTGATCGCAATGTCGTATGCACAGACTCCTCCTCGA:1	GCTTCACCTGGAATTCCGTGCT	GTATGCACAGACTCCTCCTCGA	-	chr3L	2631190	-	chr3L	2631084	106	+	chr3L	2631084	+	chr3L	2631190
ATGGGCCTTCAGTCCGAGGAGCGAGGGGCTTGTAAAATAATTTGAAANCACGGCATTAGCGTAATGANGCATGCA:1	ATGGGCCTTCAGTCCGAGGAGC	CATTAGCGTAATGANGCATGCA	+	chr3R	12135534	+	chr3R	12135773	239	+	chr3R	12135534	+	chr3R	12135773
CAATGAAATTTACTCTTACAGCTATTTTTCGCAACTTTGTTCAAAGGTAGATAAAATCGTATAGTATTTATATTA:1	CAATGAAATTTACTCTTACAGC	AAATCGTATAGTATTTATATTA	+	chr3L	10211337	+	chr3L	10211418	81	+	chr3L	10211337	+	chr3L	10211418
CAATTTTATGGCATTCGCATAAAAGTAAGCGACTGATTTCCATAATTATTTAATTTCCTTTTTTCTGAAATTGA:1	CAATTTTATGGCATTCGCATAA	ATTTCCTTTTTTCTGAAATTGA	-	chr2L	14369277	-	chr2L	14369162	115	+	chr2L	14369162	+	chr2L	14369277
TAACACGACTTTCGCACAGAGTATCTGCGTTTCGTGTTACTTAACATCTATTGGAATTCTTCATGGCGTGCCT:1	TAACACGACTTTCGCACAGAGT	TGGAATTCTTCATGGCGTGCCT	+	chr3L	875662	+	chr3L	875747	85	+	chr3L	875662	+	chr3L	875747
ACTGAATTAACTGAAAATAGCTCTGCTGCCATTAAGCCTTTAAATGGTTATATAAGTCAAACAACCA:1	ACTGAATTAACTGAAAATAGCT	GGTTATATAAGTCAAACAACCA	-	chr2R	17412477	-	chr2R	17412376	101	+	chr2R	17412376	+	chr2R	17412477
AATTGAGATGCCTCAGTCTTATGTTCTTGTAGTTATGCAAAGCCCTGNCCAGCGGATCTCCACTTGATGGGCGAT:1	AATTGAGATGCCTCAGTCTTAT	GGATCTCCACTTGATGGGCGAT	-	chr3R	25841894	-	chr3R	25832712	9182	+	chr3R	25832712	+	chr3R	25841894
GCGCGACTTCTTTTCGATCGTGTGTTTTAAGCCCCGCAGTATACATATATGTCTATGATCATGATCTATATGTGC:1	GCGCGACTTCTTTTCGATCGTG	TATGATCATGATCTATATGTGC	-	chr3L	16621864	-	chr3L	16616536	5328	+	chr3L	16616536	+	chr3L	16621864
GAGGATATCTAAAAGCTATTTTTCAGGATTAAAATATTCAATATTCCCAAAAGATTAAAAGTACCATATCACATT:1	GAGGATATCTAAAAGCTATTTT	ATTAAAAGTACCATATCACATT	+	chr3L	14468474	+	chr3L	14473680	5206	+	chr3L	14468474	+	chr3L	14473680
TTTTGAGTTCATATAATTATGGATTACGCTTGGTGTGTTCACAATTTAAATAGACTATATACATAAACGACTTAA:1	TTTTGAGTTCATATAATTATGG	ACTATATACATAAACGACTTAA	-	chr3L	13296629	-	chr3L	13296538	91	+	chr3L	13296538	+	chr3L	13296629
AAGGGGTGATTAGGGCAAATTAGATAGACAACAACTAGCATTCAGTTTTAAATATTCCTTTGGTTGCATTAGAAA:1	AAGGGGTGATTAGGGCAAATTA	ATTCCTTTGGTTGCATTAGAAA	-	chr2L	7000448	-	chr2L	7000370	78	+	chr2L	7000370	+	chr2L	7000448
CTGGTGAGNTGGAATTTACCAACTTCAAGCCCAAACTGGCCAACAGAAAAGAACCAGCAACAACTTGGCCGAAT:1	CTGGTGAGNTGGAATTTACCAA	ACCAGCAACAACTTGGCCGAAT	+	chr3R	12892566	+	chr3R	15809638	2917072	+	chr3R	12892566	+	chr3R	15809638
AACATTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGTG:1	AACATTTCGGGATATAATCTCA	GACTTCACTTAAAGTGCATGTG	-	chr3R	28484368	-	chr3R	28486286	1918	+	chr3R	28486286	+	chr3R	28484368
TGGACCCAAAAAAAGGTAAAAAATATTTTTTGAATTATTTTCAAAATATTTTCGGAATCTAGTTCCTTGAATAAG:1	TGGACCCAAAAAAAGGTAAAAA	GGAATCTAGTTCCTTGAATAAG	-	chr2L	21743832	-	chr2L	21743755	77	+	chr2L	21743755	+	chr2L	21743832
CGAAGCAATCAAGTCCAAAAAGCAAGCGAACTCACTAACATCGGCCTGCAGACGTTG:1	CGAAGCAATCAAGTCCAAAAAG	TAACATCGGCCTGCAGACGTTG	-	chr3L	27728760	-	chr3L	27727671	1089	+	chr3L	27727671	+	chr3L	27728760
ATATCGGACGCATCGATGTTATTATTGAGTTTATAAGTCGTTAAGTACCATCACTACTGAATAATTGTCCTG:1	ATATCGGACGCATCGATGTTAT	TCACTACTGAATAATTGTCCTG	+	chr3L	27980703	+	chr3L	27985495	4792	+	chr3L	27980703	+	chr3L	27985495
CGTGTCAAGTGCAGAACATTAATCATCCGACACCTCTAGCAACTTTGGCTGCATTTCTGGCACCGCGGAAGAGT:1	CGTGTCAAGTGCAGAACATTAA	ATTTCTGGCACCGCGGAAGAGT	-	chr3R	27043784	-	chr3R	27043691	93	+	chr3R	27043691	+	chr3R	27043784
TACCTGCAGATCTTCGCTTNATGTATATAGTTTTGGTCGGTTATAATAATTTGCGTAGTGGCAATTAAAATGCCA:1	TACCTGCAGATCTTCGCTTNAT	CGTAGTGGCAATTAAAATGCCA	+	chr2R	23402639	+	chr2R	23407715	5076	+	chr2R	23402639	+	chr2R	23407715
TCGGAAGGGTCCGAGAGGGCTCATTCCCATCAATNTGGTGGATCAACCCGAGCGGAAAGAGGAAGAACAACCGAG:1	TCGGAAGGGTCCGAGAGGGCTC	GGAAAGAGGAAGAACAACCGAG	+	chr3R	5104160	+	chr3R	5104431	271	+	chr3R	5104160	+	chr3R	5104431
CGGTGGAGGATCGGCAAAGGATCTTGGACAGCGAGGGGCAGACATACGGCA:1	CGGTGGAGGATCGGCAAAGGAT	AGCGAGGGGCAGACATACGGCA	+	chrX	16539596	+	chrX	16539648	52	+	chrX	16539596	+	chrX	16539648
CCAGTGCATTCCAGTTTACGCTGCGTGTGTGTACACTGTACTGCAAATTTCA:1	CCAGTGCATTCCAGTTTACGCT	GTACACTGTACTGCAAATTTCA	-	chrX	1635451	-	chrX	1628006	7445	+	chrX	1628006	+	chrX	1635451
TAAATATATCTTGTAACAGATATTAAGGTTAACTAAAATAAAATATTAGCCAAATACACCGAGCTTT:1	TAAATATATCTTGTAACAGATA	TTAGCCAAATACACCGAGCTTT	+	chr3R	30761364	+	chr3R	30761438	74	+	chr3R	30761364	+	chr3R	30761438
GTTATTAAGAGAAATCTGTTTCCTCCTTGAATACGAAATGATCTAAGCAAATTGAAAAAAAACATTTTAATATTT:1	GTTATTAAGAGAAATCTGTTTC	GAAAAAAAACATTTTAATATTT	-	chr2L	21766762	-	chr2L	21766675	87	+	chr2L	21766675	+	chr2L	21766762
AGGCTAAGCGTTACATACCTGCAAGAAAAGAAAAACAAAATTGTTAGTCAAATTTGCTGTCGAAACTAATTTGTA:1	AGGCTAAGCGTTACATACCTGC	TTGCTGTCGAAACTAATTTGTA	+	chr2L	17687517	+	chr2L	17692262	4745	+	chr2L	17687517	+	chr2L	17692262
ACCATCAGATACTTCTCATATCGCAAACGTCCNTCAAATAATAATAGGAGCATAAAGAGTAGAATTNTTAACAC:1	ACCATCAGATACTTCTCATATC	TAAAGAGTAGAATTNTTAACAC	+	chr3L	20710776	+	chr3L	20710852	76	+	chr3L	20710776	+	chr3L	20710852
TACAACGTTGTGTAGGAATACAAAATAAAAGTAGATATGTATTGGTAAACAAACACACTCACCTTTGCGCGA:1	TACAACGTTGTGTAGGAATACA	AAACACACTCACCTTTGCGCGA	+	chr3R	10920062	+	chr3R	10920137	75	+	chr3R	10920062	+	chr3R	10920137
ATTGACAAGATAAAACCGTACACAACACACAATTGGTGCCAAGCAGGCCACAGAGAGCCACA:1	ATTGACAAGATAAAACCGTACA	AAGCAGGCCACAGAGAGCCACA	+	chr3R	16179097	+	chr3R	16179207	110	+	chr3R	16179097	+	chr3R	16179207
TAAAATAAATTTTTTTAATATTTTTGGTGTGCTTTGATAAACAAATAAAATAACTGTTGAG:1	TAAAATAAATTTTTTTAATATT	AACAAATAAAATAACTGTTGAG	+	chr3L	14547560	+	chr3L	10769814	3777746	+	chr3L	14547560	+	chr3L	10769814
CACAGACATCTGGCCAAAACTACAATGCCCACACACACGGGCAACAAAACTTTCAAAGAACTGAACGACA:1	CACAGACATCTGGCCAAAACTA	ACTTTCAAAGAACTGAACGACA	-	chrX	3421201	-	chrX	3415021	6180	+	chrX	3415021	+	chrX	3421201
TGTCAGCTTAAAGGCGTGAAGCACAACAAAAAACTCGTAAACTTTTTGGTCATATTTTCATATGCAGGCTAAGTT:1	TGTCAGCTTAAAGGCGTGAAGC	ATTTTCATATGCAGGCTAAGTT	+	chr3L	14141765	+	chr3L	14141855	90	+	chr3L	14141765	+	chr3L	14141855
GCTAGTATTCTCTGAAGAAATCGTATATAATAATAATAATAAATGCCTATGAAAAACAACATTTTTATAGCTG:1	GCTAGTATTCTCTGAAGAAATC	AAAAACAACATTTTTATAGCTG	-	chr3R	25861912	-	chr3R	25861837	75	+	chr3R	25861837	+	chr3R	25861912
ATGACGCATTACTGGCCATGACGGCGGTGACATCAGCAAAGGTGGCAACTGGCAGG:1	ATGACGCATTACTGGCCATGAC	AGCAAAGGTGGCAACTGGCAGG	-	chr3L	25007800	-	chr3L	23698355	1309445	+	chr3L	23698355	+	chr3L	25007800
CGAGTGAAAACGACACTACATTAGCCTTATAGCAATTAACAAGGCTTTCCCTTTCGACTGTCTAAGCCCAATTA:1	CGAGTGAAAACGACACTACATT	TTCGACTGTCTAAGCCCAATTA	+	chr3R	21330870	+	chr3R	21330960	90	+	chr3R	21330870	+	chr3R	21330960
TTTTTGGAAATAATGAAATACGAAATCAGCTTACCCCACATGAGCCATCTCAAGATGAAGCGAGTGTTNATCCAT:1	TTTTTGGAAATAATGAAATACG	GATGAAGCGAGTGTTNATCCAT	-	chr3R	8613742	-	chr3R	8613635	107	+	chr3R	8613635	+	chr3R	8613742
GATGGGGGATCGAATGCAGGTAACTGCATGCCAGACAACGTGCCACAATNGCAAAACAAAGAAAAGAATTGTTTT:1	GATGGGGGATCGAATGCAGGTA	AAACAAAGAAAAGAATTGTTTT	+	chr3L	6433578	+	chr3L	18441348	12007770	+	chr3L	6433578	+	chr3L	18441348
AGGAAAATAGCAAAATAAAGCGCATTCGANTGAAATTGAACTAAACTCAAAGTGGGCACANACCCAATTATGGCA:1	AGGAAAATAGCAAAATAAAGCG	GGGCACANACCCAATTATGGCA	-	chr2L	11660466	-	chr2L	8667909	2992557	+	chr2L	8667909	+	chr2L	11660466
GGCGAGATCAAGTCTTATATATACATATATACATATTATGTAGTAGTNAATCTGGCGCAATGATAATGACATGGA:1	GGCGAGATCAAGTCTTATATAT	GGCGCAATGATAATGACATGGA	+	chr3R	24207244	+	chr3R	24212320	5076	+	chr3R	24207244	+	chr3R	24212320
TTCTACGTAAATGGAGTGGGCGAGGCATGATGAGGTGGGGGGAAAAAATAGGAAAATAGTCCGACAGCTAGATG:1	TTCTACGTAAATGGAGTGGGCG	AAAATAGTCCGACAGCTAGATG	+	chr2L	8286320	+	chr2L	8286406	86	+	chr2L	8286320	+	chr2L	8286406
ACATTCCCACCAAGCACTGAAACTGGGCTTCTACTCCTCCAAGGACTTCGGACTCGACTCG:1	ACATTCCCACCAAGCACTGAAA	CAAGGACTTCGGACTCGACTCG	-	chr2R	20031089	-	chr2R	20031010	79	+	chr2R	20031010	+	chr2R	20031089
TTATTGGTCTTAAAGCAAAGAAAACTTGGAAATTAAACCAGCTAAAT:1	TTATTGGTCTTAAAGCAAAGAA	TTGGAAATTAAACCAGCTAAAT	-	chr3L	7845471	-	chr3L	7845416	55	+	chr3L	7845416	+	chr3L	7845471
AGATTAATGGTGTGAATGGAAGGAGCGATCCTTGACGACGATCCTGGCGT:1	AGATTAATGGTGTGAATGGAAG	TCCTTGACGACGATCCTGGCGT	-	chr2R	24154651	-	chr2R	24147098	7553	+	chr2R	24147098	+	chr2R	24154651
TAAAATGCGGTTAAAACGAAAAACAACCAGGGTGNGTGGCCCAATTCAAAAACAAACAAAATGGCAAAACCGAA:1	TAAAATGCGGTTAAAACGAAAA	CAAACAAAATGGCAAAACCGAA	+	chr2L	16270406	+	chr2L	16270485	79	+	chr2L	16270406	+	chr2L	16270485
TGAAATAATAAAAAGGAATCAATTCAAATTTAAATATTTGAGCGCGCGTAC:1	TGAAATAATAAAAAGGAATCAA	TTAAATATTTGAGCGCGCGTAC	-	chr2R	6499286	-	chr2R	6494548	4738	+	chr2R	6494548	+	chr2R	6499286
AAGTAGAAACGTCTAGATATCGGGAAGCTTAGGCTGTGAATGTTT:1	AAGTAGAAACGTCTAGATATCG	GAAGCTTAGGCTGTGAATGTTT	-	chr2L	21285734	-	chr2L	21285666	68	+	chr2L	21285666	+	chr2L	21285734
CATCGACGCCATATCATGCCTGGAAAACGACACTT:1	CATCGACGCCATATCATGCCTG	TCATGCCTGGAAAACGACACTT	+	chr2R	3915031	+	chr2R	3291928	623103	+	chr2R	3915031	+	chr2R	3291928
ATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGNTTATTGTTT:2	ATTGTTTATTGTTTATTGTTTA	TATTGTTTATTGNTTATTGTTT	-	chr3R	7773344	-	chr3R	7890532	117188	+	chr3R	7890532	+	chr3R	7773344
GGTAAAATGCGGTTAAAACGAAAAACAACCAGGGTGTGTGGCCCAATTCAAAAACAAACAAAATGGCAAAACCGA:1	GGTAAAATGCGGTTAAAACGAA	ACAAACAAAATGGCAAAACCGA	+	chr2L	16270404	+	chr2L	16270484	80	+	chr2L	16270404	+	chr2L	16270484
TTTATACAAATTAAAAAACTACTAAAGCAGCTCATAGCAAAGCTATTGCGTTGCTTATAGATTTTAGACTAGAAC:1	TTTATACAAATTAAAAAACTAC	CTTATAGATTTTAGACTAGAAC	+	chr3L	10600455	+	chr3L	10600537	82	+	chr3L	10600455	+	chr3L	10600537
TTATGCGTTTAATGTGCTGAGAGGCCTTGACCGGCTCCAGCATCGCCGAGTATTTTGCAATTATCG:1	TTATGCGTTTAATGTGCTGAGA	GCCGAGTATTTTGCAATTATCG	+	chr3R	4568590	+	chr3R	4568670	80	+	chr3R	4568590	+	chr3R	4568670
AAAACCTAACAAAGGATTACGGCTAATTTTCACTTCGAAAACTATACAAATTTTAAAGTTTTAAGTTGTATCTTA:1	AAAACCTAACAAAGGATTACGG	TAAAGTTTTAAGTTGTATCTTA	+	chr2L	13892849	+	chr2L	13893712	863	+	chr2L	13892849	+	chr2L	13893712
ATAGTTCTTTCAGCACCCTGCTAGGCAATGGATGTCCTTGTTATG:1	ATAGTTCTTTCAGCACCCTGCT	GGCAATGGATGTCCTTGTTATG	-	chr3L	10779841	-	chr3L	8306393	2473448	+	chr3L	8306393	+	chr3L	10779841
TACAGGTTTCATTTTTCAAGAGCGCTGGCCAGGAAAGCCGTATTTACATACATCCCTCTTTGTGGAGATAAGA:1	TACAGGTTTCATTTTTCAAGAG	ATCCCTCTTTGTGGAGATAAGA	-	chr2L	6366104	-	chr2L	6363180	2924	+	chr2L	6363180	+	chr2L	6366104
GATTGGTTCCCTTGCCTCAATTTTCTGATATTTAATGTTCGTATTGTTGTGTATATTTTTGGCACAAATT:1	GATTGGTTCCCTTGCCTCAATT	GTGTATATTTTTGGCACAAATT	-	chr2L	5180639	-	chr2L	3958687	1221952	+	chr2L	3958687	+	chr2L	5180639
GATGCAGCACCAACCACTATGCTTAAATATTTGATATTGGTTTTTTCTTTGGCACTGCAGCCCCCAACCACCAA:1	GATGCAGCACCAACCACTATGC	CACTGCAGCCCCCAACCACCAA	-	chrX	189576	-	chrX	984675	795099	+	chrX	984675	+	chrX	189576
GGAAAGGGAAGGGAACGAAAGTTTCGAAGATATCCCTTTGAGCTCCGTTTAAACCGACGAGCAGCCGATTAAC:1	GGAAAGGGAAGGGAACGAAAGT	AACCGACGAGCAGCCGATTAAC	+	chr2R	23243376	+	chr2R	23243459	83	+	chr2R	23243376	+	chr2R	23243459
TTTATAATGTTTTTGGTAAAGCGTTATGACAANTGATTTTTAAATCGACGAGCCACTCATTTTAGCNATATAAC:1	TTTATAATGTTTTTGGTAAAGC	CCACTCATTTTAGCNATATAAC	-	chr2R	6161408	-	chr2R	6161330	78	+	chr2R	6161330	+	chr2R	6161408
CACATTTTGATAGTATTATTACTATAATTACCATAGACTCTTTCACTTTCACTCTTCTGGCGTGTTCTGCCGTAT:1	CACATTTTGATAGTATTATTAC	CTTCTGGCGTGTTCTGCCGTAT	-	chr3L	12222968	-	chr3L	19411109	7188141	+	chr3L	19411109	+	chr3L	12222968
AGTGATCAAAACAAAAACCGACAAAAAAAAAGTAGCAGCAACGAGAANCGTGTAATTATTTCTTCAGCATTTGGC:1	AGTGATCAAAACAAAAACCGAC	AATTATTTCTTCAGCATTTGGC	+	chr3R	16231535	+	chr3R	18584589	2353054	+	chr3R	16231535	+	chr3R	18584589
TACCGAACGATGAGCTGCCTTTGCAGCCATGTGCTCTAATTCTATTTTTGCAGTTTAATGAAGTCCTTGGCTGCA:1	TACCGAACGATGAGCTGCCTTT	TTTAATGAAGTCCTTGGCTGCA	-	chr2R	16737237	-	chr2R	16737137	100	+	chr2R	16737137	+	chr2R	16737237
AATTTCCCTGGAGGCGGACGCTCCAACCCCGAGNAAGCAACAGCCCAG:1	AATTTCCCTGGAGGCGGACGCT	CCCCGAGNAAGCAACAGCCCAG	-	chr3L	11409764	-	chr3L	11409468	296	+	chr3L	11409468	+	chr3L	11409764
CGGATTAAGCTTCACTTGTGAGCCACCATTGCGATGACTATTCTCGTGCGCACACCTGTGGCCACAATACTAGTG:1	CGGATTAAGCTTCACTTGTGAG	ACCTGTGGCCACAATACTAGTG	+	chrX	15413070	+	chrX	15417372	4302	+	chrX	15413070	+	chrX	15417372
GGCCGTCCCTCCAGTGTCATCACCATCGACTGCCGCCCGTCCTTGGCACCCACCACTGACCGACCCAGCCAACAA:1	GGCCGTCCCTCCAGTGTCATCA	CACTGACCGACCCAGCCAACAA	-	chr2R	10266609	-	chr2R	10266518	91	+	chr2R	10266518	+	chr2R	10266609
GTGACATTGCATCTCAATTTATAATCTGCACTATATCTGCGCGTTAGATTTGCAAATAAATTATATTGAGGGAA:1	GTGACATTGCATCTCAATTTAT	CAAATAAATTATATTGAGGGAA	-	chr2L	17637256	-	chr2L	17637172	84	+	chr2L	17637172	+	chr2L	17637256
TACGTCACCGACCTAAGGAGCTATTAACGAGAGGTGCATGCGGAAGCAGAGACTTTAATGTTACGCATAGA:1	TACGTCACCGACCTAAGGAGCT	AGACTTTAATGTTACGCATAGA	+	chr3R	31831551	+	chr3R	31831626	75	+	chr3R	31831551	+	chr3R	31831626
GAATGATGGAGGATCCGAGGGAATGCGGGTGCAGGGGGCAACGACATNTGAATTTGCCTGCCATATTNGCAAATG:1	GAATGATGGAGGATCCGAGGGA	TTGCCTGCCATATTNGCAAATG	+	chr2L	5396129	+	chr2L	5396218	89	+	chr2L	5396129	+	chr2L	5396218
GGCAATAAAGATGGAGAGGAGCAAAAAAAAAATAGCACACACACTCGTGCTGAGAAAATTCTATGCCANAACGAG:1	GGCAATAAAGATGGAGAGGAGC	GAAAATTCTATGCCANAACGAG	-	chr3L	6816142	-	chr3L	3495957	3320185	+	chr3L	3495957	+	chr3L	6816142
AATTACGAATAATCAACAAAAAAAATATAAATATTAATTTTAGCATTTAGCCATAACAGCTTTGTCTTTGTG:1	AATTACGAATAATCAACAAAAA	CCATAACAGCTTTGTCTTTGTG	-	chr2L	14246366	-	chr2L	14246291	75	+	chr2L	14246291	+	chr2L	14246366
TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGTTTGTGTTT:1	TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTG	GCTTGTGTTTGTGTTTGTGTTT	-	chrX	7978935	-	chrX	4805477	3173458	+	chrX	4805477	+	chrX	7978935
AGACTTTCACTGCAAATCGCTTCCTAAGAAAGTTGTTAACTTGGGTAGAAAAAACCTGATTAATCAGGGCTTACT:1	AGACTTTCACTGCAAATCGCTT	ACCTGATTAATCAGGGCTTACT	-	chr2R	12527509	-	chr2R	12527300	209	+	chr2R	12527300	+	chr2R	12527509
CTCTNTCTCTCTCTCTATCTCTNTCCTNCATTGTTATTTNGNGTTTGCGGGTAAAATAAGACAGAGAATGAG:1	CTCTNTCTCTCTCTCTATCTCT	GTAAAATAAGACAGAGAATGAG	-	chrX	13874129	-	chrX	22383384	8509255	+	chrX	22383384	+	chrX	13874129
ACGCAAACAGTGGTAATGATCAGTATGAGGTAATGTTCGGGTCTTTAGGCAAATAAATGGTAAGCGTTAAGTGAC:1	ACGCAAACAGTGGTAATGATCA	TAAATGGTAAGCGTTAAGTGAC	+	chr2R	11472677	+	chr2R	11473874	1197	+	chr2R	11472677	+	chr2R	11473874
GAAGNTGTAAAGTCAAAGCTAANTGGTNTTGGCTTTTCANAACAAGCAAACAAGGTTCAGTCAATTGCAATTTAT:1	GAAGNTGTAAAGTCAAAGCTAA	GGTTCAGTCAATTGCAATTTAT	+	chr3L	925185	+	chr3L	932611	7426	+	chr3L	925185	+	chr3L	932611
GTNTGGCCAGCTACTTCTCCCAATTCTCCGATTCNGNTCCTCCGCCAGAGAGCCCAAGCA:1	GTNTGGCCAGCTACTTCTCCCA	CCTCCGCCAGAGAGCCCAAGCA	-	chr3L	19426842	-	chr3L	19426779	63	+	chr3L	19426779	+	chr3L	19426842
AAGTCGGAGTTTATTTCCGTTATATGCACTGTTGTTCGCCTAATATTATTTTTTTGCCATTCGG:1	AAGTCGGAGTTTATTTCCGTTA	ATATTATTTTTTTGCCATTCGG	-	chr3R	20165865	-	chr3R	20156706	9159	+	chr3R	20156706	+	chr3R	20165865
GAAAGTAATTTATTAGGATAGTGCCCTAATCTTTTTGTGTACTAAAGCACCGTCAGAATATGTTACTTTCTCCT:1	GAAAGTAATTTATTAGGATAGT	TCAGAATATGTTACTTTCTCCT	-	chr3L	18359701	-	chr3L	18359610	91	+	chr3L	18359610	+	chr3L	18359701
AAAAGTGTTGCATGCTTTCGGGCGTGTGCAGCACGCTGTCCTTTTACACAAACACTCGCACACACAGACACTGG:1	AAAAGTGTTGCATGCTTTCGGG	CACTCGCACACACAGACACTGG	-	chrX	19472726	-	chrX	19472157	569	+	chrX	19472157	+	chrX	19472726
ATAGGATTAGGGCACACATTTACTAAATGAAAGAAATGAGCTTAAAATTCAACCATATTATAAACATTCCTTAAA:1	ATAGGATTAGGGCACACATTTA	CATATTATAAACATTCCTTAAA	-	chr3R	12763214	-	chr3R	12763137	77	+	chr3R	12763137	+	chr3R	12763214
TAAGTAAAATGAAAGGAGTGAAAGTAATTTCTATAAAACAGCAACACTTTCTAACCCGACTAAGAAAAGAAACG:1	TAAGTAAAATGAAAGGAGTGAA	AACCCGACTAAGAAAAGAAACG	+	chr3L	13804556	+	chr3L	13822841	18285	+	chr3L	13804556	+	chr3L	13822841
CCTTAAAAAGTATCGTGAAAGGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTC:1	CCTTAAAAAGTATCGTGAAAGG	GGAATCGTTGTACTCTGTTTTC	-	chr2L	15957495	-	chr2L	15956028	1467	+	chr2L	15956028	+	chr2L	15957495
GGCCGCAGTGGAAACTCCGCGAATTGGGAGAGCATCGGAGGATTACAGCGTAGTGTGGAACAAGGAGAAGAAGTT:1	GGCCGCAGTGGAAACTCCGCGA	TGTGGAACAAGGAGAAGAAGTT	-	chr3L	20866403	-	chr3L	25352101	4485698	+	chr3L	25352101	+	chr3L	20866403
AAGCCGTTTTGGGCCAGANAGCGCCGAGACTTTTATTTGGTGANTGGTCNATTGCAACTTAAGTGTGTAATGTT:1	AAGCCGTTTTGGGCCAGANAGC	TGCAACTTAAGTGTGTAATGTT	+	chrX	1051065	+	chrX	1051142	77	+	chrX	1051065	+	chrX	1051142
CTTGCCACNTGTTTGGTAAAAAAAAATAAATAAATAAATAATAAAATGTCCCAGCAATGTGACCCGTTATTAAA:1	CTTGCCACNTGTTTGGTAAAAA	AGCAATGTGACCCGTTATTAAA	-	chrX	2561526	-	chrX	6182189	3620663	+	chrX	6182189	+	chrX	2561526
CTGCCTCTTTTTTCTTTTTTCTCATTTTTTTTTTT:1	CTGCCTCTTTTTTCTTTTTTCT	CTTTTTTCTCATTTTTTTTTTT	-	chrX	12734498	-	chrX	10866039	1868459	+	chrX	10866039	+	chrX	12734498
CCATCGCCAATTCCATTTTGTTGCCTTGGCAGCGGCGCACAATCAAACTACGTGAGTCTNT:1	CCATCGCCAATTCCATTTTGTT	CAATCAAACTACGTGAGTCTNT	+	chrX	15263647	+	chrX	15263996	349	+	chrX	15263647	+	chrX	15263996
GGCGAACTGGGAAAAGAGAGCAAGCCAGGAAAAGTGCGTGACTTGTTTCTTACACTTGCGGTCAATGGGCCAGAA:1	GGCGAACTGGGAAAAGAGAGCA	ACTTGCGGTCAATGGGCCAGAA	-	chr3R	5573251	-	chr3R	5573166	85	+	chr3R	5573166	+	chr3R	5573251
TTACCATCGAGTTTTTATGTAAGGCCACCCCAAACCCAGCGGAAGCAACACCCGCTGTGC:1	TTACCATCGAGTTTTTATGTAA	GCGGAAGCAACACCCGCTGTGC	+	chrX	1954912	+	chrX	1962837	7925	+	chrX	1954912	+	chrX	1962837
CTCTCGCAACTCAACACTCGTAAGACAACAGGCAACTGACAAAAAATGAATAACGATTAAGGTTAATNACTATTG:1	CTCTCGCAACTCAACACTCGTA	CGATTAAGGTTAATNACTATTG	-	chr2L	19357241	-	chr2L	19345032	12209	+	chr2L	19345032	+	chr2L	19357241
CTTTGAAGTTGGCCACTGAAGGAGCAATGCGAGATCCTGCAAGTAATAAATGAACCCCCAAAAAATCGGCCTGA:1	CTTTGAAGTTGGCCACTGAAGG	AACCCCCAAAAAATCGGCCTGA	+	chr2L	9501709	+	chr2L	20831584	11329875	+	chr2L	9501709	+	chr2L	20831584
CTGCATATTTCACAATCGCTACTCAGGCAGGGCAGGACTAGTGGTCTAGTCCAGAGGACAAATCAATTATGCAAA:1	CTGCATATTTCACAATCGCTAC	GAGGACAAATCAATTATGCAAA	+	chr3R	23572778	+	chr3R	23572898	120	+	chr3R	23572778	+	chr3R	23572898
TCGTATTACTTTATAATATAGTAAAAAAGGTAATAATCGGAATCATCAGTGCCCTAGTCATTCATGTCTGGCTT:1	TCGTATTACTTTATAATATAGT	CCTAGTCATTCATGTCTGGCTT	+	chr3R	24434246	+	chr3R	24434323	77	+	chr3R	24434246	+	chr3R	24434323
AACAGCCACAGTTGGGNAAGCGAGCTGAGGGCAGAAATCTGTTTCGGAATCGAAG:1	AACAGCCACAGTTGGGNAAGCG	GAAATCTGTTTCGGAATCGAAG	+	chr3R	24657353	+	chr3R	16812974	7844379	+	chr3R	24657353	+	chr3R	16812974
AAACAAAAGCTGCTAAGTGATGATGCAACGCAAAATATATGTATATTCCAAACAAATTTAAATTTCAACAAAATT:1	AAACAAAAGCTGCTAAGTGATG	AAATTTAAATTTCAACAAAATT	-	chr3R	18040467	-	chr3R	18032797	7670	+	chr3R	18032797	+	chr3R	18040467
ACTTCCTGAAGATTTGTGGAAAACTTTNAANNTTGAAACAATTTATCAGNANACGCTCTTTGACAATGTAAGTTT:1	ACTTCCTGAAGATTTGTGGAAA	CGCTCTTTGACAATGTAAGTTT	-	chr3L	17580771	-	chr3L	17580595	176	+	chr3L	17580595	+	chr3L	17580771
GTTTTTGCAAAGATTTTGTAAAGCGTTTGGCAAAAAGGAACAAGACACTTGGGCTTTTTGTGGTGACCATGGGA:1	GTTTTTGCAAAGATTTTGTAAA	GCTTTTTGTGGTGACCATGGGA	+	chr2L	15942525	+	chr2L	2383781	13558744	+	chr2L	15942525	+	chr2L	2383781
GAACCATCGCGAATACCCTAAATANCATAGTGCTGACNCGATNGGNGATGCNCTCNCCCACGAATGCCATACTCA:1	GAACCATCGCGAATACCCTAAA	TCNCCCACGAATGCCATACTCA	+	chr3L	2298200	+	chr3L	2342748	44548	+	chr3L	2298200	+	chr3L	2342748
CAGACATTCTGCCCCATTTTGGCATGCGGCTAGTGCATGAAATTGTTGTCTGCAAGGGGCCGAAGGGTACTGG:1	CAGACATTCTGCCCCATTTTGG	GCAAGGGGCCGAAGGGTACTGG	+	chr2R	21932249	+	chr2R	21932325	76	+	chr2R	21932249	+	chr2R	21932325
TATGCATTTTATTTTACAATTACAATATTTATTAGGTGTGACGGCCTTTGGCTTTACGAGCTGTT:1	TATGCATTTTATTTTACAATTA	GCCTTTGGCTTTACGAGCTGTT	-	chrX	4763754	-	chrX	4763276	478	+	chrX	4763276	+	chrX	4763754
GACGACTGTGGCAATAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGTGATATTTAAGGCACNAATTT:1	GACGACTGTGGCAATAGTTTTG	GTGATATTTAAGGCACNAATTT	+	chr2R	18785937	+	chr2R	18786014	77	+	chr2R	18785937	+	chr2R	18786014
AACAAATTAAAATAAAATATATATATGTGGAGAGGTGGGTCACGCACGTGCGCCTG:1	AACAAATTAAAATAAAATATAT	GTGGGTCACGCACGTGCGCCTG	+	chr3L	19557287	+	chr3L	10080500	9476787	+	chr3L	19557287	+	chr3L	10080500
AAATAGTGTTGTAAATTTGGTTACCTATATATATTACTTATACAATTCTAGCTTTT:1	AAATAGTGTTGTAAATTTGGTT	TACTTATACAATTCTAGCTTTT	+	chr2L	15586435	+	chr2L	15593468	7033	+	chr2L	15586435	+	chr2L	15593468
TAAACCTACATATATACGGGCGATATTACAACATTGTAATTATCATTGCGACACTATTTGCTGTTTGGCTTAA:1	TAAACCTACATATATACGGGCG	CACTATTTGCTGTTTGGCTTAA	+	chr2L	12848452	+	chr2L	12848538	86	+	chr2L	12848452	+	chr2L	12848538
CAACTGAAACCGATCGTTGGGTACTTTCTGTTTGTTCTTGTTTTTCACTTTTTCGTTTAGCAAGTATTTAA:1	CAACTGAAACCGATCGTTGGGT	TTTTCGTTTAGCAAGTATTTAA	-	chr3L	9344281	-	chr3L	9344207	74	+	chr3L	9344207	+	chr3L	9344281
CCGGATCCCACAACACACCCATATATTCCAGAAAAGTGCGTGAGGTGGCCAAGCTGAAGAGCTGCGAGGCGG:1	CCGGATCCCACAACACACCCAT	AAGCTGAAGAGCTGCGAGGCGG	+	chr3R	21835071	+	chr3R	19177553	2657518	+	chr3R	21835071	+	chr3R	19177553
ATACGGGTCTTGCTTTTTTTAGTCTGTATGGCAAACATTCAAACATCATTAACATTAGAAGCAATAAATCGTATG:1	ATACGGGTCTTGCTTTTTTTAG	ATTAGAAGCAATAAATCGTATG	+	chr3L	9390856	+	chr3L	9390986	130	+	chr3L	9390856	+	chr3L	9390986
TAAAATAAAAACACTTCAAATTAAACGATTAGTTAAGTCAAACACATAAAACAATTAAAATCCTGAAAATAAATA:1	TAAAATAAAAACACTTCAAATT	ATTAAAATCCTGAAAATAAATA	-	chr3R	5639119	-	chr3R	17658290	12019171	+	chr3R	17658290	+	chr3R	5639119
TCTCGGAAGTAGCGAAAAGATCCTGGAATTTAAATTTTAGTTATGATATAACAATAATCATGCATCTTAAAAGCC:1	TCTCGGAAGTAGCGAAAAGATC	ATAATCATGCATCTTAAAAGCC	+	chr3R	18897610	+	chr3R	18897686	76	+	chr3R	18897610	+	chr3R	18897686
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACACAACACAACACAACACAACACAAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
GCTTATTTTTATTCCCATGACTTAAATACTTATTTACTTATTTACTTTTTATTTTTATTTAAAACCAACCATTG:1	GCTTATTTTTATTCCCATGACT	TTTTATTTAAAACCAACCATTG	-	chr2L	7005342	-	chr2L	7005247	95	+	chr2L	7005247	+	chr2L	7005342
TCGTACCCAATAAAATTTGTTTAAAGAAATATAGAAATCCACAATATATATTTTTGGATCAAAAAATGTAACCGA:1	TCGTACCCAATAAAATTTGTTT	TTGGATCAAAAAATGTAACCGA	+	chr2L	6799568	+	chr2L	6799656	88	+	chr2L	6799568	+	chr2L	6799656
GTAATAATTTAACCTTCTCCCTGTGGCCCAATTCAAATGTTGGGCGTGTTTACTTGGCCACAAACTCTC:1	GTAATAATTTAACCTTCTCCCT	GTTTACTTGGCCACAAACTCTC	-	chrX	5469800	-	chrX	5469637	163	+	chrX	5469637	+	chrX	5469800
AAGCTTTTTCTAAAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCAAACAAGTCTAAGCGCACACAACCTGT:1	AAGCTTTTTCTAAAAACGCATT	AGTCTAAGCGCACACAACCTGT	-	chr2L	1227597	-	chr2L	1220131	7466	+	chr2L	1220131	+	chr2L	1227597
AAAGTGGAGGGCTTTTTATTTGGATTTTTGTGCTGTGTTGAAAGTGATGCAACCCATTGATTGATAGTAAATTTA:1	AAAGTGGAGGGCTTTTTATTTG	CCATTGATTGATAGTAAATTTA	+	chr3R	13306142	+	chr3R	13306529	387	+	chr3R	13306142	+	chr3R	13306529
CTAAGATTATGATTGATCTTNAGCACTTTACTNAAAATACCTNACCTTCAAAATCGAGCAGTTCCCACCTACATT:1	CTAAGATTATGATTGATCTTNA	TCGAGCAGTTCCCACCTACATT	+	chr2R	18808170	+	chr2R	18808246	76	+	chr2R	18808170	+	chr2R	18808246
AATCAACATAGAACACACAAAATATTACAACAATTTGCATAAAGCCTGTTACTGTTACGATTTCGAGACGAC:1	AATCAACATAGAACACACAAAA	ACTGTTACGATTTCGAGACGAC	-	chr3L	14296492	-	chr3L	14296009	483	+	chr3L	14296009	+	chr3L	14296492
GGCGCTTCATTCGCGTCCTGGATGCCAGTTAGAAAGCTTCCCATTCGCGATACACACATACAGTCCAAGCCGAGG:1	GGCGCTTCATTCGCGTCCTGGA	ACACATACAGTCCAAGCCGAGG	+	chr3R	16472599	+	chr3R	16472675	76	+	chr3R	16472599	+	chr3R	16472675
TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTCTCATATCATATATTTACTATAAGTTTT:1	TAGTTTTGTAAACTATTCTATC	TCATATATTTACTATAAGTTTT	+	chrX	23065112	+	chrX	2974069	20091043	+	chrX	23065112	+	chrX	2974069
GCTAAAACTTGGAAAGGAACAACCATAACTATTCCTCGTCACCTATCCCTTCTTAAAAAATATTACAGAAA:1	GCTAAAACTTGGAAAGGAACAA	TTCTTAAAAAATATTACAGAAA	-	chr3R	13318912	-	chr3R	13314128	4784	+	chr3R	13314128	+	chr3R	13318912
GCTAAATGAAAGCCACAAAAGAGAGAAAACNNNANTTGGCAACTTGAAGCATAAATGTCGGCCGAATGCCAAGTC:1	GCTAAATGAAAGCCACAAAAGA	AATGTCGGCCGAATGCCAAGTC	+	chr3R	29356119	+	chr3R	22647486	6708633	+	chr3R	29356119	+	chr3R	22647486
TATGTTTANTACTTTCTCCTAGAAAGTGCAGTTCAAANNNNTACCCCTTCTCAGTGCTTTCNCAAACATCAAAG:1	TATGTTTANTACTTTCTCCTAG	AGTGCTTTCNCAAACATCAAAG	-	chr3R	31426987	-	chr3R	31426896	91	+	chr3R	31426896	+	chr3R	31426987
AAATCATGGAACTCGAGCATTAAAGAGCCTGTTTGGTGACTTGAAGCTGATAGCAAAAAGAGCTTCGTGATAAG:1	AAATCATGGAACTCGAGCATTA	GCAAAAAGAGCTTCGTGATAAG	+	chr2R	6247833	+	chr2R	6247910	77	+	chr2R	6247833	+	chr2R	6247910
CAATTTTCTTGGGAAAAAGCTGCAAGCATGAGGTGGCAAAAATGTACCCTTTTTTTAAGGTGCTGCCAAGGCTGC:1	CAATTTTCTTGGGAAAAAGCTG	TTTAAGGTGCTGCCAAGGCTGC	-	chr2R	15022880	-	chr2R	15015456	7424	+	chr2R	15015456	+	chr2R	15022880
CTACAACTCTATCCAAAGGATATGAAAATGGCACTAAAATATATTGAGGNAAAGCTTTTAAGATCCGTCTCAAAT:1	CTACAACTCTATCCAAAGGATA	GCTTTTAAGATCCGTCTCAAAT	+	chrX	14531358	+	chrX	14531447	89	+	chrX	14531358	+	chrX	14531447
GTTCTGGCCGCCTTCTGGCNATTGGCAGTNCCAATACCCAATCACCAAAAACCGAAAACAAAACCA:1	GTTCTGGCCGCCTTCTGGCNAT	CCAAAAACCGAAAACAAAACCA	-	chr3L	714240	-	chr3L	1153652	439412	+	chr3L	1153652	+	chr3L	714240
TCTCATTTCTGCGCGACATGAAGAATGGCTTGGGGACGAGGCTCGG:1	TCTCATTTCTGCGCGACATGAA	ATGGCTTGGGGACGAGGCTCGG	+	chr3R	6575185	+	chr3R	6575291	106	+	chr3R	6575185	+	chr3R	6575291
AACCAGTCCATTGCAATGTCCGAGTGCGTTACCAAACTGGATCAGGACTGGAATGCACCGCCTTTTGTCCAAAAT:1	AACCAGTCCATTGCAATGTCCG	TGCACCGCCTTTTGTCCAAAAT	-	chr2L	20679824	-	chr2L	10296455	10383369	+	chr2L	10296455	+	chr2L	20679824
TGTAGAAGCCTCCAAGGCACTGGGAAAGTGCACACAAAAAAAACATCGATTTGCACCGACTATATCATTTTGGCA:1	TGTAGAAGCCTCCAAGGCACTG	CACCGACTATATCATTTTGGCA	-	chr3R	27680066	-	chr3R	27679943	123	+	chr3R	27679943	+	chr3R	27680066
GTTAACAAGTATTTAAACAAACAAGGCGGAAACACATAAACAAAATTCCATAAGGGAGGCATTTTCCATTAAGCC:1	GTTAACAAGTATTTAAACAAAC	GGGAGGCATTTTCCATTAAGCC	+	chr2L	7493671	+	chr2L	7493882	211	+	chr2L	7493671	+	chr2L	7493882
CCCACAATTTGAGCCCTTNCACGTACGCAGTGTGGGCGGGCAANGGAATNGAAATGAATTTCACAAACAACAGAG:1	CCCACAATTTGAGCCCTTNCAC	ATGAATTTCACAAACAACAGAG	-	chr3R	6475289	-	chr3R	6475190	99	+	chr3R	6475190	+	chr3R	6475289
GAAATCTAGGAAGAACTTTAATAGAATTTATCCATTTGTAGAACACCCAGNAGCCCC:1	GAAATCTAGGAAGAACTTTAAT	TTGTAGAACACCCAGNAGCCCC	-	chr2L	8510234	-	chr2L	8510163	71	+	chr2L	8510163	+	chr2L	8510234
ACACACACCCACACACNCGCGCANAGAGGAAAANTCCTNCTACCCCCAGCCAATGTGCC:1	ACACACACCCACACACNCGCGC	TNCTACCCCCAGCCAATGTGCC	+	chrX	10857868	+	chrX	11014843	156975	+	chrX	10857868	+	chrX	11014843
CCTTCTTTTCGCTCTTTGGATCCGGAAACATAGCGTCAATCAGCTCCAAAGATCCTCTGCTCCATCGC:1	CCTTCTTTTCGCTCTTTGGATC	CAAAGATCCTCTGCTCCATCGC	-	chr2R	10064177	-	chr2R	18217981	8153804	+	chr2R	18217981	+	chr2R	10064177
ACACAGCTGCTGGGTAAAATTGCCAGGGATCCACCTAAAACGTTATTGATATGTACGAAGAATGCTCACACCTT:1	ACACAGCTGCTGGGTAAAATTG	GTACGAAGAATGCTCACACCTT	-	chr3R	30687020	-	chr3R	30679552	7468	+	chr3R	30679552	+	chr3R	30687020
TTTAGCTACGATTACACTTTTCAATAGAACCANCTGATGCCTTCAGCTTAAGTGGAACCAGATTTT:1	TTTAGCTACGATTACACTTTTC	AGCTTAAGTGGAACCAGATTTT	+	chr2R	23061777	+	chr2R	23061844	67	+	chr2R	23061777	+	chr2R	23061844
GTAGGTAATCAAACGCTTAATTAATATGACCCTCCATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCGGG:1	GTAGGTAATCAAACGCTTAATT	TTCGCTTGTGGTGGGGCCCGGG	+	chrX	21003545	+	chrX	10644473	10359072	+	chrX	21003545	+	chrX	10644473
GAAGCAAACAAAAAAAAAAATTTAAAAATACAACAGTATTTTTANAGCGC:1	GAAGCAAACAAAAAAAAAAATT	TACAACAGTATTTTTANAGCGC	-	chr3R	17496195	-	chr3R	19408462	1912267	+	chr3R	19408462	+	chr3R	17496195
GGGCAATTTCACTTGTCCAAGAAAGCAACTCGAAGATGCTGATGGTGCCGAATACGGAGCTCTATCGAGTACATT:1	GGGCAATTTCACTTGTCCAAGA	ACGGAGCTCTATCGAGTACATT	+	chr2L	19559407	+	chr2L	19559483	76	+	chr2L	19559407	+	chr2L	19559483
GGTCAGCTCTGCTGGTTCAGGGTCATGTGTGGGGTTAAGTGACAACACAAACACACTA:1	GGTCAGCTCTGCTGGTTCAGGG	AAGTGACAACACAAACACACTA	-	chr3R	19506042	-	chr3R	19505960	82	+	chr3R	19505960	+	chr3R	19506042
GTAATAAAACAAACAAAAGCTGCTAAGTGATGATGCAACGCAAAATATATGTATATTCCAAACAAATTTAAATTT:1	GTAATAAAACAAACAAAAGCTG	TATTCCAAACAAATTTAAATTT	-	chr3R	18040477	-	chr3R	18032807	7670	+	chr3R	18032807	+	chr3R	18040477
TCCTACTTTGTGTATTCACCTGGTATTTATTGGCCCTTTATCTTTGTTCACTTATAGCTCTAATCTAATGACCCT:1	TCCTACTTTGTGTATTCACCTG	ATAGCTCTAATCTAATGACCCT	-	chr3L	11340065	-	chr3L	11339983	82	+	chr3L	11339983	+	chr3L	11340065
ATTAAAAGAGGTCTCCTCTTCAACGTGCAATTTTTCATCTTCTTTTTTCTTTTTACAAGCGGGAGCAATGCGCAC:1	ATTAAAAGAGGTCTCCTCTTCA	TACAAGCGGGAGCAATGCGCAC	+	chrX	10719146	+	chrX	10719230	84	+	chrX	10719146	+	chrX	10719230
ATTCCATATAAAAACAGTTTATTATTGCATATTTTGGTGCATATGCATATTATTAATTTTTCCCATTAATGCCAA:1	ATTCCATATAAAAACAGTTTAT	TAATTTTTCCCATTAATGCCAA	-	chr3L	8166066	-	chr3L	8165982	84	+	chr3L	8165982	+	chr3L	8166066
AACATTGTGAAACTAAAAAAAAAATCAACGTTTACCG:1	AACATTGTGAAACTAAAAAAAA	AAAAAAAAATCAACGTTTACCG	-	chr2R	6381372	-	chr2R	6409719	28347	+	chr2R	6409719	+	chr2R	6381372
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
TTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACTGGATCGAATCGG:1	TTCTAGTGTCTTTGGTTTGAAC	GGTTTGAACTGGATCGAATCGG	-	chr2R	2308261	-	chr2R	22537595	20229334	+	chr2R	22537595	+	chr2R	2308261
ATAAGATTGGAAGCGAATCTAGCCCCCGATAGNATATATTTGAGCCCTTTTTCTACAGAGCGCACANTTCATAA:1	ATAAGATTGGAAGCGAATCTAG	CTACAGAGCGCACANTTCATAA	+	chr2R	7942952	+	chr2R	7943208	256	+	chr2R	7942952	+	chr2R	7943208
TTTGCCGGATTAATAAAACAGCAGTTAGTTAGACTTAGGTCACAGTCAGCGGTCAACAGCTATGGACTTTCATTA:1	TTTGCCGGATTAATAAAACAGC	CAACAGCTATGGACTTTCATTA	-	chr3R	4610721	-	chr3R	4609557	1164	+	chr3R	4609557	+	chr3R	4610721
TGACAGAATTGTCGGACTATACATGATAGGGCGCTGTGAGCAGG:1	TGACAGAATTGTCGGACTATAC	ATGATAGGGCGCTGTGAGCAGG	-	chr3L	7355717	-	chr3L	7363655	7938	+	chr3L	7363655	+	chr3L	7355717
TGTACACATAGACACTTGCATATATATTATGTATATATATATAGGTACGAATTCAGGTATATAGATACTACACAT:1	TGTACACATAGACACTTGCATA	CAGGTATATAGATACTACACAT	-	chr3L	3051989	-	chr3L	3051747	242	+	chr3L	3051747	+	chr3L	3051989
TTTTAGCTAAAAAGCAAGTCCTGTTCGATTTAAAAATAATGTTTTCTCTATAATTCAAGCACTAACACCTTTCT:1	TTTTAGCTAAAAAGCAAGTCCT	ATTCAAGCACTAACACCTTTCT	+	chr3L	18124427	+	chr3L	18124510	83	+	chr3L	18124427	+	chr3L	18124510
TAGCTTAAAACTAAGTAAACTCGTTTTATTTACACTCTAGAATGCATGCAGCTTAAGTCTCTGATTGCCAGTTTG:1	TAGCTTAAAACTAAGTAAACTC	TAAGTCTCTGATTGCCAGTTTG	+	chr2L	7801538	+	chr2L	1407764	6393774	+	chr2L	7801538	+	chr2L	1407764
ATCACAAGGAAATGCACCACACTTCTTTTACATCGTCTATTGACTATTTCGGGCAAATATTGGTC:1	ATCACAAGGAAATGCACCACAC	CTATTTCGGGCAAATATTGGTC	-	chr2L	22694022	-	chr2L	22693945	77	+	chr2L	22693945	+	chr2L	22694022
TGGACTACAAGATAGAGGTTTGTGCTTACAGTGTATGGATTTTAGGATCTTAAATATTTTATTACGCTTTTTATT:1	TGGACTACAAGATAGAGGTTTG	ATATTTTATTACGCTTTTTATT	-	chrX	17782329	-	chrX	17782231	98	+	chrX	17782231	+	chrX	17782329
AAAAAAAAAGTGCTTATGTGCAGTGCTTTTCAGTACCAATGAAAGCTTTCGGACCAACTAGCGTTCAATTTCG:1	AAAAAAAAAGTGCTTATGTGCA	GACCAACTAGCGTTCAATTTCG	+	chrX	3408990	+	chrX	3409065	75	+	chrX	3408990	+	chrX	3409065
TATAAAAAGCAAAGAAATTACTGGTGTAACTTAACTTTTTCCTGGCTGCTGATTGATTGGCTGAGTTTTCCCCGC:1	TATAAAAAGCAAAGAAATTACT	TGATTGGCTGAGTTTTCCCCGC	-	chr2R	13749572	-	chr2R	13749426	146	+	chr2R	13749426	+	chr2R	13749572
TTGGCAAGGTGTCCTTTTTGGGTCCAAGTGCAGTTTTCCAATTCAGCTTAAGCTCTTCTCTTCTCCACTTTCTTT:1	TTGGCAAGGTGTCCTTTTTGGG	TCTTCTCTTCTCCACTTTCTTT	-	chrX	6184114	-	chrX	6864243	680129	+	chrX	6864243	+	chrX	6184114
AATCAAATCGCACGAAAAAATATGTGAATTAAATGTGACCTCGTCTGGCGGGGCGGAGCCTGCAAACAAATTGCG:1	AATCAAATCGCACGAAAAAATA	CGGAGCCTGCAAACAAATTGCG	-	chr2R	7153263	-	chr2R	7153177	86	+	chr2R	7153177	+	chr2R	7153263
ACGCTGATAAACTGCAGAACTTTGACGCGTGGGATTAGCCGCCTATAATGAATCAAATGTTGTATAACATTTAAA:1	ACGCTGATAAACTGCAGAACTT	CAAATGTTGTATAACATTTAAA	-	chr2R	23668172	-	chr2R	13522224	10145948	+	chr2R	13522224	+	chr2R	23668172
AACAACCCACTTACCCACCCACAACAACCCACTCACGCACACACGTAGAGCACAACCCTCGCACGTTAAT:1	AACAACCCACTTACCCACCCAC	AGCACAACCCTCGCACGTTAAT	-	chr3L	17695511	-	chr3L	7967371	9728140	+	chr3L	7967371	+	chr3L	17695511
CTAGTTTTTGGGCCCGGCTAAATCACAGACAGTGTATGTCTAATGCGCAAAACTTTTAAT:1	CTAGTTTTTGGGCCCGGCTAAA	TCTAATGCGCAAAACTTTTAAT	+	chr3R	9811368	+	chr3R	9811431	63	+	chr3R	9811368	+	chr3R	9811431
AGTAGGCAATAAAAATTGTCAAACAATAAATATTTGCGGTAGGTCAGCGGGTCACTGAAAAGCGGGGGCGAAGTG:1	AGTAGGCAATAAAAATTGTCAA	ACTGAAAAGCGGGGGCGAAGTG	-	chr3R	28797979	-	chr3R	28792884	5095	+	chr3R	28792884	+	chr3R	28797979
ATCCAACAATGCCAACGTCCAACGACCACCCCAAAAAAAAAAACCCAACCCACGCAGCCCTTAATTATATTTAA:1	ATCCAACAATGCCAACGTCCAA	CGCAGCCCTTAATTATATTTAA	+	chrX	15207771	+	chrX	9589152	5618619	+	chrX	15207771	+	chrX	9589152
TTTTGTTAGCAGAAAATCAAAAAAATATAATCCATAAATGTGTTNAATCTTTAATTACTGCAAATAA:1	TTTTGTTAGCAGAAAATCAAAA	AATCTTTAATTACTGCAAATAA	+	chr3R	15102502	+	chr3R	15109753	7251	+	chr3R	15102502	+	chr3R	15109753
TAACATTTATTAAATAATAACTAATAGTTGGGNTAAAACTGTGGTTTTGGTACTCCGAATTCTTTCNAATGACC:1	TAACATTTATTAAATAATAACT	CTCCGAATTCTTTCNAATGACC	-	chr2L	9264466	-	chr2L	9264367	99	+	chr2L	9264367	+	chr2L	9264466
GTACGATTTCGAGCTAAATTATTGTTATACTTATAGTTTCTCTAAGACATGTCG:1	GTACGATTTCGAGCTAAATTAT	ATAGTTTCTCTAAGACATGTCG	-	chr3R	5746261	-	chr3R	5746041	220	+	chr3R	5746041	+	chr3R	5746261
CTCTAGTTAAAGCCATCANAGCCATTCCAATGCAATTGACAAANTATCCTATAACATTGAAAATGAATTAAANAC:1	CTCTAGTTAAAGCCATCANAGC	ACATTGAAAATGAATTAAANAC	+	chr3L	25303707	+	chr3L	25869518	565811	+	chr3L	25303707	+	chr3L	25869518
TGGTTCTAGCATCGAAAAACCTAAGGCTTCTTTCTTAAAATATCCCATATACATTTTCCATTTTTAAACACATC:1	TGGTTCTAGCATCGAAAAACCT	ATTTTCCATTTTTAAACACATC	-	chr3L	14320748	-	chr3L	14320672	76	+	chr3L	14320672	+	chr3L	14320748
TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGTGTGCACTCCAAGTCAAAGTAACTCCTTCACGTGAGCTGACAAG:1	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	CTCCTTCACGTGAGCTGACAAG	+	chr2L	16217660	+	chr2L	12768332	3449328	+	chr2L	16217660	+	chr2L	12768332
CACTCCGGCAAAGATAAAGGCCAGCAGGAACATGTCAGTCGTGTGTGTGAGGTCAGT:1	CACTCCGGCAAAGATAAAGGCC	CAGTCGTGTGTGTGAGGTCAGT	+	chr3R	8032332	+	chr3R	30066124	22033792	+	chr3R	8032332	+	chr3R	30066124
TGGTTCAGTTTGGCAATGTGCAATTCTTTTGCTACAATACATTGCTATTTAC:1	TGGTTCAGTTTGGCAATGTGCA	GCTACAATACATTGCTATTTAC	-	chrX	3513843	-	chrX	3513783	60	+	chrX	3513783	+	chrX	3513843
AAACAAACAAACAAAAAATACGAAATTCGAAGAAGGACAGTCGCANCAATGTAAAAGCGATNGGGATGATGAAAC:1	AAACAAACAAACAAAAAATACG	AAAGCGATNGGGATGATGAAAC	+	chr2L	18314105	+	chr2L	9212540	9101565	+	chr2L	18314105	+	chr2L	9212540
TAGTTGTACTTTTTCGGAAAAACAGAAGTTAAAGCGATTATCATCCGATTACACAAAACTAACCCTCAGAACT:1	TAGTTGTACTTTTTCGGAAAAA	CACAAAACTAACCCTCAGAACT	+	chr3L	20781406	+	chr3L	20781490	84	+	chr3L	20781406	+	chr3L	20781490
AAAAATGGCATTTTGACATGGCCACCGGGTGAGCATTATGAATGCTTGCCATGATGTCATTGCACTTGAGTG:1	AAAAATGGCATTTTGACATGGC	ATGATGTCATTGCACTTGAGTG	-	chr3R	17348819	-	chr3R	17348733	86	+	chr3R	17348733	+	chr3R	17348819
TATTGTCTAAATTATTTGAAGTTGAGAAAATATATACATTAACAAGGGTTTTTGGATTTAGAAAGCAAATTTCAT:1	TATTGTCTAAATTATTTGAAGT	GGATTTAGAAAGCAAATTTCAT	+	chr2R	8480946	+	chr2R	8481070	124	+	chr2R	8480946	+	chr2R	8481070
TTTAAATGATATTGGAAACATGTACTGCGAACTAAATTCACAATAAAATTCCGCTTTTGAAATTCTTCTCGATGA:1	TTTAAATGATATTGGAAACATG	CTTTTGAAATTCTTCTCGATGA	+	chr2L	11702653	+	chr2L	11702747	94	+	chr2L	11702653	+	chr2L	11702747
AAATGATCACCACAATTTNTGCCCATCGTGTTACCTTCTACCANCGCGANTACTGCGTCACGTCCAAAGCAAGGA:1	AAATGATCACCACAATTTNTGC	TGCGTCACGTCCAAAGCAAGGA	-	chr3L	14245672	-	chr3L	14245578	94	+	chr3L	14245578	+	chr3L	14245672
AAATCCAAAAAAAAAAAGGATAAAATATAATAACGGAACAACAGAAACGCTCCTGGCCTTAAATCAGTGCA:1	AAATCCAAAAAAAAAAAGGATA	CTCCTGGCCTTAAATCAGTGCA	-	chr2R	6775782	-	chr2R	14549279	7773497	+	chr2R	14549279	+	chr2R	6775782
CTTAAAAAGTATCGTGAAAGGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTCT:1	CTTAAAAAGTATCGTGAAAGGT	GAATCGTTGTACTCTGTTTTCT	-	chr2L	15957494	-	chr2L	15956027	1467	+	chr2L	15956027	+	chr2L	15957494
ACAATAATTTTGGGCTTATTGGCCAAAGGTGCATGTGACCTATAAGAAAGTAACAGTTGTAAAGCCAACCCGTTC:1	ACAATAATTTTGGGCTTATTGG	CAGTTGTAAAGCCAACCCGTTC	-	chr3R	29773969	-	chr3R	29773878	91	+	chr3R	29773878	+	chr3R	29773969
AGGAAGGAATCTTCGTTTAGAACAACACGCTGGGAGATCGAA:1	AGGAAGGAATCTTCGTTTAGAA	AACAACACGCTGGGAGATCGAA	+	chr3L	18606782	+	chr3L	18606947	165	+	chr3L	18606782	+	chr3L	18606947
AAAACATAAGTACGAGCGGCGGAAAAACATTGACCAAAAAACAAGCTGGCGAGTAGAGGAAAGAGGAAAGCCG:1	AAAACATAAGTACGAGCGGCGG	AGTAGAGGAAAGAGGAAAGCCG	+	chr3R	10836783	+	chr3R	23882995	13046212	+	chr3R	10836783	+	chr3R	23882995
ACAAGTGTAAGTAAGGCCAAAAGGACGAATGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATGCTCCTTTNTTGTTGG:1	ACAAGTGTAAGTAAGGCCAAAA	GGACATGCTCCTTTNTTGTTGG	-	chr2L	15852146	-	chr2L	15852063	83	+	chr2L	15852063	+	chr2L	15852146
GATATAATGGAAGCATTGCAAATAATGCCTTCTTGCTTTATAGCGCTGCTTCCAGAGTAACATTTATTATGT:1	GATATAATGGAAGCATTGCAAA	TCCAGAGTAACATTTATTATGT	-	chr3R	4568782	-	chr3R	4568698	84	+	chr3R	4568698	+	chr3R	4568782
GGACGTACNTATAAATATAAATTCAGCTTGAAATCGTNNNNTATGCCGCAATTACCATCGCNATTTCAATTTGCT:1	GGACGTACNTATAAATATAAAT	ACCATCGCNATTTCAATTTGCT	-	chr2R	22767681	-	chr2R	22767596	85	+	chr2R	22767596	+	chr2R	22767681
AATTGCTATTGGTATTGGTGCTGGTGTGGGTGAATGTGTATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	AATTGCTATTGGTATTGGTGCT	TATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	-	chrX	16148591	-	chrX	7978953	8169638	+	chrX	7978953	+	chrX	16148591
AAGGCCTAAAAAGAATGAAGCCCTGTGTACAGTTCTATATGTGCGGAATATGTTCCACTAATTTGCGGCCTATCT:1	AAGGCCTAAAAAGAATGAAGCC	TCCACTAATTTGCGGCCTATCT	+	chr2L	20976660	+	chr2L	20981475	4815	+	chr2L	20976660	+	chr2L	20981475
GCAATCATCATGAGCTAATAGGTAAGAGCTTCTAGCTTTTCTCTCAGTGCACGAATGGCGAGAGCTAACCAGACT:1	GCAATCATCATGAGCTAATAGG	AATGGCGAGAGCTAACCAGACT	-	chr3L	13267411	-	chr3L	13267298	113	+	chr3L	13267298	+	chr3L	13267411
CTGTATGTAGGTATCTCAGCGAATGGAACAATGCCAGTTCCGTATTAATGTCGTACTGTAAGATTTCAGTTCAT:1	CTGTATGTAGGTATCTCAGCGA	GTACTGTAAGATTTCAGTTCAT	+	chrX	10361721	+	chrX	10361817	96	+	chrX	10361721	+	chrX	10361817
AATGCACAACTCCATAGCATTCCAAGTGCAGAACGCGTTCGCGTTCGAAGCGTTCGCAGCAGGTGCAATAG:1	AATGCACAACTCCATAGCATTC	GCGTTCGCAGCAGGTGCAATAG	+	chr2R	22505972	+	chr2R	22506067	95	+	chr2R	22505972	+	chr2R	22506067
CAATCCACTGAGTTTCGGGGAAAACTAGGGAAGTGCAATAGAGAGGGCTTTAAAACTGCATATATTTGTAT:1	CAATCCACTGAGTTTCGGGGAA	TTAAAACTGCATATATTTGTAT	+	chr3L	3601313	+	chr3L	3606620	5307	+	chr3L	3601313	+	chr3L	3606620
TCTTATTAACGCGCAATCCTATTACGACAGTAATATGTAAGTAAAAGGTTTTCAATCTTTTTAGAATTCAGCT:1	TCTTATTAACGCGCAATCCTAT	TCAATCTTTTTAGAATTCAGCT	+	chr3L	21872428	+	chr3L	21872505	77	+	chr3L	21872428	+	chr3L	21872505
AGATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAANAATTTGTTAGATATAATTTATAATTTTGAGATAGATTCCTA:1	AGATGATAGAGAGCAATTAGAA	ATAATTTTGAGATAGATTCCTA	+	chr3R	19448598	+	chr3R	19449212	614	+	chr3R	19448598	+	chr3R	19449212
TCAAAATGAAACGGAAATATTTACTCAAGTCAATTTGCAGTTGGCAAACTTCTTGTAGAGGATTTCACAGAGTTC:1	TCAAAATGAAACGGAAATATTT	TGTAGAGGATTTCACAGAGTTC	-	chrX	21248020	-	chrX	21247908	112	+	chrX	21247908	+	chrX	21248020
ATATTTTGTTGAGTGCACTCTAGCTTGGGTTGGGCTCAGTGGGTTCCTTCTGCTCCAATAGATGTGGATGATGT:1	ATATTTTGTTGAGTGCACTCTA	CTCCAATAGATGTGGATGATGT	-	chr2L	15468882	-	chr2L	15468798	84	+	chr2L	15468798	+	chr2L	15468882
TAGAATTATAATAACATACTAAAAGCCCACAGCGCACCAGCTCGAGCACTAAACTTAATGTCCCAATGAAGTTTC:1	TAGAATTATAATAACATACTAA	CTTAATGTCCCAATGAAGTTTC	+	chr3L	18096917	+	chr3L	12041188	6055729	+	chr3L	18096917	+	chr3L	12041188
GCGTTTTTAAGTTATTAAGCTATTTTTTATTTTGTGAGCGAAATTTNGTACCCATGTGCG:1	GCGTTTTTAAGTTATTAAGCTA	CGAAATTTNGTACCCATGTGCG	-	chr2R	5773357	-	chr2R	5773269	88	+	chr2R	5773269	+	chr2R	5773357
GGCAGCCTATTGGAAATAAACAATTCAGTTATTTNTTATTCTGGCTTTAAATAACTTCCATTTCGTCTTAGTAAA:1	GGCAGCCTATTGGAAATAAACA	ACTTCCATTTCGTCTTAGTAAA	+	chrX	13937995	+	chrX	13941266	3271	+	chrX	13937995	+	chrX	13941266
CAAAACGAACAAAAATATGTTTTCTTTCCAATTTGAACAAATTACAACGTAACTGAATACCAAGAACACTTTAT:1	CAAAACGAACAAAAATATGTTT	CTGAATACCAAGAACACTTTAT	-	chr3R	22117522	-	chr3R	22117447	75	+	chr3R	22117447	+	chr3R	22117522
TGAGTTCTGGTAAGAAACATCGAACAGTAGGCCANAATATTATTAAAAATACCGCTATAAGATACAGTACGACGG:1	TGAGTTCTGGTAAGAAACATCG	GCTATAAGATACAGTACGACGG	+	chr2R	5363487	+	chr2R	5363565	78	+	chr2R	5363487	+	chr2R	5363565
TTTTTTCGGAGCTGCCTCCCCTGAGGACTGGCTNCTCATCTAGCCCAAGAAACAGATNACTGAT:1	TTTTTTCGGAGCTGCCTCCCCT	GCCCAAGAAACAGATNACTGAT	-	chr3R	32022426	-	chr3R	32022335	91	+	chr3R	32022335	+	chr3R	32022426
CACTTAACTGGGCAAATCTCGGTCATCGGATCCACTGGCCATCAGCTGTNCA:1	CACTTAACTGGGCAAATCTCGG	TCCACTGGCCATCAGCTGTNCA	+	chr3L	11383997	+	chr3L	11384053	56	+	chr3L	11383997	+	chr3L	11384053
GAGGCGAGGGTTCAAAAAACCAGCCGAGAACAAAACTCGCAATTCCCAAAAGGAGACAAGTCAAGATTAGC:1	GAGGCGAGGGTTCAAAAAACCA	AAGGAGACAAGTCAAGATTAGC	+	chr3R	20765097	+	chr3R	13347654	7417443	+	chr3R	20765097	+	chr3R	13347654
AAGGAGGGTAAACAAAAAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAAAAAAATGTCGAAGGAAAATTAAAT:1	AAGGAGGGTAAACAAAAAGCTC	AAATGTCGAAGGAAAATTAAAT	+	chr2L	9393512	+	chr2L	9396479	2967	+	chr2L	9393512	+	chr2L	9396479
TTACTGCATTTGACAGATNTCCTCCACCTGTCGCCTCTAGATTNGTCATNAACAGAAGCCCGCTGGCATGCTGGC:1	TTACTGCATTTGACAGATNTCC	AGAAGCCCGCTGGCATGCTGGC	+	chr2R	24647604	+	chr2R	24655161	7557	+	chr2R	24647604	+	chr2R	24655161
ATTATGAGGCTTGGCAACTTTTTTTTCGCTTCTTCTGCTTTTCCTACTTTTCCTGCTTTTCACCATTTTTC:1	ATTATGAGGCTTGGCAACTTTT	TTCCTGCTTTTCACCATTTTTC	+	chrX	20575183	+	chrX	20575257	74	+	chrX	20575183	+	chrX	20575257
TGTTGCTGTAAGGTCTGGCAATTTTAACCAGCGCTAATGTCTCT:1	TGTTGCTGTAAGGTCTGGCAAT	TTTAACCAGCGCTAATGTCTCT	+	chrX	20794919	+	chrX	6185409	14609510	+	chrX	20794919	+	chrX	6185409
AAATATTCATTGCCATTGGAAATGATATTAATATAATNTTAATAANAATTTTATTTTCGATATACAAGNTTATA:1	AAATATTCATTGCCATTGGAAA	ATTTTCGATATACAAGNTTATA	-	chrX	1187361	-	chrX	21034935	19847574	+	chrX	21034935	+	chrX	1187361
AGTGAGGACCCCAGAATGGATGTGTGGCTTTGCTATAGTTGTATGCCTTATGGTGTCCATATACCACTACTATTT:1	AGTGAGGACCCCAGAATGGATG	TGTCCATATACCACTACTATTT	+	chr3L	11864570	+	chr3L	11865865	1295	+	chr3L	11864570	+	chr3L	11865865
CGGGAATGAATGGAAAGCCACTTTGGAAAGCCACATTCGANAATTGGTCACAATGGTAGGCGACTA:1	CGGGAATGAATGGAAAGCCACT	TGGTCACAATGGTAGGCGACTA	-	chr3L	3594495	-	chr3L	18553406	14958911	+	chr3L	18553406	+	chr3L	3594495
ACATATATGCTACGACTGCTATTTGTATATATATATATGTATATAAAGGCGGAGAACGTTACTCAAGACCGATG:1	ACATATATGCTACGACTGCTAT	AGAACGTTACTCAAGACCGATG	+	chr2R	17785095	+	chr2R	17785182	87	+	chr2R	17785095	+	chr2R	17785182
TCAGGACACGCTTGCTGCCTTTTGTTTTTTGCATGCCTGTTGTTGGCCCGAAACCATCGCACTATAGGC:1	TCAGGACACGCTTGCTGCCTTT	CCGAAACCATCGCACTATAGGC	-	chr3R	17521732	-	chr3R	17521578	154	+	chr3R	17521578	+	chr3R	17521732
ATGTGTATAATTTTATCTTTTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	ATGTGTATAATTTTATCTTTTT	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	7241010	+	chr2L	16217660	8976650	+	chr2L	7241010	+	chr2L	16217660
AGGATTTACGCTGTTCTTTCGGCTGTGCAACGCGTAAAATTAAATAAATTCAGAA:1	AGGATTTACGCTGTTCTTTCGG	GTAAAATTAAATAAATTCAGAA	+	chrX	6291132	+	chrX	669014	5622118	+	chrX	6291132	+	chrX	669014
TTCATCGCATTTCACTTCNTTCACTTTTTGGCAACAGAACANAAANGCAAAATAAAAGAAAAGGAAAAAAAAAAA:1	TTCATCGCATTTCACTTCNTTC	AAAAGAAAAGGAAAAAAAAAAA	-	chrX	6414889	-	chrX	11967096	5552207	+	chrX	11967096	+	chrX	6414889
GCGCATTCGCATTCGAATTTGTTTGCGGTAAAAGGGGGTGGTGAAACGGA:1	GCGCATTCGCATTCGAATTTGT	TAAAAGGGGGTGGTGAAACGGA	+	chr2L	15358981	+	chr2L	15359041	60	+	chr2L	15358981	+	chr2L	15359041
CAAGAACAAAGTGAAGTCGCTGCAGTACCGTTTTTGGGGGAAAGAGTCAATTTTTGGCAATATTTTGAAACGTAC:1	CAAGAACAAAGTGAAGTCGCTG	TTGGCAATATTTTGAAACGTAC	+	chr2R	8864884	+	chr2R	8865117	233	+	chr2R	8864884	+	chr2R	8865117
TGGGTCACTTGAAAAGGTTCTTCTTCTGGGACACAGTTTTGTGGTTTTGCTACCTTTGACCGCATTGCTTGAT:1	TGGGTCACTTGAAAAGGTTCTT	ACCTTTGACCGCATTGCTTGAT	+	chr2L	15031578	+	chr2L	15031816	238	+	chr2L	15031578	+	chr2L	15031816
ATACTATGGCTTGTACTCAGATACCAAGGAAACAGATATTCATACCTCAAAGCACTTTGTAATTCCCAATTTGTT:1	ATACTATGGCTTGTACTCAGAT	ACTTTGTAATTCCCAATTTGTT	+	chrX	6003298	+	chrX	6003379	81	+	chrX	6003298	+	chrX	6003379
CTGCTTTCTGAGCAAANAGGAGANGAGAGAACTNGCAANGAGAGAATACAAATAGCTTGAAANGAGTTTAATG:1	CTGCTTTCTGAGCAAANAGGAG	ATAGCTTGAAANGAGTTTAATG	+	chr3R	3267438	+	chr3R	3267255	183	+	chr3R	3267438	+	chr3R	3267255
TGAGATATTGATATATATTATATATATTTCAGTGAGTTACCCTTNAAAAATGACCGAACTTTTCCAGATTAAC:1	TGAGATATTGATATATATTATA	GACCGAACTTTTCCAGATTAAC	-	chr2L	13456897	-	chr2L	13449463	7434	+	chr2L	13449463	+	chr2L	13456897
TGTATGTATATCTTTGTGCTCTGGGCAAATATTTTGACCGAAAATTTATTGAACATTTCCTTGGCTGAGCAAGTG:1	TGTATGTATATCTTTGTGCTCT	CATTTCCTTGGCTGAGCAAGTG	-	chrX	10343659	-	chrX	10343467	192	+	chrX	10343467	+	chrX	10343659
GAGATTAAAATTTACAATTTAATTGAGTATCTCTGTAGTGTAAGAAATGTTTTTGTATTCGCTTAACTTATTGA:1	GAGATTAAAATTTACAATTTAA	TTGTATTCGCTTAACTTATTGA	+	chr2L	12693852	+	chr2L	12693928	76	+	chr2L	12693852	+	chr2L	12693928
GCTCCATATCCTTGATTTCAATGGGAAGATAATTTCCTTTTCATTCTCTTAAACGTCAAAAAGTTCAACGTGAG:1	GCTCCATATCCTTGATTTCAAT	ACGTCAAAAAGTTCAACGTGAG	+	chr2L	17692970	+	chr2L	17693083	113	+	chr2L	17692970	+	chr2L	17693083
GTGATCATTCCCCTTTCAATTTCCCGACAGCTTGTCACTGAAGACAGCTGGTGTGCCGGTGCTGTCAATTT:1	GTGATCATTCCCCTTTCAATTT	GGTGTGCCGGTGCTGTCAATTT	+	chr3R	15811503	+	chr3R	15811740	237	+	chr3R	15811503	+	chr3R	15811740
GGCCACTGTTCTCATCTCTGNCTGCCAGCNCCCAGGATTAACGAGCGG:1	GGCCACTGTTCTCATCTCTGNC	AGCNCCCAGGATTAACGAGCGG	-	chr3R	25744783	-	chr3R	25706360	38423	+	chr3R	25706360	+	chr3R	25744783
ATGTGTAGCTAGTATTCTCTGAAGAAATCGTAAATAATAATAATAATAAATGCCTATGAAAAACAACATTTTTAT:1	ATGTGTAGCTAGTATTCTCTGA	CTATGAAAAACAACATTTTTAT	-	chr3R	25861919	-	chr3R	25861842	77	+	chr3R	25861842	+	chr3R	25861919
CATGCGCAAAATTCCACAGCCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	CATGCGCAAAATTCCACAGCCA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	6414068	+	chr3R	21907535	15493467	+	chr3R	6414068	+	chr3R	21907535
ACTGCCCTGGCAATTTAGCAAAGTTGCCCACTTTTTGTTACACCA:1	ACTGCCCTGGCAATTTAGCAAA	TTGCCCACTTTTTGTTACACCA	-	chr2L	14564272	-	chr2L	14564226	46	+	chr2L	14564226	+	chr2L	14564272
TAAGAAAAAAAGGAAGAAATGAAAACCAAAANGAGAACGACGCCAAATTCAAATCGCGAACTGCTTAAAAATNAA:1	TAAGAAAAAAAGGAAGAAATGA	TCGCGAACTGCTTAAAAATNAA	+	chr2R	17236520	+	chr2R	17241724	5204	+	chr2R	17236520	+	chr2R	17241724
AATATATAATATCGTTTCTAATCAGGTTTATATATACTTACATATGTGCCTCGGCTATCCTAATCCGTATC:1	AATATATAATATCGTTTCTAAT	CTCGGCTATCCTAATCCGTATC	-	chr3R	6519375	-	chr3R	6520867	1492	+	chr3R	6520867	+	chr3R	6519375
GAATGACTTCAACTCGAAGTGAGTACGCCCNNNCNACCCATATTAAGTTATTTTTTTTTTAAACTTTATTTACAT:1	GAATGACTTCAACTCGAAGTGA	TTTTTTTAAACTTTATTTACAT	-	chr2R	12643873	-	chr2R	12643797	76	+	chr2R	12643797	+	chr2R	12643873
GTCCGCATGGCAACAGTATAGAAAATTGCACGGAATGTTTAGCCATTTAAACCGAGGGAACTCAATAGGCG:1	GTCCGCATGGCAACAGTATAGA	AACCGAGGGAACTCAATAGGCG	-	chr3R	26211294	-	chr3R	26211206	88	+	chr3R	26211206	+	chr3R	26211294
CATTGTCATTGAATTGTGAGGGGAATGGCATTCGCTGATTACGCTGCACATTAATTTAACCATTCCATTCTGGCA:1	CATTGTCATTGAATTGTGAGGG	ATTTAACCATTCCATTCTGGCA	-	chr3R	6610209	-	chr3R	6610057	152	+	chr3R	6610057	+	chr3R	6610209
ATGTTAGTGTGCCTTCGCAGGAGCGGGCATTCACTTAGTTCAAAAGTCGAGGGCAAACAGAGAAATAGTGAGGCC:1	ATGTTAGTGTGCCTTCGCAGGA	CAAACAGAGAAATAGTGAGGCC	-	chr2L	968886	-	chr2L	968807	79	+	chr2L	968807	+	chr2L	968886
GTCAGCTATAAATTTGCTCAGCTCTAAAACCAAGCATATTCAAAATTCACACACACCTGGCNCCATCCACGCCCA:1	GTCAGCTATAAATTTGCTCAGC	CACCTGGCNCCATCCACGCCCA	-	chrX	4275770	-	chrX	3532801	742969	+	chrX	3532801	+	chrX	4275770
CTTGGCCAACGGAGAGAAGTTCCTCAGAAATGCTGTTAACATTGAAATGTCATAATTCCTATCACATTTCAAGTG:1	CTTGGCCAACGGAGAGAAGTTC	AATTCCTATCACATTTCAAGTG	-	chr2L	3150349	-	chr2L	11334158	8183809	+	chr2L	11334158	+	chr2L	3150349
CCCCCAAATATTTTCGCGTCGTTTTTGCCTTTTTTTTT:1	CCCCCAAATATTTTCGCGTCGT	CGTCGTTTTTGCCTTTTTTTTT	-	chr3R	23496794	-	chr3R	31938173	8441379	+	chr3R	31938173	+	chr3R	23496794
AATTTATGGGTTCCTTGTATCATATTTTATTTGGTATAATGCATGTGAGATTCAGCCTCTACAGCCAGATAAAGC:1	AATTTATGGGTTCCTTGTATCA	AGCCTCTACAGCCAGATAAAGC	+	chr3R	19448552	+	chr3R	19449347	795	+	chr3R	19448552	+	chr3R	19449347
CGTCAAAAGAAAAAACTGGATAAGATAACCAATGCTACAGTTTATAGTCTCTTTTATGCNGAAAAGCAAAA:1	CGTCAAAAGAAAAAACTGGATA	TCTTTTATGCNGAAAAGCAAAA	-	chr3R	8107543	-	chr3R	8107413	130	+	chr3R	8107413	+	chr3R	8107543
AACGGATTATTTTAGTAAATGACTCCATTTCTGCCTTCGTTTTTCAAATCAAGTTCAAT:1	AACGGATTATTTTAGTAAATGA	CGTTTTTCAAATCAAGTTCAAT	+	chr2R	6493497	+	chr2R	6493377	120	+	chr2R	6493497	+	chr2R	6493377
TCATTAATAGATACGTTAAGAGTTTTTGTTTTGGCAAAAGGATACGCTACGATGGGCGCCGTGTCCTTGATGTTG:1	TCATTAATAGATACGTTAAGAG	GGGCGCCGTGTCCTTGATGTTG	+	chrX	9337969	+	chrX	9338061	92	+	chrX	9337969	+	chrX	9338061
CGAAGTTCCGCTGCATTAAGTAGCAAGCGGATTTAGCAAAGGGCTGCGGATTGTTATTATACTCATGTTTATAAG:1	CGAAGTTCCGCTGCATTAAGTA	TTATTATACTCATGTTTATAAG	+	chr3R	30331318	+	chr3R	22142075	8189243	+	chr3R	30331318	+	chr3R	22142075
AGAAAAACCTTGAATGAACGGGCAAATAAAACAGACGGTCTATGAAACGCATTTAACTTGCATTTTATTTTGTCT:1	AGAAAAACCTTGAATGAACGGG	TAACTTGCATTTTATTTTGTCT	-	chr2R	25061427	-	chr2R	25061344	83	+	chr2R	25061344	+	chr2R	25061427
CGTCACATGGCCATAGTCCAAAACCATCGCCCNACCATCATAGTCGTACCCATAAACAGCGA:1	CGTCACATGGCCATAGTCCAAA	TAGTCGTACCCATAAACAGCGA	+	chr2L	20059246	+	chr2L	17497944	2561302	+	chr2L	20059246	+	chr2L	17497944
ACAATGTAGCGCACTTACAAACGTTAAGTAATACTACTTTTGAATGACCACAGGACTTGTGCCCTAATCTCTGTG:1	ACAATGTAGCGCACTTACAAAC	GACTTGTGCCCTAATCTCTGTG	-	chr2L	4953760	-	chr2L	4953519	241	+	chr2L	4953519	+	chr2L	4953760
TAAATAACTTAAATTGCTTCGTTAAAAGTGATTCACCNATTCAAAAGTGGTTTATCTAAATTAACCAAAATTAG:1	TAAATAACTTAAATTGCTTCGT	TATCTAAATTAACCAAAATTAG	-	chr2R	14911847	-	chr2R	14911725	122	+	chr2R	14911725	+	chr2R	14911847
GATTGAAGTGTTGGCGAAATATTTGCTATCAACCGAAAAAGGGTGATAANACTTTGATTAATATAAGCGAGCTAA:1	GATTGAAGTGTTGGCGAAATAT	TTGATTAATATAAGCGAGCTAA	+	chr2R	23243263	+	chr2R	23243352	89	+	chr2R	23243263	+	chr2R	23243352
CAAGCAGCTAAAATGTGAAAATGTATAACAAATATATTAGCATTGAACACATGATTAAATANGAAAACTATGCAA:1	CAAGCAGCTAAAATGTGAAAAT	ATTAAATANGAAAACTATGCAA	-	chr2R	23190125	-	chr2R	23190045	80	+	chr2R	23190045	+	chr2R	23190125
TCCCGCCGCCCCACCATCCCGCCACCATCACCACGTCTGCGGCTTATTAGGTGCGGAAATCTTTATTGAT:1	TCCCGCCGCCCCACCATCCCGC	AGGTGCGGAAATCTTTATTGAT	-	chr3L	22411456	-	chr3L	22411384	72	+	chr3L	22411384	+	chr3L	22411456
TGCTCCGTACAGCAACCTGGTCTCAGCTCAACTCAGCAGGTGAGTTCGGTTTCCGCCCGAAAGTATGCCGTAATT:1	TGCTCCGTACAGCAACCTGGTC	CGCCCGAAAGTATGCCGTAATT	+	chr3R	6206297	+	chr3R	6206514	217	+	chr3R	6206297	+	chr3R	6206514
TGACGAGGGTCTATTAGCGAAATCAATGCCATTATGGCTGATAGTGGAGGACCGATCATGTGCGCGATGGCGACG:1	TGACGAGGGTCTATTAGCGAAA	GATCATGTGCGCGATGGCGACG	+	chr2L	5109113	+	chr2L	1116935	3992178	+	chr2L	5109113	+	chr2L	1116935
ACATATGCGATCGCAAGTCGCGCACCCTGCTCACAGCGCCCTATCATGTATAGTCCGACAATTCTGTCATCA:1	ACATATGCGATCGCAAGTCGCG	TAGTCCGACAATTCTGTCATCA	+	chr3L	7363630	+	chr3L	7355720	7910	+	chr3L	7363630	+	chr3L	7355720
GAAGAACTTTAATAGAATTTATCCATTTGTAGAACACCCAGAAGCCCCGCAACGTGCTCCACTCACTGCGTCTGA:1	GAAGAACTTTAATAGAATTTAT	GTGCTCCACTCACTGCGTCTGA	-	chr2L	8510225	-	chr2L	8510136	89	+	chr2L	8510136	+	chr2L	8510225
GCCGCTACAATTACCCGAAACATCATAGCTATCCAAAGGATAGTTTAGANAAGAAATATTCGATTAGCACTACGT:1	GCCGCTACAATTACCCGAAACA	AAATATTCGATTAGCACTACGT	-	chrX	4598288	-	chrX	4598208	80	+	chrX	4598208	+	chrX	4598288
TGTTACAAACTTTCTAGCCATCTATTTTCTATATCAAATATCCTCTGTACGAAACCTCATTTGCAAACACATA:1	TGTTACAAACTTTCTAGCCATC	AAACCTCATTTGCAAACACATA	+	chr3R	9108877	+	chr3R	9108951	74	+	chr3R	9108877	+	chr3R	9108951
TAAATCCAGTAAAATGGGAAACAGCATTTTACATAAACCGACTGCTGATGTCAGTTTAATGCACTTTAGCATATG:1	TAAATCCAGTAAAATGGGAAAC	GTTTAATGCACTTTAGCATATG	-	chr3R	10919763	-	chr3R	10919685	78	+	chr3R	10919685	+	chr3R	10919763
TTACTGTATTATTTGTATGTATTTATTTTGCTGGCTCCGGTTTTGTGGTCCATATATTCGTNGTAGAAAGTATTT:1	TTACTGTATTATTTGTATGTAT	ATATTCGTNGTAGAAAGTATTT	-	chr3L	15209159	-	chr3L	15209073	86	+	chr3L	15209073	+	chr3L	15209159
GTATTAAAGTGAGAAAAACATTTCTCAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1	GTATTAAAGTGAGAAAAACATT	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	6289727	-	chr2L	16071771	9782044	+	chr2L	16071771	+	chr2L	6289727
CACAAAAAACAAAACCAAAAGGGGGACTACCTTTTCTTTTGCCCTCGTGCCACATTG:1	CACAAAAAACAAAACCAAAAGG	CTTTTGCCCTCGTGCCACATTG	+	chr2R	12504173	+	chr2R	12504232	59	+	chr2R	12504173	+	chr2R	12504232
GCAAAGTTATGAATGAAAACGAAGCGTTACNNNANTAGAAATTGCTCTGCGGAGCGGGCAAAAATGAAAAAGCGG:1	GCAAAGTTATGAATGAAAACGA	GCGGGCAAAAATGAAAAAGCGG	+	chr2R	18590893	+	chr2R	18600045	9152	+	chr2R	18590893	+	chr2R	18600045
CGCACTTTTCCCATTTCCCTCCCACAGGCACAACCACACACACACACAAACACTTGGAATAGCTAATGCTGACA:1	CGCACTTTTCCCATTTCCCTCC	CTTGGAATAGCTAATGCTGACA	-	chr2R	12703094	-	chr2R	8964284	3738810	+	chr2R	8964284	+	chr2R	12703094
CAATGACATCATGGCAAGCATTCATAATGCTCACCCGGTGGCCATGTNAAAATGCCATTTTNATGTGGCACACGC:1	CAATGACATCATGGCAAGCATT	GCCATTTTNATGTGGCACACGC	+	chr3R	17348743	+	chr3R	17348832	89	+	chr3R	17348743	+	chr3R	17348832
CACCAGCAAGTAGCACCACTCCTTTGGTAACCAAACAGAAGCCAANCACGCACGCGATACANTTCCAGACCAGG:1	CACCAGCAAGTAGCACCACTCC	CGCGATACANTTCCAGACCAGG	-	chr2R	8996533	-	chr2R	12777495	3780962	+	chr2R	12777495	+	chr2R	8996533
AGTAATATNTGTGATTAATTTGGTTGCTGTTGTTGNTGTTTCTCTGGCGGACTTCACGAAGTCATCAGTCGCAGG:1	AGTAATATNTGTGATTAATTTG	TCACGAAGTCATCAGTCGCAGG	+	chr3R	8480465	+	chr3R	8480724	259	+	chr3R	8480465	+	chr3R	8480724
GTGCAAGTGAAGCCAAAATAACAACATTCATTGCGATTGCCACCCAGCGAATAACAATGGATTAAAGGGCATCAG:1	GTGCAAGTGAAGCCAAAATAAC	ACAATGGATTAAAGGGCATCAG	+	chr3R	6964601	+	chr3R	6964700	99	+	chr3R	6964601	+	chr3R	6964700
TCTCTTTGCTAAAAATAAAATCGTTCGGCAAAAAACAGCCCGACACAGCCATAATCTTATCGCTATCAAAATAT:1	TCTCTTTGCTAAAAATAAAATC	AATCTTATCGCTATCAAAATAT	-	chr3R	16275911	-	chr3R	16275597	314	+	chr3R	16275597	+	chr3R	16275911
TTAAAAATAGTGCAGACGAGACTGTCATCTCTCTAGCATTAATGTCTCTTTGCGTAAACAATTTTAATTTCCCAA:1	TTAAAAATAGTGCAGACGAGAC	GTAAACAATTTTAATTTCCCAA	-	chr3R	19366141	-	chr3R	10998558	8367583	+	chr3R	10998558	+	chr3R	19366141
GTTCATTCAACTGTCAAAAAAGCACTATACACACACGTGGAAAGGGGCAGAGACAAAAGGGGAGTAAGCCGAGA:1	GTTCATTCAACTGTCAAAAAAG	ACAAAAGGGGAGTAAGCCGAGA	-	chr3R	6410303	-	chr3R	9164220	2753917	+	chr3R	9164220	+	chr3R	6410303
ATGTTTGGAAAAAAATATATATAAATAGGGATTGGAAACAAAATATATCTGCTTTAATATAAATTCATTTATTTG:1	ATGTTTGGAAAAAAATATATAT	TTAATATAAATTCATTTATTTG	-	chr3L	11678193	-	chr3L	11678106	87	+	chr3L	11678106	+	chr3L	11678193
AATACAAACCCACACCACCCACGGATCCAAGGACATGGAAATACAGCCAGATGGAGCAGCGAATCTAAGCGGCG:1	AATACAAACCCACACCACCCAC	GGAGCAGCGAATCTAAGCGGCG	-	chr2R	17115288	-	chr2R	8915024	8200264	+	chr2R	8915024	+	chr2R	17115288
GTGTGAACTTCCAGCTGAAACAAAAATTTGCCTTTAGTAGCAACATTTTGCGTTTTATTACCATCTTAACCTCAT:1	GTGTGAACTTCCAGCTGAAACA	TTTATTACCATCTTAACCTCAT	-	chr2L	2873518	-	chr2L	2873440	78	+	chr2L	2873440	+	chr2L	2873518
CTAAAACGTTATTGATATGTACGAAGCATGCTCACACCTTCTCCAAAAAACAAAAAAACAGAAGAAAACTCCTCC:1	CTAAAACGTTATTGATATGTAC	AAAAACAGAAGAAAACTCCTCC	-	chr3R	30686986	-	chr3R	30679517	7469	+	chr3R	30679517	+	chr3R	30686986
TATGAGTATCTTGATATACACACTTTGCTGTTAGGTGATTCTAGCACAATTTG:1	TATGAGTATCTTGATATACACA	TAGGTGATTCTAGCACAATTTG	+	chr2R	17176383	+	chr2R	17182551	6168	+	chr2R	17176383	+	chr2R	17182551
TTCTGCATCTCTGGATGCTTNGCCATCTCGTANAGGGCATCCNTGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAGAG:1	TTCTGCATCTCTGGATGCTTNG	AAGCCGGCGCTGCTTTTGAGAG	-	chr2R	12187488	-	chr2R	12190104	2616	+	chr2R	12190104	+	chr2R	12187488
TACCTTGAAGGGAATTTTTGTTTGGATGCTGGCTAATCCCCTGCATCCTCGACTGTTTCAACGAGATCCATAACT:1	TACCTTGAAGGGAATTTTTGTT	TGTTTCAACGAGATCCATAACT	+	chr2R	17045607	+	chr2R	23503588	6457981	+	chr2R	17045607	+	chr2R	23503588
TGACAAAACATTAAAATCAGCAAAAAAAAATTTTTGGTCGCTTTTGATGCCGGTNGCATTT:1	TGACAAAACATTAAAATCAGCA	GCTTTTGATGCCGGTNGCATTT	-	chr3L	22166529	-	chr3L	22166465	64	+	chr3L	22166465	+	chr3L	22166529
ATTTAAATTTAAAATTAANAAACGTTACAGTTTGAAATTTCTGNTAGATNTTCGAGCTCAATCCATTTTATACAT:1	ATTTAAATTTAAAATTAANAAA	GAGCTCAATCCATTTTATACAT	+	chr2R	12274874	+	chr2R	22807238	10532364	+	chr2R	12274874	+	chr2R	22807238
CACCAACACAAGGTAAACTCCAAACTGTGGCTTGAAACCCGAACCAGAACCGGAATTTGAGCCCATCAAGCAATG:1	CACCAACACAAGGTAAACTCCA	AATTTGAGCCCATCAAGCAATG	+	chr3L	17185249	+	chr3L	13853533	3331716	+	chr3L	17185249	+	chr3L	13853533
GTTGCTCTTCGTAACAATCGCATTTGAGTTGCTGTCAGATGCTTTAAAGTTGACGTAAGGTTAGAACTCAATGTT:1	GTTGCTCTTCGTAACAATCGCA	CGTAAGGTTAGAACTCAATGTT	+	chr2R	5491724	+	chr2R	5491865	141	+	chr2R	5491724	+	chr2R	5491865
ACGTATATATTCTATATTTTAATATTAATACTGTGTGAGATGACTTAACAG:1	ACGTATATATTCTATATTTTAA	ACTGTGTGAGATGACTTAACAG	-	chr3R	19716292	-	chr3R	19716239	53	+	chr3R	19716239	+	chr3R	19716292
GGTCTCCAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCTGACATCGACCGCCCCCTGAAGGCCGAAGTCCAACGCCCA:1	GGTCTCCAATTTAATCTTTTGA	GAAGGCCGAAGTCCAACGCCCA	-	chr3R	11846251	-	chr3R	11841060	5191	+	chr3R	11841060	+	chr3R	11846251
CAAACCCGACCAAAATCGAGCTAAAACAAATGGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTGTGCAGCCCT:1	CAAACCCGACCAAAATCGAGCT	GAGAATGGTGTTGTGCAGCCCT	+	chr3L	4190565	+	chr3L	26032634	21842069	+	chr3L	4190565	+	chr3L	26032634
TATAACTCAACCATTCCGTTTTTAATGTAATGGAAAACCACATACCCATATTACTCCACAAGTACCGGATATTAA:1	TATAACTCAACCATTCCGTTTT	CTCCACAAGTACCGGATATTAA	-	chr3L	9356823	-	chr3L	9356747	76	+	chr3L	9356747	+	chr3L	9356823
ATAGTTTTTCTATTCCTTACGCTGCTATACTTGTTTTTTGTGGCAAAAATTAAACAAACATGGCCGACTGCGG:1	ATAGTTTTTCTATTCCTTACGC	AAACAAACATGGCCGACTGCGG	+	chr3R	7401756	+	chr3R	7401860	104	+	chr3R	7401756	+	chr3R	7401860
AAACAAAAAAAAAAAGGCGGAAAAAAAAGATCCCGGGAGAGAGCGTCATAACGATGCTGCCAGGTGTGATGG:1	AAACAAAAAAAAAAAGGCGGAA	ACGATGCTGCCAGGTGTGATGG	+	chrX	8384295	+	chrX	14716586	6332291	+	chrX	8384295	+	chrX	14716586
GGTCGTTTTTTCGTCATTCTCCCTTTTT:1	GGTCGTTTTTTCGTCATTCTCC	TTTTTCGTCATTCTCCCTTTTT	+	chr2R	9641855	+	chr2R	13464498	3822643	+	chr2R	9641855	+	chr2R	13464498
TATGCCTTTGAAGAGGGAATTTCAGCTCGATGTTCGACCTTAGCCCGTGTGCTTCATTAATCAAAAGTAATTTT:1	TATGCCTTTGAAGAGGGAATTT	TTCATTAATCAAAAGTAATTTT	+	chr3R	25689131	+	chr3R	25689238	107	+	chr3R	25689131	+	chr3R	25689238
ATATAGAAAAAGATGCTTTCAAACAAACTAAACTATTGCATCTACTTAAAATTGGTTTGTCTTTTTAGAGTGAAA:1	ATATAGAAAAAGATGCTTTCAA	GGTTTGTCTTTTTAGAGTGAAA	+	chr2L	14839768	+	chr2L	14839844	76	+	chr2L	14839768	+	chr2L	14839844
AAAACTGCCAACTCCCACACACAAAAAAAAAGGAAAAAATCAGCACATGGAACAGGAAGTTCACAAGGATTGGGG:1	AAAACTGCCAACTCCCACACAC	AGGAAGTTCACAAGGATTGGGG	-	chrX	4540398	-	chrX	524392	4016006	+	chrX	524392	+	chrX	4540398
CAGACCGCTGAGCATGTAAGTATGCTACCANNNCNTAACCCTTCTATAAAATTGCTGCCTGCATTTGTCACGCCA:1	CAGACCGCTGAGCATGTAAGTA	GCTGCCTGCATTTGTCACGCCA	+	chr3R	8403019	+	chr3R	8412185	9166	+	chr3R	8403019	+	chr3R	8412185
GGACAGGACAGGACAGGACAGGACAAGACAGGACAGGACAGGA:1	GGACAGGACAGGACAGGACAGG	GACAAGACAGGACAGGACAGGA	-	chrX	4067988	-	chrX	10754861	6686873	+	chrX	10754861	+	chrX	4067988
AATATCTCAACCGCTTATCTCCCCGTATCTCTATTTCTGGGTGTTTTTTTGTTT:1	AATATCTCAACCGCTTATCTCC	ATTTCTGGGTGTTTTTTTGTTT	-	chr3L	12018751	-	chr3L	10851187	1167564	+	chr3L	10851187	+	chr3L	12018751
GTGCAGCGCGTGTGCCACATAAAAATGGCATTTTGACATGGCCACCGGGTGAGCATTATGAATGCTTGCCATG:1	GTGCAGCGCGTGTGCCACATAA	AGCATTATGAATGCTTGCCATG	-	chr3R	17348839	-	chr3R	17348752	87	+	chr3R	17348752	+	chr3R	17348839
AANACTTTCCTATTTAAAGCTTTGCACTAACTGGNANGGCAATAGTTACAAACGATTGGAAGACGCAGCGCTTA:1	AANACTTTCCTATTTAAAGCTT	CGATTGGAAGACGCAGCGCTTA	+	chr2L	1711366	+	chr2L	1711689	323	+	chr2L	1711366	+	chr2L	1711689
CTGTTGAATATCGTTTAGTTATATAATACCAAACATGCAATTAAAAAAAGAATCTAGATTTATTGTCTGCCATAT:1	CTGTTGAATATCGTTTAGTTAT	CTAGATTTATTGTCTGCCATAT	-	chr3R	17188568	-	chr3R	22509601	5321033	+	chr3R	22509601	+	chr3R	17188568
AATAAAGCAAAGAACCTGACAAACTTCGAACGTTGTATGAATAATTTCCCACCTCGTAAAAATTGCATGATTAAT:1	AATAAAGCAAAGAACCTGACAA	TCGTAAAAATTGCATGATTAAT	+	chr2L	18496692	+	chr2L	18496774	82	+	chr2L	18496692	+	chr2L	18496774
GCTGGCTGATAGCTGTCCATATTAAAAAGGGTAATCCTATCGTGATAGTNTTACCATGTACTAGATACCACAAAA:1	GCTGGCTGATAGCTGTCCATAT	CCATGTACTAGATACCACAAAA	-	chr2R	11425828	-	chr2R	11425741	87	+	chr2R	11425741	+	chr2R	11425828
CACAGGAAACTTTATTCCGCTCGATTTTAGGGCAACCTAGTGCACNTAAAGGACAATCAGGNGTACAGA:1	CACAGGAAACTTTATTCCGCTC	AAAGGACAATCAGGNGTACAGA	+	chr2L	19561360	+	chr2L	19561495	135	+	chr2L	19561360	+	chr2L	19561495
TTTTGAAGCCAGACGGACGCAGAAATTGCTGTTTATTTTTTAATGAAAGCATTTTAATATATGGTATAAATATTT:1	TTTTGAAGCCAGACGGACGCAG	TTAATATATGGTATAAATATTT	-	chr3L	27266880	-	chr3L	27266776	104	+	chr3L	27266776	+	chr3L	27266880
TCTGTCACTTAACGCTTACCATTTATTTGCCTAAAGACCCGAACATTACCTCATACTGATCATTACCACTGTTTG:1	TCTGTCACTTAACGCTTACCAT	TACTGATCATTACCACTGTTTG	-	chr2R	11473877	-	chr2R	11472680	1197	+	chr2R	11472680	+	chr2R	11473877
ATAATATTGGATTCAGTTGATATTCCGAGTAGCGCACTGCTTCCTGAAGGGCAGCAACAAATTTATAGGAGTGCA:2	ATAATATTGGATTCAGTTGATA	GCAACAAATTTATAGGAGTGCA	+	chr2L	21981694	+	chr2L	21990859	9165	+	chr2L	21981694	+	chr2L	21990859
TTTGATTGCAAATGTTTGCTTTGTTGTTATTGACACAATGCAAATTATCATTTGAGGTTTTCCAGACTGCCACGC:1	TTTGATTGCAAATGTTTGCTTT	GAGGTTTTCCAGACTGCCACGC	-	chr3L	7889040	-	chr3L	7886522	2518	+	chr3L	7886522	+	chr3L	7889040
AACACCAAATTTTTAAACAAAGACCAAATTGAGAATTGACTGAGAATTACGTTTTTGATACATAATCGCCAA:1	AACACCAAATTTTTAAACAAAG	GTTTTTGATACATAATCGCCAA	+	chrX	1200060	+	chrX	1200135	75	+	chrX	1200060	+	chrX	1200135
AAAACGAANAGTCCAGGATAGCACTTCACACCGACTTCAGGCTAGAGTTTATGCATTATCAAGACAGTTTGAGTG:1	AAAACGAANAGTCCAGGATAGC	CATTATCAAGACAGTTTGAGTG	+	chr3R	25431941	+	chr3R	25432031	90	+	chr3R	25431941	+	chr3R	25432031
CTTTAATTGTCTTATTCAACAAATTTAACATAACACAAAAAAACCTATAAGGGAAATTCCTTATTTCTTTAAATT:1	CTTTAATTGTCTTATTCAACAA	AAATTCCTTATTTCTTTAAATT	+	chr2R	10257189	+	chr2R	10257280	91	+	chr2R	10257189	+	chr2R	10257280
CTTCCGCATCCTCTTGCTCCTCTTTCTATATAACTTTGTTATTGGCTCCCATTGAGGT:1	CTTCCGCATCCTCTTGCTCCTC	TGTTATTGGCTCCCATTGAGGT	-	chr3L	7855009	-	chr3L	5685725	2169284	+	chr3L	5685725	+	chr3L	7855009
TAAAATGAATGCGTTTTTAATTTGGCATAAGCTCGACTGGCCAAGTAGCTGCTTTGAATACGAGTGTCCGATTG:1	TAAAATGAATGCGTTTTTAATT	TTTGAATACGAGTGTCCGATTG	-	chr3R	27370331	-	chr3R	27370126	205	+	chr3R	27370126	+	chr3R	27370331
GGTGCAAAAGGATGCGTTTGGGTAATTTCAGCCAGGGCGAAAGATATACGGCCCTCCCACTTCACCGCTTTAATG:1	GGTGCAAAAGGATGCGTTTGGG	CTCCCACTTCACCGCTTTAATG	+	chr2L	1993225	+	chr2L	1993311	86	+	chr2L	1993225	+	chr2L	1993311
TAAGGTATTACTGAAACTAAAGTCTTATCTTATGCCTCACNTGCTGTTT:1	TAAGGTATTACTGAAACTAAAG	TCTTATGCCTCACNTGCTGTTT	+	chr2R	24383856	+	chr2R	24383911	55	+	chr2R	24383856	+	chr2R	24383911
AACTTTCGAGCATATCTCAATGTTTGCCTGCCTCAATGGCCTGGCTTTCATCTAAATAAATTACTCGAAATTCTT:1	AACTTTCGAGCATATCTCAATG	AAATAAATTACTCGAAATTCTT	+	chr3R	27494345	+	chr3R	27494464	119	+	chr3R	27494345	+	chr3R	27494464
TCATACTGCCTGGATGAGCATGGCAATAACACAAACTAAATGGAAACTACGTTCGCAGGGCCAAAANTGAGATGG:1	TCATACTGCCTGGATGAGCATG	CGCAGGGCCAAAANTGAGATGG	+	chrX	14636484	+	chrX	14641925	5441	+	chrX	14636484	+	chrX	14641925
TGTGCCAATGGGAATGGTTGGGACCACTGTTGTCCTGTAATTAAATAATGCCA:1	TGTGCCAATGGGAATGGTTGGG	GTCCTGTAATTAAATAATGCCA	+	chrX	10550887	+	chrX	10552332	1445	+	chrX	10550887	+	chrX	10552332
TCATCCCTTATCACATTTATGACAGTCATACGTGGAACGCAAGGTTCCACGTCTTCAC:1	TCATCCCTTATCACATTTATGA	ACGCAAGGTTCCACGTCTTCAC	-	chr3R	31430815	-	chr3R	31430744	71	+	chr3R	31430744	+	chr3R	31430815
ATAAACTGGACAACACATATGACATGCTTATAGCCATAATCACTTTAATTGGGTGCGAAAACTCAAGTGTTTGCA:1	ATAAACTGGACAACACATATGA	TGCGAAAACTCAAGTGTTTGCA	+	chr2L	13701888	+	chr2L	13701968	80	+	chr2L	13701888	+	chr2L	13701968
CCTGACCAATCGCCATGGAAACTATTACCCCTTTTTTTCAGCTTTTCCGAAGGGCTACTCCCGACATGGAAAA:1	CCTGACCAATCGCCATGGAAAC	GGGCTACTCCCGACATGGAAAA	+	chr2R	21894253	+	chr2R	21879778	14475	+	chr2R	21894253	+	chr2R	21879778
AAAAATAGNGCCCGAGGGATATGTGGGGATATGTGTCGGCTATGATTCAATTACTAACAAGTTTTGCATATTAAT:1	AAAAATAGNGCCCGAGGGATAT	CTAACAAGTTTTGCATATTAAT	+	chr2L	11339738	+	chr2L	11339815	77	+	chr2L	11339738	+	chr2L	11339815
TTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTAAATAACCAATTTTCCAGAGGACCTCCTCTAGCAGCGATTCCCAT:1	TTGCCCGGTCCACTTAATCTAA	CTCCTCTAGCAGCGATTCCCAT	+	chr2R	20739460	+	chr2R	20744228	4768	+	chr2R	20739460	+	chr2R	20744228
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGAGGGATATGGAGAAGGGACATC:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	AGGGATATGGAGAAGGGACATC	-	chr3R	21907534	-	chr3R	10639298	11268236	+	chr3R	10639298	+	chr3R	21907534
CTGTGTGGAAGGACGTGGGCTGCCCAGCCTTAACTTTCGACCGCTGCTAATGCTACTTAAGTATAATAA:1	CTGTGTGGAAGGACGTGGGCTG	TAATGCTACTTAAGTATAATAA	+	chr3R	6584320	+	chr3R	5669172	915148	+	chr3R	6584320	+	chr3R	5669172
TCAACACACACTTCAATTTCATCTGCTGCGAGGGATGAGCCAACAAACGGGCACAAAGTACAACAAAAATGGTGT:1	TCAACACACACTTCAATTTCAT	CAAAGTACAACAAAAATGGTGT	+	chr2R	18726902	+	chr2R	18726985	83	+	chr2R	18726902	+	chr2R	18726985
TAGTACTACATCTTAAATNGCAAATACGAATTGCGAATATTAANTTACANTGCGGGTTATGGGAGGCTGTCACAT:1	TAGTACTACATCTTAAATNGCA	GGGTTATGGGAGGCTGTCACAT	+	chr2L	4819511	+	chr2L	4819634	123	+	chr2L	4819511	+	chr2L	4819634
ATAATAAATAAGAAATACTGCCGTCGAAAGATTCTTTCTAAATTATACCTATATACCTATTTATTGCCTGCTCA:1	ATAATAAATAAGAAATACTGCC	ATACCTATTTATTGCCTGCTCA	+	chr2R	24848666	+	chr2R	24848749	83	+	chr2R	24848666	+	chr2R	24848749
TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTG:1	TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTG	CTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTG	-	chrX	7978935	-	chrX	4805476	3173459	+	chrX	4805476	+	chrX	7978935
AAATTCGACCAGATATCAAAAATGGTTTGCTTATCCGTATAATCATCTTTTGCTGAATGGCTTTAC:1	AAATTCGACCAGATATCAAAAA	ATCTTTTGCTGAATGGCTTTAC	+	chr3R	14635179	+	chr3R	14635246	67	+	chr3R	14635179	+	chr3R	14635246
GACATAAAGCCCCGGGCACGATATATACAAATTGGATGTGGTATTGCCAGAACTAA:1	GACATAAAGCCCCGGGCACGAT	GATGTGGTATTGCCAGAACTAA	+	chr2L	12736706	+	chr2L	12736763	57	+	chr2L	12736706	+	chr2L	12736763
CCCATATTTGTTGGAAGCCATACAAGTATGTATATTGATCTTTGTGGCANTTTGGCCGCTTAAATACCCAGGG:1	CCCATATTTGTTGGAAGCCATA	TTGGCCGCTTAAATACCCAGGG	+	chrX	19625293	+	chrX	4095041	15530252	+	chrX	19625293	+	chrX	4095041
GCAGCGCCAAAAGGTAAATGACCAAAAGCCATTTAAACTGCAATTGCAGTGAATGTTGCATGGAATGACAA:1	GCAGCGCCAAAAGGTAAATGAC	TGAATGTTGCATGGAATGACAA	-	chr3L	1581493	-	chr3L	1581163	330	+	chr3L	1581163	+	chr3L	1581493
TCCGCCAAATACCAAGTGAAAGTGCAAAGGCCCAGAAAACCAATTTATGTCAATTCCCTCTGTGCAAATAAAAAG:1	TCCGCCAAATACCAAGTGAAAG	TTCCCTCTGTGCAAATAAAAAG	+	chrX	18427384	+	chrX	18427795	411	+	chrX	18427384	+	chrX	18427795
ATAACACTCGTAACACACGTTCATAAGGTCAGTTAATGTCAAGGAAAATAGCTGAGATTGTAACTGCAGATGAAG:1	ATAACACTCGTAACACACGTTC	GAGATTGTAACTGCAGATGAAG	-	chr3L	24363351	-	chr3L	24363273	78	+	chr3L	24363273	+	chr3L	24363351
CCAGAGAAAAACGAAAAAGAAGACGCAGCCTTCGTGCGCGAAAAAAAGACTCCACAGAAAGCAGAAAGNTACGAG:1	CCAGAGAAAAACGAAAAAGAAG	ACAGAAAGCAGAAAGNTACGAG	+	chr3L	4708387	+	chr3L	2846576	1861811	+	chr3L	4708387	+	chr3L	2846576
GCTAAGCACTAAAGAGCATTCCAAGCCTTTCACTCAAAATCATTTGCCTAGCCGCACTCGTAAAAAACTTCAATT:1	GCTAAGCACTAAAGAGCATTCC	GCACTCGTAAAAAACTTCAATT	-	chr2L	20804801	-	chr2L	20804716	85	+	chr2L	20804716	+	chr2L	20804801
AATACCCAGAATCAATAGTAATTAACCTTAATCGTTATTCATTTTTTGTCAGTTGCCTGTTGTCTTACGAGTGTT:1	AATACCCAGAATCAATAGTAAT	TGCCTGTTGTCTTACGAGTGTT	+	chr2L	19345020	+	chr2L	19357229	12209	+	chr2L	19345020	+	chr2L	19357229
ACTACACACTTATCATTATGTTGAGAGAATAGTATAGTATGTAAATATATATATATATTTCAAAGCAAGCTGAG:1	ACTACACACTTATCATTATGTT	ATATATTTCAAAGCAAGCTGAG	-	chrX	6179046	-	chrX	6171614	7432	+	chrX	6171614	+	chrX	6179046
ATTTCCCTGGAGGCGGACGCTCCAACCCCGAGGAAGCAACAGCCCAGCTTCGCTTCAACT:1	ATTTCCCTGGAGGCGGACGCTC	ACAGCCCAGCTTCGCTTCAACT	-	chr3L	11409763	-	chr3L	11409455	308	+	chr3L	11409455	+	chr3L	11409763
CTCTGACTGGTCCTAATTTAATACATTAATACATGTATATGTTTGTGCATTAAATGTATATGGCTTACATTAT:1	CTCTGACTGGTCCTAATTTAAT	AAATGTATATGGCTTACATTAT	-	chr3L	7800780	-	chr3L	7793730	7050	+	chr3L	7793730	+	chr3L	7800780
ATACGTAATGCCTAATTAGCGTTAGAGCTAAAAACTCCACTTGCTCCCTTTGAAT:1	ATACGTAATGCCTAATTAGCGT	ACTCCACTTGCTCCCTTTGAAT	+	chr2L	6402668	+	chr2L	5181549	1221119	+	chr2L	6402668	+	chr2L	5181549
CATTCCAAACTGATACTCGCTTGAGTAAACGGAAAAACTGAAGCACTNTGCGCTGGCCACCNAACTGGTGAG:1	CATTCCAAACTGATACTCGCTT	CGCTGGCCACCNAACTGGTGAG	-	chr2L	8047360	-	chr2L	3306995	4740365	+	chr2L	3306995	+	chr2L	8047360
ATGGTTGGCATGGATATTTTTAAATGAAAATTGATTCAAACACATTTTCTATTTAAAATAAACATTTTCCGACTC:1	ATGGTTGGCATGGATATTTTTA	TAAAATAAACATTTTCCGACTC	+	chr3L	14555925	+	chr3L	14556007	82	+	chr3L	14555925	+	chr3L	14556007
TAACAAGTTTTGTGTGCCTACATCGTACATATGTGTATATATGCTGCTGTTGGAATAGATGACGGGCTTG:1	TAACAAGTTTTGTGTGCCTACA	GTTGGAATAGATGACGGGCTTG	+	chr2R	17784040	+	chr2R	17784276	236	+	chr2R	17784040	+	chr2R	17784276
CAGTTCCAATCAAATCGGGATGGCTTTAGCTACGATTACACTTTTCAATAGAACCAACTGATGCCTTCAGCTTAA:1	CAGTTCCAATCAAATCGGGATG	CCAACTGATGCCTTCAGCTTAA	+	chr2R	23061753	+	chr2R	23061829	76	+	chr2R	23061753	+	chr2R	23061829
CTTGCGAATGCAACACTATCTGTCAGTTAGCGATGCCATCTATACTAATATACTGCGAAGCGTATCANGAATTTT:1	CTTGCGAATGCAACACTATCTG	TGCGAAGCGTATCANGAATTTT	+	chr2L	19357569	+	chr2L	19357659	90	+	chr2L	19357569	+	chr2L	19357659
ACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTACAGCTCGCTGAAAGAAATATTA:1	ACACAGGGCACAAAGACATAGA	CAGCTCGCTGAAAGAAATATTA	+	chr2R	4312957	+	chr2R	4313041	84	+	chr2R	4312957	+	chr2R	4313041
AAAATCTTCTGCTTTCCAAGGAGGCTCCCAATNTGAAAAGTTTAAATACTGATGATGTTCACGGCANACAAAAA:1	AAAATCTTCTGCTTTCCAAGGA	TGATGTTCACGGCANACAAAAA	-	chr3R	10979758	-	chr3R	10979677	81	+	chr3R	10979677	+	chr3R	10979758
TTTTTCATTAAATGTGAAGAAACCTGATCTTTGTTATATATATACAAAACNTATGAATTCTCCGAGAAAGGTTTA:1	TTTTTCATTAAATGTGAAGAAA	TGAATTCTCCGAGAAAGGTTTA	-	chr2L	3388857	-	chr2L	3388616	241	+	chr2L	3388616	+	chr2L	3388857
TGGAGCGGGCTGAACTTGAGGTGCGGCAACTTTTTTGGATTCTTCCG:1	TGGAGCGGGCTGAACTTGAGGT	GCAACTTTTTTGGATTCTTCCG	-	chr2L	18699286	-	chr2L	18699237	49	+	chr2L	18699237	+	chr2L	18699286
TGAGTAATATAAGAGTTGATTTCGTAACCGGCTTAGGTGCAGTAGTCGCAGTCTTGTTGTGCAGAANTTTTCAGC:1	TGAGTAATATAAGAGTTGATTT	TTGTTGTGCAGAANTTTTCAGC	-	chr3R	23820750	-	chr3R	23820666	84	+	chr3R	23820666	+	chr3R	23820750
ACCTCAGCAATATATCTAGACCCGCTAGGAGATGTTGAGATTGTGAGTACTTTAATCACGGTAGGCTAAATACAA:1	ACCTCAGCAATATATCTAGACC	AATCACGGTAGGCTAAATACAA	+	chr3R	19448275	+	chr3R	19448911	636	+	chr3R	19448275	+	chr3R	19448911
TCTTCGTATGTTTTTATCTCATTATCTTCTTAGATTATTTTACGGTTTCAATCTTTTTCCTGGGCTTCGTTTTT:1	TCTTCGTATGTTTTTATCTCAT	CTTTTTCCTGGGCTTCGTTTTT	+	chr2R	8432681	+	chr2R	14021064	5588383	+	chr2R	8432681	+	chr2R	14021064
GCTCTATTCTTTTCCACAAATATTAAAATATTAAGTTCTGCTTTCAAATGGAACGTTGAATAATATTCTGCTTTG:1	GCTCTATTCTTTTCCACAAATA	CGTTGAATAATATTCTGCTTTG	+	chrX	3297276	+	chrX	3297365	89	+	chrX	3297276	+	chrX	3297365
TTCCATTGGATGCTACATGGATTTTTGTGATATAAAAAGGAATATGTGATGGTAAAATGAATATTCATGG:1	TTCCATTGGATGCTACATGGAT	ATGGTAAAATGAATATTCATGG	+	chrX	20123064	+	chrX	20123176	112	+	chrX	20123064	+	chrX	20123176
ATACCTCANCCACTTCATCCGCAACTATGTGAGCACCGTCCCGGAGGACGGTGACTTCGATATG:1	ATACCTCANCCACTTCATCCGC	GGAGGACGGTGACTTCGATATG	+	chr2R	24518033	+	chr2R	24518108	75	+	chr2R	24518033	+	chr2R	24518108
TACCACCGTACCATATATCTACATATATAANNNTNACCATATTAGTTTTTGGAAAACCATTTCTCGAATAATTAA:1	TACCACCGTACCATATATCTAC	AAACCATTTCTCGAATAATTAA	+	chr2R	6206342	+	chr2R	18240529	12034187	+	chr2R	6206342	+	chr2R	18240529
GTGGGCATGATGGTGATTGTGGGTTGCCATATAGGTTTTGTAAATAA:1	GTGGGCATGATGGTGATTGTGG	GCCATATAGGTTTTGTAAATAA	+	chr3L	7717676	+	chr3L	17070751	9353075	+	chr3L	7717676	+	chr3L	17070751
AGTTCTTGACTGTGGCAAAGAGAACAAGCATTCCAGAATATTAGTTAACTTATGTCAAAGAGAATTCTTAGTTAC:1	AGTTCTTGACTGTGGCAAAGAG	GTCAAAGAGAATTCTTAGTTAC	+	chr3R	11694733	+	chr3R	11694826	93	+	chr3R	11694733	+	chr3R	11694826
TTTTAAGGTTTCAAATGTGTAATATTTACAAGANAAGTTCAATGTAAATCCGGAAAT:1	TTTTAAGGTTTCAAATGTGTAA	AGTTCAATGTAAATCCGGAAAT	-	chr3R	13138003	-	chr3R	13135846	2157	+	chr3R	13135846	+	chr3R	13138003
TAAACGCTGGGCTGATAAAACGATTGCCCCCAGACGCTGTCCGTCTTGTTTATGCCAATAATNAATAGATAATTT:1	TAAACGCTGGGCTGATAAAACG	GCCAATAATNAATAGATAATTT	-	chr3R	22453202	-	chr3R	22450562	2640	+	chr3R	22450562	+	chr3R	22453202
AAATGAACTGAAATCTTACAGTACGACATTAATACGGAACTGGCATTGTTCCATTCGCTGAGATACCTACATACA:1	AAATGAACTGAAATCTTACAGT	TTCGCTGAGATACCTACATACA	-	chrX	10361819	-	chrX	10361722	97	+	chrX	10361722	+	chrX	10361819
ACACTTTCTTTTTTTTTTTGGCCGCTT:1	ACACTTTCTTTTTTTTTTTGGC	TTCTTTTTTTTTTTGGCCGCTT	-	chrX	13879777	-	chrX	7553455	6326322	+	chrX	7553455	+	chrX	13879777
AGGAAGCTGTAAACATAACCAGATTAGAAACCTATTCCTATAAACTCTATCATTGCATTGAATTTTCTAGTCTG:1	AGGAAGCTGTAAACATAACCAG	TTGCATTGAATTTTCTAGTCTG	+	chr2L	976886	+	chr2L	984521	7635	+	chr2L	976886	+	chr2L	984521
AAAGGGCCAGAACTGGGTATGATCAGCCGAAGGCAAGACCGAACATGGCATTCTACGTAGTCCCATTCTCTGAT:1	AAAGGGCCAGAACTGGGTATGA	CTACGTAGTCCCATTCTCTGAT	-	chr2L	14057397	-	chr2L	18236045	4178648	+	chr2L	18236045	+	chr2L	14057397
TGTCAAGTTTCTAGCGCATTACCTAAAGATGCAGGAAGGATATATCACTNGACCCATTACTAAAATTTGTCCCT:1	TGTCAAGTTTCTAGCGCATTAC	CCCATTACTAAAATTTGTCCCT	+	chr3R	19448209	+	chr3R	19448080	129	+	chr3R	19448209	+	chr3R	19448080
CAAATCGCATTCCCAGCCCCAAAATAGCAGCCACAGGACCCACACTATCATCCACACCCACCACACATCACTCA:1	CAAATCGCATTCCCAGCCCCAA	CACACCCACCACACATCACTCA	-	chr3R	21167284	-	chr3R	20887902	279382	+	chr3R	20887902	+	chr3R	21167284
GAAGGAGACATTGGCAAAAAAGAAAGCGCACAAGGCTGGGCGAGAGTGTGAGAGAGAGTGCGT:1	GAAGGAGACATTGGCAAAAAAG	GAGAGTGTGAGAGAGAGTGCGT	+	chr3L	4678998	+	chr3L	18029632	13350634	+	chr3L	4678998	+	chr3L	18029632
CATTTTTGTGACTTTTAAAACGGAAAAAATTCAAGGGCCTTGCCTTTGGNGTTT:1	CATTTTTGTGACTTTTAAAACG	AAGGGCCTTGCCTTTGGNGTTT	-	chr2L	5852624	-	chr2L	5852535	89	+	chr2L	5852535	+	chr2L	5852624
GTTGCCGGGGCAGGTGTAAGTGTAAGTGGCGCCTTGCCGGTAGCAATTCAAACAATTTGCAATAAGGCGCCGCTG:1	GTTGCCGGGGCAGGTGTAAGTG	AATTTGCAATAAGGCGCCGCTG	-	chr2R	15065710	-	chr2R	15065632	78	+	chr2R	15065632	+	chr2R	15065710
TTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTTTTAGATATATTCTCCATGCTTTCCGACACTTAAGGATCGGTATA:1	TTTGTTCTATAGAATATAACCA	CCGACACTTAAGGATCGGTATA	+	chr3L	8295818	+	chr3L	8295976	158	+	chr3L	8295818	+	chr3L	8295976
AAAATATAAATATAATATAANATATAATCAAANTAGCCTTTGNGAAAGACCAAATAGTTATGTAATCGGAAAATT:1	AAAATATAAATATAATATAANA	ATAGTTATGTAATCGGAAAATT	+	chr2L	17545010	+	chr2L	18689625	1144615	+	chr2L	17545010	+	chr2L	18689625
GTGTTTAAACATAATCCTATGCAATCCTATGTAAAGTGTAAACTAATTCCAACTAGCCTAACTAGATTTTATGC:1	GTGTTTAAACATAATCCTATGC	CTAGCCTAACTAGATTTTATGC	-	chr3L	22447312	-	chr3L	22447222	90	+	chr3L	22447222	+	chr3L	22447312
CGAATGAAGCCAACAACAAAATCACACCGAATGAAGGAAGGACAGCTGGGCGGACAACTCAAGACCTAGAATACA:1	CGAATGAAGCCAACAACAAAAT	ACAACTCAAGACCTAGAATACA	+	chr3L	3257107	+	chr3L	3257284	177	+	chr3L	3257107	+	chr3L	3257284
AATCAGAACTTGAAAAGTACTTTTGATTTTAATTTTGAGCTAGCNGTATCTTTAATATCAATATAAAAGTGA:1	AATCAGAACTTGAAAAGTACTT	TTTAATATCAATATAAAAGTGA	+	chr2R	18675160	+	chr2R	18675235	75	+	chr2R	18675160	+	chr2R	18675235
GGAATTTCAGCTCGATGTTCGACCTTAGCCCGTGTGCTTCATTAATCAAAAGTAATTTTCCGCCTTTCACAGCA:1	GGAATTTCAGCTCGATGTTCGA	TAATTTTCCGCCTTTCACAGCA	+	chr3R	25689146	+	chr3R	25689253	107	+	chr3R	25689146	+	chr3R	25689253
TAATTAGAAAACCTGCAAACAAAAAAAACCGTATTAAAACATGCTATATAATATACTACACTGAAGCTCTTTA:1	TAATTAGAAAACCTGCAAACAA	TATACTACACTGAAGCTCTTTA	+	chr2R	22723239	+	chr2R	22723313	74	+	chr2R	22723239	+	chr2R	22723313
ATGCGGAGACAAGACAAATTAAAATATGTCTTGCAGGCACAAGATATAACTGAATAAAGAACAAA:1	ATGCGGAGACAAGACAAATTAA	ATATAACTGAATAAAGAACAAA	-	chr3R	27351387	-	chr3R	27342816	8571	+	chr3R	27342816	+	chr3R	27351387
ACTAAGGCATGGGAGTGAATCCCAAAGAACGCATTAGCCTCCCTTTTGGCCCACTTCTTTTGCTATTTCAGCCAT:1	ACTAAGGCATGGGAGTGAATCC	CTTCTTTTGCTATTTCAGCCAT	+	chr2L	9303546	+	chr2L	9303626	80	+	chr2L	9303546	+	chr2L	9303626
TAAAAAGAAACATACTTTTTCAAGTGATGTGAGTATAGTACGACTCAGTTTATCCCTGTGCATTCTCCAAGCCAA:1	TAAAAAGAAACATACTTTTTCA	CCCTGTGCATTCTCCAAGCCAA	+	chr3R	17346706	+	chr3R	17348269	1563	+	chr3R	17346706	+	chr3R	17348269
ACGAGGAAAAATATAAATTAAAATTTTTTTTTTTGATGGTGTTAAGTTTCGATGGAAAGACATTTCCAAACGCTT:1	ACGAGGAAAAATATAAATTAAA	GGAAAGACATTTCCAAACGCTT	-	chr2L	21307555	-	chr2L	21307473	82	+	chr2L	21307473	+	chr2L	21307555
ATTTTACATTAGACAAAAACAGAGCGAATCTCGTATATATTTACTTTTTCACTGAGTCCACCCCGATGAC:1	ATTTTACATTAGACAAAAACAG	TCACTGAGTCCACCCCGATGAC	+	chr2L	18393994	+	chr2L	18394069	75	+	chr2L	18393994	+	chr2L	18394069
ATTTTATTTACGACCAACCAAGAGNACTTTAAAAATGTTTTTTTTTTT:1	ATTTTATTTACGACCAACCAAG	CTTTAAAAATGTTTTTTTTTTT	-	chr2L	4191265	-	chr2L	7175060	2983795	+	chr2L	7175060	+	chr2L	4191265
AGGACGACGATGATGCGACAATCGATAGTGTTGATACTACCGCAAGGAAAACAAACGGCAT:1	AGGACGACGATGATGCGACAAT	CCGCAAGGAAAACAAACGGCAT	-	chrX	3863310	-	chrX	3863241	69	+	chrX	3863241	+	chrX	3863310
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAAAAAANCGAACACCTGTCCGAAAAGAGACAACAAAGCGAAGCCAAG:1	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	GAGACAACAAAGCGAAGCCAAG	-	chrX	12649914	-	chrX	3136509	9513405	+	chrX	3136509	+	chrX	12649914
ATTTTTACAACTTCATTATGGATATATTTGGTTGCCGTTGGTTCCTTCCTCTCTGCACAGCATCCAGTAATAA:1	ATTTTTACAACTTCATTATGGA	TCTGCACAGCATCCAGTAATAA	+	chr3R	10994293	+	chr3R	10994370	77	+	chr3R	10994293	+	chr3R	10994370
GAAGATGGAAGAAAGAAAGACGACAGAAGAGAGTNCAATGAAGTGCCTCGAACCTTGAAAAGTGTCCCAAAAATA:1	GAAGATGGAAGAAAGAAAGACG	CTTGAAAAGTGTCCCAAAAATA	+	chr2L	19147277	+	chr2L	19147392	115	+	chr2L	19147277	+	chr2L	19147392
TTCGTTCTGACTGCGGCCTGTTGGCCTTTTAAAAACACAAACCAAACGAGTAAATCTCTGCGTGTTCACGTGTAC:1	TTCGTTCTGACTGCGGCCTGTT	ATCTCTGCGTGTTCACGTGTAC	-	chr3R	28073956	-	chr3R	28068514	5442	+	chr3R	28068514	+	chr3R	28073956
CATTTTTCCGCTTTTCCGCTTTTCCTGCTCGCATTC:1	CATTTTTCCGCTTTTCCGCTTT	TCCGCTTTTCCTGCTCGCATTC	+	chrX	880090	+	chrX	20742104	19862014	+	chrX	880090	+	chrX	20742104
ATTATCCTTGTCTCTACCAGAAGTTGATGCCAGCGGAGGAGATTCTTCGGGCTCCTGGTCCAAGCTAATCAAGA:1	ATTATCCTTGTCTCTACCAGAA	TCCTGGTCCAAGCTAATCAAGA	-	chr3L	11611634	-	chr3L	11611132	502	+	chr3L	11611132	+	chr3L	11611634
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:2	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
AGCACCTCCTACTTCTGCCTCCTACAACTTGACTTGAACGAATTAGTTGATCTTTGAACTCTGTAGCACACTTCA:1	AGCACCTCCTACTTCTGCCTCC	TTGAACTCTGTAGCACACTTCA	+	chr2L	7959050	+	chr2L	7960461	1411	+	chr2L	7959050	+	chr2L	7960461
TATGCAACAGTTTGGCATCTGGCTTTAAAATATTTACGGTCTCTTCGGCATGCATGCTAAACTTAGCCAGCAATT:1	TATGCAACAGTTTGGCATCTGG	ATGCTAAACTTAGCCAGCAATT	+	chr3R	28253357	+	chr3R	28255867	2510	+	chr3R	28253357	+	chr3R	28255867
GGAGAGAACCTTGCAGTTCAAAACTCCAGATACGACCACCAGGCAAACAACAAC:1	GGAGAGAACCTTGCAGTTCAAA	CGACCACCAGGCAAACAACAAC	-	chr2R	14355533	-	chr2R	20779015	6423482	+	chr2R	20779015	+	chr2R	14355533
CCACATTNTCCCACCCCTTTGCTATTTTCCACCTCCACTNTTCCACCAGAGACAACGNGCTTCTGTCTCT:1	CCACATTNTCCCACCCCTTTGC	GAGACAACGNGCTTCTGTCTCT	+	chr2R	12501708	+	chr2R	12503865	2157	+	chr2R	12501708	+	chr2R	12503865
GCAAAGTTTCTCACGTGTGTCTTTCCTCAGTGTCCTTTTTGTTTGTGTGTGTGTGGGTTTTT:1	GCAAAGTTTCTCACGTGTGTCT	GTTTGTGTGTGTGTGGGTTTTT	+	chr2L	14044311	+	chr2L	12296786	1747525	+	chr2L	14044311	+	chr2L	12296786
GGTGATTAACCCATTTTGTAATTGTCTGATAAGGGGAAACTATAAGGTTGCACGAAAAAAATGTTCATCACAAAA:1	GGTGATTAACCCATTTTGTAAT	GAAAAAAATGTTCATCACAAAA	-	chr3R	22884922	-	chr3R	22881216	3706	+	chr3R	22881216	+	chr3R	22884922
GGTGTGAAATTGTTGTTGCTCTTGATTGGATATCTGTGTTTCATCAGGGGGCACTG:1	GGTGTGAAATTGTTGTTGCTCT	TGTGTTTCATCAGGGGGCACTG	-	chr3R	31696306	-	chr3R	31691559	4747	+	chr3R	31691559	+	chr3R	31696306
AGATGTCGCCGCTGGGCACGATCATCGACGATTCAGCGGATATCACCGAAAGTAACCACCTTTCACAAA:1	AGATGTCGCCGCTGGGCACGAT	GAAAGTAACCACCTTTCACAAA	-	chr3L	7591243	-	chr3L	7591158	85	+	chr3L	7591158	+	chr3L	7591243
TGACGTGGNCGATGACGAGTTGAAGTGAGTTCACTTANNNNATTAACCCATTCTTATCGTANGACTTTTAATATT:1	TGACGTGGNCGATGACGAGTTG	TTATCGTANGACTTTTAATATT	+	chr3L	8791277	+	chr3L	8796697	5420	+	chr3L	8791277	+	chr3L	8796697
CAGCGGCAACTGCAGCAAACAGAAAAAACAGTTTAATGATCATTTAATACACCAATAAATATATTCAGAAATGCA:1	CAGCGGCAACTGCAGCAAACAG	AATAAATATATTCAGAAATGCA	+	chrX	19149730	+	chrX	17266012	1883718	+	chrX	19149730	+	chrX	17266012
ATTCGTTAGTCAAAAATTTTCCCAACTTCGGCTAGTTAACAATTTTCCCTTTGCCCGCCGCATACAAATTGCCTT:1	ATTCGTTAGTCAAAAATTTTCC	CCCGCCGCATACAAATTGCCTT	+	chr3L	5246384	+	chr3L	15687754	10441370	+	chr3L	5246384	+	chr3L	15687754
CCGATTGGCAAAAGAAGCCACAGCAAAAGCTTGCGGTGTGTGTGTGTGCNAAAAAGTGGCCAAGAAGGAAATAG:1	CCGATTGGCAAAAGAAGCCACA	AAAGTGGCCAAGAAGGAAATAG	+	chr3R	10899450	+	chr3R	10899528	78	+	chr3R	10899450	+	chr3R	10899528
GTAAAAAATGCAGCTTAACTAGGTTCTCGTTTTGTAATTCCCTCCAATTTCGTTATTTCGCTTGTTTCAAGTGT:1	GTAAAAAATGCAGCTTAACTAG	TTATTTCGCTTGTTTCAAGTGT	+	chr3L	2555411	+	chr3L	4937710	2382299	+	chr3L	2555411	+	chr3L	4937710
ATCAAGAGACACCAAAACAAAAAGTTTTTAGTAGTAATCCCTTAAATCAATTCTTTAGACTACGTAAATAGAACA:1	ATCAAGAGACACCAAAACAAAA	TTTAGACTACGTAAATAGAACA	+	chr3R	20739580	+	chr3R	20739698	118	+	chr3R	20739580	+	chr3R	20739698
AAAGGTGTTGGGCTACTGAATAAAACATTCGTGGAATCTATTCACATTTTATTACAATCAACTGCAAGGAAGNGA:1	AAAGGTGTTGGGCTACTGAATA	ACAATCAACTGCAAGGAAGNGA	+	chr3L	19430415	+	chr3L	19430493	78	+	chr3L	19430415	+	chr3L	19430493
CAGCGAAGTGATCATCAAGACGAAGAAAACATTTCCCAATTGGTTGAGTTACACTAAATTTGCCAATGCAGCCTT:1	CAGCGAAGTGATCATCAAGACG	CTAAATTTGCCAATGCAGCCTT	-	chr2R	7837038	-	chr2R	503401	7333637	+	chr2R	503401	+	chr2R	7837038
ATCGCCAACGTCAAAAACAAGGCAATACAAATACAGAGAGACTAGGGGAGAGTTGTATCTGTGTTTTTGTGGCAC:1	ATCGCCAACGTCAAAAACAAGG	TGTATCTGTGTTTTTGTGGCAC	-	chr3R	26163433	-	chr3R	11008793	15154640	+	chr3R	11008793	+	chr3R	26163433
TTAATCGAGCATATTTAGGACTTCTTTTTCATTGCGTATCTTTCATGACAAATCGGAAGGTAATAAAATTCGCAA:1	TTAATCGAGCATATTTAGGACT	CGGAAGGTAATAAAATTCGCAA	-	chr2R	14707147	-	chr2R	14707067	80	+	chr2R	14707067	+	chr2R	14707147
TTATAATTCTAACTTATAAGCAAAAGTTGTAATATCTAATTTGATAGGACCATGTTTATAGACGATTGTAAACT:1	TTATAATTCTAACTTATAAGCA	TGTTTATAGACGATTGTAAACT	+	chr3R	18269018	+	chr3R	18269152	134	+	chr3R	18269018	+	chr3R	18269152
CGTATAATGGATTCGAATATATATGGTGTGTGTGTGGTGTGTGCATGCACATGTCGGCCATACAATG:1	CGTATAATGGATTCGAATATAT	TGCACATGTCGGCCATACAATG	+	chrX	5350312	+	chrX	5350413	101	+	chrX	5350312	+	chrX	5350413
TACAAACATTTTTCTGGTATGTGGTTAAAAAGGTGTCAGAAAAAAGACGCTCAAGCAGCGAACTCAAGTTGAATT:1	TACAAACATTTTTCTGGTATGT	AGCAGCGAACTCAAGTTGAATT	+	chrX	718337	+	chrX	718417	80	+	chrX	718337	+	chrX	718417
TGAATTTATATTAAAGCAGATATATTTTGTTTCCAATCCCTATTTATATATATTTTTTTCCACACATATAT:1	TGAATTTATATTAAAGCAGATA	ATATTTTTTTCCACACATATAT	+	chr3L	11678114	+	chr3L	11678197	83	+	chr3L	11678114	+	chr3L	11678197
ATGCGTGTAGCATCAACTGGCATCCCGGATAGCTGGGCTGGCAGGATGATGACG:1	ATGCGTGTAGCATCAACTGGCA	CTGGGCTGGCAGGATGATGACG	-	chrX	10662898	-	chrX	10633060	29838	+	chrX	10633060	+	chrX	10662898
AATCGCAAAATCATGACTAAATAGTTGGTTATTACATTACTGTTCCTTACAGTTTAGATCACATTTTGCTCTTG:1	AATCGCAAAATCATGACTAAAT	TTTAGATCACATTTTGCTCTTG	+	chr2L	11395050	+	chr2L	11395131	81	+	chr2L	11395050	+	chr2L	11395131
GAAACCAACATGCCTCGGNGTCAAGTAAATGCACCCTTATAGANCCTATNGTCGAGGCCTAAAATGTTGTTTTCA:1	GAAACCAACATGCCTCGGNGTC	GAGGCCTAAAATGTTGTTTTCA	-	chr2L	22012018	-	chr2L	22011937	81	+	chr2L	22011937	+	chr2L	22012018
CTAACCAACCCGCCTGTGACTTCCTTTTATGACTATTTTTGCTTCCTCAACGAAATTCAATTGAGTTGCGAATTT:1	CTAACCAACCCGCCTGTGACTT	AATTCAATTGAGTTGCGAATTT	-	chr2R	12459197	-	chr2R	21599957	9140760	+	chr2R	21599957	+	chr2R	12459197
TTCCTTAACATCTTCTACTTGCAAACTGAATTTTTTATGCATTTTGTGAGGTGTAACTAGAATGGCNCTTATTAT:1	TTCCTTAACATCTTCTACTTGC	TAACTAGAATGGCNCTTATTAT	-	chr2L	20500518	-	chr2L	20500438	80	+	chr2L	20500438	+	chr2L	20500518
ATCGGCAATCAATGAAAATTCAATAAAAACCGCCAGACAAACAGCATCACGAAAATCAGACCCTAAGCATA:1	ATCGGCAATCAATGAAAATTCA	CGAAAATCAGACCCTAAGCATA	-	chr3R	23492535	-	chr3R	23811713	319178	+	chr3R	23811713	+	chr3R	23492535
TGNTGTTACCCATCGCCAATTCCATTTTGTTGCCNTNGCAGCGGCGCACAATCAAACTACGTGAGTCTTTGTTA:1	TGNTGTTACCCATCGCCAATTC	CAAACTACGTGAGTCTTTGTTA	+	chrX	15263638	+	chrX	15264000	362	+	chrX	15263638	+	chrX	15264000
CATGCAGAAGACAATTAAAGCAGGTGAAAGGCAAGGGAAAATAGGAGAAAACTCTAAAAAAGGAACTGTACGCA:1	CATGCAGAAGACAATTAAAGCA	TCTAAAAAAGGAACTGTACGCA	+	chr3R	31021393	+	chr3R	5555882	25465511	+	chr3R	31021393	+	chr3R	5555882
TATTTATAAAATGTCTAGAATGGCAAAAACAATTAAATTAAATTTTGCTACGTAAATCTGGCATATTTTCAAATG:1	TATTTATAAAATGTCTAGAATG	AAATCTGGCATATTTTCAAATG	+	chr3R	7404963	+	chr3R	7405039	76	+	chr3R	7404963	+	chr3R	7405039
GAAGCGCGTGCACCGCTCACACAGATACATACGGGGGGGTACTGGAGGATCGGTACATAGTGCAAGCCACCCCA:1	GAAGCGCGTGCACCGCTCACAC	GTACATAGTGCAAGCCACCCCA	+	chr3R	27106294	+	chr3R	27106401	107	+	chr3R	27106294	+	chr3R	27106401
GTATCTAAGTAGGAGTAGCGAATTAAATCTTAAGATTAGTTGTAGATAGAAATGTAAATAAGCTGAATAGCTGAC:1	GTATCTAAGTAGGAGTAGCGAA	GTAAATAAGCTGAATAGCTGAC	+	chr3R	29595387	+	chr3R	29595484	97	+	chr3R	29595387	+	chr3R	29595484
CACGTGCTCTGCNCCTAAACGGCCTTTGTCNGNCTGTCNACCCCCTTTGGCCATTTAGCGGCACTTGCTTTTA:1	CACGTGCTCTGCNCCTAAACGG	CATTTAGCGGCACTTGCTTTTA	+	chr3L	20590080	+	chr3L	20590617	537	+	chr3L	20590080	+	chr3L	20590617
TGTTACCAAACCGAATTAAAGAAAGAAAGTATAAAATAAAATACATAATCTCACAACTCAGCCAATNTTCTTTAA:1	TGTTACCAAACCGAATTAAAGA	CAACTCAGCCAATNTTCTTTAA	+	chrX	20915061	+	chrX	20915232	171	+	chrX	20915061	+	chrX	20915232
TNCTAATTTTTATCCCAGACCATTTATGCCTTTTTTGCTTTTAATGAATTGAAAGTTGTGATTTTTAGGATA:1	TNCTAATTTTTATCCCAGACCA	GAAAGTTGTGATTTTTAGGATA	+	chr2L	11540598	+	chr2L	11547997	7399	+	chr2L	11540598	+	chr2L	11547997
CTTATTTTTGATTTTATGAAATATTTATGTCTGGCTTTGGTCAGCAGGTAAACGATTTTTTAAAATAAGCAATA:1	CTTATTTTTGATTTTATGAAAT	CGATTTTTTAAAATAAGCAATA	+	chr3R	26816695	+	chr3R	25337627	1479068	+	chr3R	26816695	+	chr3R	25337627
CAAACCGCACGCGACTGAAGGCTAACCGAAATTCAATCACTTATGTATACAAAATGTTAAATATTNAATTCAACT:1	CAAACCGCACGCGACTGAAGGC	ATGTTAAATATTNAATTCAACT	+	chr3L	5297300	+	chr3L	7125469	1828169	+	chr3L	5297300	+	chr3L	7125469
GGTTGGAGCCGCTTTTTTTTTTTCTTTCTATTTTTTCTTTTTT:1	GGTTGGAGCCGCTTTTTTTTTT	TTCTTTCTATTTTTTCTTTTTT	-	chr3R	15673667	-	chr3R	23743744	8070077	+	chr3R	23743744	+	chr3R	15673667
GAGGTCCCGGTTTCGGAGGACCTGGTTTTG:1	GAGGTCCCGGTTTCGGAGGACC	GGTTTCGGAGGACCTGGTTTTG	-	chr2L	5958251	-	chr2L	5958333	82	+	chr2L	5958333	+	chr2L	5958251
TATAGGTTTTTGACTGAATTAACTGAAAATAGCTCTGCTGCCATTAAGCCTTTAAATGGTTATATAAGTCAAA:1	TATAGGTTTTTGACTGAATTAA	TTAAATGGTTATATAAGTCAAA	-	chr2R	17412489	-	chr2R	17412382	107	+	chr2R	17412382	+	chr2R	17412489
CGAGCGTTNCATTAACCCGTGCACGATACACAATGNCCCCATAACATCGTTATCTAAAGAACTTCCTATTCCGC:1	CGAGCGTTNCATTAACCCGTGC	TCTAAAGAACTTCCTATTCCGC	-	chr2R	5097129	-	chr2R	24796312	19699183	+	chr2R	24796312	+	chr2R	5097129
GCAGCCACCTGCCCTAGATACATCAGACCCTGGTAAGTGCACACTTAAATCTAAACAAGATTGGAANTCCCGGCA:1	GCAGCCACCTGCCCTAGATACA	AACAAGATTGGAANTCCCGGCA	-	chr3R	10561919	-	chr3R	10561829	90	+	chr3R	10561829	+	chr3R	10561919
GGAAGTGGGTGGCAGGGGAGGCGGCAAAGGTGGTGCCAGGCCAGAAAATACCGAA:1	GGAAGTGGGTGGCAGGGGAGGC	TGCCAGGCCAGAAAATACCGAA	-	chrX	19791774	-	chrX	3399069	16392705	+	chrX	3399069	+	chrX	19791774
TCTTTGACATTCCCACCAAGCACTNAAACTGGGCTTCTACTCNTCNAAGGANTTCNGACTCGACTCGGATGCTTG:1	TCTTTGACATTCCCACCAAGCA	TCNGACTCGACTCGGATGCTTG	-	chr2R	20031095	-	chr2R	20031002	93	+	chr2R	20031002	+	chr2R	20031095
AATCGAGTGGTGGAGCCCGAAGTCCAGAGACATTCGATAATTAAAAGGCAGCGCACGCGGGAAGGCAAAAGCAA:1	AATCGAGTGGTGGAGCCCGAAG	GCACGCGGGAAGGCAAAAGCAA	-	chrX	13006993	-	chrX	13006847	146	+	chrX	13006847	+	chrX	13006993
CAAAGGAAACAAAACGACAAACTGGTTTCTCCCCCTCCCCTTCCCCTTTT:1	CAAAGGAAACAAAACGACAAAC	CTCCCCCTCCCCTTCCCCTTTT	+	chr3L	6143244	+	chr3L	8873386	2730142	+	chr3L	6143244	+	chr3L	8873386
GTAGCAAGTTCGAGCTGAACTCCAGTCAAACTGTACTTTAAAAGAAAGAAAACATGGGTAGT:1	GTAGCAAGTTCGAGCTGAACTC	AAAGAAAGAAAACATGGGTAGT	+	chr2R	24353444	+	chr2R	24361793	8349	+	chr2R	24353444	+	chr2R	24361793
TTGAGCTTNATTTTGATTTCAATCTAAAACACACAAATAGTTGTGAGGTTCTTTGGAGGTGTTCGCTTTTCGAAG:1	TTGAGCTTNATTTTGATTTCAA	TGGAGGTGTTCGCTTTTCGAAG	+	chrX	7554375	+	chrX	13153543	5599168	+	chrX	7554375	+	chrX	13153543
GCTATACATAATTAATTTTATATGGATATCATAGCCTAATAGTTCTATGAATATTTTACAGAAATAAAGTTCATT:1	GCTATACATAATTAATTTTATA	TTTTACAGAAATAAAGTTCATT	-	chr3L	18436171	-	chr3L	18436073	98	+	chr3L	18436073	+	chr3L	18436171
GCTAAATACCGATTGGGAACTGTCCGCACCACTCCCCTAAAACTAATTATAATATTTTCGCCTTTTGCGATCG:1	GCTAAATACCGATTGGGAACTG	ATATTTTCGCCTTTTGCGATCG	+	chr3L	21407002	+	chr3L	21407079	77	+	chr3L	21407002	+	chr3L	21407079
ACACAAACATCAAGAATACGAATATGTTTTATTCGCGTGCNTTTTATTTATTTCCTATTTATTTTCTCNTCT:1	ACACAAACATCAAGAATACGAA	TTTCCTATTTATTTTCTCNTCT	-	chrX	5592328	-	chrX	20320739	14728411	+	chrX	20320739	+	chrX	5592328
GACTTGGATATGGTATATGGTATATGGCACTCTGATGTCTTGATATAGTGATCA:1	GACTTGGATATGGTATATGGTA	TGATGTCTTGATATAGTGATCA	+	chr2L	19342713	+	chr2L	8962232	10380481	+	chr2L	19342713	+	chr2L	8962232
CTTTCATCTGCTGTGTGTATGTCGATGACCTGGATAAAAGTCATTTNAAATTAAGATCAA:1	CTTTCATCTGCTGTGTGTATGT	AGTCATTTNAAATTAAGATCAA	-	chr2R	3819057	-	chr2R	3818956	101	+	chr2R	3818956	+	chr2R	3819057
GTAACTATCAATCAACTTTTNGCAAGACAAGTNAGCCTAAACNCGTCATCTACACATAAATCCGTTGAGTTAA:1	GTAACTATCAATCAACTTTTNG	ACACATAAATCCGTTGAGTTAA	-	chr2R	24008517	-	chr2R	24008433	84	+	chr2R	24008433	+	chr2R	24008517
GTTTGCCAGCTGATGGATACCGCAGGAGGAAGATATATTACAATTGCCGATCACAGGAAACAAATGAA:1	GTTTGCCAGCTGATGGATACCG	CCGATCACAGGAAACAAATGAA	-	chr3R	29841508	-	chr3R	17325210	12516298	+	chr3R	17325210	+	chr3R	29841508
TTCCCCGGTTATGTAGGGATTTGTCATCAAGGATTTGTTAGGTGAGTATTTCACATGGGCTTAAGCGCAGTGC:1	TTCCCCGGTTATGTAGGGATTT	CACATGGGCTTAAGCGCAGTGC	-	chr2R	18402587	-	chr2R	18402501	86	+	chr2R	18402501	+	chr2R	18402587
CATAGACCCCATTCAACCCTCAATAGGCTGCTATTGGAATGATGAAGAGTCATGAAATTTAATAAATTTAT:1	CATAGACCCCATTCAACCCTCA	TCATGAAATTTAATAAATTTAT	-	chr2R	14536369	-	chr2R	14536243	126	+	chr2R	14536243	+	chr2R	14536369
AAATATTACAACAATTTGCATAAAGCCTGTTACTGTTACGATTTNGAGACGAC:1	AAATATTACAACAATTTGCATA	ACTGTTACGATTTNGAGACGAC	-	chr3L	14296473	-	chr3L	14296009	464	+	chr3L	14296009	+	chr3L	14296473
ATTTATATGCCAAGTACTCTTCACTTCTCTTCTCCTATTCTCTAGCTTTTC:1	ATTTATATGCCAAGTACTCTTC	TTCTCCTATTCTCTAGCTTTTC	+	chrX	10462079	+	chrX	21381540	10919461	+	chrX	10462079	+	chrX	21381540
CTAAGCTCGCGTATTCGGTTCCTGGGATAAGTGCCTGTAAAATAAATGGGTTTGTA:1	CTAAGCTCGCGTATTCGGTTCC	CTGTAAAATAAATGGGTTTGTA	-	chr2L	22546080	-	chr2L	22546003	77	+	chr2L	22546003	+	chr2L	22546080
TGTTAATAAGCAGCTGCGTTTGTGCCATTAAAGTCGGACCCGATTTCGGGTCAAATTATAAATTTGATCACATTA:1	TGTTAATAAGCAGCTGCGTTTG	AATTATAAATTTGATCACATTA	-	chr3R	10905140	-	chr3R	10904936	204	+	chr3R	10904936	+	chr3R	10905140
AATTTTTTCGGAGCTGCCTCCCCTGAGGACTGGCTTCTCATCTAGCCCAAGAAACAGATTACTGATAGACAA:1	AATTTTTTCGGAGCTGCCTCCC	GAAACAGATTACTGATAGACAA	-	chr3R	32022428	-	chr3R	32022329	99	+	chr3R	32022329	+	chr3R	32022428
AATGAATTTCTTTCGGTGTACAAAATAGAAGCCGCTGCGCACGCGCCGCGGTGCCGGTCTGGGCTTTGTTACATA:1	AATGAATTTCTTTCGGTGTACA	CCGGTCTGGGCTTTGTTACATA	+	chr3R	31482377	+	chr3R	31482456	79	+	chr3R	31482377	+	chr3R	31482456
GAGAGCTACACCCACAAGAAGTTCAAAACCGCCGGATACATCCGATTTCCCCATTAATCGCCCCCGCCACGCCCC:1	GAGAGCTACACCCACAAGAAGT	TTAATCGCCCCCGCCACGCCCC	-	chr2L	13225140	-	chr2L	6784136	6441004	+	chr2L	6784136	+	chr2L	13225140
TGGCATATCCGTTGGCCAGAAGAATGTTTGTGTATATGTAGGCAGCCCAAGA:1	TGGCATATCCGTTGGCCAGAAG	TGTATATGTAGGCAGCCCAAGA	-	chr3R	24426542	-	chr3R	24426308	234	+	chr3R	24426308	+	chr3R	24426542
TATATTGATATTCATGCAGTGGCACTTGTATATGGACACCGAGTGCCCGCTGCCCGATAACCGCTAGATGGCGGA:1	TATATTGATATTCATGCAGTGG	CCGATAACCGCTAGATGGCGGA	+	chrX	11312086	+	chrX	11319439	7353	+	chrX	11312086	+	chrX	11319439
TGAATGAATAAATCTGTTTCCGTTGTTCGAACTCGGACATCACATGTATGCTCGCATTGGGCGGTCAAAATGAAA:1	TGAATGAATAAATCTGTTTCCG	GCATTGGGCGGTCAAAATGAAA	+	chr2R	9052733	+	chr2R	9052814	81	+	chr2R	9052733	+	chr2R	9052814
TGCTAATTTTTATCCCAGACCATTTATGCCTTTTTTGCTTTTAATGAATTGAAAGTTGTGATTTTTANGATAAAA:1	TGCTAATTTTTATCCCAGACCA	AGTTGTGATTTTTANGATAAAA	+	chr2L	11540598	+	chr2L	11548000	7402	+	chr2L	11540598	+	chr2L	11548000
ATCCACAAGTTGCACAATGCGCCGCAGCAAATNGCGCCAGTGCACAAAGGAAATTAAGAATCAAACNAAAATAT:1	ATCCACAAGTTGCACAATGCGC	ATTAAGAATCAAACNAAAATAT	+	chr3R	11786496	+	chr3R	20045545	8259049	+	chr3R	11786496	+	chr3R	20045545
TTTCTCCTTTCTTTTAAGAGCTTTGTGTTTCCCGTTTTCCAAATTTTAGAACTGTGGATATG:1	TTTCTCCTTTCTTTTAAGAGCT	AAATTTTAGAACTGTGGATATG	-	chr3R	5627134	-	chr3R	5627031	103	+	chr3R	5627031	+	chr3R	5627134
CGCATGTGTGGATGGCTGGGGGGCATTGGGGCGTGGCTTTGGTCGGGTTNCGCTGGCAGGAAAATGTCATAA:1	CGCATGTGTGGATGGCTGGGGG	CGCTGGCAGGAAAATGTCATAA	+	chr2L	11614080	+	chr2L	11615572	1492	+	chr2L	11614080	+	chr2L	11615572
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAA:2	CACAACACAACACAACACAACA	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
CTTGCTGGACATTTCTGAATTCTACATCTTCTAAGAAATGTCGAGTTNTTTTTATTTTTTTTTTAATNTTTTTT:1	CTTGCTGGACATTTCTGAATTC	TATTTTTTTTTTAATNTTTTTT	+	chr2L	1026774	+	chr2L	21740029	20713255	+	chr2L	1026774	+	chr2L	21740029
GCTAAGTTTAGCATGCATGCCGAAGAGACCGTANATATTTTAAAGCCAGATGCCAAANTGT:1	GCTAAGTTTAGCATGCATGCCG	TTAAAGCCAGATGCCAAANTGT	-	chr3R	28255859	-	chr3R	28253363	2496	+	chr3R	28253363	+	chr3R	28255859
GAGCCAAGCCAAATTGCGGATGGTAAAAAAAAAAATTAAAAATATTGTTGGACTNGGAGGGTTTGCGTCTCGG:1	GAGCCAAGCCAAATTGCGGATG	ACTNGGAGGGTTTGCGTCTCGG	-	chr2R	20599821	-	chr2R	23907345	3307524	+	chr2R	23907345	+	chr2R	20599821
CATTCACCTTTCGCCTTCGCGGGGAATGGCTCTTCTCGTCCACCTCCCACCTCCATCTCCTTCACATCCTCATCC:1	CATTCACCTTTCGCCTTCGCGG	CATCTCCTTCACATCCTCATCC	-	chrX	19992508	-	chrX	19992432	76	+	chrX	19992432	+	chrX	19992508
CAGGCAGCGATCTGCATACATATATATATGTATATGGGCCTGGTGG:1	CAGGCAGCGATCTGCATACATA	TATATGTATATGGGCCTGGTGG	-	chr2L	17914139	-	chr2L	17911990	2149	+	chr2L	17911990	+	chr2L	17914139
CGATACGCATTTACGGACGTATACTCGGAATATCTACANATAAATAATGCCCAGAACATGCCGCATACACACACT:1	CGATACGCATTTACGGACGTAT	GAACATGCCGCATACACACACT	+	chr3L	21765382	+	chr3L	21765463	81	+	chr3L	21765382	+	chr3L	21765463
CAGCAGCCAAATCCCGTGCTGAGGATTTCCATTTGAGATGGAAAATAGACGGGGGAGGGGCGTG:1	CAGCAGCCAAATCCCGTGCTGA	AAATAGACGGGGGAGGGGCGTG	+	chr2L	597307	+	chr2L	597178	129	+	chr2L	597307	+	chr2L	597178
GTAAATTTCATAGTATTTTGGAATTGTTATACTCTCTTGAAAAATTTTTGTTTTATTTTTCATGGTGCACTAA:1	GTAAATTTCATAGTATTTTGGA	TTTATTTTTCATGGTGCACTAA	-	chr2L	14651739	-	chr2L	14642578	9161	+	chr2L	14642578	+	chr2L	14651739
TAGTAAATTCTTATTAGTTAGTAAAAAAGAAAGACATACCCATAAACCGCTCACACTGCCCGCAAAAAGTCAGCG:1	TAGTAAATTCTTATTAGTTAGT	CACTGCCCGCAAAAAGTCAGCG	-	chr3L	1145329	-	chr3L	1145250	79	+	chr3L	1145250	+	chr3L	1145329
AACATTTGCTGACCCCGACGTGATCGGTAACATTTCTTTATCGTGAGCACTTTTGTACATAAATGGCTGCA:1	AACATTTGCTGACCCCGACGTG	CTTTTGTACATAAATGGCTGCA	-	chr3L	25996024	-	chr3L	25995947	77	+	chr3L	25995947	+	chr3L	25996024
GATTAGAAATATGACGAAATAGGGCCCCCGGCAATATTGCCAGTCTACATCGCCGTCGAAAATTCATCTGTA:1	GATTAGAAATATGACGAAATAG	CGCCGTCGAAAATTCATCTGTA	+	chrX	22870882	+	chrX	22870970	88	+	chrX	22870882	+	chrX	22870970
CAAGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGTTCTAAACAAAATACAGCTCAGCACATAATGGGTAAC:1	CAAGGATGGGGTTCTAAGAGTT	AGCTCAGCACATAATGGGTAAC	+	chr3R	19446900	+	chr3R	19447155	255	+	chr3R	19446900	+	chr3R	19447155
CTTTGATATAAAAACCAATATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTGCTTA:1	CTTTGATATAAAAACCAATATT	CCCACAGTGGAGCCTTTGCTTA	+	chr3L	16971226	+	chr3L	16971303	77	+	chr3L	16971226	+	chr3L	16971303
GCGCTTGGTGCGGATTAGTTTGCGCACTGATAGATTGGATCGTATTCTACTTAAGCACGGGGAA:1	GCGCTTGGTGCGGATTAGTTTG	TATTCTACTTAAGCACGGGGAA	+	chr2R	13440210	+	chr2R	13438881	1329	+	chr2R	13440210	+	chr2R	13438881
ACGTGAACACGCAGAGATTTACTCGTCTGGTTTGTGTTTTTAAAAGGCCAACAGGCCGCAGTCAGAACGAA:1	ACGTGAACACGCAGAGATTTAC	AACAGGCCGCAGTCAGAACGAA	+	chr3R	28068518	+	chr3R	28073956	5438	+	chr3R	28068518	+	chr3R	28073956
CTTTGATTTTTCATGCCCAACAAACCGTGGTGCATATGTGCTTTTGATCAGTGATTAATGCGAACAATGCACTT:1	CTTTGATTTTTCATGCCCAACA	GATTAATGCGAACAATGCACTT	-	chr2R	22951918	-	chr2R	22951833	85	+	chr2R	22951833	+	chr2R	22951918
TGTACATACTTGTACACAAGGCCACTTGGCAGGACAGCGGGATTATTGGGAACCTTGAACAAC:1	TGTACATACTTGTACACAAGGC	ATTATTGGGAACCTTGAACAAC	+	chr2L	19716487	+	chr2L	9654376	10062111	+	chr2L	19716487	+	chr2L	9654376
ATGACTTACTGAACATAATGACGTCCAATCGATATAAAAAAAATTTTNTTAAGCTTAATAGTGCATACTTTGGCT:1	ATGACTTACTGAACATAATGAC	CTTAATAGTGCATACTTTGGCT	+	chrX	19595741	+	chrX	19595830	89	+	chrX	19595741	+	chrX	19595830
TAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTNATAGGGANGACAAATGTAATACAGTGCTCANATATA:1	TAATTATGAGTAGGGGGCAAAT	TGTAATACAGTGCTCANATATA	-	chr2R	18372632	-	chr2R	18358421	14211	+	chr2R	18358421	+	chr2R	18372632
TATGCACACACTGGATATATAAATATTATATATTATAACTTGGATAGAACCAAGTTTTTTAACGCGATGG:1	TATGCACACACTGGATATATAA	ACCAAGTTTTTTAACGCGATGG	+	chr2R	6547959	+	chr2R	6548117	158	+	chr2R	6547959	+	chr2R	6548117
ATGCACGCAGGAATAAGTCGTATTTCCTTGTAATACGTAATATTAAAATAGAAATAATAGGGTTCAAAGAAAAC:1	ATGCACGCAGGAATAAGTCGTA	AATAATAGGGTTCAAAGAAAAC	+	chr3L	6001712	+	chr3L	6004411	2699	+	chr3L	6001712	+	chr3L	6004411
AACTCAATGTCGCTTGGGCAAACAAATATGCAGACCAGACCAGACCAGACCAGACAATTTGAGTATCTAAACAG:1	AACTCAATGTCGCTTGGGCAAA	GACAATTTGAGTATCTAAACAG	+	chr3R	25528038	+	chr3R	25528140	102	+	chr3R	25528038	+	chr3R	25528140
CGGATTCGTGAACTCAATTCGATCCCGATCGCCAGATACGCATCATCCGCAATCCGCAGCANAGTGTCCACATGC:1	CGGATTCGTGAACTCAATTCGA	CCGCAGCANAGTGTCCACATGC	-	chr2R	24481487	-	chr2R	7727954	16753533	+	chr2R	7727954	+	chr2R	24481487
TACAAATAAATTTCGCACATAACTTGGNGTNNATCAAACTAAACAGTCANCNAGAATTAGCAAGACTTCGGTTTT:1	TACAAATAAATTTCGCACATAA	GAATTAGCAAGACTTCGGTTTT	+	chr2R	21159025	+	chr2R	21159107	82	+	chr2R	21159025	+	chr2R	21159107
TTTTATTTGATAATTGCAAATGCATTTTCTTTTATCCCTATTTGCTATTAATTAAAATGCAATTTACTCTTTAAT:1	TTTTATTTGATAATTGCAAATG	AAAATGCAATTTACTCTTTAAT	+	chr2R	22037789	+	chr2R	22037871	82	+	chr2R	22037789	+	chr2R	22037871
GGAATGTGTAGGGAAATTTATTTTGCTATGGGAAATAGGAAAACCTTCGTGGTTCTTGAAAACATGGACATATAT:1	GGAATGTGTAGGGAAATTTATT	TCTTGAAAACATGGACATATAT	-	chr2R	7290291	-	chr2R	7290189	102	+	chr2R	7290189	+	chr2R	7290291
AATGTTACGAAAAAAACGTTGTGATTATGCATATGCATATGTGAGTGCTTAAAACAAAGCTAAATGANTTCTGCT:1	AATGTTACGAAAAAAACGTTGT	ACAAAGCTAAATGANTTCTGCT	-	chr3R	22335939	-	chr3R	22335853	86	+	chr3R	22335853	+	chr3R	22335939
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAGCAACATACATTATTTCTTTAGTCA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACATACATTATTTCTTTAGTCA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	20317398	1590137	+	chr3R	21907535	+	chr3R	20317398
AAATACGCACACATTGAACCGCCCATAATCCCTCTGACAATGTGTGTTCTACTTTTTTCGGGTCAACGCTTCGGG:1	AAATACGCACACATTGAACCGC	TTTTTCGGGTCAACGCTTCGGG	-	chr3L	5926529	-	chr3L	5926339	190	+	chr3L	5926339	+	chr3L	5926529
GTTATATATATTTTTGAATCATGGAAAGAGTAAATAGTGAATACGTACGATAATTGATTTGATAGTTATTATATA:1	GTTATATATATTTTTGAATCAT	TTGATTTGATAGTTATTATATA	-	chrX	667754	-	chrX	667670	84	+	chrX	667670	+	chrX	667754
AAACTGCAGAAAAACCAATAAGCAGGACACGTTGGAACACAGCGTCGAGGTGTGTCAAAACGCCCAATTCCCTGA:2	AAACTGCAGAAAAACCAATAAG	GTCAAAACGCCCAATTCCCTGA	+	chr3L	22665012	+	chr3L	22665099	87	+	chr3L	22665012	+	chr3L	22665099
ACTTCCCACTTGGCCAGGACGAAGATTAGCTGCATGCCAGCCATGATTTATGCCGTAGTCCGGGTGAGAGTCAG:1	ACTTCCCACTTGGCCAGGACGA	CCGTAGTCCGGGTGAGAGTCAG	-	chr3L	5476271	-	chr3L	5476191	80	+	chr3L	5476191	+	chr3L	5476271
GGTGAGACAGATTTCTGGACATTCTTTTAAAAAACCGCATTATTAAGAAGTGCAATGGATCTAACACACGCAT:1	GGTGAGACAGATTTCTGGACAT	GCAATGGATCTAACACACGCAT	+	chr3L	2766765	+	chr3L	2766860	95	+	chr3L	2766765	+	chr3L	2766860
ACTTTTCTCCTACTATTCTATTCTTCATAATTACGCTGCTATGCTGTTGGCATAGATCAACGCAAACACATCAA:1	ACTTTTCTCCTACTATTCTATT	TAGATCAACGCAAACACATCAA	+	chr2R	25101288	+	chr2R	25101389	101	+	chr2R	25101288	+	chr2R	25101389
GGTTGCTTATCTGACAGGATGGAGATGAGTCTGGGCTCTTCAGCTTTTGGTGAATGTCACTGAAAA:1	GGTTGCTTATCTGACAGGATGG	TTTTGGTGAATGTCACTGAAAA	+	chr3L	18677906	+	chr3L	18677992	86	+	chr3L	18677906	+	chr3L	18677992
ATAGTTGNCTCAGATCAGGTTGCTTGTATAAAGTAAAGTNTAAATGATTCTTCCATANTGGAACACCTGCAGGGA:1	ATAGTTGNCTCAGATCAGGTTG	CATANTGGAACACCTGCAGGGA	+	chr3L	21868589	+	chr3L	21868679	90	+	chr3L	21868589	+	chr3L	21868679
AATACATCAGAAATAGGTCTTTGAACTGCTTTTAAAAACCTTTGGTTTCTGACTTTTTCGAACATCATCCTTAAA:1	AATACATCAGAAATAGGTCTTT	TTTTTCGAACATCATCCTTAAA	-	chr2L	15355815	-	chr2L	15355737	78	+	chr2L	15355737	+	chr2L	15355815
AAGTTGTTAACTTGGGTAGAAAAAACCTGATTAATCAGGGCTTACTATTATTAGTATGCATTTCCACCACTTTGA:1	AAGTTGTTAACTTGGGTAGAAA	GTATGCATTTCCACCACTTTGA	-	chr2R	12527480	-	chr2R	12527271	209	+	chr2R	12527271	+	chr2R	12527480
TGGAAAAATANAGAAAAAATGTGTAGGGTAAAAAAAAATCCCTTGAGTAAACATAGAGTTGTTTGANTGTGTG:1	TGGAAAAATANAGAAAAAATGT	CATAGAGTTGTTTGANTGTGTG	-	chr3R	18695846	-	chr3R	18695764	82	+	chr3R	18695764	+	chr3R	18695846
ACTTCATTTTAACACACCAATCAATCAGCAATCAACAAAGAACTCTTCTAAAGGGCAGAAACCACAATATCACGG:1	ACTTCATTTTAACACACCAATC	GGCAGAAACCACAATATCACGG	+	chr3L	16969427	+	chr3L	16969653	226	+	chr3L	16969427	+	chr3L	16969653
GTTGTCAAAAATACCAAGCCACGAAATAAAGAATTGCAGTCTCGGTGTCTGCCCATGGACAGAACAAAAAATTCG:1	GTTGTCAAAAATACCAAGCCAC	CATGGACAGAACAAAAAATTCG	-	chr2L	632801	-	chr2L	632721	80	+	chr2L	632721	+	chr2L	632801
CAACCCCTAAAAGAATAAAAAGGACTGGCANNNGNACCAACCCCCGTGCTGGTCCTGTGCTGCCGTGTGCTTTGC:1	CAACCCCTAAAAGAATAAAAAG	CCTGTGCTGCCGTGTGCTTTGC	+	chrX	8640794	+	chrX	20387222	11746428	+	chrX	8640794	+	chrX	20387222
TCAACAAATAATCATTTATTTTGCCACAACATAAAAAATAATTGTCNGAATATGGAATGT:1	TCAACAAATAATCATTTATTTT	TAATTGTCNGAATATGGAATGT	+	chrX	20928939	+	chrX	13057302	7871637	+	chrX	20928939	+	chrX	13057302
CAATCTAAAAATAGCATACCTTTAGGGGTTCTTCGCTTCCAATCAAACAACCGAAACTTTTTCACACCAACCACC:1	CAATCTAAAAATAGCATACCTT	AAACTTTTTCACACCAACCACC	+	chrX	5338716	+	chrX	5339969	1253	+	chrX	5338716	+	chrX	5339969
ATATTAAATTGATTTGCATTTCGGAGCCACTCATTTAAATAGTGCCACCCAATCCCTTTGTCTGGCCATTAGGCG:1	ATATTAAATTGATTTGCATTTC	CCCTTTGTCTGGCCATTAGGCG	-	chrX	2900042	-	chrX	2899932	110	+	chrX	2899932	+	chrX	2900042
AATAGGAATTCTTAATTTGAACAAATTTAAAAATTAGATGAAAATTTCAATAAAATGTAATGTTTGAAGAGTAGA:1	AATAGGAATTCTTAATTTGAAC	AATGTAATGTTTGAAGAGTAGA	+	chr3R	23360184	+	chr3R	23360260	76	+	chr3R	23360184	+	chr3R	23360260
AAGTTACTGGGCTCTGGACAGCTGATGGCCAGTGGATCCGATGACCGAGATTTGCCCAGTTAAGTGG:1	AAGTTACTGGGCTCTGGACAGC	CGAGATTTGCCCAGTTAAGTGG	-	chr3L	11384067	-	chr3L	11383996	71	+	chr3L	11383996	+	chr3L	11384067
GCTTGCCTTGTCGCAATTACAAAGTGTAATTTTTTGTTAGATTCCACAGTATATACAGTATATGAGGCACAAGA:1	GCTTGCCTTGTCGCAATTACAA	ATACAGTATATGAGGCACAAGA	-	chr2L	1686465	-	chr2L	1679001	7464	+	chr2L	1679001	+	chr2L	1686465
CTTTTCACACGCTTTCACTTGAACAAAAACTCAAAAAACTCAGCAAACACACAAAAACAAAGCTGATTCCATGTT:1	CTTTTCACACGCTTTCACTTGA	AAAACAAAGCTGATTCCATGTT	-	chrX	3812001	-	chrX	5313140	1501139	+	chrX	5313140	+	chrX	3812001
ATTTAAAAAAGTCGAATTTAATGCATAGCTGAGTGTGTGGTTCTTATGAAAAACTTGTAACCGACTGACCAGAAA:1	ATTTAAAAAAGTCGAATTTAAT	CTTGTAACCGACTGACCAGAAA	+	chr3R	4606771	+	chr3R	4607120	349	+	chr3R	4606771	+	chr3R	4607120
TTATTGCATACTTTTGGGGTCCAGTTAGAAACAGCCATAATAGTACTTTCCCAAGCTATCTAAAAAGACAGGTGT:1	TTATTGCATACTTTTGGGGTCC	AGCTATCTAAAAAGACAGGTGT	-	chr2R	9183222	-	chr2R	9183140	82	+	chr2R	9183140	+	chr2R	9183222
TCTTGGATCACCGAATCAAATTGGACATCCACCAGGATCACAGAAGCCTGCTAGTTCCAACATACGTCCTCCACC:1	TCTTGGATCACCGAATCAAATT	GTTCCAACATACGTCCTCCACC	+	chr2L	4646028	+	chr2L	4646342	314	+	chr2L	4646028	+	chr2L	4646342
GGACTTCCNAAGATCTCCAAATAAATCGCTATATANAGATACCAAAAACACGCATCGCGACATTTCGATGTTACT:1	GGACTTCCNAAGATCTCCAAAT	ATCGCGACATTTCGATGTTACT	+	chr3R	27215181	+	chr3R	27215257	76	+	chr3R	27215181	+	chr3R	27215257
GTCAATATGGCCAACTACCAAAGGAGAGAAATGGCAGAAGGAGTGCAAAAGTGACTCCGGAACGCGAAAGGAGAG:1	GTCAATATGGCCAACTACCAAA	ACTCCGGAACGCGAAAGGAGAG	+	chr3R	17995328	+	chr3R	17731005	264323	+	chr3R	17995328	+	chr3R	17731005
ATTAAATTAACACAAAGGCATGCCGTGTCAACTTTTTCGGCAATCAATATTATCGCCAGCAC:1	ATTAAATTAACACAAAGGCATG	CAATCAATATTATCGCCAGCAC	-	chr3R	8633254	-	chr3R	8633185	69	+	chr3R	8633185	+	chr3R	8633254
AAAAGCTTTGAAAAACAGTAATTCTGGTAAAACCTTAAAACGACACATTTAGTAAATGAACTAAAATATGAGGAA:1	AAAAGCTTTGAAAAACAGTAAT	AAATGAACTAAAATATGAGGAA	+	chr2L	16447823	+	chr2L	16447902	79	+	chr2L	16447823	+	chr2L	16447902
GAAGAAGGAGCTCTACGCNGGAGATAAGCGAAGTGAGTTGTTTTGATTGCTAAAACAGTCTTCGCTAATCTTNTA:1	GAAGAAGGAGCTCTACGCNGGA	AACAGTCTTCGCTAATCTTNTA	+	chr3R	20066565	+	chr3R	20066801	236	+	chr3R	20066565	+	chr3R	20066801
TGTTACACCTTCCCAACTTACTTCGCTTGTTGCTATTCAGAGATTGCAGTCAGGAAGCTCACTATTTCGATAACG:1	TGTTACACCTTCCCAACTTACT	GAAGCTCACTATTTCGATAACG	+	chr2R	13484550	+	chr2R	13238454	246096	+	chr2R	13484550	+	chr2R	13238454
CAACAAGTAGAGATTACCCGAGATTAATTTGCGGTTTAGTTTTTACTNACTGTAGAAAGTCTACAGGNAATGTTT:1	CAACAAGTAGAGATTACCCGAG	AGAAAGTCTACAGGNAATGTTT	+	chr3R	29238789	+	chr3R	29238903	114	+	chr3R	29238789	+	chr3R	29238903
CTTTAATATATATAATTATAAAAGTGTAAAATTTATTTCAGTGTCCAAGGGGCAGGCGAAAAAAAT:1	CTTTAATATATATAATTATAAA	CCAAGGGGCAGGCGAAAAAAAT	+	chr2R	21200957	+	chr2R	22520816	1319859	+	chr2R	21200957	+	chr2R	22520816
GTGCCCCCCTTCCATCAACTGCCACAATTAGCCTTTTTGATTACCAATAAATACAATCAATGAAGATAACTTTTG:1	GTGCCCCCCTTCCATCAACTGC	CAATCAATGAAGATAACTTTTG	-	chr2L	15000867	-	chr2L	15000993	126	+	chr2L	15000993	+	chr2L	15000867
GAGAACGAGCCCGGTAGCTNCATCATGCCCGGAAAGGTGAATCCCACGCAATGCGAG:1	GAGAACGAGCCCGGTAGCTNCA	GGTGAATCCCACGCAATGCGAG	+	chrX	6683118	+	chrX	6681215	1903	+	chrX	6683118	+	chrX	6681215
GACTTGACTGGATTCCGCCACTTTTAAACAGGTACTTATGCATGCCTCCTTTTGCAGGCCATTTAGGAATGGCCC:1	GACTTGACTGGATTCCGCCACT	GCAGGCCATTTAGGAATGGCCC	-	chr2L	5836726	-	chr2L	5827718	9008	+	chr2L	5827718	+	chr2L	5836726
AAACGACACTACATTAGCCTTATAGCAATTAACAAGGCTTTCCCTTTCGACTGTCTAAGCCCAATTACAGTCTGC:1	AAACGACACTACATTAGCCTTA	TCTAAGCCCAATTACAGTCTGC	+	chr3R	21330877	+	chr3R	21330968	91	+	chr3R	21330877	+	chr3R	21330968
ATATCACAATGTATCTAGAATCTAGCAGATAGGTATCTAGGTATAAAATTCATATAAATACAAAATNCTGATATT:1	ATATCACAATGTATCTAGAATC	ATAAATACAAAATNCTGATATT	+	chr2L	5501462	+	chr2L	5501538	76	+	chr2L	5501462	+	chr2L	5501538
GGTTGTCTTAAAGCGATTGTAACGGTAGAAATTATTCGTACCANGAANATGTCATTAGCCGACTGGCNAACATCT:1	GGTTGTCTTAAAGCGATTGTAA	ATTAGCCGACTGGCNAACATCT	-	chr2L	13152333	-	chr2L	13152255	78	+	chr2L	13152255	+	chr2L	13152333
TAATATAATATCCAACAAGTGGTTTTCCCAACAGCTTCCACCGTTTTTGCCTATTTAAAACACATTTTAAATGGC:1	TAATATAATATCCAACAAGTGG	TTTAAAACACATTTTAAATGGC	-	chr3L	2257011	-	chr3L	2290005	32994	+	chr3L	2290005	+	chr3L	2257011
GCAATGCCCAGGGAACCATCGTTATTGGGACCGGCAAAGGCTCCTCTCTAGAAGCAGAGCATTTGTAACTGACAG:1	GCAATGCCCAGGGAACCATCGT	GCAGAGCATTTGTAACTGACAG	-	chr3L	7651539	-	chr3L	2469920	5181619	+	chr3L	2469920	+	chr3L	7651539
GTCTTATTTTGTTAAATTTCTGTTTGGTTTCGTGTTGTTTCTGTTTTGT:1	GTCTTATTTTGTTAAATTTCTG	TTTCGTGTTGTTTCTGTTTTGT	-	chrX	13815160	-	chrX	16059665	2244505	+	chrX	16059665	+	chrX	13815160
ATAGGAGTCCTTGTCTTCAAAATATTTTGTTGTGTAAATTTTCAAAGCTACTTGCCTCGCATACAAAGAAGACAA:1	ATAGGAGTCCTTGTCTTCAAAA	GCCTCGCATACAAAGAAGACAA	+	chr2L	16728696	+	chr2L	5696406	11032290	+	chr2L	16728696	+	chr2L	5696406
CACACACACACACACACACACCGACAAAATGCACAAAAGGAGATGGAAACTATAGACTCGAGGAAAATCTGGC:1	CACACACACACACACACACACC	ATAGACTCGAGGAAAATCTGGC	+	chrX	17971843	+	chrX	5227410	12744433	+	chrX	17971843	+	chrX	5227410
CAATTAAAAGCGCTAAGCACTAAAGAGCATTCCAAGCCTTTCACTCAAAATCATTTGCCTAGCCGCACTCGTAAA:1	CAATTAAAAGCGCTAAGCACTA	TTTGCCTAGCCGCACTCGTAAA	-	chr2L	20804812	-	chr2L	20804727	85	+	chr2L	20804727	+	chr2L	20804812
TCAGTCAGCCAATTCACCGTCATTGTTNATNNAACAGCAATTATGCTAANCNGTTTNAAGGCGCGTCGAGGCCT:1	TCAGTCAGCCAATTCACCGTCA	GTTTNAAGGCGCGTCGAGGCCT	+	chr3L	1219614	+	chr3L	1227346	7732	+	chr3L	1219614	+	chr3L	1227346
GTGAGGTGAAGTCAGAGCCAGAATGACGATGAAATGAGAGAGTTGGGGAGTGGGCCGATTATCTGGATGAGCT:1	GTGAGGTGAAGTCAGAGCCAGA	GGGCCGATTATCTGGATGAGCT	-	chr3L	21177570	-	chr3L	12061556	9116014	+	chr3L	12061556	+	chr3L	21177570
AGGGCAAAGGGGAGTAAGATAGAACGAACAAAAACTGGCCGGAGTTAGGTATATCAAACAGATGTATTTAAAACT:1	AGGGCAAAGGGGAGTAAGATAG	TCAAACAGATGTATTTAAAACT	-	chr2L	9391706	-	chr2L	9391539	167	+	chr2L	9391539	+	chr2L	9391706
GTCAACAGTTGAACGCCCACGTTGTGAAAAGCGACGGGAATGGAAAACCGCTTGAGCCTGCCGAAGGAC:1	GTCAACAGTTGAACGCCCACGT	CCGCTTGAGCCTGCCGAAGGAC	+	chr3R	29472027	+	chr3R	29472114	87	+	chr3R	29472027	+	chr3R	29472114
AAGTGGCCATGTGCACGGTGATGAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCTCTGTCACTTGAAGTAAAGA:1	AAGTGGCCATGTGCACGGTGAT	TCTCTGTCACTTGAAGTAAAGA	+	chrX	2189432	+	chrX	2189508	76	+	chrX	2189432	+	chrX	2189508
GTTCTTAAAGGTTAACTAAGGCTGAATCCCCATCCCTCCAATCCCATAGCCAGGCATCCATTGTACCCCA:1	GTTCTTAAAGGTTAACTAAGGC	GCCAGGCATCCATTGTACCCCA	-	chr3L	21897442	-	chr3L	13421195	8476247	+	chr3L	13421195	+	chr3L	21897442
AAAGTGACACTGCGATAATCGCAAGTCAATAAACGACACTTACAATGGGTAAAAGTCAG:1	AAAGTGACACTGCGATAATCGC	ACTTACAATGGGTAAAAGTCAG	+	chr3R	18891844	+	chr3R	18891911	67	+	chr3R	18891844	+	chr3R	18891911
ATCATAAGCTTATTTCAAATTATCTCAGGGGCTGGAAAGCACATGTAAGTGATAGTGGACGTCATAATATTTT:1	ATCATAAGCTTATTTCAAATTA	ATAGTGGACGTCATAATATTTT	+	chr3R	5001526	+	chr3R	5001992	466	+	chr3R	5001526	+	chr3R	5001992
TAAAACTGCGCCAGGTGCCCNGAGAAAAGCACNCTCGAAGAGNGCTGGAAAGAAGAGAGCCGAAGCCAGCGAAC:1	TAAAACTGCGCCAGGTGCCCNG	AAGAGAGCCGAAGCCAGCGAAC	-	chr3R	16128680	-	chr3R	27597158	11468478	+	chr3R	27597158	+	chr3R	16128680
TTTGAAGGGGCATCGGACAACCGAAATCTGCGGGTGTGTGTGTGTTTGGCCGTATGGTTGAAT:1	TTTGAAGGGGCATCGGACAACC	GTGTTTGGCCGTATGGTTGAAT	+	chrX	551436	+	chrX	558986	7550	+	chrX	551436	+	chrX	558986
AACAACAGCGATGACAATAACAAATACCAGGAATCCAGAGGGGTGCTTCCATGCATAGTCGACGGAGTTGTGA:1	AACAACAGCGATGACAATAACA	TGCATAGTCGACGGAGTTGTGA	+	chr2R	12082784	+	chr2R	1749718	10333066	+	chr2R	12082784	+	chr2R	1749718
CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAANNNANACACAACACGACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1	CACAAACACAAACACAAACACA	CAACACAACACAACACAACACA	-	chr2L	16071771	-	chr2L	16217660	145889	+	chr2L	16217660	+	chr2L	16071771
TGCTCAGGAATAATAATAATGTCTTGATCTGAACTTTTTAAATTTTCTCATTATTTT:1	TGCTCAGGAATAATAATAATGT	TTTTAAATTTTCTCATTATTTT	+	chr3R	29332300	+	chr3R	29332359	59	+	chr3R	29332300	+	chr3R	29332359
AAAAAAATTGCAAAAAATNCCATTGCAAATGCAAATTAGAAGCNGATGGNGAAATTTTTAGGGCGAAAAAAGAAA:1	AAAAAAATTGCAAAAAATNCCA	ATTTTTAGGGCGAAAAAAGAAA	+	chr3L	21772975	+	chr3L	10745427	11027548	+	chr3L	21772975	+	chr3L	10745427
ATACCACTTTTCTCGGATTTCAGCCAAGAAGAAGACGTTGGCTANGAACAAGAACAAGAAGATGGCG:1	ATACCACTTTTCTCGGATTTCA	GAACAAGAACAAGAAGATGGCG	+	chr2R	24727890	+	chr2R	24735390	7500	+	chr2R	24727890	+	chr2R	24735390
CGGTAAAATTTGAATTTGTTTTATTTCGTTAGAAAGCATTTACTGTTTTTTCATTGTGATTGATGGATGCTGG:1	CGGTAAAATTTGAATTTGTTTT	CATTGTGATTGATGGATGCTGG	-	chr2L	21720932	-	chr2L	14453003	7267929	+	chr2L	14453003	+	chr2L	21720932
AGGAAATCGGACAAGTTTGGGTATCAATCTTCCATTGTGGGCTCAAAGACCTCAGCTGGGACCTCTTG:1	AGGAAATCGGACAAGTTTGGGT	AGACCTCAGCTGGGACCTCTTG	+	chr3L	21158622	+	chr3L	21158691	69	+	chr3L	21158622	+	chr3L	21158691
ATTTCAACTCAAATTGCTGCTGTTAATGCTGCTGCTGCTGCAGTGGATTAAAAGCCATAAAAAGCGAAAGTTGAG:1	ATTTCAACTCAAATTGCTGCTG	GCCATAAAAAGCGAAAGTTGAG	-	chrX	8232232	-	chrX	8232155	77	+	chrX	8232155	+	chrX	8232232
CTCGGCATTGAGCATCCTGACCCCCTACTTTCAGTACATTCCAATGACTCCACCTCCGCCATCTTTAACA:1	CTCGGCATTGAGCATCCTGACC	TCCACCTCCGCCATCTTTAACA	-	chr3R	15403752	-	chr3R	14347970	1055782	+	chr3R	14347970	+	chr3R	15403752
ATTAATCAGTTGAGCATATGTTTGTACCATTNCAGCGTAACTCGAGCAAGGTGATGTCCTTCCGANGCGACTGC:1	ATTAATCAGTTGAGCATATGTT	GATGTCCTTCCGANGCGACTGC	+	chr2R	19334677	+	chr2R	19334752	75	+	chr2R	19334677	+	chr2R	19334752
AAATAGGACGCTTTGCGATTGCCTTTAAAGCCAACTTCCCTCCATTTAAATGATAAGCCGGCTGACGAGCTGCCA:1	AAATAGGACGCTTTGCGATTGC	TAAGCCGGCTGACGAGCTGCCA	+	chr2R	14393877	+	chr2R	14393962	85	+	chr2R	14393877	+	chr2R	14393962
TGCAGGCGACTGTGTTTAATGGGCCCATATTACCCAACCACGAA:1	TGCAGGCGACTGTGTTTAATGG	GCCCATATTACCCAACCACGAA	-	chr3R	28364561	-	chr3R	11998453	16366108	+	chr3R	11998453	+	chr3R	28364561
TACGGCTAGTAACCTCTTGCACATAATACATAAGTTTATTAAATTTAAATTGGCTTAGCCTGGCCAGGATTCC:1	TACGGCTAGTAACCTCTTGCAC	GGCTTAGCCTGGCCAGGATTCC	+	chr3R	13464700	+	chr3R	27910590	14445890	+	chr3R	13464700	+	chr3R	27910590
TACAATTTGTAATTTAGATATTGTTTCCCAGATGTGCAGATGTGTGCTTNGAATCAGATCGGTTAGCTTCAGTG:1	TACAATTTGTAATTTAGATATT	ATCAGATCGGTTAGCTTCAGTG	+	chr3R	30210674	+	chr3R	30210753	79	+	chr3R	30210674	+	chr3R	30210753
AATACTTAATGCAAATATTTCCCCTTCCCCTGTTCTTAGCCGATTCTCTCTTTGTCTTCCCCATTTCTCTCAATG:1	AATACTTAATGCAAATATTTCC	GTCTTCCCCATTTCTCTCAATG	+	chr3R	15678409	+	chr3R	21827875	6149466	+	chr3R	15678409	+	chr3R	21827875
GTTTCGAGGGTTGGAGTAGTAACTAAGAATTCTCTTTGACATAAGTTAACTAATATTCTGGAATGCTTGTTCTCT:1	GTTTCGAGGGTTGGAGTAGTAA	TATTCTGGAATGCTTGTTCTCT	-	chr3R	11694844	-	chr3R	11694751	93	+	chr3R	11694751	+	chr3R	11694844
AATCTCATTTGGGCCATGCGGAGATCTCTGCGTAACGAGTGCTTGCGTAACGAGTGAGCAACACACATGTACAT:1	AATCTCATTTGGGCCATGCGGA	AGTGAGCAACACACATGTACAT	-	chrX	1845844	-	chrX	1845745	99	+	chrX	1845745	+	chrX	1845844
AAAACATTACTTTAACTGCGCCTTTTTTTCAGTTTCAAAATGAAAAACTTTCCCGTGCTGATTCATTCCGTAGGC:1	AAAACATTACTTTAACTGCGCC	CGTGCTGATTCATTCCGTAGGC	-	chrX	16651011	-	chrX	16650934	77	+	chrX	16650934	+	chrX	16651011
GGCAACAGCAGCAACAGCAGCAGCAGGCACCGCAGCAACATGCAACATCTATGCTTAGCGCAGTTGGCCATTTGA:1	GGCAACAGCAGCAACAGCAGCA	CTTAGCGCAGTTGGCCATTTGA	+	chr3L	1112065	+	chr3L	17582279	16470214	+	chr3L	1112065	+	chr3L	17582279
AATTAATAGATTGACCACACAAAACACACTCGGGGGCCCTGCACTTCAGCTCATTCATCA:1	AATTAATAGATTGACCACACAA	CTGCACTTCAGCTCATTCATCA	-	chr2L	11560800	-	chr2L	18041225	6480425	+	chr2L	18041225	+	chr2L	11560800
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGGCAGATCAACCAGAGATAACCACTAAAGTGGAANGGAAACA:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	CCACTAAAGTGGAANGGAAACA	+	chr3L	22908067	+	chr3L	4276070	18631997	+	chr3L	22908067	+	chr3L	4276070
AAAAGAACTGTAGTCACATTTAAGCAATTTAAAAAACCTATTAGAGCATTTATTTATGTTACGTTTCCATTTTTT:1	AAAAGAACTGTAGTCACATTTA	TTATGTTACGTTTCCATTTTTT	+	chr2R	20069234	+	chr2R	20071873	2639	+	chr2R	20069234	+	chr2R	20071873
TTTCAGATCCACAAGAACCCCTAGCCATGACCCCTGAGAGACCCTCTGCCATCCGTAGGAATGTCTG:1	TTTCAGATCCACAAGAACCCCT	CTGCCATCCGTAGGAATGTCTG	-	chr3R	21640773	-	chr3R	21640673	100	+	chr3R	21640673	+	chr3R	21640773
GCCAGTTCTCTATTTTGATACCCGCCCCCTTGGCGCTCATACTCTTT:1	GCCAGTTCTCTATTTTGATACC	CCCCTTGGCGCTCATACTCTTT	-	chr3R	30410385	-	chr3R	9174543	21235842	+	chr3R	9174543	+	chr3R	30410385
AAACTGAAACCCATTTACGCAGGAAGCTGCTTTAAACTTAGCTGTCAACTTCAATTACTTTTGCCAAAGTTTT:1	AAACTGAAACCCATTTACGCAG	CAATTACTTTTGCCAAAGTTTT	+	chr3R	27041847	+	chr3R	27041935	88	+	chr3R	27041847	+	chr3R	27041935
CTTTTCGCCCCGCCGACTTTTCATATTTGTGTTATACATATTTATGTTCGCGG:1	CTTTTCGCCCCGCCGACTTTTC	TTATACATATTTATGTTCGCGG	-	chrX	14823977	-	chrX	14818795	5182	+	chrX	14818795	+	chrX	14823977
GAGTTTTTTAAGACATTCCCTAACATTAACAATATATTAAAAAAATAGTAGATATTAACATACAGTTTTGCGGCG:1	GAGTTTTTTAAGACATTCCCTA	ATTAACATACAGTTTTGCGGCG	-	chr3R	5846982	-	chr3R	5846906	76	+	chr3R	5846906	+	chr3R	5846982
ACACCTAATTTAATGCATCCCAAATGACACTTCAACTCGCTTACACTTGAATACGCNTGCCA:1	ACACCTAATTTAATGCATCCCA	TTACACTTGAATACGCNTGCCA	-	chrX	4176969	-	chrX	4176613	356	+	chrX	4176613	+	chrX	4176969
CAACTGATTGAGTTCGCCTCTGCTACGAACTAAACAATGAGCAGAAATTAATTAAAATTCTAGTTATTCGCAACA:1	CAACTGATTGAGTTCGCCTCTG	AAAATTCTAGTTATTCGCAACA	-	chr2R	17490695	-	chr2R	17485925	4770	+	chr2R	17485925	+	chr2R	17490695
AAACTCAATTAAAAGTTTTGCGCATTAGACATACACTGTCTGTGATTAAGCCGGGCCCAAAAACTAGGTTGGCGA:1	AAACTCAATTAAAAGTTTTGCG	GGCCCAAAAACTAGGTTGGCGA	-	chr3R	9811438	-	chr3R	9811360	78	+	chr3R	9811360	+	chr3R	9811438
GCCTTTGCAGGGAGAATAAAATCCCGAAAAATTTATTTGATCAATAATTTGGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GCCTTTGCAGGGAGAATAAAAT	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	10375147	-	chr3R	21907534	11532387	+	chr3R	21907534	+	chr3R	10375147
GATGCATTACCGGCAATTCACCTGAGTTTCAAATGGCTGCAATTGTAAATAGTCCCATGGTCAAATATTTGTGTT:1	GATGCATTACCGGCAATTCACC	CCCATGGTCAAATATTTGTGTT	+	chr3L	2481561	+	chr3L	2481650	89	+	chr3L	2481561	+	chr3L	2481650
ACCAGGTTTCCGAGGAACCAGCCATCTTTCGATCCTGAAGATGTTTTCCTACGAAATAAGATGATTTTTCTATCA:1	ACCAGGTTTCCGAGGAACCAGC	AAATAAGATGATTTTTCTATCA	-	chrX	19662257	-	chrX	19662034	223	+	chrX	19662034	+	chrX	19662257
AAACATTCTTGGGCTGCCTACATATACACAAACATTCTTCTGGCCAACGGATATGCCA:1	AAACATTCTTGGGCTGCCTACA	CTTCTGGCCAACGGATATGCCA	+	chr3R	24426302	+	chr3R	24426542	240	+	chr3R	24426302	+	chr3R	24426542
GTTGCAAAAAAAAAAATGTAGCTGTCTGTGCCATTAATTTCGCCGCTCAATTATGTGCATAAATGCAGCAAAAA:1	GTTGCAAAAAAAAAAATGTAGC	ATGTGCATAAATGCAGCAAAAA	-	chr3L	9938444	-	chr3L	9929666	8778	+	chr3L	9929666	+	chr3L	9938444
ACCAACTTGTTCGACTTTCCATTAATGCATCGTATATTAAATTGAATGCAAACTTTGAATCATCACTNCGATTAG:1	ACCAACTTGTTCGACTTTCCAT	TTTGAATCATCACTNCGATTAG	+	chr2R	19680843	+	chr2R	19680920	77	+	chr2R	19680843	+	chr2R	19680920
GCAATATCTCTTTTACGTTATTTAAAATGATTAAAATTGTTGAACTACAATGGGTATTGTAGATGAAAAAATAAT:1	GCAATATCTCTTTTACGTTATT	GTATTGTAGATGAAAAAATAAT	+	chr2L	16141190	+	chr2L	16146397	5207	+	chr2L	16141190	+	chr2L	16146397
ACTATGTCTAGATGAAAACGCTACTCCTTGCTATGCTGACCACTACTATCTAAAAGCTTAACACAGATTATTTAA:1	ACTATGTCTAGATGAAAACGCT	AAGCTTAACACAGATTATTTAA	+	chr3R	21520127	+	chr3R	21520221	94	+	chr3R	21520127	+	chr3R	21520221
ATGCTCTTAGTCAACTGCATATTCTATGTAATGTCATCCAAGTCAATATTAAATTGAAGCAATTAAATATAGAAC:1	ATGCTCTTAGTCAACTGCATAT	TTGAAGCAATTAAATATAGAAC	-	chr2R	24637000	-	chr2R	24636914	86	+	chr2R	24636914	+	chr2R	24637000
ACTAACATATATTTGAAAAATGAAATGTGTCTACTCATTTCAAATTGTTTCACAGCGAAGCTCAATCCTATTATT:1	ACTAACATATATTTGAAAAATG	AGCGAAGCTCAATCCTATTATT	-	chr3R	6656160	-	chr3R	6655841	319	+	chr3R	6655841	+	chr3R	6656160
GCAANTTGACATTTGCATCCCANTTTGNATATTTATAAANGGCATTGACGGGCCGAACTGAATCAGACATGCATT:1	GCAANTTGACATTTGCATCCCA	CGAACTGAATCAGACATGCATT	-	chr3L	17638366	-	chr3L	8612893	9025473	+	chr3L	8612893	+	chr3L	17638366
AACTGAAAAACTAAAACTATAACTTTGATATAGTTAAAGCAAATATAAATATATGAATTAAAGCAAATTTTCGAA:1	AACTGAAAAACTAAAACTATAA	TGAATTAAAGCAAATTTTCGAA	-	chr3R	14898603	-	chr3R	14898483	120	+	chr3R	14898483	+	chr3R	14898603
TTAAAAACTCGCGTATACGCCATGTTGTCAACTGGTTGGGCAGCAAAAAAACATAGCACACTTTTAAGCTTGAGT:1	TTAAAAACTCGCGTATACGCCA	TAGCACACTTTTAAGCTTGAGT	+	chr3R	26642756	+	chr3R	26643150	394	+	chr3R	26642756	+	chr3R	26643150
CAGACCCTGGTAAGTGCACACTTAAATCTAAACAAGATTGGAACTCCCGGCAATACTGAGGCTAGTACATGGTAT:1	CAGACCCTGGTAAGTGCACACT	TACTGAGGCTAGTACATGGTAT	-	chr3R	10561896	-	chr3R	10561806	90	+	chr3R	10561806	+	chr3R	10561896
CCTGGTATTTATTGGCCCTTTATCTTTGTTCACTTATAGCTCTAATCTAATGACCCTACAACGCCCCATATTTTT:1	CCTGGTATTTATTGGCCCTTTA	CCCTACAACGCCCCATATTTTT	-	chr3L	11340047	-	chr3L	11339965	82	+	chr3L	11339965	+	chr3L	11340047
TAAGTCGTTTATGTATATAGTCTATTTAAATTGTGAACACACCAAGCGTAATCCATAATTATATGAACTCAAAAA:1	TAAGTCGTTTATGTATATAGTC	CATAATTATATGAACTCAAAAA	+	chr3L	13296539	+	chr3L	13296630	91	+	chr3L	13296539	+	chr3L	13296630
CCGGCCTAGAGCCTCGATGTCAAAATAAATAGATGAAAATCCCGCTTCATCTCTCACTATTTTTATGGAATTCT:1	CCGGCCTAGAGCCTCGATGTCA	CTCACTATTTTTATGGAATTCT	+	chr2R	22511926	+	chr2R	22512012	86	+	chr2R	22511926	+	chr2R	22512012
CAAAAAGAAAAAAGAAAAACCAGAGACATATGGAGACGCGACATCATCT:1	CAAAAAGAAAAAAGAAAAACCA	ATATGGAGACGCGACATCATCT	-	chr3L	1996046	-	chr3L	10248396	8252350	+	chr3L	10248396	+	chr3L	1996046
CACGTTGAACTTTTTGACGTGTAAGAGAATNNNANGGAAATTATCTTCCCATTGAAATCAAGGATATGGAGCTGC:1	CACGTTGAACTTTTTGACGTGT	GAAATCAAGGATATGGAGCTGC	-	chr2L	17693081	-	chr2L	17692967	114	+	chr2L	17692967	+	chr2L	17693081
ATCAAAATATTTTTGTGTTATTCTTTATTAAGGNAAGAATGCCGACTTCTCTGATGGNGAGTCC:1	ATCAAAATATTTTTGTGTTATT	CGACTTCTCTGATGGNGAGTCC	+	chr2R	8455895	+	chr2R	8454941	954	+	chr2R	8455895	+	chr2R	8454941
CTGGAATATGGATGGTCGATGGTCGATTGGTGCCTGGTGCCTGGCATTGTTATTGGGTCGAAGGTGAGCCCTCGA:1	CTGGAATATGGATGGTCGATGG	TGGGTCGAAGGTGAGCCCTCGA	-	chr2L	9202137	-	chr2L	9202061	76	+	chr2L	9202061	+	chr2L	9202137
CTTCCCAAGTTCANCAACAGCCTTAAGCTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTCGGAG:1	CTTCCCAAGTTCANCAACAGCC	GCTGACCGAAAGCTCCTCGGAG	-	chr3L	22572193	-	chr3L	22572120	73	+	chr3L	22572120	+	chr3L	22572193
GAAAGAAAGAAGTAGAAATTGCTTAAACCATATACATATATGTACTAAAAGCTACGGGTCAAAAAATAAGAATAA:1	GAAAGAAAGAAGTAGAAATTGC	ACGGGTCAAAAAATAAGAATAA	+	chr2R	11793015	+	chr2R	11793100	85	+	chr2R	11793015	+	chr2R	11793100
CAATTAANTGGAAAATAATAAATTCAGAAATGTGTGTTGNCAACAATGATTTAGAGANTGAATGAAAGCAAAAGC:1	CAATTAANTGGAAAATAATAAA	GAGANTGAATGAAAGCAAAAGC	+	chr2R	12707541	+	chr2R	12715907	8366	+	chr2R	12707541	+	chr2R	12715907
CGCACTCGACATCGCAACTCATATGCACACACCCACACACCCACATACACATGCAGCCATACATATGTGTGGGA:1	CGCACTCGACATCGCAACTCAT	GCAGCCATACATATGTGTGGGA	+	chr2L	19627321	+	chr2L	19627408	87	+	chr2L	19627321	+	chr2L	19627408
TGGGTTGAGTTGGGTATGCCATGCTAGCCAGAAAACTGAACTGAAACGACAAGACTGTTGCGCGCAGGGGAAATG:1	TGGGTTGAGTTGGGTATGCCAT	ACTGTTGCGCGCAGGGGAAATG	-	chr3L	9907964	-	chr3L	9907887	77	+	chr3L	9907887	+	chr3L	9907964
TAATTCCAACTCAGAAGAATGTTCAAAGATGTTTTTCCCACTTGCATCGCCGACTTGTTTTTGAAAAAATTCTGT:1	TAATTCCAACTCAGAAGAATGT	CTTGTTTTTGAAAAAATTCTGT	-	chr2R	25159339	-	chr2R	25141649	17690	+	chr2R	25141649	+	chr2R	25159339
CAAAAGGCAAGGAAAAACGGAGAAAAAGAGGAAAAGCATAAGCGCACATAGCCTGCAAGCTAGAAATCAAATGCA:1	CAAAAGGCAAGGAAAAACGGAG	TGCAAGCTAGAAATCAAATGCA	-	chr3R	30806396	-	chr3R	31545162	738766	+	chr3R	31545162	+	chr3R	30806396
GTTTCTGGTCGCTGAGAAATATACAAAGCTGCTGGCCAGCTTGCATTTTCGCTTCCACAA:1	GTTTCTGGTCGCTGAGAAATAT	GCTTGCATTTTCGCTTCCACAA	-	chr2R	4242451	-	chr2R	23139712	18897261	+	chr2R	23139712	+	chr2R	4242451
TGGTGGCCCAAACGCACTGGCCAACTTGGCGACTGAGAGTAAAANGCGAAAAGCGCAC:1	TGGTGGCCCAAACGCACTGGCC	GAGTAAAANGCGAAAAGCGCAC	+	chr3L	8285485	+	chr3L	8285575	90	+	chr3L	8285485	+	chr3L	8285575
AAATAACTAAGATGTTTGCCAGTCGGCTAATGACATGTTCATGGTACGAATAATTTCTACCGTTACCATCGCTT:1	AAATAACTAAGATGTTTGCCAG	ATTTCTACCGTTACCATCGCTT	+	chr2L	13152246	+	chr2L	13152323	77	+	chr2L	13152246	+	chr2L	13152323
GGTAAACAAAAAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAGAAAAATGTCGAAGGAAACTTAAATTGTTA:1	GGTAAACAAAAAGCTCTACAGT	TCGAAGGAAACTTAAATTGTTA	+	chr2L	9393518	+	chr2L	9396484	2966	+	chr2L	9393518	+	chr2L	9396484
ATTTTTTAAGAACAATGAAGGACCAGTCAGTGAGCATCAGAAACGTCAATCTTTAGTTGGCAAAGGCTTCTGGC:1	ATTTTTTAAGAACAATGAAGGA	TTAGTTGGCAAAGGCTTCTGGC	-	chr3L	25842576	-	chr3L	25842491	85	+	chr3L	25842491	+	chr3L	25842576
GCCAGGGCAAGGACAGGCAGCAAAAAAGGCAAGCGAAGCCGAAGTTGCGAGCGAGAGAGAGAGAATGGGAGAAAA:1	GCCAGGGCAAGGACAGGCAGCA	AGAGAGAGAGAATGGGAGAAAA	-	chr3R	6129756	-	chr3R	14098766	7969010	+	chr3R	14098766	+	chr3R	6129756
CACTCCGGCAATGTTTCGTTAAGCTCAAATATAAAGTCAGATAAACTCTGTGAAAAACTAGCGCACAACCATG:1	CACTCCGGCAATGTTTCGTTAA	GAAAAACTAGCGCACAACCATG	-	chr3R	16073541	-	chr3R	16073439	102	+	chr3R	16073439	+	chr3R	16073541
TAACTGGCTGCCTGGCTGCCTGGCTGGCTGGAGGNCCTCGATGGCCAAATGGCACGACACATGCCCCATGATTTT:1	TAACTGGCTGCCTGGCTGCCTG	ACGACACATGCCCCATGATTTT	-	chrX	20021108	-	chrX	16263185	3757923	+	chrX	16263185	+	chrX	20021108
GACCATATTGTACAGGAAGTGGAAAATGACTTTATTATACTCAAAGCTTTGAGAAAGTTTTATCAAATCTTATAG:1	GACCATATTGTACAGGAAGTGG	AAAGTTTTATCAAATCTTATAG	+	chr3R	7021680	+	chr3R	7021787	107	+	chr3R	7021680	+	chr3R	7021787
CTCAAAGTGCGAGTAAATCCCATGCCATTCCGTTCTATTCACTCCTATTTTGTTTTTATTCCGTGTCCAAAGTT:1	CTCAAAGTGCGAGTAAATCCCA	TTTTTATTCCGTGTCCAAAGTT	-	chrX	8772716	-	chrX	14089153	5316437	+	chrX	14089153	+	chrX	8772716
ATGATGTGCCAAGTATCTAGGCGTGTCAGCACAAATAAAAAACATATAATCGACAAATTACTTTCACTCAAAACA:1	ATGATGTGCCAAGTATCTAGGC	CAAATTACTTTCACTCAAAACA	-	chr3R	26907468	-	chr3R	26907373	95	+	chr3R	26907373	+	chr3R	26907468
ACAACACAACACAACACAACACAACACATCTGCCATGTGGCGCTGCTACCAACTTTGGCCACCATCNGCC:1	ACAACACAACACAACACAACAC	CCAACTTTGGCCACCATCNGCC	+	chr3R	21907536	+	chr3R	15033778	6873758	+	chr3R	21907536	+	chr3R	15033778
CGGCACTTGACGCGTGGTGTGTGTGAGTATATATGTGTGTGTGTGCGTGTGCG:1	CGGCACTTGACGCGTGGTGTGT	TATGTGTGTGTGTGCGTGTGCG	+	chr2R	10948049	+	chr2R	10955578	7529	+	chr2R	10948049	+	chr2R	10955578
CAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGGGTAATTTAT:1	CAGAATGTGCGTGGAGAATGCG	CATACTTTTTGGGGTAATTTAT	-	chr2L	12863164	-	chr2L	12861701	1463	+	chr2L	12861701	+	chr2L	12863164
AGCATTGTAAGCAATACTATAGTTTTGAGTTGATTAAGTTCTGGAAGTTGGTTTTTTAGAACTGTAACTAAAGAG:1	AGCATTGTAAGCAATACTATAG	TTTTAGAACTGTAACTAAAGAG	+	chr3R	29079399	+	chr3R	29080771	1372	+	chr3R	29079399	+	chr3R	29080771
TGAAACCGCTTCCGGAGCTGCTAAAATTAAATTATTCATATTAATGCAT:1	TGAAACCGCTTCCGGAGCTGCT	TAAATTATTCATATTAATGCAT	-	chr3L	6450963	-	chr3L	6450755	208	+	chr3L	6450755	+	chr3L	6450963
ATCTCATAAACACATGATATGCTCTACCANCACCCACTTTTATTCCCGCCCTAACAACCGNCATTTGCAATTGGA:1	ATCTCATAAACACATGATATGC	ACAACCGNCATTTGCAATTGGA	+	chr2L	18848057	+	chr2L	20944687	2096630	+	chr2L	18848057	+	chr2L	20944687
TGCGCAACATCATCCACATCTATTGGAGCAGAAGGAACCCACTGAACCCAACCCAAGCTAGAGTACACTCAACAA:1	TGCGCAACATCATCCACATCTA	CAAGCTAGAGTACACTCAACAA	+	chr2L	15468792	+	chr2L	15468877	85	+	chr2L	15468792	+	chr2L	15468877
ATTATGAAAATGACAAATGGAGCGCAAGTGTCCGCCTTCCCGGCCGTAAATGTTTAATTTAA:1	ATTATGAAAATGACAAATGGAG	CGGCCGTAAATGTTTAATTTAA	+	chr2L	11295982	+	chr2L	2058110	9237872	+	chr2L	11295982	+	chr2L	2058110
AATGCTTTCCATGGCAACACTGGCTTTTCGGCATCGGGATTTCCTGCTGCAGCTG:1	AATGCTTTCCATGGCAACACTG	TCGGGATTTCCTGCTGCAGCTG	+	chr3L	901447	+	chr3L	901511	64	+	chr3L	901447	+	chr3L	901511
GTGTTGGAAGGAGCCGCCGGCAGGAGACTAAATTCATTCATAAAACGCACAATCAAAAGTGAAGTTAATGGAGG:1	GTGTTGGAAGGAGCCGCCGGCA	TCAAAAGTGAAGTTAATGGAGG	+	chr3L	7203352	+	chr3L	14207243	7003891	+	chr3L	7203352	+	chr3L	14207243
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAA:2	ACAACACAACACAACACAACAC	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801
AATTGTGCTGATTTAACTCCTCAGCATACACATTTTACATGTTCGTTCGATACATGTGAACACATTTTTTCCCAT:1	AATTGTGCTGATTTAACTCCTC	ATGTGAACACATTTTTTCCCAT	+	chr3L	4607291	+	chr3L	4607382	91	+	chr3L	4607291	+	chr3L	4607382
CTCTTAAAGAGGCAAAAAAAACCTGGTAAACGATCGCACCTTCAACATACGGCCANCATTTTTAGGCCATCAT:1	CTCTTAAAGAGGCAAAAAAAAC	GCCANCATTTTTAGGCCATCAT	+	chr2R	5947938	+	chr2R	5948087	149	+	chr2R	5947938	+	chr2R	5948087
CTCTTTAAACCATCCTTTTTCTATATGCACAGTTACCCGTTGAAAAGTGAACAGCCTGCTGTTGACCTTTTCTTA:1	CTCTTTAAACCATCCTTTTTCT	GCCTGCTGTTGACCTTTTCTTA	-	chr3R	11130221	-	chr3R	11130132	89	+	chr3R	11130132	+	chr3R	11130221
GGCACAAAGTCGCCGCGGATATAAAACTGAGCTCGAATATTTCGTATAATTTATGCGAAAAACATTAGGGAAA:1	GGCACAAAGTCGCCGCGGATAT	TATGCGAAAAACATTAGGGAAA	-	chr3R	30747629	-	chr3R	30747555	74	+	chr3R	30747555	+	chr3R	30747629
TCTCTGCGAGTATATTCAAACAGTTGGCGGAGGGACCATTTCCGTCTAATTAGCATTTTGAGCCAGTCCAGTTG:1	TCTCTGCGAGTATATTCAAACA	GCATTTTGAGCCAGTCCAGTTG	+	chr2R	24707865	+	chr2R	24707943	78	+	chr2R	24707865	+	chr2R	24707943
ATTAAGTGAAGTGCAAGCCAACCAAACAAACAAAGGAACACCANAGCTTCAATGAGAAGCAACAGCCGCCACAGA:1	ATTAAGTGAAGTGCAAGCCAAC	GAGAAGCAACAGCCGCCACAGA	-	chr2L	13053947	-	chr2L	683650	12370297	+	chr2L	683650	+	chr2L	13053947
CAACGCTAAGCCCGTCTCGTCCCCTCCCCCTCGTTGACCGCCAGAATGATAATTTGTTT:1	CAACGCTAAGCCCGTCTCGTCC	CCGCCAGAATGATAATTTGTTT	+	chr3R	29971270	+	chr3R	29971341	71	+	chr3R	29971270	+	chr3R	29971341
TAAGGAACTCTTCCTTTGTCAAGATTTTGCATGCTTCTTTTNTTTTTCCACTTACCTTGAAGATAAANTGTCCC:1	TAAGGAACTCTTCCTTTGTCAA	TACCTTGAAGATAAANTGTCCC	-	chr2L	9156653	-	chr2L	9156576	77	+	chr2L	9156576	+	chr2L	9156653
ATCTAAATCATTAATTCGTTTGACCCCGCNTCACACCAAGGCCACCACCACCCACTTT:1	ATCTAAATCATTAATTCGTTTG	CAAGGCCACCACCACCCACTTT	+	chr3R	12379628	+	chr3R	12862693	483065	+	chr3R	12379628	+	chr3R	12862693
CATGGCAACTTGGCGAAACAAAGTGAGACGAAAAGTTTTCGGAAAGAGACAAGAGCAAAAAATGTGTGTATGTGT:1	CATGGCAACTTGGCGAAACAAA	AGCAAAAAATGTGTGTATGTGT	-	chr2L	12759325	-	chr2L	12759230	95	+	chr2L	12759230	+	chr2L	12759325
AAAAAGCTGACAGCCAAAAGAAAAACGCCAAGTTGACATCCATTTTCTCTCTCACTGCACTACAGCTGCAAACTT:1	AAAAAGCTGACAGCCAAAAGAA	ACTGCACTACAGCTGCAAACTT	-	chrX	13398007	-	chrX	20927790	7529783	+	chrX	20927790	+	chrX	13398007
AACAGCAAAGTCGAATTCCTTAGATACTAATACTCCTTTTTCGGAGCCAAATATTTTTAATGTTGTCGCCGCT:1	AACAGCAAAGTCGAATTCCTTA	TATTTTTAATGTTGTCGCCGCT	-	chr2R	2508458	-	chr2R	2508322	136	+	chr2R	2508322	+	chr2R	2508458
ACATACTTTAACTTACATAGAAAGACGTTAATATTAATGCTTATTACCTTTTCGGGAAGTCCCC:1	ACATACTTTAACTTACATAGAA	ATTACCTTTTCGGGAAGTCCCC	-	chr3R	15135130	-	chr3R	15132081	3049	+	chr3R	15132081	+	chr3R	15135130
GCAGCTTTGGTGCAATTTCCATGGATATCATTTCCTGACCCAACAACTTNTGCAGCACCTTGTGCTCCTCCATCT:1	GCAGCTTTGGTGCAATTTCCAT	AGCACCTTGTGCTCCTCCATCT	+	chr2R	23345519	+	chr2R	13873453	9472066	+	chr2R	23345519	+	chr2R	13873453
ACAATCCATAAACTTTATAAGAAATATGTGCTATATTTTATAGAAGGTTTCTCCCTTTCCCATGACNACATTATG:1	ACAATCCATAAACTTTATAAGA	CCTTTCCCATGACNACATTATG	-	chr2L	7867689	-	chr2L	7867595	94	+	chr2L	7867595	+	chr2L	7867689
CTTTATAGTGCATAAATTATTCAATGAACCCCATGCCAGCACGAGTCGGCGGCTTCCTGG:1	CTTTATAGTGCATAAATTATTC	GCACGAGTCGGCGGCTTCCTGG	-	chr3R	26655021	-	chr3R	10928866	15726155	+	chr3R	10928866	+	chr3R	26655021
GGCATGCAAGCCCATAAGTTCCAGCAAATACAACNCTCACCATTCACATTATGACTGAATGCATCTCGAAAATCA:1	GGCATGCAAGCCCATAAGTTCC	ACTGAATGCATCTCGAAAATCA	-	chr3R	20118108	-	chr3R	20118022	86	+	chr3R	20118022	+	chr3R	20118108
TTCGACTGGTTAATTTGTCATGTTGCAAAATGTATATAAGTATGTTTGGTTAATAATTTAAACGAT:1	TTCGACTGGTTAATTTGTCATG	TTTGGTTAATAATTTAAACGAT	+	chr2R	9510691	+	chr2R	9510798	107	+	chr2R	9510691	+	chr2R	9510798
CAACTGGGAACTTGGGTACTTGTGATTAGCGGCCCTAGAGAGCGCGAAAAGAAAGTGAAATCGGCTGCCATGAA:1	CAACTGGGAACTTGGGTACTTG	AAGTGAAATCGGCTGCCATGAA	+	chr2R	9832882	+	chr2R	9832970	88	+	chr2R	9832882	+	chr2R	9832970
AATGATTACTTTTTGGATCCATCTCATAAGCGGTCTGCCGGGCATGCGCGTGCTGCCAGCCAAGTG:1	AATGATTACTTTTTGGATCCAT	TGCGCGTGCTGCCAGCCAAGTG	-	chr3R	13062718	-	chr3R	5685991	7376727	+	chr3R	5685991	+	chr3R	13062718
AAAGTTTTTAGCAAGGTTTTNCTTTCAATAAANCCGGGCTGANCAAGAACAACAAATCGTGAGAAATGGTTATAT:1	AAAGTTTTTAGCAAGGTTTTNC	AAATCGTGAGAAATGGTTATAT	+	chrX	20484392	+	chrX	20484497	105	+	chrX	20484392	+	chrX	20484497
AACAACATNGGACATAGCAACTATGACTGCACTCCAAAATCAACAGCTTTGATTCATTCGATGCACTTNGCGG:1	AACAACATNGGACATAGCAACT	ATTCATTCGATGCACTTNGCGG	+	chr3R	26434107	+	chr3R	26434186	79	+	chr3R	26434107	+	chr3R	26434186
CGCGTCAATATTTAATAGCGCTCCGAGCCTCGTTCCCAAGCCATTCTTCATGTCGCGCAGAAATGAGA:1	CGCGTCAATATTTAATAGCGCT	TTCATGTCGCGCAGAAATGAGA	-	chr3R	6575313	-	chr3R	6575185	128	+	chr3R	6575185	+	chr3R	6575313
AGTATTAGAGTGNTCTCCACATTGCAAATGNTNAGTGANGAATTTTGGTGGTCAACGAGTTTGTTTTGCGGCTC:1	AGTATTAGAGTGNTCTCCACAT	CAACGAGTTTGTTTTGCGGCTC	-	chr3R	15892732	-	chr3R	15892652	80	+	chr3R	15892652	+	chr3R	15892732
TGGGTGGTGCAAGTGGTGCAAGGGGTGGCTGCTGGTGGGGG:1	TGGGTGGTGCAAGTGGTGCAAG	AAGGGGTGGCTGCTGGTGGGGG	+	chr3L	3800298	+	chr3L	6437577	2637279	+	chr3L	3800298	+	chr3L	6437577
CCTTAGTCTTGATTAGAAATAATTGGGTTTCGGGTTTCCTACATATCCGACTTGTTCGACTAAGTTGGGCCATTT:1	CCTTAGTCTTGATTAGAAATAA	GTTCGACTAAGTTGGGCCATTT	+	chr2L	5633625	+	chr2L	5633711	86	+	chr2L	5633625	+	chr2L	5633711
AAAAAGCGATGGAGGAGAAGCACTACAAAATAATCCAACGCAAAGAGAGGTGCCCGGGCGGTGATTAAA:1	AAAAAGCGATGGAGGAGAAGCA	AGGTGCCCGGGCGGTGATTAAA	+	chr3R	12214353	+	chr3R	12214438	85	+	chr3R	12214353	+	chr3R	12214438
ATGGCTAACAAGCAGCACATCACTTTGCCTTTAACTTGAATGTGTGTGTGTAAGTAAGTAACAACCAACTCTGTG:1	ATGGCTAACAAGCAGCACATCA	GTAAGTAACAACCAACTCTGTG	+	chr2R	14467291	+	chr2R	14476443	9152	+	chr2R	14467291	+	chr2R	14476443
AAACACCCGCATTACTCTCCCACCCTCTCACAACTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	AAACACCCGCATTACTCTCCCA	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	11118652	-	chr3R	21907534	10788882	+	chr3R	21907534	+	chr3R	11118652
TGTTGGCTTTGCCTGAATATCTCTTTGTAAATTTTCGGGTGCAAGGT:1	TGTTGGCTTTGCCTGAATATCT	TGTAAATTTTCGGGTGCAAGGT	-	chr3L	14286800	-	chr3L	6504258	7782542	+	chr3L	6504258	+	chr3L	14286800
ATACATCAGACCCTGGTAAGTGCACACTTAAATCTAAACAAGATTGGAACTCCCGGCAANACTGAGGCTA:1	ATACATCAGACCCTGGTAAGTG	ACTCCCGGCAANACTGAGGCTA	-	chr3R	10561902	-	chr3R	10561817	85	+	chr3R	10561817	+	chr3R	10561902
CATAAATATGTAATCCTATTGGATTTTGATTTCTATCATTTATTTATCGACTACCAGAATATATTTCTCAGTGTG:1	CATAAATATGTAATCCTATTGG	CCAGAATATATTTCTCAGTGTG	-	chr3L	3891061	-	chr3L	3890980	81	+	chr3L	3890980	+	chr3L	3891061
CGTAGTAGGCCATGACAAAGCGCAGATCGCTGGACGACGCATTTGTTAGTCAGTGGCATTGG:1	CGTAGTAGGCCATGACAAAGCG	ATTTGTTAGTCAGTGGCATTGG	+	chr3L	1463437	+	chr3L	1463505	68	+	chr3L	1463437	+	chr3L	1463505
TGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT:1	TGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTG	CTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT	+	chr2L	19024097	+	chr2L	21768291	2744194	+	chr2L	19024097	+	chr2L	21768291
CAATTCCGGCTCTGCTCTCAAAAGTTTTTCGGACCGACCAGTGGACGAGAGTAGCAATTTACGCGCAAGTA:1	CAATTCCGGCTCTGCTCTCAAA	AGTAGCAATTTACGCGCAAGTA	+	chr3L	6013034	+	chr3L	11466984	5453950	+	chr3L	6013034	+	chr3L	11466984
CTCATTTCGATCTTAAAAACCATAGAATATTGATTTTTGGTATATTATTTCGAAGTCAAAATATGATAATTTAG:1	CTCATTTCGATCTTAAAAACCA	AAGTCAAAATATGATAATTTAG	-	chr2R	10318628	-	chr2R	10318543	85	+	chr2R	10318543	+	chr2R	10318628
CTAATCCATTGCAGTAAATATCAGTATAATACTGTATGAAACATGGTAAGTGATATTGTACGACACACTGAGAGA:1	CTAATCCATTGCAGTAAATATC	TATTGTACGACACACTGAGAGA	+	chr2R	19536481	+	chr2R	19536563	82	+	chr2R	19536481	+	chr2R	19536563
ATCGAGGAGGAGTCTGTGCATACGACATTGCGATCAAATTTCTGTTTTGGAGCA:1	ATCGAGGAGGAGTCTGTGCATA	ATCAAATTTCTGTTTTGGAGCA	+	chr3L	2631083	+	chr3L	2631172	89	+	chr3L	2631083	+	chr3L	2631172
GAGAAATGCAAACGACTGCGTCGGAAGCTGCTGCGTGGCAATTTCGTATTCCTCATGCGAATTCTTAAGAATCGT:1	GAGAAATGCAAACGACTGCGTC	CATGCGAATTCTTAAGAATCGT	+	chr3R	7286805	+	chr3R	25172858	17886053	+	chr3R	7286805	+	chr3R	25172858
GAGTGGGATTCGNTAAGTTTCTGCATCTGCNGGCGGAGA:1	GAGTGGGATTCGNTAAGTTTCT	TTTCTGCATCTGCNGGCGGAGA	-	chr2R	18856606	-	chr2R	14239477	4617129	+	chr2R	14239477	+	chr2R	18856606
ACTGAATAAACCAACAACAAAATAAATCAATGTAAACAATCGAAANAGTT:1	ACTGAATAAACCAACAACAAAA	AATGTAAACAATCGAAANAGTT	+	chr2L	10655547	+	chr2L	17026656	6371109	+	chr2L	10655547	+	chr2L	17026656
AAGTGTATATGACAGAGCGCAACAACGGCCACATGAAATGTAACCAGAATCGAGTGCAGTCGATGAACCCCATA:1	AAGTGTATATGACAGAGCGCAA	AGTGCAGTCGATGAACCCCATA	+	chr2L	12647712	+	chr2L	12647793	81	+	chr2L	12647712	+	chr2L	12647793
TTTCAGTTAAAGGCCCTCTTCGGCAAATAAATGGCGCAATGCAGCCAAACCCAAAGCCCTAAGAGAGGAATTTAC:1	TTTCAGTTAAAGGCCCTCTTCG	AAGCCCTAAGAGAGGAATTTAC	-	chr2R	24710388	-	chr2R	24714238	3850	+	chr2R	24714238	+	chr2R	24710388
TTGACAAANGGATTGATTTCAATGCCACGTCCCGCNTGTTAATTTGCCGTGCCAAAAGTTTAGGCCT:1	TTGACAAANGGATTGATTTCAA	GCCGTGCCAAAAGTTTAGGCCT	+	chr3R	22846798	+	chr3R	22847011	213	+	chr3R	22846798	+	chr3R	22847011
ATGGCCCATAGCATGTGGGGGTAGGAAATGCGTTNCTCCACATACGAAGGCAGCAACGTCAAGACACTGCCATTG:1	ATGGCCCATAGCATGTGGGGGT	CAACGTCAAGACACTGCCATTG	-	chr3R	20118273	-	chr3R	20118189	84	+	chr3R	20118189	+	chr3R	20118273
GTGCAACTAATTTAGCCCAAAGTGCACTAAAATTAGTATACGATGGCAGTGCTATTAATCTGAACACAACTGTGC:1	GTGCAACTAATTTAGCCCAAAG	ATTAATCTGAACACAACTGTGC	+	chr3R	25239233	+	chr3R	25239344	111	+	chr3R	25239233	+	chr3R	25239344
TCAGTGGATTAGGTAGCCCATAGATAGTTGGTGTGATATATGTGAGGATTATGCACCTTCTGTTAGCTGGG:1	TCAGTGGATTAGGTAGCCCATA	TATGCACCTTCTGTTAGCTGGG	+	chr2R	8160940	+	chr2R	8161026	86	+	chr2R	8160940	+	chr2R	8161026
TATCCAGCGCTCAACTAGTTTATTACCGCCAGACTCCACTGCACTTAGTATATCAATAAAATATAANTCTACTGC:1	TATCCAGCGCTCAACTAGTTTA	CAATAAAATATAANTCTACTGC	+	chrX	3880479	+	chrX	3880565	86	+	chrX	3880479	+	chrX	3880565
GTGACCGCACTTTAAAGCAGTGCCCACCTTGTTGAGCACTATCCGGATCCACAGCTCCTCCTCCCCGGCAGTCAC:1	GTGACCGCACTTTAAAGCAGTG	GCTCCTCCTCCCCGGCAGTCAC	-	chr3L	6372218	-	chr3L	6372133	85	+	chr3L	6372133	+	chr3L	6372218
AACATACTGTTAAGTTTAACTTCCTCTTAAAGCGAAGATGATACCTCTTATTTTCCCCTGTGCACATTGACTGTG:1	AACATACTGTTAAGTTTAACTT	TCCCCTGTGCACATTGACTGTG	+	chr3R	14458895	+	chr3R	14458976	81	+	chr3R	14458895	+	chr3R	14458976
GGAAACCAAATCATTAGCTAGAAAAATTGAAACGAACCGGACTTTTATTGAATTTTTCGTTGCTATCAACT:1	GGAAACCAAATCATTAGCTAGA	GAATTTTTCGTTGCTATCAACT	+	chr2L	17880022	+	chr2L	17880105	83	+	chr2L	17880022	+	chr2L	17880105
CAAGAGCAACCAGCTTGGTCAAGAGGANGANNTTGGCAAGAAGCAGCGANANGCCATGTTGGATACCCTGTTA:1	CAAGAGCAACCAGCTTGGTCAA	NGCCATGTTGGATACCCTGTTA	+	chr2L	5267599	+	chr2L	5265127	2472	+	chr2L	5267599	+	chr2L	5265127
GATTGAGACAGAATGGCAAACGCAATGCATACTCATATTATAACTTTTCCATCTTCCATCAATCTTGNTGGCG:1	GATTGAGACAGAATGGCAAACG	TCTTCCATCAATCTTGNTGGCG	+	chr3L	21799953	+	chr3L	21800036	83	+	chr3L	21799953	+	chr3L	21800036
TACTCCTTATCTGGCGAAAGGTGGGGCATAACACGCTGTGTTATGCTTATCTTGACAGCAAACATTTAAAAAAA:1	TACTCCTTATCTGGCGAAAGGT	TGACAGCAAACATTTAAAAAAA	-	chr3L	22610689	-	chr3L	22610594	95	+	chr3L	22610594	+	chr3L	22610689
AAAACCAAAAAGAGAACGACNCCAAATTCAAANCGCGAACTGNTTAAAAATGAACAACAAATGAAATTCCCATAG:1	AAAACCAAAAAGAGAACGACNC	ACAACAAATGAAATTCCCATAG	+	chr2R	17236541	+	chr2R	17241745	5204	+	chr2R	17236541	+	chr2R	17241745
TAAAACGAAAAAGTTCTAACCGAAATGAATACTAAAGCGTACTTGGATAACATATACAATAC:1	TAAAACGAAAAAGTTCTAACCG	ACTTGGATAACATATACAATAC	+	chr3L	4209846	+	chr3L	4209911	65	+	chr3L	4209846	+	chr3L	4209911
ATNTTGAAAATTATATTTTGGTAAATTTTGAAAANANATTATTCATAAAAAGAGGGTTATTGTTTTGGTTCTTTC:1	ATNTTGAAAATTATATTTTGGT	GGGTTATTGTTTTGGTTCTTTC	+	chr3R	16402630	+	chr3R	16402907	277	+	chr3R	16402630	+	chr3R	16402907
AGACACAGAGCATATGGGAAATGCTATTGCTTTCTCGGACTATGNGGCTAATCAGC:1	AGACACAGAGCATATGGGAAAT	TCGGACTATGNGGCTAATCAGC	-	chr3R	22892719	-	chr3R	17367923	5524796	+	chr3R	17367923	+	chr3R	22892719
TTGGCAAGTTCAAGGTNTAACCTTATCACAAGCCAGTGAGAAAACTTACCCAGGTGGGCTGAAAGAAAA:1	TTGGCAAGTTCAAGGTNTAACC	ACCCAGGTGGGCTGAAAGAAAA	-	chr3L	18896904	-	chr3L	18896775	129	+	chr3L	18896775	+	chr3L	18896904
GGCTGAGCCGCCATCGCCNTTCACACAACTATTCGCAGTTAAGCCGTCCAAGGCCATCTGCATTTCAAATG:1	GGCTGAGCCGCCATCGCCNTTC	AAGGCCATCTGCATTTCAAATG	-	chr3L	19137737	-	chr3L	19137622	115	+	chr3L	19137622	+	chr3L	19137737
ACCCATTCCCATACCCATTCCCATACCCATNTACCCACTCCCGTTTCCCGGTCTCTT:1	ACCCATTCCCATACCCATTCCC	CACTCCCGTTTCCCGGTCTCTT	-	chrX	7144507	-	chrX	16425429	9280922	+	chrX	16425429	+	chrX	7144507
AAGAACGCAGAAGAAATACCAGGGGGGAGCACAAAAAACTGGGCGGCAGACTCGTAAAAATCAACGAGCGGCG:1	AAGAACGCAGAAGAAATACCAG	TCGTAAAAATCAACGAGCGGCG	-	chr2R	15598680	-	chr2R	15598591	89	+	chr2R	15598591	+	chr2R	15598680
TTCCATTTCGTTTATTTCCAGACCGCAAAGCANACGACGGTTTAGGCAATTTTCAATCCTCGAAA:1	TTCCATTTCGTTTATTTCCAGA	AGGCAATTTTCAATCCTCGAAA	+	chr2L	18883875	+	chr2L	18883947	72	+	chr2L	18883875	+	chr2L	18883947
GGCGTAGGCTACAGAGGGAATTGACTGAAACGATTGGAAAGAAGGATTCGCGGTGTACTCGTAATCTGAACTGC:1	GGCGTAGGCTACAGAGGGAATT	GTGTACTCGTAATCTGAACTGC	-	chr2R	24304002	-	chr2R	24303919	83	+	chr2R	24303919	+	chr2R	24304002
AAAAATCGCTGGGCGAACACAAAAGCCACGGACAAACTCAAATAAATTACCCACTCATATTCTCGACGATGCTCA:1	AAAAATCGCTGGGCGAACACAA	CTCATATTCTCGACGATGCTCA	-	chr3L	14099143	-	chr3L	20527256	6428113	+	chr3L	20527256	+	chr3L	14099143
AAAGAACGATGATCTATTAACTGAATTACATCNCTTTCAGTTATGCAGCCTATAGATACTATTATTNAAAATGC:1	AAAGAACGATGATCTATTAACT	TAGATACTATTATTNAAAATGC	-	chrX	12954029	-	chrX	12953892	137	+	chrX	12953892	+	chrX	12954029
CTCAAAAAAATGCTCACACAAACCGAAAGTCGGAAAACAACAACAGAGGCAAACACAGCAGCAGTCATATCACAG:1	CTCAAAAAAATGCTCACACAAA	CACAGCAGCAGTCATATCACAG	+	chr3L	6314595	+	chr3L	15304565	8989970	+	chr3L	6314595	+	chr3L	15304565
AAATGTTCCATGAATCTGAGAAGCACAAAAACATCAAGCCCAAACACACACAGCTCACACACACACACACA:1	AAATGTTCCATGAATCTGAGAA	ACAGCTCACACACACACACACA	+	chrX	8344211	+	chrX	11441772	3097561	+	chrX	8344211	+	chrX	11441772
TTTGCATGCCCCACAAGCCTTTTTCGACATAAAGCCCCGGGCACGATATATACAAATTGGATGTGGTATTGCCAA:1	TTTGCATGCCCCACAAGCCTTT	AAATTGGATGTGGTATTGCCAA	+	chr2L	12736681	+	chr2L	12736757	76	+	chr2L	12736681	+	chr2L	12736757
AAATAACAGAAAAAAAAAACAAAAACGGAAAAAACCGACATATGCTNACAAAAGCCTG:1	AAATAACAGAAAAAAAAAACAA	GACATATGCTNACAAAAGCCTG	+	chr2L	8647387	+	chr2L	2925506	5721881	+	chr2L	8647387	+	chr2L	2925506
TATGAACAGCAGATGCATAGCGAACAAATTTTCACAGTTCAATACACCTTTCCTTTTAGCCACACATCTAATATA:1	TATGAACAGCAGATGCATAGCG	TTTTAGCCACACATCTAATATA	-	chr3L	10035327	-	chr3L	10035240	87	+	chr3L	10035240	+	chr3L	10035327
ATACATTGATTAAAACTATTCGTAGTGCTAAAGCATTTTTTTGTAGACATAAATTTCCTTGTGAATAGCTGG:1	ATACATTGATTAAAACTATTCG	AAATTTCCTTGTGAATAGCTGG	+	chr3L	3254111	+	chr3L	3254199	88	+	chr3L	3254111	+	chr3L	3254199
CTTAAAATTTCGTTTAGTTCTTCCCTACTAGATATTATGAATCAAGATATTATAGGTTGAGATCAGTTCAAGATT:1	CTTAAAATTTCGTTTAGTTCTT	AGGTTGAGATCAGTTCAAGATT	-	chr3L	5103713	-	chr3L	5103633	80	+	chr3L	5103633	+	chr3L	5103713
ATTGTTTGAAGTGATTCCCCTCTGGATCTTCATTGACATTTAAGAAGTATTTCCAAAGAAGCTAGTTATGTT:1	ATTGTTTGAAGTGATTCCCCTC	TTCCAAAGAAGCTAGTTATGTT	-	chr3L	3294228	-	chr3L	3294140	88	+	chr3L	3294140	+	chr3L	3294228
ATCCTCATAATTTCGACGTTTCTGTTTGCATTAATCCAGTTTTTGTTCTAACTCTTTTAAAGATTTTGCATGTTT:1	ATCCTCATAATTTCGACGTTTC	CTTTTAAAGATTTTGCATGTTT	-	chr3L	12012381	-	chr3L	12012302	79	+	chr3L	12012302	+	chr3L	12012381
GGAAAAAAAAGGAAAAACTGTCGCCACATTGGGAAACTCAACTGATAACATGCAAGAA:1	GGAAAAAAAAGGAAAAACTGTC	CTCAACTGATAACATGCAAGAA	-	chr3R	13121177	-	chr3R	21591163	8469986	+	chr3R	21591163	+	chr3R	13121177
GGAGCAGGGAATGGGTATGGCAATTAGATAAAACAAACGCAATGCTGACAAAGGCAGATGGATGGTAATGGG:1	GGAGCAGGGAATGGGTATGGCA	AAGGCAGATGGATGGTAATGGG	+	chr3L	22123864	+	chr3L	5822269	16301595	+	chr3L	22123864	+	chr3L	5822269
TATATGAATAACGTATCTTATGGATTCTCAANTTGTGAACAAAATTCTTTGGGGTTGGTTCGTCAGCATAATG:1	TATATGAATAACGTATCTTATG	GGGTTGGTTCGTCAGCATAATG	-	chr3L	16869667	-	chr3L	16869586	81	+	chr3L	16869586	+	chr3L	16869667
TTCCAGGAAAAGCTTCATGGAAAAGCGTGTTGCATTTTGCACAGTTAGTTAAACAAGGGGTGAGTAAATTT:1	TTCCAGGAAAAGCTTCATGGAA	TAAACAAGGGGTGAGTAAATTT	-	chr3R	10723868	-	chr3R	10723780	88	+	chr3R	10723780	+	chr3R	10723868
TGCCATTTGCTGGTGTGTGAAGTTTTTGGCTTGCCCTTTGTGCGGGTGGG:1	TGCCATTTGCTGGTGTGTGAAG	GCTTGCCCTTTGTGCGGGTGGG	+	chr3R	28132524	+	chr3R	28132581	57	+	chr3R	28132524	+	chr3R	28132581
ATGCGCACACATACCCTCGGTGCTGGATAAATGTAATTCAAATTAAATCAAATATTAAATTCATATTCA:1	ATGCGCACACATACCCTCGGTG	TCAAATATTAAATTCATATTCA	+	chr3R	12022903	+	chr3R	12025074	2171	+	chr3R	12022903	+	chr3R	12025074
ATCCGAGCAAAAGACCTTTTTTTATTATGAATAAGCCGAAATACACAATTATGCCAAAAGGTGTCATACTATGA:1	ATCCGAGCAAAAGACCTTTTTT	GCCAAAAGGTGTCATACTATGA	+	chr3R	4408442	+	chr3R	4412745	4303	+	chr3R	4408442	+	chr3R	4412745
AACTTGAAAAATTTATTAGAGTGCGAAAACAGTCATCGAGAGTGAACATGGGGTAGTCGATCAAACGCAGCTCA:1	AACTTGAAAAATTTATTAGAGT	GTAGTCGATCAAACGCAGCTCA	+	chr2R	5421617	+	chr2R	5421534	83	+	chr2R	5421617	+	chr2R	5421534
ATGATTTCTAGAAAATCACATTAACTGCAATTCACTTTTTCAACATTATTTTTCATGTTTTCCATTCGGTTACA:1	ATGATTTCTAGAAAATCACATT	TCATGTTTTCCATTCGGTTACA	+	chr3L	16443853	+	chr3L	16446192	2339	+	chr3L	16443853	+	chr3L	16446192
TTTTTATATTATTTAATATTAAAAAGTTAAGGAGAAACGACTTATCCGCTTTTTCACAACTCATTTCATTTCGAC:1	TTTTTATATTATTTAATATTAA	TCACAACTCATTTCATTTCGAC	-	chr3L	19488573	-	chr3L	19488491	82	+	chr3L	19488491	+	chr3L	19488573
CAGGATACGGCGAGCCACAAACAAAACTGCNNNANTATTGTTAACCAACAATAACAACAACACAAAGGGGGATGG:1	CAGGATACGGCGAGCCACAAAC	ACAACAACACAAAGGGGGATGG	+	chr3L	5437956	+	chr3L	15288005	9850049	+	chr3L	5437956	+	chr3L	15288005
GCACAACTTTCCACCGCCCACCCGCCGCCATTCTATGAAGCCAAACGAGTTGT:1	GCACAACTTTCCACCGCCCACC	TCTATGAAGCCAAACGAGTTGT	+	chr2R	7630909	+	chr2R	7631328	419	+	chr2R	7630909	+	chr2R	7631328
ACAAAGATTAGATACTTTACCNTTTAATTGCCAGGGTTTTGCGGGGTTTTCGCGAATTCAAGTATACGTGGCGCG:1	ACAAAGATTAGATACTTTACCN	GAATTCAAGTATACGTGGCGCG	-	chr3R	17317679	-	chr3R	17317599	80	+	chr3R	17317599	+	chr3R	17317679
ATTCAAGCCGGAGTCAATGGTTGTATATCGCATCCATAAATTATCGTAACTGTAACAGTCGCGCATGTTT:1	ATTCAAGCCGGAGTCAATGGTT	ACTGTAACAGTCGCGCATGTTT	+	chr2L	9973745	+	chr2L	9980859	7114	+	chr2L	9973745	+	chr2L	9980859
AAGACCGGACCCAGAAAAGTCCATTCTCGTGTTTTTTTTTTGACGCTCTTCGCTGAATTTCATGAATGAATTT:1	AAGACCGGACCCAGAAAAGTCC	GCTGAATTTCATGAATGAATTT	-	chr3L	3451007	-	chr3L	3450921	86	+	chr3L	3450921	+	chr3L	3451007
TGAGTGTACTCTAGCTTGGGTTGGGTTCAGTGNGTTCCTTCTGCTCCAATAGATGTGGATG:1	TGAGTGTACTCTAGCTTGGGTT	TCTGCTCCAATAGATGTGGATG	-	chr2L	15468873	-	chr2L	15468802	71	+	chr2L	15468802	+	chr2L	15468873
ATATTAATTACNCGGCCAGCAGTAACTAGTACCTCCACCTCCTTCCCGTACACCACCCGCCATAATTCTAATGTC:1	ATATTAATTACNCGGCCAGCAG	CACCCGCCATAATTCTAATGTC	-	chr2L	11332162	-	chr2L	11332056	106	+	chr2L	11332056	+	chr2L	11332162
ATATGCACACAATTTTTGTGAATCATTTAAATCATCACTAGTTCTTTTTNACCCTAGGAGATAGACAATTTACTG:1	ATATGCACACAATTTTTGTGAA	CTAGGAGATAGACAATTTACTG	+	chr2R	13431518	+	chr2R	13431597	79	+	chr2R	13431518	+	chr2R	13431597
CGTTTAATTATAGAGATTTTTAAAATCGTAGTATCTTTTTTATGATTATTATTTTGCTTCATTTCGCTTAGCATT:1	CGTTTAATTATAGAGATTTTTA	TTGCTTCATTTCGCTTAGCATT	+	chr3L	3743651	+	chr3L	17128777	13385126	+	chr3L	3743651	+	chr3L	17128777
CTGGACCAAAGTAGTGAAAAAAATCATACACCTAATTTAAGTAGCTTTTACTTACATNTTGTTATATTCTATATA:1	CTGGACCAAAGTAGTGAAAAAA	ACATNTTGTTATATTCTATATA	-	chr3R	22798018	-	chr3R	22797922	96	+	chr3R	22797922	+	chr3R	22798018
TTTTCAAGCTGGACCACATTTTCGAGGACTGTCAGCGGCAGCAAAAGGAACTTTAAGGGAAAAGGATCAGGACGA:1	TTTTCAAGCTGGACCACATTTT	TAAGGGAAAAGGATCAGGACGA	-	chrX	21040470	-	chrX	21045388	4918	+	chrX	21045388	+	chrX	21040470
GAGACGAAAAGTTTTCGGAAAGAGACAAGAGCAAAAAATGTGTGTATGTGTGTACCCAGGGTGCATCAACATAGA:1	GAGACGAAAAGTTTTCGGAAAG	ACCCAGGGTGCATCAACATAGA	-	chr2L	12759301	-	chr2L	12759206	95	+	chr2L	12759206	+	chr2L	12759301
GCTAAGACAGCCTGGAACATGCGTATATGCAGGCCTTACCTCACGTTAGCCCAA:1	GCTAAGACAGCCTGGAACATGC	GCCTTACCTCACGTTAGCCCAA	+	chr3R	6873950	+	chr3R	6874140	190	+	chr3R	6873950	+	chr3R	6874140
ATAGTTGTAAAAGTAAATATTATCACAAGGCGCCAAAATGTTTATTAAAATTTCAANTT:1	ATAGTTGTAAAAGTAAATATTA	ATGTTTATTAAAATTTCAANTT	+	chr3L	482288	+	chr3L	482351	63	+	chr3L	482288	+	chr3L	482351
AAAATATTTTACATGTTTTGAAAGCAATACAAAGTAATTAACATATTCTTCTGTACTCGGTTCATGGCTAATAAG:1	AAAATATTTTACATGTTTTGAA	TACTCGGTTCATGGCTAATAAG	-	chr3R	19340491	-	chr3R	19340414	77	+	chr3R	19340414	+	chr3R	19340491
CCCGGTCTCTTTTGGGGGAACAAATATATAGATGGCATGGAAGCATGGTACCATCTACCTGCTTGA:1	CCCGGTCTCTTTTGGGGGAACA	ATGGTACCATCTACCTGCTTGA	+	chrX	4613566	+	chrX	4613647	81	+	chrX	4613566	+	chrX	4613647
CTGTAGCTTTATTTCTTAAAACTTTTTACACTGATCAAGAAATAATATAAAACTGGGGTAATATGTGAAACTGGG:1	CTGTAGCTTTATTTCTTAAAAC	TGGGGTAATATGTGAAACTGGG	-	chr3L	6706504	-	chr3L	6706425	79	+	chr3L	6706425	+	chr3L	6706504
AGCAATGGTAGTGCCTTCTTGCACTTGTTGCCTCGCCTTTGCTAATTNTTCGCCATGCACTCGAGACTTTGTA:1	AGCAATGGTAGTGCCTTCTTGC	GCCATGCACTCGAGACTTTGTA	-	chr3L	3281955	-	chr3L	3281461	494	+	chr3L	3281461	+	chr3L	3281955
TGTAACTAAAATAGAAGCCTAAATTAAAGTAAATACAGTGTTCTTCAAATCAAATCAAATTTGCTANTTAAACG:1	TGTAACTAAAATAGAAGCCTAA	AATCAAATTTGCTANTTAAACG	-	chr3L	11727902	-	chr3L	11723108	4794	+	chr3L	11723108	+	chr3L	11727902
GCATGTATACCATATATTTTATATAATAAAACGAAGCTTTTTGCTGCTGCATTTTCTCGACCATTTTCCTTTGC:1	GCATGTATACCATATATTTTAT	TTTCTCGACCATTTTCCTTTGC	+	chrX	15277653	+	chrX	15277737	84	+	chrX	15277653	+	chrX	15277737
ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTTCCCTTTTTGTGTT:1	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	GTGAGTGTTCCCTTTTTGTGTT	-	chrX	7978952	-	chrX	5120637	2858315	+	chrX	5120637	+	chrX	7978952
ATCCAAACCCCTTTTTTTCCGAGGGCGTGGCAATCTGAGCAAGATCTGAAATCGGTCGTGC:1	ATCCAAACCCCTTTTTTTCCGA	CAAGATCTGAAATCGGTCGTGC	-	chr3R	13863789	-	chr3R	13863715	74	+	chr3R	13863715	+	chr3R	13863789
TTTAGGGATTTCAAGATTTTACCGTCGTTGTCCCATTCTTCCCCTGTAAAATATGTTTGAAGAGTACAAGGAAAT:1	TTTAGGGATTTCAAGATTTTAC	TGTTTGAAGAGTACAAGGAAAT	+	chr3L	3484436	+	chr3L	3484513	77	+	chr3L	3484436	+	chr3L	3484513
TTAGGTATAATTTTTTTGTGCGTTTTTCTTNNNTNTTTCTTTCCTTCCAACTTGAAATGTTCCTCCCAGATTGAG:1	TTAGGTATAATTTTTTTGTGCG	GAAATGTTCCTCCCAGATTGAG	-	chr3R	13400908	-	chr3R	20070997	6670089	+	chr3R	20070997	+	chr3R	13400908
AGATCTGTTTGGGGCGTACTCTTCGCCATGTGCGGTGGTCACGTTG:1	AGATCTGTTTGGGGCGTACTCT	GCCATGTGCGGTGGTCACGTTG	+	chr3R	29854861	+	chr3R	29854912	51	+	chr3R	29854861	+	chr3R	29854912
TCAACATCTACTTGCTGCGGTTCAATCGGAGTTTNGTTGCCTGGAGCTCTTGTCTCTCCCTTCAACAAAAG:1	TCAACATCTACTTGCTGCGGTT	TTGTCTCTCCCTTCAACAAAAG	-	chr3L	7332572	-	chr3L	7332499	73	+	chr3L	7332499	+	chr3L	7332572
AAAGTTAATCCGCAAATTTATGACATGCCAACAGCCATTTTGGCTGACACGCGTGTGCGTTAGGCTTTCCCG:1	AAAGTTAATCCGCAAATTTATG	GCGTGTGCGTTAGGCTTTCCCG	+	chr3R	15517609	+	chr3R	15517689	80	+	chr3R	15517609	+	chr3R	15517689
AAAAAGATAAATATTTGGCATACTACGATATATCAACGCACCCATCACGTACTTCATATACAACATA:1	AAAAAGATAAATATTTGGCATA	CACGTACTTCATATACAACATA	+	chr2L	19560025	+	chr2L	19560269	244	+	chr2L	19560025	+	chr2L	19560269
AAGGCATACAAAGGATGCACTTCCCACTTGGCCAGGACGAAGATTAGCTGCATGCCAGCCATGATTTATGCC:1	AAGGCATACAAAGGATGCACTT	CATGCCAGCCATGATTTATGCC	-	chr3L	5476289	-	chr3L	5476211	78	+	chr3L	5476211	+	chr3L	5476289
AGGCTTTTTTGGGTTTGGTATATGNTATATGGCCAGAAGGNGNGCNTGCGANACANGGTCCAGGTAGACACATG:1	AGGCTTTTTTGGGTTTGGTATA	ACANGGTCCAGGTAGACACATG	-	chr2R	15127823	-	chr2R	15119343	8480	+	chr2R	15119343	+	chr2R	15127823
ATGCGTAGCACATGCATGCGCTCGATGAGCTCATCGCCTAGGATAGATCTTTCCACCGCCTTTCGTGCTCTATTA:1	ATGCGTAGCACATGCATGCGCT	CACCGCCTTTCGTGCTCTATTA	-	chr3R	19860059	-	chr3R	19859978	81	+	chr3R	19859978	+	chr3R	19860059
TACCTTTTTATTTGCACAGAGGGAATTGACACAAATTGGTTTTCTGGGCCTTTGCACTTTCAC:1	TACCTTTTTATTTGCACAGAGG	TTCTGGGCCTTTGCACTTTCAC	-	chrX	18427798	-	chrX	18427399	399	+	chrX	18427399	+	chrX	18427798
AAACGGAAATATTTACTCAAGTCAATTTGCAGTTGGCAAACTTCTTGTAGAGGATTTCACAGAGTTCCCAGTGTC:1	AAACGGAAATATTTACTCAAGT	ATTTCACAGAGTTCCCAGTGTC	-	chrX	21248012	-	chrX	21247900	112	+	chrX	21247900	+	chrX	21248012
AATAGAGTCCTAATGGAATTNATTTGATGCAGNGGTCAAATANGGAAAATCTGCCCTACGATATCCTATGAAAAC:1	AATAGAGTCCTAATGGAATTNA	CCCTACGATATCCTATGAAAAC	+	chr2L	19560853	+	chr2L	19560933	80	+	chr2L	19560853	+	chr2L	19560933
GGAAGTTTGCACAGTTCAATGCTTTTGGAGCAAAAACTCCATCTGAATGCGCCCCATTGTGGAAACAGCTTTCAT:1	GGAAGTTTGCACAGTTCAATGC	CCATTGTGGAAACAGCTTTCAT	-	chr3R	4981808	-	chr3R	4981731	77	+	chr3R	4981731	+	chr3R	4981808
CATCAAAAGTGTAGCTATAATCATTACTATATTAAACTCATTTCCGCATCTGCTTTTGGCGCTATATTATTT:1	CATCAAAAGTGTAGCTATAATC	TGCTTTTGGCGCTATATTATTT	+	chrX	5884186	+	chrX	5884424	238	+	chrX	5884186	+	chrX	5884424
AAGGACACTTCAGGCTCCGCCCCTCGCTCCCCCTCCTCCTTCCCCAATTTTCCCAATTTCCCTCCTCC:1	AAGGACACTTCAGGCTCCGCCC	ATTTTCCCAATTTCCCTCCTCC	-	chr3L	20757832	-	chr3L	20757698	134	+	chr3L	20757698	+	chr3L	20757832
CAACTGCTGCTCCAAGTATTGAAATCGATGAAGNAGCCACCACAGTGG:1	CAACTGCTGCTCCAAGTATTGA	GATGAAGNAGCCACCACAGTGG	+	chr3R	25018291	+	chr3R	25018341	50	+	chr3R	25018291	+	chr3R	25018341
CCATAAAATGATGAAATCAACTCTCCACGCCTCCCCCTACGTCCTGGTGTGTCCGTTTTTGGGTTTC:1	CCATAAAATGATGAAATCAACT	GGTGTGTCCGTTTTTGGGTTTC	+	chrX	20897812	+	chrX	20273601	624211	+	chrX	20897812	+	chrX	20273601
AAAGTATGCCACATTGCCCGTGACGAGGAGATTATTGCTATTGTCGTATCAATNGGTAGCATTTACATGCGGCGC:1	AAAGTATGCCACATTGCCCGTG	NGGTAGCATTTACATGCGGCGC	+	chrX	8922328	+	chrX	8922762	434	+	chrX	8922328	+	chrX	8922762
AAGCTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTCGGAGGGAGGATG:1	AAGCTCCCTGTTATCAGCAAAG	AAAGCTCCTCGGAGGGAGGATG	-	chr3L	22572169	-	chr3L	22572112	57	+	chr3L	22572112	+	chr3L	22572169
TACTTGGGATCTCCGCGGATCGATTCGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGGTTGTG:1	TACTTGGGATCTCCGCGGATCG	TGTTGTGTTGTGTTGGGTTGTG	-	chr3R	15644295	-	chr3R	21907535	6263240	+	chr3R	21907535	+	chr3R	15644295
ATCAAATTTAATATATAATTTCAGGGCATTTAAAGTTGATCTGCACACCTTCATTCATTCGTCTATCTCATT:1	ATCAAATTTAATATATAATTTC	TCATTCATTCGTCTATCTCATT	-	chr3R	21239900	-	chr3R	21239809	91	+	chr3R	21239809	+	chr3R	21239900
TTCACCTTTCGCCTTCGCGGGGAATGGGTCTTCTCGTCCACCTCCCACCTCCATCTCCTTCACATCCTC:1	TTCACCTTTCGCCTTCGCGGGG	CCTCCATCTCCTTCACATCCTC	-	chrX	19992506	-	chrX	19992436	70	+	chrX	19992436	+	chrX	19992506
AATGTACAGAGAGAAAAGCTTTGAGTGAAATCTCAAGTTACTTTAAATTAGCATGTGTATTTTGGTAACAAGGTT:1	AATGTACAGAGAGAAAAGCTTT	TGTGTATTTTGGTAACAAGGTT	-	chr3L	17537120	-	chr3L	17537039	81	+	chr3L	17537039	+	chr3L	17537120
GGTGTGTAGTTCGATAGTGTCTGATAGTGTCTGCTAAATGGAGAAGTGGAGAATAG:1	GGTGTGTAGTTCGATAGTGTCT	TAAATGGAGAAGTGGAGAATAG	+	chr2R	4622985	+	chr2R	4624125	1140	+	chr2R	4622985	+	chr2R	4624125
ATACAACTTGCTAACAGCAAATAAATGTAATTTGCGAAAAACAAGCAGCCAAACGCACGGAATGACGCGTGCCGA:1	ATACAACTTGCTAACAGCAAAT	CGCACGGAATGACGCGTGCCGA	+	chr3L	11087089	+	chr3L	11088878	1789	+	chr3L	11087089	+	chr3L	11088878
CAAGAATACCAGTTTAGGCAAGAGATAAAGTGCCTTACGANTTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGNTC:1	CAAGAATACCAGTTTAGGCAAG	TCCGTCTGCAATGTACTGGNTC	+	chr3R	19446805	+	chr3R	19449470	2665	+	chr3R	19446805	+	chr3R	19449470
AAAATCAGGTGAATTTGAAATGTGTTCTTGGCACTCATTTCGCCTCACTTTTCCCCCCCCACCACTTGATTCACC:1	AAAATCAGGTGAATTTGAAATG	CCCCCCCACCACTTGATTCACC	+	chr2R	19331236	+	chr2R	19331316	80	+	chr2R	19331236	+	chr2R	19331316
TATAATAGTTTTCCACAACGTTAGTCACAATCCCATCCTATCCCATCCCATCGTATTCTTTGGGACGCAGAAAA:1	TATAATAGTTTTCCACAACGTT	GTATTCTTTGGGACGCAGAAAA	+	chr3L	13139027	+	chr3L	295380	12843647	+	chr3L	13139027	+	chr3L	295380
AACCCCTGNAAAGCAAAAATTAAGTTGAGTGCTTGNTGCGTGCGAAATTGTTTGGTCGCGAGGTGTGTACGGA:1	AACCCCTGNAAAGCAAAAATTA	TTGGTCGCGAGGTGTGTACGGA	-	chr3L	6924155	-	chr3L	9188628	2264473	+	chr3L	9188628	+	chr3L	6924155
CTGTAGAAGAATAAGTTTCCTTTTCCAAATCAACTTAGCTACCTATAGGCTATATCACTTCCTGTAGTTTTTGTC:1	CTGTAGAAGAATAAGTTTCCTT	ATCACTTCCTGTAGTTTTTGTC	-	chr2L	6544482	-	chr2L	6544390	92	+	chr2L	6544390	+	chr2L	6544482
GGTGGCCAAAAAGGGTTGGCCCAAGGGGTGGGGTGAGAAAAGGGTGAGCAGCAGGATGTGTTCGAATAAGATGA:1	GGTGGCCAAAAAGGGTTGGCCC	AGGATGTGTTCGAATAAGATGA	-	chr3R	16178344	-	chr3R	22861296	6682952	+	chr3R	22861296	+	chr3R	16178344
CGATTGGAAAGAAGGATTCGCGGTGTACTCGTAATCTGAACTGCCCTGTTGAAATACCAGTGGTGAGAAATACAT:1	CGATTGGAAAGAAGGATTCGCG	ATACCAGTGGTGAGAAATACAT	-	chr2R	24303972	-	chr2R	24303888	84	+	chr2R	24303888	+	chr2R	24303972
CTTTAGATACCCATTAAAGCTAAAGCTAGAAGTANAAAAAAGAAGCAACACAAATATCCCAACTCCAATGCAACA:1	CTTTAGATACCCATTAAAGCTA	ATATCCCAACTCCAATGCAACA	+	chr2L	8698292	+	chr2L	2291731	6406561	+	chr2L	8698292	+	chr2L	2291731
ACTGTTCGAAAAGTGGATAGGCAAAAAAAATAAAATAAAATTTATTTATAAAAA:1	ACTGTTCGAAAAGTGGATAGGC	AAATAAAATTTATTTATAAAAA	+	chrX	13147507	+	chrX	1600851	11546656	+	chrX	13147507	+	chrX	1600851
CTAAGATGGATCGGGACTTCCTAAGATCTCCAAATAAATCGCTATATAAAGATACCAAAAACACGCATCGCGA:1	CTAAGATGGATCGGGACTTCCT	ATACCAAAAACACGCATCGCGA	+	chr3R	27215168	+	chr3R	27215242	74	+	chr3R	27215168	+	chr3R	27215242
ACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTT:1	ACGTACTTCTAAACAAACGAGA	ATGCGATCGCCTTTTCTTCTTT	+	chr2R	9871046	+	chr2R	9871526	480	+	chr2R	9871046	+	chr2R	9871526
CGTTAAAAGTGATTCACCCATTCAAAAGTGGTTTATCTAAATTAACCAAAATTAGTTATTANAAGGCGCAATTAA:1	CGTTAAAAGTGATTCACCCATT	AGTTATTANAAGGCGCAATTAA	-	chr2R	14911828	-	chr2R	14911705	123	+	chr2R	14911705	+	chr2R	14911828
CGATGGCATCAAATTATGGGGCAAGTCAAATAAGGTTATCCACAAAANGCGAGGAATGCGAGCCAGANGAACATG:1	CGATGGCATCAAATTATGGGGC	GAATGCGAGCCAGANGAACATG	+	chr3R	12568509	+	chr3R	12568589	80	+	chr3R	12568509	+	chr3R	12568589
GAGACAGGGGCAGGGGCAGGGTGTGCGAAAGAGATGCAGAGCGACA:1	GAGACAGGGGCAGGGGCAGGGT	GCGAAAGAGATGCAGAGCGACA	+	chrX	3518909	+	chrX	12076735	8557826	+	chrX	3518909	+	chrX	12076735
GGCAAGACTCTTCCCCCGATCGAGATATATATGTATATACGTAGACATACGACATAGAGATCGATTGGCTTACGC:1	GGCAAGACTCTTCCCCCGATCG	ATAGAGATCGATTGGCTTACGC	+	chr2R	11415542	+	chr2R	11418691	3149	+	chr2R	11415542	+	chr2R	11418691
TACATATGAAGCAATCCCATATGACACATACATTACGCCGNTTCCAAAAAAAAGATGGTAACGCACTA:1	TACATATGAAGCAATCCCATAT	AAAAAAAGATGGTAACGCACTA	+	chr3R	31924606	+	chr3R	31924680	74	+	chr3R	31924606	+	chr3R	31924680
TTTCGATATCGCATGGGGGGTTTCCCCATTTACAACTCTCGAGGGGAGATTTCTT:1	TTTCGATATCGCATGGGGGGTT	AACTCTCGAGGGGAGATTTCTT	-	chr3L	12304167	-	chr3L	12304111	56	+	chr3L	12304111	+	chr3L	12304167
AGCCTAAACTAAACAAAACCNAGCATGTAAAANATTGCCACCNAGAATGGCCAGAGTATTGAGACCACCTGTCG:1	AGCCTAAACTAAACAAAACCNA	AGAGTATTGAGACCACCTGTCG	-	chr2L	12190625	-	chr2L	18067635	5877010	+	chr2L	18067635	+	chr2L	12190625
AACATTTTTCTGGTATGTGGTTAAAAAGGTGTCAGAAAAAAGACGCTCAAGCAGCGAACTCAAGTTGAATTGTTT:1	AACATTTTTCTGGTATGTGGTT	GCGAACTCAAGTTGAATTGTTT	+	chrX	718341	+	chrX	718421	80	+	chrX	718341	+	chrX	718421
GCGACTTGACTTATTACTCGCAGTAAGAGCAACACACACTCAGTGCCACTGAGTTTTTGGGTGGTTGGTGTGAA:1	GCGACTTGACTTATTACTCGCA	GTTTTTGGGTGGTTGGTGTGAA	-	chrX	2803655	-	chrX	2803513	142	+	chrX	2803513	+	chrX	2803655
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	13693028	8214508	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907536
ACTCTCTGTGGATTTTACATTCCTTCAATTTATTTGCATTACTATTTTTGTAATAGTTAAAAAATCTTCAAAATT:1	ACTCTCTGTGGATTTTACATTC	TAGTTAAAAAATCTTCAAAATT	+	chr3R	13067121	+	chr3R	13067197	76	+	chr3R	13067121	+	chr3R	13067197
CAGCAGCAGCAGCAGTTGCAACAGCAAAAGCAGGAGCATTGTGTTGGGATTGCTGCTCGGCAGGAG:1	CAGCAGCAGCAGCAGTTGCAAC	TGGGATTGCTGCTCGGCAGGAG	-	chr3R	21987959	-	chr3R	12531985	9455974	+	chr3R	12531985	+	chr3R	21987959
TCAGCACGCGTCTGTCAGCCGCGCTAAGGATACAATAAATGTCTTTCGCGGTC:1	TCAGCACGCGTCTGTCAGCCGC	ACAATAAATGTCTTTCGCGGTC	+	chr2L	2294064	+	chr2L	2299247	5183	+	chr2L	2294064	+	chr2L	2299247
TTATATTATGAAGCTTAGCTGTTGCAGGGCCTTTAAGAATCGTGCACGTAACTACAACTTTCTTTCAATAGAA:1	TTATATTATGAAGCTTAGCTGT	CTACAACTTTCTTTCAATAGAA	+	chr2L	6242980	+	chr2L	6243076	96	+	chr2L	6242980	+	chr2L	6243076
ATTAAAAAATTTGTAGCCATTCGGCTGTCCATGAAGGTTGAATTGTGGGGCAGAAAAGTGANAGAGGG:1	ATTAAAAAATTTGTAGCCATTC	GGGGCAGAAAAGTGANAGAGGG	-	chr2L	11947107	-	chr2L	11947006	101	+	chr2L	11947006	+	chr2L	11947107
CCGCAGCCGGCGTCGCTGCCCGCTTA:1	CCGCAGCCGGCGTCGCTGCCCG	AGCCGGCGTCGCTGCCCGCTTA	+	chrX	1608762	+	chrX	5781731	4172969	+	chrX	1608762	+	chrX	5781731
ATTCCAAAAACCTATTTAGTGCCACAATCAATGTGAACTCTCGTTTTTTAACATAGCTTTAGAATTTATATTTTT:1	ATTCCAAAAACCTATTTAGTGC	TAGCTTTAGAATTTATATTTTT	-	chr3L	14724908	-	chr3L	14724824	84	+	chr3L	14724824	+	chr3L	14724908
ATTCTGGTCACACTCTTTAACTTTGCTTAACTTTGCCAACTCGCCCTGTAGCTGAGAGGACTCTTCACGAGAAGG:1	ATTCTGGTCACACTCTTTAACT	GAGAGGACTCTTCACGAGAAGG	+	chr3R	25555559	+	chr3R	25555638	79	+	chr3R	25555559	+	chr3R	25555638
GCAGCTTGTTTATCTAGTNGTACATTTATTTGGCTAACTGCCTNCAACCNCAAAATGTTTTTGTGCCCCGTTTTT:1	GCAGCTTGTTTATCTAGTNGTA	AATGTTTTTGTGCCCCGTTTTT	-	chrX	4736913	-	chrX	4731820	5093	+	chrX	4731820	+	chrX	4736913
ACTGCACTGAATGCTCACACTGAGAAATATATTCTGGTAGTCGATAAATAAATGATAGAAATCAAAATCCAATAG:1	ACTGCACTGAATGCTCACACTG	GATAGAAATCAAAATCCAATAG	+	chr3L	3890965	+	chr3L	3891046	81	+	chr3L	3890965	+	chr3L	3891046
ATCAATGGCCAAGGATGGCCAGTCGCAACGAGCTGACACATATATAGCTATGTGTGTATAAACCTCGGTTACCTG:1	ATCAATGGCCAAGGATGGCCAG	GTGTATAAACCTCGGTTACCTG	+	chr3L	20283397	+	chr3L	20283477	80	+	chr3L	20283397	+	chr3L	20283477
TATAAGCTAGTATATAACGAAATCGAGCAAGTCTCAAATAGAATATAGAAACCACACGAGATCCACCTTAC:1	TATAAGCTAGTATATAACGAAA	AACCACACGAGATCCACCTTAC	+	chr3R	30032182	+	chr3R	30032257	75	+	chr3R	30032182	+	chr3R	30032257
GGCGAACTGGGAAAAGAGAGCAAGCCAGGAAAAGTGCGTGACTTNTTTCTTACACTTG:1	GGCGAACTGGGAAAAGAGAGCA	CGTGACTTNTTTCTTACACTTG	-	chr3R	5573251	-	chr3R	5573183	68	+	chr3R	5573183	+	chr3R	5573251
ATTAAAAACCAGAAGCAGGAAAGGCGAAATAGAAGCCACAGGGGGGGGGTGTGGGGTGCTTGCAGCGTAGCTAA:1	ATTAAAAACCAGAAGCAGGAAA	GGGGTGCTTGCAGCGTAGCTAA	+	chrX	11449941	+	chrX	3448463	8001478	+	chrX	11449941	+	chrX	3448463
TTTTTGTGGTATCTAGTACATGGTAAAACTATCACGATAGGATTACCCTTTTTAATATGGACAGCT:1	TTTTTGTGGTATCTAGTACATG	ACCCTTTTTAATATGGACAGCT	+	chr2R	11425740	+	chr2R	11425818	78	+	chr2R	11425740	+	chr2R	11425818
GAAAAATGATTTTGAATTAGTTATACGAACGGGGAAATACCCTTAGGTGTTACTAAAACATATAGCACTCCAAAT:1	GAAAAATGATTTTGAATTAGTT	TAAAACATATAGCACTCCAAAT	-	chr3L	3619494	-	chr3L	3619400	94	+	chr3L	3619400	+	chr3L	3619494
GCGGATGACGTTTCCATCGTGGAGCGGAACGAAGATGAGGACGATGAAGCACGAATTGTGCACACACAAGAGAAA:1	GCGGATGACGTTTCCATCGTGG	AATTGTGCACACACAAGAGAAA	+	chrX	778133	+	chrX	778223	90	+	chrX	778133	+	chrX	778223
TGTGCTCAATGTCTTCGTGTTGACACCTAGGTCCTTCGATGTGGAGCATCCTGTAGCACGGAGAACAAAAGTGA:1	TGTGCTCAATGTCTTCGTGTTG	GTAGCACGGAGAACAAAAGTGA	-	chrX	20105206	-	chrX	20105310	104	+	chrX	20105310	+	chrX	20105206
ATTTAGAAACAGCGTATGAAAACAGANAGNTCACAACTACTTAGAAATTCCTAATATAGANGAAGGGCAAATAG:1	ATTTAGAAACAGCGTATGAAAA	AATATAGANGAAGGGCAAATAG	+	chr3R	23726583	+	chr3R	19447930	4278653	+	chr3R	23726583	+	chr3R	19447930
TTATCCTCGACAAGTCTTGCCTTCCAGCTGACTGGCCCTACGACACGA:1	TTATCCTCGACAAGTCTTGCCT	GCTGACTGGCCCTACGACACGA	+	chr3L	10953216	+	chr3L	18225499	7272283	+	chr3L	10953216	+	chr3L	18225499
TAATTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCGATGTGTTGGTGATGAGCAGAGCGGGCTAANATGTTAGA:1	TAATTTTCCAGACTGCATTCAA	CAGAGCGGGCTAANATGTTAGA	+	chr3L	19182409	+	chr3L	19182490	81	+	chr3L	19182409	+	chr3L	19182490
GAGACGAAAAGTTTTCGGAAAGAGACAAGAGCAAAAAATGTGTGTATGTGTGTACCCAGGGTGCATCAA:1	GAGACGAAAAGTTTTCGGAAAG	GTGTGTACCCAGGGTGCATCAA	-	chr2L	12759301	-	chr2L	12759212	89	+	chr2L	12759212	+	chr2L	12759301
ATTGTGCGGTAATTAAAGCGAAAAACTGCAATGCATAAACTTAAAGGCANATGAAAAGCACATTTTGTTCACCCA:1	ATTGTGCGGTAATTAAAGCGAA	AAAAGCACATTTTGTTCACCCA	+	chr2L	9297384	+	chr2L	9297461	77	+	chr2L	9297384	+	chr2L	9297461
CGGCCAGTGCAAAGGTTTAGGGCGGGTTTTCCAACAGCAACAGCAAANGTTTTATATGTTGNTATGAATTTTAG:1	CGGCCAGTGCAAAGGTTTAGGG	TATATGTTGNTATGAATTTTAG	-	chr3R	11043221	-	chr3R	11043116	105	+	chr3R	11043116	+	chr3R	11043221
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAA:2	ACACAACACAACACAACACAAC	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831801
CTTTTAATTCCTCAGTTTGATGGCGCAAAGGAGTGCAGGCGACCAAGTCTTAGAGGGATTTTCCTCTTCCTGCAA:1	CTTTTAATTCCTCAGTTTGATG	AGGGATTTTCCTCTTCCTGCAA	-	chr2L	10479473	-	chr2L	10479391	82	+	chr2L	10479391	+	chr2L	10479473
ATTAGAGAGCCCCTAACGACTCCTTTTAGCTGAAAGCCTGATTTATTTATAATTTGATGCGGATGCTCGGTTCAA:1	ATTAGAGAGCCCCTAACGACTC	TTGATGCGGATGCTCGGTTCAA	-	chr3R	29603032	-	chr3R	23197207	6405825	+	chr3R	23197207	+	chr3R	29603032
AAGAAGGGGTAACCTGGGTTAAATAGGTTTTCCAAGTCTACAGCAAGGAACTTTTAGATAGGTGTGTTATTAAT:1	AAGAAGGGGTAACCTGGGTTAA	TTTAGATAGGTGTGTTATTAAT	-	chr2R	18124435	-	chr2R	18124359	76	+	chr2R	18124359	+	chr2R	18124435
GAACAGTTTAATACTGTCAACAGTTGAACGCCCACGTTGTGAAAAGCGACGGGAATGGAAAACCGCTTGAGCCTG:1	GAACAGTTTAATACTGTCAACA	AATGGAAAACCGCTTGAGCCTG	+	chr3R	29472012	+	chr3R	29472105	93	+	chr3R	29472012	+	chr3R	29472105
TCCAATCGTTATGAATTTATGTGAGATATGGTAAGATACTTTGGATTNTTTGAGGTGCAGTTAAGTTNTCAGCTT:1	TCCAATCGTTATGAATTTATGT	GGTGCAGTTAAGTTNTCAGCTT	-	chrX	8085686	-	chrX	8085600	86	+	chrX	8085600	+	chrX	8085686
CAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTNGANNCTATCACAATATATATGNANCAATAGTTATCTATATGCGAGGA:1	CAACTACCAAAATACCGTACTA	AATAGTTATCTATATGCGAGGA	-	chr3L	24104314	-	chr3L	25777058	1672744	+	chr3L	25777058	+	chr3L	24104314
TTTACCAAATACCAGTACAGATAAGACCTTATTGTCAAGCGGATGGGATGAAGCTTAACAATTTTTATGGCG:1	TTTACCAAATACCAGTACAGAT	AAGCTTAACAATTTTTATGGCG	+	chr2L	16060995	+	chr2L	16060381	614	+	chr2L	16060995	+	chr2L	16060381
TCAAAATTCATTGCCTACTTATGAGCGCACGAACGAATCTGGCTTTCCATTATGACCGTAATACTGTCAAAAACA:1	TCAAAATTCATTGCCTACTTAT	GACCGTAATACTGTCAAAAACA	+	chr3R	9319573	+	chr3R	9320008	435	+	chr3R	9319573	+	chr3R	9320008
GTTTTTGCTGTCCTGCCACTTTTGTAGTCTTAAATGGTGGGGACTGCGCTGCTATGTGATAGACA:1	GTTTTTGCTGTCCTGCCACTTT	CTGCGCTGCTATGTGATAGACA	+	chr2R	552776	+	chr2R	553984	1208	+	chr2R	552776	+	chr2R	553984
CATCGCCAGTGAATTTCACTGAGATACATTTAATTTTGTGTAGATTCGTATTTAGATTTACTTATAGGAAATCT:1	CATCGCCAGTGAATTTCACTGA	TAGATTTACTTATAGGAAATCT	-	chr3L	11846526	-	chr3L	11846419	107	+	chr3L	11846419	+	chr3L	11846526
AGAGGCTAAGAAAAAAAGGAAGAAATGAAAACCAAAAAGAGAACGACGCCAAATTCAAATCGCGAACTGCTTAAA:1	AGAGGCTAAGAAAAAAAGGAAG	TTCAAATCGCGAACTGCTTAAA	+	chr2R	17236514	+	chr2R	17241718	5204	+	chr2R	17236514	+	chr2R	17241718
CTTTCCTCTACTCCAGAATGTGCGTGGAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATACTTTTTGGG:1	CTTTCCTCTACTCCAGAATGTG	ATTATGTTGCATACTTTTTGGG	-	chr2L	12863177	-	chr2L	12861710	1467	+	chr2L	12861710	+	chr2L	12863177
GCAGCGCCGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAGAGATGCAGAAACGCCTG:1	GCAGCGCCGGCTTGTGGAACAC	TCCAGAGATGCAGAAACGCCTG	+	chr2R	12190113	+	chr2R	12187495	2618	+	chr2R	12190113	+	chr2R	12187495
CGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAATAATCTTCGGCACTTCACTAACTTCTCCTATATAAGGTG:1	CGCAATGCTTAAAACTCCTTGC	CTAACTTCTCCTATATAAGGTG	-	chr3R	19449519	-	chr3R	19449623	104	+	chr3R	19449623	+	chr3R	19449519
AAGTGCTGGAGCTGACTTTGATTATTTATTTACTAGAAATTAAGGAAATATTTCGAAATGGCTTGAAAACGGCTA:1	AAGTGCTGGAGCTGACTTTGAT	CGAAATGGCTTGAAAACGGCTA	+	chr2L	12183951	+	chr2L	12184189	238	+	chr2L	12183951	+	chr2L	12184189
CAACAACAGCCTCGTGGTAAATATTCCGCCCCCCGTAGCACCTAAACAACCA:1	CAACAACAGCCTCGTGGTAAAT	CCCCGTAGCACCTAAACAACCA	+	chr3R	6596124	+	chr3R	6596263	139	+	chr3R	6596124	+	chr3R	6596263
AGGAAAATCCCTCTAAGACTTGGTCGCCTGCACTCCTTTGCGCCATCAAACTGAGGAATTAACAGGGAAG:1	AGGAAAATCCCTCTAAGACTTG	AACTGAGGAATTAACAGGGAAG	+	chr2L	10479401	+	chr2L	10479478	77	+	chr2L	10479401	+	chr2L	10479478
CGCCACTCAAATACTCTATATAGGTGATATCCAATCAGGAATCCCTTTCACTATGTAACCAGAAGGCATATTTAA:1	CGCCACTCAAATACTCTATATA	TGTAACCAGAAGGCATATTTAA	-	chr3R	24975007	-	chr3R	24974928	79	+	chr3R	24974928	+	chr3R	24975007
TGGCACCGCCTAATGAACACGATTCAAAACTTTACACTAACGTGACGGCGAA:1	TGGCACCGCCTAATGAACACGA	TTTACACTAACGTGACGGCGAA	-	chr3R	23241359	-	chr3R	23241299	60	+	chr3R	23241299	+	chr3R	23241359
GATATAATGGAAGCATTGCAAATAATGCCTTCTTGCTTTATAGCGCTGCTTCCAGAGTANCATTTA:1	GATATAATGGAAGCATTGCAAA	GCTGCTTCCAGAGTANCATTTA	-	chr3R	4568782	-	chr3R	4568704	78	+	chr3R	4568704	+	chr3R	4568782
AAAAACCAATATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTGCTTACCTACGAATA:1	AAAAACCAATATTTATTTTGCT	AGCCTTTGCTTACCTACGAATA	+	chr3L	16971235	+	chr3L	16971313	78	+	chr3L	16971235	+	chr3L	16971313
CACCAACTGGCAGTGAAAATGCATGTGGAAATGTNAATGGCCAGGCGGAACAAAAAGGGCTCGCTTGACATCCAA:1	CACCAACTGGCAGTGAAAATGC	AAAGGGCTCGCTTGACATCCAA	-	chr3R	30880683	-	chr3R	15395890	15484793	+	chr3R	15395890	+	chr3R	30880683
ACACAGTCAAACAACTCTATGTTTACTCAAGGGATTTTTTTTTACCCTACACATTTTTTCTATATTTTTCCAAT:1	ACACAGTCAAACAACTCTATGT	ATTTTTTCTATATTTTTCCAAT	+	chr3R	18695765	+	chr3R	18695848	83	+	chr3R	18695765	+	chr3R	18695848
GCTTGGCCATTAGATCATTCAAGGTGTGTTGAAGTAACAAAACGTGACGCAAATGAACTTTTTGGCTTTCCTTGC:1	GCTTGGCCATTAGATCATTCAA	TGAACTTTTTGGCTTTCCTTGC	-	chr2L	19942074	-	chr2L	9819453	10122621	+	chr2L	9819453	+	chr2L	19942074
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGTGTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831802	6924267	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907535
TATGGAAACGGAATGGGTGGTCAGTATGAAACGGAATGGGTGGACAGNATGGAAATGGTATG:1	TATGGAAACGGAATGGGTGGTC	TGGACAGNATGGAAATGGTATG	+	chr2L	17286794	+	chr2L	17286859	65	+	chr2L	17286794	+	chr2L	17286859
GTCCAAAGATGGAATGCCCTTGCAGAGGCTAAACAATTCAATTTAAAATGGCCATAACAATCTCGCTTGGTAACC:1	GTCCAAAGATGGAATGCCCTTG	ATAACAATCTCGCTTGGTAACC	+	chr3L	1720555	+	chr3L	2278978	558423	+	chr3L	1720555	+	chr3L	2278978
TGGATTAGGTAGCTCATAGATAGTTGGTATGATATATGTGAGGATTATGCACCTTCTGTTAGCAGGGAACGCGAC:1	TGGATTAGGTAGCTCATAGATA	TTCTGTTAGCAGGGAACGCGAC	+	chr2R	8160944	+	chr2R	8161034	90	+	chr2R	8160944	+	chr2R	8161034
TGAAGGCCAAAAGATAATTCAATATGAACTGTGGCTGCGGCATTACGTATACGC:1	TGAAGGCCAAAAGATAATTCAA	GGCTGCGGCATTACGTATACGC	-	chrX	5442095	-	chrX	5442008	87	+	chrX	5442008	+	chrX	5442095
ATCTAGATATGCATATGTATATATATACTACATAATAGTCATACCCATGGGGAAACCTCTTACTTCTCGGCTAT:1	ATCTAGATATGCATATGTATAT	AAACCTCTTACTTCTCGGCTAT	+	chr3L	7377349	+	chr3L	7380453	3104	+	chr3L	7377349	+	chr3L	7380453
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGCTGCGACTGTGACACATGTGT:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	GCTGCGACTGTGACACATGTGT	+	chr3L	22908067	+	chr3L	10247044	12661023	+	chr3L	22908067	+	chr3L	10247044
AGGTGCAGCGTGGATATATCAGGGGGCGGGTATCCTGCCATACTNACGGGATAAATTA:1	AGGTGCAGCGTGGATATATCAG	GCCATACTNACGGGATAAATTA	-	chr3L	21186127	-	chr3L	21186068	59	+	chr3L	21186068	+	chr3L	21186127
ATGATAACGAGCGACTTAAGAGAGTACAAGAGAAAGCCTGCGAAAGAGGAGAGCTTAGATAATGGAGATATTTCT:1	ATGATAACGAGCGACTTAAGAG	CTTAGATAATGGAGATATTTCT	-	chr2R	5473461	-	chr2R	5473366	95	+	chr2R	5473366	+	chr2R	5473461
GATGGAAGGTGAGTTATTCATAAATAGGCTTTAATATATTATATGATTCATATTCATATTTCCCAGCTCGATACT:1	GATGGAAGGTGAGTTATTCATA	TCATATTTCCCAGCTCGATACT	+	chr3R	14067145	+	chr3R	14067224	79	+	chr3R	14067145	+	chr3R	14067224
GGCATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTCCCTGTCTCATCAATTAATCTCGTTTGCAGCGTTTACTCAAATCAATTA:1	GGCATTGCCCATTTGGGCTTCG	CAGCGTTTACTCAAATCAATTA	-	chr2L	14809085	-	chr2L	14803882	5203	+	chr2L	14803882	+	chr2L	14809085
TGTCGCAAGTTTTTCCATTGCTTCAGAAGTCGAGGAATTTCCCGATAATGCATATGTAAATAGCGCTCGGAATCG:1	TGTCGCAAGTTTTTCCATTGCT	ATGTAAATAGCGCTCGGAATCG	+	chr2R	17281938	+	chr2R	17282020	82	+	chr2R	17281938	+	chr2R	17282020
GGCCATATTGGTAGGTGATTGGTAATATATAGACGGCCAATGACCCAGCGTTTTGGTTATCTGCCACTGTTGACA:1	GGCCATATTGGTAGGTGATTGG	TGGTTATCTGCCACTGTTGACA	+	chr2R	11636437	+	chr2R	11636515	78	+	chr2R	11636437	+	chr2R	11636515
CCTTAGTTTTCTGTGTAATATGCAAAAAAGTTTTTGGTTATCCTAACTAAAACAAATATTGACTGAGNTCGATGG:1	CCTTAGTTTTCTGTGTAATATG	AAATATTGACTGAGNTCGATGG	+	chr2L	17819936	+	chr2L	17825140	5204	+	chr2L	17819936	+	chr2L	17825140
AGATTTTTGTCTATTAATTTAAATCTTAAACTTTACGTTTCAACTTTTTTGCACCAAACCTAATCATGTTTTC:1	AGATTTTTGTCTATTAATTTAA	CACCAAACCTAATCATGTTTTC	+	chr3L	18262480	+	chr3L	18262561	81	+	chr3L	18262480	+	chr3L	18262561
CAAATGTTGCATGTTTTTCTTGAGNCCTTTAGCATAACGAGCNCTNAACCANCCANAGCCACATCCTGTACTCA:1	CAAATGTTGCATGTTTTTCTTG	CCANAGCCACATCCTGTACTCA	+	chrX	17412680	+	chrX	9999954	7412726	+	chrX	17412680	+	chrX	9999954
TTTTGGTTCGATTTCAGGTGTCCAAGGCGAAGGTTGTCTGTATATATGCTGGCATTTTAGGNCCTTTTCTGCCC:1	TTTTGGTTCGATTTCAGGTGTC	CATTTTAGGNCCTTTTCTGCCC	+	chrX	906710	+	chrX	908498	1788	+	chrX	906710	+	chrX	908498
CTGCACTCAGGGTCCATCTCGATTTTCTGCAATGCAAATCATTGCCAAACGTCTCCTTTACTATTTATTTCACCA:1	CTGCACTCAGGGTCCATCTCGA	TCCTTTACTATTTATTTCACCA	+	chr3L	7567904	+	chr3L	21067393	13499489	+	chr3L	7567904	+	chr3L	21067393
AACAACTACAATAAAACAAAACACCCATCCAGTTGCCCCTTGCTGGNAATCTACAATAGA:1	AACAACTACAATAAAACAAAAC	CTTGCTGGNAATCTACAATAGA	+	chr2L	16750746	+	chr2L	16750812	66	+	chr2L	16750746	+	chr2L	16750812
ATCCACACAAAAAGCAACAACACAGCAGATTTTTAGAGAGAGAGAGAGAGGCAAGATAGTGGGCAATGCCATGA:1	ATCCACACAAAAAGCAACAACA	AAGATAGTGGGCAATGCCATGA	+	chrX	8611542	+	chrX	20916703	12305161	+	chrX	8611542	+	chrX	20916703
TAAAATCTCAATTAGCAAAATTGCTACCAAACAGATTACTGATTGCTGTTACTGCCGCAATTGTTTGCGCAAATC:1	TAAAATCTCAATTAGCAAAATT	GCCGCAATTGTTTGCGCAAATC	-	chr3R	21194179	-	chr3R	12540030	8654149	+	chr3R	12540030	+	chr3R	21194179
GTACAAAATCATTCTCCCTGCGAGCGAACCTATAGTGACTGCAA:1	GTACAAAATCATTCTCCCTGCG	AGCGAACCTATAGTGACTGCAA	-	chr3R	17540814	-	chr3R	24364133	6823319	+	chr3R	24364133	+	chr3R	17540814
ATTTTCTTCATTTTTTTTCTTATTTTTTTTTTACATATATTTCTTTTT:1	ATTTTCTTCATTTTTTTTCTTA	TTTTTTACATATATTTCTTTTT	+	chrX	5075871	+	chrX	16104159	11028288	+	chrX	5075871	+	chrX	16104159
CAAATAATATATTGCACAGTNTTTTTTCCTTTNTAATAATTTNTGGAGCATTTGTCACAGGACACAAGTCATTTG:1	CAAATAATATATTGCACAGTNT	GTCACAGGACACAAGTCATTTG	-	chr2R	6216783	-	chr2R	10273938	4057155	+	chr2R	10273938	+	chr2R	6216783
TGGCGAAATCATGGTGCACAAATTAATTTTCATAGTATATTTTTTATGCGCTTATGTTGTCAGCATGACATTGTT:1	TGGCGAAATCATGGTGCACAAA	ATGTTGTCAGCATGACATTGTT	+	chr2L	13481471	+	chr2L	13482078	607	+	chr2L	13481471	+	chr2L	13482078
CAGTACTACCTACACCAGTTCGCAGTGCAACAGCCAGGACCATGACCAANATGTTCATGG:1	CAGTACTACCTACACCAGTTCG	ACCATGACCAANATGTTCATGG	+	chr2R	8472550	+	chr2R	8470454	2096	+	chr2R	8472550	+	chr2R	8470454
GGCCAAAAGGACGAATGTAAGTTGGGTCGCAGGACGAAGGACATG:1	GGCCAAAAGGACGAATGTAAGT	GGGTCGCAGGACGAAGGACATG	-	chr2L	15852132	-	chr2L	15852078	54	+	chr2L	15852078	+	chr2L	15852132
AGAAGTCTTGGCTATCAAAAGATTAAATTGGAGACCCCGAAGGCAAGAGAAGCAGCAAAA:1	AGAAGTCTTGGCTATCAAAAGA	GAAGGCAAGAGAAGCAGCAAAA	+	chr3R	11841099	+	chr3R	11846275	5176	+	chr3R	11841099	+	chr3R	11846275
TTATTCANTTTTTAATGGTTTTTTTTTAATTTATTTGCTCGGACGGACTGCATGCTGTG:1	TTATTCANTTTTTAATGGTTTT	CTCGGACGGACTGCATGCTGTG	+	chr3R	19570649	+	chr3R	19570801	152	+	chr3R	19570649	+	chr3R	19570801
GTGGCCAGCGGGGACACTGGGACCACTGGCCATTTCTAATGTGTTTTCATTCTTTTTTCCCTCCAGTG:1	GTGGCCAGCGGGGACACTGGGA	TCATTCTTTTTTCCCTCCAGTG	-	chr3R	27789181	-	chr3R	27789111	70	+	chr3R	27789111	+	chr3R	27789181
ACAGTAAACAATTCGATTTGGTCAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCCNCAGAGGCAAGAA:1	ACAGTAAACAATTCGATTTGGT	GGAAAGCCCNCAGAGGCAAGAA	-	chr2L	18244339	-	chr2L	18243705	634	+	chr2L	18243705	+	chr2L	18244339
GGAAAAACCTAACAAAGGATTACGGCTAATTTTCACTTCGAAAACTATACAAATTTTAAAGTTTTAAGTTGTAT:1	GGAAAAACCTAACAAAGGATTA	ATTTTAAAGTTTTAAGTTGTAT	+	chr2L	13892846	+	chr2L	13893708	862	+	chr2L	13892846	+	chr2L	13893708
CGTTTGCGTACCGTTCCGTTTTCTCGAGCTCCCCAGCCGGCACAGAGAATTCCCCATTGGAAGCCCCGACCCCAG:1	CGTTTGCGTACCGTTCCGTTTT	CCATTGGAAGCCCCGACCCCAG	+	chr3L	10994427	+	chr3L	16016500	5022073	+	chr3L	10994427	+	chr3L	16016500
TTGAGTTTGGGCACTTGGCAATTTACTGCGCTGGCGACAATAAAACGGGTCCGAAACATTCGATGACACTCCACG:1	TTGAGTTTGGGCACTTGGCAAT	AAACATTCGATGACACTCCACG	-	chr3R	30473798	-	chr3R	30473682	116	+	chr3R	30473682	+	chr3R	30473798
GCATAACCATTAGATCTCAGCGCTTGATTAACCCTTATTAGTACCCATTCAACA:1	GCATAACCATTAGATCTCAGCG	CCTTATTAGTACCCATTCAACA	-	chr2L	8461591	-	chr2L	8452441	9150	+	chr2L	8452441	+	chr2L	8461591
CTCGCATCCTGGCATCCTGGCATCCATGCATCCCCTGTCCTTCT:1	CTCGCATCCTGGCATCCTGGCA	TCCATGCATCCCCTGTCCTTCT	+	chr3R	10423742	+	chr3R	11136688	712946	+	chr3R	10423742	+	chr3R	11136688
ACCAGCATATAAATTAATTTTAAAGCAAATAGTTAATGATATGTTTCTTTTACTTTACTTTACTTACAAATAAAT:1	ACCAGCATATAAATTAATTTTA	TTTACTTTACTTACAAATAAAT	+	chr3L	11187713	+	chr3L	11187794	81	+	chr3L	11187713	+	chr3L	11187794
ATACCTGACATTTGTTTTTGACCTATTAAAACTACCAGTGCGATACTAAGTATTGCATG:1	ATACCTGACATTTGTTTTTGAC	GTGCGATACTAAGTATTGCATG	+	chr3R	14923739	+	chr3R	14923800	61	+	chr3R	14923739	+	chr3R	14923800
TAAAGGGTCATCTTATTGTTTTGGCAACTAAATGTTTCCCTATTAACTATTTAAATACTATTGTATTTATTTAGG:1	TAAAGGGTCATCTTATTGTTTT	AATACTATTGTATTTATTTAGG	+	chr2R	6978651	+	chr2R	6978834	183	+	chr2R	6978651	+	chr2R	6978834
GGTACCCAGCATTCTTCATCCATTCATTTTTGAACAGATTTTCCTTGACCAAAAAGGTAGCTGTCCATAATTCC:1	GGTACCCAGCATTCTTCATCCA	AAAGGTAGCTGTCCATAATTCC	-	chrX	3160174	-	chrX	14134712	10974538	+	chrX	14134712	+	chrX	3160174
AACTCGATATGTTGGATACGTAGTTCCCGCATCCTCGTCATCCACACCCTATATCCACTTTGACAGAGCCCATAA:1	AACTCGATATGTTGGATACGTA	TCCACTTTGACAGAGCCCATAA	-	chr3R	11175326	-	chr3R	11174612	714	+	chr3R	11174612	+	chr3R	11175326
GGTAATCCTGTGCCATCCTGTGAACTCNATTGAACTTGACTATTATGTTTTTTGTGTT:1	GGTAATCCTGTGCCATCCTGTG	TGACTATTATGTTTTTTGTGTT	-	chrX	14183505	-	chrX	14183442	63	+	chrX	14183442	+	chrX	14183505
GAGATGTGAGCCAGGCCAAAAGGAGTGATGCATTAAAAACAGGTGTTAGTTAACGTTAGTAATTATGGG:1	GAGATGTGAGCCAGGCCAAAAG	AGTTAACGTTAGTAATTATGGG	-	chr3R	26601039	-	chr3R	26600960	79	+	chr3R	26600960	+	chr3R	26601039
TTGACCGCTGACTGTGACCTAAGTCTAACTAACTGCTGTTTTATTAATCCGGCAAANACAAGTTC:1	TTGACCGCTGACTGTGACCTAA	TTAATCCGGCAAANACAAGTTC	+	chr3R	4609576	+	chr3R	4610730	1154	+	chr3R	4609576	+	chr3R	4610730
TNGAACTTTGCTGAACTGGGTGGACTTTTGGTTGGGTGAAAGGTCAAAGTATCAACTAGCA:1	TNGAACTTTGCTGAACTGGGTG	AAGGTCAAAGTATCAACTAGCA	+	chr3L	3912495	+	chr3L	3912557	62	+	chr3L	3912495	+	chr3L	3912557
CTCATACTGCTCCAGCTTGCATTTGATGTTAATAATATTTTATGCTTNTTGTTAGTTTAGTNGTTGTTTGCCAAG:1	CTCATACTGCTCCAGCTTGCAT	AGTTTAGTNGTTGTTTGCCAAG	+	chrX	18451986	+	chrX	9917738	8534248	+	chrX	18451986	+	chrX	9917738
AGTCAATTTGCAGTTGGCAAACTTCTTGTAGAGGATTTCACAGAGTTCCCAGTGTCATTTCTTTTCACATTTAAA:1	AGTCAATTTGCAGTTGGCAAAC	GTCATTTCTTTTCACATTTAAA	-	chrX	21247993	-	chrX	21247881	112	+	chrX	21247881	+	chrX	21247993
CATCCACCACCCACCACCCACCGCCCATATGA:1	CATCCACCACCCACCACCCACC	CCACCACCCACCGCCCATATGA	+	chrX	2318294	+	chrX	18901662	16583368	+	chrX	2318294	+	chrX	18901662
ATAACCCCACGTAACACGCAAATCGGACTCTCATTCGAAAACCAGGTAAAAGTCAATTGCGTTTT:1	ATAACCCCACGTAACACGCAAA	AGGTAAAAGTCAATTGCGTTTT	-	chr3L	22570577	-	chr3L	22570443	134	+	chr3L	22570443	+	chr3L	22570577
TGTATGTAGGTATCTCAGCGAATGGAACAATGCCAGTTCCGTATTAATGTCGTACTGTAAGATTTCAGTTCATTT:1	TGTATGTAGGTATCTCAGCGAA	ACTGTAAGATTTCAGTTCATTT	+	chrX	10361722	+	chrX	10361819	97	+	chrX	10361722	+	chrX	10361819
AAGTGAACCACGCGTCGAGAAACCTGGGCGACTATTTAGTTGGGTTCGTCGGCGTCGGGATCACATGCTCATG:1	AAGTGAACCACGCGTCGAGAAA	GCGTCGGGATCACATGCTCATG	+	chrX	10885756	+	chrX	10885873	117	+	chrX	10885756	+	chrX	10885873
GTCGATAAAACATTTTGATTTATTTCGAGCTGCGACAATTGCCCTCAGGCGTTTGCCAATTAAATTTGCATGC:1	GTCGATAAAACATTTTGATTTA	TTTGCCAATTAAATTTGCATGC	-	chr3R	24085979	-	chr3R	18556850	5529129	+	chr3R	18556850	+	chr3R	24085979
TAGTATCGAATTTCCCTAGCTGAAAACCCATTTCNTGAATTCCTCGAGAACTGAATGGGAGCCTAAAGACCGTTA:1	TAGTATCGAATTTCCCTAGCTG	AATGGGAGCCTAAAGACCGTTA	+	chr3R	26885710	+	chr3R	26885810	100	+	chr3R	26885710	+	chr3R	26885810
TTTCCTATCCATTTCAATTTAAAAAAGTCGAATTTAATGCATAGCTGAGTGTGTGGTTCTTATGAAAAACTTGTA:1	TTTCCTATCCATTTCAATTTAA	TGGTTCTTATGAAAAACTTGTA	+	chr3R	4606755	+	chr3R	4607104	349	+	chr3R	4606755	+	chr3R	4607104
TTTATTTTCTTCTCCCGGCAGTGAAAAAGCAAGGGGTTAACACTTAAAGGTTGGAAAATTATAAATGAAAATT:1	TTTATTTTCTTCTCCCGGCAGT	TGGAAAATTATAAATGAAAATT	-	chr2L	12264745	-	chr2L	12264656	89	+	chr2L	12264656	+	chr2L	12264745
CAGCAAGTAGGCTTCATAAGGCGGAGCTGCACTGAGAAAAAAACAATCTTTCATTTCACCATTTTCACAGCAAAT:1	CAGCAAGTAGGCTTCATAAGGC	TTTCACCATTTTCACAGCAAAT	-	chr3L	12014023	-	chr3L	12013932	91	+	chr3L	12013932	+	chr3L	12014023
ACATCTTAGCGACAACATTTTCACAACAAGAAAAAACAGAGGTCAAGTGATAAAGCCCATGATGATGNGGCACTG:1	ACATCTTAGCGACAACATTTTC	AGCCCATGATGATGNGGCACTG	-	chr2R	11254951	-	chr2R	11254863	88	+	chr2R	11254863	+	chr2R	11254951
TAACTTACATAGAAAGACGTTAATATTACTGCTTATTACCTTTTCGGGAAGTCCCCGTTTCGAATTTCAAATTA:1	TAACTTACATAGAAAGACGTTA	CCCCGTTTCGAATTTCAAATTA	-	chr3R	15135122	-	chr3R	15132063	3059	+	chr3R	15132063	+	chr3R	15135122
CATGTTGGTGTAACAAAAAGTGGGCAACTTTGCTAAATTGCCAGGGCAGTGGCA:1	CATGTTGGTGTAACAAAAAGTG	CTAAATTGCCAGGGCAGTGGCA	+	chr2L	14564221	+	chr2L	14564276	55	+	chr2L	14564221	+	chr2L	14564276
GGATGATGTGAAATTTATGCATTAATAAAGCAGTATCAGCAACAANTTACCCTCAACAACANGTTTTTCTTTTT:1	GGATGATGTGAAATTTATGCAT	TCAACAACANGTTTTTCTTTTT	+	chr3L	2290871	+	chr3L	5274653	2983782	+	chr3L	2290871	+	chr3L	5274653
AATGCTTATTTGTTGTTTATCTGTGTAAAGCATCTCTGTGACACTTTCGGGCCACGGCAG:1	AATGCTTATTTGTTGTTTATCT	TGACACTTTCGGGCCACGGCAG	-	chr2L	10956168	-	chr2L	10946968	9200	+	chr2L	10946968	+	chr2L	10956168
ATTTACTATGTATATGTTGAACTGAATATGTACATAAGTGAAACAATTTACAACCGAAAGATTACAAAAAATATA:1	ATTTACTATGTATATGTTGAAC	CCGAAAGATTACAAAAAATATA	-	chr3L	20484362	-	chr3L	20476763	7599	+	chr3L	20476763	+	chr3L	20484362
TGGCCAAGGACTCGTAGGACCTCCTGCCTATATACCTATATATTGCCGCATTTGCAGCATTTCAACTGCTTCCAC:1	TGGCCAAGGACTCGTAGGACCT	GCAGCATTTCAACTGCTTCCAC	+	chr2L	1999580	+	chr2L	1999744	164	+	chr2L	1999580	+	chr2L	1999744
AGCGGCGCCTTATTGCAAATTGTTTGAATTGCTACCGGCAAGGCGCCACTTACACTTA:1	AGCGGCGCCTTATTGCAAATTG	GGCAAGGCGCCACTTACACTTA	+	chr2R	15065633	+	chr2R	15065694	61	+	chr2R	15065633	+	chr2R	15065694
ACCAATAAGCAGGACACGTTGGAACACAGCGTCGAGGTGTGTCAAAACGCCCAATTCCCTGAATGCCCACAGAAG:1	ACCAATAAGCAGGACACGTTGG	ATTCCCTGAATGCCCACAGAAG	+	chr3L	22665025	+	chr3L	22665112	87	+	chr3L	22665025	+	chr3L	22665112
CATAGAGCTTCTGAGATGGACGAAATATACNNNANGTAGTTGATGAGTCCCAAGAACACGTAGTTACTTTGGGTT:1	CATAGAGCTTCTGAGATGGACG	GAACACGTAGTTACTTTGGGTT	-	chr3R	21784960	-	chr3R	21784862	98	+	chr3R	21784862	+	chr3R	21784960
TAAGAGGCTTGTCATTTGCTGCCTGCCCTTTTGCCACTGAGTTCAACTTATAAACGCGCTAAACGGCGTCTTGG:1	TAAGAGGCTTGTCATTTGCTGC	AACGCGCTAAACGGCGTCTTGG	-	chr2L	10499680	-	chr2L	10499582	98	+	chr2L	10499582	+	chr2L	10499680
ATCCTTTATTTTATTCCCAAGATCAGTTTTTACCTCTCTGCGCTGCGTGGACGACGACTCTATAGC:1	ATCCTTTATTTTATTCCCAAGA	GCGTGGACGACGACTCTATAGC	+	chr2R	13905627	+	chr2R	13907600	1973	+	chr2R	13905627	+	chr2R	13907600
TTCAGTATTACGTAGGCTTGCGTTTTTTTTTTGGGTTGTTTTTTT:1	TTCAGTATTACGTAGGCTTGCG	TTTTTTTTTGGGTTGTTTTTTT	-	chrX	8509746	-	chrX	2036226	6473520	+	chrX	2036226	+	chrX	8509746
CGAAAAGAGGGCGTTCGACGAGGCGTGGCACCGCCTAATGAACACGATTCAAAACTTTACACTAACGTGACGGCG:1	CGAAAAGAGGGCGTTCGACGAG	ACTTTACACTAACGTGACGGCG	-	chr3R	23241384	-	chr3R	23241301	83	+	chr3R	23241301	+	chr3R	23241384
AATGGATGAAGATGATAGAGAGCAATTCGAATTCAAAAGTNCGTCTGCAATGTAC:1	AATGGATGAAGATGATAGAGAG	CAAAAGTNCGTCTGCAATGTAC	+	chr3R	19448589	+	chr3R	19449464	875	+	chr3R	19448589	+	chr3R	19449464
CGTTGCCTCCTCCCAATTTGGTCACCCATCGAGTTTGCATTGAACTTAAACAACAAGACCGACAACCAAGATCCA:1	CGTTGCCTCCTCCCAATTTGGT	CAAGACCGACAACCAAGATCCA	-	chrX	19176320	-	chrX	19176236	84	+	chrX	19176236	+	chrX	19176320
GGGGCGCCACTGCCACTGCCCTGGCAATTTAGNAAAGTTGCCCACTTTTTGTTACACCAACATGAG:1	GGGGCGCCACTGCCACTGCCCT	CTTTTTGTTACACCAACATGAG	-	chr2L	14564286	-	chr2L	14564219	67	+	chr2L	14564219	+	chr2L	14564286
GCATCAGCATCAGCAACAGCTCCACTGACGNNNGNGACAATTTCGCNCACAGCGTCCACTTCCAGTTCCGG:1	GCATCAGCATCAGCAACAGCTC	CAGCGTCCACTTCCAGTTCCGG	+	chrX	13908634	+	chrX	16429777	2521143	+	chrX	13908634	+	chrX	16429777
CTTTGATCACTGTACATCACAAGTGGGATGAAATACACTAACTAAAATGCAGGTGGATATCCATCCAGCCTTAGT:1	CTTTGATCACTGTACATCACAA	TGGATATCCATCCAGCCTTAGT	-	chr2L	854456	-	chr2L	14314814	13460358	+	chr2L	14314814	+	chr2L	854456
TGTCGAAAACCTTTTCGCTTCATACGTTCGCCTTGGGGCACAATTTGCCCCAAGGAACTCCGCCGGCGTACTCAG:1	TGTCGAAAACCTTTTCGCTTCA	GGAACTCCGCCGGCGTACTCAG	-	chr2L	11522135	-	chr2L	11525297	3162	+	chr2L	11525297	+	chr2L	11522135
TTGGTGTACTATCATTTTTTGGCATTTTATTAGACACTATAATTNTTGATTCTGTCCCATTTATTCTTCGAG:1	TTGGTGTACTATCATTTTTTGG	TCTGTCCCATTTATTCTTCGAG	-	chr2L	10692914	-	chr2L	10692819	95	+	chr2L	10692819	+	chr2L	10692914
CTGAGCTCCGAGGGCATACTGTACAGTGTATATTCCATTTTTTCATGCCGTGAAGTATGGCAATCAATGAATT:1	CTGAGCTCCGAGGGCATACTGT	GAAGTATGGCAATCAATGAATT	-	chr2L	16374427	-	chr2L	16374348	79	+	chr2L	16374348	+	chr2L	16374427
TGATCCTGATGTACGTCCTTTTACCATCATAACCCCTTATTAACGATGCCTTCTATTAACTAGTTGATATGCTTT:1	TGATCCTGATGTACGTCCTTTT	TATTAACTAGTTGATATGCTTT	+	chr3L	22522723	+	chr3L	22522800	77	+	chr3L	22522723	+	chr3L	22522800
CGCAGGTCATGCAACACGGGTGAGTGGAAAGTGTGGAAAGTGGAGGCAGCTT:1	CGCAGGTCATGCAACACGGGTG	GTGTGGAAAGTGGAGGCAGCTT	+	chr2R	12492120	+	chr2R	12492183	63	+	chr2R	12492120	+	chr2R	12492183
AATAACTTAATATGGGTCGAATGGGCGTACTCACTTCGAGTTGAAGTCATTCATTGCGTTGGGGTATGGAGGCGG:1	AATAACTTAATATGGGTCGAAT	TTGCGTTGGGGTATGGAGGCGG	+	chr2R	12643819	+	chr2R	12643896	77	+	chr2R	12643819	+	chr2R	12643896
AAGCAATACTATAGTTTTGAGTTGATTAAGTTCTGGAAGTTGGTTTTTTAGTACTGTAACTAAA:1	AAGCAATACTATAGTTTTGAGT	GTTTTTTAGTACTGTAACTAAA	+	chr3R	29079407	+	chr3R	29080768	1361	+	chr3R	29079407	+	chr3R	29080768
TGCCCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTTTCAGTATGGACAGGAACAGCGGC:1	TGCCCAGTGCAATTTAATTATG	CAGTATGGACAGGAACAGCGGC	+	chrX	670288	+	chrX	670368	80	+	chrX	670288	+	chrX	670368
AAATTTTCACAGTTCAATACACCTTTCCTTTTAGCCACACATCTAATATATAAATCCATAGAGGTAGTCTGTTTG:1	AAATTTTCACAGTTCAATACAC	ATCCATAGAGGTAGTCTGTTTG	-	chr3L	10035302	-	chr3L	10035215	87	+	chr3L	10035215	+	chr3L	10035302
ATGTGTCGCAATGATATCGGAACCTTAAAGAAGTCCCGCATCGACTTGGCTCTTAGTTAAACTGCTNCAAGCAAA:1	ATGTGTCGCAATGATATCGGAA	TAGTTAAACTGCTNCAAGCAAA	-	chr3R	7857753	-	chr3R	7857670	83	+	chr3R	7857670	+	chr3R	7857753
GAACCTGTTGTATTATTTTTTGCAAATACANNNTNCTAACAGCAAATAAATGTAATTTGCGAAAAACAAGCAGCC:1	GAACCTGTTGTATTATTTTTTG	AATTTGCGAAAAACAAGCAGCC	+	chr3L	11087064	+	chr3L	11088853	1789	+	chr3L	11087064	+	chr3L	11088853
CCTGAACACTCTGCTCACAGTGGTTTCAGTTAACTGCAGTTCTGCGAATTAAACAACACAGATCTCTTACCAAC:1	CCTGAACACTCTGCTCACAGTG	ACAACACAGATCTCTTACCAAC	+	chr2L	10483149	+	chr2L	10476525	6624	+	chr2L	10483149	+	chr2L	10476525
CCATAGGAAAGTATGCAGGCAATACGAGAATGTAATAAAAATGGCAAATCGGAACACTCGATCGTTAAATACCCT:1	CCATAGGAAAGTATGCAGGCAA	ACACTCGATCGTTAAATACCCT	-	chr2L	17543705	-	chr2L	17543612	93	+	chr2L	17543612	+	chr2L	17543705
CGAGTCACATCTGTATCCTGTCTTCCACTCATTGGAAGAGATTTTTATCAATCAAAGTGA:1	CGAGTCACATCTGTATCCTGTC	AGATTTTTATCAATCAAAGTGA	-	chr3R	25424755	-	chr3R	25424692	63	+	chr3R	25424692	+	chr3R	25424755
GCAATAAATAGGTATATAGGTATAATTTAGAAAGAATCTTTCGACGGCAGTATTTCTTATTTATTATTGTTTACT:1	GCAATAAATAGGTATATAGGTA	TTCTTATTTATTATTGTTTACT	-	chr2R	24848742	-	chr2R	24848658	84	+	chr2R	24848658	+	chr2R	24848742
TACAAAATTTTTGTTTACGTAATTGTCTTTTCTGGACTTAATGTTTTAAAATTTTTCATACTTGCATCTAATAAA:1	TACAAAATTTTTGTTTACGTAA	TTTCATACTTGCATCTAATAAA	+	chrX	14778050	+	chrX	14782847	4797	+	chrX	14778050	+	chrX	14782847
CAGGTGTAAGTGTAAGTGGCGCCTTGCCGGTAGCAATTCAAACAATTTGCAATAAGGCGCCGCTGCCGCCTTTCA:1	CAGGTGTAAGTGTAAGTGGCGC	AAGGCGCCGCTGCCGCCTTTCA	-	chr2R	15065700	-	chr2R	15065622	78	+	chr2R	15065622	+	chr2R	15065700
AGGACACGTTGGAACACAGCNTCGAGGTGTGTNAAAACGCCCNATTCCCTGAATGCCCACAGAAGTGGGCTGCTG:1	AGGACACGTTGGAACACAGCNT	TGCCCACAGAAGTGGGCTGCTG	+	chr3L	22665035	+	chr3L	22665122	87	+	chr3L	22665035	+	chr3L	22665122
TGGGGCAGTTCCTTTACCCGTAGAATTTAAACTTCAAAA:1	TGGGGCAGTTCCTTTACCCGTA	CCGTAGAATTTAAACTTCAAAA	-	chr3L	21836810	-	chr3L	21836760	50	+	chr3L	21836760	+	chr3L	21836810
TGCTGGCATTGACACTGACACTGCGCCACTCCGGCAATGGCCATGTCGCACATCATGCTGGAGGCCTACAAAA:1	TGCTGGCATTGACACTGACACT	ATCATGCTGGAGGCCTACAAAA	-	chr3L	18082046	-	chr3L	20840508	2758462	+	chr3L	20840508	+	chr3L	18082046
CACACACCCGCAAAATTCTCCCTCAGTTGCATCGCACAGACGTACGTACCATTGCTTGTAGCGTAATAAAAGCAC:2	CACACACCCGCAAAATTCTCCC	GCTTGTAGCGTAATAAAAGCAC	+	chr2R	6500993	+	chr2R	6501088	95	+	chr2R	6500993	+	chr2R	6501088
ATCTGTAAGATACGAAAACGAGCTGCTTTCCACCATGGGCATCAATTGCCTTAACATCTTCAGACGAGGC:1	ATCTGTAAGATACGAAAACGAG	CCTTAACATCTTCAGACGAGGC	-	chr2R	11293056	-	chr2R	11292982	74	+	chr2R	11292982	+	chr2R	11293056
TATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTGCTTACCTACGAATATCTTTGTT:1	TATTTATTTTGCTTTCCATCCA	CTTACCTACGAATATCTTTGTT	+	chr3L	16971244	+	chr3L	16971321	77	+	chr3L	16971244	+	chr3L	16971321
GTGCGGCAGAGCCTAATTGTGTCTCCAAAGTTGCTTATGTTTCAGTCTATTGATTAATGTANCGCGAATTGTA:1	GTGCGGCAGAGCCTAATTGTGT	GATTAATGTANCGCGAATTGTA	-	chr3L	25237834	-	chr3L	19004844	6232990	+	chr3L	19004844	+	chr3L	25237834
AGAACTTGCAAATTGGGAGAAGCCTTCGCATTACAGCCCCACTCGGGTGGCAAAATAATAATTATTCTGCATTCG:1	AGAACTTGCAAATTGGGAGAAG	AATAATAATTATTCTGCATTCG	+	chr3R	27799755	+	chr3R	27800133	378	+	chr3R	27799755	+	chr3R	27800133
CACTGCCACCGTACTGTCCGCCATTCATTGACAACTGAGGGCACCATGGACGACATCCAATACCTGCTGCACC:1	CACTGCCACCGTACTGTCCGCC	GACATCCAATACCTGCTGCACC	+	chrX	11901993	+	chrX	4114294	7787699	+	chrX	11901993	+	chrX	4114294
AAAAACTCACGTAATTTTTCACAGGGCGAGGCATTGTGTATTTAATACCGAAAACCTTTGTGGGACAT:1	AAAAACTCACGTAATTTTTCAC	ACCGAAAACCTTTGTGGGACAT	-	chr3L	4825645	-	chr3L	4825570	75	+	chr3L	4825570	+	chr3L	4825645
TTCATTTGCCGACTGACCACCCCTGCAGCTGAGTTGGCAATTAAGCGAGTTAAAATACTTCTTTCTTTTGGCTT:1	TTCATTTGCCGACTGACCACCC	AAATACTTCTTTCTTTTGGCTT	-	chr3R	16411554	-	chr3R	16411477	77	+	chr3R	16411477	+	chr3R	16411554
ATGTGGAGCTGCATCATCACNATGGTGGCCTTNCTCGTGGTGNGCCTCTCTCTTTTCCTTCTTGGCGTCATG:1	ATGTGGAGCTGCATCATCACNA	TCTTTTCCTTCTTGGCGTCATG	+	chr3L	10881314	+	chr3L	10881463	149	+	chr3L	10881314	+	chr3L	10881463
TCCAGCTTGCCTCATTATGGCTGCATACTTTTCGCGCCCAGTGTGTTTCGCAGCCGTAAGACAGCAATTT:1	TCCAGCTTGCCTCATTATGGCT	CGCAGCCGTAAGACAGCAATTT	-	chr3R	29412115	-	chr3R	29412041	74	+	chr3R	29412041	+	chr3R	29412115
CTCTCAAAGTCTCTATTAAGACGACTATCATTCAAAGGACTGCAGTTTATTATATTTACTTTATTTTTAGTCGCA:1	CTCTCAAAGTCTCTATTAAGAC	ATTTACTTTATTTTTAGTCGCA	+	chr3R	25890225	+	chr3R	16689687	9200538	+	chr3R	25890225	+	chr3R	16689687
ATTTTGACAAGCATCCGAGTCGAGTCCGAAGTCCTTGGAGGAGTAGAAGCCCAGTTTCAGTGCTTGGTGGGAATG:1	ATTTTGACAAGCATCCGAGTCG	GTTTCAGTGCTTGGTGGGAATG	+	chr2R	20030995	+	chr2R	20031088	93	+	chr2R	20030995	+	chr2R	20031088
ATATTTCAATCTCTTGGCTTTTTGACCTTTTTCTACCNCGACTGCNGGTATTTTAATTTGACTGACATNT:1	ATATTTCAATCTCTTGGCTTTT	TATTTTAATTTGACTGACATNT	-	chr3R	8081228	-	chr3R	8081155	73	+	chr3R	8081155	+	chr3R	8081228
ATGACATTGTGTGGAACANGATGTCCACCTACAAAAAATTTCAAAATCAATCTATCGGG:1	ATGACATTGTGTGGAACANGAT	ATTTCAAAATCAATCTATCGGG	-	chr4	959804	-	chr4	959641	163	+	chr4	959641	+	chr4	959804
TAAAAGTATACCTTAATAAGAAACGCAAACACATGTAATAACATTTTATATTAGACAAAAACTTTTGTGGTATAT:1	TAAAAGTATACCTTAATAAGAA	GACAAAAACTTTTGTGGTATAT	+	chr2R	17169316	+	chr2R	17169556	240	+	chr2R	17169316	+	chr2R	17169556
CAGCTGCGTGTCGAAGGCATCGTGGGCCGCGTTTGTTTGTCTTTTTTTGTTTTTTTTT:1	CAGCTGCGTGTCGAAGGCATCG	TTGTCTTTTTTTGTTTTTTTTT	+	chrX	15446960	+	chrX	13812970	1633990	+	chrX	15446960	+	chrX	13812970
TACTAATAAATAATGATATTGATAAATAAATGTATATNCACCTAANAGAACTCTTTCACATCAA:1	TACTAATAAATAATGATATTGA	TAANAGAACTCTTTCACATCAA	-	chr3R	12828576	-	chr3R	27606083	14777507	+	chr3R	27606083	+	chr3R	12828576
GTGAAACTCGTAAAAAAAAGGAAATTCAAAACAAGCTGAACGCAGATGAAAAATAGTCGAGGAAACTCAAGAAAC:1	GTGAAACTCGTAAAAAAAAGGA	TAGTCGAGGAAACTCAAGAAAC	-	chr3L	13152695	-	chr3L	5195711	7956984	+	chr3L	5195711	+	chr3L	13152695
GCTAGTGCCATGATATGAGGAAAGTAACAAACGCCTCAGAATTGTTAATGAATCACTCCTAAAATCTTTAACTGA:1	GCTAGTGCCATGATATGAGGAA	CACTCCTAAAATCTTTAACTGA	+	chrX	17647294	+	chrX	8893381	8753913	+	chrX	17647294	+	chrX	8893381
GGACGTATGCATAATTGTGCTTTTACGTGTTTTAGCAAAAAATCAAAAAGAACTATGTAAGATTTCGATGGGGAA:1	GGACGTATGCATAATTGTGCTT	TATGTAAGATTTCGATGGGGAA	+	chr3R	28479157	+	chr3R	28479240	83	+	chr3R	28479157	+	chr3R	28479240
TTTGTGCTTAAGAATCAAATACAGAACTGAAATGAGTCTGAAAACTAATTAACTGGCACACTAGAAGTCATTTGA:1	TTTGTGCTTAAGAATCAAATAC	TGGCACACTAGAAGTCATTTGA	-	chr2R	22118516	-	chr2R	22118438	78	+	chr2R	22118438	+	chr2R	22118516
GTCTGCACTTTTGTATCTGTNTCTGTAACTGCNTCTGCGTTTNGTAACTGGGCAGTCACGGCCA:1	GTCTGCACTTTTGTATCTGTNT	NGTAACTGGGCAGTCACGGCCA	-	chr3L	20580412	-	chr3L	13687011	6893401	+	chr3L	13687011	+	chr3L	20580412
GCATATGCAATTGGCTTCNTCGAGGCCTTAGCCAACAGTAANGCTNAAGCCAAAGCCAAAGCCGAAGCTAA:1	GCATATGCAATTGGCTTCNTCG	CCAAAGCCAAAGCCGAAGCTAA	+	chr3R	22290441	+	chr3R	14710156	7580285	+	chr3R	22290441	+	chr3R	14710156
AACCACCACTCTCCTCTACTCCAGAATGTGNNNGNAGAATGCGCTTACACAAATTTCTGGTATTATGTTGCATAC:1	AACCACCACTCTCCTCTACTCC	TTTCTGGTATTATGTTGCATAC	-	chr2L	12863185	-	chr2L	12861718	1467	+	chr2L	12861718	+	chr2L	12863185
GTATGTGCTTTGCATTTGACTGCCCATTGATGAGAGATGTGCCATTGTGTTGCCAGGCCAAGTCTCNTCAGCTG:1	GTATGTGCTTTGCATTTGACTG	CCAGGCCAAGTCTCNTCAGCTG	-	chr3R	23629528	-	chr3R	23629453	75	+	chr3R	23629453	+	chr3R	23629528
ACTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAA:1	ACTCTGTGCATATCAACGAACG	GATAAAAAGCTCTAGCGTGTAA	-	chrY	311461	-	chrY	311344	117	+	chrY	311344	+	chrY	311461
GGGTGTGGTGTTGGATNTCGGAANGGGAAGTAANGGGCNTACCGAATGAAAGGGATG:1	GGGTGTGGTGTTGGATNTCGGA	GGCNTACCGAATGAAAGGGATG	+	chr2R	6922979	+	chr2R	15706462	8783483	+	chr2R	6922979	+	chr2R	15706462
CGGGGTCCATGTAATGCTCCTCCTTATCGAGGCGGATTTTTGCGATAATTGCGAGTGCAAAATCGAGCACACGCG:1	CGGGGTCCATGTAATGCTCCTC	AGTGCAAAATCGAGCACACGCG	-	chr2R	11675087	-	chr2R	11675007	80	+	chr2R	11675007	+	chr2R	11675087
GGGAAAAGCTCGCACGTGCGACGCTTGCGAAAAAAAAATTGAAAATATATATATACATATATTGCGAAGAGAGGG:1	GGGAAAAGCTCGCACGTGCGAC	TACATATATTGCGAAGAGAGGG	-	chr2L	7984081	-	chr2L	7977106	6975	+	chr2L	7977106	+	chr2L	7984081
ATAGGAAAATACACACACACACAAAACTATTGTANAGGTTTTATTTATTTTGTCTATAGAATATCTTGGTGCTAT:1	ATAGGAAAATACACACACACAC	CTATAGAATATCTTGGTGCTAT	-	chr3R	23186723	-	chr3R	19448239	3738484	+	chr3R	19448239	+	chr3R	23186723
TACGTATGTGCTTTGCATNTGACTGCCCATTGATNAGAGATNTGCNATTGTGTTGCCAGGCCAAGTCTCTTCAGC:1	TACGTATGTGCTTTGCATNTGA	TGCCAGGCCAAGTCTCTTCAGC	-	chr3R	23629531	-	chr3R	23629455	76	+	chr3R	23629455	+	chr3R	23629531
GACTCAAACCAATGTGACCGTGTATAGAAGGCTTNGACGTGTGCGGCAACTCTGACGCCCAGCAAAACAAAAACA:1	GACTCAAACCAATGTGACCGTG	GACGCCCAGCAAAACAAAAACA	-	chr2R	7916520	-	chr2R	7916435	85	+	chr2R	7916435	+	chr2R	7916520
TCTTCTGGGCTTACCCTCANTTCCCTGCCTGCGCTCCTGGTCGCT:1	TCTTCTGGGCTTACCCTCANTT	CCTGCCTGCGCTCCTGGTCGCT	-	chr3R	8334140	-	chr3R	18399828	10065688	+	chr3R	18399828	+	chr3R	8334140
CGTCACTGGCGACTGTTACGTGAGGGGATNGGATCGGATCGGAT:1	CGTCACTGGCGACTGTTACGTG	AGGGGATNGGATCGGATCGGAT	-	chr3L	4229304	-	chr3L	1445726	2783578	+	chr3L	1445726	+	chr3L	4229304
TCTAACAAGCTGCATGTAAAAGATTTTAAAGTGCAATTAAGGGATTGCATTGATGCAAAGACGCGCACTGCGGTT:1	TCTAACAAGCTGCATGTAAAAG	TGCAAAGACGCGCACTGCGGTT	-	chr3R	31805215	-	chr3R	31805139	76	+	chr3R	31805139	+	chr3R	31805215
TTTCAAGCTGAGCTTTACAAATTGAGCTTTTGATGGCGCCATCTAGCAGATAACAATATCATTAAGCTTGTTT:1	TTTCAAGCTGAGCTTTACAAAT	AACAATATCATTAAGCTTGTTT	+	chr3L	4475206	+	chr3L	20097458	15622252	+	chr3L	4475206	+	chr3L	20097458
TTAAATTGTAATACCTAATCAATATTTCCAATGAATATAAACATTGCGAGCCAATCTCAAAGCACCATTATTTAT:1	TTAAATTGTAATACCTAATCAA	ATCTCAAAGCACCATTATTTAT	-	chrX	4409227	-	chrX	4409142	85	+	chrX	4409142	+	chrX	4409227
TAAAGAGGCCTTCGAGTTNCTTTTTAATATTTTAGTTCTTTNGTANATGTACAAATAAAGTATTAAAGACAATTC:1	TAAAGAGGCCTTCGAGTTNCTT	AATAAAGTATTAAAGACAATTC	+	chr2L	16511967	+	chr2L	16519081	7114	+	chr2L	16511967	+	chr2L	16519081
ACTTTTATATTCCGTTGGTACTTTATATTCATGTTGGTACTACCACTCCATCAACATGTATATTTAT:1	ACTTTTATATTCCGTTGGTACT	CTCCATCAACATGTATATTTAT	+	chr3R	27452603	+	chr3R	27452775	172	+	chr3R	27452603	+	chr3R	27452775
AGTTATTCNTAGCATCCAAGGGCGTCGCCAGGCCANCAGCCAGGGGGGGCAGATAGTAGAATTCCTCTTCCTACA:1	AGTTATTCNTAGCATCCAAGGG	TAGTAGAATTCCTCTTCCTACA	-	chr3L	21500479	-	chr3L	21498843	1636	+	chr3L	21498843	+	chr3L	21500479
AGGAAGTGGCCTCGGGGATTGGGACATGAGCAACTCCGCATCGTCATCATCAGCGGCCTCAAAGGAAGCACTC:1	AGGAAGTGGCCTCGGGGATTGG	AGCGGCCTCAAAGGAAGCACTC	+	chr3L	3565957	+	chr3L	3566031	74	+	chr3L	3565957	+	chr3L	3566031
TATCAGCTTCAAGTCACCAAACAGGCTCTTTAATGCTCGAGTTCCATGATTTGTGATAAAAGTGAAAAAATAAAA:1	TATCAGCTTCAAGTCACCAAAC	TGATAAAAGTGAAAAAATAAAA	-	chr2R	6247888	-	chr2R	6247810	78	+	chr2R	6247810	+	chr2R	6247888
AATGACAAATAAGGCATTCAAGTGTAATAGCTAGCGAAATGGGGGATGTAGTGCTTCATCTTTGTTTTTCTGGC:1	AATGACAAATAAGGCATTCAAG	GCTTCATCTTTGTTTTTCTGGC	+	chrX	827611	+	chrX	835402	7791	+	chrX	827611	+	chrX	835402
GCACAGCACCTCCGACTAACTTTACCGCTCCACCCACTCACACCTTAGCCACATAACCTCCCCCCTGGTCCAACG:1	GCACAGCACCTCCGACTAACTT	TAACCTCCCCCCTGGTCCAACG	-	chr2L	14952919	-	chr2L	6787417	8165502	+	chr2L	6787417	+	chr2L	14952919
AACATCAAGTGATTTCTCGCAGTGTAAATTCCTCTCTTAGGGCTTTGGGTTTGGCTGCATTGCGCCATTTATTTG:1	AACATCAAGTGATTTCTCGCAG	GCTGCATTGCGCCATTTATTTG	+	chr2R	24714215	+	chr2R	24710365	3850	+	chr2R	24714215	+	chr2R	24710365
CAAAGACAAAGACAAAGACACAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACA:1	CAAAGACAAAGACAAAGACACA	GACAAAGACAAAGACAAAGACA	+	chrX	19404963	+	chrX	16983077	2421886	+	chrX	19404963	+	chrX	16983077
AATTGGTTTGGCCGCTGATAAATTTACTTTTACTAAATGATGGCTTAAATGAGTCGTGCCTGGCTGGCATAAG:1	AATTGGTTTGGCCGCTGATAAA	AGTCGTGCCTGGCTGGCATAAG	-	chr3L	5225902	-	chr3L	5225573	329	+	chr3L	5225573	+	chr3L	5225902
TTCATTGTTTTAGTGTTTTTGCGATTTTGAGCTGTGCGCGTGCCGCATTCAACGTGATGCCGAATTGAACATTTA:1	TTCATTGTTTTAGTGTTTTTGC	GTGATGCCGAATTGAACATTTA	+	chrX	6335226	+	chrX	6337736	2510	+	chrX	6335226	+	chrX	6337736
CTGAATATGATTAAAATGCTTACCTTATTCGGGTGGTGGCTAGTGTTCGCCTCGTTACGTCTCATTGA:1	CTGAATATGATTAAAATGCTTA	TCGCCTCGTTACGTCTCATTGA	+	chr2R	18289463	+	chr2R	18289558	95	+	chr2R	18289463	+	chr2R	18289558
CGCAACGCGGCGTATACCATCGAGAACGAGCGCGAAACGTAGAGATTTTGATAAACAGCTCCAAAATGG:1	CGCAACGCGGCGTATACCATCG	TTGATAAACAGCTCCAAAATGG	+	chr2L	18078290	+	chr2L	18078370	80	+	chr2L	18078290	+	chr2L	18078370
GTGGAAAACCCCTCCATGGATCAGACCTTCAATAATGGCGCGATAACCGAGTCTCAAGAGCAATTCAGATTTAT:1	GTGGAAAACCCCTCCATGGATC	CTCAAGAGCAATTCAGATTTAT	+	chr2R	22834793	+	chr2R	22834905	112	+	chr2R	22834793	+	chr2R	22834905
ATTGATTGAATCCGTATGCAACAATTGGACAGTCGACCAGTGTGGGCAAGTGGCAGGGACG:1	ATTGATTGAATCCGTATGCAAC	GTGTGGGCAAGTGGCAGGGACG	-	chr3R	27619824	-	chr3R	27619723	101	+	chr3R	27619723	+	chr3R	27619824
TGAGACTGGAATATGGATGGTCGATGGTCGATTGGTGCCTGGTGCCTGGCATTGTTATTGGGTCGAAGGTGAG:1	TGAGACTGGAATATGGATGGTC	TTGTTATTGGGTCGAAGGTGAG	-	chr2L	9202142	-	chr2L	9202068	74	+	chr2L	9202068	+	chr2L	9202142
CCTGCCACCGGAAAATTGACAGCACCGGCACACCAGCTGTCTTCAGTGACAAGCTG:1	CCTGCCACCGGAAAATTGACAG	AGCTGTCTTCAGTGACAAGCTG	-	chr3R	15811752	-	chr3R	15811530	222	+	chr3R	15811530	+	chr3R	15811752
GGGCGGTGTACGGGAAGGAGGTGGAGGTACTAGTTACTGCTGGCCGNGTAATTAATATGC:1	GGGCGGTGTACGGGAAGGAGGT	GCTGGCCGNGTAATTAATATGC	+	chr2L	11332073	+	chr2L	11332164	91	+	chr2L	11332073	+	chr2L	11332164
CTTTTTCGTCGCTTTGACAGTAACGGGAGGATCAGTTTCTGCCTCTTTCGCTGACCCGTCTATG:1	CTTTTTCGTCGCTTTGACAGTA	CTCTTTCGCTGACCCGTCTATG	+	chr3L	11952873	+	chr3L	21330771	9377898	+	chr3L	11952873	+	chr3L	21330771
CTCGGCAAGTCACAAAAGTATCTCATTTTCCAAATTACACACGCTAAACAAAAAACCCAAACCCATCCCGAACGT:1	CTCGGCAAGTCACAAAAGTATC	AACCCAAACCCATCCCGAACGT	-	chr3R	21475702	-	chr3R	14095420	7380282	+	chr3R	14095420	+	chr3R	21475702
CAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCTATGTGTTGGTGATGAGCAGAGCGGGCTAAAATGTTAGAAATGAATT:1	CAGACTGCATTCAACTGCTGCA	GCTAAAATGTTAGAAATGAATT	+	chr3L	19182417	+	chr3L	19182498	81	+	chr3L	19182417	+	chr3L	19182498
AATGCAAGCACTTCAATCCTTGCGACTTATAAATAATGCTAATTGATTGTGG:1	AATGCAAGCACTTCAATCCTTG	AAATAATGCTAATTGATTGTGG	+	chr2L	10592864	+	chr2L	10600503	7639	+	chr2L	10592864	+	chr2L	10600503
TTGATGTTTCGCAAAGTCAGAATTTGATTNACAAATGGCACTAGAATTTGAATTCATAAANCCATGTTGCCCAG:1	TTGATGTTTCGCAAAGTCAGAA	TTCATAAANCCATGTTGCCCAG	-	chr2L	1829024	-	chr2L	1828948	76	+	chr2L	1828948	+	chr2L	1829024
GTTTAATTCTACACTAAATTAACTATTTGTTTATTTGAAAGTGGCATGCTATGTTCTCCCTTCCGATTGGGTTGC:1	GTTTAATTCTACACTAAATTAA	TTCTCCCTTCCGATTGGGTTGC	+	chr3R	4479552	+	chr3R	16098598	11619046	+	chr3R	4479552	+	chr3R	16098598
TGGGTAAAGTGGATGGTTTGTGGGAGAAATCATTCACGGAATAGGCGACCAGGTAGGTGGAGATT:1	TGGGTAAAGTGGATGGTTTGTG	GGCGACCAGGTAGGTGGAGATT	+	chr3R	29237271	+	chr3R	29239282	2011	+	chr3R	29237271	+	chr3R	29239282
GTGGCGCCTATTGAGTTCCCTCGGTTTAAATGGCTAAACATTCCGTGCAATTTTCTATACTGTTGCCATGCGGAA:1	GTGGCGCCTATTGAGTTCCCTC	TCTATACTGTTGCCATGCGGAA	+	chr3R	26211202	+	chr3R	26211294	92	+	chr3R	26211202	+	chr3R	26211294
TTCACTATNAGGTTCCAAAACATAATATATGTATGNAATCTTTGAAACTTGGACTTAAAATAACTAACAGGTCTA:1	TTCACTATNAGGTTCCAAAACA	CTTAAAATAACTAACAGGTCTA	+	chrX	18429521	+	chrX	18434832	5311	+	chrX	18429521	+	chrX	18434832
GTGGGTCCAACATTCAGATGGGAAGCCATAAAATATATCCACACACGAGGTGGAGAAGGGCATTG:1	GTGGGTCCAACATTCAGATGGG	CACGAGGTGGAGAAGGGCATTG	+	chr3R	23688496	+	chr3R	23688577	81	+	chr3R	23688496	+	chr3R	23688577
TTCTTTTCATTGTTATATTCTATAATTTATATTCTTCTAATTTTAGCATTTCGGCCAACTGATCGCTGATGCAGG:1	TTCTTTTCATTGTTATATTCTA	GCCAACTGATCGCTGATGCAGG	-	chrX	3306363	-	chrX	3306260	103	+	chrX	3306260	+	chrX	3306363
TAAATCGACTTTAAAGTCTAGCCAAAGGATGGGGAGCAGCATATGCAGTTCCCTTAATGAGCGCTAGCAAAAC:1	TAAATCGACTTTAAAGTCTAGC	CCTTAATGAGCGCTAGCAAAAC	-	chr2L	10777330	-	chr2L	10777220	110	+	chr2L	10777220	+	chr2L	10777330
GTATGCCAACTGCCAACAAATCAAGCTGTCGTGAGGCAGTGGAGCATTCAACCATAGCAAAGTATTTCTGGAG:1	GTATGCCAACTGCCAACAAATC	CCATAGCAAAGTATTTCTGGAG	-	chr3R	12893558	-	chr3R	12893482	76	+	chr3R	12893482	+	chr3R	12893558
AGAAAACATTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGANGACTTGACGACTTCACTTANAGTGCAT:1	AGAAAACATTTCGGGATATAAT	GACGACTTCACTTANAGTGCAT	-	chr3R	28484372	-	chr3R	28486289	1917	+	chr3R	28486289	+	chr3R	28484372
GTCCAGGGTTCAAGTCCCTNCTCGGGCGTAAGGAACCAAATGCTTCAGAGCTGCATGATTCCAAATTCAAGATCA:1	GTCCAGGGTTCAAGTCCCTNCT	CATGATTCCAAATTCAAGATCA	+	chr2L	8290772	+	chr2L	3331083	4959689	+	chr2L	8290772	+	chr2L	3331083
TTACGACTCGATGAACGTGAAGTTGGCTTTTGACGAGCCATGTCTCTGGTCAGGAGCAG:1	TTACGACTCGATGAACGTGAAG	CCATGTCTCTGGTCAGGAGCAG	+	chr3R	23242314	+	chr3R	23242378	64	+	chr3R	23242314	+	chr3R	23242378
GTTAAATCAACATTATTTAGGCACCCATGCATTCGGGCAAAGACAATTTCGCA:1	GTTAAATCAACATTATTTAGGC	TTCGGGCAAAGACAATTTCGCA	-	chr3L	18328431	-	chr3L	18328325	106	+	chr3L	18328325	+	chr3L	18328431
AAAAAGCATCGGATTGGAATGAACACTAAAAACCATTTAATATATTTTATACGGTAGGACCATATCGTCTTCAA:1	AAAAAGCATCGGATTGGAATGA	GGTAGGACCATATCGTCTTCAA	-	chr3L	22105863	-	chr3L	22099678	6185	+	chr3L	22099678	+	chr3L	22105863
GGCACGAGGGCAAAAGAAAAGGTAGTACCCCTNTTGGTTTTGTTTTTTGTGCCATCGCTTGA:1	GGCACGAGGGCAAAAGAAAAGG	TGTTTTTTGTGCCATCGCTTGA	-	chr2R	12504226	-	chr2R	12504162	64	+	chr2R	12504162	+	chr2R	12504226
CAGTAAGAGGATCAAGTTGGAACAGGGACAGACACCAAATTACATAGAAAGTGAAAAGGATCACGAAAAGCGTAT:1	CAGTAAGAGGATCAAGTTGGAA	AAAAGGATCACGAAAAGCGTAT	+	chr3L	17451440	+	chr3L	220087	17231353	+	chr3L	17451440	+	chr3L	220087
AGTTGGGGCTTCGGATGGAGCCAGCTGACTGACGACGTCGTTCCAGTGCATACAAATAAATTTTATTAAGCAGTT:1	AGTTGGGGCTTCGGATGGAGCC	AAATAAATTTTATTAAGCAGTT	+	chr2R	11485142	+	chr2R	11485224	82	+	chr2R	11485142	+	chr2R	11485224
ATCCGTGTACCGGCAAATTTTGTTTACAGTACAGAAACTGATTTTAATGAACATAGTAAGCAGTATTGCTATTTT:1	ATCCGTGTACCGGCAAATTTTG	TAGTAAGCAGTATTGCTATTTT	-	chr3L	2168880	-	chr3L	2168789	91	+	chr3L	2168789	+	chr3L	2168880
AACGGAATCTTAATGAATTTAACGAATTTANNNTNCTGTGCACTTCAAACATCCGCTCACTACGGGGTGATGGTG:1	AACGGAATCTTAATGAATTTAA	CGCTCACTACGGGGTGATGGTG	-	chr3R	5060819	-	chr3R	5060729	90	+	chr3R	5060729	+	chr3R	5060819
CAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
AAATGGGTCAATAGGAAGTAATAATCTNTGNNTCCAAAACCAGTCTGAGNCNTACCTTTCCATTGCTCTTAGAGC:1	AAATGGGTCAATAGGAAGTAAT	ACCTTTCCATTGCTCTTAGAGC	-	chrX	19594055	-	chrX	19593970	85	+	chrX	19593970	+	chrX	19594055
TCAGTTGACTTATGTTTTAAAATGGATTGTATAAAATTTGCTGGAAAATAC:1	TCAGTTGACTTATGTTTTAAAA	TATAAAATTTGCTGGAAAATAC	-	chr3R	6705910	-	chr3R	6705710	200	+	chr3R	6705710	+	chr3R	6705910
TGCTCCACGCCAGGCGTCCATAGAGGGTAAGTTCTCAAGTTTGGAAAAAAAGGGATGGTTTATAAATCAGAGGGT:1	TGCTCCACGCCAGGCGTCCATA	GATGGTTTATAAATCAGAGGGT	+	chr2L	10153210	+	chr2L	10153289	79	+	chr2L	10153210	+	chr2L	10153289
ACAAAAACTGCTGTGACGAGAAAAAGTGTGGTTCATGTGTTACATGGTCATGTTTTTCATCTCTATTCTCGCTCT:1	ACAAAAACTGCTGTGACGAGAA	TTTTCATCTCTATTCTCGCTCT	+	chr3R	1443439	+	chr3R	1443515	76	+	chr3R	1443439	+	chr3R	1443515
AATTTAAATAGAATTCAAATAGAGTGCGTAAGTGGACAAGAATAAAATATTTCACAGCTTTGAGAATAATCTTCA:1	AATTTAAATAGAATTCAAATAG	ACAGCTTTGAGAATAATCTTCA	-	chr3R	28393820	-	chr3R	28393720	100	+	chr3R	28393720	+	chr3R	28393820
CAAAAAAGTCGGAGTTTATTTCCGTTATTTGCACTGTTGTNCGCCTAATATTATTTTTTTGCCAT:1	CAAAAAAGTCGGAGTTTATTTC	CCTAATATTATTTTTTTGCCAT	-	chr3R	20165870	-	chr3R	20156710	9160	+	chr3R	20156710	+	chr3R	20165870
CGAAGAACAAGCCAATCAAAATGGAACAGAGCACATGAAACGACCTACCATAGACCGACCGACTGACGCCACGAA:1	CGAAGAACAAGCCAATCAAAAT	ACCGACCGACTGACGCCACGAA	-	chr2L	2738489	-	chr2L	1011142	1727347	+	chr2L	1011142	+	chr2L	2738489
AAAAATAATGATCGGGAACAAGAGCGCGCAGCACTGGGAGAAAATAGGGGGTGCTGACTGTACGTGAAAAAACAG:1	AAAAATAATGATCGGGAACAAG	CTGACTGTACGTGAAAAAACAG	-	chr2L	19163459	-	chr2L	19163378	81	+	chr2L	19163378	+	chr2L	19163459
TTGTTGGATATGGTTAGACCAGGATTGAACGGATGACTGGCCGGCATTTCAAA:1	TTGTTGGATATGGTTAGACCAG	GATGACTGGCCGGCATTTCAAA	-	chr2R	10993033	-	chr2R	10992969	64	+	chr2R	10992969	+	chr2R	10993033
CTCTCATTATGTTAAAGTCGAACGCCGTAGCCCATATTTGCGCCTTATCAACTCTGTTATAAATTCCGTCGAATC:1	CTCTCATTATGTTAAAGTCGAA	CTGTTATAAATTCCGTCGAATC	+	chr2R	1880705	+	chr2R	5639656	3758951	+	chr2R	1880705	+	chr2R	5639656
AGCTGCAAAAAAAAAATATATATAAACGTATATAAATNTCAAACCNCCATTTGCCATATAAATGGATGNAAGCT:1	AGCTGCAAAAAAAAAATATATA	GCCATATAAATGGATGNAAGCT	-	chr2L	11108846	-	chr2L	9404068	1704778	+	chr2L	9404068	+	chr2L	11108846
GCTGAAGACAAAAAACACCAAAAACGACAAAACAAACAAAAGCAAGGAAAATGCGAAATTTGCCATTTT:1	GCTGAAGACAAAAAACACCAAA	AAAATGCGAAATTTGCCATTTT	-	chr2L	8588275	-	chr2L	13425057	4836782	+	chr2L	13425057	+	chr2L	8588275
GATACTATGGCTTGTACTCAGATACCAAGTAAACAGATATTCATACCTCAAAGCACTTTGTAACTCCCAATTT:1	GATACTATGGCTTGTACTCAGA	AGCACTTTGTAACTCCCAATTT	+	chrX	6003297	+	chrX	6003376	79	+	chrX	6003297	+	chrX	6003376
CAGCTGCTCCTCTTAAATTTCCGACCTCGATGTTAAACAGAAAAAATTCAAAGCTGAAAATGTGCATTTGTAT:1	CAGCTGCTCCTCTTAAATTTCC	AGCTGAAAATGTGCATTTGTAT	+	chr2L	20984614	+	chr2L	20984693	79	+	chr2L	20984614	+	chr2L	20984693
CAGTTCTAGGCTGGTAATATTGTTTTATATAGGTATATGCATTAATAATCGCTAGGGTTTCTATTAAATACGC:1	CAGTTCTAGGCTGGTAATATTG	CTAGGGTTTCTATTAAATACGC	+	chr3L	6866392	+	chr3L	23848454	16982062	+	chr3L	6866392	+	chr3L	23848454
AATTGAAAAATGTATACACAACAAATAACAACATCAACTAAAACTAAGACAACAAAAAATGTTACAAATTTTCTA:1	AATTGAAAAATGTATACACAAC	AAAAAATGTTACAAATTTTCTA	-	chr2L	13999437	-	chr2L	8903905	5095532	+	chr2L	8903905	+	chr2L	13999437
CATATAGTNCTATAGTTCAGTATATTTTAAGCTCANATTAACTTTTAAAATATGGCAGAATGTTCAGCACGTTAT:1	CATATAGTNCTATAGTTCAGTA	GGCAGAATGTTCAGCACGTTAT	-	chr3L	19253922	-	chr3L	19253845	77	+	chr3L	19253845	+	chr3L	19253922
GTTCATCTGGCTCGCATTCCTCGCATTTTGTGGATAACCTTATTTGACTTGCCCCATAATTTGATGCCATCGTTT:1	GTTCATCTGGCTCGCATTCCTC	CCATAATTTGATGCCATCGTTT	-	chr3R	12568586	-	chr3R	12568506	80	+	chr3R	12568506	+	chr3R	12568586
ACATTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGTGCC:1	ACATTTCGGGATATAATCTCAG	CTTCACTTAAAGTGCATGTGCC	-	chr3R	28484367	-	chr3R	28486284	1917	+	chr3R	28486284	+	chr3R	28484367
AAATAATATGACATTTTTTAGACTAATAATCCTAGCTAGTTGCCATTGCAATTGNAATTT:1	AAATAATATGACATTTTTTAGA	GTTGCCATTGCAATTGNAATTT	-	chr3L	16643852	-	chr3L	16643771	81	+	chr3L	16643771	+	chr3L	16643852
AAATATTTGCAAAAATAATCCCCCAAAATATATGCATACACATTGGTTTATAATGAAAATATTCGTTTTCCTCAT:1	AAATATTTGCAAAAATAATCCC	TGAAAATATTCGTTTTCCTCAT	-	chr3R	20273003	-	chr3R	20266532	6471	+	chr3R	20266532	+	chr3R	20273003
AATTATCTACACATTTAGGCACACGCATTAGCCACCACAATGGCCAGGAGTATATACGATATAGTAGTTGGCCA:1	AATTATCTACACATTTAGGCAC	TATACGATATAGTAGTTGGCCA	+	chr3R	28103335	+	chr3R	28103427	92	+	chr3R	28103335	+	chr3R	28103427
AGTAGGCAACGAAATTGTTCGGCCAAATTCAATTTTCCTAGCTCTTAAGAGCTGCGCATATCGATTTAAGCGAGT:1	AGTAGGCAACGAAATTGTTCGG	GCGCATATCGATTTAAGCGAGT	+	chr2R	22774968	+	chr2R	22775387	419	+	chr2R	22774968	+	chr2R	22775387
TACTGAATATGATTAAAATGCTTACCTTATTCGGGTGGTGGCTAGTGTTCGCCTCGTTACGTCTCATTG:1	TACTGAATATGATTAAAATGCT	TTCGCCTCGTTACGTCTCATTG	+	chr2R	18289461	+	chr2R	18289557	96	+	chr2R	18289461	+	chr2R	18289557
GGCTTTTGTTGTGCTTTTNTTTCTGGCTTTCGGTCCCATCCCGGCTGGCTCTGTTTGGCTTTCAATCAAAGTNTT:1	GGCTTTTGTTGTGCTTTTNTTT	TTTGGCTTTCAATCAAAGTNTT	-	chr2L	17191971	-	chr2L	17191886	85	+	chr2L	17191886	+	chr2L	17191971
AACCTAGANTTGAATCACTGGTGTAGATTGCATTTNCTCTCCTTGCTCCACCGTTCAGTCCAAAAGTCAATTAA:1	AACCTAGANTTGAATCACTGGT	GTTCAGTCCAAAAGTCAATTAA	-	chr3R	4992685	-	chr3R	12599612	7606927	+	chr3R	12599612	+	chr3R	4992685
AATTAAATTTGGAGTGCTTCCCAAGATTGTGGGGTTTTTCCAATGCCATCGAACTTTGAGGGCTGCGGATTCTAA:1	AATTAAATTTGGAGTGCTTCCC	CTTTGAGGGCTGCGGATTCTAA	-	chrX	12277286	-	chrX	12277195	91	+	chrX	12277195	+	chrX	12277286
GATTTTTCAGCAATTCGCACCGCTTTTGAAACTATATTTAAATATGGTAAA:1	GATTTTTCAGCAATTCGCACCG	AACTATATTTAAATATGGTAAA	+	chr3R	12516087	+	chr3R	12516158	71	+	chr3R	12516087	+	chr3R	12516158
GTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTNT:1	GTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCT	CTTTGTCTTTGTCTTTGTCTNT	-	chrX	16983076	-	chrX	1053120	15929956	+	chrX	1053120	+	chrX	16983076
AGTAACGAAGCACGCTAGGAAAAATCATATACATATACCGAACGTAATAGCACAAAAAATAAAAAATTGCATAAC:1	AGTAACGAAGCACGCTAGGAAA	AAAAAATAAAAAATTGCATAAC	+	chr3L	22825567	+	chr3L	22825644	77	+	chr3L	22825567	+	chr3L	22825644
TTTCCGGAAGCTGAGCCCGAAGTAAAGGCTCCTGGTCAATTATGCCAAAAATCGCAAGTAAATGTCTCTTACAAG:1	TTTCCGGAAGCTGAGCCCGAAG	GCAAGTAAATGTCTCTTACAAG	+	chr2L	5693220	+	chr2L	5692169	1051	+	chr2L	5693220	+	chr2L	5692169
AGCCAAAGGCACCGCAGCCAAAATGAGCTAGGGATGGCAAAGTGAGGAGACTAGAGATGACTTTCAAGCAGAAA:1	AGCCAAAGGCACCGCAGCCAAA	AGAGATGACTTTCAAGCAGAAA	+	chr3L	5983836	+	chr3L	5983956	120	+	chr3L	5983836	+	chr3L	5983956
CAAATAATGCACTTGAATTTGCATAAAGAATTTGCGAGTAAATTCGCAAAAATTTATGCAAATTAGCCGGCGTG:1	CAAATAATGCACTTGAATTTGC	TTTATGCAAATTAGCCGGCGTG	-	chr3L	10308832	-	chr3L	10308756	76	+	chr3L	10308756	+	chr3L	10308832
AACATATTGCATATTTTGTTTGTGCCTCATGCGTGTCNCATGCTCNAATCGATGGGTTTT:1	AACATATTGCATATTTTGTTTG	CATGCTCNAATCGATGGGTTTT	-	chr2L	14554245	-	chr2L	14554183	62	+	chr2L	14554183	+	chr2L	14554245
TAATGCATTTGATTTCATAAGAACATATCTAGCCTTGATATATATATGAAAATAATTTACTTCACTTCGTT:1	TAATGCATTTGATTTCATAAGA	AAATAATTTACTTCACTTCGTT	-	chr2L	20601873	-	chr2L	20601799	74	+	chr2L	20601799	+	chr2L	20601873
GATGCTGCAGAAATATCAAGCAATAAGTGCAAAGAAAAATTCAACAATTTTCCGNGCTCCCTTTT:1	GATGCTGCAGAAATATCAAGCA	ACAATTTTCCGNGCTCCCTTTT	+	chr3R	5914174	+	chr3R	14333544	8419370	+	chr3R	5914174	+	chr3R	14333544
ATAGCCAAAAATATCAAAAGATAACAATTGAAGCTAAAGAAATGTATCGAAAATATTGGNAAGTAGCTAAAA:1	ATAGCCAAAAATATCAAAAGAT	AAATATTGGNAAGTAGCTAAAA	-	chr3R	7229890	-	chr3R	21939732	14709842	+	chr3R	21939732	+	chr3R	7229890
CTTCAAGTAAAAAACTCCAAACTAGACCCAATTACACAAAATAATAATTGGAATTTAAATAACAATTCTAAGGTT:1	CTTCAAGTAAAAAACTCCAAAC	TTTAAATAACAATTCTAAGGTT	+	chr2R	11554709	+	chr2R	3205950	8348759	+	chr2R	11554709	+	chr2R	3205950
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907534
TTTACTACGCATGTTTTTACCCCAGAATCTTATCAACNTTAATTCNCAGCCACATACACACACACGCCNTAGA:1	TTTACTACGCATGTTTTTACCC	ACATACACACACACGCCNTAGA	+	chr3L	13074053	+	chr3L	13074184	131	+	chr3L	13074053	+	chr3L	13074184
TTTAACTATACCATTCTTCATGTATGGCATTGTCCTCGTCATGCTTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGGTT:1	TTTAACTATACCATTCTTCATG	ACTTGCTTTATTTGGCCTGGTT	+	chr3R	18766780	+	chr3R	18766858	78	+	chr3R	18766780	+	chr3R	18766858
CTGGAAAAATCCTCCCCAAAAGCAGTGCGGTTGCAGTCGCTT:1	CTGGAAAAATCCTCCCCAAAAG	AGCAGTGCGGTTGCAGTCGCTT	+	chr3L	7414902	+	chr3L	21347825	13932923	+	chr3L	7414902	+	chr3L	21347825
GTGTTACACGCCTATAACAAAGACTCACGTAGTTTGATTGTGCGCCGCTGCCAAGGCAACAAAATGGAATTGGCG:2	GTGTTACACGCCTATAACAAAG	AGGCAACAAAATGGAATTGGCG	-	chrX	15264014	-	chrX	15263651	363	+	chrX	15263651	+	chrX	15264014
TCAACTTTTTGCAAGACAAGTCAGCCTAAACACGTCATCTACACATANATCCGTTGAGTTAATCGTAAATA:1	TCAACTTTTTGCAAGACAAGTC	TCCGTTGAGTTAATCGTAAATA	-	chr2R	24008506	-	chr2R	24008424	82	+	chr2R	24008424	+	chr2R	24008506
TCAATGATGCTAGTTTTTTAGAGACTTTTTAGAGACTAACCTTTTCGTGTTCGCTTTAATTGTTTTTTT:1	TCAATGATGCTAGTTTTTTAGA	TGTTCGCTTTAATTGTTTTTTT	+	chrX	17566998	+	chrX	7925446	9641552	+	chrX	17566998	+	chrX	7925446
AAAGTTTCCATTTTTTTTTTTACTC:1	AAAGTTTCCATTTTTTTTTTTA	GTTTCCATTTTTTTTTTTACTC	+	chrX	4881328	+	chrX	3104779	1776549	+	chrX	4881328	+	chrX	3104779
GCTGTGCCATCTATTAGCCATAGCTATTAGCTATTAGCCACTTTCTTTGATGCTCTGGCTCAT:1	GCTGTGCCATCTATTAGCCATA	TTTCTTTGATGCTCTGGCTCAT	-	chr3R	10545581	-	chr3R	10545375	206	+	chr3R	10545375	+	chr3R	10545581
CGATTGAGACAGAATGGCAAACGCAATGCATACTCATATTATAACTTTTCCATCTTCCATCAATCTTGTTGGCGA:1	CGATTGAGACAGAATGGCAAAC	CTTCCATCAATCTTGTTGGCGA	+	chr3L	21799952	+	chr3L	21800037	85	+	chr3L	21799952	+	chr3L	21800037
TTACAAGCAATTATGCAATNTCGTCTCCGGCTCTTTTGTTGCGATTGCTGTTGTTGTTTTTGT:1	TTACAAGCAATTATGCAATNTC	CGATTGCTGTTGTTGTTTTTGT	+	chr2R	20582895	+	chr2R	16589194	3993701	+	chr2R	20582895	+	chr2R	16589194
GTCCAACTGGCCATATCCGCCAGGCCTACACTTTTAAAGATTGAACTGTATACTAGATTCGATGAAAAGTATG:1	GTCCAACTGGCCATATCCGCCA	ACTAGATTCGATGAAAAGTATG	-	chr2L	22073165	-	chr2L	22211545	138380	+	chr2L	22211545	+	chr2L	22073165
CATAAATAATTAAAGTTCGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTCCTNGGCGTAAT:1	CATAAATAATTAAAGTTCGACT	GAATGAATCTCCTNGGCGTAAT	-	chr3R	25828316	-	chr3R	25828560	244	+	chr3R	25828560	+	chr3R	25828316
GCAAGCAGTATTTGAACTTGCATAAATAAATAAATTAAATATTACATCCAAAATTCAATTGTTCCTGTACAAGTG:1	GCAAGCAGTATTTGAACTTGCA	TTCAATTGTTCCTGTACAAGTG	+	chr3R	18157618	+	chr3R	18157726	108	+	chr3R	18157618	+	chr3R	18157726
CCACTTAACTGGGCAAATCTCGGTCATCGGATCCACTGGCCATCAGCTGTCCAGAGCC:1	CCACTTAACTGGGCAAATCTCG	TGGCCATCAGCTGTCCAGAGCC	+	chr3L	11383996	+	chr3L	11384058	62	+	chr3L	11383996	+	chr3L	11384058
CAAGCACAAACACAAACACAAGCACAAACACAAGCACAAACACAAGCACAAGCACAAGCACAAACACACGCACA:1	CAAGCACAAACACAAACACAAG	CACAAGCACAAACACACGCACA	+	chrX	4805476	+	chrX	1562991	3242485	+	chrX	4805476	+	chrX	1562991
CGTGTGTTTATGGCCCTGCGTGCAGCTTGCAAAAACAAGCAAGGTCCAAAAACAACCTGAGTGTGAGA:1	CGTGTGTTTATGGCCCTGCGTG	CAAAAACAACCTGAGTGTGAGA	-	chr3R	28415826	-	chr3R	28415748	78	+	chr3R	28415748	+	chr3R	28415826
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
TATAGGGTACAGTATTTATATGATTTTTCAGAAACTTTTGAACATTGTAAGACAAAGCAACAAATCGAAGATAC:1	TATAGGGTACAGTATTTATATG	CAAAGCAACAAATCGAAGATAC	+	chr3L	7112592	+	chr3L	7112678	86	+	chr3L	7112592	+	chr3L	7112678
CTTGAACTTTAAGCTTTGCGGGGGGGATCNGCAACAGGTTGAGCATTATGATTTAGTATTATTTTCACTATTTCT:1	CTTGAACTTTAAGCTTTGCGGG	TAGTATTATTTTCACTATTTCT	-	chrX	20662414	-	chrX	20662331	83	+	chrX	20662331	+	chrX	20662414
CTAGAAAAAAACAGGATAATTATTCAAACACTTTCAAAGTCAATCATACACATCCACATGAGGGCAGACGTGAAA:1	CTAGAAAAAAACAGGATAATTA	CCACATGAGGGCAGACGTGAAA	-	chr3L	7987692	-	chr3L	7985364	2328	+	chr3L	7985364	+	chr3L	7987692
CTCTAATCCAAATCAATTTGCATCAAGAGCCTCATTTTTTGCGGATTATAATGTAAACATTTTTTATTTTTTTGA:1	CTCTAATCCAAATCAATTTGCA	TAAACATTTTTTATTTTTTTGA	+	chr3L	13708567	+	chr3L	2003164	11705403	+	chr3L	13708567	+	chr3L	2003164
AGAAGAACAAATAAGTAATTNATGGTGAAATTNAAAAAGANGNGTATCTTTTATTAAAAAAGATACAAAAAAGTT:1	AGAAGAACAAATAAGTAATTNA	TTAAAAAAGATACAAAAAAGTT	-	chr2R	8683352	-	chr2R	20799170	12115818	+	chr2R	20799170	+	chr2R	8683352
AATCTTTGATTTTTCATGCCCAACAAACCGTGGTGCATATGTGCTTTTGATCAGTGATTAATGCGAACAATGCAC:1	AATCTTTGATTTTTCATGCCCA	GTGATTAATGCGAACAATGCAC	-	chr2R	22951921	-	chr2R	22951835	86	+	chr2R	22951835	+	chr2R	22951921
TAGGTAGAGTACTCGCACGTCCACACGTCCGCACGTTGTTTTTCGTATTCAAAATTCATCAGGGTTT:1	TAGGTAGAGTACTCGCACGTCC	TATTCAAAATTCATCAGGGTTT	-	chr2L	21196303	-	chr2L	21196185	118	+	chr2L	21196185	+	chr2L	21196303
ACAATAATGTCTCATTTTTCTTTGCAGTGTACTTTAGAAAATACGAGGGCATATGTAA:1	ACAATAATGTCTCATTTTTCTT	GAAAATACGAGGGCATATGTAA	-	chr3R	12733934	-	chr3R	12733871	63	+	chr3R	12733871	+	chr3R	12733934
TAAAAGAGTTAGAACAAAAACTGGATTAATGCAAACAGAAACGTCGAAATTATGAGGATGCACGTAAGAGGATCG:1	TAAAAGAGTTAGAACAAAAACT	GAGGATGCACGTAAGAGGATCG	+	chr3L	12012318	+	chr3L	12012397	79	+	chr3L	12012318	+	chr3L	12012397
AAATACCGCAAGGCTGCAATCGCCCTATCGATAGTTATATGTATGTATGTAGAATTTGTCAGAAATNTTCTCG:1	AAATACCGCAAGGCTGCAATCG	GAATTTGTCAGAAATNTTCTCG	-	chr2R	6696698	-	chr2R	6696617	81	+	chr2R	6696617	+	chr2R	6696698
GTGTCACACTGTGCAGCAATATTTATGAAAGCCGCCTCAATCCCGCCCAGAAGATCGGCCTGCTCCGCGC:1	GTGTCACACTGTGCAGCAATAT	AGAAGATCGGCCTGCTCCGCGC	+	chr2L	6772006	+	chr2L	6772088	82	+	chr2L	6772006	+	chr2L	6772088
ATCGCACGAAAAAATATGTGAATTAAATGTGACCTCGTCTGGCGGGGCGGAGCCTGCAAACAAATTGCGACTAA:1	ATCGCACGAAAAAATATGTGAA	CCTGCAAACAAATTGCGACTAA	-	chr2R	7153257	-	chr2R	7153172	85	+	chr2R	7153172	+	chr2R	7153257
CACTTTCGACGCTCCAATATGAAGATACANCTACCTTTGTGCCTTTCGTCCTTTCTGCTTNCCTTCGTCAGTTC:1	CACTTTCGACGCTCCAATATGA	TTCTGCTTNCCTTCGTCAGTTC	+	chr3L	17515859	+	chr3L	2025681	15490178	+	chr3L	17515859	+	chr3L	2025681
TTTTACAAAAAATTCTGCATTGCAATAGTACAGTTTTTTTAGTCTCAATAAGAATATTAAAAGATTACACTATA:1	TTTTACAAAAAATTCTGCATTG	AATATTAAAAGATTACACTATA	+	chr4	1081946	+	chr4	1082072	126	+	chr4	1081946	+	chr4	1082072
ACAATTAAGGTAGGTCAACCAATTAAAATCTGCGAATCTTGGGTATGAAACGTTACACATTCCACACCCAATATT:1	ACAATTAAGGTAGGTCAACCAA	TACACATTCCACACCCAATATT	-	chr3L	20488120	-	chr3L	20487669	451	+	chr3L	20487669	+	chr3L	20488120
TTTTCGCTGTGCATAGACCCCATTCAACCCTCAATAGGCTGCTATTGGCATGATGAAGTGTCATGAAATTTAA:1	TTTTCGCTGTGCATAGACCCCA	GATGAAGTGTCATGAAATTTAA	-	chr2R	14536380	-	chr2R	14536252	128	+	chr2R	14536252	+	chr2R	14536380
GCTTAGGATTTTATTGCATCTTCTAACGCATTGATTGCTATACTCATTATTTGGCCTCATCGTACGGTCGCAGTT:1	GCTTAGGATTTTATTGCATCTT	GCCTCATCGTACGGTCGCAGTT	+	chrX	9508140	+	chrX	9509658	1518	+	chrX	9508140	+	chrX	9509658
TTTTCCCTTTTTTTTATTGTTTATTCANTCNNGGTCAGAATTTTTATGCNTNTGGATTTTCATGCTGACCTCAAG:1	TTTTCCCTTTTTTTTATTGTTT	GGATTTTCATGCTGACCTCAAG	+	chr3L	8506157	+	chr3L	12321494	3815337	+	chr3L	8506157	+	chr3L	12321494
TAAATTTATAAAGTTGCTCATAAGCATTTAGTTTAAAATGTAGTTAGTTGTAAGAAGTATGGCCAGGTTTTCCCT:1	TAAATTTATAAAGTTGCTCATA	GAAGTATGGCCAGGTTTTCCCT	+	chr2L	5339208	+	chr2L	15001151	9661943	+	chr2L	5339208	+	chr2L	15001151
CATAATTATAAAAATGTTGCTCATACGCCGCGTGTGTTCGCCAGCTGCAGCGCTGGGGGAATGAAACCTTTTTGG:1	CATAATTATAAAAATGTTGCTC	TGGGGGAATGAAACCTTTTTGG	-	chrX	11291788	-	chrX	11291706	82	+	chrX	11291706	+	chrX	11291788
ACAATATATGTGTTGAGCTAACAAGCGTTTTTAAGTTATTAAGCTATTTTTTATTTTGTGAGCGAAATTTGGTAC:1	ACAATATATGTGTTGAGCTAAC	TTTTGTGAGCGAAATTTGGTAC	-	chr2R	5773381	-	chr2R	5773278	103	+	chr2R	5773278	+	chr2R	5773381
AGGTAGCACATGCAAGCCAAAAAACATAATAATAATAAATATTCANTTCAGAAGTGGGAACNCTTGAAGTTCAAA:1	AGGTAGCACATGCAAGCCAAAA	GTGGGAACNCTTGAAGTTCAAA	+	chr2R	21246373	+	chr2R	4326831	16919542	+	chr2R	21246373	+	chr2R	4326831
AGGAATTCTCTGAACGTGCACCTAGTTTATCACGACAGCAACTTTAACGCCAGACGAAGAAGAGGACGATTGCGA:1	AGGAATTCTCTGAACGTGCACC	ACGAAGAAGAGGACGATTGCGA	+	chr2R	5472452	+	chr2R	5472874	422	+	chr2R	5472452	+	chr2R	5472874
CACTACTTCTTCTCCACTTCCATCCATGACGAGCTCCGCCTAAACAATCATCCAGAGCTGGTCCAATTCTACTTC:1	CACTACTTCTTCTCCACTTCCA	AGAGCTGGTCCAATTCTACTTC	+	chr3R	25269542	+	chr3R	25268173	1369	+	chr3R	25269542	+	chr3R	25268173
TGGCAGGATATTCTGAATACGGAACAGTCGGAGCAGCAGGAGTGGCAATAAAACAAAGAGCCCGAGAAAAGAAAA:1	TGGCAGGATATTCTGAATACGG	CAAAGAGCCCGAGAAAAGAAAA	-	chr3R	22880680	-	chr3R	22880603	77	+	chr3R	22880603	+	chr3R	22880680
TTCCGCCTTGGCAGGACATAGTGACACCAGTTCAAAAAGAAGAACGAATGACATTCGGAAATTAAAAAA:1	TTCCGCCTTGGCAGGACATAGT	ATGACATTCGGAAATTAAAAAA	+	chr3R	19230080	+	chr3R	19446416	216336	+	chr3R	19230080	+	chr3R	19446416
ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGAAAAGAGATTAAATCTGCAGATGAGTTTCGCCAGCG:1	ATTGCTCATCTCCCATGCGAAT	CTGCAGATGAGTTTCGCCAGCG	+	chrX	14321910	+	chrX	18171624	3849714	+	chrX	14321910	+	chrX	18171624
GATAAACATAACACGACTAAGGTATATTATAAGTCACATAACTATTTGATTGTGGTGTGGGCCATATTGCGTTG:1	GATAAACATAACACGACTAAGG	TGGTGTGGGCCATATTGCGTTG	-	chr3R	4375149	-	chr3R	4366767	8382	+	chr3R	4366767	+	chr3R	4375149
GAATCCTTTTAGAAGAGAACTCCCCAGTTATGAACAATATACATAGATGTTTTTTTAAGTGCAAGGCTAAAGGA:1	GAATCCTTTTAGAAGAGAACTC	TTTTAAGTGCAAGGCTAAAGGA	+	chr2L	3582897	+	chr2L	3582973	76	+	chr2L	3582897	+	chr2L	3582973
TGATTCTGAATGAAGGATAAGCGAGTTCCGGGGGAAATTCAGGTCAGCTATCTCTGATATTAACCCTAAGGTAA:1	TGATTCTGAATGAAGGATAAGC	TCTGATATTAACCCTAAGGTAA	-	chr3R	4012622	-	chr3R	4012534	88	+	chr3R	4012534	+	chr3R	4012622
CCGAGTCGCACTATGTGACGCTTTATGGCGTACGGTGCATGGCTGGCAGCGGCAAC:1	CCGAGTCGCACTATGTGACGCT	GTGCATGGCTGGCAGCGGCAAC	-	chr2R	10167200	-	chr2R	10167143	57	+	chr2R	10167143	+	chr2R	10167200
ACACACAGATACAAACGCACACAGNTGTACGCTCGCACACA:1	ACACACAGATACAAACGCACAC	CACAGNTGTACGCTCGCACACA	-	chr2R	15478215	-	chr2R	19080490	3602275	+	chr2R	19080490	+	chr2R	15478215
CTNTGCGCTTCCATTTTACGGACCGCAACCACTTNGNATGTATCTGCTGCTCACGTCCCCAATTCTACTTGCCCA:1	CTNTGCGCTTCCATTTTACGGA	CGTCCCCAATTCTACTTGCCCA	-	chr2R	20523178	-	chr2R	20523067	111	+	chr2R	20523067	+	chr2R	20523178
CACCATGGTTCCGTGAGAAATATCCACAATATGTGAAGGCTCTCGCCCAGAATCAG:1	CACCATGGTTCCGTGAGAAATA	GAAGGCTCTCGCCCAGAATCAG	+	chr2L	8966388	+	chr2L	8964002	2386	+	chr2L	8966388	+	chr2L	8964002
GGCTTAACGCTGGGCGAACTTGTCTTTACAAATCTGCCGTTTCAATGGCAACCATTTACAATATGTCTATTAAT:1	GGCTTAACGCTGGGCGAACTTG	CATTTACAATATGTCTATTAAT	+	chr3L	22617192	+	chr3L	22624643	7451	+	chr3L	22617192	+	chr3L	22624643
TTATTGTAATAGCCTTAACTAAACAATTTATCACTTATTATCACTAATACATATCTAATTTTCTTTTT:1	TTATTGTAATAGCCTTAACTAA	ATACATATCTAATTTTCTTTTT	-	chr2L	107056	-	chr2L	106983	73	+	chr2L	106983	+	chr2L	107056
AGTTAAATAATTGCTGGGCCTGGAACTAAGGTTTCAGGGCCGAGAGTACGATA:1	AGTTAAATAATTGCTGGGCCTG	TTTCAGGGCCGAGAGTACGATA	+	chr2L	21819353	+	chr2L	21819419	66	+	chr2L	21819353	+	chr2L	21819419
CATCTGGCTGAACTGTCAAAAAAAAAGGGACTGAGAAAGAGACGGAGACATACGGGTCGAAAGAGAGAGAGAGAG:1	CATCTGGCTGAACTGTCAAAAA	GGGTCGAAAGAGAGAGAGAGAG	+	chr2R	17893240	+	chr2R	19450096	1556856	+	chr2R	17893240	+	chr2R	19450096
GGCAAGGAAACTACACGTGTAGGCAAAGCAATCAATTTGAAAATTGCATAATCATTCTGTTGTTTGGGTCATGTG:1	GGCAAGGAAACTACACGTGTAG	ATTCTGTTGTTTGGGTCATGTG	+	chr2R	23193463	+	chr2R	13275751	9917712	+	chr2R	23193463	+	chr2R	13275751
ATAATGATTGATTGATTGATTGACTGATTGTTTCGCTGACTCTGTAATTACGCGTATAGGATGATGATTAACGC:1	ATAATGATTGATTGATTGATTG	CGTATAGGATGATGATTAACGC	-	chrX	20914576	-	chrX	4071668	16842908	+	chrX	4071668	+	chrX	20914576
AAGCTCTGACTTTCACCCGGACTACGGCATAAATCATGGCTGGCATGCAGCTAATCTTCGTCCTGGCCAAGTGGG:1	AAGCTCTGACTTTCACCCGGAC	ATCTTCGTCCTGGCCAAGTGGG	+	chr3L	5476186	+	chr3L	5476267	81	+	chr3L	5476186	+	chr3L	5476267
ATTATTATACGAACCGACATATAATGTAAGCCATATACATTTAATGCACAAACATATACATGTATTAATGTATTA:1	ATTATTATACGAACCGACATAT	ATATACATGTATTAATGTATTA	+	chr3L	7793710	+	chr3L	7800762	7052	+	chr3L	7793710	+	chr3L	7800762
TGAATCTAACAAGCTGCATGTAAAAGATTTTAAAGTGCAATTAAGGGATTGCATTGATGCAAAGAAGCNCACTG:1	TGAATCTAACAAGCTGCATGTA	ATTGATGCAAAGAAGCNCACTG	-	chr3R	31805219	-	chr3R	31805144	75	+	chr3R	31805144	+	chr3R	31805219
TTAAATTCTCCGATAAAANGGTTCGATATCCTTTATTTTATTCNCNAGANCAGTTTTTACCTCTCTGCGCTGCGT:1	TTAAATTCTCCGATAAAANGGT	TTTTTACCTCTCTGCGCTGCGT	+	chr2R	13905600	+	chr2R	13907582	1982	+	chr2R	13905600	+	chr2R	13907582
CCACATCTNTAAACTAAGGGCCGAAGTTCTTTACCNAAAACAAAAAAGCTTCCTAGAAAGATCTTTCCTATAAA:1	CCACATCTNTAAACTAAGGGCC	CTAGAAAGATCTTTCCTATAAA	-	chr2R	3288555	-	chr2R	24336917	21048362	+	chr2R	24336917	+	chr2R	3288555
AGAGACATCGCGACGACCACACAACCAAACGAATTGGAGGATTGGCAATCGGACAGCCCGAAGCACTAGTAGGGA:1	AGAGACATCGCGACGACCACAC	CAGCCCGAAGCACTAGTAGGGA	-	chrX	7511308	-	chrX	4085930	3425378	+	chrX	4085930	+	chrX	7511308
CAGCCTTGGCCTGGTTCAATTCCCCAGCGAAAATATATCAATTGCAAACTTCAGTTCGGCAACTTTCTCATCGAG:1	CAGCCTTGGCCTGGTTCAATTC	GTTCGGCAACTTTCTCATCGAG	+	chr3R	7393276	+	chr3R	7393353	77	+	chr3R	7393276	+	chr3R	7393353
GGCTGAAACGGCGACATTCTTAAGAAGGAGCTGCGAGGCTGAG:1	GGCTGAAACGGCGACATTCTTA	AAGAAGGAGCTGCGAGGCTGAG	+	chr3R	14172491	+	chr3R	14172647	156	+	chr3R	14172491	+	chr3R	14172647
GTACACTGAGCAAACAGTAATGCTGCTGCATATTATTCTATAATAGCCAAGAATCTGTATTTAAGCATGATATCT:1	GTACACTGAGCAAACAGTAATG	TCTGTATTTAAGCATGATATCT	-	chr3L	10386468	-	chr3L	10386391	77	+	chr3L	10386391	+	chr3L	10386468
AAGTACAATATATATAATAACTATCAAATCAATTATCGTACGTATTCACTATTTACTCTTTCCATGATT:1	AAGTACAATATATATAATAACT	ACTATTTACTCTTTCCATGATT	+	chrX	667660	+	chrX	667738	78	+	chrX	667660	+	chrX	667738
CAATTAGCAGGGTATTCACAAAAAGGCACTTGGCTTACACCCCGTTTTTGGC:1	CAATTAGCAGGGTATTCACAAA	TGGCTTACACCCCGTTTTTGGC	-	chr2R	21546869	-	chr2R	21546811	58	+	chr2R	21546811	+	chr2R	21546869
AGGGAGGGGGCAGTCGAACTTGTTTCGCCTCAACAAGTATTTCCCTATTTACTGTTAAGAACAGCTGGCGGCTAT:1	AGGGAGGGGGCAGTCGAACTTG	GTTAAGAACAGCTGGCGGCTAT	+	chr3R	21239950	+	chr3R	21240026	76	+	chr3R	21239950	+	chr3R	21240026
CACTACAAAGTCTCGAGTGCATGGCGAACAATTAGCAAAGGCGAGGCAACAAGTGCAAGNAGGCA:1	CACTACAAAGTCTCGAGTGCAT	AGGCAACAAGTGCAAGNAGGCA	+	chr3L	3281458	+	chr3L	3281944	486	+	chr3L	3281458	+	chr3L	3281944
TATTAAAAGGACCACCAGAGGCCTGCTGCCAGTGATATCGACGATCGTTGCATGGTTA:1	TATTAAAAGGACCACCAGAGGC	ATCGACGATCGTTGCATGGTTA	+	chr3R	15891686	+	chr3R	15892061	375	+	chr3R	15891686	+	chr3R	15892061
CGAAAACAGTTGGGAACAGCAGGTGCAGGTAGAGCGGAGATGTTGGGAGAAAAATTCAGCTCTCTAGCTCGATTT:1	CGAAAACAGTTGGGAACAGCAG	ATTCAGCTCTCTAGCTCGATTT	-	chr2R	8657832	-	chr2R	8657755	77	+	chr2R	8657755	+	chr2R	8657832
ATTCCTGATGAAACGAAAAATCGTTTCTTTTGAAATAAGCCCGTTCTGAGATTTTCCCCCATTGTTAATTCATGT:1	ATTCCTGATGAAACGAAAAATC	TTCCCCCATTGTTAATTCATGT	+	chr3R	26199742	+	chr3R	29007448	2807706	+	chr3R	26199742	+	chr3R	29007448
GGGTAAGTTCTCAAGTTTGGAAAAAAAGGGATGGTTTATAAATCAGAGGGTCCTTTTTCTCAGC:1	GGGTAAGTTCTCAAGTTTGGAA	TCAGAGGGTCCTTTTTCTCAGC	+	chr2L	10153234	+	chr2L	10153302	68	+	chr2L	10153234	+	chr2L	10153302
GGTGGACAGAGGCGGAGGTCAGTGGGAAGTGATATAGAATGGTCA:1	GGTGGACAGAGGCGGAGGTCAG	GGGAAGTGATATAGAATGGTCA	+	chrX	11421208	+	chrX	17798652	6377444	+	chrX	11421208	+	chrX	17798652
AAAAATAAAACAAAAATTTTTCAAGAGAGTATAACAATTCCAAAATACTATGAAATTTACGGATTTTTCAACAGT:1	AAAAATAAAACAAAAATTTTTC	AATTTACGGATTTTTCAACAGT	+	chr2L	14642591	+	chr2L	14651754	9163	+	chr2L	14642591	+	chr2L	14651754
CTATGCGGGTCAAAGGCCATAAAAGTCGATATACATTGGTNCATATACATGTATGTATG:1	CTATGCGGGTCAAAGGCCATAA	GGTNCATATACATGTATGTATG	+	chrX	295875	+	chrX	303479	7604	+	chrX	295875	+	chrX	303479
CAGATATGCGGAGACAAGACAAATTAAAATATGTCTTGCAGGCACAAGATATAACTGAATAAAGAACAAAAACAG:1	CAGATATGCGGAGACAAGACAA	ACTGAATAAAGAACAAAAACAG	-	chr3R	27351392	-	chr3R	27342811	8581	+	chr3R	27342811	+	chr3R	27351392
CTGGCAGTCGCGTCGGAAGGACATCACCTTGCTCGAGTTACGCTGCAATGGTACAAACATATGCTCAACTGATTA:1	CTGGCAGTCGCGTCGGAAGGAC	CAAACATATGCTCAACTGATTA	-	chr2R	19334755	-	chr2R	19334679	76	+	chr2R	19334679	+	chr2R	19334755
GTGCCTTGTGGTGTCTTGTGGTTCAACAGTTAATAAAGGTTGTTTCATATTCATTCTATTGCCTGGCTAAAGAA:1	GTGCCTTGTGGTGTCTTGTGGT	ATTCTATTGCCTGGCTAAAGAA	-	chr2L	1699210	-	chr2L	1699121	89	+	chr2L	1699121	+	chr2L	1699210
TTTATATTATATTCATGATAATCATAATGCATACCTGGCAACCCTAAAAACATAAAAAAGGCATCACTTTAAGCG:1	TTTATATTATATTCATGATAAT	AAAAAAGGCATCACTTTAAGCG	-	chr2R	10808283	-	chr2R	11239074	430791	+	chr2R	11239074	+	chr2R	10808283
CGCTATGCTGCAGCATAGCATAGCAAAGACGCGAGATTCCAAGAATG:1	CGCTATGCTGCAGCATAGCATA	AAGACGCGAGATTCCAAGAATG	+	chr2L	16280284	+	chr2L	16281427	1143	+	chr2L	16280284	+	chr2L	16281427
CAATGGCCGAAACGCTGTNCTATCTCATCCTACGCAATCCATCCAGTCAGAT:1	CAATGGCCGAAACGCTGTNCTA	TACGCAATCCATCCAGTCAGAT	-	chrX	9576114	-	chrX	9575813	301	+	chrX	9575813	+	chrX	9576114
CAAAATAAAAAAAATAAATAAAAAAAACAGCAAATACGGAATTCCTGATCCGATGGA:1	CAAAATAAAAAAAATAAATAAA	ACGGAATTCCTGATCCGATGGA	+	chr3L	11255463	+	chr3L	12384602	1129139	+	chr3L	11255463	+	chr3L	12384602
CATCGTTCCGAAACTCATATGAAATGTTACCTAAAAAATAAATCAANTTTGAACAGATTGTTTTAGCGGAGAA:1	CATCGTTCCGAAACTCATATGA	AACAGATTGTTTTAGCGGAGAA	+	chr3R	10151127	+	chr3R	23308764	13157637	+	chr3R	10151127	+	chr3R	23308764
TATATTATGTTGTTCTATTATTATTTAACAATATGATTTAGTTGNTATAATATATATCTACACTT:1	TATATTATGTTGTTCTATTATT	GNTATAATATATATCTACACTT	+	chr3R	20205595	+	chr3R	20205707	112	+	chr3R	20205595	+	chr3R	20205707
AGAACGTGGACTTTTATAAAATGAAGTGGCAAGCAATCCAATACCAAACTAAGCTCATGCCCCTTCCCTTGAACC:1	AGAACGTGGACTTTTATAAAAT	CTCATGCCCCTTCCCTTGAACC	+	chr3L	1710707	+	chr3L	6057958	4347251	+	chr3L	1710707	+	chr3L	6057958
CGTCTATAAACATGGTCCTATCAAATTAGATATTACAACTTTTGCTTATAAGTTAGAATTATAACTCCATATTTC:1	CGTCTATAAACATGGTCCTATC	TAGAATTATAACTCCATATTTC	-	chr3R	18269142	-	chr3R	18269007	135	+	chr3R	18269007	+	chr3R	18269142
CACGCCAGTGCATTTTCTAATTAGTGGCCAGTGGCCGATCTACCTATCACAACGAAAAGCAACGGAAACGAATAA:1	CACGCCAGTGCATTTTCTAATT	GAAAAGCAACGGAAACGAATAA	+	chr2L	23008326	+	chr2L	20876072	2132254	+	chr2L	23008326	+	chr2L	20876072
ACTAAGTCTTAACTAATCCAATCTTCACTCTCATGAAGCAACCAACATTTCATTCTATTTGCCACACACTTTCC:1	ACTAAGTCTTAACTAATCCAAT	TTCTATTTGCCACACACTTTCC	-	chr2L	19227176	-	chr2L	19227086	90	+	chr2L	19227086	+	chr2L	19227176
TTTATTGATCGATTCCATGGCATTTTGTTTGGAAAAGTTGCAAACTTCGCTTGCAGTACTGCTGCATAGACGGG:1	TTTATTGATCGATTCCATGGCA	GCAGTACTGCTGCATAGACGGG	+	chrX	19755537	+	chrX	19755627	90	+	chrX	19755537	+	chrX	19755627
GCGAGTTTGATTTTCGATATCGCATGGGGGGTTTCCCCATTTACAACTCTCGAGGGGAGATTTCTTAAGGTCCTC:1	GCGAGTTTGATTTTCGATATCG	GGGGAGATTTCTTAAGGTCCTC	-	chr3L	12304178	-	chr3L	12304102	76	+	chr3L	12304102	+	chr3L	12304178
GCTTAGTGATGCATCTTGACTGAATATGACTGGCAGAGTTGGATACTTTGGATACTTTAGTGCTCACTTTATT:1	GCTTAGTGATGCATCTTGACTG	ATACTTTAGTGCTCACTTTATT	+	chrX	10306058	+	chrX	10306146	88	+	chrX	10306058	+	chrX	10306146
AAAAACAACCAGCGCTGAAATGCCCCACCAAATCCACNCGTTTGANCCCACGCACCTGTG:1	AAAAACAACCAGCGCTGAAATG	CGTTTGANCCCACGCACCTGTG	+	chr3R	29968248	+	chr3R	9446612	20521636	+	chr3R	29968248	+	chr3R	9446612
TGTCCCACGCCTACAGGGACTGCCTACCTNAAGGTCTAATATCTGTCCATTAAGGAGTGCTACAACCAGTGCATA:1	TGTCCCACGCCTACAGGGACTG	GGAGTGCTACAACCAGTGCATA	+	chr2R	3384100	+	chr2R	3384176	76	+	chr2R	3384100	+	chr2R	3384176
CAATCAAACAAAGAAACGTTATAGCTATTACATATATATTATTCTTCGGAGAAACCCGC:1	CAATCAAACAAAGAAACGTTAT	ATTATTCTTCGGAGAAACCCGC	+	chr2R	7815691	+	chr2R	7822144	6453	+	chr2R	7815691	+	chr2R	7822144
CCTTCCCCAACCCCCTTTCCCTGTCTTTTCCGTTTGCCGCAATGCCTGCCACGCCCACCCCCTTTTT:1	CCTTCCCCAACCCCCTTTCCCT	CTGCCACGCCCACCCCCTTTTT	-	chr3R	30551372	-	chr3R	18004428	12546944	+	chr3R	18004428	+	chr3R	30551372
CGAATGGAACAATGCCAGTTCCGTATTGATGTCGTACTGTAAGATTTCAGTTCATTTAATTGCAAAAGAAAAAAG:1	CGAATGGAACAATGCCAGTTCC	ATTTAATTGCAAAAGAAAAAAG	+	chrX	10361740	+	chrX	10361837	97	+	chrX	10361740	+	chrX	10361837
AATACCGATTGGGAACTGTCCGCACCACTCCCCTAAAACTAATTATAATATTTTCGCCTTTTGCGATCGCGACCT:1	AATACCGATTGGGAACTGTCCG	TCGCCTTTTGCGATCGCGACCT	+	chr3L	21407006	+	chr3L	21407085	79	+	chr3L	21407006	+	chr3L	21407085
TATGAAAACAAAAACTTACATGTAGCCGCCACGGCGCACAAATTACNCCATTTATAATTGNACTTGAGCCTCGC:1	TATGAAAACAAAAACTTACATG	TATAATTGNACTTGAGCCTCGC	+	chr3L	11255643	+	chr3L	9751288	1504355	+	chr3L	11255643	+	chr3L	9751288
CTAAGATTATTTGGCGTGCNGTTCGCAATGCACAGCGGGCACTTATCCGGTCGACTGAAGCCAACAGCCCAGATT:1	CTAAGATTATTTGGCGTGCNGT	ACTGAAGCCAACAGCCCAGATT	+	chr3R	7589808	+	chr3R	7589929	121	+	chr3R	7589808	+	chr3R	7589929
ATGAACGATCTCAACAACGCCGTCGAGAAGCGATTGCACCTGGACTCCAGCACCTCCAGAGATCCCAGCCA:1	ATGAACGATCTCAACAACGCCG	GCACCTCCAGAGATCCCAGCCA	-	chr3R	30627688	-	chr3R	30627612	76	+	chr3R	30627612	+	chr3R	30627688
ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGGAGTTGCTTT:1	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	TGTCTGTGTGTGGAGTTGCTTT	-	chrX	7978952	-	chrX	11086061	3107109	+	chrX	11086061	+	chrX	7978952
CAATGGGGCGCATTCAGATGGAGTTTTTGCTCCAAAAGCATTGAACTGTGCAAACTTCCACAGAATCCAGACATG:1	CAATGGGGCGCATTCAGATGGA	ACTTCCACAGAATCCAGACATG	+	chr3R	4981747	+	chr3R	4981824	77	+	chr3R	4981747	+	chr3R	4981824
TGCAAAACCGTCATTGCGCCACCAAGCTCTGATATGAACTGATTGCATATTGCAGTGATTAAATTTACAGAGAAA:1	TGCAAAACCGTCATTGCGCCAC	AGTGATTAAATTTACAGAGAAA	-	chr2R	15700373	-	chr2R	15700258	115	+	chr2R	15700258	+	chr2R	15700373
CAAAGCGAAGAACAGGACTAAAAAATGNGANNGAATGATCATACATCCTNTNAGCATATAGTTCAATCTGATAAA:1	CAAAGCGAAGAACAGGACTAAA	GCATATAGTTCAATCTGATAAA	+	chrX	19549665	+	chrX	20486725	937060	+	chrX	19549665	+	chrX	20486725
ATAATGCACTTGTCCGAATGTGAATGCTTCTTTCTGTGAGCCTACAATTTGGCGCGCTTAAGGTAATCCTTGTAG:1	ATAATGCACTTGTCCGAATGTG	GCGCTTAAGGTAATCCTTGTAG	+	chr2L	6426871	+	chr2L	6445131	18260	+	chr2L	6426871	+	chr2L	6445131
GAGCGCAGCATTTGGATAACCACCACATGCTGAATCAAATATGAGCACACACACACACATACACATACACAGATG:1	GAGCGCAGCATTTGGATAACCA	CACACATACACATACACAGATG	+	chr3L	4842773	+	chr3L	24763634	19920861	+	chr3L	4842773	+	chr3L	24763634
CCACCCAATTCTCTGTGTTTTTTCCGTGTGCGCCATTTTGTCAGAGCATAAATTACA:1	CCACCCAATTCTCTGTGTTTTT	TTTTGTCAGAGCATAAATTACA	+	chr3L	3475090	+	chr3L	3475516	426	+	chr3L	3475090	+	chr3L	3475516
CGACAGAATGTTGGACATTCGGACGCAGGAAAGAACGGAGGTATTGTGTGCTTGAACAAATGAGGGG:1	CGACAGAATGTTGGACATTCGG	GTGTGCTTGAACAAATGAGGGG	-	chr2R	20796407	-	chr2R	22926159	2129752	+	chr2R	22926159	+	chr2R	20796407
GAGCTGTGTTGAGGTCCTGATCAGCAATTAAAGTGTTATTAATTTGTATAGCTTTCGATGTTTAAATAAATATAA:1	GAGCTGTGTTGAGGTCCTGATC	TTCGATGTTTAAATAAATATAA	-	chr2R	13571639	-	chr2R	13571538	101	+	chr2R	13571538	+	chr2R	13571639
CTGAAAGTGGAACTGAAACCGATGCCTTAAGAGTTGGTTGGGGGGTT:1	CTGAAAGTGGAACTGAAACCGA	CTTAAGAGTTGGTTGGGGGGTT	+	chr2L	14143928	+	chr2L	8209722	5934206	+	chr2L	14143928	+	chr2L	8209722
TATAGCTTGGCCATCTCAACTTCACTGCCAATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCGCATAATCTCGGTTCCNGGGCC:1	TATAGCTTGGCCATCTCAACTT	GCATAATCTCGGTTCCNGGGCC	-	chr2L	8588654	-	chr2L	8588564	90	+	chr2L	8588564	+	chr2L	8588654
GCAAAAAAAACCTGGTAAACGATCGCACCTTCAACATACGGCCATCATTTTTAGGCCATCATCAAAAGGCTTCAA:1	GCAAAAAAAACCTGGTAAACGA	GGCCATCATCAAAAGGCTTCAA	+	chr2R	5947949	+	chr2R	5948100	151	+	chr2R	5947949	+	chr2R	5948100
ACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	ACACAACACAACACACCACAAC	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907535	6924267	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907535
CATAAATAAAGGGAAATTAAATCCATTTAGAGAAAAACCCTTACCTTAGAAAAGAAATTATTAAGTGATGGAAAT:1	CATAAATAAAGGGAAATTAAAT	GAAATTATTAAGTGATGGAAAT	-	chr2L	9280115	-	chr2L	9280021	94	+	chr2L	9280021	+	chr2L	9280115
GCTATCGAAGGCACGCCATGAAGAATTCCAATAGATGTTAAGTAACACGAAACGCAGANACTC:1	GCTATCGAAGGCACGCCATGAA	GTAACACGAAACGCAGANACTC	-	chr3L	875755	-	chr3L	875680	75	+	chr3L	875680	+	chr3L	875755
ACAGCACACAATTGCACGGGCCCAAGGGCACAGGACGAACAAGGTTCAGGTGTTCGGCTGAGCAGGATTTTCCCA:1	ACAGCACACAATTGCACGGGCC	TCGGCTGAGCAGGATTTTCCCA	-	chr2L	10864467	-	chr2L	10862853	1614	+	chr2L	10862853	+	chr2L	10864467
ATATGTCAAATAGTTTCCATAAAAACAGGATTCTTCACTTAATAAATATATATAAATAAACACAAAAAAAAAA:1	ATATGTCAAATAGTTTCCATAA	ATAAATAAACACAAAAAAAAAA	+	chr2L	21860342	+	chr2L	21860489	147	+	chr2L	21860342	+	chr2L	21860489
AAGTAGTGAATCTTGTGGATCTGAGATAGTATTGATTAGTCGCAATTCAATATACGGGTTCAATTCTTGCCACTC:1	AAGTAGTGAATCTTGTGGATCT	ACGGGTTCAATTCTTGCCACTC	+	chr3R	15594662	+	chr3R	15594745	83	+	chr3R	15594662	+	chr3R	15594745
GCCGCACTATTATAATTTTNGGCACTAATATNATAATCATCATCATCATCGCCGTCG:1	GCCGCACTATTATAATTTTNGG	ATCATCATCATCATCGCCGTCG	+	chr3R	24205811	+	chr3R	8141576	16064235	+	chr3R	24205811	+	chr3R	8141576
AAAAAGGTTCGCCCACGACCTCCACAGCTCAATCAAGAGGCATTGACTAAAGGCTTAATTGTGGCTCAATGT:1	AAAAAGGTTCGCCCACGACCTC	AGGCTTAATTGTGGCTCAATGT	-	chr2L	12963904	-	chr2L	12963805	99	+	chr2L	12963805	+	chr2L	12963904
GTGACAAGCTGGGCGACAGAAAGCTGCAGGNNNANAGGCGCGGATAATACCACTTGCTGTATATACCTGGTA:1	GTGACAAGCTGGGCGACAGAAA	CACTTGCTGTATATACCTGGTA	+	chrX	20641194	+	chrX	20641302	108	+	chrX	20641194	+	chrX	20641302
GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAATGAAAATGAAAACAAATAAGAATCCAGTCCAATGGGGATGGGGA:1	GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA	TCCAGTCCAATGGGGATGGGGA	-	chr3L	15253229	-	chr3L	16552476	1299247	+	chr3L	16552476	+	chr3L	15253229
GTTTTGCAATTTATCAACTTCTGCACTTCATCAAAACATATACACTAACTGTCTGGACTCGGCAACCTCAACT:1	GTTTTGCAATTTATCAACTTCT	TCTGGACTCGGCAACCTCAACT	-	chr2L	13862259	-	chr2L	13853111	9148	+	chr2L	13853111	+	chr2L	13862259
AAAAAGAACACCGTACAATTTTTTGAAGCTCTATCTATCTAGTCTGCAAGTATGTATTTAAGTTAACTAGATTAC:1	AAAAAGAACACCGTACAATTTT	GTATTTAAGTTAACTAGATTAC	+	chr3L	18301353	+	chr3L	18301442	89	+	chr3L	18301353	+	chr3L	18301442
TATACATAAATTCCCTTTTTTGCACTTGCTGCGCATAGATCGTCCAAATAATCCATTGCGAAGGCAAATCGGTGA:1	TATACATAAATTCCCTTTTTTG	CATTGCGAAGGCAAATCGGTGA	-	chrX	5884077	-	chrX	5883836	241	+	chrX	5883836	+	chrX	5884077
ATCCATATACCCAGCACCNTGTGAGTGCCTTCCCTATTTACNTACNTATGTACGTATGTATGTACATGCATATGT:1	ATCCATATACCCAGCACCNTGT	GTATGTATGTACATGCATATGT	+	chr3R	30014509	+	chr3R	6435457	23579052	+	chr3R	30014509	+	chr3R	6435457
ACGTTCCCCGCCCTGGAGNGGTTGTTCATCCTTGACACAGACGNGTGCANTAATGTTGCACGCGCGGTGCTGA:1	ACGTTCCCCGCCCTGGAGNGGT	AATGTTGCACGCGCGGTGCTGA	-	chr3L	24176140	-	chr3L	24168814	7326	+	chr3L	24168814	+	chr3L	24176140
GGCAAACAAAACCGGGGAAAACTTTCACTTAGGCGAATATTGCGAAACTATTGGGCTGCAAATGAAATTTCAGCG:1	GGCAAACAAAACCGGGGAAAAC	GGCTGCAAATGAAATTTCAGCG	-	chr3R	30420317	-	chr3R	11116180	19304137	+	chr3R	11116180	+	chr3R	30420317
GTAATCAGGAGAATAATTGAAGTNAGGCAAACCCAGGGACAAAACCATGATGCTCTGCACATTGATATAATT:1	GTAATCAGGAGAATAATTGAAG	TGCTCTGCACATTGATATAATT	-	chr2R	6691201	-	chr2R	6691125	76	+	chr2R	6691125	+	chr2R	6691201
TATCTACGTATCACTTATTTTTCTTTGTGTA:1	TATCTACGTATCACTTATTTTT	ATCACTTATTTTTCTTTGTGTA	+	chr3L	3398106	+	chr3L	13377528	9979422	+	chr3L	3398106	+	chr3L	13377528
AGAATAAAGTGAAAATAATAAAAATTAAATGCAACATGCTGGGCCACTTTCACTGCCGCCGCTGCTGCTGACACT:1	AGAATAAAGTGAAAATAATAAA	TGCCGCCGCTGCTGCTGACACT	+	chr3L	9596682	+	chr3L	9596759	77	+	chr3L	9596682	+	chr3L	9596759
ATTTTGACCGCCCAATGCGAGCATACATGTGATGTCCGAGTTCGAACAACGGAAACAGATTTATTCATTCATCGA:1	ATTTTGACCGCCCAATGCGAGC	AACAGATTTATTCATTCATCGA	-	chr2R	9052810	-	chr2R	9052729	81	+	chr2R	9052729	+	chr2R	9052810
AGGCTTTTAAAGAAATACACGAAAACATATTACTATGGATTCGAATGGAATATAACCATGGCTATATGCGATAGT:1	AGGCTTTTAAAGAAATACACGA	AACCATGGCTATATGCGATAGT	+	chr3R	28377776	+	chr3R	28378182	406	+	chr3R	28377776	+	chr3R	28378182
AAAACAANAATTTTTCAAGAGAGTATAACAATTCCAAAANACTATGAAATTTACGGANTTTTCAACAGTTCTTTG:1	AAAACAANAATTTTTCAAGAGA	CGGANTTTTCAACAGTTCTTTG	+	chr2L	14642597	+	chr2L	14651760	9163	+	chr2L	14642597	+	chr2L	14651760
GGTGAACACTGGAATCTTTTTGGTTGAAAATAGGGGTACCAAAAATGCTTCCGTCGTGAGCATAGGATTTAAAGA:1	GGTGAACACTGGAATCTTTTTG	TCGTGAGCATAGGATTTAAAGA	+	chr3R	10531885	+	chr3R	10531966	81	+	chr3R	10531885	+	chr3R	10531966
GCAATTACACAGGCGTCTAGAATTATGTGCCACGGCTGACAACTGACTGTGCAATCAATTAGCGAATCGCATGTG:1	GCAATTACACAGGCGTCTAGAA	ATCAATTAGCGAATCGCATGTG	-	chr3L	16818032	-	chr3L	16817892	140	+	chr3L	16817892	+	chr3L	16818032
AAGGCATGCCGTGTCAACTTTTTCGGCAATCAATATTATCGCCAGCACAAAATTCCAATCTATGCTCGAGGAAA:1	AAGGCATGCCGTGTCAACTTTT	TTCCAATCTATGCTCGAGGAAA	-	chr3R	8633240	-	chr3R	8633159	81	+	chr3R	8633159	+	chr3R	8633240
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGATGTGGATGATTTTGGTTGANGTTGTCC:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	ATGATTTTGGTTGANGTTGTCC	-	chr3R	21907534	-	chr3R	10653161	11254373	+	chr3R	10653161	+	chr3R	21907534
TTGTTACTAGGTGCGATAGATTCACATACGATGATGGTTTAGTAGATCCCGTATAATATATAATTAAATAT:1	TTGTTACTAGGTGCGATAGATT	CGTATAATATATAATTAAATAT	+	chr2R	13281911	+	chr2R	12088883	1193028	+	chr2R	13281911	+	chr2R	12088883
CTGTTTTTTGTTTATTTCTAAAATATTTTTAGTCTCCCTTTTTTCGTCAAGCGGTAGTTGAAATGCAAAACTATA:1	CTGTTTTTTGTTTATTTCTAAA	GTAGTTGAAATGCAAAACTATA	+	chr3L	10621864	+	chr3L	10621951	87	+	chr3L	10621864	+	chr3L	10621951
TAAGCCATCAACGCTTGTCAGCAGCCGTCTCTTTCGCGAGGCCTTCGCANAACTGCC:1	TAAGCCATCAACGCTTGTCAGC	GCGAGGCCTTCGCANAACTGCC	-	chr2R	8658316	-	chr2R	8658258	58	+	chr2R	8658258	+	chr2R	8658316
TGGGATTTATAACCGCATNTAGCGCACATCAATCAAGCAGCAGCAGCAACAACAACTC:1	TGGGATTTATAACCGCATNTAG	GCAGCAGCAGCAACAACAACTC	-	chr2L	5512144	-	chr2L	6724039	1211895	+	chr2L	6724039	+	chr2L	5512144
CAATTGCGTTTCCGACGCAGCGAAACAAAGCGCCGAAAACGTGGTCATCCTTAATTCAATTAACTCTTTCATTAG:1	CAATTGCGTTTCCGACGCAGCG	ATTCAATTAACTCTTTCATTAG	+	chr3R	21416712	+	chr3R	13596116	7820596	+	chr3R	21416712	+	chr3R	13596116
GTGGGGCAGCTTTTGAATTCAGTCTGGACCTTCACCGATGTGTGCCGCTGAACTTCTGCGACCGCCTAGTGACG:1	GTGGGGCAGCTTTTGAATTCAG	CTTCTGCGACCGCCTAGTGACG	-	chr3R	9722755	-	chr3R	7294493	2428262	+	chr3R	7294493	+	chr3R	9722755
CAATGGCCAAGGATGGCCAGTCGCAACGAGCTGACACATATATAGCTATGTGTGTATAAACCTCGGNTACC:1	CAATGGCCAAGGATGGCCAGTC	GTGTGTATAAACCTCGGNTACC	+	chr3L	20283399	+	chr3L	20283475	76	+	chr3L	20283399	+	chr3L	20283475
GCTATGTATTCAATTTAAACACATGAAATAAGTGTAATGAAAAAGTTTTTGAGAACTCACCCAACTTTTCTGTAT:1	GCTATGTATTCAATTTAAACAC	AACTCACCCAACTTTTCTGTAT	+	chr3R	4896298	+	chr3R	4896391	93	+	chr3R	4896298	+	chr3R	4896391
CATTTCATTAAGCTTAAATATGCCTTCTGGTTACATAGTGAAAGGGATTCCTGATTGGAAATCACCTATATAGAG:1	CATTTCATTAAGCTTAAATATG	ATTGGAAATCACCTATATAGAG	+	chr3R	24974915	+	chr3R	24974994	79	+	chr3R	24974915	+	chr3R	24974994
TTTTTTTATTAAAACATGTCCCACTGGCAAATGAAGTGAGAAGGATGCAGAATGCCACGGCCGGGCACAATAAAC:1	TTTTTTTATTAAAACATGTCCC	GCCACGGCCGGGCACAATAAAC	+	chr2L	1883436	+	chr2L	1884016	580	+	chr2L	1883436	+	chr2L	1884016
CGCAACCAAAGCTGAAATTTGATTCGAATTGCTTGTTAGCTGAGTCTCCNCCATTCATTTGTAACCACG:1	CGCAACCAAAGCTGAAATTTGA	CCNCCATTCATTTGTAACCACG	-	chr3R	27036524	-	chr3R	27036417	107	+	chr3R	27036417	+	chr3R	27036524
AAATACTTGCTAAATGAAAAAGTGAAAAACAAGAACAAACAGAAAGTACCCAACGATCGGTTTCAGTTGTTCATA:1	AAATACTTGCTAAATGAAAAAG	CGATCGGTTTCAGTTGTTCATA	+	chr3L	9344209	+	chr3L	9344287	78	+	chr3L	9344209	+	chr3L	9344287
GGCAATTATTCATTTAGCTGCCTGCCGAACTCATTGCTGATACCACTAACTTACTTGCATACAAGACGCCAAGA:1	GGCAATTATTCATTTAGCTGCC	ACTTGCATACAAGACGCCAAGA	-	chr3R	4681923	-	chr3R	4681844	79	+	chr3R	4681844	+	chr3R	4681923
TTGCTTCGTTAAAAGTGATTCACCNATTCAAAAGTGGTTTATNTANATTAANCAANATTAGTTATTATAAGGCG:1	TTGCTTCGTTAAAAGTGATTCA	CAANATTAGTTATTATAAGGCG	-	chr2R	14911834	-	chr2R	14911712	122	+	chr2R	14911712	+	chr2R	14911834
AATTTCATTTATTTACATNGATGGGTTCAGATTCCAAACAAACNCTCCGNCCCATGCTCAAGCCTATGCCATCT:1	AATTTCATTTATTTACATNGAT	CATGCTCAAGCCTATGCCATCT	-	chr3R	9606188	-	chr3R	5076517	4529671	+	chr3R	5076517	+	chr3R	9606188
GATCGTATNTATCAATACATCTCCCACATTTTTCGGGATTTAGATA:1	GATCGTATNTATCAATACATCT	CACATTTTTCGGGATTTAGATA	+	chr3R	445633	+	chr3R	6489449	6043816	+	chr3R	445633	+	chr3R	6489449
CAAAGTGAAAGGTGAAAGATAACAAGAGCNTGGACAAAATGTTTGGATTTGCTGTGTGGCNCCGTTTGTGCGGCC:1	CAAAGTGAAAGGTGAAAGATAA	GTGTGGCNCCGTTTGTGCGGCC	-	chrX	13586585	-	chrX	14654222	1067637	+	chrX	14654222	+	chrX	13586585
CCCGGGTGTGTGCTGTATGTTTAGCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCTCATCCTATTTCTCAATGGGGTCTGCA:1	CCCGGGTGTGTGCTGTATGTTT	CTATTTCTCAATGGGGTCTGCA	+	chr2R	10585580	+	chr2R	10594164	8584	+	chr2R	10585580	+	chr2R	10594164
AAACAGCTTAAAGGTCACTGGGCGTGGAAAATTCAACATGCACACCCAATACATTTGGAATAACTCTGAAAA:1	AAACAGCTTAAAGGTCACTGGG	ACATTTGGAATAACTCTGAAAA	+	chr3R	28286946	+	chr3R	28284409	2537	+	chr3R	28286946	+	chr3R	28284409
GGCGTTCACCCAAATTCCTTGCCTTGCTCCACACTCACGCNCAGCCCACACACATATACACATAAGCGNACTC:1	GGCGTTCACCCAAATTCCTTGC	ACATATACACATAAGCGNACTC	-	chr3R	24001906	-	chr3R	29635979	5634073	+	chr3R	29635979	+	chr3R	24001906
CATTGGGCAAGGAGATTCCCCCAGGTCCTTAGCTCCTGCTCGCTNCCTAATCGTATTGAGCTTATACA:1	CATTGGGCAAGGAGATTCCCCC	CTAATCGTATTGAGCTTATACA	+	chr2R	16962266	+	chr2R	16962336	70	+	chr2R	16962266	+	chr2R	16962336
CGGTGGTCTTCATTTTGATTAAACGCANACNNTGCCACCCTGAAAAAAANTNTTTGGCCATTTGACTGCTCG:1	CGGTGGTCTTCATTTTGATTAA	TNTTTGGCCATTTGACTGCTCG	+	chrX	13061356	+	chrX	13061464	108	+	chrX	13061356	+	chrX	13061464
CTAGAGCACAGCAACAACAGCTGCACACTCTATTTATCATATTGCACGCTGCGTGGGAACCACAAAGCGTAGCAT:1	CTAGAGCACAGCAACAACAGCT	TGGGAACCACAAAGCGTAGCAT	+	chr3R	29406616	+	chr3R	29407902	1286	+	chr3R	29406616	+	chr3R	29407902
AAAACGGCATAACGTGTTAATTTCTTACTCCCAATGCTATTTTGGTTNGGAAAGAAATCACTATTTTNTGTTTCT:1	AAAACGGCATAACGTGTTAATT	GAAATCACTATTTTNTGTTTCT	-	chr3R	16921915	-	chr3R	16921831	84	+	chr3R	16921831	+	chr3R	16921915
CATTTGGCCGGGTGGTCCTGCTCATCCAGCCCACCAATATTATTCACAAGATGATATTCACAAGATATAACCGCA:1	CATTTGGCCGGGTGGTCCTGCT	ATATTCACAAGATATAACCGCA	+	chr3L	2355449	+	chr3L	2355637	188	+	chr3L	2355449	+	chr3L	2355637
GGACACAACCCCTCCCATCCAATCCAATCCAATGCTTCCTACACACAACAAGGAACCCCCAAAAAAGAAGGACAT:1	GGACACAACCCCTCCCATCCAA	AACCCCCAAAAAAGAAGGACAT	+	chr3L	18561991	+	chr3L	15487518	3074473	+	chr3L	18561991	+	chr3L	15487518
CANAATTTTATCTTTCAAATTAAATTCCTTACTANANTTATAAAACTATAACTAGCAACTAATTAAGTACTTTCT:1	CANAATTTTATCTTTCAAATTA	AGCAACTAATTAAGTACTTTCT	+	chr3R	27028747	+	chr3R	27028826	79	+	chr3R	27028747	+	chr3R	27028826
GCTGGCGAGGCCGGTGTTCCAGTCGCTGGAGGTGG:1	GCTGGCGAGGCCGGTGTTCCAG	GTGTTCCAGTCGCTGGAGGTGG	-	chr2R	23752175	-	chr2R	23752072	103	+	chr2R	23752072	+	chr2R	23752175
TCTGCATCTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAGAGA:1	TCTGCATCTCTGGATGCTTAGC	AGCCGGCGCTGCTTTTGAGAGA	-	chr2R	12187487	-	chr2R	12190103	2616	+	chr2R	12190103	+	chr2R	12187487
AGTACATAAAAATAAAAATAAATTTATAACAAATCAGTCTAAGCNAATTAAAGAAACTTTTCAATAAATTT:1	AGTACATAAAAATAAAAATAAA	AAAGAAACTTTTCAATAAATTT	-	chr3R	30296191	-	chr3R	24900858	5395333	+	chr3R	24900858	+	chr3R	30296191
TGGAGCTGNAGATGGAGCTGAGAACGGAGTTGGGGNTTCGGATGGAGCCAGCTGACTGACGACGTCGTTCCA:1	TGGAGCTGNAGATGGAGCTGAG	GCTGACTGACGACGTCGTTCCA	+	chr2R	11485115	+	chr2R	11485194	79	+	chr2R	11485115	+	chr2R	11485194
GTCTACTTTCGGCCAAAGTAGCTCTGTCATAACGGTTTTCATTTTTCAGCCCTCCACCCCAAGAATCGATTCT:1	GTCTACTTTCGGCCAAAGTAGC	CTCCACCCCAAGAATCGATTCT	-	chr3L	24995318	-	chr3L	14442916	10552402	+	chr3L	14442916	+	chr3L	24995318
AGTCGCAGGGCCAGAAATTAACTGCCGCTTAACTTTCGACACGAATTAGTCACTCGATGACCAAAAACGATCATT:1	AGTCGCAGGGCCAGAAATTAAC	TCGATGACCAAAAACGATCATT	+	chrX	14623099	+	chrX	14623187	88	+	chrX	14623099	+	chrX	14623187
CATGGGATAAGATATGTACTAAATAATTGTTAAGAAGTACATATGTAAAAAATCAATTCAATTTCTTTTGAGTGC:1	CATGGGATAAGATATGTACTAA	CAATTCAATTTCTTTTGAGTGC	-	chr2R	11538422	-	chr2R	11538322	100	+	chr2R	11538322	+	chr2R	11538422
GCCAAGTATCTAGGCGTGTCAGCACAAATAAAAAACATATAATCGACAAATTACTTTCACTCAAAACAAACAAG:1	GCCAAGTATCTAGGCGTGTCAG	ACTTTCACTCAAAACAAACAAG	-	chr3R	26907461	-	chr3R	26907367	94	+	chr3R	26907367	+	chr3R	26907461
AAATATTAGGCAGAGGAAAATCAATGCGAACAAAGGCCATTCATTCACACCTTCTTTTAATTTAGTAGAAATGTG:1	AAATATTAGGCAGAGGAAAATC	CTTTTAATTTAGTAGAAATGTG	+	chr2R	21675310	+	chr2R	10206327	11468983	+	chr2R	21675310	+	chr2R	10206327
ATCAATTCAAATCAAATTTTTAAGTTTGTATGGGATTAGCAAGGAATTGGCAAAAATGCCATAATGTGTGTTGGT:1	ATCAATTCAAATCAAATTTTTA	AAATGCCATAATGTGTGTTGGT	-	chr2L	11227115	-	chr2L	22497730	11270615	+	chr2L	22497730	+	chr2L	11227115
AGCATATACTTTAGGACAGTCTAAAAGTATACCTTAATAAGAAACGCAAACACATGTAATAACATTTTATATTAG:1	AGCATATACTTTAGGACAGTCT	ATGTAATAACATTTTATATTAG	+	chr2R	17169295	+	chr2R	17169535	240	+	chr2R	17169295	+	chr2R	17169535
AGCAGTAAGCAGTAACTACACTACAGCAACTTAACAATCTAAGTCAGCGAATTG:1	AGCAGTAAGCAGTAACTACACT	AACAATCTAAGTCAGCGAATTG	+	chr3R	17944229	+	chr3R	2399677	15544552	+	chr3R	17944229	+	chr3R	2399677
TANTATATTAAAGTAAAAAAAATTGATTTGTTAANCNTTTTGATGAGACATCAAGCTGAACTGTAATTAATAC:1	TANTATATTAAAGTAAAAAAAA	CAAGCTGAACTGTAATTAATAC	+	chr3R	22687489	+	chr3R	18094378	4593111	+	chr3R	22687489	+	chr3R	18094378
AACATAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	AACATAAACACAACACAACACA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	21554040	+	chr3R	21907535	353495	+	chr3R	21554040	+	chr3R	21907535
GGATTTACATTGAACTTTTCTTGTAAATATTACACATTTGAAACCTTAAAATTATAATAAATAAAAGGTTTTATA:1	GGATTTACATTGAACTTTTCTT	ATAATAAATAAAAGGTTTTATA	+	chr3R	13135852	+	chr3R	13138027	2175	+	chr3R	13135852	+	chr3R	13138027
TGAAAATTCTGATAGAACAGTTGTTTCTTTCCACCCAGCTTCTGCG:1	TGAAAATTCTGATAGAACAGTT	TTCTTTCCACCCAGCTTCTGCG	+	chr3R	31497055	+	chr3R	28052824	3444231	+	chr3R	31497055	+	chr3R	28052824
AAATGTGCAAGTACTCGTACATGGTCTCACCTCGTCTCGATGTTCAANGTCCGGCAGTGAGNTAACATTGAGAG:1	AAATGTGCAAGTACTCGTACAT	GGCAGTGAGNTAACATTGAGAG	+	chr3R	2210740	+	chr3R	2474054	263314	+	chr3R	2210740	+	chr3R	2474054
TATGCGTATGCATTTAAAAGTTAAATTAAGTCTGAAAATGTCGATCGAATGG:1	TATGCGTATGCATTTAAAAGTT	TCTGAAAATGTCGATCGAATGG	-	chr2R	7873984	-	chr2R	7869221	4763	+	chr2R	7869221	+	chr2R	7873984
CTCTAGGTATTGATTAGACCGCAACCACTTGATTGGAATTTACAACAAATTATGGCAATTTGTTGAACAAAGTAC:1	CTCTAGGTATTGATTAGACCGC	GGCAATTTGTTGAACAAAGTAC	-	chr3R	4913817	-	chr3R	4913726	91	+	chr3R	4913726	+	chr3R	4913817
CAAAGTTAGCAGCAAGTGCTGCTAAAAAGATTAGGAAGACCCAGTTGAAATTCCTTGGAGCGCACAAAATGCCAA:1	CAAAGTTAGCAGCAAGTGCTGC	CTTGGAGCGCACAAAATGCCAA	+	chr2L	23032690	+	chr2L	16416842	6615848	+	chr2L	23032690	+	chr2L	16416842
TCCAATTAGTGCAGGCAGCGATCTGCATACATATATATATGTATATGGGCCTGGTGGCCAGAACTTTTATGAG:1	TCCAATTAGTGCAGGCAGCGAT	TGGTGGCCAGAACTTTTATGAG	-	chr2L	17914150	-	chr2L	17911974	2176	+	chr2L	17911974	+	chr2L	17914150
TAATGTCAAGGAAAATAGCTGAGATTGTAACTGCAGATGAAGAGCCTGTCTGTATAACGGAGAGTTCTGAGAAA:1	TAATGTCAAGGAAAATAGCTGA	TATAACGGAGAGTTCTGAGAAA	-	chr3L	24363318	-	chr3L	24363241	77	+	chr3L	24363241	+	chr3L	24363318
TATANACAACAATTTAGACAAANAAAANAGGCTGAGGAGNAACGAGAAGACACAACAAGATGGAGAACCAGACGA:1	TATANACAACAATTTAGACAAA	AACAAGATGGAGAACCAGACGA	-	chr3R	19215805	-	chr3R	28860905	9645100	+	chr3R	28860905	+	chr3R	19215805
AGGATGCGTAACGAAANTTCAATNAAAAATGCTNATGTNTCTGAAGGGCAATGGAGATGGGCNTGGGGGATCA:1	AGGATGCGTAACGAAANTTCAA	TGGAGATGGGCNTGGGGGATCA	+	chr3R	10210116	+	chr3R	14388485	4178369	+	chr3R	10210116	+	chr3R	14388485
GACAAGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGA:1	GACAAGACAGGACAGGACAGGA	GACAGGACAGGACAGGACAGGA	-	chrX	10754861	-	chrX	4067987	6686874	+	chrX	4067987	+	chrX	10754861
GACAACCGGGAGGAATTGGGGGGAGGGGAGGCAAGGTTTGTGTACGTGCCTGAAATT:1	GACAACCGGGAGGAATTGGGGG	GTTTGTGTACGTGCCTGAAATT	-	chr2R	10190535	-	chr2R	10190471	64	+	chr2R	10190471	+	chr2R	10190535
ATGATTGTGCGCTAGTTTTTCACAGAGTTTATCTGACTTTATATTTGAGCTTAACGAAACATTGCCGGAGTGCCG:1	ATGATTGTGCGCTAGTTTTTCA	ACGAAACATTGCCGGAGTGCCG	+	chr3R	16073440	+	chr3R	16073544	104	+	chr3R	16073440	+	chr3R	16073544
CAAGCACTCATATTATTTAGTCGAACGTAATCATNTTGATATCCAAGCCTCAACGTATAGTTTTTCCACCTTCGT:1	CAAGCACTCATATTATTTAGTC	CGTATAGTTTTTCCACCTTCGT	-	chrX	19125831	-	chrX	19125702	129	+	chrX	19125702	+	chrX	19125831
CTTCGCCAACCTAGTTTTNGGGCCCGGCTTAATCACAGACAGTNTATGTNTAATGCGCAAAACTTTTAATTGAGT:1	CTTCGCCAACCTAGTTTTNGGG	TGCGCAAAACTTTTAATTGAGT	+	chr3R	9811358	+	chr3R	9811436	78	+	chr3R	9811358	+	chr3R	9811436
TAGCAAATTGAAATTTTTTCCACCGATCACAAAACAAAAACACCCCCACCCGGACCATCGGCCTCTCAAAGTCAA:1	TAGCAAATTGAAATTTTTTCCA	ACCATCGGCCTCTCAAAGTCAA	+	chr3R	22971255	+	chr3R	22971349	94	+	chr3R	22971255	+	chr3R	22971349
GCCAGCGGAGGTCACCGAAAGTTGATTGAGGAAATACCTCAAAATAAACTTAGATGCAAATTATTGAACGGCAAA:1	GCCAGCGGAGGTCACCGAAAGT	ATGCAAATTATTGAACGGCAAA	-	chr3L	15260119	-	chr3L	15259125	994	+	chr3L	15259125	+	chr3L	15260119
GTAAATCTCACTAAACACTACCTTTTTAGAACACGAAAATAAGACTAAGTTAACAAAAGTAAGACTAACATTTAT:1	GTAAATCTCACTAAACACTACC	CAAAAGTAAGACTAACATTTAT	+	chr2R	10313322	+	chr2R	10313416	94	+	chr2R	10313322	+	chr2R	10313416
TCCACATTTGCTGACCCCGACGTGATCGGTAACATTTCTTTATCGTGAGCACTTTTGTACATAAATGGCTGCAA:1	TCCACATTTGCTGACCCCGACG	TTTTGTACATAAATGGCTGCAA	-	chr3L	25996026	-	chr3L	25995946	80	+	chr3L	25995946	+	chr3L	25996026
TTGTGCGCTCTGTAGAAAAAGGGCTCAAATATATGCTATCGGGGGCTAGATTCGCTTCCAATCTTATATATTTT:1	TTGTGCGCTCTGTAGAAAAAGG	CGCTTCCAATCTTATATATTTT	-	chr2R	7943201	-	chr2R	7942945	256	+	chr2R	7942945	+	chr2R	7943201
AAATCTAAAAAAAAAATTGTGTAAGGATAAAAATGTGACAATGCCGAGGTTTTCCAAAGCATACCAATGTTCCGG:1	AAATCTAAAAAAAAAATTGTGT	CCAAAGCATACCAATGTTCCGG	+	chr2R	8726579	+	chr2R	12149362	3422783	+	chr2R	8726579	+	chr2R	12149362
TATTATCCTGCTTAAAACCTATCCATTATTTCTAAACCCANACGTNTGCCATCCAAATTCAATNTTGCACT:1	TATTATCCTGCTTAAAACCTAT	CATCCAAATTCAATNTTGCACT	-	chr3L	16867621	-	chr3L	16867547	74	+	chr3L	16867547	+	chr3L	16867621
CATTGAATCAAGTATCTGTTATTTCTCCATTGAAATTGAAACTACTAGGACATAGATTAAAATGCAAACGCCT:1	CATTGAATCAAGTATCTGTTAT	ATAGATTAAAATGCAAACGCCT	+	chr2L	19703556	+	chr2L	19712690	9134	+	chr2L	19703556	+	chr2L	19712690
TCTTTTTCGGCGACCAAAACTTAATGTCCAGAAAAAACGTTGTAATAATGCGTAGAAACCAAG:1	TCTTTTTCGGCGACCAAAACTT	GTAATAATGCGTAGAAACCAAG	+	chr2L	22490527	+	chr2L	22497651	7124	+	chr2L	22490527	+	chr2L	22497651
CATTCAGGGAATTGGGCGTTTTGACACACCTCGACGCTGTGTTCCAACGTGTCCTGCTTNTTG:1	CATTCAGGGAATTGGGCGTTTT	TTCCAACGTGTCCTGCTTNTTG	-	chr3L	22665102	-	chr3L	22665027	75	+	chr3L	22665027	+	chr3L	22665102
GGAGCGATGAGGTTCCGGNTGTCAAAATGCGACGTTTCGTGGTNCTAAANAATCTCCAGGTGCGGCCAAAC:1	GGAGCGATGAGGTTCCGGNTGT	NAATCTCCAGGTGCGGCCAAAC	-	chr2R	15888635	-	chr2R	10309166	5579469	+	chr2R	10309166	+	chr2R	15888635
TAAACAGAACATATTTATAGGGCGTGTAACTAAACAGNTAACAAANTTGTTCATACCCATT:1	TAAACAGAACATATTTATAGGG	AACAAANTTGTTCATACCCATT	-	chr3R	14821763	-	chr3R	14821628	135	+	chr3R	14821628	+	chr3R	14821763
CATTTGATTTGACACCTATAATTATCATCATTACTGAGACTTGAATACTACGTTCAGTGCATACTCNCTCTGCCG:1	CATTTGATTTGACACCTATAAT	TCAGTGCATACTCNCTCTGCCG	+	chr3L	21847430	+	chr3L	21847526	96	+	chr3L	21847430	+	chr3L	21847526
AGTGGTTTTTCGCCGATCTTTTCGAAAAAGAGAAATGGTTCCCCCAACTGGCTTGACCTGTGCACCTTTACTTT:1	AGTGGTTTTTCGCCGATCTTTT	TTGACCTGTGCACCTTTACTTT	+	chrX	11839049	+	chrX	11839296	247	+	chrX	11839049	+	chrX	11839296
AGCTACTTTACTGACACTGATGATTTTCGATGTGTGCATTCTCTAANAACTACTGATTGCNCAGGCTATAAATA:1	AGCTACTTTACTGACACTGATG	CTGATTGCNCAGGCTATAAATA	+	chr3R	22084614	+	chr3R	22084702	88	+	chr3R	22084614	+	chr3R	22084702
AAGAAGGCACTGGCATCTGTTGAATCTCGTAGCATAAACAACCATAAGGATTTGTTTATGGCCAGGCAATATTTT:1	AAGAAGGCACTGGCATCTGTTG	GTTTATGGCCAGGCAATATTTT	-	chr3R	8618720	-	chr3R	8618640	80	+	chr3R	8618640	+	chr3R	8618720
TTATGGCTCAAAAACCCCAAAAACCAAACAACGGATTCCATCACTTAACTTGAGCTGATTGACCAGGACAAT:1	TTATGGCTCAAAAACCCCAAAA	TGAGCTGATTGACCAGGACAAT	+	chr3L	5388221	+	chr3L	5388542	321	+	chr3L	5388221	+	chr3L	5388542
ATTCCAGTTTACGCTGCGTGTGTGTACACTGTACTGCAAATTTCACTTATCAAGTGGAACTCCAACAAAGGGAG:1	ATTCCAGTTTACGCTGCGTGTG	AGTGGAACTCCAACAAAGGGAG	-	chrX	1635444	-	chrX	1627977	7467	+	chrX	1627977	+	chrX	1635444
CTCCAAAATCCGAGATTCNCTGGACAGAACTTCAGCCAGCCNAGANTTCCTCCCTTTTTGGCGCTCGCCCTTTTA:1	CTCCAAAATCCGAGATTCNCTG	CTTTTTGGCGCTCGCCCTTTTA	+	chr3R	24276663	+	chr3R	13443982	10832681	+	chr3R	24276663	+	chr3R	13443982
GGTTTCATTTTTCAAGAGCGCTGGCCAGGAAANCCGTATTTACATACATCCCTCTTTGTGGAGATAAGAGCCA:1	GGTTTCATTTTTCAAGAGCGCT	CTCTTTGTGGAGATAAGAGCCA	-	chr2L	6366100	-	chr2L	6363176	2924	+	chr2L	6363176	+	chr2L	6366100
GTAGGTTTGAAGCAATAGAAACACTTGTTAGTTAGCACACTTTTGGAATATCATTAACTTATG:1	GTAGGTTTGAAGCAATAGAAAC	TTTGGAATATCATTAACTTATG	-	chr2R	19301054	-	chr2R	19300983	71	+	chr2R	19300983	+	chr2R	19301054
GCATAATTGTGCTTTTACNTGTTTTAGCAAAAAATCAAAAAGANCTATGNAAGATTTCGATGGGGAACCGATAAT:1	GCATAATTGTGCTTTTACNTGT	ATTTCGATGGGGAACCGATAAT	+	chr3R	28479165	+	chr3R	28479248	83	+	chr3R	28479165	+	chr3R	28479248
GCATATATCTCTATATATATATTTGAGAATCAGAGGCGCGNGAGGGCGTCACACGCGT:1	GCATATATCTCTATATATATAT	CGCGNGAGGGCGTCACACGCGT	+	chrX	10772691	+	chrX	10772757	66	+	chrX	10772691	+	chrX	10772757
GGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGAAGGGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1	GGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGG	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	+	chr3L	19220636	+	chr3L	22908066	3687430	+	chr3L	19220636	+	chr3L	22908066
GAGCNGAGCTCCCTCTTGGCAGNGGAANATTCACTAGTTNCACCCATCCTCGTCGTCCTCGGA:1	GAGCNGAGCTCCCTCTTGGCAG	ACCCATCCTCGTCGTCCTCGGA	-	chr2R	11982670	-	chr2R	12182171	199501	+	chr2R	12182171	+	chr2R	11982670
AGAATTGTTCAACACTCAGAAGCAAGTGCATTGTTTTACAAAGAGAACAAATGAAAAGGTANGAAAAGCGATAAG:1	AGAATTGTTCAACACTCAGAAG	AAAAGGTANGAAAAGCGATAAG	-	chr3L	606973	-	chr3L	606897	76	+	chr3L	606897	+	chr3L	606973
AAAGAAAAGCGCTCCCAAGCACACACACACACACCCAATAAATAACTCATACGCAGCGTGCNCCAGCGGCACTTG:1	AAAGAAAAGCGCTCCCAAGCAC	CAGCGTGCNCCAGCGGCACTTG	+	chr2L	2337055	+	chr2L	3247230	910175	+	chr2L	2337055	+	chr2L	3247230
AAATACAAACATTATTTAAATGAANGAACTTTCCCTTTTGCANGANCTTATNGTTNTTGGTCGAGAATTACGTA:1	AAATACAAACATTATTTAAATG	GTTNTTGGTCGAGAATTACGTA	+	chr2R	25131027	+	chr2R	25131103	76	+	chr2R	25131027	+	chr2R	25131103
TTTAAATAAAGCTAATTCCACATTCAACATAATCAGCGCAGTTTATTCAACTAACTTTATTTATTGTCATTATGC:1	TTTAAATAAAGCTAATTCCACA	ACTTTATTTATTGTCATTATGC	+	chr3R	25194588	+	chr3R	25194666	78	+	chr3R	25194588	+	chr3R	25194666
AAATAAGAAATCTGACTTTCAAGAACACCAATATGAAACAAATACAANAATAGAATACCAATAGTAGAGTTCGAT:1	AAATAAGAAATCTGACTTTCAA	AATACCAATAGTAGAGTTCGAT	-	chrX	19358428	-	chrX	19356987	1441	+	chrX	19356987	+	chrX	19358428
TGAGGAAAGAGCATCGTTAATGGGAAGGACGGCGAGTTTACACAATCTCCCTCAACCAGCAACTCAAATGG:1	TGAGGAAAGAGCATCGTTAATG	CCTCAACCAGCAACTCAAATGG	+	chr3R	10727655	+	chr3R	10727731	76	+	chr3R	10727655	+	chr3R	10727731
GCGAAATTACCTAATTCGTACAGGAAGCGAAGCTCCCAATCGATAATACTGTAGGAGTAAGCAAGAACAGG:1	GCGAAATTACCTAATTCGTACA	TGTAGGAGTAAGCAAGAACAGG	+	chrX	22632257	+	chrX	10761511	11870746	+	chrX	22632257	+	chrX	10761511
AAACGGCTCGAAGAATAAATGGGACAGAATCAGAAATTATAGTGTCTAATAAAATGCCAAAAAATGATAGTACAC:1	AAACGGCTCGAAGAATAAATGG	ATGCCAAAAAATGATAGTACAC	+	chr2L	10692813	+	chr2L	10692911	98	+	chr2L	10692813	+	chr2L	10692911
GGACGAACTCATCAGACTGTAATAATTTGCTATCAGAGAGTGTCACGNACAGGGTGCCAATNGAGGAGCCGAGGG:1	GGACGAACTCATCAGACTGTAA	GTGCCAATNGAGGAGCCGAGGG	+	chr2L	17859306	+	chr2L	5899493	11959813	+	chr2L	17859306	+	chr2L	5899493
TAACATCAGGCTCGCCGCAGCAGAAATTCAAACTTGAAGAGAGTTGCAAGAGTATCGATTACCGACGCGCTATGG:1	TAACATCAGGCTCGCCGCAGCA	ATCGATTACCGACGCGCTATGG	+	chr2L	5783128	+	chr2L	5783247	119	+	chr2L	5783128	+	chr2L	5783247
GGCCTGCCAACACAGCAGCAACACTGGCGAAAGGTCGCGACTCGCCCGCCC:2	GGCCTGCCAACACAGCAGCAAC	AAAGGTCGCGACTCGCCCGCCC	-	chr3R	5105638	-	chr3R	5105579	59	+	chr3R	5105579	+	chr3R	5105638
AGGCGCATAATTTTATTAGATAACTTCTGTTTTTTTTTTAAGCTAAACTTTAATAATTTTCCAACTTGCAAGCAG:1	AGGCGCATAATTTTATTAGATA	TAATTTTCCAACTTGCAAGCAG	+	chr3L	13740046	+	chr3L	13740138	92	+	chr3L	13740046	+	chr3L	13740138
CTCACAGGCTACACAGTCAACTTAATTCCAGGAAAGCAACTAACCCAGCTAAACTAACGTAATTTTGTTGCTAG:1	CTCACAGGCTACACAGTCAACT	ACTAACGTAATTTTGTTGCTAG	+	chr3R	12551574	+	chr3R	16276855	3725281	+	chr3R	12551574	+	chr3R	16276855
TAGCAGCACGGCAAGAAATCGGGATCAGNTTAGATTATAAATCTGTAGATAGGATTTTCAAATGGATAGTAGAG:1	TAGCAGCACGGCAAGAAATCGG	GATTTTCAAATGGATAGTAGAG	-	chr3L	119386	-	chr3L	110220	9166	+	chr3L	110220	+	chr3L	119386
GTGACCAAGATATCGGGAGTCATGAAGTTCTTCAGAGGATGATGCAGGAAAACATTTCAAATGGTGATAAGCACT:1	GTGACCAAGATATCGGGAGTCA	ATTTCAAATGGTGATAAGCACT	-	chr2R	22217718	-	chr2R	21853887	363831	+	chr2R	21853887	+	chr2R	22217718
TTTGAGTGCAGTTAAGTCCATCAANTGCTCCGATTTGCTTTTNTGNTTCAGNTTTNTTAGAATTCCCCTTCTCAA:1	TTTGAGTGCAGTTAAGTCCATC	TTNTTAGAATTCCCCTTCTCAA	-	chr2R	18219737	-	chr2R	18219655	82	+	chr2R	18219655	+	chr2R	18219737
GCTCCGTTTTGTATACAAATNATTGTGAGNTGTTGTTGTTCTTATTGCTTTT:1	GCTCCGTTTTGTATACAAATNA	TGTTGTTGTTCTTATTGCTTTT	+	chr3L	22743365	+	chr3L	8996240	13747125	+	chr3L	22743365	+	chr3L	8996240
AATAGCTTCGGAATCGGGTATCAAAGGTTTGAACCACAGTCCGCGGAAAGGCG:1	AATAGCTTCGGAATCGGGTATC	AACCACAGTCCGCGGAAAGGCG	-	chr2R	9368205	-	chr2R	9368151	54	+	chr2R	9368151	+	chr2R	9368205
GTCTAAAACTTGGGGGCGTAGCAGGGTGCTTTTGCCTAAATGTGTTTTTCTTGGCTTTCCCCGATCTCGGACAG:1	GTCTAAAACTTGGGGGCGTAGC	GGCTTTCCCCGATCTCGGACAG	+	chr3R	31279386	+	chr3R	31285576	6190	+	chr3R	31279386	+	chr3R	31285576
CTAAAAGTTTACTTTTAAAAGTCAAATTTTTTTCTTCTTTTATTTATTTATGGGCCGACAGTATGGC:1	CTAAAAGTTTACTTTTAAAAGT	ATTTATGGGCCGACAGTATGGC	+	chr3R	28449653	+	chr3R	22063512	6386141	+	chr3R	28449653	+	chr3R	22063512
AACAAGTCAAACATTCAGCAAGAGACAGTTAAGAAGAAAAAACAAANAGCTGGCCCATAAA:1	AACAAGTCAAACATTCAGCAAG	AAACAAANAGCTGGCCCATAAA	+	chr2R	11582387	+	chr2R	19199094	7616707	+	chr2R	11582387	+	chr2R	19199094
GTGTCATTTACATTTTTGCTNCTACTGATTAANTGATTTTAANAATATTTCAAATTGACATTGTCGATGGTCC:1	GTGTCATTTACATTTTTGCTNC	AAATTGACATTGTCGATGGTCC	-	chr2L	17623906	-	chr2L	17623678	228	+	chr2L	17623678	+	chr2L	17623906
GTCTGATGAATGGCCATTTGAAGTAAGCGGCAATTGCACAAGCAGCTTAA:1	GTCTGATGAATGGCCATTTGAA	GGCAATTGCACAAGCAGCTTAA	+	chr3L	12933118	+	chr3L	12933177	59	+	chr3L	12933118	+	chr3L	12933177
CTTTTATATTTATATATATGTATATATATCATGTGTGTGTAATGGAGTTCGGACAGGTTAGGGATATCGCATAGC:1	CTTTTATATTTATATATATGTA	CAGGTTAGGGATATCGCATAGC	+	chrX	17181798	+	chrX	5336467	11845331	+	chrX	17181798	+	chrX	5336467
GGGAACATTTTGGTTTCCTNCCTGCCTTTTTACTAGAAAGCCATCTTTTTTTATATGCCCCGTCTCTTTCATGCC:1	GGGAACATTTTGGTTTCCTNCC	TATGCCCCGTCTCTTTCATGCC	+	chr3L	24514846	+	chr3L	4720259	19794587	+	chr3L	24514846	+	chr3L	4720259
CCAAACACATCCAACCAGGCCAAATAAAGCAAGTTTGACAAAAGCATGACGAGGACAATGCCATACATGAAGAAT:1	CCAAACACATCCAACCAGGCCA	GACAATGCCATACATGAAGAAT	-	chr3R	18766870	-	chr3R	18766792	78	+	chr3R	18766792	+	chr3R	18766870
CGATGATTATGGAAAAAATAATGATCGGGAACAAGAGCGCGCAGCACTGGGAGAAAATANGGGGTGCTG:1	CGATGATTATGGAAAAAATAAT	TGGGAGAAAATANGGGGTGCTG	-	chr2L	19163472	-	chr2L	19163397	75	+	chr2L	19163397	+	chr2L	19163472
CAAGGAAAAGAGCTCGGGGTGTTTGGGTCAAAGGGACATCCCTACTTTGTTGTTTTGATAAGTATAAAATGGAGT:1	CAAGGAAAAGAGCTCGGGGTGT	TTTGATAAGTATAAAATGGAGT	-	chr3L	13347665	-	chr3L	5537050	7810615	+	chr3L	5537050	+	chr3L	13347665
TATTATACTCAGATCGTATGGTCTTAAGCCTTTGCTGATGTTGCACANAGAAGTACAATGTAAGCTAAAGCCTTT:1	TATTATACTCAGATCGTATGGT	TACAATGTAAGCTAAAGCCTTT	-	chr2R	5476900	-	chr2R	5476356	544	+	chr2R	5476356	+	chr2R	5476900
ATTCCGAAACATCAACAAATTGGCTGGTATTAATATATTATATATTATATCTAAATAGGCTAATAATGTCTGAAA:1	ATTCCGAAACATCAACAAATTG	AATAGGCTAATAATGTCTGAAA	+	chr3L	920428	+	chr3L	920520	92	+	chr3L	920428	+	chr3L	920520
ACTAAATGAATTGACAAGATAAAACCGTACACAACACACAATTGGTGCCAAGCAGGCCACAGAGAGCCACA:1	ACTAAATGAATTGACAAGATAA	AAGCAGGCCACAGAGAGCCACA	+	chr3R	16179088	+	chr3R	16179207	119	+	chr3R	16179088	+	chr3R	16179207
TGGCTTAGCAATGGACGAAGCCATTAAAGTTAATTTAAAGTGCCTCGACTGGCGCCACACAAAGGAAACTTAATT:1	TGGCTTAGCAATGGACGAAGCC	GCCACACAAAGGAAACTTAATT	+	chr3R	14965208	+	chr3R	9291229	5673979	+	chr3R	14965208	+	chr3R	9291229
AATACCCTGTTCGCACGGGCGGGCTTGCTTTGATCGGCATATGCAGATGGCCAAAGGTTGGCCTTTTCTATTAT:1	AATACCCTGTTCGCACGGGCGG	AAAGGTTGGCCTTTTCTATTAT	-	chr3L	19446694	-	chr3L	21864671	2417977	+	chr3L	21864671	+	chr3L	19446694
GAAACTTTTAATGCTTGACAAAACTTTAAATTTCCAACTTAGGACATGGTGAAGACCCCTTACATTTTGCATACT:1	GAAACTTTTAATGCTTGACAAA	GACCCCTTACATTTTGCATACT	-	chr3L	22169579	-	chr3L	22169486	93	+	chr3L	22169486	+	chr3L	22169579
TTTTATAGTTCGCTCGCCCAAAGCTTTTTCTAAAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCGTGCCAAACAAG:1	TTTTATAGTTCGCTCGCCCAAA	ATTCGTTGGCGTGCCAAACAAG	-	chr2L	1227617	-	chr2L	1220151	7466	+	chr2L	1220151	+	chr2L	1227617
CAAATTTTTAAACAAAGACCAAATTGAGAATTGACTGAGAATTACGTTTTTGATACATAATCGCCAAATTCTTTT:1	CAAATTTTTAAACAAAGACCAA	TACATAATCGCCAAATTCTTTT	+	chrX	1200065	+	chrX	1200143	78	+	chrX	1200065	+	chrX	1200143
TATGAGGATATATTGAATTAATATACATTAATTGCAACAGATTAGGTGTGCGTTAAAATGTTTCCTTAAATTTTG:1	TATGAGGATATATTGAATTAAT	TAAAATGTTTCCTTAAATTTTG	-	chr3L	11083610	-	chr3L	11083512	98	+	chr3L	11083512	+	chr3L	11083610
GCCAATTGTAAGGCAAACACACTCACACCAAAACACCAAGTCCTTCTT:1	GCCAATTGTAAGGCAAACACAC	ACCAAAACACCAAGTCCTTCTT	+	chr2R	8653811	+	chr2R	9537641	883830	+	chr2R	8653811	+	chr2R	9537641
ACAAACAAGGCGGAAACACATAAACAAAATTCCATAAGGGAGGCATTTTCCATTAAGCCTGTCATTTG:1	ACAAACAAGGCGGAAACACATA	TTTCCATTAAGCCTGTCATTTG	+	chr2L	7493687	+	chr2L	7493891	204	+	chr2L	7493687	+	chr2L	7493891
TAGATCATGTAGATACACTCTTATCCAAACGGCTTCAAAGGCATTCCCCGGGTGTGGAGGGCATCAAA:1	TAGATCATGTAGATACACTCTT	CCCGGGTGTGGAGGGCATCAAA	-	chr2L	6185521	-	chr2L	6185450	71	+	chr2L	6185450	+	chr2L	6185521
GGGGTACATACAAATATAGTGTACCATATATGTATATACATATAGTNCATATAGCTATGCTCA:1	GGGGTACATACAAATATAGTGT	ATAGTNCATATAGCTATGCTCA	-	chr3R	27882768	-	chr3R	27875725	7043	+	chr3R	27875725	+	chr3R	27882768
TCGGGAAAGGCAGAAGTTATAACTTTTAATGAGATCAAAAAAGCCGGGTAATA:1	TCGGGAAAGGCAGAAGTTATAA	AGATCAAAAAAGCCGGGTAATA	+	chr2L	19645442	+	chr2L	10269304	9376138	+	chr2L	19645442	+	chr2L	10269304
GTTCGATATCCTTTATTTTATTCCCAAGATCAGTTTTTACCTCTCTGCGCTGCGTGGACGACGACTCTATAG:1	GTTCGATATCCTTTATTTTATT	TGCGTGGACGACGACTCTATAG	+	chr2R	13905620	+	chr2R	13907599	1979	+	chr2R	13905620	+	chr2R	13907599
TTTGGGATCTCGAAAAGTGTTGCTTAGGTGTTTTAGGTTTCTATACAAAAGCACACTTATT:1	TTTGGGATCTCGAAAAGTGTTG	TCTATACAAAAGCACACTTATT	+	chr3R	27644271	+	chr3R	27644349	78	+	chr3R	27644271	+	chr3R	27644349
GCGACATGTCTTAGAGAAACTATAAGTATAACAATAATTTAGCTCGAAATCGTACCCGGAAAGTACCAAACAT:1	GCGACATGTCTTAGAGAAACTA	GTACCCGGAAAGTACCAAACAT	+	chr3R	5746040	+	chr3R	5746279	239	+	chr3R	5746040	+	chr3R	5746279
AATGATTTNGATTTTGGTAGCTTATATTAAAGATANATAGACTTGGAAGATAGGAGATGAATTTAATGCTCGTGA:1	AATGATTTNGATTTTGGTAGCT	GAGATGAATTTAATGCTCGTGA	+	chr2R	15374734	+	chr2R	15376538	1804	+	chr2R	15374734	+	chr2R	15376538
ATCATTGAAAACATGAAAGGACCTAGCCGTTCACCAGCGAGTACACGGATACCCACAAGTCAAATGACAGCG:1	ATCATTGAAAACATGAAAGGAC	ACCCACAAGTCAAATGACAGCG	-	chr3R	14682046	-	chr3R	5481747	9200299	+	chr3R	5481747	+	chr3R	14682046
CTGCAGGTGCAGCGTGGATATATCAGGGGGCGGGTATCCTGCCATACTGACGGGATAAATTAGGCCAAAGCAGGC:1	CTGCAGGTGCAGCGTGGATATA	GATAAATTAGGCCAAAGCAGGC	-	chr3L	21186131	-	chr3L	21186055	76	+	chr3L	21186055	+	chr3L	21186131
GTTCAAGATACAGAAACCGAAAGAAAATTTCAATGAACGAAGGAAAGGGGGGCAGAGATGGAG:1	GTTCAAGATACAGAAACCGAAA	GGAAAGGGGGGCAGAGATGGAG	+	chr3L	11532194	+	chr3L	3785020	7747174	+	chr3L	11532194	+	chr3L	3785020
TTAAACAGATCAAAAATTAAATATTGTTTTGAAATATTTAAATTTCTNACACAGATTTCTTCAATTCATATTTTA:1	TTAAACAGATCAAAAATTAAAT	GATTTCTTCAATTCATATTTTA	-	chr2R	16564807	-	chr2R	16494644	70163	+	chr2R	16494644	+	chr2R	16564807
TCATTGTTGTGCTTTCCTAATCAATTTCTTGCAAAAAGCTTTCCAAAGCGCCTAATTGCTTGGTTCATCTCCTCA:1	TCATTGTTGTGCTTTCCTAATC	AATTGCTTGGTTCATCTCCTCA	+	chr2L	16880053	+	chr2L	17423182	543129	+	chr2L	16880053	+	chr2L	17423182
CACTTAAATCGGAAAAATACATCTCAATAAAGATGTCTGTGTAGCTAGCTCAACGATGATGATGATGCATTG:1	CACTTAAATCGGAAAAATACAT	CAACGATGATGATGATGCATTG	+	chr2R	23427778	+	chr2R	23427917	139	+	chr2R	23427778	+	chr2R	23427917
CCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCTTGTC:1	CCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCC	TCCTGTCCTGTCCTGTCTTGTC	+	chrX	4067988	+	chrX	10754861	6686873	+	chrX	4067988	+	chrX	10754861
TAAGAAAGNTGATAGATATAAAAAAATCACAAACANTTATGGCCAAATGCAATATGGCCGATGAAGAGAAGTTA:1	TAAGAAAGNTGATAGATATAAA	TATGGCCGATGAAGAGAAGTTA	-	chr2L	1893080	-	chr2L	18476694	16583614	+	chr2L	18476694	+	chr2L	1893080
AATAAATGATTGCTAGCTCATCTGCTTATATATCTTAATTTTACTTATATGTACTTGCCATTTTCTTAGAGTGCA:1	AATAAATGATTGCTAGCTCATC	CTTGCCATTTTCTTAGAGTGCA	+	chr3R	21903632	+	chr3R	21903729	97	+	chr3R	21903632	+	chr3R	21903729
CAGATAGCAGCCACCGCAAAAGCAAAAGCAAGAGCAAAACCATGGAAAAAAAAGGCCAGGAAAATCGATGCGAAA:1	CAGATAGCAGCCACCGCAAAAG	GGCCAGGAAAATCGATGCGAAA	+	chr3R	13143048	+	chr3R	13148624	5576	+	chr3R	13143048	+	chr3R	13148624
GTTAGCCAAACTTTCGGAGCCATAAAGAGCTGAAATTCGTAGTTTTGAGTGAGTACGTGTGTTGCATACTTTATG:1	GTTAGCCAAACTTTCGGAGCCA	TACGTGTGTTGCATACTTTATG	-	chr3L	11730809	-	chr3L	2344872	9385937	+	chr3L	2344872	+	chr3L	11730809
GTTAGTCTCGTCTGGCCAGCTACTTCTCCCAATTCTCCGATTCCGATCCTCCGCCAGAGAGCCCAAGCATACAG:1	GTTAGTCTCGTCTGGCCAGCTA	GCCAGAGAGCCCAAGCATACAG	-	chr3L	19426851	-	chr3L	19426774	77	+	chr3L	19426774	+	chr3L	19426851
TGTGTTACATGGTACTTCTTGTACAATTTCAATAGTCTGTAATTCTATTGATATGTTTTGCTGTTCNATATGATT:1	TGTGTTACATGGTACTTCTTGT	TGTTTTGCTGTTCNATATGATT	-	chr2R	7642960	-	chr2R	7642880	80	+	chr2R	7642880	+	chr2R	7642960
AAATGTTAATACTTTCAATATATGGTCATAAAATAGATTTTCACTTTAGACCAGAAATGAAGACCAGCTGCTTAA:1	AAATGTTAATACTTTCAATATA	GAAATGAAGACCAGCTGCTTAA	+	chr3R	15646799	+	chr3R	15646882	83	+	chr3R	15646799	+	chr3R	15646882
ATAATGTAGCTAAAGTACTGGTGTATATTTGCAATTGACCAGCACTTATAAGGGTACCCCAAAGCGTTCAATTG:1	ATAATGTAGCTAAAGTACTGGT	GGTACCCCAAAGCGTTCAATTG	+	chr3L	22761411	+	chr3L	22766844	5433	+	chr3L	22761411	+	chr3L	22766844
AAGAGAGGCAGTCGGAAAAAAAAAAA:1	AAGAGAGGCAGTCGGAAAAAAA	GAGGCAGTCGGAAAAAAAAAAA	-	chrX	8841463	-	chrX	4720644	4120819	+	chrX	4720644	+	chrX	8841463
CTCGGCGATCCCCTCACCCCGCCCATGGCATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAGATTCAGCCTCTAAA:1	CTCGGCGATCCCCTCACCCCGC	CATGTGAGATTCAGCCTCTAAA	+	chr3R	8195307	+	chr3R	19449335	11254028	+	chr3R	8195307	+	chr3R	19449335
TTATACATATACATGCCTTTTTNTCACTGAACGAATTTAATAAATTTTTTACTTTCGGATTTGTAGAGTCTGCCG:1	TTATACATATACATGCCTTTTT	TTCGGATTTGTAGAGTCTGCCG	-	chr3L	12437939	-	chr3L	10855876	1582063	+	chr3L	10855876	+	chr3L	12437939
TTGAACACTAGGGGTAACGTCTACTCGGAGGAGCGCCTGGCCGG:1	TTGAACACTAGGGGTAACGTCT	ACTCGGAGGAGCGCCTGGCCGG	+	chr2L	10642393	+	chr2L	10644796	2403	+	chr2L	10642393	+	chr2L	10644796
TAAGAATCCCTGTATCTTCAGCACTCACAAAAAGCGCATCGTCTTTTCTTAAGCTTACAAAATGATGCATTTTC:1	TAAGAATCCCTGTATCTTCAGC	GCTTACAAAATGATGCATTTTC	+	chr2R	20079866	+	chr2R	20079947	81	+	chr2R	20079866	+	chr2R	20079947
GATTTTTTCGATTTCTCTGATGATTTCTAGCCGGNCAAAGTCTTTGACTTTGTTGTCATGGTTTTTAATGAAG:1	GATTTTTTCGATTTCTCTGATG	GTTGTCATGGTTTTTAATGAAG	+	chr3L	27368884	+	chr3L	27369427	543	+	chr3L	27368884	+	chr3L	27369427
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGTG:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTGGTGTTGTGTGGTGTGGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13104419	8803115	+	chr3R	13104419	+	chr3R	21907534
TGGCCCTGCGTGCAGCTTGNAAAAACAAGCAAGGTCCAAAAACAACCTGAGTGTGAGAAATGAAATTGTTTGGCG:1	TGGCCCTGCGTGCAGCTTGNAA	TGAGAAATGAAATTGTTTGGCG	-	chr3R	28415816	-	chr3R	28415731	85	+	chr3R	28415731	+	chr3R	28415816
GCTGTAAAACTGCATCAATCAAGAAGCACGCAGTTGAAGCAGTTCATACCTGTATATATAGATATATATTGTGAG:1	GCTGTAAAACTGCATCAATCAA	ATATATAGATATATATTGTGAG	-	chr3R	4174985	-	chr3R	24396736	20221751	+	chr3R	24396736	+	chr3R	4174985
GTCGTTGGAATGCGAGCCACTCAGGCAAAAACCATAATGGAATAGGCACGAAATAATGTATACAATTGCTGCTTT:1	GTCGTTGGAATGCGAGCCACTC	TAATGTATACAATTGCTGCTTT	-	chrX	3893863	-	chrX	3893775	88	+	chrX	3893775	+	chrX	3893863
TTGAAATGTGTTCTTGGCACTCATTTCGCCTCACTTTTCCNCCCCCACCACTTGATTCACCGAAC:1	TTGAAATGTGTTCTTGGCACTC	CCCACCACTTGATTCACCGAAC	+	chr2R	19331250	+	chr2R	19331320	70	+	chr2R	19331250	+	chr2R	19331320
TAGGGCAGATTTTCCATATTTGACCTCTGCATCAAATAAATTCCATTAGGACTCTATTGTAATAAAGTATTTT:1	TAGGGCAGATTTTCCATATTTG	CTCTATTGTAATAAAGTATTTT	-	chr2L	19560916	-	chr2L	19560838	78	+	chr2L	19560838	+	chr2L	19560916
AAGCTATATAGAATATAACAACATGTAAGTAAAAGCTACTTAAATTAGGTGTATGATTTTTTTCACTACTTTGGT:1	AAGCTATATAGAATATAACAAC	TGATTTTTTTCACTACTTTGGT	+	chr3R	22797918	+	chr3R	22798014	96	+	chr3R	22797918	+	chr3R	22798014
TACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTGGNGTAGAGGAGAGTGG:1	TACCAGAAATTTGTGTAAGCGC	ATTCTGGNGTAGAGGAGAGTGG	+	chr2L	12861731	+	chr2L	12863180	1449	+	chr2L	12861731	+	chr2L	12863180
CAGTTTGTTGCTACCAAATGGGTAGTTTCCATTCAAAACATTCTATTAGGGGGAAACCGAAAATTTCTTCCTTGA:1	CAGTTTGTTGCTACCAAATGGG	AAACCGAAAATTTCTTCCTTGA	+	chr2L	6458592	+	chr2L	6458673	81	+	chr2L	6458592	+	chr2L	6458673
TGCTAGTTGATACTTTGACCTTTCACCCAACCAAAAGTCCACCCAGTTCAGCAAAGTTCGAACAGCCCG:1	TGCTAGTTGATACTTTGACCTT	TCAGCAAAGTTCGAACAGCCCG	-	chr3L	3912557	-	chr3L	3912487	70	+	chr3L	3912487	+	chr3L	3912557
GCGTTGACCCGAAAAAAGTAGAACACACATTGTCAGAGGGATTATGG:1	GCGTTGACCCGAAAAAAGTAGA	CACATTGTCAGAGGGATTATGG	+	chr3L	5926345	+	chr3L	5926507	162	+	chr3L	5926345	+	chr3L	5926507
TAACTTTGTTCTATAGAATATAACCATTATAAGTTTTAGATATATTCTCCATGCTTTCCGACACTTAAGGATCG:1	TAACTTTGTTCTATAGAATATA	GCTTTCCGACACTTAAGGATCG	+	chr3L	8295814	+	chr3L	8295971	157	+	chr3L	8295814	+	chr3L	8295971
ATATTTATTAATCTGCATGCTTAATCTGAACCTTCTGATTTTTACTCAGGTCACAATTTGTTGTAATATAACACA:1	ATATTTATTAATCTGCATGCTT	CAATTTGTTGTAATATAACACA	-	chr3R	29240580	-	chr3R	29240496	84	+	chr3R	29240496	+	chr3R	29240580
ACAACAAGTAGAGATTACCCGAGATTAATTTGCGGTTTAGTTTTTACTAACTGTAGAAAGTCTACAGGAAAT:1	ACAACAAGTAGAGATTACCCGA	CTGTAGAAAGTCTACAGGAAAT	+	chr3R	29238788	+	chr3R	29238899	111	+	chr3R	29238788	+	chr3R	29238899
ACAGGAATGCATCGCGAATGCCACATCATCATGCCAATTAAATCAACATCGCATCATCATTTGGAGTCATTTTGG:1	ACAGGAATGCATCGCGAATGCC	TCATCATTTGGAGTCATTTTGG	-	chrX	12038289	-	chrX	12038095	194	+	chrX	12038095	+	chrX	12038289
TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGGTTGCGTTGTGTTGTG:1	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	TGTTGGGTTGCGTTGTGTTGTG	+	chr2L	16217660	+	chr2L	9084339	7133321	+	chr2L	16217660	+	chr2L	9084339
TCTATATAGGTGATTTCCAATCAGGAATCCCTTTCACTATGTAACCAGAAGGCATATTTAAGCTTAATGAAATGT:1	TCTATATAGGTGATTTCCAATC	ATATTTAAGCTTAATGAAATGT	-	chr3R	24974993	-	chr3R	24974914	79	+	chr3R	24974914	+	chr3R	24974993
TTGGCGACTAAATGGAGAAGATGGCGGCAGAGGGAGTATGCACTGAACGTAGTATTCAAGTCTCAGTAATGATGA:1	TTGGCGACTAAATGGAGAAGAT	ATTCAAGTCTCAGTAATGATGA	-	chr3L	21847550	-	chr3L	21847454	96	+	chr3L	21847454	+	chr3L	21847550
CAAGCTNCATGTAAAAGATTTTAAAGTGCAATTAAGGGATTGCATTGATGCAAAGAAGCGCACTGCGGTTCCAGT:1	CAAGCTNCATGTAAAAGATTTT	AGAAGCGCACTGCGGTTCCAGT	-	chr3R	31805210	-	chr3R	31805134	76	+	chr3R	31805134	+	chr3R	31805210
AGAGATAGGCACTCGGTCTGAAGTTGGAAAACAAAAAAAGAACACAAAACTCCTAGCCAAACAAAAAATGAAAG:1	AGAGATAGGCACTCGGTCTGAA	CTAGCCAAACAAAAAATGAAAG	-	chrX	11036475	-	chrX	11036361	114	+	chrX	11036361	+	chrX	11036475
GACGACCTTGTATGTCAAGAAATTCCTTTTTCCGAGAAAGCTGCCACCGGACGGACCGTCTTTGTAACGCCTGAT:1	GACGACCTTGTATGTCAAGAAA	GACCGTCTTTGTAACGCCTGAT	-	chr3R	15408116	-	chr3R	15407900	216	+	chr3R	15407900	+	chr3R	15408116
TCCCCTTAGTTTTCTGTGTAATATGCAAAAAAGTTTTTGGTTATCCTAACTAAAACAAATATTGACTGAGATCGA:1	TCCCCTTAGTTTTCTGTGTAAT	AACAAATATTGACTGAGATCGA	+	chr2L	17819933	+	chr2L	17825137	5204	+	chr2L	17819933	+	chr2L	17825137
ACGGAAATTGCAATTTTATAAACAGTATATAAGGACAATTTGACGTAAACTAATTC:1	ACGGAAATTGCAATTTTATAAA	ACAATTTGACGTAAACTAATTC	-	chr3R	28017603	-	chr3R	12366927	15650676	+	chr3R	12366927	+	chr3R	28017603
TGACATATTCTGTATTATATATTCTATTTATGGGCAAAATATAAATATCATTTAGCCATTTTTTGTGAACATAT:1	TGACATATTCTGTATTATATAT	TAGCCATTTTTTGTGAACATAT	+	chr3R	27725595	+	chr3R	27731036	5441	+	chr3R	27725595	+	chr3R	27731036
CAACACACACGCACACACAGGATGAGGGGCGGGGGAGG:1	CAACACACACGCACACACAGGA	ACAGGATGAGGGGCGGGGGAGG	+	chr3L	1746591	+	chr3L	10855439	9108848	+	chr3L	1746591	+	chr3L	10855439
AATAGGAAATGTGTGAACGGCGAGGTTCATATATTTTTCTAAATATATATTCTATTGAATTGCTACAAGCGGAA:1	AATAGGAAATGTGTGAACGGCG	TATTGAATTGCTACAAGCGGAA	-	chr3L	11145633	-	chr3L	11145544	89	+	chr3L	11145544	+	chr3L	11145633
TAAGTTTCCCAGCCCAACATACATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCCCGAACGCCAATCACCAAGCCCAAAT:1	TAAGTTTCCCAGCCCAACATAC	ACGCCAATCACCAAGCCCAAAT	+	chr2R	24490149	+	chr2R	24488267	1882	+	chr2R	24490149	+	chr2R	24488267
GTNTTCCCATTGAATCAAGTATCTGTTANTTCTCNANTGAAATTGAAACTACTAGGACATAGATTAAAATGCAAA:1	GTNTTCCCATTGAATCAAGTAT	AGGACATAGATTAAAATGCAAA	+	chr2L	19703549	+	chr2L	19712685	9136	+	chr2L	19703549	+	chr2L	19712685
ATGTATTTAACAATAATGTCTCATTTTTCTTTGCAGTGTACTTTAAAAAATACGAGNGCATATGTAAATTGA:1	ATGTATTTAACAATAATGTCTC	TACGAGNGCATATGTAAATTGA	-	chr3R	12733943	-	chr3R	12733866	77	+	chr3R	12733866	+	chr3R	12733943
TAGGGCTGGGGAATGTATGTACGCATGTACAGCAACGAATCATCTATTAAGATTGATTGGTTTTGGTATGCAAAT:1	TAGGGCTGGGGAATGTATGTAC	TGATTGGTTTTGGTATGCAAAT	+	chr2L	18898428	+	chr2L	18898510	82	+	chr2L	18898428	+	chr2L	18898510
GAGACGTAACGAGGCGAACACTAGCCACCACCCGAATAAGGTAAGCATTTTAATCATATTCAGTATTGATTTCTT:1	GAGACGTAACGAGGCGAACACT	TCATATTCAGTATTGATTTCTT	-	chr2R	18289553	-	chr2R	18289451	102	+	chr2R	18289451	+	chr2R	18289553
AACCCCTCGTTCTCTAGTATCATCAGGGCAAGCGTTAAAATGAGTCAGAAACTTTGCATTCGATGGAGAAGGGGG:1	AACCCCTCGTTCTCTAGTATCA	TTGCATTCGATGGAGAAGGGGG	+	chrX	16176192	+	chrX	16176269	77	+	chrX	16176192	+	chrX	16176269
GTGTCCCAATCATAATCAAAAAAGGTTCGCCCACGACCTCCACAGCTCAATCAAGAGGCATNGACTAAAGGCTTA:1	GTGTCCCAATCATAATCAAAAA	AGAGGCATNGACTAAAGGCTTA	-	chr2L	12963922	-	chr2L	12963820	102	+	chr2L	12963820	+	chr2L	12963922
TTTCGGTTTCGGTTTTTCAGGGGGTTCTGCTCCGCTCTGATCCAAAGTCTCCCCTTGATTATTCATTCATG:1	TTTCGGTTTCGGTTTTTCAGGG	TCCCCTTGATTATTCATTCATG	+	chr3L	2895893	+	chr3L	2895973	80	+	chr3L	2895893	+	chr3L	2895973
TCCTATCAAATTAGATATTACAACTTTTGCTTATAAGTTAGAATTATAACTCCATATTTCAATGTTAAAATGTAT:1	TCCTATCAAATTAGATATTACA	ATATTTCAATGTTAAAATGTAT	-	chr3R	18269127	-	chr3R	18268992	135	+	chr3R	18268992	+	chr3R	18269127
GATGACGTTTATGAGGCATTGCCTTTGTCTTGTGGAATGTGGAACACCAACAATTATTGAAATGATCAATTCAGG:1	GATGACGTTTATGAGGCATTGC	TTATTGAAATGATCAATTCAGG	+	chr2L	14180067	+	chr2L	14180143	76	+	chr2L	14180067	+	chr2L	14180143
TGGGTAGATGGTTCTTCAAAATATCTCATCACCGTACATAGGTTACTATGAGTTTAACAATGGAAGAACCAGTAA:1	TGGGTAGATGGTTCTTCAAAAT	TTAACAATGGAAGAACCAGTAA	+	chr2R	22729466	+	chr2R	22729674	208	+	chr2R	22729466	+	chr2R	22729674
TACTTGTGTGCAGTTACTATCGAGGCGACTTGGAAAAGTTCCTCCTCTGGCGGAGTGGCCATATGCAATT:1	TACTTGTGTGCAGTTACTATCG	GGCGGAGTGGCCATATGCAATT	+	chr3R	28478438	+	chr3R	28478514	76	+	chr3R	28478438	+	chr3R	28478514
ATAGAATTCAAATAGAGTGCGTAAGTGGACAAGAATAAAANATTTCACAGCTTTGAGAATAATCTTCANATGC:1	ATAGAATTCAAATAGAGTGCGT	TTTGAGAATAATCTTCANATGC	-	chr3R	28393813	-	chr3R	28393715	98	+	chr3R	28393715	+	chr3R	28393813
ATTCCTGCTTATTTGCCTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	ATTCCTGCTTATTTGCCTTTGT	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	13033226	+	chr2L	16217660	3184434	+	chr2L	13033226	+	chr2L	16217660
TCTTGAAGAAATGGAAAAAGCGTTTGTACCTAGTAAATAAATAGAAGGCTTACATTTTAATGATATATATAATAT:1	TCTTGAAGAAATGGAAAAAGCG	ATTTTAATGATATATATAATAT	-	chr3R	24665580	-	chr3R	24665403	177	+	chr3R	24665403	+	chr3R	24665580
TTTTAAGAACGANAGCCACAGACGCACACANANGGGACNCCAATAAAAACCAATTTATGAAGCATGCTTCTCA:1	TTTTAAGAACGANAGCCACAGA	AATTTATGAAGCATGCTTCTCA	-	chr2R	22351483	-	chr2R	22349701	1782	+	chr2R	22349701	+	chr2R	22351483
CAACGCAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	CAACGCAACGCAACACAACACA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	8339246	+	chr3R	21907535	13568289	+	chr3R	8339246	+	chr3R	21907535
AGCCCCTTCTAAGCCAATTCAGTCAGCCAATTCACCGTCATTGTTGATATAACAGCAATTATGCTAATCAGTTTG:1	AGCCCCTTCTAAGCCAATTCAG	AGCAATTATGCTAATCAGTTTG	+	chr3L	1219596	+	chr3L	1227329	7733	+	chr3L	1219596	+	chr3L	1227329
CAAAACAAACTGTTGCTGGTGGCCCAAACGCACTGGCCAACTTGGCGACTGAGAGTAAAAAGCGAAAAGCGCACA:1	CAAAACAAACTGTTGCTGGTGG	AGTAAAAAGCGAAAAGCGCACA	+	chr3L	8285469	+	chr3L	8285576	107	+	chr3L	8285469	+	chr3L	8285576
GCATCGATGAGTGGTGAAAAAAAGTGGTTTTAGTTGCAGGTGGAAAATTNAAATTTCATGCAAAAAAATCGAGCA:1	GCATCGATGAGTGGTGAAAAAA	TTTCATGCAAAAAAATCGAGCA	-	chr2R	17983033	-	chr2R	17982948	85	+	chr2R	17982948	+	chr2R	17983033
AAATGTTATTTCTTTAACTTTAGTTAAGTTTTAAATGAAGGCAACTTGTTAGCAAATTTAGTGTATTTGTAAAAA:1	AAATGTTATTTCTTTAACTTTA	AAATTTAGTGTATTTGTAAAAA	+	chr2L	14684135	+	chr2L	14684219	84	+	chr2L	14684135	+	chr2L	14684219
AAGCCCATAAATAATTAAAGTTCGACTTATTTCCGATTTANTAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTNCTG:1	AAGCCCATAAATAATTAAAGTT	CACTACTTGAATGAATCTNCTG	-	chr3R	25828321	-	chr3R	25828568	247	+	chr3R	25828568	+	chr3R	25828321
CTTTTAATGCTTGACAAAACTTTAAATTTCCAACTTAGGACATGGTGAAGACCCCTTACATTTTGCATACTGAT:1	CTTTTAATGCTTGACAAAACTT	CCCTTACATTTTGCATACTGAT	-	chr3L	22169575	-	chr3L	22169483	92	+	chr3L	22169483	+	chr3L	22169575
GTCTTCCTTTTCTTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGAGTTTTT:1	GTCTTCCTTTTCTTTTCTGTGT	GTGTGTGTGTGTGTGAGTTTTT	+	chr2L	2510359	+	chr2L	12296786	9786427	+	chr2L	2510359	+	chr2L	12296786
AACTTGTGAGCGATATTAAACAATTTAAGCAGCCACCGCGTTTTCGCCTTGCTGGCAAAATATTAATGCTGCAT:1	AACTTGTGAGCGATATTAAACA	TGGCAAAATATTAATGCTGCAT	+	chr2R	15276812	+	chr2R	15276898	86	+	chr2R	15276812	+	chr2R	15276898
ATAGGAAGTAATAATCTTTGTTTCCAAAACCAGTCTGAGTCCTACCTTTCCATTGCTCTTAGAGCTATCACCACC:1	ATAGGAAGTAATAATCTTTGTT	TGCTCTTAGAGCTATCACCACC	-	chrX	19594045	-	chrX	19593960	85	+	chrX	19593960	+	chrX	19594045
TCCTGCCAGCGAAACCCGACCAAAGCCACGCCCCAATGCCCCCCAGCCATCCACACATGCGGCTGGGTAATTT:1	TCCTGCCAGCGAAACCCGACCA	CACACATGCGGCTGGGTAATTT	-	chr2L	11615561	-	chr2L	11614068	1493	+	chr2L	11614068	+	chr2L	11615561
TTATTTAATTTCACCAGTATTAGAGTGCTCTCCACATTGCAAATNTTCAGTGAAGAAT:1	TTATTTAATTTCACCAGTATTA	TTGCAAATNTTCAGTGAAGAAT	-	chr3R	15892747	-	chr3R	15892683	64	+	chr3R	15892683	+	chr3R	15892747
ATCAACATGACAAACAAACGGGCGAAAACGCAAAAAACGAACGAAAAAATCTCGTGAAAAGGAAGTGAAAAGAAA:1	ATCAACATGACAAACAAACGGG	GTGAAAAGGAAGTGAAAAGAAA	+	chr3R	16406622	+	chr3R	23236465	6829843	+	chr3R	16406622	+	chr3R	23236465
ATTGTTATTATTTTTCCGGCAGCGTTTTTGTTTCTGCATCTGTCTGTAGTTGTG:1	ATTGTTATTATTTTTCCGGCAG	TCTGCATCTGTCTGTAGTTGTG	+	chr3L	13707851	+	chr3L	13707906	55	+	chr3L	13707851	+	chr3L	13707906
TGTACGAAATATTATAAACTGATAAGGTGCCTATATTTCATCTTTCACGCTCTTTTCCCTGCCATTTCTGCTTCT:1	TGTACGAAATATTATAAACTGA	TTTCCCTGCCATTTCTGCTTCT	+	chrX	2194316	+	chrX	15298807	13104491	+	chrX	2194316	+	chrX	15298807
TGAGCGAGTATAATATAAATACAAATAAATTTCGCACATAACTTGGCGTGAATCAAACTAAACAGTCACCGAGA:1	TGAGCGAGTATAATATAAATAC	TCAAACTAAACAGTCACCGAGA	+	chr2R	21159006	+	chr2R	21159087	81	+	chr2R	21159006	+	chr2R	21159087
ATGACATTTGGCCTGATTAGATTTGCTTGCAGCAGTTTAACTAAGAGCCAAGTCGATGCGGGACTTCTTTAAGG:1	ATGACATTTGGCCTGATTAGAT	TCGATGCGGGACTTCTTTAAGG	+	chr3R	7857649	+	chr3R	7857731	82	+	chr3R	7857649	+	chr3R	7857731
AACTCGATATGTTGGATACGTAGTTCCCGCATCCTCGTCATCCACACCCTATATCCACTTTGACAGAGCCAATAA:1	AACTCGATATGTTGGATACGTA	TCCACTTTGACAGAGCCAATAA	-	chr3R	11175326	-	chr3R	11174612	714	+	chr3R	11174612	+	chr3R	11175326
TCTCTGCAATCTCGTATCNTGCGAATGCAACACTATCTGTCNGTTNGCGATGCCATCTATACTAATATACTGCG:1	TCTCTGCAATCTCGTATCNTGC	CCATCTATACTAATATACTGCG	+	chr2L	19357552	+	chr2L	19357641	89	+	chr2L	19357552	+	chr2L	19357641
GACAGACGCCCGTTGTCTCTGGTGGAAAAGTGGAGGTGGAAAATAGCAAAGGGGGGGGAAAATGTGGTGA:1	GACAGACGCCCGTTGTCTCTGG	AAGGGGGGGGAAAATGTGGTGA	-	chr2R	12503862	-	chr2R	12501705	2157	+	chr2R	12501705	+	chr2R	12503862
ACCTGCCTCCCGTTGAGGAGTCGGCTTCTGATGCTGTTGCCGTCGAGACTCCCCTG:1	ACCTGCCTCCCGTTGAGGAGTC	TGTTGCCGTCGAGACTCCCCTG	+	chr3L	4897756	+	chr3L	4897517	239	+	chr3L	4897756	+	chr3L	4897517
TATAGCGCTAACTAAAGCCGCTTGCTGCCCCAAAACCACACAAATAAAAAATAAAAATAAAAAGA:1	TATAGCGCTAACTAAAGCCGCT	ATAAAAAATAAAAATAAAAAGA	+	chrX	14741009	+	chrX	8005856	6735153	+	chrX	14741009	+	chrX	8005856
CTATATCTTTATATGATTTGTCTGCTGCGCTGTGGTCCTGAAGTTGTTTAGCTAACGTAAANGTGGCA:1	CTATATCTTTATATGATTTGTC	TTTAGCTAACGTAAANGTGGCA	-	chr3L	10746786	-	chr3L	8724624	2022162	+	chr3L	8724624	+	chr3L	10746786
CATTGCAATCGTTTTACCTTGATTGCGGACGCGAAAATTTAGAGTTGTTGCTTT:1	CATTGCAATCGTTTTACCTTGA	GAAAATTTAGAGTTGTTGCTTT	-	chr3R	14410456	-	chr3R	25182266	10771810	+	chr3R	25182266	+	chr3R	14410456
TGTACTCAGATACCAAGTAAACAGATATTCATACCTCAAAGCACTTTGTGATTCCCAATTTGTTTANAGGCTTTG:1	TGTACTCAGATACCAAGTAAAC	CCCAATTTGTTTANAGGCTTTG	+	chrX	6003309	+	chrX	6003390	81	+	chrX	6003309	+	chrX	6003390
TCAGTGGAGCCGCCATCACCTACCGCAATTTGAAACAACAAAATACCAANAAACTCAAAGGGCTGGTCGACGTCC:1	TCAGTGGAGCCGCCATCACCTA	CTCAAAGGGCTGGTCGACGTCC	-	chr3R	12736383	-	chr3R	20463013	7726630	+	chr3R	20463013	+	chr3R	12736383
TTTTGTGCTCCCATACAAATATATGCAGTTTTAAAGCCCTCTCTATTGCACTTCCCTANTTTTC:1	TTTTGTGCTCCCATACAAATAT	CTATTGCACTTCCCTANTTTTC	-	chr3L	3606632	-	chr3L	3601332	5300	+	chr3L	3601332	+	chr3L	3606632
ATCCATTTCATTATCATTGCGCCAGATTGACTACTACATAATATGTATATATGTATATATAAGACTTGATCTCGC:1	ATCCATTTCATTATCATTGCGC	TATATATAAGACTTGATCTCGC	-	chr3R	24212321	-	chr3R	24207245	5076	+	chr3R	24207245	+	chr3R	24212321
TGTTGTAAATTCCAATCAAGTGGTTGCGGTCTAATCAATACCTAGAGCCACTTGTTTGTTCGTTCAGTCGAAG:1	TGTTGTAAATTCCAATCAAGTG	TTGTTTGTTCGTTCAGTCGAAG	+	chr3R	4913754	+	chr3R	4913843	89	+	chr3R	4913754	+	chr3R	4913843
GTGCCACCTGATGAAACACAGATATCCAATCAAGAGCAACAACAATTTCACACCTTTGCACCGTTAGAGAGGGGA:1	GTGCCACCTGATGAAACACAGA	CTTTGCACCGTTAGAGAGGGGA	+	chr3R	31691561	+	chr3R	31696327	4766	+	chr3R	31691561	+	chr3R	31696327
GAGGAGGAGCTGTGGATCCGGATAGTGCTCAACAAGGTGGGCACTGCTTTAAAGTGCGGTCACTGATTGGAGTG:1	GAGGAGGAGCTGTGGATCCGGA	AGTGCGGTCACTGATTGGAGTG	+	chr3L	6372145	+	chr3L	6372229	84	+	chr3L	6372145	+	chr3L	6372229
TGTAATTCAAAACCAAACAAAACCGTCGAGGAATCAAAAGGCAAAGCGATGGCAAATTACAGCGTTACAGTTGCA:1	TGTAATTCAAAACCAAACAAAA	AAATTACAGCGTTACAGTTGCA	+	chr2R	8015679	+	chr2R	8017702	2023	+	chr2R	8015679	+	chr2R	8017702
CTTTTTGCTCTGTGCGCTTTTCGCTTTTTACTCTCAGTCGCCAAGTTGGCCAGTGCGTTTGG:1	CTTTTTGCTCTGTGCGCTTTTC	CCAAGTTGGCCAGTGCGTTTGG	-	chr3L	8285586	-	chr3L	8285492	94	+	chr3L	8285492	+	chr3L	8285586
CGCAGTTACAAAAAACAAAAAAAACGTAATTCTTAAAGAA:1	CGCAGTTACAAAAAACAAAAAA	AAAAAACGTAATTCTTAAAGAA	-	chr2L	16574297	-	chr2L	8739763	7834534	+	chr2L	8739763	+	chr2L	16574297
TTTTGTATTATTTATTTTATGTTCGTAAACGATGTTGTATTCAAGTGCTGCCGTTTTTTGCATTACTTCAATGAG:1	TTTTGTATTATTTATTTTATGT	TTTTTTGCATTACTTCAATGAG	+	chr2R	12093972	+	chr2R	12094085	113	+	chr2R	12093972	+	chr2R	12094085
AGGGTATTTAATGTACAGTACTATCAAATTCGGCCAGTCTTCTTAGCTTTTATTCAGTTTTGTTCCTNTTTGGTG:1	AGGGTATTTAATGTACAGTACT	TCAGTTTTGTTCCTNTTTGGTG	+	chr2R	21809543	+	chr2R	21817783	8240	+	chr2R	21809543	+	chr2R	21817783
AATCTAGGAAGAACTTTAATAGAATTTATCCATTTGTAGAACACCCAGAAGCCCCGCAACGNGCTCCACTCACTG:1	AATCTAGGAAGAACTTTAATAG	CCGCAACGNGCTCCACTCACTG	-	chr2L	8510232	-	chr2L	8510143	89	+	chr2L	8510143	+	chr2L	8510232
AGTGCGCATGTCGCCTGTATTCGAATTCGATTCTGGTTCTGGTTTTGGTTT:1	AGTGCGCATGTCGCCTGTATTC	ATTCTGGTTCTGGTTTTGGTTT	+	chr3R	15991963	+	chr3R	15992017	54	+	chr3R	15991963	+	chr3R	15992017
TGAGGAATCCCTGTCCAATCTCGCTATCTTCCNTTGTGTGTCCACGCTGCATAGATAATGTCAAAT:1	TGAGGAATCCCTGTCCAATCTC	CGCTGCATAGATAATGTCAAAT	-	chrX	17282953	-	chrX	17282884	69	+	chrX	17282884	+	chrX	17282953
GCAATAGTTTATTAAGATATCAAGACTTTCTCCTTTCTTTTAAGAGCTTTGTGTTTCCCGTTTTCCAAATTTTAG:1	GCAATAGTTTATTAAGATATCA	TTTCCCGTTTTCCAAATTTTAG	-	chr3R	5627160	-	chr3R	5627044	116	+	chr3R	5627044	+	chr3R	5627160
TTTGTTTCGTATCATTCTGGGCAACATGGATTTATGAATTCAAATTCNAGTGCCATTTGTANATCAAATTCTGAC:1	TTTGTTTCGTATCATTCTGGGC	CATTTGTANATCAAATTCTGAC	+	chr2L	1828932	+	chr2L	1829009	77	+	chr2L	1828932	+	chr2L	1829009
GACCAAAAATATCCACNTATTCGNATTATCCACNTTGTNGACTATTGGGTTGTGCGGTTGCANTGTGCAGAT:1	GACCAAAAATATCCACNTATTC	TGTGCGGTTGCANTGTGCAGAT	+	chr3L	5030784	+	chr3L	5030857	73	+	chr3L	5030784	+	chr3L	5030857
GGGTGAACAAAATGTGCTTTTCATCTGCCTTTAAGTTTATGCATTGCAGTTTTTCGCTTTAATTACNGCAAAA:1	GGGTGAACAAAATGTGCTTTTC	TTTCGCTTTAATTACNGCAAAA	-	chr2L	9297460	-	chr2L	9297385	75	+	chr2L	9297385	+	chr2L	9297460
TTTAGAAATTGATATGTAAACAACTTTATACAAATTTCACTAGAAGGTAGATACGAATGCGA:1	TTTAGAAATTGATATGTAAACA	TAGAAGGTAGATACGAATGCGA	+	chr2L	6740762	+	chr2L	6740836	74	+	chr2L	6740762	+	chr2L	6740836
AGTTATCTTTTGGTTTTGCTTTCTATTTCTCAGAAAATCTTCTAATGCATCATAAATGTATACTCATAAAATTCG:1	AGTTATCTTTTGGTTTTGCTTT	AAATGTATACTCATAAAATTCG	+	chr2L	7088889	+	chr2L	7089090	201	+	chr2L	7088889	+	chr2L	7089090
GGCGCAAAGGTTGGCCAGGAAAAGGGGGCGTGGCAAGGGGTTCCACTCGAGTGCGAAAAAAGCGGCTTTTGTTTC:1	GGCGCAAAGGTTGGCCAGGAAA	CGAAAAAAGCGGCTTTTGTTTC	+	chr2L	1340651	+	chr2L	934017	406634	+	chr2L	1340651	+	chr2L	934017
ATTTGATGGGAAACTTACATTGTCAAAGAGCGTTTTCTGATAAATTGTTTCAAAGTTCAAAGTTTTCCACAAATC:1	ATTTGATGGGAAACTTACATTG	AGTTCAAAGTTTTCCACAAATC	+	chr3L	17580585	+	chr3L	17580761	176	+	chr3L	17580585	+	chr3L	17580761
TTAACATTTTTTTAAAATAATCGAGATCTTCTGGTACAATCTCCAGCCCAAAAAGATCAGCGATCCACAGACGCA:1	TTAACATTTTTTTAAAATAATC	AGATCAGCGATCCACAGACGCA	+	chr3R	23536973	+	chr3R	23537155	182	+	chr3R	23536973	+	chr3R	23537155
TGCTAACTGGCACTAGTATTGTGGCCACAGGTGTGCGCACGAGAATAGTCATCGCAATGGTGGCTCACAAGTGAA:1	TGCTAACTGGCACTAGTATTGT	GCAATGGTGGCTCACAAGTGAA	-	chrX	15417382	-	chrX	15413080	4302	+	chrX	15413080	+	chrX	15417382
AGAAATAGTAATAGATATTTTTAAATGTATTGATTAAAGAATATAGAAAATATTTTGGTAAGCTGTNGGGTATTT:1	AGAAATAGTAATAGATATTTTT	TTTGGTAAGCTGTNGGGTATTT	-	chrX	15248361	-	chrX	15248285	76	+	chrX	15248285	+	chrX	15248361
ACTGCTGACTTATTCAATAAGCCAAGTTGAAGTATGCTCCATTATATATNTGGTGGAGGTGCCTTCTCGAGTCTG:1	ACTGCTGACTTATTCAATAAGC	TGGAGGTGCCTTCTCGAGTCTG	-	chr3R	17636131	-	chr3R	25348072	7711941	+	chr3R	25348072	+	chr3R	17636131
TTATTTGTATTCACAATTTCCCTTATTATTCCGNGATATGAAAAATCATTTAATGATNAAAAAAC:1	TTATTTGTATTCACAATTTCCC	AATCATTTAATGATNAAAAAAC	-	chr3R	6121385	-	chr3R	6121177	208	+	chr3R	6121177	+	chr3R	6121385
AAAAAAAAAGAAGGAAAATTAAGCCCCTCGAAAAAAGCGAAACTTTCNGGTTACGTTTGTAATTTTTNTTGT:1	AAAAAAAAAGAAGGAAAATTAA	TTACGTTTGTAATTTTTNTTGT	+	chr2L	13322423	+	chr2L	19595393	6272970	+	chr2L	13322423	+	chr2L	19595393
GTGAGGATGCCAACATTCTGAATGTAGCGGAGCTAAGGGTGTCAAGAGCAGCAGGAAAGCAGCAAACCAGATTGG:1	GTGAGGATGCCAACATTCTGAA	GGAAAGCAGCAAACCAGATTGG	-	chr2R	11588514	-	chr2R	16083231	4494717	+	chr2R	16083231	+	chr2R	11588514
ATCAAAGATACATTTTATATATGTATCTAACAGCGTTGAAATGTTATACGAATAGTATAGGGTATGAGCTGGGTG:1	ATCAAAGATACATTTTATATAT	AGTATAGGGTATGAGCTGGGTG	+	chr3L	18406150	+	chr3L	18406226	76	+	chr3L	18406150	+	chr3L	18406226
GGAAAATCCCCCAACAGGCCCCACTAACTAAGGTAGACGGTCGACAACGACAACTAATGAGTTCCTAATTTAAAT:1	GGAAAATCCCCCAACAGGCCCC	CTAATGAGTTCCTAATTTAAAT	+	chr2R	21902636	+	chr2R	21902713	77	+	chr2R	21902636	+	chr2R	21902713
CACATTTTTTGCTCTTGTCTCTTTCCGAAAACTTTTCGTCTCACTTTGTTTCGCCAAGTTGCCATGTCATTGTG:1	CACATTTTTTGCTCTTGTCTCT	GCCAAGTTGCCATGTCATTGTG	+	chr2L	12759239	+	chr2L	12759333	94	+	chr2L	12759239	+	chr2L	12759333
CATTTAAGATACTATTTTAAAATATTAATAATGACAATATTTTTCCGAATAAAATTTGGAAGCTAAGNTACGA:1	CATTTAAGATACTATTTTAAAA	AAATTTGGAAGCTAAGNTACGA	-	chr3L	17035129	-	chr3L	17034943	186	+	chr3L	17034943	+	chr3L	17035129
CAGCTTGTCATGCTTATGGCACACGCTCCANNNGNAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACA:1	CAGCTTGTCATGCTTATGGCAC	AACACAAACACAAACACAAACA	+	chr3L	8031622	+	chr3L	11777678	3746056	+	chr3L	8031622	+	chr3L	11777678
GCAGCCCGCAGCTAAGAAGAACCCCAAAAGTGTGAATCACAAAAGTTTGGGCCACTGGGTGGCTGGG:1	GCAGCCCGCAGCTAAGAAGAAC	TTTGGGCCACTGGGTGGCTGGG	-	chr3R	25576941	-	chr3R	25576850	91	+	chr3R	25576850	+	chr3R	25576941
AAAAACCTGCCACCGGAAAATTGACAGCACCGGCACANCAGCTGTCTTCAGTGACAAGCTGTCG:1	AAAAACCTGCCACCGGAAAATT	TGTCTTCAGTGACAAGCTGTCG	-	chr3R	15811757	-	chr3R	15811527	230	+	chr3R	15811527	+	chr3R	15811757
ATTAGAGAAACTGAAAATTTCCCCCGGTCTACAACTCTCAATGAAGGTCTGCTGATTCCAGCACCTGACATACT:1	ATTAGAGAAACTGAAAATTTCC	TGATTCCAGCACCTGACATACT	-	chr3L	9084498	-	chr3L	9076939	7559	+	chr3L	9076939	+	chr3L	9084498
GTCCCGTCAACTTCATTTAAACGGAAATATTTCGCAGATTTCTCTGTGCGCAGCCCAGATCTTGTGAACTCAAAT:1	GTCCCGTCAACTTCATTTAAAC	CCCAGATCTTGTGAACTCAAAT	+	chr2R	15752899	+	chr2R	15752978	79	+	chr2R	15752899	+	chr2R	15752978
AAAAAAACAATTGCAATACAGAAAATAGAGAGGGGGCGAGTGTTGTCTATGAGTTATAGCTCTTCAA:1	AAAAAAACAATTGCAATACAGA	TCTATGAGTTATAGCTCTTCAA	-	chr3R	5571315	-	chr3R	22109395	16538080	+	chr3R	22109395	+	chr3R	5571315
CAGCAACTAAAGGTAATGTGATTCCATGTTTATGCATGTACACTCCTCAAATTGGCTACCACTTCAGTCATTTCC:1	CAGCAACTAAAGGTAATGTGAT	GGCTACCACTTCAGTCATTTCC	-	chr2L	11538907	-	chr2L	11538822	85	+	chr2L	11538822	+	chr2L	11538907
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACAAAACACA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	CAACACAACAAAACAAAACACA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	17389054	4518482	+	chr3R	21907536	+	chr3R	17389054
GTTCTTTAATCAGAAGTAATATTATTAATGTTTAGATCCGCGTAGATACTTACCTTAGCAGTTCG:1	GTTCTTTAATCAGAAGTAATAT	AGATACTTACCTTAGCAGTTCG	+	chr2R	10203658	+	chr2R	10203733	75	+	chr2R	10203658	+	chr2R	10203733
TGGCGAGTTTTCTGCAAAAACGGAAAATTTAAGCTTCTATAATCTAATGTAGACGATAAATGAGTAGCTTTCAAT:1	TGGCGAGTTTTCTGCAAAAACG	CGATAAATGAGTAGCTTTCAAT	-	chr3L	22543008	-	chr3L	22542887	121	+	chr3L	22542887	+	chr3L	22543008
AAATAATAACTAATAGTTGGGCTAAAACTGTGGTTTTGGTACTCCGAATTCTTTCTAATGACCGACCATCCATCC:1	AAATAATAACTAATAGTTGGGC	TCTAATGACCGACCATCCATCC	-	chr2L	9264455	-	chr2L	9264355	100	+	chr2L	9264355	+	chr2L	9264455
AGTGACCCCCAAAAAAATGGGCGTGCAAATGCTGGAAATACGACAAACAAATAACGGTGNATAGAAGCTG:1	AGTGACCCCCAAAAAAATGGGC	AAATAACGGTGNATAGAAGCTG	-	chr3L	9999875	-	chr3L	25731458	15731583	+	chr3L	25731458	+	chr3L	9999875
AGCTACTTCTCCCAATTCTCCGATTCCGATCCTCCGCCAGAGAGCCCAAGCATCCAGAATA:1	AGCTACTTCTCCCAATTCTCCG	GAGAGCCCAAGCATCCAGAATA	-	chr3L	19426834	-	chr3L	19426770	64	+	chr3L	19426770	+	chr3L	19426834
ATAACTCTATACTCTACACTCGAGCAATGGCAATTTGCGTCGGTACGAATTTCACATTAGCCCCATGACATCTCT:1	ATAACTCTATACTCTACACTCG	ACATTAGCCCCATGACATCTCT	-	chr3L	9918994	-	chr3L	9918899	95	+	chr3L	9918899	+	chr3L	9918994
TAAAGCATTTCTTGAGATATGATTTCTGTAAAAATACTAACTTCAAATGGTAAAAGAGCATCTAGACTTCAA:1	TAAAGCATTTCTTGAGATATGA	TAAAAGAGCATCTAGACTTCAA	-	chr3R	18610760	-	chr3R	18606531	4229	+	chr3R	18606531	+	chr3R	18610760
AACAGCAGGTGCAGGTAGAGCGGAGATGTTGGGAGAAAAATTCAGCTCTNTAGCACGATTTTAAATATTAACAGA:1	AACAGCAGGTGCAGGTAGAGCG	CACGATTTTAAATATTAACAGA	-	chr2R	8657818	-	chr2R	8657741	77	+	chr2R	8657741	+	chr2R	8657818
GTATAAAACAAGTGCACTAAATGCTTTAAAATTCCGTCTCATATTACGCATACGCACTGGTGTCTAGCCTTCG:1	GTATAAAACAAGTGCACTAAAT	ACGCACTGGTGTCTAGCCTTCG	+	chr2L	12256810	+	chr2L	15646020	3389210	+	chr2L	12256810	+	chr2L	15646020
CTTAGACTGATGAGTTGTCCTATTTGAAACCGAAAGCTCATTAGTTTTTTCTCTAAGTTTATTTGTATTTTTCCT:1	CTTAGACTGATGAGTTGTCCTA	TAAGTTTATTTGTATTTTTCCT	-	chr3L	20266422	-	chr3L	20266573	151	+	chr3L	20266573	+	chr3L	20266422
AAGCACTACTCAAAAGACAAAACCTTCAGGTTGGAATCCCGGC:1	AAGCACTACTCAAAAGACAAAA	ACCTTCAGGTTGGAATCCCGGC	-	chr3L	15655298	-	chr3L	15654884	414	+	chr3L	15654884	+	chr3L	15655298
GCCCCTCCCCCGTCTATTTTCCATCTCAAATGGAAATCCTCAGCACGGGATTTGGCTGCTGAATACGAAG:1	GCCCCTCCCCCGTCTATTTTCC	GATTTGGCTGCTGAATACGAAG	-	chr2L	597175	-	chr2L	597298	123	+	chr2L	597298	+	chr2L	597175
GCCAGGTGCAAAACGAAACGTGTGGATATATCGAAGTGTTTGGTGGGGGCTAGGAACTGGCCACTGGAAA:1	GCCAGGTGCAAAACGAAACGTG	GCTAGGAACTGGCCACTGGAAA	+	chr3L	10417579	+	chr3L	10417651	72	+	chr3L	10417579	+	chr3L	10417651
GAACAATGGGATGCTTCAAGTTGAAAACTACCCCGTCGATTGTCATGGGTAATAGTCGG:1	GAACAATGGGATGCTTCAAGTT	GATTGTCATGGGTAATAGTCGG	-	chr3R	5897334	-	chr3R	5896991	343	+	chr3R	5896991	+	chr3R	5897334
CAGCAATAGTGCTGTAAAGGTGCTCGATGTCTGGATGGCAGCAAATAT:1	CAGCAATAGTGCTGTAAAGGTG	ATGTCTGGATGGCAGCAAATAT	-	chr3R	19136510	-	chr3R	19133915	2595	+	chr3R	19133915	+	chr3R	19136510
GGGATGAAGGCAACCACACAACGCATTACACAAACACACACATGTCCACGCAATGCAATGTGTGTANTGAT:1	GGGATGAAGGCAACCACACAAC	GCAATGCAATGTGTGTANTGAT	-	chrX	10803123	-	chrX	10803042	81	+	chrX	10803042	+	chrX	10803123
GAATTTAGAACTTGTTTTCACACAGATCACAAGCTAATGATTTATTGTATGATTAAACAGGAAGATATTTAGCGA:1	GAATTTAGAACTTGTTTTCACA	TAAACAGGAAGATATTTAGCGA	+	chr3L	6866550	+	chr3L	6866631	81	+	chr3L	6866550	+	chr3L	6866631
GTTACTAACAACCAACTGGTTTGGAATTAAAACCCACTTTCTGTGACAAAATCATCCCTATTCTGGCATTTAACG:1	GTTACTAACAACCAACTGGTTT	ATCCCTATTCTGGCATTTAACG	+	chr2L	3888833	+	chr2L	5543984	1655151	+	chr2L	3888833	+	chr2L	5543984
AGTAATTGAAGTTGACAGCTAAGTTTAAAGCAGCTTCCTGCGTAAATGGGTTTCAGTTTTCACACTTTGGC:1	AGTAATTGAAGTTGACAGCTAA	GTTTCAGTTTTCACACTTTGGC	-	chr3R	27041921	-	chr3R	27041835	86	+	chr3R	27041835	+	chr3R	27041921
TCCCGGCAGTGAAAAAGCAAGGGGTTAACACTTAAAGGTTGGAAAATTATAAATGAAAATTCCAAAAGTGCCGAG:1	TCCCGGCAGTGAAAAAGCAAGG	TGAAAATTCCAAAAGTGCCGAG	-	chr2L	12264733	-	chr2L	12264642	91	+	chr2L	12264642	+	chr2L	12264733
GTCTCTCAAAAGCAGCGCCGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAG:1	GTCTCTCAAAAGCAGCGCCGGC	TACGAGATGGCTAAGCATCCAG	+	chr2R	12190102	+	chr2R	12187478	2624	+	chr2R	12190102	+	chr2R	12187478
TTTTCGGGGGAACAGCTTGAGGTGGGTGGATAACAAAATGTCAATAAAAATAAATACTGTTGACGCAG:1	TTTTCGGGGGAACAGCTTGAGG	AAAATAAATACTGTTGACGCAG	+	chr3L	5389000	+	chr3L	5447218	58218	+	chr3L	5389000	+	chr3L	5447218
CCCTGCCANTTGCCCACACTGGTCGACTGTCCAATTGNNNNATACGGATTCAATCAATCAANTATGCAACTGCCC:1	CCCTGCCANTTGCCCACACTGG	TCAATCAANTATGCAACTGCCC	+	chr3R	27619726	+	chr3R	27619841	115	+	chr3R	27619726	+	chr3R	27619841
GACCGCCGAGCCTCACAGTCTTTTGTCCTTAAATGGCCAGNTGTTNAGTGCTTAAAATATGCANGCTT:1	GACCGCCGAGCCTCACAGTCTT	AGTGCTTAAAATATGCANGCTT	+	chr3L	16875821	+	chr3L	16875925	104	+	chr3L	16875821	+	chr3L	16875925
TCCCAATCAGTTACACTTTTTTTGTAATGGTTATTGTATTGCGGACTATATGGGGATATTTGTTATGGGTATT:1	TCCCAATCAGTTACACTTTTTT	GGGGATATTTGTTATGGGTATT	-	chr3R	9875431	-	chr3R	9875353	78	+	chr3R	9875353	+	chr3R	9875431
TAACGAATGCATCAGAAGACACAACGATATCGCATATTAACTTACATATTGTTTTCGCA:1	TAACGAATGCATCAGAAGACAC	TAACTTACATATTGTTTTCGCA	-	chr2R	21188308	-	chr2R	21188243	65	+	chr2R	21188243	+	chr2R	21188308
CAATTTTCCACCGACTACAACGAATCCAATTAAAACCCGGTATATATTTATATATGTACCTTGCCTTCGAACTGT:1	CAATTTTCCACCGACTACAACG	ATGTACCTTGCCTTCGAACTGT	+	chr2L	10105298	+	chr2L	10105374	76	+	chr2L	10105298	+	chr2L	10105374
TCAGGTTACGTTCTATTATAATAATTATAATTACAATTACCATTACCATTCATATTTTATTCAGGTTCCCAACCA:1	TCAGGTTACGTTCTATTATAAT	ATTTTATTCAGGTTCCCAACCA	+	chr2L	7198012	+	chr2L	7198091	79	+	chr2L	7198012	+	chr2L	7198091
GCCGACGTGNGTTCGAGAGGAAATATGCACTGGCCGNAGGCTGGATAGGTACACCGCCAGTAAGAAATGCAACAA:1	GCCGACGTGNGTTCGAGAGGAA	CCGCCAGTAAGAAATGCAACAA	+	chr3R	6891248	+	chr3R	6891324	76	+	chr3R	6891248	+	chr3R	6891324
AATGTTCTTTAAAAGTTGGCTTTTTTGCCAATGTAATTCTTTTGAATAAACGATC:1	AATGTTCTTTAAAAGTTGGCTT	TAATTCTTTTGAATAAACGATC	-	chrX	21565493	-	chrX	21565435	58	+	chrX	21565435	+	chrX	21565493
GGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAGAGA:1	GGATGCTTAGCCATCTCGTACA	AGCCGGCGCTGCTTTTGAGAGA	-	chr2R	12187476	-	chr2R	12190103	2627	+	chr2R	12190103	+	chr2R	12187476
AGGTAGTACACCGCTGCGTATACCAAAGGGCTCGGGTCGTTACGGTCAAA:1	AGGTAGTACACCGCTGCGTATA	GGCTCGGGTCGTTACGGTCAAA	-	chr2L	10916654	-	chr2L	10916551	103	+	chr2L	10916551	+	chr2L	10916654
GCAGAACTCATTTAGCTTTGTTTTAAGCACTCACATATGCATATGCATAATCACAACGTTTTTTTCGTAACATTT:1	GCAGAACTCATTTAGCTTTGTT	CAACGTTTTTTTCGTAACATTT	+	chr3R	22335854	+	chr3R	22335940	86	+	chr3R	22335854	+	chr3R	22335940
CGNGAGGAAATATGCACTGGCCGCAGGCTGGATANGNACACCGCCAGTAAGACATGCCACAAGAATGCATTCCC:1	CGNGAGGAAATATGCACTGGCC	CATGCCACAAGAATGCATTCCC	+	chr3R	6891261	+	chr3R	6891336	75	+	chr3R	6891261	+	chr3R	6891336
TACTAACGTTAACTAACACCTGTTTTTAATGCATCACTCCTTTTGGCCTGGCTCACATCTCAGTTCACCCGTCA:1	TACTAACGTTAACTAACACCTG	TCACATCTCAGTTCACCCGTCA	+	chr3R	26600968	+	chr3R	26601052	84	+	chr3R	26600968	+	chr3R	26601052
GGCCGTATATATATTGATATTCATGCAGTGGCACTTGTATATGGACACCGAGTGCCCGCTGCCCGATAAACGCT:1	GGCCGTATATATATTGATATTC	TGCCCGCTGCCCGATAAACGCT	+	chrX	11312077	+	chrX	11319429	7352	+	chrX	11312077	+	chrX	11319429
TAAAAATTCTAATGGTTCATTTTCAACATTTGGCTTGGGCGAAATCGCCCCGAAGTTTGTCTAATTTATCATTT:1	TAAAAATTCTAATGGTTCATTT	AAGTTTGTCTAATTTATCATTT	-	chr3L	15267524	-	chr3L	15267400	124	+	chr3L	15267400	+	chr3L	15267524
TTGCAATGTGGCACGAGGGCAAAAGAAAAGGTAGTCCCCCTTTTGGTTTTGTTTTTTGT:1	TTGCAATGTGGCACGAGGGCAA	CCCTTTTGGTTTTGTTTTTTGT	-	chr2R	12504235	-	chr2R	12504174	61	+	chr2R	12504174	+	chr2R	12504235
GCTTCCGCAATTCTTGATCTGCGATCCTCCATCCTCCATCCTCCATCCTTGATCCTTCTTCCTTCGCGATCGAGG:1	GCTTCCGCAATTCTTGATCTGC	CCTTCTTCCTTCGCGATCGAGG	-	chr3L	21810065	-	chr3L	21809970	95	+	chr3L	21809970	+	chr3L	21810065
GTTGTGCAGTTGGGCTATCAAAAACCATGCGGGAGGTGAGCATCGACG:1	GTTGTGCAGTTGGGCTATCAAA	ATGCGGGAGGTGAGCATCGACG	-	chrX	13922342	-	chrX	5877501	8044841	+	chrX	5877501	+	chrX	13922342
GGGATATCGTTTAAATTATTAACCAAACATACTTATATACATTTTGCAACATGACAAATTAACCAGTCGAAGAGT:1	GGGATATCGTTTAAATTATTAA	ACAAATTAACCAGTCGAAGAGT	-	chr2R	9510803	-	chr2R	9510687	116	+	chr2R	9510687	+	chr2R	9510803
ACAGTGCCATATTGTGAAATGGCTGGTGGGCGGGCGG:1	ACAGTGCCATATTGTGAAATGG	GAAATGGCTGGTGGGCGGGCGG	-	chr3R	9340843	-	chr3R	13541164	4200321	+	chr3R	13541164	+	chr3R	9340843
TTATGGCTAAATGCTAAAATTAATATTTATATNTTTTTTGTTGATTATTCGTAATTTCTGTATTTCNATTGACT:1	TTATGGCTAAATGCTAAAATTA	AATTTCTGTATTTCNATTGACT	+	chr2L	14246307	+	chr2L	14246384	77	+	chr2L	14246307	+	chr2L	14246384
ATTGGGTTTCTTCTAAGAAGAACAATTTCCCTACGAATTANAGCAAATATTTAAAAATCGATAATTTANCGAT:1	ATTGGGTTTCTTCTAAGAAGAA	TAAAAATCGATAATTTANCGAT	-	chr2R	11152516	-	chr2R	19446333	8293817	+	chr2R	19446333	+	chr2R	11152516
GCAGCANTTGTATACATTATTTCGTGCCTATTCCATTATGGTTTTNGCCTGAGTGGCTC:1	GCAGCANTTGTATACATTATTT	ATGGTTTTNGCCTGAGTGGCTC	+	chrX	3893778	+	chrX	3893850	72	+	chrX	3893778	+	chrX	3893850
ATGGAACAAATTCAAAATGAAGTACCAGCGATTTCAAGACAAACTAAAAGTTAATGAAATACAGTTGAAAATGGC:1	ATGGAACAAATTCAAAATGAAG	ATGAAATACAGTTGAAAATGGC	-	chr2L	3813686	-	chr2L	17676773	13863087	+	chr2L	17676773	+	chr2L	3813686
CCGGGTAAGAATACATCGAAGGATGAAAACCATACCGATCCCATCAGTCCCTTTCTTC:1	CCGGGTAAGAATACATCGAAGG	GATCCCATCAGTCCCTTTCTTC	-	chr2R	15265613	-	chr2R	9001233	6264380	+	chr2R	9001233	+	chr2R	15265613
GTCGCCATNGAGCATGTGAGTATTCATTACCATGGNAATTACGAAACCGACGGAGGGAAATTTACGGCTTTGGG:1	GTCGCCATNGAGCATGTGAGTA	GAGGGAAATTTACGGCTTTGGG	+	chr2R	18248449	+	chr2R	7134028	11114421	+	chr2R	18248449	+	chr2R	7134028
CCCGAGCGCTGTGGGCGTGGTCCGATGCCCGCTAGCCGCNAATTTGCATATTGCATTACGCGAAAATTTCCAACT:1	CCCGAGCGCTGTGGGCGTGGTC	CATTACGCGAAAATTTCCAACT	+	chr3L	9533778	+	chr3L	9541338	7560	+	chr3L	9533778	+	chr3L	9541338
ATGTTATGTTTAAAAGTCTTCTTAATTGATAAAACGCACTTAATTGATTAAGTGATGAAATTCCGCTTCCCTTTC:1	ATGTTATGTTTAAAAGTCTTCT	GATGAAATTCCGCTTCCCTTTC	+	chr3L	6562853	+	chr3L	6562933	80	+	chr3L	6562853	+	chr3L	6562933
GTGTTGAGATCCGAAAACACGAAGAAAGTAAAGAAAATCAAGAGGAGCAAGGGAAAGGGAAAATTCACTTATTGA:1	GTGTTGAGATCCGAAAACACGA	AAAGGGAAAATTCACTTATTGA	-	chr3L	20607511	-	chr3L	8129040	12478471	+	chr3L	8129040	+	chr3L	20607511
GAGACAACCCATATATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATACGGACACAATCACACGTTGTCTCTGCAAAG:1	GAGACAACCCATATATGCATGT	ATCACACGTTGTCTCTGCAAAG	+	chr3L	8456488	+	chr3L	8456579	91	+	chr3L	8456488	+	chr3L	8456579
TATGTTGATGCACCCTGGGTACACACATACACACATTTTTTGCTCTTGTCTCTTTCCGAAAACTTTTCGTCTCAC:1	TATGTTGATGCACCCTGGGTAC	TTCCGAAAACTTTTCGTCTCAC	+	chr2L	12759208	+	chr2L	12759303	95	+	chr2L	12759208	+	chr2L	12759303
GAAAATCCACACAGACGTCTTAAGTTTCTGCTTTTCTTTTATGCCCGCACATGTGTGTGCTTGCAACNCTTTCGT:1	GAAAATCCACACAGACGTCTTA	TGTGTGCTTGCAACNCTTTCGT	-	chr3R	27148147	-	chr3R	27140537	7610	+	chr3R	27140537	+	chr3R	27148147
ATGGCAAGCATTCATAATGCTCACCCGGTGGCCATGTCAAAATGCCATTTTTATGTGGCACACGCGCTGCACTCT:1	ATGGCAAGCATTCATAATGCTC	TGTGGCACACGCGCTGCACTCT	+	chr3R	17348753	+	chr3R	17348842	89	+	chr3R	17348753	+	chr3R	17348842
GTGAGTATCACGAAAATGTTACAGCGGGAAATTCTGTAAGCGATCTGCACGATTGAAAAG:1	GTGAGTATCACGAAAATGTTAC	AGCGATCTGCACGATTGAAAAG	-	chr3R	19696493	-	chr3R	15181302	4515191	+	chr3R	15181302	+	chr3R	19696493
AGAGTGAGTTCAAAGGTGAGGGCACGTGCAAATCGACACCGACACAGTGTCCTTAGGTTCGAGGAGCACGTTG:1	AGAGTGAGTTCAAAGGTGAGGG	CTTAGGTTCGAGGAGCACGTTG	+	chr3R	28744418	+	chr3R	28744511	93	+	chr3R	28744418	+	chr3R	28744511
AGGTAGATGGTACCATGCTTCCATGCCATCTATATATTTGTTCCCCCAAAAGAGACCGGNTTTTAT:1	AGGTAGATGGTACCATGCTTCC	CCCAAAAGAGACCGGNTTTTAT	-	chrX	4613641	-	chrX	4613560	81	+	chrX	4613560	+	chrX	4613641
CCCACAAGCTTGCGAAATGTTGACTGAACTTGGCCCGCAGAATCACTGCTATCGCAGCCACCGTCCGCATTGAGA:1	CCCACAAGCTTGCGAAATGTTG	GCAGCCACCGTCCGCATTGAGA	+	chr2L	8118420	+	chr2L	10195319	2076899	+	chr2L	8118420	+	chr2L	10195319
GTACGTTTTCAAGCTGGACCACATTTTCGAGGACTGTCAGCGGCAGCAAAAGGAACTTTAAGGGAAAAGG:1	GTACGTTTTCAAGCTGGACCAC	AAAGGAACTTTAAGGGAAAAGG	-	chrX	21040475	-	chrX	21045398	4923	+	chrX	21045398	+	chrX	21040475
TCCTGCATTGCCGTTAAGTCTTCCTCTGGCCAAAATAGTTTTTTTCGCCGATTGCCAATTTTATTAAGGGGTG:1	TCCTGCATTGCCGTTAAGTCTT	TTGCCAATTTTATTAAGGGGTG	-	chr3R	28775173	-	chr3R	28775036	137	+	chr3R	28775036	+	chr3R	28775173
TTAAATGGGATTGAATGTAACCGCTTAACCCCAGAAAGGCTTTCAGTTTGCTATAAAATAATGAGTATTTCAATC:1	TTAAATGGGATTGAATGTAACC	TAAAATAATGAGTATTTCAATC	-	chr3R	30262705	-	chr3R	30262608	97	+	chr3R	30262608	+	chr3R	30262705
TCATTTGACCATTATAACATTTGCTTTTAATTCATATTGCATTGATAGAAATTCGAAAAACTTTGCGTTCTATT:1	TCATTTGACCATTATAACATTT	TCGAAAAACTTTGCGTTCTATT	+	chr3L	11105297	+	chr3L	11107007	1710	+	chr3L	11105297	+	chr3L	11107007
CACTGAAAGCGGAAACCACTGGTTTGCCAGCACTAATAGTGGGCCATGGCAACGGCAGCCAACG:1	CACTGAAAGCGGAAACCACTGG	GCCATGGCAACGGCAGCCAACG	-	chr3R	13100307	-	chr3R	30346005	17245698	+	chr3R	30346005	+	chr3R	13100307
AAGTGGATGGTTTGTGGGAGAAATCACTCACGGAATAGGCGACCAGGTGGGTGG:1	AAGTGGATGGTTTGTGGGAGAA	GAATAGGCGACCAGGTGGGTGG	+	chr3R	29237277	+	chr3R	29239277	2000	+	chr3R	29237277	+	chr3R	29239277
AAATTCAAATTTCACATCTTTCCACATGGGTTATCAACCATTTTGGTTGGGTATAGTTTCGTTTTTTGCCGGC:1	AAATTCAAATTTCACATCTTTC	TATAGTTTCGTTTTTTGCCGGC	+	chr3L	25343654	+	chr3L	25346419	2765	+	chr3L	25343654	+	chr3L	25346419
AAAGCATCTTAGCTTCACTTGTTCAAGCCAAATTTAAATGTAATGTATTTATGTTTTAGTANCCTTCCAGAAATT:1	AAAGCATCTTAGCTTCACTTGT	TTTTAGTANCCTTCCAGAAATT	-	chr3R	8685413	-	chr3R	8685313	100	+	chr3R	8685313	+	chr3R	8685413
TCAATGCCACGTCCCGCATGTTAATTTGCCGGGCCAAAAGTTTAGGCCTCCCTTTTGTCAAACGCCTGTCAAC:1	TCAATGCCACGTCCCGCATGTT	CTTTTGTCAAACGCCTGTCAAC	+	chr3R	22846816	+	chr3R	22847035	219	+	chr3R	22846816	+	chr3R	22847035
ATAGAAAGCCATCCTGCNTACCATTCGACTCCGACTCGTTTATTTGCATGGAAATTCGAAATTAAACTATTGAAT:1	ATAGAAAGCCATCCTGCNTACC	ATTCGAAATTAAACTATTGAAT	-	chr3L	22554517	-	chr3L	22554441	76	+	chr3L	22554441	+	chr3L	22554517
AACAATTTCATTTCTCACACTCAGGTTGTTTTTGGACCTTGCTTGTTTTTGCAAGCTGCACGCAGGGCCATAAAA:1	AACAATTTCATTTCTCACACTC	AGCTGCACGCAGGGCCATAAAA	+	chr3R	28415736	+	chr3R	28415821	85	+	chr3R	28415736	+	chr3R	28415821
CGTGACACGGATCACGGCTAGCACTCAGTGTAAGTATTCTTCTAAAGTCGTTTACCGCTTGCTACTGCCTCAACT:1	CGTGACACGGATCACGGCTAGC	ACCGCTTGCTACTGCCTCAACT	-	chr2R	24320287	-	chr2R	24320183	104	+	chr2R	24320183	+	chr2R	24320287
ATGCCCCTGAGAGTCCAGACGAAGAGGATGACGACGACGAAGATGCACACACACGCACAATCTCAGCCGCACATT:1	ATGCCCCTGAGAGTCCAGACGA	CGCACAATCTCAGCCGCACATT	+	chr3L	11078195	+	chr3L	5690080	5388115	+	chr3L	11078195	+	chr3L	5690080
ACCACTGCCATAAACCACTTTTATCATGGCCCAACAATTCTGGCCATCCTTATTTCGACTGGCCGACTTACTTGG:1	ACCACTGCCATAAACCACTTTT	TTCGACTGGCCGACTTACTTGG	+	chr2L	13622160	+	chr2L	13622259	99	+	chr2L	13622160	+	chr2L	13622259
GAAAATATAAGAGTGAGGAGCAACCAAGCAAAGGTGAATAAAGGGAAGGGAACAAGAGGGAAAAGGAGCAGTTTT:1	GAAAATATAAGAGTGAGGAGCA	AAGAGGGAAAAGGAGCAGTTTT	-	chrX	10119870	-	chrX	9907707	212163	+	chrX	9907707	+	chrX	10119870
AATAATAAAACGGATTTTATATCATCGACATTCGCAATCCCAAAGGACCCTCAGGGGTAAATAA:1	AATAATAAAACGGATTTTATAT	AAGGACCCTCAGGGGTAAATAA	+	chr3L	7311614	+	chr3L	7311694	80	+	chr3L	7311614	+	chr3L	7311694
TTTACTTTGCCAGCATGCCAGCGGGCTTCTNNNTNTGACAAATCTAGAGGCGACAGGTGGAGGAGATCTGTCAAA:1	TTTACTTTGCCAGCATGCCAGC	CAGGTGGAGGAGATCTGTCAAA	-	chr2R	24655169	-	chr2R	24647612	7557	+	chr2R	24647612	+	chr2R	24655169
TAGTGAATCTTGTGGATCTGAGATAGTNTTNNTTAGTCGCAATTCAATANANGTGTTCAATTCTTGCCACTCAA:1	TAGTGAATCTTGTGGATCTGAG	GTGTTCAATTCTTGCCACTCAA	+	chr3R	15594665	+	chr3R	15594747	82	+	chr3R	15594665	+	chr3R	15594747
ACTTGAATAAAGTGCATATGAAACATGTAGCTNTGAAAATATGTCTCAGGTCTCGTTTTTCGACAGNACCTCGA:1	ACTTGAATAAAGTGCATATGAA	TCGTTTTTCGACAGNACCTCGA	+	chr3R	31642810	+	chr3R	31643054	244	+	chr3R	31642810	+	chr3R	31643054
CGGGGAGGTGGAAAAAAGCGAAAAACAGAGGACCATTTGGGGCTACAAGATC:1	CGGGGAGGTGGAAAAAAGCGAA	GACCATTTGGGGCTACAAGATC	+	chr3L	11371460	+	chr3L	18877083	7505623	+	chr3L	11371460	+	chr3L	18877083
TTTCTTCTAAATATTCTGTCAGCCATTTGTGCGCCTCAGTGCCTTTTTTCTG:1	TTTCTTCTAAATATTCTGTCAG	GCGCCTCAGTGCCTTTTTTCTG	-	chr3R	31887219	-	chr3R	20940211	10947008	+	chr3R	20940211	+	chr3R	31887219
CGGTTTAGCTTCAGTTTGTCCTGTCACTTGTGGTTTTGGCCTTTAGCTTNTTTTGTCTCGTCTGTTCACTTTGCT:1	CGGTTTAGCTTCAGTTTGTCCT	TGTCTCGTCTGTTCACTTTGCT	+	chr3R	17845211	+	chr3R	17845288	77	+	chr3R	17845211	+	chr3R	17845288
AACCAAAGAGATATATTTTACTTTTTGTCAGCTTCGCTATGCGAATATTTTGTAAGCTTACTTCAATANTTTAC:1	AACCAAAGAGATATATTTTACT	TAAGCTTACTTCAATANTTTAC	-	chr3L	18408836	-	chr3L	18408751	85	+	chr3L	18408751	+	chr3L	18408836
TACACTTGACAAGAGTCCAATTTCTAGCGGTGTATTTGTATATAAAATGATAAATAAATAACAGTATGCGC:1	TACACTTGACAAGAGTCCAATT	ATAAATAAATAACAGTATGCGC	-	chr3R	30404497	-	chr3R	30396235	8262	+	chr3R	30396235	+	chr3R	30404497
AATTAGGGAAGTGACCGCCCCCGAGCGCTGTGGGCGTGGTCCGATGCCCGCTAGCCGCTAATTTGCATATTGCA:1	AATTAGGGAAGTGACCGCCCCC	AGCCGCTAATTTGCATATTGCA	+	chr3L	9533759	+	chr3L	9541318	7559	+	chr3L	9533759	+	chr3L	9541318
TATCTGTAAGATACGAAAACGAGCTGCTTTCCACCATGGGCATCAATTGCCTTAACATCTTCAGACGTGGCCTCC:1	TATCTGTAAGATACGAAAACGA	AACATCTTCAGACGTGGCCTCC	-	chr2R	11293057	-	chr2R	11292978	79	+	chr2R	11292978	+	chr2R	11293057
CAAACTGAACTCCAGACCAACTAATAATTATAATTCAATAATCGGGGAAGCCCCATAACTCGCAGGTGGAAG:1	CAAACTGAACTCCAGACCAACT	CCCCATAACTCGCAGGTGGAAG	-	chr3L	9348970	-	chr3L	9348471	499	+	chr3L	9348471	+	chr3L	9348970
AATCACCGAGACATTTGCAAAATATGTACCACTGTACATCGTTTAGAGTTCTGCCTGAAATGAATGGCCCTA:1	AATCACCGAGACATTTGCAAAA	CTGCCTGAAATGAATGGCCCTA	-	chrX	16821316	-	chrX	16821239	77	+	chrX	16821239	+	chrX	16821316
CAAATAAGGCATTCAAGTGTAATAGCTAGCGAAATGGGGGATGTAGTGCTTCATCTTTGTTTTTCTGGCGTGGG:1	CAAATAAGGCATTCAAGTGTAA	ATCTTTGTTTTTCTGGCGTGGG	+	chrX	827616	+	chrX	835407	7791	+	chrX	827616	+	chrX	835407
TAATGAAATTTCAATTCGGATGCGACCTGANNNGNAGCCTGTAGCCGGAAAATTCCACGAAATTTTCGCGCACTC:1	TAATGAAATTTCAATTCGGATG	TCCACGAAATTTTCGCGCACTC	-	chr3L	1404700	-	chr3L	1404623	77	+	chr3L	1404623	+	chr3L	1404700
TAAGCCGCAACGCCACGAAAAGGAAATGCCGATGATAAGAGGGCGAAAGCGGAAACGGAAGTCACAGAAGGGT:1	TAAGCCGCAACGCCACGAAAAG	GAAACGGAAGTCACAGAAGGGT	-	chr2L	3397497	-	chr2L	3397357	140	+	chr2L	3397357	+	chr2L	3397497
TATTAGTGGTCCAAGAAGGAGAGCAAACAGTGGGGCT:1	TATTAGTGGTCCAAGAAGGAGA	AAGGAGAGCAAACAGTGGGGCT	-	chr3L	10417312	-	chr3L	10414978	2334	+	chr3L	10414978	+	chr3L	10417312
GATTACACTTTTCAATAGAACCAACTGATGCCTTCAGCTTAAGTGGAACCAGATTTTCAGGGGAACGGATTTGGA:1	GATTACACTTTTCAATAGAACC	TTTTCAGGGGAACGGATTTGGA	+	chr2R	23061786	+	chr2R	23061862	76	+	chr2R	23061786	+	chr2R	23061862
CTTGGGCTGCCTACATATACACAAACATTCTTCTGGCCAACGGATATGCCATGAATATGCGTCCCGNAAACCTTT:1	CTTGGGCTGCCTACATATACAC	AATATGCGTCCCGNAAACCTTT	+	chr3R	24426309	+	chr3R	24426566	257	+	chr3R	24426309	+	chr3R	24426566
CAATGCCCCTCCTGAACTCGGATTCCTGGTGCTGCTACCAAGTTGAGCGTCAAAAGTTTTGATAGCNTGTGAGCT:1	CAATGCCCCTCCTGAACTCGGA	AAGTTTTGATAGCNTGTGAGCT	+	chr3L	19208070	+	chr3L	19209444	1374	+	chr3L	19208070	+	chr3L	19209444
TTGAAGATACGCTTGCCTTGTTGCAATTACAAAGTGTAATTTTTTGTTAGATTCCACAGTATATACAGTATATGA:1	TTGAAGATACGCTTGCCTTGTT	CCACAGTATATACAGTATATGA	-	chr2L	1686475	-	chr2L	1679010	7465	+	chr2L	1679010	+	chr2L	1686475
GAAAAAAGTAAGAAACAAAACCAAATGTTAGGAAAACCATTTGAAAGTAAACAAGAACTCTGCTAATAAGAGCGC:1	GAAAAAAGTAAGAAACAAAACC	AGAACTCTGCTAATAAGAGCGC	-	chr2R	10106583	-	chr2R	16547932	6441349	+	chr2R	16547932	+	chr2R	10106583
ATTTTTCGACCAACTTAAAGCACGCAAAAGCATAGGAAGAAAATGAATCTGTTATTGAATAGTTTTAAATATAT:1	ATTTTTCGACCAACTTAAAGCA	TATTGAATAGTTTTAAATATAT	+	chr3L	12874963	+	chr3L	12877254	2291	+	chr3L	12874963	+	chr3L	12877254
TTTTGTGTGCCTACATCGTACATATGTGTATATATGCTGCTGTTGGAATAGATGACGGGCTTGGAGCGCTGGA:1	TTTTGTGTGCCTACATCGTACA	ATGACGGGCTTGGAGCGCTGGA	+	chr2R	17784047	+	chr2R	17784286	239	+	chr2R	17784047	+	chr2R	17784286
GCTGGACGAATATGACGAGCCCGTAGAGTTCAAGTACAACCGACTCGCACAACCAGCCACCCACCACTCGCACAA:1	GCTGGACGAATATGACGAGCCC	CAGCCACCCACCACTCGCACAA	+	chr3R	31729690	+	chr3R	27434456	4295234	+	chr3R	31729690	+	chr3R	27434456
AGGAATAATCCTTGGAGAGTTCACTGAAAACCATCCAGAATGGAATGGAAGCCAGTTAGGGGATTACTTTNGGGA:1	AGGAATAATCCTTGGAGAGTTC	AGTTAGGGGATTACTTTNGGGA	-	chrX	20499253	-	chrX	20499170	83	+	chrX	20499170	+	chrX	20499253
ACCGGACGAGTACCGAAAACTTTCGTATCGCAATCTTTAGACAGCCGGACAACCGCAGAACAGACTCAATGGAC:1	ACCGGACGAGTACCGAAAACTT	CCGCAGAACAGACTCAATGGAC	-	chr3R	8610943	-	chr3R	8601791	9152	+	chr3R	8601791	+	chr3R	8610943
TTGGGACACTTTTCAAGGTTCGAGGCACTTCATTGAACTCTCTTCTGTCNTCTTTCTTTCT:1	TTGGGACACTTTTCAAGGTTCG	CTCTTCTGTCNTCTTTCTTTCT	-	chr2L	19147387	-	chr2L	19147286	101	+	chr2L	19147286	+	chr2L	19147387
ATATTTAATAAGTTATTTAATTATTGTGACTATATTGTCATGATTTCACTTTATTAATCGGAAATTTAAGCCCGG:1	ATATTTAATAAGTTATTTAATT	TTAATCGGAAATTTAAGCCCGG	-	chrX	21358160	-	chrX	21358080	80	+	chrX	21358080	+	chrX	21358160
CATCTTAAATCTTTGCCTGCTGTCGGAATATTAATAACATAATATTTCTCAATTTTCTCTCTGTGCACAAACA:1	CATCTTAAATCTTTGCCTGCTG	ATTTTCTCTCTGTGCACAAACA	+	chr3R	26810563	+	chr3R	26811046	483	+	chr3R	26810563	+	chr3R	26811046
GGGGTAAGAGGGATGCAATAGAACAGGGAGCAAAGGGAGAACTACTACAAACTACATTTGGTTATATATGGTTAT:1	GGGGTAAGAGGGATGCAATAGA	ACATTTGGTTATATATGGTTAT	+	chrX	16793127	+	chrX	13126285	3666842	+	chrX	16793127	+	chrX	13126285
TATGTATGCCCCTATATACTGGGAACGTACATATGTACATACATATATCCCATCCATCTATATGCCCAGCGCAG:1	TATGTATGCCCCTATATACTGG	TCCATCTATATGCCCAGCGCAG	-	chr3L	409762	-	chr3L	402710	7052	+	chr3L	402710	+	chr3L	409762
ATAAAATTGGCAATCGGCGAAAAAAACTATTTTGGCCAGAGGAAGACTTAACGGCAATGCAGGACGACAAGGACA:1	ATAAAATTGGCAATCGGCGAAA	GCAATGCAGGACGACAAGGACA	+	chr3R	28775045	+	chr3R	28775184	139	+	chr3R	28775045	+	chr3R	28775184
TATTGAAATCAACTTTTAAACAAGCCAGTGTCTGTGTGTGCGAGTGTTTGTGTAAAAGGACAGCATGCTGCA:1	TATTGAAATCAACTTTTAAACA	TGTAAAAGGACAGCATGCTGCA	+	chrX	19472133	+	chrX	19472700	567	+	chrX	19472133	+	chrX	19472700
CAATATAGAATTCCATAAAAATAGTGAGAGATGAAGCGGGATTTTCATCTATTTATTTTGACATCGAGGCTCTA:1	CAATATAGAATTCCATAAAAAT	TTATTTTGACATCGAGGCTCTA	-	chr2R	22512018	-	chr2R	22511932	86	+	chr2R	22511932	+	chr2R	22512018
CAGGCAATNAAAATTGAGGTCAACAGCAACGTTCGNTTGACAAACGCGAAGGAAAAAAGGCTGAAACGCTGTTA:1	CAGGCAATNAAAATTGAGGTCA	AAAAAAGGCTGAAACGCTGTTA	-	chr3L	14362361	-	chr3L	12881563	1480798	+	chr3L	12881563	+	chr3L	14362361
AGTGAAAAAAATCATACACCTAATTTAAGTAGCTTTTACTTACATGTTGTTATATTCTATATAGCTTAAGAAACT:1	AGTGAAAAAAATCATACACCTA	ATTCTATATAGCTTAAGAAACT	-	chr3R	22798006	-	chr3R	22797910	96	+	chr3R	22797910	+	chr3R	22798006
CACTTTCCACCACCCAATTCTCTGTGTTTTTTCCGTGTGCGCCATTTTGTCAGAGCATAAATTACAACTTCAGGT:1	CACTTTCCACCACCCAATTCTC	AGCATAAATTACAACTTCAGGT	+	chr3L	3475081	+	chr3L	3475525	444	+	chr3L	3475081	+	chr3L	3475525
AGTTCGAAGGCAAGGTACATATATAAATATATACCGGGTTTTAATTGGATTCGTTGTAGTCG:1	AGTTCGAAGGCAAGGTACATAT	TTAATTGGATTCGTTGTAGTCG	-	chr2L	10105372	-	chr2L	10105309	63	+	chr2L	10105309	+	chr2L	10105372
TTAGTTTAGCGCATAATCACTTTAACACAGAAGACGCAAAAAAGTAGGCAATGATTTTTAAAAACTGTGATTCTT:1	TTAGTTTAGCGCATAATCACTT	ATTTTTAAAAACTGTGATTCTT	-	chrX	7134408	-	chrX	7125249	9159	+	chrX	7125249	+	chrX	7134408
AGCTTAACCCATTTCCACTGTTGGCCCTTTGTTATGACCCCCGCC:1	AGCTTAACCCATTTCCACTGTT	GCCCTTTGTTATGACCCCCGCC	+	chr3R	23073688	+	chr3R	23073747	59	+	chr3R	23073688	+	chr3R	23073747
AATCGAGTGGTGGAGCCCGAAGTCCAGAGACATTCGATAATTAAAAGGCAGCGCACGCGGGAAGGCAAAAGCAAA:1	AATCGAGTGGTGGAGCCCGAAG	CACGCGGGAAGGCAAAAGCAAA	-	chrX	13006993	-	chrX	13006846	147	+	chrX	13006846	+	chrX	13006993
AGCCCATAAATAATTAAAGTTCGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGAACTACTTGAATNAATCTCCTGGGC:1	AGCCCATAAATAATTAAAGTTC	TACTTGAATNAATCTCCTGGGC	-	chr3R	25828320	-	chr3R	25828565	245	+	chr3R	25828565	+	chr3R	25828320
CGTTATACAGACAGGCTCTTCATCTGCAGTTACAATCTCAGCTATTTTCCTTGACATTAACTGAACTTAT:1	CGTTATACAGACAGGCTCTTCA	CCTTGACATTAACTGAACTTAT	+	chr3L	24363256	+	chr3L	24363329	73	+	chr3L	24363256	+	chr3L	24363329
TGGAACTTAACCACCCAGAATTACATTATCAAACAAGTTCTTTATCATTTGTTTATGGGCACTTGAATGTATAAT:1	TGGAACTTAACCACCCAGAATT	TATGGGCACTTGAATGTATAAT	-	chr3R	4984417	-	chr3R	4984325	92	+	chr3R	4984325	+	chr3R	4984417
TTATGATTACCTGCTGCTGGCTGCTGGCTGCATAACCAAACA:1	TTATGATTACCTGCTGCTGGCT	CTGCTGGCTGCATAACCAAACA	+	chr3L	24051084	+	chr3L	23912216	138868	+	chr3L	24051084	+	chr3L	23912216
CTCCATTGCTGGCTTAAATCTATGTTAACGTATGTTATTCTTCCTTGGCTGG:1	CTCCATTGCTGGCTTAAATCTA	TATGTTATTCTTCCTTGGCTGG	-	chr2R	21199365	-	chr2R	15469432	5729933	+	chr2R	15469432	+	chr2R	21199365
AGCAGATGCCCAGATACCCAGGACCCCTGCCACGCCCCCATTTATCAGCTAACAAAATTAAGCATTTTCAG:1	AGCAGATGCCCAGATACCCAGG	TAACAAAATTAAGCATTTTCAG	+	chrX	3287198	+	chrX	3286877	321	+	chrX	3287198	+	chrX	3286877
CATTTTGGCCAGTAAAATGTTTGAATGCAATTGACCTTGTTAATTAAATCAAGTGATTTTTAAAGCCGACAATAT:1	CATTTTGGCCAGTAAAATGTTT	TGATTTTTAAAGCCGACAATAT	+	chr2L	3637218	+	chr2L	15125395	11488177	+	chr2L	3637218	+	chr2L	15125395
GTTGGCAGCCTCAAGTCAAATACTTAACCACTTTAATTCAGTTCGTTCGCTTTATTTTCGGTAAATACTTCCG:1	GTTGGCAGCCTCAAGTCAAATA	TTATTTTCGGTAAATACTTCCG	+	chr3R	7655020	+	chr3R	7655100	80	+	chr3R	7655020	+	chr3R	7655100
ATAAGTTCTTGAAGAATTGCTGCAACTTTCCCAAAGCAACTCCATTACAAGGCACCTATAAAGCTTTCGC:1	ATAAGTTCTTGAAGAATTGCTG	AAGGCACCTATAAAGCTTTCGC	+	chr2R	15149180	+	chr2R	15149256	76	+	chr2R	15149180	+	chr2R	15149256
ATCAGCTTCGCGAGGATCAACCCTCTAGCTTTTTTCGATTTTTCAGGCTTTATTGAATTTTTGTATTCGTTT:1	ATCAGCTTCGCGAGGATCAACC	TATTGAATTTTTGTATTCGTTT	-	chr3R	28035567	-	chr3R	28035493	74	+	chr3R	28035493	+	chr3R	28035567
CAGTTGTGTTTTCGTATCTACGGAGAAGAGGAGCAAACACGGTGCCGTATAGATTACTGGNCAATCAGCTAAC:1	CAGTTGTGTTTTCGTATCTACG	GATTACTGGNCAATCAGCTAAC	+	chr3L	2812366	+	chr3L	2812446	80	+	chr3L	2812366	+	chr3L	2812446
AACACTGAAACAGCATAGGTTGTGTGCCACACAAGGAAATGTGAANGAAACAAACATATGTNAATTACTTT:1	AACACTGAAACAGCATAGGTTG	ACAAACATATGTNAATTACTTT	+	chr2R	12897481	+	chr2R	12897568	87	+	chr2R	12897481	+	chr2R	12897568
ATTAAATTCACGTTCTCTCTTTCTCTTCAACAATTTCCAGGAGAACAAGACAGCTTCTCCTTCNGAGAGCAAAGA:1	ATTAAATTCACGTTCTCTCTTT	CTTCTCCTTCNGAGAGCAAAGA	+	chr2L	9859953	+	chr2L	7819576	2040377	+	chr2L	9859953	+	chr2L	7819576
CGAATGTGAATGCTTCTTTCTGTGAGTCTACAATTTGGCGCGCTTAAGGTAATCCTTGTAGGTAACATCACGCCA:1	CGAATGTGAATGCTTCTTTCTG	CCTTGTAGGTAACATCACGCCA	+	chr2L	6426885	+	chr2L	6445145	18260	+	chr2L	6426885	+	chr2L	6445145
TAATATAATTTCTTAAAACGTAATTGGTACGCATCTGTCTTGTGATTATTCGATTTTGAATTGATTTAACAAGA:1	TAATATAATTTCTTAAAACGTA	ATTTTGAATTGATTTAACAAGA	-	chr3L	18030053	-	chr3L	18029977	76	+	chr3L	18029977	+	chr3L	18030053
TCATCATCATCGTTGAGCTAGCTACACAGACATCTTTATTGAGATGNATTTTTCCGATTT:1	TCATCATCATCGTTGAGCTAGC	TTGAGATGNATTTTTCCGATTT	-	chr2R	23427910	-	chr2R	23427783	127	+	chr2R	23427783	+	chr2R	23427910
AACAATAATAAATAAGAAATACTGCCGTCGAAAGATTCTTTCTAAATTATACCTATATACCTATTTATTGCCTGC:1	AACAATAATAAATAAGAAATAC	TATATACCTATTTATTGCCTGC	+	chr2R	24848662	+	chr2R	24848746	84	+	chr2R	24848662	+	chr2R	24848746
CCGTATTTCAATTAAGGGCGAAAAAATTCGCTCAATTAAACGACAGCGAGTCCTTCGCTGGTCGGAGTTGAG:1	CCGTATTTCAATTAAGGGCGAA	TCCTTCGCTGGTCGGAGTTGAG	-	chr2R	10796811	-	chr2R	10796715	96	+	chr2R	10796715	+	chr2R	10796811
ATTGACAAGATAAAACCGTACACAACACACAATNGGTGCCAAGCAGGCCACAGAGA:1	ATTGACAAGATAAAACCGTACA	GGTGCCAAGCAGGCCACAGAGA	+	chr3R	16179097	+	chr3R	16179201	104	+	chr3R	16179097	+	chr3R	16179201
CCATGATTTTGTATTATTTATTTTNTGTTCGTAAACGATGTTNTANTCAAGNGCTNCCGTTTTTTGCATTACTTC:1	CCATGATTTTGTATTATTTATT	CTNCCGTTTTTTGCATTACTTC	+	chr2R	12093966	+	chr2R	12094079	113	+	chr2R	12093966	+	chr2R	12094079
CACATTCAGGGCCAGTGCATTCCAGTTTACGCTGCGTGTGTGTACNCTGTACTGCAAATTTNACTTATCAAGTGG:1	CACATTCAGGGCCAGTGCATTC	GCAAATTTNACTTATCAAGTGG	-	chrX	1635462	-	chrX	1627994	7468	+	chrX	1627994	+	chrX	1635462
AGCAAATCGAATAAATATTTGCCGGGCAGCGAACGACAGAGGGAGACGG:1	AGCAAATCGAATAAATATTTGC	AGCGAACGACAGAGGGAGACGG	+	chrX	5725141	+	chrX	5994055	268914	+	chrX	5725141	+	chrX	5994055
ATTTTTAAATGTATTGATTAAAGAATATAGAAAATATTTTGGTAAGCTGTAGGGTATTTTCGGCAGGATTA:1	ATTTTTAAATGTATTGATTAAA	TAGGGTATTTTCGGCAGGATTA	-	chrX	15248345	-	chrX	15248273	72	+	chrX	15248273	+	chrX	15248345
TGACTAAGGAAGGTCTGGGGAGCACCAGGCAGAAAAAGACAAGACAAGACAAGACAAGGCAAAAAAAGACAAGAC:1	TGACTAAGGAAGGTCTGGGGAG	ACAAGGCAAAAAAAGACAAGAC	-	chr2R	11203542	-	chr2R	15369629	4166087	+	chr2R	15369629	+	chr2R	11203542
ATAAGCCTGTATTCGTTTTGTCCTTTGCATGGGTCTCTGANTGCTGGTGATGTTGCTGCTGAG:1	ATAAGCCTGTATTCGTTTTGTC	TGCTGGTGATGTTGCTGCTGAG	-	chr3R	19320377	-	chr3R	28909517	9589140	+	chr3R	28909517	+	chr3R	19320377
GGTGTCATTTACATTTTTGCTTCTACTGATTAAATGATTTTAATAATATT:1	GGTGTCATTTACATTTTTGCTT	ATTAAATGATTTTAATAATATT	-	chr2L	17623907	-	chr2L	22249229	4625322	+	chr2L	22249229	+	chr2L	17623907
GCAGAATTTGGGTTATCTCACTAAGCAGTCAGTGATGAGGTTTTGGGATCATAGGAGGTTGACTGGTATAAGTAT:1	GCAGAATTTGGGTTATCTCACT	GGAGGTTGACTGGTATAAGTAT	+	chr3R	31522476	+	chr3R	31522807	331	+	chr3R	31522476	+	chr3R	31522807
GTGTGTGTGTGTGTGTNTGTGCCNCCTTTGCTTNGTCTNTTCTTTCTGCTCTTCTGCTT:1	GTGTGTGTGTGTGTGTNTGTGC	TNTTCTTTCTGCTCTTCTGCTT	-	chrX	7978946	-	chrX	12626338	4647392	+	chrX	12626338	+	chrX	7978946
ATCATAAGCCTATAGGTGAGTTGGATAATTATGGCGTTATGGCCATCAATGTTGCAGCAGGGTCACCCTAATCCA:1	ATCATAAGCCTATAGGTGAGTT	GCAGCAGGGTCACCCTAATCCA	+	chr2L	9730986	+	chr2L	9731069	83	+	chr2L	9730986	+	chr2L	9731069
GCTTGAACCTTTTTGATTAGGGCCGAGGAATCCACTCCCCTCGGAGATC:1	GCTTGAACCTTTTTGATTAGGG	GAATCCACTCCCCTCGGAGATC	+	chr3L	1711017	+	chr3L	1711073	56	+	chr3L	1711017	+	chr3L	1711073
AAAGCGACAAATGCGGTCAACAAAGAACGGGAAACCCTCGACGGACACAAAAGGCTAGCAAAGCGATTCGGATGC:1	AAAGCGACAAATGCGGTCAACA	GCTAGCAAAGCGATTCGGATGC	-	chr3L	19124487	-	chr3L	19117040	7447	+	chr3L	19117040	+	chr3L	19124487
GCAGGGAGCAGGGAGCAGGNGGCATTGTATTAAACAAACAACAACAAGCTGCACGAAACAAATAGCAATAACAAC:1	GCAGGGAGCAGGGAGCAGGNGG	CGAAACAAATAGCAATAACAAC	-	chr3L	22233156	-	chr3L	4976605	17256551	+	chr3L	4976605	+	chr3L	22233156
GTAAAACTGTGATTTTAACTTTGTTAAATAATATATATTTTTAAAAATANTTAACATAAATTAATAGGAAATGG:1	GTAAAACTGTGATTTTAACTTT	AACATAAATTAATAGGAAATGG	+	chrX	7805171	+	chrX	8857380	1052209	+	chrX	7805171	+	chrX	8857380
AACCCAAAAAAAAAAACACGAAACACAGCCATGTGCACTTGAGCCCCGGGGTTTGTGCCCCTCATTTGCGTTTG:1	AACCCAAAAAAAAAAACACGAA	TTGTGCCCCTCATTTGCGTTTG	+	chr2R	20392633	+	chr2R	22309327	1916694	+	chr2R	20392633	+	chr2R	22309327
TTCCCAGGCGACGACGCAGCGAAAATGAAGGTGAGCACTTTGAAAATTATTCACAAACANTTCGGGTAGAC:1	TTCCCAGGCGACGACGCAGCGA	TTCACAAACANTTCGGGTAGAC	-	chr3L	2534719	-	chr3L	2534640	79	+	chr3L	2534640	+	chr3L	2534719
GCGCGCTTTGTCTCATTGACTTTCACCTGCATACTGTGGAGAAAGATAGAGATTTCGAGAAACTGCTATGTCCTA:1	GCGCGCTTTGTCTCATTGACTT	TTCGAGAAACTGCTATGTCCTA	+	chrX	1055564	+	chrX	1055979	415	+	chrX	1055564	+	chrX	1055979
GATTATATTTCAGTTCGTTCGTTAATAAAATTGAAATTGTCCAGAAAACACCTCCGAACTCGCCCGCAGCT:1	GATTATATTTCAGTTCGTTCGT	ACCTCCGAACTCGCCCGCAGCT	+	chr3R	24789999	+	chr3R	24790140	141	+	chr3R	24789999	+	chr3R	24790140
CATAAACTATTTTATCGCCTCTGGCATTTATGGCCAGCGTTTAGCGC:1	CATAAACTATTTTATCGCCTCT	ATTTATGGCCAGCGTTTAGCGC	-	chr2L	7113863	-	chr2L	7113667	196	+	chr2L	7113667	+	chr2L	7113863
GAAAAAAACACAAATTTATGGCTCCGCGTCGCAGCAGCCGCAGCAGCCGCAGC:1	GAAAAAAACACAAATTTATGGC	CAGCAGCCGCAGCAGCCGCAGC	+	chr3R	30278927	+	chr3R	29098372	1180555	+	chr3R	30278927	+	chr3R	29098372
AGCCCGTCTATGCAGCAATNCTGCAAGCGAAGCTTGCAACTTTTCCAAACAAAATGCCATGGAATCG:1	AGCCCGTCTATGCAGCAATNCT	CAAACAAAATGCCATGGAATCG	-	chrX	19755629	-	chrX	19755546	83	+	chrX	19755546	+	chrX	19755629
CTGCCCCAAGTACACAGGAAACTTTATTCCGCTCGATTTTAGGGCAACATAGTGAACCTAAAGGACAATCAGGAG:1	CTGCCCCAAGTACACAGGAAAC	GAACCTAAAGGACAATCAGGAG	+	chr2L	19561348	+	chr2L	19561489	141	+	chr2L	19561348	+	chr2L	19561489
TAGAAACGCGTGTGCTCGATTTTGCACTCGCAATTATCGCAAAAATCCGCCTCGATTAGGAGGAGCATTACAT:1	TAGAAACGCGTGTGCTCGATTT	TCGATTAGGAGGAGCATTACAT	+	chr2R	11675001	+	chr2R	11675079	78	+	chr2R	11675001	+	chr2R	11675079
AACGCGACGATGGGTCTTGTACCGGTAGCCATCATC:1	AACGCGACGATGGGTCTTGTAC	TCTTGTACCGGTAGCCATCATC	-	chr3L	4481009	-	chr3L	4480584	425	+	chr3L	4480584	+	chr3L	4481009
ACCCAGGACCCCTGCCACGCCCCCATTTATCAGCTAACAAAATTAAGCATTTTCAGTTTCTACAACAACCTCA:1	ACCCAGGACCCCTGCCACGCCC	TTCAGTTTCTACAACAACCTCA	+	chrX	3287213	+	chrX	3286894	319	+	chrX	3287213	+	chrX	3286894
TTCGGCAAATAAATGGCGCAATGCAGCCAAACCCAAAGCCCTAAGAGAGGAATTTACACTGCGAGAAATCACTTG:1	TTCGGCAAATAAATGGCGCAAT	TTACACTGCGAGAAATCACTTG	-	chr2R	24710370	-	chr2R	24714220	3850	+	chr2R	24714220	+	chr2R	24710370
GTTTTCAACCACACTCTATATATAGTAATGTGGTTCAATGTTTTTTCACTGGGGATTCGTAATGGGTTTGGGCTT:1	GTTTTCAACCACACTCTATATA	GATTCGTAATGGGTTTGGGCTT	+	chrX	2332741	+	chrX	6120045	3787304	+	chrX	2332741	+	chrX	6120045
AATCTCTTTTACTGCGAATCAAGGGATTCCTGAGGGTATTGTAAAGTCCGCCAAAGTGCTGTAAGGTTTAGTTGG:1	AATCTCTTTTACTGCGAATCAA	AAGTGCTGTAAGGTTTAGTTGG	+	chr3L	6621792	+	chr3L	6621948	156	+	chr3L	6621792	+	chr3L	6621948
AACTAAATAGAAAGCCATCCTGCTTACCATTCGACTCCGACTCGTTTATTTGCATGGAAATTCGAAATTAAACTA:1	AACTAAATAGAAAGCCATCCTG	ATGGAAATTCGAAATTAAACTA	-	chr3L	22554523	-	chr3L	22554447	76	+	chr3L	22554447	+	chr3L	22554523
AGAAAACGCACTTAAATCGGAAAAATACATCTCAATAAAGATGTCTGTGCAGCTAGCTCAACGATGATGATGATG:1	AGAAAACGCACTTAAATCGGAA	TAGCTCAACGATGATGATGATG	+	chr2R	23427770	+	chr2R	23427912	142	+	chr2R	23427770	+	chr2R	23427912
ATTAGGTAGCTCATAGATAGTTGGTATGATATATGTGANGATTATGCACCTTCTGTTAGCAGGGAACGCGACA:1	ATTAGGTAGCTCATAGATAGTT	TCTGTTAGCAGGGAACGCGACA	+	chr2R	8160947	+	chr2R	8161035	88	+	chr2R	8160947	+	chr2R	8161035
CTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGNGCNNCCATGTGTTCCACAAGCNGNCGCTGCTTTTGAGAGACCCCGA:1	CTCTGGATGCTTAGCCATCTCG	CGCTGCTTTTGAGAGACCCCGA	-	chr2R	12187480	-	chr2R	12190097	2617	+	chr2R	12190097	+	chr2R	12187480
AAATCTGGTTTTTTGTGCTTAGCTTCAGTTGAAATGACTATAAGTCGGGTTTAGTTAGTGCTCTTAAAATGACGA:1	AAATCTGGTTTTTTGTGCTTAG	GTTAGTGCTCTTAAAATGACGA	+	chrX	14862140	+	chrX	14861926	214	+	chrX	14862140	+	chrX	14861926
CTTTAGGTGCACTTCAACTTCACGTAAAAATCNGCACGACCCGATGTAATAATAATTAACTAAATGNAAACAGA:1	CTTTAGGTGCACTTCAACTTCA	TAATTAACTAAATGNAAACAGA	+	chr3R	31046967	+	chr3R	31047043	76	+	chr3R	31046967	+	chr3R	31047043
ACAAAATATTTGTTACAGTGCATTTGGACACTTGAATGCTACGGTTTCGGGATCGTTTGGTTAACTGTGGCAAGG:1	ACAAAATATTTGTTACAGTGCA	CGTTTGGTTAACTGTGGCAAGG	-	chr3R	28480316	-	chr3R	17014589	11465727	+	chr3R	17014589	+	chr3R	28480316
CTCCCTTGTTCACTCTCTNCAAGCACTTGCGCAGAAATGCCGCNTGTGCNTCAGATTCTGTTGTTCGTCC:1	CTCCCTTGTTCACTCTCTNCAA	CNTCAGATTCTGTTGTTCGTCC	+	chr3L	15146859	+	chr3L	16215742	1068883	+	chr3L	15146859	+	chr3L	16215742
ATGTCCTTGTGTTAAATGGGATGTTTTTTGCCCATGTGAATGGGCGATAGGTGGCTGGCCGAAATGGACTCT:1	ATGTCCTTGTGTTAAATGGGAT	GTGGCTGGCCGAAATGGACTCT	+	chr2L	17321525	+	chr2L	14075143	3246382	+	chr2L	17321525	+	chr2L	14075143
TATTCCTTACGCTGCTATACTTGTTTTTTGTGGCAAAAATTAAACAAACATGGCCGACTGCGGAACNGGCAAAAA:1	TATTCCTTACGCTGCTATACTT	CCGACTGCGGAACNGGCAAAAA	+	chr3R	7401766	+	chr3R	7401872	106	+	chr3R	7401766	+	chr3R	7401872
CCACTGATCGGAAATTAATCCAATCAAGTCAGCTNAATCACTTCATTTCATTTTCAACTTCTTCTGGTACTTACA:1	CCACTGATCGGAAATTAATCCA	TCAACTTCTTCTGGTACTTACA	+	chr3L	13144141	+	chr3L	13144218	77	+	chr3L	13144141	+	chr3L	13144218
AATATTTTTTAGACCTTTAGTAAAGAGTATTCCATGGGTAGCATTTAAAATAAGCCGTTAAATGTAATTTATTCC:1	AATATTTTTTAGACCTTTAGTA	GCCGTTAAATGTAATTTATTCC	+	chr2R	8525108	+	chr2R	8525185	77	+	chr2R	8525108	+	chr2R	8525185
ATTTATTCATTTAGATACAGTATACAGTCAATTAATTTAATTTAATATTACAACTTATTTTCGCATCAATGGGTT:1	ATTTATTCATTTAGATACAGTA	CTTATTTTCGCATCAATGGGTT	-	chr3R	13659826	-	chr3R	13659720	106	+	chr3R	13659720	+	chr3R	13659826
AAATGCATCGGGAAAAGCGAGGAGAAAACAACAAAAAAAAAATGAAACTAACCTTATACGAAATGAATACTGCGA:1	AAATGCATCGGGAAAAGCGAGG	TTATACGAAATGAATACTGCGA	-	chr2R	20425177	-	chr2R	13995147	6430030	+	chr2R	13995147	+	chr2R	20425177
ATGAATGCGTTTTTAATTTGGCATAAGCTCGACTGGCCAAGTAGCTGCTTTGAATACGA:1	ATGAATGCGTTTTTAATTTGGC	CAAGTAGCTGCTTTGAATACGA	-	chr3R	27370327	-	chr3R	27370137	190	+	chr3R	27370137	+	chr3R	27370327
ATAAATCACACAACTTTGCAGACAAGGGAACCCCCAAGAGTCGGGCTTTGGGCTCGGTGCACTG:1	ATAAATCACACAACTTTGCAGA	GGGCTTTGGGCTCGGTGCACTG	+	chr2R	19957454	+	chr2R	19962645	5191	+	chr2R	19957454	+	chr2R	19962645
TATTAAATTGATATATGTAAAACTTTCTCGTTAAAATAAGCCTAAACGAGAAAATTTCTTGCCGTGCTCGCTTAC:1	TATTAAATTGATATATGTAAAA	ATTTCTTGCCGTGCTCGCTTAC	-	chr3L	19981289	-	chr3L	19981208	81	+	chr3L	19981208	+	chr3L	19981289
ATTCCATATTCTGACAATTATTTTTAATGTTGTGGCAAAATAAATGATTATTTGATGACCAAATTTTGGAAAAAC:1	ATTCCATATTCTGACAATTATT	GATGACCAAATTTTGGAAAAAC	-	chrX	13057300	-	chrX	19242814	6185514	+	chrX	19242814	+	chrX	13057300
ACGCAACCATCTCCATCATGTTAGCATACTTTATACATAAGCTTTTTTTTTTATGAAAATGTTATTCTCATTT:1	ACGCAACCATCTCCATCATGTT	TATGAAAATGTTATTCTCATTT	+	chr3R	12528125	+	chr3R	12528200	75	+	chr3R	12528125	+	chr3R	12528200
CAATTACACAAGCCCTCTCCCAGAGTCATAAATTCAGTCCTTTGCCGGGAAAAGCAAAAGGAG:1	CAATTACACAAGCCCTCTCCCA	TTGCCGGGAAAAGCAAAAGGAG	+	chr3R	16756336	+	chr3R	16762515	6179	+	chr3R	16756336	+	chr3R	16762515
AGCCAACCGCTGTGTGGGTTAACCAGGCANATTAAGCATTCATTGGCGAAACAGCCAAAANTGTCAAGACGTTTA:1	AGCCAACCGCTGTGTGGGTTAA	GCCAAAANTGTCAAGACGTTTA	+	chr3L	9646470	+	chr3L	9646595	125	+	chr3L	9646470	+	chr3L	9646595
TGCAGCTCCTACAAAATTTGATCCGTTAGTGACTGTGGTTAATTTATATGTTTTAATTTTTTCTTTTGGAGAAT:1	TGCAGCTCCTACAAAATTTGAT	TTAATTTTTTCTTTTGGAGAAT	-	chr3R	19447434	-	chr3R	19445462	1972	+	chr3R	19445462	+	chr3R	19447434
AGCAGGAATGAAGCATGTGCCAAAATAATACAATAGAACGTTACCTTTGTTTTCAGCATGTCCTTTC:1	AGCAGGAATGAAGCATGTGCCA	TTTGTTTTCAGCATGTCCTTTC	-	chr3R	22640875	-	chr3R	31649880	9009005	+	chr3R	31649880	+	chr3R	22640875
TGAACCATTGTTTACTGCTAATCTACGTCACCGGCCCTGAGGCCACCATCTTAATTATGGGGCGAACAAAGCG:1	TGAACCATTGTTTACTGCTAAT	TAATTATGGGGCGAACAAAGCG	+	chr3R	6845203	+	chr3R	6845459	256	+	chr3R	6845203	+	chr3R	6845459
AAGTCATCTCACACAGTATTAATATTANAANNTAGAATATATACGTCCTNANTTCGACCATTAAATGCAATTCTA:1	AAGTCATCTCACACAGTATTAA	TCGACCATTAAATGCAATTCTA	+	chr3R	19716244	+	chr3R	19716321	77	+	chr3R	19716244	+	chr3R	19716321
TTTCATTCATCCAAACACTGCATTTATAACGGGCTCTGTTGTAGAATGGCAACTCTAACCTTGAGGCAACTTGCG:1	TTTCATTCATCCAAACACTGCA	TCTAACCTTGAGGCAACTTGCG	+	chr3L	6220938	+	chr3L	6230090	9152	+	chr3L	6220938	+	chr3L	6230090
TAATCTAAAATTCTAAGCTTTTGAATTTTTTTGGGTCCTTCGGTTAAGAATTTAAAATTATAGTTCAAACTTAT:1	TAATCTAAAATTCTAAGCTTTT	TAAAATTATAGTTCAAACTTAT	+	chr3L	17024070	+	chr3L	17024150	80	+	chr3L	17024070	+	chr3L	17024150
TGCGCAGAACCTATCCAAATATCTATACGATGCCCTGGGTGGCTATCTGCGC:1	TGCGCAGAACCTATCCAAATAT	TGCCCTGGGTGGCTATCTGCGC	+	chr3R	27240649	+	chr3R	27234308	6341	+	chr3R	27240649	+	chr3R	27234308
GTGCGCTCTGTAGAAAAAGGGCTCAAATATATGCTATCGGGGGCTAGATTCGCTTCCAATCTTATATATTTT:1	GTGCGCTCTGTAGAAAAAGGGC	CGCTTCCAATCTTATATATTTT	-	chr2R	7943199	-	chr2R	7942945	254	+	chr2R	7942945	+	chr2R	7943199
GAACTGAAATCACACAAATTGCTACTTTTTTCCAATCTTTTTTTTT:1	GAACTGAAATCACACAAATTGC	CTTTTTTCCAATCTTTTTTTTT	-	chrX	8916512	-	chrX	4886078	4030434	+	chrX	4886078	+	chrX	8916512
CTGCAAAAGCAGCAACACAAACAGCAAAAGACTGGGGACTGCTATGAATCAAAACTAAATAAAAGTGTCGATGGA:1	CTGCAAAAGCAGCAACACAAAC	ACTAAATAAAAGTGTCGATGGA	+	chr3R	31872295	+	chr3R	31875781	3486	+	chr3R	31872295	+	chr3R	31875781
TAAGCCTTTAGTCAATGCCTCTTGATTGAGCTGTGGAGGTCGTGGGGGAACCTTTTT:1	TAAGCCTTTAGTCAATGCCTCT	GAGGTCGTGGGGGAACCTTTTT	+	chr2L	12963820	+	chr2L	12963904	84	+	chr2L	12963820	+	chr2L	12963904
CGCGTTTAATCAATAAGTTTTATTTCGTGAAAAAAAGGGAAAGGAAAAAGGGAGAGGCAGAATGAGAATGATAGG:1	CGCGTTTAATCAATAAGTTTTA	GAGGCAGAATGAGAATGATAGG	-	chr3L	10538319	-	chr3L	17162717	6624398	+	chr3L	17162717	+	chr3L	10538319
CTGCGAANATCGCTAAATATCTTCCTGTTTAATCATACANTAAATCATTAGCTTGTGNTCTGTGTGAAAACAAGT:1	CTGCGAANATCGCTAAATATCT	TGTGNTCTGTGTGAAAACAAGT	-	chr3L	6866640	-	chr3L	6866559	81	+	chr3L	6866559	+	chr3L	6866640
TATACCGTATTTTTTGTGGTATCTAGTACATGGTAAAACTATCACGATAGGATTACCCTTTTTAATATGGA:1	TATACCGTATTTTTTGTGGTAT	GGATTACCCTTTTTAATATGGA	+	chr2R	11425730	+	chr2R	11425813	83	+	chr2R	11425730	+	chr2R	11425813
ATTATTATGGAGGATGATGAACGCCGGTGGCCACTTTCTCAGCGACTCGGACACCACGCAGTTCAGATATTTCA:1	ATTATTATGGAGGATGATGAAC	ACCACGCAGTTCAGATATTTCA	-	chr2R	17491035	-	chr2R	24632409	7141374	+	chr2R	24632409	+	chr2R	17491035
TCTTTAAACTGTCATCCCTTATACCATTTCGTCACCATGATTTGTATCATGAGCGATGATGCTGTTTCAATAG:1	TCTTTAAACTGTCATCCCTTAT	AGCGATGATGCTGTTTCAATAG	-	chr2R	19779933	-	chr2R	19776612	3321	+	chr2R	19776612	+	chr2R	19779933
GGTCAATTGCCCTAACCCATAGGGTATATGGAACATCGATTTCTTTTNGTTTTTTTTGTTGTAGAATAAATTCTA:1	GGTCAATTGCCCTAACCCATAG	TTTTGTTGTAGAATAAATTCTA	-	chrX	10176139	-	chrX	12390807	2214668	+	chrX	12390807	+	chrX	10176139
TTTACTTAGTTATTACATTCTTAATAGTGTGTATAAAGAACATATGTATCATCTTTCTCTAGGCTTATC:1	TTTACTTAGTTATTACATTCTT	ATCATCTTTCTCTAGGCTTATC	+	chr3R	18501613	+	chr3R	18501688	75	+	chr3R	18501613	+	chr3R	18501688
TGTTGGGCTAGGTATGCAGAAAAAAGAAAATGCTGAATAACCACACTTAAAATAAAAATTCTTAATACTGAGTT:1	TGTTGGGCTAGGTATGCAGAAA	TAAAAATTCTTAATACTGAGTT	-	chr3L	6913746	-	chr3L	6913655	91	+	chr3L	6913655	+	chr3L	6913746
TTGTGTACTATACAGCTCCCTCTCACAATCTTTGTGCGCTGATGCTCACAGTTTGGTGTCAGTTTTAGGCGAAG:1	TTGTGTACTATACAGCTCCCTC	TTGGTGTCAGTTTTAGGCGAAG	-	chr2R	15556019	-	chr2R	12031304	3524715	+	chr2R	12031304	+	chr2R	15556019
ATCGGAAATACAAATGCACATTTTCAGCTTTGAATTTTTTCTGTTTAACATCGAGGTCGGACATTTAAGAGGAG:1	ATCGGAAATACAAATGCACATT	GAGGTCGGACATTTAAGAGGAG	-	chr2L	20984700	-	chr2L	20984620	80	+	chr2L	20984620	+	chr2L	20984700
CAGCCACTTGGCCCGAGTTCATTATTCATGCCAGCAGCTCGTCGCTGAAAATCGCTTAATTGTAATCGCCACC:1	CAGCCACTTGGCCCGAGTTCAT	TCGCTTAATTGTAATCGCCACC	-	chr2L	21025283	-	chr2L	19897803	1127480	+	chr2L	19897803	+	chr2L	21025283
TGAAAGGACCTTTTGTATTCATGGACTGTAGTAAAGAAAGAGGGCACAT:1	TGAAAGGACCTTTTGTATTCAT	GTAGTAAAGAAAGAGGGCACAT	+	chr3R	4759742	+	chr3R	4761213	1471	+	chr3R	4759742	+	chr3R	4761213
ATTTGGCTAAGTGTATAGACGACAAGGAGATAAACAAAGTTTTCTATAACACATAATTGAATTTATGCTGGACAA:1	ATTTGGCTAAGTGTATAGACGA	TAATTGAATTTATGCTGGACAA	-	chr3L	7101434	-	chr3L	7101341	93	+	chr3L	7101341	+	chr3L	7101434
TTAACAATAATGTCTCATTTTTCTTTGCAGTGTACTTTAAAAAATACGAGGGCATATGTAAATTGAAACGAAAGG:1	TTAACAATAATGTCTCATTTTT	ATATGTAAATTGAAACGAAAGG	-	chr3R	12733937	-	chr3R	12733857	80	+	chr3R	12733857	+	chr3R	12733937
CATACGGGGAGAGATTGGGGAGTTTGGGGGCGAAGAGCAGGACATTTTGCGGCGCACAAAGATTCTTAATTTTTT:1	CATACGGGGAGAGATTGGGGAG	GCACAAAGATTCTTAATTTTTT	+	chr3R	7830476	+	chr3R	22223723	14393247	+	chr3R	7830476	+	chr3R	22223723
CATTTTGTTGCTCTTCCACGAAAAAATCGCGTCCTTATGCTTTTCCGATCTGGTAGCCCTGGTCTGT:1	CATTTTGTTGCTCTTCCACGAA	CGATCTGGTAGCCCTGGTCTGT	-	chr2R	8518802	-	chr2R	12066204	3547402	+	chr2R	12066204	+	chr2R	8518802
AAAAACTCACGTAATTTTTCACAGGGCGAGGCATTGTGTATTTAATACCGAAAACCTTTGTGGGACATGGGTGAC:1	AAAAACTCACGTAATTTTTCAC	ACCTTTGTGGGACATGGGTGAC	-	chr3L	4825645	-	chr3L	4825563	82	+	chr3L	4825563	+	chr3L	4825645
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACGAGAC:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACAACACAACACAACACGAGAC	+	chr3R	21907536	+	chr3R	9620954	12286582	+	chr3R	21907536	+	chr3R	9620954
AAACAGTCGCATGGCGGATAGTTTTTCTAATGTTATATACATATATATATATCATCTGTAATTTCCTCGCTCCG:1	AAACAGTCGCATGGCGGATAGT	CATCTGTAATTTCCTCGCTCCG	-	chr2R	23819237	-	chr2R	23819143	94	+	chr2R	23819143	+	chr2R	23819237
AATCGAATGATTTCCCTTATGCGGGTCAGGCCATTCATAATCCATTGTAAAATAACTTACACATGCAATTGAATT:1	AATCGAATGATTTCCCTTATGC	AACTTACACATGCAATTGAATT	-	chr2L	1842388	-	chr2L	1842312	76	+	chr2L	1842312	+	chr2L	1842388
CAGACCACATACCTATGGATGTGGGCATTCTTCTGTTCATTCG:1	CAGACCACATACCTATGGATGT	TGGGCATTCTTCTGTTCATTCG	-	chr3R	12314341	-	chr3R	12314259	82	+	chr3R	12314259	+	chr3R	12314341
ATAGTTCTGTAAACAGTTTCCAGTTTTTAGAGATAACATTTCTTGATTGTGGCAATAAAGCAATTTNTCATTCA:1	ATAGTTCTGTAAACAGTTTCCA	CAATAAAGCAATTTNTCATTCA	-	chr3R	30850332	-	chr3R	30850241	91	+	chr3R	30850241	+	chr3R	30850332
GTAAGCAGCACCACAAACAACATTTCAATAGCATAGAAAGCGCGCCAAGAATCATACATTTTCATATGTATATAT:1	GTAAGCAGCACCACAAACAACA	ATACATTTTCATATGTATATAT	-	chrX	11711088	-	chrX	5451340	6259748	+	chrX	5451340	+	chrX	11711088
GAAACGATTGGAAAGAAGGATTCGCGGCGTACTCGTAATCTGAACTGCTCTGTTGAAA:1	GAAACGATTGGAAAGAAGGATT	AATCTGAACTGCTCTGTTGAAA	-	chr2R	24303976	-	chr2R	24303909	67	+	chr2R	24303909	+	chr2R	24303976
CACAATTATATTGCGCATTTCATTATTGTGAAAGATTAACATTCCATTTATTTCTCAGTTATTCACAAGAAAAGC:1	CACAATTATATTGCGCATTTCA	CTCAGTTATTCACAAGAAAAGC	+	chr3R	23161944	+	chr3R	23162041	97	+	chr3R	23161944	+	chr3R	23162041
GGTCGTTTGGAAAACCGAACTTTATAATATACGAAACAAATTGGATGGCCTA:1	GGTCGTTTGGAAAACCGAACTT	ACGAAACAAATTGGATGGCCTA	-	chr3R	23533657	-	chr3R	31044437	7510780	+	chr3R	31044437	+	chr3R	23533657
CGATATTAACCCTCCTGACACTGTTTCCANCGGTGCAACTCCCACTGGTTTTGCCTGGCTNTTCCTACCCATTT:1	CGATATTAACCCTCCTGACACT	GCCTGGCTNTTCCTACCCATTT	-	chr3L	27284445	-	chr3L	10311742	16972703	+	chr3L	10311742	+	chr3L	27284445
CTGGTTTATCATCACATTTGACCATTTTCGTATTCAATCCAGCTGTTTGTTTGTATCATGTAGTTTCATTATAT:1	CTGGTTTATCATCACATTTGAC	GTATCATGTAGTTTCATTATAT	-	chr2L	15786457	-	chr2L	10402857	5383600	+	chr2L	10402857	+	chr2L	15786457
TTTCGAGGATTGAAAATTGCCTAAACCGTCGTTTGCTTTACGGTCTGGAAATAAACGAAATGGAATAAGTTGACC:1	TTTCGAGGATTGAAAATTGCCT	AACGAAATGGAATAAGTTGACC	-	chr2L	18883947	-	chr2L	18883865	82	+	chr2L	18883865	+	chr2L	18883947
TTAATACTATACTATATTATATTATTTATATACTTAGAGTGTGATTAAATGTCAGATAATAATTCTTACTGT:1	TTAATACTATACTATATTATAT	GTCAGATAATAATTCTTACTGT	+	chr3R	17658746	+	chr3R	29581655	11922909	+	chr3R	17658746	+	chr3R	29581655
ATGACAGGAATATTTATAATTTCCGCTGCCAGCAGACACAACAGAAAAGTTAAACGGCAGCAACACAACACAAAA:1	ATGACAGGAATATTTATAATTT	ACGGCAGCAACACAACACAAAA	+	chr3R	28147425	+	chr3R	15673304	12474121	+	chr3R	28147425	+	chr3R	15673304
CATTCCTTCAAGATTAATTTGATAAAGGTGACAAGAAATTTGTCAGCTCAAAATATTTGCCTGTTGCTCCAATCT:1	CATTCCTTCAAGATTAATTTGA	TATTTGCCTGTTGCTCCAATCT	-	chr2L	19304353	-	chr2L	19304251	102	+	chr2L	19304251	+	chr2L	19304353
GATTAGGCAGTGGCAAAAAAAGGATTATAATAGTAGGTAGGCCTTTGCTTATTCATTATTAGTTTCCCAAATTAT:2	GATTAGGCAGTGGCAAAAAAAG	CATTATTAGTTTCCCAAATTAT	+	chr2R	23346542	+	chr2R	23346618	76	+	chr2R	23346542	+	chr2R	23346618
AGCGAGTTCTGCGTTTAATTGTTTGCATGATGAATGATGTATTATTATTTGTAATTTGTAATTTGCATTGTGCAG:1	AGCGAGTTCTGCGTTTAATTGT	ATTTGTAATTTGCATTGTGCAG	-	chr3L	4915047	-	chr3L	4914801	246	+	chr3L	4914801	+	chr3L	4915047
TCTTTTCTCTTCTCTTTTCTTTTTTTTT:1	TCTTTTCTCTTCTCTTTTCTTT	CTCTTCTCTTTTCTTTTTTTTT	+	chr2R	3289578	+	chr2R	18356886	15067308	+	chr2R	3289578	+	chr2R	18356886
CAATGTTTGTGATACCCTAAGTTTCCCAGCCCAACATACATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCCCGAACGC:1	CAATGTTTGTGATACCCTAAGT	ATTCATTGACCTCCCCGAACGC	+	chr2R	24490132	+	chr2R	24488249	1883	+	chr2R	24490132	+	chr2R	24488249
GGTTGGTACACCTTCAGGCCTGCTAAGATCTCAAAAAAGAAAACACCGCACCTAGCCCCCCTAAAG:1	GGTTGGTACACCTTCAGGCCTG	ACCGCACCTAGCCCCCCTAAAG	-	chr2L	19076060	-	chr2L	18315399	760661	+	chr2L	18315399	+	chr2L	19076060
TCCTTGGTCCTTTCTCTTTGAACATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGCTTTCTGGCAAAGTGGCACACTAAC:1	TCCTTGGTCCTTTCTCTTTGAA	TCTGGCAAAGTGGCACACTAAC	-	chrX	21016449	-	chrX	21016362	87	+	chrX	21016362	+	chrX	21016449
GAGTCCATGATGGTCTTGATGTTGTAGTCCTTTGGTAGAGAACCAGTCTNATGGGCAGCTTGGGTAAGAG:1	GAGTCCATGATGGTCTTGATGT	TNATGGGCAGCTTGGGTAAGAG	+	chr3R	29246802	+	chr3R	29236592	10210	+	chr3R	29246802	+	chr3R	29236592
TAAATTTCAGCACTCAAAAAACCGCGAAACGAATATTGCCGTAAGTTAGAAAAACAAACGATTTGTCAAGGACCA:1	TAAATTTCAGCACTCAAAAAAC	ACAAACGATTTGTCAAGGACCA	+	chr2L	10540871	+	chr2L	10540949	78	+	chr2L	10540871	+	chr2L	10540949
ATTATGACGTCCNCTATCACTTACATGTGCNTNCCAGCNCCTGAGATAATTTGAAATAAGCTTATGATGATAT:1	ATTATGACGTCCNCTATCACTT	TGAAATAAGCTTATGATGATAT	-	chr3R	5001987	-	chr3R	5001521	466	+	chr3R	5001521	+	chr3R	5001987
CCCGACCGNAGGCTGGCCCAAATTGCGTTCGATGANTTGAGAAAAAAGGAGAAAGCTCGAGCAAGGA:1	CCCGACCGNAGGCTGGCCCAAA	AAGGAGAAAGCTCGAGCAAGGA	-	chr3L	9858363	-	chr3L	1136213	8722150	+	chr3L	1136213	+	chr3L	9858363
TTAAGATGCGAACGCAGGAATCGGAATGTTTTTTAATAAATACAANTAGCAAACAAAATGTNAATAGCTGTTTCC:1	TTAAGATGCGAACGCAGGAATC	CAAAATGTNAATAGCTGTTTCC	+	chr3R	7447997	+	chr3R	7448075	78	+	chr3R	7447997	+	chr3R	7448075
TGCATAAAACAAACAGCAATTTCTCACACATGGGTTGTGTTTGCAGATTTCATTTGTGGCCCGCAGCTAAAAAA:1	TGCATAAAACAAACAGCAATTT	TTTGTGGCCCGCAGCTAAAAAA	+	chr2L	730785	+	chr2L	730875	90	+	chr2L	730785	+	chr2L	730875
TAATGTTTTTACGAACTCTTATCTTTTAATCCATTTTTTTAAATTTGCATAACAGCGGTTTTGTTA:1	TAATGTTTTTACGAACTCTTAT	TTGCATAACAGCGGTTTTGTTA	-	chr3R	14185576	-	chr3R	14180820	4756	+	chr3R	14180820	+	chr3R	14185576
ATTGCTGCTAATCAGAAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATATAATGACTGCCTCTCATTCTCTGTC:1	ATTGCTGCTAATCAGAAAAAAA	TGACTGCCTCTCATTCTCTGTC	+	chrX	22383294	+	chrX	22383375	81	+	chrX	22383294	+	chrX	22383375
GGTANGCGGTAGGTAATTAATCNCCTTNGGAGTTTGCCANTAAACCTGTGTCGATTGTGGTCCCTTTTTCATTT:1	GGTANGCGGTAGGTAATTAATC	GATTGTGGTCCCTTTTTCATTT	+	chr2L	4945036	+	chr2L	18610416	13665380	+	chr2L	4945036	+	chr2L	18610416
GTAGTATGGTTGAAACACCTACATGGGTGAATGACTACGATTATTTGAGTACTATTATGCTATTAAGGGAATCTA:1	GTAGTATGGTTGAAACACCTAC	ATTATGCTATTAAGGGAATCTA	+	chr3R	5068010	+	chr3R	5073527	5517	+	chr3R	5068010	+	chr3R	5073527
CCGTCCTATACTTGAGCTGCGTTTGATCGACTACCCCATGTTCACTCTCGATGACTGTTTTCGCACTCTAATA:1	CCGTCCTATACTTGAGCTGCGT	TGACTGTTTTCGCACTCTAATA	-	chr2R	5421546	-	chr2R	5421630	84	+	chr2R	5421630	+	chr2R	5421546
ATTTATTATTGGCATAAACAAGACGGACATCGTCTGGGGGCAATCGTTTTATCAGCC:1	ATTTATTATTGGCATAAACAAG	GGGGGCAATCGTTTTATCAGCC	+	chr3R	22450571	+	chr3R	22453193	2622	+	chr3R	22450571	+	chr3R	22453193
AGAAATTGAGACAAGATTGTCGAGTTGCCAAAAGTTGAGAAATGATATTTTGTTTGGGCTTCATATATATAATTC:1	AGAAATTGAGACAAGATTGTCG	TTGGGCTTCATATATATAATTC	+	chr3L	8243848	+	chr3L	8243931	83	+	chr3L	8243848	+	chr3L	8243931
CATAAAATGTTTTTTTTTTCTTTTCATTTTTTTTTCCAATTT:1	CATAAAATGTTTTTTTTTTCTT	TTTTCATTTTTTTTTCCAATTT	-	chr2R	7378405	-	chr2R	327744	7050661	+	chr2R	327744	+	chr2R	7378405
TTGGTCAGTTCAAGTTGGCCTTCCAATGGACCTGAGACCAATTGCAAAAAGCACAGCACACCTTTCTAGATATAT:1	TTGGTCAGTTCAAGTTGGCCTT	CAGCACACCTTTCTAGATATAT	-	chrX	6118809	-	chrX	6118727	82	+	chrX	6118727	+	chrX	6118809
GGTACACTGAGGAATTAGCAGGGGCAGAAAAGGCCCTAAAATGCCAGCATATATACAGACAACCTTCGCCTTGGA:1	GGTACACTGAGGAATTAGCAGG	TACAGACAACCTTCGCCTTGGA	-	chrX	908519	-	chrX	906730	1789	+	chrX	906730	+	chrX	908519
TTAATTCATATTGCATTGATAGAAATTCGAAAAACTTTGCGTTCTATTTATCCACGACGCCTTCGTTCGCCGGCG:1	TTAATTCATATTGCATTGATAG	ACGACGCCTTCGTTCGCCGGCG	+	chr3L	11105323	+	chr3L	11107034	1711	+	chr3L	11105323	+	chr3L	11107034
ACGTNAAGACACGAGCGGAGCTNCAACNACAACTCAGAGNCGACTTCGTATTATCAAACCATCAAT:1	ACGTNAAGACACGAGCGGAGCT	TTCGTATTATCAAACCATCAAT	-	chr2L	23395528	-	chr2L	18734557	4660971	+	chr2L	18734557	+	chr2L	23395528
TTTTCATATATGTTTAGCTTTGAGCTCTTGCTAAATAGAGATACTAAGATTAATGCTTTTCCGTTCCTTGCAGAT:1	TTTTCATATATGTTTAGCTTTG	TGCTTTTCCGTTCCTTGCAGAT	-	chr3L	11744136	-	chr3L	11744028	108	+	chr3L	11744028	+	chr3L	11744136
CTTAACCTAATCACGAGAAGCGCGACAAACAAACTAGCATCTAATTGTATTGAAATAGCTTTTACCCCGCAAGAA:1	CTTAACCTAATCACGAGAAGCG	AATAGCTTTTACCCCGCAAGAA	-	chr2L	5028076	-	chr2L	5027992	84	+	chr2L	5027992	+	chr2L	5028076
AGTTATAACGTTCTTTTGATCATATGACATCTTGTCACTTTCCTGTTTTCTCAGCACAAAAGCTGTCTCGCCAAT:1	AGTTATAACGTTCTTTTGATCA	GCACAAAAGCTGTCTCGCCAAT	-	chrX	21258949	-	chrX	21258849	100	+	chrX	21258849	+	chrX	21258949
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGGAGATGGAGATGGAGAAGGAGAAGGAGAAG:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	GATGGAGAAGGAGAAGGAGAAG	+	chr3L	22908066	+	chr3L	9013693	13894373	+	chr3L	22908066	+	chr3L	9013693
ATATTAGGATCTCAATTACACTTGGCAAGGCCTTGTGGCCGGGCAAATTCCCCTCTTGCGGAAACTTAAGCTGAA:1	ATATTAGGATCTCAATTACACT	TCTTGCGGAAACTTAAGCTGAA	+	chr2R	24724215	+	chr2R	24724703	488	+	chr2R	24724215	+	chr2R	24724703
GTTGGTGGGGGTATGCCGATGCGGAAAAGCGGAAAAGCGAAAAGCAGGCNAACGGAATAATCAACTGCCATTGA:1	GTTGGTGGGGGTATGCCGATGC	CGGAATAATCAACTGCCATTGA	-	chrX	5418657	-	chrX	5476897	58240	+	chrX	5476897	+	chrX	5418657
ATTGCGTGGCAATTACACAAGCCCTCTCCCAGAGTCATAAATTCAGTCCTTTGCCGGGAAAAGCAAANGGAGTAG:1	ATTGCGTGGCAATTACACAAGC	CCGGGAAAAGCAAANGGAGTAG	+	chr3R	16756327	+	chr3R	16762518	6191	+	chr3R	16756327	+	chr3R	16762518
GCCCCATCCATGCCCCTAAAATCGTACAATAAAAATCGCATTAACAAATATGCGAAGCAGCTGCTGGAAGAAAG:1	GCCCCATCCATGCCCCTAAAAT	CGAAGCAGCTGCTGGAAGAAAG	+	chr2L	14065584	+	chr2L	19787241	5721657	+	chr2L	14065584	+	chr2L	19787241
CATAAAAGCAAATGTTTTGTATTTCTTGCTTAGTAATCTTAGTTTATCAACAGCCAAGTTCCGATTATCAAA:1	CATAAAAGCAAATGTTTTGTAT	CAGCCAAGTTCCGATTATCAAA	-	chr2R	19129460	-	chr2R	11778913	7350547	+	chr2R	11778913	+	chr2R	19129460
TTTACTATATCCCGATCTACAATTCCTGGCAATCCTGGACTACATGTTTTTTGTTTTGATTTTGGAATTAAAGCA:1	TTTACTATATCCCGATCTACAA	TTTTGATTTTGGAATTAAAGCA	+	chrX	2045031	+	chrX	2045108	77	+	chrX	2045031	+	chrX	2045108
TCTACGTGATTAGACAAAGAAAAGGAGTTACAACAAATGTGTGTCGAGTTACTTGGTGGCTGTAAAAGAAATTGT:1	TCTACGTGATTAGACAAAGAAA	TGGTGGCTGTAAAAGAAATTGT	+	chrX	15689932	+	chrX	14065589	1624343	+	chrX	15689932	+	chrX	14065589
ACCTATCATTCTTGACCTCATATATGCATATATGAGACACATATCAGCACACTAATCCCTTACCTTCCGACCCAT:1	ACCTATCATTCTTGACCTCATA	AATCCCTTACCTTCCGACCCAT	-	chr3L	13007800	-	chr3L	13007721	79	+	chr3L	13007721	+	chr3L	13007800
CTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT:1	CTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCT	CTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT	+	chr2L	19024096	+	chr2L	21768291	2744195	+	chr2L	19024096	+	chr2L	21768291
CTGATTATTTAACTTTACAAAAAACCCTTCTTGGTTAAGTTGGTTGGCGAAGGTATAAGTCTGCGGTCCCTAAAC:1	CTGATTATTTAACTTTACAAAA	TATAAGTCTGCGGTCCCTAAAC	+	chr2R	3144110	+	chr2R	3393388	249278	+	chr2R	3144110	+	chr2R	3393388
ATAAAAACATACAAAACAACAAGGCAACGCAACAACGTCAAACCGCAAAGTCAAATATGGAAAATGGAGATCGCC:1	ATAAAAACATACAAAACAACAA	AATATGGAAAATGGAGATCGCC	+	chr3L	13590840	+	chr3L	18013830	4422990	+	chr3L	13590840	+	chr3L	18013830
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGTGAAGTGTGTGAAGGT:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	AAGAGGTGAAGTGTGTGAAGGT	+	chr3L	22908066	+	chr3L	9678467	13229599	+	chr3L	22908066	+	chr3L	9678467
ATATTGTATCAACAGCCAGTACATGGGCCACAATTGTTTGACTCTGCAACAAAAGCAATTAAAACTGTGATACA:1	ATATTGTATCAACAGCCAGTAC	AAGCAATTAAAACTGTGATACA	-	chr3L	26695023	-	chr3L	26694944	79	+	chr3L	26694944	+	chr3L	26695023
GCTGATCCCAGTCCTCCAAAAGCCCCCATTTGCCTTTTTACGCTTGCTGAGCCAGATAATTAAGATTTCATATA:1	GCTGATCCCAGTCCTCCAAAAG	CAGATAATTAAGATTTCATATA	-	chr3L	19857714	-	chr3L	19848525	9189	+	chr3L	19848525	+	chr3L	19857714
AGATTTGCTTGCAGCAGTTTAACTAAGAGCNNNGNCGATGCGGGACTTCTTTAAGGTTCCGATATCATTGCGACA:1	AGATTTGCTTGCAGCAGTTTAA	AGGTTCCGATATCATTGCGACA	+	chr3R	7857667	+	chr3R	7857750	83	+	chr3R	7857667	+	chr3R	7857750
AGAGTACCGCGAGCCTCCGAACGCTGCAAGAAATGTGCATTATTGGCNTTGGCC:1	AGAGTACCGCGAGCCTCCGAAC	ATGTGCATTATTGGCNTTGGCC	-	chr3L	21905413	-	chr3L	21905354	59	+	chr3L	21905354	+	chr3L	21905413
TAGTAGTGGTATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGCCACACATCCATTCTGGGGTCCTCACTGCG:1	TAGTAGTGGTATATGGACACCA	CCATTCTGGGGTCCTCACTGCG	-	chr3L	11865862	-	chr3L	11864567	1295	+	chr3L	11864567	+	chr3L	11865862
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGTG:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TGTGGTGTTGTGTGGTGTGGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	13104419	8803116	+	chr3R	13104419	+	chr3R	21907535
GTAGTCCATCGTACATCATGCATCAGCAGAGGGACATTCACAATGGAAAATCCGTAACGAAAACTGGAACACACA:1	GTAGTCCATCGTACATCATGCA	GTAACGAAAACTGGAACACACA	-	chr2L	8084337	-	chr2L	14444204	6359867	+	chr2L	14444204	+	chr2L	8084337
ATGCAGAATAATTATTATTTTGCCACCCGAGTGGGGCTGTAATGCGAAGGCTTCTCCCAATTTGCAAGTTCTTG:1	ATGCAGAATAATTATTATTTTG	TCTCCCAATTTGCAAGTTCTTG	-	chr3R	27800130	-	chr3R	27799753	377	+	chr3R	27799753	+	chr3R	27800130
CTCGCACAGCAATTCCTCGGAACCACCCGTNNNGNTCGCCGAACTTATTCTGCGTACCAAGGAACCCTTGATG:1	CTCGCACAGCAATTCCTCGGAA	GCGTACCAAGGAACCCTTGATG	-	chrX	14197210	-	chrX	2159242	12037968	+	chrX	2159242	+	chrX	14197210
CTATCCTGNACTGCAGCATTATTTGTTTCTCTGTANATTTAATCACTGCAATATGCAATCAGTTCATATCAGAGC:1	CTATCCTGNACTGCAGCATTAT	TGCAATCAGTTCATATCAGAGC	+	chr2R	15700233	+	chr2R	15700348	115	+	chr2R	15700233	+	chr2R	15700348
CACTCCAATCAGTGACCGCACTTTAAAGCAGTGCCCCCCTNGTTGNGCACTATCCGGATCCACNGCTCCT:1	CACTCCAATCAGTGACCGCACT	ACTATCCGGATCCACNGCTCCT	-	chr3L	6372229	-	chr3L	6372149	80	+	chr3L	6372149	+	chr3L	6372229
TAAGTATATATAAAGCCTTATTTGAGTCCTGGTCNAGATAACAAAATGNTATAAAGATAGATATCCCTACATCTG:1	TAAGTATATATAAAGCCTTATT	AAGATAGATATCCCTACATCTG	+	chr2L	9862349	+	chr2L	9862457	108	+	chr2L	9862349	+	chr2L	9862457
TGGCCTCAATGTAAATGCATATTTACATATATATCTAGAAAGGTGTGCTGTGCTTTTTGCAATTGGTCTCAGGT:1	TGGCCTCAATGTAAATGCATAT	CTTTTTGCAATTGGTCTCAGGT	+	chrX	6118699	+	chrX	6118780	81	+	chrX	6118699	+	chrX	6118780
TGTCCCACTCGCATTTTCAGTTCCGTTTCGCAACTGCCAGCGCCACATCTTTCGACCCTTC:1	TGTCCCACTCGCATTTTCAGTT	GCGCCACATCTTTCGACCCTTC	-	chrX	11201866	-	chrX	11194459	7407	+	chrX	11194459	+	chrX	11201866
CTACAAAATACCCTAAGAACCCTAGACTGGAAATGGATAGATTAAATCATGGGCGGCTTCCACAATAATTTGTGG:1	CTACAAAATACCCTAAGAACCC	CGGCTTCCACAATAATTTGTGG	+	chrX	5760392	+	chrX	10320143	4559751	+	chrX	5760392	+	chrX	10320143
GAACATTTTGATTTAAGTACCAGGTATAAAGGTTCACTTTATTTATATCCTAACATATATGGCTTACCTGAAGA:1	GAACATTTTGATTTAAGTACCA	ACATATATGGCTTACCTGAAGA	-	chr2R	9870053	-	chr2R	9869978	75	+	chr2R	9869978	+	chr2R	9870053
GAACGTAGTGTAAAATGCAGCTGGGCTGCAAAAGGCAGATGAAGAAATGGGAAGAATCGTAGCTCCTGCGGTG:1	GAACGTAGTGTAAAATGCAGCT	AAGAATCGTAGCTCCTGCGGTG	+	chrX	14300830	+	chrX	14300906	76	+	chrX	14300830	+	chrX	14300906
GCTTTCGCAAGCAGTGAGCGTTCAATTTAACTTCGTATCACTGACTACCCGCGGAGCCGAGAAACCTTTGTACAT:1	GCTTTCGCAAGCAGTGAGCGTT	GAGCCGAGAAACCTTTGTACAT	-	chrX	806896	-	chrX	806800	96	+	chrX	806800	+	chrX	806896
TTCCTTTGGTTTTTTTTCCGCTATATTTAATGGCAGACAGATGAAGATGTGTCAAAAGTGTCTAGACCGG:1	TTCCTTTGGTTTTTTTTCCGCT	GTGTCAAAAGTGTCTAGACCGG	-	chr2L	2755956	-	chr2L	16618635	13862679	+	chr2L	16618635	+	chr2L	2755956
ATCAGCTTCTCGTTGCAGCCTTTTGGCTTATTTGCATATTGTTCTTGAACAGGAGTTTCCTCATTCGGTACTT:1	ATCAGCTTCTCGTTGCAGCCTT	GGAGTTTCCTCATTCGGTACTT	+	chr3L	2412865	+	chr3L	2053464	359401	+	chr3L	2412865	+	chr3L	2053464
AAGAGAACTCCCCAGTTATGAACAATATACATAGATGTTTTTTTAAGTGCAAGGCTAAAGGAGAAACCAGTCCCT:1	AAGAGAACTCCCCAGTTATGAA	GCTAAAGGAGAAACCAGTCCCT	+	chr2L	3582909	+	chr2L	3582986	77	+	chr2L	3582909	+	chr2L	3582986
TAGATTGAATTAGGGATTTTCTTTTACGCTTCGCTGTGTCGTTTGTCAAAAAATAAAAGTGTTTTTTGTTTT:1	TAGATTGAATTAGGGATTTTCT	AAATAAAAGTGTTTTTTGTTTT	+	chrX	14988873	+	chrX	10556434	4432439	+	chrX	14988873	+	chrX	10556434
AAGGCCTCTGCATGTTAGGCGGTGGGGGAGGTTTCCCTACGCAAGAATCCCCCCGCTTCCAAATGTGATGAGGG:1	AAGGCCTCTGCATGTTAGGCGG	CCGCTTCCAAATGTGATGAGGG	+	chr3L	21828952	+	chr3L	21829038	86	+	chr3L	21828952	+	chr3L	21829038
TGCACGCGAAAAACTTTGCGATAACCAAGCTACTCACTCACTCACTCCATTTTCAGATACAACATCTCCTGGGCC:1	TGCACGCGAAAAACTTTGCGAT	CAGATACAACATCTCCTGGGCC	-	chr3R	27779357	-	chr3R	27779277	80	+	chr3R	27779277	+	chr3R	27779357
GCCCAACATACATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCCCGAACGCCAATCCCCAAGCCCAAATATGGG:1	GCCCAACATACATACCTACCAG	AATCCCCAAGCCCAAATATGGG	+	chr2R	24490160	+	chr2R	24488272	1888	+	chr2R	24490160	+	chr2R	24488272
GTGATCGTATTAAAGGAGTTTAGCAAAAGAATAAAAAACAAAAGGAAAATAAAA:1	GTGATCGTATTAAAGGAGTTTA	AAAAAACAAAAGGAAAATAAAA	-	chr2L	4432919	-	chr2L	18868182	14435263	+	chr2L	18868182	+	chr2L	4432919
ATTCCGACAGATTCCGGCAATATCTTCACACTCTTTTCCTGCTACACAGAGCATTATTTCTATCATATCATGAA:1	ATTCCGACAGATTCCGGCAATA	ATTATTTCTATCATATCATGAA	+	chr2R	21363137	+	chr2R	21363234	97	+	chr2R	21363137	+	chr2R	21363234
TGCAGTTGCAGTTATGCTCACCGTAGGCCAGAAATCGTAAATTGCATTGCGCACTAGTCTTTCTTTTGCAACAAT:1	TGCAGTTGCAGTTATGCTCACC	CTAGTCTTTCTTTTGCAACAAT	-	chrX	3370711	-	chrX	3370629	82	+	chrX	3370629	+	chrX	3370711
GCATTTGTGTGAAGTTTCCGATAAATTCATGCACCAGACCAACCCCTCGAAAATNGCAAATTCGCGACTTGGCG:1	GCATTTGTGTGAAGTTTCCGAT	ATNGCAAATTCGCGACTTGGCG	+	chr3L	2479036	+	chr3L	2479132	96	+	chr3L	2479036	+	chr3L	2479132
CTTATATTTAAACTCAATTAAATGGAAAATAATAAATTCAGAAATGTGTGTTGACAACAATGATTTAGAGAATGA:1	CTTATATTTAAACTCAATTAAA	ACAACAATGATTTAGAGAATGA	+	chr2R	12707527	+	chr2R	12715893	8366	+	chr2R	12707527	+	chr2R	12715893
GACATTTTTTGCATAACAACGTTTTAATTTATGTATGTGTGTTATATATTTCAATTTTTCCTATTTGCAAAACCT:1	GACATTTTTTGCATAACAACGT	ATTTTTCCTATTTGCAAAACCT	+	chr3R	5696136	+	chr3R	5696232	96	+	chr3R	5696136	+	chr3R	5696232
CAATCGGACACTCGTATTCAAAGCAGCTACTTGGCCAGTCGAGCTTATGCCAAATTAAAAACGCATTCATT:1	CAATCGGACACTCGTATTCAAA	CCAAATTAAAAACGCATTCATT	+	chr3R	27370126	+	chr3R	27370328	202	+	chr3R	27370126	+	chr3R	27370328
ATTTATTATTAATGTTCATTAATGAAACAAAATATGACTTTTTTTTCTAGTGCATGTAAGAGCAGGACGGGCCTA:1	ATTTATTATTAATGTTCATTAA	ATGTAAGAGCAGGACGGGCCTA	-	chrX	22963162	-	chrX	22963086	76	+	chrX	22963086	+	chrX	22963162
AAGGAAAACAAAAAACACACTAGCTTTTTCAAAAAGCTTCCGTTT:1	AAGGAAAACAAAAAACACACTA	CTTTTTCAAAAAGCTTCCGTTT	+	chr2L	12188285	+	chr2L	12188842	557	+	chr2L	12188285	+	chr2L	12188842
AAAAAATGTGAGNAGACAATTTGACGCCTANANGCGAANTTGCTTTGTTTTTTCTCTCAGTTTCTTGTTTAATT:1	AAAAAATGTGAGNAGACAATTT	TCTCTCAGTTTCTTGTTTAATT	+	chr3L	8019734	+	chr3L	8024146	4412	+	chr3L	8019734	+	chr3L	8024146
CCCATGAGCTGGCCGATGATGGCTACCGGTACAAGACCCATCGTCGCGTTGTTT:1	CCCATGAGCTGGCCGATGATGG	AAGACCCATCGTCGCGTTGTTT	+	chr3L	4480570	+	chr3L	4481013	443	+	chr3L	4480570	+	chr3L	4481013
GGCAAAGGGGGCAAAATAAANATAGCAAAGTCNTTTAATTGCNAAAACGCGTTTTATTGATTGCGTTAGGTGG:1	GGCAAAGGGGGCAAAATAAANA	TTTTATTGATTGCGTTAGGTGG	+	chr3L	1449885	+	chr3L	816236	633649	+	chr3L	1449885	+	chr3L	816236
GTGCGCATAACTGGCACAAGCCAGTTCGGTTTTTGGACAAGATGCAGTGCAGCGCCAATGTGGAACCTG:1	GTGCGCATAACTGGCACAAGCC	TGCAGCGCCAATGTGGAACCTG	-	chr3L	13128226	-	chr3L	13128059	167	+	chr3L	13128059	+	chr3L	13128226
ATTAAAGTGAGGCCAAGACAAACGAATGCGAACACGATTGAAATGGAAATCTGCCCTGCGGTTTGATTATGTATC:1	ATTAAAGTGAGGCCAAGACAAA	CCCTGCGGTTTGATTATGTATC	+	chrX	13515717	+	chrX	13515966	249	+	chrX	13515717	+	chrX	13515966
CACCATTCAACCCACCCCGGACGAACGATTCCTGCCCCTGGCGACTAGCACGTTC:1	CACCATTCAACCCACCCCGGAC	GCCCCTGGCGACTAGCACGTTC	+	chr3L	1317851	+	chr3L	1561808	243957	+	chr3L	1317851	+	chr3L	1561808
CGTACAATGGTGGCTTAATCTATGATCTTCTTCTTTGTATAACTTTTTGCGCTTAATAGCATTAATAATATCAC:1	CGTACAATGGTGGCTTAATCTA	TTAATAGCATTAATAATATCAC	-	chr3R	29590476	-	chr3R	29590384	92	+	chr3R	29590384	+	chr3R	29590476
CTCAGGATGCCTATCAATATAAAGTTACTCTTGTTTCGGTAAGAACTCTGATCTGTTGAAAATGTTAACATTTT:1	CTCAGGATGCCTATCAATATAA	CTGTTGAAAATGTTAACATTTT	+	chr3L	13400532	+	chr3L	13400607	75	+	chr3L	13400532	+	chr3L	13400607
AACAAATTTTAACTCAAAAATTTTGATAATTTACGGCACCTGGTTTATGTATATTTTCCATATAAAGTATTATAG:1	AACAAATTTTAACTCAAAAATT	TTTTCCATATAAAGTATTATAG	+	chrX	13335222	+	chrX	9606265	3728957	+	chrX	13335222	+	chrX	9606265
ACTGCCAATTCGAATAAACATAAAAATAGTTTTTNAATAGCGCAGAAATCTATTAGTCTTACTCAATGCACGTAG:1	ACTGCCAATTCGAATAAACATA	TAGTCTTACTCAATGCACGTAG	+	chr3R	19236314	+	chr3R	17215957	2020357	+	chr3R	19236314	+	chr3R	17215957
GACTCCAATTGCAGGGGTAAAACCTTTAACAAAAAAAAACCAAGGAGACAGCGACAGCAGCAAATCAATCAACGC:1	GACTCCAATTGCAGGGGTAAAA	ACAGCAGCAAATCAATCAACGC	+	chr2L	5457898	+	chr2L	20049556	14591658	+	chr2L	5457898	+	chr2L	20049556
TGATAAAATATTGGAAAAATATAGAAAAAATGTGTAGGGTAAAAAAAAATGCCTTGAGTAAACAT:1	TGATAAAATATTGGAAAAATAT	AAAAAATGCCTTGAGTAAACAT	-	chr3R	18695857	-	chr3R	18695783	74	+	chr3R	18695783	+	chr3R	18695857
GGAATTTGTTTGATTCAATTATCTCTTTCAATTGTTGTTTCGAAGTGTAGCAAAGCCAAGGACTAAACTTAAG:1	GGAATTTGTTTGATTCAATTAT	AAAGCCAAGGACTAAACTTAAG	-	chr2L	9733672	-	chr2L	9733582	90	+	chr2L	9733582	+	chr2L	9733672
CGAACAATACAAGAAAAAACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAG:1	CGAACAATACAAGAAAAAACAA	ACAACACAACACAACACAACAG	+	chr3R	14553624	+	chr3R	21907536	7353912	+	chr3R	14553624	+	chr3R	21907536
ACCTCGAGGACTGGACACGCTCTGGAGGAGCTGGCCAAAGTAAAAG:1	ACCTCGAGGACTGGACACGCTC	GAGGAGCTGGCCAAAGTAAAAG	+	chr3R	19079605	+	chr3R	19079661	56	+	chr3R	19079605	+	chr3R	19079661
TGTAAGCAGCACCACTGAAGAAAGCTCCAGCGCCAGTCTAGGCGCTGAAACCGACAAAAAGTCTACTTCTGA:1	TGTAAGCAGCACCACTGAAGAA	CCGACAAAAAGTCTACTTCTGA	+	chrX	10035457	+	chrX	10035540	83	+	chrX	10035457	+	chrX	10035540
AAGGGGATATCTACATAGGCAACATTGCAATTCTCAATGAATTGGGAATAGTAGATAGAGGC:1	AAGGGGATATCTACATAGGCAA	ATTGGGAATAGTAGATAGAGGC	-	chr3L	13338378	-	chr3L	13338295	83	+	chr3L	13338295	+	chr3L	13338378
CTGAAAAGCAACTCCACACACAGACACACACACACACACACACACACACATA:1	CTGAAAAGCAACTCCACACACA	CACACACACACACACACACATA	+	chrX	11086057	+	chrX	7978953	3107104	+	chrX	11086057	+	chrX	7978953
AATTAATAGACATATTGTAAATGGTTGCCANNNANACGGCAGATTTGTAAAGACAAGTTCGCCCAGCGTTAAGC:1	AATTAATAGACATATTGTAAAT	ACAAGTTCGCCCAGCGTTAAGC	-	chr3L	22624644	-	chr3L	22617193	7451	+	chr3L	22617193	+	chr3L	22624644
ATATGTTTTTCGTTACAATTTGATATCATGAAAGAGTGACTTTTAAAGTTACCTTCAGAGTATTAACTTTAAAAT:1	ATATGTTTTTCGTTACAATTTG	TTCAGAGTATTAACTTTAAAAT	-	chr3L	10518731	-	chr3L	10518596	135	+	chr3L	10518596	+	chr3L	10518731
TGCACATTATGCNGCTAATCGAAGGGAAAGNGNATACANTTTCGTTGTAGTCATAAAATGTAATTAATTAACTT:1	TGCACATTATGCNGCTAATCGA	ATAAAATGTAATTAATTAACTT	-	chrX	14813833	-	chrX	14813756	77	+	chrX	14813756	+	chrX	14813833
GCCACTTTATTGCTTCTCCTGTTTTCGCTTTTCAATATGTGTTCGTTTTTCGTGCATATTTGTTGCT:1	GCCACTTTATTGCTTCTCCTGT	TTTTTCGTGCATATTTGTTGCT	-	chr2L	52576	-	chr2L	47479	5097	+	chr2L	47479	+	chr2L	52576
AAACGGATAAACTTTGCTCGATTTTTTTGCATGAAATTTCAATTTTCCACCTGCAACTAAAACCACTTTTTTTCA:1	AAACGGATAAACTTTGCTCGAT	CAACTAAAACCACTTTTTTTCA	+	chr2R	17982934	+	chr2R	17983019	85	+	chr2R	17982934	+	chr2R	17983019
CTTTTTGGGCAGCTTCCTCAGCGGCCTTTTGGGC:1	CTTTTTGGGCAGCTTCCTCAGC	CTTCCTCAGCGGCCTTTTGGGC	+	chr3R	10768780	+	chr3R	10768723	57	+	chr3R	10768780	+	chr3R	10768723
TATAAAATAATATAACGACAGTTTTGANATNNAACGATCCAAACAAACANANGTTTTGTATTAGTATGGATTT:1	TATAAAATAATATAACGACAGT	NGTTTTGTATTAGTATGGATTT	-	chr2R	25236412	-	chr2R	24812823	423589	+	chr2R	24812823	+	chr2R	25236412
CCGTAAATTTCCCTGGAGGCGGACGCTCCAACCCCGAGGAAGCAACAGCCCAG:1	CCGTAAATTTCCCTGGAGGCGG	CCCCGAGGAAGCAACAGCCCAG	-	chr3L	11409769	-	chr3L	11409468	301	+	chr3L	11409468	+	chr3L	11409769
TTTTTACAAATACACTAAATTTGCTAACAAGTTGCCTTCATTTAAAACTTAACTAAAGTTAAAGAAATAACATTT:1	TTTTTACAAATACACTAAATTT	TAAAGTTAAAGAAATAACATTT	-	chr2L	14684219	-	chr2L	14684135	84	+	chr2L	14684135	+	chr2L	14684219
TTAATTGTTGGTAATTAAAGTACAATTAAAAGAACATTCTCTTACCAATTAGTAATAAGAGCAACAAGACGTTAA:1	TTAATTGTTGGTAATTAAAGTA	AATAAGAGCAACAAGACGTTAA	-	chr3L	3902562	-	chr3L	3902474	88	+	chr3L	3902474	+	chr3L	3902562
AAAGTGAATCAAATCGCACGAAAAAATATGTGAATTAAATGTGACCTCGTCTGGCGGGGCGGAGCCTGCAAACAA:1	AAAGTGAATCAAATCGCACGAA	GCGGGGCGGAGCCTGCAAACAA	-	chr2R	7153269	-	chr2R	7153183	86	+	chr2R	7153183	+	chr2R	7153269
CATTGATGCCGACGTGGGTTCGAGAGGAAATATGCACTGGCCGCAGGCTGGATAGGTACACCGCCAGTAAGAA:1	CATTGATGCCGACGTGGGTTCG	ATAGGTACACCGCCAGTAAGAA	+	chr3R	6891241	+	chr3R	6891315	74	+	chr3R	6891241	+	chr3R	6891315
GATGACNATGCGTCGTTGCCTAGGGTTTCTGTTTTGTTGTTTTTTNTTTTCTGTTTTT:1	GATGACNATGCGTCGTTGCCTA	TTGTTTTTTNTTTTCTGTTTTT	+	chr2L	8127724	+	chr2L	7861231	266493	+	chr2L	8127724	+	chr2L	7861231
CATTGCATCTCAATTTATAATCTGCACTATATCTGCGCGTTAGATTTGCAAATAAATTATATTGAGGGAAACGTG:1	CATTGCATCTCAATTTATAATC	AAATTATATTGAGGGAAACGTG	-	chr2L	17637252	-	chr2L	17637167	85	+	chr2L	17637167	+	chr2L	17637252
AAGCTGATTTGGCCTGAGAATATTTGAAACTTCTTGTTGGTCCTTCTCACTAACTATAGTGTATAATGGCCTTGA:1	AAGCTGATTTGGCCTGAGAATA	CTATAGTGTATAATGGCCTTGA	-	chr3R	19448934	-	chr3R	19447693	1241	+	chr3R	19447693	+	chr3R	19448934
GCTGTCAGTATAAGAGTTTCTCGCTTGCTTAATTTAAAAATAAAAAAATGTCTCTATCATCATGTGGAAGATTTT:1	GCTGTCAGTATAAGAGTTTCTC	CTATCATCATGTGGAAGATTTT	-	chr3R	27027774	-	chr3R	27027692	82	+	chr3R	27027692	+	chr3R	27027774
GTGCCCTGTCCAGTTTTCCCTGGGGAATGGNNNTNTAGGTGCACGCATACTGGAAAATCCGTTTCGTTTTGACAT:1	GTGCCCTGTCCAGTTTTCCCTG	AAAATCCGTTTCGTTTTGACAT	-	chr2L	21049417	-	chr2L	21041156	8261	+	chr2L	21041156	+	chr2L	21049417
TTTAGCCTGGCTACATGGCGAAATCATGGTGCACAAATTAATTTTCATAGTATATTTTTTATGCGCTTATGTTG:1	TTTAGCCTGGCTACATGGCGAA	TATTTTTTATGCGCTTATGTTG	+	chr2L	13481456	+	chr2L	13482062	606	+	chr2L	13481456	+	chr2L	13482062
AACAAAAAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAAAAAAATGTCGAAGGAAACTTAAATTGTTAAA:1	AACAAAAAGCTCTACAGTCATT	GAAGGAAACTTAAATTGTTAAA	+	chr2L	9393522	+	chr2L	9396486	2964	+	chr2L	9393522	+	chr2L	9396486
AAATCAAGCATAACATCAACATTTTCACATCTCCCCCAATGCTACACCCATTTGCGAGATAAAGACCAATCGCAA:1	AAATCAAGCATAACATCAACAT	GCGAGATAAAGACCAATCGCAA	+	chr2L	5897598	+	chr2L	5897681	83	+	chr2L	5897598	+	chr2L	5897681
AGCATTACTCCGTGGTGATTTTCTAGTTTCCTTGAGTGAAGCATATAGTGCTTAGATCCGAAAAAAAAGTTAAGC:1	AGCATTACTCCGTGGTGATTTT	AGATCCGAAAAAAAAGTTAAGC	-	chr3R	21472114	-	chr3R	21472033	81	+	chr3R	21472033	+	chr3R	21472114
GCTAATGGCCATCAGCAGCACCTCGCCCAGCAGCTGCAGCATTTGCAGCATAAA:1	GCTAATGGCCATCAGCAGCACC	GCTGCAGCATTTGCAGCATAAA	+	chr2L	5897375	+	chr2L	2225108	3672267	+	chr2L	5897375	+	chr2L	2225108
TATTATTTTCTTTAAGCAATCGAGTTAATCGGTGGACAGTTTAGGTTNTGCCAATAAGTGCTGTGTTATCGTTC:1	TATTATTTTCTTTAAGCAATCG	AATAAGTGCTGTGTTATCGTTC	-	chrX	5272938	-	chrX	5272852	86	+	chrX	5272852	+	chrX	5272938
GTGGCGTATGCGTAACGTNGTATAATGCACGTTAAGAGGAGAANTCCTGNCATCGGTCAACTGGCCG:1	GTGGCGTATGCGTAACGTNGTA	CCTGNCATCGGTCAACTGGCCG	+	chr3R	26772279	+	chr3R	31476395	4704116	+	chr3R	26772279	+	chr3R	31476395
ACGTTTGTGAGTCCTTGCTGCATCCAGCCTTGGTAGTGGAAGGTCTTGTGGGTAATCTCGTTGGTGTTT:1	ACGTTTGTGAGTCCTTGCTGCA	GTGGGTAATCTCGTTGGTGTTT	-	chr3R	24441905	-	chr3R	24441629	276	+	chr3R	24441629	+	chr3R	24441905
CTAAAAAACAGCAATGAATTATTGATCAAACGTAATTAAACTTTAAAAATGATGTTATATAAGTTTATGGCATTT:1	CTAAAAAACAGCAATGAATTAT	GTTATATAAGTTTATGGCATTT	+	chr2L	21286619	+	chr2L	21286697	78	+	chr2L	21286619	+	chr2L	21286697
TTCAACTCTCTCACGCGCTTTTGGAGAGTGGTGAGAAGTGGGGAGAGCGTTGATTAAACTCNATGAAATAAATTA:1	TTCAACTCTCTCACGCGCTTTT	TTAAACTCNATGAAATAAATTA	-	chr2L	12529516	-	chr2L	12529440	76	+	chr2L	12529440	+	chr2L	12529516
CGAAACTTTGGGGGAAAGTGTTAAGAACTCGTGTAAATTCCATTAGGGCCAAAAAGTTTCAGGCAACGAGCAAAG:1	CGAAACTTTGGGGGAAAGTGTT	AAGTTTCAGGCAACGAGCAAAG	-	chr3R	30086348	-	chr3R	30084881	1467	+	chr3R	30084881	+	chr3R	30086348
AAAATTANAAAAAAAAAGAAACAACGAACCGAAANGCCAAACAATCTCACAGCAAATCCGAGACGCGTC:1	AAAATTANAAAAAAAAAGAAAC	CACAGCAAATCCGAGACGCGTC	-	chr3R	9294952	-	chr3R	13567256	4272304	+	chr3R	13567256	+	chr3R	9294952
TTAAATCATCCAATTCCCATTTAGCTTTATCATTTTTTGTAGGTGTTAACTCATATTTTCCATCTCTCGCCCAAG:1	TTAAATCATCCAATTCCCATTT	TATTTTCCATCTCTCGCCCAAG	+	chrX	4324397	+	chrX	4324474	77	+	chrX	4324397	+	chrX	4324474
CGATAGCATAACATACAAAATACGTTCATAAATANTCATGCGTTATATACAAATACAAAATCTACAATTATGGTC:1	CGATAGCATAACATACAAAATA	TACAAAATCTACAATTATGGTC	-	chr2R	8331374	-	chr2R	8330888	486	+	chr2R	8330888	+	chr2R	8331374
GGTTTTATTGTTTAAGTTAAGTAACTTATATAATATAGTACTGTTGTTTATGATAATCGTCTTTGAATGCATTAT:1	GGTTTTATTGTTTAAGTTAAGT	TAATCGTCTTTGAATGCATTAT	-	chr3R	20252319	-	chr3R	20252241	78	+	chr3R	20252241	+	chr3R	20252319
GCCCCGTTCTCAACCACTCTNGTTTTTCAGTCNAAACATCCANATGTATAAATTTCCAACTTGGCTTCTGTTTT:1	GCCCCGTTCTCAACCACTCTNG	TTTCCAACTTGGCTTCTGTTTT	+	chr3L	351337	+	chr3L	18199546	17848209	+	chr3L	351337	+	chr3L	18199546
TTTCTGATTTAGCCTAGTGGAACAAGATGCTAACAACGGCAGACACACAAAGCTAAGACCACCATCCCAAA:1	TTTCTGATTTAGCCTAGTGGAA	AAGCTAAGACCACCATCCCAAA	+	chr2R	17260596	+	chr2R	17260779	183	+	chr2R	17260596	+	chr2R	17260779
TAAACTCAATTAAATGGAAAATAANAAATTCAGAAATGTGTGNTGNCAACANTGANTTAGAGAATGAATGAAAGC:1	TAAACTCAATTAAATGGAAAAT	GANTTAGAGAATGAATGAAAGC	+	chr2R	12707535	+	chr2R	12715901	8366	+	chr2R	12707535	+	chr2R	12715901
CACGCTTTGTTTTAGCAGAAGAGCAATTCAGATGCCGTCGCACATCATTCACTACTGTGGC:1	CACGCTTTGTTTTAGCAGAAGA	GCACATCATTCACTACTGTGGC	+	chr2L	7657783	+	chr2L	7657847	64	+	chr2L	7657783	+	chr2L	7657847
ATAATATAAATACAAATANATTTCGCACATAACTTGGCGTGNATCNAACNAAACAGTCACCGAGAATTAGCAAGA:1	ATAATATAAATACAAATANATT	CAGTCACCGAGAATTAGCAAGA	+	chr2R	21159015	+	chr2R	21159097	82	+	chr2R	21159015	+	chr2R	21159097
CCGAAGCAGCAGTCTCCACATTCAACTTAAGCTTAAACAGAGAGATAGTTATTGTTCAAATTCTCAACTTTTGAT:1	CCGAAGCAGCAGTCTCCACATT	GTTCAAATTCTCAACTTTTGAT	+	chr2L	21284080	+	chr2L	21284553	473	+	chr2L	21284080	+	chr2L	21284553
CTAAAGTCGGCGCTTATTTTTTTTTTGGTCAAATTTTTTATATGCACATAATTA:1	CTAAAGTCGGCGCTTATTTTTT	ATTTTTTATATGCACATAATTA	-	chr2L	19263049	-	chr2L	10056791	9206258	+	chr2L	10056791	+	chr2L	19263049
TTTCCCCGGGTGTGTGCTGTATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTAT:1	TTTCCCCGGGTGTGTGCTGTAT	TTGTGATGTGTTCACATTCTAT	+	chr2R	10585576	+	chr2R	10594146	8570	+	chr2R	10585576	+	chr2R	10594146
ACCTGAAATGTTTGGCGCTGCAACAGATAACTTTNATGTTCAGTTGGCTACACGGAACTAATGATGTCGCGGC:1	ACCTGAAATGTTTGGCGCTGCA	ACGGAACTAATGATGTCGCGGC	+	chr3L	11157750	+	chr3L	11157867	117	+	chr3L	11157750	+	chr3L	11157867
TAGTAATCAGGAGAATAATTGAAGTAAGGCAAACCCAGGGACAAAACCATGATGCTCT:1	TAGTAATCAGGAGAATAATTGA	AGGGACAAAACCATGATGCTCT	-	chr2R	6691203	-	chr2R	6691141	62	+	chr2R	6691141	+	chr2R	6691203
CATAGCATACTTTTTGGGGCAAGGCCAGCTAGCTGCAGCCTAGCGGTATAAAATTAAAAAACTCGAA:1	CATAGCATACTTTTTGGGGCAA	GTATAAAATTAAAAAACTCGAA	+	chrX	7845736	+	chrX	7847219	1483	+	chrX	7845736	+	chrX	7847219
TTATGTGCTTTGTTTAATTGTTGACTCTGAATCAGGCCTACAAATCCATCAACTTCTGTTCACCTTTTCCCATAT:1	TTATGTGCTTTGTTTAATTGTT	TTCTGTTCACCTTTTCCCATAT	+	chr3L	8148075	+	chr3L	8148283	208	+	chr3L	8148075	+	chr3L	8148283
CTCATTTCTGTATGCATCCATAATTTTATCTTTCAAATTAAATTCCTTACTAAATTTATAAAACTATAACTAGCA:2	CTCATTTCTGTATGCATCCATA	ATTTATAAAACTATAACTAGCA	+	chr3R	27028729	+	chr3R	27028808	79	+	chr3R	27028729	+	chr3R	27028808
AAAAAAAAATATCCTTACTAAAGTTAATCCAATAACTAAAGTGATTTACCATCTGGCTGCTTGATTCCCGG:1	AAAAAAAAATATCCTTACTAAA	CATCTGGCTGCTTGATTCCCGG	-	chr2L	7183379	-	chr2L	7183301	78	+	chr2L	7183301	+	chr2L	7183379
ATTGTGTGTGTTTGTGGAGGGAAAGGATGATAGAGCGAGGGACTCGGAGAATGGGGTTAGCAATGGGATTGGGAT:1	ATTGTGTGTGTTTGTGGAGGGA	GGGTTAGCAATGGGATTGGGAT	+	chr2L	10039431	+	chr2L	19514376	9474945	+	chr2L	10039431	+	chr2L	19514376
GTGTGCGTGAGCTTAAGAGCAAGAGGGCGGGGGCATGTGTCGTATTTCGTTGGTGGCCTTGACTTTTAGTAACCT:1	GTGTGCGTGAGCTTAAGAGCAA	TGGCCTTGACTTTTAGTAACCT	-	chr3L	9465867	-	chr3L	18032033	8566166	+	chr3L	18032033	+	chr3L	9465867
GACAGAGCGGAAACGGAAACGAAAACGATAACAGNAGAGCAGAGCAGCGTTCGCCATAATGACGTTCCAAAAATT:1	GACAGAGCGGAAACGGAAACGA	CCATAATGACGTTCCAAAAATT	+	chr3R	21561448	+	chr3R	18291571	3269877	+	chr3R	21561448	+	chr3R	18291571
GCAAATGTTTGCTTTGTTGTTATTGACACAATGCAAATTATCATTTGAGGTTTTCCAGACTGCCACGCCCACACC:1	GCAAATGTTTGCTTTGTTGTTA	TCCAGACTGCCACGCCCACACC	-	chr3L	7889033	-	chr3L	7886515	2518	+	chr3L	7886515	+	chr3L	7889033
GGGTTTCCATTTTCGCCTCTTTAGCATAAAATATTCGCCAATTCTATGCGCGACTAGATGCCGTGGCACATT:1	GGGTTTCCATTTTCGCCTCTTT	CGACTAGATGCCGTGGCACATT	+	chr2L	19871555	+	chr2L	19871639	84	+	chr2L	19871555	+	chr2L	19871639
AAAGACAGATCAATTCTCGAAGCATTCGCTAAGCTGGACTTCTCCCGTTGGGTTGTCAAGGAGGTGTACACA:1	AAAGACAGATCAATTCTCGAAG	GGTTGTCAAGGAGGTGTACACA	+	chr2R	4656796	+	chr2R	4656897	101	+	chr2R	4656796	+	chr2R	4656897
CGTAGCCACACTGGCAAAAAAAAGTGGAACGGAAAATGCTTACTAAATGAGTAACATAATTAACAC:1	CGTAGCCACACTGGCAAAAAAA	AAATGAGTAACATAATTAACAC	-	chr2L	20552802	-	chr2L	3212072	17340730	+	chr2L	3212072	+	chr2L	20552802
TCTGCACACGAGCAGCTTCCGCGCGCGTCTGATAAGACGAGGTCCGTCTGAAA:1	TCTGCACACGAGCAGCTTCCGC	ATAAGACGAGGTCCGTCTGAAA	-	chr3L	866481	-	chr3L	858022	8459	+	chr3L	858022	+	chr3L	866481
GGACTGGGAGGGAACCATGCGGGCGTGACTAATTAGCCATGCGATGTTGGTGATGG:1	GGACTGGGAGGGAACCATGCGG	AGCCATGCGATGTTGGTGATGG	+	chr3L	1347192	+	chr3L	1347258	66	+	chr3L	1347192	+	chr3L	1347258
CCATTACTTACATTGTACCCAAATACCTTTATTGTCTTGTATACACTTCGTAAACGTT:1	CCATTACTTACATTGTACCCAA	TTGTATACACTTCGTAAACGTT	-	chr2L	20079639	-	chr2L	20079535	104	+	chr2L	20079535	+	chr2L	20079639
CTCAATTGTGTTTATTTGCGCGAACTTATGGCGCTAAAGGCAAGTCCTGAGCGCTGAGTGCNCACTCACACAGGA:1	CTCAATTGTGTTTATTTGCGCG	CTGAGTGCNCACTCACACAGGA	+	chr2L	13321928	+	chr2L	13322017	89	+	chr2L	13321928	+	chr2L	13322017
TGGATGGTTTGTGGGAGAAATCATTCACGGAATAGGCGACCAGGTAGGTGGAGATTGGCAACGACTCCTGGAAC:1	TGGATGGTTTGTGGGAGAAATC	GATTGGCAACGACTCCTGGAAC	+	chr3R	29237280	+	chr3R	29239300	2020	+	chr3R	29237280	+	chr3R	29239300
ATCAAAAACAAATTGCACAGAAATGTAATGNNNGNTTATTTGATGGACTCCCTTTTGCTTCCATCTCCTCAAATC:1	ATCAAAAACAAATTGCACAGAA	TTTGCTTCCATCTCCTCAAATC	-	chr3L	13727315	-	chr3L	13628484	98831	+	chr3L	13628484	+	chr3L	13727315
CAGGAGNCTGTCGTGGTGGGCGGCTGTGTGTGTGTGTGGGTATGGNTTGGGTTTTTTTTT:1	CAGGAGNCTGTCGTGGTGGGCG	GGTATGGNTTGGGTTTTTTTTT	+	chr2R	19259244	+	chr2R	13194179	6065065	+	chr2R	19259244	+	chr2R	13194179
TTTCTCCATTTCACGTATGTATATGTGCAACGAAAAGTAAATAAATTTAACAAAATGGAAAGCTAAAATTATTTC:1	TTTCTCCATTTCACGTATGTAT	AATGGAAAGCTAAAATTATTTC	-	chr3R	7396157	-	chr3R	7396062	95	+	chr3R	7396062	+	chr3R	7396157
TTATTCAAAAGAATTACATTGGCAAAAAAGCCAACTTTTAAAGAACATTTGTAGAAAATCCTGCACTCAAAAATA:1	TTATTCAAAAGAATTACATTGG	GAAAATCCTGCACTCAAAAATA	+	chrX	21565441	+	chrX	21565519	78	+	chrX	21565441	+	chrX	21565519
GACAAGCCACAACGACGAGGCAGCGAATTTCACCTTGTTANCCACGTTTGAACAGCAGAAGCAGC:1	GACAAGCCACAACGACGAGGCA	ACGTTTGAACAGCAGAAGCAGC	-	chr3L	5843767	-	chr3L	4713740	1130027	+	chr3L	4713740	+	chr3L	5843767
TTGGCTTTCTCCATTTCACGTATGTATATGTGCAACGAAAAGTAAATAAATTTAACAAAATGGAAAGCTAAAAT:1	TTGGCTTTCTCCATTTCACGTA	TAACAAAATGGAAAGCTAAAAT	-	chr3R	7396162	-	chr3R	7396068	94	+	chr3R	7396068	+	chr3R	7396162
AAATCTAGGAAGAACTTTAATAGAATTTATCCATTTGTAGAACACCCAGAAGCCCCGCAACGTGCTCCACTCACT:1	AAATCTAGGAAGAACTTTAATA	CCCGCAACGTGCTCCACTCACT	-	chr2L	8510233	-	chr2L	8510144	89	+	chr2L	8510144	+	chr2L	8510233
CATATTTTTTTAAATTATTATAAGTTGGATTGGCTTGCGTTTTTCTTAACCCTAATCATTGAACATATCTATTT:1	CATATTTTTTTAAATTATTATA	TAATCATTGAACATATCTATTT	+	chr3L	18731137	+	chr3L	14199016	4532121	+	chr3L	18731137	+	chr3L	14199016
TACGAAAAAAAGCCCGGTCCGCGCCCACCTCTACTTGGGGGTGACATTGAAATAAAGAAGTACTGTATTTTCATC:1	TACGAAAAAAAGCCCGGTCCGC	AAAGAAGTACTGTATTTTCATC	-	chr2R	5192346	-	chr2R	5192244	102	+	chr2R	5192244	+	chr2R	5192346
AGCTCAATACGATTAGGAAGCGAGCAGGAGCTAAGGACCTGGGGGAATCTCCTTGCCCAATG:1	AGCTCAATACGATTAGGAAGCG	GGGGGAATCTCCTTGCCCAATG	-	chr2R	16962330	-	chr2R	16962266	64	+	chr2R	16962266	+	chr2R	16962330
CCAATAAATGCCCATTCGGCATATGCATTAAATATTAGTTTGGCCATTGAGTTGAGGAACTCGATTATTAAAGGA:1	CCAATAAATGCCCATTCGGCAT	GAGGAACTCGATTATTAAAGGA	-	chr3R	11958137	-	chr3R	11957854	283	+	chr3R	11957854	+	chr3R	11958137
TTTAATAATTGCCGCCAAATCATTAAACTCTTTTCAAGCTATTTGTATTCTCTCATTGCAAGTTCTCTCGTCTC:1	TTTAATAATTGCCGCCAAATCA	TCATTGCAAGTTCTCTCGTCTC	-	chr3R	3267275	-	chr3R	3267457	182	+	chr3R	3267457	+	chr3R	3267275
GACCTTGATGCCGGGATTCTCGCGCTTGATCGACTCGCGGGCACATACAATTTGATATTTATATTTTGTTGT:1	GACCTTGATGCCGGGATTCTCG	TTTGATATTTATATTTTGTTGT	-	chr2R	21715542	-	chr2R	17274282	4441260	+	chr2R	17274282	+	chr2R	21715542
GTTTTTGTTTTGCTTGGCGTCAGAGTTGCCGCACACGTCAAAGCCTTCTATACACGGTCACATTAGTTTGAGTC:1	GTTTTTGTTTTGCTTGGCGTCA	CACGGTCACATTAGTTTGAGTC	+	chr2R	7916436	+	chr2R	7916520	84	+	chr2R	7916436	+	chr2R	7916520
CCGCGGCACTGAGGCGTGTGGCTTAACTTTTTTTTCGGATCTAAGCACTATATGCTTCACTCAAGGAAACTAGAA:1	CCGCGGCACTGAGGCGTGTGGC	GCTTCACTCAAGGAAACTAGAA	+	chr3R	21472013	+	chr3R	21472094	81	+	chr3R	21472013	+	chr3R	21472094
CGCTGGCAGTCTCAACAGCAACTTTTTTTGAAGGACTGAAAAGTTTTCGCGCTCGCCCAGAAGCGTTGACATTTC:1	CGCTGGCAGTCTCAACAGCAAC	CGCCCAGAAGCGTTGACATTTC	+	chr3R	28107032	+	chr3R	28107114	82	+	chr3R	28107032	+	chr3R	28107114
CGAGCAAGTGCATTTTCCAGGAAATCAAAATCCTTGGCGTTTAGTCGNGATCAACAGGATANTAATAGACAGAAA:1	CGAGCAAGTGCATTTTCCAGGA	ACAGGATANTAATAGACAGAAA	+	chrX	1543307	+	chrX	6801915	5258608	+	chrX	1543307	+	chrX	6801915
ACCTTCAGCCCGTGTCATACGTGGCATATATGCCCCATATGCTGCCCCAAGATCGGTTTTGCATTTATGCGGAGT:1	ACCTTCAGCCCGTGTCATACGT	CGGTTTTGCATTTATGCGGAGT	+	chrX	20331940	+	chrX	20332036	96	+	chrX	20331940	+	chrX	20332036
GTGAAAATCTTAGCACCGAAATTGCGAGGCAAATACAATACAATACAATGCAATACAATACAATACAATACAATA:1	GTGAAAATCTTAGCACCGAAAT	TACAATACAATACAATACAATA	-	chrX	19810950	-	chrX	12946234	6864716	+	chrX	12946234	+	chrX	19810950
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTTTGTTTGTGTTT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTTGTGTTTTTGTTTGTGTTT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13693026	8214508	+	chr3R	13693026	+	chr3R	21907534
TAAATTGTGTTGNATGTTTAGTACTTTCTCNTNGAAAGNGCAGTTCAAAGTTTTACCCCTTCTCAGTGCTTTCT:1	TAAATTGTGTTGNATGTTTAGT	TTACCCCTTCTCAGTGCTTTCT	-	chr3R	31426999	-	chr3R	31426908	91	+	chr3R	31426908	+	chr3R	31426999
ATATACACCCCTAATCAATATATGGTAGAGGTACTATGTTTCAAAGGATATGTATTTTATCTTTGATTTTCTTT:1	ATATACACCCCTAATCAATATA	TATTTTATCTTTGATTTTCTTT	-	chrX	16498234	-	chrX	16492658	5576	+	chrX	16492658	+	chrX	16498234
CAATTACTAAATGGACAGCTTTTAGTATAAAAAGTTGATATGGATACTAGACACATTTGTA:1	CAATTACTAAATGGACAGCTTT	ATGGATACTAGACACATTTGTA	-	chr2L	5449820	-	chr2L	5449744	76	+	chr2L	5449744	+	chr2L	5449820
CACATTCAAGAATACCCACAAAAAAATTCCAACTCTGCATACTTNCAAATTAACAATAAATTTAAGGAGG:1	CACATTCAAGAATACCCACAAA	ATTAACAATAAATTTAAGGAGG	+	chr3R	24912513	+	chr3R	24912590	77	+	chr3R	24912513	+	chr3R	24912590
ACCATGTACTAGCCTCAGTATTGCCGGGAGTTCCAATCTTGTTTAGANTTAAGTGTGCACTTACCAGNGTCTGAT:1	ACCATGTACTAGCCTCAGTATT	TGTGCACTTACCAGNGTCTGAT	+	chr3R	10561808	+	chr3R	10561898	90	+	chr3R	10561808	+	chr3R	10561898
ATGCATGCCGAAGAGACCGTAAATATTTTAAAGCCAGATGCCAAA:1	ATGCATGCCGAAGAGACCGTAA	TATTTTAAAGCCAGATGCCAAA	-	chr3R	28255847	-	chr3R	28253367	2480	+	chr3R	28253367	+	chr3R	28255847
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGACGAGACAAGGCAACGACAGTTTTAAAATCTCTACGGG:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	ACAGTTTTAAAATCTCTACGGG	+	chr3L	22908066	+	chr3L	17301575	5606491	+	chr3L	22908066	+	chr3L	17301575
TACCTTTAGGGGTTCTTCGCTTCCAATCAAACAACCGAAACTTTTTCACACCAACCACCAACACACCGCCCCC:1	TACCTTTAGGGGTTCTTCGCTT	CAACCACCAACACACCGCCCCC	+	chrX	5338732	+	chrX	5339983	1251	+	chrX	5338732	+	chrX	5339983
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907536
CACGGGATGTGGGCAGGGTTCGACCCATCATCAAATCAATGAGCGGCNTGATATAAGGGAGGAGCATAGT:1	CACGGGATGTGGGCAGGGTTCG	TGATATAAGGGAGGAGCATAGT	-	chr3R	28597578	-	chr3R	28597506	72	+	chr3R	28597506	+	chr3R	28597578
TGTATCTAGAATCTAGCAGATAGGTATCTAGGTATAAAATTCATATAAATACAAAATACTGATANTGTAATTATC:1	TGTATCTAGAATCTAGCAGATA	AAATACTGATANTGTAATTATC	+	chr2L	5501471	+	chr2L	5501547	76	+	chr2L	5501471	+	chr2L	5501547
GTGTTTTGCTCACTCGTTACGCAAGCACTCGTTACGCAGAGATCTCCGCATGGCCCAAATGAGAT:1	GTGTTTTGCTCACTCGTTACGC	CTCCGCATGGCCCAAATGAGAT	+	chrX	1845753	+	chrX	1845843	90	+	chrX	1845753	+	chrX	1845843
GAGGGCTTAAAAATTAGTNTAAGATCTGTTTGGGGCGTACTCTNCGCCANGTGCGGTGGGCACGTTGAGGGC:1	GAGGGCTTAAAAATTAGTNTAA	GTGCGGTGGGCACGTTGAGGGC	+	chr3R	29854840	+	chr3R	29854917	77	+	chr3R	29854840	+	chr3R	29854917
ATAAAAAACAGATAGGNACAAAGNGTGCAGAAANAATANTAATAAAAAAAATGACTCCAGTTNTACGCTCGAG:1	ATAAAAAACAGATAGGNACAAA	TGACTCCAGTTNTACGCTCGAG	-	chr3R	9617291	-	chr3R	14230632	4613341	+	chr3R	14230632	+	chr3R	9617291
AGCATAAATAAAGGGAAATTAAATCCATTTAGAGAAAAACCCTTACCTTAGAAAAGAAATTATTAAGTGATGGA:1	AGCATAAATAAAGGGAAATTAA	AAAGAAATTATTAAGTGATGGA	-	chr2L	9280117	-	chr2L	9280024	93	+	chr2L	9280024	+	chr2L	9280117
TAAAAACCATAGAATATTGATTTTTGGTATATTATTTCGAAGTCAAAATATGATAATTTAG:1	TAAAAACCATAGAATATTGATT	AAGTCAAAATATGATAATTTAG	-	chr2R	10318615	-	chr2R	10318543	72	+	chr2R	10318543	+	chr2R	10318615
TATGCTTAATTGCGCCTTATAATAACTAATTTTGGTTAATTTAGATAAACCACTTTTGAATGGGTGAATCACTTT:1	TATGCTTAATTGCGCCTTATAA	TTTTGAATGGGTGAATCACTTT	+	chr2R	14911700	+	chr2R	14911823	123	+	chr2R	14911700	+	chr2R	14911823
GGATTCAGCAGCCAAATCCCGTGCTGAGGATTTCCATTTGAGATGGAAAATAGACGGGGGAG:1	GGATTCAGCAGCCAAATCCCGT	AGATGGAAAATAGACGGGGGAG	+	chr2L	597302	+	chr2L	597171	131	+	chr2L	597302	+	chr2L	597171
TGACTGGATTCCGCCACTTTTAAACAGGTACTTATGCATGCCTCCTTTTGCAGGCCATTTAGGAATGGCCAATAT:1	TGACTGGATTCCGCCACTTTTA	GCCATTTAGGAATGGCCAATAT	-	chr2L	5836722	-	chr2L	5827714	9008	+	chr2L	5827714	+	chr2L	5836722
CATTCAGCATTTTGAAATGCTCGTGTCAAAAATCTAGAACTAATTTTTTTATTGTTATTATTTTTTTTGTTT:1	CATTCAGCATTTTGAAATGCTC	ATTGTTATTATTTTTTTTGTTT	+	chrX	8449882	+	chrX	21056526	12606644	+	chrX	8449882	+	chrX	21056526
ACTATGTACCGATCCTCCAGTACCCCCCCGTATGTATCTGTGTGAGCGGTGCACG:1	ACTATGTACCGATCCTCCAGTA	GTATCTGTGTGAGCGGTGCACG	-	chr3R	27106388	-	chr3R	27106300	88	+	chr3R	27106300	+	chr3R	27106388
TATCGCGTTTTACAACACTTGCAATTTGTAAGCTTAAATTTTGTAAATCAACAAGAGTTCAACTTGAATAAATCA:1	TATCGCGTTTTACAACACTTGC	AGAGTTCAACTTGAATAAATCA	+	chr2R	14018173	+	chr2R	14018257	84	+	chr2R	14018173	+	chr2R	14018257
CCTGGGGAATGGCACTCTAGGTGCACGCATACTGGAAAATCCGTTTCGTTTTGACATTTATTGTTTTTAA:1	CCTGGGGAATGGCACTCTAGGT	TTTTGACATTTATTGTTTTTAA	-	chr2L	21049399	-	chr2L	21041143	8256	+	chr2L	21041143	+	chr2L	21049399
TTTTTAGCCCAGAGGAGAAGGCTGACAGCTNNNCNAAATTTTCGGTAACCATGGCAAGACAGCGACTTCTCGGCT:1	TTTTTAGCCCAGAGGAGAAGGC	GCAAGACAGCGACTTCTCGGCT	+	chr3R	7527451	+	chr3R	11696649	4169198	+	chr3R	7527451	+	chr3R	11696649
CCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTTTCAGTATGGACAGGAACAGCGGCTAT:1	CCAGTGCAATTTAATTATGCAG	TATGGACAGGAACAGCGGCTAT	+	chrX	670291	+	chrX	670371	80	+	chrX	670291	+	chrX	670371
CAACGCAAAGTTATGAATGAAAACGAAGCGTTACACAAATAGAAATTGCTCTGCGGAGCGGGCAAAANTGAAAAA:1	CAACGCAAAGTTATGAATGAAA	CGGAGCGGGCAAAANTGAAAAA	+	chr2R	18590889	+	chr2R	18600041	9152	+	chr2R	18590889	+	chr2R	18600041
AANATATATAGACATTTTTAAAAAATTAAAAAGANANCCCATCTCCGTGACAATGTTTATTTCAACATTGCCGTG:1	AANATATATAGACATTTTTAAA	TGTTTATTTCAACATTGCCGTG	+	chr2R	12334902	+	chr2R	12334980	78	+	chr2R	12334902	+	chr2R	12334980
CTATAAAATAGGAAACCGACCTGCGATCGGAAAATCAAGGGGAGAAAACAAAAAACTAAACNAATTGCTTACTAA:1	CTATAAAATAGGAAACCGACCT	AACTAAACNAATTGCTTACTAA	-	chr3L	22314858	-	chr3L	19429238	2885620	+	chr3L	19429238	+	chr3L	22314858
AAAATTACCGAATTTCGGAACAATTCGTTTTGACTAACAAGAAATCCTATGCTTCCTCGCTGATCTCGACAAACA:1	AAAATTACCGAATTTCGGAACA	TCCTCGCTGATCTCGACAAACA	-	chr3R	30012638	-	chr3R	30017942	5304	+	chr3R	30017942	+	chr3R	30012638
GGTAAGTTTAGCTAGCCCGCACATACTCTTTTCCATCGTTCGTTTATCATCGTTTATTTTTTTTTCT:1	GGTAAGTTTAGCTAGCCCGCAC	ATCATCGTTTATTTTTTTTTCT	+	chrX	8068783	+	chrX	8663926	595143	+	chrX	8068783	+	chrX	8663926
ATTGTACCTCACAATGATTATTACATGAGCGTATATAACTTTATAATTATAATCTTCAAGTAAATGTTTTTACTG:1	ATTGTACCTCACAATGATTATT	CTTCAAGTAAATGTTTTTACTG	+	chr3L	18092791	+	chr3L	18092906	115	+	chr3L	18092791	+	chr3L	18092906
TTTGTCTTCCGGCTGCGACCTCCCTTGCATCCACTAGAGGATTACAANGGCGAATGTCAAGNATTTGAGCGAAAA:1	TTTGTCTTCCGGCTGCGACCTC	ATGTCAAGNATTTGAGCGAAAA	+	chr2L	3403598	+	chr2L	3403792	194	+	chr2L	3403598	+	chr2L	3403792
ACTCGGCTTTGGGTTTCTTATTTGGGGGTGGTACATATTGTGGCACGTAAGCTGCGCACTTGCATTTCCTGTTCT:1	ACTCGGCTTTGGGTTTCTTATT	GCGCACTTGCATTTCCTGTTCT	-	chr2L	5063935	-	chr2L	5064197	262	+	chr2L	5064197	+	chr2L	5063935
AATGTAGCTAAAGTACTGGTGTATATTTGCAATTGACCAGCACTTATNAGGGTACCCCAAAGCGTTCNATTGTCA:1	AATGTAGCTAAAGTACTGGTGT	ACCCCAAAGCGTTCNATTGTCA	+	chr3L	22761413	+	chr3L	22766847	5434	+	chr3L	22761413	+	chr3L	22766847
GTCCGTCTGTATCTATAGTTTTTAGAGTTNAGTTCAGGCAGTCAGTGCGTGATTGAGGCG:1	GTCCGTCTGTATCTATAGTTTT	CAGTCAGTGCGTGATTGAGGCG	+	chr3L	9392491	+	chr3L	9395297	2806	+	chr3L	9392491	+	chr3L	9395297
TTGACAAGCATCCGAGTCGAGTCCGAAGTCCTTGGAGGAGTAGAAGCCCAGTTTCAGTGCTTGGTGGGAATGTCA:1	TTGACAAGCATCCGAGTCGAGT	TCAGTGCTTGGTGGGAATGTCA	+	chr2R	20030998	+	chr2R	20031091	93	+	chr2R	20030998	+	chr2R	20031091
TGTTAAGGGGCCCCCCGAAATCGTAAGTATAACATTGATACGACAGATGTGAACCTCGATGACGATTTTCTAAGC:1	TGTTAAGGGGCCCCCCGAAATC	CCTCGATGACGATTTTCTAAGC	+	chr2L	11341885	+	chr2L	13382151	2040266	+	chr2L	11341885	+	chr2L	13382151
TGAAGACGTAGGTTGGTTTGGAAAGGGGGGGTGTGTTTCAGCGGGTGGCCAAGTGTACAGGACACCGCCGA:1	TGAAGACGTAGGTTGGTTTGGA	CAAGTGTACAGGACACCGCCGA	+	chr2L	11491149	+	chr2L	11491226	77	+	chr2L	11491149	+	chr2L	11491226
AAATGTATAAAAAAAATAACAAAANAATTGCATTCCAGATTANTANAATATNTTCNCCTCTTATACAATCACGAT:1	AAATGTATAAAAAAAATAACAA	TCNCCTCTTATACAATCACGAT	-	chr3L	13050475	-	chr3L	1177557	11872918	+	chr3L	1177557	+	chr3L	13050475
AAATAAGAAACATAAACATATTTTTCGACCAGCTTGTTTTTTTTTTTATGTAAAACACTTCCGTGG:1	AAATAAGAAACATAAACATATT	TTTATGTAAAACACTTCCGTGG	+	chr3L	14116556	+	chr3L	7876274	6240282	+	chr3L	14116556	+	chr3L	7876274
ACCACCGTCAATAGTTGGGAGTGGTAAAATNNNANTACGATGTAACTGGAAGCCGTCTCCAATGACTTTGGCGAT:1	ACCACCGTCAATAGTTGGGAGT	CGTCTCCAATGACTTTGGCGAT	+	chrX	12094038	+	chrX	12094130	92	+	chrX	12094038	+	chrX	12094130
CTTGCCGGCTGAAACGGCGACATTCTTAAGAAGGAGCTGCGAGGCTGAGGAGGCTGAG:1	CTTGCCGGCTGAAACGGCGACA	CTGCGAGGCTGAGGAGGCTGAG	+	chr3R	14172485	+	chr3R	14172656	171	+	chr3R	14172485	+	chr3R	14172656
GTTAGAGGGGCAACCAACCTTTATCACACAAGGTATCCAAAAATAAAGCGAAAAATCTGCAATTTCAGATATTTA:1	GTTAGAGGGGCAACCAACCTTT	AATCTGCAATTTCAGATATTTA	+	chrX	15950337	+	chrX	2247637	13702700	+	chrX	15950337	+	chrX	2247637
TATTTTAATATTACGTATTACAAGGAAATACGACTTATTCCTGCGTGCATTTGTATGCAAATTATAATTGCCTAC:1	TATTTTAATATTACGTATTACA	TATGCAAATTATAATTGCCTAC	-	chr3L	6004387	-	chr3L	6001687	2700	+	chr3L	6001687	+	chr3L	6004387
TTTAATTTCATATATACATACATATATATATTTTTTTTTTGCCGTGTNAGGCAGGCATCACTAGAGCNCTATAC:1	TTTAATTTCATATATACATACA	AGGCATCACTAGAGCNCTATAC	+	chrX	13714217	+	chrX	2668105	11046112	+	chrX	13714217	+	chrX	2668105
CGGAGATTTAAAGCTAGAAAGGCTAGTAAAACCAGCAGTGGCGCCGATGTCCATCGTGG:1	CGGAGATTTAAAGCTAGAAAGG	GTGGCGCCGATGTCCATCGTGG	+	chr2L	22192247	+	chr2L	22192625	378	+	chr2L	22192247	+	chr2L	22192625
AAAGCCCATATAAATTATTTAATTAATCCTTGGGTTTCGGCTTCAGCTATCAATGCCATAAACGCACACGTGTGT:1	AAAGCCCATATAAATTATTTAA	TGCCATAAACGCACACGTGTGT	+	chr3R	31026496	+	chr3R	31026577	81	+	chr3R	31026496	+	chr3R	31026577
TCACATATGCATCGCTGTATCACCACATCAGTATCCTGGCACATGCGATTCGCGGGCACTGTCAGTC:1	TCACATATGCATCGCTGTATCA	CGATTCGCGGGCACTGTCAGTC	+	chrX	12350785	+	chrX	12350858	73	+	chrX	12350785	+	chrX	12350858
CAGATCTCATACCTGTAGNCCTAGCCGGGATTACAGACCATCCACACACGATATTAAAATCCGCTCCAA:1	CAGATCTCATACCTGTAGNCCT	ACGATATTAAAATCCGCTCCAA	+	chr3L	16066948	+	chr3L	5191206	10875742	+	chr3L	16066948	+	chr3L	5191206
GACAGACAGATAGAGCTCTTACCGTATCCCCACCGTAACTCCTTGTCGCCGAAACACACAGACAGTTTATT:1	GACAGACAGATAGAGCTCTTAC	CGAAACACACAGACAGTTTATT	+	chrX	14105045	+	chrX	14114192	9147	+	chrX	14105045	+	chrX	14114192
AATTATGTGTTATAGAAAACTTTGTTTATCTCCTTGTCGTCTATACACTTAGCCAAATTGCGCGCGACACCAAAG:1	AATTATGTGTTATAGAAAACTT	CAAATTGCGCGCGACACCAAAG	+	chr3L	7101358	+	chr3L	7101451	93	+	chr3L	7101358	+	chr3L	7101451
ATTGTCTTATTTTTATGCCAACTGTCGTTCGGTTTCTCGGGTGAAGGGTACAAATTAGTTGGCCTTGTCACAGG:1	ATTGTCTTATTTTTATGCCAAC	AATTAGTTGGCCTTGTCACAGG	+	chr2L	12933854	+	chr2L	12941320	7466	+	chr2L	12933854	+	chr2L	12941320
GGCTAGGTATGCAGAAAAAAGAAAATGCTGAATAACCACACTTAAAATAAAAATTCTTAATACTGAGTNTGGAAA:1	GGCTAGGTATGCAGAAAAAAGA	TTCTTAATACTGAGTNTGGAAA	-	chr3L	6913741	-	chr3L	6913649	92	+	chr3L	6913649	+	chr3L	6913741
GGAGGGACGGACTCTTGCTCTCAATACACACACCCCTAAGTGGTGGGCATTTTCAAAGGAACCGGAAATTG:1	GGAGGGACGGACTCTTGCTCTC	TTTTCAAAGGAACCGGAAATTG	-	chr3L	2573385	-	chr3L	2573297	88	+	chr3L	2573297	+	chr3L	2573385
GTAGTTTACGGATGCAAAAGTATGTTTTATTTGCTTACTTTATAAGATAGTATAGTTTAATGGAACATACTTTCT:1	GTAGTTTACGGATGCAAAAGTA	AGTTTAATGGAACATACTTTCT	+	chr2L	8824347	+	chr2L	12024081	3199734	+	chr2L	8824347	+	chr2L	12024081
GATTTGCCCAACGCGGCAGCAATTAAAAACAAAATGCCAAGAGGAAAGACATGGTCGTCA:1	GATTTGCCCAACGCGGCAGCAA	AAGAGGAAAGACATGGTCGTCA	-	chr3L	7954558	-	chr3L	14859073	6904515	+	chr3L	14859073	+	chr3L	7954558
TTGCTAATGCCAGGTGAGCTNCACGCAATTAANCCGAATGCANACACACACACACACACACACAAACACACA:1	TTGCTAATGCCAGGTGAGCTNC	CACACACACACACAAACACACA	-	chrX	14548357	-	chrX	6498788	8049569	+	chrX	6498788	+	chrX	14548357
AGAGGAGGAAAAGCCAGGGAAAAACTAGGGAATAGCATAGTGGGCAGCTGCAACAG:1	AGAGGAGGAAAAGCCAGGGAAA	GCATAGTGGGCAGCTGCAACAG	+	chr3L	9219264	+	chr3L	9219917	653	+	chr3L	9219264	+	chr3L	9219917
TGAATTCGAAGACACTTAAAAATCGTATCAATCAAATTGCAGTTACCATTTGAAACCTTGTCTGGCCGTTTAGCC:1	TGAATTCGAAGACACTTAAAAA	AACCTTGTCTGGCCGTTTAGCC	-	chr3R	31304461	-	chr3R	17984584	13319877	+	chr3R	17984584	+	chr3R	31304461
AACGCAATATGGCCCACACCACAATCAAATAGTTATGTGACTTATAATATACCTTAGTCGTGTTATGTTT:1	AACGCAATATGGCCCACACCAC	ATACCTTAGTCGTGTTATGTTT	+	chr3R	4366768	+	chr3R	4375146	8378	+	chr3R	4366768	+	chr3R	4375146
CACCTGGCGGATGTTCATAGACCATTGGATTAATTCGATACGATACGTTCGAATCAGTTT:1	CACCTGGCGGATGTTCATAGAC	TACGATACGTTCGAATCAGTTT	-	chr3L	9797330	-	chr3L	9797254	76	+	chr3L	9797254	+	chr3L	9797330
CATTTCGNTTCTGGTCACACTCTTTAACTTTGCTTAACTNTGCCAACTCGCCCTGTANCTGAGAGGACTCTTCAC:1	CATTTCGNTTCTGGTCACACTC	TGTANCTGAGAGGACTCTTCAC	+	chr3R	25555552	+	chr3R	25555631	79	+	chr3R	25555552	+	chr3R	25555631
AACTGATCAAATTGGAAATGAGTTTCAGCCCTTTCCCGTGCTCAAGAACTTCCTGGGGCCAAGTGAATTAAT:1	AACTGATCAAATTGGAAATGAG	TCCTGGGGCCAAGTGAATTAAT	+	chr2R	9584900	+	chr2R	7187533	2397367	+	chr2R	9584900	+	chr2R	7187533
AGCGGCAACTGCAACAACTGCAGCAACAACACCTAAGCCCCGCATTGCCGCTGCTCTTGTATAGGTGAGCTGGGT:1	AGCGGCAACTGCAACAACTGCA	CTCTTGTATAGGTGAGCTGGGT	-	chr3R	14432215	-	chr3R	20152850	5720635	+	chr3R	20152850	+	chr3R	14432215
CGGGCTTCTGTTTATGACAAATCTAGAGGCGACAGGTGGAGGAGATCTGTCAAATGCAGTAAAA:1	CGGGCTTCTGTTTATGACAAAT	AGATCTGTCAAATGCAGTAAAA	-	chr2R	24655148	-	chr2R	24647602	7546	+	chr2R	24647602	+	chr2R	24655148
TATAAATAATAAATATCCCCCCACCACTAATTCCCATACGCCTGTTAGCNCTCTTCCCCAGATTGTCATATGAAG:1	TATAAATAATAAATATCCCCCC	TTCCCCAGATTGTCATATGAAG	-	chr3R	10240023	-	chr3R	5445505	4794518	+	chr3R	5445505	+	chr3R	10240023
GGAGGGGAGTTGACTTGGGGTCAGGGTGCACGGGCTTGGAACTGGAACTGGTCTGGTGGCAGTG:1	GGAGGGGAGTTGACTTGGGGTC	TGGAACTGGTCTGGTGGCAGTG	+	chr2L	13699568	+	chr2L	13699634	66	+	chr2L	13699568	+	chr2L	13699634
GGAAATACCAAACAAATCAAGAAAATTGCTATAACTTTTAACTTTTAATCCACCAATTCAGTTCCAAAACAGATT:1	GGAAATACCAAACAAATCAAGA	CAATTCAGTTCCAAAACAGATT	+	chr3L	7524151	+	chr3L	7524248	97	+	chr3L	7524151	+	chr3L	7524248
TTCCTCAGCGGCCTTTTGGGCGGCAGCCTCCTC:1	TTCCTCAGCGGCCTTTTGGGCG	CCTTTTGGGCGGCAGCCTCCTC	+	chr3R	10768724	+	chr3R	10768804	80	+	chr3R	10768724	+	chr3R	10768804
TAAAAATTTTGTGCCATTAATGCAAAACTCTGTCGCACAATCGATAGGCGGGCAAAAAATCAGACGTTTCGAT:1	TAAAAATTTTGTGCCATTAATG	GCAAAAAATCAGACGTTTCGAT	-	chrX	7370528	-	chrX	14490695	7120167	+	chrX	14490695	+	chrX	7370528
AAGTATTTCAATCTCTTGCGGTTGTTTTCTCGTTATTAATTTAGTTGTCGCCTTG:1	AAGTATTTCAATCTCTTGCGGT	TATTAATTTAGTTGTCGCCTTG	-	chr3R	5809366	-	chr3R	5809145	221	+	chr3R	5809145	+	chr3R	5809366
TGGCTTTGGGTTGCCATTGCTACTGCTATTGGTATTGCTACCAACGATTTCGTGTTTTGTTTCTGTGCTGCGGTT:1	TGGCTTTGGGTTGCCATTGCTA	GTTTTGTTTCTGTGCTGCGGTT	+	chr3L	4342410	+	chr3L	4342489	79	+	chr3L	4342410	+	chr3L	4342489
CTGCTTTCCAAGGAGGCTCCCAATATGAAAAGTTTAAATACTGATGATGTTCACGGCAGACAAAAAACAAACAG:1	CTGCTTTCCAAGGAGGCTCCCA	ACGGCAGACAAAAAACAAACAG	-	chr3R	10979750	-	chr3R	10979669	81	+	chr3R	10979669	+	chr3R	10979750
CCATAAATAATTAAAGTTNGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTCCTGGGCGNA:1	CCATAAATAATTAAAGTTNGAC	TTGAATGAATCTCCTGGGCGNA	-	chr3R	25828317	-	chr3R	25828562	245	+	chr3R	25828562	+	chr3R	25828317
GGTGGTGACATTAGGGGGCGATGGGAGGACAGGGATCGGGATGCTCGGTGCTGCCAAGACGCAGGATAAGG:1	GGTGGTGACATTAGGGGGCGAT	GCTGCCAAGACGCAGGATAAGG	-	chr3R	27718953	-	chr3R	8624755	19094198	+	chr3R	8624755	+	chr3R	27718953
CANTTACTATGTATATGTTGAACTGAATATGTACNTNAGTGAAACAATTTACAACCGAAAGATTACAAAAAATAT:1	CANTTACTATGTATATGTTGAA	ACCGAAAGATTACAAAAAATAT	-	chr3L	20484363	-	chr3L	20476764	7599	+	chr3L	20476764	+	chr3L	20484363
ATCCGAGTCGAGTCCGAAGTCCTTGGAGGAGTAGAAGCCCAGTTTCAGTGCTTGGTGGGAATGTCAAAGAGTGG:1	ATCCGAGTCGAGTCCGAAGTCC	TGGTGGGAATGTCAAAGAGTGG	+	chr2R	20031007	+	chr2R	20031099	92	+	chr2R	20031007	+	chr2R	20031099
CAATAATCTTTTTTGTTTGCATTTAAATTTTCTCTTGTTATTTCGGATGAGCAATTTGAATACACACGACGAGGA:1	CAATAATCTTTTTTGTTTGCAT	ATTTGAATACACACGACGAGGA	-	chr2L	9148108	-	chr2L	9147966	142	+	chr2L	9147966	+	chr2L	9148108
CAGACACAGCAGGGGAGTGGTAATGCAGCCAGCCAGTCGGGTGAG:1	CAGACACAGCAGGGGAGTGGTA	TGCAGCCAGCCAGTCGGGTGAG	+	chr3R	11865326	+	chr3R	11865375	49	+	chr3R	11865326	+	chr3R	11865375
GCAAATATTCCTTTTCACCGCTGGCCAGACAGCCAACAAAAACACAACCACCATCATCAGGAGCCGCCAAAAAAT:1	GCAAATATTCCTTTTCACCGCT	TCATCAGGAGCCGCCAAAAAAT	+	chr3R	17854783	+	chr3R	17854861	78	+	chr3R	17854783	+	chr3R	17854861
GTATTTAGCTGGAAATACTCGCAATTTATTTCTTGTATAAATTGCGTTCACCATTTTTTCACCATACCAACAATG:1	GTATTTAGCTGGAAATACTCGC	TTTTTTCACCATACCAACAATG	+	chr2R	12844719	+	chr2R	12844810	91	+	chr2R	12844719	+	chr2R	12844810
GCTCCCACACTTTTGAATAAGGTTTTAATTTTTATTAAGCAGCGATAAAAAGCGTCTGCAGTGGCAAATAGGGA:1	GCTCCCACACTTTTGAATAAGG	CGTCTGCAGTGGCAAATAGGGA	-	chr2R	5299543	-	chr2R	17381635	12082092	+	chr2R	17381635	+	chr2R	5299543
TCCATTAGCATTCCATTTTCATTAATATTACCATTACGCATTGTAACCATTCTACCCTGATTCCCCTACTCCT:1	TCCATTAGCATTCCATTTTCAT	CTACCCTGATTCCCCTACTCCT	+	chr2L	17120860	+	chr2L	17120937	77	+	chr2L	17120860	+	chr2L	17120937
CTGCGTGCAGCTTGCAAAAACAAGCAAGGTCCAAAAACAACCTGAGNGTGAGAAATGA:1	CTGCGTGCAGCTTGCAAAAACA	ACAACCTGAGNGTGAGAAATGA	-	chr3R	28415811	-	chr3R	28415743	68	+	chr3R	28415743	+	chr3R	28415811
ATTCTACATATTTTTATGCGAGTGTATTCGAGTGCGCGTGTATAGAAAANTCTAGCCCATTCAGTGATCAAACT:1	ATTCTACATATTTTTATGCGAG	TAGCCCATTCAGTGATCAAACT	+	chr3R	5445990	+	chr3R	5452449	6459	+	chr3R	5445990	+	chr3R	5452449
TGAGCAAGCATAAAATACATTTTTCAAACTGTCCGGATAATCGATTCCAAATCAATCGAACTATTGGCACAGTGT:1	TGAGCAAGCATAAAATACATTT	AATCGAACTATTGGCACAGTGT	+	chr3L	12052731	+	chr3L	12052820	89	+	chr3L	12052731	+	chr3L	12052820
AGTTCTCGAGGAATTCAGGAAATGGGTTTTCAGCTAGGGAAATTCGATACTACTCCGGGCATTGTGGCCACCCAC:1	AGTTCTCGAGGAATTCAGGAAA	TCCGGGCATTGTGGCCACCCAC	-	chr3R	26885787	-	chr3R	26885687	100	+	chr3R	26885687	+	chr3R	26885787
CTGAGCAGCTTAACCCATTTCCACTGTTGGCCCTTTGTTATGACCCCCGCCAAATGGTTGAGTTAAGTGTTTGCA:1	CTGAGCAGCTTAACCCATTTCC	ATGGTTGAGTTAAGTGTTTGCA	+	chr3R	23073682	+	chr3R	23073771	89	+	chr3R	23073682	+	chr3R	23073771
AACGCGTGAACCAAAGTTATGCAGTCAATGGAAGTGCGCCCCTAAATATGCAATGAATTTTGGGAAAGGACCGAC:1	AACGCGTGAACCAAAGTTATGC	TGAATTTTGGGAAAGGACCGAC	+	chr2R	9945461	+	chr2R	9945657	196	+	chr2R	9945461	+	chr2R	9945657
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAGCACAACACAACACAACACCACACAACACAACACACNACAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	CACACAACACAACACACNACAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801	6924265	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831801
AAGTACAACAACAACAAAAACAACCGAAATCACAGAGAACACTTCACTAAATTTTCTGGCACAGGANAAGTCAAA:1	AAGTACAACAACAACAAAAACA	TTCTGGCACAGGANAAGTCAAA	+	chrX	6662344	+	chrX	288773	6373571	+	chrX	6662344	+	chrX	288773
TAATTCTTTGATATAAAAANCAATATTTATTTTGCTTTCAATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTG:1	TAATTCTTTGATATAAAAANCA	TTAGCCCACAGTGGAGCCTTTG	+	chr3L	16971221	+	chr3L	16971299	78	+	chr3L	16971221	+	chr3L	16971299
TCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTNATCGTTGATCGCCACCATTGGCGCATTGACACAGGCGCCC:1	TCGTGACTTTAAATATTTAATT	TGGCGCATTGACACAGGCGCCC	-	chrX	17629765	-	chrX	17633060	3295	+	chrX	17633060	+	chrX	17629765
ACATGGCTATAAATACGTAATTCTCGACCAAAAACTATAAGATCCTGCAAAAGGGAAAGTTCTTTCATTTAAATA:1	ACATGGCTATAAATACGTAATT	GGAAAGTTCTTTCATTTAAATA	-	chr2R	25131116	-	chr2R	25131039	77	+	chr2R	25131039	+	chr2R	25131116
ATCTATAGATTTGCATTTCGTTTGCCAGTCGCCATTTTGTTTGCCAAAAAAACGAAAAGAACAAAAT:1	ATCTATAGATTTGCATTTCGTT	AAAAAAACGAAAAGAACAAAAT	-	chrX	14768526	-	chrX	15247532	479006	+	chrX	15247532	+	chrX	14768526
GGTCATACCGCGGAACCTCAGTCCGGCGGAGTGGATCGAGGTGAAAATTAATACGGGCTTAAAATGATTCAG:1	GGTCATACCGCGGAACCTCAGT	ATACGGGCTTAAAATGATTCAG	+	chr2L	11123920	+	chr2L	20943352	9819432	+	chr2L	11123920	+	chr2L	20943352
GCAACCAAAGCTGAAATTTGATTCGAATTGCTTGTTAGCTGAGTCTCCCCCATTCATTTGTAACCACGTCGTAC:1	GCAACCAAAGCTGAAATTTGAT	TTCATTTGTAACCACGTCGTAC	-	chr3R	27036523	-	chr3R	27036411	112	+	chr3R	27036411	+	chr3R	27036523
TACCAAAATGAAGACGGAAAAAGTTGGGATACTGTCAGTGTGCACTCAATGGGTAAGCTCACATTANTGAATAG:1	TACCAAAATGAAGACGGAAAAA	GTAAGCTCACATTANTGAATAG	+	chr3R	6598319	+	chr3R	6598508	189	+	chr3R	6598319	+	chr3R	6598508
TTATACACTATAGTTAGTGAGAAGGACCAACAAGAAGTTTCAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAA:1	TTATACACTATAGTTAGTGAGA	GCCAAATCAGCTTAAAAAAGAA	+	chr3R	19447702	+	chr3R	19448943	1241	+	chr3R	19447702	+	chr3R	19448943
GCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTTAAAAGTGTGT:1	GCAAAATTAAAGGGTGTTTCGT	TTATTTTAATTTAAAAGTGTGT	-	chr2R	5627618	-	chr2R	5581409	46209	+	chr2R	5581409	+	chr2R	5627618
TGTCGATGCGCCATGTTCTCATCTTCTCACCTTTTAAACTCAGCGCACTCCACAGGTGATCTAGACTAAGAACGC:1	TGTCGATGCGCCATGTTCTCAT	AGGTGATCTAGACTAAGAACGC	+	chr2L	15391405	+	chr2L	15391489	84	+	chr2L	15391405	+	chr2L	15391489
CGAGAGTTGCAGAGAGCTCTCGCTGCAATTGCTGCTGCGACTG:1	CGAGAGTTGCAGAGAGCTCTCG	GCTGCAATTGCTGCTGCGACTG	-	chr3R	16206384	-	chr3R	22487934	6281550	+	chr3R	22487934	+	chr3R	16206384
TAATCACTGCAATATGCAATCAGTTCATATCAGAGCTTGGTGGCGCAATGACGG:1	TAATCACTGCAATATGCAATCA	GAGCTTGGTGGCGCAATGACGG	+	chr2R	15700272	+	chr2R	15700366	94	+	chr2R	15700272	+	chr2R	15700366
GGTAGCTCATAGATAGTTGGTATGATATATGTGAGGATTATGCACCTTCTGTTAGCAGGGAACGCGACAATAG:1	GGTAGCTCATAGATAGTTGGTA	TTAGCAGGGAACGCGACAATAG	+	chr2R	8160951	+	chr2R	8161039	88	+	chr2R	8160951	+	chr2R	8161039
CANCTGAAACTCAATTAAGCCAATGGCATTGATCNTNGATGGAACTATATAGACTTCACTTGAACGAATTTTAAC:1	CANCTGAAACTCAATTAAGCCA	CTTCACTTGAACGAATTTTAAC	-	chr3R	21154794	-	chr3R	21154579	215	+	chr3R	21154579	+	chr3R	21154794
TGTGTGGTTTGTCCATACCATCATCAAGGCTGCGCCAGATGGTTCGTCACAGGAGTCCAG:1	TGTGTGGTTTGTCCATACCATC	ATGGTTCGTCACAGGAGTCCAG	+	chr3L	19269846	+	chr3L	19270035	189	+	chr3L	19269846	+	chr3L	19270035
GATTTCAGATTTCATTTCATACCCTGTTTTCCTTGCCACATTTTAGGGGCGTGGTGCACAAGAAGCAGCTCAA:1	GATTTCAGATTTCATTTCATAC	TGGTGCACAAGAAGCAGCTCAA	+	chr2L	3674471	+	chr2L	2718299	956172	+	chr2L	3674471	+	chr2L	2718299
GTGGGGTTCTGGCCCATTGACCGCAAGTGTAAGAAACAAGTCACNCACTTTTCCTGGCTTGCTCT:1	GTGGGGTTCTGGCCCATTGACC	CNCACTTTTCCTGGCTTGCTCT	+	chr3R	5573160	+	chr3R	5573235	75	+	chr3R	5573160	+	chr3R	5573235
GCATCATCTGCTAATTCCACCTGCCTTNATNNATATTTACAAACTATGCNGNAGTCAGTTCAAAGGCCTCTATTG:1	GCATCATCTGCTAATTCCACCT	GTCAGTTCAAAGGCCTCTATTG	+	chr2L	2932460	+	chr2L	2932917	457	+	chr2L	2932460	+	chr2L	2932917
TTATGGATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTT:1	TTATGGATTGTTTATTGTTTAT	TTATTGTTTATTGTTTATTGTT	-	chr2R	23052211	-	chr2R	21358403	1693808	+	chr2R	21358403	+	chr2R	23052211
AAAGTTTCCACCCTAGTTTTCTGGCACAGCTGAGTCTGAACACCAAAAATTAATAACAATTTCTGTTCTGTAACG:1	AAAGTTTCCACCCTAGTTTTCT	TAACAATTTCTGTTCTGTAACG	+	chr2L	16111280	+	chr2L	20081850	3970570	+	chr2L	16111280	+	chr2L	20081850
AAAAATTTGTAGCCATTCGGCTGGCCATGAAGGGTGAATTGTGGGGCAGAAAAGTGAGAGAGGGG:1	AAAAATTTGTAGCCATTCGGCT	GGGCAGAAAAGTGAGAGAGGGG	-	chr2L	11947103	-	chr2L	11947005	98	+	chr2L	11947005	+	chr2L	11947103
ATCTCTGGCATTTTGGATGCCCCAGCAGCAGCAACAATTGCTGCGCCCACGCCCGCTTCAGTGGCTTTTTGTT:1	ATCTCTGGCATTTTGGATGCCC	CCCGCTTCAGTGGCTTTTTGTT	+	chr3L	5572158	+	chr3L	5572266	108	+	chr3L	5572158	+	chr3L	5572266
TCCAGATAGCGAGTATGTGTGTGTGTAGTCGTGCAGCTAACGAAGAGGAAAGTTAAATGGTTCCGTNCGGAATCA:1	TCCAGATAGCGAGTATGTGTGT	TAAATGGTTCCGTNCGGAATCA	+	chrX	20585776	+	chrX	1168664	19417112	+	chrX	20585776	+	chrX	1168664
GTTCACACACACAACAAAACAAGCCCGTCGCACAGCGGGTGTAACAANCGAGTAAAAAAAANCATAAATTTAATT:1	GTTCACACACACAACAAAACAA	AAAAAAAANCATAAATTTAATT	-	chr3L	3847625	-	chr3L	99491	3748134	+	chr3L	99491	+	chr3L	3847625
ATTGAATTNGTTATTCTCTGAACAAAAGAATATTGTAGTTAATATTAATATTAATTTTTTAACAGATAATGATAA:1	ATTGAATTNGTTATTCTCTGAA	ATTTTTTAACAGATAATGATAA	+	chr3L	16070744	+	chr3L	16070821	77	+	chr3L	16070744	+	chr3L	16070821
TGGGATATTTGAAGCGATGCCTTGGGATTTGGGATATATTTTAAAGAATTTAACTATTGTTAAATTCATGTCAAC:1	TGGGATATTTGAAGCGATGCCT	CTATTGTTAAATTCATGTCAAC	+	chr2R	15898885	+	chr2R	15898983	98	+	chr2R	15898885	+	chr2R	15898983
GATTGGTCTTTATCTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATG:1	GATTGGTCTTTATCTCGCAAAT	GGGTGTAGCATTGGGGGAGATG	-	chr2L	5897677	-	chr2L	5897625	52	+	chr2L	5897625	+	chr2L	5897677
GACTTTTGAACTAAGTGAATGCCCGCTCCTGCGAAGGCACACTAACATATGCTAATAGC:1	GACTTTTGAACTAAGTGAATGC	CACACTAACATATGCTAATAGC	+	chr2L	968834	+	chr2L	968897	63	+	chr2L	968834	+	chr2L	968897
AGTTATAGTAAAACAATAAACAGCTAACTAACGCTATTAAAAATTTTACAAAGTTTTTTATAAAATATAAAACGC:1	AGTTATAGTAAAACAATAAACA	TTTTTTATAAAATATAAAACGC	-	chr2L	12254144	-	chr2L	12254052	92	+	chr2L	12254052	+	chr2L	12254144
GAAGATAAATAAACCTATAAGATATATATANNNANACTTGATTATAAAATGATAAATAAACGCGGTG:1	GAAGATAAATAAACCTATAAGA	AAAATGATAAATAAACGCGGTG	-	chrX	10356366	-	chrX	10348809	7557	+	chrX	10348809	+	chrX	10356366
GTTGTTATTAAGAAACAACAAGAATTTATGTTAAATGTTCAAAAAATCGTGGCCAAAAAACATTTAAAGGATA:1	GTTGTTATTAAGAAACAACAAG	GCCAAAAAACATTTAAAGGATA	+	chr3R	19446787	+	chr3R	19447271	484	+	chr3R	19446787	+	chr3R	19447271
ATATATATATATATTGCTTGGAAACTCGGAGTCATCATCAATGTGGCATAAAAATTAACATTTTCTTCGTTGCCA:1	ATATATATATATATTGCTTGGA	ATTAACATTTTCTTCGTTGCCA	+	chr2R	15097653	+	chr2R	10865717	4231936	+	chr2R	15097653	+	chr2R	10865717
ACTGCAGAAAAACCAATAAGCAGGACACGTTGGAACACAGCGTCGAGGTGCGTCAAAACGCCCAATTCCCTGAAT:1	ACTGCAGAAAAACCAATAAGCA	CAAAACGCCCAATTCCCTGAAT	+	chr3L	22665014	+	chr3L	22665101	87	+	chr3L	22665014	+	chr3L	22665101
AAATATTTTACCTCCCATTTTAAGAACGAAAGCCACAGACGCACACACATGGGACCCCAATAAAAACCAATTTAT:1	AAATATTTTACCTCCCATTTTA	ACCCCAATAAAAACCAATTTAT	-	chr2R	22351500	-	chr2R	22349716	1784	+	chr2R	22349716	+	chr2R	22351500
GTATGTATGTGCACATATGTATGTACATATATATGTATGTGGGCTGCTCGCGTGTGTGTTTGTTAATTTGCCCAT:1	GTATGTATGTGCACATATGTAT	GTGTGTTTGTTAATTTGCCCAT	-	chrX	4164949	-	chrX	4157896	7053	+	chrX	4157896	+	chrX	4164949
GCTAACAGCGGCTCACAGGGCATACATCCTAGTCAGAGGCAATCGACGCAATTAAAATTTCCTACG:1	GCTAACAGCGGCTCACAGGGCA	GACGCAATTAAAATTTCCTACG	-	chr3R	13376380	-	chr3R	13376300	80	+	chr3R	13376300	+	chr3R	13376380
AGAAAACGGCTCGAAGAATAAATGGGACAGAATCAGAAATTATAGTGTCTAATAAAATGCCAAAAAATGATA:1	AGAAAACGGCTCGAAGAATAAA	AATAAAATGCCAAAAAATGATA	+	chr2L	10692810	+	chr2L	10692905	95	+	chr2L	10692810	+	chr2L	10692905
ATTTGATAAAGGTGACAAGAAATTTGTCAGCTCAAAATATTTGCCTGTTGCTCCAATCTCCAAGTACAGCATA:1	ATTTGATAAAGGTGACAAGAAA	TCCAATCTCCAAGTACAGCATA	-	chr2L	19304337	-	chr2L	19304237	100	+	chr2L	19304237	+	chr2L	19304337
TTGCAAAGTGCAACGGGGAGTTGAATTATGAAAGGATGAAGGATTTGGTCTATCTAGATCAGGTTATATCGG:1	TTGCAAAGTGCAACGGGGAGTT	TATCTAGATCAGGTTATATCGG	-	chr2R	14885820	-	chr2R	14880231	5589	+	chr2R	14880231	+	chr2R	14885820
TTTTGATTTAGTCCAATGTGTAACATTACACACTTAAGTTGCAATGGACCAATCACCAAATAAAAGTCTCGGCGC:1	TTTTGATTTAGTCCAATGTGTA	CACCAAATAAAAGTCTCGGCGC	-	chrX	1051163	-	chrX	1051085	78	+	chrX	1051085	+	chrX	1051163
ATATGCAAAAATCCGATACGCTTAGAGCCGAAACCTGCGAAAAGAGCGAACAAAATCCAAA:1	ATATGCAAAAATCCGATACGCT	AAAAGAGCGAACAAAATCCAAA	+	chr2L	17000141	+	chr2L	17000249	108	+	chr2L	17000141	+	chr2L	17000249
ATTAAATGTAAATAAACGAGTAAAATTTGATTCAGAAAAGTACTTAAATATTAGAATAT:1	ATTAAATGTAAATAAACGAGTA	AAGTACTTAAATATTAGAATAT	+	chr3L	7562000	+	chr3L	10869656	3307656	+	chr3L	7562000	+	chr3L	10869656
TGTTTTGAAAGCAATACAAAGTAATTAACATATTCTTCTGTACTCGGTTCATGGCTAATAAGCTCT:1	TGTTTTGAAAGCAATACAAAGT	CGGTTCATGGCTAATAAGCTCT	-	chr3R	19340478	-	chr3R	19340410	68	+	chr3R	19340410	+	chr3R	19340478
ATTTGTTTNTTATGATTGCTCTGCGACAGCGAAGCNAGCGTCTAACAATAGATGTTGTTGCGGGG:1	ATTTGTTTNTTATGATTGCTCT	AACAATAGATGTTGTTGCGGGG	+	chr3L	11274527	+	chr3L	17971458	6696931	+	chr3L	11274527	+	chr3L	17971458
CGGGCAGTTGCATAATTGATTGATTGAATCCGTATGCAACAATTGGACAGTCGACCAGTGTGGGAAAGTGGCAGG:1	CGGGCAGTTGCATAATTGATTG	ACCAGTGTGGGAAAGTGGCAGG	-	chr3R	27619842	-	chr3R	27619727	115	+	chr3R	27619727	+	chr3R	27619842
CAACAGCAACTTGCAACTTGCAAGCTGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAACATTTTGATATGGCACACGCAATGCTC:1	CAACAGCAACTTGCAACTTGCA	TGATATGGCACACGCAATGCTC	+	chrX	13908803	+	chrX	13908881	78	+	chrX	13908803	+	chrX	13908881
CAGAACGAGAACACCTCGAATGCCTCCTCCACCAACAACACGCCGGCGTGTTCCTTTGCCTCCTTCTCCAGCTGA:1	CAGAACGAGAACACCTCGAATG	CTTTGCCTCCTTCTCCAGCTGA	+	chr2R	6235130	+	chr2R	23841905	17606775	+	chr2R	6235130	+	chr2R	23841905
CAATNCATTGAGAATTGCAATGNTGCCNATGTAGATATCNCCTTGTGAGCGCCTGTTCAGCTCTCATTACAATA:1	CAATNCATTGAGAATTGCAATG	CTGTTCAGCTCTCATTACAATA	+	chr3L	13338313	+	chr3L	13338408	95	+	chr3L	13338313	+	chr3L	13338408
CATGATTTTGTATTATTTATTTTATGTTCGTAAACGATGTTGTATTCAAGTGCTGCCGTTTTTTGCNTTACTTCA:1	CATGATTTTGTATTATTTATTT	TGCCGTTTTTTGCNTTACTTCA	+	chr2R	12093967	+	chr2R	12094080	113	+	chr2R	12093967	+	chr2R	12094080
AAAGATTATTATCAGCTTTGTTCCTTCCGATTTGGATAAGTAAATTNCGTTTACTTAA:1	AAAGATTATTATCAGCTTTGTT	TAAGTAAATTNCGTTTACTTAA	+	chrX	10401412	+	chrX	10401476	64	+	chrX	10401412	+	chrX	10401476
ACAGACAACTCTTCGGAGTTGTCAAAAATACCAAGCCACGAAATAAAGAATTGCAGTCTCGGTGTCTGCCCATGG:1	ACAGACAACTCTTCGGAGTTGT	CAGTCTCGGTGTCTGCCCATGG	-	chr2L	632818	-	chr2L	632738	80	+	chr2L	632738	+	chr2L	632818
ATTTGGTCACCCATCGAGTTTGCATTGAACTTAAACAACAAGACCCACACCCAAGATCCAAGACTCCNAACTCTA:1	ATTTGGTCACCCATCGAGTTTG	AGATCCAAGACTCCNAACTCTA	-	chrX	19176305	-	chrX	19176221	84	+	chrX	19176221	+	chrX	19176305
ATGGACGGACGGAACCAATATGTCGGAGGAATAAGTCAGTCCTCCCACTGAACACTGCCACATACTTTCCTTT:1	ATGGACGGACGGAACCAATATG	ACACTGCCACATACTTTCCTTT	+	chr3R	5399852	+	chr3R	5399931	79	+	chr3R	5399852	+	chr3R	5399931
AAAATAATGTAGCTAAAGTACTGGTGTATATTTGCAATTGACCAGCACTTATAAGGGTACCCCAAAGCGTTCAAT:1	AAAATAATGTAGCTAAAGTACT	AGGGTACCCCAAAGCGTTCAAT	+	chr3L	22761408	+	chr3L	22766842	5434	+	chr3L	22761408	+	chr3L	22766842
CCCAAAAAGTATGCAACATAATACCAGAAATTTGTGTAAGCGCATTCTCCACGCACATTCTGGAGTAGAG:1	CCCAAAAAGTATGCAACATAAT	CCACGCACATTCTGGAGTAGAG	+	chr2L	12861710	+	chr2L	12863172	1462	+	chr2L	12861710	+	chr2L	12863172
CAAGAGTTGGCGAGATAATCACACAATTTTCAATGGCCGAAACGCTGTACTATNTCATCCTACGCAATCCATCCA:1	CAAGAGTTGGCGAGATAATCAC	NTCATCCTACGCAATCCATCCA	-	chrX	9576144	-	chrX	9575820	324	+	chrX	9575820	+	chrX	9576144
AAGGGAAAAAGGAAATGCGAAGAGAACACATTGTCGCACATAAATCAGCACAATAG:1	AAGGGAAAAAGGAAATGCGAAG	CGCACATAAATCAGCACAATAG	+	chr3R	23970700	+	chr3R	17657898	6312802	+	chr3R	23970700	+	chr3R	17657898
TGGTGTGAATGGAAGGAGCGATCCTTGGCGACGATCCTGGCGTGAGAACTCGAT:1	TGGTGTGAATGGAAGGAGCGAT	GATCCTGGCGTGAGAACTCGAT	-	chr2R	24154644	-	chr2R	24147087	7557	+	chr2R	24147087	+	chr2R	24154644
AGGATTTCAAAGGAATGCAAATTAAGTAATACTTGAAAGTGGAAAAAAATAGTTACGAAAATAACTGCAAAAATA:1	AGGATTTCAAAGGAATGCAAAT	TACGAAAATAACTGCAAAAATA	-	chr3L	20851668	-	chr3L	14476521	6375147	+	chr3L	14476521	+	chr3L	20851668
GGCTTTANTTTGCAACTAAAGTACAATTGATAGATCGATNCAATCATAGATTCATCTNTGAGCCCCTTTGGAGC:1	GGCTTTANTTTGCAACTAAAGT	CATCTNTGAGCCCCTTTGGAGC	+	chr3L	10894867	+	chr3L	12090209	1195342	+	chr3L	10894867	+	chr3L	12090209
GCAAAGAGAAATTGTATACAACGCTTGATGTGTATGATGATGTGTATCTATGTGATGACAGCGACTTGTGCGTT:1	GCAAAGAGAAATTGTATACAAC	TGATGACAGCGACTTGTGCGTT	-	chr3R	23453782	-	chr3R	23453326	456	+	chr3R	23453326	+	chr3R	23453782
CGATGGGCTATCAAACCTAAGAAAATTGCCAGTGATGGAAATTTTCATCTCTAACAGCGAGTTTGGTTTTCCAAT:1	CGATGGGCTATCAAACCTAAGA	ACAGCGAGTTTGGTTTTCCAAT	+	chr2R	9807462	+	chr2R	9807606	144	+	chr2R	9807462	+	chr2R	9807606
TCCGCCTCCGAATCCACCGTATCCGAACTGGGGAGC:1	TCCGCCTCCGAATCCACCGTAT	CACCGTATCCGAACTGGGGAGC	+	chr2R	23086086	+	chr2R	23086130	44	+	chr2R	23086086	+	chr2R	23086130
CCTTCTCGGAGATAGGAGCCACTGTGGTGGCTTCTTCCTCGATTTCAATACTTGGAGCAGCAGTTG:1	CCTTCTCGGAGATAGGAGCCAC	TCAATACTTGGAGCAGCAGTTG	-	chr3R	25018359	-	chr3R	25018291	68	+	chr3R	25018291	+	chr3R	25018359
ATCAGGCCGCTCATTGATTTGATGATGGGTCGAACCCTGCCCACATCCCGTGCCCCACATGGCCCAGCAACCA:1	ATCAGGCCGCTCATTGATTTGA	GCCCCACATGGCCCAGCAACCA	+	chr3R	28597524	+	chr3R	28597599	75	+	chr3R	28597524	+	chr3R	28597599
GATCGCCACAGTGCCACCTGATGAAACACAGATATCCAATCAAGAGCAACAACAATTTCACACCTTTGCACCGTT:1	GATCGCCACAGTGCCACCTGAT	AATTTCACACCTTTGCACCGTT	+	chr3R	31691551	+	chr3R	31696317	4766	+	chr3R	31691551	+	chr3R	31696317
AGCCATTTTTTTTATCAGTGTTCGACTTGAGGTTGGACTANCGGAA:1	AGCCATTTTTTTTATCAGTGTT	ACTTGAGGTTGGACTANCGGAA	+	chr3L	8458400	+	chr3L	1281437	7176963	+	chr3L	8458400	+	chr3L	1281437
AAATCCAATTTTGATTTTCCTCTTCGGTTTCCATTCAAATTAACTAGTTCTGCAATTCTCACTTT:1	AAATCCAATTTTGATTTTCCTC	CTAGTTCTGCAATTCTCACTTT	+	chr3L	18012778	+	chr3L	14707277	3305501	+	chr3L	18012778	+	chr3L	14707277
CCAACCAGCTGCCAACAGCTGGTGTCGCCAAGTCCGTAATGTGTCACGCCTTTTCAACGGGCCGCCGTT:1	CCAACCAGCTGCCAACAGCTGG	GCCTTTTCAACGGGCCGCCGTT	+	chr3R	15937447	+	chr3R	15937528	81	+	chr3R	15937447	+	chr3R	15937528
GAGTGCAGNTAAGTCCATCAACTGCTCCGATTTGCTTTTTTGATTCAGTTTTTTTAGAATTCCCCTTCTCAACGA:1	GAGTGCAGNTAAGTCCATCAAC	TTAGAATTCCCCTTCTCAACGA	-	chr2R	18219734	-	chr2R	18219652	82	+	chr2R	18219652	+	chr2R	18219734
TTACAGTGTATAGATAAGTGTGGCGTGTTGGGCTGGATGGTTGGATGTTGTATCCGTCTTGACGTCGAGCGCTTA:1	TTACAGTGTATAGATAAGTGTG	CCGTCTTGACGTCGAGCGCTTA	-	chr3R	15313880	-	chr3R	31548887	16235007	+	chr3R	31548887	+	chr3R	15313880
AGTGGGCCCAAAGTTTTGCACACTGCGATAATGATGTCGGAAGAATATTTTATTAACGCAT:1	AGTGGGCCCAAAGTTTTGCACA	GAAGAATATTTTATTAACGCAT	+	chr3R	18812091	+	chr3R	18812155	64	+	chr3R	18812091	+	chr3R	18812155
TTATAGTATTAAAGCCAAAAATCCCACTCACAACTTTTGGGCTGTGTATCCGTTTTTCATCCATTTTTTTTTTT:1	TTATAGTATTAAAGCCAAAAAT	TTTTTCATCCATTTTTTTTTTT	+	chrX	7836679	+	chrX	7836761	82	+	chrX	7836679	+	chrX	7836761
CATTACTCACCGCACAGGAAAGCCTTCCCCGGTTGAATTGNTCATGCGTAATAATTTGGTCCACTTCANTTTC:1	CATTACTCACCGCACAGGAAAG	TAATTTGGTCCACTTCANTTTC	-	chr3R	13380807	-	chr3R	13380721	86	+	chr3R	13380721	+	chr3R	13380807
AAGACCTAAGAAACTAGCGATAGAGTTCCACAATAAAATGTTCAATNTA:1	AAGACCTAAGAAACTAGCGATA	CCACAATAAAATGTTCAATNTA	-	chr2R	24184720	-	chr2R	24177261	7459	+	chr2R	24177261	+	chr2R	24184720
TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGAGCGAAGTTCTTTTTCTGGTTGGGAT:1	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	AAGTTCTTTTTCTGGTTGGGAT	+	chr2L	16217660	+	chr2L	12185602	4032058	+	chr2L	16217660	+	chr2L	12185602
CANAGCTTTCATACGTCACCGACCTAAGGAGCTATTAACGAGAGGTGCATGCGGAAGCAGAGACTTTAATGTTAC:1	CANAGCTTTCATACGTCACCGA	GAAGCAGAGACTTTAATGTTAC	+	chr3R	31831540	+	chr3R	31831619	79	+	chr3R	31831540	+	chr3R	31831619
AATGACTGCAATCTCTGATCTGTTGCCATAATAATCTTATTCTCTATAAATGATTGGCTTTACAACATATGTACG:1	AATGACTGCAATCTCTGATCTG	TTGGCTTTACAACATATGTACG	-	chrX	19125047	-	chrX	19124954	93	+	chrX	19124954	+	chrX	19125047
TGACAAGCTGGGCGACAGAAAGCTGCAGGAAAACAGGCGCGGATAATACCACTTGCTGTATATACCTGGTAAGC:1	TGACAAGCTGGGCGACAGAAAG	TTGCTGTATATACCTGGTAAGC	+	chrX	20641195	+	chrX	20641305	110	+	chrX	20641195	+	chrX	20641305
TGTTGCCTTTTGCTTTTGCCTTCCCGCGTGCGCTGCCTTTTAATTATCGAATGTCTCTGGACTTCGGGCTCCACC:1	TGTTGCCTTTTGCTTTTGCCTT	TCTCTGGACTTCGGGCTCCACC	+	chrX	13006838	+	chrX	13006985	147	+	chrX	13006838	+	chrX	13006985
TCAATCGAGGAGGAGTCTGTGCATACGACATTGCGATCAAATTTCTGTTTTGGAGCACGGAATTCCAGGTG:1	TCAATCGAGGAGGAGTCTGTGC	TTGGAGCACGGAATTCCAGGTG	+	chr3L	2631080	+	chr3L	2631186	106	+	chr3L	2631080	+	chr3L	2631186
AACGCACGNGATCAAAAGGCAGACTTGCAGCAATT:1	AACGCACGNGATCAAAAGGCAG	AAAAGGCAGACTTGCAGCAATT	-	chr3L	627155	-	chr3L	10248772	9621617	+	chr3L	10248772	+	chr3L	627155
CTCCGCCTNTTTTCAGGCATTTTGGGGTAATCTAGTTACCAATTCAACTTGAATTAACCCCTTCCATTAAGGAT:1	CTCCGCCTNTTTTCAGGCATTT	ATTAACCCCTTCCATTAAGGAT	+	chr2L	21020283	+	chr2L	21023959	3676	+	chr2L	21020283	+	chr2L	21023959
AGCACCTTAAAAAAAGGGTACATTTTTGCCACCTCATGCTTGCAGCTTTTTCCCAAGAAAATTGCATTCCATACC:1	AGCACCTTAAAAAAAGGGTACA	CAAGAAAATTGCATTCCATACC	+	chr2R	15015467	+	chr2R	15022891	7424	+	chr2R	15015467	+	chr2R	15022891
AACAAATGTCATCCGCCTGCACTGAAACAAATGGAAACTGGCTAATAAATATTGGTTTTTATACAATTTGGCAG:1	AACAAATGTCATCCGCCTGCAC	TGGTTTTTATACAATTTGGCAG	+	chrX	2833424	+	chrX	17816451	14983027	+	chrX	2833424	+	chrX	17816451
ATAGATACCTCACCTCTCGGTTAGTTTTTTTTTTTCCCC:1	ATAGATACCTCACCTCTCGGTT	CGGTTAGTTTTTTTTTTTCCCC	-	chrX	3455108	-	chrX	19383208	15928100	+	chrX	19383208	+	chrX	3455108
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGACAGTTGAATCATAATTTA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	CAGACAGTTGAATCATAATTTA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	24231897	2324361	+	chr3R	21907536	+	chr3R	24231897
GTGGCAAAGTTCGAGGCATTGGTAAAGTTTTTGTTATTTTACTTGGCAAACGTGGCGC:1	GTGGCAAAGTTCGAGGCATTGG	TTTTACTTGGCAAACGTGGCGC	+	chr3R	15752300	+	chr3R	15752371	71	+	chr3R	15752300	+	chr3R	15752371
GAACTTATTCCGTTGTCCATCGATATATGATCCGAACCACCGCTTTCCGTTGTGCCAC:1	GAACTTATTCCGTTGTCCATCG	CCACCGCTTTCCGTTGTGCCAC	+	chr3L	25331653	+	chr3L	25331727	74	+	chr3L	25331653	+	chr3L	25331727
ACCAGCCAAGACTCGAGANCCCAAGAGCTGAAAACCAGACCACNAATGCNAATCAGCGATGCTTTATGATTTTCG:1	ACCAGCCAAGACTCGAGANCCC	CAGCGATGCTTTATGATTTTCG	-	chr3R	27470725	-	chr3R	27470063	662	+	chr3R	27470063	+	chr3R	27470725
TTGGGTTGCCATTGCTACTGCTATTGGTATTGCTACCAACGATTTCGTGTTTTGTTTCTGTGCTGCGGTTTTGG:1	TTGGGTTGCCATTGCTACTGCT	TGTTTCTGTGCTGCGGTTTTGG	+	chr3L	4342415	+	chr3L	4342493	78	+	chr3L	4342415	+	chr3L	4342493
CCTCCTACTTCTGCCTCCTACAACTTGACTTGAACGAATTAGTTGATCTTTGAACTCTGTAGCACACTTCAATGA:1	CCTCCTACTTCTGCCTCCTACA	ACTCTGTAGCACACTTCAATGA	+	chr2L	7959054	+	chr2L	7960465	1411	+	chr2L	7959054	+	chr2L	7960465
GGTCTGTACCGCAGCTACACCTTTCTACAGATGCCAATGATAGGGATCAAACGGATCGTGAGCGACCAGAAGC:1	GGTCTGTACCGCAGCTACACCT	CGGATCGTGAGCGACCAGAAGC	-	chr2R	19400642	-	chr2R	19400563	79	+	chr2R	19400563	+	chr2R	19400642
TAATCCCTAATTACAATCGCATTCAATGGAATCGAGCAGGAACAAATATCATACATAAATTATTTCTACACAGAC:1	TAATCCCTAATTACAATCGCAT	CATAAATTATTTCTACACAGAC	+	chr2L	2634541	+	chr2L	2634641	100	+	chr2L	2634541	+	chr2L	2634641
GTGGCAATTACACAAGCCCTCTCCCAGAGTCATAAATTCAGTCCTTTGCCGGGAAAAGCAAAAGGAGTAGCGTGC:1	GTGGCAATTACACAAGCCCTCT	AAAAGCAAAAGGAGTAGCGTGC	+	chr3R	16756332	+	chr3R	16762523	6191	+	chr3R	16756332	+	chr3R	16762523
TTTTTTTGCCTGCACTCTTATCAGTCACAATGGNTAGTTTCTATGCTCGG:1	TTTTTTTGCCTGCACTCTTATC	AATGGNTAGTTTCTATGCTCGG	-	chr3L	1189717	-	chr3L	1189656	61	+	chr3L	1189656	+	chr3L	1189717
TTTAGCTGGCAAGCACATTTTCATGGTTTTCCAGTTCCGTTTCGACAGCAACTTTTTCGTAGCATACTTTTGCCG:1	TTTAGCTGGCAAGCACATTTTC	TTTTCGTAGCATACTTTTGCCG	+	chrX	20377338	+	chrX	20378805	1467	+	chrX	20377338	+	chrX	20378805
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:2	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
GATGCAGGGTTTTATTAATCAAATTCACAAATTTAATTGAACTGATTGGAGACGGAG:1	GATGCAGGGTTTTATTAATCAA	ATTGAACTGATTGGAGACGGAG	-	chr3L	20551964	-	chr3L	18450859	2101105	+	chr3L	18450859	+	chr3L	20551964
AATGGCATTTTGACATGGCCACCGGGTGAGCATTATGAATGCTTGCCATGATGTCATTGCACTTGAGTGGA:1	AATGGCATTTTGACATGGCCAC	GATGTCATTGCACTTGAGTGGA	-	chr3R	17348816	-	chr3R	17348731	85	+	chr3R	17348731	+	chr3R	17348816
ACATAGTGGGATCGCATCACAAGGAAATGCACCACACTTCTTTTACATCGTCTATTGACTATTTCGGGCAAATAT:1	ACATAGTGGGATCGCATCACAA	ATTGACTATTTCGGGCAAATAT	-	chr2L	22694037	-	chr2L	22693950	87	+	chr2L	22693950	+	chr2L	22694037
CAATTGANTTGACTCGTTGCCGTANTTTTATAAACACATNTTAGTTGGAATCATTAANCATTTTTAGCTAGTTTC:1	CAATTGANTTGACTCGTTGCCG	TTAANCATTTTTAGCTAGTTTC	-	chr3R	26770339	-	chr3R	26770262	77	+	chr3R	26770262	+	chr3R	26770339
AAAGTCTCTGGGCACAGGTGAGCACTGTCCACGTGCGTGGCGCAACAAGTTGCCTTGCTGCTTTGGTTCCACGAC:1	AAAGTCTCTGGGCACAGGTGAG	CTTGCTGCTTTGGTTCCACGAC	-	chr3R	6300778	-	chr3R	15429722	9128944	+	chr3R	15429722	+	chr3R	6300778
GTGTCAAGNGCCAGCGAAGAAAAACCAAGAAAGATNTAATGTATAAGTACGCGATTGGGCACAAAGAAAGTGAGA:1	GTGTCAAGNGCCAGCGAAGAAA	ATTGGGCACAAAGAAAGTGAGA	-	chr3L	2308132	-	chr3L	2308026	106	+	chr3L	2308026	+	chr3L	2308132
CGAAAACGGACGACGAGGACAACAAGGACAGCNGTTGTAGGGGAAGGAAAGAGAGCGCAAA:1	CGAAAACGGACGACGAGGACAA	GGGGAAGGAAAGAGAGCGCAAA	-	chr3R	6711545	-	chr3R	27700069	20988524	+	chr3R	27700069	+	chr3R	6711545
TCATCATTTATCATCGAAGTCTTTTATAAGCTGTATTCAACCGCTTAAAGTTTAAAAGCACACTATNCTTTTA:1	TCATCATTTATCATCGAAGTCT	TTAAAAGCACACTATNCTTTTA	+	chr2L	8171274	+	chr2L	8171353	79	+	chr2L	8171274	+	chr2L	8171353
ATGATTTTTCAGAAACTTTTGAACATTGTAAGACAAAGCAACAAATCGAAGATACGTGACAAATTTTNGGA:1	ATGATTTTTCAGAAACTTTTGA	AGATACGTGACAAATTTTNGGA	+	chr3L	7112611	+	chr3L	7112694	83	+	chr3L	7112611	+	chr3L	7112694
TTAATAGTAAATAATTAANATTCTTGAAACTTAATTTTGTGAGGAAAACAAGAGTGGC:1	TTAATAGTAAATAATTAANATT	TTGTGAGGAAAACAAGAGTGGC	-	chr3R	25888115	-	chr3R	9357490	16530625	+	chr3R	9357490	+	chr3R	25888115
TTCACATCGCCGAATATTCAGGGTCATTTTAGCGTTGAAACTGCAACTTTTTTACCTTTTCCAGTTGTTTTTAGC:1	TTCACATCGCCGAATATTCAGG	ACCTTTTCCAGTTGTTTTTAGC	+	chr3R	29738282	+	chr3R	29739749	1467	+	chr3R	29738282	+	chr3R	29739749
ATAAATTATCTACACATTTAGGCACACGCATTAGCCACCACAATGGCCAGGAGTATATACGATATAGTAGTTG:1	ATAAATTATCTACACATTTAGG	AGTATATACGATATAGTAGTTG	+	chr3R	28103332	+	chr3R	28103423	91	+	chr3R	28103332	+	chr3R	28103423
ACCCAATTTCAGCGAACCACTGATCATGCACAGCCACCCACTAAAGGTCACCACCGATCCCAGCCCCGATAAATA:1	ACCCAATTTCAGCGAACCACTG	CCGATCCCAGCCCCGATAAATA	-	chr3L	14416849	-	chr3L	1963520	12453329	+	chr3L	1963520	+	chr3L	14416849
CTCGGAAGGAAAAGCGGAAATGAAGTTGGCAGTTTAGAATGCTAAAAGTGCATTTCAGCAGGTTTCCTCGA:1	CTCGGAAGGAAAAGCGGAAATG	GCATTTCAGCAGGTTTCCTCGA	+	chr2L	17703508	+	chr2L	16121098	1582410	+	chr2L	17703508	+	chr2L	16121098
ATAAATAATAGACAAAATAAAAATNAACCCTGGGCATAATAANCANAAGAGNAGGNCACTTTCCTTTCCCTTTC:1	ATAAATAATAGACAAAATAAAA	AGGNCACTTTCCTTTCCCTTTC	+	chr3L	19564975	+	chr3L	19565068	93	+	chr3L	19564975	+	chr3L	19565068
TACTAGCTGAGCCAAACTGGTTTCCAAATTATTTTTAATTGATATCTTTCACTACTCTGCAACCAATGAAAAATA:1	TACTAGCTGAGCCAAACTGGTT	ACTCTGCAACCAATGAAAAATA	+	chr2L	9892508	+	chr2L	9892584	76	+	chr2L	9892508	+	chr2L	9892584
CTTTTCCAGTTGTTTTACACAAAAATTCAGACCGCTTTTTTTTGGCTCAGACATTATTTGCCCAAGACNTTGACG:1	CTTTTCCAGTTGTTTTACACAA	TTATTTGCCCAAGACNTTGACG	+	chr2R	11091992	+	chr2R	11092071	79	+	chr2R	11091992	+	chr2R	11092071
GAAGCGGAAAACCAGCAAGTGACTCAGCTACACTGCGCGAAAATATTTATGACAAGTTAAATA:1	GAAGCGGAAAACCAGCAAGTGA	AATATTTATGACAAGTTAAATA	+	chr3R	22797790	+	chr3R	22797864	74	+	chr3R	22797790	+	chr3R	22797864
CTGCTGTGNGTATGTCGATGACCTGGATAAAAGTCATTTTAAATTAAGATCAAGCTCAAGCTC:1	CTGCTGTGNGTATGTCGATGAC	AATTAAGATCAAGCTCAAGCTC	-	chr2R	3819050	-	chr2R	3818946	104	+	chr2R	3818946	+	chr2R	3819050
GTCATCAATACTAGTCGGTACACTGAGCAAACAGTAATGCTGCTGCANATTATTCTATAATAGCCAAGAATCTG:1	GTCATCAATACTAGTCGGTACA	TTCTATAATAGCCAAGAATCTG	-	chr3L	10386485	-	chr3L	10386409	76	+	chr3L	10386409	+	chr3L	10386485
CCACAATGGGGCGCATTCAGATGGAGTTTTTGCTCCAAAAGCATTGAACTGTGCAAACTTCCACAGAATCCAGAC:1	CCACAATGGGGCGCATTCAGAT	CAAACTTCCACAGAATCCAGAC	+	chr3R	4981744	+	chr3R	4981821	77	+	chr3R	4981744	+	chr3R	4981821
AAAAAAGATCCTGCGACATGAAGATGTCCGAACGTAACAAACATTAAAACCAGATAATGCCTAGCATCTAATAA:1	AAAAAAGATCCTGCGACATGAA	GATAATGCCTAGCATCTAATAA	+	chr2R	2498986	+	chr2R	2508132	9146	+	chr2R	2498986	+	chr2R	2508132
TGCTACGAAAAAGTTGCTGTCGAAACGGAACTGGAAAACCATGAAAATGTCCTTGCCAGCTAAATGCCACTCTCT:1	TGCTACGAAAAAGTTGCTGTCG	TGCCAGCTAAATGCCACTCTCT	-	chrX	20378794	-	chrX	20377327	1467	+	chrX	20377327	+	chrX	20378794
CCTCTAAGCCCTTTATCGCCCACTCCCTACGGCTCAGCCATTCTAAGATTCTAAGACCTTCAGACTTCGGC:1	CCTCTAAGCCCTTTATCGCCCA	TCTAAGACCTTCAGACTTCGGC	-	chrX	1554149	-	chrX	8771305	7217156	+	chrX	8771305	+	chrX	1554149
TAAAAGTGGCAATTAAATAAAAGCAATTCGTTATTACATTTTTACCATTTATGAGCTTCGAAATGCCATAAAGCT:1	TAAAAGTGGCAATTAAATAAAA	AGCTTCGAAATGCCATAAAGCT	+	chr3L	17636111	+	chr3L	17636259	148	+	chr3L	17636111	+	chr3L	17636259
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAANACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAA:2	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
TTTTAATTCACAATATTCTGCTTATTCTGCTGATTAGTTGGAATTGTGTTTGTTTGCACGGATACACAGATACG:1	TTTTAATTCACAATATTCTGCT	TTTGCACGGATACACAGATACG	+	chr2L	18573538	+	chr2L	18573836	298	+	chr2L	18573538	+	chr2L	18573836
TTAGTCGCAATTTGTTTGCAGGCTCCGCCCCGCCAGACGAGGTCACATTTAATTCACATATTTTTTCGTGCGATT:1	TTAGTCGCAATTTGTTTGCAGG	TCACATATTTTTTCGTGCGATT	+	chr2R	7153172	+	chr2R	7153258	86	+	chr2R	7153172	+	chr2R	7153258
ATAGAGGGTAAGTTCTCAAGTTTGGAAAAAAAGGGATGGTTTATAAATCAGAGGGTCCTTTTTCTCAGCTGCCAC:1	ATAGAGGGTAAGTTCTCAAGTT	GGTCCTTTTTCTCAGCTGCCAC	+	chr2L	10153229	+	chr2L	10153308	79	+	chr2L	10153229	+	chr2L	10153308
GTGCACACAAACAGAGCCAGAAATCACAGCCAACAAAAAACCCCAAAATTAAATGTCCCCAGCGGACATCCGAAG:1	GTGCACACAAACAGAGCCAGAA	TGTCCCCAGCGGACATCCGAAG	-	chr2R	22515843	-	chr2R	24741713	2225870	+	chr2R	24741713	+	chr2R	22515843
GCCGTCCTGTGCTGCTGCAGAGAGAGAAAATATTTATATTTTAAATATTTCAATGAAATTATATTTATTGAAAAT:1	GCCGTCCTGTGCTGCTGCAGAG	TGAAATTATATTTATTGAAAAT	+	chr3L	17272255	+	chr3L	17272388	133	+	chr3L	17272255	+	chr3L	17272388
CATTTCGTAACAATTAATATACCACCATGTCATTAGCCAAATTGCTCAAACAATCGGCTAAAAACTAATTACTTA:1	CATTTCGTAACAATTAATATAC	TCGGCTAAAAACTAATTACTTA	-	chr3R	21843904	-	chr3R	21843801	103	+	chr3R	21843801	+	chr3R	21843904
CTTGGCTGCACTTCGCTTCGCAACCGATTAGTTACCGCCTTAGACAANGCGTTCACTAGGCTAAGAAGCTAGA:1	CTTGGCTGCACTTCGCTTCGCA	TTCACTAGGCTAAGAAGCTAGA	-	chr3R	29032853	-	chr3R	29032778	75	+	chr3R	29032778	+	chr3R	29032853
GAATGTGTGTATGTTTGCGGCTGACAGTTATTCGAGCTGCATGCNAATTATCGGACATTTACCAGAGGCG:1	GAATGTGTGTATGTTTGCGGCT	TATCGGACATTTACCAGAGGCG	-	chr3L	5633167	-	chr3L	20678030	15044863	+	chr3L	20678030	+	chr3L	5633167
CAAGAAGCTAGCCAAGCTGGGTGGTCAATTCAGTGCATCCACTCCACTGACAGGCGTTTGCATTTTA:1	CAAGAAGCTAGCCAAGCTGGGT	ACTGACAGGCGTTTGCATTTTA	-	chr2L	19712772	-	chr2L	19712696	76	+	chr2L	19712696	+	chr2L	19712772
TCTATAAGACATATATATAGGGGAAATTTTTGAACCTTTGTGCATCATTTTTTGTTCAACTATAAGGATTATAGC:1	TCTATAAGACATATATATAGGG	GTTCAACTATAAGGATTATAGC	+	chr2L	13147961	+	chr2L	13148042	81	+	chr2L	13147961	+	chr2L	13148042
TGTGTTTTCCACTCAGTCCCACCAGTCGTCGTCGCGTTACGTCACGAGAGCAGTTGTAGAACTAAAATTGTTGT:1	TGTGTTTTCCACTCAGTCCCAC	GTTGTAGAACTAAAATTGTTGT	-	chr3L	9134338	-	chr3L	9130578	3760	+	chr3L	9130578	+	chr3L	9134338
AATCTAGGCTTCTGGTTGTCAAAATGTATAAGCTNGGACAATTGTAATGTAGTCAAAGAAGTGATGTGGTACGAG:1	AATCTAGGCTTCTGGTTGTCAA	CAAAGAAGTGATGTGGTACGAG	+	chr3L	1104000	+	chr3L	1104191	191	+	chr3L	1104000	+	chr3L	1104191
GTGGAAACTTAACAGCTGTTGTAGGCAACTCATAGACGGAATAGCATTTTCTTTTATTGCTTGCCCAAATAATC:1	GTGGAAACTTAACAGCTGTTGT	TTTATTGCTTGCCCAAATAATC	+	chrX	1163309	+	chrX	1163386	77	+	chrX	1163309	+	chrX	1163386
CAATACAATACAATACAATACAATACAATANNNTNCAATACAATAAAAACCAAAAACCAAACTTCAACAATAGCA:1	CAATACAATACAATACAATACA	AAACCAAACTTCAACAATAGCA	-	chr3L	21448027	-	chr3L	18419995	3028032	+	chr3L	18419995	+	chr3L	21448027
ATCCCAGTGAAAGTGTTGAANTAGATGCANCAATATCAGCAGCAACAACAGCA:1	ATCCCAGTGAAAGTGTTGAANT	AATATCAGCAGCAACAACAGCA	+	chrX	10907189	+	chrX	17306219	6399030	+	chrX	10907189	+	chrX	17306219
ATATTCGCTTTAGATAAGAAAATTGACTAAGTTGCTTAACTTTAAATTTTACGAATC:1	ATATTCGCTTTAGATAAGAAAA	TTAACTTTAAATTTTACGAATC	+	chrX	2112340	+	chrX	2112418	78	+	chrX	2112340	+	chrX	2112418
AGACGGAAAAAGTTGGGATACTGTCAGTGTGCACTCAATGGGTAAGCTCACATTATTGAATAGATTTTGCGGAA:1	AGACGGAAAAAGTTGGGATACT	TTATTGAATAGATTTTGCGGAA	+	chr3R	6598330	+	chr3R	6598519	189	+	chr3R	6598330	+	chr3R	6598519
AAAACCNATAACTCATCGATCACGACAGTTGGCTTTTGAACGCGGNACGCCAAAGTC:1	AAAACCNATAACTCATCGATCA	TTGAACGCGGNACGCCAAAGTC	-	chr3R	15727616	-	chr3R	5279905	10447711	+	chr3R	5279905	+	chr3R	15727616
ATTTTGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	ATTTTGTGGTGTGTTGTGTTGT	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	28831804	-	chr3R	21907535	6924269	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831804
GGGATGCATCCGCCAGATGAAGATACATTTCAAAGGCGCGCTGCAAGATACTCCAGACATGAACCCAGCTCATAA:1	GGGATGCATCCGCCAGATGAAG	CAGACATGAACCCAGCTCATAA	-	chr3L	535727	-	chr3L	15693672	15157945	+	chr3L	15693672	+	chr3L	535727
TATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGTTTCTCTGGTTTTCCTCCAATTTAAAGCATACT:1	TATGTATAGTAGTAGTAGGTAT	TTCCTCCAATTTAAAGCATACT	-	chr2R	15005073	-	chr2R	15004757	316	+	chr2R	15004757	+	chr2R	15005073
GGCTTATGTGATATCTGAACGTGGCCCACTTGAAGGACCTTGGAGTCCTACCAGCCTATCGGCG:1	GGCTTATGTGATATCTGAACGT	GAGTCCTACCAGCCTATCGGCG	-	chr2R	13721297	-	chr2R	13721225	72	+	chr2R	13721225	+	chr2R	13721297
TACAGCTTGATGGAAATATTTAAATTTTCCCTATATATACATTCCCTNTTCAGATTCGTTCGTCCGCCTGACTT:1	TACAGCTTGATGGAAATATTTA	GATTCGTTCGTCCGCCTGACTT	-	chr3L	20148402	-	chr3L	20148313	89	+	chr3L	20148313	+	chr3L	20148402
GAAAATGTGTGCTACCTTATGGAATTAATCCCCCGATTCAGATCTAATCGTCTTGACTGACAAGCGNGATTCACA:1	GAAAATGTGTGCTACCTTATGG	TGACTGACAAGCGNGATTCACA	+	chr3L	6261299	+	chr3L	6259254	2045	+	chr3L	6261299	+	chr3L	6259254
TGGCTGTGCAATATCTACATACATGTATACATGTATACATTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTAT:1	TGGCTGTGCAATATCTACATAC	GCGGCATGAATCACTGGTCTAT	+	chr2R	17626869	+	chr2R	17626947	78	+	chr2R	17626869	+	chr2R	17626947
CGCTTTGTCTGATTCTGATTCGACTTATCAGTACGCGGTCCACAGCTTAAATTAAATCCATCACTGCAATGTAAT:1	CGCTTTGTCTGATTCTGATTCG	AAATCCATCACTGCAATGTAAT	-	chr3L	22909122	-	chr3L	22909031	91	+	chr3L	22909031	+	chr3L	22909122
CGAAAAACTTTGCGATAACCAAGCTACTCACTCACTCACTCCATTTTCAGATACAACATCTCCTGGGCCG:1	CGAAAAACTTTGCGATAACCAA	AGATACAACATCTCCTGGGCCG	-	chr3R	27779351	-	chr3R	27779276	75	+	chr3R	27779276	+	chr3R	27779351
TCTTTCTAGAAGTGGAGCCGAATTTTCGGGACATCTTGTTAGCTGGATACCAGATTTGGCTGCCACTTATTTGCA:1	TCTTTCTAGAAGTGGAGCCGAA	ATTTGGCTGCCACTTATTTGCA	+	chr2L	325137	+	chr2L	325214	77	+	chr2L	325137	+	chr2L	325214
CCGCATAATAGACCAGTGATTCATGCCGCCCAGTGACCCAAAATGTATANATGTATACATGTATGTAGATATTGC:1	CCGCATAATAGACCAGTGATTC	TATACATGTATGTAGATATTGC	-	chr2R	17626954	-	chr2R	17626876	78	+	chr2R	17626876	+	chr2R	17626954
CATCGCCATTCACACAACTATTCGCAGTTAAGCGNTCCAAGGCCATCTGCATTTCAAATGACCAACGCAACAATG:1	CATCGCCATTCACACAACTATT	TCAAATGACCAACGCAACAATG	-	chr3L	19137726	-	chr3L	19137607	119	+	chr3L	19137607	+	chr3L	19137726
CGCAAGTGTAAGAAACAAGTCACGCACTCTTCCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCA:1	CGCAAGTGTAAGAAACAAGTCA	CCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCA	+	chr3R	5573181	+	chr3R	5573244	63	+	chr3R	5573181	+	chr3R	5573244
AATCGGCAGTCATTTGGGCTTAAAGGGGTATAACTCAGTGA:1	AATCGGCAGTCATTTGGGCTTA	TTAAAGGGGTATAACTCAGTGA	-	chr3L	14156987	-	chr3L	14352870	195883	+	chr3L	14352870	+	chr3L	14156987
AAATGACTGAAGTGGTAGCCAATTTGAGGAGTGTACATGCATAAACATGGAATCACATTACCTTTAGTTGCTGGC:1	AAATGACTGAAGTGGTAGCCAA	CACATTACCTTTAGTTGCTGGC	+	chr2L	11538824	+	chr2L	11538909	85	+	chr2L	11538824	+	chr2L	11538909
GCTGCGGCTGAGTAAAACGAAACCAGCGGCAAAACGCTGACAGATAAACAAACAGGTTGGGATTGCACCGTTTTG:1	GCTGCGGCTGAGTAAAACGAAA	AGGTTGGGATTGCACCGTTTTG	+	chr3R	30830575	+	chr3R	30830658	83	+	chr3R	30830575	+	chr3R	30830658
ATAAAACTTTACTTACTTGCAGTAAGTATCAATTTTAACGTCTTAAAGATATACCAATCTAAAAAGAAAATTAAA:1	ATAAAACTTTACTTACTTGCAG	CCAATCTAAAAAGAAAATTAAA	-	chr2L	17419377	-	chr2L	17419301	76	+	chr2L	17419301	+	chr2L	17419377
CATCTCCGCAATAATACTTATATATGTACATACGTATTAATACACTGGCCTATGAATGGTTCACAACTATATTGG:1	CATCTCCGCAATAATACTTATA	GAATGGTTCACAACTATATTGG	-	chr2R	9157776	-	chr2R	9151306	6470	+	chr2R	9151306	+	chr2R	9157776
GTACTATCATTTTTTGGCATTTTATTAGACACTATAANTTCTGATNCTGTCCCATTTATTCTT:1	GTACTATCATTTTTTGGCATTT	TGATNCTGTCCCATTTATTCTT	-	chr2L	10692909	-	chr2L	10692823	86	+	chr2L	10692823	+	chr2L	10692909
CTTAATTATCTGGCTCAGCAAGCGTAAAAAGGCAAATGGGGGCTTTTGGAGGACTGGGATCAGCGGAGGGTAAAA:1	CTTAATTATCTGGCTCAGCAAG	CTGGGATCAGCGGAGGGTAAAA	+	chr3L	19848535	+	chr3L	19857725	9190	+	chr3L	19848535	+	chr3L	19857725
GCCTCCACAATCCTGCCCTTCACACACACGCAAGCACATCGAAGACGGCGATGAGAATTGTTTGTTGAAAATGTC:1	GCCTCCACAATCCTGCCCTTCA	AGAATTGTTTGTTGAAAATGTC	+	chr2R	23831168	+	chr2R	19058531	4772637	+	chr2R	23831168	+	chr2R	19058531
TTACAATTTGTAATTTAGATATTGTTTCCCAGATGTGCAGATGTGTGCTTGGAATCAGATCGGTTAGCTTC:1	TTACAATTTGTAATTTAGATAT	TGGAATCAGATCGGTTAGCTTC	+	chr3R	30210673	+	chr3R	30210749	76	+	chr3R	30210673	+	chr3R	30210749
CAAAAAGAAAAAAAAAAGGAGGCGTGGCCGGGGAACTTG:1	CAAAAAGAAAAAAAAAAGGAGG	GGAGGCGTGGCCGGGGAACTTG	-	chr2R	20591362	-	chr2R	12104014	8487348	+	chr2R	12104014	+	chr2R	20591362
TTAACCAATCAGGGTTCTGCNGTGAGTGCAGANAATTTGACGNTGAGTTTTTTTAGTTGCTTAAAAGTCCTTTTT:1	TTAACCAATCAGGGTTCTGCNG	TAGTTGCTTAAAAGTCCTTTTT	+	chr2L	19558539	+	chr2L	19558643	104	+	chr2L	19558539	+	chr2L	19558643
TTGCATTTAGTTAATTATTATTACATCGGGTCGTGCTGATTTTTACGTGAAGTTGAAGTGCACCTAAAGTACATA:1	TTGCATTTAGTTAATTATTATT	TGAAGTGCACCTAAAGTACATA	-	chr3R	31047038	-	chr3R	31046961	77	+	chr3R	31046961	+	chr3R	31047038
GCTGCTAATAAACTTTCGGGCATAAAAATCGCACTGCAAATTTACCACACGACCCGAAAGTAGGCAACACTTTT:1	GCTGCTAATAAACTTTCGGGCA	CCCGAAAGTAGGCAACACTTTT	+	chr3L	19008868	+	chr3L	19009205	337	+	chr3L	19008868	+	chr3L	19009205
TTCAATATTTTGTAGAAGTCCTTCCTTCCTTCCTTCCATCATGTTCATTGAGCTCGCTTCGACTATATTGTTTGA:1	TTCAATATTTTGTAGAAGTCCT	TCGCTTCGACTATATTGTTTGA	-	chr2L	17796106	-	chr2L	17796025	81	+	chr2L	17796025	+	chr2L	17796106
TGACATTTGGCCTGATTAGATTTGCTTGCAGCAGTTTAACTAAGAGCCAAGTCGATGCGGGACTTCTTTAAGGTT:1	TGACATTTGGCCTGATTAGATT	GATGCGGGACTTCTTTAAGGTT	+	chr3R	7857650	+	chr3R	7857733	83	+	chr3R	7857650	+	chr3R	7857733
AAACTTTAAATTTCCAACTTAGGACATGGTGAAGACCCCTTACATTTTGCATACTGATAATGGGGCCATCGTGTG:2	AAACTTTAAATTTCCAACTTAG	CTGATAATGGGGCCATCGTGTG	-	chr3L	22169559	-	chr3L	22169466	93	+	chr3L	22169466	+	chr3L	22169559
ATTTGGCCNGGTGGTCCTGCTCATCCAGCCCACCAATATTATTCACAAGATGATATTCACAAGATATAACCGCAT:1	ATTTGGCCNGGTGGTCCTGCTC	TATTCACAAGATATAACCGCAT	+	chr3L	2355450	+	chr3L	2355638	188	+	chr3L	2355450	+	chr3L	2355638
ATTGAAGTTGACAGCTAAGTTTAAAGCAGCTTCCTGCGTAAATGGGTTTCAGTTTTCACACTTTGGACAAGAGT:1	ATTGAAGTTGACAGCTAAGTTT	TTTTCACACTTTGGACAAGAGT	-	chr3R	27041917	-	chr3R	27041828	89	+	chr3R	27041828	+	chr3R	27041917
GAAATAAATCTAGAAAATAATCGAATCACTTAATGGTCTTTTAATTCAATAGACCGGCGTATTACAAACAATTAA:1	GAAATAAATCTAGAAAATAATC	CCGGCGTATTACAAACAATTAA	-	chr3R	16374439	-	chr3R	16374322	117	+	chr3R	16374322	+	chr3R	16374439
TTTAAAAGCCGTTTTAAATCATAATGTAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACAC:1	TTTAAAAGCCGTTTTAAATCAT	ATTGATGATGCTGAAATTACAC	+	chr2L	18925227	+	chr2L	18925322	95	+	chr2L	18925227	+	chr2L	18925322
GCAAGGACATCAAAACGATTTCCTCCTCCANNNGNTTGACCTGCAATTAAAGTGCATAAGTATTGGCACATAGA:1	GCAAGGACATCAAAACGATTTC	TGCATAAGTATTGGCACATAGA	-	chr2R	22278503	-	chr2R	13451894	8826609	+	chr2R	13451894	+	chr2R	22278503
TTTGTAATTGAATTTTTCACGGCGAATTGTTGGTTCGTATTTTTCTTGTTTCCGGCGTTTGGGGTTTGGATTTAC:1	TTTGTAATTGAATTTTTCACGG	GGCGTTTGGGGTTTGGATTTAC	+	chr2R	17992128	+	chr2R	17992204	76	+	chr2R	17992128	+	chr2R	17992204
GTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCGTCGTCGCCTGGGAA:1	GTCTACCCGAAATGTTTGTGAA	TCGCTGCGTCGTCGCCTGGGAA	+	chr3L	2534640	+	chr3L	2534719	79	+	chr3L	2534640	+	chr3L	2534719
CTATTTATGCGGTGCATCTATAACCGCTGCAACAAATGNAGTACGAAGTGCACATGCGATGGCCGCAACTGG:1	CTATTTATGCGGTGCATCTATA	CACATGCGATGGCCGCAACTGG	+	chr3L	20703684	+	chr3L	20703823	139	+	chr3L	20703684	+	chr3L	20703823
CTGCGTTTGATCGACTACCCCATGTTCACTCTCNATGACTGTTTTCGCACTCTAATANATTT:1	CTGCGTTTGATCGACTACCCCA	GTTTTCGCACTCTAATANATTT	-	chr2R	5421530	-	chr2R	5421625	95	+	chr2R	5421625	+	chr2R	5421530
CAAGCCTTACGACCAAATTGAGAGTAGTTTTTGATGCTTCAGCACAGATTCACGGATTTGCGGACGCATCCGAAA:1	CAAGCCTTACGACCAAATTGAG	GGATTTGCGGACGCATCCGAAA	+	chr3R	19445231	+	chr3R	19446130	899	+	chr3R	19445231	+	chr3R	19446130
TTCCGAGGAAGTGGCCTCGGGGATTGGGACATGAGCAACTCCGCATCGTCATCATCAGCGG:1	TTCCGAGGAAGTGGCCTCGGGG	TCCGCATCGTCATCATCAGCGG	+	chr3L	3565952	+	chr3L	3566014	62	+	chr3L	3565952	+	chr3L	3566014
GTTTTTCACTTGCATTGATCGTCCTTGTATGTCCTCTTCGACACTCACT:1	GTTTTTCACTTGCATTGATCGT	TATGTCCTCTTCGACACTCACT	-	chr3R	2541703	-	chr3R	2534160	7543	+	chr3R	2534160	+	chr3R	2541703
TACAACTTCCGAGGTTTAGTGCTCTTCTGAACTGTAAGACAAACCGAAGGTGTTCATTATTTAAATGCTTTTCA:1	TACAACTTCCGAGGTTTAGTGC	TTCATTATTTAAATGCTTTTCA	-	chr2R	16618813	-	chr2R	16618738	75	+	chr2R	16618738	+	chr2R	16618813
GATTTATCTACCTGAAATGTTTGGCGCTGCAACAGATAACTTTCATGTTCAGTTGGCTACACGGAACTAATGNTG:1	GATTTATCTACCTGAAATGTTT	TGGCTACACGGAACTAATGNTG	+	chr3L	11157741	+	chr3L	11157860	119	+	chr3L	11157741	+	chr3L	11157860
AAAGATACCGGGCGAGGGGTACGCAAAACTAAATTATGTTCGAAAGACTAATTAGTTCAATAAAACTAAATAA:1	AAAGATACCGGGCGAGGGGTAC	TTAGTTCAATAAAACTAAATAA	+	chr3L	10198656	+	chr3L	10198732	76	+	chr3L	10198656	+	chr3L	10198732
GGCGTTCGGGGGGGTCAATGAATTACTGGTAGGTATGTATGTTG:1	GGCGTTCGGGGGGGTCAATGAA	TTACTGGTAGGTATGTATGTTG	-	chr2R	24488250	-	chr2R	24490163	1913	+	chr2R	24490163	+	chr2R	24488250
GCCTAAGCTCGCGTATTCGGTTCCTGGGATAAGTGCCTGTAAAATAAATGGGTTTGTATCG:1	GCCTAAGCTCGCGTATTCGGTT	TAAAATAAATGGGTTTGTATCG	-	chr2L	22546082	-	chr2L	22546000	82	+	chr2L	22546000	+	chr2L	22546082
TTAGCTCAGAAAGAGAGGTGTCTGTATGTGGTGTCACATTGTAAAGTCTCTTTACTAGGGATCGATTCATATCT:1	TTAGCTCAGAAAGAGAGGTGTC	TACTAGGGATCGATTCATATCT	-	chr2R	1365994	-	chr2R	1365883	111	+	chr2R	1365883	+	chr2R	1365994
GACTTTAATACACCTTTAAACAGTGTTTCAGTGTAACAGTGTTACAAGACATAAGTAATTTGTGAAGAGTCTTA:1	GACTTTAATACACCTTTAAACA	AAGTAATTTGTGAAGAGTCTTA	+	chr3L	15511314	+	chr3L	15511393	79	+	chr3L	15511314	+	chr3L	15511393
CGTTATATCAGTAACGCAAAATGCCAACTTTTAATCGTCTTAACNTTATTCGAGGTAAATGAAGTTTTACA:1	CGTTATATCAGTAACGCAAAAT	TCGAGGTAAATGAAGTTTTACA	-	chr3L	23102003	-	chr3L	23101904	99	+	chr3L	23101904	+	chr3L	23102003
TCAACGGATTTATGTGTAGATGACGTGTTTAGGCTGACTTGTCTTGCAAAAAGTTGATTGATAGTTACGACAGAT:1	TCAACGGATTTATGTGTAGATG	TTGATTGATAGTTACGACAGAT	+	chr2R	24008438	+	chr2R	24008524	86	+	chr2R	24008438	+	chr2R	24008524
GCCAAACAAACTTAAGTTTATTTTAAGTTTTTCAGGACTAGCTGTCATAACAACAATGTCTACACAAGGGTATT:1	GCCAAACAAACTTAAGTTTATT	ACAATGTCTACACAAGGGTATT	-	chr3L	165845	-	chr3L	3972374	3806529	+	chr3L	3972374	+	chr3L	165845
AAGATAAGCATAACACAGCGTGTTATGCCCCACCTTTCGCCAGATAAGGAGTAAGGAGTCCGTGCGACGGG:1	AAGATAAGCATAACACAGCGTG	AGTAAGGAGTCCGTGCGACGGG	+	chr3L	22610615	+	chr3L	22610707	92	+	chr3L	22610615	+	chr3L	22610707
TAAGAACTCGTGTAAATTCCATTAGGGCCAAAAAGTTTCAGGCAACGAGCAAAGCAAAACACAGGGTGTGTGATT:1	TAAGAACTCGTGTAAATTCCAT	GCAAAACACAGGGTGTGTGATT	-	chr3R	30086327	-	chr3R	30084860	1467	+	chr3R	30084860	+	chr3R	30086327
AATATACTAAAGAGTTCAGAAACTGNATAATATTTAACGACTTCGAACATAAAAAGATAACTACACTTGGATAGG:1	AATATACTAAAGAGTTCAGAAA	AAGATAACTACACTTGGATAGG	+	chr3R	28830905	+	chr3R	28830983	78	+	chr3R	28830905	+	chr3R	28830983
CAATTCANTCTGCTATCTAAACAACTAGAAAAACAAATANTGTTATCGCAGTGTGGCNACAAAAAAAGCTAGAAA:1	CAATTCANTCTGCTATCTAAAC	TGGCNACAAAAAAAGCTAGAAA	+	chr2L	20891544	+	chr2L	20896645	5101	+	chr2L	20891544	+	chr2L	20896645
AAATTAATGGACTATCGGGGGGCGTGGCTATCGGCATATATCATTAATTTAATGTC:1	AAATTAATGGACTATCGGGGGG	CATATATCATTAATTTAATGTC	+	chrX	13432516	+	chrX	8308932	5123584	+	chrX	13432516	+	chrX	8308932
AAGGTTTTCCTATTTCCCATAGCAAAATAAATTTCCCTACACATTCCAACCTCAATTAATAAACCAAAATAAAAA:1	AAGGTTTTCCTATTTCCCATAG	AATTAATAAACCAAAATAAAAA	+	chr2R	7290217	+	chr2R	7290319	102	+	chr2R	7290217	+	chr2R	7290319
GAATTTTCGGGTGCCAGCACCAACACACACACACGCACACACACACAGTACAAGGAACAGGATGCCCCTGTGA:1	GAATTTTCGGGTGCCAGCACCA	AAGGAACAGGATGCCCCTGTGA	-	chr3R	14037664	-	chr3R	14037585	79	+	chr3R	14037585	+	chr3R	14037664
CCGAACACGTGTTCTCGTCCGAGATGTGGCATCTTGTTCTGAACGCAGGCCAACAAAATAGCCAT:1	CCGAACACGTGTTCTCGTCCGA	CGCAGGCCAACAAAATAGCCAT	-	chrX	561669	-	chrX	561583	86	+	chrX	561583	+	chrX	561669
AAGCTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGANNNCNCCTCGGAGGGAGGATGGAATATCCTGCA:1	AAGCTCCCTGTTATCAGCAAAG	AGGGAGGATGGAATATCCTGCA	-	chr3L	22572169	-	chr3L	22572100	69	+	chr3L	22572100	+	chr3L	22572169
AAAAGTTCATAAAAACACTATTTCCATTCTTCAAGTGAAAATGCTCATTTTAAACAATTTACAATTAGCTGTAAA:1	AAAAGTTCATAAAAACACTATT	ACAATTTACAATTAGCTGTAAA	+	chr2R	20542006	+	chr2R	20542084	78	+	chr2R	20542006	+	chr2R	20542084
GTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTNT:1	GTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCT	CTTTGTCTTTGTCTTTGTCTNT	-	chrX	16983076	-	chrX	1053120	15929956	+	chrX	1053120	+	chrX	16983076
AGGCCTTGCACAAAACCCATCGATTCGAGCATGTGACACGCATGAGGCACAAACAAAATATGCAATATGTTCACA:1	AGGCCTTGCACAAAACCCATCG	CAAAATATGCAATATGTTCACA	+	chr2L	14554172	+	chr2L	14554249	77	+	chr2L	14554172	+	chr2L	14554249
TTTTTGGGACACTTTTCAAGGTTCGAGGCACTTCATTGAACTCTCTTCTGTCGTCTTTCTTTCTTCAATCTTCG:1	TTTTTGGGACACTTTTCAAGGT	GTCTTTCTTTCTTCAATCTTCG	-	chr2L	19147390	-	chr2L	19147276	114	+	chr2L	19147276	+	chr2L	19147390
ATATGAAACATGTAGCTCTGAAANTATGTCTCAGGTCTCGTTTTTCGACAGGACCTCGAAAACAG:1	ATATGAAACATGTAGCTCTGAA	TTCGACAGGACCTCGAAAACAG	+	chr3R	31642825	+	chr3R	31643060	235	+	chr3R	31642825	+	chr3R	31643060
AGGCGCTTGCAGGANAAAAAAGGGCGGGCGGAAAAAGGGCGAGGTGGTATGTGGAAGATGTTCGAGTCGCTGCGG:1	AGGCGCTTGCAGGANAAAAAAG	GAAGATGTTCGAGTCGCTGCGG	-	chr3R	25573767	-	chr3R	6962010	18611757	+	chr3R	6962010	+	chr3R	25573767
GTGCAAGGAGAAACTCCACGGCATCACCCCCTCCCGCCCCAGCGAG:1	GTGCAAGGAGAAACTCCACGGC	CACCCCCTCCCGCCCCAGCGAG	-	chr3R	26058824	-	chr3R	9400761	16658063	+	chr3R	9400761	+	chr3R	26058824
ATTGGGTGTTGAATGTGTAACTTTTCATACCCAAGATTCGCAGATTTTAATTGGTTGACCTACCTTAATTGTGAT:1	ATTGGGTGTTGAATGTGTAACT	GTTGACCTACCTTAATTGTGAT	+	chr3L	20487672	+	chr3L	20488123	451	+	chr3L	20487672	+	chr3L	20488123
AAATATTTGCTTTCGAAAAANATTGTTATTTANAACTTCAACNACAACATAATGGTAAAAATGTTTTTTCTCCGC:1	AAATATTTGCTTTCGAAAAANA	GGTAAAAATGTTTTTTCTCCGC	+	chr2L	14677759	+	chr2L	21052108	6374349	+	chr2L	14677759	+	chr2L	21052108
TACGGTAAGTTTAGCTAGCCCGCACATACTCTTTTCCATCGTTCGTTTATCATCGTTTATTTTTTTTTCT:1	TACGGTAAGTTTAGCTAGCCCG	ATCATCGTTTATTTTTTTTTCT	+	chrX	8068780	+	chrX	8663926	595146	+	chrX	8068780	+	chrX	8663926
CACTTAAGCTGAAGGCATCAGTTGGTTCTATTGAAAAGTGTAATCGTAGCTAAAGCCATCCCGATTTGATTGGAA:1	CACTTAAGCTGAAGGCATCAGT	AGCCATCCCGATTTGATTGGAA	-	chr2R	23061832	-	chr2R	23061756	76	+	chr2R	23061756	+	chr2R	23061832
TAACCAATTGCACTTGTTTGTATCACTAGATGGCGGAGGCTGGTGGTCAACATGTCGAACATATTGCCAAAACCA:1	TAACCAATTGCACTTGTTTGTA	GTCGAACATATTGCCAAAACCA	-	chr2R	14416307	-	chr2R	13444649	971658	+	chr2R	13444649	+	chr2R	14416307
AGTTTGTGGCCAAGTAAACACGCCCAACATTTGAATTGGGCCACAGGGAGAAGGGTAAATTATT:1	AGTTTGTGGCCAAGTAAACACG	ACAGGGAGAAGGGTAAATTATT	+	chrX	5469640	+	chrX	5469798	158	+	chrX	5469640	+	chrX	5469798
CACAACAGAACACAACACAACACAACACAACACAAACACCATACTTTTT:1	CACAACAGAACACAACACAACA	CAACACAAACACCATACTTTTT	+	chr3R	21907535	+	chr3R	18299854	3607681	+	chr3R	21907535	+	chr3R	18299854
TAATAAACAAAAGTCAATGACTGTTGTTCGGGGGAGGGAAGATATATGGTAATGTGATATTGGGTCCAAGAACTC:1	TAATAAACAAAAGTCAATGACT	GTGATATTGGGTCCAAGAACTC	-	chr2R	18582019	-	chr2R	18575831	6188	+	chr2R	18575831	+	chr2R	18582019
GTTATTAATAATATGTATTTAAATGGTTACTTTATTAATCAATGATCTGTTACACGTGCGTTCTGATTTTGTAT:1	GTTATTAATAATATGTATTTAA	CACGTGCGTTCTGATTTTGTAT	-	chr3L	1163291	-	chr3L	1154142	9149	+	chr3L	1154142	+	chr3L	1163291
ATCACAGANCTTGTCAACACGAAATGGACATGTATCAATTAATCTTACGCATTGTTGGGGGATTTTCTAATACGT:1	ATCACAGANCTTGTCAACACGA	GTTGGGGGATTTTCTAATACGT	+	chr2R	20039406	+	chr2R	15771109	4268297	+	chr2R	20039406	+	chr2R	15771109
GTATGAGCAACGCAAATATACCGAAAATCATAAAGCATCGCTGATTAGCATTTGTGGTCTGGTTTTCAGCTCTTG:1	GTATGAGCAACGCAAATATACC	GTGGTCTGGTTTTCAGCTCTTG	+	chr3R	27470042	+	chr3R	27470704	662	+	chr3R	27470042	+	chr3R	27470704
CAGCNACAAAAGAAATGAAGGCNCCACNGTACCCACCAANGTCCCCATAACAATGAACACAATGCAACATCATTT:1	CAGCNACAAAAGAAATGAAGGC	TGAACACAATGCAACATCATTT	+	chr3L	10851813	+	chr3L	17497935	6646122	+	chr3L	10851813	+	chr3L	17497935
CCAGCGGAGGTCACCGAAAGTTGATTGAGGAAATACCTCAAATTAAACTTAGATGCAACTTATTGAACNGCAAAA:1	CCAGCGGAGGTCACCGAAAGTT	TGCAACTTATTGAACNGCAAAA	-	chr3L	15260118	-	chr3L	15259124	994	+	chr3L	15259124	+	chr3L	15260118
GATGCCACACCGTGGTACAACTTCGAGGATTGCTACTGATAGCTTTTGGAGCAATAAAGTAACTTCTTTAGTGG:1	GATGCCACACCGTGGTACAACT	AATAAAGTAACTTCTTTAGTGG	+	chr2L	6021634	+	chr2L	6021711	77	+	chr2L	6021634	+	chr2L	6021711
TGCAACGGACACATTTGCCAAGATTGACTGTACACAGGGGCCCAACATCCAGCTGCTCGGA:1	TGCAACGGACACATTTGCCAAG	GCCCAACATCCAGCTGCTCGGA	+	chr3L	5495061	+	chr3L	3862243	1632818	+	chr3L	5495061	+	chr3L	3862243
TAAAACATGTCCCACTGGCAAATGAAGTGAGAAGGATGCAGAATGCCACGGCCGGGCACAATAAACTGTTTCGC:1	TAAAACATGTCCCACTGGCAAA	CGGGCACAATAAACTGTTTCGC	+	chr2L	1883445	+	chr2L	1884024	579	+	chr2L	1883445	+	chr2L	1884024
AGAATGACTGACAGCGAATTCCTGAGTTTGTCATTTCTTTTTAAGTATTTAGTTGCCCAAAATAGGGGATTTGTT:1	AGAATGACTGACAGCGAATTCC	TGCCCAAAATAGGGGATTTGTT	+	chr3R	19602786	+	chr3R	19602864	78	+	chr3R	19602786	+	chr3R	19602864
AGCACACTTAACTGTCTTAACTGCCTTAGCAGCAGAGGTGGAAGCTTNCAGCAGGAGGAGCAGAGCCACCTAATG:1	AGCACACTTAACTGTCTTAACT	GGAGGAGCAGAGCCACCTAATG	-	chr3L	17579147	-	chr3L	17578881	266	+	chr3L	17578881	+	chr3L	17579147
CGTGTACTGGCTGGGGAAATGCGAAACTCTCNTTAATCACGAAATCAATGCAATTTACCTTGCATTAAATGAGG:1	CGTGTACTGGCTGGGGAAATGC	ATTTACCTTGCATTAAATGAGG	-	chr3R	6739302	-	chr3R	6737516	1786	+	chr3R	6737516	+	chr3R	6739302
AAAACCANAGCCAAAAACGGGGTGTAAGCCAAGTGCCTTNTTGTGAATACCCTGCTANTTGGCAG:1	AAAACCANAGCCAAAAACGGGG	TGAATACCCTGCTANTTGGCAG	+	chr2R	21546802	+	chr2R	21546873	71	+	chr2R	21546802	+	chr2R	21546873
GAGCGTTCAATTTAACTTCGTATCACTGACTACCCGCGGAGCCGAGAAACCTTTGT:1	GAGCGTTCAATTTAACTTCGTA	CGCGGAGCCGAGAAACCTTTGT	-	chrX	806881	-	chrX	806804	77	+	chrX	806804	+	chrX	806881
ATACAAAGTTGTGTCAGAGAATATCTTATATATATAATATTCGTTGGTAATTTTGATAAGAAAAGTAATTAATT:1	ATACAAAGTTGTGTCAGAGAAT	TTGATAAGAAAAGTAATTAATT	+	chr3R	21108060	+	chr3R	21108320	260	+	chr3R	21108060	+	chr3R	21108320
AATGTGCTGAGAGGCCTTGACCGGCTCCANCATCGCCGAGTATTTTGCAATTATCGTGAGNCACATAATAAATGT:1	AATGTGCTGAGAGGCCTTGACC	TCGTGAGNCACATAATAAATGT	+	chr3R	4568600	+	chr3R	4568689	89	+	chr3R	4568600	+	chr3R	4568689
ATGACCAAATTATTTTCTTTTTGCAAGTTCAGATGCTGAGATATTATTCACAAAGAAACAATTATATCTCAAATG:1	ATGACCAAATTATTTTCTTTTT	AGAAACAATTATATCTCAAATG	-	chr2L	1573566	-	chr2L	1570694	2872	+	chr2L	1570694	+	chr2L	1573566
GCAAAAGAAGCCACAGCAAAAGCTTGCGGTGTGTGTGTGTGTGCTAAAAAGTGGCCAAGAAGGA:1	GCAAAAGAAGCCACAGCAAAAG	GCTAAAAAGTGGCCAAGAAGGA	+	chr3R	10899457	+	chr3R	10899523	66	+	chr3R	10899457	+	chr3R	10899523
GTGATGTTACCTACAAGGATTACCTTAAGCGCGCCAAATTGTAGGCTCANAGAAAGAAGCATTCACATTCGGAC:1	GTGATGTTACCTACAAGGATTA	AAAGAAGCATTCACATTCGGAC	-	chr2L	6445141	-	chr2L	6426882	18259	+	chr2L	6426882	+	chr2L	6445141
CTTCGTNTGTTGAATACTATCCCACACACTATCTGACCCGTATTATTCATTTGATGATCCATCAG:1	CTTCGTNTGTTGAATACTATCC	TATTCATTTGATGATCCATCAG	-	chrX	2578926	-	chrX	2578844	82	+	chrX	2578844	+	chrX	2578926
GTTCGAGGTTGATTTTGCNGACAATCGAAAGACTTAAGGCANAAANTTGTTGAAAGAACTTTCCTAGGGCACG:1	GTTCGAGGTTGATTTTGCNGAC	GAAAGAACTTTCCTAGGGCACG	+	chr2L	4601717	+	chr2L	4609156	7439	+	chr2L	4601717	+	chr2L	4609156
TGGGACTGGATGTGCGGCACTGAATTGCTGANTGCGCTAGCCACCGGTCAACACAACCCACTTACC:1	TGGGACTGGATGTGCGGCACTG	CGGTCAACACAACCCACTTACC	+	chr3R	23497976	+	chr3R	23498051	75	+	chr3R	23497976	+	chr3R	23498051
GTTAACTGAATCCTTTTAGAAGAGAACTCCCCAGTTATGAACAATATACATAGATGTTTTTTTAAGTGCAAGGCT:1	GTTAACTGAATCCTTTTAGAAG	ATGTTTTTTTAAGTGCAAGGCT	+	chr2L	3582890	+	chr2L	3582967	77	+	chr2L	3582890	+	chr2L	3582967
TTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGANAC:1	TTATTATGCATTTTAATATCTA	TAGAGGCCTGAAAAGTTGANAC	+	chr2L	1615403	+	chr2L	1615485	82	+	chr2L	1615403	+	chr2L	1615485
TTTATATTTTACACTAAATAATGCCCATTTCACCCGCCCAATTAGTGAAAATCCTGCATGTCTGCGTTGCATTGC:1	TTTATATTTTACACTAAATAAT	CTGCATGTCTGCGTTGCATTGC	+	chr3L	18567046	+	chr3L	18567132	86	+	chr3L	18567046	+	chr3L	18567132
GGATTTTAATAAGTTTAGCTTTCGAAAATATGCACAATAATGTTGTTTCGTTCGTTGGCAACTTCATAACTTTTA:1	GGATTTTAATAAGTTTAGCTTT	GTTGGCAACTTCATAACTTTTA	-	chrX	22701812	-	chrX	22697515	4297	+	chrX	22697515	+	chrX	22701812
GAAACAAAGTGAGACGAAAAGTTTTCGGAAAGAGACAAGAGCAAAACATGTGTGTATGTGTGTACCCAGGGTGCA:1	GAAACAAAGTGAGACGAAAAGT	GTATGTGTGTACCCAGGGTGCA	-	chr2L	12759311	-	chr2L	12759216	95	+	chr2L	12759216	+	chr2L	12759311
AAATTTGCATGTGACCCCNACACACTCACACCCCTCGATGTCGNCATATNTTTTTGTTTTTGTTGCCACTTT:1	AAATTTGCATGTGACCCCNACA	TTTTTGTTTTTGTTGCCACTTT	+	chr3L	7001619	+	chr3L	15241545	8239926	+	chr3L	7001619	+	chr3L	15241545
GGTAGGCAGGTTCATTGGTTTTTGGCAGCCTGCTCAAGTGAAACGTCGCGTCGCTGTTGTCAGGTCACATGATCT:1	GGTAGGCAGGTTCATTGGTTTT	CTGTTGTCAGGTCACATGATCT	-	chr3L	9061261	-	chr3L	9061153	108	+	chr3L	9061153	+	chr3L	9061261
CATAGGCCCGGCTTTAACCATTAACATTTCAGGGGAGAAGCTATTGCNGCTATCATCATCTCCTGCATTCGCATT:1	CATAGGCCCGGCTTTAACCATT	CATCATCTCCTGCATTCGCATT	+	chr2R	16722132	+	chr2R	16722375	243	+	chr2R	16722132	+	chr2R	16722375
AGGCTTAACCACTAACTTAAACTAGACGTAAATACAAAAGCTTGACCAAATACAAATCATCTATGTTATGAA:1	AGGCTTAACCACTAACTTAAAC	TACAAATCATCTATGTTATGAA	+	chr2R	11344155	+	chr2R	11344248	93	+	chr2R	11344155	+	chr2R	11344248
CATTAGATTCATTTGTATAGTACTTAGAAATTAGTAATAATTTATCTTAGAAGTTCTTTTACTACAGATAAAATT:1	CATTAGATTCATTTGTATAGTA	TTCTTTTACTACAGATAAAATT	-	chr3R	21321592	-	chr3R	21321496	96	+	chr3R	21321496	+	chr3R	21321592
AAAAATAGATTTTATTTTTTGTTTTTGATTAACATTTTTCCGTTTTATTTGATTATTTCTCTCTTGCTCGGCTGC:1	AAAAATAGATTTTATTTTTTGT	TATTTCTCTCTTGCTCGGCTGC	-	chr3R	17183120	-	chr3R	28240469	11057349	+	chr3R	28240469	+	chr3R	17183120
AATACAATACAATACAATACAATACAATACAATTCAATACAATACAATACACACAACCCGGAGCCCCTAAAGCTA:1	AATACAATACAATACAATACAA	CAACCCGGAGCCCCTAAAGCTA	-	chr3L	21448026	-	chr3L	3058484	18389542	+	chr3L	3058484	+	chr3L	21448026
AACGGACTGACGTGCTGGCTGCCCGTGGGCGGCACGAGGGGGCGTGGTGCAATGCCTGCTCATGCAATGATAAAT:1	AACGGACTGACGTGCTGGCTGC	GCCTGCTCATGCAATGATAAAT	-	chr2R	14737717	-	chr2R	14737633	84	+	chr2R	14737633	+	chr2R	14737717
GATAAGGAAACCAATGTTGAAGCCAAAAAAGATGAAGAGTTACATGAAAAGCACGATGAAAAGTTAGTTGTGTG:1	GATAAGGAAACCAATGTTGAAG	ACGATGAAAAGTTAGTTGTGTG	+	chr2L	1294278	+	chr2L	1294358	80	+	chr2L	1294278	+	chr2L	1294358
GGAGGTTTGTTAGTGGGCGTAGAGGTCAGGGTGCTCAGTGGGTGGCGTGTGGGATCGGAAGAAACATAACTCAAC:1	GGAGGTTTGTTAGTGGGCGTAG	ATCGGAAGAAACATAACTCAAC	-	chr2R	10671353	-	chr2R	10671275	78	+	chr2R	10671275	+	chr2R	10671353
TAGTCAAGAAAATCCAAACCAAGTGCGCGATTTGTCTAATTGCACAATTTCCTAGATTCTAGATTGCGCAGTGCT:1	TAGTCAAGAAAATCCAAACCAA	AGATTCTAGATTGCGCAGTGCT	+	chr2L	9618904	+	chr2L	9618981	77	+	chr2L	9618904	+	chr2L	9618981
TATAATTTTAAATTCTTAACCGAAGGACCCAAAACAATTCAAAAGCTTAGAATTTTAGANTAAGCATGCAG:1	TATAATTTTAAATTCTTAACCG	GAATTTTAGANTAAGCATGCAG	-	chr3L	17024138	-	chr3L	17024061	77	+	chr3L	17024061	+	chr3L	17024138
AACAACAGCTTANCGCTCCGCCTCCACTGTNCCTGTTGTTA:1	AACAACAGCTTANCGCTCCGCC	GCCTCCACTGTNCCTGTTGTTA	-	chr2R	21605390	-	chr2R	21729329	123939	+	chr2R	21729329	+	chr2R	21605390
AGCATAGTCATCAACCATGTGCAATCCGCATGCCTTGTCCATGTGAATGGGTCGC:1	AGCATAGTCATCAACCATGTGC	CTTGTCCATGTGAATGGGTCGC	+	chr3L	5310374	+	chr3L	5310481	107	+	chr3L	5310374	+	chr3L	5310481
CATTGCNATTGAAGTCGATTGGGAACTGCGCCGTAAAACGAACGANGGTCTCATTTCGG:1	CATTGCNATTGAAGTCGATTGG	ACGAACGANGGTCTCATTTCGG	-	chr3R	31563617	-	chr3R	27637247	3926370	+	chr3R	27637247	+	chr3R	31563617
GTCCGACGAACCTTGAAATATAGAGAGAGAGATCTTGCGAATATTTAGATCTAACTACGACTATATTTCCTAATC:1	GTCCGACGAACCTTGAAATATA	ACTACGACTATATTTCCTAATC	-	chrX	19806016	-	chrX	20252649	446633	+	chrX	20252649	+	chrX	19806016
CATAATGNGCCTGGCTGTCATTGGAAAATGTAATTTATTNAAGAGCCGCTCAAT:1	CATAATGNGCCTGGCTGTCATT	ATTTATTNAAGAGCCGCTCAAT	-	chr3L	20374622	-	chr3L	19087954	1286668	+	chr3L	19087954	+	chr3L	20374622
TTGGACTATGGCCATGTGACGGCGA:1	TTGGACTATGGCCATGTGACGG	GACTATGGCCATGTGACGGCGA	-	chr2L	20059245	-	chr2L	17497889	2561356	+	chr2L	17497889	+	chr2L	20059245
GAGAATTCGCACATAATCGAGGAATCGAGCCGGTGGCTAGACACGCCAGCTTTTTGCCTGAAGAAGTNTTTTT:1	GAGAATTCGCACATAATCGAGG	TTTTGCCTGAAGAAGTNTTTTT	+	chr3L	22779058	+	chr3L	22779178	120	+	chr3L	22779058	+	chr3L	22779178
TAAAAATCGTATTTTCCCGGTGACTACATAAAACGCATACTAATACTAAGTGAAAAATTCATATTTAAAATTCTA:1	TAAAAATCGTATTTTCCCGGTG	AAAATTCATATTTAAAATTCTA	+	chr2L	18079843	+	chr2L	18079929	86	+	chr2L	18079843	+	chr2L	18079929
ATCTGATTGACCTCCATTTGGGGGCATTTATTGTGCCTGTGAGATCATCGAAGCTTCACAGCTTATCTCCATT:1	ATCTGATTGACCTCCATTTGGG	AGCTTCACAGCTTATCTCCATT	-	chr3R	29986172	-	chr3R	29986093	79	+	chr3R	29986093	+	chr3R	29986172
GTGGACCACTCCAACGACACTGACAGGCAAACACGAAGGCAAAAGGGGTTGGTTGGCTGGCACTAAAAAAGG:1	GTGGACCACTCCAACGACACTG	GGTTGGCTGGCACTAAAAAAGG	+	chr2R	24381926	+	chr2R	19582284	4799642	+	chr2R	24381926	+	chr2R	19582284
CACAAACACAAACACAAACACAAAAACAAACACAAACACAAACACAAAAAGTATATATACTATATTTACAAGAAG:1	CACAAACACAAACACAAACACA	TATATACTATATTTACAAGAAG	-	chr2L	16071771	-	chr2L	12353886	3717885	+	chr2L	12353886	+	chr2L	16071771
ATGGATGGTCGATGGTCGATTGGTGCCTGGTGCCTGGCATTGTTATTGGGTCGAAGGTGAGCCCTCGAAAATCCT:1	ATGGATGGTCGATGGTCGATTG	AAGGTGAGCCCTCGAAAATCCT	-	chr2L	9202130	-	chr2L	9202054	76	+	chr2L	9202054	+	chr2L	9202130
AGAAGATTGGAGGTATCCCACATCCCTTTTGTATTGCTTGGATTTATTGTCAGTAGACA:1	AGAAGATTGGAGGTATCCCACA	TTGGATTTATTGTCAGTAGACA	+	chr2R	5463162	+	chr2R	5463464	302	+	chr2R	5463162	+	chr2R	5463464
GCAGCTAAATACCGATTGGGAACTGTCCGCACCACTCCCCTAAAACTAATTATAATATTTTCGCCTTTTGCGATC:1	GCAGCTAAATACCGATTGGGAA	AATATTTTCGCCTTTTGCGATC	+	chr3L	21406999	+	chr3L	21407078	79	+	chr3L	21406999	+	chr3L	21407078
ACTTGTGCCAGCTCTCTTTTTTTTATACATATATACATATATTCTTTTTGTATTNTGTAG:1	ACTTGTGCCAGCTCTCTTTTTT	ATATTCTTTTTGTATTNTGTAG	-	chrX	17796260	-	chrX	17792979	3281	+	chrX	17792979	+	chrX	17796260
CACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAAAACAAACACAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACAAACACAAAAACAAACACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	26659334	4751799	+	chr3R	21907535	+	chr3R	26659334
TGAAAGTTNAGTGCCGCAGCCGAAAAAAAACCAAGAAAAGGACCGGAGCTCGGACAGAAAACACATTGTTGG:1	TGAAAGTTNAGTGCCGCAGCCG	CGGACAGAAAACACATTGTTGG	-	chr3L	19115820	-	chr3L	19115643	177	+	chr3L	19115643	+	chr3L	19115820
TCATGCAGTTTCATTTCCTTACCTGATTAAATACCCCCGAAATTGTGCTGCACATTGACCCACTTGAGTTCATTT:1	TCATGCAGTTTCATTTCCTTAC	ATTGACCCACTTGAGTTCATTT	-	chr2L	9007803	-	chr2L	9000293	7510	+	chr2L	9000293	+	chr2L	9007803
TAGGGTTCTTAAAGATGCGGAAATCAACTCCTTAGCATGTAGTCAACATAAATTGAAAAACAATTAGCAGTAAAA:2	TAGGGTTCTTAAAGATGCGGAA	TGAAAAACAATTAGCAGTAAAA	-	chr2L	10836437	-	chr2L	10836356	81	+	chr2L	10836356	+	chr2L	10836437
CAATTAAGATACAACGCATCGGGAGCGAAAGCGATGGGTATATTTTGAATGTCCAACGGGCGACGGTAAAGG:1	CAATTAAGATACAACGCATCGG	GTCCAACGGGCGACGGTAAAGG	+	chr3L	1906609	+	chr3L	20027369	18120760	+	chr3L	1906609	+	chr3L	20027369
TCTCAAAAGCAGCGCCGGCTTGTGGAACACATGGATGCCCTGTACGAGATGGCTAAGCATCCAGAGATGCA:1	TCTCAAAAGCAGCGCCGGCTTG	TGGCTAAGCATCCAGAGATGCA	+	chr2R	12190105	+	chr2R	12187485	2620	+	chr2R	12190105	+	chr2R	12187485
GGACAAGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGG:1	GGACAAGACAGGACAGGACAGG	GGACAGGACAGGACAGGACAGG	-	chrX	10754862	-	chrX	4067988	6686874	+	chrX	4067988	+	chrX	10754862
GTTTCTCCNAGCCGATAACGCGCTCATCCTCAGCCAGNNNNGTGGCATAAATAAAAATAAGNGAGTGAGGG:1	GTTTCTCCNAGCCGATAACGCG	AATAAAAATAAGNGAGTGAGGG	-	chr3R	6167092	-	chr3R	6158513	8579	+	chr3R	6158513	+	chr3R	6167092
TAGCGAAGTTCAACTGTATGGCGCCAAAAACTCTGGGTTCGGAATAAAGGCCATAGATTCCGTGAAACCAAGGGG:1	TAGCGAAGTTCAACTGTATGGC	TAGATTCCGTGAAACCAAGGGG	-	chrX	19318587	-	chrX	19318452	135	+	chrX	19318452	+	chrX	19318587
TCTGTAGCCCCTAAAATAATGCATTCCAATAGAATCCAAATATCGATTCACGTACTGGGCACTTACACAGCTGC:1	TCTGTAGCCCCTAAAATAATGC	TACTGGGCACTTACACAGCTGC	+	chr3L	19961977	+	chr3L	14863813	5098164	+	chr3L	19961977	+	chr3L	14863813
TTAAAGCTTTGCACTAACTGGGACGGCAATAGTTACAAACGATTGGAAGACGCAGCGCT:1	TTAAAGCTTTGCACTAACTGGG	AACGATTGGAAGACGCAGCGCT	+	chr2L	1711379	+	chr2L	1711687	308	+	chr2L	1711379	+	chr2L	1711687
AGGACGATCCCAAATTAATTATCACTCTCAACAGCATNTTGGGGGAAATCAAAACAAAATCTAGTGATGATTTTA:1	AGGACGATCCCAAATTAATTAT	ACAAAATCTAGTGATGATTTTA	-	chr3R	25669163	-	chr3R	25669069	94	+	chr3R	25669069	+	chr3R	25669163
CTTTCGTTTTATGAGAGATTCTATCTTTTTAATTTGTTTAAATT:1	CTTTCGTTTTATGAGAGATTCT	ATCTTTTTAATTTGTTTAAATT	+	chr3R	19215773	+	chr3R	16473104	2742669	+	chr3R	19215773	+	chr3R	16473104
CCTCCCTCCCAAAAGAACGTGTATATATATATATTTAAGCGAGGGTTGCAAAAAGAAGGCCTCTTCTGGCTAATA:1	CCTCCCTCCCAAAAGAACGTGT	AGAAGGCCTCTTCTGGCTAATA	-	chr3R	4894858	-	chr3R	4887481	7377	+	chr3R	4887481	+	chr3R	4894858
GCAGGCCAAGCAGGCCAAATCCTGCATGACCTTGACTCTT:1	GCAGGCCAAGCAGGCCAAATCC	ATCCTGCATGACCTTGACTCTT	+	chr2L	19887084	+	chr2L	1585314	18301770	+	chr2L	19887084	+	chr2L	1585314
TCCACAGGAGCGGATGGTGGGCCGTTGGGNGGATTTGGGGGT:1	TCCACAGGAGCGGATGGTGGGC	GCCGTTGGGNGGATTTGGGGGT	-	chr2R	6101914	-	chr2R	6096749	5165	+	chr2R	6096749	+	chr2R	6101914
GTGGGGCTNGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCAACTTGATAATTTCCACAATA:1	GTGGGGCTNGGCAACCTCATAA	CAACTTGATAATTTCCACAATA	+	chrX	23291025	+	chrX	16571365	6719660	+	chrX	23291025	+	chrX	16571365
CAGCACAGTACCCTCTGTAGNAGAGATCTAGANGATATTATANTGAATCATTTGTTTAGTGGGTGACCTTTAATG:1	CAGCACAGTACCCTCTGTAGNA	GTTTAGTGGGTGACCTTTAATG	+	chr3R	19772947	+	chr3R	19777058	4111	+	chr3R	19772947	+	chr3R	19777058
GTGATATGAAAACAAAACACTTACCCGATATGAATAAAAACCTGAATCTTGTTTTACTAATTAAAATCCAAAGGC:1	GTGATATGAAAACAAAACACTT	TTACTAATTAAAATCCAAAGGC	-	chr2R	7868709	-	chr2R	7868628	81	+	chr2R	7868628	+	chr2R	7868709
CCCGTAAAGCGGAAGTATTTACCGAAAATAAAGCGAACGAACTGAATNAAAGTGGTTAAGTNTTTGACTTGAGG:1	CCCGTAAAGCGGAAGTATTTAC	TGGTTAAGTNTTTGACTTGAGG	-	chr3R	7655109	-	chr3R	7655028	81	+	chr3R	7655028	+	chr3R	7655109
AAAACAAATTCCAAGCCGTCGACACGCACACAAAAAAAGGCACACAGTTGTCAGAGCGACAAGAAAAGCGGG:1	AAAACAAATTCCAAGCCGTCGA	TCAGAGCGACAAGAAAAGCGGG	-	chr3L	14089798	-	chr3L	3915600	10174198	+	chr3L	3915600	+	chr3L	14089798
CTTAATAAAATTGGCAATCGGCGAAAAAAACTATTTTGGCCAGAGGAAGACTTAACGGCAATGCAGGACGACAAG:1	CTTAATAAAATTGGCAATCGGC	AACGGCAATGCAGGACGACAAG	+	chr3R	28775041	+	chr3R	28775180	139	+	chr3R	28775041	+	chr3R	28775180
ACACCACTTTTCCAGCTGTGCTCAGCTGCTTCGCATTTTCCAGCAAATATCCGGGGGACTTTACCGCTTTCTGCG:1	ACACCACTTTTCCAGCTGTGCT	GGGGACTTTACCGCTTTCTGCG	+	chr2L	10563937	+	chr2L	10564030	93	+	chr2L	10563937	+	chr2L	10564030
TTCTTATTACATGATTATTTCGTATTTTGTATTTTTNTTATATCAAGTTCAAACGAATCTAATGGCATTTGCATA:1	TTCTTATTACATGATTATTTCG	CGAATCTAATGGCATTTGCATA	-	chrX	3842579	-	chrX	3842338	241	+	chrX	3842338	+	chrX	3842579
ATTTTCTATCTGGGCCTGAGCCCAAAACCCAAATATAAAAAGAAATGACTTACTTTTGCCGCGCTTAATGAACT:1	ATTTTCTATCTGGGCCTGAGCC	CTTTTGCCGCGCTTAATGAACT	-	chrX	4189691	-	chrX	19510258	15320567	+	chrX	19510258	+	chrX	4189691
TCCAAGGGCTCGGAAAAGCGGGGAAAACTCAGCCAATCAATCAGCAGCCAGGAAAAAGTTAAGTAACACCAGTA:1	TCCAAGGGCTCGGAAAAGCGGG	AAAAAGTTAAGTAACACCAGTA	+	chr2R	13749409	+	chr2R	13749554	145	+	chr2R	13749409	+	chr2R	13749554
AAATTTTCGTTCGGTTCGNTTGAAACCACCACCAGCATGAANATTNCATAAGATGATTTGTATGCATTTATGCG:1	AAATTTTCGTTCGGTTCGNTTG	ATGATTTGTATGCATTTATGCG	-	chr2L	1178769	-	chr2L	1178686	83	+	chr2L	1178686	+	chr2L	1178769
GGGCACAAAGGCGCACACACACAAAAAATAAATGAAAAACATTATCTCACGTTTGAATGTGAAAAACGAAGAG:1	GGGCACAAAGGCGCACACACAC	TTTGAATGTGAAAAACGAAGAG	+	chrX	10757238	+	chrX	23291843	12534605	+	chrX	10757238	+	chrX	23291843
TCTGCACTTCATCAAAACATATACACTAACTGTCTGGACTCGGCAACCTCAACTCCTGGAGGAACATTAACTGAT:1	TCTGCACTTCATCAAAACATAT	TCCTGGAGGAACATTAACTGAT	-	chr2L	13862240	-	chr2L	13853090	9150	+	chr2L	13853090	+	chr2L	13862240
ATTTTAGGCCTCGACTATAGGTTCTATAAGGGTGCATTTACTTGACACCGAGGCATGTTGGTTTC:1	ATTTTAGGCCTCGACTATAGGT	GACACCGAGGCATGTTGGTTTC	+	chr2L	22011947	+	chr2L	22012018	71	+	chr2L	22011947	+	chr2L	22012018
TATGATTTTCATCAAATATTTTTCTAGCTAAATTCAATTAAATGAATACAATATTCCCCCTTCTCAACTCATTCC:1	TATGATTTTCATCAAATATTTT	TTCCCCCTTCTCAACTCATTCC	+	chr3R	29402898	+	chr3R	29403268	370	+	chr3R	29402898	+	chr3R	29403268
TATATTTCAATCTCTTGGCTTTTTGACCTTTTTCTACCCCGACTGCGGGGATTTTAATTTGACTGACATTTGGT:1	TATATTTCAATCTCTTGGCTTT	TTTAATTTGACTGACATTTGGT	-	chr3R	8081229	-	chr3R	8081152	77	+	chr3R	8081152	+	chr3R	8081229
AAAGTAATTTAACGCCTAACACCATCGAAATCCAATTGCCTTTGCTTTGGCAGTAAGTCTCGCCG:1	AAAGTAATTTAACGCCTAACAC	GCTTTGGCAGTAAGTCTCGCCG	+	chr3R	30177772	+	chr3R	30177879	107	+	chr3R	30177772	+	chr3R	30177879
CATAGAAGGTAAATTTTGGAAGTCTTTCTNTCACCTCCAACTGTTGTTGCTGCCTATCAGNTGATGCCAGAGTTT:1	CATAGAAGGTAAATTTTGGAAG	CTATCAGNTGATGCCAGAGTTT	-	chrX	9390849	-	chrX	9390770	79	+	chrX	9390770	+	chrX	9390849
CTAGCGACTTCTGTACACCCTTTCGAAAATATTTGAGATATTGATATATATTATATATATTTCAGTGAGTTACCC:1	CTAGCGACTTCTGTACACCCTT	TATATATTTCAGTGAGTTACCC	-	chr2L	13456930	-	chr2L	13449494	7436	+	chr2L	13449494	+	chr2L	13456930
TGCTGCCGCATCAGCAACATTCTCAGATTGCCCCAAGGCCACT:1	TGCTGCCGCATCAGCAACATTC	CTCAGATTGCCCCAAGGCCACT	-	chr3R	8385093	-	chr3R	24910908	16525815	+	chr3R	24910908	+	chr3R	8385093
GAATCGCTTTGCTAGCCTTTTGTGTCCGTCGAGGGTTTCCCGTTCTTTGTTGACCGCATTTGTCGCTTTCCAC:1	GAATCGCTTTGCTAGCCTTTTG	GACCGCATTTGTCGCTTTCCAC	+	chr3L	19117046	+	chr3L	19124491	7445	+	chr3L	19117046	+	chr3L	19124491
TTATGTCACTTTTCACTTTCTCACTCGCTTGCTGTCTCTTTTACCCCCTTCTACCAACCCCTTTGCCATCCTTCT:1	TTATGTCACTTTTCACTTTCTC	CCAACCCCTTTGCCATCCTTCT	+	chr3R	11856454	+	chr3R	18459332	6602878	+	chr3R	11856454	+	chr3R	18459332
TGAATCGTTTGACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTGTGGTTGTCTGCCGAATAGCCTTACTCTTACCTTG:1	TGAATCGTTTGACTTAAAGAGA	GAATAGCCTTACTCTTACCTTG	-	chr2R	13141652	-	chr2R	13136854	4798	+	chr2R	13136854	+	chr2R	13141652
CTGCCACGCAAACAAATCAACTCAAGTGTATCGAAATGAGTTTCTTTTGAGTTTCCACGAACACGTGTCACAAGC:1	CTGCCACGCAAACAAATCAACT	TCCACGAACACGTGTCACAAGC	-	chr3R	17287437	-	chr3R	17896332	608895	+	chr3R	17896332	+	chr3R	17287437
ATTAGGATCTCAATTACACTTGGCAAGGCCTTGTGGCCGGGCAAATTCCCCTCTTGCGGAAACT:1	ATTAGGATCTCAATTACACTTG	AAATTCCCCTCTTGCGGAAACT	+	chr2R	24724217	+	chr2R	24724694	477	+	chr2R	24724217	+	chr2R	24724694
TATTTTTCAAACGTGTTGTGATACGCCAGTTTACAGAGGGAGGGTCAACGAAACAATGCAATGGAAACTCATA:1	TATTTTTCAAACGTGTTGTGAT	AACAATGCAATGGAAACTCATA	-	chrX	5204659	-	chrX	5204458	201	+	chrX	5204458	+	chrX	5204659
ATGCGGGTCAGGCCATTCATAATCCATTGTAAAATAACTTACACATGCAATTGAATTTGATGGCCCGATAAAAG:1	ATGCGGGTCAGGCCATTCATAA	GAATTTGATGGCCCGATAAAAG	-	chr2L	1842370	-	chr2L	1842295	75	+	chr2L	1842295	+	chr2L	1842370
GTATTGAAGCGGCGAAAAAGTTTTACGAGCATCAGGGAAAGGAAGTCACAAATTCAAATCACCACCGGNAAAGGG:1	GTATTGAAGCGGCGAAAAAGTT	TCAAATCACCACCGGNAAAGGG	+	chr2L	18592057	+	chr2L	4283428	14308629	+	chr2L	18592057	+	chr2L	4283428
CGAATTTGTTTAGCGCGTTCTTTAATCAGAAGTAATATTATTAATGTTTAGATCCGCGTAGATACTTACCTTAGC:1	CGAATTTGTTTAGCGCGTTCTT	CCGCGTAGATACTTACCTTAGC	+	chr2R	10203642	+	chr2R	10203727	85	+	chr2R	10203642	+	chr2R	10203727
CATAAAACATAAAACATAAAACATAAAACATAAAACATAAAACATAANACATAAAACATAAAACATAAAAAATAA:2	CATAAAACATAAAACATAAAAC	AAACATAAAACATAAAAAATAA	+	chr2R	11463556	+	chr2R	11557713	94157	+	chr2R	11463556	+	chr2R	11557713
TATTATATTTGCAGTCAAGTTTAGTGACTTGCTTTTGTTTCTGTTCAGTTCACAAAGGCACACACTGTTTACACT:1	TATTATATTTGCAGTCAAGTTT	AAAGGCACACACTGTTTACACT	-	chr2L	16870529	-	chr2L	16870130	399	+	chr2L	16870130	+	chr2L	16870529
GGAGCTGTGGATCCGGATAGTGCTCAACAAGGTGGGCACTGCTTTAAAGTGCG:1	GGAGCTGTGGATCCGGATAGTG	GTGGGCACTGCTTTAAAGTGCG	+	chr3L	6372150	+	chr3L	6372213	63	+	chr3L	6372150	+	chr3L	6372213
ATTTAAGCAACTGAAAAATGAGTTAGTATATTTTNAGTGTTAACGTTGCAGATTAGCCACCTGGATTACGCGATA:1	ATTTAAGCAACTGAAAAATGAG	TAGCCACCTGGATTACGCGATA	+	chr2L	17032517	+	chr2L	17032602	85	+	chr2L	17032517	+	chr2L	17032602
TGTGTTTCGCAGACAACAAGAAAAGTAAGTAAGTAAGTTTTTTAATATTTCCGATTAAATGACAATGACAACTT:1	TGTGTTTCGCAGACAACAAGAA	GATTAAATGACAATGACAACTT	+	chr2L	12490101	+	chr2L	12490239	138	+	chr2L	12490101	+	chr2L	12490239
GAACAACAGAAGATGTTAACTCCAATTTTAGAAGTATGTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGT:1	GAACAACAGAAGATGTTAACTC	TTCAAAAGTCCGTCTGCAATGT	+	chr3R	19448717	+	chr3R	19449462	745	+	chr3R	19448717	+	chr3R	19449462
AGGAGGAGATAAGCGCAAAAAAAAAGTGCCGCCCGAAGAGGTTTGATCAGTGA:1	AGGAGGAGATAAGCGCAAAAAA	CCCGAAGAGGTTTGATCAGTGA	-	chr3R	5155624	-	chr3R	5155540	84	+	chr3R	5155540	+	chr3R	5155624
AATCAACACATTTATCGAGAAAACCCGAATTTGGCCAGTGCAACCGGGTCCACCTCCATCCATGGCCATAAACCA:1	AATCAACACATTTATCGAGAAA	CTCCATCCATGGCCATAAACCA	-	chr2R	15596775	-	chr2R	15596699	76	+	chr2R	15596699	+	chr2R	15596775
CCGAAAAATGGATGGTGAAATGGGGGCGAAAAGGATCAGCAGAAGTACGCACGGAATGCCTTCCTGTTTAAC:1	CCGAAAAATGGATGGTGAAATG	ACGGAATGCCTTCCTGTTTAAC	-	chrX	5125812	-	chrX	16883825	11758013	+	chrX	16883825	+	chrX	5125812
ATTATTGGTCATATCGCATGGCTACTGTTCGTAGGAGTTTATCTGGCTTAAGATCTGTGTTTGTACG:1	ATTATTGGTCATATCGCATGGC	GCTTAAGATCTGTGTTTGTACG	-	chr3R	29256345	-	chr3R	29256273	72	+	chr3R	29256273	+	chr3R	29256345
CTCCCAAAAATCAAACGTTTTTTAGCAAGCAAAACCACACACACACACACACCATCCATTCCTCCCCCCTGA:1	CTCCCAAAAATCAAACGTTTTT	ACCATCCATTCCTCCCCCCTGA	+	chrX	6235566	+	chrX	7640784	1405218	+	chrX	6235566	+	chrX	7640784
ACCGAAAACTTTCGTATCGCAATTTTTAGACAGCCGGACAACCGCNGAACAGACTCAATGGACACCCATACCAGG:1	ACCGAAAACTTTCGTATCGCAA	CTCAATGGACACCCATACCAGG	-	chr3R	8610932	-	chr3R	8601779	9153	+	chr3R	8601779	+	chr3R	8610932
TATGAGCAACGCAAATATACCGAAAATCATAAAGCATCGCTGATTAGCATTTGTGGTCTGGTTTTCAGCTCTTGG:1	TATGAGCAACGCAAATATACCG	TGGTCTGGTTTTCAGCTCTTGG	+	chr3R	27470043	+	chr3R	27470705	662	+	chr3R	27470043	+	chr3R	27470705
TGCTGACTTACTTTCTGGGCTGAACATATCTCAGATGCTTACAACTGAATAGAATACCAAGATAGCCAATTTGAA:1	TGCTGACTTACTTTCTGGGCTG	ATACCAAGATAGCCAATTTGAA	-	chr2R	24031464	-	chr2R	24031380	84	+	chr2R	24031380	+	chr2R	24031464
ATGNAAATCATGGAAGGGGAGATCAGGACTCGAAAATGGTGACAATTCTNCCCTAACAAAATACAATTTAACGCA:1	ATGNAAATCATGGAAGGGGAGA	TAACAAAATACAATTTAACGCA	+	chr3L	15047368	+	chr3L	15279097	231729	+	chr3L	15047368	+	chr3L	15279097
GTGGATTAAGTCATTTACTTACTTCCCAACGCTTTTTTAGATTTTCAATCTTCCGCTGTCCGCTGTTTTCAGCCA:1	GTGGATTAAGTCATTTACTTAC	CGCTGTCCGCTGTTTTCAGCCA	-	chr2L	13410448	-	chr2L	13405651	4797	+	chr2L	13405651	+	chr2L	13410448
TTCGTTAAAAGTGATTCACCCATTCAAAAGTGGTTTATCTAAATTAACCNAAATTAGTTATTATAAGGCGCAATT:1	TTCGTTAAAAGTGATTCACCCA	TTAGTTATTATAAGGCGCAATT	-	chr2R	14911830	-	chr2R	14911707	123	+	chr2R	14911707	+	chr2R	14911830
ACTTGAAAAGTACTTTTGATTTTAATTTTGAGCTAGCAGTATCTTTAATATCAATATAAAAGTGATCAAGCGAAT:1	ACTTGAAAAGTACTTTTGATTT	ATATAAAAGTGATCAAGCGAAT	+	chr2R	18675167	+	chr2R	18675245	78	+	chr2R	18675167	+	chr2R	18675245
TTGAAATGGCAAACAATAACAGAAACACCGACCATTAGTAACTTTTCCAGGGATTGCAGGATGGCAAGAGGAG:1	TTGAAATGGCAAACAATAACAG	GATTGCAGGATGGCAAGAGGAG	+	chr3L	15479142	+	chr3L	18308353	2829211	+	chr3L	15479142	+	chr3L	18308353
TATTTTGTAGTCCTAATGAGGTCACGATTAATCAAGACCACAGCCAGTCGGAGTGCCTTCTTCCTTCCTTCCTTC:1	TATTTTGTAGTCCTAATGAGGT	TGCCTTCTTCCTTCCTTCCTTC	+	chr2R	17902767	+	chr2R	11578729	6324038	+	chr2R	17902767	+	chr2R	11578729
TAAATACTGTTGACGCAGCTCGCTTATATTTTTGAACCAAAGTAAGGGTCGTTGACTTGGCTGCCGCTGATGAG:1	TAAATACTGTTGACGCAGCTCG	TGACTTGGCTGCCGCTGATGAG	+	chr3L	5447222	+	chr3L	5389077	58145	+	chr3L	5447222	+	chr3L	5389077
CGGACCCGTTTTATTGTCGCCAGCGCAGTAAATTGCCAAGTGCCCAAACTCAAGCAGCAGCTGCCC:1	CGGACCCGTTTTATTGTCGCCA	CAAACTCAAGCAGCAGCTGCCC	+	chr3R	30473704	+	chr3R	30473811	107	+	chr3R	30473704	+	chr3R	30473811
TGATACTAACAGTTCGCAGAATCTTTGATTGACATATTCTATAATGTCTATGTTGGGGCTCGCGTTCCCCCAAA:1	TGATACTAACAGTTCGCAGAAT	TTGGGGCTCGCGTTCCCCCAAA	+	chr2R	2688957	+	chr2R	4570974	1882017	+	chr2R	2688957	+	chr2R	4570974
CTTATTCCNTTTCGTTTATTTCCAGACCGCAAAGCAAACGACGGGTTAGGCAATTTTCAATCCTCGAAAAACAT:1	CTTATTCCNTTTCGTTTATTTC	ATTTTCAATCCTCGAAAAACAT	+	chr2L	18883871	+	chr2L	18883952	81	+	chr2L	18883871	+	chr2L	18883952
CGGGGAAAGCCAAGAAAAACACATTTAGGCAAAAGCACCCTGCTACGCCCCCAAGTTTTAGACGAGAGTTGGCTT:1	CGGGGAAAGCCAAGAAAAACAC	AGTTTTAGACGAGAGTTGGCTT	-	chr3R	31285565	-	chr3R	31279374	6191	+	chr3R	31279374	+	chr3R	31285565
AAGCCACATTCAATAGCCGGCAAATACATATCTACTAGAATCTAAAATTACTTAGAGCGTCATCGATATTGAGTG:1	AAGCCACATTCAATAGCCGGCA	AGAGCGTCATCGATATTGAGTG	-	chr2R	8603358	-	chr2R	8603167	191	+	chr2R	8603167	+	chr2R	8603358
GCAAGTGTTAGATGAGGTCATTTCACTAGGGTATTTCTTAGCCCTTAACTTTTTCGCGTTTTCTAAGCTTAT:1	GCAAGTGTTAGATGAGGTCATT	TTTTCGCGTTTTCTAAGCTTAT	+	chrX	3866119	+	chrX	3866194	75	+	chrX	3866119	+	chrX	3866194
TAGATCCTACTCCCAAGAACCGAGCACCCAGCTTAATTTATCATTTTTAATTTAGGATAGTCATACTTTTCACAT:1	TAGATCCTACTCCCAAGAACCG	AGGATAGTCATACTTTTCACAT	-	chrX	1367978	-	chrX	1357808	10170	+	chrX	1357808	+	chrX	1367978
GCATTTGATTTCATAAGAACATATCTAGCCTTGATATATATATGAAAATAATTTACTTCACTTC:1	GCATTTGATTTCATAAGAACAT	TGAAAATAATTTACTTCACTTC	-	chr2L	20601869	-	chr2L	20601802	67	+	chr2L	20601802	+	chr2L	20601869
TGAATCTATATCCTGACAAGCTTTCATCGATTCCTATGTCAACGTTNTGCGAAAGAGTAT:1	TGAATCTATATCCTGACAAGCT	TCAACGTTNTGCGAAAGAGTAT	-	chrX	4022185	-	chrX	4022124	61	+	chrX	4022124	+	chrX	4022185
TTAGAAAATAACCAAGTCAAAAAAATTCCCTCTGGTAATTAGCTTTAAAAGTGCTAGTCGTATCCTTTGTTTTCA:1	TTAGAAAATAACCAAGTCAAAA	CTAGTCGTATCCTTTGTTTTCA	-	chrX	3502255	-	chrX	3493096	9159	+	chrX	3493096	+	chrX	3502255
CCTTTGCACAGAGCCATTCATTCTGGTCCGTTCGGA:1	CCTTTGCACAGAGCCATTCATT	CATTCATTCTGGTCCGTTCGGA	-	chr3R	17340963	-	chr3R	30330430	12989467	+	chr3R	30330430	+	chr3R	17340963
TGAATACCCTTTTTTATATGAAAAATTCAAAGATCTTGAAAGGAAATGAGACATTTTCAGGCATGCCTATGTTTT:1	TGAATACCCTTTTTTATATGAA	TTTTCAGGCATGCCTATGTTTT	+	chr3L	7104072	+	chr3L	7104176	104	+	chr3L	7104072	+	chr3L	7104176
TAAGAGGACACTAGTACCAGGTTTTTCGAGTGATATGGCTCAGTTCCCATCATGGGATTGCACGAAAAGCTGCGA:1	TAAGAGGACACTAGTACCAGGT	GGGATTGCACGAAAAGCTGCGA	-	chr3R	5278194	-	chr3R	5278113	81	+	chr3R	5278113	+	chr3R	5278194
TTGCCAAATGTTTTTCGAGGATTGAAAATTGCCTAAACCGTCGTTTGCTTTGCGGTCTGGAAATAAACGAAATGG:1	TTGCCAAATGTTTTTCGAGGAT	GGTCTGGAAATAAACGAAATGG	-	chr2L	18883959	-	chr2L	18883877	82	+	chr2L	18883877	+	chr2L	18883959
GATAGAGGGGGGGGGGTTGGGGGCGGTAGAAAGTAGACTGCCACAAGG:1	GATAGAGGGGGGGGGGTTGGGG	TAGAAAGTAGACTGCCACAAGG	-	chrX	12562679	-	chrX	12694541	131862	+	chrX	12694541	+	chrX	12562679
ATCACAGCAGCAGCAGCAAGAAGAGCAGCAACAACCGCAGCAACAACAGCCGCTGC:1	ATCACAGCAGCAGCAGCAAGAA	CCGCAGCAACAACAGCCGCTGC	+	chr3L	19987567	+	chr3L	888485	19099082	+	chr3L	19987567	+	chr3L	888485
ATCCTAATTAGGCGGAAAAACTACCCATCCTACTTAATGCCCTTTGGCAATCAAAGCCGCTGACA:1	ATCCTAATTAGGCGGAAAAACT	TTGGCAATCAAAGCCGCTGACA	-	chr3R	20060724	-	chr3R	20060651	73	+	chr3R	20060651	+	chr3R	20060724
ATAAAAACCAATATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTGCTTACCTACG:1	ATAAAAACCAATATTTATTTTG	GTGGAGCCTTTGCTTACCTACG	+	chr3L	16971233	+	chr3L	16971309	76	+	chr3L	16971233	+	chr3L	16971309
CCTCTTGCCATCCTGCAATCCCTGGAAAAGNNNCNAATGGTCGGTGTTTCTGTTATTGTTT:1	CCTCTTGCCATCCTGCAATCCC	GTCGGTGTTTCTGTTATTGTTT	-	chr3L	18308351	-	chr3L	15479152	2829199	+	chr3L	15479152	+	chr3L	18308351
AAAAAAACAAAAAAAGGGGCAGTCAAGCGGTAAAGCACAACGTCT:1	AAAAAAACAAAAAAAGGGGCAG	CAAGCGGTAAAGCACAACGTCT	-	chrX	20148789	-	chrX	8543253	11605536	+	chrX	8543253	+	chrX	20148789
TAATTGTAGAATATCTTANTCTTAAAACAAAAATCAGAACTNACANGATCCTACACCTGCTCACCACCCATATAC:1	TAATTGTAGAATATCTTANTCT	CACCTGCTCACCACCCATATAC	-	chr2R	13566350	-	chr2R	13566270	80	+	chr2R	13566270	+	chr2R	13566350
TAAAATCAATAAAGTTTTAGCCTTATAAAATGGTTGAATATACATAAAGCATATGGTATGAAACACATAACAAG:1	TAAAATCAATAAAGTTTTAGCC	ATGGTATGAAACACATAACAAG	-	chr3R	5052967	-	chr3R	5045866	7101	+	chr3R	5045866	+	chr3R	5052967
AATCCCCGTTGATCTTTTCTAGTTCATTCNCTATTTCATTTAGCAAACCAATAAACCAACNAAAAGCGATGATGA:1	AATCCCCGTTGATCTTTTCTAG	AACCAACNAAAAGCGATGATGA	+	chr3R	14666466	+	chr3R	5454264	9212202	+	chr3R	14666466	+	chr3R	5454264
AGCCCGTAGTTTATGTAGCATACTTTTTCGCGCTGCGNTTGCCAANAACAAAAAACAAAAAAACA:1	AGCCCGTAGTTTATGTAGCATA	AANAACAAAAAACAAAAAAACA	-	chr3R	25566082	-	chr3R	5025843	20540239	+	chr3R	5025843	+	chr3R	25566082
TGTGTTTCGGCGACAAGGAGTTACGGTGGGGATACGGTAAGAGCTCTATCTG:1	TGTGTTTCGGCGACAAGGAGTT	GATACGGTAAGAGCTCTATCTG	-	chrX	14114179	-	chrX	14105051	9128	+	chrX	14105051	+	chrX	14114179
GAAGATTCCATGAGATTCTCCTCCTCATTAAATAGGGTATTTGCAGCTCTTACTTAATATGTACTTATTTTNTGG:1	GAAGATTCCATGAGATTCTCCT	TTAATATGTACTTATTTTNTGG	-	chr3L	19528005	-	chr3L	19527926	79	+	chr3L	19527926	+	chr3L	19528005
GTGCCCGTTTTAAACAAAATGAGGAAATATATTTCGAACCTATCAAAACTGTTGATTTGTTTGTTGCATTCCATA:1	GTGCCCGTTTTAAACAAAATGA	GATTTGTTTGTTGCATTCCATA	-	chrX	21575624	-	chrX	21575545	79	+	chrX	21575545	+	chrX	21575624
AACAATAAATTAAGACAAATTCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTCATCGTTGATCGCCACAA:1	AACAATAAATTAAGACAAATTC	TAGTCATCGTTGATCGCCACAA	-	chrX	17629785	-	chrX	17633083	3298	+	chrX	17633083	+	chrX	17629785
TGGAGCACACTTGCCAACTTAAAAGACTGATTTCAGGCATCTTAAATAAATAACAAAAACTTGGTTCCT:1	TGGAGCACACTTGCCAACTTAA	AAATAACAAAAACTTGGTTCCT	-	chr2L	1611292	-	chr2L	1611209	83	+	chr2L	1611209	+	chr2L	1611292
CTCAGAAAAATTTTAAGCAATAACACATTTAACAACTAAAACATAAACCAAATCAGCTGGGCTAAGCACACATCG:1	CTCAGAAAAATTTTAAGCAATA	CAGCTGGGCTAAGCACACATCG	+	chr2L	11454903	+	chr2L	2784843	8670060	+	chr2L	11454903	+	chr2L	2784843
ATCTGCCGTTTCAATGGCAACCATTTACAATATGTCTATT:1	ATCTGCCGTTTCAATGGCAACC	AACCATTTACAATATGTCTATT	+	chr3L	22617223	+	chr3L	22624640	7417	+	chr3L	22617223	+	chr3L	22624640
TTACCATTTATTTGCCTAAAGACCCGAACATTACCTCATACTGATCATTACCACTGTTTGCGTGACTTACCGCTA:1	TTACCATTTATTTGCCTAAAGA	CTGTTTGCGTGACTTACCGCTA	-	chr2R	11473862	-	chr2R	11472665	1197	+	chr2R	11472665	+	chr2R	11473862
TAAGATCTNTTTGGGGCGTACTCTTCGCCATGTGCGGTGGTCACGTTGAGGGCTTGACTCGTATACAGCTTATC:1	TAAGATCTNTTTGGGGCGTACT	CTTGACTCGTATACAGCTTATC	+	chr3R	29854859	+	chr3R	29854938	79	+	chr3R	29854859	+	chr3R	29854938
TTTTATACCAACTTATTTTTTTCATAATTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1	TTTTATACCAACTTATTTTTTT	AATTTTTTTTTTTCTTTTTTTT	-	chr2L	19171875	-	chr2L	8548563	10623312	+	chr2L	8548563	+	chr2L	19171875
CTTTTCAGTACCAATGAAAGCTTTCCGACCAACTAGCGTTCAATTTCGTTCAGTGCATTTGGTCTCGAAGGCAAG:1	CTTTTCAGTACCAATGAAAGCT	TGCATTTGGTCTCGAAGGCAAG	+	chrX	3409015	+	chrX	3409092	77	+	chrX	3409015	+	chrX	3409092
AGCATATGTTAGTGTGCCTTCGCGGGAGCGGGCATTCACTTAGTTCAAAAGTCGAGGGCAAACAGAGAAATAGTG:1	AGCATATGTTAGTGTGCCTTCG	GAGGGCAAACAGAGAAATAGTG	-	chr2L	968891	-	chr2L	968812	79	+	chr2L	968812	+	chr2L	968891
ATCTGTCAGATCTCTCGTCTTAATGGATGGATGTATGTTTTTTTTTTT:1	ATCTGTCAGATCTCTCGTCTTA	ATGGATGTATGTTTTTTTTTTT	+	chrX	6609872	+	chrX	5684401	925471	+	chrX	6609872	+	chrX	5684401
GAAGTTGACAGCTAAGTTTAAAGCAGCTTCCTGCGTAAATGGGTTTCAGTTTTCACACTTTGGCCAANAG:1	GAAGTTGACAGCTAAGTTTAAA	GTTTTCACACTTTGGCCAANAG	-	chr3R	27041914	-	chr3R	27041829	85	+	chr3R	27041829	+	chr3R	27041914
TTTAAAACTGCTGTGTTATTTGGCCTTAAGAAGTAATAATGTCCGGTCTCTA:1	TTTAAAACTGCTGTGTTATTTG	AAGTAATAATGTCCGGTCTCTA	+	chr3R	13782080	+	chr3R	13782138	58	+	chr3R	13782080	+	chr3R	13782138
ATAAACAATAAACAATAAACAATAAACTAATTTGCGGGTGGGTGGCAATTGGGGGGCG:1	ATAAACAATAAACAATAAACAA	GGTGGGTGGCAATTGGGGGGCG	-	chr2L	9723025	-	chr2L	4419188	5303837	+	chr2L	4419188	+	chr2L	9723025
ATGCAATTTAAATCCTCATTCATCTTCTTCATACATAGTTATGTTATTTATTTAAGTTAATNGAACAGATGAAGG:1	ATGCAATTTAAATCCTCATTCA	AAGTTAATNGAACAGATGAAGG	-	chr3R	23844569	-	chr3R	23835419	9150	+	chr3R	23835419	+	chr3R	23844569
CTGAGGCTGAGACCGGGATANGGTCCCTANATCCGAATCCGACTCCGAATCT:1	CTGAGGCTGAGACCGGGATANG	ATCCGAATCCGACTCCGAATCT	-	chr3L	762752	-	chr3L	8676826	7914074	+	chr3L	8676826	+	chr3L	762752
AAAACGAATCGATTACGCAAGGCGACTAAAAGTTGAATTTATTAAACGAAATTCTTTTAATTAAAATCGTGA:1	AAAACGAATCGATTACGCAAGG	ATTCTTTTAATTAAAATCGTGA	-	chr2R	14541488	-	chr2R	14541234	254	+	chr2R	14541234	+	chr2R	14541488
ATTTGTAAAGTGATATAGAGGTTAGCCGCTGCAGGTAAGCTGCTGGTCAAGCGG:1	ATTTGTAAAGTGATATAGAGGT	AGGTAAGCTGCTGGTCAAGCGG	-	chr2L	11854364	-	chr2L	16420546	4566182	+	chr2L	16420546	+	chr2L	11854364
AAACATTACTTTAACTGCGCCTTTTTTTCAGTTTCAAAATGAAAAACTTTCCC:1	AAACATTACTTTAACTGCGCCT	TTTCAAAATGAAAAACTTTCCC	-	chrX	16651010	-	chrX	16650955	55	+	chrX	16650955	+	chrX	16651010
AGCCTCAATTTAAAATTAAGCTCATGAAAAGTAGTTAACCTCCAAAGCCACCCACCGTCGCCCACTCACCCACCC:1	AGCCTCAATTTAAAATTAAGCT	ACCGTCGCCCACTCACCCACCC	-	chr2R	21747448	-	chr2R	21738288	9160	+	chr2R	21738288	+	chr2R	21747448
CATGGTCAGAAGGGGGGANGGGGGGGGGGCAAC:1	CATGGTCAGAAGGGGGGANGGG	GGGGGGANGGGGGGGGGGCAAC	+	chr2R	10018931	+	chr2R	6890195	3128736	+	chr2R	10018931	+	chr2R	6890195
CACCTAATCAGATTAATATATACATTTTTTTAACCATCAATGGCAATCCTTTATTAGAAGTCAATGTCCTTTCCA:1	CACCTAATCAGATTAATATATA	TTAGAAGTCAATGTCCTTTCCA	+	chrX	11008921	+	chrX	16197894	5188973	+	chrX	11008921	+	chrX	16197894
ATTCACTCATTTAATTCAATATTACTATTAAAATACTATTTTTCTTGATCTGTACCTATTTGTTGACTGACCAGG:1	ATTCACTCATTTAATTCAATAT	ACCTATTTGTTGACTGACCAGG	+	chrX	19060434	+	chrX	19065218	4784	+	chrX	19060434	+	chrX	19065218
AATGTTCACTGATCAAACCTCTTCGGGCGGCACTTTTTTTTTGCGCTTATCTCCTCCTGCTGCCGCTTCTAAT:1	AATGTTCACTGATCAAACCTCT	TCCTCCTGCTGCCGCTTCTAAT	+	chr3R	5155535	+	chr3R	5155639	104	+	chr3R	5155535	+	chr3R	5155639
AGGATTCATTAAACAAAAAAAACTCCAAAGAAAGAATGACTCAATCATTTAAGAAGCAAACTGATTTTGTGCCGT:1	AGGATTCATTAAACAAAAAAAA	AAGCAAACTGATTTTGTGCCGT	+	chr2L	16001476	+	chr2L	16001564	88	+	chr2L	16001476	+	chr2L	16001564
GAGTTGTCATTCCATGCAACATTCACTGCAATTGCAGTTTAAATGGCTTTTGGTCATTTACCTTTTGGCG:1	GAGTTGTCATTCCATGCAACAT	TTTGGTCATTTACCTTTTGGCG	+	chr3L	1581160	+	chr3L	1581489	329	+	chr3L	1581160	+	chr3L	1581489
GTCAGGTTTATATATTTTTTGTAATCTTTCGGTTGTAAATTGTTTCACTTATGTACATATTCAGTTCAACATATA:1	GTCAGGTTTATATATTTTTTGT	TACATATTCAGTTCAACATATA	+	chr3L	20476753	+	chr3L	20484352	7599	+	chr3L	20476753	+	chr3L	20484352
CACACACGNGTGGGATCCTGGACGAGTGCATCCTTGCAGCAGGGGGCGTGCGCAGCAGCTTTGCGAGGGCAGCTC:1	CACACACGNGTGGGATCCTGGA	AGCAGCTTTGCGAGGGCAGCTC	-	chr3L	11901718	-	chr3L	11901588	130	+	chr3L	11901588	+	chr3L	11901718
TATACGCAAAAAAGTCGGAGTTTATTTCCGTTATATGCACTGTTGTTCGCCTAATATTATTTTTTTGCCATTCG:1	TATACGCAAAAAAGTCGGAGTT	AATATTATTTTTTTGCCATTCG	-	chr3R	20165876	-	chr3R	20156707	9169	+	chr3R	20156707	+	chr3R	20165876
GTCTGTGCGATGCAACTGAGGGAGAATTTTGCGGGTGTGTGCG:1	GTCTGTGCGATGCAACTGAGGG	GAGAATTTTGCGGGTGTGTGCG	-	chr2R	6501054	-	chr2R	6500991	63	+	chr2R	6500991	+	chr2R	6501054
TCTAGTCATGAAAAAAAAAAATTTGCATTTTTTTTTTT:1	TCTAGTCATGAAAAAAAAAAAT	AAAAATTTGCATTTTTTTTTTT	+	chrX	12649346	+	chrX	20760310	8110964	+	chrX	12649346	+	chrX	20760310
ATGCGTTGGTGTTTTCCCTTNTAGGGTGTGGCNGCCAGCTTCNTTTGTGTGTACTTGTGTGTGTGTGTGTG:1	ATGCGTTGGTGTTTTCCCTTNT	TGTACTTGTGTGTGTGTGTGTG	+	chr2R	13316603	+	chr2R	14055116	738513	+	chr2R	13316603	+	chr2R	14055116
ACTAAATTTGTTTGCCTATGCTAAAATCGGTAACGATTGTAAGTTACGACTG:1	ACTAAATTTGTTTGCCTATGCT	TAACGATTGTAAGTTACGACTG	+	chr3R	26558352	+	chr3R	26565641	7289	+	chr3R	26558352	+	chr3R	26565641
AACTACATNTCAAAAGTTAACCAAGCAATGGCACAAGAAAAAAGCCGAAACAATAAACAATAAACAATAAACAAT:1	AACTACATNTCAAAAGTTAACC	TAAACAATAAACAATAAACAAT	+	chr3R	8880027	+	chr3R	7773344	1106683	+	chr3R	8880027	+	chr3R	7773344
ATTACTTTTTTATAATTATATTGCCTTTATTTAAGTCCTCNTTAANTGTTTGAAATTGAATCGNAGTTTAGTT:1	ATTACTTTTTTATAATTATATT	GAAATTGAATCGNAGTTTAGTT	-	chrX	8092402	-	chrX	8092319	83	+	chrX	8092319	+	chrX	8092402
TGATAAATGAGCGTAAGAGTTAAATGCCGGCAAAAGGAGCGGACTGGACCGGGCCTGGCCCAAACGACCGC:1	TGATAAATGAGCGTAAGAGTTA	CGGGCCTGGCCCAAACGACCGC	-	chr2L	16940083	-	chr2L	16940009	74	+	chr2L	16940009	+	chr2L	16940083
GGTTGCGCCGAACAGAAAACCAACAAAAGTCGGGCCCCACATTAGCAGCTTGTAAAAACTGTGAGTGCTCCAA:1	GGTTGCGCCGAACAGAAAACCA	GTAAAAACTGTGAGTGCTCCAA	+	chr3L	14721193	+	chr3L	14723034	1841	+	chr3L	14721193	+	chr3L	14723034
TGCACACACACACACACACACACAAGGACCTTCCTTCTCTCATCGCTCGCATTCCATTGTCCTTCG:1	TGCACACACACACACACACACA	GCTCGCATTCCATTGTCCTTCG	+	chrX	17971835	+	chrX	17047276	924559	+	chrX	17971835	+	chrX	17047276
ACGGCATCTAGTCGCGCATAGAATTGGCGAATATTTTATGCTAAAGAGGCGAAAANGGAAACC:1	ACGGCATCTAGTCGCGCATAGA	TAAAGAGGCGAAAANGGAAACC	-	chr2L	19871631	-	chr2L	19871556	75	+	chr2L	19871556	+	chr2L	19871631
ATGAAAACCAAAAAGAGAACGACGCCAAATTCAAATCGCGAACTGCTTAAAAATGAACAACAAATGAAATTCCCA:1	ATGAAAACCAAAAAGAGAACGA	TGAACAACAAATGAAATTCCCA	+	chr2R	17236538	+	chr2R	17241742	5204	+	chr2R	17236538	+	chr2R	17241742
TGAAATCCACTCTCTGTGGATTTTACATTCCTTCAATTTATTTGCATTACTATTTTTGTAATAGTTAAAAAA:1	TGAAATCCACTCTCTGTGGATT	TATTTTTGTAATAGTTAAAAAA	+	chr3R	13067113	+	chr3R	13067186	73	+	chr3R	13067113	+	chr3R	13067186
AACCCCACGTAACACGCAAATCGGACTCTCATTCGAAAACCAGGTAAAAGTCAATTGCGTTTTCAGTCCTCGCC:1	AACCCCACGTAACACGCAAATC	AATTGCGTTTTCAGTCCTCGCC	-	chr3L	22570575	-	chr3L	22570432	143	+	chr3L	22570432	+	chr3L	22570575
CCACTGATCGGAAATTAATCCAACCAAGTCAGCTTAATCACTTCATTTCATTTTCAACTTCTTCTGGTACTTACA:1	CCACTGATCGGAAATTAATCCA	TCAACTTCTTCTGGTACTTACA	+	chr3L	13144141	+	chr3L	13144218	77	+	chr3L	13144141	+	chr3L	13144218
TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTTTTTTGGT:1	TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT	GTGTTTGTGTTTGTTTTTTGGT	-	chr3L	11777678	-	chr3L	6604043	5173635	+	chr3L	6604043	+	chr3L	11777678
CAGAGACGGACTGGGCCATANATAAGGATCCGNCCAGGACGGNTCCCATTCCGGGTATAATTGCATCATCTGT:1	CAGAGACGGACTGGGCCATANA	CGGGTATAATTGCATCATCTGT	-	chr3R	7726311	-	chr3R	5663989	2062322	+	chr3R	5663989	+	chr3R	7726311
GGCAGCTGCGAGTGAAAACGCGCTAAGGAACAAAAACAAAAAGGAAACTATTTCATTTTCATTTGGGGTGCGAAA:1	GGCAGCTGCGAGTGAAAACGCG	CATTTTCATTTGGGGTGCGAAA	+	chr3R	27783529	+	chr3R	17945807	9837722	+	chr3R	27783529	+	chr3R	17945807
GAAATCCCTTTCTGCCTTTCTGAAATGAAAAATTTGGAACTTCTCTGTTCACTTTTTTG:1	GAAATCCCTTTCTGCCTTTCTG	AACTTCTCTGTTCACTTTTTTG	-	chr3R	19101900	-	chr3R	19101805	95	+	chr3R	19101805	+	chr3R	19101900
TGGGCGCCGGTGGAAATCGCGATGGAAACANNNTNATCGCTCATGATACAAATCATGATGACGAAATGGTATAAG:1	TGGGCGCCGGTGGAAATCGCGA	CATGATGACGAAATGGTATAAG	+	chr2R	19776593	+	chr2R	19779916	3323	+	chr2R	19776593	+	chr2R	19779916
CAGCTGCTGCGATGCCATAATGAGCACTTGAACAGTGGACAGAAGGGAGGTGAAGTCCTGCTCCTGGGGC:1	CAGCTGCTGCGATGCCATAATG	GGTGAAGTCCTGCTCCTGGGGC	+	chr3L	2854499	+	chr3L	2854572	73	+	chr3L	2854499	+	chr3L	2854572
GAAACTTACATTGTCAAAGAGCGTTTTCTGATAAATTGTTTCAANGTTCAAAGTTTTCCACAAATC:1	GAAACTTACATTGTCAAAGAGC	NGTTCAAAGTTTTCCACAAATC	+	chr3L	17580594	+	chr3L	17580761	167	+	chr3L	17580594	+	chr3L	17580761
CTGCTCAGCAATTTTTTTGTGTTAGTGTGNGTGTGTGTGTGCATGAAGGTCCTGTGTGCTNAATGTTTTGAATAC:1	CTGCTCAGCAATTTTTTTGTGT	GTGTGCTNAATGTTTTGAATAC	-	chr2L	17214485	-	chr2L	5997616	11216869	+	chr2L	5997616	+	chr2L	17214485
TAATACGAGTTACTCGGTAAGGGTAACAGGCAGAAGGAAGCATTTCGGACGAACTAGAGTTGCCTACTCGGCG:1	TAATACGAGTTACTCGGTAAGG	AACTAGAGTTGCCTACTCGGCG	+	chr3L	23205454	+	chr3L	23205682	228	+	chr3L	23205454	+	chr3L	23205682
AACCCTTTTTATCTTGATTCCACCATCCACNNNANTGCGTATAAAATGTCAAAACGTTTTACTAACAATTTTGAA:1	AACCCTTTTTATCTTGATTCCA	ACGTTTTACTAACAATTTTGAA	-	chr2L	19374606	-	chr2L	19374497	109	+	chr2L	19374497	+	chr2L	19374606
TATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATATATCATTTTTTTTGNGGAGCGA:1	TATAAATTAATTAGTTACTAAT	TATCATTTTTTTTGNGGAGCGA	-	chr2L	22724123	-	chr2L	22724040	83	+	chr2L	22724040	+	chr2L	22724123
AGTCGCGCACCCTGCTCACAGCGCCCTATCATGTATAGTCCGACAATTCTGTCACCATTGAAC:1	AGTCGCGCACCCTGCTCACAGC	GACAATTCTGTCACCATTGAAC	+	chr3L	7363645	+	chr3L	7355726	7919	+	chr3L	7363645	+	chr3L	7355726
GATTGCCGCCTTGCCTTTTACACTCTCGATATTATACAATATTTTTGCGTAACGTAGACTCGTCGCGTTTG:1	GATTGCCGCCTTGCCTTTTACA	TAACGTAGACTCGTCGCGTTTG	-	chr3R	10206162	-	chr3R	546269	9659893	+	chr3R	546269	+	chr3R	10206162
GGAGCTCTNCATCTGCCGCCAGCTTCTTTGATTATNATTTCGCCATCAATCATGGATCAGCAGCAAGCGGAAAAG:1	GGAGCTCTNCATCTGCCGCCAG	GGATCAGCAGCAAGCGGAAAAG	-	chr3L	15697507	-	chr3L	21316823	5619316	+	chr3L	21316823	+	chr3L	15697507
CGAAAAGTTTTAAAAACCCGGTAACTGTGCACCAATGCCACGCCCCGCTTGCGAAACTGAACAAAACAAAAATGT:1	CGAAAAGTTTTAAAAACCCGGT	AAACTGAACAAAACAAAAATGT	+	chr2L	10579288	+	chr2L	11242516	663228	+	chr2L	10579288	+	chr2L	11242516
GAATTAGCAGGGGCAGAAAAGGCCCTAAAATGCCAGCATATATATCGACAACCTTCGCCTTGGACACCTGAAAT:1	GAATTAGCAGGGGCAGAAAAGG	CTTCGCCTTGGACACCTGAAAT	-	chrX	908508	-	chrX	906720	1788	+	chrX	906720	+	chrX	908508
ATCTTCTGACTGCACATTTANGCTAGCTGTAANATACATATTNTAAAACTGCATTACCCTTTTAGTCAAATGTTG:1	ATCTTCTGACTGCACATTTANG	TTACCCTTTTAGTCAAATGTTG	+	chr2R	14373929	+	chr2R	12837675	1536254	+	chr2R	14373929	+	chr2R	12837675
GATTGCAGCACTGTGCAAAACATATGCAAGGCTAGTTAGTCACGCAATTTCGAACTTTGTTTGAAAGTCATGTAG:1	GATTGCAGCACTGTGCAAAACA	ACTTTGTTTGAAAGTCATGTAG	+	chr2L	17016217	+	chr2L	6520342	10495875	+	chr2L	17016217	+	chr2L	6520342
AAATTAATTAACCCAATTAAATGAGAATAATGAGAGAGCCTATTATAAATTAAGTATTTCTCCCCAGTACCCCCA:2	AAATTAATTAACCCAATTAAAT	GTATTTCTCCCCAGTACCCCCA	+	chr2R	7067623	+	chr2R	7067707	84	+	chr2R	7067623	+	chr2R	7067707
GTACAGTACTATCAAATTCGGCCAGTCTTCTTAGCTTTTATTCAGTTTTGTTCCTCTTTGGTGCTGACCAAATG:1	GTACAGTACTATCAAATTCGGC	CCTCTTTGGTGCTGACCAAATG	+	chr2R	21809555	+	chr2R	21817794	8239	+	chr2R	21809555	+	chr2R	21817794
GTCACTTAGAGAGTATACGAGCACAGTTGGGGGCAAAATAATAAGGAAACGAAAGG:1	GTCACTTAGAGAGTATACGAGC	AAAATAATAAGGAAACGAAAGG	-	chr3L	12587633	-	chr3L	2059120	10528513	+	chr3L	2059120	+	chr3L	12587633
ACTTAATGTATGGTTTACCATAATGCTTCAGCTCATAATATCAAATCCCTAACCATTTATTGATAGACACCCAAA:1	ACTTAATGTATGGTTTACCATA	CATTTATTGATAGACACCCAAA	-	chr2L	11496725	-	chr2L	11496647	78	+	chr2L	11496647	+	chr2L	11496725
AAAAGTAACGAATGCATCAGAAGACACAACGATATCGCATATTAACTTACATATTGTTTTCGCAGACATTCTTGA:1	AAAAGTAACGAATGCATCAGAA	TTGTTTTCGCAGACATTCTTGA	-	chr2R	21188313	-	chr2R	21188232	81	+	chr2R	21188232	+	chr2R	21188313
GGTGACCGAGCCGCCGGGTGACTCATATGTGCTGCAATGAGAAAGGCCAGTGAGATATAAAAATATCTTTTT:1	GGTGACCGAGCCGCCGGGTGAC	TGAGATATAAAAATATCTTTTT	+	chr3R	4885416	+	chr3R	4885504	88	+	chr3R	4885416	+	chr3R	4885504
GTCCCTATACATAATTTAATGCACTGGAGTGCGCATGACGAGCATGATGCAAACGAGGAAGGCGATCCCCAAAGC:1	GTCCCTATACATAATTTAATGC	CGAGGAAGGCGATCCCCAAAGC	-	chr2R	8200999	-	chr2R	11870411	3669412	+	chr2R	11870411	+	chr2R	8200999
GCGAAGATTCCATGAGATTCTCCTCCTCATTAAATAGGGTATTTGCAGCTCTTACTTAATATGTACTTATTTTTT:1	GCGAAGATTCCATGAGATTCTC	ACTTAATATGTACTTATTTTTT	-	chr3L	19528007	-	chr3L	19527928	79	+	chr3L	19527928	+	chr3L	19528007
CATTGACTTTATATATACTTTTATATTATCATTTCTTATTGTCTATCCAGTGCTAAGCTATTAATATCAAAAG:1	CATTGACTTTATATATACTTTT	GCTAAGCTATTAATATCAAAAG	+	chr3L	17144171	+	chr3L	17144253	82	+	chr3L	17144171	+	chr3L	17144253
TATAAACATGCTATTATTTTGATTATTTTTTATTACTTATACGTCTGGTGTGCCCACTCATTGATTGAAATATTT:1	TATAAACATGCTATTATTTTGA	CCACTCATTGATTGAAATATTT	-	chr3L	5327476	-	chr3L	5327384	92	+	chr3L	5327384	+	chr3L	5327476
CTCGTTTAAGTTCAGTTATGACCAAATTATTNTCTTTTTGCAAGTTCAGATGCTGAGATATTATTCACAAAGA:1	CTCGTTTAAGTTCAGTTATGAC	GCTGAGATATTATTCACAAAGA	-	chr2L	1573583	-	chr2L	1570713	2870	+	chr2L	1570713	+	chr2L	1573583
TGCCGCCTTACGTGGCGTATACGTAATGGGCCAGCAACTAAAGGTAATGTGATTCCATGTTTATGCATGTACAC:1	TGCCGCCTTACGTGGCGTATAC	TTCCATGTTTATGCATGTACAC	-	chr2L	11538938	-	chr2L	11538854	84	+	chr2L	11538854	+	chr2L	11538938
AATCCCCCAAAATATATGCATACACATTGGTTTATAATGAAAATATTCGTTTTCCTCATAACTATAGTTG:1	AATCCCCCAAAATATATGCATA	GTTTTCCTCATAACTATAGTTG	-	chr3R	20272987	-	chr3R	20266521	6466	+	chr3R	20266521	+	chr3R	20272987
CAACTGAAACCGATCGTTGGGTACTTTCTGTTTGTTCTTGTTTTTNACTTTTTCATTTAGCNAGTATTT:1	CAACTGAAACCGATCGTTGGGT	CTTTTTCATTTAGCNAGTATTT	-	chr3L	9344281	-	chr3L	9344209	72	+	chr3L	9344209	+	chr3L	9344281
AGGCGGACGAACGAATCTGAAAAGGGAATGTATATATAGGGAAAATTTAAATATTTCC:1	AGGCGGACGAACGAATCTGAAA	TAGGGAAAATTTAAATATTTCC	+	chr3L	20148318	+	chr3L	20148391	73	+	chr3L	20148318	+	chr3L	20148391
TTCGCCAACCTAGTTTTTGGGCCCGGCTTAATCACAGACAGTGTATGTCTAATGCGCAAAACTTTTAATTGAGTT:1	TTCGCCAACCTAGTTTTTGGGC	GCGCAAAACTTTTAATTGAGTT	+	chr3R	9811359	+	chr3R	9811437	78	+	chr3R	9811359	+	chr3R	9811437
GCAAGTCCAAAACGGGCATAAATCATAGATCGATTTGAATTACATACATTCATCCTCGCACTGCTCTCACAATTA:1	GCAAGTCCAAAACGGGCATAAA	CCTCGCACTGCTCTCACAATTA	+	chr3R	15452302	+	chr3R	15452379	77	+	chr3R	15452302	+	chr3R	15452379
TACGGGTAACTTTTGGAAAAAATTGCTTTTACATTCGTGGTAACCGCCTCTTGAGACCGCATCTCAAAAATGCTA:1	TACGGGTAACTTTTGGAAAAAA	AGACCGCATCTCAAAAATGCTA	-	chr2L	23241930	-	chr2L	23241850	80	+	chr2L	23241850	+	chr2L	23241930
GATTCATTCAAGTAGTGCGGCATTTATTAAATCGGAAATAAGTCGAACTTTAATTATTTATGGGCTTNAAGTA:1	GATTCATTCAAGTAGTGCGGCA	AATTATTTATGGGCTTNAAGTA	+	chr3R	25828573	+	chr3R	25828327	246	+	chr3R	25828573	+	chr3R	25828327
TAAGCTTTTGATTAGCCAAGTTAAGATGAGGGCGATAAAAAGCAGCACCTGCAATATTTGCAACAANTGCACAAA:1	TAAGCTTTTGATTAGCCAAGTT	ATATTTGCAACAANTGCACAAA	-	chrX	3109540	-	chrX	3109463	77	+	chrX	3109463	+	chrX	3109540
AATTGAGTGGCAAAAAAANAAATGTTCGTGTTTCAGTAGTTTTCATTTCTCCTTCTTTTTTTTTTGTTTTTTNT:1	AATTGAGTGGCAAAAAAANAAA	TTCTTTTTTTTTTGTTTTTTNT	+	chrX	13846298	+	chrX	2168782	11677516	+	chrX	13846298	+	chrX	2168782
AACAACTTCCACTTGTGCNCCAACGACAACTACTCCTAGATCANCAACANCACCTTGTCAAACTACAACACCA:1	AACAACTTCCACTTGTGCNCCA	ACCTTGTCAAACTACAACACCA	+	chr2L	4938333	+	chr2L	4940976	2643	+	chr2L	4938333	+	chr2L	4940976
CGATTCGCAAATGAAGTATTCGAATATTTCTGAAATGAAATAAATGTTTAAAAAGTAATCGAAATGTAATTGAC:1	CGATTCGCAAATGAAGTATTCG	AAGTAATCGAAATGTAATTGAC	-	chr3L	4170244	-	chr3L	4170167	77	+	chr3L	4170167	+	chr3L	4170244
CATTTAATTTGTGCGGATNAGCAGACACCGCCGGGATGTTANAGCNTCCCTAATTATATCAGAAAAGCAACAATT:1	CATTTAATTTGTGCGGATNAGC	TTATATCAGAAAAGCAACAATT	-	chrX	6989600	-	chrX	6989513	87	+	chrX	6989513	+	chrX	6989600
ATGCAGAAAAAATTAATTTAACAACTCAGTTGACTTGAGCTGAGGCTCATTGTCCTTGTCAAGGATTCGTGTAT:1	ATGCAGAAAAAATTAATTTAAC	TCCTTGTCAAGGATTCGTGTAT	+	chr3R	8329493	+	chr3R	11000083	2670590	+	chr3R	8329493	+	chr3R	11000083
GTAAAAGAAAGTTCTGCAAGTTGTCGAGACGAAAACAAGAGGAATAACACAAAGCTGCTTGTCACTCACTGAC:1	GTAAAAGAAAGTTCTGCAAGTT	AAGCTGCTTGTCACTCACTGAC	+	chr3R	29176380	+	chr3R	15158921	14017459	+	chr3R	29176380	+	chr3R	15158921
AAAAGAGGGCTAAAGGAAAAGGTGGTAGGGGAGGGGGGGGACAAGCGGTAAATGAAATGAACTACAGGTGGACAG:1	AAAAGAGGGCTAAAGGAAAAGG	GAAATGAACTACAGGTGGACAG	-	chrX	15204549	-	chrX	15204454	95	+	chrX	15204454	+	chrX	15204549
CATACGAACGTGTAGCGTATGCGTATGCATNNNANANTTAAATTAAGTCTGAAAATGTCGATCGAATGGCATGGA:1	CATACGAACGTGTAGCGTATGC	AATGTCGATCGAATGGCATGGA	-	chr2R	7874001	-	chr2R	7869215	4786	+	chr2R	7869215	+	chr2R	7874001
GATGGAGTAAGAAGTGTCGTATACTTATACCAGTCAACCTCCTATGATCCCAAAACCTCATCACTGACTGCTTAG:1	GATGGAGTAAGAAGTGTCGTAT	AACCTCATCACTGACTGCTTAG	-	chr3R	31522827	-	chr3R	31522496	331	+	chr3R	31522496	+	chr3R	31522827
AGCCCCATAGATAGGTAGGTAGCTATTGCCATGGAGGGGCAGACCGCTCTCAGCTTCGCACCAGACGACCCC:1	AGCCCCATAGATAGGTAGGTAG	CAGCTTCGCACCAGACGACCCC	+	chr2L	6136139	+	chr2L	270444	5865695	+	chr2L	6136139	+	chr2L	270444
GACTTATTTACCAACTGCAATAGAAATACATCAATAGATTAAAATCAAAATCGAGTGAGACGCAAAAAATAA:1	GACTTATTTACCAACTGCAATA	TCGAGTGAGACGCAAAAAATAA	-	chr2R	10419933	-	chr2R	12894264	2474331	+	chr2R	12894264	+	chr2R	10419933
CCTCTTCAGAGGTTCTTTNAGCACTTGAACTGACATAAAATNAACNTGGACTGCCTGGTTTCATTCACCAGATCC:1	CCTCTTCAGAGGTTCTTTNAGC	CCTGGTTTCATTCACCAGATCC	+	chr3R	6794239	+	chr3R	6794639	400	+	chr3R	6794239	+	chr3R	6794639
ATTCAGATATCTCATGCCATTCGAACCTTAGATACTTGAATGATTTGAACGCCAGCGACTTGAGTAGCTGGCAAG:1	ATTCAGATATCTCATGCCATTC	AGCGACTTGAGTAGCTGGCAAG	+	chr3L	12285298	+	chr3L	12285499	201	+	chr3L	12285298	+	chr3L	12285499
CATTAAGGCCGCCCAAAATGCGATTGACAGCCAAACACACACACAGAAAAAATGTTTTAATGTAAATAAAGTTTA:1	CATTAAGGCCGCCCAAAATGCG	GTTTTAATGTAAATAAAGTTTA	+	chr2L	12261266	+	chr2L	17889393	5628127	+	chr2L	12261266	+	chr2L	17889393
ACTGTCCTTCGCCAATTAGCTGTGTGTATCTGTGTGTGGGTGGCAATATTTCAACTTTCCTAATAATAAAGTTG:1	ACTGTCCTTCGCCAATTAGCTG	AACTTTCCTAATAATAAAGTTG	+	chr3R	22863930	+	chr3R	22864007	77	+	chr3R	22863930	+	chr3R	22864007
ATCCGAAATATCTCAAGCAAATTAACGTGATGAGAAAATAATCGACGCCATATCATGCCTGGAAAACGACACTTG:1	ATCCGAAATATCTCAAGCAAAT	CATGCCTGGAAAACGACACTTG	+	chr2R	3914992	+	chr2R	3291929	623063	+	chr2R	3914992	+	chr2R	3291929
GATGGCTTTATCCGTGGTTAATTTTCTTTCACTACTTCTTTTAGCCTCTTCTTCCCGTTTTTTTTTTTGTTCTTT:1	GATGGCTTTATCCGTGGTTAAT	CCCGTTTTTTTTTTTGTTCTTT	-	chrX	3557931	-	chrX	5332628	1774697	+	chrX	5332628	+	chrX	3557931
TGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCCTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTNT:1	TGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTC	CTTTGTCTTTGTCTTTGTCTNT	-	chrX	16983077	-	chrX	1053120	15929957	+	chrX	1053120	+	chrX	16983077
ATAAATAATTAAATAATAAATAATCAAATAATAGCTCAAACTCACCTGTATGTGTGGCAATCCTTGATCTG:1	ATAAATAATTAAATAATAAATA	ATGTGTGGCAATCCTTGATCTG	+	chr3L	18452045	+	chr3L	9207977	9244068	+	chr3L	18452045	+	chr3L	9207977
ATAGTGTCTGGAATTTGCTAAAAACCATTTTCAAAAACCGAAAAA:1	ATAGTGTCTGGAATTTGCTAAA	ACCATTTTCAAAAACCGAAAAA	+	chr3R	26258902	+	chr3R	10139296	16119606	+	chr3R	26258902	+	chr3R	10139296
GTGTAGTCCCAGATATTATATTACNTAATATTATATATTATTNTANTAAGTNTTCNGGCTGGTCAGTTGTGGGA:1	GTGTAGTCCCAGATATTATATT	TTCNGGCTGGTCAGTTGTGGGA	+	chr3R	4105065	+	chr3R	4110268	5203	+	chr3R	4105065	+	chr3R	4110268
TGAGCTTACCCATTGAGTGCACACTGACAGTATCCCAACTTTTTCCGTCTTCATTTTGGTATTTTAAATTCACAT:1	TGAGCTTACCCATTGAGTGCAC	TTTTGGTATTTTAAATTCACAT	-	chr3R	6598495	-	chr3R	6598305	190	+	chr3R	6598305	+	chr3R	6598495
AATCTGTAATTATGGCCGACTGACTATATACAGAGTTCAAAAGTTTAGACGTGCAGCCCCTCAAAATATTAAA:1	AATCTGTAATTATGGCCGACTG	TGCAGCCCCTCAAAATATTAAA	-	chrX	20320380	-	chrX	20320305	75	+	chrX	20320305	+	chrX	20320380
TTAACCACTAACTTAAACTAGACGTAAATACAAAAGCTTGACCAAATACAAATCATCTATGTTATGAATGGCAAA:1	TTAACCACTAACTTAAACTAGA	CATCTATGTTATGAATGGCAAA	+	chr2R	11344159	+	chr2R	11344255	96	+	chr2R	11344159	+	chr2R	11344255
ACGAATAATCCCTAAATTATCATANTTTGACTTCGAAATAATNTANCAAAANTCANTATTCTATGGTTTTTAAGA:1	ACGAATAATCCCTAAATTATCA	CANTATTCTATGGTTTTTAAGA	+	chr2R	10318532	+	chr2R	10318618	86	+	chr2R	10318532	+	chr2R	10318618
TAGTTCAGCCAATTAAAGTGAGGCCAAGACAAACGAATGCGAACACGATTGAAATGGAAATCTGCCCTGCGGTTT:1	TAGTTCAGCCAATTAAAGTGAG	ATGGAAATCTGCCCTGCGGTTT	+	chrX	13515706	+	chrX	13515955	249	+	chrX	13515706	+	chrX	13515955
ACNAGAGCACAGCAGGGCACTGCAAAAAAAATGGTGNCATGGTGTGTAGA:1	ACNAGAGCACAGCAGGGCACTG	AAATGGTGNCATGGTGTGTAGA	-	chr2R	18727251	-	chr2R	18727102	149	+	chr2R	18727102	+	chr2R	18727251
ATTGGAATGCTGCTTACTTTTAAGTCAATTACTCCTGATTACTTTACTTAAATAAAATAATAAGAGTGACTACA:1	ATTGGAATGCTGCTTACTTTTA	TAAAATAATAAGAGTGACTACA	+	chr2R	25175334	+	chr2R	17397912	7777422	+	chr2R	25175334	+	chr2R	17397912
CTGCATTCAACACTGACGCCAACCGGTGTACAAAAAAGTAGAAAAAAAAAAGAATGCCCAAAATATCACGATTAC:1	CTGCATTCAACACTGACGCCAA	ATGCCCAAAATATCACGATTAC	-	chr3L	12574702	-	chr3L	12129018	445684	+	chr3L	12129018	+	chr3L	12574702
CATTAAAANAACAATCCACACTGGAAAAAAACTGGACAACCTGCATTAACCAAATCAATCATGTGACTTTGCAG:1	CATTAAAANAACAATCCACACT	AATCAATCATGTGACTTTGCAG	-	chr2L	3339032	-	chr2L	3329672	9360	+	chr2L	3329672	+	chr2L	3339032
AGCAGTGCGGTAGATGCCAGACGAAAGAGTTGCAAGCACACACATGTGCGGGCATAAAAGAAAAGCAGAAACTTA:1	AGCAGTGCGGTAGATGCCAGAC	ATAAAAGAAAAGCAGAAACTTA	+	chr3R	27140517	+	chr3R	27148127	7610	+	chr3R	27140517	+	chr3R	27148127
ATACGAGGTGTAATATAATTTTATAATTTATGATTTATAAAGTACCTTCTTATCACTGTGCATTGCAATTCATT:1	ATACGAGGTGTAATATAATTTT	TCACTGTGCATTGCAATTCATT	+	chr3L	10032565	+	chr3L	10032651	86	+	chr3L	10032565	+	chr3L	10032651
ACAATCTTCGTGTGTTGAATACTATCCCACACACTATCTGACCCGTAATATTCATTTGATGATCCATCAAATCA:1	ACAATCTTCGTGTGTTGAATAC	CATTTGATGATCCATCAAATCA	-	chrX	2578931	-	chrX	2578840	91	+	chrX	2578840	+	chrX	2578931
GGGTCCATGTAATGCTCCTCCCTATCGAGGCGGATTTTTGCGATAATTGCGAGTGCAAAATCGAGCACACGCGT:1	GGGTCCATGTAATGCTCCTCCC	GTGCAAAATCGAGCACACGCGT	-	chr2R	11675085	-	chr2R	11675006	79	+	chr2R	11675006	+	chr2R	11675085
TTAAAACCAACTNGTTCGACTTTCCATTAANGNATCGTNTATTAAATTGAATGCAAACTTTGAATCATCACTCC:1	TTAAAACCAACTNGTTCGACTT	GCAAACTTTGAATCATCACTCC	+	chr2R	19680838	+	chr2R	19680914	76	+	chr2R	19680838	+	chr2R	19680914
GCNTGACGCCGATAGGCTGGTAGGACTCCAAGGTCCTTCAAGTGGGCCACGTTCAGATATCACATAAGCCACGG:1	GCNTGACGCCGATAGGCTGGTA	TCAGATATCACATAAGCCACGG	+	chr2R	13721219	+	chr2R	13721301	82	+	chr2R	13721219	+	chr2R	13721301
ATGCGATAGAAACCAAACTAAATGAGCCATTTGAATGATAAATTCTACTTATGA:1	ATGCGATAGAAACCAAACTAAA	GAATGATAAATTCTACTTATGA	+	chr2R	14217914	+	chr2R	13448477	769437	+	chr2R	14217914	+	chr2R	13448477
CGATTCCGAGCGCTATTTACATATGCATTATCGGGAAATTCCTCGACTTCTGAAGCAATG:1	CGATTCCGAGCGCTATTTACAT	TTCCTCGACTTCTGAAGCAATG	-	chr2R	17282020	-	chr2R	17281953	67	+	chr2R	17281953	+	chr2R	17282020
ATGCATTCTTAGCATGTTTGTTTGTGGTTTGCCTTTGTTTTTGTTTATCGCCAATCCGCGAATCTTTGCT:1	ATGCATTCTTAGCATGTTTGTT	CGCCAATCCGCGAATCTTTGCT	-	chr3L	1374517	-	chr3L	1374445	72	+	chr3L	1374445	+	chr3L	1374517
CCGTCGTTTTCAAAAATTATTGTTCGATATTTATTTTTTTAAAACATTCTGCGATAGTTCTATTCCTTTTTCTGC:1	CCGTCGTTTTCAAAAATTATTG	ATAGTTCTATTCCTTTTTCTGC	+	chr2L	15077907	+	chr2L	15077995	88	+	chr2L	15077907	+	chr2L	15077995
AAGCGCAAAAAGTTATACAAAGAAGAAGATCATAGATTAAGCCACCATTGTACGAATCACTCACCCCAGAGGCCA:1	AAGCGCAAAAAGTTATACAAAG	GAATCACTCACCCCAGAGGCCA	+	chr3R	29590404	+	chr3R	29590497	93	+	chr3R	29590404	+	chr3R	29590497
AAGCTGNGGCCGAACAATATGCGAGACTGCGGCGTCATTGTTGCAAAA:1	AAGCTGNGGCCGAACAATATGC	CTGCGGCGTCATTGTTGCAAAA	-	chr2R	9129624	-	chr2R	9129564	60	+	chr2R	9129564	+	chr2R	9129624
GGGCTTGAGCTGTTAGAAAGTAAAAACAAAATCATGGCTTNCAAAAGCCAAAAAGACTGCAAAACTTTNATGG:1	GGGCTTGAGCTGTTAGAAAGTA	AAAGACTGCAAAACTTTNATGG	+	chr3R	17461226	+	chr3R	17461306	80	+	chr3R	17461226	+	chr3R	17461306
CTTGGATACTAAATGCCAGTGATCACTGCTCAGGTTGTTTGGAGGGGTTTATGCTCGTCATCGACTCCACTCCTA:1	CTTGGATACTAAATGCCAGTGA	CTCGTCATCGACTCCACTCCTA	-	chr3L	16749286	-	chr3L	16749210	76	+	chr3L	16749210	+	chr3L	16749286
AATTATTGAGACAAAATAGTTAACTTGTACATATGCACACAATTTTTGTGAATCATTTAAATCATCACTAGTTCT:1	AATTATTGAGACAAAATAGTTA	CATTTAAATCATCACTAGTTCT	+	chr2R	13431488	+	chr2R	13431567	79	+	chr2R	13431488	+	chr2R	13431567
TTATACCAGTCAACCTCCTATGATCCCAAAACCTCATCACTGACTGCTTAGTGAGATAACCCAAATTCTGCATAA:1	TTATACCAGTCAACCTCCTATG	AGATAACCCAAATTCTGCATAA	-	chr3R	31522803	-	chr3R	31522472	331	+	chr3R	31522472	+	chr3R	31522803
AAGAGTGTGGAAATTCAAGACAGTTGTTTGGTGGAGCAACAATTGTTTAGCTGCCGTCTTTGTGCAATTTGGCCG:1	AAGAGTGTGGAAATTCAAGACA	CCGTCTTTGTGCAATTTGGCCG	+	chr2L	18478829	+	chr2L	18480260	1431	+	chr2L	18478829	+	chr2L	18480260
AATTTATTTACTTTACACTATACCTTACATTTGCAGATTTATAAAGCCTATTTTTGGGCAGTCAATNCCATTAAA:1	AATTTATTTACTTTACACTATA	TTGGGCAGTCAATNCCATTAAA	-	chr3L	9572250	-	chr3L	9571902	348	+	chr3L	9571902	+	chr3L	9572250
ATTTTTGCTACCATTTTTTTTCGAATGTAAGCTATTATTGGCTA:1	ATTTTTGCTACCATTTTTTTTC	GAATGTAAGCTATTATTGGCTA	-	chr3R	18242925	-	chr3R	31525574	13282649	+	chr3R	31525574	+	chr3R	18242925
GATTTAGAACTTACTTCTGGAGTTAGTTTATAAGTGTATTGCTTT:1	GATTTAGAACTTACTTCTGGAG	TAGTTTATAAGTGTATTGCTTT	-	chr3R	31345831	-	chr3R	10681249	20664582	+	chr3R	10681249	+	chr3R	31345831
CGAGTTTTGTCGCACTCGCACACACCCGCAAAATTCTCCCTCAGTTGCATCGCACAGACGTACGTACCATTGC:1	CGAGTTTTGTCGCACTCGCACA	GCACAGACGTACGTACCATTGC	+	chr2R	6500975	+	chr2R	6501068	93	+	chr2R	6500975	+	chr2R	6501068
GGAAGGGTCCGAGAGGGCTCATTCCCATCAATGTGGTTGATCCACCCGAGCCGAAAGAGGAAGAACAACCGAG:1	GGAAGGGTCCGAGAGGGCTCAT	CGAAAGAGGAAGAACAACCGAG	+	chr3R	5104162	+	chr3R	5104431	269	+	chr3R	5104162	+	chr3R	5104431
AACTTAATATTTTAGTTACTGTATNATTTGTATGTATTTATTNTGNTGGCTNCGGNTTTGTGGTCCATATATTCG:1	AACTTAATATTTTAGTTACTGT	GGNTTTGTGGTCCATATATTCG	-	chr3L	15209174	-	chr3L	15209088	86	+	chr3L	15209088	+	chr3L	15209174
GGCATTTTGGGGTAATCTAGTTACCAATTCAACTTGAATTAACCCCTTCCATTAAGGATCTCGACGNGGAACCA:1	GGCATTTTGGGGTAATCTAGTT	TAAGGATCTCGACGNGGAACCA	+	chr2L	21020298	+	chr2L	21023974	3676	+	chr2L	21020298	+	chr2L	21023974
ACACGCTCACAACCGCACGCACATGTTCGCCTAATAAGCGGAGAAAGTTGGAAGAAGGNAGCCATATATCTACCG:1	ACACGCTCACAACCGCACGCAC	GAAGGNAGCCATATATCTACCG	-	chr3R	5912375	-	chr3R	22941614	17029239	+	chr3R	22941614	+	chr3R	5912375
CGCCCAAAGCTTTTTCTAAAAACGCATACTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCAAACAAGTCTAAGCGCACACA:1	CGCCCAAAGCTTTTTCTAAAAA	CAAACAAGTCTAAGCGCACACA	-	chr2L	1227603	-	chr2L	1220137	7466	+	chr2L	1220137	+	chr2L	1227603
AATCCTATNACGACAGTAATATGTAAGTAAAAGGTNTTCAATCTTTTTAGAATTCAGCTGCAGAACTTGTAAACT:1	AATCCTATNACGACAGTAATAT	TCAGCTGCAGAACTTGTAAACT	+	chr3L	21872442	+	chr3L	21872521	79	+	chr3L	21872442	+	chr3L	21872521
TACGTTTCAAAATATTGCCAAAAATTGACTCTTTCCCCCAAAAACGGTACTGCAGCGACTTCACTTTGTTCTTG:1	TACGTTTCAAAATATTGCCAAA	CAGCGACTTCACTTTGTTCTTG	-	chr2R	8865116	-	chr2R	8864884	232	+	chr2R	8864884	+	chr2R	8865116
AATAAGCCTATGGAAAATGTTAGATGAGTGTACTAAGTGCCTCTCGAGTTTTTCTCTCTGTGTGCCTNTCCCC:1	AATAAGCCTATGGAAAATGTTA	TTCTCTCTGTGTGCCTNTCCCC	-	chr2R	11102961	-	chr2R	11102881	80	+	chr2R	11102881	+	chr2R	11102961
TTCCTAATATAGAAGAAGGGCAAATAGTTTCTAAGGTGTTGGCTTTCATCCTTGGCGCAGGGATTGTGCTCTTTA:1	TTCCTAATATAGAAGAAGGGCA	GGCGCAGGGATTGTGCTCTTTA	+	chr3R	19447925	+	chr3R	27066383	7618458	+	chr3R	19447925	+	chr3R	27066383
TGTGGCATTTGTGGAAATGTACGCCCACCTTAAATTGATTGAACTTTTTGCCCAAAATTGATAGTTGCTTAAATA:1	TGTGGCATTTGTGGAAATGTAC	AAAATTGATAGTTGCTTAAATA	+	chr2L	12779756	+	chr2L	12780213	457	+	chr2L	12779756	+	chr2L	12780213
CCAGGGAAGTCCATCGGAAGAATCCAAAAAAGTTGCCGCACCTCAAGTTCAGCCCGCTCCACATGTTGATTCA:1	CCAGGGAAGTCCATCGGAAGAA	GCCCGCTCCACATGTTGATTCA	+	chr2L	18699223	+	chr2L	18699298	75	+	chr2L	18699223	+	chr2L	18699298
TCTGATGGAGTAAAAGTANTCAGTAGGCATTGACTTTGATTNCGCNTTACATATCATGTGCTCTGTAAGATATTT:1	TCTGATGGAGTAAAAGTANTCA	TCATGTGCTCTGTAAGATATTT	+	chr3R	22491740	+	chr3R	22493119	1379	+	chr3R	22491740	+	chr3R	22493119
TGGACATNCAAAGATTAATTATCAATGCCAAATTATTTTNACATACAATTTCAAAATNGCTTTACTATCTCGGAC:1	TGGACATNCAAAGATTAATTAT	AAATNGCTTTACTATCTCGGAC	+	chr3L	18868971	+	chr3L	18869052	81	+	chr3L	18868971	+	chr3L	18869052
ATCAAAACTTTTGACGCTCAACTTGGTAGCAGCACCAGGAATCCGAGTTCAGGAGGGGGATTGTTGTTTT:1	ATCAAAACTTTTGACGCTCAAC	TCAGGAGGGGGATTGTTGTTTT	-	chr3L	19209432	-	chr3L	19208063	1369	+	chr3L	19208063	+	chr3L	19209432
CAAGTCTGCCGTGGCCTGAAAGTGTCACAGAGATGCTTTACACAGATAAACAACAAATAAGCATTATTTGTAATT:1	CAAGTCTGCCGTGGCCTGAAAG	CAAATAAGCATTATTTGTAATT	+	chr2L	10946963	+	chr2L	10956178	9215	+	chr2L	10946963	+	chr2L	10956178
GAAACCGAAACAACCGAAACTTACGCAACTGAAAACCAGCAGAACAGAAAGAAGTGAG:1	GAAACCGAAACAACCGAAACTT	CAGCAGAACAGAAAGAAGTGAG	+	chr3R	9944414	+	chr3R	30923782	20979368	+	chr3R	9944414	+	chr3R	30923782
GAGGCAGTCATTATATATTCAAGCATTTAACGGGGCAATAATTTTTTTCTGATTAGCAGCAATTT:1	GAGGCAGTCATTATATATTCAA	TTTTTCTGATTAGCAGCAATTT	-	chrX	22383363	-	chrX	22383292	71	+	chrX	22383292	+	chrX	22383363
AGAACAAAAACTGGATTAATGCAAACAGAAACGTCGAAATTATGAGGATGCACGTAAGAGGATCGGATCCATG:1	AGAACAAAAACTGGATTAATGC	ACGTAAGAGGATCGGATCCATG	+	chr3L	12012328	+	chr3L	12012405	77	+	chr3L	12012328	+	chr3L	12012405
TATGGGATGCATTCTTAGCATGTTTGTTTGTGGTTTGCCTTTGTTTTTGTTTATCGCCAATCCGCGC:1	TATGGGATGCATTCTTAGCATG	TTTGTTTATCGCCAATCCGCGC	-	chr3L	1374523	-	chr3L	1374454	69	+	chr3L	1374454	+	chr3L	1374523
TGGGGGTGCTGCGAAAATAAAGGGGATAAAATGGAGCCAGGAAGGGCGCTTAAAAAAGGGGGTTAAGTGTGAGC:1	TGGGGGTGCTGCGAAAATAAAG	AAAAAGGGGGTTAAGTGTGAGC	+	chrX	12301961	+	chrX	12303266	1305	+	chrX	12301961	+	chrX	12303266
CACACAGCTGAATTTTCTTTTCGGATTCGTGGATTGACCGTTAACATATGCATTTTCGGTTTTT:1	CACACAGCTGAATTTTCTTTTC	AACATATGCATTTTCGGTTTTT	-	chr3R	4427427	-	chr3R	6254830	1827403	+	chr3R	6254830	+	chr3R	4427427
AAAGTCATAGAACGACGCATTAAATTAAGTGGTATGCACANACAANTATGTATTTATACATGGNAATTCCAAT:1	AAAGTCATAGAACGACGCATTA	ATTTATACATGGNAATTCCAAT	+	chrX	20037651	+	chrX	20037728	77	+	chrX	20037651	+	chrX	20037728
ATACAGAGATACTTATGTGAGAACATTAACTTGTGTTCACTATAGCACCATATGTATTAATTAATGTAATTTTC:1	ATACAGAGATACTTATGTGAGA	TGTATTAATTAATGTAATTTTC	-	chr2L	290750	-	chr2L	10788030	10497280	+	chr2L	10788030	+	chr2L	290750
GTGTAGTAGCACCTCTGATGGAGACTGTGAACCAGATGATTGTGGGCTTATCTCTGATTGCAATTGGGATTGTGA:1	GTGTAGTAGCACCTCTGATGGA	CTGATTGCAATTGGGATTGTGA	-	chr2L	10648499	-	chr2L	10647984	515	+	chr2L	10647984	+	chr2L	10648499
TATTATATGGAAATGCATATTTTGTCTAACTCGAGTCTGGTTTCCGATTCCGATTTCGCTTCCT:1	TATTATATGGAAATGCATATTT	TCCGATTCCGATTTCGCTTCCT	+	chr2L	6124011	+	chr2L	3842789	2281222	+	chr2L	6124011	+	chr2L	3842789
AATTATCAGAACATGTACCATGTGTACATCTATATACAAACAATAGCAAATTATAATTACAAATAAATAAATTGA:1	AATTATCAGAACATGTACCATG	TAATTACAAATAAATAAATTGA	+	chr3L	15423784	+	chr3L	15426628	2844	+	chr3L	15423784	+	chr3L	15426628
TTTTTCCTTTGCTTGGGGAAACTATTCAAATTAACCGNTTCACGTNGCAAAATCATGCATTCTTTAA:1	TTTTTCCTTTGCTTGGGGAAAC	NGCAAAATCATGCATTCTTTAA	+	chr3R	25520994	+	chr3R	25521085	91	+	chr3R	25520994	+	chr3R	25521085
CTGCGTTTGTGCCATTAAAGTCGGACCCGATTTCGGGTCAAATTATAAATTTGATCACATTAGGACATATT:1	CTGCGTTTGTGCCATTAAAGTC	TTTGATCACATTAGGACATATT	-	chr3R	10905127	-	chr3R	10904927	200	+	chr3R	10904927	+	chr3R	10905127
GGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGCAAGAAAGAGGAGAACGAGAGAATTGCAGAGAAACGGCAAAAAGGGAAA:1	GGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGG	AGAGAAACGGCAAAAAGGGAAA	+	chr3L	19220636	+	chr3L	3763371	15457265	+	chr3L	19220636	+	chr3L	3763371
GTTTTTACACACAACTTANTTGTGTGCGCCCAAAACTCTTGNGACNACGTTATATTATTATTATTGTTTATTAT:1	GTTTTTACACACAACTTANTTG	TATTATTATTATTGTTTATTAT	-	chr2R	3639497	-	chr2R	5145622	1506125	+	chr2R	5145622	+	chr2R	3639497
GCCAAGGCTCATTAAAATGTACGCCGCAACGGAAAAAAGGAACACAGACCGTGTCGTATCCAATAAGACCACCTA:1	GCCAAGGCTCATTAAAATGTAC	TCGTATCCAATAAGACCACCTA	+	chr3L	4733752	+	chr3L	6251611	1517859	+	chr3L	4733752	+	chr3L	6251611
ACTTAATCGCTTTCACTAACTATCTAATATCTAATATNTAATATCNTAAAACAGGAAGAA:1	ACTTAATCGCTTTCACTAACTA	TAATATCNTAAAACAGGAAGAA	+	chr2L	15249613	+	chr2L	15249702	89	+	chr2L	15249613	+	chr2L	15249702
AGCACTGATATCGCTGCATCTTCCATCTGCCAACTTGTCCGCTAGTTCTTCGCTTACGAAACTTGGTNTACCCCA:1	AGCACTGATATCGCTGCATCTT	TTACGAAACTTGGTNTACCCCA	-	chr3L	25464192	-	chr3L	25464094	98	+	chr3L	25464094	+	chr3L	25464192
CCTTGGGCCTGCCCAAAATGGATCTGTACACGGCCTACGCCTACCAGCAGCAGTTGCTGAGAGCTCCGCCGGCGA:1	CCTTGGGCCTGCCCAAAATGGA	TTGCTGAGAGCTCCGCCGGCGA	-	chrX	2428611	-	chrX	13321232	10892621	+	chrX	13321232	+	chrX	2428611
ACTAAAATCTCAGAGGTAAAAGGTGAAGAACCAAAAATGAATGGAGGCTAGGCTAAGAGGGCGTGGCAGGGCAGG:1	ACTAAAATCTCAGAGGTAAAAG	TAAGAGGGCGTGGCAGGGCAGG	-	chr3L	1613055	-	chr3L	22397641	20784586	+	chr3L	22397641	+	chr3L	1613055
GGTTAGTGGTGCAAGGGTGTGGTGCGGATTGCCTNGATTCGAAGCGAGGATGGGGAAAGACAAATCTGATTTT:1	GGTTAGTGGTGCAAGGGTGTGG	GGGGAAAGACAAATCTGATTTT	+	chr2R	15944682	+	chr2R	7072744	8871938	+	chr2R	15944682	+	chr2R	7072744
AGAGTATTTAGTATGTGTTGTATGCAACATCGTTCATTCTGATTGATTCATACTAAAAGATGTTTCCCACACATT:1	AGAGTATTTAGTATGTGTTGTA	TAAAAGATGTTTCCCACACATT	+	chr3L	933942	+	chr3L	934045	103	+	chr3L	933942	+	chr3L	934045
ACGCACTTNTCCCTCCAGGGCTCGAAGTTCTTGACNTCGCTGATGGTGCGTGGGTTCTGCATCCACTGGATCAC:1	ACGCACTTNTCCCTCCAGGGCT	GGTTCTGCATCCACTGGATCAC	+	chr3L	19701502	+	chr3L	19690712	10790	+	chr3L	19701502	+	chr3L	19690712
AATGGACGACATCTTGGCAGNGCGAGATGGCANCAGCAGCTTNCGAAATTTGAACTTCCTAATGTTTTTTTTT:1	AATGGACGACATCTTGGCAGNG	GAACTTCCTAATGTTTTTTTTT	-	chrX	1240407	-	chrX	10729971	9489564	+	chrX	10729971	+	chrX	1240407
CGGATTAATAAAACAGCAGTTAGTTAGACTTAGGTCACAGTCAGCGGTCAACAGCNATGG:1	CGGATTAATAAAACAGCAGTTA	AGTCAGCGGTCAACAGCNATGG	-	chr3R	4610716	-	chr3R	4609567	1149	+	chr3R	4609567	+	chr3R	4610716
AATAAATACACCAATGCTCAAGATAATAGTAGTTTTCAAGCTTTTAGCACTGGATATACATATATACAAAAGTGT:1	AATAAATACACCAATGCTCAAG	ATATACATATATACAAAAGTGT	+	chr3L	2683963	+	chr3L	2684039	76	+	chr3L	2683963	+	chr3L	2684039
GCATTTGCGTGATATGAAAACAAAACACTTACCCGATATGAATAAAAACCTGAATCTTGTTTTACTAATTAAAAT:1	GCATTTGCGTGATATGAAAACA	ATCTTGTTTTACTAATTAAAAT	-	chr2R	7868717	-	chr2R	7868636	81	+	chr2R	7868636	+	chr2R	7868717
GTGTGACAATTAAAATAGGTNTACGAGATGGTNCATGGCGACNAGAGGCAGAATCTTTATTAGCATACGGCATA:1	GTGTGACAATTAAAATAGGTNT	ATCTTTATTAGCATACGGCATA	-	chr3R	21998147	-	chr3R	11551001	10447146	+	chr3R	11551001	+	chr3R	21998147
TTTGTATGCATTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCGTCG:1	TTTGTATGCATTTTTGTCTACC	CACCTTCATTTTCGCTGCGTCG	+	chr3L	2534625	+	chr3L	2534708	83	+	chr3L	2534625	+	chr3L	2534708
ATCCGAAATATCTCAAGCAAATTAACGTGATGAGAAAATCATCGACGCCATATCATGCCTGGAAAACGACACTTG:1	ATCCGAAATATCTCAAGCAAAT	CATGCCTGGAAAACGACACTTG	+	chr2R	3914992	+	chr2R	3291929	623063	+	chr2R	3914992	+	chr2R	3291929
CAAACATTCTGTTTTCAAATCAAAAGCATAATACATCATTTAACAAATCACTACCATACAAAATTAATCTAGTCA:1	CAAACATTCTGTTTTCAAATCA	CCATACAAAATTAATCTAGTCA	-	chr3L	17692074	-	chr3L	17691991	83	+	chr3L	17691991	+	chr3L	17692074
GGTGGTTCGTATTCGAGGGGACAGCTGGCAGCTATGAGACGTGTTGAACAAAGGCAAGAAGAAACTGAAAT:1	GGTGGTTCGTATTCGAGGGGAC	AAAGGCAAGAAGAAACTGAAAT	+	chr2L	15194312	+	chr2L	16263927	1069615	+	chr2L	15194312	+	chr2L	16263927
GTTAATTGTTTTCCTTCTCTCTTTTATTTTGATTATAACACTTTTTGTGTGCAGAGTTCCTGTCCATCTGTCTGT:1	GTTAATTGTTTTCCTTCTCTCT	GAGTTCCTGTCCATCTGTCTGT	+	chr3R	24572328	+	chr3R	13511227	11061101	+	chr3R	24572328	+	chr3R	13511227
AAATATTTGGCATACTACGATATATCAACGCACCCATCACGCACTTCATATACAACATAGTTGCA:1	AAATATTTGGCATACTACGATA	CTTCATATACAACATAGTTGCA	+	chr2L	19560033	+	chr2L	19560275	242	+	chr2L	19560033	+	chr2L	19560275
TATAGTTTGTGAGACTGCAAAACGTGTGGAAAAGACTGGATTTAAGGATGTGCAGAACTAACTCTTATCCTCCG:1	TATAGTTTGTGAGACTGCAAAA	CAGAACTAACTCTTATCCTCCG	-	chr3R	29386721	-	chr3R	29386640	81	+	chr3R	29386640	+	chr3R	29386721
AGCTTGGGCGAGAGATGGAAAATATGAGTTAACACCTACAAAAAATGATAAAGCTAAATGGGAATTGGATGATTT:1	AGCTTGGGCGAGAGATGGAAAA	CTAAATGGGAATTGGATGATTT	-	chrX	4324476	-	chrX	4324399	77	+	chrX	4324399	+	chrX	4324476
AGACAACTCTTCGGAGTTGTCAAAAATACCAAGCCACGAAATAAAGAATTGCAGTCTCGGTGTCTGCCCATGGAC:1	AGACAACTCTTCGGAGTTGTCA	GTCTCGGTGTCTGCCCATGGAC	-	chr2L	632816	-	chr2L	632736	80	+	chr2L	632736	+	chr2L	632816
ATATAATTTAACAGTGATAATCTGGAATTGAAGCAATACAATAAAAANAAAGGGATGAACAATTATANAGGAAAA:1	ATATAATTTAACAGTGATAATC	GATGAACAATTATANAGGAAAA	-	chr3L	7503541	-	chr3L	7498764	4777	+	chr3L	7498764	+	chr3L	7503541
TTCAAATGAGCATTGTAAGCAATACTATAGTTTTGAGTTGATTAAGTTCTGGAAGTTGGTTTTTTAGAACTGT:1	TTCAAATGAGCATTGTAAGCAA	GAAGTTGGTTTTTTAGAACTGT	+	chr3R	29079391	+	chr3R	29080761	1370	+	chr3R	29079391	+	chr3R	29080761
TTTCCCTGCGCTAGACCATGGCGACCACTGCTTTCCACCGTTTTTGCT:1	TTTCCCTGCGCTAGACCATGGC	ACTGCTTTCCACCGTTTTTGCT	+	chr2L	19620132	+	chr2L	19621094	962	+	chr2L	19620132	+	chr2L	19621094
CGGAATCCGCGAGCTCCTCCATCGGATGCGGATGCGTCCTTTTGCTAATAATGCCAGTGTGTTCGTGTGTTT:1	CGGAATCCGCGAGCTCCTCCAT	ATGCCAGTGTGTTCGTGTGTTT	-	chr3L	9514519	-	chr3L	14882840	5368321	+	chr3L	14882840	+	chr3L	9514519
GACTCCATTCCGTTGGCCAGCCAGTCAAAGGAACAACTTCCACAAGTGGGGTCGAGGTTGGCCATATTGTAGTCA:1	GACTCCATTCCGTTGGCCAGCC	GAGGTTGGCCATATTGTAGTCA	+	chr2L	10633363	+	chr2L	10633450	87	+	chr2L	10633363	+	chr2L	10633450
TCACGCAGTGGGCAGCGGTCAGCACATAGCGACTGTTGATCAGTGAGCCCGCACAA:1	TCACGCAGTGGGCAGCGGTCAG	GTTGATCAGTGAGCCCGCACAA	-	chr3R	23685191	-	chr3R	23684724	467	+	chr3R	23684724	+	chr3R	23685191
TTNCATACTTTGCGGATCAGTCATAAAAAACGACNTNTAATACTTGTAATAAAATGCCTTGTTTATTCGCAAAAA:1	TTNCATACTTTGCGGATCAGTC	ATGCCTTGTTTATTCGCAAAAA	+	chr3R	20506597	+	chr3R	20507400	803	+	chr3R	20506597	+	chr3R	20507400
CATGTTTTTCCCTGATAACTTTGCGAATGAGTGTGCTCGTTAGGACAGCGACGGAGGACAGGA:1	CATGTTTTTCCCTGATAACTTT	AGGACAGCGACGGAGGACAGGA	+	chr2R	10080589	+	chr2R	18477674	8397085	+	chr2R	10080589	+	chr2R	18477674
AACTTGTATCCATAATGCCCTTTTCTGCGAAAGTGTATCTCTTCCGCCTTGAGAAAATAATTAAGTTGGTTTTCT:1	AACTTGTATCCATAATGCCCTT	AAAATAATTAAGTTGGTTTTCT	-	chr3R	29032108	-	chr3R	15691121	13340987	+	chr3R	15691121	+	chr3R	29032108
TAATGAAATCAAGCATTCTCATTTAAAATATTCTGCCAAACTCCATTAATATGCTGATCCTCTTCCCATTCAAAA:1	TAATGAAATCAAGCATTCTCAT	CTGATCCTCTTCCCATTCAAAA	-	chr2R	13790409	-	chr2R	13790333	76	+	chr2R	13790333	+	chr2R	13790409
GATTGTCCAGTAATCTATACGGCACCGTGTTTGCTCCTCTTCTCCGTAGATACGAAAACACAACTGCCTTGCATT:1	GATTGTCCAGTAATCTATACGG	GAAAACACAACTGCCTTGCATT	-	chr3L	2812439	-	chr3L	2812357	82	+	chr3L	2812357	+	chr3L	2812439
GAGCGAAGGAAAAGCGGGAAAATCCGCCGGAGGGAGAGAGCCGAAGANCCGGAGAGCGGGGTCTTGTNCCTTAAA:1	GAGCGAAGGAAAAGCGGGAAAA	GAGCGGGGTCTTGTNCCTTAAA	+	chr2R	12797834	+	chr2R	21969830	9171996	+	chr2R	12797834	+	chr2R	21969830
GTCGGGTAGTGCGAAATGGGGTAATCCCTCGCTGCTGGTGCGAATCACATTG:1	GTCGGGTAGTGCGAAATGGGGT	GCTGCTGGTGCGAATCACATTG	-	chr2R	24765594	-	chr2R	24763641	1953	+	chr2R	24763641	+	chr2R	24765594
AGATTAATTATAAATTTCTTTGCATATATATATTTTTAGTTCTAGAACGAGACAAATTTAAAATTCTAAACCCCT:1	AGATTAATTATAAATTTCTTTG	AAATTTAAAATTCTAAACCCCT	-	chr3R	9036467	-	chr3R	9036389	78	+	chr3R	9036389	+	chr3R	9036467
GACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTACTTTTTATTATATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGA:1	GACTCTGATTTCAATGCACTTT	TTGTGATTTTATAAGGTACCGA	-	chr3L	17921196	-	chr3L	17918392	2804	+	chr3L	17918392	+	chr3L	17921196
AATCAGCATGCGNCCTAGATCTGAGAACTCGTTCCTCAGATCCGTTAGTC:1	AATCAGCATGCGNCCTAGATCT	TCGTTCCTCAGATCCGTTAGTC	-	chr3L	20343942	-	chr3L	20322055	21887	+	chr3L	20322055	+	chr3L	20343942
AGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTGAAAGGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCTGGTGCAAAAGGAATCGTT:1	AGAGTATACTATTCCTTAAAAA	GTCTGGTGCAAAAGGAATCGTT	-	chr2L	15957508	-	chr2L	15956041	1467	+	chr2L	15956041	+	chr2L	15957508
TCATTTCTAAGGATATTAAAGAGTNTCCCGGAAGCTACAGATNCTNGCCTTNGGTNGACATAATATCGGTAGGG:1	TCATTTCTAAGGATATTAAAGA	GGTNGACATAATATCGGTAGGG	+	chr2L	8799817	+	chr2L	8799932	115	+	chr2L	8799817	+	chr2L	8799932
TGGTTGATTTCGGAAGCAATATTGGCACCANNNTNAACAACCATGAAAGCGGGAAAAAGCAGTAGTACTCCATAG:1	TGGTTGATTTCGGAAGCAATAT	AAAAAGCAGTAGTACTCCATAG	+	chr3R	28571186	+	chr3R	28571280	94	+	chr3R	28571186	+	chr3R	28571280
CTGGGGAAAAGAGCAACATTAACGAGGATAATANCTAATAGTTGTCGG:1	CTGGGGAAAAGAGCAACATTAA	GATAATANCTAATAGTTGTCGG	+	chr3R	18634896	+	chr3R	7189777	11445119	+	chr3R	18634896	+	chr3R	7189777
AAATGTTCACTGATCAAACCTCTTCGGGCGGCACTTTTTTTTTGCGCTTATCTCCTCCTGCTGCCGCTTCTAATC:1	AAATGTTCACTGATCAAACCTC	CCTCCTGCTGCCGCTTCTAATC	+	chr3R	5155534	+	chr3R	5155640	106	+	chr3R	5155534	+	chr3R	5155640
GTAGACTCATCGGAAAATGTTTTTAAGATTTCGTCATACCCGCCTANTATATATAGTGACNTATTTGGGTGGTC:1	GTAGACTCATCGGAAAATGTTT	ATAGTGACNTATTTGGGTGGTC	+	chr2R	14884836	+	chr2R	1355079	13529757	+	chr2R	14884836	+	chr2R	1355079
TAGCAAACGCTGAAGCATACTGCACCCCATTCAGTCACCAGAGACTGCATCATCAGCAGATAGCGTGGAAAACAA:1	TAGCAAACGCTGAAGCATACTG	CAGCAGATAGCGTGGAAAACAA	-	chr2R	14955347	-	chr2R	14955197	150	+	chr2R	14955197	+	chr2R	14955347
TTTAGTGAACAGGATTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	TTTAGTGAACAGGATTTTGTGT	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	15176954	-	chr3R	21907534	6730580	+	chr3R	21907534	+	chr3R	15176954
AACATAATTAAACACAAAGCCCATATGCTATCTGTTCGAAAACGTATTTAATATATTTTTTTAAACACTTTTATC:1	AACATAATTAAACACAAAGCCC	TATTTTTTTAAACACTTTTATC	-	chr2R	21963282	-	chr2R	21963197	85	+	chr2R	21963197	+	chr2R	21963282
GAATTAATTTTAAATAATTCAAAAAAAAAACTTAT:1	GAATTAATTTTAAATAATTCAA	ATAATTCAAAAAAAAAACTTAT	+	chr2L	11731057	+	chr2L	21721964	9990907	+	chr2L	11731057	+	chr2L	21721964
AATGACAACCGGGAGGAATTGGGGGGAGGGGAGGCAAGGTTTGTGTACGTGCCTGAAATTATATCGCCTGCCTG:1	AATGACAACCGGGAGGAATTGG	CTGAAATTATATCGCCTGCCTG	-	chr2R	10190538	-	chr2R	10190457	81	+	chr2R	10190457	+	chr2R	10190538
CAAGAGCTTGCTCGCTTTCAATTAAATCCAGTAAAATGGGAAACAGCATTTTACATAAACCGACTGCTGATGTC:1	CAAGAGCTTGCTCGCTTTCAAT	ACATAAACCGACTGCTGATGTC	-	chr3R	10919785	-	chr3R	10919708	77	+	chr3R	10919708	+	chr3R	10919785
CAACAGTAAACAGTAAACAATTCGATTTGGTCAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCC:1	CAACAGTAAACAGTAAACAATT	GAGCAGCCCAGCAGGAAAGCCC	-	chr2L	18244348	-	chr2L	18243718	630	+	chr2L	18243718	+	chr2L	18244348
TTTAATCTACGAGGGCTTAAAAATTAGTTTAAGATCTGTTTGGGGCGTACTCTTCGCCATGTGCGGTGGTCACGT:1	TTTAATCTACGAGGGCTTAAAA	TCGCCATGTGCGGTGGTCACGT	+	chr3R	29854830	+	chr3R	29854910	80	+	chr3R	29854830	+	chr3R	29854910
AATCCTGAATGATATATAATTGACTGGGTTCCCTTAATCCCTCCCCCAANGCTTTACCATTTAAATGTTCAATC:1	AATCCTGAATGATATATAATTG	TTTACCATTTAAATGTTCAATC	+	chr2R	16518051	+	chr2R	16518126	75	+	chr2R	16518051	+	chr2R	16518126
GTTAATAAGCTCGGGAGCAGAATTTCTATTATTTCTTAATGTAAGTGAATGTTTTTTGACCAATTAAACATTA:1	GTTAATAAGCTCGGGAGCAGAA	TTTTTTGACCAATTAAACATTA	-	chr3L	15541723	-	chr3L	15541634	89	+	chr3L	15541634	+	chr3L	15541723
AGTATTGTGGCCACAGGTGTGCGCACGAGAATAGTCATCGCAATGGTGGCTCACAAGTGAAGCTTAATCCGGC:1	AGTATTGTGGCCACAGGTGTGC	CACAAGTGAAGCTTAATCCGGC	-	chrX	15417368	-	chrX	15413068	4300	+	chrX	15413068	+	chrX	15417368
TAGACTTNACAATTCACGCAACGGAAACGATAAACCGAGNCCCACAGATCCCGAGCANAGAGCAAGTATC:1	TAGACTTNACAATTCACGCAAC	TCCCGAGCANAGAGCAAGTATC	-	chrX	17680982	-	chrX	17680910	72	+	chrX	17680910	+	chrX	17680982
GTAAATAAAACATACAAAGTGCAAAAAAGGCATAAAAAGTGCATGACCAAGTAAATCACAAAGGAAAATAAAACT:1	GTAAATAAAACATACAAAGTGC	AATCACAAAGGAAAATAAAACT	-	chr3R	17079841	-	chr3R	29276275	12196434	+	chr3R	29276275	+	chr3R	17079841
TTCCCAGTGAACGTTCTTTTATATTTAATTNNNANTCAGAAGAATGTTCAAAGATGTTTTTCCCACTTGCATCGC:1	TTCCCAGTGAACGTTCTTTTAT	ATGTTTTTCCCACTTGCATCGC	-	chr2R	25159364	-	chr2R	25141674	17690	+	chr2R	25141674	+	chr2R	25159364
TAGGGTACCTTCTATCGACTACGCCCCGTGGCCATGTCACGCACTCCCACAC:1	TAGGGTACCTTCTATCGACTAC	GCCATGTCACGCACTCCCACAC	+	chr3L	15006044	+	chr3L	15006177	133	+	chr3L	15006044	+	chr3L	15006177
CCATGTGATGTTCTCAAAGGCAGGATCCGACTCCAGAGCAGATAAGCCAAGTCAAGAATAGCATTCTGCAGAGA:1	CCATGTGATGTTCTCAAAGGCA	CAAGAATAGCATTCTGCAGAGA	+	chr3L	219533	+	chr3L	5922690	5703157	+	chr3L	219533	+	chr3L	5922690
TCTGCTTTTTTATTTGTATTCACAATTTCCCTTATTATTCCGCGATATGAAAAATCATTTAATGATTAAAAAACA:1	TCTGCTTTTTTATTTGTATTCA	ATCATTTAATGATTAAAAAACA	-	chr3R	6121394	-	chr3R	6121176	218	+	chr3R	6121176	+	chr3R	6121394
TTTATACTTTCTGTCAGCGGCTTTGATTGCCAAAGGGCATTAAGTAGGATGGGTAGTTTTTCCGCCTAATTAGGA:1	TTTATACTTTCTGTCAGCGGCT	TAGTTTTTCCGCCTAATTAGGA	+	chr3R	20060640	+	chr3R	20060723	83	+	chr3R	20060640	+	chr3R	20060723
TAAGCAGTGCTAAGATAAAGAACGTGAATAGATTATAAATCATATAAAACCAAGAAACTGGTTCGCGTAAC:1	TAAGCAGTGCTAAGATAAAGAA	CCAAGAAACTGGTTCGCGTAAC	+	chr3L	1324631	+	chr3L	1324705	74	+	chr3L	1324631	+	chr3L	1324705
GCTATTCTTATTGCACTGGAAAAAAATATACATCCTTAAACTCATACTCATACAGACATATTACCTCTCCTATCC:1	GCTATTCTTATTGCACTGGAAA	AGACATATTACCTCTCCTATCC	-	chr2R	20434182	-	chr2R	20434103	79	+	chr2R	20434103	+	chr2R	20434182
ATCAATGGCACTTTTATTTTGACTTGCTTTCAAAGCTTCTGAGAAACTGTTTTTTATGTGCATGGCTGCTGCAG:1	ATCAATGGCACTTTTATTTTGA	TTTATGTGCATGGCTGCTGCAG	+	chr3L	12776178	+	chr3L	18236764	5460586	+	chr3L	12776178	+	chr3L	18236764
CCCAGAAAAGCTGAAAAGCCAATACGAAAAAGCANATGCTGCAGTAGTCTATCCTAAAGTAGGACCTCATGTTAA:1	CCCAGAAAAGCTGAAAAGCCAA	CTAAAGTAGGACCTCATGTTAA	+	chr3R	10211555	+	chr3R	19446176	9234621	+	chr3R	10211555	+	chr3R	19446176
CGACGTTTCTTTTCTTAGTCGGGTTAGAAAGTGTTGCTGTTTTATAGAAATTACTTTCACTCCTTTCANTTTACT:1	CGACGTTTCTTTTCTTAGTCGG	CTTTCACTCCTTTCANTTTACT	-	chr3L	13822844	-	chr3L	13804558	18286	+	chr3L	13804558	+	chr3L	13822844
ACCCCTATAACGACATCGTAAAATGAATGAAATGCAGCTATATATATATGAGTTGCCTCACATATTCTGTGACAT:1	ACCCCTATAACGACATCGTAAA	TGCCTCACATATTCTGTGACAT	-	chrX	22382680	-	chrX	22259781	122899	+	chrX	22259781	+	chrX	22382680
CATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTCCCTGTCTCATCAATTAATCT:1	CATTGCCCATTTGGGCTTCGGT	TCCCTGTCTCATCAATTAATCT	-	chr2L	14809083	-	chr2L	14803910	5173	+	chr2L	14803910	+	chr2L	14809083
TCTCAAATATGCATGCAAATAAGTGGCAGCCAAATCTGGTATCCAGCTAACAAGATGTCCCGAAAATTCGGCTC:1	TCTCAAATATGCATGCAAATAA	AGATGTCCCGAAAATTCGGCTC	-	chr2L	325227	-	chr2L	325151	76	+	chr2L	325151	+	chr2L	325227
CCCTCCCCNGTATTTCATTGGCCACTTTTTATGCATANNNNTGTTTTTTTTCTTATTTTGTNGGGCCTTCTGCGC:1	CCCTCCCCNGTATTTCATTGGC	TATTTTGTNGGGCCTTCTGCGC	+	chr2L	12532206	+	chr2L	18456305	5924099	+	chr2L	12532206	+	chr2L	18456305
ACAAGGATTACCTTAAGCGCGCCAAATTGTAGACTCACAGAACGANGCATTCACATTCGGANAAGTGCATTA:1	ACAAGGATTACCTTAAGCGCGC	TCACATTCGGANAAGTGCATTA	-	chr2L	6445129	-	chr2L	6426872	18257	+	chr2L	6426872	+	chr2L	6445129
TAAATTTATTTACTTTTCGTTGCACATATACATACGTGAAATGGAGAAAGCCAAAGTGATGTATGGCTAACTCTA:1	TAAATTTATTTACTTTTCGTTG	AAGTGATGTATGGCTAACTCTA	+	chr3R	7396088	+	chr3R	7396183	95	+	chr3R	7396088	+	chr3R	7396183
AAAATCCGTGACAGTTTAGTTTATGGCCCATAGCATGTGGGGGTAGGAAATGCGTTGCTCCAAATGCGAAGGCAG:1	AAAATCCGTGACAGTTTAGTTT	GTTGCTCCAAATGCGAAGGCAG	-	chr3R	20118295	-	chr3R	20118211	84	+	chr3R	20118211	+	chr3R	20118295
GTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT:1	GTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGT	TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT	-	chr3L	9313027	-	chr3L	11777678	2464651	+	chr3L	11777678	+	chr3L	9313027
ATATGCAATAAAATTTTTACAGGCCGCCATGAATTTGCTAAGGTGGAATNAAATTTATAGACCCTGCCGCAGCGC:1	ATATGCAATAAAATTTTTACAG	TTTATAGACCCTGCCGCAGCGC	+	chr2R	11019898	+	chr2R	11024964	5066	+	chr2R	11019898	+	chr2R	11024964
GTCAGTTGGTGCCCACACCACCTCCGCCCACGAAAAACTAACCGAAAGAGAAGGGGAAAAAATTGTCTGCAATTT:1	GTCAGTTGGTGCCCACACCACC	GGGAAAAAATTGTCTGCAATTT	-	chr3R	20939029	-	chr3R	10917258	10021771	+	chr3R	10917258	+	chr3R	20939029
TAAATCCTNTACTAACATATATTTGAAAAATGAAATGTGTCTACTCATTTCAAATTGTTTCACAGCGAAGCTCAA:1	TAAATCCTNTACTAACATATAT	ATTGTTTCACAGCGAAGCTCAA	-	chr3R	6656170	-	chr3R	6655851	319	+	chr3R	6655851	+	chr3R	6656170
GTAGGCAATAACAAATACGAATACAAACTCAGCAAAGTCCTGTCACCCTACCCTTGTACGGGTGGTTGTAA:1	GTAGGCAATAACAAATACGAAT	ACCCTTGTACGGGTGGTTGTAA	+	chr3L	21058682	+	chr3L	23286338	2227656	+	chr3L	21058682	+	chr3L	23286338
CTCAATCTNAATGCACTCTCAGCTGCTGCAACAAGNTATTTTTGTCCAAGTCATCGATTGAATGGCAGCTTTTG:1	CTCAATCTNAATGCACTCTCAG	ATCGATTGAATGGCAGCTTTTG	-	chr3L	3259720	-	chr3L	3259626	94	+	chr3L	3259626	+	chr3L	3259720
CTGCAAGAAAATAGCATCATTTTAGAGTGCATATGTGTGGAGAAAAATTTGTAAAATAGATGTATTTCAAATGT:1	CTGCAAGAAAATAGCATCATTT	AAAATAGATGTATTTCAAATGT	-	chr3L	16941527	-	chr3L	16941427	100	+	chr3L	16941427	+	chr3L	16941527
CAGTACCCTTCGGCCCCTTGCAGACAACAATTTCATGCACTAGCCGCATGCCAAAATGGGGCAGAATGTCTGGCG:1	CAGTACCCTTCGGCCCCTTGCA	AAATGGGGCAGAATGTCTGGCG	-	chr2R	21932324	-	chr2R	21932246	78	+	chr2R	21932246	+	chr2R	21932324
CCTTGGAAAATATCTTCTTGTTATATTTACGNACAGTTTTACTTTTGTTCGAAAAAATGTTTGCTTGTTGCATTT:1	CCTTGGAAAATATCTTCTTGTT	AAAATGTTTGCTTGTTGCATTT	+	chr3R	25522873	+	chr3R	7480150	18042723	+	chr3R	25522873	+	chr3R	7480150
GACTCCTTCGTTGTCAACTTAACAATGACATTCTGGATGCCTTGGTACATGTTCCACTTATCATCAAAGTATCCT:1	GACTCCTTCGTTGTCAACTTAA	CCACTTATCATCAAAGTATCCT	-	chr2R	12363849	-	chr2R	12363417	432	+	chr2R	12363417	+	chr2R	12363849
GAGGCAATTGAAAAAACACAGAAATAAAGCTATTATTAATTTAATATGTCCTTCTACACGAGTAAGACGGATGTG:1	GAGGCAATTGAAAAAACACAGA	CTACACGAGTAAGACGGATGTG	+	chr2L	10124217	+	chr2L	22250107	12125890	+	chr2L	10124217	+	chr2L	22250107
AATCAGTTACACTTTTTTTGTAATGGTTATTGNATTGCGGACTATATGGGGATATTTGTTATGGG:1	AATCAGTTACACTTTTTTTGTA	ATATGGGGATATTTGTTATGGG	-	chr3R	9875427	-	chr3R	9875357	70	+	chr3R	9875357	+	chr3R	9875427
AGAACAATGGGATGCTTCAAGTTGAAAACTACCCCGTCGATTGTCATGGGTAATAGTCGGGCGGG:1	AGAACAATGGGATGCTTCAAGT	TCATGGGTAATAGTCGGGCGGG	-	chr3R	5897335	-	chr3R	5896986	349	+	chr3R	5896986	+	chr3R	5897335
GAGCGAGGGAAAAGGACAAGGCTATGGAAAGTCGAATTTCTTTTGGCCATAGCAATTTACCAAATATGTAC:1	GAGCGAGGGAAAAGGACAAGGC	TAGCAATTTACCAAATATGTAC	+	chrX	19878342	+	chrX	10107727	9770615	+	chrX	19878342	+	chrX	10107727
TTTTAGCTAAAAAGCAAGTCCTGTTCGATTTAAAAATAATGTTTTCTCTATAATTCAAGCACTAACACCTTTCTA:1	TTTTAGCTAAAAAGCAAGTCCT	TTCAAGCACTAACACCTTTCTA	+	chr3L	18124427	+	chr3L	18124511	84	+	chr3L	18124427	+	chr3L	18124511
TTTCCCAGGAGAACAAGGTCGAAAAGCTGGTGCGGGTCTTCAACCTGGA:1	TTTCCCAGGAGAACAAGGTCGA	TGGTGCGGGTCTTCAACCTGGA	-	chr2R	8631199	-	chr2R	23545715	14914516	+	chr2R	23545715	+	chr2R	8631199
AAAATCCGTTTTTCCACATTTCTGTCATAAAATAATCATTTTTTTTT:1	AAAATCCGTTTTTCCACATTTC	CATAAAATAATCATTTTTTTTT	+	chr3L	26882296	+	chr3L	9327134	17555162	+	chr3L	26882296	+	chr3L	9327134
ATCCTTGACCAGGCGCAGCTCGTCTGCAATACACATGGAGAAATTGGGATTACAAAAAATATCGATCTTTTTAG:1	ATCCTTGACCAGGCGCAGCTCG	CAAAAAATATCGATCTTTTTAG	-	chr3L	9278388	-	chr3L	9270634	7754	+	chr3L	9270634	+	chr3L	9278388
AAAGCCGTTTTAAATCATAATGTAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACACAACA:1	AAAGCCGTTTTAAATCATAATG	ATGATGCTGAAATTACACAACA	+	chr2L	18925231	+	chr2L	18925326	95	+	chr2L	18925231	+	chr2L	18925326
ACTAAGGCCTAAAAAGAATGAAGCCCTGTGTACAGTTCTATATGTGCGGAATATGTTCCACTAATTTGCGGCCT:1	ACTAAGGCCTAAAAAGAATGAA	ATGTTCCACTAATTTGCGGCCT	+	chr2L	20976657	+	chr2L	20981471	4814	+	chr2L	20976657	+	chr2L	20981471
TTGCAAGCATTTTCAGATTTCAATGCTGTATATGCTGTGTGGCTAGAGTTATTTGTACAATTCTTTTTAATAAA:1	TTGCAAGCATTTTCAGATTTCA	TTGTACAATTCTTTTTAATAAA	-	chr2L	1836899	-	chr2L	1836792	107	+	chr2L	1836792	+	chr2L	1836899
TTTGCATAAATTTTTGCGAATTTACTCGCAAATTCTTTATGCAAATTCAAGTGCATTATTTG:1	TTTGCATAAATTTTTGCGAATT	GCAAATTCAAGTGCATTATTTG	+	chr3L	10308768	+	chr3L	10308832	64	+	chr3L	10308768	+	chr3L	10308832
ATTTAGATCCCTACTTTCATTAATCATTAACGACGACAACCCATGAGCTGACTCACAATGTGGGTTTAATAAGTT:1	ATTTAGATCCCTACTTTCATTA	CACAATGTGGGTTTAATAAGTT	-	chr2R	7064999	-	chr2R	7064923	76	+	chr2R	7064923	+	chr2R	7064999
TGTGATGCGCTGAGTGAGCATTGCTAACAATATAATGAAATAATATGATATATATATAATATGAAATATAATATA:1	TGTGATGCGCTGAGTGAGCATT	ATATAATATGAAATATAATATA	-	chr2L	19298979	-	chr2L	6798951	12500028	+	chr2L	6798951	+	chr2L	19298979
AAAAAAAAAAACAAATTGGTCAGGATATGCAAAAAAAAAAAGAATTGNTACAGATGTCCATNACGAGCAGCACAA:1	AAAAAAAAAAACAAATTGGTCA	ATGTCCATNACGAGCAGCACAA	-	chr3R	15171932	-	chr3R	7302593	7869339	+	chr3R	7302593	+	chr3R	15171932
GGTGGAGCGTCGAGTGGAGGAAAAGTTGCCACTGCATCCTCATCCTCATGACGAGCTTATCTTGGACACGTACTG:1	GGTGGAGCGTCGAGTGGAGGAA	AGCTTATCTTGGACACGTACTG	+	chr3L	5826150	+	chr3L	5826234	84	+	chr3L	5826150	+	chr3L	5826234
CTCCGTTGCAAATAAAAAGTCAACCAGCCACTGGGGGAGACAAATTGGCCGCATGGGGGAGGCATAGCCACAAT:1	CTCCGTTGCAAATAAAAAGTCA	ATGGGGGAGGCATAGCCACAAT	-	chr3R	30629474	-	chr3R	5037041	25592433	+	chr3R	5037041	+	chr3R	30629474
CTGCATACTTTTCGCGCCCAGTGTGTTTCGCAGCCGTAAGCCAGCAATTTGGCGCACAAGAGCGTTTCCCTTTCG:1	CTGCATACTTTTCGCGCCCAGT	GCACAAGAGCGTTTCCCTTTCG	-	chr3R	29412095	-	chr3R	29412016	79	+	chr3R	29412016	+	chr3R	29412095
CAATGATCGAAATTGCTGTCTTGATAATGTCAACTGTTCGAGTGTAACTAATAAGTTGCAGTATCAATCGCTGCG:1	CAATGATCGAAATTGCTGTCTT	AGTTGCAGTATCAATCGCTGCG	+	chr2L	19913072	+	chr2L	19913518	446	+	chr2L	19913072	+	chr2L	19913518
ATAAGATGGGGAAAACAAATGAGTTGCAGGGGGTCAAAGGTTAGTTTGTTTGTTTGTATTTGCTACTGCTG:1	ATAAGATGGGGAAAACAAATGA	TTGTTTGTATTTGCTACTGCTG	-	chr2R	6750714	-	chr2R	17258518	10507804	+	chr2R	17258518	+	chr2R	6750714
AAAAATAAAGAAATTCCTAACTTACATATAATTGTAATTTGTCATAATTGGCAAGCTGCCAGGTTTTAAGAC:1	AAAAATAAAGAAATTCCTAACT	GCAAGCTGCCAGGTTTTAAGAC	-	chr3R	21226545	-	chr3R	24359618	3133073	+	chr3R	24359618	+	chr3R	21226545
AAACAAAAAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAAAAAAATGTCGAAGGAAACTTAAATTGTTAA:1	AAACAAAAAGCTCTACAGTCAT	CGAAGGAAACTTAAATTGTTAA	+	chr2L	9393521	+	chr2L	9396485	2964	+	chr2L	9393521	+	chr2L	9396485
CATCAGTCGCGTCTGCGCCGTTCTNCGTCGGACATCGGATTACGGATAATAATAAGAGCCCATCGGAAATGGCAA:1	CATCAGTCGCGTCTGCGCCGTT	AAGAGCCCATCGGAAATGGCAA	-	chr3R	12392996	-	chr3R	12392896	100	+	chr3R	12392896	+	chr3R	12392996
TTTTCAATAGGTTTTTAAAAATTTAAACTTGTTAATAGAACAAACGTTATTTTCCGGAATGCTGTAAGAGTTT:1	TTTTCAATAGGTTTTTAAAAAT	TTCCGGAATGCTGTAAGAGTTT	-	chr3L	13897540	-	chr3L	13897396	144	+	chr3L	13897396	+	chr3L	13897540
AGCGGGTTCCTTCCGCAACAGTAGGGCTCCTGCGGAACAGCGACAGGTACTGGCATGGTTATGAGTAAAGGTA:1	AGCGGGTTCCTTCCGCAACAGT	GGCATGGTTATGAGTAAAGGTA	+	chrX	2399868	+	chrX	2408219	8351	+	chrX	2399868	+	chrX	2408219
AGTTCTAATAGTTGACCAGCTTAACTGCTTGACTAGCTTAAAATTGTTTTCATATATCTCAAAGTCCCTCTAGTA:1	AGTTCTAATAGTTGACCAGCTT	ATATCTCAAAGTCCCTCTAGTA	+	chr2R	6168206	+	chr2R	6168288	82	+	chr2R	6168206	+	chr2R	6168288
GTCGTAAGTCCATATAAAATCACAAGTATTTTCATCATTTACAATTGCTTCAAAGCCACACTTAACCCCCACTAA:1	GTCGTAAGTCCATATAAAATCA	AGCCACACTTAACCCCCACTAA	+	chrX	18457903	+	chrX	2748456	15709447	+	chrX	18457903	+	chrX	2748456
AGATTAGGAACTCTACAAATAAACATTGAGTTCTAAACTTACGTCAACTTTAAAGCATCTGACAGCAACTCAAAT:1	AGATTAGGAACTCTACAAATAA	AGCATCTGACAGCAACTCAAAT	-	chr2R	5491886	-	chr2R	5491745	141	+	chr2R	5491745	+	chr2R	5491886
CAACACAACACAACACAACACAACAATCATTACATACATTTGCCTTTTTATATG:1	CAACACAACACAACACAACACA	CATACATTTGCCTTTTTATATG	-	chr2L	16217660	-	chr2L	22695112	6477452	+	chr2L	22695112	+	chr2L	16217660
AATTTTATTAGATAACTTCTGTTTTTTTTTTAAGCTAAACTTTAATAATTTTCCAACTTGCAAGCAGATTATTT:1	AATTTTATTAGATAACTTCTGT	CCAACTTGCAAGCAGATTATTT	+	chr3L	13740054	+	chr3L	13740145	91	+	chr3L	13740054	+	chr3L	13740145
TTTAATCCATATGATCTTTTGTATATGTCTTCTGCTAGATACAAGTAGCATTTGAAACCATCGTTTCCCATTAAA:1	TTTAATCCATATGATCTTTTGT	GAAACCATCGTTTCCCATTAAA	-	chr2L	6284088	-	chr2L	6283977	111	+	chr2L	6283977	+	chr2L	6284088
GATTGTCTTCGCCTCTCGTTTTTTTCAGTGGGCCAACGTGTTTTTAATATGATT:1	GATTGTCTTCGCCTCTCGTTTT	CCAACGTGTTTTTAATATGATT	-	chr2L	7470094	-	chr2L	11250776	3780682	+	chr2L	11250776	+	chr2L	7470094
CGCATTGAGAGATGTCATGGGGCTAATGTGAAATTCGTACCGACGCAAATTGCCATTGCTCGAGTGTAGAGTATA:1	CGCATTGAGAGATGTCATGGGG	CATTGCTCGAGTGTAGAGTATA	+	chr3L	9918892	+	chr3L	9918987	95	+	chr3L	9918892	+	chr3L	9918987
ACACAGAAAGCAACTTTAAATCGCCACCCAAGCTGACTCGCCGATAAGGCGATGGGTTATAAAAACTATTCGC:1	ACACAGAAAGCAACTTTAAATC	ATGGGTTATAAAAACTATTCGC	+	chr2R	21910408	+	chr2R	21910498	90	+	chr2R	21910408	+	chr2R	21910498
GCATTCATTCATAACTTTTGTTCCGGTTCCGGTNATGATTTGTGGTCCAAGTT:1	GCATTCATTCATAACTTTTGTT	GTNATGATTTGTGGTCCAAGTT	+	chrX	6100930	+	chrX	6101039	109	+	chrX	6100930	+	chrX	6101039
GTCCTTTCCCAAAATTCATTGCATATTTAGGGGCGCACTTCCATTGACTGCATAACTTTGGTTCACGCGTTTATT:1	GTCCTTTCCCAAAATTCATTGC	AACTTTGGTTCACGCGTTTATT	-	chr2R	9945653	-	chr2R	9945457	196	+	chr2R	9945457	+	chr2R	9945653
GTATGCATTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCGTCGTCG:1	GTATGCATTTTTGTCTACCCGA	CTTCATTTTCGCTGCGTCGTCG	+	chr3L	2534628	+	chr3L	2534711	83	+	chr3L	2534628	+	chr3L	2534711
AATGATGCAAAGTATTTTCTATTTGAGTGTTGAATCTCCGTTTTTTTTCTTTTTT:1	AATGATGCAAAGTATTTTCTAT	ATCTCCGTTTTTTTTCTTTTTT	+	chr2L	10854606	+	chr2L	7559956	3294650	+	chr2L	10854606	+	chr2L	7559956
CCGGCCTTGCCCTGTCGCCTGTCTGTCGCTATCCTTCGATGCATGCAGCACTTGTAGAAGCAG:1	CCGGCCTTGCCCTGTCGCCTGT	CATGCAGCACTTGTAGAAGCAG	-	chr3R	28421762	-	chr3R	28421686	76	+	chr3R	28421686	+	chr3R	28421762
GTATGACNATTATGTAGTATATATATACATATGCATACCTAGATAAGAAGCTCTNGCATAT:1	GTATGACNATTATGTAGTATAT	TAGATAAGAAGCTCTNGCATAT	-	chr3L	7380423	-	chr3L	7377332	3091	+	chr3L	7377332	+	chr3L	7380423
TCTAAAAACTTGTGAGTAAATCGAGCTAGAATCCATTCTTAATTGGAAACTGCTGATAATTTATTTTTTTTTTGC:1	TCTAAAAACTTGTGAGTAAATC	TGATAATTTATTTTTTTTTTGC	+	chr3R	15635778	+	chr3R	28484806	12849028	+	chr3R	15635778	+	chr3R	28484806
TCCGGACTAAGAGCAAAAATTAACCATNAANNTTTTTACTTAATTGTCCNANAGCACAATCTAATAAATATAAAG:1	TCCGGACTAAGAGCAAAAATTA	GCACAATCTAATAAATATAAAG	-	chr3R	25235808	-	chr3R	25235718	90	+	chr3R	25235718	+	chr3R	25235808
GTCCATTGCAGTTATGGTATGTGATAGTTCCACACGGGACNTTAAAACTCGAACTTATGCCGATGTC:1	GTCCATTGCAGTTATGGTATGT	AACTCGAACTTATGCCGATGTC	-	chr3R	20979567	-	chr3R	20979499	68	+	chr3R	20979499	+	chr3R	20979567
CGGCACATCTGTGGTCGAGAAACGAGCAGAGAGGAAGGGAGGAAACAAGGGGAAAAAGCCAAACAGGTAGTAGAA:1	CGGCACATCTGTGGTCGAGAAA	AAAAGCCAAACAGGTAGTAGAA	-	chr2L	6207879	-	chr2L	13773015	7565136	+	chr2L	13773015	+	chr2L	6207879
AAATAAATTTAATCATTTTTAAATAAATCGCAACCTCAAACAACATAAATTGATCAACATTTTCCCNTAACATTT:1	AAATAAATTTAATCATTTTTAA	TCAACATTTTCCCNTAACATTT	-	chr2L	18304091	-	chr2L	18304000	91	+	chr2L	18304000	+	chr2L	18304091
CATGACTCACATAGAAAATTACTGGGTCTGCAACAATAGAACGCACAAATATTGTCGTTCCAAAAAAATATTTAT:1	CATGACTCACATAGAAAATTAC	GTCGTTCCAAAAAAATATTTAT	-	chrX	12462419	-	chrX	3063440	9398979	+	chrX	3063440	+	chrX	12462419
GCAAACAAATCGACAGGAAAGACACGTATTACAGGCAGCACTAACTTACTTACTATATAGACTATCATTCATGTT:1	GCAAACAAATCGACAGGAAAGA	TATATAGACTATCATTCATGTT	+	chr2L	12487886	+	chr2L	12487967	81	+	chr2L	12487886	+	chr2L	12487967
AATGTGGCACGAGGGCAAAAGAAAAGGTAGTCCCCCTTTTGGTTTTGTTTTTTGTGCCATCGCTTG:1	AATGTGGCACGAGGGCAAAAGA	TTGTTTTTTGTGCCATCGCTTG	-	chr2R	12504231	-	chr2R	12504163	68	+	chr2R	12504163	+	chr2R	12504231
TACCTGACATTTGTTTTTGACCTATTAAAACTACCAGTGCGATACTAAGTATTGCATGGATGGTACAGAATATGC:1	TACCTGACATTTGTTTTTGACC	GCATGGATGGTACAGAATATGC	+	chr3R	14923740	+	chr3R	14923817	77	+	chr3R	14923740	+	chr3R	14923817
CCACCTGCCGTGATTTTAGCGATAGCCAAAACAATTAAATTCAAATGGCCAAAAAAGAGGTTTTACTTCCTCCCC:1	CCACCTGCCGTGATTTTAGCGA	AAAGAGGTTTTACTTCCTCCCC	-	chr3R	12366034	-	chr3R	5272913	7093121	+	chr3R	5272913	+	chr3R	12366034
AGTGGATTTTCGAAAGTGGAAAGCGACAAATGCGGTCAACAAAGAACGGGAAACCCTCGACGGACACAAAAGG:1	AGTGGATTTTCGAAAGTGGAAA	AACCCTCGACGGACACAAAAGG	-	chr3L	19124506	-	chr3L	19117061	7445	+	chr3L	19117061	+	chr3L	19124506
GCTGCCTGCCCTTTTGCCANTGAGTTCAACTNATAAACGCGNTAAACGGCGTCTTGGACTTTCTTGGGCATTCT:1	GCTGCCTGCCCTTTTGCCANTG	CTTGGACTTTCTTGGGCATTCT	-	chr2L	10499663	-	chr2L	10499565	98	+	chr2L	10499565	+	chr2L	10499663
ATACATACACATGTACACACACACACACGCACACACATAGGAACACAAATTCACGCATG:1	ATACATACACATGTACACACAC	TAGGAACACAAATTCACGCATG	+	chrX	11687892	+	chrX	13964136	2276244	+	chrX	11687892	+	chrX	13964136
TGGTTTATTTCTTTCTGTGNGACATTGCATCTCAATTTATAATCTGCACTATATCTGCGCGTTAGATTCGCAAAT:1	TGGTTTATTTCTTTCTGTGNGA	TCTGCGCGTTAGATTCGCAAAT	-	chr2L	17637274	-	chr2L	17637189	85	+	chr2L	17637189	+	chr2L	17637274
TGATCCTGATGTACGTCCTTTTACCATCATAACCTCTTATTAACGATGCCTTCTATTAACTAGTTGATATGCTT:1	TGATCCTGATGTACGTCCTTTT	CTATTAACTAGTTGATATGCTT	+	chr3L	22522723	+	chr3L	22522799	76	+	chr3L	22522723	+	chr3L	22522799
GTCATATCGACCGCACACAACCTGCAAGACACGGACAACTAACACACACACATATCAAATTTCAATATGCTAATA:1	GTCATATCGACCGCACACAACC	ATCAAATTTCAATATGCTAATA	-	chr2L	4309977	-	chr2L	20604159	16294182	+	chr2L	20604159	+	chr2L	4309977
GACCGCAAGTGTAAGAAACAAGTCACGCACTTTTCCTGGCTTGCTCTCTTTTCCCANTTC:1	GACCGCAAGTGTAAGAAACAAG	GCTTGCTCTCTTTTCCCANTTC	+	chr3R	5573178	+	chr3R	5573248	70	+	chr3R	5573178	+	chr3R	5573248
ACAGTCCTCGCAAAACGATTAGTATGAAACTATTTCAACTGGTTNATCTGCGTGTTTAATGATTAATGATT:1	ACAGTCCTCGCAAAACGATTAG	GCGTGTTTAATGATTAATGATT	-	chrX	3619720	-	chrX	3597556	22164	+	chrX	3597556	+	chrX	3619720
TCTCTATGCTGCAAGAGGTGATTTAAACACCTCNCCAATGTCTTTATTTTCGATCTANTTTAGTT:1	TCTCTATGCTGCAAGAGGTGAT	TTATTTTCGATCTANTTTAGTT	+	chr3R	18331799	+	chr3R	18333283	1484	+	chr3R	18331799	+	chr3R	18333283
CGCTACAAGCAATGGTACGTACGTCTGTGCGATGCAACTGAGGGAGAATTTTGCGGGTGTGTGCGAGTGCGACAA:1	CGCTACAAGCAATGGTACGTAC	CGGGTGTGTGCGAGTGCGACAA	-	chr2R	6501076	-	chr2R	6500981	95	+	chr2R	6500981	+	chr2R	6501076
GGCGGAATTTAACCCGTGTGCCAGTAGTTCAGATTACTGGCAATTTATAATATAGAAATTTGTTCAAACAAGTGC:1	GGCGGAATTTAACCCGTGTGCC	AGAAATTTGTTCAAACAAGTGC	-	chr3L	7508776	-	chr3L	7508692	84	+	chr3L	7508692	+	chr3L	7508776
GTACAAACACAGATCTTAAGCCAGATAAACTACTACTAACAGTAGCCATGCGATATGACCAATAATTGATAATGT:1	GTACAAACACAGATCTTAAGCC	TATGACCAATAATTGATAATGT	+	chr3R	29256274	+	chr3R	29256354	80	+	chr3R	29256274	+	chr3R	29256354
ATTCAGCATCGATTGTGCAGAATATACACTGCNCGTCATCAGATTAGCGCCCCCAAATGCAGTTTTGAATTTAAT:1	ATTCAGCATCGATTGTGCAGAA	CAAATGCAGTTTTGAATTTAAT	+	chr2L	21396602	+	chr2L	21396837	235	+	chr2L	21396602	+	chr2L	21396837
CGCTACAAGCAATGGTACNTACGTCTGTGCGATGCAACTGAGGNAGAATNTTGCGGGTGTGTGCGAGTGCGAAAA:1	CGCTACAAGCAATGGTACNTAC	CGGGTGTGTGCGAGTGCGAAAA	-	chr2R	6501076	-	chr2R	6500981	95	+	chr2R	6500981	+	chr2R	6501076
CTGTTTTCGTAATGGAATGTAATTTTATTTACTTACGCATTCAGTGTAAATAAAATCAGCTGCGAAATGAGTGGG:1	CTGTTTTCGTAATGGAATGTAA	AATCAGCTGCGAAATGAGTGGG	-	chr2L	16086895	-	chr2L	16086703	192	+	chr2L	16086703	+	chr2L	16086895
ACAAAGACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAAACACAAACACA:1	ACAAAGACAAACACAAACACAA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	10522357	-	chr2L	16071771	5549414	+	chr2L	16071771	+	chr2L	10522357
CGAGGGCAAAAGAAAAGGTAGTCCCCCTTTTGGTTTTGTTTTTTGTG:1	CGAGGGCAAAAGAAAAGGTAGT	CCTTTTGGTTTTGTTTTTTGTG	-	chr2R	12504222	-	chr2R	12504173	49	+	chr2R	12504173	+	chr2R	12504222
TATGAATTTTTAAGAGGACTTTCTTGGACTCCTGCTTCCTTTTCGCTTTGTCACGGCCTTGGGCTTGGAGCG:1	TATGAATTTTTAAGAGGACTTT	TCACGGCCTTGGGCTTGGAGCG	-	chrX	17011055	-	chrX	17010971	84	+	chrX	17010971	+	chrX	17011055
TGGTATAAACTAAGCATTGTATTTCGGGTATACTTAAGGTAACTGCCAACAGGACACTCACCTGGCGCCTCTCAT:1	TGGTATAAACTAAGCATTGTAT	ACACTCACCTGGCGCCTCTCAT	-	chr3R	4904879	-	chr3R	18214585	13309706	+	chr3R	18214585	+	chr3R	4904879
AATTAAACAGCAAGACGAAACAACTGCTGCTCCAAGTATTGAAATCGATGAAGAAGCCACCACAGTGGCT:1	AATTAAACAGCAAGACGAAACA	TGAAGAAGCCACCACAGTGGCT	+	chr3R	25018271	+	chr3R	25018343	72	+	chr3R	25018271	+	chr3R	25018343
AGAATATAACAACATGTAAGCAAAAGCTACTTAAATTAGGTGTATGATTTTTTTCACTACTTTGGTCCAGATCTT:1	AGAATATAACAACATGTAAGCA	TCACTACTTTGGTCCAGATCTT	+	chr3R	22797927	+	chr3R	22798023	96	+	chr3R	22797927	+	chr3R	22798023
AAGCTAATAAATGCTTTTAATTATGATTTAAACATTTCGGCACATCAATCCGCCCCGAGGAGACTCACGAATT:1	AAGCTAATAAATGCTTTTAATT	GCCCCGAGGAGACTCACGAATT	-	chr3R	31418289	-	chr3R	31413091	5198	+	chr3R	31413091	+	chr3R	31418289
ATTGATATCCTTTTGTATTGTATATGTTATCCAAGTACGCTTTAGTATTCATTTCGGTTAGAACTTTTTCGTTTT:1	ATTGATATCCTTTTGTATTGTA	TCGGTTAGAACTTTTTCGTTTT	-	chr3L	4209925	-	chr3L	4209847	78	+	chr3L	4209847	+	chr3L	4209925
AATCCTATGCAATCCTATGTAAAGTGTAAACTAATTCCAACTAGNCTAACTAGATTTTATGCGCTTCG:1	AATCCTATGCAATCCTATGTAA	TAACTAGATTTTATGCGCTTCG	-	chr3L	22447300	-	chr3L	22447216	84	+	chr3L	22447216	+	chr3L	22447300
TTTTAAGCAGTTCGCGATTTGAATTTGGCGTCGTTCTCTTTTTGGTTTTCATTTCTTCCTTTTTTT:1	TTTTAAGCAGTTCGCGATTTGA	GTTTTCATTTCTTCCTTTTTTT	-	chr2R	17241719	-	chr2R	17236524	5195	+	chr2R	17236524	+	chr2R	17241719
AAATGCCATTAGATTCGTTTNAACTTGATATANTAAAAATACNAAATACGAAATAATCATGTAATAAGAACCACT:1	AAATGCCATTAGATTCGTTTNA	TAATCATGTAATAAGAACCACT	+	chrX	3842343	+	chrX	3842584	241	+	chrX	3842343	+	chrX	3842584
AGAAACTCCTGGTAAGTAANGAATTTAAAATATAATTTAAATATGATATTCAATGCGCGAAAAAACATACTAAAT:1	AGAAACTCCTGGTAAGTAANGA	TGCGCGAAAAAACATACTAAAT	+	chr2R	7434921	+	chr2R	7439222	4301	+	chr2R	7434921	+	chr2R	7439222
CAAATTACTCGAAATTAAACGATTACGCCAAATAAATAAAATAACATTTCGATTCGAATGTGAATTAAGAGAACC:1	CAAATTACTCGAAATTAAACGA	TCGAATGTGAATTAAGAGAACC	+	chr3R	13835624	+	chr3R	13835716	92	+	chr3R	13835624	+	chr3R	13835716
TGGGTCATTGCACTTTAAGCAACATGTGAAACAAATGTTCGGTGCTAATTACAGTGGTTTCTAAGGGGAAACTAG:1	TGGGTCATTGCACTTTAAGCAA	GTGGTTTCTAAGGGGAAACTAG	+	chrX	13110407	+	chrX	13110493	86	+	chrX	13110407	+	chrX	13110493
ACTCATTTAAGCCATCATTTAGTAAAAGTAAATTTATCAGCGGCCAANCCAATTAAAGTTTTTACCA:1	ACTCATTTAAGCCATCATTTAG	AANCCAATTAAAGTTTTTACCA	+	chr3L	5225592	+	chr3L	5225915	323	+	chr3L	5225592	+	chr3L	5225915
GGTCAGCGGCGGAGCTCGAGGGGATTGGGTTTGCATAATATTTACAATTAAATGAATAATGAAATACTTAGTTTT:1	GGTCAGCGGCGGAGCTCGAGGG	GAATAATGAAATACTTAGTTTT	-	chr2R	20337307	-	chr2R	20337218	89	+	chr2R	20337218	+	chr2R	20337307
CTTCTATATATGCGAATTCATTTTATGCTTTGCAGCGTACGTTTGGGNACATCCATAAGTTNTGCAAGCGCAATC:1	CTTCTATATATGCGAATTCATT	CATAAGTTNTGCAAGCGCAATC	-	chr2R	4077362	-	chr2R	4054665	22697	+	chr2R	4054665	+	chr2R	4077362
GTTTTTCGCCGATCTTTTNGAAAAAGAGAAATGGTTCCCCCAANTGGCTNGAACTGTGCACCTTTACTTTCGAAC:1	GTTTTTCGCCGATCTTTTNGAA	CTGTGCACCTTTACTTTCGAAC	+	chrX	11839053	+	chrX	11839301	248	+	chrX	11839053	+	chrX	11839301
TGTAAAATGTGTCACGGCATCTAGTCGCGCATAGAATTGGCGAATATTTTATGTTAAAGAGGCG:1	TGTAAAATGTGTCACGGCATCT	AATATTTTATGTTAAAGAGGCG	-	chr2L	19871644	-	chr2L	19871568	76	+	chr2L	19871568	+	chr2L	19871644
ATGGGATGAAGGCAACCACACAACGCATTACACACACACACACATGTCCACGCAATGCAATGTGTGTACTGATAA:1	ATGGGATGAAGGCAACCACACA	AATGCAATGTGTGTACTGATAA	-	chrX	10803125	-	chrX	10803040	85	+	chrX	10803040	+	chrX	10803125
GTACCGTATAGCACATTGTCCAANATTTGTTCACGTGGACCGAGATTCGCGGGAAGTATCAACAAGTGAACGGGT:1	GTACCGTATAGCACATTGTCCA	AAGTATCAACAAGTGAACGGGT	+	chr3R	4429265	+	chr3R	20538377	16109112	+	chr3R	4429265	+	chr3R	20538377
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGT:2	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	GTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13104420	8803114	+	chr3R	13104420	+	chr3R	21907534
TCACAAATCATGGAACTCGAGCATTAAAGAGCCTGTTTGGTGACTTGAAGCTGATAGCAAATAGAGCTTCGTGAT:1	TCACAAATCATGGAACTCGAGC	ATAGCAAATAGAGCTTCGTGAT	+	chr2R	6247829	+	chr2R	6247907	78	+	chr2R	6247829	+	chr2R	6247907
GCTTTGTGGTGGGAAAGAGAGGGAAGAGAAGCTGCAATCAGCCTTAANGATTACACTTAGAAAATTGTTATAATC:1	GCTTTGTGGTGGGAAAGAGAGG	CACTTAGAAAATTGTTATAATC	+	chr2R	17395318	+	chr2R	17395396	78	+	chr2R	17395318	+	chr2R	17395396
TAGCTTTTAGGAATATTTTTCATTGGTTGCAGAGTAGTGAAAGATATCAATTAAAAATAATTTGGAAACCAGTTT:1	TAGCTTTTAGGAATATTTTTCA	AAAATAATTTGGAAACCAGTTT	-	chr2L	9892597	-	chr2L	9892521	76	+	chr2L	9892521	+	chr2L	9892597
GACTATCTATTGCATAATCCCTAGAACCGTACGAGGTAATCTGCTCACTGGATGTTCCTCAGGTCGCACCTG:1	GACTATCTATTGCATAATCCCT	GATGTTCCTCAGGTCGCACCTG	-	chrX	2303440	-	chrX	2303346	94	+	chrX	2303346	+	chrX	2303440
CCACTGAGTTATTTAATTACTTTATCCCGACTTGGGCTAACGTGAGGTAAGGCCTGCATATACGCATGTTCCAGG:1	CCACTGAGTTATTTAATTACTT	CTGCATATACGCATGTTCCAGG	-	chr3R	6874171	-	chr3R	6873960	211	+	chr3R	6873960	+	chr3R	6874171
ACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTAACCAGCAAATAGATCTGTGCGAAAAGCTTTCGCACACACGGACAGTTTTC:1	ACAGTTTCTTGACAAACTGTAT	TTCGCACACACGGACAGTTTTC	+	chrX	15019100	+	chrX	19607913	4588813	+	chrX	15019100	+	chrX	19607913
GTGCATGAAATTGTTGTCTGCAAGGGGCCGAAGGGTACTGGCGCAATGGCATTATTACTGGAGTCTGAAACAACT:1	GTGCATGAAATTGTTGTCTGCA	ATTACTGGAGTCTGAAACAACT	+	chr2R	21932281	+	chr2R	21932359	78	+	chr2R	21932281	+	chr2R	21932359
AATTAGAATATCTATCTTTTAGTCGAACGACACAATATCACACGGTTCCATTGTATTTTTAGCAGTATAAATACA:1	AATTAGAATATCTATCTTTTAG	TATTTTTAGCAGTATAAATACA	+	chrX	18645031	+	chrX	18645129	98	+	chrX	18645031	+	chrX	18645129
AGGAAAAGGGTGCAGTTCCGCTTGATTTTGGACACTTTTGGCCAGCTCCACTTCTACTTCCACTCCGCTGGGG:1	AGGAAAAGGGTGCAGTTCCGCT	TTCTACTTCCACTCCGCTGGGG	-	chr3L	4491973	-	chr3L	4491891	82	+	chr3L	4491891	+	chr3L	4491973
AGAGCAAAAGGAACACAAGCAAAAGCCAAGCGCGTGTTTTAAATTTTACAAGTAATTGCAATCGTGGGACCT:1	AGAGCAAAAGGAACACAAGCAA	AGTAATTGCAATCGTGGGACCT	-	chrX	8516257	-	chrX	190595	8325662	+	chrX	190595	+	chrX	8516257
CTTGCCACCCCCTTTTCCACCCCCTTTCCCAACCAAT:1	CTTGCCACCCCCTTTTCCACCC	TCCACCCCCTTTCCCAACCAAT	-	chr2L	1663729	-	chr2L	16718620	15054891	+	chr2L	16718620	+	chr2L	1663729
CGATTGAATANCAAGTAATACAAATAAAAACAACAATTTACCATATAATAGTTATATTCCTAAAGAGTTAGATCC:1	CGATTGAATANCAAGTAATACA	ATATTCCTAAAGAGTTAGATCC	+	chr2L	10095661	+	chr2L	10095741	80	+	chr2L	10095661	+	chr2L	10095741
TGCTGCTGCTGCTGATGATGATGATGATACTGGCATATGTAGGCATTTCGGGTGTGTGTGCTTGCCTGTTTATTT:1	TGCTGCTGCTGCTGATGATGAT	GTGTGTGCTTGCCTGTTTATTT	+	chr3R	29286543	+	chr3R	30975858	1689315	+	chr3R	29286543	+	chr3R	30975858
GATCGATATTTTTTGTAATCCCAATTTCTCCATGTGTATTGCAGACGAGCTGCGCCTGGTCAA:1	GATCGATATTTTTTGTAATCCC	CAGACGAGCTGCGCCTGGTCAA	+	chr3L	9270641	+	chr3L	9278384	7743	+	chr3L	9270641	+	chr3L	9278384
TGGCATATATGCCCCATATGCTGCCCCAAGATCGGTTTTGCATTTATGCGGAGTGGAAATTCCCAGCGAGG:1	TGGCATATATGCCCCATATGCT	GGAGTGGAAATTCCCAGCGAGG	+	chrX	20331961	+	chrX	20332053	92	+	chrX	20331961	+	chrX	20332053
GTAATTGTTTTGTCTTTTGTGAGCACACCGGATATGCTCCAATTTTGTGTATGCATTTGGGTCTTGCATTCAT:1	GTAATTGTTTTGTCTTTTGTGA	TGCATTTGGGTCTTGCATTCAT	-	chr3R	17222011	-	chr3R	26824246	9602235	+	chr3R	26824246	+	chr3R	17222011
TCTATGCAAATTTCCGAATATAGACCATAAATTGGAGTCTAATTGGGACTAGAGTTCTTTCCCGTATTCTTTCAC:1	TCTATGCAAATTTCCGAATATA	GTTCTTTCCCGTATTCTTTCAC	-	chr3L	8214161	-	chr3L	1268340	6945821	+	chr3L	1268340	+	chr3L	8214161
TATCTTCTTTGTAAATGCCATTCGTGGTTTCTATGGTTTACCCCTCAGCAACTGCAGCATGCTAGATGTGGCATA:1	TATCTTCTTTGTAAATGCCATT	GCAGCATGCTAGATGTGGCATA	+	chr3L	21082235	+	chr3L	21082313	78	+	chr3L	21082235	+	chr3L	21082313
AAAACTTGGGGGCGTAGCAGGGTGCTTTTGCCTAAATGTGTTTTTCTTGGCTTTCCC:1	AAAACTTGGGGGCGTAGCAGGG	ATGTGTTTTTCTTGGCTTTCCC	+	chr3R	31279390	+	chr3R	31285563	6173	+	chr3R	31279390	+	chr3R	31285563
AACAACAACAACAAGCCCGAGATGCTCTTCGTGAAATACCGCACCAACCAAGATGCCCTCAACGCCC:1	AACAACAACAACAAGCCCGAGA	AACCAAGATGCCCTCAACGCCC	+	chr3R	26619877	+	chr3R	26634388	14511	+	chr3R	26619877	+	chr3R	26634388
TAAGTCTCATCTGGCGAGTTGGACATTGCCAAGGTAAGTGTTGCTTGCCAACTGCTTTGTACAAAC:1	TAAGTCTCATCTGGCGAGTTGG	TTGCCAACTGCTTTGTACAAAC	+	chr2R	9075913	+	chr2R	9076039	126	+	chr2R	9075913	+	chr2R	9076039
TGTGACCGTGTATAGAAGGCTTTGACGTGTNCGGCAACTCTGACGCCAAGCAAAACAAAAACAGTACAGCAAA:1	TGTGACCGTGTATAGAAGGCTT	AAAACAAAAACAGTACAGCAAA	-	chr2R	7916508	-	chr2R	7916425	83	+	chr2R	7916425	+	chr2R	7916508
GATATGGTAAGATACTTTGGATTGTTTGAGGTGCAGTTAAGTTCTCAGCTTTTGGTTTCGCNCAGTGTATTTCGA:1	GATATGGTAAGATACTTTGGAT	GGTTTCGCNCAGTGTATTTCGA	-	chrX	8085662	-	chrX	8085576	86	+	chrX	8085576	+	chrX	8085662
ATATGCCTTAAAATTAAATAGTTAGATATTTCCGAAATATATGTAAATATGTATTACAAGATGTTTATAGAATCA:1	ATATGCCTTAAAATTAAATAGT	TTACAAGATGTTTATAGAATCA	-	chr3L	12089161	-	chr3L	12089081	80	+	chr3L	12089081	+	chr3L	12089161
CAACTTAAAGTATTACTCTGAATTTGTTAGAACCATTAGATTGTTGAAATCTATGCAAATTGGCGCCATTCCGCA:1	CAACTTAAAGTATTACTCTGAA	TGCAAATTGGCGCCATTCCGCA	-	chr2L	4905208	-	chr2L	2821939	2083269	+	chr2L	2821939	+	chr2L	4905208
CTATTGTCTGGCGAAGGTGTTGAAATTCTGAAAAACAGATATTAAAATTCATCAATTACTTACTAT:1	CTATTGTCTGGCGAAGGTGTTG	AAATTCATCAATTACTTACTAT	+	chr3R	19248886	+	chr3R	19248957	71	+	chr3R	19248886	+	chr3R	19248957
TATGTAGTTCAGTTTTGAGCAGGCAATAAATAGGTATATAGGTATAATTTAGAAAGAATCTTTCGACGGCA:1	TATGTAGTTCAGTTTTGAGCAG	TAGAAAGAATCTTTCGACGGCA	-	chr2R	24848764	-	chr2R	24848684	80	+	chr2R	24848684	+	chr2R	24848764
GGTATGACAATGTTATGATAAGACCTAAGTGGGGGATTACATAAAGATTTTAAGGAAACAGCAATGNCTAGCAT:1	GGTATGACAATGTTATGATAAG	AGGAAACAGCAATGNCTAGCAT	-	chr2L	18254931	-	chr2L	18254832	99	+	chr2L	18254832	+	chr2L	18254931
CTGTCCTCGAGTTCTGAGACCCTCTTGTGAACTCTGATCTACGAACATTAATTTCATGGCAAATGTCATTAAAAA:1	CTGTCCTCGAGTTCTGAGACCC	TCATGGCAAATGTCATTAAAAA	-	chr2L	4166480	-	chr2L	4166397	83	+	chr2L	4166397	+	chr2L	4166480
CGACTCCTTTCACTTTTGTTCTCCGTGCTACAGGATGCTCCACATCGAAGGACCTAGGTGTCAACACGNAGACA:1	CGACTCCTTTCACTTTTGTTCT	CCTAGGTGTCAACACGNAGACA	+	chrX	20105301	+	chrX	20105197	104	+	chrX	20105301	+	chrX	20105197
GCAACTTTTACAAGTCGCCGCCTTAAAACTTCAGTTATAACGCTGTAAAAATTGTTAGATACACAACATTGTTT:1	GCAACTTTTACAAGTCGCCGCC	TGTTAGATACACAACATTGTTT	+	chr2L	12176242	+	chr2L	12176322	80	+	chr2L	12176242	+	chr2L	12176322
ACTCATATTATTTAGTCGAACGTAATCATTTTGATATCCAAGCCTCAACGTATAGTTTTTCCA:1	ACTCATATTATTTAGTCGAACG	GCCTCAACGTATAGTTTTTCCA	-	chrX	19125826	-	chrX	19125709	117	+	chrX	19125709	+	chrX	19125826
TTAAAGAAGTTATGCGATCAAAATNTTTTTGTGTTATTCTTTNTTNAGGAANGAANGCCGACTTCTCTGATGGGG:1	TTAAAGAAGTTATGCGATCAAA	AANGCCGACTTCTCTGATGGGG	+	chr2R	8455879	+	chr2R	8454936	943	+	chr2R	8455879	+	chr2R	8454936
AAGTTTAAAAATTTATCAATTGGATTTGCGAACTGCTTTGTCATAAGTTCTCTAACCTTTGGCACTCGCAACTT:1	AAGTTTAAAAATTTATCAATTG	TAACCTTTGGCACTCGCAACTT	-	chr2L	14890406	-	chr2L	14889982	424	+	chr2L	14889982	+	chr2L	14890406
GACTGGTTTCTCCTTTAGCCTTGCACTTAAAAAAACATCTATGTATATTGTTCATAACTGGGGAGTTCTCTTCT:1	GACTGGTTTCTCCTTTAGCCTT	CATAACTGGGGAGTTCTCTTCT	-	chr2L	3582983	-	chr2L	3582907	76	+	chr2L	3582907	+	chr2L	3582983
CACAACAANGCCTCCGAAAGAGCGAATGTGTGAGGAGGAGAAAAAATTGGAGGGGAGGGCATGATAAAGCAGCTA:1	CACAACAANGCCTCCGAAAGAG	GGAGGGCATGATAAAGCAGCTA	-	chr2R	9950384	-	chr2R	9950307	77	+	chr2R	9950307	+	chr2R	9950384
AATAGTTTAATAATATGAGAATAATTTCAATTTAAAATACCATTTCGGCATAATGTGACCGGACATAGGGTTCAA:1	AATAGTTTAATAATATGAGAAT	TGTGACCGGACATAGGGTTCAA	-	chrX	20275877	-	chrX	20275381	496	+	chrX	20275381	+	chrX	20275877
AGGTGTTGTTAATTGCGGGTCTTGGATACGAAAGTAGTTTCCCCGTTTCATATATTCGAGCTTATCTATGGT:1	AGGTGTTGTTAATTGCGGGTCT	TATATTCGAGCTTATCTATGGT	-	chr3R	22843238	-	chr3R	22843165	73	+	chr3R	22843165	+	chr3R	22843238
GCGAACGGGGATTGGTACCTTAAGCTGACCCGCGACATCGACAGAATCTTGCAGTAAAGTTTCGCCTGCACAAA:1	GCGAACGGGGATTGGTACCTTA	AGTAAAGTTTCGCCTGCACAAA	-	chr2L	1823009	-	chr2L	10796280	8973271	+	chr2L	10796280	+	chr2L	1823009
GAATTTTTGTTCATCTGCTTGTGAACTTTTTAGCTTTTATTGTGTCGCTTGGCAATTTAATGAATTTTAATGAGA:1	GAATTTTTGTTCATCTGCTTGT	AATTTAATGAATTTTAATGAGA	-	chr3L	6042736	-	chr3L	6040380	2356	+	chr3L	6040380	+	chr3L	6042736
GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT:1	GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT	TGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGT	-	chr3R	21907536	-	chr3R	13693028	8214508	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907536
ATGGTATTTGACAAGTGGCAAGGACNTTGGCAGGACCCAGGGCAGCGGAACTTCAATTTCATTTGATGCAGAAAA:1	ATGGTATTTGACAAGTGGCAAG	CAATTTCATTTGATGCAGAAAA	+	chr2L	407490	+	chr2L	17936047	17528557	+	chr2L	407490	+	chr2L	17936047
AACATGTATAATTGCATATTGTCTATAAATGTATATTGTGCGTACTTTTAGGATTAACGGAAAGAACAACAATAT:1	AACATGTATAATTGCATATTGT	TTAACGGAAAGAACAACAATAT	+	chr2R	11297644	+	chr2R	11301965	4321	+	chr2R	11297644	+	chr2R	11301965
AGTTCCTTCACAGCCTCTTCATAGCATGGTGGCATAACGGATTAACTTTTTTTTGGTGCCTCACGTTTTTATA:1	AGTTCCTTCACAGCCTCTTCAT	TTTGGTGCCTCACGTTTTTATA	+	chr2R	16893795	+	chr2R	16893876	81	+	chr2R	16893795	+	chr2R	16893876
ACAACAGGCTACACAAAATTGAACAAGTTGAAGAGAAGAAAAAGAGTTGCTCCTTCCCGACTGTAAAATTTTCTG:1	ACAACAGGCTACACAAAATTGA	TTCCCGACTGTAAAATTTTCTG	-	chr3L	2411423	-	chr3L	2411343	80	+	chr3L	2411343	+	chr3L	2411423
AAAGCCCAAACGCCGGAAACAAGAAAAATACGAACCAACAATTCGCCGTGAAAAATTCAATTACAAAGTCGCACC:1	AAAGCCCAAACGCCGGAAACAA	AATTCAATTACAAAGTCGCACC	-	chr2R	17992196	-	chr2R	17992120	76	+	chr2R	17992120	+	chr2R	17992196
CGAGTGATATGGCTCAGTTCCCACCATGGGATTGCACGAAAAGCTGCNAAAGTTTCACCATNATCAACGGAGTCC:1	CGAGTGATATGGCTCAGTTCCC	TTCACCATNATCAACGGAGTCC	-	chr3R	5278168	-	chr3R	5278087	81	+	chr3R	5278087	+	chr3R	5278168
CATCCGCCATTATGGCCAAATGCAAACTTCAAGTACTTGGTCCTTAATCAGGTGTCCATATCCATTGCTTAGTGA:1	CATCCGCCATTATGGCCAAATG	GTCCATATCCATTGCTTAGTGA	+	chr2R	16095299	+	chr2R	16450338	355039	+	chr2R	16095299	+	chr2R	16450338
CTGTAAAACAGCATTACTAAATTTAAAATCTCCGGCAGTAATTTTTCTAGATTGCTCTCCCTGCCACAGACAT:1	CTGTAAAACAGCATTACTAAAT	TTGCTCTCCCTGCCACAGACAT	+	chr3L	11494979	+	chr3L	15024536	3529557	+	chr3L	11494979	+	chr3L	15024536
GAGCGCTGGCCAGGAAAGCCGTATTTACATACATCCCTCTTTGTGGAGATAAGAGCCAGAATTGTTGGTGAAAAC:1	GAGCGCTGGCCAGGAAAGCCGT	AGCCAGAATTGTTGGTGAAAAC	-	chr2L	6366085	-	chr2L	6363159	2926	+	chr2L	6363159	+	chr2L	6366085
ATACTCGCAATTTATTTCTTGTATAAATTGCGTTCACCATTTTTTCACCATACCAACAATGAAAAACGAAATTA:1	ATACTCGCAATTTATTTCTTGT	CCAACAATGAAAAACGAAATTA	+	chr2R	12844733	+	chr2R	12844823	90	+	chr2R	12844733	+	chr2R	12844823
TGGCATCGATACTATATAAACGACATTCCACAGCACTCGCAAAAATACCAACATACCCGAGTTAAATGAC:1	TGGCATCGATACTATATAAACG	CAACATACCCGAGTTAAATGAC	-	chr2L	18028562	-	chr2L	18028476	86	+	chr2L	18028476	+	chr2L	18028562
GTTCGTTCGTTAATAAAATTGAAATTGTCCAGAAAACACCTCCGAACTCGCCCGCAG:1	GTTCGTTCGTTAATAAAATTGA	ACACCTCCGAACTCGCCCGCAG	+	chr3R	24790011	+	chr3R	24790138	127	+	chr3R	24790011	+	chr3R	24790138
TAGAAAAACCTTGAATGAACGGGCAAATAAAACAGACGGTCTATGAAACGCATTTAACTTGCATTTTATTTTGT:1	TAGAAAAACCTTGAATGAACGG	TTTAACTTGCATTTTATTTTGT	-	chr2R	25061428	-	chr2R	25061346	82	+	chr2R	25061346	+	chr2R	25061428
CATAATAAGATGCACATATATACACAAACATATATACGTCGTATCTCCATCCGCGGGTAAGAGATAAATAACGTT:1	CATAATAAGATGCACATATATA	CGGGTAAGAGATAAATAACGTT	-	chr2R	25104928	-	chr2R	25104803	125	+	chr2R	25104803	+	chr2R	25104928
GCCTCCAACTCAAACGATGGCATCAAATTATGGGGCAAGTCAAATAAGGTTATCCACAAAATGCGAGGAATGCGA:1	GCCTCCAACTCAAACGATGGCA	CCACAAAATGCGAGGAATGCGA	+	chr3R	12568495	+	chr3R	12568575	80	+	chr3R	12568495	+	chr3R	12568575
AAGCAAAAATCTTTGATCTATTCTTCGTCAGCGCTGT:1	AAGCAAAAATCTTTGATCTATT	ATCTATTCTTCGTCAGCGCTGT	+	chrX	480167	+	chrX	482670	2503	+	chrX	480167	+	chrX	482670
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTAGTAGATGCAGCATTCGTAGGTCACATTA:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	GCAGCATTCGTAGGTCACATTA	-	chr3R	21907534	-	chr3R	18647905	3259629	+	chr3R	18647905	+	chr3R	21907534
TTTTTTAGTGCATGATTCATATTTATTTCTAATATGAGATGTGTAAACCTGTGAAATTACATAGTATTCTGGAG:1	TTTTTTAGTGCATGATTCATAT	GAAATTACATAGTATTCTGGAG	-	chr3R	8099724	-	chr3R	8094420	5304	+	chr3R	8094420	+	chr3R	8099724
AAAAATTTATCAATTGGATTTGCGAACTGCTTTGTCATAAGTTCTCTAACCTTTGGCACTCGCAACTT:1	AAAAATTTATCAATTGGATTTG	TAACCTTTGGCACTCGCAACTT	-	chr2L	14890400	-	chr2L	14889982	418	+	chr2L	14889982	+	chr2L	14890400
TACAGTAGCTATACAGCATAAACTTATTTCTAATTGTCTGCCAATTATTTGTATACTATTCTATATAGATATG:1	TACAGTAGCTATACAGCATAAA	TATACTATTCTATATAGATATG	+	chr3R	20995908	+	chr3R	30283205	9287297	+	chr3R	20995908	+	chr3R	30283205
CTCGAAAAAAAATGAGAAGCGGAGCGGAGCGAAGCATGTGGCCAAAAGGGAAAACATAAAGCCAAAGTAGAGAT:1	CTCGAAAAAAAATGAGAAGCGG	AACATAAAGCCAAAGTAGAGAT	+	chr3R	26039945	+	chr3R	9891045	16148900	+	chr3R	26039945	+	chr3R	9891045
CATTTTTCATTAAATTGCTTATTCTTTAAGTTTTGACTTCAGACA:1	CATTTTTCATTAAATTGCTTAT	CTTTAAGTTTTGACTTCAGACA	+	chr2R	4888291	+	chr2R	16919870	12031579	+	chr2R	4888291	+	chr2R	16919870
TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGCTTGTGCTTGTGCTTGTGCTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTG:1	TGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTG	CTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTG	-	chrX	7978935	-	chrX	4805476	3173459	+	chrX	4805476	+	chrX	7978935
ATTGGCATAAACAAGACGGACATCGTCTGGGGGNAATCGTTTTATCAGCCCAGC:1	ATTGGCATAAACAAGACGGACA	GNAATCGTTTTATCAGCCCAGC	+	chr3R	22450578	+	chr3R	22453197	2619	+	chr3R	22450578	+	chr3R	22453197
ATTGGAGGCATTATGTACACATATATGGATAGACTACTATGAAATATTATAGAGCACTGTATCTTGTTTAAAT:1	ATTGGAGGCATTATGTACACAT	GAGCACTGTATCTTGTTTAAAT	-	chr2L	11309123	-	chr2L	11309017	106	+	chr2L	11309017	+	chr2L	11309123
AGTTAAGTTCGAAGGTATAAGCACTTTTAAATGCTTTCCTTTTTTNCACCTTTTTCTAAAGCCTTTCATTTTG:1	AGTTAAGTTCGAAGGTATAAGC	TTTTCTAAAGCCTTTCATTTTG	-	chr2R	14109585	-	chr2R	14093436	16149	+	chr2R	14093436	+	chr2R	14109585
ATTAATATAAGCGAGCTAAATGGAAAGGGAAGGGAACGAAAGTTTCGAAGATATCCCTTTGAGCTCCGTTTAAA:1	ATTAATATAAGCGAGCTAAATG	ATCCCTTTGAGCTCCGTTTAAA	+	chr2R	23243355	+	chr2R	23243439	84	+	chr2R	23243355	+	chr2R	23243439
CGAGTTTGCATTGAACTTAAACAACAAGACCCACAACCAAGATCCAAGACTCCAAACTCTAGACTCCGCGAACTC:1	CGAGTTTGCATTGAACTTAAAC	AAACTCTAGACTCCGCGAACTC	-	chrX	19176291	-	chrX	19176207	84	+	chrX	19176207	+	chrX	19176291
ACCAGTTTAGGCAAGAGATAAAGTGCCTTACGNATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGG:1	ACCAGTTTAGGCAAGAGATAAA	AAGTCCGTCTGCAATGTACTGG	+	chr3R	19446812	+	chr3R	19449467	2655	+	chr3R	19446812	+	chr3R	19449467
CGCCATCGCCATTCACACAACTATTCGCAGTTAAGCCGTCCAAGGCCATCTGCATTTCAAATGACCAACGCAACA:1	CGCCATCGCCATTCACACAACT	ATTTCAAATGACCAACGCAACA	-	chr3L	19137729	-	chr3L	19137610	119	+	chr3L	19137610	+	chr3L	19137729
AAATAATTGGTATAAACAATGTGTCTGAATATAAATGTTGCCTATATTATTGGTCAGCAAAATATTCC:1	AAATAATTGGTATAAACAATGT	TTATTGGTCAGCAAAATATTCC	-	chrX	23003562	-	chrX	22996335	7227	+	chrX	22996335	+	chrX	23003562
TACAGTATCTGATGGATACAACAGATAGCATTGATGCTGCAGTACTATATGCTCCTAAAACCCATCTCTGTTGG:1	TACAGTATCTGATGGATACAAC	TCCTAAAACCCATCTCTGTTGG	-	chr2R	9070872	-	chr2R	11092977	2022105	+	chr2R	11092977	+	chr2R	9070872
GGCCCATCGACTTCTGATAAGCCATCGACTTCTGCACGGACACCTGTTCGGGAGCCGGGTCCATCCTCATC:1	GGCCCATCGACTTCTGATAAGC	GGGAGCCGGGTCCATCCTCATC	+	chr2L	12398692	+	chr2L	12398777	85	+	chr2L	12398692	+	chr2L	12398777
AAAACCCCTGTTAAATATTGTGCATAAAATTGTTCAAAAGAGTCGAGTTCATATTCTTACACTTGTAGCTTTTTA:1	AAAACCCCTGTTAAATATTGTG	TTCTTACACTTGTAGCTTTTTA	+	chr3L	22726439	+	chr3L	22726525	86	+	chr3L	22726439	+	chr3L	22726525
ACTTTTGCCCAAATGAGTTTTATTGCTAATTTATAAAAAGAAGCAAAAATTTGTGTGATCGTTGTATCTATTTC:1	ACTTTTGCCCAAATGAGTTTTA	GTGTGATCGTTGTATCTATTTC	-	chr3L	14565859	-	chr3L	14565769	90	+	chr3L	14565769	+	chr3L	14565859
TTTTAGTTATCAACATAGTTGAGCCAAACAAGATGTTTGCTGCCGGGTGCTGAAA:1	TTTTAGTTATCAACATAGTTGA	TGTTTGCTGCCGGGTGCTGAAA	+	chr2L	877107	+	chr2L	877164	57	+	chr2L	877107	+	chr2L	877164
ACCAATATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTTTGCTTACCTACGAATATCTT:1	ACCAATATTTATTTTGCTTTCC	TTTGCTTACCTACGAATATCTT	+	chr3L	16971239	+	chr3L	16971317	78	+	chr3L	16971239	+	chr3L	16971317
TGATCCAGACAGTAGCCGGTAATTTGGTCCGATATACAGTCAAAGACATCGAACGCCAGATCGCAGCTTCCACCT:1	TGATCCAGACAGTAGCCGGTAA	CGCCAGATCGCAGCTTCCACCT	-	chr3L	16954905	-	chr3L	16945752	9153	+	chr3L	16945752	+	chr3L	16954905
TCTCGTGCTGTGCTCGCANTTGTCGTCATTGCCTCATTATTATNATCTGNGTCAACTTGTAATGGAAACTTTTGT:1	TCTCGTGCTGTGCTCGCANTTG	AACTTGTAATGGAAACTTTTGT	+	chr3L	57791	+	chr3L	57871	80	+	chr3L	57791	+	chr3L	57871
CCGGGGATTAAGCGGGTTCCTTCCGCAACAGTAGGGCTCCTGCGGAACAGCGAC:1	CCGGGGATTAAGCGGGTTCCTT	AGGGCTCCTGCGGAACAGCGAC	+	chrX	2399858	+	chrX	2408190	8332	+	chrX	2399858	+	chrX	2408190
ATCAACTGCTCCGATTTGCTTTTTTGATTCAGTTTTTTTAGAATNCCCCTTCTCAACGAGCG:1	ATCAACTGCTCCGATTTGCTTT	GAATNCCCCTTCTCAACGAGCG	-	chr2R	18219718	-	chr2R	18219649	69	+	chr2R	18219649	+	chr2R	18219718
CATAAACAGCTTAAAGGTCACTGGGCGTGGAAAATTCAACATGCACACCCAATACATTTGGAATAACTCTGAAAA:1	CATAAACAGCTTAAAGGTCACT	ACATTTGGAATAACTCTGAAAA	+	chr3R	28286943	+	chr3R	28284409	2534	+	chr3R	28286943	+	chr3R	28284409
ATAATTTAAGTTTCAATATAAATCCTCTCTTTTGTGTTCGCTGACGTAATGGCATGTACTCGATCGCAAT:1	ATAATTTAAGTTTCAATATAAA	ATGGCATGTACTCGATCGCAAT	-	chrX	22983039	-	chrX	22982861	178	+	chrX	22982861	+	chrX	22983039
AAATTAGCCTAAACAATAAAGATGAAAAGCTATTTAATGCACGACCAAGCCGGCTGGAACCCCAGTCGAGTTTT:1	AAATTAGCCTAAACAATAAAGA	GCTGGAACCCCAGTCGAGTTTT	+	chr3R	21105372	+	chr3R	13353635	7751737	+	chr3R	21105372	+	chr3R	13353635
AATCCCATCTTGCATGCTCCCCCCATGTTTCAAGCTCTGATAACTGATAACAGAGGGTCAGTTTTCATTACAATA:1	AATCCCATCTTGCATGCTCCCC	AGGGTCAGTTTTCATTACAATA	+	chr3R	23626323	+	chr3R	23626422	99	+	chr3R	23626323	+	chr3R	23626422
TTTGATGTTGGGAAACCCGTAAACTTGGTAATCAATAAAGTGTGAGTGTTAATTGAACATTGTTTATTTCAAGAT:1	TTTGATGTTGGGAAACCCGTAA	TGAACATTGTTTATTTCAAGAT	+	chr2L	10495447	+	chr2L	10495533	86	+	chr2L	10495447	+	chr2L	10495533
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAAACAAAATAACACTCGGGATAACTCCCGCACCGGAGAAACGGAGA:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	TCCCGCACCGGAGAAACGGAGA	+	chr3L	22908067	+	chr3L	429417	22478650	+	chr3L	22908067	+	chr3L	429417
ATTTTGCAACAGACGCTTGCCACACAGGGCATTCCCGCCATCCGTCCNGATTCTGTGGCACTCTTCTGGCACCCA:1	ATTTTGCAACAGACGCTTGCCA	TGTGGCACTCTTCTGGCACCCA	+	chr2R	12540482	+	chr2R	12540565	83	+	chr2R	12540482	+	chr2R	12540565
GTCCTAATGTGATCAAATTTATAATTTGACCCGAAATCGGGTCCGACTTTAATGGCACAAACGCAGCTGCTTATT:1	GTCCTAATGTGATCAAATTTAT	GGCACAAACGCAGCTGCTTATT	+	chr3R	10904932	+	chr3R	10905136	204	+	chr3R	10904932	+	chr3R	10905136
AAAAGTTTTAGCAATCATTGTAATTTAGACTTCTTCTTTTGATAAGTTACAATTTGGCAGGTGCATACCCATATT:1	AAAAGTTTTAGCAATCATTGTA	TTGGCAGGTGCATACCCATATT	-	chr3L	5504648	-	chr3L	5504570	78	+	chr3L	5504570	+	chr3L	5504648
TTTTAAATGCATTTAGAAAATAAATAGGATTTGTTTTGTTCAGGAATATTTTCAGAAAAGTGAGCACCACGCTG:1	TTTTAAATGCATTTAGAAAATA	CAGAAAAGTGAGCACCACGCTG	+	chr3L	2719553	+	chr3L	2719654	101	+	chr3L	2719553	+	chr3L	2719654
ATTCGCTTCAGGAACCGATTCACAGTGCTCAGATGGAAAATGCTCAGTTGAAAATGGTGGACTTANCGTTTCAAT:1	ATTCGCTTCAGGAACCGATTCA	ATGGTGGACTTANCGTTTCAAT	-	chr2R	7642519	-	chr2R	7642352	167	+	chr2R	7642352	+	chr2R	7642519
CGAAAAAGAAAGGAAATTGCTGGCAAATGAAAATAAAATCAAGGGGAGAAACAGAGAGAGATTCGAGGTCAGGGC:1	CGAAAAAGAAAGGAAATTGCTG	GAGAGAGATTCGAGGTCAGGGC	+	chr2R	24208029	+	chr2R	18758167	5449862	+	chr2R	24208029	+	chr2R	18758167
GAATACTATAAAGCTTTTGCTGCTTTTGTTTTTTT:1	GAATACTATAAAGCTTTTGCTG	CTTTTGCTGCTTTTGTTTTTTT	-	chr3R	18789251	-	chr3R	16117352	2671899	+	chr3R	16117352	+	chr3R	18789251
ACGGAAATNTTTACTCAAGTCAATTTGCAGTTGGCAAACTTCTTGTAGAGGATTTCACAGAGTTCCCAGTGTCA:1	ACGGAAATNTTTACTCAAGTCA	TTTCACAGAGTTCCCAGTGTCA	-	chrX	21248010	-	chrX	21247899	111	+	chrX	21247899	+	chrX	21248010
GGGAATGAAATATATACCTTTTTATTTGCACAGAGGGAATTGACATAAATTGGTTTTCTGGGCCTTTGCACTTTC:1	GGGAATGAAATATATACCTTTT	TTTTCTGGGCCTTTGCACTTTC	-	chrX	18427812	-	chrX	18427401	411	+	chrX	18427401	+	chrX	18427812
ACTAAATAATTGTTAAGAANTACATATGTAAACAATCAATTCAATTTCTTTTGAGTGCCACTTGCTTGGAAATAT:1	ACTAAATAATTGTTAAGAANTA	AGTGCCACTTGCTTGGAAATAT	-	chr2R	11538405	-	chr2R	11538305	100	+	chr2R	11538305	+	chr2R	11538405
CTATTCATAAAAATAANATACTANATGTTTTATNTATGNATATCAATAAATATACATAATAANCATACAT:1	CTATTCATAAAAATAANATACT	AATATACATAATAANCATACAT	-	chr3R	20515723	-	chr3R	20513025	2698	+	chr3R	20513025	+	chr3R	20515723
GTCAATTTTTCACAATTATATTGCGCATTTCATTATTGTGAAAGATTAACATTCCATTTATTTCTCAGTTATT:1	GTCAATTTTTCACAATTATATT	TTCCATTTATTTCTCAGTTATT	+	chr3R	23161934	+	chr3R	23162029	95	+	chr3R	23161934	+	chr3R	23162029
TCATTGAAGTAATGCAAAAAACGGCAGCACTTGAATACAACATCGTTTACGAACATAAAATAAATAATACAAAA:1	TCATTGAAGTAATGCAAAAAAC	ACATAAAATAAATAATACAAAA	-	chr2R	12094084	-	chr2R	12093972	112	+	chr2R	12093972	+	chr2R	12094084
CATATTACACATACGCCATGTGGGACCGACTGGACCGACATAGCGATCGCCATCGAGATCGGAATCGCCATCTC:1	CATATTACACATACGCCATGTG	TCGAGATCGGAATCGCCATCTC	+	chr3L	15087232	+	chr3L	8783191	6304041	+	chr3L	15087232	+	chr3L	8783191
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTTTTGTATTGTTTTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	GTTTTGTTTTGTATTGTTTTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	29013340	7105806	+	chr3R	29013340	+	chr3R	21907534
ATTGTTGTTTTGGAAATTTTTGTTCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTNTTGTG:1	ATTGTTGTTTTGGAAATTTTTG	TGTTGTGTTGTGTTGTNTTGTG	-	chr3R	21185098	-	chr3R	21907535	722437	+	chr3R	21907535	+	chr3R	21185098
ATTATTCGNCTTGAAAACATTGAAAGAGTGCGAGGNGGAGCGAGGGCGGGCGCAACCGCAGCATAAGCAGGCCGA:1	ATTATTCGNCTTGAAAACATTG	AACCGCAGCATAAGCAGGCCGA	-	chr3L	3069893	-	chr3L	3061310	8583	+	chr3L	3061310	+	chr3L	3069893
TTTGAAATTTAAGAATCATTTACACTCTCACTTTTAAAGTTGCCCCAAAAAGATTAAGAGATACGACCACTTTT:1	TTTGAAATTTAAGAATCATTTA	ATTAAGAGATACGACCACTTTT	-	chr2R	7201356	-	chr2R	7196582	4774	+	chr2R	7196582	+	chr2R	7201356
ATTTGTTTATTTAATTCGCCATAATCGATGATGAAATTTAGATGAAATATTTGCAGCAGCTCTAAGAAGTAAAG:1	ATTTGTTTATTTAATTCGCCAT	GCAGCAGCTCTAAGAAGTAAAG	-	chr3L	11849437	-	chr3L	11849338	99	+	chr3L	11849338	+	chr3L	11849437
CAGGTCGTTAACCGTTGCCTCCTGGACATCCACCTCCCCAATATTATATTTGCTTTTAAATATTTTGATATACAG:1	CAGGTCGTTAACCGTTGCCTCC	TTTTAAATATTTTGATATACAG	+	chr3L	4876369	+	chr3L	17441655	12565286	+	chr3L	4876369	+	chr3L	17441655
TGGCATTGTTCAACTCCTTTGATCTCATTAACANAAACCGAAACAAATGCAAGTTTTNAAA:1	TGGCATTGTTCAACTCCTTTGA	GAAACAAATGCAAGTTTTNAAA	+	chr3R	15618752	+	chr3R	15626212	7460	+	chr3R	15618752	+	chr3R	15626212
GCCATGGCTGGGCAATATCTACCTACATGTATACATGTATACATTTTGGGTCACTGGGCGGCAT:1	GCCATGGCTGGGCAATATCTAC	ATTTTGGGTCACTGGGCGGCAT	+	chr2R	17626865	+	chr2R	17626932	67	+	chr2R	17626865	+	chr2R	17626932
CACGAAGCAGTATCCTGCCAAGCCAAAGGNGATCACCCCCAGTGATTCCCCCCTTGCACCNAACTTGCTTGTTTG:1	CACGAAGCAGTATCCTGCCAAG	TTGCACCNAACTTGCTTGTTTG	+	chr2L	818732	+	chr2L	2637159	1818427	+	chr2L	818732	+	chr2L	2637159
GTTATTGGTGAAAAAACCNATTAAAGACGAATTTCTTCGAATTNGAAAGNAGTTAAAACTTATGACCTATTTGTA:1	GTTATTGGTGAAAAAACCNATT	TAAAACTTATGACCTATTTGTA	+	chr2R	22503879	+	chr2R	22503974	95	+	chr2R	22503879	+	chr2R	22503974
TTCGATGTGCCCTCTTTCTTTACTACAGTCCATGAATACAAAAGGTCCTTTCAAGGATGACA:1	TTCGATGTGCCCTCTTTCTTTA	AAAGGTCCTTTCAAGGATGACA	-	chr3R	4761217	-	chr3R	4759733	1484	+	chr3R	4759733	+	chr3R	4761217
GCGAAGGACCTGCTCACCCAGCAATGGGCTTAGGTGGGTGGGAAAATTTAATTTGTAAGAAATA:1	GCGAAGGACCTGCTCACCCAGC	AAAATTTAATTTGTAAGAAATA	-	chr2L	9259638	-	chr2L	920066	8339572	+	chr2L	920066	+	chr2L	9259638
AATAGCCAACTTAAACTTAAGCGATTGACTTAATTCGAGAAAGGAACCAGCCAGAAGGTATATTGAAATAACTTT:1	AATAGCCAACTTAAACTTAAGC	GAAGGTATATTGAAATAACTTT	-	chr3L	1991225	-	chr3L	1991147	78	+	chr3L	1991147	+	chr3L	1991225
ATAAATCTTTTGTAAACCACCAAACCAACCAAGTTTGATTAGACTAAAACCATCATAATCACACAATTTTTTCAA:1	ATAAATCTTTTGTAAACCACCA	CATAATCACACAATTTTTTCAA	-	chr3L	5066399	-	chr3L	5066300	99	+	chr3L	5066300	+	chr3L	5066399
ATTTTTATCCCAGACCATTTATGCCTTTTTTGCTTTTAATGAATTGAAAGTTGTGATTTTTAGGATAAAAAATTT:1	ATTTTTATCCCAGACCATTTAT	TGATTTTTAGGATAAAAAATTT	+	chr2L	11540603	+	chr2L	11548005	7402	+	chr2L	11540603	+	chr2L	11548005
CATTAAACACGCAGATGAACCAGTTGAAATAGTTTCATACTAATCGTTTTGCGAGGACTGTCATGGATTACCTGC:1	CATTAAACACGCAGATGAACCA	AGGACTGTCATGGATTACCTGC	+	chrX	3597566	+	chrX	3619734	22168	+	chrX	3597566	+	chrX	3619734
GTAATAGCTGAATGCATCATAATTTACCTTGACATTTAGACCAAAAACACAAATCAAACGCAAACAGCGCGACGA:1	GTAATAGCTGAATGCATCATAA	TCAAACGCAAACAGCGCGACGA	+	chr2R	22159661	+	chr2R	15824996	6334665	+	chr2R	22159661	+	chr2R	15824996
TACACTTTAAAATAATGCCAACTAAGATTTGCATCACCTTTCAATCGGATTTGTTAATAAGACCCTGTTCTTCT:1	TACACTTTAAAATAATGCCAAC	GTTAATAAGACCCTGTTCTTCT	-	chr2L	16226297	-	chr2L	16226211	86	+	chr2L	16226211	+	chr2L	16226297
TGTTATCTGAGCATTTAATTATTCCTTGGTCAATACTGACAGCGAAAGAAGAGTAATAATCGTATTTTCAATCTG:1	TGTTATCTGAGCATTTAATTAT	TAATAATCGTATTTTCAATCTG	+	chrX	19098776	+	chrX	19098854	78	+	chrX	19098776	+	chrX	19098854
ATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAAGGAACGATTGCCGAACAATTACAGCACTACCTGGACCTAAACAAT:1	ATAAACAATAAACAATAAACAA	GCACTACCTGGACCTAAACAAT	-	chr2L	9723025	-	chr2L	8222356	1500669	+	chr2L	8222356	+	chr2L	9723025
GCATCAATGCAATCCCTTAATTGCACTTTAAAATCTTTTACATGCAGCTTGTTAGATTCAGTCATGANAAACGA:1	GCATCAATGCAATCCCTTAATT	TAGATTCAGTCATGANAAACGA	+	chr3R	31805158	+	chr3R	31805233	75	+	chr3R	31805158	+	chr3R	31805233
CTGAGAAGCATGCTTCATAAATTGGTTTTTATTGGGGTCCCATGTGTGTGCGTCTGTGGCTTTTGTTCTT:1	CTGAGAAGCATGCTTCATAAAT	TGCGTCTGTGGCTTTTGTTCTT	+	chr2R	22349700	+	chr2R	22351479	1779	+	chr2R	22349700	+	chr2R	22351479
GATAGCNGATTCTGCTGATGCAGCAGCCACAGCTGC:1	GATAGCNGATTCTGCTGATGCA	CTGATGCAGCAGCCACAGCTGC	-	chr3L	7450048	-	chr3L	19828496	12378448	+	chr3L	19828496	+	chr3L	7450048
AGAATATGCAAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATAACAATTTTGACAGATAAATGCAAC:1	AGAATATGCAAAGGAAGTTGGC	AATTTTGACAGATAAATGCAAC	+	chr3R	19449289	+	chr3R	21657918	2208629	+	chr3R	19449289	+	chr3R	21657918
GAACTCATCATCATTAGGGCACGACCGATTTCAGATCTTGCTCAGATTGCCACGCCCTCGGAAAAAAAGGGG:1	GAACTCATCATCATTAGGGCAC	CACGCCCTCGGAAAAAAAGGGG	+	chr3R	13863697	+	chr3R	13863782	85	+	chr3R	13863697	+	chr3R	13863782
CTCGTAAANCTGAGGGTCTTACCGATAAGCAGGCGGCTTAACCGAAAGGCCCATAAATCATGTATCCTAACATC:1	CTCGTAAANCTGAGGGTCTTAC	ATAAATCATGTATCCTAACATC	+	chr2L	20069542	+	chr2L	20069621	79	+	chr2L	20069542	+	chr2L	20069621
TTCGAGAATGCCACACGCGACTGACCAGCACACCAGCACCACATCCCAGCTGCATGATGACTACAGCACTG:1	TTCGAGAATGCCACACGCGACT	CTGCATGATGACTACAGCACTG	-	chr2R	20612139	-	chr2R	17929302	2682837	+	chr2R	17929302	+	chr2R	20612139
CCCACCCAAAGANACAAAGCCGAGTGGACANTCAATAAAGG:1	CCCACCCAAAGANACAAAGCCG	CCGAGTGGACANTCAATAAAGG	+	chrX	6989003	+	chrX	16476666	9487663	+	chrX	6989003	+	chrX	16476666
ACCGAATGCTTGACTGGATGTGTCTACCTCCCCGAGAACCTATCGTGCCTTTGAGAAAGCTCCTC:1	ACCGAATGCTTGACTGGATGTG	CGTGCCTTTGAGAAAGCTCCTC	-	chr3R	27731287	-	chr3R	27731216	71	+	chr3R	27731216	+	chr3R	27731287
ATTTTGCCGTTCAATAAGTTGCATCTAAGTTTAATTTGAGGTATTTCCTNAATCAA:1	ATTTTGCCGTTCAATAAGTTGC	TTTGAGGTATTTCCTNAATCAA	+	chr3L	15259123	+	chr3L	15260098	975	+	chr3L	15259123	+	chr3L	15260098
GTAATTTCTATAAAACAGCAACACTTTCTAACCCGACTAAGAAAAGAAACGTCGANATCACG:1	GTAATTTCTATAAAACAGCAAC	GAAAAGAAACGTCGANATCACG	+	chr3L	13804579	+	chr3L	13822852	18273	+	chr3L	13804579	+	chr3L	13822852
CTTTCAAATAAAAATAATAAAAGTCGCTTTTACCTTTCGCTTTTTCCTTGTTAAAAATTGTGCAATATTTGTT:1	CTTTCAAATAAAAATAATAAAA	TAAAAATTGTGCAATATTTGTT	-	chrX	16943910	-	chrX	21473199	4529289	+	chrX	21473199	+	chrX	16943910
AGTGATCAGTTTCCTACACAACAACTGATTGATTCGTCTCAAACTGAAACACACGTTGCCACGTTTTCCCACATA:1	AGTGATCAGTTTCCTACACAAC	CGTTGCCACGTTTTCCCACATA	-	chr2R	5778651	-	chr2R	19096634	13317983	+	chr2R	19096634	+	chr2R	5778651
TGGAAAAANAATTCTTTATAATATCAAGATGTTTANAAGAGCATCCAAATAAGTGTTGGATCAGGAACAGTGGTA:1	TGGAAAAANAATTCTTTATAAT	TGTTGGATCAGGAACAGTGGTA	+	chr3L	14867629	+	chr3L	14867713	84	+	chr3L	14867629	+	chr3L	14867713
ATGCATGAAGTAGATAATGAACAGATAGCAACTATGACGATAACCACACAGCCCGACAAATAGAACCCGACCA:1	ATGCATGAAGTAGATAATGAAC	CCCGACAAATAGAACCCGACCA	+	chr3R	4707302	+	chr3R	26494036	21786734	+	chr3R	4707302	+	chr3R	26494036
GTTAATCCAAATCTTATGGCTTATAGTGTCGCAATCTACAATGGTTAACAACAATAGCGCTGAATATTTAAAT:1	GTTAATCCAAATCTTATGGCTT	CAATAGCGCTGAATATTTAAAT	+	chrX	6315190	+	chrX	6315318	128	+	chrX	6315190	+	chrX	6315318
AATAAAACAGCAGTTAGTTAGACTTAGGTCACAGTCAGCGGTCAACAGCTATGGACTTTCATTATTTATTGATCC:1	AATAAAACAGCAGTTAGTTAGA	GACTTTCATTATTTATTGATCC	-	chr3R	4610710	-	chr3R	4609546	1164	+	chr3R	4609546	+	chr3R	4610710
ATATTTTTGGTGAATTACAAAACTAATGTGGATTCTACAAGATGTCTCTTGGTCCTCTTAAAAGTTTAATGTAAA:1	ATATTTTTGGTGAATTACAAAA	CCTCTTAAAAGTTTAATGTAAA	-	chr3L	13988592	-	chr3L	13988471	121	+	chr3L	13988471	+	chr3L	13988592
GGGCTGTTGCTTCCCCGGGGTTGGAGCGTCCGCCTCCAGGGAAATTTACGGAAACTGCCGTGCTCAAACACTGG:1	GGGCTGTTGCTTCCCCGGGGTT	AACTGCCGTGCTCAAACACTGG	+	chr3L	11409470	+	chr3L	11409792	322	+	chr3L	11409470	+	chr3L	11409792
GTAAGTAGAGGAAGGAAGGATACGTTGCGCCACGGCGATCCGATTGGG:1	GTAAGTAGAGGAAGGAAGGATA	GCGCCACGGCGATCCGATTGGG	-	chr2R	6246182	-	chr2R	18245363	11999181	+	chr2R	18245363	+	chr2R	6246182
GTCCACCCAAAGTGAAATTGTGTTAACGTATTTTCCTCAGCCATTCCTTCGTGTGAAAAATGGAGCTTGGGGGA:1	GTCCACCCAAAGTGAAATTGTG	GTGAAAAATGGAGCTTGGGGGA	-	chr3R	6905078	-	chr3R	26667272	19762194	+	chr3R	26667272	+	chr3R	6905078
CACCACCCAATTCTCTGTGTTTTTTCCGTGTGCGCCATTTTGTCAGAGCATAAATTACAACTTCAGGTGTAGTT:1	CACCACCCAATTCTCTGTGTTT	AATTACAACTTCAGGTGTAGTT	+	chr3L	3475088	+	chr3L	3475531	443	+	chr3L	3475088	+	chr3L	3475531
AGCCCCACACAAGAGAAAACTAATTTTACAGCAGTTTACGGAATATTTATTTTGNCAAACCATGGCT:1	AGCCCCACACAAGAGAAAACTA	TTTATTTTGNCAAACCATGGCT	+	chrX	19025301	+	chrX	19025378	77	+	chrX	19025301	+	chrX	19025378
TTGCGATTGGTCTTTATCTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAAAATGTTGATGTTATGCTTGATTT:1	TTGCGATTGGTCTTTATCTCGC	ATGTTGATGTTATGCTTGATTT	-	chr2L	5897681	-	chr2L	5897598	83	+	chr2L	5897598	+	chr2L	5897681
TACCTTCCATCGTGTGTTCGCATATATGTATATAAAAACCTACAGACATGAGTTCCCGATAATCGTGTTTTGGGC:1	TACCTTCCATCGTGTGTTCGCA	TCCCGATAATCGTGTTTTGGGC	-	chr3L	11230118	-	chr3L	11230021	97	+	chr3L	11230021	+	chr3L	11230118
CACATAAACAAAATTCCATAAGGGAGGCATTTTCCATTAAGCCTGTCNTTTGGGATGTGCAAAAACCCATGACAG:1	CACATAAACAAAATTCCATAAG	GATGTGCAAAAACCCATGACAG	+	chr2L	7493703	+	chr2L	7493914	211	+	chr2L	7493703	+	chr2L	7493914
CCTGGACGAGTGCATCCTTGCAGCAGGGGGCGTGCGCAGCAGCTTTGCGAGGG:1	CCTGGACGAGTGCATCCTTGCA	GTGCGCAGCAGCTTTGCGAGGG	-	chr3L	11901702	-	chr3L	11901594	108	+	chr3L	11901594	+	chr3L	11901702
AACTCATAATATTTGCAAATGATGAACGTGAAAGTTTTTGATAAGTTTTTCGGGTGGGCCAGGGCATTACGCAG:1	AACTCATAATATTTGCAAATGA	GGTGGGCCAGGGCATTACGCAG	+	chr3L	6636623	+	chr3L	14132683	7496060	+	chr3L	6636623	+	chr3L	14132683
CCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGTGAAGCAGAAACATATAAAAAATGTTGCATATTTTTGGGCATGTGGGAAACTGG:1	CCTGCCTGCGCAAAAGTTTTGT	TTTTGGGCATGTGGGAAACTGG	-	chr3R	8709802	-	chr3R	8707361	2441	+	chr3R	8707361	+	chr3R	8709802
ACCGATCACGCAGTGGGCAGCGGTCAGCACATAGCGACTGTTGATCANTGAGCCCGCACAACCCGTTCGTTGATT:1	ACCGATCACGCAGTGGGCAGCG	CCGCACAACCCGTTCGTTGATT	-	chr3R	23685196	-	chr3R	23684710	486	+	chr3R	23684710	+	chr3R	23685196
CGATGTACAACAGTATAGCTCANCATAAAACACGATACTCTAAGTATCTACTCTTCACTAAGCCTGTCAACTTAT:1	CGATGTACAACAGTATAGCTCA	TTCACTAAGCCTGTCAACTTAT	-	chr2R	2004577	-	chr2R	2002819	1758	+	chr2R	2002819	+	chr2R	2004577
CCCCATCACCCCCCCGCAAAACAAGCGACGCCGATAGAAACATTTAATTTGTGCACATGAGACTCATTCGGCGAA:1	CCCCATCACCCCCCCGCAAAAC	CACATGAGACTCATTCGGCGAA	-	chr3L	12002664	-	chr3L	2540499	9462165	+	chr3L	2540499	+	chr3L	12002664
TCTGCCTGTTACAGGAGATCTTTGGACACAAAGAACACCAGATTCAGGAACACGTTCAGTGTCTGG:1	TCTGCCTGTTACAGGAGATCTT	CAGGAACACGTTCAGTGTCTGG	+	chrY	975811	+	chrY	975967	156	+	chrY	975811	+	chrY	975967
CCAGGACACACAATTCCCCCNTGGCATGCAAGNCCATAAGTTNCAGCAAATACAACTCTCACCATTCACATTATG:1	CCAGGACACACAATTCCCCCNT	AACTCTCACCATTCACATTATG	-	chr3R	20118130	-	chr3R	20118044	86	+	chr3R	20118044	+	chr3R	20118130
AAAAAAGAAGAAAAAAAANGGAACGCCAACGGGTTTCATTTNTCANGGATGCCAATGGATACCCAAACTTATAA:1	AAAAAAGAAGAAAAAAAANGGA	CAATGGATACCCAAACTTATAA	-	chr2L	4035812	-	chr2L	8001043	3965231	+	chr2L	8001043	+	chr2L	4035812
CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTTGTCTTCTCTTTTTTTTTT:1	CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT	CTTTGTCTTCTCTTTTTTTTTT	-	chr3L	22908066	-	chr3L	10601092	12306974	+	chr3L	10601092	+	chr3L	22908066
TTCTGGTGGGGGATATCGTTTAAATTATTAACCAAACATACTTATATACATTTTGCAACATGACAAATTAACCAG:1	TTCTGGTGGGGGATATCGTTTA	TGCAACATGACAAATTAACCAG	-	chr2R	9510812	-	chr2R	9510696	116	+	chr2R	9510696	+	chr2R	9510812
AACAATGTTCGGTCAGGTGGTAATCGTAGCTCAGAGGATCTGTAATGTTTATCTGAATAGTTC:1	AACAATGTTCGGTCAGGTGGTA	GTAATGTTTATCTGAATAGTTC	+	chr3R	18379644	+	chr3R	18379938	294	+	chr3R	18379644	+	chr3R	18379938
CAAGNGAACTTAAAGAGAATCGNCATGNAAAGTAAAAATNCAAATGGCTTTTTCCCGGGTTAAATGTTGCAGA:1	CAAGNGAACTTAAAGAGAATCG	TTCCCGGGTTAAATGTTGCAGA	-	chr3R	17193942	-	chr3R	22228981	5035039	+	chr3R	22228981	+	chr3R	17193942
TTTATTGAATCGTGTTTACCCTTATGTCGACTCGGGTTTTGTTTGTGTTTTCCTTTACTCATTTTTATTACCCGC:1	TTTATTGAATCGTGTTTACCCT	TTTACTCATTTTTATTACCCGC	-	chr2R	22529305	-	chr2R	22525750	3555	+	chr2R	22525750	+	chr2R	22529305
AATTTAAAACCAGTTAAATAATAATTTGGATAACTATAGTGCACACGGGATTTTCATCTAAGAAACANACTATTT:1	AATTTAAAACCAGTTAAATAAT	TCATCTAAGAAACANACTATTT	-	chr2L	3078243	-	chr2L	3073040	5203	+	chr2L	3073040	+	chr2L	3078243
GGACCAGCAAGACAAGACCGCCTTTGCGGCATGTGTAACATATGTCAGATGGCCGGACTTGGCCTAAATCAATAC:1	GGACCAGCAAGACAAGACCGCC	CGGACTTGGCCTAAATCAATAC	-	chr2L	772263	-	chr2L	770482	1781	+	chr2L	770482	+	chr2L	772263
CAGATAGCCACCCAGGGCATCGTATAGATATTTGGATAGGTTCTGCGCAGAGCGGGCGGCGGCGTTGGATATACG:1	CAGATAGCCACCCAGGGCATCG	GGGCGGCGGCGTTGGATATACG	-	chr3R	27234305	-	chr3R	27240623	6318	+	chr3R	27240623	+	chr3R	27234305
CTAATATCCAGCTTTCATCGCAGCAATTAGCCATTCATAACTCAATTTATACCGTGCACCAAGTGATTGACACTG:1	CTAATATCCAGCTTTCATCGCA	GTGCACCAAGTGATTGACACTG	+	chr2R	21918414	+	chr2R	21643481	274933	+	chr2R	21918414	+	chr2R	21643481
AAATACAATAGTATTTAAATAGTTAATAGGGAAACATTTAGTTGCCAAAACAATAAGATGACCCTTTATGTTGTT:1	AAATACAATAGTATTTAAATAG	TAAGATGACCCTTTATGTTGTT	-	chr2R	6978827	-	chr2R	6978644	183	+	chr2R	6978644	+	chr2R	6978827
GCCAAAAAGCAAGAAACAGCTTTGGGGGAAAAAAGAATGGCTGCAAGGAGTCCGGAGGACCCAACATA:1	GCCAAAAAGCAAGAAACAGCTT	GGAGTCCGGAGGACCCAACATA	-	chr3R	19954042	-	chr3R	19953972	70	+	chr3R	19953972	+	chr3R	19954042
CATCGGCAATTAGGCGTCTTCCAAACTCGTGGCAACATGGGTCAACAGATGGTGCAATTAAAAAAGCCTGGACA:1	CATCGGCAATTAGGCGTCTTCC	TGCAATTAAAAAAGCCTGGACA	+	chr2R	10741396	+	chr2R	4723086	6018310	+	chr2R	10741396	+	chr2R	4723086
AAGGATATTACAATTTGTAATTTAGATATTGTTTCCCAGATGTGCAGATGTGTGCTTGGAATCAGATCGGTTA:1	AAGGATATTACAATTTGTAATT	GTGCTTGGAATCAGATCGGTTA	+	chr3R	30210666	+	chr3R	30210744	78	+	chr3R	30210666	+	chr3R	30210744
TATTGTAATATTCACAGAGCTGTGCAGCAGCGAGAATTTGCCCGAGGTGGAGATTTTTGCTTTTGAAACAGAACG:1	TATTGTAATATTCACAGAGCTG	TTTTTGCTTTTGAAACAGAACG	+	chr2L	7040933	+	chr2L	19264721	12223788	+	chr2L	7040933	+	chr2L	19264721
ACTGAGCCACTGAGCTCTGGAAACTGAGGCAACCACCAAGCCACCAAACCACCAAGCAACCGATTGCCAAGTGGT:1	ACTGAGCCACTGAGCTCTGGAA	AAGCAACCGATTGCCAAGTGGT	+	chrX	17837364	+	chrX	17837441	77	+	chrX	17837364	+	chrX	17837441
TATAATGGATGAAGATGATAGAGACGAAACCACACCCTGTGTGGG:1	TATAATGGATGAAGATGATAGA	ACGAAACCACACCCTGTGTGGG	+	chr3R	19448586	+	chr3R	10082185	9366401	+	chr3R	19448586	+	chr3R	10082185
CATTAATACATTTGATCCGCAATTTATTGTGATTATTTTAATATTACNCCGCAATGCAAATTAAATTNATCCCTT:1	CATTAATACATTTGATCCGCAA	ATGCAAATTAAATTNATCCCTT	-	chr2R	13926028	-	chr2R	13925852	176	+	chr2R	13925852	+	chr2R	13926028
TGCATATTACAATTAGGTTTAACAAAATCGAGAACTTATGAACAATTTTCTACATCTAGAGATTTTTATGGCAG:1	TGCATATTACAATTAGGTTTAA	CATCTAGAGATTTTTATGGCAG	+	chr3R	27496592	+	chr3R	27496696	104	+	chr3R	27496592	+	chr3R	27496696
TGAATATGTCCGGCGCAGTCGTAACTTACAATCGTTACCGATTTTAGCATAGGCAAACAAATTTAGTG:1	TGAATATGTCCGGCGCAGTCGT	GCATAGGCAAACAAATTTAGTG	-	chr3R	26565656	-	chr3R	26558351	7305	+	chr3R	26558351	+	chr3R	26565656
TAAGTTGGGACTCAAATATGAAGGCTGGGTATTATTACTGGTCCATTTTTCTATCTTTTCCATCCGGA:1	TAAGTTGGGACTCAAATATGAA	TTTTCTATCTTTTCCATCCGGA	+	chr2R	8524078	+	chr2R	8524153	75	+	chr2R	8524078	+	chr2R	8524153
AATGGCCGAAACGCTGTACTATCTCATCCTACGCAATCCATCCAGTCAGATTGTC:1	AATGGCCGAAACGCTGTACTAT	CAATCCATCCAGTCAGATTGTC	-	chrX	9576113	-	chrX	9575809	304	+	chrX	9575809	+	chrX	9576113
GAAAAATACATCTCAATAAAGATGTCTGTGTAGCTAGCTCAACGATGATGATGATGCATTGAACCTGGGAGTGAA:1	GAAAAATACATCTCAATAAAGA	ATGCATTGAACCTGGGAGTGAA	+	chr2R	23427789	+	chr2R	23427931	142	+	chr2R	23427789	+	chr2R	23427931
AAAGGTGTGAAATTGTTGTTGCTCTTGATTGGATATCTGTGTTTCATCAGGTGGCACTGTG:1	AAAGGTGTGAAATTGTTGTTGC	TGTTTCATCAGGTGGCACTGTG	-	chr3R	31696309	-	chr3R	31691557	4752	+	chr3R	31691557	+	chr3R	31696309
GAGGTTCTGCGAAAGTGGCCGCCGGCAATTGCCTTCGATCGGGAATGCAACAAGGATATCACCTTCGAT:1	GAGGTTCTGCGAAAGTGGCCGC	CAACAAGGATATCACCTTCGAT	-	chr3R	12396869	-	chr3R	12403841	6972	+	chr3R	12403841	+	chr3R	12396869
CATGCCGCATGGCCCAAATGTTTGACCCACTTACAATGTAGACAGCAATTTACTGTCTCTTTCCATACAACATAT:1	CATGCCGCATGGCCCAAATGTT	TGTCTCTTTCCATACAACATAT	-	chrX	13236980	-	chrX	13236895	85	+	chrX	13236895	+	chrX	13236980
GCAAGTCGCGCACCCTGCTCACAGCGCCCTATCATGTATAGTCCGACAATTCTGTCACCATTGAACTGATGTCGG:1	GCAAGTCGCGCACCCTGCTCAC	GTCACCATTGAACTGATGTCGG	+	chr3L	7363642	+	chr3L	7355735	7907	+	chr3L	7363642	+	chr3L	7355735
CATCGAGCCAGTTGCAAGTCGACTCGAACGTGTTGTAAAGAGTATGGACTTGACAAGATTTTTTTATAAAATTA:1	CATCGAGCCAGTTGCAAGTCGA	ACAAGATTTTTTTATAAAATTA	+	chr3R	26194629	+	chr3R	24048086	2146543	+	chr3R	26194629	+	chr3R	24048086
CATTCAATAGAATGCAGATTTTGTGTTGTGTGCCACGTGCTGTTGCTGCTGGTTCGGCATATGG:1	CATTCAATAGAATGCAGATTTT	TTGCTGCTGGTTCGGCATATGG	+	chr3L	4348361	+	chr3L	16678947	12330586	+	chr3L	4348361	+	chr3L	16678947
GGTAGCAACGGCACATGCACTTTAAGTGAAGTCGTCAAGTCGTCAAGTCGTGTGGCGTAGGACTGAGATTATATC:1	GGTAGCAACGGCACATGCACTT	GGCGTAGGACTGAGATTATATC	+	chr3R	28486275	+	chr3R	28484358	1917	+	chr3R	28486275	+	chr3R	28484358
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACTAGCAAACCCAAGCGGGCAAACAAACAAAC:1	CACAACACAACACAACACAACA	CCAAGCGGGCAAACAAACAAAC	+	chr3R	21907535	+	chr3R	31375955	9468420	+	chr3R	21907535	+	chr3R	31375955
ATCGGGTAACACTTTGCCATGTCATTAGATCGCCCACATAGGGATTGCGGAGACCATAG:1	ATCGGGTAACACTTTGCCATGT	ATAGGGATTGCGGAGACCATAG	+	chr2R	24310826	+	chr2R	24483143	172317	+	chr2R	24310826	+	chr2R	24483143
ATGGAATATGCCTTTGCATGGGTTAGCTAATCTCGCAGCTTATTCCGTTTTTAATTAAAAGTGACGACAAAAT:1	ATGGAATATGCCTTTGCATGGG	TAATTAAAAGTGACGACAAAAT	+	chr2R	23784490	+	chr2R	23784566	76	+	chr2R	23784490	+	chr2R	23784566
CTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAATTTGGCCGAACAATTTCGTTGCCNACTTTTGT:1	CTTAAATCGATATGCGCAGCTC	CAATTTCGTTGCCNACTTTTGT	-	chr2R	22775382	-	chr2R	22774963	419	+	chr2R	22774963	+	chr2R	22775382
CCCATCGCGAAGTCGTAAGACTCCTGGCAAAGTGCCGCGAATGAGCTTCCATCTTTCGGCTGCCGGCGG:1	CCCATCGCGAAGTCGTAAGACT	TCCATCTTTCGGCTGCCGGCGG	-	chr3R	31531152	-	chr3R	31530831	321	+	chr3R	31530831	+	chr3R	31531152
GAGAGTACCGCGAGCCTCCGAACGCTGCAAGAAATGTGCATTATTGGCATTGGCCANA:1	GAGAGTACCGCGAGCCTCCGAA	TGCATTATTGGCATTGGCCANA	-	chr3L	21905414	-	chr3L	21905351	63	+	chr3L	21905351	+	chr3L	21905414
TTTATTTATCAATTAATCAAGAAAAGTTACTATTAGCACGTTCGCCCCACTTACATCCCATAAGTAGATTTATGT:1	TTTATTTATCAATTAATCAAGA	CATCCCATAAGTAGATTTATGT	-	chr2L	12835676	-	chr2L	12835567	109	+	chr2L	12835567	+	chr2L	12835676
CATGTAATGCTCCTCCTTNTCGAGGCGGATTTTTGCGATAANTGCNAGTGCAAAATCGAGCACACGCGTTTCTAT:1	CATGTAATGCTCCTCCTTNTCG	AATCGAGCACACGCGTTTCTAT	-	chr2R	11675080	-	chr2R	11675000	80	+	chr2R	11675000	+	chr2R	11675080
AATAAATTTAATATGTGCCAGCAGCTTGGTTTTTTTTCTCCATGTTTTCTTTGATTTGGTAAGGAACAAAAAA:1	AATAAATTTAATATGTGCCAGC	TGATTTGGTAAGGAACAAAAAA	-	chr2R	19802763	-	chr2R	19802682	81	+	chr2R	19802682	+	chr2R	19802763
GTGTTTTGCGTNCCTGCCACTTGCCCACACTGGTCGACTGTCCAATTGTTGCATACGGATTCAATCANTCAATTA:1	GTGTTTTGCGTNCCTGCCACTT	TACGGATTCAATCANTCAATTA	+	chr3R	27619715	+	chr3R	27619830	115	+	chr3R	27619715	+	chr3R	27619830
ATCCCACGCACGCCGTTGGTTATGAACAAAACAAGAAAACAAAATGAGGAACAGACCAAAAGCCAACACATGTTT:1	ATCCCACGCACGCCGTTGGTTA	GACCAAAAGCCAACACATGTTT	+	chr3R	26980244	+	chr3R	10526621	16453623	+	chr3R	26980244	+	chr3R	10526621
GACAAGGNAATGCAGCAGGAAGCAGTCCGTCACCAGACANACATTGTGGCACTGGACNAAAACAGCAAGTTTCTT:1	GACAAGGNAATGCAGCAGGAAG	GGACNAAAACAGCAAGTTTCTT	-	chrX	20505675	-	chrX	20504154	1521	+	chrX	20504154	+	chrX	20505675
CACGATGAAATATTAATAACTGTTAACTATTTTTAATATTCGAATTATATAAATTATTTGTATTCTTNATCAGA:1	CACGATGAAATATTAATAACTG	ATTATTTGTATTCTTNATCAGA	-	chr2L	8956302	-	chr2L	8956226	76	+	chr2L	8956226	+	chr2L	8956302
ACTTTGCTTCTAACTAAATAAATACAAAAAATNAAAACTTTACTTTGCTGCACCCTAGCAGCAAACNGAAAATT:1	ACTTTGCTTCTAACTAAATAAA	CCCTAGCAGCAAACNGAAAATT	-	chr3R	28411100	-	chr3R	28411009	91	+	chr3R	28411009	+	chr3R	28411100
TAAATGAATTGTTTTCTGNATTGACTCTGCCAATAGCACTTNCGTNTGTTGAATTACAGATGGCTGCACTGGATA:1	TAAATGAATTGTTTTCTGNATT	TTACAGATGGCTGCACTGGATA	+	chr4	406830	+	chr4	464054	57224	+	chr4	406830	+	chr4	464054
TAATGCACATTTCTTGCAGCGTTCNGAGGCTCGCGGTACTCTNTCNTAATCNTTCNTCCATAGAATCCCCCGTTG:1	TAATGCACATTTCTTGCAGCGT	TCNTCCATAGAATCCCCCGTTG	+	chr3L	21905366	+	chr3L	21905446	80	+	chr3L	21905366	+	chr3L	21905446
ATCGTTTGNAGTTGACATAAACACCGGGATAGTTTTTGTTGGCAATTAAGTGCATGCTGCCATCCGGCCCCTTG:1	ATCGTTTGNAGTTGACATAAAC	CATGCTGCCATCCGGCCCCTTG	+	chr3L	7541620	+	chr3L	20046778	12505158	+	chr3L	7541620	+	chr3L	20046778
TAAACAGCACCTTTTANTGATAGNCAATCCGGANTTCGNAAGGCCCTCCACTCGTAAGGCAC:1	TAAACAGCACCTTTTANTGATA	AGGCCCTCCACTCGTAAGGCAC	-	chr3R	19225029	-	chr3R	19227225	2196	+	chr3R	19227225	+	chr3R	19225029
TCTGCCGNCGAAGCACTGCGCATAATCACAACAAGATAAACAACAACGACAACTCAAACATAACATGGAGAACG:1	TCTGCCGNCGAAGCACTGCGCA	CTCAAACATAACATGGAGAACG	+	chr2R	14030198	+	chr2R	10430574	3599624	+	chr2R	14030198	+	chr2R	10430574
TGAAAAAAAAAAACAAAANACTTTGGGCAGTGGGAGACCGCNTACNAGGAACTATGCTGAAATCCCCAC:1	TGAAAAAAAAAAACAAAANACT	GGAACTATGCTGAAATCCCCAC	+	chr3R	10137524	+	chr3R	29968985	19831461	+	chr3R	10137524	+	chr3R	29968985
GCCAGAAAGCCAAGCAGGNGAATGCCAAGGGCCGCCGCATTAANTAGCGNTCATCAATCATGTTTGACCGCAGT:1	GCCAGAAAGCCAAGCAGGNGAA	ATCAATCATGTTTGACCGCAGT	+	chrX	1850863	+	chrX	5190694	3339831	+	chrX	1850863	+	chrX	5190694
GTCTCCAAAGTGCCGGGCTTAAAACTAAAAAAAAGACACACACACAGCACTCAAGAACACAGATCAAGG:1	GTCTCCAAAGTGCCGGGCTTAA	CACTCAAGAACACAGATCAAGG	-	chrX	17359571	-	chrX	13696748	3662823	+	chrX	13696748	+	chrX	17359571
ATCTGCTGATGATGCAGTCTCTGGTGACTGAATGGGGTGCAGTATGCTTCAGCGTTTGCTAAATATAAACACTC:1	ATCTGCTGATGATGCAGTCTCT	CGTTTGCTAAATATAAACACTC	+	chr2R	14955211	+	chr2R	14955360	149	+	chr2R	14955211	+	chr2R	14955360
CAGCAGAAGCAGCGATAATGAAGTGAAAAAATATGACAAAAAAAAAATGAAAAAAAAGAGAAATCATACTAAAA:1	CAGCAGAAGCAGCGATAATGAA	AAAAAGAGAAATCATACTAAAA	+	chr3R	8180865	+	chr3R	8480217	299352	+	chr3R	8180865	+	chr3R	8480217
TTTTTATTTTGGTTTATTAATTGAGGTTGGAATGTGTAGGGAAATTTATTTTGCTATGGGAAATAGGAAAACCT:1	TTTTTATTTTGGTTTATTAATT	GCTATGGGAAATAGGAAAACCT	-	chr2R	7290319	-	chr2R	7290218	101	+	chr2R	7290218	+	chr2R	7290319
GAACGTACATATGTACATACATATATCCCATCCATCTATATGCCCAGCGCA:1	GAACGTACATATGTACATACAT	ATCCATCTATATGCCCAGCGCA	-	chr3L	409740	-	chr3L	402711	7029	+	chr3L	402711	+	chr3L	409740
GCAAACGACGATGTCCTTAAGCTGCTTGTGCAATTGCCGCTTACTTCAAATGGCCATTCATCAGACTCGTTGAAT:1	GCAAACGACGATGTCCTTAAGC	CCATTCATCAGACTCGTTGAAT	-	chr3L	12933193	-	chr3L	12933109	84	+	chr3L	12933109	+	chr3L	12933193
TGGAAAATGGTGGGGTAAAGNCGTTCGGAGAANAAAGCAAATNTGTATAAATTTCACCAAAACATATTTCACTTT:1	TGGAAAATGGTGGGGTAAAGNC	TCACCAAAACATATTTCACTTT	-	chr3R	28943604	-	chr3R	29707419	763815	+	chr3R	29707419	+	chr3R	28943604
CGTGTTGACTTTTGTTTGGCTTTCCACATATTGTTTGGTTTGCTCCATCNCCTTTTGTCTTTAACCTTCACCCCA:1	CGTGTTGACTTTTGTTTGGCTT	TTTGTCTTTAACCTTCACCCCA	+	chrX	18990377	+	chrX	3466889	15523488	+	chrX	18990377	+	chrX	3466889
CACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	CACACAACACAACACAACACAA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
CGTGAGAAGTAGCCAATCTTAAAACCCAATCTTAGTCGCCTGTTGTTTTTTTGTCCCCTTGCTTATAGGCAATG:1	CGTGAGAAGTAGCCAATCTTAA	GTCCCCTTGCTTATAGGCAATG	+	chr2R	11493285	+	chr2R	11493368	83	+	chr2R	11493285	+	chr2R	11493368
ACACACATACACTTGTACAAACGTATACATGTGCAGGAT:1	ACACACATACACTTGTACAAAC	CAAACGTATACATGTGCAGGAT	-	chrX	6804995	-	chrX	12365465	5560470	+	chrX	12365465	+	chrX	6804995
GGCAATCTAAAAGATTCGCTGATTGCCGTTTATTATTGGGTTAATTTCAAAACAGCAACTTCCTCGCACTCGCA:1	GGCAATCTAAAAGATTCGCTGA	CAGCAACTTCCTCGCACTCGCA	-	chr3L	7883917	-	chr3L	7883761	156	+	chr3L	7883761	+	chr3L	7883917
GAGAGGATGCTATGTCTGTTAATTTATTAATACAATTGATTTATGCACCGCCTCGAACTGCATCGCGAGCTGAC:1	GAGAGGATGCTATGTCTGTTAA	TCGAACTGCATCGCGAGCTGAC	+	chr3R	32007419	+	chr3R	16208110	15799309	+	chr3R	32007419	+	chr3R	16208110
ATAAGTTCCTTTGAGCTTATGATTATCATCATCAGACAAGATATGTGTTATATAAAGTGATAAAGTAATACTTTA:1	ATAAGTTCCTTTGAGCTTATGA	AAAGTGATAAAGTAATACTTTA	+	chr3R	18068012	+	chr3R	18068094	82	+	chr3R	18068012	+	chr3R	18068094
ATAATATACATAAGTAACGATTTTGCTTTGACTACGGTGTTTTCTTTTTTTAATGTGGATTTCTTT:1	ATAATATACATAAGTAACGATT	TTTTTTTAATGTGGATTTCTTT	-	chr2L	8109008	-	chr2L	8108921	87	+	chr2L	8108921	+	chr2L	8109008
AAAAAACTGAAATTTTAATTAATTCTGAGATGTGCAAAACAAGTGCATAATTGCAATTACGCAATCCTTTCGGAG:1	AAAAAACTGAAATTTTAATTAA	CAATTACGCAATCCTTTCGGAG	+	chr3R	29324320	+	chr3R	29324399	79	+	chr3R	29324320	+	chr3R	29324399
GTAAAAACTCAACCAGACCAGTCCCAAAGAGCCCAGATCCCAGAACAAGGAGAAACTAAAGGCGGCGGATGAGAA:1	GTAAAAACTCAACCAGACCAGT	AACTAAAGGCGGCGGATGAGAA	+	chr3L	3851728	+	chr3L	20801926	16950198	+	chr3L	3851728	+	chr3L	20801926
CGAAATTGAACGCTAGTTGGTCGGAAAGCTTTCATTGGTACTGAAAAGCACTGCACATAAGCACTTTTTTTTTAC:1	CGAAATTGAACGCTAGTTGGTC	CACATAAGCACTTTTTTTTTAC	-	chrX	3409065	-	chrX	3408988	77	+	chrX	3408988	+	chrX	3409065
AACTCCGGCGGCTGTGCTCCACTGCGGTGTACCAAAAAAACTAGAATATATTCGGGAATATTGATCAAATTTCG:1	AACTCCGGCGGCTGTGCTCCAC	CGGGAATATTGATCAAATTTCG	-	chr3R	18211928	-	chr3R	18211805	123	+	chr3R	18211805	+	chr3R	18211928
ATACGAAATCAGCTTACCCCACATGAGCCATCTCAAGATGAAGCGAGTGTTTATCCATATGCTCAGGAAAACT:1	ATACGAAATCAGCTTACCCCAC	TATCCATATGCTCAGGAAAACT	-	chr3R	8613725	-	chr3R	8613620	105	+	chr3R	8613620	+	chr3R	8613725
GTGTAACAAAAAGTGGGCAACTTTGCTAAATTGCCAGGGCAGTGGC:1	GTGTAACAAAAAGTGGGCAACT	GCTAAATTGCCAGGGCAGTGGC	+	chr2L	14564228	+	chr2L	14564275	47	+	chr2L	14564228	+	chr2L	14564275
ATTTGCCAAAGGCGGAACCGCAACTCAAGGAGTGGGTTGCNAAGTCAGAGGTCCACCATACAAGCT:1	ATTTGCCAAAGGCGGAACCGCA	TCAGAGGTCCACCATACAAGCT	-	chr2R	18848857	-	chr2R	19458521	609664	+	chr2R	19458521	+	chr2R	18848857
TTTGGGGTTTTCTTGTAATTTAATTTTGCGGTCANCCGACATGACACGTGTGTGGCTTTAATTTTTTAGGCATGG:1	TTTGGGGTTTTCTTGTAATTTA	GGCTTTAATTTTTTAGGCATGG	-	chr3R	19988925	-	chr3R	20807802	818877	+	chr3R	20807802	+	chr3R	19988925
TTCGACTTTCCATTAATGCATCGTATATTAAATTGAATGCAAACTTTGAATCATCACTCCGATTAGTCATCCT:1	TTCGACTTTCCATTAATGCATC	CATCACTCCGATTAGTCATCCT	+	chr2R	19680852	+	chr2R	19680927	75	+	chr2R	19680852	+	chr2R	19680927
GGATAAGATAACCAATGCTACAGTTTATAGTCTCTTTTATGCTGAAA:1	GGATAAGATAACCAATGCTACA	TATAGTCTCTTTTATGCTGAAA	-	chr3R	8107526	-	chr3R	8107420	106	+	chr3R	8107420	+	chr3R	8107526
TCGGATACCACCTCCATATTTTCAGATACCACCTCCTTTTGCTTATTT:1	TCGGATACCACCTCCATATTTT	TACCACCTCCTTTTGCTTATTT	-	chr3R	17083202	-	chr3R	17083128	74	+	chr3R	17083128	+	chr3R	17083202
TCATCTTATTGTTTTGGCAACTAAATGTTTCCCTATTAACTATTTAAATACTATTGTATTTATTTAGGGTATTTT:1	TCATCTTATTGTTTTGGCAACT	TTGTATTTATTTAGGGTATTTT	+	chr2R	6978658	+	chr2R	6978841	183	+	chr2R	6978658	+	chr2R	6978841
CGACGCCGATGTCCTGTCTGCTTCTTCTTCCTGTTCTTAAATGTTCGTGTTTTGGTAGTTTTCTTTTTTGGCTTT:1	CGACGCCGATGTCCTGTCTGCT	GGTAGTTTTCTTTTTTGGCTTT	+	chr3L	2829061	+	chr3L	2062650	766411	+	chr3L	2829061	+	chr3L	2062650
TTAATATACTTTACTACTTAATATATTAAGTAACTAANAAATGCANTTTCTGGCTTCAATTGAATTGGNATGG:1	TTAATATACTTTACTACTTAAT	GGCTTCAATTGAATTGGNATGG	-	chrX	450448	-	chrX	450372	76	+	chrX	450372	+	chrX	450448
AAATTATACGAAATATTCGAGCTCAGTTTTATATCCGCGGCGACTTTGTGCCTTTTTTTTTATCAANGTCCAGTG:1	AAATTATACGAAATATTCGAGC	TTTTTTTTATCAANGTCCAGTG	+	chr3R	30747576	+	chr3R	30747652	76	+	chr3R	30747576	+	chr3R	30747652
TGGCGAGGACTGAAAACGCAATTGACTTTTACCTGGTTTTCGAATGAGAGTCCGATTTGCGTGTTACGTGGGG:1	TGGCGAGGACTGAAAACGCAAT	CCGATTTGCGTGTTACGTGGGG	+	chr3L	22570431	+	chr3L	22570573	142	+	chr3L	22570431	+	chr3L	22570573
TCCAATGCAAAATCAATACACATTAACTAAGGCATGGGAGTGAATCCCAAAGAACGCATTAGCCTCCCTTTTG:1	TCCAATGCAAAATCAATACACA	GAACGCATTAGCCTCCCTTTTG	+	chr2L	9303521	+	chr2L	9303599	78	+	chr2L	9303521	+	chr2L	9303599
ATTTTCTTATCTTGAAATATTAGGCATTCAATTGCTAAGTCGAATTAAGNTCCACCCTAAAAGCATTTTTATGC:1	ATTTTCTTATCTTGAAATATTA	CACCCTAAAAGCATTTTTATGC	+	chr3L	15643608	+	chr3L	15643894	286	+	chr3L	15643608	+	chr3L	15643894
CGATTGGGTGGTGATATTATTAATGCTATTAAGCGCAAAAAGTTATACAAAGAAGAAGATCATAGATTAAGCCAC:1	CGATTGGGTGGTGATATTATTA	AGAAGATCATAGATTAAGCCAC	+	chr3R	29590374	+	chr3R	29590467	93	+	chr3R	29590374	+	chr3R	29590467
AGGTTCTTGCGGTAATTGTGTTGATTCATCACTGCAAAAC:1	AGGTTCTTGCGGTAATTGTGTT	TGTTGATTCATCACTGCAAAAC	+	chr3L	158046	+	chr3L	10650005	10491959	+	chr3L	158046	+	chr3L	10650005
ATCCACTCAAGTGCAATGACATCATGGCAAGCATTCATAATGCTCACCCGGTGGCCATGTCAAAATGCCATTTTT:1	ATCCACTCAAGTGCAATGACAT	GCCATGTCAAAATGCCATTTTT	+	chr3R	17348730	+	chr3R	17348819	89	+	chr3R	17348730	+	chr3R	17348819
CGCCAGAAAAACAAAGATGAAGCACTACATCCCCCATTTCGCTAGCTATTACACTTGAATGCCTTATTTGTCAT:1	CGCCAGAAAAACAAAGATGAAG	ACTTGAATGCCTTATTTGTCAT	-	chrX	835403	-	chrX	827612	7791	+	chrX	827612	+	chrX	835403
TGTATAAATACATAATTGTATGTGCATACCACTTAATTTAATGCGTCGTTCTATGACTTTTTGATTATAGAGCTT:1	TGTATAAATACATAATTGTATG	TGACTTTTTGATTATAGAGCTT	-	chrX	20037715	-	chrX	20037636	79	+	chrX	20037636	+	chrX	20037715
CGCAAGGCTGCAATCGCCCTATCGATAGTTATATGTATGTATGTAGAATTTGTCAGAAATTTTCTCGCACACAGC:1	CGCAAGGCTGCAATCGCCCTAT	CAGAAATTTTCTCGCACACAGC	-	chr2R	6696692	-	chr2R	6696609	83	+	chr2R	6696609	+	chr2R	6696692
CAGGACTTGCCTTTAGCGCCATAAGTTCGCGCAAATAAACACAATTGAGCAGAATGGAATGGACAGAATTG:1	CAGGACTTGCCTTTAGCGCCAT	CAGAATGGAATGGACAGAATTG	-	chr2L	13321991	-	chr2L	13321906	85	+	chr2L	13321906	+	chr2L	13321991
CTTTGCGTTTCTCCTTATACTAACTCCGTGAAAGCCACCCAACCGTCGCAGGCAACAAATTAAATGCGGAAAATA:1	CTTTGCGTTTCTCCTTATACTA	AACAAATTAAATGCGGAAAATA	-	chr2L	14121882	-	chr2L	14121800	82	+	chr2L	14121800	+	chr2L	14121882
TTTTGAATTCGCAGGAACCTTACATACTTCTAAAATTGGAGTTAACANCTTCTGTTGTTCTCTTTAANAGATTAG:1	TTTTGAATTCGCAGGAACCTTA	GTTGTTCTCTTTAANAGATTAG	-	chr3R	19449447	-	chr3R	19448702	745	+	chr3R	19448702	+	chr3R	19449447
AATGAAAAAAGGTTTTCTTGCCACGTGCAGTTCACAAAGGCTGTAAGAGAGTGTGAGTGCGTTTTAA:1	AATGAAAAAAGGTTTTCTTGCC	AGAGAGTGTGAGTGCGTTTTAA	-	chr3L	22178722	-	chr3L	4189649	17989073	+	chr3L	4189649	+	chr3L	22178722
CCAACTTAGGACATGGTGAAGACCCCTTACATTTTGCATACTGATAATGGGGCCATCGTGTGGGAATCAGCCCGA:1	CCAACTTAGGACATGGTGAAGA	CATCGTGTGGGAATCAGCCCGA	-	chr3L	22169546	-	chr3L	22169453	93	+	chr3L	22169453	+	chr3L	22169546
CCCTGCAAGTAGTTAATTTCAATGAGCATCCATCCGCTCGAGTGACGGGCATCAACTAACGGCATGC:1	CCCTGCAAGTAGTTAATTTCAA	CGGGCATCAACTAACGGCATGC	+	chr2R	12598921	+	chr2R	9721557	2877364	+	chr2R	12598921	+	chr2R	9721557
CAATATCCAAACATTTATCATTTCTAGTATAAAGTTTTCAAATTAAANCTTATATTGTTAATTTAGCCGAGAGTA:1	CAATATCCAAACATTTATCATT	ATTGTTAATTTAGCCGAGAGTA	-	chr2L	11828520	-	chr2L	11828444	76	+	chr2L	11828444	+	chr2L	11828520
CTCAGATCGACTTAATTTTAAACTGTTTTGGTTATTATTTTAACAATCCCATTATCATCAACGCCCATTGCCTTT:1	CTCAGATCGACTTAATTTTAAA	ATCATCAACGCCCATTGCCTTT	+	chr3L	9512743	+	chr3L	4751427	4761316	+	chr3L	9512743	+	chr3L	4751427
ATTTGCATGTTTTATTGTANCTGCTGTTCTCCCACGTTTAGGCGGGGGTGGAATGCGGTAGCGGAAAAGGACAGG:1	ATTTGCATGTTTTATTGTANCT	TGCGGTAGCGGAAAAGGACAGG	-	chr2R	21594305	-	chr2R	21593595	710	+	chr2R	21593595	+	chr2R	21594305
GTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTTTTTGTCTTTTTTTTTGTTTTTGTT:1	GTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCT	TGTCTTTTTTTTTGTTTTTGTT	-	chrX	16983076	-	chrX	19185099	2202023	+	chrX	19185099	+	chrX	16983076
GGTGGTTTGATTNTTTTTTCGTTTGTCCATNTNTTTGTNGTCACACACACACACACACACACACACACAGAG:1	GGTGGTTTGATTNTTTTTTCGT	ACACACACACACACACACAGAG	+	chrX	9675153	+	chrX	7978952	1696201	+	chrX	9675153	+	chrX	7978952
AAATATAAATTCAGCTTGAAATCGTTTTATATGCCGCAATTACCATCGCAATTTCAATTTGCTCTCTTNTTGATG:1	AAATATAAATTCAGCTTGAAAT	TCAATTTGCTCTCTTNTTGATG	-	chr2R	22767669	-	chr2R	22767584	85	+	chr2R	22767584	+	chr2R	22767669
TCATTTCTGTATGCATCCATAATTTTATCTTTCAAATTAAATTCCTTACTAAATTTATAAAACTATAACTAGAAA:1	TCATTTCTGTATGCATCCATAA	TTTATAAAACTATAACTAGAAA	+	chr3R	27028730	+	chr3R	27028809	79	+	chr3R	27028730	+	chr3R	27028809
TATTTTGGTTCAGTTTGGCAATGTGCAATTCTTTTGCTACAATACATNGCTA:1	TATTTTGGTTCAGTTTGGCAAT	CTTTTGCTACAATACATNGCTA	-	chrX	3513848	-	chrX	3513788	60	+	chrX	3513788	+	chrX	3513848
TTCAATAGGGGTTTCCTTTACAGTTTGTACTCTTGGTAATTAATATTATCAAATACGGCTT:1	TTCAATAGGGGTTTCCTTTACA	TTAATATTATCAAATACGGCTT	+	chr3R	18513852	+	chr3R	30605548	12091696	+	chr3R	18513852	+	chr3R	30605548
ACATAATTAAACACAAAGCCCATATGCTATCTGTTCGNAAACGTANTTAATATATTTTTTTAAACACTNTTA:1	ACATAATTAAACACAAAGCCCA	TATATTTTTTTAAACACTNTTA	-	chr2R	21963281	-	chr2R	21963199	82	+	chr2R	21963199	+	chr2R	21963281
AAGGAGTGATGCATTAAAACCAGGTGTTANTTAACGTTAGTAATTATGGGGGGGTGGGTG:1	AAGGAGTGATGCATTAAAACCA	AGTAATTATGGGGGGGTGGGTG	-	chr3R	26601020	-	chr3R	26600950	70	+	chr3R	26600950	+	chr3R	26601020
TATTTAGTTATAGGCTTGATGGATTTAAAAGGTTCAAAGGTTTTGACTACATATTTTAGAAAAATAAAAAGATG:1	TATTTAGTTATAGGCTTGATGG	ATTTTAGAAAAATAAAAAGATG	+	chr3L	642472	+	chr3L	642562	90	+	chr3L	642472	+	chr3L	642562
CAAACATTGAATAATTATTTTCCCAAGTCCCAAAAAATACCCCACTCCCTTCACATCCAATAGTTGTGACAAATG:1	CAAACATTGAATAATTATTTTC	CATCCAATAGTTGTGACAAATG	-	chr3R	26013933	-	chr3R	26013853	80	+	chr3R	26013853	+	chr3R	26013933
CAGTTTCTTGTGGCTTCGAGGCGTACCCAGCTGGTTCGCTTCTCAGACATTACTCA:1	CAGTTTCTTGTGGCTTCGAGGC	TTCGCTTCTCAGACATTACTCA	-	chr3R	9948058	-	chr3R	9947960	98	+	chr3R	9947960	+	chr3R	9948058
GGTCTCTCTGCGGTGCTCATCTCCAGCTGGTGATTAAATTTTCAGTTTTACGGCAACATTTTTGGGGG:1	GGTCTCTCTGCGGTGCTCATCT	TTTACGGCAACATTTTTGGGGG	+	chr2L	2472375	+	chr2L	4757732	2285357	+	chr2L	2472375	+	chr2L	4757732
GGATTTATNTGTAGATGACGTGTTTAGGCTGACTTNTCTTGCAAAAAGTTGATTGATAGTTACGACAGA:1	GGATTTATNTGTAGATGACGTG	GTTGATTGATAGTTACGACAGA	+	chr2R	24008443	+	chr2R	24008523	80	+	chr2R	24008443	+	chr2R	24008523
GTGAAAAAGAGCTCCAGTCGAAGCTGAGGCCGAACAATATGCGAGACTGCGGCGTCATTGTTGCAAAATTGCGA:1	GTGAAAAAGAGCTCCAGTCGAA	CGTCATTGTTGCAAAATTGCGA	-	chr2R	9129644	-	chr2R	9129558	86	+	chr2R	9129558	+	chr2R	9129644
TGGATGGGCTTGAAATACTCTCCTTTCTTCCCGCCGTCAGATTAGCANTGGTCCAATACGCNACCAAAAATTTTA:1	TGGATGGGCTTGAAATACTCTC	CAATACGCNACCAAAAATTTTA	+	chr3R	27856765	+	chr3R	27858248	1483	+	chr3R	27856765	+	chr3R	27858248
TCCGATCTNGATTTATTGAAATGAAATGTTACTTATGCTCAAACATATTATCATTGAAGATGATTTTATGCTTTT:1	TCCGATCTNGATTTATTGAAAT	TTGAAGATGATTTTATGCTTTT	+	chrX	10686076	+	chrX	10691213	5137	+	chrX	10686076	+	chrX	10691213
AATAAAACATTCGTGGAATCTATTCACATTTTATTACAATCAACTGCNA:1	AATAAAACATTCGTGGAATCTA	ATTTTATTACAATCAACTGCNA	+	chr3L	19430433	+	chr3L	19430485	52	+	chr3L	19430433	+	chr3L	19430485
AACCTGGTAAACGATCGCACCTTCAACATACGGCCATCATTTTCAGGCCATCATCAAAAGGCTTCAAGACTTCTG:1	AACCTGGTAAACGATCGCACCT	TCAAAAGGCTTCAAGACTTCTG	+	chr2R	5947957	+	chr2R	5948108	151	+	chr2R	5947957	+	chr2R	5948108
GCAAATAATGCACTTGAATNTGCATAAAGAATTTGCGAGTAAATTCGCAAAAATTTATGCAA:1	GCAAATAATGCACTTGAATNTG	AAATTCGCAAAAATTTATGCAA	-	chr3L	10308833	-	chr3L	10308769	64	+	chr3L	10308769	+	chr3L	10308833
AAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAAAAAAATGTCGAAGGAAACTTAAATTGTTAAAGCCCAAAAT:1	AAGCTCTACAGTCATTAGCACT	TTAAATTGTTAAAGCCCAAAAT	+	chr2L	9393528	+	chr2L	9396495	2967	+	chr2L	9393528	+	chr2L	9396495
ATATATATATACATACAGATATACTTTTCTGTTACATACATATTTACTTATTTTATTATATTTCAATAGAAACAA:1	ATATATATATACATACAGATAT	TATTATATTTCAATAGAAACAA	+	chrX	2480079	+	chrX	12891615	10411536	+	chrX	2480079	+	chrX	12891615
TGTCGTATACTTATACCAGTCAACCTCCTATGATCCCAAAACCTCATCACTGACTGCTTAGTGAGATAACCCAAA:1	TGTCGTATACTTATACCAGTCA	CTGCTTAGTGAGATAACCCAAA	-	chr3R	31522813	-	chr3R	31522482	331	+	chr3R	31522482	+	chr3R	31522813
ACGCACTTGACACAGTGGAAAACCCCTCCATGGATCAGACCT:1	ACGCACTTGACACAGTGGAAAA	AACCCCTCCATGGATCAGACCT	+	chr2R	22837515	+	chr2R	22834799	2716	+	chr2R	22837515	+	chr2R	22834799
AATATGTATTTAAATGGTTACTTTATTAATCAATGATCTGTTACACGTGCGTTC:1	AATATGTATTTAAATGGTTACT	ATGATCTGTTACACGTGCGTTC	-	chr3L	1163282	-	chr3L	1154153	9129	+	chr3L	1154153	+	chr3L	1163282
CCAGTATTNTCGGTTTCTTATTTTTTTTTTTGT:1	CCAGTATTNTCGGTTTCTTATT	GGTTTCTTATTTTTTTTTTTGT	-	chr3R	6013988	-	chr3R	13653778	7639790	+	chr3R	13653778	+	chr3R	6013988
ATATGCGCTTAAATGCCCNCAAAATGTACGGGCATGGCTTTNGGTNGGAGATGGTGTGGGTGTGGATGTGTGTG:1	ATATGCGCTTAAATGCCCNCAA	GGTGTGGGTGTGGATGTGTGTG	+	chr2L	14942842	+	chr2L	9947630	4995212	+	chr2L	14942842	+	chr2L	9947630
GTTCGCTACAGCAATCTGTCTACCAAGAAATTCGAAAAAATTCACTTTTGATTCAANAG:1	GTTCGCTACAGCAATCTGTCTA	AAATTCACTTTTGATTCAANAG	+	chr2R	12878766	+	chr2R	11183158	1695608	+	chr2R	12878766	+	chr2R	11183158
AAACATTGAATAATTATTTTCCCAAGTCCCAAAAAATACCCCACTCCCTTCACATCCAATAGTTGTGACAA:1	AAACATTGAATAATTATTTTCC	TCACATCCAATAGTTGTGACAA	-	chr3R	26013932	-	chr3R	26013856	76	+	chr3R	26013856	+	chr3R	26013932
CATTTAATGCAAGGTAAATTGCATTGATTTCGTGATTAATGAGAGTTTCGCATTTCACCAG:1	CATTTAATGCAAGGTAAATTGC	TGAGAGTTTCGCATTTCACCAG	+	chr3R	6737519	+	chr3R	6739292	1773	+	chr3R	6737519	+	chr3R	6739292
AGTTGCTGCAGTTGTTGCAGTTGCTGCAGTTT:1	AGTTGCTGCAGTTGTTGCAGTT	GTTGTTGCAGTTGCTGCAGTTT	-	chr3L	8856252	-	chr3L	22139606	13283354	+	chr3L	22139606	+	chr3L	8856252
ATAAACTTGTCTATCAGTAATCTGTTTCTTGGGCTAGATGAGAAGCCAGTCCTCAGGGGAGGCAGCTCCGAAAA:1	ATAAACTTGTCTATCAGTAATC	TCAGGGGAGGCAGCTCCGAAAA	+	chr3R	32022323	+	chr3R	32022424	101	+	chr3R	32022323	+	chr3R	32022424
CAGATGGTTGAAAGGGAAAGGAAAGTGGCCTCCTCTTTTGTTTATTATGCCCAGGGTTTATTTTTATTTTGTCTA:1	CAGATGGTTGAAAGGGAAAGGA	GGGTTTATTTTTATTTTGTCTA	-	chr3L	19565077	-	chr3L	19564983	94	+	chr3L	19564983	+	chr3L	19565077
CTCCGAAAGGATTGCGTAATTGCAATTATGCACTTGTTTTGCACATCTCAGTAT:1	CTCCGAAAGGATTGCGTAATTG	CTTGTTTTGCACATCTCAGTAT	-	chr3R	29324399	-	chr3R	29324341	58	+	chr3R	29324341	+	chr3R	29324399
CATATACATTTAATGCACAAACATATACATGTATTAATGTATTAGATTAGGACCAGTCAGAGGAATGAAACCTTG:1	CATATACATTTAATGCACAAAC	CAGTCAGAGGAATGAAACCTTG	+	chr3L	7793741	+	chr3L	7800793	7052	+	chr3L	7793741	+	chr3L	7800793
CAGTACAACAGGCGCTATCAGCCTGGGCCTAACCTACCAAAAGTTAGTAACATGTATTCTTTT:1	CAGTACAACAGGCGCTATCAGC	AGTTAGTAACATGTATTCTTTT	-	chr2L	15883086	-	chr2L	15865295	17791	+	chr2L	15865295	+	chr2L	15883086
ATTACACGACCATCCAGTGTATTCCCAGAATATGTGANACATCCC:1	ATTACACGACCATCCAGTGTAT	CCCAGAATATGTGANACATCCC	-	chr3L	4958502	-	chr3L	4958444	58	+	chr3L	4958444	+	chr3L	4958502
CTTCTCCAATCATCCATCCCAGTCAGCCCATCCGAGCAAAAGACCTTTTNTTATTATGAATAAGCCGAAATACAC:1	CTTCTCCAATCATCCATCCCAG	TTATGAATAAGCCGAAATACAC	+	chr3R	4408413	+	chr3R	4412717	4304	+	chr3R	4408413	+	chr3R	4412717
TCAATTGCAATAAATAAATTAATCCCAGGTTTTGGGATTTTGTTCACCCAATTGGGCTTGTTGTTAGAGCCCGAG:1	TCAATTGCAATAAATAAATTAA	GGGCTTGTTGTTAGAGCCCGAG	-	chr3L	22544479	-	chr3L	22544402	77	+	chr3L	22544402	+	chr3L	22544479
TAGATTTCGAAGAGAGGATCTCGTCGTCTTACGCTGTGCGNTTAAAACTCG:1	TAGATTTCGAAGAGAGGATCTC	TACGCTGTGCGNTTAAAACTCG	+	chr3L	16494004	+	chr3L	16494497	493	+	chr3L	16494004	+	chr3L	16494497
AAATGCGTGTATGAGCATTTTCTCTTCAATTAAAACATCTTTAAAATATTGCTTTAAGCAACCTGAAGCAAGCTG:1	AAATGCGTGTATGAGCATTTTC	TTAAGCAACCTGAAGCAAGCTG	-	chr2L	5508634	-	chr2L	5508558	76	+	chr2L	5508558	+	chr2L	5508634
ATAAAACTCTAGATCTCTACTCTTCAAACATTACATTTTATTGAAATTTTCATCTAATTTTTAAATTTGTTCAAA:1	ATAAAACTCTAGATCTCTACTC	CTAATTTTTAAATTTGTTCAAA	-	chr3R	23360275	-	chr3R	23360199	76	+	chr3R	23360199	+	chr3R	23360275
CATCGCCATCACCAACATCGCATGGCTAATTAGTCACGCCCGCATGGTTCCCTCCCAGTCCGATGCCCCATAC:1	CATCGCCATCACCAACATCGCA	CTCCCAGTCCGATGCCCCATAC	-	chr3L	1347263	-	chr3L	1347180	83	+	chr3L	1347180	+	chr3L	1347263
TCAAAAACAAAAATAAGCCGAACCTAATCAGTGACGAGTCCATCATCCAAAGCCCCCACCCCAAATGATCCA:1	TCAAAAACAAAAATAAGCCGAA	AGCCCCCACCCCAAATGATCCA	+	chr2L	6665709	+	chr2L	5429775	1235934	+	chr2L	6665709	+	chr2L	5429775
TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTTTGGTTT:1	TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTG	TTTGTGTTTGTGTTTTTGGTTT	+	chr2L	16071771	+	chr2L	1533439	14538332	+	chr2L	16071771	+	chr2L	1533439
GAGACGTCTGCACACGAGCAGCTTCCGCGCGCGTCTGATAAGACGAGGTCCGTCT:1	GAGACGTCTGCACACGAGCAGC	TCTGATAAGACGAGGTCCGTCT	-	chr3L	866487	-	chr3L	858026	8461	+	chr3L	858026	+	chr3L	866487
AGCTGTACGGCATGATTCACGCCCGATACATAGTGTCGAAGCGGGGCCTGAATGTCCAAAGATCTCCTGTAACTG:1	AGCTGTACGGCATGATTCACGC	GTCCAAAGATCTCCTGTAACTG	-	chrY	975896	-	chrY	975816	80	+	chrY	975816	+	chrY	975896
GACCACACACCAGGTTGGACAAACTGTTGGACTCCGTAGAGCAGCCCCTTAGCCAGGCAGAGGAGTACGTAAAAT:1	GACCACACACCAGGTTGGACAA	CAGGCAGAGGAGTACGTAAAAT	+	chr2R	9166032	+	chr2R	10887696	1721664	+	chr2R	9166032	+	chr2R	10887696
GCTGACAGCTGTTCTCCTTCCGATAAGATGAGCCCTAATCTCAGGGAGCTACCTACCAACATTTATGTGTCTC:1	GCTGACAGCTGTTCTCCTTCCG	CCTACCAACATTTATGTGTCTC	+	chr3L	21172862	+	chr3L	21172963	101	+	chr3L	21172862	+	chr3L	21172963
AATTTTACAAAATGCTGGCATCCGTCCGAGGAGCCAGCACTACACCACTGGCATGATAACTCCCCCGAACACCA:1	AATTTTACAAAATGCTGGCATC	ATGATAACTCCCCCGAACACCA	+	chr3R	22206261	+	chr3R	30178477	7972216	+	chr3R	22206261	+	chr3R	30178477
ATGTGGTCCACATGCCAAGACAACGGATAGTAGTAATTTTGGATAGGCCTGCACCCCAGCGAAAAANGATACTT:1	ATGTGGTCCACATGCCAAGACA	ACCCCAGCGAAAAANGATACTT	-	chrX	680929	-	chrX	680847	82	+	chrX	680847	+	chrX	680929
GTGCACTTTCGCTAGTCGTTAGGGCTACAAATCGTTACCTCAGGCTAAGTAATGTTTATTTTTAAATGAAAATT:1	GTGCACTTTCGCTAGTCGTTAG	TGTTTATTTTTAAATGAAAATT	+	chr2R	7899536	+	chr2R	10066498	2166962	+	chr2R	7899536	+	chr2R	10066498
AATGAACTCCAAACGTAGGCAGCTCCACAGGAGCGGATGGTGGGCCGCTGGGTGGCTTTGGGGGTGTCTTT:1	AATGAACTCCAAACGTAGGCAG	GGGTGGCTTTGGGGGTGTCTTT	-	chr2R	6101937	-	chr2R	6096743	5194	+	chr2R	6096743	+	chr2R	6101937
TTGACAAATCTGTTCAGTGCCGGATTAAGCTTCACTTGTGAGCCACCATTGCGATGACTATTCTCGTGCGCACAC:1	TTGACAAATCTGTTCAGTGCCG	ATGACTATTCTCGTGCGCACAC	+	chrX	15413050	+	chrX	15417352	4302	+	chrX	15413050	+	chrX	15417352
AGCACATTATTGGCGCTTGAAGAAGTGGCGCATATGGGTTAATGAATGATTGCCCCCGTACACATTGCATTACGT:1	AGCACATTATTGGCGCTTGAAG	CCCCGTACACATTGCATTACGT	+	chr3R	12080865	+	chr3R	12080942	77	+	chr3R	12080865	+	chr3R	12080942
ACAGCGATCACCGACGCATNTCTGACGCAGTGCAGAAAGTGAGAGAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAG:1	ACAGCGATCACCGACGCATNTC	AGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAG	-	chrX	15593784	-	chrX	12649915	2943869	+	chrX	12649915	+	chrX	15593784
AATAAATAAACTGAAATTGTCGGAGAAGGGATTTGCTTAAAGTGCAGTCGAGCTGGAGAACCTAATCCCAGCGGA:1	AATAAATAAACTGAAATTGTCG	TGGAGAACCTAATCCCAGCGGA	-	chr2R	19066514	-	chr2R	19843372	776858	+	chr2R	19843372	+	chr2R	19066514
TTCAAAAAAAGGTAGTATGGTTGAAACACCTACATGGGTGAATGACTACGATTATTTGAGTACTATTATGCTATT:1	TTCAAAAAAAGGTAGTATGGTT	ATTTGAGTACTATTATGCTATT	+	chr3R	5067999	+	chr3R	5073516	5517	+	chr3R	5067999	+	chr3R	5073516
GTACAGAGAGCGCCAGTTNCAATTGCCTCAAGCAGTTTACCTANAACGANCCCAAGAGACACACGAATCTTAAAT:1	GTACAGAGAGCGCCAGTTNCAA	AAGAGACACACGAATCTTAAAT	+	chr2R	13217186	+	chr2R	23030403	9813217	+	chr2R	13217186	+	chr2R	23030403
TATGGGGTATGGAGTAGGTAGAGTACTCGCACGTCCACACGTCCGCANGTTGTTTTTCGTATTCAAAATTAATC:1	TATGGGGTATGGAGTAGGTAGA	TTTTTCGTATTCAAAATTAATC	-	chr2L	21196317	-	chr2L	21196192	125	+	chr2L	21196192	+	chr2L	21196317
TGTCCTTTTTCAGCGCCAGCTGTTACCAAATAATAATTTTTGGTGGCATCCAACAAA:1	TGTCCTTTTTCAGCGCCAGCTG	ATTTTTGGTGGCATCCAACAAA	+	chrX	8371177	+	chrX	8371321	144	+	chrX	8371177	+	chrX	8371321
TGNCAACTCTGACGCAGTGCTTCCAATTCAGATTNANCGCGTGTGCGCAGCGCTTCCAGTCCGCTTACTTGTTG:1	TGNCAACTCTGACGCAGTGCTT	CTTCCAGTCCGCTTACTTGTTG	+	chrX	3957892	+	chrX	3958070	178	+	chrX	3957892	+	chrX	3958070
TTTCCGAGTAACAACCAGGTTTCCGAGGAACCAGCCATCTTTCGATCCTGAAGATGTTTTCCTACGAAATAAGA:1	TTTCCGAGTAACAACCAGGTTT	GATGTTTTCCTACGAAATAAGA	-	chrX	19662270	-	chrX	19662048	222	+	chrX	19662048	+	chrX	19662270
CCAGGTATTTACTTGTAATGTATAACTTTATCATTTCATAACCAAACCAGGTGTAATGGACCTGAGAGTCTCCGC:1	CCAGGTATTTACTTGTAATGTA	TAATGGACCTGAGAGTCTCCGC	+	chr2L	20901487	+	chr2L	20902651	1164	+	chr2L	20901487	+	chr2L	20902651
CCGTAAATTTCACTTTAAAATCATATGTGTAAGAGGAAAACAGCAAATAAAATCTGGATTTTTGTGGCATGTAAA:1	CCGTAAATTTCACTTTAAAATC	CTGGATTTTTGTGGCATGTAAA	+	chr3L	5570455	+	chr3L	5495373	75082	+	chr3L	5570455	+	chr3L	5495373
ATTTGTCCTCTGGACTAGACCACTAGTCCTGCCCTGCCTGAGTAGCGATTGTGAAATATGCAG:1	ATTTGTCCTCTGGACTAGACCA	GTAGCGATTGTGAAATATGCAG	-	chr3R	23572886	-	chr3R	23572778	108	+	chr3R	23572778	+	chr3R	23572886
ACCAAAANGAAATAAACATTAGAAAGAAATAAACCCACANCCAGGAGAAAATAAAAGNACAACCAAATTCACGAG:1	ACCAAAANGAAATAAACATTAG	AAAGNACAACCAAATTCACGAG	+	chrX	20992101	+	chrX	14957542	6034559	+	chrX	20992101	+	chrX	14957542
AGCTTATATAGAAACTATTTTAAATGATTTCACCCTTAAAATATTCCCGNTGAGTTCAATACAACACCCCCGCCC:1	AGCTTATATAGAAACTATTTTA	GTTCAATACAACACCCCCGCCC	-	chr2R	19679233	-	chr2R	11615443	8063790	+	chr2R	11615443	+	chr2R	19679233
GTTTCTCACCTACACACGTGTGCGTTTATGACATTGATAGCTGAAGCCGAAACCCAAGGATTAATTAAATAAT:1	GTTTCTCACCTACACACGTGTG	ACCCAAGGATTAATTAAATAAT	-	chr3R	31026588	-	chr3R	31026509	79	+	chr3R	31026509	+	chr3R	31026588
CTGCTCCTAAACGGCCTTTGTCCGCCTGTCCACCCCCTTTGGCCATTTAGCGGCACTTGCTT:1	CTGCTCCTAAACGGCCTTTGTC	GGCCATTTAGCGGCACTTGCTT	+	chr3L	20590088	+	chr3L	20590614	526	+	chr3L	20590088	+	chr3L	20590614
CGATCACAACACACGCCGGCTAATTTGCATAAATTTTTTCGAATTTACTCGCAAATTCTTTATGCAAATT:1	CGATCACAACACACGCCGGCTA	TCGCAAATTCTTTATGCAAATT	+	chr3L	10308745	+	chr3L	10308817	72	+	chr3L	10308745	+	chr3L	10308817
CCGATTAGTTACCGCCTTAGACAATGCGTTCACTAGGCTAAGAAGCTAGACGGGAATGGAGGAGTCAAAGCTGTA:1	CCGATTAGTTACCGCCTTAGAC	GAATGGAGGAGTCAAAGCTGTA	-	chr3R	29032830	-	chr3R	29032753	77	+	chr3R	29032753	+	chr3R	29032830
GGAACATGAATTTAAATAGAATTCAAATAGAGTGCGTAAGCGGACAAGAATAAAATATTTCACAGCTTTGAGAAT:1	GGAACATGAATTTAAATAGAAT	AATATTTCACAGCTTTGAGAAT	-	chr3R	28393828	-	chr3R	28393728	100	+	chr3R	28393728	+	chr3R	28393828
CTACTGATATNCCCTATGTTCATAATTTGTCTTATAAATCTGCCAAAACTGAACTACATAAACTCAACTCTCAAT:1	CTACTGATATNCCCTATGTTCA	CTACATAAACTCAACTCTCAAT	+	chr2R	6170619	+	chr2R	24848779	18678160	+	chr2R	6170619	+	chr2R	24848779
AAAGTTGGATTAAATATCATACATATATATTTTATAAACTNAAAAATGGTAAAGCAAAGCGAGACTG:1	AAAGTTGGATTAAATATCATAC	ATGGTAAAGCAAAGCGAGACTG	+	chr2L	4661857	+	chr2L	4669429	7572	+	chr2L	4661857	+	chr2L	4669429
CGCAGGCGTTTCTGCATCTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAA:1	CGCAGGCGTTTCTGCATCTCTG	AGGGCATCCATGTGTTCCACAA	-	chr2R	12187497	-	chr2R	12190124	2627	+	chr2R	12190124	+	chr2R	12187497
GTNTCCCATTCGCCAGCTCTCACCACCAGATCATACNTGGTTGTTCCATTCAGAANATGAG:1	GTNTCCCATTCGCCAGCTCTCA	GTTGTTCCATTCAGAANATGAG	+	chr2L	10304748	+	chr2L	2128913	8175835	+	chr2L	10304748	+	chr2L	2128913
GGTACCATACCATNTACTAGCCTCAGTATTGCCGGGAGTTCCAATCTTGTTTAGATTTAAGTGTGCACTTACCA:1	GGTACCATACCATNTACTAGCC	AGATTTAAGTGTGCACTTACCA	+	chr3R	10561800	+	chr3R	10561889	89	+	chr3R	10561800	+	chr3R	10561889
ATAATATCTATATATTTATATGGACTTTATATAATAGCACCCCCTTTTTCATTCCAACGCCCATGTATGTACCA:1	ATAATATCTATATATTTATATG	TCCAACGCCCATGTATGTACCA	+	chr3R	31662813	+	chr3R	28677125	2985688	+	chr3R	31662813	+	chr3R	28677125
GTGTGTTTATGGCCCTGCGTGCAGCTTGCAAAAACAAGCAAGGTCCAAAAACAACCTGAGTGTGAGAAATGAAAT:1	GTGTGTTTATGGCCCTGCGTGC	ACCTGAGTGTGAGAAATGAAAT	-	chr3R	28415825	-	chr3R	28415740	85	+	chr3R	28415740	+	chr3R	28415825
ATTCCTGGTTAATTTATTAATTCGAATTGATAACATAGCCATCCCTGGTTTGGTATATGTTACTAAGTTAGTAGG:1	ATTCCTGGTTAATTTATTAATT	TATATGTTACTAAGTTAGTAGG	-	chr2L	9349339	-	chr2L	12462847	3113508	+	chr2L	12462847	+	chr2L	9349339
CGAATGAAAATGCAATTTTCAAAAGCAAAACAAACAATTGTTGATATGCTGCCAAAGAGAGAAAGGGGCCGCA:1	CGAATGAAAATGCAATTTTCAA	CCAAAGAGAGAAAGGGGCCGCA	-	chr2L	4068866	-	chr2L	4066043	2823	+	chr2L	4066043	+	chr2L	4068866
CACCATCCACATCCTCATCCTCATTCCCATTCCCTCGATTTTCAGTTACTGCATCCCAGCACACAAGCGAACA:1	CACCATCCACATCCTCATCCTC	CATCCCAGCACACAAGCGAACA	+	chr3R	13526081	+	chr3R	28868806	15342725	+	chr3R	13526081	+	chr3R	28868806
CTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATT:1	CTTGATTGTACTTTGCTTGGAA	TAACTATTAGTTGGCCATCATT	+	chr3L	16184122	+	chr3L	16188940	4818	+	chr3L	16184122	+	chr3L	16188940
TACAACATCCAAGCACACGCAAGTACACCCCACTTCTACACCTACACTTCTAGTACACCCCATATAATCCCAAA:1	TACAACATCCAAGCACACGCAA	GTACACCCCATATAATCCCAAA	+	chr2L	702516	+	chr2L	702626	110	+	chr2L	702516	+	chr2L	702626
ATTCCTTGGCATTAGTCTGAAGAGTNGCAAAAAAAAAATAAATTATCAGCAGTTTCCAATTAAGAATGGATTCTA:1	ATTCCTTGGCATTAGTCTGAAG	TTCCAATTAAGAATGGATTCTA	-	chr3R	28484832	-	chr3R	15635804	12849028	+	chr3R	15635804	+	chr3R	28484832
ATGGAAAATATCCATAATAACAATGATTTCCATTAAATATTTTAGTTAGTTTTTAAAAGGTGCCAGGCCATGAGC:1	ATGGAAAATATCCATAATAACA	TAAAAGGTGCCAGGCCATGAGC	+	chr2L	764555	+	chr2L	764655	100	+	chr2L	764555	+	chr2L	764655
GAGCTCAGATCTGCGTAGTAGGCCATGACAAAGCGCAGATNGCTGGACGACGCATTTGTTAGTCAGTGGCATTG:1	GAGCTCAGATCTGCGTAGTAGG	CATTTGTTAGTCAGTGGCATTG	+	chr3L	1463424	+	chr3L	1463504	80	+	chr3L	1463424	+	chr3L	1463504
ATTCGCATAAAAGTAAGCGACTGATTTCCANNNTNATTTAATTTCCTTTTTTCTGAAATTGAAAACAAGTACCGA:1	ATTCGCATAAAAGTAAGCGACT	TGAAATTGAAAACAAGTACCGA	-	chr2L	14369265	-	chr2L	14369149	116	+	chr2L	14369149	+	chr2L	14369265
TATATGGNACACACACACACACACACACAGGGATTTCAANTCGGAACGGGTGTGTCANTATTTCAACTGAATT:1	TATATGGNACACACACACACAC	GTGTCANTATTTCAACTGAATT	+	chr3R	12973637	+	chr3R	14467486	1493849	+	chr3R	12973637	+	chr3R	14467486
TAAAGAAACGACATGCATATTAAATGAAAATAACATTTTCATAAAAAAAAAAGCTTATGTATAAAGTATGCTAAC:1	TAAAGAAACGACATGCATATTA	CTTATGTATAAAGTATGCTAAC	-	chr3R	12528221	-	chr3R	12528144	77	+	chr3R	12528144	+	chr3R	12528221
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAAAAAGATTAGCGAAAGCTTTAAAGCAAAATATTTTGAAAAGAAAAAA:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	AAAATATTTTGAAAAGAAAAAA	+	chr3L	22908067	+	chr3L	17615006	5293061	+	chr3L	22908067	+	chr3L	17615006
GACTTAGACCACTGTAAGTGGTCCAGCCAAAGTGCAAAGTGGCTGCCTTTTGTAAAT:1	GACTTAGACCACTGTAAGTGGT	AAAGTGGCTGCCTTTTGTAAAT	-	chr3L	22179184	-	chr3L	22179116	68	+	chr3L	22179116	+	chr3L	22179184
CAGAGGGTTGGTAAGTCGGCGCCCAAGAACTTTACAATTTACAATTTTCACAAAATTTAAACAACAGCAAATTGC:1	CAGAGGGTTGGTAAGTCGGCGC	AATTTAAACAACAGCAAATTGC	-	chr2R	14132205	-	chr2R	14132115	90	+	chr2R	14132115	+	chr2R	14132205
TTACTCGTTTCCACTTTCCACTTTCCTTTGCTTTTCCAACCCAGAGGCTGGGTGTGGGCGCATGCAACTAA:1	TTACTCGTTTCCACTTTCCACT	GGGTGTGGGCGCATGCAACTAA	+	chr3L	19417809	+	chr3L	19417885	76	+	chr3L	19417809	+	chr3L	19417885
ATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATATAATTTATAATTTTGAGATAGATTCCTATCACATAATGACGGA:1	ATTAGAAGAAAATATGAAGAAT	ATTCCTATCACATAATGACGGA	+	chr3R	19448613	+	chr3R	19449227	614	+	chr3R	19448613	+	chr3R	19449227
GAACCATTGTTTACTGCTAATCTACGTCACCGGCCCTGAGGCC:1	GAACCATTGTTTACTGCTAATC	CTACGTCACCGGCCCTGAGGCC	+	chr3R	6845204	+	chr3R	6845430	226	+	chr3R	6845204	+	chr3R	6845430
ATCAATCAATTTCAATTATATTCTAAAACTTCTTATAAAAAAAAAATATTTTGGAAAAATTAAACATTTTTTTCT:1	ATCAATCAATTTCAATTATATT	GAAAAATTAAACATTTTTTTCT	-	chr3L	9167386	-	chr3L	9167305	81	+	chr3L	9167305	+	chr3L	9167386
GTCCAACATTCAGATGGGAAGCCATAAAATATATCCACACACGAGGTGGAGAAGGGCATTGTACATGACCAATA:1	GTCCAACATTCAGATGGGAAGC	AGGGCATTGTACATGACCAATA	+	chr3R	23688500	+	chr3R	23688590	90	+	chr3R	23688500	+	chr3R	23688590
CAAAAACCAAAATGAAAAAAAGTACGGAAAAAAAGAGTAAGGAGTTGGTGTGTAAAAGTTTGTTGGCACCAACA:1	CAAAAACCAAAATGAAAAAAAG	TAAAAGTTTGTTGGCACCAACA	+	chrX	4381190	+	chrX	7829862	3448672	+	chrX	4381190	+	chrX	7829862
GAATTTTAAATAATTAAGTGGAACACATAAATAAACTATTATAATAATTACTAAGAGAAGTTTCGCNACTCGTAA:1	GAATTTTAAATAATTAAGTGGA	AGAGAAGTTTCGCNACTCGTAA	-	chr3L	3833999	-	chr3L	3833758	241	+	chr3L	3833758	+	chr3L	3833999
CTCCAGACCATTGAGTTCTATAAATGGGACTGAGCCACACCATACACCACACAGATACAGATACAAAACTCCCC:1	CTCCAGACCATTGAGTTCTATA	AGATACAGATACAAAACTCCCC	+	chrX	8478205	+	chrX	18468647	9990442	+	chrX	8478205	+	chrX	18468647
AAGTTAAATAAAATCACCCATCAAATTAGAAAAATATGTGCACTTANATATTCTTGATTTA:1	AAGTTAAATAAAATCACCCATC	GCACTTANATATTCTTGATTTA	+	chr2R	15330224	+	chr2R	15330344	120	+	chr2R	15330224	+	chr2R	15330344
CGGGTGGTGTACGGGAAGGAGGTGGAGGTACTAGTTACTGCTGGCCGAGTAATTAATATGCACGGCGC:1	CGGGTGGTGTACGGGAAGGAGG	GAGTAATTAATATGCACGGCGC	+	chr2L	11332072	+	chr2L	11332171	99	+	chr2L	11332072	+	chr2L	11332171
CGAAAATCAGATAAACCAAACGTGAAACCGCGACACAAATCAAACCACCTCAATAAACGNAGAGTGTTGCG:1	CGAAAATCAGATAAACCAAACG	TCAATAAACGNAGAGTGTTGCG	-	chr2L	13762935	-	chr2L	13761828	1107	+	chr2L	13761828	+	chr2L	13762935
GAAACATCAAAATACAATGTTTCCGCCCACGCTGAGGCAAATCCAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCA:1	GAAACATCAAAATACAATGTTT	ATTTGAGAGCCAGTACATTGCA	-	chr3R	11725188	-	chr3R	19449476	7724288	+	chr3R	19449476	+	chr3R	11725188
TTGCTTGCCCCATAAGTCCCCCAACTGTCCTACGTATCTGNGTATCACGTAATTTCGTGCACCTTTCANTTG:1	TTGCTTGCCCCATAAGTCCCCC	AATTTCGTGCACCTTTCANTTG	-	chr3L	19900364	-	chr3L	9525437	10374927	+	chr3L	9525437	+	chr3L	19900364
ATTATCAATTTTGGGCAAAAAGTTCAATCAATTTAAGGTGGGCGTACATTTCAACAAATGCCACAACAAGGATGA:1	ATTATCAATTTTGGGCAAAAAG	ACAAATGCCACAACAAGGATGA	-	chr2L	12780203	-	chr2L	12779746	457	+	chr2L	12779746	+	chr2L	12780203
ACACATCTCGACCAGAAATCGTACTCACAGCCAGTCTCCTCCACCTATCGGTGATAGGCGTCGACTGTTGCCCC:1	ACACATCTCGACCAGAAATCGT	GATAGGCGTCGACTGTTGCCCC	+	chr3R	5654628	+	chr3R	5654203	425	+	chr3R	5654628	+	chr3R	5654203
CTTAATTAATGACTGGCTCTTGACTTGCTAAGGGNGTGAGCTCAGGAAAAATAAACAGGTTACCCTGAGGGGAGG:1	CTTAATTAATGACTGGCTCTTG	AACAGGTTACCCTGAGGGGAGG	-	chr3L	18834970	-	chr3L	18833806	1164	+	chr3L	18833806	+	chr3L	18834970
TTCTATATTATGAATGAGCTCACCAAAACAGAGAAGTTACATACTTATTTGTACATATTCCTGCGCANGGAACTG:1	TTCTATATTATGAATGAGCTCA	CATATTCCTGCGCANGGAACTG	+	chr2R	9438463	+	chr2R	9431999	6464	+	chr2R	9438463	+	chr2R	9431999
ACTCATTACGGCCACGCGCAGCCACAACATGCCGCCCCCAAAAAGCNGGAAACCATATGTNTGTGTGTGGGTCT:1	ACTCATTACGGCCACGCGCAGC	CCATATGTNTGTGTGTGGGTCT	-	chr2R	21268164	-	chr2R	19346509	1921655	+	chr2R	19346509	+	chr2R	21268164
TCATCTTATTGTTTTGGCAACCAAATGTTTCCCTNTTAACTATTTAAATACTATTGTATTTATTTAGGGAATTTT:1	TCATCTTATTGTTTTGGCAACC	TTGTATTTATTTAGGGAATTTT	+	chr2R	6978658	+	chr2R	6978841	183	+	chr2R	6978658	+	chr2R	6978841
TTTTGATAGACCATGACAGATGGAACTGAACCCAACTCGGTCATGGCNTATTAAACGATCGNAAATGAGAAACGT:1	TTTTGATAGACCATGACAGATG	AACGATCGNAAATGAGAAACGT	-	chr3R	22185235	-	chr3R	22185138	97	+	chr3R	22185138	+	chr3R	22185235
AACATCAACATGTTTTTATTATTTGTACTTTTTTATGTGANCCGAGCCATCAACAGTCGTCACTCGGTCTGAAGT:1	AACATCAACATGTTTTTATTAT	CAGTCGTCACTCGGTCTGAAGT	+	chr3L	5850142	+	chr3L	14485868	8635726	+	chr3L	5850142	+	chr3L	14485868
CTCGGCCAGCAGTAACTAGTACCTCCACCTCCTTCCCGTACACCACCCGCCATAATTCTAGTGTCGACCCA:1	CTCGGCCAGCAGTAACTAGTAC	CCATAATTCTAGTGTCGACCCA	-	chr2L	11332152	-	chr2L	11332050	102	+	chr2L	11332050	+	chr2L	11332152
ATTGAATTAGTTATTCTCTGAACAAAAGAATATTGTAGTTAATATTAATATTAATTTTTTAACAGATAATGATA:1	ATTGAATTAGTTATTCTCTGAA	AATTTTTTAACAGATAATGATA	+	chr3L	16070744	+	chr3L	16070820	76	+	chr3L	16070744	+	chr3L	16070820
TTCTTTTTGCAACCCTCGCTGAAATATATANNNANACACGTTCTTTTGGGAGGGAGGAAGGAGGCGGGTAGAGAT:1	TTCTTTTTGCAACCCTCGCTGA	GAGGAAGGAGGCGGGTAGAGAT	+	chr3R	4887499	+	chr3R	4894876	7377	+	chr3R	4887499	+	chr3R	4894876
AAACTGAAGATAATATTAAATCTGTCTATGATATAATATATATATAATATCCAATTGAGTTTCTTCTTGTGTTCG:1	AAACTGAAGATAATATTAAATC	ATTGAGTTTCTTCTTGTGTTCG	-	chr3L	12034979	-	chr3L	12034902	77	+	chr3L	12034902	+	chr3L	12034979
GTTGAGTGTACTCTAGCTTGGGTTGGGTTCAGTGGGTTCCTTCTGCTCCAATAGATGTGGATGATGNTGCGCAC:1	GTTGAGTGTACTCTAGCTTGGG	AGATGTGGATGATGNTGCGCAC	-	chr2L	15468875	-	chr2L	15468791	84	+	chr2L	15468791	+	chr2L	15468875
AACAAGTGATAGGGATCGAAAGGGACTGGCTTGTACTATGTGTTTGTGATTTTGAAAAAGGTGTGTTCAGG:1	AACAAGTGATAGGGATCGAAAG	TTTTGAAAAAGGTGTGTTCAGG	+	chr3L	18590533	+	chr3L	4129286	14461247	+	chr3L	18590533	+	chr3L	4129286
TTTTTATCAAATAATTGAGTTTTCTTTCGTTTTATTTTTTCCAACAGTTATAAAGATAAAAGCTTAGTAAAAAAA:1	TTTTTATCAAATAATTGAGTTT	AGATAAAAGCTTAGTAAAAAAA	-	chr3R	15115020	-	chr3R	15114943	77	+	chr3R	15114943	+	chr3R	15115020
GGCCACGGACCGTTTTAATATTTCCGTTGATTTCTTTCTATTAAAATAATAATACAACTGCAACCTGTTCAAAAA:1	GGCCACGGACCGTTTTAATATT	ACAACTGCAACCTGTTCAAAAA	+	chr2R	25102524	+	chr2R	25102693	169	+	chr2R	25102524	+	chr2R	25102693
AACACAATGGGCAAAATCAAATAGAACAGAGGGAAAAGCGAAATAAAACGATATTTATCACACGCGAGATCATTG:1	AACACAATGGGCAAAATCAAAT	TTTATCACACGCGAGATCATTG	-	chr3R	19556643	-	chr3R	14092524	5464119	+	chr3R	14092524	+	chr3R	19556643
ACCCCATTTTCGTATTACTACTGCTGGCGCCCCTTTTCTTTTTCGTTGATGTTTGTGATTTTGTTGTTGTTAAG:1	ACCCCATTTTCGTATTACTACT	TTGTGATTTTGTTGTTGTTAAG	-	chrX	11286161	-	chrX	12969193	1683032	+	chrX	12969193	+	chrX	11286161
AATTTGTGTGTGAGTGCGTGTGGGGGCATAACAAAAACGTGTTGATTTGCTGAAATCATTTTCATTTGCATTTGC:1	AATTTGTGTGTGAGTGCGTGTG	AATCATTTTCATTTGCATTTGC	+	chrX	706829	+	chrX	707193	364	+	chrX	706829	+	chrX	707193
AATTCTGAACACAATCTATGTGAAAAGAAAAGGAACCATAGCACACTGCATACGACTGGCAAATTGAGTTCTAAT:1	AATTCTGAACACAATCTATGTG	GACTGGCAAATTGAGTTCTAAT	+	chr3L	3271579	+	chr3L	20556880	17285301	+	chr3L	3271579	+	chr3L	20556880
GTGCAAATAGCAACTGAGCAGCTTAACCCATTTCCACTGTTGGCCCTTTGTTATGACCCCCGCCAAATGGTTGAG:1	GTGCAAATAGCAACTGAGCAGC	TGACCCCCGCCAAATGGTTGAG	+	chr3R	23073669	+	chr3R	23073758	89	+	chr3R	23073669	+	chr3R	23073758
CGGAGTCTAGAGTTTGGAGTCTTGGATCTTGGTTGTGGGTCTTGTTGTTNAAGTTCAATGCAAACTCGATGGGTG:1	CGGAGTCTAGAGTTTGGAGTCT	TTCAATGCAAACTCGATGGGTG	+	chrX	19176214	+	chrX	19176298	84	+	chrX	19176214	+	chrX	19176298
AATTCAAATAGAGTGCGTAAGTGGACAAGAATAAAATATTTCACAGCTTTGAGAATAATCTTCAAATGCCAAACA:1	AATTCAAATAGAGTGCGTAAGT	AATAATCTTCAAATGCCAAACA	-	chr3R	28393809	-	chr3R	28393709	100	+	chr3R	28393709	+	chr3R	28393809
TTCGGAATGAAAGAGTGCCGAGGACGAAATAGCAGTGTGAAGCAATGTCGCCAGGACTGCTGCCCACTTCCATTT:1	TTCGGAATGAAAGAGTGCCGAG	GGACTGCTGCCCACTTCCATTT	+	chr2L	2667650	+	chr2L	2667729	79	+	chr2L	2667650	+	chr2L	2667729
TGTTCATCCATTTTCAATAAATATAATTTCATTGAAATATTTAAAATATAAATATTTTCTCTCTCTGCAGCAGCA:1	TGTTCATCCATTTTCAATAAAT	ATTTTCTCTCTCTGCAGCAGCA	-	chr3L	17272397	-	chr3L	17272264	133	+	chr3L	17272264	+	chr3L	17272397
TGCAGGAAAATAAGTAAGTGNTGACTGTTCGTNCAGGAACGANATCTGATTTATACCGCCACACCACTCGATT:1	TGCAGGAAAATAAGTAAGTGNT	TATACCGCCACACCACTCGATT	-	chrX	21243071	-	chrX	21242983	88	+	chrX	21242983	+	chrX	21243071
GTCAGTTAATTGAGGTGANAATTGTTGGGCCCTCTTGATTTCACATTTTCCACATTTGACTGACCTTTAGGC:1	GTCAGTTAATTGAGGTGANAAT	CACATTTGACTGACCTTTAGGC	+	chr3R	7602513	+	chr3R	20620561	13018048	+	chr3R	7602513	+	chr3R	20620561
TTTTAGAACCAATTTAGACCCTATTTTGTATATTTTTAAACTTATTTAC:1	TTTTAGAACCAATTTAGACCCT	GTATATTTTTAAACTTATTTAC	-	chr3L	12186462	-	chr3L	12186394	68	+	chr3L	12186394	+	chr3L	12186462
TATTTCTTACTCCAATTGCGTGTGGATCTGTATCATTTCGATATGCACACTGTGTAGTAAAAAGCAACTACAACT:1	TATTTCTTACTCCAATTGCGTG	GTAGTAAAAAGCAACTACAACT	+	chr2R	14979790	+	chr2R	14979866	76	+	chr2R	14979790	+	chr2R	14979866
GACTACTCTTCATCCATGAGTTCCTGACTCGGATTTTCTTGCAATAGGAAAAGAGTTATACTAACAGATCTCG:1	GACTACTCTTCATCCATGAGTT	AGAGTTATACTAACAGATCTCG	-	chr2R	11909666	-	chr2R	11909795	129	+	chr2R	11909795	+	chr2R	11909666
AAGGAGTGATGCATTAAAAACAGGTGTTAGTTAACGTTAGTAATTATGGGTG:1	AAGGAGTGATGCATTAAAAACA	TTAACGTTAGTAATTATGGGTG	-	chr3R	26601020	-	chr3R	26600958	62	+	chr3R	26600958	+	chr3R	26601020
ATAAAGGTGACAAGAAATTTGTCAGCTCAAAATATTTGCCTGTTGCTCCAATCTCCAAGTACAGCATACCCCGTG:1	ATAAAGGTGACAAGAAATTTGT	TCCAAGTACAGCATACCCCGTG	-	chr2L	19304332	-	chr2L	19304230	102	+	chr2L	19304230	+	chr2L	19304332
CACACATATTATGGTTTGATCACTCGCTCTCACTCCCTATTCTGAGCATGGTTATACCATATCCTGGACATCCTG:1	CACACATATTATGGTTTGATCA	ATACCATATCCTGGACATCCTG	-	chr2R	24489802	-	chr2R	24489691	111	+	chr2R	24489691	+	chr2R	24489802
GCCCATCGTAGCGTATCCTTTTGCCAAAACAAAAACTCTTAACTTATCTATTAATGAGAATGCTCCTTAAGGG:1	GCCCATCGTAGCGTATCCTTTT	TAATGAGAATGCTCCTTAAGGG	-	chrX	9338043	-	chrX	9337953	90	+	chrX	9337953	+	chrX	9338043
AATATTCCTTTTCACCGCTGGCCAGACAGCCAACAAAAACACAACCAACATCATCAGGAGCCGCC:1	AATATTCCTTTTCACCGCTGGC	ACCAACATCATCAGGAGCCGCC	+	chr3R	17854786	+	chr3R	17854854	68	+	chr3R	17854786	+	chr3R	17854854
AGATTTTGTTTTGATTTCCCCCAAAATGCTGTTGAGAGTGATAATTAATTTGGGATCGTCCTTTTCCCNGGACCC:1	AGATTTTGTTTTGATTTCCCCC	GATCGTCCTTTTCCCNGGACCC	+	chr3R	25669082	+	chr3R	25669176	94	+	chr3R	25669082	+	chr3R	25669176
TCTATTCAGACGAGAACTGATACGGGCCAAAACACAGAGTGTGGCCAAGTTGGGCATAATGCGGAAGCTAAAAA:1	TCTATTCAGACGAGAACTGATA	GGCATAATGCGGAAGCTAAAAA	+	chr3R	13195959	+	chr3R	13196053	94	+	chr3R	13195959	+	chr3R	13196053
CTCCCCACAAGCCCCCCTNCCCGAAAAAAAAAGAAAAAAAACTNTGTGTNGGATGAGGTTAAAAAATCTGGATGA:1	CTCCCCACAAGCCCCCCTNCCC	TGAGGTTAAAAAATCTGGATGA	-	chrX	5347979	-	chrX	11465099	6117120	+	chrX	11465099	+	chrX	5347979
TATGATTTCTGTAAAAATACTAACTTCAAATGGTAAAAGAGCATCTAGACTTCAACCTAACAAAACCAGTTTTTT:1	TATGATTTCTGTAAAAATACTA	AACCTAACAAAACCAGTTTTTT	-	chr3R	18610743	-	chr3R	18606511	4232	+	chr3R	18606511	+	chr3R	18610743
GATTAGTTAACTGAATCCTTTTAGAAGAGAACTCCCCAGTTATGAACAATATACATAGATGTTTTTTTAAGTGCA:1	GATTAGTTAACTGAATCCTTTT	CATAGATGTTTTTTTAAGTGCA	+	chr2L	3582885	+	chr2L	3582962	77	+	chr2L	3582885	+	chr2L	3582962
CTTTNTTCCGAACCCAGAGTTTNTGGCNCCATACAGTTGNACTTCGCTAACTCGAACAAACGGTT:1	CTTTNTTCCGAACCCAGAGTTT	TCGCTAACTCGAACAAACGGTT	+	chrX	19318478	+	chrX	19318603	125	+	chrX	19318478	+	chrX	19318603
AGTGGAACCGATGGCAGAAATAAGTTGTTGTGCCAAAAAGCCCCGATGATAGTAGTTAAATTTGATCAGATGACG:1	AGTGGAACCGATGGCAGAAATA	AGTTAAATTTGATCAGATGACG	+	chr2R	8722763	+	chr2R	8723004	241	+	chr2R	8722763	+	chr2R	8723004
AATAACATCTGTTAGAATGAATATGACCAGATGCAGTGTGAGTTCGAGCACACATTAGCGCGCAATAATTTTGGA:1	AATAACATCTGTTAGAATGAAT	ATTAGCGCGCAATAATTTTGGA	+	chr2L	21963778	+	chr2L	21963856	78	+	chr2L	21963778	+	chr2L	21963856
ACCTACATATCACTCACGGCCCCCTTTTACGCCCACTCTCCTCAATCGTCTTCTACAAGCACAGAAATCAAAAAA:1	ACCTACATATCACTCACGGCCC	TACAAGCACAGAAATCAAAAAA	+	chrX	20907626	+	chrX	10735187	10172439	+	chrX	20907626	+	chrX	10735187
AGAGTACCGCGGGTGAGTTAATCACAGATCATATACACCCAGAGCACCCATCTAATCCCTCCAACCAATTACA:1	AGAGTACCGCGGGTGAGTTAAT	CTAATCCCTCCAACCAATTACA	+	chr2R	23914320	+	chr2R	23921942	7622	+	chr2R	23914320	+	chr2R	23921942
AACCAGACCATGCCCAAAAAAGAACCGTCAACCAATTTTGGGTGGATATTTACGCGCACTTTTTACCACTT:1	AACCAGACCATGCCCAAAAAAG	TTACGCGCACTTTTTACCACTT	-	chrX	12900448	-	chrX	2504208	10396240	+	chrX	2504208	+	chrX	12900448
GAGTTCGGAATGAAAGAGTGCCGAGGACGAAATAGCAGTGTGAAGCAATGTCGCCAGG:1	GAGTTCGGAATGAAAGAGTGCC	AGTGTGAAGCAATGTCGCCAGG	+	chr2L	2667647	+	chr2L	2667709	62	+	chr2L	2667647	+	chr2L	2667709
TGAAGCTGGAAACTGAATAAATAAATGTACAAGATAACACGATGTGGTTATCATAGA:1	TGAAGCTGGAAACTGAATAAAT	AACACGATGTGGTTATCATAGA	+	chr3R	17823234	+	chr3R	17823293	59	+	chr3R	17823234	+	chr3R	17823293
CATTAGACAAGAGTCTGTTGACTTTTTAGGATGNTCTAACAATAATTATAAAAAATCNGTATGTC:1	CATTAGACAAGAGTCTGTTGAC	AATTATAAAAAATCNGTATGTC	-	chr3L	10820660	-	chr3L	10820521	139	+	chr3L	10820521	+	chr3L	10820660
CTCACCGGAGGCATATTGGCTAATCAGCTGCTAAAATAGTAAGTTAGCGTACATTTGGTTTATATCTAAA:1	CTCACCGGAGGCATATTGGCTA	GTACATTTGGTTTATATCTAAA	-	chr3R	4757559	-	chr3R	4753261	4298	+	chr3R	4753261	+	chr3R	4757559
ACTTCATTTTAACACACCNATCAATCAGCAATCAACAAAGAACNCTTCTNAAGGGCAGAAACCACAATATCACGG:1	ACTTCATTTTAACACACCNATC	GGCAGAAACCACAATATCACGG	+	chr3L	16969427	+	chr3L	16969653	226	+	chr3L	16969427	+	chr3L	16969653
AACATTGAGAACCGGACAATAAGCTCTCCAGATTTCGACCCATAGACGGCAATG:1	AACATTGAGAACCGGACAATAA	TTTCGACCCATAGACGGCAATG	-	chr2R	24956539	-	chr2R	22730055	2226484	+	chr2R	22730055	+	chr2R	24956539
ATTTTAACACACCAATCAATCAGCAATCAACAAAGAACTCTTCTAAAGGGCAGAAACCACAATATCACGGCAAGA:1	ATTTTAACACACCAATCAATCA	AAACCACAATATCACGGCAAGA	+	chr3L	16969432	+	chr3L	16969658	226	+	chr3L	16969432	+	chr3L	16969658
ATCCTAATTTCAAACGTCCAAATCATAGGATGATAATAGGATAAGCCAAATTAAATTACAGAGTATCACA:1	ATCCTAATTTCAAACGTCCAAA	AATTAAATTACAGAGTATCACA	+	chr3R	26374852	+	chr3R	26374949	97	+	chr3R	26374852	+	chr3R	26374949
CTTACGTGGCGTATACGTAATGGGCCAGCAACTAAAGGTAATGTGATTCCATGTTTATGCATGTACACTCCTCA:1	CTTACGTGGCGTATACGTAATG	GTTTATGCATGTACACTCCTCA	-	chr2L	11538932	-	chr2L	11538848	84	+	chr2L	11538848	+	chr2L	11538932
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACNACACAACACAACACAACACACCACAA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831801	6924267	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831801
CGGGTGGTGTACGGGAAGGAGGTGGAGGTACTAGTTACTGCTGGCCGAGTAATTAATAT:1	CGGGTGGTGTACGGGAAGGAGG	CTGCTGGCCGAGTAATTAATAT	+	chr2L	11332072	+	chr2L	11332162	90	+	chr2L	11332072	+	chr2L	11332162
TTGTTCGCCCATCACTTGCGGCTTGACCCTAGCATCATACTAACTAACATATCTTTCATCATGCAAACATCAGC:1	TTGTTCGCCCATCACTTGCGGC	CTTTCATCATGCAAACATCAGC	-	chr3L	1205563	-	chr3L	9506356	8300793	+	chr3L	9506356	+	chr3L	1205563
TATTTATTAATAACTAATAGAACTAATNGGNNTCATGCTATTGCAGGTGNANTTTGTAATCCTTTGTTTATTGAT:1	TATTTATTAATAACTAATAGAA	TTGTAATCCTTTGTTTATTGAT	+	chr2L	14017796	+	chr2L	14017888	92	+	chr2L	14017796	+	chr2L	14017888
TCAACAAATAATCATTTATTTTGCCACAACATTAAAAATAATTGTCNGAATATGGAATGT:1	TCAACAAATAATCATTTATTTT	TAATTGTCNGAATATGGAATGT	+	chrX	20928939	+	chrX	13057302	7871637	+	chrX	20928939	+	chrX	13057302
CCTCTCCCAATCATATCCCGTAAAATTTAAAATCTTGTTTTATACTACAACTAAATTTTTTTGCATATAAAATAG:1	CCTCTCCCAATCATATCCCGTA	AATTTTTTTGCATATAAAATAG	-	chr2L	19763074	-	chr2L	19762832	242	+	chr2L	19762832	+	chr2L	19763074
AATTTGATTATTTTCTCAGCTCCTTTGCTCTCGACTTTCCAAATTACTGCACCAAATTCTAAAAACCCTATTAAG:1	AATTTGATTATTTTCTCAGCTC	AAATTCTAAAAACCCTATTAAG	+	chr2L	17859925	+	chr2L	21328430	3468505	+	chr2L	17859925	+	chr2L	21328430
CTCAGAAATACAATACGGTAAATATACAACTAAAATTCAGTACGAAAAAGAGCATAAGCATTCTCTTTAAGCCAA:1	CTCAGAAATACAATACGGTAAA	ATAAGCATTCTCTTTAAGCCAA	-	chr2L	15332861	-	chr2L	15332784	77	+	chr2L	15332784	+	chr2L	15332861
TTAGAATGAGGTTTCTATTTAGAAGCAAATGTGAAATACTCACCCGCCCACTGTGGCCACACCAACATCCC:1	TTAGAATGAGGTTTCTATTTAG	ACTGTGGCCACACCAACATCCC	-	chrX	5345510	-	chrX	5345403	107	+	chrX	5345403	+	chrX	5345510
CTTGATCCATCTGCAGGCNTCCAGCCAAAGTGCAGGATAGTCCTGAATGGATGGTCCTGGATGG:1	CTTGATCCATCTGCAGGCNTCC	CTGAATGGATGGTCCTGGATGG	+	chrX	20378886	+	chrX	20378956	70	+	chrX	20378886	+	chrX	20378956
ACACGCTGTCTAAATAATGTTATATTACTTATATAACTTATTTTTGTTTTATTTCGATATACCATATATATG:1	ACACGCTGTCTAAATAATGTTA	ATTTCGATATACCATATATATG	+	chr2L	16058147	+	chr2L	16058285	138	+	chr2L	16058147	+	chr2L	16058285
TTATACTTTAAATCTTGACCTGCTTAATGGTCAATCATATTGCCTATGTTAAAGTTGTCATCTGACTGAGTCGAT:1	TTATACTTTAAATCTTGACCTG	GTTGTCATCTGACTGAGTCGAT	+	chr3L	18223180	+	chr3L	18223263	83	+	chr3L	18223180	+	chr3L	18223263
CACAGGTTATACAGGTCACAAGTTCTACTGTTCGGTAGCAGATTGCCATTTTCGCCGGCGAAGGA:1	CACAGGTTATACAGGTCACAAG	TGCCATTTTCGCCGGCGAAGGA	-	chrX	7059086	-	chrX	7381597	322511	+	chrX	7381597	+	chrX	7059086
GAGAAAAGAATGCAACAGGATTTGGAAGGAAGTAAAGTCTGCAATGTTGAGGAAAAGTACAATAAGAAAAAGCGA:1	GAGAAAAGAATGCAACAGGATT	AAAGTACAATAAGAAAAAGCGA	+	chr2R	13669472	+	chr2R	14807909	1138437	+	chr2R	13669472	+	chr2R	14807909
AAATTCTCAATCAAAAATTAAACACTTTTCTGGCGCATGCATCGCAAATATGCTGAACTTTGAGCACTCTTTAGC:1	AAATTCTCAATCAAAAATTAAA	TGAACTTTGAGCACTCTTTAGC	+	chr3L	7819801	+	chr3L	17907442	10087641	+	chr3L	7819801	+	chr3L	17907442
CTGCCGAATGGCAGAGTTAGCTGGAATCCAGCGGAGCTTCTGGGCCACTACCACTTCCACATACCACTCTCCAAT:1	CTGCCGAATGGCAGAGTTAGCT	CTTCCACATACCACTCTCCAAT	-	chr3R	10731547	-	chr3R	10731445	102	+	chr3R	10731445	+	chr3R	10731547
ATTAAAGATTTTTAAGTGAAGTGAATCAATATGTAAGAATATAGTTACAATAAAACTACTAAGGCAAGACTAATA:1	ATTAAAGATTTTTAAGTGAAGT	AACTACTAAGGCAAGACTAATA	+	chr3R	28480354	+	chr3R	28480435	81	+	chr3R	28480354	+	chr3R	28480435
AATGAAATTTCAATTCGGATGCGACCTGACGGGCAGCCTGTAGCCGGAAAATTCCACGAAA:1	AATGAAATTTCAATTCGGATGC	GTAGCCGGAAAATTCCACGAAA	-	chr3L	1404699	-	chr3L	1404636	63	+	chr3L	1404636	+	chr3L	1404699
TACATATATTGAAAGTTAAATAGTGTTGTAAATTTGGTTACCTATATATATTACTTATACAATTCTAGCTTTTTT:1	TACATATATTGAAAGTTAAATA	CTTATACAATTCTAGCTTTTTT	+	chr2L	15586418	+	chr2L	15593470	7052	+	chr2L	15586418	+	chr2L	15593470
TCGGGGCGGATTGATGTGCCGAAATGTTTAAATCATAATTAAAAGCATTTATTAGCTTGTGTAACACTTAATGCG:1	TCGGGGCGGATTGATGTGCCGA	AGCTTGTGTAACACTTAATGCG	+	chr3R	31413106	+	chr3R	31418306	5200	+	chr3R	31413106	+	chr3R	31418306
ATTTAAGATTTGATTGANTTTGAATTACATTTATCCAGCACCGAGGGTATGTGTGCGCATTTGAGCANAAGGTTC:1	ATTTAAGATTTGATTGANTTTG	TGCGCATTTGAGCANAAGGTTC	-	chr3R	12025065	-	chr3R	12022888	2177	+	chr3R	12022888	+	chr3R	12025065
TACGAAAATCCAAATAGGTTTCTCAAGTGGTCAAAATAGTTATATNTTTCAAGTGCTTTTANGCATCCTGTCTTA:1	TACGAAAATCCAAATAGGTTTC	TGCTTTTANGCATCCTGTCTTA	-	chrX	6009601	-	chrX	6009261	340	+	chrX	6009261	+	chrX	6009601
ATTGAGTTCGGAATGAAAGAGTGCCGAGGACGAAATAGCAGTGTGAAGCAATGTCGCCAGGACTGC:1	ATTGAGTTCGGAATGAAAGAGT	GAAGCAATGTCGCCAGGACTGC	+	chr2L	2667644	+	chr2L	2667714	70	+	chr2L	2667644	+	chr2L	2667714
GGGATCCCCGGTAACGGATTGCGTGTTGATTGTTTTGAATAAATTTCAACTTCAAAGATNGTTTCCTTT:1	GGGATCCCCGGTAACGGATTGC	AACTTCAAAGATNGTTTCCTTT	-	chr2R	15133577	-	chr2R	15133504	73	+	chr2R	15133504	+	chr2R	15133577
GTTGAGCGTCCGTGGGAGNAGGCGCCAGTCAG:1	GTTGAGCGTCCGTGGGAGNAGG	CGTGGGAGNAGGCGCCAGTCAG	+	chr3R	27025189	+	chr3R	27022306	2883	+	chr3R	27025189	+	chr3R	27022306
TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1	TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTG	TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
CAACACAATACAACACAATACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	CAACACAATACAACACAATACA	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	24389465	+	chr3R	21907534	2481931	+	chr3R	24389465	+	chr3R	21907534
TACTCACCCACTGCTGCAGCTCACGAAACGTGCTCGGCATGCTCGAGTGAGGCAAATCAATTAAAATTTCAGAGA:1	TACTCACCCACTGCTGCAGCTC	AAATCAATTAAAATTTCAGAGA	+	chr2R	18880386	+	chr2R	18880471	85	+	chr2R	18880386	+	chr2R	18880471
TTACGGACCGCAACCACTTCGCATGTATCTGCTGCTCACGTCCCCAATTCTACTTGCCCAC:1	TTACGGACCGCAACCACTTCGC	GTCCCCAATTCTACTTGCCCAC	-	chr2R	20523163	-	chr2R	20523066	97	+	chr2R	20523066	+	chr2R	20523163
TTGCTTGGAACTTTAGCTNAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTA:1	TTGCTTGGAACTTTAGCTNAAC	CAAAATTGAAATACTTTAACTA	+	chr3L	16184134	+	chr3L	16188924	4790	+	chr3L	16184134	+	chr3L	16188924
TCATTATGCAGGCGGCATGCCCCATTATCATTCTGCTCCCCCGACATCAAAGTGCAGGTCCCAAAGAAAACCCGA:1	TCATTATGCAGGCGGCATGCCC	GCAGGTCCCAAAGAAAACCCGA	+	chr3L	10003301	+	chr3L	20741573	10738272	+	chr3L	10003301	+	chr3L	20741573
GTTGCGATTGAGAAACCGGCGACAGGCACTTGCACTCGCCTTGGCCAAGGCCTCCGAATTGTATAAATATCAGCG:1	GTTGCGATTGAGAAACCGGCGA	CCGAATTGTATAAATATCAGCG	-	chr3R	29627653	-	chr3R	29627562	91	+	chr3R	29627562	+	chr3R	29627653
CGTAACGCTCCTTAGGAATCGTCGTTTGCTTACCGGCGAAAA:1	CGTAACGCTCCTTAGGAATCGT	GTCGTTTGCTTACCGGCGAAAA	-	chr2R	18408235	-	chr2R	18407310	925	+	chr2R	18407310	+	chr2R	18408235
ACTATTATAGGTACAGACAGNAATCGGTGTACNTATGAAATANCGCCGATCCTAACTTTTGATAACACTCACCCG:1	ACTATTATAGGTACAGACAGNA	AACTTTTGATAACACTCACCCG	+	chr2R	23994155	+	chr2R	23994231	76	+	chr2R	23994155	+	chr2R	23994231
ATTCCCTGTGGGCATAAAATGGGGCTTTTTTTTTCACGCAACAGCGGGTGAATTCAAAGTGCTTATTTATTTCTT:1	ATTCCCTGTGGGCATAAAATGG	TCAAAGTGCTTATTTATTTCTT	+	chr2L	16232470	+	chr2L	16232548	78	+	chr2L	16232470	+	chr2L	16232548
GCTAAAAATAAAATCGTTNGGCAAAAAACAGCCCGACACAGNCATNATCTTATCGCTATCAAAATATCCAACCGC:1	GCTAAAAATAAAATCGTTNGGC	CGCTATCAAAATATCCAACCGC	-	chr3R	16275904	-	chr3R	16275589	315	+	chr3R	16275589	+	chr3R	16275904
GTCATACATTTTGAATAGGAAAATTATTAACCAAAAAACCGTGACCAAAGCAACTTAGTGAAATTATAGGTTGGA:1	GTCATACATTTTGAATAGGAAA	CTTAGTGAAATTATAGGTTGGA	-	chr3R	7138456	-	chr3R	25520275	18381819	+	chr3R	25520275	+	chr3R	7138456
TTTTTATTAAAACATGTCCCACTGGCAAATGAAGTGAGAAGGATGCAGAATGCCACGGCCGGGCACAATAAACTG:1	TTTTTATTAAAACATGTCCCAC	CACGGCCGGGCACAATAAACTG	+	chr2L	1883438	+	chr2L	1884018	580	+	chr2L	1883438	+	chr2L	1884018
TTTAAGATGTTTGTTTTTCAAGCTTCCCCCAGTGACCTAAGTTTTTGCTTAAGAATCATTTACACCTTCGCAACA:1	TTTAAGATGTTTGTTTTTCAAG	AATCATTTACACCTTCGCAACA	-	chr2L	3497930	-	chr2L	3497852	78	+	chr2L	3497852	+	chr2L	3497930
TGAGGACGNATGTTTTCCCATTGAATCAAGTATCTNTTACTTCTCCATTGAAATTGAAACTACTAGGACATAGAT:1	TGAGGACGNATGTTTTCCCATT	TTGAAACTACTAGGACATAGAT	+	chr2L	19703538	+	chr2L	19712674	9136	+	chr2L	19703538	+	chr2L	19712674
TACGTATACGTATACGTATTCTTATGGGTATGGGCTATACCCATGATTAAAGTCGTGCTCATTTGAATCTCCAT:1	TACGTATACGTATACGTATTCT	TCGTGCTCATTTGAATCTCCAT	+	chr3R	7173734	+	chr3R	19276246	12102512	+	chr3R	7173734	+	chr3R	19276246
GTCGNCCCACGTTGTGATTTCANGCTGNTCTCCACCCGCNGCCCGACAGCTCTGTGCTTAAAGAATTTTTTCCCG:1	GTCGNCCCACGTTGTGATTTCA	GTGCTTAAAGAATTTTTTCCCG	+	chr3R	22598960	+	chr3R	5822147	16776813	+	chr3R	22598960	+	chr3R	5822147
ATCGGTGAGCCAACGCCGAAGCCGGAGGGGCTTTTGTTGGTCGCCAAA:1	ATCGGTGAGCCAACGCCGAAGC	GGGGCTTTTGTTGGTCGCCAAA	+	chr3L	12284906	+	chr3L	12285033	127	+	chr3L	12284906	+	chr3L	12285033
GTAACCATATTTAATAAGTTATTTAATTATTGTGACTATATTGTCATGATTTCACTTTANTAATCGG:1	GTAACCATATTTAATAAGTTAT	ATGATTTCACTTTANTAATCGG	-	chrX	21358166	-	chrX	21358094	72	+	chrX	21358094	+	chrX	21358166
CGCCTCCTTCTTTCGACATCGTCGTCATCCTGAATCGTTGTTAGTTTNTAGCTCGGTTGTTNGATTTTCGTCACT:1	CGCCTCCTTCTTTCGACATCGT	CGGTTGTTNGATTTTCGTCACT	+	chr3L	13615078	+	chr3L	13615176	98	+	chr3L	13615078	+	chr3L	13615176
TATGACTAGCCAGGCTATCTTGAAATAAACAATGTTCAATTAACACTCACACTTTATTGATTACCAAGTTTACGG:1	TATGACTAGCCAGGCTATCTTG	TTATTGATTACCAAGTTTACGG	-	chr2L	10495549	-	chr2L	10495463	86	+	chr2L	10495463	+	chr2L	10495549
TTTAATACATCATTCAAAAGTTCCAACTATGAATTCAAAGAAAATCCAATTGAAAAACGTCAACAAATCACAAGA:1	TTTAATACATCATTCAAAAGTT	AAAACGTCAACAAATCACAAGA	-	chrX	3881408	-	chrX	3881269	139	+	chrX	3881269	+	chrX	3881408
CGGTAGAAATTATTCGTACCATGAACATGTCATTAGCCGACTGGCAAACATCTTAGTTATTTTCCCTCCCAGCTG:1	CGGTAGAAATTATTCGTACCAT	TAGTTATTTTCCCTCCCAGCTG	-	chr2L	13152311	-	chr2L	13152233	78	+	chr2L	13152233	+	chr2L	13152311
ATCAAATCGGGATGGCTTTAGCTACGATTACACTTTTCAATAGAACCAACTGATGCCTTCAGCTTAAGTGGA:1	ATCAAATCGGGATGGCTTTAGC	TGATGCCTTCAGCTTAAGTGGA	+	chr2R	23061761	+	chr2R	23061834	73	+	chr2R	23061761	+	chr2R	23061834
CTGCATTGTTGCTTTCTCGTTGGTCAGCCGCATTTTGCATTGTTTTCGGGGCGAATGCTTTAGCATTTTGTCTTC:1	CTGCATTGTTGCTTTCTCGTTG	AATGCTTTAGCATTTTGTCTTC	-	chr2L	6649544	-	chr2L	2174957	4474587	+	chr2L	2174957	+	chr2L	6649544
AGCAAAACTTATTTAGCTACGCCCTAAGCCTAGGCAATATTATCAATACGATCGTTGAAAACCCAACACCC:1	AGCAAAACTTATTTAGCTACGC	GATCGTTGAAAACCCAACACCC	+	chr2R	13580511	+	chr2R	13580857	346	+	chr2R	13580511	+	chr2R	13580857
TGTGTTTTGTTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	TGTGTTTTGTTTTGTTGTGTTG	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	17389054	-	chr3R	21907535	4518481	+	chr3R	21907535	+	chr3R	17389054
CCGAAGCAGGTCAAGTGCCACCGTNCCAAAGGTCAGCTTAAANCANCTCAANTTCNCATTTCTTTCTGACGTCGG:1	CCGAAGCAGGTCAAGTGCCACC	TCNCATTTCTTTCTGACGTCGG	-	chr3R	19140744	-	chr3R	19140296	448	+	chr3R	19140296	+	chr3R	19140744
TATGGTAAGCATATATATCGGTTTTGCTATTTTCACCATATTATATCTACAAAATACATATTATAGAATCCCTTC:1	TATGGTAAGCATATATATCGGT	ATACATATTATAGAATCCCTTC	-	chr2L	2571632	-	chr2L	2565559	6073	+	chr2L	2565559	+	chr2L	2571632
AAAGTGCGTTTGATGGTTCCTTTCAAGTTTGGCTGACAGGTCACAGTTCACGATACCCTCGCCACCTCATCCC:1	AAAGTGCGTTTGATGGTTCCTT	GATACCCTCGCCACCTCATCCC	-	chrX	17012080	-	chrX	17011999	81	+	chrX	17011999	+	chrX	17012080
AAAAGCGCTAAGCACTAAAGAGCATTCCAAGCCTTTCACTCAAAATCATTTGCCTAGCCGCACTCGTAAAAAACT:1	AAAAGCGCTAAGCACTAAAGAG	CTAGCCGCACTCGTAAAAAACT	-	chr2L	20804807	-	chr2L	20804722	85	+	chr2L	20804722	+	chr2L	20804807
CTCCGTACAACGTTGATATAATTCAGTGTACAATTGTGTGAGTGCAGTGATAAATTATAGAATAGGTAACTTTCT:1	CTCCGTACAACGTTGATATAAT	ATTATAGAATAGGTAACTTTCT	+	chr3R	10112410	+	chr3R	10903365	790955	+	chr3R	10112410	+	chr3R	10903365
CAAAATAGTGGGCCCAAAGTTTTGCACACTGCGATAATGATGTCGGAAGAATATTTTATTAACGCATTGGAACAA:1	CAAAATAGTGGGCCCAAAGTTT	TTTTATTAACGCATTGGAACAA	+	chr3R	18812085	+	chr3R	18812163	78	+	chr3R	18812085	+	chr3R	18812163
CGCCCGAGGAAGCGAACCGAAGGCGTAGACAGCTGAGTTGGGCTGATATCGTATCTGCTAGATCTCTGG:1	CGCCCGAGGAAGCGAACCGAAG	ATCGTATCTGCTAGATCTCTGG	-	chr3R	16394498	-	chr3R	16393797	701	+	chr3R	16393797	+	chr3R	16394498
GGCGGCACGGATCTGACGCCCTATTACCTCTGCGAGAAGGACGCTTTCGNGCAGCGAGGAGCAATTAATCAAAAA:1	GGCGGCACGGATCTGACGCCCT	GCGAGGAGCAATTAATCAAAAA	+	chr2L	6965164	+	chr2L	3116840	3848324	+	chr2L	6965164	+	chr2L	3116840
GTCGTTCCTTTTTCCTACCATAGTACCATACCATACCATACCGTAACCAATCATAGTATCCTTATCGCGTTCTA:1	GTCGTTCCTTTTTCCTACCATA	ATAGTATCCTTATCGCGTTCTA	+	chrX	6618474	+	chrX	6618551	77	+	chrX	6618474	+	chrX	6618551
CTCGCATTNGTCGTCATTGCCTCATTATTATTATCTGNNNNAACTTGTAATGGAAACTTTTNTAAACTTTTCCAT:1	CTCGCATTNGTCGTCATTGCCT	AAACTTTTNTAAACTTTTCCAT	+	chr3L	57803	+	chr3L	57883	80	+	chr3L	57803	+	chr3L	57883
TCCAAGTGAAATCAAGTTTAATACATCATTCAAAAGTTCCAACTATGAATTCAAAGAACATCCAATT:1	TCCAAGTGAAATCAAGTTTAAT	TGAATTCAAAGAACATCCAATT	-	chrX	3881424	-	chrX	3881293	131	+	chrX	3881293	+	chrX	3881424
CAAACTAACAGTCCGCATGGCAACAGTATAGAAAATTGCACGGAATGNTTAGCCATTTAAANCGAGGGAACTCAA:1	CAAACTAACAGTCCGCATGGCA	CATTTAAANCGAGGGAACTCAA	-	chr3R	26211304	-	chr3R	26211212	92	+	chr3R	26211212	+	chr3R	26211304
TTACAGTTACGATAATTTATGCATGCGATATACAACCATTGACTCCGGCT:1	TTACAGTTACGATAATTTATGC	TATACAACCATTGACTCCGGCT	-	chr2L	9980844	-	chr2L	9973750	7094	+	chr2L	9973750	+	chr2L	9980844
TTGCAAGTCCAAAACGGGCATAAATCATAGATCGATTTGAATTACATNCATTCATCCTCGCACTGCTCTCACAAT:1	TTGCAAGTCCAAAACGGGCATA	ATCCTCGCACTGCTCTCACAAT	+	chr3R	15452300	+	chr3R	15452377	77	+	chr3R	15452300	+	chr3R	15452377
TAATAAATACCAAACAAACTAAATCAAAAATAAACGTATTTTCGCTGCTCGTTTGTTCAAAGACAGTGGTATGCA:1	TAATAAATACCAAACAAACTAA	TGTTCAAAGACAGTGGTATGCA	+	chrX	20386848	+	chrX	20386934	86	+	chrX	20386848	+	chrX	20386934
CGCAACAGCAGCAGTAGCAAATACAAACAAACAAACTAACCTTTGACCCCCTGCAACTCATTTGTTTTCCCCATC:1	CGCAACAGCAGCAGTAGCAAAT	CAACTCATTTGTTTTCCCCATC	+	chr2R	17258510	+	chr2R	6750710	10507800	+	chr2R	17258510	+	chr2R	6750710
AGTTCAGAAACTGTATAATATTTAACGNCTNNGAATATAAAAAGATAACNANACTTGGATAGGCTGCCTAGTTTT:1	AGTTCAGAAACTGTATAATATT	CTTGGATAGGCTGCCTAGTTTT	+	chr3R	28830917	+	chr3R	28830995	78	+	chr3R	28830917	+	chr3R	28830995
ATCAGCTGGTGTTGCTGGTGGAGATGCGCTATCTGAGCAAGTGGAAGCGAAGCGG:1	ATCAGCTGGTGTTGCTGGTGGA	TGAGCAAGTGGAAGCGAAGCGG	+	chr2L	6463584	+	chr2L	6463656	72	+	chr2L	6463584	+	chr2L	6463656
GGAACTAGACGCCATGCCTCGGAATAATCTTGTTTGTGAATGAAGTTAATTAATTTAGATGTCAA:1	GGAACTAGACGCCATGCCTCGG	AGTTAATTAATTTAGATGTCAA	-	chrX	15741150	-	chrX	15740914	236	+	chrX	15740914	+	chrX	15741150
ATTGCCAGAAGATTGGNGGTATCNCACATCCCTNTTGTNTTGCTTGGATTTATTGT:1	ATTGCCAGAAGATTGGNGGTAT	TTGTNTTGCTTGGATTTATTGT	+	chr2R	5463156	+	chr2R	5463455	299	+	chr2R	5463156	+	chr2R	5463455
CGTGGCTTTTGTTTTTCGACCCACCTGAATTGTATGACATAAG:1	CGTGGCTTTTGTTTTTCGACCC	CACCTGAATTGTATGACATAAG	+	chr2R	23475585	+	chr2R	17271207	6204378	+	chr2R	23475585	+	chr2R	17271207
GATATGCTATTTTAATGATAGATTTTANATNNATTGTAAGAATCTTATTNTNCTGGTTCAACACACTTGTTTCTG:1	GATATGCTATTTTAATGATAGA	TGGTTCAACACACTTGTTTCTG	+	chr2L	16597886	+	chr2L	16597977	91	+	chr2L	16597886	+	chr2L	16597977
AAACAAACTAACTTGCTGGGAGAAACTAAATTCTACATACTCGGATTTTTGTCCATTTTTTCAAGTTGCTCTT:1	AAACAAACTAACTTGCTGGGAG	TCCATTTTTTCAAGTTGCTCTT	+	chrX	8942102	+	chrX	5071158	3870944	+	chrX	8942102	+	chrX	5071158
AGAAATTCTTACTCTCATTTGACATTTTTCTTATTCATTCAACCATTCCATATGCAAATGGAAATGCCTTCACA:1	AGAAATTCTTACTCTCATTTGA	TGCAAATGGAAATGCCTTCACA	-	chrX	18688395	-	chrX	18688273	122	+	chrX	18688273	+	chrX	18688395
AACGAATCGATAGCAAGGGCAGGGGAAATGTGAAAAAACAAAAATATATAGGCAAACCGGAAAGTTACATTTAA:1	AACGAATCGATAGCAAGGGCAG	CAAACCGGAAAGTTACATTTAA	-	chrX	21406752	-	chrX	4819000	16587752	+	chrX	4819000	+	chrX	21406752
GAACAAAATGTGCTTTTCATCTGCCTTTAAGTTTATGCATTGCAGTTTTTCGCTTTAATTACCGCAAANTCAGTC:1	GAACAAAATGTGCTTTTCATCT	TTTAATTACCGCAAANTCAGTC	-	chr2L	9297456	-	chr2L	9297379	77	+	chr2L	9297379	+	chr2L	9297456
CTCTTTTCNTGCCGCATTAAGTGTTACACAAGCTAATAAATGCTTCTAATTATGATTTAAACATTTCGGCAGATC:1	CTCTTTTCNTGCCGCATTAAGT	GATTTAAACATTTCGGCAGATC	-	chr3R	31418318	-	chr3R	31413118	5200	+	chr3R	31413118	+	chr3R	31418318
AAACGAAAAAAGGCAAGGGCAAAACTAATTTCATGGGACCCTAGGTGGTCGAATATT:1	AAACGAAAAAAGGCAAGGGCAA	GGACCCTAGGTGGTCGAATATT	+	chr3L	6770100	+	chr3L	5850719	919381	+	chr3L	6770100	+	chr3L	5850719
AATTATTGGTTTATTTTAATAAATGTAAGTTTAAAAAGTGTATAAGTTATAGGCTTAAGTAACACTATGTTAGG:1	AATTATTGGTTTATTTTAATAA	GCTTAAGTAACACTATGTTAGG	+	chr2L	11327367	+	chr2L	17008280	5680913	+	chr2L	11327367	+	chr2L	17008280
ATTAAGGTTTAATTATATTCTCAGCTTCACATTGAATTCAAATTAAAAGAGCATTTGCATAATCAATGATTAATG:1	ATTAAGGTTTAATTATATTCTC	TTTGCATAATCAATGATTAATG	+	chr3R	18199758	+	chr3R	18104011	95747	+	chr3R	18199758	+	chr3R	18104011
ATGCATAATTGTGCTTTTACGTGTTTTNGCNNAAAATCAAAAAGAACTANGNAAGATTTCGATGGGGAACCGAT:1	ATGCATAATTGTGCTTTTACGT	AAGATTTCGATGGGGAACCGAT	+	chr3R	28479163	+	chr3R	28479245	82	+	chr3R	28479163	+	chr3R	28479245
CACGCACNTATCCTTGCTTTTCCCACTCATTTCGCAGCTNATTTTATTTACACTGAANGCGTAAGTAAATAAAAT:1	CACGCACNTATCCTTGCTTTTC	TGAANGCGTAAGTAAATAAAAT	+	chr2L	16086682	+	chr2L	16086874	192	+	chr2L	16086682	+	chr2L	16086874
ATACAACAGTACCTTCCAAATATATCTGCAAACTCCTTTGTCCTTTTGCTCCTCCTCCTTTTTTTTTTT:1	ATACAACAGTACCTTCCAAATA	GCTCCTCCTCCTTTTTTTTTTT	+	chr3L	14445179	+	chr3L	2265789	12179390	+	chr3L	14445179	+	chr3L	2265789
TTTCAGGTGTCCAAGGCGAAGGTTGTCTGTATATATGCTGGCATTTTAGGGCCTTTTCTGCCCCTGCTAAT:1	TTTCAGGTGTCCAAGGCGAAGG	GGCCTTTTCTGCCCCTGCTAAT	+	chrX	906721	+	chrX	908506	1785	+	chrX	906721	+	chrX	908506
CTTATGTGCGGTCAAGCGATGGCACAAAAAACAAAACCAAAAGGGGGACTACCTTTTCTTNTGCCCTCGTGCCAC:1	CTTATGTGCGGTCAAGCGATGG	TTTTCTTNTGCCCTCGTGCCAC	+	chr2R	12504151	+	chr2R	12504228	77	+	chr2R	12504151	+	chr2R	12504228
TAAACTGTCTGTGTGTTTCGGCGACAAGGAGTTACGGTGGGGATACGGTAAGAGCTCTATCTGTCTGTCCCACA:1	TAAACTGTCTGTGTGTTTCGGC	AGCTCTATCTGTCTGTCCCACA	-	chrX	14114190	-	chrX	14105040	9150	+	chrX	14105040	+	chrX	14114190
AGTGCACAGCAGGGTTCCAAAAAGATCACNGATATCCTACGCCCAAAAATCGACTCTCTCNCTCGTTCTGTGGCA:1	AGTGCACAGCAGGGTTCCAAAA	CTCTCTCNCTCGTTCTGTGGCA	-	chr2L	15362352	-	chr2L	6939849	8422503	+	chr2L	6939849	+	chr2L	15362352
CGTGGCATGCAAGCCCATAAGTTCCAGCAAATACAACTCTCACCATTCACATTATGACNGA:1	CGTGGCATGCAAGCCCATAAGT	TCACCATTCACATTATGACNGA	-	chr3R	20118111	-	chr3R	20118039	72	+	chr3R	20118039	+	chr3R	20118111
CGAAAACTTTGTTCATATTCATATCATTAATATAGAATAAAATATCTGGAGGCCAAGAAGTCCTTCAACCTTAAT:1	CGAAAACTTTGTTCATATTCAT	CAAGAAGTCCTTCAACCTTAAT	-	chr3L	3889226	-	chr3L	3889143	83	+	chr3L	3889143	+	chr3L	3889226
GCTCTTAAAGAGGCAAAAAAAACCTGGTAAACGATCGCACCCTCAACATACGGCCATCATTTTTAGGNCATCATC:1	GCTCTTAAAGAGGCAAAAAAAA	CCATCATTTTTAGGNCATCATC	+	chr2R	5947937	+	chr2R	5948088	151	+	chr2R	5947937	+	chr2R	5948088
AGGAGGGAGCGGACAATCGGACACTCGTATTCAAAGCAGCTACTTGGCCAGTCGAGCTTATGCCACATTAAAAA:1	AGGAGGGAGCGGACAATCGGAC	CGAGCTTATGCCACATTAAAAA	+	chr3R	27370113	+	chr3R	27370318	205	+	chr3R	27370113	+	chr3R	27370318
TTCCGTTGCAATTGTCGGGGTCTTAGAACTTTAAACAACAATTGGGTGGGGTTTTTGAAAGGATTGGTANTGATA:1	TTCCGTTGCAATTGTCGGGGTC	TTTGAAAGGATTGGTANTGATA	+	chr3R	9605101	+	chr3R	9605213	112	+	chr3R	9605101	+	chr3R	9605213
TAATATGTATATTAAAAGNACCACCAGAGGCCTGATGCCAGTGNTATCGNAGATCGTTGCATGGTTAAATCGAAG:1	TAATATGTATATTAAAAGNACC	TCGTTGCATGGTTAAATCGAAG	+	chr3R	15891677	+	chr3R	15892069	392	+	chr3R	15891677	+	chr3R	15892069
CACACACACACACACACACAGACANACGGAGATAAACTGAAANCANTGACANAAANTACAGCGCTATCTGGCCAT:1	CACACACACACACACACACAGA	AANTACAGCGCTATCTGGCCAT	+	chrX	7978951	+	chrX	14367049	6388098	+	chrX	7978951	+	chrX	14367049
GTAATTGACTGTAATTTAGTGTGTAACTGCAACAACAACCACACGACGAGCAAATTATGCTGTCTTTTTCCAC:1	GTAATTGACTGTAATTTAGTGT	AAATTATGCTGTCTTTTTCCAC	+	chr2L	702884	+	chr2L	702958	74	+	chr2L	702884	+	chr2L	702958
AATTCCCAAACAGTTCTGGCAGATCTTTCAAGGAGATGCCATAGTTGAGCAGCAAAAAGCATACTTAC:1	AATTCCCAAACAGTTCTGGCAG	GAGCAGCAAAAAGCATACTTAC	+	chr3R	23826274	+	chr3R	23827856	1582	+	chr3R	23826274	+	chr3R	23827856
CATCTGACTAACTATGATTATCTAATTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCTATGTGTTGGTGATGA:1	CATCTGACTAACTATGATTATC	GTAATCTATGTGTTGGTGATGA	+	chr3L	19182387	+	chr3L	19182467	80	+	chr3L	19182387	+	chr3L	19182467
TGAAATAAATTATAATTCAGTTAAATAAACATTTTTATACTCGTTACTCGAAGAGTAAAAGGGTATACTCGATAT:1	TGAAATAAATTATAATTCAGTT	AGTAAAAGGGTATACTCGATAT	-	chr3R	4504612	-	chr3R	2473813	2030799	+	chr3R	2473813	+	chr3R	4504612
ATACGCGACCCACTCCTATTNTTACCCTGTCCNTCTCTTTCTNTCGATCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCT:1	ATACGCGACCCACTCCTATTNT	CTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCT	+	chrX	12877463	+	chrX	12649915	227548	+	chrX	12877463	+	chrX	12649915
CCACCAAAACACATACCTCACAATACCTCAAATGGCACTGGCCAAGAGTGAGTGCCGATTGAAGTGCGGGTGTC:1	CCACCAAAACACATACCTCACA	TGCCGATTGAAGTGCGGGTGTC	+	chr2L	3440303	+	chr2L	3440380	77	+	chr2L	3440303	+	chr2L	3440380
CCTGANATTCTGATTTACACAATCACCACCCATTGCTGCACCGANTCGGAAGGCACACTGCACTGTTGCGTCG:1	CCTGANATTCTGATTTACACAA	GGCACACTGCACTGTTGCGTCG	-	chr2L	19587900	-	chr2L	19587805	95	+	chr2L	19587805	+	chr2L	19587900
GCCGCACAAGGGAGGCAACAAGCAACAGGCTTTTCCGAATAAGAAAAAACCAGCTGGCAGGACGAGGACGTCTAC:1	GCCGCACAAGGGAGGCAACAAG	CTGGCAGGACGAGGACGTCTAC	-	chr3L	23213602	-	chr3L	15616976	7596626	+	chr3L	15616976	+	chr3L	23213602
AAAAAACATTCCGAGAAACTGAAACCGAAAATGGTAAATGTGCAGCGGTAAGGGNTACTTTGTGA:1	AAAAAACATTCCGAGAAACTGA	AGCGGTAAGGGNTACTTTGTGA	+	chr3L	5173568	+	chr3L	19434587	14261019	+	chr3L	5173568	+	chr3L	19434587
GCTTTTCCGCCTTTCCGCTTCTCAACTCCACTCCAGTATTAACCCATTTTAGTTTCGTACGTGTAAAAATAAACA:1	GCTTTTCCGCCTTTCCGCTTCT	TTCGTACGTGTAAAAATAAACA	-	chrX	9811930	-	chrX	8534029	1277901	+	chrX	8534029	+	chrX	9811930
AAAAATCAATAAGTTTTAAGACATTTTAAAAATGTCATCAAACAGTTTTACAAACTGAAATGGGCGATGGCTAAA:1	AAAAATCAATAAGTTTTAAGAC	ACTGAAATGGGCGATGGCTAAA	+	chr3R	6523318	+	chr3R	6523694	376	+	chr3R	6523318	+	chr3R	6523694
GGCTGAAGGCTACTGAAATCAATAGACGCCACGAATGACTGAACGGATGAATGGTTGGACCGATAGATTGCTGA:1	GGCTGAAGGCTACTGAAATCAA	GGTTGGACCGATAGATTGCTGA	+	chr3L	4356478	+	chr3L	20609374	16252896	+	chr3L	4356478	+	chr3L	20609374
ATGAGCTTTTACTTCTGTCCCCTGGCACCTNNNANGGTCAAATCCGAAACCAAGTACGCCGCAGGACATGTAAA:1	ATGAGCTTTTACTTCTGTCCCC	AGTACGCCGCAGGACATGTAAA	+	chr3L	937397	+	chr3L	9324246	8386849	+	chr3L	937397	+	chr3L	9324246
ACAAGAATGAGGAGCACATCCCGACATGTTTGCCCAGACGACAAACATAATAATTGCTGCAATTTAGCCACCACC:1	ACAAGAATGAGGAGCACATCCC	TTGCTGCAATTTAGCCACCACC	+	chr3L	21408485	+	chr3L	21408563	78	+	chr3L	21408485	+	chr3L	21408563
CTAAAATCAATATCAATACCAATCCTTTCAAAAACCCCACCCAATTGTTNTTTAAAGTTCTAAGACCCCGACAA:1	CTAAAATCAATATCAATACCAA	TAAAGTTCTAAGACCCCGACAA	-	chr3R	9605223	-	chr3R	9605112	111	+	chr3R	9605112	+	chr3R	9605223
TGAATTCCTGCTAAATTTTTAATGAACTCGGCAGTGACGTGCCGATANATATTTGTGGAAAAATACTTTTTACA:1	TGAATTCCTGCTAAATTTTTAA	TTGTGGAAAAATACTTTTTACA	+	chr3R	14165003	+	chr3R	14165163	160	+	chr3R	14165003	+	chr3R	14165163
ATACGCACACATTGAACCGCCCATAATCCCTCTGACAATGTGTGTTCNACTTTTTTCGGGTCAACGCTTC:1	ATACGCACACATTGAACCGCCC	ACTTTTTTCGGGTCAACGCTTC	-	chr3L	5926527	-	chr3L	5926342	185	+	chr3L	5926342	+	chr3L	5926527
CCTGCGAGCATAGGCAGCAGCAGCGACACAGTATAATTAGGTTTGCCTTCTGTGTTCGAAACTTTTAAAGAAGA:1	CCTGCGAGCATAGGCAGCAGCA	TGTTCGAAACTTTTAAAGAAGA	+	chr3L	24021299	+	chr3L	24022455	1156	+	chr3L	24021299	+	chr3L	24022455
ATTAACGACCGCATAAATAATATTCTCCAAAAGAAAATGCTTTCGTTTCGCTTTTGTAAAA:1	ATTAACGACCGCATAAATAATA	CTTTCGTTTCGCTTTTGTAAAA	-	chr2R	21018873	-	chr2R	9956560	11062313	+	chr2R	9956560	+	chr2R	21018873
ATATATTAGATGTGTGGCTAAAAGGAAAGGTGTATTGAACNGTGAAAATTT:1	ATATATTAGATGTGTGGCTAAA	GTGTATTGAACNGTGAAAATTT	+	chr3L	10035239	+	chr3L	10035302	63	+	chr3L	10035239	+	chr3L	10035302
AGGTCAACAGCAGGCTGTTCACTTTTCAACGGGGAACTGTGCATATAGAAAAAGGATGGTTTAAAGAGCATTCCT:1	AGGTCAACAGCAGGCTGTTCAC	GGATGGTTTAAAGAGCATTCCT	+	chr3R	11130139	+	chr3R	11130228	89	+	chr3R	11130139	+	chr3R	11130228
TAAATTGTGTTGTATGTTTAGTACTTTCTCCTAGAAAGTGCAGTTCAAAGTTTTACCCCTTCTCAGTGCTTTCTC:1	TAAATTGTGTTGTATGTTTAGT	TACCCCTTCTCAGTGCTTTCTC	-	chr3R	31426999	-	chr3R	31426907	92	+	chr3R	31426907	+	chr3R	31426999
ATACGTGTAGTATTCTTAGAAGCTTGGAGGTGGTATAAATGACTTGAGGGTTTGTCCATTG:1	ATACGTGTAGTATTCTTAGAAG	TGACTTGAGGGTTTGTCCATTG	-	chrX	4835351	-	chrX	4827994	7357	+	chrX	4827994	+	chrX	4835351
CCAGAATGGCCAAGAAAGTCCAAGACGCCGTTTAGCGCGTTTATAAGTTGAACTCAGTGGCAAAAGGGC:1	CCAGAATGGCCAAGAAAGTCCA	TTGAACTCAGTGGCAAAAGGGC	+	chr2L	10499563	+	chr2L	10499656	93	+	chr2L	10499563	+	chr2L	10499656
AAAAGTTCTCATTCAACGAAATCAGTGCGTAATACGTAATACGTAATATATCAGTCACAATGGAAACAGTTGAAC:1	AAAAGTTCTCATTCAACGAAAT	GTCACAATGGAAACAGTTGAAC	+	chr3R	10732339	+	chr3R	10733211	872	+	chr3R	10732339	+	chr3R	10733211
CATATGCGATCGCAAGTCGCGCACCCTGCTCACAGCGCCCTATCATGTATAGTCCGACAATTCTGTCAGCA:1	CATATGCGATCGCAAGTCGCGC	TAGTCCGACAATTCTGTCAGCA	+	chr3L	7363631	+	chr3L	7355720	7911	+	chr3L	7363631	+	chr3L	7355720
TTAAATTAAATCGAAAAAAAAAAATACATTTATAATTTAACCTTCCAGTTACCTNGTACTTC:1	TTAAATTAAATCGAAAAAAAAA	CCTTCCAGTTACCTNGTACTTC	+	chr2L	12728948	+	chr2L	12729177	229	+	chr2L	12728948	+	chr2L	12729177
TGCAAAAGAAAGATTAGTGCGCAATGCAATTTACGATTTCTGGCCTACGGTGAGCATAACTGCAACTGCAAGGCC:1	TGCAAAAGAAAGATTAGTGCGC	GCATAACTGCAACTGCAAGGCC	+	chrX	3370634	+	chrX	3370716	82	+	chrX	3370634	+	chrX	3370716
CGTGTGGTTAAGTGACAGCGAAGGAGTAAGCAGAATGGTCGGATGGCTGGTTGGATCTCC:1	CGTGTGGTTAAGTGACAGCGAA	TCGGATGGCTGGTTGGATCTCC	+	chr3R	24072119	+	chr3R	24072542	423	+	chr3R	24072119	+	chr3R	24072542
CAGTCTGTTTATTTGGATGGCTATTTTGTTTTTTTATGCTATATAAAAGTAAAACAGATTTTTGTGTATTGCTTT:1	CAGTCTGTTTATTTGGATGGCT	ACAGATTTTTGTGTATTGCTTT	+	chr2R	18738228	+	chr2R	18738304	76	+	chr2R	18738228	+	chr2R	18738304
AGGAGGCTCCCAATATGAAAAGTTTAAATACTGATGATGTTCACGGCAGACAAAAAACAAANAGCAGCAGGAATA:1	AGGAGGCTCCCAATATGAAAAG	AAAACAAANAGCAGCAGGAATA	-	chr3R	10979740	-	chr3R	10979658	82	+	chr3R	10979658	+	chr3R	10979740
AGCCCTTCTCAGTTACGAGTCGTAAAATCAGCTGTGCTAACGTGGCTCTGTCAACACATGGCCATGTTGCATAG:1	AGCCCTTCTCAGTTACGAGTCG	AACACATGGCCATGTTGCATAG	-	chr3L	16515099	-	chr3L	16515022	77	+	chr3L	16515022	+	chr3L	16515099
CAAACAACTCAGCAAGAAACCAAAGCGCGNTCGCAAGACAAACAAGATACAGAAAATACCNAAAAAATACTCCAA:1	CAAACAACTCAGCAAGAAACCA	AAATACCNAAAAAATACTCCAA	+	chr3L	2927863	+	chr3L	2936140	8277	+	chr3L	2927863	+	chr3L	2936140
GATTGGCAAGTGATAAAGAAGAAATGAATAAACCCGATTCATTGAGTGAATAGGAAATCGAAGTTCGTAAGG:1	GATTGGCAAGTGATAAAGAAGA	TAGGAAATCGAAGTTCGTAAGG	-	chr3L	16749464	-	chr3L	15291106	1458358	+	chr3L	15291106	+	chr3L	16749464
CGACCCAACAGACAAAAGAAAGCAAACACACAGCTATATACAATTAGCCAAATTGGCAGCAATAAAACAAATG:1	CGACCCAACAGACAAAAGAAAG	ATTGGCAGCAATAAAACAAATG	-	chr2L	19220162	-	chr2L	4613453	14606709	+	chr2L	4613453	+	chr2L	19220162
ATATTTATNGTTTCTTGCCAATTTCTATTGATGCCNAGTAACTGGCATCCAAAAGTCGTTAGCTTTCTATAGTAA:1	ATATTTATNGTTTCTTGCCAAT	AGTCGTTAGCTTTCTATAGTAA	-	chr2L	19121128	-	chr2L	19121050	78	+	chr2L	19121050	+	chr2L	19121128
TGTTTGCCCAACCAAATGCCTGTGTGGAATCGNCGAAGAAACCCAATGCCGATGCACGTTCGATGGNTGCATC:1	TGTTTGCCCAACCAAATGCCTG	ATGCACGTTCGATGGNTGCATC	-	chrX	16690532	-	chrX	16690455	77	+	chrX	16690455	+	chrX	16690532
AGTTGAAAAGTTAGCACTAGTTATGGGCATATTTTCACTGATTTACTGTTGAGTAATTAGTTTGAAATCATAACT:1	AGTTGAAAAGTTAGCACTAGTT	TAATTAGTTTGAAATCATAACT	-	chr2L	3108967	-	chr2L	3108890	77	+	chr2L	3108890	+	chr2L	3108967
GCAAGCATAAAATNCATTTTTCAAACTGTCCGGATAATCGNTTCCAAATCAATCGAACTATTGGCAC:1	GCAAGCATAAAATNCATTTTTC	AAATCAATCGAACTATTGGCAC	+	chr3L	12052734	+	chr3L	12052815	81	+	chr3L	12052734	+	chr3L	12052815
ATTTAGTTGGCAGCGCGCNCAGGAAGCAGTCAGTTCCTGTTNCAANCAGGACTGTAAACTCTCGCAAATTAAGCG:1	ATTTAGTTGGCAGCGCGCNCAG	GTAAACTCTCGCAAATTAAGCG	-	chr3R	30072632	-	chr3R	30073071	439	+	chr3R	30073071	+	chr3R	30072632
TATGATTTTTCAGAAACTTTTGAACATTGTAAGACAAAGCAACAAATNGAAGATACGTGACAAATTTNTGGATG:1	TATGATTTTTCAGAAACTTTTG	ATACGTGACAAATTTNTGGATG	+	chr3L	7112610	+	chr3L	7112696	86	+	chr3L	7112610	+	chr3L	7112696
GCGACATCCTCTTCCTATCATCTTGTGTTTCACTTGGCTTGGCAGCTTGATTTTGATTTATTGACCTGACAGGTT:1	GCGACATCCTCTTCCTATCATC	TGATTTATTGACCTGACAGGTT	-	chr2R	11019005	-	chr2R	11009831	9174	+	chr2R	11009831	+	chr2R	11019005
GTGCCTTCTTTCCCTTTTTGCCTAACTGATTGTTNTTGTAATTGTTGTTTACGTTTCACTGGCCATATGGAAAAA:1	GTGCCTTCTTTCCCTTTTTGCC	TTTCACTGGCCATATGGAAAAA	+	chr3R	17882811	+	chr3R	16981138	901673	+	chr3R	17882811	+	chr3R	16981138
CGATTCCCACGACACTCCGGAGGACNTTCAGG:1	CGATTCCCACGACACTCCGGAG	GACACTCCGGAGGACNTTCAGG	+	chr3R	28884031	+	chr3R	28881130	2901	+	chr3R	28884031	+	chr3R	28881130
TCCTCAACATTTTCCCGCCCCCCGTATCGTCATCATTTCTTTATTTTTCATCTTTCT:1	TCCTCAACATTTTCCCGCCCCC	TTTCTTTATTTTTCATCTTTCT	+	chr2L	18277692	+	chr2L	5388076	12889616	+	chr2L	18277692	+	chr2L	5388076
TTGAAGCATTCTCTCTGCTTTTCAGTTCCATTCGCAAAACCAAAAGTTATATGTACATGCCCTGTTGTTTAAGCA:1	TTGAAGCATTCTCTCTGCTTTT	TACATGCCCTGTTGTTTAAGCA	+	chr2L	3251498	+	chr2L	3259063	7565	+	chr2L	3251498	+	chr2L	3259063
AAATCTCATTTGGGCCATGCTGAGATCTCTGCGTAACGAGTGCTTGCGTAACGAGTGAGCAAAACACATGTACAT:1	AAATCTCATTTGGGCCATGCTG	AGTGAGCAAAACACATGTACAT	-	chrX	1845845	-	chrX	1845745	100	+	chrX	1845745	+	chrX	1845845
GAAGGCAGCCAATGTCGAGTTTCAGACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1	GAAGGCAGCCAATGTCGAGTTT	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	9162743	+	chr3R	21907536	12744793	+	chr3R	9162743	+	chr3R	21907536
TACCAGTTTAGGCAAGAGATAAAGTGCCTTACGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCTCTCAAATT:1	TACCAGTTTAGGCAAGAGATAA	GCAATGTACTGGCTCTCAAATT	+	chr3R	19446811	+	chr3R	19449477	2666	+	chr3R	19446811	+	chr3R	19449477
ATCTTTTATCTATTACACGGAATACAAGCTACAACAATTGAAATAACCCGTTACAAAAACAAAACATAAACAAAG:1	ATCTTTTATCTATTACACGGAA	CAAAAACAAAACATAAACAAAG	+	chr3R	18281537	+	chr3R	14020743	4260794	+	chr3R	18281537	+	chr3R	14020743
ATTGTATGCCAACTGCCAACAAATCAAGCTGTCGTGAGGCAGTGGAGCATTCAACCATAGCAAAGTATTTCTG:1	ATTGTATGCCAACTGCCAACAA	CAACCATAGCAAAGTATTTCTG	-	chr3R	12893561	-	chr3R	12893485	76	+	chr3R	12893485	+	chr3R	12893561
CCCTCGCTTAAATATATATATATACACGTTCTNTTGGGAGGGAGGAAGGAGGCGGGTAGAGATGG:1	CCCTCGCTTAAATATATATATA	GGAAGGAGGCGGGTAGAGATGG	+	chr3R	4887511	+	chr3R	4894878	7367	+	chr3R	4887511	+	chr3R	4894878
CCCCACTCCCGTAGATTGCCCCCTAACCACCATCCCCTCATTCATTTAGTGGAATTTTTTTCATTTATTTCGC:1	CCCCACTCCCGTAGATTGCCCC	GAATTTTTTTCATTTATTTCGC	-	chr3R	15059824	-	chr3R	9703356	5356468	+	chr3R	9703356	+	chr3R	15059824
GTGTAGTTCCGCACACACACACACACACACACATGCCCACACAC:1	GTGTAGTTCCGCACACACACAC	ACACACACACATGCCCACACAC	+	chr3R	28958894	+	chr3R	11698251	17260643	+	chr3R	28958894	+	chr3R	11698251
CTTGATGGAAATATTTAAATTTTCCCTATATATACATTCCCTTTTCAGATTCGTTCGTCCGCCTGA:1	CTTGATGGAAATATTTAAATTT	TCAGATTCGTTCGTCCGCCTGA	-	chr3L	20148397	-	chr3L	20148316	81	+	chr3L	20148316	+	chr3L	20148397
CAATAGTGCTGTAAAGGTGCTCGANGTCTGGATGGCAGCAAANATNTTATANACTNCATAAATTTGTATGATCAC:1	CAATAGTGCTGTAAAGGTGCTC	CTNCATAAATTTGTATGATCAC	-	chr3R	19136507	-	chr3R	19133885	2622	+	chr3R	19133885	+	chr3R	19136507
CGCTCAGGACTTGCCTTTAGCGCCATANGTNNGCGCAAATAAACACAATNGNGCAGAATGGAATGGACAGAATT:1	CGCTCAGGACTTGCCTTTAGCG	GCAGAATGGAATGGACAGAATT	-	chr2L	13321995	-	chr2L	13321907	88	+	chr2L	13321907	+	chr2L	13321995
TTTGAAATGAGCCCAGCACTGAGTTCGTTCGCCAGGATGATGAGGAGCGGGGAAATGAATATTCGAAATTGCAG:1	TTTGAAATGAGCCCAGCACTGA	AAATGAATATTCGAAATTGCAG	+	chr3L	1415778	+	chr3L	1415859	81	+	chr3L	1415778	+	chr3L	1415859
GCCGACCATTATTTTGTCACTTTCATCGAGAGCACACTTAGACCTTAGACCATTTCTCATTGAGGTCTGCGACAT:1	GCCGACCATTATTTTGTCACTT	TTCTCATTGAGGTCTGCGACAT	+	chr2L	19469177	+	chr2L	19469262	85	+	chr2L	19469177	+	chr2L	19469262
CATTTTTCGTCATAATATAATAATAGAACAAAATCACAATGAGCTCATAATTATTCAT:1	CATTTTTCGTCATAATATAATA	CAATGAGCTCATAATTATTCAT	-	chr2L	15934784	-	chr2L	4721538	11213246	+	chr2L	4721538	+	chr2L	15934784
CGATTATATTTCAGTTCGTTCGTTAATAAAATTGAAATTGTCCAGAAAACACCTCCGAACTCGCCCGCAGCTGAA:1	CGATTATATTTCAGTTCGTTCG	TCCGAACTCGCCCGCAGCTGAA	+	chr3R	24789998	+	chr3R	24790143	145	+	chr3R	24789998	+	chr3R	24790143
TGTTGCTGTGGAGACCCCTCTTGCTGATGATGGCTACCGTTACAAGA:1	TGTTGCTGTGGAGACCCCTCTT	GATGATGGCTACCGTTACAAGA	+	chr3L	4897652	+	chr3L	4897272	380	+	chr3L	4897652	+	chr3L	4897272
CTCGATGAAAACATAGGAGCAACATATAAAAGGTCTTCAATACAAACTTCGAT:1	CTCGATGAAAACATAGGAGCAA	GGTCTTCAATACAAACTTCGAT	+	chr3L	3850681	+	chr3L	11202526	7351845	+	chr3L	3850681	+	chr3L	11202526
TCGCAGACTGGCCTCCCCGGAGCTGGGATGGCATTATATTTTGTTTTAATTTCTTAATTATTTTTTTACAGTGC:1	TCGCAGACTGGCCTCCCCGGAG	CTTAATTATTTTTTTACAGTGC	+	chr2L	17444086	+	chr2L	16542974	901112	+	chr2L	17444086	+	chr2L	16542974
CAATTTGGCAAATGCAATCCACTGAGTTTCGGGGAAAACTAGGGAAGTGNAATAGAGAGGGCTTTAAAACTGCAT:1	CAATTTGGCAAATGCAATCCAC	AGAGAGGGCTTTAAAACTGCAT	+	chr3L	3601299	+	chr3L	3606610	5311	+	chr3L	3601299	+	chr3L	3606610
TTTGAATGTTTGTTTTCGGAAAAAAAATTCCGGGCTTTTGGCTGGCATTCAAAAGCGATTTATTAGGNTTAGAA:1	TTTGAATGTTTGTTTTCGGAAA	AAGCGATTTATTAGGNTTAGAA	-	chr3R	19750124	-	chr3R	19750045	79	+	chr3R	19750045	+	chr3R	19750124
CTNCCACTTTTTTCGTACTCATCTTTTTATTTCTCTNTTTTTTTGTTGTTGTTTTNATGG:1	CTNCCACTTTTTTCGTACTCAT	TTTTTTGTTGTTGTTTTNATGG	+	chr3R	19165702	+	chr3R	24575233	5409531	+	chr3R	19165702	+	chr3R	24575233
TGCTAAAAAGCAATATCTATATTCGCTTTTTTAATTATCGTAACGACAGACGACACAAAGTAT:1	TGCTAAAAAGCAATATCTATAT	AACGACAGACGACACAAAGTAT	+	chr2L	10515391	+	chr2L	10515472	81	+	chr2L	10515391	+	chr2L	10515472
GTCCGTCCCCGTTTTGCCTGAGATTATTTCTTAATTACGCTCCGCTCTATATTTTTAGACTAACCGAGGTCGGCG:1	GTCCGTCCCCGTTTTGCCTGAG	TTTAGACTAACCGAGGTCGGCG	-	chr2L	13928988	-	chr2L	13928873	115	+	chr2L	13928873	+	chr2L	13928988
CGAGTTGTAGACTCCGATAAAAACTGCGGTAACGTCGGGATCACCAAATGTTTATGGGAAGACAACCTATATGC:1	CGAGTTGTAGACTCCGATAAAA	TATGGGAAGACAACCTATATGC	-	chr2R	537962	-	chr2R	529338	8624	+	chr2R	529338	+	chr2R	537962
GCATGCTTCATTACCCTAATGCCGTGTTTTCAAATTATTTTACAAGCCCCTCGCTCCTCGGACTGAAGGCCCATT:1	GCATGCTTCATTACCCTAATGC	CTCCTCGGACTGAAGGCCCATT	-	chr3R	12135772	-	chr3R	12135533	239	+	chr3R	12135533	+	chr3R	12135772
TTGGTTGCCTGGAGCTCTTGTCTCTCCCTTCAACAAAAGGTCCA:1	TTGGTTGCCTGGAGCTCTTGTC	TCTCCCTTCAACAAAAGGTCCA	-	chr3L	7332540	-	chr3L	7332494	46	+	chr3L	7332494	+	chr3L	7332540
CGAAATGATATATACTGGCGTGTCATTAGTCATGCTTTGCTGCACATACATAAGTCCTTGAGGGTCGCATGCGGA:1	CGAAATGATATATACTGGCGTG	GTCCTTGAGGGTCGCATGCGGA	+	chr3R	14233326	+	chr3R	25357944	11124618	+	chr3R	14233326	+	chr3R	25357944
AAAATATGAAGAATTTGTTAGATATAATTTATAATTTNGAGATAGNTTCCTATCACATAATGACGGAA:1	AAAATATGAAGAATTTGTTAGA	TTCCTATCACATAATGACGGAA	+	chr3R	19448621	+	chr3R	19449228	607	+	chr3R	19448621	+	chr3R	19449228
GTTAACAGCCAGGGGTTTATTCATCGACGATAAATTAATCACGGGAGGCTAAATACAAATANTCTCAGGCCAAA:1	GTTAACAGCCAGGGGTTTATTC	ATACAAATANTCTCAGGCCAAA	+	chr3R	19449051	+	chr3R	19448927	124	+	chr3R	19449051	+	chr3R	19448927
CATCTCTCACTCAAACTGTCTTGATAATGCATAAACTCTAGCCTGAAGTCGGTGTGAAGTGCTATCCTGGACTTT:1	CATCTCTCACTCAAACTGTCTT	GTGAAGTGCTATCCTGGACTTT	-	chr3R	25432038	-	chr3R	25431948	90	+	chr3R	25431948	+	chr3R	25432038
TGACTCTTTCCCCCAAAAACGGTACTGCAGCGACTTCACTTTGTTCTTGAAAAACGGCTA:1	TGACTCTTTCCCCCAAAAACGG	CTTTGTTCTTGAAAAACGGCTA	-	chr2R	8865091	-	chr2R	8864873	218	+	chr2R	8864873	+	chr2R	8865091
TAGAACTGTACCTATATGGGATATATATATATATATATGTATCTGTATAGTGGCCAAAGTAT:1	TAGAACTGTACCTATATGGGAT	ATCTGTATAGTGGCCAAAGTAT	-	chr3L	11271422	-	chr3L	11264487	6935	+	chr3L	11264487	+	chr3L	11271422
TTAATGCAAGGTAAATTGCATTGATTTCGTGATTAATGAGAGTTTCGCATTTCACCAGCCAGTACACGGCAAGAA:1	TTAATGCAAGGTAAATTGCATT	ACCAGCCAGTACACGGCAAGAA	+	chr3R	6737522	+	chr3R	6739309	1787	+	chr3R	6737522	+	chr3R	6739309
AATTCAAACGTGACCAAAAATATCCACATATTCGTATTATCCACTTTGTGGACTATTGGGTTGTGCGGTTGCATT:1	AATTCAAACGTGACCAAAAATA	TATTGGGTTGTGCGGTTGCATT	+	chr3L	5030773	+	chr3L	5030849	76	+	chr3L	5030773	+	chr3L	5030849
TTAAGTTGTGATTACTTTATACAGCATTATATTTCTATTCGTATTTTTGTATTTGTATACTGTGTATTTGTATAT:1	TTAAGTTGTGATTACTTTATAC	TGTATACTGTGTATTTGTATAT	+	chr2L	21750127	+	chr2L	21750450	323	+	chr2L	21750127	+	chr2L	21750450
ATATATATCAAATAAAAAGCATATTTTTCCAGTGCATCGCCCTCCTTGAGCAACCGTTTTCCACCCACTACCAAA:1	ATATATATCAAATAAAAAGCAT	CCGTTTTCCACCCACTACCAAA	-	chr3R	13606853	-	chr3R	13606706	147	+	chr3R	13606706	+	chr3R	13606853
TTTTTGAATCAACTTTTTACCATAAACTCCAGGCTTCCGTGCTCCCGATGAATCTC:1	TTTTTGAATCAACTTTTTACCA	TTCCGTGCTCCCGATGAATCTC	+	chr3R	29499227	+	chr3R	19244458	10254769	+	chr3R	29499227	+	chr3R	19244458
GACGGCCTCGTTTTTGCTGTCCTGCCANTTTTGTAGTCTTAAATGGTGGNGACTGCGCTGCTATGTGATAGACA:1	GACGGCCTCGTTTTTGCTGTCC	CTGCGCTGCTATGTGATAGACA	+	chr2R	552767	+	chr2R	553984	1217	+	chr2R	552767	+	chr2R	553984
AAAAATAAAAAAAAGACGAAGGCGCAGACANNNANAAAGTTCAATGAAATGTGCATCATGACGCGTCTCGGATAC:1	AAAAATAAAAAAAAGACGAAGG	CATCATGACGCGTCTCGGATAC	-	chr3L	7854153	-	chr3L	7006326	847827	+	chr3L	7006326	+	chr3L	7854153
AGNAAAACCCACAAAAAGCCGACGTCAGAAAGAANTNTGAATTTGAGGTGCTTTAAGCTGACCTTTGGCACGGTG:1	AGNAAAACCCACAAAAAGCCGA	TAAGCTGACCTTTGGCACGGTG	+	chr3R	19140278	+	chr3R	19140726	448	+	chr3R	19140278	+	chr3R	19140726
TCAAAACGCTGCTTCTACAAGTGCTGCATGCANCGAAGGATAGCGACAGACAGGCGACAGGGCAA:1	TCAAAACGCTGCTTCTACAAGT	CGACAGACAGGCGACAGGGCAA	+	chr3R	28421678	+	chr3R	28421756	78	+	chr3R	28421678	+	chr3R	28421756
GCTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAATTTGGCCGAACAATTTCGTTGCCTACTTTTG:1	GCTTAAATCGATATGCGCAGCT	ACAATTTCGTTGCCTACTTTTG	-	chr2R	22775383	-	chr2R	22774964	419	+	chr2R	22774964	+	chr2R	22775383
ACCATGAAAAATAAAACAAAAATTTTTCAAGAGAGTATAACAATTCCAAAATACTATGAAATTTACGGATTTTTC:1	ACCATGAAAAATAAAACAAAAA	CTATGAAATTTACGGATTTTTC	+	chr2L	14642585	+	chr2L	14651748	9163	+	chr2L	14642585	+	chr2L	14651748
CCGAAGGCAAAAGTTCACATAAAGCAGCCATAAAAAAAAAGCACGGANCGTACGAAGCGAANTGAAATGAATCAT:1	CCGAAGGCAAAAGTTCACATAA	GAAGCGAANTGAAATGAATCAT	-	chrX	9472972	-	chrX	10299916	826944	+	chrX	10299916	+	chrX	9472972
AAATAAAACAAAAATTTTTCAAGAGAGTATAACAATTCCAAAATACTATGAAATTTACGGATTTTTCAACAGTTC:1	AAATAAAACAAAAATTTTTCAA	TTTACGGATTTTTCAACAGTTC	+	chr2L	14642593	+	chr2L	14651756	9163	+	chr2L	14642593	+	chr2L	14651756
GGGCGTGGCAGCAGCAATGGCATTATTTAATTACAGGACAACAGTGGTCCCAACCATTCCCATTGGCACATTTTT:1	GGGCGTGGCAGCAGCAATGGCA	CCATTCCCATTGGCACATTTTT	-	chrX	10552349	-	chrX	10550882	1467	+	chrX	10550882	+	chrX	10552349
GGAATTTCATGGGAAAAGGCAAAGAAAGGCAAGGAATTCGATGGGAAGAAGGTGGAATTTGCTTAAAGATATAA:1	GGAATTTCATGGGAAAAGGCAA	TGGAATTTGCTTAAAGATATAA	+	chrX	11762236	+	chrX	11762321	85	+	chrX	11762236	+	chrX	11762321
CAAAAATATCCACATATTCGTATTATCCACTTTGTGGACTATTGGGTTGNGCGGTTGCATTGTGCAGATTTGCGT:1	CAAAAATATCCACATATTCGTA	GTTGCATTGTGCAGATTTGCGT	+	chr3L	5030787	+	chr3L	5030863	76	+	chr3L	5030787	+	chr3L	5030863
AATTGTCGAGGAATTAAATAGAAGTAGAAACAATGCATATAGCCGTTGATTATCAACTATGAATAATTATG:1	AATTGTCGAGGAATTAAATAGA	TTATCAACTATGAATAATTATG	-	chr2R	15353073	-	chr2R	16508475	1155402	+	chr2R	16508475	+	chr2R	15353073
CGCAACAATAGGTTTTGCATTTGTGTAATTTTGCTTTCCTCTTTTTTTTTGTACTTTTGTGTTTA:1	CGCAACAATAGGTTTTGCATTT	TTTTTTTGTACTTTTGTGTTTA	+	chr2L	10282783	+	chr2L	12144138	1861355	+	chr2L	10282783	+	chr2L	12144138
GATTCTAAATTGGAAGACCGCCGTTGTTTTTGTGGATCAAACCA:1	GATTCTAAATTGGAAGACCGCC	GTTGTTTTTGTGGATCAAACCA	-	chr3R	20859276	-	chr3R	20854517	4759	+	chr3R	20854517	+	chr3R	20859276
TTTGCAGACAATCGAAAGACTTAAGGCACAAACTTGTTGAAAGAACTTTCCTAGGGCACGAAGGCAGCATAAAAC:1	TTTGCAGACAATCGAAAGACTT	GGGCACGAAGGCAGCATAAAAC	+	chr2L	4601730	+	chr2L	4609171	7441	+	chr2L	4601730	+	chr2L	4609171
CAAGACATTAGGCAGCGCAGCAACAATAACAAAAACAGAAACCGTCANCGTAAGGACAACACCGCGTNTTTGCTG:1	CAAGACATTAGGCAGCGCAGCA	GGACAACACCGCGTNTTTGCTG	+	chr3L	1432106	+	chr3L	1432196	90	+	chr3L	1432106	+	chr3L	1432196
GAAGAAAAAAAGAAAAACACAAAATATAATATCCAGCACGCACACTAGCTAAGCGCNCTAACAAC:1	GAAGAAAAAAAGAAAAACACAA	ACTAGCTAAGCGCNCTAACAAC	-	chr3R	20686439	-	chr3R	19197876	1488563	+	chr3R	19197876	+	chr3R	20686439
TTTAAAAACAATAAAATAGGTGATCCCCGAATATCGAAGATCGAAGA:1	TTTAAAAACAATAAAATAGGTG	CCCGAATATCGAAGATCGAAGA	-	chrX	12029778	-	chrX	5955707	6074071	+	chrX	5955707	+	chrX	12029778
TTTCCCACGGGCCTAGGGCCCTAGCTCCCATATGTATATTACATTTAGGTAAGGATGTGCGTGCAACAAGTTGA:1	TTTCCCACGGGCCTAGGGCCCT	GGATGTGCGTGCAACAAGTTGA	-	chr2R	9375452	-	chr2R	9374848	604	+	chr2R	9374848	+	chr2R	9375452
CAGGAGCTACGATTCTTCCCATTTCTTCATCTGCCTTTTGCAGCCCAGCTGCATTTTACACTACGTTCTTCGCTC:1	CAGGAGCTACGATTCTTCCCAT	TTTTACACTACGTTCTTCGCTC	-	chrX	14300901	-	chrX	14300823	78	+	chrX	14300823	+	chrX	14300901
CAAAGCAATTTTTTACCATAAACACCAGGGTGTTTTAGGCCAGAGTTGTAGGCCTGAAATTGGATGATTATAT:1	CAAAGCAATTTTTTACCATAAA	GCCTGAAATTGGATGATTATAT	+	chr2L	18522081	+	chr2L	18522209	128	+	chr2L	18522081	+	chr2L	18522209
TACTACATTCACTCTTCTGCTTAAATCTGATAATTGAGGTGTTTGACTATAATTTGTGCTCGTTGTTGTTGTGCT:1	TACTACATTCACTCTTCTGCTT	TTGTGCTCGTTGTTGTTGTGCT	+	chr3R	10491877	+	chr3R	25398315	14906438	+	chr3R	10491877	+	chr3R	25398315
CATTGGAGCTTTTTGCTCTGTGCGCTTTTCGCTTTTTACTCTCAGTCGCCAAGTTGGCCAGTGCGTTTGGGCCA:1	CATTGGAGCTTTTTGCTCTGTG	GTTGGCCAGTGCGTTTGGGCCA	-	chr3L	8285594	-	chr3L	8285488	106	+	chr3L	8285488	+	chr3L	8285594
TGGCTGAGAATTTCACAGTATATATATGGTACGAACGTATATCGTAAATNTGTA:1	TGGCTGAGAATTTCACAGTATA	GAACGTATATCGTAAATNTGTA	-	chr3R	24078391	-	chr3R	24076945	1446	+	chr3R	24076945	+	chr3R	24078391
AATANGCCATGACCGAGTTGGGNTCAGNTCCATCTGTCANGGTCTATCAAAAGTGTTGTCACTT:1	AATANGCCATGACCGAGTTGGG	TCTATCAAAAGTGTTGTCACTT	+	chr3R	22185161	+	chr3R	22185247	86	+	chr3R	22185161	+	chr3R	22185247
GATGCGACAATCGATAGTGTTGATACTACCGCAAGGAAAACAAACGGCATTGAGGCGGAACCAGGATACGGGG:1	GATGCGACAATCGATAGTGTTG	GAGGCGGAACCAGGATACGGGG	-	chrX	3863299	-	chrX	3863218	81	+	chrX	3863218	+	chrX	3863299
TCCTGAAATTAAATTAACACAAAGACATGCCGTGTCAACTTTTTCGGCAATCAATATTATCGCCAGCACAAAATT:1	TCCTGAAATTAAATTAACACAA	ATATTATCGCCAGCACAAAATT	-	chr3R	8633261	-	chr3R	8633179	82	+	chr3R	8633179	+	chr3R	8633261
ATTTAATCACACTCTAAGTATATAAATAATATAATATAGTATAGTATTAAGCTTGATCACACTTTTTTGCCCGCT:1	ATTTAATCACACTCTAAGTATA	TGATCACACTTTTTTGCCCGCT	-	chr3R	29581633	-	chr3R	29581552	81	+	chr3R	29581552	+	chr3R	29581633
TTAAAAGAGGAACATGTTGATAATAAATCGCATTCCAGATGGCGTAGACTAATAGATTAAGTAACTAAGCCAT:1	TTAAAAGAGGAACATGTTGATA	ATAGATTAAGTAACTAAGCCAT	-	chr2L	5989138	-	chr2L	5989064	74	+	chr2L	5989064	+	chr2L	5989138
CGTGGGTTCGAGAGGAAATATGCACTGGCCGCAGGCTGGATAGGTACACCGCCAGTAAGAAATGCCACAAGAA:1	CGTGGGTTCGAGAGGAAATATG	CCAGTAAGAAATGCCACAAGAA	+	chr3R	6891253	+	chr3R	6891327	74	+	chr3R	6891253	+	chr3R	6891327
AATAAAATACTCCTACTTATTGTGAATGCTCTAATTTTATAGCTATAAATTTCTCAGCTATTTGCAATTATTCG:1	AATAAAATACTCCTACTTATTG	CTCAGCTATTTGCAATTATTCG	-	chrX	20710512	-	chrX	20710436	76	+	chrX	20710436	+	chrX	20710512
CATAATGTAATAGAACTGCTTACAAAACTTTATCATTGATGATGCTGAAATTACACAACACNTGGTACCGGGGCT:1	CATAATGTAATAGAACTGCTTA	CACAACACNTGGTACCGGGGCT	+	chr2L	18925246	+	chr2L	18925341	95	+	chr2L	18925246	+	chr2L	18925341
GCGACCACGGTTGCCATACTATCGCTGGGATGCAGCCATTACATAGCACCCAAACCACCCACCCACAGTTTCC:1	GCGACCACGGTTGCCATACTAT	AAACCACCCACCCACAGTTTCC	+	chr3L	19228131	+	chr3L	16541891	2686240	+	chr3L	19228131	+	chr3L	16541891
AATCCCACCTTGCATGCTCCCCCCATGTTTCAAGNTCTGATAACTGATAACAGAGGGTCAGTTTTCATTACAAT:1	AATCCCACCTTGCATGCTCCCC	GAGGGTCAGTTTTCATTACAAT	+	chr3R	23626323	+	chr3R	23626421	98	+	chr3R	23626323	+	chr3R	23626421
TTTTCGAGGGCTCACCTTCGACCCAATAACAATGCCAGGCACCAGGCACCAATCGACCATCGACCATCCATATTC:1	TTTTCGAGGGCTCACCTTCGAC	CGACCATCGACCATCCATATTC	+	chr2L	9202058	+	chr2L	9202134	76	+	chr2L	9202058	+	chr2L	9202134
GGGGTATGCTGTACTTGGAGATTGGAGCAACAGGCAAATATTTTGAGCTGACAAATTTCTTGTCACCTTTATCA:1	GGGGTATGCTGTACTTGGAGAT	AAATTTCTTGTCACCTTTATCA	+	chr2L	19304233	+	chr2L	19304334	101	+	chr2L	19304233	+	chr2L	19304334
TACTTTAAGATTTATCTACCTGAAATGTTTGGCGCTGCAACAGATAACTTTCATGTTCAGTTGGCTACACGGAAC:1	TACTTTAAGATTTATCTACCTG	TGTTCAGTTGGCTACACGGAAC	+	chr3L	11157733	+	chr3L	11157852	119	+	chr3L	11157733	+	chr3L	11157852
ATTTATTAGAGTGCGAAAACAGTCATCGAGAGTGAACATGGGGTAGTCGATCAAACGCAGCTCAAGTATAGGACG:1	ATTTATTAGAGTGCGAAAACAG	AACGCAGCTCAAGTATAGGACG	+	chr2R	5421627	+	chr2R	5421545	82	+	chr2R	5421627	+	chr2R	5421545
CACCAACACAATCGCACACANTCCCCAAGCGTNGTCATCGTCNGCGTCATATTTGAACTTTTAATATTGACGC:1	CACCAACACAATCGCACACANT	TTTGAACTTTTAATATTGACGC	+	chrX	7849829	+	chrX	12074788	4224959	+	chrX	7849829	+	chrX	12074788
TCTGCCCCAAGTACACAGGAAACTTTATTCCGCTCGATTTTAGGGCAACCTAGTGAACCTAAAGGACAATCAGGA:1	TCTGCCCCAAGTACACAGGAAA	TGAACCTAAAGGACAATCAGGA	+	chr2L	19561347	+	chr2L	19561488	141	+	chr2L	19561347	+	chr2L	19561488
TTTATTTGGTATAATGGATGAAGATGATAGAGAGCAATTCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCT:1	TTTATTTGGTATAATGGATGAA	GTCCGTCTGCAATGTACTGGCT	+	chr3R	19448577	+	chr3R	19449469	892	+	chr3R	19448577	+	chr3R	19449469
TGAAAATTTCCCCCGGTGTACAACTCTCAATGAAGGTCTGCTGATTCCAGCACCTGACATACTTGGTGCAAT:1	TGAAAATTTCCCCCGGTGTACA	CACCTGACATACTTGGTGCAAT	-	chr3L	9084487	-	chr3L	9076930	7557	+	chr3L	9076930	+	chr3L	9084487
ACTACGTGCAACTATGTTGTATATGAAGTACGTGATGGGTGCGTTGATATATCGTAGTANGCCAAATATTT:1	ACTACGTGCAACTATGTTGTAT	TATCGTAGTANGCCAAATATTT	-	chr2L	19560281	-	chr2L	19560033	248	+	chr2L	19560033	+	chr2L	19560281
ATGGATTCGGTTCCCTTGCTCACTGCCCAATTGGCAAATCTTT:1	ATGGATTCGGTTCCCTTGCTCA	ACTGCCCAATTGGCAAATCTTT	+	chr3L	16801432	+	chr3L	18480523	1679091	+	chr3L	16801432	+	chr3L	18480523
AAACAACTCTGCCACAGAGTTGGTGGTTACTTACTTACACACACACATTCAAGTTAAAGGCAAAGT:1	AAACAACTCTGCCACAGAGTTG	ACATTCAAGTTAAAGGCAAAGT	-	chr2R	14476455	-	chr2R	14467312	9143	+	chr2R	14467312	+	chr2R	14476455
TGACACACAAAAGACATCGGACAAGGACACTGGCGACAGGAACGACAAGGTTTGCCGGCTGACAGGCAACG:1	TGACACACAAAAGACATCGGAC	GTTTGCCGGCTGACAGGCAACG	+	chr2R	8511620	+	chr2R	8511696	76	+	chr2R	8511620	+	chr2R	8511696
GTTCATTAATGAAACAAAATATGACTTTTTTTTCTAGTGCATGTAAGAGCAGGACGGGCCTAAATGT:1	GTTCATTAATGAAACAAAATAT	AGAGCAGGACGGGCCTAAATGT	-	chrX	22963149	-	chrX	22963081	68	+	chrX	22963081	+	chrX	22963149
ACTCATCGCCCATCAAGTGGAGATCCGCTGATCAGGGCTTTGCATAACTACAAGAACATAAGACTGNGGCATCTC:1	ACTCATCGCCCATCAAGTGGAG	GAACATAAGACTGNGGCATCTC	+	chr3R	25832708	+	chr3R	25841890	9182	+	chr3R	25832708	+	chr3R	25841890
TATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGACACACATCCATTCTGGGGTCCTCACTGCGGATGAGTGA:1	TATATGGACACCATAAGGCATA	GGTCCTCACTGCGGATGAGTGA	-	chr3L	11865853	-	chr3L	11864558	1295	+	chr3L	11864558	+	chr3L	11865853
TGTTAATCNGTTAATATTTAAAATCGAGCTAGAGAGCNNNNTTTTTCTCCCAACATCTCCGNTCTACCTGCACCT:1	TGTTAATCNGTTAATATTTAAA	CATCTCCGNTCTACCTGCACCT	+	chr2R	8657735	+	chr2R	8657812	77	+	chr2R	8657735	+	chr2R	8657812
CTTCCAGCNCCACCGAAGACAACTGGTCTGCGACCACNNNNTGCAGGCCGATGTTAGTGAGNTCGCTTGCTTTTT:1	CTTCCAGCNCCACCGAAGACAA	TTAGTGAGNTCGCTTGCTTTTT	+	chr3L	27727637	+	chr3L	27728744	1107	+	chr3L	27727637	+	chr3L	27728744
AATCAACATAGAACACACAAAATATTACAACAATTTGCATAAAGCCTGTTACTGTTACGATTTCGAGACGACGGC:1	AATCAACATAGAACACACAAAA	GTTACGATTTCGAGACGACGGC	-	chr3L	14296492	-	chr3L	14296006	486	+	chr3L	14296006	+	chr3L	14296492
TATATATAAATTAATACGAGAATTCTATAAAAGCAAATGCAATTATCAATTTACATAGTTCGGAACTCATTATAC:1	TATATATAAATTAATACGAGAA	CATAGTTCGGAACTCATTATAC	-	chr3R	20209886	-	chr3R	20209800	86	+	chr3R	20209800	+	chr3R	20209886
CATTCTTTCGATGGCGCTGGTGCGACTTTGTAATTGAATTTTTCACGGCGAATTGTTGGTTCGTATTTTTCTTGT:1	CATTCTTTCGATGGCGCTGGTG	TGTTGGTTCGTATTTTTCTTGT	+	chr2R	17992102	+	chr2R	17992178	76	+	chr2R	17992102	+	chr2R	17992178
CTTCACCTGGAATTCCGTGCTCCAAAACAGAAATTTGATCGCAATGTNGTATGCACAGACTCCTCCTCGATTGAA:1	CTTCACCTGGAATTCCGTGCTC	CACAGACTCCTCCTCGATTGAA	-	chr3L	2631189	-	chr3L	2631079	110	+	chr3L	2631079	+	chr3L	2631189
GCTTATCGCATAAGTGAGTAGTTTGTAGTGTTAGTAAGCAACTTTATCATGGTAAATGGCAATCCCCATCCATCA:1	GCTTATCGCATAAGTGAGTAGT	AAATGGCAATCCCCATCCATCA	+	chr3L	14074506	+	chr3L	22915620	8841114	+	chr3L	14074506	+	chr3L	22915620
CCAATGTTCTGACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTACTTTTTATTATATATATATATTACTTTGTGATTTTAT:1	CCAATGTTCTGACTCTGATTTC	ATATATTACTTTGTGATTTTAT	-	chr3L	17921206	-	chr3L	17918402	2804	+	chr3L	17918402	+	chr3L	17921206
ACAAATATACACGGCGAATGCGAGACATCGTGGACATCCA:1	ACAAATATACACGGCGAATGCG	TGCGAGACATCGTGGACATCCA	+	chr2R	18808473	+	chr2R	15927059	2881414	+	chr2R	18808473	+	chr2R	15927059
TATCTATCGATATCCCAAAAAAAAAAATGATTTGTATTCTCACTAGATGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGG:1	TATCTATCGATATCCCAAAAAA	AACGGGTATCTGATAGTCGGGG	+	chrX	23078702	+	chrX	15903347	7175355	+	chrX	23078702	+	chrX	15903347
TCCTTCTTCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTT:1	TCCTTCTTCTTCTCCTTCTCCT	TCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTT	+	chrX	9105142	+	chrX	7652703	1452439	+	chrX	9105142	+	chrX	7652703
ACAATTGCCGCCTTATAGAGCAAGACATCGATGTTCTTCAACATTCTCCCCCGTCTTGGCGCTCGTCTCCCGG:1	ACAATTGCCGCCTTATAGAGCA	CGTCTTGGCGCTCGTCTCCCGG	-	chr2R	14918926	-	chr2R	17574341	2655415	+	chr2R	17574341	+	chr2R	14918926
TGGAGTATTGGGTCCAGGCTCACAACTTTCATTGCTTTGGTTACTATAATTCATTTCTNGTCTT:1	TGGAGTATTGGGTCCAGGCTCA	ACTATAATTCATTTCTNGTCTT	-	chr3L	18682637	-	chr3L	18682848	211	+	chr3L	18682848	+	chr3L	18682637
AGAGAGCGCTGTTTTGCCTGTGCGCGTATGAGTGATCGAGTCAAAGGTTAAGCTAAGCAATGTGTTAATTGTGG:1	AGAGAGCGCTGTTTTGCCTGTG	CTAAGCAATGTGTTAATTGTGG	-	chr3R	9873727	-	chr3R	17256081	7382354	+	chr3R	17256081	+	chr3R	9873727
AAATGGAAGTGGGCAGCAGTCCTGGCGACATTGCTTCACACTGCTATTTCGTCCTCGGCACTCTTTCATTCCG:1	AAATGGAAGTGGGCAGCAGTCC	TCCTCGGCACTCTTTCATTCCG	-	chr2L	2667729	-	chr2L	2667652	77	+	chr2L	2667652	+	chr2L	2667729
TGTTTGTGAAATTCATTTCNATTCCATTGCCCGCCCACACTGCGTACGTGGAAGGGATCAAATTGTGGGAGGAGC:1	TGTTTGTGAAATTCATTTCNAT	GGGATCAAATTGTGGGAGGAGC	+	chr3R	6475196	+	chr3R	6475295	99	+	chr3R	6475196	+	chr3R	6475295
TTGTGCACTTAATTAGGCAATTAAAGAAAGCTTTTAGCAGATATCTTCTTATTAATA:1	TTGTGCACTTAATTAGGCAATT	AGCAGATATCTTCTTATTAATA	-	chr3L	13931449	-	chr3L	13931362	87	+	chr3L	13931362	+	chr3L	13931449
TAATTATGAGTAGGGGGCAAATGCGTTTTCAAACATTTATAGGGATGACAAATGTAATACAGTGCTNAAATAT:1	TAATTATGAGTAGGGGGCAAAT	ATGTAATACAGTGCTNAAATAT	-	chr2R	18372632	-	chr2R	18358422	14210	+	chr2R	18358422	+	chr2R	18372632
GAGCTAGGGATGGCAAAGTGAGGAGACTAGAGATGACTTTCAAGCAGAAAACTA:1	GAGCTAGGGATGGCAAAGTGAG	ATGACTTTCAAGCAGAAAACTA	+	chr3L	5983860	+	chr3L	5983960	100	+	chr3L	5983860	+	chr3L	5983960
ATCGNTGAGCCAACGCCGAAGCNGNAGNGGCTTTTGTTGNTCGCCAAATCCCTCT:1	ATCGNTGAGCCAACGCCGAAGC	TTGTTGNTCGCCAAATCCCTCT	+	chr3L	12284906	+	chr3L	12285040	134	+	chr3L	12284906	+	chr3L	12285040
TATCATGTCGTGCTAATATAGCCCAGAACCTCGAGGACTGGACACGCTCTGGAGGAGCTGGCCAAAGNAAAA:1	TATCATGTCGTGCTAATATAGC	GGAGGAGCTGGCCAAAGNAAAA	+	chr3R	19079578	+	chr3R	19079660	82	+	chr3R	19079578	+	chr3R	19079660
AGTTGTTTGTGTTGTCGTTGCTATTTGAGGTTTTTTTGGTTTTTTGTTTTT:1	AGTTGTTTGTGTTGTCGTTGCT	GTTTTTTTGGTTTTTTGTTTTT	+	chrX	7087114	+	chrX	3034066	4053048	+	chrX	7087114	+	chrX	3034066
CATATGAGGTCAATGTTTACTACGCATGTTTTTACCCCAGAATCTTATCAACCTTAATTCGCAGCCACATACACA:1	CATATGAGGTCAATGTTTACTA	TTAATTCGCAGCCACATACACA	+	chr3L	13074038	+	chr3L	13074171	133	+	chr3L	13074038	+	chr3L	13074171
CTCTTTCGTCCACTTTTCGTTTTTTTTTT:1	CTCTTTCGTCCACTTTTCGTTT	GTCCACTTTTCGTTTTTTTTTT	-	chr2L	1677805	-	chr2L	6218830	4541025	+	chr2L	6218830	+	chr2L	1677805
ATACGGAAAATAGGGAAAAGGACCTCAGTCAGGAGTAACTGACTGCTGTTTCACTAAACTACGTGCGGGTGTTG:1	ATACGGAAAATAGGGAAAAGGA	ACTAAACTACGTGCGGGTGTTG	+	chrX	17782572	+	chrX	17782660	88	+	chrX	17782572	+	chrX	17782660
AATTGCACACGGCTGCTTCACATAAAAGAATATAACTAAATAACCATTGTACAA:1	AATTGCACACGGCTGCTTCACA	TAACTAAATAACCATTGTACAA	-	chr3L	9415247	-	chr3L	9415181	66	+	chr3L	9415181	+	chr3L	9415247
GAAAAGCAGGAATATTCTAGCTAGAGGCATTTCTGGTCTCCAGTNTTCCAAATTGGAGAGAGCATT:1	GAAAAGCAGGAATATTCTAGCT	NTTCCAAATTGGAGAGAGCATT	+	chr3R	20167800	+	chr3R	20167869	69	+	chr3R	20167800	+	chr3R	20167869
ATGGAGTCTGGACATGAGCAGCCTGCTGGTAAACGGGCGATGCCTGA:1	ATGGAGTCTGGACATGAGCAGC	CTGGTAAACGGGCGATGCCTGA	+	chr3L	7505787	+	chr3L	7505848	61	+	chr3L	7505787	+	chr3L	7505848
CTTCTTAGAGCTGCTGCAAATATTTCATCTAAATTTCATCATCGATTATGGCGAATTAAATAAACAAATTAAA:1	CTTCTTAGAGCTGCTGCAAATA	CGAATTAAATAAACAAATTAAA	+	chr3L	11849343	+	chr3L	11849441	98	+	chr3L	11849343	+	chr3L	11849441
GGGAAGTTATGCGAGGTCCAGGGAACGAAGATGTGATTACTATTGATATTTGGTATTC:1	GGGAAGTTATGCGAGGTCCAGG	TTACTATTGATATTTGGTATTC	-	chr2R	2752372	-	chr2R	14135234	11382862	+	chr2R	14135234	+	chr2R	2752372
GTTCTTTTGATTTAGTCCACTGTGTAACATTACACACTTAAGTTGCANTGGACCAATCACCNAATAAAAGTCTCG:1	GTTCTTTTGATTTAGTCCACTG	CAATCACCNAATAAAAGTCTCG	-	chrX	1051167	-	chrX	1051089	78	+	chrX	1051089	+	chrX	1051167
GAACGCACTTCCGTTGCAATTGTCGGGGTCTTAGAACTTTAAACAACAATTGGGTGGGGTTTTTGAAAGGATTGG:1	GAACGCACTTCCGTTGCAATTG	GTGGGGTTTTTGAAAGGATTGG	+	chr3R	9605093	+	chr3R	9605205	112	+	chr3R	9605093	+	chr3R	9605205
TATGCCCTCTATTGCAGGCAAAAAGTAATCCGATGTCAGCTTTTAAAAATATTATTCCTATTAAAAATGGTAAAA:1	TATGCCCTCTATTGCAGGCAAA	ATTCCTATTAAAAATGGTAAAA	-	chr2R	22124418	-	chr2R	22124329	89	+	chr2R	22124329	+	chr2R	22124418
CTCTATCACCATTCCTATGCCCATCTCTCTCCGATTCCCGAGTTTGTATTTGGTTAGAGAAGTTAGCTGAGCGCT:1	CTCTATCACCATTCCTATGCCC	TTAGAGAAGTTAGCTGAGCGCT	-	chr3R	10599144	-	chr3R	15708022	5108878	+	chr3R	15708022	+	chr3R	10599144
TTAAAGAAGTTATGCGATCAAAATATTTTTGTGTTATTCTTTATTAAGGAAAGAANGCCGACTTCTCTG:1	TTAAAGAAGTTATGCGATCAAA	GGAAAGAANGCCGACTTCTCTG	+	chr2R	8455879	+	chr2R	8454930	949	+	chr2R	8455879	+	chr2R	8454930
CTTTAAAAATCTTAATAAAATTAAGTTCAATATCCTGTTGCGGTGGACTTACATCGATGTTGACTCCGGGCAGG:1	CTTTAAAAATCTTAATAAAATT	ATCGATGTTGACTCCGGGCAGG	-	chr2L	17158831	-	chr2L	17158729	102	+	chr2L	17158729	+	chr2L	17158831
TTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGTGCCGTT:1	TTTCGGGATATAATCTCAGTCC	CACTTAAAGTGCATGTGCCGTT	-	chr3R	28484364	-	chr3R	28486281	1917	+	chr3R	28486281	+	chr3R	28484364
AATGAATAAGCTCCAATTTTATGGAATAGACTCCCGTCTTGGGATAAGATTTCCAATGATCTCT:1	AATGAATAAGCTCCAATTTTAT	GATAAGATTTCCAATGATCTCT	+	chr3R	20280064	+	chr3R	20280222	158	+	chr3R	20280064	+	chr3R	20280222
TTCGAGGACGACGATGATGCGACAATCGATAGTGTTGATACTACCGCAAGGAAAACAAACGGCATTGAGGCGGA:1	TTCGAGGACGACGATGATGCGA	AAACAAACGGCATTGAGGCGGA	-	chrX	3863314	-	chrX	3863232	82	+	chrX	3863232	+	chrX	3863314
CATGTTTGACTTTGATTTTTAATTGTTGTTGAGTTTGAATACGACTTCGATCTGCAGCTTGATCTCGATTTCGAT:1	CATGTTTGACTTTGATTTTTAA	GCAGCTTGATCTCGATTTCGAT	+	chr3R	8154306	+	chr3R	8154391	85	+	chr3R	8154306	+	chr3R	8154391
TTTCACCGCTTATCCGCTTGCCCAGTGCAATTTAATTATGCAGAACTGAAAATCGGGGTTATATCGCCTTTCAGT:1	TTTCACCGCTTATCCGCTTGCC	CGGGGTTATATCGCCTTTCAGT	+	chrX	670270	+	chrX	670350	80	+	chrX	670270	+	chrX	670350
TTAATATACAGTTGTTGGCAAATATCAAGGTTTTTTTCGTAAGGTAATCATATATTTTTCAAAAATTTTCACCTT:1	TTAATATACAGTTGTTGGCAAA	ATTTTTCAAAAATTTTCACCTT	+	chr2L	14333914	+	chr2L	14334014	100	+	chr2L	14333914	+	chr2L	14334014
TGGGATGGGGACTCGGATTGGGGGGGGTCAATCAGATTTCGGTTATGTTTCAAGTGGATT:1	TGGGATGGGGACTCGGATTGGG	TCGGTTATGTTTCAAGTGGATT	+	chrX	4198064	+	chrX	13978407	9780343	+	chrX	4198064	+	chrX	13978407
GCAAACAAAAAAAACCGTATTAAAACATGCTATATAATATACTACACTGAAGCTCTTTAAACGAAGTACGACTGT:1	GCAAACAAAAAAAACCGTATTA	TCTTTAAACGAAGTACGACTGT	+	chr2R	22723253	+	chr2R	22723329	76	+	chr2R	22723253	+	chr2R	22723329
CANGCCTTGCACAAAACCCATCGATTCGAGCATGNGNCACGCATGAGGCACAAACAAAATATGCAATATGTTCAC:1	CANGCCTTGCACAAAACCCATC	ACAAAATATGCAATATGTTCAC	+	chr2L	14554171	+	chr2L	14554248	77	+	chr2L	14554171	+	chr2L	14554248
ACGTAGAGCCTTTTTATTGTATCCTCGCCTTTGTGTATATATACATACATACATACATACATATATAAATATTC:1	ACGTAGAGCCTTTTTATTGTAT	ATACATACATATATAAATATTC	-	chr3R	30276532	-	chr3R	7049398	23227134	+	chr3R	7049398	+	chr3R	30276532
TGAAGGCGCAGAAAAGGCTTAAAGGCAGAAAAGGCGTAGAAAAGCGAGACAGGTGATGTCTGAACACCTG:1	TGAAGGCGCAGAAAAGGCTTAA	ACAGGTGATGTCTGAACACCTG	+	chr2L	4599437	+	chr2L	8266920	3667483	+	chr2L	4599437	+	chr2L	8266920
TTGTGTAAATGTAAATACATTTTGTATATATAAATTANTACGAGANTTCTATAAAAGCAAATGCAATTNTCA:1	TTGTGTAAATGTAAATACATTT	ATAAAAGCAAATGCAATTNTCA	-	chr3R	20209910	-	chr3R	20209827	83	+	chr3R	20209827	+	chr3R	20209910
GAGTTCTGCGTTTAATTGTTTGCATGATGAATGATGTATTATTATTTNTAATTTGTAATTTNCATTGTGCAGG:1	GAGTTCTGCGTTTAATTGTTTG	TTTGTAATTTNCATTGTGCAGG	-	chr3L	4915044	-	chr3L	4914800	244	+	chr3L	4914800	+	chr3L	4915044
ATTTGCATAATTGATTTGTCCTCTGGACTAGACCACTAGTCCTGCCCTGCCTGAGTAGCGATTGTGAAATATGCA:1	ATTTGCATAATTGATTTGTCCT	AGTAGCGATTGTGAAATATGCA	-	chr3R	23572899	-	chr3R	23572779	120	+	chr3R	23572779	+	chr3R	23572899
AACATGAATTAAATCTAATTTATTTCATTGAGTTTAATCAACGCTCTNCCCACTTCTCACCACTCTCCAAACGC:1	AACATGAATTAAATCTAATTTA	CTTCTCACCACTCTCCAAACGC	+	chr2L	12529425	+	chr2L	12529500	75	+	chr2L	12529425	+	chr2L	12529500
TTTTGCAACCCTCGCTTAAATATATATATATACACGTTCTTTTGGGGGGGAGGAAGGAGGCG:1	TTTTGCAACCCTCGCTTAAATA	TTTGGGGGGGAGGAAGGAGGCG	+	chr3R	4887503	+	chr3R	4894867	7364	+	chr3R	4887503	+	chr3R	4894867
GCAACGATTGCTGTTGGGTTTTCGGTGGGGGGGG:1	GCAACGATTGCTGTTGGGTTTT	GTTGGGTTTTCGGTGGGGGGGG	-	chr2L	17011065	-	chr2L	10558601	6452464	+	chr2L	10558601	+	chr2L	17011065
CGAAACGGATTTTCNAGTATGCGTGCACCTAGAGTGCCATTCCCCAGGGAAAACTGGACAGGGCACCGGGAAAAT:1	CGAAACGGATTTTCNAGTATGC	CTGGACAGGGCACCGGGAAAAT	+	chr2L	21041165	+	chr2L	21049426	8261	+	chr2L	21041165	+	chr2L	21049426
TTTTTTATGGCAAATTACCCAGCCGCATGTGTGGATGGCTGGGGGGCATTGGGGCGTGGCTTTGGTCG:1	TTTTTTATGGCAAATTACCCAG	CATTGGGGCGTGGCTTTGGTCG	+	chr2L	11614057	+	chr2L	11615545	1488	+	chr2L	11614057	+	chr2L	11615545
AACACACACTTACAGTTACCCACACCACAACTATTACCCGAACCACAACCGGAAACGGGTGCGACCAAACGTCTA:1	AACACACACTTACAGTTACCCA	AACGGGTGCGACCAAACGTCTA	+	chr3L	2939955	+	chr3L	19461745	16521790	+	chr3L	2939955	+	chr3L	19461745
AATTTCCACGTCATACCGCTGGTAATTGCCATATACCATGCACCATGCACCATTCCATACCATGCAAATGTGGGT:1	AATTTCCACGTCATACCGCTGG	TCCATACCATGCAAATGTGGGT	-	chr3R	27542040	-	chr3R	27541959	81	+	chr3R	27541959	+	chr3R	27542040
AACTGCCAACAAATCAAGCTGTCGTGAGGCAGTGGAGCATTCAACCATAGCAAAGTATTTCTGGAGCTGCGCTCC:1	AACTGCCAACAAATCAAGCTGT	AGTATTTCTGGAGCTGCGCTCC	-	chr3R	12893551	-	chr3R	12893473	78	+	chr3R	12893473	+	chr3R	12893551
GAAAGCCGTCAATCTTTCGATCAGCCGCACAATGGGATACATTTCACGTTTGTTTTGCA:1	GAAAGCCGTCAATCTTTCGATC	TACATTTCACGTTTGTTTTGCA	+	chr2L	2826573	+	chr2L	2826642	69	+	chr2L	2826573	+	chr2L	2826642
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAA:2	ACACAACACAACACAACACAAC	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831802	6924268	+	chr3R	21907534	+	chr3R	28831802
AGGTACAGATCAAGAAAAATAGTATTTNAANNGCAATATTGAATTAAATNANTGAATTAAAAGCAAGCATGAATA:1	AGGTACAGATCAAGAAAAATAG	GAATTAAAAGCAAGCATGAATA	-	chrX	19065200	-	chrX	19060416	4784	+	chrX	19060416	+	chrX	19065200
ATTCTCATTAATAGATAAGTTAAGAGTTTTTGTTTTGGCAAAAGGATACGCTACGATGGGCGCCGTGTCCTTGAT:1	ATTCTCATTAATAGATAAGTTA	CGATGGGCGCCGTGTCCTTGAT	+	chrX	9337965	+	chrX	9338057	92	+	chrX	9337965	+	chrX	9338057
AGTGCAGATAAAACCAAACAAAACGGCAGCAACAAAAGTGGAAAAAATTTATGAAAATAGTGCTCAANGACGG:1	AGTGCAGATAAAACCAAACAAA	TGAAAATAGTGCTCAANGACGG	+	chrX	12886910	+	chrX	1334282	11552628	+	chrX	12886910	+	chrX	1334282
AACGCAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:2	AACGCAACGCAACACAACACAA	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	8339247	+	chr3R	21907536	13568289	+	chr3R	8339247	+	chr3R	21907536
AAAACGAAACCAGCGGCAAAACGCTGACAGATAAACAAACAGGTTGGGAT:1	AAAACGAAACCAGCGGCAAAAC	AGATAAACAAACAGGTTGGGAT	+	chr3R	30830588	+	chr3R	30830646	58	+	chr3R	30830588	+	chr3R	30830646
TAACATATATTTGAAAAATGAAATGTGTCTACTCATTTCAAATTGTTTCACAGCGAAGCTCAATCCTATTATTA:1	TAACATATATTTGAAAAATGAA	GCGAAGCTCAATCCTATTATTA	-	chr3R	6656158	-	chr3R	6655840	318	+	chr3R	6655840	+	chr3R	6656158
CCTAGAGTTTGGAAGCTTCTGAAGGCGAGCACAGGGATATCGCCCGCAAAGTGACTTGTAAACATTTTAGCAACT:1	CCTAGAGTTTGGAAGCTTCTGA	ACTTGTAAACATTTTAGCAACT	+	chr3R	29550270	+	chr3R	29550351	81	+	chr3R	29550270	+	chr3R	29550351
CACACGTAGCAGAACCTCATCGTCCTTGGAATAGGGCTCTAGAGTAAGC:1	CACACGTAGCAGAACCTCATCG	GGAATAGGGCTCTAGAGTAAGC	+	chr2L	8778025	+	chr2L	8765736	12289	+	chr2L	8778025	+	chr2L	8765736
ATTTTTCACATTTCTTTATTTCCCTTCCATTTTTTTCTAATATACTTTCCGACTTTTCCCCCCGGCTC:1	ATTTTTCACATTTCTTTATTTC	TTCCGACTTTTCCCCCCGGCTC	-	chr3L	21124858	-	chr3L	13660429	7464429	+	chr3L	13660429	+	chr3L	21124858
GCACATTATGCAGCTAATCGAAGGGAAAGTGTATACAATTTCGTTGTAGTCATAAAATGTAATTAATTAACTTA:1	GCACATTATGCAGCTAATCGAA	TAAAATGTAATTAATTAACTTA	-	chrX	14813832	-	chrX	14813755	77	+	chrX	14813755	+	chrX	14813832
AAGGCTTGGCCCAGCCTGATTATGTGATTTATAGGAAGAACTTATACCCCTTGGTTGGNG:1	AAGGCTTGGCCCAGCCTGATTA	AACTTATACCCCTTGGTTGGNG	-	chr2R	13769093	-	chr2R	13769009	84	+	chr2R	13769009	+	chr2R	13769093
CAACACAACACAACACAACACAATACAACACAACACAACACAATACAACACAACACAAACACAAACACAAACACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
ACTATAAGATACCCCGTTCCCGTTTCTTGCAAGAAAATACAACACAATAATCTAATTATAATAAAAAA:1	ACTATAAGATACCCCGTTCCCG	ATAATCTAATTATAATAAAAAA	-	chr2L	18660013	-	chr2L	18659936	77	+	chr2L	18659936	+	chr2L	18660013
TTAAGCTGCAGGTGCAGCGTGGATATATCAGGGGGCGGGTATCCTGCCATACTGACGGGATAAA:1	TTAAGCTGCAGGTGCAGCGTGG	CCTGCCATACTGACGGGATAAA	-	chr3L	21186136	-	chr3L	21186071	65	+	chr3L	21186071	+	chr3L	21186136
AATATTTCAATCAATGAGTGGGCACACCAGACGTATAAGTAATAAAAAATAATCAAAATAATAGCATGTTTATA:1	AATATTTCAATCAATGAGTGGG	TCAAAATAATAGCATGTTTATA	+	chr3L	5327385	+	chr3L	5327476	91	+	chr3L	5327385	+	chr3L	5327476
CAAACAATGCTTATTTGTTGTTTATCTGTGTAAAGCATCTCTGTGACACTTTCAGGCCACGGCAGACTTGCC:1	CAAACAATGCTTATTTGTTGTT	TTCAGGCCACGGCAGACTTGCC	-	chr2L	10956173	-	chr2L	10946961	9212	+	chr2L	10946961	+	chr2L	10956173
TAATACAAAAAAAAAAGCATACATCAGTCATGGCAGGATTTTTTTTGGTCTTTTATC:1	TAATACAAAAAAAAAAGCATAC	GGATTTTTTTTGGTCTTTTATC	-	chr3L	5479950	-	chr3L	2819941	2660009	+	chr3L	2819941	+	chr3L	5479950
AAAATTTTTGGTCGCGTATTGGACCAATGCTAATCTGACGGCGGGAAGAAAGGAGANTATTTC:1	AAAATTTTTGGTCGCGTATTGG	CGGGAAGAAAGGAGANTATTTC	-	chr3R	27858247	-	chr3R	27856776	1471	+	chr3R	27856776	+	chr3R	27858247
AAAAAACGGGGCACAANAACATTNTGCGGCTGANGGCANTTAGCCAAATAAATGTACAACTANATAAACAAG:1	AAAAAACGGGGCACAANAACAT	AATGTACAACTANATAAACAAG	+	chrX	4731819	+	chrX	4736909	5090	+	chrX	4731819	+	chrX	4736909
TGCATTTAGAAAATAAATAGGATTTGTTTTGTTCAGGAATATTTTCAGAAAAGTGAGCACCACGCTGGATTGTGA:1	TGCATTTAGAAAATAAATAGGA	TGAGCACCACGCTGGATTGTGA	+	chr3L	2719560	+	chr3L	2719662	102	+	chr3L	2719560	+	chr3L	2719662
AACTATTTAGCCGCTGAAGAGAACGGTCCAATATGATTGCACTATTGTATTTTTTCTTATAACACACTTCAAAAT:1	AACTATTTAGCCGCTGAAGAGA	TTCTTATAACACACTTCAAAAT	+	chr3R	4206079	+	chr3R	4211654	5575	+	chr3R	4206079	+	chr3R	4211654
TTATTAGTCATGTACAATTTCTCTCAACCTGCGCAGCCAGAAAGAAATTTTCAAAACAAAAAGCAAAAGCTGCTT:1	TTATTAGTCATGTACAATTTCT	AAACAAAAAGCAAAAGCTGCTT	-	chr3R	9663809	-	chr3R	15433826	5770017	+	chr3R	15433826	+	chr3R	9663809
GTCGGCTGAGTGGTAATGTTGAATGGACAGTCGCGTCTAATGTCACACTGAAAATC:1	GTCGGCTGAGTGGTAATGTTGA	GTCTAATGTCACACTGAAAATC	-	chr3R	19094044	-	chr3R	22211726	3117682	+	chr3R	22211726	+	chr3R	19094044
CAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTA:1	CAATTCAATTTGAGAGCCAGTA	TCTCTATCATCTTCATCCATTA	-	chr3R	19449483	-	chr3R	19448588	895	+	chr3R	19448588	+	chr3R	19449483
AAGGAGCTCTCGAGCGAAGAACGTAGTGTAAAATGCAGCTGGGCTGCAAAAGGCAGATGAAGAAATGGGAAGAA:1	AAGGAGCTCTCGAGCGAAGAAC	GCAGATGAAGAAATGGGAAGAA	+	chrX	14300812	+	chrX	14300889	77	+	chrX	14300812	+	chrX	14300889
GTGAAAAAGAGCTCCAGTCGAAGCTGAGGCCGAACAATATGCGAGACTGCGGCGTCATTGTTGCAAAATTGCG:1	GTGAAAAAGAGCTCCAGTCGAA	GCGTCATTGTTGCAAAATTGCG	-	chr2R	9129644	-	chr2R	9129559	85	+	chr2R	9129559	+	chr2R	9129644
GCACGGGCCCAAGGGCACAGGACGAACAAGGTTCAGGTGTTCGGCTGGGCAGGATTTTCCCA:1	GCACGGGCCCAAGGGCACAGGA	TCGGCTGGGCAGGATTTTCCCA	-	chr2L	10864454	-	chr2L	10862853	1601	+	chr2L	10862853	+	chr2L	10864454
CAAAAAATTGAGAAAAGAAAAAGAGTGCACGCAATTTATT:1	CAAAAAATTGAGAAAAGAAAAA	AAAAGAGTGCACGCAATTTATT	-	chr3R	20333721	-	chr3R	16698214	3635507	+	chr3R	16698214	+	chr3R	20333721
AAATTGTGATTTTATCCTTGTGATTTCGAGTGCATAGTTTGCATTGCATTCTTGTTTTAATTAGACTCAAATCG:1	AAATTGTGATTTTATCCTTGTG	TGTTTTAATTAGACTCAAATCG	+	chr2L	9795486	+	chr2L	8800961	994525	+	chr2L	9795486	+	chr2L	8800961
AATCATCCATCCCAGTCAGCCCATCCGAGCAAAAGACCTTTTTTTATTATGAATAAGCCGAAATACACAATTATG:1	AATCATCCATCCCAGTCAGCCC	TAAGCCGAAATACACAATTATG	+	chr3R	4408420	+	chr3R	4412724	4304	+	chr3R	4408420	+	chr3R	4412724
CGGAAATGATTCCATTATGTTCTCATAAAATCGAATAATATTGACATTATTTCCTTTTAGTTAAATTCCAGTACT:1	CGGAAATGATTCCATTATGTTC	CTTTTAGTTAAATTCCAGTACT	+	chr2L	19823296	+	chr2L	19823385	89	+	chr2L	19823296	+	chr2L	19823385
GCAGTAATTTCGTGTAATTTGCATTAATTTACATTTAATTTGCAGCCACCGAGGAGCTGTGGAGCCAAGGAGCTC:1	GCAGTAATTTCGTGTAATTTGC	GAGCTGTGGAGCCAAGGAGCTC	+	chr3R	16582916	+	chr3R	16582995	79	+	chr3R	16582916	+	chr3R	16582995
GAGTCCTTTGTTGTATCTAAAGTATTCAACAAGCTTAATAGTAACTATGTGCTATAAAGGACAAGAAGCAACTGA:1	GAGTCCTTTGTTGTATCTAAAG	ATAAAGGACAAGAAGCAACTGA	+	chr3R	21518258	+	chr3R	21518342	84	+	chr3R	21518258	+	chr3R	21518342
TACATATAGTAAACTGCAGCATTTATGTCCTTATTGCTTAGCTCCTCGCTCTCGTCGTGCTTCTCGCGGTCG:1	TACATATAGTAAACTGCAGCAT	CTCGTCGTGCTTCTCGCGGTCG	-	chr3L	20650561	-	chr3L	6946331	13704230	+	chr3L	6946331	+	chr3L	20650561
ATCAAAAGCGGACCCAAAACTAGAAACTAAAGCCAACGTTCGTTAAAAAAAATAATAATTTTAGCAACGGGCCAG:1	ATCAAAAGCGGACCCAAAACTA	AATAATTTTAGCAACGGGCCAG	-	chrX	16462807	-	chrX	17831016	1368209	+	chrX	17831016	+	chrX	16462807
ACGATTCTTCCCATTTCTTCNTCTGCCTTTTGNAGCCCAGCTNCATTTTACACTACGTTCTTCGCTCGAGAGCT:1	ACGATTCTTCCCATTTCTTCNT	CTACGTTCTTCGCTCGAGAGCT	-	chrX	14300893	-	chrX	14300816	77	+	chrX	14300816	+	chrX	14300893
ACAATGCCNGCGGAGTGTTTATATTTAGCAAACGCTGAAGCATACTGCACCCCATTCAGTCACCAGAGACTGCA:1	ACAATGCCNGCGGAGTGTTTAT	CATTCAGTCACCAGAGACTGCA	-	chr2R	14955372	-	chr2R	14955223	149	+	chr2R	14955223	+	chr2R	14955372
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
GTTATGAANTGGGAATTAATTGGAAGTAGAATGAGNAGAATTAAGATGACATTGCTACGTTCTCTTCGATTCCGT:1	GTTATGAANTGGGAATTAATTG	GCTACGTTCTCTTCGATTCCGT	-	chr2R	8645625	-	chr2R	8645434	191	+	chr2R	8645434	+	chr2R	8645625
AACTNGGAAATCCCCCAAAACANAACANAAATAAGTACGNGAGCGAAAAGGAAAATAATTTGAGAAGCGTGTTCG:1	AACTNGGAAATCCCCCAAAACA	AATAATTTGAGAAGCGTGTTCG	+	chr2L	16590461	+	chr2L	9216244	7374217	+	chr2L	16590461	+	chr2L	9216244
TAACTAAGAAATGGTAACTAAAAGCATATTTACATCAGGGTCCTTATAATAATTGATTAATCAAATTT:1	TAACTAAGAAATGGTAACTAAA	TAATAATTGATTAATCAAATTT	+	chr3R	6819659	+	chr3R	6819736	77	+	chr3R	6819659	+	chr3R	6819736
GCCACTTAATTTTCTACCTTTAATGGGCTTGCGGGCAGGAAAGTGGGGTCCAGCGAATATGCACATCGTATAAAC:1	GCCACTTAATTTTCTACCTTTA	CGAATATGCACATCGTATAAAC	+	chr3R	4728479	+	chr3R	22167812	17439333	+	chr3R	4728479	+	chr3R	22167812
ACTTCATTAAACTGCAAAAATAGAATTAGAGCACATGGCTGCAAAGGCAGCTCATCGTTCGGCACAGAGTGTTGG:1	ACTTCATTAAACTGCAAAAATA	ATCGTTCGGCACAGAGTGTTGG	+	chr2R	16737148	+	chr2R	16737248	100	+	chr2R	16737148	+	chr2R	16737248
GGGGGCTTTGGCATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTCCCTGTCTCATCAATTAATCTCGTTTGCAGCGNTTACTCA:1	GGGGGCTTTGGCATTGCCCATT	TCTCGTTTGCAGCGNTTACTCA	-	chr2L	14809094	-	chr2L	14803891	5203	+	chr2L	14803891	+	chr2L	14809094
TTAGTAAGTCAGGCGGACGAACGAATCTGAAAAGGGAATGTATATATAGGGAAAATTTAAATATTTCCATCAAGC:1	TTAGTAAGTCAGGCGGACGAAC	AATTTAAATATTTCCATCAAGC	+	chr3L	20148308	+	chr3L	20148398	90	+	chr3L	20148308	+	chr3L	20148398
GAACCAGTTCAGACGAATCCCAAACACAAACTACTACAAACTCACCAACATTACCAACCAGCAACAGCTGACGT:1	GAACCAGTTCAGACGAATCCCA	ACCAACCAGCAACAGCTGACGT	+	chr2R	15665268	+	chr2R	14420712	1244556	+	chr2R	15665268	+	chr2R	14420712
GCAAATAAGTGGCAGCCAAATCTGGTATCCAGCTAACAAGATGTCCCGAAAATTCGGCTCCACTTCTAG:1	GCAAATAAGTGGCAGCCAAATC	GAAAATTCGGCTCCACTTCTAG	-	chr2L	325213	-	chr2L	325142	71	+	chr2L	325142	+	chr2L	325213
AATGCCCTCCACCTCTTGGGCCAGTNTTCACTTTCCCGCCCTGTTCTTATTGTTTTCCAATCTAGCCG:1	AATGCCCTCCACCTCTTGGGCC	TTATTGTTTTCCAATCTAGCCG	+	chr3R	17335183	+	chr3R	17335252	69	+	chr3R	17335183	+	chr3R	17335252
TTATGAATTATACCCTGTTATAAAGAACGATGATCTATTAACTGAATTACATCACTTTCAGTTATGCAGCCCATA:1	TTATGAATTATACCCTGTTATA	ACTTTCAGTTATGCAGCCCATA	-	chrX	12954050	-	chrX	12953912	138	+	chrX	12953912	+	chrX	12954050
CCAAACAGCAAANAGTGTCGCAATGATAATTACAATGTTGTAATATCGCCCGTATATATGTAGGTTT:1	CCAAACAGCAAANAGTGTCGCA	TCGCCCGTATATATGTAGGTTT	-	chr2L	12848533	-	chr2L	12848453	80	+	chr2L	12848453	+	chr2L	12848533
TTTAGTTTTGTGTAATCGGATGATAATCGCTTTAACTTCTGTTTTTCCGAAAAAGTACAACTAT:1	TTTAGTTTTGTGTAATCGGATG	TTTTCCGAAAAAGTACAACTAT	-	chr3L	20781480	-	chr3L	20781405	75	+	chr3L	20781405	+	chr3L	20781480
AAACATGTAGCTCTGAAAATATGTCTCAGGTCTCGTTTTTCGACAGGACCTCGAAAACAGCTGTCGACAGACGCC:1	AAACATGTAGCTCTGAAAATAT	AAAACAGCTGTCGACAGACGCC	+	chr3R	31642830	+	chr3R	31643075	245	+	chr3R	31642830	+	chr3R	31643075
AGCAACAACAACCGCAAANTGCACGCAAATTGAGGCGGCAATAAAAAACAAAAACTAGCGCTCATCGCTTGANAT:1	AGCAACAACAACCGCAAANTGC	ACTAGCGCTCATCGCTTGANAT	+	chr2L	14115417	+	chr2L	13127117	988300	+	chr2L	14115417	+	chr2L	13127117
GAGATCTGAAGGCGGANGAATGCNTCCGAANGTNCCCCNGGGTGGCAAAGCAAAGGAGTGGGNAATGCAAT:1	GAGATCTGAAGGCGGANGAATG	GCAAAGGAGTGGGNAATGCAAT	+	chr2L	4144303	+	chr2L	19640256	15495953	+	chr2L	4144303	+	chr2L	19640256
TTTTTCCTCAGTCATTTTCCCATTTCCCACNNNGNAGCTGAGCAAAATGGAGCGCGCAAAATGCTTTTGCATGCT:1	TTTTTCCTCAGTCATTTTCCCA	GCGCAAAATGCTTTTGCATGCT	+	chrX	5798878	+	chrX	5799040	162	+	chrX	5798878	+	chrX	5799040
TAAGATATCCCAGCCAAACTGAACTCCAGACCAACTAATAATTATAATTCAATAATCGGGGAAGCCCCATAACTC:1	TAAGATATCCCAGCCAAACTGA	AATCGGGGAAGCCCCATAACTC	-	chr3L	9348984	-	chr3L	9348482	502	+	chr3L	9348482	+	chr3L	9348984
CGTCATCTATTCCAACAGCAGCATATATACACATATGTACGATGTAGGCACACAAAACTTGTTAAGTGCTTTTCA:1	CGTCATCTATTCCAACAGCAGC	AAAACTTGTTAAGTGCTTTTCA	-	chr2R	17784270	-	chr2R	17784029	241	+	chr2R	17784029	+	chr2R	17784270
CCGTGGCTTATGTGATATCTGAACGTGGCCCACTTGAAGGACCTTGGAGTCCTACCAGCCTATCGGCGTCACGC:1	CCGTGGCTTATGTGATATCTGA	TACCAGCCTATCGGCGTCACGC	-	chr2R	13721301	-	chr2R	13721219	82	+	chr2R	13721219	+	chr2R	13721301
ATTTTAATTTAATATAATATAGCACACTTTTCGGGGCGCTTTTGAGGTCCGACGCAACGCTATACGTTCAAAGG:1	ATTTTAATTTAATATAATATAG	CGCAACGCTATACGTTCAAAGG	+	chr3R	12599373	+	chr3R	12599455	82	+	chr3R	12599373	+	chr3R	12599455
ATCCCTTTNAGCTCCCAAACGACCGTATTCACTTGCATCCCAACCCATTCAAAGCAGGAGCAGGAGCCCCATC:1	ATCCCTTTNAGCTCCCAAACGA	AAGCAGGAGCAGGAGCCCCATC	-	chr3R	25953210	-	chr3R	4534340	21418870	+	chr3R	4534340	+	chr3R	25953210
AATAAATCGCATTCCAGATGGCGTAGAATAATAGATTAAGTAACTAAGCCATGATTAATCCAATCCAGTTGGCTG:1	AATAAATCGCATTCCAGATGGC	ATTAATCCAATCCAGTTGGCTG	-	chr2L	5989117	-	chr2L	5989041	76	+	chr2L	5989041	+	chr2L	5989117
GGAGTTGTCATTCCATGCAACATTCACTGCAATTGCAGTTTAAATGGCTTTTGGTCATTTACCTTTTGGCGCTGC:1	GGAGTTGTCATTCCATGCAACA	GTCATTTACCTTTTGGCGCTGC	+	chr3L	1581159	+	chr3L	1581493	334	+	chr3L	1581159	+	chr3L	1581493
TTAATGATAGATTTTAGATAGATTGTAAGAATCTTATTCTTCTGGTTCAACACACTTGTTTCTGTATGATGCTCA:1	TTAATGATAGATTTTAGATAGA	ACTTGTTTCTGTATGATGCTCA	+	chr2L	16597897	+	chr2L	16597988	91	+	chr2L	16597897	+	chr2L	16597988
GGTGCTGGAGTCCAGGTGCAATGCCTTCTCGACGGCGTTGTTGAGATCGTTCATC:1	GGTGCTGGAGTCCAGGTGCAAT	GGCGTTGTTGAGATCGTTCATC	+	chr3R	30627629	+	chr3R	30627689	60	+	chr3R	30627629	+	chr3R	30627689
GGCCGTATATATATTGATATTCATGCAGTGGCACTTGTATATGGACACCGAGTGCCCGCTGCCCGATAACCGCTA:1	GGCCGTATATATATTGATATTC	GCCCGCTGCCCGATAACCGCTA	+	chrX	11312077	+	chrX	11319430	7353	+	chrX	11312077	+	chrX	11319430
GAACACCATTCCTTTTGCAGNACGATATCNTTGTGGAAAAGCTTCCTATAA:1	GAACACCATTCCTTTTGCAGNA	NTTGTGGAAAAGCTTCCTATAA	-	chr2L	1343597	-	chr2L	1341490	2107	+	chr2L	1341490	+	chr2L	1343597
ATCAGAAGTCAAATCACTTACAACTACTAATTGGATACTTAACTCGTAACGTTATTATCCAAAGTTTCAACCCAA:1	ATCAGAAGTCAAATCACTTACA	ATTATCCAAAGTTTCAACCCAA	-	chr2R	1646974	-	chr2R	14452975	12806001	+	chr2R	14452975	+	chr2R	1646974
TGTGTAAGTTCCAGAATGTAATAGTGGATTAAGTCATTTACTTACTTCCCAACGCTTTTTTAGATTTTCAATCTT:1	TGTGTAAGTTCCAGAATGTAAT	GCTTTTTTAGATTTTCAATCTT	-	chr2L	13410471	-	chr2L	13405674	4797	+	chr2L	13405674	+	chr2L	13410471
TAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAATTATAATTTAATAAGAAAACA:1	TAAACAATAAACAATAAACAAT	ATTATAATTTAATAAGAAAACA	+	chr3R	7773344	+	chr3R	27469620	19696276	+	chr3R	7773344	+	chr3R	27469620
CTGGGACCACTGGCCATTTCTAATGTGTTTTCATTCTTTTTTCCCTCCAGTGCCGCCGAGGATTCATCACATTA:1	CTGGGACCACTGGCCATTTCTA	CCGCCGAGGATTCATCACATTA	-	chr3R	27789165	-	chr3R	27789089	76	+	chr3R	27789089	+	chr3R	27789165
CTGTTGANATATCCATAGAAAAACCTTGAATGAACGGGCNAATAAAACAGACGGTCTNTGAAACGCATTTAA:1	CTGTTGANATATCCATAGAAAA	ACGGTCTNTGAAACGCATTTAA	-	chr2R	25061443	-	chr2R	25061363	80	+	chr2R	25061363	+	chr2R	25061443
GTGAAAACAAAACAAATGTATGCTAGCTGNGGAAAAGAAACCGCACAGGACATCAAATAANAATAGCCAGTGGGC:1	GTGAAAACAAAACAAATGTATG	CAAATAANAATAGCCAGTGGGC	-	chr3R	16098198	-	chr3R	11475374	4622824	+	chr3R	11475374	+	chr3R	16098198
TACAATGGTGGCTTAATCTATGATCTTCTTCTTTGTATAACTTTTTGCGCTTAATAGCATTAATAATATCACCAC:1	TACAATGGTGGCTTAATCTATG	ATAGCATTAATAATATCACCAC	-	chr3R	29590474	-	chr3R	29590381	93	+	chr3R	29590381	+	chr3R	29590474
AGGAACTTATTCCGTTGTCCATCGATATATGATCCGAACCACCGCTTTCCGTTGTGCCACG:1	AGGAACTTATTCCGTTGTCCAT	CACCGCTTTCCGTTGTGCCACG	+	chr3L	25331651	+	chr3L	25331728	77	+	chr3L	25331651	+	chr3L	25331728
GACATCATTTTTTCAACTGAGCAAACCGAGCAGCATCATCTTGACTGGATTGAACTGG:1	GACATCATTTTTTCAACTGAGC	CATCTTGACTGGATTGAACTGG	-	chrX	6397646	-	chrX	6392898	4748	+	chrX	6392898	+	chrX	6397646
GTTTGCCCAGCTCTCCATATTCATTATTTTCCCTTTATATTTGGTCTTTGTCGCTTGACTTAACACACTTTGG:1	GTTTGCCCAGCTCTCCATATTC	CGCTTGACTTAACACACTTTGG	-	chr3R	26164103	-	chr3R	9320076	16844027	+	chr3R	9320076	+	chr3R	26164103
ATATTTCCAAGGATCTCTTGTGTGGCGCATAACGTTAGAAATCAATGCACTTTTAAAACTGCCTTCCTTGGAAGA:1	ATATTTCCAAGGATCTCTTGTG	TAAAACTGCCTTCCTTGGAAGA	-	chr3R	10194467	-	chr3R	19587826	9393359	+	chr3R	19587826	+	chr3R	10194467
GAGCTCCACGGATGGTCCTTCCATCCACGCAGAGAG:1	GAGCTCCACGGATGGTCCTTCC	GTCCTTCCATCCACGCAGAGAG	-	chr3R	20735093	-	chr3R	20735046	47	+	chr3R	20735046	+	chr3R	20735093
GTGTGCATGAGCCTTTTGGGCTTAATCACAAGCAAGGAAACGAGTGAGCACATGTGTGCGTTGTTCATCGGAAAA:1	GTGTGCATGAGCCTTTTGGGCT	GTGTGCGTTGTTCATCGGAAAA	+	chr2L	12362766	+	chr2L	2197177	10165589	+	chr2L	12362766	+	chr2L	2197177
AAAAAAAAAACACAAAGAGCCGGGGCACCGGNCAAAGTGACAAAGTTAAATTCGNAACTCAT:1	AAAAAAAAAACACAAAGAGCCG	CAAAGTTAAATTCGNAACTCAT	+	chr2R	12748410	+	chr2R	17210780	4462370	+	chr2R	12748410	+	chr2R	17210780
AAAATAATTTGGAAAGAGAACCAAAAATTAGAAAATATAACATAATAATATTCTTATATAATCTGTATATAAT:1	AAAATAATTTGGAAAGAGAACC	TCTTATATAATCTGTATATAAT	+	chr2R	18526912	+	chr2R	18527001	89	+	chr2R	18526912	+	chr2R	18527001
CAGTATCTTTCAAAGACAGCATCCCCTCTTTCAGAACTATCTTTTATTTATTTGAGCTTGCTTTTGGGCTAGACT:1	CAGTATCTTTCAAAGACAGCAT	GAGCTTGCTTTTGGGCTAGACT	+	chr3L	19861825	+	chr3L	19863613	1788	+	chr3L	19861825	+	chr3L	19863613
TCGGACTTCCATTTCAGACGGACCTCGTCTTATCAGACGCGCGCGGAAGCTGCTCGTGTGCAGACGTCTCGCCCA:1	TCGGACTTCCATTTCAGACGGA	TCGTGTGCAGACGTCTCGCCCA	+	chr3L	858011	+	chr3L	866492	8481	+	chr3L	858011	+	chr3L	866492
TATGGTTAACCAAATTTAAGTTTAAGCAATGAAAATCTTTATCTTATAATACTTGATATTCTGGGCATTC:1	TATGGTTAACCAAATTTAAGTT	ATACTTGATATTCTGGGCATTC	-	chr3R	7713644	-	chr3R	7694588	19056	+	chr3R	7694588	+	chr3R	7713644
ATTTAAAGTTTTCGGTATCCCCTATGCCCTTCCTCTTAGAACAACAGACTACAACCACAACTTTAAATCCCCAAG:1	ATTTAAAGTTTTCGGTATCCCC	ACCACAACTTTAAATCCCCAAG	+	chr3L	18154080	+	chr3L	18154164	84	+	chr3L	18154080	+	chr3L	18154164
TGGAACAGCAAAACATATCAATAGAATTACAGACTATTGAAATTGTACAAGAAGTACCATGTAACACAGTTGGTT:1	TGGAACAGCAAAACATATCAAT	GTACCATGTAACACAGTTGGTT	+	chr2R	7642887	+	chr2R	7642967	80	+	chr2R	7642887	+	chr2R	7642967
ATCTTAATAGATGATTCGTTGCTGTACATGCGTACATACATTCCCCAGCCCTAATCCTCTCTGAAATTCCCCT:1	ATCTTAATAGATGATTCGTTGC	TAATCCTCTCTGAAATTCCCCT	-	chr2L	18898488	-	chr2L	18898408	80	+	chr2L	18898408	+	chr2L	18898488
AAAACAAGACGAAAAACAAATTAGCTTTGAGGGCCCAAAAAGGGGCATGACCGCTGTGGGCGGGGTAGCCTAACT:1	AAAACAAGACGAAAAACAAATT	CTGTGGGCGGGGTAGCCTAACT	-	chr3R	24043188	-	chr3R	20886216	3156972	+	chr3R	20886216	+	chr3R	24043188
ACCCCAGGCCATCTGGAGCTTAACAATTAAAATGGGTGGGTAGTGTAAGCTTAAAAGTAGTTAAT:1	ACCCCAGGCCATCTGGAGCTTA	TGTAAGCTTAAAAGTAGTTAAT	+	chr3R	15601176	+	chr3R	15608688	7512	+	chr3R	15601176	+	chr3R	15608688
TTGTAGCGTTTTATATTTTATAAAAAACTTTGTAAAATTTTTAATAGCGTTAGTTAGCTGTTTATTGTTTTACTA:1	TTGTAGCGTTTTATATTTTATA	TTAGCTGTTTATTGTTTTACTA	+	chr2L	12254047	+	chr2L	12254139	92	+	chr2L	12254047	+	chr2L	12254139
GTTGAAATCACACAACAATAACAAATCAAAAATAAAACCAATAACATTTTTTTTAAAGGACACAATTATGTA:1	GTTGAAATCACACAACAATAAC	TTTTAAAGGACACAATTATGTA	+	chrX	3295712	+	chrX	3295804	92	+	chrX	3295712	+	chrX	3295804
TACAAGCAATGGTACGTACGTCTGTGCGATGCAACTGAGGGAGAATTTTGCGGGTGTGTGCGAGTGCGACAAAA:1	TACAAGCAATGGTACGTACGTC	GGTGTGTGCGAGTGCGACAAAA	-	chr2R	6501073	-	chr2R	6500979	94	+	chr2R	6500979	+	chr2R	6501073
GGCGGATGTTCATAGACCATTGGATTAATTCGATACGATACG:1	GGCGGATGTTCATAGACCATTG	TGGATTAATTCGATACGATACG	-	chr3L	9797325	-	chr3L	9797267	58	+	chr3L	9797267	+	chr3L	9797325
TTCAAAGCAATTCACGTATATTTAGGTTGTTTATTAGGTTTTAAATTGTGTTTATTTAGGTTTAAATTGTCAACA:1	TTCAAAGCAATTCACGTATATT	ATTTAGGTTTAAATTGTCAACA	-	chr3R	9860110	-	chr3R	9859996	114	+	chr3R	9859996	+	chr3R	9860110
GTTGCGATTAAGTTAACAGTCAGCAGAAACTCGAATGTACAAGCTGAAGCTGATAGGTTGTCCAAGTTGCCTA:1	GTTGCGATTAAGTTAACAGTCA	GATAGGTTGTCCAAGTTGCCTA	-	chrX	8419427	-	chrX	1049420	7370007	+	chrX	1049420	+	chrX	8419427
ACGGAATCTTAATGAATTTTACGAATTTAACATGCTGTGCACTTCAAACATCCGCTCACTACGGGGTGATGCTGG:1	ACGGAATCTTAATGAATTTTAC	GCTCACTACGGGGTGATGCTGG	-	chr3R	5060818	-	chr3R	5060728	90	+	chr3R	5060728	+	chr3R	5060818
TAATTAAAGTTCGACTTATTTCCGATTTAATAAATGCCGCACTACTTGAATGAATCTCC:1	TAATTAAAGTTCGACTTATTTC	CGCACTACTTGAATGAATCTCC	-	chr3R	25828310	-	chr3R	25828570	260	+	chr3R	25828570	+	chr3R	25828310
CCAAGTAGCAATCATCATGAGCTAATAGGTAAGAGCTTCTAGCTTTTCTCTCAGTGCACGAATGGCGAGAGCTAA:1	CCAAGTAGCAATCATCATGAGC	GTGCACGAATGGCGAGAGCTAA	-	chr3L	13267418	-	chr3L	13267305	113	+	chr3L	13267305	+	chr3L	13267418
TCACACGTTCGGGATGGGTTTGGGTTTTTTGTTTAGCGTGTGTAATTTGGAAAATGAGAT:1	TCACACGTTCGGGATGGGTTTG	TGTGTAATTTGGAAAATGAGAT	+	chr3R	14095416	+	chr3R	21475683	7380267	+	chr3R	14095416	+	chr3R	21475683
GTTGGCTAATGTTATGCAGTTCGTTGGGTTTGNCATCGGATCAGATCATCTTGTTTTGTTAGGAGTNTAT:1	GTTGGCTAATGTTATGCAGTTC	TCTTGTTTTGTTAGGAGTNTAT	-	chr3L	13335652	-	chr3L	13335557	95	+	chr3L	13335557	+	chr3L	13335652
GTTCTTGGGACTCATCAACTACATGTAGTATATTTCGTCCATCTCAGAAGCTCTATGTTAGGGAAGCTAATTGA:1	GTTCTTGGGACTCATCAACTAC	CTATGTTAGGGAAGCTAATTGA	+	chr3R	21784880	+	chr3R	21784977	97	+	chr3R	21784880	+	chr3R	21784977
TACGAGTGTTTGAATTTATNACGTTTTAAATTCTCCCAGTGAAAATCCTTTTTTTCCTTTTTCTCATTTCCTTT:1	TACGAGTGTTTGAATTTATNAC	TTTCCTTTTTCTCATTTCCTTT	+	chrX	2860510	+	chrX	13648194	10787684	+	chrX	2860510	+	chrX	13648194
TTTCGATATCGCATGGGGGGTTTCCCCATTTACAACTCTCGAGGGGAGATTTCTTAAGGTCCTCG:1	TTTCGATATCGCATGGGGGGTT	GGGAGATTTCTTAAGGTCCTCG	-	chr3L	12304167	-	chr3L	12304101	66	+	chr3L	12304101	+	chr3L	12304167
TTATTAATTGAGGTTGGAATGTGTAGGGAAATTTATTTTGCTATGGGAAATAGGAAAACCTTCGTGGTTCTTGA:1	TTATTAATTGAGGTTGGAATGT	GGAAAACCTTCGTGGTTCTTGA	-	chr2R	7290306	-	chr2R	7290205	101	+	chr2R	7290205	+	chr2R	7290306
GCGCACGCTGCGCGTCAGGTAGTTTTTGCATGTTGCTGCTGCTTACTTAACTGTCTTGATGTAAACAATCATGTT:1	GCGCACGCTGCGCGTCAGGTAG	TCTTGATGTAAACAATCATGTT	+	chr3R	13715368	+	chr3R	22728724	9013356	+	chr3R	13715368	+	chr3R	22728724
TTTCTGTTGCCTGTGACAAGGCCAACTAATTTGTACACTTCACTCGAGAAACCGAACGACAGTTGGCANAAAAAT:1	TTTCTGTTGCCTGTGACAAGGC	GAACGACAGTTGGCANAAAAAT	-	chr2L	12941329	-	chr2L	12933862	7467	+	chr2L	12933862	+	chr2L	12941329
ATGCATGCGCTCGATGAGCTCATCGCCTAGGATAGATCTTTCCACCGCCTTTCGTGCTCTATTATTTTTACTCT:1	ATGCATGCGCTCGATGAGCTCA	CGTGCTCTATTATTTTTACTCT	-	chr3R	19860048	-	chr3R	19859968	80	+	chr3R	19859968	+	chr3R	19860048
ATCGTTGGTCAAGTATTTCGTGGTAACAGCTGAAAGCTGGGTCTCGTCTCCCAACCCTCCCNCCTCAACCGGCAA:1	ATCGTTGGTCAAGTATTTCGTG	ACCCTCCCNCCTCAACCGGCAA	+	chr2L	9890122	+	chr2L	1122975	8767147	+	chr2L	9890122	+	chr2L	1122975
TTGCAAACATAAGTCGCAATAAAATCTGTTTGGAATGAATAATATACTAAAGTAAGGAGTGCCTAACAAATTAGC:1	TTGCAAACATAAGTCGCAATAA	AAGGAGTGCCTAACAAATTAGC	+	chr3R	7187741	+	chr3R	7187829	88	+	chr3R	7187741	+	chr3R	7187829
ACAACCAAGATAGGCAGAAGCAGCAACAGCAGCA:1	ACAACCAAGATAGGCAGAAGCA	GGCAGAAGCAGCAACAGCAGCA	+	chr2R	17668803	+	chr2R	11810340	5858463	+	chr2R	17668803	+	chr2R	11810340
TTGCCAACTCAGCTGCAGGGGTGGTCAGTCAGCAAATGAAATGGTTTTGCATTTGCAATTGCCAAGTCGAAAAAA:1	TTGCCAACTCAGCTGCAGGGGT	TGCAATTGCCAAGTCGAAAAAA	+	chr3R	16411511	+	chr3R	16411589	78	+	chr3R	16411511	+	chr3R	16411589
CTTGAAGAATTGCTGCAACTTTCCCAAAAAGCAACTCCATTACAAGGCACCTATAAAGCTTTCGCCTTAAATGGA:1	CTTGAAGAATTGCTGCAACTTT	TAAAGCTTTCGCCTTAAATGGA	+	chr2R	15149187	+	chr2R	15149266	79	+	chr2R	15149187	+	chr2R	15149266
AAGAAGACTTTCTGTTTATTGTTTCAGGATAACCGTGAAGAGTGGCAGATAGTGTTTATAATTGCG:1	AAGAAGACTTTCTGTTTATTGT	GCAGATAGTGTTTATAATTGCG	+	chr2R	22836314	+	chr2R	22834266	2048	+	chr2R	22836314	+	chr2R	22834266
CGAGCTTGGCCAAAAAAAAAAAGACATAATAATAAAAAGAAATTTCTTCCGGATGGATGCATAATGGGGCAACAT:1	CGAGCTTGGCCAAAAAAAAAAA	TGGATGCATAATGGGGCAACAT	+	chr2R	22574151	+	chr2R	22574234	83	+	chr2R	22574151	+	chr2R	22574234
GTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT:1	GTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGT	TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT	-	chr3L	9313027	-	chr3L	11777678	2464651	+	chr3L	11777678	+	chr3L	9313027
TATGGAAAATGTTAGATGAGTGTACTAAGTGCCTCTCGAGTTTTTCTCTCTGTGTGCCTGTCCCCAAG:1	TATGGAAAATGTTAGATGAGTG	TCTCTGTGTGCCTGTCCCCAAG	-	chr2R	11102953	-	chr2R	11102878	75	+	chr2R	11102878	+	chr2R	11102953
GCAACGGCAGCGAAACTTTGTTCCTAAATCAATAATAAAAAATAGGCAACGGAAAATGAAGTCTGTCATTCTATA:1	GCAACGGCAGCGAAACTTTGTT	AAATGAAGTCTGTCATTCTATA	-	chr3L	15877793	-	chr3L	18932846	3055053	+	chr3L	18932846	+	chr3L	15877793
GAAACCAGATAAATGATGGNAGCAAATCGTTGCGCGTCAGTTAAACAGAGAGAAAGCAAGCTCAGTTCGGTAAA:1	GAAACCAGATAAATGATGGNAG	AAAGCAAGCTCAGTTCGGTAAA	-	chr2R	17136378	-	chr2R	17932086	795708	+	chr2R	17932086	+	chr2R	17136378
ATTCAATGAAACCAAGTACCTGCCTTTGGTGCAAAAGGATGCGTTTGGGTAATTTCAGCCAGGGCGAAAGATATA:1	ATTCAATGAAACCAAGTACCTG	TTCAGCCAGGGCGAAAGATATA	+	chr2L	1993198	+	chr2L	1993284	86	+	chr2L	1993198	+	chr2L	1993284
TGAAAGAGTGCCGAGGACGAAATAGCAGTGTGAAGCAATGTCGCCAG:1	TGAAAGAGTGCCGAGGACGAAA	CAGTGTGAAGCAATGTCGCCAG	+	chr2L	2667657	+	chr2L	2667708	51	+	chr2L	2667657	+	chr2L	2667708
ACACAATTGCACGGGCCCAAGGGCACAGGACGAACAAGGTTCAGGTGTTCGGCTGGGCAGGATTTTCCCACGAC:1	ACACAATTGCACGGGCCCAAGG	CTGGGCAGGATTTTCCCACGAC	-	chr2L	10864462	-	chr2L	10862849	1613	+	chr2L	10862849	+	chr2L	10864462
ATATGACAGAGCGCAACAACGGCCACATGAAATGTAACCAGAATCGAGTGCAGTCGATGAACCCCATAGGAATGG:1	ATATGACAGAGCGCAACAACGG	TCGATGAACCCCATAGGAATGG	+	chr2L	12647718	+	chr2L	12647800	82	+	chr2L	12647718	+	chr2L	12647800
TGTTTAATATTTGTTAATAATTAGATCATTACGTATGATCATCATATATGAATTGGGCCCAAATGACATTATCTA:1	TGTTTAATATTTGTTAATAATT	TGGGCCCAAATGACATTATCTA	+	chr3L	8716237	+	chr3L	8716318	81	+	chr3L	8716237	+	chr3L	8716318
CAAATAGTGTCGCAATGATAATTACAATGTTGTAATATCGCCCGTATATATGTAGGTTTACAT:1	CAAATAGTGTCGCAATGATAAT	CCGTATATATGTAGGTTTACAT	-	chr2L	12848525	-	chr2L	12848449	76	+	chr2L	12848449	+	chr2L	12848525
TCAAATGCAATCTTGTCACTCTAAAAATCTAAACCCTTTGATATTTTATATTGGGTCTAGCTTGAAAATAGCTAG:1	TCAAATGCAATCTTGTCACTCT	GGTCTAGCTTGAAAATAGCTAG	-	chr3L	4907331	-	chr3L	4901141	6190	+	chr3L	4901141	+	chr3L	4907331
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
AAAGATTAGATACTTTACCATTTAATTGCCAGGGTTTTGCGGGGTTTTCGCGAATTCAAGTATACGTGGCGCGCA:1	AAAGATTAGATACTTTACCATT	ATTCAAGTATACGTGGCGCGCA	-	chr3R	17317677	-	chr3R	17317597	80	+	chr3R	17317597	+	chr3R	17317677
TGCAAATTATCAGTTTGCAAGTCCAAAACGGGCATAAATCATAGATCGATTTGAATTACATACATTAATCCT:1	TGCAAATTATCAGTTTGCAAGT	TTGAATTACATACATTAATCCT	+	chr3R	15452286	+	chr3R	15452360	74	+	chr3R	15452286	+	chr3R	15452360
AAAATTTGAAAGATATAAAATAATGCTTCATCAAATAAAAAATGATGCTTAAGCGAAATCGCGTTTTNGATGCCA:1	AAAATTTGAAAGATATAAAATA	CGAAATCGCGTTTTNGATGCCA	-	chr3L	16437155	-	chr3L	16437076	79	+	chr3L	16437076	+	chr3L	16437155
TTGCCTCAGTTCGGTGGATTCCGTATCCGATTTGGTGCTCCTGCCTTTTCTGATAAATGTCAAGATATACATTCA:1	TTGCCTCAGTTCGGTGGATTCC	TAAATGTCAAGATATACATTCA	-	chr3R	23967804	-	chr3R	23967236	568	+	chr3R	23967236	+	chr3R	23967804
AANAACATGAGAAAAAAGTATCTAAAAAATACACNTNTAATATATATACATGTAATTCGGCAACTCGAAAATAT:1	AANAACATGAGAAAAAAGTATC	TAATTCGGCAACTCGAAAATAT	+	chr2L	12067338	+	chr2L	12074389	7051	+	chr2L	12067338	+	chr2L	12074389
CATAAAAACTCGCCATAGGAAGCGGAAAGGAAATTTGTGCCAAAAATATACACAACAATACGAACATTAAATATC:1	CATAAAAACTCGCCATAGGAAG	AACAATACGAACATTAAATATC	+	chr2L	3958656	+	chr2L	5180613	1221957	+	chr2L	3958656	+	chr2L	5180613
TACGTGCAATGGCAGCCAATAGTCAAAGTTGTCATTTATATATATGCTCCTGCCTCCTTTCCAGCG:1	TACGTGCAATGGCAGCCAATAG	TGCTCCTGCCTCCTTTCCAGCG	-	chr2L	2119789	-	chr2L	2112136	7653	+	chr2L	2112136	+	chr2L	2119789
AAGATTCACTCTTTTGTTCTTCGGCTGGCTGAGAATTTCACAGTATATATATGGTACGAAAGTATATCGTAAATG:1	AAGATTCACTCTTTTGTTCTTC	GTACGAAAGTATATCGTAAATG	-	chr3R	24078416	-	chr3R	24076949	1467	+	chr3R	24076949	+	chr3R	24078416
AGTCCTCCAAAAGCCCCCATTTGCCTTTTTACGCTTGCTGAGCCAGATAATTAAGATTTCATATAAGTG:1	AGTCCTCCAAAAGCCCCCATTT	TAATTAAGATTTCATATAAGTG	-	chr3L	19857705	-	chr3L	19848521	9184	+	chr3L	19848521	+	chr3L	19857705
CATGCCATACAAATGTGAATGAAATAAAAATAAAACACCAATCAAAATCGTTCACTTTCAACTCGATGGC:1	CATGCCATACAAATGTGAATGA	CGTTCACTTTCAACTCGATGGC	-	chr2L	17540064	-	chr2L	13899457	3640607	+	chr2L	13899457	+	chr2L	17540064
TATGTAGTTCAGTTTTGAGCAGGCAATAAATAGGTATATAGGTATAATTTAGAAAGAATCTTTCGACGGCAGGAT:1	TATGTAGTTCAGTTTTGAGCAG	AAGAATCTTTCGACGGCAGGAT	-	chr2R	24848764	-	chr2R	24848680	84	+	chr2R	24848680	+	chr2R	24848764
ATAGTGCGATGGTTTCGGGCCAACAACAGGCATGCAAAAAACAAAAGGCAGCAAGCGTGTCCTGAC:1	ATAGTGCGATGGTTTCGGGCCA	AAGGCAGCAAGCGTGTCCTGAC	+	chr3R	17521582	+	chr3R	17521733	151	+	chr3R	17521582	+	chr3R	17521733
GACAGTCGAAGAAATTGATNAAAAGAAACTGGTAACCAAATGGCAGCCGAATTACAACAACAATA:1	GACAGTCGAAGAAATTGATNAA	CAGCCGAATTACAACAACAATA	+	chr2L	15810605	+	chr2L	9672991	6137614	+	chr2L	15810605	+	chr2L	9672991
ATTAGATGTGTGGCTAAAAGGAAAGGTGTATTGAACTGTGAAAATTTGTTCGCTATGCATCTGCTGTTCATATT:1	ATTAGATGTGTGGCTAAAAGGA	CTATGCATCTGCTGTTCATATT	+	chr3L	10035243	+	chr3L	10035329	86	+	chr3L	10035243	+	chr3L	10035329
TGGACTTTGATAAAAAAAAAGGCACAAAGTCGCGGCGGATATAAAAATGAGCTCGAATATTTCGTATAATTTA:1	TGGACTTTGATAAAAAAAAAGG	CTCGAATATTTCGTATAATTTA	-	chr3R	30747649	-	chr3R	30747575	74	+	chr3R	30747575	+	chr3R	30747649
GTGAAAAGCCCCACGGAAACACAACCACCACACACACACAACC:1	GTGAAAAGCCCCACGGAAACAC	CAACCACCACACACACACAACC	+	chrX	3766989	+	chrX	1533746	2233243	+	chrX	3766989	+	chrX	1533746
CAGATAAGTGCCGAAAAAGGTTTACAACTTTTGCCGACAGCCATTTATTATTGATGTCCGCATGCTGAAGTCCCA:1	CAGATAAGTGCCGAAAAAGGTT	ATGTCCGCATGCTGAAGTCCCA	+	chr2R	9212705	+	chr2R	9213191	486	+	chr2R	9212705	+	chr2R	9213191
CTGCAAACTCACCTGCGAGTGGTTGACACTCTTAAAATCGTTGGATTCAACGCGGCATATGCCAGACCTCGTG:1	CTGCAAACTCACCTGCGAGTGG	GCGGCATATGCCAGACCTCGTG	-	chr2R	14836560	-	chr2R	12279568	2556992	+	chr2R	12279568	+	chr2R	14836560
TTCTTGTGGTCGTTGACTTTGGTTTCGGTTTGCCGCCCCATTTTGCATGCCGTATTACCTAACTCTTCTATGC:1	TTCTTGTGGTCGTTGACTTTGG	GTATTACCTAACTCTTCTATGC	+	chrX	13471362	+	chrX	13471439	77	+	chrX	13471362	+	chrX	13471439
TGAACGCACACACACACAGGCGCAGAGAAACGAAGAGCGTACAAATCAAATAAATTATCTGAGGATTTACAGNAA:1	TGAACGCACACACACACAGGCG	ATTATCTGAGGATTTACAGNAA	-	chr3L	21347189	-	chr3L	5447943	15899246	+	chr3L	5447943	+	chr3L	21347189
CAGCGACCCGCGCTGATGAATAGCGCCTGAAATGAGCCTACAAAGCTGTCAATTTTAATAAATTATTGCACGGCA:1	CAGCGACCCGCGCTGATGAATA	TTTAATAAATTATTGCACGGCA	+	chr2L	7343332	+	chr2L	7350448	7116	+	chr2L	7343332	+	chr2L	7350448
CTCCCTGCAAAAGCAGAACTCATTTAGCTTTGTTNTAAGCACTCACATATGCATATGCATAATCACAACGCTTTT:1	CTCCCTGCAAAAGCAGAACTCA	TATGCATAATCACAACGCTTTT	+	chr3R	22335842	+	chr3R	22335928	86	+	chr3R	22335842	+	chr3R	22335928
GGAGCAGGACTTCACCTCCCTTCTGTCCACTGTTCAAGTGCTCATTATGGCATCGCAGCAGCTGCCACCTGCCT:1	GGAGCAGGACTTCACCTCCCTT	TCGCAGCAGCTGCCACCTGCCT	-	chr3L	2854566	-	chr3L	2854489	77	+	chr3L	2854489	+	chr3L	2854566
AAGTTCCTTTGAGCTTATGATTATCATCATCANACAAGATATGTGTTATATAAAGTGATAAAGTAANACTTT:1	AAGTTCCTTTGAGCTTATGATT	TAAAGTGATAAAGTAANACTTT	+	chr3R	18068014	+	chr3R	18068093	79	+	chr3R	18068014	+	chr3R	18068093
CAATGCGANATCCCCCCGAGTGGGCAGCGATAAGGCANNNNGTGGAAGCAACGTGTACGAGNGAGTGATAATCTG:1	CAATGCGANATCCCCCCGAGTG	TGTACGAGNGAGTGATAATCTG	+	chr2L	2092396	+	chr2L	20922257	18829861	+	chr2L	2092396	+	chr2L	20922257
CGCAACACAACACAACACAACACAACACANCACAACACAACACAACACAACACACCACAA:1	CGCAACACAACACAACACAACA	AACACAACACAACACACCACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831801
GAAACACAAACATAGCTATGTACATTTGCATTTGCAATCTTCACCTTATTCGGCACTTCAATAGTACGAATATTT:1	GAAACACAAACATAGCTATGTA	CACTTCAATAGTACGAATATTT	-	chrX	441073	-	chrX	440995	78	+	chrX	440995	+	chrX	441073
ATGTTAAGTGAGCATTAAAACTAGGCATCGACTTAGCACTTGGCCTCNACCAGCGCTTTAACAGCCACCGTTA:1	ATGTTAAGTGAGCATTAAAACT	AGCGCTTTAACAGCCACCGTTA	+	chr2L	15991017	+	chr2L	16306029	315012	+	chr2L	15991017	+	chr2L	16306029
TTTTATTATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATTTATATGTATGTACAATAAATGCACATATNCAAATT:1	TTTTATTATATGTATGTATGTA	AATAAATGCACATATNCAAATT	-	chr3R	4953314	-	chr3R	6322061	1368747	+	chr3R	6322061	+	chr3R	4953314
AGNATTATGTATTTGTTAGTCCTTTAAAGAAGAANANAGAAGAAGAAGACAATCTTGTAAAACTAATTACGTCAG:1	AGNATTATGTATTTGTTAGTCC	CTTGTAAAACTAATTACGTCAG	+	chr3R	26153044	+	chr3R	26153129	85	+	chr3R	26153044	+	chr3R	26153129
TGCCAGCGGGCTTCTGTTTATGACAAATCTAGAGGCGACAGGTGGGGGAGATCT:1	TGCCAGCGGGCTTCTGTTTATG	AGGCGACAGGTGGGGGAGATCT	-	chr2R	24655154	-	chr2R	24647618	7536	+	chr2R	24647618	+	chr2R	24655154
ATGAGCAACGCAAATATACCGAAAATCATAAAGCATCGCTGATTAGCATTTGTGGTCTGGTTTTCAGCTCTTGGG:1	ATGAGCAACGCAAATATACCGA	GGTCTGGTTTTCAGCTCTTGGG	+	chr3R	27470044	+	chr3R	27470706	662	+	chr3R	27470044	+	chr3R	27470706
CTTGTTTTGAATGGTTCAGCGGGCCCTAAACAATAGGCCGGCGTAATAAATCTTCCGCCATGCAGGCCAAATAGC:1	CTTGTTTTGAATGGTTCAGCGG	TCCGCCATGCAGGCCAAATAGC	+	chr2L	19697148	+	chr2L	19697241	93	+	chr2L	19697148	+	chr2L	19697241
GCGGAGCAGCGGAGAAGCTGCCTAAAACGGATTGTACTCAACCAACCGCAAAATACTTTCGAGCGTTATTGTTTA:1	GCGGAGCAGCGGAGAAGCTGCC	TACTTTCGAGCGTTATTGTTTA	-	chr3R	23291341	-	chr3R	23291255	86	+	chr3R	23291255	+	chr3R	23291341
CTGGGCGCTATATACCTATATAGCTGTGACGATTTCACAGTCACATTTTNGCGTGTGATTTTAGTCTTCAATGGC:1	CTGGGCGCTATATACCTATATA	TGTGATTTTAGTCTTCAATGGC	-	chr3L	298064	-	chr3L	21533699	21235635	+	chr3L	21533699	+	chr3L	298064
ATGTATTCGAATACACCCCCCGGCCCCTCATCGCCATTTAACCCCCTTTCAC:1	ATGTATTCGAATACACCCCCCG	TCGCCATTTAACCCCCTTTCAC	-	chr3L	23343354	-	chr3L	14909458	8433896	+	chr3L	14909458	+	chr3L	23343354
AAATCTCAGCTCACCTGCTTGTATTTGGGGTTATGTTGGGATAATTGTTTATATATATTATGTGAGCATTTTTTA:1	AAATCTCAGCTCACCTGCTTGT	TATATTATGTGAGCATTTTTTA	-	chr2L	17167835	-	chr2L	17167594	241	+	chr2L	17167594	+	chr2L	17167835
CCCCGTCTCGCTCCACCATCACCCCGTAGTGAGCGGATGTTTGAAGTGCACAGCATGTTAAATTTGTAAAAT:1	CCCCGTCTCGCTCCACCATCAC	CAGCATGTTAAATTTGTAAAAT	+	chr3R	5060716	+	chr3R	5060803	87	+	chr3R	5060716	+	chr3R	5060803
GTTATATTTGAAGCTTACTTATACCTTCCAACCNAACAATTCCAACTTTTACCTGGANATTTG:1	GTTATATTTGAAGCTTACTTAT	CCAACTTTTACCTGGANATTTG	+	chr3L	18772436	+	chr3L	18781105	8669	+	chr3L	18772436	+	chr3L	18781105
AAACAATTGTTGCTCCACCAAACAACTGTCTTGAATTTCCACACTCTTCCAGGGTATAAGCATAGTGTTGAGCGA:1	AAACAATTGTTGCTCCACCAAA	GTATAAGCATAGTGTTGAGCGA	-	chr2L	18480233	-	chr2L	18478802	1431	+	chr2L	18478802	+	chr2L	18480233
GTACATTTTCAAGCTGGACCACATTTTCGAGGACTGTCAGCGGCAGCNAAAGGAACTTTAAGGGGAAAGGATCA:1	GTACATTTTCAAGCTGGACCAC	GAACTTTAAGGGGAAAGGATCA	-	chrX	21040475	-	chrX	21045394	4919	+	chrX	21045394	+	chrX	21040475
ATCAAGTCCAAAAAGCAAGCGAACTCACTAACATCGGCCTGCAGACGTTGGTCGCAGACCAGTTGTNTTCGG:1	ATCAAGTCCAAAAAGCAAGCGA	GTCGCAGACCAGTTGTNTTCGG	-	chr3L	27728753	-	chr3L	27727649	1104	+	chr3L	27727649	+	chr3L	27728753
AAGCAAGAATTAATTTTCCAAACAATTAAATCNGAACTGTCCAACGTTGTTGGCCAATTTGGGAATNAATTGC:1	AAGCAAGAATTAATTTTCCAAA	GGCCAATTTGGGAATNAATTGC	-	chr2R	22579702	-	chr2R	22579618	84	+	chr2R	22579618	+	chr2R	22579702
CGTATTTTGTATGTACGTATGTCGCTAGCGAGTGCACAAACCATTCAACCAGAGTTTCACA:1	CGTATTTTGTATGTACGTATGT	ACCATTCAACCAGAGTTTCACA	+	chrX	17548105	+	chrX	15886812	1661293	+	chrX	17548105	+	chrX	15886812
GTGACCAAGGAGCGGAAGAAGAACGTCAGTCTGCTGCACCTCATCCTGGGCCTCCTTCATTTTCTTC:1	GTGACCAAGGAGCGGAAGAAGA	CTGGGCCTCCTTCATTTTCTTC	+	chr3R	29684803	+	chr3R	9629202	20055601	+	chr3R	29684803	+	chr3R	9629202
TGGCTAATCTGCTTTTTTATTTGTATTCACAATTTCCCTTATTATTCCGCGATATGAAAAATCATTTAATGATTA:1	TGGCTAATCTGCTTTTTTATTT	ATGAAAAATCATTTAATGATTA	-	chr3R	6121401	-	chr3R	6121183	218	+	chr3R	6121183	+	chr3R	6121401
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCACACAACACACCACAACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACCACACAACACACCACAACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	18622718	2405058	+	chr2L	18622718	+	chr2L	16217660
ATTTATATCGAAACATACTTAAACATTAGAACACACATTAGAACNTAATTGTATATATACGAGTATAGAGA:1	ATTTATATCGAAACATACTTAA	TGTATATATACGAGTATAGAGA	-	chr3L	10584378	-	chr3L	10584295	83	+	chr3L	10584295	+	chr3L	10584378
GGGGCAGAGGCTTTTTTTGGTTTGGTATATGGTATATGGCCAGAAGGAGGGCGTGCGATACATGGTCCAGGTAGA:1	GGGGCAGAGGCTTTTTTTGGTT	TGCGATACATGGTCCAGGTAGA	-	chr2R	15127830	-	chr2R	15119349	8481	+	chr2R	15119349	+	chr2R	15127830
AACGCTGCAAACGAGATTAATTGATGAGACAGGGAAACCGAAGCCCAAATGGGCAATGCCAAAGCCCNCAATC:1	AACGCTGCAAACGAGATTAATT	GGCAATGCCAAAGCCCNCAATC	+	chr2L	14803897	+	chr2L	14809098	5201	+	chr2L	14803897	+	chr2L	14809098
TTATTTCTATTTTAATATTACGTATTACAAGGAAATACGACTTATTCCTGCGTGCATTTGTATGCAAATTATAAT:1	TTATTTCTATTTTAATATTACG	GCATTTGTATGCAAATTATAAT	-	chr3L	6004394	-	chr3L	6001694	2700	+	chr3L	6001694	+	chr3L	6004394
GCGCATATGGGTTAATGAATGATTGCCCCCGTACACATTGCATTACGTTTTTTTTTCGGAACAAGGCAAACTTAA:1	GCGCATATGGGTTAATGAATGA	TTTCGGAACAAGGCAAACTTAA	+	chr3R	12080892	+	chr3R	12080970	78	+	chr3R	12080892	+	chr3R	12080970
GTTTCAGTTAAAGGCCCTCTTCGGCAAATAAATGGCGCAATGCAGCCAAACCCAAAGCCCTAAGAG:1	GTTTCAGTTAAAGGCCCTCTTC	GCCAAACCCAAAGCCCTAAGAG	-	chr2R	24710389	-	chr2R	24714248	3859	+	chr2R	24714248	+	chr2R	24710389
AAAATGCAGCGACCCGCGCTGATGAATAGCGCCTGAAATGAGCCTACNAAGCTGTCAATTTTAATAANTTATTG:1	AAAATGCAGCGACCCGCGCTGA	TGTCAATTTTAATAANTTATTG	+	chr2L	7343326	+	chr2L	7350441	7115	+	chr2L	7343326	+	chr2L	7350441
GTTGTCGCCAGAATTTCCTCCTTGGGCGATAAGTTCTCACATTTTTAATTCCTTGGCACATTTG:1	GTTGTCGCCAGAATTTCCTCCT	TTTTAATTCCTTGGCACATTTG	-	chr3L	9369766	-	chr3L	15401796	6032030	+	chr3L	15401796	+	chr3L	9369766
CCCTGTTAAATATTGTGCATAAAATTGTTCAAAAGACTCGAGTTCATATTCTTACACTTGTAGCTTTTT:1	CCCTGTTAAATATTGTGCATAA	ATTCTTACACTTGTAGCTTTTT	+	chr3L	22726444	+	chr3L	22726524	80	+	chr3L	22726444	+	chr3L	22726524
ATACAAGGCAAAAGTTTTTTAAAAAAAGGTTTAACAAATGGCTTATTTGAATGAATGTTTAATTGCTAA:1	ATACAAGGCAAAAGTTTTTTAA	TGAATGAATGTTTAATTGCTAA	+	chr3L	18047724	+	chr3L	18056774	9050	+	chr3L	18047724	+	chr3L	18056774
ATAAGTATGTACATATATNTCCGACTGTTACCAACCCAACTNAGCNCACACACACACACACACACACACACAGAG:1	ATAAGTATGTACATATATNTCC	ACACACACACACACACACAGAG	+	chrX	10824482	+	chrX	7978952	2845530	+	chrX	10824482	+	chrX	7978952
GCGACTTCTGCATCCATCCGCACGCTACCCTAGTCTTAATCACCTGACCGTGTGTGGAGGAATCTANATACTTAG:1	GCGACTTCTGCATCCATCCGCA	GTGGAGGAATCTANATACTTAG	+	chr3R	28604823	+	chr3R	28604901	78	+	chr3R	28604823	+	chr3R	28604901
GTCAATCAGCTCAAGTTAAGTGATGGANTCNNTTGTTTGGTTTTTGGGGNTNTTGAGCCATAAAACATAACCCAA:1	GTCAATCAGCTCAAGTTAAGTG	TGAGCCATAAAACATAACCCAA	-	chr3L	5388533	-	chr3L	5388209	324	+	chr3L	5388209	+	chr3L	5388533
CTTGTGTGTGCACAATTCGTGCTTCATCGTCCTCATCTTCGTTCCGCTCCACGATGGAAACGTCA:1	CTTGTGTGTGCACAATTCGTGC	CCGCTCCACGATGGAAACGTCA	-	chrX	778218	-	chrX	778138	80	+	chrX	778138	+	chrX	778218
TATATCAGCTTAAACTGCCTATTAATAAGAAGATATCTGCTAAAAGCTTTCTTTAATTGCCTAATTAAGTGCACA:1	TATATCAGCTTAAACTGCCTAT	TAATTGCCTAATTAAGTGCACA	+	chr3L	13931343	+	chr3L	13931448	105	+	chr3L	13931343	+	chr3L	13931448
ATACGTATGTGTGTGTGTGTGTGCATGTGCATTTATGTATATGCAAAAGTAA:1	ATACGTATGTGTGTGTGTGTGT	ATTTATGTATATGCAAAAGTAA	+	chrX	15483497	+	chrX	13898737	1584760	+	chrX	15483497	+	chrX	13898737
ATATGGTTGACTTTACCAACGCAGATATACCCAGCAATCGCAGTTAAATGAACCAAATGTAATAGTAGTTGCCAC:1	ATATGGTTGACTTTACCAACGC	CAAATGTAATAGTAGTTGCCAC	-	chrX	4047606	-	chrX	4047493	113	+	chrX	4047493	+	chrX	4047606
TATTCAAAGCAATTCACGTATATTTAGGTTGTTTATTAGGTTTTAAATTGTGTTTATTTAGGTTTAAATTGTCAA:1	TATTCAAAGCAATTCACGTATA	TTATTTAGGTTTAAATTGTCAA	-	chr3R	9860112	-	chr3R	9859998	114	+	chr3R	9859998	+	chr3R	9860112
CACTAATTAATGGGTTTTTAAACAAACTTGGCAACGCGTTCTGCTCACGTTTGCACCGGCAACAACAAGTAAGCA:1	CACTAATTAATGGGTTTTTAAA	CACCGGCAACAACAAGTAAGCA	+	chr3R	18139833	+	chr3R	28082500	9942667	+	chr3R	18139833	+	chr3R	28082500
CGAACGAAAACACGCAATCTCCGAGCACGACAATAAGCTTCGGGGTGCGAAAAAGCCAACGACAATGGATTGA:1	CGAACGAAAACACGCAATCTCC	AAAGCCAACGACAATGGATTGA	+	chr2R	13089767	+	chr2R	13089875	108	+	chr2R	13089767	+	chr2R	13089875
GGCAAGAGTTGGCGAGATAATCACACAATTTTCAATGGCCGAAACGCTGTACTATCTCATCCTACGCAATCCATC:1	GGCAAGAGTTGGCGAGATAATC	ATCTCATCCTACGCAATCCATC	-	chrX	9576146	-	chrX	9575822	324	+	chrX	9575822	+	chrX	9576146
CTTACCTGCAACGAGAGCGCGAAATTCACAGTCAATTAGTGTGCAGGATCAGGCCAGGACATGGTTTGTCACTTG:1	CTTACCTGCAACGAGAGCGCGA	CCAGGACATGGTTTGTCACTTG	-	chr3R	29781674	-	chr3R	5722012	24059662	+	chr3R	5722012	+	chr3R	29781674
ATTAATGANAGTTAACGGTTGCGATGCTTTAATGCNGATATAATGTTGATATATGTATATATAAAATCCTTTACA:1	ATTAATGANAGTTAACGGTTGC	TGTATATATAAAATCCTTTACA	-	chr2L	16505116	-	chr2L	16505006	110	+	chr2L	16505006	+	chr2L	16505116
TTCAGGTGTCCAAGGCGAAGGTTGTCTGTATATATGCTGGCATTTTAGGNCCTTTTCTGCCCCTGCTAATTCCT:1	TTCAGGTGTCCAAGGCGAAGGT	TTTTCTGCCCCTGCTAATTCCT	+	chrX	906722	+	chrX	908510	1788	+	chrX	906722	+	chrX	908510
AGCCAAGTCTTTCGAACACTAGAATCAGAAGATTTATACGTCACAAATGAAGTACTATTCCTTTTTTTTTT:1	AGCCAAGTCTTTCGAACACTAG	AAGTACTATTCCTTTTTTTTTT	-	chr2L	12400811	-	chr2L	11697732	703079	+	chr2L	11697732	+	chr2L	12400811
GTCAGCGGCTTTGATTGCCAAAGGGCATTAAGTAGGATGGGTAGTTTTTCCGCCTAATTAGGATATAGAAATT:1	GTCAGCGGCTTTGATTGCCAAA	GCCTAATTAGGATATAGAAATT	+	chr3R	20060652	+	chr3R	20060733	81	+	chr3R	20060652	+	chr3R	20060733
GGAGAAGGAGAAGAAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAAGGAGAANGA:1	GGAGAAGGAGAAGAAGAAGGAG	AGGAGAAGGAGAAGGAGAANGA	+	chr3R	16910586	+	chr3R	10451880	6458706	+	chr3R	16910586	+	chr3R	10451880
ATGATTCTTAAGCAAAAACTTAGGTCACTGGGGGAAGCTTGAAAAACAAACATCTTAAAATTCAAATAGTATGTT:1	ATGATTCTTAAGCAAAAACTTA	CTTAAAATTCAAATAGTATGTT	+	chr2L	3497868	+	chr2L	3497946	78	+	chr2L	3497868	+	chr2L	3497946
TGGGAAGAGGATCAGCATATTAATGGAGTTTGGCAGAATATTTTAAATGAGAATGCTTGATTTCATTAGAAAAAT:1	TGGGAAGAGGATCAGCATATTA	TGCTTGATTTCATTAGAAAAAT	+	chr2R	13790340	+	chr2R	13790416	76	+	chr2R	13790340	+	chr2R	13790416
CCCATGAAATTAGCACAAAACGCTCACACACCGACCGACTTAATTTATTTGATATATTTTTTAAATATTCCATTG:1	CCCATGAAATTAGCACAAAACG	ATATTTTTTAAATATTCCATTG	-	chr2L	14686211	-	chr2L	20720645	6034434	+	chr2L	20720645	+	chr2L	14686211
TTTGGTTCGTCCAGATTAGCTTTCTTAATCAGCCTTTGTATCAATGATTTGGTCGGCTTGTCACCACTTTTT:1	TTTGGTTCGTCCAGATTAGCTT	GGTCGGCTTGTCACCACTTTTT	+	chr3L	23144146	+	chr3L	25807026	2662880	+	chr3L	23144146	+	chr3L	25807026
CAGCAACTGCGCCAACAAGTAAGCGAACTGGAAGCGNTGCGCACACGCGATCAATCTGAATTGGAAGCA:1	CAGCAACTGCGCCAACAAGTAA	CGATCAATCTGAATTGGAAGCA	-	chrX	3958082	-	chrX	3957909	173	+	chrX	3957909	+	chrX	3958082
TAGTCCAATGTGTAACATTACACACTTAAGTTGCAATGGANCNATNACCAAATAAAAGTCTCGNCGCTGTCT:1	TAGTCCAATGTGTAACATTACA	AATAAAAGTCTCGNCGCTGTCT	-	chrX	1051155	-	chrX	1051080	75	+	chrX	1051080	+	chrX	1051155
GCCACAAAGAAACGCTTTTCGAAATGCAATTCGACTGTGTTTGGTCGAAGTGATAATTAAAAC:1	GCCACAAAGAAACGCTTTTCGA	TGGTCGAAGTGATAATTAAAAC	-	chr2R	17724949	-	chr2R	17724877	72	+	chr2R	17724877	+	chr2R	17724949
TCTGTAAGTTTATATTGATCTCTAAATACCTTTTATTGTTGCTATTATATTTTTTTTTT:1	TCTGTAAGTTTATATTGATCTC	GTTGCTATTATATTTTTTTTTT	-	chr2R	16762078	-	chr2R	11110337	5651741	+	chr2R	11110337	+	chr2R	16762078
GGCCGTGGCTTATGTGATATCTGAACGTGGCCCACTTGAAGGACCTTGGAGTCCTACCAGCCTATCG:1	GGCCGTGGCTTATGTGATATCT	TTGGAGTCCTACCAGCCTATCG	-	chr2R	13721303	-	chr2R	13721228	75	+	chr2R	13721228	+	chr2R	13721303
GTGATATGAAAACAAAACACTTACCCGATATGAATAAAAACCTGAATCTTGTTTTACTAATTAAAATCCAAAGG:1	GTGATATGAAAACAAAACACTT	TTTACTAATTAAAATCCAAAGG	-	chr2R	7868709	-	chr2R	7868629	80	+	chr2R	7868629	+	chr2R	7868709
TCGACCATTACACTAATTGCTGGCATACAACAATAAACAAGGCTTCTAGTTGGGCTGAGAAATCGTGGGATGNTG:1	TCGACCATTACACTAATTGCTG	GCTGAGAAATCGTGGGATGNTG	-	chr2L	10568870	-	chr2L	17024613	6455743	+	chr2L	17024613	+	chr2L	10568870
TATATCGAAGTGTTTGGTGGGGGCTAGGAACTGGCAACTGGAAAAGCCTTGGCCAATAGATTTACGGCAAAC:1	TATATCGAAGTGTTTGGTGGGG	GGCCAATAGATTTACGGCAAAC	+	chr3L	10417605	+	chr3L	10417679	74	+	chr3L	10417605	+	chr3L	10417679
TAAAAGTAGGTTACTCGTAGATGTGGAAAAGTAGTAAACAAATAAGCAACAATAATTACGCGTTGGTAAACAAAA:1	TAAAAGTAGGTTACTCGTAGAT	AATTACGCGTTGGTAAACAAAA	+	chr3R	18418362	+	chr3R	9125029	9293333	+	chr3R	18418362	+	chr3R	9125029
TGACGCGTCTTAAAATTCTTCGTATCGCGTGGACAATAAATATAACAAAATCTAGAACTGTTGACAGATATTTG:1	TGACGCGTCTTAAAATTCTTCG	TAGAACTGTTGACAGATATTTG	-	chr3L	24009878	-	chr3L	24009697	181	+	chr3L	24009697	+	chr3L	24009878
ATTTGTGTTAACTTAGACTGCAAGATGTTTATAATAAATATTACTTAAATACATATTTTATAAATAAGCTTTACT:1	ATTTGTGTTAACTTAGACTGCA	TATTTTATAAATAAGCTTTACT	-	chr2L	11665913	-	chr2L	11665835	78	+	chr2L	11665835	+	chr2L	11665913
GTAGCAGTTGCAATTAATGTTCTTTGCAAGTTTANTCTCCTCCTGCAAAAGTATCTTATGGATACGCTTTG:1	GTAGCAGTTGCAATTAATGTTC	AGTATCTTATGGATACGCTTTG	+	chr2L	20967944	+	chr2L	20968033	89	+	chr2L	20967944	+	chr2L	20968033
GTAAAAAAAGAAGAAGCAAAACCCGAGGAGGAGAACCAACGAAACAGAAGCCGAGAGCAACTATGACCGTCTGAT:1	GTAAAAAAAGAAGAAGCAAAAC	AGAGCAACTATGACCGTCTGAT	+	chrX	14631744	+	chrX	15187319	555575	+	chrX	14631744	+	chrX	15187319
TGTGTGTTTATTGACTTTATTGAGTGTCAAGTAAAAACTTTGGTGGATCATTTGGTGGAACATTTTTCCAAGTAT:1	TGTGTGTTTATTGACTTTATTG	GGTGGAACATTTTTCCAAGTAT	-	chr3R	17835824	-	chr3R	17835574	250	+	chr3R	17835574	+	chr3R	17835824
TGTCTAGCCTGTCTGGGAAGATATCGGTTACGTGCAACATCTTTACAAACACAATTACGGGGGTTTAATTACTCA:1	TGTCTAGCCTGTCTGGGAAGAT	ATTACGGGGGTTTAATTACTCA	-	chr3R	16083442	-	chr3R	30248133	14164691	+	chr3R	30248133	+	chr3R	16083442
AAACCAAATTATTATACAGGCTGAACTGAAGGCCAAAAGATAATTCAATATGAACTGTGGCTGCGGCATTACGTA:1	AAACCAAATTATTATACAGGCT	ACTGTGGCTGCGGCATTACGTA	-	chrX	5442121	-	chrX	5442013	108	+	chrX	5442013	+	chrX	5442121
GTGACCACTCTGCCCAACAAGGACGGTGTGGAGACGCCGCTTTATCTAGTTACTTTCAGATCCTCATCGTCATC:1	GTGACCACTCTGCCCAACAAGG	CTTTCAGATCCTCATCGTCATC	+	chr3L	18918880	+	chr3L	20598456	1679576	+	chr3L	18918880	+	chr3L	20598456
GCCGAAATANGTGAAAAATATATGAAATAAGGATTAAGCCTTATCCGTCTCACAAATTCATTGGCCTTTAAGT:1	GCCGAAATANGTGAAAAATATA	ACAAATTCATTGGCCTTTAAGT	-	chr2R	22969304	-	chr2R	22971556	2252	+	chr2R	22971556	+	chr2R	22969304
TTGTTTTCTTTTTCATTGTTATTCGTATCTTTTCGTGCGTCAAANTCAATTCCTCAACGCCTTACTT:1	TTGTTTTCTTTTTCATTGTTAT	TCAATTCCTCAACGCCTTACTT	+	chr3L	27380869	+	chr3L	15663833	11717036	+	chr3L	27380869	+	chr3L	15663833
AAATTCAATAAAGCCTGAAAAATCGAAAAAAGCTAGAGGGTTAATCCTCGCGAAGCTGATAAAAAGGACGCGGGC:1	AAATTCAATAAAGCCTGAAAAA	AGCTGATAAAAAGGACGCGGGC	+	chr3R	28035505	+	chr3R	28035582	77	+	chr3R	28035505	+	chr3R	28035582
CGTAGTTGATTTTTTATTAACTAATTTTTTGTTAGTTGAGGAAATGTCGAAAGTCAAGCACAGAAGACTCATTCA:1	CGTAGTTGATTTTTTATTAACT	TCAAGCACAGAAGACTCATTCA	-	chr2R	10235079	-	chr2R	10234990	89	+	chr2R	10234990	+	chr2R	10235079
AATCTCGTATCTTGCGAATGCAACACTATCTGTCAGTTAGCGATGCCATCTATACTAATATACTGCGAAGCGTA:1	AATCTCGTATCTTGCGAATGCA	TACTAATATACTGCGAAGCGTA	+	chr2L	19357559	+	chr2L	19357648	89	+	chr2L	19357559	+	chr2L	19357648
TTTTGCAACCCTCGCTTAAATATATATATATACACGTTCTTTTGGGAGGGAGGAAGGAGGCGG:1	TTTTGCAACCCTCGCTTAAATA	TTGGGAGGGAGGAAGGAGGCGG	+	chr3R	4887503	+	chr3R	4894868	7365	+	chr3R	4887503	+	chr3R	4894868
ACAAAATGNCTGCAAATTGCAGACACGACCGGATCNGGAATCTAGAAGCCCCACTCCTTCCCCACCAGCACTCAA:1	ACAAAATGNCTGCAAATTGCAG	CTCCTTCCCCACCAGCACTCAA	+	chr3L	16521177	+	chr3L	496576	16024601	+	chr3L	16521177	+	chr3L	496576
AGTTTTTTAAGACATTCCCTAACATTAACAATATATTAAAAAAATAGTAGATATTAACATACAGTTTTGCGGCGA:1	AGTTTTTTAAGACATTCCCTAA	TTAACATACAGTTTTGCGGCGA	-	chr3R	5846981	-	chr3R	5846905	76	+	chr3R	5846905	+	chr3R	5846981
GATCTCTGCGTTGCTCCGTTTTTCACTTGCATTGATCGCCCTTGTATGTCCTCTTCGACACTCACTGG:1	GATCTCTGCGTTGCTCCGTTTT	TGTCCTCTTCGACACTCACTGG	-	chr3R	2541720	-	chr3R	2534158	7562	+	chr3R	2534158	+	chr3R	2541720
TCAGACAGATAAAATAAGCCATCTACCATAAGGAGTTGGGTGGTGTTTTTGCGGTTCGTTTGTTGTGGGTTTTT:1	TCAGACAGATAAAATAAGCCAT	GGTTCGTTTGTTGTGGGTTTTT	-	chrX	20912027	-	chrX	12218478	8693549	+	chrX	12218478	+	chrX	20912027
AAAGGCGCTGACTGGAAATGTCCCTTAATGTTGACTAAAAAGGGTCAACGATTTCAACTGCCCCTTCCCGTT:1	AAAGGCGCTGACTGGAAATGTC	ATTTCAACTGCCCCTTCCCGTT	-	chr3L	22611729	-	chr3L	22611858	129	+	chr3L	22611858	+	chr3L	22611729
ATGATTATTACATGAGCGTATATANCTTTATAATTATAATCTNCANGTAAANGTTNTTACTGTTTTTAGTTTAGA:1	ATGATTATTACATGAGCGTATA	TTNTTACTGTTTTTAGTTTAGA	+	chr3L	18092804	+	chr3L	18092919	115	+	chr3L	18092804	+	chr3L	18092919
GCAGTGTCTTGACGTTGCTGCCTTCGCATTTGGAGCAACGCATTTCCTACCCCCACATGCTATGGGNCATAAACT:1	GCAGTGTCTTGACGTTGCTGCC	CACATGCTATGGGNCATAAACT	+	chr3R	20118194	+	chr3R	20118278	84	+	chr3R	20118194	+	chr3R	20118278
GACACCTTAAGATAGGCCACATATCAGTTCACCAACCTTGACAAACGACTGCGAATGCTTCTCGTAGACACGG:1	GACACCTTAAGATAGGCCACAT	CGAATGCTTCTCGTAGACACGG	+	chrX	16329449	+	chrX	16329530	81	+	chrX	16329449	+	chrX	16329530
GGTTGGTTGAGTACAATCCGTTTTAGGCAGCTTCTCCGCTGCTCCGCTGCTAATCCACATCTTTTTTCTCAATCT:1	GGTTGGTTGAGTACAATCCGTT	TCCACATCTTTTTTCTCAATCT	+	chr3R	23291283	+	chr3R	23291369	86	+	chr3R	23291283	+	chr3R	23291369
CAGCGGAATTTATTTTTAAATACGATTTCTTTGATTGTTTAACTTGTTAAAATGCTGCGNTTTT:1	CAGCGGAATTTATTTTTAAATA	CTTGTTAAAATGCTGCGNTTTT	-	chr3R	29969077	-	chr3R	24608524	5360553	+	chr3R	24608524	+	chr3R	29969077
TCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAG:1	TCTGGATGCTTAGCCATCTCGT	ACAAGCCGGCGCTGCTTTTGAG	-	chr2R	12187479	-	chr2R	12190106	2627	+	chr2R	12190106	+	chr2R	12187479
ATTTTCTACCGCTCCCAAGCCGCTATTAAACTATTTTGCTTTTGCTTTGGTCTGCGCATAAATTAGCACTAACA:1	ATTTTCTACCGCTCCCAAGCCG	TGCGCATAAATTAGCACTAACA	-	chr2R	5300544	-	chr2R	25129991	19829447	+	chr2R	25129991	+	chr2R	5300544
GTTTTTTCTCCTCTCCCTGAAAATCCTGAGCATTTGGCACTATCGCACCGAAGCTTGGCGGCTGATGTACGAACT:1	GTTTTTTCTCCTCTCCCTGAAA	CTTGGCGGCTGATGTACGAACT	+	chr3R	25683009	+	chr3R	22987579	2695430	+	chr3R	25683009	+	chr3R	22987579
AAACTTTCCTATTTAAAGCTTTGCACTAACTGGGACGGCAATAGTTACAAACGATTGGAAGACGCANCGCTTAA:1	AAACTTTCCTATTTAAAGCTTT	GATTGGAAGACGCANCGCTTAA	+	chr2L	1711367	+	chr2L	1711690	323	+	chr2L	1711367	+	chr2L	1711690
ATACATATACATTCGTACATATATGCACATATAGCCAGCGATAAAAAT:1	ATACATATACATTCGTACATAT	ACATATAGCCAGCGATAAAAAT	+	chr3R	16207113	+	chr3R	13980906	2226207	+	chr3R	16207113	+	chr3R	13980906
TCTTAGATGAAAATCCCGTGTGCACTATAGTTATCCAAATTATTATTTAACTGGTTTTAAATTGCTGTGCTCGAT:1	TCTTAGATGAAAATCCCGTGTG	GTTTTAAATTGCTGTGCTCGAT	+	chr2L	3073052	+	chr2L	3078255	5203	+	chr2L	3073052	+	chr2L	3078255
TAAATTTAATCACTGCAATATGCAATCAGTTCATATCAGAGCTTGGTGGCGCAATGACGGTTT:1	TAAATTTAATCACTGCAATATG	CTTGGTGGCGCAATGACGGTTT	+	chr2R	15700266	+	chr2R	15700369	103	+	chr2R	15700266	+	chr2R	15700369
GAGAAACGCCGCCAGGTGCAAAACGAAACGTGTGGATATATCGAAGTGTTTGGTGGGGGCTAGGAACTGGCAACT:1	GAGAAACGCCGCCAGGTGCAAA	TGGGGGCTAGGAACTGGCAACT	+	chr3L	10417569	+	chr3L	10417646	77	+	chr3L	10417569	+	chr3L	10417646
ATGTGAGATATGGTAAGATACTTTGGATTGTTTGAGGTGCAGTTAAGTTCTCAGCTTTTGGTTTCGCTNAGTGTA:1	ATGTGAGATATGGTAAGATACT	GCTTTTGGTTTCGCTNAGTGTA	-	chrX	8085668	-	chrX	8085582	86	+	chrX	8085582	+	chrX	8085668
AAAAGCAGAGATACCGTGACCACATGGAGCACCAGCGTCAGCAGGAGC:1	AAAAGCAGAGATACCGTGACCA	GAGCACCAGCGTCAGCAGGAGC	+	chr2R	23161681	+	chr2R	22265662	896019	+	chr2R	23161681	+	chr2R	22265662
TGCGTTCTCCCAATTCCTCTTGCTTTTGCGCTTGCCCCCCCCCC:1	TGCGTTCTCCCAATTCCTCTTG	CTTTTGCGCTTGCCCCCCCCCC	+	chrX	21430846	+	chrX	14574074	6856772	+	chrX	21430846	+	chrX	14574074
GATGATCTCTGCNTTGCTCCGTTTTTCACTNGNATTGANCGTCCTTGTATGTCCTCTTCGACACTCAC:1	GATGATCTCTGCNTTGCTCCGT	GTATGTCCTCTTCGACACTCAC	-	chr3R	2541723	-	chr3R	2534161	7562	+	chr3R	2534161	+	chr3R	2541723
AACATCTTTTAGTATGAATCAATCAGAATGAACGATGTTGCATACAACACATACTAAATACTCTGCATCCTGTGA:1	AACATCTTTTAGTATGAATCAA	CTAAATACTCTGCATCCTGTGA	-	chr3L	934034	-	chr3L	933931	103	+	chr3L	933931	+	chr3L	934034
ATCATCATCATCGGCGAGCAGCAGCGAGCAGATTGTTTACGAATTGCGAAAACTAATGGCGTTTAAANTACAA:1	ATCATCATCATCGGCGAGCAGC	ACTAATGGCGTTTAAANTACAA	+	chr2L	4427811	+	chr2L	4427887	76	+	chr2L	4427811	+	chr2L	4427887
AGTAAGCATCAATGGGTTAAGTGAATGAGGCATCCGCATGTATGTACATACATAGACATTCGCGGACTAGCTTG:1	AGTAAGCATCAATGGGTTAAGT	TAGACATTCGCGGACTAGCTTG	-	chr3R	5927823	-	chr3R	5927584	239	+	chr3R	5927584	+	chr3R	5927823
AATCTTGCTTTAAGTCAGTTGATTTTTACAATTTCTAAAACTGTATTTATTCAAACTCTACCACT:1	AATCTTGCTTTAAGTCAGTTGA	TATTTATTCAAACTCTACCACT	-	chr3R	14203597	-	chr3R	14194458	9139	+	chr3R	14194458	+	chr3R	14203597
AGCAATCTTACTCTTCGATCGATAACAGTGCGATTTACTGATAACGAATTCAGAATGTCGCCCACAAAAGTTTCT:1	AGCAATCTTACTCTTCGATCGA	AATGTCGCCCACAAAAGTTTCT	+	chr3L	7399944	+	chr3L	7400025	81	+	chr3L	7399944	+	chr3L	7400025
AACAGACAAGCAGTGAAAACAAGACAATGAAATGGATAATAATGATAGAAAAAATACTNTAAGAAA:1	AACAGACAAGCAGTGAAAACAA	ATAGAAAAAATACTNTAAGAAA	-	chr2L	17863694	-	chr2L	17863622	72	+	chr2L	17863622	+	chr2L	17863694
TATTGATATTCATGCAGTGGCACTTGTATATGGACACCGAGTGCCCGCTGCCCGATAACCGCTAGATGGCGGAG:1	TATTGATATTCATGCAGTGGCA	CGATAACCGCTAGATGGCGGAG	+	chrX	11312088	+	chrX	11319440	7352	+	chrX	11312088	+	chrX	11319440
AAGACGCTAATATTACTGCTTATTACCTTTTCGGGAAGTCCCCGT:1	AAGACGCTAATATTACTGCTTA	TACCTTTTCGGGAAGTCCCCGT	-	chr3R	15135109	-	chr3R	15132079	3030	+	chr3R	15132079	+	chr3R	15135109
ACTGAAGCNGGTTTAATTAAAACAGCGCCACTAAAGGNNNNCCTGTATGTGAATGTGTGTGNGTGTGTTGGCCC:1	ACTGAAGCNGGTTTAATTAAAA	ATGTGTGTGNGTGTGTTGGCCC	-	chr2L	10899518	-	chr2L	5314273	5585245	+	chr2L	5314273	+	chr2L	10899518
GTTCATAATTTCGAATTAATGAAACTTTTACAGGGGAGCTTAAGACTTTGAATACCGGAAGTTTTCCATTAGCT:1	GTTCATAATTTCGAATTAATGA	TACCGGAAGTTTTCCATTAGCT	+	chr2R	20556047	+	chr2R	20129535	426512	+	chr2R	20556047	+	chr2R	20129535
ATTTGGTNAAGTAACTGGCTGTACGAGCAGCCCAGCAGGNAAGCCCACAG:1	ATTTGGTNAAGTAACTGGCTGT	AGCCCAGCAGGNAAGCCCACAG	-	chr2L	18244324	-	chr2L	18243714	610	+	chr2L	18243714	+	chr2L	18244324
CCTCTGCCGCTCCATCGGNTAACCAGTCGGCCACTCCATCAATNTCTGGNTCGATCCCTGATGCTCAGCTTGAG:1	CCTCTGCCGCTCCATCGGNTAA	GATCCCTGATGCTCAGCTTGAG	+	chr2L	19544625	+	chr2L	19544701	76	+	chr2L	19544625	+	chr2L	19544701
TTAGCCTATGAAACCTCATTACCTCATTAATCACAGGAAGTGACTAGGATTAAANTAAT:1	TTAGCCTATGAAACCTCATTAC	AAGTGACTAGGATTAAANTAAT	+	chr2R	25193366	+	chr2R	25193492	126	+	chr2R	25193366	+	chr2R	25193492
TGTAACTCATATTTGGGCCGAGGCCAATTGTCTGATTTTGGCTAAAAGCTAAATGGTATAAA:1	TGTAACTCATATTTGGGCCGAG	GCTAAAAGCTAAATGGTATAAA	-	chr3R	18214685	-	chr3R	4904892	13309793	+	chr3R	4904892	+	chr3R	18214685
GGCGGATGTTCATAGACCATTGGATTCATTCGATACGATACGTTCGAATAAGTTTTATTTGTTCGATTGCAAT:1	GGCGGATGTTCATAGACCATTG	GTTTTATTTGTTCGATTGCAAT	-	chr3L	9797325	-	chr3L	9797236	89	+	chr3L	9797236	+	chr3L	9797325
GAAAAGGCCCTAAAATGCCAGCATATATACAGACAACCTTCGCCTTGNACACCTGAAATCGAACCAANAACGCA:1	GAAAAGGCCCTAAAATGCCAGC	CTGAAATCGAACCAANAACGCA	-	chrX	908493	-	chrX	906705	1788	+	chrX	906705	+	chrX	908493
AGGGGGGAAAAGGCGAAATAAATAAAAATGCCAAACGGAAGCTTCCAACGACCATCGAGGGGGGGGCGAAAGCG:1	AGGGGGGAAAAGGCGAAATAAA	CATCGAGGGGGGGGCGAAAGCG	-	chr3R	30972559	-	chr3R	8706110	22266449	+	chr3R	8706110	+	chr3R	30972559
GAGGGCCCATCTGCTGCCAGTAGAGTGAAATATTTAAATAAATTTGATAAGCGCTGACTAAGCCCTTGCAAG:1	GAGGGCCCATCTGCTGCCAGTA	GCGCTGACTAAGCCCTTGCAAG	-	chr2L	3339311	-	chr2L	3395001	55690	+	chr2L	3395001	+	chr2L	3339311
ACTTTTCCAGCTGTGCTCAGCTGCTTCGCATTTTCCAGCAAATATCCGGGGGACTTTACCGCTTTCTGCGGTCTG:1	ACTTTTCCAGCTGTGCTCAGCT	CTTTACCGCTTTCTGCGGTCTG	+	chr2L	10563942	+	chr2L	10564035	93	+	chr2L	10563942	+	chr2L	10564035
CTTCATAANTTGGTTTTTATTGGGGTCCCATGTGTNTGCGTCTGTGGCTTTCGTTCTTAGAATGGGAGGTAAAAT:1	CTTCATAANTTGGTTTTTATTG	TTCTTAGAATGGGAGGTAAAAT	+	chr2R	22349712	+	chr2R	22351496	1784	+	chr2R	22349712	+	chr2R	22351496
CCTCGAACAGCTGGGCAAAAAAGTAATTTTNNNTNGCGAGCGAGGAGATTAATGACTAAACGAATATAAATA:1	CCTCGAACAGCTGGGCAAAAAA	AATGACTAAACGAATATAAATA	-	chr3R	22591770	-	chr3R	22591693	77	+	chr3R	22591693	+	chr3R	22591770
CAAGAGAGTCTTCTTTCTCTTCGCACGCACACAACACTCCGTGCTCACACACATACACACATCGGCGCCAATGGG:1	CAAGAGAGTCTTCTTTCTCTTC	TACACACATCGGCGCCAATGGG	-	chrX	8864316	-	chrX	10072093	1207777	+	chrX	10072093	+	chrX	8864316
GTTTAATCCAGATGGCTTCTTAACAATATAACCTTAAACCCTTTCATACCCAGTCGAAAGACAGTAGCCTCT:1	GTTTAATCCAGATGGCTTCTTA	CAGTCGAAAGACAGTAGCCTCT	-	chr3R	6339566	-	chr3R	6339464	102	+	chr3R	6339464	+	chr3R	6339566
TATACATGTTTATAATGTCGNTGTGAAAGGTCNCATGTCAATNACTTGGATGAAGTT:1	TATACATGTTTATAATGTCGNT	TGTCAATNACTTGGATGAAGTT	+	chr2L	11450154	+	chr2L	11450218	64	+	chr2L	11450154	+	chr2L	11450218
TAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATATATCATTTTTTTTGCNGAGCG:1	TAAATTAATTAGTTACTAATGC	ATATCATTTTTTTTGCNGAGCG	-	chr2L	22724121	-	chr2L	22724041	80	+	chr2L	22724041	+	chr2L	22724121
AGTATTAGAGTGCTCTCCACATTGCAAATGTTCAGTGAAGAATTTTGGTGGTCAACGAGTTTGTTTTGCGGCTCA:1	AGTATTAGAGTGCTCTCCACAT	AACGAGTTTGTTTTGCGGCTCA	-	chr3R	15892732	-	chr3R	15892651	81	+	chr3R	15892651	+	chr3R	15892732
GCAAAACGNACTCGTGGCCTCTCTGTTTTCTTGGTCTNNNNTCACACATGTTCGCCGATGANTGAATGTGTCAAA:1	GCAAAACGNACTCGTGGCCTCT	GCCGATGANTGAATGTGTCAAA	-	chr3R	6588684	-	chr3R	8515209	1926525	+	chr3R	8515209	+	chr3R	6588684
AAACATCAGCTGTGTGCAAATAGCAACTGAGCAGCTTAACCCATTTCCACTGTTGGCCCTTTGTTATGACCCCCG:1	AAACATCAGCTGTGTGCAAATA	TGGCCCTTTGTTATGACCCCCG	+	chr3R	23073656	+	chr3R	23073745	89	+	chr3R	23073656	+	chr3R	23073745
GCCTGCAGGACACTCTTCATGCTGGGCGGCGACTGGGCATAGGA:1	GCCTGCAGGACACTCTTCATGC	TGGGCGGCGACTGGGCATAGGA	-	chrX	3878325	-	chrX	3879986	1661	+	chrX	3879986	+	chrX	3878325
CTACGCAGTGGGACAAGAAGAGACATAAGTAGTGGCGAACAACTTGCGCTCCGCTCCGTATGCAAAAAATTGACC:1	CTACGCAGTGGGACAAGAAGAG	CTCCGTATGCAAAAAATTGACC	-	chrX	16505394	-	chrX	4091283	12414111	+	chrX	4091283	+	chrX	16505394
AACGAAATGCTAATGGCCAGTTGATATGGCGCGCAATTGCCCAACTT:1	AACGAAATGCTAATGGCCAGTT	ATGGCGCGCAATTGCCCAACTT	+	chr3L	19217112	+	chr3L	19218002	890	+	chr3L	19217112	+	chr3L	19218002
CTTATCGAAAGCCTCGGAATCCTGGCGAAAACCCAAACTCACCGTGAACTATGCTCATTCATGTTGGTGAATCCC:1	CTTATCGAAAGCCTCGGAATCC	CTCATTCATGTTGGTGAATCCC	-	chr3L	11796668	-	chr3L	11796589	79	+	chr3L	11796589	+	chr3L	11796668
CATTTTCAACATTTGGCTTGGGCGAAATCGCCCCGAAGTTTGTCTAATTTATCATTTACTTACCATTNAATTCG:1	CATTTTCAACATTTGGCTTGGG	CATTTACTTACCATTNAATTCG	-	chr3L	15267507	-	chr3L	15267383	124	+	chr3L	15267383	+	chr3L	15267507
AGCACTGAGTTCGTTCGCCAGGATGATGAGGAGCGGGGAAATGAATATTCGAAATTGCAGTGATA:1	AGCACTGAGTTCGTTCGCCAGG	AATATTCGAAATTGCAGTGATA	+	chr3L	1415792	+	chr3L	1415864	72	+	chr3L	1415792	+	chr3L	1415864
AACAAGCGCATCCCAAATAATTAAAAACGAAAAAAAAATTAAAAAACAAGCCACTGNCAGCGGT:1	AACAAGCGCATCCCAAATAATT	AAAACAAGCCACTGNCAGCGGT	-	chr3R	11992460	-	chr3R	29399929	17407469	+	chr3R	29399929	+	chr3R	11992460
GTAATCTGTTTCTTGGGCTAGATGAGAAGCCAGTCCTCAGGGGAGGCAGCTCCGAAAAAATTAAATAGCGA:1	GTAATCTGTTTCTTGGGCTAGA	CTCCGAAAAAATTAAATAGCGA	+	chr3R	32022339	+	chr3R	32022437	98	+	chr3R	32022339	+	chr3R	32022437
CTTTACATTGTTGAGTTATGTTTCCTCCGATCCCACACGCCACCCACTGAGNACCCTGACCTCTACGCCCACTAA:1	CTTTACATTGTTGAGTTATGTT	CCCTGACCTCTACGCCCACTAA	+	chr2R	10671266	+	chr2R	10671344	78	+	chr2R	10671266	+	chr2R	10671344
GTGGCAAGCAGGGCCAACCCATCAAACTCCCATAATTAACGCTAATTACGAATGTACTCTCTTTTT:1	GTGGCAAGCAGGGCCAACCCAT	ATTACGAATGTACTCTCTTTTT	-	chrX	11035052	-	chrX	15652046	4616994	+	chrX	15652046	+	chrX	11035052
TTTATGTTAAAAATGCTTCGAAAAAGGTTTTCAAAACTGGTGTTAAAGTTTAGTTTTTTTTTTTGTTTAT:1	TTTATGTTAAAAATGCTTCGAA	TTTAGTTTTTTTTTTTGTTTAT	+	chr2L	14998942	+	chr2L	14631758	367184	+	chr2L	14998942	+	chr2L	14631758
TGCCACTAAATCGCTACTTAAACACAACAAAAGTCAATAGAAATGGGTAGAAAGAAATTCGTTAATAGATCAGTT:1	TGCCACTAAATCGCTACTTAAA	GAAATTCGTTAATAGATCAGTT	+	chr2L	9317338	+	chr2L	5284196	4033142	+	chr2L	9317338	+	chr2L	5284196
CGAAATTAGTGCCTTAAATATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCACAGTCGTC:1	CGAAATTAGTGCCTTAAATATC	CAAAACTATTGCCACAGTCGTC	-	chr2R	18786016	-	chr2R	18785937	79	+	chr2R	18785937	+	chr2R	18786016
CCATCATGGGCTACACACCCTAGATTTTAGAGAGCTCACCTACATGCATAAGAGGATATATGCTGCAGCGGAAAA:1	CCATCATGGGCTACACACCCTA	GGATATATGCTGCAGCGGAAAA	+	chrY	3666453	+	chrY	3666606	153	+	chrY	3666453	+	chrY	3666606
ATTATTCAATAACAAATTNATCTTATACCTTAATGCAGAAGNGGGNAAACAGATTGATGTCGAGCATGAGCCAAG:1	ATTATTCAATAACAAATTNATC	TTGATGTCGAGCATGAGCCAAG	-	chr2L	6251525	-	chr2L	6251156	369	+	chr2L	6251156	+	chr2L	6251525
CTAATAAATCGCTTTTGANTGCCAGCCAAAAGCCCGGAATTTTNTTTCCNAAAACAAACATTCAAAATCAATCAG:1	CTAATAAATCGCTTTTGANTGC	ACAAACATTCAAAATCAATCAG	+	chr3R	19750053	+	chr3R	19750133	80	+	chr3R	19750053	+	chr3R	19750133
GACGAAACAAAGGCAAACAGGGCAAACGAAAGAAGCAAAACAAA:1	GACGAAACAAAGGCAAACAGGG	CAAACGAAAGAAGCAAAACAAA	-	chr3R	26589151	-	chr3R	24100969	2488182	+	chr3R	24100969	+	chr3R	26589151
GGAGTGATGCATTAAAAACAGGTGTTAGTTAACGTTAGTAATTATGGGTGGGTG:1	GGAGTGATGCATTAAAAACAGG	CGTTAGTAATTATGGGTGGGTG	-	chr3R	26601018	-	chr3R	26600954	64	+	chr3R	26600954	+	chr3R	26601018
CACGCAACGGAAACGATAAACCGAGGCCCACAGATCCCGAGCATAGAGCAAGTATCTTTCCCTGCTTAGCTGCT:1	CACGCAACGGAAACGATAAACC	TATCTTTCCCTGCTTAGCTGCT	-	chrX	17680968	-	chrX	17680892	76	+	chrX	17680892	+	chrX	17680968
ACTTAACATAAATAATAGACAAAATAAAAATAAACCCTGGGCATAATAAACAAAAGAGGAGGCCACTTTCCTTT:1	ACTTAACATAAATAATAGACAA	AAAGAGGAGGCCACTTTCCTTT	+	chr3L	19564968	+	chr3L	19565061	93	+	chr3L	19564968	+	chr3L	19565061
CGAGCATGTGACACGCATGAGGCACAAACAAAATATGCAATATGTTCACATTGCGGTAGGGAGAAACCTCAAC:1	CGAGCATGTGACACGCATGAGG	TGCGGTAGGGAGAAACCTCAAC	+	chr2L	14554197	+	chr2L	14554272	75	+	chr2L	14554197	+	chr2L	14554272
TTATTTCATTGAGTTTAATCAACGCTCTCCCCACTTCTCACCACTCTCCAAAAGCGCGTGAGAGAGTTGAAATAG:1	TTATTTCATTGAGTTTAATCAA	GCGCGTGAGAGAGTTGAAATAG	+	chr2L	12529444	+	chr2L	12529520	76	+	chr2L	12529444	+	chr2L	12529520
GAAACAATGTTTGGAAAAAAAAAAATATCATCAATCTGCTTTCATTATACTCAGATGAACATCTATTTATTCGAT:1	GAAACAATGTTTGGAAAAAAAA	GATGAACATCTATTTATTCGAT	-	chr2L	10604298	-	chr2L	10604216	82	+	chr2L	10604216	+	chr2L	10604298
AAAAAAGCAAACACCAGCAAACGAAATGGCAAAGGCCGGAAAAGCGTCGATGAGTGGGCGTCATCGGAAAATCAG:1	AAAAAAGCAAACACCAGCAAAC	GTGGGCGTCATCGGAAAATCAG	-	chr2L	12567843	-	chr2L	12343420	224423	+	chr2L	12343420	+	chr2L	12567843
AAGCACCCTTAGGAACACCACCCATCACGTAAGTCAAAGCGCAGAGTCCCGCTATCTTGTCAACCGAATCTGGGC:1	AAGCACCCTTAGGAACACCACC	ATCTTGTCAACCGAATCTGGGC	+	chr2R	7254835	+	chr2R	7254950	115	+	chr2R	7254835	+	chr2R	7254950
AAGCTAGACCCAATATAAAATATCAAAGGGTTTAGATTTTTAGAGTGACAAGATTGCATTTGATTA:1	AAGCTAGACCCAATATAAAATA	GTGACAAGATTGCATTTGATTA	+	chr3L	4901153	+	chr3L	4907334	6181	+	chr3L	4901153	+	chr3L	4907334
CATTCCTCCCCACCCACGTGGACACCTCCGAAGTCACGCCTTTCATCAAGNTTTGGC:1	CATTCCTCCCCACCCACGTGGA	ACGCCTTTCATCAAGNTTTGGC	-	chr2L	6107762	-	chr2L	11645101	5537339	+	chr2L	11645101	+	chr2L	6107762
GTGATTATGGAAAGCAAGGCTTCTTTTTCATCAATTTAATAGAAATTCAATTTCCTTGTTGCTTTATCCACTTGC:1	GTGATTATGGAAAGCAAGGCTT	CCTTGTTGCTTTATCCACTTGC	+	chrX	13492460	+	chrX	13229153	263307	+	chrX	13492460	+	chrX	13229153
GGAAATGAGATTTATTTATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAG:1	GGAAATGAGATTTATTTATTTA	ATATAAATTTCTGACAGTGTAG	+	chr2L	1615384	+	chr2L	1615466	82	+	chr2L	1615384	+	chr2L	1615466
AAAATGTTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCAGCTTGCAAGTTGCAAG:1	AAAATGTTGCTGCTACTGCTGC	GCTGCAGCTTGCAAGTTGCAAG	-	chrX	19262346	-	chrX	13908812	5353534	+	chrX	13908812	+	chrX	19262346
GGCTCCTGAGGTCTTTTCTTAATTTCGGATGAAACTACTCAAACACCAACTCAC:1	GGCTCCTGAGGTCTTTTCTTAA	AACTACTCAAACACCAACTCAC	+	chr2L	15610319	+	chr2L	18403802	2793483	+	chr2L	15610319	+	chr2L	18403802
ATGTATGTTGTGNGTATTTGTGGCGAGTACNTNAAACANCGGCGTTTCCTATAAAAATAATG:1	ATGTATGTTGTGNGTATTTGTG	GGCGTTTCCTATAAAAATAATG	+	chrX	23439063	+	chrX	23291095	147968	+	chrX	23439063	+	chrX	23291095
TGTATGCACTGGAACGACGTCGTCAGTCAGCTGGCTCCATCCGAAGCCCCAACTCCGTT:1	TGTATGCACTGGAACGACGTCG	CATCCGAAGCCCCAACTCCGTT	-	chr2R	11485203	-	chr2R	11485137	66	+	chr2R	11485137	+	chr2R	11485203
GAGTCAATGAGACGTAACGAGGCGAACACTAGCCACCANCCGAATAAGGTAAGCATTTTAATCATATTCAGTA:1	GAGTCAATGAGACGTAACGAGG	AGCATTTTAATCATATTCAGTA	-	chr2R	18289561	-	chr2R	18289461	100	+	chr2R	18289461	+	chr2R	18289561
ACCAACCGACACTTGTCGTATCCAAACTGTCGTCTTATTGGATTGGCAACGACCCACTGTGCAGACAGC:1	ACCAACCGACACTTGTCGTATC	AACGACCCACTGTGCAGACAGC	+	chr3R	31878630	+	chr3R	31878723	93	+	chr3R	31878630	+	chr3R	31878723
CAATTTGAATGCACTTTGGCAGGTGATGCTGGCTGCTGACAGCTACTGGGCGGAAAAGCGAGCTTA:1	CAATTTGAATGCACTTTGGCAG	ACTGGGCGGAAAAGCGAGCTTA	-	chr3R	18398806	-	chr3R	22848265	4449459	+	chr3R	22848265	+	chr3R	18398806
TGTAGATCCAATCTAGTTATATCGCCAGCCCCACTGTTTGCTCTCCTTCTTGGACCACTAATATGCGTCTGGCTT:1	TGTAGATCCAATCTAGTTATAT	ACCACTAATATGCGTCTGGCTT	+	chr3L	10414952	+	chr3L	10417324	2372	+	chr3L	10414952	+	chr3L	10417324
TACGCCTTCATATGAACCACAATTAGTTTATAAATTCCCAACACATATGAGCCACAAGGATACCGAGGAGTTACG:1	TACGCCTTCATATGAACCACAA	ACAAGGATACCGAGGAGTTACG	-	chr2L	8074314	-	chr2L	12185555	4111241	+	chr2L	12185555	+	chr2L	8074314
AAGGCTGCAATCGCCCTANCGATAGTTATATGTATGTATGTNGAANTTGTCAGAAATTTTTTCGCACAAAGCAAA:1	AAGGCTGCAATCGCCCTANCGA	AAATTTTTTCGCACAAAGCAAA	-	chr2R	6696689	-	chr2R	6696606	83	+	chr2R	6696606	+	chr2R	6696689
ATTTAAGTNTAAAAATTTATCAATTGGATTTGCGANCTGCTTTGTCATAAGTTCTCTAACCTTTGGCACTCGCAA:1	ATTTAAGTNTAAAAATTTATCA	CTCTAACCTTTGGCACTCGCAA	-	chr2L	14890410	-	chr2L	14889985	425	+	chr2L	14889985	+	chr2L	14890410
GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGGGTGGAAGGAGCGTATCGCATTGAGAATCACTTAAGTGTAA:1	GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA	ATTGAGAATCACTTAAGTGTAA	+	chr3L	22908067	+	chr3L	18019292	4888775	+	chr3L	22908067	+	chr3L	18019292
TCTTCCCCATTCCCATTCCCATTCCCCTTGCCCCAACCAACAGCCCCCAACCGAAAGTAGGCCTAACCCTCCGCA:1	TCTTCCCCATTCCCATTCCCAT	AAAGTAGGCCTAACCCTCCGCA	-	chr3L	20548702	-	chr3L	17963670	2585032	+	chr3L	17963670	+	chr3L	20548702
AATTTGGAGTTTGCAGTTTGCCGAGTCGAGCGGCTAAGAATGCGACTGCGACTGTCAAAGATGCG:1	AATTTGGAGTTTGCAGTTTGCC	GACTGCGACTGTCAAAGATGCG	+	chrX	4450257	+	chrX	3557051	893206	+	chrX	4450257	+	chrX	3557051
ATCCACATCCATAACCACCCACATTTGTGCCAGAATATTAATACT:1	ATCCACATCCATAACCACCCAC	TTTGTGCCAGAATATTAATACT	-	chr2L	1257099	-	chr2L	13707727	12450628	+	chr2L	13707727	+	chr2L	1257099
GTGATTATGGATAACAGATCACAGACCAATCCCCGTAATTTCTAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1	GTGATTATGGATAACAGATCAC	CAACACAACACAACACAACACA	-	chr2L	12190582	-	chr2L	16217660	4027078	+	chr2L	16217660	+	chr2L	12190582
TGAGCTGGGTGCCAGAAGAGTGCCACAGAATCAGGACGGATGGCGGGAATGCCCTGTGTGGCAAG:1	TGAGCTGGGTGCCAGAAGAGTG	CGGGAATGCCCTGTGTGGCAAG	-	chr2R	12540570	-	chr2R	12540497	73	+	chr2R	12540497	+	chr2R	12540570
TGCAACAGACGCTTGCCACACAGGGCATTCCCGCCATCCGTCCTGATTCTGTGGCACTCTTCTGGCACGCAGCTC:1	TGCAACAGACGCTTGCCACACA	GCACTCTTCTGGCACGCAGCTC	+	chr2R	12540486	+	chr2R	12540569	83	+	chr2R	12540486	+	chr2R	12540569
AAATGGCCGACCGGAAACTAATCAGCAAACTTCTGATTGAAATCAATGTACCCTTTGCAAGCGCATAGAAAGTA:1	AAATGGCCGACCGGAAACTAAT	CTTTGCAAGCGCATAGAAAGTA	+	chr3L	18345122	+	chr3L	18345199	77	+	chr3L	18345122	+	chr3L	18345199
CGCAGCAGAAATTCAAACTTGAAGAGAGTTGCAAGAGTATAGATTACCGACGCGCTATGGGGGC:1	CGCAGCAGAAATTCAAACTTGA	ATTACCGACGCGCTATGGGGGC	+	chr2L	5783143	+	chr2L	5783251	108	+	chr2L	5783143	+	chr2L	5783251
ATAAAGTAGAAAAATGTACTCTAAGAACCTTGAAAAATGATTTTGAATTAGTTATACGAACGGGGAAATACCCTT:1	ATAAAGTAGAAAAATGTACTCT	ATACGAACGGGGAAATACCCTT	-	chr3L	3619525	-	chr3L	3619431	94	+	chr3L	3619431	+	chr3L	3619525
ATCGCAAAAGGCGAAAATATTATAATTAGTTTTAGGGGAGTGGTNCGGACAGTTCCCAA:1	ATCGCAAAAGGCGAAAATATTA	GAGTGGTNCGGACAGTTCCCAA	-	chr3L	21407077	-	chr3L	21407014	63	+	chr3L	21407014	+	chr3L	21407077
GAACCGCGGGCCGTACCAAATTAGACGGGACAGCACCGAAGGTTATGCTGGTTACGAATGTATACCGATA:1	GAACCGCGGGCCGTACCAAATT	TGGTTACGAATGTATACCGATA	+	chrX	15217310	+	chrX	15254036	36726	+	chrX	15217310	+	chrX	15254036
CCGTACATACCCCATAGTCTCAACTAGAAAAGTCTCAACTAAAAAGTCTGGCTTTCGGTAAAAGCTCTGCAGG:1	CCGTACATACCCCATAGTCTCA	CTTTCGGTAAAAGCTCTGCAGG	-	chrX	325727	-	chrX	325644	83	+	chrX	325644	+	chrX	325727
AGTGCTTTTCAGTACCAATGAAAGCTTTCCGACCAACTAGCGTTCAATTTCGTTCAGTGCATTTGGT:1	AGTGCTTTTCAGTACCAATGAA	AATTTCGTTCAGTGCATTTGGT	+	chrX	3409011	+	chrX	3409080	69	+	chrX	3409011	+	chrX	3409080
TGAGCAAACCGAGCAGCATCATCTTGACTGGACTGAACTGGACAAACAATA:1	TGAGCAAACCGAGCAGCATCAT	GGACTGAACTGGACAAACAATA	-	chrX	6397629	-	chrX	6392888	4741	+	chrX	6392888	+	chrX	6397629
AAAAAGTGCAAGGGTAAGTGGCCATGTGCACGGCGATGAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCTCTG:1	AAAAAGTGCAAGGGTAAGTGGC	CTTACTCCAAGGGGGATCTCTG	+	chrX	2189417	+	chrX	2189492	75	+	chrX	2189417	+	chrX	2189492
ATTGTCAAGAACATGAGACCAAAGANTGGACTCGAT:1	ATTGTCAAGAACATGAGACCAA	GAGACCAAAGANTGGACTCGAT	+	chr3L	25934996	+	chr3L	24862300	1072696	+	chr3L	25934996	+	chr3L	24862300
CTTATATACTCCCATCGAAGATCTGCTGCACAGCCGAGGAGCAATCGGCATTGGCATTTGGCCAACTGGTTCAGT:1	CTTATATACTCCCATCGAAGAT	GCATTTGGCCAACTGGTTCAGT	-	chrX	5683179	-	chrX	5682992	187	+	chrX	5682992	+	chrX	5683179
TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACCCTCTAAAAAATGTGCATATTCATGAGATGATTTATAAAT:1	TACGCATCTTGTTATTCTAGTG	ATTCATGAGATGATTTATAAAT	+	chr2R	1982172	+	chr2R	11661157	9678985	+	chr2R	1982172	+	chr2R	11661157
TGACTGGGCCAACAAAAAGTAATAATTTTTAGAAATTTAATTGGGTACTTTCGAAGATAGTTAAACAATACGTGT:1	TGACTGGGCCAACAAAAAGTAA	AAGATAGTTAAACAATACGTGT	-	chr3R	19265738	-	chr3R	19265656	82	+	chr3R	19265656	+	chr3R	19265738
AAAGAATATAAACTTAAGTACTTTGTCTTTAATATCTATTATTATTCATTNCAATATTAAACGCCTTGTTTTAAA:1	AAAGAATATAAACTTAAGTACT	ATATTAAACGCCTTGTTTTAAA	-	chr3L	9584923	-	chr3L	1620283	7964640	+	chr3L	1620283	+	chr3L	9584923
TCAACTCCTTAGCATNTAGTCAACATAAATTGAAAAACAATTAGCAGTAAAAAATAACATCAAATTGAGTGCCAA:1	TCAACTCCTTAGCATNTAGTCA	ATAACATCAAATTGAGTGCCAA	-	chr2L	10836414	-	chr2L	10836333	81	+	chr2L	10836333	+	chr2L	10836414
GGTGAAGGTAAGGGTGTGATTCATTTGTAATGAAGTATGATTCCAAAAGCTAAAACAAAAAGCATTTCCCTGAA:1	GGTGAAGGTAAGGGTGTGATTC	AAACAAAAAGCATTTCCCTGAA	+	chr2L	931669	+	chr2L	931747	78	+	chr2L	931669	+	chr2L	931747
TTTTCCCGCACATATGCAGTAGAAATTGAGACAAGATTGTCGAGTTGCCAAAAGTTGAGAAATGATATTTTGTTT:1	TTTTCCCGCACATATGCAGTAG	GTTGAGAAATGATATTTTGTTT	+	chr3L	8243828	+	chr3L	8243911	83	+	chr3L	8243828	+	chr3L	8243911
AATATGGGAAAAGGTGAACAGAAGTTGATGGATTTGTAGGCCTGATTCAGAGTCAACAATTAAACAAAGCACATA:1	AATATGGGAAAAGGTGAACAGA	CAACAATTAAACAAAGCACATA	-	chr3L	8148284	-	chr3L	8148076	208	+	chr3L	8148076	+	chr3L	8148284
GGGGGAAATGCGCCAGAAATCCTTTTACTANNNANGCAGAACATTTTCCATTACATTTCGTTGCATTTACCAAGC:1	GGGGGAAATGCGCCAGAAATCC	CATTTCGTTGCATTTACCAAGC	+	chr2L	2682935	+	chr2L	8266566	5583631	+	chr2L	2682935	+	chr2L	8266566
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACA:1	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	16071771	145889	+	chr2L	16071771	+	chr2L	16217660
TGCACGCGAAAAACTTTGCGATAACCAAGCTACTCACTCACTCACTCCATTTTCAGATACAACATCTCC:1	TGCACGCGAAAAACTTTGCGAT	CATTTTCAGATACAACATCTCC	-	chr3R	27779357	-	chr3R	27779283	74	+	chr3R	27779283	+	chr3R	27779357
TTGATACAAGTTTTTAAAGTAGGGTGTTCCAAAATGCTACCGCAGCCTTGGTGTTTT:1	TTGATACAAGTTTTTAAAGTAG	GCTACCGCAGCCTTGGTGTTTT	-	chr3L	18552720	-	chr3L	12627611	5925109	+	chr3L	12627611	+	chr3L	18552720
TAATCCGTGTACCGGCAAATTTTGTTTACAGTACAGAAACTGATTTTAATGAACATAGTAACCAGTATTGCTAT:1	TAATCCGTGTACCGGCAAATTT	ACATAGTAACCAGTATTGCTAT	-	chr3L	2168882	-	chr3L	2168792	90	+	chr3L	2168792	+	chr3L	2168882
AACATGAAAAGGAATTCGGCGCATTGCGCCTTCTTATATTTCTTAGCTTTGCTTCTTCGGACGGCTAG:1	AACATGAAAAGGAATTCGGCGC	CTTTGCTTCTTCGGACGGCTAG	-	chr3L	10125783	-	chr3L	19478245	9352462	+	chr3L	19478245	+	chr3L	10125783
GAGAGAGTGAATAGCTGTGGGTGAACAAAATGTGCTTTTCATCTGCCTTTAAGTTTATGCATTGCAGTTTTTCGC:1	GAGAGAGTGAATAGCTGTGGGT	TTTATGCATTGCAGTTTTTCGC	-	chr2L	9297478	-	chr2L	9297401	77	+	chr2L	9297401	+	chr2L	9297478
AGTTTTAATTTTCTTTCCATCATGTTCACCACCCACCAAAATGTGCAGCATCCTGAATAAAATACCA:1	AGTTTTAATTTTCTTTCCATCA	CAGCATCCTGAATAAAATACCA	-	chr3L	22124907	-	chr3L	22124832	75	+	chr3L	22124832	+	chr3L	22124907
GACTATCTATTGCATAATCCCTAGAACCGTACGAGGTAATCTGCTCACTGGATGTTCCTCAGGTCGCAC:1	GACTATCTATTGCATAATCCCT	CTGGATGTTCCTCAGGTCGCAC	-	chrX	2303440	-	chrX	2303349	91	+	chrX	2303349	+	chrX	2303440
GACATTTGAATGCCACCCATTTGTTTCGCTCAGTTT:1	GACATTTGAATGCCACCCATTT	ACCCATTTGTTTCGCTCAGTTT	-	chr3L	7288710	-	chr3L	12986566	5697856	+	chr3L	12986566	+	chr3L	7288710
TATTGCAGATAAATGTAANAACCAAGTTATTTAATGCAATACAAGAAAATATAACGATTGCAGCGCAGCTT:1	TATTGCAGATAAATGTAANAAC	TATAACGATTGCAGCGCAGCTT	+	chr3R	19445556	+	chr3R	19447497	1941	+	chr3R	19445556	+	chr3R	19447497
CAAATGGCGAACTTGGGGANTACACGCTCTGACAAGTATGCTTTAAATTGGAGGAAAACCAGAGAAACTAAGATA:1	CAAATGGCGAACTTGGGGANTA	GAAAACCAGAGAAACTAAGATA	+	chr2R	15004723	+	chr2R	15005052	329	+	chr2R	15004723	+	chr2R	15005052
ATAGGAAGTATTCATGCATTGAAAATATATGTGTTTAAGCTTAAGCATAATAGTACGTTTCACGTCCCCTTTCTG:1	ATAGGAAGTATTCATGCATTGA	TACGTTTCACGTCCCCTTTCTG	-	chr2R	20032035	-	chr2R	20031939	96	+	chr2R	20031939	+	chr2R	20032035
GTAGGTGCTTAAATAATGGTTGCATCAAGCTTTCAAGCACAACCGATTGCTCTTTTTGCTTGAAAACCGG:1	GTAGGTGCTTAAATAATGGTTG	GCTCTTTTTGCTTGAAAACCGG	-	chr3R	6640000	-	chr3R	6639927	73	+	chr3R	6639927	+	chr3R	6640000
ATAATGGACATACAAAAGTATGGTTCAATTAGCCTATNTATAATTNAAAAGCCCAAGTTTTG:1	ATAATGGACATACAAAAGTATG	TAATTNAAAAGCCCAAGTTTTG	+	chr3L	22137546	+	chr3L	22137610	64	+	chr3L	22137546	+	chr3L	22137610
TTTCAAACATTTATAGGGATGACAAATGTAATACAGTGCTCAAATATACAAATATTTAAACAAATAGGCTTGTAC:1	TTTCAAACATTTATAGGGATGA	ATTTAAACAAATAGGCTTGTAC	-	chr2R	18372606	-	chr2R	18358394	14212	+	chr2R	18358394	+	chr2R	18372606
TAAATTGTTATAATGTGAAAGATTTTGAAATATATAAGTTGAATAAGGAGTCTATTTAAACATAATTCCAAGTAG:1	TAAATTGTTATAATGTGAAAGA	ATTTAAACATAATTCCAAGTAG	+	chr2R	10551072	+	chr2R	10551163	91	+	chr2R	10551072	+	chr2R	10551163
ACTACGCAAATTATTATAAACGACCAAAACTATATACATCAAGCGAAGATCTGCAGGTACAGGGCAAACGAAAAA:1	ACTACGCAAATTATTATAAACG	CAGGTACAGGGCAAACGAAAAA	-	chr2R	23407699	-	chr2R	23402623	5076	+	chr2R	23402623	+	chr2R	23407699
CGATGACAGGTTGCAGGACCGGGGATTAAGCGGGTTCCTTCCGCAACAGTAGGGCTCCTGCGGAACAGCGACAG:1	CGATGACAGGTTGCAGGACCGG	GGCTCCTGCGGAACAGCGACAG	+	chrX	2399840	+	chrX	2408192	8352	+	chrX	2399840	+	chrX	2408192
AAGCCGGAGTCAATGGTTGTATATCGCATGCATAAATTATCGTAACTGTAACAGTCGCGCATGTTTCAGTTCATT:1	AAGCCGGAGTCAATGGTTGTAT	GTCGCGCATGTTTCAGTTCATT	+	chr2L	9973749	+	chr2L	9980868	7119	+	chr2L	9973749	+	chr2L	9980868
GTTTTTTGGCGCAGAAAATAATGAGAAAATTTAAAAAGTTCAGATCAAGACATTATTATTATTCCTGAGCATACT:1	GTTTTTTGGCGCAGAAAATAAT	TATTATTATTCCTGAGCATACT	-	chr3R	29332373	-	chr3R	29332296	77	+	chr3R	29332296	+	chr3R	29332373
CTCAGGCGTGTTATCAAANTATAAACAATTTCAACGTGAGTTCNCGTTANTTAGGTTGCAGCGCAAAGAGCCATA:1	CTCAGGCGTGTTATCAAANTAT	GGTTGCAGCGCAAAGAGCCATA	-	chr2R	6895502	-	chr2R	6895423	79	+	chr2R	6895423	+	chr2R	6895502
AAAAGAAAACCACAAAAAGAAACCGCGCACACTACCACCTACACTTCTCCCTCCTGATTTGTATCCCCCA:1	AAAAGAAAACCACAAAAAGAAA	CCCTCCTGATTTGTATCCCCCA	+	chr2R	291736	+	chr2R	18780928	18489192	+	chr2R	291736	+	chr2R	18780928
CTCCCAATTCAACCACCCAACCAGCCACACAAATATTAAGGGGTGATGGCCAAAACGAAAGCAGCAACATTATTT:1	CTCCCAATTCAACCACCCAACC	AACGAAAGCAGCAACATTATTT	-	chr2R	22744946	-	chr2R	19199011	3545935	+	chr2R	19199011	+	chr2R	22744946
TCTATTGAGCTTAAAATATTTGGAAAGATCTTGTCTCAACTTTTATTGGGAAATAAAGTTGTAAATTAAATACAT:1	TCTATTGAGCTTAAAATATTTG	TAAAGTTGTAAATTAAATACAT	+	chr2L	16958115	+	chr2L	16962903	4788	+	chr2L	16958115	+	chr2L	16962903
GCAAATTTATGACATGCCAACAGCCATTTTGGCTGACACGCGTGTGCGTTAGGCTT:1	GCAAATTTATGACATGCCAACA	GACACGCGTGTGCGTTAGGCTT	+	chr3R	15517620	+	chr3R	15517684	64	+	chr3R	15517620	+	chr3R	15517684
AATCCGATNCGCTTAGAGCCGAAACCTGCGAAAAGNGCGAACAAAATCCAAACAAAAGCGAGAGTTCCATCGATA:1	AATCCGATNCGCTTAGAGCCGA	AAAAGCGAGAGTTCCATCGATA	+	chr2L	17000150	+	chr2L	17000272	122	+	chr2L	17000150	+	chr2L	17000272
CGTGCATATAATACAACGCGGTTTCCTGATGCACGTAACCTCCACTTTGTTTATGGCCTATGCAAAGACCAAGGA:1	CGTGCATATAATACAACGCGGT	TGGCCTATGCAAAGACCAAGGA	-	chr2L	15771640	-	chr2L	19943372	4171732	+	chr2L	19943372	+	chr2L	15771640
AATTTCGCTTGGGCAAACAAATATGCAGACCAGACCAGACCAGACCAGACAATTTGAGTATCTAAACAGCCGTAA:1	AATTTCGCTTGGGCAAACAAAT	TTGAGTATCTAAACAGCCGTAA	+	chr3R	25528043	+	chr3R	25528146	103	+	chr3R	25528043	+	chr3R	25528146
AAACTGGGAGGTGAAATTTCAGTCTGGCAAAGAGATATGAAAAAGCCAAATGGCCAGACGCCGCATAAATTGC:1	AAACTGGGAGGTGAAATTTCAG	GGCCAGACGCCGCATAAATTGC	+	chr2L	17273216	+	chr2L	17277997	4781	+	chr2L	17273216	+	chr2L	17277997
GGCATACCGAAAATATCTTCAAATAGCAAGTGCGGAGGATCGGTATTGCCAACTTATTAAAACAGGAACAAGAAC:1	GGCATACCGAAAATATCTTCAA	TTATTAAAACAGGAACAAGAAC	-	chrX	8810763	-	chrX	11580474	2769711	+	chrX	11580474	+	chrX	8810763
TCCACAGNGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGATGAGGGGACNGGGCGCCAGATAATCCTNATCCCCAAGATGTGCAA:1	TCCACAGNGAGAGAGAGAGAGA	TCCTNATCCCCAAGATGTGCAA	-	chr2R	9955190	-	chr2R	22743352	12788162	+	chr2R	22743352	+	chr2R	9955190
TGGGCAAGCAATAAAAGAAAATGCTATTCCGTCTATGAGTTGCCTACAANAGCTGTTAAGTATCCACGGTTGT:1	TGGGCAAGCAATAAAAGAAAAT	GCTGTTAAGTATCCACGGTTGT	-	chrX	1163379	-	chrX	1163303	76	+	chrX	1163303	+	chrX	1163379
CGTTTTACGATTACCCCACCATAAGCCATCAAAATAAACAGCATCCATGGGCGTGTGGAATAAGGGGTGAAGA:1	CGTTTTACGATTACCCCACCAT	CGTGTGGAATAAGGGGTGAAGA	+	chrX	18442107	+	chrX	7514474	10927633	+	chrX	18442107	+	chrX	7514474
TTGTGCGTGGTAAATAAAGGCAAACTAATTCAGCCATTGCATTTGTGAATCGCTGCTGAAAGGATTAAAATGAAT:1	TTGTGCGTGGTAAATAAAGGCA	TGCTGAAAGGATTAAAATGAAT	-	chr2R	18992159	-	chr2R	18992018	141	+	chr2R	18992018	+	chr2R	18992159
CAAAAAAGGAGCATGTCCTTCGTCCTGCGACCCAACTTACATTCGTCCTTTTGGCCTTACTT:1	CAAAAAAGGAGCATGTCCTTCG	ATTCGTCCTTTTGGCCTTACTT	+	chr2L	15852067	+	chr2L	15852138	71	+	chr2L	15852067	+	chr2L	15852138
GCTTCCACNGAGAAGCAAAATAAAAAAACACGACCNCCTCAGAAGCCAAAAAAACCCAACTTAAACTCAAAGCCA:1	GCTTCCACNGAGAAGCAAAATA	ACCCAACTTAAACTCAAAGCCA	+	chr3R	6310300	+	chr3R	20953884	14643584	+	chr3R	6310300	+	chr3R	20953884
AAGTGTATACCGTATTTTTTNTGGTATCTAGTNCATGGTAAANCTATCACGATAGGATTACCCTTTTTAATATGG:1	AAGTGTATACCGTATTTTTTNT	AGGATTACCCTTTTTAATATGG	+	chr2R	11425725	+	chr2R	11425812	87	+	chr2R	11425725	+	chr2R	11425812
CTTTTAAACAAGCCAGTGTCTGTGTGTGCGAGTGTTTGTGTAAAAGGACAGCATGCTG:1	CTTTTAAACAAGCCAGTGTCTG	TGTGTAAAAGGACAGCATGCTG	+	chrX	19472145	+	chrX	19472698	553	+	chrX	19472145	+	chrX	19472698
TAAATATGAATTTTTCACTTAGTATTAGTATGCGTTTTATGTAGTCACCGGGAAAATACGATTTTTAAAAAGGTT:1	TAAATATGAATTTTTCACTTAG	AAATACGATTTTTAAAAAGGTT	-	chr2L	18079921	-	chr2L	18079835	86	+	chr2L	18079835	+	chr2L	18079921
ACACATAAAACTCTGTAGGGCAAAGGGGAGTAAGATAGAACGAACAAAAACTGGCCGTAGTTAGGTNTATCAAAC:1	ACACATAAAACTCTGTAGGGCA	GCCGTAGTTAGGTNTATCAAAC	-	chr2L	9391722	-	chr2L	9391555	167	+	chr2L	9391555	+	chr2L	9391722
ATGCCAGCCAGTAATATTGCGATTGGTCTTTATCTCGCAAATGGGTGTAGCATTGGGGGAGATGTGAAAATGTTG:1	ATGCCAGCCAGTAATATTGCGA	TGGGGGAGATGTGAAAATGTTG	-	chr2L	5897697	-	chr2L	5897614	83	+	chr2L	5897614	+	chr2L	5897697
AGAGTGAGAGAGAGGAGGGAGCGCCCACATGCACACATACATACGTAATGAAATCTTTTTGGCAAGGCAAACGCA:1	AGAGTGAGAGAGAGGAGGGAGC	TCTTTTTGGCAAGGCAAACGCA	+	chr3R	17925875	+	chr3R	17927342	1467	+	chr3R	17925875	+	chr3R	17927342
ACAACCGAATGATGGAGGATCCGAGGGAATGCGNGTGCAGGGGGCAACGACATTTGAATTTGCCTGCCATA:1	ACAACCGAATGATGGAGGATCC	ACATTTGAATTTGCCTGCCATA	+	chr2L	5396123	+	chr2L	5396208	85	+	chr2L	5396123	+	chr2L	5396208
ATCATCATCATCGTTGAGCTAGCTACACAGACATCTTTATTGAGATGTATTTT:1	ATCATCATCATCGTTGAGCTAG	CATCTTTATTGAGATGTATTTT	-	chr2R	23427911	-	chr2R	23427791	120	+	chr2R	23427791	+	chr2R	23427911
GATTTATTTAGATTTATGGCCTTGGTCCCCGAAATAAATGACCGCCTGCTAAGCATGTGCCACTTGCCAC:1	GATTTATTTAGATTTATGGCCT	CTAAGCATGTGCCACTTGCCAC	-	chr2R	8403002	-	chr2R	8398226	4776	+	chr2R	8398226	+	chr2R	8403002
TTTGTCACGTGGCCAATAAACGCGTGAACCAAAGTTATGCAGTCAATGGAAGTGCGCCCCTAAATATGCAATGAA:1	TTTGTCACGTGGCCAATAAACG	GCGCCCCTAAATATGCAATGAA	+	chr2R	9945443	+	chr2R	9945639	196	+	chr2R	9945443	+	chr2R	9945639
TAGCTGCGGGCCACAAATGAAATCTGCAAACACAACCCACGTGTGAGAAATTGCTGTTTGTTTTATGCACATGA:1	TAGCTGCGGGCCACAAATGAAA	GCTGTTTGTTTTATGCACATGA	-	chr2L	730870	-	chr2L	730780	90	+	chr2L	730780	+	chr2L	730870
CGTAGTGTAAAATGCAGCTGGGCTGCAAAAGGCAGATGAAGAAATGGGAAGAATC:1	CGTAGTGTAAAATGCAGCTGGG	AGATGAAGAAATGGGAAGAATC	+	chrX	14300833	+	chrX	14300891	58	+	chrX	14300833	+	chrX	14300891
TTTCGGGATATAATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATCTGCCGTT:1	TTTCGGGATATAATCTCAGTCC	CACTTAAAGTGCATCTGCCGTT	-	chr3R	28484364	-	chr3R	28486281	1917	+	chr3R	28486281	+	chr3R	28484364
TAGAGATGGAAATCTACTGGAGGGAGGAATGCGGACAGTTAGCACGGTGGAATCGATGGTGCCCCCCTTGCAGG:1	TAGAGATGGAAATCTACTGGAG	TCGATGGTGCCCCCCTTGCAGG	-	chr2R	15789741	-	chr2R	15981253	191512	+	chr2R	15981253	+	chr2R	15789741
GACCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCA:1	GACCGTGTGTGTGTGTGTGTGT	GTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCA	+	chr3R	24662853	+	chr3R	29095476	4432623	+	chr3R	24662853	+	chr3R	29095476
GGGTAATCTAGTTACCAATTCAACTTGAATTAACCCCTTCCATTAAGGATCTCGACGCGGAACCACTGTGCCCAC:1	GGGTAATCTAGTTACCAATTCA	GACGCGGAACCACTGTGCCCAC	+	chr2L	21020307	+	chr2L	21023984	3677	+	chr2L	21020307	+	chr2L	21023984
AGTAAGTCAGGCGGACGAACGAATCTGAAAAGGGAATGTATATATAGGGAAAATTTAAATATTTCCATCAAGCTG:1	AGTAAGTCAGGCGGACGAACGA	TTTAAATATTTCCATCAAGCTG	+	chr3L	20148310	+	chr3L	20148400	90	+	chr3L	20148310	+	chr3L	20148400
TGTGTGTTGGGGTTTTCGGTGAGTGTTGTGCAAATTCGTATCTGGTTGTATATACT:1	TGTGTGTTGGGGTTTTCGGTGA	TTCGTATCTGGTTGTATATACT	+	chrX	4810114	+	chrX	8746478	3936364	+	chrX	4810114	+	chrX	8746478
GGCAAGCATTCATAATGCTCACCCGGTGGCCATGTCAAAATGCCATTTTTATGTGGCACACGCGCTGCACTCTTT:1	GGCAAGCATTCATAATGCTCAC	TGGCACACGCGCTGCACTCTTT	+	chr3R	17348755	+	chr3R	17348844	89	+	chr3R	17348755	+	chr3R	17348844
CACTTGCTAACCGTCACTTTGAAATGCCGGCCAGTCATCCGTTCAATCCTGGTCTAACCATATCCAACAAGGAAG:1	CACTTGCTAACCGTCACTTTGA	CTAACCATATCCAACAAGGAAG	+	chr2R	10992952	+	chr2R	10993038	86	+	chr2R	10992952	+	chr2R	10993038
ATAAGCGTGCACCACTTGACGGACAACTATGCGGAGTCCTGGAACTCGTCCTGATTAATGGCTGATGCTTGCCAA:1	ATAAGCGTGCACCACTTGACGG	ATTAATGGCTGATGCTTGCCAA	+	chr2R	8277655	+	chr2R	8277750	95	+	chr2R	8277655	+	chr2R	8277750
ATCAAATTCATTCATGAAATTCAGCGAAGAGCGTCAAAAAAAAAACANGAGAATGGACTTTTCTGGGNCCGGTCT:1	ATCAAATTCATTCATGAAATTC	TGGACTTTTCTGGGNCCGGTCT	+	chr3L	3450918	+	chr3L	3451006	88	+	chr3L	3450918	+	chr3L	3451006
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831802	6924267	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907535
CACGCCCACAACTAAACTGCGAAACGGCAGCCAGCAATCCACACAAATCACAACACAACACNACACAACACAACA:1	CACGCCCACAACTAAACTGCGA	CACAACACNACACAACACAACA	+	chr3R	15758089	+	chr3R	21907535	6149446	+	chr3R	15758089	+	chr3R	21907535
CTAAAAGTAAGTGCTGCTCAAAATTCATTGCTCAGAAAGAGCACTTNCAACCACTTACTTNGGTGTAATCTCCG:1	CTAAAAGTAAGTGCTGCTCAAA	ACTTACTTNGGTGTAATCTCCG	+	chr3R	23944927	+	chr3R	23945011	84	+	chr3R	23944927	+	chr3R	23945011
ATCCGGAATGGCGTTCCATGGTGCTAGAATCACTGGCGAATTTGCTAGAAATTTTTCGAAAGGACTCTCTGGAGA:1	ATCCGGAATGGCGTTCCATGGT	TTTCGAAAGGACTCTCTGGAGA	-	chr3R	29247123	-	chr3R	29236812	10311	+	chr3R	29236812	+	chr3R	29247123
CTCTTTCTGTTGCCTGTGACAAGGCCAACTAATTTGTACACTTCACTCGAGAAACCGAACGACAGTTGGCATAAA:1	CTCTTTCTGTTGCCTGTGACAA	ACCGAACGACAGTTGGCATAAA	-	chr2L	12941332	-	chr2L	12933865	7467	+	chr2L	12933865	+	chr2L	12941332
GTTTTCTGAAGTTTTCCACCCAACAGTTTCCCTGACCACTGACCTGGGTGCGAGTAAACAACGTCGTTTACCCAC:1	GTTTTCTGAAGTTTTCCACCCA	GTAAACAACGTCGTTTACCCAC	-	chr3L	10730538	-	chr3L	19073346	8342808	+	chr3L	19073346	+	chr3L	10730538
ACAAATTTGGAATTTTAAACATTTATTTATATATTTTAATGCTTGAAAATTCGATTTTCCTGGTAAACCAAAAAT:1	ACAAATTTGGAATTTTAAACAT	ATTTTCCTGGTAAACCAAAAAT	-	chrX	11103109	-	chrX	11096007	7102	+	chrX	11096007	+	chrX	11103109
ACAATCGCATTCAATGGAATNGAGCAGGAACANATATCATACNTAAATTATTCTTACACAGACAAGACATATTCA:1	ACAATCGCATTCAATGGAATNG	TTACACAGACAAGACATATTCA	+	chr2L	2634553	+	chr2L	2634653	100	+	chr2L	2634553	+	chr2L	2634653
AGCACAAAAGACACCCCCAAATCCACCCAACGGCCCACCATCCGCTCCTGCGGAG:1	AGCACAAAAGACACCCCCAAAT	CCCACCATCCGCTCCTGCGGAG	+	chr2R	6096737	+	chr2R	6101915	5178	+	chr2R	6096737	+	chr2R	6101915
AAGCGCAAAAAGTTATACAAAGAAGAAGATCATAGATTAAGCCACCATTGTNCGAATCACTCACCCCAGAGGC:1	AAGCGCAAAAAGTTATACAAAG	NCGAATCACTCACCCCAGAGGC	+	chr3R	29590404	+	chr3R	29590495	91	+	chr3R	29590404	+	chr3R	29590495
CCTCACGTTTTAAAATCATAAAGGGCATACACATTAGCCTATATGAATTNAAATTTGATTTAAGTCGCGCAGTTA:1	CCTCACGTTTTAAAATCATAAA	TTTGATTTAAGTCGCGCAGTTA	-	chrX	19983953	-	chrX	19983873	80	+	chrX	19983873	+	chrX	19983953
TAAATTCAGCTTGAAATCGTTTTATATGCCGCAATTACCATCGCAATTTCAATTTGCTCTCTTTTTGATGTTTCG:1	TAAATTCAGCTTGAAATCGTTT	TTGCTCTCTTTTTGATGTTTCG	-	chr2R	22767664	-	chr2R	22767579	85	+	chr2R	22767579	+	chr2R	22767664
GTGTTGAATACTATCCCACACACTATCTGACCCGTAATATTCATTTGATGATCCATCAAATCATC:1	GTGTTGAATACTATCCCACACA	TTTGATGATCCATCAAATCATC	-	chrX	2578920	-	chrX	2578838	82	+	chrX	2578838	+	chrX	2578920
GATGAAAGCGAATGCGAAGATCCTCGCCCAACGGGATAGTTAACNTGCCCCCTCTCTCCGACC:1	GATGAAAGCGAATGCGAAGATC	AACNTGCCCCCTCTCTCCGACC	-	chr2R	5600381	-	chr2R	5061560	538821	+	chr2R	5061560	+	chr2R	5600381
CTCATTCTTGGCTGATCTACGAATTTTAGCGATTTCTGTTCACAAAATATATATTAATAATAAATATAATTATAT:1	CTCATTCTTGGCTGATCTACGA	TTAATAATAAATATAATTATAT	-	chr3R	29402240	-	chr3R	8581699	20820541	+	chr3R	8581699	+	chr3R	29402240
TGGCATTGCCCATTTGGGCTTCGGTTTCCCTGTCTCATCAATTAATCTCGTTTGCAGCGTTTACTCAAAT:1	TGGCATTGCCCATTTGGGCTTC	CGTTTGCAGCGTTTACTCAAAT	-	chr2L	14809086	-	chr2L	14803888	5198	+	chr2L	14803888	+	chr2L	14809086
ATATTTGCTTATCAACCGAAAAAGGGTGATAACACTTTGATTAATATAAGCGAGCTAAATGGAAAGGGAAGGGA:1	ATATTTGCTTATCAACCGAAAA	AGCTAAATGGAAAGGGAAGGGA	+	chr2R	23243281	+	chr2R	23243368	87	+	chr2R	23243281	+	chr2R	23243368
TGGCAGTCGCGTCGGAAGGACATCACCTTGCTCGAGTTACGCTGCAATGGTACAAACATATGCTCAAATGATTAA:1	TGGCAGTCGCGTCGGAAGGACA	AAACATATGCTCAAATGATTAA	-	chr2R	19334754	-	chr2R	19334678	76	+	chr2R	19334678	+	chr2R	19334754
AAAACCCCACAAACCAAACAACGGATTCCATCACTTAACNTGAGCTGATTGACCAGGACA:1	AAAACCCCACAAACCAAACAAC	CNTGAGCTGATTGACCAGGACA	+	chr3L	5388231	+	chr3L	5388540	309	+	chr3L	5388231	+	chr3L	5388540
TGCTAATCGCTCGACAATTGCGCAGGATGCGANAAACAACGGAACAACGACGACTAGCGGAAACATNTAATTAT:1	TGCTAATCGCTCGACAATTGCG	ACTAGCGGAAACATNTAATTAT	-	chr3L	8884618	-	chr3L	8884420	198	+	chr3L	8884420	+	chr3L	8884618
TGCGTGTGTGTGAGTGNGTGCACNGGTATGCGGNTTATNGGGTGCTCTTACAGCCAGACTAA:1	TGCGTGTGTGTGAGTGNGTGCA	GGTGCTCTTACAGCCAGACTAA	-	chr2R	7763357	-	chr2R	24644282	16880925	+	chr2R	24644282	+	chr2R	7763357
AATACTTTGGATAACTGCGAGCATTACTAATTAAAATCGTTTTCCTTCCTATTCCTATTTCCAGGTCTTGGCTG:1	AATACTTTGGATAACTGCGAGC	TCCTATTTCCAGGTCTTGGCTG	+	chr2R	11676154	+	chr2R	11672705	3449	+	chr2R	11676154	+	chr2R	11672705
CATAATAGACTACAGCAACCTCTGCCACTGATAAAGTTGAAAAGTGAATGCTTTTTAGTTGCACAAATTGCCAAA:1	CATAATAGACTACAGCAACCTC	TTTAGTTGCACAAATTGCCAAA	+	chrX	22848529	+	chrX	4816044	18032485	+	chrX	22848529	+	chrX	4816044
CACAATTTTTGCCCATCGTGTTACCTTCTACCAACGCGATTACTGCGTCACGTCCAAAGCAAGGACCTCCGAT:1	CACAATTTTTGCCCATCGTGTT	GTCCAAAGCAAGGACCTCCGAT	-	chr3L	14245662	-	chr3L	14245570	92	+	chr3L	14245570	+	chr3L	14245662
GTTTCTCATTTGCGATCGTTTAATATGCCATGACCGAGTTGGGTTCAGTTCCATCTGTCATGGTCTATCAAA:1	GTTTCTCATTTGCGATCGTTTA	CCATCTGTCATGGTCTATCAAA	+	chr3R	22185140	+	chr3R	22185234	94	+	chr3R	22185140	+	chr3R	22185234
GCTGGGAATTTGCACTCCGCATAAATGCAAAACCGATCTTGGGGCAGCATATGGGGCATATATGCCACGTATGAC:1	GCTGGGAATTTGCACTCCGCAT	GGGCATATATGCCACGTATGAC	-	chrX	20332049	-	chrX	20331953	96	+	chrX	20331953	+	chrX	20332049
CCAGTCAGTGAGCATCAGAAACGTCAATCTTTAGTTGGCAAAGGCT:1	CCAGTCAGTGAGCATCAGAAAC	CAATCTTTAGTTGGCAAAGGCT	-	chr3L	25842554	-	chr3L	25842497	57	+	chr3L	25842497	+	chr3L	25842554
AGGAAAAAAAAAACGGAAAATAAGGCGGGAGAGCNAGAAGTAAAAGGGGTTTGGTTTT:1	AGGAAAAAAAAAACGGAAAATA	GAAGTAAAAGGGGTTTGGTTTT	+	chr3L	24253012	+	chr3L	8825735	15427277	+	chr3L	24253012	+	chr3L	8825735
AGTTCAATGGTGACAGAATTGTCGGACTATACANGATAGGGCGCTGTGAGCAGGGTGNG:1	AGTTCAATGGTGACAGAATTGT	AGGGCGCTGTGAGCAGGGTGNG	-	chr3L	7355727	-	chr3L	7363650	7923	+	chr3L	7363650	+	chr3L	7355727
AGAAGTGNAGCCGAATTTTCGGGACATCTTGTTAGCTGGNTACCAGATTTGGCTGCCNCTTATTTGCATGCATAT:1	AGAAGTGNAGCCGAATTTTCGG	TGCCNCTTATTTGCATGCATAT	+	chr2L	325144	+	chr2L	325221	77	+	chr2L	325144	+	chr2L	325221
GCTAATAAACTTTCGGGCATAAAAATCGCACTGCAAATTTACCANACGACCCGAAAGTAGGCAACAC:1	GCTAATAAACTTTCGGGCATAA	ACGACCCGAAAGTAGGCAACAC	+	chr3L	19008871	+	chr3L	19009201	330	+	chr3L	19008871	+	chr3L	19009201
CAGGTATGTACATACATACATGTATATGCACCAATGTATATCGACTTTTATGGCCTTTGACCCGCATAGCTGAAC:1	CAGGTATGTACATACATACATG	CCTTTGACCCGCATAGCTGAAC	-	chrX	303489	-	chrX	295869	7620	+	chrX	295869	+	chrX	303489
GGAGGCAACAACCCAAAAACATACACACACACACACACACAAACACGTGCATGTAATACCATACG:1	GGAGGCAACAACCCAAAAACAT	CACGTGCATGTAATACCATACG	-	chrX	12315377	-	chrX	7544691	4770686	+	chrX	7544691	+	chrX	12315377
CACTGGAACGACGTCGTCAGTCAGCTGGCTCCATCCGAAGCCCCAACTCCGTTCTCA:1	CACTGGAACGACGTCGTCAGTC	CGAAGCCCCAACTCCGTTCTCA	-	chr2R	11485197	-	chr2R	11485133	64	+	chr2R	11485133	+	chr2R	11485197
ATTATCATTATCGCCGCTGCTACCCTTTCGCCCTTCACCATTTCTCTAGCATTTTCCCCTATTTTCCCAGCAGT:1	ATTATCATTATCGCCGCTGCTA	TTTCCCCTATTTTCCCAGCAGT	+	chr2L	18730098	+	chr2L	4418408	14311690	+	chr2L	18730098	+	chr2L	4418408
AATGATATTGGAAACATGTACTGCGAACTAAATTCACAATAAAATTCCGCTTTTGAAATTCTTCTCGATGACAGG:1	AATGATATTGGAAACATGTACT	TGAAATTCTTCTCGATGACAGG	+	chr2L	11702657	+	chr2L	11702751	94	+	chr2L	11702657	+	chr2L	11702751
GCTATATTTTATAGAAGGTTTCTCCCTTTCCCATGACAACATTATGTCCAATTGATGGCAATTATTTCCAACA:1	GCTATATTTTATAGAAGGTTTC	TTGATGGCAATTATTTCCAACA	-	chr2L	7867660	-	chr2L	7867568	92	+	chr2L	7867568	+	chr2L	7867660
TTTGTTAGCTGTTTAGTTACACGCCCTATAAATATGTTCTGTTTATAATTGAGCGATAGAATGTTCAATAACTAA:1	TTTGTTAGCTGTTTAGTTACAC	CGATAGAATGTTCAATAACTAA	+	chr3R	14821644	+	chr3R	14821793	149	+	chr3R	14821644	+	chr3R	14821793
ATTATATATATTTTTCTCAATACTTGATATATATATTCCTGAAAGGACTTTGGTGCATGCTTTGAGTGCATTTCC:1	ATTATATATATTTTTCTCAATA	TGCATGCTTTGAGTGCATTTCC	+	chr3R	18500738	+	chr3R	18500859	121	+	chr3R	18500738	+	chr3R	18500859
CAATGTGTTTTTTGTTTATTCGCCGGCCCACTGCCCTGGGACACTGTAAATAATTTACTAGACGTAATTGCAA:1	CAATGTGTTTTTTGTTTATTCG	AATTTACTAGACGTAATTGCAA	-	chr3L	2988006	-	chr3L	2987746	260	+	chr3L	2987746	+	chr3L	2988006
CATTTCGATCTTAAAAACCATAGAATATTGATTTTTGGTATATTATTTCGAAGTCAAAATATGATAATTTAGGGA:1	CATTTCGATCTTAAAAACCATA	TCAAAATATGATAATTTAGGGA	-	chr2R	10318626	-	chr2R	10318540	86	+	chr2R	10318540	+	chr2R	10318626
TCCGCTCNGAACTAATTTTCGTAGAAACTTTAGTTAATGNTTAAGTTAAAATGTTTANTGTCAG:1	TCCGCTCNGAACTAATTTTCGT	AAGTTAAAATGTTTANTGTCAG	-	chr3R	17899178	-	chr3R	17899111	67	+	chr3R	17899111	+	chr3R	17899178
AGCGTTGCAGTTAACTTANCGCTAAAATCAACGATCCAACANTCANGCAAAAAAAAACACAAAAGAAAAACCATC:1	AGCGTTGCAGTTAACTTANCGC	AAAACACAAAAGAAAAACCATC	+	chr2L	9126921	+	chr2L	8083903	1043018	+	chr2L	9126921	+	chr2L	8083903
AATCCCTAGCATAGTCAAGCTGGCCATGTACGTCGAGATAAAAAAANGTAGTAAGTCGG:1	AATCCCTAGCATAGTCAAGCTG	ATAAAAAAANGTAGTAAGTCGG	-	chr2L	20583694	-	chr2L	20576242	7452	+	chr2L	20576242	+	chr2L	20583694
CACTATTTAAATAGTCTAAGTACATAAATAATTTGCTTTGATGTGAAAAATAAGACCATGAGAGAC:1	CACTATTTAAATAGTCTAAGTA	GAAAAATAAGACCATGAGAGAC	+	chrX	17349882	+	chrX	17350065	183	+	chrX	17349882	+	chrX	17350065
TAAATATAATTTCATTGAAATATTTAAAATATAAATATTTTCTCTCTCTGCAGCAGCACAGGACGGCTAGGNAAG:1	TAAATATAATTTCATTGAAATA	CAGCACAGGACGGCTAGGNAAG	-	chr3L	17272380	-	chr3L	17272247	133	+	chr3L	17272247	+	chr3L	17272380
TCCTCGCAATCCGTGGAGTTGCCACTGGCCTCCAGGTTGTAGGTCACGATTTCATCATGTGTGTAGAGTCCGG:1	TCCTCGCAATCCGTGGAGTTGC	TCATCATGTGTGTAGAGTCCGG	-	chr3R	22125998	-	chr3R	31661122	9535124	+	chr3R	31661122	+	chr3R	22125998
CAAAGGGCACAACTTTCCACCGCCCACCCGCCGCCATTCTATGAAGACAAACGAGTTG:1	CAAAGGGCACAACTTTCCACCG	TTCTATGAAGACAAACGAGTTG	+	chr2R	7630903	+	chr2R	7631327	424	+	chr2R	7630903	+	chr2R	7631327
TATGTCGATGGAATAATTAATGCGCGCATTTGCTTAGCCTATTAATGAATTTCCCAGCACGTTTATTACTATTTA:1	TATGTCGATGGAATAATTAATG	CCAGCACGTTTATTACTATTTA	+	chr2L	8723144	+	chr2L	8731521	8377	+	chr2L	8723144	+	chr2L	8731521
CGTTTCTCCAAANTTTTCTTTGTTTCGCACNGNTTCGCNTCCTACAACACTGGGGC:1	CGTTTCTCCAAANTTTTCTTTG	TCGCNTCCTACAACACTGGGGC	-	chr2R	350590	-	chr2R	441097	90507	+	chr2R	441097	+	chr2R	350590
AGCCAGTACATGGGCCACAATTGTTTGACTCTGCAACAAAAGCAATTAAAACTGTGATACACCAAATGAAACTCA:1	AGCCAGTACATGGGCCACAATT	GTGATACACCAAATGAAACTCA	-	chr3L	26695010	-	chr3L	26694930	80	+	chr3L	26694930	+	chr3L	26695010
CACCGTCAATAGTTGGGAGTGGTAAAATTCGAATACGATGTAACTGGAAGCCGTCTCCAATGACTTNGGCGAT:1	CACCGTCAATAGTTGGGAGTGG	CGTCTCCAATGACTTNGGCGAT	+	chrX	12094040	+	chrX	12094130	90	+	chrX	12094040	+	chrX	12094130
CTAAGGCGTGTGTGTGTATGTGGCTGCGAATTAAGGTTGATAAGATTCTGGGGTAAAAACAT:1	CTAAGGCGTGTGTGTGTATGTG	TAAGATTCTGGGGTAAAAACAT	-	chr3L	13074183	-	chr3L	13074063	120	+	chr3L	13074063	+	chr3L	13074183
AAATGTTTCACTTAAGCAGGGAAGCTGCTCGCGAGCCCCAATAAAAACAAAATGTGGACACCACTTTGTCGGA:1	AAATGTTTCACTTAAGCAGGGA	ATGTGGACACCACTTTGTCGGA	+	chr3R	30957464	+	chr3R	27965086	2992378	+	chr3R	30957464	+	chr3R	27965086
ACAAGAATCACAGTTTTTAAAAATCATTGCCTACTTTTTTGCGTCTTCTGTGTTAAAGTGATTATGNGCTAAACT:1	ACAAGAATCACAGTTTTTAAAA	TAAAGTGATTATGNGCTAAACT	+	chrX	7125247	+	chrX	7134406	9159	+	chrX	7125247	+	chrX	7134406
GCGATTTTTTCAGAGTTATTCCAAATGTATTGGGTGTGCATGTTGAATTTTCCACGCCCAGTGAC:1	GCGATTTTTTCAGAGTTATTCC	TGAATTTTCCACGCCCAGTGAC	-	chr3R	28284415	-	chr3R	28286959	2544	+	chr3R	28286959	+	chr3R	28284415
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAAAACAAACACAAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	CAAACACAAAAACAAACACAAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	26659335	4751799	+	chr3R	21907536	+	chr3R	26659335
TTCTCCATTTAGCAGACACTATCAGACACTATCGAACTACACACCTTTGTAGACGCCAGCGAGGTC:1	TTCTCCATTTAGCAGACACTAT	CTTTGTAGACGCCAGCGAGGTC	-	chr2R	4624114	-	chr2R	4622964	1150	+	chr2R	4622964	+	chr2R	4624114
TTACACATAAAACTCTGTAGGGCAAAGGGGAGTAAGATAGAACTAACAAAAACTGGCCGTAGTTAGGTATATCAA:1	TTACACATAAAACTCTGTAGGG	TGGCCGTAGTTAGGTATATCAA	-	chr2L	9391724	-	chr2L	9391557	167	+	chr2L	9391557	+	chr2L	9391724
CAAGCTGCCTCCACTTTCCACACTTTCCACTCACCCGTGTTGCATGACCTGCGAAAGTATTTCATATTTTCACAT:1	CAAGCTGCCTCCACTTTCCACA	AAAGTATTTCATATTTTCACAT	-	chr2R	12492184	-	chr2R	12492098	86	+	chr2R	12492098	+	chr2R	12492184
TTAAAGTATTTATTTTCCTTCACTAAGTCGCAATATTGTTTTATGTACATATACACATTTTTGAGACCTTTCAA:1	TTAAAGTATTTATTTTCCTTCA	ACACATTTTTGAGACCTTTCAA	+	chr3L	5351113	+	chr3L	5351197	84	+	chr3L	5351113	+	chr3L	5351197
ACAAAAAAAACTTTTTAATATCTATGAATTATTCATAAAAAAAAACAATCTGATATGTGTTCATAGAGTCTGATA:1	ACAAAAAAAACTTTTTAATATC	TATGTGTTCATAGAGTCTGATA	+	chr3R	6903376	+	chr3R	13462364	6558988	+	chr3R	6903376	+	chr3R	13462364
ATCCAGATCCAGATCTGTAAGATACCCAGTTGTGCACCACCCTGTAGAGGCCCAGTCACAGTGCCATTCGTATT:1	ATCCAGATCCAGATCTGTAAGA	CAGTCACAGTGCCATTCGTATT	-	chr3R	29894480	-	chr3R	22137420	7757060	+	chr3R	22137420	+	chr3R	29894480
CCTTGCACAAAACCCATCGATTCGAGCATGTGACACGCATGAGGCACAAACAAAATATGCAATATGTTCACATTG:1	CCTTGCACAAAACCCATCGATT	AATATGCAATATGTTCACATTG	+	chr2L	14554175	+	chr2L	14554252	77	+	chr2L	14554175	+	chr2L	14554252
TTAAACATTCTTGGGCTGCCTACATATACACAAACATTCTTCTGGCCAACGGATATGCCATGAATATGCGTCCCG:1	TTAAACATTCTTGGGCTGCCTA	TATGCCATGAATATGCGTCCCG	+	chr3R	24426300	+	chr3R	24426557	257	+	chr3R	24426300	+	chr3R	24426557
GGGAACGTACATATGTACATACATATATCCCATCCATCTATATGCCCAGCGCAGTCACGTCCCGC:1	GGGAACGTACATATGTACATAC	GCCCAGCGCAGTCACGTCCCGC	-	chr3L	409742	-	chr3L	402699	7043	+	chr3L	402699	+	chr3L	409742
CATCTAATTTAGTCTAAAAATTACGCATTTAATGATTCTATGGGTAAAAGCGATGCATCCAATCCTGGTTG:1	CATCTAATTTAGTCTAAAAATT	GCGATGCATCCAATCCTGGTTG	+	chr2R	15375876	+	chr2R	15374937	939	+	chr2R	15375876	+	chr2R	15374937
AATGTCAAGGAAAATAGCTGAGATCGTAACTGCAGATGAAGAGCCTGTCTGTATAACGGAGAGTTCTGAGAA:1	AATGTCAAGGAAAATAGCTGAG	GTATAACGGAGAGTTCTGAGAA	-	chr3L	24363317	-	chr3L	24363242	75	+	chr3L	24363242	+	chr3L	24363317
TCATTGTTTGAAGTGATTCCCCTCTGGATCTTCATTGACATTTAAGAAGTATTTCCAAAGAAGCTAGTTATGTTA:1	TCATTGTTTGAAGTGATTCCCC	TCCAAAGAAGCTAGTTATGTTA	-	chr3L	3294230	-	chr3L	3294139	91	+	chr3L	3294139	+	chr3L	3294230
AAACTTTCAGTCCAATTTGCTGCGCGGATATCAGGACCATATCATGTAAAACGCCTAACAAGCTTGCTGAATCCC:1	AAACTTTCAGTCCAATTTGCTG	CCTAACAAGCTTGCTGAATCCC	+	chr3R	29798243	+	chr3R	17921005	11877238	+	chr3R	29798243	+	chr3R	17921005
ACCTGCGCAAGTACATCAACAACCCACAGATCGAGCACTTTCCAGCCCTGGAAAAATACCAAGACANCAACC:1	ACCTGCGCAAGTACATCAACAA	GAAAAATACCAAGACANCAACC	+	chr2L	1079518	+	chr2L	21154091	20074573	+	chr2L	1079518	+	chr2L	21154091
TTTATGAGGAAAACGAATATTTTCATTATAAACCAATGTGTATGCATATATTTTGGGGNATTATTT:1	TTTATGAGGAAAACGAATATTT	CATATATTTTGGGGNATTATTT	+	chr3R	20266529	+	chr3R	20272991	6462	+	chr3R	20266529	+	chr3R	20272991
CTCCTTATACTAACTCCGTGAAAGCCACCCAACCGTCGCAGGCAACAAATAAAATGCGGAAAATAATACAAAGA:1	CTCCTTATACTAACTCCGTGAA	AATGCGGAAAATAATACAAAGA	-	chr2L	14121872	-	chr2L	14121791	81	+	chr2L	14121791	+	chr2L	14121872
CCTTGTTTAACTAACTGTGCAAAATGCAACACGCTTTTCCATGAAGCTTTTCCTGGAACTTCAGAAAATGTCGC:1	CCTTGTTTAACTAACTGTGCAA	CTGGAACTTCAGAAAATGTCGC	+	chr3R	10723793	+	chr3R	10723884	91	+	chr3R	10723793	+	chr3R	10723884
AATGTGGCACGCAAACATCATGCTCGACTAATAGTCACCCACTACTTCAAACTAGTTTCTTAACTTTAAAAGAAA:1	AATGTGGCACGCAAACATCATG	AGTTTCTTAACTTTAAAAGAAA	+	chr3R	17497965	+	chr3R	17498051	86	+	chr3R	17497965	+	chr3R	17498051
CTTTTTGGAGTCATNATCCCGTATTTCAATTAAGGGCGAAAAAATTCGCTCAATTAAACGACAGCGAGTCCTTCG:1	CTTTTTGGAGTCATNATCCCGT	TTAAACGACAGCGAGTCCTTCG	-	chr2R	10796829	-	chr2R	10796730	99	+	chr2R	10796730	+	chr2R	10796829
ACTACCTACACCAGTTCGCAGTGCAACAGCCAGGACCATGACCAACATGTTCATGGCATCTGCATTGG:1	ACTACCTACACCAGTTCGCAGT	ATGTTCATGGCATCTGCATTGG	+	chr2R	8472554	+	chr2R	8470466	2088	+	chr2R	8472554	+	chr2R	8470466
TTGTTGTACTTTGTGCCCGTTTGTTGGCTCATCCCTCGCAGCAGATGAAATTGAAGTGTGTGTTGACTTTGAC:1	TTGTTGTACTTTGTGCCCGTTT	TGAAGTGTGTGTTGACTTTGAC	-	chr2R	18726976	-	chr2R	18726895	81	+	chr2R	18726895	+	chr2R	18726976
ACTTATATACATTTTAATTGCTATAAATGGACTGAATTTATTTCCTATAGAAAACCATCCGAACGGAGTTCAAAG:1	ACTTATATACATTTTAATTGCT	ACCATCCGAACGGAGTTCAAAG	+	chr2L	12739202	+	chr2L	12743983	4781	+	chr2L	12739202	+	chr2L	12743983
ACTCACAATCAAACAAAGAAACGTTATAGCTATTACATATATATTATTCTTCGGAGAAACCCGCAATGGGATCGA:1	ACTCACAATCAAACAAAGAAAC	GAGAAACCCGCAATGGGATCGA	+	chr2R	7815686	+	chr2R	7822155	6469	+	chr2R	7815686	+	chr2R	7822155
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAANACAACAAGGACGGGCATTATATGCTAG:1	ACAACACAACACAACACAACAC	AAGGACGGGCATTATATGCTAG	+	chr3R	21907536	+	chr3R	26796769	4889233	+	chr3R	21907536	+	chr3R	26796769
AGAATAAAATACTCCTACTTATTGTGAATGCTCTAATTTTATAGCTATAAATTTCTCAGCTATTTGCAATTATT:1	AGAATAAAATACTCCTACTTAT	TTCTCAGCTATTTGCAATTATT	-	chrX	20710514	-	chrX	20710438	76	+	chrX	20710438	+	chrX	20710514
GGATTACGTATGTGCTTTGCATTTGACTGCCCATTGATGAGAGATGTGCCATTGTGTTGNCAGGC:1	GGATTACGTATGTGCTTTGCAT	ATGTGCCATTGTGTTGNCAGGC	-	chr3R	23629535	-	chr3R	23629469	66	+	chr3R	23629469	+	chr3R	23629535
GAGACGGATAAGGCTTAATCCTTATTTCATATATTTTTCACTTATTTCGGCATTGGAATTGAATTTTCATGTTC:1	GAGACGGATAAGGCTTAATCCT	TTGGAATTGAATTTTCATGTTC	+	chr2R	22971578	+	chr2R	22969327	2251	+	chr2R	22971578	+	chr2R	22969327
TTNTATAGGAAATAAATTCAGTCCATTTATAGCAATNAAAATGTATATAAGTATANAACA:1	TTNTATAGGAAATAAATTCAGT	AAATGTATATAAGTATANAACA	-	chr2L	12743960	-	chr2L	12739194	4766	+	chr2L	12739194	+	chr2L	12743960
CGTTTTTAAGTTATTAAGCTATTTTTTATTTTGTGAGCGAAATTTGGTACCCATGTGCGCTTGCATGGGTTACAA:1	CGTTTTTAAGTTATTAAGCTAT	TGTGCGCTTGCATGGGTTACAA	-	chr2R	5773356	-	chr2R	5773253	103	+	chr2R	5773253	+	chr2R	5773356
TGTTGTGGCAAAACACGAGCCCGCATCATCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGTAGCAGCA:1	TGTTGTGGCAAAACACGAGCCC	AGCAGCAGTAGCAGTAGCAGCA	+	chr3R	6636525	+	chr3R	4439167	2197358	+	chr3R	6636525	+	chr3R	4439167
CCCGGGCCNACTGCAAAAGTCTATTAACGTACATGACNNNNAACTCGGCACACGCCCACTTNTTTCACCGACCTC:1	CCCGGGCCNACTGCAAAAGTCT	GCCCACTTNTTTCACCGACCTC	-	chr3L	17257895	-	chr3L	15292887	1965008	+	chr3L	15292887	+	chr3L	17257895
CGTGAAAACAATTTGTTGCCAATTTTATGACGCCCTTAAANTAACCACCAATTTTGTTACTTTGCAGANGTCC:1	CGTGAAAACAATTTGTTGCCAA	TTTTGTTACTTTGCAGANGTCC	-	chr2R	11509470	-	chr2R	24789163	13279693	+	chr2R	24789163	+	chr2R	11509470
AGACGTGAAATCGAGGTGAGATAAGAAGAAGTCTGCGAGTCCTTAATCAGAAGGACTGGCGG:1	AGACGTGAAATCGAGGTGAGAT	CCTTAATCAGAAGGACTGGCGG	-	chr3L	1055184	-	chr3L	1047385	7799	+	chr3L	1047385	+	chr3L	1055184
CTTGTGGAGAAGGCAGTTATGTAAGCTCACTCAAGATTGTAAATTCAGCACTTTATGTATTTGAAATTCTATTTG:1	CTTGTGGAGAAGGCAGTTATGT	TATGTATTTGAAATTCTATTTG	+	chr2L	1164269	+	chr2L	1164355	86	+	chr2L	1164269	+	chr2L	1164355
CAGTGCATTCCAGTTTACGCTGCGTGTGTGTACACTGTACTGCAAATTTCACTTATCAAGTGGAACTCCAACAAC:1	CAGTGCATTCCAGTTTACGCTG	TATCAAGTGGAACTCCAACAAC	-	chrX	1635450	-	chrX	1627982	7468	+	chrX	1627982	+	chrX	1635450
CAAAGTCAGAATTTGATTTACAAATGGCACTAGAATTTGAATTCATAAATCCATGTTGCCCAGAATGATACGA:1	CAAAGTCAGAATTTGATTTACA	CATGTTGCCCAGAATGATACGA	-	chr2L	1829013	-	chr2L	1828938	75	+	chr2L	1828938	+	chr2L	1829013
AGGCACCAGTTTGCCAGCCTAAGCTCGCGTATTCGGTTCCTGGGATAAGTGCCTGTAAAATAAATGGGTTTGTAT:1	AGGCACCAGTTTGCCAGCCTAA	TGTAAAATAAATGGGTTTGTAT	-	chr2L	22546098	-	chr2L	22546002	96	+	chr2L	22546002	+	chr2L	22546098
CGTAGGCTACAGAGGGAATTGACTGAAACGATTGGAAAGAAGGATTCGCGGTGTACTCGTAATCTGAACTGCCCT:1	CGTAGGCTACAGAGGGAATTGA	TACTCGTAATCTGAACTGCCCT	-	chr2R	24304000	-	chr2R	24303916	84	+	chr2R	24303916	+	chr2R	24304000
AGAAGCATAACAAACACTCAATGCATCACATGATTAGACTGATATGA:1	AGAAGCATAACAAACACTCAAT	TCACATGATTAGACTGATATGA	+	chr2R	18142924	+	chr2R	18143135	211	+	chr2R	18142924	+	chr2R	18143135
AATAATAAAAAGAAATTTCTTCCGGATGGATGCATAATGGGGCAACATTNTGCGGCATAAAGTATAGTGGGGCAC:1	AATAATAAAAAGAAATTTCTTC	GGCATAAAGTATAGTGGGGCAC	+	chr2R	22574181	+	chr2R	22574261	80	+	chr2R	22574181	+	chr2R	22574261
ATGAAGCCAATTAATAGACATATTGTAAATGGTTGCCATTGAAACGGCAGATTTGTAAAGACAAGTTCGCCCAGC:1	ATGAAGCCAATTAATAGACATA	TGTAAAGACAAGTTCGCCCAGC	-	chr3L	22624652	-	chr3L	22617200	7452	+	chr3L	22617200	+	chr3L	22624652
GTTGTCGCTGCCAGCCATGCACCGTACGCCATAAAGCGTCACATAGTGCGACTCGGGTTA:1	GTTGTCGCTGCCAGCCATGCAC	TCACATAGTGCGACTCGGGTTA	+	chr2R	10167143	+	chr2R	10167204	61	+	chr2R	10167143	+	chr2R	10167204
TCAAGTGCAGAACATTAATCATCCGACACCTCTAGCAACTTTGGCTGCATTTCTGGCACCGCGGAAGAGTAACTG:1	TCAAGTGCAGAACATTAATCAT	TGGCACCGCGGAAGAGTAACTG	-	chr3R	27043780	-	chr3R	27043686	94	+	chr3R	27043686	+	chr3R	27043780
TGTGGGCGCCCTCTTGCGGCAGACATTTGTATATTGACGCACCCGCTTGTACATCTGATATTTAATGCTTATTT:1	TGTGGGCGCCCTCTTGCGGCAG	ATCTGATATTTAATGCTTATTT	-	chr2R	21239038	-	chr2R	21238955	83	+	chr2R	21238955	+	chr2R	21239038
AAAAAATACACACCAACAAAGCAAAAGTGCTCAAAGAGAAGCGCTCA:1	AAAAAATACACACCAACAAAGC	AGTGCTCAAAGAGAAGCGCTCA	-	chrX	7376797	-	chrX	3451488	3925309	+	chrX	3451488	+	chrX	7376797
AAATTTTCCCTATATATACATTCCCTTTTCAGATTCGTTCGTCCGCCTGACTTAC:1	AAATTTTCCCTATATATACATT	TTCGTTCGTCCGCCTGACTTAC	-	chr3L	20148381	-	chr3L	20148311	70	+	chr3L	20148311	+	chr3L	20148381
TAATTGGGCCTCATTCATTGCTTGGAAACCTAGNCCGCATGCTGCCAGGGGGTCCACACCAGCAGACTCCAACG:1	TAATTGGGCCTCATTCATTGCT	TCCACACCAGCAGACTCCAACG	-	chr2R	22345876	-	chr2R	9573561	12772315	+	chr2R	9573561	+	chr2R	22345876
TAGAACAATTTGTTTTGTGCCTTTCAGGGGTTAACAGTTAATCGACTNGGAAAATCTCAAANAAAAACAGCAATT:1	TAGAACAATTTGTTTTGTGCCT	ATCTCAAANAAAAACAGCAATT	+	chr2L	2474635	+	chr2L	12512191	10037556	+	chr2L	2474635	+	chr2L	12512191
ATTTTCCCACCCCTTTGCTATTTTCCACCTCCACTTTTCCACCAGAGACAACGGGCTTCTGTCTCTGT:1	ATTTTCCCACCCCTTTGCTATT	GACAACGGGCTTCTGTCTCTGT	+	chr2R	12501712	+	chr2R	12503867	2155	+	chr2R	12501712	+	chr2R	12503867
CATTCAGGTTACGTTCTATTATAATAATTATAATTACAATTACCATTACCATTCATATTTTATTCAGGTTCCCAA:2	CATTCAGGTTACGTTCTATTAT	CATATTTTATTCAGGTTCCCAA	+	chr2L	7198009	+	chr2L	7198088	79	+	chr2L	7198009	+	chr2L	7198088
TAGATAATACCAATTATTAAAGCTAAAATTGAAGTAAGAAGTAATTTTCNGAGCTGTATGTCATTTTAGTTTGCC:1	TAGATAATACCAATTATTAAAG	CTGTATGTCATTTTAGTTTGCC	+	chr2L	5931517	+	chr2L	5931601	84	+	chr2L	5931517	+	chr2L	5931601
ATTGTAAATTTGTTTATTGAGAATGCATTTGGATTCGTGTTTCATTCATTGTTGGTTTTATGGGCGTTTTTTTTT:1	ATTGTAAATTTGTTTATTGAGA	GGTTTTATGGGCGTTTTTTTTT	+	chrX	9780988	+	chrX	15156934	5375946	+	chrX	9780988	+	chrX	15156934
ATCCGCAGGAAAATATACATTTAAAAAAAAATGTAATTAAGAAATGCTCGTATTT:1	ATCCGCAGGAAAATATACATTT	TAATTAAGAAATGCTCGTATTT	+	chr3R	6722029	+	chr3R	2592276	4129753	+	chr3R	6722029	+	chr3R	2592276
ATATATAGCTACCGAGTATGTCAAAGTGCAAAGTGGCATAAATCCCGCGACCGCCAATATAAAGTTATTGCAATA:1	ATATATAGCTACCGAGTATGTC	CCAATATAAAGTTATTGCAATA	-	chr3R	31985103	-	chr3R	31979730	5373	+	chr3R	31979730	+	chr3R	31985103
CCGGGATTAGCCGACGGAGCAGCTGATGTCCCAACCGAAACGCTGCAAAAAGAAAGCAGAGGAAG:1	CCGGGATTAGCCGACGGAGCAG	TGCAAAAAGAAAGCAGAGGAAG	-	chr3R	4861662	-	chr3R	4861591	71	+	chr3R	4861591	+	chr3R	4861662
TGTTAAATAGTAGTGGTATATGGACACCATAAGGCATACAACTATAGCAAAGCCACACATCCATTCTGGGGTACT:1	TGTTAAATAGTAGTGGTATATG	CACACATCCATTCTGGGGTACT	-	chr3L	11865869	-	chr3L	11864574	1295	+	chr3L	11864574	+	chr3L	11865869
GTAACGCCCCTCGACAAAGCACCGCAAGCAGTAGTAGTGAAGTATTTGGTAT:1	GTAACGCCCCTCGACAAAGCAC	GTAGTAGTGAAGTATTTGGTAT	-	chrX	18273595	-	chrX	16186790	2086805	+	chrX	16186790	+	chrX	18273595
AAATATAACCAGTTGATTTTGTATTTCCCATGTAACCTTTTTTAAAATTGATCTATTGATATTTCATACGAAA:1	AAATATAACCAGTTGATTTTGT	TCTATTGATATTTCATACGAAA	+	chr2L	8003043	+	chr2L	8003123	80	+	chr2L	8003043	+	chr2L	8003123
CATATGCCTTAAAATTAANTAGTTAGATATTTCCGAAATATNTGTNAATATGTATTACAAGATGTTTATAGAAT:1	CATATGCCTTAAAATTAANTAG	TATTACAAGATGTTTATAGAAT	-	chr3L	12089162	-	chr3L	12089083	79	+	chr3L	12089083	+	chr3L	12089162
ATTTCTTGAAAAGTTCGACAAAAGCCATGAGAATTTTATATATCTTTGTAAAGGTAGTCTATTTGTTAATCAAAA:1	ATTTCTTGAAAAGTTCGACAAA	GTAGTCTATTTGTTAATCAAAA	-	chr3R	18061535	-	chr3R	18061443	92	+	chr3R	18061443	+	chr3R	18061535
GTAATTCAGTGGAAATTGCATTTTGTCATTAATTAATACAAAGTCAACCTGGCGACTGCTCATTGTTTATTCC:1	GTAATTCAGTGGAAATTGCATT	GCGACTGCTCATTGTTTATTCC	-	chrX	3820287	-	chrX	18733254	14912967	+	chrX	18733254	+	chrX	3820287
GAAATACAAAAAAAAAGGGAAAAACAACCAGTTGCTCCACCGCAAGTGCCCGCCCGCTGATTGACATGTG:1	GAAATACAAAAAAAAAGGGAAA	CCCGCCCGCTGATTGACATGTG	+	chr3L	4354652	+	chr3L	747031	3607621	+	chr3L	4354652	+	chr3L	747031
ATAGCGCTCCGAGCCTCGTTCCCAAGCCATTCTTCATGTCGCGCAGAAATGAGACATTTTAT:1	ATAGCGCTCCGAGCCTCGTTCC	GCGCAGAAATGAGACATTTTAT	-	chr3R	6575299	-	chr3R	6575177	122	+	chr3R	6575177	+	chr3R	6575299
TATTTAATNAGGTTTGCTAACTGTTATACGTATAANTTATTAACATCTATTTCTGATGGCATAATCTTTCATCGA:1	TATTTAATNAGGTTTGCTAACT	TGATGGCATAATCTTTCATCGA	+	chr2L	16134647	+	chr2L	16134747	100	+	chr2L	16134647	+	chr2L	16134747
TTNGACTTAACAATTCACGCAACGGAAACGATAAACNGAGGCCCACAGATCCCGANCATA:1	TTNGACTTAACAATTCACGCAA	AGGCCCACAGATCCCGANCATA	-	chrX	17680983	-	chrX	17680921	62	+	chrX	17680921	+	chrX	17680983
ATTGCTATTAGCATATGTTAGTGCGCCTTCGCAGGCGCGGGCATTCACTTAGTTCAAAAGTCGAGGGCAAACAGA:1	ATTGCTATTAGCATATGTTAGT	TCAAAAGTCGAGGGCAAACAGA	-	chr2L	968900	-	chr2L	968821	79	+	chr2L	968821	+	chr2L	968900
TTTCTTTAAAGCTCTTCGTAGTTTCTCAAAGACTAGTCACAATTATTTTTCGTTTTTATTT:1	TTTCTTTAAAGCTCTTCGTAGT	CAATTATTTTTCGTTTTTATTT	-	chrX	2852322	-	chrX	2844926	7396	+	chrX	2844926	+	chrX	2852322
AGTTCGCTCGCCCAAAGCTTTTTCTANAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCAAACAAGTCTAAG:1	AGTTCGCTCGCCCAAAGCTTTT	TGGCATGCCAAACAAGTCTAAG	-	chr2L	1227611	-	chr2L	1220145	7466	+	chr2L	1220145	+	chr2L	1227611
AGTCCTGTAATGGGGTCCAACAAGTCAGGATTGTCTTTCGCTATGCCNCCGAAGAGTCACACTTAAANGAGAGT:1	AGTCCTGTAATGGGGTCCAACA	AGAGTCACACTTAAANGAGAGT	+	chrX	20670951	+	chrX	20671048	97	+	chrX	20670951	+	chrX	20671048
CATAAGCCAAGAACAGACCAATTAGAAAATTCCAAAAGAACAAAAAAACAACACCAAGATGCAGGCCGCATTGAT:1	CATAAGCCAAGAACAGACCAAT	CCAAGATGCAGGCCGCATTGAT	+	chr2L	2455392	+	chr2L	13485101	11029709	+	chr2L	2455392	+	chr2L	13485101
ACATCGGACAAGGACACTGGCGACAGGAACGACAAGGTTTGCCGGCTGACAGGCAACCAAGCAAAATGTTAATGG:1	ACATCGGACAAGGACACTGGCG	CAACCAAGCAAAATGTTAATGG	+	chr2R	8511633	+	chr2R	8511713	80	+	chr2R	8511633	+	chr2R	8511713
GTCAATTAATCATTTATTTTGCCACACCATAAAAAATAATTGTCTGAATATGGAATG:1	GTCAATTAATCATTTATTTTGC	ATAATTGTCTGAATATGGAATG	+	chrX	181074	+	chrX	13057301	12876227	+	chrX	181074	+	chrX	13057301
ATCATTTTAGAGTGCATATGTGTGGAGAAAAATTTGTAAAATAGATGTATTTCAAATGTTTTTAAANATAATTAG:1	ATCATTTTAGAGTGCATATGTG	AAATGTTTTTAAANATAATTAG	-	chr3L	16941512	-	chr3L	16941411	101	+	chr3L	16941411	+	chr3L	16941512
TGGCCAGGACGAAGATCAGCTGCATGCCAGCCATGATTTATGCCGTAGTCCGGGTGAAAGTCAGAGNTTAGA:1	TGGCCAGGACGAAGATCAGCTG	CGGGTGAAAGTCAGAGNTTAGA	-	chr3L	5476261	-	chr3L	5476183	78	+	chr3L	5476183	+	chr3L	5476261
TGGAAAGTTTCTGTTTCTGTTTTTATTTGACTACCCCGGCGCATTTACATAAGTGAACTTTGGCATGCGCGCGGC:1	TGGAAAGTTTCTGTTTCTGTTT	TGAACTTTGGCATGCGCGCGGC	+	chr2R	18977759	+	chr2R	15401516	3576243	+	chr2R	18977759	+	chr2R	15401516
AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAATGGGAGAGGAAGAATGTTGTGGAGAGAATCGGAGAAAATT:1	AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	GTGGAGAGAATCGGAGAAAATT	+	chr3L	22908066	+	chr3L	15329658	7578408	+	chr3L	22908066	+	chr3L	15329658
GTCCATTCGAAAGGTGAGAAAACGAGGTGTTGAAAGCGGAGTTGGGTTATCTGTTCAAGTTCGGTTTCTTCAATT:1	GTCCATTCGAAAGGTGAGAAAA	TTCAAGTTCGGTTTCTTCAATT	-	chr3R	29323418	-	chr3R	23523401	5800017	+	chr3R	23523401	+	chr3R	29323418
TTTCACATATTTTCTGAAGTTTGCTGATCTGTATTTGCCCCAGTTAAAACACACGACGATCTTTTCGGCTAAAAA:1	TTTCACATATTTTCTGAAGTTT	CGACGATCTTTTCGGCTAAAAA	-	chrY	1280097	-	chrY	858881	421216	+	chrY	858881	+	chrY	1280097
AAAATTTATGATGACAAANTTTCAACGCCAGCTGCAAAGATNTGCNAAGCCCGAAAAAAGAAATGAAAAAAAAAA:1	AAAATTTATGATGACAAANTTT	AAAAAAGAAATGAAAAAAAAAA	-	chr3L	9757733	-	chr3L	13895588	4137855	+	chr3L	13895588	+	chr3L	9757733
CTGAACCTTAAAAGCCAGGTACACTGAATTGTGTTTGTGTTGTTTGCCGNTTATCTGGTATATTGGAATGGGCAC:1	CTGAACCTTAAAAGCCAGGTAC	TCTGGTATATTGGAATGGGCAC	-	chr3L	5412365	-	chr3L	5412192	173	+	chr3L	5412192	+	chr3L	5412365
AGAATGCATGCCAAATATTTAATTAGGTTTGCTAACTGTTATACGTATANTTTATTAACATCTATTTCTGATGGC:1	AGAATGCATGCCAAATATTTAA	ATTAACATCTATTTCTGATGGC	+	chr2L	16134632	+	chr2L	16134732	100	+	chr2L	16134632	+	chr2L	16134732
TAAATCGCAATTTTGCAACAATGACGCCGCAGTCTCGCATATTGTTCGGCCTCAGCTTCGACTGGAGCTCTTTT:1	TAAATCGCAATTTTGCAACAAT	CAGCTTCGACTGGAGCTCTTTT	+	chr2R	9129554	+	chr2R	9129640	86	+	chr2R	9129554	+	chr2R	9129640
ATATTTACACTTCTTTCTGTCTTTGTAGCTCGCTACGAATGTCGCTGATTTACTAATCACTTCTCCACGCACTTG:1	ATATTTACACTTCTTTCTGTCT	TAATCACTTCTCCACGCACTTG	+	chr2R	7608414	+	chr2R	7613617	5203	+	chr2R	7608414	+	chr2R	7613617
AAGTGGCACTCAAAAGAAATTGAATTGATTTTTTACATATGTACTTCTTAACAATTATTTAGTACATATCTTATC:1	AAGTGGCACTCAAAAGAAATTG	ATTATTTAGTACATATCTTATC	+	chr2R	11538317	+	chr2R	11538417	100	+	chr2R	11538317	+	chr2R	11538417
CTGATTGATGGACGCCGAGCAAACAATAACAACAATCGAGAGCACTTGANGCCGATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1	CTGATTGATGGACGCCGAGCAA	GATTCGCATGGGAGATGAGCAA	-	chrX	16718776	-	chrX	14321911	2396865	+	chrX	14321911	+	chrX	16718776
GGATTCCTGGTGCTGCTACCAAGTTGAGCGTCAAAAGTTTTGATAGCCTGTGAGCTGCCTACTCAAGNGACTTGG:1	GGATTCCTGGTGCTGCTACCAA	GCTGCCTACTCAAGNGACTTGG	+	chr3L	19208089	+	chr3L	19209463	1374	+	chr3L	19208089	+	chr3L	19209463
AAGATAAATATACATGTTGATGGAGTGGTAGTACCAACATGAATATAAAGTACCAACGGAATATAAAAGTAAAA:1	AAGATAAATATACATGTTGATG	CCAACGGAATATAAAAGTAAAA	-	chr3R	27452778	-	chr3R	27452599	179	+	chr3R	27452599	+	chr3R	27452778
CGGTAATAAAATGACTCAACTACATACTTATGAAAAAGTCAAATTCAATTCAAAAGGTAAAAACTCTTTTAA:1	CGGTAATAAAATGACTCAACTA	CAAAAGGTAAAAACTCTTTTAA	+	chr3R	13994316	+	chr3R	13994568	252	+	chr3R	13994316	+	chr3R	13994568
AATTTACAAAAGGCAGCCACTTTGCACTTTGGCTGGACCACTTACAGTGGTCT:1	AATTTACAAAAGGCAGCCACTT	GCTGGACCACTTACAGTGGTCT	+	chr3L	22179115	+	chr3L	22179179	64	+	chr3L	22179115	+	chr3L	22179179
CACCAACCACCCAAAAACTCAGTGGCACTGAGTGTGTGTTGCTCTTACTGCGAGTAATAAGTCAAGTAGCTGGCA:1	CACCAACCACCCAAAAACTCAG	GTAATAAGTCAAGTAGCTGGCA	+	chrX	2803517	+	chrX	2803660	143	+	chrX	2803517	+	chrX	2803660
TTCATTCTCGCAGTGTACTTGTGCCACCGAAACCGATAAATTGCTGGCGCAATGTTAGCAA:1	TTCATTCTCGCAGTGTACTTGT	ATTGCTGGCGCAATGTTAGCAA	-	chr3R	4214165	-	chr3R	7395990	3181825	+	chr3R	7395990	+	chr3R	4214165
TAATGTGAATGGTGAGAGTTGTATTTGCTGGAACTTATGGGCTTGCNTGCCACGGGGG:1	TAATGTGAATGGTGAGAGTTGT	ATGGGCTTGCNTGCCACGGGGG	+	chr3R	20118046	+	chr3R	20118115	69	+	chr3R	20118046	+	chr3R	20118115
TTGAACAACATAAAGGGTCATCTTATTGTTTTGGCAACTAAATGTTTCCCTATTAACTATTTAAATACTATTGTA:1	TTGAACAACATAAAGGGTCATC	TAACTATTTAAATACTATTGTA	+	chr2R	6978641	+	chr2R	6978824	183	+	chr2R	6978641	+	chr2R	6978824
CCATTTCAAGATTTAAGCANTTCTCGTGAGAAATAGCCCTCAATTAGCATAGAAATTGGGACTGCTCCTTGATTT:1	CCATTTCAAGATTTAAGCANTT	AATTGGGACTGCTCCTTGATTT	+	chr3R	8080269	+	chr3R	8080365	96	+	chr3R	8080269	+	chr3R	8080365
CAACACAACAGCACACAATTGCACGGGCCCAAGGGCACAGGACGAACAAGGTTCAGGTGTTCGGCTGGGCAGGAT:1	CAACACAACAGCACACAATTGC	CAGGTGTTCGGCTGGGCAGGAT	-	chr2L	10864474	-	chr2L	10862860	1614	+	chr2L	10862860	+	chr2L	10864474
GTGGGTAGATGGTTCTTCAAAATATCTCATCACCGTACATAGGTTACTATGAGTTTAACAATGGAAGAACCAG:1	GTGGGTAGATGGTTCTTCAAAA	AGTTTAACAATGGAAGAACCAG	+	chr2R	22729465	+	chr2R	22729671	206	+	chr2R	22729465	+	chr2R	22729671
TTAGAACTGGAATGCATTAATAAATATTAGGATCTCAATTACACTTGGCAAGGCCTTGTGGCCGGGCAAATT:1	TTAGAACTGGAATGCATTAATA	AGGCCTTGTGGCCGGGCAAATT	+	chr2R	24724192	+	chr2R	24724677	485	+	chr2R	24724192	+	chr2R	24724677
ATGTCCATTTAGTTAATTGCAATCAGGAATGTTGACAATTTCGCTGACGTGGGC:1	ATGTCCATTTAGTTAATTGCAA	TGACAATTTCGCTGACGTGGGC	+	chr3L	18514942	+	chr3L	18520112	5170	+	chr3L	18514942	+	chr3L	18520112
TATGTGGGTTTGGCCCCAACCCATTTCAAGATTTAAGCATTTCTCGTGAGAAATAGCCCTCAATTAGCNTAGAAA:1	TATGTGGGTTTGGCCCCAACCC	TAGCCCTCAATTAGCNTAGAAA	+	chr3R	8080249	+	chr3R	8080345	96	+	chr3R	8080249	+	chr3R	8080345
GGAAAGTGGCCTCAAATGTGTTCAATTCAAACTTAAATATAGGTCTTATATATTAGAATTATATACA:1	GGAAAGTGGCCTCAAATGTGTT	TTATATATTAGAATTATATACA	+	chr3L	22327360	+	chr3L	8221242	14106118	+	chr3L	22327360	+	chr3L	8221242
TGATTTATGGGCCTTTCGGTTAAGCCGCCTGCTTATCGGTAAGACCCTCAGATTTACGAGTTGTGTATAT:1	TGATTTATGGGCCTTTCGGTTA	CAGATTTACGAGTTGTGTATAT	-	chr2L	20069607	-	chr2L	20069532	75	+	chr2L	20069532	+	chr2L	20069607
ATTGCATGTCCGCCTTTCTGCGCATGTACAAAATGGCAAAGGAGGTGACCGAGAAAATGAAATTCATTGACAAAC:1	ATTGCATGTCCGCCTTTCTGCG	AAAATGAAATTCATTGACAAAC	-	chr3L	6602061	-	chr3L	18201280	11599219	+	chr3L	18201280	+	chr3L	6602061
TGTGTTTGCGTTGATCTATGCCAACAGCATAGCAGCGTAATTATGAAGAATAGAATAGTAGGAGAAAAGTAG:1	TGTGTTTGCGTTGATCTATGCC	TAGAATAGTAGGAGAAAAGTAG	-	chr2R	25101385	-	chr2R	25101286	99	+	chr2R	25101286	+	chr2R	25101385
AATCTGTAATTATGGCCGACTGACTATATACAGAGTTCAAAAGTTTAGANGTGCAGCCCCTCAAAATATTAAA:1	AATCTGTAATTATGGCCGACTG	TGCAGCCCCTCAAAATATTAAA	-	chrX	20320380	-	chrX	20320305	75	+	chrX	20320305	+	chrX	20320380
AAGATAACTGTACGACATTTAAAATCTATATAGTTTTTAAAATCCTTCTTTTGCAACTGTTAATAAAATTAAAG:1	AAGATAACTGTACGACATTTAA	GCAACTGTTAATAAAATTAAAG	-	chr3L	17789936	-	chr3L	17789861	75	+	chr3L	17789861	+	chr3L	17789936
CTCAACTTTTGTTGTATAGNGCTGTTTCTCAATGTTTAGTATAAGACTTCGTTTT:1	CTCAACTTTTGTTGTATAGNGC	GTTTAGTATAAGACTTCGTTTT	+	chr2L	21312902	+	chr2L	21278569	34333	+	chr2L	21312902	+	chr2L	21278569
AATTTAATTAGAATATCTATCTTTTAGTCGAACGACACAATATCACACGGTTCCATTGTATTTTTAGCAGTATAA:1	AATTTAATTAGAATATCTATCT	CATTGTATTTTTAGCAGTATAA	+	chrX	18645026	+	chrX	18645124	98	+	chrX	18645026	+	chrX	18645124
TGGCCATGTGCACGGTGATGAGGAGCAAATACCTCTTACTCCAAGGGGGATCTCTGTCACTTGAAGTAAAGAGG:1	TGGCCATGTGCACGGTGATGAG	TCTGTCACTTGAAGTAAAGAGG	+	chrX	2189435	+	chrX	2189510	75	+	chrX	2189435	+	chrX	2189510
TGTCAGCGGCTTTGATTGCCAAAGGGCATTAAGTAGGATGGGTAGTTTTTCCGCCTAAT:1	TGTCAGCGGCTTTGATTGCCAA	ATGGGTAGTTTTTCCGCCTAAT	+	chr3R	20060651	+	chr3R	20060718	67	+	chr3R	20060651	+	chr3R	20060718
AATGCCGAGTTATTGGCAAATCATAAGCAAAATTTAAGAACACATTTCCAGTTGTAAAAACTCATGTTTTTTAGG:1	AATGCCGAGTTATTGGCAAATC	GTAAAAACTCATGTTTTTTAGG	+	chr2R	18713257	+	chr2R	18713334	77	+	chr2R	18713257	+	chr2R	18713334
AATAGAATATAGAAAATAGAAAATAATGTTAATTCACCTATAAATAACGAAAAATAAGAAAAATAAAAAAC:1	AATAGAATATAGAAAATAGAAA	AAAAATAAGAAAAATAAAAAAC	+	chr3L	17831195	+	chr3L	7104453	10726742	+	chr3L	17831195	+	chr3L	7104453
TGAATGTCAAGAGTACACAGCCTACACGAGTGTGTGTTACTTAAATTATGTTATGTTACTTAAATGATGGCACCA:1	TGAATGTCAAGAGTACACAGCC	TGTTACTTAAATGATGGCACCA	-	chr2L	13032615	-	chr2L	13032519	96	+	chr2L	13032519	+	chr2L	13032615
TTTTTCAAATTATAATTGCAAAACGGAAGTTGCACGAAAATAGTTTGAAAATTTCGCTCAATATTTTCACACAAA:1	TTTTTCAAATTATAATTGCAAA	TCGCTCAATATTTTCACACAAA	-	chr3L	7264968	-	chr3L	7264885	83	+	chr3L	7264885	+	chr3L	7264968
TCATNATTGTGCGCTAGTTTTTNACAGNGTTTATCTGACNTTATATTTGAGCTTAACGAAACATTGCCGGAGTG:1	TCATNATTGTGCGCTAGTTTTT	TTAACGAAACATTGCCGGAGTG	+	chr3R	16073438	+	chr3R	16073541	103	+	chr3R	16073438	+	chr3R	16073541
TGATGGTGAAACTTTCGCAGCTTTTCGTGCAATCCCATGATGGGAACTGAGCCATATCACTCGAAAAACATGGT:1	TGATGGTGAAACTTTCGCAGCT	CATATCACTCGAAAAACATGGT	+	chr3R	5278099	+	chr3R	5278179	80	+	chr3R	5278099	+	chr3R	5278179
ATAAAAATGCAGCGACCCGCGCTGATGAATAGCGCCTGAAATGAGCCTACAAAGCTGTCAATTTTAATAAATTAT:1	ATAAAAATGCAGCGACCCGCGC	GCTGTCAATTTTAATAAATTAT	+	chr2L	7343323	+	chr2L	7350439	7116	+	chr2L	7343323	+	chr2L	7350439
GAAATGTTAATACTTTCAATATATGGTCATAAAATAGATTTTCACTTTAGACCAGAAATGAAGACCAGCTGCTTA:1	GAAATGTTAATACTTTCAATAT	AGAAATGAAGACCAGCTGCTTA	+	chr3R	15646798	+	chr3R	15646881	83	+	chr3R	15646798	+	chr3R	15646881
AACTTAGCATGATATAAAAACGTGAGGCACCAAAAAAAAGTTAATCCGTTATGCCACCATGCTATGAAGAGGCTG:1	AACTTAGCATGATATAAAAACG	CCACCATGCTATGAAGAGGCTG	-	chr2R	16893888	-	chr2R	16893805	83	+	chr2R	16893805	+	chr2R	16893888
TTGTTACCAAAATACACATGCTAATTTAAAGTAACTTGAGATTTCACTCAAAGCTTTTCTCTCTGTACATTTAAT:1	TTGTTACCAAAATACACATGCT	CTTTTCTCTCTGTACATTTAAT	+	chr3L	17537043	+	chr3L	17537124	81	+	chr3L	17537043	+	chr3L	17537124
AAATGATTGCTAGCTCATCTGCTTATATATCTTAATTTTACTTATATGTACTTGCCATTTTCTTAGAGTGCATT:1	AAATGATTGCTAGCTCATCTGC	TGCCATTTTCTTAGAGTGCATT	+	chr3R	21903635	+	chr3R	21903731	96	+	chr3R	21903635	+	chr3R	21903731
GCTGTCCTCGGGAAGACTTTCCACCTCCTCNNNGNACTTCTTCTGGACATCCTCGTGGAGTGCCAGCATCAATAG:1	GCTGTCCTCGGGAAGACTTTCC	CGTGGAGTGCCAGCATCAATAG	-	chr2L	5265307	-	chr2L	5267777	2470	+	chr2L	5267777	+	chr2L	5265307
AGTGTTTTCATATATGTTTAGCTTTGAGCTCTTGCTAAATAGAGATACTAAGATTAATGCTTTTCCGTTCCTTGC:1	AGTGTTTTCATATATGTTTAGC	TTAATGCTTTTCCGTTCCTTGC	-	chr3L	11744140	-	chr3L	11744032	108	+	chr3L	11744032	+	chr3L	11744140
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACACAACACAACACAACACACCACAAC:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACACCACAAC	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
TTTTGTTGTGCTTTTGTTTCTGGCTTTCGGTCCCATCCCGGCTGGCTCTGTTT:1	TTTTGTTGTGCTTTTGTTTCTG	CCCATCCCGGCTGGCTCTGTTT	-	chr2L	17191968	-	chr2L	17191905	63	+	chr2L	17191905	+	chr2L	17191968
TTTTAACGGTCTTTAGGCTCCCATTCAGTTCTCGAGGAATTCAGGAAATGGGTTTTCAGCTAGGGAAATTCGATA:1	TTTTAACGGTCTTTAGGCTCCC	TTTCAGCTAGGGAAATTCGATA	-	chr3R	26885813	-	chr3R	26885713	100	+	chr3R	26885713	+	chr3R	26885813
CTCTAAGCTCTGACTTTCACCCGGACTACGGCATAAATCATGGCTGGCATGCAGCTAATCTTCGTCCTGGCCAAG:1	CTCTAAGCTCTGACTTTCACCC	GCTAATCTTCGTCCTGGCCAAG	+	chr3L	5476182	+	chr3L	5476263	81	+	chr3L	5476182	+	chr3L	5476263
GTAAATGGAGTGGGCGAGGCATGATGAGGTGGGGGGAAAAAATAGGAAAATAGTCCGACAGCTAGATGACATCCG:1	GTAAATGGAGTGGGCGAGGCAT	TCCGACAGCTAGATGACATCCG	+	chr2L	8286326	+	chr2L	8286413	87	+	chr2L	8286326	+	chr2L	8286413
TTAGAACAAAAACTGGATTAATGCAAACAGAAACGTCGAAATTATGAGGATGCACGTAAGAGGATCGGATCCATG:1	TTAGAACAAAAACTGGATTAAT	ACGTAAGAGGATCGGATCCATG	+	chr3L	12012326	+	chr3L	12012405	79	+	chr3L	12012326	+	chr3L	12012405
ATTTAAAATCAATTAAATGCTATTTGTTGCTTTTAATAATTAAAGGTTATTGTGTAACAAGTTTTTGAGGTAAG:1	ATTTAAAATCAATTAAATGCTA	TGTAACAAGTTTTTGAGGTAAG	-	chr3R	15127872	-	chr3R	15127793	79	+	chr3R	15127793	+	chr3R	15127872
GCGATGTCCTCGTACGGTGGACATGACCAAGCCGCCGGTCTACAAGCCCAGTAAGGAATCNAAGAGTTGGC:1	GCGATGTCCTCGTACGGTGGAC	AGTAAGGAATCNAAGAGTTGGC	-	chrX	20426177	-	chrX	20428375	2198	+	chrX	20428375	+	chrX	20426177
TAACATTTTAGTTTAGCTTTAATTAGTTTCGATTTCGTTGTTTCAAATTGGCATTCGACATTAATTTAAAAA:1	TAACATTTTAGTTTAGCTTTAA	GCATTCGACATTAATTTAAAAA	+	chr3L	18638584	+	chr3L	18638675	91	+	chr3L	18638584	+	chr3L	18638675
GGAAAGGGAACGAGTGGCTCAAAACTTTCGAAAGTGGGTCTGGCCAATGGAAACTCCACTTTGGGTTT:1	GGAAAGGGAACGAGTGGCTCAA	ATGGAAACTCCACTTTGGGTTT	-	chr3R	6747553	-	chr3R	16776823	10029270	+	chr3R	16776823	+	chr3R	6747553
TGACCATAAGCTTTTGCTGAAATTTTCATGCTTCAACTTTCTTGCTGTTGCTTTCTT:1	TGACCATAAGCTTTTGCTGAAA	ACTTTCTTGCTGTTGCTTTCTT	-	chr3L	940904	-	chr3L	939801	1103	+	chr3L	939801	+	chr3L	940904
TAAAAATACATTTACATATATGTTAGAATAGCCAGTTGACNGCAAAAATGCAATACGTATGTACATAT:1	TAAAAATACATTTACATATATG	AATGCAATACGTATGTACATAT	+	chr2R	16334691	+	chr2R	17638590	1303899	+	chr2R	16334691	+	chr2R	17638590
TCTTTGACATTCCCACCAAGCACTGAAACTGGGCTTCTACTCCTCCAAGGACTTCGGACTCGA:1	TCTTTGACATTCCCACCAAGCA	CCTCCAAGGACTTCGGACTCGA	-	chr2R	20031095	-	chr2R	20031014	81	+	chr2R	20031014	+	chr2R	20031095
AATAATCTGCATACATTGAAAGTGGCAAGGAGNCGGCAATGAAAAGCAAATGCAAAAAAAAATATTNAACCTAA:1	AATAATCTGCATACATTGAAAG	CAAAAAAAAATATTNAACCTAA	-	chr2L	13441922	-	chr2L	9814092	3627830	+	chr2L	9814092	+	chr2L	13441922
TCAAAAACAGAAATGGTGACGAGGAAGTTCTTCTTTATAANGAAGCTTGTATGCTA:1	TCAAAAACAGAAATGGTGACGA	TTATAANGAAGCTTGTATGCTA	+	chr3R	22675203	+	chr3R	22675290	87	+	chr3R	22675203	+	chr3R	22675290
ACCCAAGCTGACTCGCCGATAAGGCGATGGGTTATAAAAACTATTCGCTACAGCTTGTCTGCACTTCACAGAGCG:1	ACCCAAGCTGACTCGCCGATAA	CTTGTCTGCACTTCACAGAGCG	+	chr2R	21910433	+	chr2R	21910525	92	+	chr2R	21910433	+	chr2R	21910525
CTTCTCCACAGATTTGAGTGGCAGAAGGATAAGGCCGAAACGAAACAGGAAGACCGACCGGCA:1	CTTCTCCACAGATTTGAGTGGC	GAAACAGGAAGACCGACCGGCA	+	chr3R	18766205	+	chr3R	12005522	6760683	+	chr3R	18766205	+	chr3R	12005522
CGGCTAGATTCTTTCCACCTTCATGGACCTCTGGCCTTTTTGTTTGTAAATACATTTTGTGGACAGGGAGAAATA:1	CGGCTAGATTCTTTCCACCTTC	ATTTTGTGGACAGGGAGAAATA	+	chr2L	12558325	+	chr2L	12565454	7129	+	chr2L	12558325	+	chr2L	12565454
GTGTTTTGCTTTGCTCGTTGCCTGAAACTTTTTGGCCCTAATGGAATTTACACGAGTTCTTAACACTTTCC:1	GTGTTTTGCTTTGCTCGTTGCC	ACACGAGTTCTTAACACTTTCC	+	chr3R	30084873	+	chr3R	30086336	1463	+	chr3R	30084873	+	chr3R	30086336
CAAGGTCCTGATTATTTAACTTTACAAAAAACCCTTCTTGGTTAAGTTGGTTGGCGAAGGTATAAGTCTG:1	CAAGGTCCTGATTATTTAACTT	GGTTGGCGAAGGTATAAGTCTG	+	chr2R	3144103	+	chr2R	3393376	249273	+	chr2R	3144103	+	chr2R	3393376
TGCAAAAATAGAATTAGAGCACATGGCTGCAAAGGCAGCTCATCGTTCGGTACAGAGTGTTGGAAAAGCAAACCG:1	TGCAAAAATAGAATTAGAGCAC	AGAGTGTTGGAAAAGCAAACCG	+	chr2R	16737160	+	chr2R	16737260	100	+	chr2R	16737160	+	chr2R	16737260
TCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCG:1	TCTGGATGCTTAGCCATCTCGT	CCATGTGTTCCACAAGCCGGCG	-	chr2R	12187479	-	chr2R	12190117	2638	+	chr2R	12190117	+	chr2R	12187479
CTATCTGCCACTCTTCACGGTTTTTCTGAAAGAAAAATAGAATGACTACTTTATTATAAACACTAACAGTGCAAA:1	CTATCTGCCACTCTTCACGGTT	TTATAAACACTAACAGTGCAAA	-	chr2R	22834252	-	chr2R	22836265	2013	+	chr2R	22836265	+	chr2R	22834252
AAAATGGCCGAACTTAGTCGAACAAGTCGGATATGTAGGAAACCCGAAACCCAATTATTTCTAATCAAGACTAA:1	AAAATGGCCGAACTTAGTCGAA	AATTATTTCTAATCAAGACTAA	-	chr2L	5633712	-	chr2L	5633627	85	+	chr2L	5633627	+	chr2L	5633712
TTAAAGAGGCCTTCGAGTTTCTTTTTAATATTTTAGTTCTTTTGTACATGTACAAATAAAGTATTAAAGACAATT:1	TTAAAGAGGCCTTCGAGTTTCT	AAATAAAGTATTAAAGACAATT	+	chr2L	16511966	+	chr2L	16519080	7114	+	chr2L	16511966	+	chr2L	16519080
CAGAACGCAGCATACCGCTTTGTCTGATTCTGATTCGACTTATCAGTACGCGGTCCACAGCTTAAATTAAATCCA:1	CAGAACGCAGCATACCGCTTTG	TCCACAGCTTAAATTAAATCCA	-	chr3L	22909137	-	chr3L	22909046	91	+	chr3L	22909046	+	chr3L	22909137
ATGCAACCGCACAACCCAATAGTCCACAAAGTGGATAATACGAATATGTGGATATTTTTGGTCACGTTTGAATTT:1	ATGCAACCGCACAACCCAATAG	ATTTTTGGTCACGTTTGAATTT	-	chr3L	5030848	-	chr3L	5030772	76	+	chr3L	5030772	+	chr3L	5030848
CATCAGAAATAGGTCTTTGAACTGCTTTTAAAAACCTTTGGTTTCTGACTTTTTCGAACATCATCCTTAAAGCAA:1	CATCAGAAATAGGTCTTTGAAC	TCGAACATCATCCTTAAAGCAA	-	chr2L	15355811	-	chr2L	15355733	78	+	chr2L	15355733	+	chr2L	15355811
CACAATAAAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACA:1	CACAATAAAATACAATACAATA	CAATACAATACAATACAATACA	-	chr3L	4341331	-	chr3L	21448027	17106696	+	chr3L	21448027	+	chr3L	4341331
GAAAAGCATAAGGACGCGATTTTTTCGTGGAAGAGCAACAAAATGTGTTCCTTTTTTTTCTTCTTTTCGTGCAAT:1	GAAAAGCATAAGGACGCGATTT	TTTTTTCTTCTTTTCGTGCAAT	+	chr2R	8518779	+	chr2R	12066248	3547469	+	chr2R	8518779	+	chr2R	12066248
TAAGATTTTCTCGAACTGCAGACCACATACCTATGGATGTGGGCATTCTTCTGTTCATTCGGTCCATTCTGCATT:1	TAAGATTTTCTCGAACTGCAGA	TTCATTCGGTCCATTCTGCATT	-	chr3R	12314359	-	chr3R	12314245	114	+	chr3R	12314245	+	chr3R	12314359
GACGACGTCAACGAAGCGACGAAACTTTTTTCGAGCAGAACAACTTCATTTTGGGTATCTCCGAGATGCAAACTA:1	GACGACGTCAACGAAGCGACGA	GGTATCTCCGAGATGCAAACTA	-	chr3R	21965991	-	chr3R	7972583	13993408	+	chr3R	7972583	+	chr3R	21965991
TGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT:1	TGTCCTGTCCTGTCCTGTCCTG	CTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTT	+	chr2L	19024097	+	chr2L	21768291	2744194	+	chr2L	19024097	+	chr2L	21768291
AACTGCCATATGCCAGAGCTTCTTATCTAGATATGCATATGTATATATATACTACATAATAGTCATACCCATGG:1	AACTGCCATATGCCAGAGCTTC	TACATAATAGTCATACCCATGG	+	chr3L	7377325	+	chr3L	7380429	3104	+	chr3L	7377325	+	chr3L	7380429
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACAACACAACACGAGACG:1	CACAACACAACACAACACAACA	CAACACAACACAACACGAGACG	+	chr3R	21907535	+	chr3R	9620955	12286580	+	chr3R	21907535	+	chr3R	9620955
AGAAGGATTAGGAGAGAGTACCGCGAGCCTCCGAACGCTGCAAGAAANGTGCATTATTGGCATTGGCNAGACAGG:1	AGAAGGATTAGGAGAGAGTACC	TTATTGGCATTGGCNAGACAGG	-	chr3L	21905427	-	chr3L	21905347	80	+	chr3L	21905347	+	chr3L	21905427
TAACATTCTAACATTTATTAAATAATAACTAATAGTTGGGCTAAAACTGTGGTTTTGGTACTCCGAATTCTTTCT:1	TAACATTCTAACATTTATTAAA	TTTGGTACTCCGAATTCTTTCT	-	chr2L	9264474	-	chr2L	9264374	100	+	chr2L	9264374	+	chr2L	9264474
GTACCGCGTTTGCCGAACTCCAGATTACTTCGCTGTNCGTTGAGTTTATTTAATTCACCTTAAACTTCTGTATCA:1	GTACCGCGTTTGCCGAACTCCA	TTCACCTTAAACTTCTGTATCA	-	chr3L	14245091	-	chr3L	19687780	5442689	+	chr3L	19687780	+	chr3L	14245091
GAAACGCANCGATAATACAAATTACGAATATTCAANGAAGAAGATTTAAACCACACCAAGTTGAACCTTAGAAGT:1	GAAACGCANCGATAATACAAAT	CACCAAGTTGAACCTTAGAAGT	-	chr3L	13666644	-	chr3L	5401263	8265381	+	chr3L	5401263	+	chr3L	13666644
ATTTCCCTAGCTGAAAACCCATTTCCTGAATTCCTCGAGAACTGAATGGGAGCCTAAAGACCGTTAAAATAGTTG:1	ATTTCCCTAGCTGAAAACCCAT	CTAAAGACCGTTAAAATAGTTG	+	chr3R	26885719	+	chr3R	26885819	100	+	chr3R	26885719	+	chr3R	26885819
AATATACTGCTGGAACTAAAATACTTTTCTTTTAAAGTTAAGAAACTAGTTTGAAGTAGTGGGTGACTACTAGTC:1	AATATACTGCTGGAACTAAAAT	AAGTAGTGGGTGACTACTAGTC	-	chr3R	17498076	-	chr3R	17497990	86	+	chr3R	17497990	+	chr3R	17498076
TAAGTGACCTTTTACTATATGGGACATGTGTGCTGATACAATTTNAGCTGCTTTTTAAATTAATATATATATT:1	TAAGTGACCTTTTACTATATGG	TTTTTAAATTAATATATATATT	+	chr3L	7791321	+	chr3L	21797449	14006128	+	chr3L	7791321	+	chr3L	21797449
CACTGGCCTTTCTCATTGCAGCACATATGAGTCACCCGGCGGCTCGGTCACCGTGAAACCGAACTAATTTGACAG:1	CACTGGCCTTTCTCATTGCAGC	TGAAACCGAACTAATTTGACAG	-	chr3R	4885484	-	chr3R	4885393	91	+	chr3R	4885393	+	chr3R	4885484
ATAATAGATCTCCAAAATAAAATGATCTTTTCCAAAAATATATAACTCCAAGCTAAAGGAATTCTTATAAA:1	ATAATAGATCTCCAAAATAAAA	AAGCTAAAGGAATTCTTATAAA	+	chr2L	20674837	+	chr2L	20674918	81	+	chr2L	20674837	+	chr2L	20674918
ACAGGTGTGGGCAGGTGGCCAGAGGAGTGGGGATCGGGATGAGGACGATCGGTGGGACCGCTGAGTT:1	ACAGGTGTGGGCAGGTGGCCAG	CGATCGGTGGGACCGCTGAGTT	+	chr2L	950882	+	chr2L	15284403	14333521	+	chr2L	950882	+	chr2L	15284403
TCCTCTTCTCTCGCAACTCAACACTCGTAAGACAACAGGCAACTGACAAAAAATGAATAATGATTAAGGTTAA:1	TCCTCTTCTCTCGCAACTCAAC	AATGAATAATGATTAAGGTTAA	-	chr2L	19357248	-	chr2L	19345041	12207	+	chr2L	19345041	+	chr2L	19357248
AAGCAATGCGGTCAAAGGTAGCAAAACCACAAAACTGTGTCCCAGAAGAAGAACCTTTTCAAGTGACCCAGTGCA:1	AAGCAATGCGGTCAAAGGTAGC	CCTTTTCAAGTGACCCAGTGCA	-	chr2L	15031813	-	chr2L	15031573	240	+	chr2L	15031573	+	chr2L	15031813
TAAATGAGGAATGGCTTAGCTTCGACTGTGTGTGTGTGTGTAGGAATTTCCACGAGTGTGTGTGTGTGTG:1	TAAATGAGGAATGGCTTAGCTT	TCCACGAGTGTGTGTGTGTGTG	+	chr3L	9322655	+	chr3L	17209820	7887165	+	chr3L	9322655	+	chr3L	17209820
ATGTTTTAGCTAATGAATTCAATTATGTAATAGCGATTTATTTACTGAAAGGCTGAAGAAAATGATAGGAAAAG:1	ATGTTTTAGCTAATGAATTCAA	CTGAAGAAAATGATAGGAAAAG	+	chr2L	17723794	+	chr2L	17723886	92	+	chr2L	17723794	+	chr2L	17723886
TATATATATATATATGTGAATATATATATGGTCGATTCTCGGTGGATCTCCGTTCTGCTC:1	TATATATATATATATGTGAATA	TCGGTGGATCTCCGTTCTGCTC	+	chr3L	10814548	+	chr3L	4236112	6578436	+	chr3L	10814548	+	chr3L	4236112
GAAAAATCAACAACAACAACAGCAGCGGACGGGCAACAACAAAAGCCAAAAGGGGCAAAGGAAAATCAAAGGCAA:1	GAAAAATCAACAACAACAACAG	GGCAAAGGAAAATCAAAGGCAA	-	chrX	14214883	-	chrX	8940133	5274750	+	chrX	8940133	+	chrX	14214883
CACAAACACAAACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1	CACAAACACAAACACAAACACA	CAACACAACACAACACAACACA	-	chr2L	16071771	-	chr2L	16217660	145889	+	chr2L	16217660	+	chr2L	16071771
GGTCAGCTTAAAGCACCTCAAATTCACATTTCTTTCTGACGTCGGCTTTTTGTGGGT:1	GGTCAGCTTAAAGCACCTCAAA	CTGACGTCGGCTTTTTGTGGGT	-	chr3R	19140714	-	chr3R	19140284	430	+	chr3R	19140284	+	chr3R	19140714
ACAACAGCAGCAGCAGCAGCAAATGAATGCTGAGCCGAATGCAAANAGAGTTCGATTGTCCNGAGCTGG:1	ACAACAGCAGCAGCAGCAGCAA	GAGTTCGATTGTCCNGAGCTGG	-	chr3L	18058272	-	chr3L	9837297	8220975	+	chr3L	9837297	+	chr3L	18058272
AATATGTATGCACTTAGAGGAAGTTCACGATTATATTATGCATGAATTNTACACTCTACATATTTATGTTCATTT:1	AATATGTATGCACTTAGAGGAA	CTCTACATATTTATGTTCATTT	-	chr3L	3935913	-	chr3L	3935835	78	+	chr3L	3935835	+	chr3L	3935913
AAAATAAATAAAATTATCCCTTCAATTGCATCATTTACCGAATAAACATTGGCATTATTTATATTTGTGGAA:1	AAAATAAATAAAATTATCCCTT	GGCATTATTTATATTTGTGGAA	+	chr3R	28552788	+	chr3R	28553138	350	+	chr3R	28552788	+	chr3R	28553138
AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATCTTGCGTTCCACNTATGATAGATGTTAAATATNTTTTTGA:1	AGTGTGTAAACAGTTTCTTGAC	TAGATGTTAAATATNTTTTTGA	-	chr3L	23730762	-	chr3L	9419529	14311233	+	chr3L	9419529	+	chr3L	23730762
ATACGATTTATTGCTTCTAATGTTAATGATGTTTGAATGTTTGCCATACAGACTAAAAAAATCAAGACCCGTA:1	ATACGATTTATTGCTTCTAATG	ACTAAAAAAATCAAGACCCGTA	-	chr3L	9390985	-	chr3L	9390857	128	+	chr3L	9390857	+	chr3L	9390985
GAACCTTTTAGGTACGGCGTAAGAGTTTTCGCGTACAAATCACATTTATTATGAGACAACGTCAAGAATAAACAC:1	GAACCTTTTAGGTACGGCGTAA	AGACAACGTCAAGAATAAACAC	+	chrX	780598	+	chrX	780674	76	+	chrX	780598	+	chrX	780674
GTTGGAATTTATGTACATTAGGAGGCCTAGGCGAGCTAGCAAGCTGGAAGCGAGGAAAATGGAGG:1	GTTGGAATTTATGTACATTAGG	CTGGAAGCGAGGAAAATGGAGG	-	chr2R	11028633	-	chr2R	9558146	1470487	+	chr2R	9558146	+	chr2R	11028633
TGTTATTATTTTTCCGGCAGCGTTTTTGTTTCTGCATCTGTCTGTAGTTGTGGAGTT:1	TGTTATTATTTTTCCGGCAGCG	ATCTGTCTGTAGTTGTGGAGTT	+	chr3L	13707853	+	chr3L	13707911	58	+	chr3L	13707853	+	chr3L	13707911
CCTTAACTTGATTTTTGCTTATTAGCCCTGNNNTNGAACATTTTAGCAACTCAGTAAATAATTGTTTTTTTTTTT:1	CCTTAACTTGATTTTTGCTTAT	GTAAATAATTGTTTTTTTTTTT	+	chrX	2798022	+	chrX	10029242	7231220	+	chrX	2798022	+	chrX	10029242
ATTGTTTTNTTATATTATTTAATATTAAAAAGTTAAGGAGAAACGACTTATCCGCTTTTTCACAACTCATTTCAT:1	ATTGTTTTNTTATATTATTTAA	GCTTTTTCACAACTCATTTCAT	-	chr3L	19488579	-	chr3L	19488497	82	+	chr3L	19488497	+	chr3L	19488579
TTGTTGCCAATGTTGAAGGCTTAAGCCTAANNNTNCACTGGGACCACCGAAATAAGAGGGCGACAGTACTTTCA:1	TTGTTGCCAATGTTGAAGGCTT	TAAGAGGGCGACAGTACTTTCA	+	chr3R	31881297	+	chr3R	31881380	83	+	chr3R	31881297	+	chr3R	31881380
GTGGAGTGTCGAGTGGAGGAAAAGTTGCCACTGCATCCTCATCCTCATGACGAGCTTATCTTGGACACGTACTGG:1	GTGGAGTGTCGAGTGGAGGAAA	GCTTATCTTGGACACGTACTGG	+	chr3L	5826151	+	chr3L	5826235	84	+	chr3L	5826151	+	chr3L	5826235
ATAATTGCAAATAGCTGAGAAATTTATAGCTATAAAATTAAAGCATTCACAATAAGTAGGAGTATTTTATTCTGA:1	ATAATTGCAAATAGCTGAGAAA	AAGTAGGAGTATTTTATTCTGA	+	chrX	20710439	+	chrX	20710516	77	+	chrX	20710439	+	chrX	20710516
ATCAGAGAGCGAAGACAAACAGGATGATGGAGAAACCACACACAGAAACCATTTGCTGATTGCCATTAACGAGCT:1	ATCAGAGAGCGAAGACAAACAG	TGCTGATTGCCATTAACGAGCT	-	chr3R	24065642	-	chr3R	17436960	6628682	+	chr3R	17436960	+	chr3R	24065642
AGCGAGAGCAGCAGCAGAATNTTATCCAGCAGNTTGTGGTGCNACAGTCTGGAGCGACTTCTCAACAG:1	AGCGAGAGCAGCAGCAGAATNT	GTCTGGAGCGACTTCTCAACAG	-	chrX	2118937	-	chrX	2128804	9867	+	chrX	2128804	+	chrX	2118937
GTGTTTGTGGGTTGAGTTGGGTATGCCATGCTAGCCAGAAAACTGAACTGAAACGACAAGACTGTTGCGCGCAG:1	GTGTTTGTGGGTTGAGTTGGGT	ACGACAAGACTGTTGCGCGCAG	-	chr3L	9907971	-	chr3L	9907895	76	+	chr3L	9907895	+	chr3L	9907971
CCACTCCCGTTGCCATTATTTGCTTTACTTAGCAAAAGTGTGTTTTTCTGATTAAATTTAAATTGGTTTTTATT:1	CCACTCCCGTTGCCATTATTTG	TAAATTTAAATTGGTTTTTATT	-	chr3L	17997174	-	chr3L	19902047	1904873	+	chr3L	19902047	+	chr3L	17997174
CTCCTCCCAGGGGGACGAGGACGATGATCTGGAGGACTCGTCGAGCAGCAAC:1	CTCCTCCCAGGGGGACGAGGAC	GGAGGACTCGTCGAGCAGCAAC	+	chr3R	22132946	+	chr3R	19594564	2538382	+	chr3R	22132946	+	chr3R	19594564
ATGCCAGACGAAAGAGTTGCAAGCACACACATGTGCGGGCATAAAAGAAAAGCAGAAACTTAAGACGTCTGGGTG:1	ATGCCAGACGAAAGAGTTGCAA	AGAAACTTAAGACGTCTGGGTG	+	chr3R	27140530	+	chr3R	27148140	7610	+	chr3R	27140530	+	chr3R	27148140
CAATACAATACAATACAATACAAAACAATACAATACAACATAAAAGAGAATAAATAAGANGAGGAAA:1	CAATACAATACAATACAATACA	GAGAATAAATAAGANGAGGAAA	-	chr3L	21448027	-	chr3L	5551553	15896474	+	chr3L	5551553	+	chr3L	21448027
GTTCAATGACCAACTAGCTTTTTGTGTCGTCATCCTTACTCCCACCCACCCTGTGAATGTGGGAAT:1	GTTCAATGACCAACTAGCTTTT	CCCACCCTGTGAATGTGGGAAT	-	chrX	2146759	-	chrX	2146675	84	+	chrX	2146675	+	chrX	2146759
AATAATGTAATGTACATCATAGTCTAAGTTAATAGTTGTTTCTCAAATTTACTTTTTTCTTATTTTAGAAATCA:1	AATAATGTAATGTACATCATAG	TTTTTTCTTATTTTAGAAATCA	+	chr3L	27085027	+	chr3L	9723278	17361749	+	chr3L	27085027	+	chr3L	9723278
CTAACACATGTGAATAATATGTGTGCGGTCCGTTAGTTTTTCCCTTTGTCGG:1	CTAACACATGTGAATAATATGT	CGTTAGTTTTTCCCTTTGTCGG	+	chr2R	10854676	+	chr2R	14211551	3356875	+	chr2R	10854676	+	chr2R	14211551
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAAAGCATGGCCCAAACCGACCTTCTGCCCGAACATCAAACACATCT:1	ACACAACACAACACAACACAAC	TGCCCGAACATCAAACACATCT	+	chr3R	21907534	+	chr3R	18967436	2940098	+	chr3R	21907534	+	chr3R	18967436
GCTTGTGTTTGTGCTTGTGTTTGTGCTTGTGCTTGTGCTTGTG:1	GCTTGTGTTTGTGCTTGTGTTT	TGTGCTTGTGCTTGTGCTTGTG	-	chrX	4805477	-	chrX	1562991	3242486	+	chrX	1562991	+	chrX	4805477
AATCNATATCACCAACAAACGANAACANGACCGATTATANCAAGCACATTTTGCTAATTTGCTTAAGAATCTCCT:1	AATCNATATCACCAACAAACGA	CTAATTTGCTTAAGAATCTCCT	-	chrX	21084138	-	chrX	7678217	13405921	+	chrX	7678217	+	chrX	21084138
TTTGGTAAAGGTTTTTTCTGGAACAATTCTTTTTTTCATACGTTTATGTTCTGTTTGTTTTGTTCACTGCATGCA:1	TTTGGTAAAGGTTTTTTCTGGA	TTTGTTTTGTTCACTGCATGCA	+	chr3L	8310476	+	chr3L	1177072	7133404	+	chr3L	8310476	+	chr3L	1177072
GTTAATTCTTTGATATAAAAACCAATATTTATTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGCCTT:1	GTTAATTCTTTGATATAAAAAC	GTTTAGCCCACAGTGGAGCCTT	+	chr3L	16971219	+	chr3L	16971297	78	+	chr3L	16971219	+	chr3L	16971297
AATAAAGCTAATTCCACATTCAACATAATCAGCGCAGTTTATTCAACTAACTTTATTTATTGTCATTATGCATAT:1	AATAAAGCTAATTCCACATTCA	TATTTATTGTCATTATGCATAT	+	chr3R	25194592	+	chr3R	25194670	78	+	chr3R	25194592	+	chr3R	25194670
GAAGCCACACCTGACGGAAGAAGAGGGAGCAGACACGGA:1	GAAGCCACACCTGACGGAAGAA	AAGAAGAGGGAGCAGACACGGA	-	chr2R	9606568	-	chr2R	13393005	3786437	+	chr2R	13393005	+	chr2R	9606568
GAATAGAATGGGAAGGAGGGTAAACAAAAAGCTCTACAGTCATTAGCACTGTAAACAAGTAAAAAAAATGTCGAA:1	GAATAGAATGGGAAGGAGGGTA	AACAAGTAAAAAAAATGTCGAA	+	chr2L	9393500	+	chr2L	9396467	2967	+	chr2L	9393500	+	chr2L	9396467
TCCTAAGTGCAAATAATTGGTATAAACAATGTGTCTGAATATAAATGTTGCCTATATTATTGGTCAGCAAAATAT:1	TCCTAAGTGCAAATAATTGGTA	ATATTATTGGTCAGCAAAATAT	-	chrX	23003572	-	chrX	22996338	7234	+	chrX	22996338	+	chrX	23003572
TCGACCCAATAACAATGCCAGGCACCAGGCACCAATCGACCATCGACCATCCATATTCCAGTCTCATTGTAAAC:1	TCGACCCAATAACAATGCCAGG	ATATTCCAGTCTCATTGTAAAC	+	chr2L	9202075	+	chr2L	9202150	75	+	chr2L	9202075	+	chr2L	9202150
TATCTGTATCTGTATTTGTATCGGGTTCTTCCCTGTGGATGGCCATTGTCCCAATAAATCACTTTGCTNACTTTT:1	TATCTGTATCTGTATTTGTATC	ATAAATCACTTTGCTNACTTTT	+	chr2R	9941242	+	chr2R	7071621	2869621	+	chr2R	9941242	+	chr2R	7071621
CACAAAACATCTTGCTGTGTTTCAGCTCACAAGTGCTGACAACGGTCNGGAGTCTGTTAAAAATGTANTATCATT:1	CACAAAACATCTTGCTGTGTTT	CTGTTAAAAATGTANTATCATT	+	chr3R	20870283	+	chr3R	20870368	85	+	chr3R	20870283	+	chr3R	20870368
CCATTCTGTTGGCCATTTACCATTTACTAAAAAGAAGGCCATTGATGATGCTGGGTCACCCTTCTATTAGACG:1	CCATTCTGTTGGCCATTTACCA	TGGGTCACCCTTCTATTAGACG	-	chrX	6814378	-	chrX	6814302	76	+	chrX	6814302	+	chrX	6814378
TTGGAGAGTTCACTGAAAACCATCCAGAATGGAATGGAAGCCAGTTAGGGGATTACTTTCGGGATTCGTAACT:1	TTGGAGAGTTCACTGAAAACCA	ATTACTTTCGGGATTCGTAACT	-	chrX	20499242	-	chrX	20499161	81	+	chrX	20499161	+	chrX	20499242
TTTTTGCGATTTTGAGCTGTGCGCGTGCCNCATTCAACGTGATGCTGAATTGAACATTTATTGAACAATTTCCAG:1	TTTTTGCGATTTTGAGCTGTGC	ACATTTATTGAACAATTTCCAG	+	chrX	6335241	+	chrX	6337751	2510	+	chrX	6335241	+	chrX	6337751
ATGAACCTATAGATTCTTGTAGCTGCCGTATGTCTGCCCCTCGCTGTCCAAGATCCTTTGCCGA:1	ATGAACCTATAGATTCTTGTAG	GCTGTCCAAGATCCTTTGCCGA	-	chrX	16539671	-	chrX	16539606	65	+	chrX	16539606	+	chrX	16539671
CACACAAATTCGAGCTAAAATAAGAAAAACCAGCAAATGAATGCGGCCGAAGGGAGCATTCACACAAGTGGGGAG:1	CACACAAATTCGAGCTAAAATA	GAGCATTCACACAAGTGGGGAG	-	chr3R	19523610	-	chr3R	10898205	8625405	+	chr3R	10898205	+	chr3R	19523610
ACATTAACTTATAGACAGCTACTACAAAATAAAAAGATTTGTTTATATTTGCTTCGCAGACAAAAANATCAACTA:1	ACATTAACTTATAGACAGCTAC	TCGCAGACAAAAANATCAACTA	+	chr2L	13215412	+	chr2L	13215687	275	+	chr2L	13215412	+	chr2L	13215687
TGCGTTATTTCACTGAAAATGTGTATTTAATTTAAAACAAACAANCAAGCATATAAAATGAATATAATTA:1	TGCGTTATTTCACTGAAAATGT	GCATATAAAATGAATATAATTA	-	chr3L	706023	-	chr3L	705932	91	+	chr3L	705932	+	chr3L	706023
ATCTGCTGTTCTCCCACGTTTAGGCGGGTGTGGAATGCGGTAGCGGAAAAGGACAGGCTCAGAGGATGAGAAAG:1	ATCTGCTGTTCTCCCACGTTTA	ACAGGCTCAGAGGATGAGAAAG	-	chr2R	21594287	-	chr2R	21593578	709	+	chr2R	21593578	+	chr2R	21594287
AATGAGCATTGTAAGCAATACTATAGTTTTGAGTTGATTAAGTTCTGGAAGTTGGTTTTTTAGAACTGTAACNAA:1	AATGAGCATTGTAAGCAATACT	GGTTTTTTAGAACTGTAACNAA	+	chr3R	29079395	+	chr3R	29080767	1372	+	chr3R	29079395	+	chr3R	29080767
TCCTGTATNTGTCAGCTTAAAGGCGTGAAGCACAANAAAAAACTCGTAAACTTTTTGGTCATATTTTCATATGCA:1	TCCTGTATNTGTCAGCTTAAAG	TTTGGTCATATTTTCATATGCA	+	chr3L	14141756	+	chr3L	14141846	90	+	chr3L	14141756	+	chr3L	14141846
ATGAAATAATGGAAATAGATAAAGTAACTTTCGATTTACATACCTCTATCTATCTATCTATGTTTTTGTTTTCAG:1	ATGAAATAATGGAAATAGATAA	CTATCTATGTTTTTGTTTTCAG	+	chrX	10154287	+	chrX	10154363	76	+	chrX	10154287	+	chrX	10154363
ACCTGTTCCCGCCATCCATTCCGCACCTCCTAATCCCTTGGATTTGATTTGTAANCGAAAAATAAGCCACACAA:1	ACCTGTTCCCGCCATCCATTCC	AANCGAAAAATAAGCCACACAA	+	chr3R	6994236	+	chr3R	26733036	19738800	+	chr3R	6994236	+	chr3R	26733036
TGCGCAGAACCTATCCAAATATCTATACGATGCCCTGGGTGGCTNTCTGCGCTACTATCTGGTGCCCATGG:1	TGCGCAGAACCTATCCAAATAT	CGCTACTATCTGGTGCCCATGG	+	chr3R	27240649	+	chr3R	27234327	6322	+	chr3R	27240649	+	chr3R	27234327
GTCGCAGACGTATTCAAGGTCAACCGAAAACGTAGAAACAAAGACATGAAGACCTCCACTGTAAATAACAATAGG:1	GTCGCAGACGTATTCAAGGTCA	CTCCACTGTAAATAACAATAGG	-	chr3R	25907290	-	chr3R	23921129	1986161	+	chr3R	23921129	+	chr3R	25907290
GGATTGGACCTTTTGTTGAAGGGAGAGACAAGAGCTCCAGGCAACCAAACTCCGAT:1	GGATTGGACCTTTTGTTGAAGG	CTCCAGGCAACCAAACTCCGAT	+	chr3L	7332490	+	chr3L	7332548	58	+	chr3L	7332490	+	chr3L	7332548
TGTCTAATCTACTTAGTTTTAGTTGTGCCATTGTTTCNATTGCTTNTTGCTAAGTCATCTATCAAATGNTATG:1	TGTCTAATCTACTTAGTTTTAG	AAGTCATCTATCAAATGNTATG	+	chr2L	12305412	+	chr2L	12305498	86	+	chr2L	12305412	+	chr2L	12305498
GTCGGGTTTCTTTAAATGCTGTTCGAGACGCTCCCCAGGATATCCACACATAATTGAATATCCCCTCACATGCAT:1	GTCGGGTTTCTTTAAATGCTGT	TTGAATATCCCCTCACATGCAT	+	chrX	10036692	+	chrX	12618511	2581819	+	chrX	10036692	+	chrX	12618511
CTCAGATCCCCCATCCAGACGTTGCAGCCTNNNTNCCCGTTCCCGTTCCCGTTCCCGTGC:1	CTCAGATCCCCCATCCAGACGT	GTTCCCGTTCCCGTTCCCGTGC	-	chr3L	2034365	-	chr3L	16171992	14137627	+	chr3L	16171992	+	chr3L	2034365
ATAAATTACTATTTCCATTTGATGAGTCCCAATGTTTCATTCCATAAGCTATAAGCTTTAATTTAGATGCTTTCA:1	ATAAATTACTATTTCCATTTGA	AGCTTTAATTTAGATGCTTTCA	+	chr3R	30538087	+	chr3R	14206999	16331088	+	chr3R	30538087	+	chr3R	14206999
ACACACAGAGGCATGAAGCATAGGGTAGCGTTCTCACACACACACACACACACAGA:1	ACACACAGAGGCATGAAGCATA	CACACACACACACACACACAGA	+	chrX	16525773	+	chrX	7978951	8546822	+	chrX	16525773	+	chrX	7978951
GACAAGAATGGGAAGCACGGAAAGGGGTTGGGGGGGGGGTTGGCCAGGTAATTTCCATTTAAAGTG:1	GACAAGAATGGGAAGCACGGAA	CAGGTAATTTCCATTTAAAGTG	-	chr2R	23467703	-	chr2R	23467583	120	+	chr2R	23467583	+	chr2R	23467703
TCTATATCCCTTGCCAATGCCACGCGAACTTTTTCCAGCTGATGTAAGNCCACACTCATCAGCGTATCCTTTCA:1	TCTATATCCCTTGCCAATGCCA	CACTCATCAGCGTATCCTTTCA	-	chr3L	27268298	-	chr3L	6723728	20544570	+	chr3L	6723728	+	chr3L	27268298
GTCGACAGCTGTTTTCGAGGTCCTGTCGAAAAACGAGACCTGAGACATATTTTCAGAGCTACATGTTTCATAT:1	GTCGACAGCTGTTTTCGAGGTC	TTCAGAGCTACATGTTTCATAT	-	chr3R	31643068	-	chr3R	31642825	243	+	chr3R	31642825	+	chr3R	31643068
GAAAACAATAACAAGCCCAACTACAAGATAGCGAATTGGCGGCCAGCAAAGATAATAGAGCAC:1	GAAAACAATAACAAGCCCAACT	GCCAGCAAAGATAATAGAGCAC	+	chr2R	20296562	+	chr2R	13683582	6612980	+	chr2R	20296562	+	chr2R	13683582
ATGGCAGACTGTTTCACACCTACACACGTGTGCGTTTATGACATTGATAGCTGAAGCCGAAACCCAAGGATTAAT:1	ATGGCAGACTGTTTCACACCTA	AAGCCGAAACCCAAGGATTAAT	-	chr3R	31026598	-	chr3R	31026517	81	+	chr3R	31026517	+	chr3R	31026598
TTGCCAGCAAGGCGAAAACGCGGTGGCTGCTTAAATTGTTTAATATCGCTCACAAGTTGCGGCAGAAAGAGG:1	TTGCCAGCAAGGCGAAAACGCG	CACAAGTTGCGGCAGAAAGAGG	-	chr2R	15276882	-	chr2R	15276798	84	+	chr2R	15276798	+	chr2R	15276882
GTCGAATTCGGAAACCAGAGAAAAGGCTCATGTGTTGTACTTTTGATCAAATTTATTTGTAAANTCTAAACCT:1	GTCGAATTCGGAAACCAGAGAA	TTTATTTGTAAANTCTAAACCT	-	chr3R	24906811	-	chr3R	24906734	77	+	chr3R	24906734	+	chr3R	24906811
CCCCGTGTNACCCATTTAATCGGCTATTTACTTGTGTNNNNTGTGTCTCTTCCCAGCAAAANAGGAAGTAAGT:1	CCCCGTGTNACCCATTTAATCG	CCCAGCAAAANAGGAAGTAAGT	-	chrX	12819213	-	chrX	1618511	11200702	+	chrX	1618511	+	chrX	12819213
AACGACATAATGTGGGTTGGGCCACGAGTTCAAAAAGATATTTTAAAAAATTAAAACATATAAATT:1	AACGACATAATGTGGGTTGGGC	AAAAAATTAAAACATATAAATT	+	chr3R	19445299	+	chr3R	19445474	175	+	chr3R	19445299	+	chr3R	19445474
GCGCGGAGGCGGGCGCAGTCAAAGGGTTAAGGGGGCGTGGCAATGTCTGGG:1	GCGCGGAGGCGGGCGCAGTCAA	AGGGGGCGTGGCAATGTCTGGG	+	chrX	17556971	+	chrX	17557446	475	+	chrX	17556971	+	chrX	17557446
ATAAGCAGCTTAATCCGATGATTTGATGGATCNTCAAATGAATATTACGGGTCAGATAGTGTGTGGNATAGT:1	ATAAGCAGCTTAATCCGATGAT	GTCAGATAGTGTGTGGNATAGT	+	chrX	2578822	+	chrX	2578911	89	+	chrX	2578822	+	chrX	2578911
AGGTGTGCGCACGAGAATAGTCATCGCAATGGTGGCTCACAAGTGAAGCNTAATCCGGCACTGAACAGATTTGTC:1	AGGTGTGCGCACGAGAATAGTC	TCCGGCACTGAACAGATTTGTC	-	chrX	15417354	-	chrX	15413052	4302	+	chrX	15413052	+	chrX	15417354
CGCCTTTGGATTTTAATTAGTAAAACAAGATTCAGGTTTTTATTCATATCGGGTAAGTGTTTTGTTTTCATAT:1	CGCCTTTGGATTTTAATTAGTA	GGTAAGTGTTTTGTTTTCATAT	+	chr2R	7868627	+	chr2R	7868706	79	+	chr2R	7868627	+	chr2R	7868706
TTTAATTGCCGGCCTAGAGCCTCGATGTCAAAATAAATAGATGAAAATCCCGCTTCATCTCTCACTATTTTTA:1	TTTAATTGCCGGCCTAGAGCCT	GCTTCATCTCTCACTATTTTTA	+	chr2R	22511918	+	chr2R	22512003	85	+	chr2R	22511918	+	chr2R	22512003
AATTTGACATTATCTATGCAGCGTGGACACACAAAGGAAGATAGCGAGATTGGACAGGGATTCCTCAGGTAAGT:1	AATTTGACATTATCTATGCAGC	GACAGGGATTCCTCAGGTAAGT	+	chrX	17282883	+	chrX	17282960	77	+	chrX	17282883	+	chrX	17282960
CCAATATGTCGGAGGAATAAGTCAGTCCTCCCACTGAACACTGCCACATACTTTCCTTTCCGTTGATCAATGTG:1	CCAATATGTCGGAGGAATAAGT	TTCCTTTCCGTTGATCAATGTG	+	chr3R	5399866	+	chr3R	5399946	80	+	chr3R	5399866	+	chr3R	5399946
GCAGCACAGACGCCGCGCAGTAAAAAAAAAAAGTGCATGCAATGCACTGGGTTTCTAAGCTGCTTAGAGGGATTC:1	GCAGCACAGACGCCGCGCAGTA	TCTAAGCTGCTTAGAGGGATTC	+	chr3L	10654146	+	chr3L	10654233	87	+	chr3L	10654146	+	chr3L	10654233
CTGGAGGTGCTGGAGTCCAGGTGCAATGCCTTCTCGACGGCGTTGTTGAGATCGTTCATCATGGTAGCGATGAG:1	CTGGAGGTGCTGGAGTCCAGGT	CGTTCATCATGGTAGCGATGAG	+	chr3R	30627624	+	chr3R	30627703	79	+	chr3R	30627624	+	chr3R	30627703
GATTTACTCAAATCGCATAAAAATTATAAAATATTTAACAGCGAGCAATAATCTACCAAACAGAGGAATTCAGAC:1	GATTTACTCAAATCGCATAAAA	TACCAAACAGAGGAATTCAGAC	-	chr3L	5251940	-	chr3L	5251861	79	+	chr3L	5251861	+	chr3L	5251940
CAAGGACACAAAACAAACTGTTGCTGGTGGCCCAAACGCACTGGCCAACTTAGCGACTGAGAGTAAAAAGCGANA:1	CAAGGACACAAAACAAACTGTT	CGACTGAGAGTAAAAAGCGANA	+	chr3L	8285461	+	chr3L	8285568	107	+	chr3L	8285461	+	chr3L	8285568
CAGAGTGTGAGTGTGATTGTGTGTGTGCCAAACAGAGACAGCACCATCGGCCAACTTTTTTAACTTCACAATAAA:1	CAGAGTGTGAGTGTGATTGTGT	ACTTTTTTAACTTCACAATAAA	-	chrX	12666329	-	chrX	16872845	4206516	+	chrX	16872845	+	chrX	12666329
GCTGTATACGAGTCAAGCCCTCAACGTGACCACCGCACATGGCGAAGAGTACGCCCCAAACAGATCTTAAACTA:1	GCTGTATACGAGTCAAGCCCTC	GCCCCAAACAGATCTTAAACTA	-	chr3R	29854933	-	chr3R	29854854	79	+	chr3R	29854854	+	chr3R	29854933
GTCTGGAAAACCTCAAATGATAATTTGCATTGTGTCAATAACAACAAAGCAAACATTTGCA:1	GTCTGGAAAACCTCAAATGATA	AACAACAAAGCAAACATTTGCA	+	chr3L	7886530	+	chr3L	7889034	2504	+	chr3L	7886530	+	chr3L	7889034
GTTGAGGTTATTATAGCTAGAGTTGGAACAAAAAGTGCAAAAGTGAACGTGCTGCAAAGTGG:1	GTTGAGGTTATTATAGCTAGAG	AAGTGAACGTGCTGCAAAGTGG	+	chr2L	4163412	+	chr2L	10099674	5936262	+	chr2L	4163412	+	chr2L	10099674
TTATACTTGTATGCTACCGAGTCCGAGGTTGTGAAAACGCTAAGCTNTCGAAATATCTTANAGCCGGAAAAAC:1	TTATACTTGTATGCTACCGAGT	AATATCTTANAGCCGGAAAAAC	-	chr3R	6516203	-	chr3R	6516124	79	+	chr3R	6516124	+	chr3R	6516203
ATNTATAATTGACTGGGTTCCCTTAATCCCTCCCNCNATGCTTTACCATTTAAATGTTCAATCTACCTTGATTTT:1	ATNTATAATTGACTGGGTTCCC	ATGTTCAATCTACCTTGATTTT	+	chr2R	16518062	+	chr2R	16518138	76	+	chr2R	16518062	+	chr2R	16518138
TGTANTGCTATCAAATAAAACGNCTAANAATTCAAACAANAATGCGAGTGAGCGGGTCAGAGGGAGAGAGGTGAA:1	TGTANTGCTATCAAATAAAACG	GGGTCAGAGGGAGAGAGGTGAA	+	chr2L	9815989	+	chr2L	14490189	4674200	+	chr2L	9815989	+	chr2L	14490189
TATCTGTATGTAGGTATCTCAGCGAATGGAACAATGCCAGTTCCGTATTAATGTCGTACTGTAAGATTTCAGT:1	TATCTGTATGTAGGTATCTCAG	TGTCGTACTGTAAGATTTCAGT	+	chrX	10361718	+	chrX	10361813	95	+	chrX	10361718	+	chrX	10361813
ATTTATATATTAGATGTGTGGCTAAAAGGAAAGGTGTATTGAACTGTGAAAATTTGT:1	ATTTATATATTAGATGTGTGGC	GTATTGAACTGTGAAAATTTGT	+	chr3L	10035235	+	chr3L	10035304	69	+	chr3L	10035235	+	chr3L	10035304
CAATCAGAAATGTGTCCCGCAAAAAAAAAACTCGCTT:1	CAATCAGAAATGTGTCCCGCAA	CCCGCAAAAAAAAAACTCGCTT	-	chr2L	7617502	-	chr2L	16676396	9058894	+	chr2L	16676396	+	chr2L	7617502
CAAATACGACAAACATTCACCTGCCGCCGCTGCCGATTTCGAGCAGGTGGCAACCCTGG:1	CAAATACGACAAACATTCACCT	TTCGAGCAGGTGGCAACCCTGG	-	chr3L	10683739	-	chr3L	10683561	178	+	chr3L	10683561	+	chr3L	10683739
CGGTTTAGCTTCAGTTTGTCCTGTCACTTGTGGTTTTGGCCTTTAGCTTGTTTT:1	CGGTTTAGCTTCAGTTTGTCCT	GTTTTGGCCTTTAGCTTGTTTT	+	chr3R	17845211	+	chr3R	17845267	56	+	chr3R	17845211	+	chr3R	17845267
TCATATGCAGCTGCTCTCACTGGAGACATTTGCTCCATATAATTAGTACCAATGCATCGTGTGGAGAGACTCTC:1	TCATATGCAGCTGCTCTCACTG	TGCATCGTGTGGAGAGACTCTC	+	chr3L	24150004	+	chr3L	24150085	81	+	chr3L	24150004	+	chr3L	24150085
CGTTAAACTGTTTGGTACTCTAATCTAGCCATTGTCTCTTCTTCGGCACTCCTGCACTCATTCGAAATTTTCCTA:1	CGTTAAACTGTTTGGTACTCTA	GCACTCATTCGAAATTTTCCTA	+	chr2L	15500102	+	chr2L	15500181	79	+	chr2L	15500102	+	chr2L	15500181
AGGACCATGACGCCAAGAAGGAAAAGAGAGAGGCTCACCACGAGGAAGGCCACCATGGTGATGATGCA:1	AGGACCATGACGCCAAGAAGGA	AGGCCACCATGGTGATGATGCA	-	chr3L	10881468	-	chr3L	10881323	145	+	chr3L	10881323	+	chr3L	10881468
TATCATTTGAATTACCATTTTAAGTATGCACTTGGGGCCTTTTTTTGTTTCTGCTTTTTTTC:1	TATCATTTGAATTACCATTTTA	TTTTTTGTTTCTGCTTTTTTTC	-	chr3R	9485469	-	chr3R	24564878	15079409	+	chr3R	24564878	+	chr3R	9485469
CATATTTCTGCTGATTTTGTTTTCCTTTCATCACGCAACGCAAAAGCTNATAACAATCATTTATGGCAATTTCGT:1	CATATTTCTGCTGATTTTGTTT	CAATCATTTATGGCAATTTCGT	+	chr2R	6813713	+	chr2R	13941580	7127867	+	chr2R	6813713	+	chr2R	13941580
TAGCTTGGGTTGGGTTCAGTGGGTTCCTTCTGCTCCAATAGATGTGGATGATGTTGCGCACATGCGACGCTCTT:1	TAGCTTGGGTTGGGTTCAGTGG	GTTGCGCACATGCGACGCTCTT	-	chr2L	15468862	-	chr2L	15468778	84	+	chr2L	15468778	+	chr2L	15468862
CGTCAGTAATATGTAAGTAAAAGGTTTTCAATCTTTTTAGAATTCAGC:1	CGTCAGTAATATGTAAGTAAAA	TTCAATCTTTTTAGAATTCAGC	+	chr3L	21872452	+	chr3L	21872504	52	+	chr3L	21872452	+	chr3L	21872504
TTTCTAAGCCAATATTTTCGATTTATTTTTTTT:1	TTTCTAAGCCAATATTTTCGAT	ATATTTTCGATTTATTTTTTTT	-	chr3L	15995877	-	chr3L	11929111	4066766	+	chr3L	11929111	+	chr3L	15995877
TTCCCCCGCCAAAATTTCGCTGCTTAGGCATTATCTGCTGCTTGCCGNAAAGTATCCTTTTNAAGTTGTGATAG:1	TTCCCCCGCCAAAATTTCGCTG	TATCCTTTTNAAGTTGTGATAG	-	chr2R	19819817	-	chr2R	15586119	4233698	+	chr2R	15586119	+	chr2R	19819817
TGGCAGGATATTCTGAATACGGAACAGTCGGAGCAGCAGGAGTGGCAATAAAACAAAGAGCCCGAGAAAAGCAA:1	TGGCAGGATATTCTGAATACGG	ACAAAGAGCCCGAGAAAAGCAA	-	chr3R	22880680	-	chr3R	22880604	76	+	chr3R	22880604	+	chr3R	22880680
TATTGATCCAGACAGTAGCCGGTAATTTGGTCNGATATACAGTCAAAGACATCGAACGCCAGATCGNAGCTTTC:1	TATTGATCCAGACAGTAGCCGG	CGAACGCCAGATCGNAGCTTTC	-	chr3L	16954908	-	chr3L	16945756	9152	+	chr3L	16945756	+	chr3L	16954908
GCGCACGGNCCGCTCGGGTACAAGGCCCAACAGTT:1	GCGCACGGNCCGCTCGGGTACA	TCGGGTACAAGGCCCAACAGTT	+	chr3L	24290896	+	chr3L	25497424	1206528	+	chr3L	24290896	+	chr3L	25497424
GCCACTCNTGGCGACTCCCGTTGCCCCATTCCCGAACTCNCATTCACACTCCGAATANAATA:1	GCCACTCNTGGCGACTCCCGTT	CATTCACACTCCGAATANAATA	+	chr3R	29950591	+	chr3R	29950655	64	+	chr3R	29950591	+	chr3R	29950655
TGCTGCATTTATGCACATANTTGAGCGGCGAACTTAATGGCACAGACAGCTACATTTTTTTTTTTGCATCCAC:1	TGCTGCATTTATGCACATANTT	ACATTTTTTTTTTTGCATCCAC	+	chr3L	9929670	+	chr3L	9938447	8777	+	chr3L	9929670	+	chr3L	9938447
GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTTTTTTTGTGTTTTTGTTT:1	GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGT	GTTTTTTTTTGTGTTTTTGTTT	+	chrX	9845361	+	chrX	21062356	11216995	+	chrX	9845361	+	chrX	21062356
CCACAAAGCAAGGAAAAAATGTAGAGAAGGAAATTGAGTCGAGCATGCAACAATCATTTCACGTGGGACGTGATT:1	CCACAAAGCAAGGAAAAAATGT	TCATTTCACGTGGGACGTGATT	+	chr2L	10830044	+	chr2L	3647319	7182725	+	chr2L	10830044	+	chr2L	3647319
AGCTAGTAATGATCGTCATANTGCCGAAGCCTNCCCAGAGAGNTAACCTGATGCTCTACCAATTGAAGAACCTGG:1	AGCTAGTAATGATCGTCATANT	CTCTACCAATTGAAGAACCTGG	+	chr3L	20343662	+	chr3L	20321856	21806	+	chr3L	20343662	+	chr3L	20321856
CAACTAAATCATATTGTTAAATAATAATAGAACAACATAATATAACAAGAAAATTAAAGGAAAATTTNAGACT:1	CAACTAAATCATATTGTTAAAT	AATTAAAGGAAAATTTNAGACT	-	chr3R	20205686	-	chr3R	20205566	120	+	chr3R	20205566	+	chr3R	20205686
GAGGGGCGTGCAGCAGGACAGGTGGTGCAGTGCAGTGGGGAACCTCAGCCNGTTGGG:1	GAGGGGCGTGCAGCAGGACAGG	TGGGGAACCTCAGCCNGTTGGG	+	chr3L	2502950	+	chr3L	673460	1829490	+	chr3L	2502950	+	chr3L	673460
AACCACACTGTTCGGTTANGTTGAAAAACTGAGCCAGACACTTNGACATNATTTCCCCGCCAGCAGACTCTGCCA:1	AACCACACTGTTCGGTTANGTT	TCCCCGCCAGCAGACTCTGCCA	-	chr3L	4794379	-	chr3L	10299356	5504977	+	chr3L	10299356	+	chr3L	4794379
ACTGCACTTGTGCGTCCTGACATTCCTTTTGCCCCTCATGCGTGCACAGCGAAAAAA:1	ACTGCACTTGTGCGTCCTGACA	TCATGCGTGCACAGCGAAAAAA	+	chrX	9270050	+	chrX	13221958	3951908	+	chrX	9270050	+	chrX	13221958
GTAGCGACTGCTTTGATTGGAAGTGAGTCATTAACCAGTCTGAATTACCAATAATATTCCATTCGAAATCTGCCA:1	GTAGCGACTGCTTTGATTGGAA	ATATTCCATTCGAAATCTGCCA	+	chr3R	31069658	+	chr3R	31069753	95	+	chr3R	31069658	+	chr3R	31069753
GTTTGGAAAAATCGAGTAAAAAACGATGCGGAGAACTGGAAAAAAAACTGCTCAACTGGTAGGAGAAATACACCG:1	GTTTGGAAAAATCGAGTAAAAA	AACTGGTAGGAGAAATACACCG	-	chr3R	26470865	-	chr3R	16531198	9939667	+	chr3R	16531198	+	chr3R	26470865
TTCGCATGTATACCATATATTTTATATAATAAAACGAAGCTTTTTGCTGCTGCATTTTCTCGACCATTTTCCTT:1	TTCGCATGTATACCATATATTT	CATTTTCTCGACCATTTTCCTT	+	chrX	15277650	+	chrX	15277734	84	+	chrX	15277650	+	chrX	15277734
AACGAAAGCGAATGATAACGAGCGACTTAAGAGAGTACAAGAGANAGCCTGCGAAAGAGGAGAGCTTAGAT:1	AACGAAAGCGAATGATAACGAG	TGCGAAAGAGGAGAGCTTAGAT	-	chr2R	5473472	-	chr2R	5473381	91	+	chr2R	5473381	+	chr2R	5473472
CAGCGCCGTCAGCAGCAGCAGCAAAAGCAACAGCAGCAGCATCAC:1	CAGCGCCGTCAGCAGCAGCAGC	AAAGCAACAGCAGCAGCATCAC	-	chr3R	16485823	-	chr3R	14816254	1669569	+	chr3R	14816254	+	chr3R	16485823
CACTAGTTTTGTAATTAGCTTGCGATGTCCCAGGTGATAAGGGATATTTAAGGCACTACTTTCGCTTGTAT:1	CACTAGTTTTGTAATTAGCTTG	AAGGCACTACTTTCGCTTGTAT	+	chr2R	18785948	+	chr2R	18786023	75	+	chr2R	18785948	+	chr2R	18786023
GGTCGCCTTGATGTGGGTCCAATTCCCGATTCCCGATTCCCAATAACAATTTTCGATACTCACACACACACA:1	GGTCGCCTTGATGTGGGTCCAA	TTTCGATACTCACACACACACA	-	chrX	8669076	-	chrX	13321905	4652829	+	chrX	13321905	+	chrX	8669076
AAATATCATCACTTTAAGTTAATTAATTACATTTTATGACTACAACGAAATTGTATACACTTTCCCTTCGATTA:1	AAATATCATCACTTTAAGTTAA	GTATACACTTTCCCTTCGATTA	+	chrX	14813741	+	chrX	14813818	77	+	chrX	14813741	+	chrX	14813818
AANTATAAGGAGAAAGGTAAAAGAAGTGACAAGANGNACTGGGAAAAAGGAGAAAACAACGGTGGCGCATAAGAG:1	AANTATAAGGAGAAAGGTAAAA	AAACAACGGTGGCGCATAAGAG	-	chr3L	5491345	-	chr3L	3191877	2299468	+	chr3L	3191877	+	chr3L	5491345
CCGCCTTTCCGCCCCCACTTCTCGATTCCACCGCCACTGATGACGACGATGGCAACAACAAAGAGCCAGCCGCT:1	CCGCCTTTCCGCCCCCACTTCT	CAACAACAAAGAGCCAGCCGCT	+	chrX	9535613	+	chrX	2305872	7229741	+	chrX	9535613	+	chrX	2305872
CATTCAAATCACCAGCAATTTTCGGACGAAATTGAAATTTTAATAAACATTTTGGCGCCTTGTGATAATATTTAC:1	CATTCAAATCACCAGCAATTTT	GGCGCCTTGTGATAATATTTAC	-	chr3L	482379	-	chr3L	482300	79	+	chr3L	482300	+	chr3L	482379
TTGAAATGCCGGCCAGTCATCCGATCAATCCTGGTCTAACCATATCCNACAAGGAAGCCCTNATTAAACGAGTG:1	TTGAAATGCCGGCCAGTCATCC	GGAAGCCCTNATTAAACGAGTG	+	chr2R	10992970	+	chr2R	10993055	85	+	chr2R	10992970	+	chr2R	10993055
AAAAAGTTAGAACAATGGGATGCTTCAAGTTGAAAACTACCCCGTCGATAGTCATGGGTAANAGTCGGTCGGG:1	AAAAAGTTAGAACAATGGGATG	TCATGGGTAANAGTCGGTCGGG	-	chr3R	5897343	-	chr3R	5896986	357	+	chr3R	5896986	+	chr3R	5897343
ACTGTGCGCCTGTGGACCCCATCGCTCCACGAACCCCCTCCCCACCCCTC:1	ACTGTGCGCCTGTGGACCCCAT	ACGAACCCCCTCCCCACCCCTC	+	chr3L	10512026	+	chr3L	18789805	8277779	+	chr3L	10512026	+	chr3L	18789805
GAGGAAGTCCCCGCTTCAACATTGGCACAAACGATTTTCTTTACATGTCTT:1	GAGGAAGTCCCCGCTTCAACAT	AACGATTTTCTTTACATGTCTT	-	chr2L	20393954	-	chr2L	20393812	142	+	chr2L	20393812	+	chr2L	20393954
ATCCTCACAAACCAAATTTTATTTCATATATTATACAATGTGCTCGGAACAACTTGAGAAATCGGATATTAGCCA:1	ATCCTCACAAACCAAATTTTAT	TTGAGAAATCGGATATTAGCCA	+	chr3L	11887260	+	chr3L	11887357	97	+	chr3L	11887260	+	chr3L	11887357
TACACATTCGCCCCATGGTTATCAATCAAGGAAGCATTTGGCAGACACTGNAGTCAAAGTTCGGACATGGTAAA:1	TACACATTCGCCCCATGGTTAT	GTCAAAGTTCGGACATGGTAAA	-	chr2L	11721002	-	chr2L	11713535	7467	+	chr2L	11713535	+	chr2L	11721002
ATTGTTTTGATGCTGGCAATGCCATAGATTTCGAAGAGAGGATCTCGTCGTCTTACGCTGTGCGTTTAAAAATCG:1	ATTGTTTTGATGCTGGCAATGC	TACGCTGTGCGTTTAAAAATCG	+	chr3L	16493980	+	chr3L	16494497	517	+	chr3L	16493980	+	chr3L	16494497
TATAGAAGTAGTAGTATATGTATACTTATGTTTAATGATTTTATATATAGCTTTATTTATTTGTTGAATATTGTA:1	TATAGAAGTAGTAGTATATGTA	TATTTATTTGTTGAATATTGTA	+	chr2R	12602828	+	chr2R	12602912	84	+	chr2R	12602828	+	chr2R	12602912
TAAAGCAAACACCCACTACTCTCTGCGAGTATATTCAAACAGATGGCGGAGGGACCATTTCCGTCTAATTAGCA:1	TAAAGCAAACACCCACTACTCT	GACCATTTCCGTCTAATTAGCA	+	chr2R	24707846	+	chr2R	24707924	78	+	chr2R	24707846	+	chr2R	24707924
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831802	6924268	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907534
TGCCATATGCCAGAGCTTCTTATCTAGATATGCATATGTATATANATACTACATAATAGTCATACCCA:1	TGCCATATGCCAGAGCTTCTTA	TACTACATAATAGTCATACCCA	+	chr3L	7377328	+	chr3L	7380426	3098	+	chr3L	7377328	+	chr3L	7380426
ACCCGTTTAGTTCCCCCTTTTTTGCTCAATT:1	ACCCGTTTAGTTCCCCCTTTTT	GTTCCCCCTTTTTTGCTCAATT	-	chr3L	4524818	-	chr3L	18084494	13559676	+	chr3L	18084494	+	chr3L	4524818
TGTACTACAGTCATGTCCCTAGAAAGTATTAGTACCACAAAGGGTGTATATTTAAATTTCTTAGGGTAACATT:1	TGTACTACAGTCATGTCCCTAG	TTAAATTTCTTAGGGTAACATT	+	chr2L	17199182	+	chr2L	17200647	1465	+	chr2L	17199182	+	chr2L	17200647
TATGCAATGTTTAGGAATGTTTGCTCGACTTCAGCCTTATTTGTGCGCTCCTACAATAAATTGTGATAATTTAAA:1	TATGCAATGTTTAGGAATGTTT	CAATAAATTGTGATAATTTAAA	-	chr3L	2493933	-	chr3L	2493845	88	+	chr3L	2493845	+	chr3L	2493933
AGGTTGCCGAGTCCAGACAGTTAGTGTATATGTTTTGATGAAGTGCAGAAGTTGATAAATTGCAAAACACTGATG:1	AGGTTGCCGAGTCCAGACAGTT	GATAAATTGCAAAACACTGATG	+	chr2L	13853116	+	chr2L	13862266	9150	+	chr2L	13853116	+	chr2L	13862266
AAAACGTTATTCTGTGTCGTTGTTTTACATTTTTTTTATAATTCAAGAAATGAATTTTGAACCAAGCAA:1	AAAACGTTATTCTGTGTCGTTG	AAATGAATTTTGAACCAAGCAA	+	chr3L	25952573	+	chr3L	25989644	37071	+	chr3L	25952573	+	chr3L	25989644
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACCAAACACGGCCNAACAAACTGAAGT:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACGGCCNAACAAACTGAAGT	+	chr3R	21907536	+	chr3R	11861378	10046158	+	chr3R	21907536	+	chr3R	11861378
CCCCGAGCNCTGTGGGCGTGGTCCGATGCCCGCTAGCCGCTAATTTGCATATTGCATTACGCGAAAATT:1	CCCCGAGCNCTGTGGGCGTGGT	CATATTGCATTACGCGAAAATT	+	chr3L	9533777	+	chr3L	9541331	7554	+	chr3L	9533777	+	chr3L	9541331
TGTTTTTTAGCTCTTCTCAGAACATTATATAGTGGTTTTTCCCAANCAATTATAATAAAATNCTTTAAACAGCAG:1	TGTTTTTTAGCTCTTCTCAGAA	AATAAAATNCTTTAAACAGCAG	-	chrX	11719981	-	chrX	11719901	80	+	chrX	11719901	+	chrX	11719981
AACCAAATGTACGCTAACTTACTATTTTAGCAGCTGATTAGCCAATATGCCTCCGGTGAGCACGC:1	AACCAAATGTACGCTAACTTAC	AATATGCCTCCGGTGAGCACGC	+	chr3R	4753271	+	chr3R	4757564	4293	+	chr3R	4753271	+	chr3R	4757564
CCGCGCTTGTTTATTTTATCGGCATT:1	CCGCGCTTGTTTATTTTATCGG	GCTTGTTTATTTTATCGGCATT	+	chr2L	5753230	+	chr2L	16220396	10467166	+	chr2L	5753230	+	chr2L	16220396
AAATTGATAAAGTGAGTATGAGTGTTCTTGAAAACAGGATACTTTGATGATAAGTGGAACATGTACCAAGGCATC:1	AAATTGATAAAGTGAGTATGAG	GTGGAACATGTACCAAGGCATC	+	chr2R	12363382	+	chr2R	12363814	432	+	chr2R	12363382	+	chr2R	12363814
AGGTAGTGNGTACATCTGGAATTTTGGCAGCTAACNTAAGTGTTCGAAACCCGGGTGCTCAACACA:1	AGGTAGTGNGTACATCTGGAAT	CGAAACCCGGGTGCTCAACACA	-	chr2R	3382725	-	chr2R	4519903	1137178	+	chr2R	4519903	+	chr2R	3382725
TGGAAAACGGGCTGATTCATNTGCACAGTTTGNCACTCACTGNAGCGGGTTTCGTCGAGTGGGCTTCCCTTACTT:1	TGGAAAACGGGCTGATTCATNT	GTCGAGTGGGCTTCCCTTACTT	+	chr3L	11126324	+	chr3L	1656902	9469422	+	chr3L	11126324	+	chr3L	1656902
AGGCGCTTTACGAGCCGGCAGCAAAATAGAAAAGGAATATGGAACG:1	AGGCGCTTTACGAGCCGGCAGC	AATAGAAAAGGAATATGGAACG	-	chrX	12097560	-	chrX	17928940	5831380	+	chrX	17928940	+	chrX	12097560
TAGTTCCCATGTTGTCTAAGTTAAGTAATGACAATCCAAGATTATGGTCTAAGAATTTAGGACAAGNTCAACAA:1	TAGTTCCCATGTTGTCTAAGTT	GAATTTAGGACAAGNTCAACAA	+	chr3L	25628506	+	chr3L	25633276	4770	+	chr3L	25628506	+	chr3L	25633276
GTAGCGTATGCGTATGCATTTAAAAGTTAAATTAAGTCTGAAAATGTCGATCGAATGGCATGG:1	GTAGCGTATGCGTATGCATTTA	AAATGTCGATCGAATGGCATGG	-	chr2R	7873990	-	chr2R	7869216	4774	+	chr2R	7869216	+	chr2R	7873990
CAATTTGGACACATTTTCGTATATGCTCAACACTTTCCCCCGCCGCCTCCCCCATTTTCCGCCCACTCCAAGAGT:1	CAATTTGGACACATTTTCGTAT	ATTTTCCGCCCACTCCAAGAGT	+	chr2L	2696088	+	chr2L	1583073	1113015	+	chr2L	2696088	+	chr2L	1583073
TACTGCTCGGCTTTCTCTGCCTGTCTATACTTATATATATCTTATATATATCTTATATATCTGTATTTGTAT:1	TACTGCTCGGCTTTCTCTGCCT	TCTTATATATCTGTATTTGTAT	+	chr2L	12781812	+	chr2L	12789252	7440	+	chr2L	12781812	+	chr2L	12789252
AACGAGTCACATCTGTATCCTGTCTTCCACTCATTGGAAGAGATTTTTANCAATCAAAGTGACCATCGGGATGCT:1	AACGAGTCACATCTGTATCCTG	TCAAAGTGACCATCGGGATGCT	-	chr3R	25424757	-	chr3R	25424679	78	+	chr3R	25424679	+	chr3R	25424757
AACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACACAACACAACACAACACAACAC:1	AACAAAACAAAACAAAACAAAA	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	29013339	+	chr3R	21907536	7105803	+	chr3R	29013339	+	chr3R	21907536
GGTTTGGCCCCAACCCATTTCAAGATTTAAGCATTTCTCGTGAGAAATAGCCCTCAATTAGCATAGAAAT:1	GGTTTGGCCCCAACCCATTTCA	AGCCCTCAATTAGCATAGAAAT	+	chr3R	8080255	+	chr3R	8080346	91	+	chr3R	8080255	+	chr3R	8080346
GGCGCACTCAAAGCTGAAGCAAAAGGAAAGGGTGAGCTGAATGAATCTCTGGCATTTTCACTGCTGCGTGACGCT:1	GGCGCACTCAAAGCTGAAGCAA	ATTTTCACTGCTGCGTGACGCT	-	chr3R	28660091	-	chr3R	14914339	13745752	+	chr3R	14914339	+	chr3R	28660091
AGCGTATTCGTTTCAAATGAAATATGTATATTCACATTTATTGTATTTTGATAATACTGGCACAAAATGGAATA:1	AGCGTATTCGTTTCAAATGAAA	AATACTGGCACAAAATGGAATA	+	chr2R	6579800	+	chr2R	6584885	5085	+	chr2R	6579800	+	chr2R	6584885
AAGAGTAATTTGATAAAATGCTTCTGCGGCCGCGGCTAAGTGCAATTAGTGCCACAAATTTAGTGCAATGAATTG:1	AAGAGTAATTTGATAAAATGCT	ACAAATTTAGTGCAATGAATTG	+	chr3L	14043275	+	chr3L	7424009	6619266	+	chr3L	14043275	+	chr3L	7424009
GAAGGTCGCCTATAAGATTTGATAAAACTTTCTCAAAGCTTTGAGTATAATAAAGTCATTTTCCACTTCCTGTAC:1	GAAGGTCGCCTATAAGATTTGA	AGTCATTTTCCACTTCCTGTAC	-	chr3R	7021796	-	chr3R	7021689	107	+	chr3R	7021689	+	chr3R	7021796
AATCTCTCCCCCAAGAATTTTCCAAAAGAAAACCAAAAAAACGAGAAAATCCGGCGTACTCCTGTGCCAACTCA:1	AATCTCTCCCCCAAGAATTTTC	GGCGTACTCCTGTGCCAACTCA	+	chr3R	31552614	+	chr3R	10879061	20673553	+	chr3R	31552614	+	chr3R	10879061
AATCTCAGTCCTACGCCACACGACTTGACGACTTGACGACTTCACTTAAAGTGCATGTGCCGTTGCTACCATAAA:1	AATCTCAGTCCTACGCCACACG	CATGTGCCGTTGCTACCATAAA	-	chr3R	28484353	-	chr3R	28486270	1917	+	chr3R	28486270	+	chr3R	28484353
AGTGGCAACAACACACCGAGCTGGCCGCCACGTAAGGATCATTAATCAAACAAAAACGCTGATAACAATGGA:1	AGTGGCAACAACACACCGAGCT	CAAAAACGCTGATAACAATGGA	-	chr3R	25452350	-	chr3R	16528308	8924042	+	chr3R	16528308	+	chr3R	25452350
ATTTCCCCCAAAATGCTGTTGAGAGTGATAATNAATTTGGGATCGTCCTTTTCCCAGGACCCTGCCNCGCG:1	ATTTCCCCCAAAATGCTGTTGA	TTTCCCAGGACCCTGCCNCGCG	+	chr3R	25669095	+	chr3R	25669185	90	+	chr3R	25669095	+	chr3R	25669185
GTATATTGGAGAAGAACTTCTTGCCTGCCCCCAANCCATGTATGGAGCGGGTATGATAGCCAGTTCATCGGTGGG:1	GTATATTGGAGAAGAACTTCTT	TGATAGCCAGTTCATCGGTGGG	+	chr3R	16080659	+	chr3R	31989949	15909290	+	chr3R	16080659	+	chr3R	31989949
CACAAAAAGGGATGAAGCCGAAGGAACAACAACCGCAGGAGCAACAACTTAATATTCAACAATTAACGCACTTTT:1	CACAAAAAGGGATGAAGCCGAA	ATTCAACAATTAACGCACTTTT	+	chrX	3122068	+	chrX	10195411	7073343	+	chrX	3122068	+	chrX	10195411
TGGCATTTATTTTGTGGCAATTTACGCATTGATTGCATATTTATTTGTTTCGTTTTCGCCTTGTTTATTTCTGTT:1	TGGCATTTATTTTGTGGCAATT	TTTCGCCTTGTTTATTTCTGTT	+	chr3R	22054839	+	chr3R	20901535	1153304	+	chr3R	22054839	+	chr3R	20901535
ACTTATGAACCAGCAGCAGGATTGCGAATGTGTCCGAATGTGCCACAACCTCTCACCTTTTGCACCCGTCA:1	ACTTATGAACCAGCAGCAGGAT	CTCTCACCTTTTGCACCCGTCA	+	chr3R	13120793	+	chr3R	13120866	73	+	chr3R	13120793	+	chr3R	13120866
ATATGTTACATACCTGACATTTGTTTTTGACCTATTAAAACTACCAGNGCGATACTAAGTATTGCATGGATGGT:1	ATATGTTACATACCTGACATTT	TACTAAGTATTGCATGGATGGT	+	chr3R	14923730	+	chr3R	14923806	76	+	chr3R	14923730	+	chr3R	14923806
AAGTGGCAATTAAATAAAAGCAATTCGTTATTACATTTTTACCATTTATGAGCTTCGAAATGCCATAAAGCTAA:1	AAGTGGCAATTAAATAAAAGCA	CTTCGAAATGCCATAAAGCTAA	+	chr3L	17636114	+	chr3L	17636261	147	+	chr3L	17636114	+	chr3L	17636261
GCCACAAATTGAGATGCCTCAGTCTTATGTTCTTGTAGTTATGCAAAGCCCTGATCAGCGGATCTCCACTT:1	GCCACAAATTGAGATGCCTCAG	CCTGATCAGCGGATCTCCACTT	-	chr3R	25841900	-	chr3R	25832722	9178	+	chr3R	25832722	+	chr3R	25841900
AAGCTAGAAACTGTTTTGAAATAGTATATATATANTTATAAATAAACATACGCCAGGCTTACAAAACAATTGCA:1	AAGCTAGAAACTGTTTTGAAAT	CCAGGCTTACAAAACAATTGCA	-	chr3R	31081835	-	chr3R	31074238	7597	+	chr3R	31074238	+	chr3R	31081835
CTGACATTTGAGTATCTANCTTTGTACACTATTCAAAAAAANTTTNTTGTTCAAATGGTCAACAAAGTTGCTGA:1	CTGACATTTGAGTATCTANCTT	AAATGGTCAACAAAGTTGCTGA	+	chrX	21480554	+	chrX	21480883	329	+	chrX	21480554	+	chrX	21480883
TAGACACTATAATTTCTGATTCTGTCCCATTTATTCTTCGAGCCGTTTTCTTAGCGGTCGAAAGAAGACTTTTCC:1	TAGACACTATAATTTCTGATTC	GCGGTCGAAAGAAGACTTTTCC	-	chr2L	10692884	-	chr2L	10692786	98	+	chr2L	10692786	+	chr2L	10692884
CAGCGCTATAAAGCAAGAAGGCATTATTTGCAATNCTTCCATTATATCGCCGAAATTTACCTTAAAACGTTTAAT:1	CAGCGCTATAAAGCAAGAAGGC	AATTTACCTTAAAACGTTTAAT	+	chr3R	4568722	+	chr3R	4568809	87	+	chr3R	4568722	+	chr3R	4568809
CTGCCAAAGTTGAAGCGGAAAACCAGCAAGTGACTCAGCTACACTGCGCGAAAATATTTATGACAAGTTAAATA:1	CTGCCAAAGTTGAAGCGGAAAA	AATATTTATGACAAGTTAAATA	+	chr3R	22797779	+	chr3R	22797864	85	+	chr3R	22797779	+	chr3R	22797864
AATTTGGGACACGAAACACTNGAAGAATTGAANTGAATTCAANATGAATTGAAATAAAGTTATATCGCGTATACG:1	AATTTGGGACACGAAACACTNG	ATAAAGTTATATCGCGTATACG	-	chr3R	8576343	-	chr3R	8576172	171	+	chr3R	8576172	+	chr3R	8576343
AGAATTTTTTTATTAATATTAATATCATTGTAGTNCCCAGATTTCCTTTCCCCCTTCTTTTGTCG:1	AGAATTTTTTTATTAATATTAA	TCCTTTCCCCCTTCTTTTGTCG	-	chr3R	11013952	-	chr3R	3522293	7491659	+	chr3R	3522293	+	chr3R	11013952
GGCAAGGGAGCGGAGGACAGCAATGTCAGGCAGTTCGTGAGCAGTATCTTGATGTGCGCGATCCAGGGCAGG:1	GGCAAGGGAGCGGAGGACAGCA	GATGTGCGCGATCCAGGGCAGG	-	chr3L	19883305	-	chr3L	8998900	10884405	+	chr3L	8998900	+	chr3L	19883305
TAGCAATGGTAGTGCCTTCTTGCACTTGTTGCCTCGCCTTTGCTAATTGTTCGCCATGCACTCGAG:1	TAGCAATGGTAGTGCCTTCTTG	AATTGTTCGCCATGCACTCGAG	-	chr3L	3281956	-	chr3L	3281469	487	+	chr3L	3281469	+	chr3L	3281956
TCAGATGCAAGTGCGAGTGCGAGGAAGTTGCTGTTTTGAAATTAACCCAATAATAAACGGCAATCAGCGAATCTT:1	TCAGATGCAAGTGCGAGTGCGA	TAAACGGCAATCAGCGAATCTT	+	chr3L	7883750	+	chr3L	7883907	157	+	chr3L	7883750	+	chr3L	7883907
ATGAGTTTTTGAGTTTTGGTNGGTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1	ATGAGTTTTTGAGTTTTGGTNG	TNGGTTTTTTTTTGTTTTTTTT	+	chrX	6611842	+	chrX	9472517	2860675	+	chrX	6611842	+	chrX	9472517
GAGCTGTATATTTCTTCTGGGATGGCTGGTTAAANGCTTCCGGTTTTATTTGCAATTT:1	GAGCTGTATATTTCTTCTGGGA	CTTCCGGTTTTATTTGCAATTT	-	chr2L	4685444	-	chr2L	4685336	108	+	chr2L	4685336	+	chr2L	4685444
CGCTTGCTATTTAACTTGTCATAAATATTTTCGCGCAGTGTAGCTGAGTCACTTGCTGGTTTTCCGCTTCAACTT:1	CGCTTGCTATTTAACTTGTCAT	TGCTGGTTTTCCGCTTCAACTT	-	chr3R	22797871	-	chr3R	22797785	86	+	chr3R	22797785	+	chr3R	22797871
AAATGTAGATTGCTGTCGCATACCAGCACAAAACATCTTGCTGTGTTTCAGCTCACAAGTGATGACAACGGTCGG:1	AAATGTAGATTGCTGTCGCATA	CACAAGTGATGACAACGGTCGG	+	chr3R	20870257	+	chr3R	20870342	85	+	chr3R	20870257	+	chr3R	20870342
CATGTTTGGAGTTGGGTGCTGGACATGTGATGAATTTGCCGCGCAGTTTGCAGTTATAAATATTTGCACATTTCG:1	CATGTTTGGAGTTGGGTGCTGG	TTATAAATATTTGCACATTTCG	+	chr3R	8144327	+	chr3R	12114705	3970378	+	chr3R	8144327	+	chr3R	12114705
CTTACGTGCATCCTCATAATTTCGACGTTTCTGTTTGCATTTATCCAGTTTTTGTTCTAAATCTTTTAAAGATTT:1	CTTACGTGCATCCTCATAATTT	GTTCTAAATCTTTTAAAGATTT	-	chr3L	12012390	-	chr3L	12012311	79	+	chr3L	12012311	+	chr3L	12012390
TTTGGGCTTTTTTTTATAAANTAAGTTAAGTTNTTGTTTTTANATATTTTTAAAGCGATTTGTTTCAAATACAG:1	TTTGGGCTTTTTTTTATAAANT	AAGCGATTTGTTTCAAATACAG	+	chr3R	1062412	+	chr3R	1062569	157	+	chr3R	1062412	+	chr3R	1062569
ACTGACAAAAATGTTGGTAGTTTCAGAAATTTGTTTATATTCCTTTACCTCATATCGTTTTTTTTTTT:1	ACTGACAAAAATGTTGGTAGTT	ACCTCATATCGTTTTTTTTTTT	-	chr3R	14384715	-	chr3R	14384632	83	+	chr3R	14384632	+	chr3R	14384715
ATTGTAATTGCTTTGTTTCGCTTTCAAATTATTTTCGCCTCTCGCAGACGTCGACAGATGGNAGTGGGCAAAG:1	ATTGTAATTGCTTTGTTTCGCT	CGACAGATGGNAGTGGGCAAAG	+	chr2R	9785926	+	chr2R	19995509	10209583	+	chr2R	9785926	+	chr2R	19995509
CTAGAGTTTGGAAGCTTCTGAAGGCGAGCACAGGGATATCGCCCGCAAAGTGACTTGTAAACATTTTAG:1	CTAGAGTTTGGAAGCTTCTGAA	AAGTGACTTGTAAACATTTTAG	+	chr3R	29550271	+	chr3R	29550346	75	+	chr3R	29550271	+	chr3R	29550346
GATGCATTNTTGTATTGTATTAATTATTAGTTTTGATATTCTTACACATTTGCCAGCTAGCTTGTATATTAATGG:1	GATGCATTNTTGTATTGTATTA	CAGCTAGCTTGTATATTAATGG	-	chrX	14705982	-	chrX	5401691	9304291	+	chrX	5401691	+	chrX	14705982
TCTTTTTAGATTGGTATATCTTTAAGACGTTAAAATTGATACTTACTGCAAGTAAGTAAAGTTTTATGCCTGGTT:1	TCTTTTTAGATTGGTATATCTT	AAGTAAAGTTTTATGCCTGGTT	+	chr2L	17419309	+	chr2L	17419385	76	+	chr2L	17419309	+	chr2L	17419385
AACGTCGATTTAATAATAGGATTGAGCTTCGCTGTGAAACAATTTGAAATGAGTAGACACATTTCATTTT:1	AACGTCGATTTAATAATAGGAT	ATGAGTAGACACATTTCATTTT	+	chr3R	6655830	+	chr3R	6656144	314	+	chr3R	6655830	+	chr3R	6656144
CTAACTATACACATTTAAGATATACGTTCGTACCATATATATACTGTGAAATTCTCAGCCAGCCGAAGAACAAA:1	CTAACTATACACATTTAAGATA	TCTCAGCCAGCCGAAGAACAAA	+	chr3R	24076938	+	chr3R	24078404	1466	+	chr3R	24076938	+	chr3R	24078404
AAGTTATGCGATCAAAATATTTTTGTGTTATTCTTTATTAAGGAAAGAATGCCGACTTCTCTGATGGGGAGTCCA:1	AAGTTATGCGATCAAAATATTT	GACTTCTCTGATGGGGAGTCCA	+	chr2R	8455885	+	chr2R	8454942	943	+	chr2R	8455885	+	chr2R	8454942
CGCATGCAAACAATTTAATTAACTTTATGCAAACACACAGAGCGCCTAATCAAAGGAAGCACTTAAAAAGTAAAA:1	CGCATGCAAACAATTTAATTAA	AGGAAGCACTTAAAAAGTAAAA	+	chr2R	17355020	+	chr2R	19077807	1722787	+	chr2R	17355020	+	chr2R	19077807
TATTTGTAAGGATATGTCGAATTCGGAAACCAGAGAAAAGGCTCATGTGTTGTACTTTTGATCAAATTTATTTGC:1	TATTTGTAAGGATATGTCGAAT	ACTTTTGATCAAATTTATTTGC	-	chr3R	24906826	-	chr3R	24906747	79	+	chr3R	24906747	+	chr3R	24906826
ATACCAATNCTTTCAAAAACCCCACCCAATTGTTGNTTAAAGTTCTAAGACCCCGACAATTGCAACGGAAGTGCG:1	ATACCAATNCTTTCAAAAACCC	CGACAATTGCAACGGAAGTGCG	-	chr3R	9605208	-	chr3R	9605096	112	+	chr3R	9605096	+	chr3R	9605208
AATATCGATCAGATGATCAGCCCAGAGTGATTCTGTTGAGACACCGAACGAGGTAGGGATATGCAGATAAA:1	AATATCGATCAGATGATCAGCC	GAGGTAGGGATATGCAGATAAA	+	chr3L	775617	+	chr3L	23032199	22256582	+	chr3L	775617	+	chr3L	23032199
ATAAACAATTTACACACGCAAAGCGCTTTGTGGTGGGAAAGAGAGGGAAGAGAAGCTGCAATCAGCCTTAACGA:1	ATAAACAATTTACACACGCAAA	AAGCTGCAATCAGCCTTAACGA	+	chr2R	17395294	+	chr2R	17395371	77	+	chr2R	17395294	+	chr2R	17395371
AATGGGCAGCACTAAGGTCAAGGACTTGGAAAAGAGACTTGTGGCCAAAAAAAAAAATAAATAAAAAATAAAAAG:1	AATGGGCAGCACTAAGGTCAAG	AAAATAAATAAAAAATAAAAAG	+	chr3R	14459837	+	chr3R	7023566	7436271	+	chr3R	14459837	+	chr3R	7023566
AAAATGCGCGCAACAGCAACAGCTGATGCTGGTGCATCTCCCCACTAAAAG:1	AAAATGCGCGCAACAGCAACAG	TGGTGCATCTCCCCACTAAAAG	-	chr2R	18267851	-	chr2R	18267774	77	+	chr2R	18267774	+	chr2R	18267851
TGAGAATATTTGTATTTAGCCTACNGTGATTAAAGTACTCACNATNTCAACNTCTNCTAGCGGGTCTAGATATAT:1	TGAGAATATTTGTATTTAGCCT	CTNCTAGCGGGTCTAGATATAT	-	chr3R	19448920	-	chr3R	19448284	636	+	chr3R	19448284	+	chr3R	19448920
CTTTCTGTTGCCTGTGACAAGGCCAACTAATTTGTACACTGCACTCGAGAAACCGAACGAC:1	CTTTCTGTTGCCTGTGACAAGG	TGCACTCGAGAAACCGAACGAC	-	chr2L	12941330	-	chr2L	12933877	7453	+	chr2L	12933877	+	chr2L	12941330
TCCCTTGTCAATGAAGCAACATTTTTTTTTTAAATATAATACAATGGNGCAACTTAAAGCGNTCTTATAGCTTAG:1	TCCCTTGTCAATGAAGCAACAT	TTAAAGCGNTCTTATAGCTTAG	-	chrX	4132847	-	chrX	4132679	168	+	chrX	4132679	+	chrX	4132847
TGCTCAATGTCTTCGTGTTGACACCTAGGTCCTTCGATGTGGAGCATCCTGTAGCACGGAGAACAAAAGTGAAAG:1	TGCTCAATGTCTTCGTGTTGAC	GCACGGAGAACAAAAGTGAAAG	-	chrX	20105204	-	chrX	20105307	103	+	chrX	20105307	+	chrX	20105204
TTTATATGAACAACTGAAACCGATCGTTGGGTACTTTCTGTTTGTTCTTGTTTTTCACTTTTTCATTTAGAAAGT:1	TTTATATGAACAACTGAAACCG	TTCACTTTTTCATTTAGAAAGT	-	chr3L	9344291	-	chr3L	9344213	78	+	chr3L	9344213	+	chr3L	9344291
GATGAGCTCAACTGTATGAACATATGCCATTGTCTTGTGCTTGGGGATGCGCTCAGATTATGGCAAATATGATGT:1	GATGAGCTCAACTGTATGAACA	CAGATTATGGCAAATATGATGT	+	chr2L	15396158	+	chr2L	15396243	85	+	chr2L	15396158	+	chr2L	15396243
ACGAAATAGGACGCTTTGCGATTGCCTTTAAAGCCAACTTCCCTCCATTTAAATGATAAGCCGGCTGACGAGCTG:1	ACGAAATAGGACGCTTTGCGAT	TGATAAGCCGGCTGACGAGCTG	+	chr2R	14393874	+	chr2R	14393959	85	+	chr2R	14393874	+	chr2R	14393959
GTGCAGCTTTATGAGTAATATTTATCATCACCAATAGACAGATAATAGAATGCAACATATGTATTGTTCATGTT:1	GTGCAGCTTTATGAGTAATATT	CAACATATGTATTGTTCATGTT	+	chrX	18832285	+	chrX	18832376	91	+	chrX	18832285	+	chrX	18832376
GCCCACTCACTCTGTAAAGAACTTAGCCGCCTGCTCGGTGCGTCCCTGGTAGACGATCCTGCCGCCATCCAT:1	GCCCACTCACTCTGTAAAGAAC	AGACGATCCTGCCGCCATCCAT	+	chr2R	23529582	+	chr2R	23537155	7573	+	chr2R	23529582	+	chr2R	23537155
AAACATAAATATAGCAATCCCAAACCTAAATTTAAACTTGCGGTAAAGTTTCCTTATTTTTGAACTTTGACATG:1	AAACATAAATATAGCAATCCCA	CTTATTTTTGAACTTTGACATG	-	chr3L	11663863	-	chr3L	11663784	79	+	chr3L	11663784	+	chr3L	11663863
TTTATACANTTTTATGCTAGACATTGCTGTTTCCTNAAAATCTTTATGTAATCCCCCACTTAGGTCTTATCATA:1	TTTATACANTTTTATGCTAGAC	CCCCCACTTAGGTCTTATCATA	+	chr2L	18254819	+	chr2L	18254918	99	+	chr2L	18254819	+	chr2L	18254918
CGGGTGCAAAAGGTGAGAGGTTGTGGCACATTCGGACACATTCGCAATCCTGCTGCTGGTTCATAAGTGCCCCG:1	CGGGTGCAAAAGGTGAGAGGTT	CTGCTGGTTCATAAGTGCCCCG	-	chr3R	13120863	-	chr3R	13120787	76	+	chr3R	13120787	+	chr3R	13120863
AAATGCAGGCAGCAATTTTATAGAAGGGTTACGAAATGGTAGCATACTTACATGCTCAGCGGT:1	AAATGCAGGCAGCAATTTTATA	GCATACTTACATGCTCAGCGGT	-	chr3R	8412176	-	chr3R	8403022	9154	+	chr3R	8403022	+	chr3R	8412176
CGAGAGCCCCAGGAGCAGGACTTCACCTCCCTTCTGTCCACTGTTNAAGTGCTCATTATGGCATCGCNGCAGCTG:1	CGAGAGCCCCAGGAGCAGGACT	CATTATGGCATCGCNGCAGCTG	-	chr3L	2854577	-	chr3L	2854499	78	+	chr3L	2854499	+	chr3L	2854577
GTTATGGGCATATTTTCACTGATTTACTGTTGNGTAATTAGTTTGAAATCATAACTAATGGATG:1	GTTATGGGCATATTTTCACTGA	TTGAAATCATAACTAATGGATG	-	chr2L	3108948	-	chr2L	3108882	66	+	chr2L	3108882	+	chr2L	3108948
CTCGTAAANAAAGCCAAAAGCCTATCTTCAAGGCCCTNNNNGCGGCTTTGGGCCAACAAAANGCTGGAAAATCGG:1	CTCGTAAANAAAGCCAAAAGCC	CAACAAAANGCTGGAAAATCGG	+	chrX	19118677	+	chrX	20554377	1435700	+	chrX	19118677	+	chrX	20554377
TCTAAACTTACGTCAACTTTAAAGCATCTGACAGCAACTCAAATGCGATTGTTACGAAGAGCAACTCTGG:1	TCTAAACTTACGTCAACTTTAA	TTGTTACGAAGAGCAACTCTGG	-	chr2R	5491855	-	chr2R	5491719	136	+	chr2R	5491719	+	chr2R	5491855
GGCCTTAAGCTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTCGGAGGGAGGATGGAATCTCCTGCAGA:1	GGCCTTAAGCTCCCTGTTATCA	GGAGGATGGAATCTCCTGCAGA	-	chr3L	22572175	-	chr3L	22572098	77	+	chr3L	22572098	+	chr3L	22572175
TTATCTTGAAAATGTTTATTTCCAAGGCTTTGCACTTAATTCAATAACAACCAGACAGCTAATATGTTAATATT:1	TTATCTTGAAAATGTTTATTTC	AGACAGCTAATATGTTAATATT	+	chr3L	10450699	+	chr3L	10450778	79	+	chr3L	10450699	+	chr3L	10450778
TGGTTCCGTGAGAAATATCCACAATATGTGAAGGCTCTCGCCCAGAATCAGAATC:1	TGGTTCCGTGAGAAATATCCAC	GCTCTCGCCCAGAATCAGAATC	+	chr2L	8966393	+	chr2L	8964006	2387	+	chr2L	8966393	+	chr2L	8964006
AATCACCGCCCGGGCACCTCTCTTTGCGTTGGATTATTTTGTAGTGCTTCTCCTCCATCGCTTTTTGGCTCTT:1	AATCACCGCCCGGGCACCTCTC	CCTCCATCGCTTTTTGGCTCTT	-	chr3R	12214435	-	chr3R	12214346	89	+	chr3R	12214346	+	chr3R	12214435
ATTAAATAGTTGTAAAAGTAAATATTATCACAAGGCGCCAAAATGTTTATTAAAATTTCAATTTCGTCCGAAAAT:1	ATTAAATAGTTGTAAAAGTAAA	AATTTCAATTTCGTCCGAAAAT	+	chr3L	482283	+	chr3L	482362	79	+	chr3L	482283	+	chr3L	482362
AATGGCCATTTGAAGTAAGCGGCAATTGCACAAGCAGCTTAAGGACANCGTCGTTTGC:1	AATGGCCATTTGAAGTAAGCGG	GCTTAAGGACANCGTCGTTTGC	+	chr3L	12933126	+	chr3L	12933193	67	+	chr3L	12933126	+	chr3L	12933193
CACTCCGCATACCACTTTTCTCGGGTTTCAGCCAAGAAGAAGACGTTGGCTAGGAACAAGAACAAGAAGATGGCG:1	CACTCCGCATACCACTTTTCTC	GAACAAGAACAAGAAGATGGCG	+	chr2R	24727882	+	chr2R	24735390	7508	+	chr2R	24727882	+	chr2R	24735390
GGCAACGCCCAACCCATGCCCAGTCGTCGAGACTCACCCGCTTGCCACC:1	GGCAACGCCCAACCCATGCCCA	CGAGACTCACCCGCTTGCCACC	-	chr2R	12482940	-	chr2R	12481162	1778	+	chr2R	12481162	+	chr2R	12482940
GAATAAATGTTGGGGGCGTGGCACGTGAAGGTCGGGAATATGAATGGAGTTATCTGCTGTGGCAAGAACTGAGC:1	GAATAAATGTTGGGGGCGTGGC	TCTGCTGTGGCAAGAACTGAGC	-	chrX	3296949	-	chrX	6038202	2741253	+	chrX	6038202	+	chrX	3296949
TCCTTGACCCCTATGTCCGGTCACATTATGCCGAAATGGGATTTTAAATTGAAATTATTCTCATATTATTAA:1	TCCTTGACCCCTATGTCCGGTC	GAAATTATTCTCATATTATTAA	+	chrX	20275378	+	chrX	20275871	493	+	chrX	20275378	+	chrX	20275871
TTTGCTTACGAAAAAGGCTCAGCTTGATCACTGAACTTTTGTTGAGTTCAATTAAGCTGTCGTCATAATTGGCAT:1	TTTGCTTACGAAAAAGGCTCAG	AAGCTGTCGTCATAATTGGCAT	-	chr2R	13590000	-	chr2R	13590099	99	+	chr2R	13590099	+	chr2R	13590000
TGCAGAATTCTGGCAGCTCGTCAGCCGGCTTATCATTTAAATGGAGGGAAGGTGGCTTTAAAGGCAA:1	TGCAGAATTCTGGCAGCTCGTC	GGGAAGGTGGCTTTAAAGGCAA	-	chr2R	14393972	-	chr2R	14393895	77	+	chr2R	14393895	+	chr2R	14393972
TAAGCAAATTTAACAACTTTAGGGGTCCCATTAATGTTTCCTAAATTGAAATTTAACCACCAAACTGCCGGTCAG:1	TAAGCAAATTTAACAACTTTAG	TAACCACCAAACTGCCGGTCAG	-	chr2R	21924866	-	chr2R	21924751	115	+	chr2R	21924751	+	chr2R	21924866
TTGAGCTATATGTCACTCGCTTAAATCGATATGCGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAATTTGGCCGAACAA:1	TTGAGCTATATGTCACTCGCTT	AAAATTGAATTTGGCCGAACAA	-	chr2R	22775401	-	chr2R	22774982	419	+	chr2R	22774982	+	chr2R	22775401
AGACTCTTCCCCCGATNGAGATANATATGTATANACGTNGACATACGACATAGAGATCGATTNGCTTACG:1	AGACTCTTCCCCCGATNGAGAT	CATAGAGATCGATTNGCTTACG	+	chr2R	11415546	+	chr2R	11418690	3144	+	chr2R	11415546	+	chr2R	11418690
AAAATACTTTGGATAACTGCGAGCATTACTAATTAAAATCGTTTTCCTTCCTATTCCTATTTCCAGGTCTTGGCT:1	AAAATACTTTGGATAACTGCGA	TTCCTATTTCCAGGTCTTGGCT	+	chr2R	11676152	+	chr2R	11672704	3448	+	chr2R	11676152	+	chr2R	11672704
GGCAGATGCACGGACTCCNGCTTCTCCCCGCCCACCGCTTNCATAACCCGCACTGAAAAATGCTTTAA:1	GGCAGATGCACGGACTCCNGCT	CCCGCACTGAAAAATGCTTTAA	+	chr2R	16947813	+	chr2R	14142826	2804987	+	chr2R	16947813	+	chr2R	14142826
AGCTCAGTTCAATTTAATTGTATTTTTCATTAAATGTTGATTTCAAGTAACTTTTTAACAACAATCTGTCAATTT:1	AGCTCAGTTCAATTTAATTGTA	TTTAACAACAATCTGTCAATTT	-	chr3L	20849356	-	chr3L	20849277	79	+	chr3L	20849277	+	chr3L	20849356
ACAAAATACTTTCATAAATAGTCATGCGTTATATACAAATACAAAATCTACAATTATGGTCGGT:1	ACAAAATACTTTCATAAATAGT	AAAATCTACAATTATGGTCGGT	-	chr2R	8331360	-	chr2R	8330885	475	+	chr2R	8330885	+	chr2R	8331360
CAAAAGAAAGCGCCCGCCGGNAGCCGAAAGATNGAAGNTCATNCGCGGCACTTTGCCAGGAGTCTTACGACTTC:1	CAAAAGAAAGCGCCCGCCGGNA	TTGCCAGGAGTCTTACGACTTC	+	chr3R	31530818	+	chr3R	31531144	326	+	chr3R	31530818	+	chr3R	31531144
AAAGATACAGATACTTTGCCCCGAACCACAAACGCACCGCTTTTGCTGCCATATGGGCCATGGTCATGGTTTGAG:1	AAAGATACAGATACTTTGCCCC	TGGGCCATGGTCATGGTTTGAG	-	chr3R	18478130	-	chr3R	21825897	3347767	+	chr3R	21825897	+	chr3R	18478130
CAAAAGCAGATGCGGAAATGAGTTTAATATAGTAATGATTATAGCTACACTTTTGATGGGGATTTCGTTTGGCT:1	CAAAAGCAGATGCGGAAATGAG	TTGATGGGGATTTCGTTTGGCT	-	chrX	5884410	-	chrX	5884170	240	+	chrX	5884170	+	chrX	5884410
TCCTTCTTTCGACATCGTCGTCATCCTGCATCGTTGTTAGTTTTTAGCTCGG:1	TCCTTCTTTCGACATCGTCGTC	TCGTTGTTAGTTTTTAGCTCGG	+	chr3L	13615082	+	chr3L	13615157	75	+	chr3L	13615082	+	chr3L	13615157
AATACGAAGTTCTTTCACTTTTAAGACGTCTTCACGTTTATCAAAATTTGACTCACNAAATG:1	AATACGAAGTTCTTTCACTTTT	TCAAAATTTGACTCACNAAATG	+	chr3R	25436508	+	chr3R	25436589	81	+	chr3R	25436508	+	chr3R	25436589
CACCAACCACCCAAAAACTCAGTGGCACTGAGTGTGTGTTGCTCTTACTGCGAGTAATAAGTCAAGTCGCTGGCA:1	CACCAACCACCCAAAAACTCAG	GTAATAAGTCAAGTCGCTGGCA	+	chrX	2803517	+	chrX	2803660	143	+	chrX	2803517	+	chrX	2803660
GCCAAGGATGGCCAGTCGCAACGAGCTGACACATATATAGCTATGTGTGTATAAACCTCGGTTACCNGGTGAAA:1	GCCAAGGATGGCCAGTCGCAAC	AAACCTCGGTTACCNGGTGAAA	+	chr3L	20283404	+	chr3L	20283483	79	+	chr3L	20283404	+	chr3L	20283483
ATGTTCACACTTGCCGAATTGTTTGTTCTGTCCATGGGCAGACACCGAGACTGCAATTCTTTATTTCGTGGCT:1	ATGTTCACACTTGCCGAATTGT	TGCAATTCTTTATTTCGTGGCT	+	chr2L	632707	+	chr2L	632785	78	+	chr2L	632707	+	chr2L	632785
CTGGATGGNTGTCCCTGGGTGTCTGTGTGTTTGCGNAACCTGTAAGTCATTTTCGTGACACAATCTGGAATGGCG:1	CTGGATGGNTGTCCCTGGGTGT	CGTGACACAATCTGGAATGGCG	+	chr3R	24973514	+	chr3R	6974328	17999186	+	chr3R	24973514	+	chr3R	6974328
TTGCACGTTAAATGTTGCCAGCTTTTCGCTTAAGTGCAATGGGAAATGCGACAGCTGCAGCTAGAAA:1	TTGCACGTTAAATGTTGCCAGC	ATGCGACAGCTGCAGCTAGAAA	-	chr3R	9382942	-	chr3R	9382825	117	+	chr3R	9382825	+	chr3R	9382942
AGCAGAAATAAAAACTGAAAGGAAAAGCCAACGCAAATGCGAGCAAAGACAAAAATAATGTGTGTCGGATGCTGG:1	AGCAGAAATAAAAACTGAAAGG	AATAATGTGTGTCGGATGCTGG	-	chr2L	20996976	-	chr2L	21191898	194922	+	chr2L	21191898	+	chr2L	20996976
GATACCCTGCCATGTGACCCCTGATCTCCGGCGCTTCCTTTCCTTTTCTG:1	GATACCCTGCCATGTGACCCCT	CGGCGCTTCCTTTCCTTTTCTG	+	chrX	3584812	+	chrX	2333508	1251304	+	chrX	3584812	+	chrX	2333508
TGTTAATTAAGTGCCATTAACTGAAGGATATAAACGCAATTAGCGCCGAGTAATAATCAAAGAAAAGTGACTGGA:1	TGTTAATTAAGTGCCATTAACT	TAATCAAAGAAAAGTGACTGGA	-	chr3R	21471985	-	chr3R	22421412	949427	+	chr3R	22421412	+	chr3R	21471985
GAGAATTTCCCCTAGCCAAGATCACACTTANNNCNCTTTTTTAAGCGCCCTTCCTGGCTCCACTTTATCCCCTT:1	GAGAATTTCCCCTAGCCAAGAT	CCTGGCTCCACTTTATCCCCTT	-	chrX	12303285	-	chrX	12301980	1305	+	chrX	12301980	+	chrX	12303285
TGATTTTTTTTTTTGGTTTGGCCTCGTTCCACAACCTATGCAATCAGCATAGGCAACAAAAACGATAACA:1	TGATTTTTTTTTTTGGTTTGGC	ATAGGCAACAAAAACGATAACA	+	chr3L	9548824	+	chr3L	6844707	2704117	+	chr3L	9548824	+	chr3L	6844707
AAGAGCGATTATACATGGAAATCAATCACTGATTTAAACGTTATATTNAACTTACTAATTTTCCGACTGCAACTT:1	AAGAGCGATTATACATGGAAAT	ACTAATTTTCCGACTGCAACTT	+	chr3R	23888107	+	chr3R	23888193	86	+	chr3R	23888107	+	chr3R	23888193
TTTTCTGCTTATTTGCCGCAAAGCAAAACTTTGGACTGAAACCGTGGAACGTTGAGCTGGCACTGCAGACAGCAC:1	TTTTCTGCTTATTTGCCGCAAA	GAGCTGGCACTGCAGACAGCAC	-	chr3R	12805195	-	chr3R	12804812	383	+	chr3R	12804812	+	chr3R	12805195
TATTTCCCCGGGTGTGTGCTGTATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATG:1	TATTTCCCCGGGTGTGTGCTGT	GTTCACATTCTATTTCTCAATG	+	chr2R	10585574	+	chr2R	10594155	8581	+	chr2R	10585574	+	chr2R	10594155
TGCGCCTGTCTTGGTTTGTCTCCCTCGCTTGTTATTTTTT:1	TGCGCCTGTCTTGGTTTGTCTC	TCTCCCTCGCTTGTTATTTTTT	+	chr3R	19573069	+	chr3R	29326019	9752950	+	chr3R	19573069	+	chr3R	29326019
GCGTCTTGCAAATGGGCGGTGTGCTAGTGTCCCTTTTCTTGACCGTTTGCGGGTTTCCTCGTTACCATTTGCGAT:1	GCGTCTTGCAAATGGGCGGTGT	TTTCCTCGTTACCATTTGCGAT	+	chr3L	1656411	+	chr3L	16764276	15107865	+	chr3L	1656411	+	chr3L	16764276
AGGTAGTATGGTTGAAACACCTACATGGGTGAATGACTACGATTATTTGAGTACTATTATGCTATTAAGGGAATC:1	AGGTAGTATGGTTGAAACACCT	CTATTATGCTATTAAGGGAATC	+	chr3R	5068008	+	chr3R	5073525	5517	+	chr3R	5068008	+	chr3R	5073525
ATTTACAAAATTAAATTGCGTTTTTAGCATAGAGTGCAGCCTTCGGCGATTCTCAAAAGTTTCCCCNTAAATTTA:1	ATTTACAAAATTAAATTGCGTT	CAAAAGTTTCCCCNTAAATTTA	+	chrX	13875975	+	chrX	13876059	84	+	chrX	13875975	+	chrX	13876059
ACTTATTCTGGATGCCAAGGTCCAGCAGATTCTAAATTGGAAGACCGCCGTTGTTTTTGTGGATCAAACCATATG:1	ACTTATTCTGGATGCCAAGGTC	TTTTTGTGGATCAAACCATATG	-	chr3R	20859303	-	chr3R	20854513	4790	+	chr3R	20854513	+	chr3R	20859303
ATCTCTCTGGTGCCATCATTTAAGTAACATAACATAATTTAAGTAACACACACTCGTGTAGGCTGTGTACTCTTG:1	ATCTCTCTGGTGCCATCATTTA	TCGTGTAGGCTGTGTACTCTTG	+	chr2L	13032512	+	chr2L	13032608	96	+	chr2L	13032512	+	chr2L	13032608
TATGTGTGTATCGCGAATGGGAAGCTTTCTAACTGGCATCCAGGACGCGAATGAAGCGCCAGTCGTTCGTCGC:1	TATGTGTGTATCGCGAATGGGA	TGAAGCGCCAGTCGTTCGTCGC	-	chr3R	16472660	-	chr3R	16472586	74	+	chr3R	16472586	+	chr3R	16472660
GTAGGCGCCTTGCCAAGTTGCGAGTTGTGCAAAAAAGGAATGATTATCTGAAATTCTTTCAGGATTTTTATATTA:1	GTAGGCGCCTTGCCAAGTTGCG	TTCTTTCAGGATTTTTATATTA	-	chr3R	15556451	-	chr3R	19992398	4435947	+	chr3R	19992398	+	chr3R	15556451
TTTGTTGAGTGTACTCTANCTTGGGTTGGGTTCAGTGGGTTNCTTNTGCTCCAATAGATGCGGATGATG:1	TTTGTTGAGTGTACTCTANCTT	GCTCCAATAGATGCGGATGATG	-	chr2L	15468878	-	chr2L	15468799	79	+	chr2L	15468799	+	chr2L	15468878
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAA:10	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
AATAAATTTCAATTGACTGAACCTTGTTTGCTTGTTTTGAAAAGCCAAAACCAATTAGCTTTGACTTTACATCT:1	AATAAATTTCAATTGACTGAAC	AATTAGCTTTGACTTTACATCT	-	chr3L	932612	-	chr3L	925187	7425	+	chr3L	925187	+	chr3L	932612
TTTGGGAAACTAATAATGAATAAGCAAAGGCCTACCTACTATTATAATCCTTTTTTTGCCACTGCCTAATC:1	TTTGGGAAACTAATAATGAATA	CTTTTTTTGCCACTGCCTAATC	-	chr2R	23346614	-	chr2R	23346542	72	+	chr2R	23346542	+	chr2R	23346614
GGAGCTGTTTATCAAAATCTCTACGTTTCGCGCTCGTTCTCGATGGTATACGCCGC:1	GGAGCTGTTTATCAAAATCTCT	CGTTCTCGATGGTATACGCCGC	-	chr2L	18078363	-	chr2L	18078296	67	+	chr2L	18078296	+	chr2L	18078363
AGAGGGAATTGACTGAAACGATTGGAAAGAAGGATTCGCGGTGTACTCGTAATCTGAACNGCCCTGTT:1	AGAGGGAATTGACTGAAACGAT	TCGTAATCTGAACNGCCCTGTT	-	chr2R	24303990	-	chr2R	24303913	77	+	chr2R	24303913	+	chr2R	24303990
CAGAGGAGAATCATTACTCACCGCACAGGAAAGCCTTCCCCGGTTGAATTGTTCATGCGTAATAATT:1	CAGAGGAGAATCATTACTCACC	GAATTGTTCATGCGTAATAATT	-	chr3R	13380818	-	chr3R	13380738	80	+	chr3R	13380738	+	chr3R	13380818
TTCGTTAAAAGTGATTCACCCATTCAAAAGNNNTNTATCTAAATTAACCAAAATTAGTTATGATAAGGCGCAATT:1	TTCGTTAAAAGTGATTCACCCA	TTAGTTATGATAAGGCGCAATT	-	chr2R	14911830	-	chr2R	14911707	123	+	chr2R	14911707	+	chr2R	14911830
ATAGCAAAAGGACACTGAAAGAAAACTATTTCCGCAAAATAGTTTGTGAGTAAAGACTTTACTAGAGTTGG:1	ATAGCAAAAGGACACTGAAAGA	GTAAAGACTTTACTAGAGTTGG	-	chr3L	7212958	-	chr3L	23727302	16514344	+	chr3L	23727302	+	chr3L	7212958
AGAGTGGTATGTGGAAGTGGTAGTGGCCCAGAAGTTCCGCTGGATTCCAGCTAACTCTGACA:1	AGAGTGGTATGTGGAAGTGGTA	TGGATTCCAGCTAACTCTGACA	+	chr3R	10731450	+	chr3R	10731539	89	+	chr3R	10731450	+	chr3R	10731539
AGGCTTTTTTGGGTTTGGTATATGGTATATGGCCAGAAGGAGGGCGTGCGATACATGGTCCAGGTAGACACATGA:1	AGGCTTTTTTGGGTTTGGTATA	CATGGTCCAGGTAGACACATGA	-	chr2R	15127823	-	chr2R	15119342	8481	+	chr2R	15119342	+	chr2R	15127823
GTAGTTTTGGTTTAGTTGCATGCGCCCACACCCAGCCTCTGGGTTGGAAAAGCAAAGGAAAGTGGAAAGTGGAAA:1	GTAGTTTTGGTTTAGTTGCATG	AAAGGAAAGTGGAAAGTGGAAA	-	chr3L	19417896	-	chr3L	19417816	80	+	chr3L	19417816	+	chr3L	19417896
GCACCTCCGATATCAGCAGCGTCTCGGCATTTTCGAACTCTGAAACGAAGGGAAACGAAAGGATTTTGTTTAAAA:1	GCACCTCCGATATCAGCAGCGT	AACGAAAGGATTTTGTTTAAAA	+	chr3R	18253417	+	chr3R	18951860	698443	+	chr3R	18253417	+	chr3R	18951860
AACGAAACGGATTTTCCAGTATGCGTGCACCTAGAGTGCCATTCCCCAGGGAAAACTGGACAG:1	AACGAAACGGATTTTCCAGTAT	TTCCCCAGGGAAAACTGGACAG	+	chr2L	21041163	+	chr2L	21049412	8249	+	chr2L	21041163	+	chr2L	21049412
AATGTATTATTTTGGTTNAGTTTGGCAATGTGCAATTCTTTTGCTACAATACATTGCTATTTACCTGGCCTCCAT:1	AATGTATTATTTTGGTTNAGTT	TTGCTATTTACCTGGCCTCCAT	-	chrX	3513855	-	chrX	3513772	83	+	chrX	3513772	+	chrX	3513855
ACAAATTCCAACCAATAAACCAAAAATGACAAAGCCAAAATCCAGACATTGAGCAGAGAAATATGACAAGCCAAC:1	ACAAATTCCAACCAATAAACCA	CAGAGAAATATGACAAGCCAAC	+	chr3R	7428992	+	chr3R	7429080	88	+	chr3R	7428992	+	chr3R	7429080
AATCACTTTGGTTTGACTTTAGTAAGTCAGGCGGACGAACGAATCTGAAAAGGGAATGTATNTATAGGGAAAATT:1	AATCACTTTGGTTTGACTTTAG	GAATGTATNTATAGGGAAAATT	+	chr3L	20148290	+	chr3L	20148380	90	+	chr3L	20148290	+	chr3L	20148380
TAAGGACACCTTAAGATAGGCCACATATCAGTTCACCAACCTTGACAAACGACTG:1	TAAGGACACCTTAAGATAGGCC	CACCAACCTTGACAAACGACTG	+	chrX	16329445	+	chrX	16329508	63	+	chrX	16329445	+	chrX	16329508
AAATGTTGTTTCAGAATCATTAGAAATGTTAAAGTAACTACTTTGAATAAGTTT:1	AAATGTTGTTTCAGAATCATTA	AGTAACTACTTTGAATAAGTTT	-	chr3R	12000225	-	chr3R	11005539	994686	+	chr3R	11005539	+	chr3R	12000225
TTCCNTTGCCACCCATACCATTNCCATNCTGTCCACCCANTCCGTTTCCATACTGACCACCCATTCCGTTTCCAT:1	TTCCNTTGCCACCCATACCATT	TGACCACCCATTCCGTTTCCAT	-	chr2L	17286872	-	chr2L	17286795	77	+	chr2L	17286795	+	chr2L	17286872
AAAAGATTTGCATATATACTCCAACAGAAAAGACCTTTGTAGGAAATACTTACCATTTCAAAGAATCATCATATA:1	AAAAGATTTGCATATATACTCC	CATTTCAAAGAATCATCATATA	+	chr3L	17834328	+	chr3L	17834492	164	+	chr3L	17834328	+	chr3L	17834492
TCTTCGGTTTGCTTTTCCAACACTCTGTACCGAACGATGAGCTGCCTTTGCAGCCATGTGCTCTAATTCTATTTT:1	TCTTCGGTTTGCTTTTCCAACA	CCATGTGCTCTAATTCTATTTT	-	chr2R	16737264	-	chr2R	16737164	100	+	chr2R	16737164	+	chr2R	16737264
TGAGTGGCCTTGCACTGGGCCAAAATGCATCGAAAGAGTTTACTAATAATGAAGCGCGACAATTTGGCTAATTGA:1	TGAGTGGCCTTGCACTGGGCCA	GCGCGACAATTTGGCTAATTGA	-	chrX	10064229	-	chrX	9613315	450914	+	chrX	9613315	+	chrX	10064229
GTTTGGGCACTTGGCAATTTACTGCGCTGGCGACAATAAAACGGGTCCGAAACA:1	GTTTGGGCACTTGGCAATTTAC	ACAATAAAACGGGTCCGAAACA	-	chr3R	30473794	-	chr3R	30473699	95	+	chr3R	30473699	+	chr3R	30473794
TACAAGTTCTAATAGTTGACCAGCTTAACTGCTTGACTAGCTTAAAATTGTTTTCATATATCTCAAAGTCCCTCT:1	TACAAGTTCTAATAGTTGACCA	TCATATATCTCAAAGTCCCTCT	+	chr2R	6168202	+	chr2R	6168284	82	+	chr2R	6168202	+	chr2R	6168284
TGTATGTATGTACATATATGCCATATACATATATACATATTCTACATGTGCAACGAGCTCTTTAAGCCGGGCCTC:1	TGTATGTATGTACATATATGCC	CGAGCTCTTTAAGCCGGGCCTC	+	chrX	16763383	+	chrX	8832035	7931348	+	chrX	16763383	+	chrX	8832035
TGTCGGAAAGCATGGAGAATATATCTAAAACTTATAATGGTTATATTCTATAGAACAAAGTTACAATATTAGTAC:1	TGTCGGAAAGCATGGAGAATAT	AACAAAGTTACAATATTAGTAC	-	chr3L	8295960	-	chr3L	8295802	158	+	chr3L	8295802	+	chr3L	8295960
CGAGTTCTGAGACCCTCTTGTGAACTCTGATCTACGAACATTAAGTTCATGGCAAATGTCATT:1	CGAGTTCTGAGACCCTCTTGTG	TAAGTTCATGGCAAATGTCATT	-	chr2L	4166473	-	chr2L	4166402	71	+	chr2L	4166402	+	chr2L	4166473
TTTGCAAATACAACTTGCTAACAGCAAATAAATGTAATTTGCGAACAACACGCAGCCAAACGCACGGAATGACGC:1	TTTGCAAATACAACTTGCTAAC	AGCCAAACGCACGGAATGACGC	+	chr3L	11087082	+	chr3L	11088871	1789	+	chr3L	11087082	+	chr3L	11088871
GGTATAAACTAAGCATTGTATTTCGGGTATACTTAAGGTAACTGC:1	GGTATAAACTAAGCATTGTATT	CGGGTATACTTAAGGTAACTGC	-	chr3R	4904878	-	chr3R	18214614	13309736	+	chr3R	18214614	+	chr3R	4904878
TTCGTATTAATGACCTTTGGTCATCCGATGTTTGTACCTTTCTCCTAGCTTCTCGTGATATAGGGATGTTAGCTA:1	TTCGTATTAATGACCTTTGGTC	CGTGATATAGGGATGTTAGCTA	-	chrX	18122925	-	chrX	18122849	76	+	chrX	18122849	+	chrX	18122925
AAGGAGGATTAATTGAGATAATGGGGTTAATTTAGTTTTATAGTTTTTTTTATAGGATTATAGTTTTCTAGAATT:1	AAGGAGGATTAATTGAGATAAT	AGGATTATAGTTTTCTAGAATT	-	chr3R	6828115	-	chr3R	6828039	76	+	chr3R	6828039	+	chr3R	6828115
AATTGCACATTTTATCCAACTGCATAGCATTTGATAGATGACTTAGCAAAAAGCAATGGAAACAATGNCACAACT:1	AATTGCACATTTTATCCAACTG	CAATGGAAACAATGNCACAACT	-	chr2L	12305520	-	chr2L	12305432	88	+	chr2L	12305432	+	chr2L	12305520
TATAAAAACCAATATTTANTTTGCTTTCCATCCATCGTTTGTTNAGCCCNCAGTGGAGCCTTTGCTTACCTACGA:1	TATAAAAACCAATATTTANTTT	TGGAGCCTTTGCTTACCTACGA	+	chr3L	16971232	+	chr3L	16971310	78	+	chr3L	16971232	+	chr3L	16971310
GTTTCCCCATGGTAAATACCTCAACTTAATACCTAACTTCACAGAAGAATGATTTCCGTTCGGAGAAAA:1	GTTTCCCCATGGTAAATACCTC	AATGATTTCCGTTCGGAGAAAA	-	chr2L	10945332	-	chr2L	10945079	253	+	chr2L	10945079	+	chr2L	10945332
TTTAGTGCCGCAGCCGAAAAAAAACCAAGAAAAGGACCGGAGCTCGGACAGAAAACACATTGTTNGCAGCACGG:1	TTTAGTGCCGCAGCCGAAAAAA	AAACACATTGTTNGCAGCACGG	-	chr3L	19115814	-	chr3L	19115635	179	+	chr3L	19115635	+	chr3L	19115814
ACATATGTACATATGTACTTTAAAGTTTGACAGTCGACGGGAAAT:1	ACATATGTACATATGTACTTTA	AGTTTGACAGTCGACGGGAAAT	+	chrX	12743118	+	chrX	13786512	1043394	+	chrX	12743118	+	chrX	13786512
CGTGTTACACGCCTATAACAAAGACTCACGTAGTTTGATTGTGCGCCGCTGCCAAGGCAACAAAATGGAATTGGC:1	CGTGTTACACGCCTATAACAAA	AAGGCAACAAAATGGAATTGGC	-	chrX	15264015	-	chrX	15263652	363	+	chrX	15263652	+	chrX	15264015
TCATTGAATTTTTGTTCATCTGCTTGTGAACTTTTTAGCTTTTATTGTGTCGCTTGGCAATTTAATGAATTTTAA:1	TCATTGAATTTTTGTTCATCTG	TTGGCAATTTAATGAATTTTAA	-	chr3L	6042741	-	chr3L	6040385	2356	+	chr3L	6040385	+	chr3L	6042741
CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAGACAAGACAAGACAAGA:2	CAACACAACACAACACAACACA	CACAAGACAAGACAAGACAAGA	-	chr2L	16217660	-	chr2L	21768294	5550634	+	chr2L	21768294	+	chr2L	16217660
AGTATATTGTTCTTCATCATCGTATGTTTTATTAAAAGCAGCTGTACTTAATTAGTAATTATTGAAGTTCTTCA:1	AGTATATTGTTCTTCATCATCG	TAGTAATTATTGAAGTTCTTCA	+	chr3R	19827526	+	chr3R	19827611	85	+	chr3R	19827526	+	chr3R	19827611
ACACAACACAACACAACACAACACAACACACACACACACACACACACACACATATGATGGAAGGGGGAGGAGGAG:1	ACACAACACAACACAACACAAC	ATGATGGAAGGGGGAGGAGGAG	+	chr3R	21907534	+	chr3R	29362617	7455083	+	chr3R	21907534	+	chr3R	29362617
TAAATAGCGCAGTTTATACGGGCCTGCAGTGCAATTGAATGTGAATGAATAAAGTATTTGGAGTTCTTAGTCTG:1	TAAATAGCGCAGTTTATACGGG	AGTATTTGGAGTTCTTAGTCTG	-	chr2R	21461983	-	chr2R	21461739	244	+	chr2R	21461739	+	chr2R	21461983
ATTGTTGTGGGGCGAGCTGAATCGAAGTGCTTTTTTTTATTAATGTTGTACA:1	ATTGTTGTGGGGCGAGCTGAAT	TTTTTTTTATTAATGTTGTACA	+	chrX	17630140	+	chrX	17632230	2090	+	chrX	17630140	+	chrX	17632230
AGCAATACGGAAAAACTTTCAACTGCAAGTGGCAGACAGCTCAAGACAATACAAACAAACAGACGGTTCACTTGG:1	AGCAATACGGAAAAACTTTCAA	AACAAACAGACGGTTCACTTGG	-	chr3R	14842676	-	chr3R	14842592	84	+	chr3R	14842592	+	chr3R	14842676
CAAAAATTGACTCTTTCCCCCAAAAACGGTACTGCAGCGACTTCACTTTGTTCTTGAAANA:1	CAAAAATTGACTCTTTCCCCCA	ACTTCACTTTGTTCTTGAAANA	-	chr2R	8865098	-	chr2R	8864879	219	+	chr2R	8864879	+	chr2R	8865098
AGGAAGCATATATTTAAAATGCAATTGGAATAAACAAACACATAAATCCGATGTATATATATTACTCATATGCA:1	AGGAAGCATATATTTAAAATGC	GTATATATATTACTCATATGCA	-	chr3L	10745646	-	chr3L	10745567	79	+	chr3L	10745567	+	chr3L	10745646
TGTAAACCGGTTTGTGCTTAAGAATCAAATACAGAACTGAAATGAGTCTGAAAACTAATTAACTGGCACACT:1	TGTAAACCGGTTTGTGCTTAAG	AAAACTAATTAACTGGCACACT	-	chr2R	22118526	-	chr2R	22118451	75	+	chr2R	22118451	+	chr2R	22118526
GTTGAGAGAGTGCCCAAGACCCCGAATACNAGCCAGCATCACATTATCAGACAGGCAG:1	GTTGAGAGAGTGCCCAAGACCC	CATCACATTATCAGACAGGCAG	-	chr3L	12125017	-	chr3L	13884226	1759209	+	chr3L	13884226	+	chr3L	12125017
GGATAGCGTCTGGATGCAAAGGAGCTCCACGGATGGTCCTTCCATCCACGCAGAGAGCTGGCGC:1	GGATAGCGTCTGGATGCAAAGG	CATCCACGCAGAGAGCTGGCGC	-	chr3R	20735114	-	chr3R	20735039	75	+	chr3R	20735039	+	chr3R	20735114
GGAAACGAATACAAAAATTCAATAAAGCCTGAAAAATCGAAAAAAGCTAGAGGGTTAATCCTCGCGAAGCTGATA:1	GGAAACGAATACAAAAATTCAA	GTTAATCCTCGCGAAGCTGATA	+	chr3R	28035491	+	chr3R	28035568	77	+	chr3R	28035491	+	chr3R	28035568
CATTTTTGTCTACCCGAAATGTTTGTGAATAATTTTCAAAGTGCTCACCTTCATTTTCGCTGCGTCGTCGC:1	CATTTTTGTCTACCCGAAATGT	TTCATTTTCGCTGCGTCGTCGC	+	chr3L	2534633	+	chr3L	2534712	79	+	chr3L	2534633	+	chr3L	2534712
AAGAAAAGTGATATACATTTGGGGCGAACTAAGCCCTTATCCTTTTTATTTCCAACACTATATTTTANGCATATA:1	AAGAAAAGTGATATACATTTGG	AACACTATATTTTANGCATATA	-	chr3R	30170867	-	chr3R	30170780	87	+	chr3R	30170780	+	chr3R	30170867
TATCGGGCCATCAAATTCAATTGCATGTGTAAGTTATTTTACAATGGATTATGAATGGCCTGACCCGCATAAGGG:1	TATCGGGCCATCAAATTCAATT	AATGGCCTGACCCGCATAAGGG	+	chr2L	1842299	+	chr2L	1842375	76	+	chr2L	1842299	+	chr2L	1842375
TCTGGCATTTTATTAGACACTATAATTTCNGATTCTGTCCCATTTATTCTTCGAGCCGTTNTCTTAGCGGTCGAA:1	TCTGGCATTTTATTAGACACTA	AGCCGTTNTCTTAGCGGTCGAA	-	chr2L	10692897	-	chr2L	10692799	98	+	chr2L	10692799	+	chr2L	10692897
ATNAATTCAGTTACAGTGTCGTAAAAATGCCAAANANGAACTCATAAAAGTTGCTGGGCCAGTGCTTCACAAATT:1	ATNAATTCAGTTACAGTGTCGT	CTGGGCCAGTGCTTCACAAATT	-	chr3L	11765480	-	chr3L	7290925	4474555	+	chr3L	7290925	+	chr3L	11765480
ACTNTCACCCGGACTACGGCATAAATCATGGCTGGCATGCAGCTAATCTTCGTCCTGGCCAAGT:1	ACTNTCACCCGGACTACGGCAT	CTAATCTTCGTCCTGGCCAAGT	+	chr3L	5476194	+	chr3L	5476264	70	+	chr3L	5476194	+	chr3L	5476264
CGCACACAAACACACGCACACACACACACAGAGACACTGGGAAAAGGCAACTTTTCAGGATATA:1	CGCACACAAACACACGCACACA	AAAGGCAACTTTTCAGGATATA	+	chr3R	31060569	+	chr3R	22499275	8561294	+	chr3R	31060569	+	chr3R	22499275
GAACGCGGCTCCAAACCAAAGATACAAAAAGAAAAAAAAGGAGGAAAACAATTGCTTTTGCAAATAATTTGTTAA:1	GAACGCGGCTCCAAACCAAAGA	GCTTTTGCAAATAATTTGTTAA	-	chr3R	26923617	-	chr3R	9742276	17181341	+	chr3R	9742276	+	chr3R	26923617
CGTCTAGTAAATTATTTACAGTGTCCCAGGGCAGTGGGCCGGCGAATAAACAAAAAACACATTGACCTCGCCCA:1	CGTCTAGTAAATTATTTACAGT	AAAAACACATTGACCTCGCCCA	+	chr3L	2987755	+	chr3L	2988016	261	+	chr3L	2987755	+	chr3L	2988016
ATTACCTANGGACCCCAGGCCATCTGGAGCTTAACAATTAAAATGGGTGGGTAGTGTAAGCTTAAAAGTAGTTAA:1	ATTACCTANGGACCCCAGGCCA	GTGTAAGCTTAAAAGTAGTTAA	+	chr3R	15601165	+	chr3R	15608687	7522	+	chr3R	15601165	+	chr3R	15608687
AATACCAAGCCACGAAATAAAGAATTGCAGTCTCGGTGTCTGCCCATGGACAGAACAAACAAATCGGCAAGTGTG:1	AATACCAAGCCACGAAATAAAG	AACAAACAAATCGGCAAGTGTG	-	chr2L	632792	-	chr2L	632712	80	+	chr2L	632712	+	chr2L	632792
GCGGTCAAAGGTAGCAAAACCACAAAACTGTGTCCCAGAAGAAGAACCTTTTCAAGTGACCCAGTGCAACACGAC:1	GCGGTCAAAGGTAGCAAAACCA	AAGTGACCCAGTGCAACACGAC	-	chr2L	15031806	-	chr2L	15031566	240	+	chr2L	15031566	+	chr2L	15031806
ATTATGCTTGCGAGAATCTTGTGGACGCCTTCGTATGCAAATGATGATGATG:1	ATTATGCTTGCGAGAATCTTGT	TCGTATGCAAATGATGATGATG	+	chr2R	11974591	+	chr2R	7317201	4657390	+	chr2R	11974591	+	chr2R	7317201
TTCGCTGTNAGGCGCGCGATTCAGCAAGGGGGGGGGGGTGGGGG:1	TTCGCTGTNAGGCGCGCGATTC	AGCAAGGGGGGGGGGGTGGGGG	+	chrX	2460527	+	chrX	7783749	5323222	+	chrX	2460527	+	chrX	7783749
CCATCGCGAAGATCGCATANTAGTTACACTTTCGCGGGGCTTCTTCATCCAGTCGAAGTATGGCGG:1	CCATCGCGAAGATCGCATANTA	TCATCCAGTCGAAGTATGGCGG	-	chr2L	14218925	-	chr2L	20771855	6552930	+	chr2L	20771855	+	chr2L	14218925
CCTTCTGCAATGGTATACAAATTTACTCAGTTTCGATTTCCGAAGAAACTAGCTTTTTACTTAAAGACTTCTAAA:1	CCTTCTGCAATGGTATACAAAT	TTTTTACTTAAAGACTTCTAAA	+	chr3L	22952408	+	chr3L	23935144	982736	+	chr3L	22952408	+	chr3L	23935144
TTATAACAAGCCCTTCGCATGTACATATGTATGTATGTATATATGACCATTACATCCCTTGATTTTCTCAT:1	TTATAACAAGCCCTTCGCATGT	TTACATCCCTTGATTTTCTCAT	+	chrX	12930604	+	chrX	12937716	7112	+	chrX	12930604	+	chrX	12937716
AGAAAATATTTCGGATGCTCTGTTTTGGCTCTGCGAATCGTCATCAACAAACTTTTCCT:1	AGAAAATATTTCGGATGCTCTG	TCGTCATCAACAAACTTTTCCT	+	chr2R	3914905	+	chr2R	3291790	623115	+	chr2R	3914905	+	chr2R	3291790
ATTTTTCACGGCGAATTGTTGGTTCGTATTTTTCTTGTTTCCGGCGTTTGGGCTTTGGATTTACAAT:1	ATTTTTCACGGCGAATTGTTGG	GTTTGGGCTTTGGATTTACAAT	+	chr2R	17992139	+	chr2R	17992207	68	+	chr2R	17992139	+	chr2R	17992207
ATATATTACATTGCTCGACAACATTAGGCGGAGATCTCAAACAAACGAAAGAGAATCCGTGCTGTGACACTTGAA:1	ATATATTACATTGCTCGACAAC	AATCCGTGCTGTGACACTTGAA	+	chr3L	5224303	+	chr3L	5376169	151866	+	chr3L	5224303	+	chr3L	5376169
ATGTAACTATTTATTTAATTTCACCAGTATTAGAGTGCTCTCCACATTGCAAATGTTCAGTGAAGAATTTTG:1	ATGTAACTATTTATTTAATTTC	AAATGTTCAGTGAAGAATTTTG	-	chr3R	15892757	-	chr3R	15892679	78	+	chr3R	15892679	+	chr3R	15892757
TATTTCCAAAGGTTTTCGGGACGCATATTCNNNGNATATCCGTTGGCCAGAAGAATGTTTGTGTATATGTAGGCA:1	TATTTCCAAAGGTTTTCGGGAC	AATGTTTGTGTATATGTAGGCA	-	chr3R	24426573	-	chr3R	24426316	257	+	chr3R	24426316	+	chr3R	24426573
TATGCACAATAATGTTGTTTCGTTCGTGGGCAACTTCATAACTTTTAATTAA:1	TATGCACAATAATGTTGTTTCG	CAACTTCATAACTTTTAATTAA	-	chrX	22701784	-	chrX	22697510	4274	+	chrX	22697510	+	chrX	22701784
TATCGAATTTCCCTAGCTGAAAACCCATTTCCTGAATTCCTCGANAACTGAATGGGAGCCTAAAGACCGCTAA:1	TATCGAATTTCCCTAGCTGAAA	ATGGGAGCCTAAAGACCGCTAA	+	chr3R	26885713	+	chr3R	26885811	98	+	chr3R	26885713	+	chr3R	26885811
GACAGAGCGCAACAACGGCCACATGAAATGTAACCAGAATCGAGTGCAGTCGATGAACCCCATAG:1	GACAGAGCGCAACAACGGCCAC	GTGCAGTCGATGAACCCCATAG	+	chr2L	12647722	+	chr2L	12647794	72	+	chr2L	12647722	+	chr2L	12647794
GCAAAAAGAAAATTATATATGTATTAGTGATAATAAGTGATAAATTGTTTAGTTAAGGCTATTACAATAACTGAC:1	GCAAAAAGAAAATTATATATGT	TAAGGCTATTACAATAACTGAC	+	chr2L	106981	+	chr2L	107061	80	+	chr2L	106981	+	chr2L	107061
GAACAATATCGATCCGAATCCCTAGCATAGTCAAGCTGGCCATGTACGTCGAGATAAAAAAAGGTAGTAAGTCGG:1	GAACAATATCGATCCGAATCCC	ATAAAAAAAGGTAGTAAGTCGG	-	chr2L	20583710	-	chr2L	20576242	7468	+	chr2L	20576242	+	chr2L	20583710
GGACTTGCCTTTGGTTTGCTCGGATCGGTAAAGTTTGT:1	GGACTTGCCTTTGGTTTGCTCG	TGCTCGGATCGGTAAAGTTTGT	-	chr2L	7210287	-	chr2L	16790668	9580381	+	chr2L	16790668	+	chr2L	7210287
TTAAGGTGTTGGCGGCACNTTTCTTTCACGGCCTTTTGAATACCCTTTCGAGGCAAACAGATGACCAGATGGNCA:1	TTAAGGTGTTGGCGGCACNTTT	CAAACAGATGACCAGATGGNCA	-	chr3R	13946196	-	chr3R	13945873	323	+	chr3R	13945873	+	chr3R	13946196
TATTAGTTAAAATTCGTTCAAGTGAAGTCTATATAGTTCCATCAAAGATCAATGCCATTGGCTTAATTGAGTTT:1	TATTAGTTAAAATTCGTTCAAG	TGCCATTGGCTTAATTGAGTTT	+	chr3R	21154574	+	chr3R	21154788	214	+	chr3R	21154574	+	chr3R	21154788
CGACCAGCAAAATGGGCAAAAAGTTTCCGTCCTCTTAAATGTGAATGCAAATATATTCGACTGCGGACTGAGATT:1	CGACCAGCAAAATGGGCAAAAA	TATTCGACTGCGGACTGAGATT	-	chrX	4792826	-	chrX	4792393	433	+	chrX	4792393	+	chrX	4792826
AGTTAATTATTCAAAGTTGCTCATACGCAACGTTGTCGCTGCCAGCCATGCACCGTACGCCATAAAGCGTCACAT:1	AGTTAATTATTCAAAGTTGCTC	CGTACGCCATAAAGCGTCACAT	+	chr2R	10167112	+	chr2R	10167188	76	+	chr2R	10167112	+	chr2R	10167188
CGGGCCCTAAACAATAGGCCGGCGTAATAAATGTTCCGCCATGCAGGCCAAATAGCATGCAATAAATTTCGCAAC:1	CGGGCCCTAAACAATAGGCCGG	AGCATGCAATAAATTTCGCAAC	+	chr2L	19697167	+	chr2L	19697260	93	+	chr2L	19697167	+	chr2L	19697260
CTGTGGGCATTCAGGGAATTGGGCGTTTTGACACACCTCGACGCTGTGTTCCAACGTGTCCTGCTTATTGGTTTT:1	CTGTGGGCATTCAGGGAATTGG	ACGTGTCCTGCTTATTGGTTTT	-	chr3L	22665109	-	chr3L	22665022	87	+	chr3L	22665022	+	chr3L	22665109
ATTATGACGACAGCTTAATTGAACTCAACAAAAGTTCAGTGATCAAGCTGAGCCTTTTTCGTAAGCAAATTAGAG:1	ATTATGACGACAGCTTAATTGA	CTTTTTCGTAAGCAAATTAGAG	+	chr2R	13590105	+	chr2R	13590006	99	+	chr2R	13590105	+	chr2R	13590006
GACCAAAATTCATGCTTTTCCATCACATACAAAATTACATCGCTGCGATTTTGAAAGAAAATTCTTATGGCGC:1	GACCAAAATTCATGCTTTTCCA	TGAAAGAAAATTCTTATGGCGC	-	chr3L	7926007	-	chr3L	7916838	9169	+	chr3L	7916838	+	chr3L	7926007
TTCTCATTTGCGATCGTTTAATATGCCATGNNNGNGTTGGGTTCAGTTCCATCTGTCATGGGCTATCAA:1	TTCTCATTTGCGATCGTTTAAT	TCCATCTGTCATGGGCTATCAA	+	chr3R	22185142	+	chr3R	22185233	91	+	chr3R	22185142	+	chr3R	22185233
ATAAGCGANATGGCATCGCATCGCATCGCATCGCT:1	ATAAGCGANATGGCATCGCATC	CATCGCATCGCATCGCATCGCT	-	chrX	16670996	-	chrX	8332068	8338928	+	chrX	8332068	+	chrX	16670996
TAAAATTAGGTTAGTCCTCCTCTACGTCTTGATTAGGCATTTATTGAAAAATTAAGGA:1	TAAAATTAGGTTAGTCCTCCTC	GCATTTATTGAAAAATTAAGGA	+	chr2R	4634173	+	chr2R	4634235	62	+	chr2R	4634173	+	chr2R	4634235
TGCCTACATATACACAAACATTCCTCTGGCCAACGGATATGCCATGANTATGCGTCCCGAAAACCTTNGGAAATA:1	TGCCTACATATACACAAACATT	GTCCCGAAAACCTTNGGAAATA	+	chr3R	24426316	+	chr3R	24426573	257	+	chr3R	24426316	+	chr3R	24426573
CACCTTTTAAGTGCCCCCCTTCCATCAACTGCCACAATTAGCCTTTTTGATTACCAATAGATACAATCAATGAAG:1	CACCTTTTAAGTGCCCCCCTTC	CCAATAGATACAATCAATGAAG	-	chr2L	15000877	-	chr2L	15001003	126	+	chr2L	15001003	+	chr2L	15000877
TATGTTGCATTCTATTATCTGTCTATTGGTGATGATAAATATTACTCATAAAGCTGCACTATTTCATCGTTATTT:1	TATGTTGCATTCTATTATCTGT	CTGCACTATTTCATCGTTATTT	-	chrX	18832361	-	chrX	18832269	92	+	chrX	18832269	+	chrX	18832361
GAAGTGAGCTCGAAAAGTCAAATGAATTCGGTTAGTTGTGGGTGCTGTTAAATCGGGCATTACTTGTCACTTGA:1	GAAGTGAGCTCGAAAAGTCAAA	TCGGGCATTACTTGTCACTTGA	-	chrX	20886779	-	chrX	4496030	16390749	+	chrX	4496030	+	chrX	20886779
GTGCACAAATGCCGGAAAAGGTGGCCGGTGGGGTTGCGCCAACGGGAAAATTCCCCTTGGAGTGCACCGCAAATT:1	GTGCACAAATGCCGGAAAAGGT	CCCTTGGAGTGCACCGCAAATT	+	chr3L	15853724	+	chr3L	21399374	5545650	+	chr3L	15853724	+	chr3L	21399374
TTCAATCCATTGTCGTTGGCTTTTTCGCACCCCGAAGCTTATTGTCGTGCTCGGAGATTGCGTGTT:1	TTCAATCCATTGTCGTTGGCTT	TCGTGCTCGGAGATTGCGTGTT	-	chr2R	13089876	-	chr2R	13089775	101	+	chr2R	13089775	+	chr2R	13089876
CACCATACAGCTAATGTACCCTACCATAAACGCCCACTCCGAGAAAAGCCTAGAAAATAAAACTAAAATTAGTAG:1	CACCATACAGCTAATGTACCCT	AAAATAAAACTAAAATTAGTAG	+	chr2R	14681651	+	chr2R	14681733	82	+	chr2R	14681651	+	chr2R	14681733
AACAAGTCGGGAAATTTGAAATCGGTTCAGTTGAGTGCTTTTTCT:1	AACAAGTCGGGAAATTTGAAAT	GGTTCAGTTGAGTGCTTTTTCT	+	chr3R	20764702	+	chr3R	31607727	10843025	+	chr3R	20764702	+	chr3R	31607727
ATTGACAGATTGTTGTTAAAAAGTTACTTGAAATCAACATTTAATGANAAATACAATTAAATTGAACTGAGCTTA:1	ATTGACAGATTGTTGTTAAAAA	CAATTAAATTGAACTGAGCTTA	+	chr3L	20849279	+	chr3L	20849358	79	+	chr3L	20849279	+	chr3L	20849358
AAACCTACCTTAGCTTCCTTACCTTCTCATGTTTTAATTATAAAGTGTCGAATTCCTAAGATTCCACTTGGCTTT:1	AAACCTACCTTAGCTTCCTTAC	TCCTAAGATTCCACTTGGCTTT	-	chrX	15423448	-	chrX	15421937	1511	+	chrX	15421937	+	chrX	15423448
ATGATGAACGATCTCAACAACGCCGTCGAGAAGGCATTGCACCTGGACTCCAGCACCTCCAGCGATCCC:1	ATGATGAACGATCTCAACAACG	CTCCAGCACCTCCAGCGATCCC	-	chr3R	30627691	-	chr3R	30627617	74	+	chr3R	30627617	+	chr3R	30627691
AGAAGTTACTTTATTGCTCCAAAAGCTATCAGTAGCAATCCTCGAAGTTGTACCACGGTGTGGCATCCACATCG:1	AGAAGTTACTTTATTGCTCCAA	CCACGGTGTGGCATCCACATCG	-	chr2L	6021704	-	chr2L	6021627	77	+	chr2L	6021627	+	chr2L	6021704
CGCTTTAGTTTTCTTTTTTTTCTTTGGGGAATTGTGGAAATATTT:1	CGCTTTAGTTTTCTTTTTTTTC	TTGGGGAATTGTGGAAATATTT	+	chr2L	6579681	+	chr2L	20629447	14049766	+	chr2L	6579681	+	chr2L	20629447
TAAATTTAAAACTGCTGTGTTATTTGGCCTTAAGAAGTAATAATGTCCGGTCTCTAACGACCGA:1	TAAATTTAAAACTGCTGTGTTA	ATGTCCGGTCTCTAACGACCGA	+	chr3R	13782076	+	chr3R	13782146	70	+	chr3R	13782076	+	chr3R	13782146
ACAATTCCAGCACTCACCGACCTCACCCAGCCCCCCTTGTGAACTCCGTTCTAATGAACGCCAAGATAGAATGA:1	ACAATTCCAGCACTCACCGACC	AATGAACGCCAAGATAGAATGA	+	chr2L	11248590	+	chr2L	11248672	82	+	chr2L	11248590	+	chr2L	11248672
GTCAGGCACAAGCGAAAGCATCTTGGGAACCACGCCCCCATTTGGCTGTCTTGCATGTTTGGCGGCACTTTTGTG:1	GTCAGGCACAAGCGAAAGCATC	CATGTTTGGCGGCACTTTTGTG	-	chr2R	13563729	-	chr2R	18863407	5299678	+	chr2R	18863407	+	chr2R	13563729
TGGTAATCTTCGTTAATTTTTACTCTTCTTTACTTAAAATTTGCAAAAACCTTGGGAAGTCATAAAAAATGTCAG:1	TGGTAATCTTCGTTAATTTTTA	GGGAAGTCATAAAAAATGTCAG	-	chr2R	22290165	-	chr2R	22290081	84	+	chr2R	22290081	+	chr2R	22290165
CATCAGGGATCGAACCAGAAATTGATGGAGTGGCCGACTGGTTAGCCGATGGAGCGGCAGAGGGAAAAGCTG:1	CATCAGGGATCGAACCAGAAAT	GGAGCGGCAGAGGGAAAAGCTG	-	chr2L	19544690	-	chr2L	19544616	74	+	chr2L	19544616	+	chr2L	19544690
AAGTGTACATATATTGAAAGTTAAATAGTGTTGTAAATTTGGTTACCTATATATATTACTTATACAATTCTAGCT:1	AAGTGTACATATATTGAAAGTT	TATTACTTATACAATTCTAGCT	+	chr2L	15586413	+	chr2L	15593465	7052	+	chr2L	15586413	+	chr2L	15593465
GCTGTTAGGAACTGGCAATACCAGTTGACTTGTGATAAGTTCTGAAAGCAAACCAAAACTAACTTAAATGTAATA:1	GCTGTTAGGAACTGGCAATACC	CAAAACTAACTTAAATGTAATA	+	chr2R	14595476	+	chr2R	9301264	5294212	+	chr2R	14595476	+	chr2R	9301264
TTTATTATTATTTTCCATATATGAAGGGTATTCNAAATTTAAATTCTACCAAAGTGTNTTG:1	TTTATTATTATTTTCCATATAT	TAAATTCTACCAAAGTGTNTTG	+	chr2R	18443574	+	chr2R	11938709	6504865	+	chr2R	18443574	+	chr2R	11938709
ACCAGCGACATCGGTCGGCGGCAGACAGTCACTTAAAAAAGTATTTGNACTCGCTTATATGNAAGGCAAACAAGA:1	ACCAGCGACATCGGTCGGCGGC	CTTATATGNAAGGCAAACAAGA	+	chrX	15307678	+	chrX	10972696	4334982	+	chrX	15307678	+	chrX	10972696
GAAAGCTACCAAAATCAAGAAGAGCGTGGAATGGATGGAGAGGTAAGGGAAGGGCCAACAGGTAAACAGGCAAG:1	GAAAGCTACCAAAATCAAGAAG	GGCCAACAGGTAAACAGGCAAG	-	chrX	11728857	-	chrX	8214269	3514588	+	chrX	8214269	+	chrX	11728857
GATTGCAGTCTTTGCGCGNTAAATTTGTGGGGACGCGTTCANCTGNCATCTGTTGCTGGCTGCCCCTACATT:1	GATTGCAGTCTTTGCGCGNTAA	TGTTGCTGGCTGCCCCTACATT	+	chr2R	4481915	+	chr2R	4503489	21574	+	chr2R	4481915	+	chr2R	4503489
TATAGTTGTAATTTTATAGTCGATTGAAAAGCAGGAAAAATAGTGTAACATTATTTTTCTT:1	TATAGTTGTAATTTTATAGTCG	ATAGTGTAACATTATTTTTCTT	-	chr3L	14486225	-	chr3L	14486162	63	+	chr3L	14486162	+	chr3L	14486225
GGATACTCAGTAAAGCTAGAAACTGTTTTGAAATAGTATATATATAGTTATAAATAAACATACGCCAGGCTTAC:1	GGATACTCAGTAAAGCTAGAAA	AATAAACATACGCCAGGCTTAC	-	chr3R	31081847	-	chr3R	31074250	7597	+	chr3R	31074250	+	chr3R	31081847
GTGCGCAGCGCTTCCAGTTCGCTTANTTGTTG:1	GTGCGCAGCGCTTCCAGTTCGC	CTTCCAGTTCGCTTANTTGTTG	+	chrX	3957934	+	chrX	3958070	136	+	chrX	3957934	+	chrX	3958070
AATTATGGATTACGCTTGGTGTGTTCACAATTTAAATAGACTATATACATAAACGACTTAAAGGAATACAATGT:1	AATTATGGATTACGCTTGGTGT	ACGACTTAAAGGAATACAATGT	-	chr3L	13296615	-	chr3L	13296525	90	+	chr3L	13296525	+	chr3L	13296615
GAAACATGATTGTGATATTAAAGTTAAATAAAATCACCCATCAAATTAGNAAAATATGTGCACTTAAATATTCTT:1	GAAACATGATTGTGATATTAAA	ATATGTGCACTTAAATATTCTT	+	chr2R	15330204	+	chr2R	15330338	134	+	chr2R	15330204	+	chr2R	15330338
AGCTTGCCNGTTTACTTTGCATGCTACCTCCACCACCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1	AGCTTGCCNGTTTACTTTGCAT	ACACAACACAACACAACACAAC	+	chr3R	18012028	+	chr3R	21907534	3895506	+	chr3R	18012028	+	chr3R	21907534
CTTTTGCTTTTGCCTTCCCGCGTGCGCTGCCTTTTAATTATCGAATGTCTCTGGACTTCGGGCTCCA:1	CTTTTGCTTTTGCCTTCCCGCG	TGTCTCTGGACTTCGGGCTCCA	+	chrX	13006844	+	chrX	13006983	139	+	chrX	13006844	+	chrX	13006983
ATCCTTAAAACCATAAATATGTAATCCTATTGGATTTTGATTTCTATCATTTATTTATCGACTACCAGAATATAT:1	ATCCTTAAAACCATAAATATGT	TTTATCGACTACCAGAATATAT	-	chr3L	3891072	-	chr3L	3890991	81	+	chr3L	3890991	+	chr3L	3891072
ACTTCTCATATCGCAAACGTCCATCAAATAATAATAGGAGCATAAAGAGTAGAATTTTTAACACCTCACTCCTCT:1	ACTTCTCATATCGCAAACGTCC	ATTTTTAACACCTCACTCCTCT	+	chr3L	20710786	+	chr3L	20710863	77	+	chr3L	20710786	+	chr3L	20710863
AATAGAAAAATCGCCACATATCTCAATGTGTTGTCCAAAACTACATACATATATGTATGTAAAAGTTTAGACTGT:1	AATAGAAAAATCGCCACATATC	TGTATGTAAAAGTTTAGACTGT	+	chr3L	22989863	+	chr3L	22996837	6974	+	chr3L	22989863	+	chr3L	22996837
ATCCCAGTACGTGTCTAAGATAAGCTCGTCATGAGGATGAGGATGCAGTGGCAACTTTTCCTCCACTCGACACTC:1	ATCCCAGTACGTGTCTAAGATA	ACTTTTCCTCCACTCGACACTC	-	chr3L	5826238	-	chr3L	5826154	84	+	chr3L	5826154	+	chr3L	5826238
CGGGAAATNGTACTTAGCGCTGAGGGTAGGGGTTGCGNNNNTTCGTTCTACGTTCCCAGATNAAA:1	CGGGAAATNGTACTTAGCGCTG	CGTTCTACGTTCCCAGATNAAA	+	chrX	1590399	+	chrX	9859678	8269279	+	chrX	1590399	+	chrX	9859678
AAATAACCGATGTCAACAATTTCAATGCGGTAATCCCTTAAGCCTCATTAATTAGCGCGTAATTCATATTTTTT:1	AAATAACCGATGTCAACAATTT	TAGCGCGTAATTCATATTTTTT	-	chr3R	28337765	-	chr3R	29979632	1641867	+	chr3R	29979632	+	chr3R	28337765
AAAACTGGACACCAAACGAGTTTTGTCGCACTCGCACACACCCGCAAAATTCTCCCTCAGTTGCATCGCACAGAC:1	AAAACTGGACACCAAACGAGTT	CCCTCAGTTGCATCGCACAGAC	+	chr2R	6500959	+	chr2R	6501054	95	+	chr2R	6500959	+	chr2R	6501054
AATTGGGAGCTGNATGGGAAAGAGATCCAANANGACATNTTTTCACAATGTTTTGTATTTCTTCTGGTTGTCT:1	AATTGGGAGCTGNATGGGAAAG	TTTGTATTTCTTCTGGTTGTCT	-	chr3R	22391181	-	chr3R	19756706	2634475	+	chr3R	19756706	+	chr3R	22391181
CACATGCNCTTTAAGTGAAGTCGTCAAGTCGTCAAGTCGNGGGGCGTAGGACTGAGANTATATCCCGAAATGTTT:1	CACATGCNCTTTAAGTGAAGTC	GAGANTATATCCCGAAATGTTT	+	chr3R	28486286	+	chr3R	28484369	1917	+	chr3R	28486286	+	chr3R	28484369
GGCTGAAATATATACATCCAACAGCTGACTTTTCTCCATTTACTCCGGGNACTAAGTACCTACTAAGCCCCCAAA:1	GGCTGAAATATATACATCCAAC	AAGTACCTACTAAGCCCCCAAA	+	chr3L	15959162	+	chr3L	2698349	13260813	+	chr3L	15959162	+	chr3L	2698349
CATATACCCTTTGAAAGAGTGATTACTACCTTTAACATTTTGTTGTGGATGCTGCCACCTGTGAGAAGTACTCT:1	CATATACCCTTTGAAAGAGTGA	TGCCACCTGTGAGAAGTACTCT	+	chr2L	1322051	+	chr2L	1322139	88	+	chr2L	1322051	+	chr2L	1322139
ATCGCTTTCGGTACCGGAGATGTAGTCATCTGCTAGTTGGGCTGCTTTCAGATCCAGTCCATGGTTGCGAAC:1	ATCGCTTTCGGTACCGGAGATG	GATCCAGTCCATGGTTGCGAAC	-	chr3L	1310991	-	chr3L	1315854	4863	+	chr3L	1315854	+	chr3L	1310991
GTTTAGTGACTTGCTTTTGTTTCTGTTCAGTTCACAAAGGCACACACTGTTTACACTCACTTTCTAGCACCA:1	GTTTAGTGACTTGCTTTTGTTT	TTACACTCACTTTCTAGCACCA	-	chr2L	16870511	-	chr2L	16870115	396	+	chr2L	16870115	+	chr2L	16870511
CCAGTTGATTTTGTATTTCCCATGTAACCTTTTTTAAAATTGATCTATTGATATTTCATACGAAATATAAAAC:1	CCAGTTGATTTTGTATTTCCCA	TATTTCATACGAAATATAAAAC	+	chr2L	8003051	+	chr2L	8003131	80	+	chr2L	8003051	+	chr2L	8003131
CTACTTAGTTTTAGTTGTGCCATTGTTTCCATTGCTTTTTGCTAAGTCATCTATCAAATGCTATGCAGTTGGATA:1	CTACTTAGTTTTAGTTGTGCCA	TCAAATGCTATGCAGTTGGATA	+	chr2L	12305420	+	chr2L	12305508	88	+	chr2L	12305420	+	chr2L	12305508
GCTTTTTCTAAAAACGCATTCTGGCACTTAAATTCGTTGGCATGCCAAACAAGTCTAAGCGCACACAACCTGTCT:1	GCTTTTTCTAAAAACGCATTCT	TCTAAGCGCACACAACCTGTCT	-	chr2L	1227595	-	chr2L	1220129	7466	+	chr2L	1220129	+	chr2L	1227595
ATTACCATAACGTTTGTAGGCCATAGAGAGTAGAGAGAAGCAATGATCATATCTGCCGCAGAAGAGTATAAAAA:1	ATTACCATAACGTTTGTAGGCC	CTGCCGCAGAAGAGTATAAAAA	+	chr2L	1156862	+	chr2L	1156966	104	+	chr2L	1156862	+	chr2L	1156966
CAAAATCTAAGCGGCACCCCTTAATAAAATTGGCAATCGGCGAAAAAAACTATTTTGGCCAGAGGAAGACTTAAC:1	CAAAATCTAAGCGGCACCCCTT	TTTGGCCAGAGGAAGACTTAAC	+	chr3R	28775022	+	chr3R	28775161	139	+	chr3R	28775022	+	chr3R	28775161
TATCTAAATTAAAGCGACNCTTCTGCATAAATTAGCTTAAAACTTTTCATTGCGAAATGGTTTTGAATTCTC:1	TATCTAAATTAAAGCGACNCTT	TGCGAAATGGTTTTGAATTCTC	-	chr3L	6474429	-	chr3L	6283071	191358	+	chr3L	6283071	+	chr3L	6474429
TTTGATGAGGATTGCTTTGTAGGCTCCAGGGTAAAAAGGTGGGCAGTGCCATCGCTTCGCTTGAGAAGGGCGCCC:1	TTTGATGAGGATTGCTTTGTAG	GCTTCGCTTGAGAAGGGCGCCC	-	chr2L	19740835	-	chr2L	19737366	3469	+	chr2L	19737366	+	chr2L	19740835
TTGTTTGCNATGTTTTTCCGAACACTGGGGAGCAANGACAACAAAAGCAGACTCGCAGGCCTTTTGCCCACACCG:1	TTGTTTGCNATGTTTTTCCGAA	CGCAGGCCTTTTGCCCACACCG	+	chr3L	628080	+	chr3L	17428659	16800579	+	chr3L	628080	+	chr3L	17428659
TTATTAACCAAACATACTTATATACATTTTGCAACATGACAAATTAACCAGTCGAAGAGTAAAAACTTCTGGC:1	TTATTAACCAAACATACTTATA	TCGAAGAGTAAAAACTTCTGGC	-	chr2R	9510788	-	chr2R	9510674	114	+	chr2R	9510674	+	chr2R	9510788
TATACTCAGGGCCATAAACAAAGTTTAAACCTAGACATGCATACATCCTTAAGTAACTTTTAGTTCGATCCTATC:1	TATACTCAGGGCCATAAACAAA	TAACTTTTAGTTCGATCCTATC	-	chr3R	18078234	-	chr3R	18078155	79	+	chr3R	18078155	+	chr3R	18078234
GTGAAAATGGTAGGTATTTGGGTGCTCATTGGGTTGGCAATCATTGAACTCATAATTGATTGCGTTTTATATATT:1	GTGAAAATGGTAGGTATTTGGG	AATTGATTGCGTTTTATATATT	-	chr2R	22072785	-	chr2R	22072698	87	+	chr2R	22072698	+	chr2R	22072785
GGGCAAAGGGGAGTAAGATAGAACGAACAAAAACTGGCCGTAGTTAG:1	GGGCAAAGGGGAGTAAGATAGA	AACAAAAACTGGCCGTAGTTAG	-	chr2L	9391705	-	chr2L	9391566	139	+	chr2L	9391566	+	chr2L	9391705
GACCGAGCATAAACGAGCAATTCATTCGAACTGAGGAGGAATAAATGTGATCAAGTGCCTGTTAGTAAATA:1	GACCGAGCATAAACGAGCAATT	ATCAAGTGCCTGTTAGTAAATA	-	chr2L	1612671	-	chr2L	10023519	8410848	+	chr2L	10023519	+	chr2L	1612671
GTTGAAGATAAAAGAGCTGGCAACAGTTGGTGTGGGTGCCTGTTGAATTTC:1	GTTGAAGATAAAAGAGCTGGCA	GTGTGGGTGCCTGTTGAATTTC	-	chr2L	245323	-	chr2L	1972942	1727619	+	chr2L	1972942	+	chr2L	245323
ACAATTAAGGTAGGTCAACCAATTAAANTCNNCGAATCTTGGGTATGAANANGTACACATTCAACACCCAATATT:1	ACAATTAAGGTAGGTCAACCAA	TACACATTCAACACCCAATATT	-	chr3L	20488120	-	chr3L	20487669	451	+	chr3L	20487669	+	chr3L	20488120
AAAAACATTTGTAAATCATTTAAAAAATTCAATTTCTTATGGCATTNTCAATTAATTTAACCG:1	AAAAACATTTGTAAATCATTTA	GCATTNTCAATTAATTTAACCG	-	chr3R	17333270	-	chr3R	28937984	11604714	+	chr3R	28937984	+	chr3R	17333270
CGAAATCAAATTCATTCATGAAATTCAGCGAAGAGCGTCAAAAAAAAAACACGAGAATGGACTTTTCTGGGTCCG:1	CGAAATCAAATTCATTCATGAA	AGAATGGACTTTTCTGGGTCCG	+	chr3L	3450914	+	chr3L	3451002	88	+	chr3L	3450914	+	chr3L	3451002
TCAAAAGAGTTCTTGGGTCTGGGGGGCTCACCTTTTGTGATTTTCAGCATTTTAAAAAGTGCATAGCGAGCGAAG:1	TCAAAAGAGTTCTTGGGTCTGG	AAAAAGTGCATAGCGAGCGAAG	-	chr2R	6229667	-	chr2R	8286361	2056694	+	chr2R	8286361	+	chr2R	6229667
GGCAAGAAAAATGCAAAAGCACAAAGCAAAAAATCCTATAGCCAAACAAGTGCACTGATGCGTTCAATTTGAACT:1	GGCAAGAAAAATGCAAAAGCAC	ACTGATGCGTTCAATTTGAACT	+	chrX	4846137	+	chrX	16940715	12094578	+	chrX	4846137	+	chrX	16940715
TTTTTTTGAAAACTTAAGACCTGTTTGGATTCTTTTAGTCAACAAATNTTGTCTAGTAAAATGTATTTTTA:1	TTTTTTTGAAAACTTAAGACCT	TGTCTAGTAAAATGTATTTTTA	-	chr3L	3530794	-	chr3L	3530720	74	+	chr3L	3530720	+	chr3L	3530794
GTCAGTTGTCTGAAAATTGTTGTTTTTTGTTGGAAATTGCGGTTAATTGAATTCACTGAACTGGGTTCACAGTC:1	GTCAGTTGTCTGAAAATTGTTG	TCACTGAACTGGGTTCACAGTC	+	chr2L	13616903	+	chr2L	13617015	112	+	chr2L	13616903	+	chr2L	13617015
AACTTGCCTGCACTGAGGCAAAAAATAAGATGAATTTATGTGAGATCTTGACTTATATAAAGTGTTGAGTATCTT:1	AACTTGCCTGCACTGAGGCAAA	TATATAAAGTGTTGAGTATCTT	-	chr3L	2795849	-	chr3L	2795726	123	+	chr3L	2795726	+	chr3L	2795849
ATTGTCCATCCACAGCAGCAAAGTATGCAACAAAAATTTTTGTAGAAACTGCAAGCAGTAATAAAACAAAAAGGC:1	ATTGTCCATCCACAGCAGCAAA	AGCAGTAATAAAACAAAAAGGC	+	chrX	4700393	+	chrX	4700736	343	+	chrX	4700393	+	chrX	4700736
GACAAAGACAAAGACAAAGNCAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGCG:1	GACAAAGACAAAGACAAAGNCA	AGACAAAGACAAAGACAAAGCG	+	chrX	16983077	+	chrX	1053122	15929955	+	chrX	16983077	+	chrX	1053122
GAAAAGCGGGGAAAACTCAGCCAATCAATCAGCAGCCAGGAAAAAGTTAAGTTACACCAGTAATTTCTTTGCTTT:1	GAAAAGCGGGGAAAACTCAGCC	ACACCAGTAATTTCTTTGCTTT	+	chr2R	13749421	+	chr2R	13749567	146	+	chr2R	13749421	+	chr2R	13749567
AATTTAAATTTCTGCATTCCAGGACAGTCCTCCTTCATAGTAACTGCAAGTGCACGGGGTATGGGTTATTATGGG:1	AATTTAAATTTCTGCATTCCAG	ACGGGGTATGGGTTATTATGGG	+	chr2L	7340042	+	chr2L	7340121	79	+	chr2L	7340042	+	chr2L	7340121
ATTATTTGGCTAACAAACTTTTACAAAGTTGTCCAGAAGCGAGGCAGGAACCCACATGATGTATTACAAATACAC:1	ATTATTTGGCTAACAAACTTTT	ACATGATGTATTACAAATACAC	-	chr3R	24395738	-	chr3R	16370559	8025179	+	chr3R	16370559	+	chr3R	24395738
AAATCATCTTATGAAATATTCATGCTGGTGGTGGTTTCAAACGAACCGANCGAAAATTTATTCGACAAAGTGCTC:1	AAATCATCTTATGAAATATTCA	AAATTTATTCGACAAAGTGCTC	+	chr2L	1178701	+	chr2L	1178785	84	+	chr2L	1178701	+	chr2L	1178785
ATAATTATCATCATTACTGAGACTTGAATACTACGTTCAGTGCATACTCACTCTGCCGCCATCTTCNCCATTTA:1	ATAATTATCATCATTACTGAGA	CTGCCGCCATCTTCNCCATTTA	+	chr3L	21847447	+	chr3L	21847542	95	+	chr3L	21847447	+	chr3L	21847542
CGGCCAAATTCAATTTTCCTAGCTCTTAAGAGCTGCGCATATCGATTTACGCGAGTGACATATAGCTCAAATTTA:1	CGGCCAAATTCAATTTTCCTAG	AGTGACATATAGCTCAAATTTA	+	chr2R	22774987	+	chr2R	22775406	419	+	chr2R	22774987	+	chr2R	22775406
ATGCTAATCCTCCAAAATTATCTATTTATTATTGGCATAAACAAGACGGACATCGTCTGGGGGCAATCGTTTTAT:1	ATGCTAATCCTCCAAAATTATC	CGTCTGGGGGCAATCGTTTTAT	+	chr3R	22450548	+	chr3R	22453188	2640	+	chr3R	22450548	+	chr3R	22453188
ATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1	ATAAACAATAAACAATAAACAA	CACAAACACAAACACAAACACA	-	chr2L	9723025	-	chr2L	16071771	6348746	+	chr2L	16071771	+	chr2L	9723025
AACCATATAACCATTTCTCACGATTTGTTGTTCTTGTTCAGCCCGGTTTTATTGAAAGTAAAACCTTGCTAAAAA:1	AACCATATAACCATTTCTCACG	GAAAGTAAAACCTTGCTAAAAA	-	chrX	20484501	-	chrX	20484396	105	+	chrX	20484396	+	chrX	20484501
TTTTTGGAGAAGGTGTGAGCATGCTTCGTACATATCAATAACGTTTTAGGTGGATCCCTGGCAATTTTACCCAG:1	TTTTTGGAGAAGGTGTGAGCAT	GATCCCTGGCAATTTTACCCAG	+	chr3R	30679543	+	chr3R	30687011	7468	+	chr3R	30679543	+	chr3R	30687011
GCACTTGAAGCCAGAGTTCCGAAATGTCGCAGACCTCAATGAGAAATGGTCTAAGGTCTAAGTGTGCTCTCGATG:1	GCACTTGAAGCCAGAGTTCCGA	AGGTCTAAGTGTGCTCTCGATG	-	chr2L	19469285	-	chr2L	19469200	85	+	chr2L	19469200	+	chr2L	19469285
CCCGAGTGCAGAAAAAGAGTAAACTTTGCATATGCGCTTTCTCCATTCAGCGTGTCCATTTTGCAAATTTCACAG:1	CCCGAGTGCAGAAAAAGAGTAA	GTCCATTTTGCAAATTTCACAG	+	chr3L	5683278	+	chr3L	5683365	87	+	chr3L	5683278	+	chr3L	5683365
GTTGCCAATCATTTGGAAGCTATGCGATGTCCGCCCCCGAAAACAGGNTGCATAACTTCCTATCCAC:1	GTTGCCAATCATTTGGAAGCTA	GGNTGCATAACTTCCTATCCAC	-	chr3L	17327680	-	chr3L	17327599	81	+	chr3L	17327599	+	chr3L	17327680
ATTAATGGATACAGAACATTATTTGTAAAATATGTATCACGTATAATGAATATATGACGCACATATGTATAAGA:1	ATTAATGGATACAGAACATTAT	TATGACGCACATATGTATAAGA	-	chr2R	5547302	-	chr2R	5543219	4083	+	chr2R	5543219	+	chr2R	5547302
ATGTTAATTTCCGAATTGNAGGGTACCTTCTATCGACTACGNCCCNTGGCCATGTCACGCACTCCCACACACT:1	ATGTTAATTTCCGAATTGNAGG	ATGTCACGCACTCCCACACACT	+	chr3L	15006026	+	chr3L	15006180	154	+	chr3L	15006026	+	chr3L	15006180
TGTAGCTTTATTTCTTAAAACTTTTTACACTGATCAAGAAATAATATAAAACTGGGGTAATATGTGAAACTGG:1	TGTAGCTTTATTTCTTAAAACT	CTGGGGTAATATGTGAAACTGG	-	chr3L	6706503	-	chr3L	6706426	77	+	chr3L	6706426	+	chr3L	6706503
AACAAAAACAGAAACCGTCAGCGTAAGGACAACACCGCGTGTTTGCTGTCAGTCGAGGAGTCGAGGG:1	AACAAAAACAGAAACCGTCAGC	CTGTCAGTCGAGGAGTCGAGGG	+	chr3L	1432133	+	chr3L	1432215	82	+	chr3L	1432133	+	chr3L	1432215
TAATATGTATATTAAAAGGACCACCAGAGGCCTGCTGCCAGTGATATCGACGATCGTTGCATGGTTA:1	TAATATGTATATTAAAAGGACC	ATCGACGATCGTTGCATGGTTA	+	chr3R	15891677	+	chr3R	15892061	384	+	chr3R	15891677	+	chr3R	15892061
AATTAGAAAACCTGCAAACAAAAAAAACCGTATTAAAACATGCTATATAATATACTACACTGAAGCTCTTTAAAC:1	AATTAGAAAACCTGCAAACAAA	ACTACACTGAAGCTCTTTAAAC	+	chr2R	22723240	+	chr2R	22723316	76	+	chr2R	22723240	+	chr2R	22723316
AGAAAGGTGAAAGCTGCGATCTGGCGTTCGATGTCTTTGACTGTATATCGGACCAAATTAC:1	AGAAAGGTGAAAGCTGCGATCT	ACTGTATATCGGACCAAATTAC	+	chr3L	16945748	+	chr3L	16954887	9139	+	chr3L	16945748	+	chr3L	16954887
GAAAGCACTACTCAAAAGACAAAACCTTCAGGTTGGAAT:1	GAAAGCACTACTCAAAAGACAA	GACAAAACCTTCAGGTTGGAAT	-	chr3L	15655300	-	chr3L	15654890	410	+	chr3L	15654890	+	chr3L	15655300
CAAATCGATGTTTTTTTTGTGTGCACTTTCCCAGTGCCTTGGAGGCTTCTACAATC:1	CAAATCGATGTTTTTTTTGTGT	TGCCTTGGAGGCTTCTACAATC	+	chr3R	27679965	+	chr3R	27680069	104	+	chr3R	27679965	+	chr3R	27680069
TGTAATAATACTTTAAATGCTACGAACAAATTTCGTATATTTCTTTCAGGTGCACACACATATATCAAAGACGTG:1	TGTAATAATACTTTAAATGCTA	ACACACATATATCAAAGACGTG	-	chr3L	21156963	-	chr3L	21151879	5084	+	chr3L	21151879	+	chr3L	21156963
GCGAGGAGAAGCCAAGCTTATGGGAAGCGCACTTGTCCAGCCTGCGTCTTTTCATTTGTCCAAGGGCTCATGGCA:1	GCGAGGAGAAGCCAAGCTTATG	ATTTGTCCAAGGGCTCATGGCA	-	chr2R	17865603	-	chr2R	9187302	8678301	+	chr2R	9187302	+	chr2R	17865603
CGTAACCCTTCCAATAACTATTGAAGGAACATTATAATTTTTTCTATGCGAAAGTTTTTCGCTTGGCTATCA:1	CGTAACCCTTCCAATAACTATT	AAAGTTTTTCGCTTGGCTATCA	+	chr2L	19601580	+	chr2L	19601654	74	+	chr2L	19601580	+	chr2L	19601654
GGGCACAAGTCCTGTGGTCATTCAAAAGTAGTATTACTTAACGTTTGTAAGTGCGCTACATTGTTTATGTTTTAA:1	GGGCACAAGTCCTGTGGTCATT	CGCTACATTGTTTATGTTTTAA	+	chr2L	4953530	+	chr2L	4953771	241	+	chr2L	4953530	+	chr2L	4953771
TATAAAGTCTGATAGACTAGTAAATTCTTATTAGTTTGTAACAAACAAAGACATACCCATAAACCGCTCACACTG:1	TATAAAGTCTGATAGACTAGTA	TACCCATAAACCGCTCACACTG	-	chr3L	1145346	-	chr3L	1145267	79	+	chr3L	1145267	+	chr3L	1145346
CAAATAAGACTTTAAAATGGCTTGGATTACTCATTACTTGCGTATGAACATTTTTAGTATCCAATGTCATGTAAG:1	CAAATAAGACTTTAAAATGGCT	TTAGTATCCAATGTCATGTAAG	-	chr2L	11413442	-	chr2L	11413318	124	+	chr2L	11413318	+	chr2L	11413442
CGGAATAATCCTAGCCCTAACGTCTAAACATTTTNTACTGAGAATTAAATAAACTTAAAGCAATTCAATCCCTGA:1	CGGAATAATCCTAGCCCTAACG	CTTAAAGCAATTCAATCCCTGA	+	chr2L	20498688	+	chr2L	20498787	99	+	chr2L	20498688	+	chr2L	20498787
ATGAAAATCCGTTTAGAGGGGAAAACAGCTGGAAATCAATGAGAGCTAAACAAAACAGCTTCCAAAAAAGAACAA:1	ATGAAAATCCGTTTAGAGGGGA	AACAGCTTCCAAAAAAGAACAA	-	chr2R	21886211	-	chr2R	21886132	79	+	chr2R	21886132	+	chr2R	21886211
AGCTAATAATCAACCACCACTTTTCCACGCTCTGCCCGTTGCGGTTTGAATAAGTGGCAACGTCCTGTTGCAGG:1	AGCTAATAATCAACCACCACTT	AGTGGCAACGTCCTGTTGCAGG	+	chr3R	26641663	+	chr3R	26641749	86	+	chr3R	26641663	+	chr3R	26641749
GACTCAGAAAATGCTCTAGAAAAAACGTTAAAAAACGCTAAAATTTCCATAAATTTTCCGTGTGTAT:1	GACTCAGAAAATGCTCTAGAAA	TCCATAAATTTTCCGTGTGTAT	-	chr3R	13060156	-	chr3R	13059969	187	+	chr3R	13059969	+	chr3R	13060156
GCCGAATTGTTGCATACTTTTGGACATCTCTATATACCCTATAGATGTTGTGTAGTGTACATTCCTCCCAGATCT:1	GCCGAATTGTTGCATACTTTTG	AGTGTACATTCCTCCCAGATCT	+	chr3L	2139218	+	chr3L	2139299	81	+	chr3L	2139218	+	chr3L	2139299
TTATAAGAAATATGTGCTATATTATATAGAAGGTTTCTCCCTTTCCCNTGACAACATTATGNCCAATTGATGGCA:1	TTATAAGAAATATGTGCTATAT	ACATTATGNCCAATTGATGGCA	-	chr2L	7867675	-	chr2L	7867581	94	+	chr2L	7867581	+	chr2L	7867675
ATTTGAACNACAAGAACCACCGACTATTTCCCATTNTCCACTTTTCCCGCCATGTGAACTCTTATTACTCGCAAT:1	ATTTGAACNACAAGAACCACCG	GTGAACTCTTATTACTCGCAAT	+	chr3L	21141384	+	chr3L	19677715	1463669	+	chr3L	21141384	+	chr3L	19677715
TTGAATAAGGAGTACATTTAAACATAATTCCAAGTAGCAGAATAACGAATTTTGGTATCGTTATGGATCATATTC:1	TTGAATAAGGAGTACATTTAAA	GGTATCGTTATGGATCATATTC	+	chr2R	10551148	+	chr2R	10551268	120	+	chr2R	10551148	+	chr2R	10551268
ACACTGAAAATAGTAAATGATAACAAAATCGTACAAAAGTATTACTTACTTTTCCAGTTTGTTTCTATGCACTAA:1	ACACTGAAAATAGTAAATGATA	CCAGTTTGTTTCTATGCACTAA	-	chr2R	10198312	-	chr2R	10198229	83	+	chr2R	10198229	+	chr2R	10198312
CAAANACATTTTGCGGTTGAAGNCAGTNAGCCAAATAAANGTACAACTAGATAAACAAGCTGCTCAACCTAGTT:1	CAAANACATTTTGCGGTTGAAG	AAACAAGCTGCTCAACCTAGTT	+	chrX	4731832	+	chrX	4736924	5092	+	chrX	4731832	+	chrX	4736924
TAACTTTCAATAGAATGCTATTTAAGCAATTATCAATTTTGGGCAAAAAGTTCAATCAATTTAAGGTGGGCGTAC:1	TAACTTTCAATAGAATGCTATT	AATCAATTTAAGGTGGGCGTAC	-	chr2L	12780231	-	chr2L	12779774	457	+	chr2L	12779774	+	chr2L	12780231
CTCTGGCTCGGATCCGAGTGGTTGTGGAAAAGTGGAGGCGAAG:1	CTCTGGCTCGGATCCGAGTGGT	TTGTGGAAAAGTGGAGGCGAAG	-	chr3R	15306756	-	chr3R	27087640	11780884	+	chr3R	27087640	+	chr3R	15306756
AGCCGTANTTGCCATCCTTGACCAGGCGCAGCTCGTCTGNAATACACATGGAGAAATNGGGATTACAAAAAATA:1	AGCCGTANTTGCCATCCTTGAC	GAAATNGGGATTACAAAAAATA	-	chr3L	9278401	-	chr3L	9270647	7754	+	chr3L	9270647	+	chr3L	9278401
TGATTTTTATGTTTTTTTTTATGCACTTTTTTGTGTACGTAACCAATGTAATTTCCACGCCTCGTTTTAAAATTG:1	TGATTTTTATGTTTTTTTTTAT	TCCACGCCTCGTTTTAAAATTG	+	chr3R	13418988	+	chr3R	25822210	12403222	+	chr3R	13418988	+	chr3R	25822210
GTGCACAGGTCAAGCCAGTTGGGGGAACCATTTCTCTTTTTCGAAAAGATCGGCGAAAAACCACTTGCAATTTCA:1	GTGCACAGGTCAAGCCAGTTGG	CGAAAAACCACTTGCAATTTCA	-	chrX	11839287	-	chrX	11839039	248	+	chrX	11839039	+	chrX	11839287
AATAATAATAAATAATAATAATAATAAATAATAATAATAATAAATAATAATAAACCTCAATTTCCTTTGCGGCCT:1	AATAATAATAAATAATAATAAT	ACCTCAATTTCCTTTGCGGCCT	+	chr2R	5171823	+	chr2R	25018641	19846818	+	chr2R	5171823	+	chr2R	25018641
GATCGGCTCCTGATAGCGNCAACAAACTAATGACCAAAAGTCCCACTGAGCAAGGACCGGCACAGGAAAAAANCA:1	GATCGGCTCCTGATAGCGNCAA	GGACCGGCACAGGAAAAAANCA	-	chr3L	22001422	-	chr3L	22001343	79	+	chr3L	22001343	+	chr3L	22001422
CCAAAGAGCTCGCATGCGGTGCAAAGTCAATACCGCTCTAACTGTGCCAGGACCATTAGTCGAAATNCCAGAG:1	CCAAAGAGCTCGCATGCGGTGC	ACCATTAGTCGAAATNCCAGAG	+	chr2L	317781	+	chr2L	3945207	3627426	+	chr2L	317781	+	chr2L	3945207
AAGCGGAAATGCCAGAGCAGTGCTCACACAGACACGACACACACACACACGCACACAAAGAACGGCACACAGAC:1	AAGCGGAAATGCCAGAGCAGTG	ACACAAAGAACGGCACACAGAC	-	chr3L	8238855	-	chr3L	8233594	5261	+	chr3L	8233594	+	chr3L	8238855
GACCGAAATTTGGAAAAACAGACTCTGCAAAAATGTGGATATTTACAAACGAAATTTTCGCTATAACTTGGCTAA:1	GACCGAAATTTGGAAAAACAGA	ATTTTCGCTATAACTTGGCTAA	-	chr3L	26882300	-	chr3L	16066181	10816119	+	chr3L	16066181	+	chr3L	26882300
AAACAACATTTAATTTTTAGCAACACATTTCAAGCCAGTTAAAATCGTGAAACTGTAACCATTGCACTTTTTCTT:1	AAACAACATTTAATTTTTAGCA	TGTAACCATTGCACTTTTTCTT	-	chr3R	19490533	-	chr3R	19490444	89	+	chr3R	19490444	+	chr3R	19490533
GCCATGCAGGGCATCGATGTCACTGCA:1	GCCATGCAGGGCATCGATGTCA	GCAGGGCATCGATGTCACTGCA	-	chr2L	6353500	-	chr2L	15087581	8734081	+	chr2L	15087581	+	chr2L	6353500
TATGAATTTTTAAGAGGACTTTCTTGGACTCCTGCTTCCTTTTCGCTTTGTCACGGCCTTGGGCTTGGAGC:1	TATGAATTTTTAAGAGGACTTT	GTCACGGCCTTGGGCTTGGAGC	-	chrX	17011055	-	chrX	17010972	83	+	chrX	17010972	+	chrX	17011055
GAAAAATAATGTTACACTATTTTTCCTGCTTTTCAATCGACTATAAAA:1	GAAAAATAATGTTACACTATTT	TGCTTTTCAATCGACTATAAAA	+	chr3L	14486164	+	chr3L	14486214	50	+	chr3L	14486164	+	chr3L	14486214
GTTTAGNTGACAACTGAAGCTGTCAAAGCTTCTTATTTCTTACGCNTTGTTGGTTCGGCGC:1	GTTTAGNTGACAACTGAAGCTG	TTACGCNTTGTTGGTTCGGCGC	+	chr2R	9273929	+	chr2R	6575992	2697937	+	chr2R	9273929	+	chr2R	6575992
CGTTGGCCAGCCAGTCAAAGGAACAACTTCCACAAGTGGGGTCGGGGTTGGCCATATTGNAGTCACTTCCTAGCG:1	CGTTGGCCAGCCAGTCAAAGGA	ATATTGNAGTCACTTCCTAGCG	+	chr2L	10633373	+	chr2L	10633460	87	+	chr2L	10633373	+	chr2L	10633460
ATTTCACATAAAACTTACNATTACACAAAAAGAAAAAAGCGCAAAAAAGGCACGAAAAGGAACATTCTATTANAC:1	ATTTCACATAAAACTTACNATT	GAAAAGGAACATTCTATTANAC	-	chrX	6422753	-	chrX	5240977	1181776	+	chrX	5240977	+	chrX	6422753
GGCTGAGCACTTGACCTGTTTTCGCCCAACTTATTTGATTTGTGGCCTGCCATCGCGCAGGTCAATGAAGCACCT:1	GGCTGAGCACTTGACCTGTTTT	CGCGCAGGTCAATGAAGCACCT	+	chr2R	22349573	+	chr2R	18559297	3790276	+	chr2R	22349573	+	chr2R	18559297
CTCGTTGCCATTGCCATTCAGCTTGGTGGGGCGGGTAAAGTGAGAAGGTGAACAAAAGGAATTTGAAAGTTGGG:1	CTCGTTGCCATTGCCATTCAGC	CAAAAGGAATTTGAAAGTTGGG	-	chr2L	3446450	-	chr2L	4641683	1195233	+	chr2L	4641683	+	chr2L	3446450
ACCCTTAGGAACACCACCCATCACGTAAGTCAAAGCGCAGAGTCCCGCTATCTTGTCAACCG:1	ACCCTTAGGAACACCACCCATC	AGTCCCGCTATCTTGTCAACCG	+	chr2R	7254839	+	chr2R	7254941	102	+	chr2R	7254839	+	chr2R	7254941
TTATTGTGGAAAATGGAAAGTCAATATTGTCAAGGGAAAAGCATTTATAGTATTTTAGTTTCCACTCGATTGGA:1	TTATTGTGGAAAATGGAAAGTC	TTTTAGTTTCCACTCGATTGGA	+	chr2R	9328935	+	chr2R	9329036	101	+	chr2R	9328935	+	chr2R	9329036
ACTCGCTTTTCTTTTACATCTCTCGTCTTTGTTGTTTACGTTCCCCATGCTCCCCTCCGATGGATGCGACGTTTT:1	ACTCGCTTTTCTTTTACATCTC	CCTCCGATGGATGCGACGTTTT	+	chr2L	20352558	+	chr2L	20352651	93	+	chr2L	20352558	+	chr2L	20352651
AGTTATGGGCATATTTTCACTGATTTACTGTTGAGTAATTAGTTTGAAATCATAACNAATGGA:1	AGTTATGGGCATATTTTCACTG	GTTTGAAATCATAACNAATGGA	-	chr2L	3108949	-	chr2L	3108884	65	+	chr2L	3108884	+	chr2L	3108949
ATTGGGATGCTCAACCTGTGTCTCAATGATCCGCACCATGAACCCTTCANCTTTCGATTGGCGCACTCGTTAG:1	ATTGGGATGCTCAACCTGTGTC	TTTCGATTGGCGCACTCGTTAG	-	chrX	6554131	-	chrX	18643873	12089742	+	chrX	18643873	+	chrX	6554131
AAGCAATGNGGTCAAAGGTAGCAAAACCACAAAACTGTGTCCCAGAAGAAGAACCTTTTCAAGTGACCCAGTGCA:1	AAGCAATGNGGTCAAAGGTAGC	CCTTTTCAAGTGACCCAGTGCA	-	chr2L	15031813	-	chr2L	15031573	240	+	chr2L	15031573	+	chr2L	15031813
GTGCAACTGTCAAATCTTCCATGAAGATATAACTCACTGCCGGTCCAATGAGT:1	GTGCAACTGTCAAATCTTCCAT	ACTCACTGCCGGTCCAATGAGT	-	chrX	15274879	-	chrX	15273734	1145	+	chrX	15273734	+	chrX	15274879
AAGAATGCAGATTCTAGAAANGGCGAGATNGTGCATCTTACCCACTCTAACG:1	AAGAATGCAGATTCTAGAAANG	GTGCATCTTACCCACTCTAACG	-	chr2L	15197493	-	chr2L	15197232	261	+	chr2L	15197232	+	chr2L	15197493
AAACGCGTGTGCTCGATTTTGCACTCGCAATTATCGCAAAAATCCGCCTCGATAAGGAGGAGCATTACATGGAC:1	AAACGCGTGTGCTCGATTTTGC	TAAGGAGGAGCATTACATGGAC	+	chr2R	11675004	+	chr2R	11675083	79	+	chr2R	11675004	+	chr2R	11675083
ACACACACACACACACAGCGAAAGAAGCGAAGAACAAGCTGATTGAAGCCTAT:1	ACACACACACACACACAGCGAA	GAACAAGCTGATTGAAGCCTAT	+	chr2R	16077847	+	chr2R	23901639	7823792	+	chr2R	16077847	+	chr2R	23901639
ATACCCTTAAGAAGGCACTGGCATCTGTTGAATCTCGTAGCATAAACAACCATAAGGATTTGTTTATGGCCAG:1	ATACCCTTAAGAAGGCACTGGC	ATAAGGATTTGTTTATGGCCAG	-	chr3R	8618728	-	chr3R	8618650	78	+	chr3R	8618650	+	chr3R	8618728
TGAAGCCAGAGTTCCGAANTGTCGCAGACCTCAATGAGAAATGGTCTAAGGTCTAAGTGTGCTCTCGATGAA:1	TGAAGCCAGAGTTCCGAANTGT	GTCTAAGTGTGCTCTCGATGAA	-	chr2L	19469280	-	chr2L	19469198	82	+	chr2L	19469198	+	chr2L	19469280
AGTTTAGTGACTTGCTTTTGTTTCTGTTCAGTTCACAAAGGCACACNCTGTTTACACTCANTTTCTAGCACCAC:1	AGTTTAGTGACTTGCTTTTGTT	TACACTCANTTTCTAGCACCAC	-	chr2L	16870512	-	chr2L	16870114	398	+	chr2L	16870114	+	chr2L	16870512
CTCAGATCGACTTAATTTTAAACTGTTTTNGTTATTATTTTAACAATCCCATTATCATCANCGCCCATTGCCTTT:1	CTCAGATCGACTTAATTTTAAA	ATCATCANCGCCCATTGCCTTT	+	chr3L	9512743	+	chr3L	4751427	4761316	+	chr3L	9512743	+	chr3L	4751427
AGATATTAATCAGCGGAGGGAAAAGGCAAACANGCTGGGCAATTTTCGATGTAGCCACAGCCTATGNAGTTGCA:1	AGATATTAATCAGCGGAGGGAA	AGCCACAGCCTATGNAGTTGCA	+	chr3R	7220062	+	chr3R	8420169	1200107	+	chr3R	7220062	+	chr3R	8420169
TTTTCAGTACCCTTTGAAATAAATTTAATTTTGCAAGTAAAACAAAAATCCAATACACACACAGGCTGCTTG:1	TTTTCAGTACCCTTTGAAATAA	CAATACACACACAGGCTGCTTG	+	chr2L	16444991	+	chr2L	6324032	10120959	+	chr2L	16444991	+	chr2L	6324032
TATCTCTTGAAATTATATTCTTTATTATTTCAACGATTCCTAGAAGCAGGGAATTGATTTCATGATCTGCA:1	TATCTCTTGAAATTATATTCTT	GGAATTGATTTCATGATCTGCA	-	chr3R	3181358	-	chr3R	3181279	79	+	chr3R	3181279	+	chr3R	3181358
GGAATGAGGGGGGGATAAACTCACGCAGCGCCAAAAGGTAAATGACCAAAAGCCATTTAAACTGCAATTGCAGTG:1	GGAATGAGGGGGGGATAAACTC	CATTTAAACTGCAATTGCAGTG	-	chr3L	1581517	-	chr3L	1581183	334	+	chr3L	1581183	+	chr3L	1581517
CAAAATAATCATAAAACATCAAACTTACCGCCTCCACTTTTGGAGTTTAGGCCGTCTTGTTTGCCCAATAA:1	CAAAATAATCATAAAACATCAA	GGCCGTCTTGTTTGCCCAATAA	-	chr2L	12594677	-	chr2L	11299101	1295576	+	chr2L	11299101	+	chr2L	12594677
ATTAATAAAACAGCAGTTAGTTAGACTTAGGTCACAGTCAGCGGTCAACAGCTATGGACTTTCATTATTTATT:1	ATTAATAAAACAGCAGTTAGTT	CTATGGACTTTCATTATTTATT	-	chr3R	4610713	-	chr3R	4609551	1162	+	chr3R	4609551	+	chr3R	4610713
TGCGTATGCATTTAAAAGTTAAATTAAGTCTGAAAATGTCGATCGAATGGCAT:1	TGCGTATGCATTTAAAAGTTAA	GAAAATGTCGATCGAATGGCAT	-	chr2R	7873982	-	chr2R	7869218	4764	+	chr2R	7869218	+	chr2R	7873982
TCTGTGGAAGTTTTCACAGTTCAATGCTTTTGGAGCAAAAACTCCATCTGAATGCGCCCCATT:1	TCTGTGGAAGTTTTCACAGTTC	CTCCATCTGAATGCGCCCCATT	-	chr3R	4981813	-	chr3R	4981748	65	+	chr3R	4981748	+	chr3R	4981813
GTGAAACATGAAAGTGAATTGCCACAAAAAAAAAAAGGTGTAAGTAAGTCTCGTGGAGAGGGGCCCATGGGAAA:1	GTGAAACATGAAAGTGAATTGC	GTGGAGAGGGGCCCATGGGAAA	-	chr3R	25387147	-	chr3R	19349608	6037539	+	chr3R	19349608	+	chr3R	25387147
CACATCCCGAACACGTGTTCTCGTCCGAGATGTGGCATCTTGTTCTGAACGCAGGCCAACAAAATAGCCATGGAC:1	CACATCCCGAACACGTGTTCTC	GGCCAACAAAATAGCCATGGAC	-	chrX	561675	-	chrX	561579	96	+	chrX	561579	+	chrX	561675
ATGCAGTCTACGCGGCCCTGGAAATGATTATACAGAGAAATCTGTATTAAGGATCAACATTTCCTGTAG:1	ATGCAGTCTACGCGGCCCTGGA	TAAGGATCAACATTTCCTGTAG	-	chr3R	18730105	-	chr3R	18730035	70	+	chr3R	18730035	+	chr3R	18730105
ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACNCAACACAACACAACACAACACAACACAAA:1	ACAACACAACACAACACAACAC	ACACAACACAACACAACACAAA	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802	6924266	+	chr3R	21907536	+	chr3R	28831802
AATAAATAAAAAACGTCCGCCGGTATGTAGTTCCCGTCTGGCCCAGTCCTCTGTGGAATTTTTATGCCTAT:1	AATAAATAAAAAACGTCCGCCG	TCTGTGGAATTTTTATGCCTAT	-	chr2L	4661560	-	chr2L	4661483	77	+	chr2L	4661483	+	chr2L	4661560
ATTTTTGACATTTAGCTTTGCCTTGTCGTACTAAGGAAACCATTCTTATACCAAAACCTCGAGATGCCGAAC:1	ATTTTTGACATTTAGCTTTGCC	CCAAAACCTCGAGATGCCGAAC	-	chrX	20362955	-	chrX	20362881	74	+	chrX	20362881	+	chrX	20362955
ATGACATGGCAACTTGGCGAAACAAAGTGAGACGAAAAGTTTTCGGAAAGAGACAAGAGCAAAAAATGTGTGT:1	ATGACATGGCAACTTGGCGAAA	GACAAGAGCAAAAAATGTGTGT	-	chr2L	12759329	-	chr2L	12759236	93	+	chr2L	12759236	+	chr2L	12759329
TTAATCAAGACAGTTTAAGATCTTTAGATATTACATCTAAAAGTTTTTTTTTGTCCAAAGTATTCTATTGCACCT:1	TTAATCAAGACAGTTTAAGATC	TCCAAAGTATTCTATTGCACCT	-	chr3R	18807408	-	chr3R	18807332	76	+	chr3R	18807332	+	chr3R	18807408
AAAAGTTTGAATAAATTGATAATTGATTGCACTTGGTGAGTCGGTAAGCAAACTGACCGAAATGTCCGGACTTCG:1	AAAAGTTTGAATAAATTGATAA	TGACCGAAATGTCCGGACTTCG	+	chr3R	26361953	+	chr3R	26362102	149	+	chr3R	26361953	+	chr3R	26362102
GGAGAATATCGAAAAGAGTTACAACGTTGTGTAGGAATACAAAATAAATGTAGATATGTATTGGTAAACAAACAC:1	GGAGAATATCGAAAAGAGTTAC	ATATGTATTGGTAAACAAACAC	+	chr3R	10920043	+	chr3R	10920121	78	+	chr3R	10920043	+	chr3R	10920121
TGTGGCCAAGTAAACACGCCCAACATTTGAATTGGGCCACAGGGAGAAGGTTAAATTATTACATGGAAATAA:1	TGTGGCCAAGTAAACACGCCCA	TTAAATTATTACATGGAAATAA	+	chrX	5469644	+	chrX	5469810	166	+	chrX	5469644	+	chrX	5469810
AGTATAGTTTTGTATTGGCNGGTGTTTTATGGCGCGTTGGCCTTTTTTGTCCTCTTTGTTTATCAATCTCACTCT:1	AGTATAGTTTTGTATTGGCNGG	CTTTGTTTATCAATCTCACTCT	-	chr3R	8356073	-	chr3R	8355990	83	+	chr3R	8355990	+	chr3R	8356073
ACGAAAATGGCATTAGAAATACAAAAAAAAAAGCCAGAACGACCACATGATAGAAAGAAAGAAAAAACTTAATTG:1	ACGAAAATGGCATTAGAAATAC	AAAGAAAGAAAAAACTTAATTG	-	chrX	3305015	-	chrX	8234511	4929496	+	chrX	8234511	+	chrX	3305015
ATAAAGTTTAGTGTTCCANTGTCCAGCGACAAAAGACAAATCTTTTACTGAAATTTACCTAATTTT:1	ATAAAGTTTAGTGTTCCANTGT	TTACTGAAATTTACCTAATTTT	-	chr3R	13584817	-	chr3R	9574277	4010540	+	chr3R	9574277	+	chr3R	13584817
GAGGAAGCATATATTTAAAATGCAATTGGAATAAACAAACACATAAATCCGATGTATATATATTACTCATATGCA:1	GAGGAAGCATATATTTAAAATG	GTATATATATTACTCATATGCA	-	chr3L	10745647	-	chr3L	10745567	80	+	chr3L	10745567	+	chr3L	10745647
GGCAAAGCTTTTCTATGAAAGCTAAAAAAAAAGACAGCTTTCGAGACCATCTCAAAGTAGTAACTCGCAACGTCA:1	GGCAAAGCTTTTCTATGAAAGC	AAAGTAGTAACTCGCAACGTCA	-	chr2L	10476471	-	chr2L	2322493	8153978	+	chr2L	2322493	+	chr2L	10476471
CTGACTGGGTTGCCGCTGNGGTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	CTGACTGGGTTGCCGCTGNGGT	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	16232787	-	chr3R	21907535	5674748	+	chr3R	21907535	+	chr3R	16232787
CAGGATCAACTGCTGGATTTCAGTCAGCTCTCTCCATCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCT:1	CAGGATCAACTGCTGGATTTCA	CTCACTCTCTCTCTCTCTCTCT	+	chrX	9744073	+	chrX	12649915	2905842	+	chrX	9744073	+	chrX	12649915
CANATTGTGCGTGGTAAATAAAGGCAAACTAATTNANCCATTGCATTTGTGAATCGCTGCTGAAAGGATTAAAAT:1	CANATTGTGCGTGGTAAATAAA	TCGCTGCTGAAAGGATTAAAAT	-	chr2R	18992163	-	chr2R	18992022	141	+	chr2R	18992022	+	chr2R	18992163
AAATCAGAACTGAACAAAGCTGATGAAACCTTTGAATACCCAAATATTGACTGCGGGAAACACCCAGCCAACACC:1	AAATCAGAACTGAACAAAGCTG	CGGGAAACACCCAGCCAACACC	+	chr3L	1331215	+	chr3L	2993801	1662586	+	chr3L	1331215	+	chr3L	2993801
ATCCGGTTGCGTGGTTTAAGTGATAATTTTAATAAATCATGCCAGTTTGTTAGTGAAGG:1	ATCCGGTTGCGTGGTTTAAGTG	CATGCCAGTTTGTTAGTGAAGG	+	chr2R	12287093	+	chr2R	9120088	3167005	+	chr2R	12287093	+	chr2R	9120088
GCTTTGTCTGATTCTGATTCGACTTATCAGTACGCGGTCCACAGCTTAAATTAAATCCATTACTGCAATGTAAT:1	GCTTTGTCTGATTCTGATTCGA	AAATCCATTACTGCAATGTAAT	-	chr3L	22909121	-	chr3L	22909031	90	+	chr3L	22909031	+	chr3L	22909121
TAAAGATAGAAGATTATAATAATAGCGTTAAGAGATGTAAATATGAATTGGATTTGGAAACCATAGACGTCGTTA:1	TAAAGATAGAAGATTATAATAA	TTGGAAACCATAGACGTCGTTA	+	chr3L	24349942	+	chr3L	24352511	2569	+	chr3L	24349942	+	chr3L	24352511
TCACAAACCTATCAGAATTCTTATTTATAGGATACGAACACAGTTTTCCTGTCGCANAAGAAAG:1	TCACAAACCTATCAGAATTCTT	GTTTTCCTGTCGCANAAGAAAG	-	chrX	20145028	-	chrX	20144869	159	+	chrX	20144869	+	chrX	20145028
ATTGTTTAGTGCATAAATCACTGGTCTCCTCAAAAGCCACGTGAAATTCCAGCATTCCAATGGGTGTGTGC:1	ATTGTTTAGTGCATAAATCACT	CAGCATTCCAATGGGTGTGTGC	-	chrX	14650049	-	chrX	4943133	9706916	+	chrX	4943133	+	chrX	14650049
TATTATACTCAGATCGTANGGTCTTAAGCCTTTGCTGATGTNGCANAAAGAAGTACAATGTAAGCTAAAGCCTTT:1	TATTATACTCAGATCGTANGGT	TACAATGTAAGCTAAAGCCTTT	-	chr2R	5476900	-	chr2R	5476356	544	+	chr2R	5476356	+	chr2R	5476900
ACATCTGTTAGAATGAATATGACCAGATGCAGTGTGAGTTCGAGCACACATTAGCGCGCAATAAGTTTGGAA:1	ACATCTGTTAGAATGAATATGA	TTAGCGCGCAATAAGTTTGGAA	+	chr2L	21963782	+	chr2L	21963857	75	+	chr2L	21963782	+	chr2L	21963857
TGGCCACCGTTGCCGGGGCAGGAGTAAGTGTAAGTGGCGCCTTGCCGGTAGCAATTCAAACAATTTGCAATAAGG:1	TGGCCACCGTTGCCGGGGCAGG	ATTCAAACAATTTGCAATAAGG	-	chr2R	15065718	-	chr2R	15065640	78	+	chr2R	15065640	+	chr2R	15065718
TTTATTTGTAATTATAATTTGCTATTGTTTGTATATAGATGTACACATGGTACATGTTCTGATAATTGTACAGCA:1	TTTATTTGTAATTATAATTTGC	ATGTTCTGATAATTGTACAGCA	-	chr3L	15426620	-	chr3L	15423776	2844	+	chr3L	15423776	+	chr3L	15426620
GACTTTGATTTCACTGTGTCATCCGNAACCCTCGAGTTTTCTTTGCCNGAAAAAAATACTGNAGCATAAAAAGTG:1	GACTTTGATTTCACTGTGTCAT	AAATACTGNAGCATAAAAAGTG	+	chr3R	28091819	+	chr3R	28091907	88	+	chr3R	28091819	+	chr3R	28091907
AAAACATAAACAGAAGCTCAGAAGCACGTTTGCCATCATACCTCAGCAACTGGGAAAAGCATCGGGAAACACAAA:1	AAAACATAAACAGAAGCTCAGA	GAAAAGCATCGGGAAACACAAA	-	chr2L	3892012	-	chr2L	3891927	85	+	chr2L	3891927	+	chr2L	3892012
AGTACGTTTCAAAATATTGCCAAAAATTGACTCTTTCCCCCAAAAACGGTACTGCAGCGACTTCACTTTGTTCTT:1	AGTACGTTTCAAAATATTGCCA	GCAGCGACTTCACTTTGTTCTT	-	chr2R	8865118	-	chr2R	8864885	233	+	chr2R	8864885	+	chr2R	8865118
TATCTTGCATAGTAAGGTACATAATTACTCAGTGATTAGTAATTCCGACTCACCTAGGAAATATTGCCGGAAAG:1	TATCTTGCATAGTAAGGTACAT	CCTAGGAAATATTGCCGGAAAG	-	chr3L	17510838	-	chr3L	17510755	83	+	chr3L	17510755	+	chr3L	17510838
GTTGCTTTTTACTACACAGTGTGCATATCGAAATNATACAGATCCACACGCAATTGGAGTAAGAAATACAAAAAC:1	GTTGCTTTTTACTACACAGTGT	TTGGAGTAAGAAATACAAAAAC	-	chr2R	14979859	-	chr2R	14979783	76	+	chr2R	14979783	+	chr2R	14979859
ACACAAACACAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1	ACACAAACACAAACACAACACA	CACAACACAACACAACACAACA	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907535	8214507	+	chr3R	13693028	+	chr3R	21907535
GCAGCATATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGAATCTGTGCTGAAGCATCAAAAACTACTCTCAATTTG:1	GCAGCATATGCTTTTTCGGAGG	ATCAAAAACTACTCTCAATTTG	-	chr3R	19446143	-	chr3R	19445244	899	+	chr3R	19445244	+	chr3R	19446143
GCAATACCTGTATCTGATATATAGATCATAGANTGATATTATATTATAGTCATTTGAGAATGATTANGTAAAG:1	GCAATACCTGTATCTGATATAT	ATTTGAGAATGATTANGTAAAG	+	chrX	9218085	+	chrX	9218174	89	+	chrX	9218085	+	chrX	9218174
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	GTGTGGTGTTGTGTGGTGTGGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	13104420	8803114	+	chr3R	13104420	+	chr3R	21907534
CAAAATGTTTACTAAAAGGTATCCAACAAGTCTATCTAAGCAACAACAACACCAATAACCACGGCCGGCAAAACA:1	CAAAATGTTTACTAAAAGGTAT	AATAACCACGGCCGGCAAAACA	+	chr3L	16911862	+	chr3L	20493803	3581941	+	chr3L	16911862	+	chr3L	20493803
GCCAAAAAGCCCCGATGATAGTAGTTAAATTTGATCAGATGACGCAGCAGCGG:1	GCCAAAAAGCCCCGATGATAGT	TGATCAGATGACGCAGCAGCGG	+	chr2R	8722794	+	chr2R	8723013	219	+	chr2R	8722794	+	chr2R	8723013
CGGTTGCGCCGAACAGAAAACCAACAAAAGTCGGGCCCCACATTAGCAGCTTGTAAAAACTGTGAGTGATCCA:1	CGGTTGCGCCGAACAGAAAACC	TGTAAAAACTGTGAGTGATCCA	+	chr3L	14721192	+	chr3L	14723033	1841	+	chr3L	14721192	+	chr3L	14723033
CATATAACAACTTAAAAATTTGTATATTTCACATTTCTTACATCTTAACTGGTATATCCAAGATTAAAACTGCAT:1	CATATAACAACTTAAAAATTTG	ATATCCAAGATTAAAACTGCAT	-	chr3R	20594577	-	chr3R	20594487	90	+	chr3R	20594487	+	chr3R	20594577
TTTATACACAGCTTACAATAAATACCTAAAATTGTTTTTATTGTATATGTATTATGCTAAGTATTATATATTTTA:1	TTTATACACAGCTTACAATAAA	ATGCTAAGTATTATATATTTTA	-	chrX	9273124	-	chrX	9273043	81	+	chrX	9273043	+	chrX	9273124
TCAGACGCGAACCAAAAAAAAAACAAGGGCAAAGGAAATGCTGCTGAGATTGGAGTTTAAAATTTGTTTATCAA:1	TCAGACGCGAACCAAAAAAAAA	GAGTTTAAAATTTGTTTATCAA	-	chr3R	26759761	-	chr3R	2417945	24341816	+	chr3R	2417945	+	chr3R	26759761
ATTTTTGGTGGGTAAGGGTAATGTGCCGTTTGTGGGGCATAAGTACATGCAAATAGATTTTACCTCATCCTAAAC:1	ATTTTTGGTGGGTAAGGGTAAT	TAGATTTTACCTCATCCTAAAC	-	chr2L	8244865	-	chr2L	8244743	122	+	chr2L	8244743	+	chr2L	8244865
CTAATAAAACAATAAATTAAGACAAATTCGTGACTTTAAATATTTAATTTTACATAGTAGTCATCGTTGATCGCC:1	CTAATAAAACAATAAATTAAGA	ATAGTAGTCATCGTTGATCGCC	-	chrX	17629792	-	chrX	17633087	3295	+	chrX	17633087	+	chrX	17629792
GCAAGGGCTGGATTCGGAGGATGAATGAGCATATGCTTGGAAACATGTGCGACATGGCTATGGTTTATATAAA:1	GCAAGGGCTGGATTCGGAGGAT	ACATGGCTATGGTTTATATAAA	+	chr3R	5590726	+	chr3R	12682343	7091617	+	chr3R	5590726	+	chr3R	12682343
GAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGACCTATAAAGAAAATCATGCCAGGCCATGTGTGTCT:1	GAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGA	TCATGCCAGGCCATGTGTGTCT	+	chr3R	6090419	+	chr3R	25825828	19735409	+	chr3R	6090419	+	chr3R	25825828
GTTGCAGCTCTTCAGGGTCTTAACTAAATACCACATGCCCCTGCCTTTAGCCACTTGGCTTTGGTGGCACAT:1	GTTGCAGCTCTTCAGGGTCTTA	CCACTTGGCTTTGGTGGCACAT	-	chr2R	23238271	-	chr2R	16923509	6314762	+	chr2R	16923509	+	chr2R	23238271
GCCTCGTTTTTGCTGTCCTGCCACTTTTGTAGTCTTAAATGGTGGGGACTGCGCTGCTATGTGATAGACA:1	GCCTCGTTTTTGCTGTCCTGCC	CTGCGCTGCTATGTGATAGACA	+	chr2R	552771	+	chr2R	553984	1213	+	chr2R	552771	+	chr2R	553984
AGCATAAACATATTAAATGAATACCGATCTATAATCCTTTCAGACTTACCTATATCATAAATCTATGTGTAGCT:1	AGCATAAACATATTAAATGAAT	TATCATAAATCTATGTGTAGCT	+	chr3R	29882047	+	chr3R	29891203	9156	+	chr3R	29882047	+	chr3R	29891203
CCGAACGGCGAATGCAGAATAATTATTATTNNNCNACCCGAGTGGGGCTGTAATGCGAAGGCTTCTCCCAAT:1	CCGAACGGCGAATGCAGAATAA	TAATGCGAAGGCTTCTCCCAAT	-	chr3R	27800141	-	chr3R	27799766	375	+	chr3R	27799766	+	chr3R	27800141
TAACGGTGCAAAGGTGTGAAATTGTTGTTGCTCTTGATTGGATATCTGTGTTTCATCAGGTGGCACTGTGGC:1	TAACGGTGCAAAGGTGTGAAAT	TTTCATCAGGTGGCACTGTGGC	-	chr3R	31696318	-	chr3R	31691555	4763	+	chr3R	31691555	+	chr3R	31696318
GCCGAAGCTGGAAAGCTGCAATGTCGTTCTAATTNGATTGGACGATTTAAACAAACAATTATGATTGATAATGAA:1	GCCGAAGCTGGAAAGCTGCAAT	AACAATTATGATTGATAATGAA	-	chr2R	1340160	-	chr2R	1340070	90	+	chr2R	1340070	+	chr2R	1340160
TACGCAAAAAAGTCGGNGTTTATNTCCGTTATANGCACNGTTGTTCGCCTAATATTATTTT:1	TACGCAAAAAAGTCGGNGTTTA	GTTGTTCGCCTAATATTATTTT	-	chr3R	20165874	-	chr3R	20156718	9156	+	chr3R	20156718	+	chr3R	20165874
ATTTTGCATGTGATAAAGTGTGGAGCGCCATCTGTTA:1	ATTTTGCATGTGATAAAGTGTG	AAGTGTGGAGCGCCATCTGTTA	+	chrX	1518077	+	chrX	1523441	5364	+	chrX	1518077	+	chrX	1523441
TTCGCAATCCCACACAGAAGGAATTTATTGTACAACAAGCGGAGAACCAGGCCCAATGGTACACTGGCAGAAAA:1	TTCGCAATCCCACACAGAAGGA	CCAATGGTACACTGGCAGAAAA	+	chr2R	18246130	+	chr2R	18246212	82	+	chr2R	18246130	+	chr2R	18246212
AGCTTGATTATAATATTAATTTAGTGTTGTTGGAGCTTGTGTCACTGTAGATTGCGATGTTTCTGTTGTTATAGT:1	AGCTTGATTATAATATTAATTT	GCGATGTTTCTGTTGTTATAGT	+	chrX	2325936	+	chrX	4245264	1919328	+	chrX	2325936	+	chrX	4245264
TTGATTCCCCAAAATTGTTTTGACATCATTTGTCGCAATTCGTTTTTATGTTTCAATGAATGGAT:1	TTGATTCCCCAAAATTGTTTTG	TTTTATGTTTCAATGAATGGAT	-	chr3L	12261788	-	chr3L	21923908	9662120	+	chr3L	21923908	+	chr3L	12261788
ACTTTTAAATAGTTTGTTTCTTAGATGAAAATCCCGTGTGCACTATAGTTATCCAAATTATTATTTAACTGGTTT:1	ACTTTTAAATAGTTTGTTTCTT	CAAATTATTATTTAACTGGTTT	+	chr2L	3073034	+	chr2L	3078237	5203	+	chr2L	3073034	+	chr2L	3078237
TTCGGTTTACAGTATCATTTGGGTTTATTGAAGCAAAAATAAATAATTTAGGCCCTCGATTGTTTATTT:1	TTCGGTTTACAGTATCATTTGG	TTAGGCCCTCGATTGTTTATTT	-	chr3R	11534037	-	chr3R	11533959	78	+	chr3R	11533959	+	chr3R	11534037
AATCCCATACACCGAGAATAGATGGAACGGCAGAAAGAGAAAGGAAAACAATGACTTAAAAAGAATAGAACAAC:1	AATCCCATACACCGAGAATAGA	GACTTAAAAAGAATAGAACAAC	-	chr3L	22049235	-	chr3L	13428073	8621162	+	chr3L	13428073	+	chr3L	22049235
CGGTTATTTGTTTTAAGGTACATTTACTATGTATATGTTGAACTGAATATGTACATAAGTGAAACAATTTACAA:1	CGGTTATTTGTTTTAAGGTACA	ACATAAGTGAAACAATTTACAA	-	chr3L	20484383	-	chr3L	20476785	7598	+	chr3L	20476785	+	chr3L	20484383
ATTTTGACTTATCCATATAACTTTTTATGTTCAATTGATTCAGGAGAATTTTTGGATATCAGAATATTGCTCATT:1	ATTTTGACTTATCCATATAACT	GGATATCAGAATATTGCTCATT	+	chr3R	26370343	+	chr3R	26370428	85	+	chr3R	26370343	+	chr3R	26370428
CTCTGCGTGGATGGAAGGACCATCCGTGGAGCTCCTTTGCATCCAGACGCTATCCCGGC:1	CTCTGCGTGGATGGAAGGACCA	TGCATCCAGACGCTATCCCGGC	+	chr3R	20735048	+	chr3R	20735118	70	+	chr3R	20735048	+	chr3R	20735118
AAATTGTGCTGATTTAACTCCTCAGCATACACATTTTACATGTTCGTTCGATACATGTGAACACATTTTTTCCCA:1	AAATTGTGCTGATTTAACTCCT	CATGTGAACACATTTTTTCCCA	+	chr3L	4607290	+	chr3L	4607381	91	+	chr3L	4607290	+	chr3L	4607381
AACCTAACCTCAATGATGCGCGCAAGCACGTGCACGTCCTCGATTAACCGTTAACTGAGCGCGTGCTCTCGCTGT:1	AACCTAACCTCAATGATGCGCG	ACTGAGCGCGTGCTCTCGCTGT	+	chrX	6562851	+	chrX	6571333	8482	+	chrX	6562851	+	chrX	6571333
TATTAGAGTGCGAAAACAGTCATCGAGAGTGAACATGGGGTAGTCGATCAAACGCAGCTCAAGTATAGGACGGTG:1	TATTAGAGTGCGAAAACAGTCA	GCAGCTCAAGTATAGGACGGTG	+	chr2R	5421630	+	chr2R	5421548	82	+	chr2R	5421630	+	chr2R	5421548
TAAATTCATTCTTAATTAACAAGAATGNGGNNCACATCCCGACATGTTTNCNCAGACGACAAACATAATAATTGC:1	TAAATTCATTCTTAATTAACAA	AGACGACAAACATAATAATTGC	+	chr3L	21408467	+	chr3L	21408545	78	+	chr3L	21408467	+	chr3L	21408545
CGACAGCGACAACAATGAAAAGAAGCTTCGTTGTCATTTTGATTTGAAATCGAAATGTGCATGGATGGGGGGGCT:1	CGACAGCGACAACAATGAAAAG	AATGTGCATGGATGGGGGGGCT	+	chr2R	10921716	+	chr2R	17163700	6241984	+	chr2R	10921716	+	chr2R	17163700
CATGATCTTTGGCTTTGGCAACCAGCTTTGCTGTTCGTTTTTTTT:1	CATGATCTTTGGCTTTGGCAAC	AGCTTTGCTGTTCGTTTTTTTT	+	chr3R	10593461	+	chr3R	10593516	55	+	chr3R	10593461	+	chr3R	10593516
ACGTGTCCAAGATAAGCTCGTCATGAGGATGAGGATGCAGTGGCAACTTTTCCTCCACTCGACACTCCACCA:1	ACGTGTCCAAGATAAGCTCGTC	TCCTCCACTCGACACTCCACCA	-	chr3L	5826230	-	chr3L	5826149	81	+	chr3L	5826149	+	chr3L	5826230
AAAATTATATTTTGGTAAATTTTGAAAATATATTATTCATAAAAAGANGGTTATTGTTTTGGTTCTTNCGTGGC:1	AAAATTATATTTTGGTAAATTT	ATTGTTTTGGTTCTTNCGTGGC	+	chr3R	16402636	+	chr3R	16402912	276	+	chr3R	16402636	+	chr3R	16402912
GCATCCTTTGCACCCTTCNGTGACTTCCGTTTCCGCTTTCGCCNTCTTANCATCGGCATTTCCTTTTCGTGGC:1	GCATCCTTTGCACCCTTCNGTG	ATCGGCATTTCCTTTTCGTGGC	+	chr2L	3397346	+	chr2L	3397486	140	+	chr2L	3397346	+	chr2L	3397486
ATCGGAGATAAGTGCAGGCAGGCATGAAATATAGCAAATAAAGCTTGC:1	ATCGGAGATAAGTGCAGGCAGG	AAATATAGCAAATAAAGCTTGC	-	chr2L	2663041	-	chr2L	2661230	1811	+	chr2L	2661230	+	chr2L	2663041
TTTCTGAACCTATAAGTCAGAAAAATGCGCGATCTTCCCCTTTAAATAGATTGTCCAGGTGTGGAATCGCATTG:1	TTTCTGAACCTATAAGTCAGAA	GTCCAGGTGTGGAATCGCATTG	-	chr3L	11579670	-	chr3L	11579565	105	+	chr3L	11579565	+	chr3L	11579670
CACCCAAAAACTCAGTGGCACTGAGTGTGTGTTGCTCTTACTGCGAGTAATAAGTC:1	CACCCAAAAACTCAGTGGCACT	CTCTTACTGCGAGTAATAAGTC	+	chrX	2803524	+	chrX	2803648	124	+	chrX	2803524	+	chrX	2803648
AAGGATGCACTTCCCACTTGGCCAGGACGAAGATTAGCTGCATGCCAGCNATGATTTATGCCGTAGTCCGGGT:1	AAGGATGCACTTCCCACTTGGC	TGATTTATGCCGTAGTCCGGGT	-	chr3L	5476279	-	chr3L	5476200	79	+	chr3L	5476200	+	chr3L	5476279
CAAAGCCGAGTCCGGATAGTCCGAGTATCCATTGCCCGTCCGCTCTGCACATAAATTTCTCCTTGCCAGCTAC:1	CAAAGCCGAGTCCGGATAGTCC	TAAATTTCTCCTTGCCAGCTAC	-	chr3R	28378708	-	chr3R	28378588	120	+	chr3R	28378588	+	chr3R	28378708
GCAGGAATATTCTAGCTAGAGGCATTTCTGGTCTCCAGTTTTCCAAATTGGAGAGAGCATTTGCAGTTCGTATA:1	GCAGGAATATTCTAGCTAGAGG	GAGAGCATTTGCAGTTCGTATA	+	chr3R	20167805	+	chr3R	20167882	77	+	chr3R	20167805	+	chr3R	20167882
AACTTTTACCATNTTTAAATATAGTTTCAANANCGGTGNGAATTGCTGAAAAATCATACAGTGTTTTAAAATG:1	AACTTTTACCATNTTTAAATAT	AATCATACAGTGTTTTAAAATG	-	chr3R	12516162	-	chr3R	12516069	93	+	chr3R	12516069	+	chr3R	12516162
CTCAATTGAAACTTGCNTAACATNTTAGTTTAGNGCATNATCACTTTAACACAGAAGACGCANAAAAGTAG:1	CTCAATTGAAACTTGCNTAACA	CACAGAAGACGCANAAAAGTAG	-	chrX	7134432	-	chrX	7125277	9155	+	chrX	7125277	+	chrX	7134432
CGAAAATTTACATATAGATTAGTAGCTGGTCACGTCATTAAAATTGCATTTGGTTAAACGGGCCCGCGGTCATGC:1	CGAAAATTTACATATAGATTAG	TTAAACGGGCCCGCGGTCATGC	-	chr3L	18307659	-	chr3L	12483350	5824309	+	chr3L	12483350	+	chr3L	18307659
ATAATAATATATAAAACGCAATCAATTATGAGTTCAATGCTATTGCCAACCCAATGAGCACCCAAATACCTACCA:1	ATAATAATATATAAAACGCAAT	ATGAGCACCCAAATACCTACCA	+	chr2R	22072693	+	chr2R	22072778	85	+	chr2R	22072693	+	chr2R	22072778
TAGTTGGGCTAAAACTGTGGTTTTGGTACTCCGAATTCTTTCTAATGACCGACCATCCATCCTCATACAGCATT:1	TAGTTGGGCTAAAACTGTGGTT	CCATCCATCCTCATACAGCATT	-	chr2L	9264442	-	chr2L	9264343	99	+	chr2L	9264343	+	chr2L	9264442
TGGTGAGCCTGTCCAGTGCCAGTACCACAACCACAACTACAGATGCCACCACGACCACAACGACCACC:1	TGGTGAGCCTGTCCAGTGCCAG	CACCACGACCACAACGACCACC	+	chr3L	11564791	+	chr3L	11572409	7618	+	chr3L	11564791	+	chr3L	11572409
GCACTTCATGGCACAAGTNAAATGCCCGAGTTAAGTGGTTCGCNATTTTNTTGCAGTTAAGCTTAAATTTGGTAA:1	GCACTTCATGGCACAAGTNAAA	CAGTTAAGCTTAAATTTGGTAA	+	chr2L	18570963	+	chr2L	11602257	6968706	+	chr2L	18570963	+	chr2L	11602257
AAACTGCGTTATTTCACTGAAAATGTGTATTTAATTTAAAACAAACAAGCAAGCATATAAAATGAATATAATTAT:1	AAACTGCGTTATTTCACTGAAA	CATATAAAATGAATATAATTAT	-	chr3L	706027	-	chr3L	705931	96	+	chr3L	705931	+	chr3L	706027
TGTCTATCTCCTAGGGTAAAAAAGAACTAGTGNTGATTTAAATGATTCACAAAAATTGTGTGCATANGTACAAG:1	TGTCTATCTCCTAGGGTAAAAA	AAATTGTGTGCATANGTACAAG	-	chr2R	13431589	-	chr2R	13431511	78	+	chr2R	13431511	+	chr2R	13431589
ATGTTAATATTTAGATCTCATGTTATTGTAGATGACTATTGAGGGTGTAATAACATCTGGTTAATAAAATACAAC:1	ATGTTAATATTTAGATCTCATG	CATCTGGTTAATAAAATACAAC	+	chr3L	10214828	+	chr3L	10214930	102	+	chr3L	10214828	+	chr3L	10214930
AATCTAACNAACAAGTCCGTTCTTTGGCATATTTGGCCATATTTTCCCATTTCATCCGAACCCCAAAAAATGTCT:1	AATCTAACNAACAAGTCCGTTC	ATCCGAACCCCAAAAAATGTCT	+	chr3R	12344148	+	chr3R	12344225	77	+	chr3R	12344148	+	chr3R	12344225
TATCTGTGATGAATTAATGTGAAAAATAGAAATGTAGTTAAATTTATGTCAAAAGATACAATATAATAACATGT:1	TATCTGTGATGAATTAATGTGA	AAGATACAATATAATAACATGT	-	chr2L	10495381	-	chr2L	10495305	76	+	chr2L	10495305	+	chr2L	10495381
GCGATCTGCGCGCCAATATGGTGGATATAAAGCTGAAATTCTGAAATTCATTTCAAAAAGATATTCCTATCATCT:1	GCGATCTGCGCGCCAATATGGT	CAAAAAGATATTCCTATCATCT	-	chr2R	11368116	-	chr2R	11368040	76	+	chr2R	11368040	+	chr2R	11368116
AAATGCGAAATCAACATTTGGTCTTTGAAAGTTTTCTACCTGTTCNGGTCTGGCA:1	AAATGCGAAATCAACATTTGGT	TTCTACCTGTTCNGGTCTGGCA	-	chr2L	9287422	-	chr2L	9287345	77	+	chr2L	9287345	+	chr2L	9287422
ATTTATTAACCAACCACAACCTTTAACTTTTTCGCGGTGTACGCCTCGCTCGCATGGGTAAACAATTATA:1	ATTTATTAACCAACCACAACCT	CTCGCATGGGTAAACAATTATA	+	chr2R	15951858	+	chr2R	15951929	71	+	chr2R	15951858	+	chr2R	15951929
TTTTAGCTTCCGCATTATGCCCAACTTGGCCACACTCTGTGTTTTGGCCCGTATCAGTTCTCGTCTGAATAGA:1	TTTTAGCTTCCGCATTATGCCC	TATCAGTTCTCGTCTGAATAGA	-	chr3R	13196052	-	chr3R	13195959	93	+	chr3R	13195959	+	chr3R	13196052
AATATACATATTAAAGTCAAGAAATTTCTAGCATCCTACTATTCCATAAGCTAAGGCCAGGCTTTACTGCAAAAG:1	AATATACATATTAAAGTCAAGA	AGGCCAGGCTTTACTGCAAAAG	+	chrX	16295528	+	chrX	16295612	84	+	chrX	16295528	+	chrX	16295612
ATTAATTCTGAGATGTGCAAAACAAGTGCATAATTGCAATTACGCAATCCTTTCGGAGACGAAAAGGATTAAGTT:1	ATTAATTCTGAGATGTGCAAAA	CGGAGACGAAAAGGATTAAGTT	+	chr3R	29324337	+	chr3R	29324416	79	+	chr3R	29324337	+	chr3R	29324416
CGCTCATCGTTGCATTTCCCTGCGCTAGACCATGTCGACCACTGCTT:1	CGCTCATCGTTGCATTTCCCTG	TAGACCATGTCGACCACTGCTT	+	chr2L	19620118	+	chr2L	19621079	961	+	chr2L	19620118	+	chr2L	19621079
TTGTTATATTATGAAGCTTAGCTGTTGCAGGGCCTTTAAGAATCGTGCACGTAACTACAACTTTCTTTCAATAGA:1	TTGTTATATTATGAAGCTTAGC	ACTACAACTTTCTTTCAATAGA	+	chr2L	6242977	+	chr2L	6243075	98	+	chr2L	6242977	+	chr2L	6243075
ACGAAATGGAAGTTATTTAAAGCCAGAATAATAAATAACTGAATTGTTTATTTCCAATAGGCTGCCTCATTAAA:1	ACGAAATGGAAGTTATTTAAAG	TCCAATAGGCTGCCTCATTAAA	-	chrX	13941257	-	chrX	13937987	3270	+	chrX	13937987	+	chrX	13941257
CACCAACAGCCTTAAACTCCCTGTTATCAGCAAAGCTGACCGAAAGCTCCTCGGAGGGAGGATGGAATCTACTG:1	CACCAACAGCCTTAAACTCCCT	GGAGGGAGGATGGAATCTACTG	-	chr3L	22572182	-	chr3L	22572102	80	+	chr3L	22572102	+	chr3L	22572182
AAGGGGATATCTACATAGGCAACATTGCAATTCTCAATGAATTGGGAATAGTAGATAGAGGCTAGATTGCATT:1	AAGGGGATATCTACATAGGCAA	TAGATAGAGGCTAGATTGCATT	-	chr3L	13338378	-	chr3L	13338284	94	+	chr3L	13338284	+	chr3L	13338378
CGACAGCAAAAATACGTTATTCCCGTTTATGTTGGCTGAGGCTCCAGGCATGGAGATGGGGCATGAACACATGCG:1	CGACAGCAAAAATACGTTATTC	AGATGGGGCATGAACACATGCG	-	chr3R	29287755	-	chr3R	29287672	83	+	chr3R	29287672	+	chr3R	29287755
ATTTGATGAGATACTGGCAACCTCCACTGTTTTCCCTAGCTGCGCCCATTTTTTGTTAGCCCATTTTTGCCACAC:1	ATTTGATGAGATACTGGCAACC	TGTTAGCCCATTTTTGCCACAC	-	chr2L	2504519	-	chr2L	2503740	779	+	chr2L	2503740	+	chr2L	2504519
ATAGTGGCACATACAGCCCTACATCTCCGTACATGTATTTAGACATATGTCCATATGTATGTGGGACCCAGGCG:1	ATAGTGGCACATACAGCCCTAC	ATATGTATGTGGGACCCAGGCG	-	chr3R	23335537	-	chr3R	23335460	77	+	chr3R	23335460	+	chr3R	23335537
CTCCGCCAACGAAATCGGGCCAAATGATGTGCAATTTCTATACGAGTATATGTGCAGGTGTCTGGATTCAAATTA:1	CTCCGCCAACGAAATCGGGCCA	GCAGGTGTCTGGATTCAAATTA	-	chr3R	14073630	-	chr3R	6998666	7074964	+	chr3R	6998666	+	chr3R	14073630
GGCCTGCTTTTTTTTTTCCANTGGGATAAATTNAATTGTAATNCGATTTTAATACACGGTCTAACATAA:1	GGCCTGCTTTTTTTTTTCCANT	TTTAATACACGGTCTAACATAA	+	chr3R	18814687	+	chr3R	7003556	11811131	+	chr3R	18814687	+	chr3R	7003556
AGCGGGAGCTGAGAAGCAGCTGTCTCTGTCTGGTTTCT:1	AGCGGGAGCTGAGAAGCAGCTG	CAGCTGTCTCTGTCTGGTTTCT	+	chr2R	20602672	+	chr2R	6573839	14028833	+	chr2R	20602672	+	chr2R	6573839
AACTCCGTGAAAGCCACCCAACCGTCGCCGGCAACAAATTAAATGCGGAAAATAATACAAAGACA:1	AACTCCGTGAAAGCCACCCAAC	TGCGGAAAATAATACAAAGACA	-	chr2L	14121861	-	chr2L	14121789	72	+	chr2L	14121789	+	chr2L	14121861
CTACCCTCATCCTCTAGAATGGTGATGTCGTCTTCGCGGAAGGTG:1	CTACCCTCATCCTCTAGAATGG	GATGTCGTCTTCGCGGAAGGTG	+	chrX	20868339	+	chrX	20868284	55	+	chrX	20868339	+	chrX	20868284
TCTTATAGAAATGTGAAATTATCAGCAGAATATANAAAGCTTACACATTCTGGACATTACATTTGCATGTCCCAC:1	TCTTATAGAAATGTGAAATTAT	ACATTACATTTGCATGTCCCAC	-	chr2L	16867127	-	chr2L	16867032	95	+	chr2L	16867032	+	chr2L	16867127
GTTGTATGAGTATCTTGATATACACACTTTGCTGTTAGGTGATTCTAGCACAATTTGTTCTGAAGTTTA:1	GTTGTATGAGTATCTTGATATA	GCACAATTTGTTCTGAAGTTTA	+	chr2R	17176379	+	chr2R	17182563	6184	+	chr2R	17176379	+	chr2R	17182563
TGNAATCAAATGCTTGAGCTCACTTAAAAATGCANANACCACTTTCCGTAGGCCAATTTGTATAATGGTATTAAA:1	TGNAATCAAATGCTTGAGCTCA	CAATTTGTATAATGGTATTAAA	-	chr2R	23184382	-	chr2R	23184297	85	+	chr2R	23184297	+	chr2R	23184382
AAATAAAATATGTGATATTAATTGACAAACAAAAAACCCGAATACGAATCCGACACACGAAGAGCGGAAAAGAAC:1	AAATAAAATATGTGATATTAAT	CACACGAAGAGCGGAAAAGAAC	-	chrX	615760	-	chrX	175945	439815	+	chrX	175945	+	chrX	615760
AGCAGTCAAATGGCCAAAAACTTTTTTTCAGGGTGGCAGTGTTTGCGTTTAATCAAAATGAAGACCAC:1	AGCAGTCAAATGGCCAAAAACT	GTTTAATCAAAATGAAGACCAC	-	chrX	13061462	-	chrX	13061358	104	+	chrX	13061358	+	chrX	13061462
TGGCTACTCCACCGCTTCAGTGTTTATGACTCATTTG:1	TGGCTACTCCACCGCTTCAGTG	TTCAGTGTTTATGACTCATTTG	-	chr2L	519800	-	chr2L	13570909	13051109	+	chr2L	13570909	+	chr2L	519800
TGATTTGTGGACTATTTCTTACAAATTAAATTTTACCACCCACCTAAGCCCATTGCTGGGTGAGCAGGTCCTTC:1	TGATTTGTGGACTATTTCTTAC	TTGCTGGGTGAGCAGGTCCTTC	+	chr2L	920054	+	chr2L	9259636	8339582	+	chr2L	920054	+	chr2L	9259636
ATAACTCTCACTTATAGATGACTACATATACCGCTACTTTTTCTCCCAGTGCATACACTTGCAGTGCGTTTTGTG:1	ATAACTCTCACTTATAGATGAC	TACACTTGCAGTGCGTTTTGTG	-	chr3R	29277184	-	chr3R	29277104	80	+	chr3R	29277104	+	chr3R	29277184
TACAGTTACGATAATTTATGCATGCGATATACAACCATTGACTCCGG:1	TACAGTTACGATAATTTATGCA	GATATACAACCATTGACTCCGG	-	chr2L	9980843	-	chr2L	9973752	7091	+	chr2L	9973752	+	chr2L	9980843
TATATTTTGGATTAATAATGTATATTTTTGGTGAATTACAAAACTAATGTAGATTCTACAAGATGTCTCTTGG:1	TATATTTTGGATTAATAATGTA	GATTCTACAAGATGTCTCTTGG	-	chr3L	13988613	-	chr3L	13988494	119	+	chr3L	13988494	+	chr3L	13988613
ACAAGCGCCAAAACGAAAGANTCTGGACACGANCTTGTCTTANACAGAACAACAAAAAGCAGCCAGCGACAAGA:1	ACAAGCGCCAAAACGAAAGANT	CAAAAAGCAGCCAGCGACAAGA	-	chr2L	15381484	-	chr2L	17206878	1825394	+	chr2L	17206878	+	chr2L	15381484
AAACTAGAGGTACTGTACTTTTCTGTGGAAGGTTCGGAGTTGGAAAAATTGCCTTTGCACAAAAACAAAATCGTA:1	AAACTAGAGGTACTGTACTTTT	TTTGCACAAAAACAAAATCGTA	-	chr2R	10421309	-	chr2R	16892296	6470987	+	chr2R	16892296	+	chr2R	10421309
AAATAGAGNTAGATAAATGCCGCACAAAATGGCAGTGGACTATGCAAAAAAACTCACATAATAAATTGAGCCAG:1	AAATAGAGNTAGATAAATGCCG	CTCACATAATAAATTGAGCCAG	+	chr2R	9792761	+	chr2R	20763642	10970881	+	chr2R	9792761	+	chr2R	20763642
AGCTCTTTGCACTGAAAACAAATTAGCAATTGTACTCAATTTGAAAGGTATGCAACTTAATTGCTTGCTTTTAGA:1	AGCTCTTTGCACTGAAAACAAA	AACTTAATTGCTTGCTTTTAGA	+	chr2R	22756626	+	chr2R	22756710	84	+	chr2R	22756626	+	chr2R	22756710
CATCTCTGACCCATAACTTTGATCGCGTTAATGTCCAAGTGCACCCCCTGTGCGGCGTTGTGGCACCCCCCGCCG:1	CATCTCTGACCCATAACTTTGA	GGCGTTGTGGCACCCCCCGCCG	-	chr3R	9926588	-	chr3R	9926501	87	+	chr3R	9926501	+	chr3R	9926588
GAAGAACCGGCAACGGGCCGTCGAAAAACAAAAAGTTCACATTCAGAACTTTGCGCTTAACTTTTTCCTGCTGG:1	GAAGAACCGGCAACGGGCCGTC	GCGCTTAACTTTTTCCTGCTGG	-	chr3R	6043514	-	chr3R	6043433	81	+	chr3R	6043433	+	chr3R	6043514
GCTAAATGCTAAAATTAATATTTATATTTTTTTTGTTGATTATTCGTAATTTCTGTATTTCCATTGACTTATCAC:1	GCTAAATGCTAAAATTAATATT	TGTATTTCCATTGACTTATCAC	+	chr2L	14246312	+	chr2L	14246390	78	+	chr2L	14246312	+	chr2L	14246390
ACGCAGTGCTTCCAATTCAGATTGATCGCGTGTGCGCAGCGCTTCCAGTTCGCTCACTTGTTGGCGCAGTTGCTG:1	ACGCAGTGCTTCCAATTCAGAT	TCACTTGTTGGCGCAGTTGCTG	+	chrX	3957903	+	chrX	3958082	179	+	chrX	3957903	+	chrX	3958082
TGACTCTTTCCCCCAAAAACGGTACTGCAGCGACTTCACTTTGTTCTTGAAAAACG:1	TGACTCTTTCCCCCAAAAACGG	TTCACTTTGTTCTTGAAAAACG	-	chr2R	8865091	-	chr2R	8864877	214	+	chr2R	8864877	+	chr2R	8865091
CATAAACTTTATAAGAAATNTGTGCTATATTTTATAGAAGGTTTCTCCCTTTCCCATGACAACATTATGTCCAAT:1	CATAAACTTTATAAGAAATNTG	CCATGACAACATTATGTCCAAT	-	chr2L	7867683	-	chr2L	7867589	94	+	chr2L	7867589	+	chr2L	7867683
GCTANATAAGCTTTTCTCGCTANTATCNTTCTGATATCTNTCTAAAGAATGCATATTTTTTTTATGTTTTTTTCA:1	GCTANATAAGCTTTTCTCGCTA	TATTTTTTTTATGTTTTTTTCA	-	chr3L	21081934	-	chr3L	27364765	6282831	+	chr3L	27364765	+	chr3L	21081934
ATCGGAAGATCCTCAGCAGAAGATCACGCAAATCCCCGAACTTAAACTGTTTGTGTTAGCAG:1	ATCGGAAGATCCTCAGCAGAAG	CTTAAACTGTTTGTGTTAGCAG	+	chr3R	13878686	+	chr3R	20905406	7026720	+	chr3R	13878686	+	chr3R	20905406
TTATAATAATTTTATACGTCCATTTTGAGCAGACGAACGAGATCCTCGCGGGAATCCATTTCCACATACGCAAAT:1	TTATAATAATTTTATACGTCCA	ATCCATTTCCACATACGCAAAT	-	chr3L	14651880	-	chr3L	11395142	3256738	+	chr3L	11395142	+	chr3L	14651880
TTTTCCAACCAGCTGCCAACAGCTGGTGTCGCCAAGTCCGTGATGTGTCACG:1	TTTTCCAACCAGCTGCCAACAG	GCCAAGTCCGTGATGTGTCACG	+	chr3R	15937443	+	chr3R	15937507	64	+	chr3R	15937443	+	chr3R	15937507
CACGTGATCAGGTGCGGATTAGTCAAAAATTATTTTACATNTAAGTAATCATTCGGTACATCT:1	CACGTGATCAGGTGCGGATTAG	TAAGTAATCATTCGGTACATCT	+	chr3R	16041602	+	chr3R	16087164	45562	+	chr3R	16041602	+	chr3R	16087164
CATGTCTGTCTTTTTCGGNGATCAAAACTTAATGTGCAGAANAAANGTTGTAATAATGCGTAGAA:1	CATGTCTGTCTTTTTCGGNGAT	AANGTTGTAATAATGCGTAGAA	+	chr2L	22490519	+	chr2L	22497645	7126	+	chr2L	22490519	+	chr2L	22497645
GTGCGATAGTAATGTANACACCCNTACCTTCACNAGCANTTTCCATCAGCTTCAGAACTCGANCTTTAACAGT:1	GTGCGATAGTAATGTANACACC	TCAGAACTCGANCTTTAACAGT	-	chr2L	8282191	-	chr2L	931630	7350561	+	chr2L	931630	+	chr2L	8282191
GATTACCCATCATTCGATGCTTATATAAACAAATCTTTTCATGTCGCCAAAGGAATTTCCG:1	GATTACCCATCATTCGATGCTT	CATGTCGCCAAAGGAATTTCCG	+	chr3R	31087401	+	chr3R	17650172	13437229	+	chr3R	31087401	+	chr3R	17650172
CACAAGTCTGCACTCGGGCCACGCCCCCACCGCAAGCCTTGCACATCAGAGACCGCCCCTCATTTCGCAGTCTGG:1	CACAAGTCTGCACTCGGGCCAC	CGCCCCTCATTTCGCAGTCTGG	-	chr2L	12413680	-	chr2L	1829754	10583926	+	chr2L	1829754	+	chr2L	12413680
TAAATATACACCTTCATAGACATTCCATATGTGTAAAACAATATCCTCCGCTTAACGTCATTCTTGTTGCGGCTT:1	TAAATATACACCTTCATAGACA	AACGTCATTCTTGTTGCGGCTT	-	chr3R	16219087	-	chr3R	16219000	87	+	chr3R	16219000	+	chr3R	16219087
CACCAAGTATGTCAGGTGNTGGAATCAGCAGACCTTCATTGAGNGTTGTNCACCGGGGGAAATTTTCAGTTTCTC:1	CACCAAGTATGTCAGGTGNTGG	CGGGGGAAATTTTCAGTTTCTC	+	chr3L	9076934	+	chr3L	9084494	7560	+	chr3L	9076934	+	chr3L	9084494
TATGTCCGGCGCAGTCGTAACTTACAATCGTTACCGATTTTAGCATAGGCAAACAAATTT:1	TATGTCCGGCGCAGTCGTAACT	TTTAGCATAGGCAAACAAATTT	-	chr3R	26565652	-	chr3R	26558355	7297	+	chr3R	26558355	+	chr3R	26565652
GGCGATGTAAAAATGAGCGGAGAGGAAGCTGAAGCTGAAGCTGGCATTCCATTTGAATTATTCATTGTCAAGGCA:1	GGCGATGTAAAAATGAGCGGAG	TGAATTATTCATTGTCAAGGCA	-	chrX	8219482	-	chrX	8219379	103	+	chrX	8219379	+	chrX	8219482
TTAANCGCACAGCGTAAGACGANGAGANCCTCTCTTCGANATCTATGGCATTGCCAGAATCAAAACAATCACGCA:1	TTAANCGCACAGCGTAAGACGA	CCAGAATCAAAACAATCACGCA	-	chr3L	16494491	-	chr3L	16493974	517	+	chr3L	16493974	+	chr3L	16494491
GTTGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGNGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1	GTTGTGGTGTGTTGTGTTGTGT	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	-	chr3R	28831802	-	chr3R	21907535	6924267	+	chr3R	21907535	+	chr3R	28831802
TCAGGCCCATTTATCTGTGNATCGGATTGTGTGTATGGTGGTATCTGCAAAAGTTGGGCAAAAAAAGTTT:1	TCAGGCCCATTTATCTGTGNAT	AAAAGTTGGGCAAAAAAAGTTT	-	chrX	13531928	-	chrX	9136696	4395232	+	chrX	9136696	+	chrX	13531928
CTCGGCGCGATCTCTTTTCCCCCATGATTTAATGTTTAATTTCTCTGGCGTGTTGGCATTAAAATACTTAAATT:1	CTCGGCGCGATCTCTTTTCCCC	TTGGCATTAAAATACTTAAATT	+	chr2R	24318171	+	chr2R	15515913	8802258	+	chr2R	24318171	+	chr2R	15515913
CCCCCTTACTCACCCACTGCTGCAGCTCACGAAACGTGCTCGGCATGCTCGAGTGAGGCAAATCAATTAAAATT:1	CCCCCTTACTCACCCACTGCTG	GTGAGGCAAATCAATTAAAATT	+	chr2R	18880380	+	chr2R	18880464	84	+	chr2R	18880380	+	chr2R	18880464
CACACACACTCAGACAATCACACATGACTACCCAGCCCTTCGCTTTAAGCTTTCTTTAAGCAAAATATGTGACAA:1	CACACACACTCAGACAATCACA	CTTTAAGCAAAATATGTGACAA	+	chr3L	19246187	+	chr3L	23323661	4077474	+	chr3L	19246187	+	chr3L	23323661
TGACAGCCGGTGGCTCATCATTAAACTTTTGACACTATTAGCGCGGGGGCTGAGGGGGCGAGGGGTGAGACACTT:1	TGACAGCCGGTGGCTCATCATT	GGGGGCGAGGGGTGAGACACTT	+	chr2R	20036240	+	chr2R	9954704	10081536	+	chr2R	20036240	+	chr2R	9954704
CAATCAGCTCAAGTTAAGTGATGGAATCCGTTGTTTGGTTTTTGGGGTTTTTGAGCCATAAAACATAACCCAACG:1	CAATCAGCTCAAGTTAAGTGAT	AGCCATAAAACATAACCCAACG	-	chr3L	5388531	-	chr3L	5388207	324	+	chr3L	5388207	+	chr3L	5388531
GAAAAAGCAAGGGGTTAACACTTAAAGGTTGGAAAATTATAAAT:1	GAAAAAGCAAGGGGTTAACACT	TAAAGGTTGGAAAATTATAAAT	-	chr2L	12264723	-	chr2L	12264663	60	+	chr2L	12264663	+	chr2L	12264723
AAAGCAAAAGCAAGAGCAAAACCATGGAAAAAAAAGGCCAGGAAAATCGATGCGAAAGTGTTTGCTGTCTAAAAA:1	AAAGCAAAAGCAAGAGCAAAAC	GAAAGTGTTTGCTGTCTAAAAA	+	chr3R	13143066	+	chr3R	13148642	5576	+	chr3R	13143066	+	chr3R	13148642
AGGGTAAGTCAAATGAATATATATATTTCTTAAATACCTTT:1	AGGGTAAGTCAAATGAATATAT	TATATATTTCTTAAATACCTTT	-	chr3R	25204564	-	chr3R	8312104	16892460	+	chr3R	8312104	+	chr3R	25204564
TTTCTATTGAATTTTTTATTTCAATAAGAAAAGCTTTAGCGTCTTCTGTCTTCCCTG:1	TTTCTATTGAATTTTTTATTTC	TTAGCGTCTTCTGTCTTCCCTG	-	chr2L	21722601	-	chr2L	17960644	3761957	+	chr2L	17960644	+	chr2L	21722601
CTCAATTCGTACAAAATGAAAATAAAACGTNNNTNTAAGCATCTGCCGTAAAACTCCCCCGCACAGAAACACAGA:1	CTCAATTCGTACAAAATGAAAA	CTCCCCCGCACAGAAACACAGA	-	chr2L	4294087	-	chr2L	4293995	92	+	chr2L	4293995	+	chr2L	4294087
ATATTTTATTTGGTATAATGCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATNTATAAA:1	ATATTTTATTTGGTATAATGCA	AGCGGCGAACTGCATNTATAAA	+	chr3R	19448573	+	chr3R	19449366	793	+	chr3R	19448573	+	chr3R	19449366
AATCAGATAAACCAAACGTGAAACCGCGACACAAATCAAACCACCTCAATAAACGGAGAGTGTTGCGAGGAATTT:1	AATCAGATAAACCAAACGTGAA	CGGAGAGTGTTGCGAGGAATTT	-	chr2L	13762931	-	chr2L	13761820	1111	+	chr2L	13761820	+	chr2L	13762931
ATTTTGAGAATAATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	ATTTTGAGAATAATCAGAGAGA	AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	-	chrX	855359	-	chrX	12649915	11794556	+	chrX	12649915	+	chrX	855359
ATTGCCAAATCCCCGATATTGGTGCGCGCACACGAACACACAACCACTCAACCACACAACTATCTCTCTTTTTTC:1	ATTGCCAAATCCCCGATATTGG	ACACAACTATCTCTCTTTTTTC	-	chr3R	18420487	-	chr3R	17896091	524396	+	chr3R	17896091	+	chr3R	18420487
GTCCGAATGTGAATGCTTCTTTCTGTGAGTCTACAATTTGGCGCGCTTAAGGTAATCCTTGTAGGTAACATAACG:1	GTCCGAATGTGAATGCTTCTTT	AATCCTTGTAGGTAACATAACG	+	chr2L	6426882	+	chr2L	6445142	18260	+	chr2L	6426882	+	chr2L	6445142
TGAAAAGCAATCCCTATCAAAAAATCGGTAAATTTCATAGCCGCAAGCAATACGACCTCAAAATGTTCCTTTG:1	TGAAAAGCAATCCCTATCAAAA	ACGACCTCAAAATGTTCCTTTG	+	chr2L	6450269	+	chr2L	15784441	9334172	+	chr2L	6450269	+	chr2L	15784441
AGACAAAANCGAGAAGTCTGTGGTGGAAGTTTTAAACNNNNATAAGCCATCAAGCGAAGTGNTGAAATAGTCAAT:1	AGACAAAANCGAGAAGTCTGTG	GCGAAGTGNTGAAATAGTCAAT	+	chr3R	11656516	+	chr3R	11656596	80	+	chr3R	11656516	+	chr3R	11656596
TGGCCAACGAGAAAATCGCGTGAGCGCAACCGAGCAATCTTAATTTGGCATTTGGCACTGAAAAACACATCCTTG:1	TGGCCAACGAGAAAATCGCGTG	GGCACTGAAAAACACATCCTTG	+	chr2R	23636737	+	chr2R	23636815	78	+	chr2R	23636737	+	chr2R	23636815
CAGCAGCATCATCAGCAACACCACCAACACCAGGNGGCAGCTGCAGCATCGG:1	CAGCAGCATCATCAGCAACACC	CAGGNGGCAGCTGCAGCATCGG	+	chr3R	5678266	+	chr3R	16017181	10338915	+	chr3R	5678266	+	chr3R	16017181
AATGATTTATTATACCCGTTAACCGTAGAGTAAAAGGAAGCGTATCGTGCGACCCGGGTTCGTTTTAAAA:1	AATGATTTATTATACCCGTTAA	GCGACCCGGGTTCGTTTTAAAA	-	chr3R	32009369	-	chr3R	7728994	24280375	+	chr3R	7728994	+	chr3R	32009369
CTTCACCATGGTGATCTCGCCTGTCCGATCATAGCAAGTAATTCATCAATTAAAGCGTAGCCCAAGGAGCACGCG:1	CTTCACCATGGTGATCTCGCCT	AGCGTAGCCCAAGGAGCACGCG	+	chr3R	18102745	+	chr3R	5252840	12849905	+	chr3R	18102745	+	chr3R	5252840
AAAGAAGCCACAGCAAAAGCTTGCGGTGTGTGTGTGTGGGCTAAAAAGCGGCCAAGAAGGAAATAGCCAACAAC:1	AAAGAAGCCACAGCAAAAGCTT	CAAGAAGGAAATAGCCAACAAC	+	chr3R	10899460	+	chr3R	10899536	76	+	chr3R	10899460	+	chr3R	10899536
AACACTTTATTAGCCATTCACTAACAATTCCTAACTAACCATATTACCGAAGAGCTCGCCGGATGAC:1	AACACTTTATTAGCCATTCACT	ACCGAAGAGCTCGCCGGATGAC	+	chr2L	3291263	+	chr2L	3291335	72	+	chr2L	3291263	+	chr2L	3291335
GCATTTCGTTTCGCTATTAATACACTGCAAACACTAGCAAGAAAAACTCTAGAGATCAGTTCCATATTTACCGAT:1	GCATTTCGTTTCGCTATTAATA	GATCAGTTCCATATTTACCGAT	+	chr3L	7617696	+	chr3L	7617805	109	+	chr3L	7617696	+	chr3L	7617805
GGCGAAAGGAAAATCTTTTAACCTAAAGACTGTAGGACAATTAATTCGGAAACATGTATCTCAAGCTNAGAAT:1	GGCGAAAGGAAAATCTTTTAAC	ACATGTATCTCAAGCTNAGAAT	+	chr2L	18408053	+	chr2L	18412835	4782	+	chr2L	18408053	+	chr2L	18412835
ATTTACACCCCCCTTACTCACCCACTGCTGCAGCTCACGCAACGTGCTCGGCATGCTCGAGTGAG:1	ATTTACACCCCCCTTACTCACC	GTGCTCGGCATGCTCGAGTGAG	+	chr2R	18880372	+	chr2R	18880447	75	+	chr2R	18880372	+	chr2R	18880447
GAAATATTTGAATTCCCAGTAGTTGTTCACAGAGTGTNTGGTATANGTATCGAATCGAAAG:1	GAAATATTTGAATTCCCAGTAG	GGTATANGTATCGAATCGAAAG	+	chr2L	21744708	+	chr2L	21744781	73	+	chr2L	21744708	+	chr2L	21744781
AGTGCAGCGCGTGTGCCACATAAAAATGGCATTTTGACATGGCCACCGGGTGAGCATTATGAATGCTTGCCATG:1	AGTGCAGCGCGTGTGCCACATA	AGCATTATGAATGCTTGCCATG	-	chr3R	17348840	-	chr3R	17348752	88	+	chr3R	17348752	+	chr3R	17348840
AATGTAATAAGTAATATAATTTAACAGTGATAATCTGGAATTGAAGCAATACAATAAAAAAAAAGGGATGAACAA:1	AATGTAATAAGTAATATAATTT	ATAAAAAAAAAGGGATGAACAA	-	chr3L	7503554	-	chr3L	7498777	4777	+	chr3L	7498777	+	chr3L	7503554
TACAGTAGAAAAAATAAACAAATATTTAAATGAAAAAATTTGCTTTCGGATTCCATATCAATGACTACCAAGCCG:1	TACAGTAGAAAAAATAAACAAA	CATATCAATGACTACCAAGCCG	+	chr2R	18407681	+	chr2R	13958613	4449068	+	chr2R	18407681	+	chr2R	13958613
ATGGAATGCAATTTTCTTGGGAAAAAGCTGCAAGCATGAGGTGGCAAAAATGTACCCTTTTTTTAAGGTGCTGC:1	ATGGAATGCAATTTTCTTGGGA	TACCCTTTTTTTAAGGTGCTGC	-	chr2R	15022888	-	chr2R	15015465	7423	+	chr2R	15015465	+	chr2R	15022888
GCATGTTTTTACCCCAGAATCTTATCAACCTTAATTCGCAGCAACATACACACACACGCCTTAGACAAA:1	GCATGTTTTTACCCCAGAATCT	ACACACACACGCCTTAGACAAA	+	chr3L	13074061	+	chr3L	13074188	127	+	chr3L	13074061	+	chr3L	13074188
CCTTACTAAAGTTAATCCAATAACTAAAGTGATTTACCATCTGGCTGCATG:1	CCTTACTAAAGTTAATCCAATA	TGATTTACCATCTGGCTGCATG	-	chr2L	7183367	-	chr2L	7183309	58	+	chr2L	7183309	+	chr2L	7183367
AGACGAATAATCCCTAAATTNTCATATTTTGANTTCGAAATANTATACCAAAAATCAATATTCTATGGTTTTTAA:1	AGACGAATAATCCCTAAATTNT	ATCAATATTCTATGGTTTTTAA	+	chr2R	10318530	+	chr2R	10318616	86	+	chr2R	10318530	+	chr2R	10318616
TAAGTTGGACAAGTTATTAACCCTTAAATCAACCNTCCCATTCTCTCTTCCTTAAATAGAGTATTGAATGAATGT:1	TAAGTTGGACAAGTTATTAACC	AAATAGAGTATTGAATGAATGT	+	chr2L	16267200	+	chr2L	16408237	141037	+	chr2L	16267200	+	chr2L	16408237
CTCACATTCACACGTGATTTCAAAGTTTTCAACAAACATAGGTCTTTATNTAAAACAATCCACAAATAGTGGTT:1	CTCACATTCACACGTGATTTCA	AAACAATCCACAAATAGTGGTT	-	chr2R	12475496	-	chr2R	9109928	3365568	+	chr2R	9109928	+	chr2R	12475496
GCCGTTTGTTTTCCTTGCGGTAGTATCAACACTATCGATTGTCGCATCATCGTCGTCCTCGAAGTCCTC:1	GCCGTTTGTTTTCCTTGCGGTA	CATCGTCGTCCTCGAAGTCCTC	+	chrX	3863243	+	chrX	3863320	77	+	chrX	3863243	+	chrX	3863320
ATCTGGACCAAAGTAGTGNAAAAAATCATACACCTAATTTAAGNAGCTTNTACTTACATGTTGTTATATTCTATA:1	ATCTGGACCAAAGTAGTGNAAA	TTACATGTTGTTATATTCTATA	-	chr3R	22798020	-	chr3R	22797924	96	+	chr3R	22797924	+	chr3R	22798020
AAATTCGTTCAAGTGAAGTCTATATAGTTCCATCAAAGATCAATGCCATTGGCTTAATTGAGTTTCNGTTGTTTT:1	AAATTCGTTCAAGTGAAGTCTA	TTAATTGAGTTTCNGTTGTTTT	+	chr3R	21154583	+	chr3R	21154798	215	+	chr3R	21154583	+	chr3R	21154798
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGNGTTGTGTTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGCGTGGGTG:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TGTGTGTGTGAGTGCGTGGGTG	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28240365	6332831	+	chr3R	28240365	+	chr3R	21907534
TTGGGGTGGCGAAAAGCAGAGCATCAGATGAGCTNGTGGGGGAAATCGAAGTAAAAAATTCCCCAGCCACAGCGA:1	TTGGGGTGGCGAAAAGCAGAGC	AAAAATTCCCCAGCCACAGCGA	-	chr2L	18061040	-	chr2L	18051893	9147	+	chr2L	18051893	+	chr2L	18061040
AATTTCACTTGTCCAAGAAAGCAACTCGAAGATGCTGATGGTGCCGAATACGGAGCTCTATCGAGTACATTCAC:1	AATTTCACTTGTCCAAGAAAGC	GAGCTCTATCGAGTACATTCAC	+	chr2L	19559411	+	chr2L	19559486	75	+	chr2L	19559411	+	chr2L	19559486
GCTCGATGAGAAAGTTGCCGAACTGAAGTTTGCACTTGATNTATTTTCGCTGGGGAATTGCACCAGGC:1	GCTCGATGAGAAAGTTGCCGAA	TCGCTGGGGAATTGCACCAGGC	-	chr3R	7393354	-	chr3R	7393284	70	+	chr3R	7393284	+	chr3R	7393354
GCAATGGTACGTACGTCTGTGCGATGCAACTGAGGGAGAATTTTGCGGGTGTGTGCG:1	GCAATGGTACGTACGTCTGTGC	GAGAATTTTGCGGGTGTGTGCG	-	chr2R	6501068	-	chr2R	6500991	77	+	chr2R	6500991	+	chr2R	6501068
AAATGACAAAATCTTGAAACTCCTTTCTTTCTTGAAACGTCTTCTTCTTGTAGTGGACAACGGTAGACTTCTTCT:1	AAATGACAAAATCTTGAAACTC	TGGACAACGGTAGACTTCTTCT	+	chr3L	11131815	+	chr3L	11132079	264	+	chr3L	11131815	+	chr3L	11132079
GTTGACGAAGATGACAATCACGCTTAGCTCATGCAGCTTATGAAATATCCAGAGAACTTTTTTTTAACGAATTG:1	GTTGACGAAGATGACAATCACG	AGAACTTTTTTTTAACGAATTG	-	chr3L	24282245	-	chr3L	24282162	83	+	chr3L	24282162	+	chr3L	24282245
CTCCAACTGTGACCAGCANCTTATTGTGGTTACAAATTGTGNTAANAGCATCTCTGTTTAAGTTTTTTTCCTTT:1	CTCCAACTGTGACCAGCANCTT	TCTGTTTAAGTTTTTTTCCTTT	-	chr3R	32034298	-	chr3R	11332017	20702281	+	chr3R	11332017	+	chr3R	32034298
TGATCAAATTTTCCATATACCCTTTGAAAGAGTGATTACTACCTTTAACATTTTGTTGTGGAT:1	TGATCAAATTTTCCATATACCC	CCTTTAACATTTTGTTGTGGAT	+	chr2L	1322038	+	chr2L	1322115	77	+	chr2L	1322038	+	chr2L	1322115
TGCAGCGACGCATGGCGAGATCAAGTCTTATATATACATATATACATATTATGTAGTAGTCAATCTGGCGCAAT:1	TGCAGCGACGCATGGCGAGATC	GTAGTAGTCAATCTGGCGCAAT	+	chr3R	24207231	+	chr3R	24212306	5075	+	chr3R	24207231	+	chr3R	24212306
ACAAATTAAAATAAAATATATATATGTGGAGAGGTGGGTCACGCACGTGCGCCTG:1	ACAAATTAAAATAAAATATATA	GTGGGTCACGCACGTGCGCCTG	+	chr3L	19557288	+	chr3L	10080500	9476788	+	chr3L	19557288	+	chr3L	10080500
ACTATATCCCGATCTACAATTCCTGGCAATCCTGGACTACATGTTTTTTGTTTTGATTTTGGAATTAAAGCA:1	ACTATATCCCGATCTACAATTC	TTTTGATTTTGGAATTAAAGCA	+	chrX	2045034	+	chrX	2045108	74	+	chrX	2045034	+	chrX	2045108
ATCTACGAGGGCTTAAAAATTAGTTTAAGATCTGTTTGGGGCGTACTCTTCGCCATGTGCGGTGGTCA:1	ATCTACGAGGGCTTAAAAATTA	TCTTCGCCATGTGCGGTGGTCA	+	chr3R	29854834	+	chr3R	29854907	73	+	chr3R	29854834	+	chr3R	29854907
ATGTCTACCAAAGGCAAGAATCTGTAGCTTCCGGGATACTCTTTAATATCCTTAGAAATGAAGCCAATGTC:1	ATGTCTACCAAAGGCAAGAATC	CCTTAGAAATGAAGCCAATGTC	-	chr2L	8799919	-	chr2L	8799807	112	+	chr2L	8799807	+	chr2L	8799919
CCCATATTTTCCTGGAACTTTCTATAAAATATGAGATAATAAAAAGTGAATTATGATTTTGCGTTTTTGCGTTTT:1	CCCATATTTTCCTGGAACTTTC	TGATTTTGCGTTTTTGCGTTTT	-	chrX	15245923	-	chrX	19989834	4743911	+	chrX	19989834	+	chrX	15245923
CTGCAAAAGGAGGCATGCATAAGTACCTGTTTAAAAGTGGCGGAATCCAGTCAAGTCCTGTATTTTATCGC:1	CTGCAAAAGGAGGCATGCATAA	GTCAAGTCCTGTATTTTATCGC	+	chr2L	5827736	+	chr2L	5836740	9004	+	chr2L	5827736	+	chr2L	5836740
CACAACACAACACAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAA:2	CACAACACAACACAACAAAACA	AACAAAACAAAACAAAACAAAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	29013339	7105804	+	chr3R	21907535	+	chr3R	29013339
GAAGCATGAATTTATACGTCAGAAATTCAAGAAAATGCACAGGTAACCGCAGGCCATTGGCCTCCTTCACATTAA:1	GAAGCATGAATTTATACGTCAG	CCATTGGCCTCCTTCACATTAA	+	chr3R	17264653	+	chr3R	26318985	9054332	+	chr3R	17264653	+	chr3R	26318985
CGTCTGAATTTTATTAAATCTAGTTCCTTATATGGCAACGGATAGTTACAGTGTATCAAGTTTGTTACTTACTC:1	CGTCTGAATTTTATTAAATCTA	GTATCAAGTTTGTTACTTACTC	-	chrX	12465562	-	chrX	12465487	75	+	chrX	12465487	+	chrX	12465562
TATTGCATATTGAATTGTTGTTCAAAAAAGCATTCACCAGCAACAGGGATTTAATTAAATTTGTTTATTTAATGT:1	TATTGCATATTGAATTGTTGTT	ATTAAATTTGTTTATTTAATGT	-	chr2L	22260748	-	chr2L	22258623	2125	+	chr2L	22258623	+	chr2L	22260748
CTGTACATAATCCCGAGTGCCCCCGTCCCCTAATCCAATACTCCCCCGAAGAAAGTGTAATAAACGTAGTGGAAT:1	CTGTACATAATCCCGAGTGCCC	AGTGTAATAAACGTAGTGGAAT	+	chrX	21078780	+	chrX	21078858	78	+	chrX	21078780	+	chrX	21078858
TATCTGTGAGATATTCGGTGTAACTGTGGCCTCGCAAATGTCTGGGCCTGACTGCTTAATGACATTGTACGTGG:1	TATCTGTGAGATATTCGGTGTA	TGCTTAATGACATTGTACGTGG	+	chr3L	3450272	+	chr3L	5720764	2270492	+	chr3L	3450272	+	chr3L	5720764
CTCATACCTTGCCCGTAATCAAGCCTCCTCGGCCCGGCCCCCTTTGTTGAGCT:1	CTCATACCTTGCCCGTAATCAA	GCCCGGCCCCCTTTGTTGAGCT	-	chr3R	23548373	-	chr3R	23548090	283	+	chr3R	23548090	+	chr3R	23548373
ATTGTGCCTGTGAGATCATCGAAGCTTCACAGCTCATCTCCATTCGATTGCGACACTCACCTGGGCTGGCAGCA:1	ATTGTGCCTGTGAGATCATCGA	ACACTCACCTGGGCTGGCAGCA	-	chr3R	29986143	-	chr3R	29986063	80	+	chr3R	29986063	+	chr3R	29986143
TATACTTTCTGTCAGCGGCTTTGATTGCCAAAGGGCATTAAGTAGGATGGGTAGTTTTTCCGCC:1	TATACTTTCTGTCAGCGGCTTT	TAGGATGGGTAGTTTTTCCGCC	+	chr3R	20060642	+	chr3R	20060714	72	+	chr3R	20060642	+	chr3R	20060714
GTTAGCTGTAGTTGAGTTGAAACTATTAGTTAAAATTCGTTCAAGTGAAGTCTATATAGTTCCATCAAAGATCAA:1	GTTAGCTGTAGTTGAGTTGAAA	ATATAGTTCCATCAAAGATCAA	+	chr3R	21154551	+	chr3R	21154756	205	+	chr3R	21154551	+	chr3R	21154756
TCAATATAAAGTTACTCTTGTTTCGGTAAGAACTCTGATCTGTTGAAAATGTTAACATTTTGATTTTAAAT:1	TCAATATAAAGTTACTCTTGTT	TGTTAACATTTTGATTTTAAAT	+	chr3L	13400545	+	chr3L	13400617	72	+	chr3L	13400545	+	chr3L	13400617
CCACTCTCTAATTGCCCGATACGCATGGCATACTATATGAATCAAGTCTAAATCAGCAAGGAGACATCGTTGAAG:1	CCACTCTCTAATTGCCCGATAC	CAGCAAGGAGACATCGTTGAAG	+	chr3R	30621385	+	chr3R	18113340	12508045	+	chr3R	30621385	+	chr3R	18113340
AATAAGTTTCCTTTTCCAAATCAACTTAGCTACCTATAGGCTATATCACTTCCTGTAGTTTTTGTCAAAATTAAT:1	AATAAGTTTCCTTTTCCAAATC	TGTAGTTTTTGTCAAAATTAAT	-	chr2L	6544473	-	chr2L	6544381	92	+	chr2L	6544381	+	chr2L	6544473
GCTCGCTCACGAAATTCACTTAAGTAAAAGCGTCNGTAAATACCAAAACAAAAAAAAAAACGGAGGAAAAAGAAA:1	GCTCGCTCACGAAATTCACTTA	AAAAAAACGGAGGAAAAAGAAA	+	chr3R	20263610	+	chr3R	28559274	8295664	+	chr3R	20263610	+	chr3R	28559274
GAATTTAACATGCTGTGCACTTCAAACATCCGCTCACTACGGGGTGANGGTGGAGCGAGACGGGGGTAGGGAAAC:1	GAATTTAACATGCTGTGCACTT	AGCGAGACGGGGGTAGGGAAAC	-	chr3R	5060796	-	chr3R	5060706	90	+	chr3R	5060706	+	chr3R	5060796
CAAACATATTCACATTCTNAGCGTTCAGTTTTTAAAATGATTTAACTGAGAATCTACGAAAATCAAATAAAT:1	CAAACATATTCACATTCTNAGC	AATCTACGAAAATCAAATAAAT	+	chr2L	8538182	+	chr2L	8538255	73	+	chr2L	8538182	+	chr2L	8538255
CACAAACACAAACACAAACACATTGGCAAACATAATTATGTGGGTTTTCGAAAGTTATTTTTCGAATTGCAAC:1	CACAAACACAAACACAAACACA	AAGTTATTTTTCGAATTGCAAC	-	chr2L	16071771	-	chr2L	8934133	7137638	+	chr2L	8934133	+	chr2L	16071771
GAAGGAACAGCGCTGCATGCACATAAACGACGAGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1	GAAGGAACAGCGCTGCATGCAC	ACAACACAACACAACACAACAC	+	chr3R	5773688	+	chr3R	21907536	16133848	+	chr3R	5773688	+	chr3R	21907536
CTTAAGGATATTATGTTATTNCGGACACATTANACAGCAGACNGCGGGCAGGATATGGAGTAGATGGTCCGATGG:1	CTTAAGGATATTATGTTATTNC	TATGGAGTAGATGGTCCGATGG	+	chr3R	30736076	+	chr3R	16416327	14319749	+	chr3R	30736076	+	chr3R	16416327
AGCAATTGCCATGGCCGCCTGCCTCCGCCACAATCGCAGCTTGAATTNAAA:1	AGCAATTGCCATGGCCGCCTGC	ACAATCGCAGCTTGAATTNAAA	+	chr3R	28641307	+	chr3R	28641372	65	+	chr3R	28641307	+	chr3R	28641372
TGGCAGTCTCAACAGCAACTTTTTTTGAAGGACTGAAAAGTTTTCGCGCTCGCCCAGAAGCGTTGANATTTC:1	TGGCAGTCTCAACAGCAACTTT	CGCCCAGAAGCGTTGANATTTC	+	chr3R	28107035	+	chr3R	28107114	79	+	chr3R	28107035	+	chr3R	28107114
GGGCCAGAAACGAGGATGGGAATGGGAATGGACAGGGCCACAACCTTAAATCAAACAANGTCA:1	GGGCCAGAAACGAGGATGGGAA	AACCTTAAATCAAACAANGTCA	-	chr3L	11740231	-	chr3L	11740145	86	+	chr3L	11740145	+	chr3L	11740231
CTGCCTGATGGGCAAGCCAGCATTTTTCTGGCAAGACAAGCATCTTTCTTAAGTAATAAGTATAACTTTAATAAT:1	CTGCCTGATGGGCAAGCCAGCA	TAATAAGTATAACTTTAATAAT	+	chr2L	18452735	+	chr2L	11940076	6512659	+	chr2L	18452735	+	chr2L	11940076
TATAAACATCTTGTAATACATATTTACATATATTTCGGAAATATCTAACTATTTAATTTTAAGGCATATGTTAAA:1	TATAAACATCTTGTAATACATA	TAATTTTAAGGCATATGTTAAA	+	chr3L	12089087	+	chr3L	12089167	80	+	chr3L	12089087	+	chr3L	12089167
GCCTATACCAATGGGGTTTGTTTCAATACGCCTTGTTGAGTGAGAAAGTAGTAGGTGTATGGGTGGGGGGAGAAA:1	GCCTATACCAATGGGGTTTGTT	GGTGTATGGGTGGGGGGAGAAA	-	chr3L	22886482	-	chr3L	8105859	14780623	+	chr3L	8105859	+	chr3L	22886482
TAGTTGATACTCGCAATGAAAAAATAGTATTCAACAATTGTTTGAACTGTACCGGAAAATTGAATATTATTTAAT:1	TAGTTGATACTCGCAATGAAAA	GGAAAATTGAATATTATTTAAT	+	chr3R	28742510	+	chr3R	28742586	76	+	chr3R	28742510	+	chr3R	28742586
TAAATTAGATATAAATCTCATTCATTTCACGCACAAGTGAATGATA:1	TAAATTAGATATAAATCTCATT	TTTCACGCACAAGTGAATGATA	+	chr3R	27007435	+	chr3R	27016541	9106	+	chr3R	27007435	+	chr3R	27016541
ACATGGATTTATGAATTCAAATTCTAGTGCCATTTGTAAATCAAATTCTGACTTTGCGAAACATCAAAATGTTTC:1	ACATGGATTTATGAATTCAAAT	TTGCGAAACATCAAAATGTTTC	+	chr2L	1828955	+	chr2L	1829032	77	+	chr2L	1828955	+	chr2L	1829032
ATCATGTCGAAATCATAAAATTAATTAAATACTAACATTGTTCATCCCATTTTCAGGATACTATCAAGCACTTAG:1	ATCATGTCGAAATCATAAAATT	CAGGATACTATCAAGCACTTAG	-	chrX	20041621	-	chrX	20041541	80	+	chrX	20041541	+	chrX	20041621
AGCGTTCAATGGAGCAAGTGATAAGCGTGCACCACTTGACGGACAACTATGCGGAGTCCTGGAACTCGTCCTGA:1	AGCGTTCAATGGAGCAAGTGAT	GGAGTCCTGGAACTCGTCCTGA	+	chr2R	8277635	+	chr2R	8277729	94	+	chr2R	8277635	+	chr2R	8277729
AGGTAGGACATAATTGGCTTTGGTTTGAAACCGTTTAAAAGTTATTGACTACATGGTAACAATCTTGCCTTGGG:1	AGGTAGGACATAATTGGCTTTG	ATGGTAACAATCTTGCCTTGGG	-	chr3L	12962289	-	chr3L	12957808	4481	+	chr3L	12957808	+	chr3L	12962289
GTAAAAGTGTTTGCCTACTTAATGATACGACCCTAGGGAAAAAGTGTGGAAGAACATAATGCCAACCTATATAG:1	GTAAAAGTGTTTGCCTACTTAA	AACATAATGCCAACCTATATAG	+	chr3R	27844754	+	chr3R	19544665	8300089	+	chr3R	27844754	+	chr3R	19544665
ATTATGCAAGCACATTTATCGATGTGCAGCAGCAGCCAACTTTAACATACAACAGCCACGCAAGCTGAAAAGTAT:1	ATTATGCAAGCACATTTATCGA	AGCCACGCAAGCTGAAAAGTAT	+	chr3R	22660108	+	chr3R	15030532	7629576	+	chr3R	22660108	+	chr3R	15030532
CTTTGATGTGTTTGCGCAGCCAATTCCNAGNNGCTGCCCTGCAAATAATNTNGCATTTCAATTTTGAGTTGGTTG:1	CTTTGATGTGTTTGCGCAGCCA	CATTTCAATTTTGAGTTGGTTG	-	chr3R	25236338	-	chr3R	25236199	139	+	chr3R	25236199	+	chr3R	25236338
TTAGATTGTTCTTCTTTGGTTTCTCCGTTTGCTCCTCCTTGGTCCTTGGNCCTTCGTCACCAAGCAGCCAGCATG:1	TTAGATTGTTCTTCTTTGGTTT	TCGTCACCAAGCAGCCAGCATG	+	chrX	8013258	+	chrX	8013370	112	+	chrX	8013258	+	chrX	8013370
GCCTTGAGCCCACCACCCCAACCTCTCGAATTCCTTATTTACTTTATAGNTGCAGGCAAAGTAAACCAATACCAA:1	GCCTTGAGCCCACCACCCCAAC	AGGCAAAGTAAACCAATACCAA	+	chr2L	1469424	+	chr2L	16215424	14746000	+	chr2L	1469424	+	chr2L	16215424
GTCAGCTTGGAAGACGTAGAACTTAGAATTTATCAAGTTAATTTTATCCATTCTTTTGTTTGCGTATAGTGACA:1	GTCAGCTTGGAAGACGTAGAAC	CTTTTGTTTGCGTATAGTGACA	-	chr2R	20788091	-	chr2R	20783320	4771	+	chr2R	20783320	+	chr2R	20788091
GGCCTGAGAATATTTGTATTNAGCCTACCGTGNTTAAAGTACNCACAATCTCAACATCTCCTAGCGGGTCTAGAT:1	GGCCTGAGAATATTTGTATTNA	ACATCTCCTAGCGGGTCTAGAT	-	chr3R	19448924	-	chr3R	19448288	636	+	chr3R	19448288	+	chr3R	19448924
GGGAAAACCACTAGCACCTTCAAATTTGTGTGTGAGTGCGTGTGNGGGCATAACAAAAACGTGTTGATTT:1	GGGAAAACCACTAGCACCTTCA	CATAACAAAAACGTGTTGATTT	+	chrX	706807	+	chrX	707166	359	+	chrX	706807	+	chrX	707166
AAAGTGACACTGCGATAATCGCAAGTCAATAAACGACACTTACAATGGGTAAAAGNCAGCGAAG:1	AAAGTGACACTGCGATAATCGC	CAATGGGTAAAAGNCAGCGAAG	+	chr3R	18891844	+	chr3R	18891916	72	+	chr3R	18891844	+	chr3R	18891916
GTTGGAAAAACCTAACAAAGGATTACGGCTAATTTTCACTTCGAAAACTATACAAATTTTAAAGTTTT:1	GTTGGAAAAACCTAACAAAGGA	ACTATACAAATTTTAAAGTTTT	+	chr2L	13892843	+	chr2L	13893699	856	+	chr2L	13892843	+	chr2L	13893699
AAATAAATATAAATTGAAACCACGATCTGTATAAACACTTGGCAAGCACA:1	AAATAAATATAAATTGAAACCA	GTATAAACACTTGGCAAGCACA	-	chr2L	408029	-	chr2L	407973	56	+	chr2L	407973	+	chr2L	408029
GATGGACAGCCATCAAAGCAGACATGAAAACAAGTACAAAAAAAAAAGAGATAAACCAA:1	GATGGACAGCCATCAAAGCAGA	AAAAAAAAAAGAGATAAACCAA	+	chr3R	30564342	+	chr3R	30564409	67	+	chr3R	30564342	+	chr3R	30564409
TACGTTTGATAAAAGACTACTTATGTTTTATGGCGAATCATTTTTTTTTTCACGCCTGTAAACTTCTTTAGTAA:1	TACGTTTGATAAAAGACTACTT	CGCCTGTAAACTTCTTTAGTAA	-	chrX	21077694	-	chrX	21077606	88	+	chrX	21077606	+	chrX	21077694
TATTTACATATATATCTAGAAAGGTGTGCTGTGCTTTTTGCAATTGGTCTCAGGTCCATTGGAAGGCCAACCTGA:1	TATTTACATATATATCTAGAAA	GTCCATTGGAAGGCCAACCTGA	+	chrX	6118718	+	chrX	6118800	82	+	chrX	6118718	+	chrX	6118800
GGGAAAAGGGAAAACGGCTATCAGTTAACGGGAATGCAACAGAAACTGTTAGTTTATCACTTATCAAGTGTCAAA:1	GGGAAAAGGGAAAACGGCTATC	TTATCACTTATCAAGTGTCAAA	+	chr2R	14653538	+	chr2R	24483853	9830315	+	chr2R	14653538	+	chr2R	24483853
GTTTTAAGGTAAATTTCGGCGATATAATGGAAGCATTGCAAATAATGCCTTCTTGCTTTATAGCGCTGCTTCC:1	GTTTTAAGGTAAATTTCGGCGA	CTTGCTTTATAGCGCTGCTTCC	-	chr3R	4568802	-	chr3R	4568717	85	+	chr3R	4568717	+	chr3R	4568802
ACTCATCAGAACTCATCATCATTAGGGCACGACCGATTTCAGATCTTGCTCAGATTGCCATGCCCTCGGA:1	ACTCATCAGAACTCATCATCAT	CTCAGATTGCCATGCCCTCGGA	+	chr3R	13863689	+	chr3R	13863772	83	+	chr3R	13863689	+	chr3R	13863772
GAATTCTGGCAGCTCGTCAGCCGGCTTATCATTTAAATGGAGGGAAGTTGGCTTTAAAGGCAATCGCAAAGCG:1	GAATTCTGGCAGCTCGTCAGCC	CTTTAAAGGCAATCGCAAAGCG	-	chr2R	14393968	-	chr2R	14393885	83	+	chr2R	14393885	+	chr2R	14393968
GTACCGCAGTCCCATTGGACCTCGCTCATCCTGAAAAATGCCGAAGAAGGGAAAAGAAACCATTGTAGCCACAA:1	GTACCGCAGTCCCATTGGACCT	AAAGAAACCATTGTAGCCACAA	+	chr3R	14162808	+	chr3R	19444867	5282059	+	chr3R	14162808	+	chr3R	19444867
CAGCATGAGTGTAAACGATATGTACCATACATCGGGAGGCCCAATCTCTCGACCTTTGCCAGCCAGCCACAGCCT:1	CAGCATGAGTGTAAACGATATG	CTTTGCCAGCCAGCCACAGCCT	+	chr2R	25227840	+	chr2R	23174599	2053241	+	chr2R	25227840	+	chr2R	23174599
ACTTAAGCGGATGCACTTGTAATTTTTTTTATGATATAATGGTATTTTAGCTTGTTTCTAATAACCCGTTGACAG:1	ACTTAAGCGGATGCACTTGTAA	GTTTCTAATAACCCGTTGACAG	-	chrX	19380418	-	chrX	19380177	241	+	chrX	19380177	+	chrX	19380418
TTCTAATGTTTTTTGTTGTTGTTGCTG:1	TTCTAATGTTTTTTGTTGTTGT	ATGTTTTTTGTTGTTGTTGCTG	+	chr3L	922699	+	chr3L	5622144	4699445	+	chr3L	922699	+	chr3L	5622144
GATTCGAATTTAATTATACTCCTTTCTGGGTCGTGCAAATGTAAATGTAGAACAAAAGTTATAAATCTCTTATGC:1	GATTCGAATTTAATTATACTCC	AAAAGTTATAAATCTCTTATGC	-	chr3L	14522222	-	chr3L	14522123	99	+	chr3L	14522123	+	chr3L	14522222
GCCCTCTTCCTTTACTACAGTCCATGAATACAAAAGGTCCTTTCAA:1	GCCCTCTTCCTTTACTACAGTC	TGAATACAAAAGGTCCTTTCAA	-	chr3R	4761209	-	chr3R	4759741	1468	+	chr3R	4759741	+	chr3R	4761209
AAATAGCAATACTGGTTACTATGTTCATTAAAATCAGTTTCTGTACTGTAAACAA:1	AAATAGCAATACTGGTTACTAT	TCAGTTTCTGTACTGTAAACAA	+	chr3L	2168790	+	chr3L	2168861	71	+	chr3L	2168790	+	chr3L	2168861
AAACTAGTTTAAAAGAATAGTGTGCTTTTAAACTTTAAGCGGTTGAATACAGCTTATAAAAGACTTCGATGATAA:1	AAACTAGTTTAAAAGAATAGTG	TTATAAAAGACTTCGATGATAA	-	chr2L	8171362	-	chr2L	8171281	81	+	chr2L	8171281	+	chr2L	8171362
CGAGATTAATTGATGAGACAGGGAAACCGAAGCCCAAATGGGCAATGCCAAAGCCCCC:1	CGAGATTAATTGATGAGACAGG	AATGGGCAATGCCAAAGCCCCC	+	chr2L	14803908	+	chr2L	14809094	5186	+	chr2L	14803908	+	chr2L	14809094
CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACGCAACGCAACACAACACAA:1	CACAACACAACACAACACAACA	AACGCAACGCAACACAACACAA	+	chr3R	21907535	+	chr3R	8339247	13568288	+	chr3R	21907535	+	chr3R	8339247
CTACTGATGGCTCAATTTGGGAGAAAGACAAAAAAACATTTAAGAAACTGTTTGCTTAAAATAAGCNAGCAG:1	CTACTGATGGCTCAATTTGGGA	TTTGCTTAAAATAAGCNAGCAG	+	chr2R	10198842	+	chr2R	19864774	9665932	+	chr2R	10198842	+	chr2R	19864774
CGGATGCACTTGTAATTTTTTTTATGATATAATGGTATTTTAGCATGTTTCTAATAACCCGTTGACAGANTTC:1	CGGATGCACTTGTAATTTTTTT	TAATAACCCGTTGACAGANTTC	-	chrX	19380411	-	chrX	19380172	239	+	chrX	19380172	+	chrX	19380411
CAAATAAACAGATCCACGTGCCGAGCATAGAAACTAGCCATTGTGACTGATAAGAGTGCAGGCAAAAAAAATAAA:1	CAAATAAACAGATCCACGTGCC	GAGTGCAGGCAAAAAAAATAAA	+	chr3L	1189636	+	chr3L	1189722	86	+	chr3L	1189636	+	chr3L	1189722
AGGCAAAGTTATATTTACGATATTTGGTAGGAGCACAAACACAGCGAAAAGAGCACTAGAATGGCAAACTAACC:1	AGGCAAAGTTATATTTACGATA	GCACTAGAATGGCAAACTAACC	+	chr3R	7219164	+	chr3R	14832520	7613356	+	chr3R	7219164	+	chr3R	14832520
CTACGCCCTAAGCCTAGGCAATATTATCAATACGATCGTTGAAAACCCAAC:1	CTACGCCCTAAGCCTAGGCAAT	ATACGATCGTTGAAAACCCAAC	+	chr2R	13580527	+	chr2R	13580853	326	+	chr2R	13580527	+	chr2R	13580853
AACCAAATTTTATTTCATATATTATACAATGTGCTCGGAACAACTTGAGAAATCGGATATTAGCCACCTG:1	AACCAAATTTTATTTCATATAT	GAAATCGGATATTAGCCACCTG	+	chr3L	11887269	+	chr3L	11887361	92	+	chr3L	11887269	+	chr3L	11887361
TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1	TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG	TTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG	-	chr3R	21907535	-	chr3R	28831801	6924266	+	chr3R	28831801	+	chr3R	21907535
TTCCCCGGTGGAAAATCCCCCAACAGGCCCCACTAACTAAGGTAGACGGTCGACAACGACAACTAATGAG:1	TTCCCCGGTGGAAAATCCCCCA	GTCGACAACGACAACTAATGAG	+	chr2R	21902627	+	chr2R	21902699	72	+	chr2R	21902627	+	chr2R	21902699
CATTCTCCTCAATTTCTGCACCCGACCAAGTTAAACGATATTTCAAAGCGACAATCGCACGGCAAG:1	CATTCTCCTCAATTTCTGCACC	AAAGCGACAATCGCACGGCAAG	+	chr3L	8039254	+	chr3L	12246458	4207204	+	chr3L	8039254	+	chr3L	12246458
GACCATCCAACCATCCACCCATCTACCCATNNNANCATCCGCCCATCCAGTCAGGCACCCAGGCATTTCCTCTTA:1	GACCATCCAACCATCCACCCAT	GGCACCCAGGCATTTCCTCTTA	+	chr3R	21545647	+	chr3R	13092471	8453176	+	chr3R	21545647	+	chr3R	13092471
ATGTTAATAATATTAAAAGTCTTACGATAAGAATGGGTTAATTAATTAAGTGAACTCACTTCAACTCGTCATCGG:1	ATGTTAATAATATTAAAAGTCT	ACTCACTTCAACTCGTCATCGG	-	chr3L	8796705	-	chr3L	8791285	5420	+	chr3L	8791285	+	chr3L	8796705
CGGTCAAGCGATGGCACAAAAAACAAAACCAAAAGGGGGACTACCTTTTCTTTTGCCCTCGTGCCACATTGCAAT:1	CGGTCAAGCGATGGCACAAAAA	TGCCCTCGTGCCACATTGCAAT	+	chr2R	12504159	+	chr2R	12504236	77	+	chr2R	12504159	+	chr2R	12504236
CAATCAAACATTCACAGCCTAAGCTTCCCGATATCTAGACGTTTCTACTTTTCGATAATAAGCAA:1	CAATCAAACATTCACAGCCTAA	TCTACTTTTCGATAATAAGCAA	+	chr2L	21285661	+	chr2L	21285749	88	+	chr2L	21285661	+	chr2L	21285749
ACTCGGTACCTTATAAAATCACAAAGTAATATATATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAGAGCATTGAAATCAGA:1	ACTCGGTACCTTATAAAATCAC	AAAAAAGAGCATTGAAATCAGA	+	chr3L	17918390	+	chr3L	17921193	2803	+	chr3L	17918390	+	chr3L	17921193
GGTCATTTTTCGACGAAATTGGGGGCACCTACAAAATGGTGAGCACGAAAGGGGAATTGGATGTCAAATGCCAAG:1	GGTCATTTTTCGACGAAATTGG	GAATTGGATGTCAAATGCCAAG	-	chrX	17339000	-	chrX	7494143	9844857	+	chrX	7494143	+	chrX	17339000
TTCTCAGCCCATCCTGTCTGGCCAATGCCAATAATGCACATTTCTTGCAGCGTTCGGAGGCTCGCGGTACTCTCT:1	TTCTCAGCCCATCCTGTCTGGC	TCGGAGGCTCGCGGTACTCTCT	+	chr3L	21905335	+	chr3L	21905415	80	+	chr3L	21905335	+	chr3L	21905415
ATGGAAAATATCCATAATAANAATGATTTCCANTAAATATTTNAGTTAGTTTTTAAAAGGTGCCAGGCCATGAG:1	ATGGAAAATATCCATAATAANA	TTAAAAGGTGCCAGGCCATGAG	+	chr2L	764555	+	chr2L	764654	99	+	chr2L	764555	+	chr2L	764654
TAAACACAGGGCACAAAGACATAGAACTGGGTCGCATTATACACATAATAGATCTACAGCTCGCTGAAAGAAAT:1	TAAACACAGGGCACAAAGACAT	TCTACAGCTCGCTGAAAGAAAT	+	chr2R	4312954	+	chr2R	4313037	83	+	chr2R	4312954	+	chr2R	4313037
ATTGTGACTGATATATTACGTATTACGTATTACGCACTGATTTCGTTGAATGAGAACTTTTTATGAATTCAATTT:1	ATTGTGACTGATATATTACGTA	GAACTTTTTATGAATTCAATTT	-	chr3R	10733197	-	chr3R	10732325	872	+	chr3R	10732325	+	chr3R	10733197
TAGGATGTTGTAATGATTTCCTGCGAGTATTGTAATGAAAACTGACCCTCTGTTATCAGTTATCAGAGCTTGAA:1	TAGGATGTTGTAATGATTTCCT	TTATCAGTTATCAGAGCTTGAA	-	chr3R	23626449	-	chr3R	23626351	98	+	chr3R	23626351	+	chr3R	23626449
ACAGTGCGCTAAGACAGCCGGGAACATGCGTATATGCAGGCCTTACCTCACGTTAGCCCAAGTCGGGATAAAGTA:1	ACAGTGCGCTAAGACAGCCGGG	TAGCCCAAGTCGGGATAAAGTA	+	chr3R	6873943	+	chr3R	6874154	211	+	chr3R	6873943	+	chr3R	6874154
GACTTGGGGTCAGGGTGCACGGGCTTGGAACTGGAACTGGTCTGGTGGCAGTGTCATAAGCCTCAAGTGCTATT:1	GACTTGGGGTCAGGGTGCACGG	GTCATAAGCCTCAAGTGCTATT	+	chr2L	13699579	+	chr2L	13699655	76	+	chr2L	13699579	+	chr2L	13699655
AATTACCGAATTTCGGAACAATTCGTTTTGACTAACAAGAAATCCTATGCTTCCTCGCTGATCTCGACAAAC:1	AATTACCGAATTTCGGAACAAT	TTCCTCGCTGATCTCGACAAAC	-	chr3R	30012636	-	chr3R	30017943	5307	+	chr3R	30017943	+	chr3R	30012636
GCAGTCTCTGGTGACTGAATGGGGTGCAGTATGCTTCAGCGTTTGCTAAATATAAACACTCCGCCGGCATTGTTT:1	GCAGTCTCTGGTGACTGAATGG	AAACACTCCGCCGGCATTGTTT	+	chr2R	14955224	+	chr2R	14955374	150	+	chr2R	14955224	+	chr2R	14955374
TTGTTTACCACAATATCCNGAACTGGAACTGGAACCACAACNTTGNCACACACACTCAGACACACACACACACAC:1	TTGTTTACCACAATATCCNGAA	ACTCAGACACACACACACACAC	+	chr3L	17207082	+	chr3L	9714698	7492384	+	chr3L	17207082	+	chr3L	9714698
TTTCATTTGTAAAGTTGTTCTTCTAGAGTTGCTGATTCATTGGTTTGTTCAAATAGTTCAAATGCAGACACTTGT:1	TTTCATTTGTAAAGTTGTTCTT	TAGTTCAAATGCAGACACTTGT	-	chr3L	695411	-	chr3L	695179	232	+	chr3L	695179	+	chr3L	695411
TGAGTGTCGAAGAGGACATACAAGGACGATCAATGCAAGTGAAAAACGGAGCAACGCAGAGATCATCGAG:1	TGAGTGTCGAAGAGGACATACA	GAGCAACGCAGAGATCATCGAG	+	chr3R	2534162	+	chr3R	2541726	7564	+	chr3R	2534162	+	chr3R	2541726
CAACACAATGGCACATCTCTCATCAATGGGCAGTCAAATGCAAAGCACATACGTAATCCCAGGAAAAGTGGGTGG:1	CAACACAATGGCACATCTCTCA	TAATCCCAGGAAAAGTGGGTGG	+	chr3R	23629475	+	chr3R	23629551	76	+	chr3R	23629475	+	chr3R	23629551
TTTTTAAAAACATTTGAAATACATCTATTTTACAAATTTTTCTCCACACATATGCACTCTAAAATGATGCTATTT:1	TTTTTAAAAACATTTGAAATAC	GCACTCTAAAATGATGCTATTT	+	chr3L	16941418	+	chr3L	16941519	101	+	chr3L	16941418	+	chr3L	16941519
AACCGGAAACCATAATTATTGCACACAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGCGAGTGTGCGGCCTTGAATAGA:1	AACCGGAAACCATAATTATTGC	CGAGTGTGCGGCCTTGAATAGA	-	chr3R	27794798	-	chr3R	27791644	3154	+	chr3R	27791644	+	chr3R	27794798
TATGGGTATGGGTATGGGGATGTACTGGGCACAGAGACCCATACTCCCCACTACT:1	TATGGGTATGGGTATGGGGATG	GAGACCCATACTCCCCACTACT	+	chr2R	21772142	+	chr2R	23669711	1897569	+	chr2R	21772142	+	chr2R	23669711
AGAGCAGTGCGAGGATGANTGTATGTAATTCAAATCGATCTATNATTTANGCCCGTTTTGGACTTGCAAACTGAT:1	AGAGCAGTGCGAGGATGANTGT	CGTTTTGGACTTGCAAACTGAT	-	chr3R	15452371	-	chr3R	15452294	77	+	chr3R	15452294	+	chr3R	15452371
AGTACATCCTGTTGTCGTTGTGGTCGGCGACAGGGTGCCTTAAATGCGGGTAGGGAAATGCGGATAGGGAAACGG:1	AGTACATCCTGTTGTCGTTGTG	GGAAATGCGGATAGGGAAACGG	-	chrX	22763702	-	chrX	22763616	86	+	chrX	22763616	+	chrX	22763702
GAGGAAAATGCGGCAAAAAGAAAGTGGAGAAGAGAAGAGCTTAAGCTGAATTGGAAAACTGCACTTGGACCCAAA:1	GAGGAAAATGCGGCAAAAAGAA	GAAAACTGCACTTGGACCCAAA	+	chrX	6864227	+	chrX	6184098	680129	+	chrX	6864227	+	chrX	6184098
CAAAAAGAACTTAAACAGCATGTGGGTCAAAAAAAAAAACAAAAGAGGGAAAAACATTTCTAGGTGGCTAGAAAG:1	CAAAAAGAACTTAAACAGCATG	ACATTTCTAGGTGGCTAGAAAG	+	chr2L	14212327	+	chr2L	12475720	1736607	+	chr2L	14212327	+	chr2L	12475720
GTTACTCTCGGCTAAATTAACAATATAAGCTTTAATTTGAAAACTTTATACTAGAAATGATAAATGTTTGGATAT:1	GTTACTCTCGGCTAAATTAACA	GAAATGATAAATGTTTGGATAT	+	chr2L	11828442	+	chr2L	11828518	76	+	chr2L	11828442	+	chr2L	11828518
AATCACATCTCCGAACCGACCACGACGCATCATCATCATCATCATTTATGCCACTGCCAGACTAGCCACTC:1	AATCACATCTCCGAACCGACCA	GCCACTGCCAGACTAGCCACTC	-	chr3R	28649340	-	chr3R	28648989	351	+	chr3R	28648989	+	chr3R	28649340
GGTAGATGCCAGACGAAAGAGTTGCAAGCACACACATGTGCGGGCATAAAAGAAAAGCAGAAACTTAAGACGT:1	GGTAGATGCCAGACGAAAGAGT	GAAAAGCAGAAACTTAAGACGT	+	chr3R	27140525	+	chr3R	27148133	7608	+	chr3R	27140525	+	chr3R	27148133
CACGACAACAACGCCAAAGCACAAAAGCAACATCAGCCCGCAACAGCAGCAACTACCACCACGAACAACCACA:1	CACGACAACAACGCCAAAGCAC	ACTACCACCACGAACAACCACA	+	chr3R	24910145	+	chr3R	23960452	949693	+	chr3R	24910145	+	chr3R	23960452
TGCTACCANATGGGTAGTTTCCATTCAAAACATTCNATTAGGGGGAAACCGAAAATTTCTTCCTTGAAATTGTAT:1	TGCTACCANATGGGTAGTTTCC	AATTTCTTCCTTGAAATTGTAT	+	chr2L	6458600	+	chr2L	6458681	81	+	chr2L	6458600	+	chr2L	6458681
ATGCTCTAATTTTATAGCTATAAATTTCTCAGCTATTTGCAATTAT:1	ATGCTCTAATTTTATAGCTATA	TTTCTCAGCTATTTGCAATTAT	-	chrX	20710487	-	chrX	20710439	48	+	chrX	20710439	+	chrX	20710487
CAAAGGGGGTGGGGAAGGTTGGTGGGCAAGTAGAATTGGGGACGTGAGCAGCAGATACATGCGAAGTGG:1	CAAAGGGGGTGGGGAAGGTTGG	GCAGCAGATACATGCGAAGTGG	+	chr2R	20523045	+	chr2R	20523150	105	+	chr2R	20523045	+	chr2R	20523150
GCTATACAAAATCTTGGTCAGAAGAAAAAAACCATGTTATGTGCATTGAAAGCTACATTTAATTTAAGATTTAAT:1	GCTATACAAAATCTTGGTCAGA	TACATTTAATTTAAGATTTAAT	-	chr2L	11224172	-	chr2L	11224061	111	+	chr2L	11224061	+	chr2L	11224172
TATAGCACAACAATTTTAGTTCTACAACTGCTCTCGTGACGTAACGCGACGACGACTGGTGGGACTGAGTGGAAA:1	TATAGCACAACAATTTTAGTTC	GACTGGTGGGACTGAGTGGAAA	+	chr3L	9130572	+	chr3L	9134333	3761	+	chr3L	9130572	+	chr3L	9134333
AGGTTGTCNTCCCATAAACATTTGGTGATCCCGACNTTACCGCAGATTTTATCGGAGTCTACAACTCGGGCTTGT:1	AGGTTGTCNTCCCATAAACATT	GGAGTCTACAACTCGGGCTTGT	+	chr2R	529344	+	chr2R	537969	8625	+	chr2R	529344	+	chr2R	537969
GCGCTGAAAAATTCTGCANAACAAGACTGCGACTACTGCACNTAANCCGGTTGCGAAATCAACTCTTATATTAC:1	GCGCTGAAAAATTCTGCANAAC	GCGAAATCAACTCTTATATTAC	+	chr3R	23820664	+	chr3R	23820747	83	+	chr3R	23820664	+	chr3R	23820747
GCGATCGTTGTCCAATTAATGCTTGGATACTAAATGCCAGTGATCACTGCTCAGGTTGTTTGGAGGGTTTTATG:1	GCGATCGTTGTCCAATTAATGC	AGGTTGTTTGGAGGGTTTTATG	-	chr3L	16749307	-	chr3L	16749232	75	+	chr3L	16749232	+	chr3L	16749307
CGAGTCTTGTTTTTTTTACAAATTCGATATTACTCTTTTTTACAATTCTCTACATTTCCATGGCTAAAGAAATT:1	CGAGTCTTGTTTTTTTTACAAA	CATTTCCATGGCTAAAGAAATT	+	chr3L	8314756	+	chr3L	8314848	92	+	chr3L	8314756	+	chr3L	8314848
GACAGAAAAGCGGTGGAGGCCAGTGGAAAACCAAAAAAGGAAAAAGGAAAAATGAAAGGTGAAATTACGGAAATG:1	GACAGAAAAGCGGTGGAGGCCA	GAAAGGTGAAATTACGGAAATG	+	chr3L	20156357	+	chr3L	18606700	1549657	+	chr3L	20156357	+	chr3L	18606700
TGTTATCAAATTATAAACAATTTCAACGTGAGTTCACGTTAATTAGGTTGCAGCGCAAAGAGCCACAACAGCTCC:1	TGTTATCAAATTATAAACAATT	CGCAAAGAGCCACAACAGCTCC	-	chr2R	6895494	-	chr2R	6895415	79	+	chr2R	6895415	+	chr2R	6895494
AGCCCAANATACATACCTACCAGTAATTCATTGACCTCCNCGAACGCCAATCCCCAANCCCAAATATG:1	AGCCCAANATACATACCTACCA	CCAATCCCCAANCCCAAATATG	+	chr2R	24490159	+	chr2R	24488270	1889	+	chr2R	24490159	+	chr2R	24488270
TGACTTTTTAAAGATTTGTGCAAAGGGGCTGTCGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTT:1	TGACTTTTTAAAGATTTGTGCA	TTGTTTTTTTTTTTATTTTTTT	-	chrX	7111867	-	chrX	11762021	4650154	+	chrX	11762021	+	chrX	7111867
ATAAAAACAGTTTATTATTGCATATTTTGGTGCATATGCATATTATTAATTTTTCCCATTAATGCCAATCGAGTT:1	ATAAAAACAGTTTATTATTGCA	TCCCATTAATGCCAATCGAGTT	-	chr3L	8166059	-	chr3L	8165975	84	+	chr3L	8165975	+	chr3L	8166059
GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT	-	chr3R	21907534	-	chr3R	28831802	6924268	+	chr3R	28831802	+	chr3R	21907534
AAAGTAAGGCAGGAGGTTTCTCGGACTGGTGGCATGTGCAGATAGAACCATTCTCCACTCCACTCCACTCTGCTC:1	AAAGTAAGGCAGGAGGTTTCTC	TCCACTCCACTCCACTCTGCTC	+	chr3R	30259526	+	chr3R	13062327	17197199	+	chr3R	30259526	+	chr3R	13062327
GTGTTTGGCCAAAAACACGAAAATAATTAGAACTCAAGGCGAGGACTCGAAATAGCACGGGTTGGCAAAGATATG:1	GTGTTTGGCCAAAAACACGAAA	AGCACGGGTTGGCAAAGATATG	+	chr2R	24881028	+	chr2R	16835822	8045206	+	chr2R	24881028	+	chr2R	16835822
TCACTCCCAGGTTCAATGCATCATCATCATCGTTGAGCTAGCTACACNGACATCTTTATTGAGATGTATTTTTCC:1	TCACTCCCAGGTTCAATGCATC	CTTTATTGAGATGTATTTTTCC	-	chr2R	23427930	-	chr2R	23427788	142	+	chr2R	23427788	+	chr2R	23427930
AGCTTTGGGGGAAAAAAGAATGGCTGCAAGGAGTCCGGAGGACCCAACATATCCCCCTCCAGACAAGTAGACAA:1	AGCTTTGGGGGAAAAAAGAATG	CCCCCTCCAGACAAGTAGACAA	-	chr3R	19954025	-	chr3R	19953949	76	+	chr3R	19953949	+	chr3R	19954025
CATCATAATGTATGGCTATTATGCATTGAGTGTGCTGGGTCCTCGA:1	CATCATAATGTATGGCTATTAT	ATTGAGTGTGCTGGGTCCTCGA	-	chr3L	11102245	-	chr3L	11100904	1341	+	chr3L	11100904	+	chr3L	11102245
CAAGTGCGGAGGAAAACTCGCGTAGATTTGTTTGGTAGTCAGCACCGTCAACTGATTAGCAGATCTCACAGATAG:1	CAAGTGCGGAGGAAAACTCGCG	GATTAGCAGATCTCACAGATAG	-	chr2L	13115695	-	chr2L	17741344	4625649	+	chr2L	17741344	+	chr2L	13115695
ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAAAGCTGCTACGGATACAGATTGAGGTAAAGATA:1	ACACAACACAACACAACACAAC	GATACAGATTGAGGTAAAGATA	+	chr3R	21907534	+	chr3R	22050415	142881	+	chr3R	21907534	+	chr3R	22050415
GAAGCGCTTTAAGAGTTATTCAAATAACCTTAAAAAAAACTTTTTAATTGATAAG:1	GAAGCGCTTTAAGAGTTATTCA	AAAAAACTTTTTAATTGATAAG	-	chr2L	19688617	-	chr2L	16537713	3150904	+	chr2L	16537713	+	chr2L	19688617
TANCTATTAAAAGAGGTCTCCTCTTCAACGTGCANTNTTTCATCTTCTTTTTTCTTTTTACAAGCGGGAGCAATG:1	TANCTATTAAAAGAGGTCTCCT	CTTTTTACAAGCGGGAGCAATG	+	chrX	10719141	+	chrX	10719225	84	+	chrX	10719141	+	chrX	10719225
AAAGCACATGTGCATCTGCTAGTCAACGAATTGGTTGGGAAAGGGGGTGGAAAAGGGGGTGGCA:1	AAAGCACATGTGCATCTGCTAG	GGGGGTGGAAAAGGGGGTGGCA	+	chr2L	16718591	+	chr2L	1663727	15054864	+	chr2L	16718591	+	chr2L	1663727
ATACATTTATTTTTATTANTTACGATGACTTAGCCCTGCATTCCCAGCATTCAACAGCGTATCAAATATTTANAC:1	ATACATTTATTTTTATTANTTA	ACAGCGTATCAAATATTTANAC	+	chr3R	5891685	+	chr3R	5891991	306	+	chr3R	5891685	+	chr3R	5891991
GCTGTACTTGGTGATTGGAGCAACAGGCAAATATTTTGAGCTGACAAATTTCTTGTCACCTTTAT:1	GCTGTACTTGGTGATTGGAGCA	ACAAATTTCTTGTCACCTTTAT	+	chr2L	19304240	+	chr2L	19304332	92	+	chr2L	19304240	+	chr2L	19304332
TTCAGCAGAAAAAGAAGAAAATCGGTGAGCCAACGCCGAAGCCGGAGGGGCTTTTGTTGGTCGCCA:1	TTCAGCAGAAAAAGAAGAAAAT	GAGGGGCTTTTGTTGGTCGCCA	+	chr3L	12284886	+	chr3L	12285031	145	+	chr3L	12284886	+	chr3L	12285031
GATGNAGATGACGAGCAGTAGCNGAAGNGGAATGCCCCTNAAACTGCTGGCGTGTGGTGAATGACTCTGGGA:1	GATGNAGATGACGAGCAGTAGC	CGTGTGGTGAATGACTCTGGGA	+	chr3L	10693079	+	chr3L	22042325	11349246	+	chr3L	10693079	+	chr3L	22042325
AAGAATTAATTTTCCAAACAATTAAATCCGAACTGTCCAACGTTGTTGGCCAATTTGGGAATTAATTGCCACCGG:2	AAGAATTAATTTTCCAAACAAT	TTTGGGAATTAATTGCCACCGG	-	chr2R	22579698	-	chr2R	22579612	86	+	chr2R	22579612	+	chr2R	22579698
AGAATCGTTCAGTAGCCGTGATAGGCGGAGAGCCACTTGATTATGCATATAAGTATGAGATATTGTTATTA:1	AGAATCGTTCAGTAGCCGTGAT	TAAGTATGAGATATTGTTATTA	+	chr3L	12615763	+	chr3L	12615835	72	+	chr3L	12615763	+	chr3L	12615835
TACANCCGGTGCGTGCACTTATNGTACNTACTGTACGGANGATCTGCGCATGTGTGTGTGTGGGGGTGTGTGTG:1	TACANCCGGTGCGTGCACTTAT	TGTGTGTGTGGGGGTGTGTGTG	-	chr3R	24520950	-	chr3R	28240377	3719427	+	chr3R	28240377	+	chr3R	24520950
ATCGCCACTTTTAGCTATTACTAGTATAAAAATATTAAAATGTTTTTTTTCAATTTGCTTAGATCATTTCGTAT:1	ATCGCCACTTTTAGCTATTACT	ATTTGCTTAGATCATTTCGTAT	+	chr2L	21766646	+	chr2L	21766732	86	+	chr2L	21766646	+	chr2L	21766732
TTCCATTTTTGTGACTTTTAAAACGGAAAAAATTCAAGGGCCTTGCCTTTGGTG:1	TTCCATTTTTGTGACTTTTAAA	TTCAAGGGCCTTGCCTTTGGTG	-	chr2L	5852627	-	chr2L	5852538	89	+	chr2L	5852538	+	chr2L	5852627
TCAATGCAAAGGGTCAGAGGTATGTTTCGCTTATTTATATGTTGTTTCACCGCCGGTACATTGTATA:1	TCAATGCAAAGGGTCAGAGGTA	TTCACCGCCGGTACATTGTATA	+	chr3R	31161442	+	chr3R	31161948	506	+	chr3R	31161442	+	chr3R	31161948
CAATACTCATTCAAAGATGGTTGAAAATAATATAATCAGATAGCCTTAAAAAATACTTTTTCCCAGAAACCTTT:1	CAATACTCATTCAAAGATGGTT	ATACTTTTTCCCAGAAACCTTT	-	chr3L	5910279	-	chr3L	5910039	240	+	chr3L	5910039	+	chr3L	5910279
AATTAAGGACACCTTAAGATAGGCCACATATCAGTTCACCAACCTTGACAAACGACTGCGAATGCTTCTCGTAGC:1	AATTAAGGACACCTTAAGATAG	GACTGCGAATGCTTCTCGTAGC	+	chrX	16329442	+	chrX	16329525	83	+	chrX	16329442	+	chrX	16329525
GTAANGATGGACGTATGCATAANTGTGNTTTTACGTGTTNTAGCAAAAAATCAAAAAGAACTATGTACGATTTCG:1	GTAANGATGGACGTATGCATAA	AAAAGAACTATGTACGATTTCG	+	chr3R	28479149	+	chr3R	28479232	83	+	chr3R	28479149	+	chr3R	28479232
CTCGAAGATTATTAACGAGAAGATCCAGTGCGGCAAATTGGAATCTTTAATTTGGCCAATGNACCCCCAACTTCA:1	CTCGAAGATTATTAACGAGAAG	GGCCAATGNACCCCCAACTTCA	+	chr3R	16644700	+	chr3R	7260436	9384264	+	chr3R	16644700	+	chr3R	7260436
AACATAGGAAGAATACATGAGCTCACCGTTTTGTTTCCAAGACCGCTGCCGAAGTGACGAACGACAAAC:1	AACATAGGAAGAATACATGAGC	GCCGAAGTGACGAACGACAAAC	-	chr2R	3066887	-	chr2R	13005136	9938249	+	chr2R	13005136	+	chr2R	3066887
ATGCTTATACCCTGGAAGAGTGTGGAAATTCAAGACAGTTGTTTGGTGGAGCAACAATTGTTTAG:1	ATGCTTATACCCTGGAAGAGTG	TGGTGGAGCAACAATTGTTTAG	+	chr2L	18478814	+	chr2L	18480235	1421	+	chr2L	18478814	+	chr2L	18480235
AATGNCGCAGCCTAGCGTTTAANAATGNCCCATCATATGNACATACATACATATATGGGATGTGAGACGTTCTCG:1	AATGNCGCAGCCTAGCGTTTAA	TATGGGATGTGAGACGTTCTCG	-	chrX	16691898	-	chrX	11507897	5184001	+	chrX	11507897	+	chrX	16691898
GTTTCTGCATCTCTGGATGCTTAGCCATCTCGTACAGGGCATCCATGTGTTCCACAAGCCGGCGCTGNTTTTG:1	GTTTCTGCATCTCTGGATGCTT	CCACAAGCCGGCGCTGNTTTTG	-	chr2R	12187490	-	chr2R	12190108	2618	+	chr2R	12190108	+	chr2R	12187490
CGTTTAAAAAACTTTTTTCTGAGTGCAGATATTTAACGTTTTGTTGTGGCTAATTTGGCATTACGATAGCGTTTT:1	CGTTTAAAAAACTTTTTTCTGA	TTTGGCATTACGATAGCGTTTT	-	chr3L	14271814	-	chr3L	14267374	4440	+	chr3L	14267374	+	chr3L	14271814
CCTTCCCTCACTGTCCTTCGCCAATTAGCTGTGTGTATCTGTGTGTGGGTGGCAATATTTCAACTTTCCTAATAA:1	CCTTCCCTCACTGTCCTTCGCC	AATATTTCAACTTTCCTAATAA	+	chr3R	22863921	+	chr3R	22863999	78	+	chr3R	22863921	+	chr3R	22863999
GGTTTAACTATACCATTCTTCATGTATGGCATTGTCCTCGTCATGCTTTTGTCAAACTTGCTTTATTTGGCCTGG:1	GGTTTAACTATACCATTCTTCA	AAACTTGCTTTATTTGGCCTGG	+	chr3R	18766778	+	chr3R	18766856	78	+	chr3R	18766778	+	chr3R	18766856
AACAAGCGTGTGTTTGCCAAAGCCAAGGCAAAAACAACACAAAGAATAATAAAACCCATGCGCCCAGCCAACCAC:1	AACAAGCGTGTGTTTGCCAAAG	ACCCATGCGCCCAGCCAACCAC	+	chr3L	8693726	+	chr3L	19426219	10732493	+	chr3L	8693726	+	chr3L	19426219
GAGAATGGCAACAGGGCAAAGGAAGGTGAGTTGTCAAGTCTGCCAAATTTTAAGATTTTAATTAGGTTATATTAG:1	GAGAATGGCAACAGGGCAAAGG	GATTTTAATTAGGTTATATTAG	+	chr3L	535313	+	chr3L	4418523	3883210	+	chr3L	535313	+	chr3L	4418523
CCTCAGCTCGTCAGGTCCCCAACGTTACTGACGTGTGTTTGCTGGTGGTAGGCAGCTG:1	CCTCAGCTCGTCAGGTCCCCAA	GTTTGCTGGTGGTAGGCAGCTG	-	chr3L	22507220	-	chr3L	22507150	70	+	chr3L	22507150	+	chr3L	22507220
GTGTGGTAACGGGGAAAATGTGTGCGAGTGTATNTTTTCGACTTCTTTTCA:1	GTGTGGTAACGGGGAAAATGTG	GTATNTTTTCGACTTCTTTTCA	+	chrX	14659478	+	chrX	10649350	4010128	+	chrX	14659478	+	chrX	10649350
ATCACTTATCACCTGGGACATCGCAAGCTAATTACAAAACTATTGCCACAGTCGTCGTCGCAACTGAGCCGCAGA:1	ATCACTTATCACCTGGGACATC	GTCGTCGCAACTGAGCCGCAGA	-	chr2R	18785997	-	chr2R	18785918	79	+	chr2R	18785918	+	chr2R	18785997
AGAAACAGCTTTGGGGGAAAAAAGAATGGCTGCAAGGAGTCCGGAGGACCCAACATATCCCCCTCCAGACAA:1	AGAAACAGCTTTGGGGGAAAAA	CAACATATCCCCCTCCAGACAA	-	chr3R	19954031	-	chr3R	19953957	74	+	chr3R	19953957	+	chr3R	19954031
GCTTTCAACGAGCAGAAAAGCATTTCAATTGCGGGGCGTACGAGATTATTAAGGCAATTTGATGATTAATACTT:1	GCTTTCAACGAGCAGAAAAGCA	GGCAATTTGATGATTAATACTT	+	chr3L	21886419	+	chr3L	21886501	82	+	chr3L	21886419	+	chr3L	21886501
TGATTTCGCTCATTTTTTCAGTATATTTTTTCTTTCCACCCCTTTATTGTTATTAT:1	TGATTTCGCTCATTTTTTCAGT	TCCACCCCTTTATTGTTATTAT	+	chr2L	12731080	+	chr2L	12735828	4748	+	chr2L	12731080	+	chr2L	12735828
TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCAGGAAGG:1	TGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCT	TGCTGCTGCTGCTGCAGGAAGG	-	chr2R	10614681	-	chr2R	13323486	2708805	+	chr2R	13323486	+	chr2R	10614681
CTTTTCGCAGCAATTGCACAATTGTCTTTTTTTTGCCCTTTTATTTGCTGTGTGTGGGCAGAGCTCACTTGTAAT:1	CTTTTCGCAGCAATTGCACAAT	GTGGGCAGAGCTCACTTGTAAT	-	chr2L	6611086	-	chr2L	4671421	1939665	+	chr2L	4671421	+	chr2L	6611086
GCAATATATAAGTAATTACATACTTTAAACTCAGCTAATTAAATTAGATCCAATGAAACTTAATCAAATCCTCTT:1	GCAATATATAAGTAATTACATA	TGAAACTTAATCAAATCCTCTT	+	chr2L	11024958	+	chr2L	11025038	80	+	chr2L	11024958	+	chr2L	11025038
GAAAATTAGTCTTTAGTTAATAATGAGNTCNNTTAAAACAGTGCTGAGCNCNTCATCGTAACCAATGAAGTTCTA:1	GAAAATTAGTCTTTAGTTAATA	CATCGTAACCAATGAAGTTCTA	+	chr2L	19810890	+	chr2L	19810752	138	+	chr2L	19810890	+	chr2L	19810752
GTCGCAACAAAACAACAAACCGGAGCGGACGAAAAAGGTGCAGAACGGCATCGAAACGTCGGGCCTGTGCTCGAT:1	GTCGCAACAAAACAACAAACCG	AAACGTCGGGCCTGTGCTCGAT	-	chr2R	9308363	-	chr2R	14861389	5553026	+	chr2R	14861389	+	chr2R	9308363
AAGACAAGACAAGACAAGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAGGACAG:1	AAGACAAGACAAGACAAGACAG	AGGACAGGACAGGACAGGACAG	-	chr2L	21768291	-	chr2L	19024096	2744195	+	chr2L	19024096	+	chr2L	21768291
ATAGGCTTACTCGACTTTGAATATCGTTTTAGACACCATAACCAAATGCTGAGCTTTTATTGAGTGCGTAATATT:1	ATAGGCTTACTCGACTTTGAAT	CTTTTATTGAGTGCGTAATATT	+	chr2R	15051082	+	chr2R	15051164	82	+	chr2R	15051082	+	chr2R	15051164
TTTTTAAATGATATTGGAAACATGTACTGCGAACTAAATTCACAATAAAATTCCGCTTTTGAAATTCTTCTCGAT:1	TTTTTAAATGATATTGGAAACA	CGCTTTTGAAATTCTTCTCGAT	+	chr2L	11702651	+	chr2L	11702745	94	+	chr2L	11702651	+	chr2L	11702745
CGGGACTTTCCATGATAAAAAGTCAGGCTTGGCCAGCTGTCCCAGCCNCATCCCAT:1	CGGGACTTTCCATGATAAAAAG	AGCTGTCCCAGCCNCATCCCAT	+	chr2L	21381228	+	chr2L	21381312	84	+	chr2L	21381228	+	chr2L	21381312
GCTGTGAACGCCGACGAGTGGGGGGAAATTCACGGTTCGCCCTACTTGATAACGATATTCTG:1	GCTGTGAACGCCGACGAGTGGG	CCTACTTGATAACGATATTCTG	-	chr3R	18853186	-	chr3R	9782737	9070449	+	chr3R	9782737	+	chr3R	18853186
CATTGTTGNTGGTTGTCAGGACTTTTGGGGGCGCCNCATGTCATTTGTGTAATCAAGTTTCAAGTGTAAATTG:1	CATTGTTGNTGGTTGTCAGGAC	ATCAAGTTTCAAGTGTAAATTG	-	chrX	7260208	-	chrX	9998735	2738527	+	chrX	9998735	+	chrX	7260208
AAAACTTCATTTTGGGATAAATAAATGTATAATGTATTTCTTTTTTATTATAATCGTATCACCCAAAAATAANTT:1	AAAACTTCATTTTGGGATAAAT	TCGTATCACCCAAAAATAANTT	-	chr3L	18145888	-	chr3L	18145806	82	+	chr3L	18145806	+	chr3L	18145888
GTGAAACCGCGACACAAATCAAACNACCTCAATAAACGGAGANTGNTGCGANGAANTTTCCCGAATAATTGCCAC:1	GTGAAACCGCGACACAAATCAA	AANTTTCCCGAATAATTGCCAC	-	chr2L	13762914	-	chr2L	13761803	1111	+	chr2L	13761803	+	chr2L	13762914
AGCACGCAAAGTTCATTTAGATGCATGCCCCCAGATAGACGGGCTGCCCATCCATTTCTCCGCCCACTTCGT:1	AGCACGCAAAGTTCATTTAGAT	TCCATTTCTCCGCCCACTTCGT	+	chr3R	6015974	+	chr3R	6024452	8478	+	chr3R	6015974	+	chr3R	6024452
ACCGCCTATAGTGCGATGGTTTCGGGCCAACAACAGGCATGCAAAAAACAAAAGGCAGCAAGCGTGTCCTGACTG:1	ACCGCCTATAGTGCGATGGTTT	GGCAGCAAGCGTGTCCTGACTG	+	chr3R	17521575	+	chr3R	17521735	160	+	chr3R	17521575	+	chr3R	17521735
ATGCAATCGATGACTTGGACAAAAATAACTTGTTGCAGCAGCTGAGAGTGCATTGANAT:1	ATGCAATCGATGACTTGGACAA	GCAGCTGAGAGTGCATTGANAT	+	chr3L	3259637	+	chr3L	3259716	79	+	chr3L	3259637	+	chr3L	3259716
CCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTTTT:1	CCTGGTGGTGATCGCGGGATAT	TTGTATTGTATTGTATTGTTTT	+	chr3L	25455121	+	chr3L	21448026	4007095	+	chr3L	25455121	+	chr3L	21448026
CACCCAAAATCCACCCGCCCCGACGCAAGCTTTATTTGCTATATTTCATGCCTGCCTGCACTTATCTCCG:1	CACCCAAAATCCACCCGCCCCG	TGCCTGCCTGCACTTATCTCCG	+	chr2L	2661206	+	chr2L	2663039	1833	+	chr2L	2661206	+	chr2L	2663039
AATGAACTCAAGTGGGTCAATGTGCAGCACAATTTCGGGGGTATTTAATCAGGTAAGGAAATGAAACTGCATGAC:1	AATGAACTCAAGTGGGTCAATG	TAAGGAAATGAAACTGCATGAC	+	chr2L	9000294	+	chr2L	9007804	7510	+	chr2L	9000294	+	chr2L	9007804
GTCTAAAAAAATCATTTAANTAAGAATTAAGAAGAATAAGAATAAAATAAATGGCAATTTAATACACTAAACATG:1	GTCTAAAAAAATCATTTAANTA	GCAATTTAATACACTAAACATG	-	chr3R	7625755	-	chr3R	7625307	448	+	chr3R	7625307	+	chr3R	7625755
GTATAACAAATATATTAGCATTGAACACATGATTAAATATGAAAACTATGCAACTGGTA:1	GTATAACAAATATATTAGCATT	TATGAAAACTATGCAACTGGTA	-	chr2R	23190103	-	chr2R	23190039	64	+	chr2R	23190039	+	chr2R	23190103
CGCAACCAGACGGAAATCATAAAAATATGCAATAGAAAACCAACTTTATAAAGCCATCGTACTAATGCACATAA:1	CGCAACCAGACGGAAATCATAA	GCCATCGTACTAATGCACATAA	-	chr3R	21345618	-	chr3R	21929016	583398	+	chr3R	21929016	+	chr3R	21345618
GCACTACTCAAAAGACAAAACCTTCAGGTTGGAATCCC:1	GCACTACTCAAAAGACAAAACC	AAAACCTTCAGGTTGGAATCCC	-	chr3L	15655296	-	chr3L	15654887	409	+	chr3L	15654887	+	chr3L	15655296
ATACAAAATTCAATTGAAGTTTTTTACGAGTGCGGCTAGGCAAATGATTTTGAGTGAAAGGCTTGGAATGCTCTT:1	ATACAAAATTCAATTGAAGTTT	GTGAAAGGCTTGGAATGCTCTT	+	chr2L	20804705	+	chr2L	20804790	85	+	chr2L	20804705	+	chr2L	20804790
TTCTTACAGCACCTCCTACTTCTGCCTCCTACAACTTGACTTGAACGAATTAGTTGATCTTTGAACNCTGTAGCA:1	TTCTTACAGCACCTCCTACTTC	TTGATCTTTGAACNCTGTAGCA	+	chr2L	7959043	+	chr2L	7960454	1411	+	chr2L	7959043	+	chr2L	7960454
CGAAGCTCTTTTTGCTATCAGCTTCAAGTCACCAAACAGGCTCTTTAATGCTCGAGTTCCATGATTTGTGATAAA:1	CGAAGCTCTTTTTGCTATCAGC	GAGTTCCATGATTTGTGATAAA	-	chr2R	6247903	-	chr2R	6247825	78	+	chr2R	6247825	+	chr2R	6247903
TATAGCCCAGAACCTCGAGGACTGGACACGCTCTGGAGGAGCTGGCCAAAGTAAA:1	TATAGCCCAGAACCTCGAGGAC	TGGAGGAGCTGGCCAAAGTAAA	+	chr3R	19079594	+	chr3R	19079659	65	+	chr3R	19079594	+	chr3R	19079659
TGCATTCGATTACGGCCAGCATGCCAAGGATGCATTTCCAGATGCAAATGTAACTGCGGGTCGTATTCTGCATT:1	TGCATTCGATTACGGCCAGCAT	ACTGCGGGTCGTATTCTGCATT	-	chr3R	17350893	-	chr3R	17350778	115	+	chr3R	17350778	+	chr3R	17350893