Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score CAATGTTAAGCTGAATTTTATTCCATTTCCTCTTGTTAAAGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGCCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGAT:1 - chr3L 7785450 5' - Idefix 239 2 61.82 AGCATTCTGGGCAGCTACTCCTCCGTCTCTACCACCCTTTCATCCTACCAAAAGGACAAACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACC:1 + chr2L 19321889 5' - baggins 4963 1 57.27 TTTTTTAAAATATATATACTCTATATTGAAAAAAACGTGTTTGCTATCAGGAAATATTTAATAAGAGCACAATATAGATATAGTAAAGATATTCAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 7092109 5' + TART-A 13401 1 73.33 GAGCTCAAAAAGTGGCCAAATTGGCGACCAAAGCCTTAGGTTTCCATATGACTCATTCGAGTGTTGATGAAAGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGT:1 + chr3L 16727118 5' + gypsy3 7 4 66.36 CAGAAATGAAAAATGTTTGTTGCAACACAAAGAAAAAATGCGAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCAAGGCGAAAAAATCGTGTGCAAAA:1 + chrX 9427903 5' - 1360 43 1 56.86 CGTGTTGTCAAAATAAACCAATTTTGACTTTACATTGCAGTAAAATCTCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGACACTGGGGCCT:1 + chr2L 42122 5' - opus 316 2 56.67 GTTGTCCTAGTTGCGTGCCATTTTGTGTGCTTTCATTTTCACCCACCACAAGCTCAGTACTGTTCCGTTTTCCTCTGGTTCTTCATTCCCATTTTTTTTTTATATTTTTT:1 + chr3L 5029119 5' + hopper 141 1 57.27 ACTCAATCAGTTCCTGAACGAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAAATA:1 + chr2R 11273975 5' + Stalker2 7266 2 59.00 ATTTTTCCAGGCAACAAATTTATCAGTGGCATAAAATGAGTTCCACTGACGCCTCCACTTGATTGCGAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATG:1 - chr3R 12819428 5' + HMS-Beagle2 7109 2 61.29 GGAGAATGAGAGAGCGAAAGAGAGGTGCTCAAGACAAATAAACAAATCTGCGAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTGGATCAGAATTAAT:1 + chr2L 2493454 5' + 1360 3169 1 54.81 CGCGGGTGGATCTGCTGGTGCGGGATCGGGATCGGGATTGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAAAATCTGGG:1 - chr3R 31601782 5' + Circe 5 2 61.64 ATACGGCCACACTGCACAGTTCACTCCGCAGATACGTGCAGCCCAAAAGTATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3L 2244226 5' + jockey 18 1 63.95 TTCAATCATTTCGCCATCATCCATTTTGCAAATCCTTTTTTCACCAGTTGTCCGTTTGGATGGACACGACCGACTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGCATCGAGC:1 - chr2L 14034923 5' - Idefix 428 2 78.18 TGCTTCAGTCGATGTGCACATATTCACTTCCTCGTCGTGTGTATTCAAATTGCTCATCAGTGAGAGGCGCCACATTCGGCATTCCACAGTCT:1 + chr2L 9147938 5' + Doc 1 1 75.00 TGTAACAATTTGCTAAAATGTCGGGGCTTAGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAATCACACACTACA:1 - chr3R 10956245 5' + hobo 29 1 68.67 AGTCACAGTATATAAATTCAGTTCCTTTTTATAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGGCTAGAA:1 - chr3R 12038331 5' - G2 2890 1 62.64 CCAGAACCAAAACTATTTCCATCAATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr3L 17787019 5' - pogo 2062 1 72.04 GAGAAGCTCGAAATGCTCGCATTTTGTTTATAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGATTTTTACTCTGTAACTAACAAG:1 + chr3L 21387960 5' + R2-element 85 1 60.00 AATAACAATAAAAATGTAACTAATGCCTTAGCATGATGTGAGGAAAAAGTTTTATTTATTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 - chr3R 4554397 5' + Bari1 25 1 58.33 TTTCTTATATAGAACATTTTGTTCCTTTCCATTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACC:1 + chr2R 5173097 5' + Stalker4 3 4 76.36 GCAAAAAAGTATTGTTATTTGCCATTAATAAACTGTGATGATTGTGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr2L 14708837 5' - opus 7487 2 63.89 GAACGACTAAAAGTGTAGAGGTACCAACACTCCAGGTTCATGGAGCCCAGACAATAGGATCTTCCGTTGGGAAAAATTGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTGTGC:1 - chr2L 10340636 5' - I-element 5122 1 74.55 AAACTATAAATTCGCGGGGGGCACTAATATTAAAAACTGCGCATTTCAATGGCGCCAAGCAAGTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGAC:1 + chr2L 18693987 5' - pogo 2092 1 69.31 ACGGCAAACTTATTACACACACATACGGACAGTGAGCGGATGGTAAACAAAAGAACCCAGGTGAAGATAAGGATAAAAAAAAAAAGGAAA:1 + chrX 11087872 5' + Doc2-element 226 1 77.78 GTTCTATATATAATTTGATCATGATCCACCATTTATGAAGCTATTCGAAAATACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr3L 9822227 5' - pogo 2098 1 49.40 GCCTATGTCACATCAAAAGAATTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGT:1 - chr2R 23354390 5' - Tabor 7321 2 71.82 GAAAGCAAACTTCTGAGACAAATATCCCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTAAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTT:1 + chrX 14579206 5' + 412 473 2 72.45 AATACTTTTGCACAGTGAGTTTCGCAGTTTCAAGCTTGTGAATTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2L 2484364 5' + jockey 4685 1 53.95 CACAGAAAAGCGAGACAAGTTTTTGTTTTAATTACAAAAATCGCTAAACTATATATTACATGTAATTATTTATCAAACCGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAG:1 - chr2R 1879647 5' - gypsy5 7347 2 77.06 GCCGATCAGTCAGCGCTACTCGTCTTTGTTTGCCAACTGCAAACTGCAACTCCAACTCCAGATACATAGATACATATATACATACATACAACATA:1 - chr2R 18213317 5' - Dm88 4374 2 64.21 ACACCTAAATTAAACGTAATTATAGCTATAAGCTCTCACACACACACACACACAGGGTTACAACTGAGGGGCATAACCAGAAGCAAACATAAA:1 - chr3L 5814122 5' - Transib5 2644 1 62.37 CTCCACTACCACCACTACCACCACTTTCAACGCTTTCACTACTCTCGTTATGGTT:1 + chr3L 5737060 5' - invader1 370 2 70.91 CTCGTTTGGGACACGCCTTCTATGTGGAGCATAGCCCAATCTCCTCGGCCAGACTCGACCAAACAAACATAATACGACTTCG:1 - chr3R 21952619 5' + I-element 4930 1 63.41 ACGCCCATGCTCTCTTTTACGTGGTTGCGTCAATTTATATTAAATATATGTATTTTCATACATACATATGTACGTATAAATATGTATTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 1569470 5' - Doc2-element 232 3 56.48 ATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr2R 12416879 5' - pogo 2051 1 76.00 ATTCACTTTCATGTTACCAACAAAGTTGGGCAATATTGCGTCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGG:1 - chr2L 17926775 5' - roo 8922 2 63.64 TGGATTACTAAACGCAAATTATAATTTCTATCCTGAATTTCCGCTATATCTTCAATACTCCTTACTTTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATCATTT:1 - chrX 5010895 5' - Burdock 265 1 62.73 GATCAACATTATCGACGTGAGCTGCAAGCTATTCGCCTTTCTTAACCGCACTGGGTAAGCGTAGTTAAAATCGCGCAC:1 - chr3R 23751827 5' - NOF 376 1 66.67 ATTCCACAATTGTTTGTAAATGAAGATGCTTACACAACATGAAATATTGTATCAACTATTGGATCAACTATTTCATTATTAGGAATTTTATTCTTTTTTTTTATTATTTG:1 + chr3L 9838624 5' - Rt1b 5147 1 26.36 AAAACATTTTACTTTTTGTCTTACCATTCTTGAGCTTATTAAAGTTACATTTTTCAGACACTTTTCATTTATTTTATTCGACGTTTGCTATATTGTGCCGTTTTTCCGAA:1 - chr3R 20063972 5' - Bica 305 1 70.91 TCTGTCCACGTCTTTATATCCGTCCATCCAAAGACATTAGAATAACAAGATTCGTAACGCCATACGATTTTTTAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCT:1 - chr2L 23164739 5' - Tirant 391 2 73.64 TAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 21034105 5' + 412 7095 2 68.42 CAACACAACACAACACAACACAACACAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTT:1 - chr2L 16217660 5' + Juan 3941 1 76.36 CGCTCTTAAGATATCCCAATCTGCCTGTATAAGCCCATACATGTCCCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:1 - chr2R 892458 5' + Stalker2 7265 2 65.45 TGAAAGATCATCCATAGCAACACTCCTGCGAAGATCAGTAGTCCGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTTACTTC:1 + chr3L 17821479 5' - invader4 3063 2 60.00 CAGCTACATTCTCACTCACTCCTGTTCACCACAAATCAATCCACTGTAAAATGGCATTCAATTCCTTCGCAATATGATGAGAACTTATGTTGTCGCCACATATGGTTAT:1 - chr2L 15645764 5' - Copia1_DM 4058 1 65.14 TAAATGTAATATGTCAAATAAACGAATTTAAAAAAAAAAGCCTAATCCTGCGAACCAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTA:1 + chrX 21034686 5' + Idefix 315 2 51.82 CAACTCTGTTTGTTTTGTACTGTTTGTTGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATATAAGTTTTCTTGCAAGAG:1 + chrX 21305564 5' - Doc3-element 4535 1 64.00 GCGGAGCAAGAAAAAAGGAAACAAAAAGCGCACAAAACCAGCTGGAGCTGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCC:1 + chr3L 17706515 5' + rooA 7200 1 60.00 CCTACAAATGAGCCATAATCGACGTAGAGTTTGAGGCCAAAATTGCTCTCTTTATGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTG:1 - chr2R 23479435 5' - 1360 3261 1 68.52 GATTCTTGTACTCCTCCGTATCGAAATCGGGTGGTTGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTG:1 - chr3L 9612139 5' - FB 783 4 65.05 AGCGAGGGCGCACACCTCTAATGCGACCTCAACGTAAAATAATTGCTGACCAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 5910762 5' - roo 9039 1 55.96 TTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAACACAAGCGGTTTGGAAGT:1 + chrX 23406394 5' + R1A1-element 120 1 57.14 TATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr2R 12416963 5' + pogo 11 1 70.64 CTAGCTCTTGGTTACTCAAGTTTTTGTCTTATAGATAAGTGCTTTTTTTAAAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATCATTATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACC:1 - chr2R 5071020 5' - Porto1 4372 1 64.55 TAATGTATAAAAGAAAGTAAGCAAGTGAGTTTGTTTAAACGTGGTTATAAGGTTGAGTAAGAACATTCAATGAATTTATATAACCTTTAAAAAACCAATTCAACATAT:1 + chr3L 3793966 5' + S-element 140 2 59.26 AAGAATTGAGAATGGCCCATGACATAACCCCAACTAACTTTCACACGAATGAGTGGAGAACTGGGACTGGACTGTGGTTTTCGTTCTAAGACAAAGAACAAAACAAAGTA:1 - chr2R 7431155 5' - S-element 247 1 70.00 AGAAGAAGGGGGATTTACACAGACAATGGCTGAGCGCACGTAGCAAATGCGTGCGAGAACAGCG:1 + chr3L 5209374 5' - diver2 4641 2 78.12 TTGTGCCACTAGAACTATTAACCAACTAATTATTAACAAACGAAATGTTTTCCTTTGTCATTCGTTGACATTCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3R 5219202 5' + Doc 14 1 66.67 CTAAAATGGGAACTATTGAGGATTGTGGTTTGATTTTGGAATTGAATGAAGGGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr2L 21034044 5' - 412 7522 2 59.41 AACGAAAGTATGTGGGAAATTTGTCTAAACATTGCAGGTTATAGGTGCTTCAGGGAAACTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 + chr3R 19497882 5' - F-element 4413 1 58.10 TTTAAAAGACCCACTAATTTAGGAATACATTTAAATGACCTACTACCACTGCCTCGTAATTTTTTGCAGTATCCTTTTGCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAAT:1 + chr2R 20459373 5' + Doc 4500 1 62.39 CAACACAATTGACTTAAGAATGGATTTAAGATTTATTATTTATTTATTACATTGGAATAAATATATTAGATCCCTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCACACCAG:1 - chr2L 21191462 5' + 297 7 2 75.23 TCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAG:1 + chrX 22633263 5' + INE-1 76 1 67.31 ACAAGAGCAACAAAAACAATGGCAATGGACTTGGGGAACACAACCCTGCATAAAGACCTCACGCTAGCCACTGTCTTTGAGACACTAAACATGCACTCCA:1 - chr3R 25860468 5' + BS3 1460 1 62.00 AAAGTGAATTGAACAGCTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr3L 19063466 5' - P-element 2873 1 38.60 TAAAGTTCTCTATGATTCTGGGTACATCGTATGGTACCAAAAGTCGCGAAATTTAATCTTTTATGTTCACTTGCTGTAACACCAACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTA:1 + chr2R 11497926 5' - I-element 425 1 55.05 TAAGGAAAATCCGAGTGGAGCTTTTCCCGAAGAGCTTTCCTTTGGCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATC:1 + chr3L 18946063 5' - accord 169 2 58.18 CCTGCCAGGACTCTCGGTTACGCTTGGGCTGGCCCTTACTTCTTGTTTACAAATGAACAAGAATATTTTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 5320603 5' + roo 21 2 51.76 GTAATATTGGGTTATTGGGTTGTGTATTTTTGCGGGTTTCGGCGGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAA:1 - chr2R 25160850 5' + INE-1 555 1 72.86 ACTTAATGTTAAAACGGAACTACAACATATTTTGAAAAACATAAATTCGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAA:1 + chrX 6874846 5' - hopper 24 1 57.27 GTAGTAGGAAAAGCATACAAATACTTATTCGGCACATTAGATGAGGATGACAGAGAAGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGGGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAAC:1 + chrX 16972231 5' + Bica 58 1 57.41 ATGCTGCCAGTAGCGATAGTAAAAACAGGCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTAATATATTATGTAAATGAATCGA:1 + chrX 1503348 5' + roo 8719 2 72.73 ATAAGATCAGTTGATCCTAGATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGT:1 + chr3L 4264943 5' + Transpac 19 2 64.55 TACATTTTTAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr2R 9963664 5' - pogo 2079 1 60.24 GTCATCCCATCAGTCCGGAGACACAAAACTATGCGGCGCAGTCCCAAGGATCCGCCGCAGTTTAACTTCCTTCGCCTGCAAAAAAACTGAAAAATTAAAAAAATTTTTTT:1 + chrX 8016784 5' + HB 326 1 78.18 CGTTAATGGTCTTTAATTTCGTTTGACCCATTAGCTGCACATAAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATT:1 - chr3R 8633558 5' - FB 54 1 60.91 ATTAAAACTCAAATGAAAATTCTTACACTTCTCCGCACTCTTTTTTACCCCAGACCTGTATTCCGTACGGCCAGATCGGGGCGACGTAGTGGACG:1 + chr3L 129286 5' - BS 4647 1 54.74 TATTTTCCTCGGCACGCACTGCTAAGCCTTATTTTTTTGCCCAGGTCAGGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 - chr3L 16259001 5' - Transpac 287 2 53.68 AGCCGCGGAATATAAATAGTGTTTGATTCCAAGGTCGAAAGGGGTAAAGTGGGGTTTTTTCTATTCTCGAGGATCGTATAACAGTCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGG:1 - chr2L 2171330 5' - Idefix 101 2 55.45 TTCGCAAAAGTTGTTTTCCTTTGCCTGTCGGCATCGAAGCGTAGTCATCCCATCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGACTTCCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGA:1 - chr3R 7757488 5' - R1A1-element 212 1 53.64 CCCCGAACCCAACAAAAAATTGTTGTTTGTAATAACACTTATGAACCAAAGAACCTAGAATAACAAGCTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 - chr3L 24031650 5' + 1360 42 1 62.39 AATGGCACTTTTACCCTCAGTCTGTACCATAAAGTTGCAACTCTGCATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCG:1 + chr3L 36277 5' - Tirant 403 1 81.52 TCCCTCAAAATTTCCACAATAGTAGACAGATAGGCCGCATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3L 18072705 5' - 412 476 2 64.55 CTCGCGAAGCGATGCCATCAGGAGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1 - chr3L 22108177 5' + Transpac 28 2 55.45 CTGTTCCCGGTTCGCAATGGAAGGAGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGTTT:1 - chrX 5376098 5' + Doc2-element 42 1 61.02 TCAAGCTATGCGATCTCTACAAGAATTACTTTACTGTAAGTCGAGTCTAGTCAATTTCAAAGTACTTTTCATTAATATATATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTA:1 + chr2R 17106169 5' + Cr1a 4295 1 69.09 TTTAACATTTTCGTCTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 - chr2R 18807923 5' - BS 5081 1 67.89 GTTTTGCGTTGCATTTGGATTGTTGTTGTCTGAGTGCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAGGTATTTCCCTTTAAG:1 - chr3L 24080282 5' - gypsy5 7265 2 60.00 ATCCAATCTCCATTTGACAGGCCCAGCTTAGTGCTACAGAAAAATTTTACCAATAATACGGTCAGAAATGTCGACGAATACCTAATATATCGTAAA:1 - chr3L 10982409 5' + Helitron 532 1 56.25 TTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 + chr2R 4606205 5' - 1360 3369 1 59.00 GTTTTTCACACCATTTTTGCAATAAATATTGAAACACTTTGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGAGAGACTCTGTAG:1 + chr3L 7936028 5' + 412 363 2 63.64 GTACCTCCACCAGCAAAGTTGAAAAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAACAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGACTCCCGCAAATTTAAAA:1 - chr4 1294994 5' + TART-A 13246 1 76.36 AAGGTTCATATGTAAAATATTATTCCTAAAACAACAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 + chr2L 21936596 5' - INE-1 556 1 70.67 CAAAAAGTGTCTGGGTGTATATCTGCACTTTGACCCAGTCGAAGCTAGGATTTGGCGGCAAGGCGGCAGG:1 + chr2L 18697588 5' - gypsy12 454 2 67.14 AGCGAGAGAAAGCGAGAGAAAGAGACTTTAAAGAGACGCCCAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 - chr3L 3371220 5' + copia 4915 2 65.45 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGAGTCACATCATTTTCAACACTCTTAAGTTGAATTTTGTGTACTTTATATTTCTT:1 + chr2L 16217660 5' - Tabor 7305 2 58.18 TCGCATTCTGTTGCAGGAACTGCTTTTTGCTCCTGCAGCTCCACCTCTTTTAGTGTATTTCCTTCATACTCACTTTTTTTAAGTGTAAAAATTTTGCTACATTTTTGTAA:1 + chr3R 12212184 5' + looper1 1791 1 58.18 CCCCAATTCGACGCCATCGACTTCCGGCCACCCCCCATAATTCTGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCC:1 - chr3L 2920590 5' - Dm88 373 1 64.94 GCAAAATGCTAAAAGGCAGCTGGATGAGTCTTAAAGCCAGGAGACTTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGCGC:1 + chr3R 25692589 5' + jockey 442 1 54.05 TTTAATTGAGCAAATCACTACTTTTAAATAAAAAGGCAGAAAATTTAAGAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCA:1 + chr3R 14096394 5' + I-element 4974 1 55.45 CTACTTAATTTACCAATATATCAAGAAGATCATATATATATAATATATATATAATTGCAACTTCGTGGCTTGTTGGTTTATAAAAAAA:1 - chrX 23431896 5' - Quasimodo 7352 2 60.23 GAAAGTGCTGCATGTCACAAGTATTTCCAATGAGAAATGGTTGGAGTTTGGTCGACAGAAAAAACAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTT:1 + chr2R 21254793 5' + invader4 2641 1 49.09 GTATTTGTGCATTTGTGTTCGCATAAAAGAGTCGTATATTTAAAATTTGCAATGCTGTTAGCTGTAGAGCTCTGCGCTCTCTCGCTATTGAACAAAAATTCGAGAGAGCC:1 + chr3R 13442661 5' - 1360 86 1 65.45 AATATTATATATATATTATATATACATATATATACACACATATATTTATATATTATATATATATATATGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr2R 3220111 5' + F-element 28 1 60.91 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACTACCTAAATCCCA:1 - chrX 9845361 5' + I-element 4974 1 38.20 AAATCATAAAATTAATTAAATACTAACATTGTTCATCCCATTTTCAGGATACTATCAAGCACTTAGTTTCTGCAGTTTTCGTGTTCTTCAGATTTGGAAATATATAAT:1 - chrX 20041612 5' + transib2 2558 1 74.07 GGGTCAGAGCGAAGCGTGACGCAAATGGCAAATGAAAAGCAAATGAAAAGCAAAGCGAAAACTGCTCGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2L 4012969 5' + pogo 15 1 67.27 TTCAGCAGCAGCCTAAGGTTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTT:1 - chrX 2023141 5' - Quasimodo 108 2 75.32 TGCACCTAGCCTCTTTCAACTATGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGAGCTTCAGCTGGCTTAACAGCGG:1 + chr2L 6519826 5' + diver 30 2 67.11 GAAACGATTAACCTGAGAAAAGTTCATAAATCAATAGGAAACCGAAAACCACTTGAATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAAT:1 - chr2L 18199787 5' - Ivk 5350 1 53.21 TTCGACGAACCGGAAGCAGATTTCGCTGCGAATCCGCAACGCCGCCAATTTCCTGCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTCCAT:1 + chr3R 13592461 5' - R2-element 480 1 60.00 AGAATTTTCAGTTTTCAGTAGGCAACATTTCTTCATAGCTGTTAAAATGTAGCATGCAAATTTCCTGATCCCCATTTTTGCTGTTTTTTTTAAAAGTTTCGTTGACTGTT:1 + chr2R 16716565 5' - Porto1 4415 1 73.64 TTTTCGTGTTTCTCAATGCGTCCCTAATTCCATTGTATGCCGTGTGACTCGGCCAAAATTGCACTCTTTCCGCTCGC:1 + chr3R 7610261 5' - 1360 3309 1 70.13 AAAATGGGAACTATTGAGGATTGTGGTTTGATTTTGGAATTGAATGAAGGGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 + chr2L 21034046 5' - 412 463 2 55.24 CACATGTGTGTCAGCACAACCGCCCCCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGCAAGTAAACATGTAAGAA:1 - chrX 7463532 5' + Tirant 461 1 75.23 TCTTTTATCACACGCAATTAAGTCGCCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTT:1 - chr3L 1971737 5' + I-element 5139 1 77.06 TGGCTGATAAAATTCGTAGCCTTAAATAATTAATAATTGTCGCGTGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACACCTACA:1 - chr3L 18348057 5' + ZAM 36 2 55.34 TTTCCAAAATGTCTAAAAACAATAATAATATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 - chrX 13202674 5' - Tirant 372 2 54.90 GGGGCAAAAGGGCAGAGGCTGCAACAGTTTACCTGGCAAAAAATCAAACAAAGAGCAATGGATGACATATTGAGAGAACAAGTCGGAAAAA:1 - chr3L 14634797 5' + TLD2_LTR 8 1 58.24 TGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr2R 9408199 5' + FB 24 1 68.49 GTACTATTCAGGTGGGGTCTTTGTTCTGTTTGTAGGTGTACTGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAA:1 + chr3L 6252683 5' - baggins 5382 1 69.51 TAAGCACATTTTCCGTGAATTATTCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTG:1 + chr3R 20703207 5' - flea 4946 1 71.30 GTTTTGCGCTGGTCACTAATTTTCTACTAGCATTCGAGCCGATTTACGACCGAAACGTTAAAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAACTAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 24813914 5' - P-element 2882 2 75.70 ATTTCTTTTTTTTTATCCTTTTTTTGCGTATCTACTCCAGATGAAGAGTTTTCACGAATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTT:1 - chrX 10418684 5' - 297 467 1 62.39 TAGCGGATGAAAACTGTTGAATATTTCCGATAGTTTACGACATAACAGGCAAAACATCATAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAAACACATAACGTAGAGTAAA:1 - chr2R 5770157 5' + 17.6 6947 1 63.64 AATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATACATAAT:1 + chr3L 16291865 5' + jockey 4821 1 78.18 ATATAAGTGTAATCCAGAGACTATGGGAAATTTGGTGGAATCTTCTTGATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAG:1 + chr3R 15309329 5' - HMS-Beagle2 7171 2 55.10 AGCTAGAAAGTTGAGATTAAGCATGCAGTTTCCAGAGACATTGACTGTTTTGTTCATTATTGTTGACACGCCCACTCTAACGTGGAAATGAATATAATGTAAA:1 + chr3L 23341014 5' - Cr1a 4327 1 73.79 CCTTTTTGGGCTTTTACAACAAAAAGGGTGTCTTGCTAACAGTCGACCACCATTTATGTTCTAGTCTTTGGGGTTTGTGTATTATTATTATTATTATTATTAT:1 - chrX 3379288 5' - mdg1 38 8 74.76 CAAATTTTAGTAGAACAAAAACACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACGTTTACGCCTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTC:1 - chr2R 8963007 5' + Tirant 382 2 69.89 TTCCGCAAACGTCTTAGTTTGTCTTTGCGTCTGGAACTCCATTCAAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCAGGCTCAAGCCCTTAACCAA:1 + chr2R 1765619 5' + I-element 160 1 59.09 GTTAAAAATAATTTATTTCTTTAAAATTAGTTTTAATCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCAC:1 - chr2R 3100099 5' + FB 856 2 80.91 GAAATGAAAGCCAACCCACAAAGTATATAAAAAAGAACATTTTCAATAATCACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCT:1 + chr3R 9439208 5' - 1360 123 1 54.55 TAGGCAATTTGTTCGTCATTTGCCTAGGGAGCAGGTGAAGTGGGGTCTTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chr3L 22399808 5' + FB 38 1 56.36 AACTATGCGCTAATAAAGCTATTAGCTGATTTAACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2R 9953263 5' + pogo 26 1 57.27 GTGTCACACGAAGCAGCGAGTCCTGCAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGACGATAATAAAACCAATATGAACATATGGAATA:1 - chr3R 25211257 5' + Porto1 4262 1 72.63 TTGTCCTTTGAATATTTAAGTATATATTTGGTGGGTTATATTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATC:1 - chr2L 23005748 5' - I-element 4887 1 73.64 CAATCGCCGCCTAATGGAGTGGGGTTTTTTTTTTGAGAAAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGGGGTCAGCTTTTCGTTATAGTTCGTTTTTTTCTCAGCTAT:1 + chr2R 11996993 5' - Doc 4451 1 59.81 CAAGAGGGAAAATGAAAGAAAAACCAACGTTAAATTAGTGGCAATTGTGCGCGACATGTGTAACGCATAAAACAACATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAG:1 - chr2L 13068255 5' - hopper 47 1 59.62 ATTTTCTACATTCAATAGCCATAAACCGATTCTGCATTATTTAAGATCACCTGATCTTTTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCAGCTATTTGTTA:1 + chr3L 5445379 5' - invader2 4771 1 63.64 AATAAATGCGAAAATTGATCTAACTTTAAGAGTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2R 8086802 5' - 1360 3352 1 69.15 CGTTGTAAAATCCAGCAAATACTGACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACA:1 - chr2R 16686968 5' + I-element 4943 1 78.18 AAAATAATGTATATTCTGCGATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr3R 13503070 5' + hopper 4 2 68.97 CATCTAATAAAGAATTTTTTCTAGAAATTCATTTAGAAGAACACTTTCAATTGGCACCATGGGAAAAATTCATGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAAT:1 - chr3L 23722475 5' + 1360 312 1 58.18 TAGCCAGCGAAATGTAACAAACGTTTGACTAACCAAACTCCAGCTGACAGATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAA:1 - chr3R 22500879 5' + invader3 5207 2 56.99 TACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTT:1 - chr3R 14357337 5' - Rt1b 5121 1 66.18 TGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTGTTTTTTTTTTTCTTGT:1 + chr2L 21768292 5' - gypsy7 5012 1 62.79 TGGCAAAAAAGTATTGTTATTTGCCATTAATAAACTGTGATGATTGTGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:2 + chr2L 14708835 5' - opus 484 2 64.55 GTTTGTGATCATCGAGCGCTCGAATCGGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr2L 5338050 5' + F-element 14 1 69.47 TTGTTGGGTATTAGTATCAGTATTAGTATTGGTATTTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTT:1 + chr3R 21334942 5' - gypsy4 446 1 68.18 TTTGCCTTCTTATCGATGGCCTGTGATATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chrX 10300772 5' + 412 20 2 58.06 TTATAGTTTTATCATGACGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGGACAAAAAAGAACG:1 - chrX 19538219 5' - rover 149 2 81.25 GATGTACAATCTTTAAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr3L 2987425 5' + blood 7012 2 69.57 AGGGGACACAACGTTCCCTATTAGTTAATGAGATTAAAACTACCTTTTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAAAGTCATCGGACAAGTTCGAGAAGAAGATTAAAACGCCA:1 - chr3L 8131777 5' + jockey2 3163 1 57.27 TGCCTGTACTTTTTCTGCGGTCCCAGCGACACTCTCCATTTTCGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGC:1 - chr3R 6028268 5' + Gypsy6A_LTR 80 1 68.12 GAAACTGGACAGGGTTATTACACTGCCCCAGCCAGCTCCAAACGCTTGTATTCTCCGAGTCACATGCAGTGTCCCACAAGAAAGCCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCCT:1 + chr2L 7718169 5' + Q-element 505 2 60.00 AAGGCTATCAAATATCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTT:1 - chr3R 31965286 5' + 1360 3387 2 63.04 ACAAGTGTGGTTCATAGTTGATTTTAGTAGTTTTAGCATAGACGTTTCTTGTTGCAGTTGCAGTTGCAGTCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGGT:1 + chr2R 19568528 5' - TART-B 153 2 58.70 GATGAATATATGTGTAATAACTTAAATCATAAAAGGCTACACACACAGGCACAAAACACAGACACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACC:1 + chr3L 20834677 5' + I-element 5107 1 75.53 GCGTAGGCTTAATCGGCGAATTCTTTCCATTGCCATTTAGGTTAAGAAAACAATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAG:1 + chr2R 2788669 5' - Porto1 4468 1 69.05 TATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATAATATAATATAATATAATATAATATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAAC:1 + chr3L 20525230 5' - 1731 302 1 65.45 CTTAATGTGACTCAGCTCAGCTTTTGGTCTGCAGCATTAACTGCATTCCATTGCATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2L 20313862 5' - Stalker3T 203 1 56.88 GACCATACCCCTTACCCCATTCCACAGCCTTGTTTTGCCCGCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - chr3R 11315282 5' + hopper 1 2 68.12 AGCCCTCGCAGGACAGACCGGTATAGCCAGCTGGGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGT:1 - chr2L 14287675 5' - Stalker3T 144 7 67.62 TGATTGCACAAAAGGAAACCCGAAATCCGTACATTAATTAAACACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCG:1 + chrX 4740668 5' - Doc2-element 4371 1 59.05 GTCCATATCTTTTGTGCCACAGTACACAGTCCCACAGTGGCTCAGCTTGTATGGGCAAGCGGGAATAAAAACATCCAATAAAGATAGAAGCCTAAGA:1 - chr2R 4265284 5' - Transib5 2937 1 51.55 GAGGTTTTTGAGAGCAGCAAGGTGTCCTGATCGACTCGGAGACGACATGGTTGACCGTCTTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTAACTTTGCTGGTCGAGGT:1 - chrY 2971712 5' - TAHRE 10429 2 60.00 TTTAAAACTGTCGTATAAATATTTCGAGTATTAACAACATTTAGCCAATGTTTATTGCAAATAAATTCATTATTAGTTATTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGCTTAATAT:1 + chr2L 7238658 5' - invader3 4996 1 73.64 ACTCATAGTTTTTTCAACTTTTCCCCCGAAGTTTCTCAGCCTATTTTTATTTTACTTACACTTAAGCGCATAATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTT:1 - chr2L 9691172 5' + rover 135 2 58.18 AACACATGCTCCCCAAGTTGCGCAACAACATAACATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCC:1 - chr3R 14938293 5' + G-element 4174 1 53.52 ATGCCCTTCACTCAAACTATTCTCCTACGGGTGAGAAGCGTTTATTATAATAACTATGCACAATATAAGAACAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr2L 10858271 5' + blood 7012 2 69.09 CCTCATTTGATGCCAACCTCCTGTGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGG:1 + chr2R 14968665 5' - jockey 4675 1 69.23 GGAGCACAAGAAGATATAAACTACCACATTGGTGTGCCCATGCCGTGGTGCAATGAAGCTGTGGCCGCGTGAG:1 - chr2L 12705931 5' + pogo 496 1 80.82 AAAGCAAACAAACAATTGACGAGTGACAATTGAAATGGGTACTCTCAATCGGATAAATATGCATTCTCTCTGCTTCGCAACATCGGCTCTGTA:1 - chr3L 2547860 5' + invader2 100 2 70.97 TCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTT:1 - chr3L 22908067 5' - Stalker3T 200 1 75.53 AAAGTATTTCCAGAAAAAAACGATTCAACTTTTTCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCCACTTTTGTCGCAGATCCCATTTTATCATT:1 + chr3L 16670045 5' + G2 386 1 61.29 CCAGCACACTCGATTCCATTTATTGACTCTGGGAAATTTAAGTAGCCAAACAGAGGCAAATGTTCTGGGCAAACATGGGCAAACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAAT:1 + chr3L 18242195 5' - FB 32 1 66.36 CGGCGTTTTATTAGGTATCTGTAATCTGAATTAGGGTTCACTTTTCGGTCAGTGCTGTTTCCTCGTCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chrX 1601090 5' + hopper 6 2 73.74 ATACTATGCAACAGTGTTAAGCCGCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTATACTCATTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chrX 16893442 5' - roo 9009 2 75.45 GCTCCAGCCCACGCTTTTACTTCTGGCTTTTTGCTTTTGGCTTTTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACCATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 17405760 5' + roo 8703 2 60.91 CTTTCGCGCCAGATATCAAATCATTGAAGTAAAATAACGCCGAAGAATCTCACCAACCGCTGGAAATGCCACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCACAGTGTAAT:1 + chr3L 23236482 5' - Stalker2 392 2 68.57 TATGTTTCTTAAATCCCATATTGTCTCTATATAGTTTTTTATACTTTTTATTTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr2R 20431705 5' - Stalker3T 202 1 50.00 TCCTGCGTGGAATCCTGTATCCATTTATAAACAGTACACAAAATGTTAAAATAAACATAAAAAATAAATGGCTTATTCAAACAAAAAAAAGGAAA:1 - chrX 4336719 5' - pogo 61 1 56.84 CTTTCCGAAATTAGCAATGGAGTGAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGAAGTAACAGCAACTGAACATAAAACATTAAACTTCTCAAAG:1 + chr2L 22002317 5' + I-element 471 1 78.50 CAGGGCTACCAACGAATCATGGAACGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTATCATCATGTACGGATTTTGAGCGGAGTCACCCGTTGCT:1 + chrX 20433317 5' + diver 11 2 58.14 CGATCAGTATACACATGAGAGTATAATATTAATTTGGGGTTTAATTTTAAATTTATGTTCACCTAATTGAGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTG:1 - chr2L 15137964 5' - I-element 197 1 60.91 ATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 75.45 AGGATCTATTTGTTGTCGCGTAATCTTGTGCAATCACTACAAAACGGCAATAAATCAGGATTATTGCGAATGTGGTGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCG:1 - chr3R 10456660 5' - G-element 4165 1 70.09 AATAAAAACAACAACAAAAACAACAATGCCGCTAACCCGGGCTTGAACCCACATTAATAAGCGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAG:1 - chr3L 17400328 5' - gypsy 7427 2 59.09 TGAGACAGCTCTGGTTTCACTAAAATGTGCGAGACCAGATCTCGACTATGACACGGACACACGGACATGGACATAGATCGACTCCGCTATTGATCCTGATCAAGAATAT:1 + chr4 582777 5' - INE-1 84 1 62.39 TACTGTTCGACTGCTCGTATATCATGAGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGAAGCGGGGCGGG:1 + chrX 10288371 5' + opus 289 2 70.71 GTAGTTATAATATAAGCAACTTTAAAACCAAATACTATGAATAAAAATATTTAGCATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 - chr2L 17263218 5' - Transpac 303 2 69.89 TATATGGACTTTTTAGGTCTAAGGAGAAGAATACCGGGTTATTTATCATTGAATTCGATCGCTGACGTGTGAAG:1 - chr3R 1023420 5' + F-element 14 1 66.22 TTCTCGCTTCGCCCCTTTTTTTTTTAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATACTTATTCAACTCTTATT:1 - chr3R 31634333 5' - Doc2-element 4712 1 80.43 CTCAAACCTATCCCTAGGGAATCCTCGGCGCAGACCTTGGCCTATTTGCCAGAAATCTATGATGATGATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTAT:1 - chr2L 17531629 5' + 3S18 4 2 73.40 ATGCTAAATATCTGCGAGGGCAGACGAACTTTTCTTCTCTTTCTACTCAATATTTAGGAGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAAAGAGA:1 + chr3L 577107 5' + Porto1 224 1 72.73 ATTTTTAAAATAATATGCAGCTTCAAAGCTTAGCTAAATCTACGTAGTCAACATATCGCACAATCTCTTTAGCGACTGTACAAAATCGCGCAGTGAATAAATAATATG:1 - chr3R 18638769 5' + invader4 301 2 75.00 GAAAGATTTATAATTGTAGCAACATTATAGAGGGGACCATAGCCAAAATTGCTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTG:1 - chr4 311182 5' - 1360 3267 1 62.39 CAGACGACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr3R 13437259 5' + hopper 11 2 70.64 GTCAATGGAATGAACTAAAGATGTACAATCTTTAAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - 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Doc 374 1 78.85 ATCCAAATCTGATTACGAGCACTTCCAACTTCAACTGCAGCTGCAGGCCAGGCTAAACAAACAAAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAA:1 + chr2L 13420389 5' - hopper 290 1 65.31 CTGGGTTGGATTAGATAAGCCGGTGGCAGAAACTATAAATAAATCGAGATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2L 14214007 5' + 297 6605 2 57.28 GGAGCATTTTCGGCTAGGAAAACAGAGCGCAAGATACTTTATATTGTGGATAGAAAAAGGAAATTATTATTATTATTATTATT:1 + chr3R 14976530 5' - mdg1 7081 2 46.99 TTTCCTCGGAACTCTCTTCGCTTCTGATGGATTGACATTTGTTTTATCTGCCTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3L 17490648 5' + roo 8692 2 53.33 AATTTGCAATGGGCAGCCCAGAAAGTAAGTCAGCACCTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr2R 24031451 5' - 1360 3374 1 68.32 ATAAATTTTGTAAATTATTACAACTCGGCGAGACCGAAAATAAAATACCTACATTTGTAAACAATATAGAAAGTACATTTTTTTTTGTTTTTATTTTACTTTGCTTTTAT:1 + chr3L 18687527 5' - F-element 4673 1 70.00 AACAGAAAAAAAAGAAGTCGAAGAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACG:1 + chr3L 9311828 5' + hobo 2907 1 66.18 TAGCTTCAATAGAAACTGTGTTTGTAACTTGTGCACAAAACTTACATTTGATGATTTTACCTCTACAATTCGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACC:1 + chr2L 17681870 5' - 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chr2L 18675688 5' + 412 7090 2 55.45 GACCCATGTTGGAGCCCAATTTTGAGAGGGGTTGTAAAAACGATTGTGGTACAAATCGACTGAGGCACACAAACATAACCCACTAACACTACCTAAATACCAATTCAATA:1 - chr3R 20426655 5' + I-element 4982 1 62.73 TTAAAGTTGGTTCCGCTGGCATTTAATCGCTTAGAGAAATGCGGTCAGCTTTGTTTTATAGTCCTGCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCC:1 - chr3L 5290128 5' + I-element 4993 1 66.67 TGCTACTTATCTGATTAACCAGCTGGTGTATAATCTCGAAGATAATGCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 7400734 5' - roo 397 1 56.47 GAAATAGTTGCCTTGAAGTTTACTAGTTTTTGAATGCTATAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 - chr2L 3146149 5' - Tirant 362 2 61.82 TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGGTTTGGGTTTGTGGTTGTGTTTGTGTGTGTG:1 - chr3L 11777678 5' - Quasimodo 44 2 31.82 GTGCCAGACCGCCAGACCCTTAACTCAGCAGAGGGTACCCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 + chr2L 13534269 5' + 1360 66 1 75.76 ACTGTACACACACACACACACTCATACACAAGCGCTCGCATACATAGCCACGTACAATGTCATTAAGCAGTCAGGCCCAGTGTAATGATGAACTCCACTTAAGA:1 + chr3L 10479970 5' - 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1360 3046 1 70.73 ATCGACGACAACGAAAAACGAGTGCACCAACCACAGCAGCTGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 12897029 5' - accord 188 2 70.27 AAAAGAATTTTGATTGAACTAAATAGATTTTGATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2L 14848375 5' + pogo 17 1 58.42 CAGAAAAATGATGAAATTTTGCGTTCGAATTCCCAATAGCAGATATCATGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAG:1 + chr3L 22848579 5' - I-element 5067 1 55.45 ACTGGAAAAATTGTATGACATAAAAAGCTTGGCTGAATGAAAAGTTTGCCAAACAGCAGTTGAATAGCTGGGATTTTTTTCTAATATTTTTTTTT:1 + chr2L 5566634 5' + Tc3 77 2 66.32 CTCGAAAACCATTCCATTCCCATGCTCTCCATCCATGCCGACCCATATCCAATGCAGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAG:1 - chr3R 28926097 5' - F-element 4535 1 67.82 TAACAGCGAAGCGAAGGATTTCCGCTGTAAAGCATTAACATTTTTGTTTACTTTCGAATACTTTACTTTAAATTAAGAAGAACACTTCTAAAAAATATTAAAAAATTTGT:1 - chr2R 10564147 5' + Transib-N1_DM 290 1 52.73 GTTTAGCACAAATGCTTTAATTTCAAGCTCGAATGACTCGTTGCTGCCTTATTCACTGAACATAAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr3R 19223026 5' + Quasimodo 6 2 64.58 CGGGCTTAAGTAGCTTTATGTGTCTGTATGTGTGAGTTTTGTGTGGTTATAACATTTTTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCA:1 - 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chrX 12946233 5' - transib1 1900 1 40.00 ACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr2R 21199686 5' + jockey 64 1 72.73 CGAAGCAATGTCTGATGTGGAGCAAGAAGCCTCTGGAGACGTTGATAATGAGCAAAACTCATACTTCTCCTCAAAAAAAGTAAATTATACCACAAAATCCAAAAACAAAA:1 - chr3L 75196 5' + I-element 5182 1 52.73 GAGGTCAGCGGAGCTTTGTTTTTTCGTTTTTGTTTTTAATGTTTTTGTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCT:1 - chrX 7691954 5' + accord 7214 2 62.11 ATCAAAGGCCACTGGGAACAACGGCCTGTCCGCTGTTTTTATTGTTATTGTTATTATTATTGTTATTGTT:1 - chr2R 8641295 5' - mdg1 28 4 91.43 AACAAAAAAGAAAAAAAACTATTTGTATGGAATATAAAAAAAAATTAAAAAAAACATGTTACAAACAAGTGAAATCTAACAAATAAAAAAAAGGAAACAAAAGAAAAG:1 - chr3R 19520501 5' - S2 234 1 68.52 GAGGCTTTTGCACCTAGCCTCTTTCAACTATGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 + chr2L 6519818 5' + diver 9 2 53.97 GTTCAAAAAAATATTTAACATCTATCATATGTGGAACGCAAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAA:1 + chr3L 9419527 5' - S-element 1672 1 68.18 GATAAAATAATTAAGCCCTCCTTCAAGACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGGG:1 - chr3R 15676239 5' - accord 7007 2 66.28 TAATCTGAATTAGGGTTCACTTTTCGGTCAGTGCTGTTTCCTCGTCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 - chrX 1601069 5' - hopper 1379 1 57.41 GTGTATGGCTGTGTGTGTTTGTGTGTGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATGAAATTAAAATTAAATTAAATCATATGCATATTAAAAAAAATATTTATTATATGTA:1 - chr3R 27472604 5' - Transib5 2726 1 77.27 TTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATT:1 + chr4 1294991 5' - HeT-A 6042 1 86.24 TACATTTAAAATATATGTTTCCTAATATTTGACATGTATACCATTCCCCGTTTTCCACCCCCCTCGAACTAATCCGTAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATAC:1 + chr2L 1299051 5' + I-element 5136 1 79.09 AAATCGAAGCCGAAGATCGCTGCAAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTA:1 + chr2R 21679897 5' + 1360 3387 2 76.00 GATTTCAGGAAAAGCAGGGGACCTATCAGTCGCTGCTATTTATCATTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCG:1 + chr2L 4173057 5' - I-element 4944 1 72.06 CGTTGCAGTTTTGGTCGGTTTGTGGGCGTGGCAACATGGTCTATGTCTCTAGAGGCTGTATGCTGAATCTGAACCTTCTCGCTTTTATAGTTCTTGAGATCTC:1 + chr2L 22017969 5' - INE-1 148 1 77.67 CGACGCCGTGTCATTTTTTATCTTTTTATCAAAAAATGTCCTTGACTTGTGTCTGTGTTCGCGGCTATGATGGCGAA:1 - chr3L 8756175 5' + Rt1b 4714 1 79.22 TGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTAT:1 + chr2L 9723026 5' - Porto1 163 1 44.05 ACCTTACTCACACACACGGACAGTTAGTACACACACATAGACACACACACTCAACCACCCACGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAAC:1 + chr3R 10918471 5' + 17.6 7009 2 60.00 TAACAGCTTTACCCTCGTAACTTTATCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 - chr4 869673 5' + 1360 203 1 77.57 TATTATTCCCATTCCTCGTAGAGAAAATTTTATTTCCCAATATCTATCGATATCTTAGAAAACTGATGAAATTTTGCGTTCGCATTTACACTAGCTGAGCAACGGGTATC:1 + chr4 616620 5' + INE-1 541 1 80.00 AGACACGTTCAAGAATGTTTCGATTCCAAACCGTTTCCAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGGGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGT:1 - chr2R 14829280 5' - Idefix 193 1 63.64 GTTGGCTGCATCCGAATGGTAACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTCCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCC:1 + chr3L 776602 5' + FB 792 3 79.09 AACATCTACTGCGCCCCGTGGCATGCAACCCTCTTCGAATGCACTCGCGGTTGGAGCCGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 6707678 5' + 1360 4 2 66.67 TTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr2L 21034122 5' + 412 40 2 57.27 AGATCCTGAGAAAATTTCCACAATTATGAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTCCGAAGTTTTCTAGGCCTCAAAGGTGTAGTAGGCTAGAGGTAAATATACA:1 + chr2R 1873396 5' + invader2 5 2 70.91 TTCCTTTCCACTCGAGATCAACCTTTTTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 - chr2L 16606849 5' + F-element 98 1 61.47 CGACATAAAAAGTGAACATTTGAACCGCATTACGAGGCAGAAAAGTGAATTGAACAGCTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chr3L 19063425 5' - P-element 2866 1 60.00 GGTGGCTCATCATTGCTGATTGTCGGTGCTCAGAGGCGACTTTTGACCCCCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGGTTCCTGGGCTATGGGTTATTGAGC:1 - chr2L 259896 5' - F-element 316 1 53.92 CTAAGTTTCGTACTTTTTTTTTACTAGTTTTGCTTACAAAAATTAAGTAAGAATAACAAAATACAATCGTCTAAAATTAAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTC:1 + chr2L 22214506 5' - F-element 4378 1 77.67 CGTCACCACTTTTCCATCATAGCACCCAACCACCTGGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCC:1 + chr3R 25152071 5' + F-element 4495 1 62.32 ATGCGAGCTTACACAGATTTTTTTTGTGTCTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGAATCCACTTTTTTG:1 + chr2L 9754807 5' - 1360 3341 1 68.57 GAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGA:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 205 1 70.00 AGGGGGCAAGGTAGGACGATGTCAAATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGTGG:1 - chr3L 291683 5' - gypsy5 38 2 60.66 AGTATGTTACAATTATTTTCATCAAAAAACCAGCCAGCGAATTCCCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACTGAAGTC:1 - chr2R 14650654 5' + jockey 32 1 50.00 ATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr2L 5338015 5' + F-element 61 1 71.03 CGGCATCGACAACAACAGCAATACGCATGTTGCACTCAACGCAACGACGCACACAGCAACGAAACAATTTAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACATAAATCAACTA:1 + chr3L 15199592 5' + Porto1 4446 1 70.19 GTGTGCGTGGCAGAATTAACCAGGCATCAGGACACTCCTTCCCACAGAGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGAT:1 - chr2R 20426360 5' + flea 486 1 54.00 GGAAGGCAGATGTACAGCATGTGACACATAAACACAAAACACACTGTAAACGAGCTGTAGATGTGCAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAA:1 + chr2R 19205631 5' + G2 3076 2 83.15 AGACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - 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chr3R 16863358 5' - BS 5056 1 64.22 CGTCATTACTGTACTCAGCCGTGTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTAT:1 + chr3R 902567 5' + R1A1-element 35 1 76.36 ATTATGCTTTTCAATATATTCCCATTTGCTTAGCTTTTTTGGAACCATCGTTCATATAGTCAAGTACGTTTATATAATGAAGGTTTAAAATTAAAAAAAAATATTTTAAC:1 - chr2L 12978750 5' + transib1 36 1 78.18 CAAAACTTTTTACAATTGAGTAATTTGGTGTTAACATTCTAAGTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTC:1 + chr3L 18312630 5' - Bari1 81 1 60.91 TTCAAGTGCCTCCGCCCCCATTTTCTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 13351506 5' + hopper 140 1 92.11 TGTAAAGCTGTCGATTCGTGGACGATTCTTTAATCGTGAAGATTACCAGCAATTGGTGTTTGGCGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGATCCCGGCT:1 - chr2R 14599140 5' - I-element 158 1 56.73 CCCAAATTGATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 20167940 5' + 412 41 2 71.88 GCCAGCCGTGTTTGACTTTGCTAATGGAGTTGTCCTGCCACCACGACCAGCTGTCCCAAGCGCTCCAAATGGACTTGCTTATGCAAC:1 - chr3L 21191814 5' + BS3 179 1 55.17 GCATATGCATTAGTTTGGCGTTATTGACAGTTTAATTGGAAATTAGAATTCTTATCGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCCGCCTCGAGTACGTTG:1 - chr3L 126357 5' - pogo 2088 1 69.09 TTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 - chrX 9376921 5' - HeT-A 6059 2 70.91 AATTTCACGTCAAGCTACAATATTTTATGGCAATTCTGCTTTTTGTAGCCGCATTCGAAACGAGGTATGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCT:1 - chr3R 5075279 5' - P-element 398 1 65.45 GCTCAAAACGCAGACATTTTAACAAACTTAAATGCCAATTAAGTAACATTAAATTGTGCGACAAATGAATCAATAGATTAATAATAAAAATAATAATACT:1 - chr2L 18088397 5' + mdg1 27 2 69.00 TAGACCAAGGCAGTGGAGAGAAAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATAC:1 + chr3R 4571137 5' + X-element 4397 1 76.84 GCTTAAAGTCCTTTTTCAGACCACCTCCTTCAAACATCCTTGCATTCACATGTGCTGGGCATTATTTGCTTACATGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATT:1 - chr2L 12244083 5' - 1360 442 1 70.91 TGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr2R 22663340 5' - mdg1 389 2 61.05 GAAAATCTGCTTACTTTAACATTTTCGTCTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCACACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTT:1 - chr2R 18807937 5' - Tc1-2 480 3 78.18 TCCATGTGTCATGGAAGCTGACAGGCCCGGCTGAGATCCACCAGCATAGTTAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAAGTTAAATAACAAAATAAATTAAACTTAT:1 - chr2L 1548901 5' + HeT-A 346 1 64.55 CTTCGAGGGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 18072781 5' + 412 42 2 69.15 TAGCCATAATATCCACCGTATGGATTGCCGTATCCGCCACCGAAGCCGCCGCCAAAGCCACCTGGATAACCTGTAATGATGAAATCCAATTAAGAACACA:1 - chr3R 17619589 5' - 412 486 2 71.00 AGATTTCTTCAAGCAGACGATGACGATGTCTCAAGACAGGTGTAGCTTGACCACTTGAGGTGCAAAGTGCATG:1 + chr3L 21900768 5' - Stalker4 7163 4 68.49 GCCCCAGATATTTGTTTGGGTCAGGCACAACTTTACGCATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTCAACTCGCGTGCTAAAAAATCGTATGGCGTTA:1 + chr3R 2461987 5' - 1360 27 1 50.00 TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTG:1 - chr3L 11777678 5' - gypsy3 419 1 68.42 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGACTTT:1 - chrY 311346 5' + 1360 79 1 77.27 AAACGACATCAAGTCAAGTCAAATATTTTGACGGTTTGTCAAAGAAGTGACACTACAAACCCTCACTCCGAACGTACCACGGAGCCCCAGTGATG:1 + chr3R 16974261 5' - F-element 4351 1 67.37 AGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr2R 5214950 5' + F-element 19 1 62.24 CGTGAGTTTAGTGTAACAGATACGAATTACTCTTGCATCACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTAAAGCTCTCCCCAT:1 + chr3R 17792713 5' + Doc3-element 440 1 58.51 AATTAAAACTAAAATTACATATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 - chr2L 19157533 5' + Juan 4092 1 80.00 GCCACTTCTTTCCACCCATTCTTCAGACTCTGTCTCAGTACTGCCATCTTCTTCTATTAATTTTTTCGACTTTCTTTGTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTAT:1 - chr3L 5196873 5' - F-element 4669 1 76.36 TGCGTCAGGTAGACAACTACGATATACTGCGTGATTTGTAGAGCTCGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCTTGCC:1 + chr2L 5040020 5' + GATE 8170 1 78.38 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCC:1 + chr3R 21907536 5' + 297 6526 1 59.00 TGTAATTAAATTAACACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 9432822 5' + roo 23 2 59.00 TTTTTTGTTTTGTTTTTTGTTGGCTTTTTGCTGTTTTGTCGAACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCC:1 + chrX 12160079 5' - 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chr3L 18452049 5' - TAHRE 10410 1 60.91 GTATATTTACATACATATGTGTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCC:1 - chr3R 21096048 5' + I-element 140 1 80.00 TATGCCAAAATCAAAGCGACCCCGTGATTAATGACACTTGATTAGGAATTCAAAGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 20642677 5' - roo 9048 2 56.73 TACTTACTCAACTGCTGCAGGCCAAACATGACAAGGAAGCCGACGAAGAGGGCCAAATAAAGTTCTGACTATAATAGACTTTATCTTATTATCAGTAATCTTAACTCTCT:1 - chr3R 16307384 5' + Cr1a 4227 1 53.64 TTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTAT:1 + chr2L 9723025 5' - Porto1 163 1 41.18 ATGCCAGCGAAAAATGGTAACCAGTGCGCAGAAATGAACAGTTTCAAAACAACTTTGTTAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACA:1 - chr2R 16469121 5' + 1360 136 1 58.25 AACTTTTAAGCACAACGCAAAAACATTGAAAGCTCTTTATTTACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr2R 24031532 5' + 1360 29 1 56.84 CAATCCCCATTGAAAGAATTTCCGCCTTTGTCACTGTCCGCAAACAAAGTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGC:1 - 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I-element 5303 1 68.18 GGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr2R 23477859 5' + F-element 43 1 65.59 ACCTGTCTGCGTTACACATTATAGGTAAGCCAAGCCTTACATTCCAGTCTTTTAAGAGATTAATAGGTTTATTTTTTCTTCTTTTTTTCCTCTAGCCTACTACAATTCGA:1 - chr2R 13667305 5' - invader2 4853 1 38.18 GTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGTTATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr3R 25702211 5' - Tirant 362 2 78.48 AATTTGTGGCCAACTGACTCGACAACCCGCTTACCCAGATCCCACTACCCAAAAAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAACAAAACACAAAGACG:1 - chr3R 17442630 5' - Cr1a 201 1 57.28 AATGCAGCTACTTAAATGCAACTCAAATCTGTGGGCCAGTGCGGGGGCTCTTGGCGGGATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTG:1 + chr3L 14282082 5' + Dm88 413 1 67.86 GTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTA:1 - chr2R 6801712 5' - McClintock 384 4 55.96 AAGCCAAAAATCGCTTTATTCACTTTTGGACAAATATCTATACACCATCAATATATTATTAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATAC:1 - chr2R 11883690 5' + hopper 1156 2 54.55 CACGGAGTCGCTAAGAAACGCTACATTCACCGATTAATTAATAAGGCAATGATTGTTAATTGCT:1 + chr2L 14076164 5' + 1360 449 1 65.62 GGGTTTTTCTACTCAATCAGTTCCTGAACGAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:1 + chr2R 11273965 5' + Stalker2 18 2 62.73 AATAGTAAATTTTGTTAGGTTTTAATCGTTTGTTTCTCTGCGGCTTAAATACTTTTCATTAAATTTATTATATATTTTTCCTTGCATATGCATTTGTGTGTTTTACTTAA:1 - chr2R 14059694 5' + invader2 219 2 68.18 TGGGAGGTGAGTAGTATTCATCATGCAATCTGGTAAGGATTTTCGCGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCTTCTGAATTTTCTCATT:1 + chrX 9627150 5' - Doc2-element 4516 1 64.29 AGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 6537927 5' - roo 349 2 75.93 CCCCATAAAAACTCAATTGCAGACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGT:1 + chr2L 2476006 5' - I-element 5127 1 79.09 TATTAAAAGTGACGATATCGAGTTGATAAGCCAATGGAGACTATTAGCCTTAAGCTTCAGATGTGATCGAAGGGCAGTCTTGCTGGTTGAGTGTGAATGTTATTTGCT:1 + chr2L 14332754 5' - Fw3 3080 1 80.56 ACTTTCTAATTAATGCAAAATATTGCAGCTGCAAAAAGAAACTAGCATATGTGCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAA:1 - chr2R 14588919 5' + jockey 4793 1 53.64 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTC:1 - chrX 9845361 5' + 297 6504 1 44.09 AAATGTTTTGTAATATATTATACATAAACCACATTGTCCAAACTCAAATGAATGGTAAAATCTATGCTAAATATTTTAGTGTTTTTTTTTTTAAAGATTTT:1 + chrX 15642898 5' - TART-B 10507 2 43.56 CTGACGTCTTGAATTATTTTTAATCACTTTACACGCGCAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3L 9822297 5' + pogo 42 1 65.14 ATAACCTACTACGAGTACAAATTATAAAAGACTTGACTCGCGGAACCGCTAAAATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACAC:1 + chr2L 16807669 5' + I-element 5080 1 54.13 AACAATTAAAGAGCCACACATACCGTTAAACCCAACCTCTAATGGAGCCATTTGAAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAACACGGTTTTATGAAACGCAG:1 - chr3R 10173676 5' + Q-element 209 2 56.36 GTTTTTTATGCTAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 6213918 5' + G-element 4324 2 80.00 CACATTTATAAAGTCCTCTGTGCACTTATCGAATTCAAAGTCCTAAAGAAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGACAAGTTTA:1 + chrX 5515543 5' - copia 5088 2 58.18 CCACATTTTTCCACAGAATTCATCGGTGACAGCAGGGGAAAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATT:1 - chr3R 12040252 5' - HMS-Beagle 243 2 78.18 CTCAAAGTCGATGCAATCTACCTTAGATTTCTTGCTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATCATTCGCCTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3R 21612961 5' + jockey 22 1 60.22 AGCTGTGCTCGACGTCAACTTCACCGCTGACGGGCCGTTGATCTCTTTGCATTGGAGCCATTGGCCTCGGGTATACTGGTCGGATCAGTACCACTTCAACATCCGAAGAG:1 + chr3R 6132015 5' + I-element 4 1 77.27 CAGTGAAGAGGTTTTGCATATGGAGCTTTGTTTATTGTTTATCCAGTCTTTATTACTTTATTAATGATTACAAAACTTTTTCGGTTTCGAGCTTTTCCAATATGGACTTT:1 + chr3L 7260324 5' - Idefix 410 2 70.91 CTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAAGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTGTATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1 + chr2R 6984342 5' + HMS-Beagle2 37 2 69.32 ACCGTTTACATGTTGCGCCATTGCCTGGCCACTCGAGCCGCAACAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 23569009 5' + roo 8704 2 63.64 GCTTTAAGGATATTCTCAGTGTATTTGCATGGGAATCTGTTACTGTGGCTATGTGTGTGTACTGCTGATGTGGTAACTCCTCTCCCCGTAGAATGAAGTGACGGCCATAA:1 + chr3L 9166485 5' - gypsy5 6908 1 56.36 CATCATTGCACAGGCATACATGATGAATCTGCATAAGGGAGAACCACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:2 + chr3L 18915120 5' + 412 7070 2 61.82 TATCTTTGTTTTAATTGTGTATATAATCAACACTCTTATCTGCCGAATATGTCAAGTTAGTATAATCCCTAAATGCCAAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 - chr3L 8736149 5' - Transpac 305 2 79.81 CCCAAAACCGTCTGGCCATCTCAGGCTGACCGTAAAAACTTTCTGCTGAAGGCAAAGCAAAACAAAACTGTGGTGAGTTTTACCGGACTCAT:1 - chr3R 26161238 5' - invader5 3844 2 79.35 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGACAAAGACAAAG:1 + chr3R 21907534 5' - Rt1c 237 1 23.64 ATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCG:1 - chr2L 9778710 5' + INE-1 559 1 81.71 TTACGAAATATCCTTCATCCTTCAACCCCTAATAATAAAAACGTCACAGTCCTTGCAAATGTATATCCGTCTGTCCGTCTATCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAC:1 - chr4 408010 5' + INE-1 140 1 61.47 GCGGAAAATCGGAAAATGCTTTCGCACCGTTCCTAGGAAACGGATACCAGCTCGAAGGTAAAAAGTATAAGTGAATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTA:1 - chr2R 15406918 5' + 412 207 2 57.27 CTAAATGAAAAACTAGATAAATGTTGTACAAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGG:1 + chrX 17330078 5' - opus 491 2 71.72 GAAGATAGTTTGCCCATAAATATCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGTCTCCCGCAAATTTAAAACATAGATTAATACTTGTAAGTATGGCGCACACA:1 - chr3R 23665984 5' + TART-A 13279 1 73.83 CAGCGTCAGCGGCACTGGGCAAATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCA:1 - chr3L 17467924 5' + accord 482 2 72.50 TTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr2L 9496599 5' - TAHRE 10431 2 68.82 ACTAATATTAAAAACTGCGCATTTCAATGGCGCCAAGCAAGTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2L 18694009 5' - 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chr3L 18095564 5' + I-element 42 1 58.18 TGATTAAGACCTATAGTTCAACCGCAGCTGTGCATTTATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 - chr2L 12910776 5' + Burdock 6177 2 66.36 GAGAACAACAGAAGATGTTAACTCCAATTTTAGAAGTATGCAAATAAGAATTGAGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCT:1 + chr3R 19448715 5' - 1731 4453 1 60.55 AATCTCACCTGCCATGGGACGCCAGGTCCATCAAATTAAATTTGGAATTTTCAGGCATACGAATACATTATAACAGCTCCTGTTACAGCATCCACGAAACTAA:1 + chr3L 1439318 5' + Fw3 81 1 64.08 CTGGCCAGAAGAAGCGACTCGCAATCGCCCTGGAGCTGATAAGTAATCCTCCCAGCCCAGCACTAAACTCATTAGGGCATTAATGAAAAAAACAC:1 + chr2L 1743701 5' + Doc 4584 1 54.74 AAACTGAACTCCTCTGTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3R 5671449 5' - 1360 3366 1 69.14 TGCACTTCTTTGATTCGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr2L 18675606 5' + 412 7086 2 51.82 ATACAAAATGCTTTTCCTTTGGAATTTTAGGGATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAA:1 - 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Dm88 414 1 78.41 GTTGAGTTCCTTAAGCGGATTACACGGACAGAAGCTATAACAGCTACCAATTTTATAACTTTAAGCAAGAGAGAATGCTATAGTCCAGTTCC:1 - chr3R 32044761 5' - INE-1 573 1 60.87 CAGACATACATATGAGCAATTGGGTCTGGCTATTAGCACTGGCAACTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTACGCTCTCAGCTCTC:1 - chr3R 15941546 5' + Porto1 492 1 61.82 CTTTTTGAGCCTCGCAGATATTTTCATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAC:1 - chr2R 18507932 5' - Bari1 1694 1 67.62 TGAACTTTATTTAATTGAGTATTTCGGTGTTAAGGTTGTCACCGGCACACAATCTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 + chr2R 12839044 5' + jockey 4773 1 61.96 GGCATACCTCTAAAATAGAGCGGAGTAAATTGAAAAAATTATAAAAAAAAAAACAAATAGACAACGAACGAATCGATCGTTCTAAAAAGAGCAAACGCGAA:1 - chr2L 11578453 5' + Doc3-element 214 1 60.40 CACAGCTTTTGAACCTCAATGAAAGTTCAGCCGTACGCTGTTAAATGTTCATGTTTTCCACAACTACTTACAATAGAACTAATAAAAGGTTTAATAGAGTATTTTCTATT:1 + chr3R 28512920 5' - ZAM 493 1 54.55 CCCCAAAATATTGTGTTCCATACTGGACACCGGACCAAACTTTGTGACATTGAATTTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATAACGTTACAATAGCGTCG:1 - 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chr3R 24080837 5' - Juan 3764 1 60.91 CTCGAGATCAACCTTTTTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAG:1 - chr2L 16606839 5' + F-element 107 1 52.78 ATTGAGGTGCTCAACCGAATGATCTGCGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTGGGCTCTGCCC:1 - chr3R 26189381 5' - G2 311 1 76.92 AAAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr3R 12040214 5' - HMS-Beagle 7029 2 58.54 GCTGGAACGCTGGCCCACATCTGCGTGCCAGTCAAGTAGAAGAAATAACCAGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATA:1 + chr3L 16301067 5' + mdg1 7069 2 57.14 TTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTACAATTCATTAGAATAAT:1 + chr3L 16291867 5' + jockey 4809 1 77.08 AAAAATCGAGAGATTTTATTAGTTGGTGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGGACA:1 + chr2L 15988719 5' - 412 7541 2 53.45 TGAAGCACTAGCAATGATAAAATCCAACAAAAGGGAATAGACCAAAAAATGACGAACACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTCA:1 + chr2L 18291735 5' + Stalker 150 4 54.13 CGTCGTGTTTTCGTGTTTTTTTATTTGGCTTTGGGGATTTTGTGAATCTTTTTGTATAAGAACTAAAAATAAGTTTAAAA:1 + chr3R 29523227 5' - F-element 4631 1 56.25 AACAGGAACAAGAACAACTTAATACGCGGCCACAAACAATAATAATAACAGTGTAAGCAAGTGAAAACTAACTAACTAAGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 12387894 5' - 1360 3384 2 35.45 AACCAACCCAAAAGTAAACAGGAGTTTTTTTCGGTCCAGCGGAAGGGGGATGCCCATTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 13063459 5' + hopper 141 1 81.33 AGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAACCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCAAG:1 + chr2L 12036118 5' + 297 47 2 72.28 GTTCTATTGGTTTTATTTTTATTAGTTCAATGGGTGTGTAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGC:1 + chr2L 2283715 5' - gypsy 7400 2 66.36 CCACCTGTTTGTCAAGTAAATGCATCGACGGCGCAATT:1 + chr3L 13002242 5' + invader2 319 1 63.16 CCTCGTTGCGCAAGGCAGCATCCACACTTTCCTCTAACTCTTGCCAATCCCTTCCTTCTTTGCAATCCTTCCATTTATTTTCCCTTCCTGTTTTCCGGC:1 - chr2R 17072293 5' - ZAM 480 1 73.74 ACGAGCAGGGCTACCAACGAATCATGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 + chrX 20433312 5' + diver 29 2 54.13 CCACATTAAATCAATGTCAGAAATGGCAACTAAATAAGAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCTCGA:1 + chr3R 19449251 5' + Transpac 5016 2 65.45 TTGGCCAAGGATGCTGGCCTGGCCAATTTGCGATTCCCAGCCTCTCGTTATTTTGACATTTTTTTCCTTTTGATAGAAGCAAAAAGTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATG:1 + chr3L 15919146 5' - INE-1 309 1 55.45 GGGCCAAATGCGGTTTGCTAATACATATGAAACGGAATAACACAGCTACGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTG:1 + chr3L 17071411 5' - 1360 3338 1 54.55 CGGTACTTTCCGCTCTCACCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGCGTCTGAGGTGAAGAGCGAGAGAGCGTAAGAGAGAGCGGAGAGCGGGTG:1 - chrX 12546423 5' - GATE 8271 2 77.42 CTCCTTTTTCCCCCGACAAATCAGCCAAGTTTGGTTGGGACCAATGCACGTGCATTAGTTTTTTTTTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCT:1 - chr2L 17444411 5' - Doc 4681 1 75.00 AACGACAATGACCACTTGTCGTTGGCAAACATTTGCCAAAATGACCGCATTGACCAAATAGAGGCGCTGCCGTTTATCGTACGGCTCGAAT:1 - chr2L 4171126 5' - Cr1a 4391 1 78.02 TATTTTAAGACTAATCGGAAATTTTTTCTCAGATTGAAAAAATGTTAAAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTAC:1 - chr3L 64587 5' + F-element 251 1 74.76 GAAGTATGCTTTAATATCCGGGGCCAAGTGGAATGGCAGTATGTGTGAATATGTGTATGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGGGCAA:1 - chr3R 31134765 5' - accord 7004 2 58.95 CGCTTAGTTGTTCTGACTCCATCTGCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCT:1 + chr3L 20881081 5' - Doc 4384 1 77.27 GACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 13024046 5' + 412 41 2 74.44 GTGCGTTGGGTTTATGCCACTCAAAGTTGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAA:1 - chr2L 20842002 5' - G6 2014 1 70.91 GCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGNTG:1 - chrY 2720356 5' - Quasimodo 7365 2 78.43 ATCACAATCAATTAGCCATACATTGATAACCCTATCAGAACGAAAGTTCCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTA:1 + chr3R 6670778 5' - 1360 27 1 59.09 AGGAAGGGCCGGAGAAATAAAGGCATTAAAATCACTGACAGCCAAAAGGATTGTGCCGCAATCACACTCACACGCACACATATACGCGTTCTCG:1 + chr3R 10483659 5' + 1360 3222 1 81.91 CGATCGATGCCAACGGTTTTCTTCAATTACTTCGAGGGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 18072810 5' + 412 29 2 54.55 AGCTCAGCTATTGCAGATCAGTCAATACGTTCAACATTAGAAGGAGATAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chr3L 12677144 5' - pogo 2088 1 63.04 GCACTTGTTTAGGCGGCACTTGGCAAAACGGACAAGTTGGCAATGAATTGAGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTCTGTGTGTCCTAG:1 - chr3R 18955192 5' - I-element 4953 1 80.22 AGTTATGAAATTTTGTAAACATTTTCTAAATTAAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 18769753 5' - roo 9020 2 72.73 AATTATTATCAACGCAGGCGGAATAGAAGCGGGAAAATGTAGAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATG:1 + chr2L 3647248 5' - copia 85 2 55.32 TGGTGTGTTTGCCGTCGAGATGTTTGCAAGAGCGATAGGTGGTTGGTGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAATTGATGG:1 + chr2R 16292678 5' - F-element 4409 1 64.55 AGTTCCGTTTTTAAGTATGTAAATAAGATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 - chr3R 14279786 5' + FB 50 1 75.00 TATGTTAATTCTATATGATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTATTGTTTAT:1 + chrX 11936533 5' - Porto1 163 1 31.82 GTATTCTCATAATTTGACTGAAAAAAGACAATACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chrX 16693826 5' - 1360 3342 1 71.03 TGTATAAATTGCGAAGTAAATTCAAGCTCAATTCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3L 20039845 5' + Doc 33 1 63.95 AAAAGAGAGAAAGAGTGAGAGAGGGATAGGCGAGAGGGTGGGGGTGGCCGAGTGGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGGGGATCTTATATCACGCTC:1 - chr3L 5718408 5' - blood 87 2 54.81 ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr3L 20525229 5' + HMS-Beagle 34 2 55.45 AAAGCACCGTACGCGCACGCTGCTCAAAACGGAATGAAAACAAGAGCTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCAGTCGGCAAGAGACATACACTTAACGTAT:1 - chr2L 20797730 5' - P-element 2853 1 51.40 GGATTTTTGTTGAGATTTTGGAGATTTTGTCTTATTATTTTTTTTTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCCGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTGT:1 - chr2L 16641823 5' + Cr1a 440 1 52.73 AAGCCATTTGTTTGTTGTTGACATTTTTCGTGCTTTTTCGCCTTCTTGTTGCTCAAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGTA:1 + chr2L 13320912 5' + jockey 37 1 55.96 TAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAANAACAAGATGNGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3R 7049658 5' + 1360 22 1 63.75 GAGAATTTTTCGAAAACTTTTGTGCCTGTATATGTGCGGTATGTTTGTTTAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATCACTGATCTTAGTGTGGTCTAC:1 - chrX 877967 5' - mdg1 297 2 50.49 CAACAACATTGCGGAAGCAGAATCTCCGACTTGTCGCGTTTCCGTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGATCTTGAACAAAAATTCGGGAGAGCCTGGAGCCACCTCTA:1 - chr2R 24133236 5' - 1360 72 1 60.00 ACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 - chr3L 22721116 5' + INE-1 30 1 78.82 CTGCCATTGTACATGTTTCACTGTACAATACACTCGTACACAGAAATGAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCG:1 - chr2R 16476431 5' + X-element 50 1 55.96 CAAAAAGAAGAAGGCAGAGAAGTAAGGAAATAGAGAGAGAATCAGCTTTAGAATTAAGATAAAAATATTATCCGTAAGGCTTGACATATTGCATTGAGAA:1 + chr2L 14230004 5' + Dm88 4335 1 55.00 CGTAAATCATGATTAAAAGCTTCGGGCGACAGGGCAGGCCGCCCAACTACTATGCCTAACACGTAGCTAACCAAAAAAACATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTACA:1 + chr3R 28436258 5' + mariner2 807 1 71.82 TAACAAAAAAAAAAATAAATAAAAACGAAGTATGAACTTCATACTTACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTG:1 + chrX 12332162 5' + mdg1 276 2 72.28 TCCAGCTCTCTGGCCACAAAAAAAAAGTTGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAACATAACGGTATGGCTGC:1 + chr3R 14230314 5' - rover 7079 2 67.00 GCGAACGGCTCGCCATATTTTTGTACAACCCCCACAAAATAAAACAAACAAAAAAAAA:1 - chr2R 10992675 5' + F-element 4687 2 74.14 GAAGCAAAAATGGATGGTCCGATATGGTTGATTGTGCTGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAAAGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCA:1 - chr4 749184 5' + invader1 27 2 58.95 GCAATTCAAAAATATATGGAGACGGAGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAA:1 - chr4 834685 5' + mdg3 246 2 66.18 GTCGCCTGTTTGTAATTTACTCAATTTATATGTTCCATCGCCAAGACATTACTCTACTTTCACTGAAAGTATGATGCCTTTGAAGTTTGCTTTTGGAATGCAGAAATTAC:1 + chr3R 29955723 5' - Transib5 197 1 60.00 CCGTGGGTTATGGGTGCTCTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTGTGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCT:1 + chr2L 21916095 5' - Quasimodo 7047 2 76.25 TGGTGGTAACCTATCTGCCTCCAAGACAAACAACAACAAAGGCCGCAGATACGTGCAGCCCAAAAGTATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 1688464 5' + jockey 14 1 54.55 CTTTTAGTCAGACTCGCAGACTGACATTGATTGCCTCAAATGTCGCTACCATGACCAAAAGAGATACGGGAGCGAATGAAAAAGAGCTGG:1 - chr2L 6116187 5' + G5 491 1 70.00 CCCTGGGCTCCTCCTCATTACTTCCCTCCCGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chrX 17536386 5' - hopper 1378 1 64.21 AGCATTAGGAAAAATTACCCCAGGCTCAACTGAGAAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGC:1 + chr2L 14243051 5' + I-element 5000 1 63.77 ATTTTCTTTTTACAGCATTTTAGTCTCTTTTATTCCTCGTCGATTTCCATTAAAATTCAATTGATGTGCCACACAAAATTGTTTGGCTGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 17375200 5' - accord 189 2 68.18 GGCTGCCATTGTACATGTTTCACTGTACAATACACTCGTACACAGAAATGAAAGGTTCGTGTCTAAAAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTG:1 - chr2R 16476433 5' + X-element 35 1 46.88 AATATCATCGATCTGTGGAATAGGATTTCATTGCCTTCGGGGGTAGAAGTTAAGATGCTGAAATATCTTAGGCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGT:1 - chr3R 5719273 5' - INE-1 143 1 68.18 AGAGCAGACGTAACTGCTAGGTCAGGCTTGGCAATCTGTTTACAAGAGCGGCCC:1 - chr3R 2062283 5' - McClintock 6014 2 92.59 TAACAATTTGCTAAAATGTCGGGGCTTAGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chr3R 10956243 5' + hobo 58 1 81.82 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAGGATA:1 + chr3R 21907534 5' - Tabor 7278 2 61.68 GCAGAAAGCCATTTCAATGATAAAGAAATTGATATACTGGTTAGGTATTAAATAGTTCAGTTTATGTGTAGATTATCCTCTGCTCCCTAAATCAAAATTGTTAAATAATT:1 + chr3R 26271329 5' - Tc1-2 1554 1 90.00 CCATCAATTTTAAATATACATTAATACACGACGAAAAAGAACTGAAATTCCTGGAATTTTTATCATTCAAATGGCGCCAACACAAGCTGTTAAAATTAATACTGAACTTA:1 - chr3R 29251837 5' + Juan 3887 1 72.73 TAAGCTGGAAACTGTAACGAATGACACAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTA:1 - chr3L 23236584 5' + Stalker2 7281 2 50.91 GTGTTGCTTTTGCTAAAATGCTGCTGCTATAATCGCTGCTAATTGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 - chr3R 29635271 5' + mdg1 7079 2 63.64 GGCCAGGAGTGGGACTGCAATTATTGCGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 27795472 5' + roo 22 2 66.22 GGGCTGTGAACCGAAAACAGCGGGAATATCCCTCAGTCCATGACCAAACCTTTCCAATTCATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCG:1 + chrX 16134776 5' - jockey 386 1 60.00 GCGCTCCAGGACCCTGTTGATCTATTAACTTTTGTTTTATGACCGAGACGAAAGAAAAGCATGCTT:1 + chr3R 29418231 5' - Doc 286 1 71.21 GTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACG:1 + chr2L 10507868 5' - FB 384 1 77.65 CTCTTCGCCCGAGGTTGTGTGACCAATGTGGAACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr2R 7981223 5' + 1360 1 2 75.56 TCTCTTTCGCACCGTCTATAGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chr2L 6503185 5' + blood 168 2 93.48 ATTGAACAAGTCAAATCAAATTTCAAAATAGCGCAACCTCCAACCGACCGATGGGCGCTGCCGTGTGTCGTACGGCTC:1 + chr2L 14199745 5' - Cr1a 4395 1 50.00 CACCGTACGCGCACGCTGCTCAAAACGGAATGAAAACAAGAGCTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2L 20797726 5' + P-element 1 2 72.86 TCCTTTGGCATGCAGTGGGGCATTAAGTTTTTGGTGCTTTTTCTCAGAATGTGCATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATG:1 - chrX 21314005 5' - Stalker 54 4 58.59 ATGGGGCGTCTATAGGTCTATGATTAATGTGCAAAGCGCTGAAGTGGACAAAATTCTCCTCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 + chr2R 19231804 5' - Tirant 8463 2 60.55 CGAACTCAAAACTGAAGCTGGTCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACTGAAGTATACACTTAA:1 + chr3L 13925361 5' + P-element 41 1 31.11 AGCATTTGTTGAGCTCTAATACCTAATAAGGAGTGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCAT:1 + chrX 14684755 5' - I-element 401 1 70.00 CAGTTGCCACCATCCAGCACCCAGCTCCATCCCTCATCCCGCCAAGAATCTCATATTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 + chr3L 3412940 5' - Stalker3T 204 1 61.96 ATATTTATTTAAAAAATAAATATGAAAATTTATTTGTATTAATGGTATAACCGCGACTGCTGGCACCAATTTAGTCAATACTTTTTTATATTCTATTTTTAAATTTCTT:1 - chr3R 28145350 5' + 1360 3272 1 23.85 CCACCCGCTTTTCCACCCAATTTCCATTCCCCTGCTCACTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGGTCTTGTACAACTGTTGTGCTATTCCTTG:1 + chr3R 31188040 5' - Bica 402 1 63.64 GTCAGCATATTTGGATAATTTAAATTAATTAAAACAAATGCAATAAACTCTCGGGCCTTGATGGCTTGATTAACGATTCGTCCGCCCGTCCATATCAGCGGCGCTCAAAT:1 - chr3R 16389962 5' - micropia 5398 2 80.91 GATGCTAAATATATAACTTGGCATTTACAAGTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 17184894 5' + roo 29 2 57.80 AAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2R 12416947 5' + pogo 28 1 55.45 ATACATACATTTTGCGCTTCTTATTTGACTTGTTCGTTCCGAAGGTAGGAAGTGATGGTTCTCAGTGTTGTTGACTGATGGACGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCGATAG:1 + chrX 11389270 5' - Doc3-element 4326 2 70.00 GGATGCGACTTGATCGCCATGTAGGTCGATAGCAACTGAAAACCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAACCGA:1 + chr3L 16496196 5' + P-element 18 1 55.68 CGCGTCATGAAATATTATTAACGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGGCCAGATTGGTTTCATTATAGAAT:1 + chr2L 17349577 5' - F-element 4245 1 75.73 CAGGAAAACCTTTCATAAAATACAGGAGCGTGGAAAAAAAAAAGGAAAACGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATCTGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGC:1 + chr3L 5217061 5' - 17.6 7196 2 52.73 ACATCAATAACTTGAAAGCTGAAACCACCATCTGTCACGAATCATCTTTCAAATGTATCAGGCTTTTACCAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACT:1 + chr3R 28847886 5' + Tc3 318 1 60.00 CAGATATTTTCATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 - chr2R 18507918 5' - Bari1 1676 1 52.29 CGGCTCTTAGATAATGATATCAAGAGTCCAACACATTTATTATAATAATTATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTACATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGA:1 + chr3L 18006123 5' + S-element 312 1 54.46 TTAACTGAACCCACACACACACAGGCGAACGGCAAGCAAATTAAGCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAATTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTAC:1 + chr2L 1943044 5' + invader2 5102 2 58.33 GGAATGGATGGAAATTGTATAGATGTACAAGTTTGTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3R 15524468 5' - pogo 2077 1 65.48 TTACAGACATCCTCAAAAAACTCGAACTCAAGAAAGAAAAATCCAATGAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr3L 3555544 5' + 412 10 2 71.56 TGTAATTAGTTTTGCAATCAAAGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr2L 13836518 5' + blood 30 2 56.57 TTTCGATACACATACACGTTTACATTGCAATATATTTTCACTGATTTTGGTAATTCGTTTTTTTTTTAATCTACCGTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGC:1 + chrX 15511371 5' + Circe 102 1 64.00 GACCCAGCCTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATCTGCCACCACTTGAGACCACGTGTTTTCC:1 - chr3L 3611759 5' - blood 7366 2 66.67 ATCAATTATGTGAACGCAACGCCTTCTTACAACACAAAGCTTCTAAATATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTT:1 - chr2L 22173301 5' - S-element 1684 2 59.09 GGGAACCTTACATATTTATGTATTGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTG:1 + chrX 19352165 5' - G2 47 1 73.63 AGACGAATATCGTTTATCTACGCGCGCGTTGTATTAAAAAAGAGTTAAAGTGCATTTCCTAAATATACCAACCTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTT:1 - chr2R 21571166 5' - I-element 283 1 70.91 ATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCACATAAGACTCATATATACACTATTTAACTTCGTTT:1 - chrX 20433363 5' - diver 160 2 78.10 AATGGGAAAAATGTAGGCGGTACGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCGG:1 - chrX 11671786 5' - G5A 2635 1 56.00 CATACATATGTGTGAGAAAGCAAGCATGCTTCATTAGATAAAATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1 + chr3L 23069384 5' - 1360 9 2 52.17 GATTGGCGAGCTCCTCCTTCTTTTTCTCCCGATATCTTTGCTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTT:1 - chr3R 24830706 5' + S-element 246 1 60.64 AAAAACTGTGTATGTTCGCCAAAAACAAAATAATCATAGATAATTCTATTATTTTGGCTCTCTCTTTTCTCAGTGTAGAACATTTGGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 3798690 5' - 1360 3388 2 69.09 AAAAAAGTAAATGTCTTGTTTTAAATATAAACGAAATACACTAATTGCTACTTCTACTAACCCAAAACCATAGACACAAGAATAAAAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 8896238 5' - 1360 3368 1 80.00 TAAATTTTATTGATTTCATTTGACAGGCGTCATGTATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chr3R 25434848 5' + opus 13 2 69.09 ACCGTGCTCCAGCGCGTGTTTAACTACAATTTTTTACAATATTTTTAATTTGATTTATCTTGCTTTTTGCACTAGGAAATTAACTAAATCTTTTGTCTTTGTGTTTTGTT:1 + chr2R 12936411 5' + Cr1a 196 1 62.73 ATAAGTCTTAAAATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 + chr2L 10746622 5' + flea 4770 2 69.09 TTCGCTGCCATCGCCATCGATGGCTGCCAGGGCGTTCATTTCGATTTGGTGCGTTGCCCCACCGCTCGGCGCCATAAGTCCAGATCGGTT:1 + chr3R 7242488 5' - Doc 4281 1 60.00 CCGTAACTTTGCCAACTGAAATGCCTAGACAGATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:1 + chr2L 1217673 5' + Burdock 52 2 73.64 GAAACTTTTTATTCGGTTCAAAATCATAACTAAAAACTCAAAATTAAAAAAAGAGTAATGTGCGTTTACGTGCGTTTATTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTG:1 + chr3R 20375988 5' - G2 3041 2 49.09 CAGCCCAAAGCCCAACGTTCCCCCAATTTCCACTCCGAATATATGCCTGTGGCACAACAACATCACATAGAAGAAAGATCCAGC:1 + chrX 6950630 5' + G2 2700 1 78.57 AGAAAAACCATCGGAAGGTTAATAGTTCTACAAGGCGGAGGGCAGAGGACGGCGGTGCCCCAGGGATGATCCTCAGAATCTTTGATTGTG:1 - chrX 2105113 5' - F-element 4329 1 68.89 AAAACAATTTCTTTGTATGTATGGTAATTGTAAAATTGTAATTGTTTTATCAAAATGTAAATAGAGACATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3R 29970595 5' + pogo 8 1 68.57 GTGTCTCAAATCTAAAATTAACAAACTGCCCCAGTCAGTCAGGCCAGTCAGTCAGCCCACGATTTTCTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2L 5584133 5' + 1360 55 1 70.24 ACGTATGCCAAAATCAAAGCGACCCCGTGATTAATGACACTTGATTAGGAATTCAAAGCGACTGTAAAATCCCAACTAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3L 20642674 5' - roo 9045 1 56.36 GCAACAAAAACAACAATATGCGTTTTATCAGAGCTCCAGTTATTATCGAAGTTTAAAAGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAAGCGAAATA:1 + chrX 7198954 5' + Porto1 88 1 78.43 AATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATAAAATAAAATAAAATACAATAA:1 - 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chr2R 15855728 5' - opus 7469 2 72.94 CTACCATCAGTCTGTCCTTCATTGACCACCTGTTGATGGAAAACCACAGAGAGATCTCCCACTCCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTG:1 - chr3L 14740824 5' + I-element 4894 1 66.67 CGGGCGATCTCTCTCCTGAAATAATATTAACAACAATTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCT:1 + chr2R 1329756 5' + 297 6909 2 64.15 TACGCGACATGCACGCGTAGGTGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTC:1 - chr3L 11689410 5' - Cr1a 4395 1 65.96 TAATATAATTTTTTTGCTCGTGTAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 + chr2R 19166646 5' + FB 47 1 82.11 ATTAAGTTTTGTAATAATCATGTAAAAAGAAAAATCTTAAAAAAAACACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACC:1 + chr3L 13372720 5' + I-element 5085 1 58.18 GGGCGAAGTTTGTTTTTTGGGATTACGGAAGAATGCGAGCAAGGAAAATTTGTGTCTCCCTTAGTGTCTATCACCTTTTGAAGACGTTTTGGTACAGACTGTAC:1 - chr3L 22035888 5' - Tc1-2 1313 1 55.77 TGTCAACGGAATTGCGTATCCAAATGGGCAGCGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr2R 25118085 5' + Transpac 4964 2 67.59 ATAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGATTAAATTATTTTATTT:1 + chrX 17456069 5' - jockey 4931 1 73.39 ATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTTTTGTTTAT:1 - chr3R 7773344 5' - Porto1 163 1 36.56 GCCGATTTACGACCGAAACGTTAAAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr3R 24813951 5' + P-element 45 1 40.00 TATTGCATGTCTGGCAATATAACACAAATAAAATGAATTAAATAAATGAATATAACACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chrX 2419533 5' + Tabor 6882 2 53.64 GGTATACTTTTTTCTAACTTTCATAGCTTATACATGCAAGAACCGATTTTGCAAGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTC:1 + chr2R 6952089 5' - Ivk 260 1 55.45 TTTACTTCACTTCAATTCCATTTTGGGTGCAGTTAATTTGAATGCTTTATGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTAA:1 + chrX 17730185 5' - hopper 1064 1 53.19 ATTTTAATATTTTTTTCATTTTCCACCGATATTACAGAAAATGTTGAAATCTTTCACTTTTCCAGCTGAGTGACGGGTATCTGATAGTACCTCGACCATAGCATTCTCTC:1 - chr3L 24303737 5' + INE-1 575 1 67.27 GCACGCGTTTTTCGCCTGCAAGCTGCATGCTCGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGG:1 - 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ZAM 238 2 52.63 GAGGCATATCCTTTGGATATGTGCTGCCCTTTCATCCTTTTGCTTTCCTTTCACTTTTTTCCTTTTTTTTTGTTTTGT:1 + chrX 6494826 5' - Doc2-element 227 1 85.90 CAATGGGAATTTGATATATCTTCCAATGTATGTAGTTACATTTCGTTCTATGCATCGTACATCGTTTTATCAATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTA:1 + chr2R 10685483 5' + I-element 5073 1 68.18 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGAAATCAAGGGCAAA:1 - chrX 14317414 5' + HeT-A 5998 1 65.48 TATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAACATAATATAATATAATATAATATAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTG:1 + chr3L 20525230 5' - Max-element 286 2 66.04 AACAGAAAAAACGGCTAGACAAGAGCGGTGCGGAAAAAATTTTGTGGGGGGGAAACAATTAGTGTTCAAACATGAAAACGAATATATTTA:1 + chrX 8885477 5' + roo 8671 2 64.44 GGAGCGTTATGGCAGAAGCATGTACCCACCAGCTGCACTGGGAAAAAGAACACTGTCACATTGCCACATTGCTAGCAGAATGGAGAACCA:1 + chr2R 8769723 5' + G2 2845 1 75.56 TGTGCGATGATTTTCAAGAAAGTTATGATACAAAATCTCACTTAGGGTTACTATTTTTGCAAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chrX 1703349 5' - mdg1 7439 2 57.01 TAACTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr2L 21034128 5' + 412 34 2 51.82 AAAAAAAAAATCAGAATTCTGAGACTTCAGCTGGATGCGATGACACTAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAA:1 + chr2R 8684300 5' + Doc 4582 1 67.09 GTTTTAACTTAAGATGTGGAAAAATATTATTATCAGCACTTCGATTTATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCG:1 - chrX 20926591 5' - gypsy 7401 2 58.18 AACTGTGTGCTCAAATGTGTGCGGCCTGTCAAAGGTTAAAGGCGTTTTGTTGTATTGCCAAATTTGCTCTTGACCAACGGCAAAGGCACGCTCCTCACTATTCCAACGCA:1 - chr2L 17989389 5' - mariner2 135 1 75.45 CACACTCGCCGGCTGTGTTGTGCGGACTCTTTCACACTCGCCAGTACTCAACTTGATCGTCCATTGTTGCTTCTCGATGCGTTTCCTC:1 + chr3R 15396830 5' - Doc3-element 4343 1 70.45 CCTACACACTGTGAGGACAATGTCCTTTTCCTCGGTCCCAAAAGCAACCCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCCACAAAATTAAACTATT:1 - chr3L 15037807 5' + Porto1 4540 1 54.13 TGAAAGGCATTTTATGAATAACTTAAATTTTCTGTTCCAAACCAATTTTGAAAACATTATTACCTTGCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr2L 18307045 5' - hobo 2883 1 61.82 AAAATATGAAGAACGGACGGGTATAAAATTCCAAATGGGGGTCTTTAGGGTTGTACAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGACT:1 - chrX 7654568 5' - BS 4909 1 60.40 TATGCTAAATGACCACCCGTATGGGGAAAACATGTATGTATTGTAGTATGTATGTAAGCGCAGCAGACAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr2R 23230563 5' + 412 7071 2 64.55 GATTGCGCTTTGAAAGGGGTTATATGGGACTTTCCGGCTCCAAGTTTTCAATTTTTATTTATTTATGTAACGTGGCCTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chr3R 20415738 5' + F-element 20 1 68.18 TCTCCGAATTATTATTTTATTGTCTTGCCATTGCCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3L 12677068 5' + pogo 14 1 54.55 GATTGCTCTTACTTGCATATAAAATTGTTGGATTAACCGATTGGAACATACTTTAAGTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTG:1 - chr3L 16973479 5' - S-element 1706 1 69.09 ATGATGTCACGGACTTTTCCGGTCTCCGAATTATTATTTTATTGTCTTGCCATTGCCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 12677046 5' + pogo 13 1 65.31 GTCTACTGTCCTCGCCGGTATCTCTTATAGTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTCATAATTTGTTTATTGCAATAGATACTTTTG:1 + chr2R 14613602 5' - Idefix 7103 2 68.52 ATGGCAATGCATTTAGAACCAGATCTTATAGCATTTTTTAGTGGGGGAGCCAGCATCTTGCTGTCCTCCTTTGATATCTATATGCTTACTACGTGCATGGAAAGTTTCAT:1 - 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chr3L 3240577 5' + diver 5927 2 60.61 GAATATTTTATGCAGCTTTATGTCAACTTTTTCGGGCTACGTGTCCTGCATCCTGGCCACGTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTAGC:1 + chr3L 20868589 5' + BS 11 1 73.86 TAATAAGTGCAACAAATGTTAATTTGATATTAGTGAAGCACTACAATGCACTTCATTTTAACCACTCAGTGCTGCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATAAAG:1 - chr2R 8189194 5' - Dm88 394 1 70.00 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAATAAA:1 + chr3R 21907534 5' + 412 20 2 42.00 TGATTTATTTATTGAATTAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGGGACAGAGTAAATTCTGTTCCGC:1 + chr3R 27842158 5' - HeT-A 6033 1 54.00 GTTTTTGTTTTCTTTCGCTTTTTTGTTTGTTTCTCTTAGTTTGTCGATTTTGTTTTTATAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTT:1 - chr3R 12589151 5' - F-element 4587 1 60.75 ACGCACAACTACCAACCAACAACGAACAACTGACCCACACAGATGCACCACTCGCATCCAGATTAGATGTGTGGATGTTGGGGCAACAAATCGCTGTACTGCCTCTCTGC:1 - chr3R 23330876 5' + 3S18 5718 1 79.09 TTAAAATTGAATTTCATTCAAACTACCCGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 12623707 5' + roo 41 2 63.64 CAGATGGCTAATTGGTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 + chr3R 22595822 5' + FB 51 1 70.00 CAAACTGCCACCGACTGGATTCAGATTCGTGGGCATTGGGTAGAACTCCAGCATCGTATACGAGTTGCCACTTAGCACGACGCGACTGCGGTAGTTCTTT:1 - 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roo 9037 1 57.94 GTGCAGTTATTTGCATTTTCCTCAGCGGCCAAGCGACTCTAACTATTGTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACAC:1 - chr2R 23230656 5' - 412 7540 2 64.47 ACTGACCCAAAAGTTGACAATCGCAAATAAACATAAATGGTAATTTGGCACGCCGAAAACCAAACAAGACATATTCAACAACTCCAACCCTCTAGACCTTCTTA:1 - chr3R 31545514 5' + I-element 5100 1 61.54 GTGAAATTACACAACCATATACTTTACTTTGATCTGAGCAAACCTTTTTGTAACAGCAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAAC:1 - chr2L 13041117 5' + F-element 4456 1 62.92 ATACCCCTTTTGTCGTCGTAGAGCACTAAATGTATTTTGAACTCGTCTAAAAGCGTTTTGAGATGATGAGATATATGAAAGTCTGTCCGTCCGTATAAACGTCGAGATC:1 + chr2R 13005254 5' + INE-1 132 1 77.06 TGACATTTCCTCATCAGATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGCAAATGAATCG:1 - chr3R 13481214 5' + roo 54 2 83.33 GGGTTTTTGGGGTGGTGCATCAGAAATGTGCAAACCAAAAAGCCAGAGAAAAAGTCCTAAAGCTCTCTTTGGTTTT:1 - chr3L 20647744 5' - Fw3 113 1 73.68 GGTGTGATTACCGCAAGTAAACTATCTCTCGCAGCTGGATGTTTTCGCTCTTTCGTTTCATTTGTTGGGGGGAAACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATT:1 - chr3L 13253839 5' - Gypsy6A_LTR 172 1 75.45 CGGCATTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTCTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - 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chr2L 12404302 5' + 1360 3232 1 63.55 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACCAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAACACAACAACACACACCAACA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 417 1 40.00 TTACTTTCTTTCCTGTTCACCCACTTTTATTTTCGATTTTTTTTTCCAACGCTTTTGTGGTTAGAACCAGAGAACTGCACGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chrX 7802835 5' + hobo 22 1 60.91 TTTCTTGGGTTACATAACAATGGGAATTTCGTTCAAAAAAATATTTAACATCTATCATATGTGGAACGCAAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 + chr3L 9419497 5' - S-element 1702 1 65.45 ATCTGAATTAGGGTTCACTTTTCGGTCAGTGCTGTTTCCTCGTCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chrX 1601067 5' + hopper 4 2 67.57 TAACCAGGCCAAGATAAATAGGAAAACAAAAACCACTCACAGCTGCGTAAATTGAAGATCCCAATCCCAATTAGAAGAACCTAAATTTATTATTATTAAAAGAAAAGAC:1 + chr2L 9047451 5' + I-element 258 1 56.88 AATGTAAATATGAGAAGTGAATCGAGGCGGGACAAAAGGAAGTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCGACTTTGTATCGCAACGCTTCCC:1 - chrX 8985084 5' - ZAM 8040 2 56.04 TTCCCATTTTAGTTTCTCCTCTATTTTTTCAAACGGTTTTTGCTTTATTTTTGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCA:1 + chr3R 14004847 5' - blood 7021 2 59.09 AACATCGTAATTGTATTGAAATTAAATTTTTAGATTATTAAAACTATTAAAGTTTATTTTTTTTTTATATTTTTCTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chrX 18021012 5' + Doc 12 1 44.04 GTTAAGTGGACTCCCACACACAAACAGAAGCGATCCATACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:1 + chrX 15202697 5' + hopper 45 1 64.55 GGAAGCAACCACATTGATGGACTGGACGGTCCAGTGTTTGTGTTCCATTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 + chr3R 25228338 5' - Quasimodo 7046 2 63.75 CGGATGTTATATCGTCCGATGACAAGTCAAGGTCTAGTCTAGTCATATTTCTATGTTGAATATAAGCAATGCCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACAT:1 - chr3R 545922 5' + 1731 4376 2 56.36 GTCGCGACCTCCTCTTTGATCTGATTGCAATGATCGACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACGGCAG:1 - chr3R 16203886 5' - diver2 282 2 71.21 GAAGTTTCAGCATGCTTCGGTATTTTTCGGCTGAAACGATGCGACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1 + chr2L 20797659 5' + P-element 23 1 53.76 ATCTTGATCGCAGGAGTAGTGCTAGTGGGCTCATCTGCATTCCCACTGGCTCAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGCCTATAGCATTCCCTC:1 + chr3R 15363530 5' + INE-1 575 1 64.65 TATGCGCTAATAAAGCTATTAGCTGATTTAACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr2R 9953266 5' + pogo 28 1 55.05 AATAGAAGCTAGTTTCGGCAAGTTAAATCATTAATAATATATATTCTTTATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATC:1 - chr4 846996 5' + INE-1 132 1 66.36 CAGCACCTCGGCGATGAGTCTCCTGTATGAGTGCATCAACACGGTGATCGCGACCTTTATTCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTAC:1 - chrX 13730626 5' + Ivk 5066 1 53.85 ACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chr4 311578 5' + 1360 49 1 67.27 GCATTGCCTGGAATGGGAACTGGATGATGTCGATGTGGAAGTGGAATGAACTCGCCCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCAAAAATTTGCGCACCCCTTCCACGGAACAC:1 + chrX 17577616 5' - R1A1-element 84 1 65.45 CATGTTGGGGGGAGTGTGGGGGATAGAGAACGAAATGAATAAAGAGGGAGGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAGTTGGGGTTT:1 - chr2L 17294817 5' - Idefix 154 2 50.53 CTTCGCTCGATTCTTAGATTCATGTGAAAACGGCTTCACGCAAATTTTGATCATCATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTTTATTATTAATTT:1 - chr2R 4265439 5' - flea 239 2 54.55 CAAATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2R 22663335 5' - mdg1 381 2 61.11 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACTCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGC:1 + chr3R 21907536 5' + springer 463 1 67.27 AAAAGCACAGATCAGGACATACAAAGGTAGGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGGAGG:1 + chr2R 22424246 5' + Circe 7183 1 69.14 AATATATGTCATATTTTACTTAGTATATTGCACTCTCTTTTCATTTTTCTTATTTGTCTGGATATGGGTTTTTCCTCCACGTCTCCTTTTGTTTTTCCTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 13428859 5' - Doc2-element 231 1 65.45 CATATTTTTATGTATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGACATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 - chr2R 22661310 5' + Transpac 4925 2 70.65 AAAATATTGCAGCTGCAAAAAGAAACTAGCATATGTGCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATACATTAGAATAAT:1 - chr2R 14588903 5' + jockey 4809 1 66.36 GAATTTCTCATTTTGTAAGGGGCTCTAGGCAATTTGTTCGTCATTTGCCTAGGGAGCAGGTGAAGTGGGGTCTTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3L 22399833 5' + FB 1 1 77.55 GTATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 - chr2R 22661299 5' + Transpac 4954 2 54.55 CTTGGTGGCGTTGTGTTTTTTTTTTTGGTAATATATAGGTTTTTTGGTTCCAAAATAAAAATAAAACAAAAAAAA:1 - chrX 11795300 5' + BS 5102 5 72.00 CTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - chr2L 5724360 5' + 1360 38 1 72.53 CAACAAAAATACCAAAAAACGAATAGATCTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACACTA:1 + chr2L 12910717 5' - Burdock 217 2 68.75 CAACTGCCTCTCTCAATGGGATCCTGAATTTACAGCTTAATAAACTGGCTTTTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 - chrX 22806755 5' - Burdock 6358 2 52.73 TACAGTCGAACATCAATAACTTGAAAGCTGAAACCACCATCTGTCACGAATCATCTTTCAAATGTATCAGGCTTTTACCAAAGAAACTAGAATATTAT:1 + chr3R 28847877 5' - Tc3 312 1 76.53 GGCCAATAAGGTGAATGGGGAGGTAGGTCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGGG:1 - chrX 3120909 5' + R1A1-element 4993 1 63.16 GGGTATCTATTGGCAGGAGTGCAAAATGTGAAAAAGCTCCGAATATATTTATTTATTTT:1 - chr2R 9144042 5' - mariner2 834 1 89.83 TACATTAATTTCAAACATTTCCCTCTCCACTTTGCTTATTTCAGCATTGACAGCTTTCTCTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCC:1 + chr3R 26387054 5' - Doc 4401 1 73.47 ATATAGATATAGCGCATACGCCCCGCTGGCCGTGTCAACAGCAGCCGCCGCATCATCCCAACCAGAAATGCTCATAAAAATCGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3R 9481171 5' + roo 8 2 70.00 AATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACACAT:1 - chr2L 16067157 5' + HMS-Beagle2 6895 2 65.26 ACCTCCACCAGCAAAGTTGAAAAATATTTAAATTTAAATTCTACACTTGAACAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGTCTCC:1 - chr4 1294992 5' + TART-A 13233 1 76.84 TATTTTTCCTTAAAAAAATAAAATTAGGTTAGCTGCCTTTTTAAGTTACC:1 + chr2L 7749185 5' + pogo 2049 1 88.00 AAATGGGGTTTTGGGCAAACAAGCCATTGTGATCTAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGACGT:1 - chr3R 8451760 5' - X-element 4699 1 59.63 GTTCCTGCTTTATTAACTTAATAATCCTTATAAATTTTTCATTACGATTAAAGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCA:1 + chr3L 1478788 5' - flea 381 1 53.64 TCCGATGCACATTCTGGAGATAAATTTATGGCTCATGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr3R 7874832 5' + jockey 4685 1 51.28 CATCCAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCTGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3R 9481224 5' + roo 8722 2 78.50 CAGGCAGATGCACAATAGGCGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTG:1 - chr3L 10322994 5' - I-element 4919 1 73.68 TGAACTGCGCGCCGATTTTTCTTACGAACGATGTGATCTATAAATACGACCTCCCAGCCCAGAAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAA:1 + chrX 9640314 5' + Doc 4582 1 53.68 ATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTAAACATCATTT:1 - chr2L 16067118 5' + HMS-Beagle2 6913 2 72.97 TTGACAATTATATTTTCGGTTGTGAAATCAATGAGAGCAATAGCGTTCATAAGGCCATATTTACCCTTCAATCTACCCATAGTCGTTCTATGTACATAATATCCGCACAT:1 - chrX 20811947 5' + gypsy11 211 2 65.45 ACTATGCCAGTTATTACCATTGAAATCGATTGATAGCACGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 17272032 5' - hopper2 1567 2 60.91 TTACTTAGATACTTACTCAGTCGTGACAATTTAAATGCATCCGCCGTATTGATCACATCCACGTAGGCTTTCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCCCAAGTTTGGGTTTTG:1 - chr3L 9257551 5' - Porto1 4477 1 61.82 AAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGGTGGCATACATTGGTTTGTTACATG:1 - chr3L 3611761 5' + blood 379 1 55.21 AGGTCTTCCATTCTGGCTCTGGTTCGTCCATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGTTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCAT:1 + chr3L 14119186 5' - F-element 4272 1 68.48 TTTATTTACCTTCCTTGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATACTTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 9963485 5' + pogo 4 1 64.94 GAAATAAAGATTTTTGCGCAAACACTCTGTTAACGCTTTCCTAAAAAGATTTATACCCGTTACTCATAGAGTGAAAGGATATACAAGATTCGTTGAAAAGAATGTA:1 - chr4 449823 5' + INE-1 13 1 61.32 CCGACCGCCCGTCTGCCACTTTACTTTCTTGGACTTAGCTAAAACGTTTGGTTC:1 - chr3L 16165540 5' + R2-element 3349 1 48.15 TAAAAATTTTTATTTTTCATTTCATTTTTGAGTGACTCTGGGATTTCTTTAATTTTATTTTTATTACTTAATATAATTACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chr2R 15311395 5' + diver 7 2 74.55 AATTTTTGTTATTTATTCGATTTCGACCATTATTTATGATATATTCAACTAGAATTGAAAGAGGAATGGCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGGCCTT:1 + chr3L 20062723 5' - F-element 4529 1 77.45 CCAGCTCATCCCCACCAATCTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAAC:1 + chr2L 7902845 5' - invader1 3708 2 72.86 ACCCTAAAAACTGATTGGTGTACTTACGTACATTCATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAAT:1 + chrX 6866775 5' - S-element 1671 1 70.19 CGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTAT:1 - chrX 20433380 5' - diver 6060 2 69.09 CGCTGTTGTCCTTTACTATTTGAGGAAAGAAAAGATGAAAAAAAACCGGGAACATGGGAATAGTAAACGATTGGATTAGGGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAA:1 - chr3R 13778977 5' + Bica 257 2 56.36 TTTATTACTAGATTTTTAGCTAATCGTTATTAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAAT:1 - chr3R 18626858 5' + roo 8716 2 72.48 TTATCCTTAAGGATACGTATGTATCTGTAATACCACATGCCCAACAGTTATGGATACAAATCACTTAATATTATTATTATTGTTAT:1 + chrX 4284458 5' - mdg1 35 8 60.47 ATAAATTCATTAATAATGCCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr3R 31633128 5' - opus 7475 2 57.27 TTATGTATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 - chr2R 22661303 5' + Transpac 7 2 67.44 GTAAACAAATACCTTTAAAAAAATTTTAATATATTCCATTCCATATTCAAATAACAAGAGAAATTGCCATAGTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTA:1 + chrX 21388009 5' - INE-1 544 1 55.45 TTATTAGCCAGCTAGATAGCTCACTGACAGGGCGCAGAAAGGCAGCAAAAGACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGG:1 + chr2L 4587592 5' - diver2 108 2 54.29 ATTTCCACACCGATTTTTAAAGTCATCCAGATCAAGAGCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTC:1 + chr2L 23005477 5' + G2 65 1 57.50 GGTTAAAGTCACTCCTCACCATCCAATTATAATGAAACTATGGCGTTGAAACCCCAACGAAGACTAAAGAGAATCACACGCGAAGCGAACGGATCTTTAACAATTATGTT:1 - chr3L 17507201 5' - Cr1a 109 1 71.82 ATAAATAATGGGCCAGTGTGAAGGACTAAAATGATGTTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAA:1 - chr3R 15763721 5' - copia 4740 1 63.00 ACCGCCCACTCACACGCAAAAATGGCTCATTTCCACACACACACACATATACACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACA:1 - chr2L 4026536 5' + accord 7089 2 68.18 CGCCTGCCACTTTTCAACCTCTTTAATTCAAGTCGAATCGAATCGAATCGAATCGTAATGATGGCAATGTGACACACTCACACACACACACATATT:1 - chr3R 27836523 5' + accord 184 2 62.50 CACTTGTTCCTACTCGATGGAGGTTTCTTAAGGTTTTACCAAAAGGCCACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTACTTTTCATTTATT:1 + chr3L 19948846 5' - 3S18 316 2 48.96 ACAAGTTGGTTGCCAAGAACCAGTTAAGCGTTGCAGACCAACTGCTCCGCCCACCGCCCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 + chr2L 9496361 5' - Tirant 400 1 70.00 AGAAAAATTCTAATCTGAGGTAATTATTCCATTAATTTGTATTCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 30369757 5' + roo 8687 2 60.55 AGGATGTAATTTTTGCATGTCTCCGGCATTAAATTCTACACTGCCCACGCTCTCCGTGATTCCCTCGCTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr3R 13732929 5' + hopper 13 1 66.97 AGTGTTTAAAGTAAAAGTTTGATTATGTAACTGCTGGCAGGTGTCGGTCACCTGTGCGCCGGAATTTGCTGCATCCACACACACACACACACA:1 + chr2L 1627385 5' + accord 7026 2 76.34 GCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 + chr3R 21993233 5' - jockey 4933 1 77.27 AACCCTCTCCCCCTCCCACCTTCTCGGCCACCCTAAACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 19457165 5' + jockey 36 1 60.00 GGTCAAACAGGCGAGATGTTTGCATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTC:1 + chr2R 20213330 5' - R2-element 3341 1 81.37 AATGTTCGACACTTTATCTAGCTTGGCTTGCTAGAAATCGTTTTTAAATGTGATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTT:1 + chr3L 3240511 5' - diver 220 1 67.50 GAACTCTCTTCGCTTCTGATGGATTGACATTTGTTTTATCTGCCTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3L 17490656 5' + roo 41 2 60.91 TTGTTAAAAATATATATTTCCCAGTATTAGCTTGTGTTTCCTTTTTCAGCTTTTGCGGTCTTAGGAGAAATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATT:1 - chr3R 12863685 5' - TAHRE 10411 1 63.64 CGCCGACTATCTGTGTCTCTCCCTCGCCCTTCGTTTCGGTCCAGCGCTTTGATCTTTCCTTTCCGTCTTCGTTTTTTCTTTTTTTTTGGTATTT:1 - chr2R 8654754 5' - gypsy7 5000 1 77.66 ATTAGCACTCACGCACTCAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCA:1 - chrX 4263025 5' + Tirant 18 2 64.62 AGGTTCGTCCTTGCTGTTCGCGCCTCACACTTTACACACCCTCACCCACACAGCCGCAAATACACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAA:1 + chr3L 10830297 5' + accord 7263 2 63.64 GTAGATCATTTGGGGATATATGCCAATGGTTGACACTTCGATACTGTTGAGATGGGTAAGGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 - chr2L 14268672 5' - roo 328 2 62.73 CGATCCCGATATAGATCCCACTCAGACTATAACATATAACATAGTTTCCGGAAATCTTGTCGGGTACTTTGAAATTGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAGTATTAAGA:1 + chr3L 20012595 5' + G4 3491 1 73.64 AAAATTTTAAAAAATTTCTTAAATGTATTATTTAATAAAAAATTACTTTTTAAAAAAAATAATTTTAATTTTTTAAAAAAAATAGTAGATAATAAAAAAAAACAAAAAAA:1 + chr3L 18566850 5' + Rt1a 5076 3 34.55 TTTACCTTCTAGTAAGCGGAAAAATGCTTAACATAATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTT:1 + chr2L 15746450 5' - invader2 5046 2 65.00 ACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAAT:1 - chr2R 6801685 5' - McClintock 429 2 75.96 ATTTTTACGAATACTAAGCTGCGTGATAAACTTTAAATGAATGGACGGACAGACGGACAGGGCCAAATCGAATCGGCTATTGATCCTGATCAAGA:1 + chr2R 15003601 5' - INE-1 88 1 73.68 AAAGACCCTAGAATAACAAGATGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAAAAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAG:1 + chrX 14317415 5' + 1360 90 1 92.05 GAGCGTGGGCGCTCTCCTGCTCTCTCGCTCTCTCCCCTACTCTGGATCTGAGCAACATATGTTTTCCGTCTATTTTCAACTACTAATAACGTTAAGGCAATGC:1 + chr3R 24565856 5' - 1360 302 1 72.82 AGTATAATGGCCGAGAGGTTTTGCAGTGGAAGCTAAAGAGAAAAAACCAAAAAAATTTTGTGAAAAATAAATAGCCGAGGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTAT:1 - chr2R 17293983 5' - diver2 4835 2 48.18 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAAAACAAACACAAACACAACAACAAACACACACAC:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 418 1 34.65 AATTTTTTCACTTTTATATTATCGGCTTTTGGTTTGTCTTGTATAAGGAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGAGCGTTTATTGTAATTGT:1 + chr3L 23145550 5' - HMS-Beagle2 7151 2 60.00 GGCCAATAGCTAAAATTATACAGTCACGAGTTCGGGAAGAAATATAATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr3L 12158524 5' + 297 1 2 73.42 AAAAAAATATAAATATAAAAATAAGTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 - chr3R 8811223 5' - 1360 3336 1 79.05 AACAAATAATAAAAAGTTAACAAAATGAAACAAGCGAACCTATACTTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 - chr3L 17719071 5' - 297 6944 2 60.75 CGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 18675621 5' + 412 42 2 63.46 CGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 1291050 5' + 412 7082 2 65.85 GGGGCAGTCTTTGTCTGACGTACCGTACTTTTAATTTCTTGTCGCCCGGTTTAATCCAATTTATCCAGCTTTGAATTCCATGTTGTAGTGTGTTCCATTCTTAGCTCATA:1 + chr3R 5216910 5' - hopper2 1154 1 72.73 GGCTCCACACAGAAGCTGGCAACTGACAGCGAAAAAGAAGTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 16061663 5' - roo 394 1 52.50 ACCCAAAAAGGTTTATAATGATACATTTTTTAGTTCCATAACTATTCTCGTTTTAATATTATTTACATGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGT:1 - chr3R 6263391 5' + diver 19 2 63.64 CCAAAATGACTTAGGTGACAGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGC:1 + chr3R 24496467 5' + invader4 2858 2 71.74 CATTCTCTCTTGTTTTTTATGAAATGACTATATATATGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAACTTGTAATATTGCGGTAAC:1 + chr2L 21820792 5' + invader4 2817 2 70.64 GAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 + chrX 23362223 5' - 297 6961 2 60.00 AAATAAAGAGTTCTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCC:1 + chr3R 26733991 5' + hobo 20 1 56.84 TTACTAAAAAAGTACAACTGTCACATAATGGAAAAAACCCAAAGCAAGCAATAATTAAAATCGTAAAAACCTAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr3R 2275682 5' - opus 492 2 74.77 GCGTTAATTAGCCAGTGGGCCAGTGTGTGTTTGTATTTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2R 23654860 5' - accord 7031 2 59.26 ACACATACACATACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr3L 13228556 5' + P-element 8 2 67.42 GATAAACGCCATAAGCCAGGAGTTGCAATTACAATTGGAATTGCTACGAAAGCCATTAAGCTTTATGCGTGGCTAATAGAAAAAAAAAAAGGAAA:1 + chr3L 2544172 5' + Doc2-element 245 1 62.11 ATATTCGAGGCCCCGGCCCAGTGTATTTATCTTATCTTATCTTATCTTCACTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCT:1 + chrX 854317 5' - Stalker3T 204 1 36.96 AATCATAGATATGCGCGACCTTTAAAATGCTTACTGATGAGATCGGCGCGACCACCATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTG:1 + chr2R 5542831 5' + Ivk 5139 1 71.03 ATCATTTATATATTCGTACTATATAGATTTGATAAAGTTCTCGACAACAGATGCTTATAAACTTTCATACCACACCCACCCATACCGCCCATATTAGGATATAAAGTTAG:1 + chr2R 23163545 5' - transib3 2719 1 66.36 ACACACACACACATGCGTTCCATTTGGCACACAAAAAAAAAAGAGGAAAAAACATGGTCCCAATTTAAGACACTAGAATAAAAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 25591065 5' + 1360 9 2 74.47 GAGAAAGTTGGGCGGGTGAAAGAATGGGCAGAGAAAGCAGAAGGACAGAAAGCATTCAGTCAACGTGAATCTGCAGACATTGATTATTATTCAATAAACTTACAAGTTTA:1 + chr3R 9109268 5' + gypsy7 164 2 69.09 AAAAACTTAAGGCTGACTACACTAAATTCATGAATGAATACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGGAAGGCAAGGAAACCTGTTCTGGCGGG:1 + chr3R 19445114 5' - Gypsy12A_LTR 2227 1 78.43 CGAATATTTTCTAGGAATTTACGCAACTGTCATTTGCAGTGTTGAAAAGTGTTTTTGTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chrX 21399386 5' + pogo 24 1 59.09 GGCGTGTTGTTTTTTCCTTTTTGTTTTTTTGCACAATAAGTGTGTGCAACAGAGAACTGCAAGGGGGGCAATTTTTTACCACTCGACACACACCCCACAA:1 - chr3R 27150021 5' + hobo 30 1 47.00 CGATTCTGTCAATATTGCCCTGCTGTCTGCCGTTCGCATTGTTCATTGGGGTCGCCGAAACAATTGAATCGAAAATTATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGG:1 + chrX 4859776 5' - roo 8653 1 69.09 GAATAATGTCCCGAGAGAAATTAGATTGAATACACATATTAGTTGATTTAAAAGCGGGGGTAATTTTAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGCTTTTC:1 - chr3R 17777684 5' - Burdock 253 2 74.75 TGTTTAAGCTGGAAACTGTAACGAATGACACAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAA:1 - chr3L 23236588 5' + Stalker2 29 2 54.55 TGCAAAATTAAACTGAAGAGCCGAGGCGACGACTCCAACAACTCCAACACTGAACGCATCTGGATGCTCCACGTTTCATAGGATCCATCCTCCAGCTTATTGATCTGATA:1 + chr2L 6604907 5' - 1731 443 1 59.09 TGATATTGAGAAATTCTGTAGAATCTTTCTCCTTAGCCATTAGCTTTTCTTTCTTTTTTGTCTTTTTGGGTAACGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGG:1 - chr3R 21881163 5' + R2-element 499 1 80.00 GAAAGTCACTTGAAACCTTTGTGTTGCCGCTGTGATTTCCGTTGCGTATCCCCAGAATTGGTCCCCAAAACTCCCCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAAT:1 + chr2L 316132 5' + 1360 3165 1 64.49 AGTCATCGCTTTTCAGTCATCGTCTTCTTTCTTATCTGCAAAAAAATTACTCAGCTCTCCATTCGTTCAGTTTGGGTTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTA:1 - chr2L 374152 5' + FB 660 2 74.31 GTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTTA:1 + chr2L 12591736 5' - roo 9014 2 73.64 TGGGAGCAGACGGCTAAACAGCCGCAGCCTCATTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTG:1 + chr3L 4081257 5' - Doc 4489 1 66.10 ACACATTGTCAACGGAATTGCGTATCCAAATGGGCAGCGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr2R 25118091 5' + Transpac 41 2 62.73 AAAGTATGCAACGAATTGCTTGGATCAGATGATTAATTCGTGATTACTCATCCGGCTGGCAACGACAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr2L 3323200 5' - hobo 2934 1 68.09 TTTACGCGTCTCTTTAGTATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 19602888 5' + hobo 42 1 79.07 TGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 - chr2L 16067150 5' + HMS-Beagle2 33 2 54.13 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACATAACATAACATAGCACAACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGGTATAAGTCATAAAATCATGTATCCAAT:1 - chr2L 16217660 5' + Quasimodo 110 2 64.55 GAAGCCTCGGAAGAGCAGGCGCAGCAGGGCGAGGCCTTGGAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTA:1 + chr3L 8511799 5' - 17.6 7122 2 68.75 CCCATAAATACATTAAAATACACTACCAGAATTCGCTTGAAGTGAATATTTTTCTCTTGTGTGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGTGTAACGCCATA:1 + chr3R 8811152 5' + 1360 15 1 63.81 TGGCTTAAATATTTCCAAGTCATTTAATTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACCT:1 + chr3R 13110455 5' - Juan 3947 1 74.29 GTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGCAGTATACACTT:1 - chr3L 13228527 5' + P-element 39 1 34.07 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACCCAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCA:1 + chr3R 21907536 5' - Rt1b 4994 1 37.78 GAAGGTAGGTGGTTTGTTGAATATATGAACCTCACATACATTACATATTTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATTT:1 + chr3L 13853886 5' - Stalker3T 199 2 58.95 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATAAATATTGA:1 + chr3R 21907535 5' + accord 6931 2 69.09 GGATATCTCGCCCGCAGAAAAGGTTGGTGCTGAACATTCGGTTGACATTGTTAAATTTAATAATTCATAATTCATAATCAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr2R 649461 5' + F-element 19 1 54.55 TTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTAAACATCATTTCT:1 - chr2R 330209 5' + HMS-Beagle2 32 2 52.73 TTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 + chr3L 17595336 5' + jockey 4700 1 78.08 AGCGTTCCACGAAATCGCTAACAAACACGATTGTTCGCCGAACCAGTCACGCCCACACTTTTGAACAATTTTTAAATTGTTTTCTCATTTTAT:1 - chr3L 17097083 5' + INE-1 473 1 62.37 ACGCGCACACACAACACTCACTCAACTCACACACACCCACCCACCAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCACACCCAGTCCAGATAACATAC:1 - chrX 16615245 5' + I-element 5124 1 51.06 TACAAACTCAATAAAGAAGAAAAAGAATATTCTTGATCAGGATCAATATCCTCTCCGACTGTCCATATGAACGTCTCGATCTCAGGAACTATAAATGCTAGAAGGTTGAG:1 - chr3L 25750987 5' + INE-1 161 1 76.36 GAAACAAACGCATCGATATATAGTAGACAAACCGAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGC:1 + chr3L 22936354 5' + F-element 4466 1 68.52 CAAACAATTCCCGATTGCTATGTAAATAAATGTAAATAACAAAATCCATAAGGGAAAACAAAAAGCCTTTAATTTTGCATTGAAAGGAAGAAAATACAATTTGTTTTCAT:1 + chr2R 11146896 5' - S2 27 1 71.82 AAAAAGGAAGTAAACAGGATTTGAGCTTTACCGGGAATCTTTTCTGTCTTATTTTCGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chr2L 9171399 5' - opus 7500 2 76.00 GTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 18072773 5' + 412 43 2 75.86 CCGAATCCAGTTGATTGCTAGCCGTGTAGGAATTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAG:1 - chr2R 14594756 5' - F-element 4520 1 62.96 CGGCAGACATTGAAAAGATGTACCGACAAATTCAAATAGATAATAACGCTTACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTTATATATCTCTGTGAAGAAGATAAACAAAAAA:1 + chr3R 19445384 5' + Porto1 153 1 62.73 CGACGTATTGCATAAACACTCTTGATAACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTG:1 + chr2L 10750116 5' + X-element 4563 1 71.28 GTACTTAGGTGGCCAAAAAAAAAAGAAAAATGTGAAAAACCAAATATGTAGAAAGAATATAGAAAGAACAATTTATACGAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAA:1 + chrX 2638186 5' - FB 326 1 80.00 AAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGAAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATACAAAAGATAA:1 - chr2R 18807871 5' - BS 5028 1 81.82 ACACCAGCCAGCTACAGAACCTATCACATTCAATTTTAACTTTGTAAATACATAATTAGATCCTACTAACACAAATATTTATTACAGTTATTGTACATTATATTCATT:1 + chr2L 14370709 5' + Cr1a 4322 1 73.15 AATTACTTTCGTGCATTCATCATGCGATTCTCGCTTCGTCCTTTTTGCTTTTTACAATAATTCACTCTTTCATAGTTTCGTTTTCTTGTTTTTTTTTTGTTTGTATTATT:1 + chr2L 4479230 5' - Rt1a 5075 3 72.73 GTTAGTTAAATATTTTATTAATTTATTTATACAGACGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 - chrX 19339577 5' + Burdock 6184 2 73.64 GCTGCTGATTGCAGATGGTCCAATCCGCGGATTGGGTGTATAAATTAATTAAATATAAGGTGC:1 - chr3L 10911576 5' - springer 7521 1 50.79 TTTGAACCCAGCTAAGCTTACTTCAGTTATTATTTATTACAACACGAAAACATAATGAATGAAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 + chr3L 2987337 5' - blood 7369 2 55.96 ACGAGAGAAACAAAATAAAAAAACACTAAGACCTTAAAATTCATATTGTTAGCAAACGTGGGCATTGTTAGACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGT:1 - chr3R 23422199 5' - hopper 51 1 68.81 GGTGCGTTGGGTTTATGCCACTCAAAGTTGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATCT:1 - chr2L 20842003 5' - G6 2017 1 73.15 TATGGAACCTGGGCACCCCCCGCAAAGTGACCAAATGGTGGTCGAAAGAAGGGAACGATTCTACACGATGTAGGAATCTATAGATTATCGTTT:1 + chrX 9491128 5' - 3S18 440 1 63.44 ATTAAATCAATAACTTATTTTCTGTCTTTTTTGGAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3L 17718997 5' + 297 36 2 65.69 GCACCTGGGCTGCTTACACCAACAGTTACTACTACCGATATTTTAAAAGGTGTCCGAAGAGTTCAAAATATTAAACATAGGATAGGCAACA:1 + chrX 22502257 5' + invader3 4998 1 56.04 CAGTCAAGAGAAAAGGGCTGACACATCCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTCA:1 - 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chr3R 6263366 5' + diver 22 2 52.27 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACACAACACAAACAAACACAACAAAACACAAAAACACA:1 + chr3R 21907534 5' + gypsy3 419 2 29.63 TTAAAGCATATGCAATTGGAATGGCCAGCTGACGTAAACATTACTCATACACGCATTACTCGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACAC:1 + chr2L 13731366 5' + accord 173 2 63.54 CGAATAATTGGCCTAGCTACTGATACTTTCCCATTTTCCCCCCGCAACCCATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGG:1 + chr3L 10973788 5' - R2-element 3174 1 75.00 TGCATCACCGCAAAATGCCCCAATAAGTATGCTAAGCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTATGG:1 + chr3L 17768016 5' + 3S18 5959 2 67.27 AAGCCGAGTCAACTGAAACTGAACTCCTCTGTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3R 5671464 5' + 1360 9 2 63.41 ACATTGATAAGGAAGCAAAAGTATTTGCCTTAAGATGTAGCTTATTGATTTGATTTTAATGTATAGCATTAAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTAT:1 - chr2L 5304947 5' - flea 5007 2 74.55 TGACCTTCTTTTCCAAAATGTCTAAAAACAATAATAATATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 - chrX 13202683 5' - Tirant 8481 2 57.80 AATTGGGCAACGCCAACGCCGGATGTAAAAAAAAGAAAAAAAAAACTTACTAAATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATTAGA:1 - chr3L 17563476 5' + 1360 381 1 66.32 TTTGACTTTCCTTCGATTCGCTCTTTTGTGGGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chrX 711748 5' + 297 47 2 70.00 GTCGTACTATGTTTACTAATTACAGCAACTTTGCTAAGTACTTACTAACTTAACTTAACTAAACCAAACCAAACTAAACAAAATCACAAAGAATCACTCGCGAAGCGAGA:1 - chr2L 9801928 5' - Cr1a 129 1 76.36 GAGTACTCTCATTTTGTGGTCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCACTAACCTGGAAGATATGC:1 - chr3R 5854733 5' + jockey 471 1 72.41 ATAAAACATCCCGAACTGTGCTAATGTTTTTATTTTCTCATATGCGTGTATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCTGTCGTTTGACTAAGATC:1 + chr2L 7088307 5' - rover 313 2 55.45 TTACAACTTAATATACATAAAATAAATTCACGTAGTATTTTTCTTTTATTTTTCGGTCAATTTTTTGATTTTTTTAAATTTTATGCCAATTATTGTTAAAAAAAAACACA:1 + chrX 17560482 5' + Circe 468 1 80.91 AAAAGCCAACACTCTGCCCCATTTTACACCCCTTAACTGGCGCTTCTTTCGCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATTTTATCTTA:1 - chr2R 10959801 5' - Stalker3T 202 1 52.73 CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCCTCTTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTCTCTT:1 - chr3L 22908066 5' - Stalker3T 203 1 37.61 AAATTTAGCTATACATCCAGTACAAAAGACCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 - chr2R 14884066 5' + mdg3 5260 1 69.89 TAAAGCATTTTTCAGGATCATTACATAACTAGGCTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr2L 5724318 5' - 1360 3354 1 70.53 TTCCAGTTTCTGTAAACATCCCATCTCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 18030861 5' + Tirant 8122 2 60.61 CATGCGCAACAATCCACGCCTCCTTCCCCGAGTCTCATTCTCCCACTTTCCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTA:1 - chr3R 6853280 5' + HeT-A 5986 1 55.45 AATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr2L 15763839 5' + blood 42 2 63.64 CGCATTTTAAACGCTTTTAATTTACAGACTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1 - chr3L 5204426 5' + jockey 4722 1 75.24 ATACAAAATACACCGAAAATAATTGTCCAACAACATATTGTTGCACAAAATCAAGTTCCACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCA:1 + chr2L 196422 5' + 297 6506 1 71.88 TATTCTGAAACATTTCGATTTGCTTTTGGCCAAGTTATTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 - chr3L 10702689 5' + hopper 44 1 61.82 AGTGAATAAAAACGATGAAAAGGGATCCGAGCAAAAAACTGCAACAAAAATACCAAAAAACGAATAGATCTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTT:1 + chr2L 12910676 5' - Burdock 6380 2 69.09 ATTAAATGAAGTGCACATGAAACGGGCATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAA:1 - chr3R 30626190 5' - 297 164 2 71.58 TAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064833 5' + Stalker3T 205 1 75.45 TTTAATTTCAGAATCACGTGATATATGTAATGGCCGTGTTCAAATGCGATCTCGGCACACAGACGAACTTGATGAA:1 - chr3R 15040940 5' + R2-element 429 1 61.84 TATTATGACCACTTAACTGGCAATTACTTTTAAACGCGATTACAACAGAAAAGGTTCTTTTGGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGCCCGAAATGAGG:1 - chrX 14722064 5' + Tc1 185 1 55.00 TGACAGCAGGGGAAAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr3R 12040226 5' - HMS-Beagle 7029 2 63.83 TAATTTAAAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3R 12039932 5' + 412 41 2 60.00 ATGCTAATTTTTACCCGAAAGCGGAGGCTAGATTAGAATTTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chr2L 10684514 5' + hopper 149 102 87.69 ATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 - chr2L 22575942 5' - INE-1 546 1 77.66 ACGCAGGGACAATCCACACGATGTTTGCTCTCCTGGTTGGTCCACCCGAACCAACTAGCAA:1 - chr2L 18922600 5' + G5 4585 1 68.85 CTGAGCCAAGCCACGCTATGGCTTCGGGAATTTCTGCCGCGATTTTGAAATGAAAAAAAAAGGAAAAAGAAATGAAAAAA:1 + chr3R 7322726 5' + Doc2-element 240 1 88.75 AAAACATTGAAAATTCCTTAAAAAGTTTACTTAACAGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 7219762 5' + roo 49 2 70.00 GATGCGCACCTCTCCACGGTACATTTTTATACGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chrY 3239776 5' - pogo 2043 1 77.98 CTAAGCGAGATGTGGACTTTAGGTTTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2R 6707772 5' - 1360 3362 1 55.96 TTGTGCGTATTGACGTTGCTGTTTTATGTGCACGCATCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCACTAACGAGTGCA:1 + chr2R 14393283 5' + Doc 491 1 57.78 AGAGCTGCCTTTGTTCCATACGGTGCCCTTTTCGGCTCACAACCATAATATTTTTCTCAAAATCATTGCATCGATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAAT:1 + chr3L 23953833 5' - TLD2_LTR 111 1 76.19 AGCAGCCTCAACTGCGATATATTCCTTCCAGGATAAACAGCAATATATATATTTATTTCTCTTGTATATAGTTATGTGGAAGGCTGATAGGGCC:1 + chr2R 25118000 5' - Transpac 5225 2 74.47 GTTTCTCACACTACTTGGTAAATAAGTGCCCAACAACAAAAAAGAACCGTTACATTGAAAGAGTAAAAATTTCTTGCTTAGAGATGCAACATATGGTACTTATTAT:1 + chr3R 18703985 5' - Tc1 101 1 76.42 ATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGG:1 + chr2L 23299989 5' + invader4 336 1 60.49 AAGGCACACCTGTATTGTTTTTTCTGGCTCAAGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGG:1 + chr3L 10098820 5' + Stalker 7133 4 75.45 CGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 9871063 5' - roo 352 2 77.27 GCATATTCTTTTGGTTATGTGAAAATCACGGCGACAATTTTAATAACAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAATT:1 - chr3R 20425533 5' - Cr1a 422 1 61.18 TGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACCTCATTTCTGG:1 + chr2R 6984325 5' + HMS-Beagle2 6917 2 56.86 CCATTTCTTAAATGCAAATACATCTAGAAATATTTAATAATATTTACATATTCAAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAG:1 - chr3R 6698082 5' + Idefix 93 2 55.45 TTTCAATGACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTAACC:1 - chr3L 3240610 5' + diver 4 2 74.23 TCTTTGAGTGACAGTTGATTAGCGAATTTAAAGTTCCTTTACTCAAAGACCAAAAATTCCCTAGTTATTCCCTAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAA:1 - chr2L 6354770 5' + Tc1 406 1 59.09 GTGCGCCAAGATAATTACCGAAAAATTAAAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTA:1 - chrX 21519394 5' + I-element 155 1 70.24 GGGGCAGTTTACTAGATGCTTTCAGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACC:1 - chr2R 7795659 5' - flea 37 2 75.26 CCTTTGCTTTTTATTCTACTTTACTGTAGGTCTCATTCGTATTAATTATATCTTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr2R 6418932 5' + flea 11 2 70.21 CACAAACACAAACACAAACACAAACACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 419 2 49.07 TGTCAACCAAATATGGAGAGGACTGTTCCGTGAATATATTAAAAAAAAACTTGAGACAAATATCGATGACAGAATTGGAACCAAGAAGATTAAAA:1 - chr2R 9407617 5' + Porto1 4512 1 67.37 TTAAATCTACGGATTGAATTTGAATTGGTTTAAATGTTCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTT:1 - chrX 7051082 5' + Cr1a 209 1 57.33 CGTCGATGTGCCAAGACCAAAAGCCTTAAAACTCCAATAGCCTAAAACCCCGAAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTCCCCTTCTTTTTACCTTATT:1 + chrX 6638267 5' + Q-element 509 2 51.82 TTTAAAACCATCTAACTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2L 21034140 5' + 412 18 2 63.21 GGCAATAATGTACGTATTAAACCTGGAATAAAGCTTACTTGGAAATGCTATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 - chr3L 20897060 5' - Tabor 448 2 57.27 GCCGAAGCATCCCGAATATACATAAGTTAAGCTAAAAAGAGGCAAAAAGTATGCCACAATCCCACAAACTCATTCTGAGAAAAGCTACAAAAAAACAAAACAAAAAAAAA:1 + chr2L 9323022 5' - hopper 146 108 70.00 AAATAAGATGGGTAAACTTACCCTTAAAATCTTTGCCACTCTTCATTTTCCCTCCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr3R 6088628 5' - transib2 2796 1 52.73 TTAAAAAATAAAAGGTACATGAAAGGACGCGTTGTCAAAAATGGCATAGAGAACCAAATTGGCAAGGCACATATTAACCTAGAAATAACAAGAGAGAATGCTATAGCCGA:1 - chr3L 23233445 5' - INE-1 578 1 68.18 CAATTCATTCGGTTTTTTTTTTTGCTAGTGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGGGCAGCC:1 + chr3R 10971028 5' - F-element 470 1 68.92 CTAGATTTTTATATCAGTGCATTATCATTAAAATGCCATTTGATTAGTCACGTTACCGAGGGAATTCCCTAGTCGATTGTCACAAGAATTTGGGTTCTTATTGGAT:1 + chr3R 15868199 5' - Quasimodo 125 2 75.47 TCGGGCGATAAGCCGGCACGTAATGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATT:1 - chrX 4942188 5' + jockey 4851 1 78.10 AAAAAAAATGCCCCTAAAATGTTCCTATTTCGTATTTGTATTAAAATTATTCATGCATGCTCCGAAGTCTGGTCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCAG:1 + chr2L 23071868 5' + Doc 4503 1 66.97 CGTCTTCGGTTTCCTTTATTTCCTACCGCCAAATTTGTGTCGTTTTTGCTTTGCAAAAAGAA:1 + chr2L 22218248 5' + G3 12 1 90.32 ACCCATTAAATTGGCTCCCAACTCCTGTGTAGTTAATTATTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 - chr3L 16301121 5' - mdg1 7398 2 75.45 CAGCGATGCCGACGTCTATTTACAACGCATCGTTTTGTTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCG:1 + chr3L 15968168 5' - P-element 2880 2 68.18 GATTATTTTTTATGCACATAACGCCACACAAAGCAAGCAACATCCGCCGACATCCGCCCATATACATACTTATAAACATACTTATACTTTCTGTTGTGT:1 - chrX 14646653 5' + ZAM 8177 2 73.74 CTCTTGCAATAATGTTGTCGTTGTAGCCTGGAAGCGATAAACAAACCGACAGCAAGAACAACAAGGACCCAGCGAATCGGTGCTTCCGTC:1 + chr3R 29577857 5' + HeT-A 5722 1 80.00 TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGTGTTTGTG:1 - chr3L 11777678 5' - gypsy3 419 2 44.90 TTTAAAACTAAGCTCTATAAATTGGCAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 769967 5' - roo 405 1 72.83 TAGTGAGTCCCAGTCTTTTGCATTTTTCTTCTTCTCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr3L 22984862 5' - Stalker3T 202 1 66.06 GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1 + chr2R 11132217 5' + hopper 147 107 40.21 CAAACTACTCTCTAGATAGAAAGAGAAGCAAAGGGAATGGGGCGACAGGCTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2R 6126929 5' - 1360 3377 1 43.82 GGCTCAATTATTCTAGTATTCTCAATGGCTTGAATTCGTTGCATTTGCTATAAAAAAAAGAATTTAGAGGCGATGTTTTTTTAAAATAAAATTTATTTAATTCT:1 + chr3L 9758307 5' - HB 328 1 77.88 CGAAATAAAATCAAGCATAAATGCAATAATACAATTTATGTGCCGAATTTCATAAGGACCATAATGGACATACAAGCACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATA:1 - chr3L 7507522 5' + Quasimodo 58 2 75.45 ATTTAGATACTTTTGCTGTTATTCAGTGGTTTAAAGCGCACATTTATAAAGTCCTCTGTGCACTTATCGAATTCAAAGTCCTAAAGAAATTGTTGTAATTTATAATTTAT:1 + chrX 5515505 5' - copia 257 1 80.00 CTGCTCAAATTGACCGCTATAAATTCAGACAATTTAAGCAGACACAAAACGTTAAAATAGTTTTACTATGTTCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGACATTTCCATT:1 - chr3L 13802666 5' + GATE 335 1 71.82 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATA:1 + chr3L 22908066 5' - transib1 1899 1 52.78 CAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCTGCAAGAGATCTGCAT:1 - chr3R 11526840 5' + pogo 35 1 65.56 CAAGGATATGGAGCGCCCGAAAGTAGGCAACAAATTGTAGCTGCTTGTGCGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTT:1 + chr3L 10702613 5' - hopper 1409 2 65.88 ATTTGAATGTATGGAATGGGGAAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 - chrX 4216602 5' - I-element 5294 1 78.18 ACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chrX 12271485 5' + pogo 37 1 71.11 GAAATTGTTCAGCTATGGGGATTAGGTATAAAGGGATGTATGCATAACACATATTTGGATTATAGTTAAGATTCTTTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGTCG:1 + chr2L 9194081 5' - 17.6 188 2 78.43 CACGACTACATGCAATTGAATCGTACATGGGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 25125943 5' - 1360 3369 1 54.55 TGGCGTAGATACGCGCAGTAAGTAACTGAAATACACTCTAAAAAAAAAGCAGCCGAAAAAGAACATGCTGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGATCCTTAAAGCTGTG:1 + chrX 2573594 5' - Quasimodo 360 2 66.36 ATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAG:1 - chr3R 4604461 5' + INE-1 148 1 62.37 CTCCTGTGTCGAAGACCTGGCCCAATCTGGGCGAAATTTCACAAGCAAAGTCAAAAAAGTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATACAAAGACAAAAATAACGGAAAAA:1 - chrX 12175234 5' - S-element 283 1 68.18 GCTTAGCTCAGAAAAAGGTGATCACAAAATAAAAGAAAAGAGTGAAGAAGCTCCAGGGAAAGCCGGAAACGAAACTGCGGAAACCAGGAGAAATTAAGAAGACAAGGAGG:1 + chr3R 10244197 5' + TAHRE 328 1 76.36 AATGCCAATGTGTATGATGATGATTAGCCGCCATAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGTGTGTGCGGGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGAT:1 + chr2R 23650471 5' - 1360 3179 1 66.97 ACACGTAGCGTTTATTCCTATTTTATTTTATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 - chrX 8364718 5' - jockey 4943 1 77.23 AACTTAATTTCCAGGTGAGAGTATCGATCGGCACAAGAAGAAACCTAATTGCCCATGGAACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTC:1 + chr2R 13540751 5' - Bica 21 1 63.37 ACTTGGACACTGCGGCGATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCA:1 + chr2R 4203478 5' - opus 496 2 65.31 GACGGTTAAATTTTAAGTAAGCGGCGCACGCAATACAAAATTAAAGAGAGAGAATTAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTAACAGATACCCGCTACTCAGCT:1 + chr2L 21622184 5' - INE-1 545 1 68.18 GAAAATAGTATAGCTGCGCGCACGATATGGATATCAAAAAATCCTGGCACTCTATCGGGTTTATAGATAATTCATCTGTTCATCCTCACACATTGACAATAATTAGTAAC:1 - chr3L 7528929 5' - micropia 5118 2 58.18 ACCGCCGCCAACAAAGCCATTTTCGTTGCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 + chr3L 16291832 5' + jockey 4773 1 57.89 CTTATAATTCGATCTAGGTTCCATGCGTATGTTTATGTTGGGGTTTGGTAGATATAGTTCTATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATAAAATCAGA:1 + chr3R 4514509 5' + Tabor 22 2 60.19 GCCTTGCACGCTCCACTGGCCAGCAGCGTTTCGATTTGGTGAACCCTAAGAGCGCGAGGTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 + chr2R 21361973 5' - Tirant 8495 2 63.64 GGTCTTAGCCATGAGACAGATAAATCAGTTAAGCATCGTCATGTCAAGTTAACAGGCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGT:1 + chr3L 17689030 5' - McClintock 5978 2 58.18 TGAACTTTCCATATACATAGTTCCGCCGCATTATTTGTGTAAAGTTTTGCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chrX 9522223 5' - opus 7481 2 59.00 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 21907536 5' + 412 7089 2 61.68 GCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGGTACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 + chr3L 19951168 5' + Ivk 9 1 69.09 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 204 1 77.27 CAATGGCGCCAAGCAAGTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAAGGAACTTAAAAATGC:1 + chr2L 18694033 5' - pogo 2055 1 76.09 GTCACCGAAAATGAAATAAGTGCATAATGGAAATTTGCGAAAGCCAATTTTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 13160642 5' + pogo 23 1 56.44 AAGTGAGGACACATGAAGGACTATCAAACAGGTCAGACTGATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 - chr3L 10723733 5' - Burdock 6374 2 62.35 TTTTAAAATTTTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTTTTCTAAAAACTCACTTTTTAGAAAATAATGATCATTTCGGAACTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACTG:1 + chr3R 16899422 5' - HB 224 1 60.58 AAATGAAAAGCAAAGCGAAAACTGCTCGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3R 28074134 5' + pogo 39 1 74.47 GTCCTAGATTCCACTACAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGCAGTATAACGAAAAGCTGA:1 - chr3L 3823504 5' + Doc 4466 1 80.41 CTGCACCATATTTGGCTACCAGGGTTCTGGTAGATATTGCAGACAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3R 19445522 5' - roo 9034 1 59.43 TAACCATAATCAAGTATAAACAAATATCACACACAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCACAAGCGATCCCGGTGCCT:1 - chrX 20800140 5' + accord2 7179 1 72.22 AGATACGGAAAATGGGAAACAAAGCTCGTTTAAGCCGAAATAATAAACGAATAACAGATTAATATAGTATGTACATATGTATAAATAAGGTAAAAGAATTCATCATACAA:1 - chr3R 30409061 5' + invader3 5110 1 60.91 AATCGTAGCTATTGGACTCGGATTGGGTAAGAAAACATATATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr3R 28639981 5' - mdg1 7417 2 63.64 ACAAATCGAACAGACCACTAAAGGCTTTTTCGCAAGCGTTTGGCATAAAGTAAACTAATTAAAAAATCTG:1 - chrX 14974660 5' + F-element 95 1 91.43 TATAACTTAGCTATCTACGCCTATTGTACGCTTAAACGGTTTCTGTTTTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTAT:1 - chr3L 18817565 5' - Quasimodo 21 2 55.67 CCCAGTAATTTGATATTCAGTGAGCAACTGCGCCACAACAACAACAGCAGGAACAACAACAACTCAAGAAAGAGCGC:1 + chr3L 3387727 5' + Doc2-element 435 1 81.82 ACCAAAAATTGTACATCAATATTTCCAGAACCAGAAAGCTATTTTAAACAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 14391164 5' + roo 8675 2 67.06 TCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 + chr3R 26734017 5' + hobo 61 1 77.27 CTGACCCACCCACCCACTTAGCCACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACG:1 - chr2L 7144533 5' + gypsy5 106 2 62.26 TGATACTGATATATTCGCTATACTCGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGAC:1 + chr3L 10911519 5' + springer 7174 2 71.11 GGGATCAGAGCCCACAAAAAAAAAACACGATGCCAGGCAGAAGGCAATTGCTGGGCAGAAAAAAAAGGAAAAAGGCAAAAAA:1 - chr2L 9777751 5' + Doc2-element 237 1 64.63 CATAGAGTTGGTCATCCACATTGACTAGCCACAGATTTTCACGCTTTTTTTTTTAACATTTTCCTGGACACCAGGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGGTCTCAGTGT:1 - chr2L 15223285 5' - Tc3 1308 1 74.07 CTACAATTTACCAAAGCAAACTGGTGAGTACTAGGGAATTTTACAAATTGTTTTGAAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGGCT:1 - chr2L 20903017 5' + roo 27 2 55.45 CTACAGCGGTTAGGTCAAACAATTAAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGA:1 - chr2L 14033727 5' + micropia 425 2 68.75 ATCCCATCGCCGTTTTTCTACACCCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCAGCGCAGCCTAGATCACAAG:1 + chr3L 5652608 5' + F-element 4210 1 72.16 TTCCACCCATTGCTACCCAGTTNTAACAACGAGTTCCTTTTTTTTTTTCCA:1 - chrX 18427027 5' - TART-A 60 2 86.27 CCAACGAGTTGTCAATGGCTCAACCAGAGAATAAAATAACGATAAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAA:1 + chr3R 31198662 5' - rover 120 2 49.32 AATAAACGCCAAATTATGTGGTGTTGCACGTGTTTGGTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTG:1 + chr3R 9575393 5' + Tabor 146 2 66.06 TTTGTCATTTTTCTTGTTGATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 - chrX 17330149 5' + opus 144 4 78.21 AACCAATTGAAAAGAAGGAAAAGGCAAAGAAGAAGAAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATG:1 - chr3L 2061273 5' - rover 133 2 66.67 CTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACATAACATAGCAT:1 - chr2L 21034125 5' + 412 7080 2 52.00 AATCTAATTGGAAATCTGTGAACAAAATCGCCTTTCTCGCGGTCTTCAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACCCGAGTCC:1 - chr3R 12252398 5' - hobo 2798 1 56.36 ATAAACTAAAATAAAAAGTATAATCTTTCTGTAGCCTTTAATAAGTTTACAACGATTGTCTACAAATCACAAAAGAATCACTCACGAAGCGAAAGAATCTTTAATAAT:1 + chr3R 5441733 5' - Cr1a 115 1 63.89 AACCCAAAGCAAGCAATAATTAAAATCGTAAAAACCTAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCGGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr3R 2275647 5' - opus 7457 2 69.09 GCAACTACGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2R 5530011 5' - 1360 3360 1 68.52 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAGAAAAAATAAGGAACCCAGCCATACG:1 + chr3R 21907536 5' + Transpac 354 1 28.44 GTCTGTCCAACCATTTAATCCATTTTTCAAACCGCCTGCTGCCTCTGACAACAATAACAAAACTAAAGAACAAATACACAAC:1 - chr3L 16736457 5' + Doc3-element 178 1 80.49 CTATAATCTCCCAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACCTCATACATACATAT:1 + chr3L 15638228 5' + mdg1 227 2 65.38 CAGGGCTACCAAAGCGACCGCCCGTCCCACGAATTTTCCACCCCCTTTTTTTCCTAACCAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAATCCTCTAGACCTTCTTAGCA:1 - chr3L 9306186 5' + I-element 5103 1 61.82 AAAACAATTTTCGTGGCTTAAATGCCTCGATATTTGTTTTGGAGAGGGCGGAGAAGACGTAGACTGCTGATGTGGTAAG:1 - chr2L 20905073 5' - gypsy5 74 2 67.09 GTCCTTGCACACATACATCTGTTTAGAGAAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATA:1 - chrX 3229284 5' + I-element 4982 1 71.84 CTCACGTATTGCCACTAAAAGTGGGTCAGCATGAAACAAGCCAGAAAAAAGTAAAAAAGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGC:1 - chr3R 8945882 5' + invader1 3804 2 72.94 AAATGGGGTTTACTTCCGAGTCTTCTCCGAAACGTCTGCATGAAATTTAATCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCACCGGGCAACGGTGTAT:1 + chr2R 25006495 5' + Tc1-2 454 1 54.55 ATTGGAAAATCGAAACAATCTTCGAATAATTAATGCCTCAAATGCAGAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAG:1 - chr3R 9423720 5' - Transpac 4782 1 60.00 GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTACTCTCCCTGTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTGT:1 - chr3R 21907534 5' + Cr1a 232 1 40.38 ATTTTCTTCTTCTTTCAATATTTTTGTGACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATTGCCCTATACGTTATCGTCCCACATCTGATATTTCACCATCATTTC:1 - chr3R 15309414 5' + HMS-Beagle2 31 2 50.91 AATTTTTATGATATGTTGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTG:1 - chrX 20433417 5' - diver 209 1 67.27 GAAAAAGACCAAACTTATGAATTTCTAATTGATAGCAAGCGTTTATCTTGTTCACAGGTTTTTAACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAA:1 + chr3R 17760674 5' + Porto1 151 1 43.64 TATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 - chr3L 17220743 5' - opus 7451 2 73.15 AGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAAG:1 - chr3R 31458535 5' + jockey 26 1 58.33 GGTGCCTTCAATTCGCATGCAAATTTGGGAAATTGAACCAAATCCGAACGCGCCCACGTGATGCGAAATTCAGAGTGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTA:1 + chr2L 4916676 5' - S-element 1706 1 71.82 CCGGTTCCTAAAACGCCCGGTTCTTCCTCGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGC:1 + chr3L 14300140 5' + invader2 4952 2 73.64 CAAATTGTCGCAGTTTCTAGACCACCACCACGCAGTATGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTG:1 - chr3L 9231237 5' - accord 7007 2 70.45 TATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGNTCTCGGCGCTCGCTGCCGCATA:1 - chr2L 4016904 5' - opus 467 2 60.00 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 - chr3R 21907535 5' + 412 11 2 33.64 ATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 204 1 67.89 GAAGAAAAAAAATTAGAAAATGCTTTACAAACTCCACAATTTGCATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGACTG:1 - chr3L 2070315 5' - INE-1 535 1 65.79 TAACAATGCAGCCAAGAAAAGACTGCAGGTGGGGCAAAACAAAAAAGAATTACAAGCCAAAAAACTCTTAAAAC:1 - chr3R 23620421 5' + I-element 409 1 64.86 TCTATTATTTTTATTACTAATCTATTTAAAATATTTATAATTGACAACACATTGACAACACAATTTGACAAGATCGCATGAACACGAATATATTTGAAGACTTACAG:1 + chr3L 27262668 5' + roo 8682 2 58.88 TTTCAGGATTTATGATGTTTTAGCCCAAAAGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAA:1 - chrX 15500032 5' - pogo 2058 1 71.00 TTTGGTTACTTATTCACGAATTAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 - chr2L 21784892 5' - I-element 5311 1 71.58 GTAGTTAAGTAATTTGTTTCTCTATAGAATAAAACCATCTTCATTTGTCTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr3R 1313790 5' + Doc 21 1 55.56 CAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAAAACAAACACAAACAC:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 418 2 39.09 AAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCACTCAACAACCACCTCCGCTTATGAAGCACG:1 - chr2R 12185398 5' + accord 35 2 56.00 GGATGGACGTTCTGTTCCAGTTGGACGGTGGGCGGTGGGCGTCACTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATAT:1 + chr3L 11040695 5' - Quasimodo 31 2 73.68 CCCAAGCTGTCGTCATCTTTTTGCTCATCCCACTCGGCTTTTCCTCAATTTTTCACATACCACCTCGCCCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATT:1 + chr3R 25573683 5' - invader2 486 1 78.95 TGTCAACGAAAATGAAACGGCGAAATAGGGTAAATACGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGAGA:1 + chr3R 7080446 5' + micropia 5291 1 64.55 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATAGCTTAAGAGGAAGTGTTGAAATTACGTTATAATTTAAATAAGCTT:1 - chr3L 13306248 5' + Copia1_DM 11 1 62.04 ATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 11549819 5' + 297 6620 2 76.36 AGTTTCGCAGTTTCAAGCTTGTGAATTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATACTGACCCTCGGAC:1 + chr2L 2484381 5' + jockey 4713 1 73.56 TGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr2R 11379778 5' - jockey 4951 1 64.55 CAGTTAACACCGACAACGGCGGGCAACACCAAAGTGAACGCGATAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chrX 20521933 5' + R2-element 3579 1 65.00 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATGAGAAGAGACGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 204 1 49.09 GATCATAAACGAGCAAACGATCTTTTGTGCGTAGCTATATGCTTGTTCTTTTTCTTCTTCTTTTCTTTCTTTCTTCTTTT:1 - chr3L 9304085 5' - Osvaldo 1438 1 56.25 ACGTCGTCGCTTGAAGACCGATTTACAGTTAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 23665065 5' - 1360 3368 1 66.25 GTTGCCATGTTTTTTTTTTGTGAGGTAAATATTCAATTGGCAAGGTAACGAAAAAATGGTGCATAACTTTATATCTATTTTTAGAAAGTATCGGT:1 + chrX 18168929 5' - Transib5 126 1 64.21 CGTGGTAACTTCAGACAAAGAAACTTATAGTCTCATAGTTTCAAAATGGAAAAAAAGACACAACAACATCATTACCTGAATGATAAATGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGT:1 - chr2R 24084873 5' + mdg1 480 1 69.09 GGCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAAAGCA:1 - chr2L 6243735 5' + 412 26 2 51.55 CCAACGAGTTCAAGAATCTTCAAAATTCAAGTAGGATATGAATCATCAGCATGTGTAAATTCCTGATCTATTCCTGATTCATA:1 - chr3R 30585859 5' - mdg1 7356 2 59.04 TAAATAATATCACACTAAATATAGACCTTAAGAGAGGACATCAATACTTAATGCAATTAAATTAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAATCCACC:1 + chr2L 10338659 5' + I-element 4956 1 66.36 ATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 204 1 77.14 AAGATAATCAACAAACTTCACTTAATTGGTACCAATATCGTAGAACTTTCAATTGAAATCGTACAGCGAGCCCAGTCCACGATTCTGCGAACTATAACTGGGGCACCATG:1 - chr3R 24812757 5' + Doc2-element 4445 1 54.55 TTTGACGCCGTATCTTAATTTATCTATACCATACTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCC:1 + chr3L 20578189 5' + 297 6781 2 57.50 TTTTTTTACCGTATTTTGCTGGTTCTCGTCTCTATATCCAATATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 5638518 5' + jockey 36 1 56.25 AACTTGTTGCCAGATATTAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGCATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 + chr3R 3915041 5' - I-element 5304 1 76.04 TACAGACTAAGGGTTAAGATTTTCCAACGCATACACACTCACGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAAT:1 - chr2R 1892069 5' + I-element 5157 1 61.47 ATATACATAGTTCCGCCGCATTATTTGTGTAAAGTTTTGCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTAGGCACTCGC:1 - chrX 9522213 5' - opus 7479 2 53.26 TACAATGTTAAAGCCCTTTTGTTTAGGTTTTAAATTTGAAAGCTGGAATTGTT:1 - chr2L 13363775 5' + FB 39 1 49.06 TAAAGTTTCAAATTAGTTTTGTGGCTGGGGAATAAAAATTATTTTTTTTT:1 + chr3L 15769380 5' + Idefix 7362 2 76.00 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACATAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAAAACACACACAAACACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 421 2 49.09 GTGCAGTTGAAAGAAAAACGCTTAAGCAGACAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGT:1 - chr3R 10516845 5' + F-element 176 1 72.12 GTGCAGGTGCCGCAACCCCCTCCCCGCCAACACACACACACACACATATACACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCT:1 - chr3R 22877186 5' + accord 212 2 62.82 CTGGCCTGCTGGCACTGCATGTTTTCCATGCATAATGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCT:1 + chr3L 13614344 5' - G2 212 1 61.96 TGAAATCCAGTAACCATTAATATAAAATAAAAAATTAGATTTGAATATGTAACACATGCGAGTAAACAGAACTGTGAAAATGAATATAATGTAAAATAACTATAT:1 - chr4 236258 5' - Cr1a 4317 1 75.24 GGTGTTAAAGTGTTAATAAAACCAAAAGGGATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr2R 10241514 5' - I-element 5333 1 61.32 CCATTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chrX 9845542 5' + F-element 26 1 57.14 ACAAGAGAGTGAGGGGTTCTTTTTTCGATTCCAATTGGGGGGAGTTGCTCGATATATGAACGTTGGCTGTTATTTATTATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAAA:1 - chrX 5968698 5' + G2 3062 1 42.73 GAGCAGTCGACGGACCACAAATGTTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1 - chr3L 15968271 5' + P-element 16 1 66.36 AGGACAGTCACCCCTATTGCGACTCGTCGTCTTTCGAACCCCGATCTCCAGATAATGAAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTTCACATA:1 + chr3L 5354304 5' + HeT-A 5981 1 54.00 AAGAAATGTTTTGAATCGTAACAATGACATATTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAG:1 + chr2R 14883993 5' - 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chr3L 14158352 5' - G5 451 1 78.21 ACTGCCCAAAATGTAAGTGGGGCTGTGGAGATGTATATAGTTGTGATGTAAAATTGTGTGCTAATAATATTAATAAAAACGTGTAAAATATTTATATATATTTTTAAAAT:1 - chr2R 15256233 5' + copia 4664 1 66.36 CGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTTTTTTTATTAATTTGTTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAA:1 + chr2L 13292970 5' - X-element 4665 1 64.55 TGTGCCTTGTGGCTTTCTTCCTGTTCCGCATGGACGTGCGTTGTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 23822154 5' - Doc2-element 251 1 64.06 CCGAAACATTACATATTGTTGTCCTTTTTTTTTGACTTTTCCTGGTTGCGGTCTTCTTTCCTCTTTTCGTCTTTATGGATTTTCTTTTCCTTTTGGTTATGGCGG:1 - chr3L 8845643 5' - TAHRE 272 1 80.00 CATGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAA:1 + chrX 20433334 5' + diver 5923 2 62.37 AACTAAAACTAGGTTCAATTATAGAATAATAATTTAAAGGTCACAAGTATATCTTTACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCG:1 - chr3R 6763672 5' + F-element 4467 1 51.82 ACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 418 2 43.01 GATAGCTCCCCCCGCCCCCTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 22107979 5' + hopper 136 1 81.82 CGCTGGCTGTTTGTTTTGGTCGTTAAATCAATGATTGAATATTTCTGGATGTGCATGGTAAATGCAGCTGAGGTTTATTCTTAAATCTATTT:1 + chr3L 9746237 5' - rooA 7424 2 67.39 ACAGGACATGGGATATCGGGACATCAGGAGCATAGGACACCGGACGGGGCATGGTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACATGGGGAG:1 + chr2R 16394944 5' - G2 86 1 66.67 AATACAATAATTTTGGGGGAAAATGTAAATTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chr2L 7841343 5' - jockey 4947 1 73.64 GATTTGCGAAAGGTAGCTTCGAATAATTCCTTAGTCCACCTCACTAGTGTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2L 14708939 5' + opus 7022 2 53.68 AAAAATAAAATGGAAGTGTAACTGAAACGACTCGAAACGAGACACTAAGTCTAGTACCGTACCGGAACGACACACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGC:1 + chr2R 15410254 5' + Doc3-element 4598 1 68.00 GATCCACAATCTTAATGCTGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTAAGGGATTGGC:1 - chr3R 7153877 5' - G2 2902 1 71.43 GGAAAAAATAGAATAGAATTTCAATTTTAGAAACGTGTTTTGGGCCTCCATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTG:1 + chr3R 6937610 5' + F-element 145 1 52.50 ACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chrX 22769346 5' + 412 40 2 61.11 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACACACACACACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 419 2 48.15 CACCTTTGGCCTCCAAACACATGGGTGGAATAACCCTTTTAGGGTGTGAGTACTGCCCATGGTAACATATACATACATATGAACTGTATATA:1 - 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Quasimodo 318 2 63.27 CTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr2R 11379724 5' + jockey 4688 1 56.98 ACCGCTAAACTAAGAGACGAATACGATTTCAAAGAAACCATTTTGCTGGCCCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 + chr2R 21945048 5' + I-element 5013 1 53.64 AACCAGCCATTCATAAACACTGGCCCCATCCATTTTGGCCTGCTCATCTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAA:1 + chr3R 22500804 5' - invader3 254 2 53.68 GAATGTAAAACTAGAAGAGAAGGAAAAAGCAGCGGAGCTGAGACGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCC:1 + chr2R 19694517 5' - blood 7161 2 61.25 AAGAAGTTTCCATAAATAAGCTGTTTAAAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr2R 9963581 5' - pogo 2095 1 73.68 AATAAAAATATTTCATTAAATGAGAAAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTGGAATTACATAATATAATAGCAATATACCAGGCGATAATAAACCCAATAT:1 + chr3R 18264325 5' + Porto1 4248 1 77.27 CTTAATGTGAATGAACCCAAGCGCAAAATCATACGCTCCGCTCATATATCTTAGGCCTTCATCGTTTTTCTAAATTCCATTTTGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTT:1 + chr2L 16493756 5' - 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gypsy7 5009 1 60.00 TAGCTTTGGCGCTAAAGAAATAAACCATAAGATTGCGATTGAAAATTTTCCAACGCACACGCAGACACCACAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAA:1 - chr2R 19696651 5' + Doc 4581 1 69.09 CAAAGGAGATGGATGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3L 16682053 5' + FB 1 1 60.71 CTTGAATATTTCCAAGCACTTAAACAATCCTTTCCTGCACGAAATGCAAAACTAATCAGCTTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTG:1 - chr2L 3425802 5' - R1A1-element 5247 1 60.00 TTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTTCGTCCACCCGATAAAC:1 - chr3R 13225561 5' - hobo 2913 1 50.00 CTCGCGAAATTTTCACTTTGAATTTCGAATGCTGCCAGTAGCGATAGTAAAAACAGGCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chrX 1503320 5' + roo 8674 2 66.67 GCTCAAAATAATGTCAAATCGATTAAATAAATATGTCGGGAAATTAAAATGAAATTGTCACGCACACACACACACACACACATATACACCC:1 - chr2R 15569075 5' + accord 7035 2 76.92 ATGAGACATATTTCTGGCATCATTCTAGTTATTTGTTTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3R 26734057 5' - hobo 2912 1 56.67 TTTGATCATGATCCACCATTTATGAAGCTATTCGAAAATACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAATTAAA:1 + chr3L 9822240 5' - pogo 2060 1 64.81 TATTTCCACTTTCCTATTCTTGCTTTTGTTGTTTCCGCTCTCCCCTTGTTACTGTTTTTCTGATTTTTTTACTATGTTTTGCTATTAAAATGGAGCATTAAAAATTTGTA:1 + chr3R 28938490 5' - G4 3511 1 49.09 AAAAAAATTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTATTAAAAAAGTATTTTATAATTAATCTTAAATTAACAGAGTCAGCAGCTATCCATTACTCCCTACTACATAC:1 + chr2L 21030413 5' - G4 3753 1 46.79 ATATGCAGATGAATAAAAGTATGATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2L 21734986 5' + Doc 16 1 65.98 GATTTATTTATTGAATTAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGGGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTT:1 + chr3R 27842159 5' - HeT-A 6022 1 58.18 CAAAAAACAGATTTCTCAAACCAAAAAAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAA:1 + chrX 7676154 5' + R2-element 3404 1 73.00 TGCGAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAACC:1 - chrX 20330601 5' - P-element 2864 1 52.69 CTTGGCAGTGCCGTTAAAAAAGGTTTTCAAAATCTAACAACATGACCTTTTGACTCTTCATCACTTTTAATTTCATCTAAATTTGTGGAAAAATGCAAATTCTTAATAAC:1 + chr2R 21091073 5' - G4 389 1 70.91 TGTTTGTACAACAGGATATCTCTTTAGCTGGCCATTGGGATTTTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 - chr2L 19678205 5' + flea 4762 1 72.28 TGCTAACTCAATTTGATGAACGAAAAAGAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATG:1 + chr3L 11547967 5' + invader2 4822 1 79.09 AAATAAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr2L 2484419 5' - jockey 4966 1 49.49 TAAATTAATAATTTAACTTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGAGAGAGCGAGATATGTACTTATGTATTATGGATTTGGTCGGCGTGGGAATGCTGACCATGCACTTA:1 - chrY 321780 5' - gypsy11 4147 2 80.00 TTGGCGGGCCAGATTAGCACTCACGCACTCAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 4263037 5' + Tirant 8139 2 63.74 ATTACGGGGAAGCCTGAGTGAAACAAGAACATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr2R 7981110 5' + 1360 15 1 70.00 ATTTTTCTTTTCGGAGCGTCTCTGCACTTCACTCACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr2R 11632326 5' + Tirant 16 2 53.75 TGTGGGCCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1 + chr3L 25455115 5' + HMS-Beagle2 6922 2 60.00 CTAAAACAAAGGGAAAAGTGCAAGTAATGAGCGGCCAGTAAGGAGATACCCTAGCGTTATTTTGTTTATGTGTATGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTA:1 + chrX 3448068 5' - rover 6954 2 70.91 TTTTGGCCTTTTGACGGTTGGCCTGTGCCTGGCATACCGAATGAGCTTTAAAGAGGTATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 17405659 5' - roo 9064 1 72.90 TTTTTTCTTTGTTATACTATTTTCTTTTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:1 - chr3R 4553375 5' + Juan 61 1 74.55 AACTGTATTGGGCAGAGGCAATTACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 - chr3L 13556802 5' - hobo 2912 1 69.74 CGGATGTGTGGCGCCAGGACTGCCTAGTTTGTTCGAGTTCGGGTCAATAGACTGTTGCAACATGAGGGGACAACGAACTAGCGG:1 - chrX 19299294 5' - gypsy5 133 2 64.29 GCTTAATAAAAAATGAATAACTTTTTGGAATACATTTTGTCAAGAAAGTGTTTACACATAACATTATAGACGGGATACAGAAAACATTTCTACTAATTCTGAAATAGATT:1 - chr2R 21497814 5' - S-element 468 1 74.55 GACAGCGCACCTTTTCTTCGCGTGCGATTTTCAGGAAATTGCGCTGCTCAATTACAGCGAATCCTTGCGCTGGGTATTTTGAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATA:1 - chr2L 13852610 5' - micropia 262 2 79.09 ATATGTACATGTGTGATACAACTTCCGGTCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGATTTTCACAAGTATGCAAATTTGCT:1 + chr2R 14661111 5' - hopper2 1564 1 65.66 TAATTCGTTCAGATTTTACATAACGACAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCT:1 + chrY 661098 5' + Ivk 338 1 76.36 TCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 - chr2R 12416932 5' + pogo 17 1 54.76 TATACTAAAATTATACAAAATAAGCAAATTGCAATGACATGGATTAAATGGCTGTTGGAATATACTATTCAAACTACAACAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr3L 18700331 5' + copia 37 2 56.36 TGTGATGATTGTGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chr2L 14708870 5' - opus 471 2 63.64 AGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 - chr2R 23354346 5' - Tabor 7277 2 63.64 ACTCCAATTGGAAAATGTGTAAAGTTGGTGTACTTAGGATTTTCAAATGTTGATTTTTTGAATTTCCTTATATGTTTTTTTCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATT:1 - chr2L 6339769 5' - HB 386 1 57.27 TGGCCAATTATGAAGCACAATAGATCTGCGTACTTAAAGCTGAACACGGGAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTT:1 + chr3R 17015772 5' + invader2 5070 2 64.58 ATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACAGTACCTATAAGTA:1 + chr2L 15763836 5' + blood 7033 2 54.84 ATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 + chr2L 16529222 5' + blood 56 2 75.45 GCAAACTTTTTTGGCAAATTAGTCTGGGACCCAGACCAGAATCAGGATCTCCCCCAAGTTTTAAGGCTTCCATTCCATTCCATTCTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCG:1 - chrX 7645051 5' + INE-1 93 1 76.36 GATAGTTTTGCCATAAAACTGAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTTG:1 - chr3L 20555997 5' + roo 412 1 79.61 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGATACTAGATAAGAAAAAGATTGTTATATGTTCCTCGAGAATGGATA:1 + chr3R 21907536 5' + Idefix 132 2 42.59 TTTTGGCCTACACATGTATCCAAAGTATAGATGTCCACGTACGCCAGGCTATACAAATGCACATATAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCAAATA:1 + chrX 4712432 5' + Quasimodo 12 2 70.91 GAGCCATTGGCCTCGGGTATACTGGCCGGATCAGTACCCCTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTATAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr3R 6132069 5' + I-element 44 1 65.62 TTCGATTTCATTATTACATATTTGGCGATTGTTTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 - chrX 17456096 5' + jockey 4692 1 52.70 ACATATCTACATGGGTAGTTTGGAAAGAGAAAGCAGGAGAAAGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chrX 16994101 5' + roo 41 2 61.82 CTTCTTTTTAAGTATGTATAGTAAAGAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr2L 18749853 5' - pogo 2049 1 78.50 TCCCCCCCCAAAAAAAAGGGGGAAAGGAAAAAGAAAAAAAAACAGAACAAA:1 + chrX 18968763 5' + gypsy7 5013 1 56.86 AATAAGGGGAAGCGCAGAGGCGGGGGGGGTGGGAAAAATTTTTATTTTTTTTTAATTTTT:1 - chr3L 4800697 5' - Doc 4697 1 66.67 CTGCGATCCTTATCCTTGACCTTGCCGGCCACTGGTTTGGGCAGTTCACATAAGCACGGGATTTCAAAAACCAAATAGAAAAAAATCACAAGAGGGCAG:1 - chr3L 8415414 5' - mariner2 581 1 61.62 GCTTTTTGTCATTGTTTTTAGAAAAGTTTACAAGACTAATAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2R 15855675 5' + opus 21 2 57.30 TTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTT:1 - chr3L 20187393 5' - FB 495 1 55.67 TCCCTCGTCTGCCAGACAGCCCCAAAAAGTATGCAGCACGCATTTTAAACGCTTTTAATTTACAGACTAGTACACACCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chr3L 5204464 5' + jockey 4678 1 68.69 CGAAAAGTATGTTACAATTATTTTCATCAAAAAACCAGCCAGCGAATTCCCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2R 14650659 5' + jockey 20 1 59.77 TACATAAAGATATAGCCGCTAGTGTGTGTGCTTGCCGTTGCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATCATATCCATATCTAATCTTAGCGATGGTAA:1 - chr3L 13924770 5' + Ivk 436 1 63.73 TATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chr3R 21993227 5' - jockey 4959 1 65.56 AGAAATGCACTTAGTTAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGCTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACC:1 - chr3L 5361089 5' - Stalker4 304 4 78.57 TAAGAAAGGCATACAAAATGCTTTTCCTTTGGAATTTTAGGGATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 - chr2R 20924281 5' + mdg1 7079 2 61.11 GGCTGCGGAGGAAGTGGAAGTCACGAAAAGTGTTTGATGGGAAAAGGAAATGTCTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTAC:1 + chr2L 15740537 5' - Idefix 184 1 69.51 GAGGCGAATCACCGGCGCAGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGCGGTATGCTCTTACA:1 - chr2R 12586016 5' - copia 4966 2 77.23 ACTGAGCTAATTGACAGTTGCGAATGTATTTAATTATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAA:1 + chr2L 16529187 5' + blood 7016 2 72.34 ACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 6537925 5' - roo 9014 2 74.31 AACATAAGTGACCAATTTTATGTGTCATTAAAATTGGACGCGCTACCTTCGCCTACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTT:1 - chrX 17343074 5' + I-element 5138 1 51.82 TCAGCTAGTGGAAATAAAAACTCAAAATTTGGGCATTTCGATAGAAATAAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGC:1 - chr2R 5245736 5' - Ivk 57 1 55.05 AATTAAATTAACACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 9432825 5' + roo 36 2 63.64 TCCTTCGATAAAGTTTACTCGCCCCTAGAAATTATACGCGTTTTATACATTTTGGTTCGTCAAAACAATTTGTAGATACAATGAGATGGATTTAGATTTTATTACTACTT:1 - chr2R 25215536 5' + Quasimodo 7267 2 62.73 AAGCATGTGCAAATATAAATCAAAATCAACGAAAAAGAAGTCAAGTCCTTTGTGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACG:1 + chr3L 6624194 5' - Quasimodo 449 2 56.36 TGCTTTTTTCCCGTTCTGCGTTCGAATGCAACCTTAATTCACGCCCATCGTTGCTTGTGAGCACTTTCTATGTTTTCAGAGCTAACTGTAAGCGTGCCTTTTGT:1 - chr3L 9425656 5' + looper1 54 1 58.65 CATAATTTCATGTGCTGCAGACTCATAATTCACATCTAATAGCCATTCATTTAAATTAGTTCGCTTTCGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTACAGACTACGGGGAG:1 - chr3L 16339239 5' - Doc2-element 4307 1 65.14 TTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAG:1 + chr3R 10672728 5' + invader4 332 1 51.61 ACGGGCCGATTGGAGCAGCCTCGAACATAAATGCTCGATGTCAACAACAATGCACTATGGGGCAATTGGGCTGGTTTTTTTAACAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 + chr2L 14917892 5' - hopper 1378 1 52.73 ATGAATTCCGCGAATGGCAAACCAACATGAACAACCATAAAGAAATGCAAAGTCAGCCAAAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGTTTACTTGTGTGAGTAAAA:1 - chrX 8979495 5' - 1360 3252 1 63.55 ATGCCTGGCCACTCGAGCCGCAACAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 9435872 5' + roo 24 2 72.97 GTCCTTACTGTACTCAGCCGTGTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATA:1 + chr3R 902568 5' + R1A1-element 10 1 70.24 TTGATATTTAATGACCAGGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTTCACCTCGTCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCACTC:1 - chr3L 19957108 5' - G2 290 1 75.61 GAATTAGAATGGGTGCGGTAATGGGTATACTCACGGCAAAGAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 24867462 5' - roo 9060 1 69.09 ATAAATTGGCAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2L 769983 5' - roo 9034 1 62.73 AACCATCTAACTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2L 21034135 5' + 412 7080 2 56.36 CAGCAAAGGGGCTCAACTAACAAAAAAGAACAGGCAAACAGAAAGAATGCGGCATTGCTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATTG:1 + chrX 1975387 5' + R2-element 3326 1 62.63 AATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCC:1 + chr3R 2527719 5' - INE-1 572 1 48.18 AGTCAAATATATATTAGATACATGCTGACACCATCATAACCCTAGAACAAATATAAAGGTGGGGGGAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATA:1 + chr2R 1986905 5' + Idefix 14 2 52.94 ATATGAACAAATTTAGCTGTGCATACACACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACAAGCAGATATAG:1 - chrX 18750707 5' + BS 4835 1 67.42 TTTAGGTTCTCCAATGTTTTAGGTGGTGGTTTCATTCATTCGGAACAATAATTTTGAAGCTCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTAAGTGGTTTTTGATCTG:1 + chr3L 11740907 5' - Q-element 228 2 53.64 CTTCAGGCACGAAAGACATACCCTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chr4 934561 5' - 1360 3353 1 74.12 AGTATGTTTATTAGGGTCTTAAAATCTAGTTTATACGTACTCGTGTTGCATAAGCCCATTCTCCAAAAATGCATTCACACTAGCTGAGTAACTGGTATTTGATAGTCGGG:1 - chr3R 22383377 5' + INE-1 552 1 71.82 GAGGCTATGGAAATTTGTTTAACGTAAAAAAAAAATCCCCAAAACTTATTCATATGGATTTTCTTTAAATTTACATTAAGTGCATTTAAATTAATTTATGAAAAAAATGC:1 - chr2L 12620441 5' - INE-1 398 1 57.27 TACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACATTACATTACATTACAATAGACAACACATATAAAAACCGCCACAAATACATGTACAA:1 - chrX 12946234 5' + G6 1930 1 38.18 TTTTGCGAAGTCCTAATACCTTGGGTAAAAGGGTCGTAAGGCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - 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hobo 2925 1 61.11 AATTTATTTTCCTCAGAGTGCAGAACTATTTCTTTCTCTTATGGTTAACGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGACTTACGGTAGGGAAATT:1 - chr2L 21369539 5' - Rt1b 5129 1 50.00 GCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGACA:1 + chr2R 11379736 5' + jockey 4721 1 66.36 AAATAAAGAGAGAATGGGGACGAGTAGATAGGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 + chr3L 10722972 5' + copia 4920 2 70.64 ACATTTGTTTAGTTACACATATATTGCGGCTGGGAAAATTCTGCCTGTTTTTTAACCGTAAAAATTAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 335096 5' + Doc 4699 2 67.47 GGTGTTGTGAGATAAATGTATCTTTAAGTTGAAATACTGCCACTACTGTGGATTACTTAGTTACATTATTTAATCTTCTTGATTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTC:1 + chr3L 11181818 5' - Porto1 4491 1 66.36 AATGCTCGATGTCAACAACAATGCACTATGGGGCAATTGGGCTGGTTTTTTTAACAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 + chr2L 14917921 5' - hopper2 1542 1 74.55 GACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAACCACAAGTGCCCACA:1 - 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chr2R 12636296 5' + I-element 23 1 59.09 GTTGCAATTTTGAACAGGCAGAGCATTGAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCCACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTT:1 - chrX 16309320 5' + S-element 1702 1 67.39 AAAGCACGTACGCACACGCGAATAAGCAAAGTATCTGTGTAGCCATATTTTTAATGTTGTTGTTAAGAATACCAGCAGAAGCGCACAAATAAAGACTGTTCCAATCATAG:1 + chr3R 31605509 5' - Cr1a 4026 1 79.09 TGTTTGGCCTAACAACAAACCATTTCTTTATTTCAAGTTCTAATTCAAACAAAGATACTAGAATATTTTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAAC:1 + chrX 20145422 5' + Tc3 317 1 83.51 GTGTTAATATATTATTAATTAACTATTATTTAAATTGGACTTCAATTAAAACTTCTATTGGAACGGTCCATTTAATAGACTCACAACTATTTATTGCAACCATTTCTTTG:1 - chr3L 20750154 5' + 17.6 7413 2 58.18 GAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTACACACTC:1 - chr3R 13225552 5' - hobo 2909 1 52.87 AGCACTCCGCCACTTGACCCCAAGCCCATAAATGCATCCCCACCCTCAAGACTGACCGGGACTTAAAATAAATCCTACTTAATTAAAATATTCTAAATATTACTGCCTAA:1 - chr2L 3536061 5' + jockey2 3239 1 62.73 CACTCCCTTTTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGC:1 - chr3R 23730038 5' + Burdock 6187 2 73.64 ATGTATAGCCATGTATATTACACAACGAACAAAACGACTCACACTGGATCATCTTTCCCGCGACCAGACTACGTTCGGCAG:1 - chr2R 11642373 5' - invader1 109 2 74.07 TAATCTTGAAAAAAAAAGAAAAAAATACGAACACCCAAAAACATAAAGCGGCGAACTAATGACGGCTAATAGGAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCC:1 + chr3R 14783539 5' + mdg1 7207 2 73.74 ATAAATTCATTAATAATGCCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGAACTTGAATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3R 31633128 5' - opus 7477 2 58.33 GATGGACTTGTGGTGGACGTTGTCGTAGAGTCCGTTGTGGAGGATGTCAATATTTCTGTTGCTCGCATTGCACCATAACTGTG:1 + chr2R 20782543 5' - F-element 4278 1 56.63 TCCCATTTTTCGGTTGCAATACTATTTGAGACATCGGCCAACCGGCCAGGGACCAGTGACTGCTGCGAGGGACCCCC:1 + chr2L 3975508 5' + gypsy3 352 2 62.34 CTACCGAGACAATTGTGTAAATGTTGTTGTCGATGCGATTGCGGTTGTGAGAGAGGCAACCATGCTGGTAG:1 - chr4 216320 5' - Doc4-element 275 1 73.24 CGCATTATTCCCTTTTATATATATAGCACCTAGAGCTAATGATAAGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTGA:1 + chr2L 9331630 5' + FB 101 1 59.09 TGCAACTTTACAGCTTTAAGCCAACTTGCCCAGCCCAGACCGCGCATGGAAGCAGATAGTGAGACGGAGCATTGAAGGAAGGAGTTCGGGCGCGAGAGCGCGC:1 - 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Gypsy12A_LTR 2254 1 51.38 GGGGAGCCAAGCTGAGCTACAAGCTGCAGGGACCAGCAACACACAAAAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAAAGTTGGATCCAAGA:1 - chr2L 8619665 5' + Porto1 4503 1 66.36 AAAAGGATCATTGAATATTATCTAAACATTTATATAAATCTCACCAAAAGCCAAAATACACTTGCCACCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTC:1 - chr3L 6240583 5' - 1360 236 1 72.55 TGTAAGTTCGCGCCTAGTGAATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCCTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGAAAAAC:1 + chr3R 21993195 5' - jockey 4983 1 67.35 GATACCACCGGGAATACACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTTATTTGTACGGCCCACGCACTGTAGTTTTCATCATAAAGTTTTTCTATTT:1 - chr2L 13601703 5' - Dm88 336 1 79.82 GATGGGACGAACACATAAACTCCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 - chr2L 19129401 5' + FB 33 1 52.29 CAGCTAGTTTCCTTTCCTTTTCATTTTTCTCTTTTACCTTCAGGACCAGGTGTTCTTCTAACCACTTTGAATAAACTTGTGAGGAGTTTTAAAACTCCCCATAAAT:1 + chrX 2550483 5' + gypsy8 4657 2 66.04 TCCATAAAAGTATTTTTTTTTCTATATACATGTACTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACAC:1 - 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chr2R 16260758 5' + diver 53 2 53.64 TTGGTACTCTATATATATATTTAAAATGTTTACCCAACGACGAAAGCTGAGTTAGTTACATTTGTAAATCGCATGCTAAAATATTTTTTCACAAATATGCAAAT:1 + chrX 5570796 5' - hopper2 1569 1 67.31 TGGGCAAATATAAACAAAGTGATGGATTGGCCTCCTCTCTTTGGGGTTCTTCACCCTCTCTTCGCTTCGTTGTTTTTTTTTTCGTTTTTT:1 + chr3R 29790990 5' - gypsy7 5010 2 80.00 TTGGTCAAAATAATCTTTGCACTGAAATGTCATTTTAGTGAGCATAATTATGAAACATGGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chrX 22861736 5' - 1360 3367 1 60.55 TATCATTTTCGTTAGCAGCGCCTACGCAACAACGCGTATTTGTCACCGACAACCCCAAACGCACACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTC:1 + chr2R 16089863 5' + F-element 324 1 74.76 AGTATATATGTAACAGGCAAGTAATAACAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGGGGGGGTACGGGGACAGAATAAATTCTGTTC:1 + chr2R 25257603 5' - TAHRE 10405 1 54.35 ACCAGGACTTCTACACTCGACAAAAAAATTTAACGTTCCGTTGTTGAAAGAAGCTTAAAAAAATATTTATTATATCATTTTTTCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 2397180 5' - roo 408 1 28.18 CTGACACAAGTGCTGAACATCTCCGCGGACAACCTGACCAGTCTTCTCCAGGGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGT:1 - chr3R 13332143 5' - 1360 17 1 55.05 ATTTTGTTGTCTTAGATGTTTTTTAAAATTCTAAGAGGCTCTCTTTTGATTCATTATTATACCAGTTACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTT:1 + chr2R 3502526 5' + INE-1 32 1 60.00 ATACACTAATTGCTACTTCTACTAACCCAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3L 24759782 5' + 1360 54 1 75.00 CACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr3R 17673836 5' + FB 31 1 53.64 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 2 40.91 AAAAAGAATTCAATTTAAACAATTAAATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2L 22720585 5' + F-element 59 1 79.80 TAGCTGTTTGTTTCCCGTGTCCTTTGTGCCGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr2R 19677836 5' - hobo 2923 1 55.71 CTAATGTCCGAGAGGTTAAAGACACAACAAACACAGGCAACACGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGCACT:1 - chr2L 9171524 5' + opus 16 2 66.36 TGTCGCTCATGTGCCAGAGCTCGGTTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCG:1 - chr3R 24608491 5' + invader1 67 2 75.00 AGCGCAAAACATTTGCAATTTCTCCAATACAGAATTCCATCTTCGTAAGAATGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAGA:1 - chr2R 25219685 5' + Doc 4442 1 53.64 TTGATAGGGAGTCCAGAATTTTCAGCAGATCAAAATTGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAATCACGCCATATG:1 + chr3L 25332030 5' - 3S18 5974 2 69.33 ATAATACAGGCGAACCCGGTGTCCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTT:1 + chrX 15227636 5' + hopper 61 1 80.00 GGCACAGTTTGATACTGATATATTCGCTATACTCGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGG:1 + chr3L 10911510 5' + springer 7161 2 60.47 GATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chr2L 14848406 5' + pogo 57 1 79.09 AGACTTCGAAACAGAAACTGTCCGTGTGTCATTTTGTGAGCATATTATTTACAAGGTTCAGTTTGATTTTATATTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCA:1 + chr3R 26089212 5' + gypsy6 191 2 52.73 AAGAGCTCTGGGTTGGACACCCTAGTCGGCAAACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTT:1 + chr2L 14141286 5' - hopper 1364 1 70.00 TGCTCAAAGAAAAGTTATATTGAACATTTCTGATGATTAATTACCAGAAATAAATCAATAATGCCCGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chr2L 14917989 5' + hopper 11 2 65.71 TGAGCAGCTCACCGCTGCGCTGAGCGATGCACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTGTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTA:1 + chr3R 22496360 5' - diver2 4603 2 68.09 CAAGAATTGCTAATTCTCAACAACACACACACTCACTCACACAAGCACACACACACACACACAT:1 + chr3L 15545045 5' + accord 7027 3 71.88 AAATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGTCA:1 + chr2L 10746632 5' + flea 4780 2 60.00 GACAGGCAACGAACGGACTAATTTATGCATGCTGGAGTGCCGAGTACTTGTATTTCGTATCTTTAATACTTAATAAAAATTCTCACCTTTTTTTTACTTTTTCCGTTTTT:1 - chr2L 20983897 5' - Doc2-element 237 1 56.36 CGGCATTGTGGAGACATAAACACGGATTTAAGTTTGCAAAAATCTGGCATTGTTTTGTTTGCAATGCAAAATCCCGTGAGGTCGTTAACTGAATCGTTTGAGT:1 - chrX 12157387 5' - Doc4-element 346 1 59.22 GCTCTTTATTGGCTTTTTATCGTTCATTTATTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1 + chr3R 5774853 5' - I-element 5297 1 74.55 ACACGAAAACCAACTCTCAAAAATTATGACAGAACCGCACAATAGACGACAACACACAACACAATTCTAAATCATTAAGTTATACCTATATTAATCATACCT:1 + chr3R 26597615 5' - transib3 288 1 62.75 GAGCAACAGTGAAGTACGTGCGTCAGTCAATCAATCAATCATTCGGTCTGAAAAGCTGACCACCCATACAACTCCCCTCGCAAGAAAACTAATC:1 + chrX 1167023 5' + Doc 4501 1 52.13 AACTCTAAGAACACCCTGTAAGACTGGCATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAGCGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTG:1 - chr2R 11988794 5' + S-element 354 1 72.73 ATTCCCAGAAAACTCTGGTATTCTCATAATTTGACTGAAAAAAGACAATACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chrX 16693843 5' + 1360 1 2 71.79 CAGGCCGCCGCCCTTTATGAGTGCCACAGCGTGTGTCCAAGATAATCCTAGAAACAGACTGACAAAACCGGAACGCACAGATGTAAGTTAACACACTCACAACACACCCG:1 - chrX 19010180 5' + Burdock 4 2 77.27 CTGAGTATTGACGAAAAATCACTTTTAATTAAGATCAGTTGAAAAGATGAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAACATCCCGTCTATCTGTCCGTCCGTATGAACGT:1 + chr2L 6745764 5' + INE-1 125 1 65.45 AAATAAAATAAACGACACATGGCTGCGAAACGGAAACTGCGATATGCGAGCTGAGAAACAATAATAATAATATAATAATAATAATAACAGATTAATATTGTATGTACATA:1 + chr3R 10983944 5' + invader3 5077 1 55.45 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAACCACAAACACAAACAAAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 417 1 30.19 GCACATATTGCCGCCATAGTTTGGCCCCATCGGGCACAACAACACGGCCAACAAATCATTGCCTTATTAATTTTTCCCACGCCG:1 - chr2L 12774237 5' - 1360 430 1 66.67 AGTCATTGAAAGTTAATGATTGGTCGCAGAAAGACCGAAAACAGGAACAAAAAGAGATTTGAAATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAA:1 - chr2R 14301535 5' + invader2 421 1 60.91 CAAACACAAACACAAACACAATCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chrX 4805476 5' + gypsy3 419 2 40.91 TCCTCGTTTCACTTCCCCTGCTGCTGGGAGTGCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTAT:1 + chr2R 10715058 5' - I-element 313 1 65.59 TAAGATGTAGCTTATTGATTTGATTTTAATGTATAGCATTAAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAA:1 - chr2L 5304917 5' - flea 218 2 60.00 CTTTCTTTAAGTCTATCTCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTAGCATGTTG:1 - chr3L 2591656 5' - Ivk 5106 1 79.79 TTCCACGCCAAAGCGATCACTTCATATGCCACGCTTTGGTTTTCACTCTTACCTTATATTGGTTTTCACTCTTACCTTATATTAAAAAATTAAAAACAATTTTAT:1 + chr3R 15199964 5' - Penelope 101 1 71.43 TCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAACTTGCAAAAGCAAAAAATCAAGTTGACAAATAAATGGTTTAAAATTGTCTTCAGGCTGCAAAGAAA:1 - chr4 1294989 5' + HeT-A 142 1 54.44 GTAACAGTAACAGTCGCTCGTTTTGTGCTTGGCCGAAAGAAAAAGAAAAAGGGCAAGGCGGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAA:1 + chrX 17832414 5' + Stalker3T 202 2 71.28 GAAAATTTTCCCATAAATATGTATGAGCAAATAAAGCGCGTTCCTCTCTTAATATAATCAGAAGCGAGAGTTTCATTCACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCA:1 + chrX 7710496 5' + Porto1 299 1 53.64 TAAAATATCATTTTTCCACACGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGC:1 - chr2R 17640807 5' - blood 215 2 66.67 ATAGTAACTTAGTATCCTTTTGTTAGAAAACCCTACACAAATATGAATTTACTTCCTAACAAGTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGAC:1 + chrX 15654781 5' - jockey 4905 1 77.08 TGTTTGTGTTTGTCTATTGGCATATGAACAAATTTAGCTGTGCATACACACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAG:1 - chrX 18750728 5' + BS 4835 1 56.36 ATCCCTCGTCTGCCAGACAGCCCCAAAAAGTATGCAGCACGCATTTTAAACGCTTTTAATTTACAGACTAGAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3L 5204465 5' + jockey 4688 1 62.73 GGCGTACAAATTGGGCTTCTTCCGGTTTCAAGCATAGACGGGGATAAAAGTGGCTCTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGC:1 + chr2R 20780111 5' - gypsy5 7124 2 54.55 GGAGGCACACTTGAGAGAAAAAAAATATTTTAAAAAATCCCGCTCTTTACCTACCCTGTAATAGCTGAGTGAGAAACAGGGCATTGACTTTATTACATA:1 + chr3L 18185768 5' - Dm88 4401 2 73.74 AGATATTTTCATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTC:1 - chr2R 18507917 5' - Bari1 1674 1 52.73 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATACGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 204 1 17.27 TTATAATGTTCGAGGACAGACGTTAACTCCTTCCATATTGTTGGTACTGTTTACGTCAGCATTTCATAAAATCGATTTTATTTTTATTTTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTG:1 - chr2L 86391 5' - gypsy4 489 1 77.27 CCTTTTGACGGTTGGCCTGTGCCTGGCATACCGAATGAGCTTTAAAGAGGTATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 17405665 5' - roo 392 2 65.45 CCTTGGTCCCTGTTTCCTTTAGTGTCGTCTTTCGACCAAGCGCACAGCTTAATTGAATACATATCGATTTATCAGCTGCATTTTTAAGTTGCGTG:1 - chrX 10584452 5' + pogo 2051 1 65.26 ACTCCCTTTTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:1 - chr3R 23730037 5' + Burdock 6188 2 74.55 ACTTGATTTTATTTCTTAGTTGTCTAGTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAA:1 - chr3L 14397023 5' - BS 5034 1 75.45 ATGTGGAATGCACTTACAATGGGGAGTCGCGAATGCGTCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGG:1 + chrX 2528858 5' - Quasimodo 298 2 62.30 AATTAGGTTATTTCGCAGATTATTCTATTTTACAGTTCAGTGGGCGATAATTGTTTTTCAGCGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCC:1 + chr2R 19522706 5' - GATE 106 2 57.27 TTCCGACCATATAAAGTATCAGGATCAATATCAGAGTCGATTTGGCATTGAAGCTTCCAAAAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAA:1 + chr3L 23932901 5' + INE-1 555 1 58.06 CAGGTTTATTGTTACTGGTTTTTTCACTTTTCATCAATAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr3L 8919697 5' + roo 45 2 65.14 CAAGCAAAAAAGTGAAATAAAATCAATTGGCATTCTGACATTTTTTTTAAAGAAAGTAGATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 + chrX 15169949 5' - I-element 5344 1 63.54 TAATGAATATAGAAAATACTTTACACAGTACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTTGTATGTGTGTGCGTGTG:1 - chrX 6718920 5' - Quasimodo 40 2 78.38 CCACACCCAGTAACCATTGAATAGAACAGGGCTCTCTAGTTAAGATGGGCTCATACTTCTCCTCAACAAAAGTAAATTATACCACAAAATCCAAAAAC:1 - chr3L 498702 5' + I-element 5178 1 54.08 GATGCTAAATATATAACTTGGCATTTACAAGTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 17184894 5' + roo 30 2 58.18 CAAAAGTTTGCCTGCCTTATCTACCGTTATCTCCCTTAATTTTATCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTACCAGGCAGAAGGAAG:1 - chr2R 4656642 5' + INE-1 28 1 77.27 GCTCAAATAAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - chr2L 2484423 5' - jockey 4959 1 50.91 TGTGTGCACTGGGAAAAAAGTGCGATCTTTTACATTACAAAACTTACTTGAAATAAATATTGTTGAAATTATGTGCAAAGCGGAACAAGGTATGTCGTTTTTACCGTATG:1 - chr3R 18141549 5' + transib2 289 1 55.45 TCTCACATAATTTGGGGCTCAACAATTAATATACAACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGTATTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCA:1 + chr2R 4745718 5' - rover 80 2 37.27 GACTAATAAGACCTGCCAAGGCATTTATCATACCATATGAATTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTAGATCGG:1 + chr3R 31967797 5' - jockey 4948 1 60.00 ATGTAATTAGTAAACACTACCCCAAATCAAATAGAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2R 12336647 5' + pogo 39 1 64.76 TGTTATGGAATGTGCCCTAACATTTTGACTTTCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCCCCTCGCC:1 - chr2L 2707138 5' + G6 1818 1 69.09 AATTGTTTTGATGCTCACAAACTAGTTTATTTTTAAGTTTATAGTCGCCCGTGATTTCACTAAATGTTTATTGTTGCCGCGGCTT:1 - chr3R 29905025 5' - HeT-A 163 1 71.76 TAATATTTTCGGTTCCACAATGGACTTACACCGTCCACATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACATTCGCTATGGACG:1 - chr3R 29182220 5' + Tirant 8065 1 63.16 TGGGGAATGATACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCT:1 - chr3R 14357347 5' - Rt1b 5122 1 57.14 AACAAATTAAGAGAGCCACAGGTGCCGTACAATCAGAACATGGTGCTATAAATAAAGATACATTTAACACTAACAATTCTTAAGCGCGAGCTCTTCGCTCTCTCTCTCTC:1 - chr3R 16475432 5' - 1360 107 1 60.91 CCCTGGCAACCGCTGATTTAATGAAGAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTCCATTCGGGCGCTGCT:1 + chr2R 24388333 5' + BS 98 1 72.55 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCCCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAG:1 + chr3R 21907536 5' - Rt1b 4972 1 58.70 GTTTTATGTCGCAACAGAGACACAAAAAAGACAACCCAGAAATCGGCTTAAAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGA:1 + chrX 19004855 5' + X-element 4475 1 66.67 TGCGCTTTCATTTAATCAATATCGTCTGGAGCGTAGGGCTGGGAAATGCATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATGTTTGTGCATG:1 + chr2R 18507829 5' + Bari1 25 1 53.47 CATTCGGCATTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - 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chrX 2822896 5' - Burdock 255 1 70.00 AATCGCTTATAAATAAAATGCATTTTAAACGTTTGTAATCTCATTCTAGATATACACCCACCGTAACACAAACGTCGAGCATGAAGGCT:1 + chrX 16402393 5' - R1A1-element 5038 1 71.91 ATCTTTGTATCTTTCTATCCGTGAGCTTCCACTTTTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTG:1 + chr2L 11404087 5' + Stalker 437 1 68.18 GCAAAAGCCAACAAGAAAGGAAAAATTCTTAACTCAAGCAATATAAAGGAAAACGATAACGAAAAAACGAAAAGAAAAGATAAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAG:1 - chrX 1217641 5' + Stalker3T 204 1 69.09 GATGCTTTACCCATCCCTGGAGCCACATTTATTTCCCTTCTGCCGCTGGACAATTGCAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr3L 15614515 5' + jockey 4683 1 63.33 AACTAATTGCAGTCTGCGGTTAAAAATAATTTTAAGGGTTATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr3R 25434721 5' - opus 486 2 70.00 TTTAAGTATTCCAGCTTAAAAGGAAAAACTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chrX 5018767 5' + roo 8721 2 78.18 GGACACGGACACAAGAGTCCTGCCCACCAAGGACCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 + chr2R 23477815 5' + F-element 17 1 69.09 TGGTTTAAGTTTACCAATTTAAAATTACAAATTAGATTGAATAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTA:1 + chr2R 17243730 5' - 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Ivk 5044 1 63.64 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTAC:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 190 1 53.75 GAAGTAAAATTCGAAAACACTCACACTTACTGTAATTAATCTTTTGTCCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAGA:1 + chr2L 19502710 5' + Doc 4479 1 52.38 ACAAACGTTTTTAAAACTAAAAAGTGTTAAAATCGGTAAGTTTAGGAAAAACAATATTTGAAGATGGGAAAATTACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGAATATAAGAAAT:1 - chr3R 13964553 5' + invader2 302 1 70.00 AGGACGGCAATCAGAAACCCTGAACCAAGCCGAGTCAACTGAAACTGAACTCCTCTGTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 5671490 5' - 1360 3378 1 70.91 TTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 15988752 5' + 412 7095 2 76.92 TCAAGTGCACAAATATATGGCTAATTGTGAATAAAAGCGATATAACGTTTCTCACAGCACTAATATCTAAACACAAACATAACCCACCAACACTACATAAATCCCAATTC:1 - chr3L 22570544 5' + I-element 4978 1 71.82 TGCCTTGCAAAGTACTTAATGTGTTGTTTTAGTAAAACATAACTTTTAAGCACAACGCAAAAACATTGAAAGCTCTTTATTTACCCAACGACACTAGAATAACAAGATG:1 - 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Stalker3T 202 1 67.27 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 1 29.89 ATAAAGAGTTCTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3R 26733993 5' + hobo 36 1 55.05 CGAGTCAGAGAGCAGCCACGGCAGACGAAAGAGAGGGAAGGGTGGGTGCGGGCGGATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACG:1 + chr3L 7790417 5' + P-element 117 1 40.48 TGCTGGGGTCCATTACAAAGATTTGAGATTTCCTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTG:1 - chrX 13913906 5' - Idefix 7156 2 68.00 AGTGTCACATTGTACAAGTTCCCTGAGTCCGTCGCAATCAAGTGGAGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGATCGC:1 + chr3L 9762903 5' - HMS-Beagle2 126 2 76.74 TTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTACCGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chrX 17330110 5' - opus 7468 2 62.37 GCAATTATTTTTTAAAATGTGTAGAATATTAATATTTATTGGTATTATTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGT:1 + chrX 13460649 5' - Stalker4 6933 2 77.27 TAACGGCAAGCTAGTTGTTTTGGCCGTAGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGACGG:1 + chr3L 7729093 5' - G2 2881 1 72.00 AGTACTTTGTCTCAGTTGTTTTTGTTTGTACATGATATTAATTTCGCGTAAAAGGGCGCAGAAGGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAACCA:1 + chr2L 14455226 5' - Juan 86 1 61.82 ATGTATATTCCAATGCATTAAATGCTGTAATTAAATAAGTATTTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 + chr2L 19320454 5' - Juan 4175 1 66.36 CTCGTTTGACAGACTAACTGAGTTACTGTCTCAACTGAACCAAGCATACATACACGAGTATTCACTGTACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 + chr3L 518715 5' + Burdock 6148 2 70.00 CAAACACACACACGCGCACATAAATAGCGGGGGGCGCATGGAAAATTTCGGGGGAGTGGGGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGAC:1 - chr2R 13806974 5' + accord 7114 2 58.72 GACAAAAAATATATCGACATGGCTGTGTAAACTGATCAAGAATATGTGTTCTTCTATTGACATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGCTGCTTT:1 - chr4 572915 5' - Doc2-element 4481 1 69.16 GATCTTGACTTGGCTCGAACAAAACGTGAAGTTCTATTTTTCTTCTAATCAAA:1 + chr3L 5616865 5' + Gypsy12A_LTR 254 1 84.91 ACCGGAGCAGACAGAGAGGGGTATAGGCACGGGAACGAGACGGGCATAGGGGCAGTAGGCGATAAAGTCTCGATGAATAATCGATAGTGG:1 - chrX 13982102 5' + gypsy12 35 2 61.11 AAGTCTCGTTCGAGTTTTATACAATGTCTCCACCTCTCGTTCCCTCTGACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTAT:1 + chr2L 9715234 5' - mdg3 5021 1 56.36 GACCTCATCAATTGCATGCATCATGCGCTGCGGCTCAGTGAGAAACCACATCCACAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCG:1 + chr2R 20992383 5' + blood 441 1 69.32 AATAGCTCTTTATACACGCACTACATTAAATAAACTATGTAAATTTACAAGAGAATTAACAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTG:1 + chrX 16789150 5' + I-element 429 1 69.79 TGAGTCCAAAGACGGACTAGGAAAAGGGGAGGCAGCTCGGGGGGGTGGAGAAATTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGG:1 - chr2R 17318688 5' - gypsy5 6991 2 69.88 GAGGAAGTGAAGTGAGAGGGTTCCAGAAACAGGTTTAACTTGCCGCAATTGTTAACTCTTCAGAATTTAGGCCGTCACTTTTGTCAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATG:1 + chr3L 14202568 5' - Idefix 32 2 79.09 GGCACTGGCTCAAGAGCCAGGAAGCTGACATGATTGGATGCTGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGC:1 + chr2R 15801083 5' + roo 26 2 56.52 TTTATACGCAACATATTTCAAGAACGCGGCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAA:1 + chrX 20272981 5' - Doc 299 1 82.24 AGATACTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTT:1 - chr2R 19405975 5' - HMS-Beagle 216 2 56.48 GAGTAGGAGGAGTCATGTGACAATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAAAGAGCTGTTCG:1 + chrX 17732517 5' - 1360 135 1 80.00 TTGTCGCCTATGTCACATCAAAAGAATTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGAATT:1 - chr2R 23354395 5' - Tabor 487 1 76.36 TAAGAATTCGAGCGATAGCAAAAAGTCGGGGCAATTAAACAACAGTCATAACAATCCATTTAGCTTATTTATTAACGACCT:1 + chr3L 18478624 5' + Q-element 521 2 66.67 TAAACGAAGTGCACCACAGCACTCACACACACACACACATACGCAGCCTTGCACACTTGTACACCCACACACACACACACATAC:1 + chr2L 5575888 5' + Quasimodo 35 2 72.62 ATTAAGAAACTGAATTAATGCACAATTGTTGTGCATCATTGAGTTTGAATGATAAATGTGTGACAGGAAATGTGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTG:1 + chr2L 9188407 5' - Burdock 6156 2 70.00 AATTCAGTCATTTTAACTTCTACCTTTTTTAAACATTTTTACAAATTTAAATTTATTTTATTAATAATTAATTTTATTTATT:1 - chr2L 16448670 5' - Tc3 258 3 87.80 TGAGTACTAGGGAATTTTACAAATTGTTTTGAAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2L 20902993 5' + roo 8683 2 58.97 AGGAAAGCAGAACACACAGATGTAAGGACACACTGACTTACATTCAATTTAGCGTTCAATCACGCCGCTTAAACGGCAATCTCAAGCGGAATCAGAATCAGAATCGGAAT:1 - chr3L 21324783 5' - transib2 2533 1 71.82 GTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGA:1 - chr4 1271902 5' - 1360 82 1 72.34 CCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTTTTCCTTTTCCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr2L 12270972 5' - Doc2-element 234 1 45.07 GCCAGTTAAAAGTCGATTTATTACCGCCGCCAACAAAGCCATTTTCGTTGCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTCG:1 + chr3L 16291810 5' + jockey 4766 1 70.00 GTTAATGGGGTTCACGCAGATTTATTATTGGGAGGGTTGTTTAAAACCGGAAAGGGGAAGTGGGAGCACTGTTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACAC:1 + chr2R 19684431 5' - 412 7540 2 75.00 TATTCAAGTTGTATGAAAGCCTAAGGGACAAAAAATTAAAATTAAAATAAAGAAGCTAAACAAGCGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAATAAAAAACAACAAA:1 + chr4 1093359 5' + gypsy7 5013 1 72.73 ATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCGGTGGC:1 + chr3R 7049654 5' + 1360 48 1 63.64 GCGGAAATTACCCAGGTGGGAAAAAAAGTCAGTTAACAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 10203045 5' + roo 46 2 72.48 AATCGACTCCTATTTCCCAACAAAATCAACATCATTTTACTTGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTATTTTTTACCTTCAGAGATCAGGTTTTTATTCAAAT:1 - chr4 552126 5' - Tc1 396 1 68.81 AAATACACAAGTCGGCCCTCCATTCCCCCAAACCCCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGT:1 - chr2R 15419067 5' - hopper 1395 1 55.70 CTAACTTTAATTTTAACTAGAATAAGTGGTAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACA:1 - chr3L 16162072 5' + Bica 374 2 73.03 AAAACTAAGCTCTATAAATTGGCAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 769970 5' - roo 9047 1 58.18 AACAAATGAATAATAAGCAAGGTGGGCAGCTATCATTGAGGTAGGTAGGTAGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTG:1 + chr2L 20098604 5' + R1A1-element 4993 1 66.67 CGCCCGTTTTCTATGCCAACTCAGTTAGATTGCCACACAGTCGCCGAGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCA:1 - chr3R 7222004 5' + mdg3 397 1 54.37 ACGCAATTAATTTGGGCAAATACATTGCAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGA:1 + chr2R 11575029 5' - INE-1 146 1 42.50 ACATGTCCCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr2R 892420 5' + Stalker2 7283 2 64.44 TCCTTGAGCTTTTCTTCCTTTTCTTTCTTTAGTTTTTCTTCTCGTTCCTTCTCCTTGATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATC:1 - chrX 11831318 5' - Stalker3T 205 1 66.36 TTTTACCCCCTTTTTTTGTGCTACGGCACTTGATTTTCTCATTCTCTATTTCCTCTTCATTTTTAAGGTTTATTTTTGATTTCAATATTGTATA:1 + chr2L 15547151 5' + hopper 193 1 68.09 ACAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGT:1 - chr2R 6801723 5' - McClintock 461 2 65.45 ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTTTCTATCTATCTATCTATCTTTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 - chr3R 21211613 5' - Stalker3T 201 1 83.64 TTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACA:1 + chr2L 23299997 5' + invader4 351 1 72.73 AATAATTGAAAGTTTGGCAAGTTCTTTTTGCTATAATTAATTTTCAATTCAATATTTTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGT:1 + chr3L 16748489 5' - rover 5 2 53.64 AATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGA:1 - chr2L 14025657 5' - HeT-A 6055 2 74.55 TAAACTCCACTTAAAGTTCTAGTAAGATGCTCCAACTCATTTTAGCCCCTATCAATTCAAGACATTCCCCAACCAAAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCTTACAGAT:1 + chr2L 7180310 5' - diver2 4661 2 73.64 GTGTTTATTTGGTAAAATGTACAATTATTTACATCAATTTAGCTACAGAGAATGGGTTTCAAGATATATAAATTAATTAAATATAAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTC:1 - chr3L 16727256 5' - springer 7503 2 62.73 TGGATTGTCTTGGCCATAATGGAGTTAATACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr3L 2965858 5' - 297 374 2 67.07 GAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGG:1 - chr3L 20187375 5' - FB 464 1 77.27 TAAAGCTAGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2L 12036111 5' + 297 6609 2 65.17 TGGTCATACGTCCCTGTCTAAGGATGCTTAATTCTGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGTGGGTACATTGTTGTGGGTTATA:1 + chr3R 908387 5' - G-element 4202 1 54.88 CCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3L 13228473 5' - P-element 2870 1 58.24 TTACAATTAAATCAATAACTTATTTTCTGTCTTTTTTGGAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 17718992 5' + 297 39 2 63.64 GAAAGGGGAATGGGAACCAGCCATTCATAAACACTGGCCCCATCCATTTTGGCCTGCTCATCTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGGT:1 + chr3R 22500790 5' - invader3 5455 2 69.15 GCATAGTCCTTAAAATTTTATAACTTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAAC:1 + chr3R 22979360 5' + Juan 4128 1 68.81 TGGGTCACTTGATCCTGCACCAAATGAAATTCCACTCAACTTTGAAATCAATAAAACAAAGAAAAAGTAAGAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTGGACAAACA:1 - chr2L 7941837 5' - Cr1a 53 1 70.91 CACAGACAGAACAACAAAAAACAAACTCATTTTACAAGACTAATAAAATTACGAAAAAATTTCGAAAAATGGTTCAAAAGTGTGGGCGTG:1 - chr3L 50410 5' - INE-1 253 1 66.67 TCGCTGCTGCAACTGCAATGCAATTTACACTTGAATATGAAATGTTGCGTGTGTAGTCCCGTCTATAAAAAAAGGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCC:1 + chr3L 22932274 5' + S-element 1396 1 77.32 TAAGTAAGTGCTAACAAACCATTTGCACAGCCGGCATATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 + chr2R 17512982 5' + jockey 4809 1 67.27 ATATACAAATGCAACCCATTTAAAATCAAGAAACAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 13481182 5' - roo 9022 2 71.56 ATAAACTGCAGGCCGAGTTTGAAAAGCTGTCTGAGGAGAATGCCACCCGAAAGCGAAGAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTTTACTGAACTTATGTATGTGTA:1 - chr3L 3191115 5' - invader2 4875 2 66.36 CAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGC:1 - chr3L 3240596 5' + diver 5898 2 65.17 GCGCTATCTAAATGTGGCACGATTATTGTTATTATTGCTGTTGTTTCACAGCGCTCGCAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr2R 21591972 5' + Tirant 8116 2 68.54 AAAAGCCCTCCCGACCGGGCAGCAGCAATGGCACCGTCCACTTCCGCACCATGGGCAATTATCCGCCTCCTCATGTCCCAAGCGCTTCAGATAGC:1 - chr3R 7930435 5' - Rt1c 5033 1 63.16 GATATATGCTACCAGGGGGGATTCAAGTTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTAACCATCAAAGAACATCA:1 + chr3L 12231091 5' + McClintock 6051 2 71.82 CACGCAGTGCTCCCATAAAACCAAACATAATGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACAT:1 - chr3L 10046453 5' + G2 2933 1 71.96 TGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1 + chrX 20433336 5' + diver 5942 2 70.00 CCACAACAATGCGGCGCTGATCGAAAAATCAATAATTCATGAGTGACTGTCTTTTTGGCAAATTTATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr2R 8845574 5' - 412 475 2 53.21 GTTTAGCTTTAGTCTAGCCCTTTTTAAAGGCCTAAAAAATCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAG:1 - chr3R 4698353 5' + Porto1 472 1 64.22 TTTTGGCCTTTTGACGGTTGGCCTGTGCCTGGCATACCGAATGAGCTTTAAAGAGGTATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 17405659 5' - roo 9061 1 70.91 TATACAATTTATCCCATTTAATTAGTTGTTATTGGTGTAAAACTGTCCGAATATCAAAACATGTTGTGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr2L 6757448 5' - Tirant 385 2 68.18 GATGGAGAGGTTCATAGTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr2R 10047145 5' + FB 31 1 75.34 CCGCTTATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 - chr2L 5724373 5' + 1360 28 1 61.70 GTTGGTGGAAGGGAATTTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCCTA:1 + chr2R 16702182 5' + R1A1-element 5006 1 69.09 TCATGGGATTGCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2R 12416852 5' - pogo 2085 1 60.22 ATGCACACATTTCGTCCTAAGCTTATCTAAAGGCACTGAACTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTCGAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCA:1 + chr3L 19901335 5' + FB 160 1 61.68 GGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - 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chr2R 8086862 5' + 1360 5 2 64.56 TCTCTAGTTTATATACAAAATATACTACTCTACAAATATATTTATCAATTCAGATTGTGAATTCGATTCGATTCATTCGATTCGATCGCCGACGTG:1 + chr2R 23415620 5' + F-element 9 1 65.62 TGTTTGCCATAATTTTTTGTCACACAGCTGTCACACGCACACTCACAAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTCACTCACAC:1 - chr3R 8190816 5' + 1360 3242 1 66.33 TACACAATACTTGATACTTTTAATTTGTTTGCCTGGCAGAGTAACGCAGACATTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTT:1 + chr2R 21407004 5' - mdg3 5085 1 57.27 CGTGCATTTTTGCAGTTCCCGGAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGACA:1 + chr2L 18192833 5' - Tc1 1277 1 75.51 CATGAATGCAATTGTGCAACTTAATACGAGTTTTCATTCAATTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr2L 2514542 5' + jockey 62 1 67.27 TATGATATGTTGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGT:1 - chrX 20433411 5' - diver 6091 2 61.82 GGTGGTAATGAACTAAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGG:1 - chr2R 11104541 5' - FB 658 3 76.79 CCGAAGTCGATTTCGAATCCCTCGGCTTCACGCTAATTCTGTAAACATTTAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 + chr3L 16046862 5' + P-element 19 1 56.99 CAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1 - chr2L 22775545 5' - pogo 2043 1 81.82 CCAACTAACTTAGATTCAAACCCCTTCAATAAGATCATTATTGAACAAATTTCTTTCTACCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2L 16771779 5' - Stalker3T 203 1 59.09 GCAAAAGGTTAAGGACGACCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2L 18675659 5' + 412 38 2 75.61 ATTTTTTGTGTGCCATCTCAACGCATTGATGCACAGAGAATAATTTTACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGCG:1 - chr3R 26398948 5' + Doc 11 1 61.68 ACAACGAATTTGGCCAGGTATGCAACTAAAACCACCACCTACTTTAACACCCCCCCCACGACCATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 + chr2R 20527308 5' + Tabor 6886 2 63.64 CATATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chrX 13495526 5' + Max-element 16 2 57.58 GAAAGTCCTAATTTGTTACCTTTGTGTATAATCAACAAAAAAATATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAA:1 + chr3L 5320461 5' + flea 382 1 63.64 TTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATT:1 + chr2L 13292973 5' - X-element 4667 1 67.62 ACAAATATGCTCGACCAGATGACCAAATATGACAATGACCTTATAAGTTCAACTAAACTATAGCTTTTGTTCGTTATTTTTGCCGTTGCCTTAACGTTATTATAATTTGA:1 - chr3R 6402242 5' + 1360 308 1 81.82 CAACACAAGAGGTTTATACACACATCACATTTTCGGCTATGTGCTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATT:1 + chr2L 3817412 5' - flea 4651 1 68.24 AATTAAATAATTATAATTAAAATACATACATATAAAGATACACAAAAACTTTTGGTTGTACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAG:1 - chr2R 2916930 5' + gypsy 21 2 61.11 AAACTCGAATGCGACTCAGTGGGCCAAGCACACACAGATACTCACACACATACTCACACACATGCGAGTAAAAAAAAAAGGCGCTGCTGTGCACCGCAAA:1 + chr3R 22569822 5' + Rt1a 4847 1 71.00 GTTCTACTTAGTTTATTTCACGGTTTATCTATGAATACTTAAGCACAAGATGTGGTCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATATTA:1 - chr2R 23469617 5' - Stalker3T 202 1 55.45 GTGGTTGTGGCATTGGTATTGGTATATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCG:1 - chr3L 10600922 5' + Stalker 445 1 70.37 CGATGAAACCCAGCATCATCACGGGTATGGGCAGATGCATGGTGTCCTGATGATCGATGTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAGTATGTTGAAGAAGGG:1 + chr3L 20485888 5' + invader4 2964 2 61.54 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGCCGACCACCGACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATT:1 + chr2L 16217660 5' - Rt1b 5061 1 60.98 CACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2R 6537954 5' + roo 8722 2 81.90 TAGAAATCACCAGATCTTTGCCCACTGTGCTACGTATTTCTCCTTCGAGCGTGTGTGCCATGTCATATGAAAGCCACAAGGTTGTATCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - chr3L 8634438 5' + 1360 2 2 51.82 GATCTTTACATTATTGATTGAACGAACATTTTTAAAGCGCACCATACAGTTTCTTGATATCATAGCGGAGCGCTAGGTGTCGCGATCAAGAGGGGCTACT:1 + chr2L 6840205 5' + mariner2 77 1 72.00 TGATTAACGCCTTGCACTTTGTCCAGATGACCACGTCCACAATCCTGTCTCTTGATTTGTGAAGTCGTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGGGTCG:1 + chr3R 1447362 5' + Cr1a 217 1 57.43 CACTTGAAGTGAATATTTTTCTCTTGTGTGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 8811185 5' + 1360 53 1 73.64 GTTCGGGAATTGAAAAACTTTTCTACCCAACCTAATAGAAAAATAACTCCAGATCAATATAGAACAATCCTACCCAAATTGGATCGACCAAATAAAAATAATACGACTTC:1 + chr3L 11335863 5' + I-element 4929 1 78.18 TGAGTTAGCAATGCCAATGACAATGGGCAAACTGCGAACTCCAGGATGAGACAGCGACAACAAGGAGATATAAAAAAGAGTTCTTTACATTTTTTTTACTTTT:1 - chr3L 18151433 5' - invader2 4755 1 73.79 GCACTTTTACCCTCAGTCTGTACCATAAAGTTGCAACTCTGCATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGA:1 + chr3L 36281 5' - Tirant 8488 2 64.55 GAGTGAAACAAGAACATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 + chr2R 7981125 5' + 1360 30 1 56.36 CCCACGATATCCAATGACGCACGTCTGGGGTAGACCATTATTAATAAACAATAAACTGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAA:1 + chr3L 7737765 5' + micropia 5267 2 68.57 TCTCGAGTGTTACGCCTCACGCCCATGCCCACACACACACACACAATTTGCAAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCAATGT:1 - chr2L 5934080 5' + HeT-A 5853 1 60.00 CCACAGGACTATCTGGATCATGGATTAGCTGCTGTATGGCCATTTTGTTGAGCTGCTCAATCAATAAGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAG:1 + chr3L 21341856 5' + Bica 82 1 70.91 ACGAACACAAATACAAATGCAGGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCAACATGCTAACTATGCGGGGACGAG:1 - chrX 5552715 5' + Ivk 5110 1 73.20 CCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr3R 31633170 5' - opus 7466 2 77.92 TCTGCAGCGCGACCTGATACGAAAGTGTCTCAACCCGCAGCCGCATTCGCGACTCC:1 + chr3R 5744022 5' + Quasimodo 315 2 80.36 AAAGTGAAACTGAAACTGGCTCTTGGTTAAGTGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTAT:1 + chr2R 22152161 5' - I-element 94 1 80.00 GCTGCTGCCAGTTCATTTGGTAAGGGAAGGAGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 29345635 5' + roo 17 2 58.90 CGCAAAAACAACAGCAACATCACAAAAGTCTGCTTCTGGGCATATTCGTAGGTGCCAGAATGCGGGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC:1 + chr2L 15567864 5' - accord 183 2 71.43 TAGATGGTGACTCTTTTAAAAAATGATCTTGCATTTAGAATCTGTCTTTTTAATAAAAGTATGACAATAAGTATATTTTATAATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAG:1 + chrX 18914318 5' - G4 3781 1 70.09 ACTATAGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 16742244 5' + 412 7095 2 62.73 CCATTGCATCAAACAAGTTACAAATTACACCACTATACAGTGGACCAAAAATGCATTTTATGGGGAATAATAAAACTGTTTTATTATATTTATTTATTATTTATTATA:1 - chr2L 10474629 5' + INE-1 416 1 77.78 GTGTATTATGTTTACAACACGCACACACACTCACACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACAACATATT:1 + chr3R 20804173 5' + I-element 5029 1 68.18 CAAATGATAAATAGCAAAATTAGATTTGACAGCAAAGCACGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 + chr3R 12605002 5' - jockey 4963 1 50.00 TGTAACCATATTGCAAACCCAAGAAACACAATCACACAAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACAAAC:1 - chr3L 22794309 5' + Ivk 4989 1 56.47 CGTTGCAGCTCAAAGAGAACTGTGTCGCAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATG:1 + chrX 14082948 5' - blood 7164 2 65.82 TGCTGCAGATTGTGCAGAGCGCGCAAAAGTAAAAGCCGGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3L 14755066 5' - P-element 2865 1 47.06 CAACAAATTGTAGCTGCTTTTGCGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGAATTTTAGTATTA:1 + chr3L 10702640 5' - hopper 1357 1 74.55 GCCGTCCATAGAACACCTCCTGCGATTTGTCAACCCAAACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGATAAGAG:1 + chr3L 21916069 5' - opus 7406 2 61.17 TCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCTCAGTAATCTGT:1 + chrX 22726200 5' - Helena 1259 1 51.82 TATTGAACCCAAAGACGAGGGAATACAATATTTGTCGCCCACATTAACACCAGCCGTCGTTTAGATATCATAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTT:1 + chr2L 13741685 5' + hopper 1163 1 73.33 TTGGAGACCATAACGTACTTAGACTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGT:1 - chr2L 5595535 5' - Max-element 284 2 60.94 GATTATCGCTTTCTGAATTTTGCACCTAACTTTTAATTTATTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3L 14929017 5' - I-element 5322 1 62.22 GATGATGTGATAATGCGCGGACTTGAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTG:1 + chr2R 12647427 5' + Dm88 407 1 65.75 ATCGATTTCGGAAACGCTTTCGGAGTCAACACTCGAGTGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTA:1 + chrX 17193331 5' + F-element 158 1 54.67 CTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGCCGCG:1 - chr3R 8621711 5' + jockey 35 1 61.64 TGGCAGCAAATGGGGTTTTGGGCAAACAAGCCATTGTGATATAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGG:1 - chr3R 8451767 5' - X-element 4705 1 67.27 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTG:1 - chrX 12649914 5' - Doc 364 1 61.67 GGTGCAAGTGACGCTTGCAAGTATGCTACGAAAAATACTGAAATCCAACGCCCTACACATGAGCCATTTTTTTTTTAACACGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr3R 7874904 5' - jockey 4987 1 61.47 CGCATTAAGACACTCAACCCAGTTGCATTTTAGCTGTTTGTTTCCCGTGTCCTTTGTGCCGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - 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chrX 6417906 5' - gypsy3 427 1 59.55 CCATCCTCCTCTGTGCATAAATCACAGGCTAGGGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chr3L 20167980 5' - 412 464 2 62.65 CTACCTATTTTTAGATACTTTCCTGCATATTCCCATTTCCCATCCGGTGCCACGCCCACTCTAACACCATAAAGCCGCCAAACCGGTCACGCCCACACTTTTGAACAA:1 - chr3L 5699847 5' + INE-1 252 1 60.19 ATAATATTACTAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGGTGGCATACATTGGTTTATTACATGGCG:1 - chr3L 3611772 5' + blood 382 1 48.18 GCCAGCGATTGCCAAATGGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGACACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCAT:1 - chr3L 20131794 5' + Quasimodo 305 2 83.70 GAACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:2 + chrX 12271483 5' + pogo 49 1 73.08 ATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAA:1 - chr2L 21794177 5' + invader1 3615 2 72.92 AGCATGCACGAGTTGTTGTGCAACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTT:1 - chrX 4093335 5' - accord 7030 3 75.00 TAAAATAAAGAGACAAACCAAAGACCGCATTGACTGTTCAACTACTATATACATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCT:1 + chr3L 17220665 5' + opus 110 2 78.82 ATTCCCAATTCACTAGCAAATGGCTTGAGAGAGCTTCAGACACAAATGCATTTAAATTAAAAAAAAAATAAAAACAAGTG:1 - 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mdg3 171 2 60.00 GAGGTAATTATTCCATTAATTTGTATTCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 30369741 5' + roo 5 2 66.67 AAATAAAATTATCTAAAATTGGTGTATCTGTATTTGCCATTGTATATATGGTGCTGTTATTGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTGACGCTACTGCTTTGAGTT:1 - chrX 2717647 5' - BS 481 1 71.82 TGTATGTAAGTGTACATCTGTATGTTGCACATTTCCTTTTGAAAAGTTATTAGCGTGCTGAGCGCCATTTTTCTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTA:1 - chr3L 4717080 5' - F-element 4646 1 71.82 TTAATAAACAATTCTTTAATCTTAATATTTATCTAAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCTGAAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 - chr3L 24492833 5' + blood 22 2 60.91 CCATCATTTTGCCAACAACAGGTTGATTGTTGATGTTGAAGGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGG:1 - chr2L 19855139 5' - gypsy7 276 1 76.14 TACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAAAATTTGTACA:1 - chrX 12946234 5' + Juan 354 1 21.05 CAAAATAGAAAACAGAAGAAAAGTGTGCAAACAATTTCTTTGCAGTGTGAAATCTGTGCAAGCTTGGATTTAGGTGTTTTTCTCGTTTATTGTTAATAGTTTTGTTATT:1 - chr2L 5990396 5' + S2 1565 2 90.83 CTTGCTCCCATGCACACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2R 6537968 5' + roo 8676 2 54.79 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATAAAAAAAAGTTAAATAAAAGCTAAATAAATTAAATAAAATAAATTACAC:1 - chr4 1294995 5' + HeT-A 2 1 60.58 CCCTTGACATTAACATTATTGAAAACATTTGGGGACTTTTGTACAGGAATCATAATATTTTTTAATTTCATTTAGTGAAATTGTTGACCAGGCTTTTTTAATTGCTTCAA:1 + chr2L 22749988 5' - Tc3 1323 1 60.00 GATCAGATGATTAATTCGTGATTACTCATCCGGCTGGCAACGACAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2L 3323222 5' - hobo 2931 1 56.00 CAAACATTACATCATTTCATTACGTTCATATTTCCATGAATTTTACTGTGTTCAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chrX 16693760 5' + 1360 32 1 53.21 AGCAGGCATTGCATACTTATGGGCCACCTCCGCTAACTGGTTACACGGCGAAAAAATCGTTTGCCAAAAAATCGCAT:1 - chr3L 17177330 5' - 1360 34 1 72.73 GTCGAGTCAATGTAATTGATGCAAAACAACATATAAACTAAGAAGCAGGTCAATCTTCACTGAAGGGATCTTCTTACACGTCCCTTCTTCATCATATTCTCAAATGTCTA:1 - chr2R 16458120 5' - invader4 198 2 59.09 GATATGTGTGGATACACATCGCAATTAATTTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTT:1 + chr2R 18553173 5' - F-element 4384 1 64.29 AACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 - chr2L 8476739 5' - Juan 4151 1 79.09 GTATGCGTAATCTACGTATTGTTTTCCTCAAATTCTATACTCTCCCCAGCTTATCTCATTTTTAGGCGTCTACAACATCA:1 - chrX 14970114 5' + invader3 283 1 73.75 TATGAATATTCCTTCGTGATTAACCACAGCAGATAAGCTTTGTGTCTTTTATAACGTCGTTAATCCAATTGGAAATAAGTCTCTCCCATAGTTTAGAAAGGGAGGGAAA:1 - chr2L 17900871 5' - Helena 202 1 54.13 AGTCATTACCATCAATTTCCAGCCCCAAGGGCAGTGGACAAGCTCGGGTTTTGGCACATGGGTCATTTGTGTGCATTTTGCTGCTTTTTTTTAATAGT:1 + chr3R 15590177 5' - Porto1 4428 1 77.55 CACTCGCTTGCCACGGATTTTGTCATCTGTTGATTTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGATCTCGGGAGAGTTCCGGAGCCATACCGGAG:1 - chr2R 23615568 5' + Circe 391 1 62.77 AAACAAATTTATTCGGAAATGGCATTGGCGAAAAATAAAATCTTCTAAAGATAC:1 + chr2L 14636374 5' - Rt1b 5111 1 70.37 ATAACATACATACAGAACAGTATTTTGTTTTTGTTGTAGGTTTTTGAACAATATTTATAAATTGCAGGCTTAGCAAGAGAGAACGTTATAGTCGAGTTTCTCGACTATTA:1 - chr2L 7671806 5' - INE-1 563 1 61.82 CAAGGCATCCTTATCTCGTTGGACTTCGAAACGAGGTATGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCGACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAACTAATTATA:1 - chr3L 20139779 5' + mdg3 39 2 54.90 TTTAATGGAAGAAAATTTATTTCCTCAATTAAACACAATTCGTTTTTTTTATCATTGTTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATATCATACTCT:1 + chrX 21922351 5' + diver2 4562 2 47.71 AGTGACAATTTATTATGGCGCACAGTTTGGCATTCGTATAACCAAAATGTGGTACCAATTGATCAAGAATAATATAGATTTGGCTATTTCTATTCTATTTTCAAATAATA:1 + chr2L 15100507 5' - 1360 320 1 48.18 CCGCATACTGCAGCCGGAGTTTTCATGCGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATGTCTGGGTA:1 + chr2R 15693501 5' + HMS-Beagle2 37 2 67.03 CAGCGAAATACTGGGTCAGCAATTGGCCGTGGAGCGGGAGTTAGAGTTTCTCCCGAACGTAGTCTGGGCG:1 + chr2R 12666477 5' + invader1 108 2 64.29 TATTAAAATTGCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATTAACTACCTTGTTTATTTACACACGTACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCG:1 - chr3R 16799811 5' + X-element 4626 1 57.58 ATGATTCATTGGCGCTGATGAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCCTTTAAAGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 21381378 5' + hobo 14 1 50.00 GAATTGCAAAAGGAAGGATGGTAAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGC:1 - chr3R 14452698 5' - BS 4655 1 75.53 CAAAAAATAAACTACGCCATATACGCTATCTCTTTACAATCTTAGTTCGCTCGAAAATATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 - chr3R 25051675 5' + 17.6 6949 1 63.64 CCCAGTGGCAAAGGCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAATGGA:1 + chrX 2929610 5' - hopper 140 1 74.36 ACCAATATCTTATGCCTTCAAATATTGCTAAAAAAAAAATCAATTTTGTTGAATAAAAATTCGTTTTATAATCTAAGAACATTAAAAAATAAATTATTTAAAAAAAATAA:1 + chr3R 13939408 5' + jockey2 3406 1 75.45 CGGCGACTTAGTACATATATTTTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAACACGAAGTATAACGAACAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAG:1 + chr2L 21178533 5' + Doc 4491 1 76.36 CCTTTGCTACGGGTCAGTTGGCTAGTTCGGCATATTGTATAACATCTGCGGATCTACACAGATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGCCAGAACGA:1 + chr2L 7790230 5' + F-element 184 1 59.09 GATACGGCCTCGCAGAACGAAGCTAAGGATGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGAACGATAAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAAT:1 - chrX 16709146 5' - rover 119 2 62.77 TATTGTTTTTGCAAAACGTGTTGTTGCTTTTTAAGTTTTTAACCAATTTTGTGGTATAAATTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTGTATTTTATCTGGTTTGG:1 + chrX 10580082 5' - I-element 5128 1 56.48 AAGTGTAACAGGGAGAATTGAAAATCTGCAAAATGGAAAAGGTTTTGATAGAAAAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATG:1 - chr3R 15741223 5' - FB 674 2 54.55 TATTCCAGAAAAGTGAGGAGTAGGTAGCGTTCCCGTTTCGCTGATTTCCTGCCGTTCGCAACATTTCAGGTATTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATT:1 + chr3R 21835094 5' + S-element 310 1 71.30 CAAAGAAGCATATAATTATTAATTAATGGATAATATTGAGTTTTACTTTTTACTGGATTTGCGAATTTAGGAATAAACGTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chrX 1523622 5' + jockey 11 1 76.92 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chr3R 21907536 5' + blood 7016 2 44.62 CATCAGAGTGCCATTCGGCATTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAG:1 - chr3L 17220784 5' - opus 7495 2 74.29 ACACAACACAACACAACACAACACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGGATGTTATATGATCCTCGA:1 + chr3R 21907534 5' + Idefix 123 2 78.18 ACACATTTACCGCCGTCTAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCTATGTTGCTTTCTTTGGGTACAGCT:1 - chr3L 644454 5' - Stalker2 309 2 74.39 ACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3R 23621036 5' - roo 9009 2 81.82 CGTATGAGTAATTTAAAATGTTTTTGGCGGATCAGGAAACAATTTTTTTTTTGGTTTTTTT:1 + chr2R 12256865 5' - transib2 103 2 73.77 CCATTGCATCCAGTCTCAGCGCATACGCTTCGATTGAAATCTAAATTGCATTGCATGCCACACCCACTCCCGCCCACCCTTTAAAAAACATTTAACACA:1 + chr3L 5316731 5' + FB 395 1 71.72 GTTAATTAGATTAAATTCCCCAGCGAAATAGAAATATTGTTACATGTTCTTTGCCAGCTTTCCATTCGCCCGCTTCCTACTGTCTGAGTAACGGATATCTGATA:1 + chr3R 18507705 5' + INE-1 546 1 75.00 AATCCTTCGCCTACATTTCAATTAATTTAAAACGCTGTCGCACTCAACGAGCTTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGG:1 + chr3R 26715533 5' + HeT-A 5733 1 64.37 GACCATTGGACATTGTCCTTCTCTATCTTTTTGGGTCTAAGTGTTTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGAGCGACCTTTTTGTAAATTTGTATATTTATATTTATTATGACA:1 - chr3L 10824278 5' - Stalker 6929 4 58.33 AAAACTGTCAACGTCTAGAGGCAAGGAGGGAAGATACAAACACTGAATAACAAGATGCATACGATTTTTTGGCACACGGCACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGG:1 - chr3L 12943664 5' + G4 8 1 69.09 TAAAAATCTTTGTATTTTACAATATAACTCAGAACATAATGCAACAAATACCATCGGAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAG:1 + chr3L 6679357 5' - Doc 453 1 68.09 GCCAACAGCATTGGCAGTAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCC:1 + chr3R 23374610 5' - blood 150 2 75.34 AATTTGACAAGTATTCTTGTAACTCACTTTCGAGTTAATTTTCAATTTTTTGCTCCTCCGTAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr2L 15763926 5' - blood 362 2 62.14 CGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:2 + chr2R 22663352 5' - mdg1 7401 2 77.06 AAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - chr3R 27071923 5' - jockey 4959 1 59.09 GCCAACGCAGCCATATTTATAAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGCAGACTCAAG:1 - chr2R 19254211 5' + jockey 4735 1 76.42 GGATATATCTTGATATCTGGCATATATCTGAGGCGACAATTGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGCGAG:1 + chr2L 5021368 5' + Ivk 5082 1 59.09 CTCGGGCCCAAGACAAACAGAAATAGAAATTAATGAGTTGATACAAGGTGCTGCAGTTGAAGAAAAAAGTCGCACAAAGGTATACTAGAAGAGTGGCATAAGATCCC:1 - chrX 7464653 5' + S2 1328 1 58.88 CAGTTCATTTGGTAAGGGAAGGAGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTCTGTAAATGAA:1 + chr3R 29345643 5' + roo 8715 2 75.76 ACTAGGCACGCATTAATGTGAAGGGACATTCGACAAAGCGAATACTTTCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAG:1 + chr2L 22082632 5' - INE-1 547 1 54.67 TTATTTATTTATGTAACGTGGCCTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAGGCAAAA:1 + chr3R 20415792 5' + F-element 70 1 71.70 ATCAAATTGTAAAATATTCATACGAATCATTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATGAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCT:1 + chrX 23016441 5' - Tc1 4 1 74.55 TGTGTGCAGGTCCTTTCCTAAATGGACCCCCAACGGAAGAGTTCAACTAATGAAATCTAGATGGTAGATAAGTTGAAAAGCGCACACCGACCGGATATCACACATCGATG:1 - chr2R 20680334 5' + Chouto 5923 1 64.55 ATCACCATTCTATATACACACGAAATACCTCTAATCCTCATAAAACAAAGCAATCACTTATCCTTATCGGCTAAACTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGA:1 + chr2L 20777684 5' + Tirant 8316 2 68.18 TATTGTTATTTGCCATTAATAAACTGTGATGATTGTGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr2L 14708846 5' - opus 476 2 56.07 TTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGTTTATTTTTTATTGTTTAT:1 + chr2L 9723025 5' - Porto1 163 1 41.18 GGGTGGTTGGGTCGCTGGTGGGATGTGTGTCCTTATAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATGGTCTAG:1 - chrX 10177458 5' - G2 2892 1 61.11 AGCGATCACAATAATTGTCTATGTCAATTGATCGAGTTGAGATTTCGGTGGCATACATATATCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTT:1 + chr2R 16128100 5' + hopper 45 1 63.64 TTCAGCATACTTATCAATATTTGTATATATATATTTCGGTAATATCTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAG:1 - chr3R 15697107 5' - 3S18 304 2 64.76 TCTGCTAAAGAGCTTATGCGCTTTACCCCAACTTAATCTGTTGGCAAGCGGCAACGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGG:1 - chr2L 4358926 5' - G5 4621 1 69.32 AAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAA:1 - chr3R 20683400 5' + 1360 2988 1 61.82 TAATAAACGAAAATTACCAAAAAATATTGAAAAGATACAGATAATATTTCGATACATTTTTCTAAACCTAAGAACATCTCTTATTGAGTTATTTTGCTTAT:1 - chrX 10813765 5' - Circe 6993 1 69.31 AATTTCTAAAAACAAGAGAGTCCGAAACAAATATAAATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAACGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGACAGC:1 - chr3R 7500936 5' + FB 29 1 52.29 CTCCGCCAGTGTGGGCCACATGCTCCACCCACCAAATGGTTAGAAAGCGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTT:1 - chr2L 18826015 5' - INE-1 344 1 55.42 GCTAGCCATGCCATAAAACACCCACCTTCAATGCAGTAGACGTAGCCATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCT:1 + chr3L 6197723 5' - flea 470 1 76.36 GAAAAGGAGCAGAGCAGAGTTGAGGTGGAGGTTAATGCTGAAAAGAAGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTC:1 + chr3R 10244636 5' - hopper 1212 1 78.57 GTAGCGGCTTTAGCGCCCCGAGCCGCCCAAAACCCCAAACCAAACACGCTTGGGCCTCATGTTTTACTGAACTTATGTATGTGTACCTCT:1 + chr2R 5838512 5' - invader2 4870 2 77.78 AAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATACTTGATCAGGGTCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGT:1 - chr3L 25482719 5' + INE-1 109 1 80.00 CGCATCTTAGCTACTCTTTAAAAATCTCTAAATTTGTACTTCTTCTTTCGAAGATTTCTATACCTCCGCGATCAA:1 + chr3R 8691185 5' + R2-element 3566 1 66.67 CGAATGGCGTACAGGAATATTAAAATGGCCAAATAGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 - chr3R 18576970 5' + copia 30 2 62.92 TTATTAAAACATTCAAAATGAACAAGTATTGTTTTTGTTTCTACGGAAACTCTCAAGCCCTCCCAAGACCAAAGAGCGCACTCTTACTCT:1 + chr2R 9822897 5' + Doc4-element 117 1 51.11 AATTGAATTGGGTTGCAAATTGAATACCTCACACATGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACACACAGAACCCACCAACACTACCCACATCCCAATTC:1 - 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roo 498 1 59.09 ATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGTACACA:1 - chr3L 6630128 5' - 1360 179 1 74.51 GTGATAATCGTTTGAGTGAAAATTTAATTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGG:1 + chr3L 13567282 5' - 297 6605 2 64.18 TGTAGAATGCTGTTTTTTTTTTTCCTTTTTT:1 - chr2L 4576780 5' - gypsy7 5009 1 83.87 ACAACAACAACTTCCACCTGTGCCCCAACGACAACTACTCCTAGATCCACAACAACAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGAGATATTTCTTTAAACCACATAT:1 + chr2L 4938328 5' + I-element 5028 1 58.00 ATGTGCTTGTTTCTCCAAGTGTACGTCATATGTGCGGTGTAGCAATGAGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr2R 9138772 5' - pogo 2072 1 57.69 TATCAAATTTGGACTAGACGGCACGCTTCGATTTCCATCGGGTGCCATTGTGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 + chr3R 25773419 5' + hopper 43 1 58.18 ATAATGGTGAATAATTAACAGTTATTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1 - chr2L 6311327 5' - hopper 1381 1 55.45 TCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTCCGACAATAAGTAAATTTTATAAG:1 + chr3L 15099554 5' - G4 3804 1 63.64 TAATGCGATGATCGTAGCCAGGGTGGGCAAACGGACGAAGAGGGATAAAAAAAACTAATTGGTGG:1 + chr2L 373957 5' - FB 85 1 80.00 GAAATTGAATTATAAGAGCACTCCAACAAGCAATGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTA:1 - chr3R 27816182 5' - Burdock 6376 2 53.25 GATTTCATTTGACAGGCGTCATGTATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chr3R 25434837 5' + opus 24 4 59.09 AGGTGCAGGCGTGACCGTAGCGGCAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCCCGGCTCGC:1 - chr2L 4795276 5' + Max-element 8295 2 69.05 CCCTAACGCACGTCGAGCAGCAATTGTTTGAATAGTTTTCAGCCTCTCCAGTTGGTGTTTGGAGGCTGTTCCCCACATTTGGTTGG:1 + chr3L 24120318 5' - G5A 2438 1 70.93 GGCTATACACATACATGTAGTGATTGTTATATCAACACATAAACAAATTACATAATCACAAACAACAGAATTTTATTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTT:1 + chrX 2150726 5' - Dm88 4248 1 71.82 GAAATGTCATTTTAGTGAGCATAATTATGAAACATGGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chrX 22861713 5' - 1360 3362 1 62.64 ATAAAGAGTTCTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3R 26733993 5' + hobo 37 1 55.45 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACAAACACACAACAACACAC:1 + chr3R 21907534 5' + gypsy3 410 1 48.48 AAATAGGTTTCGGATTGGGGCAATCGCGGAGATTGAGATTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGG:1 + chr2L 21177839 5' - I-element 5128 1 62.00 CAACAAAGTGTAAAACTCTAATCATTTACTTATACCTTAAATAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAACACATTAAACTTCTCTAAG:1 - chr2R 6436577 5' + I-element 471 1 63.30 CAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 418 2 40.91 TAGCCGAAAAAAAACAAAATGCTTAAAAATAGCCCGGCTAGAGAGCGGACAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTA:1 - chr3R 27660534 5' - FB 680 4 60.91 ATTGTGCTGGCCGAACTCAAGAAAAATGCTTACCAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGCACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAACTTTCGACAAGA:1 + chr2R 18994625 5' + invader2 4805 1 66.00 CGCGAGGCAGACGAGAAGTCCAAAAAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTG:1 + chr3R 27121378 5' - 17.6 7112 2 73.63 AACACTGGCCAGTGTAACCTCAGCAACAATCATCTGAGCAACAGTTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTACGCACG:1 - chr3R 32016241 5' + 17.6 288 2 55.56 GCCTGCCATTCTCCAAATCCGATGAACAGCGGCGTCCATGCACTGCAGATACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCC:1 - 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roo 285 2 66.36 TGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGTTT:1 + chr2L 9723026 5' - Rt1b 5148 4 36.46 TCTCTTAGCCATGCTCTCTTAACCTTTCCATTTGGTACCAATCTATTAATACGAATACCTCACACACATGAGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTC:1 + chr2R 18404532 5' + I-element 4904 1 69.09 GCAAAGACACTAGAATAACAAGCTGAGGTGTAGGCCATCGGCGGAAAT:1 + chrY 917823 5' - gypsy12 207 2 60.42 TTAACCTTTCTTTGCCAATTTCACTTTTTTAATCCAAATTACATGTACCACCATAGACAACCCATCAATGTTTCACAATTGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCG:1 - chr3L 14198821 5' - aurora-element 4216 1 62.04 TCACACAAAAGTCTTTTCACTATTTTCCTCGGCACGCACTGCTAAGCCTTATTTTTTTGCCCAGGTCAGGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 - chr3L 16259021 5' - Transpac 293 2 65.14 GCCGTGATCTGTGATGATAATTAGCCATTGAATCGCAACTAATCTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGT:1 + chr3R 30721646 5' + hobo 218 1 60.00 TAAAAAACAAACTTACCAACGCGGTCTGGCCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGG:1 + chr3L 11273107 5' - Doc 330 1 73.97 AATCTAACACGCATCTGCGGACCAAACACCCAGTCTTATGTATGTATTTATGTATTTATGTGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - 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transib4 113 1 43.64 CTCCCTCGCCACCCAGCCGATATAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chrX 7677142 5' + jockey 4703 1 72.84 GGTCATTTGTCTGGGCCAAGTGACAAACAACATCAAACTTATCATCCATCAAGCAATGAATATCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr3L 15819434 5' - pogo 2100 1 78.26 TAAACAGGAAAAATTCTTGATTGGAGTAATCAATTTCTGAAGTGGCTAAGAAAGAAGAAGAAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3L 27174892 5' - pogo 2082 1 63.64 AATTAATAAAACAAACGTGAATTTAAACAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTCTGACAACTGA:1 - chr3R 8986388 5' - Bari1 203 1 79.05 TATTCTATTGCACCAATTAAAACATCATTAAACTGATAATATCAACCATTTGTGGGCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATT:1 - chr2R 23054831 5' - Stalker4 63 4 54.55 GCGACGCGGTGCCATCGCCCGTCCCCTTTCGTGGCAATCTTTTGTTTACATTTTTAGAAGACTGGTAACACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGAA:1 - chr3R 16246435 5' + Bari1 1668 1 76.36 AGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAAATTTTATATATCGATGCTAATTG:1 + chrX 20433341 5' + diver 59 2 72.73 AGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGC:1 + chr2L 22076771 5' + Tirant 401 1 70.91 GTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGAGTGCGATGGGACTCTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr3L 1861518 5' - hobo 2928 1 65.75 TGGAGTAATGCTAGAAGTTGTTGGGCCAGCACTCACTTACACACACACACGTGCACACAATACCACTTAGCAACAGCCATGCACCAAATTATAGAATGCCTTAGGATATA:1 + chr3R 13556586 5' + Quasimodo 87 2 63.64 CCTGGCTTAGAAAGGTAAGCAGACTGCAGACTCTCTTCGCAGCGGAAAAACACCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAG:1 + chr3R 22389166 5' + Doc3-element 347 1 68.89 CTGAGAGAGCGAAACAAGTTTGTCCATTTGCTTTTGTCTGCAAACATTTGATTACTGGCTGTTTAAAAATAAAACCGCCCAGGTTTATGTTAATTTTCATTTTATGGTTA:1 - chr2L 21064994 5' - 3S18 311 2 54.55 TGAATTCAGTTTTCAAGAGATTCATAAAATTAGGCTATTTACATATGTTAAATTGAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTGCTGAATACCAT:1 + chr3R 9228625 5' + Tc1 228 1 63.83 CTCTTTGAAAAGTGTGTAACAGGTAAAAGGAAGGGTTTCTGACCCTTTAAAGTACATAAATAAAGAATATAAATTCTTGATCAGGATCA:1 - chr3L 14815799 5' + INE-1 81 1 62.92 AACCGAACTAATTCCGAAATCAGCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACT:1 - chrX 3528617 5' - roo 347 2 75.23 GGGGCGTGTCTGCAGTAATGCGTGCATTTTAAGTGTCGGACGTGGACATAATGATTTATATATTTTAAAACGATACTTGTGAGGTATAAATACCCTGGTTTTTAAATTGT:1 + chr2L 13075907 5' - TAHRE 391 1 70.00 ATCCACAAAGAATTAAACATGTATATTTGGCATAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTC:1 + chrX 7695360 5' + Doc 4540 1 59.26 TACTGCATTCCGCAACATCCATTGGGCATATGAAATATAAAAAAAAAAACAAAAAAA:1 + chr3L 12544320 5' + gypsy11 3930 3 78.95 GATGGGTTATTGGGTTAATCAGCACGCACGGGGATTTCCAAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTAATAGCCAGATGGTTAGGGT:1 - chrX 20730985 5' - G-element 4115 1 57.89 GAAACCGCATACCGTCAACAATTATTTGTCCAGAGATTACTTTGCTTAAATACGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTT:1 + chr3L 3390819 5' - Ivk 4926 1 55.45 GTGCCATCTCAACGCATTGATGCACAGAGAATAATTTTACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 - chr3R 26398939 5' + Doc 13 1 57.00 CTTATTCAAATGTGTTTCTAGGCCAGAAGTAAAGCGGGTGGGGTGCGGGGAGTCTAAAAGGGACAGAGCTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAACTC:1 + chr2L 1847869 5' - 1360 3183 1 66.36 AATTGTTAATGAATATGGTGATAAATTAGGTGTGAAGTCATGGTCTTGTCATAGAAAACGTGGAATAATATAGGAAAAGTACAAAATATAAGATGTGGGACAATAACTTA:1 - chr2R 18674431 5' - HMS-Beagle2 6897 2 71.82 ATACATACGTACTAGCACATCTCATACTTGTGCCTTGAGTTCGGCCAATGACGCCAACGAATTTCGATAGAACACTAGTGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAG:1 - chrX 10766712 5' - Stalker4 128 4 71.82 AAGTTTAAGGGAGTAGCTGGGGATTACTGTGAAGTCAAACTGTTGTTCAGGGAAAATGGGGAGTGGTTTAATTGAGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTT:1 + chr2R 11483683 5' - S-element 402 1 59.63 AACCAGTTGTAAAGCTGCTACGATCGTACTTGACATTAGCTCCCACAGTCAAGATCGCATGTCAACCAAATGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGTCCTCAAAAATAGAT:1 - chr2L 16819568 5' + rooA 7410 2 70.00 TTTCCCGGAAACACCTGGCCAGAACAATGAAAATGCACTGCCGAAGGGAAAAAATTGGTGGCACGAAGTGCGGACAGAAG:1 + chr2L 19629645 5' - 1360 469 1 76.25 TTCGGAGTAATTCTCACGGTGGATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGACCTCGACTGACTGCAACGCTGACTTC:1 - chr3L 6840214 5' - flea 4896 2 78.18 GGTTAACTCGTTACAAACTTCATTGCTATATAGATTTTTTTTGGGGAGAGAGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAG:1 + chr3R 14995673 5' + Doc 11 1 48.00 CCACTACTTCCTCTTCACTTCACTAACAAAATTTTTCTTTGCTGGGCTGAAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGGCTCGTGTAAGCGACTTCG:1 + chr3R 9705070 5' - Doc2-element 4583 1 64.08 GGACCGGAACATGGCCCACTTTCTAATTAATGCAAAATATTGCAGCTGCAAAAAGAAACTAGCATATGTGCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCAG:1 - chr2R 14588936 5' + jockey 4776 1 64.55 ATGCTACACAGGAATCGCGGGTCTGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTAT:1 - chr3R 11553705 5' + hopper 63 1 77.27 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGACACTGGCAGATATGACGTTAAAAA:1 + chr3L 22908066 5' + flea 4607 1 41.33 GCCAAATTTGTATTGAGAGAGGTTGTTGTTCGTTCTGCATAATGCAGTTCAGTTAAGTGGCATTTATTTTGTTTGGTGTTCTTTTATAAAATATTTTACGTCGCGAGTTC:1 - chr2R 17465570 5' - gypsy9 379 1 59.09 AACCCTTTTAAAAGGAATCCCAAACCCAAAGAGATGACCAGGCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTACATTATACCACAAAATCTCA:1 - chr3R 26504096 5' + I-element 5174 1 57.80 CACACTCCCCTCCCCCCACAAGATTTCCGCCCCCTCAAAAATAACGGCTATAATTAAAAAAATAACAAAA:1 - chr2L 18426296 5' - copia 4827 1 55.71 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 204 1 25.45 CGAAAGATCTAATGGACTTGGGCGATACCCTGCAATCGTTGGAGACCATAACGTACTTAGACTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTG:1 - chr2L 5595573 5' - Max-element 292 2 68.09 GCAATCGCTTAACCACGAAAATCAGAGAGAGACACTCCGAAAAAATCGAGTGCAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTTTTTT:1 + chr2R 17766744 5' + 1360 3386 2 70.10 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACACACACAAACA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 417 2 55.06 TCTTTCGAAAGTTAATTCTTTTGATATCAATTGAACACAACACGTTAAGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chr3R 24558672 5' - P-element 2792 1 49.52 CTTTATCACAGTTGAACAGTAGATAGACAGAGTAGATAAGTTACAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAG:1 + chr3R 5324251 5' - I-element 155 1 60.00 TATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTT:1 + chr2R 5064833 5' - Stalker3T 203 1 79.12 TGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCCTCTGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAA:1 - chrX 3464219 5' - 1360 58 1 87.50 TTCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAGCTAGAAG:1 + chr2R 4906442 5' + INE-1 155 1 58.18 CAAAGACTTGGCCAATAATTGATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chr3R 29635224 5' - mdg1 7399 2 81.31 TCATTAGGTCACAACTGTGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTATAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGAAGATAGTTG:1 + chr3L 18030832 5' - Tirant 8441 2 80.73 ATGTGAAGCCCATCGATATTCGAGTATCCGAATCGAAATGAAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAA:1 + chr3L 4359958 5' + Porto1 4213 1 72.73 TTGCCTGGCACACTATGACCTCGGCTTCCCAACCCCCAATCCCACCCCAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAACTAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATA:1 + chr2R 10571215 5' + I-element 4949 1 62.96 AGAAAATGAAAAAATCGTCCGACTCAATTACTGCCGAAATTAACTTACCTACATCTTCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAA:1 + chr4 565683 5' + Doc 4459 1 58.49 GAATGATTTTTCAAACGTGTTTCAAATCATTTATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3L 16496708 5' - hobo 2922 1 63.16 GTTGGAATTTCCGAAAAGGGAATTTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGCCGGAACACCTGCGGCC:1 + chr3L 2297517 5' + Bari1 435 1 77.27 CTAATTTGGACTGAGAGAGCCAAGGAATTAACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTA:1 - chr4 1141039 5' + Doc3-element 4642 1 72.73 TCATGTCCGTTGGGGGGTCTTAGTTGCACCAATGAAAGTTCAATTCTACATATTCCTCTGAAAAAAATAACCTTAAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2R 966257 5' + P-element 10 2 57.27 TTATTGACACAAAGAAACATCATCTCGTCGGTTCCTTTGTGGTGCAATTCTAAACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAG:1 - chrX 21933418 5' - Bari1 1524 1 52.73 TCAATTTCACCAACGCGAAATTCAAAAACATGAGTGAAACGATTTAAGAATATTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAA:1 - chr2L 15519604 5' - Bari1 1407 1 54.55 GAGGAATGCTTTTACTTCTGTTGTCCACTCTCCTTTCTGGCAACAATTTACATAAAAGCAGGTTTTCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGAT:1 - chr4 488920 5' - Cr1a 394 1 65.45 CAACAAATGCAACTACTCGAAGATGAGGTAATTCCCCGCAGCAGGAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAGTCAACA:1 + chrX 4983810 5' + Doc2-element 4526 1 61.82 TAATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTAT:1 - chr3L 23112568 5' - R2-element 3232 1 59.09 CCTACATAAACCCGCACAAAAGCTAATTGTGGAGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAATTGGCGCCCAAACGTTGGACAG:1 - chr4 372012 5' + Circe 249 1 64.89 GCGCTGCCAGGGGTTTTAAATTAGATTCACAGAACATCGGGCTGAGTTTGCATTAGTTTTTTTTTGCTATTTCCTGAATCCTGTCTCCAATTTTTGTCACATTCAGATCG:1 + chr3L 12568277 5' - jockey2 3032 1 50.91 TTCGCTTGCTTTTTTTTTGTGTAGCAAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGACAATTCCGCCATCC:1 - chrX 14698329 5' + G2 2766 1 70.53 CATTCATTTCAAGAAAAAATTAGAGAAAAATCAATGGCAATTATAAATTTTTGCCAGCTCAAAGACGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGA:1 + chr2L 18570478 5' + FB 25 1 55.45 AAATGGATGCTAAATATATAACTTGGCATTTACAAGTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 17184889 5' + roo 8687 2 59.26 GATTCAGCTCATATTTTTTAACCCACACTTCTTTAATAAATTTGTTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGT:1 - chr3L 207317 5' - hopper 1068 2 59.09 GAAAAGACAGAGACAGAAGCCCGTTGTCTTTGGTGGAAAAGTGTTGGCGGGCTTTTGATATTATTTATGTTTATTATAATTTATGTGACAAAGTGTAACAATGTATATA:1 - chr2R 12503873 5' - Stalker2 7301 2 59.63 ATACTGAATATTTAGTCTGTATTATATATATATATATATATATATAATTTATATATATATTATATATAATAATATATT:1 + chr3R 10341635 5' + Tc3 286 1 71.79 TCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAG:1 - chr2R 6801690 5' - McClintock 6387 2 70.87 GGTGTCTCCCGGTGTTTTCCCACAGCAACATGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTTT:1 + chr3R 17795336 5' - Quasimodo 113 2 63.74 TCAGCATCCCCACCGAGCACTTCCAATAACCATTCAATCCGGTCCTCCTCCTGGATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAGGTTTTCTAATCTTATTCTAAACTA:1 + chr3R 6144028 5' - Doc3-element 4657 1 57.27 AAGGACATCGTCCTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 - chr3R 31954895 5' - Tabor 7312 2 36.08 AATGCAAAGCATTAAAAACAGCAGAACTTAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGGGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGA:1 - chr2R 5879521 5' - FB 981 2 70.75 ACTGCTGTTCACACTTTTTGTCCATCTCTTGCCACCGATCCATCCGACTGGTAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCC:1 + chr3L 12449624 5' + I-element 4993 1 54.64 TAATTGAGAAGATTAAAGTCAAGCACACGAGAGCAGACAGAGATGGCAAATGAGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAA:1 + chr3R 14283467 5' + micropia 5358 2 52.29 GTTTATACCAATATATTTGGGTTCTGCAATTCTACTGCGGCATTTATAAGATTTATAAACTACATATTCTTGAGACATTCTACAACTCTATATGGATGATATTATAATAT:1 + chrX 7592402 5' + TLD2_LTR 43 2 73.64 CCATGTTATCAATACAACCCACCTAAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGTTCGGAAAATCGAATTTTTAAAATTTGAAAGCTAAAATCGTTTGCCCGTTTTTGCCCACCAATT:1 - chrX 8929857 5' + FB 72 1 73.64 AAACAGATATATGTATGCCACCGAAATCTCAACTCGATCAATTGACATAGACAATTATTGTGATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCACACCAATTAGTTTTTTT:1 - chr2R 16128146 5' + FB 81 1 62.73 GACGAAAATTGTAATTTTCATCAAACGAAAGAAAAGAAAGTTTTTTGTATTCCATTTCAGTCACAATTTCTCACTTTGGCCTGTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTG:1 + chr3L 17460385 5' - accord 7026 2 59.09 AAAAGGGCGCTAAATTAAGGGAGCAAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATAC:1 - chr2L 14446897 5' + Doc 4394 1 77.27 ATATAAAGTTAATGTATTTTGGCTGGGCCTGTCACGGTCGCCACGTAGTTAAATAGGAATCAAAACGCAATCGGTCATATTTATATAATAGGAAATCACTCAAAACTAGA:1 + chr3L 7259901 5' + Porto1 4201 1 73.64 CAGGCGTCATGTATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr3R 25434825 5' + opus 7151 4 66.06 TGGGGAAATTAAAACAAAGAGCTGTCGGAGATGACTAACTAATGAATATGTAAACTAAGCTTGTTTCCCCCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATAC:1 + chrX 15305985 5' + I-element 4983 1 75.76 ATTTGAAAGCACTAAAGCGGCACTTAGCACTAAAGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACATATATATTGCA:1 + chr2R 9049086 5' + HeT-A 5977 1 65.38 TTATTTGATAGCCAAGAATAACCCTTAAGCTATTTTAGTTATCCTTCAACGCTCCATTTGCCTTCCTTTAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 + chr3R 16194486 5' - flea 5003 2 71.82 AGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTACCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 24867504 5' - roo 9025 2 69.90 GTTATTTAACCTTTGTGGTGAGTATAAAATGGCTACTGGATATCTTTTTGGTTTATAAAAGTATTTATTTTTAAGGATTACATTTTATTTTTATTGTTCTTATTATT:1 + chr3R 30503617 5' - mdg1 7063 2 42.06 TTAAGGATTAGGATGAAAATGTGCATACTAAAATTCGAGGGAAGGCTAGAAGGTATAAAAATCACATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTA:1 - chrX 19934791 5' - 17.6 7233 2 61.00 GTTTCCTTTCCTTTGCCAGTAATTTATACTTAGAAAATATAGGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTATTCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAA:1 + chr3R 31867494 5' + FB 308 1 75.51 ACTGTTGTGTTAGACTTTACAAATAAATTACAAAGAAATCGATCAAAATAAAATCATGGAAGAAAGTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTTCGCGAATTG:1 + chr3L 146449 5' + R1A1-element 5157 1 67.27 TTTTTGATCAGAAACCGAAGCTGGTATATTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3L 23651547 5' - 1360 3362 1 78.05 GAAGCGAGAGATGAAGTGGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGGGATTTGAGGG:1 - chr2L 17703643 5' + micropia 5385 2 77.08 TTTTCAGCATCTGAAATCTCAAAATCCTGCTGCAGAATGTGCAGAGCGCGCAAAAGTAAAAGCCGGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3L 14755093 5' - P-element 2867 1 62.73 GCAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATA:1 + chr2R 4606195 5' - Tc3 316 1 78.82 GAGCTTTTTAGCATACTAACTTCTTTTTGGACTTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAACCATCGCAAACTA:1 + chr2L 11095538 5' + R2-element 3407 1 72.73 TGCACATAGTATATACAAAATAATATATGACATAAAAAAAACAATCTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTA:1 + chr2L 21574135 5' - 1360 3199 1 57.27 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAA:1 + chr3L 22908067 5' + invader4 3066 2 72.48 ATCCATAAAACATATCTGCCTGAATAATTCAAGGCAAATATAACGCAGTCTACACGCCGCCATTCGAAAACTCTACACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAT:1 + chrX 6193208 5' + G5A 2606 1 74.55 GAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 204 1 67.31 AGTCAGCACCTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2R 24031478 5' - 1360 3343 1 68.57 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACCCAAAACAACACCACACAAACCAACACAAAACCAAACACAACCACAAACACAAACACA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 419 1 34.83 AGCCCGGTACTATATAAGTTTGTGGATGGATTCCTGGCCCGCCGGCGCCCGCACTTCCCG:1 - chr2R 7750661 5' - Osvaldo 1484 2 66.67 ACAATCTGAACTGATATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGAGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 9435806 5' - roo 403 1 68.13 AAACGAGGCAAGCAAACTCAAAACTGTGGACAAGAGAAGTGAGGACACATGAAGGACTATCAAACAGGTCAGACTGATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATA:1 - chr3L 10723769 5' - Burdock 249 2 80.91 ATTATGCTGCTCAATTGAGCAGAGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chrX 18483138 5' - pogo 2095 1 69.32 TATTTCAAAATTTCAAAATCTCTTCTATTTGGGGATTCAGCCAACTATTTTCAAGCACTACCTGTTAGATCTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATA:1 + chr2R 4547541 5' - S-element 1701 1 65.14 GTTATTATTTGCTAAATGTGGGGTGTGTAAATCGCGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTTCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTG:1 - chr2R 11790477 5' - F-element 4391 1 74.55 CTCCCATAAATAATCCTTGAACCCCTCCCCCCTCTCTCACGCCCACTTCTACGCCTGTGCAATTTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATA:1 + chr3R 30392751 5' + 297 211 2 61.17 GTGTACATTGTGGGTGTTTCAGGGCTGTTTCCTGCAAGGATAATTGCAATTTCCTTTGCTTTTGGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGG:1 + chr2L 13578751 5' - I-element 5127 1 80.90 GATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 - chr3R 13225543 5' - hobo 2938 1 55.10 TGCCTGGCCACTCGAGCCGCAACAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3R 9435871 5' + roo 60 2 82.57 AAAGGCATAATTTTTGACATTTTTTATTGGATTTTACAGACTGATTCGAGATGTTCGGTAATTGCAGGATGCCTAATTATATATATATAAAAA:1 + chr3L 8852317 5' + transib4 2573 1 84.95 CGTGGTTCGCAGTCAGGAGTCACTGCCCTTATATCCGGACTGGTGGGTCGAAGCTGCTGGTTTTGCTGCTGGTGG:1 - chrX 22498545 5' - TART-B 151 2 92.00 TATAATAAAAGATCCTATCTTCTCTGGGAATTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chr2L 13710730 5' + copia 4923 2 74.55 GGAGAAAATGACTGAAAGCAGATAAAACAAACAAAATCGAAACCACAAATAAACAGAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATG:1 - chr3L 22967735 5' - FB 674 2 58.18 TTTGGTCTTTGAAGTCGTTAGGTTCGATTTCATTATTACATATTTGGCGATTGTTTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chrX 17456118 5' + jockey 4686 1 62.22 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACAAAAACACAACAACAAACACAAA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 415 1 30.00 ATTGAAGTAAAATAACGCCGAAGAATCTCACCAACCGCTGGAAATGCCACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGATCAGAGCGTCTG:1 + chr3L 23236504 5' - Stalker2 7614 2 55.96 ATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGCACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTCGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGC:1 + chr2R 1320684 5' - diver2 4884 2 52.69 GCACACCCGGATGACTTTCGCTATTCACGATAATGCCCACACCGACCAAGGCTTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCT:1 + chrX 13197409 5' + TAHRE 10088 1 75.64 CGATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr3R 13503052 5' - hopper 1385 1 54.74 ATCTTGCCGTAGGGCTCAAAGAATTCCTTCAGTTTTTCATCGTCGAAATCCTCAGTGATCGGCTTATGTATATATCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTAT:1 - chr2R 18143851 5' - Stalker2 144 6 52.73 GAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCG:1 + chr2R 1320679 5' - diver2 4883 2 56.57 AATAATAATAATAATAATTATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTA:1 - chrX 13383542 5' - Dm88 4513 2 58.18 GTATTAATTATATCTTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGCTGGCAG:1 - chr2R 6418894 5' + flea 24 2 75.36 ACGATTAATCTTATTTCTCTCTGCTCTTTCGACTAACGCATTCACTTAAAATGTGCAAAATAAAGAGACACTTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCG:1 - chr2L 13103563 5' + mdg3 5492 2 58.72 TCAACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr3R 27071878 5' + jockey 4725 1 77.27 CAAATGTTTATATGTTTGCCTGTTTGCCGTCTAATTTTGCGCATAGTTATTAATATTATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 - chr3R 9481287 5' - roo 9045 1 57.27 CTGTATACATTTTCGTTTATAAATAAATCATAAAATAAGAGCAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATG:1 + chr3R 10162867 5' + hobo 2557 1 61.82 TCTTCTCTTCTTTCATTTGTTTAAATCATTTTTTTTTTATGCCCTGCTCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATATCTTCGT:1 - chrX 17549106 5' - Chouto 49 1 50.00 ATCTTATCGATGTCCTTGGAGCTAAGACCCACTCGCTGTCCAATTACCGCACTGGAATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTAT:1 + chr2L 15610934 5' - Idefix 81 2 70.59 AAAGTGTTAATAAAACCAAAAGGGATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTAAA:1 - chr2R 10241508 5' - I-element 5339 1 62.77 TTGCTAAAAACACATGTTTTTCACATACTGAGTCTGCCAATACATAGATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chr3L 23996577 5' - HMS-Beagle 211 4 57.27 GCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGCCGAACAAATGATCCTTCGT:1 - chr3R 13423379 5' - rover 325 2 60.00 TATTAAAACTGCGTCCATCCCACTAATATATGTATATATTTGGTAGTCCATCCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCCTGGCA:1 + chr2R 8107014 5' - Tc1 1277 1 76.36 GTGGATTCGGTTAGGTTTCGGTTTTCGTCTTCAGAATCCACCACCAACTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCACTTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTG:1 + chr3R 27280508 5' + Transpac 5071 2 54.21 GCTGCGAATAACAACCCTGTCCTTAATCTGTATGCTAAATCTCAACTTTCTAGTTTTTATAGTTCCTGATATCTCGGCGTTCATACGGACA:1 - chrX 4507439 5' - INE-1 132 1 73.63 GAAAAGAGAAAGGAGTAGCTTCATCCTGAAACCGGCCGAAGCTATAAAGTTTTATGTGAATAATGCAAACCGTTGTCAAGGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCG:1 - chrX 16247880 5' - 17.6 150 2 77.27 AGCGACCCCTAGGAGGCCCTAGTAGGTCTATTCAATTTAACTACGATAGTCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACA:1 + chr3L 26722680 5' + Tc1-2 1577 1 70.91 GCTGCAGAACTCCAATGGTCGTGAACGTGTCCCCCTGCGAGCTTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAATTTGTTTACGTCTTATGCTAGTT:1 + chr3R 18040874 5' + 3S18 183 2 65.45 ATCCAATTTGCCCTCGTTATGTTCGAGTACCGGATATGCATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2L 9626869 5' - hobo 2922 1 55.56 AGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 - chr3L 22108155 5' + Transpac 4969 2 69.09 TGGGTTTAGGTTATGGATTCTGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGCTGTCTGCGTTTGGGGTTGCCGG:1 - chr3L 18277819 5' - F-element 288 1 67.11 AGCATGAAACGTCATATCCGCAGGGAATTGGCAAGAATTATTAATAACGAAACAATATAAAGCAACAAAGCGTACTTCTCCTACGTCACA:1 - chr2R 25108652 5' + F-element 266 1 66.67 GACATTAATGCGTGTGTGTGATTGTTTACAATAGTGTGTGTGGTTGGGGAGATATGTTACAATATATATATTTATAATACGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 - chr3R 3375514 5' - opus 7500 2 80.00 AATTTGATGCCATAAACGTAACAATTACAGATATCAGGCACATAAAGAAAAAAAAAGAGGAATAAAATTTTGATCCCATAATATTATAAATAAATTTAA:1 - chr3L 9743062 5' - hopper 338 1 61.62 AAATGAAATACTTTCTTCAGTTGTTAATTGAGGTAAAGATTTTGAAAGTTCTGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGNGCCCCAGTGATGGTTCTC:1 - chrX 16048255 5' - F-element 4345 1 60.20 CGTCGTCTTGCCCTGTTTTCTTCCAGCCTTCGCCTTGCCATAGAAGCTGTCCACATCGCCAATGATTTTGTCGACCCTATTTCCCTTCGACGTCTGAA:1 + chr3L 16932399 5' + G5A 2666 1 72.45 GGCATTGCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGA:1 + chr3R 23861061 5' - pogo 2075 1 56.48 TCAGAAACTCCATGCCCCGCCAGTCGGCGAGTCCGTGAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAATAGAATTCATT:1 + chr2L 10584086 5' + TAHRE 10397 1 56.18 ATTTCGTTCAAAAAAATATTTAACATCTATCATATGTGGAACGCAAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGA:1 + chr3L 9419522 5' - S-element 1687 1 60.00 GAAACGCAGTGCGCTCGTATGCCACATAAATCCATGTAGCCATTTATCTCATTTGTCTAAACGGACCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACA:1 - chrX 17783863 5' + I-element 5125 1 64.15 CTGCGGTCTCAACCAGTTTTAAATTCATTTTCATTATAATTGGTTTTTTTGCGCAAAGAAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCAT:1 + chr2L 12367464 5' - P-element 153 1 57.27 CAACGAATCATGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 + chrX 20433326 5' + diver 5910 2 51.14 AACCTGCCGGCATATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCA:1 + chrX 13495516 5' + Max-element 8235 1 63.33 ACATAATTTGAGCCCCAATTTGTGGCACATGCATGGCCAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGACTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGATAGACCCACCAAACATT:1 + chr2R 18025517 5' + I-element 186 1 66.36 GGCAGGCAAGCAGAGACGCCGACAGCGGCAGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGATAAGTCTGTC:1 + chr2R 10535266 5' - G5A 2617 1 66.67 GCTCTTTATTGGCTTTTTATCGTTCCTTTATTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAACCTAGACTAACTTAGCTAGTATAGCCTTAGCTACGGGG:1 + chr3R 5774853 5' - I-element 5299 1 68.52 GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGATTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGTGTTTGTGTTTGTTGT:1 + chrX 9845361 5' - gypsy3 423 1 44.94 AATAAAATCGTTGAGTTGTGCTGCCGTTTTGTCGGGAAATCCGTCGCTTAAGAGAGAGAATATATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGCATTCTTTTTTCTTT:1 + chr3R 4574826 5' - G4 9 1 75.45 CCATTTGCAAATGAAAGTCGTTAGTCAATACATCACTCTTCATTAAATCAGCGGTTGCCAGGGGTCGCAAATCTGAATTCATAGAGATAGGTT:1 - chr2R 24388374 5' + BS 4 1 66.67 GCCCAATTACTTTCGACAAATGGTTACACATTTTGTTTTTCTCATAAAAAAAATTGCTTAAACTGGGGGTAGCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 - chr2L 10128757 5' - copia 241 1 60.00 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCA:1 + chr3R 21907535 5' - Rt1b 4990 1 38.00 GCTCAATTGAGCAGAGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chrX 18483146 5' - pogo 2096 1 63.29 ACTTATATTTATTCTTTATTTAAAAGAATACATTTTTAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr2R 9963636 5' - 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Doc2-element 245 1 80.26 CAATTTGGAAGCAAATTGGACTCAGCGATTCGAATTTAAATCAAATAGAAGAGAGATTAGATACCAATTTGAAAATAAATAACAAACTAATATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 22796167 5' + F-element 4680 1 66.35 AACTCACACATATACATATATCATATTATCTTGTCTTAACTTATCTTATCTTATCCTTCTTATCTTATCTTCTTCTCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATTTT:1 - chr2L 13474166 5' - Stalker3T 203 1 69.72 GACCGAAACGTTAAAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGAG:1 + chr3R 24813961 5' + P-element 49 1 32.69 ATGGCCGAACCAATCATGTTGACTATAAAGCTGTTAGTGGTCATGAGTGAAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAG:1 + chr3L 25752790 5' + Transpac 27 2 54.37 TGGTTTTGTTCTGTGATTATGTGAATTATGCCAATAATTTTATGTGGAATGGGTGCACAATGTTTTGTTGATGTCGTGGCTATGGCCTAAGAATTATATTTAGATTATAT:1 - chr2L 13751525 5' - gypsy7 187 2 65.45 TGAAAGAATGTTGTTGTTTCTATGCAACGGAGATTATAGTGGCGTGCCTGATCCTGGGCTGCCTTCTCCATATTCCCCGCACCAGCTCGAAGATTTCTT:1 + chr2R 6969263 5' - Osvaldo 1205 1 67.68 GGTAGCGATGGGAATTCGAGTTGGCTTTAACAAATCTAAAGTTTATATTAAATGTCGCATTATTTTTATTTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGT:1 - chr3L 17696197 5' - I-element 4881 1 56.36 TTAGTTTCTAATTCGGTAACTACATACGGGAAACAGTATGGTGCATATGGTACAAATCTTATCCAGCTCTTTAACTTTTTGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTG:1 + chr3L 2060868 5' - Tirant 329 2 80.00 CGATTTCGAATTCAATTTGGACCGCCTCTCATAAATAGCACAAAGACTTGGCCAATAATTGATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3R 29635184 5' - mdg1 414 2 74.47 CAGCAATATTTCTTGGGGCTTTTAAAACGTACATTAAAACAATTAAATGTGGGGGTGCTGCAGGGGGTCCCACGCTGCAG:1 + chr2L 3335211 5' - gypsy3 356 2 58.75 TTAGTACGATTGCAGACCTATAAAAATATATATATTTAAATCTTTGCCCGAATTAACACATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAA:1 + chr2L 13763469 5' - Bari1 1684 1 60.00 CACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAACACAAA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 421 1 29.09 TACATATTGTTGTTTGCCGATCCATTGATTTGTGGGGTCTATATTAATAGGCGTCTGCTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chrX 9576607 5' + FB 28 1 55.45 ACAATGCCTCGAGATTACGCCCACACAACGCCACTCGACTAAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAA:1 + chr2L 16639710 5' - 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S-element 450 1 64.81 TCAATAAAAAAATTAGATTTTTCACAGTTTCGATTAGATCACCTAAATCAGGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 15211744 5' - roo 9037 1 55.45 AAAAGTATATATGTAACAGGCAAGTAATAACAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAAAGAATAA:1 + chr2R 25257600 5' - TAHRE 10414 1 61.63 AAGTTTCCATAAATAAGCTGTTTAAAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr2R 9963578 5' - pogo 2077 1 60.91 TGTTAATTAATCATTGCTTTGGAATTCGCACAGCCATTAAAGAAGCTCCCGCAGAATATACACAGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCAAA:1 + chr3R 14703856 5' + 297 2 2 74.00 AAAAAGGAGCAGAAAAGAAAAAAAGTAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCCGGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCA:1 + chr2R 21851338 5' + I-element 64 1 71.11 CTTCAGTTTTACGGCAAACAACTAAATTTTGAAAATGGGTACCAACCACAGCAACCACGATACTCCCACCAGGGGGC:1 + chrX 14927521 5' - R1A1-element 4984 1 53.25 CATGCAACACTCTTCGAATGCACTCGCGGTTGGAGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 + chr2R 6707699 5' + 1360 44 1 67.92 TTGGTTCTTGAGGTAAACTTTCTATGTGAAATTCTTGTCACTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACG:1 + chr2R 12544367 5' - Idefix 198 1 60.58 CATGACAAATCAAAACCTCAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGC:1 - chr3R 15454049 5' + Idefix 7059 2 73.53 GTACACGTGAAGGAAATTTAAAACCATCTAACTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 - chr2L 21034156 5' + 412 6 2 75.45 AAGTATGTATAGTAAAGAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr2L 18749862 5' - pogo 2077 1 77.14 GACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 - chr3R 31458513 5' + jockey 27 1 61.33 TTGTGTGCCAGGACAAAAGTGACAAAATATAAAAAAGAAGAAAACGTTAAAATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGCTTTTCGAGACGAAATCAATTCTGATCGAAGAA:1 - chr2R 24696104 5' - 1360 3172 1 51.82 AAAAAAACAAGCCATATTCTTAATGCGTGACACTAACTCCAATTTCGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAG:1 + chr2L 1870271 5' + blood 481 1 58.18 CACCACAAGCTTAATAGATCCCTAAAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr3R 27071947 5' - jockey 4983 1 64.55 CCATGCAACCAAATTGCTTCCATGCATCACACGTCCACACACCACCCCCCATCATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACA:1 - chr3L 12232796 5' - Dm88 376 1 69.32 TGCAGTCGATAGCGGCGTTTTATTAGGTATCTGTAATCTGAATTAGGGTTCACTTTTCGGTCAGTGCTGTTTCCTCGTCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - chrX 1601102 5' + hopper 5 2 77.27 CCAAATCCAGTCTCCTTCGTAAAAATCGTGGTAAATCGTGCTTAAATACGCTTTTAATTCGCCTGATTTGAGGAATAAGATGGATTGAAATATGATTTTATTTAATTTGA:1 + chr3L 20386902 5' + transib1 1894 1 80.91 GTAGGCAACAAAAACATTTATTGCAATTGTCCTTTTTTTTTTATTGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTCCC:1 + chr3L 15614458 5' - jockey 4972 1 58.95 AAAAAATGTGCACATTGTCACGACATTTTATCACACTATTGCAGATCATTCCCACAGTACCTAAATGTATATGATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chr2R 18296980 5' - pogo 2098 1 72.82 ATTGGATACTTACAGTAGACGATAATCCAAAAAAAATTACTTTTAGGCATACAACTAATATTTGGGGGTATTTTTAAATTTTTTAATTTTTT:1 + chr2R 10477458 5' - HB 317 2 28.26 CGAATCAGGCAGAAACGGAGAAGAAGAAAAAAAAGGGGAATGTGCTAGCTACGGAAGTGCTCATCTCAAAGAAGCTGGGCACGGAAAAATAGAATCGTTTGCCCATTTTT:1 + chrX 10742161 5' + FB 50 1 65.45 CATTTAAAGCTAAGGAAAAACTATTACAATTTAGACAAGTGAATTTGTGACAAATGAAACTTATATATTATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 7219675 5' - roo 393 1 65.45 GGGGGCTACCACGTTACGCCATTTGACGCATACAAAATGTCCTTGAAACGAGCTGCCCGTAGTGCCCAGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAAT:1 + chr2R 9947199 5' - I-element 265 1 67.89 GACCTCATTTGCACTTTAAGTATGTGTTGCGCGCTGATTCCAATTAGCAATATAATTACTTTAATAATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 + chr3R 7833096 5' + Doc 5 1 78.49 ATTAAATCAGCGCCAACAAGTCTTGGCTGCCTGAAGAGCAGTGAAATAAAAAAAAATTCACGCATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAG:1 - chr2R 4137618 5' - HMS-Beagle2 7179 2 63.81 TTCATTTAATACCACACTTACACTTCATCTCTTACGAAGAAGGATTGCACAATTGAAATCCTAAATGACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCC:1 + chr3R 14163639 5' - jockey 381 1 71.70 AGCGGGGTACACCCCCCGTCCTATTCCATCGTGCATTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGA:1 + chr3L 15534427 5' + Doc 4425 1 58.33 AACGCGTCAGAAAACGTTACGCCGACGCGGTAGAGAGTGATGCCGAGTATAAAAGTAATTCAGATCCAACATTTTTTTAATTTTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCTT:1 - chr2L 22490481 5' - Doc 4680 1 65.45 AATCTATTCATAAGGTATCTAAAGTTAATAACTATGACTAGTAATAAAATAATAGTCATTGAATTTTGCTCGAATAATCCTTTAGATATTTGAACTTGATTTCGTTTT:1 - chr3L 16257990 5' + accord2 7242 1 61.11 CCGAGAGAAAAAGTATGGGAAATTGCTAACTAGCTTAATATTTAATTTCAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGC:1 + chr3L 4683227 5' + HMS-Beagle 276 1 63.92 CCCCGAAAATCGCGCCCCCAAATATATGCTACACAGGAATCGCGGGTCTGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATAC:1 - 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Stalker3T 203 1 78.18 GTGTGTTTCGACCGCTTTTGGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGTG:1 + chr2R 19774486 5' - I-element 4905 1 75.56 TTCTTGATTGTTGTAAACCTTAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCC:1 - chr3R 25217757 5' - Tabor 365 2 76.40 TTCGTGAAGGTGATCCACCTTCCTTGGTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr3L 23650354 5' - 1360 3344 1 73.74 TATTTAATACAACATTTTTGTTCTATCTCTTTGTTTGACAATATTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGG:1 - chr2L 12358977 5' - F-element 4522 1 60.91 CAATTCGACGATGTCGCAGATAGCCCTTAGAGGAAATGGCCAAAGGAGCCTCATAGTGTATGTTTATGTTTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 - chr3L 11456763 5' - Quasimodo 265 2 57.80 GGTAGTAGTCAGTTTAGTTCTAAAGGCACAGCCCCCAAAATTCCAGGTGGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCTAGTAGCTAAAGAA:1 - chrX 20986306 5' - Doc3-element 478 1 56.38 GGAGCGCTGCGAGTGACTTCCTAAAGGCATTAAAGGTATCAAGACTTGTCGCTAACCGCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCT:1 - 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copia 129 2 75.49 TGCTAAAATCAACAAACAAATACTCGAAAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAA:1 - chr3R 23303734 5' + Idefix 195 1 75.76 ATGCAAATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAACGTCTCAAAACG:1 + chr2R 22663332 5' - mdg1 7427 2 54.37 AATCAATAACGAGGATTTCATGATGAACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr2L 17785846 5' - roo 9018 2 74.29 TACATAAGGGTTATATTGAGTATACACCATTAACAACGAACTGCTAGTGGATTATATGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGAT:1 + chr2R 19405855 5' + HMS-Beagle 6796 1 79.09 TGCAGTTGAATGGCACGCATGCACCTTCAGTCCATGTGAATATGGGGAAAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGAT:1 + chr3L 13832719 5' - 17.6 7188 2 53.33 AGTGTATGAGCAATTAAAGCTTTTTTACTGGCAAAAAAACGGTTTCCCTAAACATCAATCACCTTCAGCACCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACAGA:1 - chr3L 12977726 5' + jockey 4686 1 78.22 CCACAATCAACACGAAAACCAAGTAAACAGAAAAACTCGAGTATACATAACTATTTATTGAACAATATACCGTTAGCTTATTTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTA:1 - chr2R 24213210 5' + S-element 1 2 60.00 CTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAG:1 - chr3L 19339436 5' + Tc1 13 1 68.42 GCTTTGTTTACAATGTTGACCCTTACTTTATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr2L 15763807 5' + blood 7021 2 72.73 GCAGGTGTGGCACCTGTTGCCACCAATTAAGCGAATGGCGTACAGGAATATTAAAATGGCCAAATAGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 - chr3R 18577001 5' + copia 20 2 62.73 CACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTC:1 + chr3R 21907535 5' - Rt1b 4991 1 62.71 CGAAATTAAAATTGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3R 7049631 5' + 1360 21 1 60.38 ATACAAAACGCTGAAAAAGCAAGCCAGCAAACACTTGTAGACGTACATAATCTCCGATCAAAATTCTCCCAAGACGACCGTGGCTACGTTCTGGACC:1 + chr2R 17943960 5' + ZAM 8354 2 79.38 AAATAAGATTCATTTCCTGAAAATAGGTTAAGTTGAATGAAGACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr3L 13024087 5' + 412 10 2 69.00 AAGAACCAGTTAAGCGTTGCAGACCAACTGCTCCGCCCACCGCCCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGATGATATGACGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr2L 9496375 5' - Tirant 8464 2 57.80 AAAATAATTTTAAGGGTTATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chr3R 25434743 5' - opus 484 2 61.11 GTCTATTGAGCGAACTTTTCCCAAAAGTGGAATTGCATTTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCA:1 + chr2L 4748228 5' - F-element 4273 1 63.51 AGCAATTTCGATTTCGAATTCAATTTGGACCGCCTCTCATAAATAGCACAAAGACTTGGCCAATAATTGATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 29635176 5' - mdg1 7444 2 70.91 AAGTGTGCTCGTTAGAGTGGCTAAGGGACACTAGAATAACAAGAAGCGTAACGCCATACGGTTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCC:1 - chr3L 23495933 5' + 1360 43 1 65.12 AGTCTTCTTAGAATCACAAGTGCTGGGTAGAAGTGGAAGCGATTGGCAAACGTAATTTCAAAACTTCTTCTTAAGCTATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGC:1 + chr3L 23271188 5' + Chimpo 9 1 47.27 AAATTAAAATCAATTTCAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTACTTTGTCATAATAAATATAAAT:1 - chr3L 9063203 5' + Stalker 6926 4 74.55 GATAAAGGACGAAAAAGTTACAGTAAAATGAAATCGATGTCCGGATTTGAAGAGCCTAAAGATCAAGTTCAATATAACAAGATGCGTAACCTCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chrX 17067928 5' + 1360 29 1 72.73 ATTAATCCTTTTTTCCAGCATCTTTTCACACAAATTCTGAGAAGGAAATAATTTCACAAGAA:1 + chrX 7640682 5' - copia 392 1 61.29 GTCAGCCTAATGAAAAAATGTTCAACCAAGCTCCTTAAACTCTAATTAAAGTTTTTAAGTGTCTGTAAGTGAGTTCGTTCGGTGGGTGATTTACTGTAACGACCTTAGAC:1 + chr3L 16468934 5' + I-element 499 1 79.09 TTATAAGGGGGACGCAACAATTCACTTACAAGTTTTTTCCTCAGTGTACTTATGTAATAATGTAATTATACTTTTGAGTCAAGACACAGTAAGTCCTCACATGATTAGTG:1 - chr3R 25275616 5' + BS 4994 1 64.55 TTATTCCACCTCACTAGTGTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2L 14708909 5' + opus 147 4 75.00 TTTGTCAGAACAGCAAACGAGATGGCAATTCACTGGAAAACAGAGATACCCAGAGCGAAAAAGGCAGTCTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACG:1 + chr3L 17183787 5' - Cr1a 237 1 58.18 CTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr2R 5214967 5' + F-element 48 1 57.27 TCCATTCGCAGCTCCTTCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGG:1 - chr3R 17942293 5' - R1A1-element 4962 1 73.85 AAAAATATGACTTACTATTAGGTAGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTG:1 + chr3R 3377200 5' - Max-element 282 2 64.62 TGCAACAAAAATACCAAAAAACGAATAGATCTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2L 12910715 5' - Burdock 220 2 68.42 GAATATAACTCCAGCAATTGTCAATTGTTACACTATGAAAAAAATCTTAATTCAATGCCTTTTGAAACAAAATTATATTATAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chrX 5018677 5' - roo 404 1 74.55 TACAAGTGTCCTTGACTTTTGTTTCGCATTTTTTCTGTTCATCTTGCGTACGAAGTTAAGTTGTTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATGTG:1 - chrX 5342124 5' - Quasimodo 30 2 70.00 ACCAAGTTGCCACTTTTGCTTGTTGTTTGATTAAATTGTTTCAATTGTAAACGTTGCTCGCAATTTGTCGCTTAAGAGAGCGAAATTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAAT:1 + chrX 15596237 5' - G4 33 1 62.73 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGAGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGGCCAAATGAAAAGAGCCAAAACAAATCCCAACTCAAAGCGTTGAGGGGACAGATCGGAAGAGCGG:1 + chr3L 4001105 5' - mariner2 568 1 61.82 AATCCTGCTGCAGAATGTGCAGAGCGCGCAAAAGTAAAAGCCGGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3L 14755071 5' - P-element 2852 1 45.63 TTGCAATAGTAAAGTACGGAAATATACGCGCAAATAGTAATTGTTAAAACATAATGGCCCATTTGAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 4582647 5' + 1360 9 2 71.29 AATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATATAATATAATATAATATAATTGTTTGGGAACGAGACAACATGTATA:1 + chr3L 20525228 5' + 3S18 5770 2 72.92 TTTCGTAAGTTCCTGTAATGTTTTTATTTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAT:1 - chrX 10739571 5' - Stalker4 10 4 69.47 ATTGCATTTTAAACAAAGCGTATTTATTCTTTTCCCATTGCTTTTTGTCATTGTTTTTAGAAAAGTTTACAAGACTAATAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 + chr2R 15855636 5' + opus 3 2 72.73 TAAGAGGATTTTTCCTAGTCTCAGAGCTTTTATTTTAAATAACTTTTTTAAATATTAAATTGGGTTTTATTTAACTTCTCGGTTTACCTTTTTTCTTATTTAATTAATTT:1 + chr3L 17119845 5' - X-element 4719 1 39.09 AATTTCACGACTTATATCTATGGAAATATATCTTTCTCATTAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGC:1 - chr3R 21801331 5' + 17.6 99 2 62.73 ACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAAT:1 - chr2R 6801710 5' - McClintock 468 2 65.56 AACATGTTATATAAGGAAAACATTGAAAATTCCTTAAAAAGTTTACTTAACAGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 7219778 5' + roo 28 2 58.10 TAAACGCTGCTTGAAAAGCATAGCATACTTTTTTGGGCTCGCCTTTAAGAAAGCATATTACTCAAGTTGGCATGGACATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGC:1 - chrX 5859417 5' + BS 19 1 72.48 CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCCTCTTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTTTTCCTCTTCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 - chr3L 22908066 5' - Stalker3T 206 1 40.62 ACCCGCATGTCTGTGACACTTGGACATCATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCACGCAATCACATA:1 + chr2L 14522029 5' - baggins 5246 1 68.83 AGTCAGCTTGGGGTAACAAAACACTGGGTATATACAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCCTGATAAGACAACCA:1 + chr2R 15445855 5' - opus 445 2 68.18 CGGAAAATTGGAAGAGCAAGAGGAGAGGTGAACTTTGGGAAAAACCAGTGTATGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 - chr3R 10285578 5' + 1360 16 1 49.46 AACCAGAAGCTCAATTATCAAAATGCTATGTGTGTTTGTTTGTTTGCTTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCG:1 - chrX 20013916 5' - accord 7011 2 64.95 CAAATTAGAGGCCAAACACGTTTACTGTTTGTTTTTTTTTCTTTTCTT:1 + chr2L 9676070 5' - gypsy7 5014 1 77.08 GCAACGCGGCTTTTTGCGGATCACGTTCATCTCCTGGGGACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 - chr3L 15408510 5' - jockey 4946 1 64.55 CTTCAGGCTTTATTATGTGGCTTCCAGCGACTCGGGGCTTGCGTCCTTTTGGCGGGGG:1 + chr3L 18271542 5' + HeT-A 5735 1 58.62 TATTCTAATATCTTTATGCAGAGGAAAAGGCCAAATTCATTACCCAGCAACGACCAGCCGAAATGCCATCCAACACCGGATGTGCCAACAACAACATCGACGATGCTTA:1 + chr3R 28510421 5' + gypsy10 5710 2 55.05 AGCAGGCAGGCACTGATGTGTTGTTGCCGCTGCCCACCTCTCCATATCCACTATGCACCATCCACTTAGAAATAAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAG:1 + chr2R 18312929 5' - Bica 159 1 60.78 TTTAAAAGAATACATTTTTAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGTAGGGAACTTA:1 + chr2R 9963654 5' - pogo 2062 1 50.91 GTATAAAGAAGACCATTAAAGGTCTTATAAATGTCACTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr3R 18202282 5' + jockey 4709 1 67.01 AAGTAAAATTTTTTAATAATTTTAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTA:1 - chr2L 4076887 5' - Tc1-2 1473 1 72.73 CGCCCGCCTTCCGGCCGATGATAATGGCGCTGGTCTCGCGTAAGCGACTTCGCGGGAGGATTTTCGCGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCT:1 + chrX 12868325 5' - Doc2-element 4532 1 65.05 AAACTTAGCTTGCGGAATGGTCACGTGATACGTCAGGTGCGGGAGAAACCTATTCTGAAATACAAAAAAGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATA:1 + chr2L 15296352 5' + hobo 2711 1 73.12 GGTTGTGAACGTGTCCATAGTCAAGTCTTCCGAAAGATTTGAAGATTCTTGGCGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chrX 14853458 5' - P-element 2867 1 58.59 GCACCCCAATATTTCGCCCCGTGTAGCAACAAAGTGGGGTTCTCTTGAATCACGAAATAGTTTCGCATTTTTTGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTG:1 - chr3L 20508786 5' + Cr1a 217 1 62.73 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAG:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 204 1 65.45 CCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAACTTGCAAAAGCAAAAAATCAAGTTGACAAATAAATGGTTTAAAATTGTCTTCAGGCTGCAAA:1 - chr4 1294988 5' + HeT-A 138 1 52.94 GTTAGTGGCACTCAGCCTCCTTTAAGTTCACTTCCATAGTTTTGCATTTTGATTGTGATGCCGTCCGGTGTGTTAGTTTCAGTTTCAAATGATCAGTTACAATAAACGGT:1 + chrX 19343774 5' + HMS-Beagle2 264 2 67.27 GGAGCGAATTATAATGCGAACACAAAAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCG:1 + chrX 16235554 5' - G5A 2636 1 73.74 TCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chrX 9845530 5' + F-element 49 1 65.69 AATAGTGAAACACAACATCAGCAGCAAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGG:1 - chr2R 10556635 5' - McClintock 6083 2 76.36 CTTTACTGCCTGGATTTCCGTTAGTAAATTGAAAAAGCTCTGTGGGGGTAAGAAAAAAGAAAACAGCAAAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTAACA:1 + chrX 6208522 5' - copia 97 2 40.91 GCATTTTACAGAAACCAAAACGAAAAAATGGAAAAACCCAAAATAAGAGTAGCCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAA:1 + chr2R 9299517 5' + accord 130 2 71.08 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACACA:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 421 2 42.16 ATGGGGCATACATATTGTTGTTTGCCGATCCATTGATTTGTGGGGTCTATATTAATAGGCGTCTGCTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGACA:1 - chrX 9576615 5' + FB 20 1 62.73 TCATAGACAGCTTCGTCCGAAGCGCCCAACTTGGCATATTCAATGTTGTAGAAGATGGTGTTGTTAAAGAGACTCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCG:1 + chr3R 15854646 5' + F-element 4356 1 79.21 CAGCATGCTTCATGCTTTATGGTTACTTGGTCAAGGGCCTTTCATGCTCTCTAGCACACCCACACGCACACAATTATGACAGTTGTTCTA:1 + chr2L 20529880 5' - invader1 221 2 77.78 TCAATGGACAACAATCTTTTTATCACGTAACAAGAAGAGAAGGCAAGACAAAAAAAGCGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAA:1 + chrX 2462326 5' - Circe 7258 2 62.22 ACTAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTGTGTAAACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTAT:1 + chr3L 16973391 5' + S-element 1581 2 70.00 AAATTGTGGAGCTGCTGGATTGCAATAATCGAGTTTAACCACTTGTGGCATATCAAAAGTACTTATGGAATACTTGAATTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGAT:1 - chr2L 13066685 5' - Quasimodo 86 2 61.82 GTGAGAAAGAGAGGGGGAGAGGGGGAGAGGTGAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGG:1 + chr3L 16770096 5' - GATE 39 2 64.29 AGGGCTTTTCAAAAGAACTTATGTTCTTAAATTCTTTAAGATCGAGCTACTTTACATGATTTCATTTTCTCAAGACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr3L 23257591 5' - blood 7377 2 69.09 TAAACTCCACGTGCTTTTTCAGACAACACTTACTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCC:1 + chr3L 19136068 5' + Idefix 7075 2 54.29 TGGCCCCAAAAAGTGTGCTATACATTTTGTAAGCTGCTTTCGATGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACTTCTTAAA:1 + chr2L 6311248 5' + hopper 30 1 50.00 CATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCTTCTGGCTGACATATATTTATT:1 + chr3L 18072742 5' - 412 439 2 66.36 TGACGGGTATACTTATAGTTATGAAATTGTCCATGCAAATCTGCAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCCGGGATAATGCTTACGTTGCAGTA:1 + chr2L 149579 5' - gypsy2 6545 2 62.11 AGGGTTATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGATAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACGC:1 + chr3R 25434755 5' - opus 478 2 58.33 ATCGATGGTTATTAGTCAAATAAATATAAAAATTCCAGATATATGTATAGCAAATAAGTTTTAATAAAATGTAAGCAAATCTGATATATTCTTTGTTTTTTGTTTTGAAC:1 - 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chr3R 30209346 5' - F-element 4653 1 60.64 GTCTGTAATTTTTCTTTTAGTGGTTGTATCTAATAGAGGTTGTTAACTTTAAGTATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGAGTGCATT:1 + chr2R 8335396 5' + invader1 3789 2 64.04 GGACTTCGGAGTTGTCCGCCGGGTAAATTGCTTGTAAAATGTAAGCAGCGTCTAAATTAACTTTTGTTTAACATCAAATATATATAGCTTAAG:1 - chr3R 11289525 5' + Copia1_DM 4300 1 74.19 AGCCGGAGAAGTCCGCAAAAATTCCTAGACACAAGACTTTTGGGAAATAACCCTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCATT:1 - chrX 8811048 5' - 1360 3358 1 70.00 GTGATTTATACGATCTAACTGTTTTTCCATTACATTTGCTTTTCCACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - chr3R 5694367 5' + INE-1 556 1 55.56 ATGTCCACAATTCGACAGGTGTTGCAACCGTGAAAGATAGAAAAAGCGTATTTATGTCGTCATGTACTTTGCTACAAACTTGCTACGTAACAGGTATCTGATAGTCGAG:1 - chr2L 9173197 5' + INE-1 552 1 62.39 GCTGATTTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAAAAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr2R 25203747 5' - 1360 3371 1 64.55 CTCTGATTACATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATTCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr2L 4013040 5' - pogo 2065 1 76.92 CAGGCGTCATGTATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr3R 25434825 5' + opus 36 4 66.36 TTGTGGGTTGTTGTGGCCCACCATCGCAACATGGATCGCTTTTTTATGGGCCTCCAAATCGCTTCTTTATTGCTGAGACCGCCGCTGTCTAAGAGAGTCATGTGGACATA:1 + chr2R 20298260 5' - Tabor 7046 2 79.09 TAAACAATGAGAGACACAAAAAAGCCGAAATGATTTTTCTCACGGGCTAAGAGAAATTAAAAGGAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 2910749 5' + Doc2-element 239 1 62.50 TGATTATGATAAGCGGACAAGGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGGGGCTTGTTTTGGACTCTGGATGCGTGCCACTTGCAATATG:1 - chr3R 16982400 5' - TAHRE 9999 1 73.86 AAAAAGAATTTTGATTGAACTAAATAGATTTTGATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATACTTCGCTTCGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr2L 14848374 5' + pogo 25 1 54.55 CGAGTCTCAATGGCAAAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chrX 5515620 5' + copia 28 2 54.46 GTGCATAGAATATATGTAGCCTACTTTTAAGGGCCTAAGATGTATAAAGAAGACCATTAAAGGTCTTATAAATGTCACTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 - chr3R 18202323 5' + jockey 4669 1 79.59 CAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 419 2 32.38 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACAACGCAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 419 2 38.18 AGTTCGGTTATCAATCAAAGAGCGAAATCGCAGCGCCAGCAAAGCAAAGCCCGAAAAAAATAAATGGCTCAACACCAAAAACAACAACAGCCGGGATCAAGCCCTTAACC:1 - chr3R 24490311 5' + I-element 158 1 70.00 ATCGTATAATGTGCGGTTTAAATTTTGTGCCATTTATAGACAGATTTATTTATATTTATTTATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 + chr3R 6309790 5' + F-element 33 1 43.64 AGTGGTTTTTCGGAGTTGGAGTTGGACTTCTATAGACTGCGGTTACTTATTTCGCCATTAAACGTGTAAGTGACGTTGTGCATTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 - chr3L 38274 5' - HeT-A 6062 2 69.90 AAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAA:1 - chr2R 2879430 5' - Stalker 6927 4 80.00 AGTTGTTGGCACTGAAATGCGCACACAAACAGCACACATATACGCGTTTTCGTCTCTTGTTTTAACTCTCACAAACAAGCAAATTCTATTTT:1 + chrX 22919197 5' + 1360 3262 1 67.39 ATTTTCGTCTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 - chr2R 18807917 5' - BS 5081 1 66.67 ATTTCATCATATTAAGTCAGATAGTAGTTATCCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2L 7750563 5' + opus 7043 4 69.47 GTTCCTGCAGAAGATTCGCGAGGTCATCGCCATTGCCAAGTACAAAATGGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 + chr2R 11332812 5' + Burdock 62 2 60.22 GTGCTTGCAAATAGTTTATGCACGTCACCGAAAATAAATGGAAGACGACCAGTTGGCCAGAGGAAAAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAG:1 - chr2L 2943636 5' + 1360 445 1 66.06 TAAATCGGATGTGATTTTGGTTATTTTGGTTTTTTATTTCGATTGTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 - chr2R 8146904 5' - Stalker3T 205 1 44.55 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 - chr3L 3456093 5' + Doc 63 1 73.64 ACCACCGCTCGAAGCTGATATAATTCCCCCACTTCCACCAGGCACGTTTCCAGCACGCCTACACAAGTGAAGACATCGAACCGGGAAG:1 + chr3R 7120355 5' + ZAM 8024 2 63.64 GGGACCTTAACATTATTGTTTTCTGTTCGCTTATGTTTGAATTAAGTAGGATTTATGTCATGTTCCGATCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTC:1 + chr3R 14420058 5' - jockey2 3164 1 69.09 GTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chr3R 31633167 5' - opus 7453 2 78.49 AGCCAGCAGTCCTACTCTAATTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGA:1 - chr2L 12036185 5' - 297 6946 2 58.18 CTCCGTCTCGGATTACCCAGCAAAAACAACACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGCGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAATTACTTTGTATATTTTTTTGAAC:1 + chrX 18535612 5' - Cr1a 167 1 74.55 TAAAATTAAACAAAATGAAATAATTTAAACAAGTAACAAAGAAAGCAAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAG:1 + chr3R 15950568 5' + invader2 4675 1 68.92 GAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAAATAAA:1 - chr3R 12040198 5' - HMS-Beagle 189 2 71.82 GGGGTATGAGCTCAGAAATAGGTACACTTTTCTCGAAGTGTAGCTGTTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTT:1 - chr2L 886917 5' - I-element 100 1 56.25 TTCAATCATCGACAGAAAAGCGGTGACAAATGGATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGT:1 + chr2R 24635216 5' - I-element 190 1 70.00 ATTGTTACTGGTTTTTTCACTTTTCATCAATAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGACTC:1 - chr3L 8919690 5' + roo 53 2 71.82 GGAATGGGAATAGGAGTTGGGGAGCCAGAAAAACAGAACAGAATTCAAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGT:1 - chr2R 16815024 5' - Tirant 270 2 57.27 CTGGGACTGGCCCGAATTCAACTCGAACTCAACTGTATTTGTATCTGTATCTTTGGGTTGTCAGCATGAAACATGCAACTTAACTGGCTAATAGGAAAAAAATCAAA:1 - chr3L 16299979 5' + Porto1 4195 1 71.96 GTACAATTGTATAAACGTATGTACATGTGCACGTGAAAGCAATTTTATTTTCCATCCGATATTCCACTTTGTTGTTGTTGTTTTCAGTGTGCATCTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 10959037 5' - accord 187 2 62.73 TTTGGCAACTTTATGGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTTTTTGGGAACACGACACCCTCTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACCTTCTTAT:1 - chr3L 19948914 5' + 3S18 5809 2 50.00 CAACAAGTGTCCGATTCTTGGAGTTTCTTGGCCTTGCACATTGGTGAACGTTTTTTTGTAAATCGATCCGAGCACGTGGCAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACA:1 - chr3R 25737887 5' + S-element 3 2 74.31 GTATAAAAAGTATATAAATATGTATACAGGGACCGAGAAAGCGTTAGGTAAAAACCACACACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCA:1 + chr3R 31862780 5' + 1360 3247 1 60.91 AATAAAAAATCGAAACAAAAAAATAACTAGGCAAGAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGCATTTTCGTAC:1 - chr3R 20255640 5' - pogo 91 1 70.00 CCAGTTGCAATATTTTTTGCATACCAGCAACAAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGGGAG:1 - chr3L 23599779 5' + invader4 110 2 54.67 GTCGTATCACAGCTGATACCCTTTTGTTTTAGTTTTTATTTACAGTCTGTCTTGGTAGACAATAAACAAATTTGGGAGCGTTAAATAATTGTATCACCGGATGAATTGAG:1 - chr3R 21133846 5' - G3 4547 1 79.09 ATTTATTTCTCCTCCTGCAAGCATACTCTTTAGTTGGTGTGTGTTTCAGTAGTAAATAAAAATTAAATCAGAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 - chr2R 4137762 5' + Juan 9 1 70.71 AGCTATTGCAGATCAGTCAATACGTTCAACATTAGAAGGAGATAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr3L 12677139 5' - pogo 2083 1 57.61 AATCGTAGCTATTGGACTCGGATTGGGTAAGAAAACATATATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTATCAAAA:1 - chr3R 28639981 5' - mdg1 391 2 57.14 TTTCGATGTGTTGCAAGCATGATTGAAAAATATTGTATATAAAAAACTATCGAAAAATGGTTCAAAAATGTGGGCGTGCCAGCTTTGGGCGGTTTTAGGGCG:1 + chr3R 22564935 5' - INE-1 346 1 73.53 CATTGCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 23861063 5' - pogo 2077 1 56.73 ACAAGTTCGTACATCAATCGCTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTTGTATTATTTTTATTTGTTCGAGTCTGGGCCAATT:1 + chrX 8063397 5' - I-element 4911 1 70.00 TAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGTGA:1 - chr2R 5064833 5' + Stalker3T 202 1 74.77 AGCAATTGAATGTTCTCGGGATGGATTTTTAAGCCACTATTTTGTGTGGTAATAATTGATTATTCGTGTTTTTCGATTCGATTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTA:1 + chrX 6794640 5' + invader6 4607 2 70.91 GCCTACACAGAATGGGGCTTACATTGGGAAACTCGGACGGCGCACTCCCTTTTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATA:1 - chr3R 23730080 5' + Burdock 6145 2 72.73 CATTTCTATCCTCGGTTCTCTTTTATAGACATGTGTACATACACCCCACAGCACCCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCT:1 - chr3L 17060871 5' - roo 8841 2 64.44 TTGTTTTACGTAAGCCATTCAGTCATTCATGCCCGGCGTGAAAGAACCCAAGCCCAAGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCA:1 + chrX 18699284 5' + F-element 332 1 73.40 CGGATGGAAACAGTTTCACTTCATTCTGATGTAGCTAATTGTGGCCATTAGCAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATG:1 + chrX 14812298 5' + R2-element 469 1 57.28 GCAAAAGGATAAATTGTTTGCATGTCCTACAGAAACAACACCGATCCAGCAAACGAAAAACCGAGAGCAGAGCAAAAAATTAAACGAAGATCGCCAATA:1 + chr3R 30658688 5' - accord2 7574 2 68.69 GAAGCGACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCCTGATGAAATAACATCAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr3L 131824 5' - P-element 2875 1 65.59 CGTGTCATGCTGGGTCTCACTAGCAGATTAGTTTCGTTGCAAGTGTGTTTTTGAGTTTTATTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTG:1 + chr2R 16382198 5' - Doc2-element 439 1 57.27 AAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACACTCCCAACCGCAGACATCGAGCGGTCA:1 - chr3L 64540 5' + F-element 299 1 68.27 GTTTACAACAAAATGTTACAATATTTTATTCTTGGGTTTGTTGAAATTTTCAAGCTGTGTAAACAACGCTGTTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3L 15819309 5' + pogo 10 1 71.82 GCAGCGTTTCGATTTGGTGAACCCTAAGAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 + chr2R 21361995 5' - Tirant 8457 2 72.12 GCTTCACGCTAATTCTGTAAACATTTAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 + chr3L 16046886 5' + P-element 60 1 26.36 TCGGAAAAGTCTGCGCTTCCGTTGTGTATATTCCATTGAGTTTCCCCCATCAAACCGTTAGGCACCTCTTTTGCTTTTCCTTTTGTGCGTTGTCCGCAGTGCTGTTTG:1 + chr3R 14582836 5' + Cr1a 233 1 74.07 GATTTTATGGAGGTAGTTTTAATCCTCGAAAAAGAGTCAAATCGATAACCGAAATAATAAAGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chrX 22861631 5' + 1360 16 1 63.81 CCATTACCCAAACAATGGCTATCTTTATACCAGTCAATCGTTTCGTAGATCGATGCCTCGAGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCAC:1 - chr3R 4627143 5' - Circe 7205 1 70.21 CTACCACAAGAGGCTTCACAAAAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAA:1 - chrX 10760579 5' - baggins 5128 1 60.00 CAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 769992 5' - roo 9026 1 70.64 ACTCAGAACTCAAGTGACGTGCGCGACATATAACTCTTTTGGATTCCGGATCTTGTCGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr2L 3323298 5' + hobo 21 1 56.86 TTTGTTGCTGTTGTTCTTTGCCGTGCTGCTGCGGCTTTGGTTTTTGCCTTTATTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26779693 5' - Doc2-element 232 2 52.86 AGCGCTTTCGGTTTGTCCCACTGTTGGTGACAGAAAGATGCCAAAGCGCAAAGTAGACCGCAAATAAACACCGCAAAACACAGCACACAAAAAATAAAAAAAAAAATGGG:1 - chrX 20656570 5' - hopper 140 1 61.82 TGTGTGCCTTCTCTGATTCCCAAATGTAATCTCTGCTTTGATGTGCCTTAATTTGATGGAAGAGACACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 7113606 5' + roo 19 2 62.96 CTTGAAACGCCCGGAGGACGCATCAGGCCAGTGAGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAA:1 - chrX 2246313 5' + jockey 474 1 62.64 CCACAGCAATTGTAATGTTTAAATATTCAATGGGCTCGAGCGGAAAGTATTCAAACCCAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chr3L 10836512 5' - opus 477 2 61.82 TTTAGCTAGAAATTTATAAGGCGAATGCGACACGTTGCCAAGCCCCAATCCGATCCACACCCACAAAAATGCTACGCCCACATTTGTAAAAAATT:1 + chr3R 21985707 5' + INE-1 371 1 69.47 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACACACACAAA:1 + chr3R 21907534 5' + gypsy3 415 1 28.18 CAGGTCCTTTTTGTGTTCGTCGTGACAGTCTTTCTCTGTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTG:1 + chrX 14560788 5' - Doc3-element 4567 1 60.82 GAAAACATGGGGCTCTTTCCAAGCCGCTCTCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAA:1 - chr3L 14274317 5' + P-element 19 1 43.42 AACGGGCAATTTAATTTACAAAGTTGAAAGCAAGCATAGGCCACCCCCTTTAAGTCTCATACATATTTTGATTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGGGTAC:1 + chr3L 76299 5' - Idefix 6913 2 76.36 AAAGCAAAAATCAATCAGGCATGACAAAAGCAACAAGCTGGAAATGACCAACCAGCCCAACGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCATTTAATAAAATGATATT:1 + chrX 8877347 5' + Doc3-element 4631 1 57.27 AGTGTCGTGTTACGAGTGGTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAA:1 - chr3L 972827 5' - 297 6961 2 51.11 ATTCATGCGGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3R 15524394 5' + pogo 30 1 55.45 AGATTCCTCGGAATTGAGCTCCATTACGTCCTCGTGGCCGTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAA:1 + chr2L 234271 5' + Dm88 4522 2 60.00 CGCAATTGTGCACTGTGTGTATTTGTCTTTTTTTTTTTGGGCAGGTCTTGGGAAAAGATAGTCGCATTAATTTTCACGCGAGTGCATATTTGATTTTCCCTTTTTTTTTT:1 + chr2R 20403726 5' - Doc2-element 251 1 56.36 CAAAAGGTTCAAGCGAATTTTATGCGTTTGTCGAGGTGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAG:1 - chr3R 26775933 5' + Rt1a 45 1 68.63 AGATGCTCGGTCAAAAAGGGTTTTCGGCTCACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTATACAACAGATACCAGATAGGAATAAGAT:1 - chr3R 28979054 5' + Idefix 106 2 65.22 AATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTA:1 + chr3R 19449918 5' - roo 8699 2 74.49 AATTCAATTAAAATTGAATTTCATTCAAACTACCCGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACAAT:1 + chr3R 12623700 5' + roo 19 2 57.89 GATTAGTAGGCCAAAGCTGGAATTATGACCTTAGCCTTCAGTTTATATCATAGTCAAATTTCCCATTTTCTTATGCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCG:1 + chr3R 5807740 5' + F-element 4503 1 78.12 TACCGAGTTAGTATGTGTGTTAGTATTTAAGTGAAGTACCCATTAACGAAACTTCCTTAAGGCTAACGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATT:1 + chr2L 21360587 5' - rover 9 2 65.45 GGATTGTGAAGCCCCAAGAGTACTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAACGCTGG:1 - chr3R 22595855 5' + FB 32 1 65.82 GATGTAATTTTTGCATGTCTCCGGCATTAAATTCTACACTGCCCACGCTCTCCGTGATTCCCTCGCTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3R 13732931 5' + hopper 3 2 73.20 GATGCGACGATACTGCCACCCAGAATTTCGAGGGAGGGAGTTGTACCAGGAGGTTGATTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTTTTATTTATTTATAATTATTCAGTT:1 - chr3R 30865449 5' - Burdock 306 1 54.29 TGACTCGTTGTGGTCATAAAAATTAAATTTTGTGTGGGCTAAAAGTTCGCAAAAAAAAAAATATATATATGTAGTGACGTATTTGGGGGGTCAAA:1 - chr3L 5553281 5' + 297 6583 2 71.58 TGGATTTGCTTTTGTTCGGGCCACGGGGCGTATGCGTAATGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTAATTTGTAAGTCTCTGTGTATAT:1 - chrX 4753163 5' - Doc3-element 4442 1 62.86 CAATCAAAGAAATTGCGGATTTTCAATTATCTGTTGACTGCTTCTATGTTTAAATCATTATGCATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTG:1 - chr2L 5697322 5' - Porto1 4349 1 70.37 AGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 23146500 5' + 1360 53 1 70.64 GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGTGTTTGTGT:1 - chr3R 21907534 5' - gypsy3 418 2 34.55 TTGCTCAACGCCTCGCTGTCGGCCTTTCCTTTATGTTCACATTTGTTTATTGGTATAGCGGAAG:1 + chrX 5081884 5' - Porto1 449 1 70.31 TGCATATTTGCATTATTTAATTGACTCGTACCTTTCCTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGCCATTTTA:1 + chr2R 20924220 5' - mdg1 7412 2 69.09 CAAAAGTAAAATACGTGACATGTGTTTATTTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCG:1 + chr2L 11921313 5' + Doc 4424 1 73.64 TTCACCGAAAAGCTCTGTGGGTGGAGTGCCCGCTAGAAACGCGGCGCCATGGTGAAATAACATAAGGGGG:1 + chr3R 23943188 5' + P-element 2 2 64.29 AAGCCACTCGGGCGAAGGAAATAAGTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACAGGTCTCCAC:1 - chr3L 12103131 5' - Doc 27 1 75.00 CGCTTACCTGGACACAAGCCTGCGAGAGGACGAAAACATGCAACACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACA:1 + chrX 15945100 5' + Idefix 85 2 60.91 CGCTCAGTCTGGGCTTGATTTTTGCTATAGACCAAGTTCTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGGGGTGCGCAAATTTTCG:1 - chr3R 25529538 5' + R1A1-element 93 1 63.64 AAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGCCA:1 - chr2L 2484415 5' - jockey 4963 1 51.02 GTGAAATAATAACTTGAAATGTCTTTAATTTTTATGGCAAATAAATAAACACCTAACAACTGACCAACCTCTGCAAATCCCCTCGCAAGAAAACAAATCAGAGTA:1 - chr3L 8014368 5' + Doc 4507 1 72.38 TGGAGAATATGTTTACACTAAACTATAAATATACCCGTACTGTATACTCTTAATGCAATTAATTTACCAAACAAGTCCGCTAAAAAACAAAAAAACAGATTTTCCGAAA:1 + chr3L 5165864 5' + HMS-Beagle 439 1 78.90 TTTGATACTGATATATTCGCTATACTCGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTG:1 + chr3L 10911517 5' + springer 32 2 67.82 GAGAATGGGTTTCAAGATATATAAATTAATTAAATATAAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCAGCGTAGGTTGCAGGTAACAGGGGGTTCTCCTGTCACTGTGAG:1 - chr3L 16727209 5' - springer 7457 2 76.15 TCCAACGAATTAGGAATTCCCTAACTTCGGTATGCTAACAAACAGCTGACAGTTGTTTTACGATAACGTAACTTTATTTCGGCTGTCAGTTCAGAACTATATAATACAAA:1 + chr3L 15748728 5' - Chouto 121 1 53.64 ACAGTGTTCTAATTTGGTATACACAAACTATTTGAAAATATGTAATTTTAATTTTAATTTTTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 + chr2L 19157496 5' - Juan 4186 1 51.82 GATCAGTTGATCCTAGATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATG:1 + chr3L 4264947 5' + Transpac 4942 2 60.91 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAGCACTCAACTATCATTGCCTTATAAATTTTTCACAC:1 - chr2L 16217660 5' - 1360 434 1 36.70 GTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 17184924 5' + roo 14 2 75.00 GTGCGAATGTGTGAAAAGCACACCGGCCGAATGGAGTTAACAGTTAAGTCATGACGGAAACTGGCCAAAAAGAACGATAAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACA:1 - chr3L 16977066 5' - rover 122 2 69.81 CATTAGCTATCATAAGCAAATATAAATTAAACTTATTGCGAAATATATAATAGATTGTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCA:1 - chr2R 10163633 5' + Juan 4108 1 56.36 TTCAATCCTCTATTACATATAGTACATATATCGTGTATATTTTGCAGCGCTCGATTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTG:1 + chr2R 19332661 5' + micropia 5051 2 55.96 CAGAGCTACTCCTCTGGGTGCGACTGATATTATTTATTGTCGAGTCAGAGGATTTGTGTGAATTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAA:1 - chr2R 12825911 5' - 1360 3172 1 61.82 TTTCGACTACATGATACCTGGTTATACTAAATAATAAATATATACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr2L 16230377 5' + blood 30 2 62.24 ATGGAAACATTTACCTTGCTTATGGAGAGCAGCTGAGGAATTTCTTCTCTTTTCTTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTCTCTTTTCTTCTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTT:1 - chr3L 6793793 5' - Doc2-element 222 4 52.73 AGCTGAAAACAGCACTGACATCATTTGGTTATCGTTTATCTGACCACCTAATCGACGTCTTACTACGAAAATTTGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCG:1 + chr3R 3623569 5' - invader2 4819 1 67.27 AGCTAAAATTATACAGTCACGAGTTCGGGAAGAAATATAATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAACCCAGC:1 - chr3L 12158517 5' + 297 8 2 64.56 TACAATACAATACAATATAATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCACACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCT:1 - chrX 12946234 5' + 1360 49 1 83.87 ATACCCAAAAACCCGACATTAGAAAATAAAAGAGCCGGATATCCTGGATTTTTCAAGTTTGTCCTTCAGCGACCAACTTATAAGATAA:1 - chrX 14184391 5' + GATE 319 1 64.77 AGGTCACCCCATATACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGAT:1 - chrX 17026957 5' + flea 4722 1 79.69 GCTGCACTTTGCATTATTACATTAAACAAACAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCG:1 - chrX 16309842 5' + invader2 4799 1 70.45 CATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2R 24031496 5' - 1360 3350 1 81.25 ACGGGTTGTGGGTCATATCGATCAGCTTCCAAACGGTAATCTCGAAGTCGTGATGCTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGC:1 + chr3R 21100632 5' - F-element 4509 1 75.31 TCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr4 311173 5' + 1360 4 2 77.06 ATTGTGTTAAAGCACAAATAATTTATGAAACGACACTTGTAATAAGGATCACTAGACGAATCGATCTGGACATATCCGTCTGTCCGACTGTCCGTATGAACGTCGAGATC:1 + chr2L 21204769 5' + INE-1 132 1 67.27 AAAGCGAAACTCAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAAA:1 - chr2L 6835028 5' + Doc2-element 252 7 70.59 CAGGTTGATGGCTTTTCCCAGAAAATAAAGAGAGAATGGGGACGAGTAGATAGGGATACTGTTGGAATATACTATTCCACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 + chr3L 10722950 5' + copia 4894 2 56.19 GACGTATGTGGGCCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 + chr3L 25455109 5' + HMS-Beagle2 27 2 57.69 TAAACAAGTCTCTAAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTG:1 - chr2R 6984438 5' - HMS-Beagle2 311 2 79.09 CACGAGCTGTTGGCCAATCTACGCATTAACCTTTAACAAATGAACCCATTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGATTCACACGCACCCCAAC:1 - chr2L 1203619 5' + F-element 4456 1 54.55 ATCGAACGCTGCGAGCCGAAACTGGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAG:1 - chr2L 5951148 5' - opus 7028 4 61.90 CTGCACTAGAGAAAGAAATCTGAACAAAAATGTATTAAATCTTCTTAAAAGAGAAAAATTAGAAAAAAAAGAGAAAATTTAAAGGAACTTAAATAAATATAATTTATTAT:1 - chr2L 17057546 5' - HeT-A 350 1 54.55 AGCAAAGGCAGTCCGTGGCAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGGTCTATGCGAGGCAAGATCG:1 + chr2R 4312767 5' + F-element 130 1 73.86 TGCCGCTCGCAATCATTTAATCATCTGGAGTCATCAGTTTACTCTGACCAAAATGTGATGAAGTGGGGGGCAGCAACCCGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGGGTCGCTT:1 + chr3L 11471748 5' - jockey 4754 1 70.00 TGCGTCGCATCTGTTGCATAATCCTTAACCCACTGGCGCGGTACATGGCCATTTTCTAGTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGTGTCCAATATAT:1 - chr3L 21028338 5' - HeT-A 5989 1 73.40 TTAGCTGCGTTTTTGTGGTTTCGCCATCCTTGTCTTTGTGTGAAAATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACA:1 - chr3R 20119623 5' + rover 32 2 59.09 ATGCAGCTGCGGGGGTGGAAAGATGGGCGCGGGGTGGAGAGTTACGTACATAC:1 + chr2L 7910949 5' - Helena 1173 1 67.92 AGTCTAAAATGACTTCGCAGTGAATATTTTCTTGAAATAATAATAGTTGTTAGACATATAATATAACGAGAGTGTGGCTTATTGAAATATCACATTGGCAAAACGGACAA:1 + chrX 21580609 5' - I-element 5009 1 76.36 CGCTCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCACGCTACTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGA:1 + chr3R 24565865 5' - Stalker4 399 1 55.00 AATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTAC:1 + chr2L 19364081 5' + BS 4759 1 50.67 ATTTTTGTCAACAGCCAGAAGGGGAAACACATAACTTATACGCATTCTTGTCTCTTGTTTTTACTCACAAGCAAGCAAATTCAATTTTTAGATTTCTTACGCTCCCAGCG:1 + chr2L 2471696 5' + 1360 3284 1 76.36 AGGAAAAATTCTTGATTGGAGTAATCAATTTCTGAAGTGGCTAAGAAAGAAGAAGAAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr3L 27174897 5' - pogo 2095 1 70.65 ATTTTTCGGTACACGTGTGTGACAGGTGCCAAGACAAAACCACCCCTCTTCCAACCCCTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAA:1 + chr2R 17297052 5' - 1731 4540 1 69.23 GTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTT:1 + chr3R 24867505 5' - roo 353 2 74.55 ATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 63.64 TTTATGGGGACGCTAGAATAGAGAAATTCGCGTTTAAATCTATCATATATATTATTTAATTACTATAGTCAATAATTGTAAGAACTTCACTTTGCACTTTGTGTTTAACT:1 - chr3L 4627601 5' - Doc 90 1 56.36 TATGTTTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTTTAT:1 - chr3R 22081599 5' + 412 74 2 25.81 CGTCACCTTGAACGTATGCCAAAATCAAAGCGACCCCGTGATTAATGACACTTGATTAGGAATTCAAAGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3L 20642663 5' - roo 408 1 76.84 ATCGAAAACAGGATGCGCATGCGCAGTTGAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAGGGAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGGGAGGTACAACAAA:1 + chr3R 8927305 5' + Bica 240 2 71.82 AGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTC:1 - chr3L 15099656 5' + G4 3804 1 49.09 AGAGACATCAACATGGTTATGGTTTCGTGTCTATTTTTTTGTTGGTTTTTTGATCCCTTTTTAAAAAAATATCAAATTAAAAAAAAAGAAAAAA:1 + chrX 7082283 5' + Doc 4698 1 35.11 TCTAGTTCGTCTTTTTGGCTCTTGGTCAGCCTCATTTTTGTCAACAACCACTAACCTTTTGGAGCTAACTTCTTTCTTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAT:1 - chr3R 19448142 5' + Q-element 280 2 60.91 AGAGAGAGCAGGTTTAAGGACATGTAAACACATGTAGCACGACACATCCAGCAGAGCGATGGCTGGTGCTTCGCCTAGGTAACCGTAGGCCATCAT:1 - chr3R 9284071 5' + Rt1b 354 1 63.54 TGTTGAGAGCCAATTTTGAATTGGAATTGAATGGTAAGTGATGAGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCATGCGCCCTGCAG:1 - 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chr2L 14961825 5' + R1A1-element 349 1 54.44 CGAACCTTAGAAACGAAATCGAATCTCAACCTTTCGAACCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 + chr3R 11474901 5' - hopper 1393 1 59.77 GTAAACCACACAACCTTGCCCGAAGTGCTGATACCCTTCCACAGGGAGAAGTAACAAATTAAGTAGACAATCAGAAGGCACAGTCTAGGGTTCTGAGAATCATTACTG:1 + chr2R 16560599 5' + Doc3-element 4393 1 76.85 ACCTTTTCGTGTCCGCATTAGCGCTTCCCCCTCTCCACTTGCCCCAAGCCCCTCGATTTCCCTTGCTATCGCCGAACTTCCTTCTTTATACAGGGCTTCAAAAATAATCT:1 + chrX 1421164 5' + Q-element 272 2 70.00 CTAGGCAACTAATTGTAAGTAAAGTTACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGGG:1 - chr2L 14080062 5' + invader1 3783 2 73.08 TAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAAT:1 - chr2L 14025654 5' - HeT-A 6043 1 73.33 AGCGACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCC:1 - chr3L 131822 5' + P-element 5 2 72.62 TTGGAGACCATAACGTACTTAGACTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGG:1 - chr2L 5595535 5' - 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HMS-Beagle 209 2 57.01 CGCGTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chr3R 16349209 5' + P-element 35 1 49.09 AATACAATACAATACTATACAATACAATACAATACAATTATAATAAACATAAATAATATCAAAAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCT:1 - chr3L 21448026 5' + Stalker3T 113 1 68.18 TGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGCACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGGGGTCAATGCTGACACTCGGACTA:1 + chr2R 11379747 5' + jockey 4715 1 70.00 GATTACTTAAGCCATTTTCAATCAACACGGCCAAAACCATACCCACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTCTTCAA:1 - chr2R 21840177 5' + hopper2 1216 1 60.55 TCCAAAATCGGTGGGGCTGTTAACCGAACTAATTCCGAAATCAGCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chrX 3528638 5' - roo 9041 1 57.00 ATTGGCGCCGGAAATGTGGGGGGCGATCTCGGCACACAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTG:1 - chr2L 18128326 5' + R2-element 466 1 73.33 TATCACGTTCTTTATTAGCAAGCCGATGAGACAAAAGCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTC:1 + chrX 387306 5' + 17.6 7109 2 68.18 TAAGGTTCATTTATAATACATATGATATATACACAATAAATGCCTAACGACTCATAGTTCGACGTAAAGTTCTTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAG:1 - 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chr2L 7660732 5' - Quasimodo 40 2 79.61 GTAAAAAGCGAAACATATTTGAAATGCTATCAAGGCCTCTTTAGACGCCTACTCACCGCCCAAATCATTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGACAATTGAAAAG:1 - chr3L 455154 5' - Tc1-2 150 1 50.91 TATACGAGGAATGGGTGAAATTAAAAAAGGCATACGTAGTATCCATTTAGAATTCGTGATTATAGGAATATAACAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 19368287 5' + Osvaldo 1520 1 72.94 GTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr3R 5671434 5' - 1360 3338 1 80.85 ATTTAACTTATCTACTTCTAATGACGACACTATCCATAAATATACTAAATGCATGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCAAC:1 - chr4 617446 5' - R1A1-element 5034 1 62.89 GTGCGTGCGTGCGTTAATTTTGATTTATTCGAATAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTG:1 - chr2R 18116216 5' - jockey 4753 1 66.00 CTCTCACTGTTTTGGCCACAATCTGAACTGATATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGGGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATTAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 9435789 5' - roo 9064 2 71.82 GCTTCCACCATCGGGCATCTACGGGAAATGCCTTTGACGATCATCGCCGTCGAAGGGGGAAAGGAAGTTAAATTTCTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATA:1 + chr2R 17785672 5' - Tc1 1637 1 70.75 TAAACTTTGGCAGCCACTTGTACAAATACCTTTTCGCTACAGACATTAATGTATAAGATCAAGAATTGAGCGCGCTTGCGGCAAAAGAATA:1 - chr3R 27465405 5' - Gypsy12A_LTR 2099 1 78.02 ATAGAACTATAAACACGATTTTTATGACATTTCCTCATCAGATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 13481238 5' + roo 8687 2 57.30 TGGGTGGGTTTTGGATGGGATGAGTGACTAGCTGGCTGTGTGTGTGTTGTGTGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chr3L 1908044 5' + S-element 8 2 44.32 TGAAAAGCATAGCATACTTTTTTGGGCTCGCCTTTAAGAAAGCATATTACTCAAGTTGGCATGGACATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATC:1 - chrX 5859406 5' + BS 29 1 62.96 TTTAATTTCTTTGAAATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 + chr2R 15155194 5' - flea 216 2 63.81 CGCTCCCCACGGACGGAAGCCAATTCAATAACATATTACGAGAGTCAAGCTGTAAAAAATGTCCTGCGGCCGCAAAGTTAGAACCGCGACGATA:1 - chr2L 10811201 5' + TAHRE 189 1 78.72 CATGGCGATTGCAATGGCATAGGGGGTTTCATTTTGCCATCTGAAAAGCGTCTTAACCCC:1 - chrX 19162999 5' + G7 51 1 86.67 ATATGGAAAAGACTTTGACGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr2L 21784853 5' + I-element 32 1 59.60 GGCACCGATGCTGGCTTTCCGCTGGAAGTAGCAGGTGTTGCAACTGCGAGTCTGGGCCAATTTGGGGGG:1 + chr2R 23316361 5' - I-element 4904 1 78.26 AATGCAAAAAGGCAGAGAAACCAAAGAGTCACGCCAGAATACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATG:1 - chr3L 3294676 5' + I-element 433 1 66.67 AATGCGCCAAATTAATGAAGTTGCATAATTTATAAAATATGATCTTAAACACAGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3R 7049726 5' - 1360 3370 1 60.00 GTACATGAAACCAGCTGCCCTCAACACAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGATCTTGCTCCACAATTCTATAT:1 + chr2R 25173872 5' + F-element 4232 1 70.64 CTGTCTCAGCGCCCTCGTCCTCGCCACTCGCACTACTCCCATTTTAGCGCATTCGATTGGTTTTTTTTTTGAATAAATCAAAGTGTGCTGAGGTTGG:1 - chrX 823577 5' - Stalker4 316 4 72.16 ACATATTTCTGGCATCATTCTAGTTATTTGTTTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 26734052 5' - hobo 2922 1 54.67 ATACTGCCGCGCCGTCAACATTAAGTTTGCCAAATGAAAGGATAAACTCTTCCAGAGATTTTACACGATATATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 12452919 5' + roo 4 2 75.26 ACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGGGCCGCTTAAGGCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGGC:1 - chr2R 5924403 5' - jockey 4724 1 23.23 TTCAATAAACGATTATAGCAAAAATGAAAAATTCGACGAAACTATTTATTCAATTGATTGAGAAGCACTTTATTATTATTATTATTATTA:1 - 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chr3R 30285754 5' + pogo 447 1 63.73 ATAATATAATATAATATAATATATAATAATATATAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 + chr2L 15950935 5' + Quasimodo 36 2 91.00 TTTTAGAAGACGAAGTCATAAACATTCTTAAGCTCCGCCGACGTCACTGCAATCTGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAA:1 - chr2L 21264390 5' + I-element 5155 1 57.27 TAATTTTATTAGCTTCTGAAATATGATCCTATCTTATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTT:1 - chr3L 11426367 5' - Stalker3T 203 1 73.64 TTTCGCTGGTAGCGCCTCATAGCTCCTTTCCGGCCAGCCCACCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCACATTATATTTTTAGA:1 + chr3R 16527036 5' + 1360 3266 1 58.49 TACGTGTACTTATGAATGAATTTTTTTTTGTAAAATGTAATGTGTAGATAGAAAAAAAAGTCCCCTTAGTTTTTCGTGTTCTTATTTTATTTACATTCTT:1 + chrX 22509789 5' + HB 164 1 91.00 AGACATTCACACAGATACTAGACAGCGGACTATCCTGTTTGTGTGTGTGTGTTAGTGCTTGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATAT:1 - chr2R 13634764 5' - Quasimodo 7 2 70.91 GGCTAATTGGTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr3R 22595827 5' + FB 35 1 68.54 TGGCCGTTACGCATCTTCTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCTAACTCTGTCA:1 + chrX 20783462 5' - Porto1 4505 1 66.36 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACA:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 419 1 33.33 TACTAAAACATTTTAAACATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 + chr3L 17595303 5' + jockey 4681 1 62.07 CAGAAATGCATTCATTTCAAGAAAAAATTAGAGAAAAATCAATGGCAATTATAAATTTTTGCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 + chr2L 18570470 5' + FB 17 1 61.39 ATACGCTGACAAACTGAGGAACTGAAAACATGGGGCTCTTTCCAAGCCGCTCTCTCGCCCATGCTGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 14274340 5' + P-element 6 2 65.12 GTTTGTTTTCTGTTAAATGTTCAAATATATTATTGCAGCCCCTGAGATACTGAAGGCTACTATATGTGTGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 + chr3R 28224727 5' - flea 5003 2 71.82 CACAAGGAACTATACATGTACATATATGTGTGTGTGCAGTGGAAAAACTGGTGTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTG:1 + chr2R 9552275 5' - S-element 1688 1 52.73 TTGTTCCTCGCAAAATAGTTTTTCCATTATGGCGTTATACACACACACAACACACACACTGTTAGCTTATTTAAGACCAAGAATAAAGACGA:1 - chr2L 15222279 5' + ZAM 8264 2 63.04 GTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAATTTAAACATTTTTTTTATTTTTTATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGA:1 + chr2L 22136609 5' + INE-1 506 1 60.91 ATACCCGTAGGATTCTTTTTTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGGTGGTAGGGCCTTTCGCCG:1 - chrX 16251586 5' - F-element 4523 1 73.86 TTTTCAGAAGGCATTGGCAACAGGAACAAGAACAAATGTTCAATTGATCTAAAAAAAAGTCAAAAGTTTGATATTCATCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATG:1 - chr3L 24211077 5' - Tc1-2 227 1 74.55 ATGCGTCTAGTATTTTGTTTAGAAATGAAAAACAAGATAGAACGCTGCAGTCTAGTTGCTCGACTATCAGATACCCGTT:1 + chr2R 6948424 5' - INE-1 553 1 77.22 TTGGGCAACTCGATACCAAATACCCCGCCGTTTATAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTACGGACAACGACAA:1 - chr3L 17153638 5' - 297 6930 2 68.18 TGTATTGCCACGCACGCGCTGAACATCCGAGTACAATATTTTGCTAATGAAAGTCTGTCTCTAGTTGTAAAACTCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTC:1 + chr3L 3089631 5' + 297 6735 2 71.56 ATCTGCGGTATAATACTATCGTTTGCCATAGAATTTCCAATCCTCAAAGGAGATGGATGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAA:1 + chr2R 1592630 5' + FB 11 1 51.82 TTTTCATTTTTAGGGTTTGATTTAAAAATTGTTTTTTCTTATATTTATAAATAAAGTACAATATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGT:1 - chr2R 883153 5' - F-element 4656 1 59.63 GCTGTCGAAGAACTAACTCTTTCGGCCCAACTTGGCTCTTAGCGACATTGTGCTCCTTTTATTTATCAGTCATCTTAGGTGCTGCATTCTTTGGCCACATCGTT:1 - chr3L 1265748 5' - BS4 467 1 70.19 AATGATAGAAATGAACGGGGAAAACCAGAGAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTT:1 - chr3L 16637182 5' - hopper 33 1 72.73 ATGACTGTTAATAGACTAAGTTTTACGTGCTAATGCGATTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 - chr3R 16194585 5' + flea 23 2 55.43 AAAGGGGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAATAACAATAACAATAAATAAATAAAATAAATTTATCAA:1 - chr2L 19310433 5' + HeT-A 4 1 72.73 CTCGGAATAACCCCTTCTACCGCTGGGGTTATGGTTCACGAACCCAACCGACCCCAAAAGTCAGCCGATATGCCGACAGACTTATCGCCCAC:1 + chrX 7397778 5' + G5A 2613 1 69.57 TTTGGGTTTTTCTACTCAATCAGTTCCTGAACGAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAC:1 + chr2R 11273962 5' + Stalker2 7258 2 68.57 AACATAGGCGAATGGATTGTAAGGAGGCGGAAAGTAGTTGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATAT:1 - chr2R 24085975 5' - accord 96 2 54.12 TTTGCAGTGTTGAAAAGTGTTTTTGTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chrX 21399418 5' + pogo 41 1 70.53 GACCTTGACACGGTTTTTACTTGCTATGCAGAAAGAAAGGGTTTCCCGCATCCACCGTACCGTATCCATTGAAATTTATAATATATAATTTGTTTATTGAAATCGATACT:1 + chr3L 3305972 5' - Idefix 290 2 71.82 CATTATTTATGCATAAATACAAAAGGCAGCGATCTGTTTGATTGGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACATCCTAAACTATTG:1 + chr2R 15419005 5' + hopper 36 1 52.78 GACAACCACAACAGAGTCATCGACAACATCCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAAC:1 + chr3R 6308232 5' + I-element 5084 1 68.82 TTCGCCGGTGGAGAGAGAGAGAAAGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGGACCCATATCGCGGG:1 - chr3R 11064065 5' + R1A1-element 5013 1 61.19 CCCACACATACATATACATGGAACACTCGCACTCACACTCGACTGCATTGCCATGGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 + chr3R 11315206 5' + hopper 32 1 50.91 AGAATAACAAGATGCGTAACGGCTATACATTGGTTTGGCCCTATGCAACCACTTTTTTCTGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAA:1 - chr3R 1202714 5' - 1360 3275 1 85.00 CCACCAGGCAAGTACACATGACTCATCCACTTTAGTTATTTATAAAATAACATTATACCATCCAGGACTCCCCGCGGTGTGGCCGTGAAGCTTTG:1 - chr3R 24158477 5' - Rt1c 5333 1 68.42 CCAACGACCCCGAATATTTTCTAGGAATTTACGCAACTGTCATTTGCAGTGTTGAAAAGTGTTTTTGTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chrX 21399376 5' + pogo 14 1 68.18 AATACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 419 1 27.78 CGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTTTTCGTCAGGACTCA:1 - chr2L 9171482 5' + opus 18 2 65.71 CATATATTTAATCAAATTTTATAATTATTTATTGGTGGTAATGCGATTATCGCTTTCTGAATTTTGCAACTAACTTTTAATTTATTTTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 - chr3L 14929061 5' - I-element 5346 1 74.55 ATTTGTCTAATATAAACTATTTAGCGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGGAATTTTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC:1 + chr2R 1339206 5' + S-element 6 2 53.21 TACAGTTAACAGGGCTTAAGAGAGAAGTACAGTCGACACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTATCGTCTCTTG:1 + chrX 10548355 5' + 1360 3229 1 59.14 GTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAA:1 - chr3R 12040209 5' - HMS-Beagle 7021 2 52.94 TGATTCCGACTCGCCAACTGCCCTCACTCTGATTACATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2L 4013066 5' - pogo 2078 1 53.85 CCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTA:1 + chr2R 5214956 5' + F-element 22 1 57.89 GATTTATTACCGCCGCCAACAAAGCCATTTTCGTTGCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 + chr3L 16291824 5' + jockey 4780 1 57.27 ATAATGTTGTGCTGATGTAGTAACCGCAACGAACCCAACCCCCAAGCCAAAAGAAACGAGCAAGCCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATC:1 - chr2R 22287290 5' + I-element 5171 1 67.62 TTTTTTTTACCGTATTTTGCTGGTTCTCGTCTCTATATCCAATATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr2L 5638517 5' + jockey 18 1 63.29 AGTTCGCGCCTAGTGAATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGGTACCCATGC:1 + chr3R 21993199 5' - jockey 4967 1 58.18 GTGTTGATTTAGTTGTTGTTATTGTTTGGAGACTTTTGTGCTGAGAGTAACTGTTGGGTCTCTCCCATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCGCTTT:1 + chrX 8004080 5' - Porto1 335 1 68.63 AGCAATAAAATCCCAAACAACATTAGCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACC:1 - chr2R 7164758 5' + F-element 4239 1 76.36 GATAAGATAAGTACAGAAAACCCAAAAAGTATGAGCTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTT:1 - chr2R 18352537 5' - I-element 5094 1 72.83 AGATGACAACTGAATGGAAACAATCGCAACTCTCAAGTGACCAACATGCAGGCCTCCTTCTTGTGGGTTTTTCTTTCAACATCAACAATCAACAT:1 - chr2L 9587929 5' + gypsy7 323 1 78.95 ATATATTTCATAAAAATAATATAAACATACATAGTTAAAAACAAGAGGGGATGCTATAGTTGACTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr2L 22929238 5' - INE-1 548 1 80.65 CGGAAAACCGAAAAGCCGAAAATCGAAAACAAAACCACTGCAAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTTATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAAT:1 - chr3L 10932285 5' + 17.6 7280 2 60.00 CATTCGTGGAATTTCAATGGACTGGAAGACCTTTTGAGGAGACACCCTCCTTACCACCGTTATTTTGTTTTTTTCTTTTTTAAA:1 + chrX 8086782 5' - TART-C 11100 1 47.62 GTTTACTGATGGAAATGGGGAATGATACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCT:1 - chr3R 14357362 5' - Rt1b 5122 1 60.87 GTTTTGTGCATTTTTCCCGTCCGGTGTTTAAATTTTATTTAATACTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGCAT:1 + chr3L 17530132 5' - Tirant 363 2 60.91 ATCTGGTTGGCGTGCAAACAAGGTGTACATGTTTATGAATGTATGTATGTATGTAGTATG:1 + chrX 4000093 5' - 412 222 2 66.67 ATCCTCAAAAAACTCGAACTCAAGAAAGAAAAATCCAATGAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGACCAATTAAATAA:1 - chr3L 3555536 5' + 412 19 2 63.64 GATTGAGCATGTACTCACATTATTTGCAATGAATATTGTCGTTCGTATGTAATAGAATTTATTTATATGCTTTTTTTTTCTTTTTTTAATAAT:1 - chr2L 12706822 5' + hopper 155 1 48.39 AAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 - 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INE-1 500 1 58.43 TGCGAGCAGCCTCAACTGCGATATATTCCTTCCAGGATAAACAGCAATATATATATTTATTTCTCTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 + chr2R 25117996 5' - Transpac 5227 2 77.08 TGGTCCACACGGAATCCCTTACGGGACACGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 9432884 5' - roo 360 2 68.93 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAAACAACACAAACACACACACAACAACAACCACAAACA:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 417 1 36.73 ATGGAAGAAAATTAATAATAAGGAAAAAGAGCAAGCAAAGCAGGAAAAGTAAGTACGGGAATGCAAGAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTAAGCGACGCTATTGTAAC:1 + chr2L 18963515 5' + Bica 4809 1 66.36 AAAAAAAAAACATAGAGAAAAAGAAACAAATTAACTTTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTATAATTCTATATTGAAACAA:1 - chr3R 11598573 5' + F-element 4240 1 64.22 GGTCTAGTCCTGTTAGTCCTGCCCGTCCTGCCCGTCCTGCGCCCCCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATG:1 + chr2L 2091000 5' - Rt1b 4983 1 66.67 CAATGGCAAAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chrX 5515613 5' + copia 44 2 64.55 AATTGCGAGCAGCCTCAACTGCGATATATTCCTTCCAGGATAAACAGCAATATATATATTTATTTCTCTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 + chr2R 25117993 5' - Transpac 297 2 70.00 AGTGCATAATTAGCATCCGACTTTAGCTGGAAAATGCCCAAATGTCGGTGCGAGTGGTGCGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGG:1 + chr3L 11413233 5' - jockey 4774 1 70.33 TATGACATTTGCCACTGGATGACTCCATGGATGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGGAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTACGTGCCGTGATTGCG:1 - chr3L 11907412 5' - F-element 4423 1 64.81 CATCATCCGAAAGACTGTGGCATACTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 - chr2R 11379806 5' - jockey 4979 1 57.27 GTGTATATAGCTGTGTGTGCCAGCAGACACTTTATGAACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCAATACACAAAATCATAGAATGCATTAGGATATAAGT:1 + chr2L 8898875 5' + Quasimodo 90 2 62.73 CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTATTCTATTCTATTCTCTTCTATTCTCTTCTATTCTCTTCTATTCTCTTCTCTTCTCTTGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTA:1 - chr3L 22908066 5' + blood 5 2 22.73 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATAACATAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACACACAAAC:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 416 1 25.74 AATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - 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F-element 4214 1 76.67 CGGGCCCATAACACGGTTATTGCATTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTAGACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTCCCCGTCTC:1 - chr2R 15720134 5' + F-element 4501 1 74.55 AGTAGGGTCAGACCCTAAAATATTTGTGTACCCATATAAGAAAACAACGATGTTGTACAGAGGATATTGATTTAAAGTCCAGAGAGCCAGATCGGCACGGCTATTGATCC:1 + chr2L 5608511 5' - INE-1 97 1 73.64 TGAGAAAGTGTACATCAATCCGGTAGTTTTTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr4 311620 5' + 1360 7 2 71.82 ACAATATTCTGGAAAACTTAAGGCTGTGCGTCACGACGTTGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTG:1 - chr3R 25774069 5' + HB 1299 1 59.77 GGCCAACCCTTAAAAGTAGGCAACAAAAACATTTATTGCAATTGTCCTTTTTTTTTTATTGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 + chr3L 15614443 5' - jockey 4972 1 52.73 CGATTTTCACACGCAAAAACCAATTGACAATTACCAAACGCTTGCGAGTTATTTACAAAACCTATATGGCAACACACAGACACGAACACACACAAACACAC:1 + chr3R 9226582 5' + gypsy3 420 1 75.25 CGTTGTCGGAAAGGGGTCAGAAAAACGGGTTTCGTTGTGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTG:1 - 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accord2 171 2 52.38 GCACTCTCACTGTTTTGGCCACAATCTGAACTGATATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 9435786 5' - roo 405 1 77.06 GTGCTCTCTGGAAACACATGCATATTTATGCAAATCCACTTTACACACCAGCAAATAGTCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACAATTCAA:1 + chr3R 13275246 5' + Bica 4525 1 58.18 AGCGAAATTTCACTCATCGTCAACAGCGCGCACCCACAAATCACTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACAACCAA:1 + chr2R 18779308 5' + Doc 4473 1 53.54 CATAAGTCAAAATATATCTATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3R 2275606 5' + opus 7038 4 84.62 TTAAACCATTTAAAACAAATTTGGAGTTTAGCAGTGCCTCGACCGTTGTTGAATAATTTAGATAGCAACATAATTATTTAATTGCGAATTCA:1 + chr3L 8085985 5' - invader4 2628 1 61.96 ACAAACATTACATCATTTCATTACGTTCATATTTCCATGAATTTTACTGTGTTCAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chrX 16693759 5' + 1360 32 1 52.73 GTTCGCTCGGGAGCAAGGCTTAACTTTGGATCGGTAAACAAGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATC:1 - chr2R 6820354 5' + BS 4789 1 62.73 GAAAAAAAATGTATAATAATAATGAATAATACCCCAGAAGACAACTCAACTATTGTATAACTCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGCACATAC:1 - 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diver2 4883 2 58.25 GCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTTTGGGCTCCGTTCCT:1 - chr3R 19450091 5' + roo 8699 2 72.73 CCAAACCCCAAAGGATAATCTCGAACAACAATGGGATGACTGAAAGGGCCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAAAATTAAATAAA:1 + chr2L 16022568 5' + 412 7073 2 49.09 AAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2R 9963674 5' - pogo 2098 1 57.41 GCAATGTTCGTAGGCAACCAACCGCCACTACACACATAAGTATGTACTCACACTTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGCCCAAACCAGCAACT:1 + chr3L 2033742 5' + 297 6593 2 68.27 ACTCGTTTACCCACGCGCTCACACACATGCATACATATTTAGTTTATTTTTTTCTATTATTTCTTTTTTTTTTTGTTGATAATAGTGGGTCCGAGGAATCAATAGCTCTG:1 + chrX 12115295 5' - transib2 2381 1 61.82 AACATTAGAAGGAGATAAAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCGGCCTCGAGAACTTTGCACA:1 - chr3L 12677112 5' - pogo 2084 1 67.19 GAACTCTGACATCTGCGGGGAAGAACAGTGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGACAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCA:1 - chrX 2927778 5' + F-element 4449 1 70.48 GCAAATGGAAAATCCATTAACGGTGTAGCATACTTTTGAGGGCAATAGGGTGAAATAAAATAACCTTGCTCATTTACCGCTCATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCG:1 - chr3L 21144054 5' - GATE 8450 2 56.36 ACTACTCAAAAACATACACGACTTTCCATATAAAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGCTGAACCA:1 + chr3R 27928980 5' + mdg3 5421 2 69.09 GACTTTAGGTTTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr2R 6707758 5' - 1360 3347 1 63.64 GTAATATCACTACCCAGTGAGGTTAAGTGCGGTCAGCCACCATGAGGTTGCTCGGAGGACAAGCCTACGATGTATAAGTTATTGCCCTATACGTTATCGTCACACATCT:1 + chr2R 4137499 5' + HMS-Beagle2 12 2 69.72 AAAGAAGAAATTATAAGAACAAAAGATATAAATAATAAACTTATTCAATCAAAAAGAAAAGTTATAACAATTCTTATAGAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAA:1 + chr2R 3550380 5' - X-element 4589 1 28.18 TGGAAAAGATACCAAGCGATTCCCGCAACAAGTTTTTTAGTCAGGTGACTATCACAACAAATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 22593669 5' - I-element 5328 1 57.41 TTCTTAAAATTCCCATGTTTACTTGTTGATAGGGAGTTTTCCCCAGGAAAAACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTTATTCGTTTTT:1 - chr2R 15891725 5' - I-element 397 1 50.00 ATATAATATAATGTAATATAATGTAATATAATATAATATAATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCT:2 + chr3L 20525229 5' - TAHRE 10382 1 61.82 GACTATGCCAGTTATTACCATTGAAATCGATTGATAGCACGCTCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr3R 17272033 5' - hopper 1393 1 52.17 TAAGAGAGTTGGTTGGTGAGTTGGTTCATATTTATCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 + chr3R 25163133 5' + mdg1 7074 2 62.37 AATTAAGTGTCTAGATGATTCAACTCAAGTAACCTAAGACACGTGATCAACTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAG:1 + chr2L 6846654 5' + P-element 368 1 53.21 CCAATCCTGCTCCATTGAAAATCCAGTCCAAAATCCACATCCAACCCACGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTATTACACAAACACTAAGTAC:1 - chr3L 4671767 5' + Juan 3911 1 54.63 TCATAAACTATGGAAAGTACTTCTATGAAGTGCGTGCTGGTCTCCTGCGTCGCTCTAGCTACTCACCCGCCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTC:1 - chr3L 6598863 5' + Gypsy12A_LTR 2232 1 73.91 CCACACTTTGGCTGGCATTTTAAATGTTTATTTGTACCAGAGAACTGCAGCACGACACTCGC:1 + chr2R 13313400 5' - hobo 2935 1 59.68 GAGCCTATCTGGCTGATAAAATTCGTAGCCTTAAATAATTAATAATTGTCGCGTGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTC:1 - chr3L 18348066 5' + ZAM 7980 2 58.51 CAGCCCCATGTGGGTACCAGGATCGACTTCCTACGCTGAGGTTCTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCCAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCC:1 + chr2L 5159195 5' + Max-element 8530 2 56.48 GAGGGTGTGTCCCATAAACAGAAAACCGAACCACAAGGGATCGGATCTTATGGGAGTGGAAAGGAACGAAATAATTTCTTTTTAAAGGGTGGGCA:1 + chr2R 9710880 5' - FB 687 2 73.68 AGCGGGCGGCTTATACGGATCTTGGATGGCATCCATTTCACAATACTTTAAAGCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:1 + chr3L 12300116 5' + 1360 35 1 55.05 TAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGACTATGCAATATTAAGAAAAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chrX 22769350 5' + 412 36 2 58.00 TTGGCTAAAAATGTTCATATAGATGTGTGTTTTCATGTATTTCGTGGCTATGGCCTACGAATTACAT:1 - chrX 9534538 5' - gypsy7 198 2 73.13 TATGGGCACACTTCTGTTTAATTGCCGGCATCGTTAACGACATTTGGGCAAGTAACCGGGCATTATATAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGG:1 + chr3L 9767853 5' - FB 219 1 67.27 TGGTATTGATACCCTTTTGCATGTGACTCACACCGTCGCGAAGACGTTCTCTCAGTGGGATGTGGGTTTGGTTGTTGGACATAGTTAGTATTAATGTAAAAGTAGTTAG:1 + chr3R 12257042 5' - TAHRE 10269 1 70.64 GTTTCCGTGTTATCACGCCAGTGAAAAAAACTTTCCCATGCGTAAATGAATATTTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTAT:1 + chr2R 5990056 5' - Quasimodo 53 2 70.97 TAAACTAATCTGGCAAACGTAATTAAATTACAACACAAATTGGAATAAAAAAAATGAAACTGAAAAACAACTAAATCTAATGTGAATTTTAAATAATAAAAATTAATAAT:1 - chr3R 17395559 5' + HeT-A 38 2 62.73 GGCAATGCCAGCAACAGCAATAAACTTATTAGGGCATTATTGAAAAAAAAAAACCATCA:1 - chr2R 10572710 5' + Doc 4591 1 74.58 TGAAAAGCCAACGAAAAGAAAATTATGAAAATGCACAAGATGCAGTGCTCTAATGGAAAAAAAAAACTACCACTAAGTGAAAGTTAATTA:1 - chr3L 3564400 5' + Doc 4609 1 65.56 CGGGGCGTGGCAAAGGCGTCGTCTGTGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAA:1 + chr3L 2002007 5' + gypsy5 30 2 66.27 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 421 1 25.45 AGATTGAATAAACATATTAGTTGATTTAAAAGCGGGGGTAATTTTAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTACGTTTATTAATTACA:1 - chr3R 17777662 5' - Burdock 6356 2 57.27 GATAAAATGAAGGGCATTTGGGTGTCATGAGGTGAAGCTAAAAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTC:1 + chr3R 10887181 5' - I-element 4916 1 61.82 TGGCTGCTTATTAAATTTATGTTGGTTTAGTTTTGTTTCACTGGTCCAAGCACAATTTTAATTTTTAATTAATTTTTTTATTTTAATTTAATTTAATTTTAATTTTTT:1 + chr3R 7277420 5' + Rt1b 127 1 56.48 GCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr3R 31633151 5' - opus 472 2 58.62 TTTTAATACAAGCTGGATTAGTGCATACGTCACAGGAAATGAGGAATTAGCTGGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGCCGAAGTCGTATTATTT:1 - chr2L 16769897 5' - I-element 4936 1 69.57 TAAGCCAGGTAAAACTAAACCTTCTGCCAACTTTTTTTACCCTGCACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 23620986 5' + roo 37 2 59.63 TCAGACTCGATATCATCTTTTTCTTCTTCTTCCACTTCCCAGTAGCGATCTAACTCTTTTATTTCTATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTG:1 - chr3R 19444937 5' + copia 117 2 64.55 ACCCAAACAGGGTAAATTTCTCATTGCAATCACATTGTCTATAAAAAAGAAAATCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAAGGGATTTCA:1 - chr4 707508 5' + Circe 7175 1 56.07 AGTGTGGCGTTTCACGTCCCTCGGCACTTTTGCCAACTGGTCTCAAGCTCCAATTCAAAGAAAAACAAAACAATCAAGGACGGCCAGCGACCAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 10996433 5' + R2-element 3581 1 57.80 TTTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chrX 12176316 5' + 1360 203 1 75.45 AGACGTGAGAGGCGTGACGCGACCCAACGCTCTGCTCACCAATGTAATACCTTGACTGACAGTCCCGG:1 + chr2L 5799434 5' + Rt1a 4913 2 73.53 GAAGTGGTCTTGCGACCATGGTTACCATTAAACATGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 + chr3R 13298181 5' - I-element 5310 1 66.36 GTTTGGTAATTCTATAGTCTTCATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACACTGTATTTTTTCT:1 + chr2R 20705578 5' - flea 326 1 76.36 ATGACACAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 - chr3L 23236564 5' + Stalker2 7301 2 69.09 AGATCAACTTTAAAATACTAGTACCAACCATAATTTGAAGCTTAGCTTTGAGTTATAAATATTTACACGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTA:1 - chrX 22854520 5' + Tirant 8502 2 59.09 TAAAATAAAATAAATAAAATAAAAATTAAATAAAGACAAAACTCAACAAGTCACATACACAAAACACAACCCAAAAACTTCGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACT:1 + chrX 15216190 5' + I-element 5235 1 78.18 CTGCTTATCAATAAAATTCTTGAAATTTAGTTTATTATTTTGTAGGGAAATAAATGATAGAAAAGGATATTTAAGAAGAAACACAAATAGACAACGAGCAAATCGATCG:1 - chr3L 9666552 5' + Doc3-element 192 1 60.55 AAAGTAGCGCTAGTAGCGATTCTTCGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr3L 22108097 5' - Transpac 292 2 54.76 TGTTCGTTTGTTTAACCAAAACTGAAGGTGGGGTCGGTGCAAGTGTGTGGGCTTGGGTTTTAAACTGGGTGGCACGACTTATCTCT:1 - chr3R 21274158 5' - I-element 22 1 74.42 TAAGAATTATTTTCCGCACTCTATACTAGACACCACTACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 + chr2L 16245190 5' + hopper 46 1 64.55 GTACTTCAAGGCAGTCAGTCGCTTTTTGCTGAAGTTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAATGTATGACTAAGAGTAAA:1 - chr2R 8932417 5' - mdg3 5283 2 60.92 GACTTTTTAGGTCTAAGGAGAAGAATACCGGGTTATTTATCATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGCGCTCCG:1 - chr3R 1023414 5' + F-element 33 1 50.57 CATGAATCAGCGGCAGATACATAGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTG:1 - chrX 4052237 5' + Doc 4525 1 75.00 GTCATTTCATCATAAGATCAGTTGATCCTAGATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCATCTTA:1 + chr3L 4264932 5' + Transpac 4927 2 74.55 AGTGTTTGTGATTGTGTTTTCTACTTGTGATGTGGGGCTAAAAGACCATAAGACACTAGAATAACACGCTGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 15128211 5' - 1360 3368 1 60.67 AGAGGGGTTGGAAAATGCAGGCAGTTACACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 - chr2R 19166673 5' + FB 58 1 75.45 ATGACTAATCACTATTGTTATTCGATTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCC:1 - chr2R 1982209 5' - 1360 3332 1 74.55 CCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr3R 13437252 5' - hopper 1396 1 63.64 AAAAAAAAGACGAATGGATAACTAACTGCCAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTG:1 - chr3R 10171860 5' - hopper 280 1 72.63 CAAACTGACAATGCAACCGGGCAAAAACAGAAGGCACAAGCCCGAGGAAAACAAAGGGAATAGGGACAACATCAAGCAACATCCCCTCACGAAGTCGCTTACGCGAGC:1 - chr3R 6700343 5' + Doc2-element 4580 1 75.00 ACTAAAACGACATCATCGATTTGAATGCCTGTCTTCTGTGCTCGCCATTTGGAACGTTGCGGAATAAGCGTTAGATATGTGGCGACCAGAATGAAGCCCGGTC:1 - chr3L 25442551 5' + Chimpo 5 1 64.08 CTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATCTATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAAT:1 + chrX 3464214 5' - Burdock 6354 2 59.22 ATCCTTCATGAACTGGGCGATTCTCGTGCGGATCGGGCTTGATATGAAAGTTGGCATAGCCATAGCGATCGCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATT:1 - chr2L 13912507 5' - 1360 3273 1 79.09 TTGCGGCTGCGCATTTCCGGTGCACGTCTCACTCTGAGTTTAATTTTTAATTTCATTTTT:1 + chr3R 17858149 5' - P-element 2641 1 76.67 AAGGATATGCACTATCTTTATGAAAAAGCCAAGCAAATTACAGCATTAAATTAATTTTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGG:1 - chr2R 20453530 5' + mdg3 357 1 67.42 CTTGACCGCACACAAAACACAAACATACACAAAAAAAAAACCAAAACACAGATACTGAGAGACAATAACAAATCCATAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCCGT:1 + chr2L 14679881 5' + Quasimodo 6914 2 57.27 CTGGTTAAGTTTATTTATTTTTCGCTTAGGTTAAATGTTTATCCATCCGTTTTGTTCTCAGCTTAGTTGCAAAGCTTACTCGCCCCATTTATCAGTTAATTATTTATTAT:1 + chrY 3649260 5' + INE-1 415 1 72.73 CGTGAGAATGCGGAATTTGGCAAAGTCCGCTAAGCGAATTGTACTGCAGTAATTACCTACCGAATCTCGTGTAGGGAAGTGGCCTAGCAACA:1 + chr3L 1039736 5' + gypsy8 33 2 68.48 GAAATTCCTAATATAGAAGAAGGGCAAATAGTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGTTTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTG:1 + chr3R 19447921 5' - I-element 4878 1 63.74 ATGGGCTGCCATTGAATCGTAGGATTGTGGGATTTGTGTGAGATCGGCACGCCATGTTGTCTATATCTATGTCTATGTCTATGTTTAT:1 - chr2L 4624576 5' + 412 7127 2 69.32 CGGCTTCACGCTAATTCTGGAAACATTTAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1 + chr3L 16046884 5' + P-element 11 1 46.03 CATTTAGTTTTTCAGAATCGTGTGCACTGGCGCCACCTAGGTATGCTTCTTGTGTTTGCAATCCATGAAAAAAAGGCTTCCACTTGTAGCTAAA:1 + chrX 17820340 5' + S-element 1393 1 67.02 GCAGGAAAAATATTGAAAAATAACTACGTAATAGAGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATAAAGAGGAAATATAATAC:1 - chr3R 30617079 5' + invader2 5096 2 65.45 GGGGCGTGGCCATTAAGTGAAGTGAACTGCTACTGCTGCTCCTGCTGCTTGTGGTTTTTATTTATGGTCTATTTTTGTTTTCATTTTTTTATTTTTTGGTTAGTT:1 - chrX 9289893 5' + Tc1 1402 1 74.29 ATAGCCACAAGCCTCCAAATCATTGCATCAATGAATCGAAATCGAAATCGAAATTCGCTAAAAACAGGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACAC:1 - chrX 4431927 5' + hopper 951 1 66.06 TCCCAAATACTTTATATACTATATACATACGCGTTTATATTTTTTATCAGAATCAAAAGCCCTGTCTGTCTTTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGTACTATTAA:1 - chrX 3272955 5' + INE-1 146 1 68.18 ATTTGTGACAAATGAAACTTATATATTATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 7219717 5' - roo 350 2 79.09 TAAAACGCCGCAAAATGTCAAGTGCTGCAAATGCCAAACGAGAGAGAGAGAGAGTGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACAC:1 + chrX 12144673 5' - Cr1a 255 1 65.66 TTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTTTTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGT:1 - chr3R 19450164 5' + roo 8646 1 66.04 GATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr2L 21735008 5' + Doc 31 1 57.78 TGTAAGTTCTTTTGTACAAACCAATAAATGCGAAAATTGATCTAACTTTAAGAGTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 + chr2R 8086780 5' - 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Stalker4 90 4 68.32 CTTCTAGGGGGTGTGTAAATGAGCTATGTAGCTATTTGCACAGATAGCAACAGGCCAGCACAACAACAAAAAAAACAAGAAAAGCAAAAAAAAAA:1 - chr3L 3433206 5' + Porto1 157 1 89.47 TTTACTTTTTCATATTTTTTGTGTTAATTCGCTTTTGCTGCTTCTGCTCGCTGATTGGGTTTTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTTATATTTATT:1 + chr3R 12561482 5' - Tc1-2 485 4 65.26 GAAAATAATAAAATATTTTTTAAGTTCTTGATTGTGGATATCAATCCAACACCTACTAAAGAAACTTTTAATTGTTTTAAGTCTGTTTTCTTATATTTATTTTCCATGTT:1 - chr3R 16884546 5' + invader6 18 2 80.91 ATCCTAGTCCCTCATGGCGATGAGGTCCTGGTCAGTGTGCTGCCCGCATATGTCGTGTCCACTGACAATTTGCACGCAATTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAACGCGA:1 - chr2L 14379722 5' + Porto1 333 1 83.49 AAGCTCACTTTATGAGCAACTGCCTCTCTCAATGGGATCCTGAATTTACAGCTTAATAAACTGGCTTTTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 - chrX 22806771 5' - Burdock 238 2 65.45 ACACAAATCGCCGCTAATAAAAACATCAACAAATTATGATTTACATACCAAACGTTGGACAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAACCGAGCTT:1 - chrX 17074485 5' + Circe 291 1 54.81 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAG:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 204 1 68.27 ACCCTGTCGGCACGTCATATGCCCTTTCCCACTTCCACAATGCTCTCCTCTCACTCGCACCCTCTTTTTCGTTTTGTAGATCGCAAGCG:1 - 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chrX 15026089 5' + FB 31 1 52.29 TATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCGGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGCATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAAG:1 - chr2L 22224562 5' - Rt1c 5395 1 57.14 GAAAAATGTCTAAAAATCGCTTTAATAGGCTCAATCAATAACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACAACAAACTTAACCAATTAGCGCTGTGC:1 - chrX 5137199 5' + gypsy7 5034 1 62.64 CAATACAATACAATACAATACAATACAATCCAATACAATATAATACAATACAATACAATTGAACAACATTACACTGATTTAATTCAAATAAATAATATTTTACAACAAGC:1 - chr3L 21448027 5' + TLD2_LTR 109 1 59.09 TTACTTTTTACTGGATTTGCGAATTTAGGAATAAACGTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chrX 1523580 5' + jockey 60 1 65.45 AAAGCGGCCATCAACGTCAAGTTTGCCGCAACCACAGCTGCATCAACAACAAAACTGTCAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCAGGATGTA:1 - chrX 5847000 5' + Idefix 78 2 69.00 TTTGGCCTTCCGCACCGAATTCCTTTCGCAGTTGATAAATGGCTTTCTACTCGGAGTTTGTTGTTTATCTTGTTCACAGAGATATGTAAGGTTTTTATCACATATAAATA:1 - chr3R 16705605 5' - Porto1 121 1 60.91 GGAAATTATTCAGCGGAAATGCTATGACAAAGTGGCTGGGTGAATTTTTCACCCTGGTCTTTAACTTTATTTTTTTTTTTGTATTTTTTT:1 + chr3R 13890068 5' + hopper 143 10 77.78 TGGACTCATTCTCGCTTTGATCTGGACATAGAGCCTCGACCTATACCGATCACCAATACCACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATTCCAGATAAGAAAAAGATT:1 - chr2L 1997783 5' + Idefix 107 2 55.45 GCCTGTTCCAAAGGCGCTGTAAAACTTAAAAACAACAAACAGACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chr2R 17436706 5' - Tirant 358 2 61.47 GAATTTCGAAATACTCCTGTTACATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATCGATTTCGCCCCGA:1 + chr3R 11243503 5' + 1360 3179 1 75.00 GGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr2R 19405913 5' + HMS-Beagle 39 2 72.53 TGTGTTCCCACTGCGAACTGACAAGCAGCAGTGAAACCAAAATAAAGCAAAAAATAATTGTACATATATATTGCACA:1 + chr3L 14077444 5' + HeT-A 5979 1 76.62 GAATCATGAGCAGACCATTATCATCATTTTTTTTTAATCATTCATTCTATTTATTTTGGATTCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTA:1 - chr2L 22225077 5' - G5 4789 1 81.44 AACAGAATCTCATCGAAAATCGAGATTCGATATTCGGGGGAAAAGTGATCAGTTAGTTGACGCGAAGGCTCTAAATTTTTAGGCGGGGAGAAAGAGAGAA:1 - chrX 3742730 5' + Gypsy12A_LTR 499 1 67.00 ACCGCTTTATCTGCGGAGCCTTTCGTCACATTAGTTTTTACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 + chrX 15043114 5' + S-element 37 2 64.55 GATACTTTTGCTGTTATTCAGTGGTTTAAAGCGCACATTTATAAAGTCCTCTGTGCACTTATCGAATTCAAAGTCCTAAAGAAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chrX 5515510 5' - copia 252 1 75.45 GTCTATCAGTCGTCTGTATATCTCGTATATTTAAATTAAAAAAAAAATTATATTTTAGTGGGTTAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAAAGTTA:1 + chr3L 15540598 5' + HB 371 1 79.57 CAATTTGTGATGACGTGCCAGAGGGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATCG:1 - chr2L 128128 5' - 1360 3177 1 75.79 TTTGGAAATTAAACTGCGCATAGTCCTTAAAATTTTATAACTTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATT:1 + chr3R 22979343 5' + Juan 4105 1 52.43 TTGCACTAAAATTCCAGAAAAAAATAAGAATATAGATATCATTCAATTCATTAATTTTATTCGTTTCAAATATTTATTGTGACTGATCTAGATTACA:1 + chr3R 3484654 5' - Dm88 159 2 53.61 TTAGGTCAATATTTAATTTTTGTGCTCTTTTTTTTCTCTATTGATACAATTTGTTGATTTCAAAATGTAAAATCAGCAATCATTTTTGAACCAAACGTTTTAGCTAAGTC:1 + chr3L 5096525 5' - R2-element 3348 1 73.64 TCATAATTTATTACGCAAGCCCAAGCGAAAACAAAACCGAAAAACAGAAACTAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGA:1 - chr2L 11434412 5' - Cr1a 4230 1 55.77 CGTTATGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGACACTTATTGTTTACGT:1 - chrY 2682676 5' - 17.6 60 1 70.00 AAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3L 2987411 5' + blood 7051 2 68.09 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAACACAA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 420 1 25.69 AGTTCGGGAACAGCCTAAGTCCTCATTGGTAATACTGTTTGTGTGCAGGAATGCATAATCTCGAGTGGGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTGTTGTTGTTT:1 + chr3L 21693753 5' - I-element 141 1 68.22 ATCCTGACTCATTTCATCGAGTTCATGCCACTGTACAGAGCAGCGGCGTACAAGGATGCCCCGTCCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:1 - chr2L 14141367 5' + hopper 19 1 63.64 GTGCCAGCCCCACGACCCAGTCTAAGTCAAGTTACCTCCTCATTCATGTAGACTACTTTTAATTTACCTTCCCTAGCTATCCGTAGAACTATGCTTGGA:1 + chr2L 6375203 5' + Cr1a 4015 1 68.69 ACTCGAGTAAAGTAAATATAAAGTAAAGTAAAGTAAAGAGTTTTAGGTGTCCAGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chr3R 13543853 5' + 1360 32 1 53.64 AATCCCAATTCGTTTAAGTCACTGACAATCCATGGATGCCCAGGCGATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTT:1 + chr2R 22269154 5' + copia 336 1 62.73 TCTTTAGCAGTAAATCGAGTGAATTGGGCCTATGTCTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGCTTGCGTTGGTAACTGATGGGATATT:1 - chrX 22762909 5' - F-element 4403 1 65.45 TAAGCTGCTAGATATTTCCCTTTTTATTGGGACAGATGGCGATTGGCTATTAACAGCGAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCACTTTGTGGG:1 - chr3R 27272353 5' + Ivk 198 1 61.11 TGTTGCTGGGTAGTCGAATAGTCAAGTAATGTGCTCGTTTCGGTACCACGGGTTGGGCAGCTATCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGGGGG:1 - chr2L 5159461 5' + R1A1-element 4975 1 54.55 CCCAGACAAACAAAATCCCATAGTGAAAACCATATCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGACTTGCTCTACA:1 + chrX 17377975 5' + F-element 4223 1 72.48 AAATAACTGGCGCATGGAAATGGCGTGAAAATCGTTTGACATTCAATTTTCAACTTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATA:1 + chrX 18393388 5' - Quasimodo 124 2 65.22 GATTAGATTGCTAATATTAGTTCTTTCTCAGTGGGCCAAGACACCGTTTAAAGATATAATTCAGGAGGGTGTTTTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGAGTGCG:1 + chr3R 21243762 5' - F-element 4423 1 70.91 GCTAAATACGAAATCAAATTAATGCTTCACACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAGTTTAAAGCCCGGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCATTATCAGCAAA:1 - chr3L 18483873 5' + I-element 66 1 71.82 TTTGCTCATTTATTTGGGAACATTTTTTAGATTTTGACACAGCTTGGTTTTTCTTTGTGCTCACCACACATTTGTGGCGCTTTTTTATGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr3L 5340864 5' - jockey 4987 1 78.18 CTCCCATGCACACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTATAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 6537964 5' + roo 53 2 71.82 CTCCTCGACCATGAGATACCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGAACAGACGTACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGAT:1 - chr3R 4588590 5' - INE-1 99 1 76.67 CATCTTTGTTCTACAAGTAATAATGTAACGTTCTGAAACTTTTTCGATGTTTAAAAAATACATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGT:1 + chr3R 6263284 5' - diver 200 2 61.82 AAACTGAGCGCCTGTTCCAAAGGCGCTGTAAAACTTAAAAACAACAAACAGACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 + chr2R 17436697 5' - Tirant 382 2 59.57 GAAAGAACATCACTCACCTTTCCTATAAGAAAATAGTTTTCTAGCTTTAATAAGATATATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr2L 16230292 5' - blood 7370 2 57.14 TATGAGCGTTTCCAATCGCAATTTAGGGGTCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACATATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATAGCATAAATAAATG:1 + chr3L 23257509 5' + blood 57 2 68.18 TGCTCACATGTGTACATACATACATATATGTACTGCAACTGCAGCTGGAGAGCCCGTTGCTTCGGTCAGGCTTTACGATTTGTTTACAAGAAC:1 - chrX 10027638 5' - 17.6 200 2 66.67 GCTCAGCTATTGCAGATCAGTCAATACGTTCAACATTAGAAGGAGATAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr3L 12677143 5' - pogo 2100 1 72.15 AATTCCTATAGATATCCAAAAATATTATAGACCGCTCAGAAAACTGTTTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTGCCTGCAGCCTGCC:1 - chr3L 24731810 5' + GATE 8170 1 61.45 TCGCAATTTAACATTTCTGTTACGCCTGTCAGCCGGGAAAACATAAAGCCAAAAAAAAACAAGTCGAAAAGCGCCAAAAAATCGTGTGCCAAACAATTGTATGGCGTTAC:1 - chrX 20808680 5' - 1360 26 1 70.91 CGAAGACTCTCGAAGGAGGCTGACTTGGCAGAGCGGACAACATGACAAAGTCGTCTGTAATTTATTTTGTGCAGTCATAAGGATTGGTGAGCAAGACCGCGATCG:1 + chr2L 19308170 5' - Doc3-element 377 1 61.90 AGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr2L 13836539 5' + blood 22 2 68.57 CGGAATTCTAAGGCCCCGGGCCATGAAGCAGCATAGTTAGAGTGGGCAATAACGTATTATGACTTTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACA:1 + chrX 15046699 5' + S-element 3 2 69.47 TGCCCTCGTTATTTCGCCATTTATGCGACTACCTTTTCGTCCCACCCTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGG:1 - chr3R 26172074 5' - F-element 4543 1 53.68 TCATCTCAAAATCCAGTTCAATTTTCTTCTTCTTTCAATATTTTTGTGACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGATATCGTCCCACAT:1 - chr3R 15309434 5' + HMS-Beagle2 6893 2 69.72 AGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGGATAAGTTATTGCCCTATCAGTTATCGTCCCAC:1 + chr2R 6984299 5' + HMS-Beagle2 8 2 67.65 AATCTACAAACATAGTCCGATTTGTATGAGCGTTTCCAATCGCAATTTAGGGGTCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGCACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr3L 23257485 5' + blood 33 2 52.73 ATTTCGGCAAAAGTGAAAAATCATTCACATAACCCACCCAGTCACACACCCAGTCGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCACTCCAG:1 + chr2L 13746952 5' + BS3 1461 1 55.05 CGGCTTTTGAAGTAGCTTTCAACCGATTTGATACGGAGCTCGATGAACGTCTTCACACGTCAGCGACCAAGCATCCAATGCTTATGACTGCACGAAATGAACC:1 + chr2R 8424229 5' + Doc3-element 402 1 81.55 ACAGGGACGCGCCGCAAATATTGGTGGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGTCACCGTTTTTGAGAAATTTTGGTCCATGAATCCTTGACAACACCCCACAGATCCTCGT:1 + chrX 16177678 5' - Tc1 1221 1 74.07 GTCAAAAGCAATCAAGGCCCACACTTTTAAAAAATGTTT:1 - chrX 674671 5' + INE-1 257 1 66.67 ATGAAAATATAACAAATAATTAGTGAATATACGTTAAATTCAGCTTAAACATGTTGATCGTTTAATTTTAAAGCTTGAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGC:1 - chr3R 19149740 5' + Bari1 1507 1 74.55 TAATTGAAAGAACAAGCCAACCAGAAAAAAACATACACACACACACAAATTCTATGTAGCTAAGCGAATTTTCCAAAAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATA:1 + chr3L 7846424 5' + 3S18 5770 2 77.78 CACTATCGGGTTTCTCATTTCTCGTTGGTCTCTTTTGGGAAACGCCTCCTTCCTGACCAGACTTTTGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2L 18359997 5' + roo 8681 2 65.14 AACTGTGCTGGTACGGTTGCCAATAAATTGCATTATTAGAGTATACTTTCCTACTGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGG:1 - chr3R 20176245 5' + 1731 408 1 59.09 CACTGCAAATCAATCAGAGGTGTGCGCACCCTACATGCCTGCTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCCGCTAGCTCGTTGCCCCCTCATGTTGCAACAGT:1 - chr2L 6827392 5' + gypsy5 145 2 58.72 ACTGAAATCCAACGCCCTACACATGAGCCATTTTTTTTTTAACAAGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr3R 7874868 5' - jockey 4951 1 67.89 CGACGTCATGTGCACCGTATCAAGGCTTGCACTGCAAAAGGTTAAGGACGACCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 18675692 5' + 412 33 2 51.82 ATCAATCGAATTCCTTACCCCAAGGCAGCAATGTAACTACATATGTAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATG:1 + chrX 7275117 5' + invader1 3608 1 73.75 CAGATCAAACGACGAAAGGCCGACAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAGCATATAAGGACATTCAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTA:1 + chr3R 23302464 5' + HB 446 1 73.91 CCTCTTCCTCTTTCTCTTCCTCTTTCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTCCTCTTCCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTC:1 + chr2R 14800212 5' - invader5 3890 2 27.27 TGAGCTGCCGCCTTAGCGAGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATCATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr2L 20526083 5' - hopper 1385 1 68.42 GAAGACGCATCGCACAGTGGTTAAATACGTATATAAATATAATGAATTATTAAAATTATTTTTATTTTATTAAATTATTAAAATTAAAGCAAACTTAAAT:1 - chr3R 13843921 5' + HeT-A 325 1 65.00 AAGGCAAATAAGAGTAAATTAAAGGCAGTCGTTTGGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3L 2726146 5' + pogo 16 1 52.22 TTAGTAAGGGTGTAGATGCTATGTAGAATGTATGGTGTAAATATCAGTCAAAAATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGG:1 - chr3L 19569157 5' + invader1 25 2 52.73 CTTTATCTAGCTTGGCTTGCTAGAAATCGTTTTTAAATGTGATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGGCATCATTGTAATGGGGGTCGCAAATAA:1 + chr3L 3240522 5' - diver 190 2 53.54 ATTAAAGAAGCTCCCGCAGAATATACACAGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 14703891 5' + 297 6628 2 71.82 TATCCAACAGAAAATATTTAAATACTTTAAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGGGTAAGCGGCCAATGC:1 + chr2L 5595503 5' + Max-element 32 2 66.28 CTTTAGGACGGTTTCGATCAGCTGCTATGGAAAATATCTATGGAAATCCCAGAAAATGATTAAGTCGGCTTCACACTAGCTGTGTAACGGGTATCTG:1 + chr3R 21675236 5' + INE-1 543 1 67.01 GCCATAATGAGCTCAAGTTGGGCAAATGGCTGAATGGGTGAATGGGTCTGAGGTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGGGAGGCT:1 - chr2L 17049004 5' - Idefix 228 2 52.73 TTGTTCGCCCGCTTCTTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTCTCTTCTCTTGTCTTTTCTTGTCTTCTTCTCTCTTTTCTTTTCTTGTCTTTTCTTGTGT:1 - chr2R 24986585 5' - Penelope 648 1 27.84 TTCCTCCTCCCCGGACATTACCTCTCATTCAGCCACATATCAAACTACACAAAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAG:1 - chr2L 7499674 5' + Porto1 317 1 77.50 ATATTTAATTTTTCTTGCGTTTCTATATGTGTAAGCTAGGTGTAAATTTTAAGCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 15497997 5' + roo 8694 2 58.72 ACGTGTCGTATGTGTATGTACATCTGTATGTTGTATTTCGTATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCCAC:1 - chr2R 9543835 5' - 412 7440 2 52.75 ATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGGAGTC:1 - chr2L 22762327 5' + invader1 3711 2 66.33 TGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr2R 11379730 5' + jockey 4703 1 57.89 TACAGCTTTTTGCTGGAAAATATTTTAAGGTACGTGCCAAATGTTTCAAACTAAAACCTGAACCAAAAAGCTGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCTAT:1 - chrX 16475635 5' + pogo 6 1 64.15 AGCAAATACTTCGGTGACACACGATCCATAGTTGTATGTAGATAATGATAAGCTGCGTGGAACAGGTCTACATATGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2L 12591821 5' + roo 8 2 73.64 GAAGGGCTCTATCTCAGTACTCATGCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTCTCAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 + chr2L 19212279 5' - flea 206 2 70.48 ATATGTAAGTATATTTTCCAGTTCTAGAATTTGTCTCCGAGCCACACATTACCATCCCTGAGCGCCACGGCCACTTCAAGCTTTTATTATAATCGTAACCT:1 + chr3R 5232398 5' - Stalker4 461 1 67.33 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGAAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr2L 16217660 5' - 412 7539 2 33.33 ATATGAATCATTCGAGTGTTGATGAAAGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAG:1 + chr3L 16727163 5' + springer 7178 2 71.72 GGGTTAAATATGATTAATGATCAACAATAATAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTA:1 + chrX 6759014 5' - I-element 5071 1 56.52 TGGTCCTTGGTGTACCAGTGGGTAACCGGGCGGCGCATGTTCCTGCAGGTAAAATTTAAATTAAATTTAATTATATAATGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 - chr2R 8872499 5' + Doc 10 1 76.36 ACCAATTTCTCGGAATATCTTGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTT:1 - chr3L 3538296 5' - Ivk 5000 1 75.58 CGGCTGATAAGGCGAGTTTAAGTGGACGGATCTACAACCCTCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3L 16496262 5' - P-element 2873 1 57.32 TCATAAACCTTCGGCTCCGCTGGCATTTATTGTCCTCTGATTTTTGCTTAAAAATATATAGTGACAATTTGTGGCAAATTACATTTTCGG:1 + chr3R 26772104 5' - TART-A 13317 1 77.78 ACAGCACGGACAATAGCAACAAACAGCCTTGGCTGGCACTCGCATTAAATAACGGAAATGAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAA:1 + chr2L 9046105 5' - copia 4806 1 69.47 GCCATCACCTGTCCCTGACTCCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTAGAGAGCGTCGCCACCAC:1 - chr2L 5615453 5' - accord 218 2 79.09 TGATTGAACGTTTGTATAAATTTGCATGCCTTGTTCTTTAGCTTTTATACAATAAGCAAATCATATTTTGCAGTGATTCTTTCTTTTCTCTCTTGTAATTTTGCGGTCAT:1 + chrX 12872449 5' + diver 5992 2 71.82 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGA:1 + chrX 21346105 5' + Stalker3T 205 1 71.82 TCATTTGATTCACAGATCTCACCAACTCCAACTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTAT:1 - chr3R 11635658 5' - invader3 237 2 67.24 CTAATCGTAGCTATTGGACTCGGATTGGGTAAGAAAACATATATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3R 28639983 5' - mdg1 7440 2 53.93 ATCAATTTTTATAGCCCACATGCAGTGCCTAGCCGACGGAAACCGCCCTTCCAGGCCACTTCATACCATTTTAGCCCACTGACTTGTATTGATTGATAGCTTCTAAATAA:1 - chr2L 15894647 5' + BS 5078 1 76.36 TTCACACCCACCCAAAACAAAATGAAATCCCGCTTTTAATTATATTTATACCCAAGTGGTCAATGCCAAGTAAACACACACACACACACACA:1 + chr3L 22516251 5' + accord 7028 2 70.65 AATCGAGAGGGCGGAAAATCAATTTCCATTGCTGTGGCAACGCGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTT:1 + chr3L 2679874 5' - FB 10 1 63.30 TTTTGCCATAGAATTTCCAATCCTCAAAGGAGATGGATGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGATG:1 - chr3L 16682077 5' + FB 31 1 52.73 TTAAGCATAATTTGAAGGAATTGATGTGAGAAATAATTACACATACATATACATATATAGATACACAATTATTGCAATGCACTATCGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3L 10506735 5' + hopper 10 2 72.73 TTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAG:1 - chr3R 13423366 5' - rover 316 2 56.60 GATACATTTACACAGAGAAATAAATGTTTATCTTTTAACAATATTTCCTTGTGCAGTATTTTATGAGCAGCTTTGAAAGATATCACTAGTTTTTAAAGTTTATTTATAAT:2 + chr2R 11571086 5' + hopper 179 1 63.64 AACAATTTACCTCTCGAAGGGTGTACAATTAGGTTAATTTAAAAATGAAAATAGGTTGAAGAAAAAAAGATTATACATCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGA:1 + chr2R 4425448 5' + 3S18 10 2 72.73 ACACTATAGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 16742242 5' + 412 7093 2 60.91 CGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 + chr3L 25455133 5' + HMS-Beagle2 56 2 76.15 GAAATTAAACTGCGCATAGTCCTTAAAATTTTATAACTTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAG:1 + chr3R 22979347 5' + Juan 4116 1 57.27 ATCTCTCATCCCCAAATCCTCTTTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAACTG:1 - chr2R 21735228 5' + blood 57 2 75.96 TCCGCACATTTTTCATAAGCTCGGCCAAGTACTTGCTCCCATGCACACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACGACTTACAA:1 - chr2R 6537999 5' + roo 8682 2 64.55 GTCAGAATGGCTATCTATTATCGCTTTAAACACAGAATAGAAATCCAGACAGTTAACACATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGG:1 - chr3R 2685220 5' - Ivk 196 1 74.12 GATTCCCCGAGGCGGCAAGGAAAATTCGTTCAAGGCATGTAACAGGAAGAACGAAGCGTCTCCGTATGAACGTCGAGATATCAGGAACTATA:1 + chrX 15550233 5' + INE-1 144 1 59.78 GTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 + chr3R 17673754 5' + FB 26 1 54.90 GCGCGGAGCATTTAGCCAGCAGTCCTACTCTAATTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - chr2L 12036198 5' - 297 378 2 67.27 AAATCCTGTCTAGCACACTTGATCCTCTGATGGAGCTAGTCCATCTGGACTTAAGCAGGAATGAGCTCACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGT:1 + chr3R 8220691 5' + Idefix 77 2 66.36 TTAAGATGTAGCTTATTGATTTGATTTTAATGTATAGCATTAAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 - chr2L 5304918 5' - flea 4978 2 59.09 GGCCATTTCAAAAATTGTATATGGACTTTTTAGGTCTAAGGAGAAGAATACCGGGTTATTTATCATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 - chr3R 1023437 5' + F-element 18 1 69.47 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGACATAAACATCCGCAG:1 + chr3R 21907535 5' + Quasimodo 7027 2 21.15 CCGAGTGTGATCGGCATCCGCGACGCAGAGTGCCGTATTAATTCGGTTGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTC:1 - chr3R 1465934 5' - gypsy5 390 2 56.38 AACTTGCCAACAAGTTAGATGGACTGTATATCCCAACTTCGAATTGCTTTAATTCCATTAAACCCACAACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACACCCAC:1 + chr2R 23771363 5' + Tirant 10 2 57.27 GAAGTAACAACGCAGGAAGGGGAGAAAAGGAGGCAAGGGTCTAAGCTGTGCTTGCCGGCTGCGCACGG:1 + chr2L 917693 5' - Gypsy6A_LTR 87 1 75.00 ATATGATAAGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCT:1 - chr2L 8476763 5' - Juan 4175 1 57.27 CCGAAGAAGTCCGTTGAAAATGCAGTATGGATGGGTAATAACTATAAATATTTTGAAAAAATAATTTAAAAAAATTAAAA:1 + chr2L 5569614 5' + HB 316 1 68.75 CTTTTTGCCACTTCCCGAATAAAAGCGAAACAGAAGCCGTAACAGAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3L 5320667 5' - roo 9034 1 71.03 TTGCTGTTGATTGTTCTATATTTGGTTTGTTTATATTTGCTTTCGGTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 + chr2L 18118934 5' - 1360 3313 1 54.08 GTTCATGTTTATTGTTCTTGTAATTAAATTAACACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chrX 9432804 5' + roo 15 2 70.00 TATTTAGGGAACTTATTTTATAGTTATTTTATTTTATTATTATTTTATTATTATTATTTTATTTTATTTTATTTTATTATTTAT:1 - chr2R 7416289 5' + transib1 1902 2 60.71 GTTAAAATTTATTTCAAATTGCTCTGTTTCTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAG:1 + chrX 7619625 5' - I-element 5109 1 72.73 TGTGTGCCATCTCAACGCATTGATGCACAGAGAATAATTTTACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 - chr3R 26398942 5' + Doc 20 1 54.55 GGTCAGTTTTCGGTTTCACTTAAAAAAACACAAAAAGTATAAAAAAAAAGGTAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAA:1 - chr3L 10963487 5' + Stalker3T 203 1 55.05 ACGATCGCAGTGGCTCAACAAATAAAAGCTTGAGCTGGTTTGTCGTTCCGGTGCAGTC:1 + chr2R 18770948 5' - Doc3-element 4574 1 63.79 AACAGCAAATTTTTATTAGCAAATGGGACAATTAATTCGGCTATATGGACATTTGCAGAAATCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAAATGATAAAGTTG:1 + chr3R 20260555 5' + flea 466 1 69.47 TTGTCTGTGCTCACTTAGGGATAACAAAAGGAATGAAAAACCCAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGAAACTG:1 - chr3R 18458376 5' + gypsy5 426 1 60.76 CAATAAATAAATAGTAATTTAAGGTTCGGAGGAATCAAAATTATCATAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chrX 8808814 5' + roo 8697 2 56.36 CCTGCCACGCCCATTCGCTCGACCCGCCTCTCTCTCTCTCTTTCGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 + chr3L 10034813 5' + blood 168 2 79.41 ACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAA:1 - chr2L 21570238 5' + Dm88 29 2 63.95 TGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAAC:1 - chrX 20433375 5' - diver 6055 2 73.64 AAAGATATACAGGGTAATATATGTAGTTTGATATCTAGTGTCTATAAGAACACGATTCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 - chrX 15026091 5' + FB 30 1 53.64 AATCAATAGAAATTTACAAGACTAATTAAATTATAAAAAAACATCCAAACAATTTTCAAAAATGTGGGCGTG:1 + chrX 22586087 5' - INE-1 253 1 76.39 AAAGAAGCTCGACACAGTGGCTACATTTTATTGGGTTTTTTATTACTTAGGGGTTTATGGTTTAAAAAAGGGAAATTTTTTAAAATAATTTTAATTT:1 + chr3L 16487919 5' + 1360 3092 1 63.92 GGCCATAACTCGTAAGTTATATGCACATTAGAATGGTAACAATGTACTGTTGCCTAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAA:1 - chr3L 18687624 5' + F-element 4316 1 46.32 ATATAAAGCCATTTGAGCAACGATTTATCGACATTTACTCCCAGCCGCCACCTCCGACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCC:1 + chr3L 214461 5' + gtwin 7316 2 61.96 ACAAAATATACTACTCTACAAATATATTTATCAATTCAGATTGTGAATTCGATTCGATTCATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGATTTT:1 + chr2R 23415634 5' + F-element 22 1 51.58 AATTCGACTTGATTACTCCCCCTTGCTGCGGAGCGAGATCTACCTAAA:1 + chr3L 18967934 5' - R1A1-element 5116 1 66.67 AGTAAATTTCCTGGGCCCTTCCTACACGAAATATGATTAAGAAGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGNACAAAACACAAAGAATCACT:1 + chr3L 15761598 5' - Cr1a 141 1 62.50 CCATAAACCCATAAATCTCAGACGAAACCCTTTCGCTAACGCCATAAAAATCTTCGATCAGAATTGATTTCGACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATAT:1 + chr2R 19273057 5' + 1360 3211 1 54.55 AGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3R 7049646 5' + 1360 10 2 61.25 AAATAAACTAAATAAAAAAAAATCTGAAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAAATTTTTGAATACATAATTAGATATTACTAAC:1 + chr3R 18473001 5' + Cr1a 4284 1 78.57 ATATGGCAACTCATGCGAATTTTCTTGAGGGGCTTCCTCTTGGGGTTGGTGTGTGTATGAGGTTAGAAGGTCTGCGAAAACTAGGGACCTACACCTTATATTTA:1 - chr3L 10275625 5' + springer 7513 2 50.00 ATGAAAAAACTTTTTGTCAATTGTGTCGACTTATTATTAGCATTAGCACTTCTCGACTACGAATCCAGCACACTTCTCAACTGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGAGGT:1 + chr2R 24660182 5' - copia 4977 2 80.00 CCAGCAGCGGCAGAACCTCATCCATGACCTGCCACAGAGATATGAGAGGAAGATAGTGAAGAAACAGAAAAACCGGTAGTAAGTGAAATTAAAGGTAATGGTATAATTT:1 - chr3L 9954562 5' - Juan 4162 1 48.62 ATTGTACATGTTTCACTGTACAATACACTCGTACACAGAAATGAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGAGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATA:1 - chr2R 16476426 5' + X-element 56 1 59.09 ATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGATATCTTCTATTCTCTCTGATCACATTTTGGTGTAC:1 - chrX 8027462 5' + Juan 51 1 64.22 ACAAACGGAATATCTTTTTCTATAATAAAAATGCAAATAAATGACTACTGAATTCAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 14624437 5' + roo 7 2 67.42 AAGTAGTTAAGTAATTTGTTTCTCTATAGAATAAAACCATCTTCATTTGTCTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTT:1 - chr3R 1313792 5' + Doc 22 1 55.91 ACTGCACACAAAAAGGATCCGGAGCTCGTAAAAAAAAAAATTGGAAAAAAA:1 + chrX 14479861 5' - FB 173 1 94.12 GAATTCTATACTTCCCAGAATTGATCTTCATACGCAATTTGCCGAGCTTGCTAAAAAAAAAACTTATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCACGT:1 + chr2R 18054348 5' - FB 48 1 56.36 GAAAGTAGGCAACAAATTGTAGCTGCTTGTGCGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 + chr3L 10702631 5' - hopper 1366 1 68.18 GACCGCAATTAGGGACCTTTATTTAAATATTATTTTAATGATTTAAACTGCTTAAATTGTTCGAAACACAAACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCAT:1 - chr3L 21084250 5' + 297 6501 1 75.73 ATATTGAATTACCAGATATTGCCTAATTGAAATGTTTGCTCTATTTTTACCAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATCTGTTACTTTTTTTTTTATTTCGATTGAAGA:1 + chrX 8619427 5' + Tc1 1530 1 57.41 AAAATAAAAACAGTAAAAGATGCCCGAGAATTTGGGCTAAAAACGAACCGAAAAGCGGAAAGAAAAGTACAAACAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGG:1 + chrX 21439109 5' + Bica 30 1 76.92 GCAGCAGGTGAGGCCATCACATTATGTCCAAATGCAACTATTAGATACCCATTAGCTGACAAATGCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTA:1 + chrX 639010 5' + I-element 5154 1 63.55 TCCTTCTGTCAGGACCAATTGATGCTTAGAGACAGGGGTCCCTACTTATTAGTTATTCATTAGTCAGTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTGATGTGTAGC:1 + chr2L 18222667 5' - G5A 2785 1 57.27 GCATACGCCCCGCTGGCCGTGTCAACAGCAGCCGCCGCATCATCCAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 9481184 5' + roo 8685 2 61.82 GCTGCAGAAGCGACGCTAAGCTCGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGCATGTGTGAATAT:1 + chr3L 3982303 5' - 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Burdock 6369 2 58.72 TACATTTCTATACTCTGTAACTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTCT:1 + chr2L 19129353 5' + FB 49 1 75.53 CGCCGCTCCGCAAAGGTATATTTAGAGACCTGGCAAGGTGGCTGTGTTGTTGCCATTTTGTGTAGGATTACTTGGAAATTGCACTATGGGGGATTTGGTCTGTTT:1 + chr3L 6899794 5' + hopper 3 2 73.33 AATACTGCGTAAAGCATTTGGAAGTCAATGGAATGAACTAAAGATGTACAATCTTTAAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chr3L 2987467 5' + blood 7011 1 80.00 AAATTAATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTACATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCACGGAAGCTCGGAACTGCAGC:1 + chr2R 11379710 5' + jockey 4689 1 60.40 TTTGTTTATTTTTATTAACTTTTAACTTTGCTTTTTTTTAACTTTGCTTTTTTATTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTC:1 + chr3L 13958678 5' - HeT-A 6041 1 77.98 TGAGAACTTTTGGACAAGGTCCGAATGGAGGAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTAACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCAT:1 - chrX 7938643 5' - Idefix 6963 2 71.82 ACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGG:1 - chrX 20330593 5' - 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chr3L 11085840 5' - S-element 1706 1 71.82 GGTTTCGCTCAGAATTCGAATTTCCATTTTCCTCTCACTTTTTCCCCATAGTTTTCCCTTCAAGCTTGTTAGCAAACGTTTACGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGG:1 + chrX 7777719 5' - gypsy4 476 1 77.98 TGAAGAAGTCCTATAAATAAGAATTTTATCATCATGAAAGTCTTACAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGA:1 - chr2R 7956624 5' + pogo 431 1 59.09 CAATTTAAAGTTTTAGTTTGCGCTAAATAAAAATTGTCACTTTCTATTTAAGTACGACCTTCCAAGACTTCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCTCGGCGGCACTC:1 - chr2L 14172684 5' - frogger 12 2 70.00 TTTTATGGACAAGAATTTCTTCATTTTTACTGTTAAATTTTCTGGCGATAAGAACTTAACTTAAGTCGTGTCACAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAG:1 - chrX 7413822 5' + hobo 2890 1 71.29 AATTCACCGTTAGCCTCGAACGTGGGAGCGCGCAACAGTAACTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACG:1 - chrX 13669730 5' + TART-A 12932 2 68.13 TGCATGCGTATGATAAAATAATTCACTCGACTGCAACTCATAAATTCTCTAATGTCTATACACACTGGCGTGCACTACATTGTCATCTTTCTCTAACACACTATTTATG:1 + chr3R 28270458 5' - invader4 147 2 60.55 TAGCATTCTCTCTTGTTTTTTATGAAATGACTATATATATGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTA:1 + chr2L 21820789 5' + invader4 56 2 70.91 TTTTGAATGATTTACTATATATTTTATCTTAGCTAATTATCATCTGCCTGCCAAACGTGACAAATCTCTAAAAACCAAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACAATAGCAA:1 + chr3L 9501280 5' + F-element 4437 1 72.73 TAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 31458506 5' + jockey 36 1 72.73 ACAAACAGTAAACTTTAATTGCAAAAATTTGTGGCGAAAATTAATGAATGTACCCAGGATTGGTGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATT:1 - chr2L 11679969 5' + micropia 5138 2 60.91 CCGTAGTGTATTACTTGGACACTGCGGCGATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chr2R 4203466 5' - opus 7471 2 67.42 ACTGTCTTTATTCAATACACAAAACCTGGGGCTTCAGTTACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGAACACAGCA:1 - chr3L 25414240 5' + blood 29 2 52.69 GTTTTCACCCAAAAACTCTCTTTATTTAATAAACTAAGATTGAGGTCAAAAATATGCCGATAAAGTGCGATAACACGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTTACACAAGCAAG:1 + chr3L 18187429 5' + 1360 3249 1 70.91 GTATTACTTTTAATTCAGCGAGTATGATTCCTTTTGGAATGTTAGTCAATTAAAACTAATGCAATGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAAT:1 + chr2L 2456016 5' + flea 4963 2 69.72 AGTCAGCGCCCGATTGCTTCACCTTTAACGTTTTGCGTTTTGATTTTGTCATTTTTCTTGTTGATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chrX 17330193 5' + opus 19 2 63.64 TGCAATTGAATCGTACATGGGTCTAACCAAAGACCCTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3R 25125933 5' - 1360 3374 1 55.79 GCAACAAGACACTCAGAGAAAAAACCATAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCA:1 + chr3L 19137056 5' - FB 82 1 60.00 ACCTGCACGGACGCAGCACCACCTCCTCCACGGCTCCCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCCCTCTCC:1 + chr2L 184885 5' + Max-element 8337 2 67.50 CAAACTTCAAAGAATCCCCTCCCTCTACTTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGTA:1 - chr2R 1398690 5' + Stalker2 7305 2 71.82 GCTTTCGAAAACCAATAACAAAACATGACAATTAATTAAAAGAGAGATAAAACTAAACAAATACAACAACAAAATTAATATATATAAGTTATTGCACTGCAATTGATTCT:1 - chr3R 563990 5' + HMS-Beagle 6799 2 78.18 CTTAATCATCCAAATAACTTTAGTTCGAAAACTTTGCCCAGTGTCCAGAGAACCAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATAAACAA:1 - chr2L 9324632 5' + FB 327 1 59.00 CTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAGCATGGGTCAACAAACTAGAGCTGCGTGTATGCGTGTCTCTAGAATCTGTATACTAAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGATC:1 - chr3L 22511716 5' - INE-1 158 1 90.91 CTTAACGTTCTAGCTTTTATATGAGCCAAGAACTGCCACGCCCAAAAAATATCGTATTGATAAAATAAACTTTTTGCCACGCCCACTCTATCGATATGCCAGAAATATT:1 + chr2L 20413738 5' + INE-1 502 1 30.28 CTTTTGCTTTTCACACCGGGCTCGAGTGCATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTA:1 - chr3R 28568981 5' - BS3 1446 1 68.42 ATTCTCACGGACGTGGTTCGATATGGCAGATGGATCAAAAAGGGAGTGGATTGGTATGGGCGGGGAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 15696413 5' + Doc 4693 109 64.77 ATAACTCATAAATTGGTTATAATCACTATAATTTTCAGATTAACTAATTTAATTTGTTTGGAAATTTATGTTTGAACGACTTTCTGGGATACTTAAACAATTCGAGAGAC:1 + chr3L 8757303 5' - Ivk 5205 1 80.00 ATGCAGTGAAATTGATTACAAAATAATAGCATACTTTTTGGACACGTTTCAGCATTGATGTGGCATAATTTTAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:2 - chr2R 13345996 5' + jockey 20 1 60.00 ACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:1 - chr2R 19405961 5' - HMS-Beagle 6996 2 66.36 CTGGGAAAATAGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGTTGAACTAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTTGACAGAGATACGGTAGATTAAAAA:1 + chrX 23368527 5' - Circe 86 1 90.80 GGCGACGACTGCGCCTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGGTTA:1 + chr2R 20664809 5' - Stalker3T 296 1 78.75 TGCCAACTAGATGCTTCGGATTAAAACATAAAAACAAATAACAACAAAACTTGCTAATAATTAATAAGAAAAATCAATATCAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATAT:1 + chr2R 1597211 5' + Stalker 6773 2 60.00 CCTCCAGGTGAGTTGTGTTTGTGTATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr2R 15445894 5' + opus 7031 4 73.08 AGTTTTGCCTTTGTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAAAACAAGGTAATATGCTAAAGAAGTCGGATTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAG:1 + chrX 22596342 5' - INE-1 547 1 57.27 ATTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCG:1 - chr3R 18873667 5' + micropia 14 2 68.18 ATCGCAACATAGAAAGGCGCTCATTTTTTGCTAATTCAATAAAATATCCAAACATTTTGCCGCACAGCCTTTATTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCC:1 - chrX 9538166 5' + McClintock 6181 2 76.15 CCACTTGGAGCATAACTTGCGTCACGCTTGTTATTGCTGTTGGTCGTGTAGTTTACTTATGTATCGCTCTGCATTTGACTTTATTTCGTCTTTAACAAGAG:1 + chr2L 17687127 5' - G3 4341 1 60.40 GGCAAAGGCATTAAGCGGCGCCCACACACACACACACACACACACATACTCGCA:1 + chr3L 10813512 5' + accord 7034 2 87.04 AAAGCGAAAAGTAGCGAGAGAAAGCGAGAGAAAGAGACTTTAAAGAGACGCCCAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3L 3371232 5' + copia 33 2 54.13 CGTGTGGCCACGACCTTTCGAGCCCAATCCTGGGCACATGCGACCCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGC:1 + chrX 1537107 5' + TAHRE 10069 1 71.62 ATTAAAGCATCACCCGAAATACAATAGATCCATTGACTAAACCTCACCCCATCGTCATTCTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGAT:1 - chr3R 24597227 5' + Idefix 277 2 66.36 GGCTTAATCGGAGTGGGCGACACTCGGGGGGGTGTCCATGTCCGTGGCAACATGGGAATGGGGCGACAGGCTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 12300171 5' + 1360 1 2 29.29 TCTGCAAAGTTTTGCTTAAACGGTCATAACAGTAAAAAAAACATTTTGCACTTAAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAG:1 - chr3L 15439491 5' + 1360 473 1 56.36 TTGGCAGACAGGCCGAAGAGAAATTGCCAAAAAAAAAAAGGGAAAGGGGG:1 + chr2L 18539205 5' + Bica 341 1 84.00 AAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1 + chr2R 6984322 5' + HMS-Beagle2 32 2 56.31 CTGTTCACCCACTTTTATTTTCGATTTTTTTTTCCAACGCTTTTGTGGTTAGAAACAGCGTACAGCACGGGCGCCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chrX 7802823 5' + hobo 22 1 54.08 ACTAAAATAACAAGATGCATGAGAATACGTGTGCACACATACAGCTGTCTGCTATCACTGTATGCGCAGAAAAGAGTTGTTCGCTGTAGCG:1 - chrY 846985 5' - 1360 127 1 84.62 CTTGTTTTAACTTTTTATATTTTGGGATGTGAAAAAGAAAAGAAGAGGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTTTGTTGGAG:1 + chr2R 870750 5' - Porto1 4541 1 77.06 GGAGTTTGTTGGTTCCGCTTCGCTCGAGCTACCAGGCACTTCTGAGGTCCCCGGAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 217395 5' - roo 398 1 65.96 GCTGAATTTTATTCAATTCGATCGGTATGCTGCTGCCGAAAAAAAAAAGACATGCGATTAATTCATAAATGGTTTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAAT:1 + chr3L 21300389 5' - gypsy10 5945 2 61.39 AGTAGCTCGGTGCACAGGACATTCTAGAGTGAGCACAGAAAAAATATAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chr2R 20436705 5' - opus 489 2 66.29 GGTGGCTAAAGTAAAGATGCAGGAAGGATATATTACTAGACCCATTTAACAAAAATAAGTGGGATAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATATCTTTGTATT:1 + chr3R 19448040 5' - HB 47 1 62.73 TTACTTTAACATTTTCGTCTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 - chr2R 18807927 5' - BS 5085 1 71.56 ATCAGTGGGCTTGTTGGCCCAGTTTTTCGCATGCGCAGTCCTTGATCCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAACTCA:1 + chr3R 31421234 5' + Quasimodo 68 2 55.96 GCTGTTGGAATTCGGCGAATTGTTTAGAATCCGCGACTGGAACCAGGTATTAAGTGCCAAACATTAAAACTGTGAGGAGTCTTAAAACTCCC:1 + chr2R 4057986 5' + gypsy8 4650 1 57.61 TTGGAAGCGTCATTCGCTAGGATATTAAATTTCATGTTTTGCCTAAGAATGACATTTGCTTTTGTGTGCCTTTTTGTGCATTTTGTTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGT:1 + chr2L 13724386 5' - G2 3042 1 78.18 ATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 3555492 5' + 412 7095 2 75.28 GTATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 17405714 5' - roo 9021 2 85.26 CCCTGCCACTCGATAATCGCGTGGGGGTTTCCTCATACATATATTGTATGGAAATGTATGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGAC:1 + chr2L 3165241 5' + 1360 468 1 70.45 AGTATGTATAGTAAAGAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr2L 18749863 5' - pogo 2072 1 82.43 TATTTATGAAAAATACTCAAAAAATACCCAAAAACCAAACCATTCCCAAAAGCACCTTACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAA:1 + chr3R 20001933 5' + Doc 4552 1 70.24 TAGTCCATATCGCATGCCGCATAAATTTATTAGAAAGAATGTTCTGCCAACTGTCAAAATGCCCGACAATCTTCCCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTG:1 - chr3R 11850186 5' + Doc 403 1 76.64 TGTCTATTAAAGTTTTATTGAGTCATAATAAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 3528583 5' + roo 8694 2 70.59 CATCGCCCAGTTTCGACATTATTTTCTGCGTGAGATGAATGGAATTAGAATAATAAAACGCAATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACGCAGT:1 - chr3L 11878563 5' + I-element 23 1 71.82 AACTCGCGGGAGCGGGAAACGGCAGAAGGATAAGGCCAAATGGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAG:1 - chr2R 20600451 5' + F-element 4556 1 54.84 TCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chr2R 23477850 5' + F-element 51 1 62.73 ATTTCAATTTAATAATTTTATTATTGTTCATGTGTCTATGTCTATGTCTAAAAAACCAACAAAAAATTGAAAAATACTAAGAAATTGCCTTTTACTTATATTTTTTTTTT:1 - chr3L 15116467 5' - gypsy2 437 1 55.45 CGGAATGGGTGTACGGCATCGGAATATGTTCTATAAATGCTCTCGCTATACACATACAACTAAATAACAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAAC:1 + chrX 4138675 5' - BS 5020 1 70.64 AGCCACAGCTGAAAAACGGCATTTTATTTTGCAATCGCGGGCGGGACCCTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGCAG:1 - chr3R 15095627 5' + P-element 20 1 53.41 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 - chr3R 21907535 5' - 412 7483 2 79.09 ATTGTATTATATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTTTTTTATTTTATTTTATTTTATTTTAT:1 + chrX 12946235 5' + transib1 1900 1 45.45 TACATAGTTCCGCCGCATTATTTGTGTAAAGTTTTGCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chrX 9522210 5' - opus 7479 2 57.30 ACATTAAAATGTACAATTTCCAAACACAGTAAACGAGTAGAGACGTTGAGAAAAAGAAAAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATG:1 - chr3L 21167319 5' - G6 1986 1 72.22 AACAAGGCTCAGGGAATTGGTAAGTAAAAAAAAAAGAAAAAATTTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATC:1 + chr2R 19596550 5' + invader2 4815 1 77.27 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 419 2 44.12 TGTTTTTCCTATTAAAAAGAAAAATGTGAACGTAGAGCGGACTTGTGTAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3L 14822846 5' - mdg1 7416 2 60.91 CGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 9871543 5' + roo 8712 2 69.09 TTACAAAGCTCTTGAATGCCGCTGGAGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCTGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTC:1 - chr3R 25254602 5' + blood 7292 2 84.38 TAATCTGTTGGGTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAAT:1 + chr3R 25583758 5' + P-element 2709 1 29.09 GACTATGAATGGATGGGCTTAATAAACCAACATTACTACAGTACCCAGATTTCGGTAAAGAAATGTGGTCACAGATCACCACAGCTGAGATGACTCATGAATAGAAGGAA:1 - chr3R 29108837 5' + Helena 992 1 47.27 TGACGCCTTGCACTTTCAATGACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 - chr3L 3240623 5' + diver 4 2 77.27 CGTTTTTTTTTTCTAATTTGTTATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGTATCGTTTGCCCCTTTTTTGCCCCTGTTTGCCCACCCATTAGTTTTTTT:1 - chr3L 10858100 5' + FB 81 1 67.74 TTAACTTGGAAAACTGGCCTGGTATGGAAAGTTGAAGTGTGTTTTTGAAAAGATCAAATTTACAAAAATGTGAACTTATTTCAACTCTTCTTTCAAAAGTGTGGGCGTGG:1 + chr2R 15546334 5' - INE-1 252 1 54.55 AGAATAGAATTGAATAGAATAGAATATTTTATTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTACAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1 + chr3L 24821492 5' - Juan 4155 1 73.64 TGAAATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 + chr2R 15155205 5' - flea 200 2 75.45 TATAAATTTATATCTATGTTTACAGCGTTACACAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATG:1 + chr3L 16373785 5' - Stalker 6818 2 70.91 AATTCGAGCCGATGTGAAGTGAAGTGCGGCAACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGC:1 - chrX 19900195 5' - 1360 128 1 71.82 AATTTAATACTGGAAAATGTGTGATAAGTAGAAGCAAAACCCCGAAGAGCATTAAACTGCTAAACAACATTACACTGATTAAATTCAAATAATTAATATTTTACAATAAG:1 + chr3L 469012 5' + TLD2_LTR 108 1 60.91 GAACAAACAAATGTTTAGAATTAGCAATCTAGCCACGTAAGACTCGTAAATGGTAAATCGTAAATCGACAACTAACTAAATCAAAATGAAAAAACATCAAAAAATATTTA:1 + chrX 8569454 5' + Transib5 32 1 67.27 TGCAACCTTTTATTTCCAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:1 - chr2R 330237 5' + HMS-Beagle2 4 2 75.45 GATCGATGCCAACGGTTTTCTTCAATTACTTCGAGGGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr3L 18072809 5' + 412 30 2 53.64 ATGCGATCCCCTGGCAATTGATATTTGATTTCAATTGTTTTCAACACTTATGTTCAAATTAAAAATGTCATTTATGATACTAGCCACTTTACGCTTTGAGTTTTTGTAAA:1 + chr2R 12473851 5' - roo 384 1 34.55 GCTTCTCCGCCGAAAAGGTACATGAACTGTTGTACCTCTACCCTACCTATGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGGC:1 + chrX 20699892 5' - Gypsy12A_LTR 1924 3 55.42 GAGTCCTTCGGTGTTTCATAATGTGAAATTCTTATATTGTACCGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 17787077 5' + pogo 20 1 56.67 CGGTACAAGGACAGCGACAGAACGAGACAAGAACCACCCAAACTGGCAAATTTGGCCATAAACCTCCCGGACAACAGTCAAACCCTCAGACGCCTGCAGAGGAAAC:1 - chr2L 16112985 5' + G-element 4159 1 73.58 ACTGCCTAAATCTATGTACACTCATTGCCCTACTCCTGTTGAGCCTTCAAGCGATTTTGCTAGTCTTTTCCTTAAACTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2R 18523636 5' + roo 8672 2 70.00 TATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2L 4016904 5' - opus 471 2 61.63 TGTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTTTGGTTAAACCAAAGACACTAGAAT:1 - chr3L 23456269 5' - Tc3 317 1 51.85 CAAACAAGCCATTGTGATATAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGT:1 - chr3R 8451745 5' - X-element 4683 1 54.55 CCAACTCTCGCACTAAAAAAAATAGAAAGAAAAAACCAAACTCAAACAACGCACAAGAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAAACGAAAAATGCAACATACTTTGTATATTT:1 + chr3L 9547786 5' - Cr1a 175 1 64.55 ACGACCCCATCCCAAAACCCCACTTGCACGTATATACGAGGGTATACGAGTATAAAACCAAACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACAAGACTC:1 + chr3R 6553297 5' + I-element 4904 1 59.26 AGCCGACGTATTGCATAAACACTCTTGATAACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGAT:1 + chr2L 10750113 5' + X-element 4565 1 69.70 TTCCCAATGGGCCGGTCAACAAAAGCCCCCCAGCCAGAATGCCACAATTACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCG:1 - chr3R 21869841 5' + TAHRE 10070 1 71.95 CTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 - chr2R 8086862 5' + 1360 36 1 55.45 ATAATGATAAGCTGCGTGGAACAGGTCTACATATGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 12591780 5' + roo 8699 2 66.67 TCACGTAGCTGTCAATTCAAAAAAAATCGCATTAGCCAACAGGGGAATCTACATGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATAGCAAAATAATGGTTATA:1 + chr3R 27429947 5' + R2-element 3416 1 49.07 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGG:1 - chr2L 16217660 5' - Rt1b 4968 1 54.55 TTTCTGTAAACATCCCATCTCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 18030855 5' + Tirant 15 2 66.67 ATTTAATACAATTTCATTTGGGCCGATAACAGGTGATGTCATGACACTTTTGCATTGCTTCAATCGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTGGCTGCA:1 - chrX 18483247 5' + pogo 17 1 65.45 ACCACAACTGATATCAAATTAATTTTATTTGAGCGTCAAGTTAAGCTAAATTTTGCGGTCAATGCAGCCACGTGGTATGTGCTCGCAACAGCTGACTTTAACAGCTGTT:1 + chr3R 7315693 5' + hopper 1264 1 64.22 AAGAGATGGATGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 - chr3L 16682050 5' + FB 58 1 74.55 AAGCTTTACAAAAGTCGAACAAAAAACCAGACCGAACTAAAGCAATGCTGAAAGTTAAATAGATTTTATTTTTCAAGTCGAACAAATGATCCGTATTTA:1 - chr2L 18638607 5' - McClintock 6341 2 51.52 CACCCGAAAAAAAGCCAACGAATGGGAGGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCTGCTGAGCTGTTCG:1 + chr2L 16631767 5' - G-element 228 1 73.40 CACGGAAATTGATTCATTTCCGTTTCATGCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCTTGCCGTTTTGTTGTACG:1 - chr3L 10624522 5' - Bica 251 2 73.64 AGTTTGGCTGGGGGAATTTAATTTTCTTTGGTTTTATCCTATTATCTCTAATCTTGGCTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAGA:1 + chr2R 24695544 5' + Cr1a 4274 1 70.91 ACAACATGGCAACAACAAGAGTTACAGCTCGACAAGGCAACGATAAGAGGAGCGCATGCATACACTGACAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACAC:1 - chr3R 6194776 5' + jockey 4656 1 78.00 GATAATTTCCACAAACTACGTAGTTGACAGCGCAGTGGGAGGCAGTCCCCCTGATCGCAACGACCCGTTCAGGAGGAGCTC:1 - chr2L 9468812 5' + Rt1b 420 1 69.14 CCTTGTTTTCTTGGGATATCACTTGAAAAATCGATTTCCACACAACGCGATTGCGATAAATACTTTAATTTAATTGCATATATGTATTATATATATGTATATGTATAAAT:1 - chr2L 17152051 5' + Stalker 244 4 60.00 CGACGAGACCGAGGTTACCCAATAAATCACTGCCTCCGGATCCTGCGGATTTTATAGAGCAATGGAACCCCAGTCCACACACATCAATACTAATGCACACCGCATTTTT:1 - chr3R 26078011 5' - invader1 3793 2 71.56 ATAAGTGCAAACTAATTGCAGTCTGCGGTTAAAAATAATTTTAAGGGTTATTAGATTACAGAATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chr3R 25434712 5' - opus 7499 2 77.06 GAACTAAGCCCGACATACAGTTCCCGCCCAAACGATTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAAATAATAATAAA:1 + chr2L 22631430 5' + flea 4990 2 63.30 CACCGAGCACAATATGAATATACATTTTCATAACCCGTATGGATTTCAACTACTTGGTATCTACTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCT:1 + chr2R 18076541 5' + I-element 5143 1 62.73 TAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTTGTTGCTGCC:1 + chr2R 12185356 5' - accord 7343 2 76.74 TCTGTCAGGACCAACCCTTTTTTTGACAGTTTGAGCTGCAAGCTTCAGATACAAACAGAGACAAACAAGCAGCATGAAGGCTCTACCCGC:1 + chr2L 18427025 5' - R1A1-element 5030 1 77.78 CGTCAGACAGGCCACCAGCAAACCCTGGGAATTACCCTCGGGCAGCAGAGAAAAAAAAAATCAACGAGGAAATAAATATAATGGAAAATAACTGAATTAAATATTAG:1 - chr3L 6620053 5' - Cr1a 4307 1 68.22 CGTACCAATGTTGCACTTGCAAGTAGTTGCACAGAAATTATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACATTGCTTGGAACAGTCTTTATGTGTAAGCTTATTCGTGGTG:1 + chr3R 2561820 5' + Cr1a 4046 1 68.52 TGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 - chr4 311592 5' + 1360 35 1 55.45 GTTACACGTCCTGCAACAAGGACTCACACACATGTGCTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3L 10109746 5' + hobo 37 1 64.65 CACTGGAAGTACATGCAGCTGACAACTCAAAGGAAACCAATAAACCACAAAGCTATATATATGTGATGTAAAACGAAAATTAATTTAATCCAAGCAACTTAGCAAAATTC:1 + chr2R 12045425 5' - Copia1_DM 4258 1 55.45 AGTTTTTGCCTGCCGTGCATACAAAGCACTTGCATTTTTTATGACCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGATTTTTTTACAAAAATTAATA:1 + chr2R 9754707 5' + hopper 21 1 54.35 AATATGTATTAATTTAAATAAGAGTAGAGTACTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 12040008 5' - 412 7530 2 58.70 GCAACTGACAGCGAAAAAGAAGTAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 16061681 5' - roo 355 2 80.00 AAGTGTTCAATCCAACCCAAAGAAATTCTATAACATTCCCAGAACGCTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCACACATTCACAAAA:1 - chr3L 2078429 5' + I-element 193 1 54.13 TGTGGTAAATTTGCGTCATCCTCTTGAATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGAT:1 + chr3R 1849564 5' - 297 6543 2 75.45 CCGTTAAATGCTTTAGATGCAACAAGGAAGGGCACATGTCTAGAGATTGTCCAGGGTTTGTCCGTCCGTATGAACGTCGGGTTCTCAGGAAC:1 + chr3L 24751451 5' + INE-1 140 1 63.04 TCTGCGGTTAAAAATAATTTTAAGGGTTATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3R 25434733 5' - opus 7477 2 59.09 GGGAGTACATATAAGTGTAATCCAGAGACTATGGGAAATTTGGTGGAATCTTCTTGATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3R 15309321 5' - HMS-Beagle2 284 2 52.73 ATGTAAGAACACGCACATCAATGCAAGAATCATAATATCTGAAACAAACTTACCAATTAGCATTACAAACTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTC:1 - chr3R 18331091 5' + Idefix 7040 2 70.91 GAAGAATAGCAGAAGCGAAAGGAAAACTCAGGCCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACT:1 + chr3R 20230815 5' + Bari1 1692 1 73.39 GAGCCATCAACTGTAAGCCTACAATTAACGCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGTTTTTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGC:1 - chr2L 6767149 5' + invader1 3678 2 72.73 CAATCGTTGGAGACCATAACGTACTTAGACCTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1 - chr2L 5595541 5' - Max-element 8509 2 63.75 TAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCTAATTGTGTG:1 + chr3L 19951194 5' + Ivk 34 1 54.13 TTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 - chrX 23283047 5' + HMS-Beagle 27 2 52.78 GAATTATACGCATTCACACAACCGCAAAGCAGTTGAACAAACAATATTCCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTGAAAATTAC:1 + chr2R 8638316 5' - Circe 7037 1 53.33 CGATCGAACGTTCTTATGCTATTCAAATGCTCCGAAGACGAAGAGGAAATACTACTTTTCTGGCCTTGATGCGTCATTGGTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCT:1 + chr3L 13013402 5' - Porto1 239 1 77.27 GCTGAATATGTTTTAACTCATACTGGAGCGACCCCTAGGAGGCCCTAGTAGGTCTATTCAATTTAACTACGATAGTCTACCTATTTACTAAAATTATT:1 + chr3L 26722654 5' + Tc1-2 1539 1 60.20 AAAATAAAATAATTTTTAAAAAATTAAATTTTTTAAAATTCGTTGCTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTTATT:1 - chrX 16758625 5' - 1360 2962 1 88.30 TGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3R 13544023 5' - 1360 3371 1 41.82 AATCCAAATAATTAGCATGGGAATTAAATGGAAGACCACAAAGCCAATTTATATATGGTCCAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr3L 16681984 5' + FB 23 1 60.91 GTATTTTCAAAAAAAGAAAGCGAAGAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chrX 5911765 5' + Stalker3T 204 1 43.59 GACAAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 + chr2L 21089152 5' - flea 4981 2 58.18 TGATTCCTTTACAGGTGATCCCTGCTCCGTTTCATCTTTTATCCACCGAATTCCATCATATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 12453031 5' - roo 9051 2 66.97 ATTAAAAGAAATTTCCCAGCTGAGAAGAGACAAGGCAAGGAAAAACATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTT:1 - chr2L 5655860 5' + Ivk 208 1 63.64 CATGCTCCTCAAAGTGTGCTACATAAAATTGCACAATATGCGCATTTTTTTATTTCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr3R 17927503 5' - jockey 4971 1 53.19 GTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr3R 31633160 5' - opus 465 2 68.24 GAGTATAAAATTGATTGCCTCGGACCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAA:1 - chr2R 15374792 5' - 1360 393 1 76.36 GTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCA:1 - chr2R 5924410 5' - jockey 4720 1 45.45 AAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGC:1 + chr2L 10746647 5' + flea 4795 2 59.09 GTTTCCGCTTACACTCATATGAGAACAAAATGATCTATAAAATACGTTTAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2L 770062 5' + roo 34 2 56.36 AATGGCGAAAACATCATCACGTGTATCTAGTATAAACAACAAAAAAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACA:1 - chr2L 6748600 5' - accord2 7214 1 55.32 GTTTTGGGCAAACAAGCCATTGTGATATAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATC:1 - chr3R 8451753 5' - X-element 4691 1 54.55 ACGCAAAATCCCCAAAAAGTTCTATTTACAGCTGCAGTTTGTTGTCTCACCCAGAAGAAAAGAAAAAATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAG:1 + chr2R 12596958 5' - Doc3-element 363 1 60.00 ACTAAAAATCCTAACGAATTCTTCTGGGGGAAGTTCCTACAAATTGAGGCGCAAAATATTTAATTATAAGGCAAAGCGATTATTTTGTTTTGAGTCGATCTTTTGTTTAT:1 - chr3L 18391195 5' - transib3 2431 1 66.36 GAGTGCGTAATGAAATTTGGCGACGAAGTGGAAACTTATTACAACAAAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCG:1 - chr2L 11391942 5' - Quasimodo 328 2 67.95 CTTGTGAATCAAATTTCCATGTTGATTGACCCCACCAGAATTGCTTAGTCGACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAAAAACTATACACCCCTTATCTTAAATCACTAT:1 + chr2L 1416806 5' + Cr1a 4138 1 63.64 CGAGAGAATTCTCTCTCCCGCTCTCTCGCAGGACTCACAGTGGGCAAAAATATATGGTTTATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 - chr2R 15155282 5' + flea 4769 2 69.90 TGATAGAAATATATATTTCAGTTCAAATCACTTGAAATGCATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 13024000 5' - 412 7503 2 61.47 ACTCATTCGAGATTTTTTCATCAGGAAGTTGAAAACAAAATCAGAACTCTTTACAACTGCATTGTTTGTGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCA:1 + chr2R 16777071 5' - Porto1 4298 1 68.57 GCACAAATGTATGCTACACTTTTTTGTGTTCTGTTCGTGGTTTTCATCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chrX 7992524 5' + jockey 35 1 53.54 ACATATTTCTGGCATCATTCTAGTTATTTGTTTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3R 26734052 5' - hobo 2934 1 58.73 TGATCGCCATGTAGGTCGATAGCAACTGAAAACCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr3L 16496206 5' + P-element 49 1 35.78 CATATATGAAATTTAAAACGAAAATCCTTCGAATAATACAAAAAATCTTCCTACTTCATAAGCACGGTATAAATGCCAGAATTTTATTGG:1 + chr3L 5378457 5' - baggins 5333 1 76.67 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGAAGAGGAAGAATATAAAACCCCAACAACTAACCCAACTACAGGGTGCGACAGCAAAATTTCCTTTTTTTAGA:1 + chr3L 22908066 5' - mariner2 880 1 61.82 TATGGTGCTCGGCTTAAGGCATCGACGTGTTCACTGTAGCGCTCTTCGCTCTC:1 + chr3R 2873748 5' - 1360 115 1 56.60 AGTTGCTGAATTATTTGCCGGTTTTCCAAATTTAATCTCATTTAATTTGGAATTCAGGCAGGTTTGCTAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGAC:1 - chr3L 16875781 5' + jockey 4570 1 60.00 GTCATGCCAACTATTATGTACATTTTACTTACACTTCCTCGTTACACGTCCTGCAACAAGGACTCACACACATGTGCTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 + chr3L 10109706 5' + hobo 8 1 73.64 AGGCGACACTGGCCCACATGGAAAATTAATAAGGCAATGCTTGTTGATAAGATATGAACAAAGCAAAGACA:1 + chrX 15969120 5' + 1360 493 1 67.61 AACAGCAATTAAAACAAAGTGAGAAAATAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAA:1 - chrX 5062634 5' + Transpac 411 1 74.55 AAAATCGAATCTCTAAGAAACCGAATCTACAACAGCAACAGCAACAACATGTTGACTCAAGGCAAATGGTTAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26266737 5' - Tc1 1476 1 70.93 TGCCAAGTCAGCTGCAACATCTTTCTGCGAACCCGAAGCGCCTGCACAAAATTGCATTTTTCTCGTTAAAGCCCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 - chr3R 20148935 5' + jockey 4768 1 78.22 AACTGACAAACTGAAGCTGTCACTCACGAGTCAGAGAAAAAAAAAAATTAATAGAAGCAA:1 + chrX 9989286 5' + invader2 301 1 61.67 ACCCATTTTCCGAGCCATATGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATCCATACCTAATTA:1 - chr3R 17436892 5' + mdg3 5289 2 75.27 TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTGTGT:1 + chr2L 16071771 5' - gypsy3 416 1 26.21 AAAGGGGAGTGTCCTAGAAGTGTGTCAACTCAGCCAACCCACGGCAGTCAACATAGTATATAAACATTAAGTTCTTGTTCGCTTTCGGG:1 + chr2L 9319095 5' + invader2 65 2 62.92 AAGTCATTTCAGGATTTATGATGTTTTAGCCCAAAAGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chrX 15500038 5' - pogo 2069 1 65.26 CCTCATCTCCGCCAAAAACGCCGAGAACCAAAAAAAAACCATAGCAAACACCAGGCAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAAC:1 + chr3L 20913008 5' + jockey 4956 1 66.35 CAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAGACACTTAAATTC:1 - chr3L 13228519 5' + P-element 45 1 25.84 TACCAATATTGTTAGGAGACTTAATACCCTTGACTAGCCCGTTGATTGGCAGACACTTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATATAGTGGTCTC:1 + chr3R 7539010 5' + Ivk 325 1 60.91 GTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGCGGCTCCAGG:1 - chrX 22671400 5' + 1360 66 1 89.87 TGAGCCTCGCAGATATTTTCATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAA:1 - chr2R 18507927 5' - Bari1 1684 1 60.00 GAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 204 1 50.46 AAATGGAGTCATTTCAGAGTGCGCGTGTGTGTGTGTGTATTTTGCTGGACAGTGATACGGTAGATTCAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAA:1 - chr3R 17735954 5' - Circe 7260 2 51.89 CATTTCCAATTTTGTCTTCCACTTGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGGGGCACATAAGTTAAATTTTATAGTCCAG:1 - chr2L 4999392 5' + 297 471 1 69.70 AGCAATTTTACTTGATTTTGCTTGTTTCTTTTGTTTTATTTGAACTTGAACGTCATTATCTTATGCTTTATTTATTTTTTTTTTATATTTCACCACAACCACTGCCGTCA:1 - chr3R 7104730 5' + accord2 7350 1 47.27 GCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2R 12416862 5' - pogo 2098 1 65.71 CAGCGTACTTATACAAGCTCACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAACCACAAACACAAACAC:1 - chr2R 10498407 5' + gypsy3 418 1 50.00 AGAATGATTTTTCAAACGTGTTTCAAATCATTTATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGAACTCTAGGCACCCCG:1 + chr3L 16496707 5' - hobo 2891 1 64.81 ACAATTTCGTTTGTGATTTTCCATGGGGTTTTCCTAATAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCACACACTATATCAATCAA:1 + chr3R 1966292 5' + 297 6522 1 61.82 CGTTTTTTTGTAAATCGATCCGAGCACGTGGCAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGGGT:1 - chr3R 25737839 5' - S-element 1664 1 69.09 GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTAT:1 + chrX 16983077 5' + F-element 172 1 72.45 AAGTCTCCAAAGTGTGTTTGTATTGCGGGTAGACTTGGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATTCAGTCACTTT:1 + chr3R 4565285 5' - 1360 3345 1 62.73 GCAAAGGCGTCGTCTGTGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTT:1 + chr3L 2002016 5' + gypsy5 6941 2 58.70 ACAAGTGCTTATTTGGCTACATTTCTATACTCTGTAACTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTT:1 + chr2L 19129336 5' + FB 48 1 69.09 GGCATCGGACAGACTGTTGTTTTGAGGATGGAGAGGTTCATAGTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATAGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr2L 1941357 5' + FB 27 1 51.58 TAATTGTAAGCGCAATTCTCAGCTATTCGATGCAGATAAAAGTTAAAATAAAAAACTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTA:1 - chr3R 14806821 5' + Doc 136 1 57.27 TGATTTCGACTCCCAGCAGCTGCCGTTCAGATATTTTTGCACAGTTGCTGTAGTGTTGTGTTTTTATTTATTTTTTTTTCTTTTCTTTTTT:1 + chrX 14813336 5' + hopper 143 7 50.55 TGTTAACCGAACTAATTCCGAAATCAGCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 3528621 5' - roo 9045 1 68.35 GCCTCGTCTGTGGAGGATCTGGTGGTCCGCTTCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGA:1 - chrX 13612993 5' - Copia1_DM 96 1 70.91 TGAGAAGCACATACACATCATGGACGGGCACACACACTGCATCCACATCCGCATCCACATCCATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAG:1 + chr2R 17496830 5' - Quasimodo 280 2 73.63 CGATTCTGAGCCATATAATCAGCGTCGCATTCAGCCATTCATCTTTCTGCTTTCTCCGTGGCCTCAACCGAGTAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTAT:1 + chr2L 7863884 5' - invader4 2643 1 70.64 AATAAGTCGTGTATAATTTTAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTGAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATT:1 + chr3R 16025218 5' - Bari1 1455 1 80.00 TTAGTTAGTTTAAGCTCAAGATTAAATTATGGCATCGTTATGGGTATATAATATTACTAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 - chr3L 3611819 5' - blood 370 2 75.45 CTTGGGTGCAGTCTGTGTGTACTTAATATCCGGATGAAGTGTAATTAGCGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGCTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGACTT:1 - chr2L 14439686 5' - Porto1 231 1 53.54 ATGCTACGCAACCTGGACGCCCTGACCAACGAAGAGGCTGTTGCTGGCATTTCCCCCTA:1 + chr2L 1175292 5' - F-element 4284 1 69.49 CAGGAACAGAACCATCACCAAAACGAGCACCCCTCAAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCAGCCGCTGCCAGCAACATATCTAGGTA:1 + chr3R 17367636 5' + Helena 889 1 70.65 ACTTGCGTTCATAATTCTCCGAAAGATTCGACTACCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAA:1 - chr2L 10618573 5' + Idefix 7081 2 60.23 TTATACTCCCCATAATAACAGCGAAAAACTTGATTGTACCTGGAACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTGCGCTGAG:1 - chr3R 20600412 5' - Doc 362 1 55.34 CTGAAACATTTCGATTTGCTTTTGGCCAAGTTATTGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGA:1 - chr3L 10702685 5' + hopper 48 1 65.45 TGGAATCCAATTTGCCCTCGTTATGTTCGAGTACCGGATATGCATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2L 9626865 5' - hobo 2921 1 56.98 AAATATGATCTTAAACACAGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3R 7049692 5' - 1360 3341 1 78.95 AAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACCCAAGCACTCAACAATCACAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3R 4604452 5' + 1360 4 2 75.73 TGAAGCTTATGTAATGCTGCAATTAGGGGCGGCAGTCCCTTAATTTCTTCTTTTCAGGTACCCCC:1 + chr2R 11873169 5' - TAHRE 10116 1 61.54 GATGATATAAACGTAGCCCCTCTCCACACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGAAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chrX 22769319 5' + 412 6 2 73.27 AAACGTTTTTGTGTTTATTTCCATCTTACTATTGTAGTATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTATTTCTAAATGCG:1 + chr2R 6418850 5' - flea 4973 2 63.30 CCGGGCATTTTGGGCATTATCAGGGGGAGGCTCAACCTGCTGTTTGATATTTTCCTTCTCTCGGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCCCATTGACAAGATTTATGTGG:1 + chr3R 23421987 5' - Doc2-element 4500 1 66.36 TGGCAGGAGGCACTGCTGACACACTTAGTCCAAAGGCACAGCAAGCCCCCAAACCCAGACCGGCCACCCCTTTCAGCAAACCCTGCACC:1 + chr3R 28067470 5' + G2 15 1 66.29 CATAGGATCCGAATATACCTTCTACCTCCCATCTTCGACTTTTCCCACCCGCAAAATAAAAAAAAAATCTTAAATGAAACCAAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr2L 22999891 5' - hopper 144 105 62.73 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAACACAAACACAACACAAACACAACACAAAAACAACACAA:1 - chr2L 16217660 5' - transib2 329 1 34.48 ACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 21907534 5' + 412 40 2 68.89 CATAAATTATTAAATATTAGTCTAAATATATTTGAAGCCAAGATATCCTAAATTGATATGTATTTTTTGTATTAAAGCAAACCATCAATGGATACATCGGATTCTTTACT:1 + chr3L 15444959 5' + transib3 2396 1 67.27 CAGGGAGGTGGTGGAATGGTAGTACTATGAAAGCAGGAGGGGATCGGGATTGATAGAACGTGGGTTTAACCAAAGACATTAGAATGACAAGATG:1 + chr3R 31232554 5' - 1360 3386 2 71.28 TCAGATTTACAAAAGCAATAAAAATATGGAAAAGACTTTGACGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr2L 21784830 5' + I-element 8 1 70.41 TCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACGGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGACCCTCTGCT:1 + chr2R 6438363 5' - Stalker4 7318 4 68.32 GAACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chrX 12271483 5' + pogo 51 1 73.58 TAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3L 131801 5' - P-element 2872 1 54.79 GATCTGATCGCTGCTGCGCACGTTACGTCGTTCGTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTTTTCCATTTT:1 + chrX 13332797 5' + S2 234 1 78.12 CTCATCCCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCACCTCATCTCATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 + chr2R 12726400 5' - Stalker3T 204 1 73.91 CGCTGCCAAAATGAATGGATATATATGGGTTTTGGGGAATATATATTTTTTTTTTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTACTTATTAGTT:1 + chrX 10433010 5' - flea 228 2 59.09 ATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTC:1 - chr3R 4604461 5' + INE-1 165 1 57.27 GTTTTCCATTCTCCGCATTCACAGGACTCGCATTCTGCAAGACAATAAATCCCGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAG:1 - chr2L 1351085 5' - F-element 4399 1 69.05 ACTTTAGGTAACTTTATTTACCTTCCTTGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2R 9963473 5' + pogo 6 1 68.13 GTGTGGCCATGTGTCTGCATTTGAGTGCACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTAACAATTTT:1 + chr3R 5910700 5' + roo 8686 2 62.34 TATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chr3R 25434814 5' + opus 141 4 71.43 ACGCCCTCAGTCCTCATAAGAGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTG:1 + chr2R 6537902 5' - roo 9059 1 60.92 GTACACTGGTTGTGTAGCTCAAATAAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr2L 2484439 5' - jockey 4985 1 64.00 ACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAG:1 - chrX 22913203 5' + gypsy7 21 2 64.22 CATGTCGCTTCGTGCCCTGTAGAAGTCGTTCTCATTCAGTCACGGGCAGCACTTAACCACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGC:1 + chrX 1171396 5' + F-element 451 1 73.81 TCAATTCATTTCATTTTGGGTCACTGTAACACAAAACGAGTCCAACTGAATCAGCGCACAGGTAATCCAATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTA:1 - chrX 19390788 5' + I-element 5173 1 67.27 GTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAA:1 + chr3R 17673740 5' + FB 5 1 73.68 GATATCGACGATTCCTTCATAGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGACTACAGAGCTGGGG:1 + chr2L 1309037 5' + BS 4673 1 73.96 CTGCCTACGTTAAGTTCGACTACACGATTCCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCT:1 - chr3L 22304376 5' - Cr1a 4396 1 67.80 GCTTGCTTTTGGAATTTCTTCTTTTCCAAAAACTAAAATTCACTTTTCTCGACCGTTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTT:1 - chr2R 16974089 5' + S-element 317 1 56.36 CGCAAGACATAAAACGTGGCACTCGATGATGCCTATGGGCGACTTCGCACATCGCGTTAAACCAATACATATATATATATATATAGAAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 - chr3L 2033859 5' - 297 389 2 77.27 ATATTTAAACATTCGAAAAATCGAAAAATCTTAATTTAGCGAATAAATATCAATATCATTATCATTACAATATGTAATGATGAACTCCCATTTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr2R 8397416 5' - 412 7531 2 50.91 GCGACATCCATTCCTTTTGCCAGGTATCGGGCCGCAGTTTGACTTTGTTTCATCTGACGTCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTCCC:1 - chr2L 18991827 5' - invader4 430 1 54.64 AGCCATTGTGATATAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTT:1 - chr3R 8451739 5' - X-element 4677 1 60.00 CTGCTGCTCGCAGGTTTATTGTTACTGGTTTTTTCACTTTTCATCAATAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3L 8919707 5' + roo 8700 2 58.18 AAAATGCCATAATGTGTGTTGGTATTAGTGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGAATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGT:1 - chr2L 22497731 5' + invader1 268 2 71.82 AAAGTATTTACGTTCGTGTTCGTGTGTGTTATTTGAATGTATGGAATGGGGAAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chrX 4216632 5' - I-element 5324 1 50.91 CGAATATGTTTAAAAGGGACCTGCTGTACATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 + chrX 2867507 5' - 297 6943 2 72.34 CATCGTAAATAAGAAAGGCATACAACATGCTTTTCCTTTGGAATTTTAGGGATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 - chr2R 20924290 5' + mdg1 28 2 50.96 AGAGTATAAGTTGAATCAATTATTTAATCTAATAAAAGACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chrX 14771739 5' + jockey 4687 1 53.75 ATCGGGCGGAACAGGCATAGATACTAGTACCTACATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 + chr3R 19058383 5' + Burdock 6183 2 69.72 CTGCTTGACAGCGCGACCATCTTGTATGTGCCAGCATACTAGCGCACGCACACTCACACACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTT:1 - chr3R 8181599 5' + 1360 3232 1 73.20 GTGTCGGCGGAAAGGTGTCATATACTCCAAAAATTGGGTGTTCTAAATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTGACTG:1 + chr2L 18014601 5' + invader4 2999 2 53.68 ACTGTGATGATTGTGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 + chr2L 14708868 5' - opus 7470 2 63.83 ACCTCCGATCCAGAGTAATATCTTATGATGTGGGGCAGGAAGTGTTCCGTGGAAGTGGAGCGCAAATTTTCGCGATTCAAA:1 + chr3R 3915192 5' + R1A1-element 102 1 56.79 TTTGGCCACAATCTGAACTGATATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGGGCATTCCATTTTTAAAATCCCAAATAAAAAGACTTTACT:1 + chr3R 9435799 5' - roo 401 1 69.00 AAGTCTTCGCGATTAGGTACCCAAACAGCAAGGCACCTCTCCAGTAATTCAGACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACAACAAACTCTAAAAAC:1 + chr3R 25100667 5' + I-element 5178 1 50.00 TTAAAACGGCGTACGTATGTACAAGTTTAAACGTAGCGTGTCCATGGGTTTCCAGATAACTTTTAAATGCATAGACTCGTTGAATAGTATGTAACAGACAGAAGGCAGCG:1 - chr2R 5645313 5' + INE-1 30 1 57.27 CTCGAAGAAGTACAAAAGAGCAAATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCAAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGA:1 + chr3L 7021658 5' + roo 9043 1 70.93 ATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGACGA:1 + chr2R 1320684 5' - diver2 4867 2 46.36 CAGGATATGGAGTCAAACAAAATGAATCGAGATTGTAAAACAAATCGTGAGAAAAACAAGATTACAGATAAAGGATAGGATAAAGTCTTTTATAGTCAGAACATAAAACT:1 - chr3R 17446167 5' - 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BS 5081 1 67.31 TTATCGGAGGCACCCACAATTGACTGCCAGTTTACACGTATCGAAACGAGAAGTATCATGGTTTTTTGTAAATTTTAAATTTTAATTTAAAATT:1 + chr3L 16845007 5' - 1360 3048 2 61.70 ACGTGTGGCCGAAAATATATGGTAATAAACCGGTCTACGGGTGGGTCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr3R 23665005 5' + 1360 32 1 57.69 GTTCAAGTTTGTCGACACTCTATTGTAATTAAGCGAGCGGCAACTGAAATGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCAAGATGGCTCC:1 + chr2L 18515431 5' - Q-element 497 2 60.00 GTAAGCCGAGATAATACATTGCAAATCGCCATACATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAGGCT:1 + chr2R 8500511 5' + G6 1793 1 75.96 TTTCAAAGGAACTTACTGTTAAGGGACTGGAGGCGGAGATCAACAAGATGAACTGCGACCACCAACGGAGTTCAGCGCTCTGCTCTACGAACGGTCAGCAACA:1 - chr2R 9824290 5' + gtwin 97 2 59.22 AAGAACGTCATCTCTGGATATGATTTGGTATGTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTA:1 - chr2L 17027073 5' - Stalker3T 202 1 35.45 CAAAGGACAACAAACCAAACCAAAACTGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCACG:1 - chr2L 3400667 5' + I-element 443 1 77.53 ACAGGAAGCAAATTTTTTCCACGAGAAAGAAATCATTTTTTCATTTTACATGACCGACGCTTCTAATCTCCCAAAATCGACTGACTTAAGTCT:1 + chr3L 16193473 5' - Burdock 6262 2 61.29 AGGCACCAGAAAGCAATTCAACACACAAACCGAACTTAACTTGATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGT:1 + chr2L 14090778 5' + G2 2728 1 52.81 CTTTATTTATTTGCTGCTTGCTGTAGGGTTGTAATATATAGGTACAATAATTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTAT:1 - chrX 408404 5' - TAHRE 10287 1 74.55 TGAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGCGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 3555498 5' + 412 7090 2 63.33 ACAACCATCTGGACCGGTTTGCCGGGCTGTTGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGGTGGTAGCGG:1 + chr2L 5593656 5' - F-element 411 1 60.61 TGGGGTTTTGGGCAAACAAGCCATTGTGATATAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTG:1 - chr3R 8451757 5' - X-element 4695 1 58.18 AGTTTCCATGTCAGCAAATTTTCTTTGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGGGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTA:1 - chr3L 5614503 5' - blood 7081 2 73.39 AAAGACCCGGGTTGGTTCATTGAGATATTCCACCTGCAGACATCTACTTCCCCCGCTCTTACCCACGACCAGACTACGTTCGGCAGAAA:1 + chr3L 13050897 5' - invader1 3715 2 64.04 CTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGG:1 - chr3L 23909060 5' - I-element 5069 1 71.74 TAATAACAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGGACGGGGGCAGAATAAATCCTGTTCCGCATCCACTATTTATT:1 + chr2R 25257624 5' - TAHRE 10388 2 54.55 TTCTTTGAAATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATA:1 + chr2R 15155200 5' - flea 205 2 70.91 AACCATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCTCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 23861099 5' - pogo 2075 1 74.29 CACGTTGAGCCACGTTTATTTGGTAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAGTTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTA:1 + chr2L 16067052 5' - HMS-Beagle2 297 2 65.71 GCTTTTGTTATCGTTCGCCTCGTTTCATATCCCTGCTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTGTTCTTT:1 + chrX 2998968 5' - Doc2-element 240 2 88.89 CAATGCAGTGAAATAATTTCATCATAAAGCTTTTATTGCTTTTATTATTTTATTTTTATTATATTACCCTAGCACTGGCCAACAATTCCAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 - chr3L 24999035 5' - INE-1 543 1 60.00 CAGGGCAATCTAATTAGCTGAAACCAAAACCAAATCCTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATAGATG:1 + chr2R 18747968 5' + blood 173 2 54.93 ATAATAATTCATTGAATAAACACAGTCAGCAGGGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTA:1 - 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Cr1a 235 1 75.93 GAGTTCCCTAGATATATAAGAAAATAATTACTTTGACTATTACCTATCAGTTCGCCATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 + chr3R 19996493 5' - copia 225 1 51.82 GACAATCAAGTAGGTGCCTAACCACCGTTTTTATAGCCCACCTCTAATTTCCACACATTTACACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 18403609 5' + roo 8686 2 74.00 TTTGGTTTCCTCTTTCTCTACAGCCAAATTCGCGTCGTTTTGGCTGCGCA:1 + chr3L 24037272 5' + G3 5 1 88.00 TGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTGT:1 + chr2L 16071771 5' - gypsy3 418 1 29.47 GTGGTGAATAATTGAGGTAAATTGGATGTTTAGCCATCAAAGGATACATTTTCCCTCTGCCTTTTCAAAATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAGATCG:1 + chr3L 5267746 5' - invader1 3890 2 70.37 AAATTTGTGCCATTATCTGAGAATATTTTCTTCGGTGTTGCTCGTCGAGACATTAAGTTAGTAAGACACATCGCACAAGATGTGCACACATTGGACTCATATGGTCGCTT:1 + chr2R 4621645 5' - Bica 4839 1 72.73 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACATTGTATGGGGTGAGTTTGGGCCTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTAATCTTGGCTTTTAGACA:1 - chrX 14317415 5' - HeT-A 5878 1 72.73 GGAAGTAAGGTAATAGAAATCGAAGAATGTTGTAAATAGGTAGGTAGTTAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCTG:1 + chr2R 19422290 5' - Quasimodo 7081 2 55.21 GTTTACCAGTTTGCCTCGTAGTCGTAGTGTTTGTTTTACTTTTGGGGGTTGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATT:1 - chr2R 17369546 5' - accord 7020 2 64.37 AATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 - chr3L 19347211 5' - jockey 4943 1 65.38 AAACAGGATTTGAGCTTTACCGGGAATCTTTTCTGTCTTATTTTCGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2L 9171410 5' - opus 7493 2 67.71 AAATCCAGAGTCAGATCGGCCGCCAATTTTTTTTCTGAAGAGGAATCAC:1 + chr3R 28669797 5' - Q-element 64 2 63.27 GCACTTGGCAGCATTGTCTTTTGAATTTGAATTCAAAGATAACTTTTTTTAATTTTACGCTAGAAAAAGGATATATTGTAATAAACCAATATATGACACCAATTGAGAAC:1 - chr3R 22094057 5' - blood 365 2 61.82 ATGTCACATCAAAAGAATTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTT:1 - chr2R 23354386 5' - Tabor 479 2 68.81 GTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTTTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 13225524 5' + hobo 49 1 78.26 TGGGAGAGGGAGGAGTGGGGGGGATTCGCTTCCATTTCGCATGCGCGCGCATTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAA:1 + chr3R 16427736 5' - Idefix 181 1 70.24 ATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2L 15988761 5' + 412 37 2 68.42 TGCTTAACGCGTGCGTTTCTCTCCGTGCGACAAAGCAATAACGGAACTTAAGGAAAAATACAATAGCAAGC:1 + chr2R 20126410 5' + F-element 4439 1 53.52 ATGCGACTTAATTACGCATGGCAAGCCGATCGGACCTCACGCAGCTGCAGAGGTTG:1 - chr3L 11303885 5' - invader4 2870 2 55.36 TTTGGGCAAAGTTAAAGTGGTTTTCACACAGTTGCGACAAAATGTGCATGAAGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGAAATCCCGAAAAA:1 + chr2R 24431716 5' + Idefix 7081 2 67.71 CTGCAGCCGGAGTTTTCATGCGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTACACACA:1 + chr2R 15693508 5' + HMS-Beagle2 6926 2 74.44 TTCGGTTGCGTTTTCCTTTTATTTTTTTTTCTCTTTCTT:1 + chr3R 12645389 5' - Doc2-element 220 1 92.31 GGGCACTGGCATAGTGTCAGCTTAAATGTAATTGTTTGGAATTTTAATGAAATTGAAAGACTCCATGCTGATGCAGCTGCAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTA:1 - chr2L 17878272 5' - Tabor 3 2 76.85 TTACACTTCTTGCACGCATAGTTAATGTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTTAA:1 - 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gypsy3 419 1 35.16 TTTCCACAATAGTAGACAGATAGGCCGCATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 + chr3L 18072715 5' - 412 7523 2 57.55 TGTCGACAATGTACAAATAAATAAGTATATCTCAGCTTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAA:1 + chrX 20099927 5' - S-element 1674 1 63.64 AAAAATGCATATAGCAGCCTGCATCCTATGCCCACATTCATGCTCTTCACTTGGTTAATCTTGCATTGATTTCATTGATTCCCCGATATCTATCGATATCCCAGCAAAAT:1 + chr3L 6361958 5' + INE-1 501 1 76.36 TGGATACTAAAAAATGTTGAGGATGGTTGTGGTTCTTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCC:1 + chr3R 19279384 5' - Ivk 5025 1 56.96 TACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTTTTTCAAGC:1 - chr3R 26398902 5' + Doc 28 1 65.38 AGGGATCCGAGCAAAAAACTGCAACAAAAATACCAAAAAACGAATAGATCTATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1 + chr2L 12910696 5' - Burdock 237 2 57.73 ATAAATCACAATTTAATGGCTTTTCCATTATGTGACAGTTGTTCTTATCTAGCAAGTAGGCGTGTGTAGGCATGTGCTTAAGTCTAAGGGACTT:1 - chr3L 1585570 5' - Idefix 14 2 78.72 TAAGATAAGCGAAAGGGGTAAATTCCGCTGATTTATCATAGTAGATTCGGACCGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGACCTT:1 + chr3L 3782329 5' - gypsy9 5027 2 77.17 GATGACAGTAAAAGAAGCAGCCACCAAATTGCTTATTTATTAGCCAAAAGAAAAGAAAATATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAG:1 + chr2L 12115552 5' - I-element 5109 1 74.44 CAAATGTTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCAGAAGCT:1 - chr3L 15968254 5' + P-element 22 1 56.57 GTGGGTCAAGGGTTAAAGGTTGTTTGCTGATTGCAAATGTTTCAAATGGAAAATAGCTTCAATAGAAACTGTGTTTGTAACATGGACTGGTAACATTATCACATTGTATG:1 + chr2L 17681817 5' - TAHRE 10209 1 73.64 AATAACATTTGTGCCTGGCATAAGCAATTGTTTAAAGCAAAAGTCACCCGCACTTCTTGAAAATTCCTGCGTCGTCGGTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGG:1 + chr2R 17213151 5' - Bica 4878 1 64.55 CATTCTCCCCGCAAAACAAAAAGGGAATGCTAAACAATAGACGAAAACGGGTATATGCGTGCGTGTTGTGCTAAAAGACTATTGCCGAAATCAATTCTGATCTAAA:1 - chr2L 15986006 5' - 1360 3174 1 66.04 TGTGTTGTGTTGTGTGGTTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTCATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 + chr2L 16217660 5' - Tabor 7272 2 66.97 AGCACTGATCTAATGTTCATTCACACCCATGCTGACACGATCACAAACTCACTCACGCTCGCACTCATACATATTTACAAATTAAACCGGACTTGTGTTCTGATTTGGAG:1 - chrX 11619837 5' + 412 7534 2 79.09 ACACGAATTTCGTCATCCGCCGCAAACACATAATTTATTCTCATCTTTAATCTCAAACGCAAAAGCATCCAGCTTTAAATTTTTTCATTTTTTTTTTATTTGTTTTTTGT:1 - chr3R 6295438 5' - G2 3076 3 60.00 ACCAAATACAAACCAAATTACTTTCAGCATTCTTCGCAGTGGCTCTTTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 + chr2L 17393342 5' + FB 1 1 69.44 CTGAGCTTTTCATTCGGCATTAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATAAGTCATCTAAG:1 + chr2L 17127552 5' + flea 84 2 74.49 GCCGGAAGCTCCTACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAT:1 + chrX 21772477 5' - springer 3 4 51.76 GCTGCATTGCATTGCATTGCTCGTTGCAAGGGTCGGCTGTTTTTTCTTTTTTTTTTTAAAAA:1 + chr3R 20774368 5' - HMS-Beagle2 480 4 66.13 CGAGCGTAGGACTATGCAAGGGGCATTTTGAAAAGAGGAGAGTACTTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chr3L 126251 5' + pogo 35 1 58.18 TAAAACTTTATTGGATAGATCATGATCTTTGTTAATGTCGTTTCAAATTCAATTTCATTTAAAATTTTAAAA:1 + chr2R 13759796 5' + 1360 3049 1 68.06 GTCTCCCCGCTTTTCCGTCTCCCTTTACCGCTATTGCACTTCCTTTTTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTGGCTT:1 + chrX 17865222 5' - 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opus 478 2 64.56 GTCCAGCTAATACGCCCTCAGTCCTCATAAGAGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr2R 6537891 5' - roo 9065 1 69.57 CTCAGAAGAGCACGAACGAATGCAGGGCAACCACAACAACAATAACAACGACAACAACGGACAACAGGGAGAGTAAACAACACACAAAG:1 - chr3R 11531122 5' - Cr1a 204 1 66.29 ATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr2R 12416870 5' - pogo 2085 1 56.00 CAAATAAAACCACATTTATTAGGCTGAGACATGTTGATTACCTGAAAAGGCTCGAAAA:1 + chr2L 8854517 5' + G6 1799 1 74.14 TAGCAAAATGCAAATTTCATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTGCTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 23621058 5' - roo 9033 1 57.41 ATTTTTCATAAGCTCGGCCAAGTACTTGCTCCCATGCACACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 6537992 5' + roo 19 2 61.54 AACCTTCTGCCAACTTTTTTTACCCTGCACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAATCGA:1 + chr3R 23621003 5' + roo 55 2 73.64 CCATCACATATTTCGTCCTTTTTTATTATTTTATTAATCCCCGCAGTGAAAACCGTGATGATTTTCATTCAGGAAGTATGGGTATGTAATTGTAGTAAAATTACTGTAAA:1 + chr2L 10899593 5' + X-element 4596 1 71.82 TACCAGGGTATAAAGTGAGAGAAAGCTTTTGCGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGAACGGATGTATA:1 + chrX 2477413 5' - Idefix 190 1 60.00 GTCCACCCCTTGCACTTTCGGGTTTTTCTCTTGGCCCGGATTTCTTTTATTTTACTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 9559523 5' - Doc2-element 251 1 71.21 AATAAAGCTTATTACCTCTTTGGACAACGATAATCCTTTGTCGTTGAAACTAAATAAATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2L 18488977 5' + 1360 8 2 69.89 GAGATCGACGACCGTTGTGGGGGTTTTAACGAAAACAACAAATTTTAAAGGGTGGGCGGCAAACGAAATAATTTACTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAAT:1 - chr3L 9766970 5' - FB 671 2 67.59 TCGATAAGGTTAATGACTTCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 13556739 5' + hobo 40 1 74.42 GACACTAAACTTAACTCGACTCTAGCTTAATGTTAATTTAAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTC:1 - chr3R 19303831 5' + I-element 5048 1 63.64 AACTCCCTATCTCTAGTTTATATACAAAATATACTACTCTACAAATATATTTATCAATTCAGATTGTGAATTCGATTCGATTCATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 + chr2R 23415611 5' + F-element 14 1 65.45 GGAGCTCCACCTGATCCCCACCCACATCTTTCACATCCGGCATAACAACCGGGCAGACGGCAACTGGAACACC:1 + chr3R 22313099 5' + Tirant 63 2 69.86 TATTATCATTATACCCGTTACTCTTAGACCCGTTACTCTTATTCGCCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAACTA:1 + chr3L 16289241 5' + INE-1 142 1 56.00 TAACTAAATAGAAGAATATAAAATAGAATATTTAAATAATAAACAGCATTCTCAAAAAATTATGGCTAAGCTTTAGAGAATAACTAAAATAAAATATTTT:1 + chr2R 15253933 5' + G7 1150 1 82.00 AAAAAGGCATTGAAAGCAATAAAAACCAGAGCCAGCGTGGCAACAAGGAGAGAAATTAAGCGTTAGAGCGGCGATTTATACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATA:1 + chr3L 8604765 5' + 1360 3018 1 63.64 TGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTTTTGTTTATT:1 + chr2L 9723026 5' - Porto1 162 1 40.22 TATCTCAAGCGGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATTT:1 + chrX 4556547 5' - blood 164 2 63.41 AATGGTAAAACATCAAGTCGAACGGGCCATACTCAAAAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGC:1 - chr3L 9313421 5' + accord 6956 2 60.22 GAAATTTAAAACCATCTAACTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTATATA:1 - chr2L 21034144 5' + 412 7071 2 64.55 ACAGGAAAATCTTTACGAAAAATCGATGCAACCATAGAAAGAAAATAAAACAAAAGAAACAAACCAAATCAAGTACAAAGTGCTTCACA:1 + chr2R 17671246 5' - accord2 7234 1 59.55 TAAAACGAGTCAACAAGCAAAAGCGTTTGGTGTTGTTACGTGCCAGTATGAATCAAATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCA:1 - chrX 5030516 5' + roo 9011 2 59.09 GTTCTTTGGTGAGTATTTATCAGAATGAAGAATGACCGATGTGGAAAAAAGGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTG:1 - chr3R 16578976 5' + 1360 3333 1 62.79 CGTTTATTTGTGTGGGTGACTGCCTTTGTTTGTTTGGATTGCCAGGAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGACTGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAAT:1 - chr3R 12874354 5' - 17.6 176 2 57.80 CCGGCCTATAAATAGGCGTCACTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 217334 5' + roo 8682 2 70.77 CATTGTTAATAAAAATACTATTTTATTACATTATGAAATTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - 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chr2R 19321272 5' - roo 355 2 71.82 CTTCTGGTAAACCGAAGACCGCAACTGACAGGAAACCATTTCAACTAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCT:1 - chr3L 4729321 5' + Cr1a 4362 1 58.72 GTAAATCAAATACTATAGGACTAACAAGTATCATTCTATTGGATGAAATTAGGCACAGCCAACTTATTACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCAAT:1 + chr3R 23166903 5' + Tirant 385 2 69.09 ATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTAATTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTATTTTGCTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGA:1 - chr2L 14025656 5' - TAHRE 10432 1 77.27 GATTAAGGACACACAAAAAAACCGCCAAACGGGGCGTGGCAAAGGCGTCGTCTGTGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAG:1 + chr3L 2001978 5' + gypsy5 28 2 51.82 CAAGTGACAATGTCGTCGAGCAGCCTTTATTGGAATAAATCCAAAGCCGAGTTCCGAGACGCGACTCACGACCAGCTGTCCCAAGCGCTCCAAATGGACTTGCCG:1 + chr3L 21473139 5' + BS3 172 1 67.62 CTGCTAGCCATTTCGGACCTTTCCACCAAAAATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAATCCACTCCCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 19446535 5' + roo 8686 2 60.91 GTTTCACATATTAGCGAAATTTGTATATTTGTACAAATTTGGTGAACTTTCCCCAGAACGAACGGGGCTCCAAGCAATTTACAAATTATTTTCGTCCACTACAAACTTTA:1 + chr2R 12245466 5' + Juan 250 1 52.73 GAGTCAGGAGGAAAACGAAAGCAAACGTATGGAACGGAACTCTGCGGAATTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCAAA:1 + chr3L 15800996 5' + Porto1 4321 1 74.74 CTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCGTTCTCTCTCTTGAATCTGTATGCGGAATCTAAACCTTTTAGATTTTCTAGTTCCTGAGATTTCGAAGTTCATACGGACAGAC:1 + chr3L 23747154 5' - INE-1 129 1 69.09 CTCGCTGCTCGCAGTTCGTCTCCTGGGGACACAGTGTGGGCCAAAGAGCACCATCTGTCGAAGGCAG:1 - chr3R 24146823 5' + Osvaldo 1324 2 64.18 TGTTTCTAAGGCACGGTCACACTCAGTCTGATTGGCACAACAAACGAAAAAGTTTGCGTATACTGCTCTGTCGTGATGAGAGCGAGCGCGATAG:1 + chr3L 11214483 5' - diver 366 1 60.64 ATGTTCCTCTATATTGGATTTTCGTTTAGATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGTTGGG:1 + chr3R 30554772 5' - 297 6545 2 71.82 TTCGATGTCAACCTTTGAAGTCATCCCATTTATTCACGTTTCAATGCGTTTCTTGGTTAGTTTTGCTTAGTGGGATGTTGGTAGGGTTTCTTTTTTTTTCTTTTTGTTT:1 + chr3R 12872200 5' - Doc2-element 219 2 63.30 TGCTTTAAATTAAAGTACATATTTAACTTTAATTAAGATTGTGTGCAGAAAATGAATGGGAAAAAGTATTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAC:1 - chr3R 20703291 5' + flea 4767 2 71.82 CCGGACTTTCCCGGCAGCCTCTGTCTCCCTCACACACACACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTT:1 - chr3L 1840591 5' + 1360 3231 1 63.01 AACAAAACAAAACAAAACAAAACTTAAAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCAATCAATC:1 + chr3R 29013339 5' + 297 6524 1 82.57 AAATAGCAAGAAATAGCAACAAATAACCAGCTAGCTGGAAGACCATAATAAGTTAAAGTTACAGGTGGAGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGTAC:1 + chrX 4944099 5' + invader1 3752 2 77.89 AAGTAAATATTGACATGGCAAGCGGCAGTCATATAAGCAGGGAATGTAATGGAAATAAAAATGAAAAAATGATGCAGA:1 + chr3L 16246975 5' - pogo 50 1 75.64 TTCGCAGTTTCAAGCTTGTGAATTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGCGTCAAAAGAAGACTCAAGCGAC:1 + chr2L 2484384 5' + jockey 4739 1 80.00 GATTTTTATACCCATTTATATTCTTTGAAAAGTATATATGTAACAGGCAAGTAATAACGAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 + chr2R 25257573 5' - HeT-A 6056 2 76.47 TACTTATCTGATTAACCAGCTGGTGTATAATCTCGAAGATAATGCCGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3L 7400737 5' - roo 9032 1 60.00 GCAGATAACCCATTTGACACTCGACTTTATGACAGTTTGCGACTCATTTAAAGCGTATTAAGTTCTTGCTTTTTGTTATTCTCTTGTATTTTTGTTTTTTTTTTAATTTT:1 - chrX 17488660 5' - Doc 4698 1 67.27 TTTATTAAAATGTTAAGTTTAAAAATAAAAGTTGGCAAAATTTTAATTTATTTGCCGGGACGTCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTTACGC:1 + chr3L 12527053 5' - 1360 3303 1 64.89 GTTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTTAACTAATTTTAACTTTGCTGGTGGTTTTGATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAAAGAATAAATTCTG:1 - chr3R 18052450 5' - TAHRE 10408 1 71.82 GCACTCACACTCGACTGCATTGCCATGGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACATCCTAAACTATTGTAG:1 + chr3R 11315234 5' + hopper 39 1 66.29 AAGGAAAATCTTTTATGACACGTTATTAGTTGTGCGCCGCGAAGGGATGTGTATGTATGTACACACATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr2L 15963422 5' + 297 19 2 64.55 GGTAACTCTAGGCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGTGGCGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2L 6243745 5' + 412 7071 2 60.61 AGCACGGCACAAAAAAAAATAGACGCAAAGGGAAGGTATATTTTTGTATTAATTTGTCATAATTTCGTAGTTGACTTTTTTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGT:1 + chr2R 22033236 5' + Tc1-2 1416 1 73.64 TGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr3R 7049643 5' + 1360 36 1 61.47 CGGATGCGACTTGATCGCCATGTAGGTCGATAGCAACTGAAAACCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 + chr3L 16496195 5' + P-element 12 1 60.24 CAAATTGATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 20167942 5' + 412 42 2 73.68 AAGGCGAGTTTAAGTGGACGGATCTACAACCCTCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3L 16496254 5' - P-element 2870 1 50.65 AAATCAACATGAATTGAATACTCCTCTCTACGTTGAAAAAGACTACTGGGTGTAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:1 - chr2L 9754869 5' + 1360 33 1 51.82 GGATGAATATACCCCATATCCTTACTTTAATTTTTGTTTCGGATTCAATGTTATTATTATTTTTAAGCTTTCTAGTTTCACTTGTTTGTTTTTTTTTTGTTTTGTAACTT:1 + chr3R 18537371 5' + Tc3 93 3 70.00 TACCCCTATCAGACTCTTTTCCTATTTCCCAATTAAAAAACCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTAGCGATTAC:1 + chr3R 11483050 5' - accord 7125 2 58.25 TAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 + chr4 1294995 5' - HeT-A 6056 2 92.31 CGCCTAAAAGTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTATTTAATCTAATAAAAGACTGTACACACCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chrX 14771707 5' + jockey 4685 1 65.45 ACAGTTTAGAAAGTAAGATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATGCGCATGGGAGATGAGAAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 31458554 5' + jockey 18 1 70.09 TGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAACGGAAAAATTTTTTTTGAAA:1 + chr2L 21750457 5' - Stalker4 6867 2 65.45 CAGGAGACTGAAGACGTGTTTTTCCTATTAAAAAGAAAAATGTGAACGTAGAGCGGACTTGTGTAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr3L 14822830 5' - mdg1 394 2 55.45 CGGGAGTTTGTTGGTTCCGCTTCGCTTGAGCTACCAGGCACTTCTGAGGTCCCCGGAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 217397 5' - roo 405 1 74.16 TGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAA:1 + chr2R 1320688 5' - diver2 342 2 47.47 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:2 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 2 45.45 TCAAATACTAATATTTGGTTTATTTAACTCCACAGTAGTGGTTCTTTATTCAAGGTTCGATTTTGATTTGATTTTGATTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 - chr3R 434807 5' + F-element 19 1 58.18 CAAGCCGAGTCAACTGAAACTGAACTCCTCTGTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3R 5671465 5' - 1360 3367 1 57.29 ACTTACATTTTATTTGCGAAATTGTGATTGACAAGCTGTTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGA:1 - chr3L 18859721 5' - mdg1 7237 2 64.22 TTCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGATAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTATTTAATATATTG:1 - chr3R 4487815 5' - hopper 1116 1 64.22 ATTATGTTTCTTCCACTACTCAATTTAATTCCCACTAATCCACTCATTTTTGCTCTGCGGACTGAGCTCTCGTCTTTATGGATTTTCTTCTCCTTTTAGTTATGGCGG:1 - chr2R 23670775 5' - TAHRE 272 1 71.30 CCTCCCAAAGCGAAAAGTAGCGAGAGAAAGCGAGAGAAAGAGACTTTAAAGAGACGCCCAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTCAACAACACTAC:1 - chr3L 3371238 5' + copia 28 2 55.45 AAAATAAATGCTGTACAATTATCAGAACATGTACCATGTGTACATCTATATACAAACACTAGCACATTATAATTACAAATAAAATCTACTTATAACTGTCCC:1 + chr3L 15423768 5' + TART-C 10748 1 43.14 TAATGTAACGTTCTGAAACTTTTTCGATGTTTAAAAAATACATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATG:1 + chr3R 6263304 5' - diver 204 1 55.81 ACAATTTTCCCGACTTCCCCAAGATTGATAAGTCTATATTGCAGACTTGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chrX 15499965 5' + pogo 13 1 61.80 GTCAGTTAAGTCAATCCAACGTGCCACCCACTTCCGGTAGAGCCATAAATCCTAGCCCAAGTACAGGCT:1 - chr2L 15763103 5' + 297 6542 2 76.81 ATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 81.82 GTTGTATGCTGTGTGGTTTTGTGCCGTGCGCTTTGCCATTCATTGAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTAT:1 - chr3L 15251422 5' - Quasimodo 65 2 62.50 AAACAAAAGGAACCCCAAAATGTAAATGATAGTGGAAAATCCCAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTAT:1 - chr3R 8815919 5' + flea 372 1 60.91 ATGATATAAACGTAGCCCCTCTCCACACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 + chrX 22769320 5' + 412 7068 2 66.97 CTACGTAGTGGGGCTTTTAGTTGTCGTCACCGAAAATGAAATAAGTGCATAATGGAAATTTGCGAAAGCCAATTTTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr3L 13160617 5' + pogo 7 1 74.55 TTGTCAGCTTAATTTCTACACATGTAGATTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 18181060 5' + hobo 41 1 66.67 GGATTTTGTGTGACTTAGCGGGTGGGAACTGCACTACGCAATAAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAG:1 + chr3R 12878008 5' + Gypsy12A_LTR 2071 1 65.28 TACACTAGTCGGCATACTTATGCGTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCGTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTT:1 + chr3L 18463458 5' - gypsy5 7301 2 75.79 CAGGTTTATCTATGCGCATCCGTTCCAAGTGCGGTTTTGTGATTTATGCTCGTTTCTGTGGGCCAACAGGCAGATCTCTTGTGACAGC:1 + chr2L 1358693 5' - mdg1 276 2 77.27 CGACGACGCGAACATAACGAGCAAAATAAATGAACGATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGCTAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3R 5774887 5' + I-element 41 1 59.80 ATTCGCCTTTATTGGAGTGTCTTCTCTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATT:1 - chr3L 5205820 5' - I-element 5000 1 76.36 GTCGAGGAATCTGCGCTTGTTATCGCTCTCACTCTCTCTTCTTCTTTCGCTCTTCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGCTCTCGGCCGGTTCTTT:1 - chr2R 10460150 5' + Cr1a 349 1 75.47 TAGTTGACAAGGACACGAATCTAAAATCGATAGCTCTCATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chrX 23045346 5' + blood 7179 2 53.73 CTTTGTTCAACGCTTCTAAGCGTATTTATTTAAATATTAGTTGGTTTGTTATGTGTATTTTCTGTTTATCTGGAAGTTTATAAAATGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 15124256 5' - roo 9018 2 80.91 AAAATGGGACAAATGAAAAGCGCACACACAAACAAAGGCGCAGAAGTTTACAAACAAATTTTAACTACTTAATATTAATACTAACTCACTATGTCCAAGCCCCAAACTCA:1 + chr3R 19322506 5' + TAHRE 10294 1 60.91 CACCACAAGTGCCGGCGAAATTATAGCAATCTCAATACCATGTTTTTGTATTTGCTGGACGTCGATAAATAATGTTTAGGAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGGATTCTG:1 + chr3L 11260285 5' - copia 4785 1 74.55 ACTTGATTTTAATACGAAATTAACCTTAACTTTAAATATAGCCTAAGTGGTAAGTTTATATATCACATCTTCAGTCACCGCCTATCTCTCTTCGAGCG:1 + chr2R 19010388 5' + Ivk 6 1 60.20 CCTTGCCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTTTCTTTTTTT:1 + chr2R 22289381 5' - gypsy7 5009 2 52.27 TACTAGAGTCCTTTAAAAATTTCCCTTCAAAATATAGTGATTTGTATTGTTAGTTTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAG:1 + chr3R 24700836 5' - 17.6 179 2 67.78 AGGAACAAATCGTATACTCAAATTGTTTTTAAATTTAATAGCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chrX 16893399 5' + roo 33 2 60.20 TAATTGATGGCCTGCACATGGCAAGCTCATCAATAACTAACATGACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1 + chr3R 7588832 5' + F-element 18 1 70.00 CTCCATCTCGATGGAAAGGAAAACAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATAT:1 + chr3R 29954718 5' - roo 8753 2 78.18 GCAAATGCCAAACGGAAACTCTAAACACTTGAATGAAATTAAAAGACAACTTATTAAAAATACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTG:1 + chr3L 993633 5' + Tc1 438 1 68.54 CTGCGATAAAAATTGTAAACAAATTTTGACGGAGGGCAAAAAAGTGAATCAAAGCTCGAGTTTAAACAAATATTTATGAGTACAAAAAATGACCTGCGGTCGATCGT:1 - chr3L 14260842 5' + hobo 2736 1 74.77 TAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr2L 15763850 5' + blood 42 2 70.71 CTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr3R 17673756 5' + FB 31 1 56.19 ACGCCGACGTCATGTGCACCGTATCAAGGCTTGCACTGCAAAAGGTTAAGGACGACCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 18675696 5' + 412 7082 2 52.73 GCCTTCTAGCGTTCAATGTTAAGCTTAACCTAGATATTTCCACTTCAGCTTCAGCATCGGCATCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACAC:1 - chrX 11333823 5' - P-element 215 1 74.73 GTTTCGTGTTATCCTTCAGCTCAATTTCGGCTACTTTTGGATGGCTCTCGGCGAGGGGGTTTCTTTTTTTTTTGCTTTTTTT:1 - chr2R 18209625 5' - gypsy7 5009 2 73.17 TTTTTTAATAATGCAGTAAACAACGACACATACAGCGGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAA:1 + chr3L 7173673 5' - copia 4947 2 66.36 CGACTAAGCCAGGTAAAACTAAACCTTCTGCCAACTTTTTTTACCCTGCACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 23620982 5' + roo 20 2 57.29 CTTGCTCACACATACGCAGACACATTTTCACTTTTCACAAAACGTAGGGTACAAAACCCGGCTGCTCTATATCCATGCGCAATCCACTCAA:1 + chr2L 17557758 5' + Quasimodo 7139 2 68.13 GGTGTAGAACCAAGAGGATTTTTAATTTTTTACGTTGTGCATATATTTTTACAGTTTGGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 23653378 5' - pogo 2083 1 62.50 GCCCCAAAACCATCGAGCATTCGAGAAAACTGCACGGCCAACGCAGCCATATTTATAAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGAAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr2R 19254247 5' + jockey 4703 1 53.64 ATGCAGCAGCAACATCAGAGTCAATAAATGCCATGGCCATGCGTCCATACTCCCCTGTAAGCCGATTTATCACCAACTTTTCAAAACTCCCTCTCAATGCAATATGTCAA:1 - chr2L 17692455 5' - Dm88 4337 1 74.55 GAAAGCTACTGGCCTGAATTGCGACCATATTTGCTTAAACAAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTAT:1 + chr3L 3759927 5' + F-element 4537 1 56.84 CTATATGATTGATAGAAATATATATTTCAGTTCAAATCACTTGAAATGCATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3L 13023991 5' - 412 7517 2 50.96 GAACATAACGAGCAAAATAAATGAACGATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGC:1 - chr3R 5774878 5' + I-element 35 1 65.52 ATGCAAATACTTTTGCACAGTGAGTTTCGCAGTTTCAAGCTTGTGAATTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACTC:1 + chr2L 2484359 5' + jockey 4707 1 56.31 GGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTTATTAAGGCATACGGGAAAATCTTGGGACCCCTTTGTATCCTTCTTTTCTATTAATT:1 + chr3R 11000776 5' - X-element 4663 1 71.84 ACTTAAATTCAATTCAATTCATCTTTAAAATAAAAAGAAAATAGTTTATTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 + chr3R 4553337 5' - Juan 4179 1 57.14 TACACCAACAACAACAATTGCCAAATCACCACCATGCAATGTAATTCTCAAAAATCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAAT:1 + chr3R 18130827 5' + HeT-A 6000 1 77.67 GGGGGCGAGACAAAGGGGCGACACAAACACACATAAAGATAGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAAGAACGGAAAAATAACGG:1 - chr2R 15617987 5' - rover 7088 2 58.59 GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAGACAAGACAAGAAAAGAAAAGACAAGAAAAGAAA:1 + chrX 16983077 5' + Penelope 651 1 24.73 TATTTGTTTTTATAATAATTAATAGTGCACATTAATAATTAAGTTTGTTTTTTGGATTATTTAATTTAATTGTTCTTAG:1 + chr2R 19836889 5' - 412 23 2 72.15 AATGATGCGTGCTTGGGTGCTTCATAGCTATGCATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAACTTCATTAGAATAATCA:1 - chr2R 13699463 5' + jockey 4811 1 68.52 AAATGCACACTAAAGCGTAAAAATTAACAAACAGTCATTATACAAGGCGATAATAAAATCAATATAGAATAGAACTCTGGGGAACTTCCAGTAAATCCCACTTACAGCTA:1 + chr3L 10874839 5' + Porto1 4301 1 65.45 AACTAATTAGTTTAAGGTTTCTGGTAAAAGAAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGACAAGA:1 + chr3L 12158451 5' - 297 347 2 69.09 GGAACCTTTCAAAATAAATTGACAATAATTTATTACCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAG:1 - chr2L 4094626 5' + Quasimodo 145 2 67.19 GTAGCACTCAGGTAGGGCCTGTGGTCCTGTTTTCTTATATATACTGTTTGGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCG:1 + chr3R 10463032 5' + Cr1a 4231 1 54.55 TGTTCGGCATTAACTTACTGACTCCTTTATCCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATT:1 - chr2R 15092985 5' + I-element 5012 1 62.03 GTGCATCTGCAGTGCGATGTGATCCAGTGCTATGGTCGCTGTGTGGAGATCGATGACTGCAACGCTGACTTCCCCTCCACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTTG:1 - chr3R 10172948 5' - flea 4858 1 58.72 CACAACCGTTCGCTTTAAAAGCTAATAGACGAAGTTGCACTGCGCCTATGTCTATAGAATCTGCAGGCTTAGTCTTAACCGCTTTTAAAGTTACTGAGATCTCGACGTTC:1 - chr2R 3341945 5' - INE-1 141 1 67.27 GCAAACTCTCAAATCAGCCACAGTAACAGCAAATAGTAACGTTCCACACACCACAACAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAAC:1 + chr2R 11454210 5' + F-element 334 1 65.56 GTTGGACCCTTCGCCTGTTCGGCTGTTTGCCGTTTGCCTGGTTGTCTGTCAGTCTGGCTGGTTTCCTTATTTTTT:1 - chr3R 26820817 5' - Transpac 351 1 81.33 ATTTGTCTGGGCCAAGTGACAAACAACATCAAACTTATCATCCATCAAGCAATGAATATCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTA:1 - chr3L 15819430 5' - pogo 2093 1 71.58 TGCACCATGAGAGAAAGTTTACAGGCACTTGGGAAAAAGTTGTTCTAAACATCAAACATTTGTATATAATTTTATATATATATAATATAATTATATTAAGCA:1 + chr2L 3281481 5' - gypsy7 5061 1 56.86 GTGTTAGGCGTCATTAAGGGCTTGGCCGTTGACGTCTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAA:1 + chr3L 23384747 5' - 1360 147 1 69.44 AAAACATTTAAATTGCCACACATTTTTTCAAAGTTGATGAAAAAGCTTATTGCCTCAACATAGATTTTATCTGTAATCTTTACTCTCTGCCGCTCTTAAAAAA:1 - chr3L 25985854 5' + Cr1a 4242 1 63.11 GCTTATTTGGCTTCCTGCACTTTTCTTTTTCTTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGG:1 + chr3R 15428411 5' - F-element 23 1 69.66 AAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 21034120 5' + 412 42 2 59.09 TTCTTTGGCAGGAACAGGAATATTGGCGCGAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGG:1 - chr3R 10761379 5' + HeT-A 5733 1 70.18 GTTCAAGCCATTTGTATTGCTGTCAACATATGCGCGTTCAATTTATCAGGATCTGTTTTAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAAGA:1 - chr3R 16333446 5' - TLD2_LTR 185 1 55.56 ATCGAGCTTTAGGAATGATTCACTGACCCTTTGACCTTTAAATCCCAGTTCTACAATTCGTCTCGTTTGTTTTTCTTTTGCCTTTTTT:1 + chr2R 24979020 5' - Doc2-element 237 1 64.77 TTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTAT:1 - chr2R 21358403 5' - Porto1 163 1 50.00 TTGAAGTATATATTTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGACCCTGTCCGTCCGATTGCTCCGAAACGTCAAGATCTTAGGAACTATAAA:1 + chrX 12627633 5' + INE-1 146 1 72.92 CCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAAATA:1 - chr2R 14884037 5' + mdg3 43 2 62.63 GATGAAAGCGGCATTGCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 + chr3R 23861052 5' - pogo 2100 1 76.09 TGCTGAACGAGAATAAAAAGATCGGGAGTACATATAAGTGTAATCCAGAGACTATGGGAAATTTGGTGGAATCTTCTTGATATAAGTAAATAATGACAGTTTATTGATT:1 + chr3R 15309298 5' - HMS-Beagle2 308 2 73.39 CTTGTTTTGCATAATCCTTAATATTTGATTTTTCTTACAAAATTTCTTTCTTATATACTATTACGATTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTA:1 + chrX 18302342 5' - I-element 4933 1 69.09 ATCCACTGACAACCTAAGCTGCAATTTCTTCCCAAGAGATTTCTGGCCTTTTCGCATCGGTGTGTTGTTGTTTGGCTATTGTCTAAAAGGTTG:1 - chr2L 7910528 5' - G6 1842 1 78.49 CACTGCTGGGGGTGTTGGGTGATTTAGGGCTTGTTGTTGGGTTATGTTTATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGG:1 + chr3L 17010479 5' - I-element 4908 1 73.33 TATTAATTGAATGTATGTGGCACCGAACGGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGGTG:1 - chrX 12349814 5' - Quasimodo 6917 2 60.00 ATCACCATTGTATCTGGCAGACCTCCTGCTCCACTTAATCCCCATAACGCATCGTCGACCCGAGGCTAT:1 + chr3L 1682774 5' - invader6 4660 2 66.67 TATAATACCCACTTCCCCCTTTTGTCGACAATGTACAAATAAATAAGTATATCTCAGCTTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCG:1 + chrX 20099905 5' + S-element 8 2 69.39 AGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 + chr2L 21089157 5' - flea 220 2 61.68 ATATTTAATCTGTTTATTATCATTATACCCGTTACTCTTAGACCCGTTACTCTTATTCGCCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGG:1 - chrX 18031420 5' + INE-1 137 1 50.00 CAGGAATGGGATTAAGTCTGACTGACTCGTCGCGAAACGAGCTGCCAGGACCCTTGAGAAGGATTGCATAGACTGAGTTCATATTCGGAACGGGCCATTTAATAGACTCA:1 - chr3L 18929510 5' + 17.6 459 2 74.55 AAGAATCCAAGCACATACACACACAAATTTGGGCATTATCTTTTTTTTCGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 - chr3L 8527241 5' - hopper 1389 1 67.11 AATCCCTGGAGAAGATGATCATTCCACGTCGGTTATTATACTTCTTGTTACATTTGTTATTAATTTTAAAAACTACCCAACAAGACATTTTTGGCTG:1 + chr2R 4694687 5' - Cr1a 495 1 73.20 GATCGGAGTAACCGAGTGGGCGCGTTTACGTACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAA:1 - chr2R 24807760 5' + Idefix 133 2 72.73 TGACACTATAGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGACAAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 16742240 5' + 412 38 2 55.45 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 419 2 43.52 AAATAACTCGCGAGCGCAAAAACAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTACTTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chr2R 23488943 5' + jockey 75 1 73.91 TGTAAGCAGTAAGCTATTTCACGAGCAACTAGCGCAAACGAAACGTGGCAAAAACGAGTGTGTTTTCGAATACTTTTATAGAATTTTTTTCATGTTTTGCTTATTTTTTG:1 - chr2L 21400819 5' - Doc3-element 4714 1 26.36 GTCTATCGCACCCAAGTGGTTCTTATCTTCTTCGTAATTGCATACTTTCGGGCGGCAATTTGGAAACAATTTCACACTGGCCAGAGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 - chr2R 19357464 5' + jockey 4668 1 74.29 TTTCATCTTCCAGCTGCCAATTTCCTATTTGTATTTGTGACAATTTCTTTTCGCTTTGCGCCGTTTCCTTGGCTTTATTGCTTTTCTTTTCTTCT:1 - chr3R 25368085 5' - mdg3 5102 1 74.74 AAAAATTTAAAAATTATTTCAAAGTGTGGGTTTGGCAGTTTTGAGGGGTTTTAGGGCGTTAGAAACATAGTTCATCATTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAG:1 - chr3R 20292664 5' - INE-1 153 1 66.00 ATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 37.27 CATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTAGAATTTTTGTTGGA:1 + chr3L 25272572 5' + 1360 87 1 70.30 GAGGATGGAGCGCGGCAGCCATTTTATGTCCTTGTCGTCTGCTATCAGTGTATGTATGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTT:1 + chr3L 13889896 5' - accord 7032 2 72.50 TGTCCCTGCGATTTTGTCGTTTTGCTTCGGATCATTGTGTTGTTTGTGTTGTTTCTATTTTGTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr2L 20939500 5' + hopper 4 2 73.68 TTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTTCAATCTGTCTTAAAAAAGGATGACAATAAGTAAATTTTATATTTTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGGTGTT:1 + chr2L 19817862 5' - G4 3776 1 74.55 GAGCTCAAAAAGTGGCCAAATTGGCGACCAAAGCCTTAGGTTTCCATATGAATCATTCGAGTGTTGATGAAAGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGA:1 + chr3L 16727118 5' + gypsy3 3 4 70.75 CATAAAAGAAGACATTAAATCGAAATCATAATACGTGAATATTCAAATGAGAAACTAAATGAAGTTTGTTTTTGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGA:1 - chr2R 13287300 5' + Doc 4492 1 53.21 AGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCA:1 - chrX 4617442 5' - blood 149 2 64.86 GGCACTATCCTTTACCGATTGCGAGCGGAAAATGTGAGTCCGAATCTGTTTTCTGTTCGCACAGATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATT:1 - chr3L 5283297 5' - Quasimodo 153 2 74.23 TGTTCGACACGGAGAATCGGAGAAAAGCCACCATCAGCGATCCCCTAATTGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAA:1 - chr3L 20930358 5' + I-element 297 1 65.22 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAGTCGCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTG:1 + chr3R 21907534 5' - Rt1b 4872 1 37.89 AAGCGTAAAAGAATGTGGCAAAAAAGGGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACA:1 + chr2L 7354939 5' - 3S18 121 2 65.82 AAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGA:1 - chr2R 9963554 5' - pogo 2067 1 64.58 CATGCTCCTCAAAGTGTGCTACATAAAATTGCACAATATGCGCATTTTTTTATTTCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 - chr3R 17927503 5' - jockey 4967 1 55.10 ATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 21034123 5' + 412 33 2 53.85 CCGCCTGCCTTTGTTAACATCCGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAGAGTGAGGCTCTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 13925439 5' - P-element 2881 2 73.40 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 204 1 68.18 AGACCCAAAACACAGTTGTCCGTCCGTTTATAAGTAGCTTTTGTGCCCCTCTCTTTGCCTTTTTTTTTCCCGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGC:1 - chr3L 8074249 5' + 1360 48 1 68.18 TATTTTTGAACTGAAAGTTTTGCTAACATTTTAACGAGCACGTGAGCTTTTCGAACAGTTGTGAGAAGCTTATTAGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGT:1 - chr2L 20714084 5' + R1A1-element 241 1 55.45 AATTGCGAAGTAAATTCAAGCTCAATTCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 - chr3L 20039839 5' + Doc 16 1 60.32 TTTGAAAATTCCGTTACAAAAATGCTCAAAAATAGTGCATAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACA:1 + chrX 14827562 5' + G2 3029 2 65.45 ATGGGGTCAGAGTTCAAGTGAGAGAGTGAGAGCGAGAGAATAGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCGAAAAACAACAACACCAAACAAAACTGCGAACAACGCACAAA:1 + chr3R 24395888 5' - Cr1a 228 1 69.09 AAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAGCTTATGCGCATATATG:1 - chrX 4617443 5' - blood 153 2 56.76 TTACTAAGCCATTCAAGTTTTATAGTTTCCGACAAGCCGATCGTGACCGTGACCATTAAACTTGGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGC:1 + chr3R 8581893 5' + jockey 214 1 61.82 CGAAGCCAGCACACCTCCGTCTTTATAACCAACACCCACCCAAATACGTCACTATTTATATAAATATATAGGGACGTATTCACGCCAACTCA:1 + chr3R 30549891 5' + McClintock 2 2 60.87 TGGAACTGAAATCGAGAACACAAAAAATATGATAAGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTAT:1 - chr2L 8476789 5' - Juan 4201 1 63.64 ATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 - chr3L 20525229 5' + 3S18 5804 2 65.26 GGAAACGCTTTCGGAGTCAACACTCGAGTGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGACA:1 + chrX 17193340 5' + F-element 202 1 72.73 CATTGCTTTGGAATTCGCACAGCCATTAAAGAAGCTCCCGCAGAATATACACAGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3R 14703867 5' + 297 23 2 57.27 CCATTGGCCTCGGGTATACTGGTCGGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATACGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr3R 6132072 5' + I-element 25 1 62.16 TGTGTGTGCCACTGATGACGACACCGACATGGCTTAAAAGGGTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTT:1 + chr3L 10054476 5' - I-element 71 1 57.58 TATTTACAACGCATCGTTTTGTTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3L 15968184 5' + P-element 10 2 58.67 AAATTCTAATCTGAGGTAATTATTCCATTAATTTGTATTCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 30369753 5' + roo 23 2 59.05 TTTCTGCGATGCCTATGATTGTTTGGTTTTCTTTTTGTTGTTCAATTAAATATATTCCAGTGCAGCCCCAACCGTGAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATG:1 - chr3L 14806197 5' + G2 141 1 75.45 ACTAATTAGCCTGCAGCTCGTCAAATTGCAAGTCATACAAAGGAGGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTA:1 + chrX 4479084 5' - McClintock 5952 1 59.09 GAGCTTTACCGGGAATCTTTTCTGTCTTATTTTCGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr2L 9171421 5' - opus 469 2 57.55 AATATAAATTCATTTAACCTTAGTTGGACATTTTTTATTACTAGATTTTTAGCTAATCGTTATTAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 18626891 5' + roo 8684 2 56.36 ACATTAATCTGCCATATGAATTGCAGTCGCATTTAAATAAGCCGACGTATTGCATAAACACTCTTGATAACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAAGCTGACGCTT:1 + chr2L 10750074 5' + X-element 4537 1 69.09 GGATCCTACGTGCAAGATGTTTACATCGCGGCGTCGCCCTGACAAATGTGCCAAGTGTGCGGACGTGTGCTCGCTACGTGAACGATGAAGGAAGATGTATACTGA:1 + chr2R 20837731 5' + Bica 80 1 63.81 AAAATATTTATTATATCATTTTTTCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2R 16799188 5' - roo 9012 2 81.82 CAGTCTATGCTGAATTTTTTTTTTGAAATGGGTATCTTAATGTTAAACATGAGTGTTGTGTATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTGGCTAAT:1 - chrX 18203996 5' + accord2 498 1 49.49 AACATTTACCGACATTTTAATTCTCAGCATATTATTTACGCTCACAGCATTTTTGACAATTTAATTGGGCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 + chr2L 10128636 5' + copia 17 2 65.45 GGTCCCCAAAACATCGACTAGTTATTGACTATAAAAATTAAACGAAAGCACAATACCTGACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTAGATA:1 - chr3L 26507208 5' + Idefix 150 2 62.39 TCACTCTTCCTTTTCCCTTCTCATTACCCCGCCACGCCCACTTTAACGCCCTAAAGCCGCCATACCAGTCACGCCAAATTTTTTAACAATTTTTAATTTTTTTCTCATTT:1 - chr2L 7533286 5' + INE-1 470 1 72.73 CTAATGTGCCACGCTTTGTTTTCTATTTTTGCTACCTTTAGCTGTAAGATGTTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTT:1 + chrX 18218912 5' - roo 476 1 72.73 TAAATAAGAGTAGAGTACTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCTGTTTTANGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr3R 12039994 5' - 412 7498 2 71.82 CCTTTCAAATTGACGTCCTGCTTAATATCAAACCATAAACTGCACTGTGCAACTATTCTCTCGCTTTCACTCTCTCGCTGTTTCGCTCTCCCACACACAATCTACATTTC:1 - chr3L 11919835 5' + Cr1a 317 1 66.36 TTTAACTTTGTTCTTTTTCAATACTATTTTTGACATTTACACTCAATGTGCTACAGAAACAACAACTTTAGGATTTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGT:1 + chrX 15836060 5' - jockey 4915 1 71.82 TAACAGCTCTATTCGGTTATTCAATATTAGTTTGAGACATCCGGAGACCTTTCTTGAATACAGACCTCCCAGCCCAGCACTAAACTTATTAGGGCATTAAT:1 + chr2L 139191 5' + Doc 4573 1 68.32 TGAATATTTGAAAATAATAATACATAATAATAATAATAATAATAGAGTGTCATTTCTTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr4 425309 5' + copia 4890 2 57.84 TTGTGCGAGTGCCAAACGAAATCAAATCAAAAAGTTCACAAAAATGCCAGACCAAGAGAAATTAATTAATTTAATTACTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 - chr3R 22979427 5' - Juan 4197 1 59.09 TAGCACTTCATAGTTCATCGTCTCTTAAATTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chr2L 13710686 5' - copia 203 2 73.64 TGACCATACCCCTTACCCCATTCCACAGCCTTGTTTTGCCCGCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTTTTACAAAAATGAGTTTTTCA:1 - chr3R 11315283 5' - hopper 1389 1 50.53 ACTAATTTTCTACTAGCATTCGAGCCGATTTACGACCGAAACGTTAAAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1 + chr3R 24813928 5' + P-element 20 1 62.04 GTACATAAAAAATCTGGAATAACCTACAGAATATTATTAGTGCAATTATGTGGTCCGAAAAGATTCTTCGAGTCCGCGATACATCCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGG:1 + chr2L 16920767 5' + Max-element 348 1 60.91 TGCTGCAGACATATTTCTTGTATAGATTTTCCTGTATCCGATGCACATTCTGGAGATAAATTTATGGCTCATGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 + chr3R 7874796 5' + jockey 4673 1 74.51 CGCGCGCTTGGCTGCGGTATGGTTCGGTCCTGCCATTCAGGCACATTTACACCAAGTAATTTAAAAAATAAAAAAAAA:1 - 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chr3L 25414247 5' + blood 7050 2 46.36 CTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCCTCTTCTCTTCATCTTCTCTTCCTCTTCTCTTCCTCTTCTCTTCCTCTTCTCTTCATCTTCTCTTTTCTTATCTTATCTTATCT:1 + chrX 4617441 5' - Stalker3T 204 1 67.89 ATCCTTAGCGGTGGTGTGCGAGGGAAACTTTCGCTTTATAAATAAAATTACAATTTGTGTTCCATGTTGCAATTGTTGTTGTCTTTGTTTACGTCTTAGTTTAGAAAAAA:1 - chr3R 20076126 5' + transib3 362 1 61.82 TTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 - chr2L 13268395 5' - HeT-A 6059 2 69.90 CTGTTAAACCAATCTTAGACATATAATGCTTTTTTGGTTACTTATTCACGAATTAAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chr2L 21784924 5' - I-element 5328 1 55.45 TTGCTAATAAATTCTAGATTTGGATGGCAAAATGCATATGCAAATAAATAGCTAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGGTGGAGCCT:1 - chr2R 21592088 5' - Tirant 391 2 71.82 ACAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACTCTTTATT:1 + chr2R 25257629 5' - HeT-A 6019 2 65.06 CGAAAGCCAATCAATAAGTCAAACATAAACTGAATATAAAAAATGAATCTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCAC:1 + chr2R 14691716 5' - Gypsy6A_LTR 119 1 81.25 TATTGGCAAAACTCGATCCACTAAAAATAAATTGACATCAATCAGGGGGCCCGAGGCAAAAGGAAAAGGTCAAAATAATGGCAGAAACGGCCGATTTCGTTAAAAATAAA:1 - chr2L 12287554 5' + hobo 474 1 61.82 AAACACAACGGCAGTTGGTCTATTCGTCAATCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr3L 21103461 5' + Doc 35 1 59.46 CCTGCTTCAAAAGGGCTTCAGGTCTCGTTCATCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAA:1 - chr2R 12649831 5' + I-element 100 1 67.37 TAGAATGGTTATGCTTAAATACAAAATCTATTACGGAATGTTAATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 + chr2L 11762180 5' - mdg1 7449 2 60.76 GGCCTACGTGGTGCTGGACTTTCCTTCAGTACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCATCATCAAGTTT:1 - chrX 22850307 5' - Dm88 344 1 72.73 AATCATTGCATGTTTTCAATTTGCGTTGATGAATAAGTTAGAGCCTTTTTTCATGAAATGGATAAGTATTTGTAGGTCATATTCAAGCGGG:1 + chr3L 9040273 5' - S-element 1348 1 62.64 AGCGAATGGATGGAGGGATCCCCAGCTTGACTGGGCTTTCGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTACAGTATT:1 - chr2L 12842326 5' + Circe 97 1 60.81 AATTTGTGCCATTATCTGAGAATATTTTCTTCGGTGTTGCTCGTCGAGACATTAAGTTAGTAAGACACATCGCACAAGATGTGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTG:1 + chr2R 4621646 5' - Bica 4838 1 71.82 TGATCTTATCCAGTTAATGGATGGAAAGGGTTAAAAACAAGCGCCAAGGGAGTTTTATTGTTAGAGATGTAAAGCCAGAAGATGGCTCTGAAGATTCCGAAAGATGGAA:1 - chr3L 15838997 5' + Copia1_DM 465 1 63.30 TTAATTACCAGAAATAAATCAATAATGCCCGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAA:1 - chr2L 14917953 5' + hopper 52 1 70.91 GTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2L 21768293 5' - Stalker3T 203 1 74.29 AGTCTGAAGACTTTTCAGGAAAGAGTCAAACTCACCCCACGTAATGTACACCTCAAAAATTCAAATAATTGTACCTACATATTGCATTCTATGTAATCAAAGGCAAAATA:1 - chr3R 25108159 5' + TAHRE 10370 1 76.36 AAGGAACTTTCTTCAATTCCTCCACCAGCGGAGGATTTTTTCGTCCATTCCCTTTGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGGGGGGTTT:1 + chr4 411902 5' - G2 128 1 61.70 AATAACAAAGAAAAGCATAGAATAACATAGAATAAAATATAATAACATAGAATAAAATAGCATAACATAGAAAAGCATAGAAACATTCAACGAAACTATTTAAAAAAA:1 + chr2L 7961050 5' + Porto1 4420 1 33.33 CCAAAATCTCCGATAGAAAAGATTACGATGCCTTGGTATTTACGCATCTTTTAAAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAAT:1 + chrX 1160590 5' + Idefix 300 2 56.86 AATTTTTACTAAACAACGCATTTCTTTTTTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAA:1 - chr2L 229474 5' + Quasimodo 427 2 38.18 TGGCCAAACTTTAACTGGACTTGCTTTGGTTTAGCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 16994161 5' - roo 9034 1 67.35 AATCAGCTCGAATCACTTCAATATCTCTCATCCCCAAATCCTCTTTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2R 21735250 5' + blood 37 2 57.55 ATGCAAACATACAAAAGTGTACGTATATGCAACAAATATGCAACTACAACATGCCGGCATATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAAC:1 + chrX 13495469 5' + Max-element 3 2 79.09 TTTAACTACTTTATCTGAATGTCTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCT:1 - chr2L 4856320 5' - I-element 169 1 70.51 TAAAACTGGTAACTCAGAACTCAAGTGACGTGCGCGACATATAACTCTTTTGGATTCCGGATCTTGTCGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chr2L 3323309 5' + hobo 17 1 61.47 ACTGTGAAAAGCAAATGAGCAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCA:1 + chr3L 19426345 5' + I-element 166 1 80.00 ACAATCCAGAGCTCTCAGGACTCGCCAGCATATGTGTGTTTAAGTGTGAGTGTGTGTGAGTATATATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 16247489 5' - accord 186 4 77.38 GATCGGCTAATCCCGCGATGCGCCGGCATCTGTATCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAA:1 - chr2R 14230296 5' + invader4 2848 2 54.79 GATAAAGGATATCTAGAAATTGGAAATAACCTTACAGCAAAATCTGGCGGTTTCTTAATTATGAAGTACAGAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTA:1 + chr3R 11162965 5' - G5 4692 1 56.36 AGAAAACTAGTTTACTTGGGGAAATGTTGTGGGTGGACTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCC:1 + chr4 470551 5' - 17.6 7168 2 66.06 CATTCTAGAGTGAGCACAGAAAAAATATAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chr2R 20436724 5' - opus 7472 2 71.11 GTGGAACAAATAATCCAAAGACAAGAAAGATATTATTAGATAATTCTGGGACTTTACGTTGTTCAAAACCAAGCACTGCTTTTCTTATGAACATCCTAAAAGTTGTGATT:1 - chr3L 3894978 5' - HB 192 1 68.18 ATACGAGCAGGACTTTCTAGCAGAAAACAGATAGAAAGAGTTTGCATGGAGGAGAAATGATGTGTGCCAACTTGTGCCAAAAACTAATAACTGATGTGTTTACTCAAAAC:1 - chr3R 10437567 5' + transib3 451 1 57.27 TGAAAGTAAAACTTCTCGCCTGGTACTTAGAATCGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGACGAAAGCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAAAT:1 + chr2L 8696374 5' + INE-1 163 1 70.00 AGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGGAAGAGAAAGAGAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACA:1 + chr3R 6090420 5' + Bica 235 2 58.95 GCTGACCATAATACAATAAATGGCACTGCAATTGCTGCTTGCTGCTCTTCCGTCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAACCCC:1 - chr2R 19419910 5' + I-element 5108 1 71.60 AAAAAAAAGTAAAGTAAAGTAAAAAAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCACACCCAATCCAGATAACATAC:1 + chr3R 8550600 5' + I-element 5124 1 72.16 ACATCCCGAACTGTGCTAATGTTTTTATTTTCTCATATGCGTGTATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATC:1 + chr2L 7088312 5' - rover 7264 2 60.00 TTTACTGAGCAATTTTGAGATGTTGGTAATGTGTGGGTTGGGTGTGCCCGATGCGTGGGCGGATGAAGGTCGTGCATTCCTGTTTATGTACGTTCGTTGGGGGTTT:1 + chr3R 14741166 5' - Ivk 5000 1 68.87 TACAACGAGATTCCGTTTCAGCGGTCAAACAACTGCAATCGACGAAGGCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTC:1 - chr3R 4813681 5' - roo 115 2 56.36 GTAACGAGCGTCAGCTTGCTGACCAAACAACTTTTTGCGTGTTTTCCTTACAAACACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTACCCCCTCC:1 + chr2L 19231170 5' + G2 2956 1 58.42 GTGGACTTTAGGTTTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr2R 6707761 5' - 1360 3351 1 60.55 CAGCTGTTCAAGGCCCCCACAAAAAAAAGGAAACACTGAAAAAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2L 18694085 5' + pogo 16 1 51.11 CTATAGTTTTGCATTATTCGATTGCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCACTTTTTT:1 - chr3R 23861128 5' + pogo 51 1 73.53 GATATAATTTTATTTTATACATTGAAAAAATATCAACTCATTTTCTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTT:1 - chr3R 5505442 5' - INE-1 246 1 67.65 AGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 12039956 5' + 412 7095 2 77.01 AATAAGCCAAACCGAAAAAGCACCCCAAGCCACTTGGAAAAGAGGAAAGCTGTTTATTACAGAAGTTGTATGTTTCCCTCAAAAACTGTCTTAGTCCGAGTTCGTATTGG:1 + chr3R 22401513 5' + accord2 131 2 58.18 AAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr2R 2427620 5' + Doc 11 1 66.32 GTAAACAGGATTTGAGCTTTACCGGGAATCTTTTCTGTCTTATTTTCGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 + chr2L 9171408 5' - opus 498 1 74.44 GGTGCTTTTTCCAAGTACCCGCTTACACTCGGAGAAAAATCAAAGCCCATCTCTCATCAAATACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGCAAA:1 - chr3L 12678241 5' + 17.6 6958 1 73.12 CAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr3R 11526865 5' + pogo 30 1 54.55 ATTTATATCGGTGTACCAATTAGATGTTGGCCACGCCCCTCTAGCACCCACAAGCCTGACCAAAGACACTCGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr4 935754 5' - 1360 3368 1 56.86 GCCCGTTTTCCCGCATCTATTGCTGGGCAATGGCCGCGACGCCGAACGACCCCAGCGAGGGGCACTGACCGTAGCAGCATCATGTTGCCTCCTGTTATGTGTTGCCATTA:1 + chr3R 8111099 5' + gypsy2 6366 1 64.55 GCTGACCTTGGCCACACCTAGCACCATTTTAAATGTTCTTTTTCGGGGGGTTTCTTGCGATATATCTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr2R 12636198 5' - I-element 5322 1 63.64 ATAAAGTTCTTAAGTGCAAACAATCATCTAACCAGATTCTATTTCCTATCTATTATATGCTGACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCAAG:1 + chr3R 24260865 5' - roo 9047 1 59.09 TTTCTGTGCACTCAAAAAAAAAAGTGTGTCACTTTACCACATGGTATCTTCAATAATGATCCCTAACTGTTCAGAGACTTCACTTTACTTCAATACTTTACTTTACTTTA:1 + chr2L 3507540 5' - TART-A 13111 1 78.18 CGGTGAAAGCGAAGAAAGGGGAGATAGAGAGGCGAGAGCGCCACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCTCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTT:1 + chrX 13048713 5' - Bica 5 1 59.00 ACCTCTAGCAGATGCGGTCAATCTGACGCCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3R 24813999 5' - P-element 2849 1 36.56 CCCATAGTCATTCCTGAATGGTATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCAAC:1 + chr3R 17469185 5' + HeT-A 6046 1 76.77 ACGCCGATAAAATTACCAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATCGTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCC:1 + chrX 18738226 5' - mdg1 196 2 80.00 TCATCATAAATTATAAATTTCCAACATCTTAGCACCGCTTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAATGATTT:1 - chr3L 13702615 5' + Tc1-2 177 1 63.51 GGATGGAAAAATTAATGTAATATACATACATACATGTGTGTGTGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATG:1 - chrX 3154398 5' - accord 7026 2 64.58 TGAGCGGATGAGCGGATGATGTCTCCCCCAGAACCAGCAACTGCAAACTCGAAAAAATAGCAGAATAATTATCAGAGTT:1 - chr2R 20614882 5' + Idefix 457 2 79.75 ATCAAGACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCA:1 + chr3R 19446856 5' + Bari1 51 1 56.76 ATGTGGGCCACCCCACAGCACATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGGGAAACAGAG:1 - chrX 9955101 5' - accord 153 2 63.38 ACGATCGAGCGGTACAACAATATATTCAGATTTTTACTGATCATTCGAACATATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCC:1 + chr2L 10484990 5' + HeT-A 6044 1 52.73 GGGGGAATAAGCAGCATAATCTCTTGATATGTTAGCATGCTTTGGGCGGAATATTCAATGTAGGCTATTTCCTTTGTATGTTAAGGATGGGGG:1 + chr2R 5076100 5' - mdg3 96 2 47.31 TGTCATATTCAGCATTTTTTTTTATATTTTGCAAGGCCGTATCTCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATACGTTTA:1 + chr2R 1370509 5' - Doc 4574 1 57.94 GGTGTGGAATGGATGGAAATTGTATAGATGTACAAGTTTGTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCCCAATG:1 - chr3R 15524473 5' - pogo 2081 1 57.65 TCCCGAGTTGGCAAATGTGGCGCGCAGCATTTAAACAGCAGTGGCAACAACTGGCGGCAACAAAAACAACAATACCGCTACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACAC:1 + chr3R 21919922 5' + HeT-A 5943 1 61.47 GAAAAATATATTGCTCTACATAAGAAAGCACTTTTAGAATTAACCTATTCGTATTCTATTCTAATTACTGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 - chr3L 21403730 5' - roo 9067 1 72.64 ACACCATTAACAACGAACTGCTAGTGGATTATATGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 + chr2R 19405878 5' + HMS-Beagle 23 2 60.00 TTAGTCATTTAACAATAATAATTTATGCCATATATCTTAGGCCAAAACCCATTTTGTTAAAGACTGTTGATTAAGATAACATTAAATGCATGAATTCATAAT:1 + chr3R 8493414 5' - Transib-N1_DM 424 1 59.80 GCTCCTTTCTATTTGCCACTTTTATGTTTGCCGCCGCAGTCGCCGCCAGTTGGACATCCTTTTTTCAGGCGCTGGTTTGTTTTTTTTCTTTTTCACTTCTCTTTTTTTTT:1 + chr3L 16022356 5' - gypsy2 406 1 69.09 GATGGAAAAATTTAAGTACAAAGAAAAAGTAGTCACAAGGGTGTAAAAAATTAAAGGGTTATTATAGTAATTGTTAATTTGCTCGACTATCAGATACCCG:1 - chr2R 8201666 5' - INE-1 555 1 46.00 TATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 4016898 5' - opus 457 2 71.28 CCTGTTTATTGGCACTCAACTGAACAGACAACAATTTCGATACCCAAATTATATGTCTCTGGAAACTGGAAACAGCTTCTACAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTATATGG:1 + chr3R 28315784 5' - INE-1 135 1 55.45 AATTTTGTGCCATTTATAGACAGATTTATTTATATTTATTTATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACCAC:1 + chr3R 6309810 5' + F-element 39 1 53.12 ACCGCTGTACACATAAATTCAATAAAAGATTTGCCGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTAT:1 + chr3R 14192410 5' - copia 4879 2 68.18 ACAAATCTTTTAATATGGCACGGGCATTAATATCTGGGTGACCCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3R 27795522 5' - roo 9029 1 60.91 CAGAAAACTCTGGTATTCTCATAATTTGACTGAAAAAAGACAATACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chrX 16693838 5' - 1360 3351 1 60.91 TTTTTTTACGAACAAAACTGTTAGTTTTTCTTTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTGTTTATTTGTCACAGCT:1 - chr2R 21440137 5' - gypsy4 332 2 77.27 TCTGTAGCGTCCAGCTAATACGCCCTCAGTCCTCATAAGAGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTT:1 + chr2R 6537883 5' - roo 9055 2 65.45 TTGTGACCCAAAAAATAACGAAAAATTATAAAAAAAAGATTTCGCTTTAAAAAAATTGTCAGATGAGAGACAAATTCGAATTAAACATAAATATAAATGTGTA:1 - chr3R 14152643 5' + 1360 2958 1 69.90 AATGTGCGGTTTAAATTTTGTGCCATTTATAGACAGATTTATTTATATTTATTTATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAACA:1 + chr3R 6309797 5' + F-element 40 1 48.18 ATATCCATCCTTTAGAACTTCCGTTTCCTCGGAACTCTCTTCGCTTCTGATGGATTGACATTTGTTTTATCTGCCTGACTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAG:1 + chr3L 17490625 5' + roo 8674 2 71.82 GGGCCAAGGGACACACGGCCAAGTAGCTCGGTGCACAGGACATTCTAGAGTGAGCACAGAAAAAATATAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chr2R 20436684 5' - opus 496 2 77.67 CACCTCGCCCACCGTTTCAAATGCAGCAGCCGCGTCAAGTTGCACCACAATATGTGATTCCACCTCACCCACATTGGACCAGACTCGAC:1 + chr3L 12891223 5' + I-element 4907 1 78.65 CGTGTTGATAATATAGTCGTACAGGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGG:1 - chr2L 20753347 5' - I-element 5013 1 70.73 AGAAGTCCATTCAAATGACATAAAGTGTGTGGGAGAGGGGTAACTAAAACGAGATCTATGGTTTGAGCTAAAAAATGATCTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGGGAG:1 + chrX 12300454 5' + Bica 4 1 71.43 CATACACCTATACACACACGTTCAGGCCCAAGTATAGGCTTCTCT:1 - chr3R 22224424 5' + 297 6547 2 66.67 GAGTGCATTTTGCGTCGAATTATAGGCAATTCGGCACGGAATCTCCGCACACGCGATACGCATTACACACACATGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 + chrX 4262942 5' - Tirant 8501 2 75.70 CCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 + chr3L 19951188 5' + Ivk 28 1 55.05 TAAATTTTTCTTTGTTTTTTCTTTGTTATACTATTTTCTTTTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTG:1 - chr3R 4553389 5' + Juan 45 1 61.11 CTAATTAGAGACAGGTTGCAAGCGTTATTTTTATTATCTTCAAGTTATGCAACTAAGGTTCTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 10312597 5' - gypsy7 5017 1 76.00 TCTTTGCATTGGAGCCATTGGCCTCGGGGATACTGGTCGGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGACGTGCATCTCAGTCTAAAG:1 + chr3R 6132058 5' + I-element 29 1 52.17 CATAGTTTATTCGCTGGCCGCCAATTTCAGCGATTTAATCACTCTAAGCGAGATCACAGCCATAAAGAAGAGCCATGAGTAGCTAAAATAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3R 16732039 5' + F-element 4685 1 51.43 AAGCCAGCGAGCGCGGCGAACCAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCCC:1 - chr2L 18246826 5' + F-element 355 1 68.12 ATATTTTGATAAAGAAAATAAAGTTATAAATAAAGAAATAAAAAATGAATGTGTCACCAATATTATTAAACACTCTTAACAGATCTCGCCCACAAAGGAGGCTAA:1 + chrX 12680310 5' + X-element 4470 1 55.24 ACAAATCTTTGCACCCCACAGATAATCGTCCCAATGCCTCCGTTCGCCCACTGAGCAAGGAGAAACAGCAGCAACACCAGCAGCAACAGCAGCAGC:1 + chr3L 3231888 5' + TART-B 152 3 79.17 AAAACTACATGTTTTAGAACTTCAATATTTAATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 + chr2L 17263140 5' + Transpac 4969 2 70.00 ATAGAAATTTACAAGACTGATAAAAATTTTAAAAAATATGAACAAAATATTCAAAAGTTACGAGACTAGTAAAAATATGCAAAAATATCAAAACATTTTTCAAAAGTGTG:1 + chrX 22586092 5' - INE-1 259 1 52.73 GTGAAAAATAAAAGCAGTTAAGAATGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCAT:1 + chr3R 6088521 5' + transib2 11 1 69.81 TGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2L 4016902 5' - opus 7463 2 67.37 TGCGGAGGTAAAAAAATGAAATCTTTCGACCAGCTTATCGCCTTATCTCGTTGCCAGAGAAACCAAACACGTCAAACCCCACATGAATCT:1 + chr2L 4670129 5' + G2 123 1 67.78 TGCGCATTAATGAATTATTAATTTGTGTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTACGC:1 + chr3R 10964619 5' + I-element 46 1 72.63 GCAAAACATAAAAGAAAAAATAATTAGAAAAAATCAAGAAGATAAGATGATAAAGATCAATGTAACGGCGATAAGCTGGGCGATGGTAATTACGCGATATGCAAAGCGCA:1 - chr3L 27171881 5' - Ivk 54 1 73.64 CAACCAAAAAGAGCCAGCCTTTGTGGCTGCGCCGTGCCATGGATGGGTGGTTTGGTTTTTAAAAAAATTAAAAAATTTT:1 + chr2R 22989878 5' + HB 322 1 69.62 AGTCGACTATTAATTTGAATTCAAGCAGTCAAACGCTGCCTCGGCCGCCAAGTCAACAGCCACAGCTGCGGTCACAATAATAG:1 + chr2L 6694204 5' - Tc1 1644 2 79.52 GATTTACTTGAAAAGTTGAACTGTACCAGATAACTTTAAAGGAAAACCCTTTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACT:1 - chr2R 23458734 5' - roo 8828 2 53.64 GTTATTTTTTATCTGTTAACGATACATTCCGTGGGAGTTCTTCCTTCAGTCTTCTGTTGGGGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr3R 1220300 5' - copia 233 1 60.19 TTAAAGCAATAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1 + chrX 17456061 5' - jockey 4938 1 68.18 AATCAGCATCTTAACTGGTTTTGCATAACTTATGATCTCCAGCAGCTACGACAACTTTTCTGCTTTTAATATATGTCGGCATTATAAGACAAGGCAATATATTGCCGG:1 + chr2L 6987631 5' + Helena 262 1 56.48 TCTCTACCTCGCAACAGCGTGGCAAATAACTGTTTCTGCCGAACGTAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGG:1 - chr2L 22497836 5' + Stalker4 26 4 52.63 CATCTTTTTTTTTTTCTTTTAGCTCGTGCCCCCACGACAACCTCAACCTACGACCCATTGGAAACAGTCTCAGTTTTTGTTTTCCTTTTTTTTT:1 + chr3R 12309251 5' - Doc2-element 253 4 69.15 CGGAACTAATTGTTCTGGGAATTGGATTCAAATCCGACCGATTGATAGGGATTTGGCCAGGTCAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAC:1 - chr3R 11474985 5' + hopper 22 1 60.91 GTCAGTTATGCAAAGTTGCGTGTATGTGGAGAGTGATGAAATTAAGAGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTG:1 + chr3R 1704539 5' - Max-element 8521 2 57.14 TTTGCGCATAGTTATTAATATTATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chr3R 9481252 5' - roo 9010 2 80.00 TTTTTTTATGTGGAAGTGTTTGTGTGAATGTGTGTTTTACAAGATATGAAAGTATGCATTGGAATGGATAAGAGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3L 10506877 5' - hopper 1405 2 49.09 GTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAACGAAGTATACACTTAAA:1 + chrX 20330560 5' + P-element 42 1 28.24 GACATATAACTCTTTTGGATTCCGGATCTTGTCGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2L 3323274 5' + hobo 37 1 63.83 CACTTTTATTTTCGATTTTTTTTTCCAACGCTTTTGTGGTTAGAACCCGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTTCCACTC:1 - chrX 7802814 5' + hobo 14 1 56.79 CATATACATTGCATACATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chrY 2720346 5' - opus 474 2 58.18 AACCAGAAAGCATATATAGTGTTTACAGCTATTACAACAAAATATAAAGTATATACGGCTTATGGCTTCAAAAAAAAAACCAAAATCAAAATT:1 + chrX 5849926 5' + transib2 102 1 55.91 TTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr3L 17220764 5' - opus 7474 2 54.72 GCTAATACAGGTGGAGCACGCCATTCAATATCCAGCCCAGATCAAGGACTTCGAGGTGGATCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCG:1 - chr3L 710990 5' + X-element 4501 1 68.09 GTCTGCAACTAGACTTAAAACTAAAGGGATACAAAACCAAGATATAAGAAAATAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 4305377 5' - roo 395 1 62.37 TTTGTACAATTTGGTAAAATTTCAATATGAAAATTAGCATTTGCACACGATTTTTTATGTGTTTTTTTTGGCAGAAATTCGAAATGATGACCTATCTTAACCAATTTTGG:1 + chr3R 20967974 5' - transib1 2099 1 55.45 AAAACGTGCTCTTCTCGTGATGACACAATCTAAAGTCATTTCAGGATTTATGATGTTTTAGCCCAAAAGATTTACAGTATAATTCGCATAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chrX 15500070 5' - pogo 2086 1 67.27 TGGACAAAACCCACAAAGGCATTCATTATTAAGGGCAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCG:1 - chr2R 8959084 5' + Quasimodo 7038 2 61.54 ATTAGAATGGGTGGGGTAATGGGTATACTCACGGCAAAGAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTAGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 24867464 5' - roo 9058 1 67.27 ATTGAAAAAATGTTAAAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCTCAAACGCAGACATC:1 - chr3L 64555 5' + F-element 290 1 58.18 ATTCTAATCTGAGGTAATTATTCCATTAATTTGTATTCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 30369751 5' + roo 8694 2 54.55 GCTAACCCCAAAGTGGGTACGAACCTTAGAAACGTAATCGAATCTCAACCTTTCGAACCCTTGCACTATGGGGCATTTGGGCTGTTT:1 + chr3R 11474882 5' + hopper 3 2 70.11 CAAAATGCATATGCAAATAAATAGCTAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGG:1 - chr2R 21592061 5' - Tirant 399 1 69.33 TCTGACTTCTGGCGGCAGTTAAATGCACGCACGTCCAAAAAAATACAACATACACCACTCCGGATGTATCCAGATACCAGATAAGAATATGATTG:1 + chr2L 5455294 5' + Idefix 6924 2 56.84 CAATAGTTGTAAACAAGACTTTTTGTTCAATATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3R 17419752 5' - I-element 5305 1 68.18 ATCTTAACCTAAAACACGAAATTAGCTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTACTCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGA:1 - chrX 12669601 5' + mdg3 148 2 73.33 TCAACACTTGGCCGAATTGCCGCGAGTTCCAGTTCCAATTTGTATATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCTGCTTTTGTGATTATTCTGACCATTTTCGATTGCGTTCGCT:1 - chr3L 8836254 5' - Porto1 4327 1 61.82 AAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 - chrY 311341 5' + 1360 22 1 47.71 AGGACTTCTCTTAGCATATGTTCTATTTCGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTA:1 + chr2L 21773621 5' + opus 205 2 65.88 CAGAACTCTTATCCTGGCATCCCCATCATTATGTCGGTATACTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAAAATGAGGCAATT:1 - chr2R 11093074 5' - Ivk 4985 1 56.79 AAATCCACTCGTTGTGTAAATATGTACGTGCAATTGGCAAAATCTAAAGAAGAAAACATTTGAAAAAAACACAAATCACAAAGAATCACTAT:1 + chr3L 16965910 5' - Cr1a 139 1 72.83 TGCCAATTGAAATTGCCACAAGCCCAAGCACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACATATATA:1 - chr3R 18934841 5' + accord 186 4 67.11 GCTTGCTGGCCCTTTGGCAGCATGTTCCCACATGAACAC:1 + chr3R 19450209 5' + roo 8660 1 89.74 AAGGAAGACCCAAAATTCAAACCCCAATAAGGCTAAAAGCTCATTTCACAATGTGGAACATAATTCAACCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAA:1 + chr3L 23632512 5' - hopper 27 1 67.27 CTTCCGTTCGATGATTACAAAGCGCAGCCAAAGGAATTTCTCATTATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACACTAT:1 - chr3R 15561338 5' + HMS-Beagle2 6812 1 54.81 AGGGGCAAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGACGCTAATGGGAATACCAGTTAATGATTACCGTTATCGATTTGATTTTGACGATCGCAAGCGACCG:1 - chr3R 12040219 5' - HMS-Beagle 7014 2 45.10 CGAGTTAATTGGTTTGCAAACAAATTAACCAACGTGGGTGTGTACGTTTCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTC:1 - chr2R 13577908 5' - Quasimodo 69 2 64.29 CCAATTTTTGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTAACAACAATTCGAGAGAGCCTG:1 - chr4 1271911 5' - 1360 84 1 58.06 TTTAACAATTTTTTTTTTGAAATGGGTATCTTAATGTTAAACATGAGTGTTGTGTATAACAGTTTAGGGATAATGTTTCGTTTACTGGCT:1 + chr2R 6170459 5' + accord2 495 1 61.11 ACTTTACACTCGAGCGCATGCAGAATGTGGAATGATAAAGGAGGTGGGGTTGTGGAGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCG:1 + chr2L 13429988 5' - Doc 4523 1 69.14 ATGCAACATGCAGAACGCATCTCTTTCCCTCTCTTTCGCACTCGCATTCGACTGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCA:1 - chrX 2997639 5' + Quasimodo 355 2 63.64 TATATACCAATAGCAAATGGGAGACTATATCTTAGCATTAAAATATATATACACATCATATCACCAAGATTTTCTCCCTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 10202951 5' - roo 402 1 68.18 TATTTATTTTATTTTTTAACTTTGCTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTACGCATCCACGATTTATTTTGC:1 - chr3R 9214280 5' - HeT-A 6015 1 91.01 TGGGACTGCAATTATTGCGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 27795481 5' + roo 8718 2 83.51 GATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr2L 21735008 5' + Doc 14 1 57.53 AATACATCACTCTTCATTAAATCAGCGGTTGCCAGGGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATG:1 - chr2R 24388348 5' + BS 18 1 54.32 GCCAAGCTATCGAATTTCTTCTAAAAGAGATTGTCAACGTGGTGAGTCTGCAGAAACAGCGTCGTCGGGAGCAGGACGAAGAGCAAAAGAAGCGGTGTATCTACGCCGTT:1 + chr3R 17663051 5' + Copia1_DM 4001 1 80.91 CTGGCCTGGCCTCTTGCCTGTGGCCTGTCGCCTCTCGCCAGAAATGTATCTGCCATCATGTTTTCTGTGGGTACCTAATTTACTTCTATT:1 + chr3R 28860663 5' - Dm88 4177 1 61.11 GGAGCGAAAAAGTTGAGTTGGCAAATTAAATAAACAAACGAAAAGCGAAGTCAATTGAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTT:1 + chr2R 16214864 5' + invader2 451 1 68.54 ATACAATTTGTACAAAATTTTTGGGTAAAAAAAATAATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTC:1 - chr3R 22828735 5' + Dm88 84 2 67.27 GCTAGGAAAAAAAGGAATCGTTTAGCTTTCAAACAGCAACAAACTTGAAATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chr3R 25859600 5' - 297 6955 2 54.08 GTCCTAACTTTAGAGGGTGAGTATCTTAGTGATAGGTGAATGTAACCCATAATCTAATGGGAATCCCAATCACTATATATAATAAGATTA:1 + chrX 19724124 5' - Tc3 281 1 76.67 TTCAATTAAAATTGAATTTCATTCAAACTACCCGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 12623702 5' + roo 36 2 57.27 GCTTTAAATTTACTCATTCTCCAAACTCAACCAATGCATCCCATAGTCATAGTAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAAA:1 + chr2R 8519193 5' + 297 481 1 54.55 TAGTATAAACATAAGTTGTATTGCCCTCATGGGAAAATTTTGAGGTATATGTCAAATAGTTTCCATAAAAACAGGATTCTTCACTTAATAAATATATATAAATAAACACA:1 + chr2L 21860292 5' + Tc1-2 483 1 61.82 TGAGCTCTTCGCCCGAGGTTGTGTGACCAATGTGGAACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGCTTGGTAAGTGCACAGACACTAGAAGAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - 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chr3R 19259348 5' + F-element 4344 1 53.64 ACTACCTGTATAGTTATTGTGATAGCCAAAGTCAATCTATAGTCAATCTAAAGGAGCTCTAAAACAGATGAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCG:1 - chrX 17358639 5' + Doc2-element 4540 1 75.26 TTTGACGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr2L 21784866 5' + I-element 56 1 75.45 CATGCAGCAGGCACGTAGTTCCCTGCCACTTGGCGTTGCATACTTTTACGCGTCTCTTTAGTATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACCCGACTCAC:1 - chr2L 19602932 5' + hobo 21 1 61.47 CCTTTGGCCACAAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAG:1 - chr3R 29475653 5' - Quasimodo 6923 2 82.09 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACACAAACACA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 419 1 47.12 AGCCATTGGCCTCGGGTATACTGGTCGGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr3R 6132070 5' + I-element 43 1 70.21 GCCAATGCCTTTCTGCCTACGCCCCGCCCCCCCCAAGCCACACCCATGGAAAACCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACC:1 + chr2L 2317813 5' + Doc 4529 1 54.90 TATTAACTATTCTTCAACATGTGATTTTCCAATATGGATCTTATGAAAGAACTGAAAATGGTATAGTAAAATATATTAGGGATTGTAGCTGTTAATTGTTTTGCGTGTAA:1 + chr3R 25086068 5' - Doc4-element 385 1 77.27 TGGGCCGAAAGAATGTTCTAGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGACT:1 - chr3L 16909801 5' - Idefix 176 2 78.26 ATATAAGTGTAATCCAGAGACTATGGGAAATTTGGTGGAATCTTCTTGATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1 + chr3R 15309329 5' - HMS-Beagle2 7159 4 60.00 CAACGATTTTTTATGGTTATATTCTTTGAGTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACAT:1 + chr2L 3138329 5' + copia 4925 2 75.23 ATAACTCGAGTGCCGCAGACTCATATACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTTATTGCTCTACAATTCTAT:1 + chr3R 30735034 5' + F-element 4230 1 73.64 GCTCGTAAGTGGAATGGTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAACAAAACTAAATTATACAA:1 + chr2R 10865425 5' + I-element 5164 1 80.91 CACTTAATGCCGCTCCGGTCACAGGACACTGCACAAGTCGGCCAAGACGGGCCGAGAAGGACCTCCATACGAGTGCGCGCTTGTATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 28171024 5' - accord 184 2 66.06 TCACACTCCCGTCTGTAGCGCAGAATCGATGAGGTATCATCGTTCTCTATATTTGCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGACTTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGAGCAGA:1 - 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HeT-A 6057 2 56.44 ATTTTCCTGTATCCGATGCACATTCTGGAGATAAATTTATGGCTCATGTGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr3R 7874821 5' + jockey 4694 1 52.04 TGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTTTATGTCTAT:1 + chr3R 22316301 5' + 412 7127 2 35.29 AACAATCTGGTTAAATTTGAATCCTATAAAGGCAAATGCTCATTAAATTTTATTCACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAAACACAACCACACACACAAACA:1 + chrX 8663539 5' + gypsy3 417 1 51.82 ACCATTCAACCGACATTTTTGTAAATAAATAAGCATAATATCTCAGATAATATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAG:1 - chr2L 9464159 5' + 1360 215 1 60.00 GGACAATTCTTGATATTTTCGATAGTCGGAACCAGTAGTTGATCGATAGTAGTTCACGTGACAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCAGTCG:1 + chr2L 21682142 5' - P-element 2877 2 68.04 CACAACACGGCGTATACGCAACCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGG:1 - chr3R 29964059 5' + F-element 4348 1 76.09 ATCCAAATTTCTTTGGTGTTCGGGGTTGATACTCTGATTTTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGGGTTTCTTTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGG:1 - chr3R 435995 5' - Idefix 7155 2 61.00 AGGATCACATGTCAATCAGCGGGCGGGCACTTGCGGTGGAGCAACTGGTTGTTTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 747036 5' - Doc2-element 231 1 71.43 TTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 11549814 5' + 297 6602 2 68.04 TGCAGTTCAAAATGATGCAATATCTTGTTGTTAGCCTGGCACTCTGTGCCACAATTTGCTCTGCCGGCGCAGACGGATTGCATTTGGCTAGCTTGGACT:1 - chr2R 11382301 5' + Tabor 313 2 72.73 TTTAAGGGCAGGAAAACACAACTCTGCTGTAAAAAAACTAAATTACTTAAATTATATCAGTTCCCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTT:1 + chrX 17367324 5' + 1360 306 1 62.73 CTTGTAGACACAGAAGCCTCGGGTTTGCTTAAATTTTTATGGCCTCAACACCTACCAGGTCTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACC:1 + chr3R 31106163 5' + baggins 5056 1 59.79 TTTGTGATCATCGAGCGCTCGAATCGGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chr2L 5338049 5' + F-element 17 1 67.01 CGACACCATAACATCCTAAGTCCCATTCGCACCCGATTTCTTCGGCGTGGCTCTAAAGCTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 - chr3L 25842181 5' + 1360 81 1 66.67 CTCGTTCTCTCTTACATGATCCTCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCT:1 - chr3R 1704586 5' + Max-element 8268 2 71.25 ATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr2R 7981140 5' + 1360 21 1 59.30 ACTTAATTCATTACTAAATTCCGAGCGTAGGACTATGCAAGGGGCATTTTGAAAAGAGGAGAGTACTTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3L 126230 5' + pogo 14 1 68.18 TCAAAAAGTGGCCAAATTGGCGACCAAAGCCTTAGGTTTCCATATGAATCATTCGAGTGTTGATGAAAGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGC:1 + chr3L 16727122 5' + gypsy3 11 4 64.55 TTGGCCTGGCCTTTAAGACAAAGTTAAAGTTGCCTGGGTGGGCGAGAGATTTTGGTGTGTGCTTTTATGCTTTATCGTCGTGGTTGTTATCCCTTCAATGTGGAACACGC:1 + chrX 6611946 5' + R1A1-element 5296 1 72.73 AAATTCAGTGCCGTAGAATTGCTCTCATACTCGGGTTCTACACTGAAAATAAATCAACCTTGGACCTTAATTTCGTGGATGCTGCCCTTTTTT:1 + chr2L 4071650 5' - Fw3 76 1 72.04 AAAGAAACACTCATAATTTCTTCACTTGAAGAAGGAAGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGTCAGAACTTTGT:1 + chr2L 12855822 5' + 412 7103 2 65.45 CGGATTACGTGAAAACACTCACTTTAAATACCCTGGCTTTTAATTTGTAATTTATCCTCCAGTTTAGATCGTCTTTTTAATTAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTT:1 - chr4 1064886 5' - TAHRE 330 1 58.72 GAGGCACATTGTTCTGGCATTTTCGACTGGCCAAACAGCAGGTGCAAGTTGACGCAGAGTAGTTGGCCGATCCTTGATATGCGTGCTA:1 - chr2L 4894211 5' - Chouto 6048 1 55.68 CAACTGTTGTGATTCCGATTTCTCGTTTGTTTTCGTTTTCCGATTTTAAAATTAGACACCGGCACTTTGGGCAAGGTCTTAGAGCCACCTGCCCTGAATTCTGGTCTGTT:1 - chr2R 20231810 5' - gypsy10 292 2 74.55 ACGCTACTCGAAGAGAGAAAATACCCACCTCAGCGAATGCAGCCGCAGCCACTAATACGACTTCGACTAGGACACACAA:1 - chr4 1301742 5' + I-element 4944 1 74.68 ATAACACCCAGACTTCGCGCCAAATTCGAAAAAAAAGTTTACAACACACGCTTTATTGCGCCTAGAATAGCCTTGTATGTACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTG:1 - chr2R 6652861 5' + 1360 163 1 77.27 GCAGTGAGACAATTTAAAGTGCACAAACCGTTTTTTTTTTTAATATTAATGCAGACATACTTTGTCCCAAAAAGTAATAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 + chr3L 20896929 5' + Tabor 9 2 37.27 CATAAAACGTAAAAACTAAAAAATTCTTAGGGATTAATTTACAAAAAAAAATGTATTAAAAACTAAAGAACGATGTTGTCGAGTTCGTCGACTAACAGATACCCGTTACT:1 + chr2L 22757381 5' - INE-1 550 1 62.73 TTTCCCACACCAAAATCAGAAAAAAACTGGAAAAAAATGTCACAACAAAATCAACTAAAAAGGAGGAAGCACTACGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCAAAAC:1 - chr3L 8025317 5' + invader1 96 2 75.70 AAAAGCGAGACAAGTTTTTGTTTTAATTACAAAAATCGCTAAACTATATATTACATGTAATTATTTATCAAACCGCGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCT:1 - chr2R 1879642 5' - gypsy5 403 2 72.48 GCCGATTTAACAGCAAATGATTCGTTTTAGCCACGCACCTGATACGCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACAGAAGTATACAC:1 - chr3L 19063510 5' + P-element 37 1 45.45 ATCGTACATACACAACTCCCATGATACTTGGATCCTAACTAGAGAACACAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATATCACAA:1 + chr3R 20318905 5' + I-element 5167 1 52.78 AATAACAACAGCAATAGCAGTGAGTGAGGCTTTGAGACTTATATTTTGATAGTCCCGACTTGGTTAGTCGGCTAAACTTCTCTGTTCC:1 - chr2R 12936259 5' + Cr1a 4092 1 79.55 AATCCTGATCAAACGATAAAACCCATTTTTTAAGTGTGGGCAAACTTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAACTGGACGTGGGCAAAAGAAACT:1 - chr2R 5180276 5' - FB 94 1 79.09 ATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chrX 5515598 5' + copia 4923 2 77.14 CACTTCTCTCATGCCACGGAAAACAAGAAAACAAAAAACACACAAACAGAAATCAACAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 12099580 5' + BS 5094 1 73.24 AACGATTTTGTAGATCGCTAAAATACTTACCACTTAACATTAACACCAAATCTATGTCCAATCCCCAAACTCACCCCACGCAATGTAAACCTCAAAATTCAAATAATTGT:1 + chr2L 17515297 5' + HeT-A 5963 1 76.36 TAGAGAGCTTTTGCGTGTCTTTGAGGTGGCTTACATGCGGGCTACTTATGGCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAA:1 + chr3R 16193499 5' + Doc 4461 1 54.55 AAGTTAATGCCACACATATGTATGCACAATATGTATGCATGGGACGGGCTGGAGGATTGTAACTGGCGCAGCCG:1 + chr3R 5730927 5' - accord2 7427 1 67.57 ATCGCAGATTAACTATGCAGTACTATACCATTATTTACTCTACTAACTACCATTGCAAGCTACATAGCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGATCGCAC:1 + chrX 15817598 5' + Doc3-element 411 1 67.68 AAAAAATGACAAAACTGGAGCGGGTGCGGCTGGTTTTTTTTATTTTTTTTTAAAT:1 - chr2R 21914563 5' - TART-B 10633 2 74.55 CATTGCCACTAACCGTTGTTGCAGCCATAAACTGTATTGGGCAGAGGCAATTACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3L 13556831 5' - hobo 2933 1 67.86 GAAAAGCTGTGAACTCTTCTCTTCCGAGTGTTCTAATACAGTAAAAGTTTATTGTTTTTTGTAGTAATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAGTAT:1 - 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I-element 5017 1 75.49 AAACGCCCACGCCTAGACCAGCAGCTTTCCCGACTTTTACC:1 - chr2R 6785083 5' - flea 446 1 60.98 AACGCCTGATTCTACCAATGTTATACATATCGTTACATCCAGCCCAAAGATACAGTCCAAGTACGCTCATAAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTACTCAAAAAAA:1 + chr2R 15261888 5' + I-element 5151 1 68.81 ATGGGAATTAAATGGAAGACCACAAAGCCAATTTATATATGGTCCAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 + chr3L 16682000 5' + FB 36 1 61.68 ACGCCCCGCTAGCACTCAATCAAGCCACTCGAGCCCATTTATGCTCAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGAGTGAGTAAAAACAATTGACGAGA:1 + chr3R 26821034 5' - 1360 3239 1 70.37 TTGTTTAGACTTCCTTTCTGCGTTCCTCGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr2L 1291023 5' + 412 30 2 53.64 CAATTACTTCGTTCGCTTATCAGATAATATGTTTGCATTTCCACTAAGCGCAATGAAGACATTTTCCGAGGCAAAGTGTGTATGTGTGTGTGT:1 - chr2R 20748832 5' - accord 258 2 55.91 CGATTTTTGATAGAAATCGATAAGGTTAATGACTTCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3L 13556723 5' + hobo 36 1 61.22 AACCGCACAGTGGTTCCAATCATTCACAAACAGCAGTCGAATCTGATGCGATCGAAAAGATAAGACTTGGTTTCAAATATAAATGAGAAAAATTAAACAAAATTTTAGT:1 + chrX 8863454 5' - 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invader1 3794 2 52.73 CGGCTTATACGGATCTTGGATGGCATCCATTTCACAATACTTTAAAGCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chr3L 12300122 5' + 1360 32 1 58.00 GAGCACTCAGCTCTCAGAGATCTGAGCCTCTGTTTCTGACTCGCTGGAAGCCTCTGGAGACATTGCAGGTAAGTAG:1 - chr2R 19154108 5' - HeT-A 5693 1 61.84 AAGTCTATATTGCAGACTTGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAAATCTGCATTATTTTTTCATTTTTT:1 + chrX 15499994 5' + pogo 51 1 75.51 GCAGCTCCTCATCTAAATAGTTATATACTGATAAAAGAACGTATGATTTTAAAACGAGTCAGTAGTAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCA:1 + chr3L 8907649 5' + I-element 4985 1 66.02 ATTGATTAAGGTTTAAGTTGGCCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGAGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCAC:1 - chr2L 20512453 5' - Circe 7205 1 75.25 CCCATTCAGTCCCCATTTATTTATGTCTTATTTATCCGCCCTCGCGAAACTCAGTGCTCATTGGGAGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGGGATATGA:1 - chrX 22839761 5' - Q-element 194 2 75.76 CACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCG:1 + chr3L 25272560 5' + 1360 72 1 62.24 CCAGGGTGACGGGGCGGAGAAAGTGCGGGAAAATTTGGGGAAAGTGGTCGCGGGAAGAGCCGAAGCTGAGACAACATGCAAACTGTTGTACTTTATAATTTATATTTCCT:1 - chr2L 19808608 5' - copia 250 1 75.45 AAATATACAAACTCACTTAGAAACTATAAAAAATGGTAATTTGTACGCTTTGCCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTT:1 + chr2R 16218751 5' - Bica 459 1 53.64 CATAAATAATAACGACAGCCGAGTCAGCCAAGGATGCTGGGGAGAACGGGAAAGGGATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr3L 17153560 5' + 297 3 2 67.86 AAACCACACACAAACAAGTCCGCCATATTTGGCAATTGACTTTGCAGCACCACCAGCAGCACCACCAGCAG:1 - chr3L 7096874 5' + TART-B 151 2 74.65 GAAAATGTGTGGTACAACGGGGCGTATACGTGATACTCATACGCACTGCTCTCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCACGATG:1 - chrX 14357048 5' - 1360 423 1 67.82 ATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 58.18 GACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTG:1 - chr2R 5173200 5' - Stalker4 364 2 63.64 GGATGCGTTTACGAATACATAAATTCATTAATAATGCCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGATGCACTTGCATCAGGG:1 + chr3R 31633110 5' - opus 7493 2 73.64 CACACACACACAAATTCTATGTAGCTAAGCGAATTTTCCAAAAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:1 + chr3L 7846459 5' + 3S18 42 2 62.73 GACGACTTTCACTCAAGCGAGCGGACAGAAGGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCCTAGTGCC:1 - chr3R 29343353 5' + 1360 3342 1 77.46 CTGCGGAAAAACAGAAAAAGAAATGTGATAAATTTTCGCGTCAGCTGGGTAAAATGTGGAACACCAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACG:1 - chr3L 12866947 5' + Stalker4 6914 2 65.45 AATGAAGACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 13024052 5' + 412 7095 2 70.10 TGAAGCCATGGAAGCTCTACTGTAGTTGCGAGGATGGAGAAGGCAAACACCCATGCCACACGACCCCGCCTTAAAACCTATCTGGACTTA:1 + chr2L 9564815 5' + Doc 4275 1 71.11 ACAACGCATCGTTTTGTTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr3L 15968189 5' - P-element 2852 1 41.05 GCATAAAGCAAATTTTCACGTAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGCAGGCGACATCAGCAAAGAGCCAACGCTGCATATATATATAT:1 + chr2L 15413321 5' + accord 82 2 70.65 TTAACAGTTATTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGAATGCAAATTTGAAGTAT:1 - chr2L 6311313 5' - hopper 1367 1 66.36 CCCAATTTGCAATGGGCAGCCCAGAAAGTAAGTCAGCACCTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 24031448 5' + 1360 4 2 77.42 CTGGCCACTCGAGCCGCAACAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGAGATAA:1 - chr3R 9435868 5' + roo 8728 2 80.00 GACGTTCTCATAGTTTAATTATACCTGTATTACTAGATGCGTTGAAAAGTATCATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTC:1 - chr3R 23891576 5' + INE-1 106 1 60.00 ATGCATCACGCCAATTATTTAATATTTATTAAACGTCGTCGCTTGAAGACCGATTTACAGTTAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3R 23665097 5' - 1360 3370 1 64.55 ACGGGGCGTGGCAAAGGCGTCGTCTGTGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTT:1 + chr3L 2002006 5' + gypsy5 6941 2 55.36 TTTGTTGGCGTATAAACATAAATATATTATATTATATCCTATAGCTACCACATTAAAAAAGTTATATTTTAAAAGTGAATTGAAAAAAAATAATATAAGAAAATAATTGT:1 - chr3R 20617773 5' + Stalker2 7175 1 75.45 TGTTAAAAATATATATTTCCCAGTATTAGCTTGTGTTTCCTTTTTCAGCTTTTGCGGTCTTAGGAGAAATTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 - chr3R 12863684 5' - 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roo 388 2 57.58 AGCACTGCGAGCAGAGGGTAAACTGAAACTTATTTATGAGTTTAGAGAAGCAGAAGATGAAGTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACACCAAAACGGCACGGAA:1 - chrX 19361206 5' + Bica 251 2 64.55 GAAGGGCAGACCACCAGGCAAGTCCTATCTGTGCAGCATGTACCAGTATGGGTATATATATATATGGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chr3R 7171234 5' - 297 378 2 53.64 TTTTTACATTGTGTATAAATGTGCGTCTGTCCATTTTATTCTTTGTATAAACCAATCCAGAGAACTGCAGACCGCCACTCGC:1 - chr2L 18181121 5' - hobo 2935 1 69.51 ACAAAAGTCAGTTATGCAAAGCTGCGTGTATGTGGAGAGTGATGAAATTAAGAGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGA:1 + chr3R 1704533 5' - Max-element 300 2 68.42 CGGCGAAAAAGCAAAAGCCGCAACAAAAACAAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTAATTTTAAGGATGGGTTTGCAG:1 - chrX 13024118 5' + pogo 1733 1 74.77 GCGGCGTCCTCATGGTCCGATTCTTCATCCGAGATTAAAACATAACTTAAAAACAAGAGAGAATCTTATGGTCGAGTTCCAGGGTATCAGATATCAGTTACTCAGCTAGT:1 + chr3R 22034020 5' - INE-1 542 1 72.73 GCAGTTCTTAACTGTTGCTTTACACTGGTTAAAACAACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTCAATAAAATAGCATAT:1 - chr2R 19684517 5' + 412 7082 2 63.33 CTCGACTACAGTGACAACTTCGTCCGACCCATCCAAACCAACATGCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGG:1 + chr3L 10216234 5' - invader4 188 2 53.57 CGTTTTGCCAGCTTGTTTGCAGAAATGTTCGCTCGCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 - chr3L 12301252 5' - hopper 1366 1 66.97 AATAGATGGGTGAAATGGAAATTATGTAAGCGTCCTTAAACTACATTTAACTTCCGTCACACTTAAAACTTCTTATGAACAGAATATAAATTATAAATATAAAAAATAT:1 - chr2L 17104664 5' + transib4 2575 1 34.86 AGTCATGTTTTATCGCTTGGCAAATTAAATTCAAATAAATTTAAATTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 - chr2L 17334570 5' + copia 4908 2 63.64 AATGCTTTTGTTCATATTAAGAGGAATGTGCTTAATATCCGAATGAAATCAAAACTTTTCTGTCTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTG:1 - chr3R 31266109 5' - I-element 5102 1 61.47 CAGATGTTGAATCTACCAAATAGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGCACAAGTTGGGATTGAATTGGGATTTAGGTAGGGTTAGGGGGTTATGTTTGTGTG:1 + chr4 175554 5' - I-element 4959 1 75.23 AGATGCAGTCATCGCTCTACAAATGCATTTTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAG:1 + chr3R 14633862 5' + F-element 4488 1 64.56 GATTCTAACGAGCTCGCCGGATGTGGATGCGAACGGAAAAATGCGGCGTGCATAAGTAATGGTGGATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATG:1 - chr3L 22771436 5' + invader1 3843 2 62.04 AATCCACCACATGGGTGCACCACTAGTCTTGTATACTAATGCCCACATAAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTTTGCGTAGAAAAGAGCTGTT:1 + chr2L 3830199 5' - 1360 137 1 55.05 AAAATATACTGCTTTAATGCAACGTACTTTTCTATTTATCTGCAACATGGCCCAAGAATTTGTTTTAAGTGTACTCTGCTATTTCATTGAACACAAGAATTTCTGCCTTT:1 + chr3R 20711892 5' + HB 1442 1 70.91 AGCTAATACGCCCTCAGTCCTCATAAGAGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAAAAAC:1 + chr2R 6537895 5' - roo 9043 2 54.55 GAACTTCAAATATACATATGTACGTATGTGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chr2L 5304859 5' + flea 37 2 78.02 GGCCGTAAAATATTTTACGATGTTACGCCAATGTTAGCCCCACAACTCGATGCCCTGTACCCCTGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGTTTATAATAGACTTTATCCTA:1 + chr3L 3852523 5' + Cr1a 4205 1 64.55 CAGGCGGTCCAGGACCTCGAGTCCTGACAATGACTGTGCAAATTTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTC:1 - chr3L 15787912 5' - G2 63 1 52.75 CTGTTGCAGCACCCACACCCATTAAATTGGCTCCCAACTCCTGTGTAGTTACTTATTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGCTGG:1 - chr3L 16301137 5' - mdg1 7420 2 54.81 GAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTACGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2R 21199700 5' + jockey 9 1 48.57 TCCTTATGATCCACATGCATGTGTGTAGCATATAGCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 + chrX 2552054 5' - blood 7340 1 66.36 GGTGTCACTAGTCTACAGGAGAATCTGAAGACGTGGCGCTTGGATCTGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chr3L 25443163 5' + Stalker3T 201 1 22.73 CACAGACCAAAATCGATTGAGCAGCAGAGGTGGCGGCTTACCGTACCTAAATTTGTACATATGTATATGCCGCAGCATACACGGCCGCTTTGAAAAATAATCTGATCCC:1 - chr4 396876 5' - G5 4538 1 76.15 GGTGTTTTATTTTAGATTACTTCACACACACACACACACAACCGCCCACCTACACCTACACACACACACACACAC:1 + chrX 17962866 5' + accord 254 2 65.33 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGTTTGTGTTGTTGTGT:1 - chr3R 21907536 5' - gypsy3 418 1 18.69 CATTCAAAGAGACGAAAACAGATGATACTATTAAACCAATCATCGAAACATCGCCTGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGACCTTATTCTATA:1 - chr3R 16464102 5' - Circe 7210 1 56.48 GACTTACAAGATACATTAGGTGGCTACATGTGGCCTGCTACGTGTGGCAGAAGATTCTTTGTTCAGCAATAAAAATAAAATCTAATTTAAGAAGCAATTGTAACACAAAG:1 + chr2L 8074619 5' + mdg3 5070 1 79.09 TTTGCTGCTTTCTTTGCGACGACGTCGACTCTGGGAGTTAATTGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACG:1 + chr3R 13987771 5' - Ivk 242 1 59.62 GTATGAATTCGGCGGGGCAATCCATGAGAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGAAGATCAAATTAAGTTGC:1 + chr2R 13789756 5' + jockey 4944 1 62.50 AATCCCACTGGACTAATTCGGCTGTAACCCCGTTGATATACCCCACCCATTTTCCCGCACCCAACTCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCT:1 + chr2L 6841757 5' + springer 438 1 50.91 CGACAAGTCACTGCCACTTGTCGCACCGGAGCAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAG:1 + chr3L 11066394 5' + Idefix 93 2 67.68 ATGATTAGATCTTTTTAATAGGTTTTTAATTTTTTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGC:1 + chr2L 9418995 5' - X-element 4649 1 77.27 TCGTACCTGATGATCCATGAAACGTTCGAATAGAGAGCGCCCAAAACTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTATCATATTGTATGG:1 + chrX 15209412 5' - 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chr2R 10604359 5' + accord 7104 2 74.67 ACAGATAGTTCGTGCAGTTATTTGCATTTTCCTCAGCGGCCAAGCGACCCTAACTATTGTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr2R 23230667 5' - 412 472 2 56.86 CCACGTTGAGCCACGTTTATTTGGTAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATC:1 + chr2L 16067051 5' - HMS-Beagle2 293 2 63.64 TCACGGTACCGATTCCATGGCTACATCCTCATCCGCCCACACTCTCAGTTTATTTACGAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATAGCGGTATTAGTC:1 + chr2R 18992415 5' - R1A1-element 4865 1 66.67 CATTCAGAAACAAATAACTTGACTTGGTTTCAAAGAAAAGTTCCTCTTTTTCCACTCTAATTAGTTGTTGTCGATGAGATTGCAGTTGTGAGA:1 - chr2R 12224250 5' - Doc4-element 294 1 68.82 AGCGGACAACTTGAAAAACTTTTATTAATTGCATTTTGCGCCACATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCACAATAAACACACCCTCAACTC:1 - chr2R 13657699 5' + Porto1 460 1 60.20 AGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chr3R 16349226 5' + P-element 30 1 42.05 GCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chr3R 25702204 5' - Tirant 358 2 75.56 GTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr2R 7981151 5' + 1360 46 1 76.00 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACACACACAAACACA:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 419 1 56.58 TTGAAAATTCCGTTACAAAAATGCTCAAAAATAGTGCATAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATATAATTATTGTCCACTAGGACAG:1 + chrX 14827563 5' + G2 3030 2 64.55 AAATCCTACTAGGCTCACCTTACCTGTAACTTAAAATCTTATCCTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTACCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2L 16997212 5' - Stalker3T 203 1 62.73 GAAATAAAGTGAACATTTTTGCATAGAGAAAAGTGTTTCGGAAAAAATTACGCCCGAAACAGAGAAATGCAAAATACGTTGTATATTATTTGTTTAAACTACTGCACAAA:1 + chr2R 16508184 5' - Cr1a 156 1 60.00 AGCATTAAGATCTCAGGGATCTTAACTAATATAAGTACCTTAAATAATTGCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAA:1 - chr2L 1560471 5' + I-element 461 1 54.55 CTAAGATGATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 15988769 5' + 412 42 2 62.96 CGCATCGAACGTCTTACTCTTAAATCGAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGC:1 - chr2R 7011688 5' + Dm88 384 1 64.86 CGAAGCGCTTGTCCTGATCCATGTTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCAACT:1 + chr3R 28855085 5' + I-element 4976 1 75.00 TTTTTCAAGTTTATTGGCTCACAAGTGTCAAGGGAAGTACGTATTAATGGCAACCTGTTAATAAAAACAAAAAACGAATTAGAAGCCAGAAAACT:1 + chr3R 14873596 5' + I-element 401 1 60.00 AGTTTAGAAAGTAAGATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 31458552 5' + jockey 20 1 66.36 TACCATTTTTCTTCATCTTTTGTGAGCGCTGATGAATTCGTTAGACGCCACCCCCTTTATCCACAACCCACCACCACTACCTAACTCCCAATTCAATACCAACTTGCC:1 + chrX 17021822 5' + I-element 4992 1 70.37 AAGACCCGAATGCCAAGTAGGCGACAAAACGCAAAAAAAAATGAAAAA:1 + chr3L 1001548 5' + Bari2 917 1 58.33 TGGGCTGCGAAAATTGTGTTTCCGGCAAAAGGCTTAAGACTGTTGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAGCGCACTC:1 + chrX 14635317 5' - Doc4-element 178 1 49.43 ATGAAATCCATCACGGAATTCACTAGATCAAGCTCATATCACCATCACCAGTTAGCTAACGAAATAATGTACACATATCTAGCAAGCTTCACACGCACCCAAACCACATA:1 - chrX 6742650 5' + F-element 4462 1 74.55 TATACACTATGTATATCGGAGTAGGGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCA:1 - chr3R 14537717 5' - G-element 251 1 81.25 CGTTTACAGTTTATAGCCAGCACTTTCAGCTTGCCCCTCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACATTAAGCCTT:1 + chr3R 28633300 5' - jockey 4660 1 58.67 GTGCCCGCGAGTTGCAACACCTTACAACGCCATCAAAATAAAACATTTCCCACTCGTAAAAAGAATTCAACCGAATTCAACAGAACTCAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr2R 18238766 5' - Tc3 313 1 59.09 TTGGTTGCAGCAATTCAATCAATTGAGCACTCATAAATTATAAGCACATTCTTTTGGGCCAATCCAATTATGCACATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 + chr2L 14924355 5' + mdg1 7 2 73.33 CCATAGTAGATAGTAGAAGCAAAGACACTAGAATAATGCAAAACAAGAACTTATAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGC:1 - chr3R 22733363 5' - 1360 194 1 52.63 CACTCAACAATGGACTGACGTCCAGTTTTCGTTTCGACTCGTTTTTGTTCGCCGCTCATTAGCATTTCTTATCTTGTCTTATCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTT:1 - chr3R 5027594 5' - Stalker3T 203 1 63.64 ACAATGGCCAAGCAACATGAGTATTTGAAAATTTGGAAACATATCAAGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGT:1 + chr3L 6523168 5' - Cr1a 350 1 57.27 CCTTTGCTTTTTATTCTACTTTACTGTAGGTCTCATTCGTATTAATTATATCTTGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 - chr2R 6418932 5' + flea 27 2 60.00 TACTTGATTTTATTTCTTAGTTGTCTAGTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAA:1 - chr3L 14397024 5' - BS 5035 1 74.55 ATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTAT:1 - chr3R 7773344 5' - Porto1 163 1 39.78 ATTTTATTTAATTTCTTTGAAATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chr2R 15155188 5' - flea 217 2 60.00 CATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 18675632 5' + 412 41 2 70.65 TGAGAAATTTGTTTTAGTCATTAATAAATTGACTGTGAGCCTATTAAATGAAATTTAAAAATAATATTAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 17425229 5' + Rt1a 5073 2 65.85 CGGCTCAAAGCGTGCGGCTCTCGTGCGGGTCGCTTGAGGGTTTTGATCTTGTATTTTCGTGCGCAGTGG:1 + chr2R 7623217 5' + Cr1a 396 1 72.46 CGGAGGTAAAAAAATGAAATCTTTCGACCAGCTTATCGCCTTATCTCGTTGCCAGAGAAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACACAGTAACATGGAAC:1 + chr2L 4670131 5' + G2 145 1 53.64 TTTATGAGCATTTAATTTTTGTAACATTAATTTAAACATAACTGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAG:1 + chr2L 14537036 5' + 1360 380 1 58.00 GCCATAGTGCACTAAATTGATTCCCATACAGTATGGGGGGGTCAAAATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGACACCC:1 - chr3R 3673330 5' + 17.6 111 2 52.58 ACCCACCCAAATATGCCCCTCAATATAAGAAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCC:1 - chr2L 11155592 5' + accord 119 2 68.42 ACTCAAAACTGAAGCTGGTCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACAGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr3L 13925364 5' + P-element 44 1 27.78 AACACAACGAAACAGATCTTTTGCAGTAATATGTTGCCTTCAAATCAATTGGGAAACCAACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAA:1 - chr3L 17236056 5' + G2 2885 1 68.04 AAGCTGAAAATTAATGCAGACTACTACAGACTGCAGACAACAGACTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACACAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAA:1 + chr2R 17302773 5' - Transpac 4959 2 57.41 AAAGACTTTGACGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr2L 21784860 5' + I-element 40 1 67.00 TTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 - chr3R 13437217 5' - hopper 1361 1 74.55 TAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGGTGGCATACATTGGTTTA:1 - chr3L 3611762 5' + blood 7384 2 58.89 CTATGTCACATCAAAAGAATTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTGTGTG:1 - chr2R 23354388 5' - Tabor 7320 2 70.64 AAACGTTAAAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chr3R 24813966 5' + P-element 14 1 45.31 TTTAAATTCCCCATCAAATAGCGTATTATAAATGTAAACAAACAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAAT:1 + chr4 1232402 5' + gypsy4 423 2 66.36 GAACACTAAGTGATTTTTCATTGACTTTGTATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATG:1 - chr3L 19443604 5' - 297 6538 2 72.22 AAGCGCATAATCTCATGTCAAACCGAGAGTCTAGAAGTCGTGCTTTTTCCCTCCGTCTGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACACAT:1 - chr3R 19983934 5' + 1360 3209 1 72.34 GGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 - chr2L 5338024 5' + F-element 40 1 57.89 GGACATGTAAACACATGTAGCACGACACATCCAGCAGAGCGATGGCTGGTGCTTCGCCTAGGTAACCGTAGGCCATCTTTCA:1 - chr3R 9284054 5' + Rt1b 357 1 53.66 ACAATTTTCCCGACTTCCCCAAGATTGATAAGTCTATATTGCAGACTTGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chrX 15499965 5' + pogo 18 1 58.51 GCCATTTACCGGGATACAAGAGTGCATACACTCACACTCACAGGCTGCGCACCAAACACATACTCACACATATGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAATATATGCC:1 + chrX 3508817 5' + 1360 204 1 63.30 AGGATTTGAGCTTTACCGGGAATCTTTTCTGTCTTATTTTCGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr2L 9171414 5' - opus 492 2 67.78 AACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGTATGCAGACACCAGAGACATATGCACCGCGAGTTTGTTGACACGCCCACAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTT:1 - chr2R 1751259 5' + INE-1 256 1 74.55 AGTTGTCATTGGTTTTTATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGGCG:1 - chr2L 4016920 5' - opus 7474 2 52.94 CTACTCAAACGCAATCTGGACCGCTTTTATGGCTTTTTTTTCTTTGCTTTTAGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 16328118 5' + hopper 144 103 44.00 CTTACTGCCGGCCACTGACTTCACTGTATCTTTCAAACACTCCGAAAACCATATCCGACTATAACTGCTTTGCCGTCCACAGAGCCTTTAAGTATA:1 + chr3L 23768919 5' + Ivk 393 1 64.58 TGAGTTATATAAAATTTTCACTTGATGACTCAATAGTTAATTCTTAAAAATGTAAAATATTTTGTTTTCAGCATTTAAAAAAAAATAATTTTATTTTTTTTAATGTATTA:1 - chr2L 13445906 5' - BS4 732 1 79.09 TTATAATTATTTATTGGTGGTAATGCGATTATCGCTTTCTGAATTTTGCAACTAACTTTTAATTTATTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chr3L 14929043 5' - I-element 5328 1 58.18 GATACGGGGGAAAATCTGTGATGGGGAATGATGATGCTGATGGGCTGACGACTTTTACAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGAGACACAA:1 + chr2L 13324567 5' + jockey 4743 1 52.38 CAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAACATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - chr3R 17673831 5' + FB 36 1 54.55 TTGTTTACTGTTATAAACAGAGATTAATAAAATAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGTTTGATATTTGTTTAT:1 - chr3R 32050426 5' - I-element 94 1 67.35 TGGCATTTCTGCGCAACATATTTGCAGGCTTTGGCAAGCGAAAATCCCTGAATAGGGGGAAAAAATATATATTAAAAAAAAAA:1 + chr3R 29440843 5' + BS4 729 2 77.11 GATCATTTATTCGACTGACAAAGTTAATAACTACGTAAGTATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chrY 473358 5' - opus 7467 2 66.35 AAATAAGATTCATTTCCTGAAAATAGGTTAAGTTGAATGAAGACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATAAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 13024087 5' + 412 7073 2 62.73 TGCGACTGGAAAGGTTTCTGGCAATGCCTACGATCTTAAAACCATGATGAGCGAGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCG:1 - chr2R 12937974 5' + 1360 457 1 63.64 TCCAAAGATGGAGAACAAAATTACAAGAATTTCAGTTTACTATCGACTATATTAAGGGCAAACAGCACGAATCAAAATTGTAGAGGCGACTGAAGCAGAAGG:1 + chr3R 613207 5' + gypsy12 3 2 61.76 TTTTTATTTTATTTAATTTCTTTGACATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 + chr2R 15155183 5' - flea 222 2 55.45 ACTAAAATGGGAACCTCAAAATGATTTATTTAAATTCAGCGTAAATTGTAATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACACAGGCAGGAGTTGGCCT:1 + chr3R 19445814 5' - invader2 5066 2 51.82 CCTGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 + chrX 20433334 5' + diver 5897 2 52.24 ATTTTCAACCGTCTTCATAGTGATTACAGAGCATAAGTTTCATAACCGACTTCAATTAAAAGAGTTCGAGTCGAGTTCCCCTACTATCAGGTACCCCTTACTCAGCTAGT:1 + chr2L 21362901 5' - INE-1 542 1 57.27 TCAAATAAGAAATGAGTTTTTAAACAACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTA:1 - chr2R 9950522 5' + S-element 34 2 67.02 TCTAAATTTTCTATGTTGACAAAGCGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGG:1 + chr2L 13292946 5' - X-element 4703 1 64.58 ACTTTAGGTTTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGCTTGGCACTATGC:1 - chr2R 6707757 5' - 1360 3354 1 59.80 TGTGTGACCAATGTGGCACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCAATACATTGGGTT:1 - chr2R 7981208 5' - 1360 3364 1 51.52 TGCCCAACCGTAAACAGTAGCCACAAAGCAAGGCGTTTGACTCTTTGATTTATTTTTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTC:1 - chr2L 16202490 5' - invader2 5009 2 59.60 TAAGGACACCCACACACATACATACTAGACTCGAGATGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGCGGGTGACAGCGGGTG:1 - chr3R 7428147 5' - GATE 8251 2 68.92 CGATTATATCTAATAAAATGTGTTTTCTACTCTTTTATTGTCAGGTAATTACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCT:1 - chr2L 18552432 5' + flea 262 1 56.84 GTTAACAAATGTTTAATTTCACAAAAACATATATTTCATGATTGCTGTCTTTGTTGCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTA:1 - chr3L 11251153 5' - Stalker3T 202 1 60.00 GATTTGCTAAAAACACATGTTTTTCACATACTGAGTCTGCCAATACATAGATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 - chr3L 23996580 5' - HMS-Beagle 214 2 54.55 GATGGCTGGTCCACAGCCCATTTCACACCGCCTTTTTCTGCATGCTTCTCGTTTT:1 - chr2L 5217499 5' - invader1 3775 2 50.91 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTTTTTTTTATTATTTGACTT:1 - chr3R 21907536 5' - Rt1b 5143 1 32.11 GTTACATGAATCTGGAGAAAAAACTAAAAAGAAATTTGATTAAAAACGTGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAAAA:1 + chr3R 19445078 5' + Tc1 446 1 74.29 CCCTTTGTATCTCCGCCTCGTCTTGGTTTCTCTTACAACTGCGTCGTTTTAACTTCATGGGGCAAGTTACGGGGGATACGTATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCA:1 + chr3R 9339593 5' - Burdock 6388 2 72.73 TAATATTTGTTTAATTTATTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 - chr2L 4034964 5' - TAHRE 10427 2 62.00 AAATATATAATTCGTCCGAACAGTTCCAGCAACTGATCAACCTAAGGTGACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGAC:1 - chrX 8075350 5' + 297 357 2 59.09 ATGAAAGTGCCCGCTGGTCTGTTTATTCCGTCCGTGGTGGGGATGCATAAGGAGTTCACAGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGAAAATGG:1 + chr3L 16094127 5' - G5A 2666 1 70.00 TTAAGTGACTAATTGCGGGAAAGTTTATCCTTTACCTTCAACTCCATTACTCCCAAACTAATAGAATAGAATAATAATAATAATAATAATAT:1 + chrX 19542890 5' + mdg1 32 3 77.17 TGTGTAATTTTTTTTCGGTGTTTTTAAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGGC:1 + chrX 13118529 5' + flea 154 1 74.31 GTCTCGCCTGAGTTGTAGGTGAAGGTCACCATTCTGTTGTTCTATTTACGTTCTGTTCCTTAATTATAGTGTATACATATGTACCGTACTATCTTACGTGTAAGGAGTGC:1 + chr2L 13084034 5' - G5A 2704 1 54.55 TTCGCACTGTGTACATTTGACCCGAAGTGCATTGGTCATCACGTGTGGCCATGTGTCTGCATTTGAGTGCACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 5910658 5' + roo 13 2 69.09 TGAAGTCGAATGAGTTTGTTTGGGCTTGCTGTAACAGAACAGGTAATTGTTGTTGTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTT:1 - chr3R 435945 5' - 1360 3008 1 50.46 GGAGGCGGAGAAGCCCTTCACACCTTGGAGAAACTTCACTCGGCGCCCGTGAGAATAAATAAGTACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAA:1 + chr2R 24572667 5' - GATE 442 1 55.79 AAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACTATTTAT:1 + chr2R 25257631 5' - TAHRE 10389 2 68.75 TACGGGGAAGCCTGAGTGAAACAAGAACATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2R 7981112 5' + 1360 11 1 72.12 GTACGAAACTTCGCATAAAATATTCAAATACCTCCACTTATCACTTTCTACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAG:1 - chr2L 7186810 5' - aurora-element 4181 1 55.05 CCTTTGCCCAGATGATTCGCGAAAAGGTGGAGTCCGGCAAGGGTGCAGTTCGACGACTCGGCCTGTAGTCCATTTAGCTGGTGGTAGATTATCAT:1 - chr2L 3511194 5' - diver 5666 1 64.21 CATATTATGGGTAAAATGAAATGAAACGGAAGTTGCGAGCACTGAACACGTTTTATTGGCCCAAACCCCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACC:1 + chr2R 20417622 5' + F-element 424 1 63.81 GGGCGCACTACCATCACCATCAGCAGCACATCACAGATAAACAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAACCTA:1 + chrX 16167542 5' - Tc1 1419 1 62.96 TTCCTTTTGGGTTGTCGCTTCTGTCTCCATTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 - chrX 9845568 5' + F-element 19 1 70.91 TGAAGGTCCGCCTTTACTACTGGTGTCCTGTGGTCATCTGTAAAGCCCACCGTAACCTTTTGGTCTGCGTAGTCTTCGTAGGACGTCATTGTTGAATATAGGCAATGCCC:1 + chr3R 796972 5' + 1731 4312 1 86.36 TACTAGACAAGACCATTAAAGGGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAG:1 + chr3L 25414199 5' - blood 7350 2 75.29 AAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAAC:1 - chr3L 64540 5' + F-element 304 1 73.39 TTTTAGAGCCGAAAAAGACAAACATTTTCCAATTTGGTGAGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 - chr2L 14556070 5' - Tirant 359 2 62.26 AAGAGCAGTTGATATGCAGTGTGACCGCGCCGATGACGAAAAAAAATACCAACCGTCTATGAAAATTTGCATATTATTGTCAAATTTACAATGCATGAG:1 - chr2L 419938 5' - 1360 195 1 80.81 CGCTTCAAGGACTTGGAAGAGGAACGTGAATCAGACAAGAACAAATGGCTTAATTTTAACAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGTATAAAAATCGGAGGAAGCAAAT:1 + chr3L 23716431 5' - gypsy12 10018 2 60.19 TTGAAATGTCAAAAGGCGTAAACAAAGTTTAAGCACATTTTCCGTGAATTATTCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 + chr3R 20703178 5' - flea 4973 2 56.36 ATTGGTTCAGCATTAAAGCGATAAAATGTTAAATTGTAAAAAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGAAAA:1 + chr2R 18139406 5' + I-element 342 1 53.33 CCCGCCTGCATTTCCGCATCCGGTTTTTGCATTTGACACCATGCCCAGAGACGAAGGGGTACAGAGAGGGAAATATAAGGTATAATTTTATTTTATTTTTAAA:1 - chr3L 13159422 5' - NOF 3956 1 71.84 GACTAAGAAGTAAAAAAAAACGCTAAAAAAATAATATAAAAACTGGAAAATAACTATATTAAATATTACTATTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAATTCG:1 - chr3R 12172744 5' - Cr1a 4266 1 68.18 GATTTTCTGAATGAAGGAGCAAACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAAC:1 - chr2R 18807884 5' - BS 5041 1 75.45 GTAATTATCATATTTGTTCATTAGCTTTTATAATATTTCGTGCTATATATTAATTTGGACGTAGAGTATAATTCGCTTAGCTGCATAG:1 - chr3L 8011472 5' + pogo 4 1 71.59 TTGTAATTTGTAATTTTTATAATTTTTGGATGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTAT:1 - chr2R 1231019 5' - Stalker 6899 4 71.82 ATTTTACAAAAGGGATTAATCTGTATTCTTTAATATTGAAATATTCCTATTCATAGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 - chr3L 14811501 5' + copia 24 2 47.06 CCAAAAAGACGAAAAAGCCACGAAAAATATAAGAGGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCA:1 - chr2R 9036992 5' - copia 58 2 70.91 GATGATGACGTGGTTCTTAGTGGATGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAACCGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGG:1 - chr3L 19613332 5' + Dm88 449 1 75.00 GGGGGCGTACTTCTTATTTTGGGAATTATGCATAGTTCTTAACTCTACACGCATCACCAACACATTTTGGAGACCCACTCCAGTCCACATACATCAATACTAATGCACAC:1 - chr3R 21112075 5' - invader1 193 2 77.27 ATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATACAATAAATGATTGAGTATAACATTGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATGTA:1 - chr2L 7958671 5' + Stalker 80 4 64.55 ATTATAATTATTATTATTATTATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGA:1 + chrX 13383540 5' - Copia1_DM 148 1 51.82 CCTTGATTAAGACCTATAGTTCAACCGCAGCTGTGCATTTATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 - chr2L 12910779 5' + Burdock 38 2 63.64 GTTATCTGCTTGTAGCACTGATGGCCATCTGTGCGATCTATAATTTTTCAGTATTGTCCTTTGCCTCACTAGAATCGCTAAACCATCCCATTTTTATTTTGTTTTTTTT:1 - chr2L 8051639 5' + hopper 141 1 70.64 GATTTAAAGCGTTTAACACTCACTGGAGCACGGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACT:1 + chrX 20621922 5' - Bica 418 1 70.91 ATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:2 + chr2R 15155209 5' - flea 196 2 79.09 TGTTGGAAAAAAACCCAGAAATCTTGGAATTATACAACCCATTAAAACAAAATAAAACAAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCT:1 - chr2L 21762390 5' - INE-1 545 1 63.64 GCCTGCGTTTATCTGGCTTCTAATTAGATGCAACCAAAACATAATAAACTGCACTCCATGGTACCAATCTATTAATAGGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAAC:1 - chr3R 25009268 5' + I-element 4878 1 68.18 TCCTCTGTTAGTCGATGTATCATGGCGATGCACATAGTAGGGGTATATAGTAAAATTAGGTGTAATATTTTTTTATTTGAGTCGAATAAATGTCCCGTCAGTTAACTAAG:1 - chrY 3563050 5' - 297 360 2 68.18 GGGTATTAAAAAAAGGTGTAGATTGGGCGGGGGGTTCATTGTTGTGGGTAATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGGGGTTCCTCTGGAGGCGTCTGATG:1 - chr3R 29690697 5' - G-element 4158 1 76.29 GTAAACCATAACTTGGAACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATAATTT:1 + chrX 12271468 5' + pogo 40 1 57.27 TATTTAAAAACATTCAACGGCACAACTACAATAAATAATATTTCATACACCAATTTAGAAAACAAAATACTTGACTACATAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAA:1 - chr3R 1319490 5' + 17.6 6956 1 78.18 TTAAAGTTTTATTGAGTCATAATAAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chrX 3528589 5' + roo 8720 2 81.90 GTCCCATTTCACGTTCACCTTTTGCTACTGAACCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 4305307 5' + roo 51 2 72.73 AAAGTACACTTTACAAAACCGTTGGAAAACATATGAAAAATGTTCGCCGCATTAACATTAAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAG:1 - chr2L 16240763 5' - F-element 4270 1 67.96 ATATGCAAATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr2R 22663330 5' - mdg1 7422 2 57.27 TTATGTATCTTTTAATCTTGCAACCTGTTGTGATATAGGCTTGAGGGGGGATTTTAGCGTTGGAACTTAAAAAAAAGTTTATTTATTAAAATTTAAATTAAAATTTT:1 + chr3L 14840164 5' + 1360 3045 1 42.99 TGCCCGCAATGTAAACACTGTGAGAATACAGCAAATGGGGAAATTTAAGAATAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAAC:1 + chrX 1198812 5' + HMS-Beagle 280 1 58.65 TCAGGTTGTTTTTGCGTTGGCGGCTGCTGTTGGCGCCTTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTGGCCTCACCCCTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr2R 18718789 5' + hopper 140 2 43.33 ACTATTTTAAGGGGCCTATTGGTCAAAATAATCTTTGCACTGAAATGTCATTTTAGTGAGCATAATTATGAAACATGGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 22861754 5' + 1360 5 2 76.36 GAAGAAAAGAGAAGAAAAGAGAAGAAAAGAGAAGAAAAGAGAAGAAAAGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGG:1 + chr3L 22908067 5' + micropia 5294 1 50.00 AATGACAAATGCGCCAAATTAATGAAGTTGCATAATTTATAAAATATGATCTTAAACACAGTTGACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3R 7049733 5' - 1360 3367 1 60.91 CAAGTATGCGCATCGCATCTGTCAGATATATATTTTTCTGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGG:1 - chr3L 15258138 5' - Doc 4492 1 57.61 ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 - chr3R 21211613 5' - Stalker3T 205 1 63.64 TAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr2R 9963672 5' - pogo 2054 1 73.00 CCAGAAGAATTTATATGATAAGCGGAGGACAGGCAAAGCGTTTCGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGAAGTGGT:1 - chr3L 13630618 5' + Circe 7145 1 56.60 ATGAAAGGAAAACTAACAATTAGCCCCCATCCGGCATCTAATATCATTTAGATTTGGCATTAATACTGATTACTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCA:1 + chrX 10876092 5' - transib2 2549 1 69.72 AACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTA:1 - chr2L 20841948 5' - G6 1967 1 73.79 TCTACGTTGAAAAAGACTACTGGGTGTAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr2L 9754843 5' + 1360 58 1 75.23 ACTAGTGCCTCCTAATGGACTTACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 + chr3R 19949140 5' + copia 47 2 77.66 GACCGCATTGACTGTTCAACTACTATATACATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGAGTTTTC:1 + chr3L 17220687 5' + opus 42 4 75.00 AATCTAAAATTCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGACCTGCAGCTGT:1 + chr3R 27071847 5' + jockey 4692 1 56.48 ACCATGGGTATCCGTATCCACTAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGCGCTA:1 - chr2L 10611829 5' + accord 6941 2 69.66 GACCTGCACCCTCCTCTTCCTCATTTGATTTTCCCTTTTTTTTTT:1 + chrX 2976543 5' - Doc2-element 251 1 91.11 CTCACACTCGACTGCATTGCCATGGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTAT:1 + chr3R 11315237 5' + hopper 63 1 77.27 ACAAAAAACAAAATAAAAAAAAACTGAGACTGCAAACACCATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGAATTCATACATACATACATACTATATATGTATGTATATATATTCT:1 - chrX 11541570 5' + 1731 4412 1 73.64 GATTAAGTTTAGTGCCTGATGATGATTGTTCCTGGGGGGTCGTGACCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGA:1 + chr2L 9075389 5' - F-element 4233 1 56.31 TTTTGCTTTGCTGATTTGTTTGCCAACGAATCGCTTTTTGTTTGTTTGCTTGGTTGTTTGCTTGCTTTTTTTGCGGTAAACACATGCAATACAAACACAATTATGACAGT:1 + chr2R 18737158 5' - invader1 3837 2 68.18 TCAGTACAATTACATTGTACAAAATATTTACGCTTTTTTGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACT:1 + chr3L 346784 5' - Bica 30 1 56.18 TGTTTATGGCCAATCAGAAATCATGCCCATGCCCACCTCAGCCGCATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCG:1 - chr3L 15215604 5' + Tirant 8065 1 56.86 GACGCCTGGAGTGGATTGCACTGAGGTGTTCCAGAGGGCAGCATCTGGAGTGGCCATGTCTCGATGTCCGGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAG:1 + chr3R 5174079 5' + INE-1 161 1 56.84 TTTAAATGAATTATATTAAAACGCAGCAATAACAGCTTATAGATTGTCTTTTATTATTTTTTTTTTTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 - chrX 14771802 5' - jockey 4978 1 52.29 ATGGATTGAAAGTGATATGGAAAAGTGGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGG:1 - chr3L 5194203 5' - I-element 4918 1 68.97 TGTGCGCATGGAGGGCCAACATAAATATTCAATTTAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCCCAATGCC:1 - chr3L 13160716 5' - pogo 2079 1 63.10 ATTTTGATTTGGCATTTTTCTTCGATTTCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAACCCACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTT:1 + chr3L 6696403 5' + Doc3-element 4594 1 75.45 ACTTCACACGTCATTCGATTTGACATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGTTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCA:1 + chrX 1510845 5' + 1731 297 1 77.06 GATCGGGTTGCTGTGTGAGAAGTTGCTGCGTCTTGAAGCTAGGTTTAAAGCCGGTACACCTGCGGCCAAA:1 - chr2L 9610630 5' + Bari1 438 1 57.14 CAAGAAGGTGCCATTCTTATAAAGGGAAATAATATTGTGAACGATTCCCATTTAAACGGGTATTTATATTAAATATATTATTATATTTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2R 2893321 5' - copia 255 1 55.96 CTCAGGTTTAAACAATTTCAAAAAAGGCAGCACATAAAGCTATTATCGCCGTTAACTCAAACAAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACA:1 + chrX 8888505 5' + hopper 991 2 63.64 CACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAAAACACACACAAACACA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 419 2 37.96 AGCCCACATGCAGTGCCTAGCCGACGGAAACCGCCCTTCCAGGCCACTTCATACCATTTTAGCCCACTGACTTGTATTGATTCATCGCTTCTAA:1 - 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1360 374 1 50.91 TCCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAACATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chr2L 19129381 5' + FB 37 1 63.44 AAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGGTGACATGACATGACATGAGAATAGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCCAAGTAAATAGTC:1 + chrX 15019098 5' - roo 286 2 58.06 AACAAAAAGAGATCTCGAGATGAAGTGGAAAAGCAAAGACAACGTCATCGGAGCTGTGCCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACAAACACACACACATAT:1 + chr2R 14120929 5' + accord 7029 2 57.80 AACGAAAACTTACGATAACGACAACATTGAGAGTAAAACACCATGTCTGACCAACAGGGGCTTACAAATAAAACTTGTTATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAA:1 + chr2L 22033605 5' + Doc3-element 4482 1 53.21 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 2 54.67 CTCGTTGAAAAGTATATAACAGCCAAAAGGAAGCGAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCTATCTAGCCTTCTCCGTCTGTCCGTATGAAAGTCGAG:1 + chr3L 19471444 5' + INE-1 129 1 69.09 ATTTAGTGGGGCTGTTCAATTTGGGATGCTTGAACATTAAATAGAATACGTTTATTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGGACGG:1 - chr3L 18378964 5' - TAHRE 10425 2 53.85 TAGAGGGTGTGCATAATGGGTTCAGAAAGGGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCG:1 + chr2L 7077244 5' - 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chr2L 18105572 5' + F-element 267 1 76.36 AGTTCATTGCCGCTTTTTAGGCGCCAACAGCAGCTTACTGCGAAAAATTCCACAGAAAAGTTAAAAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTA:1 + chr2L 20261721 5' - Cr1a 4210 1 54.55 GCGTTTTAATTGAACTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr2R 8086876 5' + 1360 21 1 61.47 CTCCGAATGTGTCTAGAGCTTCAATAGCAGGCCAAAATTGCTCTCCTTTCGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTA:1 + chr3L 17616854 5' - 1360 3255 1 73.64 CATGTTTATGTGTGCTTTGCGGTCGGCGCATCTACATATATTTTCATATTGTAATGCTCTCTTTTTGGGGTATTATGCGGAAGTTGTATTTTCGAACAAGTTCACTTAT:1 - chr3L 20871756 5' - Fw3 32 1 62.39 CATTAAGAAGGACTACAACGTGTGCGGTTTCTGTTTCCGAATGGTGTGTTAAAATACTGTAGTCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAG:1 + chr2R 8918221 5' - Tabor 7172 2 63.64 GTAATATTTTATGTATGATTTAATTTTTAATTTAATTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTA:1 + chr2R 4137699 5' - Juan 4162 1 74.31 ACATTCAGCTGCGCCAAACTACACATGCGATTGTCTAAGACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr2L 21768210 5' + 1360 26 1 59.34 TAATGCTCTTGACTCAAATGTCTTTACGCTTGCGTAGGGACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAAT:1 - chr2L 17540527 5' - Doc2-element 4408 1 70.00 GAACAATTATTTACAAAACCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2R 18523558 5' - roo 361 2 80.65 GGTGAATAATTAACAGTTATTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2L 6311322 5' - hopper 1376 1 60.00 AGTGGACGGATCTACAACCCTCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCCATAAG:1 - chr3L 16496242 5' - P-element 2841 1 28.72 CTTTCAACTACAATATTAAGTGCGCAGTGTAGAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTA:1 - chrX 12186153 5' + G6 1984 1 70.91 CCCAATACCCCGCTGAGCCCACAGAAAAAACCAACGCTGCATGATAGTCGCTTAAAATCTCATTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCA:1 - chr3R 17493285 5' + Idefix 325 2 62.73 CCCCCCTTTGTTTTCACTTCAATCATAAAAGCATAACACAAAAGCCATTATTCTCTGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGCGGGTGACAGCGGGTGAGCG:1 + chr2L 6285400 5' - GATE 8247 2 61.54 AAACAGAAACATCATCTATACGTTTTGTTCTAAAAAATAATTTGTGAAATATATAATTTAATCATTTAAATTTTAAAATTTATTCA:1 + chr2L 5195670 5' - 1360 3035 1 77.91 TGATGTCCACCATGGGCAGGCAGTTGTACTTTTTATAATTAATCAAACTATTAGGCATTTGATGAGTCAGTAAGCTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGG:1 - chr2R 22715477 5' + 1731 184 1 71.82 AGTTTAGATTGATTGTGTTCGGCTACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAATGAGTCTGAGAGAGACAGCGATATGATTGGTGA:1 + chr3R 24868475 5' - P-element 2773 1 29.09 CAGATAGATACATACCCGGGCAGCAGGCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTGC:1 + chr3L 6111295 5' + X-element 4507 1 71.57 TATGTATGTATAATATGTATGGGACTAGGGTACGATAGTTCGTAGACAAGCCAAACATATCAAATAGACACAATTACGCACACACACACACACACACACACATATAC:1 + chr2R 14068206 5' + accord 185 2 45.79 TAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 13544016 5' + 1360 1 2 36.00 ACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGAAAATTGCCTATATTCAA:1 + chr3R 20627938 5' - 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chr3R 23692475 5' - jockey 4618 1 66.67 AAATTATGCACAAGTGAATAATTGTGGCATTTTAATGGCGGGCCCCGCCAATAAAAATTAAAAAAAAAA:1 + chr2L 12373491 5' + Doc 4692 1 59.42 CATTTATGGCACTTGTCTTGGATGGACATTGGATATGGGATATGGGATATAGGATATATAGACATCAAGAGAGTATTTGAACACACACACACACACACA:1 - chr2R 17504813 5' + accord 7028 2 63.64 TAATTCGCTCCAAACACCTTTGAGAACCCAGACTGACAAGAGCCCCGACTTGACAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACG:1 - chr2R 20078619 5' - 1360 3169 1 63.54 AACTATCTGATGAATCTGTCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2L 21682199 5' - P-element 2865 1 34.38 AAACTGAGCGAAACAGCAACAACAAGGAACCAAAACCACATACCAAAAAAAAACAAAACCAACCACTCACGGGATTTTGCAAAAACGAGAG:1 - chrX 13688519 5' + micropia 5169 1 78.02 ATTACAGGAACGCCCCAAAATTATGCTGCATATTTTTAAAGCAATAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chrX 17456026 5' - jockey 4973 1 62.73 ATCTTTCTCTAAATCAATCTATCTATTTGTATCTCAGTAACAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTG:1 + chr3R 24693153 5' - I-element 378 1 56.84 TATTGTTCTTGTAATTAAATTAACACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 9432813 5' + roo 19 2 64.76 CGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCACTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 12623734 5' + roo 8713 2 81.32 TGCCAATTTCTATTTGAACTTTCCATATACATAGTTCCGCCGCATTATTTGTGTAAAGTTTTGCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - 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chr3R 21532310 5' + Bica 2 1 61.11 CCCCGGGTTAGCGCAATCTTCGACCTTTTGATCTTGTTTCCACAGCCAGGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTCT:1 - chr2L 14296860 5' - Porto1 4410 1 64.21 AAATTTCCGAAGAAGGAACTGAAATCGAAAAAAAACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTCTTGGTGA:1 - chr3L 16828661 5' - 1360 3337 1 68.18 GTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTGT:1 + chrX 9845361 5' - gypsy3 418 1 31.71 CGAATCACTTTAATTCGGCAAGGCGACCAGCACACATGTACACTTTCTCCTTTATTGTTTTTACTTACACAAGCAAGCAAATTTTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAG:1 + chr2L 9839107 5' + 1360 3282 1 73.64 ATAATGATTCACAGTACGTGGAATTTTGTTGCGAGGACACTACGCACTCATGTGAGTTGCGTTTCGAAAATGATATTTTGTACCGAAATACCAGAATTATACTTAATTAT:1 - chr3L 11954506 5' - Tc1-2 401 1 68.18 GCATATGCTTTTGCATGCATAAGTATTTAAATCTGTGTGATGTTCTAACGTTTATATATAGTCTCAAAAGTGTGCAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTTTTGTATATT:1 - chr3R 11957294 5' + S-element 1552 2 70.00 CTCGTTGTGTTGCCTGAAACAGCCCTGACCAGCCAGTATCGTGCCCCATTCTATCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATGGGGTTCA:1 - chr2L 4126781 5' - S-element 1239 1 54.63 ACAAAAGCGGCTAAAGCGAATGAAAATAGGGGTAGAAGCGAAGGGGGCACAGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCGGATATGG:1 - chrX 8832109 5' + micropia 412 2 52.00 CAAATAAAAACGACAACACTTCCGTTATTTTTTCCTTTGCATTGCTTTTTAAAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTT:1 - chr3R 27899656 5' + S-element 339 1 79.57 CTGGTAAAAGAACTTAGTACAATGCAATTCAATGAATATTCAAACATAGTTATACCGAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATA:1 + chr3R 7317447 5' - INE-1 559 1 78.00 AAAGTTTGAAGCTTAAATGGCATGTTTGAATTCAGGCAATATATCAGATTTATTTGCAGAAATTAAAGATTAAACACATTTATGGATTATATTTTTTTTTCATTTTCTGC:1 - chr3R 15109802 5' - transib1 30 1 66.36 ATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 35.45 AAAACGAGTAAACGGAAAAAATGACAAGCGAAGCAACCGACTGCAAAGCGTAGCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCACAATTA:1 - chr3L 13545167 5' + I-element 222 1 57.73 GTGTGTGCGATGTAAGCAGTGGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTTGGCG:1 - chr2R 18357556 5' - Ivk 5045 1 61.82 CGCCGCATCATCCAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 9481216 5' + roo 8717 2 73.64 TGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGAG:1 - chr3L 19347207 5' - jockey 4966 1 55.84 AATCTTATCCTCCTTCGGTACTCTATTGAAAGGATATTTTGATATTGTTTATAAAGTCGTCTTTTTCTCTGCTATTGCCTCAATGACAAGATTTAT:1 + chr3L 21975466 5' - Doc3-element 4462 2 70.83 TGCCATTCCATTACCGACACCATTGGCGTCAACGTCAGCATCCATCGCACATGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGC:1 + chr2L 11247678 5' - Bari1 237 1 55.56 AAGGCACACGAACTTGAACATGGCTCGCGATTGGGAATTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chr3R 6260412 5' + hopper 147 102 47.62 TGGCTGTAAGTGCACCCAAGGCAGTCCGGCCACCTAAACCACCACCTCCTAAGCACACAGGCACCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAGCTATAAGTACA:1 + chr3R 27197967 5' + blood 7035 2 55.45 TTTTCTCAACTTTGCGTCTGAAATTGTGGAGGAGGGTGGACATATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTTT:1 + chr2L 20513254 5' - Stalker3T 201 1 50.53 ACAAAACCTTGTGGAGACTTTTTCGTGGTAGCTGATTTTTCAATCTGGTGATGGAATTATGGTCAAAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr3R 19949209 5' - copia 237 1 63.64 ATTTGTTCTACGCACACACAGTCGCACGAAGAAAGGACAGAAAAAAAAACGTTGGCACGATGGGCGCCACCAACATGCTAACTATGCGGGG:1 + chr2L 19617650 5' + Ivk 5105 1 74.73 TATATTTTGGAGTTATCAATAATTCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTT:1 + chr2L 23179052 5' + diver2 4780 2 75.00 CCAGGCAACCAAAAACACATAAGTAAAATCTGTAATAAACTTGTTGTTGTTGCCGATGCGATTGCAGTTGTGAGATG:1 + chr3R 13139026 5' - Doc4-element 292 1 66.23 TGCGATGGGTTTTGATTTCTCATATTTTTATGCATGAAAGTTTGCTGTTTGCTGTTGTTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTTTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAA:1 - chrX 5388742 5' - I-element 5049 1 57.27 TAAAGCCTTCCTGGTGACCTTGTCTTTGGGTACATTCGGAGTAGTGTATGGCGTATTTGGGTGTACATGATGTTTGTTTATTAGGGGGTAGGCATGTACTTAAGTCTTA:1 + chrX 8983710 5' - Idefix 21 2 71.56 ATACAATTAAATCTTTCACCGAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTCAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 24050671 5' - roo 9013 2 79.61 CACATGCATCTGCAAATATGCATCGCACTTTCTGCCTCTGTTCTTCCGTCGCTGGGCTTATTTACTTCTTCATATTGAG:1 + chr3L 10943255 5' - Quasimodo 7205 2 72.15 GATTCCGACTCCGAGTTGCAGTCCAAATTGCAGGAAGCTGGCATCGGAGAACACGATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAA:1 - chr3L 16429332 5' - FB 215 1 55.45 AAAGTACTTAATGTGTTGTTTTAGTAAAACATAACTTTTAAGCACAACGCAAAAACATTGAAAGCTCTTTATTTACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr2R 24031564 5' + 1360 12 1 70.00 AGGAGTGCTCCTTGGAGCAGGTAAGTTGTCGCAGCTTAATCGATTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAG:1 - chr3L 13371967 5' - Doc2-element 470 1 64.47 AAGCTCTAATTTTCTCACGTACTTGTAAATTTTGCGGAAAACCGCAACAAATTCACTTATAAAAGTAATCTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chr3L 17706351 5' - Juan 4202 1 65.45 GAAACTATTTTCCGACTTTTTTATCGTTTCTATTAATTACATTTATACCCGTTACTAAACCAATCCTAAAACAAAATTTTAATGAATAGTAACGGGTATCAGATAGTCGG:1 - chr3L 22245410 5' + INE-1 551 1 78.18 GAGGGATTCGGAGGGCTACATGCTAATGACGCCCTTCCTGTCCAGTTCGCAGAGCCACAGCCACACCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTA:1 - chr3R 11748682 5' - invader2 120 2 72.45 TGAGCAGAGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chrX 18483153 5' - pogo 2058 1 63.64 TTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATATCTTATCTTATCTTATCGTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 + chrX 21668886 5' - Stalker3T 201 1 44.04 GTTAAAAATAATTTTAAGGGTTATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr3R 25434739 5' - opus 7483 2 60.20 ATATTGAGTATACACCATTAACAACGAACTGCTAGTGGATTATATGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 + chr2R 19405867 5' + HMS-Beagle 12 2 70.00 AATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2R 9871016 5' - roo 401 1 73.39 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAAT:1 - chr2L 16217660 5' + Chimpo 159 1 28.85 GGCGAATTGCCGAATTGACTTTAATCTTTGGGGTAGGTGAAATGGGGCTCTGTCTATATTAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGG:1 + chr2R 22590794 5' + invader4 2919 2 72.73 ATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr2L 10746641 5' + flea 4768 2 64.04 AACACGGAAAAGTGTTCCCAGGTCTGGGAAAAAGTTGTGAAGATGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAAC:1 + chr3L 2559033 5' - roo 103 2 55.67 CAGGTCCCTGATGGTGGGTTCAATAACCAATATACGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGA:1 + chr4 91349 5' + 1360 3168 1 61.11 CAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGG:1 + chr2R 12185302 5' - accord 7377 2 69.81 TATAACATAATATAATATAATATAATATTATATAATATAATATAATATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 + chr3L 20525230 5' - HMS-Beagle 7027 2 77.17 TCTTTAAGATCGAGCTACTTTACATGATTTCATTTTCTCAAGACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 - chr3L 23257559 5' - blood 7359 2 63.54 TGAGGAGTTTTTTTGCCTGTTTACTGATGGAAATGGGGAATGATACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCT:1 - chr3R 14357380 5' - Rt1b 5122 1 67.27 CACCAGAATCAAGGCCATGTGGCTTTCGTTTGTGAACAACGTAGCGGATGTGGTGCAGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCC:1 + chrX 18438049 5' + jockey 472 1 68.54 ATAGTAGACAGATAGGCCGCATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3L 18072723 5' - 412 458 2 52.73 ACTACTTTTGGGAAAGTATCAACAAGTTTACTCTGAAACGGACAAGGCTATATCGACTTTGCTGTTGATCAAGAATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC:1 + chr3R 6461718 5' - S-element 1710 2 75.45 AGTTCGCGCCTAGTGAATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chr3R 21993199 5' - jockey 4967 1 58.18 TGCGCAAATCACACAAAAGTCTTTTCACTATTTTCCTCGGCACGCACTGCTAAGCCTTATTTTTTTGCCCAGGTCAGGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCTGA:1 - chr3L 16259029 5' - Transpac 5219 2 71.82 TTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCAT:1 - chr2R 23354369 5' - Tabor 488 1 72.29 GAATCAATATCAATCAATAACAAATCCGAGACTAAGCGAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAAT:1 - chr2R 5303421 5' + Idefix 7117 2 62.38 AGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAACCTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTT:1 - chrX 6522064 5' - pogo 491 1 60.56 CAGAGGAATGGAATGGAAAATCGGAGGCTATTGCCCAGGATGTGGCATGTGGCATGTATGTAGGTATGCTCGCTGTACTATGTCGATGTTGCTTCTCGATGCGTTGCCCC:1 - chrX 18267396 5' - Doc3-element 4343 1 67.27 TTTTCCTCACTGCCAGGAAGCGGGCCAACATAAACAAGCAATTTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAA:1 - chr3L 6015318 5' + I-element 4877 1 66.25 ATGGCCATGGGTGCCATGGGTAAATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 + chr3L 26288795 5' + HMS-Beagle 32 2 71.60 GAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 - chr2L 5338020 5' + F-element 32 1 56.63 CTTTAGGAGCAATATCCAAGATATGGATGGAGCTACAAGACGCCCACAGACTCACGACGACACACACACCACACCAAGAACAACTTTATCAGGTCTCTCTAGCAGCTTTA:1 - chr2L 622774 5' - flea 458 1 70.91 CTTTTTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAG:1 - chr2L 16606827 5' + F-element 105 1 52.13 CGAGTGTGTGTGTGTGGGTGAAATTATGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAAT:1 + chr2L 16805118 5' + hopper 53 1 72.73 TACAAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGATGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 + chrX 17330104 5' - opus 7474 2 55.91 ATCATTTAAAAGACATAATCATATCAATTTACCAGACACCAACCAGAACACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACACTGTCTTTTTTCTTTAAAC:1 - chr2L 7448826 5' - flea 320 1 54.55 TTAGGCGCCTTTGTTGGCTACGCCATCCTGGACTTCCGCTTATTTTTATTATTTTCACTTTTTTTTT:1 + chr2R 15922743 5' - Porto1 176 1 79.10 CTACTGTGCTTTGCTTTCTTCTACAAATGCGGTTCTTTTTGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAACTGAATTT:1 - chrX 724514 5' - Bica 182 1 64.55 AAGTAGTTAAGTAATTTGTTTCTCTATAGAATAAAACCATCTTCATTTGTCTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr3R 1313792 5' + Doc 39 1 56.36 ATGTGTGTAAAAGTGTGTCATCACTTGTTATGTACTGGGTACATATGTATGTATGTACACAAGTATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGGTTACACACTGTAAAAT:1 - chr2R 9552381 5' - S-element 1702 1 65.38 TTTTATTCACTATCAATCAATCTTGATAATTCGTTTCGTTTTTCATTAAAATCAAAAAGATTGATTCCATGTAGTATATAAATTATCATTTTAGCAGATTTTCCATATAT:1 - chrX 19339795 5' - Burdock 246 2 70.91 GGGGGTGGTGGTGGTTTGTGGCGCCACCCCTTGGGGCAAAACGCACATGGTCGGCATCTTTAAATATTGTGATTCAGGGAGTTAATACGAAAAA:1 - chrX 16449519 5' + Dm88 280 1 60.64 AATAAAATCAAATCGAAATCAAAGCGCCAGACAATTTCATAACAAAAATTGAGAAGAGACAAAGAGGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGTAGAAGCAA:1 - chr3R 24573123 5' + micropia 329 2 58.18 GATAAGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:2 - chr2L 8476759 5' - Juan 4171 1 60.91 GTTAATTAAAGTGTTCACTACGTCCTCCGTTCATTGATTGGACAAAAGTGACGGAGCGAAAGGGGGAGGACCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACAGAT:1 + chr2L 8202766 5' + R1A1-element 4929 1 67.68 GAGAGAGCAAGTTGCAAGGATATGGAGCGCCCGAAAGTAGGCAACAAATTGTAGCTGCTTGTGCGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAATAATG:1 + chr3L 10702599 5' - hopper 1398 1 63.64 AAGTATCTGACGGATACACAGACACACATATAAATACGTGCGCCAGCTTACAAATAAAGACTGTTCGAAGCATCGTTCTACGGTT:1 + chr3L 19170008 5' - Cr1a 4016 1 58.82 CAAAACGAAGAACAGCAATTTTGCCGAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTC:1 - chr2R 7779858 5' + Tirant 290 2 77.14 TTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chrX 9432846 5' + roo 57 2 77.27 CACGAATTGCTCTCATATGTGTACATGCACACACATCCACACACACACACACATATGCA:1 + chr2L 10231048 5' + accord 7032 2 88.14 AAAAGCACAGATCAGGACATACAAAGGTAGGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGGGGAGTCCGAATGGATTCCACAGG:1 + chr2R 22424246 5' + Circe 7179 1 66.23 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATCGGGAACAATCACA:1 + chr3L 22908067 5' + Tabor 6879 2 60.00 TTGGAAAGTGATAAATGGTTTGGCCTGGTCAGCTGGCCACATAATTGTTGTTGTCCTGTTTGTTGCTTTTTGATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTAT:1 + chr2L 7566156 5' - Stalker 64 4 62.39 CCCGAAGTGCATTGGTCATCACGTGTGGCCATGTGTCTGCATTTGAGTGCACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 5910678 5' + roo 4 2 69.14 ATCAGTGTTAAAATTTAACGACCTATCGTGGCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAGATT:1 - chr3R 14545685 5' + R2-element 3325 1 65.48 CTCCTTGATCATCCCCACTTAGCGTTTCTCTCGCCTTTTTTTTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTTGTCGGAAAAAATACTTCACTT:1 + chrX 20588015 5' - gypsy4 460 1 65.42 AAAAAAAGTCGAGCCAAATATTGTCCATATGTATATGTATTTGTATTCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTT:1 + chr3L 2625210 5' - Doc 4475 1 54.37 GGCTTGGACTAAGGTGATAGCCCGCTTGACACTATAGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATCTCCATAATGATTGGTGTAGTATGTGCCTATGGTATATTAAGAACAA:1 + chr2L 16742214 5' + 412 11 2 66.97 AACAGCTTTGGGCTTCTCTTTGTATTTTTTGTAATTTATGTTTCTTGCTTTTTTTTAACTTTGCTTTTTTATTTTTAACTTTGCTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr2R 20053665 5' - TAHRE 10426 2 48.18 GTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAATCGTTTCCGATTTTTTAAAGTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAC:2 + chr3L 19471447 5' + Quasimodo 29 2 54.55 ATATTCCTTTCTTTTTTCTTTTTAAATGTCTATTACCCGTGGTTTTAACTATTGAAATATTTTCAAGAGTACCAAAGCACCATTCGGTTTTTACTTGGACCTTA:1 + chr3L 18301478 5' - Fw3 100 1 57.69 AAAATAAGATGGGTAAACTTACCCTTAAAATCTTTGCCACTCTTCATTTTCCCTCCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 - chr3R 6088629 5' - transib2 2797 1 53.64 AAAGTGAGTTGTTACATAGATGGGTTCAGATTGGATTTGCTGTATTTTGATTTATCGTTGCAATCTCTTGGGTGCTAAAAATAACACTCACCAGTACATTCGGGCGCTGC:1 - chr2R 13811068 5' + BS 97 1 61.82 TGTATTTTCACTGAGGGTTTTTTATTGTAACACACATCGAAGTTTTGATTATATAGTATAGTTATTTATTTTGCAACTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 3290072 5' + roo 2 2 74.55 GGTTATCACTTTCGGTTTCTGAGATGTGACTCCTAGTTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCCACTCTGGTATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 6994997 5' - Porto1 4476 1 62.73 AGGACCATTTTCATATTTGGTACATTTAAATATGTTGCATTTCTAGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCT:1 - chr3L 1033290 5' - flea 4771 2 59.09 CCTAATACCTTGGGTAAAAGGGTCGTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2L 20398521 5' - roo 9013 2 81.82 GTCATATGTGCGGTGTAGCAATGCGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTT:1 - chr2R 9138748 5' - pogo 2063 1 71.91 TGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 + chr2R 24031491 5' - 1360 3334 1 80.20 CGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 + chr3R 11553680 5' - hopper2 1546 1 75.45 CCAAAGATGCACTAAAGGCCGAAATGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCGCGTC:1 - chrX 11757093 5' + accord 116 2 67.86 CCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 - chr2R 892413 5' + Stalker2 7301 2 75.25 TAATAATAATAATCGTAATTATAAGGAAGAAGTTAATACAAATCTAAAACTCCAATAAAAACTTTAATTAAATTGATGTTAGTAACGCCTTGTGCCCAAATTTGCC:1 - chr3R 25465385 5' + transib3 495 1 57.55 ACGATTTGTAATTGTAGTTTTATTTTTTATATATGGCCAAAATGAGAATTGTTGATTTTTGATAGGATGGATATTCGTATCTATTATTAAAAAAAGAAAAAAAA:1 + chr2L 12706681 5' - hopper 155 1 57.69 AAGTCGCACCACAAACAAATTATCGGAATCTAAATATAAAGTCATAAAAATAGTTATTAGCCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 885819 5' + roo 17 2 64.08 TGTTTCAAAATATATTCTAAGACACTTTCTTAGTACATTTTCATTATCCTCTTCATTTCCTTTCATTAATTTTCATTCAAATATTTCACCAAACAGCACTGCGAACAACG:1 - chr2R 19376003 5' - Cr1a 234 1 70.00 ACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chr3R 7588876 5' + F-element 54 1 73.53 AAATAATAAAAAGTTAACAAAATGAAACAAGCGAACCTATACTTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGA:1 - chr3L 17719068 5' - 297 358 2 64.22 CATTCCTGGATTTCCGGATTTCTGGATGCGGAATGGTGGGCACGAGGTAGGGCGGGCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTTGTTGG:1 + chrX 20325606 5' - F-element 420 1 52.87 TACACCACCGATTGCGACTGGGAGAAGTGCTACATGGCCCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACAAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAG:1 + chr2R 7569458 5' + flea 4960 2 56.84 ACGGATGATCGATCGAATTAGTCGTTATATCGAATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chr2R 10129805 5' - Burdock 220 2 67.02 ATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCCCTGTTACCCATGCGG:1 + chr3R 21993215 5' - jockey 4965 1 53.12 AAAGTTTTTGCCTCTTGATGTCAAGCAAAGACATTTCTTCCCGCGACGTCATCTTCCTTTTGTTGAATGTGAATGCTTTTAACTC:1 + chr3L 21876774 5' + transib1 1739 1 22.35 GTTGGGACCGCTATACGAAACGCAAAAACAAAAATATAGAGAAAAGCGAGAAGAAAAGAGACGAGAACTCTGGTGATAAGGGGTATATAGTTTATAGTGAATCTACTTG:1 + chr3L 16161180 5' - Cr1a 4113 1 66.06 AAAACCACCTGCCGGTCGGTAGGGGCACAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chr2L 23189411 5' + 1360 37 1 87.95 GTTGTTAGCCGATGTCTGCCAAAAAAAAAAATCGGTACAGCAAAACAGTTGAACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACACACGGAG:1 + chr3R 14880208 5' + Bica 444 1 57.45 ACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAACCACAAACACAAACACACACACAAACACACACACAAACA:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 417 2 44.55 AATAGAATTTCAATTTTAGAAACGTGTTTTGGGCCTCCATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGCATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGA:1 + chr3R 6937621 5' + F-element 180 1 65.38 CACAACCGAAAACACAACCAAATGGAATAAACTGGAGTTGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTA:1 - chr3L 9306890 5' + Ivk 4996 1 65.45 CTTCGAGTGTGTGCGTGTTAGTGTAGCTGTGTTTGTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACT:1 + chrX 7249114 5' + 1360 228 1 68.18 ACAAAAACATGATAATCCAAATGAGGTATAAAATATAATTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAG:1 - chr3R 26208938 5' + P-element 2745 1 44.55 ACTCACACTTCTTCGACTGCTTGTCGCTCTCATACCAACACATCAAGAAAGAGCGCGCTC:1 + chr3R 25381385 5' + F-element 355 1 66.67 TGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3L 131816 5' - P-element 2867 1 59.14 GAAATGCTAATAAATTTTAATTGAATTTTTAAAA:1 - chr2R 7146348 5' - 1360 3043 1 88.24 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 2 51.72 ATCAATAGAAAAAATTACTTTCTTGAACTGTAGAACTCAACATTAATTGGGTTTTATTCTTGAAAACGTTTGATACATTTGTTTTCAGTGTAAAGTGTAGTTTGAACA:1 - chr3L 11556020 5' + Doc 102 1 74.07 GTAATATAATGCAATGCATTTTTAGTCTTGAAATAATGCTATAGTCGAACACCCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTA:1 - chr2R 10426586 5' - INE-1 541 1 81.18 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 16217660 5' + 412 29 2 50.00 GAACAAGCAGCGAGGAGCTGCTGCCATCCTGCAACAGGATGTGTATTGTTACGGTAGAGCGACGCATCCTAAATTTTTTTCCATTTTTCCCTATTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 25566637 5' + hopper 139 1 71.82 ATGCAGGACCGTTGGTCTGGGTAACTCTAGGCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGTGTAGTATGTGGCTATGGAATATTAAGAACA:1 - chr2L 6243764 5' + 412 10 2 71.82 CATCTGCCCCCAAGCCCCAACTTTTCCCCTCTTTCTTTCCCAGATTCGGTGATTTTTCCTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 15251530 5' - Doc2-element 229 1 72.60 ATCCCATACTACCGCAGCTCACACGCACCCCAACCACATCGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGC:1 + chr2R 14872951 5' + F-element 4505 1 73.49 CATTTTCATTATGTTTTATCTATAGGAGCTGTATTTGCTATTATAGCAGGTTTTATTCACTGATACCCTTTATTTACAGTTTAAAACTTTTAACAGTTATTTCTTTTTTA:1 - chr2L 21794096 5' + accord2 346 1 52.73 TTCATTAAATTTCATGAATCGCCCGCAGCGCTTTGCCATATCCTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 - chrX 22769417 5' - 412 7523 2 52.63 GAAAAATATAAGAAAAGCACACGAACACACATACAGAACTGCGTTTTTGACGCACGCACACGCACGCACTTCGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATAAGGATCTTCCCAATAT:1 - chrX 246062 5' + 1731 4582 2 71.82 AGTTCACTCCGCAGATACGTGCAGCCCAAAAGTATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr3L 2244209 5' + jockey 60 1 68.18 GAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCCCTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chrX 20330598 5' - P-element 2870 1 52.38 TCTCCAAATTTAGCTATACATCCAGTACAAAAGACCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 - chr2R 14884071 5' + mdg3 5272 2 63.64 GTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATT:1 - chr2L 2484396 5' - jockey 4932 1 75.45 CCATCAAAAAGAGAAAGCCTGAAAAGCGAAAGAGCAGCGGACGAACGGATGAACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGG:1 - chr2L 3976710 5' - Doc 393 1 75.00 GCGACTAGCAAAGGAGGAAGGGCGATGTCCAAGCCCCAGCACCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAA:1 + chr2L 16254027 5' + FB 19 1 54.65 AGAAGAGAAGAACAAGAACAGGAAGCGGCTGGGCGTGCGCTGTGGCACCAATGTGTGGCCAAAGAGCAAAAAGAGGTGAAAAAGAACAAAAAAAAAAACAA:1 - chr2R 23759369 5' + gypsy7 5009 2 30.69 GAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGTATGATATCTGCATTATTTTTCAATTTTTT:1 - chr3R 11526830 5' + pogo 51 1 76.04 GTTTTCCAATTCTGAATTTGCTAACACTTAAAATGGTTTTCGTCAGTGTTCTTTAGGCTATCTTGGCGCTCGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCT:1 - chr2R 4388742 5' - McClintock 6091 2 63.64 ACGAGTCACGGGTCGGCTCTAAAAATGGTTTTAGTCGACTAGAAAACATAGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTACACAACA:1 + chr2L 11231822 5' + copia 4893 2 55.00 GAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 + chr3L 4264965 5' + Transpac 39 2 57.41 GTCGAGCGGGAGGCTGACTCCTCCGGTTTGGTTGGCTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGGAGCA:1 - chr2L 7517519 5' + invader3 5213 2 56.72 TGACCTACTGCGAGTAAATGAGAGCACAGAGATAAGGCAGTGGAAATCACCGCTCTTCCACCTCACCCCGTATTTGTGTCCCACTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr2R 13934525 5' + FB 1 1 78.18 CCGGTTGTGTACGCGCTTTCTAGATTACTTTTATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGCACGCGGATGGAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTGCATT:1 - chr3L 17706421 5' + Juan 54 1 65.09 CATTGTATCTTTGTACTATATATATAGTTTGTATAAAATTTCCAAGGGACTGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTT:1 - chr3R 17616323 5' - micropia 5257 2 54.55 ACCGCTGACGGGCCGTTGATCTCTTTGCATTGGAGCCATTGGCCTCGGGTATACTGGTCGGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 + chr3R 6132037 5' + I-element 26 1 57.27 ACATATTTCTGGCATCATTCTAGTTATTTGTTTTTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATCAACAC:1 - chr3R 26734052 5' - hobo 2911 1 53.49 CGAAGCGGGAGAGGATTCGGTCGCCAATGCGTTAAGGTCACACTGGCACACGGGCGAGGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGCTGTTTAGT:1 + chrX 15710600 5' - Idefix 188 1 55.45 TGACCGTCAAACTTTATTACAGGAACGCCCCAAAATTATGCTGCATATTTTTAAAGCAATAGCCGCGCTTTTCAACCAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chrX 17456011 5' - jockey 4988 1 72.73 CCCCGTCTCGAGATCAAGTTCAGCTCGAGACCCCATGCTACGTGGGTCCCAAAAACCAGGAAACAAATATAACAAAAACG:1 + chr3L 17392789 5' + G4 95 1 66.25 AATGTAGAATCGAGTTTGATATAAATTTGGTTCTTATCAAGATATTGTTAAGAATTGTCTTTAATACTTTATTTGTACATGCACAAAAGAACTAAAATATTAAAAAGAAA:1 - chr2L 16519132 5' + HB 1355 1 70.00 GAAAATTGATTAGAATGCTGTTGCTCACTTCTTAAGCGCGCCGAAAAGCTGGCAGTACCAAACTGGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGAACTCGT:1 + chrX 3696142 5' + micropia 5336 2 65.45 AGTGCGCTTTCATTTAATCAATATCGTATGGAGCGTAGGGCTGGGAAATGCATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACA:1 + chr2R 18507827 5' + Bari1 32 1 53.64 GCAAGAAACCATATTAACCATCCGACCAGTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr3R 6132097 5' - I-element 5310 1 69.61 TAAGCATGCTTAGCATTAAGCACATTAAGTATATAAACCAAAGATAATAACCAAATCTAAGTGAGCACATCCTTGCTACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATA:1 - chr2R 13310909 5' + rover 7098 2 81.82 AATATTTATGGGCAGAGACACCTTTCACACAGTGATTAAGTGATCCTAATTTTTGGGCGTCGCATAACTAGTTTGTTTTTTGGAGCATTTTTTGACATTCTAGTG:1 + chr2R 21674073 5' + copia 350 1 79.05 AAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr2L 2484415 5' - jockey 4951 1 58.18 TGGTTCTCGTCTCTATATCCAATATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 5638537 5' + jockey 35 1 69.74 AACTGACACTTGTTCCTACTCGATGGAGGTTTCTTAAGGTTTTACCAAAAGGTCACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGT:1 + chr3L 19948840 5' - 3S18 313 2 53.33 CAAAAACTTAGTCTATAAACCGCGAATGTTTAGCACTATTCCTGACTATTCCAACGCATGATGGCGACTGAACCGTGTC:1 - chr2L 9793762 5' - mariner2 114 1 50.63 ACTTCTTTATCGCTGAGCATAGTTTTTTTTTTTCTTAAATTTTTTTGTTTTTTATTTGGTCTTTCCTTTTTTTGGGACTTACAATAATTTTTTAAATCTTAT:1 - chr2R 2514361 5' - Doc3-element 4666 2 33.33 ACAATATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1 - chr2L 16067140 5' + HMS-Beagle2 44 2 63.64 ATTTAATACCACTTCACCTTTATTTTTTTGTTTCCCTCTTCTCGGCTTTTCTCCCTTTTTTTTTGTCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTTGT:1 + chr2R 18345028 5' + S-element 320 1 60.38 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAAACACACACACAAACACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 421 2 42.73 AAAGCATAAATGAAAATCAATAAATACAAAATTTATGGTTCGTAAGAGGGGGGCAAAAAAAAAAATAAAAAATATATATTTTAGTGGGTAGAGGACAGCACTACTCCCA:1 - chrX 3298886 5' + HB 355 1 67.89 ATTTCCTATCTATTATATGCTGACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 24260905 5' - roo 9011 2 80.19 AAGTGCTTATTTGGCTACATTTCTATACTCTGTAACTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGTAACGTTTGCCCATTTTT:1 + chr2L 19129338 5' + FB 50 1 67.27 ATGAAGGCTGCTTTAGATCTCAGCCCGTGGAGTTGGGTTTACTGGCTTTTTCATATGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 24289769 5' + FB 175 2 67.65 ATTTGATTTTAATGTATAGCATTAAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAA:1 - chr2L 5304900 5' - flea 202 2 75.23 TGATATGGGGTAGTTTAATATTCAAAAAAGAATTTTGATTGAACTAAATAGATTTTGATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr2L 14848350 5' + pogo 1 1 76.36 GAGGACAAATGTTTAAAAATTTATAACAATAAATAACAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGAAGTTTAATCCTAAATTT:1 - chr3R 31411248 5' - S-element 1472 1 70.00 AAACATCATGTTTTTGACCAATACAGTGATTCCCAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chrY 1989134 5' + 1360 37 1 67.78 ATTAGGGCAATTAGTTTGAAGTACCTGCCCCAACCACCGACATGGTCCCCTCCACTTAATTGCGACGAACTTAGGGAAATATTTTGTATGTTAGTTTCAGTTTCAAATAA:1 - chr3L 4299956 5' + 1731 4471 2 52.73 TGCTTCATCTTGTCTGAATAACATTTGGGGCAGGACCTAAGTAGGAACAGAAGCATTTACCTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACT:1 + chr2R 15405632 5' + mdg3 5370 2 59.09 TAAAGCTTGCCGCCGCGTTTGAGTCGGTGTTCCTTCTCCACACACATGTCTGTACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 - chr2L 15963527 5' - 297 382 2 64.89 TCACATTGTATTTTCTTTGGCAGCAGTTGGTTAGAAATTAGTCGACCTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTAAAGTTTATGT:1 + chr3R 18576910 5' - copia 5085 2 55.45 TGACCATATTTCATATGAAATTTGCTTGCTTTTTTTTGGGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTACACAACACTACTTT:1 + chr3R 30298308 5' + copia 31 2 58.51 CGTCCGCCACAAAGGCACAAATATTAAAACAAATAGAGGCAAACGTAAAATACAATGAAAAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGGGTATGCAGCC:1 + chr3R 27782459 5' + Doc3-element 4546 1 60.00 CATATTGTAAAAAATACGACTCTTACGTGTGTTTCAATTATATTTTGTATACCCTTCTTCCTCTTCAC:1 - chr2R 8500794 5' - invader1 3995 2 66.18 TAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAAT:1 - chr3R 28959225 5' - HeT-A 6043 1 75.00 TTAAGCGAAGTGTTTCCAATATCTCGAAAGGATCGTATATATGGTTCGGATGGTGGCTGAGCTGAATTAGTCCTCGCGCTAGGGGGTTGG:1 - chr2R 15500848 5' - F-element 4473 1 66.67 TGATTTTATCGAATCAGTAATGTGTTTTGGCCCTTTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGCATTGGGA:1 + chrX 4389152 5' + opus 7222 2 53.85 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGATGAAGGCAGCC:1 - chr3R 21907536 5' - 412 461 2 74.67 ATCGAGTGGTTGTAAGTGGTCGAGTTGTGGTGGAAGGCCGAGTTGTGGGGTTGCTTACTGTTGGAAACGGGATTGTTGCTCTTGTTGGTGTTTTTTTTTTTCCTTTTT:1 + chr3L 7728492 5' - gypsy7 5010 2 73.15 CCACAAAGCCAAAAAATCAGCGGAAGATCAGCAAACAAACCGCAAGGCCCCACTGGCGAAGAGAACGGATCTTTAATA:1 + chr3L 6369561 5' - Cr1a 117 1 70.51 AACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAAAAATAAACAA:1 + chr2R 21358403 5' + Porto1 163 1 31.82 TATTTCATAAAAATAAATTTATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1 - chr3L 15002652 5' + Max-element 8253 2 69.84 GGTTTGCAATGTAATGTTTTTATGTCTGATTTCGTTTTCCTAGATTGTGGTGGTGCACGTTTGCTTGTTGAGGGGAAAGGTTGTGGGCGGAGGAATTTTTTTTTGAAA:1 - chr2R 7171814 5' + P-element 102 1 55.56 GGGAAAAGTGTTGGCGCGTGTATCGAAGTGAACGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTGTGCGTTTGG:1 + chr2R 14036098 5' - F-element 297 1 64.13 CCAACCGCCAACAGTTTGCTTCATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTA:1 + chr3R 11469341 5' + I-element 4934 1 75.56 GTTTTACTGATAAGTTCATCATCAAGTGGGGAATCACTTAAGCACATATAAAATTGATGTTAAAACTGACATTACCAGAGTTTCTTAATTCTAAAATTAAATAA:1 + chr2R 14638452 5' + G4 217 1 51.92 GCACTCGCGGTTGGAGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2R 6707718 5' + 1360 17 1 75.00 TGTTAAAGTGTTAATAAAACCAAAAGGGATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 - chr2R 10241512 5' - I-element 5327 1 57.27 ATTGCACACTCCCCTCGCAGCTGCACTTACTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCT:1 - chr2L 2300960 5' - Doc 4420 1 68.82 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3R 21907535 5' + 412 38 2 59.80 CCGTCGACATCCGGCGGGGCCTCAGTCCACGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCC:1 + chr3R 14928215 5' + I-element 4883 1 72.09 AAGATAATGCACAGACATCTGTTGCTTATCGAAAAAAATATAAATATAAAAATAAGTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr2L 18957582 5' - 1360 3362 1 53.64 TGACACTTGACAGACTTTTTGAGCCCACTGTGTCTAAAAACAAAGTTAACAGAGCACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTATCTA:1 + chr3L 11280391 5' + Doc2-element 4452 1 53.64 ACCAGCTCCTACATTTAATTAACAAGAGAACTATTGTATTTATCTAACACCTGGATTATCTCCACCTTTCATTTGATCCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATA:1 - chrX 15607874 5' - micropia 69 2 62.39 CGGCTTTCAACTTTTCGACCATACACGGTAGAAGAGACGCTTATGCGAACAGAGGACATGCACACCCGCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGA:1 + chr2L 2721388 5' + springer 53 2 79.00 TCGAAAGTAATTGCTGCAATTTTGGAAAAGCGACAGATCGCGTACTACAGATCCGTTGCAGATACAGCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTC:1 + chr2R 19988061 5' - invader2 474 1 74.75 TGATAGCTGACGAGGATCGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTT:1 + chr2R 16722750 5' - I-element 5083 1 67.44 TTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATAC:1 - chr3L 20525228 5' - Ivk 5365 1 54.55 TTAATAGTTTAATGAGTTGTAGAATGGTTATGCTTAAATACAAAATCTATTACGGAATGTTAATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr2L 11762161 5' - mdg1 7438 2 61.47 GGAAGTAGTTGAGTGCACACAATCAGCGCTTCAACAAAAAAAAAATAGCTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAATGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAA:1 - chrX 9642424 5' + S-element 36 2 61.11 GGGAAAGTTAAGCCAAAGAGTGTGGAAATGGAATCTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2L 17545838 5' - opus 7460 2 67.29 AACACTACTCCCCACCGTCCCCTAAAACACACCCACTCCCCACCATTTGGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCTAATGTAGCCGCC:1 - chr3L 2823371 5' + G-element 477 1 64.29 CATATCAGAGCGAAGAAAGCAAACGAGAAACTTAAACAAATAACCACCAGCAGAGTATAACGAACTAAGAACACCAACAAAATTAAACTATTAAATTATTAATGTATTAG:1 - chr3L 16372288 5' + Porto1 4558 1 71.82 ACTGGCCAGCAGCGTTTCGATTTGGTGAACCCTAAGAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr2R 21361987 5' - Tirant 374 2 57.95 CGCCATATACGCTATCTCTTTACAATCTTAGTTCGCTCGAAAATATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1 - chr3R 25051661 5' + 17.6 6958 1 60.95 AACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 + chr3R 27071880 5' + jockey 4696 1 70.89 GAAGAGAACGAAAATAACACGACCTCCTTCTAGCTTCCCAGCCCCCTCTCACCCGCCACGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAAT:1 - chr3R 20377663 5' + FB 902 3 57.27 TTTCTCAAACTTACACCTAATGATTAAGCAACTTAGTTATATTTGTATAAATTATGGAGTATAGAAAAATAACGATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 - chr3R 25163220 5' - mdg1 7449 2 70.64 GGCGTACAAGGATGCCCCGTCCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGA:1 - chr2L 14141323 5' + hopper 40 1 78.16 AAACTCTTAGTAGCCTATCGTATCTCTCGAATCCTTTGCCTAAACTACACTTGCCACACACAGAGTAGTGCTTTGTAGTAAAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGACTC:1 + chr2L 5593351 5' - Doc3-element 112 1 56.88 AGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGA:1 + chr3L 19220635 5' + Stalker3T 202 1 13.89 CAATGGATTTGTGATCTTCGGCGGGTATCTCATTGGGCTGGTTTTGTGTATGTGTGGGTGGGGAAATTCAACCTTCTAGCTTTTATATTT:1 + chr2R 18103770 5' - INE-1 159 1 62.22 TTTTTATTTCTGTGCGAACGAGGAAATGGAATAATCAAAAGATAATGACACAAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCG:1 + chr2R 6845601 5' - 3S18 5883 2 60.38 TGTCGCCATGAATCAGGTGGCTTTTTTGTTATTTGATTCACATTAGCAT:1 + chr3R 22510286 5' - 17.6 7009 2 55.10 TTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGTTTAT:1 - chr2R 21358403 5' - Porto1 163 1 36.84 ATGGCCTCCCTTGACTTTGACATGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTG:1 + chr2R 18566469 5' - 1360 3181 1 73.86 GAAAGGCTGGAACCAAAATGTGATATCATGGGAAATAAATACAATTAAATAAAACGTTATTGAAATATAATGACGTGCAACTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAA:1 + chr2R 3962375 5' - accord2 7260 2 61.90 CTTCGGAGTTCTCTATCCGTCCTATACATATACATATATATATATATATATTTAAAGAACTCTCTTATTGCGCTCTTCGTCAGCACTCACCAG:1 - chr2R 20436784 5' + opus 7025 2 60.22 ATCAATAACTAACATGACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chr3R 7588860 5' + F-element 37 1 57.43 ATTCGTCGCGCGGACTCATTAAAAGTTCATGAAATCGAATTCGACCCGTGGTGTTCGACGCGATTTCTCTTCGACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2R 21362083 5' + Tirant 10 2 73.39 GTCCACCTCAAATTATGCCAAGAGATGCTCGAGTGGGCACAGCCGCCAATAACCACGCACAACATATACACCCCAATACAACATA:1 - chr2L 8845032 5' + Idefix 62 2 72.94 TACACACCAAGAGCTCAGAGAGGGAGCGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGTCTCGGAGTAGGGAAGGAGGG:1 + chr3R 21808087 5' - G-element 297 1 61.97 AAATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATAGTTT:1 - chr3R 7500902 5' + FB 40 1 72.09 TTATGCTCTTCACGCGCCGGCGACTCCTCAAAAGGTGTGTTTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAG:1 + chr2R 19138228 5' + flea 422 1 59.00 GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr3R 21907534 5' + blood 7036 2 67.12 CTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAGTTAAAAAAGTTAAAAATAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATTA:1 - chr4 1294990 5' + X-element 4716 1 58.72 AAAAACATTTATTGCAATTGTCCTTTTTTTTTTATTGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr3L 15614467 5' - jockey 4966 1 69.57 TAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAAT:1 + chr4 1294995 5' - TAHRE 10412 1 78.67 AAAGGTACTTTTGAAAATTCCGTTACAAAAATGCTCAAAAATAGTGCATAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATTTATTTATTGTCC:1 + chrX 14827553 5' + G2 3020 1 73.64 TCCCTGCCGAAAAACAATATTAGAGGCATCCAGGGACCACGTGCTGTTTGTTTAGGTGTTTTAATCTTCTTCTCGTACTTGTCCGATGGCTTTGGGCTGCGAT:1 - chr3R 29401912 5' - jockey2 3135 1 60.19 TAGTTTTCTGTGTACGTTTCGGGTCCCCGAAAATGCCAAAACGAATTTAGCTTAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATATTTCCTG:1 - chr2L 21027724 5' - INE-1 155 1 63.10 AGGACAAAAAAAAGAAGGGAGAGCTGATAAACTCTGACTGCGCTGTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr3R 5671393 5' + 1360 36 1 59.05 CGATACCCTGCAATCGTTGGAGACCATAACGTACTTAGACTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTG:1 - chr2L 5595551 5' - Max-element 8517 2 51.22 AAAAAAAACACTACAAATTTATATAGTTTTATTACATTTGACGGTTTTAGATTTCGATTTTATAATATCAGTTGTATGCTAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTG:1 + chr2R 11158541 5' - 297 44 2 77.27 GAGGTTGTATTATATTATTATATAGAAGATGGAAACCGTTTGCTGCTACCCATTGTTGTTCATACAATTTGCATCTTGATTGTGCTTTTTTTCTTTTTTCTAATTTTTAT:1 + chrX 3395842 5' - Doc 4695 1 50.91 TCTTGCTTTCGTTTGTTTTGTGATTTGTTAACAACTATTTTATTTACACTTAACTTAGGTTCCATTAGATTTGATTTGTTGTTTGTTTTTTTTTTGTTTCATTTTCTTTT:1 - chrX 8431480 5' - Doc2-element 218 1 50.91 TGAATGCCTTATACATATTTATGTATGTATATTTACAAAACATGCCCTCTTTGGTTTATTTTGTACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTT:1 + chr3L 707728 5' - invader2 146 2 59.09 TACAACCTCAAAAACACATAAATATTGTAAACATTAGAAATAGCGAGATTAAAAAAATACCAAACAAAAATCACGATCAAAGCAAAACCAAAAACGCACATGCGCAGATA:1 - chr3R 11247725 5' - pogo 261 1 66.36 GTAGATAAAGGCGAAGCAAAGATATGGATAAATGAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGA:1 + chr2L 4032090 5' + Stalker3T 205 1 67.29 TTTGCACATTATCATTGTCTGAATCAGCCATTAGACCTCGCGCTCGGTGGTTGGGGTGCGTGTGTAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTC:1 - chr2L 71709 5' - F-element 4433 1 65.96 TAAATTAATATATAATATGTATATGTTATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTT:1 - chr4 1218547 5' - Tc1 1589 1 76.36 TCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTCTGTCTATGTCTATGTTTATGTGTAT:1 - chr3R 22081601 5' + 412 74 2 23.60 CAAGACCACCAATGGCGACTCGGCCCAAAGAAACGAAGGTGTGACTAATGCGAGTGCTGTGTGAATAGCTTTTATAGTTCCCGAAATC:1 - chrX 4476909 5' - INE-1 150 1 82.95 GCAAATGTCATTCTTCGAACCTAAGGCGTTGCAGTTCTAAAAGTTTTTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 - chr2R 10015714 5' - Juan 4174 1 61.82 CTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTATGGTTAACCGTAATGTAAGTGGCTCACATATCGAATTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTT:1 - chr2R 9440231 5' + 1360 280 1 57.27 GACGATTGTAATTGAGGCATTTGAAAGTGGCAACAAATTGCCCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAATCGTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAGATCT:1 - chrX 1207800 5' - INE-1 149 1 65.45 TGAATTGCCTTGCCTTTGGCTGCCAGTTTCCACACACACAGCACACACTCACACAACCGCACTACCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAG:1 - chr3R 14478426 5' + 1360 53 1 77.17 TGATATCAAGCAATTCTTTCATATCTCTGCAAAATAAAGACCTTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGC:1 - chr3L 15525684 5' + Ivk 42 1 57.27 AGGAACGAGAAGAAAAACTAAAGAAAGATAAGATAAGATAAGACAAGAGAAGAAGATAAGATAAGAAGGATAAGATAAGATAAGTTAAGACAAGATAAGATAAGATAAGA:1 + chrX 11831291 5' + Stalker3T 205 1 68.18 TTTACAATATTGTTAAATAAGACGCACACGTATAAGACGCACGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAA:1 - chr3L 18463501 5' + gypsy5 15 2 54.43 AATAATGGAGTCGCCGCGACTTTCAGTTAAAAAAAAAATACAGAAAAAAAAAACAACTTTTGGTT:1 - chrX 17953733 5' + HMS-Beagle2 496 1 55.38 CAAAGCATTTATTTGTAAGGCCTAACTAAGAACAAAACCAGCGGCATTCGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAATAAAAATTTCCTGATTACATAAAAAATAATATTAATT:1 + chr2R 9715970 5' + Burdock 405 1 70.00 CGACCAGGAACTTGGTGGTCTACACCAAATTTTTCTCATAGAGTTTGCTTTCCGTAAGTGGTTTGGCACATATTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGTA:1 + chr3L 22432625 5' - Bari1 356 1 76.36 ACACCACCCCACTTTCCATTCACCCTCAAGACCTGTCTAACCGGAACTTTACATAAATCATACTTAAT:1 - chr2L 12206195 5' + jockey2 3212 1 64.71 CAACGTTATACGCCTTTTGATTTGAAAATGGATTGATTTGTGTAACAACGCGATAATAGTTCATTAACAAAGTTAAAAACAAAAACAAAATAATAAAAAAATAAAACAA:1 + chr2R 8052282 5' + Rt1b 5148 2 81.65 GTTTCCGTTGAACCGTCTCCAAAATGGTCGACGCTTGATTGGTTCAGTTTTTGTTTGATCGCGTGATTGTAAAGAGTTAAATTTTTTT:1 + chr3R 6726769 5' + Tc3 372 1 59.09 TAACCCCAAAGTGGGTACGAACCTTAGAAACGAAATCGAATCTCAACCTTTCGAACCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chr3R 11474884 5' - hopper 1387 1 55.45 TTATTTGTTTAGACTTCCTTTCTGCGTTCCTCGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGCAGTATGTGCATATGCAATATTAAG:1 + chr2L 1291019 5' + 412 6 2 70.00 ATCAAAGCCAAGCTGTACAGTTCCTGGACTAGGCCATTTATCAGGCGATGATTAACGTATTTTTATTTTGTTTGTTAAACCAGCCGTGGTTTTAATAATCTTCTTTAATT:1 - chr3R 24412334 5' + Cr1a 74 1 61.82 AATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTGTTTCACAAGT:1 - chr3R 13437240 5' - hopper 1384 1 52.73 TCTCGAAAAACCAAGGAATATCTAAAGTTGTGAAGTACCTAATTTAAATAAATCCGTGTACAAAATAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGATATTGTTGTGTGCG:1 - chrX 16087312 5' + flea 328 1 69.16 ATGGTGCAGCCTTTTAAAACTAAGCTCTATAAATTGGCAAGAATCACAATTTCTAATAACATTGTTTTTAAATACCTATTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr2L 769955 5' - roo 399 1 71.82 CATTCAAAGCTGGACAAACAACAACCAGTCGTCATCCCCACTCAGCAGCAGCAATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGC:1 - chr3R 26244191 5' + G6 2013 1 59.14 TAATAAATGCATTGTTTGTGTTTGTCTATTGGCATATGAACAAATTTAGCTGTGCATACACACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCA:1 - chrX 18750740 5' + BS 4820 1 57.01 CATCAAATTTACACCTAACAAACTTCATAACAAAGTCATAAAACCCACACACATCGACTGCGCCAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTTAGTCTATTAAAT:1 - chrX 960997 5' - 17.6 467 2 53.64 CGATGTCGCTTAATTGAATATCGCCCAACAAACAAAGGGCCAACAGAGCGGCGAGCAAAACAACAAAAAAAACAAAAAAAAAATG:1 + chr2R 14022698 5' - hopper 142 2 69.41 CTGCGGTCACACTAAATGTTCGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGAGTCAATCGCTGACGCTCACCCATACCATGAAAACTCCGTTATCCACAAGGA:1 - chr3R 9237682 5' + G-element 4022 1 77.89 ATATTGAATCTAAAGACTCAAGCAAAAAAGTGAAATAAAATCAATTGGCATTCTGACATTTTTTTTAAAGAAAGTAGATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGA:1 + chrX 15169931 5' - I-element 5349 1 72.48 GTTCATCGTAAATAAGAAAGGCATACAAAATGCTTTTCCTTTGGAATTTTAGGGATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATACTAATAATAATA:1 - chr2R 20924293 5' + mdg1 7069 2 52.73 CACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1 + chr3R 28831801 5' + Tabor 6867 2 45.87 ATGTCTGGCAGCCGTGAGGACTGGTATATAATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTGGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chr3R 31633200 5' + opus 7045 4 70.41 GTCAAAAATAAGTGAATTACGAAATGGTCTTTAATTATACTGTAATAAACCAATATATGCCACTAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 16529269 5' - blood 7347 2 64.42 GGAAATTTGCGAAAGCCAATTTTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTACATTTTTTTGTGT:1 + chr3L 13160670 5' + pogo 56 1 81.13 GGAAAATCCCCCCACCCTGCAGCAGGAAAAACAGAGCAAAAGGCCGCACAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAG:1 - chr3R 31701117 5' + flea 4624 1 67.47 AAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 + chr3R 17673750 5' + FB 30 1 54.55 CTCTACACCACCCTCCCCGCCAAACCTTTACACCCCTTGCGAAATGTGCCACTGCAACGAGAGGAAGATTAGTTCATTATGGACCCCAT:1 + chr3R 20977875 5' - Circe 7103 1 73.03 TCCAAGCGAGCATGGTTATATGGGAACTTGAGCTCGAATGCTCGCCAAATTCATCTGCGCGTACACCAACAACA:1 - chr2R 6501413 5' + Porto1 426 1 52.70 CGATTTGTGGGTTTACCCTTATATGTTTACATATATTGGAGAACGAGCCGCGGGACGTCGAAAAGAAACGAAGACAAGAACAGCTCGATACGAATTTTAT:1 - chr3R 21416408 5' - invader6 71 2 68.00 GTGTGAAACCGAAAAATCAAACGAAATTTGCTGAATTCCTGATTACTGCTCACACACACACACACACATCTT:1 - chrX 7944934 5' + accord 184 2 77.78 TGGAAAAGTTGTATTCAATAGCGCAACTGGCGTTAAATCTCCCATGACCACATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCA:1 + chr2L 15919793 5' + pogo 476 1 61.29 AGATATTTTCATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTG:1 - chr2R 18507917 5' - Bari1 1688 1 58.33 GTAAATTCAACTTTTAACGACTTGTGGTGTACAATACAAATTAATTACAATTCAGTTACAATTCAATTACAATTCAGACGTAAAAAGGTTTAAAGTTAAAATATATTTTA:1 + chr2L 16490494 5' + P-element 2599 1 32.73 GGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCATAT:1 + chr2L 17574375 5' - hopper 1376 1 60.00 TATCGTCGAATTAACGGATGCGTTCAATTTTTAAATGGGTTGGGATTGACTTGCTATTTTTAATATTTTTATTTTGTATGATTTTCCTTTTTTTTTTATTTTT:1 + chr3L 12335928 5' - Doc2-element 227 5 82.52 GTCTGTAATCTACACAGCTTCTAAAATTACTTAATTAATATTTATAAAAGTAAATAAAAGATTTGATAAGCACTACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTG:1 - chr2L 10554389 5' + G2 268 1 69.09 GTCTACTTTTTAAATTTTAACTAATATATAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3L 16496747 5' + hobo 48 1 74.00 AATACAAGAAACCACACGAAACAAGCAAATAGAAAACGTAGTTTATAGCTCCCATTGTACATATTGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGT:1 - chr2L 11013460 5' - invader2 18 2 62.73 GGGCTTACATTGGGAAACTCGGACGGCGCACTCCCTTTTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 - chr3R 23730066 5' + Burdock 11 2 67.35 CTTAAACTTGCCGTTTGGTACTTCATACACAATGGTAACAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCGTGCAGCAGAAGCGACCG:1 + chr2L 98377 5' - baggins 5202 1 59.80 AAGGGAAATGTGCACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr2R 4830303 5' - Tc3 313 1 75.53 ATTAAACGTCGTCGCTTGAAGACCGATTTACAGTTAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3R 23665070 5' - 1360 3359 1 65.96 ATACACTTCGTAATTCCCAGCAAATTGGAATTATTGGACTGGCACTTGGTCGGGATTTTTAATTTGTTTTTCTTTTATTATTTACGATGATGTTTTTATCATTTGATCAA:1 + chrX 7073588 5' - jockey 4984 1 66.36 AGTGAGAAGTGGGAGGGAGTATGTAGATCACATAAACACTGGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 14013411 5' - roo 9035 1 62.00 CAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCACGAGACATCCACTTAACG:1 - chrX 20330579 5' - P-element 2856 1 34.18 GCTGCAAACCGTTTTATAGACATAAGCACACAAAAATTTGTTTTAATTTTTGTAAACATGTTGGCATTGAGGAAGGCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTG:1 - chr2R 12220882 5' + 1731 4324 2 70.00 CATTTCAGATTTACAAAAGCAATAAAAATATGGAAAAGACTTTGACGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 + chr2L 21784826 5' + I-element 15 1 66.97 TTTTAAATAAATTCTGGCGCAAACGGCGCGTGACAGGAGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCCGCAGGCGAC:1 - chrX 13886697 5' + opus 62 4 60.27 ATAATGAGTTACGAATTTAAATAATTAATATTATCAATAGCCGAGTAGATCCATGTCCGTCCTCAAAAAGGCCACGCCCACATTTTGGAACAATTTTTGGATATTTTTCA:1 + chrX 21283375 5' - TART-B 10248 1 70.91 TAAGCTCAAATTAATAGCCAGCGATCTGGGCCAACCTCTCAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTC:1 + chr2L 20526037 5' + hopper 25 1 52.13 TTGTGTGTGCGTGTGCTTTTCCTTTCCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCCTATCTT:1 - chr2R 19423137 5' - Stalker3T 203 1 59.57 CCCCTTCTGCACTTATTGTTTTACTGCGAAAATAAGGAGCACAAAGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACA:1 + chr3L 22530889 5' + baggins 5383 1 62.35 TCCATTCCCCTCACTTGCTCAACACTCTCGCACACACACACGCAACGTTTTGTTTGATACCCTCGAAAATCAGGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chrX 12271573 5' - pogo 2097 1 74.29 AGGCCAATAGCTAAAATTATACAGTCACGAGTTCGGGAAGAAATATAATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr3L 12158525 5' + 297 12 2 64.84 AATGGCTTTAAGAAAACAATAAAAGTTTTCGTGTCCCTATACCTGGTGCAATAAATTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:2 - chr2R 8530832 5' - mdg1 392 2 52.73 CAGAGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chrX 18483157 5' - pogo 2095 1 60.87 TAATTGTAAAGAATATACACACTTCTTTTTTTTTACCCCACATAACTTATTTTGTGATATCATGACATTTGTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATG:1 + chr2R 21846175 5' - invader2 4710 1 64.55 GATGATTGAAGATATATGAAGTAGGTATATTGAAGGTATCTTTTTTATCTATTTTCTTCCAGTGCAGTGGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAA:1 + chr2L 858327 5' - FB 686 2 70.91 CGGCTCATCTCTAGCTGAGTGCGAGAAAAAAAATCGTGGCCAAAATGTCAGACCGGTTGAAGCCTTTGGCGGGAAGGGAAAAGATCGGGAGAGCG:1 + chr3L 3772878 5' - mariner2 569 1 72.63 GCAGGAGAAACTGAAAAGGACGAGTGTCCCAAATGTGTCATATCATCGATATATCTACCTCACACACACACACATACATAACAACATAGCAAC:1 - chr2R 19021271 5' + Quasimodo 51 2 79.57 GGATTCACATGCTAAGCAAAAACAACAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCA:1 + chr3R 31967083 5' - rover 7013 2 79.09 TGAGGTGCAGCCGAATAGTATAATTAGCTTTAGTCAGCGAGAGACCACATTCGCATAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAACAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGAC:1 - chr3R 24627357 5' - mdg3 5237 1 56.36 TATCTTTGCCGAAAGTGCAGCCAGACGACAGTTAGAGGTAGTATGAGATGAGNATGCGTGTTGGAGAATGAGTTAAATATGTGTTTT:1 + chr2R 21854160 5' - I-element 5039 1 79.31 AGATCTAAGAAGTTCGAAGTTCGAACTTCGATGCCATTTCCTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTACATAAT:1 + chr3L 22456197 5' + FB 628 4 66.06 CAATTAAAGTTTCGTTTAGGCCACTTTAAAAAGACAAAATGCAAATAATTGTAAGTGATGGATTGTGATTGATTTGATTTGCTAAGAATGTCTAGAGGGTTGGGGTTGTT:1 + chr3R 17613967 5' - I-element 5094 1 72.73 GACACCCAAGGATTGGGATCTCAAAACTCAGCATCAAATATCATGCCAGAAAACTCCGACGATATTTTGAATTTAAC:1 - chr3L 2176871 5' + accord2 330 1 75.32 CATCCGCTTCCGATCGGCTAAAAATGTCTTTTACTTTTCAATTTTGGTTTTTTTTGTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 3964991 5' + hopper 146 112 43.48 CGCGCCGGGCCGTAGTTGTTGTTTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAAAAGAGAGAATGACACCCGAAAACGAACA:1 + chr2R 18882347 5' - invader2 4931 2 67.86 GGGTGGTTGCACCAAGGAACGGAGGTGCATAAGGTTCAGGAGGTGGGCGCATACTTGTGTGCGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3R 19286008 5' - blood 7180 2 67.42 TCCCCTTGCTATTTTTCATACTCTTCCTTATGATCCACATGCATGTGTGTAGCATATAGCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chrX 2552030 5' - blood 7382 2 66.30 TATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATT:1 + chr2R 5064833 5' - Stalker3T 200 1 28.72 TGCCATGTTGGCTTTGTGCTCATTGCACTATTTTGTATTGTATTTGTATTTGTTATTATTTGTTTAATAAGTTTTTTTTGATATAGATTTCTTTTTGTTCTTTTTTTTTG:1 + chrY 1977674 5' - gypsy7 5006 1 37.27 AGCGGATCAACTGTTTATGGCTTTTTTTTTTTAAAATTTTTTTTT:1 - chr2L 1668651 5' + Tc3 77 3 48.89 TCCTGTCCTGTCCTGTCCTGTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTC:1 + chrX 4067987 5' - Stalker3T 202 1 43.64 ATCAGCCTTATTGCATTTAATACTATATTCGTTTAACAGTATAAACGATCAGGATCACTATCCAATCTCGCCCTGTCTGTCTTTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCA:1 - chr2R 16710805 5' + INE-1 135 1 80.91 TCATTATGTAAATTGTATGCGAAATTTAAATAATCATCTGCAATTTAAATGCACAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTA:1 - chr2L 4135038 5' - Bari1 371 1 56.36 TTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCGGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACA:1 - chr2L 22224575 5' - Rt1c 5418 1 49.47 TGTGCCACATTTCCACATTCACAAAGGAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAACGAGCGCGCTCCTGCTCTC:1 - chr3R 19297717 5' + F-element 363 1 65.17 TTGTGGCCAACCGATGTCAGGCCATGTGTCGGCGTCCGACCCGTTGTTGATGTTTATGCTGCAACTTTGTATCGC:1 - chr3L 13058555 5' - ZAM 88 2 62.67 AAAGTAAACATAAAGAAACATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCCCCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACAC:1 + chr2R 21218771 5' + accord 179 2 78.49 ATTAAAAATAAACGTAGGACTTAGTTACATTTTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTTTTGTGTGTGTGTGTGTG:2 + chr2R 6626502 5' - Quasimodo 42 2 76.53 ACCTTAACCCTCCTCCTTACTCCTTACCACCACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACACAATCATAGAATGACTTAGGACATAAG:1 - chrX 17946162 5' + Quasimodo 89 2 61.29 GATGCCATCAGGAGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 - chr3L 22108167 5' + Transpac 38 2 58.18 AATTTAACCATTTTTTTTTTTAGAAATGTTAAACACGAGTGTTGTTACATCTCATGCTAAAGTTACATTTTGCTTACTCATTATCTATCTTATTTTATCATTTGTTTCT:1 + chr2R 7847857 5' + accord2 454 1 51.38 CGAAATTAAAAAAAGGCCAATAGCTAAAATTATACAGTCACGAGTTCGGGAAGAAATATAATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3L 12158538 5' + 297 6592 2 69.90 ACAAACCAAATTACTTTCAGCATTCTTCGCAGTGGCTCTTTAGAGCTCAAAGAAGCGGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAA:1 + chr2L 17393349 5' + FB 20 1 51.19 AAACTGATTGATGAATCAAAACTTCTCGAATGAAAAGGTAATTAAATAAAAATTGTAATTCTGTGTTCGAAATGATGACAATAGTTTTACTTGAGTTCTGAAAAA:1 + chr2R 14623942 5' + mariner2 867 1 84.76 GTAGCGATTGAAATGAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr2L 6757524 5' + Tirant 29 2 73.33 CAAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chrX 17330106 5' - opus 7455 2 66.36 CCACAATTCGCTGGACCATTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGC:1 + chr2R 8828822 5' - Bica 463 1 73.91 TTTTTACTGCTGTGCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 - chr3R 21653546 5' + Tabor 39 2 60.91 TACATTTTTTGATTCAAAAACAAGAGAGAACCGACTATAAGATAACCGTTTCAATACTTTTTAGAATATCGTGAAATTGGGGAAAATAAAATATTTTATTGAAAAAAAAA:1 + chr2R 5883557 5' - hopper 161 1 63.64 CATATTGATGATCTGCAACTATGTCGCACTAAATTGCATTGCAATACGTTCAATAAAAACAAGCCTCACATAGATCTTGATTCAATTGTAGCATATTGGACTAATCTAC:1 - chr3R 9354166 5' + Stalker4 2 4 57.80 TTTGAATTTTTTGATCTTTTTATATATTTGTTTCTTATGAAATAACAGTTTAGGGATAATGTTCAGTTTACTGGCTA:1 + chr3R 5251892 5' + accord2 496 1 70.13 GTGCTTGGGTGCTTCATAGCTATGCATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:2 - chr2R 13699455 5' + jockey 4821 1 78.18 GACGATGTCGCCGGCGATGATAAACGAACGTGATTTTGTAGCTGGCTTTCTGTCTTTCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTA:1 - chr3R 11057976 5' - micropia 401 2 67.92 TTCATAATTCCTTCTTTTCTCCATTTCATTTCATTTTCTTTTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGCGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGAT:1 - chrX 6266164 5' - accord 7021 2 61.82 TTACTTCATTTGCTTGCTGGGAAATCGAGTGAAAGACATCTGAACTGGTAAAGGTCTCTATTGCGTTTAGTATAGGTGTGCAAAAAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATA:1 - chr2R 9378988 5' + Bica 303 1 76.36 ACGCAGCGTATGACGAGCGGAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCATCCTCTCACCGTGCTGGTGGCTAAGCAGAGGCTCTGGGGGCC:1 + chr2L 2507152 5' + Rt1b 243 1 71.59 GATTATTTATTAAAACGAAAGTTAAACAGCGAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAACTTCACACGCA:1 + chr3L 14241422 5' + F-element 4449 1 70.00 ACTTTATTCAAGTAACTTAATAAAATAAATACTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chrX 22717141 5' + pogo 22 1 63.75 TTCGGTATTTTTCGGCTGAAACGATGCGACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTGCCGAAGTATAC:1 + chr2L 20797674 5' + P-element 35 1 38.89 GAGCGAAAAATCGTACATATAGCAAATAGATGTGCCATTGAAAAATTATTCGAGTATGCAACCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGT:1 - chr3L 21184078 5' + Doc3-element 4593 1 64.55 TTCCACTCGAGATCAACCTTTTTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAA:1 - chr2L 16606844 5' + F-element 104 1 56.36 AACTCACCATGGGAAACCAGAAGTTGGCGGGATATATCACAGGGCCTCACTCCGCACAAAGCCAAGTCGAAACGAGGCTATGTAGAACAGAGCAAAA:1 + chr2R 15830308 5' - invader6 152 2 70.10 GAACGAGAACTGACCACAACCAAATTGCTGCAGATGCGCAAGTAAACCAAATCGGTTTGAATTGCCGCCATATCTAGGTTCTGTAGCCGAAGGGTTTTCCCCTTGTTTGC:1 + chr3L 2318137 5' - X-element 479 1 71.82 TTCAATGATTCTCAATTGCAAACTGAATTGAGTTTAGTTAGGTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAA:1 + chrX 8518942 5' - S-element 1675 1 62.73 TCGTCACGCGACCACCGCTGTTGGAATATCCTGCCAGGACTCTCGGTTACGCTTGGGCTGGCCCTTACTTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3L 5320574 5' + roo 8680 2 66.06 TACTCTCTGCCTCTCTATATATTCATATCTTTCTCTCTTCAAACCTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAA:1 + chr3R 24684579 5' + Tirant 8440 2 60.00 GTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chrX 9845526 5' + F-element 61 1 71.82 CCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chr3L 3240601 5' + diver 7 2 69.23 CTCCACATACATACACATATCGAAAAATGTCGCGTTCGCTTCCATTAAAACGTGAGTTGCCAACGAAAAGAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAACTTGCTTCACAGG:1 + chrX 12526953 5' - accord2 7232 1 70.91 GAAATTTCGACATCGTTTCCTTCATCGCAATTTTTTCTCCGGCTCTAATTAAGTGGGGAACGAGATGGGTGAATGGGTGGATGGGGTGAGGCTTATGCAAAGAATTGTTT:1 + chr3L 10543895 5' - Idefix 211 2 75.45 GACAAAAATGTATTTACGATATCGATTGAAATTGTCTTGATAATAGTCAATAGTCAAAAAGTCAAAAAATTTTGAAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGT:1 - chrX 22689447 5' + mariner2 27 1 72.73 ATTGAAAAGCGCTGAGCGGCTGGGAATTCTGCACCGCTCAAGTTAGAAAAGGAGGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGACTTAG:1 + chrX 13436687 5' - TAHRE 10253 1 53.21 TCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTGTCTTATCTTGTCTTATCTT:1 + chr2L 21768294 5' - Stalker3T 203 1 77.27 CTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 21034108 5' + 412 7095 2 66.33 CACTGTTCGTAGCTTTTGCTTTTGAGGGAAATGTGAATAAACTTGAAACGCCAGCATTATATTGTTTGCTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGA:1 + chr3R 15455521 5' - I-element 4902 1 75.24 CTCTCTTGGCCAAGAAATTTATTTTAAACGTCAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 17490711 5' - roo 9057 1 62.86 CGAGCGGGAATGACTTAATATACTGCAACGCTGATATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCC:1 + chr2R 9790031 5' - mdg3 5241 1 69.09 CATTTTCCTCAGCGGCCAAGCGACTCTAACTATTGTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr2R 23230643 5' - 412 440 2 67.27 GTTCGCCCATTTTCATTCGCATCGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAAAAAGTTTATTGCTGGGTTGG:1 - chr2L 14090399 5' - Doc 4562 1 63.77 TCCTGGTTGAATATCTTCATTGTAGGTTGAATATCAGTATCGCAATTTGTTGGTTTTACGATATTTCTTTCTGCCTTTTATTTTGTTGTTGTTATTTTCCTTTTTTTTTT:1 + chrY 2827517 5' - Doc2-element 252 1 50.00 CGCCGAAGGCCAAACACGCTCTTGTACACGCATATTGAAATGTGTACATTTTTATTTATTATTTTTATTTTTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAAT:1 + chr2L 3010525 5' - HB 297 1 79.25 TTCAGTTTAATGAAATTCAATTTTATTTTCGAGTTCCGTTCGAGTTCTCTGCCGCTCATCAAAAGAACAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAACCACGCA:1 + chr3L 22320296 5' - invader1 30 2 60.91 ATAAATACATTATATTTCCTAAGCCCGGTACTTCCTCCACCAGCATAGCAAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAATTTAAATAACATAATAAATTAAACTTATT:1 - chr3L 15679228 5' + HeT-A 347 1 68.18 GTCTGTCATTCACAACAGAAAAAAAAATGAAAAGAGAAGAGTAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCTTTCT:1 - chr2R 18356906 5' + hopper 1165 1 57.43 TAACAACAAATGTCAAAAGGTTAAGAGCCCCACATCTATAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTAC:1 - chr3L 12458759 5' + I-element 5195 1 64.55 AGAGTTTTCTCGATTCGTTTTTCTTCTGATATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATAT:1 + chr2R 8530746 5' + mdg1 7088 2 72.38 CCAATGATTAAATCAATGCGACCCGGTTTATTAAAATCGGGGTCGGCTAATTTAAAGTTCTTCCATTTTTCTAGAGAAATTTTCATACGGCTTTTTGTAAAATATTAATT:1 - chr3R 19444733 5' - TLD2_LTR 110 1 63.64 TATGGGACTTTCCGGCTCCAAGTTTTCAATTTTTATTTATTTATGTAACGTGGCCTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chr3R 20415760 5' + F-element 37 1 50.48 TTTGGTTGGGCTGTGTGGTCGTCTTAAGCGCTTGGGGGCTTGTAAAATTCCAAATAAGAAGACTTTACGCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 29345683 5' - roo 9050 2 51.81 ACAACGTTAATGTATACATATATGTTTAAGTATATGTGTGTATAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAACGCTTTGCGTTTCTC:1 - chr3R 5456286 5' - Idefix 364 2 60.91 ACAATCAAAGAGTCTATCAATTTGGGGAACCAAATAAGCAAACTCAGCGTAAGCGAGCGGAAGAGATCAATTTTGACCGTCACCAAAAAAGTG:1 + chr2R 8337538 5' + 1360 3329 1 54.84 ATGAAATATGTACATATATGTAATATTGGATTGTGAAGCCCCAAGAGTACTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr3R 22595882 5' + FB 31 1 50.48 GCTCTTGCTCCTTCAGTATATATATATATATAACAGTTTGCCAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACA:1 - chr2L 9804008 5' + G6 1901 1 62.73 GAAATTTTTTCTCAGATTGAAAAAATGTTAAAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATC:1 - chr3L 64570 5' + F-element 275 1 54.55 GCAGTTAAGAATGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 + chr3R 6088534 5' + transib2 25 1 57.01 TGCTCAGTCTAAAGAGCTGGCCAAAGAAGACCGAGAACGAGCGGCGTTATATATAAAGATACATCCAAAAATAAAATAAAAGATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTA:1 - chr2R 10128165 5' + 1360 2969 1 69.09 ACTAACATCATCCGAAAGACTGTGGCATACTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1 - chr2R 11379811 5' - jockey 4984 1 61.82 CATATACAGAAGAAGTTCCCCCATAGCATTCTCGCTCTCCTCCTGTTCTGTTTATGCATGTGGAAGATTGTATGTAAGTTAACCAAAGCTAACGCCGCTACCA:1 + chrX 703047 5' + gypsy2 6 2 51.46 ACTCCTGTAAACGCTCGTGGCGTACTCGTAATTCGCAATTTAAATTACAACTCTATAAATACATATGTAAATAATAGGAGTACAGAAATGTTAGGTGTCACAATCTTCAT:1 + chr3L 4911509 5' - Transpac 4820 1 60.00 CAGGGGAAGTGCTGCGGTTCGGGTTGAGGAGATCGACTGATATGGCCTTCTCTTGTCCATGCATGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTATCCGATGA:1 + chrX 9746654 5' - Chimpo 4015 1 75.45 ATTTTCCTCTCTCTGGGCGTGATGAGAAATTTAATATTGGCAAACGGATAAAACCGCCAGATAATTATACATTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGGG:1 + chr3R 27224530 5' + R1A1-element 5069 1 73.15 GTAAGAACATTGATAAGGAAGCAAAAGTATTTGCCTTAAGATGTAGCTTATTGATTTGATTTTAATGTATAGCATTAAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATT:1 - chr2L 5304953 5' - flea 5013 2 79.09 TGTAATTGTTTTATCAAAATGTAAATAGAGACATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 29970559 5' + pogo 49 1 70.91 TGAAACTGAACTCCTCTGTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCAATACATTGG:1 - chr3R 5671451 5' - 1360 3367 1 64.63 TATGTGTCTTTCTACCTAAGGGATGAATATACCCCATATCCTTACTTTAATTTTTGTTCGCAAAACTTTCTCTTTTTCCCAAATGTTATTAAAAAAAAACAAACAAAAA:1 + chr3R 18537351 5' - hopper 152 4 70.64 GAGATGTAATCGATTTGGGGATGTCGAAATGGGATTATTGTGGATTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCCTGCGGCAACTTAAA:1 + chr2R 18948005 5' - jockey 4956 1 56.00 TTCGCCAGGACAGAACACTTCTTATAAGGTATATTATGTATGGATGGGACATATACTACCTACCTCCACTCCACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTC:1 + chr2L 9454681 5' + accord 7123 2 68.57 TAGTTTATATACAAAATATACTACTCTACAAATATATTTATCAATTCAGATTGTGAATTCGATTCGATTCATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 + chr2R 23415624 5' + F-element 12 1 62.11 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATCCCAAACGCAGACATCGAG:1 + chr3R 21907535 5' + F-element 293 1 43.33 TTCACGGGGTATATTAAAAGTTATTACAACGTGATTTTTTTTTAAATTAATTAAATCTTTAAAATTAATTAAATCTATATGCACACGTATTTTTTTGAACAGTTGTATTA:1 - chr2R 6902471 5' - F-element 4592 1 80.91 ATGAATCTGCATAAGGGAGAACCACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAACTTATGG:1 + chr3L 18915142 5' + 412 7092 2 58.18 TGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 + chr2R 5214948 5' + F-element 29 1 57.27 CGAGCGAGCGAAATGGTGAAGCCGGAGAGAACCGAAACGCTACTGGCATCGGATGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTT:1 - chrX 21399488 5' - pogo 2090 1 63.44 AACCTTCGATGACCTTAATGATAAATTGTTATAATTCGTTATTATTATTAGTTTATCGAGGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAA:1 - chrX 22663762 5' - S-element 1703 1 59.18 GGGAGTTTGTTGGTTCCGCTTCGCTTGAGCTACCAGGCACTTCTGAGGTCCCCGGAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 217396 5' - roo 9047 1 59.63 AAGGATTACAAGATCTCGCTGCCTCTTAAACAAATACAATTTACATTTGCGCTAAGGTCACACACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3R 28319683 5' + gypsy3 419 2 72.83 AGAAAGCCTTTCTTCATTCTTCTCGCACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAA:1 + chrX 3067624 5' + 412 7511 2 74.29 TAACAGCAAATAATGTTTAAGCAGCGGTAAAGTAAAGCAAAGCCAACCCGAAAAAGCGAGAAATCGGGAAGAAGTAAGCACAAATAACCAACTGTTCCTGGTATGTACGT:1 + chr2R 19620063 5' + Helena 1161 1 79.09 AGCCACGCCCCCAACAAACACACAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCAAGAACAGC:1 + chr3R 23599612 5' - diver2 110 2 72.83 CATAGCCTACTTTTGGGCCTTTTTTTTTCTGAACATTCGAATCTAGTTTGAGTAGACCTCCCCTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1 + chr2R 14885124 5' + BS 4999 1 63.74 CGGAAGTACATTTGTCGTCGGCTGCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAAATATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTT:1 - chr2R 14661147 5' + hopper 60 1 73.64 CTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCAGGGGGGGCACTTTTT:1 + chr3R 26734003 5' + hobo 6 1 60.87 GGTCTAAAATAAAAATGTTCTTAATATACTCAACCTTCCAGCTTTTATAGTTCCTCAGATCTCTACGTTCAAATAGACGGACAGACGGATATGGCCA:1 - chr3L 23026200 5' - INE-1 118 1 61.86 GACTGCCACATCGCTGATTGTCATCTTTACGGTTTAGGGGGGTGGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTAAGATG:1 - chr2L 6681127 5' - gypsy5 7010 2 60.49 AAGTCAGTTACAATGCAAACTACTTGTGTTAAAATAAGTGAAAATTGTTCGGATTAGTAGTTTAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTC:1 + chr2R 20832621 5' - FB 53 1 63.64 TTTGCATAAAAATTGCCAGATTCGCAATTCGAAGGGGCAAGTGTCGAGTGCTCTATCTCCTCCCTTATGAATATTTCGTTTCATTTAAATGATT:1 + chr3R 14086669 5' - invader1 3617 2 64.89 TTCACTTACGAGTGGCAAAGACTTAATGCGACTTTCACTCCGTTCTTCTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAG:1 + chrX 6664945 5' + Stalker 7102 4 56.88 ACCCACCACCTGGATGATAGTGAATGCTCCGTATGTAAGGGCAATCCAGTATATACAGCCCACGCACTGTAGTTCTCATCATCAAGTTTTTCTATTTGGTTTATT:1 + chrX 3463406 5' - Dm88 328 1 56.19 ACAGAAGGTTTTATGTATCTGTTTACACTTACAAGCTGCAACTTCGCATCCGGTGGGGATAAAAGTCACATGGACAGGCCCCAACTCACACACACACACACACACATTT:1 + chr3R 18568543 5' + accord 7031 2 70.64 GTTGAAAGCCCACAACACAAGTAAATGCTATCGAACAAGAAAACTATTAATTAATTATGGACAACCCAATCGGACCTCACGCAGCTGCAGAGGTTG:1 - chr3L 13522846 5' - invader4 2870 2 66.67 CTTCTTTTTTTGTTTTTGTTCGCTCTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGCGCTTTGAACGGGGGAATGTG:1 + chrX 13878577 5' - Idefix 244 2 61.11 CATACATCACTAGATTAAGGCGGCAAATAAAAGTTGGTTCAAGCATAGTTCTACAGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAA:1 + chr3R 10144238 5' - Cr1a 3991 1 60.24 AAGAAGGCGACTACCAACTTTTGAACAATCAACAGCACGAGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCAAAAAAAAAAATATAGATTTCAATAAACAA:1 - chrX 9998304 5' + Idefix 289 2 59.26 CTAATGCGACCTCAACGTAAAATAATTGCTGACCAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3R 5910745 5' - roo 9034 1 68.04 AACAAGTTGACACCCACGCAAACAAAACAATTCAACAATTCTGGCGCATTTCAAAGCATTTCAGGAAGCTCGGCTGTGAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCATCGGGCTG:1 + chr3L 18501819 5' - Circe 268 1 56.36 CCAGGGCAGCAGCGGGGTCAAAGGAGGGGCGTACTTGCTTACATTTTTGTTCGTTTATTTAGATTCGCCAATCAGATAGCCACCTCTCCACAGCAACTAAGTGACGAGAG:1 - chrX 17294473 5' - Fw3 3009 1 70.00 CTGGAACTAGAATTAAATATTTCATAAAAATAATACAAGATAAAGTAGTTCAAAATCAAATAGATGCATAAAAAAGACGAAGTTTTTGGCGACTT:1 - chr3L 14370612 5' + gypsy7 495 1 53.68 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACCCGATCGGACCTCACGCAGCTGCAGAG:1 - chr2L 16217660 5' - invader4 2874 2 31.68 CTGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTCTTCCACGTACTTAATACTATTTGACTTTTAATTCCACTTATTTTTGTAAAATGAAATGTGTAGATAGGAAAAAAAA:1 - chr2L 18885844 5' + HB 116 1 51.92 GGCGAGGACATGGATGAGCACGGAGAATTGGAGAAAGTGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAA:1 - chr3R 5137405 5' + flea 4608 1 60.27 GCTTAACAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACA:1 - chr2R 6801728 5' - McClintock 471 2 73.33 AAAAGCCCACCAAAAAAATGGATAAACAGAAACAACAACTTACACTGGCTAAATAACAAGGTCTTGCTCTACAA:1 - chr3R 15618200 5' + F-element 4224 1 51.35 TGGTTTATGTATAAATGTATACTTTGGTATACGTTTTGAGATATAGTACTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAG:1 - chrX 7022719 5' + pogo 1688 1 56.00 AAGTAAAATCGAACAACAAAACTCACGGAATTACTTCGAAAATAGTTGGCAAAAACAACAACAGCGAATGTTTTATTACTAAGAGAAGGTCGTTACTAAATAAGGTAAAA:1 - chr3L 5199677 5' - Q-element 519 2 62.73 CGCTAGTAGCGATTCTTCGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3L 22108104 5' - Transpac 290 2 60.76 AAGATCTTCGTTTCAGTTTGCTGACACAACCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTGTAAGAACTTCTAGGATGGAAGGGCATATATTGTCAAATTTACA:1 - chrX 4109551 5' - 1360 204 1 72.38 TTTTATATATATGTATATATACATAACCAACTATACATACATATATGTATGTATGTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCGGAGCAGAGACCG:1 - chr3L 2469087 5' - Transpac 5209 2 63.11 AAATCGATAAGGTTAATGACTTCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 13556736 5' + hobo 40 1 69.66 CAGGCTATTAATTTCTGGCCCAATTGGACCCGACTCGCCCAAATAAAAATAATACGACTTCGCC:1 + chr2L 20048808 5' + I-element 4932 1 57.81 TTATGCAGATTTATTCATTGTGTTGCGATTTCAAGTGTGGTAAAATGCAGCCCGCCTAATGAAGGTTTCTTAAGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATG:1 - chr3R 6105363 5' - F-element 308 1 67.35 CTTGTGCAGTTTTATTCTCTTTAAAAAGGTTGTTTATTTCTGACGGCATTTAAATCGTCAAATTAGTACTTGAAATTGAAATGTAGTTATAATAAAAATTCATGTATTTT:1 - chr2L 10302266 5' + S2 1633 1 43.64 CCAAAGTTTAAGCTCGCTCAGATCTTACAGATACAAAAACTTGCTGTTCGTACACACACAACTATTAATAAATATACATATATATTTGTATGC:1 - chr2L 12321117 5' - Stalker2 7498 2 64.52 GCATTCAGATTCATGCGGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 15524386 5' + pogo 22 1 54.55 CAAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGCT:1 - chr3R 29588501 5' + Transib5 2931 1 48.08 GTTAATTTTATCAATGGTTTTTGCACCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCCACGC:1 + chr2R 4547745 5' + transib4 2337 1 88.46 AATACAAATACGCAAATGATATATACGATTTAGTTCGAATACCGCTGGAAAATCTACAAAAATACTCCGGATGTACCCAACAGC:1 + chr3L 1544811 5' + Idefix 87 2 72.62 CTGGCGTCTCGCACACAGCCCTACAAAATACGTGCACATATTGATGAGAGAGATTTTCTGCATTGCTCTTTGGATTCGTTGTAGCGCGCGTCGCTCTCTCGCTCTCTACC:1 - chr2L 12529931 5' - 1360 103 1 72.73 ATTTAGGTATGTTTTAAACTTTCTTGTAGATATCAAGAGTAATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTATTTTGCTGCTTTTTTTTAAT:1 + chr4 1053051 5' - Porto1 4431 1 62.73 CAGGCCGGGTTGGGTTTTGGGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGA:1 + chr3R 7861196 5' - ZAM 124 2 78.49 AATAGATCAATTATATGTTTAGAAATATTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3R 28407572 5' + pogo 51 1 78.50 CTACCCTTCCCACCCTGAAAGCCAATCCATCTGAGACTCTTTTCTCTATATTTTTCTGCCATATTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTAAAACTGTT:1 - chr2R 16931983 5' - Bica 415 1 60.00 CTACGATGCGTAACCGATTATAAATCTTATATAGTAACTTGATAATCCATGAAATGTTCTTAATTCTTTAATTGTTATTAGGTTGACGGAGTTGTGTGACTTGGACTTG:1 - chr3L 23959406 5' + invader4 2690 1 67.89 TTTACTAAAAAGAAAAAAAAACACGCAGATAAGCATTGAAATCGGCACCAAAAGAAGAAATATGCATGTGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAACCTGTTTACACACTGT:1 + chr3L 11085705 5' - S-element 1707 1 70.00 GACACTCGACACCAAATGGGGCAGCTGCAAGCCACAGAAACAACAGCACAAGGACCAATATCGGAGCAATGCCGATTGAGAGCG:1 - chr3L 18488716 5' + R1A1-element 373 1 75.00 AAGCTGACAATATCAGCGCAATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCC:1 - chr2L 13421882 5' + Doc 4520 1 77.53 GCCTAATCCAATACAATTTGTCAGCTTAATTTCTACACATGTAGATTGGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr2L 18181043 5' + hobo 22 1 54.26 GCCGTTTTGCCAGCTTGTTTGCAGAAATGTTCGCTCGCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 - chr3L 12301254 5' - hopper 1367 1 65.45 CGGAGAGAACGGTGGGTGGCATGGGTTTTGCGGTTACGGTATCGGGTTTATCGGGTAACGGTTAAGGGTTTGGGTTTGGGGGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTT:1 + chr2L 9727272 5' - gypsy7 5009 1 49.09 CGCAGTTTAATTGCCGTAATGATGGGATTAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAA:1 + chr3L 3926734 5' - Stalker 6780 2 73.64 TCGTAATTGTATTGAAATTAAATTTTTAGATTATTAAAACTATTAAAGTTTATTTTTTTTTTATATTTTTCCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chrX 18021016 5' + Doc 16 1 42.20 GCACACTAAGTCTGTCTTTGCCTATTTTTGGCACATCAAAAAACTCCGGAAGAGAATGCTATAGTTGAGTTCCTCGATTATCAGATATCCGTTACTCA:1 + chr2R 2562919 5' - INE-1 548 1 51.02 CTCGCCGATTTCATATCATTTCATTTTATATATATGTATATATACATAACCAACTATACATACATATATGTATGTATGTTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 + chr2R 22661182 5' - Transpac 5226 2 80.73 AACAGTAATTTTATCGATTATTTTTTATATATTAAACTTTTGTCAACTTTTAAATATATTTTAGGGTTATTCTCGAGCTCGCTGAAGTATGGCAATATTGCTGTTGCTGT:1 - chr4 1226487 5' - F-element 4296 1 73.64 AACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTG:1 + chr2R 330142 5' - HMS-Beagle2 261 2 73.15 CTTTATCTTTGAGTTTTTTACACGTGCTAAAAGGGTTGACAGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGAGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGAAGCCACTTT:1 + chrY 873205 5' - 1360 3345 1 61.82 CGAACTCAAAACTGAAGCTGGTCCCGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr3L 13925361 5' + P-element 39 1 31.82 CTATCTCCCAATGTAGGTCCGGGAGTTTGAGTAGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAAT:1 - chr2R 1320004 5' - Bica 4594 1 66.36 GATTAAAATTAAATGGTAATTTAGCTTTGAGAGATTATACTTTTAAATCGTTGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACAC:1 - chrX 13837542 5' - F-element 4367 1 56.84 TTGAATAGCATTAAAATTATTAGCTACAAATGAATAAAAAACGAGCGGTGGTGGTCTTACTTGTACAGATACCTTTTCGTTACAGACATTAATGAATAAC:1 - chrX 7343592 5' - Gypsy12A_LTR 2133 1 54.00 CAGCACTGCGGAATTTGGCGAGGCAGTTGACAGCTGTTCTGTAATGGAGCTCCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGG:1 - chr3L 9421046 5' + G-element 4155 1 61.80 GAAATGTCACATTTCAGATTTACAAAAGCAATAAAAATATGGAAAAGACTTTGACGACTATTATTATTAATATTTACTTCGTCAGTACCACTTCAACATCCGAAGAGATA:1 + chr2L 21784817 5' + I-element 7 1 70.91 TAAGTTGAATCAATTATTTAATCTAATAAAAGACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chrX 14771745 5' + jockey 4721 1 71.30 CTTTCACCCAGTCGGTGAGAAAAACTCCAACGACGTTTCATTTATATCCTCCTATCGACTTGGTCCATGTTACTGTCTAAAAGCCAAGATTACAAAA:1 + chr2R 17472627 5' + HeT-A 5880 1 69.07 CCAACCTCACACTCCATTGTCATTTCGATGCAGGACTGCATTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCCGCTTC:1 + chrX 10119577 5' - FB 9 1 46.91 ATATGTAAAAGCGAAGAAGGTAGAAACAAGACATCCACACAGACATGGCACGACTATTGATTCTGATCAAGAATATATATATATACTTTATATGGTCT:1 + chr2L 18796815 5' - INE-1 56 1 61.22 ACACAGCTCACACACACACACACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTT:1 + chrX 11441770 5' + Tirant 8501 2 81.65 CTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCAATACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAAA:1 - chr3L 19339423 5' + Tc1 39 1 52.78 TGGTTTGGTTTTAATTGTTTTTCTTGTTGAGTCTGATTTTTACTTCTGTTCTTGTTATTTTTCTTATGTATTTAATTCCCTCTCAATTCAATATGTCAACCCTTACGGAT:1 - chr3R 904377 5' - Dm88 4326 1 76.36 GCTGTACCTTTCTCCTAGCCAGGATGTGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGCCGTACATCGTACGGCTC:1 + chr3R 18537581 5' - Cr1a 4395 1 66.25 TTCCTTTTCCTTTTCCATTTCCTTTTTTCCTTTTCCATTTCCTTTTTTCCTTTTCCATTTCCTTTTTTCCTTTTCCTTTTCCTTTTTTCCTTTCGCTCAACCGTTTGCGA:1 - chr3R 11524425 5' - Bica 488 1 29.09 GTTTAATTGGAAATTAGAATTCTTATCGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3L 126328 5' - pogo 2059 1 61.82 GATCTGAGAAAATAACGAAGAGGGGCCGTGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACTAT:1 + chr3R 30222713 5' - invader2 50 2 72.83 ACTTTATTTCCGAAATAGATCGATTTTAAATAGTAGATGGCAGTACCAGGTTGGCAGTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATA:1 + chr2L 12391296 5' + Burdock 6063 1 64.22 TTATTTTGCGTTCATGTTTATTGTTCTTGTAATTAAATTAACACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chrX 9432795 5' + roo 6 2 78.18 TCAAGCGGCTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATTT:1 + chrX 4556551 5' - blood 7175 2 78.38 CTTACAATTGGTTTCTCCAGAACCAAAACTATTTCCATCAATTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3L 17787003 5' - pogo 2091 1 61.25 GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATAAA:1 - chr3R 21907534 5' + Tabor 16 2 40.40 ACGAGGGCACACTAGTGCGCGAAACGAGTTTATTTGCTGCACACAACAGCAACAACAACAACAAAAGCGAAATAACGCTTACACATATTTATATGTGTTAAAAACCTTAT:1 - chrX 17107875 5' + Porto1 124 1 63.64 ATGGCCTGCACTCCAAGCAATTGCAGCGTGGGCGTTTTTTATATTCCTCTTTTTTTTT:1 + chrX 17299258 5' - Doc2-element 251 1 89.66 TACACAGATACCCTGGGTATTTTTGGGCATGCTTATAAATCTATCAAAATTATGAAAACTATGACTATGTCCCTTACATGAATGAAAATTTTAAAATTACAAT:1 - chrX 5996242 5' + 1360 3056 1 89.32 AAATACCAAATGCTTTGATGTTTATGTTTAGAATAAGGCATTTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCA:1 + chr3L 16874573 5' - Tabor 329 2 62.39 GTAGTTTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATACTGAACTCGTCTGATGTTTCTCTGGACATAGGGCACC:1 - chr2R 10553767 5' + Gypsy12A_LTR 1896 1 75.68 TTAGTCAAATTTGATTTGTAAACAAACCGCAAGAGAATTTCATTAAGCAGCAGAGATGGTGATGGACGGATGAGATGCGAAGAAAGGTGAAGC:1 - chrX 4188009 5' + Osvaldo 340 1 55.91 GCCATTAAAAATCCATAAACGCAAACTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAGCGA:1 + chr3R 18769715 5' + roo 61 2 78.18 TAATTGTAATAAAAAATTTACAAAACATACCAAAAAGCTGAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3L 5971746 5' + pogo 38 1 60.95 GCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGA:1 + chr3L 23456269 5' - gtwin 7359 2 51.92 TTAGTTAAGATGCTAATGCTACTACAACAACATCTATTCCTACTCCCCCCCTCGCACCTCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGG:1 + chrX 1684574 5' - F-element 4477 1 69.57 CGCCTGTCTTCTGTGCTCGCCATTTGGAACGTTGTTGAATAAGCGTTAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGC:1 - chr3L 25442526 5' + Chimpo 35 1 56.48 AAACAGTCGAGACACGAACCTAAACAATGTTCTAAAACCAAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGAT:1 + chr3L 6550196 5' + 17.6 7001 2 69.09 TTGATAGTTAGGAACTCCTTCTTTCAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTTGCACAACACAAAAACAGTACAACTACACATATATAA:1 - chr2L 1486468 5' - transib2 315 1 76.15 ACTCTTGCCACTCTCTGCCCAAAAGACCCCAAAAACGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAACTACATATTACATACGCACATAC:1 + chr3R 21711813 5' + 412 220 2 61.05 AAAGGGAGTGCGGGTACGATACAATAATCCGAGCTCAACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGTAGTTTTCATAAT:1 + chr2R 12664682 5' - Dm88 351 1 65.45 GTAGCAGAAAGTCATAATTCAACCTAACTTAATTTTGGCTGGCACCAAAAAAGTGGCTG:1 - chr2R 16307901 5' + 1360 3333 1 69.49 GCAGAAAAGCGACATTTGCATAAAATGCCAGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGC:1 + chr3R 27439817 5' - Quasimodo 5 2 60.53 CTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTGTCTTATCTTATCT:1 - chr3L 22908066 5' - Stalker3T 204 1 77.98 CTAAAGCCAACTTTGTGGTGTCGCCTTCCGAATCATAACACAGCACCTTATATAGTACTTATTTCTTTCCCTAGTTTTTCTTTTTAATGTTAATTAGGGCCTAATATTTG:1 + chr3R 17948493 5' - HB 1341 1 75.45 CACTGGATTTTGCCTTCTTATCGATGGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 10300764 5' + 412 42 2 75.00 AATGAATTCTTACAAAGGACATGGCCCCACACATACATATACATGGAACACTCGCACTCACACTCGACTGCATTGCCATGGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 11315181 5' - hopper 1407 2 73.64 CAGCGTACTAAAAATGTTTTACGGTAGTATGCGGTTATAGCCACACTGAGATAAATTGTCAAACATCCCTCCTAATAGCATTATTATTATTATTATTATTATTAT:1 + chr3R 10231477 5' - mdg1 7076 8 78.10 CCCGCCATTGTGCCCTCTTTTCCTATGTCCCTGGCACACCAACTCACCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chrX 22745164 5' + jockey 4776 1 54.65 CTTAAATCGAGTTAAGTTCCGCTTCATTGTTCGGACTGGCCCACAGAATGCAAATAAAAAAAGGATAACATGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCCTTATCTACAC:1 - 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chr2L 14053791 5' - Idefix 7236 2 70.91 CATTTCCGTCTGATAATACCCCCTGGTAGGGTACAGAAAGAGAGCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGTCATGGGTTCG:1 + chr2R 15047160 5' - Burdock 5927 1 69.62 TGACCCCAAAATCTTTGCCGCCAAATCAAGAAAAGTGTAAGCCTTAAGTTCATGGGGTCTCGGGGTTAAGTCGAGAGCTGCACGTCACGCATCTGGGCTCCCCT:1 - chr2L 1944062 5' + G5 4465 1 70.19 TAAAAGTATGCTATAATTTAGCGCTTAAATGATGCGTGCTTGGGTGCTTCATAGCTATGCATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 - chr2R 13699490 5' + jockey 4777 1 61.39 AAAACGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr2R 21199705 5' + jockey 21 1 47.13 CCGCGCTCTCCCCTCTTCACCCCTTCCCATCCCGCTGGACACGCCACACACCACACACCACACACACACACATATACACATAT:1 - chrX 1566747 5' + accord 191 2 66.27 CGTCATTGGCCTAAACCAATGCGAATAAGGCACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 10956204 5' - hobo 2899 1 62.63 AGCGCTAGTAGCGATTCTTCGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGGCTT:1 + chr3L 22108102 5' - Transpac 304 2 59.70 TTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 - chr2L 6311303 5' - hopper 1359 1 76.85 TTCAACGCGATAAAAAAATTATTACATTCTACAAAACGGTGATCAGCAAAAATTTCATTCATGGATGGCGCAGGTAACTTT:1 - chr2L 12504176 5' - pogo 191 1 80.25 TGCGAATTTGTTGTGCGACAAATAGAATAGAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTTTGCAGCCAAAGCCGACTGCA:1 - chr3L 2367387 5' + Doc3-element 4559 1 75.96 TGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGCATTGTATTTTATTGTATTTTATTTTTT:1 + chr3L 21448027 5' + transib1 1900 1 52.31 CGTAGCGAGATGTTTCTTCGGGCTGAACGAACGATCGCAGACATCGCAACTAAAACGGGAATGAAAGATTATAACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAAT:1 - chr3R 8724478 5' + Doc 4431 1 69.09 TTTATGTATGATTTAATTTTTAATTTAATTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATCATTAGGTATTTA:1 + chr2R 4137706 5' - Juan 4154 1 79.09 CACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 9432836 5' + roo 47 2 68.18 AAAACAATTTACGCGTTTATTAAAAGAAAATTTCCACTTAGTTCGCCAAAAGTTTACCAACTATTTTCATAATTTTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTG:1 + chrX 8811302 5' - X-element 4695 1 77.27 CGACTCACCTATTTATAGCTATGCTCGTTTATTACGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGTCGAAAAA:1 - chr2L 1462164 5' - 1360 56 1 64.00 TACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACACAAA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 415 1 26.00 GATGGCAATCGAGCGATCGAGCGATCCCTTTTAGCAGCTGTCACAAGAGCAGCAACAACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACAAACCCTCAA:1 - chr2L 19155217 5' + Porto1 457 1 66.00 TGGATTGCCGTATCCGCCACCGCAGCCGCCGCCAAAGCCACCTGGATAACCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr3R 17619569 5' - 412 7533 2 56.98 TTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 - chr2L 12036165 5' - 297 6934 2 74.51 AACGACATCATCGATTTGAACGCCTGTCTTCTGTGCTCGCCATTTGGAACGTTGTTGAATAAGCGTTAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGC:1 - chr3L 25442546 5' + Chimpo 17 1 57.27 ATTAAATAACTTCTTAATTTAATTTAAAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACATAAAAT:1 + chr3R 12039913 5' + 412 22 2 60.91 AATACACCCCCTTCAACATTTTATCATGCTAGCTGCGAAAGGTTTTTATACCCGTCAATCGTGGATAAAAAGAGTAATCTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACAGGCAGA:1 + chr3R 32072783 5' + INE-1 22 1 59.09 GAGCACCGAGTGATCTTCCCATTAATAAATGTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTAAAAAAGCTAACTATA:1 - 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chr3L 12677135 5' - pogo 2095 1 64.47 GCTTGAAATGAAGTCGCAACGATCCGAATAGTCGAGATTTGATGAGGGATATTTTCTGGATTGCGATGTTTTCCTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTG:1 + chr2L 21000815 5' + Cr1a 363 1 71.03 ACATCAACAGCAACTTAATTTTCCCTTTCTATAGAACACACACAGCGAAAATACATTTTTCTTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAA:1 + chr2L 3116630 5' + F-element 4241 1 60.91 AGCAAGTTGCACAATTCCACGACAGACCTCTATAGAAATCATACATAAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCACTTAGTT:1 + chr3L 11060321 5' + I-element 5216 1 55.45 CAACAGTTTTTTGCAACTGCCGCACAAGCGGAAGTACATTTGTCGTCGGCTGCACAGCACTAAGGGGCATTTGGCCGGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAA:1 - chr2R 14661175 5' + hopper 30 1 52.78 GAAAAGCGAAAGAGCCGAAACAAAGGAAAGAAAAAAGGAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3L 4632336 5' + Doc2-element 238 1 66.04 GATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 18675628 5' + 412 7094 2 67.71 CACACAAAAAATCGTATTAAACGAGAGATTTTCAATAGTTAAGAGTATGTGGTTTCCTTTATTTTATCGTTGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTT:1 - 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Doc 4460 1 53.85 AAATGAATGAAACAAAAACACATAGCGCCTTCTCTATCTGCAACATAAGAAAAGGAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 13999915 5' + Doc2-element 221 1 68.12 TTTTTTCCGGTTACTTATATTTATTCTTTATTTAAAAGAATACATTTTTAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr2R 9963624 5' - pogo 2095 1 72.90 TGTGAAACGCGAGTTCCATGTCCATATACTAAAAGGTTTTCTCCTCTAATTGACTTCATTTGGTAGTGTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 - chr3R 5081218 5' - gypsy7 5009 2 65.88 GACCCTGGTGCCCAAAGGTGTCCTCTGGGTTAACAAAAGGTTCAAGCGAATTTTATGCGTTTGTCGAGGTGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCG:1 - chr3R 26775966 5' + Rt1a 20 1 59.09 CAAGAGAAAAACACGCGAAGTTATGGATATGCAAATGCACAGCAAATAAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACAACA:1 + chr2L 12604083 5' + R2-element 260 1 62.22 TGGAATTTTATGTAAATATTTGGCAACTTTATGGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAA:1 - chr3L 19948932 5' + 3S18 11 2 66.32 ACACACTAGAGCAACCAAACTATTGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAA:1 + chr3R 10220197 5' + Bari1 1628 1 81.82 GATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chrY 311344 5' + 1360 20 1 56.36 TGGCTTCTACTGAACTCTACAATTCTAAAGTTAAAACAAATAAAAAAA:1 + chr2L 16286508 5' + TAHRE 10441 1 89.58 TGGATGTCCTGAACTCCTCGGATCTTTAGCACTTCATAGTTCATCGTCTCTTAAATTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTACATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 + chr2L 13710660 5' - copia 229 1 57.27 TGATGTTTTAGCCCCAGACTGGTTTACACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCG:1 - chr2R 16507688 5' + ZAM 69 2 70.79 CACGAGATGAAGATGTTTCAAAAATGCTGAAAAACGTGCAGAAAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATGCAGCTGTCTGCTATCACTGTATG:1 + chr2R 11326020 5' - 1360 154 1 54.26 TGTTTTATCAAAATGTAAATAGAGACATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3R 29970553 5' + pogo 51 1 75.47 ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr3R 21211613 5' + Doc 16 1 55.38 GCGCATCAGATGTCCAGGTATACAGTTGAGATATGTACATATATAAATAGATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 - chrX 10433105 5' + flea 14 2 67.37 GTCAGAACCGTAATTAGAGATATTGGCTTTAAATAATCGAGCGGCACTCATTTGTTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATATAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACG:1 - chr3R 25077578 5' - rooA 7474 2 52.73 TTCAATACACAAAACCTGGGGCTTCAGTTACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3L 25414230 5' + blood 29 2 61.45 TATGGCCCTGAAATGCTGTCATATCCAAGCCATATTCCAGTTGCACTTCCCTGCAGGGGGAGTGATCGAAAATAAACAAACAAAAATGTG:1 - chr3L 15763752 5' + Fw3 3058 1 73.33 TTGGATTTACTGGCCGATTTTTGAATTAATACAATTTTTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCTTTTTGAAGTATGTAACAGAGAGAAGGAAGCG:1 - chrX 22519231 5' + INE-1 30 1 62.73 GCAAGCCAAGCTAGATAAAGTGTCGAACATTATTCCTCAAAATTCGAATAATTTAAGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTG:1 - chr3L 3240520 5' - diver 209 1 71.74 TTTGTGGGTTTTTAAGCTTTCTGTCTAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGA:1 + chr3R 19990303 5' - F-element 4317 1 76.36 ATAAATAAAATATGTTGCAAACTGCAATTTATGGCTGTGGCTAAAAAAAAATTTTTTCCTTTT:1 + chr2L 3423518 5' + Stalker 6761 1 68.25 CCGCATATATATTCCCGATTCCCCCGATTTGTGTTTTTGTGTGTCTTCGTCGAACTCGCAGTATTTTTGTTTGGTGGAGTCTGGCCCAATTTGG:1 - chrX 3964865 5' - I-element 4908 1 42.55 CGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAACGTTG:1 + chr3L 22108121 5' - Transpac 287 2 75.38 ATGGGACATTTTTTTTTTATAGTGGCTGGTTCGCACACCTTTACCCAGTTATCTCGTAAAATTGTTGTTTTATT:1 + chr3R 14139069 5' - 297 395 1 45.95 GCGGGGGGCACTTGCTTTTTTACGCCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTT:1 - chr3L 2002042 5' - gypsy5 7325 2 66.22 AATAAAAGGTGATATATTCGTGCATTCGCGGGCTACATTAATATTTACACAATCTAGGTTATGGGCCCAGCGCCCTAGGAGCTGCCTAAAGGAGAAACGTGTAGTG:1 + chr3R 8369084 5' + 1731 366 1 56.60 CAATGGGAATTTCGTTCAAAAAAATATTTAACATCTATCATATGTGGAACGCAAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACT:1 + chr3L 9419514 5' + S-element 31 2 54.55 ATGGCAAAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 - chrX 5515611 5' + copia 46 2 66.36 ATCCACAATTTAAGTTAATTAAGCAATCATTGAAAAGTCAAATGATCTTGAACTATAGAAAAAGGACAGGAAGGAAGTGCTTGGAATGTTGATCGCTTAATTGGAATTTA:1 + chr2L 8894877 5' + Bari2 179 1 78.18 GTCAGCAAGACATGGCCACAAAGTTGCTCGCATCTGGCCAACCATTTTCATTTCCCCCAATAATTTACGCAATGTAAACCTCAAAATTCAAATAATTGTA:1 + chr2R 23513846 5' + HeT-A 5964 1 74.00 GGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTA:1 - chr2R 10572710 5' + F-element 4381 1 60.00 TGTTTGCTGCCGTTGGTTTTTACTTTACTTTACTTTACTTTGTCTTATGGAAAAGGAGAAAATAGTTTTGGTGAGTAATTTTATGGTATAGTTGAGCGATG:1 + chr3L 616766 5' - TART-A 13052 1 76.24 CATATCAAGTCAGGATATCTCAACTATTAGGCTTAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAACTAAAGGAAAATAACTGTAACTGTTCGGCGCCCGAACAGGGACCAACAAAT:1 - chr3R 6508730 5' + HMS-Beagle2 336 2 70.00 TGGATGGAAATTGTATAGATGTACAAGTTTGTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 - chr3R 15524464 5' - pogo 2047 1 77.27 GGATCTTAAAGCCTAATCATAATAATAAACAATCTTACATGGGGG:1 + chr2R 8240062 5' + flea 260 1 60.00 TGTTTGTTTACCCTCCTGCGTCCAGTGTCGGATAAAAAACACACAGATAAACTACTTAGCCACAAAAACTTAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAA:1 - chr3L 15760417 5' + Porto1 4502 1 61.82 ATAATATTTTTGGATATCTATAGGAATTTGCAAGACAATTATTCGAAAGTGTGGATTAATATTTAAATGCAAACAAGAGAGAGAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACA:1 + chr3L 24731804 5' - INE-1 563 1 58.18 CGCCTTCTTTCATTCGGTTTTTGTGTAATCTCAACGTCATAGATACCGTCAAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3L 15388092 5' + jockey 37 1 50.00 GTATAGAATCTCGCATTTCCCGTGTTTATTTTTTCATCTCTCTTTTTCGGTTCCCCCTTTTTTATTTTATTAATGTCCTAATAAGTTTATTGCT:1 - chr2L 5325713 5' - Doc 4569 1 78.72 TAATAAAGCTATTAGCTGATTTAACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2R 9953273 5' + pogo 33 1 57.94 AAAACATTTATTTGATTTGCGTAATTTAGTAATGTTAGTTATAATAATTACCGGATTTGCCGGACTAAGGTGTCTTTCGACCCGTGCCGAGAGT:1 - chr3L 5429314 5' + baggins 227 1 75.53 GTCATATCCGTTTTTATAACCCATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTA:1 + chr3L 14447470 5' + Ivk 358 1 80.00 ATACTAGATTCATAGGCCTGTATGTACTATAAGAGGTAGAAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr2R 5143495 5' - 1360 3353 1 96.00 GCTAAAAAAAATGTACCCAAGTTTTAGGGCTGAAAAAGATGGTAAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATT:1 - chr3L 4316172 5' - hopper 1013 1 58.49 TGAAACCCTATGTTTTCACTTCGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3R 13225574 5' - 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chr3L 19948924 5' + 3S18 33 2 51.38 GATTGTAGAAGCTATGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACG:1 - chr3R 29553910 5' + micropia 338 2 77.94 AACTTATATACACAACTTTAGTTACCTGCTTTCATAGAGCAATCGGGTCTATTTACATCATCGTCGGTATCACAGTAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCG:1 + chr2L 4533546 5' - diver 5893 2 77.88 CCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 + chr3R 11553664 5' - hopper 1389 1 57.78 TTCTTCTTTCAATATTTTTGTGACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1 - chr3R 15309408 5' + HMS-Beagle2 6904 2 53.19 AGGAAACCATTGAGACGGAGAACAACTTTATGCTCCATTTTTTACGGGATGAGAACGATGTGGCCTTTTTGGAGTCTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1 + chr2L 233274 5' - copia 146 2 72.73 TGTGATCGGGAATGAAATGTGTTTTGAAAAGAAATTATATAATTCTTTGCTTTTCTGTCTTTCTCTTGTGTTTACTCTCTCTTTCGTGCGTTCTTCGCAGTGCTGTTTGG:1 - chr3L 15343943 5' + Cr1a 234 1 75.45 AATGGATATCCTAGTAAATGTGTCTGCTCGCACTTTGTGCTACGTAATCTTTCTTGGTTTGTAGGAGGG:1 + chr2L 1279362 5' - I-element 5065 1 73.91 GGACTTTCTATCTATATTGTGCCAGAACAATGCCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTAT:1 - 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chr3L 22738606 5' + Tc1-2 1273 1 78.18 ACCTTTATCTATACGCCAATATTAAAACAATAGAAAACAGAAACACCACCCTTCCGCTCGGAACAGATACTTCTCTTATCTTTAATTATACAAATATACTTTCT:1 + chr3R 4635502 5' - invader2 4725 1 73.08 GCGCCTAAGAACGACCTTGGATGCTCACTGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT:1 - chr3R 29326858 5' - accord 181 2 71.88 AAATATCTTAAATATATTTATAAAAATATATATAGGAGTATTTAGAGAGTTTACTTTACTTTACCAAGAAAGATTAAACACAAGACGTATGTATGTATTATGTATGTATT:1 - chr2R 19687332 5' + Dm88 4371 3 79.09 CGAATCTTTTTTCACGCTTTCCACTCACTTCACTCAAGTTGCTGCCGTTGCCTTTGGTTCAGTGGTTGGCGTGTGGGAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTG:1 - chr3L 15743769 5' + 1360 451 1 60.55 AACACAACTGGCAACTGGTAACTAAACTAAAAGCGTCAGTACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 - chr3R 14567881 5' + Stalker4 92 4 64.77 AATCGTCGCCTTGTCGTGTGTATGTGAGTTGAGGAAGAGGAAGTTCTTGGGCGTTAGAGCGGGTGTGGCAAACCGAATTTTGGCAAATCGATAGAAATGTACAAAACTAA:1 + chr2L 16589082 5' - INE-1 298 1 65.45 AGCAGGAAGCCGGAGTACCCTCTCCCACCTGTGAATCATCCTGCAGCAGCCAATCTTCACTGGCTTATTAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTGGAATA:1 + chr3R 8060701 5' + Doc2-element 4304 1 55.10 AGCACAGCCATTGACATTGAGCAAACTTCGGCAAATGGCACGTGAGCGGAAAAGAGATGACGAAAGAGCGAGAGAGAGAGAGCGAAAAGTTCAGTTTATGTGCATGCAA:1 - chr3L 1336361 5' - Cr1a 265 1 67.89 AAATTTTCAAGCTGTGTAAACAACGCTGTTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 + chr3L 15819352 5' + pogo 53 1 75.45 TTGTTTTCCAGTTTGTATTATAAATTTACCATCTTAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chr4 1039180 5' + jockey 4687 1 63.16 CCTAGGGAGCAGGTGAAGTGGGGTCTTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 - chr3L 22399786 5' + FB 58 1 75.93 TGGGTTGGACACCCTAGTCGGCAAACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chr2L 14141294 5' - hopper 1382 1 70.24 TTTCCCATGAAAAATAGTCCGCAATTTGCTTTGTTTATTGAACATTTGTCTATTTGCGAAGATGAGGAGGGGCTTACAGCTATATTTATTTAC:1 - chrX 6472903 5' - I-element 5278 1 74.19 AATGCTCAAAAATAGTGCATAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCAACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAA:1 + chrX 14827582 5' + G2 3048 1 50.46 CCTAATCACGATATGCATTCACATTTGCCTAATCATTGGGCCTAATTAATTGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCA:1 + chr3L 9189318 5' - G2 2846 1 71.59 CACAACAAACACAGGCAACACGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr2L 9171502 5' + opus 151 4 61.82 ATTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 - chr2L 6311304 5' - hopper 1358 1 76.36 GCCATATGTTCTAAAGAGAAAGAATACTAATTATTCTGGTAATGCCCAGTAAAGGAAAGTAAGCTTACTTGGAAAAATTATCAACACATTTATCAAAAGTGTGGGCGTG:1 - chr3L 15250332 5' - INE-1 253 1 51.38 GAAATATTTCCCACTTGATGTGTTGTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGC:1 - chr3L 19900729 5' - I-element 55 1 77.27 AAATACTAGCCAAATTATTCGCTCTCCTTTTGCAGTGCGAAAGAGACGGACTCGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12925836 5' - blood 171 2 67.78 AACCAAGGCCTTTATGGTCACCACTTAAAATATGGGGGTGTACTATGTTTGTTTAAATTGTTTATATTGAGTAAGTGTATAAGTGCATATTATTGATCAGGATCAACAGC:1 - chr4 277341 5' + INE-1 86 1 58.18 CAAACTGAGGAAAATGTATCCTCCAGTTTAGATCGTCTTTTTAATTAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGCTTACTTTCTCC:1 + chr2R 20625994 5' - TAHRE 311 1 44.57 CTGGCGGTCTTCCTGGTGGTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 17619523 5' + 412 7095 2 77.38 ATATCGTATGGAGCGTAGGGCTGGGAAATGCATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCA:1 + chr2R 18507847 5' + Bari1 51 1 71.56 ACCAACTATTTGGCCGAATCCAATGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTT:1 + chr3R 17288083 5' + S-element 340 1 78.18 TTCTATTAAAATTGCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATAAACTACCTTGTTTATTTACACACGTACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCG:1 - chr3R 16799814 5' + X-element 4628 1 54.81 TGAAATCGATTGATAGCACGCTCCATTGCACTATGGGGCCTTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1 - chr3R 17272012 5' - hopper 1359 1 76.19 AAAAATAAATAATAAAAAAAAGCAATATATCTATATAGTATCACCAAAGCTCATACTCGGAAAATACAGCAAAAAAAAGAAATTATTAAATATTT:1 + chr2R 1487083 5' + Tc1 53 1 73.68 CATCGTTGATGGCAACCACGACAATGCATTCGTTATTGAACCCGCCTTCAGTGGCATAGTGAGGACAAACATAGTGCTGGATCGAAAATGTTTTAAACTAATTTTT:1 - chr2L 644651 5' - transib4 106 1 77.36 TCACGCAAAGCCTTCAAAGTGATTGACACATGTTCGATTCCTGTACGAAATAATGACCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATACTACGACT:1 + chr3R 8874932 5' + I-element 4927 1 72.82 GAAAATATTTATAAATAAATATTTACTCTTCTTTTTTATTGTTTTTAGGTTTTTCTTGATCAACCATTTCTCCACCGATCTCTTTTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTG:1 - chrX 16704406 5' - Doc 4673 1 25.45 GTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGGATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAG:1 - chrX 22824218 5' - Gypsy12A_LTR 2250 1 48.94 CTGTTGCGAGGTAGAGAATGCGTGTTCTAAGAATATGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGTCTCCCGCAAATTTAAAACATAGATTAATACTAGTA:1 + chr2L 22497841 5' + TART-A 13264 1 62.75 AAACAGGGCGAAAAAATAAACTGAAGCACGTTAAAAATATAACAAAAACGAAGATCTCGAAATGGTAAGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGCCCC:1 + chr3L 3879098 5' + G4 146 1 64.58 ATTCCACGACTCTGGCACGCGAATAGATAATTCCGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGGTGG:1 - chr3L 8805201 5' - invader2 5069 2 67.27 AACAAGGCATAAATATGAAAAAAGGCGCGCTGCGTTTTCAGGTCAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGT:1 - chr3L 15848238 5' + copia 4832 1 60.00 TACTGCATCTGCACCACTAACTTATAGTAATTAATTGTAGCAACTTATAATTAAAAGAAATCGGTTTATGGAAAAAGAAATCTAAATAAAAACTTTAAACATGTACATAC:1 - chr2L 15820976 5' + mariner2 806 1 53.64 GTATTTTATGTGCATGTTTGCATAGCTTTCAAAGTTTTCAACTTTGTGTTCTGTTTGCTTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGG:1 + chr3L 18818277 5' - I-element 4972 1 76.19 GGTTGCACTCAGAAATGTTGCTGATGGTCAGCTGGGGAATGCGAAAAGCGCGGCGAGGAAAGGGAATGTTGAAATTGGGATTTAGGTAGTGTTG:1 + chrX 9906053 5' - I-element 4977 1 80.85 TTAATAACCGATGCCACCGACGTGTCGTAGAGTAAATAAGTAGACTATAAGTAGATTCTTCGAAAAGTAGAAAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTT:1 + chr3L 22953774 5' + INE-1 34 1 74.47 GTGGTGTTCGACGCGATTTCTCTTCGACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATCGGACACT:1 - chr2R 21362036 5' + Tirant 35 2 66.67 GGAACTCACAACGAAGACGTGCCTGCCGAGATCCCCGATGATTACCTGAACCGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATACAAGGCGTG:1 + chr2L 17929780 5' - copia 4940 2 57.55 TGTAAAAAGTCCAAGGAAGTGGTCTTGCGACCATGGTTACCATTAAACATGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTAAAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr3R 13298166 5' - I-element 5322 1 51.82 TTTATAAGATAAATAAAAATATAACTGTTTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGGGCGGACACAAG:1 + chr2L 21745538 5' - 1360 469 1 75.28 GTCTTTTTTTTTTTATTGTTGGGTGGGTAAATAAATCTTTAAATGACAGTTGAGCTATTATTCCCATTCTTCTTTCACTTGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAA:1 - chrX 9479383 5' - Bari1 108 1 61.68 GTGTAACGAAGGGCTCTATCTCAGTACTCATGCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 + chr2L 19212272 5' - flea 4968 2 68.81 TTTATGTTGTCATGTTAGCTTTTAGAATTTTATAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTTATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTACCACAACACGC:1 - chr2R 10407751 5' + 1360 3203 1 66.67 AAATAACACTTGTTGCTGTTTTTGTGGCCGTCGACTTACTTTTTTTTTTATTTGTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 23441084 5' - Doc2-element 233 1 58.21 TCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2R 9871537 5' + roo 34 2 68.89 TTGTAGAAAAGTCAAGATGGAAAGTCACTGCTAGAGGGATGGGTGAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAA:1 - chr2R 24643224 5' - Cr1a 265 1 53.33 TAACCGGGCGGCGCATGTTCCTGCAGGTAAAATTTAAATTAAATTTAATTATATAATGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr2R 8872477 5' + Doc 31 1 59.63 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGGG:1 + chr3R 21907535 5' + 297 6562 1 56.84 GGTCTTTTTTTTTATCGCCTTTTGTGCCGGCGGTACCAGTGTTGTTGTTGTACTGCGCCACGGTCTTCTTTATTAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGTC:1 - chr3R 9480941 5' + invader4 2927 2 72.73 CCAAAATATTTATATATTTTATACCATACAAAACAGCACAAATAACATTACAAAGCTCTGTTTAAGACCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTC:1 + chr3L 101160 5' - gypsy5 374 2 70.91 ATTTATAATTAATTGAAATATTTCCCCCTCTGAATAATTACACACACTGCACTCACTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATAC:1 - chr3R 23003115 5' + blood 7193 2 57.00 TAGGTCTCTGTGAACTCAGGAACATTGGTTGTCAGAAGAAATTAATTTAATACAGTTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACT:1 - chr2R 18398101 5' + S-element 31 2 56.36 GTGGCGCCACCCACAATAATGTTTTCAAAATATTTATAAAACTGTGTTTGCCGTCTAATTTTGCGCATAGTTATTAATATTATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 17109037 5' - roo 407 1 44.95 GGCTGAGTGCAAATGATGCGGCACGACGAGGCACATCCGCGGGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATG:1 + chr2L 20757154 5' - rover 129 2 62.86 CATATGTATACACATAGAGATGTCTAAAACGAATATACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATA:1 - chr2L 4916774 5' + TART-B 10199 1 70.00 GAAGTTCTTCTGTAAGCGATGTTTCTGGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGTTT:1 - chr3L 9096136 5' - HeT-A 5933 1 75.45 GACCTTAACTGATATCAGCAGCCAGAACCAGCAGACTGAACTCAGCTGATATTTCTCCGTACGTAGGGCACCTAAGGGGCCACTAGAGCCA:1 + chr3R 10095769 5' + Gypsy12A_LTR 1915 1 62.64 CGCATACCTATTTAATACAATTTCATTTGGGCCGATAACAGGTGATGTCATGACACTTTTGCATTGCTTCAATCGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chrX 18483256 5' + pogo 6 1 75.00 GATACTACAGATTAAAAAAAAAATATGTATATTTATTTGTACATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 + chrX 3091931 5' - opus 462 2 64.42 TATGGGGGAAACAAATGCTTTTCGATAAATATTCCATAATTATTGATGCATTTTGCAGACTCATTCCCATGCGATTAGCTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACT:1 + chr3R 13531011 5' + I-element 4903 1 62.73 CTGAATTTGGCTTAGTTGCAATTGTTTGCTTTCACCAGTTGTTGTAGGTCAGTGTGCAAAAACAAAAATCCGAATGCGATTCTTTGCGTTTTGATATTCCTCGC:1 + chr3L 6987313 5' - Bica 463 1 77.88 CATATTGAACATGCTTTTAGTGGAATATATATGTTCTTATGCATTTTATGGCACTCTGAGTTGTGTCGTCTTTTTTAACTAAATTGTACACAGTCTTACGTGATATTTTG:1 + chr3L 1058678 5' - Bari2 350 1 69.09 GATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr3L 13228465 5' - P-element 2872 1 62.89 CTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3R 21612927 5' + jockey 35 1 70.83 CAAATTGCCAACTCGCTTTGGCCAGAAAAACGTCCGGGGCTTATGAATTTCCACGCATTAATTTTATTTCCCTTATTATTGCTATTGTGTGTTCATTGTG:1 - chr3R 13207185 5' + G3 64 1 75.00 CGGCATATTTGCCACCGGCGACACTTTGCGTTGCAAGACATCCGACATCCAAGTTGCCAACTGGTTTGTGTGTCAAAAAAATTAAAAATCAAATAGAAAA:1 - chrX 19076614 5' + P-element 2648 1 81.00 TATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 - chr2R 22661298 5' + Transpac 35 2 55.05 TGCTTGCACTTCTTTGATTCGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 18675602 5' + 412 29 2 54.55 AAAATGAAGTGAGAAGTGGGAGGGAGTATGTAGATCACATAAACACTGGTGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAGACTGATTTTATT:1 - chr3R 14013418 5' - roo 9033 1 56.88 CTTAATCATCGCTGTGGGCACATCGATTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAACGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGACGG:1 + chr2R 21561581 5' + invader4 204 2 75.45 TTCGCACAGCCGAAGATTTCAATTGGGGGTGTTGGCATATACATATGTATATATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACCAAAAACTACGTAAGCA:1 - chr3R 11461858 5' + Stalker 6966 4 55.45 AATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAAT:1 + chrX 21474432 5' + 1731 4357 2 71.28 AAATGTGTAAAAATTGTTTTTTTGGGTGAAAAAATTTAGCAAAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAA:1 - chr3L 5130319 5' - pogo 100 1 68.18 GCTAATTCATTTTAACACACGCAATTTAAATAAAAAGTAACTATACGATGCTCTCACTCGCACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTGAGC:1 + chr4 660524 5' + 1360 3289 1 54.55 AACACATTTGCCTGACTTTTCCACATACTTACCCCACAAAAGGATGCTTTATTCAACCTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACCTCG:1 + chr2L 7844473 5' - Copia1_DM 395 1 69.23 AAAATAGAACACAAACACACGTAGCATTCGTTTGTCAAATCGCATAAAATGAAGAAAGTGAAGAGCAAAAAGAGTGTCCTGATGACCCTTCGACATCAGAAGTGGGATCG:1 + chr3R 12000293 5' + invader1 417 1 62.73 TCCGCCGATCATGTCAATAAACTTTGGATCCCACATTCTCGGCTTATCGCCAACCTATATTAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATT:1 + chr3R 11968675 5' - F-element 4590 1 77.27 TAGAGCCACAGATACAGATACAGCTACAGATACTTGAAGATACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 - chr3R 10079115 5' + flea 4791 2 59.43 TGATATGTTGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGG:1 - chrX 20433409 5' - diver 201 2 60.00 ATAACAATAAAAATGTAACTAATGCCTTAGCATGATGTGAGGAAAAAGTTTTATTTATTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGT:1 - chr3R 4554396 5' + Bari1 28 1 56.36 TCTCTTTCTAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATTACTGTTTTCTTTGAAA:1 + chr3L 4411183 5' - 297 6622 2 58.93 GACATCCGGATCGTGGACTAGGGAGTCCATGGAACTGCGTCGCGAGAACATCAACGGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGTCTGCCCTTTGATGTTATGTTTCATGCACTGA:1 + chr3R 28837780 5' - Gypsy6A_LTR 35 1 58.18 ACATGTGTGCCCTGCCACAGAATGTGGCACATTGCCAGCAAAAGGGCAAACGGAATGGAATCGAGGAAATTTAAAAATAAAACAAAAAA:1 + chr3R 8549907 5' + TART-C 11098 1 55.06 TGTCTTCCAGGTGATGTTAAAGTTGGTGGTGGTTCAAAACGAAAGTGATAGTGCTGCGCTAAAGGCTTTGTGCGACGCGAAGG:1 - chr3L 7662879 5' + Dm88 467 1 59.04 GAGATAGGTGGATTCTGGGCAAGATCCATCACTCATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr2R 17806155 5' - Transpac 276 2 60.87 TTTTTAAGGCAGATCCCAGCACGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTT:1 + chrX 198514 5' + F-element 46 1 75.00 CTTCGCTCTTAAGATATCCCAATCTGCCTGTATAAGCCCATACATGTCCCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTATTCTA:1 - chr2R 892461 5' + Stalker2 14 2 68.18 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTGAGAACAGAAACGAGGAAATAAATACAATGGAAAATAACTGTATTAAATATAAGTGTTAGAAGG:1 + chr3L 22908066 5' - Cr1a 4297 1 62.86 GATGGCTAATTTCAATGGCTCCACGCTGCTTGCACCATCAAGCTCCCAAATATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACC:1 + chr2R 21504904 5' + G2 69 1 64.44 GTGTTTGTCTATTGGCATATGAACAAATTTAGCTGTGCATACACACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACAC:1 - chrX 18750723 5' + BS 4823 1 53.76 TTTTCCTTAACTTTTATTTATTGAATTTTCTTGTATACGAACTAACAATA:1 - chr3L 15787495 5' - F-element 4640 1 72.00 TAAGGTGATAGCCCGCTTGACACTATAGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 16742223 5' + 412 7072 2 62.96 ATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTTTTT:1 + chr2L 8894666 5' + Tc1 1460 1 68.18 CAACACAACACAACACAACACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACTAAGAAGAA:1 - chr2L 16217660 5' - Cr1a 199 1 76.83 CTCCAATTTACTACTTCTGTTTTTCGGGACTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGCAAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAATGGG:1 + chr3R 1060262 5' - Idefix 6993 2 81.82 CAGAATCGCTTGTGACAGCCAAATCAAAAGGATCCAGGCTATCCAAAATAAGGTCGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGGGGGTT:1 - chrX 1118905 5' + X-element 4319 1 77.65 AAAGCGGGAAACGAATTCACTTACTCATGCATCCGTCGTTCATGTAACGTGCGAAAGAGATGGGACATGTTAATAAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3L 13780240 5' - blood 171 2 72.53 GGCTGTTATAAATTTCACGCTTTTCACTTAACACCGCCCCAGTCCGCCCATCCTCCCACAACTGCATCGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAG:1 + chr3R 26477993 5' + invader2 4996 2 76.60 GTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr3R 23861076 5' - pogo 2089 1 58.23 GTATAGTACCACAGTGCGGGTATTGTTCTCACTTCCTATTTCAACATAATTATGATCAACACACGGATCAAGAATAACAAGGAGCCTTCATGCTGGACGACGCATTGGCG:1 - chr3L 18873678 5' + diver 5860 1 73.64 ATAACAAGAGTAGAAATTCGACGCCAGAAGGTGGAAAAGGTAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAAC:1 + chr3R 28437620 5' + invader2 352 1 66.36 TAGGAGTCGCACACAAAAAGAGGGGAATGGAAAGGGAAAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGT:1 + chr2L 17034994 5' + Tc1-2 1302 1 54.88 AGTGCATCAATAACAGGCTAAAAACAGGAAGGAAAATACGGGCAACAAGAGAGGGCTAACGAAAGGGCGGGGGAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAGA:1 + chrX 3653143 5' + invader1 3774 2 67.27 CTTGCGTGCGAAAGTCCGATGTGTAATTGTTGATTTCAAATGTTCAGTGTTCGGCGAACAAAAGTGGCTGGCTGGGAATAAATTTTTTTTTAAATT:1 - chr2R 14426801 5' - Stalker 6757 1 50.00 GTAATCAAAATGGATGCTAAATATATAACTTGGCATTTACAAGTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 17184882 5' + roo 17 2 65.14 GTGCAAGTATGAGTATATGGGTATTGAAATGCCTAGACAGATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAG:1 + chr2R 10129748 5' + Burdock 6180 2 66.36 CAGCTGCTGCGCTCAGTTTTTTGTACACTCCATTTTTCCGCTGAAATAATTAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATCCCAAAAAA:1 - chr2R 18349694 5' + transib2 2802 1 53.64 TTTTAATTTAATTAATAGGAGTGAAAAATGTGCGCGACTAAAAGGAAACAGCATAGAGAAAAAAGTCATCTGCGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGC:1 + chr3R 19549100 5' - FB 841 2 69.16 ATTTGAGCATTTAAAGCTAAGGAAAAACTATTACAATTTAGACAAGTGAATTTGTGACAAATGAAACTTATATATTATTCTGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 7219668 5' - roo 400 1 71.82 GTTAATTGAGTCAGTCGACATTAGTTGTGTGAGTGAGTGTGTGTGATTGTGTTAACTCCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCAAATC:1 + chr2R 12403104 5' - Burdock 6085 1 62.39 ACGATGCTTTATGCTGGCGTGGTAGAAAGCGTGTTGGAAAATTAAATCATCGTTGCTTGTGGTCTCAAAAGTGTGTTAACTTGGAATTTGTTATTTATT:1 + chr3L 9038240 5' + S-element 1540 1 65.66 AACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAG:1 + chr2R 21358403 5' - 1360 3208 1 42.59 CGAATGAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACTTAAA:1 - chr2R 4339515 5' - G5A 2792 1 77.78 GATTTACGACCGAAACGTTAAAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAACTAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1 + chr3R 24813954 5' + P-element 15 1 53.25 TGAACGGCATAAGTAATGATTCAATATGCAACACTCAAAAACTATTATGTAATATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCCAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTT:1 + chr3R 1541561 5' + I-element 5317 1 55.45 CTAAACACAACAACAACAACCGGAGAGAAAGGACGAAAACAGGAGACAGCCCGCCCTACCTCGTCATCGGCTG:1 + chr3R 27816437 5' + F-element 453 1 69.86 TTAGTTGTAGTTGCCCTTTTTGTTGTTTCTGTTTTATATTCTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTA:1 + chr4 402121 5' + invader6 4553 2 61.70 TAACACTGCTATCCAAATTTCCAGCACAAAAATGGGTGTTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGGTCTATATCCATGCGCAATCCACTCCAGAGAGCG:1 - chr2L 15135154 5' + Quasimodo 7146 2 59.05 GTAGTTAAGTAATTTGTTTCTCTATAGAATAAAACCATCTTCATTTGTCTTTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr3R 1313790 5' + Doc 25 1 53.19 TTTATTAATTAGTCCTAATTTGCCTTTTACTATGCTAGCGGAATATTGCTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCT:1 + chr3R 21983141 5' - R2-element 3546 1 60.00 AGTGGGCTCGGTAACTAATCGCTTTGTTGATGGAAAGGAGCTGCATCAGGTCCAGTTTCCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGGCTTCCTTCTGTG:1 - chr2R 6195198 5' - gypsy5 393 2 71.03 ACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3L 17220746 5' - opus 7488 2 56.76 TTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr3R 10451877 5' - Stalker3T 204 1 25.45 CATTGCGATTGCTAATAAATTCTAGATTTGGATGGCAAAATGCATATGCAAATAAATAGCTAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGG:1 - chr2R 21592096 5' - Tirant 399 1 79.09 ATTGTTCTTAATTTTCCACTTTGGTCTTTGGCATCTCATCTATTTGCGGTGCCCAAAGGATTGATGAAGCCTTTCAGGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTGTCTCCAATGC:1 + chr2L 6016911 5' - Porto1 367 1 75.45 TGACCACAGGGAGGATCACCCAATCGAAGTCCAACAGAAGATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 7400804 5' + roo 8708 2 63.64 TGCGGCCAATGCAAACTGCTGGCATGCGAAAATAAACTCCACTGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCCAAGAAATCAGTAATGCACTCTCGTAATTTTCCAT:1 - chr3L 4280366 5' + 297 6639 2 55.24 TTACCCATTCCGATGTGTATCCCATCATCCCATCGTCATGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAGAACGACAGCATTGATTTCAATAAACAAATTAGAT:1 + chr3R 23501279 5' + Idefix 296 2 68.18 CTTTGATTCGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2L 18675613 5' + 412 7093 2 58.18 ACTCAGCTAAAATGGTGTGTGAGAAAGATGGGGATAGGCAACCGACTGATTTCCACGGTCCTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3R 31965266 5' + 1360 3 2 73.86 CCGCAACTTTGGGCGGAGGGCATGGAACCGTATAGTCCGGTATCTCTGCTCTCTCCTATCGTGCACATATAGACAACAATGAACCCCAGACCACTTTACAACTTTGTAAT:1 - chrX 10886480 5' + G-element 4226 1 71.82 TCTACCGCGTCGGCGTAACGTTTTCTGACGCGTTTAATTCGGGAGCGAGGCATGTCTGTTATGCGTAAAGATCGAAAAATGACTGACTGATCTATTCTTCAAAAAA:1 + chr2L 22490469 5' - invader1 3893 2 62.26 GTGATTAAGCCCTGACCTTTGAACCCCTCCCAAAAACGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCG:1 - chrX 6974206 5' + 297 200 2 67.21 GTGAATTCTTAATGTCAGACAATAAAAAAAGAAGTAATCGAACCTATAAAGATTCGTTGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAGAGGCACATG:1 + chr2L 4072804 5' + Bari1 169 1 54.55 AATACAATAATTTTGGGGGAAAATGTAAATTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCAATGCGGCAATTTATTTTGATCTGC:1 + chr2L 7841343 5' - jockey 4947 1 68.18 TACGTACTTTTTGTAATATATATAAATAATACAACATATAACATGATATAACAATCAAAATATGATTTTTATATTTTATGTAATAGTCCGAATTTTTTTTTTCAAAATTT:1 + chr2L 7168760 5' - HMS-Beagle2 400 1 87.27 GTGTACAAGAAAATGTTAGCTAAAAATACTTGCCATCGGTAAAGGTTAACACAGAAAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAA:1 - chr3L 10863401 5' + Stalker3T 203 1 66.67 ACAAGGCATCCTTATCTCGTTGGACTTCGAAACGAGGTATGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 - chr3L 20139780 5' + mdg3 45 2 60.55 ACAACACTATTATGAAAAAAAAAAACGTAATAGCTAATAAACGTATGCAGCTAAAACCTTTTGCTCCCACTAATACACATTAAACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCT:1 + chr3R 1136623 5' - S-element 1510 1 65.45 GTGCACAGGACATTCTAGAGTGAGCACAGAAAAAATATAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2R 20436714 5' - opus 461 2 66.67 CTGATTCCACCTCCGCAGTTGCATTCGAGCAGGCCCGCAAAACGTTGGCCAACGCCGCCCACAATAATAATAATAATAATAACAA:1 + chr2L 13821529 5' + mdg1 17 2 90.59 AACAATTCATCATTTATGCCAAATAGTGTGTTGCTGCTGATTGTCACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACATTCCAGGTTAG:1 - chr3R 12130053 5' - jockey 475 1 69.15 CCACAACAATAGAAATAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATG:1 + chr3R 19444883 5' + invader2 4774 1 67.05 CAACCCGTTGCCGCCAACACTTAGCCGCCCGATAAATAACCAAACTTAAAGTAGACACTAACCCTCTAGACCTTCTTTGCAAACCCAGTCCAGATAACACACAA:1 + chr2L 22778876 5' + I-element 5126 1 55.77 TAAGTATTCCAGCTTAAAAGGAAAAACTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 5018765 5' + roo 8686 2 69.86 GTACTTGTAAATTTTGCGGAAAACCGCAACAAATTCACTTATAAAAGTAATCTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 + chr3L 17706369 5' - Juan 4184 1 57.27 AATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 + chr2L 10746644 5' + flea 4774 2 58.70 GAGGTTGCTCGGAGGACAAGCCTACGATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1 + chr2R 4137542 5' + HMS-Beagle2 6907 2 66.67 TGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGTTTTGAGTG:1 - chr2L 5338012 5' + F-element 56 1 69.70 CTTTGCGTTTAGTGCAAATTCAATATCGTGCATAATTAATTTGCAATTAGCACGTTTCTGTTTTTGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAG:1 - chr3R 21561130 5' - F-element 4343 1 65.45 GCAAGGCAACATCGTAGATAAAACTTTGACAGAATTGGGGGCGTGGTCGAGGGCGTAGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATG:1 + chr3L 17210714 5' - ZAM 69 2 67.02 GATAATTATAGTCGACTAAAAAATACCTTTTAATTACATTTAAATACAATTACATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACAATCACTTGGGCACCG:1 + chr3L 18703494 5' + F-element 4345 1 53.64 TAGCTGAAAGTTTGCTTATCAAAATGTGGGGCCATGGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAACGGTATTG:1 - chrX 14710463 5' - I-element 147 1 63.30 GCTCGTTCCACTTTTCTCACACGTTCCGCAGAGCGCGCGGAGGAGCAGCCATGCTCATCAGGAGGGGCATCCAGTA:1 - chrX 11817922 5' + G2 472 1 61.84 CTATAAAAATGTACGATAAACTTGCAGTACATGGCCAACACGATGGCTGAAATTACTGTGCAAATGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGGGTTCTGCATTT:1 - chr2L 14528247 5' - Chimpo 229 1 66.67 TTACCAATTTCATTTGTTGTTACTTCAATGCTCCCGATTGTCTGCCTGTCTGCTTTTTTTTAATGTGCCAACTGTATCAAACTTTTTTATTAAGTAGTAGACAGTTCTAC:1 + chr3L 4737417 5' - Bari1 485 1 53.64 AGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTACTTTGA:1 - chr3R 27071914 5' - jockey 4952 1 64.81 TTAGTAGAGTAACTAATTATCAAATACAATCAATAACGAGGATTTCATGATGAACGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 17785873 5' - roo 388 2 67.68 GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr3L 15253229 5' + Stalker3T 202 1 22.02 CACACACACACACACACAAGCGAGTTGGGAAAAGCAATGCACATCCACATTTAGCTGGCAACATGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATA:1 + chr3R 30100734 5' + hopper 21 1 61.11 GTATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAA:1 + chr3L 25455137 5' + HMS-Beagle2 54 2 78.64 TTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chr3R 23730029 5' + Burdock 42 2 78.26 ATAATATTTTATAAATATTATAGAGTTATAAATAATAGTATTGGTCCTAGTTAGTATTTTTTCCGCACTAGATTTTTGACAGTAACATGGACTGGTAACATTATCATAT:1 + chrY 677338 5' - HeT-A 5850 1 74.31 ACTCACCTTTCCTATAAGAAAATAGTTTTCTAGCTTTAATAAGATATATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGA:1 + chr2L 16230303 5' - blood 369 2 59.04 TGAAATCTTTCGACCAGCTTATCGCCTTATCTCGTTGCCAGAGAAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTACCATGGAACACAT:1 + chr2L 4670145 5' + G2 149 1 52.00 TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGGTTTGTGTTTGTGTTTGTTTTTTTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTTTGTGTGTTTGTGTTTGGTGTTGT:1 - chr3R 28831802 5' - gypsy3 420 1 35.45 TCCGTATTTATTTATAATTTTTTCATCATTTATCAGCGATACTACTTTCTCACAATCCCGCAATTGCATATTTATGTAGGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGG:1 - chr3L 8540808 5' - accord 163 2 75.24 AAAATACATTTTCAGAATTACTTTTGGAAAATGAATTTGGAAATGTTGCAGTTTGAGTCGATGACGGTAACGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGAT:1 + chr3L 27364907 5' - F-element 174 1 68.18 CAGAAGCTTACCTTCCTCCCCTGCGTTTTGCCCCTTTTGTGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3L 19193745 5' - gypsy7 5009 109 42.72 AGTCACGAATCTCTAATACCAAAGTCCTTTTTAAACACAATTAATATTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTT:1 - chr3R 29362843 5' - F-element 4636 1 68.18 AGTTGAAATATGAGAGACACACTGGGCATCGAAGTCCCGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACACAGAAAA:1 + chr3L 19945369 5' + mdg3 5074 1 63.64 TCTGTCACTGCGGTTTATGCATATATCAATTTCAAAATAGCCGGCAAATAGCCAAGCCTCTCTTTACCGCACTCACACTCACACACACACACACCTAC:1 - chr3L 12577398 5' + Quasimodo 35 2 52.04 GTGTATTGTATTGTATTGTATTGTGTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTT:1 + chr3L 21448026 5' - gypsy7 5004 1 43.64 TATTATTAATATCCATCTAGACAAATATTAAACTGTTTGAAAGCGCGTAAAACCTGTATTTAACTATTTTATTTTATTTGTTATTATGTTTTTTTTTGTTTTTTTAGATA:1 - chrX 21309044 5' - TART-B 10632 3 37.27 TTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTAT:1 - chr2R 21358403 5' - Porto1 163 1 39.77 AACAACCAAGAAAACTAGAACCTATGATCGACAGAGCGGCACAAAGAGATTTACGTATAAAAAAATGGGTACTGGTATGAGGTAGGAATTGAACACACTACAACATGGAT:1 + chr2R 25198305 5' + hopper 963 2 77.27 TTCTGCTGTTTTTCTAGGAGTTTATTACATCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATACGCAC:1 + chrX 4208746 5' - Copia1_DM 401 1 77.27 TAGCGCAACCATTACTATTTGCTTACGTTCCAAAGGAAGTAATATTTGATATTAAATATTTTAATGTTGATTATGTAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCA:1 + chr3R 32035494 5' + micropia 5248 2 73.64 TTCTTCTTTTCTGAGAGGAGTTGTCATTGGTTTTTATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr2L 4016938 5' - opus 7495 2 72.73 AAACTACCCGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 12623726 5' + roo 60 2 80.91 AAACCTTTAAGTGCTGTTTTCGTGCGGAAGGGGATTTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCACAACCTCCTCGTGGTGGGCCC:1 - chr2R 5843231 5' + R2-element 131 1 73.53 ATCTTTGCACTGAAATGTCATTTTAGTGAGCATAATTATGAAACATGGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chrX 22861724 5' - 1360 3356 1 58.33 ATGGAGCACTTAGCGGTTCGCTTTTCAAGATTCAGGCTATGTAAATATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTA:1 - chrX 15043197 5' - S-element 1682 2 61.82 ACCAATGTGGAACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 7981202 5' - 1360 3375 1 57.32 AATTTGTTGATAAATTGCGCAAAAATGGGAAAATAGGTTAAAAGCTCTCAACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCC:1 - chrX 12863667 5' + 297 6780 2 51.92 TTTGTGCCATTATCTGAGAATATTTTCTTCGGTGTTGCTCGTCGAGACATTAAGTTAGTAAGACACATCGCACAAGATGTGCACACATTGGCCTCATATG:1 + chr2R 4621648 5' - Bica 4846 1 77.00 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGAAAAGATAAGAAAAGATAAGATAAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 204 1 37.27 AAACAAAGCTAAACAAGAAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCATTCGGCT:1 - chr2R 17866959 5' + X-element 483 1 81.82 AACACAAAAACACATCAAACTAAGAACAACACTAACAATATTAAGATTATATAAAAAAGAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 - chrX 22252859 5' - flea 236 2 64.22 ATACATTTGTGCGCAAAATCGAAGCACGCAATTCTTCACGTGCCGTTTTGTTTTGCGTCTCTAATCCACTCGTTTACTATTCCTCTTTTTCCTTTTTT:1 + chr3R 7266668 5' - Bica 346 1 59.18 AGACAGCAACAAGCCATATCAATTATTCAAGCATAATTTGAAACATTCTCATACTGAAGGGCAAAGGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTT:1 + chr3R 27614158 5' - 1360 172 1 54.55 AACAAATAAAAATATACAGTCACACCAAATGCCTGGCCACTCGAGCCGCAACAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 19449945 5' + roo 8681 2 49.47 ATGGACGGGCACGATGCTCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATA:1 - chr3L 14969747 5' - gtwin 7322 2 68.52 GCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr2L 6243734 5' + 412 7093 2 58.18 TTATTGTTTGGCTGAGCTTTCGCTAAAACTACATCTGCAATTTTTGCTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGT:1 - chrX 13703279 5' - I-element 380 1 70.00 CGGATTTTCACTTGAGGGCGTGCGAGTCTCAATGGCAAAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chrX 5515642 5' + copia 5 2 73.00 TAATAAACAATCTTTTTATCATAAATATTCAAAAGTGAACTAGAGATTTGTTGCATCTTTCTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTTTTTGCTTA:1 + chr3R 24102771 5' + Bari1 292 1 63.64 ACATGATGAATCTGCATAAGGGAGAACCACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3L 18915137 5' + 412 7087 2 55.45 TGCATTGCCTACTTGGCGGCGTCTTTTATTTATGTATCTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTTAATCTACCGTATCTT:1 - chr2L 16415703 5' + Circe 84 1 61.70 CGCGTGCAGATCCGCAAAAACAATTGAAAACAAACAAATATTACATTAGTGCTGCAAGTCAAGCCCAAGTGCAACCATCAACTAAAAGCGAAAAGACACTAACACATATG:1 - chr3L 20037805 5' + Porto1 103 1 70.00 AGAGGGGGTGGGGGAATTACCGACCCATCGGTACC:1 - chrX 21667998 5' + ZAM 7962 1 77.14 ACAGCAACCGACGACAAAGAAATATCCGTTTTACACATCCTACACTTGTAATCATTTTTTTCCGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTG:1 + chr2R 20711440 5' - Bica 491 1 60.00 AAAGTCAAGTATTTGAATGCAAATGACTCGCCTCCGTAAAGCAGGCAAGCATTTCACGTGTTTTTCGCCCTAAACTAACTTACAAATATTTTTTTTTCTTATTTTTTTGT:1 + chr2R 19356113 5' - G2 3076 3 61.82 GGTCGGAAATCGAGTTGGGTTGCGATACTTACCAGTACTCGTACAGATAATGAGGGGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGAT:1 - chr3L 2346401 5' - F-element 4427 1 60.61 GCACGAATAACGAGCAAAGTTGAATTCTCTATGGGAAATTTAGATTTTGTGTGTGAAAGCGATGCAAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAA:1 + chrX 23065234 5' - Cr1a 223 1 69.09 TTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATG:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10415 1 71.91 TTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 15524409 5' + pogo 42 1 68.22 ATATTTCATTTTCTTAATTATAATACACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCACAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr2L 9488159 5' + 297 53 2 80.56 GGATGGCCAATTTTGGCCATTTATCTTGGCCGTATTCAGGGATTTAATACGAAAAACTTATCGAAGTGAAAATGAGTTCATCAATAAACCAAATAGAAAA:1 - chr3R 8681114 5' + Dm88 324 1 67.00 GGTGTTGGATGAGGCTCTTTTCAACTGGTGGTTTCATTCTATTTTACTTTCTTCTTTGCTATTCCCTCAATGACAAGTTTTATTTGCAA:1 - chr3R 7057374 5' - Doc3-element 4456 1 65.17 AGTATTTTTTATTTTTCTTCATTCGTCCTGTAGTGACCCACCCAGTTTAGGCCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCG:1 + chr3R 9461377 5' - Doc 4400 1 57.27 AGGAAATAGTTGCAGTGCCTAATCAATTCTGTCCCGATTTGGAGCGACGGAATATTATGACCATAGGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCAGATAGAGCAACGAATCGTGCAT:1 - chr3L 16915527 5' + R2-element 3493 1 67.27 GTATTTAATATGCTTTTTATTTACCAGCAACAATTTATTTCATCATATTAAGTCAGATAGTAGTTATCCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2L 7750516 5' + opus 7022 2 44.55 TTGTACGAGTGCACTCGAGAGCTGCTTTATAATTATGCGAAAACGGTTTTACCGGTTTTTCCACCCACATATTTTTTCATTTTATTCCCCATCTATCGATATCCCAGAAA:1 - chrX 5201578 5' + INE-1 498 1 70.91 GCCTCCACCATCATTTGGGATTCTCATTTTGCATTTATTTTTGCTTCTATTGTATGTTTGAGCATGTGTGTGGCTTTTATTTTTTTTATATATTTT:1 + chr3R 10904643 5' - TART-B 10507 3 66.67 TCCACACGACAACGCCCCCGAATCTCACCCCAATTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGTGCAAT:1 - chr2L 14661522 5' + F-element 4273 1 60.94 CTTAACACGCAGATTAACTTCTTCTTGTATGCCCAAATTTAGTTAATATCTAATTTGCTAGC:1 + chr2R 7173889 5' - I-element 5235 1 66.13 AGGGGATAGACCTATGATTATTGGTTAAGGGCTTGAGTCCGGGGTAGCGGTCTTGTTGTTTTTGTTGTT:1 - chr3L 5970589 5' - I-element 133 1 72.46 GTTGGTCTGGGTAACTCTAGGCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTACGAACAATTAAATA:1 - chr2L 6243754 5' + 412 18 2 63.89 GAACCAGCAATAACCAGCATAGAGCACAATTGGGAAAAACATAGACCGTCCAAATCACCTTTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAA:1 + chr2R 5356721 5' + Stalker3T 28 2 61.82 GAACAGGCATAGATACTAGTACCTACATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1 + chr3R 19058391 5' + Burdock 6192 2 77.27 AAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAA:1 + chr2R 1320682 5' - diver2 349 2 54.08 ATACTCATTTTGAAATGTGAACAGAGTCGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCG:1 - chr2R 18420426 5' - accord 225 2 57.50 TCTTTTAGTCAGAAATCTAACAAGATATATTCTAGATCAGGATCGATAGCCGAAGTCGCTTTGGTCTTGTCCGTATGAACGTCTCGGTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 - chr3L 8717553 5' + INE-1 153 1 78.18 TTTCATGGCCAAGAGGAGCCGTAAAGTATGAAAAAAAAATAAGATAAAAGCAGGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTG:1 + chr2R 21462993 5' - Porto1 446 1 62.37 TACAATGATCTCGAGCAGTCGACGGACCACAAATGTTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCAATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr3L 15968283 5' + P-element 4 2 77.27 AGAATTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATAT:1 - chr2R 23354373 5' - Tabor 471 2 59.62 CCCGCCTAAGCCAAGTATTTGCTGATTGCGGCTTTGTTGTTGTTAGTGGTTTTGGGAGAGCAATGCTCTTGG:1 - chr3R 25640558 5' - 17.6 7190 2 59.72 ATCGTTTCTGTATCAAGATCGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTCACTTAATTTTTT:1 - chrX 22717180 5' - pogo 2038 1 79.09 GGGTTTCCCCATTTGCTGCAGACCGCGGAACTTAGGGCATACGACGCCGCAAACTGCAGCCGGAGTTTTCATGCGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAGA:1 + chr2R 15693455 5' + HMS-Beagle2 6892 2 70.64 TGAATGTTCGGTGTGGAATGGATGGAAATTGTATAGATGTACAAGTTTGTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr3R 15524482 5' - pogo 2081 1 56.38 CCCTTCGTGAGGTGTCTCACTTTCCGCCCCAAATACCCTGTAGTTCCCGCCTTTGGCGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGG:1 - chrX 8884092 5' - I-element 160 1 54.74 GTTAGTTAGTCCCAAATGCGATATAATCACACCGAAACAATCATTAGCCAACATATACACCCCACTACAACATACACTACTCCGGATGTACCC:1 + chr2L 13742497 5' + Idefix 81 2 59.14 GAATTATTTTATAGTTATGACCGTGACGCCGAAATTTGCATTCCTTTTGTTTTAATAATACTGTATTGTTGCCATATTCGGGTGGCATTGGAGAAGCGCACTCTTCGCTC:1 - chr3L 10961417 5' - Doc4-element 171 1 77.27 AAGAGTCTAAGGCTCAATTAATGAAATTTCATTTAATTACCAGCGGGTGGCAGTTCCCAACACCTGGATGGTATAACTCCTC:1 + chr3R 19475301 5' - G5 4383 1 63.41 CTTTCTGCGTTCCTCGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 1291036 5' + 412 37 2 59.62 GTTGTTCCACGGCAAACTTGCGTCCGGATTTTCCCATTTAGTTTGTTTTTTATATGGTTAATTTGGGATGTCTTAATGCATAGCATTATACATGCTAAGGCTTTTTCGT:1 + chr2R 13054285 5' - Dm88 489 1 55.96 ATGCAACATTTTCTGGAACATAAAATGGAAATAAAATCGGAGAAAAAATAAAAAAAACAAGAGGGAATGCTATAGTAGAGTTCCCCGACTATCA:1 - chr2R 5741211 5' - INE-1 563 1 89.36 CACAAAATAATGGAGAGAGAATAAAAAACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCAT:1 - chr2L 19681393 5' + Bica 4675 1 66.25 ATAAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 - chr2L 2484417 5' - jockey 4953 1 56.36 GGGTGACGACCAATATGTTATCCCTGATGATTTGTTTGACCTTCACATTCGCCACCCATACAAATTTTATGAGTACACAAAATGACCTGCTGCCG:1 + chr2L 12928295 5' + hobo 2731 1 61.05 TTAGCATCCGCATCTTGGCTTTAAAAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTAC:1 - chr3R 21163781 5' + I-element 4983 1 77.27 TTCAAGGCTAATCACATGGCGAAAATGTGCAAATTAATTTATGCAAGCAGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chrX 9576525 5' + FB 35 1 58.33 GGGCAAAAAGAAAATAAAGAAACACAACGGCAGTTGGTCTATTCGTCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr3L 21103480 5' + Doc 5 1 68.25 CGAGGCACTTCCATGTCAACCCACAATTCAGATCGTGCCACACTCCAAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTTTGATA:1 + chr2L 18725978 5' + Bari1 499 1 60.00 ATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATAGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGACG:1 + chr3L 36323 5' - Tirant 359 2 72.22 GGGGATGTGAATGCCAAAAAAAAATGTGGGTCGGGGTGGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 - chr2L 17574440 5' + hopper 43 1 63.64 TATTTGCTTTTTCCTCTTTCAAAGGCAACTAGATGTGCATGTCCCTATTCACGGCTTTACTAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACA:1 + chr3L 12742201 5' - flea 342 1 77.78 CATTCCTTTTTGGTGCAGGGGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATATACGGCAGGAAAAACAAATCTTCTAAAGATACC:1 - chr3L 21498663 5' - Rt1a 5040 1 51.28 GTTGAAAATACTTCTTTTCTGAAGAAAGCTAATGTAAACAAATTTTCAGCTTCCAACAACACTCAAAATCCTTATGAGCCGATATCAAAAGTGGGATCTGTG:1 - chr4 779456 5' + micropia 473 1 54.90 AGTCAAATAAATATAGGCAGATAAACTATAAAGCAGTCAATCGTCTTTCTTAGTGGCTCAAAATCTCGGAGCAGACTTTGTGTTGTTGGCCAAAATAACACAG:1 + chr2R 6078060 5' + G3 419 1 61.17 TATGCCGCTCTTTATTGGCTTTTTATCGTTCATTTATTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr3R 5774847 5' - I-element 5303 1 69.09 AAACAAAACGATATTGCTGGTGAAAAAAACAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCAAG:1 - chr2L 16653641 5' + 297 6528 1 80.39 CAAAAAATGAACGAACGACCAACACGTGACTACACCACAAAACTAAAGGAAAATAACTGTAACTGTTCGGCGCCCGAACAGGGACCAACAAATA:1 - chr2L 10582211 5' + HMS-Beagle 271 2 61.70 TTTTTGCGGCAATTACGAAGCAATTGTTAAACGTAGTAATTATCAGCGACAAATATTGTAATGCATACTTGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAA:1 + chr3R 26472359 5' - hobo 2690 1 71.82 CAATCAGGCGCCCGCTGCTAAGCCACTTCGGCTAATTGTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGTAGTTCCTAGCTTCCTTG:1 - chr2R 16077901 5' - jockey 4689 1 57.45 GTTGTCGCGAAAGTTTCCTGACTGTTGGAGAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCATCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTC:1 + chr2R 5649157 5' + I-element 5132 1 70.91 GGCGGAACTTTGGAAATCCTACGATTCTGGCTCAATTTCTTTCCCTATACCGCAAATCCAAAAATGTAAATATGCCATAAATTGTTACTATATATTTTTAAAAAAGAAAA:1 - chr3R 19565217 5' + TART-C 11034 1 58.18 ATACAATACAATTCAATACAATACAATACAATACAATACAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAA:1 - chrX 12946235 5' - transib1 1900 1 61.19 CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTTTT:1 - chr2R 1982172 5' - Stalker4 347 4 75.45 TCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAT:1 + chr3R 21993225 5' - jockey 4941 1 70.00 ATTAAGTACAACAAAATAATTAAAGTCAATTAGTGGCTCTGGCCTGTGCAACTAGCTATCGCATATCCAGCCACATTTTTAGTGACGGCCAAAA:1 + chr2L 10673455 5' - 1360 3328 1 70.21 CGCTTCTGTCTCCATTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chrX 9845553 5' + F-element 33 1 57.80 ACGAAGTTGCAAACGGTAGCAGAAACCGCAACAAAACAATCGAGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTGTCGG:1 - chr3L 20658008 5' + diver2 4746 2 53.76 CTCGATCGGTTTTGGTACACTGCAAGAGATACGTTCGAACGTTTTATATGTTTTATTTTAATCTTTTTGAAAGTTTTGATTTTGTGTCTCCGTTCACAGTGGTCTGATTT:1 - chr3R 16496565 5' + Cr1a 404 1 66.36 TGATACTTGATTTGTTCATAGTCCAATGGAGTCTTTAAATACAGATTTCCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTAC:1 - chr3L 20016757 5' - Stalker2 7555 2 54.55 AAAACACATACAACTACGTATGCATATATACACTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 - chrX 15227677 5' - hopper 1367 1 66.97 TTGTGTCAACGATGAGTAAATGTGTTTTTTACCCCGCTCTCTTGGCCAAGCAATTTATTTTAAACGTCAGAGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 17490747 5' - roo 392 2 62.96 CAAAAATCAACGACAGCCAAACCAGATGAGAGTGCCAAGGACGAAGAGGAGAGTATCAATGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGG:1 + chrX 7369708 5' + hobo 2925 1 68.75 TGGCCCCACAGATGCGAGCTTACACAGATTTTTTTTGTGTCTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2L 9754796 5' - 1360 3384 2 61.64 AATTACTTAAAATGTTATAATTCTTTTGAATCAATTAGTTTAAGTGTTAAGAAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCAC:1 + chr3L 19248841 5' + Bari1 1701 1 59.63 TCCTGAATTAGCCCGTCAGGCCCAAAAAATTCATACCTTCTTAATAGTTTGTGCCATCTTGAACTTTCGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGG:1 + chr2R 1338251 5' + accord2 176 2 68.09 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAATTGTTTTAAAAATGTAA:1 - chr2L 16217660 5' - Stalker4 409 1 24.49 ATCCAAAAAATGAAGAAAGATTTCTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTGACACCCCAA:1 + chr3R 19447837 5' + X-element 110 1 76.36 AAAATTCGTTTAGCTGGCAGGCAATGGTGAAAGTGGACAATGGGCAAAAGATAATAGTTAAAGGTACAAACTGACATTTTTAATTTTAGTCAGAAATTGTCAGAAAATGA:1 + chrX 9541853 5' - transib2 418 1 65.45 GTAAAAAAATGAAATCTTTCGACCAGCTTATCGCCTTATCTCGTTGCCAGAGAAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATG:1 + chr2L 4670136 5' + G2 150 1 51.82 GAGCGCCCGAAAGTAGGCAACAAATTGTAGCTGCTTGTGCGTACAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGGTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr3L 10702623 5' - hopper 1392 1 51.09 TTTTTTATTGTGTTTAGTTGTTTGCTTTTGTTGTTTGCGCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTATATGTATGAAGG:1 + chr2L 16531028 5' - Tirant 8465 2 64.55 TACAAGAAAGTAAACTTTGATTTGAAAAATTCGAATAATAAAATAGATCATATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCAACTTCCATTATTTCAAA:1 - chr2R 10859695 5' + 297 6607 2 58.18 TTCAAATAATAACAATTACAACATTATTCATGATAATTATTATTGTAATATTGTACTTGTACTTGTACAGACAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 + chr2R 883064 5' + F-element 28 1 53.21 ATTAAAGCTGAACTAAATTATCACAGTTTTGAACTTAACAAAACACATATTTAACATTGCTCACCACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTACA:1 - chr3R 16981335 5' + gypsy7 278 1 58.95 GGCGAAGGTAAAAGCGAAGGCTTCCGAGGCACGTAAAAAAAAAGTTCAAACCCGACTATGACGAAAAAAAATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGATTTCAATTTT:1 + chr2L 2109929 5' - FB 39 1 50.91 GCTATTTCTCACCTTTCAGCTGTCCTGGAGCACTCATGTTCTTCTCCTTTTCCTTTTTGCTCTTTCTTTGCTTCTCTTTTTCTTTTTCTTGTTCCTTT:1 + chr3R 5556240 5' - Doc2-element 240 1 59.18 TGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGTTTCTCGTCACTCGCT:1 + chr2L 14708881 5' - opus 7478 2 65.75 TTTGCCTCTTTCTGAGTGGGTTCGAAAAGTTTTTATAATTTGTTAACAAGCCCAAGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGACGCG:1 - chr2L 1416199 5' + jockey 35 1 64.21 GTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACAAAAGACACTAGAATAAAAAGATGAGTAA:1 + chr3R 7049647 5' + 1360 8 2 62.34 AAGAATACAAACGGTGTGGCAATGGATTTTGCATATGTCCAGTCAATATAAGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGA:1 + chr2L 20854873 5' + Dm88 4534 2 53.64 AGTTAAGGGAGCACCTTGCAGGCGAGGAATATTAATCAGACATACACTTGCTTCACACACACACACACAGCGGCAGAGAGGCAAGATTACAGATAATAGGATAAAATCTA:1 - chrX 12930143 5' - Cr1a 4213 1 72.73 GAGAACTTGTGCGTCTCCTGGGGTGCATTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGA:1 + chr3R 9469416 5' - jockey 4605 1 57.63 AGGGCGAAACCATAGCAGTAAGATCAGAGCGTAAACATTGAGAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGC:1 - chr3L 10665886 5' + 1360 486 1 62.73 GCCGCTTTTCCCTTCCATTATGCTCGTTTTCCGTTTTTCTGTGCATTGCTGCAGAAATGTTCTTATCATTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCT:1 + chr3R 10457838 5' - Bari1 129 1 77.89 AGCGCTGCATTTCAATCAATTTTAATATGTACTTTTATGTATATTTAACAGTGTTTTTATTTGCCTCAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr3R 19058473 5' - Burdock 6377 2 60.00 CTAAATCATAGAACTATAAACACGATTTTTATGACATTTCCTCATCAGATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 13481245 5' + roo 37 2 57.27 CTACCCATCTCATTTAGGCCTTTTTCCCAGGCGCTTTTCCCGGGCCATTTTGTCAAATTTACAACGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCT:1 + chr2L 4312540 5' - 1360 168 1 55.56 TTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 - chr2L 4016896 5' - opus 455 2 73.40 ACTGGGATCCCCCTTTTCGGTACAGGCGTGCGTCGTATTTACGGTGCTGGGTGCGCAAAACTCGGG:1 - chr2R 15001271 5' + R1A1-element 5067 1 60.61 ATTCGAAATCCATTACCGTTCATTTAACTTCGACTACACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTTGTACAGCCCACGCACTGT:1 + chr2R 8864434 5' - Dm88 363 1 64.71 TGGCATTGCCACTCACCGTTGTTGCAGCCACAACCTGTATTGGGCAGCGGCAATTACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCC:1 - chr3L 13556834 5' + hobo 2709 1 65.82 AACACTCTCGCACACACACACGCAACGTTTTGTTTGATACCCTCGAAAATCAGGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chrX 12271553 5' - pogo 2089 1 63.44 GAAAAACTATTACAATTTAGACAAGTGAATTTGTGACAAATGAAACTTATATATTATTCTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 7219689 5' - roo 395 1 61.70 AATCTGCCTGTATAAGCCCATACATGTCCCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAAGTAC:1 - chr2R 892441 5' + Stalker2 7282 2 50.00 TTTTGATTTAACTTCAATTTTCCTAGCCCTATTACACTTTTGTCCCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTA:1 - chr2R 8047605 5' + G2 394 1 61.11 AGGATCACCCAATCGAAGTCCAACAGAAGATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 7400793 5' + roo 50 2 72.38 TAGCTTTGCTAATAAACATTAATTGGTAATATCTTATCTTAATTCCAAAAACAAAATACATTTTTGTTAGTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATC:1 - chr3R 5445900 5' - Dm88 4242 1 71.82 CAAGGCTTGCACTGCAAAAGGTTAAGGACGACCTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 18675672 5' + 412 7095 2 66.67 GAATTTGGACCAGGATGCGGCCCAGGAAGACGCGATGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGG:1 + chr2R 9569514 5' - Doc3-element 259 1 66.13 GAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 981617 5' + 1360 4 2 61.82 TTTTGTTAGCCCACGTTAAGGTAGACTTTCAAGAAGCAAAATCACATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAG:1 - chr2L 3648809 5' + Doc 4438 1 51.43 CCTTTCCTTTGTGTTTTTCTTGCAAATTGTTATTTGCCATCGTAAGTGCCCCTCCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAA:1 + chr2L 5586824 5' - 297 41 2 56.36 CGATCTGTCTGCAGTCCATGCCATCTTTCCCAAAACTTTTTGAAAATGGTATCACTCCTCTATTGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGTACGGTTTT:1 + chr3L 12649322 5' + Q-element 198 2 78.18 AAAGACCAAGGACCCAGGACCCAGGACATGCCGTGCAGTTGCAGTTACATATGTTTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCACCAGAG:1 + chr2L 1862386 5' - accord 153 2 61.00 ATCTTTTGTGCTCATTAGCATTGTGTTCCCCTTGCTATTTTTCATACTCTTCCTTATGATCCACATGCATGTGTGTAGCATATAGCAATTGTAATAAACCAATATATGC:1 + chrX 2552004 5' - blood 379 1 79.82 GGTCGAAATACCCCCCCTCCTCCACCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTT:1 - chr3R 16845702 5' + gypsy5 137 2 76.79 TGATATGAACTTGATAAATTTGAACAACTCTTTAATCAGGAATCAGAATTTTAATCAGAAACTTATTTGCCAATAGATAACACAATATAATAATAATAATATTAAAAAT:1 + chr3R 6769699 5' + mdg1 39 2 64.22 CTCGAGGAACCGATCGTTGAGAACCCCTTTGCCTTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTACTT:1 + chrX 13613102 5' - Stalker3T 199 1 54.74 ACAATTAAGTAAAATACTTGTGTGAAAATCAAATAACTTAATTTACTATTATATTTAAAAGAAGGGTGGCGTAGTTGTTTTCCGCTGTTTGCGGGCGTTAGAGTG:1 - chrX 707434 5' - INE-1 221 1 61.90 TTTAGTTTCGATTTCAGTGGCGCAGTGAACAAATTGTGCCCATTGTTGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATG:1 - chr3L 20612256 5' - gypsy11 4302 2 57.94 TGAAAAGCATAGCATACTTTTTTGGGCTCGCCTTTAAGAAAGCATATTACTCAAGTTGGCATGGACATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGC:1 - chrX 5859406 5' + BS 19 1 69.39 TTGAGCTTTACCGGGAATCTTTTCTGTCTTATTTTCGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTCCTCGGC:1 + chr2L 9171419 5' - opus 7485 2 58.95 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTACACGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCT:1 + chr2L 16217660 5' - Rt1b 4895 1 65.56 TCGACTGCAGTTGAATTGGAACTTGGGGGCAGAAAAGGCAGAATCGCTGGCAGAAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGGTTATGTGGATGCA:1 - chr2L 12618332 5' - Cr1a 266 1 70.83 AGGCAACAATCGCAATGTGGACAAGGAGGTCGTGGACAGGAAATCCTATCAATGGTTGGGCGCCAATTAGAAAAAGGGTTGGCCG:1 - chrX 16769931 5' - gypsy2 333 1 76.47 TAAGGACCACAGGACAGGTCCAAGATATATTCAGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2R 16462326 5' - roo 354 2 67.27 AAACAAACACACGCTCCCCACGGACGGGAGCCAATTCAATAACATATTACGAGAGTCAAGCTGTAAAAAATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCA:1 - chr2L 10811212 5' + TAHRE 10315 1 66.36 GATGAAAAGTGGTAAAAGTGTAAAAGGATATATGTAAACAAGAGAGAATGCTATAGACGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTAACTCTGCT:1 - chr2L 21343415 5' - INE-1 545 1 60.22 CACCTTCGCAACCGGTGCCCCAAGAACCGAGGCGATTGCCATCTTGCCCCCGAATTCCCCATTGAGACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACAAGATAGGAAT:1 + chr2L 17262175 5' + Idefix 6917 2 63.64 CTATTTTTATACCCGTTACTCTTAGAGTAAAAGGGTATGCTACAGGCAGAATGAATCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCTATAGCCGATTC:1 + chr2L 11924454 5' + INE-1 92 1 75.45 ATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTTTTTTATTGTATTTTATTTTATTTTATTGTATTTT:1 + chrX 12946235 5' + transib1 1898 1 49.23 ATACGCCCTCAGTCCTCATAAGAGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATT:1 + chr2R 6537900 5' - roo 9038 1 51.82 CGCAGATTTTTGCCTGCCTTTTAATTAGCCTGACATTTATTTCGTGCCGGACTTCTTCGTCGCCGTCTGTCAGTCAGTTTTCAGTCATTGCGCAGAACAGACATGCCTCG:1 + chr3L 19163613 5' + invader1 323 2 64.55 GTTGGCCAAAAGTGTAGCTAGTCTTGGCCAACTGGGAGCGCCTTGCGTGTCCAGGCACAAACCGAAAGGAAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 16464251 5' + Doc2-element 240 2 69.77 AATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGCGGAGATCTG:1 + chr3L 23456278 5' - gtwin 439 2 56.57 TTATTTCGAGTGCCTCGAATATCAGATACCCAATCATTGCACTCAAGCTCCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCC:1 - chr2R 10162648 5' + F-element 4496 1 65.56 CCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 8621712 5' + jockey 36 1 68.00 CTGAAAATGACCGAAATGAAAAATAAAGCCAATTTATGGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTAAT:1 + chr2R 11532892 5' + mdg1 7373 2 56.84 AGATCAAAACCCTCGACTTCTACAATTTACCAAAGCAAACTGGTGAGTACTAGGGAATTTTACAAATTGTTTTGAAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 20903036 5' + roo 8671 2 73.39 AATAAGATGGGAGGGCAAAATATTTCCTTCCTGACAGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGGAAAAACGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 - chr2L 13558230 5' + FB 32 1 54.35 TGTGTGTTTGCAAATGTTTCCATTTGTCGCTGGCCGTTCGCTCGTTCATTGTGACTAGTGACTAAGCGCGATATGATTGCGACGGACTTAGGGAAATATTTTGTATGT:1 - chrX 2595054 5' + HMS-Beagle2 227 2 72.22 CCTGCGCAATTTTCATTGAAATAATATGGCATTGTGGTGGAAGGATTGCGGGGCCGAGCTTTGAACG:1 - chrX 996865 5' - Idefix 254 2 71.64 AAAAACTAGATAAATGTTGTACAAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGG:1 + chrX 17330085 5' - opus 490 2 68.82 ATGGTACACTCACATGATAAGGAAACTAATTAAGCTTCAACTCTGATTAACAGCAAAAACTCTTTCCTGTGTCCTTTGAAATTAACATGAACCTAAACACACACATACA:1 + chr3L 13713241 5' + accord 7097 2 75.23 AAAAAAAAATTAATTTAAAGGATGTGGTCAAGTCATTGGACTCTGTGGCACTTACAATATTTCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr2R 9963748 5' + pogo 4 1 73.12 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy7 5004 1 27.27 TCCTCAAAGTGTGCTACATAAAATTGCACAATATGCGCATTTTTTTATTTCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTACTTTGATC:1 - chr3R 17927498 5' - jockey 4950 1 62.73 AAAACATATAGTAAACACAGTTAATCCGACATCGGAATCAAATAAGAAATGAGTTTTTAAACAACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAA:1 - chr2R 9950559 5' - S-element 1703 1 69.09 TAAAAACGGAAATATTAAATGAGTAGGCGTTATAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAAGTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGT:1 + chr2L 7596201 5' + invader4 2656 1 69.52 ACATACACCAGCATTGATAACTCATGACTGAGCTTGACGTTGACTAAAGAGATTGGTTAGGGTCACACATATTCGATTTAATCAGAATGTGAAATCACAGAAGGAATTCC:1 - chr2L 2439105 5' - invader4 2787 2 72.73 AGAGGGTGGAAAGGAGGGGTGGAGAAGAAAAAAAGTAAACATCAGCATCAGCAAAGATCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGC:1 + chr3L 21013672 5' + Doc2-element 4570 1 64.44 GTCCCTGCGATTTTGTCGTTTTGCTTCGGATCATTGTGTTGTTTGTGTTGTTTCTATTTTGTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTCCTAAAATTAAT:1 + chr2L 20939501 5' + hopper 20 1 62.73 ATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATAAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATA:1 - chr2R 5173216 5' - Stalker4 401 1 61.80 AAAAGCAGCAAAGCGGAAAGGATATTTTTGCGAAGTCCTAATACCTTGGGTAAAAGGGTCGTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 20398557 5' - roo 390 2 62.26 ACACACATCACTGATTGATCACTGCTCATGTTAACTTAAGTTCGTTCATGGTGTTGTTGTTGGTTGTGGTTGTTGTTGTTGGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTACT:1 + chr3L 3371121 5' - copia 250 1 75.45 ACTCGCAGGAACCACTTGACGCATTTCAAGGACACGTGAAGTCTTTGCATGAATACACACACACACACATATTCACACAT:1 + chr2L 16715651 5' + accord 7037 2 56.25 TTTGTCTTCGTTATTGACGGATCATTTATTCGACTGACAAAGTTAATAACTACGTAAGTATATATATAAGTTAACGCAAGATCCACTTGCATCAGGG:1 - chr2R 3146371 5' - opus 490 2 65.98 TGTGCGATACTTTCAAAATATGTTTGCAAAAGCTATGTTTTTTTTATGAAATCATTTTAATCCATTAAAAAAATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 + chr2R 10859578 5' - 297 389 2 66.36 CACGAATGCACCTATTTTCCTATAGTACATACAACCAGAAATAGTTAAACGAAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGGACACACTGTAATCAAAGGCAAAATAAA:1 + chrX 3388018 5' + TAHRE 10372 2 52.73 TCCACCAAATAGAGCAGTGTTACTTTTCAGATCCCATTTGTTTTGGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGATAAAC:1 + chr2L 19808502 5' + copia 4889 2 54.95 TCACACGGATGATGAACTTTTTTTTATCTGTGAGATGGCAATGTCCCACTGTTGCTCCCGGTGTGGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTAT:1 - chr3R 28742292 5' - I-element 122 1 68.18 ACTTGTGTTCCCATCCAATCAGCTCGAATCACTTCAATATCTCTCATCCCCAAATCCTCTTTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAACTATAAGTACAC:1 - chr2R 21735266 5' + blood 7036 2 57.27 AAATTGTGACCTTTGCACCCGAAAGTAAAGCCACGATCCCATACCCAGTCTCCTGTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTC:1 + chr2L 9874063 5' + 1360 3280 1 55.66 TTTCCCAGACGTTTGGTGCCAGTTTTTATGCTAGCTACAAAGAATGGGATGTTTTAGATCGTTTCTGTATCAAGATCGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chrX 22717237 5' - pogo 2095 1 80.00 GAAAGGGGAAAGCAGAGGTGTAGAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAG:1 + chr2L 12643014 5' + R2-element 3275 1 72.29 TGTAAAATGCGTGGGAAAGACTAAAAATTAGGTAGTGCTGTTGTGCATGCCTTTATATGCATTAACTGCGTTGCTTTTAAATTTAAAAACTTGCCAGGGCCTTTTGATCG:1 + chr2L 5432690 5' - Copia1_DM 493 1 68.18 ATTCATTTGTACGGAAAAGAATAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr2L 17855746 5' + 1360 59 1 67.65 CCGCCGGGTTCTGGCATAACTGTCTCCTCCTCGCTGGCCTCCTCCTCGGCATCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCT:1 + chrX 11991403 5' - R2-element 3153 1 58.95 ATCAATCTGGTACGTTGGAAATTAACCAAAAACAGCATGGGAAATCAATGTGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCCACAATGCATACTCTTCT:1 - chrY 1007027 5' + Doc 278 1 50.00 CTTTTATTGAACAGAACTGATCCCAGTAGGTTTTAAAAGGTCATTTTGTGCTGGCCCACATTCTTAAATAATGTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCA:1 - chr2R 21428361 5' - Quasimodo 146 2 66.36 AATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr2R 9408180 5' + FB 32 1 58.00 ACACTATTCACTATTCACTATTTATCGCAATTACTATTTGCGCTTATATTTCCGTACTTTACTTTTGCAACAAAACGACTTTAGTTTTTTCTTTTCTTTTTGTTTGTG:1 - chr2R 24817410 5' - mdg3 5094 1 79.63 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCACCTAAGTAGCTTTGTATGAACA:1 - chr3L 23730764 5' + gypsy 34 2 69.23 AAAACTTTTCGCCAAATTCGAAATTAAAATTGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 7049613 5' + 1360 7 2 74.55 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAA:2 - chr3L 14971177 5' + 1360 3306 1 74.55 CAGGTGATTCTTACCCTCGAAATAAGGTACATATTTTACTACACCAACCCCCTCCTCACAGCCACCACAAACATAACCCACAACCACTACCTAAATCCCAATTAATTAC:1 + chr3R 9448741 5' + I-element 4983 1 61.47 TGCGCAGGCGCAGTTTGTTGTCGGCTCTCACGCTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACAATTAGTTGGTTG:1 - chr2L 606177 5' + gypsy5 6983 2 53.25 AAAAAAAACAATTCAACACGAAAATATAAATATTAAATATCCCACCAATACTGTAATTATTACTAAAATTAATAATGCATGATCATGAAAAAAAATTAATTGTTCTATTA:1 + chr2L 15547519 5' - TAHRE 62 1 31.82 TGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTG:1 - chr2R 21199696 5' + jockey 20 1 45.45 TTGATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 20167946 5' + 412 7094 2 76.67 GTTTGGTTTGTTGTGTTTTGTTTTGTTTGCTTGTTTGCTTGACCTTGTTGCGAGGAGTGCTGTCTCCCTCTAAGGCCTCTTCTTTTCTTTTTCACATCTAGTCACCCAAT:1 - chrX 1018550 5' + Porto1 4615 1 69.09 TGATTTATTTATTGAATTAATTTTTTTGTTTTTGTTTTTCTTTTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGGGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGCTT:1 + chr3R 27842158 5' - HeT-A 6023 1 55.45 AAGAAAAGAAAAAAACAAAAAACAAAACAAAGTACCTTTTAAAAAATAGAAAACTGTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAAAGG:1 - chr3L 19891381 5' + Bica 296 1 71.91 TTTTTTGGGTTGGCAGCTGCAATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTTAAATTTAAATTTCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTC:1 - chr2L 17061705 5' + copia 4713 1 80.00 TGGTGAAAAAACACCGAACACCTCTCATTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTA:1 - chr3R 12393029 5' - flea 448 1 60.87 AAATTGAGCGCAAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 - chr3L 19347227 5' - jockey 4953 1 52.73 CACATCGATTTCGGAAACGCTTTCGGAGTCAACACTCGAGTGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGA:1 + chrX 17193328 5' + F-element 174 1 57.45 GGACAAAAAATCTGCAGAGTGTTCGGCAACTTTTGCAGTAGATTTCAGATTATAGATAGATTACAAAGATATTTAATAATAGAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCAGACTA:1 + chr4 706908 5' - INE-1 566 1 62.73 AAATCAGATAACAACACAAATACCAACGCCCACGCGAAAAGTTAACAAAATAAATGGATCGGAATTAAATGAAGGAGCACGTGTATTAATTTTTCGGCGTCCACAACATC:1 + chr3L 14447776 5' + invader3 282 1 66.36 TGTAAATATTTCGCTGCACCTTCCAGCTAAAAGATTTTTTGCACATCGAAATTAACAAGACTAATATAAGTGAAGAACCCTCTTCTCGCGCTCTTCGTCGGGACTCACC:1 - chr2R 5266035 5' + opus 20 2 62.39 GGTGCTATTATGAAAAATAAAAACCAAATTCGAATTTCCATTAGAAGTGGTTGAGATTTTCTCGGGATCTAAGAAAATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 21403543 5' + roo 8 2 73.64 TGTATGTACTGAATTAAATATTTTGATCTCTAATTTCGTTAGAGCTACAACAATTAACAATTAACTTAGTAAGCAATTTTTGAAATTTATTTTGTTATGATATGTACATG:1 + chr2L 12008026 5' - 1360 354 1 74.55 GTCGGTTAATATAGAAAAACAATTACAAATTTAAAAAAATTTAAATGTTTAATTAAGTATATCTGCTGTACAAGTATCAACAGTGTGTAATCTTGGAATTTGTTGTTTA:1 - chr2L 11674997 5' + S-element 1538 1 68.81 CATACTTATGCCGTGATGTTTGGCCGCCACTTTGAGCTCTAATTAAATGGCTATGAGGGTGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATACAGCAATGAA:1 + chr2R 10653284 5' + R2-element 3485 1 60.91 AATTTATGTCAATTCCAGAAGCGACAAACAACAAACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGG:1 - chrX 18004797 5' + F-element 4339 1 54.05 CTCTTTTAACCCCTACCGGCAAAGCAACTTTGTTTCAGTTCCCCTAATCATATCTTATTCTTATCTGGTATCTGT:1 + chr3R 28898974 5' - Idefix 104 2 77.33 TTAAAATTCACTTCTACTAGATTAAAAAAAAACAAGGGAAAAAAG:1 + chrX 2201849 5' + Bica 340 1 91.11 TTAACCTCGTGTCTCTGTTAATTGCTTTTGTAGTTTCGCTTACAATTGAACAAACATCGATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTT:1 + chr3R 30614705 5' - I-element 428 1 61.82 TGGTGGTGGTGGTGGGGGCGGTGGGGGGGGGGGAGGAG:1 - chr3R 27940152 5' - accord2 223 1 60.53 CACACTGAAAGTAAAAGCGTTGGAATATCATGTAAGTTAGGATCAGATACAACTTTATAATATGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTA:1 + chr3R 25051564 5' - 17.6 7400 2 66.36 TTAGGCAGGCAACAAGTTTAGGAAAAGCCCCCGACAAGACGAACACAGATGCGTCCGCCCCTCAAAACAAAAAAATTGTATAGAAAAAAACGCAATTGGACCAAAGAA:1 - chr3R 26550502 5' - Tc3 59 1 74.07 GGTTGGAGCACTGCTGCGGGCGTGGTGGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGCTGTTTAGTCTACCAGTGGGTG:1 - chr4 656605 5' - Idefix 175 2 69.15 TGGAGAATCCCCACAATTTGTTCTAAGCCCAAATAAAAGTAATAAAATAAAAGCCCCAACCCCCATCACCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCG:1 - chr2R 18611354 5' + GATE 269 1 67.02 AACTGTAAAGAAGTATTGTCCATAACTATGAAAATAAAGAAAAGCAAGGGATCAACTTAAACTTTTCTTGGGTTATTTGAATATATTTTTTTAAAACATTTTTTAATCCA:1 - chr2L 15351010 5' + Juan 3785 1 49.09 TATTGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTGTAGCGGATTATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAAATAGTATCATCCTACCGACTGCGCCGTTTACGT:1 - chr2R 4122850 5' - rover 360 1 79.09 TAAAAGTGGACAACAAATGCTCGTGGTCCGCGCTTCGTTCCCCGGAGGCTTACTGAAGACAGTAGAGGAAGAAAAACG:1 + chr3R 14207161 5' + baggins 4991 1 60.26 GGCTACCAACGAATCATGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 + chrX 20433320 5' + diver 5897 2 62.96 AAGAAAATGAGAAACATTTACCACTCACACACACACACACATATACACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCG:1 - chr2R 10531251 5' + accord 214 2 64.00 TTTGGGCTTGCTGTAACAGAACAGGTAATTGTTGTTGTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTGCCGCTCGAATTA:1 - chr3R 435927 5' - 1360 2989 1 66.36 ACAAAAGCGTAGCAACCATCTTAAACAAGCTTAACTTATAGTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCAT:1 + chr3L 24031466 5' + 1360 3336 1 62.73 TGTGTTTTCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAGC:1 + chr2R 4906436 5' + INE-1 149 1 63.64 TAAATATAAATTAGGGTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACGCTG:1 - chr2R 5792140 5' - 1360 3301 1 80.00 CATAGTCCGGCGACACCATGCGACGATATGGAACCATCGATGCTCCGTAGGTCCTGGGATGTTGCACCGTCTTGTTGGAATCAA:1 - chr3R 22696049 5' - mariner2 454 1 76.19 AAGGAAACTCAGCTCAGATGCTCTGCGTTTGCCAACACAACCAATGCAATTTAATAATCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGC:1 - chr2L 7195515 5' + Quasimodo 6902 2 73.33 GTCTATATTAATAGGCGTCTGCTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGCTTGCCCATCTTTTGCACATGTTT:1 - chrX 9576571 5' + FB 61 1 78.50 GCAATTAGAATGAATAGGAGCTAAGCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAG:1 - chr3L 3745204 5' - jockey 4722 1 72.22 ATTATTGGATTACAGCCACTTTACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAACTTATTGGTGGTAGTCACTGCTTAGG:1 + chr3R 30673647 5' + R1A1-element 234 1 73.74 TTTAAATATTCTTAAAATAAGCAAGAAACCATATTAACCATCCGACCAGTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:2 - chr3R 6132117 5' - I-element 5322 1 53.64 TTGTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 12591734 5' - roo 9017 2 73.39 CTATTTGTATGCGCAACCCCCCACGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGGTTGTTTAAGGGAATCGCATGGG:1 - chr3R 12681609 5' - I-element 4880 1 61.64 CGTAAATAGAGTCTTGCTCTATAGCTTACTAAACTCAAACTAGTTCTATATACATAGCTATACTTACATAGGGATTTATTCATACTTCCGG:1 - chrX 8046625 5' + Fw2 3677 1 78.02 TATTTAACCTTCGTCGGTAAAACGTTTCAACCTTTTTTGCTGGTTTTTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTT:1 + chr2L 14669478 5' - gypsy4 451 1 65.52 CAAATATTTAAGATCTTTTATATCTTTTATAAAAAATAAACAGCGAATGTTATGAAAAAAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTTAAAATCAGAAGCGAGAGTTTCA:1 - chr2L 4025509 5' + Porto1 230 1 60.00 TCTGCAATCCAATGGCCTGATCGAGAACTGGCCAGGTGCATGTGGAGTTTGCGACGACCTTCTTCATCTCGCTCACCAATGGTGTGCAGATGACGG:1 - chr2L 9645152 5' - R1-2 133 1 54.17 CTCGCTTGAAACCCTATGTTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3R 13225580 5' - hobo 2923 1 63.37 CTTGCTGTGTGTGCAATATGCAATATGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 + chr3R 21858696 5' + Tirant 6 2 63.79 AGCAGGCCCAGAAGGCACGACTTGTCACGTCTTTGTGGCCCCATCTCCAATTCCTTCTCTTTCGAAACACCTATCCCCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGA:1 + chrX 13516669 5' + Idefix 7064 2 81.90 CCAACAATTTCATCATGGCTCAACCAGCGCCCTTTCTCGTCCACATTGCTCAGGTCAGGCCCATCATCATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTT:1 - chr3L 21690998 5' - Stalker3T 203 1 76.34 GAAATTAAAAAACAACTAAAACAAATTAACAATATAATGACAAAAGTCTTATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGAGA:1 + chr3R 11556464 5' + Bica 231 2 57.00 GTGCACAGACAATTGCACTCAGAGAAAAAATTGAACTTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGCATGCATATTTTCTTTTGCTT:1 + chr3R 11802910 5' + Bari1 1527 1 66.36 ATTGGTTTAGTTATTTTAAGACTAATCGGAAATTTTTTCTCAGATTGAAAAAATGTTAAAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGC:1 - chr3L 64598 5' + F-element 247 1 80.00 CACAACAAACGAAATCAACAAATTTGCCGAAACGATTGACTGAACGACTGATTGACTGATTGAGTGTTAGAATTGAATGACTTAAAATTGATCTACAATGATTTAAGATA:1 + chr3L 13869690 5' - Cr1a 4144 1 58.18 GAGTGCAGCGACAGCCACTGCAATTCTCTATGTACGTGCTCAGAGATATATGTGTCCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:1 - chr3R 11326961 5' - flea 230 2 61.82 TAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGCTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr3L 19347200 5' - jockey 4971 1 55.38 TAGGATAGAATGCGACATGTGCGCACAGAAAGGGTCACGCGAATAGTGGCACTCGGGGTATCTGTAGTTCAACAACTTTATATTTGATATGAATGGACACACATTTTATG:1 - chr3L 19081895 5' + copia 62 2 73.64 AAATCCAGTCTCCTTCGTAAAAATCGTGGTAAATCGTGCTTAAATACGCTTTTAATTCGCCTGATTTGAGGAATAAGATGGATTGAAATATGATTTTATTTAATTTGATT:1 + chr3L 20386904 5' + transib1 1896 1 79.09 AATATAATATAATATATAATATAATATAATATAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACACTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAG:1 - chr4 1218551 5' + 3S18 5819 2 72.73 TTGAGGCCAATAAATTTTTATTATGGCCAATTAAAAGCAAATAAAATCATATACATCTTAATATGATTTTATTTTATTTGATATTATATACAGAAAATCAAATAAAATAA:1 + chr2L 17269635 5' - transib1 1903 1 43.64 TGGACACGGATATTAGGGAGCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGAC:1 - chr3L 16778865 5' - ZAM 8085 2 60.00 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAGTCGCCTTTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCG:1 + chr3R 21907534 5' - Rt1b 4857 1 53.68 CACATTTAGTCAACATTGGTTTTTGAATCACATTAACTAGTTTACAATATTAGATGTTTTGTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCT:1 + chr2L 5926589 5' - Doc 4361 1 62.73 TGCAAAACAAAACAAAACAAAAAAAGAAGTGGGCGGTGGGCCTTCGTACGTGTATGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAG:1 + chr2L 9874637 5' - FB 918 3 53.64 AACCTCGTGGGAAAGTGTGATATTATTATATTCCCCACCCCCTGATACTTTAATACTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATCTCATAACAG:1 - chr3R 11594455 5' + hopper 1314 1 62.73 CTATTGAAGGTCACGTACAGAAATAACAACAATAACATGCGACCCATAACTAGAGAATTTTTGGACTTCGTTTGGAAAAAATTCAATAAAAACCTTTAATACAACTCAT:1 + chr2L 18966197 5' - Tc1 297 1 63.30 GTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTG:1 + chr2R 1320703 5' - diver2 4888 2 45.71 CAATTTGGGCAAAACAATTCCAATACTTTAGCCATAAAAATGATAGCCAAGTCCCCCCTCCAGTACGTAAGCATATTTTGTCAAATTTACAACGCATAAGCATACGTGTG:1 + chr2L 20473414 5' - 1360 185 1 72.73 GAAAATGTGCAAATTAATTTATGCAAGCAGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chrX 9576545 5' + FB 32 1 70.59 GTACCAACAGAACCAGCAGTATCCCCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAA:1 - chr3L 16288072 5' + Bari1 135 1 77.27 CTCTTACTGTCATTGATTTTCATTTTTCACTGGCACTCGTTAAGCGCGACCAGGCGTCCTCTTTGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCGA:1 - chr3R 7171339 5' + 297 6591 2 69.52 CTTTACACCTTATATAATTCCCGATATGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGGGATCTCAGGAACTATAAAGGC:1 - chr3R 5252071 5' + INE-1 149 1 70.89 CCTCGTCCTTCAGTTGGGTCCTCGAGGAGACGCGATGGCACACTCAAAACAAAAAAAAAAATTTT:1 - chr3L 4978488 5' - Tc3 88 1 83.08 TATGCAGAATGACCAAATCGGGAGAGGATTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTAT:1 + chrX 22564048 5' - I-element 4932 1 67.44 TGTTACTACTTTGATATACCTCCTGAGAAAGTGTGGTATCAATATCGTCTGCGTTGTTTAGGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATAAATTTTCT:1 + chr3R 25108058 5' - transib2 85 1 60.00 TAAGATAAGATAAGATAATATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAACGAACACGTAGTCTTAAGCACGTCATATGCGGGTGGCTGTAC:1 - chr2R 5064833 5' + Stalker3T 245 1 59.09 TTTTTAAAGCATTTTTCAGGATCATTACATAACTAGGCTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2L 5724314 5' - 1360 3360 1 65.59 CCATTCCCATTCTCGGCCAGCTTCCACTTTCAGGGAGCATTAATTTTATATTGCAGGTACATGTCTAAAGTTTTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTG:1 + chr3R 19717934 5' - mariner2 770 1 60.91 AAAACTTAAAATTTTAATATTTTTTTTTAATCAACAGTGCTGCGCAAAATTAATGAATAAAACAAATGGGGTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATATATTATTTAAAAT:1 + chrY 1447540 5' - G2 3052 1 50.00 TAAGGCGAAAAAGTAATGCGAAGAACTTGGCAAAGGCACGCTCCTCACTATTCCAACGCATGATGGCGACTGCACCGTGTCGGGACAA:1 + chr3R 31395147 5' - mariner2 107 1 68.18 AAACAAGAAATAAATGTGCAAAAGGAAGAAGATTGAAAACTCTGAAAGATTTTGCCCAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCAC:1 + chrX 10194550 5' - rover 126 2 72.22 TACTTGATCGTGATGATCGTGAATGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAG:1 + chr2R 10294784 5' + R1A1-element 5087 1 75.00 CATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2R 12416931 5' + pogo 43 1 66.06 ATGATTCTCAATTGCAAACTGAATTGAGTTTAGTTAGGTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAAT:1 + chrX 8518946 5' - S-element 1671 1 66.36 CATAATGTGGAGCAGCAAGGCGTGGGTTGATTTCATTTTTTTTTCTGGTTTTATTATTTTTTTTTATTTTTTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGGGTCCT:1 - chrX 13896241 5' - X-element 4678 1 60.91 TGTCTTCGTTATTGACGGATCATTTATTCGACTGACAAAGTTAATAACTACGTAAGTATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr2R 3146369 5' - opus 7478 2 56.36 CTTGTTGTTTCCGGATTTTGTCACTCTACAAAGTGCGTGGGATATAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCACCAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 - chr3R 18851065 5' + flea 34 2 60.00 ATGATCACTGTGCTATTTCCTTATGACTGCAGCCAAACCCTCTACAGATTTTTACAACTCCTTATTTCAAAATTTTTCGAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTATT:1 - chrX 8848783 5' - Tc1 248 1 52.73 ATCTAGGTATAGGTGGCTTAATATATCTCCACACTAATAAAAGGAGCGATTTTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTTAACTTTTAAAA:1 + chr2L 6243879 5' - TAHRE 15 1 51.40 TAAGAATCTATTGGGTTTAAGCTTAGAGCAATGGGTGATATATTTATCTAGGATAGAAATTAAATAATTGTACATATTTTATTTAATTTATATAA:1 - chr2L 276623 5' - G7 1147 1 67.37 CAGCACAGCTCGTGATTTAAACGGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTTACAAGTATGCAA:1 + chr3R 13437370 5' - hopper 1378 1 57.27 CCATCCATTTTAATAAAACCCTTTTTAATCACACCAGCAAACAAAAGCGGGTGGAGGTGCAAAAGTAAATGACAAAAAAAAAACCGAAAATAAAAA:1 - chr2R 18918260 5' + Doc2-element 252 1 61.46 TATTTTTAGTTAATGGGGCCTCTCCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 14013368 5' + roo 55 2 78.85 CTCTTCTCCCGCTCTGCAAGCAATTCGAGTTGCTCTTCCTTTCGATTTGTGTGCCAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAA:1 - chr2L 16102064 5' + Bica 57 1 66.67 CAAGCCCTTTGTTGGTGGCTTTTCCGTTTCCTCCTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGATGGACATGTCCAGATCGACTCAGCTATTGATCCTGTTCCAGAAT:1 - chr2R 8931505 5' - INE-1 86 1 61.11 GACTGATGAAACCGTCAGCTGCAATCGATTAAAGCACTCCACCTTCGTTTCAATCAGTTTGAATGTTTGGCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGGGAGACGTAGG:1 - chr2L 1874814 5' - F-element 277 1 70.75 CTCTTTAGTCACCTACAACTTTCCACCCAACGAATTTTTTGAATCGCACACTCCAACCGCCTTCAGCAAGGATCACCGACTAACCGAGCAACTACGACAACATATCAG:1 - chr3L 18030748 5' + Chimpo 3858 1 75.00 ATCGATTTAAATGAAGTCGACCAAAGCTCGCATACACAGAGAAAAATATCAGCGATAGTATATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATAAGATTGAGTT:1 + chrX 3346388 5' + Transpac 20 2 47.27 AAAACATTCGTCGAAGTAGTGAGTTCATTTTCTTTCCCTTCTTCAACATATTCTCTAATATCTATACACACTGGCGTTCACTACATTTTCATCTCCCTCTAACACACTA:1 - chr2R 23080921 5' - invader4 153 2 70.64 ATTTATTACAACACGAAAACATAATGAATGAAATACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCGGTTGGGTGCAGCCG:1 + chr3L 2987368 5' - blood 335 2 65.00 AATTTTAAACTATTTATTTGTCAACTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTC:1 - chr2L 8608057 5' - TAHRE 10405 1 68.06 AAGGACACGGACACAAGAGTCCTGCCCACCAAGGACCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 + chr2R 23477813 5' + F-element 14 1 71.56 ACCACCAGCGACCAGGAACCATTATTAGCTATTTATGGGGGAATGGCCAAAAATAACGCTGGAGTGCTTACGTAGCTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTAT:1 - chr2R 11721895 5' - Stalker 93 4 55.45 TGCGCAGATGGTTGTGAACGTGTCCATAGTCAAGTCTTCCGAAAGATTTGAAGATTCTTGGCGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chrX 14853467 5' + P-element 1 2 75.28 GAAGGCATCAAATCCGAAGGCGACAAAATGTTTACCACCATTTTTTATAATTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3L 13234863 5' + Tc3 85 3 68.66 ATGCATTCATTTCAAGAAAAAATTAGAGAAAAATCAATGGCAATTATAAATTTTTGCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr2L 18570475 5' + FB 31 1 51.82 TGGCCGACATCGGTCGACTGTTCACGACTCTCAACTGCTCATAATTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTAAGCTA:1 - chr3R 16681606 5' - Stalker4 307 4 54.81 GCCGACCAGTCACGTACCAAGCACCACGCCCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGAAATAAAAAGAGAGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATA:1 + chr3R 13788040 5' - copia 4949 2 77.27 TAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064833 5' + Stalker3T 205 1 58.10 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTATTCACAATTTGTTGTTGCAGCTGCTGATTGCTGTTGTTGTTGGTGTTGGTGTTGTTATTATTATTGTTATAA:1 - chr3R 21907535 5' - mdg1 7056 2 70.91 TTGTCCTCATAGTCAGCCGCCTTGCTGACTCTGGAAGTGAATTTAAATATCATCAAATAATGTTTAGCTTGTATATATATACGTATATTTTAAACTAAATTTAAGTTT:1 + chr3L 4154216 5' - Penelope 322 1 64.81 AAATAAGATGGGAGGGCAAAATATTTCCTTCCTGTCAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCAATTTTT:1 - chr2L 13558231 5' + FB 50 1 62.39 TTTAGATCGTTTCTGTATCAAGATCGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chrX 22717185 5' - pogo 2050 1 74.76 CTTTTTCCCAACGCTGTCTCAAGGACTTGTTGACCAAGTAGTACAATGCTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCT:1 + chr3L 13048010 5' - P-element 386 1 49.09 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCC:1 - chr2L 16071771 5' + F-element 4490 1 37.00 TTTCTGTATCAAGATCGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chrX 22717176 5' - pogo 2083 1 72.13 AGTGTTGAAACTGTAACAAAATGTTATTTCGCGTTTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGT:1 - chrX 3654612 5' + 1731 4594 1 79.09 GTTCCAAACTAGTTCAGCAACATCTACTGCGCCCCGTGGCATGCAACACTCTTCGAATGCACTCGCGGTTGGAGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAA:1 + chr2R 6707660 5' - 1360 3381 2 73.39 TTCTTGGGATTTTCCGAGCAGCTATAAAGCCCAGTCCATGGCTAATAAGCA:1 - chr3R 23332391 5' + copia 286 1 86.27 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAACAGCACTGC:1 + chr2R 6629974 5' - Cr1a 242 1 56.36 GTCCAGTGTCGGATAAAAAAAAAAAGAAAAGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 - chr3L 15760398 5' + FB 54 1 65.91 AGCATGCAGCAGCCAAGTATGCAACACATTCTATGTTATCATATTTCAAGCAGTTTCTAAATTCAAAGAATAGGAATTCATAATTTAATAATTTAAATAATTTAAAATGG:1 - chr3L 3766884 5' + Transib5 255 1 65.45 CTTTAAGAAAACAATAAAAGTTTTCGTGTCCCTATACCTGGTGCAATAAATTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 - chr2R 8530827 5' - mdg1 7425 2 57.27 TCAAAAACTCATCCAAAACATCATAAACAAATGTAAAATCTGTATCATCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTA:1 + chrY 738917 5' + FB 361 1 58.33 GAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3L 23146501 5' + 1360 55 1 71.82 CATCGGCCTCGGGTCCTTGGGCCAGAATCATTTTCATATTGGCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 25306603 5' - roo 9036 1 60.78 ATTTATTTTGTTTAAAATTATATGTATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATA:1 + chr2L 13224553 5' + P-element 2834 1 29.36 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAATCTTTCAGGATGTCAGAACGCACACACAAACATAAAACACACACACACTTACAAACACACACACACAC:1 - chr2L 16217660 5' + Quasimodo 35 2 72.22 CAAAGTCCAAAGCTCGTCCCTGGGTCCCAGCCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACACACTCTGTAATCA:1 - chr3L 12014472 5' + TAHRE 10359 1 66.33 ACGTAGTAATGATTAATTAGGAAAATGAACGATAACCAAAACGAAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTG:1 + chrX 13874645 5' + Circe 7117 1 68.57 GAAGTTTGTGTTTTATTATGTTTATTTGTATTATTATGTACACTAGTCGGCATACTTATGCGTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTT:1 + chr3L 18463420 5' - gypsy5 7325 2 58.72 GGCAGTTTTGTTCTCGATTTTGTCGCCGTTTTGTGCATTTTTCCCGTCCGGTGTTTAAATTTTATTTAATACTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTT:1 + chr3L 17530105 5' - Tirant 390 2 72.73 ACCAACATTAATTTGCTACAATATTTAAATTTGAATATAAAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr3L 18095558 5' + I-element 46 1 61.11 TATGGCTGAAATTTAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCCTTATCTTTAT:1 - chr3L 19948903 5' + 3S18 32 2 60.92 TATTTAATATTTGTATTTAGTTACAGGTAATGTGTGCGTCTACCCTTTCTCGAAATACGCATCTTCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTT:1 + chr2L 1426979 5' - F-element 4301 1 77.42 TTATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr2L 15763834 5' + blood 7048 2 59.09 TTTATAAATATTATAAAGTTATAAATAATAGTATTGGTCGTAGTTAGTATTTTTTTCGTAATAGGTTTTTGACAGTAACATGGACTGGTAACATTACCATATGG:1 + chrY 677345 5' - HeT-A 5848 1 81.73 GTACTTCGATTCACCCAACACCCAACACTCTTACAATCTTTTTCCCCAACGCACTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAACCTCATACTTTTC:1 - chr3R 15730386 5' + I-element 5141 1 61.22 GACTGCCTTGCAAAGTACTTAATGTGTTGTTTTAGTAAAACATAACTTTTAAGCACAACGCAAAAACATTGAAAGCTCTTTATTTACCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr2R 24031575 5' + 1360 1 2 80.00 GTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 23146508 5' + 1360 46 1 74.47 GCCTTGTCCTGCGACTGCTACTATCGCATACATATGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATAT:1 - chrX 12993435 5' - accord 7047 2 68.18 CGTCTTTATGAGCCACTATATCTAGGGTACCCCCCCTCCTATCGAGTCACACATATGCATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTT:1 - chr3L 518829 5' - Burdock 6367 2 58.33 CGATGTAGCCTTCCAGCCCTTGTAAAGGATGTATTAATGGATGACAGGAAGCAACATACTTAAACTAAATAAAAACTAAAAAAAATAATTCAACAAATG:1 - chr3L 8522503 5' - Tc1 1387 1 68.69 GCATTATTGGAAATATGAAAACTTAATGTTTATTTAAGCTAGCATTGCAATATTATGTTTAAACTACTGCACAAATCAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTAAATA:1 - chr3R 8886482 5' - Cr1a 117 1 57.27 GTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 + chr2R 11379745 5' + jockey 4678 1 54.55 TTTCAATATTTTTGTGACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATT:1 - chr3R 15309402 5' + HMS-Beagle2 6912 2 59.38 TTTGGACATTAAAAATGTATCAATTATGTGAACGCAACGCCTTCTTACAACACAAAGCTTCTAAATATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 - chr3L 25610201 5' - S-element 1702 1 58.18 GGCTGAAAATCACCTTTAACAGATTGCTCTCTCCTATTTTAAAATTTCTCTGTTACACGGCTATAGTTATAGTCTTATGATTGCTTTTTCACTAAAATTAATAAAATAAT:1 - chr2L 9320328 5' + HeT-A 43 1 75.45 TCTGCCTTATCCATTACAAGTTCGAGAAGATTTAGCTTGAATTTACCCAACACTGAAGTGGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTA:1 + chr2L 7890517 5' + Ivk 5308 1 69.39 TTTTCTGCTCTTCGTACGCCTTGCACCGCTAGATATTCTTCGACGATACTGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTAT:1 - chr2R 5949504 5' - invader2 4897 2 51.96 TGACAGCGAATGAAACATAAGAAGCCATCATCACACCTGAGAACCCATTTTCCGAGCCATATGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTT:1 - chr3R 17436934 5' + mdg3 5263 1 67.37 GAATTACAATGCCAAATGCAAATATAAGAAAATATACATGCCTACTAGTTGGTACATACAATTGAGGCCAAACTGATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAAT:1 - chr3R 8789334 5' + Dm88 4219 1 75.24 CTAAGATGATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2L 15988769 5' + 412 38 2 63.46 TTATTTTAAGACTAATCGGAAATTTTTTCTCAGATTGAAAAAATGTTAAAAAACGAATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCC:1 - chr3L 64588 5' + F-element 257 1 70.91 GATTACAGCGAATTCCTGAACAATTAAGCTTATTCCTGGAAGCGGCTTTGGCTGCATACTCGGATAAGTT:1 + chr3R 18479936 5' - Doc3-element 4547 1 62.86 TATTTAAATTTAGCTTCATCATCATATTGCAAAGAAACAGTAATTAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chrX 17184976 5' - roo 9032 1 60.00 CATGTGTTCTTACAAAGTTTGCCTAATTATGGGTAATAGATCTTAATAACTATGTGAGACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGT:1 - chr3R 12342308 5' - mdg3 5095 1 60.00 CTTAATTTATAGTGCAGCGTTCCCTAGACCCCAACTGATACACAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCA:1 - chr2R 8646863 5' + Idefix 319 2 61.82 CCCACTTTTCGCTTCGCCCAGTGCCATTCCTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCAC:1 + chr2L 10785134 5' + 17.6 233 2 70.00 TACATTCAGGCGATGGAAATTATGGGTCGAATCGCCTGTCAAAAATATATGTCCAAAATTTATGCCGAACACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTATATAACATCT:1 - chr2L 6281351 5' + HMS-Beagle 12 2 70.00 CTAAACCCTTTATTATCCTTTATGTGTTTTTATACCAATTTACACACACACAATCACTGACCACGTAAGCATATCCTGTCACAATGTATTGATGCTATGTTATAC:1 + chr2L 13422639 5' - Stalker 48 4 76.19 GCTACGTCCAACTGCAGATAATCGATGGACGGACTTGCAAATCCAACTTCCCGCTATCCTATCGAGGTACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAA:1 + chr3L 6060873 5' + Idefix 327 2 65.45 GGCTAGAATACATTTTCGCCCGTTACCATATTTTTACTTACAATATAATAATAGTGCTTAACAAACAATTTTAAGGTAGATGGTCTTAGTATTTAATATTATATTTTAT:1 + chr3R 20165962 5' - Burdock 408 1 74.31 CGTTTTGATTTTGTCATTTTTCTTGTTGATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 - chrX 17330158 5' + opus 18 2 64.86 AAAACAAACCAAATAATCGTTCTAGATTTTAAATCCCCTGACCAAGGGCAACATTCATGAAACAAAAGTGCATGTCAAAACGCAAGTAAACTTCAGAGCGCTTACAAA:1 + chrX 310858 5' + Fw2 351 1 50.00 TTGGATCAAAGTTGGCGAGGAGGTGGAGAACATGCTGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2L 16237788 5' - hobo 2907 1 64.13 TGGTGCAGACCCACCCATAATGAGTGCCAAGGCATTGTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTGGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 12591700 5' - roo 389 2 62.04 TTATTTTAAAGATGAATTGAATTGAATTTAAGTATTATGCATTTTATGCATTAATTTACAAATTATTATATACATATATGTATTATTTATTTATTTATTTATTTATTTGT:1 - chr3R 4553348 5' - Juan 4215 1 78.18 CAAAATCCCACACAGTACAAAAAGTGCCAAGTAAAAAAAAGCATGAAAAGATAGCAAAAAGACAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTG:1 + chr3L 14725120 5' + 1360 3333 1 67.37 AAAACCCAAAACTTCAACGTGTGTGGCCTTTGCTTTTCTTTTCCCCAAAAAGGGCAAAACCTTTACAATCTTCCATGATTTATGGTCATGTTATATTTGATTTAAAAAAA:1 - chr3L 12087152 5' + Transib5 2793 1 63.64 CGGACTTGCATGCTACGACGAGCACTGTCGCCAGCCTTTGACTAAGATAGACTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCTATCCGAC:1 + chr3R 20695443 5' - Cr1a 4425 1 63.54 TGTCTTTTCATGTATAAATTGCGAAGTAAATTCAAGCTCAATTCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chr3L 20039855 5' + Doc 26 1 53.93 ACAGTTTTATGGTTTTAATAATAGATAGAAATTTCGGAAGATATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGGGTCGTCTTTTGAATCGACAGTAACGGATGT:1 - chr3L 535028 5' - gypsy4 6468 1 64.00 GGCAAGAATGGAGCAGGGAAGTCCACAATCTTCAAGCTGCTCACTGGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCG:1 + chrX 21138811 5' + roo 262 2 74.39 TTCAATGAATTGCTATGTTACATGAATTGCTATTTTGTACTATCTCCACCGCTTTATGGCCTACAAACATAATTATGATCAACACACGGATCAAGAATCACAAG:1 - chrX 19875155 5' + diver 5831 1 69.23 ATGGTATATGAAAACCGTGAGTTTGTTGCACGAAAATAAAACTTAAAATAACTTCCCAAACGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATCA:1 - chr2L 10388918 5' + 412 7293 2 60.91 AATTCCTTTGAAAAGTATAAAACAGATTGAAGAAAGTGCACCTGTGATCAATAGCCGAGTTGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTCGAGATCTCAGCAAC:1 + chr2R 21818553 5' + INE-1 140 1 66.06 ATTTAAAGCCCACGTTGTTTAAACTAGTTTGAATAGAATAAAAAAAAAACAAGAAAA:1 - chrX 1819088 5' + Osvaldo 1522 1 50.88 GATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTA:1 - chrX 20433377 5' - diver 169 2 71.82 TTTGGGGGGTTGCATTGCCTATTTTCTGTGTTTACATGTTTTTGAGAAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTACATATAATTTATCGCTCT:1 + chr2R 15610314 5' - roo 76 2 65.00 TTGTGGATGAATTAGTCAGGAAATTAATTAATCAAAACTAACGCAAACAGCAACAACTAATGGACGCCCAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGAGG:1 + chrX 1285252 5' + TART-A 12951 2 61.70 CAGCCAAAACGGAAGAAAGTTCTAAATAAAAACAAATAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGAATTGTGCAA:1 - chrX 9378347 5' + pogo 2069 1 62.11 AAGATAATCCTAGAAACAGACTGACAAAACCGGAACGCACAGATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chrX 19010142 5' + Burdock 6178 2 62.73 CTTTCTTTTGTGAAATCAATTAAAGACTATCAATCACTCTTGGGAAATTACACACGAATTTCCGAGGGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAG:1 + chr2R 24259184 5' + Bari1 160 1 65.45 ACAGCGAAGCGAAGGATTTCCGCTGTAAAGCATTAACATTTTTGTTTACTTTCGAATACTTTACTTTAAATTAAGAAGAACACTTCTAAAAAATATTAAAAAATTTGTA:1 - chr2R 10564145 5' + Transib-N1_DM 291 1 51.38 TTCTTGAATCAGAAAGTTGCGCTGCGCTTCGTTTGTAATATTCTGGTAGGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGGAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACT:1 - chrX 742714 5' - G5 4701 1 56.36 AGTTTCCATTTTCCCCGATTTTCCCCTTTGCTAACAAATGCTTTATTATTTTGACTACTCCAAACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATCGAAAACCT:1 + chr3L 2640281 5' - invader2 4652 1 59.60 TTCGATGGTAAATAATAAATAGAGCAGGACGGCAAAGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGTGATTGAATTGGGATTTA:1 - chr2R 15108105 5' - I-element 4987 1 63.64 GCTGAACTTTGGGCTACAAAATGCAACTAATTCACGTACTAGAAACACATTTCATTTATATTTCGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAAACGTCTTCAAA:1 + chr2R 16824301 5' + Tc1-2 1319 1 65.45 ATTGATTCCAAAATTCAAGATCGGATGAAAAAGCCAAACAAACGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACA:1 - chr3L 3169339 5' + Transpac 4820 1 64.55 CCAAAGTCGCAGTTTTAGATAAGCACTGAGAGAAATGGAATTAGGTTCAGCTTAAAATAAACAAATATCGTGTCAGTAAGCTACGTGATATACATATTTATATATTTGT:1 + chr3R 18485290 5' - G3 4503 1 71.56 GCTGCAGCGCAACAATTAATGCGCATTAATGAATTATTAATTTGTGTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr3R 10964600 5' + I-element 30 1 56.12 CTCATAAATAGCACAAAGACTTGGCCAATAATTGATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGAAG:1 + chr3R 29635211 5' - mdg1 7424 2 65.26 ACCCAACAACTTACTCAAATCTCTCTCTCTCATCGATCAGCCGAACACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAA:1 - chrX 16476951 5' - roo 8705 2 58.18 TAAAAGTTTTGCTTTTCGTTTTAGAATTCAGCTGACAATGTTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAG:1 + chr3R 6450067 5' - F-element 4520 1 65.33 AATAGCTGCAAAAATATATATTACAAAATATTAGTCAAAAGGGGGATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTG:1 - chr2R 10113526 5' + copia 324 1 59.09 GTCTGCACCTGCCAGCTCACCTTGGCACATTCCGGTTTTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAATTTATAATGTAGAACTAGAAAAAGAAGA:1 - chr3R 29432936 5' + transib2 2578 1 71.91 TCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 7981185 5' - 1360 3343 1 75.26 GAGATACGTAGAATCTCGGTGCTCCCATTTGCTGGCCCGCAGCGCTTTCCAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGG:1 - chr3L 14227503 5' + X-element 424 1 59.76 ATGAAAGAAAAGAATATGGTTAAAATAAACAAGATATTTAAATTGGATATTTATAGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAA:1 - chr3R 19992331 5' + P-element 103 1 57.27 GAAAACGGAAGCCGGGCGAACAAGAAAGCCCAAACTGGAGTCCTGGGTGACGG:1 - chr3R 5920225 5' + Rt1b 4831 1 71.70 TAACCCCAATAGCCAAATAGTTTTTCACCTGCATGCGGCGGTCGTGGATTGCATGTCCTCGGCACCTAACGGGTTTCTTTTAAAGTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTA:1 + chr2L 18245831 5' + Doc 53 1 51.82 GAATAGATATCGATTAAAATGTAGATTTGAAAATTCGATATTCTTCGGGATATGAAAACTTATCATTTTCTCAGACAGACTTGTTTAAAAATAATAAAAATAAGTAATTG:1 - chr3L 18625855 5' - Porto1 4633 1 75.45 TTCTTCTATGAATGTGAATGAAATAGTTTTGCCATAGAATTTCCAATCCTCAAAGGAGATGGATGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3L 16682103 5' + FB 1 1 79.25 CTGGTAGCCAAATATGGTGCAGATGGAGTTCCGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTT:1 - chr3R 19445522 5' - Stalker2 49 2 69.81 TAGACACACACACACACACACACACACACACACTTATCGATGTATATATATATATATATATATATAATACACACAAAAACACACATAAACATACACATACACATA:1 - chr3R 9418245 5' - 412 75 2 64.76 GCAAATGCATTTTCCACACATTTTCTTTCCTCTTTTCGTCTTTATGGATTTTCTTTTCCTTTTGGTTATGGCGG:1 + chr3R 14756332 5' - TAHRE 272 1 70.27 CCAGGACATTCGGATGAGATGATTAAGTTGAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTGAACTAATA:1 - chr3R 26301721 5' + flea 214 2 72.73 ATAAAGGCGTCGACCCTTTTCCATTCCAGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTAAAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTAAA:1 - chr3R 31444032 5' - copia 4966 2 70.91 TAATTGACAACACATTGACAACACAATTTGACAAGATCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTGAAGACTTACAGTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATA:1 - chr3L 24896005 5' + roo 8713 2 66.36 CCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTTAAACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAATAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATAAAACAA:1 - chr4 1294991 5' + HeT-A 4 1 67.33 ATCCAAAATATTTCGTACACTTAATTTGGAATCCGGCTCTAGCTCTTTGGCGTTGTGGGGTGGTGGTCTATGCTTGCGACAAAAGAATATA:1 + chr2L 3712663 5' - Gypsy12A_LTR 2097 1 69.23 CCGTGAACATAAGACGCATGAGGTCGAGTTCCCAGACTACTTTACTTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGATTGGAACAGTCTTTATTTGTACGCTTAT:1 + chr2R 4409761 5' + Cr1a 4038 1 67.89 ATGGGATGTGTTGTTAGCTGGTGGAGGGGTGTGCCAAATCAGGGGAACATTGCAGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGGGGCTTGTTG:1 - chrX 2840502 5' - TAHRE 10030 1 55.56 AACAAATATGCAACTACAACATGCCGGCATATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chrX 13495499 5' + Max-element 16 2 61.29 GCAAGGCGGCGGCGTTGTGCTCAGTGTATCGAGTAGAAGGACTGAGTCCTTAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATT:1 + chr2L 5639500 5' + 1360 393 1 65.59 GCTGCCATTGTACATGTTTCACTGTACAATACACTCGTACACAGAAATGAAAGGTTCGTGTCTAACAATA:1 - chr2R 16476432 5' + X-element 10 1 62.86 GCAGTGTATGTCATTTGTTGATGCACTTTCGCAATTTTCAGCTTACATATGTGCGTATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTG:1 - chr2R 10139133 5' - jockey 4606 1 66.30 ATCTCTATCTCCATCTCCATCTCTATCTCTATCTCCATCTCCATCTCCATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCT:1 + chr2L 2902655 5' - Stalker3T 204 1 60.82 TGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTATTGTATTTTATTTTATTTTATTGTTTTTTATTTTATTTTTTT:1 + chr3L 21448027 5' - gypsy7 5009 1 50.62 AAACGTGCTCTTCTCGTGATGACACAATCTAAAGTCATTTCAGGATTTATGATGTTTTAGCCCAAAAGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chrX 15500069 5' - pogo 2085 1 66.36 AAAGTAAAATTTTTTCACTTTTATATTATCGGCTTTTGTTTTGTCTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr3L 23145543 5' - HMS-Beagle2 7160 2 56.48 TATATAATATTACTAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3L 3611775 5' - blood 7372 2 57.89 AAACGATCGACTAAATCATAGAACTATAAACACGATTTTTATGACATTTCCTCATCAGATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3R 13481255 5' + roo 8676 2 64.21 TCTACCATTATTTCGGTTTTCGTTTTTGTTTTTTAATGTGCCAACTGTATCAAACTTTTTTATTAAGTAGTAGACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAGCTATTT:1 + chr3L 3995968 5' - Bari1 458 1 84.55 AGCGCCATGTGATAATTAAAAACTATATCAGGCAAATAGCACACTTACAACATATACACCCCAATACAGCATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGA:1 - chr2R 18763315 5' + Idefix 6915 2 61.82 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAGTACCCACGGAGTATGAGAAAATGAGAGCGCGCCAGACGCGGCATTCGGTGG:1 + chr3L 11777678 5' + invader3 5377 2 69.88 GGCAAATAACTGTTTCTGCCGCACGTAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGG:1 - chr2L 22497816 5' + Stalker 6876 4 67.11 TATTACCACCTTTCATTTGACAGAGACCGGCTCTAGCTCATGGCGTTGGGTGTGGTGGTCTT:1 - chr3R 16295232 5' - Gypsy12A_LTR 2175 1 66.13 TGTCTGTTGGCCAAGACAGACTGGGAAGGGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTGGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTAC:1 + chr3R 16415310 5' + flea 4951 1 69.52 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 418 2 43.12 TTTGCTTCTCCTGCTCCTGCTCATCCTAGTCCTATCCCAGTCCCTTCTCACAACGCTTAAACTGCGATCATCAGCACTTCTCCGCTGCGACGCTGCTGACGCC:1 - chr3L 2707206 5' + HMS-Beagle2 186 2 53.40 TGATTTCCAAAGCAAACATTGTATCAAAGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAATATGAGT:1 + chr3R 23487407 5' - I-element 5150 1 68.42 TCATTTCCTTTGCTTCAGTTTTCAGTCGTTGTGGGGTTTTTTAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAA:1 - chrX 2453489 5' + Bari1 1596 1 64.55 TGCATAACCCTTGCTGCCACTGTAATAAATTAATTACAAAATTGTCGCTCCATAAAAAGATAAACAAAGGATACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGATTCACAGGCGACC:1 + chr2R 5944205 5' - accord2 7227 1 69.09 TACAATTAGGCTTGGTACTATGTATTTGGTTTCGGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTT:1 - chr2R 18526149 5' - Doc 4514 1 55.26 AATTAACATTTTCAGACACCAAAAAAAGACAGCAAACAACGAATTTCCGCAAATAGAGAAGAAACCCGAACTTCAATTGTAGAGGGAAGTATTGCAGCCTCACTATAGCG:1 + chrX 9041441 5' - BS3 337 1 60.00 CAATGAAGAAGTTTTTATGAATTCAGGATTTGTAAATGATTTCGTAATCCCAATTTTTTGTGGCCAATTAAAATACCATATGAACGTAGGTTTTTTTTTTATTATTTATT:1 + chrX 3476349 5' - BS 5095 1 59.09 TAATCCAAATAATTAGCATGGGAATTAAATGGAAGACCACAAAGCCAATTTATATATGGTCCAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chr3L 16681983 5' + FB 6 1 72.34 CAACGCTTCGGAGTTCTCTATCCGTCCTATACATATACATATATATATATATATAAGTTAAAAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGT:1 - chr2R 20436789 5' + opus 9 2 62.35 ACAAAATGAAAAATGAAACAGGACGAAATTAAAAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAATTAAACAAGAGGAGAAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAG:1 + chr3L 10308157 5' + invader2 4738 1 77.78 CACCTTGTGGTTGTTGTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGTAGGG:1 + chr2R 7490608 5' + Circe 7184 1 80.90 TATAAGCCCATACATGTCCCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:1 - chr2R 892431 5' + Stalker2 7276 2 54.26 TTGAAAAATGTCACTGATGGTTTGGGGATGTATCTCCAGCCGTGGAATGGGAACTGGTAAAACTTTTAAAAATTTTATAAAATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTTG:1 - chr2R 4659349 5' + S-element 1470 1 42.73 GTAATCTAAACTAGCTTTAGTTGATAGTAACATTTTCCTACATTTCCCTACTTCAAGCCAAAAAGTCCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - chrX 9213711 5' + jockey 4780 1 61.68 TTACTAGTAATGATTTTAAACAGTTCTATTCACTTTAAAAGAGGTCAATCACAAAGCTTTGTCAACTTCCTATTTCAACATAATTATGATCAACACACGGATCAAGAATA:1 + chr2R 2178215 5' + diver 5826 1 65.45 GGGTTGGGGGTTTCTTTTTTTTTCAGTGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGGAGTG:1 - chr3R 13582860 5' - I-element 4980 1 74.55 CGGTCAGCAAAGTACACCGCATATAGAGTGCCCTACAAAATCTGAGTACTAGTTAAATATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGGGGTAG:1 + chr2L 8739000 5' + baggins 5379 1 58.18 CAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr3L 15968229 5' + P-element 57 1 28.44 ATTGCGCTATGGACAGTTGTGTTGTGGGCCAGATAAGCCGAGCTACAATAATATATGTATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGGAGTGTG:1 + chr3R 10173813 5' - Tirant 327 2 58.33 AAGAAGCTGCGCGAGACCATGGAGCGCGCCAAGGGGGGCATATATTGGTTTATTACATGGCG:1 - chr3R 5740464 5' + blood 382 1 56.45 GCCACTGAAAACTAATTAAAATAACAAAAACTAATCAAAGCATAGAAAACATAAAAACCCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGAGTACATAGGCTCTCATT:1 - chr2L 14687516 5' - Quasimodo 459 2 54.55 CGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGACCACAACACAACACAACACAACACAACACAAACAATTATCACAGCTTAC:1 + chr3R 21907535 5' + Porto1 307 1 23.66 GAAGTTGGTTCTCTCAGACATTTATCAATATATTTTGGATAATTATCCTTACTTTAGAAGTCGGGACTCTTAACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTGC:1 - chr4 838544 5' - Cr1a 4035 1 59.63 ATATGTATATACATATGTTCATATGTATGTCCTTGGCGAGCAAAGTTGAATGAGCATCAGAAGCTTGCTGAGGTTGAGCAGGCTGGGAGCGAGATGACG:1 + chr2L 20609224 5' - G3 267 1 54.55 CTTTCTTTCCTTTTGGGTTGTCGCTTCTGTCTCCATTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAA:1 - chrX 9845574 5' + F-element 13 1 76.36 AAGTCTTCCGAAAGATTTGAAGATTCTTGGCGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCACGAGACATCCACTTAACGT:1 - chrX 14853436 5' - P-element 2855 1 40.45 AAGCGTTGGAATATCATGTAAGTTAGGATCAGATACAACTTTATAATATGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTT:1 + chr3R 25051578 5' - 17.6 7386 2 59.09 CAATATAATAAAAGATCCTATCTTCTCTGGGAATTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 - chr2L 13710733 5' + copia 4920 2 71.82 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAACAACAAACACAAACACAA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 420 1 35.56 GCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 - chr3L 22108144 5' + Transpac 4979 2 78.90 TATTTAATGTTATTCAATGTTATTCTATGTTATTCTATGTTATTCTATGTTATTCTATGTTATGCTATGTTATTCAATGTTATTCTATCATTCGGCATTCCACAGTCTTC:1 + chr3R 13272230 5' + Doc 3 1 54.55 ACTAGTTTGTATATTTGATGTAGCTTAGTTTAAGGTTTCAAAAGAAATGTTTTGAATCGTAACAATGACATATTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 + chr2R 14883952 5' - mdg3 5486 2 70.91 CTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 4606204 5' + 1360 9 2 64.44 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGG:1 + chr3L 22908066 5' + transib2 2581 1 80.73 TACGAAGACGTCGAAGACGAAGAGCTCTGGGTTGGACACCCTAGTCGGCAAACCATGAACTATGGGGGATTTGGCCGGGTTTTTTTACAA:1 + chr2L 14141267 5' + hopper 12 2 63.33 CTCAGATTCTGACTCCAGCGAGAGTTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTCTGACCTAGAAAGTCTTAGCTTTAAAATT:1 + chr2R 24101334 5' + jockey 4797 1 68.48 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAG:1 + chr3R 21907535 5' - Stalker4 400 1 31.73 TTAATCAACCTGTTCCATGGATTATCCTATGTATATCGATGCCATCATGAACATAAATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTG:1 + chr2R 17718317 5' + McClintock 19 2 61.00 GACAACGTGGCTACCAGTTGGCGCAGCTCCTCCTGCCTACTCTAAAATCCAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCC:1 - chr2L 15277274 5' + 412 435 2 58.02 GCCCACATCTTATCTTTTTTTACACATTGAAAAAATAGGTATATCAATCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTA:1 - chr2R 19357985 5' + 17.6 137 2 60.00 TGGCACTTTTACCCTCAGTCTGTACCATAAAGTTGCAACTCTGCATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGCGTTAAGTCCGTGAGCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr3L 36279 5' - Tirant 385 2 68.52 AAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAAATTCGCAGTTGGCATTTATA:1 - chrX 4617443 5' + HMS-Beagle2 464 1 51.55 TTTTACTGCGCGAAATTCTTTTTCAAGGCAAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAACATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 - chrX 1599440 5' + hopper 44 1 65.05 ATTGGGAAACTCGGACGGCGCACTCCCTTTTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAAAACAATCACAAAACA:1 - chr3R 23730058 5' + Burdock 6136 1 73.42 AGTATTCGTTTTAAATACAAATGCAATTATAATAACACACACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGCGTGCG:1 + chr3R 17409445 5' + Ivk 8 1 80.00 AATTAAATGACTAAGTACTTTGTGAAAGACTAATGAATGTGTGAAGTATTTGTTTTGTGATCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACA:1 + chr3R 11990898 5' - hobo 2568 1 52.73 AATAATAAATAGAATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTTATTATTCTATTTTATTTTATTTTTTTAATTTTTTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAATCT:1 + chr3R 16799790 5' - X-element 4697 1 43.64 AAAAGCTATAAAATGCTTTAGATGCGTCTTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCAC:1 - chr3R 15813411 5' - gypsy4 436 2 74.55 CGTCCCCAAGGGCCAACAGATTGCCGGGTATGTTGAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAA:1 - chr3R 6342534 5' + HB 1318 1 64.29 CGCGAATCATCCTTTCCTGATCTATGAGTGCTTGCACTTCTTTGATTCGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTACAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 + chr2L 18675574 5' + 412 1 2 78.18 ATTAATTTGTTGCCTTAGCTGGGCTCAGCTTATAATTGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTNTCTTAAGTTCCGTGATTGCGTGTGTAA:1 + chrX 17110050 5' - F-element 4416 1 54.90 ATCAGTAGGTAAACTGAACGTTAACGTTAACCTGATTACGGTCATTACAGCCTATAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTT:1 + chr2R 25127154 5' - S-element 62 1 65.96 GCAATCCTTCGTCGCGAATCCTCCTCCGCGTGCTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAG:1 - chrX 13787975 5' - Rt1b 4993 1 67.16 TGGTAACTCAGAACTCAAGTGACGTGCGCGACATATAACTCTTTTGGATTCCGGATCTTGTCGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 3323303 5' + hobo 20 1 59.43 TTTACAAAACGGCTTTCGATTTTTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATATAAGATTCGACGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATACGTCGGGCCTCTCA:1 - chr3L 23035572 5' + I-element 21 1 61.32 TAGCAATATAATAAAATAAAATATTTATTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTATTTAAATTCGTTTTACTTCTCTTCTCTTACGTCTTCGCTACTTC:1 + chr2L 5307481 5' + Doc2-element 364 1 65.45 AATCCGCACATTTTTCATAAGCTCGGCCAAGTACTTGCTCCCATGCACACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2R 6538001 5' + roo 16 2 66.36 GATGGATGGAGATGGAGATGGTGTTGGTGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGGTTGCC:1 - chr2L 16254073 5' + FB 43 1 70.53 TTTCTCCAGCCGAAGAAGTGTGCGTCGACATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGAAG:1 - chr3R 27504700 5' - Quasimodo 36 2 93.75 TTGGCGTTGCATACTTTTACGCGTCTCTTTAGTATTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr2L 19602903 5' + hobo 26 1 61.18 AGGTGATATCAAGCAATTCTTTCATATCTCTGCAAAATAAAGACCTTGAACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 - chr3L 15525687 5' + Ivk 26 1 49.48 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACACCACAACACAACACACACAAACACA:1 + chr3R 21907534 5' + gypsy3 419 1 38.18 GTAAACGAGAATTCATTCCAAAACAAATACAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA:1 + chrX 11836320 5' + Doc2-element 231 4 70.00 TGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGGGTTGTGTTGGTGTTTGTGTTGGTGTGTGTGGTTGTG:1 - chr3L 11777678 5' - gypsy3 419 1 25.45 ACTTTATGTCAAGCCGGAAAGCATCAATCCTGTTCACTCCGTTTAACTCCAAGGACCTAAACAGTCGAATCAAGTTATACCTCAACGAAAAGAAACTCTCCGACTGGGCA:1 + chr3R 13997264 5' + Ivk 4930 1 75.45 CGCGGGAAGAGCCGAAGCTGAGACAACATGCAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 - chr2L 19808560 5' - copia 202 2 76.36 TTTTTATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACATTGATATGA:1 - chr2L 4016908 5' - opus 451 2 64.55 ATCTCCGGGCACTGAAATGTTGTTCGGCCTTAGCTTCAACAAGTGGCATCATGCTCCTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACG:1 + chr2R 6690889 5' - R2-element 52 1 58.18 AAATTATGCTTACGTTTAAACTGTACTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGG:1 - chr3R 10510017 5' - I-element 5300 1 74.55 GTAACACCTGACAATTATGCTGCTCAATTGAGCAGAGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGC:1 + chrX 18483125 5' - pogo 2087 1 67.89 TGACGAGCAGGGCTACCAACGAATCATGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGC:1 + chrX 20433310 5' + diver 5916 2 55.45 TCCACACGGAATCCCTTACGGGACACGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTACG:1 - chrX 9432881 5' - roo 9019 2 70.48 ATCTAACAAGAGCGAATCGAATCGAATCGACGCAGACAGTGACCGCCGACAACCGCATATGCCCCGCACTTTAAATCGATATTATTTTTGAG:1 + chrX 15861570 5' + 1360 250 1 69.57 GTCAAATACGTTTAAATGCGCAATCTATTTTTGATTTCCCACAACGCAAACGAAATCGCTGCGAAAGGAATGCGATTCGCGCCAAATTA:1 + chr2L 11770605 5' + transib2 190 1 51.69 GGAGCGCTGACCAACAAGCCCTACAGTTTTGTGGCCCGTCCCTGGGGGATCCGGAAGGTGAGAGATCGGGAGAGCG:1 - chrX 8250497 5' - mariner2 569 1 76.32 CTCGAGCGGAAAGTATTCAAACCCAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr3L 10836546 5' - opus 7460 2 75.00 CCGATATCGGTCGGCTATAGGTGCCTGTATATATGTCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3L 17530201 5' + Tirant 8136 2 63.33 ATAATAAATAATGACAGGGACACCGAACTACCCAGTTTTTTTGTTCTTTATGTTTCTTCGTCTCCTTTTTGTTATGGCGG:1 + chr3L 3482044 5' - HeT-A 246 1 52.50 AATCATGAATTTTCTTATGGCACCAAAGCCGCCGGTTACATCTCTGCCCAATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr3R 12040135 5' + HMS-Beagle 6827 2 53.21 CTCGATGGGTTTGCACTTGGTGGCCGGAGAAGGCATGCTGTGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 - chr2R 5703505 5' - Transpac 250 2 54.95 GGTAGTGTGGGTAATAATATTTGGTGTAGCGGCGATGAGGGAGCACCAAGGGCTGCCACAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATA:1 + chr2L 6367768 5' - 412 7074 2 46.32 TATTGTTTTGCCATTGTTTTATTTCATCGGCAAGACATTTCTCTTCCGCATTGTGTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGTCCGAGCT:1 + chr2R 16400363 5' - Idefix 7078 2 65.98 AACTGCAGCTATTCGAATGCAAGCTGCTATTGCCATACGCAGTTAGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2L 494072 5' - roo 402 1 61.54 TTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTG:1 + chr2L 12355487 5' - TAHRE 10434 1 69.72 AAATGCATTCGGCAACAAAAGGCTGTGTGAGGGCCACACAATTATATGAAAGTGCAGTGCGAGACGGCCAGACAAAACACCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTC:1 - chr3R 7460411 5' + gypsy7 301 1 75.23 GCCATGTAGGTCGATAGCAACTGAAAACCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chr3L 16496211 5' + P-element 55 1 30.91 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr3R 21907534 5' - Tabor 464 2 39.09 GGAAACTAAGTTTACCAATTTGCATCTCAAAGGTAGTTAATTTCAGATCATATTATGGAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2L 7750630 5' - opus 468 2 51.82 CACGGCAAAGAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTGATTT:1 + chr3R 24867493 5' - roo 9037 1 60.78 CACGTCGTCGTCGGTTAACGGAGGTTTTTCCGAGCCATACCACAAAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATAAATGTAACGGCGA:1 - chr2R 9388205 5' - Ivk 93 1 57.78 ATACTAGGAAATTATTTATATGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATATATAAAGTATGAATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCCAG:1 + chr2R 4854977 5' + INE-1 90 1 57.14 AGGACTTCTACACTCGACAAAAAAATTTAACGTTCCGTTGTTGAAAGAAGCTTAAAAAAATATTTATTATATCATTTTTTCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2L 2397183 5' - roo 406 1 30.28 TTTAAATTGAGTCTAATATCGTGCGATCGAACTAACAACTGCACTGTGCACTCGATCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGCTCTCGTG:1 + chr3R 16331733 5' + Cr1a 340 1 67.27 CTTCAGATGAATGGTCGGGTGGTGGGGTTTCCTTCTGGACAGAGCCAAGAGTCTCCACCAGGATCATCCACACGGCGAAGCGAAACGACGATGTTGATAAACAAGTAAAA:1 - chr3R 8230340 5' + P-element 2568 1 83.64 GGCCACAACTTACCCATGACGATCAATGGAGCAGTACTGAAACCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACTT:1 + chr3L 16791568 5' + Juan 3890 1 58.72 GCTACCAGGCACTTCTGAGGTCCCCGGAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 217368 5' - roo 9045 1 67.47 CAAAGCCATTTTCGTTGCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 + chr3L 16291843 5' + jockey 4784 1 53.68 CATGTCACCGTCTTTTTTTTTTTCGACGTTTGCTTTATCGTGCCGTTTTTCCG:1 - chr3R 18578083 5' - Bica 307 1 71.70 AAATTAACTAACCGCTTTAATACAAAACTTTAGTTCTTGTGGTCTGCGAGCAGAAACACGAAATATCGTTTCATTTAAAT:1 + chr2L 5219033 5' - invader1 3621 2 66.25 GACAATAGCCGCTAATGCCAATGTCAGTCAAAACACTGAGAAATAATTTAATAAAATAATTTAATAAAAATAAAATAATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 6529544 5' + Rt1a 5070 12 53.33 TTATTAATGACTAGGAAAGGTGTTAAAGTGTTAATAAAACCAAAAGGGATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATTATTATTATTATTATGATATATAGA:1 - chr2R 10241532 5' - I-element 5349 1 76.85 GAATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chr3L 22744729 5' + FB 21 1 77.27 AATGAGAGCACAGAGATAAGGCAGTGGAAATCACCGCTCTTCCACCTCACCCCGTATTTGTGTCCCACTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAA:1 - chr2R 13934509 5' + FB 4 1 72.16 AGAGTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGG:1 + chrX 21852436 5' - gtwin 473 2 78.89 AAAGGCCATTGTCTTTCCTTAAAGTCAAAACACGTGTACAGTGTAGGTCCTGGAGTACGCCGTATTCTCAGGGACCAACTGCGCACACCAACCACCTAGCGCGAGG:1 + chr2L 21748989 5' + F-element 4470 1 78.30 TCTACAAAAAGATGTTATCATTTTGTCAATGACATTTCACTACCATCTGTCCGTGTGTCTTAAAAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATT:1 - chr3L 18460973 5' + 1360 183 1 56.36 GAAAAGTAAATTCTGTAGCTCAAATCGAACTGATATGTGGGTAGAGCTTAAAGGTGTCCCGGGATTAACAATCCTTTGGTAGTTGATGAAATAGACTTGGCTCTG:1 - chr3R 28773775 5' - Stalker3T 315 1 79.05 GCTTGCAAGAGCATCCGAACTTCTTGGCCCGACTAAGCCAGGTAAAACTAAACCTTCTGCCAACTTTTTTTACCCTGCACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3R 23620953 5' + roo 5 2 76.36 GTTTTATGAGTGATTGAGTGTTTCTTCTTTTTCTTTTCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGCATGAAGATTCAGATCACGGCGAAGGG:1 - chr3R 9679363 5' - BS 4790 1 56.84 ATGCGATGGGACTAACATATACCCTAATAGCTAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCA:1 - chrX 11231974 5' - Tirant 318 2 70.00 GTTATAGGCCTTATATTGTGTGCGCTCGTGTGCGCTTTTGCGTGGCAGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACC:1 - chr2R 25049886 5' + R2-element 3509 1 57.27 ATACATTTAGGCGCTTGGTTTGCAGCAGGCAAGTTGCTTTCACTTTTAGTTAACTAAAACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGGTTT:1 - chr3R 22608501 5' - invader2 5057 2 58.43 AAAGACCCGCATCCAATGTCCTTCCTCCACGGTTTTAAATATTTTGCGTGTAGAAGCTTTTCTTTTCGTTGTTTTTTTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACACGTTT:1 + chr2R 14827477 5' - Doc3-element 4465 1 71.82 GCGCTGATTCCAATTAGCAATATAATTACTTTAATAATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3R 7833126 5' + Doc 34 1 63.04 ACTAACTACAATAGCTGATCAATCAAGCGAACGTAGCGATTTTTGGGCACTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTC:1 - chr3R 27893535 5' - F-element 4378 1 56.38 ATTTAAACGATGAATAAACTACACACCAAATCATGTTAAATAAATTCATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 12623781 5' - roo 388 2 57.89 ACTTGATAATCAGGAACTACCAATATAATAAAAGATCCTATCTTCTCTGGGAATTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr2L 13710753 5' + copia 31 2 53.64 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCA:1 - chr2L 16217660 5' + F-element 4487 1 35.00 CCATGTCATATGAAAGCCACAAGGTTGTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr3L 9198469 5' - 1360 3360 1 71.25 CGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2R 7981154 5' + 1360 55 1 80.19 TCTCTACGTTGAAAAAGACTACTGGGTGTAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2L 9754845 5' + 1360 55 1 73.15 AGTAGCACAAACACAATTAAGACAGCAGGGAACGGGGGAGCCGAAAATAACTTGCCGTCGATCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAG:1 + chr3R 30624541 5' - G-element 18 1 54.55 GCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTC:1 + chr3L 16291859 5' + jockey 4798 1 67.74 AAAGGCAGATCAACTTCATTCACAATTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGC:1 + chr3R 22207299 5' - 17.6 7196 2 77.27 TTCTCTGTGTGCGCTATCTAAATGTGGCACGATTATTGTTATTATTGCTGTTGTTTCACAGCGCTCGCAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAC:1 + chr2R 21591962 5' + Tirant 3 2 76.34 CAGTAAAGCGGCACAATAAAAATCCATCTAGCAAAGCCAACAACTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTA:1 + chr3L 18489491 5' + F-element 4229 1 70.91 TTAAAATTGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3R 7049636 5' + 1360 10 2 65.56 TGCGACACCAACTTCGAGGTAATCGCCAACCTGCCCAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATAT:1 - chr2L 20725582 5' + Chimpo 187 1 68.18 ACAAGAAAATAAACAACAAATTTCAAGTTTACACACTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTCTTTACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGAGCAGACGT:1 - chr3L 23583085 5' + G6 13 1 66.67 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACCCAACACAACCCAACACACCACAACACAACACACAAACACAC:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 420 1 25.24 AGTTATATGAAAAACTTTATTCAAGTAACTTAATAAAATAAATACTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chrX 22717128 5' + pogo 39 1 61.82 ATCCAATCCCCGTCCACCCGAATTTCTTAACATTTCTGTATTCCTGGCTGGATAAGAAAAAGGATAATGATTAAATAATAAAATGAAAAGAAAAAGATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 15213065 5' + Doc2-element 220 1 23.85 CCATCCTCAACGGTAACAAGTTGAAGCACAATGCTGGGGCTTCCCAACTATAAGATACGCTAGTACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTA:1 + chr3L 15189830 5' - Porto1 4529 1 53.64 TAACCAAACGCCCCCTTTTCCAACACTAATGCACTACACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGA:1 + chr3R 24699908 5' + 1360 3266 1 66.97 AGGAGTCAGGGAAAATGAGCGCAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGCTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAG:1 - chr2L 20614043 5' - Cr1a 4276 1 80.00 CATGATGCAATATGGCATGTTAAAATGATATGATAAGATATCATGACGCGAAGATAGGGGAAGCATATTAGATTTTTTTTTTGTTTATTGTGT:1 - chr2R 16289145 5' - Porto1 189 1 60.22 GTATTCAAATTGCTCATCAGTGAGAGGCGCCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCCAGTTCTAA:1 + chr2L 9147978 5' + Doc 47 1 71.43 CAAAAAAAGAAAAGGGAATCGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGAACCCCCGACCAATTTACCA:1 - chrX 9419747 5' + G-element 4217 1 77.42 CGACCAAGAACAAAAAACCTACAAAGAGGAAAATGTTATGATCCTTGTTACCGGCCCAAGCCCACAGAATGGTTCTGCATTGCAAGCAAAACAATTAACAGCTACAATTA:1 - chr3R 31918514 5' + Doc4-element 394 1 71.82 AAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAACGACACTAGAATAAAAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 23146473 5' + 1360 17 1 64.00 AGTATTCCGTACAAACATTTTCATTTTAAATACTTATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACAT:1 - chr2L 19320503 5' + Juan 53 1 72.73 TCCAATCTACCTTGTAGTTCATCAATTTTTAATGCATACCCTGTACTTGTCGATTATAGTTATCTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2R 10090990 5' - roo 407 1 75.27 TTACCGTTTTCGTTGTTCTCGGTCGGCTTATCATACATTTGTTAAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATCCGCTCCTATTTTTGTTT:1 + chr3L 11836748 5' - Porto1 201 1 59.00 ACTTGTTTGCTTAGATTGTTTGGCCTTTATTTTTTTTTGTCGTATATTTTTCTTTTCGGAGCGTCTCTGCACTTCACTCACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chr2R 11632281 5' + Tirant 1 2 76.36 CAGCATCTGAAATCTCAAAATCCTGCTGCAGAATGTGCAGAGCGCGCAAAAGTAAAAGCCGGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATACA:1 - chr3L 14755089 5' - P-element 2863 1 59.09 ATAATAACCTCTGCTGAAGTTTAATTTTTAATCACCTACACACATGTGTAGATTGGTGATCTACATGTGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAG:1 - chr3R 20833658 5' - F-element 457 1 57.14 CCAGACAAATACAAACGTTTTCACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTT:1 + chr3L 14463138 5' - Doc 4536 1 80.00 TTAGTTTTCTATTTGTGGGCGCCACCAATAACACGGTAAGATATTTTTTAGTCTTATGTTTCCATGTATAAGATTTTGTTGCACTCTTTAAAAATATTTTATTTAAAAAA:1 - chr2L 18603720 5' - hopper 164 1 51.82 AAGATTACTTTTATTGAGACATTACCGAGATAAGATCCGCGTGTCTCTGATGGAATGGAGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTT:1 - chr3L 4533529 5' + 1360 3261 1 64.65 TTTCATAGACGTAAAATTTGCTTTTCTTCACACATGAACATGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr2R 25081866 5' + roo 65 2 81.82 GGATTCTGGGCAAGATCCATCACTCATGAGTTATGTGGAAGGTTGATA:1 - chr2R 17806146 5' - Transpac 311 1 58.33 CATGACTGCCAACAGAACTTGCTTGTTTGCAAGACAATAATTGCAGAATTGAGGACCGCGTCTGGAGTAATAATGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTG:1 - chr3R 21515572 5' + diver2 4462 1 59.60 TATTTTAAATTTATTTTAATTTAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAA:1 - chr3R 20705684 5' - FB 804 3 81.65 GAAAATAGTCCCAATAGCCAAGCACTGTGAAAATGGCCAAAACGTTTTGCAGAAAGTTAGTGAAACCAAGGAAGATCGACA:1 + chrX 11192570 5' + Bica 437 1 80.25 GCAGCAAGCCGTAAATCCATCTCGCTCCTCTGTGAGTCGGACCAAAGTTTCGAGGCCAAGTTGTCATAAAATTAATTTATGTCTAAATTTTTTTTTTCTTTTTATTATAT:1 + chr3R 18853621 5' - Rt1b 5148 5 64.55 CTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 + chr3L 4264979 5' + Transpac 40 2 66.32 AATCTAAAGCTGTCACAGTCAATGGTAAAAACCGGATTTCGTGTCAAGTTTTGCTATAGTTTCAATTAAACCGTCAACTATACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCG:1 + chr3L 2890134 5' + Copia1_DM 129 1 60.00 TTTTCATGCCCTTGCCAAATGTATTTAAATTTTTGTCAGACGTTTGCATAGCTATATATACATATGTTATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3R 11549791 5' + 297 11 2 71.82 ATCTAGATTGCTTGCCGTTTATACAAGCCTCACATAGATCTTGATCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3R 3282369 5' + Stalker2 35 2 53.64 ATACCTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTG:1 + chr2L 8523090 5' - Gypsy6A_LTR 383 1 75.00 GGTTGTGTACGCGCTTTCTAGATTACTTTTATGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTGTGTGTA:1 - chr3L 17706419 5' + Juan 50 1 64.00 TAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACCGATTCAAACAGAGCAGAGGCTCTGAGC:1 + chr3R 7773344 5' + Stalker4 356 4 31.82 GTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 9435832 5' - roo 9021 2 70.00 TCGCTCCCCATGTAAAGTGGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAATA:1 + chrX 1881504 5' - Quasimodo 6936 2 79.35 TGGCAAAGTTTAATCTTTGATGCCGGCGACACATTGGGCCCAAATTGATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAAT:1 + chr3L 20167902 5' + 412 17 2 65.45 ATAAGCTGTTTAAAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACCAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr2R 9963566 5' - pogo 2090 1 62.35 TTAAAGAGCCTATTGCATTGCCCCCAGCGCATGTTTTCATGTGTGTTGTTGTTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGGACC:1 - chr2R 19281148 5' - Doc 4392 1 58.89 ATACAAATCCGATACAATACGCAAATAACCCATCAGTTACCAACGCAATCACGAAACTTAAGGAAAAATACCATAGAAAGCTTTACA:1 + chrX 1677530 5' + F-element 4445 1 70.11 AGTGAAATAAATACAAATAAATAATGTGCGAGTGTGCAAGGTGTTAAGTGGACTCCCACACACAAACAGAAGCGATCCATACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 + chr3R 21630571 5' + hopper 1 2 44.44 GATAAGCACGCAAAATTTCATCAGAATCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAAATAATAATAAAAAATAATAATA:1 + chrX 23189451 5' + flea 5001 2 72.73 ATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACACC:1 + chr2L 10746634 5' + flea 4770 2 65.31 GAATAGATTTCAAGAATAACTTTCCATATTAATGATATCTTTGGTAGCGTCGTAGAATCTTAATATTTGAGTTGCTGGCAGTA:1 - chr3L 6696975 5' - G4 3455 1 61.45 CAACCAACTTTGTTCGGAAAGGAAGATCAAATGCCGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTACCCAAGCAGCGC:1 + chr3R 4699073 5' - micropia 5221 2 64.76 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTG:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 4 1 60.00 ATGTTATTAAATGTGACCCGTTTAAATGCGAATCGTTCACAATATTATTTCCATTTATTTATTATTTATTATTTCCATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - 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chr3R 19533953 5' + Osvaldo 1518 1 70.91 ACTTTGCCGCCTTATCCACTTCCAACTTTTGGCCCACACACTCACACACATACACACACGTAAAACGCACCCACCCAGACACATACTTACACACACACAAA:1 + chr3R 9091492 5' + Quasimodo 30 2 53.47 CCCTGTGCAGTCGAGCACATTTTTCAAGTGCTAAACAAATGTTTTTCTTTTGTTTTCCTTCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCTTGTTCGGACGCTCGGCTCAAG:1 - chr3L 14814160 5' + 1731 4502 1 59.09 TCGCTTTTTTGTTTAACAAGCGACTGACACACGAACCAAAAAAAGAGAAAAAAAAAACACTGCCGAAGGCATTAATAAGTCTTTTGGAAATAAAGTTTAGTTTTAA:1 + chrX 20755005 5' + transib2 2485 1 53.77 GTTCGCTGTTTTACTTAACTTAGTAAAACTTTTTCATGACATATTATGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGAT:1 + chr3L 13955645 5' - Q-element 118 2 54.35 ACGCCCCAAGGTCCCATAGCTGATTTGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTG:1 - chr2L 10903815 5' + invader4 380 1 63.38 CCACCCAAATACGTCACTATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGG:1 - chr2R 1355077 5' + 1731 4488 2 83.50 GTTCAAAATTTGAGGAGTCCTTCGGTGTTTCATAATGTGAAATTCTTATATTGTACCGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGTATCG:1 - chr3L 17787091 5' + pogo 20 1 58.65 CATTGAAATCGATTGATAGCACGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3R 17272015 5' - hopper 1372 1 72.63 AATTAAAATTGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 7049634 5' + 1360 28 1 55.45 TGTTATTGTGGTAGTTCATGTAAATATCATCGGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTATTTTTTTTTGTTTATT:1 - chr3L 12762290 5' - BS 5102 7 33.03 AAAAAAACATTAATCTGCCATATGAATTGCAGTCGCATTTAAATAAGCCGACGTATTGCATAAACACTCTTGATAACCCGATCTCCTTTGACCAGGGACCGCAG:1 + chr2L 10750068 5' + X-element 4525 1 78.85 TTACTTTTGGCATCGCCCAAAAAACACTTTCTTTCACTATTAGCTTTCAAAGCGAACGGATGTGTTTTTTTTTGCGCTCCGATTTTTATTTTATGTTTGT:1 + chrX 16646406 5' + Cr1a 38 1 70.00 ACTGCTCATTTGGCCTTTTGTTTGGCATTGGTCCGTGAGCCGTGCAAGTTGCCAACGAACTTTGGCCCCCAAAACAGGCTAACACACACACACACACATAC:1 + chr3R 20142741 5' + accord 7029 2 71.29 GGAACCACAAATAGTAAATTATGTATAAAAAAATTACAAAATCCTTCAATCGGTAAATGCGCCAAACAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 18912691 5' + G2 3077 5 52.38 ATTGAAATGATTAGGTACTCCCCTTTTGGTCGTTTTTGTTTGTGTTCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTGAGTTCTGTTGGAGTTCTG:1 + chr2R 16849820 5' - Porto1 4536 1 60.91 TAAATAACTTCTTAATTTAATTTAAAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 12039915 5' + 412 23 2 59.63 CACCTAGCACCATTTTAAATGTTCTTTTTCGGGGGGTTTCTTGCGATATATCTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1 + chr2R 12636212 5' - I-element 5308 1 52.73 CTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 - chr2R 11379782 5' - jockey 4966 1 56.57 TTTCTCCGCCTTGGGTTTCTTTTCGGCCTTGACTTTGGCTTTCTTTTCTGCTTTTAATATATGTCGGCATTATAAGACAAGGCAATATCTTGCCGGATCATCAATTTGGA:1 + chr3L 8174250 5' + Helena 276 1 61.82 TTTACTTAAATTGGTAGAGCCGAACTCATCGCAATCATTTGACAGGAACGTAGTGGTGTAATTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATAGGAATTT:1 + chr3L 14603147 5' - Copia1_DM 83 1 55.21 CGCCGTTTTGTGCATTTTTCCCGTCCGGTGTTTAAATTTTATTTAATACTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCGTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr3L 17530128 5' - Tirant 372 2 55.24 AATAATAAATAACCAAAGACAGTTTCAAATTAAGAAGGCTAATATCAAATTAAGGCCGTGGACGTAGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAA:1 - chr3R 11246654 5' + Stalker 7211 4 60.19 CATGCCTCAGATATCGGCCTTAATTGAAATGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGCCC:1 + chrX 15592910 5' - Gypsy6A_LTR 77 1 61.82 ATTTAGTGAATTAATCAAGAAACGCAAAACGGAACCATTCATTATACATGTAACAATAAATGTAAAAGAGAAAAAAAAACGGAGACACAA:1 - chr3R 27769738 5' + invader3 5020 1 75.56 ATCAGTATCTCCACAACACATGTATGTACATATATCTGGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCA:1 - chr3R 23171358 5' + Cr1a 4211 1 65.45 CATTCGTGGTGGCGTCTCCTGGCCTTCTGCTGCTCTGCTGCTCTGGTATCTGTTTTGGATTTTTTTTGTTTTTTTTTTTATGTTTTT:1 + chr2R 24301152 5' - Porto1 163 4 56.32 ATTCCAACTTTTGTCGGAAATTGAATTTGATAAACTTTCTAAAGGCAAAAGGCGGAAGAAGAGAGGAGTTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGT:1 - chr2R 19346983 5' - G2 2896 1 71.57 GCAAAGCATTCCGATTTTTATCAATTCTAAGCCGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATCAG:1 - chr3R 7824030 5' + micropia 459 1 59.76 ACAAACATCCTTATCATAAGCTTGTTTTAAGTAACTGATTTGCGAAAGGTAGCTTCGAATAATTCCTTAGTCCACCTCACTAGTGTATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:2 - chr2L 14708975 5' + opus 7114 2 77.27 ACCCACTCAGCCCCCTGCAACCATCATCAATATACCCATCAGCATCAGTGCCATTAAAAATAAAGCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCA:1 + chr2L 18574774 5' + Stalker2 7365 2 58.49 GCTATTTTAAGCATCCAAGTTTTCCCAAGACAGTAGAAAATTGCCGCTGTTTTGATGATCCACAAGCCTGGAAAACCTGAAGATGATCCTGAGGCGTATCG:1 + chr2R 18254273 5' + Helena 167 1 77.23 GAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGCTCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTG:1 - chr2R 6801682 5' - McClintock 439 2 73.63 TTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTC:1 - chr3L 15968241 5' + P-element 45 1 39.45 AATCCATAAAAGTATTTTTTTTTCTATATACATGTACTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATAC:1 - chr2R 8083835 5' + Idefix 46 2 73.64 AGGTTACCTAATTCCTAATACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCCACTTAAAA:1 - chrX 13084551 5' + 412 7511 2 78.57 CACTGGAATATGTTGACAGTTACAAGTTAAAAAAAAAAACCAAAA:1 - chrX 1109806 5' + TAHRE 10442 1 82.22 GTAGGCCCTACTACAAAGTATATATAAATTCTTAATCAGACGAGGGGTTATCTTCTCGTAAATTAACCTGTACGATACACGGGTGCGCCCCTCGG:1 + chr3R 31953832 5' + Cr1a 4404 1 48.42 AGGGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 18072776 5' + 412 42 2 73.03 CTAAAAACACATGTTTTTCACATACTGAGTCTGCCAATACATAGATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1 - chr3L 23996574 5' - HMS-Beagle 223 2 53.68 TACACATGCATTTAGATGAAAGGACTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACTATTATTATGAAATAAAAGTCAATAAATTTTTTTATATTTTATTAT:1 + chr3L 22371777 5' - transib4 2277 1 75.23 TTTGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr4 311594 5' - 1360 3366 1 55.00 CGTGTCGACAATGCCGTGTAAGGCAATTCGGTAACTCCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTGCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCT:1 - chrY 311148 5' + jockey 482 1 60.87 TGAAAGGACCTTTTGTATTCATGGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAAA:1 + chr3R 4759742 5' - hopper 1404 2 91.67 TGGCCAGGCCTTCGGCACCATCTGCATCATCTCGTACTATGAACCGTTATCTTTCGGATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAG:1 - chrX 5407571 5' + Bari1 1586 1 58.33 CATATACAACTCGTATTCGTACTCTTTTGTCATTATTTGCGAATTTTATAACAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 - chr3L 7694641 5' - 1360 3317 1 65.17 CAAAATAATGTATATTCTGCGATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr3R 13503071 5' - hopper 1411 2 69.32 ATCCAGGTGCCAACCATGTTCGCAGACAACTGGTACTACTACGCCGACTACCCGGAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATACACA:1 + chr2R 7148419 5' + Ivk 4943 1 70.59 AGCACAGACTTTAACACGACTTCCACATCCTTGTCAAATCCTTTCGAAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGTATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCT:1 - chr3L 12760673 5' + 1360 3191 1 58.18 CAGGAATGTTTCCGGTTGGGTTGAAGCGCTCTCCAGGATAACATGAAACAGGTTGACTTAGAAATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAAAATATTGAAA:1 + chr3R 4822012 5' + 17.6 6957 1 64.15 ATCGAACCATTTTGTTTAGATAAACTGTATGTATTATACATACATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 + chrX 22489619 5' - S-element 1677 1 62.73 ATGCCATCAGGAGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 - chr3L 22108166 5' + Transpac 39 2 59.09 ATATTTTGCAAATTTTGATGACCCCCCTCCTTACTGTTCGAGCTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr2L 7466149 5' + GATE 8269 2 65.00 CTTCTCTTTTGTTTGGTGGTTTATTTTGATAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCTATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATCGC:1 + chr3R 30552888 5' - I-element 4885 1 67.00 AAGATCGGGAGTACATATAAGTGTAATCCAGAGACTATGGGCAATTTGGTGGAATCTTCTTGATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTG:1 + chr3R 15309315 5' - HMS-Beagle2 311 2 68.54 GACATGCGGCATAAAACACACAATGATCGGGCTAATTGTGCAAAAATTAAATAATTGTTGAATATGTTAACACTCAGAATAATGTCGCAG:1 + chr3L 10216784 5' - frogger 305 1 55.56 TAAGAAAATAGTTTTCTAGCTTTAATAAGATATATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 + chr2L 16230317 5' - blood 7352 2 66.33 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACACAATACAGATAACATACAAAAACTCATACT:1 + chr3R 21907535 5' + I-element 5137 1 57.14 ATTTCCGTATCGGGATGCTGTTTTTTCCACTCAGCCAAGAGGTCGTCATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCTG:1 - chr3L 16370079 5' + ZAM 131 2 56.82 CTCCTCCCAGCTTCTTTTGCACAGCCTTTATTGAGGTCTATAAATAGTCGGGGAGTCTGTCAGTTCGAGGTGGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTC:1 + chr3L 3430780 5' - gypsy5 7015 2 80.21 CTGTGGCTGAAAAAAGTCAATTTCTGAGTCGCTCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAATTAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAA:1 - chr3L 21025782 5' - 1360 3248 1 70.00 AATAGAGCAGTGTTACTTTTCAGATCCCATTTGTTTTGGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGGAT:2 + chr2L 19808509 5' + copia 4915 2 68.18 TGATGGGGTAAGAATTTAGAAGAGAGAGGAAACCGGATAACAGGATTGGCATGGGAGTGGTTGAAACAGTTTCTTATGGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGT:1 - chrX 6339696 5' - Porto1 302 1 77.98 TTTCTAAAAACAAGAGAGTACGAAACAAATATAAATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chr3R 7500934 5' + FB 28 1 53.77 GGTGCTTAGTTCGATAACAAATTCATAAAACTCAAACATAAACTTGTCTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACA:1 - chr3R 19853771 5' + copia 252 1 74.19 AATAGTAGACATAAAGTGAAACGAAGACAACACAACACAGGAAGCTGTCGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGA:1 - chr3R 17241594 5' + Bica 119 1 56.36 GAGTTTCGCAGTTTCAAGCTTGTGAATTCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr2L 2484380 5' + jockey 4694 1 68.12 GGAGCTACTCAAAGCATAACAATGAACATAACCGCACATTCAGCCAGAAGCAGTAAAAAAAACGCTCGGTGGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAAATGTG:1 - chr2L 9745078 5' - FB 435 1 75.49 ATGGTCGGGGTGCAATTTTTTGCAGTTGACGTTCATAAGGACAGACGGACATGGCCAGATAGACTCGGTTATTGATCCAGATCAAGAATATA:1 + chr2L 89941 5' - INE-1 83 1 68.48 TTTTGTGTTTATGGCCAAACTTTAACTGGACTTGCTTTGGTTTAGCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chrX 16994172 5' - roo 9034 1 60.55 TCATCAATTTTTAATGCATACCCTGTACTTGTCGATTATAGTTATCTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 10091008 5' - roo 9035 1 60.00 ACTAAACCGAAATTGAACTGAAATCTAAAGCAACCCAAACACAGATCGCTTAAAAAACCCTTGGCTGAGCCAATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATT:1 - chr2L 1561128 5' - Quasimodo 459 2 55.45 ATGTAAATACAAGTTCGAAAATGTCTGCAAGTGCTCTTCGCTTCGCACACATGTTCATAGATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chr3R 28224844 5' + flea 4773 2 64.08 GTAACTGAGAAGAGAGGCAAGCACAGGTGTGGGTTAATCGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTG:1 - chrX 1267716 5' - 297 30 2 55.17 TATATTTAAATATGACATTTCACAAGTTTGAATTCCATCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 + chr2R 18399116 5' + copia 47 2 66.67 AAAGAGAGGGGAACAGCGAGGGACTCGTCTGGTTATTAGCAGGATCGGCAAAGTGCCAAAAATGGAGAGAGACCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCG:1 - chr3L 18038010 5' - blood 167 2 56.25 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGAGTGAGAGTGAGAGCGAGAGCGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAT:1 + chr3L 22908067 5' - Cr1a 264 1 69.66 AATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAG:1 + chr3R 19450015 5' - roo 8654 1 60.00 AGAATTACTAAGGAGTTATTTTATATCAACTATACTTTTCTTATATTGTTAGAACATGCTTATCATTTCAAAATATAGATTTTTTTTGTAAAATAAAATAGTTATAAAAA:1 - chr3L 16476929 5' - 1360 3093 1 60.00 ATTTTAATATTACAGTTACACAAAAAAAATACAAAAAAAAAAAT:1 - chrX 4091523 5' - hopper 143 10 65.91 TAATATTTTCAATTTCCTTTTTTCTTTCATCTTGATCTAACTTCGAAAACCAGTACTCTCTTCCACTCAACCATTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGAC:1 - chr2R 6709666 5' + 17.6 164 2 35.45 TGGCTGGGAAAGTTAAGCCAAAGAGTGTGGAAATGGAATCTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 + chr2L 17545833 5' - opus 7497 2 66.67 TTTGCCGCTGATGACCCTAATTAAAAGCACATGCCTACACAATAATACACCCAAACACACCCTACAATACTCTGGATGTACCCAGCAGATACTAGATAAGAATAAGACTG:1 - chr3R 18492361 5' + Idefix 108 2 78.18 CTAAAAGTAATACAAAATAAATGATAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGGT:1 - chr3L 11418516 5' - Cr1a 62 1 78.57 TAAATTCTAGATTTGGATGGCAAAATGCATATGCAAATAAATAGCTAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGGTG:1 - chr2R 21592081 5' - Tirant 397 2 74.23 AGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2R 8397480 5' + 412 7103 2 79.80 GAATACAGAAAAATGAGTCAAGAAAAGTCCAAGAAAAAACGGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr3R 6993414 5' + Stalker3T 202 1 61.82 TTTATGATATGTTGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 - chrX 20433413 5' - diver 205 1 63.64 CCACAAGTAAAATAACCTACACCATCGCAACCACCTCCTATAACATTAATTAAACAAAATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTT:1 + chr3R 22367952 5' + Juan 390 1 74.55 TCGGGATAATCATCACCCTTTGCATACATCTCATATATGGGATTCCGCTTGCTCGGTAAGTGACTTATCTCGAATTGGGG:1 + chr2L 17329064 5' - Idefix 6973 2 77.50 GAGAGGAGAAACAGAAATAGAGAAATTAAGAAAAAAAAAATTTATTATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGAT:1 + chrX 2006192 5' + mdg1 7018 2 70.00 TGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTTTATGTCTATGTCTATG:1 + chr3R 22316301 5' + 412 7128 2 29.09 AAAGTGCAAGAGAGTACAATCGCTTTCGTATGCACTTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTAC:1 - chr3L 15099631 5' + G4 3808 1 32.58 AAAATGCAAATTTCATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 23621054 5' - roo 9027 1 65.45 GCGGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr3R 15524400 5' + pogo 11 1 54.12 CAAGTTTACTGTCGAAACAAATAAAAATATAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACA:1 - chr2L 14456976 5' + F-element 4223 1 78.90 CAAACACACTATGGTTTTTGTTTGTAAACACGAAGACTAGGACACATAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCATTTTGCCA:1 + chr3R 23157298 5' + I-element 5002 1 68.22 CGTTAACGGTATATTTTTGACAAGCTCTCACGTATGCACGGCAGGATGTGGGAGGAGAAAGGACGGCTTTAGGCGTGAACACACACACACA:1 + chrX 16607577 5' + accord 7022 2 63.74 AAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 - chr3L 3240583 5' + diver 44 2 59.09 CAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATATGTAAATAATTACAGTTTATTGAT:1 + chr2L 16067084 5' - HMS-Beagle2 7192 2 62.30 ATTCACTTCAGTTGGCATTAAAGATGAGGCTTTCCATGGGCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGAC:1 - chr2R 7629226 5' + pogo 1676 1 75.45 ATGTCAAACAATTTTCCCGACTTCCCCAAGATTGATAAGTCTATATTGCAGACTTGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chrX 15499958 5' + pogo 21 1 59.62 TATTCTTTATTTTTGGTTAGGCTTAGGTTTCTTATACATATGTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1 + chr2R 3169770 5' - HMS-Beagle 218 2 57.58 TCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAAATTGCCAAAATTCAGCAGAGTCTTTCGGAGAACCTAGTAATTCCAGGAAACTCCTAAAACTAACAAA:1 + chr3R 19448937 5' + I-element 416 1 82.11 GCTCATGGGATTGCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGCGTACTTTGCACAATG:1 + chr2R 12416850 5' - pogo 2081 1 58.59 CACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTA:1 - chr2L 21570250 5' + Dm88 4385 2 55.32 TCTTGAAATATGACAGGCAAAGTAAATTTTTTTTTTAAATTTGTGAAATTATTTCAAGTAAAAATTAAAATATTTTAAAA:1 + chr3L 7395323 5' + 1360 3029 1 77.50 TAGTGTCGCATTCTGGGTCCTTTTGCTTAGCAATGACAATAGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAG:1 + chr3R 29875680 5' + invader4 82 2 55.56 AATTAATAATTCAATTAAAATTGAATTTCATTCAAACTACCCGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 12623693 5' + roo 17 2 62.00 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATCTATCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGA:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 6 1 55.96 GGAGTCTTCGCTGGACACTCTCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTA:1 - chr3L 6527971 5' - R2-element 3261 1 77.17 CTGGTTTGCGGTAGGGTATCAAGCGGGTCTATTAATTAGGCATCAAATCTAAAAATTAATCAGGCACATGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2L 14480366 5' + 1360 63 1 66.34 CGTACGAAAAGAAAAGAAAGCCAAAAATATGTAATAAATTAAAAAGGAAAAACAATAGAAAAAATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACA:1 - chrX 3745090 5' - 1360 471 1 70.33 AGCTCGTTCTCTCTTACATGATCCTCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1 - chr3R 1704588 5' + Max-element 8253 2 62.69 GTTGACGACTCCTCCCGGCGTAATGAAGCAGAGTCTCATAAAAATTCATTATTTATTTAATCTCTCTTCAGATCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACA:1 + chrX 12290725 5' + blood 7180 2 62.24 TATATAAAAAAGAGGAAGGAAGAGTGTCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAAACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chrY 1565764 5' + 1360 55 1 71.30 TTGACAAGTCAGCGCCCGATTGCTTCACCTTTAACGTTTTGCGTTTTGATTTTGTCATTTTTCTTGTTGATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTC:1 - chrX 17330199 5' + opus 123 2 71.03 CTCGTTCGTTGGGATGTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTACAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAGAG:1 + chr2R 3118477 5' - Stalker4 6885 2 80.95 AGCACCACGCTAAATGTCTCAAAATATAACGACAAATCAGCTGATCACAGTGCAGGTCAAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAG:1 - chr3L 12804081 5' - rover 107 2 67.00 ATATATTCATATTCATATGTTATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACAACAACAGTATAGTG:1 + chr2L 21025550 5' + Doc 66 1 78.18 TTATGTAATTTAATTCAATGTACCGTTTCAAATTGAATCTGTGAAAAGCTGCGCAAAGAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACT:1 + chr2L 17066488 5' - S-element 1532 1 59.09 AGAAAGCAGAGAAAGAGAAGAGATGACCAACCGAGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCG:1 - chr2R 14534371 5' + opus 7124 2 62.64 GATCTTGATTTATCGAATCACTTGGAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCT:1 - chr2L 18521050 5' + Bari1 1703 1 77.27 GGGTAAGAAAGGGGGGTTTTTTACTCGGTCTACACTTAGTCTTAGCTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACAT:1 + chr3R 18799884 5' - I-element 5024 1 53.85 TTTATGTTCTCGCTGTTTTTACTCTGCATTTTCCATTTTGTATGTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAAATAACTAAATTCGTTTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAGTTTCG:1 + chr3L 14362093 5' + FB 632 3 58.18 CATAGCGCTGCCAGGTCGGGGGGCTACGCTTAGCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATG:1 + chr2L 16350294 5' - accord 180 2 62.92 CCACTTGAATTGGGAGATCGGCAGAAGCAACAACAAACAGAGCGGGCCAAGTGTTTTTGGCGTAAAGAATGCTTATGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTCCAAGC:1 + chr3R 19311461 5' + Stalker3T 289 1 72.64 AAAAATATCAATAAGAAATTAAGCCTTACACTTCTCATAAAATACCGGTAACCACTCATTAACTTCTTCTCCTTTTTCTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCA:1 - chr2L 6387712 5' - Tabor 436 2 30.00 AGAGGCAAACGAGTTAGGCTTACAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATA:1 - chr3R 13376346 5' + Doc 4454 1 75.00 TGATTGAAAATACTGCCCGCCTGCCAATGGATTTTCTCGAGTTTGTATGTTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAATGAT:1 - chr3R 8763617 5' + Tc1-2 175 1 57.80 TACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGACACACATTT:1 - chrX 5515593 5' + copia 4927 2 77.88 ATTTTCTAGGAATTTACGCAACTGTCATTTGCAGTGTTGAAAAGTGTTTTTGTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chrX 21399391 5' + pogo 29 1 54.55 AATGTCATTAATATCCATTTTCAGCTGTTTTAACTATTTTGAAGCTGCTATTTAGTAACACACATACATACGCCATCCAAGTGTGGGGAACAGCCTCTTACACTCAGCTC:1 + chrX 12422346 5' + G5A 2454 1 66.36 TGCCAGGACTCTCGGTTACGCTTGGGCTGGCCCTTACTTCTTGTTCACACATGAAGACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 5320605 5' + roo 8683 2 56.79 TGTCTCCATTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAC:1 - chrX 9845547 5' + F-element 40 1 51.82 GTCCAATTCAGGACCGAGACGCCGCTACCTGTAGCTCTACTGAACCGTGGAGCTCAATCTCAGTTGCCTCCCAAGATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGAC:1 - chr2R 4406652 5' - diver 5737 1 76.70 CAAGCCCATCGTGGTACACATCATATCCTTGATGCCTTTGAAAAGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3L 23854831 5' + 297 29 2 57.69 GGGGGAAATATCCTCAGACTGGCAGCTTTCAACGGGTTTATCAGTTTAATAGAGCTATAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGG:1 - chr2R 14174623 5' - Idefix 236 2 72.41 ACCACCAACCCACCAGTTTCGGGCCTGGAAACCACCTAGCGCGCGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGAAC:1 + chrX 10049594 5' + F-element 4514 1 63.33 ATGCGCTAATAAAGCTATTAGCTGATTTAACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr2R 9953267 5' + pogo 2 1 71.95 GTATATGCTATATTGTAGGATGACTTTTTTATTATTTATTAAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGGGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCAC:1 + chr3R 21848145 5' - Doc 4617 1 74.55 AATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAACAATCGAATTTTTGACATTTGAAAGCTGGACTCGTTTGCGCATT:1 - chr3R 7500901 5' + FB 47 1 72.83 GGACACCTCCAGAACGTGCGGAAATTCCTCTTCGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACACAACACACAGACACA:1 - 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chr3R 10828155 5' - F-element 4640 1 68.18 ATTGGTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGT:2 + chr3R 22595832 5' + FB 59 1 78.70 AATGCTGGACATTCCTGTTTTTTGTTGCCCTGTGTCCAATTTGATTTTTATTTGGTTTTGTTTTTGGTGTTGTGTGGGGTAGCAGTTTAAGGCAACTCCCTGGACG:1 - chr3R 12939369 5' + aurora-element 81 1 72.64 ATGCCATCGTGCAAGCAGATGAAGTTGACGGCAAGCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGAC:1 - chr2R 17766058 5' + ZAM 99 2 55.56 CTGTTTGTTGTTCGGGGAATTCTGGTTCTAGGGCTGATTGAGTGACTGACAAACTGACTGACTGGCTATTTCGTGTGTCTATTTTCGTTTGTTTGCTTTGATTT:1 - chr2R 14559712 5' + accord2 7255 1 63.46 GTCCCCACTTTTATTTTTCCCCCTGCACATTTACATACAGATTTGTCTACAAAAGCAATTGCAATTTCTGAGCACCAAACAAGTGCAACCCTACACACACACACACACAC:1 + chr2R 20449355 5' + accord 7100 2 79.09 GTTTTGTTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr3L 15968199 5' - P-element 2844 1 31.18 GAGGGACGTATGTGGGCCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTCACCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATT:1 + chr3L 25455105 5' + HMS-Beagle2 29 2 54.55 TAAATATGTCAAACAATTTTCCCGACTTCCCCAAGATTGATAAGTCTATATTGCAGACTTGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chrX 15499953 5' + pogo 11 1 67.68 AAAAAAGTAGCAGAGGAGCTAAAATTCAAAGCTATTAAAAGTCAAAACGGAAGTCAAATACCAAATACCTCAACGATGCCAAGAAAAACTTTTATACGTACCAGCTAAAA:1 + chr3R 17373013 5' + Fw2 397 1 63.64 TGCAGACTCCCCCATTAGAAAGAGAGGGGTGGAGAGCGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGG:1 - chr2R 14786651 5' - Doc 331 1 70.45 ATGCATAAACAAGTAGCAGAAACAAGGACCAACGATGATGGGACGCCGACATCCTCATAACGGAGGAGCCACGCTCGGACACACTAAGGGACTATTTTAG:1 + chrX 2904215 5' - roo 194 2 79.00 AGTGGGTAACCGGGCGGCGCATGTTCCTGCAGGTAAAATTTAAATTAAATTTAATTATATAATGTGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 - chr2R 8872483 5' + Doc 6 1 75.56 TTTCCACTAAATTGGACTAAAGCCATACTCCGCCGAAGACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTCGCTCTACAAT:1 - chr2L 16480485 5' + F-element 4225 1 61.17 AACTCGAACTCAAGAAAGAAAAATCCAATGAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 3555526 5' + 412 7082 2 54.55 CTTGCTGCGGTCGTTGCAACGAGAATTTTGCCACATAGCTGACTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chrX 10119630 5' + FB 22 1 53.26 CTTGTTTTGTCTTGTCTTTTTTTGTCTTTTTTT:1 - chrX 14985241 5' - gypsy7 5009 1 66.67 CATCATTCGTGTAACAATTTGCTAAAATGTCGGGGCTTAGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3R 10956254 5' + hobo 47 1 71.82 GTTTATTAAATGCTTGTAAATCATTTATTTCTCTGTTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGACCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGT:1 - chr3R 6448749 5' - F-element 4330 1 66.36 GCGAAAACCGAAAAACAAGCAGCACCAGCTAAACCAGCAAACGCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCT:1 - chr2L 8511198 5' + I-element 5172 1 67.89 TAAAATGTGCTTTATCCATCGAAAAAAAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCGG:1 + chr3L 12907696 5' - diver2 4545 2 60.94 CTCACCCCGTATTTGTGTCCCACTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGACAGCTGGAATCGTTTG:1 - chr2R 13934464 5' + FB 41 1 77.53 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATA:1 - chr2L 16217660 5' + I-element 4913 1 45.68 GCCAATTTTTGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATGGAGCCACC:1 - chr4 1271912 5' - 1360 76 1 65.45 GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGCTAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 - chr3L 15253229 5' + Stalker3T 204 1 17.71 CGTGTTTTTTGGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 + chr2L 9171454 5' - opus 7473 2 83.33 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1 + chr3L 22908066 5' + Tabor 6898 2 73.64 GAGAGCGAGCGAGGGACGTATGTGGGCCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGCTATCGTCCCACATCTTATATTT:1 + chr3L 25455095 5' + HMS-Beagle2 6902 2 67.27 AATTCGAAAAAAAAAATTAATTTAAAGGATGTGGTCAAGTCATTGGACTCTGTGGCACTTACAATATTTCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr2R 9963755 5' + pogo 14 1 68.18 TTTCGAATATTGATGAGTTGTGTCCTGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTTGGATTGTTT:1 + chr3R 21820746 5' - I-element 4896 1 72.45 CTTTCAGCTTCAAGTGTTCGATAGCTTTGTGCAGGTGAGTGCGCCGAATAAGGGGATAACTCACGTTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAA:1 + chr2L 2507546 5' - mdg3 357 1 73.00 GTAAACACATGTAGCACGACACATCCAGCAGAGCGATGGCTGGTGCTTCGCCTAGGTAACCGTAGGCCATCTTTCAGTTGATG:1 - chr3R 9284048 5' + Rt1b 364 1 55.42 GCTCAAACCGAAACGGGCTCAAACGTAGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAATTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGA:1 - chr3R 20099054 5' - FB 134 1 80.91 ATTTATTCGCAACGCACCTTTAGGCGATGTTTGTTTGTCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGG:1 + chr2R 20256419 5' - Doc2-element 376 1 86.89 ACAAACTTCATTGCTATATAGATTTTTTTTGGGGAGAGAGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 14995685 5' + Doc 33 1 55.29 GGGATTTAAGTCGTCTTACTATTAAAAGTTATAGCCCTTAACTGAAAGTAAACATGTGGTCAACCAATAAGGATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGCCGAAA:1 - chr2R 11786705 5' + Circe 7093 1 73.33 GATATGCTTATCAATAGCTACATATGTATGTAAGTTCATGTATACATACAAGTTAGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3R 31965172 5' + 1360 23 1 52.43 AAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 - chr2L 16067158 5' + HMS-Beagle2 6909 2 57.27 GAACAACCACCTGTGTGTTTTGGTATCTTCGCCAGGCACTCTCCGCCCTTTCCAAGTATTCACCGATCTCCTGTCGCTTGTTGGTATAAATACCCTGGCTTTTAATT:1 + chr3R 8809115 5' - TAHRE 394 1 76.64 CGCTTTGTATATATATTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGCGGGATTGTTTAA:1 - chr3R 22275881 5' - I-element 4894 1 79.78 CAGCCGAGACGGCTGCATTCTGTTAATAGATTAGTTATAGCCGGGCTAGAGTCGCGTGATAACACATCACGAATCATTTCATAAAATGATATT:1 + chr2R 12690798 5' + Doc3-element 4631 1 74.19 ACAACTGCAACTGCAAAGTTGCGCAATCTAAAACAGTAAATGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTG:1 - chr3L 19065712 5' - 1360 3217 1 64.13 GACTCGTGTTACATTTCATTTGTGACAGTCGAGGCGACACACACACACACTCCGGGCGTGTTAATAAGTTAATTTAATTTTAGCCATTAGCTCGGGTACAAATTTTGTAT:1 - chr2R 8387401 5' - Juan 360 1 71.82 TCTTTGTTTACGGAGTTTACGGTACATTACGGTAGAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATACGATTTTTTCGCCGTGGCTC:1 - chr3L 27145293 5' + 1360 50 1 71.28 TGCCTAGGGAGCAGGTGAAGTGGGGTCTTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATG:1 - chr3L 22399788 5' + FB 58 1 74.55 TATCACCATGATAATAAAGCTACACATCTTTTTTTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCT:1 - chr3R 14041742 5' - gypsy4 490 1 74.55 ACACTTTTATCAGGAGTTCGTTCCGTTTTGGGTCTCTATTTGCCAATTCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 8885566 5' - roo 9037 1 58.18 CGTAAAATTGCCGCTCGACATAAAAATGTTGCATAGTTTTTGGGCCGCTAAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTG:1 - chr3R 24481841 5' - Quasimodo 158 2 66.29 AATCGAAACCCCTTTTATTTTCTGTCTGCAACTGTTTTATGTTTTCGGAAGCTCTTGCGCGCCCAGCGGCAAAAAGACCAAGAAGAGCGCCGACTCTCTT:1 + chr2R 3860933 5' + Doc3-element 260 1 66.00 GAATCATTTTCAGTCGTCGGTGAAACTTTCATCGATTCTGTGGGCGATGGCGAGGATAAGCAGCGGGGATAAGGTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 - chr3R 8204552 5' - TAHRE 10433 1 65.96 TCTCTTTGAGTTACTGTAAGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chrY 3231987 5' - opus 7459 2 78.89 CGGGATGCGATGCAGTTGCGTGTATCGAGAAAGGTGCGACGCTGTGGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCCTTG:1 + chrX 14800413 5' + R1A1-element 4956 1 54.29 CGCCATAGGTGTCAGATGGACGACCACCGTTTCCACCACCAGGAGCGCCGTGGTACGTTTGGAACGAAGACATACACAGAGACCTAAAAACCACA:1 - chr2R 16781229 5' + Doc 4414 1 54.74 TATAGTTACAATGGTTAGATGATATACATACTTTACATTTAAAAGAACCGAAAAAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAAT:1 - chr3R 25635980 5' - I-element 5347 1 47.78 ACCATAATACATGACAATTTCTATGCTAAAGCTAGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTACCATTATTT:1 + chr2L 12036085 5' + 297 22 2 53.21 CCCCAAAGTCTCGACTGCAAGTTCGTTGCCTAAGTCTTTTGTTTTGGCCTATGTGTATGTGTGTGGCTTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTATTAG:1 - chr3L 3697536 5' - G4 3637 1 73.15 CTTGTCTGTCGCTTAATTGCATTTTTCTTTATTCTCTCACTCTACTCACTTAAGTACAATTGTGATGAAAAGGAGCTGCATCAGGTCCAGTTTC:1 + chr2R 9405152 5' - gypsy5 441 1 79.79 AAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr3L 23146496 5' + 1360 46 1 66.98 TTTTCAAGCCGATTTCAAGGGTGAACGATTATTGGCCAAGACACAAACTTTTTGTCGCCAAGCATTTTCCTTTGGTTTTTTTTCTGTTTTTTTTT:1 + chr3L 2387117 5' - transib1 2140 4 51.58 TGCTACAATCCAGTTATGTTCTTCATAAGCTATTTACATACTTCAAAAAAAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTT:1 + chr2R 5887818 5' + 297 6503 1 61.54 GTGTTTTTTGTCTTGTCGACTAAATTACATTTTCTTCCATATTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 1437957 5' + hopper 141 1 56.90 TGCAGCGGGCCAGATGAGGCAAGGAAATGCGATAAAAACGACTGAGTAGTTTGAGGGGGGAAATGAGAA:1 + chr3R 11861256 5' + accord2 57 2 59.42 ACACAGCAACTGCGAAGCTGGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAG:1 - chr3L 10518985 5' + F-element 126 1 75.61 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 21907535 5' + 412 7071 2 43.43 GGTTACGAAAAATACACAGCATTTTTTCAACGGCAGATGCCTCAGCATCGCCCATTTCATCACTTGAAC:1 + chr3R 24258598 5' - Juan 132 1 65.22 CCAGGATTTGGTAAGAAGAAAGATGGTCCAATGAGCTTCAAACATTCATAACACTGATCCTACCGACTGCGCCAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAA:1 - chr3R 9715212 5' - 17.6 488 2 54.08 CCCTTCATTCTGTCCCAGAGAATATGCAATTATTCATTTTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGGAAG:1 + chr2L 18232197 5' + invader1 129 2 58.75 TATTTACGCTCACAGCATTTTTGACAATTTAATTGGGCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 + chr2L 10128668 5' + copia 48 2 69.72 CCCGAAAAACATGAAGACATGAAAAAATATCTCTAACTTCTAGCGGCTCTAAATAAAGATTTGACTAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr3R 17346364 5' + copia 4890 2 46.36 ATGCTGCTGGAAAATCGGGTGAAAGCGGATCTTACGGGGAACATAGG:1 - chr3R 13119193 5' - Burdock 6053 1 53.19 AACTTATATAAATTTGAAATAATTTACCTCAACCTCATTCTGTAATAAACGCCATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATAT:1 - chr2L 9528342 5' - Bica 4883 1 61.46 GACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr3R 7588875 5' + F-element 56 1 73.33 ATCGATAATCTGGCTGTGTGATTTTCGCTGCTTTTT:1 + chrX 16278474 5' - Porto1 4437 1 88.89 GCAAAACCAGCAGCTTCAGCAATGAGTTCAGTTGAGTTGAGCCGAGTTGAGTTGAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAG:1 + chr3R 14490210 5' - Doc 298 1 58.42 GGAAAGTAGAGAAGTGCAAGCTATCTCAATCTCAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGACATACATA:1 - chr3R 9861672 5' + Quasimodo 62 2 61.05 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr2L 16217660 5' + 412 7076 2 42.73 CTGATCGACATGCGTTTTCGAGTGGGGTTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGNCGGGAAAGCTG:1 - chr3R 16077076 5' + flea 444 1 72.00 GCTACGGAATTTCACTCTCTCACTTCGCTTTCATTGCAAATATTTTCTGCACCTAATCTCCAAATGCGTTTTTTGGTTTTCATATTTAGAGTAGACACATAAAAGCACCG:1 + chr3L 17064126 5' - looper1 102 1 70.91 AAAAGTCAGAGCGAGCAAACAGGCATAAACCATAGGGAGCAAACAAAGAGCTAAAACGCTGACAAATAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAAATGA:1 + chr3L 2414894 5' + R2-element 3507 1 72.45 CGTCTTTAAATAGTCGGTCGCCTGCGTTCATTTCGGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGGGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCAT:1 - chrX 10547284 5' - hobo 2539 1 66.36 GGATAAGATAAGATAAGATAAGATACGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr2R 5064836 5' + Stalker3T 202 1 42.22 GAACAAGACCCATTTGAAAGATACTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:1 - chr2R 19405993 5' - HMS-Beagle 7030 2 73.15 CGAAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCAC:1 + chr2L 19364077 5' + BS 4776 1 41.67 CCAAAAACCAAACAAAAATCAGCTGATTTCGAACCCCATAACCCATACAATATATTTAATATTCCACAATGCAACAGCGTGGCAAATAACTGTTTCTGCCGAACGTAGTC:1 - chr2L 12484660 5' + invader1 102 2 70.91 AAAGTAAAAGCGTTGGAATATCATGTAAGTTAGGATCAGATACAACTTTATAATATGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATG:2 + chr3R 25051571 5' - 17.6 7393 2 60.00 ACAAGAAATCCTAAATTTGAAAATCTTTACTAAAACATTTTAAACATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chr3L 17595276 5' + jockey 4674 1 75.70 AAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGATATCGA:1 - chr3R 12040213 5' - HMS-Beagle 245 2 68.12 ATTGTTTTTCATAAATAAGCCCTAAATGCATCAAAAAGTTCACAAGTGCTTATTTGGCTACATTTCTATACTCTGTAACTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAT:1 + chr2L 19129295 5' + FB 7 1 73.64 TTGTGAAAAATGTGCTACAAGCTAAGCTCATTTATCACAATGATGAAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 + chr3L 5339521 5' + Tirant 8152 2 62.73 TTGATCGCCATGTAGGTCGATAGCAACTGAAAACCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr3L 16496205 5' + P-element 32 1 43.01 TGCATTAAAATTGTTTTGACTTTGTTAAATGCTTGCAAATCGCAAGCGATCGTTTAAAATAAATGATTATTTGAAACTGAAACTAACATACAAAATATTTCCCTAAGTC:1 - chr2L 732778 5' - HMS-Beagle2 225 2 65.14 ATCAGTGCAGTATTAAGCCCGTAAATAAAATAAATAAAATTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGCGGCCACCC:1 + chr2L 2323072 5' + G5A 2615 1 73.75 CTTGAAGACCGATTTACAGTTAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACA:1 - chr3R 23665056 5' - 1360 3358 1 76.54 CGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 + chr2L 21784871 5' + I-element 41 1 75.56 AGCTTTAGAAATTTTTTTCCCTTAAAACTTGAACAATTCTAGTTTATAAAGGACGCAGTTTGTTGTTTATTTATTTATAAACAACACTTTTTATTTAAATAAAAAAGAAA:1 - chr2R 5355902 5' + transib2 2633 1 69.09 TAAGGCGAGTTTAAGTGGACGGATCTACAACCCTCTGGGTCATGATGAAATAAAATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chr3L 16496255 5' - P-element 2853 1 42.11 GTGCGGTGTTCCCTACGGCTCGGGCAGAAAGATTGAAATATTAAATATGTATATAGTAAAATAAAATAAAATAAACTAATAAATAAAATA:1 - chr3R 19800398 5' + HeT-A 310 1 74.44 GGAAAAGAAACCCTTTCGAGCCATAACTCAGATGGCTAATTGGTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr3R 22595794 5' + FB 23 1 60.00 AAAAATAATTAATTGCGTTGCCTTAAATGGCCTAAAGCGGTTTGGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTTCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATC:1 - chr3R 29519693 5' - Bica 451 1 60.00 GCTGTAATATCACTACCCAGTGAGGTTAAGTGCGGTCAGCCACCATGAGGTTGCTCGGAGGACAAGCCTACGATGTATACGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:1 + chr2R 4137496 5' + HMS-Beagle2 10 2 71.82 ACAAAGGCAAAGGCAGGAAGTAGAAAAAATAGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCAGC:1 - chr3R 29469222 5' + invader4 99 2 71.59 TAAGTCAGCACCTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr2R 24031476 5' - 1360 3362 1 60.23 GTAGTTCGTTCGTGTCGGTTGTGGGGGTTGATTTATAATTTCACTTTTT:1 + chr3L 6550735 5' - P-element 2640 1 61.22 AAGTATATATATCTGCCGATATATACAAGTCACATTTAAAATTTCTATCATACTCTATTGTTTATCGTTCCATAAGACAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTA:1 - chr2R 5721608 5' + TART-A 13121 10 72.73 ATGGCCTTACAGGCGCCTAAAAGTATGACAGCGGTAATGCAGGGCAACGCATAAAATTCCATATACATACTTATAAACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAG:1 - chr3R 30099045 5' + ZAM 8180 2 62.14 GTAACGAAGGGCTCTATCTCAGTACTCATGCATACATATATGTATGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTAT:1 + chr2L 19212274 5' - flea 4965 2 69.09 GATAACAGCACAACTTGCCTAACGCGCTGGCCCACAGCTTATTTATTTATCCTCCTCATTCATGTAGACTACTTTTAATTTACCTTCCCTAGCTATCCGTAGAACTATG:1 - chrX 19132377 5' + Cr1a 4009 1 54.13 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 418 2 55.56 AGCACGTGTTGCAGCTCGTCTCGGAAAACCCAACCATGTAATCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGG:1 + chr3R 23039694 5' - R1A1-element 4962 1 59.74 TAAACAAATACAACAACAAAATTAATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAAC:1 - chr3R 563937 5' + HMS-Beagle 6850 2 75.93 TGATCTCTTTGCATTGGAGCCATAGGCCTCGGGTATACTGGTCGGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr3R 6132053 5' + I-element 7 1 60.00 GACTTATTTTGACCCCCTTACCTTATCCCATGCATATACATATACGTATGTTGTCTCGTTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGA:1 + chrX 16279628 5' + Doc 4399 1 76.74 TGGAAGGAAAAGCGCGTGTGGGTGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr2L 1291083 5' - 412 7515 2 75.00 GAAAGAGACTTTAAAGAGACGCCCAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAACCAACACTACTTTATATTT:1 - chr3L 3371203 5' + copia 37 2 72.62 AAGTAAGATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 31458544 5' + jockey 18 1 64.95 CGCTACGATTTTCGCAAAAATGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 8621735 5' + jockey 8 1 65.71 GATGCTGATTTTGAAAACTATTTTACAAAATTGATAAACTTATCTCTAACGGTCCAGTAAAGGGTCAGTTGCATGAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 25203744 5' - 1360 3380 2 71.15 AAGATGAGCTGTGCTTGTTTAAGCTGGAAACTGTAACGAATGACACAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 - chr3L 23236603 5' + Stalker2 13 2 68.81 TGCAAACACCACGCATTCCATTGCTCTAGCTTTCTCCTCCTGTTAAATGCGTGAAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCGGA:1 - chr2R 16053709 5' - FB 19 1 61.86 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGATCTCGAAAGTCGGGGGCTCCTCCTGAACGGGTCGTTCCG:1 - chr3R 21907535 5' - Rt1b 416 1 56.94 GTTCGGTTTATTTATCCATGAAATTGGTGTGCCTACCTTAGCGGAAAACACTAAAACTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 - chr3L 2423995 5' - Stalker3T 201 1 69.89 CACATTCTGCACAGACCGATGGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGGAGATAACAAAAATAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAA:1 - chr3R 21253874 5' - diver2 4659 2 78.30 GCAAATTGTAACTGTTCTGTCCGCCGCATATGTGTGGGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTCCCTATCTGCTCATGGTATCTGTTGTAATTTATAATTTA:1 - chr3L 10723047 5' - copia 258 1 64.58 TACCCAGTTGAATCCAGACTAGTGACAGCCAGAAGCAGGCAATGCCGTCGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAG:1 + chr3R 8528800 5' + invader4 2986 2 72.73 AGATCAACACCTCGTAGTTCATGCTGGGATTTGGCTTCTTCGGCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAGGGCTATTTTAA:1 - chr3R 8719384 5' - BS 84 1 57.14 AATGAAAAGCAAAGCGAAAACTGCTCGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 - chr3R 28074133 5' + pogo 56 1 79.09 TAAAGGGATACAAAACCAAGATATAAGAAAATAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 4305356 5' - roo 356 2 73.64 CAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:1 - chr3L 23236558 5' + Stalker2 45 2 70.83 GCGCTCGAATCGGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr2L 5338035 5' + F-element 26 1 55.43 GATACTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 - chr2R 19405974 5' - HMS-Beagle 213 2 54.55 CCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr2R 4606202 5' - Tc3 313 1 74.07 TCACAATCTTAAATTTGTTTCCTCTACTTCAATACATCTGTGGGTTCATGGGTTCCTCGATTCGTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr2L 14307260 5' - pogo 2091 1 64.36 GTCTGCGTTCTGCATAACAATGCTAATTAGACCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGAGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATC:1 + chr2R 11286397 5' + Cr1a 375 1 71.82 GCTTAGGTTCTGTGGACAATGGTCTGTCATTCAGCTAATTAGCTCTCAATTAGCGAATGTACATTGCTGGCTTTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGT:1 + chr2L 6789010 5' - I-element 5185 1 64.55 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACACAAACACA:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 419 1 28.43 ACGCATTACACACACATGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAGGCGTAAACGTATGAAGGTTTTTCAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 + chrX 4262999 5' - Tirant 8441 2 78.18 GCAACGGATCTGAATTCGAGCGATAAGAGAAGCTAGCTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 494012 5' + roo 8698 2 66.30 CCTCATGTGGCACTCGCACTGCCGCGTAAGAGTAAATGAAAAGATCCAACCAAAATAAATAAACCCCCACACGCAATGAATTCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCA:1 - chr3R 21944396 5' + F-element 4302 1 78.90 GCCATGGTATTTAATATGCTTTTTATTTACCAGCAACAATTTATTTCATCATATTAAGTCAGATAGTAGTTATCCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 + chr2L 7750510 5' + opus 13 2 39.09 GCAACAAATATGCAACTACAACATGCCGGCATATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 + chrX 13495497 5' + Max-element 21 2 59.00 ATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAGCTACAATTGCCGATTTAC:1 - chr2L 9723025 5' + Doc4-element 403 1 31.82 TTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGCGTGAAAG:1 + chr3L 15968206 5' - P-element 2829 1 21.78 GTTAGAACTGCGCACAGCTGCCGGGTCATGTTGAGAAGTGTTTAAGCAGGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCA:1 - chr3R 28163833 5' + micropia 334 2 59.18 GATTATGTGGTTATCGATTGAAAAGGTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATT:1 + chr2L 17746229 5' - gypsy4 312 2 75.24 TAAAACCAACATAAGCATTGGCGCACACACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAG:1 + chr2R 16241981 5' + F-element 4480 1 74.07 TTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAGTTCTGTTCCTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATT:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10411 1 59.14 TTTTTTTTGCTTTGCCGTCGGTAATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 6966452 5' - pogo 2083 1 68.57 CTCCCCCGTCAAAAATTTCTGCAGATATTCGGTTAACTTTTTGTTTTTTTTTATTATTT:1 + chr2L 488765 5' - BS 5098 2 93.22 TTGATATGGTTATTTAAACTTCTAAATTTTCTATGTTGACAAAGCGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCAT:1 + chr2L 13292926 5' - X-element 4709 1 74.55 TAAACAAAATAGATAAAAAAAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCG:1 + chrX 12458593 5' - Circe 408 1 79.59 CATTTTATATAATTTTACTATTTTTTAAAACCGGTGGGTTAACTTAGATGTTTAAAATCGTATTATATATAGCATTATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTG:1 - chr2L 13230790 5' - HMS-Beagle 241 2 63.64 ATTGATTTCGTGCGTAAATTTAAACGCACTTTATTGCCTTTTTGGAAGAACGTTGCTTTGTTTTGGTCATAGTGCGGACAGAAGCAATTAACAATCATTGCCTTATTAAT:1 + chrY 946217 5' - 1360 443 1 63.64 AACAATAGAAATAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAGAGATTGTGAATTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACA:1 + chr3R 19444887 5' + invader3 277 2 52.73 CTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGCGGCTC:1 - chr4 311577 5' + 1360 50 1 66.36 AGAACCAGTTAAGCGTTGCAGACCAACTGCTCCGCCCACCGCCCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGATGATATGACGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chr2L 9496376 5' - Tirant 358 2 57.94 CATGTTGTTTTTGTCTTTTTTTGTCTTGTCTTGTTTTATCTTGTCTTGTTTTGTCTTTTCTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr2L 19879816 5' + hopper 145 109 43.90 CTGCTCCACCACAAATAAAATGTTATTTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCCAACTGTGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAG:1 + chr2L 12083170 5' + Cr1a 4194 1 80.00 GGGCCTTTAAATAACAGTCCATTTGCAGAGAGAGAGAGAGAGTTCGGATAGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTTCAGCTTATGTGCATGCACAAAACA:1 - chr2R 22383006 5' - Cr1a 259 1 56.36 AAATAAATAAACCAATTTCGGTTTTCGGCCATGTTTCGCTGGATATGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACAGA:1 - chr2R 13379745 5' + accord 7042 2 55.14 CGAAGGTGGTCGGGGGTGGGGCACTTTAAAGAGTCTTCCCCGACCATTAACCCTCGAAATCCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAA:1 + chr2R 13599966 5' - R1A1-element 197 1 60.58 AGCTAATTGACAGTTGCGAATGTATTTAATTATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr2L 16529191 5' + blood 25 2 58.18 ATAGTTTTAGTCCTTGAATGAAGTTGGAAGTTGTTATTGCAAAAGTCATATTAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGAACGAAGTG:1 + chr2L 21127108 5' - 1360 479 1 68.18 GCTCAAAAATAGTGCATAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGG:1 + chrX 14827585 5' + G2 3052 1 55.45 GCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr3R 13225538 5' - hobo 2932 1 58.00 CGGTTGGGAACGGGGGTATATTTTGTGGGATGGCTGCACAGGACCAACATTAATTTGCTACAATATTTAAATTTGAATATAAAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chr3L 18095600 5' + I-element 6 1 77.27 TTGCCGCTGCTATTTTTTCAGCCACGGCTCTTTCCCTTCTGGGCAGCCTTGTCTTGTTGTTATGTTTTTTATTTTCTCTTTGT:1 + chr3L 632349 5' - I-element 111 1 61.45 TGGTGGTCTATAGACTCCCTTTCGCTCGCACACGCACTTTGCCCAACCTCTTATCAACGCACACACACACACACATATACACACATACTGCGTGGTGG:1 - chr2R 13584887 5' + accord 203 2 79.59 GTTTGTTTACCATCACGTATTAGCCACAAACCTTATAGAGTATGTACATACACATACATACATGTGTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 - chr3R 9339729 5' + Burdock 6137 2 74.49 AGTTGTTGGTATTGTCCCTGCAAGAATTCGTATTGGGTAGACATATCATTACGACGAAGACGGGGTCGG:1 - chr2L 5184151 5' - Fw2 3793 1 53.62 ACCTGGAAAAAGTTAAATCAGAAAAATCCCCCTCGCTTGAAAAGATACTTAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 + chr2R 12650162 5' + jockey 4777 1 55.79 ATTTGTGCATTTATGTATACAATATTGACAGAAAAATGTACCAAACTCTTTTTTTTTTATTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATA:1 + chr3L 20895105 5' - F-element 4640 1 60.00 ATGATCTTCACCTCCTTGGACAATAACATCGTCATCGTAGTCGGGAACATCGTAATCGTAGGGCTGCTCACCTCTCTCGCTATTTTGCTCTCTCACACAAAATCTAAAT:1 - chr3R 25406602 5' + Cr1a 314 1 72.48 AAAAGTATATATGTAACAGGCAAGTAATAACAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAG:1 + chr2R 25257600 5' - TAHRE 10423 2 68.83 TTGGTTTATTTTACAGATAAGGGGTTCCCGATAGAACGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGATTTCACTGTTATCCAGGAG:1 + chr3L 15289701 5' - G-element 4138 1 57.14 AAATGAAATATTTTATACTTTATTTTAAGTATTTGCTCATGCATAAAATTGGCATTTTTGCACACACACACACACACACA:1 + chr2R 11035618 5' + accord 7028 2 78.75 TCTTAAAGAAAATTATTATGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGATTACGAAACAGCTACACTCATTGATTGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCG:1 + chr3R 19448784 5' - Bari1 236 1 74.55 TGCCAGACAAGGCAAAAAGGCATATAAAATGCCATTGCACAACTGCAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTCTAAGAC:1 + chr2L 2828691 5' + mdg3 5113 1 51.55 CTGATTAGGCTCCTTGTTCCTGGCTTTGACGGACGCTTTATTTCTGTGCTGTGGTAACTGCACCCTGATTTGAGGGGAGTTTTAAGAATCCTCAA:1 - chr2L 4298142 5' - gypsy8 4651 1 64.21 CCCGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCGTCACTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTC:1 - chr3R 19447202 5' - micropia 256 2 57.97 TAAAGTGGGCAGCCAAAGTGTCTGCGACCGGTTGCTGTCGCACTGACAATCCTCCCATAATTGGTGTCATAATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCT:1 - chr2R 14784723 5' + I-element 494 1 68.18 GAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1 - chrX 21667904 5' + gypsy2 60 2 78.85 ATTAAGACACTCAACCCAGTTGCATTTTAGCTGTTTGTTTCCCGTGTCCTTTGTGCCGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr2R 19677863 5' - hobo 2910 1 54.55 CACACACACGCAGTGCCAGAAAGGACGAAAGGACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3R 13733015 5' - hopper 1405 2 52.17 TCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTAGCACTATGCGGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 + chr3R 443015 5' - 1360 3333 1 72.48 GTAAGGTCCACAAAATGACGTAAGCACCAGGCTTATATGATGAGCCCACGGGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGG:1 - chr3L 19542891 5' + hobo 2728 1 67.06 GTTTTCTTGGGATATCACTTGAAAAATCGATTTCCACACAACGCGATTGCGATAAATACTTTAATTTAATTGCATATATGTATTATATATATGTATATGTATAAATATAC:1 - chr2L 17152047 5' + Stalker4 7204 4 57.27 CCGAACAAAGTGAAGCGACAGATCCGTAAAGTGAGATACATATGTACCAATATCTATACATAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGC:1 - chr2L 134316 5' + 1360 448 1 74.44 CTAAACTATTGTCCATTATACAACCTTTAAATAAGTATATTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGC:1 + chr2R 11027091 5' - P-element 180 1 45.05 TTATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGTCA:1 - chr2L 4016905 5' - opus 449 2 66.97 TATTTGGTTTATTAACATAATAACTTAATACATATAAAGAAGAACTACTATATATTCGCTCCATTGCACTGTGGTCCATAAAGTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 - chr2R 5486146 5' + transib2 31 1 54.55 AATTAGACAATTTTCTCTCTGAGCAAAAACAGCGCTAGTGAAATGGATATAATTTATAATTTAAGAAGAAGAAGAAGAGTATAATTTGAAACGGATAATCAATCTTTAGG:1 - chr3L 2325072 5' - hopper 1146 1 51.82 GCTTAACAACAGTGTTTTCGGTATACCGATAATATTGGCAAGTCAAACAGTATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTAAG:1 + chr2R 5045075 5' + INE-1 136 1 55.45 CATTGCAAAGAAACCCATACACACGCCCACAAACACACACCCACGTAATGTACACCTCAAAAATTCAAATAATTGAACCTACATATTGCA:1 + chr2R 20756012 5' + HeT-A 5977 1 54.44 ATCCCCTTGTGATGAACCATCAGTTGGCCTCTCCTCAAGCCAGCAACAACAATTCCTTTTCGCTGGACGACCTGGATCACTTCGAGTGGGCGATCATGTTACATC:1 + chr3R 29029983 5' - 412 7170 2 78.10 CGCGGACTCATTAAAAGTTCATGAAATCGAATTCGACCCGTGGTGTTCGACGCGATTTCTCTTCGACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chr2R 21362075 5' + Tirant 16 2 67.29 CTGTACAGTTTTTCTCATTCACAGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTG:1 - chr2L 17988265 5' - I-element 4878 1 78.90 AAAGTATTGGATTTTCGGGTTGAAAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCGGAAGGAAGCGATTCCGACTATAAAAAGTATGTATATTCTTGATTAGGAGCAATAGCCG:1 + chr3R 19447071 5' + INE-1 88 1 74.55 TCTCAAGGTGGAGCTCGTCCACCTTGATCTCTTCTGCGAACCTCTATGGAGCTTAAAAAGGAAGGGGTTCGCCAAAACACTTGG:1 - chrX 20847587 5' + BS 4934 1 59.52 TGATATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 9435817 5' - roo 9053 2 56.99 TTTTTAGCGATTTTACTCCAGGGTGACGGGGCGGAGAAAGTGCGGGAAAATTTGGGGATGTTGTTGAAACGCATT:1 - chr2L 19808625 5' - HMS-Beagle2 6816 1 77.33 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGATATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAG:1 + chr3R 21907536 5' - Rt1b 4956 1 67.96 ATCTTAAAAAGTTTTTCAATAAAAAATAAGGAATTTGTCAAGACACTGTAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGAAGAAGGATACGATCATATCCCAGTTAGGA:1 + chr2R 25212310 5' + invader3 5247 2 57.27 CCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAATGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGTTGCGCTGCGCGAATTTC:1 + chr2R 2666333 5' + Rt1a 33 1 48.60 GTAAATATATACGACAACTGACAACTGCCGAATGGTAAATGGTAAATGGAAAATGCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCG:1 + chr3R 14356207 5' - I-element 54 1 65.88 GTTGGAAAATGCAGGCAGTTACACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chr2R 19166667 5' + FB 51 1 81.44 CGTTTTTGTTATCACTTACGCAAATGACCCGAATGGCCCTTGCAATTGCTGCCTAGATGGGAGTTTTCTTGGCAAATGAAAATGTTGTTGTCGATGAGATTGCAGTTGTG:1 + chr2L 4707745 5' - Doc4-element 297 1 78.18 GCAATGCATTGGAAATGCACCAATTAAGAGCCTGAAAGTATGCTACGAAATATTGCGCATCACATGGAAATGAGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chrX 5513409 5' + jockey 4688 1 77.32 AATTCCTGTTTTTCATCACAAAAATGCCACATGTTCCATAGAAGTTTAATGTTTTTGGAAATCTCGACAAGATCAGGTGAGGCTAGAGGTACACATACAT:1 + chr3R 19350182 5' + invader2 4864 2 52.00 AAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATATGATCTGCTTAAA:1 - chr3L 19347216 5' - jockey 4942 1 60.91 ATAAAAGCTGCTCTTCCTTTTGTGAAGTTATAAGTGGAATGCGGCAAATTGGCTTTGGCTCCTGATGAGCATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGT:1 + chr2R 5340273 5' - 297 6497 1 70.91 CTTATCGCCCGGCAGAACCGAGGGCAGTATGAACAGTTCTAGGGTACGGGCCTATTTATAAATAAAACCGCCAGTG:1 + chr2L 17531528 5' - 3S18 6103 2 67.11 CTTTCCAGCACGCGCACTTCCAATTGGCCAGCTTCGTCCATAACTGGCAATGCTCTACTTAAAAATACTCTTTCGGCAGCAAGCTTATGGGAAGATAAAAAGCGAGATTG:1 - chr2R 21872147 5' - G7 270 1 75.45 AATTCATAAAGTAATCTGGAAGAGAAGGTTATGTGGCCTGTTACATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCT:1 + chr3R 15651934 5' + invader6 86 2 63.64 ATTTAAGATGAAATTTAGCGATTTTACTAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAAAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAACAGAAAGAGAACAT:1 + chrX 13526694 5' + I-element 450 1 65.45 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACACAACACAAAACAACACAACACAACACACACAAA:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 415 1 35.92 ACTTCGGTTAATTTTATAAGCGGTTTATATTGTTGGGATAGTGGTATTTTCTCTCTTTTTCTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGT:1 + chr3L 7066774 5' - HeT-A 6047 1 65.45 CGTGCAACTGAACAAAATCGGAATTTTAAGTATATAGTAGTAGTGCGGTCTAGGGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTC:1 - chr3L 9782457 5' - F-element 436 1 57.45 AACGTTGCTAGCCACACGCCATTTTCATGTTGCATCCTGCCATTACCCAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCA:1 - chrX 12837029 5' - R1A1-element 204 1 55.96 TGGTCTCCTTCCTTTTGACTTTCCTTCGATTCGCTCTTTTGTGGGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chrX 711735 5' + 297 28 2 55.77 GAATAAACATATTAGTTGATTTAAAAGCGGGGGTAATTTTAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTATTTACAATAG:1 - chr3R 17777657 5' - Burdock 216 2 61.47 GCAATGCATCACCTTACCATTTTCATCCTGGCTTCATTGGCATCCAAGCATCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTTGGGGGTACATTAAGCCTTTCCATATATTT:1 - chrX 11057921 5' - jockey 4649 1 60.58 GGAAAAGATAAACAAACAAAAAGCAATACTGGGACCAGATGCATCATCATCCTCATCATTTACAAATTTAAAGTATTTTAGTATTAATACATTGTAAATACGTTAAACTG:1 - chr2L 5739733 5' - hopper 1333 1 66.36 TTTCTAGTTGGCATTTTTAACATTTATTCAAGCTGAACGAAAGTCTATAACCAGAGTGTGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATT:1 + chr3L 7899367 5' - Tirant 43 2 63.00 TGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr3L 23146515 5' + 1360 47 1 80.68 AGCGCAAATCAAACTGGTTTCGTCGCAAAGCCAAGCAAGATAAACAAAAAAAAAAACAAGTGAAAACAATAAACAAAACAAAAATATGAGCGAATCCGACGCTTAAAA:1 + chr3R 14072420 5' + Porto1 212 1 64.81 CAATAGGATTGGTTTCCAAATATAAGCACCTACATTGAGCTTTTTTGATATTTTCTTGTTTCTCTTTACATTTTCCCCCATTCGCATGGGAGATGAGAAA:1 - chr2L 7841414 5' + jockey 7 1 80.00 AACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr2R 7981146 5' + 1360 46 1 72.38 CTGAAAGTAAAAGCGTTGGAATATCATGTAAGTTAGGATCAGATACAACTTTATAATATGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCT:1 + chr3R 25051568 5' - 17.6 7401 2 65.71 ACAAACGAAATGTTTTCCTTTGTCATTCGTTGACATTCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chr3R 5219237 5' + Doc 41 1 71.28 ACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGG:1 + chrX 21852444 5' - gtwin 7389 2 76.83 CTAGATTTTTAGCTAATCGTTATTAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGAG:1 - chr3R 18626851 5' + roo 60 2 79.09 TACAGTATTTATTCCAATTACAATTCTGTCAAAAAGATACCTTCTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGAAGCGAAACGG:1 - chr3R 13543943 5' - 1360 3378 1 59.49 CTGCTCTATGATTCACACATTTATCTCATTATCTTCAACGATCTCAGTACCACTTCAACCTTCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAAAAACAACAATACCGCTAAC:1 - chrX 15170047 5' + I-element 138 1 39.62 GCCCAACGGAATATTATAAAAAGGATAAACCTGAAATGTCAGAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTATCGCCCACCCGAACACGTTGGCG:1 - chr3R 7934524 5' + G5A 2628 1 59.62 ACAGCACATCGAATTGCCGTCGGATAATAAAACAGGAATTAGGAGGACAATGATTATTTACCGTATTTATCGTAGCAGAGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAG:1 - chr3R 4585350 5' + R1A1-element 5099 1 75.70 TTTTAAAGCATTTTTCAGGATCATTACATAACTAGGCTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr2L 5724315 5' - 1360 3342 1 71.82 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCTCGTTCATAGGTAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGA:1 + chrX 14768479 5' - micropia 165 2 68.18 TAAGTTTGCCAAATGAAAGGATAAACTCTTCCAGAGATTTTACACGATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 12452940 5' + roo 8702 2 61.82 ATATAATTCCTTAGATCACCGAATGTTCCAATCAATACAATTTGTTCATAAATGTAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGATGTTAAAATTAATAATG:1 - chr2L 9520770 5' + Juan 3881 1 56.36 TGTGGTTGGGGAGATATGTTACAATATATATATTTATAATACGATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr3R 3375476 5' - opus 7495 2 64.94 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTT:1 + chr3R 21907534 5' + 297 6543 2 48.05 AAGCAGAGATCCTGTAAATGGATCTAATGCAATCAGCACATTAAAACCGGTAAGAAATTTTGGTATTAATATATTTTTTTTAAGATTGATATTTTAAAGCTGCTTTAATT:1 + chr2R 21767354 5' + transib4 56 1 54.55 CATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 + chr2R 9963679 5' - pogo 2099 1 62.50 AAATAATTATTATAATAGTTATATTCATTCTAATGAATCCTGAATGGATAACTAAATTTTCCATTTCAAAACATAACCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATA:1 + chr3R 22190186 5' - Cr1a 482 1 59.09 GTACATGGCGATCGACAGATTGATGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCGGATGTATACTGAAGACATATAACTAT:1 + chr3L 16650282 5' + Bica 94 1 77.98 AAGCCATCTTAAACATTTACTTTCGCATCCTTCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCA:1 + chr3R 11405045 5' + Doc 4527 1 58.97 AACCATAAGTTATATAGCCTTGATTAAGACCTATAGTTCAACCGCAGCTGTGCATTTATATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAA:1 - chr2L 12910796 5' + Burdock 18 2 61.68 ATGCCAAGCAATTGAGAAAGAAAGAAAGATTAATCAAGAGCTTTGAAGAATATGTTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr3L 10836619 5' + opus 7025 2 60.91 CACTAAGCAAACATATTTTTATGTATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 - chr2R 22661321 5' + Transpac 4931 2 69.72 TATTTCTTGGAACTCAAATTCCTTGGCTCCCCAAAAACAGTAAGTAGCGAGAATGCTAAAGTCGAGCTCCCCGACTATCAGATACCC:1 - chr2L 19362125 5' - 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chr2L 16071771 5' + gypsy3 419 1 32.93 CATCCAGAATATCACCATACAACATAATTTTCCGCCACATTGCAAGCAACACCAACACACACACACACAC:1 + chr2L 5490808 5' + gypsy3 420 1 74.29 TAGAAAATATATCAATATGCAATGTCTCGCCTACATGTGACGGCAGTGGGTGTGGGG:1 - chr4 626784 5' - accord2 7352 1 75.44 TAAATCCGATTGAGCATGTACTCACATTATTTGCAATGAATATTGTCGTTCGTATGTAATAGAATTTATTTATATGCTTTTTTTTTCTTTTTTTAATA:1 - chr2L 12706829 5' + hopper 153 1 53.06 GATCTTCGGCGTTAACTAATTAAACTTTTTCCATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTAAAGCTCTCCCCATACCAA:1 + chr2R 16576967 5' + Doc3-element 445 1 60.00 AAAAAAAGAAGGAAAAGAGCACCTGTTCGAGTGCACAAAAGAGAGGGAAAGAGAGCCCAAAAGGAAGAGCGATAGCGGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATA:1 + chr3R 29215842 5' + Bica 159 1 75.23 CAGCATTTCGGCTGATAAGGCGAGTTTAAGTGGACGGATCTACCACCCTCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr3L 16496270 5' - P-element 2876 1 60.92 CCCATCACGCCCAACACGACACTGGAGTCACTGGACGTTATTGAGGCGGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTCCAAC:1 + chr2R 14259721 5' - R2-element 479 1 54.08 CGCATCCACTTCCATCCTGATATCCATATCGGCACGTGGCTGGTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATA:1 - 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Doc3-element 444 1 67.80 CGAACGAGACGGGAAAGGACCTTTCTCGTTAGCCGTCTCACTCGCAGCCTATACCTGTCTCTATGTGTGTCTGTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGC:1 - chr3L 10811434 5' + Cr1a 293 1 76.84 AATTAACTTATTCTGATGAGTTGTGGTATCATTATCGTAATCCGAATTAACAACAAAAACATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTG:1 - chr2L 10268345 5' + mdg3 5413 2 60.00 TAAAATTATACAGTCACGAGTTCGGGAAGAAATATAATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3L 12158514 5' + 297 42 2 69.09 CACGTAGCGGGGTTTCACTATATATGGCTAATTATGAAATTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAAAGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACAAT:1 + chr3L 11143218 5' + 17.6 7406 2 60.91 CGCATTTATTTGTTTAGACTTCCTTTCTGCGTTCCTCGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAAAATTAGATAAA:1 + chr2L 1291014 5' + 412 7073 2 62.39 CCAATATCGATGTTAGAAGAGCACGAATTTTGCTGCTGATCCGAGGAAACAACATAAAATAAAATCAT:1 + chr3L 12001567 5' - transib1 1897 1 94.12 TGTTTAACATTCGCAATTTCTGTCCATTCATGCTCTGAAATGGAGGGTTTCTCCCAGCACTTTCACACCCCCTTAGTCTGGAATACAAAGTA:1 - chr3L 465087 5' + Doc2-element 4311 1 79.35 TGCCGAAAAAAAAACCCAGCAATATCCGTAGGAAAAAGGGCAACAAGACGGCAAGTCCACAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTG:1 + chrX 20705512 5' + P-element 162 1 76.77 CAGATTAGCACTCACGCACTCAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - 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I-element 4904 1 72.83 TATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGAC:1 - chrX 20433396 5' - diver 216 1 64.63 CTCATCCCACAACCTATCCAACAAATCCAAACACACAGATGATATAGCCAGACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATA:1 + chr3L 9144530 5' + I-element 75 1 53.64 GACATTGCGCAAATGGAGGGCTTTTACAAGGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTA:1 - chrX 20428072 5' - G6 1857 1 68.42 ATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTG:1 - chr2R 6984384 5' - HMS-Beagle2 7152 2 70.59 TGTATGCTCCAAACAAATGGTGATCATTGTGAGGGGCAAAAAAAGTTTTAGTTGGAAAAATTAATCGTTTTGCTGAATGAAATTGGTTGTATTTTAAATGTGGGCAATCG:1 + chr3L 8060116 5' - FB 427 1 78.18 CCATAAATACATTAAAATACACTACCAGAATTCACTTGAAGTGAATATTTTTCTCTTGTGTGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 8811153 5' - 1360 3384 2 72.34 CGAAACGGAATACATTCTAAAACTTCAACGACCAGCTAAAAATGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGC:1 - chr3R 14591607 5' + HMS-Beagle2 7020 2 65.79 ATAGCTTGCCATGGTATTTAATATGCTTTTTATTTACCAGCAACAATTTATTTCATCATATTAAGTCAGATAGTAGTTATCCAAGTTAAGAACCCTCTTCTGGCGCTCTT:1 + chr2L 7750503 5' + opus 6 2 44.55 AAGAAAGAATTGTAAAAATTTAACAATCCGAGGAAAGCTTGTAATTTTTTTTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGG:1 - chr2R 4550875 5' - Idefix 70 2 60.00 GGTGATTCTTGCTTCATTAATCGCTCGCAATTAAGCGCCACTTTATATCCAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTT:1 - chrX 4987880 5' + S-element 1561 2 80.65 CTTTAGTTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGGTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr2R 11379771 5' - jockey 4944 1 69.09 GCTGTCATAAACTTTTATTATCATTACACTTGCGTCGCTCCCACGCCAGTCCAGTCCACCAGGGAAGACACCTCCGGATCCGCCGGTTGAACAACAGACATAATAACAC:1 + chr2R 6532631 5' + transib4 2395 1 66.97 GCAATCAGAAACCCTGAACCAAGCCGAGTCAACTGAAACTGAACTCCTCTGTCACTGCAAACTGATTACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGAC:1 - chr3R 5671484 5' - 1360 3376 1 67.92 ATAATTTATACAAGAACTTTTAGAATAGTCGTATGATGCTCGCAGCACGAGAACATTAGGAATGGTGATTTAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr2R 8715522 5' + pogo 13 1 66.36 AATTCTCGATGTCAACAACAATGCACTATGGGGCAATTGGGCTGGCTTTTTTAACAAAATGTGTTTTTCATAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 + chr2L 14917921 5' - hopper2 1542 1 70.91 GTATTATACGATGGGGTAAATGCAGGAAAATCATTGTTAATAAAAATACTATTTTATTACATTATGAAATTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr3L 18915240 5' - 412 7533 2 68.81 GGCAAATGGGGAGCTGCCTTCACTCATTATTTATGCATAAATACAAAAGGCAGCGATCTGTTTGATTGGCCAGGGCACTCTGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr2R 15418981 5' + hopper 4 2 75.00 TGACTCCATATTTCTTTATTTTGTGACTGCGTTGCACTTTACAGCTGCCAGCGGGCAGAACGGACGGGGTTTATACGATTTTCAGTGCCTTTCGGCGCTGTCATATTATT:1 - chr2L 4263236 5' - TART-B 10479 2 71.82 GTCATGCTGGGGCTCACTAGCAGATTAGTTTCGTCGCAAGTGTGTTTTTGAGTTTTATTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCG:1 + chr2R 16382201 5' + diver2 4707 2 64.65 TTGTTCGCCGGAAGATCTTTGCAGCCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGG:1 - chr2R 20920421 5' - hopper 464 1 75.00 ACCATTTCCACACAGCCCGCCATTGTGCCCTCTTTTCCTATGTCCCTGGCACACCAACTCACCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 + chrX 22745149 5' + jockey 4780 1 59.05 TTGTGGGGAGTTTAAAGACTCCTCACAGTACAATAGCAAAGGCAGTCCGTGGCAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAATTGAGAGTCGGCGTGCGTCA:1 - chr4 249147 5' - F-element 233 1 48.62 TACAAAGAATGGGATGTTTTAGATCGTTTCTGTATCAAGATCGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGAAGGTAACTTAAA:1 - chrX 22717202 5' - pogo 2060 1 59.09 AAAGGAAAAACAAGAGAGGGTGAGTGAGAGGTGAGAGGCAGTGAGAGCGGAGAAAGGAAACATGGAAAAGACAACACAAAAGGAGAGAAGAAAAACAAAAAAAAGAAAA:1 - chr3L 15815714 5' + Doc2-element 226 4 74.31 TTTCAACAATGTCGCTCAAGTGGATTAACTTAAGTTTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATGAAGAGAAAATTGTGGGAG:1 - chr2L 21004060 5' + P-element 221 1 34.55 AAATAATTAATAATTGTCGCGTGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACAT:1 - chr3L 18348034 5' + ZAM 50 2 76.60 TACGTATACTCATGCACTTGTGTGCAATATGATATATCTAATAATACCTAAATCAAATCCGTTAGATCTGACAATAAATCTGACAGCACA:1 - chr3L 235556 5' - GATE 409 1 65.56 CAAATCTGTGAAACTGTGAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCAACGCTGCAG:1 - chr3R 11906757 5' - jockey 4704 1 76.84 GACGAAATTAAGTTTCATACCTTAATACAAAACCTAAACACACACGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGTGGAACGATCTCAAGTGA:1 + chr2R 15572581 5' - roo 170 2 58.18 GGGTGTGCTACATACACACATATGCAACAGCTAGGAAAAAAAGGAATCGTTTAGCTTTCAAACAGCAACAAACTTGACATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 + chr3R 25859571 5' - 297 6972 2 71.82 CACAACACAATACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATGACCATACATCATAGA:1 + chr3R 21907535 5' - Transib5 2776 1 23.85 ACATCATCGCGCGAGATAAGCACTTACTGCCCAGATTTTTATTACCGGTGGGTGCATACATACATACATACATACACATGAA:1 + chr2R 5713546 5' + 1731 4389 2 84.15 GGATTTACATATTTCCCTGCATGAGAAACTCCACACCAAATATCGTACAAACTTCATGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 14135387 5' - roo 9053 2 56.25 TGAAAATAGGTTAAGTTGAATGAAGACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 13024070 5' + 412 7090 2 57.27 CTATCGCACATATATATATGTATGTACGTACTAAATCAGCAGCGAAACCAGCGTCAGTAGCACAAAAATCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAA:1 - chr3L 10561949 5' + mdg3 5078 1 69.89 TTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr2R 11379781 5' - jockey 4954 1 61.82 AGTGCGCAGCGATGCCTTGATGCGATAGATACTTTCGTACCTACGGGTTTTGTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGG:1 + chr3R 29521110 5' - hobo 2649 1 52.29 CGGTCATAATTATGCAACGCTGCAGTGCGAGATTTTTAAAGCGTCATTGGCCTAAACCAATGCGAATAAGGCACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCAGCGACTCGCACTCTA:1 + chr3R 10956163 5' - hobo 2929 1 72.73 CAGATATTTTCATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACCATATTTGCAAACTTC:1 - chr2R 18507918 5' - Bari1 1680 1 54.29 CAAATGTGTTAGGATTCGAATTAGTATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chrX 17619373 5' + copia 52 2 79.21 AAATAGGAATTTTTACACACATTGCAGTATGTATTTTCTTTTTTTTGGAGAGAGCCTAGTTGATTTCATTTAAAGATGAAGCAACAAGTGATAAATTGTTAAATTTTTTA:1 - chr3L 16988290 5' - NOF 4123 2 70.91 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 204 1 74.55 TTTGTTTGAAATTTATGAACTTTTGAAATTTTGCGTTCGCGTTCACATATGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTAAAGCATTC:1 + chr4 740296 5' + INE-1 571 1 75.53 AAGAATGCTGCAGGAGGAACAGGGAATCTGGAATCGAAAATACAGATCAGCAGGATACAGTGAGGAACCACGATCCATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGAAGAT:1 - chrX 14651043 5' + Tc3 10 2 71.82 GTCGATGCAATCTACCTTAGATTTCTTGCTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3R 21612955 5' + jockey 35 1 51.00 TTGGTGGTACGGTTGGCGGTGGCATGGTATTTGGAAATTAAACTGCGCATAGTCCTTAAAATTTTATAAATTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAA:1 + chr3R 22979314 5' + Juan 4073 1 81.00 TTTATTATTCCAGTCTTATCGATTTTATATTTTATATATAGAGATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATACATATATATGTATATATGTGTATATAT:1 + chrX 15372497 5' + G3 4507 1 60.55 CTTGATGGCCATTAATTTCTTATGTGTTGGCTTGTTTTTTTTAATCTTTTTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTTTTTTGTCAAATACC:1 + chr2L 7510413 5' - X-element 4382 1 50.46 TGTAAAATGAGTAGGTAGGTAGGCGGTAGTTAAAAGCTAATCATCCGAATGCAAAACCAACCGAGAACCCAACCAAACCAGCAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATT:1 - chrX 16280791 5' - flea 489 1 79.09 TTATCCAAATCCATAATCTGAATTGATTGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chr3L 14261345 5' - mdg1 7405 2 72.90 ATAGCAAATACTTCGGTGACACACGATCTATAGTTGTATGTAGATAATGATAAGCTGCGTGGAACAGGTCTACATATGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 12591823 5' + roo 6 2 73.64 CATACCTCTACACCTAGAGAAATAAAAAATACAAAAAGAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 17021039 5' + BS 5118 103 66.67 TTAAGATCCTGGGAGTATAGCGGCCATTCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTT:1 + chrX 22891918 5' + rover 169 2 72.45 CGTAAAACGCATTCCCAGACAACTCTGGTCTTCTCATAATTTGACTGAAAAAAGACAATACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 16693853 5' + 1360 5 2 67.39 GGCGCTGTCCTGCAAGTTCTTTCCAATCTACAAATAGCATTAAATTTTAAAACTTAGATACAATATACAAAAAGAAAAAACAACAGCATAAACACACACAAACACACATA:1 - chr2R 6174297 5' + accord 7028 2 76.36 TATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGGTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 9435820 5' - roo 390 2 53.33 AAATCTCAATATCAAAATATGCTAAATGACCACCCGTATGGGGAAAACATGTATGTATTGTAGTATGTATGTAAGCGCAGCAGACAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 + chr2R 23230546 5' + 412 1 2 80.00 TGCCCACGCTCTCCGTGATTCCCTCGCTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAACCTATTGGAGATATTTGGATGAATTT:1 + chr3R 13732970 5' + hopper 55 1 69.09 TTAGTTTCTACTTCTTTGGTGTTTGTGATTGTACAATAGTTTGGATCTATGCATTTCTCCAAGTGTAGCACAGCTGCGTCTCCGTCGCACTCTCTTTCTCTTTCGCTCTC:1 - chrX 19106943 5' + Cr1a 297 1 57.27 CGAAGGTTAAATACCCTAATTAGGTCAGTTTTTACAAAACATTTTACAATTATTCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAATGTCTAGCTTAAAAGATATTATG:1 - chr2L 14669469 5' - G5A 2770 1 52.73 AGCCCTGAGAGCCACGAGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCT:1 + chr3L 4421332 5' - Quasimodo 7031 2 60.47 CTCATCTTTTTGTAATGAAATGCTTAGCTATGATTATTCATATGTTTTATAATAGTTGGAAATTGAGATTGTTTTGTTATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAG:1 + chr2L 3828686 5' + 1360 314 1 74.55 GAAACTTTTAAAGGTTCTTAGCTTTGTAACTGGGCAAACATATTCTTTTTTTTCTAAGTGTGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGCCACAAAAAAAGTGGCTG:1 - chrX 8460540 5' + 1360 3333 1 63.30 AGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGAAAAGATAAGAAAAGATA:1 + chr2R 6629974 5' + Stalker3T 202 1 29.09 ATTCCACCAAATAGAGCAGTGTTACTTTTCAGATCCCATTTGTTTTGGTTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 + chr2L 19808500 5' + copia 4904 2 61.11 AGTTGATCCTAGATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACACTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAG:1 + chr3L 4264951 5' + Transpac 4946 2 62.73 CACAAACTCACGCACACATGCAGGGACGCGTGGCCCCACAGATGCGAGCTTACACAGATTTTTTTTGTGTCTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2L 20615895 5' - 1360 3382 2 67.62 CATATTAAATAACTTCTTAATTTAATTTAAAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACAT:1 + chr3R 12039910 5' + 412 7070 2 64.81 CTTTTGGTTTTGCGGCATATGCTGGGGATATAAAACATCCCGAACTGTGCTAATGTTTTTATTTTCTCATATGCGTGTATATATACTTACGTATGTTACTATTTGAGTC:1 + chr2L 7088278 5' - rover 343 2 76.15 GCACAATTTTTATAAAATAAAACAAGAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCATCCAGTGGAAATGCAAACGCGTAGTTCCATAATTTTTCAGGGATATCGATA:1 + chrX 22844015 5' - INE-1 503 1 70.00 TTCTCTCTGTGCAAAAGAGCAAAGAGAAAAATTGATATTTGTTTTTGTCACTAATTAATGCATTCAAATGCTACGAAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTG:1 + chr2R 19098005 5' + copia 4946 2 72.73 CAAATGTACTTAGCGAAAAATACGTTGGATGGTCGCTGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGGGCATA:1 - chr3R 25111049 5' + invader1 180 2 68.57 TGTTCCAGAATGTTTGATTTGATTTTATGCATTTTTAACGGGGTTTTCCCAGAAATCGTCTATGTTTTTACAATTCCATATGCGGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chrX 17513332 5' - 1360 3327 1 77.27 GCTAGAAAACAAGGGCCATAAAAACAAGAGCGCGTGCAAAAATTGCAGATGTGAATGTTACAGAAAGTGAACATAAAACATTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGT:1 + chr3R 10227088 5' + I-element 486 1 67.27 TCTTTAGGTTATCATCCCCGTAAGTGAAACGCAAATGAAGTGGTCCAACCGAAATTCTTGTTATACTAATTGATAATTGTTTCTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAG:1 - chr2R 12268559 5' - Porto1 282 1 65.14 CTGCGAACTGCGACTTTTGGCTAGTTTCTTGTTCGGACCCTTGGCCACCTTTTCTACACACATGATTTAAATTTTTTAAATTTCCTTTTTTTTTT:1 + chrX 14412981 5' - Doc2-element 252 1 58.95 AGCCTTAGGTTTCCATATGAATCATTCGAGTGTTGATGAAAGATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCA:1 + chr3L 16727149 5' + springer 27 2 57.58 AGTCCACACTGAAAGTAAAAGCGTTGGAATATCATGTAAGTTAGGATCAGATACAACTTTATAATATGGTATATAATTGCAAATAAATGTTTGCAATAAATAGTTTTGAG:1 + chr3R 25051560 5' - 17.6 7404 2 70.00 TGACAGAAATTTCAATTTTCATTTAGAGCAAGTGTAGTTTTGCCCACAACATTGTTGGAATTCCACAGTCTTCGGGNGGAGACGTG:1 + chr3L 2815061 5' + Doc 16 1 66.28 ATCTGAGCATTAGTCAGTTTAAATAATTATTAAAGATATCAAATTGAGAAAACAATTAGTTTTTTTTTTATTTTTATTTATTTATTTGTGC:1 - chrX 18097449 5' - Juan 4213 1 69.23 AATTATATATTTCTTATATTTCATATTTCTTATTTATATTCATATTTACTTTAGTATACGTTAATTATATTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAA:1 + chr2R 6499397 5' - invader2 470 1 70.91 GGAAACTCGACGATAGCATTCTCTCTTGTTTATGATGTTAAGTGGTGTGTATAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr2L 3964498 5' - 1360 3375 1 51.11 AAAGTGCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACATAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr2R 330120 5' - HMS-Beagle2 281 2 53.64 GAACAACCTCTTGTGGGCGGGGGTTTTCTGGGGGGCTTTTCCCGGCGCTCGTCTTGGTCTCTTTGCCGCTGAGCGCGCAATTCGCGTTGGCTC:1 + chr2R 8336114 5' - Doc3-element 223 1 54.84 ACAACAAAAGCAAATGAACCTGTTATCAGTGGAAATTAATCAACAAAAAAATTGTTTGCACAAAGTACTTAAGCTATCTTAGACTTATAGTTTATAACAAATTATAACAG:1 - chr3L 20944604 5' - S2 1453 1 61.82 ACTCTTTTCTTAGCTAAGCAGTCAAGATGACTTACGGTTTGTATTTAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATACTTACTATGTTATATCAAC:1 - chr3R 21284538 5' + jockey 4841 1 56.36 GGAGCAGCGATTGCGAGTGGGAGCGCATATAGAGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAA:1 + chr3R 22486567 5' - roo 127 2 65.26 CTTAATAGATCCCTAAAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 - chr3R 27071938 5' - jockey 4974 1 56.36 AAAATACAGTTAGATGACCCAGCTGTTAAAGCTTTTAACGAACTTAAAGATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATACAGATAAAATACAAA:1 - chr3R 3609217 5' + I-element 5127 1 53.64 GATGCTGCTGCAGCGCAACAATTAATGCGCATTAATGAATTATTAATTTGTGTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chr3R 10964594 5' + I-element 36 1 55.45 GCAAACAGATCGTGACAGCTCGTGGAGCCTAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCACTACC:1 - chr3R 12271553 5' + I-element 4984 1 56.94 GAAAAAAACAAATGTGCAACAAAGCGAACAATTGTAATTTAACTGCAGTCAGACTCTAGTTGGCAGCACAACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGG:1 - chr3R 17821666 5' - micropia 5007 4 70.00 GAAAAAGGACGAGCATAGAGTCAGTCGAAGAAGAACAAAGCGAGTTGAAAGTTGTGCAGTAAAAAGATCGTCAAGCCGAAAGTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATA:1 + chr2R 4633829 5' + invader2 232 2 75.45 ACAAGGAAATTGCATTGTGATTTTGGCACGTTGTTTCAATTACTTCTGCTGAATTTGTTTGCTTAAATTTTGTTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGTGAAGCGGGGCTTTA:1 + chr3R 24843605 5' - I-element 46 1 64.55 AATTTGCACCTTAGAGCAGCCGCTACTCACCTCGCCTTCATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTAT:1 + chr2L 19526191 5' + 1731 4452 1 58.51 TTTCCTCATCCTCTTCATCATCCGGAGTCTCGGAAGAGCTATAACTTTTATATACACTCGAGGATGTATAAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACTTTTAAAG:1 - chrX 12973506 5' - Quasimodo 365 2 65.45 TCCGTTGAGCCCGCTGAGCCGAGCTCTATTGGACGGATGTCTGGCAGCAGTGAGGACTGGTATATAATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 - chr3R 31633236 5' + opus 7 2 71.72 AGCCAGCTGTTCCCGTCATGCAAATGGCCAAATGGCACGGACACTTTTGGTGCGGACACTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGAATTCA:1 + chr3L 12916239 5' + 1360 403 1 63.46 CACGAAAACCTAAAGCATCGACTTCCTCCGCTCCCACACAAATGTACAATACAATACTCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAAC:1 - chr2R 10539433 5' + Ivk 346 1 62.63 TTTCATTTATTGTAATTCCTTGGGGCATGGAAAAGGAAAATTAGATTGTTTGCAAGAGAGAACGACTAATGCTAATGCTGTAGTCAAGTTCCCCGAGTATCAGATACCCG:1 - chr3L 23286667 5' - INE-1 555 1 79.09 GGATTCTGTAACGTTTATGCGATCTCTACAAACCGCAATCAAATTGAAACATTTAAGATTAAGATTAAGTAACATAAGTAACAGTACGGAGGGCAAATCCA:1 - chr3L 12967445 5' - Rt1c 5364 1 52.48 TTAATTTACCATTTTTATGAGTTAGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGTTTGATGTACACATATACGATCGCCTGTGAAGCAATTTGAAATTGATTTCGTT:1 - chr3R 22133279 5' + accord2 7240 1 87.27 GCTGTGCAAAGGCAGCTGCATACATAAAATGTAGTTCTCTGTTGGCCAGGCTAAAAGGTGCACTCAGTGACACCGAAAACACACACAACCAAAAACGTT:1 - chr2R 14579296 5' + Tc1-2 499 1 76.77 CTTGTTTCTCCAAGTGTACGTCATATGTGCGGTGTAGCAATGAGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr2R 9138767 5' - pogo 2093 1 62.82 GAAAGTAAAAGCGTTGGAATATCATGTAAGTTAGGATCAGATACAACTTTATAATATGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTT:1 + chr3R 25051570 5' - 17.6 482 2 70.53 TAGAATTAAACAAATACAAATTTGTAAACGGTTGTAAACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAATTTTTTTTAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGAAAA:1 - chrX 3554277 5' + 1360 3117 1 66.06 GTAGTCCTCCGTAGGAGTTATGTGGCCATCCGTTATCGCCAGTGAAAGAAAGAGAAAGTGCCTGGAGCCAGTTTTTTTTCGGTATTTTTTTTTTCTTCTTTTCTTTTGTT:1 - chr3R 9009125 5' - gypsy7 5004 1 71.82 CACTTTATGAGCAACTGCCTCTCTCAATGGGATCCTGAATTTACAGCTTAATAAACTGGCTTTTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chrX 22806766 5' - Burdock 233 2 60.91 TACAAAGCGTTGGTCAGATAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCATTTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAA:1 + chr2R 15188446 5' - Cr1a 4256 1 80.00 CACAGACAGAATTTTCCGCAAAAGTGCAAAACGTGAGAGTGAGAGTGCTTGCGAAAAAAGAATATAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGACGCAAATTAATATATTCGG:1 - chrX 9933566 5' - Gypsy12A_LTR 2053 1 64.55 AACCGGACAATTTGAAGTTGAAAGGGACAGATGGTTAGGGTGGTTGTCCAGTCGTTTAGCGTATCTCTCGCTGAAGCGGGAGATCTCCTCTGCTACCCATGGCATTCCAA:1 - chr3R 16926583 5' - G-element 4046 1 75.45 TCTTTATTCACTCCATGCTGCAAAAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGGGG:1 + chr3L 14437774 5' - Quasimodo 7043 2 66.67 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 203 1 85.32 AAGTGCAGTGCAAAGCGCACACCTCAATTTTCCCCCACGCCAGCCCTCCTGCCACGCCCACTTTTTCCAGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAA:1 - chr3L 15327025 5' + Doc 4555 1 71.15 CACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCCACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCAC:1 - chrX 22386759 5' + hobo 56 1 43.48 ATCGCTTTTGAGATTAATTTGGATTATCTTCTCCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 + chr2R 17806030 5' + Transpac 25 2 69.52 ATAAATAGCACAAAGACTTGGCCAATAATTGATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3R 29635214 5' - mdg1 7407 2 74.31 AAAAACCGGCGAAAACATTTCGCATGAGCAAGCACAAACAATTTGGACCAGAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTATATTTT:1 + chr2R 18345586 5' - FB 24 1 56.12 GTTTCCTTGATTGCTGTATATTGGGCATTTTATTTGGCAAAATTAACAAAATCACTCTGGCCTTTAAAAAAATAGAAGAAAAACAAGAGAGAATACTTTAGTCGAGTT:1 + chr3R 20125987 5' - INE-1 575 1 31.48 AAAGTCTGCACAAAAACCCTAGCCCGAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTCTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAACACATACTTGTTAT:1 - chr3R 28666158 5' + F-element 4600 1 70.37 ACCGCCCCCACTTCCCCCGTTTTCTTCAACGATTTCGCTCCTGTGCACTCTGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2L 11211199 5' + hopper 8 2 64.86 CTCAGCTCAGCGCCTTAAATTCTTGCGTGCAACTCGAGCAATTAATTAGTGTCCTTGTACTGGAGGCATAATTAAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTT:1 + chr3L 13913566 5' - Q-element 556 2 57.27 CCCCTACACCTCAAGGGTGCGACAGAGAGGGGCTGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGG:1 + chr3L 10226116 5' + invader3 247 2 62.64 ACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAACTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1 + chrX 12271485 5' + pogo 57 1 74.55 CACAAACTCTGCCCCCTCATCCGCTGACAGTGAACAAAAAACCACCAATAGTTGACGAATTTATGACATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGG:1 + chr3L 159160 5' + Dm88 399 1 69.52 ATTTACAACTCTGAAACGCACTGCCCCTGGCTATCTATCGCATATGGCGCAGATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 - chr3R 14703967 5' - 297 6947 2 53.21 TGGCGAGCAATTGGGACGCCAATACAGGCGTATTGTATGCAACACACTGTGTGTACTGTATACCCTGTGTGGGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATG:1 + chrX 20046908 5' - Quasimodo 6 2 67.89 AAAACCAACCGTTATTCTCGTCACCCTCACTTTTTAAACATCCAAGTGCGAGGTACAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGTC:1 + chrX 2344872 5' + 297 6913 2 56.36 TTATAGTTATAAATATATACTTTACAAGCAATCTACAATGTATATTTGTGCGTATTGACGTTGCTGTTTTATGTGCACGCATCGCAGCGCCAACCGACCGTCCCGGGTAA:1 + chr2R 14393238 5' + Doc 466 1 76.36 AAGAACGTAAGAATAACAGATTTTAAACGTATCATATTTTGAGCAAACTAAGAGACACCAATGACTACATAAGCATTCCAGCGTCCGAGTAATACGATCTAACGCTCAT:1 + chr2R 1886042 5' + Stalker4 151 4 53.21 GGAGAATGGATTTTTCTAGTTTATAAAATACGATTTTTGATAGAAATCGATAAGGTTAATGACTTCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACAA:1 + chr3L 13556693 5' + hobo 11 1 64.08 AACTTTGATAGAGAGCTGCTCACAAAAGTCCCCCAGCAGCGCCATAAAACTAATAAAAATCACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTT:1 + chrX 14840141 5' - 412 155 2 65.38 ATGGATATATATGGGTTTTGGGGAATATATATTTTTTTTTTACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 + chrX 10433024 5' - flea 224 2 71.00 CTCATTTGCACTTTAAGTATGTGTTGCGCGCTGATTCCAATTAGCAATATAATTACTTTAATAATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:2 + chr3R 7833099 5' + Doc 25 1 63.64 CCCATAAATACGTGAAAACAAAAACGAGTATAATTGATTAAGGAGCATCAACACCAATAGAAGGAGTGGAAGCATAAGCTTCCCTTT:1 + chr3R 21970065 5' + rover 6918 1 59.77 TGACCTTTCTTTACAAAACGTAAAGAAATTGTCTCAACTGCACACGATAAAGCAATTTCAAGTGATTTGAACATCAAATAGAATTCAATATATGTAAATATGTATA:1 - chr3R 18765418 5' + G3 4502 1 63.21 CCAAATCCATAATCTGAATTGATTGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:2 - chr3L 14261341 5' - mdg1 7398 2 77.27 ACAGTTTGTGATCATCGAGCGCTCGAATCGGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1 - chr2L 5338053 5' + F-element 17 1 68.32 AGGAACTGCAAGGGGCCACACAGAGGCTTCTCCCCATTTTTAACTTCATTTGTTTTTTTGTCTTAAACTGAACGGTAATCAATAAA:1 + chrX 8788300 5' + 17.6 7283 2 60.47 TGGAAGTTGACCCAGTTCCAAGTGGGGGTATGAGATACAATGACCTTAATGTTGTTGGCCAGCAAAAGTGGAGCTTAACTTTGTGTAAAAAATTAATAAGGCAATGATTG:1 + chr3R 29071786 5' + 1360 440 1 76.36 GAGGAACTTTTGAGCCGTTTGTATTGTACACCCTACAAAGGTAATTTACGATACTGTTTATTTTGCGAATTGTTTAC:1 + chr2R 2947969 5' - diver2 4819 2 59.74 TTTTACATTGTTTTATTGTTATTATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTCCTTATTTTATATTTCTTAGTAGAGATACTTTTGAACGGTCTTAA:1 + chr3L 17474848 5' - mdg3 5128 1 79.09 ATAAACTCTTCCAGAGATTTTACACGATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 12452960 5' + roo 48 2 78.00 GCGTGTTGTAAACATAATACACGAATCGATTAGTATTTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGCAGACTAATCTCATACTTTTTAATATTGTAAGCAGAAGTAG:1 - chr3R 20804173 5' + diver2 52 2 69.09 AAATAGTTCTGGAAATAGCTCAGCGAAAGCGGAAAGTGAATGAATGGTAAGTAAAAATTTCCGCTAAGAGGAAAGTAACACACATTAACACACACACACATATATAAACA:1 + chr3R 6957439 5' + Quasimodo 42 2 53.64 TTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCTGTCGAAAGCCGAAG:1 - chr3L 15968248 5' + P-element 20 1 54.95 ACTGCTAGTGGATTATATGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCAC:1 + chr2R 19405894 5' + HMS-Beagle 6835 2 58.18 TGCTCAACGCTTTCGATCGGGGAAAACCCCAACTATTTAGAAAATTGAGACACCTACGGGCAAGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGAC:1 + chr3L 15771903 5' + F-element 4513 1 61.68 CATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr2L 21735022 5' + Doc 40 1 71.76 CAAAGCGAAAAGACACCAATGATACGGATGTAAATGATGCCAAAGAAGAATAATAGTGATGTATCTCCCATTTGAAGGCAAACCAGAAATAGAAGAAACTCCAT:1 - chr3R 18341591 5' + 297 6501 1 75.00 ACTGCAGAGGCAAATTGAAAACTGGGAGTTTCCTTCATCAGGGTCAATAGCCGAGTCGATATGGTTATGTCCGTCTGTTCGTATGAACGTCG:1 + chr3R 4257752 5' + INE-1 127 1 63.04 CGATGGTCACGAAATGGGCGTGGCCGGCCTGAACATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCC:1 + chr3R 14660619 5' + G2 2953 1 70.00 TTAAGTTTGATAGATACAAGTAGTAAGATTTCAGATTTAAAAGCCTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTC:1 + chr2L 17970041 5' + P-element 2812 1 49.09 TGTCCAATAACATGTTATATAAGGAAAACATTGAAAATTCCTTAAAAAGTTTACTTAACAGAATTGTTCACACATGAACACGACTATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 7219786 5' + roo 19 2 48.08 TGTTCTAAAAAATCTAAAATTCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 + chr3R 27071837 5' + jockey 4668 1 73.40 ACACCTGCCACCTGCAACACTATGCCCGGCAGTTCCAAAAGATGCCCGTGAGTGGCGAATGAAATCCAATATATATATATATATTTACATTTT:1 - chr3R 27313946 5' - G3 4506 1 67.74 GCAAATATGAGTTTTCCCATTTTCCGTTCACCATTTCCCAGGTACCAGTTAATCCGTATTGCACCATGTTCAAGCCACCAAC:1 + chr3L 6320403 5' + Ivk 4989 1 50.00 GAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3R 25702178 5' - Tirant 8481 2 54.00 GCTGAGTCTTACGGAGCATGTTATGAACCACCTTCTTTTTAAGTATGTATAGTAAAGAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr2L 18749822 5' - pogo 2080 1 60.75 AGAAACGAGTTGTGTTGGTCACCAACTTTGAATGGCAAGCAGCTGCCGTCAGCCTTGGGCAAACATACCTACCTACAGTAGGAAAATTAAAA:1 + chrX 18558483 5' - Rt1b 5125 1 54.35 CCCTACCCCCTGACCATACCCCTTACCCCATTCCACAGCCTTGTTTTGCCCGCCCATGCACTATAGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGT:1 - chr3R 11315293 5' - hopper 1395 1 58.59 ATATTCGGACTCCTAGTCATTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAA:1 + chr2R 1571521 5' - 1731 311 1 77.27 GTCTTGAATTATTTTTAATCACTTTACACGCGCAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3L 9822292 5' + pogo 48 1 70.00 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACAACGCAACACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGAT:1 - chr2L 16217660 5' + Tirant 415 1 27.27 TGTGTCTAAACAAAGGATTTTCCAGCCAAAGGCAAAGATAATTGTAATAAAAAATTTACAAAACATACCAAAAAGCTGAAACTACAGCATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 - chr3L 5971784 5' + pogo 5 1 74.55 TGAGTTATTTAGATAAGCGAAGAGCAAATATGTACATACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCACAAGATCGTTGCGTCCA:1 - chrX 19187366 5' - Transpac 264 2 68.18 ATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTACGA:1 - chr2R 16660290 5' + gypsy9 38 2 50.46 AGGCATACATGATGAATCTGCATAAGGGAGAACCACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:2 + chr3L 18915131 5' + 412 28 2 51.82 TACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATAAAATAAAATAAAATAAAA:1 - chrX 12946234 5' - transib1 1901 3 48.00 CTACACTCATTTGTATTCCATGTATCAGGCATAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCTTG:1 - chr2L 15812913 5' - blood 7129 2 63.22 GATGTGTAAATAAGGGAGTATGGGCAAGGAAATTGGCTCTCAGAGATATTTAGATGAAGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAG:1 - chr3R 17195518 5' - I-element 165 1 58.18 AAATTATTGACACACTCAAAGAACACGGACCCTACCAAATCCATTGCTCAAAGGCATGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCAACGCAACGACC:1 - chr3R 20422798 5' + Doc 4538 1 59.05 CATTTTTGTATTATTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTGCCGGTAATTAGAGGAACTTTTGCTGTAACAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGA:1 + chr3L 22832764 5' - jockey 4898 1 66.36 AGTACAACTGTCACATAATGGAAAAAACCCAAAGCAAGCAATAATTAAAATCGTAAAAACCTAATATATAAGTTACCGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 - chr3R 2275672 5' - opus 490 2 70.71 ATGTTTTGTTTGTCGTGACATAATTTAAATGCAAATGTTTGGAACTGAAAGGTAGCCATGAGTCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAGGACTAACAATTTTG:1 - chr3R 24260968 5' + roo 23 2 60.00 AGAGGAGAACTGCATATTTGCATTATTTAATTGACTCGTACCTTTCCTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr2R 20924210 5' - mdg1 7422 2 61.82 AGTTGTACCAGCAGTGTGACCGCCTTACTTTTTGTCGCGATATCATTTTATAAGGGACAAAATTAATAAAAATGAAATAATTGTTGAATATGTTAACACTCAGAATAATG:1 + chr2R 5140515 5' - frogger 311 1 65.45 ATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTTAACTTTGCTGGTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACACTTTAT:1 - chr2L 4034960 5' - TAHRE 10389 1 70.59 TGTATGTAGATAATGATAAGCTGCGTGGAACAGGTCTACATATGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 12591789 5' + roo 39 2 62.39 AGTGGAACGACGAGGGAGGAGGTGGCTCTTTGGTTGACCGATGATGAAATTTGCAAAACAATAATGTTTAAGTGGAAGCG:1 - chrX 19292906 5' + gypsy11 116 2 77.50 CCAATCAAGCCTTAATGCCCTTCTATGGAGAAGTTATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTCTAATCTTGGCTCTCTGCCGC:1 - chr3L 14353521 5' + Cr1a 4232 1 68.18 GATACCAAATACCCCGCCGTTTATAGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 - chr3L 17153627 5' - 297 6924 2 80.95 TCTGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGGCTG:1 + chr2R 4330778 5' + baggins 5234 1 66.98 CCTTACTTTATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr2L 15763827 5' + blood 7025 2 63.83 TAATAGACCTTCCAAATTAATCATGATATAAGTTAAGTGCGGTTTTTTTTCACAAATTGAAAAGTTTTGTATTTATATTTTATTTTAATAATATATAATTTTAAT:1 - chr2R 16749744 5' + Tc3 252 1 60.95 AAAAAAAAAACAATAAATAAATGTAGAAAACCGAAAATAAAGCAGCAAGAAATGAAAGCGATGATGGCACTCATACTCACGCACAGGTACCAGCCTATCAATCCGAATTG:1 - chr2R 6132277 5' + Ivk 4968 1 75.45 CAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACTGC:1 - chr2R 5924402 5' - jockey 4712 1 50.00 GATCGATCGAATTAGTCGTTATATCGAATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCT:1 - chr2R 10129799 5' - Burdock 212 2 73.96 GTTGGCAGCCCTGGCTCTCCCACCCAAAATCTTAATTTC:1 - chr3R 24048002 5' + Cr1a 317 1 82.05 TCGATGGGAGTGGAGTGGGAGTGATTTTTAATTGAGGGCCAGTATAGACTTCTGTGAGGGCATTAATCGTGGAG:1 - chr2L 16923632 5' + micropia 323 2 75.68 AACGTTTTTGTGTTTATTTCCATCTTACTATTGTAGTATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTCTAATTCTAAATGCGGT:1 + chr2R 6418851 5' - flea 212 2 64.55 GTGGTGTATATTTACTCCATGCAACAACAATAATAACAACAACAATAACAACAACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCGATCACTCCCAGC:1 - chrX 12702335 5' + 297 6529 1 49.09 GTTTCTAAGTATTAGACTCATTTTATGGAACCATTTAGTGCACGTCTGTGACGTTCTGTACAATTAGACAGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 - chr3R 11173308 5' + Transpac 4931 2 70.00 GCAATATGTGTTTACATGTGCTGCTGCTCGAGCAGGAAAATGGCCTTTTCCCACTTAGCGCGATGTGTGAAAAATTAACAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGC:1 - chr3L 10660512 5' + 1360 458 1 64.55 ATTAAAGTACATATTTAACTTTAATTAAGATTGTGTGCAGAAAATGAATGGGAAAAAGTATTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 - chr3R 20703283 5' + flea 4771 2 66.98 CAAACGAGAAACAAACAAACCAGCCTTGGAATCGGAGAACCAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGACCTTATTCT:1 - chrX 13312168 5' - Circe 7213 2 63.54 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAACCACA:1 + chr3L 11777678 5' + Quasimodo 44 2 42.59 AATAACTAAGATGATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 15988774 5' + 412 7082 2 57.00 AATATACGCATTGATCTATGTTTGGTTCATTTTAGGCGGAAACGCTCATTTGACGTCCTTTGCATTTGCAAATTTTTCATATTTTCCTATTGTTGTAATTTATAATTTAT:1 + chr3L 14811382 5' - copia 257 1 79.09 GTAAATAAAAATCAAAATTGCACACTGAATTGCATACATTACAGCGTATCACTTGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr2L 6161950 5' + 412 76 2 43.01 ATAGTCCGATTTGTATGAGCGTTTCCAATCGCAATTTAGGGGTCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCACCACTTAGTTGCA:1 + chr3L 23257496 5' + blood 42 2 57.41 CCTTAAAATCTCTTTGCACTCTTAATTGCAAAGTATTCGGCTCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTG:1 + chr2R 7891507 5' + flea 4667 1 58.00 TAACAAATAATTTATATATTTTATTTTACAATATTGTTAAATAAGACGCACACGTATAAGACGCACGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCAC:1 - chr3L 18463525 5' + gypsy5 6947 2 69.79 TATAATATATTATCCCATTTTATTATGACATTCAACATTTTTTTAGTAAGTCAAACATTTTCCCACTATTTCAACTTACCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 - chrX 17792385 5' - Stalker3T 205 1 78.18 AAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chrX 20433340 5' + diver 40 2 68.48 CTCAAAAGGCTAAAATGTGTTTGCCGAAGACGCGAATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGCTGCGCTGTTTCCGC:1 - chr2R 18271497 5' - gypsy5 7110 2 66.67 ACTATCGAAATGTTGCTTTCCATTTATGGTACTCCAGTGAGATTTATTTTGTTGACCCCGACGTGATAGTGCTAATTTGTATGCATTAATTAATGCACTTATCCCGTTTA:1 + chrX 16263634 5' + diver2 426 1 50.91 TAATACATGACAATTTCTATGCTAAAGCTAGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGCCCAAACCAGCCA:1 + chr2L 12036089 5' + 297 6591 2 58.06 CACATCGTAAGTTGAACTTGGGTGCTAAACATAATTACTTGGTTTGTAGAAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACG:1 - chr3L 14741142 5' - I-element 5014 1 63.81 ATCAACACTGCAAACGTCAAAAGAAATTGCAGGCCAAATGCATAACGGTCTTTGCAATGGACCAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGC:1 + chr3L 3452944 5' - blood 147 2 77.14 CAAAATATTGCAGCTGCAACAAGAAACTAGCATATGTGCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 - chr2R 14588904 5' + jockey 4771 1 50.68 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 + chr3R 21907535 5' + Tabor 35 2 41.82 TAAGAAGTGGGATCCACGACTGCTGGTCACTGTCATTGCACTAATTAAGCGGAAATTACCCAGGTGGGAAAAAAAGTCAGTTAACAAGAGTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr3R 10203093 5' + roo 8663 1 77.27 GGATGTCCAGTCAGTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCCCTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAA:1 + chr3L 10218185 5' + 1360 3344 1 80.00 TATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGATGTTATCCAT:1 + chr2L 19817868 5' - G4 3770 1 81.82 GAAAATTGATCTAACTTTAAGAGTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2R 8086811 5' - 1360 3352 1 76.47 TATAGCACAGCTGATTGATCAATTCGGTCTATATCTTCACAGATATCGGAACGATTGCATATTTCAACAAGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAAT:1 + chr2R 12586331 5' - 1360 209 1 70.19 GAAATTAAGCCACTAATGGCTAATTAATAATATTGAAGAACATTAAAACTTGAATTCCAAATAAACTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTTT:1 - chr2L 3138402 5' - copia 246 2 66.67 TGAAATTTATTTATTTTTTTTTATATAGATGGGCTTGATTTGTTTGTGAGTTCTTAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chrX 14547237 5' - opus 470 2 53.64 AGTATTTCGTCACGCCTTTTGTATGGAAAGATGGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGA:1 - chr4 671322 5' - 17.6 7105 2 70.00 GGATAAGTGGATACACAGGCACAGACAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAA:1 + chr2R 20914898 5' + accord 6977 2 56.00 TACCATAATACATGACAATTTCTATGCTAAAGCTAGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACAAG:1 + chr2L 12036084 5' + 297 7 2 62.11 CGACCGGATCTGCAGTTGTTGTTGCTGCCACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGGTGTGGAAATGTATGA:1 - chr3R 21858739 5' - Tirant 361 2 63.16 TAGTTATCCTTCAACGCTCCATTTGCCTTCCTTTAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 + chr3R 16194521 5' - flea 4968 2 68.18 CGAATTTCAAGAAGAACTTAGAAATCACATATGCTTTAATCTATTTTGTGGGCTTCTTAAACGGCTTTACGCATGTTATTGGCAATCAGCTGTCTTTGA:1 - chr3L 9523103 5' - transib1 158 1 74.75 ATTTTGAGGAATAATGTTCGACACTTTATCTAGCTTGGCTTGCTAGAAATCGTTTTTAAATGTGATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGG:1 + chr3L 3240499 5' - diver 6090 2 60.00 ACACAAGAGTCCTGCCCACCAAGGACCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 + chr2R 23477823 5' + F-element 14 1 68.69 CGGGTTACCCCTACAAATTAATACTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCAACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGGACCAC:1 + chr2L 19602870 5' - hobo 2892 1 70.97 ACAACGATCACTGACGACAAAATCCTTGTACGGGAATTTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGCTAGCAAATTAGATATTAACAAA:1 + chrX 23075897 5' + I-element 5237 1 65.98 AATATTCTGTGGTTAAGTTCGGTTTCGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTT:1 - chr3L 14251343 5' - I-element 5052 1 75.93 TTTGGGCCAGGCGCTCACAAAACTAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTGTACATAACTTCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGAGCAAGTGAATCTTG:1 + chr3R 12608994 5' + frogger 125 2 78.18 TAACTTGAAAGCTGAAACCACCATCTGTCACGAATCATCTTTCAAATGTATCAGGCTTTTACCAAAGACACTAGAATATT:1 + chr3R 28847893 5' + Tc3 239 2 73.75 GAAAGCTTCCTGACAGCTTAAGCCGGATTCCAGCTGACAGCAGAGGGTGGTCTTGGGTGTTAATTTGACTGTTGTTCAACCGATGGATCCGGATGTGTCT:1 + chr2R 11846980 5' - transib4 2373 1 57.00 TTTGGCAAACTCAGTTTTCGGCAAAAGTTATCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTG:1 - chr3R 9317607 5' + F-element 4234 1 71.82 CTTTGGTACACAAAGATTTCTGTATAAAGGTTTAGACAATCATTTTCAAGATAGTTTTTATAGGCACCAACCAAAGACACTAGAATTCTATTATTATTCTAGTGTCTTTG:1 - chr2R 11728634 5' + Tc3 310 1 60.00 GTTCAAGCGAATTTTATGCGTTTGTCGAGGTGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCG:1 - chr3R 26775927 5' + Rt1a 27 1 66.67 TTATAGTTATTCATAAATGTGTTCACCCTACTCTGCTCTTCGTTTATGTATTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATAT:1 + chr3R 1848889 5' - F-element 4386 1 54.55 ATTGTTTGTGTTTGTCTATTGGCATATGAACAAATTTAGCTGTGCATACACACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGA:1 - chrX 18750730 5' + BS 4802 1 64.56 TGGTCAGTTTCGCGATTGTCCTTATGCACTGTGTGTGTATCAAGAGATTCATTTTATTTACTTACCTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATG:1 + chrX 11494935 5' - F-element 4387 1 67.27 AAAAACAAGAGAGTACGAAACAAATATAAATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chr3R 7500929 5' + FB 10 1 62.65 AGGGTGATACTACTTCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTG:1 + chr3R 14774952 5' - X-element 4378 1 82.35 ATCATTTGCTTCGTTATTATTATTTCGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATG:1 - chr3L 5747705 5' - accord 357 2 76.36 TCTTAATATTGATACATTTTAATTACTATGTACAACTGTTCAAAACGTTGACGTACAGCACATCATTACTCCATATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTT:1 - chr2L 8162870 5' - invader1 3998 2 70.91 TTTACGTTTCTTTAAAGTAGTTTCTGTTTTGTAACCTTAGTTACACCAAATTCATAATTTCAAGACCGGACGTCGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCACT:1 + chr3R 28814418 5' + G2 2954 1 71.82 CCCATTTTGCTCAATTTGTTTTGCTATCGCTCGCTCGGTTCGATATCCTTTGGAAATCCAGTTCCGTCCTTTTTGTTGTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATA:1 - chr3R 21111799 5' - I-element 103 1 74.55 TGGTGTAAAACTGTCCGAATATCAAAACATGTTGTGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr2L 6757480 5' - Tirant 8469 2 67.33 TTCAAATATATTATTGCAGCCCCTGAGATACTGAAGGCTACTATATGTGTGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:1 + chr3R 28224746 5' - flea 225 2 57.27 ATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr3R 21211613 5' - Stalker3T 204 1 67.59 CGTGGTATTTATGTGACATTTTTATAGCGAACATTCGCTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATA:1 + chr2L 19273685 5' - Tirant 8299 2 57.78 ACTTTTCGGCTTGGCCTTTAAGTAATTTGTTGCCTGCAACCTGTGGGCTTCCACCAGCCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCAGAGTATGCAGTCAACGC:1 - chr3R 16506704 5' + Doc 4519 1 57.27 GCATCGTTATGGGTATATAATATTACTAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3L 3611788 5' - blood 7367 2 55.32 GCGCCCGATTGCTTCACCTTTAACGTTTTGCGTTTTGATTTTGTCATTTTTCTTGTTGATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 - chrX 17330188 5' + opus 7027 4 59.09 TACCATTTTGCCGTTTTGCCAGCTTGTTTGCAGAAATGTTCGCTCGCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr3L 12301263 5' - hopper 1376 1 57.27 TGAAACAAGCGAACCTATACTTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1 - chr3L 17719046 5' - 297 342 2 78.64 GTGCAACATTGGCATGCCACGCAGTGTAGCAACGAAAGGTGAGCAGACATGGAGGGGAAATGCTCTAGATATATGTACAGCTGGGTTAAGAAAAA:1 - chr2R 20352523 5' + HB 2 1 50.53 TCAGAACTCAAGTGACGTGCGCGACATATAACTCTTTTGGATTCCGGATCTTGTCGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2L 3323296 5' + hobo 14 1 60.22 ATGCGTATGTTTATGTTGGGGTTTGGTAGATATAGTTCTATATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 + chr3R 4514531 5' + Tabor 46 2 63.64 TGATTTCTCTCATCACACAGGCGAAAAAAGCTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGC:1 + chr3R 11764011 5' - FB 49 1 67.53 GAAAGCGGCATTGCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3R 23861055 5' - pogo 2079 1 60.91 AAATACTATGAATAAAAATATTTAGCATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGA:1 - chr2L 17263189 5' - Transpac 5176 2 73.64 CCAAAGGTGTCCTCTGGGTTAACAAAAGGTTCAAGCGAATTTTATGCGTTTGTCGAGGTGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTT:1 - chr3R 26775955 5' + Rt1a 12 1 59.34 TAAGTCCCCATCTGGGTAAGGGATTCGCCTTCAACTCCGTCTCATCCCACTCCTGGGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCT:1 - chr3R 15755801 5' - invader1 3762 2 60.00 CTTAAAAAATCAGTTTCTCTTGCCAAAAAACTCTTAAAACGAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAA:1 - chr3R 12058915 5' + I-element 461 1 77.17 AAAATATATCTTTTTATATCAGTTAAATTTCTTTAAGAGTGCTAAGAAGGCACATTTTTAAATCAACTAGGTAACAATAAGTGAACGTAAGATAAAAAATATTTAACTTT:1 + chrX 4511545 5' + McClintock 6369 2 64.55 TGCGAAAACAAAGTTGCAGAAAACGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATG:1 - chr2L 7490822 5' - F-element 4387 1 78.18 ATGAAGAAGATGGTGGAATCTGGCTGGGAACGCCTGAGTATGTGAAAAAGTACAATAAAGATTTTTTCCAAGTTCGCTACGATCATCTCCAGAACCTTGTTGCGAACCAG:1 + chr2L 12646620 5' + Burdock 5913 1 52.73 TAGAACAAGCAAAATATGATCATAAAAAGAGCTGAGCAGCAGCAGAAGCAGCAAATAAAAAATAAACAAATAAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCG:1 + chr3R 14941075 5' + pogo 492 1 80.00 TTATTTGTTTTAAAACAAAGGCAATGTCGGCAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCA:1 - chr3R 8335294 5' - R1A1-element 24 1 52.63 AGAAATGTCCGTGCTTCCAGTGACCCAACTCGTGACACACCACGCCAACGCCTGTCTAGTGCAAATAAACTTACATATTACTCTATAATCTACTTATAACTGTCACCTC:1 + chr2R 16997557 5' + TART-C 10751 1 59.63 GTATTCTGTGGGCAAGAACCAAAGTCGTGAGATACATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCTGGGGG:1 - chrX 2341161 5' + Cr1a 4420 1 55.56 TCCTCTTTTTAATTACCTAGAAAACGTAGTCAGAAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAATACATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAC:1 + chr2L 18367626 5' + I-element 5176 1 69.09 AATGTATCTGTCAGACTCCTCGACTTTTGCTATCGTTGTCGCCTGTCGCGTATCTGTATCTATGTTTGTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAGACACTGTATCAA:1 + chr2L 9009192 5' + Tabor 6855 2 66.36 TGGAGTTTCTTGGCCTTGCACATTGGTGAACGTTTTTTTGTAAATCGATCCGAGCACGTGGCAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAA:1 - chr3R 25737869 5' - S-element 1700 1 62.50 GTCGGTTCTCCAAAAGAAGTTTCCATAAATAAGCTGTTTAAAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr2R 9963594 5' - pogo 2093 1 75.45 TGTTGAAATTTTCAAGCTGTGTAAACAACGCTGTTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAACTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3L 15819347 5' + pogo 48 1 69.09 GTAATGGATTATAAAAGTACTTAAAAAGCTATCTCTAAATGTATGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGAC:1 - chrX 11651701 5' + flea 4653 1 51.69 CAATTGTCCACCTCTAGCAGATGCGGTCAATCTGACGCCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 24814008 5' - P-element 2846 1 40.95 TTATCTGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 + chr2R 19405906 5' + HMS-Beagle 6823 2 62.79 TTACCTTCCTTGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:2 + chr2R 9963490 5' + pogo 42 1 62.73 TGCGACTTGATCGCCATGCAGGTCGAGAGCAACTGAAAACCCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAGGCCGAAG:1 + chr3L 16496199 5' + P-element 20 1 45.98 TGGCTGACGTCTTGAATTATTTTTAATCACTTTACACGCGCAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3L 9822300 5' + pogo 22 1 55.43 ATGACTCCTTTTTATTTCTTTGTAGAATAACCACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAA:1 + chr3L 15054453 5' + copia 4937 2 70.91 GGATTTTTGAAATGTGCTTAGCTTAGCAAGTGGTGTCCACATGTAGCTGTTTGAAAAAAATTTCAACTTTGAAGAGAGCTACAACAATTTGTTAA:1 - chrX 10090009 5' - hopper2 1211 1 74.74 CTTCTCGCACCCAGCACCCAGCGGCGTAGAATAACTACTCTGACTTAAAACTGATTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTA:1 - chr2R 4561806 5' - 1360 3232 1 61.96 TTTATGATGTCACGGACTTTTCCGGTCTCCGAATTATTATTTTATTGTCTTGCCATTGCCGCATATCCAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr3L 12677043 5' + pogo 2 1 73.33 TAAGCTGCGTGGAACAGGTCTACATATGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2L 12591773 5' + roo 8714 2 75.96 GAAACAAGGAAGTCGGGGAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGG:1 + chrX 2854288 5' + hobo 2924 1 77.50 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAACAACACACAAACACACA:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 419 2 39.09 TAGAATTTCAATTTTAGAAACGTGTTTTGGGCCTCCATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACT:1 + chr3R 6937623 5' + F-element 188 1 70.91 ACACGCAGTGCCAGAAAGGACGAAAGGACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 - chr3R 13733010 5' - hopper2 1552 1 71.82 TGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3R 22316301 5' + 412 77 2 33.96 TCAAGTGTTGATCCCGACTCGCCAACTGCCCTCACTCTGATTACATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr2L 4013074 5' - pogo 2070 1 53.27 TAAGCGCGACAATAATTACACTTCCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGCATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTG:1 - chr3L 16926171 5' + hopper2 1181 2 76.36 AAGCGCGTGAGTAGAAGTGGGAAGGAGATGGGAGCTTTGATAATTCCGCAGCTTCTCCATCTTCATAGATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAACACCCTCGCAAGAA:1 + chr2L 22715979 5' + Doc 4493 1 70.00 TGCACACATACATCAAGTCTTTAATATGTACAATAATTATGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGAAA:1 - chr3L 13936343 5' - I-element 78 1 64.55 GGGGACTATCCACTGGCCCCACGACTGTCTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGCCTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGC:1 + chr3R 15626798 5' - invader2 129 2 66.67 AAAACAGCTTTGTGAAAAATAAAAGCAGTTAAGAATGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTT:1 + chr3R 6088510 5' + transib2 4 1 77.27 TAAATCTCAAATTTCTATATATGTGATCAATTTGAATGATTTGGCATTCAAATTGTGCTGCGAGTCCATTTGTTTCCTTATGTATGCAAATTTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 936693 5' - accord 7031 2 47.71 AATATTTCTCTGTTGTAAGGAATAAATTACCAAGTTCCCAACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGACAGGACC:1 - chr3L 22490419 5' + F-element 4514 1 60.38 CATTAGTTTGGCGTTATTGACAGTTTAATTGGAAATTAGAATTCTTATCGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAACG:1 - chr3L 126350 5' - pogo 2081 1 62.73 GTCAACGAGGTTGTTCAGGGTGTGCTCAATAACGAGAAGAAAACTCAATCCCAGGACAACAAGGATAACAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGCCCTGACAACTAG:1 + chrX 5235703 5' - mdg3 5231 1 71.56 CCCCAACCAACAGCCCAAAATTTAAATTTTTAGTGCATTAACTTATACTGCATCCACTACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGAAATAGCTGAGAA:1 - chr3L 16677777 5' + Doc 4440 1 59.09 TTGAAAATATATAGCTTCCTTCCAAACTTGAATCACCTAGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr2R 8397518 5' + 412 7070 2 63.46 ATGTCTGTCTTTTTCGGCGATCAAAACTTAATGTGCAGAACAAACGTTGTAATAATGCGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTT:1 + chr2L 22490520 5' + 1360 24 1 80.00 TATTTTTATTAATGCCGAGTGCAGACTTCAGTTATCGGCTAGGGAGGAGGTTTTATATTTTCGCTTTTAATTTTTCAATTTTAAA:1 + chr3R 7599710 5' - 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Stalker3T 203 1 64.84 GCTGCTTTTCACCTTCTCCTTCTCTTTCTAGGCACTTTGGTCAGCTTGGTGGATCGCAGGGGG:1 - chr2R 14981370 5' - G-element 336 1 88.89 ATGGATTCTTTGCCTTTACTGCAGTTCTTAACTGTTGCTTTACACTGGTTAAAACAACAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2R 19684537 5' + 412 7082 2 56.36 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3R 21907534 5' + gypsy3 419 2 45.37 CTTTAACGATATTAACACCGCCTTGGCTTTGATAAGAATTACGAGCTATCAGATAAAAATTTAGAACCAAGTACGAAACCAAATGACTGCGGCGCGGGAACAAACTAC:1 + chr3R 23101097 5' + HeT-A 5593 1 75.93 AAAAGTTCACAAGTGCTTATTTGGCTACATTTCTATACTCTGTAACTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr2L 19129328 5' + FB 31 1 58.42 AAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGTGAAGATAAGATAAGTGAAGATAAGATAA:1 - chrX 4617443 5' + Stalker3T 203 1 61.82 CCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3R 31633146 5' - opus 7477 2 54.44 CTGCGCCCCGTGGCATGCAACACTCTTCGAATGCACTCGCGGTTGGTGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2R 6707686 5' - 1360 3384 2 65.00 AATGTAAAAGGTCGCTAGGGCACGGCACTTTATTTACTTTATATACTTTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr3L 18123687 5' - copia 242 1 60.00 GGGGTTTTGTTTGTTTTTTTTTTGAAACAGTAGGCGATAAAGTCTCGATGAATAATCGATAGGGGGCT:1 - chrX 18245935 5' + gypsy12 38 2 73.53 GATCTCTTGTATGTTTTTGTGATTGTTTAACAAGGCTCCTGAGTGGGGGAAAGTGTGTGTGTGTGTGTATATGTGGTCTTATACTATGG:1 - chr3L 4929801 5' - Quasimodo 14 2 74.16 ATATCAAAAAGAAGAAACAAAAAAATAAATCTAAGCGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGGTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACAG:1 - chr3L 14699769 5' - rooA 7408 2 65.45 TTCGTTTAAAATAATTAAAAATAATAGTAAATAAAACACCACAGTCATGATTTTTTTTAATAGAACACAAAATATACACAAAAAGAAAGAATTGATTGCTTTAAGAGCG:1 - chrX 10006469 5' - Cr1a 4251 1 77.98 AACACAACAACAGAAAATATAAATACAGTACTTGATACTAATCCTGTATTGTATCTGTCGTCGTGCGTCACAGGGAGTTGCCTTAAACGGATA:1 + chr3L 2896940 5' - aurora-element 76 1 59.14 CTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATAGA:1 + chr3R 6088547 5' + transib2 41 1 60.00 CTGTTGATATTTGTTTGCAAACAAAAGAAGCGCTAAAAATTCAATTATCTGAGATGGAGAGGTTCATAGTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 + chr2R 10047093 5' + FB 12 1 69.81 GGTGTACCTGACCGTCTGCTTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGCGAATATGTGTGTGTGTG:1 + chrX 14672206 5' - accord 7036 2 71.62 GTTTTTCGTGATATATCAAAGCTAAGATGGTTAGAGTTCGCTTTTCCACTAGCTGAGTAACGGGGATCTGATAGTCGGGAAAGTCAACTATAGCA:1 - chrX 21558347 5' + INE-1 568 1 63.16 GTAAAACAGCAACCACAACAGCAAAAGAAGATTTCAGTGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTG:1 + chr2L 6483510 5' + F-element 4337 1 66.36 TCAAAGTCGCCGGCCTAACGTAATTTGCATGGACCATGACTATCCGAGAGGCATTTCTTGTTTACATTTTACAATTGAAATTATT:1 + chr2L 8616174 5' - TAHRE 10179 2 72.94 TTCTACGCAGAACGCGGCAATTTCGCTTTAGATTTTACTGCGCGAAATTCTTTTTCAAGGCAAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCAGA:1 - chrX 1599472 5' - hopper 1414 2 77.17 CATTGCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr3R 23861063 5' - pogo 2097 1 70.24 ACTCCCTATCTCTAGTTTATATACAAAATATACTACTCTACAAATATATTTATCAATTCAGATTGTGAATTCGATTCGATTCATTCGATTCGATCGCCGACGTGTG:1 + chr2R 23415612 5' + F-element 11 1 66.98 AATAACTTATTTTCTGTCTTTTTTGGAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 17719005 5' + 297 41 2 72.73 CATCCGAGCCCAATTACCAAATAACTCGACGATTGCGTAAATGCAAGAGGAGAGCCCACAGCAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 - chr3L 13608749 5' - INE-1 579 1 74.71 TTTTAAGTATTCCAGCTTAAAAGGAAAAACTATTGTTCACACATGAGCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chrX 5018768 5' + roo 8697 2 68.97 CGTGTAGTAAATAAAAATGGCAACTGAATAAAAATGAGAAAGAAGTATTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATG:1 - chr3L 21578082 5' - I-element 5087 1 60.00 GCATTATTACAACGTTTGTTCTGCACATTAAGTTTTCGATCGATACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCG:1 - chr2L 22497639 5' + invader1 3955 2 65.91 AAAAGCAAAACTAACTCTAAGCAAAACTAAGTCCTCCGTTGGCAAGGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCTCCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTG:1 + chr2L 4167438 5' - Tc1 1258 1 64.55 AATGTAACTAATGCCTTAGCATGATGTGAGGAAAAAGTTTTATTTATTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTT:1 - chr3R 4554385 5' + Bari1 39 1 62.73 GATGTTTTTTTTTAATTCTCTAACAAGTTGTACATTAAGCTCCTCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 - chrX 7302543 5' - Stalker3T 205 1 55.45 CGATGGTGGCAAAGCAATATACCCACCCTCAGCTAATTAATATTCCAATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTT:1 + chr3L 7019559 5' - F-element 98 1 56.48 ACATTGACTAGAAGAAAATAGGGCGTGGTGGTAAATTTTGAGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATG:1 - chrX 397242 5' - F-element 4451 1 54.44 CCCCCACATTAGAGTATTTCCTCAGGCAAATGCCAACTTCCGGCCTGTGGCATTGACTTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGAT:1 + chr2R 14402834 5' - F-element 4262 1 68.69 GAGATAAACGTGAAATGTATGAAAATAAAAATTGGGAAAACCAAACGATTCAAACAAAAGAAGTTTTTAATTCAGTCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCACA:1 - chrX 8038824 5' + 297 3 2 79.09 GTTAAAAAAAATCCCCTGGAACTGGGCATACACACACACACACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACT:1 + chrX 6278971 5' + accord 184 2 72.34 CTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 + chr2R 24031487 5' - 1360 3330 1 77.98 GAGCGATTGGAGCATTTCACTTTCAAGGTCACCAGACAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTG:1 + chr2R 24843161 5' - I-element 4876 1 66.36 AAATATACAATTTATCCCATTTAATTAGTTGTTATTGGTGTAAAACTGTCCGAATATCAAAACATGTTGTGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGGGCCTTT:1 + chr2L 6757445 5' - Tirant 8496 2 71.56 TCATCTGTATAGCCAATTGGTTCCCCATAACTTTTTGCGTTTTCCCTTTTGCACTCTTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTT:1 - chr2R 20618715 5' - invader2 364 1 79.75 GTTGTGTGACCAATGTGGAACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr2R 7981210 5' - 1360 3356 1 55.05 TTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAACATCTGAAAGCGAAAGAGACGC:1 - chr2L 16606823 5' + F-element 111 1 55.21 CAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTC:1 - chr2L 23372628 5' - gtwin 7382 2 68.93 AAATTTAGCTTCATCATCATATTGCAAAGAAACAGTAATTAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - chrX 17184971 5' - roo 9027 1 64.55 TATTATCTTCAATGCTTATATTTTTGGGAAAGTGCGGAACAAAACAAAAGTAAGGGCAAACGGAATGGAATCGAGGAAATTTAAAAATAAAACAAAAAAA:1 - chr3R 28340067 5' + TART-B 10633 2 77.00 ACGCTATGTTTTTCTTTTGTTTGTTTCACACAAAACGAATAAACAAAAGAACAACTAAACAACGGCCATTTGATAAAATATGCCCTTCACCTTACAAG:1 - chr3R 11932032 5' + 1360 218 1 79.59 GCCAAACAGCCCAACAGCCAAAACACAAAAGATAAAAACTTTTAAGCGTCGGGCAAATACAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATC:1 - chr3L 12045644 5' + I-element 5112 1 57.27 TATGTATTTGTTGCAGTTCAATCTTTAATTGTTAGAAACAGAGCATAAACTCCTAGATGTCAAAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 24867578 5' + roo 10 2 69.39 AGCATCGTGAAAGGTTTTGATGTTTCTGTATGGTTAATTATACCCGTTAGTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 + chr2L 21802428 5' + INE-1 21 1 67.33 TTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3L 20167950 5' + 412 12 2 70.18 CCATGAAAAATTAAAAATTGCACGCAATGCCAAAACGGTGAAAAATAATGGCAAATATGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAG:1 + chr3L 472441 5' + micropia 5214 1 72.41 TACAACTGCGTCGTTTTAACTTCATGGGGCAAGTTACGGGGTATACGTATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr3R 9339626 5' - Burdock 220 2 58.72 GGCCTGGCTAGAACAAAGCGGCTAGAAGTTTAAAATATT:1 + chr3R 25314374 5' + springer 483 1 84.62 AACAACAGCCACAAAAAGCACACAACCAACACGGCCTTTGGCCAAAAGCAACACCAGTACTACTGCCGTTAATAGTAAGACAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCT:1 + chr2L 13610283 5' + Q-element 366 2 83.33 TAGCATTAAAATATATATACACATCATATCACCAAGATTTTCTCCCTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 10202983 5' - roo 9037 1 57.55 TATATATATAATTGTTTTTATAATTGTTTTAAAAAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACG:1 - chr3L 26401056 5' - McClintock 6394 2 74.12 TTGGGAATTGAACAAATATCTAGTGTAATGAATTTTAAAGACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCACAACACG:1 - chr2R 17617719 5' + Bica 4621 1 64.81 TCGATAATTAAGTTATAGTTACACTTTATATCGTCAAAAAATCAAAAACCTTAAAAGCTAACCTCAAAATTAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACT:1 + chrX 22860030 5' - 297 6863 2 68.18 AGTGTCAGAAGAATCAAAAGTTGTAGCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGTACAAACACGAAATGTGCTTATGGGGC:1 - chr3R 31058405 5' + Tc1 1623 1 72.73 AGACTGAATTTATGGCCAGTCACCCAGAATCGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTTGGCAA:1 + chrX 15026029 5' + FB 4 1 57.63 TTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 + chr3R 21993230 5' - jockey 4961 1 67.06 AGGGAGAGGGAAGATGGCCAATAAAAAACGCTTACGACAGCGGCCAACACACGCTGTAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTG:1 - chr3R 18437241 5' + invader1 3876 2 57.27 CTAGCGTACAATGTAAATAAAACTTTGATTAACAAGGTACTTGAATTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTTTATCCTTAGG:1 - chr3R 18174390 5' - Quasimodo 97 2 55.05 CTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTATCTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCG:1 + chrX 21772485 5' - gypsy3 6546 1 61.47 GGTTAAGTGAAGCACAATGAGTCTAAGCGACAAACGTATTATTCTCGTTTAAGAGAGAAGCCACTAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr3R 9496608 5' + Stalker3T 204 1 68.18 AATTTCATCATCATACATCATATATAAAACAAAAAAAGGCGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAAC:1 - chr3L 20514859 5' + Tc1-2 1251 1 80.90 TGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTTTTGTTTATT:1 + chr2L 9723026 5' - Porto1 162 3 38.38 CCAATTGGAAATAAAAATTCACTTTATTAAGGTTTCGCAACTTTAATAATATTTAAGTCATTCGTGCGTGTCAAAAAATAAAATATTAAATTAAAAAA:1 - chrX 12872907 5' + BS4 725 1 74.49 TCAGTCGCTCTCGCTCACTCCACTGCCCTCTCCCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATTAATTTTCGAAAATAAAAAATTTCAATTTTTTTAATTTTTTTTTTAAAT:1 - chrX 13234550 5' - TART-B 10633 2 59.05 ATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr3L 20525229 5' - pogo 2081 1 70.00 GGGCCTGAAAACTTGGCTGCAATTCTTTTCAAGCATGCCCCAAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAG:1 + chrX 14980797 5' - invader4 282 2 55.79 AAACTTCATTGCTATATAGATTTTTTTTGGGGGGAGAGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3R 14995687 5' + Doc 8 1 37.93 AAAATTCACTGATATGTGTTATAAAAGTCTTATTTTTCCGTACTGAAACGAAAGTTATAGGTTTAATTTTGAATACAATATATTTTCATAAAACGATTTCACTTTTAATT:2 - chr2L 3142880 5' - gypsy9 420 1 73.64 AAAGTAAGATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCACTCGAGTGGACG:1 - chr3R 31458545 5' + jockey 18 1 65.31 AACGTACAAGTTATAGGAATAATAAATTAATAGTTATTAAAGCTGGATCAAAAATAAATTAAAGAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAA:1 - chr3L 21821521 5' + Tc3 315 1 67.29 TATATACATATATATATATATATATCTGTATATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chrX 12657093 5' - Burdock 6356 2 72.34 AAATACAGATATGGGGACAAACAATAAGAGCGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATA:1 + chr2R 5736029 5' + Rt1a 4968 1 55.38 TTCAATTATCTATTTTTATTGGCCTTAAAAAGGGTTTTTTTTTTACTTTTTTATTAT:1 - chr3R 22190060 5' - Rt1b 5150 3 70.18 TATATTATATTATTATTATTATAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAGGTTATGGGCCCAGCCCACGCGGACATAAAAGTGAATA:1 - chr2R 3785516 5' + Dm88 215 1 80.00 ATACATACAGTATTTATTCCAATTACAATTCTGTCAAAAAGATACCTTCTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 13543948 5' + 1360 1 2 70.27 TGGCATCCATTTCACAATACTTTAAAGCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 12300142 5' + 1360 51 1 76.77 ACTGCATGCCATAAAGCGATTTACAACTCTGAAACGCACTGCCCCTGGCTATCTATCGCATATGGCGCAGATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chr3R 14703985 5' - 297 6964 2 69.09 CGTTGGCCCTGGGCCGATGGGGAAACAATGGATGAACAACACTTTTCTCCTATAACCGAATTATACCAAACTTATCGGGTGCAGCTAATAAGGGTTGCATCCAG:1 - chr3L 13004969 5' - gypsy12 124 2 69.23 TCGAATCCTTAGGTCGGCAGGTATATTGGGGGGTTTTGTTTTTTTTTTCCATTTTTT:1 + chr3L 4863868 5' - gypsy7 5009 1 78.95 TCCGTAACTCAGCTAAAATGGTGTGTGAGAAAGATGGGGATAGGCAACCGACTGATTTCCACGGTCCTAACAACGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3R 31965272 5' - 1360 3375 1 67.62 AAATGTTTGTACATCCTTAATCAGCATACTAATACACTAATACACTAATACCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGCTACCAG:1 + chr2R 23176836 5' + Idefix 93 2 72.34 AAAAAGGAATCGTTTAGCTTTCAAACAGCAACAAACTTGAAATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chr3R 25859608 5' - 297 368 2 61.46 TTGAAAATCTTTACTAAAACATTTTAAACATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr3L 17595292 5' + jockey 4693 1 59.09 GTGAAAAAGCAAGATAAATCAAATTAAAAATATTGTAAAAAATTGCAGACAGGATTCAGGAAATAGCGAAAAAATACAATGGCAG:1 - chr2R 12936460 5' + jockey2 3073 1 56.47 TGCCTAGGGAGCAGGTGAAGTGGGGTCTTCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 - chr3L 22399788 5' + FB 42 1 70.21 AAATAGAATAGAATTTCAATTTTAGAAACGTGTTTTGGGCCTCCATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATT:1 + chr3R 6937615 5' + F-element 149 1 49.37 AATCGAAGCTAACGAGCCAAAAGTCAGTGCACTGGAACAAGCAACTCAAACAACCACAAAATGAAGGAGCTAGTATAAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATCTTCGGA:1 - chr3L 3783545 5' - Gypsy12A_LTR 2052 1 55.96 AGATCCTGCAGCTCGTATAAACTATTTGCTTACCGGTTTCGCCATCGCAATTGCAGCACGCCGCATTTCTTCAGATAACACGCGCT:1 - chrX 16380487 5' + Chimpo 423 1 74.42 ATAGTTGGCAGGGATTTATGGCCGGAGATCCTTAATGAGAGGAGAACTGCATATTTGCATTATTTAATTGACTCGCACCTTTCCTTATTGTAGTTAATTAGAATTCAAAT:1 + chr2R 20924173 5' - mdg1 7459 2 74.55 CAAAGTGCTCAACAATGCAGCTAGACAAATTGGACGCACGCAGCAGCAGCAGTTGGCGACTGCATCCAATTTAATTAAAATATATTTTAAA:1 + chr2R 24330811 5' + Cr1a 89 1 57.14 CATTAAAGTTACATAATAAAACTAATAATAATTATCAACGCCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAAGGAGAG:1 - chr3L 3534624 5' + micropia 5169 1 58.10 AATCTAGTTTGAGTAGACCTCCCCTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGATA:1 + chr2R 14885160 5' + BS 5035 1 71.59 TAATTTAAGGTTCGGAGGAATCAAAATTATCATAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 8808800 5' + roo 42 2 67.62 CGGGGATGATGGGCCCGGAAAAAAATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAT:1 + chr2R 8303667 5' - roo 8719 2 78.18 AGATTTGGATGGCAAAATGCATATGCAAATAAATAGCTAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 - chr2R 21592073 5' - Tirant 8483 2 58.18 TTGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr3R 7049642 5' + 1360 36 1 60.91 CCCCCCTACCCCCTGACCATACCCCTTACCCCATTCCACAGCCTTGTTTTGCCCGCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTT:1 - chr3R 11315296 5' - hopper 1394 1 59.22 TAAAATTTTCAACCGTCTTCATAGTGATTACAGAGCATAAGTTTCATAACCGACAGAAATGTATAAGACTAATATAAACGTGAATAAATATCAACACATTTTTCAAAA:1 + chr2L 21362897 5' - INE-1 264 1 51.85 ATCAGCGTGTTACGCAGATGATCTCAAGTTTCATGACTTTGTGGCAGATATATGATTTGTGTGTTTTTTGTTGCTTTTTTTT:1 + chr2R 5010109 5' - Porto1 4434 1 62.20 TGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAG:1 - chrX 21667911 5' + gypsy2 49 2 71.00 AGAAATAAATCAAAAAATGTTAGGCTTAAATTTCAATGTTTTTTGTAAAATAATTTTAATTTCAAAACGTAAACAAACCATGCAATATAATAATGTTA:1 - chr3R 20125882 5' + TAHRE 10207 1 69.39 ACATAACGAGCAAAATAAATGAACGATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chr3R 5774876 5' + I-element 45 1 70.53 TTGAAAGAGGAAAAAGGAGTAAACGATATTCATGCAGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTT:1 + chr2R 19036277 5' + FB 79 1 57.81 TATCAAGCATGTAAGTTGAAAGATATGCACAAGAAATCTGTAGAGGTTGAACAAAAGACAGTAAGATACTTTTTCAGAAAGGGGCAAAAAAAAATATATAAACAAATATA:1 - chr2L 18730885 5' - S2 108 1 78.18 TTCGGGTGCCCATAAAGTTCATAAAGCTCTAGCGGGGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCAGAAGTATGGGTGTATGCGG:1 + chr3L 18957246 5' + invader1 3806 2 69.09 ACTTCAGAAGAATTGGGATGGGTGGGCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTCATTTGATTTTT:1 - chr3R 24951712 5' - Doc 4426 1 75.86 TTTTCTCTTCCAAAAAACCCAAAATTCCAAGGATGGTGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACACATGT:1 + chr3L 9130465 5' - roo 116 2 64.55 CAACGACAACAACACGGGCGGCGATTGTCTTTCACTGTGTGTCGTGCCAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTT:1 + chrX 7683844 5' - FB 348 1 56.36 TAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAACAAACAAAGCACAAAAACACACAAAAACACACACAAACAC:1 + chr3R 7773344 5' + gypsy3 418 2 38.83 GGATTAGCTAATAATGGGGTCTAGATAACGGGCGTTCCAAGCTGAGAGAGCCACTGTCTTTTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTCGGGCCTAATACTTGGCTGGAAAGCC:1 + chr2R 13821576 5' - HB 1330 1 63.64 TGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATAAT:1 - chr3R 12040199 5' - HMS-Beagle 200 2 68.00 AACTTTGAGTTTAAATTGGAAAATTATGCTGTCAAAATCATTCAATATCCATAAATTTATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTCACTTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGT:1 - chr2R 5541030 5' + Ivk 215 1 68.18 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - 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chr2R 18316654 5' - transib4 355 1 60.00 TATTACTTTGATCGGCAACACACGAACTTGCAACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCATCAACACTACCTACATACCAATTC:1 + chr2L 10566622 5' + I-element 4978 1 65.45 TTTGGTTGGACTTTACTGACGATCCAAACCCTCTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATT:1 - chrX 20445183 5' + FB 844 2 65.62 TTCTTAAGGTTTTACCAAAAGGTCACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTAT:1 + chr3L 19948870 5' - 3S18 286 2 77.45 TTTTTATTTTTCGATTTGCAGCACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAA:1 - chr3R 13632012 5' - F-element 4567 1 78.22 AAAAAGGTGCTGATTACTTGATTTGGGGTGGCAAAATGTGAAAAAGAAAAGAAGAGGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATT:1 + chr3L 20646015 5' - Porto1 4550 1 67.89 CAATTAGCTCAAGTTTAAAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAG:1 - chr3R 12162941 5' + R2-element 300 1 77.50 GAATAAAACTAGTTAAGTTTACAAAGTTTGTATCAATATTTTATATATTCATTTTATTTGTTTAGTTTTTGTCATTTTTTTTACTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTGTT:1 + chr3R 11269496 5' + pogo 294 1 75.45 GAAACTAAATGTTGCCCCTGTGTATCGCCTGCAAATAAAACAATAACTAGAACGAGTGCAAACACGCCGGTTGAAAACACTAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAGAGAG:1 + chr3L 22122004 5' + Bari1 164 1 72.22 TTGCGTGCGCACAAATGTATGCTACACTTTTTTGTGTTCTGTTCGTGGTTTTCATCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chrX 7992516 5' + jockey 18 1 60.00 TTACCAATTTGCATCTCAAAGGTAGTTAATTTCAGATCATATTATGGAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTGCTC:1 - chr2L 7750619 5' - opus 485 2 51.22 GCTGCTGCAAAAAGCGAAAAATATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCG:1 - chr2L 3937459 5' - Doc 257 1 70.18 TAATTAGCATTCATTACGACGAATCATCAAATTGCCCCACCGCTCACGATGCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACA:1 - chr3R 6818460 5' + I-element 5125 1 54.29 ATATTGATCAAGTAAACATGGTTTGACTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCT:1 + chrX 16956557 5' - F-element 4508 1 67.50 ATGTGGTCAAGTCATTGGACTCTGTGGCACTTACAATATTTCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCCTCG:1 - chr2R 9963727 5' + pogo 20 1 53.41 CACATCTCTATAATACCCACTTCCCCCTTTTGTCGACAATGTACAAATAAATAAGTATATCTCAGCTTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTG:1 + chrX 20099897 5' - S-element 1706 1 70.37 ACAAGAGAGTACGAAACAAATATAAATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 - chr3R 7500925 5' + FB 35 1 60.58 TAAAACTATCAAGAATTGCATTGAAACGAAAATTCCTGATACACTCTATTATGCATTAAAGAAGTTAAAATCGATTGCTTTATAAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGAT:1 + chr2L 22685660 5' - Cr1a 4229 1 57.27 TTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3R 12039951 5' + 412 7101 2 74.49 GTGCGGTTTAAATTTTGTGCCATTTATAGACAGATTTATTTATATTTATTTATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3R 6309800 5' + F-element 43 1 52.73 TTTATTTAATTTCTTTGAAATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTACTTATTAGTTTAATTCTAAATGC:1 + chr2R 15155190 5' - flea 215 2 60.00 TCAATTGAGCAGAGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTACTTTGCACA:1 + chrX 18483148 5' - pogo 2084 1 57.30 AATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chrX 21452476 5' + INE-1 542 1 72.90 AACAAAGAACTACCAGCAGCAGAGAAGAAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCTCATTCATTCAGTATGCAGCTAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCT:1 - chr2R 11651142 5' + Doc3-element 4578 1 75.45 CATTTAAATGCCATTCCCGTTTAGCTGCATTTATGCAAATCATTTCTTTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAAAAGATTTTTAA:1 - chr3L 2271412 5' - jockey 4891 1 59.18 GGCAGAGTGCGTGGTGTGCTGTTGTGTCGTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCCGCCC:1 - chr3R 8920083 5' - blood 7291 2 71.56 ATGTAACAGGCAAGTAATAACAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAAAGAATAAATTCTGTTCCGC:1 + chr2R 25257610 5' - TAHRE 10402 1 48.86 TGCAGCTCGGCTCCCAGGCTACTGGGATTCTCGCTCTGCACCCGATGATGAAATCGG:1 + chr2R 22226898 5' + accord 158 2 73.68 ATATTTGCCACAATTAAATATGAGTTTTTAACTCAATTTAAACGTGACTCATTTTGAAGATTTCCAACCAAAAACCATATACATATTTATATATATACATATATACATAT:1 - chr2R 12872365 5' - G3 4507 1 59.09 TCTGTTAAGTATGGTTAAACACGAATTTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGAATTCCAGGCCAGCATCCCCCTACATCCCAACATTTTGGTCCTT:1 - chr3L 813460 5' + GATE 262 1 75.45 GACGTCTATGGTTTCCAAATCAAGTTCATTATCAATCCTACCTATTCTCGAAGGACCAAAATGTTCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGCTCAATTCGG:1 - chr3L 24352507 5' - rooA 341 2 58.88 GTCTGTTTTCCTTTTTTTTGCACATCTACAGCTCGTTTACAGTGTGTTTTGTGTTTATGTGTTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGC:1 - chr2R 19205702 5' - Quasimodo 13 2 61.82 ATAATCCTTTTCGTTTCGTTTCGCTTGGGTCCTCTCCCTCCTCTACCTCTTTCCCTTCTTCCCCTTGTTTTGGTTCTTCTTGTTCGCTTCTTAACCGTTTGGTCATCGT:1 + chrX 11378229 5' + Circe 7270 2 66.97 CGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3L 126302 5' - pogo 2079 1 75.00 TATGAAAGAAATATTTTTCCCAAGTGCTTTCAGTTTCAAAAACTGAATGTAAACATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTAAAAGC:1 - chr3R 28848015 5' - Tc3 235 1 42.45 ATTTAACAGCCACTGCAGCCCTCGGCCCAATATGTAAATTTTTCTATAAAAGCGAAACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATAT:1 - chr3L 4721035 5' - Dm88 28 2 62.39 TCAAAGTGTTATCGCTAAGCACAAGCCCCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATA:1 - chr2R 15052346 5' + Quasimodo 58 2 66.25 CAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2L 15988757 5' + 412 41 2 72.63 CCGAATCTGCGTCCGATAATTGTCGGCCGTATGCATGATGAATACTTTTGCTTTCTTCTGCTTTCTTCTCTCTTTTAGTTTCTTCTCCTTTTGGTTATG:1 - chr3L 1059823 5' - TAHRE 276 1 51.52 GTTGATGTTGCAATTACTGAGTAAGAATAGGTAAAGATCGCTGTTAGCTTTCAAAGCGAACGGACGTGTTTTTTTTTGCGCTTAGATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACC:1 - chr2R 15426049 5' + Cr1a 44 1 75.45 TTTCTGTTAAATGTTCAAATATATTATTGCAGCCCCTGAGATACTGAAGGCTACTATATGTGTGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTT:1 + chr3R 28224733 5' - flea 5010 2 75.26 CTTCTGATATCATCTCCTTCGCATTGTTGTTGTTCTTGGATCGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 6095666 5' + hopper 148 105 78.79 GTAGATTTATGAATACTGTAAATGTTTTTCCCCTGATAAGATACTGTACTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 - chr3R 19996635 5' - copia 217 2 59.09 ACTTACCCTTAAAATCTTTGCCACTCTTCATTTTCCCTCCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCTTAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAA:1 - chr3R 6088613 5' - transib2 2782 1 60.55 ATCGCCGATATCGGTCGGCTATAGGTGCCTGTATATATGTCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3L 17530205 5' + Tirant 12 2 59.74 GAAAATAATCTTTAGTGAGTGGAAAAGAAAAATCGAGAGATTTTATTAGTTGGTGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGGACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr2L 15988692 5' - 412 7524 2 56.86 GCCGCAAATTGATGAGCGGTACATTATTAATTGAATTTAATCAAATCGATTCGCATGACATTCCATGGGGAGCGATGAGGTTCCGGGTGTCAAAATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 17856713 5' - accord 7033 2 54.55 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACACACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAACACAAA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 421 1 39.56 AAAAATATGATAAGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 - chr2L 8476767 5' - Juan 4179 1 53.64 GTGGACTGCAGTTTGAAACTTGAAAATTGTTTAAAAAAAATGTTCATAACAAGCATAAAAGCCTGTCTTTCTAATTATTTTTTATACATTTATTTTTCCTTCTTTTTTTT:1 + chr2R 18796733 5' - Doc2-element 232 1 62.73 GCCGCTGTAGCTTAAATGCAATCGATTAAACTCCGCATAAACCCAAAAGACCGCCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCAAGTTATACGATCTAA:1 - chrX 8492972 5' + Stalker4 144 4 64.29 AATTACTTCGAGGGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 18072786 5' + 412 42 2 65.66 CAGTAAGCCTTAAGACGGAGATACACCTAAACACAGCCCTGAGACCCAAAAAAATTCTGGCATTTATACAGTGTATTAGACTTTAGGGGGATCTTTGAGTCATG:1 - chr2L 16777926 5' + baggins 5370 1 68.27 GGCACTTTGTTTCCTTTTAATACAGGTAAATAAACTTAACAATAGTTGTAAACAAGACTTTTTGTTCAATATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGACTAGT:1 - chr3R 17419791 5' - I-element 5344 1 65.45 AAATTCTGGACATTACTCACTCAGTCCACCACTTCTCCAGCCTTCTACTGGTGGATATGCTTCCCGGGATTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chrX 16560553 5' - S-element 1708 2 72.38 CCTTTTTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGAGA:1 - chr2L 16606828 5' + F-element 120 1 56.36 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAATAACGAGCCTCGGATAACTTTACACAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTG:1 + chr3R 21907535 5' + R2-element 285 1 69.32 CGAAATGCTCCCTCGCCACCCAGCCGATATAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chrX 7677135 5' + jockey 4687 1 59.72 GCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2R 9963513 5' + pogo 41 1 79.07 CGTATTGCATAAACACTCTTGATAACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGA:1 + chr2L 10750119 5' + X-element 4532 1 60.00 ACACGGAAACTAAGTTTACCAATTTGCATCTCAAAGGTAGTTAATTTCAGATCATATTATGGAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGG:1 - chr2L 7750634 5' - opus 490 2 61.96 TGCAACAAATCCGGGCATTATTACATTTTATTAAGATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGG:1 + chr3R 22260382 5' - F-element 4506 1 57.65 TTGCTCGTGGGCGTGGTCGCACTTCTGCAAACCAAAACACCGAGAGAATATACATAACAAGAGTCCGAATACTCATCCTTCTAACTGGTACATACTTTTCAACGAATCTA:1 - chr2R 16383366 5' - INE-1 13 1 32.73 ACAGGAAATTGAGCGCAAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - chr3L 19347232 5' - jockey 4959 1 53.21 TAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr2R 2427621 5' + Doc 25 1 58.18 TCGGAATTGCTCCACTTTGCGTGTGTACAACACTGGTTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTCG:1 - chr2L 9882791 5' - 1360 3193 1 66.36 GTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTTTCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTATCTT:1 + chr2L 21768293 5' - Stalker3T 203 1 41.54 AATGCGAAACGCACCACTTTCTGCGGTTTGCTATGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2L 9626920 5' + hobo 31 1 63.33 GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAA:1 - chr3L 15253229 5' + Stalker3T 203 1 21.82 ATTTTATTTAAAACACCTATAAAATCAACAAAAAAAACTTAAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGAAGA:1 - chr3R 30172561 5' - Cr1a 221 1 62.67 AAATTAAAACTTTTCGCCAAATTCGAAATTAAAATTGAAGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:2 + chr3R 7049608 5' + 1360 2 2 79.09 ATCCAACGCAAATGGCCAGTTCAATTTGCCAGTGGACAACATTTTTACTAACTGGCTAATAAGAAAAAACTCAAAA:1 + chr3L 12303903 5' + Porto1 4196 1 72.37 ATTGGAGTGAGCTGTAAAAATATGTGAGCAAGTTGCTGAAATTTCTTTTAAAATTTTGCTTGAATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAG:1 - chr2R 21795458 5' + R2-element 3517 1 58.18 CTAGGCTCAAAATTCTTTAAAAAATATTTGCTTTTCTCAATTGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGG:1 + chrX 808855 5' + hopper 407 1 61.82 AATACGAATTCATCGTGGTCCTTATTATTCACGTTATACTCAGACAATATCTCTGTCATTTTCACTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATTT:1 - chr3L 20003886 5' - Stalker3T 199 2 72.63 GCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 - chr2R 23354337 5' - Tabor 462 2 59.74 GCGCCTAGTGAATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCCTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGTTCAACGCAC:1 + chr3R 21993204 5' - jockey 4979 1 61.29 AATGCCCCCCTGCGCCATCACTTTATTTACCAGTTAGACAGACATCACCATGCAAGAAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCAGATCTCGTTCAAA:1 + chr2L 4266619 5' - hopper2 221 1 75.26 AAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr2R 9963673 5' - pogo 2095 1 58.62 AGAAAACTTAACTTAACTTAACGTTACTGCGGCCGCGTCCGATCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTT:1 + chr2R 23137614 5' - gypsy4 6590 2 69.70 GTGTTTCTATGCTTCATCGTCCTTCGATCATTATCGTTCTCATTCGATAAGGAGGTAGGTTTTTCCACTCTTGAGGATCATATGAAAATCTTATTCTTATCTGGTATCTC:1 + chr2L 9795153 5' - Idefix 105 2 59.09 AAACCAAATACTATGAATAAAAATATTTAGCATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTG:1 - chr2L 17263194 5' - Transpac 270 2 66.67 CTTCAGGCGCCACATATGCAGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 + chr2R 13648597 5' + hopper 36 1 75.29 TTGCTCGGTGGTGTAACGAAGGGCTCTATCTCAGTACTCATGCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chr2L 19212262 5' - flea 4978 2 59.63 GCTCATAGGCTGATTCTGTTGTTCTTCCTCCTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCTCGTT:1 + chr2L 18611119 5' - micropia 5167 1 69.61 TTATATTGAGTATACACCATTAACAACGAACTGCTAGTGGATTATATGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTC:1 + chr2R 19405865 5' + HMS-Beagle 4 2 75.96 TATCCTTCCCATTGTCGGTGAGGGTGTCGAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAAGATAACAA:1 - chr3L 20129831 5' + Stalker3T 206 1 60.00 TTCGTAGCTGCTGGCAAGACGAATGTTAATTCTATTTAAACATATACACACACACACACACATTCATAACA:1 - chr3R 27861131 5' + Quasimodo 41 2 71.83 GTACTACATTACGTCTTAAATATATAAAAATTTAAATGGAAAGCCTAGATAACGCTAGAATTTATTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGA:1 - chr2L 8777126 5' - G4 3824 1 91.82 TACCACTGCCTAGACGCTCGGCGCTGTCCTGCAAGTTCTTTCCAATCCAACAGACATAAACATCC:1 - chr2R 6174316 5' + Quasimodo 7023 2 72.31 TATACCAATATTGCAATCCAGCCATAACTGATGTATCTTTCAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCAAATATTTAACTCA:1 - chr3L 8742300 5' + I-element 5036 1 60.91 CTACGCAGAACGCGGCAATTTCGCTTTAGATTTTACTGCGCGAAATTCTTTTTCAAGGCAAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATA:1 - chrX 1599470 5' + hopper 21 1 62.73 GCTACAAGCTCCATACCAAAATTTCTAATAAACTTAGCTCCTTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAACAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGC:1 - chr2L 6103856 5' + hopper 118 1 59.81 TATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTT:1 - chr3R 12040201 5' - HMS-Beagle 242 2 58.33 GTGGCAAAAATTATGGCATAGTGTCTGTAAAGGTTCTTTTGTTTTCAGTGAAATCTTGATAATTTATGAAAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 - chr3R 30859530 5' + Burdock 4 2 59.63 TGGGAGGGCAAAATATTTCCTTCCTGACAGGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chr2L 13558223 5' + FB 37 1 64.44 ACAAAAAATATACAAGAGAAATACATACATACATATGTGCTTGAATACAAAAAAAAAATCGCAAACTATTTCATTATTAGGAATTTTATTCTTTTTTTTTATTATTTGAG:1 - chr3L 8432514 5' - Rt1b 5145 1 62.73 ACTAGTCGGCATACTTATGCGTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCA:1 + chr3L 18463461 5' - gypsy5 7348 2 60.00 ACCCTCGCGAAGCGATGCCATCAGGAGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTAT:1 - chr3L 22108180 5' + Transpac 4941 2 59.81 AAAATGGAATACCACGGTTACTTTAAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGCGTTATATTATCGCCCGCCTATGAAGCACACTGCATAAGGGCATGGTCAG:1 + chr3R 21061987 5' + gypsy11 164 2 66.06 GTACAACAGGATATCTCTTTAGCTGGCCATTGGGATTTTAGGCCAGAATCAAATACATCTACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 - chr2L 19678200 5' + flea 4763 1 70.10 CAATAACTAACATGACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chr3R 7588862 5' + F-element 37 1 58.59 GGATATGAGCGGGATTCAATCGGGCGGAACAGGCATAGATACTAGTACCTACATGGATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chr3R 19058365 5' + Burdock 20 2 49.00 TTCTAAACCAAGGATGTTACAAAATAAACAAGAGAGAATGCTATAGTTGAGTTGCCCGACTATCAGACACCCGTTACTCAGCTAG:1 + chr4 1120845 5' - INE-1 543 1 71.76 AAAGAAACAGACGATAGACCGTTAAAAGTGTGCATAAAGTGTGGCAATTAAGGTGCGAATCCACGAGATATGAGATAAAGAGGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTGT:1 - chr3L 2484533 5' - Dm88 91 2 74.55 TTGGCTTTTAGCCCCCAGTCCCATTCCCTCTCATCCGTTCACTCTTTGATATCAGTTTTTGTGATTGATATTTTAATGCTCCTTTCATTTTTTGATTTCT:1 + chr2R 19866610 5' + transib4 67 1 61.00 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 205 1 32.38 ACCGACTTCCGTTGAGGTCATCTCTGTTGGTCAACATTATCAATTGGCTGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAAAACCAACC:1 + chr3L 6872875 5' + I-element 5085 1 52.58 GTGCACACAGACACACACACACACGTGCGGGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 + chrX 1599393 5' - hopper 1367 1 70.75 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 + chr3R 21907534 5' + Tabor 6894 2 70.00 CAATTTTAAACTATTTATTTGTCAACTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCC:1 - chr2L 8608058 5' - TAHRE 10404 1 94.59 CGAGTGTTACGGACGTAACCATCGCGCCAATTGCCACTTCGTCGTCTATCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTCTTTTTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACA:1 - chr2L 4483251 5' + diver2 272 2 76.36 AACTTTCTCCATTGCCAGCTCTTCAGTGCCTGGTCCACACGGAATCCCTTACGGGACACGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 9432914 5' - roo 9046 1 57.27 AACACCCAATATGTGTAGAAATAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCAGAGCTGTTGAGCA:1 + chr4 980020 5' + flea 36 2 58.33 GTATATGTAATGCCCATTTTTTGTGTCGTTGCTCGCTACGGTTTAAACTCTCCTCTCGGTTTTTTATTTTTTTTTTTAAATTTATTGCCCTTT:1 + chr3L 19039391 5' - HB 310 1 77.42 AAAATGAAAGAAATGGATTTTTGACAGATTTATGACTATCGAGCCGTCTTCATATTTTGAATTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCT:1 - chr2L 21843620 5' - Stalker3T 204 1 74.71 AAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCTGCAGACAAGCATAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCAG:1 + chr2R 13136830 5' + Doc4-element 339 1 53.00 GATGCAGGTGGAAAACGAGAGCGATTCGAATTATCGGTTGGTTAGCTGGATTAATACGGCATATTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAAAA:1 - chrX 17838063 5' - S-element 1712 2 73.68 AAATGGAGCTGTAGTACATTTTTGAGAATCAGATTTTGACATATAGCACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTA:1 + chr2L 11528018 5' + accord 298 2 56.19 TTTTGATTTATTTGAGCTTCAATTAGTCGTTGATCTTCGTGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATCCATCTGCCTTC:1 - chr3R 8337458 5' - Bica 83 1 69.23 TGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTTTTTTATTTTTTT:1 + chr3L 21448027 5' - gypsy7 5009 2 77.05 ACTTATAATATTTTCATTTTTAGGGTTTGATTTAAAAATTGTTTTTTCTTATATTTATAAATAAAGTACAATATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAA:1 - chr2R 883163 5' - F-element 4665 1 68.18 TCACACACTTATTTGCATATTTTATGGGTAAGAGTCGGTAGTGGGAGCTCAAAGAAGGTGGGGTCGGGAAAATCGCATTTTT:1 + chr2R 13934423 5' + FB 16 1 56.10 CAGAGCCTGGAAAATGAACTCTCTGCCCATACACCACAAAAAAAATAAAACACCAAAATGCCTTTAAAAATCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 20718378 5' + jockey 12 1 50.98 ATTTGTTATTAATTAATTGTTTTGTTTGTGTAGCCCGTCTGTTGCAGCGCGGCATTACTAGTAGGTTGCAGCTGTGATAACTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 + chr2R 22978388 5' - TAHRE 10425 2 73.15 ACTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 - chr2R 11379783 5' - jockey 4956 1 60.00 CGATTCGCTCTTTTGTGGGAAACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATAAGTAATGCAC:1 + chrX 711761 5' + 297 6623 2 76.09 TAATCAAAATGGATGCTAAATATATAACTTGGCATTTACAAGTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 17184883 5' + roo 19 2 63.64 CAATGGATTGGCATCGGTAAAACAATAACGTCTGGTGTTTTGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGTATTTTGTATGTTATCTGGTTTGGGGTTG:1 - chr3R 16889324 5' - I-element 5123 1 63.64 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATAGGACCAGACTCGACCAAACAAAAAT:1 + chr3R 21907535 5' + I-element 4918 1 62.11 TCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr3R 27071857 5' + jockey 4693 1 53.54 CATGTATCCAAAGTATAGATGTCCACGTACGCCAGGCTATACAAATGCATATATAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTAT:1 + chrX 4712444 5' + Quasimodo 1 2 73.56 CGCGCCTAAAAAGCTTGCAAATAAAAACACCGTGTAAAAATATACAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTAGA:1 - chr3L 15902950 5' + F-element 4221 1 57.27 TTAAAGACTTATTTTATCTATTGCAGCATCGCTTTCACACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACCGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCT:1 + chr2L 3721797 5' + Cr1a 357 1 73.96 AAGTCATTTCAGGATTTATGATGTTTTAGCCCAAAAGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGT:1 - chrX 15500038 5' - pogo 2055 1 68.81 AAAATAATCAATAATGTGCCAATGGAGATGATAGATGATCATCACCCCTAGGGGCTTAACATGCTCAATTTCCATTGACTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTT:1 - chr3L 14784432 5' + pogo 175 1 76.36 ATGGAGAGCGGAGAGTAAAAAGAACGCTGAGAGGGGTTGGAAAATGCAGGCAGTTACACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAA:1 - chr2R 19166702 5' + FB 5 1 73.26 TAAACTTCTAAATTTTCTATGTTGACAAAGCGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTT:1 + chr2L 13292940 5' - X-element 4696 1 62.39 CAACACAACACAACACAACACAACACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCTAACAGATACCACGAGAATGGAAAAACCCCAATTCTAGATAAGACACACA:1 - chr2L 16217660 5' + Idefix 6975 2 57.27 GCTATCAATTTATAGGATTGCAAATTAATCATCGTAACTTAAATATAAAAAACAAGAACATACAATACATACATACATTAAAACAATACATATATATATATATTTA:1 + chrX 15029467 5' - G3 4512 1 58.49 ATAACAGAAAAGCATTCTCTAAGTCTCCTAAGCTACCTTGTAATTTATTATTTATGTTCCAATCATGATTTAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCTCGAT:1 - chr2R 23870185 5' - opus 358 2 74.55 TTAATTTCCTAAATTATAAAATTAGAGTGAGAAAAATCTTAATTAATCACTCTTAATAATGCTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATATTTTCGTTCCGAAGGTACCA:1 - chr2R 23553811 5' - Doc 4391 2 42.73 GCCTTCAACAAGAACGCCAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGACAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCAACGCAACGACCTCCCAGC:1 + chrX 9024745 5' + Doc 4545 1 80.91 AACGCATTCCCAGAAAACTCTGGTATTCTCATAATTTGACTGAAAAAAGACAATACTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chrX 16693848 5' - 1360 3375 1 63.54 ACTTTGCTTGGCAACAACAGCACGAATCGAAATATTCCTGCATATCCTGCATATCCTGTATAGCAATCATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCT:1 + chrX 3652471 5' - invader4 2871 2 59.09 TCTGGGAGTTGGCTTTATAATGAAGTTTGATTGCCCTGCGACTGCGGCGAAAAATTGCATTCGTCGAAACGAAAACATACACAGACACCTGAAAATCAAATTAGAAATCG:1 + chr2L 20503626 5' + Doc 4424 1 69.09 TGTATGTTCGCCTGGTATTATTTAATTAATTTTTTCCGAATATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTAGTTTTTATTAGCAGGGT:1 + chr2R 13569360 5' - I-element 379 1 59.09 GTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATACCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTG:1 - chrX 22824241 5' - Gypsy12A_LTR 2257 1 54.55 TAATCAAGACGACCCAATTAAAGGAAGACTCCACAATAATTAAGACAAACCTATTGAAGGAAAACCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 - chr3R 1220404 5' + copia 4891 2 60.91 AAAATGTGTAGTTCATACAATTACTTCAAGTGTTGATCCCGACTCGCCAACTGCCCTCACTCTGATTACATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr2L 4013099 5' - pogo 2097 1 76.19 TGGCTGCCATAAATTTTATTTATTTATTTATTGAATATGTGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3L 12640757 5' + F-element 43 1 58.16 ATAAATCCTGGCCAGGCTCAGACTGCCAAGCCTTAGGTGGTTTCGTTTGACGTTGGCGTGGTGTCCAGCGATGAGACTATAATT:1 + chrX 5882754 5' - TART-C 298 2 50.00 CATTCCGCCCCTCAGACTCCTGCCATATTTTAACTTTATTTTCCGTTTCATTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTAT:1 - chr2L 18439995 5' - F-element 4659 1 63.04 GTTGGTACACCCCATCCTCGATCCCCAAAATCGCCCTCCAGTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGGGTTTATTGTT:1 - chr2L 17493291 5' - HMS-Beagle 6662 1 54.26 GACCGCAGGATGCCACACAGCTAAGCTGGCGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2R 13313445 5' + hobo 41 1 68.00 GCAATAAAACAGCAACAAAACAACAAAAAAGAAAAAACAAATTATACAAATCGTGCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGCAGCTGTGGCCGCGTCAG:1 - chr3L 8439468 5' + pogo 496 1 56.48 AAGTGTACGTATATGCAACAAATATGCAACTACAACATGCCGGCATATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAAAAGTTGAGC:1 + chrX 13495483 5' + Max-element 8246 2 70.19 CATATTAGAAGTGACTTCACTTTGGCTTGTAAAATTAGCTTAATTTTATTTTTTTTTTAAATAATT:1 - chrX 621325 5' - TART-B 10629 2 84.85 ATTAAAAAAATATAAATATAAAAATAAGTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCGACTTTTTTGGTG:1 - chr3R 8811226 5' - 1360 3338 1 74.53 TGAATGAAGACCCACACTTTTTAAAACGTGGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 13024054 5' + 412 7095 2 68.69 AGTTCCTAATATCATTTCGATTGTAGGAAAAGTCTACAAGGGACAGCTCCTGCAGCCAAACAAAAACGCTCAGAATAATCACAAAAG:1 + chr2L 10253642 5' + Porto1 4344 1 70.11 TTTGCCTGCCGTGCATACAAAGCACTTGCATTTTTTATGACCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr2R 9754711 5' - 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FB 974 2 58.33 CCTGTTGCAGCACCCACACCCATTAAATTGGCTCCCCACTCCTGTGTAGTTTATTATTATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 - chr3L 16301138 5' - mdg1 407 2 52.50 GTTTTTCTACTCAATCAGTTCCTGAACGAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 + chr2R 11273967 5' + Stalker2 20 2 60.91 ATAGAGTTGCAAATCAAACATTAAATAGTATGAGGAAAATGCAGAGGCACGAACAACCTCTGCAGCTGCG:1 - chrX 15122772 5' + invader4 106 2 65.71 AAATAAAAATATGCCTAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATGGTCTAGAAGGTTGATGGCCAGG:1 + chrX 13256501 5' - G2 2876 1 80.00 GACGTGTGAGTTGCATGCTAAAAGCCACGAGTGAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGAGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAACAGCACTGCGAACAATG:1 - chr2L 9739827 5' - Cr1a 234 1 71.03 AAATAAATAGCTAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 - chr2R 21592047 5' - Tirant 350 2 66.36 CCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 - chr2L 19129380 5' + FB 37 1 66.30 GGGTTCCCATTCCATCTGGCCACAACTGGCCAGTAACTCCAACGCCGACCGAACAACAAAAAAAAAAGGAAAAAACTTT:1 + chr3R 28595693 5' + HMS-Beagle2 491 1 82.28 AATTACATACGCTTAACGCTTTCCGTTATTCCTGCAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTC:1 - 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chr3R 16771650 5' - F-element 384 1 58.18 GACGCAAAGGGAAAACTAAAAGCAAGTTGGGCGGGTAAATTGCATTTCACGGGTCCCACGGCCACACATC:1 - chr2L 1859478 5' - Cr1a 4438 1 60.00 GGAGAACTGCATATTTGCATTATTTAATTGACTCGTACCTTTCCTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGCCTCACAACG:1 + chr2R 20924213 5' - mdg1 389 2 57.84 GGTTACACAGTGGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGAGTAACG:1 + chr3L 25272512 5' + 1360 10 2 76.15 GTTTTTAATTAATTTAAAGTTATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCA:1 + chrX 21261713 5' + 1360 129 1 74.70 CAAGGATCTTCCAGCAATCAAGGCTCATCCAGCAATCAAAGCTCATCCAGCAATCAAGGATCGTCTAGCAATCAAGGCTCGGCTAAAAAAGCCCTAATTCTAAATTTC:1 - chr3R 17157984 5' - copia 488 1 71.30 AAAGGCGGTTCAATAACCGACCCCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr2L 6243684 5' - 412 7517 2 67.95 TAACCAGAAAGTTAACTTGAACTTAAAATAAAAGTTTGCTTCGCTTTTTTCGGTTGGCATTTTTTGGTTTCCTTATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTGTGTG:1 + chr2L 17021645 5' - Transpac 322 1 68.18 AGCAGCAGCCGGCAAAAGTGTAAAATAAATTGGCAAATATATGCGAAATATCGGGTATGAAAAGCCAAATGAGTAACCTGTATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGATC:1 + chr3L 4744621 5' + 1731 450 1 64.22 GCAATTGACACAAATCTAAGTCAGGGAGTCGGCACTTCAGCCTACCACCAGCGAAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCG:1 + chr3L 16336804 5' - Cr1a 379 1 53.75 CTTTCAATGACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCAC:1 - chr3L 3240611 5' + diver 3 2 75.26 ACCCAAGTCAACCCACTTTTGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGGTATT:1 - chr2L 14214113 5' + I-element 480 1 80.00 CTCTCTCCCGCTCTTTGTGATTGTAATTGATTTCTGATCTCTGCTCCGACGACTCCGGCTCAGTTGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTG:1 + chr2L 5805320 5' - Quasimodo 72 2 78.02 ACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCCAACTTTTGCCCACCCTTTAGATTTTT:1 + chr2R 23000262 5' + FB 224 1 56.88 CTCTTACTATCTTACAAAGACTCGATGATCTTTCTAAGAAAAATCATAAAAATATTAAGAAAACCTTATTTACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTAG:1 - chr3L 17742575 5' + blood 7214 2 70.75 TCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTTTATGTTTATGTCTAT:1 - chr3R 22081601 5' + 412 7127 2 33.71 CCATTAATTGGTAATTAAGAGCTTTGCATTTTTTGCAACGTTTTCATGTTATATTTATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chrX 3092017 5' + opus 7142 4 57.27 CAGAGGACGGAAGCGAAGGACCGCGCGTCCTGAAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGGA:1 - 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invader4 28 2 52.73 CAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATCTCTTATGTAAATG:1 + chr3R 9481228 5' + roo 8713 2 77.66 ATTTGGGTTGCCAAAACGGACTTTCCCAACACTTTCCCTTGTTTTTATTTACATTTCGGTTTCAATATTACTATTTCCAAGCTGTATTCAAATAATAATATCGTTAAGGC:1 - chrX 21191196 5' - 1360 307 1 64.55 AAGAGGGACAAGTCGACTAGTCTGATGATCTGAAGATATGCATTTAATGCGTAATGGAAATAATGATTTATTAATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGCT:1 - chrX 5020279 5' - Idefix 7085 2 71.82 CACAAGGGGAAAATATCGTGACGTTGTCTGGCAAATTATAAATGTAAATTAAACATTGAGACCGCCCATTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTA:1 + chr2L 1735532 5' - 1360 15 1 77.06 ATAATTATATTTTTTAAGTACGCGCCCCAGACAGAAACAAACAAACAGCGTGGGTAGATGGAAGAGCATAATCCTGCCGCAAGGAACTTTGTGCCACATTG:1 + chr2R 17355638 5' - G5A 391 2 77.23 ATACAAAAACAAAAAAAATTAAAATCAATAATTTTTTTTCAATAAAAAAAAATAATTTTAGTTATCACTACTACAAAACACAATTCACAAAAAAAAAGAAAAATAATA:1 - chrX 19352960 5' + gypsy7 5005 2 62.96 CTGCTCCTCGCCAGCATTGCCAGTTGCCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACG:1 + chr3R 28902444 5' - roo 50 2 73.74 GTTTCCACCCAGAGAGTTTTATATAAAAATCATACATACGCTCATATAACCGCCCAAAGCTACCAAGCCCACATATTTGAACTTTTTTTGGATTTTTTTAAATTTTTAAT:1 + chr3R 20967662 5' - frogger 239 1 60.00 AAAGGAATCGTTTAGCTTTCAAACAGCAACAAACTTGAAATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 + chr3R 25859610 5' - 297 6934 2 67.89 AATTTACCCAAACCGGGAAAGAGATTTCAATTTTTTGTTTTGACTGGCCCTGAAGATGCGCGTTTCCTCCAGGAGTCTAAATGACTGCAT:1 + chr3L 4078438 5' - G7 96 1 64.44 TGTTTGTGATGTACACATAGCCATATCCGGAGAAACACACACAGGCCACTAAAAAATTGGACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTAC:1 + chr3R 7660783 5' + hopper 1038 1 57.27 GTGATCGGCATCCGCGACGCAGAGTGCCGTATTAATTCGGTTGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTA:1 - chr3R 1465928 5' - gypsy5 368 2 63.64 CACACCACCGCCACCACCAAACGAAAAGTGCCACACGGATCCAGTTCCACACCTCCCGCCCAACCGTCCAAGGGCGCTGCCGTATATCGTACAGC:1 - chr3R 21491697 5' - Cr1a 4397 1 60.00 CTTGATATGCTTATCAATAGCTACATATGTATGTAAGTTCATGTATACATACAAGTTAGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3R 31965169 5' + 1360 26 1 52.29 GTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATCATTCGCCTAGCTGCCTCGAGTACNTTGCACA:1 + chrX 18483172 5' - pogo 2084 1 60.00 GAGGGAGGTGGATTCCGAAAGCTTACCATGAATCATAATAAGATATAATTTATTAAAATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr2L 18749926 5' + pogo 21 1 63.81 GTTTTTGGATTAATATTTTAGAGTTTATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTT:1 + chr3L 10818548 5' - I-element 140 1 74.51 GAGCTTGCAGCAAACTCTGCACAAAAAACAAAAAAAAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTTCTGGAGGCATGTGTACCGC:1 + chr2L 9127469 5' - hopper 85 1 73.74 AACAAAACGTTGTCGTCGTCTCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATC:1 + chr2R 22154356 5' + gypsy5 7002 2 73.75 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACACACACAAAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 416 4 56.47 CCAAACAAAATGGCTGCTGTCCCCGGAACACACACATACAGTTTGTCAAGAAAATGTTTA:1 + chrX 21183317 5' - S-element 1715 2 63.33 CGGATCTACAACCCTCTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3L 16496236 5' - P-element 2829 1 21.00 CGTTTTTTTTGAATCTATCGTATCTCTGTATTGTAGCTGTGACACTCTTATTCATCTCAACAAAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGAAAAA:1 + chr2R 6433220 5' + Circe 7377 1 89.11 TTTTTTTTTGTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATATTTAATATGGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTT:1 - chrX 12816954 5' + Cr1a 4339 1 60.00 ACATGTACATATATGTGTGTGTGCAGTGGAAAAACTGGTGTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAA:1 - chrX 9455820 5' - S-element 1675 1 62.73 CATACTGGGTGTGAGAGTGAGGAACCACGGGACCGGCAGGTTGACAAGTAAGGAACGAACTCCCCGCCCAGCAAAAAACTTATTAGGGCATTA:1 + chr2R 19816909 5' + Doc 4571 1 52.69 TTGATGAAAATTCTTTTGATACCCCGAAAACCTTAATCACTTTTGTTATCTACCTACGTTTAGCTTGGGCGCTGCACTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTT:1 - chr2L 13957725 5' + diver2 204 2 63.64 GTTGGATTTACCGGGCTTGAAGTTGTACCAAGGACTTTAGAAAAACAAGATGCACACGATTTTTTCACCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr2R 5028753 5' + 1360 63 1 57.30 GACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGAGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 - chr2R 5250069 5' + Burdock 54 2 73.64 CGAATAGAGAGTGAGAGAGCAAGTTGCAAGGATATGGAGCGCCCGAAAGTAGGCAACAAATTGTAGCTGCTTGTGCGTACAGTGCACTATGGGGAATTTGGCCTGTTTTT:1 + chr3L 10702587 5' + hopper 5 2 74.55 AAAGTACAAACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAA:1 + chr2L 20928052 5' + Chimpo 20 1 59.63 GTAAGTCAGCACCTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2R 24031475 5' - 1360 3361 1 60.00 CATGGCCAAAGGTCCCAAGAAACTTTGCTCCAGTCCACTCCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTT:1 - chr2L 8642049 5' + mdg3 63 2 63.64 GAATACTGCCGCGCCGTCAACATTAAGTTTGCCAAATGAAAGGATAAACTCTTCCAGAGATTTTACACGATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 12452917 5' + roo 15 2 68.18 ACAAGTTGCCGGCCGAATGCCATTGACCATCGCCACCAAGCGGCCTAAACGTGATCGCAAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTAC:1 - chr3R 23676256 5' + G2 2956 1 57.27 TTAAAAATATTACAGGAATAAAAGAAAATGCTATAGTCGGGGATCCCGACTATCATTTACCCGTTACT:1 - chr2R 5148128 5' - INE-1 550 1 91.18 TTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAC:1 + chr4 1294992 5' - HeT-A 6052 2 72.29 CGACGGTGCGTGATGTCTGCATCGCGTCTCCATTTCTCCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATAAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTG:1 - chr2L 741962 5' - mdg1 314 2 63.81 CGGCCAGGTGGTTGTGGTGGGTCTCCCGGCTGCCTGCATATCTCACGCTGTGTCT:1 - chrY 1428633 5' - G2 2829 1 81.82 ATTAATACTATCATTAGTATTAAAGCAATAATTAAAATTTTTGTCTGTTAATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCA:1 - chr3R 19449812 5' + gypsy4 309 1 76.24 TTACAAAATAGGGGAAAGTAAGGGGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCCCTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr3L 805267 5' - 1360 3333 1 79.05 TGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr3R 12039975 5' - 412 7509 2 88.75 CCACTTAAGTGAATAAACAACTTCATTTAATAAATTAAAAAGGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAA:1 + chr3L 18370438 5' + Idefix 268 2 63.30 ATCTCGCTACCGTGCTAAGGCTGCTTTTTAACATGCTCCTCAAAGTGTGCTACATAAAATTGCACAATATGCGCATTTTTTTATTTCGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr3R 17927534 5' - jockey 4986 1 69.09 AGTAGATGTGGGATAGCGAATTCTTAATATACTCGTACGTCAGAAAGTAGATAATCGTGGAGGGTTTTATATGTGTTGTCTATTGTTGGGGAAGATCGAG:1 - chrX 19612411 5' - G6 1894 1 64.00 AAATAAGTCTAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2R 9871015 5' - roo 401 1 73.64 GAAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTA:1 + chr2L 19364078 5' + BS 4758 1 28.57 AAGGATGTGGTCAAGTCATTGGACTCTGTGGCACTTACAATATTTCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATAGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2R 9963731 5' + pogo 38 1 59.09 CGTTGGTTAGATACAGCTCACCTCTAGAGTGCCAGATGTTTTCTCGGGCCAGGAGTGGGACTGCAATTATTGCGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3R 27795426 5' + roo 8667 2 73.27 CGCAAAAGTAACTTTCTAAAGAAGTGAAGAACCTCATCACATATAACAAATAGGTTTTATGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAA:1 + chr3R 23666791 5' - X-element 4517 1 66.67 CTTCTGTCTACAGGCCTCTTCTCTCTTCTGTCCCTGCCCTCATTCGCCTCTCTTTTCTTCTCTTTTCTTCTCTTTTCTTCTCTTTTCTTTTCTTTTTTTTTCTTTTCTTT:1 - chr3L 19908467 5' - Doc2-element 225 2 53.64 CTCCATTTCCAACCAGAAACTGATGATACAGCAAGGCTCTGCAGGCATTGGCATAAGTAAACTCTTTTCTTCATTAAAGAGAAGAAAAGTAAAGTAAAGCCAAGTAAATT:1 - chr3L 12805445 5' + TART-A 13130 1 59.09 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCAC:1 + chr3R 21907535 5' - Rt1b 5005 1 21.90 TGGGATGTTGGATGTTGGGGCGGTGGAGAACTGCCATCGTATCGAGAGCGTGATAAAAATCGATAAGATATCACCATTCAACACATTTTTCTAAAGTGTGGGC:1 + chrX 16115448 5' - INE-1 256 1 54.37 CAATAACTAACATGACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 + chr3R 7588862 5' + F-element 44 1 61.32 TTCAAAAGGCTATGAACAAATTTAGCACTTTAAATATTGACACTTGTTATATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 + chr2R 17900165 5' - Juan 4180 1 57.27 CTTCCGGAAAACACGTTCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCACAGCTAAGA:1 - chr2L 5693208 5' + Ivk 240 1 77.11 AGATCCTTCGCTCGATTCTTAGATTCATGTGAAAACGACTTCACGCAAATTTTGATCATCATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTTTATTATT:1 - chr2R 4265444 5' - flea 244 2 57.27 TTAAACAATTTTAAAATTTATTCTCATGTTATGCCCCAATATCGATATCTCAGAAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCATTCATACTAGCTGATTAAAGGGTATCTGATA:1 + chr3L 4772501 5' + INE-1 546 1 80.91 GTTCATATTAAAGTAGCGCTAGTAGCGATTCTTCGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 + chr3L 22108088 5' - Transpac 276 2 56.88 TATAAATTAAGTTGGATTACTATAGCCGTTAGGCGTAAAACAAGTCTTCAAAAGCAGAATGGTAAATTAGAAACAAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTC:1 + chr2R 8483963 5' + Porto1 4400 1 54.55 TCAATTAAAACGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 21199711 5' + jockey 22 1 50.00 CTTATCATCCATCAAGCAATGAATATCAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1 - chr3L 15819397 5' - pogo 2045 1 78.18 GTCATTGAGCTGCCGCCTTAGCGAGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAA:1 - chr2L 20526088 5' - hopper 1356 1 75.45 TATGGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGC:1 - chr3L 19948903 5' + 3S18 5820 2 70.91 CATGTCTTACATTTTTTTGAAATATTATTTAAAAAATTTGAGTGGCCGAAGACAGCAAGAAGATGAACTCGTAAGAGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTTTGGTGCAAG:1 - chr2R 25035455 5' - hopper 488 1 75.45 ACCAAGGGCCACTTGTCGCCGGAGGAAAACCAAAAGAAGAAGCCCACACGGCCCTCACACACTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 + chr2R 23232268 5' + jockey 4800 1 51.85 TAAGTTGCTTTTCCTGCTAACAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTT:1 + chr3L 5158421 5' + I-element 4997 1 81.82 AGCTTTAAAAAATATAAAAAAAACACCATTTGAGATGTGCCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCCAACGATCGCG:1 + chr2L 5730664 5' + Doc3-element 363 1 62.37 AATGTGAATGAAATAGTTTTGCCATAGAATTTCCAATCCTCAAAGGAGATGGATGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 - chr3L 16682093 5' + FB 9 1 71.15 ACCCGATCCCACTTCTGATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAA:1 - chr2R 4161583 5' + Doc2-element 491 1 57.45 CATTTGTCTTACGGATGATCGATCGAATTAGTCGTTATATCGAATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTATCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr2R 10129815 5' - Burdock 217 2 59.81 TCAAAAACAAACATCTGTGGTTGATTCAACTTCTAATCTATTAAAGAGAACAACAGAAGATGTTAACTCCAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAATAGATCAAGCTT:1 + chr3R 19448670 5' - Q-element 364 2 71.82 CCCGGCAATATTGTCGCTAATCAGATTGTAAATTAATTGTCGCCATGGGTGTCATTTAAGCCCATTTCTCGTTCGCTTTTACACTAGCTGAGTAACGGGT:1 - chr3R 21757857 5' + INE-1 538 1 68.00 AAGACTCAGAGAGCGGTGTATGAACCCCAAAACCCCTGGGGTTCGCTGCCCCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2L 17574361 5' + hopper 10 2 61.11 AATATAATATAATATAATATAATATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATCTTGGGAAG:1 + chr3L 20525228 5' - 1731 4593 1 76.25 GCGGAGCATTTAGCCAGCAGTCCTACTCTAATTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr2L 12036196 5' - 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I-element 4901 1 51.02 AGAGTCGTCAATGTGTCTGCAGTTCAACTGAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chrX 18483160 5' - pogo 2097 1 60.94 TGAGTACTGTTCATCCTCTGTGGATGTCGGTCGGATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTTTGACTTTTATCCTAAG:1 + chr2R 8244682 5' - Quasimodo 98 2 58.70 CTGGGCGTTCATGTATAAATAATTTGAAATTAATTACATGTAACAGACTACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGCTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAAC:1 - chr2L 19681490 5' + hopper 31 1 50.48 CAAATACATCATAATTTGTGCTGACATTATGTAAAATCCTATTTCTCGAACTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAG:1 - chr2L 16072135 5' + X-element 240 1 62.73 GTTCTAAAAAATCTAAAATTCTCAGAAATCAATTAAATCCTCAACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCAAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr3R 27071838 5' + jockey 4685 1 61.82 TACTCTTTTACTCTACAAGTAACTGGTATAAAAAGATGTATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 + chr2L 22140081 5' + Burdock 6181 2 66.36 GAAGTTCTACCGTGACCAGCTCGGCAGCATTATTTGGTCAAAATATTTTAATTCCAATTTAGATGGGTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGC:1 + chr3R 15840169 5' - Juan 386 1 64.00 GAGGGCGCACACCTCTAATGCGACCTCAACGTAAAATAATTGCTGACCAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chr3R 5910759 5' - roo 9035 1 59.09 GAACATCTATTACTGCTCTGAACCCATCCGCGATTTGGTGCTCAACAACGAAAACAACATTAAGATCATCAACACGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGG:1 - chrX 4111917 5' - Doc 448 1 69.72 TTTAAATTAATTTCTTCTTGCATCACCAACATGTTTCGTCATTATCCAAATCCATAATCTGAATTGATTGCCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr3L 14261386 5' - mdg1 405 2 65.45 ATTTTCGTTGCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAAT:1 + chr3L 16291850 5' + jockey 4806 1 66.36 TTTCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTTTCCCTCTCCCTTTTCCTTTTCCTTTTTCTTTTCCTTTTCCTTTT:1 - chr3R 29369890 5' - Doc2-element 239 1 33.33 AATCTCGTGCGAGCCAAACAAACATTAAGTTACAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTG:1 + chr3L 15692841 5' + F-element 4337 1 62.35 TCGCCTTGATGAAAGCAGGTCGACAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTT:1 - chr3R 19536990 5' + 1360 3386 2 71.95 AACTATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATCCCCGTTACTCAGCTAGTG:1 - 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Stalker3T 204 1 73.64 TGTGTATGCCCCAGCATTAATCAATCCCAGTTTGTGCGTAAACATGCGAAACTTTCGACCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCTCGGTTTTATGAAA:1 - chr2R 24508870 5' + Q-element 204 2 58.18 TGCGTTCCTCGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 1291041 5' + 412 7095 2 64.42 TGAGGCAGGGGACGATGAACTAACAAGTATTGAACAAGAGCCAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAA:1 + chr3R 3596877 5' + Bari1 1650 1 53.33 CGAATTGGCCAAATCATATTTCGGATATATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGC:1 - chr2R 9143297 5' - invader3 5404 2 68.89 AATATAGAAATGTGAATATTTTTCACTTTCTTAACAAATACCAATTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 + chr2L 21191353 5' - 297 379 2 61.11 CTCCTCTGACTCCTTTTGCCCAATATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTGTAAATAAGAACAATGATGTTTAACGGCAATGAGCCGG:1 - chr3L 16692948 5' - gypsy 275 2 76.29 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGGGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAA:1 + chr3L 27396714 5' - springer 394 1 72.37 AGCGCTAGTAGCGATTCTTCGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3L 22108102 5' - Transpac 261 2 68.18 TTAATTTAAAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 12039931 5' + 412 40 2 59.09 AATGTTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGA:1 - chr3L 15968252 5' + P-element 18 1 58.06 CATTAACGAAAACTCATCGACATCAATTCTGGCAAAAGACCCTTCCGTGCCACCTATCCACCTTTCCACCTTCACTTTTCCTCTTTTCCCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 2777588 5' - Bica 341 1 80.20 CGAAAGACGACTCCAATACGAATATTTTCTTCACCGAAAGCGCACTTCCGGTTATCCGGCTCGAAGGACCAATTTTTATGTTTATAAATA:1 - chr2R 18720124 5' - 3S18 350 1 60.00 GCCAACAAGGAGCAGCGCCAAAAAGCAAAGACAGTGAAACGAACGAAATGGCCATAAACTTAACCAAACTCACTTTTTAGAAAATAATGATCATTTCGGAACTTTACGTT:1 + chr3R 16746153 5' - HB 242 1 59.09 ATTTAGCCAGCAGTCCTACTCTAATTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - chr2L 12036189 5' - 297 6950 2 59.09 GAAATCACAATTACAAGAAAGTAAACTTTGATTTGAAAAATTCGAATAATAAAATAGATCATATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr2R 10859706 5' + 297 12 2 70.09 CATAACTATTATCATAAGTGACAAGTAATAACCTTAGCACTCTCGTAATAAATTTATTTACATTAAATTTAATTTGCACACCTACTAGCTGAGTAATGGGTATGTGATAG:1 + chr2R 16287457 5' + INE-1 547 1 75.45 TATGCGGCCGGATTCAGGTCGCACCGCACACATATACGCGTTCTCTTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTT:1 - chr3R 8756742 5' + 1360 3268 1 71.74 ATCAAATAGGATAGAATAGAACGAAGCCGAAGAAATAACTGGTAGCTACACGGCTCCATTTTTTCATTTTTTTTTTCTTTTTTT:1 + chrX 5924442 5' - transib2 2641 5 61.90 CAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTTGCAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAA:1 - chr2R 5410956 5' - FB 748 3 76.19 CGAAACAGAAACAGTAAATGTAACATGTGAGCATTGGGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGACAACAATTAATAAGATTAAGAAATT:1 + chr3R 17789840 5' - gypsy12 10080 2 62.63 ATATTGTCTTTGGGGGAATCGGATTCTGCAACTGTATCTGGAAGATATGAAATTGGGCAGAAGAAGTAAGTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGGGCCTAAAAAGGG:1 - chr2R 19623010 5' + hobo 186 1 71.30 TGACCACAGGGAGGATCACCCACTCGAAGTCCAACAGAAGATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 7400804 5' + roo 14 2 50.00 TATTACTCAAGTTGGCATGGACATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCT:1 - chrX 5859362 5' + BS 49 1 73.81 AATACAATACAATACAAAACAATACAATACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAAACCCCAATTCTCGAGGATCATATAACAATCTT:1 - chr3L 21448026 5' - Idefix 6939 2 66.36 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATGGATATGATGTCTTTGCTTATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGC:1 + chr3L 22908067 5' - Ivk 390 1 61.45 TGGTCTGTAATGAATTTTTTTAGTGTTGTGTATTTAATATTTTTAATTTATTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATAATGTTTAATTATATTTTATAAAAAAATTGCGTT:1 - chrX 11529764 5' + S-element 1628 2 75.45 ACAACTTTTCAAGCGTTAAAGCCGCAATAAGTCTCCAGACGCCATACTCTACACAGACATAAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAA:1 + chr2R 16458909 5' + Stalker 6821 2 62.04 GAGAGTGAGAGTGGGTGGCATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCG:1 - chr2L 20438820 5' - Ivk 5024 1 75.38 TATACACTCAAGCCTCATAAGCTCCAGCTTCCAAGTTTACACACTTTTGTGACTGTCAAGAAACTCTTTACAAATTTTGTTTTCCTAGTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAG:1 + chr3R 13272537 5' + S-element 250 1 74.55 TGTATTAGATAGCGAGTGAGGCGCTTCCATTTTCAAGGGTTCGCCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTG:1 - chr3R 13825200 5' + R1A1-element 5254 1 60.87 CTACCACTCCCCTAGAAGTCAACCCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCG:1 - chr3L 14181793 5' + Transpac 172 2 69.74 GAGACTTGAACGAATCCAAATTAAAACTTCTAAAATAACGCACACTTCTGCGACGACACTGAGAACCATCACTTCCTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGACACCTGA:1 - chr3R 9428629 5' + Doc 4406 1 52.73 CGATTTCATTATTACATATTTGGCGATTGTTTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chrX 17456094 5' + jockey 4711 1 63.74 CTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 - chr2R 23354366 5' - Tabor 458 2 51.82 GGTATATTTTGTGGGATGGCTGCACAGGACCAACATTAATTTGCTACAATATTTAAATTTGAATATAAAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3L 18095586 5' + I-element 19 1 65.14 ATGTATATACATATATATATTTATTTATAATATATTAAAATATTGTATATATTTTTCACAATTATTATTGATTAATTTTATTTATTCTCACACTAGCTGAGTAACGGGTA:1 - chr2R 24046184 5' + INE-1 539 1 32.73 TTATATTATATTATATTATATTTCAGTATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAAC:1 - chr3L 20525228 5' + HMS-Beagle 54 2 73.64 TATTTGCATTTTCCTCAGCGGCCAAGCGACTCTAACTATTGTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr2R 23230649 5' - 412 456 2 58.00 AGAATTATAATAATAAATAAGGCACAAATAGGTTGTATTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 5617441 5' + Transpac 4956 2 61.54 CGAAATTCAGAGACGTCAGCGGCTGCGGGGCGCCCTTTTTTTTAACAAATTTTTGATTT:1 + chr2R 23669431 5' - HMS-Beagle 330 1 44.07 CGCAGAGTGAAAGTGAAAATGCAGCGGCGGAAAAACACAGCTTTTCTTTTATGCAATTGTTCGGTGGGGAAAAGGGAAAAATACAAAAAAAAAAATAAAGAAA:1 - chr3R 6271240 5' + G2 3075 3 68.93 ATATAATATATATATATCCTTGCAGTTATTGTCTATACATATAATAAGTGGGTTATACCAAACACTAGAATAAAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGCCACTAT:1 - chr4 613465 5' - 1360 3356 1 79.09 TGCCATTTGCCCTTTTTTATGGCTGGGGAATTTTTTTTTTTGTCCTTTTTTTT:1 + chrX 5820614 5' - Doc2-element 235 2 62.26 GCTACTAAGCCACAAAACGAATATGCTCTCCTGAAACCACCTTCCACAAACATGCGTGCACCAACACTGAACGCATCTGGATGCTCCACGTT:1 + chrX 14911193 5' - 1731 478 1 72.83 TAAACAAAAGAGTCAAGTCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGGTGG:1 + chr3L 13677443 5' - Quasimodo 298 2 68.18 TTAAAATGGCCAGAAATCACCACAGCAATTGTAATGTTTAAATATTCAATGGGCTCGAGCGGAAAGTATTCAAACCCAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCA:1 + chr3L 10836493 5' - opus 496 2 79.09 TATTTGGACTACTTCGCGTATCCATGTTAAACTCCACAAAATGCCTACGAAATAATCAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACT:1 - chr3L 13785564 5' - S-element 1512 1 60.00 AAGTTGCGCCCTTGGCCCTGTGGGGCTCGTCATCAGGACATTCCACTGCGGAAGTAGCCCATGAATAGCAAAACTATAGGTATAAGTAAGAAAGTTAATCATATAAATAA:1 + chr2R 18202482 5' + transib2 85 1 55.45 ACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACA:1 - chr2L 8476738 5' - Juan 4152 1 79.63 CAGCCAAAGCCAAAACTGAATTACTAAAAATGTTTGAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAA:1 - chr3R 11173171 5' + Burdock 286 1 63.64 TTCTTAAGTGCAAACAATCATCTAACCAGATTCTATTTCCTATCTATTATATGCTGACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGA:1 + chr3R 24260871 5' - roo 9046 1 56.19 TGTACAAGTTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACACTGGCCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTAAGCTATAAGAATAATTT:1 + chr2R 3097969 5' + Gypsy6A_LTR 136 1 55.56 GATATAAAACAGCAAACGTAAGTGGATTGTATGTATTATTATGTACACTAGTCGGCATACTTATGCGTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTG:1 - chrX 22853802 5' - gypsy5 7334 2 39.05 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2L 16217660 5' + 412 38 2 56.36 GGCTGGTTGCGAAAAGTATGTTACAATTATTTTCATCAAAAAACCAGCCAGCGAATTCCCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCG:1 - chr2R 14650668 5' + jockey 14 1 67.78 GATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGGGACCGTTTATTGAAATTTATCATTTGAAACTAAA:1 - chr3R 12040196 5' - HMS-Beagle 6985 2 71.30 GAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACTCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAAAGTACATACAT:1 + chr2R 11273994 5' + Stalker2 7288 2 58.25 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAGTGACAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAAGACCAAACAGCACTGCGAACAACGCAACA:1 + chr3L 22908067 5' - Cr1a 229 1 78.90 AATAGAGAGGAATTTCGCGTGCGGAATGCTAGCGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACGTCCTAAAAACAGATGCCATCG:1 + chr3R 12538385 5' + G2 333 1 72.73 ATGCTCCAATCTACCTTGTAGTTCATCAATTTTTAATGCATACCCTGTACTTGTCGATTATAGTTATCTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 10090986 5' - roo 394 1 67.27 GGGTAGTGCAAGGTGGTTGCATCATCTACGTGGTGCAGGTGTCACGCCCAGTTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTTATGGGTAC:1 + chrX 7466392 5' - Quasimodo 262 2 65.22 CACTTGAGGGCGTGCGAGTCTCAATGGCAAAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 - chrX 5515634 5' + copia 4876 2 71.28 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGC:1 + chr3R 21907535 5' + Quasimodo 7037 2 43.24 CGGAAAATGTAAGCAATTAGCAACTGGCGACAAATTGACGAGGCCGAAACAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTC:1 + chr3L 744342 5' + 297 6498 1 65.22 AGGTACGTGATATGGGCCAACAGGTTTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGCGTAAATAGTATGTTGGGCGCCAGTTAATAGAGTTATGTTTT:1 + chr3R 8969673 5' - gypsy7 232 1 75.93 ACACACACAAATTCTATGTAGCTAAGCGAATTTTCCAAAAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 + chr3L 7846462 5' + 3S18 45 2 65.45 GCGATAAACAACAACATTGGCAGTGCCACACCTCCGCCTACGCACACAAACAAAAGGCCGAAAGAGAACTTTTATCTGACACTGTTTACCTTATCTCTGGAATCTTCATA:1 - chr2L 20922581 5' + Q-element 14 2 72.73 ATCGCCACTTTTCTCCTTGTATTGGACATGGCCAGCGGCTGGTTTTTATTTTTTAATTTTTTTATTTCCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 2294590 5' - Doc2-element 251 1 58.02 ATATTGTAGAGAGGATTTTGGATCGAAGGCATTATATGGGCCAATTACAATACTTGGTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGT:1 + chr3R 9321905 5' + roo 162 2 56.36 GCCGGTTGAGTGGTTCTCTCGTCGCGCTTCCAGGTCATCCCGTTAGAGCAACATTTAAATGAAACGCAATTTCGTGTTTC:1 + chr2R 8423415 5' + invader1 3627 2 60.00 GGCTATAAACTAAATATACATATAAGACGTTTAAACTCAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAGTGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGA:1 - chr3L 10232310 5' + mdg1 7398 2 63.64 CCAAAGGGAATGAAGGATGCAAGAAACGCTTTAACCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACA:1 + chrX 6927728 5' + accord 176 2 63.44 CGAGCGGACATTTTTTATTTGTGTCTTCGTTTCTTTTTCT:1 + chr2L 8415729 5' - invader3 5020 1 57.50 TCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3R 31458521 5' + jockey 30 1 56.98 AATACGTACCATAGTGTCTCGACTTTATTTTTTTTTTTAATTTT:1 - chr2L 5337794 5' - Doc 4698 1 90.91 TTTAAATATTAATGAACTTAATATTAATGGTCTAAAAATACTGCTCTCAGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTGCGGCCGGAAAATCGTCTTCTAGC:1 + chr2R 4719021 5' + 1360 3194 1 51.82 TATATCGAAGTGAATTTCCTGATCAGCTCAGCCTGATTGCTCTGCTGAACTCAATTTGAATTTGATTAATCCAACACCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAA:1 - chr2L 1819581 5' + Idefix 83 2 72.73 AAAGTATGTTCTTACCTAGACCGTCTTCCTTGCGCGTAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATGGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAGTTTT:1 - chr3R 25391395 5' - Bari1 96 1 75.45 TCCAACGCATTAGGTTGCAGTCGAAACACGAAACAGAACCAGTTAAACAAATGCAGAAACCAGATCAGATCAGAACCGAACAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGC:1 + chr3R 29598166 5' - invader1 46 2 79.44 TATCATTTTGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 11108139 5' - hopper 144 103 84.85 CTCATTTATTCTCCCTCCTTTAATATAAGCAATAATGCCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 3211973 5' + roo 8711 2 70.91 GTTCTGCAGAAGAACTATGCTCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGGTAGGG:1 - chr3R 31916206 5' - G6 1824 1 71.60 GTGTGTGTGGATTTGAGTGTGAGTGTCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCAACTTAACGTATGCT:1 + chrX 18009511 5' - P-element 2850 1 35.56 AAGTATGCAACGAATTGCTTGGATCAGATGATTAATTCGTGATTACTCATCCGGCTGGCAACGACAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr2L 3323201 5' - hobo 2933 1 67.02 TTTTATTCTTGGGTTTGTTGAAATTTTCAAGCTGTGTAAACAACGCTGTTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3L 15819332 5' + pogo 23 1 56.00 TTTAAAGCAATAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCACCTTAATTTGATCTGCTTAAATTA:1 + chrX 17456060 5' - jockey 4939 1 65.45 ATGTGCCGACTTCTGGCGGAGCTCAGTTACCACGGATTCGCCTCGGCCAATAACCTTCAGACCCTCGGCGAAGAGTACACGGGGATATAGATGAGCCGATATATGAATAT:1 + chr3L 1558976 5' + Bica 4887 1 79.09 AAATTATGCTGCAACTATTGTTTACCTTTACTTATTGGATGTTTTTCATTTTGCATCTGTTTCTCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTAT:1 + chr3R 13122363 5' - Transpac 4769 1 73.33 CAACACACAAGGCACTGGAGTTCGTTTGTGTAAGGGTGTTTAGTATACGTGTGTTGTAGTATATCTGCGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAG:1 - 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NOF 3958 1 67.27 CAAAAATTTAACCAAATTCAAAAAAAATCAATATCAGCGAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCG:1 - chr3R 11255710 5' + R2-element 3466 1 66.02 ACGATAAATTCGAAATATAAATAGTAAATAGTAGTAAATCTGCACTTGAGTCGGCGTATGACGCCCGCGAGCGCCAAATCATCCACCAGATCAATGACCTAGCACCTGCA:1 + chrX 16891760 5' + Doc3-element 346 1 59.09 GAGGGGTTCTTGGAAATGGCTGTCAGCACGGGCGCTAGCTCAGCATCAAGATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATA:1 + chr2R 7683462 5' + Tirant 359 2 60.87 TTTATGCACTCCTTTCCATATGTATATATGGTACATCTTTACTTGATTTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGAATCCACAATT:1 - chrX 15291812 5' - TAHRE 10392 1 56.36 TCTGTTTACATGGGATGCTGTTGGCATCATCGTTGCTTTTTGTATTTCTTATTTTTATAAATCATTCTATTTATTTTGGGTCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTC:1 + chr3L 8657185 5' - G5 4800 1 62.26 TGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGTGGTTCGCAAA:1 - chrX 20433401 5' - diver 6081 2 52.73 AAGACAGGCTTTTAAACGTAGTATGTAAAAGTTAGCTTGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCAAAGAGCAAATGCACTTGAATACAAGATA:1 - chrX 15002753 5' + Idefix 346 2 61.82 TAATTTAACTAGAAAACCGACAAAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCT:1 + chr3R 23394664 5' + 297 6542 2 72.62 CAGATGCTTTACCCATCCCTGGAGCCACATTTATTTCCCTTCTGCCGCTGGACAATTGCAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3L 15614517 5' + jockey 4688 1 60.82 GATTTACAGTTGAAAAGAATACTAAATTTAATATAATATACTTGAAATTGATAAACATTTTTGAGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAACGATAAGAAAAGTGAAA:1 - chr3R 24093757 5' + invader2 4743 1 66.06 AGCTGTTTAAAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCATCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr2R 9963563 5' - pogo 2062 1 60.91 CTGAAAAGACATCCTAAGACCAATAAGAACAATAGCAAAGCAAAAAGAGACCAAGCCAAGCCTATCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGC:1 - chr3L 20063066 5' + G4 22 1 68.18 ACTAATATTAAAAACTGCGCATTTCAATGGCGCCAAGCAAGTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr2L 18694009 5' - pogo 2061 1 61.82 AGCGATTTAAAGGCGGTTCAATAACCGACCCCTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGCCCG:1 + chr2L 6243676 5' - 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chr3R 17777658 5' - Burdock 220 2 61.32 CAAATAAATCCCTCAATAAATATTGGGTCAAGTACTTAGTTTCTCTGTGGCCCAATTAGTAAGGTTTACAACTGCATCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTATGGACGGT:1 + chr2L 1720750 5' - Cr1a 4003 1 74.55 AGCAGAAAAAATGCAGAAAAATAAAATGAAAAAATATGGAAAATAAACCAAAAATAAAAAAAAAACAATAAAACAAGAGAAAATGCTTTGGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 - chr3L 14564214 5' - INE-1 563 1 59.09 AAACAACTTAATTATTGTTTGTTTGCTTTTTTAAAAATATAAAAGAGACTCTTCGCAGTGGCTCTTTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGCAAAATCGAATTT:1 - chr2L 17393436 5' + FB 14 1 51.92 GATGGGGTAAATGCAGGAAAATCATTGTTAATAAAAATACTATTTTATTACATTATGAAATTATTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTT:3 - chr3L 18915231 5' - 412 470 2 60.00 GCGAAGAGAGGAAAGACGAAGAATGACCGTTGCGCAGGCGCAAAGAAATCAAGCGACGGAGAGAGGGAGAGCGAGCGCGAATGATTGCGTATACTGCTCTGTCGGGATG:1 - chr2R 16612092 5' - diver 382 1 66.97 TTCTCCGAGCTGGCTCAATAAAGAAATCATTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTTACATTAAAAATAAACTTTAAAAATATATTATTAAAAAA:1 + chr3L 18274213 5' - hopper 165 1 72.48 ACCATAGACCAACTCCAGACCAGCTCGTGTAGATTTTGGGGCTTGCAGAAACTGGAGGGAGGGCATTATTCGTGGAGAAGCCGAAGCAGACGCAA:1 - chr3L 1846605 5' + micropia 5326 2 58.95 TGTGCGCCATTTGTGGGACAATGTCAAACGTCAAAGTGCAAGAATTTGACAGCCAATAAACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACAAACT:1 - chr3R 30863115 5' + I-element 4988 1 61.68 CATATTTTTTGCACTTGACTTGTCTCTGAAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCT:1 + chr3L 19450960 5' - Porto1 236 1 73.64 ATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTC:1 - chr2L 21403525 5' + G5 4419 1 71.11 CATGATGATGGTTCCGAGTTTTTGCCTGCCGTGCATACAAAGCACTTGCATTTTTTATGACCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr2R 9754691 5' + hopper 8 2 69.47 TGTTGACATTTTTCGTGCTTTTTCGCCTTCTTGTTGCTCAAGAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGGG:1 + chr2L 13320927 5' + jockey 20 1 54.55 GAGGGGGAACGAGATGCCACCTTGGGCGCTGAGGTGCTGAGATTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCA:1 - chr3L 17452984 5' - Stalker 72 4 55.79 TGCACTAATTAAGCGGAAATTACCCAGGTGGGAAAAAAAGTCAGTTAACAAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 10203057 5' + roo 30 2 60.00 AATGAAAAAAATCTTGGAATACATCGGTCAAGCTTTACGCTGATCTCACCCCATGCAATGTAACACTCAACACCTCACATAATTGTACCTATATATTGCACACACT:1 - chr3L 24766278 5' + HeT-A 5983 1 52.83 CACAACAATGGAGGGATAACAAAGGAGCAGGAGCACAAAAAGAGAACAGAACCGAGGAAATGAATATAATGTAAAATACCTCTATTAAATATAAGTGTTAGAAGGATCTA:1 + chr2L 2023393 5' - Cr1a 4292 1 60.91 CCCGTAAATTTGAAATGTCATGGCGACTGTCGACTAGCATACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 - chr3L 9198515 5' + 1360 44 1 60.91 GCCAATTTGACGCACATTCTTATATTTACCTTCATTTGACGTCCCAGTCAGTTTTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCG:1 - chr2R 12507454 5' + invader1 3957 2 59.63 AGAGATACATATATTGTATACAAGTTTTTCTTGGCATTCGCCAAAATGGCAAATCGGTTATCATTGTTGGGCAATTTAGTTTTCTGTCTTGT:1 - chr2R 7377169 5' - Fw2 104 1 81.52 ATCCCAACATGCATTAACAATTGGGAATTTTGTTTTCGTCCTTTGAGCTTTTTCGGCAGGCCAACAGGAAGCGGGTTTGGGGAATGCCTCCGTTTTGCTGCGC:1 - chr3L 15758753 5' - gypsy5 180 2 76.70 GAAGTCGAGCATGGTTTTATTTTTGGGTCTGGCCAGGCCATAGACAAAGAAAACTTAAGTGGTCACTTGTGTGCGCGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTTGG:1 + chr3R 12059389 5' - Quasimodo 36 2 65.35 AAGTAATGCATCTGAAAATACACAATTGAGGCAACTTTCTAATTTCAAATCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCAAGTTCCCAAAAGCTCGGAGCCGCAATTCCGAAA:1 + chr3L 20441528 5' + Idefix 7079 2 62.73 ACACTTCTCCACGCACACCCTTAAAAACCTTTTGCACAGATTCAAGGATCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTACATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTT:1 + chr2L 17325660 5' + 1360 3171 1 51.43 CGGTTTTCCAAATTTAATCTCATTTAATTTGGAATTCAGGCAGGTTTGCTAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAG:1 - 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chr3L 1805936 5' + invader3 5051 7 70.91 CCAGATTAACTTTATGGGTAAGCCGACTACTTGAAAATGGCTTGACACTAGTTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 - chr2R 19064702 5' + INE-1 16 1 71.82 TAGACATTCCATTTTAGTATATGCCCGACATCTCTCATATATTCTAAACTTCCCAGGCATAAATATATGTTTTTCTACATCTATTTTTATCAATAGTTCGTTGGTTTAGA:1 - chr2L 18247136 5' - Bari1 1230 1 80.00 TGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTGTCTTTTTTTTTCTTTTCTTGTCTT:1 + chr2L 21768292 5' - invader2 4747 1 49.02 ATGTTTTGAAGGGCAGTTTTAAGAAGGCTTAAAATGAGTGATGAGAAAATAGTTTACTTTTAATTACATTACACAGACGCGGAATACTTATTTATAGTTATTTATTTGG:1 + chr3R 19513742 5' - Tc1-2 478 1 69.72 GTGGTAACAGAGCCAATTGAGGAAGCACCGAGTCGCTGGAAGCCTCAGG:1 - chr3L 2048997 5' - TAHRE 10076 1 63.27 TGTCAACGGAATTGCGTATCCAAATGGGCAGCGTACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr2R 25118085 5' + Transpac 36 2 64.65 AATAATAATCCGCCCGTGGCAGACGAGGAATCCGAACGAGAAATCACAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA:1 + chr3L 14921231 5' + mdg1 7075 10 55.24 TGGTCGAGTCATGATTAATTTGGCTTTTTGTGTTTATGGCCAAACTTTAACTGGACTTGCTTTGGTTTAGCTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTCATCGTTGA:1 - 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chr2R 19468824 5' - Idefix 7054 2 73.68 CGAGAGAGAGTAGCTTAGACAACGAAAGATAATCGCCTATCTGAGATGCCGTAGAGCGTAATTGCTGTAAGCGGGCGAGTTGAG:1 - chr3L 23335299 5' - Porto1 474 1 71.43 GTTTGGAATGTGCTTGTTTCTCCAAGTGTACGTCATATGTGCGGTGTAGCAATGAGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr2R 9138779 5' - pogo 2086 1 62.89 GATATGGCACGTACTCAAAGTCCACCGCCCACTATATATATCCTTATGCTCAATATATACATATATATAAATCAACCTGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr3L 16258898 5' + Transpac 9 2 73.39 GTGAACATTATGCAAACAAGAGGTGCGGGAATTGACACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCATAAACT:1 - chr3R 9924491 5' + McClintock 6123 2 62.39 GCAAAGCGAATCTTTCGTTTGCTGTTGCTGTACTTGCATTGTGCGTACGTGTGTGTATGCGTTTGTGAGTGAGCTAGGTGTACATTCTTATCTT:1 - chr3L 14028738 5' - invader3 130 2 73.40 TAGCCCTTACGTCAAACTTATAAAAAAAGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2R 16036046 5' + jockey 4711 1 73.91 GGCGCTCGTCTCCCATCGGTTTCGCTGCTCGAGCCAAATGCTTGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGATAGCCGAAG:1 + chr3L 131746 5' + P-element 20 1 53.93 TTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATCA:1 + chr3R 13423308 5' + rover 7000 2 77.00 CAGCAACATTGCGGTTGCCATTGTGTTGCTGCTGCTGCTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTTTTAGAA:1 + chr2R 11070713 5' - 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Porto1 4471 1 58.16 GCAGTGGAAATCACCGCTCTTCCACCTCACCCCGTATTTGTGTCCCACTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 - chr2R 13934489 5' + FB 15 1 56.82 TGTATATATATTTTCCGAATCCAAATCCATGTCATTTTCCCTTGCTCTGAGAACCAAATGCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAA:1 + chr2L 15812279 5' + I-element 119 1 67.37 CTTTATTTAAAAGAATACATTTTTAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2R 9963649 5' - pogo 2098 1 67.09 GTTTTGCTCCGGAATTCAATTCAGTTTATTGGTTTTCATGAATGTTATAATCTTGGGACCACTCGTGGAATCAGTCAGTTGATTTAAGATGAGGGGTATATAGTTACT:1 - chr2R 11645134 5' - Cr1a 4127 1 76.85 TATAATGTTGAATGCAACAATTTCTTGCTGCTACTGACAGAAATTTCAATCTTCATTTAGAGCAAGTGTAGTTTTGCCCACAACATTGTTGGAATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3L 2815027 5' + Doc 6 1 79.09 GTCGGTTAGCTTTTGACTATTACGTTCAGCCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCC:1 + chr3L 12769130 5' - Doc 4312 1 64.20 AACAAATGCTGCTTATGCCGAGGGATTGCGCCCAAAAGTACACTCGCAGAAAAAGTCACAAGTAGGAAAATATGTATATACAGTTTGTCAAGAACCTGTTTACACACTGT:1 - chr3L 9419628 5' - S-element 1707 1 72.73 CATGTTGCGGCTGTAAAAAATATACAATAGGTATATAAGACTTTGAAGGGGAGATCCCTTACTACTTTATATTTTATATGAATGGCCACACCTTTT:1 - 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I-element 110 1 62.73 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGATGAGATGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGATGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 205 1 53.64 ACAATGATTTGCTCGAAATGATTGCCGCCCTCTCTTGAGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGG:1 + chr3R 23276842 5' + INE-1 537 1 73.02 TGTTGCTATGCATTGAAGTTCCTTGATTCTTTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGC:1 + chr3R 24657946 5' - P-element 163 1 32.73 CGTATGTGAACATACGGATGCGGATATATGGATGCTCGGACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTTACACGCCGCAA:1 - chr3R 26398266 5' - 1360 427 1 58.70 TCGGCGGTCTTATTACTTTTAGTTAAGTTTTTTTTTT:1 + chrX 17209058 5' - gypsy2 437 1 91.89 CATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 23621041 5' - roo 9014 2 77.27 GCTTATTGTTGCCTTTCCTCTGTTTATTTTTCGCTTCAGTCTACATTGTTGTGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGGGCGTGGGCAGCTTGCTATGGTATTT:1 + chr3R 20884808 5' - F-element 4445 1 50.00 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACACACACACACACAACCACACACACAAACAC:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 418 1 61.36 GAGTTAATTTTCAATTTTTTGCTCCTCCGTAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2L 15763895 5' - blood 7339 1 75.70 TTTGTATTACTTTTTCGCCATAGTTGATTTTTATTTTTTCCTGTAGGTGTGTGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGAGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGT:1 + chrX 15645762 5' + frogger 2318 2 68.18 CAACCCGCTATCTAGATGCGTCACCTCAGGCCAACGAAACCGAACTGACTATCCAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGA:1 - chr3R 24273055 5' - Bari1 232 1 57.01 CCTAACAAAAACAGTAGCGATTAAAAGCCGCTCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCCGTGG:1 + chr3L 13040630 5' + gypsy2 348 1 71.60 TCGCTCTATCGTAATATCGCACTATCGCAATATCAGACCATCTGACGATGTGAATGGGGCACGTACGTACCTGGGGCACCGTGGTACGTGCGGAGTGAAAACATCCAA:1 + chr3L 12258986 5' + F-element 4372 1 77.78 CAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chrX 4789135 5' - opus 7476 2 62.24 TGAGTTTATTTTCATTAGTTTCTCATATGCATAAATAATTGTTGCTATTCAAAAAGTGGATTTTTAAGCATTCGTTTTTTGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTCTCTTGTT:1 + chr3L 20616053 5' - I-element 366 1 76.36 AAAGATTTCTATAAACTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr3R 24813974 5' + P-element 43 1 24.71 TTTCTTTTTTTATGATGTCCCCGATTTTTGTGCGTTATTTATTAGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATTA:1 + chrX 13588311 5' - Doc2-element 4693 1 77.98 GTTAAGTTTGATGGCTAAAACAATGTAACGTTAATTGTATATTTTTTGATCCGTTACTCCGTTTTATTATTATTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGAT:1 + chr3L 20729631 5' - I-element 88 1 70.00 ACATAATATTCTTTATGTCATAAAGAAAAATAAACAAAAACTAATTTACGTAAAAAATTGCGACGTGAAATAGATCTAGATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGT:1 - chr3R 4514631 5' - Tabor 480 2 75.45 AATTATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr2L 16529218 5' + blood 7043 2 65.56 ACAGTAAGGTTTAAAAATTAATATAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 - chr3L 18743452 5' - pogo 2049 1 81.90 GGTGCAGTAGTGCTGAGTGCTGTGCAGCGTCCTTAACCCAGTTTGGGGCACAGTTGCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAG:1 - 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chr3L 16729617 5' + TAHRE 10023 1 82.89 TACATATATGTATTTGGGTGCTCCAAACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCA:1 - chrX 3663180 5' + 297 6799 2 73.74 AAAAATAAACAGAAACAAAAACTTTCATACCAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGC:1 + chr2L 18390964 5' + Doc 4550 1 65.56 ATTTGCAGTGCAACCTTTTCGAGTTGGTTTCAATTTTGAGTCTTTGAGTGTTTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAA:1 - chrX 9586005 5' - Ivk 104 1 59.09 AAGTTGTCTAGTAAGAAAACCATGTTGAGATATATTGTTATGGCCAAATCTGTGGGTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGG:1 - chr2R 13283123 5' - G6 1830 1 65.59 ATGAAATAAAGAGCACATTTGCATTTTTTCTCTTCATTTTTAAAAAATTATTTTCTCTTCTGATGCAATGTTATGAATTGGCGTTGGTAAAGAAAATAATTTTAAAAAAG:1 + chr2L 3656996 5' - 1360 3091 1 72.73 CGTCATTTAATTTTCTGTTGCATTACAACAAATACTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCCTTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 6966499 5' + pogo 49 1 69.09 TTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCTAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 18505731 5' + jockey 33 1 51.16 AAACTATGGTTGGCATGCATTTACTTATACAAGCAAGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGCCTAGGA:1 + chr4 1039240 5' + I-element 4937 1 65.45 GATCCAAGGATCTAAGGACCCCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACAACAAAATCTACAAACA:1 + chr3R 26675658 5' + I-element 5179 1 77.57 GTGAGTTTCGCAGTTTCAAGCTTGTGAATTCCCCAACAGCCTAGCAAGGA:1 + chr2L 2484378 5' + jockey 4673 1 54.00 ACATTTACAAACAGGCGACGATTGCGACTCGATTATTTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTC:1 - chr3L 10807060 5' - Doc 4369 1 67.27 TAATAGATTTCTTTTAAGCCAATTCTCTACCCGTTAAATCTCCCCACTCACTTATCGCCTTTTTCTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTGTTTTTTTTTTCCTTT:1 - chr3L 14625338 5' - gypsy7 5013 1 48.08 GCATAACAAGAAATCCTAAATTTGAAAATCTTTACTAAAACATTTTAAACATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 + chr3L 17595271 5' + jockey 4672 1 76.36 CGAAACAGAAGCAAACTTGTTAAAATATGCTAAAAGTTTTAGGCAAATCGATAAAAATTAACATGACTAAAAAAATATTTAAAAAATCAACACATTTTTCAATAGTATG:1 + chr2R 12276897 5' - INE-1 259 1 69.72 AAAACTGTGCAAATCGAAATATTAACTGGCAGCGGGAGGATACAAAAAAGTAATACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCCGG:1 - chr2L 944752 5' + 1360 66 1 77.42 GTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 7049647 5' + 1360 20 1 57.30 ATTGGTGTAAAACTGTCCGAATATCAAAACATGTTGTGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGA:1 + chr2L 6757478 5' - Tirant 8491 2 56.79 GTAACTACAGTTCAATCCACTATACATTAACTGTTGCACAATTTATCGCTACAAAAACCATTACAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGT:1 - chr2L 23069172 5' + Doc 4451 1 67.27 TTGTGCCAGCATCCTTTTTGGATGTTTGCTGGATTTCCTCAGGATTTATTTCAGGCTCAAGGCCTTTAATAACTTGCTGCTTTTTAGCTGGTACGTATACAAGTTT:1 + chr2L 16341304 5' - 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1360 3372 1 50.62 GGCATTAGCGGATTAGTGGGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTT:1 - chrX 9614289 5' - Doc 430 1 67.24 CTTGGCGTTGCTGCTGATGAAAACACAAAACTTTGCACATTAGCACCGTCGGGGGGACATTAGCTTAAGGGATACTATT:1 + chr3R 11448350 5' - G6 1950 1 69.62 ATACATACGAAATTGCGGTTGAACAGAAATTACTCATTCAATTTGCATAAACTCATACCTTTCGGTTTTGGATGTGAATATGTCACTTCCCTTCCATTAAAGAGAAGCAT:1 + chr2R 22390280 5' - 297 6559 2 67.27 TTATTGCCATTTAATAGGAAGTTAAGCCTGCAATATTTACAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 - chr2L 13836585 5' - blood 351 2 56.99 CAAGGCGAAATTAATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 + chr2R 11379703 5' + jockey 4674 1 75.27 GTTAGGATAATGTTACTTCCAAAATCGGACAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAA:1 + chr4 574947 5' + pogo 467 1 73.64 ACCGAGAGTCTGCGTCCAGGGCCCCAATATCTTTGACAGGTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTATTTT:1 - chrX 15137194 5' - jockey 4954 1 61.82 CATAAGAACGAACCGAACAACCTTTTTAAAGCTTGTAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAA:1 - chr2L 11807970 5' + invader2 4766 1 72.13 AATAAAAGATTTGATAAGCACTACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACATCCTAAAA:1 - chr2L 10554337 5' + G2 320 1 78.18 ACAGGCCATTCCAGCTATATGCAGATGAATAAAAGTATGATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 + chr2L 21734970 5' + Doc 13 1 72.73 GAAAAGTGGAGTCCTGCCGTCATGGCCCCAAAAAGTGTGCTATACATTTTGTAAGCTGCTTTCGATGGCATTGAACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr2L 6311226 5' + hopper 4 2 74.49 GGCCGATTTAACAGCAAATGATTCGTTTTAGCCACGCACCTGATACGCCAGCTCATGATGAAATAAAATAAGGGGGTCCCGTCGAA:1 - chr3L 19063511 5' + P-element 12 1 59.30 AAGAAGCTTATTAATACTGAGTGCAGGATTTTCTGTCAGGGTGTACTGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCACATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1 + chr2R 23354290 5' + Tabor 6879 2 60.78 GATTTTATTATGCCAACATTTAATTGTCGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAA:1 + chr2R 14795718 5' + R2-element 3203 1 77.27 AAACTACCTTAGCCATAAAAAAATAAATGGAAATCATATTTCTCCGTGTACCTTTCGGTAGTACCCTCATCCAAAGAGACTTAAATATC:1 - chr3R 26853093 5' + F-element 4387 1 80.90 ATCGTTGGAGACCATAACGTACTTAGACTTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGC:1 - chr2L 5595539 5' - Max-element 281 2 59.15 TCGGTGCACAGGACATTCTAGAGTGAGCACAGAAAAAATATAAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 + chr2R 20436711 5' - opus 467 2 62.86 CTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGATTATTGATTTT:1 - chr2R 6984419 5' - HMS-Beagle2 7189 2 70.83 GGGGATTGTGGGGCTAGGAGACATCTGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAACTTT:1 + chr2R 11636315 5' - FB 148 1 71.13 GAGCCAGCTTGTGGCTCTCGGAAATTTATTAAAACGAAAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAATCCATGAAAAAAAGGCTTCAAATTGTAGCTAAA:1 + chr3R 17816755 5' + S-element 1393 1 66.06 TGTGATATGTACATGTGTGATACAACTTCCGGTCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 + chr2R 14661107 5' - hopper2 1557 1 67.27 CCCAAAATTATGCTGCATATTTTTAATGCAATAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 + chrX 17456039 5' - jockey 4967 1 52.43 TTGCGTCTTGCCGGGCTAAATGTCATAAAATTTTCAATAGGTTTGGGCGTGGCAGTTTTGGGAGGTTTGTTATTATATTTAATAAAAAAATT:1 - chr3R 17464785 5' + S-element 1623 2 79.35 CTTGCACGCTAATGAAGCATGTAAAATGTCAATGTAGTCGTATGTACACCTCACACACACACACACACATACTGCGTGGCGGCGACGCTCCCGACGTTGACAT:1 + chr3R 27909594 5' + accord 224 2 66.99 ATTGGACCACCAAGGAAACGCGTGAAAATGAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGC:1 - chr3R 13969200 5' + Bari1 1507 1 72.73 CACGTAACGTGACTTAAGTTTCGAGCTTGTTTCCAAGAATTCGACTTATTGACAGACGCGCTAAAGAGGATAACACAAAAAGAGAAAAA:1 + chr3R 14838532 5' - Dm88 4458 2 73.03 TATATAATAACAGATATGTAATTCTAAAAAACACGTCCTAACATTAATCATAATATGAATTAATTAGTGCGAATGAGGATAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAA:1 + chr2L 21772073 5' - Cr1a 4044 1 70.64 TAGAAATCGTTTTTAAATGTGATTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTACGTTTA:1 + chr3L 3240542 5' - diver 6047 2 73.64 GATCGACTAAATCATAGAACTATAAACACGATTTTTATGACATTTCCTCATCAGATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 13481251 5' + roo 8685 2 57.00 TTTAGGATCTAGTTGTTATAAAACTTGTATAGTAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTT:1 + chr3R 22876359 5' - I-element 5083 1 70.00 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACCCACACACACAAACAC:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 418 6 57.97 GGAATGTGGAATTTTCTGGGAAATCAACGAAAATCGAATCAGTTACAAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAAT:1 + chrX 4330772 5' + F-element 4427 1 56.00 GACTCCTGACCGCAGGATGCCACACAGCTAAGCTGGCGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2R 13313452 5' + hobo 42 1 63.89 TAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACCGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr2R 2427621 5' + Doc 11 1 66.67 TATATTTGTGCGTATTGACGTTGCTGTTTTATGTACACGCATCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTCACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCCGTGACCTC:1 + chr2R 14393278 5' + Doc 499 1 56.31 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACATTGTATGGGGTGAGTTTGGGCCTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTAATCTTGGCTTTTAGACAG:1 - chrX 14317414 5' - HeT-A 5877 1 73.64 AATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAACATGCA:1 - chr2R 9963553 5' - pogo 2054 1 69.44 GACATCGCAGCTATATAGACAGACAGCCTTGGTTTTTGGCAAACGACGCGGCCCCCAACAAATAAACATAAAACAAGCAAAAAGCTGACACCACATTCTTTTCTCTCAGA:1 - chr2L 16612724 5' + ZAM 8116 2 73.64 CAAAAACACACATACATACGTGTATATACCTTCCTTTGATGGGTTACCCAACAGAATTAAACTATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGG:1 + chr3R 25558985 5' + Porto1 4575 1 54.46 ATAATGAGTGCCAAGGCATTGTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2L 12591716 5' - roo 9034 1 57.27 CTCCGAAAAGAGAGAAATTTACTTGGGTTTTTTTTTTCTGTATATTTAGCGCTGTTTGCATTAATTGTTTTAGATATTACATATAAATAATTATT:1 - chrX 14740213 5' + 1360 2938 1 57.89 GTTTGAGCTTAGCTCTAGGTTTAAAGTACATATTACACAATGGTTTAATACTTGGTTGGATTGCTTTTGTTAGCCGGCATAGCCTTACACCC:1 + chrX 16623915 5' - HB 1303 1 55.43 CGCTATATGAGCCGCTTTTAGCGACAAAGGAAACGGAAGATAAATTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGG:1 - chr2L 2090306 5' + blood 7328 1 59.09 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACACACACAAACACAA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 420 1 45.37 CGACAAATGCCGCGCGAATTAAGGAGGGCAGGGAAAGGTATTGATGGGAAATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGAAAG:1 + chr2R 24505708 5' + flea 4854 1 65.48 CAGCCGCCGCATCATCCAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 9481212 5' + roo 8713 2 70.00 AATAAACTAAAACTAGGTTCAATTATAGAATAATAATTTAAAGGTCACAAGTATATCTTTACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACACCAACAACCTAG:1 - chr3R 6763676 5' + F-element 4463 1 55.45 GTGCGTTCACAGCTGTTCAAGGCCCCCACAAAAAAAAGGAAACACTGAAAAAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 18694094 5' + pogo 4 1 58.62 CCTCGCACCTTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chr3R 31633147 5' - opus 478 2 52.94 CTATCGATTTGCAAAAATAAAAAGTTTGCAACGCCCACTCTAACGCACTAGAACCGCCCAAAA:1 + chrY 3652557 5' + INE-1 344 1 87.30 AAAAAAACAGATACTATGGGGAGCCCACAACTGGCCATATTCACTGTATTATTATGGGGTAGCCAGAAATTACAAGTTGATTTCTCAGACCTCCCTGAAACACAG:1 + chr3R 18052196 5' + Ivk 296 1 61.90 ATGGGTGACAAATACAAATGCATACGAATAATAAGATGCATAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chrX 16265310 5' + 1360 59 1 67.09 ACGTTTATCACGGAGTCCCGGGACTCAAGAGCTGGAAGCCAAAAGAGTCCATGTGTGTGTGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGAT:1 + chr3L 519648 5' - 1360 3179 1 65.45 TTAAATAAGACGCACACGTATAAGACGCACGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAG:1 - chr3L 18463489 5' + gypsy5 6967 2 66.25 TTCCTTCCAAACTTGAATCACCTAGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chr2R 8397503 5' + 412 7074 2 54.84 CTGCAGTTCGGGGTCCTCGAACTGTTTGATACACGGAACAAAAATAATAAAAACACACAAGCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACAAACTGTAAAATA:1 + chr2R 11512735 5' - S-element 1701 1 68.93 CAATACAATACAATACAATACAACACAATACAATACAATACAATAGAAAACAAAACAATACAATAAAATAGAAAACAAAAAAATACAATAAAATAAAATAAAATAAAATA:1 - chr3L 21448027 5' - transib1 1899 1 45.45 ATATAATTGAGCGTTAAAGAGCGTGGAAAATGCAAATCTCAACCGTCTGGCTTTTATAGTTCATACAGACAGACGAACAGACGGAAATGGCCAGATCGA:1 - chr3R 24578285 5' - INE-1 112 1 56.57 GTGAACATTTGAACCGCATTACGAGGCAGAAAAGTGAATTGAACAGCTGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATACACTTAACG:1 + chr3L 19063436 5' - P-element 2856 1 50.00 CAACAGAGTGTTGAATCTGTGCAATGATAAGTAAATTACAAGAACAATAAAGGATAAGATACGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chrX 22544954 5' + Stalker3T 201 1 50.91 GAAGTAGTTGAGTGCACACAATCAGCGCTTCAACAAAAAAAAAATAGCTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chrX 9642423 5' - S-element 1677 1 64.55 CTAGAAACTCTTGGAATTCCGGATCGTCTTTGTGTCTGCTCAAAATTTGGTCCACCTTGTCAACTTTTTTTTTCTTCTTCTCTTTGGTAAGGTCAATTTTTT:1 - chr3L 9624806 5' + transib1 1974 1 75.49 TTTTTATCTTTTTTTTAATAACAGATACAGCTTTACAAAGGAATTTATATGTGCCATAGTGCACAAAAATATATGGTATATGTTGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr2L 22414944 5' + Doc 6 1 78.18 GTCTCTGTCATATCTGACGGCCCCCATCTTCGGCGCTAATAATAATAAACAAATTCTTTGACAG:1 + chr2L 19940331 5' + 17.6 166 2 71.88 GTATTCAAATTGCTCATCAGTGAGAGGCGCCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr2L 9147978 5' + Doc 9 1 56.67 GATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr3R 13503051 5' - hopper 1375 1 59.62 AGAACCGACTATAAGATAACCGTTTCAATACTTTTTAGAATATCGTGAAATTGGGGAAAATAAAATATTTTATTGAAAAAAAAA:1 + chr2R 5883583 5' - hopper 161 1 52.38 TAAAAGTATGCAATGCAAAAAGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTATTTAATCTAATAAAAGACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chrX 14771711 5' + jockey 4689 1 61.82 AATGGGTATACTCACGGCAAAGAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3R 24867481 5' - roo 9041 1 56.36 TGTTAGAAACAGAGCATAAACTCCTAGATGTCACAGGTTGGTCACACATGAACACGAATATATTTGA:1 - chr3R 24867549 5' + roo 8 2 55.22 AATAAATAAATAGTAATTTAAGGTTCGGAGGAATCAAAATTATCATAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 8808813 5' + roo 8673 2 62.35 ACTTGAATCACCTAGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2R 8397493 5' + 412 7095 2 68.27 GATATTGTGGTCGAGAACGGACTGAAGTTCCTATAACTCCACTTATGAGAATAGTTATTAGCAGAGTGGCAAAAACATTTTGTGAAGATCTGATGTGTAAATGTATGAAG:1 - chr3L 20978659 5' - Tirant 8466 2 72.73 GATGTCGTTGGTGGTGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCT:1 + chr2L 2225807 5' - Doc 4511 1 81.93 AAAGATACAAACAAGAGATGTTCTTTTTACCTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAACAACGGGCCAAATGCCCCATAGTG:1 + chrX 14589404 5' + hopper 1414 2 71.82 ACTCTTCAGTTGGTCCATGAACTTCAGATGCTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATC:1 + chr2R 20211854 5' - Idefix 114 2 76.36 CTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 12039977 5' - 412 7505 2 87.21 TGGAGCACCACATTCAGTCATATATAAACTGTTTTGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTA:1 + chr3L 6542934 5' + Quasimodo 149 2 69.09 TTATTGATGGAGCCATCAGCAGATCCAGCCCTCAACTGGCACCTGTTGGGATGTTGGGTCATACAGCCGCCTAAACTGTGCAGTAGACTTATCTCATACTCTTTAATATT:1 + chr2R 6592211 5' + diver2 4570 2 60.91 TAAAAACAATCAAATATTCACAATAAATGCTGAGTTATAGCTTACAAAGACTCACAGCGGCCACGCAAATATGGTATGTTTG:1 + chr3R 7379290 5' - Gypsy6A_LTR 101 1 58.54 TAAAAAAAGGCCAATAGCTAAAATTATACAGTCACGAGTTCGGGAAGAAATATAATTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3L 12158532 5' + 297 6600 2 62.86 GATTTTGATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2L 14848400 5' + pogo 51 1 73.64 CTAAATTGAACATAGTTTGAATGAGACTTCCCCACCCAATTCAACATTGACCTCTACTTAAAGTCTGAGCGGTGAATTTTGAATTTGAATTCGA:1 - chr3L 19662687 5' - Rt1a 313 1 79.79 AAACGTTGGCCAACGGCAACATGAAGCATTGACCATTTTCCATTTTTTGTTTTTTTTTTCCTCTTTTT:1 - chr3R 19106964 5' - gypsy7 5009 1 77.94 ATATATCCATCTTTAACATGTGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTCAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAG:1 + chr3L 27970080 5' + 412 378 2 78.30 AACGATTTATGAAACGATTTTTATTTATGAATTTATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCATACACACCTCAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATGCGCGAGACGCGG:1 + chr2L 6812251 5' + invader3 181 2 64.81 CATCTACCAGTGGATACCATCGGTCAAGGGGGTCGCCAAATAATGTGTTCCTCCCTCGGGATG:1 + chr2R 22872096 5' - gtwin 7386 2 57.14 TGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr2R 6984332 5' + HMS-Beagle2 6931 2 67.89 TTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTA:1 - chr3L 20187390 5' - FB 479 1 63.64 GCCGCCGCCCTTTATGAGTGCCACAGCGTGTGTCCAAGATAATCCTAGAAACAGACTGACAAAACCGGAACGCACAGATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAA:1 - chrX 19010177 5' + Burdock 7 2 74.55 AGTTATCTCAGTGTTTGATTATAAAATAGGTACATAAAACCGAGCATTTTCAGCAGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCT:1 - chr3L 15822046 5' - F-element 4298 1 65.59 TTAAAACGTAATGGTTGGAAAACTCATAATTGCAACATGCGAACTTGACTTTTGCCAAATTCGAACCTATGCAGAGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTC:1 - chr2R 13025142 5' + Bari1 145 1 60.00 GGATACAATAATTTAAATCCACAATCCTTAAAAATACTCTGTTGTTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACCCTGGAG:1 - chr2R 16476224 5' - Doc3-element 4418 1 63.64 CAAGGCCAAGTTAATTGATTTTTTATTAGCAGTCAGCTTGGGGTAACAAAACACTGGGTATATACAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr2R 15445825 5' - opus 475 2 60.00 GTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAATGATGCGTTTCCGACCATATGAAGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2R 4618504 5' + 297 13 2 69.72 CCAGAAAAGCAATGGGAAGTCGAAAAAATATTATTTATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGTACAAGAAATATATTCAATATATTTCTTTATAACTCATTGTATACTTAA:1 - chrX 17634857 5' - Tc1-2 1574 1 80.00 GGTAAAATGGTTCAACATCTACCCACGCAAAAAACAAAAAAATGTACTGGCTCTTAGGACCCCGCTCTCAATTAAGCCTAGAGAACAAATTACGGCTG:1 + chr2L 8851071 5' + G3 4150 1 70.41 TTTTCGTGCACAAATGAAACTAAATTACAACAACGTGAGCGAAGGGAACCCAGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAAT:1 + chr3R 19733564 5' + jockey 4648 1 53.64 ACAATAAAGAAACACTATACCCTTAGAAAGAAAATCGAGGAGCAAGGCGACGATAAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTA:1 + chrX 11323959 5' + Porto1 478 1 61.29 TAGCTGGATTGTCTTGGCCATAATGGAGTTAATACATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 + chr3L 2965854 5' - 297 6956 2 63.53 ACAGCGACAAAAAATAATAATAATAAAAAAAAATAAATAAATAAATAACAATGAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTAATTTCGGC:1 + chrX 9201684 5' + 1360 3175 1 57.27 ACGCTTTCGGAGTCAACACTCGAGTGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACT:1 + chrX 17193344 5' + F-element 188 1 73.91 ATTTGTATTTACTTTCAAATAAATATCATTTGAAACACATTTTAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGCGTTGGTGG:1 - chr2L 7396008 5' - I-element 4973 1 62.22 TAAGTCAGCACCTGCTGTTCCATGCGATAAGAAGGTAAATCCAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 24031476 5' + 1360 9 2 57.14 AGTTTTAGTGCATTTCCGTTGAAAGCAGATGAGTACCAAAATAAAAGAAGATCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTG:1 + chr3L 15692770 5' + F-element 453 1 56.07 CAGTGCGAGCATTGTGGGGCGAAAAGCCGTGTTTGGTGAGTCACTAAGCGACCGCTAACTTGGCTTCCACTCCTTCTATTGGCGTTGATGCCCG:1 + chr2L 6502148 5' - rover 6894 1 71.28 AAATGTCATTCTTCGAACCTAAGGCGTTGCAGTTCTAAAAGTTTTTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAA:1 - chr2R 10015712 5' - Juan 4173 1 63.30 TGATCTATGAGTGCTTGCACTTCTTTGATTCGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr2L 18675591 5' + 412 18 2 64.55 CAAGTGCATTGTCAACTACGAAGTGGCATGCGGAAAATATCCCATCACCATTCCAATCCAACAGACATAAACA:1 - chrX 18575029 5' + Quasimodo 7020 2 76.71 CTCCGGCTTTGGCTAAGTAATGTGCCAAGACTTACGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGGAAAAAA:1 - chr3R 9908781 5' + Cr1a 4448 1 50.00 TTGTGAAAAATAAAAGCAGTTAAGAATGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 + chr3R 6088519 5' + transib2 13 1 69.09 AAAGAAGATTATTTTCAAATGCCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATAGTTGAGTGCTTGTGTCTGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGA:1 + chr3R 6587476 5' + 1360 491 1 77.14 TCCACCACATCGATTTCGGAAACGCTTTCGGAGTCAACACTCGAGTGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAA:1 + chrX 17193323 5' + F-element 167 1 53.26 CAAAATGGAAGAGGATCTGGCAGAACTTAGGCAGTCCAAGATTTTCCTCCGTGAATATAACCAAAACAGGTTCAAGACCTTAATGACACACAGCGTGCGCATTTTGACTG:1 + chr2L 21364454 5' + baggins 5113 1 78.18 TGGACTCTTCATAAGGGTTACGTGTGATGTAACCTTTAACATCTTCAATCTCTGCCTGGCAAGTAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATA:1 + chr3L 2661258 5' + R1A1-element 5189 1 60.91 AGTTTCTTGACAAACTGTATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACT:1 - chr3L 23233852 5' - invader1 3994 2 71.67 TCCGCACTTCGGGAATTTCGGCGCCTTTTGTTCTAAGACCTGCTCAGGATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGG:1 + chr3L 14358341 5' - Quasimodo 7029 2 68.92 TTAACGTATTGTATGAGAGTTTAACGATTTATAATATGGATGGCAAAAGAAATCTAAAACAAGAGAGAATGGTATAGTCGAG:1 + chr2R 5722104 5' - INE-1 577 1 63.41 GTGCAATGAATGGCAATTTCAACGCAAAGAGATGGAGCAGAAGCAACAAATTATGCGCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAACTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAG:1 + chrX 11658506 5' - rover 7011 2 60.91 TAAGAAAATGTACAAATAAGCGACGAAATGTTTTTTCGTATGCTCAGTATTCAGTTGGTGTTAAGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chrX 14858976 5' + 297 6593 2 70.91 GCGGGCGTCGGGCTTATCTCGTAATGTTTATGAAAATGACTATAAATACAATACAAAAGCTTTTTTTTGCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTT:1 + chr3R 21612877 5' - jockey 4990 1 61.62 CTACTCGAAGTCCCTCCTTGCTCTGTCTTTCATCGTTCATTTTAGTTATGGTGTGTATAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGCTGCGTAACGGCCAAACATTGGTTTGG:1 + chrY 3243555 5' - 1360 3362 1 61.47 GGTGTGCCTCTATTATTTAATAGCTTAGTTCTTTAAACGGGGATGAATTGTGGGCATGTTATTAATATAAAAACTAACACATACAGTTTGTCACGAAACTGTTTACAC:1 + chr2R 5674618 5' - S-element 1712 2 75.00 TAGTTTGGCCCGATGTCAAGAATCGAGTTGAGGTGTGCGATTCAAAAAATTCGTTGGGGATACGAATAGTGGTGCCAAAAAGCATTT:1 + chr3L 16011143 5' - Chimpo 3768 1 64.37 GTGGGGAGCGCTCTAACTTCAGCTAACAACGATTTGTGAAACTTAGGGTTATTCTCTAAAATATGCCTACACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATA:1 + chr2R 22994137 5' - P-element 2824 1 69.09 AAAAACTCGAACTCAAGAAAGAAAAATCCAATGAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATAAA:1 - chr3L 3555529 5' + 412 7068 2 63.64 AGCTACCTCTAAACTAAGTGAGAACTTGACTAAAGAGGTCTATAAAGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGA:1 + chr2L 11064937 5' + Doc 4448 1 58.18 ATTTTCTCTTTTGTCGCATTGCTCATACAAATTTGCTAAATCATTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATAA:1 - chr3R 18007409 5' - I-element 92 1 52.63 CCAATTAATCAACGAATCGAATTCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCG:1 - chr3L 7842086 5' - Juan 376 1 63.46 AAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACCCGCTGCC:1 + chrX 17330107 5' - opus 7475 2 57.30 TTGTTTTTCTCATAAAAAAAATTGCTTAAACTGGGGGTAGCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 - chr2L 10128725 5' - copia 209 2 67.27 CAGCTAGGTCATTAGGTCACAACTGTGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTATAAATGTATG:1 + chr3L 18030824 5' - Tirant 362 2 69.66 AACTTCAGCATAATTCGTTGACTAGAAATTAACTTAAGTACTTAGGGCTAGACTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGC:1 + chr3R 9020954 5' + copia 484 1 56.36 GCTGTGGCCGCGTCTCGATTTTGTTTGTAAGAAGTGTTATTTTCTTTTCCATTTCATGGTAATACTTGTACTCCCCTTGCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTTGGCT:1 + chr3L 27418687 5' - 297 6548 2 78.30 CAAGCTCATCAATAACTAACATGACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTGT:1 + chr3R 7588853 5' + Doc2-element 10 2 61.54 TTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGTTTAT:1 - chr2R 21358403 5' - Porto1 163 1 37.89 ACGATCATCTTGATTTATTCTCGTGCTATTGAGATCAGGTGCCTGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACACTTACAGCGGTGCGATGCTTACATTGA:1 - chr3L 17761054 5' - 3S18 100 2 58.18 ATAGCCCATAAATACATTAAAATACACTACCAGAATTCACTTGAAGTGAATATTTTTCTCTTGTGTGTTTAACCAAAGACAAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAAAA:1 + chr3R 8811148 5' - 1360 3371 1 66.36 TAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chr3L 17220758 5' - opus 7478 2 54.17 GCGACATCCATTCCTTTTGCCAGGTATCGGGCCGCAGTTTGACTTTGTTTCATCTGACGTCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTCCCATGAGGTTACG:1 - chr2L 18991827 5' - invader4 419 1 56.48 TCAAATGTTTACCAATGCGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCC:1 - chr2R 19542135 5' - Idefix 7257 2 64.71 TGCCGTTTATCGATCAGAGCGTCATATTTTGTACATTAGTCTTAAAATTAGAAAAAATCAAAACACACCACAACAAATAGAAATAGAAGAAATT:1 - chr3L 16662202 5' + 297 6497 1 57.45 CGCCGATATCGGTCGGCTATAGGCGCCTGTATATATGTCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCCAAACCCCC:1 - chr3L 17530203 5' + Tirant 8 2 59.15 GACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr2R 2427615 5' + Doc 11 1 64.44 AATGAGGGCGTGGAAGCAGCACTCCAGTCTCCAGTCGAACAAATACTGACCTCAACAAGGCAAATGTAATGAAATAATTCTTGAATATGTACCCACTGATAAA:1 + chr3L 12978065 5' + Copia1_DM 4189 1 72.82 ACTAATTTCAAATTAAAAAAAAAAATTGAAAAAAAAGAAAATTTTGATTTTCGAAAATTTTTAAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCTAAAGCTGGACGTGGGCAAAAAA:1 + chrX 21179431 5' - FB 98 1 77.27 GATCTGCAACTCGGATTGCTAAATTTAAATTTAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACGCCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTAC:1 - chr3R 4699182 5' + baggins 5123 1 68.04 TATCAATTCAGATTGTGAATTCGATTCGATTCATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 + chr2R 23415662 5' + F-element 62 1 66.97 TGACTCATCGACTGGCTGACGGCTTGAATTATTTTTAATCACTTTAAACGCGCAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3L 9822312 5' + pogo 1 1 71.08 TGCACAAGGCACGCAACAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGG:1 + chr3R 31920077 5' + Quasimodo 268 2 74.19 AAAAGGAAACACTGAAAAAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATAT:1 - chr2L 18694062 5' + pogo 48 1 77.55 AAGGGCGGAAATGCAGCGATGGCGCCCAGTGAGGATCGATATGCCGCTCCAGGTGCTAATGAAGTGGATTGAAGGGGAGTGAAAAAAAAAAATAAACAAACTTA:1 - chr2L 835488 5' + gypsy7 5017 1 52.88 ACATACGCATTGTTTGGAATGTGCTTGTTTCTCCAAGTGTACGTCATATGTGCGGTGTAGCAATGAGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr2R 9138790 5' - pogo 2099 1 75.79 GAGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr3L 22108156 5' + Transpac 4956 2 64.29 TTTGGAATACTGATTGCTTCCATATTTCACTCGCTTGCCTTCGTCAATTTATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTG:1 - chrX 2182731 5' - Stalker4 102 4 54.55 CCTTTTGCGACTCCTGCTTTCTTAGCAGGAACATAGTCCTCGTGCAACGCCTTCCTTTTGCTCGAGTTATTTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGTAGAAGTTC:1 + chr3L 1530842 5' + 1360 221 1 49.09 CAAAATTCAAATAAACGTGTCATTTTTACACATGCCTATCAATAGCAACAATTATACACAAAATCATAGAATACCTCAGGATATAAGTCA:1 + chr2L 13530697 5' + Quasimodo 92 2 64.44 GTGTTTTGTTTGGTTTTTCGCCACTCTGGTTTGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTTGGCTAAGGAAATTGGTTGTATTTTAAATGTGGGCAAT:1 - chr2L 16027837 5' - FB 429 1 69.09 GCATCAGTCTCGGCCACCTTCTTTCCATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTTTTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGGCTTAAACCTTTTT:1 + chr2R 10074287 5' - mdg3 5120 1 70.91 TACTTTCGAATCCCTTTCTCCCTTTCATTTCATTTTATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCG:1 - chr2R 7081905 5' + Cr1a 4369 1 67.78 GAGGGTGAGATCAGCGATTTTAAGCAACGAATTTTAAAAAATTTAATTTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGAAAAAACTACCCTAATATGT:1 - chr2L 7846820 5' + 1360 3135 1 81.82 TGCACTACTTTTTGGCTCAGGCTTGGCTTTTGGTTATTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGTAGCATTTTTT:1 - chr2L 14936223 5' - G2 3066 1 61.64 GAGGTTAAAGACACAACAAACACAGGCAACACGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 - chr2L 9171513 5' + opus 5 2 70.45 CCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 + chr2R 23477848 5' + F-element 49 1 60.91 TTGACATTTGTTTTATCTGCCTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 17490679 5' + roo 8707 2 77.53 CATGCCCAAGAATAACAGAGCGCATCGTGCGAGGCATACACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCG:1 + chr3R 23831477 5' + R2-element 3453 1 66.33 TGCGTTTGTGTGTGTGTGTGCGTATGTGTGGAATGGGGAAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 + chr2R 15115824 5' - I-element 5311 1 62.73 TGGCTATTGAAAAGCAGCAAAGCGGAAAGGATATTTTTGCGAAGTCCTAATACCTTGGGTAAAAGGGTCGTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2L 20398566 5' - roo 395 1 67.27 GTACTATTTGTATAACACAATGTATCACAACGCTAAACCACACACACACTAACACCATCCATATATAAGGGAACTTTGAAGATTCCAGAGATAACG:1 + chr2L 16749940 5' - Q-element 14 2 64.58 CAATAATCAACGCTAAAACACACACGTGGAATATGATGAAGTGCCTAATCAGGCACCGGGCTGGC:1 + chr2L 20531844 5' - Circe 266 1 58.46 GGCTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTCAAGAGACATC:1 + chr3L 13228459 5' - P-element 2865 1 60.91 GCCTACAACATTTTGACAGCAATCTCGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATACTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATAGACTAATAG:1 - chrX 10646206 5' + mdg3 123 2 69.81 CGAAAGCATCATGTTGGTACAATATTTGTTTCATTATATGGTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 + chr2L 22446021 5' + 1360 42 1 67.27 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGT:1 - chr3R 21907535 5' - F-element 301 1 67.86 ACACTCCTTCGAAGGACTTTTCCTTGGCGTGTCTCTTGCGTGGGCTAGTGAAATTGGATATATTTAAAGAGGGCAATCGAAAAAAATTTTGTTAAAGGTTTTTTGAGGG:1 - chr3L 5200874 5' - FB 395 1 64.22 TTTTATGTAAATATTTGGCAACTTTATGGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAA:1 - chr3L 19948927 5' + 3S18 5776 2 64.44 GCCCATTTGGACAACCGAACAGCGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGA:1 + chr4 426196 5' + G2 2906 1 74.44 GTAGCAGTAGCGATAGAACCGATAGAAAAGTCAGCAAAAGGAAAGGAGGGAAAACTAATAAAAGAGACGAACTAAATTAGAGGAGACACCACAAATTAAAAGCCAGGGTA:1 - chr3L 8743911 5' + TAHRE 389 1 74.55 TTAGTAACAAATGACGGTAAAAAAAAGAAAAGAAAATCGGCAACAGCAAAGAAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGAATACTCTAATGACAAA:1 - chr3R 25351984 5' - 1360 406 1 52.73 GACCCCGTGATTAATGACACTTGATTAGGAATTCAAAGCGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAGACTGATTTTATTGGGAAATA:1 + chr3L 20642694 5' - roo 361 2 59.09 TATATTGTATTATATTCTGTGATGCTATGTATATGTAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACAA:1 + chr3L 8338349 5' - 17.6 439 2 93.64 CCTGGCCAAGAAGTATCGCAACCAGAAGTTCAAGTGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGA:1 - chr3R 22361993 5' - roo 166 2 67.89 GCATGACCACAAAAAAACAAAAATTGCTCAGGTGCAGCCCGACAAGAAATCTTAATCAATTTACCTTGTCTTCGCGGCGCATCATGCTAAACAACCTGTGTTCATTTGTA:1 + chr3L 5529535 5' + Chimpo 3914 1 72.73 ACTAGACAATATGGGATATGAATACGTGGCGCGCCAAAAGCCAACTTCACTTCAAGAACGCTTTTTTCTCGTTCGTTT:1 - chr3L 1379928 5' + Doc4-element 67 1 62.82 TAGAATGGTTATGCTTAAATACAAAATCTATTACGGAATGTTAATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2L 11762180 5' - mdg1 380 2 60.00 CTTGTTTCTCCAAGTGTACGTCATATGTGCGGTGTAGCAATGAGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chr2R 9138767 5' - pogo 2083 1 55.68 ACTTACATAAACTTTTATGCTACTCTTTATTTAAGCACATAAAATAAAGCTTTTGTAATTTTCTTTAAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGA:1 - chr3R 25424173 5' - accord 7140 2 63.64 AAAATATGAACAAAATTATATCTACTTTCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - chrX 15170006 5' + I-element 45 1 72.92 CACAAGAGCTATAACAACTACAACAACATCTGGAGAAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTC:1 - chr3L 956815 5' + F-element 445 1 64.06 AAAATCACAGTCAAACATGAAGTCCTTTCTCACGGCCTGGGGACTTCAGTAGAACAAGTAGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATAAGTTGTAAAGATT:1 - chr3L 20641376 5' + flea 407 1 53.77 AGATTCTTATCTCCCACCAGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGTCGAACTAGAAGCGTTGCTGTCAGCCCATGGAATGGGGTACACTTAAC:1 - chr3L 9587262 5' + Chouto 5990 1 75.96 GAAAAAAGAACGAACAAGGGGGCAGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3R 11526879 5' + pogo 16 1 67.27 TGGGTAACTCTAGGCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2L 6243747 5' + 412 27 2 56.36 GTTTGATTAATCGAAAGTTAAGTACCATTGCAGTAAGATCAGGTTGCGAGCGATATAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGATTCAGCCGCCGACATCCGCCCAAA:1 - chrX 4608016 5' + ZAM 125 2 52.78 GCAGAGCTGGCGGAGCAGCAAGAAGACAAACGTGGCGGCGACAACGGAGCAAGTGACAAACGATTAGATGGATGGATCGTTCTTCATTGCAACGAAAAAACGCGGACTT:1 - chrX 6002842 5' + Doc2-element 343 1 78.90 GTTTAAATTTTATTTAATACTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTT:1 + chr3L 17530157 5' - Tirant 8460 2 83.16 TGGCACCTGTTGCCACCAATTAAGCGAATGGCGTACAGGAATATTAAAATGGCCAAATAGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAAAACACTA:1 - chr3R 18576994 5' + copia 4896 2 56.36 TGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCGTAGTGGACAATAATTAAAT:1 - chr2L 20841975 5' - G2 3027 2 49.09 ATAAACATATTAGTTGATTTAAAAGCGGGGGTAATTTTAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr3R 17777655 5' - Burdock 6353 2 64.15 TTGATCGTAAACAAATAACTAAGATGATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACATTTAA:1 - chr2L 15988787 5' + 412 15 2 63.64 CATCATCGAGAGGCCCAGTCTCCTCCGGACCTGGCCAAGTTGAAAAACTATAGCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGG:1 + chr2L 8898679 5' - F-element 4211 1 55.45 CAACTTCATTACGGAACTTCAGTTGCAACAGTACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGAACGCTGAGAAATTAA:1 - chr2R 18067566 5' - Cr1a 331 1 67.27 GTAAACAGCGCTCCCGAAATGATAACAATTACCCCCTTCTCCTTGTCCACTGCAACAAGTGTTGGATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 22353292 5' - accord 7032 2 57.14 TATATGGGCGTGCAATAAAGTATAAAGCTATTTGCTTTCGAGTCTCAATAATCCGCATTTTTTTATGTGTTTATTTTTTGGCAGAAATTCGAAATGATGACCTATCTTCA:1 - chrX 7021295 5' - transib1 2109 1 58.18 AAGCCAACAAACTAATCTTGGGCCAAAACAAACACCCTCCACACAAAAATCCTGCGAACAATAACTGGTGCGCCTTGAACCTACGGATTCCAGTTGTAAAAACTGACATT:1 + chr2L 3970707 5' + Doc4-element 2742 1 59.09 TTGCATGTACCATAAAAATCCGCAAGGTTTACGAGGAACCCAGCACGCAAAAAGAGACGTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGG:1 + chr3L 14430655 5' + S-element 1689 1 71.91 TTTTATTGATTTCATTTGACAGGCGTCATGTATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTCAGAACCCTCTTCTTGCGCTATTC:1 - chr3R 25434844 5' + opus 7 2 72.00 TTCAAAATTAACAAAATTGAAATTTACAAAACGGCTTTCGATTTTTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATATAAGATTCGACGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 - chr3L 23035594 5' + I-element 3 1 79.09 AACCGACGACCAACATCCGCCCGCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTT:1 + chr3L 7979187 5' - invader1 3724 2 60.00 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:2 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 419 2 40.91 TGTAAATTTTGCGGAAAACCGCAACAAATTCACTTATAAAAGTAATCTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATCTCATTA:1 + chr3L 17706374 5' - Juan 4180 1 59.63 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACACA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 421 2 52.94 CATCGACAAGGTAAACAAACTGGGCGTTAAATTCAATACAACTCCGATCGCCGAATTTGAATCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGT:1 - chr2L 20752077 5' + micropia 164 2 65.45 ATGGCGATCGCAAAAGGGACTTTAATGTGTTTTATGCTCCCTGCTCAATATGCTCCGTGTGGTCCAGTCGAGAGCTGCACGC:1 + chr3R 7626068 5' + G5 4446 1 52.44 CTCTATCTCTCTTTTCATCCCACTAATTTTGTCTCTTTCACGCCACCACCTCGTGCCCTTCCCCTCTCTGTTCCCTTTGCTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTCTTAT:1 + chrX 9747399 5' - gypsy7 5012 1 62.73 TATGATGCTGATGTGTGGGCTTAGATTTGAGTAGTGAGCGATATGAAAAGTGAATGGTCGGTCTGCGGCCTAGACAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 + chr3R 9120054 5' + Quasimodo 17 2 74.55 GCACTTCTTAAGTTTTGTTATTTTGCAGTTTTCAAGTTTTACTGTCTTACATTTTTCTAATTTTACAGTCTTGCAGTTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTT:1 + chr3R 14751951 5' - Doc3-element 4697 1 75.45 TTTACGTTTGCTGTGTAATTTAATCAATAGTGCGACTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGCATCTCT:1 + chr2R 15093402 5' + Tabor 434 2 66.36 TAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr3L 17595327 5' + jockey 4688 1 64.29 TAAAAAGAGTTATATGAAAAACTTTATTCAAGTAACTTAATAAAATAAATACTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chrX 22717121 5' + pogo 30 1 54.63 TCATATAATTTTGTCGTTGAGCCTATCTGGCTGATAAAATTCGTAGCCTTAAATAATTAATAATTGTCGCGTGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCC:1 - chr3L 18348084 5' + ZAM 11 2 69.52 CTTCTTTGTCTGCCACATTAACCGGGAAATGAAAATATAATATATATATTGAAAATCTTATATTTATTGTAATTTGTTCTTGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCATCTA:1 + chr3L 9969742 5' + blood 7180 2 78.70 AGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGACTTT:1 + chr2L 16742262 5' + 412 7101 2 74.49 GCTGAGCCGAGCTCTCTTGGACGGATGTCTGGCAGCAGTGAGGACTGGCATCTAATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTC:1 - chr3R 31633224 5' + opus 4 2 63.10 TGCGAGTAAATGAGAGCACAGAGATAAGGCAGTGGAAATCACCGCTCTTCCACCTCACCCCGTATTTGTGTCCCACTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAA:1 - chr2R 13934517 5' + FB 6 1 72.90 TATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTCGCAATACGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chr3L 15968207 5' - P-element 2825 1 20.19 TTATGCCGAGGGATTGCGCCCAAAAGTACACTCGCAGAAAAAGTCACAAGTAGGAAAATATGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 - chr3L 9419616 5' - S-element 1704 1 67.33 TTGCTTTGCTTTTGTGTAACGATTTCAGGTTTTCTCTGCCTGCTCCTTTGTGTGGATAGATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 + chr3R 11351923 5' - accord 183 2 80.72 AGAGCTGCTTCGCTCGAAATGTGCCAACTTTCTTTCACTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTCATTTTGTAAAT:1 + chr3L 9162324 5' - I-element 205 1 64.55 AAAAGCATAAAGCGGTGTACTTTTTTGCGATTCTGATAATTGGCAACGGGTCACAAGATAATAGGGTAAAGTCATGCAACTCATAATTAGATGATTTAAGATAAGGGGTA:1 - chrX 9930145 5' - Cr1a 4137 1 53.64 GTTGCGGTAAAGCGAGTTGATGATCAACTTCATCATGCGGTTGACCTCCGTTTGGAAAGTAAACTTCTCCGCCTGCACGCTGAGAAATTAAGATTTTATGTGGGAGAGCG:1 - chr3R 27949392 5' - Cr1a 312 1 67.27 TGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCATTATATC:1 + chr3R 6088545 5' + transib2 39 1 59.09 CGTGTCTTTGTCAGTGTGTCTGTGTGTGTGCTTGCCGTTTGTTCTTGTTCGGTGTATTTACCTGGTTGTTGTTGTCGGGCTTTTTTTGTTTGTTTTTCCTTTTT:1 + chr3L 21330954 5' - Doc2-element 238 1 66.35 TTTAAGATCGAGCTACTTTACATGATTTCATTTTCTCAAGACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr3L 23257557 5' - blood 331 2 70.00 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAAACACAAAAACACACACACACACA:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 419 2 46.23 GCAACAGTTTTTTGCAACTGCCGCACAAGCGGAAGTACATTTGTCGTCGGCTGCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAAC:1 - chr2R 14661176 5' + hopper 31 1 52.73 ACTTGAACATATATAAAAAGATTGGCAATTGCGGGGGCCAACCCAAGCCATGCCCAACGCAGTTAAAACACTGAGAGAAAATTCACAAAACACACGCAAACACACACATT:1 + chrX 1583742 5' + gypsy3 425 1 56.36 CTATTGTAAACAATCACGCACACACATTAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGAAAAAAGAACGGTATGGATGCACCACAA:1 + chr2R 624315 5' - rover 7072 2 67.03 TGCTTCGGTATTTTTCGGCTGAAACGATGCGACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 20797671 5' + P-element 27 1 44.71 GTACAACAACAAATTACAAAAAATGAAGGATGGGCAACAGTACTATCTATCTCGTCGGATGATAGTAACCAACTTTCGTCGCCGCCGTCAATTATAGTCTCACCGCTGGA:1 + chr3R 18420513 5' + TART-C 297 2 80.00 CTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGAACTTT:1 + chr2L 16742267 5' + 412 7101 2 78.49 ATTGCAAATGCGACTCATTCGTAGTTACAACAAAATGTCAGCATTACCTGTCTCCAAATGAAACCAATATATGAAATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCA:1 + chr3L 6825637 5' + 17.6 58 1 70.00 AGCAAAATGCAAATTTCATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAATGAT:1 - chr3R 23621057 5' - roo 9039 1 57.43 ATCAGAGTGCCATTCGGCATTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr3L 17220783 5' - opus 486 2 70.00 GGTACTTGGCGGGTCCGTGTGCCCAGATCAACCACCCACCACTGCCGCCCATTCGGCACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACAC:1 + chr2R 19677774 5' + hobo 25 1 50.48 ATTCTGTCGGGGTTTGAATTTTTTCGAATCTTTCTAGCAATATGGCTGGTGTTATTTTAAAATTTTTGAATTTT:1 + chr3L 17868929 5' - 1360 3031 1 81.08 TTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGAA:1 + chr3L 15968205 5' - P-element 2821 1 20.91 TCCATTCGGTTATATCCCCCGTTTCCTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCAAACGTAGTCTGGTCG:1 - chr2R 15883988 5' + invader1 108 2 68.35 CTCAGCGCTCAGGAATCAGGACCTTCGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACG:1 - chr3L 6160307 5' - 1360 3169 1 75.00 ATTAAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr2R 12416962 5' + pogo 13 1 69.09 AATTTGGCGATATCAGAATAGTTGTGAAGTATGAAAGTCCGCACTAATCAAGCTTGACTTTCCAGAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 17123226 5' - roo 394 1 66.35 CACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGACCAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 18915164 5' + 412 7091 2 72.41 CACACCTGAGAACCCATTTTCCGAGCCATATGTGTAGTAGGCTGCTACTTCTA:1 - chr3R 17436903 5' + mdg3 5252 1 62.26 TGTATTTACCCCTTCTTTTTGCACCTGTCCAGGTGGGTGGGTGTGCGTGTGTGTGTGTGAATTGTGAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGG:1 - chr3L 5684200 5' - F-element 4515 1 75.00 AATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGGACTCCT:1 + chr2R 12185306 5' - accord 7369 2 63.64 TTGGTGTGTCGCACGTAGCAAAATGCAAATTTCATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 23621073 5' - roo 394 1 65.66 TGTTACAAACTTCTGACTGAAATGAATATACCCTCTGCACGTGTTTAATACACAATATATCATTCGGTATACGTATGTACCCTTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTC:1 + chr2R 7021433 5' + S-element 246 1 80.00 AATTGAAAATCTCTCTCTCGCGAGCTTCCCATTTTCCCAATTTACCACATTTTGTTGTTTAATTTCGCAACTTATATTACACACGAG:1 + chr3R 11356345 5' + invader6 4447 1 77.01 AGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGTTAT:1 - chr2L 8476755 5' - Juan 4167 1 62.73 GGCGAAAGCATCATGTTGGTACAATATTTGTTTCATTATATGGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATAGGTTGTTT:1 + chr2L 22446019 5' + F-element 50 1 58.88 CGGCATCCTTTAATATGAGTTTTCCACGTTTCCACGCTGAGAAATTTAGATCTTGTGTGGGAGAGCGAAAAAGCGAGAGAGTGATAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTG:1 + chr2L 2621815 5' - Cr1a 272 1 70.09 CAGGTCCTGCCTGTTCATTTGCCAGCCGGCTTTGTTGCTGCGAAAATACCTTATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCA:1 + chr3R 13491747 5' - Bica 64 1 55.77 TCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTACCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTACCTTATCTTCTCTTATCTTATCTT:1 + chr2R 5064833 5' - Stalker3T 203 1 84.62 AAGAAATGAATAAAAGAGCAGAAACCAAAACGAGAAATTCAGTTGTTCTCTGGTGGCTTCTCAGAAATTCATTTCTTAGATCGGA:1 - chr2L 9150110 5' + 1360 3163 1 82.35 GTTATAGCCACACTGAGATAAATTGTCAAACATCCCTCCTAATAGCATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 + chr3R 10231510 5' - I-element 5339 1 55.43 CCATCGAAACCTAAAAAAAAAAAGAAAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATGGAACTCTGGG:1 + chr3R 18997987 5' + Porto1 4272 1 68.89 TTAGATACAGCTCACCTCTAGAGTGCCAGATGTTTTCTCGGGCCAGGAGTGGGACTGCAATTATTGCGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 27795432 5' + roo 15 2 65.42 GCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3R 31633151 5' - opus 474 2 57.65 TATAATGGTGAATAATTAACAGTTATTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - 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FB 650 3 78.18 CTTTCCTTCCACGATTTCGATTGGGATGACATGGGGTGTTGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATT:1 + chr3L 17590440 5' - Doc 4429 1 62.86 TGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTTGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTT:1 + chr2L 23372625 5' - 1360 3344 1 63.64 TACTCTCAGTATGGAAACCGGGTGCATTGGATCCGATCCAGCTGTAGGATCCAGTTCCCCAAGGGTTGCATTTCCCGCAAAAAAAAAGAAAAAAAAACA:1 + chr2R 10548085 5' + gypsy7 5006 1 77.78 GTGTTGGTGGGATCGGGGACTTGGGCATGAATTTCAAGTTGCTGCCAATAATTGTTCGTTTGCATCCCTCGACT:1 - chr2L 2636258 5' - I-element 348 1 68.92 AAATATATAAAACATCGTAATTGTATTGAAATTAAATTTTTAGATTATTAAAACTATTAAAGTTTATTTTTTTTTTATATTTTTCCGGCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 + chrX 18021002 5' + Doc 1 1 53.70 GTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCT:1 - chr2R 12185425 5' + accord 7 2 67.68 CACAGAGATACACGCACCCATACTGCCGCAGCAATGCACATGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGCTG:1 - chr2R 8237707 5' + Bica 479 1 75.36 GTGCTGCCCATCAGACGAATTTATTAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTC:1 + chr2R 17953187 5' + transib2 2515 1 77.06 AATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - 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gypsy4 6627 2 62.20 TCTGGATATATGTCTTTAATCTTAATGTTCTTCGACTAACATAAGCTAACATATTTATGTGCACACAAAACCAACACCAAACAGCACTGC:1 - chr2R 2769502 5' - Cr1a 242 1 91.11 TTCAGCATGGCGAGATCTTTCAATAAACTTCTCGGTTCCAGGTAGATTCACTAGAAACTATATACCTCTTATCTAAAATCATTGTAGATCTAACTATACGTTGCATGACC:1 + chr3R 30727791 5' + Cr1a 4163 1 77.27 ATTGCCCAAAATGTTCCAGGCACAGAAACAGAAAGAGAAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATA:1 + chrX 16339490 5' + Stalker3T 202 1 43.27 TATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCT:1 - chr2L 15622432 5' + micropia 4972 2 65.45 AAAAAAGCGAGACCCCAGGCTATAACACCGATATGTTGTCGTTACCTTTTGTATTCTGTGCGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGG:1 + chr3L 12675483 5' - gypsy3 424 1 80.00 TCTAGACATTGACACCAAATATGAAAAGCTCCTCTTTGTAGAACAATTTACCAGTACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACC:1 - chr3L 3217462 5' + baggins 5073 1 57.27 GTGTGAACAGTGTATTTCAGGACCCACATCCTTGCACTGAAGTAGTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGA:1 + chr3L 15746778 5' - mdg3 5055 1 59.09 TGCCATCAGGAGGTGGATGAAGCACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr3L 22108165 5' + Transpac 4959 2 60.00 TCAGACATTATATATTCATCTTTTTTTTAAGTTTCAATAGAAGAGTTTAGTTCTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGG:1 + chr3L 21891447 5' - 297 24 2 58.76 TACACTGAAGTAAGGAGCGCAAATGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACAAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCC:1 + chrX 7451830 5' + HMS-Beagle2 7010 2 77.65 TCCACGCCCTACTTCATTAAATTTCATGAATCGCCCGCAGCGCTTTGCCATATCCTGTATATTGTAATGATGAAATCCAATTAAGA:1 - chrX 22769429 5' - 412 491 2 68.60 GTTTTTTCACTTTTCATCAATAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 8919680 5' + roo 8710 2 79.57 CAAAGGCAGAATAAACTAAGCAAATGGTCAATTAAAGTTTGCCGCAACGATGCATTAGTGGGCGGATAAAGATACATTTATTTATTTATTTTATTTAACAAAATTAAATA:1 - chr2L 15209918 5' - Ivk 5373 1 71.82 ATCGGGCCGTTGTCTCTATCAATAGCCGCACTAAATTCAATTTGGCTTGGTTCAAACTATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chr2R 10047196 5' + FB 23 1 59.05 GTTCACTTCAAAAGTATCTTGGGGCAAATAGTTCGACTATTTTGGTGAA:1 + chr3L 17863056 5' - hopper2 318 1 87.76 GTAACTATTTTCTGCGTTTTATATTAATAAAAATTACAATATAAGGTATGTTTCCTAATCTTTTCTTTTCCCTTTTCCTTTTCCTTTTCTTTTTCCTTTTTT:1 + chr2R 13761747 5' - Doc2-element 237 1 68.63 ATGCGTCACACCCAATCGATTTCTAATAGCCGCAGGCCCGCTCTTCCCACTGTAATTGCCCAAACCTATCACACTTTTAAAAAATATTTTTATTTTTTTTTTTGTATTAT:1 - chr2R 14918473 5' - BS 5100 3 56.36 AAAACTTTTCATCATTTCATTGATCGACTATCAATTTCTCACCACTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGG:1 - chr3L 13190399 5' - I-element 68 1 57.94 TAAATAGCTCTGCGGGAACCACAGCATCGATAGCAACCGATTCTTCGCCACTGGCTCATCGGTAACAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGAATCTCGTCTA:1 - chrX 16382749 5' + G2 2617 1 53.85 CATACTGGTATGTACATATGTATACACATAGAGATGTCTAAAACGAATATACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTT:1 - chr2L 4916788 5' + S-element 32 2 58.18 AGACGACCATATAAATATAATAGTTTACCTTTGCCTCTGCTTTTGTTGCTCACTGCACCACCTCATCGCACCACTGCACTATGGGACATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chr3R 13437258 5' - hopper 1402 1 69.09 GGGTTCACTTTTCGGTCAGTGCTGTTTCCTCGCCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chrX 1601057 5' - hopper 1402 1 52.05 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAG:1 - chr3R 21907536 5' - blood 368 2 42.35 ATTAGCTAATTAATCATTAACGACTAGCTGTCTAGATAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTG:1 - chr3L 8298710 5' + 1360 3333 1 60.00 GATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGG:1 + chr2L 20928068 5' + Chimpo 16 1 55.06 CAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTA:1 - chr2R 6801722 5' - McClintock 460 2 64.55 GGAAGGGCGATGTCCAAGCCCCAGCACCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 + chr2L 16254042 5' + FB 1 1 60.38 CCCCCTGCGCCCTTCCAACAAACTGCTGATGATGGTGATTTTTCTCGGCCCCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCCTAAATCATTGTAGATCTAACTA:1 - chr2R 21990776 5' + Cr1a 4149 1 58.18 AATCAATAGGAAACCGAAAACCACTTGAATTTATTTATTTATTTAACAACATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGC:1 - chr2L 18199759 5' - Ivk 5330 1 70.30 TTTCAATTTTTATTTATTTATGTAACGTGGCCTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 + chr3R 20415783 5' + F-element 43 1 63.64 TGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAGCCAC:1 + chr3L 13228481 5' - P-element 2862 1 49.45 ATTGAACAGCTCTAAAGCGTATGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATTCGTAACGCCATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAA:1 - chr2R 1891074 5' + 1360 3198 1 67.42 AAAAAAATAAAAGTAGAAGAATTATATTAACAAAACAACAAACAAACAATCAAATCAAAGGCAGTGAAAGTCGTAAAAGACATAAGTAATAATAATAAAATAAAAAAAAT:1 + chrX 6093909 5' + Rt1a 5073 2 72.73 GAGAAAAGAGAGAAGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGAGAAGAAGAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chrX 4617441 5' + Stalker3T 201 1 54.13 AAGCCGCATTCTGCGTGTCTCACTTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACAA:1 - chr2L 1673337 5' - pogo 432 1 77.98 TGGGGAATGATACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCA:1 - chr3R 14357347 5' - Rt1b 5109 1 63.33 TGATCGGAACGCACCTCTAACCCAATTTATAACGACTTATCGACAGTAATAAAAACAAAATACAAAATACGTTTCTACACACAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAG:1 - chr3R 13915157 5' + Porto1 316 1 74.31 TGGGTGGCGTGAGTTCGCGACTACGACGACGCGAACATAACGAGCAAAATAAATGAACGATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chr3R 5774910 5' + I-element 6 1 70.00 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACA:1 - chr2L 16217660 5' - Cr1a 223 1 43.01 CACGTATCACTCCAACTGTTTTAATAAATGGCAAGACAGAGTCCTGGCAAAGACACTCGAATAACCAGATGCGTAACGACCATACA:1 - chr3R 3696781 5' - 1360 3371 1 65.12 AGTTGTTAATGCAATATGTTTTGTTTGTCGTGACATAATTTAAATGCAAATGTTTGGAACTGAAAGGTAGCCATGAGTCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3R 24260983 5' + roo 8 2 73.64 GCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAACGGTTTTAAACATTTTTTAGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGT:1 - chr3R 19449499 5' - mdg3 5086 1 53.64 TTTCGGATCCTTGCACCTGCCTGCCTTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGCGG:1 + chr3L 14975101 5' - Idefix 230 2 56.92 ACAATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTA:1 + chrX 21452474 5' + INE-1 532 1 72.73 TGTTGCCCGAGGAGAACGAATGGGTCATCGACTATGCACTGAAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGCAAAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAA:1 + chr2R 12470584 5' + Bica 259 2 61.54 TTTCGAACACTTTGACGATGTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 + chr3R 14139097 5' - 297 356 2 75.29 GCCTGGAAAGTCTCAGTTATAGAGTTCCCACTGTTTATTGGCCAAACGAAAGTTATCTACTTAAATGGGTTTGTTTGCTGACCTTTTTGCCACTTTTTTCTTTAAATGA:1 - chr3L 10440019 5' - S2 1263 1 68.81 TTAACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chr2R 9953293 5' + pogo 56 1 77.27 AAATGCGCTTGGCTTTAATAACTACGTTCAAAACAAGTCCCGGTATGGGTTTTAAATATATTTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATTAAATGCAAATTGGATTGA:1 + chr3R 7478967 5' - 297 6838 2 66.36 GGAACAGGCATAGATACTAGTACCTACATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chr3R 19058390 5' + Burdock 6190 2 76.15 AAATATTTAAAACCATGACCAACGTTTGTTTAAGTACTTCGAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCT:1 + chr3R 15638943 5' - 17.6 7123 2 59.80 GAAATCAAAACAATCAATTGTTCGCACATTTTAAGCATTACCTTTCGTAGTCGTCAGAATCCTCTTCATCAGAGTCAAGCGTGTGTTTCTTGACAGTCTCAAAATTGTGT:1 - chr2L 10436209 5' + S-element 1517 1 80.91 AAAGTTAACAAATAGGCTTAGCACCAAAATAATAGAATTTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAACTGAAAC:1 + chr2L 12146291 5' + invader1 3612 2 61.90 CATGAGGATACTGAACAATTTGCCAAAGGCTAAGAATCAAAAGGAGAAACCAATAACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGA:1 - 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Stalker4 276 4 75.23 TATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGAAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGTA:1 - chr2L 21657038 5' + invader1 3647 2 70.41 CGACTCCTCCGATACAGTTCCACTCTGCTTTTGAGTTAGAGTTCGTAGCGAATCGTTCGCCATTTGAGTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCT:1 + chr3R 30704390 5' - invader2 483 1 75.79 GGGCATAAATAGTTAAACGTTATAGGTGTGGGTGTATTTAACTCTTACTTCGTGGGTTACAAAGAGGCGCATGTCAAAACCAGGTTAGGTAGGTCATGAGGGTG:1 - chr3R 24696727 5' - jockey 4763 1 76.92 TTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAC:1 - chr2L 13268395 5' - TAHRE 10421 2 60.00 GAAACAGACCCCCAAACTGCCAACTTAATCGCTAAACCAAGTTCTCGTTACTTTAACAATATAAGTTGAATGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3R 20987993 5' + 1360 15 1 67.27 CCGCAACGATATAATGTATACGCTCGATATTTACGCATTTATTTATGCCGCTCTTTATTGGCTTTTTATCGTTCATTTATTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATA:1 + chr3R 5774804 5' - I-element 5346 1 75.45 CCCACAGAAGCCGGCTTAAGTATAGTCGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 - chr2R 7290679 5' + Max-element 8256 2 63.38 TCTGGCTTTTTGCTTTTGGCTTTTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3L 17405739 5' + roo 8689 2 73.33 GCCATGCCACGCCACAATCGACGACGCCACTCCACCACCCCTCAAAACCTCCACGGCTGAGCTGTTAGTTCGTCGCAGCATAGTGCAACATTGTGGGCGGAAACA:1 + chrX 17028381 5' + gypsy5 7097 2 75.24 ACGGGACCGAGTACGGGACCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTG:1 - chr3R 13421968 5' + Gypsy6A_LTR 19 1 59.09 AAAATATAAAAGAGACTCTTCAGAAACTTATGGCTAAAGAGGAGCTCAAAGAAGATGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGGAATT:1 - chr2L 17393403 5' + FB 22 1 50.59 CTATTTTACTTTTTCATATTTTTTGTGTTAATTCGCTTTTGCTGCTTCTGCTCGCTGATTGGGTTTTTTTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTTATATTTATT:1 + chr3R 12561478 5' - Tc1-2 485 4 78.79 GCCATTTGACGGTGAGTACACAACGAACTGTTGATTGATAGGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAACATAC:1 + chr2L 18063922 5' - gypsy4 467 1 60.91 GGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3R 15524402 5' + pogo 38 1 62.73 GGACCAACATTAATTTGCTACAATATTTAAATTTGAATATAAAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr3L 18095560 5' + I-element 25 1 56.18 CTGGTAACTCAGAACTCAAGTGACGTGCGCGACATATAACTCTTTTGGATTCCGGATCTTGTCGTTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTGTACCACTCGACTCACA:1 - chr2L 3323304 5' + hobo 22 1 58.72 TGATGCTGTTGTCTGAGGTCAACTAGTTGGCTTCAAAACGAAAGCAAAATCCGAAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATATAGACAACCTGATATGAGTTAGG:1 - chr3R 11649497 5' + hopper 939 1 52.73 TGCGCATTAATGAATTATTAATTTGTGTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCAAAAACTCT:1 + chr3R 10964619 5' + I-element 56 1 75.24 CCTCCGTTTTTCCTCTGCACTCAAGCTGAACTAACGGCAGTTGTCAGGACTCCATGGATTCGAATTCGCAAATGGGCAGGGGTTCCGTAAATTTGTTAAAAAAAA:1 + chr2L 17112580 5' - G5 54 1 87.62 TAAGTAAAGCAAAGAACTAATTCTAAATTAGATTCTAAT:1 - chr2L 17817748 5' - P-element 2605 1 92.31 CTGCTTACTGACCTACATACCGCACCTCAGACTAAAAGCAAGGGATCTACACTGGCTTATAAACGTTCGCTCTCCCCTAAGACTTGAGTACAAAGTCCTCTTATATAACT:1 + chr3R 7191023 5' + Doc3-element 4282 1 81.82 TTCTGACCATGGCGATACAGTCAACTGTGGTCCGTCTAATTGCATGCTAACTGTACTTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 - chr3L 7939094 5' - roo 8978 2 60.91 TGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr4 96892 5' + 412 58 2 78.70 CCAATTACTTTCGATTCTTTCACTTTCGTCGTCGATTTGCTCCATAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCTT:1 + chr3L 3140277 5' + diver2 128 2 58.89 AGGCCAGTGGGACAAGTCTGGTATCTGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTG:1 + chr2R 22198266 5' + R2-element 466 1 73.40 ATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTTTCTTATCTTATCTTCTCTTATCT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 204 1 36.90 CTCAACTAGTGGTAAAAACCACCACCCAGCACCACGATCACCAAGACCCTACAGCAACCAACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTA:1 - chr3L 23154940 5' + copia 4821 1 60.00 GGAAAGTAAATAAAACACAATAACATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr3L 12433225 5' - opus 7460 2 76.40 CAATTGAGAAAGAAAGAAAGATTAATCAAGAGCTTTGAAGAATATGTTATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTG:1 - chr3L 10836611 5' + opus 112 2 74.68 TGTGATTAATAGTCCGGCGTTTGAGCTTGGAGTCAGAGAACTGCAAGGGNGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 9595647 5' + hobo 23 1 59.74 GAGCAGGTAAAAAACCCGTCGTATATTTTGGGAGGATGGGGGCCGAGGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr2L 9496444 5' + Tirant 12 2 61.25 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr2L 16217660 5' + 412 16 2 38.83 TTCGCTTGCACATGCTGCAAATGGTAACAATGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 3751904 5' + roo 8686 2 62.50 CCTTTTCCTCTTTTCCAGTGTACACAACGAATGAACTGAGGCTTAGAAACGAATTCTTTGAGCAAAAGTTGACGTCGCTGGACTAGACTAGTGGGCATAAGTATTTG:1 - chr3L 17448993 5' - Tc1-2 1623 1 61.68 GTGTTTTGTAATGTGGAATTCTTGGCTTTGGCTGGCAGGGGGCGGCAAAAAAAAAAACAAAGGCAAATAAAAA:1 + chr3L 17650585 5' + Doc2-element 252 1 53.42 TTCCCGCTCTGGCTCTGGCACTGGCTCTGGAACAGCAGCGTAGAAATTATCCAACGAGCCCAATGGAAAATCCTGAGAACCATCACCGGCGCACCGTG:1 - chrX 792628 5' + Fw2 3630 1 64.29 CTTAATCCCAGTTGAGGCGATTTGGGGCTAGTCTATAATTGTCACCACATACGCTCCCTCCGTTCTCTCCGACACACACACACACACATATT:1 - chr2R 7087034 5' + accord 7030 2 55.43 AATTGAGCGCAAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 - chr3L 19347226 5' - jockey 4956 1 51.89 GTCAATATAATTGAAAACATTTTCCCAGACACGCCCCCTCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCCTGTTTTTACTCACACAAT:1 - chrX 3586417 5' + 1360 3245 1 57.14 CGACTTGAACATGCAATTCATGCGAATTGCTTGATACGTCAATGTAATTAATTGATAAATATTTGGCATCGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACG:1 - chrX 8027512 5' + Juan 7 1 70.53 GATTTATTGCAAATCGCCATTTATGGCGTTTTTATCTCAGTAATGCTTCCTGTTCTCCATCAGATCGGCATGATATCGAGAGAGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTA:1 - chr3R 13822414 5' - Quasimodo 38 2 70.91 GACGCTTTGTTTACAATGTTGACCCTTACTTTATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:2 + chr2L 15763804 5' + blood 7018 2 75.45 TGGCCCCAGCGGCAATTAGCAGGCCTACTACACTAGCGGGCAGAGGTCTCAGAAGGTAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6839406 5' + G-element 4325 3 50.00 CCTATTTGCCAGAAATCTATGATGATGATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTC:1 - chr2L 17531589 5' + 3S18 58 2 75.00 CGGTCGAAAAGGGGAGTGCGAAAAAGATAAAGTTTTGTGTGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 - chr2R 10017008 5' + FB 47 1 59.14 ACAAATTTAGCAATTAGCTCAAAAAAGGTTTTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCCTACGTTAATGTTTCCCTCCATAAAATTTATTTA:1 + chr2L 2863926 5' + G2 3014 1 68.18 CCATAATGAGTGCCAAGGCATTGTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 12591714 5' - roo 9053 2 56.99 TGCCTTTCCACTCCATATAGAGGGGATCGCTTCGATGCTCTCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3R 27403694 5' + hobo 42 1 60.19 TAAATGAAAAACTAGATAAATGTTGTACAAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chrX 17330079 5' - opus 479 2 63.64 ATATAGCGCATACGCCCCGCTGGCCGTGTCAACAGCAGCCGCCGCATCATCCAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACGACT:1 + chr3R 9481177 5' + roo 8677 2 68.81 GTGATATGCACCTTAAACGAAATGAACTCGATTCCTTTTTAAAACGAATCATAACTGGAGATGAAATGTAGGTGCGTAAATAGTATATTGGGAGCCAGGTAATAGATTTG:1 + chr3R 1977139 5' - gypsy7 238 1 62.73 CATCCACGACCACTCCCACAACCACATGGAAACGCCCACTCTACCGCCCACAAACCAGAATATCATGAATATCATATCATCATACTAGCTGAGTAACGGGCAT:1 + chrX 22500165 5' + INE-1 540 1 67.96 ACAAGCCAACCAGAAAAAAACATACACACACACACAAATTCTATGTAGCTAAGCGAATTTTCCAAAAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGACA:1 + chr3L 7846435 5' + 3S18 5783 2 68.18 CGCAGAGCGCAGCAATAAACTCCCCCATCACACAGCCAAAAAAATAAAAAAATAATTCAACAAATGGATAATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGT:1 + chr3R 11545443 5' - Tc1 1343 1 68.18 GGAGTTCCTGGAAATCCCTGCTATACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCT:1 - chr3R 17548003 5' + accord 210 2 65.22 AATGCCATAGAAACCCTCATGATTGATGGGGTATATATTGTACGATATCAATCTCACTTGAGTTAACCCTCTAAACCTTCTTAGCAAACCCAATACAGATAACATACAAA:1 + chrX 12781519 5' + I-element 5127 1 61.82 ACGATAAACAACCCCAAATCACGCTGTCGCCCTGTCTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGCCTTCAG:1 + chr3R 21141408 5' - Bica 98 1 54.43 CAATTAAAGTAAGCCGAGATAATACATTGCAAATCGCCATACATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGAGATACCTGAAAAG:1 + chr2R 8500503 5' + G6 1790 1 69.72 TCTTTTTGTTGACTTGAAAACATCTTTGTATATTGAAAGATTCATTTAATGCCATATACTATTATATTTTTTGAATATCCTTCTTTTATTTTCTTTATCTAAAAA:1 + chr2L 5284592 5' - G7 1144 1 88.57 AGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 6537922 5' - roo 353 2 71.56 ATATCCTGCCAGGACTCTCGGTTACGCTTGGGCTGGCCCTTACTTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 5320599 5' + roo 19 2 55.17 GTCGTGTTGTTGAGGAAACCAGCGACTAAAGTAAGCAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCACAC:1 - chrX 17475283 5' + Bica 311 1 66.36 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGCAGCGTATATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr3L 22908066 5' - blood 169 2 54.55 ATTGAAATTGTTTTGCGGGTGGGTTTATTCATGTGATTGTCATTCGCTTACGCGAAGCGGGACTTTAAACTGGGTGGGGCTTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTG:1 + chr3R 22226687 5' - I-element 1 1 56.31 AAGCCGGCTTAAGTATAGTCGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 - chr2R 7290672 5' + Max-element 8248 2 66.07 ATCCCTTACGGAAGGAAGTCTTTCACGTTGGGGTACAATAAAATTCCATTAAATGCCCAGCCTTGCCTTTGGTAAATAATAATAACGTCAGAAGACTTAAAAGATTTCAC:1 - chr2R 16068940 5' + G4 3680 1 59.09 TGTCGTAGAACAGACCAAAGTCCTGCTTCCATTCTATTAGATTTGTGTTTTTATGGATGTCGTAAAAGATTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCTGCTGGTT:1 - chr3R 19479828 5' - gypsy7 5249 2 64.76 GTCCATCATGGAGAAATTGCTCATCACCGAGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCCTTTAATAGACTCA:1 - chrX 9168595 5' + 17.6 7386 2 56.76 GTAATTGACCGCAAACTAAAAAAATATTATTGATTCTTTATTTATATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATTTCCCGTCAGTTGACTA:1 - chr2R 18860073 5' - 297 362 2 67.27 GTCTGAGCCAACTTCCCAACCGAAAAGAAAAGCACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACAACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTG:1 + chr2L 5570651 5' + F-element 4234 1 64.08 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3R 21907536 5' - 412 7525 2 43.27 TTCATCAATTTTTAATGCATACCCTGTACTTGTCGATTATAGTTATCTGTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATT:1 + chr2R 10091007 5' - roo 9038 1 56.48 TGTGGCACGATTATTGTTATTATTGCTGTTGTTTCACAGCGCTCGCAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr2R 21591984 5' + Tirant 8122 2 59.04 GGTAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr2L 16067073 5' - HMS-Beagle2 7160 2 59.62 CTCTTATGCTTTTATTTTAATAATTATATTTATAATTATTTACTCGTAACACATACAGTTTATGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAA:1 - chr3R 18717482 5' - R2-element 3378 1 61.11 ACTGTACTGGTCTGATGAGCAGATTTGTTGGTGCACGTGCAGATGGATTTGGCGCACATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATAGA:1 - chr2L 18160166 5' - Porto1 383 1 68.97 CTTAGACTTAACAATTCACGCAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTAAAA:1 - chrX 17680984 5' + Doc 4455 1 75.79 CACTGTAAGTTCGCGCCTAGTGAATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chr3R 21993192 5' - jockey 4974 1 64.55 TAATATACGCTCAAACTTCAATTCCACAAAAAACAGCAAAAAGTAAAATAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCTAGTTCCCCAAATATCAGATACCCGTTACTCAG:1 + chr3L 28010492 5' - INE-1 547 1 74.29 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATAGGGAACAATCACATTG:1 + chr3L 22908067 5' + Tabor 43 2 61.17 GTTTCGGATGTTTGTTGTTTGATGTTTTTTTTTTTAACGTACTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGGGCAGGGAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAA:1 + chr3R 21192037 5' - 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chr3R 7928723 5' - Tc1-2 388 1 60.19 CTATTTTGGAGGGTACATAATTATGTGCCAAAAACTACGGGAGTTTGAAAAGTTAGTGATCCGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAAT:1 - chrX 18024952 5' + FB 959 3 60.55 GGTGTGTCGCACGTAGCAAAATGCAAATTTCATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 23621071 5' - roo 9044 1 57.27 GACAACCTTGAATGTGGTGCTGCTGGCCATGGAGTGGAAAATGGGAGTTGGAGGTGGAAGTGGGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGG:1 - chr2R 21491913 5' - hobo 2641 1 69.89 TCTAGCAGATGCGGTCAATCTGACGCCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr3R 24813996 5' - P-element 2860 1 39.24 CAAAACAAATGCTGCTTATGCCGAGGGATTGCGCCCAAAAGTACACTCGCAGAAAAAGTCACAAGTAGGAAAATATGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACAC:1 - chr3L 9419631 5' - S-element 1710 2 75.45 GAAATCGAATCTCAACCTTTCGAACCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTATTATT:1 + chr3R 11474915 5' - hopper 1358 1 75.00 TGCAATCAAAGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAAACTTAGTTGAATTGCATAAATA:1 + chr2L 13836530 5' + blood 53 2 66.36 GTAGGGCATCCCCCGTGGGGAGTACTGCTCCTGGACGTTTGTCTGCTATCAATTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACA:1 - chr2L 2560985 5' - 1360 102 1 65.45 TTTAGGGGCTTTTTTAACCAGGTTCTGGTTTGTATCGTTATATTTCACCACACAAATATTACACTCTTTGTTATTCTGTGTGCCATTTTTTTCTTGTTTTTTTTT:1 - chr2R 11247917 5' + hopper 142 2 91.43 TAAGTATTTGACTTGGGGATCTTACCTTTGGAACTATCTATACAAAGAACATTAAACCCACAACACACACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCC:1 + chrX 13202571 5' + Tirant 6 2 73.00 ATGAACATGAAGAAGTAATCCATTTTGCTTGGAACCTAATGGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGAATGCCAAAAATTGAGAAGA:1 + chr2R 19770011 5' + micropia 5261 2 61.82 CCATAATAACTCATAAATGAAAAGTGAAAATCGTGAGGAGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGGGCTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAA:1 + chr2L 13078799 5' - Doc2-element 4592 1 64.55 AGTGCAACACGTTTCTCTGTGGCAATTTCTGTTTCTTTTCGCAATTTTTTTTTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTTTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTT:1 - chr3R 19099477 5' - Stalker3T 203 1 51.38 ACTTATTGAAATATTTTTGCAAATTTATTACTTTCCTTGCAAGCAGCAAACACTTGTAGACGTACATAATCTCCGATCAAAATTCTCCCAAGAC:1 + chr2L 12571750 5' + ZAM 370 2 60.64 ATGGGAAAGTTGGCAACATTAGGTGGGTGGCAACTCATCATTTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTG:1 - chr3L 476195 5' - I-element 5093 1 56.67 TAATATGTACTTTTATGTATATTTAACAGTGTTTTTATTTGCCTCAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 - chr3R 19058451 5' - Burdock 6355 2 57.27 CCTTAGAGTACATCATGGTTATAGCATGATGCGCTGCAGGAGTAGGTCGGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTC:1 - chr3R 8358376 5' - Chimpo 3857 1 78.48 CCATCTCAACGCATTGATGCACAGAGAATAATTTTACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGTAGACGTG:1 - chr3R 26398936 5' + Doc 16 1 54.00 TTAACATCAAACTGGTTCGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACA:1 - chrX 2364771 5' - Quasimodo 122 2 71.88 ACACATGTTTTTCACATACTGAGTCTGCCAATCCATAGATATACAAGTTGATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 - chr3L 23996568 5' - HMS-Beagle 227 2 52.94 GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr3L 15253229 5' + Stalker3T 202 1 35.78 GTTGGTGGAATCCTTAAGTTCGAGTAAACTAAATGGATTTTCATTGTCGATTTATTTAAATTATTTGCCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATT:1 - chrX 5023557 5' + P-element 260 1 77.57 ACTTGAAGTGTTAAAGAGGATTTGTGTTGGCAAAAGTTCACTAATTATTTAAATGTTATAAATTGAAAAAAAAAAAGTCAACTACAAAATTATGACAACTTAATAAAAAA:1 + chr3L 19956189 5' - Tc1-2 1368 1 60.00 GACAAACGCATTTTCAACTAAAGCACCAAAAACATACAGGGACATTTAAAAAATCGTTGAATGTTCTGCCCAAATGGTATCTAATTCCATTAAATATGAATGGAAGC:1 + chr2L 14318245 5' + HB 474 1 74.77 TATTTCAAATGAAAACAAGAATCATGAATTTTCTTATGGCACCAAAGCCGCCGGTTACATCTCTGCCCAATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTT:1 + chr3R 12040116 5' + HMS-Beagle 13 2 67.27 CACTCTCTCGCTGTCTGCAAGCGAATAAAAACGATTACTCTATAACATGCATGTGAGAGCCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCCATTGAGAACACGTGCTTTC:1 + chr2R 1373018 5' - blood 7367 2 59.26 GTGGCCATGTCTTTCAAACGCCACACCCAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCAACCCTCCTAGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTT:1 - chr3R 17658619 5' - HMS-Beagle2 6942 2 48.18 ATAATTTTCTTTATTACTGAAAACAAATTTGACATAATACTATCCAACAACGAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACA:1 - chr2R 18586745 5' - copia 137 2 53.70 GTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr2R 6984336 5' + HMS-Beagle2 48 2 70.48 ATAATTTGCGGATTTTTCTTCATAAGCACAGCATATGGTATCGTATACATATATCGCTCGCATCCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCCGCTCAGCAGCCGTTCCC:1 + chr3R 26705993 5' + F-element 4496 1 62.73 TTTACAATAAGCAACTAAGAGGACAATTAAGAGCAAAAATTTATAAATAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGTAAAATGAATATCTTCAAATGGCCTTTTTATTGTCTTT:1 - 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Rt1b 4993 1 66.04 CCGTCAACATTAAGTTTGCCAAATGAAAGGATAAACTCTTCCAGAGATTTTACACGATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 12452930 5' + roo 27 2 56.88 TTTTCAAAAACGGTGCCTCCAACTAAAACACTAACACACATACACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACAC:1 - chr2L 5076889 5' + accord 252 2 69.09 AACCAAACTCCAGCTGACAGATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAAGAAAAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATA:1 - chr3R 22500849 5' + invader3 64 2 74.47 CTGCTGGCTTGCATAAAATGGTTTTGAGCCCGGTTTGGTGGCTCGAGTGGAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - chrX 12145220 5' + 412 21 2 53.93 TGTAATAAATCCTATTAAAATTAATACGAATTTAGTTAGGTTTTCATTTTGTTCACACTCACCAATACCAAGATGCACACACACACACACACA:1 + chrX 5783153 5' + accord 180 2 56.99 TTTCGTGCGTAAATTTAAACGCACTTTATTGCCTTTTTGGAAGAACGTTGCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCAATTATTGCCTAATTAATTTTTCACTCGACGCAAG:3 + chrY 946222 5' - 1360 426 1 67.27 GGTGTAAAACATATAATAAATGCTTACAAATATGTATTAATTTAAATAAGAGTAGAGTACTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCAAATTACGAACAC:1 - chr3R 12040036 5' - 412 7540 2 72.73 AAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCTGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chr2R 5617514 5' - Transpac 284 2 58.00 TATCCTATATTAAAACAGAAGAAAGTCCTTTAATAATCGAGTTCCTCAACTCAATGGCCAAACTAATATTTAATGCATATGCCGAATGGGCATTTATTGGTTTATTAGAT:1 + chr3R 11957829 5' + blood 378 1 63.64 GTGGCATTGGGGAGGGCTTCAGCGGCGACGTTTGAGTTACGGAGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTG:1 + chr2R 13173586 5' + R1A1-element 5069 1 60.61 GTTTTGTGGGCCAAAGTCATTGAAATCCAATAAAATGCTTTGATATATATGTACATATATAGACTATGTGAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGCCATGAGA:1 - chr3L 10656764 5' + invader4 2606 1 67.27 TGTGCTTGTTTAAGCTGGAAACTGTAACGAATGACACAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 - chr3L 23236594 5' + Stalker2 7253 2 71.74 AAAGTCTGCAACAAATGTTTTTGGGGCTTACTCGAATGCACACACTCGTGCTACACTCAAAAACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGT:1 - chr3R 8543718 5' + hopper2 1201 2 67.78 CGACTACCAATTAACTTCATCCAAGTGATTGACATGAGACCTTTCGTAATGATGAGTGATAATATGTGAGGGATACAGCGACAATTTAAAGATTCCTCTGTAATTACTTG:1 - chr2L 11450230 5' - Q-element 101 2 73.64 GAACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chrX 12271483 5' + pogo 7 1 54.84 CAGTAAATTGAAGAAGTAAATAGGAGAATAAAGTCTTTTAAAGATAAGATTTGGAATGTGGTTTGCTGACATTGCGGACAAATTAAAATAATAATAATTGAATAATAATA:1 - chr3L 1805937 5' + invader3 5050 7 73.64 ATTTCTATGCTAAAGCTAGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr2L 12036101 5' + 297 6605 2 56.84 ATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGGTAAAATAATAGCAC:1 - chr3L 19339443 5' + Tc1 5 1 76.60 GCATTTAGCCAGCAGTCCTACTCTAATTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr2L 12036191 5' - 297 6962 2 67.00 ATCCGCTTAATATTATTTTTTTTTAGTGCCTTTGCGAAATTAACTTGCCGAAGTGCAGCCACGCACACACAATTTGGCACAAAGTTCCTTGCGGCAGGGGGCTGG:1 + chr2R 19791914 5' + G5A 405 2 66.67 CTTAAGTTGAGGGTGTATTCATTATATGGATAAAGTTCGACTTGGACTCGAACTTCGTTTCGTGGAATATAACTTGGAAACCACTTCAAAAGAATTTTAACGGCAAGTTA:1 + chr3L 20649317 5' + transib1 441 1 54.55 GGTTTAAAGCTCGTTAGCGCCCCCGGAAAATGGAGGGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAGATG:1 - chr3L 5283223 5' + Bari1 118 1 64.00 TCCGCACCCTCTCCCACATGGTTAAAACGCTTTGGTACCACGGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGTATTGGA:1 + chr2R 16266032 5' - HB 468 1 61.54 CAAAATCTTTTAATTGTTTACTGAGCTAATTGACAGTTGCGAATGTATTTAATTATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 + chr2L 16529168 5' + blood 7011 1 75.93 GGGAGCTGCTGATTGCAGATGGTCCAATCCGCGGATTGTGTGTATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCAG:1 - chr3L 10911580 5' - springer 7505 2 50.60 CACTAGAACTATTAACCAACTAATTATTAACAAACGAAATGTTTTCCTTTGTCATTCGTTGACATTCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3R 5219208 5' + Doc 14 1 64.58 TCTGTAGCGTCCAGCTAATACGCCCTCAGTCCTCATAAGAGCACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTGTACTCTT:1 + chr2R 6537883 5' - roo 9061 1 69.23 GTTTTCTTTTCATATTTCATTCATATTTTTTGAATTGAAATAAGCAATATAAATATTATAGATTTTCCACTTTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:1 + chrX 23282935 5' - HMS-Beagle 236 2 69.72 GCCATTTTCGTTGCTCTCAATTAGCCGTGGAAAAGCCCAATATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAACTTCATTAG:1 + chr3L 16291847 5' + jockey 4803 1 61.82 GACTGTGGCATACTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 - chr2R 11379794 5' - jockey 4967 1 50.00 TATTCCGATTTTACCTCCATTAATGGATTGTTTTCTAGTTCTTTCTCGGTTTACTTCTAACGCCTCATTATGAGTTTTTTCCCCCATTTATTTTTTATTTTTT:1 - chr2L 3783319 5' + hopper 139 1 69.90 ATACTTGGGCACATTCCTACCGAACACCAAAGGACCTAGAGGTACACTTACAACATATACACCCCAATACAATATACACTGCTCCGGATGT:1 - chr2L 14111631 5' + Idefix 77 2 53.85 GTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 21199695 5' + jockey 36 1 57.61 GGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGT:1 + chr3R 19537500 5' - hopper2 1562 1 62.73 TGATCACGTAAATTATGTCCAAAACTGAAAATAAAATCAGGCAACAGCCAAAAAAAAACAGAAAAAAAAAATG:1 + chr2R 18573608 5' - hopper 142 2 75.34 AATAGTTTAATGAGTTGTAGAATGGTTATGCTTAAATACAAAATCTATTACGGAATGTTAATAGTGTAGTTAATTAGACTTCCAATACATCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr2L 11762163 5' - mdg1 397 2 59.09 TGCTCTTCTCGTGATGACACAATCTAAAGTCATTTCAGGATTTATGATGTTTTAGCCCAAAAGATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAGAATGC:1 - chrX 15500064 5' - pogo 2080 1 61.82 CGTTGCCCGCAATAAGAGCCACCCAATTAATTTTTACCGGCTGGGGTGTGGTTTTTTTGTTTTGCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 17646848 5' - Doc2-element 252 3 53.33 CAAAGAAATTGTACAAATTTAAATTGAGATTAATCCAAATTTGAGACTCAGTGGAATTTAAATATATACATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr3L 5553165 5' - 297 376 2 65.45 ATTGTTACACTATGAAAAAAATCTTAATTCAATGCCTTTTGAAACAAAATTATATTATAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 5018700 5' - roo 9053 2 58.42 ATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATATTCTAAAGTA:1 + chr3L 20189583 5' - FB 257 1 40.91 AAACAAAAGAAGCGCTAAAAATTCAATTATCTGAGATGGAGAGGTTCATAGTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCTAATTTTTGAAAT:1 + chr2R 10047111 5' + FB 21 1 57.73 CTTAACAGGAATATCTCTCTCTCGCTCTCGAGAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGCTG:1 + chr2L 22497777 5' - invader1 3703 2 82.54 TTTATTTATTTATTTATTGAATATGTGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 - chr3R 13369243 5' + F-element 48 1 69.66 ACGGTGCAGAATGTGGTCTTTGGTCACTGTCCCTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCC:1 + chr3R 24306022 5' - opus 201 2 70.00 TTAAGTGGACTCCCACACACAAACAGAAGCGATCCATACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 + chrX 15202698 5' + hopper 46 1 65.45 ACTCCACACCAAATATCGTACAAACTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATA:1 + chr2L 14135414 5' - roo 348 2 77.27 AACGTTTTGAATCACAGTTATGTTGTGTGTGGTTAAAGTCGATCGGGGATTGGCTGTGGGCTAGAAGG:1 - chrX 508131 5' - G2 2888 1 75.00 TTCATGTCGCTTAATATTGCTCTGATGGACACATAAAAAAAACTGAAAAAAGATATTAAGAAAGGTACAAAACAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTC:1 - chr2L 16163850 5' + 1360 3153 1 67.27 TTTGCATTATTCGATTGCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCCAGATATCTGCATTATGTTTCCATTTTT:1 - chr3R 23861121 5' + pogo 50 1 78.72 TTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCACCGC:1 - chr3R 13423362 5' - rover 308 2 60.00 CAACTGAATGCTGAACCCATCTTATATTTGCATGAGAAGCATTAACAATTGACCCACACGCTAACTACAGAGCGTCTCTTTCGATTTATTTGTGTGTATTATATTATTAA:1 + chr2L 2573333 5' - Doc2-element 80 1 62.73 GAATGGCATTCCTTTCTGCGCCAGTTTTTCGCCAACTCACCCCTCACAGCCCACCGTAATGCCTGAAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTC:1 + chr3R 17986059 5' + I-element 5141 1 69.52 AAAGTAGGCAACAAAAACATTTATTGCAATTGTCCTTTTTTTTTTATTGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1 + chr3L 15614455 5' - jockey 4966 1 61.54 GCAGATTTCTAAATTAGTTTCAATTGCTTTAAATAACTGGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAA:1 + chr3L 6045455 5' - Bari1 1554 1 61.00 CACTGCCATTTTTGTGTATTCTTTCATTTCGTTTTGCATCATTTATTTATAAAATTTCACAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCAG:1 - chr3R 19775432 5' - blood 422 1 57.27 TGTATTTTATGGTCAAAGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACA:1 - chr3R 14055932 5' + accord 7036 2 81.91 ATGATGTCCGGGTGATCCGGCTGCTACTTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCT:1 + chr3L 12489973 5' - G2 2901 1 59.42 TTTGCTACAATATTTAAATTTGAATATAAAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr3L 18095547 5' + I-element 53 1 70.19 CGATTTCGCCACCGGGGAATTTCAGAATAAGCATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGC:1 - chrX 16560646 5' - S-element 1678 2 70.00 GGTATACTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAGCAGCGTTTCCGATCCAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTA:1 + chr2L 12183688 5' + INE-1 135 1 70.91 GTTTTATTTTTTCCGAAACGCGCGTGGCAAAACATGAAAACAATAAATAGTTCAAACTTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATT:1 + chr3R 21058772 5' - gypsy2 130 2 51.46 TGAAAGGAATTTTGTCAAATCACAGTAAATTCTTTAACATTAAACGCTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACA:1 - chr3L 14688167 5' - invader2 4794 1 58.18 AGCAAAAATGTACTCAAAAGTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3R 12043089 5' + jockey 20 1 63.16 TAAATTATGGCATCGTTATGGGTATATAATATTACTAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 - chr3L 3611797 5' - blood 364 2 64.89 CTACGCAGAACGCGGCAATTTCGCTTTAGATTTTACTGCGCGAAATTCTTTTTCAAGGCAAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAACATTAATA:1 - chrX 1599470 5' + hopper 21 1 62.73 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGTGAAGAGAAGAGGAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAG:1 - chr3L 22648639 5' + Stalker3T 203 1 55.70 AATGCTTACAAATATGTATTAATTTAAATAAGAGTAGAGTACTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - 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chr3R 13543956 5' - 1360 3360 1 54.55 ATCTAAATCGTTGATAAAAACGTTGAACCGGGCCTAATTTATGTGTATATTGGCATTAGTTGGGTGCGGGTATTTGTGTATTTATATTTATTATGGCAAAGTGTCCCAAT:1 - chr3L 15391566 5' - Stalker 68 4 64.55 ACTGTTACGAAAAAGTCGTGTATGTGATTTTTGTTGGGCCTGTTATATGGTTTATTTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAA:1 + chr2L 11963589 5' - gypsy4 471 1 54.55 CCTTGGGTAAAAGGGTCGTAAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 20398514 5' - roo 358 2 77.66 AATCAGAATCAGTATGCATGGAAATGGACCAAGCTGAGCAAAAAAAAAGGTTTCACAACTGTTAACCTAAAATACTAGGAAATACTATGTTCATTACTGAATCTTG:1 + chrX 14519252 5' + Chouto 5853 1 60.38 TACTTTAGCCACTCGGACCTTCTCATCATTCCCCCTCACCAACAACCTCCGCCTATGAA:1 - chr3R 19448031 5' + accord 30 2 54.24 CCTGGGGCAGTCAACTAAAATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACAAT:1 - chr3R 11445582 5' - R2-element 3429 1 75.00 TTAATGACAATAATAGTTCATTGCCGCCAAACCCATTAAATAATCATGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATG:1 - chr3L 2902817 5' - Stalker4 397 1 57.27 GCCCTAATTGCCCAGGAACACACACACACACGCAGTGCCAGAAAGGACGAAAGGACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTAG:1 - chr3R 13733037 5' + hopper 5 2 65.12 AAGGTGTATGCGTGGTAGTATCTGTGTGAATGTATGTTTAATGATCTGTGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr2L 3907407 5' + hobo 28 1 56.00 CTGCCCCTTTAATCCTCCAACAATGCTCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCACTTCTAACTGTAACTTTTTTAAGTCTTATGCT:1 + chr3R 6991650 5' + 3S18 5944 2 70.00 ATGCGAAAAATCAATATTAGTTTCACTGTTATTACGGACAGACGGACATACCTAGATCGACTCGGCAATTGATCCTGATCGAGAATATACTT:1 + chr2L 21259664 5' - INE-1 80 1 63.04 CTCCAGAGTACTGAGAATCCTTGTTGCTCATCAGCATTCCATGCAATCCAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGCAACATA:1 - chr3R 19336871 5' + TART-A 13161 1 60.91 GAAAAATGAAACGCATGAAAATGTCACGAAAAGCGAGGAAGCCAAGATTAGAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAG:1 + chrX 2634282 5' - Cr1a 4203 1 58.02 CTTCGATACAACAAGCTGATCTGTTGGCGAAGGCGGCATGCAACAGGTACCGCCTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCG:1 + chr3L 16916063 5' - Bica 4659 1 54.29 GTGTTTCGTGCTCGTGGGCTAGAGTTCATTGATGTGGAAATTGAATGTTTAGGCTGTAATATTTAGGAGATTTTAATTAAGTAGGATTTGTC:1 + chr2R 20366486 5' - 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chr3R 29371606 5' - TART-B 10335 1 70.19 GTCGCTTGAAGACCGATTTACAGTTAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 - chr3R 23665060 5' - 1360 3346 1 77.32 ATTGAAAACTACATGTTTTAGAACTTCAATATTTAATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 + chr2L 17263136 5' + Transpac 46 2 66.36 CTGCTCATTAAGTTTGCGATACGAAAATCACCAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAA:1 + chr2R 11102135 5' - R1A1-element 4934 1 71.82 GGCTTATCCCGTCGATTTATTCCGCCGACTGTATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr2L 18159108 5' - 297 6941 2 69.90 ACGGCAACAAAATACAGGAAATTGAGCGCAAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr3L 19347245 5' - jockey 4971 1 64.55 ATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1 - chrX 21667933 5' + gypsy2 29 2 57.84 AGCAGTTACTGAAAACCCAAGAATATGAAAAGTGTGGATCTACCCTGGCTCCAATGCATGACGCCATA:1 + chr4 855561 5' - gtwin 7109 2 70.59 GGATGTCTGGCAGCAGTGAGGACTGGTATATACTGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGTTTCGGGCC:1 - chr3R 31633202 5' + opus 160 4 69.52 AACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAAAAAAAAA:1 + chr2R 21358403 5' + BS 5096 2 31.82 TTCTTTCTATGCCCTTCTATTAGGTTTAAGGTTTCTCATTTCCTTTTCTTTGCTCCACCCTCCTTCACTTTTTCACTTCTTCTTTCATCTGACTCTGCAT:1 + chrX 12023454 5' - Bari1 125 1 78.00 CCGCACTCGCATTCGCCTGGCTGTCATAATGCGGCCCATACGCACAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 + chr3R 21339732 5' - hopper 1393 1 53.26 GCATAGTCCTTAAAATTTTATAACTTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACA:1 + chr3R 22979360 5' + Juan 4129 1 69.09 ATTCAGCTGCTGACACATTCAGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGCTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTTTTT:1 + chrX 23453710 5' - I-element 4936 1 76.85 TATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 + chr3R 17673728 5' + FB 6 1 75.93 TACGCAGAACGCGGCAATTTCGCTTTAGATTTTACTGCGCGAAATTCTTTTTCAAGGCAAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:1 - 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Ivk 5150 1 67.50 GCGCCAGATATCAAATCATTGAAGTAAAATAACGCCGAAGAATCTCACCAACCGCTGGAACTGCCACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTG:1 + chr3L 23236487 5' - Stalker2 7644 2 67.71 ACTGACGGCCCATAAAAATAACACAGCACAAATCTCATCTGTGTAGTTTATATACGTTTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGGCT:1 - chr2L 1641057 5' - G2 2894 1 68.89 CAAATTATGACAAAATGTAACCATAAAAGGAAACACTCCGGTTGGCCAGAAATGCAGTTTCATACAAATCTGAAGGGC:1 - chr3L 2329750 5' - TART-B 424 2 37.18 ATAGCATACTTAACTGGGCCATTTTCTAAGCTCAGCTGATTGCAAATCAAATCTATCATATTATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTACGC:1 + chr3R 17777567 5' + Burdock 20 2 58.33 CATGTCGCCCCCAAAAGACCCCAAACCAAAGCGAAGTGAACCGCACCACACACATGCATACATTACTACATAGCATAAGAATCCCAATTTTGGTGACAATAACAAATTCA:1 + chr2L 5424158 5' + Quasimodo 144 2 54.55 TTATTCTTTGTTGTTCTATGTTATTTAATGTTATTCAATGTTATTCTATGTTATCTGGATTGAGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGATTGGTGT:1 - chrX 22599308 5' - I-element 5098 1 50.54 CATTGCAATCTACTGATAAAAATATTTAATTGGCTTTTACTCGCACGGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACCCCATTTCATGGTCCTTCG:1 - chr3R 16776729 5' + Max-element 310 1 55.45 ATTAAAACTGACCCAGCTGGTCGGGGGAAAAAAAAGAGTTATACGTTTCTAGGTTGTTTTTGCGGGATTGCGGCTCCGCG:1 - chr2L 19826977 5' - Idefix 263 2 82.50 ACATGGCAGAGAAGCCGATAAGAATGCAAACTCACTATAATAACAAGATGCATAACGCCATTCGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr2R 21785898 5' + 1360 59 1 64.84 GTGCAGTGGAGTACAGCTCCAACTCCAACTGCGTGTCCATGTCCAAGTCCAAGTCCAAGTCCATGTTTGCCTACCAATTAGTTTTTTTTGCCCAC:1 - chr3R 29982547 5' + FB 88 1 69.47 AGCGAAATATACAATTGCGAATAAGGCCAAGTGCAATAACACTTAATGCACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACG:1 - chrX 5926379 5' + Doc 4535 1 55.45 GTCCCGCAAGAGACGTTGACTTCAAGCCAAAGAAAACAAATTTCGACAACTTAAATGGCTAATAGGAAAACACTC:1 - chrX 3778480 5' + Porto1 4192 1 57.33 CCGTTTCTTGTCGGACGATTTTTGTAGTTAGGTTCAATATCTACATAGAACATGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTTTTAATATTACTTCTGTTTCTAACA:1 - chr3R 23196428 5' - G4 460 1 77.14 GCGAGAGAATTCTCTCTCCCGCTCTCTCGCAGGACTCACAGTGGGCAAAAATATATGGTTTATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr2R 15155283 5' + flea 4768 2 70.87 AGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACCCTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr2L 13836539 5' + blood 49 2 75.26 TTGCTGAGTCTTACGGAGCATGTTATGAACCACCTTCTTTTTAAGTATGTATAGTAAAGAATTAATACCGTATACTTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chr2L 18749820 5' - pogo 2095 1 71.28 ATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 75.45 TCCCAAGGCGTTTTAATTGAACTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2R 8086883 5' - 1360 3383 2 73.27 TAGCGGACTGCTGGTTGCGATGGTGGCCTTGCGTTCGATGGAAAAGTAAGTCGCCTATCCAATTTATACCCTAACCGCCTAGCAAATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCT:1 + chr3R 21243861 5' + G5 4610 1 64.55 ATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAAAAA:1 - chr3L 24916694 5' + Porto1 153 1 55.96 TGGCAGCAAACGTCGCATAATACTCGTAGTACGTTGCGTGTCGTAACGCTAAACGTCAACCGAATGAGAAGAGCAGCGTATATATATATG:1 + chr3L 7808130 5' - blood 191 2 72.22 AATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGCCATT:1 + chr2R 22663337 5' - mdg1 7415 2 61.82 GTTGTGTGGCCACGCGTTGGCTGTTTTGTTTTTTTTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTCATTATGTTTCAATAACTTTTTATTTAATTTTTTATTTCACCACTCACTACT:1 + chrX 8013961 5' + accord2 7325 1 75.45 GTAAATTTCCAATTGTAAACAAGACAGCCACCCAAAACTGATTTGCCATTTGCCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACAG:1 - chr3R 8726880 5' - BS 78 1 66.00 AAATTTACAAATTTTCGGCTAGTTTTAAGAATAAAGTTTTGTTATTCAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACACA:1 + chr2L 15960311 5' + F-element 39 1 55.00 TTCATACGATCTGCCATTTTGAAGCCTTTGGTCTGCAGATTTTCCGCAATGCCAAAGGTGTATTTATGTACCCCTAAATAATCTTGTAAATTGTCAACCCTTACGGATA:1 + chr3R 11685700 5' - Dm88 4325 1 41.28 AGTCAACCATTCAATCCACCTTCCTCTGGACGGGTTCCTCCCATATTTCCTCCTCGATGCCGGCATTTGTTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCGTCTCT:1 - chr3L 6046494 5' + invader6 4518 2 68.93 TATCCGATTTCAGAGTCCGGAGGTCGCCTTCTTGCCATTTGGTTGCTAATTAAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCA:1 - chr3L 5212252 5' + F-element 202 1 65.43 CTCCACTGAGTGATACATGAGCGACAAGTAGTGTGCAGTGTGGAGTGCGGACAACCCACATAGCTAGAGAGGAAAATAAACAGAATAGATTTCGGCCCGAAAATCGTC:1 + chr3R 27380137 5' + 1360 3187 1 78.70 TGGTGGACCTTGTACCCGAGCGGGCCGTACGCAAAAGGGGAAATAACGGGATCC:1 - chr3L 25497421 5' + gypsy8 314 1 92.59 TACTCATTTCAATATTTTTTTGGAATATCGGTAGAAATTGGGAAAAAAAAATAATAAAAATAAAAAATTCAAAATTATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCA:1 - chrX 15903326 5' - INE-1 91 1 61.76 GCCGCTTAAAGTTTGCAGTTGAACTTTTCGATTAGGGCTTAGAATGCAAGTTGATAGCACAGGGATGGAGGGATGAGGGATGGACAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGA:1 + chr2R 9315469 5' - Cr1a 3977 1 61.82 AGACTGTGGCATACTTCTGGGCGTCTTTAATTATTTCGCACAGTCCCCAGAGAATATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 - chr2R 11379795 5' - jockey 4968 1 49.09 TATTTCCATCAGGAACATTCCGGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGATA:1 + chr2R 1377178 5' - Doc2-element 4468 1 77.23 ATAAATCGATTAATGCCAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATAAAGCGCGAGTCCAACTGGCCATGTCCGCCTGTCCGTATAAACGTCGAGATCT:1 + chr3L 5957381 5' + INE-1 133 1 76.04 CCAAGGCATTGTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACTGT:1 + chr2L 12591726 5' - roo 9024 2 62.73 TGGCGATTTGTTCCAAATAATTGGTGCAGCTCAAGGAAGCTGGGGGCGGAAAAATCTAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 - chrX 12604513 5' + FB 51 1 76.77 ATGTTGTTGTTGTTGTTGATGATGATGATGTTGTTGTGTGGTTTGAGTTGAGTTGTTGGCAGATATTTCAAGCAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTTGCCAGTTAA:1 + chr2R 13179017 5' - Porto1 4189 1 70.00 TCCCTTTTTTATACAACGATATCATAACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGA:1 - chr3R 23730035 5' + Burdock 6181 2 74.26 TTTTTGAAGAAAAAATCATTATAATAAAATATGATACATAATAACATTATTCTATAAGCAATCCAACAACAATAACAACAATAACAACAACAATAATAATAATAACAATA:1 - chr2L 17602923 5' + mdg1 7072 10 62.73 CAAGAAAGTATTAGCCTACTATTATTTTAATTATAACTGTGAGTTGGTTTGTAAATAGTTTGTAATAGTGCATTATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr4 453861 5' + 1360 11 1 58.18 TAAAAGAGCGGAATATTTAAGCATTAGCTATCATAAGCAAATATAAATTAAACTTATTGCGAAATATATAATAGATTGTTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAG:1 - chr2R 10163654 5' + Juan 4087 1 70.91 CAAGCGTGCACACAAATACACGGAGACAAGCTGGGCAATTGCTGGTCATGGCGCACCACCTACCTTTCGTTATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGA:1 + chr2R 6934003 5' + Q-element 281 2 67.96 ATGTTCTTTTTAAATAAATGTCTCATTATATGGCTGCCACGCCCCCACCGCTCAACGCCCACACACGTGCCGCCTTCCGGCCACGCCCACACATTTGAATAATGT:1 + chr2L 12554684 5' + INE-1 255 1 74.29 GTGGAACTGCATTTTTTTTTGTTTCCTTCCTCAGTTTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTT:1 - chr3R 23819046 5' - Juan 4146 1 67.89 TTACGTTTGTTTCCTAGGGATTAGTGGAGATGTGGCTTTCGGAGGTTGAAGTGGTACT:1 + chr3L 4873231 5' - I-element 2 1 72.41 ATATTCAATGGGCTCGAGCGGAAAGTATTCAAACCCAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr3L 10836534 5' - opus 485 2 57.50 GGTTTGTAGTAGCAAGGGATTAGTTCAGGTGCAATTTGGAAATACATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chr3L 11085811 5' - S-element 1677 1 62.73 CAAAAAAAGCGCAAAAATTTAATGACGGAAATTGAATTTTCTTTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGAGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTG:1 - chrX 343631 5' - I-element 4974 1 57.27 AAAAGAAAAATTTAAACTTTCAATGTAGAGGGGCCCCGTCCCAGTACTTTTTTGCGTGTTTTTTTTGGCAGAAATTCGAAATGATGACCTATCTTAACCAATTTTGGTTT:1 - chrX 20817485 5' - transib1 2096 1 49.09 GCCAATCGAGGGGCCAGCTGCTGTTGTCTCTCCGCAATCCTGGGGGTAGCCAGCCTTTTCCTTTGCCCACTTATCATGTCTCA:1 - chr2L 8170724 5' - rooA 7251 2 79.52 ATTGTTTACATTCGCGGTTGTCTATTTAAAATTTGATAAATTTTTTGTGTGTGTTTTGTGTATGAATACCTATTCTTTCGAAATTCGTAAAAATATTTTAAAA:1 + chr3L 2169293 5' - transib4 114 1 40.78 TCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 + chr3L 19951179 5' + Ivk 20 1 62.73 ACACGGCCATAACTCGTAAGTTATATGCACATTAGAATGGTAACAATGTACTGTTGCCTAGCAACAGCAATATTGACATC:1 - chr3L 18687628 5' + F-element 4297 1 60.00 TGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATTTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTG:1 - chr2L 23295873 5' + micropia 8 2 56.82 CCCACAGTCGCAGTGTGCCAGTTCTATTTGCCAGTTTTAATTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTG:1 + chr3L 11319720 5' - Quasimodo 128 2 68.57 TAATTGACAGTTGCGAATGTATTTAATTATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 + chr2L 16529194 5' + blood 7039 2 55.45 TTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGCTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGACGACGTTTT:1 + chr2R 5214958 5' + F-element 21 1 55.43 GAAGACACTAACGTAATGGCTCATAATTTCAATTTTGGCCAGACAAATTTCTCACAATTAAAATCGCATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGAAT:1 - chr3R 8193662 5' - rover 134 2 64.22 CTCTCGGCGTTTAGTTGGAAAAGTCTGGGAAAATCTGGCCATAAATTTGGCAAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTG:1 - chr2L 1924972 5' - roo 155 2 65.56 GCACTCGTTAAGCGCGACCAGGCGTCCTCTTTGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAACTCAGTAATGCAC:1 - chr3R 7171307 5' + 297 42 2 68.57 ACAGGCGTCATGTATCATAGCGTGCATTTAATTGCTTTTAAAAAAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTCTCTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 - chr3R 25434826 5' + opus 35 4 60.00 CGATTGTCTCAACTTTAATTGCAAATTAATGGGAAACAAATTAAAAACACGAAACGAACAAAATCAAGTACAAATTGCTTCACAGGCGAC:1 + chr2R 21142135 5' - accord2 7228 1 68.89 AACCAATATTTAAACTGATTACATTAATACATAATAGTTGATAATCATAATTCTTGGAATAGATAATGAGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr2R 20673622 5' - 1360 3378 1 69.44 TGAAAAGTATGCAATATTTTTCTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGCTTGTCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGATA:1 + chrX 17262313 5' - X-element 4470 1 93.00 GGTCGCTTCGGCCCGTATCACGGCTGAGGACAATGTATGCTTTTTGGGTCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACAC:1 - chr3R 902586 5' - R1A1-element 5305 1 67.86 GTATTTTATGCCTGTGGTGGCATTTCTTGGTGTGCCAAATGTGTTTGTTTGGCAAGCAAATTGAAAACAAATTGTACTACATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATA:1 + chr2L 10886307 5' + copia 4827 1 78.18 AGTAAGATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 31458543 5' + jockey 18 1 64.58 GGCTGCCATTACTGCCCGCCGCATCAAAGTAGAACAAGGAACGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAGCAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCA:1 + chr2L 7447034 5' - diver2 4610 2 72.22 ATTAATTCAACAGAAGCTTGATAATAATGGAGAAGTCGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTG:1 - chr2R 16748763 5' - pogo 459 1 60.44 GCTCTCATAATTCCGTAATTATCAAGCGTAACCAATTAACTCGCAATTATCCCAGACAGCAAAAATGTACTCAAAAGTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 12043032 5' + jockey 15 1 72.48 GGCGGTTTCTGTAATTAGTTTTGCAATCAAAGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTTTACTGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2L 13836509 5' + blood 7 2 65.88 GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGATAAGATAAGACAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 + chrX 16983077 5' + Stalker3T 205 1 56.36 ACAAGTGCAGTCACACCAAATGCCTGGCCACTCGAGCCGCAACAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 9435891 5' + roo 8687 2 57.61 AACTATTGAGGATTGTGGTTTGATTTTGGAATTGAATGAAGGGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr2L 21034054 5' - 412 7530 2 60.24 CCAAAGAAGTTGCACAAACACAGCTGTTGCACTCATCGACCAAACAATGCGAAGAGTCGCGCTCCG:1 + chr2L 4762161 5' - invader4 2763 2 77.27 CAATAAAACACCTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 2426446 5' + roo 8710 2 70.91 CGAGCAAATAAATAAGCAGTCTCCATCCCTCACCCTCTCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCACTTAAGCTAATG:1 + chr2L 18313740 5' + G6 1950 1 70.00 CGAAACACAATAGCAGAGCTGCATAAAACGAATTCTACCTCAGCGTTTCCGGCTCGTCGTAAAAGGCTACTAAA:1 + chr2L 11275029 5' + Rt1b 4884 1 60.81 CTGCAAGCAATATGCTAGTTAAGCCATCAATTGGCATTTGGACATTACCTAATAGGCTGCCAAAGGTGGTGTTACAAAATATT:1 + chr2L 20037915 5' + Bari1 1375 1 66.27 TAAGATCAGTTGATCCTAGATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGT:1 + chr3L 4264944 5' + Transpac 19 2 64.22 GATTGACCACAGGGAGGATCACCCAATCGAAGTCCAACAGAAGATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 7400807 5' + roo 14 2 53.01 CACAGAAAGAAGCATGTTATTTGTCAAACCGACAAAGAAGTTTAAATGAAAACACTGTCTTTGCATATTCGAAATAAATATAATGTAAAATAACTATATTACATATTACT:1 + chr2L 4189183 5' - Cr1a 4306 1 72.73 GCCTGGTTACCACTTGTTACTGTTAATACTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACACCGAGCGGCCAATCACCCATAGCC:1 + chr3R 7059511 5' + F-element 312 2 61.90 ATGAATAATTGTCGCCACTGCTTTCTTGTAGATCCTCTCAATCTAAATTCAAAAACAGCAAAAAACACACAAATAAACTACTAAGCCACCAAAACTCAAACTTCAGATAA:1 - chr3R 9013502 5' + Porto1 4476 1 54.55 GTTCAATTTTCTTCTTCTTTCAATATTTTTGTGACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1 - chr3R 15309419 5' + HMS-Beagle2 6906 2 57.01 TAGATATTTTAAATTCCATTAGCTTACTTTTGATTTCGGTTCTGAATTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGTAGCCCTCGAAATTC:1 + chr3L 3020443 5' - jockey 4554 1 54.55 TAATGATGAAGTTTCCCGGCCCGCAGCTTTTCTTTGGCACTTCCTTGCCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGACCCGAAGTATC:1 - chrX 4850989 5' + hopper2 191 2 52.88 TATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr2L 16067136 5' + HMS-Beagle2 20 2 56.10 TATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTTAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTCCGGTTTAAAGAGGTGA:1 + chr3L 17405715 5' - roo 9005 2 82.73 TTGACACTATAGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 16742239 5' + 412 37 2 58.18 ACTGGTTTGAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3L 131818 5' - P-element 2852 1 51.82 ATAACGACAGCCGAGTCAGCCAAGGATGCTGGGGAGAACGGGAAAGGTATATAGTGACGGATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCCTTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chr3L 17153568 5' + 297 6616 2 55.56 TTACCAATTTGCATCTCAAAGGTAGTTAATTTCAGATCATATTATGGAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTATCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 7750619 5' - opus 7460 2 60.00 AAACCACCTGCCGGTCGGTAGGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr2L 23189412 5' + 1360 59 1 92.31 CAAACACATTTATTGCAATTGTCCTTTTTTTTTTATTGTATTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCTATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 + chr3L 15614466 5' - jockey 4949 1 71.82 GTAGGCATATTATCATCGACATAGTCCAGTAGAAAAATCGGAAAGCCACATCAAAACAATAACATCCTCAAGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTG:1 + chr3R 30891987 5' - I-element 5134 1 59.00 GTCCGCTTTTTTACCACCGCCCCCACTTCCCCCGTTTTCTTCAACGATTTCGCTCCTGTCCCCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAA:1 - chr2L 11211214 5' + hopper 19 1 57.00 CATAAATTTGATGGGACGAACACATAAACTCCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGA:1 - chr2L 19129410 5' + FB 25 1 56.36 GTCAACAGCGTGGCGTAAAATGTAATTAATTTGCTATTTTTAAAAATAAAAATGAGAAATTTGAGTGAAAAACTGGCGCCAAAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGA:1 + chr3L 10145201 5' - S-element 1527 1 77.27 GCTCCATTTCCCTCTGATGTCTTAAACTTTCGTCCAAGTTGTGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCT:1 + chr2R 19432706 5' + Stalker4 7157 4 59.72 CAAAGCTCCGTTCGATGGGGGCCACATTTGTATCTCTGTATGGTTGTTACGGAAATGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGG:1 + chrX 1080545 5' - baggins 5136 1 76.83 CTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1 - chrX 21667918 5' + gypsy2 29 2 58.62 AAGTCGTCCTTTTTCACTTTTCTGACAGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGG:1 + chr3L 2053098 5' - F-element 288 1 66.67 AAAGCCCATATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTA:1 + chr3R 13423279 5' + rover 6981 2 54.55 ATTCCTCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 - chr2R 23354370 5' - Tabor 476 2 63.54 GTTTTCCTTTCGAGAATTGGGCGCCAAAAGACAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAACGTCTTGCTCTACCATTCTATATTG:1 - chr3R 29309526 5' + F-element 4234 1 70.91 AAAGTGTGTTGAATTAAAGCGGTAGATTTATTTGTTGTGATATATTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGGCTAA:1 + chrX 22593600 5' + I-element 27 1 50.00 AGTTAGAGTTCGGAAAATACGATCTTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTAT:1 + chr3L 2818415 5' + Chouto 147 1 66.97 TGAGCCGTTTGTTTTCCATGTTCGAGATGAGCCACCAATCATTGCCGCCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAG:1 + chrX 13413861 5' + ZAM 8024 2 54.81 ACTTTTGGGAGTTCCGAGATGTCGAAATGCTCCCTCGCCACCCAGCCGATATAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chrX 7677113 5' + jockey 4691 1 55.10 GATTTAGAAGGCGGGGAGTTTTGAAGTTATGGAGTGAAGTGACTCAAGGGTGGAAGATCTGCCAGACCACACTGTTACTCAGCGACGCTATTGTAACGTG:1 - chr2L 8424516 5' + Bica 4812 1 57.00 TTTTGTTAACTTTTCGCGTGGGCGTTGGTATTATTTAAATATAGCTTATAAATAGTAATAGCTTTATCTATGTACACATCACAAAATAAATTTCAATAATGACTTTATAT:1 - chr3L 14447804 5' + 1360 377 1 73.64 GGGATCTTCGATGTAAAGCTAAATTAATTAATGAAATGAAAACAACTTTGAAACGAAAACAGGAAAATGGATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAA:1 + chr3L 13311547 5' + Porto1 4420 1 63.64 CCAAAGTGCCCAATTGGAATGTCGCATCAAGTTATACCTCAAAGACAAGAAACTCTCCGAATGGGCAC:1 + chr2R 10126108 5' + Ivk 4931 1 64.71 TGGAGGCACAAAACAAAATATCGAGATGTTCATGGAAAATAAATAAACTGAGCAGTGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAGGGGGTATATAG:1 - chr3R 11071390 5' - Cr1a 4132 1 53.21 CGCAACCTACTGCAAAAATTCAATACCAATTTTAAACTCCTTTGGATACTAGGACAAGTTGGAATACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATA:1 + chr4 195359 5' + I-element 5118 1 67.27 CACAGATACACAAACAGACGGATACGGATAAAGGCGCAAATAAAAACAAGAGTGAAAAGAAGAAGAGTTAGACCTAATATGAGAATCAA:1 + chr3L 2570419 5' - NOF 305 1 61.80 AATACATTCTTACGCAGGTAGAACGGGTATTTGTGGGTATGTGTGTGTCTACCTGCCGAAGACTTTGGCCACGAACCTTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTCATTC:1 + chrX 1899305 5' - Idefix 145 2 76.36 GCATTAGTTTGGCGTTATTGACAGTTTAATTGGAAATTAGAATTCTTATCGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr3L 126351 5' - pogo 2100 1 76.09 CAGCGAGGGAGTCTGTCTGCCATGTGGTTTTTGCGGGGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTAGAAATTTTC:1 + chr3L 3882061 5' + R1A1-element 148 1 64.55 TTTTTTCGTATGCTCAGTATTCAGTTGGTGTTAAGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chrX 14858946 5' + 297 28 2 63.54 CGGTGAAATGAGGGGGCATTGGGTCGCTGTGAAAATTGATCTGATCCCCAAGAGGGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATA:1 - chr2R 19018404 5' - roo 8685 2 37.65 TTTCTGATCCTCTGACCTGTCGGTCTATCTCCAGCTGTTGTT:1 - chr3L 9317360 5' - F-element 425 1 61.90 TCTGTAATTAGTTTTGCAATCAAAGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr2L 13836516 5' + blood 39 2 59.09 TTCCTGCTATCCCAACGGATTTCTTGTTTGCCTTGCCTAATTTGCTTTAAGCACGTTAGATCAACAAAATTTCACA:1 - chr2R 8699396 5' - S-element 351 1 61.84 GAATGTTGCTATAAAGAGCATACAAGGGTTTTTATACCCGTTACTCGTTCAGTAAAAGGGCATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 + chr3L 25703067 5' + INE-1 30 1 71.15 CGCATCGACAACTCCTGCCGCACAGACAATCCAACCTGCCACATCCGCAACCCTTGGATGTGGTCGCATTTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAG:1 + chrX 7869753 5' + I-element 5115 1 73.33 AAGTAAGGAAAAGATAAAACCATTAACGGCAAAGTGGAGAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTTAAGTGTAAACTTGAAATTTGTGGTTTATTTTCTTGTATATTA:1 - chrX 12367178 5' + S-element 1553 2 61.82 ACTAAACGTGGCCAATAAATTCTGACACGCTATTAAAATTAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAA:1 + chr2L 20807090 5' + P-element 456 1 41.82 GCAACACGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGGTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGCCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2L 9171488 5' + opus 7141 4 61.45 ACTCTAGTTAGGGTTAGGTTATTTTATAAGTGAGTAGAGAGGGGTTTAATCTATTTCCGGGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGGGGGTGTGTGTGTAAGTATATG:1 - chr3L 21437143 5' - Quasimodo 30 2 59.63 CAGGCGGACAAACTAAAAGAGAAATAAAATAAGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAACCA:1 + chr3R 16518599 5' - FB 736 2 69.09 GGACCAATCCATTCCCTAGCATGCATTCCGGCCTCCAAGAATATGGATTGCTTCTCAGCTCTCCCATCGTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGC:1 - chr2L 9767604 5' - copia 168 2 68.18 GCCGATTCTGTGCACACAGACACACACACACACGTGCGGGGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAGGCAA:1 + chrX 1599384 5' - hopper 1378 1 59.62 ATTTGGTTCAAGGAATGTATTATTCATAAAAAAAAGAAGAAGCCGGAAAAATAAGTTCGTTTTAAGATAAATTTGTATAACCAAAGACACTAGAATAATAT:1 - chr2R 7514089 5' + Tc3 241 1 79.21 AAAGGCGGTTTAAAATATAAAATGAGGCATCTTCAAAGAAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGACAT:1 + chrX 16067415 5' - FB 648 3 62.73 AGATCAATCTGTAACTTGAATGTGGTTAAGTAAAGAGGTGCATATATATTTTTTTACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAACGTAATTTTT:1 + chr2L 7055144 5' - 1360 383 1 55.45 CCCAACGGCCTTGCTTATCAGCCGTTTTCCCTTGCTTTCCTCATTCGTTGGCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCAAAGA:1 + chr2R 14307081 5' + 297 6767 2 66.28 GGAACTATAAAAGCCAGAAGGTTGATATTAAGAATACATATTGCCCGTTGACCCATGTTGTCACGCCCACTCTAACGTCCACAAACCG:1 - chrX 392288 5' + INE-1 220 1 68.18 AAAGGGTTTGGGGTGCGTCCATCGGTCATTTTGCTGGTCAGTTGACACGGGCTCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGA:1 - chr2L 17197545 5' - F-element 4321 1 65.22 CATGCAACACTCTTCGAATGCACTCGCGGTTGGAGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACCATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr2R 6707699 5' + 1360 47 1 66.97 TATATCGGTTATATCAATTTTACAATGTAACATTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAG:1 - chr3L 7984463 5' - R2-element 3447 1 70.91 GTGTGTGTGGATTTGAGTGTGAGTGTCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 18009511 5' - P-element 2875 1 49.23 TAGTCGTTGATCAAAGCTCTCTGTAATTGATTTTGTAATATTTTATGTATGATTTAATTTTTAATTTAATTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 + chr2R 4137665 5' - Juan 4195 1 60.00 AATGCATTGTTTGTGTTTGTCTATTGGCATATGAACAAATTTAGCTGTGCATACACACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACAC:1 - chrX 18750735 5' + BS 4823 1 54.29 TCATATAAATTCCATAATACAATGTAATTAAATTTGAGTCAAACTAAAGCACGTAAACCACACGTCAACACACTACCCCCCATAGTTCCGCATGAATTACGGCACTCTTC:1 + chr2L 11478550 5' - Dm88 385 1 55.45 TCCAGAAGCCTGTGAAAAAAAGTGTTGGGCTAATTGAAAGTTTGAGTGGCCGAACACAGCAAGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAAACACAAAGAACGTCTTTT:1 - chrX 12503517 5' - hopper 496 1 62.26 AATGATTGCAAAAGCCATTTATTAATAATAAAAAATAAAAAAACAAGATCGAATGCTATGGTCCAGTTCGCCGACTATCAGATACTCGTTA:1 + chr2R 14586528 5' - INE-1 552 1 72.53 TACCCAGTAGTAAATCGTCAGAAAGCTCCCTAGGTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTG:1 + chr2L 21867410 5' - F-element 319 1 57.50 TTATTAGATTAGGAACCGATTTTGGCCATATAGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2L 5978359 5' + pogo 51 1 80.73 CCCCGCGCCGCATCATTCGTGTAACAATTTGCTAAAATGCCGGGGCTTAGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 10956264 5' + hobo 12 1 60.00 TAAGGGCGGCGTTATCTAACATCCGCTGTTAGCGGGCGTGCAATAATAATAAAGAAAGTCAACAAAAGAAAAGATAACCAAAAGGTTAAGAAGGGGACAAA:1 + chr2R 18609754 5' - Circe 7261 2 70.30 ATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTATT:1 - chr3R 7773344 5' - Porto1 162 1 39.36 TGCAGTTGTTCTTTGTTTTCCATCTCGCCTGTTATTACACTCTTGTTTCTGTGTTATTTTGTGTTTTTGTTTTTTTCTGCTTTTTTTAAAGTTTCGTTGACTGTTTCTAT:1 - chr3R 28090654 5' - Porto1 4410 1 74.55 ATCCAATGAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 3555504 5' + 412 7095 2 66.34 GCTATGTACAGGGCGACTGGACAGTCCCACAAACCAACTCCACCAATAACCCAAGATAAGAACTCAGTTAGTGATCGCTCGTCGCGCAGAACAGACATGCCTCGCTCA:1 + chr4 1246109 5' + invader1 327 2 62.04 CATGTTACTTTTATGATTAATAAGTTTCCATGCACAATTTCTCGACCATTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCAAAAGGAAAA:1 - chr2L 9065916 5' + hobo 431 1 53.64 CAGCCAACGCGGAAAAATACCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGAA:1 + chrX 15289557 5' + Doc 4507 1 79.79 TGCTACGAAATTGGCCAAAACTCAAAATATGTAAATTATTGGATTATAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGGCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTATCGTCT:1 + chrX 3703807 5' + 1360 3225 1 80.00 CGGTGGCAAACTACTGTTGTCTACTCATTCTGGTTGGAATGCCCGATGAGAACGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTT:1 - chrX 10546759 5' - ZAM 8003 2 63.33 GTGGGTGGGGGAAAAACCCGCCTTCGAGTTAGGGCATTATTGCCTAGACCCCGGCTTGAGTTTCCGTTCTATTTTTTTTCTAATAAAATAGTCGTGGTGTCAAGTCGTGA:1 + chr2R 25124168 5' + Gypsy12A_LTR 276 1 61.82 CTCAAATAGAAAACGAAATGATAGAAAACTATATTAAAAGAAAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chr3R 22891980 5' - INE-1 548 1 68.82 TTTTGAAGCGGAAAACCTGTGACCAGAATAAAAGACCGCAAATGAAAAGGGCAGCAAAGAAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAACTATCTCCAA:1 + chr3R 9094508 5' - hopper 55 1 68.42 GTAGTGGTAACTAGTTATGTTCTCTTTCCCTTTTTTCTCTCAGTAAGATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTT:1 - chr3L 20766562 5' - mdg3 5101 1 57.27 GGTTAACTCGTTACAAACTTCATTGCTATATAGATTTTTTTTGGGGAGAGAGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3R 14995673 5' + Doc 45 1 54.13 TAAAATAACAAGAAATATAATGTAGAATACCCCAGCTCAAATGGCATGCAATTGAACTATCCATTACACATCATATCTTCACAAAAGGCT:1 + chr3L 2176939 5' + Tirant 374 2 75.56 ATTATATGGGGTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr2R 19405905 5' + HMS-Beagle 39 2 66.67 ACAAAACACAACTTGAGTAGCAAAGCAAACACTTGTTCCATGTTGCTGGGTTGCGGATCTTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATTGGTTTGCT:1 - chr2R 19885223 5' - G2 101 1 77.00 TATATAAGCTAAACAAGACATTGTCTGGGGCATTAAAAACGCATAACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTG:1 + chr3R 19101133 5' - accord2 7370 1 55.67 GTTTAGATAAACTGTATGTATTATACATACATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTA:1 + chrX 22489632 5' - S-element 1669 1 71.43 AGCTATGTATATGTGTGTACTTTAGGTAACTTTATTTACCTTCCTTGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr2R 9963455 5' + pogo 7 1 72.73 CAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAAAACAATACAATACAATACAATACAATGTGCTTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATA:1 - chr3L 21448027 5' - Tabor 6871 2 33.67 CAGGGGAAAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 - chr3R 12040220 5' - HMS-Beagle 7013 2 51.92 ATATATTGACACATATAAAAGTGGGGAAAATGTATGTCCGAATATATATCTCCAACCGAAAGTGAAAGGTTTGTCTAACAAAGAAATTGAACGGGCCTTAAACTTCGATT:1 - chr2L 14672761 5' + looper1 448 1 57.27 GCCATTCGGCATTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr3L 17220775 5' - opus 7481 2 62.73 AAAAAATTATTTTTACCAAATCATCTAAAAAGGGTAATGGGTCGTTAGGTTGGGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTG:1 - chrX 6897378 5' - I-element 5043 1 56.36 AATGCACGCTACGATTTTCGCAAAAATGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 8621741 5' + jockey 8 1 68.42 TATACACATTTATGTTTTTGCTTTGCGTTTGTGTAACGATTTCAGGTTTTCTCTGCCTGCTCCTTTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGG:1 - chr3R 14210337 5' - Quasimodo 36 4 77.78 TCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTCCTTTTCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTA:1 + chr3L 15253229 5' - Stalker3T 202 1 28.18 TTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chrX 4617442 5' - Stalker3T 202 1 45.45 TCAAGATTTCAGCAAATCAATTATGGCCCAGAAATTGCCAAGCAAGAATTAATGAAGAATCGAATTTCTTAGAAGAAGGTTGCAAAAAGGGGCCCCAACACACGACAAC:1 + chr2R 18884968 5' + S-element 1289 1 66.06 AGCTACTAGTGCCTCCTAATGGACTTACTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 + chr3R 19949136 5' + copia 4927 2 77.06 ACAAGGGTCCGTTTCGGTTGTCTGAATCGTGACCCGGGACCTCCCTGAAACGCAGTACAAGAATCCGAGATATTTAGTTGTCTCATCAAAAAA:1 - chr3L 22633495 5' + Ivk 334 1 60.22 TTGCACTTGTCGCGATTTCACATCAGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTC:1 + chr3R 19380924 5' - Doc 4402 1 72.53 AATTGGAAATTAGAATTCTTATCGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGCACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3L 126324 5' - pogo 2076 1 55.06 ATTTTGGCAAATGTTTCGATTCAAGGTCTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGG:1 + chr3L 15525640 5' - Ivk 5324 1 73.64 AAAACCCCGGGTATATACCACAATATCAATTCTTCAATGGGTAATAAACTAAAAATAAATTGTGACAGAACAAGACAGAAAACTAAATTGC:1 + chr2R 11557216 5' + Fw2 104 1 70.33 GACTCATACCATGACCGAGGCGACTGGAAAAACTCGCGACTGTTTCCTTCAGCTGCCTGCTCCATTTATTTTGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTT:1 - chr3L 17139647 5' - 297 472 1 65.45 TGCTGGATGCTCTCCCCGTTTTCCCTCTTTTTCTTTTCTTTTTCATTTT:1 + chr2L 18504789 5' - Doc2-element 239 1 81.63 ATGAAAAGAAGAGAGACAAACGCCCAGGAACTAATAATTGCTCCGCTAACCCGGACTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGATAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACT:1 - chr3L 23652221 5' + I-element 198 1 61.82 AGTTGCACATAAACTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATAATTGTAATGTTTTTTT:1 + chrX 21234210 5' - Tabor 7323 2 27.88 TTCCTGAAAGGCAAATTGATATTTTCATTTTCAATAAAACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAACATATATGGAAA:1 + chr3R 14842528 5' + jockey 4640 1 63.64 ATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTAT:1 + chr3L 4264973 5' + Transpac 4968 2 63.64 ATTATGACGTATTTAGTGTCCTGTTGATCTAGAAGTTCATTTCCCCATTAGGTTTTAATGGCAATAAGGATTTTCTAATTACACAATATTATTATTATTATTATTATTCT:1 - chrX 19543058 5' - mdg1 7067 13 75.45 CATATAGATGACTGCGCTCGATACTCTCGTTGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCGTTA:1 + chrX 12158593 5' - R1A1-element 488 1 56.16 GCAGCTACTTAGACAATAACGTTTACCTAACGTTTTTAAATTTCCATTATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGGTTTT:1 + chr2R 330125 5' - HMS-Beagle2 7189 2 63.75 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACA:2 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 419 1 25.00 AATATATATTCAAGGTTTTTATTTACCATATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chrX 14858885 5' - 297 6941 2 77.89 GCCGAAATTGTTTTAGCCAATTCATACATCAGAGCAAATAAATTAAAATTCCCAATCGAAGTTTAAGGCACGTTCAATTTCTTTGTTAGACAAACCTTTCACTTTCGGC:1 + chr3R 15450417 5' - looper1 414 1 55.05 ATTTGATGTAGCTTAGTTTAAGGTTTCAAAAGAAATGTTTTGAATCGTAACAATGACATATTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 + chr2R 14883964 5' - mdg3 222 2 60.00 ACTTGAATTGCTATTCTTCTTTTTTTTTTTATTTTTTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGACAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGCGGCTTTA:1 - chrX 14840467 5' - I-element 46 1 75.00 TGCGATCTCCGCCCGAGGGCTTGTCAGTGACCAATCGTCGAAACAGCCTACGCATGCACAGCCCAAGGCAAATAATAAAAAATAAAAAAA:1 - chr3R 26929953 5' + Rt1b 5147 1 71.11 AAAGTTATACCATCTAAATTCATCTGTATGCACAAATACATTTTTTTTTTTGCTGGTGGAGGTACGAAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCT:1 - chr2L 16980938 5' - TAHRE 10382 1 63.64 TGTGTGTGTGACACGCAGTAAAGAATGTTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGACTCGTGCATGCTAGGA:1 - chrX 17559453 5' + R2-element 3500 1 73.64 CTTTTGGTTCTTTTGACTCGGGGTCCAGAAACAGCGTGCGCTAAGCGTATAAATTTAAACGCGTACAGCTGTTGGCATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGG:1 - chr3L 1578036 5' - I-element 4880 1 73.64 TTCCTCACCTGTAAAACTACAGCAACTCCATCGCTCCACAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAAG:1 - chr2L 11766224 5' - R1A1-element 5133 1 52.38 AAAATATATATTCAAGGTTTTTATTTACCATATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAGTAAGGACAACGCCAAGA:1 + chrX 14858883 5' - 297 347 2 77.27 ATTTGGTCTTTGAAGTCGTTAGGTTCGATTTCATTATTACATATTTGGCGATTGTTTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 - chrX 17456119 5' + jockey 4691 1 59.38 GACAACCCAGGCAAGGTAAACTGTTTATTGATTTAGATTTTTTCCTAACTAAGGCTCTTTTACTAAAAGCCATATTTGGTGTAGTATGTGCCTATGTAATA:1 - chr3L 11677724 5' + 412 1 2 73.27 GAACACTAAATCACATAGGGCCAAATAAATATGATTTGCATAAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTA:1 - chr3L 5975047 5' + Porto1 306 1 61.82 ATGTGCTTTTGGTGTTCTCCACTCTTTACTCAACGCTTCGGAGTTCTCTATCCGTCCTATACATATACATATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGTGCT:1 - chr2R 20436819 5' + opus 3 2 76.15 CAAGAGTCCTGCCCACCAAGGACCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTG:1 + chr2R 23477826 5' + F-element 11 1 69.89 CTCAAAATTTCCACAATAGTAGACAGATAGGCCGCATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 18072708 5' - 412 473 2 61.82 ACTCTCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 + chr2R 5214942 5' + F-element 23 1 62.73 CGACATGTCGGGATACCACTGGACCGCAAGATGATCCTTTCGGAAATGATCCTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGT:1 - chrX 16896505 5' - hopper2 1204 2 64.13 CCGCTGCTGCTGCACATACAGTCGAACATCAATAACTTGAAAGCTGAAACCACCATCTGTCACGAATCATCTTTCAAATGCATCAGGCTTTTACCACAGACACTAGAATA:1 + chr3R 28847861 5' + Tc3 237 1 79.09 TATCATTTTTACTTACTTACCATTATGTTTCGATTTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCTTGTTTGTT:1 + chr2L 2409444 5' - I-element 180 1 60.91 ATATTGATCATGAAGACTTCTTTGGAAATACGCAGGAATATAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 - chr4 1080295 5' - INE-1 563 1 58.02 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTCTACAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGAGAG:1 + chr3R 21907536 5' - Rt1b 4972 1 55.67 TAATTGCCACGGCCAAGGAAAAGGGGCGTCAACTGGTGGCCAGCATGGTCGTAACCTCCAAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCA:1 - chr3R 23891946 5' - INE-1 140 1 59.78 GTATACTCACGGCAAAGAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 24867486 5' - roo 9036 1 56.36 GAAGATGCGATGCTCCTTGAGAGAGAGATAAGTATGGCGTAGATGGTTTTCCTGTAGGTGTGTGTTTGCATAAGAGTGCCGCCGAGG:1 - chr2R 21493362 5' + frogger 2284 2 70.11 TGCTCGAAACCGAAACAAAAACCGACAACTTGAAGTGAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATTGACATTAGAATTTGCACA:1 - chr3R 29276577 5' + Bari1 1304 1 66.36 TCAATCTTTAATTGTTAGAAACAGAGCATAAACTCCTAGATGTCAAAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACA:1 - chr3R 24867561 5' + roo 8681 2 57.95 CCGCATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3L 18072739 5' - 412 7515 2 57.78 ATTGTTTACTGAGCTAATTGACAGTTGCGAATGTATTTAATTATTACATTAACTTTTAATTAACTTATATGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2L 16529180 5' + blood 7 2 72.82 CAGCATATTATTTACGCTCACAGCATTTTTGACAATTTAATTGGGCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr2L 10128660 5' + copia 41 2 62.73 TATTTTTCGGCTGAAACGATGCGACAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chr2L 20797679 5' + P-element 50 1 30.00 TTTCGTCGTCAACTGTTTGACAGCTTAGCCCGCAGTATACAAAAAAGCGACGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCG:1 - chr3L 15015657 5' - GATE 8275 2 80.52 TGTTTCAAATCGAAGGTTGGCCTATTTTGGCAAATGTTTCGATTCAAGGTCTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAA:1 + chr3L 15525617 5' - Ivk 5347 1 52.73 CTCTATAGGAAACATTAATAACATTATCCGCTCCCAACGCCCAAAACAAATGCAAAACAAACTAATCAAACTTTTTGCAGGATAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAA:1 - chr2L 11587591 5' + Doc2-element 4359 1 79.82 TTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCAATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chrX 9845539 5' + F-element 37 1 55.56 GCACTATGAAGCACTGACATCTAAAAACTTCTTAATGTTTGCCTTGAAGCGCCTAAATTGGAAAGCAAACCTTACATTACCTCCATATACCAGTAGACTACTTTTAATTA:1 - chr2R 24967121 5' + Cr1a 3977 1 70.91 AACACTAAAGAAAAACATTTCATAAAAAGCTGGCAGAAAAGGGGGCCTGCATTCTACCAAAAAAAAACATGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTCACCGACTATCAGATACC:1 - chr3L 21877199 5' - INE-1 557 1 60.91 GGGATTTGCAGATTTATTCTATTTGAATTGGGATACTAACAAAAATTGAGCAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTT:1 + chr3R 10770817 5' - I-element 5125 1 51.89 AACAAACGTTTGACTAACCAAACTCCAGCTGACAGATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGAATACGAAAAAGAATACGATCATATCCC:1 - chr3R 22500864 5' + invader3 53 2 58.16 CGCTCTGAATGGAAAGCAGAAACTCTCTATAGGCACTAGCTATCCATCCAAGTGGTTCCCGAAAAAAAAAACCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGA:1 + chrX 7320750 5' + Doc3-element 4536 1 71.82 AGAGTCAGATAATATTTCCTTCCATAAATTTCGGTTCTATATACATATATAATGTACATTCTTGAACAGGATCAATAGCTGAGTCGATCTGG:1 + chrX 23065334 5' + INE-1 99 1 68.48 TGTTGCGAACCCAACTAAATGCGATGCCAAACTGGCCAACAATATTTTGCTGTCTCAGCTGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACACGCA:1 - chr2R 11756811 5' + Burdock 5966 1 66.32 AAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chr2R 11379739 5' + jockey 4684 1 53.73 TGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTAT:1 + chr2L 9723026 5' - Porto1 163 1 41.67 ATGTTGACACAGCGAACCGCGACCAGCCAACCAAACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCA:1 + chr2R 13565726 5' + gypsy5 7239 2 69.09 GCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCG:1 - chr2R 12185376 5' + accord 35 2 78.21 ACTAGGGAATTTTACAAATTGTTTTGAAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2L 20902988 5' + roo 8720 2 75.45 TTGGGAAACTGAAAAAGAGCACCCGCAACATGAACTTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCA:1 + chrX 19292567 5' + G2 2929 1 66.97 TATTCGAACATTAACCAACCTCTATTGTTTAGAAGATTAATCATATTGCTATTGAGTTAGCAGCTCAACACTAAATAAAATGAAGAAATTAAACAATATTAATA:1 - chr3R 8999897 5' + HeT-A 5769 1 91.35 CAAGCGAGGAGCAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGG:1 - chr2R 13303141 5' - blood 167 2 75.00 TAGCCTATTAAAGGTTCTACTTGTTTTCATTCAATCATATGCTTAGGATTACACAATATAAACCGAAACGCAATTTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 - chrX 6866881 5' + S-element 8 2 40.00 TGAAAGAAATATTTTTCCCAAGTGCTTTCAGTTTCAAAAACTGAATGTAAACATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTTGG:1 - chr3R 28848013 5' + Tc3 311 1 41.24 GCCTACTTAAAGTAAGGAAAATCTTTTATGACACGTTATTAGTTGTGCGCCGCGAAGGGATGTGTATGTATGTACACACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr2L 15963409 5' + 297 6587 2 76.36 GGCCTTGGCCTTGACGTCGGTTATTGGCAGCCATAAACTAAAATTAAGCGAAACGGTTTCAACAAAAAACGAAAAAAGAAAAAACAAAATGAAAA:1 - chrX 5033713 5' + Doc2-element 246 1 75.79 AACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGATGCATCGGCA:1 + chrX 12271484 5' + pogo 23 1 62.34 GTTGAATTCGAGAGCGAGCGAGGGACGTATGTGGGCCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTATTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:1 + chr3L 25455086 5' + HMS-Beagle2 10 2 75.45 TTAAGCTGACCCTAAAAAACCCCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATA:1 - chr2L 8172885 5' + hopper 1234 1 80.00 TGCCAGAAACATCGATGTCCCTGATATCGAAAAACATCGATGTTTTAAGCAGCGAAAAAAACATCGATGTTTTAAGCAGCGATGTTTTAAAAAAAAATACAAAAAAA:1 - chr2L 8403425 5' + TART-C 11100 1 73.83 AAGCTTATTAATACTGAGTGCAGGATTTTCTGTCAGGGGGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 + chr2R 23354293 5' + Tabor 6885 2 62.86 AGTTTCGGTGGCAAAGTTTAATCTTTGATGCCGGCGACACATTGGGGCCAAATTGATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr3L 20167894 5' + 412 9 2 70.91 ATCCCCATTAGCATTTTTCCGGCCATCTGAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAATTAAACTATTAAATTATTAATGTATT:1 + chrX 7366811 5' + Porto1 4556 1 73.64 TCTATGATTCACACATTTATCTCATTAATAAAATTATAAAATATGAACAAAATTATATCTACTTTCTCAGTACCACTTAAACCTCCGAAGAGATA:1 - chrX 15170043 5' + I-element 7 1 68.42 ATGCGGCCGGACTTGACATGGGGCCGTACACCGCACTCTGTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAA:1 + chr2R 8971015 5' + invader1 3704 2 58.97 TTTAATAATACAATAAGTGCTTTATTCCAATATTATTCAGATTAGATGAAAATAGCAAAAGTTATATCTTGAGGCACGATGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGC:1 - chr4 158723 5' - 1360 452 1 57.27 GACCACTAAAATTGTCGCTGGCTGCGCTAAAATTAAATGCTTAGTTGGACGACAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTT:1 + chr2R 19557874 5' + Doc2-element 495 1 67.86 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATACGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1 + chr2L 16217660 5' + Tabor 30 2 57.14 AGGATTGCTAGGTGTGCAATAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGG:1 + chr3R 23359091 5' - gypsy5 6969 2 69.70 TTGTTCGCCAACTGCATTTTCTGGGTGGTGGGGCACTTTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACG:1 + chr2R 20019951 5' - FB 806 3 65.45 GCATACCGAATGAGCTTTAAAGAGGTATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3L 17405690 5' - roo 9030 1 65.45 CGTTCGGCCAAAAACGATTGCGAAAAAAGTAGTATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCAC:1 - chr3L 13951738 5' + mdg3 132 2 72.73 ACTTGATACAATGCCAAATATTTTTTTTTTAATTTTTAATTTATTTGTGTTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGATAATGGTATAATTATGTATTTAC:1 + chrX 8027455 5' - Juan 4153 1 73.64 TGATTTATGAAATGAAGAGTAGTTGCGAACCGACATAGTATTCAGTTTCAAATCCTTTTTGATTTATTTATTACTACCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCT:1 - chr3R 11853414 5' - invader2 5012 2 54.55 TTTATTGGCTTCATTTGCCTATTTTGGGGTTGTTTTGTTGTTTTTTTTCTTTTTAATTTGTATGTTGTTTCAACCGGTTGTTTTGCTTTTTTTTTATTATTTTTATTTTT:1 - chr3L 2549648 5' - Tc3 1570 4 67.27 GATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1 - chr3R 27071910 5' - jockey 4946 1 70.91 TCCTATTTACATTTCGATACCGCTGTATTCCCTCAGCCGCAGTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTGCCGCTGAGA:1 + chr2R 6131417 5' - 1360 3298 1 60.00 TCGTTTATCTTTTGTCGGGATGTCGTTATCACTACAATATTGTACTTTAATTTTTTCTCTGCTATTGCCTCACTGACAAGTTTTATTTTTAAGTCTCTGTGTATATTCT:1 - chrX 13593082 5' - Doc3-element 4439 1 63.30 TCCGTAATTATCAAGCGTAACCAATTAACTCGCAATTATCCCAGACAGCAAAAATGTACTCAAAAGTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 12043043 5' + jockey 18 1 67.33 AAGACATAAAAAAAAGTTGAAAAAAGTTATTGCACTACAATCTATACATTTCTCAATCCAAGTCTTTAAAGAGCTGTCAATTTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCT:1 + chr2L 5026919 5' + R2-element 3369 1 79.09 GATCGGAAGCTAATTGAAATACAAGTTAATGATTACAGGTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:1 - chr3R 12040189 5' - HMS-Beagle 7020 2 72.73 ATATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 9435819 5' - roo 9034 1 58.18 AGGTCATTAGGTCACAACTGTGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTATAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 + chr3L 18030829 5' - Tirant 8443 2 80.00 CTTCTGTCTCCATTCTTTATTTCTTGTGTGCTGTGTGGCCAAAACTTTATTGTTGCTCCATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCC:1 - chrX 9845551 5' + F-element 35 1 53.21 TGTTCGGTACATCTATAAGGCTAATGTTAACCTAATCCTAACTGTTTAGCAATTATGATTTGTTATAGTTTCTTATAGGTATAGCTCGATCTATAGATG:1 + chr3R 9769774 5' - Burdock 6193 2 71.72 GGTGCAATGTTGTTATGGGGTTGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTCTTACTTCGCTTACTAAT:1 + chr4 1081114 5' - Doc 4435 1 76.36 AGTTTGACGATACCGACAATTTGGATAATGTCCTCAAGGAAAATGTCGAACTGAAGCACAAGTGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAG:1 + chr2R 20505374 5' - aurora-element 4213 1 72.34 AATTATCATGGAAAATATGGAGAAAACTCTAGAGATACATATGTATGTAATGCATATGCAGTCTTGCTAGTTAATAACAAGATGCGTAACGCCATACACTTTTTTGGCAC:1 - chr2L 16921383 5' + 1360 29 1 71.82 CAAACTGTATGTCAGGGACAATCTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTG:1 + chr2R 25257630 5' - TAHRE 10370 2 74.00 CTGGTGGAGTCCAAAAAGTTGAATCTGGTGTACAGGGACTGCACGAATTTGTTTTTTATTTTCTCTTTTTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTT:1 + chr2L 18156477 5' - I-element 71 1 54.55 GGTTGGGGAGGGAAAGAGACAAGAGGTAGAGCGAGAGAGTTGAGGGTGTG:1 + chr2R 8029503 5' - Porto1 468 1 74.00 GTTGTTTCCGGATTTTGTCACTCTACAAAGTGCGTGGGATATAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 - chr3R 18851062 5' + flea 37 2 64.55 CAAACATTGGCGTCGAGCACACAAACATACGAAAACACTGCGCCAAAAAAAAGGAATTTAATTTATTAAAAATCAAAACACACCACAACACACAGAAATAGAAGAAACTC:1 + chr2L 17421418 5' + 297 6498 1 65.45 ATACTGCAACTTGTTGCGAGCGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAACGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTTTATG:1 + chr2R 21522297 5' + 1360 159 1 77.89 GTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 - chr2R 8086859 5' + 1360 39 1 58.18 CAAATGCCTAAAATGTAAAAGGTCGCTAGGGCACGGCACTTTATTTACTTTATATACTTTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chr3L 18123676 5' - copia 228 1 56.36 ACGATGAATAAACTACACACCAAATCATGTTAAATAAATTCATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3R 12623775 5' - roo 9033 1 68.22 GAGAAATCGATAAATCACGCATACAGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACAAAAACAATTATGA:1 + chr2L 19527002 5' - invader1 232 2 73.64 TTTTGAGATCATTCTCTAATAGATTGCAGCCACAGAAGAAAAAGAAACTTGAACCGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTTGTGTTAGTAGGATCTAA:1 - chr3R 16372951 5' - Cr1a 4291 1 55.45 TAAAAGATTTTTTGCACATCGAAATTAACAAGACTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTGGGGCC:1 - chr2R 5266008 5' + opus 7050 4 63.30 GGTTGTGGCAACGTTTTGAGGACGGGCGGTGCGCAACATGGCTATGAAGCGGTTGTTGGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1 - chr3R 31193927 5' - Quasimodo 6978 2 70.79 GACATTTTCAGGCTCTGTGAAATGTAAAACAATTCCTCATTTGAAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAACACGGTTTTATGAAACGCAGATCAATAACCA:1 + chrX 12050065 5' + Q-element 220 2 70.00 GCCAAGTCGTTTTCACAGTTTTACAGTTTACGAGCTGATGGAAACTGTGTGCGGCTGGCAACTAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATT:1 + chrX 1490376 5' - 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chrX 16838447 5' - Cr1a 4257 1 60.91 GACAAATATCGTAAACAAACGCGTCAGGAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCT:1 - chr2R 4938533 5' - Doc 326 1 73.83 TACTCAAACCTATCCCTAGGGAATCCTCGGCGCAGACCTTGGCCTATTTGCCAGAAATCTATGATGATGATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCA:1 - chr2L 17531631 5' + 3S18 18 2 64.55 ATAATATAATATAATACAATATATTATAATATAATATGTTCACGCCAGAAGGGCG:1 + chr2L 15950935 5' + Max-element 8233 1 63.64 TATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCT:1 + chr2R 5064833 5' - Stalker3T 204 1 77.27 TAAGCTGTTTAAAATACATTGAACAAACGGCTCAATAAATCAACTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2R 9963565 5' - pogo 2069 1 59.05 GGCTGGGCGGAAAAGGAGGAGGCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAG:1 + chr3L 478435 5' + R1A1-element 371 1 75.51 ATATGTGTTAACTTGTTTTTGTTTGTTTGTTGTTTGCTCGTAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATA:1 - chr3L 19794531 5' - Cr1a 4208 1 62.73 CACGCGTCACTGCCAACGACGCTGGATGGGACCAGTGCACCGCACAGATGTGCGACTTGGCATCACATCCTGCTCACCGATGAAATAATTTGACTGGCAGTCCCGGT:1 - 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chr3R 26041447 5' + 1360 3149 1 68.18 CATGATGCTTTCTTACTATATCCGCCCTTGAAAAGTGGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTC:1 + chr3R 23591282 5' + I-element 5097 1 61.86 ATAGTATTTATACCATATTGCAACCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGCCTTGCTCTAAAA:1 - chr2R 15365027 5' + F-element 4224 1 77.27 TGTGTGTTTTTTTTTTTATTTTTATTATATACGGCAGGGAAAAGAAAACCCCTAAAACACCCATCTAAAGTCCTTTGATGGCATGCCCGATTCATAACCCTCAGCTGAG:1 + chrX 9141928 5' - Rt1a 4993 1 75.23 TTTACCTTCCTTGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2R 9963489 5' + pogo 40 1 61.47 TAGAATATGCAGAGCTTTTTGATCAGAAACCGAAGCTGGTATATTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3L 23651562 5' - 1360 3372 1 62.07 TAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGAT:1 - chr3R 13423385 5' - rover 7283 2 66.06 AAACATAAATATAAATGGCAGTAAAGCACGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - 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invader2 5005 2 56.36 GGACTGCATTCAATTTTCTTGTGCATTTTCCGCTTTGTATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAACTTTTTT:1 + chrX 17058964 5' + S-element 320 1 56.94 TTTTCTTGGGATATTGGGTTCAAAATTTAAAACGGGTGTTTAATTTAAATAGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTGTAGCTCATAT:1 + chr2R 8625215 5' - G2 59 1 58.00 CCTGCTGCAGAATGTGCAGAGCGCGCAAAAGTAAAAGCCGGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3L 14755068 5' - P-element 2867 1 51.76 AATTAATAAAAAAGAACAATGTAGTTGAGTTCCCGAGGATCTGGATCAATAGCCGAGTTGTTCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGGTACTAT:1 - chr2R 5943965 5' + INE-1 143 1 66.36 TTTCGAAGCAAGTACAGGAAACAAATTTACAGCTGAAATAATTTACGCATTGAACAATGACATTACCTCAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTT:1 + chr2R 2958028 5' + HMS-Beagle2 6818 1 70.64 AAATGCAATTTGATGCGTGTCATGCCCCCCTCAGGATAATGTGCTGCAATGTCTGAGATGCCACATTTTTGGGCACTCCAAAAACTATTGT:1 + chr3L 4859744 5' + jockey2 348 1 51.65 ATTTCGGGGATTTCGGGGTAGCTGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTACA:1 - chr3R 8450084 5' + F-element 4616 1 75.00 CCCCATATAGATCCCAAACATATTTAATATAAACACTAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATA:1 - chr2L 5728776 5' + I-element 4919 1 69.72 AGGAAATGAAATATGTACATATATGTAATATTGGATTGTGAAGCCCCAAGAGTACTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 - chr3R 22595887 5' + FB 1 1 72.50 TTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2L 21034122 5' + 412 7090 2 56.07 AGTGTCCACTGACACGTCCTTCCTCCCTGCAGAGGCGTCGGCACTGCTCTCCAGCCCAGCAAAGAAATCCTACGGCCGTCTCTAACTAATACAATTACTTCATATTGTAA:1 - chr3L 3315793 5' + Doc2-element 4674 1 57.27 CAATTGATTGAGTTGGGGGATTTGTAGATATCATTAGCTGTCCCCCATTAACTCTAAATAACGTCCAAATTCT:1 + chr2L 2283895 5' + Doc4-element 2390 1 57.53 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATTAGATAAGA:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 205 1 74.55 TCCACACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAACATAGCATATTAACTTAT:1 + chrX 22769341 5' + 412 7090 2 55.45 TGTAAGCCGTGTGACTTTTGCATACATGTGTACATACTTTCCAACACGCCATCTCAAAAGTTACATTGCTGTACTTTTATTACGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGG:1 - chrY 975594 5' - gtwin 474 2 61.82 GCCGCGCTTTGGGTTTTTCTACTCAATCAGTTCCTGAACGAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCT:1 + chr2R 11273955 5' + Stalker2 7256 2 71.82 CTAACAAACGGCGGACAAATGGCAAGGCTAAGTCCAAATGAACACAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGGGGACAAACGTTAAA:1 - chr2R 19012809 5' - FB 986 4 57.27 AACTGTGAAAAAACCAAGCCAAAACCAAGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACAAAAAGAAGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAA:1 + chr3L 7575567 5' - Cr1a 168 1 73.08 AGTGTCGATGAGGCGCATTTGAATTGAGTTATCGATAAGCGATCACAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTCCAC:1 - chrX 5231161 5' - micropia 4983 2 69.66 GCTATATGCAGATGAATAAAAGTATGATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr2L 21734983 5' + Doc 25 1 61.47 CTGCGACGGCGCGCCTTTGGAAACCAAAGAGAAAGAGTGAGAGAGAGAGGGGGAGAGAGCTTCTGCCGGTACGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9496159 5' - accord 188 2 80.00 TGATATTCGCTTTTAAAAAACAAAGTTCATTACAGATTTGGAATTCAAAGACCTTCTGCAGAGTTATATCGTGCCAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAA:1 - chr2R 11959954 5' - 17.6 444 2 77.27 GGCTGTACATAGCGGGGATATATGTAAGTGCATATATAGGTGGCACGCACTTAGTAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAA:1 + chr2L 14095484 5' - Tirant 284 2 55.45 AAATAAGAGTAGAGTACTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chr3R 12039993 5' - 412 7497 2 75.45 CACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAA:1 - chr3L 3240566 5' + diver 61 2 74.55 ATCCTATCTGGGCGATCCATCGATTCCCAAAGTTCTCGGATGGCTGGGAACCCCTATACCATACTTTCTTTGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTT:1 - chrX 8628831 5' - 1360 2965 1 68.52 AACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACACACACAAACACA:1 + chr3L 11777678 5' + gypsy3 419 1 27.78 CATGTTTTAGAACTTCAATATTTAATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2L 17263147 5' + Transpac 4955 2 70.79 GATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 20167948 5' + 412 7095 2 78.65 GCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGGATAAATAAATG:1 - chr3L 2987409 5' + blood 7068 2 72.48 CTCTGGAACGCAGTGAGGAATTATAACTGGCTATAGGATAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 + chr2L 7668062 5' - I-element 5339 1 55.00 ATTCTTGAAAATTTACAAACTTGATCTGAGTTTTATTTCATACCAAACTCACTCCACGCAATGTACACCTCAAAAATTCAAATAATTGTACCTACATATTGCACACAC:1 - chr2R 1443928 5' + HeT-A 5982 1 61.11 AGTTTTTACTCCAGGAACAGTTCCACCTCTTGCACCGCAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCTACTGTCTAAAAGCCAAGAATACA:1 - chr2L 8139646 5' + HeT-A 5877 1 60.42 GTAATTATTCCATTAATTTGTATTCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 30369738 5' + roo 8701 2 64.42 CAACAACTACACTGAAGACAACCACTTTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGG:1 + chrX 5837876 5' - I-element 4992 1 66.25 ATTTCGCCACCGGGGAATTTCAGAATAAGCATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAAT:1 - chrX 16560644 5' - S-element 1671 1 72.38 TAGATGTCCCGTTAGTTAACTTTGCGTCCTCTTTGTGCGTGACCAAAGCACGCACCGTATAAATATTTGTTTTTGTTGTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATA:1 - chr3L 23824118 5' - I-element 103 1 73.64 CACACACCATGTTCCATAATACATGCAAGCAGCATAGGGAAAGAACATCAGGGAACGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTT:1 - chr2R 14251228 5' - GATE 129 2 57.27 TAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAAAAACTCTCACGCGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTG:1 + chr3L 22293797 5' + TAHRE 156 1 76.92 GATGCTCCCGTCGCGTCCCTCTGCCTTTGCCTCGCCACAGCGTCTGTTTTCCTATTAGCCAGTTA:1 - chr3L 733703 5' - Porto1 4190 1 75.38 TGTGCTGTTGTTGGAAAAAAACTCAGCCAAAAGGTCGAGGGTGGGTACAGTAGCACTGAATTTATTTACTCATTGTACAATCAAGAAATAAATAATAGCAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26484196 5' + BS 5096 1 73.39 GTGAATTCTAGAATTCTATTTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGGCGATGTTTTTATTATTTGATTAACGCACTGGTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 + chr3R 21993211 5' - jockey 4956 1 49.54 GTATACGCTCGATATTTACGCATTTATTTATGCCGCTCTTTATTGGCTTTTTATCGTTCATTTATTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 + chr3R 5774819 5' - I-element 5342 1 68.69 ACATAATTGATGGCCTGCACATGGCAAGCTCATCAATAACTAACATGACGTATGTGTTATAAACAAATAAGCACAAAAACCGTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 + chr3R 7588829 5' + F-element 14 1 73.39 TAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGCGCGGAC:1 + chr3L 19951194 5' + Ivk 11 1 62.79 ACGGAATTTCTAAAATGAGATACTACAGATTAAAAAAAAAATATGTATATTTATTTGTACATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chrX 3091913 5' - opus 474 2 56.36 GCACATGCCTTAATCGCCGATATCGGTCGGCTATAGGTGCCTGTATATATGTCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3L 17530217 5' + Tirant 6 2 69.88 AATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2R 22663337 5' - mdg1 378 2 63.30 CAAATAACTAAGATGATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2L 15988776 5' + 412 37 2 59.09 AATATGCTTTTTATTTACCAGCAACAATTTATTTCATCATATTAAGTCAGATAGTAGTTATCCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGAGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2L 7750522 5' + opus 7027 4 47.71 CTGCAGAGCACGACCAACTTTCTAACCAAATTACAGCAACCTTTTGCAAGAGTAGAAAAAATATAAATAGGTACCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr3R 30298402 5' - copia 244 1 63.30 TCAACTAATGAGATATTATGTTTTCCACTGTGTTTTAAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTTGGATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTA:1 - chr3R 7255361 5' + 1731 86 1 67.27 ACACGATAAAAAGTTGTGCAACAATCTTGCAACCCCAACCACCAAACTAACCCAACTACGCCGAACTGAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGA:1 - chr3R 13124431 5' + jockey 4726 1 67.59 TAGCACTCACGCACTCAAGGCGCGCTGGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 - chrX 4263023 5' + Tirant 9 2 59.26 GATGCTGATGGGCTGACGACTTTTACAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:1 + chr2L 13324599 5' + jockey 4735 1 63.08 TGTTTAGACTTCCTTTCTGCGTTCCTCGAGTGAAACATCCGCCCACCTTTAACCCCCCTGTAGAATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr2L 1291024 5' + 412 26 2 55.24 TAGTAATATTAATCATTTGTTTTTATTTTAATTAATATTCCTTTTACATGAAAGTTTAATATTATAAAACAAGAGAGAATGCTATATGCGAGTT:1 - chr2L 10839478 5' - INE-1 575 1 35.11 GTAGTTGAGTGCACACAATCAGCGCTTCAACAAAAAAAAATAGCTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAC:1 - chrX 9642420 5' + S-element 2 2 66.67 TAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAAGAAAATAAAATAAAATAAAAAAAAAGAAAATGAAAATAAAAGAAAATAAAATA:1 - chr3R 27402577 5' - transib1 1899 1 46.24 TAGCTATTGGACTCGGATTGGGTAAGAAAACATATATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr3R 28639976 5' - mdg1 374 2 68.18 GCGGCCATAAATTAACAAATAGAATTTAATTGCATACTTTTGGGGGCGACGGCGGCGCGTACACAAATTAATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chr3R 10964685 5' - I-element 5338 1 66.67 CTCTTCAATTTCGTCAGCTGTTTCGCGTTCGCTGAACTAGCTGTAACTGGGATTTACTGGCAGGTCC:1 + chr2L 2823298 5' - Porto1 4293 1 61.19 GCCGGTTACATCTCTGCCCAATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCGGCGATCAACGCC:1 + chr3R 12040165 5' + HMS-Beagle 6843 2 73.68 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACAACAACACACAACAAC:1 + chr3R 21907536 5' + gypsy3 416 1 28.00 CTCACAAAAAATATCGTGAGCATAGAAAAAGGTGGAAAAAAGGCCAATAAAAGACGACAACACTTTATGACTGCAAAATATGACCTACCCGCTTGAATATGACCTACAAA:1 - chrX 7756038 5' + S-element 1349 1 79.09 AAGTGTAACCAAAAGAGGAAAAGAGTGAGTAGTAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACT:1 + chr2L 4046825 5' + Bari1 1692 1 69.44 GGAAAGAAAGTAGCCAACCATTAACTCACACCCACTATCCGATTCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAAC:1 + chr3L 7023251 5' - R1A1-element 5060 1 56.12 GGATAGCCGGAAAACTCGGACAGACAGACAAAACCTGCCTGCAATTAGAGACTCCGGTTGGTAGTTGGGAATGTGACGAAGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTG:1 - chr3R 29384143 5' - Idefix 7031 2 68.57 GCAGCACGCACTTTATCAAAAACAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAGACGAAAAGCGAAATCACTTGAAATTATTATTAAAAAG:1 + chr3R 21613368 5' + invader2 436 1 72.16 TCTGGCTACTTGGTGGGTCTGCAGATACAAATGTATCTGAGATGTGTGTTTTTCTGGACTAATAGCTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 + chr2L 20970305 5' - Tirant 355 2 63.64 ACTTCGCCGGTGTCTCTGTTTATGTGCACAGGGAGTGTTTCAACGAGGAGTTCTTCAACCAAATGCCTTAAATGCTAAATCTATCTGTGCTGCAATAAAGATAAAAACTG:1 + chrX 13724182 5' + looper1 1612 1 60.00 TAGATCCCTAAAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr3R 27071933 5' - jockey 4987 1 61.96 GTGGTGTTCAGTATCCTGAAGGAGAATGGTTATTTGAGATGCCAGGAGCCGGCTCGAAGGACCAAAATGT:1 - chr3R 10415636 5' - GATE 270 1 74.29 GCTTATATTAAAGATAGATAGACTTGGAAGATAGGAGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr2R 15374753 5' + 1360 16 1 46.00 ACTAATTATTAACAAACGACATGTTTTCCTTTGTCATTCGTTGACATTCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCG:1 + chr3R 5219226 5' + Doc 8 1 58.33 TTAAAATTCGAGCCGAACGTATAAATATGAAACTAATAAGCAAGTTTTTTTTTTTAATTAATG:1 - chr2L 13948180 5' - Doc 4588 1 92.06 CAGCTGATTGCAAATCAAATCTATCATATTATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 + chr3R 17777599 5' + Burdock 53 2 74.31 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACA:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 419 1 45.79 TTTCCCCTTTGGGAGACTCTAACAAGCTCTGGCAGCTGTCCCGCAGTTTTCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGG:1 + chr2R 19842772 5' + X-element 4478 1 81.01 TGGCAATTGCTAGTTATTACTTTCAGTGTATCTTCTACTAGGTTTGAATTAAGTAGGATTTATGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGTGTGGTGGAGTTTTAATCT:1 - chr2R 13586135 5' - jockey2 3171 1 60.91 AATTATTAATGACTAGGAAAGGTGTTAAAGTGTTAATAAAACCAAAAGGGATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAG:1 - chr2R 10241534 5' - I-element 5350 1 77.98 CACCCGATGATATCGAATGGCCAACAACAACTACAGCAATAAAAACAAGTCGTCAACCAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCAACGCCAATCCCAAACGCAGAC:1 + chr2L 224366 5' + F-element 287 1 60.19 TGAAATACCTTTCACTCTATCATATAATTCTTCATCTCCATTGCTAGCTAAGCGCTTTCGATTTGCACAAGTATTACACTAATAAATTGTTCGCTTTTCGCGTGCCACTA:1 - 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Idefix 231 2 60.42 ATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGC:1 + chr3L 4264963 5' + Transpac 39 2 56.36 AGCATTTAGCCAGCAGTCCTACTCTAATTAAGTTAATATCGACCATACCTGTTATTTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 - chr2L 12036192 5' - 297 6953 2 61.82 AACAATGATAGCAATTTTCAATGATAGCAATCGAAATAAGAAAAAACAATTTATTATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTT:1 + chr2L 12874894 5' + mdg1 7001 1 60.87 AGGCTTCCATCTCGCATCTCCCGATAGCCAGTCCCTCGTCCCTCTAAGCCACCACGCCTA:1 - chr2R 23577336 5' + ZAM 34 2 73.33 GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAGACAAGAAAAGACAAGAAAAGACA:1 + chrX 16983077 5' + Penelope 651 1 21.50 AAAGCGATCGATGTACATTGATTACAAGACACCAAAAACAGAGATAGATGGGAGTACAACTAGCTAACCTATCCTATGGATATTCCACTCCTTAATTATTTTGATAATAT:1 - chr2R 21278956 5' - S-element 1452 1 62.73 TTGTCGTTGGCCATTGCTGTTGTTTGCTCTAATATTTTCGTGTTCGGCTTTGTCAAAAGAATATCTTTTCCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 15040897 5' - Doc2-element 226 8 79.55 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAG:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 18 1 62.63 AGTTAAGGTTTCATATTTAGTTGGAAGTTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATAAA:1 - chr2R 19196961 5' + Bica 305 1 77.27 GTCCGGCGACCGTTTCCTGTCGGCGGGCGCCGTTAAATATTGAAAATTAACTTTTAAA:1 - chr2R 8792198 5' - hopper2 16 1 70.69 GGTTATTCTTTTTGACGCTTAACTTAGAGCTAGTAAAGGCTCTATTTCTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGG:1 + chrX 317003 5' - I-element 5106 1 60.00 TGTGTGTAAAAGTGTGTCATCACTTGTTATGTACTGGGTACATATGTATGTATGTACACAAGTATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTA:1 - chr2R 9552380 5' - S-element 1706 1 67.68 ATTTGCGCACATAACAATGACGCAAAAGCTGTTAAAATAAAATATGTACATATGTTTTTGCAGAAAAAAAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAA:1 + chr3R 19471389 5' + HMS-Beagle 359 1 72.45 ACTACTTGCATAACCACACCCGATAGCCCATTTCCGGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCA:1 - chr3R 24898083 5' + Doc 4532 1 65.38 CATGTTCGACAAACGAAAGAGCGAGGAGCAGTCCGCTCTGCAGGCGGAAGATGGTGACAACTGGCATTGTTCCGCTGCGAAGAGAGTCGGCGCTCGGCTTGGT:1 - chr2R 1653718 5' - Doc3-element 258 1 64.08 CGTCAACTTCACCGCTGACGGGCCGTTGATCTCTTTGCATTGGAGCCATTGGCCTCGGGTATAATGGTCGGATCATTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 + chr3R 6132027 5' + I-element 9 1 68.93 GGCAAAGAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 24867496 5' - roo 9026 1 68.18 CAACCACCCAGTGCGGAACGCCAAGGTCTCGGTGGTGGGGCAGACTCCATTGAGAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGACATCTCTTCGG:1 + chrX 507352 5' - roo 9018 2 55.45 AGCTCCTTGGAGAAGACCACAAAATCGCAGGGCGCACACAATTCCTGGTTTTGTTCATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 + chr3L 20139706 5' - mdg3 215 2 51.82 GAAATCCAATAAGAAACTATGGTCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3L 131810 5' - P-element 2844 1 44.55 TGTGCCACCCTGTGGCTTTCTGGGCAATTCTACAGACTGGGTCGGGAACTTTAAGATACATCCGAGAATATAAGACATCGGTGTTATATATTATATTATATA:1 - chr2R 20988984 5' - gypsy11 263 2 88.24 CAAGGAAACTGTAATCTACTTTTATACCATTATTGCATTCCAACATTGCAAATTACTGTATGAAAAGTGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 - chr2L 8633452 5' - roo 9071 1 62.37 TGTCATTTGCCACGCCCACGCAACATAAACACAAATAAACTTTTAGTTGATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAAT:1 - chr2L 20841975 5' - G6 1992 2 48.57 ATCACACAAATCATAAATTTGATGGGACGAACACATAAACTCCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTT:1 - chr2L 19129421 5' + FB 14 1 66.36 AAAAGTTGTATTTTGCCAGCAGAAAGCATATCAGTTCTCAATAGAAACATACTTGTATTAATTACTCTACCAGACCACAAGGCTGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTT:1 + chr3R 14516998 5' + Gypsy6A_LTR 268 1 58.10 ATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGGGGAGTCGCTGTTTACTTCTTCTC:1 - chr2L 23295852 5' + micropia 30 2 59.55 AAGGTAAAATATATATTCAAGGTTTTTATTTACCATATAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chrX 14858878 5' - 297 6953 2 68.89 TGGCAACTGACCAAATACAAACCAAATTACTTTCAGCATTCTTCGCAGTGGCTCTTTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 + chr2L 17393333 5' + FB 30 1 53.64 AAAAATCCAACCAATTTCCCATTCCCCAAATTTGTCGCCTTTTTCCTTGCTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATT:1 + chrX 9476416 5' - invader2 4701 1 62.96 ATTAACATTTTTTTCATTTAACGATTAATTTTTCTTCATTAACCATTTAATTTTGAAGAACATTTTTCTACTTATTCTTTAACTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAG:1 - chr3L 7130250 5' + BS 4998 1 52.78 AGTCCTTTCCCTCTCTTTTCTACCTACTGTGGGCTGCCCATTTTCCTCGTTTTTCACGCCTCACCCCGGATTTCTTCACTTTACCCCTCCTACAAACCAACCAAAATATA:1 + chrX 3739529 5' + I-element 5069 1 81.82 AATTTGATGAAAACAAACGAATTAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATACGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAA:1 - chr2L 14430120 5' + Stalker3T 203 1 68.42 TACTAACCAAGTCTTATTATTTTAATTTAAAGTTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTCTC:1 - chr2L 17717749 5' - Stalker3T 205 1 64.55 CCTATCGCGGCCTTTGATCGGCCTTTTTACTCTATCTTGGGCCTTAATACGCATCCAAAAATTATAGTAAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGT:1 - chr2L 7715556 5' + transib2 286 1 60.91 CTAATATGTAGTCCTAATTTTTAGAATTTACTTCTATATATACTTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTT:1 + chr2L 21808240 5' + S2 234 1 46.36 CTGTGTAAATATTTCGCTGCACCTTCCAGCTAAAAGATTTTTTGCACATCGAAATTAACAAGACTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 - chr2R 5266038 5' + opus 18 2 64.55 TTCCTGCTGGTTTATACTTCATTAATTGCTTGATCAACAAGTTCAAAATTCTCTTACGGAATTGCTGGCTTTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTGG:1 - chr2R 22195546 5' - I-element 5183 1 59.09 CAGGATCACATAAAAGTGGAAATGAATCCTTTTAACGTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATATCATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATT:1 + chr3R 30146597 5' + invader3 106 2 39.09 ACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 31458512 5' + jockey 20 1 58.21 TCTAGTTATGTTCTAGTTAGTATACTAAATTAATTTAATTAATTCAGTCATACTACGTTCTTAATTTGTTTTTTGATCATTAATTTAAATTAATAAAAATTGCAGCAATT:1 - chrX 3557381 5' + Transib5 2604 1 67.27 CTTAGCTCTTCGTCAACTAATGCGTTCGGTAAACAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATACGCG:1 - chr2R 16251692 5' + Quasimodo 7038 2 57.75 AATTAGTCACGATATGAGACATGCCACGGAAATGGTCTGAGATAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTA:1 - chr3L 12489706 5' + HeT-A 6039 1 53.76 AATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAAATTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAAATCGTTGCCTGTCTAGCTTTCTTATAAGCACAAGGATAAT:1 - chrX 21433275 5' - Tc1-2 157 1 69.09 CGACTCACACTTAAACGCAAACACATAAAAGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGC:1 - chr3R 19946437 5' + F-element 4439 1 72.48 CATTGAGCTTACAGTGCGCAATGCCCTGTCCTGCGGTTGCACGCAAATAAAACAATGAATAAAGACAACGGAATTTCATAAGACAAAACTAGAAAAAAAAAACAAAAAAA:1 + chr2L 2096081 5' + G2 3074 1 74.55 GGACGTATGTGGGCCTGGTGGTGATCGCGGGATATATTTTGTGTTGTATTTTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAATATCATTTC:1 + chr3L 25455108 5' + HMS-Beagle2 31 2 54.13 GGTTCTGGGTTCTGGATATCGTCTCGGTCATTTGCCGTGGCTGGGGTCAACAAAAAAATTTTAAGTA:1 + chr2L 1034973 5' + hopper 430 1 50.75 GCACGTTTTGGTTCGTGCATCTTTTGTGTACAGAATGCAATTGCATTGGGGTGGATTTTTCAGTTTACTTATGTATCGCTCTGCATTTGACTTTATTTCGTTTTTAACA:1 + chr3R 21946270 5' - G3 4345 1 59.63 CCAGTACAAAAGACCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTACTTTACTATTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 - chr2R 14884050 5' + mdg3 41 2 52.73 AGCTTTCTCAGCTTCCCAGCCTTTTATCGCACTTCAAAAATTGTCAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATGAATGTGTAAACGGCAGCTAATTCGAGCGGC:1 - chr3L 1356758 5' + 1360 2980 1 74.55 TGATATAAACGTAGCCCCTCTCCACACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chrX 22769321 5' + 412 17 2 65.45 TGTTAAATAAGACGCACACGTATAAGACGCACGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCA:1 - chr3L 18463491 5' + gypsy5 6966 2 64.20 ATCTACTGCGATGTCCTTTTCCACTATCATGTCCTTTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACCTCTGTTTTGAAATC:1 - chr2R 9782452 5' - G2 2722 1 58.89 ATGTACATTTTACTTACACTTCCTCGTTACACGTCCTGCAACAAGGACTCACACACATGTGCTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCCCAC:1 + chr3L 10109721 5' + hobo 23 1 60.00 ACAAACGTTTGACTAACCAAACTCCAGCTGACAGATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAC:1 - chr3R 22500863 5' + invader3 18 2 54.05 CTTCCTGCAACTTCAGTGCGCAGAGTAAGAAAACAATTCAAGATTCCCAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAA:1 + chr3L 19279091 5' - S-element 1501 1 57.27 CATTCGGCATTACGCTAACATATTATAACCTATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAG:1 - chr3L 17220773 5' - opus 7495 2 71.28 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAAAATCACATTGTAGCA:1 + chr2L 16217660 5' + Tabor 6887 2 66.06 GTATCGCTTATCGCATTCAAGGCCAATCACATGGCGAAAATGTGCAAATTAATTTATGCAAGCAGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 + chrX 9576510 5' + FB 9 1 69.07 CTAATGAGCATCGTCGCTGCGTTAACCCATCAACAACGGGTCAGACGCCGACATCCGCCCAAAATGCTGACACCACATTCTT:1 - chrX 14142757 5' + ZAM 144 2 67.07 ATTATTAAAGAAATGGTTTTAATATAAACAACATATATTTTTATTCAAACCTTTTTCAACCTATTTTATTGTCAGATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAG:1 + chr3R 10030596 5' + GATE 445 1 64.55 GCATACGCCGCATGTGCCCGCGTCGCAGTCGACGTCGACGGCGCTCTCTTCCTCTGCCAACACATACACAGCTTATATCTATGTATTCCTACTTAC:1 + chr3L 6997587 5' - Stalker4 266 4 67.71 TAAAATCAAACAAATACGAAAAACAATTGGTCAAAATCAAATTAAATAATTTGCATTTAATAATCAAAATAACTTCACTAGGTTACGTTATTTTTCAGAAGGAGGGAGA:1 + chrX 11302312 5' + mdg1 7017 2 69.72 ATATCTTAGAATCAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCAGCAGAGGGGCAAAACT:1 + chr3R 19512605 5' + Quasimodo 333 2 81.48 TTATGACTTTTACGTCGTTTTTAATATTATGTATTTCTTTATTGTTTGTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGAT:1 + chr3R 15975950 5' - I-element 158 1 52.94 ATGACGGAGGAGCAGGCCAAGAAGACTTACGAGCGGGCGATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATACCG:1 + chrX 11405920 5' + invader2 498 1 62.73 TTAGACCGCAAAAAATCCAATTGAAAATCCTGAGTACATATGCTGCCATTAGAGAATACGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAA:1 - chrX 22904327 5' + invader4 231 2 52.58 ATTGAACATTTCTGATGATTAATTACCAGAAATAAATCAATAATGCCCGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 - chr2L 14917971 5' + hopper 34 1 54.55 TTATAATATTTATTTATTTACGTTCGCGTTACAACGGAAATCATGTTTGATCACAGTAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTCGTGTC:1 + chr2L 23033999 5' - Tirant 485 1 57.80 CTTCTGCCAGAGAGAGGACGAGAGTAAGAGCGAGAGAAAACTCTTTCTCCAGTAGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATT:1 + chrX 5965732 5' + 1360 3170 1 67.96 TTTTTAGCACACAGATTTTCCAATTTCTGTTTGCCATCCCGTGGCGGAGGGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCG:1 + chrX 4479341 5' - G-element 4165 1 66.67 ATATAATATACTTTCATTGTAACCTTTGTTTAGATATACTAATATACTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTACCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTA:1 - chr3R 10901600 5' - Stalker3T 202 1 50.00 GTGACTCAATTGGGGGCAAGTGGCAGTGGAAATTAAAATGAAACAGAGAAACTGAAAAATAATTGGGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACT:1 - chrX 18950999 5' + 297 6896 2 65.45 TTTTTTGCAAAGCAAAAGCTAGCCCGACGAAATTCTTCCGATAAATATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2L 20902933 5' - roo 9030 1 61.82 GGCCCCGAATTCATTTTCATTTGTGCAGCTAGTAAGTTTTCCCCATCGCCACATGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGC:1 + chr3R 17823832 5' + I-element 392 1 66.30 ATAACTCGTAACTTGTTACTCAGAGCACACAACATAACTTGAACACACACACACACACACAC:1 - chr2R 9450770 5' + accord 7029 2 56.45 GGATCACCCAATCGAAGTCCAACAGAAGATCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 7400792 5' + roo 55 2 74.31 TTTATTAGGTATCTGTAATCTGAATTAGGGTTCACTTTTCGGTCAGTGCTGTTTCCTCGTCCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 - chrX 1601084 5' + hopper 11 2 68.37 TGTAGTCACGAATCTCTAATACCAAAGTCCTTTTTAAACACAATTAATATTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATA:1 - chr3R 29362846 5' - F-element 4640 1 65.14 AATAAGTTGGGTGGCGTGAGTTCGCGACTACGACGACGCGAACATAACGAGCAAAATAAATGAACGATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3R 5774917 5' + I-element 19 1 63.64 GACCCATTTGAAAGATACTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTATACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 - chr2R 19405987 5' - HMS-Beagle 7028 2 68.27 GTTTTGTTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chr3L 15968199 5' - P-element 2833 1 27.88 TGATTAAATTAGGAAGTACTTGTACGTAAATAGAGAAAGAGAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGTGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 + chr2R 21421344 5' + Stalker3T 205 1 41.28 CAAACTTTTCACCGAAAAGCTCTGTGGGTGGAGTGCCCGCTAGAAACGCGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3R 23943181 5' - P-element 2870 1 60.87 GTATTTAATATCTTAGAAAAATAAATAATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAGAACACAGAGTACACTAGATTCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAA:1 - chr2R 4134095 5' + INE-1 145 1 72.82 GAAAGTGGTCAGTTAAAAAATGTCAACTCCCCTTTGAAGATGCCCGACTGAGACAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACG:1 + chr3R 30374169 5' + hobo 2907 1 60.00 AAGCATTGAAATCGGCACCAAAAGAAGAAATATGCATGTGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 + chr3L 11085735 5' - S-element 1677 1 65.45 CATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr2R 6984385 5' - HMS-Beagle2 7162 2 66.67 CAAAATTTCCACAATAGTAGACAGATAGGCCGCATAGAGTTTAATATATTCCAGAGGAGTGTAAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3L 18072710 5' - 412 7529 2 62.86 TTATTTATGTGTTATTTATTTGGTAATTTCAATCCAAGTTGAAATCGTTTTCCGAGCTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACT:1 + chr3R 9238198 5' - hopper 954 1 64.65 TTGACAAATGCAGCCAAAAGTAACAAAAACAAGAGAGAATGCTCTAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 + chrX 21004427 5' - INE-1 561 1 94.12 CTCGGGCCACACGAAACATGCAAACAACTGGCACATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACACG:1 - chr2R 19860167 5' + F-element 4210 1 61.43 AATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chrX 4789145 5' - opus 7460 2 74.04 CGACAGCCACTGCAATTCTCTATGTACGTGCTCAGAGATATATGTGTCCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 - chr3R 11326953 5' - flea 222 2 60.00 CTAAAAGAAGACAGAGATCGGATCATTTTAATTAAGACAAAATATTTGAAATTCTGCACAAGACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATG:1 - chr3R 15923867 5' + Doc2-element 4445 1 61.82 TAACCTCAAAAATTTCAATAAAGACCATAACAAAGCAATTTATAAAAATGCCACAGAAAGTAAGGGGGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACG:1 + chr3L 15800325 5' - Cr1a 201 1 64.55 CTAGTGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATGTAACAGGATCAATAGCCATGTCTGTCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCTCAGGAAGTATAAAAG:1 - chr2R 1621920 5' + INE-1 148 1 46.36 ATGAGATACTACAGATTAAAAAAAAAATATGTATATTTATTTGTACATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chrX 3091927 5' - opus 461 2 62.39 CAAAAGCTGGAGGAGATCAATGGGGATGCCTTCAATAACTTCCAGCTGCGTGTGGGCATCTGCAGTGGTCCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGT:1 - chr3L 21138063 5' - Stalker2 68 2 68.18 AATAACACCGCGGCGCGTGGGAAAAGATCCTTAAAAAAATAATACAACTGTTCAAACAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTA:1 - chr3R 31928162 5' + F-element 4614 1 56.63 TGTTGCGGTTGATGTAGTTCGAGGGCGTGATCACGTAGCTGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGG:1 + chr3R 31184300 5' - Idefix 7018 2 62.50 TATTATTATTATTTTTTTCATGTACATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAATGCG:1 - chr2L 15622432 5' + micropia 5049 1 71.43 GTTGGCCATATGTATTTGTTGCTATCTGTTCGTGATGTGTGTGTGATATGTCGTGCTTTATTTCCACATAAATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGACA:1 - chr3L 1396389 5' - G5 4569 1 73.74 TTGGGGCACGGACTTAGCTCACCGCCCCGCCCTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCTGC:1 - chr2R 6714406 5' - 1731 4441 1 68.63 AAGATAAGTGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAT:1 - chr3R 27199602 5' + Stalker3T 201 1 55.29 CTCGCACTTCGCACAGTTCAGGAAATAGAAACTTGAAAAACTAAATTTAATTTGTCCACTCACTGACTTACAAATAACACTTGTCATTGAGACAATAGCAAAGAA:1 - chr3R 22403334 5' + Doc3-element 4472 1 63.81 AAGGATGGCATCATCTCGATATCTAAATAACGTCCAGTCACATTTAATAGGCGCAGCTGTCCCCCATTAACTCTAAATAACGTCCAAATTCTACGAAA:1 + chr3R 32009496 5' + Doc4-element 2396 1 78.57 AGACTCCTGACCGCAGGATGCCACACAGCTAAGCTGGCGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2R 13313453 5' + hobo 42 1 63.30 GTTAATAAAAAGGGAAGAGACACCAGAACAAGAATCAAAAATCGAAACGAGGAAATTAATATAATGTAAATAACTATATTAAATATTAG:1 + chr2R 20967627 5' - Cr1a 4307 1 61.80 CGGCCTGTCTCTTGCCTGAGAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAAT:1 + chrX 16854333 5' + Burdock 393 1 81.82 GATGATTTTCAAGAAAGTTATGATACAAAATCTCACTTAGGGTTACTATTTTTGCAAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chrX 1703354 5' - mdg1 395 2 53.70 CAATTATTAAAACCCATTCAGCTGAAGCGATCTATTCTATTTCCACTCAAAATACACGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCACA:1 - chr2R 18231446 5' + baggins 5143 1 60.19 GTCGACACACTTTGCTGCAGCTGCAGCCGGAAAACTCACCGCCACTCACACACACACACACACACACACACCCCGGCACACAGAAAACCCACACACACACATACAC:1 + chr2R 20426893 5' + accord 252 2 57.55 ACGCGTATGCAAATTTAGAGAACATGTTGTTCGAAAGAAACTAATTTTAACCACCAATATATATCTTATCCATATTTATCGCATTCCCACTAGCTGAGT:1 + chr2L 17009305 5' + INE-1 531 1 56.57 CTGTAGAAGAATCCAGAAAAGAGTTTAACACAAAAGGAAGATCGAGCTAGTATACAAAATCGTAGGAAGCAAATTAATATATTCGGAAGAAGACAGTTATAGAAGCG:1 + chr3L 16484595 5' - Gypsy12A_LTR 2032 1 59.81 TTTTTTCGGTTTAATTTTGCAATTATTTTCATGCACTGCCACGCCCTTACTACCACTTTTCCTGTTTAAATCTATGCAAATTCTTGTTTAGGACATCTGCTATCATGTTT:1 - chrX 5242631 5' - Dm88 4204 1 54.55 CAAACACGTGGGATTCGCTGGCTGTTTGTTTTGGTCGTTAAATCAATGATTGAATATTTCTGGATGCGTGCCACTTGCAATAT:1 + chr3L 9746222 5' - TAHRE 10000 1 77.11 TTAAATCTCTGAACGTCACATGAGTGGGTAGGAAATGGGGTACGGGATTGTACTATAGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCAC:1 - chr3R 18578730 5' + X-element 4256 1 64.84 AGATACTAATATGACTGAGTTATTTAAATATCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTT:1 - chr3R 15197816 5' - I-element 4897 1 69.57 AGCGGGATTCAATCGGGCGGAACAGGCATAGATACTAGTACCTACATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 + chr3R 19058372 5' + Burdock 17 2 51.11 TTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGC:1 + chr3L 8748916 5' - HeT-A 6033 1 73.64 ATTTACATAAATAGCAGGTCAAATGACAGTTAAGTACAAAAGTGGAATGATTGCAATAATACTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGACATT:1 + chr3R 22460507 5' + I-element 5190 1 65.45 CCTGCTACACCTGTCTGCCTTGCAAAAAAAGAAAAAACAAAAAAAATAAACAGGAGCGGGGGGCACTTGCTTTTTTACGCCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGT:1 - chr3L 2002092 5' - gypsy5 7344 2 67.27 GAGGACCAGCTGGGGATTTCGCCGGTTCTAGACAAGATCCTGGAAGATGGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGG:1 + chr3R 21883030 5' + R2-element 480 1 55.56 GGATGCTAAATATATAACTTGGCATTTACAAGTAAATTGGAAAATCATAGTTAAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTG:1 + chrX 17184893 5' + roo 23 2 57.69 TTACCCTGTATTTTTTTAGACATAACATTTTTCTACTTTTTGGACGATGTAAAACTAAAAGACAAACAACAAGAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAACGGA:1 - 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chrX 11801137 5' - S-element 1703 1 63.64 CAAGTATATGAATGGAAAATCCAGGGGAAAACTAAACATAACCCCAAACTGACAAAAGAGAAACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGA:1 - chr3L 22432304 5' + Doc 4439 1 43.12 TTCCTTTCATTTCCTCCGAATTATACATAATTATTATTTTCTTAAATACTTTAAGAAAATCTTTTACTTTTCTGTCTTTATGTTTTGTTTACTCT:1 + chr3L 24791912 5' + Cr1a 202 1 63.16 GTAAAACATACACAAAAGGTTCCTGACTTCTAAGGCTCAGCTTTGGCTAGTTGTGCAGGATA:1 - chr3L 12356579 5' + HB 1225 1 75.81 GAATAAAAGTATGATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr2L 21734996 5' + Doc 37 1 53.70 AGCACAACGCAAAAACATTGAAAGCTCTTTATTTACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2R 24031524 5' + 1360 51 1 69.72 CGTCCTTCTTTGCAACATTTATACATTTATTTAAATGTAAATTCAACTTGTAACCTTACCTAGCTAGCCGCATAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTAT:1 - chrX 7265075 5' + Cr1a 4038 1 52.29 ACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 - chr2L 9171480 5' + opus 31 4 75.31 CTCTTTTCTCTTTTCTCTTTTCTCTTTTCTCTTTTCTCTTTTCTCTTTTCTCTTTTGTCTTTTGTCTTTTGTCTTTTGTCTTGCCTCTTTTCTTTTTTTCTTTCTCCTTT:1 + chrX 4617446 5' - Doc2-element 240 1 33.64 TTTTATGATATGTTGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACAT:1 - chrX 20433414 5' - diver 214 1 69.61 TATCTAAACTACCGTGTCCCTATAGGCTTATAGGTTTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAGACAATTTTT:1 - chr2L 5724368 5' + 1360 38 1 64.65 GTCAGGCGGATCAAACTGGCCATATCCGCTTGTCCGTATGAACGTCGA:1 - chrX 596872 5' + INE-1 128 1 68.75 ACAAAGGATTTTCCAGCCAAAGGCAAAGATAATTGTACTAAAAAATTTACACAACATACCAAAAAGCTGCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3L 5971775 5' + pogo 11 1 63.55 CCCCACTGACTCCATCTGGGCATTCTCATCTCAGATCGCAGATTACACCACTCCGGATGTACCCAGATACCAGATAAGAATAAG:1 + chr3L 3696727 5' + Idefix 6920 2 52.38 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAAAACACACACAAAC:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 416 2 35.45 ACACATGTGATATGCAAGTGAGTGTGAGAGGACCACACCCTGCATTGAGAACCCGCCCACCCAAACATTTAATTATTGTCCACATGGACAGATTTTAAATTAATACATAG:1 + chr3L 14919509 5' + G-element 4300 1 57.27 GCCCCACAGTCAGGCCAAGTTGCTCTCTAGCCCGGCTGAAATCGAAAACGGTATGGATGCAAAACAAA:1 - 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chr2L 13710724 5' + copia 4929 2 80.00 AATAAATAAATAAAATAAAAAAGAACAGCCGTAGAAAGAAACGATGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGACT:1 + chr2L 16641149 5' + R2-element 3427 1 58.18 AGGATGCCACACAGCTAAGCTGGCGTACAAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 - chr2R 13313439 5' + hobo 57 1 76.36 TAATAGTCTAATATAACGCTTTATTCCTTTTGTTACTGACAATTGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGT:1 - chr2R 3009802 5' + accord2 7271 1 60.00 GGGCTAAACATAAACAATTCGGTCCACACCGCCCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGA:1 - chr3R 15888815 5' + I-element 4931 1 70.00 ACAAAAACATTCGCACACATTCAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGAT:1 + chr3L 13991819 5' + 17.6 74 2 65.45 AAAAACAGAAGAACACACGGCGGCAGCATAAAAATAAACACAAAGACAAGAAATACAAAAGAGTTAGTTTATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAA:1 + chr3R 7108661 5' - Cr1a 149 1 65.00 GCATCAGCCAAACAAAATGGCTGCTGTCCCCGGAACACACACATACAGATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTAGACTTTTTGACTTTAAA:1 + chrX 21183310 5' - 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chr2R 20924282 5' + mdg1 42 2 60.91 AATTACCTAACAATTTACCACATGTTCCGAAGTACACCAACTTGCACAAATCACAAAGAATCACTCGCG:1 + chr3R 19510231 5' - Cr1a 137 1 71.01 AAATACGTACGCATAAATTTAGCTATATGCACATAGTACATATACATATACACAGCTTTAGGCCCACATATATATATATATATGTGTATG:1 - chrX 14589919 5' - Stalker2 251 2 66.67 CGCACTGCTAAGCCTTATTTTTTTGCCCAGGTCAGGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 - chr3L 16258987 5' - Transpac 5195 2 60.87 AATAAAACGCGGATGAAAGTCGAGTGGCGCAGTCGGTAGGATAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGACATAACGCA:1 + chrX 17514496 5' + rover 431 1 76.36 CCGTCAACATTAAGTTTGCCAAATGAAAGGATAAACTCTTCCAGAGATTTTACACGATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 12452930 5' + roo 22 2 59.62 GATCGCATTATGGAGCGCTTCATAAAGGCGAATCTATTCATTGCACTGCTTTTTCAGTGAACATTACAATTTCTGCCTATTATGTTGTTTTAATCTATATTTTCGAAACT:1 - chr2R 20630734 5' + HB 1471 1 67.27 TAAGTAAAGGAAAGTGGCATTGAAATGGTTTGAAATGTGCAATACCCTAGGCATTAAATTAATTAATTAGCATTAATTGAATTAAATAAAATAATTAATATAAAAAATGC:1 + chr2L 3085514 5' + gtwin 6962 2 48.18 AAAGTGCCTACCAATGGCCCAAACCACACTGTTTTGGCCACCAAGGCAAACAATCAAACAAAGGCCCTCGCCGGACAAATAGAAATAGAAGCAACTCCATTTCCCACACT:1 - chr2R 13641229 5' + 297 6511 1 77.27 CATGTGTGTCCTTTAAAAGTAATTTACTGAAAAAAAAAATTTAATTATTATATTTATACCCGTTAGTCGTAGTGTAATAAGCGTATTCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1 - chr3L 23269408 5' + INE-1 13 1 60.00 TCAGTTGGGTCGTGAAAATGCAAAGGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGT:1 - chr3L 12250302 5' + invader4 2673 1 77.27 CAATAAACGACATTAAGCTATAAATTCATCCCTATTTGTATATTATAAGTAGATATCATTGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1 - chr2R 330221 5' + HMS-Beagle2 6903 2 62.73 TATGGTTTTGGTTTATCAAATTTCGGTTTGTTCAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTT:1 - chr3R 18174483 5' - G-element 4178 1 62.92 GCCTTATCTCGTTGCCAGAGAAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACACATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGAT:1 + chr2L 4670168 5' + G2 182 1 79.09 GCTATAGCTTCGGCAGCCACGCCCATAGACCCAGTGCGGCCATCGCCACGCCCCCCATCTAGTAAAACATAAAAAAAATAAACCACCCAAATTAAAAAAATATAATTTTA:1 + chr3L 11254414 5' + HB 329 1 48.18 CCTGATCTATGAGTGCTTGCACTTCTTTGATTCGCTGCAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAA:1 + chr2L 18675589 5' + 412 7069 2 64.55 CGGATTTGGCTAATACCACGATGCTGCGGCGGGTTGGGGAAAAGTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chr3R 29901793 5' - HMS-Beagle2 493 1 75.00 GAATTACATATGAATAAAGGTTATTAAAGGGTATTAATTTGTTAAACGACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCAATAAAACATATTGTGAGAG:1 - chrX 8493064 5' + copia 4952 2 60.00 ATAGTTACAATGGTTAGATGATATACATACTTTACATTTAAAAGTACCGAAAACATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 - chr3R 25635979 5' - I-element 5329 1 48.60 GGTTTTCTGATGCTAACAACATTTAATAAATAGTAGTTTTGAATAGTTTCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGCTCCTTTCGCCGGAGACGGGA:1 + chr2R 19523934 5' - F-element 4514 1 60.82 TCAAAATGTATTCTAGAACCATTAAAAACACTTGCAAAAATCGGCACCAAAAGAAGAAATATGCATGTGTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTG:1 - chr3R 9949447 5' - S-element 1706 1 41.82 ATCTGCGATATAAAATGCATCCTTAGAAACGAAGACATACATAATGACATAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTGTTTAAAAAAAACAGCAAAAAACACACAAATA:1 + chrX 13210779 5' + Porto1 4441 1 77.57 TTTTAATTACCATAAACAACAAAAACAGCAGGAAGAACAGAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAACCATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTG:1 + chr3R 19829804 5' + diver2 370 1 67.27 AACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 + chrX 17330115 5' - opus 7481 2 62.67 AAAAAGGGTAACTTAGTCGGACTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCTTCAGCAAG:1 - chr4 493901 5' + R1A1-element 5121 1 78.18 TACTTCCTATATAAATTTAAGTGACTAATTGCGGGAAAGTTTATCCTTTACCTTCAACTCCATTACTCCCAAAATAATAGAATAGAATAATAATAATAATAATAATATTG:1 + chrX 19542874 5' + mdg1 7072 4 76.36 TTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1 + chr2R 6984319 5' + HMS-Beagle2 6902 2 56.99 GCCGCGTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAG:1 - chr3L 23678111 5' + Osvaldo 20 1 72.50 TAAGTTTACCAATTTGCATCTCAAAGGTAGTTAATTTCAGATCATATTATGGAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - chr2L 7750624 5' - opus 481 2 51.65 GCCAGGACTCTCGGTTACGCTTGGGCTGGCCCTTACTTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 5320606 5' + roo 23 2 61.90 CACCGTGGTGCGGTAATTAAAGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTCTTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 - chr3L 22108143 5' + Transpac 56 2 76.92 CGTGAAGTCAGTAAAATCCACGATAAAACCAAACACCACTCACACCAACCACCTAGCGCGAG:1 + chr3R 17504929 5' + F-element 4469 1 70.97 GACTTCTAAATAGCTGTCGATGGGCTGGCTGAATATCGTGATTGCTGTGCTAGTAGCTAAAGAACTTGACACCGTCTTGAATGGGG:1 - chr3L 21292167 5' - Doc3-element 456 1 62.79 TAAAAAAAAAATATGTATATTTATTTGTACATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 + chr2R 4817177 5' - opus 457 2 74.23 CGTAAAATGAATGTTCGTATGGGATGAATGGGGATGTGCAAGTTTTATAGACACATCTGGCGGTTGGCTATATAGGGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 25859704 5' + 297 6 2 74.00 CCATTAGCAAGACTTGAACACACCGATTTGTTTCATTATATGGTTAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chrX 22861836 5' - 1360 3361 1 74.49 ATTTAATTTGATGTTTATTGACCTGTTTGCAAATACCACTGATACTGTGATTTAGCTACATTTCTATGTTTAAATCAATATGTACATATATCTTCGTTTCTAATGTACCA:1 - chr2R 11066475 5' - Porto1 4371 1 60.00 CTTCCTCCCTGCAGCAGTCCTCTCTGAAGCTGTTCGAGCTGGCCTACAAGAAGGTGCGTATTAGATTGGCTCCTTGTACTATGCCGTATAATTCAATTGATATTTACTAA:1 - chr2R 14253383 5' - jockey 293 1 69.09 CGGTTCCCCACCGCCCCTGGTCATCAGTCGCCTTCATTACCAACTAAAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACACAAACTCATA:1 - chr3L 12915890 5' + I-element 5135 1 55.45 GTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2L 4016891 5' - opus 471 2 72.60 CAGTGGAGTTTTGCACATTCTAACAGATTTATTTCACTCGAAATAGTTTCATTTTAGTTGCATTATTGTTATTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTG:1 - chr2L 17044552 5' - gypsy3 419 1 71.82 ACACGGCCATAACTCGTAAGTTATATGCACATTAGAATGGTAACAATGTACTGTTGCCTAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAG:1 - chr3L 18687628 5' + F-element 4318 1 47.52 ATAGTGCTTGGAAGATTGACCTGAACAGAACATTTTGTTTATTTTTTTTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATT:1 - chr2L 21625720 5' + S-element 1605 2 70.91 GACTTTCGTAGCTGGCTGTGTGCTTAGTTTCTGTGCGGAAGCCTTGTGCAAGCCTCTTTTGAAACTGTTTACCTTATCTCTGGACTCTTCACAATTCC:1 - chr3L 14070905 5' + Q-element 19 2 78.57 CGCCTTGCACTTTCAATGACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAG:1 - chr3L 3240620 5' + diver 5887 1 80.39 TCTATTAAGAACAAAGAATTCTTGATCAAGACGTACGAAAAGTACGCGTTGTTTTGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTT:1 - chr3R 29110632 5' - Doc2-element 322 1 62.20 CTTATAATAAATCGATATAACAATAACTAGTTTGCTCAGCTTGACTGTTCATAAACAATCTATTATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATA:1 + chr2R 10163543 5' - Juan 4194 1 50.00 GCCAACATACTGTTGGCCCGGAAGAAGAGTGTCTTAATTTATGCGGAATTATGGGGGGTGGGGTG:1 + chr3R 16110726 5' + Dm88 405 1 58.46 GTTCGCGAAATGTAACTCCAAGTAGTTGTCTCCTATACGAATTACTTCAAATAAATTATTTATTTCTTTAAAATATAGTATAAGTCGCATTTAAATGAAACGAAATTTCG:1 + chr2R 16859989 5' + invader1 12 2 69.09 TTCCAAACTTGAATCACCTAGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2R 8397499 5' + 412 42 2 64.55 TCCATGTCACCGTCGGAAAATGAAAAACTTCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAGTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 23653455 5' + pogo 50 1 69.16 GCAGTTAACAGCCCATTCTCACCTCACCTGGAACGCAGACGCGACTCATCTACCTGGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGGGGGCAATGCACTTA:1 + chr2R 13448015 5' - 412 154 2 57.69 TTAATTTTTCTTGCGTTTCTATATGTGTAAGCTAGGTGTAAATTTTAAGCTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 15497993 5' + roo 8699 2 62.73 TGTGTATTATGAATACATATAGGTACAGTGGTTAACCGATATGTGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAAGCGGTGGAG:1 + chrX 21852454 5' - gtwin 7360 2 54.46 TTTGTGTTCTAAGTCGGTCGCATTGTCAGTTAGTCAGCTAGTCAGCTAGTCAGTCTGGCTGTTTGGCACAATCTATCCATTTTTTTTCTTTTTTTTTATTATAT:1 + chr3R 26893651 5' - Rt1b 5148 4 60.58 ACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chrX 20330577 5' - P-element 2870 1 39.68 TACTGAGTGCAGGATTTTCTGTCAGGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACT:1 + chr2R 23354304 5' + Tabor 50 2 77.55 TTGCAGCACCCACACCCATTAAATTGGCTCCCAACTCCTGTGTAGTTAATTATTATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chr3L 16301134 5' - mdg1 406 2 51.95 CAAAAGCAAAAACCACAAAAAATAGCGGAGAGAAGTACAAAATGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chrX 8519016 5' - S-element 1677 1 61.82 CCACAGATGCGAGCTTACACAGATTTTTTTTGTGTCTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCAACTTTTTT:1 + chr2L 9754801 5' - 1360 3342 1 66.36 TGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACA:1 + chr2R 5206900 5' + Doc4-element 14 1 63.33 TGAAATGTCAAAAGGCGTAAACAAAGTTTAAGCACATTTTCCGTGAATTATTCATATATATGTAAGATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr3R 20703179 5' - flea 213 2 55.45 TTGTTTGCGTTGGCAACATGAATGTTGTCACTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTTTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATAATT:1 + chrX 8810118 5' - mdg3 5059 1 61.96 TGAAATTAAATTTTTAGATTATTAAAACTATTAAAGTTTATTTTTTTTTTATATTTTTCCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGG:1 + chrX 18021028 5' + Doc 9 1 37.78 CACTGCAAACAAAGGACGTCGGGCTAAAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTA:1 + chr2L 9224261 5' + Tirant 294 2 75.45 AATTAGCCATAACAAAACCGAAGCGAAACCGACACAGAACCCAGAAAAAAAAGACATCAAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCACA:1 - chr2L 15420820 5' + 297 491 1 60.91 ACTCGTTTTTGTGTAATCTCAACGTCATAGATACCGTCAAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2L 11082301 5' + jockey 14 1 50.75 TGCAGGCGAATTCGAAACTGTTCTCACATACTTCGTACACTCAAAAATGTTTGGTTGGATTAATATATTTATTAGATTATTTCGTAACTTAAGAAAATAAAATAAAATAA:1 - chr3R 14248984 5' - transib1 1903 1 76.36 CTCGAGCCATCGTCGCCAACGGTCGCGCTCAACGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAA:1 + chr3R 16043505 5' + invader2 286 1 64.89 GCTGAAAGCAGTTTTCACAAAAACATCCATCCTTTTCCTTTAAAAAATTGCGAAGAGCATAATGTACACGGTGCCGCAGCATAATTTCCTTTTTTCAGAACTCAATGGAA:1 + chr2R 22064467 5' - mariner2 869 1 40.91 GCGCAAATAAATATTTTAATTGTCAGCATGAAAGCCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTCCTAATCTATTTTCAAATAATAATAAC:1 - chr3R 24381190 5' - 1360 315 1 72.73 GTTGGGCTATGCCTACGTCAACTTCCAGCAGCCAGCCGATGGTGAGTAATCCCCGCAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGG:1 + chr2R 18141632 5' - hobo 30 1 73.17 ACCAAGTGAGACATCCAACAGCCCACAACAGTATACTGATAAGCAGAATTCTTACAAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCT:1 - chr2R 4094125 5' - 1360 415 1 60.95 AGCGAATAAATCTGTTTGTCTTGGTGCCAGGACACAAACACGCACGCACACCAGCACACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCG:1 + chr2L 8560466 5' - invader1 216 2 71.76 GATTGGGGTAAGCTAAGCGAAGCGGGAGCAAGTGGAGCCTAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAG:1 + chr3R 29794745 5' + copia 4737 1 63.64 ATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr2R 22661297 5' + Transpac 37 2 56.36 CATCCCTTTCTGTCTGCGACGCTCTCTTTGATTTTGCCTTTTTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTAGGAATCAATCGCTCTGTGGAAAATA:1 + chr2L 16520898 5' - transib2 2372 1 66.36 GCTTCAGCGTGACATCGAAGGTGGCCTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGAACGGATG:1 - chr3R 21755172 5' - Idefix 194 1 72.34 GTGGTCGTTGATGCGCGGTTCACCCTTGTTCTCCTTTGTTATTATTATTTGCCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATATATTTTTTTTTACTATGTTTTGCTTTTTCTT:1 + chr3R 4913125 5' - G4 3586 1 68.18 TTTTAGAATAAACTTGTCCTGTGTGTACGTCAATACGTATGATGATTTCTTCGGTCAATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTCGATCAGGATCAATAGCCAA:1 - chr3L 25106653 5' + INE-1 89 1 60.91 AAAGTTAAAAAAAAAAGCAAAATAAAAATCCACCAGCAAAGTTAAAATTAATAAAAATTAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATT:1 - chr2R 7775228 5' + HeT-A 18 1 83.64 GAATTACACACCTGACGACGGGACCAGAAATCTGAAAAGAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAG:1 + chr2L 3857701 5' + Doc 4512 1 67.59 CAAAATTAATTTTGTTCTGAAGAAATAAATTATTTTTTTCATCATTTCTTCTCAGTCAGCTTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAATATGAGTTTTTGTATG:1 - chr3R 9612672 5' - I-element 5141 1 60.91 CACACTACTCTCGCCCGCAATCCGCCCCTTACCCCACCTTCAGCACACACACACACACACACACACATACATACA:1 + chr2R 15596525 5' + Quasimodo 40 2 77.33 AAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 12039939 5' + 412 42 2 64.42 CGAGGGAATTATGCAAAACCCGAGTTCGTACAGCCATAAGAAATAAACAAGAAATGCACAAAAAACAGAATTCGAGAGTGACAGGTGGCAAAGAGAAAAAAAAGATGAA:1 + chrX 3821493 5' + invader2 292 1 72.48 AGCATTTTTCAGGATCATTACATAACTAGGCTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCTGC:1 + chr2L 5724321 5' - 1360 3351 1 71.58 TTTGTCACCTCTACAGCTAGCATCTTCTCAGTTTTCATATACACTCTTGTGCGTCTATGCCTTTAAAATCTGTGTGCTGAAGTGCAAACTTCTAGCTTTTACAGTTCCTG:1 - chr3L 23704745 5' - INE-1 155 1 55.45 GTATGATTTTTTTGGTATCATAAAAGATATGGGCTTACGTAACCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr2L 21735004 5' + Doc 14 1 59.74 TTCACTTCAGAATCAGAATTAGAAATGTATTCAAGTATGAGTTTCCGCATTGCATGGCTACATTTCTAATTTCGGTCTGGTCAAGAAACCATTTACACAAAACACTAAA:1 - chr3L 7509068 5' - S-element 1493 1 77.98 TTACGAATAATGTCCCGAGAGAAATTAGATTGAATAAACATATTAGTTGATTTAAAAGCGGGGGTAATTTTAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:1 - chr3R 17777688 5' - Burdock 6382 2 72.73 AATTAGAAATCCATTATGGTTGGCTATTATATTTCTAACGATTTTTTCTCAGTGCTCCGGGCCTTGCTGCATTTTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGG:1 - chr3L 22093214 5' - gypsy7 301 1 76.36 TTTTTCTCTGTGTGCGCTATCTAAATGTGGCACGATTATTGTTATTATTGCTGTTGTTTCACAGCGCTCGCAGGAGTTACAACCCCACCCCCTAA:1 + chr2R 21591959 5' + Tirant 8109 2 77.89 AGCATTTAAAGCTAAGGAAAAACTATTACAATTTAGACAAGTGAATTTGTGACAAATGAAACTTATATATTATTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3L 7219673 5' - roo 395 1 67.27 ACCCAACCCAAACTCAAGCGAAACGAAACGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCA:1 + chr2L 10874260 5' - roo 119 2 70.10 TATTTCATGGGCTGTCTCCAGCGGAGGAGGAGCTGGAGCCCGTATGTAGTACATCGATGGTGTTCCACCTCGGCTCTGC:1 - chr3L 10943188 5' - G2 313 1 63.29 GCGACCTTTTCGAGTACCCTGCACATAAAAGGTAAAAACCGTTGACGTGTCGTGGATGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATAATAAA:1 - chr2L 20592010 5' + copia 188 2 67.29 CACTAAGCAAACATATTTTTATGTATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGA:1 - chr2R 22661321 5' + Transpac 4932 2 69.09 ATCCGCTCTCGGCACGAATGCGTTGTGCATGTCGTAGTCCGTCTGTAGCTCCCAAATGGATTGGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAGTGGGATCTTTTCACACTCTT:1 - chr2L 4467109 5' - S-element 1332 1 56.36 TCTGCTACCCAAGATAATTCTGTAGTAGGGTCCTATTTACACAGTGATATTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3L 8011354 5' - pogo 2085 1 47.87 AAACCGAAGTAAATCTAAAATAATATTAAAACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGACTAATCCAGCTCAGCA:1 + chr2L 8110818 5' + F-element 4487 1 70.64 ACTTTTTGGTTCACTCTTTTTTTTTTTGTGTACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chrX 16487150 5' + 1360 58 1 60.00 AGAGGTGAGTAAGCGGATGTTGGATTGTGTTAGTATCGGTAATATACAACAATGAACATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGT:1 + chrX 17950244 5' - Gypsy6A_LTR 261 1 62.50 AATTAAAATTATGATACCGAAATGTGTAGAGTGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATATCAAAAGGCAAAGAATCGCA:1 + chr3R 16281966 5' + Bica 471 1 66.32 AAAGAGTTTTCTCGATTCGTTTTTCTTCTGATATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAA:1 + chr2R 8530744 5' + mdg1 7091 2 71.82 GTTCGTGTGTGTTATTTGAATGTATGGAATGGGGAAATTTTTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chrX 4216615 5' - I-element 5307 1 66.36 ACAATAATTCAATCAGAGTTTAAAGCACATAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGTTTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAAAACA:1 - chr3L 19431868 5' + 17.6 363 2 72.00 CGATGATTCACATTCAAAGTAGTTTGATATGGTTAAGTGTTTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCG:1 + chr2L 12719519 5' - I-element 246 1 62.34 GTCCATGAAACGTACTTTGTTGACCTTTCTCTGACGCTGCCGCTGCACCTACACCCACACATACCCACACACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGA:1 + chrX 1952908 5' + mdg3 5368 2 71.00 TATGGTTGGGGGCGTTCTGGGCGTCTGGGCGTGGCATGGGCAAAAGTTTTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTAT:1 - chrX 15213262 5' - G2 2899 1 64.47 TATAAACGTAGCCCCTCTCCACACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chrX 22769324 5' + 412 14 2 66.35 TCGACTGGCTGACGTCTTGAATTATTTTTAATCACTTTTCACGCGCAGAAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr3L 9822305 5' + pogo 3 1 69.23 CAACGTCCAGAAAATAACACAAGAACGGTGATGGAAACCAAAGTATTCAAGGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATA:1 + chr3R 30207085 5' - 17.6 141 2 54.55 GTGTGGCCTCAAGGAGCCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAAGCGAAAAGACGCTAAGATAAACAAAAAACAAGCGGAAACAATAAACAAACAAAAATATGAGCGCA:1 + chr3R 13450878 5' + Porto1 198 1 42.73 TTTGGTTTTGCGGCATATGCTGGGTATATAAAACATCCCGAACTGTGCTAATGTTTTTATTTTCTCATATGCGTGTATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAA:1 + chr2L 7088280 5' - rover 7291 2 75.45 TGTAAAGTAAACAGCAAATATTAGATAACTGACAAAAATTATTCATATGATATACAATGATTTAAGTTAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACAGAGAA:1 + chr3L 7882153 5' - Cr1a 4103 1 56.36 TTAAAGTTTTATTGAGTCATAATAAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGAAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 3528589 5' + roo 60 2 80.73 CGTCTTTTGGACCAGGTGCGATAAGGCAGCATTCTTGTTGTTGGCCAGGCGCCGACACCGCACGAAGCAGCGCCC:1 - chr2L 380821 5' - BS 110 1 72.00 GAGTGGCATTTCTGCGCAACATATTTGCAGGCTTTGGCAAGCGAAAATCCCTGAATAGGGGGAAAAAATATATATTAAAAAAAAA:1 + chr3R 29440840 5' + BS4 728 1 82.35 TTATTACACCCATTAACCAGAACTAACTTAGTGAAAAACCACAGAGCATACGTGACAGTTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCACGGCAATCAC:1 + chr3R 23979832 5' + F-element 4410 1 58.18 TATATTTTCTATAATTTTGTCTTTATTTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACA:1 + chr3L 5092807 5' + HMS-Beagle 24 2 70.27 GTCCCTGTGTGCGTACCTAAATGTATCCATATGCCTGAGATACGGGATACCAAAGCCAATTACCTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGG:1 - chrX 19032141 5' + flea 362 1 68.93 AGGACACTGGAGCCACGTATTTCGCTGGATAGCGCCGCATCCTCCATCGCCGGACAACCCTTGCCATCACTGATGATCGCCTGTCCACACTTTTAGAAATGCAGCATCGT:1 + chr2R 16248273 5' + invader6 447 1 60.00 TAAGACATATTAATGACATCCATCAATATGTTGCAGGAGTAAAGATCGGACCAATTAAAGCCAGCTATAAAACGTGAACTAAAGGTGCCGAAAATTGGAGACAGGATTCA:1 - chr3L 22645651 5' + jockey2 3046 1 65.45 TTTCAAAACCACAATACTACCCGCAAATAAATAAAACTCTGTTCCTTTTGTACAAACAATCATTCAGCTATAAAAATTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 3912173 5' + Doc 4693 1 76.40 TGTTGTTGAAATGTTATTCGGGGACTTGTATTTCTAGCTGTGGGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTT:1 - chr2L 16064961 5' - X-element 416 1 56.12 ATTTTGTCGGCTTATCATCCATCATCCGCCCATTAGATGATGATTCCCAATGCCATTCCTTGCTAATATAAGCAAGTAGTTTTACACCT:1 + chrX 9760639 5' + Doc2-element 194 1 78.65 GCGAAGGTAAGTCGAAGTTTGTGTTTTATTATGTTTATTTGTATTATTATGTACACTAGTCGGCATACTTATGCGTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTT:1 + chr3L 18463407 5' - gypsy5 398 2 70.00 TTGAAAATTGCGCAATTCTCACAAGTGGGAAACAGAGCATATGCCCCACTCCCCCAACTCCTCCTCCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACAGCCC:1 + chrX 5566692 5' + Doc 459 1 70.21 AAGTGCGCTATTCATTAAGGTGTCTGTGGGTGGCTTTTCGAATAGGGTGGCCATTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAA:1 + chr3R 6781687 5' + R1A1-element 335 1 63.16 TTAAGGTTTCAAAAGAAATGTTTTGAATCGTAACAATGACATATTTATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGNCTCTTTTAT:1 + chr2R 14883981 5' - mdg3 5463 2 58.65 ATATTGCATCAAATTGGCTATCAAAGAAACAGCAAAAACTTAAGCAACGGAGCCAAAACTAAAAACGAACTACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAA:1 - chr3L 7732781 5' + Doc 4421 1 70.00 GACTCAAGCAAAAAAGTGAAATAAAATCAATTGGCATTCTGACATTTTTTTTAAAGAAAGTAGATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 + chrX 15169945 5' - I-element 5334 1 59.09 CCGCGTGGTGTTATGTGAAACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAA:1 + chr3L 7204149 5' + accord 164 2 78.65 TTGTGTGCTCTTAAGCAAATTCCCATTTGACCATAAACAATCGACACCCAACATACTATTTATGCACCTACATTTCCCGAGACAACA:1 + chr3R 14042789 5' + gypsy7 266 1 58.62 AGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTATTTAATCTAATAAAAGACTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAGCCT:1 + chrX 14771731 5' + jockey 4708 1 56.88 CACTTGACAAGTCAGCGCCCGATTGCTTCACCTTTAACGTTTTGCGTTTTGATTTTGTCATTTTTCTTGTTGATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chrX 17330202 5' + opus 10 2 71.82 CACCTCTAATGCGACCTCAACGTAAAATAATTGCTGACCAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 5910750 5' - roo 394 1 56.96 TCTTTTTCGGGGGGTTTCTTGCGATATATCTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 + chr2R 12636234 5' - I-element 5286 1 72.73 GGCGGCTGAGGGGCCTAACAAACAGACAGGCTCAAATACCAGTGTCTACAAATAAACGAAAAGAAATAAAAAACAAATTTCGACAACTTAACTGGCTAATATGAAAA:1 - chr3R 13859195 5' + Porto1 4187 1 52.34 CGCCACCCGACTGATTTTAAAATCTGCCTTTGGGCGAGGCTTGAAAAAAAGAGACTACTGAACGCATCTGGATGCTCCCC:1 - chr3L 18438069 5' - 1731 481 1 77.50 TATTTTTATTTTATTTAATTTCTTTGACATTTTGAGACAATTACGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 + chr2R 15155181 5' - flea 224 2 53.64 GATAAACTTCTGTGAAAAAAAGCTCAAAAAAATCTCACAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATCCAAAAA:1 - chr3R 1272014 5' - pogo 218 1 71.56 CCGCTCCCCTCTGGCAGCTCATTCAATATCAAATTAAAAGCTACCTGTTTCTACCTTTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAA:1 - chr2L 12275025 5' + I-element 5126 1 68.54 TTGGCGTTATTGACAGTTTAATTGGAAATTAGAATTCTTATCGGTGTAGCTTAGCATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr3L 126343 5' - pogo 2089 1 65.26 CAATTTATTTTTATACGAAACGAAGCAGACAAACGCCAATACAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCC:1 - chr2R 9745541 5' - blood 415 1 56.38 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATACG:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 204 1 51.92 TTTGTTTATTGCAAAAGTCATATCCTGAGGCACGAAGTGTGGACACAAGCACGCAACAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATAAAAAAAAATATAGA:1 + chr3R 22232288 5' - 1360 255 1 61.82 ACGCGGCAAGGAGCAGGCCAAAGGATTCCCACATTCACATGGAGTCCTTCCTGTGCGCAGGGACGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCG:1 - chr2L 1307242 5' - jockey 4598 1 61.47 AAAAGTTCATGAAATCGAATTCGACCCGTGGTGTTCGACGCGATTTCTCTTCGACGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chr2R 21362063 5' + Tirant 21 2 60.00 TAAAGATGTACAATCTTTAAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTCTAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr3L 2987429 5' + blood 7048 2 54.13 CCGGGCATGTGTACTTATTATACCACTCACACGAAATGTGTGTCAACTTGGTGGTTTTTTGGGTATTTGTATATTTACGTTTACTATGACAAAGTGTCACAATGTATTTA:1 + chr3R 19915578 5' - Stalker2 53 6 57.27 AGCCGAAGATCGCTGCAAGTGCCAAACCAAAGACCAAGACGGAATCCTTGATGAAACAACAAGAGAAGAATGCAAACACATTCTATTTTTAGATTTCT:1 + chr2R 21679904 5' + 1360 3271 1 73.47 CCGAAAATGAACGGAAGTAATTATAATGGCCTCTGTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCAC:1 + chrX 6509040 5' + blood 7181 2 61.19 TACTTTACGCGCACAGAGTATCAATCATCAGTCCTAAATTTCAATGTTTTTCTGTAAAATAATTTAAATTGTTAAATGTAAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCA:1 - chr3R 25780931 5' + HeT-A 5845 1 77.27 AAGCCATTTTGTAGCGCTAATTCGCAGGACACACGTAAACGCAGCACAGCTACTCTATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAACAGCAAGA:1 + chr3R 22174233 5' + R2-element 379 1 60.19 TTTCAGCTGACCATTGGACATTGTCCTTCTCTATCTTTTTGGCCGGTTTTAGGGCGTCGAGTGTGCGCGGCAAAGAATATCAACACATTTTTTAAAAGTGTGGG:1 - chr3L 10824286 5' - INE-1 257 1 65.38 AAAACTACTTTCAGGTATTGAGGGATCGAGCTAATCGCGTGGGCTGGGCCCATAACCCCCATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATC:1 - chr2L 20134249 5' - Dm88 168 2 61.11 TTCCTTGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAGCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr2R 9963495 5' + pogo 47 1 65.45 GCCAATTTCTATTTGAACTTTCCATATACATAGTTCCGCCGCATTATTTGTGTAAAGTTTTGCGTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - chrX 9522236 5' - opus 7484 2 65.45 TGGCCGGGCGAGACTTTGACTTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAGTG:1 - chr3L 131791 5' - P-element 2833 1 27.45 TACTTCAACAGTAAACTTGGCAGCAGACTGAATGCGGATAATCTAGTCCCATTTATGCTGCAGGGGGAGGCGGAAAGG:1 - chr2R 11796534 5' + Rt1c 5208 1 76.92 AACATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr2R 7981137 5' + 1360 38 1 64.15 GAGACTTTGGCGCATTTGTCTGTCCCAGTGCCTTTCCCCTTTGTACCAAGCTCCTTCCAGCCACTAAACCTCGCCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGACTCAC:1 + chr2L 12320557 5' + BS3 136 1 56.86 GCCCATAAATACATTAAAATACACTACCAGAATTCACTTGAAGTGAATATTTTTCTCTTGTGTGTTTAACCAAAGACCCTAGAATAAAAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr3R 8811151 5' + 1360 18 1 64.22 CTGACCTTCAGTGGGCCACTTGAGGAACAGCTTCTGCAGCAACAACTCAAGCCATAACCAAAACCCAGCCACTACGCAGGCACATAGCCACGTAGCACATAAGAATTATT:1 - chr2R 18904508 5' + Tom1 157 1 58.18 CATATCGGTCAAATTACTATGTTTCAAATCGAAGGTTGGCCTATTTTGGCAAATGTTTCGATTCAAGGTCTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATA:1 + chr3L 15525598 5' - Ivk 5366 1 68.18 AGACCCACCCATAATGAGTGCCAAGGCATTGTCACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 12591706 5' - roo 9044 1 55.45 TGGTCATGCGCCGGGTACGGGAAACTCACGTGCCATCTACGGATATGCAGCTATTGCCCGGAAAAAAGGCCAAAATAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACA:1 + chr3R 12913612 5' + flea 233 2 70.00 ATTGTTTGGGTTTCTTTTCACGCTTGATTTTATTTGCGCCTGTATCCGTATCCGTCTGTTTGTGTATCTGTGAGTGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGG:1 - chr3L 2570469 5' - Doc 4388 1 78.79 AATTTTTCACAATTTGTGCATATTTTATTGGTTCCAGTGCAAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3R 11526784 5' - pogo 2061 1 61.68 TTGCTGGGGCATTTTCAAAGTCTTCCTCTTGACCTTGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATAGAGTAGCCGCTGCGTTTGGGTCATATTGGTCCTCCG:1 + chr2R 24325590 5' - R2-element 317 1 64.49 TCTACCGAATGTCCATGCAATAGCAGTATTGTTGTTTTTCATTGGTTTATTTGATACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTC:1 - chrX 12806234 5' - invader2 157 2 54.44 CAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr2R 7981177 5' - 1360 3355 1 76.62 GCCAAATAAAAAACGCATTAATACTCATTTTAGTGACAATCCGTGCTTAATGTGCGAAAGACAAAGAAGGTCACAATAATGGCAGA:1 + chr2L 1878921 5' + hobo 449 1 80.23 TCTTCTTTTAATAGTACTACTAAAATATTTATTTTAAATCCTATCTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATCCACTTACA:1 + chr3L 11105059 5' + Idefix 38 2 60.00 ACCGAGCCAATTTTAAAAATAATTTCCAAGGAAATAATTATAACCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTA:1 - chr3L 27883478 5' + Quasimodo 7065 2 60.55 AAGTGGAAGGAAAAGCGCGTGTGGGTGGGGGGTAATGATGAACTCCAATTAAGAATACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 1291086 5' - 412 463 2 67.07 TATTATAGCTTGTTTAATAAGAGCTTATTAAAATTATTAATTATTATTGTATGATATTAAAAAAAAAACCATCTAAATATATTTACGCATAAAGAAACCAAA:1 + chrX 22564490 5' + Transib5 49 1 64.71 TCTGGCCTAACATTGAAAATGCAAATGTTTATATGTTTGCCTGTTTGCCGTCTAATTTTGCGCATAGTTATTAATATTATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 9481308 5' - roo 403 1 76.36 GAAGTGTATTGCTGTTTACCATGGAGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTG:1 - chr2L 18821783 5' - Doc2-element 4404 1 78.05 TGCATTATTTAATTGACTCGTACCTTTCCTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr2R 20924228 5' - mdg1 366 2 78.18 GCGCAGTTCCGTTCGCATTCGCGCGTGATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr3R 16349188 5' - P-element 2886 2 77.32 TCTCACATTTGTCTTACGGATGATCGATCGAATTAGTCGTTATATCGAATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chr2R 10129820 5' - Burdock 220 2 57.80 TAATTAAGATTGTGTGCAGAAAATGAATGGGAAAAAGTATTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 - chr3R 20703262 5' + flea 4764 1 64.10 AAATCACGTCAAACTGAAGTGCAAATGGAACCCCAAGAGGCTTGAAAGGCAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 30848816 5' + Doc2-element 239 1 78.46 TATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGA:1 - chr3L 20525230 5' + 1731 4368 2 68.18 AATTTAATTTAAAGTTAGAAAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3R 12039928 5' + 412 36 2 55.96 GGTGTTGAAATTATTGCAACGCTGGGCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGGCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTT:1 + chr2L 14150240 5' - Doc 4460 1 69.23 GCTCCTTGGAGAAGACCACAAAATCGCAGGGCGCACACAATTCCTGGTTTTGTTCATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 + chr3L 20139707 5' - mdg3 214 2 50.91 ACCCTTAAGCTATTTTAGTTATCCTTCAACGCTCCATTTGCCTTCCTTTAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 + chr3R 16194506 5' - flea 224 2 54.55 CAATTAATTAAATAATTAAATAATTAAATAACTTAAATAATTAAAATAATCGCGCTTTGCTTGCCAAATACTCTCCCGCGCACAACTAATTAACATCAAATTTCAAGTT:1 - chr2L 10673199 5' - S-element 1540 1 70.64 TGAACAAATTGTATACCCACCAGTCCCATTTCACGTTCACCTTTTGCTACTGAACCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 4305285 5' + roo 8686 2 59.22 TGTCCTCAACTGACAGACGCACTAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGGAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACA:1 - chrX 21127608 5' + Idefix 7043 2 77.27 AGATATATACACAATAAATGCCTAACGACTCATAGTTCGACGTAAAGTTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGTGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 17123318 5' + roo 8702 2 53.64 AGTTAATTTTCAATTTTTTGCTCCTCCGTAGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCTCCAGGCCACCTT:1 - chr2L 15763894 5' - blood 7335 1 73.64 TTTGTGTGGCATCTTCTTCGTTGTCTCCGCTTCTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTTTTTAAAATCTGTCCTAGT:1 + chr2L 3412592 5' - G6 2002 1 51.95 AATATATAGCTTCCTTCCAAACTTGAATCACCTAGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2R 8397513 5' + 412 7080 2 55.96 AACAAAGAGAGCAAGTGCAAGTGTCTATAAGAACACGATTCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAGAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:1 + chrX 15026001 5' + FB 46 1 63.30 GCCGGCATTCGCCGCACTTGTGCCTATCGATATGTTTGGCAGCTGCTTCTTCTTTTTTTTGAATAACAAACACGTTCCAAACGCGCATTTTTAATAATATAATTTTAAAA:1 - chrX 16391689 5' + hopper 167 1 63.64 GGCCGAAAATGTATTTTTATGGCAGCGGCGGGGGTTGGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 5699882 5' + hopper 147 102 51.67 TTTTTGTTTGTGCAAAGTATACTATTTTACGAGTTGCTCCAAATTTATGATGTGCACGTACATTTGTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAA:1 + chrX 17132435 5' - jockey 4817 1 60.00 GTTTCCCTGACCAAAAACGTCAAAGGAAGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAG:1 - chr3L 470112 5' - BS 4900 1 73.08 AATTTCTCGAGTGCGCAATATTTTTCATTCATGAAAAAGACAACAAGACAAAAGCCAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCG:1 + chr3L 3452380 5' + Tirant 8490 2 57.41 GACCTTGCAACTATTAGCCGGGACATGCAATTGACCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACACT:1 - chr3L 11017165 5' + invader2 247 1 64.65 TGAGATTCTGACAACAACGGCCAGAGCGGGAATAAGAACGTCAACAAGTCGCAATAAAAGACAAGAGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGATGGTG:1 - chr2R 15304929 5' - INE-1 541 1 60.00 AAACGAAATCGAATCTCAACCTTTCGAACCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTA:1 + chr3R 11474911 5' - hopper 1360 1 73.64 GGGGTTCATGTTTGCGTGTGTCCAGAGAAGAGATAAAGTTTTATAATTATTTAAAGGCTTTGAAAGATAGACAGAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTT:1 + chr3L 4630386 5' - Tirant 8404 2 70.91 TGCCATACAATATTCGCCTGGCAGAATATAATAGCAACTGGACATGAGCTTAGAAAAATTAAAGCAAAAGAAACAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAATTACTTA:1 + chr3R 19568442 5' + Porto1 4450 1 77.98 CATTACTAAATTCCGAGCGTAGGACTATGCAAGGGGCATTTTGAAAAGAGGAGAGTACTTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3L 126238 5' + pogo 22 1 60.91 TTTGGAAATTAAACTGCGCATAGTCCTTAAAATTTTATAACTTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATAAATAAATATTTCAGAT:1 + chr3R 22979343 5' + Juan 4111 1 51.38 GAAGAGCCGAAGCTGAGACAACATGCAAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr2L 19808555 5' - copia 215 2 77.17 CGGCCACCGACTCCCCCCATGATGCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAG:1 - chr3L 27353161 5' + F-element 429 1 63.08 GAAAAAGTGGAAGTCGGCGGGGCCAAAATACCAATTGATCCAAAATAATAAAGATTTAAA:1 + chrX 20140360 5' - 1360 249 1 93.33 GCTTAAAGCCAACAGATTATAGCATACTTAACTGGGCCATTTTCTAAGCTCAGCTGATTGCAAATCAAATCTATCATATTATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 + chr3R 17777549 5' + Burdock 4 2 73.64 GGGTTCAAGAGAGGATCCTTCATCCGATACGCCAGGGAAGGTGAGTGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGT:1 - chr3L 16901348 5' - opus 365 2 64.94 AAAAAGATGAAATTTTTTTTTGTAATTATGCCTTGGGAGGAAAGGCATCCGAGACGACTTGTTTTCTGAGTTTGTGTAGCCCTAATAATTATCGTTGGGTTGGCATATCA:1 + chr3R 24889553 5' - Fw2 3814 1 61.82 CTTTCCCAGTTTTTGGCCACTGGATTTTGCCTTCTTATCGATGGCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chrX 10300747 5' + 412 20 2 54.02 ATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTCCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 17.27 TGCCACCTGTAATGCCGAACTGAATAAGGATAAACAGGTACGATATTATGGCAGACAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGA:1 - chr3R 21833954 5' + invader4 215 2 70.59 AGTATATACGTCTGCTCCAATGATTAATTCATTTAATAATTTTGCGTTCATTTTTTTTTTGCTGTATTTCGAGTTTGTGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 19444749 5' - copia 205 2 69.23 TGCACCCTCCGCCGCGCTTCTCACAATTCCAAAAGAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTG:1 + chrX 14384114 5' + copia 297 1 55.13 CCGACAATAATCAAGCGATTAAAACATCCACAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACA:1 - chr3R 32064208 5' + blood 7043 2 78.16 CTTTCACTTCGATGCCATGTGGTGTTGCATTTCACTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGA:1 + chr3R 19802297 5' - Stalker4 7017 4 69.09 GGCCAAAACACATGCAACAGCAGGAACTCCGTTTTGGCTTATCAGTGACCGGGCCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTA:1 - chr2L 3533572 5' + Quasimodo 7097 2 58.76 CACACTGCCAAAAAAGAGCAAAAAAATGGAGCAGACAACTGTATGTGTGCATACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTG:1 + chr2R 8593156 5' + 1360 224 1 79.09 AGTATAAATTTGAAAAATGATGCCAAGAGAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGGGAGAGCGCGAGCAGGG:1 - chr2R 9519785 5' - Max-element 88 2 60.00 TGAAGATGAAGCCAAGCTGGTGACGCCAAAGGCTCTCAAGTGACTGACTCATGTACTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAAC:1 + chr2L 5935309 5' - roo 103 2 68.18 TAAAAAGTTAACAAAATGAAACAAGCGAACCTATACTTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCC:1 - chr3L 17719062 5' - 297 6932 2 70.00 ATCGTAGAATAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAACTATGTAACAGGCAGATGTAAGCGACGATATAAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTC:1 - chr4 995954 5' + invader4 2772 2 70.00 CAAAATGGATCTAAAGTTACAAAATGCAACCGATCCCTTAGATACATAGGGTATCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAATAAAATCTGTACAA:1 + chr3L 17375515 5' - flea 418 1 55.56 GGCCAAAGAAAAAGTTGAAAGAAGATGGTGTGCAACTTGTCATCACATCCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGGCAGTGGGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCG:1 + chr2R 21600382 5' + Rt1a 4941 1 80.73 CGGGCGGAACAGGCATAGATACTAGTACCTACATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCTCATATATAGATCGAG:1 + chr3R 19058385 5' + Burdock 6186 2 68.18 CGCATTCTCTACCTCGCAACAGCGTGGCAAATAACTGTTTCTGCCGAACGTAGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATA:1 - chr2L 22497841 5' + Stalker4 6992 4 52.73 ATTTAAAGCTAAGGAAAAACTATTACAATTTAGACAAGTGAATTTGTGACAAATGAAACTTATATATTATTCTGTAAACTCCCAAATAAGACGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 7219676 5' - roo 392 2 70.00 TTGTGCTATAACGTTATGCAAAAATATTATTATGTTGTGCAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATATCAGAGAAGAAAGTAAAATAGAATGAAAAACTAGCCTCACATCC:1 - chr4 1134135 5' + Doc3-element 4508 1 64.55 CATTTTTAGCCTGTCACAATCACTGACAGTTGCAAAAATGTATGTTGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTTATAGTA:1 - chr3R 16321220 5' + Tc1-2 44 1 57.30 ATGGATATAAGCCATGTGAACGGCGATTTGGTTGACGGCCAGGGGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGGATA:1 - chr3R 31441344 5' - G2 2844 1 56.00 TATTGCAGATCAGTCAATACGTTCAACATTAGAAGGAGATAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3L 12677136 5' - pogo 2091 1 61.73 ACATATAAGTGTAATCCAGAGACTATGGGAAATTTGGTGGAATCTTCTTGATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 + chr3R 15309327 5' - HMS-Beagle2 278 2 58.18 TGTGTTTATATTCACTGCAAAAACAAACAATCCTCTGCTAATGCATTTTATGTTAATTTTTAGCTACCTTGGACTAACTATTGATTATTCTGAGCATTTTCGATTGCGT:1 - chr2L 17446286 5' - Porto1 4332 1 64.22 CAAGGGCTTGTCTACTTTTTAAATTTTAACTAATATATAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAAAATTTTGTGTGCG:1 - chr3L 16496756 5' + hobo 41 1 63.73 TGTGCATTGGGCTGCCAAGGACTCACCTAGCAGGACACTTCATTTCTACACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAG:1 - chr3R 18822762 5' - jockey 4767 1 59.78 TTTCCTGCTGCAAATGCCGAATGCGTTTGGTTTTCTCTAGTTGCTGTATTTTATTTTGCTGTGGCTTTTCTATTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATCACTGTAATAGG:1 + chr3L 7853991 5' - Bari1 357 1 72.48 GAAAACAAGAATCATGAATTTTCTTATGGCACCAAAGCCGCCGGTTACATCTCTGCCCAATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTA:1 + chr3R 12040126 5' + HMS-Beagle 6802 2 68.82 TAATGGCGCTTAACTCAAACGATATTGCCGTAAACAGAACTCCAACAGAACTAAACTATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTG:1 + chr2R 18564700 5' + Porto1 4573 1 63.44 GCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 + chr2R 12416866 5' - pogo 2070 1 60.64 TGGTCAGGATGCTGTTGGTGCCAGCACAAAATACAAGAATCTCAAAAAGTTCCAGGCGCACACGCGCCATGTTTATTTTTTTCTTTTAATTTT:1 + chr2L 9537961 5' - Doc 4698 1 72.04 AGATCACCTTCTGTCACCACATCCTCCTGCCCATAACCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr2R 13540599 5' - copia 205 2 74.55 AGAAAACCTGTCGCAATATTTCTCTGTTGTAAGGAATAAATTACCAAGTTCCCAACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATACAGCTCAGCAGCCG:1 - chr3L 22490433 5' + F-element 4491 1 59.79 AAAGTTTTGAGTGGATAAGGATATGATGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3R 12039947 5' + 412 7100 2 71.29 TGTTCGAAACTGGTTTTCAAGTACGACGCTTACGTCGCTGTCGACGTCCCCGTTGGCGATTTATGCGTTGGGTTTCGATTGCGTTCGCTGAACTAGCTG:1 + chr3L 10863491 5' - Porto1 4317 1 73.74 ATCACACATCACTTCGCATAAATACCTATTGGGAATGGACGAGAACGAGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGC:1 + chr2L 19789838 5' + invader2 200 2 54.12 CTGAGAGAGAGCACTCAATAATTCACACACACACACACACACACATATATAT:1 - chr2R 20492269 5' + Quasimodo 39 2 82.69 TGTATAGCATACTTTTGGGAGTTCCGAGATGTCGAAATGCTCCCTCGCCACCCAGCCGATATAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCCGCTGTG:1 + chrX 7677103 5' + jockey 4693 1 58.18 CTTTGAAGCCACAACCAGTTCCAGCCGGAGCGCCAACGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGAAACATGGAGTAAG:1 + chr2R 14186406 5' + flea 4751 1 64.81 CTGAATGTGGTGCTCCACTGAGCCGAAACTGCTCCCTGTATATTGTAGATATATATATATAGTAGCATATGAGCCATAGTATAAGACCA:1 - chr3L 6542929 5' + Quasimodo 8 2 68.54 TACTTCAAAAAGTAATTGTTTGCGATTTGGAGAGTGTGGTGCAGTGCGCTGTGTCTGTGTCTATGTTTATGTCTGTGTCTATGTTTATGTCTATGTCTATG:1 - chr3R 12942257 5' + 412 7128 2 53.47 TTAACCCAACTCCGAACTCGCTACCACAATGTACTGGCACAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATACACATGCACTCCAACCGGTACCGC:1 + chr3R 8015128 5' + BS3 1471 1 64.55 CTGTAGGGTATTTTGTAAAATTTGCATGAACATACGTGTGCAAGTTATCCAACCCAAACAAATTTCAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGAC:1 + chr3R 3346299 5' + gypsy2 200 2 68.22 AAACAATTTTTCCTCTTCATGACCCGGTTTACACGGCAAAAAGTATAAAAAGGACAACTCATCGTAAAAAAATAAAATATATTAATTATTTATTTATTTAATTATTTAAT:1 - chr2R 4720023 5' - HeT-A 29 1 70.91 AAGCATATATGCAAGATACATGTATATGACACTACAATAAACAAATAAAATAAATAGAAATATGAAAAGTGTCTATTGCAAAAGTCATATCTTAAGGCACGCAGTGCGGA:1 - chr2R 10513375 5' - 1360 475 1 58.18 TGTCAACGATGAGTAAATGTGTTTTTTACCCCGCTCTCTTGGCCAAGAAATTTATTTTAAACGTCAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 17490744 5' - roo 387 2 60.91 AAACATACATATACGCACAACAATCAACAATCACGCACTCACCCACTGCTTCACATTGAACACTGAAAGAAAAGAAGAATAATTATCAAAGTTCAGTTTGAGACCTTAT:1 - chrX 7261422 5' + Idefix 7290 2 71.56 TATGGCTTTTCCCCACCCGCGCCACCCATGCCACATGCCCCAAACTAGCATACACACACACATACACACA:1 - chrX 4711490 5' + accord 7101 2 78.57 CATCCGAAACTTTCCAACTAGCTGCCATCAAATTCTCGCTTATTAATTTTCCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTCTTTGTAAGCTTATTCGT:1 - chr3R 25723032 5' + Cr1a 4042 1 62.73 CAAATTGTCGTAATGTTTATCCAATTTGTTTTGTTGGTTTAGTTGCCTACATGTGTGCGCGTATCTGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAG:1 - chr3L 5403149 5' - accord 7078 2 75.45 CTTTTGTTTGCTCGGCCTGTTTTTAGAGGCGTGTGCCTTTTTAATTGTCCTTGTATGAAACACTTTTGGGCTTTTTTTTTTAAAATTTTTTTTT:1 + chr3R 26645202 5' + Tc3 77 3 36.17 GTTTTTCCCCCGTCCCCACAATGCATAATTGCCACACGAACGTACACCACAAGAAAAAGGTTCAAAAAGGGAGAGTATAAAAAACACAAAGA:1 - chr3R 9387359 5' - Cr1a 203 1 71.74 CGATTACGTTGAAAGGCGACTGGCAGAGATACTTTTGTTCAGATGTTTTTTCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGG:1 + chr2L 33762 5' - Idefix 70 2 57.29 TAATCGAAAGCAAAACAAAGAGTAGTTAATCAATTAAAAGTAATGATTATAATGTAAAATAACTATATTAAATATAAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAG:1 - chrX 12775329 5' - Cr1a 4275 1 62.73 TTACCACACAGATCTCTATAGAAAGTATAAAATTAGTAATTATGCATAATGAACAGATTAAGAATCCACCTGATATATGAATTTATTTATAAAAAAAAAAACAACAAAGA:1 + chr3R 27954295 5' + gypsy11 3931 1 90.00 AATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCTCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGCTGCAG:1 + chr3R 23861078 5' - pogo 2070 1 59.38 TGCAAAGTGGAAAAGCAAATACTTGCCATGGCGACAAATGCTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTAGTTTTAAA:1 - chrX 5008920 5' - FB 942 3 55.29 GTGAGGACACATGAAGGACTATCAAACAGGTCAGACTGATGTACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1 - chr3L 10723731 5' - Burdock 6353 2 63.46 CGTGTGCAAAGGGAATTTTGTTATTTCTTAAATTTTTTTATATCTCATTCTATTTATTTTAGTTCCAAATGTACTCGTTCAGTCAATTCAGCTGAACTTAACCTAATGTG:1 - chrX 16564415 5' - G5A 2789 1 69.09 AAACAACGCAAGACAAAACTTGTGGAATGTTAAAAGTTTCAATTGTAGCAACTTTATTAAAAGAGCTAAGTCTTCAGTATACATCTCCTTCATCGCTCACGCAGCGAG:1 - chr2L 8336836 5' - Bica 66 1 66.67 TTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTA:1 + chr3R 19450019 5' - roo 8620 1 75.45 ATTTATGTACCCACTTGCATGCACGCCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTT:1 + chr3R 11553654 5' - hopper 1394 1 56.84 GAGGTTGCTCGGAGGACAAGCCTACGATGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 + chr2R 4137542 5' + HMS-Beagle2 6939 2 76.36 GCCGCAAAATGAAAAATACAATAAAAATCAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACCCCAATTCTAGA:1 - chr3R 14429813 5' + Idefix 6964 2 72.55 TTTTTTCCCCTCCCTCAATTCTCGAGATTTCCCCCTGCGCTCAGTCCTTGTTCCTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCGTTT:1 - chr3R 28301152 5' + diver2 173 2 61.29 AAGGTACACTGGTTGTGTAGCTCAAATAAATATACATAAAAATAAAGTTAAGGTATAGCTCACAAGCTTATATATATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 - chr2L 2484442 5' - jockey 4978 1 60.91 ACAACTTGCATGAAGCGGGCTTTAAGCACTACATAGGACTACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGA:1 - chr3R 2879306 5' + Bari1 1697 1 66.36 CGGACTATTCTTCAAATCAACTTTCTGGGATTGTTGACCCACTCCAGTCCACACACATCAAAACTAATGCTCACCGCATTTTTCTGTACGCTTG:1 + chr3L 26344939 5' - invader1 3782 2 61.70 CGCTAGCAACATTTTCTTCGCTTACAGCTGGGGGGAGTTACACAGAGAAAAATTTTATGAGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1 + chrX 2972189 5' - Tirant 8441 2 64.65 ATTGGTTTGAATTTATGAGATTGAGTAAGTAACAAAGGTCTAAAGGTAATAAATGTAATTGATCTCTGTCATCGGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGA:1 - chr2L 1234044 5' - I-element 5117 1 71.56 GCTAAGCCTTATTTTTTTGCCCAGGTCAGGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 - chr3L 16258981 5' - Transpac 5202 2 62.03 CTTTTGTGCCTGGCGCAAAAAGTAGCGCAGAAAACAAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTCAAAGACAAAAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTT:1 - chr3R 16354823 5' - transib2 442 1 74.55 CATTATATGATGGAAACCAGCAAATTTGGTTAAAAACGATGTAAATTCGTTTCTTCGATCTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTC:1 + chr2L 21759744 5' + 1360 3219 1 65.45 ATAGCAATGTGGTAAAAATCATAAAAGAATATCCAAAAATAACATACAATATGATATCTTAATATATTATAAAACAACAAAATTACCTAATAAATAATAAATATTTTAAT:1 + chr3L 11480121 5' + Juan 4060 1 23.64 CAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTA:1 - chr2R 5674704 5' + S-element 66 1 80.00 CAATAAAATAATATAACAAATAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTA:1 + chr3R 19449931 5' - roo 8620 1 80.56 TAGCCAAATTAGCGCCTTTGGCTTCCCTGACATTGAAAAGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTATACGTATATGTGGACAAAAAAGAACGGAAAAA:1 + chr2R 21910211 5' - rover 7094 2 56.60 ATCTGTTTCTCTTTTTCAATCTGGCCACTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTCTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACT:1 - chr3R 9105964 5' - F-element 79 1 69.79 ATGTGAATATTTTTCACTTTCTTAACAAATACCAATTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGCATAAGGACAACGC:1 + chr2L 21191362 5' - 297 352 2 67.59 AGTACTAGGGAATTTTACAAATTGTTTTGAAGTATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTATATGAATC:1 - chr2L 20902991 5' + roo 8717 2 70.91 ATTGTTTTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTAT:1 + chrX 12946235 5' + transib1 1900 1 63.89 AGTAAATAGATAAATCAACCCCAGAGACATGTACACCAAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGGTAGAAGA:1 - chr3R 31928848 5' - 1360 3207 1 65.45 GAGCATCGTCATCATTGCTATTGATATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTTTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTAAACTATGGCACATATG:1 + chrX 6903935 5' - Quasimodo 6 2 76.36 AAATTGAAACACCAAACCCTTTCACCCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAA:1 - chr2R 12578402 5' + Idefix 264 2 67.09 GCATGTTTGATTGCAAATCCGTCTGGTTGTTACTTCAAATTGTTTTATTTTACACTGTGTCTTGG:1 + chr2R 10746716 5' - jockey 4916 1 70.77 TCTCTACGTTGAAAAAGACTACTGGGTGTAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2L 9754845 5' + 1360 51 1 72.12 TTTTACAAGAAGCCCAACAACTTCGAGGTGTGCATAATCCCACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACACTCACCTTCAAC:1 - chr2R 20684225 5' + Doc 322 1 60.91 TGGCGTGATGACCCGCATCTATGTGGACTATCAGCTGGGCGATGGTAATTACGCGCTAAGCAAAGCGCACACAATTGGAAAGACACAG:1 + chr2L 10049741 5' - Ivk 35 1 61.36 TCTGAGGTCTGAGTGGTCTGGAATCCAACGATTGTCAGCACATTAGGCCTACGAAGTTGTCGAAGAGGAGTGGTGGGCAAACGGTTTTTATTGATAATATTTCGTTTT:1 + chr3L 22547683 5' - FB 328 1 73.15 TCTGGAAGGGCATGACAAAGTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 - chrX 23317476 5' + 1360 61 1 86.11 CCTCCCCATCCCCTTTGTTTGTGCTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATA:1 + chr2L 8285291 5' - I-element 5087 1 78.18 GTAGGTGGGGCGAAGGGAACGCCACCCTGTAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAG:1 + chr3R 9932203 5' - Quasimodo 7061 2 62.03 TTTGAATAGCCAATTTTTTGTTTTGTCACATTTGCTCAACTAAAACATGTGTGTTGTTCAAAATTAAAATTTCGGGATATTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTT:1 - chr3L 13114566 5' - G4 89 1 66.06 CCTTAGCGCACATAGTCGGTGCCGCCGCTTTGGTTCGTATCGCATTTCTTGCTTTGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGGCACCAT:1 - chr2L 14716504 5' + Rt1a 4714 1 68.89 ACATACATATAAAGATACACAAAAACTTTTGGTTGTACATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTG:1 - chr2R 2916907 5' + gypsy 6989 2 65.15 CATTCAGATTCATGCGGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3R 15524387 5' + pogo 23 1 53.64 TAATAATGCCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGAGTTC:1 + chr3R 31633138 5' - opus 7490 2 62.35 AAGCCAACAGATTATAGCATACTTAACTGGGCCATTTTCTAAGCTCAGCTGATTGCAAATCAAATCTATCATATTATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCAGAAATA:1 + chr3R 17777554 5' + Burdock 9 2 69.09 CACAGGGTATGCGAAGACCAAGTACGAGTGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAAAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 6537924 5' - roo 9034 1 67.78 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAACAGAACAGAACAGATCAGAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 204 1 38.18 TGCTCGATTTTTGCGATTTCAATTGGCCAGCATTTGTTGCAGTTGGCCGTTTGGCGTTATCGTTATTATTATTATTATTATATTTTTATTATCGCTTTGTATATTGCTAT:1 - chr3L 6682487 5' - Porto1 4236 1 63.64 GTTTTTGAGTTTTGGTGGGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 6611846 5' + hopper 144 105 76.19 GCACATGTATGAATGCAGTTTAATTAAACCAAATTCCCCCATAATGCTCACCAATCCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCAC:1 + chr3L 18123432 5' + Doc3-element 411 1 57.95 CCACTTGCTGCAGCAAACTGAAAATCAGAAAAGTATAAAAACTTTTGCAACACTTTAAATAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 19372957 5' + BS 5103 9 75.00 AATGTCTTGGTGGGATCTGCATCGGAATGGAACAGCTAGGAATCCATTTGAGATGCTTGTTTTTATGTTGTGTAACATGCAATTTATGTGTATTT:1 - chr2R 9407510 5' + transib2 351 1 68.42 TGCCAAACTCAAAGCGACCCCGTGATTAATGACACTTGATTAGGAATTCAAAGCGACTGTACAATCCCACATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 20642679 5' - roo 400 1 63.22 CATTTAAAAGTGTTTGGGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTAG:1 - chr2R 9754751 5' - hopper 1363 1 78.72 GGGGATATGGCACGTACTCAAAGTCCACCGCCCACTATATATATCCTTATGCTCAATATATACATATATATAAATCAACCTGAGTCATGTATACCCTTACATACTC:1 + chr3L 16258895 5' + Transpac 3 2 78.30 GCGTGTAATATCGACAGTAGAAAAGAAGCCGAAAAAGTGAGCATTCGCGCAAGTGCAGTTATGTGCATGCAAAAAATAACACCAAAACAGCACTGCGAACAACC:1 - chr3L 7650567 5' - Cr1a 234 1 51.92 CGCACAAATGTATGCTACACTTTTTTGTGTTCTGTTCGTGGTTTTCATCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACA:1 + chrX 7992523 5' + jockey 26 1 51.65 AACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCAAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGGTCCTGATCAAGA:1 - chrY 1076846 5' - INE-1 88 1 65.17 GTAGACTATGCCAGTTATTACCATTGAAATCGATTGATAGCACGCTCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chr3R 17272036 5' - hopper 1402 1 61.63 TAATCTCAACGGTGGGAATCACTATGTCACCTTTGTCGCTATTAAATCTGCCATTTCCAGAGCGTCGTAACACAAAACAATAACAAAACAAAAATACAACTATAACA:1 - chr2R 11843165 5' - BS3 1652 1 68.22 ATTTTTAAACTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGGAAAAATAATACAA:1 + chr3L 14453866 5' + F-element 4578 1 82.00 TTCTTTTGTACAAACCAATAAATGCGAAAATTGATCTAACTTTAAGAGTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chr2R 8086786 5' - 1360 3352 1 59.09 GAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr2L 9412072 5' + jockey 32 1 73.53 ACATAGCTTGAAATGTTTATTGTACACTGGATTTTTCCAATTAATTTATTTTATTTGATTTTAAACCACTTTCAGAACTCTCGATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 18505776 5' + jockey 12 1 77.27 AGACGACGAAGCAAGAGACACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGCTAAGAATAAGATTGTTATATGATGCTCGA:1 + chr2R 9538870 5' + Idefix 123 2 74.49 CATCTTCGTTTTCGTATAACTACGATATAAGCAACTTACACCCTTAATTTAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 + chr3L 18095485 5' - I-element 5331 1 51.82 TAAGAGATACGAGACTTACTAAATAGGAGGAGTAAAGAGGACAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTAT:1 + chr3L 17601131 5' - Cr1a 4287 1 62.73 ATTTTAAAATGTTTTATTTTGTGTATTTAGTTGTATCTACTTTATGTACCATTGATCAATTTATTTGCCTTTGATTACAGAGTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTGC:1 - chrX 20363136 5' - TAHRE 10342 1 48.18 GTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr2R 2832936 5' - 1360 3338 1 84.21 TATGAGGCGGTTTTTTAATTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 16471377 5' - Doc2-element 252 1 69.70 GTCGCTGAGAAATATACAAAGCTCACGGAGGTAGCGAGAAGGCAATTAATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGGTTGTTT:1 - chr2R 4242444 5' - I-element 4896 1 63.95 AAGTAGCGCTAGTAGCGATTCTTCGATTCGCCGTCACAGCATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 + chr3L 22108098 5' - Transpac 5200 2 58.51 AAAACTAAGTAAGTATGGAGTGCGGAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATG:1 + chr3L 13315019 5' - rover 7080 2 53.70 CGCCACGTAGTGCTCTGTTTTTTATATCTGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAAT:1 + chr3L 7718352 5' + accord2 7285 1 72.38 CGCAGGACAATGCGCGTAATGAAGTGACAGCTTTATTGACAAATAAATTCTGTTTGGCAACACTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTC:1 - chr3R 17995029 5' - micropia 342 2 69.07 ACACAAATAGTATCAATGATAGCCACTGGTCAAGTGCAAACATCTTTAAATGGCGTTGTAGTTCAAAACGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTT:1 + chr2R 5327461 5' - I-element 5094 1 69.09 ATCTTAGCATTAAAATATATATACACATCATATCACCAAGATTTTCTCCCTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 10202979 5' - 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gtwin 470 2 73.33 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAG:1 + chrX 12076677 5' + Bica 32 1 74.47 AAAGGACAACGGCAATAACAGACAGTGGAGAGCACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAG:1 - chr2R 15102876 5' - rover 101 2 64.89 ATGAAGTTTCCAAGAGGCTTTTGCACCTAGCCTCTTTCAACTATGTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 + chr2L 6519805 5' + diver 6 2 63.01 CTCCATCTCCATCTCCATCTCCATCTCCATCTCCATCTCCATCTCCATCTCCATCTATTAATACGAATCCTTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCAC:1 - chr3L 18417066 5' + I-element 4886 1 50.00 TCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTCTATTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTT:1 - chr3L 24821493 5' - roo 404 1 30.93 GTAATATAATGTTTATTGTATGCATAATTTTTGCACTAATCATGCAATCTGACTTTAAAAAATATAAAGATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATCAACTTTCCCCCTGCAG:1 + chr2L 11232346 5' - Tc1 29 1 62.73 CAACACAACACAACACAACACAACCGTTGAATTTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGAGCGCAC:1 - chr2L 16217660 5' + Rt1b 148 1 72.00 AAATACAACCGACATGGTAATAAATATCCATATAAGCCACTTCAAAGAAGAAAGCCGCAGTTTCAGCTATGGCCCAAGTAAACGTTCTGAGACATATAGAGCGCCT:1 + chr3L 14924399 5' + gypsy10 5514 1 61.32 ATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 9432839 5' + roo 50 2 70.91 TCCTCAAAGTTAAGCAGCTGCTGGGGGGTAGCTCGCTCCAAAACGGGACGTAGGACTCAGATTGCTATGATCAAATATAAAGTTAACGACAGAATGCCGGAGTTGTTG:1 - 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chr2R 19165753 5' - S-element 376 1 63.64 AGGTTAACTTATATAAACTGCTACAGCAATCTAAACTAGAACTTTTTTTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTAGAGAGACTATGTG:1 + chr3L 12821810 5' - Ivk 5199 1 51.49 GAGTGGCAAACCCACAGATCACCAGCCACAAAGCAACGGCTGAAGACAGCAACACGCGCCCTAACGAAAGCTCTTAAGAATGAGACGTATGGAATCGAACTCTGGGGAAC:1 + chr3R 3190409 5' + Porto1 4276 1 79.09 CGGGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3L 26852644 5' + 1360 1 2 55.00 GTGCGATTTGTTTTTGTTTTTTTTTTAT:1 - chr3L 18193536 5' - Rt1a 5079 9 82.14 GCAATGGGGAACATAAATAAATGAAATTATTCAAAAGTAGTTTGGAATTCTCGTGACAGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGAT:1 + chr3R 6125505 5' + micropia 408 2 57.27 AAATATTTATGATGTATTTGAATTAACTGTGCTAATTGATGTGTAATTATAGTTAAATACGTTTGAATGAATTATTCTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGGTTA:1 + chr2L 10873574 5' - baggins 5073 1 74.55 GTTACCCTGATGGCATTTGGAAACACTTCTGCCGATTTTTTCGCCAACTTGGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTC:1 + chr2R 16767298 5' + roo 8697 2 53.64 GACACACAAAAAAACCGCCAAACGGGGCGTGGCAAAGGCGTCGTCTGTGGCGCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACACCCTAA:1 + chr3L 2001985 5' + gypsy5 15 2 57.78 TGATTTCTTTGTCACTTTACCATCCTCCACGACGCCTGGCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCTCTTTCTAACCA:1 + chr2L 16902053 5' - micropia 5229 2 56.38 GCTGACGTGTTTACTGGTTTACCTTTTGTTGTTGTTTTCGTTTCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTA:1 - chrX 3676918 5' - Doc 4335 1 70.91 AGCATTGTGTTCCCCTTGCTATTTTTCATACTCTTCCTTATGATCCACATGCATGTGTGTAGCATATAGCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 + chrX 2552020 5' - blood 7374 2 64.55 CGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:1 + chr2R 6984317 5' + HMS-Beagle2 6911 2 52.88 GTTTGAAACCTTAAGCCATAAATAACAAATTTTTATCTGAAACATTCGCCGAGGGGCGCTGCCCTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATA:1 - chr2L 11335195 5' - Cr1a 4379 1 56.84 CAAAATACAGGAAATTGAGCGCAAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 - chr3L 19347238 5' - jockey 4964 1 58.18 ATATAGCTTCCTTCCAAACTTGAATCACCTAGTCTTTCAAGGACTAATAATAATATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2R 8397510 5' + 412 31 2 54.55 AATTGATAGAAAGGTATTCCAGTATAGAAAAACTTATACGTATAATAGCATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 + chr3R 19446650 5' + micropia 19 2 56.52 CTCCAACTCCAACCCAAGTCCAGCTATCTATGTATCTCCAAGTACCTGTATCTGAGTCGGTCTGTATCCGTATCCGTGGTACCGAAAAGAGACTCG:1 + chr2R 7095399 5' - R1A1-element 4926 1 81.25 TGGTGGTCTTTCTGGTTTATTGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGACGCGCATTCTGCGCTATTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGGCTCTCCAAAGC:1 - chr2R 10474485 5' - Porto1 367 1 74.55 GAGGGCGTGCGAGTCTCAATGGCAAAAAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chrX 5515629 5' + copia 4897 2 56.36 TTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGA:1 + chrX 20433347 5' + diver 5938 2 76.84 TTAGCATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGC:1 + chr3R 21993230 5' - jockey 4981 1 56.92 ATTAAAGTCTCCGAATTCTTCGCATGCAGAAGCCAACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGT:1 - chrX 11531170 5' - Burdock 5959 1 68.18 ACTGGCACTCGTTAAGCGCGACCAGGCGTCCTCTTTGTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAACGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3R 7171311 5' + 297 6624 2 66.36 ATTTTTATTTTGCTCACGTAATAACGATAATAACGCTTATTTCTTTCATTTCTTTATACTTTTTTGCCAACCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTA:1 - chr3R 11911457 5' - 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chr2R 11449554 5' - mdg1 301 2 55.45 GAATCTATGAAATTTATTAAATAAACGAATATGTTTAAAAGGGACCTGCTGTACATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 + chrX 2867482 5' - 297 371 2 58.18 AAAACAAATGTGAACAACAAATGAAACCAGAGCGCTAACCAAGACTAAACCCTTAGAGTTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAAAA:1 - chrX 13597343 5' + R2-element 3571 1 68.37 CTCTTTCCAAGCCGCTCTCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAAAT:1 - chr3L 14274305 5' + P-element 44 1 23.60 TATTTAACTTTTTTTTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGGGGTACGTTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr2L 22265484 5' - HeT-A 6062 2 81.25 CATAAAAATGCCATCCACGGAGGGGGAGCACTTAAAGCTGCGTTGTTTCTTGCTTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTT:1 - chr2L 886398 5' - Bica 459 1 63.64 TGATGTTTGGGGCTCTTGATTTCTCCACTTCGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGCATTTTTCCTTAAGTTCCGT:1 + chrX 21076690 5' - F-element 4430 1 65.26 GGTCAACAAAAATCACACATAGTATACCTCAGATTTTCCTTTAGCATAATCAGTTTTTTTTGTTGTTGTTGCTTTGCTGACGTAGTTTCCTTGACTGTTTGTATGTTTAA:1 - chr3L 7846984 5' - Porto1 4404 1 72.73 AGAGATTATTTATAGACATCTGGTATCTTTTACTGTTCCATCCCCTCGCTACGCCTTATCTTAAATCATTGTTGATGTATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTAT:1 - chr2R 8659688 5' + Cr1a 4189 1 56.36 GGGTGCTCAGAAAAATAATATATAACCATCATAAAGTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAAC:1 - chr2R 6625165 5' - Copia1_DM 130 1 74.55 GTCCACGTCCACATCGAAGGAGCACTGATACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAACAAACGAAGTATA:1 - chr3L 4227028 5' + Doc 4454 1 72.73 GGTTCTTTTGTTTTCAGTGAAATCTTGATAATTTATGAAAACATACATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCACGTGCTTTTCAC:1 - chr3R 30859499 5' + Burdock 36 2 59.09 CATTTGGGACACATTTGTGGTCCGCTAATTGGTGTCGCTCTTCCCTGCCTTTATCACCTGTCTTTTCGATTCCGATTCCCTTTTTACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTCAAT:1 - chrX 1258081 5' + hopper 1179 1 81.82 TTCAAGGCCCCCACAAAAAAAAGGAAACACTGAAAAAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2L 18694079 5' + pogo 22 1 57.78 AATGAGAGGAGAACTGCATATTTGCATTATTTAATTGACTCGTACCTTTCCTTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2R 20924206 5' - mdg1 388 2 58.18 TGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATACGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGT:1 + chrX 21474414 5' + 1731 42 2 73.39 GCGAGATGTTTTTCATATTTTCGCTTCGAATTTTATTTTGACATAGTTTCATAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAAT:1 + chr3L 2120959 5' - I-element 5347 1 64.77 TGATTGAATGGTTATTCATATTTTCCTTTTTGCCAGAACACCGGCTTTATTATAACGGTTCTTTTATGTGTCTACTCTAAATATGAAAAGCAAAAAACGCATTT:1 - chr3L 13167985 5' + looper1 129 1 57.69 AACACAAGCGAAGCGCAAATACGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGT:1 + chrX 5851811 5' - invader2 48 2 61.54 TTGAAGAAGTGACGAGCAGGGCTACCAACGAATCATGGAAAGCAAATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCA:1 + chrX 20433301 5' + diver 5890 2 75.27 TGTACAATCTTTAAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr3L 2987423 5' + blood 43 2 61.47 TTAAAATGCCCAACCCCTTTGTTGTTTACTTTAATTTCGTTTTTTATTCCTTGCATATACACCCACTGACACCCTACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAG:1 + chr2L 7822545 5' + Idefix 93 2 69.16 TTTTCTTATGGCACCAAAGCCGCCGGTTACATCTCTGCCCAATATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 + chr3R 12040144 5' + HMS-Beagle 16 2 54.12 GTTGTACAAATTGTTAACTGCTTTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTAGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chrX 17330100 5' - 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chr3L 14822885 5' + mdg1 7107 2 84.55 TTATTTGAGTTGGTAATGAGTTTGTAAGAGTATTTAAAAGTTCGATTCGCATAGCTTAATTTTCCATCTTGTTTTTTTTTTTGTTTATCTTGTT:1 - chr3R 13851104 5' - Porto1 157 1 77.66 CAAATGCTTAATGTCTTAAAACCGAGCAGAATAAATACCAAAGTGGACATGAGAATGAGACAGACTAGAATCGCATCCTAATAGTCTAGCTAGACGACTAAGTATCGCAG:1 - chr2L 17271272 5' + jockey2 3120 1 57.27 GCACCACATAATGCCGCATGACCCGACCGAGGCACGCCCACATCCACATGCATACACTGATATCATTCACATTCACACTAGCTGAGTACCGGGTATCTGATAGTCG:1 - chr2L 4788302 5' + INE-1 550 1 59.43 GACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAAAAAAAA:1 + chrX 16983077 5' + Doc2-element 219 1 26.37 AACGTTTTCATGTTATATTTATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chrX 3091981 5' + opus 22 2 75.71 ATACTGAAGTTTTCGCTTAAAAATTGAACAACTTTTCTCTCTCTGTACTCACAGTGAATTTCCGGCTTAAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACACTTAAAG:1 + chr2R 18741147 5' - Quasimodo 7093 2 71.15 CAGGAAATTGAGCGCAAAGAAATATGCTATATAGGAGATGAAAAAATGAAAACGCAACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 - chr3L 19347231 5' - jockey 4968 1 57.58 TAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064833 5' + Stalker3T 205 1 82.73 AGTCATATGTTTAAGGCACTGGGGGAGGCTAAGAAAATTCGAGGAGCAGCAGTGATGCAAGTGGGTGGAGGAGATGCGAAGAAAAGTGAAGCAGC:1 + chr2L 17020813 5' + Osvaldo 343 1 58.95 GGTTGGCGGTGGCATGGTATTTGGAAATTAAACTGCGCCTAGTCCTTAAAATTTTATAACTTAATTTCTCTTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCA:1 + chr3R 22979324 5' + Juan 4082 1 71.72 GAGAGAGAGAGAGCGGGACAGCAAAGGCTAGACAGAGAGGGAAACAACTCAAAAGCTCTCTCTTCATTTTATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAACGCTC:1 + chr3R 11281723 5' + Idefix 410 2 60.00 TTCTTGGCCATTTGATTCCGCTTTTATTGTCTTCTTGGGGCCATACAAAAGTAATATTCCACAGAGTACTAGAACGTTTGTTCGTAAACAATTGAAATTA:1 + chr2L 7243168 5' - transib4 370 1 64.00 TAAAGAGACAAACCAAAGACCGCATTGACTGTTCAACTACTATATACATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACAAGCGCT:1 + chr3L 17220670 5' + opus 7142 4 59.63 CGTCAAACTTTATTACAGGAACGCCCCAAAATTATGCTGCATATTTTTAAAGCAATAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 + chrX 17456015 5' - jockey 4985 1 72.48 TCTGAGCTAGCCTTTGTAAGTCTTAGCGAGCAGAACCAAGAAAAACAGTTTGTTACAATTTAAAAATTTATTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 + chr2R 5214946 5' + F-element 14 1 67.01 AGGAAATATGCGAGGGCCATGCCAACGATGCTGAATCGTGCCCAAGCTGCAGTTTATGTGCAAAACAACACCAAAACGCACGAAAGGGAGAGTAAAC:1 - chr2L 2119848 5' - Cr1a 215 1 56.70 ATATACATAGGATACATTTTTATCGAAGATAAAATCGACCATCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATAAATGACAACAAGTAATA:1 - chr2R 23851154 5' - invader4 2655 1 57.28 AAATAGTGTTATTTTCAGCAGCCTTTAATTAGTGTAATTATATATTTTGGATGGAAAATACATAATTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATCAATTCTGATCAAA:1 - chrX 8937187 5' - 1360 3175 1 68.18 AATAGATCGAATGAGGGAGCTCTCTTCTTCCGTTTCTTCCATAACTCTTGGCTCTTTCTCTGCTCTTTCCGTTCTTTTTCCGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 12201181 5' - Doc2-element 232 1 77.17 TAAATCTGTGTGTCTTTCAAGGCATCAGATATGCGGGAGGTGGAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTG:1 + chr2R 5216900 5' - Doc3-element 487 1 55.84 AATATATTCCATTTTTAATAACACGAAACTTTATGAAAATTTTATAAATACAAGGCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTA:1 - chrX 12068147 5' + Doc 4374 1 58.10 GAAATTTTGAGACAATTAAGTTCTACACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 + chr2R 15155206 5' - flea 4959 2 76.15 CTTTAATTGCCACCTAATGGCCGAAAAGTAGTATACACCATCAGGTCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATAT:1 + chr3R 19102744 5' - 412 7295 2 58.18 CGCTTAGCACGGCAAATAATTATTTCTCGCTTACTGCCAACTGGCATGCTATTTGGCAAAGGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACAGA:1 - chr3L 6014155 5' - R1A1-element 5304 1 61.11 AAAACGAATGCGAACCAAAGCCCAAAAATAAAATCCTATTAGGCGCTCTATTTGCTCGGTGCGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTG:1 - chr2R 9944626 5' - gypsy3 419 1 66.67 GGGAGTATTTCAAATGATTTGTCATGTCAGAGTGCAAACACATCCGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGAGG:1 + chr2L 8644488 5' - F-element 4477 1 63.75 AGTTGGTTCGTATTCAATTTGGTATTCGATTCGATTGGGGTGCGAAAATGCGCAGCTCGACCTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAG:1 + chr3R 9456884 5' - I-element 5151 1 68.09 TTTGCCTGGTGTTTTATTGAGAATAAATTTTAGAATTTGTTTCTACAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 - chrX 3352017 5' - I-element 5328 1 54.55 ACCAACTAAATTATATTGCTGGCGCATTTTTACGCATTTTACGTTTGTTGCCGATAAGGCCTAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGAATCCGA:1 - chr3L 50069 5' + 297 424 1 61.82 GCAAGTGGTGTTGCGAAGGTGTTGGAGTCGGCATTTAATTTCAGACAGGTGGAAGAATTCAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTGTTATTAAAATTG:1 - chr3L 6343894 5' + Cr1a 451 1 55.66 GCAAATGTTTGGTTCTTTTGCATCTTTGTGTACTTGCTCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTT:1 - chr2L 16678749 5' - I-element 379 1 70.48 AAAAAAAGGAAACACTGAAAAAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGATGCATCCGC:1 - chr2L 18694065 5' + pogo 22 1 64.00 TAATGCTTTTTCATCATGTTGTGTAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGGAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTC:1 - chr3R 19658729 5' - F-element 4378 1 78.90 AAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:1 + chr3L 4264966 5' + Transpac 42 2 59.09 AATTAATATTTTTAAAAATAGAATCGTATAATGTGCGGTTTAAATTTTGTGCCATTTATAGACAGATTTATTTATATTTATTTATATTTCAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 + chr3R 6309768 5' + F-element 11 1 60.00 GGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 18072774 5' + 412 7094 2 74.42 ATCGTAAAAACCTATTTTCGTAGCGATTGAAATGAATTTATGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 - chr2L 6757543 5' + Tirant 8112 2 65.71 TGAACTCCTCGGATCTTTAGCACTTCATAGTTCATCGTCTCTTAAATTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr2L 13710669 5' - copia 236 1 57.45 ACCGGGGTTGTAGCTACTCGTGGCTTTGAACCACCTATAGCTCGAGGTTTTATCGATCCAGTTTCATAATATCAAAAATTAAAAAAATAATAGTAATTAAAAAAAA:1 - chr4 992116 5' + Doc 4690 2 77.36 GTCACATAATAAATTCATAACAAATCACACGGACGCAGAGCCAAACCAAGACAAGAGAGAGTGCTTTAGTCGAGTTCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGG:1 - chr2R 20213271 5' - INE-1 540 1 62.73 AACGCAATTGCGTGTGAAAAAAAGTCGGAAAAAAAGTAAAAGAGCAGAGACTGAAACCGTCGAGAAACCCTTTACACAAAACACTAAACCTAAGTTTAATCTA:1 + chr3L 12515256 5' - S-element 1478 1 63.11 GTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 9435827 5' - roo 9051 2 54.12 TTTATTTGGTTTATAAAGTTCTTAAGTGCAAACAATCATCTAACCAGATTCTATTTCCTATCTATTATATGCTGACTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 24260853 5' - roo 9061 1 71.30 GCCTGGAAGCCATGCTCATGGGATTGCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACA:1 + chr2R 12416837 5' - pogo 2084 1 65.14 AACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATAAAATAAAATAAATTAAACAAATAATTAAACTAAAAAAAATATATATATATATTATAAAAATAAATAAA:1 + chr3R 18052450 5' + mariner2 824 1 63.64 TTGTCATTGGTTTTTATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACATCAC:1 - chr2L 4016918 5' - opus 461 2 55.45 TAACATTTTCGTCTACTTATACTAGTAATTGCTTGACGATTTTCTGAATGAAGGAGCACACAATGAAACTTTTTTTTTTTATATTTTTTTTTTTAGAAGCGATGAATCA:1 - chr2R 18807921 5' - BS 5079 1 64.22 TAGCAAACTATAAAATGCAAATCAGTTGCATATAAAAATATACAAACATTTCTCGATATTGCGCATCCACTCAAGCCGTAACCAAAACCCAGAC:1 - chr3L 13545117 5' + Tom1 117 1 62.77 GTTTTAATTGAACTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCGATACGATTTTTT:1 - chr2R 8086874 5' + 1360 24 1 59.09 TGGCTCTTATCAGGATCTAAAATTGTCCAACCCACACCAAGGCGTAAAAAAAACTCATTGGCAGACAACTTTTTAGCATATTTTCATTTATCTGTTTGTATTGTATT:1 + chrX 14220384 5' - Doc2-element 85 1 57.94 GTCCTGAACCCGCAGGTCTTACATGCAACCTTCGCTGAGGGCAAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGT:1 - chr3R 27871671 5' - I-element 5126 1 53.66 GTAGCACACAAGGAACTATACATGTACATATATGTGTGTGTGCAGTGGAAAAACTGGTGTATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 + chr2R 9552269 5' - S-element 1704 1 64.00 CAACAACAATAACAACAGCAATAGCAGTGAGTGAGGCTTTGAGACTTATATTTTGATAGTCCCGACTTGGTTAGTCGGCTAAACTTCTCTGT:1 - chr3L 10987207 5' + Cr1a 4089 1 72.83 TAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACACTAAACAATAAACAAAACAGGCATTTGTACATAA:1 + chr3R 7773344 5' + I-element 5199 1 31.82 GATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGGATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCTACATCTTATATGTCAAC:1 + chr2R 6984306 5' + HMS-Beagle2 6906 2 56.36 AACAAAATAACTAATGGCGAAAAAATGGTTTAAGTTTACCAATTTAAAATTACAAATTAGATTGAATAGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 + chr2R 17243706 5' - roo 9067 1 70.83 AGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGA:1 - chr3R 4604451 5' + INE-1 175 1 75.45 ACCGTGTAAAACGTGGCTGAAACCATCCAAAAACGAAAAATAAAGTGAAAAAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCC:1 + chr2R 14816934 5' + roo 170 2 53.64 TGTCACGCTTTGAGCAAGTGACGATAAATTCGCACTACTGGAATGGGCCAGATTCTGGAGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAG:1 + chr2R 19871742 5' + R2-element 3219 1 69.61 ACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACATTTACAACATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGA:1 + chr3R 21907534 5' + I-element 227 1 46.88 CAGAACTAAGCTCAAATTAATAGCCAGCGATCTGGGCCAACCTCTCAACCACCCCACTATGGTGCATTTGTCCTGTTTTTTTTACAAAACTTAATACAT:1 + chr2L 20526031 5' + hopper 24 1 55.56 TTTTTGAACTGTTGTATTATTTTTTCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCATAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTGGGTCCTT:1 - chrX 12536776 5' - F-element 4529 1 90.24 TAATCAATTGGAGTGTCTGTCTTGGGTTTTATTTTTTCGGGGCGTTAATGGGAGGTGGGGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGG:1 + chr2L 13070871 5' + Dm88 386 1 64.21 GGAGTCAAAAACAACATTCGGGGACCACATGGCCGGCACTCGACACGAAAATCGACTGAAAAGCAATTATTTACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATT:1 + chr3R 26183402 5' + Doc 4664 1 71.56 GAATCATTCCATGTTATCCACAGCTCAGAAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:2 - chr3L 3555497 5' + 412 42 2 71.28 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATCCCACCCAAATTGGACAAGACTAGACCAAATAAAAATAA:1 + chr3R 21907536 5' + I-element 4920 1 36.70 ACAAGCTTAATAGATCCCTAAAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:2 - chr3R 27071943 5' - jockey 4979 1 60.91 GACGTTCACTTCATGGATTTTGAGTTCATTAAATCGCCATTTAGGGTTCTTTATTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTT:1 - chr3L 20918121 5' - 1360 449 1 57.27 TACAAAGTATGCAAACACACACTGAGACAGCCAAATCAAATCACAGCTATACAAATAAGGTTGCGAAACTCATCACCGGTTGCGAGTGG:1 - chr2L 15778017 5' + X-element 4316 1 71.91 ATGTTTGCGATTTCGGATGGATGTTGTATTTTGCTCTGGTTGCTGATGTTGCAGATGTTGCTGTTGTGTTCTTGGGTTGTTTTTGCTTTGATTGTGATTTTTTTGTTTT:1 + chr3R 8755752 5' + pogo 291 1 77.98 TTATTATATTATATTATATTATATTATATAATATTATATTATATTATATTATATTATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATG:1 - chr3L 20525231 5' + 1731 33 2 51.82 ATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGAGCGAGTGAAAG:1 + chr3L 13228501 5' - P-element 2829 1 24.04 TCAAAAAAGTTACTGCTTATATAAAATGCCCGATAATTGCCAGATAATAGTGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCACTAAACA:1 - chr2R 6842107 5' + Bari1 1482 1 59.09 CATAAAAAGCAATCGTTCGAGCATCCTTTTGACCCGACGCATTCTATTCCAGTGTTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACCCCCTTCTAACTGTA:1 + chr2L 14006701 5' + 3S18 159 2 53.21 TGATTGTTGACCAATTGGATAGTAGGGTCTAGAGTTTTTTGAGTTGTTTTTAATAATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACAC:1 - chr3R 13149028 5' + flea 419 1 54.55 AAAAGTCAAAAAATTTTGCAAATTAACTTCTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAG:1 - chrX 22689391 5' + mariner2 42 1 65.22 CAGCAGGGCTAAAGGAAAACCAAAACAAAAACATAAAAAAAAAAACAACCACTCCAATATGGGAATCATGTATTCCCTTACA:1 + chr3R 11940464 5' + Transpac 4917 1 78.05 CATTTGGCCCAATTTGAATTATTTATTTAACGAGCTTAATACCTATCAATTGGCATTTGGGAAACTTATCGACTGATCGACTCGCCACTCTGCA:1 - chrX 10774750 5' + mdg3 5390 2 67.02 AGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr2L 10746649 5' + flea 11 2 60.49 TTCGAAAATTTTGCCTCTATGATTTATGAATCCCTTAGGTAATGCAACACTGCACTGCTCCACTCGCTTTTCTCGGTCTCTTGTAGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATG:1 - chrY 3068302 5' - invader4 345 1 70.64 AACAACCAAGAAAAATGACCTTCTTTTCCAAAATGTCTAAAAACAATAATAATATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGC:1 - chrX 13202698 5' - Tirant 8500 2 74.29 TGTGTGTGTACCTCCTTGTGTGTCTGAGTTTGATATCTCACTGAGAGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGGGTGTTCATGTTATTTTCAACGGCG:1 - chr3R 25786279 5' - accord 234 2 48.54 CACAGCATATTTAATGGCGGAATTTCCCAATGCCCAACCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATAATGTA:1 - chr2L 19638449 5' + HeT-A 5986 1 70.00 TTGACATGTCAGTGCGCTTTCATTTAATCAATATCGTATGGAGCGTAGGGCTGGGAAATGCATATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGC:1 + chr2R 18507817 5' + Bari1 22 1 61.82 TGTATATCGTATGTTGTGTTTAGTTAGGATTGGTTTTAAATTAAAATACATATATTTTTTTTTTGCTTTATTAAATTATATTT:1 - chr3L 9472499 5' - TAHRE 29 1 62.65 AGCTTTTAAATATTCTTAAAATAAGCAAGAAACCATATTAACCATCCGACCAGTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr3R 6132121 5' - I-element 5326 1 50.91 ATAAAAAGAGACTTGTTCACAAATTGTATGCAGATAATTTGCGTAGAAAATGACAGACAGACGGACAGGGTCAGATCGACTCGGCTATTGATCCC:1 + chr3L 23286058 5' - INE-1 96 1 68.42 CATACAGTCGAACATCAATAACTTGAAAGCTGAAACCACCATCTGTCACGAATCATCTTTCAAATGTATCAGGCTTTTACCAAAGACACTAGAATATTA:1 + chr3R 28847875 5' - Tc3 313 1 77.78 CTTTCTCCTCCACTTAGCCGCCAAAATTGGGAGTACTACACGAGGACGTGTCAAGGTCAGGATGGCCGTGTCGGAGC:1 - chr2L 11872130 5' + invader4 2747 1 45.45 GTAAACACTACCCCAAATCAAATAGAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGCTAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr2R 12336638 5' + pogo 32 1 66.29 ACTTTCAATGACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGCCACCCGGTG:1 - chr3L 3240612 5' + diver 9 2 71.15 CACTCTCCCGAACAGCTTGACGGCTTCCTTCGTTCGTTGACAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAATGAAAAAAAA:1 - chr3L 5475638 5' + gypsy7 5004 2 82.05 GTTTATCTTTATGGTAAAGAACCGAGTCGAGATTCTATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAA:1 + chr3L 19941067 5' + I-element 4968 1 61.70 CCGACTACAAATTTTCCTCTTACCTTTTTTTGGACACTTTGAACGTGCAGCTTTCAATACGCTTTATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTCACTAATAAAATTCCCACA:1 + chr2L 7492890 5' + accord2 7337 1 53.64 TAAATGTTTATAAGTAAACCATAACTTGGAACTTACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chrX 12271455 5' + pogo 10 1 62.37 AGTTCGCGTTGATTTTTCGTGTGCTGGGTCTGGGGAATAGAGGGTGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCTGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 + chr3L 17648308 5' - F-element 4413 1 57.27 AAATTCTACTTGTTTTACCAATATAACAAGAAGATCATACAATTATTGTAATATATTTTCTATAATTTTGTCTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACA:1 + chrX 23283150 5' + HMS-Beagle 6805 2 70.00 TTAATATTTTATTTTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1 + chr3L 14396968 5' + BS 5021 1 48.18 ATCCCGAGACAGCTGCGGCTCACACAAATCAGGGAATGAAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCCGC:1 + chrX 2984772 5' + invader2 5058 2 69.70 AAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTAATGTATACCCTTACATACCATCT:1 - chr2R 22661292 5' + Transpac 6 2 63.51 AAAAGTCGCAACCGCCGAAAAGGACCTCTTTGCGATGGGAAATGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAA:1 - chrX 14384985 5' + 1360 3180 1 65.45 TAGCTGGATTAATACGGCATATTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTAACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTT:1 - chrX 17838021 5' + S-element 61 1 77.27 TACAATGTTGACCCTTACTTTATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2L 15763815 5' + blood 7018 2 72.73 GCTAGAGAGAATCGGAGGATTGTGCTGGTCTAGTTGGTTGGTTGTGTGAGTAAAAA:1 + chr3L 2509303 5' - 1360 3251 1 78.57 ATGCGGCCATTTCTGGTACTACGGTGAGTTACTTACATTTACTGTCGTTACTACATGACACCAATTTTGACGTTTGACTAATAAAATAAAAAAAAAAATTAAAATTAAAA:1 + chr2R 15485656 5' + P-element 2635 2 79.09 AAAAATTAAAATTCCATGCTTTACGACACCTGCACCATTGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACATGTTATAGTTAAGATTTTTAA:1 + chr3R 28270974 5' + F-element 4615 1 62.73 AAGAATTCAGAAGATTGAAATCTGCGCAAGCCCTTCACGCTCACGCGTTTGGAAAGTGTTTAGATTTTTCCTTATCGATACTTTTTTATTTTGTTTAGTTTATT:1 + chr3R 6032296 5' - F-element 90 1 22.12 CAGACCAACTGCTCCGCCCACCGCCCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGACGTGTAAATGTATGAAGGATTTTAAGTTTCAGCAGATAG:1 + chr2L 9496394 5' - Tirant 8444 2 75.45 GAGGACCTTCGAAGTGGGCAGCCGAAAATCCAAAAGTCTCCTGGCAGCGAACGGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTAA:1 + chr3R 15935470 5' - Cr1a 373 1 67.82 TATTCCCCTCCATCACACAGCGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATAATACTTAACCCCTACACAAGTACACT:1 - chr2R 10148455 5' + G2 2967 1 73.96 GTCGCCTGGATCCTGCATCGTCCAGTGATCGCGTCTCTCCGTTGTTGACTGCCCTTAAGGCTAGCCAACCAATTAAATGATA:1 - chr3L 7913875 5' - springer 7352 2 60.98 AATAAAACCAAAAGGGATATAGATGTAATATACTAACAATTCGTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 - chr2R 10241500 5' - I-element 5315 1 59.09 GATCACAATCGCAGCTATTTTACTTATTTTTTCTCCAGTTCTCCGCATCGTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAAAA:1 + chr3R 26470814 5' - F-element 4643 1 59.60 TTCCGGAAAAAGTAGAGCCATGGGGCAAAACACCCGATACGTCACTTTCCCTCCCCCACCCACACACACCCACACACACAAACAC:1 - chr2L 7941661 5' + gypsy3 418 6 67.06 GATAGCTCAACTGTGACCAAACGCTGCTCCCTGGGCCACACATCCCACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAA:1 + chr2R 13209637 5' + mdg1 41 2 60.91 TGTCTCAATTTTGTTTTCCACTTTTTCGTCATCGCCATTGTTGTTACTTTTTCCACCTCTTTCTTCACATATTTTGCGATTTTATATGATGGTTGCACTTGGGCTTGAAT:1 + chr3R 4570029 5' - Porto1 71 1 75.45 GCTTTTCCCAGAAAATAAAGAGAGAATGGGGACGAGTAGATAGGGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACACAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 + chr3L 10722960 5' + copia 4909 2 58.18 AGTAGATTACTAATAAAGTGCCTACCAGTGTTAGGGATTAAAGTGGACGAGAATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGACAC:1 - 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chr3L 12138569 5' - jockey2 3407 1 25.45 CACCTAAAAGTAAGCAATAGAAATATGGTTTGTCAAAGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTGGGTTGAAGG:1 + chr3R 6254722 5' - Transpac 5150 2 58.51 CACACAAACAAACACAAAATCAACGAAAAATTAATTTTAAAAAAAGTATTAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chr2R 6136993 5' + Tirant 2 2 70.42 TTTTGACCGCTACTGGGGAAAAAAGGTAGAAGAAACGGTCAGCATTTCGGCAGGACTCGACTCTCTTAGCGTTCCATTTTGGGGTAGGTGAACACACACACACGCACACA:1 + chr3R 22854726 5' + accord 7028 2 71.82 CGCTGAAATCGCAAAAAAAATAAATAAAGAAGGAGGGAGTACGAAGAGAAGTGGATGATGGCG:1 - chr3L 17297925 5' + R2-element 489 1 76.19 GCCGTGGCGGTTTCTTCTGCTTTCTTTTTATTAAAAAAAAAATAAAA:1 - chr3R 20332353 5' - hopper 156 2 78.72 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAAACAACACAACACAACACAACACAACCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 - chr2L 16217660 5' + gypsy3 419 2 47.62 GGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGC:1 - chr3L 19948900 5' + 3S18 5817 2 72.12 AAATATGTTCACTCAGGCCAATTAACAAAAACAGAGCTGGGATAAAAAAAAATGGCGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCT:1 + chr2L 5865521 5' - 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chr3L 12063827 5' + I-element 5133 1 56.36 AGAGTGAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGC:1 + chrX 21474399 5' + 1731 4340 2 73.64 TATCTCTGTGTCGTGTTTTTGGGTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 9435820 5' - roo 9033 1 59.09 CCTGCCTACGAAGCGTGCATTATTTAACTTTCGAGTTTTGCATTCAATTCACGCACCAAAACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAA:1 + chr2R 19068967 5' - Bari1 264 1 69.89 TGAATAATATTTGATATCATATTATTTGCAAGTGAAAAGTGATGATCTTGAACTTAAGACTAACTACTATACAATGACCCATCCAATGAGTCACTAGAAACTATATACAC:1 + chr2R 12262740 5' + Cr1a 4120 1 80.00 TAAAAACGAGGAAAAGCACAACAAGAGCGCACAGGTAGTGAGTGAGTGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGT:1 - chrX 13495571 5' - Max-element 8519 2 46.84 AAATACCACGCAAGCCAAATAAACTAGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCATATACCATGACAGGCTG:1 - chr2L 17377991 5' + X-element 4409 1 75.00 TTTATCTGTTAACGATACATTCCGTGGGAGTTCTTCCTTCAGTCTTCTGTTGGGGTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr3R 1220307 5' - 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Dm88 448 1 65.31 ATGGAAATGAAATTAAGCGAGAGAAACAAGCAAACAAGCAAAAATGAAAAACCCACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAATCTGGCGTCCTGG:1 - chr3R 17688636 5' + Rt1b 4824 1 63.33 ACAAATATTAGTTTCATACCATCAATTTTAGCCTTATTGGAAAGACTGATCCAAACTTAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCT:1 - chr4 1248834 5' - Cr1a 3983 1 61.17 CCAATTCTAGACAAATTTTGTAGTTTGCAGCTTATCTTAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTCCGCCTGT:1 - chr2R 5607130 5' - jockey 4534 1 63.64 CGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAA:1 - chr3L 3240591 5' + diver 24 2 54.08 TTGCCAAACTGGCTGTTGTCCAGCTACGATGTTATTCCTGCCCACCATCCATCTGGCAG:1 + chr3R 6372713 5' + G2 427 1 59.32 CATTTTGGCAGCTGTCCCTCCGTCGATCGGCGGACACCCCGTCGACCCCCACCCTTTTCCTTTTCTTTTTTTTT:1 - chrX 1301355 5' - Doc2-element 229 1 59.46 ATTTTGCAGCACGCGCTGACCAGACGAAACGAAAATATGGGGAAAAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAG:1 - chr3R 8480533 5' + hopper 967 2 60.91 TTCCTCAACTGTCTACAGCAATTTTCGTTACAAAACATTTTTTAAGTGTGGGCGTGGAAGTTTTG:1 - chr3L 13365703 5' - INE-1 244 1 55.38 GGTACAATGTGTGTTACAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTC:1 + chrX 16104611 5' + F-element 4213 1 80.00 GCCGAAAGTAAAACATTTTCTAAAATCATTTAAATTCTGTTGGTTCCACCTATATAAAAACATGAGAGATCGTAATTATTGAGTTTGTGGACTATCAGATACCCGTTACA:1 - chr3L 11578986 5' - INE-1 550 1 41.82 TATTATTTACGCTCACAGCATTTTTGACAATTTAATTGGGCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATATGATATGAAT:1 + chr2L 10128665 5' + copia 4915 2 65.45 GTAGCCCCTCTCCACACCTTAATCCCCACGGCATTTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chrX 22769331 5' + 412 27 2 56.36 CTTTGGTATACCTCGTGAAATATGTATGGTAGGCATATGCATGTAATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATACA:1 - chr3L 13839275 5' + TAHRE 10372 2 59.22 CCCAAAAAAAACGAAAAAAAAGAAAAAACAAACAAAACCGATTCCCTGCAGAATGCAAACGATAGCAGTCTTGCTCACCAATGC:1 - chr2R 13795601 5' + Doc3-element 380 1 53.57 CTTTATTCAGATGTACATTTTTGATCTGCCGCTCAGAAAAGGGGCAGTTGGGGTGACAATTCGTGTAGGCACCCCCAGAAAAACGCTCCACCAGGAAACG:1 + chr3R 31962578 5' + mdg3 458 1 71.00 AGCCTATCTGGCTGATAAAATTCGTAGCCTTAAATAATTAATAATTGTCGCGTGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCA:1 - chr3L 18348065 5' + ZAM 25 2 54.00 TTAGTCATTTGGTTAGTACTCAAATAAACGGAAACACCAATCAAATCAATATAAATTCCAAATCAAACTTGAGCAAGGTGTAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCAT:1 + chr3R 9486440 5' + F-element 4391 1 78.18 TGTAGGTTCTGGGTGAAAATTTACCTAAGATTCCTGGCAGAGACGGCGTCGCTCGAGTTGCCGAATTGAGGACCGCGTTTGGAATAATA:1 - chr3R 12268389 5' + diver2 4435 1 66.29 TGACTGAACTCGTAATTGTAAATCGCAATTTACCTATAAGATACGTTTACCGAGGTGTTACGATATTCAGTAATTCAAAAGACAAGGAATGAGCGCAGTACAGATAAATG:1 + chr3R 17137817 5' - diver2 4656 2 78.18 ATTTCATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 23621045 5' - roo 9018 2 73.64 AAAACACGTTTTGTCATTTTATCCAATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCA:1 - chr3L 18276759 5' + F-element 4443 1 75.49 ATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGCCG:1 - chr3R 18873667 5' + micropia 14 2 66.36 CGATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3R 13503052 5' - hopper 1372 1 60.19 GTTTTTGTCCACCCACAGCGATTCTGTACAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCACACGATTTACTCTCTGA:1 + chr2R 15323827 5' - FB 299 1 71.82 TTGATGATCATATCATGCCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACC:1 - chr3R 14052843 5' + jockey 4583 1 77.92 GCATTGGTTCCCACTCATATGAATTTTTTCGGTGTGTGTTTTATTTCGTCACTTACATAATCTGTGTGTTCGTGTGTGTTGTTGTGGGTTTCCTTAGTGGGGCGCCAATT:1 + chr2R 3479428 5' - gypsy3 395 1 56.36 TGTAAAAAGTCCAAGGAAGTGGTCTTGCGACCATGGTTACCATTAAACATGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr3R 13298166 5' - I-element 5322 1 53.64 GCTTTAGACCTTATGCTATGTTGGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGTCTCTAGAGGTGG:1 - chr2L 23066770 5' + 1360 59 1 75.45 GTGGAAGGGGTCGGGGTAGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATG:1 + chr2R 19395045 5' + Rt1b 4800 1 62.50 TGCTCCTTCAGGCTATCCACGCATTGCAGCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGAACTATGGCTC:1 - chr2L 5193362 5' + F-element 4257 1 71.82 TAGGTTTGACCCTGTACCCGAGCGGGCGTGAGATACCAGTGTGCTAGGTACACCGTGTGTGGAAAAGGTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTG:1 + chr2L 22524626 5' - F-element 4420 1 67.29 TATAATATAATATAATATAATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGC:1 + chr3L 20525230 5' - Max-element 281 2 72.13 TGTATGTATGGATGTATGTGAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTACACATATACGGTCATCACTCATTAATTGTTGTAAATTGTCCCG:1 - chr2L 13611990 5' + accord2 7159 1 53.64 GAGGTGGGAGCGATTTAACTAACAATTAAAACAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGCTTGGAAG:1 - chr2R 24698566 5' + R1A1-element 119 1 54.55 CCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr3R 19537509 5' - hopper2 1558 1 69.52 CATAAATTGTTTATATTATTTATTAAATTCATTTTTGTTTTTAGCAAGCTACGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTG:1 - chr2R 12831575 5' - I-element 5078 1 54.13 GCTATTAGCTGATTTAACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr2R 9953280 5' + pogo 41 1 64.81 AAGCTACCATCAAAATGTAGTCACGAATCTCTAATACCAAAGTCCTTTTTAAACACAATTAATATTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTAT:1 - chr3R 29362861 5' - F-element 4654 1 60.91 CTCCCGTTCCGTCAGGCAAATACAGTTCCACGGTGCCTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGTTGGGAT:1 - chr3R 22408301 5' - F-element 4406 1 68.37 GAAAAGTATGTTACAATTATTTTCATCAAAAAACCAGCCAGCGAATTCCCCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2R 14650658 5' + jockey 16 1 62.20 ACAATACACAATGCTTTTTGTTTAATTTATTTTATGTACAATAATTGTGTGATCTCGTGACATTTCGTCCACGTTTTGTATGTTATCTGGACTGGGTTTGCTACGAAGG:1 - chr2L 1701360 5' - I-element 5114 1 67.89 GTGGTGGTCCGAGCCAAAGGACTACGCACCACCAGGTGACGAGGGCGAGATAAAGTGAGAGAGCGCAGGACAAGAGAGAGCGAGAGAGAGATTATGCGCGTATA:1 - chr2L 826648 5' - blood 7166 2 78.85 CAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 21034115 5' + 412 42 2 61.90 AGGCACTGTGTAATGCATTTATAATTAGTAGTCCTTAAGTCCCAGGATAATCCTCGTGGTCCTTATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCG:1 + chr2L 6722570 5' - invader4 291 2 72.04 AATTTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 - chrX 23283050 5' + HMS-Beagle 26 2 54.55 TGGAGCACAAACACATGGGCCCTGCCACTTTCACCACCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATAGTATCCCTTACGCTAATGTTCC:1 + chr3R 12276771 5' + G6 1954 1 64.55 CGCTCAATACCACAAGAGCTATAACAACTACAACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCACTGTCCACGAA:1 - chr3L 956825 5' - Cr1a 404 1 65.06 ATACTTTCGGGCGCCGTTTGCTTGGCATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACCTAATTTGACATGCTTAAATTATTTTATTT:1 + chr3R 21993235 5' - jockey 4931 1 73.64 CCTCAATTTTGTTGTCAGAGTTGAGAGCCACATTAACCGAAAATATGCCTTCATTAATATTGCTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAG:1 + chr3R 26366832 5' - Burdock 5967 1 64.55 ACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTATCTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGT:1 + chrX 21772490 5' - gypsy3 6551 1 62.63 AGTTCCAACGCCCAGCTCACAACTGCGCAGCTCGACGTTTCTCTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATACT:1 - chr2R 9871578 5' + roo 13 2 71.82 TATATTTGGTAAAAACAAAATTATATATGTTTTCAGTTCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 + chr3L 18743400 5' + pogo 45 1 70.00 AGAAATCACCACAGCAATTGTAATGTTTAAATATTCAATGGGCTCGAGCGGAAAGTATTCAAACCCAATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAG:1 + chr3L 10836504 5' - opus 7495 2 73.79 AAAATTCTAATGCTGCTGAGCGAAGGATAAGCCACTGCCGTGGAAACACCTAGTCTGAAATTCCACTATCATATGGTGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCT:1 + chr2L 16584013 5' + R2-element 73 1 71.00 TTGTTTCGTACTTCTGCCTGACGCCCCCACACTGCCATTAGCATGCTCACACTATCACGTCGGGGGCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCG:1 + chrX 13271239 5' - diver2 351 2 55.14 AAGTCTTGGCTGCCTGAAGAGCCGTGAAATAAAAAAAAATTCCCGCATATAAGAAAATAATTACAATTTATTGATTTTTA:1 - chr2R 4137601 5' - HMS-Beagle2 7187 2 57.50 CATTGCTTTTTGTCATTGTTTTTAGAAAAGTTTACAAGACTAATAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2R 15855671 5' + opus 21 2 54.84 GATATGATTCATTCAGTTTGCCATCGACTTGTTTGTTTTTAAAATTACGCACAAGTATTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATA:1 + chrX 15171154 5' - Tirant 8414 2 64.00 TTAACAATTCTCGCTCGCACTATGGTTCTTGATGTTCTTCATTTTGGGTGTTGTTGTCGCGGTGCTCTCATAAAACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chrX 17659271 5' - roo 401 1 74.31 AAAAAAAAAATTCAAAAAAATCACACTAATTGAGAGATAATAAAGATGGAATTCGGCAGAGTGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATC:1 - chr3R 26242454 5' + R2-element 3381 1 46.60 CAGAAACGATTAAGTTGTTGAGAGAGAGAGTCTGAATGGAAATAGCGAAAAAATACAATGGCAGACTAGAATCTCATCCTAATAGTCTAGCTAGA:1 + chr2L 4111711 5' + jockey2 3104 1 61.05 GGGCACATGTCACTTGTCAACGCAGCAATTTGACAGGACCTTTACTGAAAAGCCCCGAAATACATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTC:1 + chr3R 20119525 5' - rover 327 2 62.96 GCTGTACCGGTCAATAAGAAGCTGAAGAAGAGAGTGCAACGAGCAGCAGCTACGCGTCAACACAGTAAGGAAAATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGC:1 - chr2L 22360410 5' - pogo 246 1 72.73 CAAACTCGCATCCCGCACAGAATCCAAGCCACATCTCCATCCCAGGCTTAACCAAAATGCAGGCTGTGTGTAATAAACGAACATCCTCTTCAAAAGTAGGCCTCAACGGC:1 - chrX 21514228 5' - mariner2 164 1 55.45 CATGGGAATTAAATGGAAGACCACAAAGCCAATTTATATATGGTCCAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr3L 16681999 5' + FB 27 1 57.58 GCTGTTGTGTCCGCACAGTGGGCTTAAATTGTGAGAGCTGTACGTCTGGGAAAGGTTTTTTTAGTTAAATTAGGTGTAATATTTTTGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chr2R 16211116 5' - 297 368 2 44.55 AATTTAAAACATTTTGTAAAAATGTTTTTTTGGCCTATCAGAACAAATATCCTTGGTAATCTTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCA:1 + chr3L 22964267 5' - 1360 3381 2 60.42 GAATATCGTCCTGGCCTTGGCCAGAATGTCCTTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTGGGAG:1 - chr3R 11396538 5' - F-element 275 1 65.31 GCTTCTTACAAGAAAATCGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 14688240 5' - pogo 2069 1 58.10 CGATCGTCGCGCGTGTGGCGTTGCCCCGCAGCTGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAAT:1 - chr3R 18070166 5' - blood 7074 2 72.73 AAATACCAACGAACTTCTGTAATTCGATGAACCATCTGCCACTACTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGA:1 - chrX 2323699 5' + Doc 4271 1 58.16 ATCCCTAGGGGCTCTGTAAATTCACCTGCACCCTGTACAAACTATCGGAAGTACTTAAGCAGAAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCAACCAGCTGTGACAACATGA:1 - chr2L 20423426 5' + flea 4660 1 57.27 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr2L 16217660 5' + Tabor 6864 2 49.07 AATTCCCCCAAAATCGTCATTTGATTACTGATTATTACCCAACAACGACGACACGCGTAATCGTTCTGCTGAACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGC:1 + chr2L 15612102 5' + 1360 3276 1 71.82 TAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCA:1 + chr2L 16067075 5' - HMS-Beagle2 7173 2 55.06 TCACCAGTTTTTCTCCAAGTAATGACCATCACCTCCGGTTTTCGAATTCGTAAAATTTTTTTGATTTGTGAAGGGCATATTTTTTCAAATTTACA:1 + chr2L 22548184 5' - 1360 204 1 68.42 ACTGATTTACGTTAACCATAACTTTTACAATTGGTCTTGTTTAATGATGCCGGCTCTAGCTCATGGCGTCGGGTGTGGTGGGCTTGCTT:1 - chr2R 1080920 5' - Gypsy12A_LTR 2171 3 61.80 AAAATAAAAACCAAATTCGAATTTCCATTAGAAGTGGTTGAGATTTTCTCGGGATCTAAGAAAATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 21403556 5' + roo 13 2 66.67 CAACTGACCAAATACAAACCAAATTACTTTCAGCATTCTTCGCAGTGGCTCTTTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr2L 17393336 5' + FB 33 1 53.64 GCAGCATTCAATGTCGCACTTGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTG:1 - chr3R 13851324 5' - diver2 4545 2 76.00 AAGAACCCGAAGATAAGAAACCCTTAGAAGAAAAACCGAAAAAACCAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAAGAACACCAAACA:1 + chr2L 5177227 5' - Cr1a 249 1 57.80 CAGGAACGCCCATGCCACCATCTGTATATAAGGTTTATATTGTTTGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGT:1 - chr3R 7191131 5' - Quasimodo 45 2 58.43 ACTTTGTTTTTAAATATATCTTCGATTTCTGTGCATTCTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 8808743 5' - roo 9025 2 64.55 CACCATTTCTTTCGACAATTGACCTCGTGATGTGTGTGCTTGGAGCAATGGTTTGTTCTGTTTTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAG:1 + chrX 953268 5' - Doc 4666 1 67.00 CAAAAATGCCAAAAAGTTTCGCACAGGCAAAAACGAAGACAAAGGAACTGAGCGAATTTTTAATAAATTAAATAATAATTAAGTATAACTCTGGTATTTCGGTAC:1 + chr3L 10721843 5' + Tc1-2 410 1 63.81 TCTCGGCCATGTTTGGATAATTCTCTCTCGGTGTAAACATTCAGGACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAG:1 + chr3R 11402841 5' + F-element 4639 1 59.09 TGATGCGCTCACTGGTAGTTCGTGAAAACGTGAGCTGAGTTCGACTGAGAAGAGTTACCTAAGCGTAAGCCCAAAACCCGTATAATCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1 + chr3L 12034685 5' + I-element 86 1 59.09 AGTGGTTCTATAGGAACTATAGGCCTAGCCCAAGAAGACGAGTGTGGGTCAGAAATGAAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGAGGA:1 - chr2L 1630782 5' + flea 4715 1 62.35 ATTTCAATTTTCATTTAGAGCAAGTGTAGTTTTGCCCACAACATTGTTGGAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 2815069 5' + Doc 45 1 56.07 ACATGGAAAACTTGGAGGGAACGGCCCTTAATAACGTGGGAATGTGACGATGGGCTGAGGCTTAAGCAATGTATTGTTTAAATTAGGG:1 - chr3L 1435471 5' - Idefix 202 2 56.82 TTTTTTCGTTTTTAATTTTCATAAATTTCACTTAAATATTGCCAAAGAAAACTTGTTCGCGTGGGTGCTAAATTGTCTCATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTA:1 - chr2L 22096949 5' - Porto1 4381 1 78.18 AGTTCATGATTTTAAAACGAATAAGATCCATAAATGCATAGCAGTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTT:1 + chr3R 7049646 5' + 1360 40 1 63.64 CAATACAATACAATACAATACAATGCAATACAATACAATACAATACAATACCAAATTGCCCGTTTTGCCAAGGGGATATTTATTTAAACCAAATATTTAA:1 - chr3L 21448027 5' + I-element 5032 1 50.00 TCAATTTTAGAAACGTGTTTTGGGCCTCCATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACAC:1 + chr3R 6937630 5' + F-element 187 1 75.49 TTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATT:1 + chr4 1294994 5' - TAHRE 10388 1 91.00 ACGAAGGACAACGTTTTTAATTAATTTACAAGACTAATATATATGTGACAATCCTTAACACAGTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTT:1 - chr3L 10254382 5' - INE-1 246 1 75.56 GTAGCCTCGCATAAGTGATTTTATTTTATCTTTTATTTTTTGATTCTTAAGTTACAAGATAGAATAACAATAATTTTACAACATTTTTACGAGTTATCTTTTATTTTTAG:1 + chr2L 9172040 5' + transib4 129 1 61.82 GCCCCCCGTCGTCGTGACGTCAGATGGCAAATTAAAAAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACCATATTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCCAATTAT:1 - chr3R 11147206 5' - Cr1a 4287 1 70.00 TCTTACAATTTGGTTTGCATAGGTTTCCCTTAAAAAGTTTTTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAA:1 + chr2R 19364211 5' + jockey 4805 1 65.45 AAGATGCCCCCAGATTACAAGTGGATTCCCTTTGGGTTTTTTCTATTCTCGAGGATCGTATAACAGTCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGG:1 + chr2L 11825104 5' - Idefix 101 2 64.13 GAAGTGGATATAAAAAAACCTTACTTTTAAAAATGCTAAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAG:1 + chr3L 18481247 5' - 297 175 2 65.14 AGGGCGCACACAATTCCTGGTTTTGTTCATTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:1 + chr3L 20139734 5' - mdg3 211 2 67.44 CACCGACTCAGCCCGACATCTTTCCTCTTGATTTCCGTTTCTGTGACACTGCTCTGCTATCCAGTCCGAACCTCTGAACCCCTACCCAAGTACACTCGAT:1 - chr2L 7332797 5' + G2 2971 1 79.00 CTCAGTTACACTGTCTTCCTCTTCATCTGCCTTCTCTTGACTGCCTGCCTTCATCTCCTCGTCGCCTTCATCGTCGTTGTTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAG:1 - chr3L 2408023 5' + 1360 430 1 70.00 AATTGCCCAGGAACACACACACACACGCAGTGCCAGAAAGGACGAAAGGACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3R 13733032 5' - hopper 1387 1 49.04 AATTAAATGGCAGGCACATAGGCCCGGCTCCCAACCCTTTTCCATTATTTACAAAATTTAAAAAAAAATTAAAAAA:1 + chr2L 14128156 5' + TART-C 11098 2 51.32 GCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGATCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCACCACTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTCG:1 - chrX 3464218 5' + GATE 53 3 61.29 TTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chrX 17330124 5' - opus 7457 2 78.89 AAAATATTTATTATATCATTTTTTCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2R 16799188 5' - roo 9012 2 80.00 TGGGGAAATTTCACATTTACGTGGATTTTCATAAAAATTCCAAAAAAAAGCTGTCTGTAAGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAT:1 - chr3R 11858247 5' - rover 142 2 60.58 CTACTAATGTGGCGCCCCAACCATGTATATGTAGCTTCAGGCAGTTTTATTAATTTCATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTAT:1 - chrX 22665825 5' - 412 7272 2 60.91 ATAGCTGTCGAGATATGTGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGGTCATATTGGTTTTATTATCGCCTTCTATATTGCTATTTTATTATATAATTCTAGTTTTGAGTGTT:1 - chr2L 886969 5' - Porto1 4207 1 79.82 CGAGCTTACACAGATTTTTTTTGTGTCTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 + chr2L 9754810 5' - 1360 3334 1 76.15 CAATACTATTAGGTTATTGTTATACTAATACTGAAATGTAATGATTTGATCCCGAATACTTGCCACACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACG:1 - chrX 716574 5' - Doc 4273 1 69.23 CAAAAATGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 8621721 5' + jockey 36 1 60.71 GTTACCTTATTCTTAGGTGCATTCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 9435842 5' - roo 351 2 78.30 AAAAACATTTATTAATTTGCTTACTTACTTTACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCT:1 - chr3L 6754514 5' + G6 1880 1 71.82 ACACAGCTTGCCAGCTGTGCTACCAACACACTTTTCAGCCATTTTCACCTGGCTTTCCCCCTCGAATTGCCTCCAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTT:1 - chr2L 11597946 5' + Transib5 92 1 72.00 AAGATGATAACAGCCTTTGCAAGGATATAACCATGGCTTATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr2L 15988767 5' + 412 7094 2 65.71 TTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATT:1 + chr3L 21448026 5' + transib1 1901 3 70.97 GCCAGCGATCTGGGCCAACCTCTCAACCACCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTT:1 + chr2L 20526053 5' + hopper 57 1 70.91 AACTCCAAATTTTTTCCATAACCACTTACTGTCACTTTGCCGGAACAACAACAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTACTGGAGCGC:1 + chrX 5420165 5' + Doc3-element 4399 1 51.82 AAAGTTTTCCAAAATAAGTTTTAAATGCGGAGGTAAAAAAATGAAATCTTTCGACCAGCTTATCGCCTTATCTCGTTGCCAGAGAAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTG:1 + chr2L 4670104 5' + G2 118 1 78.18 TGTGGATATATTTTTAATGTACTCGCAACTAGAGTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 - chr2L 10990944 5' - Quasimodo 265 2 53.42 GCGAACGTTTGTGCAGCTGCAACAAGTGAAGCAACCGCACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAATTGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAA:1 - chr2L 8479331 5' - Cr1a 168 1 65.45 TTTAAAGATAATGGAAGTGGATTACTTTCGCGATCATCAAGCTTGGATTGTAAAATTCTGTTTGAAATAATATCAGAATTGAAATGGGTTTATATCCATGTTGTAG:1 - chr2L 13687806 5' - hopper 972 2 65.09 TTCTCCACTTTTGGTCAGCGGGCTCAAACAGGTGAATGGAAGCGTTTCTGACCATATAAAGTATTTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCA:1 + chr2L 6074122 5' + INE-1 102 1 63.21 AATAAATACTGAAATCTTTTGTAGTTGACTGAAGAACCCTTAATACAGATAAATAAAATTGAACCCACCCATAGCATGCCTAGAATTTTATTCTTTTTTTTTATTATTTG:1 - chr2L 7844439 5' - Rt1b 5147 1 74.55 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTG:1 - chrX 14317414 5' + HeT-A 6008 1 73.40 GAATAGGCCTTATATCAATCTTTTTTTTGGTCATATTTTATAAATACACCCGTTACTTGTAGAGTAAAGGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACAGGCAGAAG:1 - chrX 20895106 5' + INE-1 24 1 89.09 TGCCGGTCTGCAACATTGTCAATTAAATAAAAAAGGCAAAACCCCCCCCAAAAAAAAGAGCAAGAAACATGCACTCTAGCCGGTACCACGACACGTTAGA:1 + chr3L 6369218 5' + BS3 1482 1 62.00 ATAACCCAGATAATAACCATCAAAAAGCACCTTGAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAACACGGCAAG:1 + chr2R 18057417 5' + Bica 248 2 64.71 GAGGGAAACATGAGATTGCGGCATTGCGTGAACACAACTCATAATTAACAGACGTTTCAGCATCCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGC:1 + chr2L 11875718 5' + Doc3-element 4606 1 61.82 TTAAATTATGGCATCGTTATGGGTATATAATATTACTAAGACCCAGACTTTGTTTTGTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGGT:1 - chr3L 3611798 5' - blood 349 2 56.36 TGCAATCGATATCCTTTCGCTTTTCCCTGTGTACGCTCCTTTTTTTTGCCATTTTACAAATTAAATGCTTAGTTTTATCTATTAACTTAACTGTTAACAGTTAGTTGAAG:1 - chr3L 9117294 5' - Bari2 197 1 67.27 CTTCCGGAAACGCAGCGAAAAGAAAAGGATAGAAGAAGAGATGCTAGAGGTGAGCAGAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCATGTTGTG:1 - chr2R 9587205 5' - 1360 3215 1 64.95 TACATGAGTTTTGTTCATGAAATTATTTCAACAACCTGCCCAGCTGAGTCCACTCCGGCTCCGGGTTCGTTCTGGCGCTCCACTAGTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCAT:1 - chr3R 23576392 5' - Juan 179 1 66.36 GGACACAAGAGTCCTGCCCACCAAGGACCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr2R 23477821 5' + F-element 22 1 64.22 ATTTCCCTACTTCAAGCCAAAAAGTCCCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTATAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:1 - chrX 9213670 5' + jockey 4821 1 73.83 CTCGTGTTGCTGTTGTCGCTTCTCTGACTGCGTCTGTGACTTTGACTCGACTCTGAATCTGATTCGGATTCGGATTTTGATTTTGAATTTGAATTT:1 - chr3R 13844940 5' - P-element 2642 1 63.54 ATTTTATGGAACCATTTAGTGCACGTCTGTGACGTTCTGTACAATTAGACAGCAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 - chr3R 11173289 5' + Transpac 4950 2 53.64 AAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTC:1 + chr2R 3031565 5' + 1360 3256 1 70.00 AAAATGTATTAATAACAATAAAAATGTAACTAATGCCTTAGCATGATGTGAGGAAAAAGTTTTATTTATTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTT:1 - chr3R 4554407 5' + Bari1 17 1 66.36 CTTTTAACACGCACACAGAGGCGCCTCAACACGCACACAACGAGACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCACATTCTATTTTTAGA:1 + chrX 18154961 5' + 1360 3266 1 66.67 TGTTGTTGTGCATTTCTGCCTGTGTGTGTGTGATGTCCTGACAGTTGCCAGTGCTCTTGACAGCATATACTTGTGTGTGTGTATGTATATGTGGTCTTATACTATGGCAC:1 + chr2L 2557577 5' - Quasimodo 11 2 79.09 TATTTTTACTAGTTTCTGCAACAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCCCAGG:1 + chr3L 18913623 5' - I-element 335 1 67.61 TGCAAGAATCCGATATCTTTTTTTGGTCCTAATGAAACCTAATATACTCGACGTTTACCCTTACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTC:1 - chr3R 17850087 5' + G2 3019 1 61.62 GAGTGAAACAAGAACATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr2R 7981125 5' + 1360 24 1 59.62 TAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATACTAAATAAAAGGCTACAAAA:1 + chrX 14827601 5' + G2 3060 1 65.69 TATCAAACAATAAAGAAAAAAAAAAGTATAAAACAATTCCCCCAGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGA:1 + chrX 15569116 5' + invader2 375 1 58.49 AATTTTCTCACGTACTTGTAAATTTTGCGGAAAACCGCAACAAATTCACTTATAAAAGTAATCTAGTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 + chr3L 17706358 5' - Juan 4195 1 60.00 TGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1 + chr3R 23861090 5' - pogo 2044 1 75.45 GTTTGCCATATGCCTTTCCACTCCATATAGAGGGGATCGCTTCGATGCTCTCTACCCGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 27403684 5' + hobo 23 1 55.56 AAAGGGGTTATATGGGACTTTCCGGCTCCAAGTTTTCAATTTTTATTTATTTATGTAACGTGGCCTAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chr3R 20415750 5' + F-element 32 1 57.27 TAATATGTGCATCGTATGTGCGTATGTACAAGTTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACACTGGCCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCT:1 - chr3L 24510191 5' + Gypsy6A_LTR 114 1 76.36 CTGTCTGTCTGCAGGGCGTCATTACTGTACTCAGCCGTGTACTCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTG:1 + chr3R 902551 5' + R1A1-element 4 1 55.79 AAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTGGTATAGAAGGACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr2L 10746647 5' + flea 16 2 57.95 ATTTTTCATACTCTTCCTTATGATCCACATGCATGTGTGTAGCATATAGCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chrX 2552040 5' - blood 7354 2 53.64 TAAATTCTTTCATTTTACTTTATTAGTTTTCTTGCCCATTTTTAGCGACAAGAGTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGATAAATTTCAAGCTTTTATAGTTCCTGAG:1 - chrX 22838709 5' - INE-1 153 1 50.91 ACATGCACTTGAAAATCTTACGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGGAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTT:1 + chrX 4797734 5' - FB 139 1 80.91 TCAAAAACTGAATGTAAACATGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTTG:1 - chr3R 28847961 5' + Tc3 310 1 61.90 TTATTCGGGAAACACATATATTAAAATCTCCTGCTAGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTA:1 + chr2L 1875435 5' - Quasimodo 442 2 62.89 GTTGGAATATCCTGCCAGGACTCTCGGTTACGCTTGGGCTGGCCCTTACTTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 5320593 5' + roo 35 2 58.72 TGGTAGATATTGCAGACAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 19445549 5' - roo 395 1 72.73 CTACTAGATAGACCAATCCCGTTTCTAAAACTATTTCAATTTCAAAGTGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAG:1 - chr3L 18790238 5' + hopper 1122 1 57.27 GTGCAATGAGGAGTATTTGAAATTAAGCCACTAATGGCTAATTACTAATATTGAAGAACATTAAAACTTGAATTCCAAATAAACTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 - chr2L 3138420 5' - copia 253 1 78.18 TTGACCGGGCACGGGTTCTATTTCGAATAAAATGGGGTCAAGTTAGCACTCTCCGCTCCAATCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCTTTAT:1 + chr2L 8684453 5' - Bica 4907 1 64.55 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGAGTAGGATGTGAGGCCAGGTCG:1 + chr2L 16217660 5' - Rt1b 4952 1 28.41 ACATAATACTTTAGCTGCATGCTCCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGCCTCCGCATCGGGCACACCC:1 + chr3L 4928477 5' + Ivk 5045 1 79.35 TTGCAAATCGCCATTTATGGCGTTTTTATCTCAGTAATGCTTCCTGTTCTCCATCAGATCGGCATGATATCGAGTGAGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAC:1 - chr3R 13822408 5' - Quasimodo 37 4 83.81 GTAATTGCGGCGCATTGTCGCTGCCATTAGTTTTCCCTTACTGTTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATG:1 - chr2L 20627725 5' - F-element 4410 1 61.73 ACTAGTGTTAAAAACAACAACAAACAGACAATCAACGCAAATGTTACATCAAAAATTGCAGATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGG:1 + chr3R 3463573 5' + I-element 473 1 55.45 AAGAGTATGCGAAACTATAGGACTTAAAAAATGTCGGCAAAAACTAAGAGAAGGTCGTTAATAAATAAGGTAAAAAGAAGCGGA:1 - chr2L 12964173 5' - Q-element 510 1 57.14 GAAGAAAGTAAAATATCAGCAATATCAGCTAAACAATTTGTTAATTTCTTTAAATACTAAAATCTTCACACTACAACTATCTGATGAAACTTAAAAACCTTCATACGTTT:1 + chr4 1095509 5' + Tirant 349 2 59.09 ACCTTTATCTATACGCCAATATTAAAACAATAGAAAACAGAAACACCACCCTTCCGCTCGGAACAGATACTTCTCTTATCTTTAATTATACAAATATACTTTCTACTCCC:1 + chr3R 4635502 5' - invader2 4719 1 69.09 ACGCTTTCCATGTTTTCCATTTTAAAGCCCACCCATTATTAAAAATGTTTCGAACACAGCGCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1 - chr3R 29448082 5' + INE-1 547 1 74.16 TTAAGAATGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAACGTCTAAATTTTTATGTC:1 + chr3R 6088538 5' + transib2 31 1 52.29 CTTGAAAAAAGGCCAAAAATGAAATAGCACACACACTCGTGCTGAGAAAATTCTATGCCAAAACGAGAATCTTAGACTGCCTAATTCCTGGTAGGTGTTTCCAAAAGGAC:1 - chr3L 3496002 5' - baggins 5016 1 60.91 CACACGCAATTCCTTTTGTGGAAGCAGTCTGTTGACTTATCTTATCTTATCTTCTTCTCTTGTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTG:1 + chrX 6704713 5' - Stalker3T 203 1 57.14 TCTGATGCAGGGCAAAGAAAAGCGGTGCAACTACCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAA:1 + chr2R 4161701 5' + I-element 4945 1 65.59 GCTCTGCACTGAAAACAATTTCTTTGTATGTATGGTAATTGTAAAATTGTAATTGTTTTATCAAAATGTAAATAGAGACATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr3R 29970606 5' + pogo 2 1 75.45 TGTGTTTCATGGACTTTTATACTCTTGAGTAACGAAAGCATTGATTTACGTAGCCATTTTAATGAATCCAGTAAATCCAAAATAATGTAAAAGGTTTTAAAATTTAAAT:1 + chr3R 28616369 5' + 1360 3036 1 88.07 CAGCCAGCCATGTTCCCATATATGTATCATTGCTTGCCATATGCCATGGCAGGAGATACAAATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTG:1 - chr2R 19097007 5' + flea 4755 1 79.35 AAATATTTTATTGGTTGTCTCACTTTCAAAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATT:1 + chr3R 14543796 5' + S-element 1633 2 78.00 TGTACCATAAAGTTGCAACTCTGCATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTCTTGTGAAGATATGATG:1 + chr3L 36299 5' - Tirant 374 2 53.54 GACTGGCCAACTAATTAAATGCGTGATAAAATAATTATAGTACATCAGGTACACACCACACACATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAA:1 - chr3R 31449583 5' + 1360 3144 1 60.91 ACCTTATTTTGCTGGTTCTCGTCTCTATATCCAATATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 5638525 5' + jockey 35 1 60.23 TGCCTTCACAGCTCCCCTGGGTGCTAATTTGCACCCTGTGTGTGGGGGGCAGTGGGGTATTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGGGG:1 + chr3R 5248432 5' - I-element 4973 1 75.53 CGAAGTTTGTGTTTTATTATGTTTATTTGTATTATTATGTACACTAGTCGGCATACTTATGCGTGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCTTTT:1 + chr3L 18463419 5' - gypsy5 386 2 59.09 GAAACAACAGCAACCGCTCTGTGTAAGCCAACCAAGGAGGCTCAATAGAAGACAAGCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGA:1 - chr3R 5083929 5' + X-element 4526 1 66.00 GCTGCTACCGCTTTTCCTTCTACTGCCCTCTTTCAACGCTACC:1 - chr2R 13360658 5' + 297 6748 2 58.14 ATGCAACAGCTAGGAAAAAAAGGAATCGTTTAGCTTTCAAACAGCAACAAACTTGAAATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 + chr3R 25859592 5' - 297 370 2 54.55 GCATCATGCATGGGCCCCAGGAATAATCGACGAGGCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGAT:1 + chr3R 17271971 5' + hopper 49 1 68.18 CACATAGATGTCAATCGTGGTACAACGAAGGGGGTGTTTCCGAAGGGGTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAAC:1 + chrX 12073938 5' - F-element 4415 1 55.96 GTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTATTTTATTTTATTTTTTTTTTT:1 + chrX 12946233 5' + transib1 1900 10 61.02 GCCTCGTGCTCCTCGACAGCCAGTTCGAAGGAAATGCCCAAGAAACGTGCCAAGGTTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAGTATCGTAAGACGGTGCGAT:1 - chr2L 4980187 5' + Gypsy6A_LTR 383 1 63.00 AGAGTCAAGGGCTTGTCTACCTTTTTAATTTTAACTAATATATAACAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3L 16496761 5' + hobo 19 1 50.59 GGCAAACATAAATATAAATGGCAGTAAAGCACGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chrX 8326762 5' + jockey 4693 1 57.50 GTTAAGTGAAAAACATGGCACACAACCACGAAAAAAAGGCCACCAAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACACATTATAAGAATCTAAGAGCACTCGTATC:1 - chr2L 5513977 5' + Idefix 317 2 56.36 TGCAGATCTGTATGCAGCTTTAAACTGAGGGACTGACGACGGACGGCGATGAACACTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCTGTGC:1 + chr2L 65603 5' + micropia 474 1 62.77 AATTGAATCGTACATGGGTCTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3R 25125930 5' - 1360 3357 1 66.06 TGTATGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTGGCAAGCCAGTGGGGAAAAAGAAAAAGGAAAATAAAGA:1 + chr2R 16150601 5' + Doc2-element 252 1 78.26 AAACACAAACACTAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACAC:1 - chr2L 16071768 5' + gypsy3 418 2 60.61 ATTTTCCTCTCTCTTTCTGTGGCTTTGAGTTCCCTGGTTTCTGTTGTTGTTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTGCGAATATCACAATTAAAGAAGAAAACAGAAAAATTT:1 + chr3R 21603269 5' - Juan 77 1 66.36 CTTCACCTCTTGACGACTTTCCACGCTTCCCATTTCCATCTCCGTCTCCGTCTCCATTTCCCATTTCCATTAAAACTCCGTTATCCACAAGGAGCTTGGAATG:1 - chr3R 21727095 5' + G-element 4032 1 66.99 ATCACGTGTGGCCATGTGTCTGCATTTGAGTGCACTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 5910695 5' + roo 8714 2 70.91 TCTGCGATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr3R 13503056 5' - hopper 1396 1 52.27 TGGGTTAACAAAAGGTTCAAGCGAATTTTATGCGTTTGTCGAGGTGTGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAG:1 - chr3R 26775941 5' + Rt1a 45 1 63.64 ATAGCCTTCATAATTGAGTAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAG:1 + chr2R 18821379 5' + jockey 225 1 74.32 TTTCTTGGAATTTAGAACACTGATAATTATACAGTATCCTAAACCATTGAAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCAAGC:1 - chr3R 23307681 5' + F-element 4481 1 52.73 GTACTGCGTGAAGAAGGGATCCGTCAAGAAGACGTCATAAAACGGTCTTGCGACATTTCCCGCAGTCAAG:1 - chrX 18066285 5' - baggins 436 1 74.29 TTTATGATCCGTATCATGGTCAAAAGCCACATTCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCCCCTGCCATAAGGAACTTTGAGCCAAATTTTGTGATGAACTGCGAAACAATAG:1 - chrX 13116117 5' - G5A 368 1 64.22 GTCGAAACATTATCAGCACTGCAAAACAAAAGCTAAAACCGAAACCAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAGAAAAAAGGAAAAAGCA:1 - chrX 4293928 5' + Doc2-element 231 1 71.76 GATGTCTCAAATTTATAAATACATTTTCGCATTCAGAAATAAAATCGAAAGACAAATAAATAAGCGAAAAAGCGACAAAACAAAAAGGAATTAAAAATAATAAAAAAAAA:1 + chr2R 22553944 5' + Doc 4700 1 74.55 AACCAACACCCACCCATCCAATCCTTCTTGTCGCCTACTTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGT:1 - chr3R 11354022 5' + 1360 441 1 60.00 GTGAGCTGGATGCTCACCATTGAGGCTAACAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGATAAAGGAGG:1 + chr2R 14784240 5' + R2-element 499 1 59.49 AATTGAATTTCATTCAAACTACCCGCAATTGAAATAAGCATGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 12623711 5' + roo 39 2 65.38 ACTCTTACTACTGATTTTTATGGCAGGGGGGGTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTT:1 + chr2L 8331087 5' + hopper 149 109 53.70 TTGTGGTCCGTTTTTGGTAATTTATTATAAGGATTGTAAGTCCAGTTTTCTTGTCGCATTTGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTT:1 - chr3L 28007003 5' - Porto1 4440 1 63.64 ACTTAGACGTATGGCCTTGTCAACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chrX 12271489 5' + pogo 51 1 78.00 AGGCGAAAAAATACGCAAACGAAATAATTAAACGGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTA:1 + chr3L 6810814 5' + I-element 4875 1 70.33 CAATGGCAATTGTAGCTTCCCTGGGTATTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCAC:1 - chr2L 8047734 5' + R1A1-element 158 1 74.55 CAGTTGCCCGTTTAACACAAATTTAATTAATTGCATTCATTTCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTATGTATGTGTGCATGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 22953902 5' - accord 7038 2 52.48 TGCTTTTGAGATCAATTTCTCTCAGTGTATTTGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACAC:1 + chr3R 22594520 5' + accord 177 2 71.82 GAGAATGGGAAGTCCATCGGCCAATTTTATTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTA:1 + chr3L 25987945 5' - Ivk 5332 1 73.00 ATGATATGCAGCTAATTCGCAGACACATTCGCTAACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACAC:1 + chr3L 7408702 5' - baggins 4956 1 55.26 ATTAGCAGTTTGGTAATTCAATTAAAACGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGA:1 - chr2R 21199728 5' + jockey 16 1 59.05 GATGCTCCCTGTCCTGGCATTCACTATCAAGGGATTATAGTTCAGAACACTGGCCAAATCCACCAATCAAGTCGAAGTCACACAACTTCG:1 + chr2L 4934958 5' - invader4 2689 1 68.89 AGGCAAAAACAAAAAAAAATAAAGAGTTCTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGACCTGCAAGGGTGGAACTTTTTTACAACT:1 + chr3R 26733975 5' + hobo 13 1 67.31 GCACTTTATAGGTATTTTAACGTTTCCTATCTTAGTTTTTTTTTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACATTAAGTGCTCAAATCTT:1 - chr3R 10224140 5' - Doc 4640 1 68.18 AAAATACTCGAGCGATATGCCAAGTGACATGTGTGCGAAAATAAAAGCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAG:1 - chrX 23004074 5' + roo 9049 2 56.88 AAGTCGATGCAATCTACCTTAGATTTCTTGCTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3R 21612957 5' + jockey 12 1 65.82 AAACAATAAACAGTTTCCTTTGTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAACACGTTATAAAGA:1 + chr2L 10990994 5' - Tc1-2 304 1 80.49 AAGTTTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCAC:1 + chr2R 6984291 5' + HMS-Beagle2 6891 2 73.64 CAATAATGTAATATTTTGTATCCTAAATTATTCGCCTATATACCATATAGCATATAGCATATGTACCACACACAAACAACACACACACACATATTCACACATCTTGCGTG:1 + chr3L 20342083 5' + accord 199 2 79.09 CATACATATTTACCTTGATTTTCGCTGCACGTATATTTATTTTTTGGCTTCTGTTTGTCTTTCATAATTATGTTGAAATAGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTC:1 + chrX 7055055 5' - diver 5778 1 60.00 CGTTTCCTGCTCTATATAGTCCCTATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAG:1 - chr3R 7436610 5' + springer 41 2 75.79 AATTTGAATATGTAAAAAAAAATATATTTTTTTAAATGTTCTATTTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGA:1 - chr2R 3091320 5' + Doc 4437 1 59.09 CAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCA:1 + chr2R 5532366 5' + Doc4-element 5 1 51.06 TGATTTAAGAGTCAACTTACTTGTGTCATATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTAT:1 - chr2L 15794671 5' - I-element 4932 1 72.00 TATATAATATATAATATATAATATATAATATATAATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACAC:1 - chrX 3391433 5' + Idefix 48 2 93.64 ACATGATTAACTTAAACGTTTACCAACTTCACATGGTCAACAATTGGCTAATTTGTGAATTAATAATAATTGGAGTAGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTG:1 - chrX 3665916 5' + invader4 236 2 76.36 CAGCCGATTAAAAAAATTTATAATGAGCGACGACGGCGACGACTGGCAATGGATCGAAGATGAGAAGTATTTGAGGTCCTGATCAGGATCAATAACCGCGTCGA:1 - chr3L 10711857 5' + INE-1 94 1 64.42 ATTGAAAAAAGACGGCCACACGTACTAGAGGCCTGCATAACACCATTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3R 21217227 5' - 1360 3372 1 48.31 TCCTGATATGGGACACGTACGGTGTCCGTCGTTTTTTTTTTTGATAGGGGCTTTTTTTCTTTGCTTTGGGG:1 - chr2L 14999676 5' - Ivk 248 1 56.34 CGCTACGATTTTCGCAAAAATGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 8621735 5' + jockey 20 1 56.10 TCATATTCCGATGCCTCAGCTTCTATATTGCCCTTGTGGTTTCCTTTTTTTTTTGGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTTGTGGACAATAAATAAATTT:1 + chrX 21421264 5' - G2 3025 1 56.36 TATTTTCCATCCATTACAAATTAGTTTCCTTCTCTTCTTTTTATATTATTTTTTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCACATCT:1 + chr2L 5947800 5' - Doc 4641 1 60.91 GTTTGCCCTCCTCAAATGCCTGAAGAACTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTAC:1 + chr2R 24614697 5' + GATE 8273 2 62.26 AATAAACAACATTGAAATAATATTGTAAAGCAATCATTAAAAACTAAAAATGGCATATAAACATTATGCTAAAGTCATTGTTCGCTTTCGGTTGGCATTCTCTCTGA:1 + chr2L 15740940 5' + invader2 4938 2 56.07 AAAAAGAGACTGCAAAAATGTTGAAATGTACAAACGAAATTTTCGTCATAACTTGGCTAATAATCAATGACGAAGTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chrX 13966949 5' + F-element 24 1 37.27 AATCGAAAGTGAAGGGGAACAGTCCCAGTAGCCAGGATGCGTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAG:1 + chr2L 1756340 5' - I-element 5054 1 58.59 CAGTTTCTCTTCAGAGTTCGCGTAGAAGTGCAGTATGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGCTACGCCGAGAACTTGAGCTGCG:1 + chr2R 12286066 5' - Quasimodo 237 2 54.35 CACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 - chr2L 16071771 5' + gypsy3 419 2 55.26 AATTAAATGTTGCAATTGCTACTCGGGGGATTTGAATGGCGATGGTGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTC:1 + chr2L 15101260 5' + I-element 402 1 56.19 CCACACGTAGCGTTTATTCCTATTTTATTTTATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1 - chrX 8364720 5' - jockey 4936 1 77.27 TTATTGCTGTTGTTTCACAGCGCTCGCAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2R 21592003 5' + Tirant 8 2 56.14 AATATAATTTTTTTGCTCGTGTAACGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGC:1 + chr2R 19166647 5' + FB 63 1 86.36 TGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr4 96892 5' + 412 7095 2 75.00 ATGGCTCATATCCCCCATAGGCAATACCCACTGTTTTCCTCATCACGGTCCTTTATGCTTCTCGCTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCGCTCCTACCCGCGACCAGA:1 + chrX 17621898 5' - invader1 3731 2 51.82 CAAAAAAATCCTAATCATCACCTTTAAGATGTGTTCAAATAATAAACATACACACTTTGAAACATTAAGAATGAAACTACTTAAAGTTAAAAACATATAAACGAATAAA:1 - chr2L 9162992 5' - S2 108 1 85.32 CAAGGACAAACTGACATACATCTACATGTACACGTATCTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAAC:1 + chr2L 12817531 5' - accord 7084 2 54.67 ATCCTCAGCAGAAGCTTAAGCTGTACATGACTTCACTCACCTGTTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCG:1 + chr3R 7901344 5' - Bica 268 1 60.91 AAAGGTTCAGCATATGAGATGAGGGATCGGAAGCTAATGGGAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTGATCGC:1 - chr3R 12040213 5' - HMS-Beagle 210 2 51.92 TGTCGTTTCTGCCCCCCTTCCCTCTCACCACAGCTACCTATGTACTCAAGTTGTTGGCTAATTACGTGTCTGTTGCTGTCTCTTTCTTTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7561724 5' - Doc2-element 233 1 76.36 CTTAGATTTCTTGCTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCACTCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chr3R 21612940 5' + jockey 34 1 57.14 TTACCAATTTGCATCTCAAAGGTAGTTAATTTCAGATCATATTATGGAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCA:1 - chr2L 7750619 5' - opus 496 2 59.15 GTTTTATTTCCACTTTTGTTTCACTTTTTATACCTCGTAAAAGGCAAGGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCAACTTCCATTATTTCACAGA:1 - chr3R 14139152 5' + 297 28 2 53.85 GCCTTCACGTTGGTTAGATACAGCTCACCTCTAGAGTGCCAGATGTTTTCTCGGGCCAGGAGTGGGACTGCAATTATTGCGGGGTGTTCACATATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 27795419 5' + roo 4 2 74.31 TTCGCAATTTTTTTATTTGTGTCAATATATTGTTCTCACAGTTTTCATTTTACAGTTTATTGTTTTGTATTATTGTATTTTTTCGCTATTTCCCGAATCCTGTCTCCAAT:1 + chr2L 15820202 5' - jockey2 3051 1 64.55 TAATTCATAGAAATCCATTTAAGACCTTTTGTTTCCGAGTTTATCATTCAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACTATTTGTACATTTAGCAATTGATGTCC:1 + chr2L 20300331 5' - hopper2 1268 1 53.64 TAAAAATTTTTATTTTTCATTTCATTTTTGAGTGACTCTGGGATTTCTTTAATTTTATTTTTATTACTTAATATAATTACTTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCTG:1 - chr2R 15311395 5' + diver 5894 2 75.23 GTTATATGCGTCAGATAATATAAGATTACTTATTTACTTGCATGTAGATCTAATGTATATTGTCGGTGGCGTGTATAAGCTCAGATGTATAACTTTTATTATATTTTTAG:1 - chr2L 18792120 5' - Transib5 137 1 68.18 AGGGCTCTGCGCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr2L 16742249 5' + 412 36 2 63.64 GTTTTTCATATTCATTTGGCCTTTGAGGATCGTATTCATCGGCAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGGTCTCAGAATCTTTGA:1 + chr2L 23067946 5' - F-element 4334 1 50.59 ATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 76.36 ATAGCGCATATCACCACACACACTTTTGTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3L 17220742 5' - opus 470 2 67.06 AACATTTTTTTCCCCAGGTCACAGAGATTTCCATAAAACGCACAAATGTGTGTGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTCAAT:1 - chrX 19989766 5' - accord 7090 2 64.58 GCTTATAGTTACAATGGTTAGATGATATACATACTTTACATTTAAAAGTACCGAAAACATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 - chr3R 25635983 5' - I-element 5332 1 51.85 CTCCATTATCGCCGGAGCAAAAGAAACGGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAGCTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTG:1 - chr3R 14723753 5' + I-element 445 1 67.39 GAGAGTGGAGTGTTCATTAGTAAGGTGAGATATCTCATAGGCGCAGAGAGTTGAGGGTGTGTTTATTGTGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGGAGATGGATTTGGCGCGC:1 + chr3R 30170706 5' - Porto1 413 1 56.36 CGATTTTAATTCAACACAAACAAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACACGAACTCAACAATC:1 + chr2L 7626676 5' - hobo 333 1 77.98 TCATTGTATTCGCCTGCTCTATCACCAGGTGGGCGGGCGTGAAGGGCTGGGCAAACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTACAGCTG:1 + chr3R 32058998 5' + diver 18 2 68.89 GAGTCAGCCAAGGATGCTGGGGAGAACGGTAAAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 17153580 5' + 297 6620 2 68.00 GTCAGAGTAAGATCAGCTACGCTTCTCTTCAAATAGATGATATCCAAGCGAGCAAGCACTTCGTTAATGGCCATTTAAATAATAATAATAACGTCAGAAGAATTAAAA:1 - chrX 13310756 5' + G4 3672 1 75.00 GGTCCCACAACTTCGATGTTTGTGTATTCTAGTTGTATTTGTTGTTGAATTGTTTTTTTTTTCGAAACGGAAGGAAATCAACTTGTAATTTTTGATAGGGGCTTTTTTT:1 - chr3L 19939896 5' - Ivk 261 1 71.56 CAACGTTATGATTCAAGTAGGCACCTTGAGAGCCGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAG:1 + chr3L 25637111 5' - 17.6 7092 2 70.41 AATAAAAAACATTTTCAAAATATGTATGCAAAAGGTGTTTTTTAGGAGTTTTATGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAA:1 + chr4 1220924 5' + INE-1 146 1 50.54 TTTAGTTATCCTTCAACGCTCCATTTGCCTTCCTTTAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chr3R 16194519 5' - flea 4980 2 63.00 CCCACGCGCCCGTCGACGGATGATTCATGGTGTCACGGTGTCAGTTACCGACCCATCGGTACCATAAACCACCACGCCTACACAAGTAGG:1 - chr2L 18750680 5' + ZAM 8006 2 53.33 CCAGAAAAAAACATACACACACACACAAATTCTATGTAGCTAAGCGAATTTTCCAAAAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGACACCCTTTATC:1 + chr3L 7846444 5' + 3S18 5792 2 60.00 GAACTTCAAATATACATATGTACGTATGTGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACAT:1 + chr2L 5304859 5' + flea 43 2 77.32 GTTCAACATTAGAAGGAGATAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr3L 12677116 5' - pogo 2058 1 77.66 CATTGCTTTATAATTAAATCGTTTCAACTTGGTAGCCGCTACTAGAAGCTACTAGACAAGACCATTAAAGGGTTGTAATAAACCAATATATGCCA:1 + chr3L 25414150 5' - blood 7389 2 76.84 GATTTTCTTTACCCCCTCCCCACATACTGCTCCCCATCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCA:1 - chr3R 8391962 5' + 17.6 61 1 66.67 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATA:1 + chr3R 21907536 5' + 412 1 2 26.36 CTCAAAGTCATGGCCGTCGTGCTAACCATTTGCTTGGTGTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGAT:1 + chr3L 1416747 5' - F-element 4316 1 63.89 GTATCTTTGGTCTGTGTGTGAGTTTGTGTCTGTGAGCATCTTTGTATCTATCGGATGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATAATAAAACTAAA:1 + chr2L 18459984 5' + copia 194 2 65.26 GCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGTCTCGATGCAGGTA:1 + chr3R 23861067 5' - pogo 2067 1 58.18 ATCATTAGCATCTTTTCAGAAATTAATTCTCTCGTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAC:1 + chr2L 8892247 5' - G2 3012 1 69.09 TTCACAATCTCATCCGACTGGGGCTTTTCTATGTTATGCTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATA:1 + chr2R 20789947 5' - 3S18 294 2 63.64 ATTTCATCCCGCCGTGCGTTTTACCCTGTTTATCACCATATTCAACTTAGCGGGAACAACCCGGAATGCGATAATAGAATGTTACCAGTCCACGCTACTGTCT:1 - chr3L 11451094 5' + HeT-A 5861 1 75.73 GTCAAATCGATTAAATAAATATGTCGGTAAATTAAAATGAAATTGTCACGCACACACACACACACACACATATACAC:1 - chr2R 15569063 5' + accord 187 2 75.32 GATCTCCTTGTGCGAATTGTCAACAGGACGAGGCGCGATAATTTGTTTTAATTTTTGTAAACATGTTGGCATCAACACATGTGTGTTGAATAAAGGCAATT:1 + chr2L 18778892 5' + 1731 4337 2 44.55 AGCTTGGCCGCAACATGTAAACCTATAGGCATACGAAGTGCTCATCTCAAAGAAGCTGGGCACGGAAAAATAGAATCGTTTGCCCATTTTTACCAACCAATTAGTTTTTT:1 - chr2R 5303381 5' + FB 80 1 71.82 GAGGTTAAAGACACAACAAACACAGGCAACACGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr2L 9171513 5' + opus 27 4 56.36 CGGTTAGGTAGCGAAACCAAAAGCAAAGAGATTTTTAAAAAATGTTTTGTTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAAT:1 - chr3L 1400019 5' + 1360 3146 1 69.52 GTCGGGCTTATCTCGTAATGTTTATGAAAATGACTATAAATACAATACAAAAGCTTTTTTTTGCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTT:1 + chr3R 21612883 5' - jockey 4990 1 59.14 ATACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGNCCG:1 - chr3R 14357338 5' - Rt1b 5098 1 72.83 AAAGTAAAGAAAATAAATACAAGCACCAAAATATACATTTCAAAACTCAATGAGAATAAATGAATATGTTTGAGCAGCTGAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAA:1 + chr2R 16500730 5' + invader2 4769 1 74.31 AGTGACACAGACAAAAGACAACCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr3L 14755028 5' + P-element 46 1 27.96 CTGGTTTTATATTGCGGCTGACACTGGCCAATATCTATTAGTTAGTTTTGCTCCTAAATTTTAAAAATAAATAATTTTAAA:1 + chr3R 25905405 5' + 1360 3028 1 67.90 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGTGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 204 1 67.27 GTCTTATGATTTATTCTTTCCTTATCTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTT:1 + chr4 310577 5' - I-element 4910 1 72.92 GATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr2L 23295844 5' + micropia 20 2 66.20 ATGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3R 8621716 5' + jockey 35 1 64.10 TTGATGGTGTAGAAATACAAACAATACCAACCATCTTTGAAATAGCACAGTGAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTCGACTGCATACTCGG:1 + chrX 8491212 5' - Doc 4522 1 51.82 TGCTTTCCTTTGCAATTGTAATGAGATTCAAGCAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTA:1 + chrX 20830947 5' + 1360 3273 1 70.91 ATCCGACCTGCAGGGGAGGGCGAGAGGTGGGCGGTAGGAGCCTTTTGTGAAGGTATGATGTGTAACT:1 - chr3R 19217352 5' - Tirant 8474 2 52.24 TTTCTCAATTAATTGGCTCCAGCCCACGCTTTTACTTCTGGCTTTTTGCTTTTGGCTTTTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 17405775 5' + roo 9 2 76.84 GGCTTCAAATGCAAATTGACTTTTTACTTTCACTGCCTGGCGTTCTTCTTTTTGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTG:1 + chr3R 6537307 5' + R1A1-element 38 1 56.57 GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATGCATGTTGCAAGCGACGCGCATTCAGCGTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATACAACAAACACTCACCTGCAATGTTTCCTGAG:1 - chr4 1294994 5' + TAHRE 10060 1 78.18 AGCGGCCAAGCGACTCTAACTATTGTGTAATGATGAACTCTAATTAAGAACCCAAGTCCGTTTTCAGTTGAAGGCAG:1 - chr2R 23230633 5' - 412 463 2 61.04 CGGTGGGGCTGTTAACCGAACTAATTCCGAAATCAGCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 3528630 5' - roo 391 2 56.96 CACTCGGCAAAAACAATTAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTC:1 + chr3R 10085647 5' - R1A1-element 330 1 50.49 ATCTTCATATAGGACAAAAAACAAAAATTCAAATAATTGTACCTACATATTGCATTCTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGAGGAACAGAATTCATTCTG:1 + chr3L 15859084 5' + TAHRE 10400 1 78.70 AAACGCAGGCAAATGTTGGTGTGATCTGTTTGTGGCATGGGTCACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCG:1 - chr3L 10809266 5' + I-element 141 1 60.91 TACGAAGAGAGTGTGATTGTGTGCAACAGCACGAACGCATACTTCGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 13228545 5' + P-element 10 2 61.25 CTCAAGCTTTTTCGAAGTTCGATTTCACAACAGGCGACAAAATTCTCAAGCTTTTACTCATGTTCTAGAAATGTCCCCTTCTGAAGGTATTAATTTTCTTCCTCAGATTT:1 - chr2R 14360341 5' + Gypsy12A_LTR 2061 1 70.91 AGGAAATGTTAGCTACGGCATTAAAGATAGTTGATTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 - chr3L 27971508 5' - 297 346 2 65.17 TGGGATCCTATTAAAATTCGAGCAGAGCAACAAGCCATCGGGGTCACTTAAAAGTCGATGGATGGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGT:1 + chr2R 20448205 5' - Circe 301 1 67.42 TGGCATGCAACACTCTTCGAATGCACTCGCGGTTGGAGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr2R 6707696 5' + 1360 28 1 60.22 TGATCAACAAGCACGATGGAAGTGCAACAACTACTTCTAATCGTAGCTATTGGACTCGGATTGGGTAAGAAAACATATATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 - chr3R 28640019 5' - mdg1 418 2 77.06 CATGCACAGCATCAACGCACAGGTGTGCAGATGCGATGATGTCGAAAGGTGAGGAACGGAATGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAACA:1 + chr3R 8373079 5' - rover 7106 2 59.09 TATTCACATTATAAAACAAACGAAGTCTGTGTTATTGTTTACTTAACAGCTGATAGATAGCAACAGGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATG:1 - chr3L 16234128 5' + Bica 72 1 73.33 CCAAGTTGATTTGCTAAAGTTAGTGTCCTAAACCTTTGGGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGC:1 + chr4 967660 5' + micropia 5184 1 62.50 AAATGCGACGCAATCGAAGGACTCTGCCCACTTTGTTTTCGTCCAATAATTTAATTTTATTTTTAAT:1 - chr2L 11397357 5' - NOF 3956 1 91.04 TAGAATCAAATAAAATATTGAATCGAAGAAAGTACGTTATTTTAATTATTGTGTTTCCTCCATCTATTGACACCCCCATACCGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTA:1 - chr3L 19888794 5' + 17.6 7073 2 64.55 AAATTGCCCATTTTTTAGTACAGAAATGTTTAATATCGCTGTCTGTTTGAGTTTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATTTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTC:1 - chr3R 5087866 5' - Bica 428 1 52.73 TGCAGCCGAGAACTTGGAAGTTAATGCTAAATTTAAGATACACAAAAGCGGGCAACCGACCCCATCGCTCAAGAAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCA:1 + chr2R 25016851 5' + Doc3-element 4387 1 67.89 AAGGGTAAATAGTGCCATTACAAACCGCTTTATCTGCGGAGCCTTTCGTCACATTAGTTTTTACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAAT:1 + chrX 15043091 5' - S-element 1702 1 65.45 AACTCTTCGTCAAACCATTAACAACAGATTTAGAACTATTCACTTTTATGTCCGCGTGGGCTGGGCCCATAACCTATTCGTTTCAAGTATTTA:1 + chr2R 8114716 5' - Dm88 180 1 69.89 CTTCGCTTGAGCTACCAGGCACTTCTGAGGTCCCCGGAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 217378 5' - roo 9028 1 66.36 TATTTTGGCTGGGAAAGTTAAGCCAAAGAGTGTGGAAATGGAATCTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr2L 17545828 5' - opus 483 2 60.44 GAGCCGAACTGTGTGCCTTCTCAAGGCGCTGATAGTGCCGGCTGAATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGG:1 - chr3R 28842611 5' + Quasimodo 490 2 49.43 AAATAAAAGACTAAGCAGACTTTAGTTTCATTAAATTCTAGCAGCGTTTGCTTGTTTTTAATGATACTTATATCAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:2 - chr2R 12416959 5' + pogo 16 1 66.36 ATATATTCACTTTAAAAAATGTATGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAA:1 + chrX 13495529 5' + Max-element 8237 2 55.10 CGCCAGTTTGCCATATGCCTTTCCACTCCATATAGAGGGGATCGCTTCGATGCTCTCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 27403679 5' + hobo 29 1 54.55 AAAATCAACAACTAGTGGGTTTCAATTAAATTAGTGCAGATATCTTATAAATTTATGCTTAAAACCTTTTTTCATTCAAAAAATTACT:1 - chr2R 15602901 5' - S2 1370 1 77.27 GCCCCCTTCAGCCGGAAAAGAAACCCTTTCGAGCCATAACTCAGATGGCTAATTGTTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCATCTCAAAGAAGCTGGGGTAGGAGAAATCGA:1 + chr3R 22595781 5' + FB 10 1 70.00 TCAACTTTTGGGCCAGGCCAAAACACATACAACTACGTATGCATATATACACTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACACTAATGTG:1 - chrX 15227696 5' - hopper 1396 1 59.60 CATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTCTCCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr3R 23861087 5' - pogo 2057 1 68.00 TAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACG:1 + chr2R 1320705 5' - diver2 4846 2 65.45 TGCCCTGCTTTCTATCCCTTTTTCTCTCTTTCATTCGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTCTAATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATCAGGGATTCCTAAGTCT:1 + chrX 705836 5' - G4 3560 1 66.67 GCCGTCTGGTCGCTGGAAGCCAACAACACTCACAAACCAACAAAACACCAACAAAAACACAACACAAAAAAAAAAACACACAACAAAAAACACAAACACA:1 - chr3R 23707017 5' + gypsy3 419 1 38.00 AATGACCAGGCATCTTCTGGTGCTTAAATTTTAATTTTTTTTCTCATTTTATTCTCCAATATCTATAGATATCCCAGAAAAATGGTGAAATT:1 + chr3L 14351778 5' + INE-1 510 1 66.30 GTGGTCCTTCCCTTTGTTTCCAACAATGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTT:1 + chr2L 13440147 5' - I-element 5083 1 71.11 CGATCAAAGAGCTAACAAAAAGCGGAGCACCGAACTCGAAAAGCAAGGGATCTACACTGGCTTATAAACGTTCACTCTCCCG:1 + chr3L 13060029 5' + Doc3-element 4249 1 53.66 CACAGTGGGCAAAAATATATGGTTTATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGA:1 - chr2R 15155247 5' + flea 4810 2 81.65 GTGCTTTGTCTTAGAGGCGGGGCGATCAAAAAAAAATTAAAAAA:1 + chr3R 29583881 5' + R2-element 3581 1 88.64 GCCCAGTTAGCTGCCTAAAATATATTGATAGGTTAATTGATTCAGAAGTATCTATCTGAGATAACCCACTGCAAGCGGATACACAATCTATATATGTATATACAATATAT:1 - chr2L 10470203 5' + Stalker2 7507 2 54.55 CACACTTGGGTAAAGGTCATATTCATACCTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2L 12591738 5' - roo 9016 2 76.42 ATGATTCGTAGTGCTCCGGTCCACATTCGTTGCAGTTTGGACCCGCATAGCCGGGATCACATTTGCAACTTTGAATTTTATTTACTTACTTATTCTTCACTATTAATTAA:1 - chr2L 103092 5' - looper1 331 1 63.64 AGGACCGTTGGTCTGGGTAACTCTAGGCCTCGTTGACAAAGATGGCTTGGTCGCGAAAAACTGATAGAGCACAAGAGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chr2L 6243760 5' + 412 10 2 70.75 CATTTTCTGACTTTCTGTGGAAACTGATGAAGACTTGCCATTCGATTCGGCCTGAGTTTTTTTTTTCTTTTCCTTTTT:1 + chr3L 12777252 5' - Doc2-element 239 4 76.92 ATCAACCTTTTTTAAGGCTTTCCTCAAATTTTTTTCATTTATATTCATTCCAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAACATCTGAAAGCGAAAGA:1 - chr2L 16606833 5' + F-element 106 1 50.50 GTATTTTTAGCCAGCGAAATGTAACAAACGTTTGACTAACCAAACTCCAGCTGACAGATGTGGTAGGATGAACACCCATAAGGCCCACGAAGCATAAGAA:1 - chr3R 22500886 5' + invader3 21 2 60.00 GTCCTGAAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGTGGGTGCAAGCTTTAG:1 - chrX 21175370 5' - Gypsy12A_LTR 2215 1 57.89 TTAACTAAACCGCATAACGGCAATCTGAAGGATAGAAGCGTTAGAAGCAGAAGAAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGAT:1 - chr3R 24095643 5' - 1360 3203 1 61.39 TACGAATACATAAATTCATTAATAATGCCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr3R 31633119 5' - opus 485 2 67.92 CTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGCTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 - chr2R 19405970 5' - HMS-Beagle 7022 2 60.22 GAAAGCATATTACTCAAGTTGGCATGGACATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCTTTATTATTGCAATTTCT:1 - chrX 5859369 5' + BS 55 1 62.96 ATGCATTGAAATTGCTAAGTATGTAATCATAATATTTTTACTTTCTGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACTGAAGGAATCTTCTTACATTTCCCTTCTTCA:1 + chr2L 9141328 5' - invader4 217 2 58.18 AGAGCACGACCAACTTTCTAACCAAATTACAGCAACCTTTTGCAAGAGTAGAAAAAATATAAATAGGTACCCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 - chr3R 30298398 5' - copia 240 1 57.80 TGGATTGAGTGTGTACTATACTCGAATGTGTGCGTGTGTGTGTGAAGTAGGAGTTGTGCATTCCCATTTGCGCCACTCAAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTG:1 - chr3L 17294371 5' - I-element 4919 1 73.64 TTTGGTGTTGGTCTTTTTTGTTTGTGTATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTAC:1 - chr2L 19832177 5' - TAHRE 10374 1 74.31 GTCCTATTGTGTAACCAACAATGTCTGACACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAAAAATA:1 + chr2L 7936318 5' + I-element 4922 1 66.99 AAAACGATGACGCGGGGATAAGAAAAGTCAACAGAGGTTTTCCCGGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGAAA:1 - chrX 3628626 5' + Doc 4533 1 72.86 ATTGAGGTTGAAAGGCGTAGGTACAATACGGTTTATCCCAAGGATGGGCCAAAGGACTCTCCAGTGTGTGAGTGTGTTTATAAGTATGTATATGGAATTTTATGCGTTG:1 - chrX 4453933 5' - ZAM 8143 2 70.64 GAAGTCTAGATGTGCTAAACGTTTTCCCTTAACCTTTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 24867502 5' - roo 388 2 65.82 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr2L 16217660 5' + 412 7091 2 68.09 AAAAATATAACTGATATGATTGCCAACTACCCTGCGACTATGTAAACCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACA:1 + chrX 350004 5' + HeT-A 5979 1 58.18 GTCAAAGCAAATCAACAATTTGTCACGGCATTTTGCATTGAATTGGAGCAGGGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAG:1 - chr2L 19898505 5' + R2-element 59 1 54.37 AAAAAAAAAAATTATTTATTTACGGATTTGCTTAAGGCGTATGTTGGCCTGGATACGCTTTCTGTTGATGTGCGGTCCCCTGGCCCTTACTCAACATACTTAATC:1 - chr3R 31848546 5' + G2 2941 1 42.86 TAAACGAGACCCCAAGCTTGGGCCCTCCGCTTCGAGGCTAATTTAGTCATATTTTCATTTTTCCCTGCTCTTCCACTAGCTAATTAACGGGGATCTGATAGTCGAG:1 - chr2R 11055989 5' + INE-1 552 1 58.49 ATTTAATAAATGTTGCATGACTTTATGGACTCCTCGATTTCCCCAAAGCGAAAAACATATTGATAAACTACCGAGCCGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAA:1 - chr2L 4092317 5' + 412 401 2 77.14 GTTTAATCTTTGATGCCGGCGACACATTGGGCCCAAATTGATTTTTAAAGTTATCAGCGAGCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 20167909 5' + 412 23 2 59.63 GTCAAATGCAGCTTCACAATTTGATTGCAATCAACATAAAAGTAATAAAAGTAAAAAATAAATAACGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAATTCTACACTT:1 + chrX 10541454 5' + TART-A 13186 1 63.46 GGTTTTGGCCTAGGTTGTCGCATTAAAAATGATATCCTAAGTAGATTGCATAAATGCCTGGGCAAAACAAACAAACAAACAAATAAATAAATAAGA:1 + chr3R 18337405 5' + Juan 4215 1 58.33 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAG:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 204 1 65.38 CTGGACCGATGCGCTGCTCCTCCAACATGGCGCATATCCGGTTCTTCGTCTCCTGAACCATAACTGGGGCACCGTGGTGCGTTCGGAACGAAAACATCCAATGAGACTTA:1 - chr2L 17504793 5' + F-element 4381 1 50.91 TATTGGGCCCGGCACACACATACAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCAACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGTATTTAT:1 + chrX 13381078 5' + baggins 5333 1 75.82 AATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGAAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCACACACAAATA:1 + chr2R 11274014 5' + Stalker2 67 2 79.09 GGGAAGTTGCAACGTGTACACATAACAAAGTCAATTTCAATTTTCATAATAACTGATTTATATGCATATGCATATATATTTTATATATATATTTTTTTTCTATATGTTTT:1 - chr2L 8508514 5' - invader5 3606 1 77.27 CAATTGCTGAAATTAAGAATTAACACGAAAGAATTCGGTTAGAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCACTAGTGGAGCGCCAGAACGAACAGG:1 - chr2R 21874625 5' + Juan 206 1 53.19 ACGCATTACACACACATGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAGGCGTAAACGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAG:1 + chrX 4262999 5' - Tirant 8444 2 79.44 GATGATTCTATCTGCTGTGATTCCCAATGTCAGTCGGCAAACGATGCAACTGGGGTTCTGGTTGCGAATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 19051919 5' - accord 188 2 70.24 TAGCCGCGCTTTTCAAACAATCGCCGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTA:1 + chrX 17456070 5' - jockey 4929 1 76.36 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGAAA:1 - chr2L 16217660 5' - invader4 2647 1 46.36 ATTGTTTTTAGAAAAGTTTACAAGACTAATAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCGC:1 + chr2R 15855685 5' + opus 7030 4 64.71 AGGTTAAGCATTACATTTTAAGCAGTATTATTTTAATTTAAAATGCTTGCCAATATGAAAAATTGTTAAGTTCTTTTCAATGTCTTTTGCCCACAAACAGCGCAAAACTT:1 + chr2R 5509517 5' + INE-1 230 1 50.91 ACTTTAAGTATGTGTTGCGCGCTGATTCCAATTAGCAATATAATTACTTTAATAATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3R 7833108 5' + Doc 34 1 55.45 GCCAGGAAAGAGACCCACTAAAACTTTATTGGATAGATCATGATCTTGGTTAATGTCGTTTCAAATTCAATTTCATTTAAAATTTTAAAA:1 + chr2R 13759778 5' + 1360 3049 1 74.44 CATTTTAAATGTTTATTTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2R 13313415 5' - hobo 2936 1 67.39 GTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAA:1 - chr3L 19339430 5' + Tc1 34 1 53.64 TTTTTGTGTTTAACGTAAACTTTTTCAAATTTTTTAAGGTTACGTTTATACTAATACACTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGC:1 - chr3R 556531 5' + Tc1-2 23 1 50.00 GGAGTTCCGAGATGTCGAAATGCTCCCTCGCCACCCAGCCGATATAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 + chrX 7677120 5' + jockey 4698 1 55.10 ATGTGTGATATGTACATGTGTGATACAACTTCCGGTCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 + chr2R 14661104 5' - hopper2 1560 1 64.55 GATTGCGATGGTGCAAAGGCCGGGGAAAACGAATCATTTTAACGTATGTAGTTAATATATGTTTAGTTGTACTGTTTTTCTGTTGTGTAACATCCACTTAATGTGTAT:1 - chr3L 12985760 5' + transib2 349 1 64.81 GAAACAAAACATGGTATGAATTACTTCATTATGTGGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGATTA:1 - chrX 1782796 5' + copia 5078 2 69.09 CGACTGCTGTGCTGGGGTTAAGCCACGTGTTTCACAATCGGAATGATTAATCTGTTCTCTAACCAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTAG:1 + chr3L 23241854 5' + 1360 26 1 59.09 TCAACGCATTGATGCACAGAGAATAATTTTACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 - chr3R 26398931 5' + Doc 19 1 50.00 ATGCACTCGCGGTTGGAGCAGCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGG:1 + chr2R 6707716 5' + 1360 47 1 81.52 TATGGATCTGTCGGAATAACATTCTACGCACTAACTCAACAAGTATATAGTTTTTCCTATCTTTCATCTGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAAGC:1 - chr3L 17829767 5' - Bari1 105 1 65.66 GAGTAAGGGGTGGTGTGCGGGAATGGGAAGTATCAGAGAAGGTGTTGGAGCTAATATGGCTTTTATTAAAAGAGCCTTAGTTGCTATATGGAGTTTGCTTGAGTGG:1 - chrX 17429493 5' - G5A 2364 1 59.43 TGGCAGTGCGGCATCTTCTTTGGGCCAAGTGGTAAAATGGGTAATGCGAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAG:1 + chr3L 20869949 5' + micropia 5292 1 59.14 TCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 21034098 5' + 412 7095 2 73.86 ATAAATTTGATGGGACGAACACATAAACTCCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATAT:1 - chr2L 19129409 5' + FB 23 1 57.01 TTCCCGTTGCTTTTTTGTTTTCAGTGCTTTTCCCATTTTTTTTTTTATTT:1 + chr3L 8441084 5' - Bica 336 1 62.00 AGCGAATAAACATCGAAAGCGTGCAAATTCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAA:1 + chr2L 14049918 5' + Ivk 303 1 70.41 CAAAACTGAAAAATAACAGAATCAGGCAATAGCTTCATTATAAAATGCAATGAAATGGCAAGATTTTAAAAACAGCAATTATTTAGCAAATTAGATATTAACTAGATTA:1 + chr2L 10145589 5' + I-element 5241 1 64.22 ATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1 - chr2L 16067135 5' + HMS-Beagle2 44 2 66.67 GAATGCAGAACATGTGTGTGAAAAACGAGGGGCGATAAGTGAGAAAAATTGTGCAGATAGGATAAGATAGGATCAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAA:1 + chr2L 8282939 5' + Stalker3T 203 1 53.64 GACTTGCCCCCAGCACATCGACCGAGGAGCTAAACCAAGAAATGGCCAATCTGGAGGGCCTCATGAAGGATCTAAGCGCAATCACGGAACATAAGGAAAAATACCATAGC:1 + chr2R 12563013 5' + F-element 4435 1 77.27 TTTGAGTCGCCGCAGCTGTGGTCAGCAGATCATCATCATCATCGTCGTTATCCAAAAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACA:1 + chr2R 10501433 5' + 17.6 7219 2 52.94 TGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 8621715 5' + jockey 20 1 56.45 ATTGCGTACTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr2R 11379716 5' + jockey 4689 1 57.89 CTTTATACATGTGTGTTTGGTTGGAAATAATTTACACTTTTTGGTTGCCTTTAGCTGCGCTGTCGGCTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGAT:1 - chr3R 5267891 5' - Q-element 118 2 76.09 ACTTTGGGTGAGCTAAGCTACCATCAAAATGTAGTCACGAATCTCTAATACCAAAGTCCTTTTTAAACACAATTAATATTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATT:1 - chr3R 29362875 5' - F-element 4668 1 73.64 GCGTAATTCCAGATTCCACAATACTTTTTTTTATTTTTTATAACTT:1 - chrX 3091774 5' - TAHRE 10442 1 52.17 TCAACCTGACAAGTTCGACAGAAGCTATGCACAGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 - chr2R 23354365 5' - Tabor 7296 2 50.91 TTATAAAGTTATTCAAAATTTGAAGAATCGTATGATATGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAAGAGGTTAATAGCCAGA:1 - chr3L 19136313 5' - G-element 4125 1 62.73 TTTTAATTTAAAACGGATTCCCAAGTTGCGTTACTTCCATATCTCAAGCTTTGAATAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGGATTTTTCCTTAAGTT:1 - chrX 15043056 5' - F-element 4434 1 58.10 TGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATTTTTGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGAT:1 + chrX 4789120 5' - opus 7491 2 64.29 AATAAAATTCTAATGTCTTTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATAAGAACAGCTTACTGTGGTTCCGAATGAATTTCTTGACGTATGGCTG:1 - chr3L 12187504 5' - Transpac 366 1 82.69 ATGAAAATAAAACTCGAGAAAGGCAAATAATGTGCAAAAAATATAACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACGGTATGCGTAGAAA:1 + chr3R 16318731 5' - 1360 146 1 58.49 GAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAACGAAAA:1 - chr3L 15253229 5' + Penelope 652 1 57.14 TATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1 - chrX 5515599 5' + copia 4927 2 77.27 TCTATGCTTTCCATCCCTAATCTGCATCCGCTTTAACGGCGTACATGCATTTTTCGCACATTAATTGCACTTTTCGCTCTTACTCTCTCTCTCTATCGCTCTCCCACACA:1 - chr3R 25648193 5' + Cr1a 304 1 48.18 AAAACAAAAAAAAAAAGAGGAACCAGTTTCAGACACAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCA:1 - chr3R 25587081 5' - S-element 1544 1 60.23 ACTAAAAAATAGTAAATACTCTAACAATAAAAAATCACATCAAGTACACAATGTTCGTTAACCACCCAAAGCTGTGACAAAGAAACGAAAGTGCAAAGTGAAGCATTTTT:1 + chr4 739730 5' + gypsy4 453 1 58.18 GTTACAGTGGGCGAAAAGGCAAGAAAGGTATGGATGCACAACAAAACATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGGTTATGCATGTGCAAGATTGT:1 - chr3L 12997598 5' - rover 7006 2 80.91 GAGATCGGAGAATGGCAATGAAGCTGGCACCTTCAGCCGGAGATAGGTGGATTCTGGGCAAGATCCATCCCTCATGAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr2R 17806194 5' - Transpac 297 2 63.64 ACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTTCGAAAATTCATATCACAAAAACTGGAGTTGGGGAAAAAAACTAATTGGTTGGTAAAAATGGGCAAACGATTCTA:1 + chr3R 4604452 5' - FB 51 1 71.82 GCAAGAGCTACGTAAATGGATCGATCGGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGGGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCAG:1 + chrX 256011 5' + R1A1-element 409 1 69.00 ATTTCTAAGTGTATGGCTTTGGTGGCCATGCAAACGAATACAGCAACGTATCCTTTAAATGTTTTTTGGCACACGCTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chr3R 19447319 5' + 1360 58 1 78.22 ATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCGC:1 + chr3R 25434761 5' - opus 476 2 66.25 AGAGAAAGAGAAAGATGGGGAGAGTGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAT:1 + chr3L 14534495 5' - 1360 397 1 77.27 ACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chr3L 3240602 5' + diver 6 2 70.33 CGAAACAAGTTCTTTGCTTCTTGGCCTTGCGTGTCCCAGCCGAGTTCCCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTACACCAATAAACACACA:1 + chr2L 12057593 5' + Porto1 452 1 54.37 TTAATTATACCTAACACAACAATACGAAATCTTACTTAAATACTTTTCAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGATGAAATTGCGTTGTGAAAATA:1 + chr2L 7562256 5' - Bari1 247 1 53.77 ACCGTTACTGGTAAAAGCGCTACCGTTGCTGTAATTGCCAGTAAAACTATTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATGTCTT:1 + chrX 7078775 5' - I-element 5083 1 55.34 CCTTAAAGATTTAAGAGTAAAGCAAGGTGTTCGTGTTCGAAAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCACTGCCAGCAAC:1 - chr2L 20293291 5' + F-element 4282 1 57.43 TAGCAATTCATCTCAAAATCCAGTTCAATTTTCTTCTTCTTTCAATATTTTTGTGACGTAACATCTTCTTTAATACTATTATATAAGTTATCGCCCTATAAGTTATCGTC:1 - chr3R 15309441 5' + HMS-Beagle2 6887 2 75.45 CAGCAAGAACTACAACAAACCCGCCCCTACAGCCAATACCACAAATCTGGGCTATGACGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTT:1 - chr2L 14196135 5' - X-element 427 1 55.05 GGGGCACAAGGTGTGCGAGTCACCATCAATCTGTCAAATATTCTCCACGTCCCAGAACTCCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1 - chr3R 30075820 5' + transib2 37 1 61.62 GATTTGAGGCTCAAGTTGTAAATATCTAGCTTGGGAGAATAGTTTTAGTGTCAATGCATTAGGAAATAGTGCCCATATAATTAACAATGATAACCGATTTGCCATTTT:1 - chr3L 16435530 5' + Fw2 132 1 68.52 TCCTTTGGCCAATTTAAGCACAGCCCGCTGGAGAAGAGAAGAAGAGTTCATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCTGCATGTGGCTGGGT:1 + chrX 15566990 5' - Tirant 8268 2 57.61 CCGGGGGCACATAGACTGGGGATTTTGAATTTTGGCATGCGCGATGCAGAGACACGGGGCGTTATTTAAGCGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGG:1 + chrX 16915671 5' - Idefix 7020 2 69.09 CAACCAAGAAAAATGACCTTCTTTTCCAAAATGTCTAAAAACAATAATAATATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGT:1 - chrX 13202696 5' - Tirant 386 2 69.09 ATTGCTCATTTCGTAATTAATCGCATTGATTTGATAAACATAATGCAGTAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3R 23861064 5' - pogo 2088 1 63.04 CAAGGTTGCGTTTTTAATTATCTTTCCTTTCTCTGACTGCTAATAACGTTAATTTGTTTGATTATATTTGGCTTGTGTTCACATGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 16917529 5' - Porto1 171 1 62.50 GTGCACTGCACAAACGAACTGGAAAAATATTGCTAAAAATAAAGAATCCAACGAACCCAATCGAAAATCCTGAGAACCATCACCGGCGCACCGTAGTACGTTCGAAGTGA:1 + chr3L 18208991 5' + Fw2 3645 1 57.27 GTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAAACTTAGTT:1 + chr2L 13836546 5' + blood 39 2 76.25 CCCTTAAACTTGCATGAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTCGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACT:1 + chr3R 4711724 5' - Idefix 172 2 81.71 AAGAGAGATAAAACTAAACAAATACAACAACAAAATTAATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:1 - chr3R 563951 5' + HMS-Beagle 42 2 63.64 AGCATAAACTCCTAGATGTCAAAGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3R 24867537 5' + roo 8724 2 79.44 CGGTTGAAACGCGCTCAAAGGGAATTTCCCTCCGATAAGAAAACACTGCGAATCCTTAATATACTCGTTCGTCTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 6076270 5' - accord 184 2 71.13 TTCATGGCATTTTTTTCTCCCGCCTCAGAGGTTGTCTCTCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGC:1 + chr2R 17287734 5' - Idefix 60 2 56.32 GGCAAATTAGGACTAATTAATAAAAGCTTTCAGCACAATGCACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAA:1 - chr3R 21983143 5' + I-element 5151 1 62.73 CGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 16742265 5' + 412 42 2 77.53 ATTTCGCCTTCTGTTCGCTCAACTTGACTCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCG:1 + chr3R 20402159 5' - ZAM 120 2 67.42 TGCGATTATCGCTTTCTGAATTTTGCAACTAACTTTTAATTTATTTTATTTATTATGATCGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1 - chr3L 14929020 5' - I-element 5305 1 64.55 TCCAGGACGCTCACCCACACACTTACAGCTAAGTCGAGCGCCAGGATAGTAGGATAGCAGGAGAAACATTTCATTATTAAATTTGATTATCTACATTA:1 - chr3R 31829219 5' - Penelope 352 1 58.16 TTTCGCCAGCCTCCTTTGTCTGTACCCATAACCGATGTGGGAACGTTAACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACCAGTTTA:1 - chr3L 20218805 5' + rover 7022 2 62.79 ACTTCGAGGGTGCCCCAATTTACGATATCTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 18072782 5' + 412 7090 2 66.67 ACTTCAGGGCGCTCTCCCGAGTGATCTACAAAAAAGTGATAGTAATCGTTAGCTGTTCAAAACCGTTATTCTTATATCTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACC:1 + chr3R 13374756 5' - Copia1_DM 172 1 33.64 GCCAAACCAAGTAATGATTATATTTTTTTCAAGTGCCATGTGCCTTGTTTGGTGAATTGGTCTGGTATGATGGACCCAGCTCTGCCATGAGGCATCTG:1 + chr3R 26519579 5' + R1-2 3109 1 67.35 TTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTTTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTTTTCTATCTTTTCTTATCTTATTTTGTCTTATCTT:1 + chrX 4617442 5' - Stalker3T 203 1 41.00 ATGAGACGTCCGTCTGCACGGCGATGTAGACTTTGTCTTCCATGTTTGTCTAAAATCAGATCACTGTTTTGATCTTGTGTTTTCG:1 - chr3R 876890 5' + Cr1a 386 1 78.82 ATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr2L 4016897 5' - opus 7473 2 67.50 CTCTAACCTTACTTTTTATATTTATTAACCCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATA:1 - chr3R 12829534 5' + 1360 200 1 72.73 CTACAAGTAATAATGTAACGTTCTGAAACTTTTTCGATGTTTAAAAAATACATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 + chr3R 6263294 5' - diver 6079 2 53.21 AGAGTACAAGAGTATAAGTTGAATCAATTATTTAATCTAATAAAAGACTGTACACCCCACCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chrX 14771731 5' + jockey 4694 1 50.53 GACTAAGAAGCTCGCTCTTTCCTCGTGATTGCCGCATCCAGCTAGCCTAGTTGAGAAACCGTATGGACATCTTCTGATACACATCAGCAGTCAACGCCACTA:1 + chr3R 5653206 5' + gypsy5 7019 2 74.51 TGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTCTCTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 + chr2L 21768292 5' - gypsy7 5008 3 57.45 GTTAGGGTTGCGCCAAGGTATCCACGAAGGTAAAGAGACCGACGCTCCCCTTTCGCTTTTTCGCCCCATCACGATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTG:1 + chr3R 15711375 5' - I-element 4899 1 75.00 AGTCAACTGTCATCCTGCTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGAAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCA:1 + chr4 1145087 5' - 297 165 2 78.49 TTCCAACCATTCCGACCGGCTTAATTGTTGGCTCTCCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCAACCACGATACTCC:1 + chr2L 11028065 5' - R1A1-element 4995 1 53.09 TTTATGCTCCCCCAGCGATTATACATTTTTAATTTGATTCCTTCAGCTTTTTTTCCATTAGGAAGTGTTCGAAATGAGATTTAGTCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAAT:1 + chrX 6452228 5' - accord 181 2 50.91 ATCAGTTGTAAGATTTGAGTTTCAAGCTTAAATCTCATAAGCTAGATTTATTTACAAAAGACGCACCCACACACACACACACACACATATACA:1 + chr3L 7204091 5' + accord 7032 2 68.82 ATCAATAGAAGTGGAGGCTAAGTTGATTAAGAGAATAGGAACAGTATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 - chr2R 2752434 5' - copia 236 1 57.30 ATCCTAAATTTGAAAATCTTTACTAAAACATTTTAAACATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chr3L 17595283 5' + jockey 4684 1 67.27 TGCCAGAGGTTAATACCTGAGCTTATTTGTCTAACTCTTTCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAA:1 - chrX 4049833 5' + Doc 450 1 72.00 ATCGTAAATAAGAAAGGCATACAAAATGCTTTTCCTTTGGAATTTTAGGGATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 - chr2R 20924289 5' + mdg1 7073 2 54.55 TAAGTAGGAAAAAAAACTGATATACAAATGCAACCCATTTAAAATCAAGAAACAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3R 13481163 5' - roo 9040 1 54.55 TTCAAGAGTAAAGCAAATTTGTTGTCCCCATTTTTTTAAGGAAATATAATTAAACAATATATATTTTACTTATAAATTAAAAAACAAATTCAAAATATCAAATATACAAG:1 + chr2R 9725235 5' - S-element 1564 2 70.00 AAATAAGAGTAATTAGGTGCAGCAGGAAATTTACTCGGAAAGTTAACTAACAAATTGTCAAAGCGGCAAGTAATATAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGG:1 - chr3L 8149993 5' + Idefix 6979 2 75.45 GGTGGAGAAAGTTGGGCGAGAGAGTTGTCTTTATGACAATCGTAAAAAATAATTTTTAGTAGCTTACGAGCTGTTCGCTGAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAATG:1 - chr2L 6286725 5' + HB 390 1 77.27 ACAGGTGTCCCCACGCACAGTGGCAAAGAAAAAAAACAAGGGAGAATGCTATAGCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 - chrX 17622353 5' - INE-1 548 1 91.36 ATCTCATCTTCCTTGCCCCCGGTACCATCTCTTTTTGGCCTTAACTTTAGCCGGAATATTGCCTTTAAATATTTTGTTTCACACGTGCGTAGCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chr2L 14750356 5' + blood 7176 2 55.45 TGCGGTATTTATTTAGCCTATAAAGCTTCAGTGGGTTACAGCCGTCTCGCACACCATCAAAGCGTTCATCCATAGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAA:1 + chr3R 19537468 5' + hopper 14 1 68.18 ATATTTTATTCTTGGGTTTGTTGAAATTTTCAAGCTGTGTAAACAACGCTGTTCTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3L 15819329 5' + pogo 30 1 54.55 ATGCTGCTGCTATAATCGCTGCTAATTGCATTGTAGTATATTCGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATA:1 - chr3R 29635254 5' + mdg1 7096 2 77.27 TTCCCGCCATCATCATTACCATCATCATTTGTGGTAGCTTTGCTCTTAGCCAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGACACCCTTTATCTTTATTTAC:1 + chr2L 21064909 5' + 3S18 36 2 50.00 TTTTAGGTCTAAGGAGAAGAATACCGGGTTATTTATCATTGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr3R 1023410 5' + F-element 44 1 60.64 TTTTATTAACTTTTTAACTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACCATTTATTTTGCCTTTG:1 - chr3R 19088318 5' - TAHRE 10379 2 83.49 GCCCGGGCAACGATAGCAATCGGTGGATGGCAGGAACAGATCTCATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAAACTTCACATTTAGGCGGTAAAAA:1 + chr3L 6873609 5' - Tc1 1453 1 62.26 GAAAACAATATCGAAACAAAACAAAATTCGAAAATTAAAGGTCTCATGGTCTCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACAAGGACACACA:1 - chr2R 3941953 5' + I-element 4943 1 54.63 AGGCTTATTTATTGGTTTCTAATCGAAATGTTAGTAAGTAGTTAGTTAGTTGCACTTGACTATCAATGACTTACTATTACTATTATTATTAATATT:1 - chrX 7377099 5' - mdg1 49 4 59.38 GCTATATGTATTTAGGGTTGTTTATGGAAATATGGAAAAAGAATTCTTATGTACTACGTGGCTATGTGCCTGCTTAGTGGCTGG:1 - chr2L 7170083 5' - Tom1 133 1 58.33 TAATGGATTAATTCTAGGTGCAAATATCATCTACTCGGTTAACTCGTTACAAACTTCATTGCTATATAGATTTTTTTTGGGGAGAGAGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr3R 14995637 5' + Doc 9 1 64.22 GACATTTTAATTCTCAGCATATTATTTACGCTCACAGCATTTTTGACAATTTAATTGGGCTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 + chr2L 10128646 5' + copia 4895 2 56.88 AGCAGAGGAGTTATACCCGAGAGTCCAGACCAAAGCCAAAGCCAAGACCAAGATCAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTAATCTATA:1 - chr3R 25643623 5' - Circe 7210 1 54.13 GCCAGCAAGAGATGGTGCTGCCAAAGGTTGTCTCTTTAAAATCCATCGCGTCAACTAACTGATCACTTTTCCCCTGATATTCACTAACCTGTGACTGCCCCAGTCAAACC:1 + chr3L 18806290 5' - Gypsy12A_LTR 426 1 65.45 AACCGTGAGGTTTCAGCCTTGATTTTAAGCCTGATTTAAGCGAGTTCGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGC:1 - chr2R 5330834 5' - gypsy5 45 2 60.61 TTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTTATTTTAACTTTGCTGGTTTTTAACTTTGCTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAAAGA:1 + chr3L 15362845 5' - HeT-A 6049 2 81.82 GAATGAGCGTCACTTGCAATAAGGGAGAGCGAAAGAGAGAGAGTGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCG:1 + chr2L 222208 5' - Cr1a 241 1 78.43 ATTTTTAAAATGCATGCCTCTAAAGAGCTCGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr2R 9963667 5' - pogo 2076 1 63.86 CGAAATAAAAGCGATGATTTATGCAATATTCAAATATCCATTTCGCACAGGCACTCACACACACACACACACACACATACATTATAGCAACACATAGCAACAGCCATACA:1 - chr2R 22560047 5' + Quasimodo 60 2 75.45 GATAGTTGAATAGATAGTTCATTCGTCTTGTCCGTTCGTCTGTCCGTCCGTAAGGAAGTCCAGATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGC:1 + chrX 663862 5' - micropia 5363 2 67.00 TGAACAAAAGTTTAATAACATGCGTTTATTTAAGCACAGAACCCTTAATTTTTTACGTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTAT:1 - chr2L 22924954 5' + S-element 1682 2 70.37 CAATCTCGAAAAGAGTAGATTCTTCTTATGCCCCTTATATTTCTTCCACTCCCACTAGCTGAGTAACGCGTATCTGATAGTCGAG:1 - chr3R 19718843 5' + INE-1 552 1 90.59 AGGCTCGCTGGCAATTTGCATGCAGCCGATTGGACCCCTCCTCTCTTTTTTTTTTTGTAATTTTT:1 - chr2L 21004796 5' - Doc 4697 1 63.08 ATAAATAAGCAATACATTTTTCAAAAGTAAGGGCAAGGATAATATCCACTGGACAAACTTAACACAAAAATAACAAATAAAGGCGTTTAGTAGATTCAATATTACAAGCA:1 + chrX 22638684 5' - Transib5 499 1 58.18 TAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 - chr3R 23621038 5' - roo 9034 1 74.71 CGATTGCTGTACATCCCGCCCACTCTCGCACTGCACACGTTCCAGTTTGTTGCTGCCAAATAGCAGCTGTTGCACACACACACACACACATAC:1 + chrX 13433999 5' + accord 7029 2 62.37 CATTTTGGCTCCCACAAAGTGCAGCAACAAAAGCGACTCAGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGCTTTCATCAT:1 + chrX 12737176 5' - accord 167 2 75.00 GTCATAGCCCGCAAATTTGAAATGTCATGGCGACTGTCGACTAGCATACAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - 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Doc 4413 1 63.64 GGGGTGTTGTTGGGTGGTCGTATGAGATGAAATACGAAAATTAAAGTCGAAAGAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAG:1 + chr3R 10024388 5' - McClintock 6109 2 53.27 GTTGGCATTTCATTTTCATTTTCACCAAAATTGTTAAAACTATGTTTGCTATACATATAACCCGAAACGCAACAAAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr2L 20939625 5' + hopper 4 2 76.64 ATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAACTTTT:1 - chr3L 20187378 5' - FB 481 1 68.75 AAGAGCCCCGAAAAGAAAATGTTGCGCTCAGAAAAGCGGACGGAAAAGCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTG:1 + chr2R 14745347 5' + invader1 3976 2 63.54 CCAGTTTAGCTTTCGGAAACACCAGAACAAGCCCATCGTGGTACACATCATATCCTTGATGCCTTTGAAAAGTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr3L 23854858 5' + 297 6588 2 73.39 AAGATGGGGTCACTTTGGTGTTGTTCTTTCCGGCCTTGTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTCTATATCGTGCCGTGACGTTTGCTATATCGTGCTG:1 + chr3L 6873255 5' - Bica 315 1 62.63 TTTAGGCAATTGCCGATCAGCCGGGCAGAGGATGTTAATTTTTACAT:1 - chr3L 12023875 5' - Quasimodo 6904 2 59.57 AAGAACTCCCTAAAAATAGCAAAGAGCATTGTAAATATTTATATAAATAATTTATGCCTAATTAAAAATATTAAATATCCAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTAC:1 + chrX 3788299 5' - 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Tom1 129 1 88.57 GCCGAGCCACAGATACACAAAAAGAGTGAACAAAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTG:1 + chr3L 10228308 5' - Doc3-element 4579 1 60.66 AGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGGAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr3L 19220633 5' + Stalker3T 204 1 66.30 ATATTAGCTTGGATTTATCTAAATAGTAGAACTACAATATTTTAAACTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGATTGGTTATTAACGGGAAGCTCTG:1 - chr2L 179707 5' - Circe 305 1 60.64 AAGTGCTTTTACTAAAAAATATTTAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTTATTATTTTATTTTATTTTATTTTT:1 + chr3R 16799753 5' + transib1 1899 1 78.18 CAAAATGGAAACCATATTGACAAGATGCAGTATCCATGGAGAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATT:1 - chr2L 15999789 5' + Doc 115 1 62.73 TTTGTTTATCAATTTGCAGGGACAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATA:1 - chr2R 20343473 5' - R1A1-element 4959 1 73.17 CACGCTCTTTGTCGCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAAGACGTAGATTCACTTGACTCTATATCTAAAATCATTGTAGATCTA:1 - chr3L 18329520 5' + Cr1a 4145 1 80.39 ACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAGACATAAACATCCGCAGC:1 + chr3R 21907536 5' + Quasimodo 7028 2 23.23 CGCCATGACTTTGAAGGTACCAGCACACTCACAGCAAAAGTACAACCAAAATAGTAAGTCTGAGGGACGGACAGTCGAGGGTAGGTAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTAT:1 + chr3R 6791103 5' - copia 4975 2 77.27 GGAGATCTTTGGACATAATTCTCATACTTAAGACGCATATCATTCACGCCACGCTTCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chrY 975824 5' - 1360 3365 1 52.38 TGTGGTTGTAGTCGCCGACNGCAGCAAATTACTTACCTAGNGTAAGGGTACTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACA:1 - chr2R 4912870 5' - invader2 5087 2 87.18 TACTCAACGCTTCGGAGTTCTCTATCCGTCCTATACATATACATATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr2R 20436793 5' + opus 22 2 66.67 ATGTATGACGACAACTCTTGGGGAGATTGCCGGTTTTTCTTTTTTTGTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 10680136 5' - BS 5108 111 93.85 ACGCTTTTACTTCTGGCTTTTTGCTTTTGGCTTTTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3L 17405750 5' + roo 49 2 71.82 TTCATTAGCAGTTTGGTAATTCAATTAAAACGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr2R 21199731 5' + jockey 14 1 61.32 TCCAACAGGCTGATAAAAATTCATTTTCCAGTATAAACAAAAGAAAACGCCCGAATGACCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAA:1 - chr3R 27740878 5' - FB 35 1 60.19 CCAAAAAACCAAATAATAAAAAAAAAA:1 + chr2R 7890569 5' + Rt1b 5143 2 92.59 CACACACTCGAAGGCGGGCAAGGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGACTACGACTGACTTTCTTGA:1 - 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297 6924 2 78.50 TATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATT:1 + chr2R 5064833 5' - Stalker3T 200 1 53.19 CCCACGTCCGGCCCATCAATGTCATCCGCTTCGTTTTACCTTATTCAATAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCACGTGTACTTATGCACGCA:1 - chr3R 16065746 5' + Q-element 561 2 73.20 GATTCCATAGTAAACTGACACGCCCACACTATCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGG:1 - chr2L 21699482 5' + INE-1 554 1 63.77 GCAGTTTCCACGAGTGTGGTTGCTTTTGTTGTTTGCGCAGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGGCTTTT:1 + chr3L 18030369 5' - Tirant 388 2 56.41 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTTTTTGTGT:1 + chr2L 16217660 5' - gypsy3 418 2 56.36 TCCATTTGCAAAGTAGGCCGACAAAAGCTTGTACACAGCTAGGTCATTAGGTCACAACTGTGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 + chr3L 18030789 5' - Tirant 8483 2 60.00 TCGAACTTTTTAAAGCTATTCTCATAATTAAGTGAAATTGGTAACAAAAATAAGAGAATTACTGCACTCTTCATACGTCTTTTCAAATGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 2415036 5' + FB 175 1 60.00 AGTTGTTAATGCAATATGTTTTGTTTGTCGTGACATAATTTAAATGCAAATGTTTGGAACTGAAAGGCAGCCATGAGTCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - 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chr3R 8796886 5' - Rt1c 5058 1 59.09 TGTACGTGTGTCCATGTGTGTATGTTGTTTGTTCACACTCACAAAAACACACACACACATACGCGCAGAACACACACACACACACATGA:1 - chr3R 19991685 5' + accord 183 2 74.16 ATTTTCCCCAGACACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCA:1 - chr2R 18507907 5' - Bari1 1679 1 55.79 GCCCTGTAAGGCAGACTAATCTATACCCTTAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3R 11937269 5' + pogo 48 1 71.82 GGATGTATGGCCTACCAGCCTACTGTCTAAATGCATTTCGACTCGTTTTTGTGTAATCTCAACGTCATAGATACCGTCAAGCCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2L 11082341 5' + jockey 16 1 66.06 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGGTAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 + chr3L 22908066 5' + Stalker3T 202 1 61.11 TTAAAGCTTTAATGTGCCGTTTTTTTGCTTGCTTGTGTGTGTAAAAACGCGTATAACGTGTAAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCCAGAAGACGATTTTCGGGC:1 + chrX 17809546 5' - 1360 3195 1 78.90 GTACGATAATCTCAGTTAAAAATAGGAATAGCAAAAAACACAAGTTGTATTCAGTTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAAT:1 - chr2R 21696473 5' - Ivk 5350 1 50.00 GTGGCACTATTTGTGTAGTACGTTCAATACTCCTCGCGATCTGACGGAATGGATCTGTAATTTGTAATTCTTGGTTTTATGAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCGT:1 + chr2L 7997578 5' + Q-element 230 2 68.18 ATTTTGTGCTGGCTTAGTTCGTTATTGCTTAGTTCTTGCTGGTCCTTTTGAGACATGTCTCAGCAGAAAAAAATCTATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTTAGTT:1 - chr2L 9857710 5' - Doc3-element 178 1 72.73 GAAAATGCGGTGAAAATCGGGGTTGGACATAGATTTGGTGTTAATGTTAAGTGGTAAGTATTTTTTTTTTTGTAAACTTAGGTTTTTGACAGTAACATGGACTG:1 + chr3R 30718593 5' - HeT-A 5865 1 70.19 ATTCAAAAAAGAATTTTGATTGAACTAAATAGATTTTGATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr2L 14848369 5' + pogo 20 1 59.09 GTGTGGGTTTGGGCCAAGCTGAGTTGAAACTCGTGTCTGGATAAGAATAGGGAAATGCCCCACTTCTCAAAAATTCAGCTCTCTCGCTTTATTATTTGGCTTT:1 + chr2R 8193740 5' + transib3 2830 1 54.37 TAGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGTTATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 - chr2R 21592036 5' - Tirant 354 2 70.53 CCTGACGTAAATGCTGCCACGCATTGCGTCATTGTGGGGCTTAGAGTAATACAATCGCGAGCGGCACGACATGCA:1 + chrX 2652592 5' + G5A 2496 1 54.67 TTTTTTATTCGTTTTTCTTAATAATCACAAAATATTTAATTATAAATCATTTGTAATCAATAATTTGGACTTCCATTTGTGTTTTGTAAAAT:1 - chr3R 5058741 5' - pogo 472 1 57.61 GTCTCCTAATTGGGAAACCGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACCGGTTGGCGGCGAGGGGGTTAGGGGGGTTTTTGAGCCTTTTCA:1 + chrX 14103225 5' - G6 1805 1 65.48 GGAAGGAAAAGCGCGTGTGGGTGGGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr2L 1291082 5' - 412 7526 2 69.12 TGTGGTTTGATTTTGGAATTGAATGAAGGGTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr2L 21034067 5' - 412 7515 2 65.88 ATGGTTGCCACCGTGGCCAGAAGGACACGGGGACATTGGGACAGTGGAATAGGAGCGCCGGCTCTCTTTAAAACGCAACAAAGCATACTTTTCTTTTGT:1 + chr3L 5711615 5' + Doc 283 1 58.59 TCTGTTGGGTGCTTATATTTATTTATTCTTTATTACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 - chrY 3648879 5' + flea 4772 2 56.10 ACCTAATAAAAAAAAATTGCAGATGTAATTAGTAAACACTACCCCAAATCAAATAGAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr2R 12336669 5' + pogo 2 1 74.44 GTCGGTCCCTGTCTGTCTGGAGTTGCAACCCCTCGGGCAACGAAATGAAAGCAAACTTCAGACTCTTGGACTTGGGGTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGGTG:1 + chr3L 18065713 5' + copia 5031 2 73.64 GGGTATCTCAAAGTCGATGCAATCTACCTTAGATTTCTTGCTTGTTTTCGCAGCTTTTGTATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3R 21612967 5' + jockey 31 1 57.41 ATTTCACCTTCAGTTCTCAAGTTATCACTTCTTATTATTTTTTCTGGTCTTTCGGCTGGGGGATATTTGGGTTTATTTTTGAACATAAAAATTTTTCCTTCGAGCCGG:1 - chr2R 14188667 5' + 3S18 363 1 66.67 CGATGCCGACGTCTATTTACAACGCATCGTTTTGTTTATTGTTCAGTCAGATCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr3L 15968171 5' - P-element 2863 1 55.88 GGTAATGTATTTTATTTGTTCATAAATTATTGGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGAATGAATAATAAAACATTCGCGTGTACTTATGAACGAAG:1 - chr2L 1550011 5' + Q-element 562 2 59.41 CTGTTTGCTGTTTCCACTTTCATTGGCCTGAGCATTGATTTTGATTTTGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCATTTTTTT:1 + chr2L 4376854 5' - Doc 4460 1 59.34 CTTACTCATTTAGCACGTTTCTTTGAATGAGGGTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGAT:1 - chr3L 7416012 5' - F-element 4427 1 65.62 AGTCCGATTTGTATGAGCGTTTCCAATCGCAATTTAGGGGTCTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr3L 23257498 5' + blood 7057 2 61.82 TGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTT:1 - chr3L 15099635 5' + G4 3813 1 36.73 CCTCTACTTCTTCTTCTTCAGCGTGTGCGTTCACAGCTGTTCAAGGCCCCCACAAAAAAAAGGAAACACTGAAAAAAAAACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr2L 18694118 5' + pogo 3 1 68.18 TCCTGATTAAATTTAATGCCGCTCTCAACTTTCCAGTTTCTGTAAACATCCCATCTCGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chr3L 18030891 5' + Tirant 13 2 65.96 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACTAACCCAACTACAGGGTGCGACAGCAAAATTTCCTTTTTTTAGAACTCAAT:1 - chr2L 16217660 5' - mariner2 873 1 50.91 CCCGTTACTCGTAGAGTGAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATCGGACTTTTAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCA:1 - chr3L 27367103 5' + 1360 259 1 74.55 ATGGGATTGTGTGTATATTTAGAGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTG:1 - chrX 11402457 5' - Doc 274 1 78.18 AATATGGTGCAGATGCAGTTCCGTAAGTGACTGTTGGGTTGTAGGGGGATGCTGTCCTGGAATTTTCCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAG:1 - chr3R 19445512 5' - GATE 197 2 71.82 CTTTTTAAATTTTAACTAATATATAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 16496742 5' + hobo 33 1 73.75 TTGTTGCGCCTTCGGATGGCGAGACATGCGCAGAATATACCACGTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTACAATTTAAGAAGAAGAAGAAGAGTATAATT:1 + chr2L 3088741 5' - hopper 1170 1 67.27 TACTCGAGTCAACCAGTCACGTCACTCTGTCTACACTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCC:1 - chr2L 802689 5' + Circe 148 2 73.63 CAGCATAAGGATACAAATTTTAGAGACGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGT:1 - chrX 4496674 5' - Doc2-element 438 1 70.73 CAACTTTATGGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCC:1 - chr3L 19948909 5' + 3S18 5786 2 53.66 AATACCCATAGATAGTGTACATACATAGGGGTGATAAAAAGAGAGCTCCATCAAGAACTGGCAATCGAGATATTGCTTCCTAAAACATAATATTTCTCAAAAAACCGAAA:1 + chr3L 3257461 5' + hopper2 1111 1 55.45 TACTTTACAAGCAATCTACAATGTATATTTGTGCGTATTGACGTTGCTGTTTTATGTGCACGCATCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACT:1 + chr2R 14393255 5' + Doc 468 1 70.53 TAAAAACACATGTTTTTCACATACTGAGTCTGCCAATACATAGATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAAT:1 - chr3L 23996573 5' - HMS-Beagle 7003 2 60.91 TCGCTCAACCGATTCGACCTAGATGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGC:1 - chr3L 1634679 5' - flea 4802 2 77.00 ATTACGACGCAGAAATTGTAAATTATTGCGCTTTGTCAAAAGCAGTTGCTGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGAT:1 - chr3L 14085214 5' + pogo 1663 1 55.45 TGCGGCGAAAGCGTAGAAAAAAGCAGCAGGACAAAACCGCTAAGTAAATAAATAAGTGTAGGAGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGAT:1 - chr2R 13629865 5' - hopper 372 1 73.33 CATATGCAGCCCTACAACTGTCCCCCAGTCTTTTGTTTAAGCCGTAGCGCCGCAAGCTGAATACTCTAATCACAAATATGCTATTCTAATAAAGTCATTTTTGAAATTTA:1 - chr2L 15145528 5' - 1360 375 1 57.27 TGACTAAGGTCGAACTAATTTCTCCCACTTCATTATAGTATGAATTCGATTTCGTTGACTTATTGTGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCAT:1 + chr4 899961 5' + Rt1b 5039 1 68.18 CATACAACTACGTATGCATATATACACTCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTA:1 - chrX 15227671 5' - hopper 1360 1 72.73 GTAGAAAGAAAACACCGTTTGTTCCTAGATAATAATAAATCGGGTCTTTCGAACGCGCCTCTTTAAATTTATTGGTGATATTATGGGATCCGAATTATCCATTGCTCTG:1 + chr3R 4798617 5' + hopper 363 1 55.96 AGGGTAAAGCTTTAAGCATTCCAACTAAATGCTACATAATCGAATTTAAACCGAGCAACTACGTCAACATATCAGGGCAGCCCGACCTACTCCTGCAGCGCATCATGC:1 - chr2R 18524907 5' + Chimpo 3891 1 55.56 AACAAACTCCAGCTGTCCGCGAAGAGCACACTTCTTCACACTATCCAGAGTGGTTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATTAATTACTTAATG:1 + chr3L 16793333 5' - G5 4696 1 56.36 CTTAGTAGGGTATTCCATTTTCAGGTAAACAAACCAGTAGCTTTTACCCTTCCGAACTGGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATA:1 - chr2R 22663415 5' + mdg1 7051 2 60.00 CGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chrX 20330576 5' - P-element 2844 1 27.27 TCATTATGTTGTCAATTGCGGGTTTAAGTTTATTTGTCTGTTTTTTGCTGCTTTTTTAAACTAGTTTCGTTAACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATCTATATCT:1 + chr4 547402 5' - Porto1 4388 1 63.81 GTATTTAACGGCCTGCTAATACGCGGGTTAAGTTTAATGTATTTATATTTATTTATAAACGGGAAGGGCGCATTAATTAATGCATGCAA:1 + chr3L 10262025 5' - diver2 414 1 61.80 TGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr3R 13544020 5' + 1360 5 2 35.00 CGAATTCTTAGGGATTCCAAGTATACCCATCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTC:1 - chr2L 1812726 5' - Bica 7 1 56.52 TGTTTTCAATAAATATGCAAATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr2R 22663318 5' - mdg1 396 2 57.27 TTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTTTTTATTGTTTATT:1 + chr2L 9723025 5' - Porto1 162 3 44.30 AGTTATTTTTCGCATACCCTGGTACCCCTTGTTCGCAGCGAGGAAAAAGTTAGACATGCTTGTCATTTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAA:1 + chr3R 31887724 5' + HB 19 1 53.64 CAATTGCGAGCAGCCTCAACTGCGATATATTCCTTCCAGGATAAACAGCAATATATATATTTATTTCTCTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAG:1 + chr2R 25117992 5' - Transpac 310 1 79.59 TTTGCTCCTTCCCGCTATCAGACTCGCTCTTTGCCCTGCATTTTCTCGCCGAGTGCAAAAGGAAAATAACAAAAAAAGTTTGCCAAACAATTATTATTAGTTTT:1 + chrX 3720784 5' + FB 359 1 73.08 AAAAATTGGTGAATTTCAATTGATTGCTCTAGCATCAAATATGCAAATATCGCATAACTAACAATCTCCTTCGCGCATGTTAATTAACAAAAAAAAAAAGAAAA:1 - chr3L 4638066 5' - hopper 152 3 57.69 GTTGCTTTGCCGACTGCTCCTCTTTGGGGCGTTTGCCGCATTTGAATTTCATTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGT:1 + chr2L 9180794 5' - I-element 5140 1 56.36 ACCGAAACCATTTGATCATAAACTGCAGCAGCGGAGTAACAGAAACATCAACAACCAACATCAATACACAGAATAATATTAATTAAGGAAAAAAAGGATTAACTTAACTA:1 + chr2L 11054712 5' + gypsy7 371 1 60.00 CTTGTATTCTATTTTTTGTAGACGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTT:1 + chr3L 18302994 5' - Porto1 4458 1 78.00 GTCTTTGTTCATATCTCAATATTATGAGATACTGTAAATGCCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCG:1 + chr3R 6973683 5' - ZAM 15 2 60.91 ATGTTTGCAAAAGCTATGTTTTTTTTATGAAATCATTTTAATCCATTAAAAAAATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chr2R 10859597 5' - 297 372 2 54.63 TGTGGTGCATATCGCAGAGAATTCCGATCGTGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 9963500 5' + pogo 51 1 71.56 CTGTCTCAACTGAACCAAGCATACATACACGAGTATTCACTGTACATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGAGCTTTTCCCA:1 + chr3L 518740 5' + Burdock 6173 2 60.00 ATATTATTATTATTATTATATTATAACCTATGCAAAGAGTATTGATAATAAAAATACATGAGTAGACCGAGGTAAACTTATATGTCATATATTTTCTAAAGTATAAATTT:1 + chr2R 11367663 5' - FB 250 1 57.27 TAATTAATGCAAAATATTGCAGCTGCAAAAAGAAACTAGCATATGTGCACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAACGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 - chr2R 14588913 5' + jockey 4799 1 57.27 TTAGAAATGCAGGAATGAACCTTTGATCTTTCGGACCGCGGAGTGGTGAAGACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGG:1 - chr3L 4344868 5' - Max-element 8338 2 63.64 CAGCGATCCTCATGGTCATTGTTTTTACTACCGAAAGTAAGTCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGACGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 31959346 5' - 1360 3368 1 70.79 TGTGTCCAAGATAATCCTAGAAACAGACTGACAAAACCGGAACGCACAGATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTACGC:1 - chrX 19010149 5' + Burdock 6156 2 56.84 GTACAAATAAATAAGTATATCTCAGCTTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTAAGGGT:1 + chrX 20099937 5' - S-element 1664 1 72.73 CGTGGAAAACCATTGGGAAAATGCTGTGGTGGGTAGGAATTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTC:1 + chr2L 9459027 5' - I-element 4921 1 57.14 TTGTAATTAAATTAACACATTGTGCTTGTTAACAAACAACTTTTGGGCTTTGGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACATTT:1 + chrX 9432821 5' + roo 8684 2 61.22 ATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 - chr2L 8476752 5' - Juan 4180 1 61.70 TGAAAAGTATAACTCACAATATAACCCACAACGGCAACAGGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGACTCGAGAGCG:1 - chr3L 19670920 5' + roo 8724 2 61.82 AGGCTAAAATAAAGAGACAAACCAAAGACCGCATTGACTGTTCAACTACTATATACATATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTCCGTCAGGACTCA:1 + chr3L 17220661 5' + opus 18 2 64.55 ACTTATTTTATTGTTTTTTTTTTTCATTTTTTACTTTAATTCGTATTATTACTGTAATATTTTTATTGTTTCAATTAGCCAAATGTGAAAAGATATTAGGATAATTTTCT:1 + chr2L 17167153 5' + Transib-N1_DM 57 1 26.36 TTGGCCTGGTGACTGTCATTCCTGCCGAGTGCTGGAAAATCGAGGAAAACCAGGAAAATGAGCAGAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAAC:1 + chr3L 20867575 5' + pogo 1656 1 64.55 TGCCATGCTAATCCCCTTTATAGAATCCCCCTCACAACGGCAAACAATCCTTCATTGTTAACTTAACCTAAGCCTAAACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTT:1 + chr2L 4263426 5' + S-element 1248 1 75.24 ATTAGATGTAATTAAAAGCCAATTTGGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGTATGCTCGGCACTCTCACGC:1 - chrX 3640995 5' - Stalker3T 162 1 64.81 TTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2R 12416880 5' - pogo 2060 1 74.44 GCAGTAATACAAAAATAATGAAAGATGATTGCCCAAGCTGCACCCACACAAAACAAAGGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGTACCTTCATATAAC:1 + chr4 501432 5' - flea 301 1 61.32 GCTGGCTTTGCGTAACGACAACTTTGACAATGCGATTAAAGTTAATTTTTGGGTAAATATTGATACGATATCTTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAAT:1 + chr2R 22314452 5' + copia 5045 2 74.55 AAATTTGCGCAAAAATGCGACTCTTTACATTTAAGTGCCGAAGGGGAATGGAAAATGGGTGGTTGGGTTGTTATGGTATTTTTCCTTAAGTGCCGTGATTGCGTTG:1 - chr3L 11437508 5' - F-element 4420 1 71.70 CGAAATAAACGAACAGCAAGAACATGGAATGCCCTTACACGAGCATATCTTATCTGAAAGGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr2R 12605484 5' + 412 17 2 60.00 GCTAAGTTCGTTGATTTTAGCCGGTTTATTCAATGTCAAGCGATTTGGCCATAAAAATAATAGCTTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGTTTACAGTTT:1 + chr2L 5151494 5' - HeT-A 6000 1 65.38 AAGCTATGATTACCTATGGACATTTCTTTGATTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chrX 5515603 5' + copia 4923 2 73.64 TCTATGGTGCAGGCACAAACCATCGAAAAATCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTCA:1 + chr3L 16566879 5' + roo 8852 2 70.64 AGACAACTAGTGAGTGCCGACTGCGGTGGTTGTTTTTTTTGAGCCTCTCTGCCTGTTTATCTGATTTTAAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTT:1 + chr2L 20770623 5' - Porto1 201 1 70.10 TGGCTGGCATATGCCATGGGCCCGCCCGAATCGATAATTGGCTCTTTATTGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACAATTCCCAGAATGCACA:1 + chr3R 26955606 5' + copia 4774 1 51.85 AATTTACACCAAATAAATTTGGTTTTAACTGTTATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 - chr2L 6313005 5' + flea 26 2 56.00 ACTACGAAGACGTCGAAGACGAAGAGCTCTGGGTTGGACACCCTAGTCGGCAAACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTCTTACAATAATGTG:1 + chr2L 14141265 5' - hopper 1396 1 58.59 ATTTGGTAATGCTAATGATGTTTTTGCTGCAGACGCCGCCTCCTGTCGCTCAGTTGAGTCCCTCGGGTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTG:1 + chr3L 22173494 5' - X-element 4480 1 73.03 ATGACGGATGTATGGCCTACCAGCCTACTGTCTAAATGCATTTCGACTCGTTTTTGTGTAATCTCAACGTCATAGATACCGTCAAGTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2L 11082346 5' + jockey 9 1 71.96 TACTATAAGTTCTGAATGCATGGATGTTTTTTTTTGTTTAATTTCAAAACTTATATTACACACGAGGACGTGTGCTGGTCAGGAAGGCCGTGT:1 + chr2R 21491333 5' + invader6 4474 1 64.52 ACTGCCCTCTGTATGTTTGTTGACGTTTTTCTCTCTTGTTTTGTTTACACTATCTGTATTAGTTTTCTTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAACGATTTTG:1 - chr3R 20394413 5' + Tc1-2 179 1 67.62 TGATTCTAATTACGAACTACCGACGTTCTCATAGTTTAATTATACCTGTATTACTAGATGCGTTGAAAAGTATCATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAATAG:1 - chr3R 23891597 5' + INE-1 85 1 62.73 TGCCGCGCTTTGGGTTTTTCTACTCAATCAGTTCCTGAACGAGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATA:1 + chr2R 11273954 5' + Stalker2 7251 2 75.47 ATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCCTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCCTATCTTATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 75.45 CACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 419 2 54.22 ATTTAAGTTTTAATTGAGTGGAAACGCAGCTCATTTTAAATATTATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGACG:1 - chr2R 18486446 5' - I-element 4947 1 61.80 TTGCAACTACGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2R 5530009 5' - 1360 3361 1 65.45 ATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGGT:1 + chrX 20433346 5' + diver 5920 2 67.95 ACAAGCAATCTACAATGTATATTTGTGCGTATTGACGTTGCTGTTTTATGTGCACGCATCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAAC:1 + chr2R 14393261 5' + Doc 484 1 58.10 TGTCCAGAGTTGTCGAGTCAACCCGTTCTGTGCAAGAGCGAAGAACTCAGGATAGGTAGGAAACCTGACACATTTCCACATTTATATTTATGTT:1 + chr2R 7414265 5' - 1360 2960 1 87.23 AAAAACGCTTTTTCAGGACTACTCCCTCAACACAAAGAACTATTATAAAACAGCGCAGCAAAACGGAGGCATTCCCCAAATCCGCTGGGTCAGCAGATTCGCGACCACAC:1 - chrX 17566964 5' + gypsy5 216 2 55.45 TAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTAGTA:1 + chr3R 7773344 5' + Idefix 315 2 31.82 AGTATGCTACGAAATATTGCGCATCACATGGAAATGAGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chrX 5513373 5' + jockey 4723 1 60.42 TGCAGCATGTACCAGTATGGGTATATCTATATATGGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGACGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 + chr3R 7171265 5' - 297 362 2 70.53 CGTTTGTATATCGGACACGTGATACAGAATATTATATACATACTTATACACATACTCATACTTTCAGCTGTGTCAGATACTTTAATTCTAAGAACTTTAACATTGTAACA:1 + chr2L 3216321 5' + ZAM 8214 2 68.18 CGCTGCGCGCGTGTGCAAGTCAAATTATGTGGAAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGACATGAACAAA:1 - chrX 3624738 5' + 1360 484 1 77.65 GTGTACTTGTCAAGCACTACTTACATGCCAATTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTCTT:1 - chr3R 12847485 5' + Cr1a 99 1 72.73 TTGTTTTTAGAAAAGTTTACAAGACTAATAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr2R 15855686 5' + opus 145 4 69.66 GCATTCGCAAATTTTGTACGGGTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGGGCGGGTGCTACTCGCTACGCACACCGC:1 + chr3R 15242668 5' + hobo 65 1 75.45 GCAGCAGGATCAACATTTGCATGGCGTTTTCGCCCACTCACATACATGTGACACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACAC:1 - chr3L 21645302 5' + accord 167 2 57.30 ATTGCACTCATTAATTAGCACGAGCTTTGAACGTGGGAACGGGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATG:1 + chr2L 10317575 5' - Idefix 194 1 78.72 CCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 - chr3R 17673848 5' + FB 10 1 70.30 ACAATTCTGTCAAAAAGATACCTTCTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGAAGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCA:1 - chr3R 13543924 5' - 1360 3360 1 64.10 TGGCAAGACAGTTAAATGAATCTTATGGAACCACGCTATGTCATTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTAATATATCGTCTCAT:1 + chr2L 21326920 5' - Bica 4889 1 55.96 AGCACGCAGTGGTGAAGGCAATTTTCTTTCAGCCGGGTTAAAGGCCATCTAAGACCGAATGTGCCAACAACAAAATCGACG:1 + chr3R 23369011 5' + gypsy10 61 2 53.09 TTACACTTCCTCGTTACACGTCCTGCAATAAGGACTCACACACATGTGCTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3L 10109734 5' + hobo 36 1 57.27 TTTTTATCGGTCGAAGGTAGAGGGAGATGAAAATGTAGTGAACGCCAGTGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAGTTCTGTTCCGCATCCACAATTT:1 - chr3L 4355639 5' - TAHRE 10391 1 55.45 GTTTACATATGTACCATAATACATGACAATTTCTATGCTAAAGCTAGGAGCATAAACGTAAACAAGCTTTATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr2L 12036073 5' + 297 6591 2 64.22 GTTGCGTCAAAACTTGGCCAACTGACAGACGACAAGGCAATGTCTCAACCCAAAGAGAGAAGAAAGGAGCACATATATTCATTTTTCGGCGTCCACAACATCAGAAGTGG:1 + chr3R 11854142 5' + invader3 290 1 62.73 CAATTATTTACAAACGTCTAAATATGCACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAA:1 - chr3L 23787391 5' - R1A1-element 5213 1 70.79 TAAATAAACCCATCTTTGCTTATAGTTACAATGGTTAGATGATATACATACTTTACATTTAAAAGTACCGAAAACATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAAT:1 - chr3R 25636000 5' - I-element 5347 1 66.36 ACGTTTGCACATTGACAAATTTTGTAGTTTAAGTTTATATCGCTTTTTCGTGTGTGTCTTTGGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCTA:1 + chrX 10206335 5' - 17.6 7018 2 54.55 CTTGCACTTTCAATGACCAAACAGAACGATAAGAAAGGCAGAGATATAATACACTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGC:1 - chr3L 3240617 5' + diver 5898 2 71.82 ATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 71.82 TTGTAAGTGAAGTGGAAGGAAAAGCGCGTGTGGGGGGGGTGGAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr2L 1291095 5' - 412 469 2 58.82 AGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chrX 835612 5' + Stalker3T 202 1 20.00 TAATTGAAATATCAAATTAAGTAGTAACTGAGCGACATCAGAACTGCTTAAAGCTAACAAAGAGAAGAGCTTCATAGCGGCC:1 - chr2L 7172432 5' - gypsy3 91 2 48.78 CAACAGAGTCATGGAAAGTGCCATTGGTTCGCAACCCTTCGCCCACTCAACCAACCAAGTAACCAACCCATCAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACAAA:1 + chrX 10574034 5' + I-element 4986 1 75.45 GGTTTCTGTAATTAGTTTTGCAATCAAAGTTTATGTCTGTCCACCTGTTTATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr2L 13836512 5' + blood 7021 2 65.88 TGCACTTCTTTGATTCGCTGAAGATACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAAC:1 + chr2L 18675606 5' + 412 7086 2 50.91 ACCAATTAAGCGAATGGCGTACAGGAATATTAAAATGGCCAAATAGGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 - chr3R 18576980 5' + copia 41 2 60.91 GTCATGGCGTAAGTGTTTTTGGTATTCATTATACCCGCTACTCGTAGAGTATATATATTCTTAACCGAGTCGATCTAGTCATGTCCGTCTGTCGGTATGAAC:1 + chr2L 21682883 5' + INE-1 123 1 51.96 GTGCAAATACAAACGAACAAAAACGAAAATTAAATACAACAAAAATCGTCCAAAACCGCCACGCCAACACATTTGAAAAAGGTTTTTATTTTTTATTTATATTGTTTTG:1 - chr3R 8862807 5' - mariner2 790 1 62.39 CCCATCAAACCGTTAGGCACCTCTTTTGCTTTTCCACGGCCGTCTTCGGAGATTATAGTGGCGTGCCTGA:1 + chr3R 14582881 5' - Osvaldo 1254 2 57.14 ATTGGAGCAGCCTCGAACATAAATGCTCGATGTCAACAACAATGCACTATGGGGCAATTGGGCTGGTTTTTTTAACAAAATGTGTTTTTCACACGTATGCAAATTTGCTG:1 + chr2L 14917900 5' - hopper2 1563 1 56.36 TATGGTGGTACCCCCACATTAGAACGATGAGAAGGCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATAC:1 + chrX 16155437 5' - invader4 391 1 65.69 CAGGCATACATGATGAATCTGCATAAGGGAGAACCACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3L 18915130 5' + 412 27 2 52.73 TGCCGCCTCACATTTTGACGCTTCATTTCCATTTCTCTCGATTTTGCGTGTTGAGGATCATATGAAAATCTTATTCTTATCTGGTATCTAG:1 + chr2L 4085556 5' - Idefix 6920 2 61.54 GTTTCAGCATTGATGTGGCATAATTTTAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2R 13345956 5' + jockey 35 1 63.75 CGTACCAGCCCGCCCCCACCCACAAACTTCCATACTTTTTTTTTTATTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 18170326 5' - gypsy11 3933 1 90.77 AAAAAACGTTGAAAGGTCAAAAAATCAATTTACCTGTAAGCGCCTGTGATAAATGTATATTTTAATGCTTTATGTAAGTATAATACTTTAATAATATAATAATAATAATA:1 - chr3R 4543762 5' + invader3 5053 4 80.91 ATTAATGAATTATTAATTTGTGTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chr3R 10964624 5' + I-element 50 1 79.79 ACTGAAGCAGAAAGTTTGAATGGCTAAGGGGGTAAGTGGAGAAAGGCAGTCGAAATGCAGCGCTCAAGCTTAACG:1 - chr3R 7614924 5' - diver2 172 2 73.33 ACTTTGCTGGCGAAACACAAAGGAGTCGCATCGAAATCCCGCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTG:1 - chr3L 12724856 5' - micropia 283 2 55.29 GTTTACATACATATATAAGATATTTCTACTGAATTTATTTCGTTGTATAAATGCACGGTAATTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTC:1 - chr2L 14222300 5' + McClintock 6180 2 72.28 GACGTCCTTTGCATTTGCAAATTTTTCATATTTTCCTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 + chr3L 14811433 5' - copia 206 2 71.82 AGACCAACTGCTCCGCCCACCGCCCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGACGATATGACGTGTAAATGGATGAAGGTATTTAAGATTCAGCAGATAG:1 + chr2L 9496395 5' - Tirant 8444 2 68.81 GTGAGTAGGTCCTCCAAAACCTCACCACCAGCATAAAAAAGCCATAACAGCGATATACTATTATCAACAATATGTTTAAAAGCGAGAGAAAAAATAGGAAAAAAC:1 - chr2R 21785471 5' + transib2 2436 1 62.86 AAACAAAGTGGGTTGCAATTTCGGCCATTGGCATATGTACAAATGTCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGCTTTTTTGAGGAAACG:1 + chr3R 20502808 5' - I-element 5157 1 59.38 AGAAAAAAAACATTCTAATATCTACATTTATTTTTAAGAAAATACCAAATTGTTTGGAAATCTATTTATATTTTCCAGACAAGAGACTATCAGATGGCCGTTACTCAG:1 + chr2L 12156891 5' - INE-1 547 1 79.63 AGTGGTCGAAAGCTGCCAAAGTCATTAAATTTAGAAAGAGATCGCCACTCACACACACACACACACACACACACACATATG:1 + chr2L 17919670 5' + accord 7030 2 80.25 ATGTAGATCTGACGAAATCGGCTGATTTTGCAAGTTGAATGATTCACAGGAACGTAGTGGTGCAGGTGACGGGTTCATTGAAACTGAG:1 + chr3R 21864519 5' - Copia1_DM 95 1 53.41 ACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACCATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 - chr2R 7981191 5' - 1360 3337 1 71.56 ATAATTTAGCGCTTAAATGATGCGTGCTTGGGTGCTTCATAGCTATGCATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 - chr2R 13699478 5' + jockey 4798 1 57.27 AAACCATAAAACTCGCCACAACAATTAAAAAGCCTGCAGCATAATTCCGGAAATGTGTTTTTCTACCATTGCGCCGTCGATGCAATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTT:1 - chr3R 18814975 5' - invader2 302 1 70.00 GTTTCTGAAATGGTTATATTTTGGAAAAGGTGAAAAGTTGTTGATGGAAAATGTGTTGCAAATGAGGAGTGATAAAATTTTCAAAAGGTTTTGGGATAGTCGACAATTTA:1 + chr2L 15816489 5' - Q-element 123 2 52.73 CACATTACTTTACAGGGCAAAATTAATAGCGAAACACCCTTCGATTGTCGTGTAAATTTTGTGCGTTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATAC:1 + chr3R 20796790 5' + I-element 4923 1 64.55 GGTAATTCAATTAAAACGAATTGTCGATTGAACATGGAACTGAATGCTCTAAGCCGATATATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 21199717 5' + jockey 18 1 55.21 GGATCGGAAGCTAATGGAAATACAAGTTAATGATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTAAAA:1 - chr3R 12040190 5' - HMS-Beagle 194 2 76.29 ATGGAAATGGGGAATGATACAAAATACACACATACTGCTTGTGTGTGTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTA:1 - chr3R 14357354 5' - Rt1b 5105 1 60.40 AGATTGATATGGTTATTTAAACTTCTAAATTTTCTATGTTGACAAAGCGTTTCCTTATGTGAACATCTATTTGTCACTTGAATGTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGG:1 + chr2L 13292923 5' - X-element 4712 1 76.36 CAAACCAGTAGCTTTTACCCTTCCGAAATGGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAAT:1 - chr2R 22663386 5' + mdg1 60 2 72.73 TTTGATGGGACGAACACATAAACTCCCTGAGCAGATATAAAAAAAATAGCTAGTTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr2L 19129404 5' + FB 26 1 53.33 AAATCCCTCGAATACGTCAAAGCGTAGTAGAAAAGAAATACGAAAGATAACGATAAGATAAGATGATAAAGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCAT:1 + chrX 19468025 5' - Bari1 1529 1 77.06 CACAAAGACAATATGAAGTTTAAGCAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3L 27174972 5' + pogo 50 1 77.23 ATACTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCACGCGACCGTTTAT:1 - chr2R 19405973 5' - HMS-Beagle 7009 2 54.13 GTTGTGCGCCGCGAAGGGATGTGTATGTATGTACACACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr2L 15963450 5' + 297 47 2 74.55 CTAATGATTAAGCAACTTAGTTATATTTGTATAAATTATGGAGTATAGAAAAATAACGATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTATTAAAGTCTCA:1 - chr3R 25163204 5' - mdg1 394 2 55.45 TTGGACAATAAAAGGAGCCAGACCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTCCAGACACAGCGTGCGATATGCTAGCAG:1 - chr2R 17762757 5' + G2 2833 1 71.43 ATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 - 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chr2L 9488231 5' - 297 357 2 62.73 TGTATAGAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGCCCGTGTGTCCATCTGTCCGCATGAAAGCCAGAAGGTTGAGATTCAGCATACA:1 + chr2L 13154261 5' + INE-1 173 1 63.30 ACTGCAAGCATTACAAAGATATTTAAATTTAGCTTCATCATCATATTGCAAAGAAACAGTAATTAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chrX 17184995 5' - roo 9051 2 61.82 TGCACAGTTCACTCCGCAGATACGTGCAGCCCAAAAGTATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCACAGA:1 - chr3L 2244214 5' + jockey 28 1 51.19 GATGCCATGGTAATATAGAGATAACGTTTAAAAGTTTTTGGGGTATCTGATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCA:1 - chr2L 22045927 5' - INE-1 548 1 41.38 CTATTGGACTCGGATTGGGTAAGAAAACATATATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr3R 28639973 5' - mdg1 7409 2 70.91 TTACTAAATCCGATTGAGCATGTACTCACATTATTTGCAATGAATATTGTCGTTCGTATGTAATAGAATTTATTTATATGCTTTTTTTTTCTTTTTTTAATA:1 - chr2L 12706833 5' + hopper 153 1 54.90 AGAGAATCGAGTTATGCAATCGCCATGAAATCAGCAACATTTCGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr3R 11526856 5' + pogo 39 1 60.91 TTACCAAGTGGCAAGTCAATTGGCATATGTCAGCGTGCCACAAACACACACACACACACACACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAAT:1 + chrX 6161709 5' + I-element 4881 1 69.15 TACTTCACAATACTACTACTAAGCCACCAAAGAGGCTGAACCGATTCTTTCCCTAACCCACTTTCCAGAACAAGTGCCTGAGGCTAATCGCTGACGCTCACCCATAC:1 + chr3R 31875372 5' + G-element 3996 1 70.09 AACAAATGACAAAAATTGTTGAGCAAATTGATTGCATTTCTTGGTTGCCGTTGTACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAA:1 + chr3L 13314466 5' + flea 4608 1 65.59 TCGTTGAATGTATACTTGAATTTTTGCATTTATTATTTTCGTCTCTATCATTGGCATCTGAGCATGCCCTTTGCAGCTCCAGTGGTCAATACCTTC:1 + chrX 8094211 5' + Stalker 7068 4 54.17 CACAGCTCCGCTTGAATTTTGGATGCACTGGCTCCCATCCTTTTTGAAATAATTGAAGTGGCCG:1 - chr2R 10784898 5' - 297 26 2 76.56 CTAATGGCACTTTTACCCTCAGTCTGTACCATAAAGTTGCAACTCTGCATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCGGTGATCGTGGGTGGAGCCT:1 + chr3L 36275 5' - Tirant 8498 2 72.64 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 21907536 5' + 412 42 2 82.93 TGCAACTTGTCTCGAGTATCAGCCACTGCTATTTACTATATTAAATGAGCTATAGCTATAAGCTATAAGCTATAAGCTATAGGCTATTGTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chrX 2552163 5' + blood 7011 1 77.27 ACACAACTCGTATAACCTCGGATGCAATCAGATCATCACCCAGCGATACCTGTTGATTTTCTAAATTTGATTTTAAGCTATCTGAATGGCAGGACGCAACAGG:1 + chr3R 25913625 5' + Q-element 418 2 53.40 TGCCTGCCGTGCATACAAAGCACTTGCATTTTTTATGACCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 + chr2R 9754713 5' + hopper 44 1 59.63 TACGATTTTCGCAAAAATGCCCTGCAGTGCACGCGATTCGACTCGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 8621732 5' + jockey 36 1 53.68 AATACAATTACCTTTAAGTACTCCCCGCCTCGTACTGTACCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTAGATTGCCCACCTTTT:1 - chr2L 2319941 5' + FB 615 3 62.73 GAAAGTAAACTTTGATTTGAAAAATTCGAATAATAAAATAGATCATATATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr2R 10859690 5' + 297 31 2 59.09 TCTGTGTTTTGGTGAATACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAAA:1 + chr2R 4673553 5' - Quasimodo 7353 2 65.45 ACCAAACCGGCAAAACACCACGTTGAGCCACGTTTATTTGGTAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGA:1 + chr2L 16067034 5' - HMS-Beagle2 7193 2 79.09 GATCCATTCACCGCTTTAGCCACCTTTTTGATTTCAATGTAACCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGAAA:1 - chr2R 2942104 5' + hobo 107 1 54.64 TAAAGATTACTTATTTATAATTCGATCGATTCATATTCTGTCTAACCTGTTCATTTTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAG:1 + chr3R 28061714 5' - R1A1-element 5083 1 65.59 CGTTGCCCTTTACCCCTTGCCCCATCTTGCCACCCTTTGCCACCCTTTGGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATA:1 + chr3R 25418840 5' + I-element 5161 1 55.45 AACTTTAAAAATACCATATAAAACTGTTCTTATCATTTTAATTGTGAATTTTTTCAAGTTTTTTTAATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAA:1 - chr2R 14848616 5' + Juan 116 1 81.25 AAAAAAAATAAAGAGTTCTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 26733986 5' + hobo 12 1 64.13 GATTGAAAACTGAGCAGGAGTGCCTCTGCGTAAAACGGAGCAGCTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chr3R 16349214 5' + P-element 14 1 58.33 AGCGCCGATCATCGGATAAGAGTGACCAATTGACCAATTCATCTTACAATCTTGAAAATAACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTAAAAAAATAAAAA:1 - chr3R 24002517 5' + HB 316 1 59.09 TACATATCCTTCTGTTCCATGTAAAACTTTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 18675630 5' + 412 37 2 67.78 GAATTTTAAACTAATCTAGTTAATAAGCCATTCCAGTGATTTTACAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2L 3136056 5' - 1360 3360 1 58.95 TATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCT:1 - chr2R 19727745 5' - R1A1-element 5162 1 61.62 AAAACTTTAAAAATACATACAAATCAAGAAAATAATTGATTTAAATGAAATAATTTAAAAATATTAAATATAAATGTTAATACAAATGATAAAAATGAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 13848722 5' + Doc 4695 1 30.00 AGTACAATAGCAAAGGCAGTCCGTGGCAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGGTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAG:1 + chr2R 4312759 5' + F-element 143 1 73.39 GCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 22663355 5' - mdg1 7421 2 74.42 GCATCACTTTCGTTTTGGCAGTTTAAAGTTCAGTGATGAAATCTATTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGCTCTTATCTTATCTTATCTTATTTTCTCTTATCTT:1 - chr3R 22937387 5' - Stalker3T 203 1 49.09 CCGTTGCCCAGAACTCGTTGCTCCAGACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTA:1 + chr3R 11553679 5' - hopper2 1547 1 74.55 TGTACCCACAGAAGCCGGCTTAAGTATAGTCGCTGTTCACGCCCCAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 - chr2R 7290683 5' + Max-element 13 2 49.25 CATGTACATAGCATTTGGAGACCCAACTCTGCACTCCCATTTTCCCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAA:1 + chr3L 9830928 5' + F-element 4241 1 57.61 AACTAGGAAACGAATGCGAAAACATTTTACCAACTTTTTTTTGTCAAGCAAAGCGACAAAAGCGAAGCGACAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGAAAAA:1 - chrX 1140952 5' - Cr1a 215 1 76.36 ATTACTTTAAGGTTTTTATCATTCTTTATGCTATTTTATTGCTGAGCGAATTGCACAAAATCGTAAAATATGATTTATTTGAAGCTTTTCCTTTATTGTTAGTCCAA:1 + chr2L 20125642 5' - pogo 362 1 69.16 TAACAGTTATTAATAATGACAAAAGCAGCTGCCGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATT:1 - chr2L 6311312 5' - hopper 1375 1 64.36 ATTGGATATTATAATTCTGCTTACATTAGACATTTTGATTTATATATGTCGAAGAGTCATCAGGATTCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCACGTTATGGTTCGCGCGCCGT:1 - chrX 722612 5' - invader1 3969 2 72.73 GCTTGGTCCAAAGGGGAGCAATGCATATGGGAGGATTGGGGACCATTAAGGGAATGCCTTAATATGTGTTTAGATATGATAAGTAGGTAAACTATAAAAATGTTCTATTT:1 + chr2L 3184052 5' + rooA 35 2 57.27 TTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATAGTTATTTTACATTATGTTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTTTATAT:1 + chr2R 16744450 5' + Cr1a 4349 1 56.36 AAGCTATGCAGATCTTTTTCTGTTGTCTCAGCGATCCGCGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAAC:1 - chr3R 26069084 5' + F-element 4329 1 61.76 AGCACACTGAAAATTAAGTATACGCCATGATGGTTCACTCAAAGCTGTTGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAATCTTGGGTCGTGTGAAAAATTAATTAGGC:1 - 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chr3R 22288568 5' - Bica 39 1 60.66 TGAGTGCACACAATCAGCGCTTCAACAAAAAAAAAATAGCTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTGGAATTTTTGACTTTAAAG:1 - chrX 9642415 5' + S-element 37 2 67.00 TGGCTTAAATAATACCCAAAGACCATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr2L 4016861 5' + opus 146 4 75.29 ACTTCTTGAGCAAAATAATGTATATTCTGCGATTATAGATTTCCTTGCAAATCCCATCCATTCCGGACCGCACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTGACAATAAT:1 - chr3R 13503081 5' - hopper 1399 1 64.55 AGTTGTGTTATTTGATGTGCAAAACCCTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTA:1 - chr2R 23354333 5' - Tabor 7264 2 75.45 CATTAAAGCGGCAACAAAGGAAAGCCTTGTACAGTATACATTAAGTATATAGAATACAGGTAGAAAAGTGGTCAATGCCTTCTGCCTGC:1 + chr2R 10722374 5' + Stalker4 226 4 79.78 TGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTTTCTTACAGGGTGACTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 - chr2R 8086860 5' + 1360 36 1 56.48 TTCCTTATTCCATCATTTAATTACAAAATCAAAAGCTGTCAACACATACACTGAAAGTATATTGAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr2L 17334480 5' - copia 234 1 73.64 GGAAGCCAAGACGACGCGGCGATAGCATGAGGGATTACAGCGCGTGATTTATATGGGATTCTTGGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAA:1 + chr3R 7046568 5' + Doc3-element 4415 1 62.24 AGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAA:1 - chr2R 5674702 5' + S-element 68 1 81.82 TTATTAAAATGTTGTCTATTTAAAAAAATAACTTAAAACAAAGTTTTGGTATGTAGTATGTTCCCTATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTTCATGGATTG:1 + chr2L 4941395 5' - S-element 1379 1 67.59 TAATAAGCCTCGCATTCTTTCCCCAGTTAATTTTAATTGCAACTGATTTATGAACAACAAAATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGCTACAATGATTT:1 + chrX 19876471 5' - Tc1 1549 1 69.70 CGGTCGTTGCAACGAGAATTTTGCCACATAGCTGACTGCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 - chrX 10119623 5' + FB 21 1 57.14 CGATATCGGTCGGCTATAGGTGCCTGTATATATGTCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr3L 17530200 5' + Tirant 8115 2 60.29 AGCGGATTATTTATAGCGTAATTATGATTACTCAATCGTAGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 + chr2R 11273995 5' + Stalker2 48 2 65.45 CTATGGCCACGTAATTTACCTGTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTCACCCGCCACACTCGGATTCGTGTTCAGATTTAGATTTATTATGACAAAGTGT:1 - chr3R 8466538 5' - Stalker 74 4 78.35 TATTGGAATTTTATGTAAATATTTGGCAACTTTATGGCTGAAATTAAAGCATCACCTTATGGTGACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAAGCGAACAAGTCACCCTT:1 - chr3L 19948935 5' + 3S18 23 2 60.00 CGACTCGCCAACTGCCCTCACTCTGATTACATTTCTTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr2L 4013060 5' - pogo 2100 1 65.08 AATTTAGTTACATTTGTGTATTATAACTGTACTATAATACAGTTTCTTAAAAAAATATTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCT:1 - chr2L 14848478 5' - pogo 2078 1 57.41 AAGCTTCGAGGAGCCAGGAAAGAGACCCACTAAAACTTTATTGGATAGATCATGATCTTGGTTAATTTCGTTTCAAATTCAATTTCATTTAAAATTTTAAAA:1 + chr2R 13759766 5' + 1360 3049 1 77.45 CTGAAACTTCTGAGAATCGTATGCACTCGCAGTTGTCATGAGCTGGCCACCTATAACCCACAACAATGAA:1 + chr3L 20082289 5' + G-element 4199 1 80.00 TATACTTTCCGAACTTTCCGCACTCATCTCGCAAATGTCAAGCCAGGACTTCATATCACTCAGCTGACAAGTCCAAAAGGTCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTT:1 - chr3R 19743675 5' - pogo 479 1 80.91 GAAGTCAATGGAATGAACTAAAGATGTACAATCTTTAAGCTCTTTATACTTAAAAATCATGAAATGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chr3L 2987447 5' + blood 5 2 71.58 AATCTAATCGAGTAAAAATCGGAATTGAAAAATTTGAATCAAAATTGGGAGTACTACACGAGGACGTGTCAAGGTCAGGATGGCCGTGTCGGAG:1 + chr3R 3266997 5' + invader4 2746 1 40.43 AAACTTGTATACGATTCGGCCAAAATCAACTCCATCACTGCCCAAAACCAATAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGTCCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAA:1 + chr3R 19170055 5' + I-element 5119 1 59.09 CTGTTTTGCCATTTAAGCCAAACAAACGATTTTGCCCTTTTTCACCGCATAACTCGCATGTGCCGTGTTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCATTAGATAACAAA:1 + chr2R 20701582 5' - roo 100 2 68.87 AGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAATACTACCACAGTCCGCTGTTGCTTGTCGTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACACTGCTTGTCGG:1 + chr3L 22908066 5' + R1A1-element 4884 1 75.47 TAAAACTGTCTCAACACTCAATTTAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGC:1 + chr2L 10496316 5' + Bari1 395 1 62.50 AAAACCGCAACAAATTCACTTATAAAAGTAATCTAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 + chr3L 17706388 5' - Juan 4195 1 65.00 TAAGGAGCAAGAGATAAATTTAAGCGTGGAGGTACGGAGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATC:1 + chrX 2721283 5' - TAHRE 10399 1 72.34 ATTGTAAATTTACATGGGTTCTACATGATTCAAATAGATGTATATTACAATAAATCATAAAACAAGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGA:1 + chr2R 18397999 5' - S-element 1695 1 61.82 TGCGTTATGTCTTTTCATGTATAAATTGCGAAGTAAATTCAAGCTCAATTCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chr3L 20039862 5' + Doc 23 1 48.39 GTCTTTCGCCGACGATCCAAGAACTGGTTTCCTATCTGAAGCAAAAGAATGGGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAG:1 - chr3R 20823699 5' - 17.6 7204 2 58.65 TACATAAACGCAGACGTCGGTACGAAACAGTGGCACTTGCCTATGACGAACGTTGTGAGCCGGAAAAACTCTAAATGGTAAATTGATAGAAATTTAAAAGACT:1 + chr3R 18125136 5' - INE-1 300 1 76.70 TTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 6707748 5' + 1360 7 2 56.92 ATTAAGGCTACACAATCGACATATGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTT:1 - chr2R 8265046 5' + roo 272 2 54.90 TACGAACATGTTGGTGTACTTGGCCGTGAAACTTACATTTGAACTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATACA:1 + chr3L 26002246 5' + I-element 296 1 57.14 TAATAGATCCCTAAAGTATGCAAGTAGATTTAAACAAGTTTGATGCAATCGTAATATATTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1 - chr3R 27071936 5' - jockey 4982 1 60.00 AACGTGTCCATAGTCAAGTCTTCCGAAAGATTTGAAGATTCTTGGCGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chrX 14853451 5' - P-element 2864 1 53.68 TTATAATCAAACGGAGTAATTTTTATTTAAAGTAAGCCACACTATGTGGCTACTAAAGTGTGAGATATTATTTTTTTTTTGGGATTTCGTGTCCGAGCTTTGAACGTGGG:1 + chrX 7007920 5' - Idefix 250 2 72.73 GAATCAATTGCGTTAATCTGGTAGGCAACCGGCCTATAAATAGGCGTCACTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 217306 5' + roo 32 2 56.07 AAAATGGGCTGGGAAAAAGGGAAAGTCTTAGTTGCTGCTTGGTGGCGAGGGGGTTAGGGTGGGTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGC:1 + chr3R 24504114 5' - G6 1788 1 55.79 CAGGTTTATTTGCTAAAGTGTGAAAAAATGAAGTGGATTTTCCTACCTCACAGAATGCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGATTGTATAGTTCCTGAGATCTCGACAT:1 - chr3R 15160062 5' - INE-1 143 1 55.45 GATACACATACATACACATACGACTATGAATTCCGGAGGAAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 9774791 5' + jockey 18 1 58.44 GCACTCACACTCGACTGCATTGCCATGGCACTATGGGGCATTTGGTCTGTTTTTTTTTACAAAAATTACTACC:1 + chr3R 11315234 5' + hopper 23 1 61.64 TTTTGACGGTTGGCCTGTGCCTGGCATACCGAATGAGCTTTAAAGAGGTATTATAAATATATGAAATATGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 17405667 5' - roo 9053 2 63.64 TTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAAC:1 + chrX 20433347 5' + diver 25 2 68.57 CTATTTTCGGGCTTATCACATTCTACTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATATCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTA:1 - chr2R 14129293 5' - INE-1 118 1 72.22 AACCATTTTGTTTAGATAAACTGTATGTATTATACATACATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGGGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAA:1 + chrX 22489623 5' - S-element 1674 1 64.22 GACAGTCGGGCAATTCATGCATTCAGATTCATGCGGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 15524368 5' + pogo 4 1 70.91 AGGGAGAACCACTTAACTACCTTAGAATTAAAAAATATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3L 18915155 5' + 412 48 2 70.75 TTCCGGTCTCCGAATTATTATTTTATTGTCTTGCCATTGCCGCATATACAGTATAATTCGCTCAGCTGCAACGATAGTTAGCTGGATCGGCAAGA:1 + chr3L 12677062 5' + pogo 26 1 50.53 GTATTTTATTTTATTTTATTGTCTT:1 + chr3R 27402576 5' + transib1 1901 1 84.00 TATGACATTTCCTCATCAGATTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 13481216 5' + roo 41 2 81.18 GTATTATAATGTTTCAACGATATTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr2R 19405915 5' + HMS-Beagle 6835 2 74.16 GAGTGCCCACATCGAGCTAAGAGTTAAATGAAGAGCGGAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGTGCAAACGATG:1 - chr3L 16073274 5' - FB 209 1 63.64 TAATTACCAGAAATAAATCAATAATGCCCGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAAT:1 - chr2L 14917952 5' + hopper 53 1 71.82 GATTACGTTGGTAGTATGCCTCCACGGCCATTATCCTTGTGGCCCTGGATCGTACTATATGTACATATACCCTATACCTGCCTGCACACACACACACATACATAC:1 + chr3R 15832185 5' + Quasimodo 39 2 63.81 GGATGGAGCGGGCAACGGGGACTGCCAATCAAGGTATGACTTCGGTGAGTAGGATATGAGGCCAGGTCGCACTCCC:1 + chr3L 18413274 5' - Rt1b 4945 1 77.63 AAAAAAAAAAACCAGCAAAGTTAAAAGCAAAGTTAAAAATCCACCAGCAAAGTTAAAAAATTAAAAGCAAAGTTTTTTAAAAGTTCAAAAATATAATAAAATAA:1 - chrX 3125961 5' + TAHRE 23 1 50.96 CGCCGTATTTAAGGTGAGTGGTTGGCTTATGAGGAGGTGGTGTTGTGTTGTGTTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGTTTGTGTTGTTGTGT:1 + chr3R 17853118 5' - gypsy3 418 1 40.59 GTAAAACAAAAAAGAATGCAATGTGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTG:1 - chr3R 23620388 5' + micropia 353 2 76.24 TAACTGTAGAAATTAAGTTCTATATATAATTTGATCATGATCCACCATTTATGAAGCTATTCGAAAATACCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr3L 9822211 5' - pogo 2087 1 50.00 CAGGCGCGTTGACTAGGTAAAAGAAAAAAAAAATCTCAAAAAAAAGAACGAGTGAAAGTTGCTTGCTATGGGATTTTTCCTTAAGTTTC:1 - chrX 12650401 5' - F-element 4432 1 70.79 ATTGTACATGTTTCACTGTACAATACACTCGTACACAGAAATGAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGGACCTGACAAAGTGGAGTAAGTGAAATTAGTT:1 - chr2R 16476426 5' + X-element 44 1 52.04 TCAGATTTACAAAAGCAATAAAAATATGGAAAAGACTTTGACGACTTTTATTATTAATATTTAATTCGTCAGTACCACTTCAACATCCGAAGAGATAAGTCGT:1 + chr2L 21784830 5' + I-element 13 1 66.99 CCAGTTAAGGCTTTATGCAATTTGATGAACGAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAAATC:1 - chr3R 28892682 5' + F-element 4227 1 68.87 GAAGGGCGATGTCCAAGCCCCAGCACCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr2L 16254043 5' + FB 27 1 70.51 GAAATGCGAGGAACACTCGAATAAATCGTTATTACATTCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATG:1 + chrX 11802197 5' - Quasimodo 415 2 57.78 CTCATCTGCATCTGGGAGGGAATAACTGACCGATTATAATTAAGTCTCAAACTGAACTCTACTAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTC:1 - chr3L 18121843 5' - Idefix 423 2 78.18 AAAGTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGACACATCACATCGATTCAAAATCTCGTTCTCTGAACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAAT:1 + chr4 909119 5' - INE-1 542 1 68.93 CTTGGGCTTGGGGTTTTTGGGATAGATATTCCTACAGAGATTGAGATTGAGATTGATATATTAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGACAGTG:1 + chr2L 7622355 5' - Circe 45 2 51.40 CTTGTCCAGCATATTTCGGTTGATCACCAGCTTCAGTGTCTCTGTCGGGGGTGTTTCGAACAAACCACTC:1 + chr2R 12969641 5' - X-element 4332 1 77.14 GCCCATGGAGCATAGAAAGTTAAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGTTCTTTTTTACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACATATGCTCATGCATTG:1 + chr3L 5337107 5' + 1360 184 1 79.09 ATGGAAATGTGATTTGTGGTGCATTTTTCCCGTCCGGTGTTTAAATTTTATTTAATACTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGA:1 - chr3R 19675903 5' - Tirant 376 2 50.91 GTCTGGATGCCCTCTGATGCATTCAACACTTTTTTCTGCCCCGCTCATTGTTCGTGCAGTGTTTTTGGTTGTTACACTGGTATGTAGTGTACATATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 14748226 5' - accord 7033 2 51.82 ATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATTTTATCTTATCTTATCTTCTCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 78.18 GCCACGCACCTGATACGCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr3L 19063481 5' + P-element 27 1 23.94 TTTTAGGGTTTGATTTACAAATTGTTTTTTCTTATATTTATAAATAAAGTACAATATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATC:1 - chr2R 883146 5' - F-element 4663 1 58.95 CCAGTTTGACCCGAATCAAGTTCGTAATATAAACATTCAGATATTCATAGCGGCACACCTGCCGTTATTTCTGTCGACGTTGC:1 - chr2R 5795312 5' - gypsy9 175 2 59.04 TTTTTACGCCTCTTTTGCTTCCTCCTTAGCCATTGAGCAGGGATCTATAAAAAGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGT:1 - chr2R 8191627 5' - Bari1 242 1 52.73 GGAACTGCGGACTTGTCCGCTGCCTAATTAGCAACGCATATTTAAATAATTTTCAATTCGATAAGCAGACATTTTTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATT:1 + chr3R 10482173 5' - Doc 4592 1 73.64 AGAATAAATAAAAATAAAGCGCAAGTGAACTTAAGACTTTGAATTACAGACCGAGGCAAATTTCATGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAG:1 + chr2R 20711811 5' - I-element 5101 1 73.40 TATTTGGTTGGAATTTTACAAAATTGTTTTGACAATTGTTTACTTTTCGGTCATCTTAACGATATACCTATTAAATTATAAAACAAGTTAGCCTTTACTCAGCTAGTGTG:1 + chr2R 13155898 5' - INE-1 539 1 90.91 ACAAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 + chr2L 21089153 5' - flea 4980 2 59.09 CGTTGTTGCGGGTGTTCATCTCCAGGGTTCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAA:1 - chr3R 29853779 5' - Stalker4 6943 2 65.85 ACGGCTGAAAACTTGTAAAACTTTTAAGTCACTTAGCCTGAATGTCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTT:1 - chr2R 6968925 5' - Porto1 4415 1 69.23 AGACGCTTTGTTTACAATGTTGACCCTTACTTTATTAATGAAGTGCTTAAGTCAATTAGGTTAAAGAAAAACTGCATTCGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr2L 15763803 5' + blood 7017 2 76.36 CATTAACAAGCGAAATTGCTGCCAGTAAATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTA:1 - chr3R 23621041 5' - roo 350 2 72.73 TGGTGAGGGTGTTGTGGAACTGAAATCGAGAACACAAAAAATATGATAAGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGT:1 - chr2L 8476803 5' - Juan 4215 1 76.36 ATAGATAGATCAATAGATCGTTGCAATAAATAAAAAATATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATTTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:1 - chr2L 21822344 5' - Juan 4163 1 63.64 TGAAGAAGGACACAATGTAAAATGATATCATATCTCTTAATATCTCTCGCCTCGAGCATTCGACATGCATCATTAAAAGTTTTCCCATTGGCAGACTAAATAAACTTCCA:1 - chrX 8516227 5' + G5A 2579 1 73.64 AACACAATATCCAACTACCACATATATATACATAGCTGCCTAGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTAT:1 - chr2L 16067143 5' + HMS-Beagle2 6915 2 55.45 ATTTCCTCGTTCTTTGCGAGAAAAAGAAAAGGGTGCGTCGACATGAGTAAGCTAACAAGCTCTTTTTGCACGCTTGATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGAA:1 - chr3R 5216660 5' - INE-1 151 1 65.45 TTGTATTCGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTTCCCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 18883365 5' + roo 20 2 68.57 AAGCACCTTTAAGTTGAAGTAATAATTAAAGTATCCAATCACACGACGCAAGATTAATACTCTAATGACAAATATTATTA:1 - chr3R 6089073 5' - 1360 398 1 53.75 GACTCTCCAGTGGCAACAAGAAAAAATGGCCGCGCACGCCAAAAATACACACACACACCAACGCACACACAGATTATGTAAGTGAGCGCCTATCTCCAAACCC:1 - chr3R 19164545 5' + gypsy3 453 1 66.99 TAAGACCCAAACATTTTAGTAATAATCTAAGTAAACAGCAGACAAGTTATATAAATCTTTAAACACACCCACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGC:1 + chrX 2679154 5' + accord 209 2 73.64 GGGGATATGGCACGTACTCAAAGTCCACCGCCCACTATATATATCCTTATGCTCAATATATACATATATATAAATCAACCTGAGTCATGTATAACCTTACATACACTCTT:1 + chr3L 16258895 5' + Transpac 7 2 75.45 ATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAGATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr3R 14688302 5' + pogo 51 1 74.29 CAAACGAGCAAACAAAGTTTCTATAGTACAAATGTTAACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAG:1 + chr2L 5776562 5' + Doc 4462 1 64.76 GCCCGCAGCGCTTTGCCATATCCTGTACATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGCCG:1 - chrX 22769397 5' - 412 7510 2 68.18 CCCCTGTCTTGTTAATTGTTGTAAGGTCCTGTCCAGGACACATTACAAACATTACATTCTACTTTTTCACGAACAAAATGATACTTAATATCTATGTGCTT:1 + chr2L 16093840 5' - Copia1_DM 4127 1 55.45 TTTGAGTTGAAGGCTTCCTAATCTGCCATCTTTCATATCTCTCAATCTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTAT:1 + chr3R 13276561 5' - invader2 487 1 58.18 CACAGGTATTTTCAAAACTACTACAGATTACGCATACCAAGATATTTTGACAAGCGATTAATTTGTAAACTATAAGTTGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 + chr2L 23001093 5' + INE-1 21 1 60.91 GCCGTATCCAAATGCCCATCTAGTTAGCTGTAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTGCTGTGCTGGTAGCTGAAGAGCTTGACACCGTTTGG:1 + chrX 6639600 5' - Doc3-element 463 1 74.55 TATTTGTTAAATAAATCACATCACCCATCAACGCTACCAATCAAAAGTATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAATATCCATAAAGACTTA:1 + chr3R 12666242 5' + G4 3545 1 74.31 CTACAGAGATAACTACTTCTGGTCAACAGATTTAGCTACCATGGTAAAAAGAAGGAGAAATCTGAGGCGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGG:1 - chr3L 26865304 5' - baggins 5031 1 69.07 AATAGTGAAATACATCTTTGGGTTGATTTTGACAAGATAAGTGATAGTGAAAATGTAGTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTA:1 - chr3R 25402486 5' + invader4 212 2 57.27 GGGCCGATAACAGGTGATGTCATGACACTTTTGCATTGCTTCAATCGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chrX 18483228 5' + pogo 4 1 67.95 TGTGAGGTACTAGCACAAAGGGAAGCTTCTTCCCAGCCAATTCAGATACAGATACAGTTTAGCTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAATTATGAATAAATCCCTATGTAAG:1 + chr2R 8741675 5' - Fw2 3670 1 62.73 TGGAGCAGATATAGTCCTGATCTTTGGAGAACTCGTAGTACTGCGACAGGCTAGGGGTGCGATGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTT:1 + chrX 6132264 5' - I-element 4934 1 73.63 AGGGATTTCCTGGCAAATCTTGTTTGTATTTAATCTGTTGCATTTTATTTTTTGTTATATTCCAATTTGATATTTTTAAAAAGCGCGCAATTTCATCATATTGCTACGAA:1 - chrX 13008608 5' + 1360 3108 1 63.64 GAAACTTGAGACTGTTCAAATGCTAAACCCTCAATTTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGGGCTTAACTGAG:1 + chr2R 19929985 5' + Transpac 5120 2 75.45 TAAAATAATCAAGCACATTTTAAGCTCAACACCTAACCGTATACGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGAC:1 - chr3L 22709291 5' + 17.6 164 2 54.44 CATTCAGTAAGACAACACCATTATCAGCACTGATGGTTTGGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 27275854 5' + 1360 20 1 68.67 GATGTGGACTTTAGGTTTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGC:1 - chr2R 6707764 5' - 1360 3377 1 61.63 TATAAGCAACTTACACCCTTAATTTAATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGAA:1 + chr3L 18095510 5' - I-element 5316 1 67.00 GAATGGATGGAAATTGTATAGATGTACAAGTTTGTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 15524467 5' - pogo 2084 1 63.16 CTCCATGAAACAGTGAAACAATGGCTGCGGCCCTATACGAATTCAAAATAGCCAGCATGTATTAAAAGACTTTTGGCCATTTCC:1 - chr3R 8590406 5' + frogger 2038 1 58.33 GTTGTGCGTGAGTTGCTGCCTTTGTCTCCATGTCTGCGTCTCTGTATGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGTCCAGAAGGTTGACGGCCGGGTGGATGT:1 - chr2R 17389937 5' - G2 2869 1 55.67 TCTCATACTTAAGACGCATATCATTCACGCCACGCTTCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chrY 975843 5' - 1360 3342 1 66.06 ATTCGAAGGCGATTTAAAACTATGCACACAACTTGTTCTAAAAACCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGAGTGAATTTGTAATAATTATTTTATTTTATCACATTGCTA:1 + chr2R 15769812 5' + 1360 3104 1 62.96 AAATGACCACCCGTATGGGGAAAACATGTATGTATTGTAGTATGTATGTAAGCGCAGCAGACAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2R 23230569 5' + 412 20 2 61.32 GTTACTCTATTGTTGTCGGCTTTTCGCCGTTGCAAATATGTTTTGAAAGCAAAGTCATGCTTGTTCACTGCCCGCCTTATT:1 - chr3R 4834816 5' - diver2 4453 1 75.31 CACAAAGCCAATTTCAGGAAAAGGGAGCGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAATTACTTTGTATATTTTTTTGAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCA:1 + chr2L 8567253 5' - Cr1a 139 1 79.09 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTT:1 - chr3R 21907535 5' - Porto1 251 1 34.55 AGCAATTCCTTAGAACAACTTTCTGTTCGCCTTTCAAATGGTGAGAAAGAATGATTTTTCAAACGTGTTTCAAATCATTTATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3L 16496655 5' - hobo 2937 1 76.15 ACAGGGTATAGACAAAAAGAGTACGCGATTATTTTTGTTATACAACAGCATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTC:1 - chr3R 11200802 5' - Tabor 93 2 55.45 GTTGGCCAAAACCAAGTCAAGGTGAGCTATGACGAGGATAATGTGAGGTCCGATCGGGTTGTCAAGAATAGTGTGTTAGAGGGAGATGAAAAT:1 + chr3L 2517283 5' + invader4 2915 2 54.84 TAATTCCACATTCTTGGGTATCCGTTCCAGGATGCCGATGTCCAGGATGTCCCCTTCTTCCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTACTTCT:1 + chr2L 13575828 5' - I-element 426 1 67.74 GTGTGCCGCATGCCAAAAGTGCCGTACCAACGTACCCAATGGTTGATGTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGC:1 + chrX 455138 5' + R1A1-element 5139 1 62.96 GTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGGCA:1 - 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chr3L 2033856 5' - 297 6967 2 74.55 GTTATAAAAATAGACGGTCTCCTTGTACGTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAA:1 + chr3R 19444789 5' + copia 5056 2 80.85 TTAAATATGCAAAAGTGGGCGTTCGCTGGTTGGGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTGTAGATCTCGTCATCTACCCATG:1 + chr2R 15719939 5' - G2 2806 1 72.92 TCATAACTATTATCATAAGTGACAAGTAATAACCTTAGCACTCTCGTAATAAATTTATTTACATTAAATTTAATTTGCACACCTACTAGCTGAGTAATGGGTATGTGATA:1 + chr2R 16287456 5' + INE-1 546 1 75.45 TTTTTGTGGCAATGGGGAAAACGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGCACAAGTTGGTATTGAATT:1 + chr2R 11767644 5' - I-element 4995 1 77.55 ACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:1 - chr2R 22661279 5' + Transpac 46 2 70.30 CAGACTCTCACTTGACGCCCCACACTGCAGGCTGGCTATTTGAAGGCTTCTACTTCCATTCTATTGTAACACATTAATAAAAGGAAAGAATA:1 + chrX 15817912 5' + Bica 122 1 70.65 TTTAAATGCACAGAGCATTACAAAAATGACGAAAAAAATGGCCTATTGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACA:1 + chr3R 26754744 5' + INE-1 144 1 58.10 ATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAG:1 - chr4 1271898 5' - 1360 92 1 72.50 CAAGCGATACTCTGCATCATTTGATATTGCAGATGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCT:1 - chrY 1995261 5' - gypsy 412 2 72.73 AAGGCAATAAATCTTAAATTGATAAGATGAGATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 + chr3R 15697053 5' + 3S18 5806 2 67.37 CAACACGCCACCTCAAAGGTTACATTGCTGTACTTTTATTACGTGCATGTCCTTCTGGGGAATAATTTTGATCCAGCATTCGCTGCGAG:1 - chrY 975553 5' - copia 4752 1 91.01 ATTTTGGTAGCTTATATTAAAGATAGATAGACTTGGAAGATAGGAGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2R 15374744 5' + 1360 17 1 43.64 CTCCGGCATTTTGAATGCGTTCTTGCTCTTTGGGAGAAAACGGCTTTTTTTTCTTTTTCCTTTT:1 + chr3R 26344930 5' - Doc2-element 239 1 68.75 GCAGTCGACGGACCACAAATGTTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3L 15968269 5' + P-element 1 2 76.34 GAGGTCAATATCACAAAGTTGAACAGTTGGAGGAATTCAGTTCGTCACTAGTTTAAATAGGACGCCAACAACTACATAAGCAAGCATTCCAGCGCCCAAGCAATACGATC:1 - chr3R 21004091 5' + Stalker 6990 4 59.09 ATAAACTGTGATGATTGTGAAATGAATTATATGGTTAAGATATAAAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 + chr2L 14708864 5' - opus 7459 2 65.14 ATGGCTATTTATAGAGCATTCAAAAGTCCCAGGTCTCTAAAACTATATTTCTAAGCGACTTTAATTGCTCAGAGTTATTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTA:1 - chr3L 14820380 5' - Stalker3T 202 1 72.73 CTACCCCCCAGCCTTGCCCACAGCCAACAGCCCACAAAAAAATAATAATGAAAATAAAAGCTATGGCAAAAAATCTAAAAACAAACAATTGCACATAAAAAGCCAGCAAT:1 - chr3L 17003649 5' + I-element 5211 1 70.91 ACCAACGACCCCGAATATTTTCTAGGAATTTACGCAACTGTCATTTGCAGTGTTGAAAAGTGTTTTTGTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chrX 21399375 5' + pogo 13 1 69.09 AGGAAACAATAGCTAATGCCAAGCCGACTGCAGATAAGAGTTTCTGAACTTGGAGCGTGATCGTGAACTTGATGCAGCGCGAATCATTTCATAAAATGACATTTAGTTAG:1 + chr2R 8614248 5' + Doc3-element 4638 1 70.91 AAAACCTCAAAAAATGGGTCAAACTTTTAATTGCACTTTGGTTTTTGGGAAAACCAAAGATTGGATTCTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCT:1 + chr3R 26583661 5' - F-element 4338 1 62.73 ACTGAAGAAACCATTTCAATATATTACGACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 + chr3R 27071881 5' + jockey 4706 1 75.00 TTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTTTTTATTGTTTATTGTTTTTTTTTTATTGTTTATT:1 - chr2R 21358403 5' - BS 5095 3 41.57 ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGA:1 + chr3L 20525229 5' - 1731 4592 1 58.18 CTAAGCAACCCAAAAACACCACCCTGCCAACAGAAGACTTGCGAAAATGCTGCTTGTAAAATAATACGGCTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACA:1 - chr2R 19575108 5' + I-element 4960 1 60.58 TATAATATTAGTAAGTTTTTTTTTTATTGCCAACTAATTCTTTTCTTTGAAAAAGTTTCAGAAAATGGAGAAACGCTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGCTATT:1 + chr3R 8972370 5' + Tc1 1627 1 64.55 GACTTGACTTTTGGTTTTCCCTGAGCCCTGCTGAATCCTTCGTCCTGCGCTGTTTCGGTTTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGC:1 + chr2L 20629895 5' - invader6 4836 2 64.71 CAGCTACCAGAGGTGGTCTTAGCACTTCAAATAGGCAGAGTCAAACGTTATTGCTTTTGAAACACATACATACACAAACACACACAAACACACA:1 + chr2L 4678286 5' + gypsy3 421 3 65.96 ATAACCAAACCGTATAAATACTCAATCCATATATTGAAATGCCATATGCGTGTGGGATTACCTTGTAAAGTTATGACCTTTTGTCGTGCCAACCCAATACGCATGAGAT:1 + chr3R 20798221 5' + Q-element 698 1 64.22 TACACGATACAGTTTGTGTTGTTTTTATTATTGCCCACCAATTAGTTTTTTTGCCCAGTTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAA:1 - chr2R 21397952 5' + FB 120 1 67.78 TAAAGGATGTGGTCAAGTCATTGGACTCTGTGGCACTTACAATATTTCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr2R 9963733 5' + pogo 7 1 65.43 ATGCAGGGGAATTAAATATTTTCCTTACTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 + chr2L 5600883 5' - jockey 4920 1 79.09 TCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATA:1 - chr3L 20187436 5' - FB 862 2 77.27 TTACCAGAAATAAATCAATAATGCCCGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTAT:1 - chr2L 14917949 5' + hopper 56 1 72.73 GTCGTTAGGTTCGATTTCATTATTACATATTTGGCGATTGTTTCCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGATA:1 - chrX 17456105 5' + jockey 4678 1 62.32 ATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 74.55 GACGCCTAAGGCTCAGAGAAAGAATAGCATCAGTTCGGAGACGATTAGCGAAAGTGGTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGA:1 - chr3R 16093328 5' + gypsy 50 2 58.65 TTTTCGTCTGTGTCTGCCAATGACATTTACAGGTTTTGCAACTAGCAGTCCGTGCAGGACACTCGAACACATGCACACAGACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACAC:1 - 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I-element 5325 1 58.95 CCAGTACTCAACAGTGTATGTCCCATTCTATTTAAAAAGAAGAGCCAAAAACAAACTATTAAAAAAAGCAGCAAAAACACACAAATAAACTACTTAGCCACAAAAACTCA:1 + chr3R 24502665 5' + Porto1 4464 1 53.64 TTGTTATTAAATCTTCAAATGAAACTTTAAGATGACTTTAAGTTTTAATGTGCAAGCAGTGGAGATTTGTTTTTTGTCAAAACGAGGACATTTTTATATGAAATATAATT:1 + chr3L 16222187 5' + S-element 93 2 34.55 CAAAAAGCTTGCCCACTTTGGAGCTCTATTTGAGCGTTATTAATATCCGCACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAG:1 - chr2L 5875504 5' + F-element 4326 1 77.38 GAAATGGAAAATCAGGAAAACCCACCAGCAGATAAGCGGTTCGATTGAAAAGAACATAGAATGGCACATTTACAGCCGTGTTGGAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26142435 5' - Tc1 1476 1 54.46 ATCTTGGATCGTCGTTGACGTTGTCGCTGTTCTCCTTCTTGCGCTTCAAGCTTCGAGTTTTGCATTTAATTACTGCTCACATTTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTA:1 + chr2R 14119998 5' + F-element 4251 1 77.06 AATTATGCTATGCTAAAAGTTGGGCTACAAGGTTTCTCTGTTCAGTTTGCACTTATACAAATACGCAGTAATCGTAATATTAATATTAATTAATAATGAA:1 - chrX 15326970 5' - Tc3 269 1 62.00 AATTTTTTCATAATTTATTTGTGTCCAAGGCTCGAAAACACATATATCAGTTGTTTAACATTTTATAACGAAAATATAAACAAATGAATGTGAAT:1 - chr3L 11374784 5' - S2 101 1 64.21 CTTGTTTAAGCTGGAAACTGTAACGAATGACACAAAGCAGTTGTCTAGGGATGTGAATGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGT:1 - chr3L 23236590 5' + Stalker2 27 2 56.36 GCTTACACTCATATGAGAACAAAATGATCTATAAAATACGTTTAATAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 770056 5' + roo 8697 2 59.22 AGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 + chr3L 4264967 5' + Transpac 4962 2 60.00 TTATGTACACACTTGCGGGAAATGGTGGGCCGTGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGAGATTGGTA:1 + chr2R 7410264 5' - I-element 229 1 70.91 CCTGCCGTCATGGCCCCAAAAAGTGTGCTATACATTTTGTAAGCTGCTTTCGATGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAAAAAAATTAATACCTCCTA:1 + chr2L 6311238 5' + hopper 28 1 55.45 TCTTAAATTTTCACTTCAAAGTACGCATATTGGAGCACAACATCCCACACTTGAAATACAACCAATTTCGTTAGACCACCTCTTCAAAATAAATATTTCAAATA:1 + chrX 17764857 5' + FB 472 1 51.92 TGTTGTGTTGTGTTGTGATGTGTTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3R 21907535 5' + 412 7095 2 74.73 TATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATT:1 + chr2R 5064833 5' - Stalker3T 200 1 79.79 GCTTATCTAAAGAAACCAAACATTTTCGAGTTCAACTATTAAGGTTGCTTAACTTCCGGTCGTCCTACTGAGTGCGCCAGTTACATAGTTTTTTAATTGAGCCGAACAA:1 - chr3L 14520784 5' - McClintock 6422 2 60.55 TGAAGAGCAGTGAAATAAAAAAAAATTCACGCATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGA:1 - chr2R 4137587 5' - HMS-Beagle2 260 2 70.00 AAAATATATTATAGTTGACAATATTCTAGATTTTATATTGTATATGCAGAATATATATATATATTAATACTTTAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1 - chr2R 16060155 5' + Doc 56 1 68.57 AACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTA:1 - chr3L 15099645 5' + G4 3815 1 39.09 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTCCTCCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCG:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 5266 1 55.56 CCGAGGCCTTGATCATTACGGGGAAGCCTGAGTGAAACAAGAACATAAACAACTTGTTCGGAACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2R 7981096 5' - 1360 3388 2 80.00 ATTTTGTGTGATTCATTATGTTTCGGTTAATGTCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGT:1 - chr3R 19438938 5' - I-element 4946 1 69.44 CATCAAATTAACCATAACAAACGGCAAATAAAAGGGTATCTTTTTATTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATG:1 - chr3L 19951263 5' - Ivk 5339 1 59.09 AATGAAAAGCGGGGTGAGGGTACCCTCTTTAGTGCCCAGATAATGCCGCAACCCCTTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAATTTTTTTTTCGATTGCCC:1 - chr2L 14464188 5' + FB 414 1 63.64 TCATTCTGGAAATGCCTTTGCATCGAATTTACACAGCTTTACCGAGTACACTGAAAAAAAAACAGATCTTGAAGAAAATACTTATTCAGCTTAATAAAATATATAAA:1 + chr3L 4617381 5' + transib4 2272 1 47.66 TATTACTTGTACTTTTGTTTGCAATGAGAAAGACTTCTAGTGTTGTTTCTAAAGACGAAAGAGCAAGAAAATAAAATAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTG:1 - chr2L 61912 5' - Q-element 233 2 78.18 CAGTTTTGTTCTCGATTTTGTCGCCGTTTTGTGCATTTTTCCCGTCCGGTGTTTAAATTTTATTTAATACTGCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 + chr3L 17530107 5' - Tirant 388 2 70.91 AAATTTGGTGTGCCCATATTTATTTGAGACTCTGCGTGCGTGTCCCCGCTCCAAAGCCCCCCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCA:1 + chr2R 24626961 5' - Rt1b 4709 1 54.95 AATACTTTTTCAACGAATTTTTCAATCCAATAACTTCTTTGGATCAAAGACACTAGAATAACACGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3R 19447093 5' - 1360 3355 1 58.59 CTACCACTACTCTTACTACTGATTTTTATGGCAGGGGGCGTTTTTTTTTTTAATTTTTTTT:1 + chr2L 8331079 5' - Doc 4694 9 57.38 AAATAGCACAAAGACTTGGCCAATAATTGATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGACTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 29635216 5' - mdg1 366 2 74.55 AATTTAGCACAAGTTGCTTAACATCATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAA:1 + chrX 20433345 5' + diver 56 2 76.70 CGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAA:1 - chr3L 15099643 5' + G4 3817 1 37.27 GTGTGGATTTGAGTGTGAGTGTCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chrX 18009515 5' - P-element 2859 1 36.36 GTAATTAAGTTGAAGTCGCATAATTCAATTAACGTCTTGGCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTCTGTA:1 + chr3L 10407543 5' + roo 8709 2 62.39 TTACTTACTTTTCAACGAATCTAGTATACGAATATCGGGTATAAAATGTATGGTAGCTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTCCTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTAT:1 - chr3R 28636017 5' - Chimpo 146 1 56.36 TATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr2L 22775586 5' - pogo 2086 1 64.81 AACCAATAAATGCGAAAATTGATCTAACTTTAAGAGTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr2R 8086798 5' - 1360 3351 1 66.67 GATTAGCACTCACGCACTCAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chrX 4263026 5' + Tirant 20 2 67.65 TCTTGACCTTTTCCTTGACTGCGATTTTCACATCATTGGGCTCTTCTGGTGTAATTGATGGGTTATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCG:1 + chr3L 2050020 5' - F-element 4376 1 68.09 AATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGAC:1 - chr3R 23020988 5' + INE-1 561 1 40.00 TGGAGCACTTAGCGGTTCGCTTTTCAAGATTCAGGCTATGTAAATATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTG:1 - chrX 15043196 5' - S-element 1706 1 63.53 CGTTTTATGCTACACTTTCAGTCGGCTTCGAGTTGGCTTACTGTTTTATTGTTTTGTTACAGCTAACTTTTGTTAGCCGGCGCTCCTGAAAGGGCTGAATTAATTACGAC:1 + chr2L 14073801 5' + BS3 1708 1 60.91 CGTGCGCTCGAATCGGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 - chr2L 5338038 5' + F-element 23 1 56.52 ATAACATGTTATATAAGGAAAACATTGAAAATTCCTTAAAAAGTTTACTTAACAGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGT:1 - chr3L 7219780 5' + roo 8695 2 50.00 TTGCCAAGACAAACATTGTGTTAAGTGGACTCCCACACACAAACAGAAGCGATCCATACGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 + chrX 15202678 5' + hopper 26 1 55.45 TGGGTAGGATGGATTCTAGCTGCTGCCAGTTCATTTGGTAAGGGAAGGAGCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3R 29345617 5' + roo 14 2 53.41 AGCACAACGAGAACAGTGAGAAAGAAAAAGACATAAAAAATCAGATGTTCATCAAAAACGCGAAAAAAAGGTAGAAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATC:1 - chr2R 1340498 5' + Quasimodo 106 2 72.73 TTACGTCTTTGTTCGTAGCACCTTCATAAACCTACTTCTCTAACTAAAGCGCGCACAACTGCCGCTGATCCGAAATTGTAAAATGCCATAAATTGTAACTATATATTTTA:1 + chrX 13847790 5' + TART-B 10560 2 67.27 AATTAAATGGAAGACCACAAAGCCAATTTATATATGGTCCAAAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATT:1 + chr3L 16682005 5' + FB 13 1 58.23 TGTGCATTTATGTATACAATATTGACAGAAAAATGTACCAAACTCTTTTTTTTTTATTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAG:1 + chr3L 20895108 5' - F-element 4638 1 62.39 AAATTTAGCTATACATCCAGTACAAAAGACCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 - chr2R 14884066 5' + mdg3 5276 2 59.63 CGGCAACAACGTGATTGACCAGCAGCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACAAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATTTAGATAA:1 - chrX 1247217 5' + I-element 5119 1 75.45 GCATTACATCTCCATATTCATACATATACATATACATTTCCATATACATACATATACATAGTGGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chrY 2720332 5' + Quasimodo 6 2 67.44 GATGCTTTACCCATCCCTGGAGCCACATTTATTTCCCTTCTGCCGCTGGACAATTGCAAACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 - chr3L 15614515 5' + jockey 4672 1 72.15 CAATAACAGAGGCTATAGGGATTTCACAATCGGCAAAACAAAACAAAAATAAGAAACTTAAAATGATTCTTATAGATAACAAAGACTCACAG:1 - chr3R 20362020 5' - Gypsy6A_LTR 126 1 65.22 ATAAAGAAGCATTCCCTGAATGCCTTCATGTCGTAGTACTTCTCGAATTATGCTCGTATGCACATAAGCATACGCAAGAGGCGCTCTCGCGCAG:1 - chr3L 24031816 5' + Tom1 204 1 71.28 CTGCAACACAACAGCAATAAAACTGCAGGACACACACGCACACACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTA:1 + chr3R 29384870 5' + I-element 112 1 58.65 CTTCCGACTCGAGCTGCTGGTCGGATGTGTTGATTTGGTCTGCAATTATTTTGTAATTGTTTTAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCA:1 + chr2R 6438343 5' - Stalker 7222 4 57.27 TGTCTCGTAGTGACCGAAGAATCGCAGTAGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGG:1 + chrX 260170 5' + invader1 3581 1 61.33 TCATGCGGGTGAATTGAAACAGAGCATAAAAATCAAGTAGGAACAAAAGTAGAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chr3R 15524396 5' + pogo 31 1 56.88 CAATTTTTTTCAATGATTCTCAATTGCAAACTGAATTGAGTTTAGTTAGGTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTT:1 + chrX 8518934 5' + S-element 33 2 55.45 ATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAAATTAAAAAAA:1 + chr3R 23638115 5' + Doc2-element 254 1 62.50 AACCTGCGGCCTCGTTGTACCTTGTACGCTCCTTTAGCTGCACCTCATTTTCCTATTACAGTTATTAACTAAAATGCCCACAACA:1 - chr2L 12601728 5' + Bari1 369 1 60.00 GTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACTATAAAAATACTTATATAAAGTCATAATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAG:1 + chr2R 6947359 5' - 1360 309 1 71.82 GTTTCCCGCACAAAATGAGGACACTTCTAAGTGGGGTTAATGCTTTATTGATCGGCGGTATGTGCTGGACAAGCTGCACCCCACTAATAATAATAATAATAACAACA:1 + chr2R 21177722 5' + mdg1 19 2 67.29 AATCTGAAAGAAAATAAATACACATAAGGAACAACTAATTAAAAGCAAATTGAATTTAAAACTAGATTTTCAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTA:1 - chr2R 1080312 5' + Quasimodo 149 2 69.09 TTATAAGTTAAAAGTTTAAAATTTAAACATTTAATGGACAAACTAAAAGCGAAAAATTAATCAGTGAATTAATTGTGCAAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGG:1 + chr3L 6501954 5' + TAHRE 267 1 80.91 TTTATTTTGGTTTTGGTTTGGTTTCGTTTGGTTTGGAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACT:1 + chr2R 15392920 5' - Tirant 467 1 65.05 AAAACAAGAGAGTACGAAACAAATATAAATTTATGAACAGGCAACAAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr3R 7500928 5' + FB 31 1 57.28 GAAATCAAATCGATCAAATTAAAACATTTTGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACATCACACCCATGCGATTACCTTAAACAAT:1 + chr3R 21960204 5' + I-element 4881 1 70.64 AGTGTTTGGTGCGGCCTTTGTCAACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACAACCCGATCGAACCTGACAGCTGCAGAGGCTGTCCGCGCCTC:1 - chr3R 20093253 5' - invader4 2860 2 77.00 AACATAAAACATTACGGCGAATGACGACATAACAAAACGGAGACGAAGAATCATAAAGAACAAAAGCTAAATCCACCAGCATAGCAAAAATAAATTAACAAATCAAATAA:1 - chrX 14326070 5' + HeT-A 311 1 73.64 GAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTCGTTTTGAGTGAAG:1 - chr2L 5338020 5' + F-element 59 1 65.45 GTGCGGAAAATTCACTTTTCTACCAGGAGAACTCAGCTTAGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTTTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCC:1 - chr3L 878189 5' - 17.6 7168 2 63.64 CACGAATCTCTAATACCAAAGTCCTTTTTAAACACAATTAATATTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAA:1 - chr3R 29362840 5' - F-element 4633 1 70.91 CATATTTCCCTGCATGAGAAACTCCACACCAAATATCGTACAAACTTCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr2L 14135394 5' - roo 9038 1 58.65 TGTCTGAATGTTTGTCTGCTGCTCGCAGGTTTATTGTTACTGGTTTTTTCACTTTTCATCAATAAAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3L 8919722 5' + roo 8685 2 61.82 ATTTTGTCTTTACAAATTTCAAAAATGTTAAAGAAACAATTAGAATAATATCTCTTGCTGCTTCGTTTGTAGGTGTGTTTGTGGGGGCGTGCGTATATGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 14548166 5' - accord 189 2 58.18 TGCTGCACGTAGAAGATAAAAGTATTTAGTTGTAGCAAGGGATTGCCCCCAACTCTTCTTGGGGTTGATTATTTATTTGTTGATTATATTTGGT:1 + chr3R 18880914 5' - FB 331 1 73.40 CAATATACGAGTCTAATTCCTTGACGTTTACGAATAAGATCAAGAAATTGAGCGTGGTTACAAAAACAACTAAATTAAGGAGCTAGTACACGAAATCGGAGGAAGCAAAT:1 + chr2R 5252704 5' - 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chr2L 21762411 5' - INE-1 566 1 58.18 GGCTAACAGGTGTGGGGATCGCTCAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr3R 16349261 5' - P-element 2869 1 38.81 ACCCATTAAACATAGTTTTTAGATTCATTTTCCCAGTTCACTTCCGCATTATCTACTTTTCGTTGTCGTGTAAGAGTTGGAGGACACACTGCGGTGAGCTAATAAGTTA:1 + chr2R 12733104 5' + aurora-element 4212 1 56.88 GTACCATAAAGTTGCAACTCTGCATTTGTTTAGCACTTTTAAATTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr3L 36300 5' - Tirant 362 2 60.00 AATTTAAACTCCTTCCCTGTGAAGCAGATTTCTGGAAATCTGTGGATAATTTTTTAAAGCATTTTTCAGGATCATTACATAACTAGGCTAAACCAAAGACACTAGAATA:1 + chr2L 5724265 5' - Tc3 316 2 68.81 ACCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCAAACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAACTATTCTTATATAAAGTCATTTTTG:1 + chr2R 6085998 5' - 1360 382 1 90.82 CAACACTCGAGTAAAGTAAATATAAAGTAAAGTAAAGTAAAGAGTTTTAGGTGTCCAGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3R 13543849 5' + 1360 28 1 50.91 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1 - chr3R 21907535 5' - 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X-element 4275 1 63.08 GGTGTAGGTAGCTTTTAAATATTCTTAAAATAAGCAAGAAACCATATTAACCATCCGACCAGTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr3R 6132130 5' - I-element 5337 1 60.19 CAAGCATTTAATTATATATATATCTATATATATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACAAG:1 - chr2R 5202156 5' + springer 7155 2 65.33 ATTCCACAGCCTTGTTTTGCCCGCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAACTTTGCTGTATTTTAGTATTAGT:1 - chr3R 11315264 5' - hopper2 1548 1 74.55 CCATAACTCAGATGGCTAATTGGTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 + chr3R 22595814 5' + FB 36 1 60.19 AATAAAGCAGTCAAGAGCTGTGGAATGGGCTGGAAATGTGGGTGGTGCTTGGTGGTTGGTTGGTAGGGGGCTGGGGTATTAGCAGTATTTCCGCATTTATCAACAA:1 - chr2R 16887498 5' - TART-C 453 1 68.87 GCTGCGAAACTATTATTTTATTGCTATATACTTAATAAGAAGGTATAATGATCGACAAAAGGAGGAGCCACGATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAG:1 - chr3R 4524619 5' + R1A1-element 380 1 57.69 TAAGGGTTATTAGATTACAGCATGTGGTTCGTATATACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr3R 25434753 5' - 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chr3L 489824 5' + Cr1a 85 1 55.45 TAATATAAATCAATTAAAGCCGCAAAACACACAATAAGCCAAACACGCAAACGCAGCATAAGCACAAATAATACATTGTAATAAAAGGCAAAATAAATCGAGGATGCGGA:1 - chr3L 11008568 5' + HeT-A 6016 1 73.64 TTCAATAAATATGCAAATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr2R 22663322 5' - mdg1 402 2 59.00 GGCGAACGAAAGAGAGGGGTCTATTGGCGAAGAAAGAGAGAGAGATAGTGAGACGGAGCATTGAAGGAAGGAGTTCGGGAGGGAGAACGCGCG:1 - chrX 5008862 5' + gypsy8 439 1 56.99 GGGGGACATAAGGCGGGGTCACCTGAATGGGAGAGCAAGAGTGTCAACTCCGACCTTTGGATGGCCGAATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGA:1 - chr2L 428597 5' - accord 7077 2 73.83 ATTCATTTTCATAAATACAATATTTCTTCGCAGATTTTAATTTTTCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAAAA:1 + chr2L 7174993 5' + Rt1b 5142 1 56.16 CGTATTTTTCGAGTATAAAATTTGTTGATTTTGACTTTGACTTTTAATGCGCCATTACTTCGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGTG:1 + chr3L 17680302 5' - accord 7026 2 76.40 TCGAAAATCTCACAAACATTACATCATTTCATTACGTTCATATTTCCATGAATTTTACTGTGTTCAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chrX 16693748 5' + 1360 21 1 60.00 GACCAACATTAATTTGCTACAATATTTAAATTTGAATATAAAAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 - chr3L 18095559 5' + I-element 43 1 61.32 AATACAATACAAAACAATACAATACAATACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGGACCC:1 - chr3L 21448026 5' + F-element 458 1 63.41 ATATTTCTCTGTTGTAAGGAATAAATTACCAAGTTCCCAACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTC:1 - chr3L 22490418 5' + F-element 4494 1 54.12 GAAAAGGACAATGGGGTACCAATATTATACTCACTCTCTTAACACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 30369672 5' - roo 9051 2 51.69 CAACTTCATTCCATTTCTGTATTTATTTCTTTACTCCGCTTTTCCGTTTATTCGCCATTTCCGCGTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTTAATTCTTCT:1 + chr2L 1839675 5' - Bari1 142 1 66.36 AGATTGGGAAATTCCCGCGACTCTACCTGATCGCTGATAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAA:1 - chr2L 11842631 5' - I-element 5049 1 66.36 TGTGACCAATGTGGAACAGGGTCTGGCCGCAGTTAACAAGATTGGTAAGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTAT:1 - chr2R 7981206 5' - 1360 3356 1 55.24 AGCATTTAAATGTGAACATATTTAAAATCCTGTGTAAAATAAAACAAGATTTCACGCCCACACATCTTAACAACCTAATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCATT:1 + chr2R 5768453 5' - INE-1 554 1 53.21 ATTCCATTAAGGCAATCACTCTGTTTTAGGTTCTTTCTCTGTTATTTATGTATACATAATTGGTGTGGCCAAAATTTCCCTCTGTCCGCTCGCTTACGCTGAG:1 - chr2L 11652388 5' - 1360 3299 1 66.99 ACTGCGCTGATTAGTATTAGTTCTCACAGATAACGAGGGGAGAGCGCAAGGGGAGCTCCAATAGAAGAGAGGGAGAGCGCGCGCA:1 + chr2L 3303161 5' - Max-element 91 2 62.35 CATTTGCAGTGTTGAAAAGTGTTTTTGTTCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATCATTTTTCCATTTTTT:1 + chrX 21399416 5' + pogo 51 1 74.77 GTGTGTGGTTTATTTGCTCGGCTCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGTACTTTTTCGTTTAT:1 - chr3R 19762633 5' - gypsy4 443 1 68.75 GTAGAAAATTGCTTTATATCTCTGCATATCTCTCAGTCGACGTCATCGTCGTTGTTATATCCCAGCTATATGTATTGTACATAAGGCATATGTAAATATGTATATATATT:1 + chr2L 15778463 5' + G3 4508 1 57.27 CTCGTAATTCTGTCAGTTGCAACCAGATATTACCAATATCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTCGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTA:1 + chr3L 18354238 5' - S-element 1269 1 65.45 GATGCGAAAACTTTCGGTGCGCCGCCCAAAACCATCAAAGCAATGCAAATAAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGCTCCGAG:1 - chr2L 19286962 5' - Idefix 7080 2 62.92 TAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTTACAAGTCGGACAGACTTCACCATTCAAGAAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCA:1 + chr3R 19450060 5' - hopper2 234 1 73.33 CCAGAAAAAAACATACACACACACACAAATTCTATGTAGCTAAGCGAATTTTCCAAAAATATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 + chr3L 7846444 5' + 3S18 27 2 60.00 CGAGCAAAATAAATGAACGATAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGAGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr3R 5774870 5' + I-element 29 1 67.12 AACCTACTTAAGTTCAGACTCTTTTCTGCATGGTCACAAGAATTATATGTACCTCAATTGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTACCAAAGTTTGTGCAAATTCTAATGTCA:1 - chr2L 4344910 5' - Bari1 1307 1 58.18 CATTGTGTTCCCCTTGCTATTTTTCATACTCTTCCTTATGATCCACATGCATGTGTGTAGCATATAGCAATTGTAATAAACCAATATATGCCACAAATTGAGAACAGGTG:1 + chrX 2552022 5' - blood 7372 2 62.73 TTAATAATGCCCTCGCACATTATGTTTTTCGTCCCAGACGAGCCTTAAAATGCAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3R 31633137 5' - opus 476 2 55.67 CCGCACTCTATACTAGACACCACTACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTT:1 + chr2L 16245203 5' + hopper 59 1 76.36 CGTATGCAGCCCAAGCACCCTCGTCGTGTGTCGATTTCTGTAATTTTTAGGGAAAAAGATAACAAAAAAACTTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 8745142 5' + gypsy2 424 2 51.19 CTCGGCCAAGTACTTGCTCCCATGCACACAACTGGCGCACAAATATGCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 6537980 5' + roo 20 2 55.91 GTACTGTAAAATTTAATTAGCGCTTCTTGCTGGCACAGTTGCATAAAATTAAATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACG:1 + chr3R 23270102 5' + micropia 5412 2 68.32 GGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTATTTGTT:1 + chr2L 16067077 5' - HMS-Beagle2 267 2 63.64 TTGTGCAAAACGTACTCTAGTTGAACGTTTTTGTTCAGAAAGCTTTCCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTG:1 - chr3L 12757816 5' - F-element 483 1 55.91 ATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTTTCTTATCTT:1 + chr2R 5064834 5' - Stalker3T 203 1 80.00 ATTTTTAATGGGAGAGAGGGAAATACAAACAAATAAAGCATAATTGGGAGGGGCAACAAGAACAACAAAAGTGTTGATTTCAATAAACAAATTACAAGAATCTAAGAGCA:1 + chr3R 25471899 5' + Idefix 309 2 61.82 AAAACATTTCGAAATTCGAATTTTGAATGTTGCGTGCGCACAAATGTATGCTACACTTTTTTGTGTTCTGTTCGTGGTTTTCATCATATTCGCATGTGAGATGAGCAATC:1 + chrX 7992487 5' + jockey 9 1 75.45 GTTGTGAGTGAGCAAAACTTTCAGTGTAAAGTCAAAAACACAAACACACAGCCACACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACACGCAAGCAAATTATA:1 - chrX 12546723 5' + 1360 3258 1 50.93 GAAATTTACAAGACTGATAAAAATTTTAAAAAATATGAACAAAATATTCAAAAGTTACGAGACTAGTAAAAATATGCAAAAATATCAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGG:1 - chr4 1101688 5' - INE-1 257 1 50.46 CTCTCCATTGCAAATCCCTGTGACATGACGAATTATGTTAGTCCTAAATTCCAATGTTTCTTGTTAAATAATTCAAATTATCAAATGTAAACATAACATACAATGTGATA:1 - chr2L 18925757 5' + TAHRE 10201 1 72.73 GAACAATTGCTGGCGATTGTGGTGGCTCACGAGAGTTCCGATTTTCAAAAGAAAAAGGAAAAAA:1 + chr3L 4890505 5' + Doc2-element 214 1 62.50 CACAAAAATCACACATTTTTAATTAGCCTAAATCTAGGTATGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGA:1 + chr3R 5206750 5' - F-element 4263 1 63.64 CAAATTCATTGATGCTTTTTTGGTGCTTTGCTCTTCGTGGAGGTGCTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTCAACTTCTCGGTTCCAAGTAGACTCACTAGCAACTAT:1 - chrX 8058929 5' + Cr1a 4114 1 66.36 TTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGG:1 - chrX 21667922 5' + gypsy2 6498 2 66.67 AACCATCAATAGATATTTAATATGGATACACCTAGTTCATGTAAACCTCAAAGTCAAAGTCAAATGGTTTAGCCACAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAG:1 - chr2L 17593516 5' + Tc3 316 2 67.27 AGCCAGGCGGAGATCCATTCAGATCGGCTAAAGCCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGAC:1 - chr2R 23627831 5' + I-element 4938 1 58.46 ACATAATTCAAAGCGCAATTTTGTATTTTCCGACCCAATTCCTCTGGATTAGGATACTTGTTTGGAAGCTGTCAAGAAATTTTACAAATTTTTCTTTTTTTTTTAAATTT:1 + chr2R 19947806 5' - TART-C 11097 1 70.91 TTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGA:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10414 1 72.22 TGCCTGTTTGCCGTCTAATTTTGCTAGCATCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTAT:1 - chr3R 9481271 5' - roo 9034 1 74.19 CTTCACCACCAAAACAGCCGGAAATCGCACACATCGCTGCCCAGGAATACGATGTAACGCTACATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGC:1 + chrX 8566280 5' + Stalker4 7137 4 50.53 GTTTATTTGGTAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 + chr2L 16067065 5' - HMS-Beagle2 279 2 54.55 ATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr2R 22663338 5' - mdg1 7414 2 64.55 GGCCTAACATTGAAAATGCAAATGTTTATATGTTTGCCTGTTTGCCGTCTAATTTTGCGCATAGTTATTAATATTATTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 9481305 5' - roo 400 1 73.64 CAGAAACACCCAAAAGATACCACCCACAAACACCCACCACTAGCAGGGAGCTAACAGATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCTTGCTATACTTA:1 - chr2R 9231006 5' + Burdock 111 2 55.45 AAATGTGTTTTTATTATTTTGGCTGGGAAAGTTAAGCCAAAGAGTGTGGAAATGGAATCTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chr2L 17545814 5' - opus 7488 2 62.14 TTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTNGTGTTTGTGTTTGTGGTTGTGT:1 - chr3R 28831802 5' - gypsy3 418 1 26.36 TTCCATTATATTGGGTAATACCTCCGGGTTTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCCAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTA:1 + chr3R 4746359 5' - blood 435 1 68.69 CTTCTTTTCTTTCTCATCTTGGAAAATGACAGCACAACAATATAAAACAGTCTGGATGAAGGCGCCTTTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGG:1 + chr2L 6229343 5' - invader4 2960 2 81.05 CAGACTGCTGCCGAGGCCAAAGTTCTTTTGGGTCTGCTAGCCATTTCGGACCTTTCCACCAAAAAACACACAGATAAACTACTTAGCCACAAAAACTTAAACTTGAG:1 - chr3R 19446568 5' + Porto1 4472 1 63.55 ATTCAATTATGCCAGTTCCGGGGAACCGAAAGGGGGAAATGCCTGGAAAATAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAG:1 - chr3L 5195674 5' - mdg1 116 2 59.57 GCACAACCAAACTATGCAGCGATGAAAATCCTAAATATAAATTATCGCTCTCGATTTATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAACTGTAAGACTTAAAATATATTCG:1 + chr3R 32024955 5' - roo 17 2 70.91 TTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10417 1 72.41 GCGCACACCTCTAATGCGACCTCAACGTAAAATAATTGCTGACCAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTCT:1 - chr3R 5910755 5' - roo 9034 1 59.81 CAATATTGAGCGATAGGAGAGAGATATTTCTTTTTGCTGGGCTAGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTGACTGCAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAG:1 + chr3R 11397922 5' - Doc2-element 4577 1 71.15 CCCCGCTCTCTTGGCCAAGAAATTTATTTTAAACGTCAGTGTAACATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACG:1 - chr3L 17490716 5' - roo 9047 1 58.82 AGTGGCATACATATGTAAGCACCCACACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCA:1 + chr2L 2419887 5' + F-element 4390 1 69.88 GAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 + chr3L 22908067 5' + Stalker3T 205 1 69.09 TTACTGAAAAGCCCCGAAATACATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGAC:1 + chr3R 20119566 5' - rover 320 2 74.32 AGTGTGTGGAGGGGTGCTTGGGGGATCCCGACCGGGGGCATACATTTAAATTTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAATATAA:1 - chr2L 14537267 5' + INE-1 145 1 54.55 ATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAG:1 - chr2R 5064834 5' + Stalker3T 204 1 48.18 ATAAAAGAAAATGACATCAGCTGTAAGGGGATGGGGTAATTTATGCATTCTTTGTTCTGTCTACATGTCAGTCGTGATATTTCATTTAAAAAAAAACAAGGGAAAACACT:1 - chr2L 20005126 5' + Porto1 174 1 70.00 TTGATACTGATATATTCGCTATACTCGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCA:1 + chr3L 10911518 5' + springer 39 2 70.97 ATCCCTATGGTTTAAGTTTTTATACAATAACAAGAGAGGATTCTATAGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACTCGTTACTTAGCTAGTGTGAAT:1 + chr3L 23974684 5' - INE-1 536 1 64.89 GAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACG:1 - chrY 2720381 5' + 1360 3214 1 62.00 TTCAAAATTATGTTAATGTTTTTAGCAGCAATAAATAAGCAAAACATGGAGAAAAAAAAAGAATATTCAGCTTACGACGTGTAAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGA:1 - chr2L 8679262 5' + 1360 444 1 73.64 AAATGCTGCCTGCGGAGGAGTCAGAAAAAAAAGAATGGAAAATCGTGAAAACTGCAAAGGAAAAAGAAAAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAT:1 - chr3L 2974487 5' - BS 5026 1 73.96 CTCTTACTACTGATTTTTATGGCAGGGGGGTGTTTTTTTTTTGATTTTTTTT:1 + chr2L 8331088 5' - gypsy7 5008 2 50.00 GAATAACAAAAAGGCGGTAATATAATGTATGTATGTTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 - chr3L 4265029 5' - Transpac 5182 2 70.91 AGCGATCTGCAGACGGGGCATCAGTCGATGATCTACATAAACACACACTGAACAAATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGATTGAGCTCACTGAAGCTCAA:1 - chr3L 3978278 5' + G3 4530 1 53.64 TTTTTTAAGGTAATTTAAAGTGAAATGGAATGTCTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAAT:1 + chr3L 7979672 5' + 1731 4417 1 63.44 CATTGTTGTGTAAATACGGACTAAGCGAGATGTGGACTTTAGGTTTCGAGCACGATGTGCTCTACAAAGTGAAAGTGCTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 6707792 5' + 1360 7 2 74.31 AAACAGCAATGCAAATTATAAACTACAATAACCAAATTTTGAAAACTGATAACGAGCAAGGCATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCA:1 + chr3R 8129046 5' + 17.6 6968 2 62.73 TGAAGTTTGGTTTTTGTGGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTT:1 - chr3L 15798172 5' - Doc2-element 4390 1 80.43 AACAAGCTAAAGCAAAACAAATATAACAAAATATTTAAATAAATATACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATAGGCT:1 - chr2L 13303350 5' + 297 6542 2 57.80 AACAGTAGCAGGAGTCACAGCAAAAAACAAGCAATCGGTACAGTGAGCGAATAAACAACAAGTAAATACTTGAAACGAATAGGTTATTGGCCCAGCC:1 + chr2L 17207077 5' + Dm88 193 1 67.01 TCCCGGCTTTCGGGCTTTCCCTGTGTGCGTGTGCACACATACAGAGGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAG:1 + chr3R 26536869 5' - 1360 129 1 67.42 AAACTAGTTCATGTATATGTATAAACTATAGAACATTTAAACGATGAATAAACTACACACCAAATCATGTTAAATAAATTCATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 12623815 5' - roo 407 1 79.09 TGCCGGACGGCATGCATAACGCACAATGCTGGTTGCCACCACCTCGGGTAACTGAAACAAAAAAATTGAAAACTAAAAAAGTCAACTAAAAAATTATAACAAATTAAT:1 + chrX 17828659 5' - Tc1-2 1374 1 73.15 CGCATTTCAATGGCGCCAAGCAAGTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr2L 18694026 5' - pogo 2091 1 60.32 ATCGAACCGTTTTCCAAGCCATAAACATAAGGAAAACAAATACTAAAGAAGGAAAAAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAG:1 - chr3R 14599999 5' - copia 76 2 56.07 AATAAGTATGCAAGAGACTTATAGATTACGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATG:1 + chr4 341301 5' - rover 7080 2 66.28 TACTTGAGTGCAAAACGCTTTCCAGACCTACATATGTGTACATATTCACATAAGCCGAGTTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGC:1 - chr3L 8924551 5' - X-element 4403 1 67.33 CTCAGTCAGGCTCTCCTAATTTTCATAAAATATATGAGACCACCCCCACTCGAGTGTGTGCGTGTCGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAG:1 + chr3L 21884565 5' - 1360 3174 1 60.91 ATCAGTGATTGGTTATTGCTTGAGCGTCTTTAAGGGCTTAACAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGACAAGTC:1 - chr2R 6801763 5' + invader4 462 1 76.85 GTACTGACTGACGGCTGGCAGAAAATGCCACACGAACCAAAGGGAAGGGAAAATTGGCAACAATGAGGGGAATACAAAAAAATAGAAAAAAAAA:1 - chr2R 14013332 5' + gypsy7 5004 4 82.98 CTGTGGCACTTACAATATTTCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr2R 9963706 5' + pogo 40 1 79.31 TTTTGGGCAAACAAGCCATTGTGATATAACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATCAATTTATTTATTAAGGCATACG:1 - chr3R 8451752 5' - X-element 4706 1 62.77 CCCCCGAACAACTTTCTCCACAAACAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGGGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAG:1 - chr3R 31173265 5' + Bica 28 1 69.51 TTCTGTTGGCAGCTGATGAAACGCTCAAAAGTATGCTTTTATTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 31427189 5' + Circe 422 1 70.91 AAGAAGCGCTAAAAATTCAATTATCTGAGATGGAGAGGTTCATAGTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGCGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr2R 10047117 5' + FB 28 1 51.02 AGAGTTATGTTTTGAGATTGTCAAATCGAATCACAAGTGAAATTGGAAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTCGACACCGATGCGTACGT:1 + chr2R 6760281 5' - 3S18 6031 2 56.36 GATTTAAGCTTACAATTAAATCAATAACTTATTTTCTGTCTTTTTTGGAATATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGACA:1 + chr3L 17718983 5' + 297 30 2 54.55 GCTTAGAAGCAATTATCTGTGCGGAATTTTTGGGGATTTTTTCAATGGCCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACAC:1 - chr3R 17380413 5' + G6 370 1 56.19 CATTAATTTTTATGATATGTTGTGATATGAAGTTATGATATCGCGATGCTTTTTATTCATTATTATCATTATTGATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATC:1 - chrX 20433421 5' - diver 213 1 70.91 TACAGGTGTTTTGTATTATTACTGCAAGGGTATGTAAGTTTCGGCTTACTTTCTTGTTCGCTTTTTTGTGTTTTGTCCATACAGTACAGCAATCACGATATCTACTGC:1 + chrX 19354854 5' + Doc3-element 495 1 79.63 CGACTGGAGACGGGGATAAGTACGCACAGAGAAAGATACAGAGAAAGAGGGGAGTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGG:1 + chrX 14586813 5' - 3S18 5760 1 58.95 CATATTATCTGATGTTGTCTGGGTGGCTGGTGGCGGTGGCAAAAGTATTTAGACATCGAATTTAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGATGAATATAAAATTTTT:1 - chr2R 13671707 5' + Tc1-2 254 1 63.55 CGCACTCTAATTAGCAGCAAACAAATTTCCAAAGTGGCGAAACCTGGGAGGGGGCTTGTGCCAAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAG:1 - chrX 3680729 5' + Bica 10 1 76.67 TTTGTGGGCAAAGCCATCAACAACATGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 22769365 5' + 412 7095 2 74.73 AAAGCTGCATAAAAATATATTAATATTTACTCTCAAAATGTGGCAAATTATTATATCTGCATACCTGTGGGTCGAGAAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAA:1 - chr3R 24062403 5' + Stalker3T 322 1 79.09 ATACCTTAGCACCCTGAGCAACATAACAGAATCGATTGTAAACATTGATGAGATTAAGGTTCATGAGAACAAGGACGGTCGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTC:1 + chr3R 14640740 5' + Rt1b 5114 1 75.23 CGCAATGAAAATGGCGAAAATTACACAGTCAGTCTTAAGCCGACAACGAAGAAATAAAGATCCAAACTAAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTACAGGCG:1 - chrX 836069 5' + rover 289 2 72.73 AATCTGCTAGCTCACTAATAAAACCACCTAATAATAAAGACAATAAACGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAA:1 - chr2L 5333215 5' + Transpac 4812 1 73.83 CTAACTATTAAACTCAATTCACTTTAGTAGGTCTTTGATTTCTTCATCAATGAACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 21034129 5' + 412 7086 2 50.91 CAAAACTATAAATTCGCGGGGGGCACTAATATTAAAAACTGCGCATTTCAATGGCGCCAAGCAAGTTTTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr2L 18693985 5' - pogo 2097 1 72.45 GAAGGCATGCGTATGTATGTATGTGTGTCTTTGTAATATCATGTGCGGTGGTGCAGGGAATGACAGTCATAGGGGGAGGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTG:1 - chr3L 17155613 5' - FB 783 3 73.64 CAACTTTTACAAGCTTAATGGCCAAAATGGGTTTGTGGTGGGTGGTTTTTATATTATGATTTGTTCCCTTTTTTTTACTT:1 + chr3R 31266951 5' - invader2 4757 1 62.50 TTGATTTGAAAATGTCATAGGCTGAGACTACACACACACACACACACAATCAAATGTATCTAAAAACACATATTTGCATGTGCGTATACATTAAGAAAAAAGCTTTCAT:1 - chr3R 12727742 5' + accord 356 2 75.23 TAATCAAAATGTCAAATAAGGGGAAACACCTTTATCTGGCCATATTATCATATTTTTTTTTTATTTATATTTATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 + chrX 12135640 5' - BS 5085 1 55.91 CACTGCCCAAAATGTAAGTGGGGCTGTGGAGATGTATATAGTTGTGATGTAAAATTGTGTGCTAATAATATTAATAAAAACGTGTAAAATATTTATATATATTTTTAAAA:1 - chr2R 15256234 5' + copia 4663 1 65.45 AGATTTAAAGGTCTGCGTGAGTCTGGTCAAATTTGGGAGGGATTGTTTAAGGTA:1 - chr3L 20687324 5' - I-element 4890 1 59.26 TTTGGGCCGATAACAGGTGATGTCATGACACTTTTGCATTGCTTCAATCGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chrX 18483231 5' + pogo 28 1 54.29 GCAGCTAAGCTATAAAGCTTTTGAACGATATTTCAGTTGCTAATTATCAGCCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACAAGTATGCTCATGCATTGTA:1 + chr2L 16445247 5' + 1360 186 1 54.29 GTACCGACTTCGGACCAGACAGAATGCGTACCTATTGTGTCATTAGAATTGAGAAGAATTGAGATATTTTAATGTTTTTAGATTTTAACATTGCATGTGGTGAGTTTGGG:1 + chr2R 5604486 5' - TAHRE 10306 2 77.27 AGCATTTTTCAGGATCATTACATAACTAGGCTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr2L 5724321 5' - 1360 3344 1 75.49 TATGTTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3R 13225566 5' - hobo 2930 1 62.50 AGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGA:1 - chr3R 29588499 5' + Transib5 2939 1 52.73 TTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGATTTTC:1 + chrX 18193714 5' - hopper 1390 1 57.14 CTAACTCCAAGCAATTAAAACGTTATATTTGAAATAACTTATGAACTTATGATACCATATATGTATGTGTGTACTCTATACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAAT:1 - chr2R 13944370 5' + Ivk 4960 1 78.18 TATTATATGTGCAGCTGACCAAAGCTGACTGGACCCCAAACACACACACACACACACACACACATACAGAAACA:1 + chr3L 1041745 5' + Quasimodo 42 2 79.73 TTTTCAATAAATATGCAAATTGTTGTTATATACGTGCTAATAGCATAGCTGGAAGGACCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr2R 22663320 5' - mdg1 7432 2 55.45 GCGGAAAACTGAACTTAATATATTTCGGGTTATTGAACACACAGTCCCTATCATTAAGCATTTCGGAAATCGAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACA:1 - chr3R 2912939 5' - rover 159 2 77.67 CACGACCAGCGTTTCACTTTTGCAAAAGGGGCAGCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATAAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTT:1 + chr2L 10230970 5' + roo 390 2 68.18 CCTTCTCAGCCAAACATCCTTGTGCAAGGTGCACGCACATAGCGAGTGCCCCTCCGACCATATAAAAAATATATATTCTTGATCAGGTTCA:1 + chr2L 8416694 5' + INE-1 81 1 56.04 CCAGGCCAGGCGTTCGCATGCATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGGACGTATGTAATATGTATTT:1 - chr2R 18316231 5' - 412 217 2 81.18 AACTACAACACAATTGACTTAAGAATGGATTTAAGATTTATTATTTATTTATTACATTGGAATAAATATATTAGATCCCTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr2L 21191467 5' + 297 6584 2 79.09 GCAAGGCGCTTTGATATATCCATAATGTTTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 16742259 5' + 412 42 2 72.63 TCAAATATATTATTGCAGCCCCTGAGATACTGAAGGCTACTATATGTGTGTATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAATAGTTTAAT:1 + chr3R 28224747 5' - flea 4983 2 56.36 ACCACCAGGCAAGTCCTATCTGTGCAGCATGTACCAGTATGGGTATATATATATATGGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGCCAG:1 + chr3R 7171243 5' - 297 369 2 55.45 GTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTTTTTTTCCTTTTTTT:1 - chr3R 21907536 5' - gypsy7 5009 1 24.55 TCAGTTGATCCTAGATGAAGAAACATGTGCCTATAATAAAACATGTAAACAAGAAAACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTT:1 + chr3L 4264949 5' + Transpac 4944 2 59.09 TTGCAGGTGATCGTTTGCAGTTCCTGCTGCGTCCTATCCCTGAATATTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGTTGTCGATT:1 - chr2R 18158711 5' - 3S18 5649 1 66.25 GCATTCTTCGCAGTGGCTCTTTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 + chr2L 17393368 5' + FB 49 1 79.79 ACAAAGCATAAGCACTGCAAATGAAATCAACACAAAAACAAATAATAATATAAGATAGAAATTAAGTAAACAAAATGTAACTTTAGCATTAGATGTAACGTTTATATACA:1 + chr2L 2329830 5' - accord2 399 1 68.18 CAGGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATG:1 - chr3L 10703549 5' - accord 7026 4 77.78 TGGAAACACTTCGATTGGAAAGCATTACGGTTTTATTTCTAGCAATTTTCGGAAATTATCCAAACAATTTTGCTGCTTTTTTTTAATAGTTTCCTTGACTGTTTGTATGT:1 + chrX 4311263 5' - Porto1 4408 1 70.91 ACAGACTGCAAGATAAATTTATTAAAGAGTTGACTGAGCGAAATTAGAGCGAGACCGACAAGACAATTAAAACACACGTAAAGCGAACGGAGTTTTAATAAT:1 - chr2L 13490149 5' - Cr1a 115 1 70.59 ACAAATTGCGTCAGTTGCGCGTCTCGCACCGTGGACGGCCGACGTTGAGGCGTCAGTTTTTTTTCTTTTCTTATATTT:1 - chrX 14890795 5' - invader2 4746 1 80.77 CTTCACTCATTATTTATGCATAAATACAAAAGGCAGCGATCTGTTTGATTGGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTACAC:1 + chr2R 15418998 5' + hopper 31 1 52.73 TGATGGGTGTATTTGTATTTGTTTGGCTATTTTATCTCTGACCGGAAGTATGAATAAGTTCCTATGATAGTTATCACTTCGAACGAACCACG:1 + chrX 17952787 5' - Fw2 3648 1 69.57 AAGTTATTCTACAATGAAAGTGGAGTACTATGAAATACGAAGAATATTGAAATAACTAGTTTACGGTCTTATATCTTATCTTATCTTATCGTATCTTATCTTATCTTATC:1 - chr3L 19229163 5' - Stalker3T 205 1 66.36 CGGTTTCGCTGCTCGAGCCAAATGCTTGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr3L 131762 5' + P-element 34 1 36.78 CTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTG:1 - chr3R 433140 5' - 1731 306 1 63.41 TATAAGTTATATAAATAAGAAGATCAAATCCAAGTGCATAACAGACAAAGGAGAACAGAGGATAGGGAGTCGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAG:1 - chr3L 16116715 5' + invader2 4728 1 65.26 GGAGTTTTTTATTTTTCTTCTTTTCTGAGAGGAGTTGTCATTGGTTTTTATGTCTATTATTGTCGTTGCCATTAGGCCAATATTGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr2L 4016952 5' - opus 498 1 78.50 TGGACTCGGTCGATAAGGTGGCTAGCAAAATTAAGCAATTAATGTGTAAAATGTTATACTATCCTCCAGGTAGGGAGTTCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCGTTCGGAG:1 + chr3L 13237649 5' - G5 4630 1 63.64 TACTTTGACGTACACTTTGCTATTGTGGGTGCCAGTTAATTGGCCCAGTTTACAATGTAACTTTAAACTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTAT:1 + chr3R 22632879 5' - Transpac 4760 1 70.83 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAAC:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 416 1 29.09 AACAACTCTCACCATGATAGATTTGTGCCATTTCATAGGAAAACTGAAATCGAACCAAGCTAAATCAAAAAATGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGC:1 + chr3R 10187397 5' + F-element 4270 1 73.64 TTTGCTTTCCCTTTGACTCTTCAACTCGGGAATGCCCCTTTGTTTTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTAAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATT:1 + chrX 13357354 5' - I-element 5130 1 65.45 GTCAAAAGTTTTGTTTGGCATCGGCAATATCCTGGCGGCAGCTGTGTGTCTCCCCTTTAACCTTTGCACTATGTGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 + chr3L 10542503 5' + hopper 14 1 66.34 TGTTCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTAT:1 + chr3L 15099551 5' - G4 3807 1 66.36 TTCTTGACGGCAGTTTGGATAAGCTGGAAAATCGATAGAAATGCTTAATCTCAACCTACTATCTTTAATAGTACCTGAGATCTCGACGTT:1 + chrX 23018526 5' - INE-1 142 1 73.33 CTCAAAATCCTGCTGCAGAATGTGCAGAGCGCGCAAAAGTAAAAGCCGGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGAACGCT:1 - chr3L 14755076 5' - P-element 2850 1 47.27 TTGTTGACTTGACTTGGCAGCTTTTGGTGGCTAATTAGTTGGTTTTTGTGTTATTTGCTACTTTTTTTT:1 - chr2L 5148536 5' - Porto1 4434 1 39.13 GTCCAGTCCAGTCGAGTCCAACCAAAACAAATAGAACAACAAAATAACACAACAACAGAAAATATAAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTA:1 + chr3R 18864128 5' + Quasimodo 166 2 79.21 TAACAAACGTTTGACTAACCAAACTCCAGCTGACAGATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAAAAGCATACGATCATA:1 - chr3R 22500865 5' + invader3 49 2 60.00 ATGGGAATTTCGTTCAAAAAAATATTTAACATCTATCATATGTGGAACGCAAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTT:1 + chr3L 9419516 5' + S-element 33 2 58.18 ATTGGTCAAAATAATCTTTGCACTGAAATGTCATTTTAGTGAGCATAATTATGAAACATGGTCTTACCAAAGACACTAGAATTACAATATGCGTAACGGCCATA:1 - chrX 22861737 5' - 1360 3373 1 64.42 CCACAAATGTTTCCAGTTAAACCAGCTGCAGCCTCATATATAAGCACATTACTCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAA:1 - chr3L 15968257 5' + P-element 13 1 63.44 TGTAAGTATCTTCTAAGAGCAAGACTACGACTCCTAAAATCTATATCTTATAATTAACAATTCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr2R 7577904 5' + 1360 3378 1 70.00 CTATTTGGTAACCTTAAGACCTTTGAAAACAGTATCTCCTCAAAGACAATCGCACATGAAGACCAATCCATCTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAAT:1 + chr3L 15755797 5' + HeT-A 5960 1 68.18 AGCGCATACGCCCCGCTGGCCGTGTCAACAGCAGCCGCCGCATCATCCAAACAAGAAATGCTCATAAAAATTGTTCACACATGAACAAGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 9481181 5' + roo 8681 2 65.14 GAATTTTTGTAATGGTTAATGCATTGTCATCACATTCGTTTTTTATTGAAAGCGTGTTCGCGTTTGGAGTGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGG:1 - chr3L 18710517 5' - 17.6 6950 1 70.48 GTTGCAGACGCACTTAAAGCTGCTCCAGAGCTCCTTGCACTGGGCGCCATTGCGACAGGGCGCTGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAA:1 + chr3L 4650974 5' - jockey 4619 1 72.94 AATTGATTTTGTAATATTTTATGTATGATTTAATTTTTAATTTAATTTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chr2R 4137689 5' - Juan 4171 1 65.45 AACAAATAATTTATATATTTTATTTTACAATATTGTTAAATAAGACGCACACGTATAAGACGCACGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCC:1 - chr3L 18463524 5' + gypsy5 6960 2 61.11 TCGCGTTCTCGTTTTAGAGTCTCTATAGGTTTACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGG:1 - chr3R 2415924 5' + 1360 47 1 71.82 GGGTGCCTTCAATTCGCATGCAAATTTGGGAAATTGAACCAAATCCGAACGCGCCCACGTGATGCGAAATTCAGAGTGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chr2L 4916675 5' - S-element 1708 2 73.39 TAAAATGTCAATACCTATTTTATTTTGTTGTTGAAAAGATTGGAAAAGTTCTTGCTCACCTGTCGCTGCGGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTACAATTTGTATGG:1 + chr2L 18124340 5' - hobo 2681 1 66.97 CTTCCTGCATAGAGTATTTGACCCGTCGACCCTGCGACTGAACTTCCCCGCGCTAACGTTTTTATTATACATCGATTTTTATTAATTTAAATTAATGATCATGAACAATA:1 + chr3R 5395158 5' - Transib5 2580 1 72.73 GGGATTGCCGGCAGATGGTAAGAATTCAACTTCGAATGTGAATTTCCTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2R 12416856 5' - pogo 2081 1 55.91 GAGCAGCTGCAGCTGGTGAAACCGAACCTGAACACCCTCTTCCAGAGGTGCATCGAAATGCTTGACACGGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGT:1 + chr3R 8824820 5' + Tirant 448 1 75.45 GAGGAATTCCCCCAGGATGCCATCCCAGTGGCTCCCTCCGATGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTACGGGCATCAACACCAATAGAAGGAGCGGAA:1 - chr3L 4463191 5' + rover 6902 1 58.59 CAACAAAACTTGTATTAGTTGTAATAAAAATAAACAAGTGAAAACAATAAACAAACTAAAATATGAGCGCATCTGACGATCAAAATCAGAAGCGAG:1 - chr3R 23866365 5' + Porto1 223 1 71.88 GTACAAGTTATAGGAATAATAAATTAATAGTTATTAAAGCTGGATCAAAAATAAATTAAAGAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATATTC:1 - chr3L 21821518 5' - Tc3 313 1 78.41 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAAAACAACACAAAACAACA:1 + chr3R 21907535 5' - Cr1a 246 1 28.26 ACTTGTGTTCCCATCCAATCAGCTCGAATCACTTCAATATCTCTCATCCCCAAATCCTCTTTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr2R 21735266 5' + blood 24 2 57.80 AAATTTGATTTTAATTAGTTTAGCGCCTGAGAGTCTTTGGCAAGCAAAGCGCGATTATTTTAATTATTTAAGTTATTTCATTATTTAATTAATTGTTT:1 - chr3R 14957724 5' - HeT-A 20 1 73.47 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGCGGCACGTTGCTGCCCACAA:1 - chr3R 21907535 5' - Chouto 336 2 31.76 ATTCTTTCCTTTAAAGTTCCAAACTCTTTGGTCGCTGCACTTGAAAAATTATGTGATATGTAGTTGGATTGTGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTA:1 + chrX 6457870 5' - Quasimodo 263 2 64.71 CGAACGAGTCACGACATTGTGGATGTAGCCCATCCCTATTTACTTGCCTTTGTTAGTTTATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr2R 23548200 5' - 1360 3364 1 60.55 AATATTTCGCTGCACCTTCCAGCTAAAAGATTTTTTGCACATCGAAATTAACAAGACTAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 5266031 5' + opus 7141 4 58.18 AGCGTGGTAGGGGATGACAACAATTGAAAAGCGAGGAAGAGGGGTAAATATTGAAAACGTTTCAATCTTTTCGCGAATTAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTAA:1 + chr2L 17805658 5' + R1A1-element 122 1 72.55 CAAAGCGTTGATATCCCTTCACACTCTTTGATTTGCTTTCTAACTTCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTGGCAAATGAGAGCAAGAGAAGCTTGCTCTCTGAGAGAG:1 - chr2L 10942115 5' + frogger 2418 1 63.64 ACATTTTTGTCAGTTTATTACCAGTAAAGTAAGACGGTGTATTAGATTCCTTTAAAAGAATTTCAACAGGCAGAATAAAGACGGAGATTTCGGGAACTATAAAAGCTAGA:1 + chr3R 14384723 5' + INE-1 153 1 67.27 GTGGTTTTTGTAGCAGGGGAAAAGCCACTTGGCATCTGTTTGCGAGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCCACAG:1 + chr3R 12930740 5' - accord 7001 2 64.36 CCCTTCAAGTTTTTCCCAGTTTTACCCAGTTTCACCCAGTTTCACCCTTTAGAATTTTGAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTA:1 - chr2R 23504438 5' + FB 276 1 60.55 ACACAACACAACACAACACAACACAATACAATACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAAAACAAACACAAACACA:1 + chr3R 21907534 5' + gypsy3 419 2 40.00 GTTTTGTTCGCAATCGATATCTCGCCATGCGTAACCCCTTAACCACATGACTATATAGATATCTGTATCTGTATCTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAA:1 + chrX 17837940 5' - S-element 1704 1 68.18 AGAGTCATCGAATAGCCCATCCGAAGTACTTTCACCATATAGCGATGTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTTGCAT:1 - chr3L 9608078 5' - Doc3-element 370 1 55.91 CGATATGCTATCCCCCTTTGTAGGAGTTCTATTCCGGCTCCCGTTCGCCGCTGTCGCTGCATCGGCTAAAATATTTTAATTTTAAAAC:1 - chr3L 18620193 5' - 1360 3026 1 75.00 TCAGGCCTCATTTTGGCACCTCGACAGTTTTGCTCCTTTTTTTTTGGTCGCACGGCTTCTAAGTGCTTTGACTAATTTTCTGAATTCTTCAATACTTTTAACCATTACTC:1 + chr3L 5684274 5' - G4 279 1 62.73 TGCGTCGCGTCGCATCATAAAATCCGCACTTATTACTCCTTTTATGCAACTAAATATGGTGCCGTGATATACGTTAAGCTTAAATGGATCCAATTGTAAAGTTATGACCT:1 + chr3L 6688351 5' + Q-element 668 2 53.64 ACATGTCCCCATACAGTAGTTTAGTTCTGAGTACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 - chr2R 892420 5' + Stalker2 7301 2 70.37 TGCCCCCACAATTGCCGCACTTTCCACGTCTTCCATGTAATAGGTTCAAGGTTATACGTTATTTTTGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTT:1 + chr3L 11409617 5' - Stalker3T 298 1 69.09 CGGGGTAGCAAGGACATAACAAAACGCTCATGGACGAACTGAAACTCGAAACATAAACAGGCAACACAGAGACGTCAGGCTTTACGATTTGTTTACAAG:1 - chr3L 2439935 5' - 17.6 203 2 75.76 AATATTTACACAGATAAACGAGCGGAAGTGTATTTGATCAGCATTTAATGCAGCAAATGTCGAGCCACCGACCAAAGACAATAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chrX 9837176 5' + 1360 8 2 60.40 TATTTATTTATTTTACTTAGACAGTAGAGTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGTATGCTTTCGCTGT:1 - chr3R 17033483 5' - Doc2-element 4475 1 70.91 AAACCATCGATAGCAGACGTTGGCTCATTAGGAATTCTTTTAAAGTTGACCACCCAGCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAA:1 - chrX 13979296 5' - S-element 314 1 56.36 ATGAGGAAATGAAAATCGCTGACCCTGTTAAAAAAAATCGTCAAAGACTATATATGCACATACACATAACAAGAGAGAACGTTATAGTCGAG:1 - chr2R 4377992 5' - INE-1 577 1 56.52 TTGAAAAAAACTGGAAAAGGGGGGAAATTGGCGCAAATTGTGCTTGAAATTCCTCGAGGTAAGCCTGAGAAATGGGATGCTGCTGATTGTGTAGAGGAAG:1 - chrX 9687038 5' - hopper2 65 1 43.00 CATTGTTGGCGCTAATAAAGTCAGCACAAAAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACCA:1 - chr3L 2854411 5' + hopper2 1186 2 72.73 ATGTCTAGGTACATCTAGGTACATTTTAAATGTTCCAATAAGGTGGTGCATACTTTTAGGATCAGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTA:1 - chr3L 22634284 5' - hobo 90 1 75.53 GGATAAAATGCATAACTAAAGATTGACCTTATCAGATATTACCGTTACACTTAATGAAGAAGCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCA:1 + chr3L 13229551 5' + 297 6764 2 72.34 CCACCTCACCCCGTATTTGTGTCCCACTACCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGTCCATG:1 - chr2R 13934468 5' + FB 58 1 78.18 GGGCGAAGTTGGCCAAAACTTCTGTCAAAGCTGGAGGAAAATAACTGTAACTGTTCGGCGCCCGAACAGGGACCAACAAATAAACGCGAACGACAGAC:1 - chr3R 14335248 5' + HMS-Beagle 287 1 65.31 ACATGTGTACATACTTTCCAACACGCCATCTCAAAAGTTACATTGCTGTACTTTTATTACGTGCATGTCCTTCTGGGGAATAATTTTGATCCAGCATTCGCTGCGAG:1 - chrY 975571 5' - copia 4752 1 86.92 CATATAATAAATGCTTACAAATATGTATTAATTTAAATAAGAGTAGAGTACTTGGTATATTTTATTGAGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3R 12040027 5' - 412 486 2 71.57 ATTTATTATTTGTTATTATTTGTTTAAATTATTTAATTTTATTTTTTTAACTTTGCTGTTTAACTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTTTTT:1 - chrX 3646354 5' - TAHRE 10407 1 54.13 TATAAATGTACCTAAAAACATATTTTGTGTGCAGAAAATGAATGGGAAAAAGTATTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chr3R 22008450 5' + flea 12 2 48.98 GGTGGCGAAGGGGCAGAAACATTTCAAGATGTCCATCTCTGTCGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGAC:1 + chrX 14671961 5' - roo 229 2 67.09 AACTTCCGTTTCCTCGGAACTCTCTTCGCTTCTGATGGATTGACATTTGTTTTATCTGCCTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 17490640 5' + roo 10 2 67.37 TGGGATCATAGCTGATGTTGTTGGGATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCT:1 - chr2L 13279605 5' - Stalker3T 204 1 76.15 TGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTTGAA:1 + chr2L 21750457 5' - Stalker4 6868 1 66.97 ACCCAACAAATAAAAAATAATCATTATTATCATATTAAGTCATTTTAAAATTTTACTGCCAACAAAAAGCTTAGCATTTATTTTGTTAAAATACTTATGCCGACTAGTG:1 - chr2R 1070129 5' - Tc1-2 1 2 72.48 TGAAAGATACTCCACAGTACTTACATCCTTCAATGTACTCAGGCTAAACGCCCATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCG:1 - chr2R 19405979 5' - HMS-Beagle 228 2 65.00 AAAGCCGTCTCCAGTCGGGTAAGTCATCCAATCGCCAATCGCTTGAAGACCGATTTACAGTTAGTTTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2L 7028649 5' + 1360 1 2 45.65 AAGTAAAAATCAGACTCAACAAGAAAAACAATTAAAACCAAACCAATATCAATAACCAAAAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACT:1 + chr3R 904354 5' - 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opus 7481 2 62.73 CAGACAAATGCCAAAGGAAAATTTCGTTTGCTCGGTGGTGTAACGAAGGGCTCTATCTCAGTACTCATGCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 + chr2L 19212235 5' - flea 5004 2 70.91 TAAAACTGAAAAAAATACGCCTGCATTGATTAAAAATGGTAATAATTTGGCTACGTTAAGAAATGAGAAAAATCAATTTCAAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAAT:1 - chr3L 25970805 5' + Stalker 6771 2 65.45 TGGTGTAATTAGCCAAAAGTTGGCAATTATTTCACTTAGTTTGCATAGGCTGCCGAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGGGTTGGTGGG:1 - chr2R 16796107 5' - I-element 4972 1 66.67 TATTGAAATTAAATTTTTAGATTATTAAAACTATTAAAGTTTATTTTTTTTTTATATTTTTCCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chrX 18021025 5' + Doc 25 1 46.79 TAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTATTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATT:1 - chr2R 20355351 5' - Gypsy6A_LTR 188 1 77.06 CGAACCAGAGATGGCCAAAAAGCTTCGATTAGACACAGTGGATGGAACAGGAACGAAGAAATGAATATAATGAAAAATAACTATATAAAATATTACTG:1 - chr2L 12206654 5' - Cr1a 4305 1 53.06 TTCTTGCTGCTACTGACAGAAATTTCAATTTTCATTTAGAGCAAGTGTAGTTTTGCCCACAACATTGTTGGAATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTTAAG:1 + chr3L 2815048 5' + Doc 27 1 61.82 ATTCTCGGCATATCTTTTGCCATTCGTTCGTTTTATTTTTAATTGCACAAACATATTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAG:1 - 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diver2 344 2 54.55 GCCAGGTAAAACTAAACCTTCTGCCAACTTTTTTTACCCTGCACATTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 23620989 5' + roo 8705 2 62.73 GGTGGTGATGGGCGTGGCACGAAAATGTGTGTAGGCCCGAAAATCGTCTACCACAACACGCACACATATACGCGTTCTC:1 + chrX 1416772 5' + 1360 3221 1 58.23 CAGGCCCCAAAACCATCGAGCATTCGAGAAAACTGCACGGCCAACGCAGCCATATTTATAAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chr2R 19254250 5' + jockey 4674 1 73.81 ACAAGAAGTGTAATGTTACACATTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCTTTTTTT:1 + chr2R 9953296 5' + pogo 51 1 77.45 ATTTTCCCCCCCCTGGCTTTTATCAGGGTTAAATCAGCGTAATTGTTTGGCCATCTCCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 + chr3R 24593239 5' - Stalker3T 204 1 61.47 ACACGACACAAAAACCAAAAAAAAAAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2L 9171485 5' + opus 19 2 66.22 GAAATTGGAAAACTAATTGTTTGCCGCACTCACACAGCCATTTGCATTTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTTCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCA:1 + chr2L 1830061 5' + Idefix 7070 2 51.89 TTGCCTCTGCTGTAAATACGCTGCTTACGACCATACAAAGGAATAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCAC:1 - chr2L 13421838 5' + Doc 4470 1 60.91 TTTGGGTATTATCGAAATTATACTTTTAGATGACAATATTTTCACTTGGCATTTCAAATGATCTACAAAGGTGTTGCAAATGAGGACTGATAACATTTTCAAAAAGTTTT:1 - chr3R 9055887 5' - Q-element 141 2 59.09 CGAATATCAAAACATGTTGTGCCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 + chr2L 6757495 5' - Tirant 8466 2 79.78 AAAAATAACTGGGCAGGAGTGCGTGTACATGGTGGGTTAAGGGCGTCGGGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCCT:1 - chrX 406272 5' - gypsy5 6937 1 57.14 ATTTAATGGTCCATCCGGGGTTTCTGTTTTTTGATAGGCTTGTTTTGGGGGGGTTTTGAATAAGGGAAAAAGAAGGGGAC:1 + chr2L 23374289 5' - Q-element 509 2 62.50 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAAGGTCGCGCACTTCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTAAATATGATGCAATTCG:1 - chr3L 11720528 5' - Ivk 4983 1 53.64 CATCCGTATATATTGCTGCTGCTCTTATGACTGCTGGCAGTTTTATTGTTCCCACTGTTGGCGAAAATAATCCTCGATTTCGATTTTATTTTTTCTTTTTTTTTCCTTTT:1 - chr3R 20206665 5' - Doc2-element 239 2 70.91 TGTATCATTATTTACTTTTCGGCTCGGGCACAAACACACACAACCACACACACACACAC:1 + chrX 12819960 5' + gypsy3 418 1 67.80 TCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCA:1 + chr3R 23020811 5' - 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chr2R 20491347 5' - F-element 4341 1 65.45 TCAGAAGTGTAAACAATCCGATTTAAAAGCCATAGTCTGTCCGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACCAATTTGATTTT:1 + chr3L 4448664 5' - Doc 4427 1 59.63 GAAGGCACATTAAATGGTTCTGCACTCCATGCATCAGTGCCATTCTGTACCATTTCTTGTTTTTACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTC:1 + chr3L 232859 5' - gypsy4 464 1 53.64 AAGCAGTTAAGAATGCTGATAACACTGTCGTTTGTTTGTGCCATTAATAATCTCTGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 + chr3R 6088532 5' + transib2 25 1 57.80 CGAATCAATCGAATAATTTCCCCCTTGGGGCCTTGAGGGGTGTTTATTTTTATTGGTAAGCTTACTCGTGGTGAAGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGC:1 + chr3L 8738987 5' + Cr1a 4076 1 53.40 TGACGGGCTGACTTGGCTCCAATTACCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATACTGTCCGGTGACATGTTTATTGCAGCCCCTACATAGA:1 - chr3R 7314509 5' - rooA 50 2 65.66 TTTTGCTCACTAAGCAAACATATTTTTATGTATGTTAAGTGATGAAGACACCACATTGACGCCGTCGATACATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 - chr2R 22661328 5' + Transpac 6 2 75.45 ATAGTTTAATGAGTTGTAGAATGGTTATGCTTAAATACAAAATCTATTACGGAATGTTAATAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr2L 11762164 5' - mdg1 7434 2 58.18 CAGCGTGTGTCCAAGATAATCCTAGAAACAGACTGACAAAACCGGAACGCACAGATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chrX 19010154 5' + Burdock 10 2 65.56 ATCTTTCCTTTATCCATGTCTTTTTTTTTTTCAAGTGCATTTGCTTTTGGATACAAGTGCTCTTAGATGCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTTCG:1 - chrY 684993 5' - Idefix 7095 2 68.18 CAAAAGACCTTGATCATTTCAGTTGTAAATTTATTTAATAAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATA:1 - chr2R 14884044 5' + mdg3 5291 2 58.82 CGGGCAGGGTTGTCGCCGTTCGCCAGTTTATGCATTGTTTCCATATGTTCATATTGGTTTTATTATCGTCTTGT:1 - chr3L 10979331 5' - Porto1 4246 1 59.46 CACAATTTATAAATAGACAAATCTGACCACCTATCCAAGTACCCTTGCAAGAAAACTAATCCGAGTATACAGTCAAAGCCGGCTG:1 - chr3L 25346696 5' + Doc 4525 1 82.35 GGCTTCGATGATCGAAAGTGGGCTATACACTAACAACGCTATATGTATAGAAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTAT:1 - chr2R 23029332 5' + copia 210 2 61.62 TCGAAATGTAATTAAACAATTTAATGTTGTTAACTACATTCTTCTAGTCCCCGTTCCGACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTTAAAGAGATG:1 + chr3R 30729212 5' + Porto1 322 1 55.05 ATCCGTTATAGAGCACTTTCAGGAATCCGTATCGGTTATGATGGAGTATGTGCAGATATCGAGGG:1 + chrX 8279776 5' + blood 3 2 60.00 AAAGTATGCACCATTTCCACACAGCCCGCCATTGTGCCCTCTTTTCCTATGTCCCTGGCACACCAACTCACCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chrX 22745140 5' + jockey 4776 1 64.55 TTTATATTTTTTTATTATTATTTTTCTTTAAATTACAATTTGTTTTTTAAAAATTAACAATAAGTAATTGGTTGACTTGATGTGAAAAATAAAAGAAGCGGC:1 - chrX 21260146 5' - Porto1 4601 1 86.27 CGAGGGCGCCCCAATTTACGATATCTTTTGCAGAATGTGCTTATGCAATATTAAGAACAATAAAAAAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3L 18072778 5' + 412 34 2 51.81 AAAAAAAAGAGAAGAAACGAAGTGTTTAAAGAAGCGGCAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGG:1 - chr3L 18095127 5' + Bica 288 1 59.78 CTCAGATAAGCCCCGTTATCTGAGCGAGAGAGCATCCCATATGATTTTTGCACAAAAAGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCACGAGACATC:1 + chr3L 13228461 5' - P-element 2865 1 60.19 GAAATTAATTGCGTGCTTTCGTGCGCGGCAAAGAAAGTTGTAAATGCTTTCTCTTTCTCTGGGGACCCCCAACAGCCGAGCAAGGAAG:1 + chr2R 11379709 5' + jockey 4675 1 72.73 ATATTAAAAAAAAATTTTAAATTTGTTTTAAA:1 - chr2L 19400173 5' + 1731 4261 1 75.00 GTTTGAAGTAGGGGAATGGGGGGGATTTTTACAAATTTACAACTTTTGCGGGGAGTTTTCTGGCTTCTAATTCGTTTTTTGTTTTTATTAACAGGTTG:1 + chrX 6507832 5' - I-element 378 1 57.14 ATTTTTAAATATTTACTCATTTTATTCTCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATAAAATTTCGCCTTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGGT:1 - chr3L 21817535 5' + INE-1 545 1 78.10 AAAAAACCGTTTTAGTTCAACCGTTTTAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATA:1 + chrX 19346989 5' + S-element 1608 2 75.45 TTCCGAACATCTATGATATATATATTCCTGATCAGGATAAATACCCGAGTATGTCCTTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGTTTGAG:1 - 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17.6 445 2 68.18 AGGACATTTATCAAGAGATTTGGTTGATGGAATCACAGATTCTATTTCCATTTTTGTTATATTAATGCCTTGTTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACA:1 + chr2L 19146601 5' - Juan 3827 1 72.73 CTCTAAAAGTTCGTTTGAGTCGATTTCGCCACCGGGGAATTTCAGAATAAGCATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAA:1 - chrX 16560666 5' - S-element 1704 1 64.89 ATTTTCCAAACGATTTGTCACAGTTTCGCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCGGACCACAT:1 - chr3L 15009476 5' + gypsy5 62 2 71.43 CACTTGCAATCTAGTTCCGTAATCAAATCGTCTAGCGTACACTGCTCGAAGAAAAATTGATTCGTTTGTTGCCCAAAACCCTTATCAGAAAAATCTTGATAAACAAATAT:1 + chrX 7604295 5' + I-element 84 1 82.73 AATAATCGGATGAATAGTACTAAAAACTTTTAAAATTTTACTGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAT:1 + chr2R 19210978 5' + jockey 4844 1 61.82 TATAAAAAATAATTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTATT:1 - chr3R 18245514 5' - Gypsy6A_LTR 216 1 61.70 ATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAA:1 + chr2R 5582167 5' + Cr1a 448 1 62.96 TTGCCACACCATCCCGGCCCACGCCCACACTTTTAAACCATTAATTTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAT:1 + chr3L 9883816 5' + INE-1 561 1 75.29 AGGCCAACTAACTGGCCGTGGACGCCTGAGTTAAGTCCGTGATTGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 - 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chr2R 19010493 5' - Ivk 5361 1 36.36 CAGGCAATATGAAAATTGAAGAGCAAAAATCGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTA:1 + chrX 1641179 5' - FB 975 2 76.36 GTTTTAGCCACGCACCTGATACGCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr3L 19063487 5' + P-element 60 1 24.55 CCAACTCACTGTGTGTGTTGACTGGTTTGAGCACACACGCACACATATACGCGTTCTGGTCTCTGGTTTTGCTCACTCAAGCAAGAAAATTCTATTTTTAGATTTCTTCT:1 - chr3L 1990064 5' + 1360 3274 1 69.09 TAGTTTATTTTAATACCGCAATTAGTGTTGTTCTCCGGGCGGAGTGGTGGAGTGCTTACGTAGCTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGAC:1 - chr2R 16353575 5' - Stalker4 81 4 55.45 AATTCTAGCCATGTTTCATTTTCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGCCA:1 - chr3L 64533 5' + F-element 299 1 75.26 GATGGAATGTAGTGGCCATTACTGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCC:1 + chr3R 5951588 5' + micropia 5195 1 74.12 TTTCAGTACGCCCTGACTGCAGATGGACAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTGTGGCGTTCG:1 - 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chr4 1168905 5' + 1360 320 1 62.73 ATTTAAATAATTGTAGTGTGTATTGCAAAATAATGAAGATTTTTTGTTACGAATGACTTCCACATTTTCGTTAAGTGCAGGGCGTGATACTTCTGACAACTGATAAAGAT:1 - chr2R 9614512 5' - Bari1 196 1 78.18 ATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATGTTATATTATATTATATTATATTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTAT:1 - chr3L 20525229 5' - Stalker3T 201 1 70.91 AACGGTTCACAGTTTGTGATCATCGAGCGCTCGAATCGGAGGAGACATATGTAAATATTTGACATAGCTGGACTAATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGGGTGAAGACG:1 - chr2L 5338061 5' + F-element 17 1 70.64 AGTAGGTGTTGCAAGTTCAAATTTATTTATGCTTTTAATATGGCTCTTTGTAAAGGCAAAAAACCCCTCTAGACTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 13544014 5' + 1360 1 2 37.25 GAGTAATATTAAAAACTGCAAAATTCTAAAATTCCCAAGCTCAACGTTCAAACGGACGGACAGACAGACGGACATGGCCAGATCG:1 - chr3R 27182448 5' - INE-1 113 1 54.12 GTAGTAGTAATCTAATATCAAACGTATGGAACGGAACTCTGCGGAATTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCAAACGCAATCA:1 - chr3L 17469876 5' + Porto1 4319 1 76.67 TTTATTGTACATTCCAGAAAAACGGGCAAAAAAAAAATAAGAATAAAAACATAAAGCATAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTAT:1 - 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chr3R 7373631 5' - mdg3 5082 1 55.77 TGCATCTTTTCTTTTTCTCGATCCAACAATAAAACAATATGTTCGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAAG:1 + chrX 10423188 5' + Doc 4506 1 52.13 ACGTACATCTTTGTTCTACAAGTAATAATGTAACGTTCTGAAACTTTTTCGATGTTTAAAAAATACATGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAAT:1 + chr3R 6263279 5' - diver 205 1 66.36 TTGAGATGGAACTTGCACAATTTCATAGCTAGGCGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGAGAAGAAGATAAGATAAGAAGGATAAGATAAGATAAGATA:1 + chr2R 19154555 5' + Stalker3T 202 1 61.82 CAACACAACACAACACAACACAACACAACACAATCTCACACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAACCA:1 - chr2L 16217660 5' + I-element 4954 1 71.03 AAAATATATATACACATCATATCACCAAGATTTTCTCCCTCTTTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 10202990 5' - roo 9034 1 60.78 ACTGCCATGTGGGGTCGACATGAAGCCCCAAATAGAGAGCCCCCAAAGCTTATCTTGACAGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGA:1 + chr3R 19742948 5' - F-element 4515 1 57.27 CTGAAAGCTCATCTCTAGGGATTTCTGCCTCAAAATTATGATTTATTCTTACGTTATAATTTTCTTTCTCAGAATCTTTGTTTGTGCTCGCTGTTTGATGTCAATATTGC:1 + chr3L 17696642 5' - F-element 4305 1 63.64 TGCGCATTAATGAATTATTAATTTGTGTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chr3R 10964619 5' + I-element 46 1 74.74 GGAGCGAGGCATGTCTGTCTTTTTCGGCGATCAAAACTTAATGTGCAGAACAAACGTTGTAATAATGCGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACACGCTGCGTAACGC:1 + chr2L 22490510 5' + 1360 11 1 69.16 GAGGTGAATAACATTCAGAGAGACACACCAGAATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATA:1 - chr2R 6518121 5' - Stalker3T 205 2 64.55 ACCTGTGCAGCTTGTAGATAAATAGCACCAGGAACGAAATGTAGATGAGGGCCACGAAGACCAGCGTGAGCAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCTGTAACCAAAAAA:1 - chrX 11340726 5' + 1360 3326 1 59.26 GCAAAAACAAAAAAAAATAAAGAGTTCTTTAACATATATCTCATTTTTAAAAAGTTTGTAATAAAAACCAGAGAACTGCACGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3R 26733977 5' + hobo 21 1 61.82 ACTGCAGACTTTTTTGCCGGTTTTTTTTTTCAAGAGACGAGAACGCGATATGGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAAC:1 - chr2L 8649658 5' - 1360 3170 1 72.73 TAAATGGCAGTAAAGCACGCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - chrX 8326748 5' + jockey 4706 1 74.68 TGTGGCTATTAAATAGTGGGCTAAAAATTAGGAATTTTCAACTCTTGCCCCACCATTTTTTTTTACTATTTGACTTT:1 + chr3L 2031642 5' - Rt1b 5142 1 77.92 TTTCGGGAGTTTGTTGGTTCCGCTTCGCTTGAGCTACCAGGCACTTCTGAGGTCCCCGGAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr3L 217400 5' - roo 411 1 80.23 ATGAAGGATTCGACCAATATTTCAGTATGATTTTTTTTCTTAATCATGTCACGATTGACAATTAAAAAAATCAAAGTTTCCCGACTTTCAGATAACC:1 - chrX 21100425 5' - INE-1 556 1 54.64 GTATGCTACGAAAAATACTGAAATCCAACGCCCTACACATGAGCCATTTTTTTTTTAACAGGTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACACATGC:1 - chr3R 7874884 5' - jockey 4967 1 51.38 AAAAGAAGAAGAGGTGAAATACCAAAGCAGTACATACACAGGCACATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAAGA:1 - chr3R 11868969 5' + blood 58 2 56.36 CTGAGCCAAATTAAGTGCATTATCACTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACT:1 - chr3L 3240564 5' + diver 5951 2 76.36 AGGACGGCTAGAGGAAATAACAAGGGCTCCGTCTTGTCCTTTGTCAGCATGAAGGAGTCCAAGGTAAACGATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTTGGGGGCCAA:1 - chrX 21386459 5' - Burdock 274 1 70.91 GAGATGCACATGCAAACGAAATATTATATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTG:1 - chr3L 19417402 5' + invader2 4925 2 60.66 ACTTTTGCCCAGGACTATAAGCCCACTTTGCCTGACTCTGGTGAAATTCAACGCGGCAACAGCGCAGGCACCGTTATTCCTGTCGTCGAG:1 - chr2L 17801856 5' + Chimpo 311 1 75.56 CACAAACACAAACACAAACACAAACACGAACACAAACACAAACACATACACATATACACAAGCAACCATAGGTACATACACAGACACACAAGAACACACACACACACACA:1 - chr2L 16071771 5' + accord 7026 2 50.91 TTGTACATGTTTCACTGTACAATACACTCGTACACAGAAATGAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGAAATA:1 - chr2R 16476425 5' + X-element 56 1 56.88 AGCCCGAGCAACAGGATAAAGCTGCAGGACACAGCCATAAAGTAGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGGGACTTATCTAGAATTGGGTTTT:1 - chr3R 19345537 5' - Idefix 6970 2 52.13 TGTATGTGTTATTTATTACAATTTTGTGACTTATTAAATCTTACGAAAGCTTCAGACAGCGGAGGGAAATAGGGTCG:1 - chr3L 18709437 5' - G5A 2661 1 80.52 CTTTTCCAAAATGTCTAAAAACAATAATAATATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chrX 13202676 5' - Tirant 366 2 56.36 ACTCTATTTGTTCAGATTACACTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2R 7981158 5' + 1360 58 1 83.81 ATATCTCAAAGTTAATGGTTGTGCACATTTTTACGAAATTTTTAAAGTAATCAATTTCTTCAGCATACTTACATACACATATATAGTAAGATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 - chr2L 9488263 5' - 297 389 2 44.55 GCAAAAAAGAAAAACGTGTCACAACAGATACATATGGGTTACTTAAATAAAGCGATACGAGTTGGGTTTACAAATGGTGAGTTAGATTATAATTAGTATTTTTTGTATT:1 + chrX 17931191 5' - HeT-A 5893 1 71.56 CAAAGGGCAACTTAAAAAGTTTGCCCTAGCTAAACAAGTTGATGCCAACAGACACACACACTTACACACACTCACACATACATAACCATATAGGAACAGCCATACACACA:1 - chrX 15406827 5' + Quasimodo 64 2 70.91 TGGCTGGACAAGCAGCCACTGTAAAAAGTCCAAGGAAGTGGTCTTGCGACCACGGTTACCCTTAAACATGTTATTATTATTATTAT:1 + chr3R 13298147 5' - invader3 5060 2 77.91 CTTTGCCAGCATGATTAAAAAGTTTTGCCACGGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATG:1 - chrX 9782230 5' - 297 36 2 65.96 CAAAAATGCTCAAAAATAGTGCATAGTTTTGAAACTTTAAATAATTCTTGTGGCACTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAA:1 + chrX 14827578 5' + G6 1997 2 56.86 CACTACAAATAAATGGAATCACAAATTTATTATGAGCTTGCTTTTGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTT:1 - chr3R 26243169 5' - flea 13 2 61.05 GAATATATGTATTCGTGAACTTTCAAATGGTGAGAAAGAATGATTTTTCAAACGTGTTTCAAATCATTTATATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3L 24773957 5' - hobo 2925 1 48.18 CATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr3L 17595320 5' + jockey 4718 1 70.09 ATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGG:1 - chr3R 433146 5' - 1731 4596 1 52.73 CGACTATCTAACAAGATGGAAACTATATGGGTATAAATAGTCAGTAATAACTGAGGAACTGAACAAACCAACGAGATTTTCTTTTTTTCTATCTACTCATTCCATTTTAC:1 + chr2L 6217110 5' - HB 107 1 60.00 TAAATATTCTTAAAATAAGCAAGAAACCATATTAACCATCCGACCAGTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAATTAGAT:1 - chr3R 6132115 5' - I-element 5320 1 53.64 GCAAGGGGTGGTTGATAAGTACGTCGCGAAGGCTGACATGCTGTTGGTCCCACGGGAAACCATTTCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGG:1 - chr3R 4199750 5' + baggins 5326 1 53.26 CCAAGATCGTTACAAAACTGTTTCGATTCTGGGGCCTGTGCAAACACACATCTCTCGTATTGATAGGCTTGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACAA:1 - chr3R 28556645 5' + Tc1 1605 1 67.27 TTTCGATCAGCTTAAAAGCTAACGCCATAAAGCTTTTGCTAAAGCTTAAATGGGTTACCGTCTTGAAATTCTTATAAAAATCAAGAGTTCATTAAAAAATACAAAATTA:1 + chrX 16404343 5' + X-element 169 1 57.80 TGCAAAGTATTCTGCCCAACTGGCTATAGTTTCGCACAGGACGTTTCAGTCCTGGAGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTT:1 + chr3L 13847357 5' - FB 158 1 54.55 GCGATGTCATTCAGCGGACATACAAAGGACTCCAAGACTTGCAGATTCGAAGCCGCAGGAGACATTGAATTCCATTCTG:1 + chr2L 14747627 5' + R2-element 3160 1 56.96 CACAACACAACACAACACAACACAACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTCCCACTCT:1 + chr3R 21907535 5' + Porto1 499 1 77.98 AGGCTTTGCAGGGGGGTTGGGGCAAGGAGTTCGGACAGGGGGAGGGAGGGAGCGCGTGAAGCGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGTTGATGATCGC:1 - chr2L 14402013 5' - HMS-Beagle2 7009 2 43.14 GGGAGGGAGTATGTAGATCACATAAACACTGGCGTAAAATCCCAAATAATAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 14013401 5' - roo 351 2 74.55 GAGGCGTATTGAAATTGCTTCTTCGAAATGCAATCGACGTGGCCATATTGGCACCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACC:1 + chr3L 13727822 5' + BS 4855 1 63.16 AAAAATAACAGAAGTCAAGGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCAAAA:1 - chr3R 31774877 5' + micropia 5316 2 71.62 TGATCGAAAACATTTTAATGAATAGAGGAAAACTGGAAGATCTACAAATCATCAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTAAG:1 + chr3L 23063498 5' + mdg3 5136 1 60.91 TTTCCCTTATTTTCGTAATTATACAATTTTGCTTTTTCCCTTATTTGACGCTCTTATGTCACAAATAGTCGAGATCCCCGACTATCAGATATCCGTTAATCAGC:1 - chr3R 3510979 5' - INE-1 546 1 60.58 TGGACTTACTTCTCCCGGCGTGTGTGCCATGTCATATGAAAGCCACAAGGTTGTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3L 9198443 5' - 1360 3370 1 56.25 AAAGGCAATAAATCTTAAATTGATAAGATGAGATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGC:1 + chr3R 15697052 5' + 3S18 5820 2 70.91 CCAAGGACCTCCTGCTGGGGCAATAATTTTATTTGATTTCATTTAAGTTTTGGATTTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 + chr2R 23477841 5' + F-element 16 1 60.24 TGTCCTGCGAGCGCGACTGGAAGTACATATAAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATA:1 + chrX 1251246 5' + invader3 5256 2 60.76 AAGTGAAGCCAAACGCGCCATCACAATAAAAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCCTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAAATATAACAA:1 - chr3R 22879139 5' + G4 90 1 73.64 GTAAGATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCACGCCTGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCACTCGAG:1 - chr3R 31458542 5' + jockey 12 1 68.54 CTCTGTCGCAGTGTGACCGTCGCAATGAAATGGGAAATGGCCCAGCGCCTATTCGAAATTATTTGGCTTGAAAATAGCTATACGTGCATTTTTCAAATTTTTATTTT:1 - chr2L 2151753 5' + FB 172 1 72.90 ATAGATTTTGATCAAATGGTCCGTCAGGTACATATGCAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2L 14848397 5' + pogo 48 1 70.91 TAGAGGCACTATAACAAAAAAACTGGCTTACTAGATGCATTATAGGTATTAGCTCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATT:1 - chr2R 14372598 5' - blood 75 2 55.45 TGTAAAATCACTAGTTTCAAAATTCCACTACATAGTTATATTAAATGTACCGATCAACACGACCAGTCAAACTTGACTGAAGGGA:1 + chrX 5962739 5' - invader4 240 2 55.29 CACAACACAACACAACACAGCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAACAACAAACACAAACAC:1 + chr3R 21907535 5' + gypsy3 418 1 32.11 CCATTGAAATACCGGAGGGCAGTGCACCGGGAGTGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATA:1 + chr3R 14635638 5' - jockey 4652 1 69.09 AAATTCATTTAACCTTAGTTGGACATTTTTTATTACTAGATTTTTAGCTAATCGTTATTAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 18626886 5' + roo 8689 2 53.64 ACCCAACAACAGAGAGTCTCACATTTGTCTTACGGATGATCGATCGAATTAGTCGTTATATCGAATACAAATTATCATTTTAGTAGATTGTCCATATATTTATTAGCGTA:1 - chr2R 10129836 5' - Burdock 6371 2 62.73 GTTGTGGAACTGAAATCGAGAACACAAAAAATATGATAAGGATTATAATTTTATAACATTATCTAATTTTATGGGATTTTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCC:1 - chr2L 8476793 5' - Juan 4206 1 67.89 CATTTTTCAAAAGTGTGGCAGTTTTGTGCGATTTGTGGGCGTTTGTGTGGGCGTGGCGAAATAGGTCAACTTTTAACTTTCTTACTTTTATAGTTCCTGAGATCT:1 - chr2R 5212074 5' - INE-1 149 1 64.76 TGCCTTTAGCTTGATTGAGAATTTCATGCCTGAAAGCTAATCGAATTGCTTTATTTTAATTTGTGTTTCTACTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTCCTTATATTCATTT:1 + chrX 17014139 5' - invader2 307 1 70.00 GGCAGAAAGTCAAGAGATGCCTCACTACTTTTTTGGCTAGACGCCTGCCGCTTGTTTGTTGACATTGTTTGATCAACGCACTGTTACCCACGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr3L 9822457 5' - jockey 4951 1 64.22 GCGTCATTGGCCTAAACCAATGCGAATAAGGCACTAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATACACACTC:1 + chr3R 10956203 5' - hobo 2909 1 55.56 CGTATGGCTGATTACCGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCAAATACCCCATGATTCC:1 + chr3R 28444273 5' - R2-element 4 1 73.85 ATGCGAAAATTGATCTAACTTTAAGAGTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chr2R 8086807 5' - 1360 3331 1 78.18 GTTGCATCTTATTGAATTCCATTTTTTTAGCAGTAAGCGTTTGGATCCGCAATCGATCCTTCACAAGCCGTATGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTTGTTT:1 + chr2R 17445280 5' - I-element 96 1 69.09 AGAATGTCCATTAATGTCTGGTAATCAAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCATGTGAACACCGAGGCCTCTCTTGCTGTTAAAGG:1 + chr3R 14408228 5' - R2-element 386 1 70.59 ATATTCTAGGGTCTTTGGTTTTACATTGTATGGGGTGAGTTTGGGCCTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGAATTTTTTGTAATCTTGGCTTTTAGACAGTAAC:1 - chr2R 5876920 5' - HeT-A 5873 1 76.15 ACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAACCACAAACACAAACAC:1 - chrX 9845361 5' + gypsy3 418 1 27.66 ATCGAGATCAGCTTGGTAACAACAAATGTTTATAAATAAGTCGAGCTACTTCCAGTTTATGTTGGAGTAGAATGTACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACT:1 + chr3R 25737744 5' + S-element 7 2 74.55 GACGTTTTTTTTATAAACGACATAACTACGTCAAACCAAATTAAAATAATCAGATTTCGACTAGGACACACCAAAATAACCTACCGATTGTCCGTTTTGCCAATGTGATA:1 - chr3L 22162311 5' + I-element 5010 1 70.00 AGATGTTTTTCATATTTTCGCTTCGAATTTTATTTTGACATAGTTTCATAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr3L 2120962 5' - I-element 5322 1 57.27 CAAACGGAATTTGCATTGAGATCGGAATCCTTATCGGATTACTCCATCTAGGGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGCCCTTTAACAGCAA:1 - chrX 7122925 5' + R2-element 377 1 54.44 TCATTTGCTGTGCAGAACATCATCATGAGGTTGAGCCAGCCAGCCCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGTTTTCTCTCTTTGCT:1 - chr3R 18264065 5' - Bica 429 1 55.67 GAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGCGACACAGTG:1 + chr3L 22908067 5' - Dm88 59 2 57.78 GTTAATAATAAATAGAATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTTATTATTTTATTTTATTTTATTTTTTTAATTTTTTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAA:1 + chr3R 16799787 5' - X-element 4700 1 49.09 GATGGGGAATGATGATGCTGATGGGCTGACGACTTTTACAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTACCCTGGT:1 + chr2L 13324586 5' + jockey 4767 1 64.55 TTAAATTTATAAAAAATAAGCTTTCTAAATTTATCAATATTTTTCGAAACATTGAATACACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTTGCTCTCCCACA:1 - chrX 9486175 5' + Cr1a 302 1 58.18 AAAGTTAGATATTTTATACCCTGTTGAATTATTTTAATAATAAATGTAGCGTGCCCGTTAGAAATCTTTTGTAGCTCTATTCCAAGACATTTAACAGTTTATTTTTTTT:1 + chr2L 14295589 5' + accord2 344 1 77.98 ATGCACTTAGCCACTTTGCATTCAGCTCAGATTACGCAACAGTCAGGCCATATAGACACATACATACTTTGTAAGTAACACACATACATATGTACATATGTATATATATG:1 + chr3L 18895968 5' + G3 4508 1 55.45 AGTTGCAGAAAGACCACAACAAACCGACGGACACACACACACACACACACACATACATA:1 - 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I-element 5053 1 74.07 GGTTTATTTACGCGCCTAAGAACGACCTTGGATGCTCACTGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT:1 - chr3R 29326869 5' - accord 181 2 76.00 ATGGCCAGTAAAATCGGGAAATGGCAAAAAGGGGAGCGGAAAAGCGGAAAGGTCGCGGACAGACCGAATATCATCCTTT:1 + chr2L 15566062 5' + Rt1b 207 1 65.82 GCATAAACACAAGCGCTGAATGTGTGATATGTACATGTGTGATACAACTTCCGGTCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACA:1 + chr2R 14661085 5' - hopper 1387 1 55.05 ACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr4 311207 5' - 1360 3355 1 59.05 TAATGCGAATTCCTATGAACAAATTGTATACCCACCAGTCCCATTTCACGTTCACCTTTTGCTACTGAACCATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTCA:1 + chr3R 4305270 5' + roo 8671 2 73.79 TTCATATATTGAGCATTTTCATCGAGAGTAGTTCAAGTGCGTTATTTGGCTAACTGGCGTATTGCAATCAACGAACAGAAATGCAAACATGTCACATTTACGCTTAATAG:1 - chr3L 10590613 5' + Doc4-element 2348 1 58.18 GAGACAAGGTCTCCAATTCCAAGTTAATGCCTTATGACTGCACGAAATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTC:1 - chr2L 18837782 5' + Doc3-element 442 1 68.82 CTCTTCTTCATCGGGCCCAAAGAGATCCTCCAGCAGATCGGGATCCGGTTTCTTGGTCGTGTTTCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGT:1 - 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roo 9039 1 59.00 GTCTGGCGAAATTGCAAAGTTCGTTTTTATAGTGGCACATTAAACAATACGTGTCGAAGAATTCCCCGATGTCCAAGATTCAGCTTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGG:1 + chrX 12423455 5' + HB 1230 1 67.27 ACTTTTTATATTGTTCCGGTTCATTCCGGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 - chr3R 26398901 5' + Doc 61 1 78.18 CACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr3R 21907535 5' + 412 7069 2 38.10 TGCGCAAGCGAGTCGGCAAGCAAGCTCTGCTACGCCATAACTGTGCGCTTTCGCATGGGAGATGAGACATCGAGTGGACG:1 + chrX 18366169 5' + jockey 18 1 58.75 GCAGCGGATTACATCAAATCGGGATATTATAAATTATTACAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGCCCCAGATG:1 + chr3L 21295446 5' - Circe 19 2 64.22 TTTTTATGCTAATCGCAGGCATATTTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 + chrX 17330122 5' - opus 447 2 78.79 CTTTAGAAATGGGTGGGTGGGAAAAACAACAAAGCACAGTTCCAAAATCTTGGAGCGAAGAGTGCGTTTCCCCAATGCCGCACCAACAACAAATTACACACAAAC:1 - chr3L 7200056 5' + Doc4-element 203 1 70.48 CGGTCACCCCTTTTATTTAGCTGGCTTCACACTGTCTTTATTCAATACACAAAACCTGGGGCTTCAGTTACCCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 - 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F-element 28 1 50.53 TGTAGATAAGCTAAAAGGATTTGAATTACTAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAG:1 - chr4 1271903 5' - 1360 88 1 69.66 ATGCTTGTTGTTGTCTATCTAATTTATTTATTTAAACCTTCAACATCATTTGCCCTAATCACCCCTTTAATAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGA:1 + chr2L 7000404 5' - Quasimodo 7075 2 80.65 AATGTCAGAAATGTCATTGGTCCCTGTATGATTTCATTTCTTTTTTTTCAACTAACAGCTTGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGAGCCACAGAAA:1 - chr3R 25991720 5' + X-element 4423 1 60.19 ATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAAT:1 - chr3R 15017464 5' - Tc1-2 1604 1 60.00 GATTCTCATGGATGCGGGGAGGGGGCGGTCTCTTCGCTCCCCGACTTGTGGGCCG:1 + chr3R 10840187 5' - Doc 409 1 58.18 CTGGACTTACTTCTCCCGGCGTGTGTGCCATGTCATATGAAAGCCACAAGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGCCATA:1 + chr3L 9198442 5' - 1360 3373 1 54.26 TGTTAATATTTTATTTTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTT:1 + chr3L 14396966 5' + BS 5015 1 50.00 CTCCTCTGCTCAGGCCGCTTTACAATTTTTTGGCTCCGCCGTGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACT:1 - 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chrY 2720381 5' + 1360 3224 1 56.36 ATATTAATTAAATGCTTACAAACCGCAAAGGGGGACAAGCCGACCGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCG:1 + chrX 10203112 5' + F-element 248 1 55.41 ACCCAAAGGGTTTAGAAATCCCATATTCATTTTTTTTTATTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTA:1 - chr3R 8451724 5' - X-element 4662 1 72.73 CACTTATACTGCCGGCAAGCACTTTACCTATCTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGT:1 - chr2R 18507895 5' - Bari1 1652 1 72.73 ACCCTTTCGAGCCATAACTCAGATGGCTAATTGGTGCTTGAGGAAATGTGAGTACTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGG:1 + chr3R 22595803 5' + FB 1 1 72.15 GTTTAATACACGGTATGCTATAAATTTTATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTT:1 - chr2L 1439953 5' + flea 398 1 74.55 GGCTTCAAACTGGAACTGAACCGAGCTCCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGTCATGGGTTCGCAAC:1 - chrX 16620888 5' - Burdock 5923 1 73.63 CTTGCAACCTTGGGGCTTTGTTTTAGCGGGCATTAAACTACATGGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAG:1 + chr3R 30293367 5' + mdg1 462 1 57.83 TTTATACAAAACTAACATAGTTATACCACACAAAATATAAGACACGGATCAGTTGTGGAAGAAATAATTGTAGTGCCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAA:1 - chrX 1217179 5' + 1360 421 1 75.93 TGAAAATCTTTACTAAAACATTTTAAACATTAATTAAAACATTTTAAAATCTTAAATTAGCTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 + chr3L 17595293 5' + jockey 4687 1 62.14 GTGTATTCAAATTGCTCATCAGTGAGAGGCGCCACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr2L 9147976 5' + Doc 9 1 54.84 GACGCCGTCGATCCATAAGGAGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chr2R 22661271 5' + Transpac 20 2 67.16 AACAAACAAATCAACCTCAATGACCGCGATCCCACACAAATCTATTAACTGGCGCCCAACATTCACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTACGTTCAA:1 + chr3R 27042767 5' + gypsy7 279 1 66.67 TTCTGTAAAAGCCCCGGGGCGACTGCGCTTTCCTGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATGCTTGTGTAAGCGTAATATGTGAAGCATAT:1 + chr3R 10916930 5' - rover 10 2 69.07 TTGGTGGGTGGTCCGTTTGTATTGTTCTAACACTTTTTCGCTTGGGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGG:1 + chr2R 18814764 5' - I-element 335 1 59.55 GTGCACTCAAGGATTTCTAAGAACTTTAACTTGCCAAAATGTGCACACACGCATGTGTGCGCACGTGTCTGATGTGTGAGTATGAGTGTGTGTG:1 - chrX 4044937 5' - accord 7036 2 64.89 TTCGCCATCCTTGTCTTTGTGTGAAAATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCAT:1 - chr3R 20119604 5' + rover 51 2 76.36 TGGAAAAGGGTAAATAGTGCCATTACAAACCGCTTTATCTGCGGAGCCTTTCGTCACATTAGTTTTTACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chrX 15043086 5' - S-element 1708 2 70.64 TGCAAAGTATGCAATGGAAAATAGGAAAAATAAGCAAGCAAACAAACAAACAAACAACACGCACACATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAA:1 + chrX 5197853 5' + 1360 3253 1 53.64 GAACTATTAACCAACTAATTATTAACAAACGAAATGTTTTCCTTTGTCATTCGTTGACATTCCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 5219213 5' + Doc 33 1 53.64 CCAAAATCCCAGAAAAAATATCACTTACGAACAGTTTCGAAATGAACTGACGCGCTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCC:1 + chr3L 11729965 5' - invader1 3753 2 70.00 ATGATGCAAAACTACATAAGACAGGCATACTGTAAGGAAAATCAATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGACTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAA:1 + chrX 463970 5' + Doc2-element 4607 1 48.18 AAATCGTAAATGGAAATAGATAGAAACTATAAATCAACATAACATTGGATACAAACAAGCGCATCCGTCACTCTAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACA:1 - chr2L 2609248 5' + Porto1 239 1 55.77 CAATTCAATCAAATAAATACAACAAAGAAGCGGGATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTA:1 - chr3L 8003027 5' - FB 729 2 68.81 GTGATCCCAAGATCCCCAAGATCCCGTGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTA:1 + chr2L 4362377 5' - FB 950 3 75.45 AACACTCGAGTAAAGTAAATATAAAGTAAAGTAAAGTAAAGAGTTTTAGGTGTCCAGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 13543850 5' - 1360 3382 2 39.77 TTATGCCGCTCTTTATTGGCTTTTTATCGTTCATTTATTTTTTTATTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chr3R 5774846 5' - I-element 5324 1 66.67 GGAATGATGATAAGGTCCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGG:1 + chr3R 19448021 5' - Ivk 5143 1 80.46 GCTTTCCGAATGGGCCGAAGTAGATTTTCCAAAATCGGTGGGGCTGTTAACCGAACTAATTCCGAAATCAGCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 3528665 5' - roo 396 1 68.81 AGACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATAAAATACAATAAAATAAAAAAAAATACAAAA:1 - chrX 12946235 5' + F-element 4685 3 50.60 CGTACAATGTCATTAAGCAGTCAGGCCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr3L 5720761 5' - 412 7502 2 69.79 TGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACACGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr3R 21907535 5' - 412 7511 2 53.33 TGATTGCAAATCAAATCTATCATATTATACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTAAAGTGCTTTTCACATCTATA:1 + chr3R 17777603 5' + Burdock 43 2 70.53 AAAAATCAATGGCAATTATAAATTTTTGCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr2L 18570503 5' + FB 28 1 68.35 GAGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGA:1 + chr2R 15376538 5' + 1360 33 1 73.49 TGCTTTTCACATGCTTTGGACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGCAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 - chr3L 16682040 5' + FB 31 1 69.86 CTTATATTACATATTTAAATATTTAAACATTCGAAAAATCGAAAAATCTTAATTTAGCGAATAAATATCAATATCATTATCATTACAATATGTAATGATGAACTCCCATT:1 + chr2R 8397398 5' - 412 495 1 67.27 AAATGCTGCTTATGCCGAGGGATTGCGCCCAAAAGTACACTCGCAGAAAAAGTCACAAGTAGGAAAATATGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 - chr3L 9419625 5' - S-element 1704 1 70.00 CCAAAAAGAGCCAGCCTTTGTGGCTGGGCCGTGCAATGGATGGATGGGTTTATTTTTAAAAAAATTAATAAATTTTT:1 + chr2R 22989881 5' + HB 323 1 75.32 GGAACAGGCGAAAAAATGATAAAGAAAAGAAAAAGAGCGAAATAAAGGGAACGAAGAAAAATTGGAACGATGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTG:1 - chr3L 11908527 5' - Porto1 394 1 66.06 TTCTAACACAAAAATAATTAAAGCAACCGCATCACCATGTAATTTTAATAATATTTCCTGATATCAATGTTGAAAGGCGTTTGAATCAAACAAAAATATGAGCGCATCCG:1 + chr2R 6114204 5' + Porto1 202 1 80.00 CGAATGGCGATTAATTTGTTCAGGTCTCAATCGCTGCTTACTCACTACCCTCCGCCGACTTTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATGCCACAATTACTCACCTGC:1 - chr3L 2026299 5' + TAHRE 10047 1 75.00 AAAATCGAATTGTGACCAACGACGATTAATGATCGTAAAATATTCAGCTCGTCTACCCGTGATTAATGCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAAC:1 - chr3R 15472534 5' - invader4 2693 1 75.79 TGTTATGAACCACCTTCTTTTTAAGTATGTATAGTAAAGAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr2L 18749840 5' - pogo 2096 1 64.38 ATTAATTTCTAATCGACTATTACTCATTTACAGACCCACTTTACATGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCTGTGCCACACCCTGCATTTTCTGAG:1 - chr2R 23398955 5' + micropia 494 1 58.18 GAGTGAAATGCATTAATGGGTCAGCGAAAGGGGAACAATTGCAGCTTAACAAATATACATAAAAAAAAACAACAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGCTA:1 - chr2R 20361468 5' - INE-1 559 1 87.27 AAATTCGGGAATGTCACCCACAGACACTGCCGAAGCATCCAAAGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCAAC:1 - chr3R 29706271 5' + Quasimodo 7047 2 59.09 CACATCCACAAAGCGAGAGGCAAAGTGCAGGCCAAAAGCGAATGAAGAACAAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTGAAAAGA:1 + chr2L 18457057 5' - Cr1a 366 1 63.74 TTAACGGTGTAAGTCATGTTTTATCGCTTGGCAAATTAAATTCAAATAAATTTCAATTTCATGTTGGAATATACTATTCAACCTACA:1 - chr2L 17334581 5' + copia 4874 2 78.16 TTCAAAATAAAATATTTATTTGAATTAATAGCTTTTTGTGTGAAAGGCATATTTTGTCAAATTTACAAAGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGCTGTCTGCTATC:1 - chr2L 18087631 5' - 1360 162 1 64.22 TTGGTCTGCAACTAGACTTAAAACTAAAGGGATACAAAACCAAGATATAAGAAAATAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 4305380 5' - roo 9045 1 55.96 CAATCAGTGTTTATTCAAACCATATTGAAAGTGTAAAAATTCTATTCTGAAAAATGGATAACGTAGAGAGCGTCGCCACCAC:1 + chr3L 9529868 5' - accord 218 2 78.05 CCGATATCGGTCGGCTATAGGTGCCTGTATATATGTCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 - chr3L 17530201 5' + Tirant 22 2 60.24 AGGACTCACAGTGGGCAAAAATATATGGTTTATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGAAACATGATTG:1 - chr2R 15155253 5' + flea 4805 2 74.55 ACAGAATGCGAAACGCACCACTTTCTGCGGTTTGCTATGCATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGCGC:1 - chr2L 9626924 5' + hobo 40 1 62.14 TAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTAAATACTAGTGCACTTCAAATTGGCGACCCATTTCAAAAGATTGCACCACATACAAATAA:1 - chr3L 10656069 3' + Idefix 13 2 50.00 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAATTGGCCGATGGACTTCCCATTCTCCAAAAAACTCGA:1 - chr3L 25987933 3' + Ivk 5334 1 64.55 TGGCATTGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTGCGGGAGAGAAGAGCGCTGAGTGTTAGAGCGAGAGCCAGTTCCGAAG:1 - chrX 522483 3' - Gypsy12A_LTR 2175 1 81.33 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAAGGGGGCGGTTATTGAACCGCCTTTAAATCGCTTGAGTTATGATGATGAG:1 - chr2L 6243659 3' + 412 457 2 54.55 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACGAATGCAGTTTTTCTTTAACCTAATTGACTTAAGCACTTCATT:1 - chr2L 15763839 3' - blood 40 2 62.96 TAATTTTTGTTAAATCAAAAATGATGTTATCCATATATTTTACCATATATTATACCTAATTTAACTACGATAGCCTACCTATTTCCTAAAATTATTAAAAAATTTTACTT:1 + chr2L 4076887 3' + Tc1-2 1473 1 72.73 AACTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAATCTCTTTCTGTATGTTTC:1 + chr2L 21762420 3' + INE-1 575 1 66.36 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGCAGGGTAAAAAAAGTTGGCAGAAGGTTTAGTTTTACCTGGCTTAGTCGGGCCAAGAAG:1 - chr3R 23620972 3' - roo 8681 2 63.11 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTAAAATTGATATAGCCATCAGATGACAGTTAAGTG:1 - chr2R 19096916 3' + flea 209 2 66.97 TATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATACGTATACCCCGTAACTTGCCCCATGAAGTTAAAACGACGCAGTTGTAAGAGAAACCAAGACGAGGCGGAGATACAAA:1 - chr3R 9339596 3' + Burdock 249 2 71.82 TGGAAATTTCGTACTTATCTTCTAATTTGTTCGCTGGTGGACAACCTTGAAAATCCAGGTTATCCGCCTCTGCCCAAAACGAATGACG:1 + chr2R 16790134 3' - GATE 333 1 70.45 AAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCGACAAACGCATAAAATTCGCTTGAACCTTTTGTTAACCCAGAGGACACATTTGGGCACCAG:1 + chr3R 26775962 3' - Rt1a 12 1 60.20 CGTTGTTGTTCTTTTGTTTTGTGGCTCAAA:1 + chr2L 620056 3' - gypsy9 451 1 60.00 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATGCATGAGTACTGAGATAGAGCCCTTCGTTA:1 - chr2L 19212275 3' + flea 4979 2 67.37 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCTCTCTCCCCAAAAAAAATCTATATAGCAATGAAGTTTGTAACGAGTTAACCGA:1 - chr3R 14995671 3' - Doc 44 1 52.73 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGTGCTG:1 - chr2R 9138715 3' - pogo 37 1 78.82 GCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAATTGAACCTAGTTTTAGTTTAT:1 + chr3R 6763675 3' - F-element 4464 1 54.55 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTAAATTGAATATTTATGTTGGCC:1 + chr3L 13160703 3' + pogo 2063 1 81.61 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACGAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTG:1 - chr3R 24260885 3' + roo 9027 1 60.91 GTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATCGGGGCAGAATAAGTTGCGAACGATGAAATAGCTCCCAATCGACTCTGCATATGGAATTATGCGAATTTCAT:1 + chr3R 20229959 3' - Juan 399 1 69.09 AATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAATACCGCAACTACATACAACTCATTAAATTGTAA:1 + chr3R 18686018 3' + hobo 376 1 70.00 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGATTATGAATTATGAATTATTAAATT:1 - chrX 5697605 3' - F-element 61 1 88.89 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCTGTGTGCATGTGTTCGAGTGTCCTGCACGGACTGCT:1 + chrX 21183373 3' + S-element 1681 2 66.33 GTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTAAAAGACGGTGGTGCTTTAATCATTGTTTTGCATTTGATTGTCTATTTGATGTAAC:1 + chr4 832593 3' - 17.6 7199 2 54.55 CCACCTACGGACGGTCGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAAATCAACAATGGGCTGCGCACAGGAACATTGACAACAAGG:1 - chr3L 2313313 3' + Rt1b 5091 1 68.18 TGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGGACTTGCGTTAACTTACATATATAGATTCCATTTCCACACTCTTTGGCTTAACTTT:1 - chr2L 17545841 3' + opus 7472 2 63.04 CTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGAACTTT:1 + chr2L 18199769 3' + Ivk 5331 1 65.45 ATTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTGTTGCGTACTCTGCTTCTCTGGTTGCTGCTGG:1 + chr3R 21813509 3' - gypsy11 3931 2 51.52 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCACAACATGTTTTGATATTCGGACAGTTTTAC:1 - chr2L 6757484 3' + Tirant 8476 2 67.78 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGCATTTTAAGGCTCGTCTGGGGCGGAAAAAATAATATGCGAGGGCATTATTAATGAATTTATGT:1 - chr3R 31633126 3' + opus 7482 2 54.29 GATATATGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' - blood 7009 1 26.51 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGCACCACCGCCGGCGGATTACT:1 + chr3R 23943231 3' + P-element 2884 2 52.00 AGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAG:1 - chrX 10119582 3' + FB 8 1 53.25 ATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGAGGACACGAAGACATGCAACATCCAACACACACCAC:1 + chr3R 20519604 3' + F-element 4310 1 61.29 GTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTACCAACCTTCCAAACTTCCGTTTCCCGATCC:1 + chr3R 15662242 3' - Bica 142 1 71.56 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTATATATATATTTTGACTTATGAAAATTGCAAGCTTGTAATTGTATATATAAGTTAT:1 - chr3R 2275571 3' - opus 27 4 55.24 GCAATCACGCAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTATTCAAAGCTTGAGATATGGAAGTAACGCAACTTGGGAATCCGTTTTAAAT:1 + chrX 15043051 3' + F-element 4424 1 54.55 AAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGTTGAGATGGGTTTTATTTGATCAGGGCCCAACTGAATTT:1 + chr2L 1699066 3' + Stalker3T 203 1 46.79 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTCGCATCGTTTCAGCCGAAAAATACCGAA:1 - chr2L 20797674 3' - P-element 49 1 33.65 ATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTGAGATTACCACCCTTGACATATCCATTTAGTTCGTTTCCTTCAGATT:1 + chr3R 24344872 3' - I-element 5211 1 62.35 CCACTCTAACGCCCACAAACCGCCCAAAACTGTCGCGCACACACTTTTGAAACATTTTTCGAAATTTTTTCAGTATTTTATCATTGATTTACTCTGTACATTATCGACG:1 - chr3L 11036471 3' + INE-1 220 1 76.15 AAACCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCTTTGTGGTCGCTGCAACAGGCGGG:1 + chr2L 13919505 3' + I-element 5074 1 71.43 AACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTACGAATCTG:1 + chr2L 23295846 3' - micropia 57 4 76.36 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' - 412 33 2 52.73 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATCTATTCGTTTTTTGGTATTTTTGTTGCAGTTTTTTGCTCGGATCCCTTTTCATCGTTT:1 - chr2L 12910685 3' + Burdock 235 2 60.91 CGCGCATCCAGCGGCCGCAACAGCCATAAACAACTAACACCTACCTGCGATAG:1 - chrY 986885 3' + HeT-A 5650 1 90.57 AACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTATTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAACATTTTTTTCGATTGCCCACACCGGCAACTTGCCTCTG:1 + chr3L 19075132 3' + FB 344 1 80.91 CGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTG:1 + chr2L 20841965 3' + G6 1978 1 59.63 GTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCTGTTCGGCGAAGGGTGGTTCATTTCGTTTTTTGACTATCGCTTTTTGCATACTATTTAATTTTC:1 - chr3L 6840526 3' - BS 4849 1 68.75 TTTATTATTTTCCTTTTTTTTTATTAATTCTCCGTTTGCATAATTTCCCCTTGCCATTCTATCTAAAGTTTTTT:1 + chrX 462515 3' - Doc2-element 253 1 70.27 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATAAAGTGTG:1 - chr3L 3240518 3' + diver 6072 2 57.80 AAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTTAGATAATCATGCATCCGACAAAGCTGCCATTTGTGAAAAGCTAAGGTTTATTTTAAGATTACAACTATGTTCAC:1 - chr2L 22574256 3' - rover 6918 1 74.55 TGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTCATATCGTCATAATAAATTGTAT:1 - chr3R 20890987 3' + copia 63 2 78.18 AAAAAAAAAGAACAAAATAATCGGGTTGTAACTCTGCAGCTACGTTGACGTCGGCGTCGCAGCTTAGAGCTAGT:1 + chrX 6868095 3' + gypsy11 3935 1 70.27 ATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTCGTATGCCGTTACGCATCTTGTTATTCGTGTCTTTGCACCGACAATATCCAGGGAATGC:1 + chr3L 23062680 3' - 1360 77 1 72.29 AGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAGAAGCTCTGGTTCTCTGGTTCGGTTCTCTTGGCTTTTCGGTTGATTAAGCATGGGGCAAACTAGAGCCAAATGTTGCT:1 - chr2L 17537839 3' + F-element 4304 1 75.70 AACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATATCCCCATTGCAGCCAGTCGACATCGACAATACTTGTATGACGACATGAAATATATAT:1 + chr4 199644 3' + flea 436 1 68.93 GACGTTCATACGGACAGTCGGACAAACGGACATGGCCAGATTGACTTGGCTATTGCTCCGCGGAGGGAACTTCTTGCACTTCCCACAGAGAAGTA:1 + chr2R 25252276 3' - INE-1 126 1 57.89 TTTTGATTTTCCTTTTTTATTTTTTTTTGCTATTCGCATATACTTGCTTTAGTGCACTCGCAAATCTTTGTAGAACGTGCTTGAACGGCCACGTTCTTCCCGCCCTCTCT:1 + chrX 15302491 3' - Doc2-element 252 1 58.18 AGTTAAGTGAGTTAAGTAAAATTAATAACAATAAATTGTTGTTTTTTTTTTAATCTTGTTTGGTTTTTGTTTCTGCCAATACGTTTTAGATTTTCATATTTCGTCTTGTT:1 - chrX 12892469 3' + Transib5 331 1 77.27 TTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAGAGGGGAGCTGCAACTGGCGAGCGAAATGCCCTAAAA:1 + chrX 16687514 3' + blood 6961 1 63.29 CTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCGAATGGATCCAAAGGTAATTGTAATAAATTTGCTAGAGCAACT:1 + chrX 13003673 3' + I-element 5067 1 59.09 TGCGAACAACGCACAAAAGGAAGAGTAAACAAAACACAATAACATCGCAATGGCGATATCGATGTTAGCATATATATAATTAATATACACTTTCATTAACAATTTCGTAT:1 + chrX 1772982 3' - Cr1a 223 1 72.73 CACATTTTTGAAAAATTGTTGGATATTTATTCATAATCCAATGCCAATTTTTATCTGTATACCAAAAAACCTTAACCATATTCACAACTGACAAAATTTTTGGAATGATA:1 - chr2R 1737960 3' + INE-1 376 1 61.82 TATATTTATACATATACATATATACAGATAAATATATATAGGGGGCTGGGCGATCGCCTAGCG:1 + chr3L 722336 3' - Stalker4 7203 4 69.84 AAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Tabor 486 1 22.33 CTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGCTGGTAGGTAATTTTGGGGGAAGTTTTTTATTTGTTTT:1 + chrX 15575890 3' - Quasimodo 185 2 54.17 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGCGAGCGAACATTTCTGCAAACA:1 + chr3L 12301239 3' + hopper 1357 1 78.10 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGTAAAAGTCGTCAGCCCATCAGCAT:1 - chr2L 13324600 3' - jockey 4780 1 78.90 TTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTTGTTTATCAAGATTTTGCTGGTCCACCCTGATATCATATTGAACCCGAAATTTAAATTGAAACACAAGC:1 + chrX 13221023 3' - I-element 120 1 55.45 GCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCAC:1 - chr3L 25455125 3' - HMS-Beagle2 48 2 68.81 GTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCACACTGATAGACTCGTGCTGCTCAAGATTCCCATTCTAATCGAAAGTTGGCATCCTGG:1 + chr2R 13282150 3' + X-element 392 1 58.18 GTTACTCAGCTAGTGTGAGTACGAATGCGTGAATGTGTGAGTACGAAGTCGATAGATATTAGGGAATAAGATGGGAAAACGATTTTAAAATTGTTTAAAAGTGTGGGCGT:1 + chr3L 24073184 3' - INE-1 534 1 47.27 CGAGCATGAAGGCTATACCCGCGAAATGGGTACCAACCACATCCACCACCCAGCCACCGGGGG:1 - chr3L 21666794 3' - R1A1-element 5030 1 69.84 ATAAATGAGAGAAGACTACTGAACGTACATATAATAATCTTGTTGTCTTATTATGAATATAAAAAAACATTATTTTGTTATTAGTAAAAATTTTGAATACTGCGTTAAT:1 + chr3L 24535858 3' + rooA 7198 1 55.05 GGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAAAACCGTTTTCTTGAGCATAAGGGCGCAGCAATACCATGCACTTAACTTGCTTC:1 + chrX 5044554 3' + F-element 64 1 58.25 GATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTTTACACTAGTTTTCCCGCATT:1 - chr2R 14093316 3' - invader2 182 2 65.52 TATTGTTTATTATTAATGTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACAACACTATTAACTTTTGCTGATGACACC:1 + chrX 10065386 3' - flea 4995 2 72.22 ACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAAGTATTTAAAATGAAAATGTTTGTACGGAATACTCTTTACCACTAGATTGTGAATTGAATTTATAATAAATGTAAAGCTTATGATA:1 + chr2L 19320555 3' - Juan 1 1 77.27 ACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCAGCAACTAAAAAAAAATGGAAGACGAACGAACATATTTATGTGAATTGCATTTCATTAATAA:1 + chrX 7289300 3' + R2-element 3531 1 57.27 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAAACTTATCAATATTTTTCTTAATTTTTTGCAGAAT:1 - chr3R 11937207 3' + pogo 2062 1 64.76 CTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCATCTCTCACGGATGAAACTGGGCAAAAA:1 - chr3L 19398282 3' + Doc 183 1 74.55 TCTGTCCAAAACTAAAGTACAATGCCATAAAGAAAATCGTTGCCGACGTGCGGTGTCTGTGTGTCCTGCATGTCCTGCGTCCGTGTTTGTGGATGTGGATGTCTG:1 + chrX 21189312 3' - gypsy9 230 2 79.05 CGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAAGTCCAAAACCGCAGCAGCTGA:1 + chrX 5465903 3' + 1360 433 1 80.73 TTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAATTTTCTTAACTTGATAAAAAACGCTTAGAAACCTGTTCATTGTCGCTAAT:1 + chr2L 21635340 3' - F-element 484 1 53.68 CATATCATAATAAAATTAATTTATATTTATATATATATATATATATACATGGCGTTTGAATCTAATATATATAATACATTTTCCGTTCAATATGCTGATTTTTTA:1 - chr2L 11462965 3' + 1360 360 1 37.14 CAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTTTGTGCAATCTATAATCGGGAAAAGAAAATCAATTTGTGTTCTCTCAAACCCCGACCAAAAGGG:1 - chr4 273561 3' + Tirant 200 2 58.18 CTGTCTTCTGCCTGTTACATTCTTTTCAACGAATCTAGATTACTCTTTTTATCCACGATTGACGGGTATAAAAACCTTTCGCAGCTAGCATGATAAAATGTTG:1 - chr3R 32072796 3' - INE-1 28 1 68.93 GCAAACAAAGTAAAAACAAGAATAAAAAAATACAGGCGGG:1 + chr3R 23612180 3' + gypsy4 491 1 70.00 GTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATACTTTCTAACCAAATTAGCATACACTGCTGGCTGGCTGGCTT:1 + chr3R 31467291 3' - Bari1 222 1 73.53 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAATACAATAAAAAAAAAAGGACAATTGCAATAAATGTTAT:1 - chr3L 15614468 3' + jockey 4947 1 76.36 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTGACATTTATAAGACCTTTAATGGTCTTCTTTATACATCTTAGGCCCTTAAAAGTAGGCTAC:1 + chr3R 18202308 3' - jockey 4696 1 57.27 AGTGAGGCATCACAACTATTCATATGTCAGTTTCTGAGGCAAAGGACTCACCAAACGGAAAACCAATGCGAACAGCAGAT:1 + chr2L 6519882 3' + diver 224 1 67.50 TCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAAGCACACCAAATGAAAATATAAAAAATTGCGAAAAAATATGTACGAAATATATG:1 - chr2L 16628690 3' - invader1 3887 2 54.55 TAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAGTGGGGAATTATGCACACTACACGGCTGAGCACTCGACATACACACTG:1 + chr2R 20521438 3' - Tc1 1437 1 54.72 TAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGTGTTTTTCGGTCGCATTGTGGTTTCGGTGCAATTTGAATTTT:1 + chr3R 20279900 3' - Doc 4614 1 61.82 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATGCCACGGGGCG:1 - chr2R 6707689 3' - 1360 16 1 57.95 CATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCTTACACTTAATACCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGT:1 - chr2R 19708627 3' + rover 6996 2 60.91 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCTATTCAATCTAATTTGTAATTTTAAATTGGTAAA:1 - chr2R 17243739 3' + roo 355 2 71.82 GTGCAATAGTTTAAACAAATATATCAAGTCTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTGTTGTTTGATTCATGGTTTAGATTTGACTCGCAGGTGGATTGGCGTTATTGATATG:1 - chr2R 17823825 3' + Cr1a 159 1 54.55 AAAAAAAAACGAAAATAAAATAATAATAATAAGAGAAATATATAGAAAAATAATACACTTTTGTGCCATTGCAGACGAGCTCGGCGGCGAATTATAATTGT:1 + chr2R 13754091 3' + Doc2-element 253 1 75.25 TATTTAAAAAAAAAATAAATAAATCTAAATTTGGTTTTCATAGATAATTTCTTTACACATTTTTTTAGACAAAGTAACGTAAGATGTATTGAATTCTTTTATTTATAAAT:1 - chr2L 10975416 3' + TART-B 10632 1 88.18 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAAAGGTTAAGGGAAAACGTTTAGCACATATAGACTTC:1 - chr3R 24867502 3' + roo 9020 2 73.64 TATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAATTGACACAGAATTACTGAGCGATGCGACCTTCGAGCGCCGGCA:1 - chr2L 18685676 3' + Doc 176 1 52.75 TAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGCCCAATTAAATTGTCAACAATGCTGT:1 - chr2L 10128679 3' - copia 60 2 80.00 GCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCGAAGTGGAAGGTGGG:1 - chr3L 21867368 3' + R1A1-element 4970 1 73.21 TTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTCTCCGTATCCGTCCAAGTTACCGTATCCGGCTG:1 - chr3L 18916385 3' - I-element 5019 1 70.00 CAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCACTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACATACATACATTATATTACCGCCTTTTTGTTATTCATGCATTTAATTA:1 + chr3L 4265042 3' + Transpac 5206 2 56.57 GATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGCTATCATAACTTCATATCACA:1 + chrX 20433401 3' + diver 213 1 62.22 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTACGCGAATTATACTGTACCAAAACTTGCTTGGCGCCATTGAAATGCGCAGTTTTTAATATTAGTGCCC:1 - chr2L 18694005 3' + pogo 2079 1 55.21 CGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAAATAAAAATGCAACCTTAGACTGCATCAATACCGCATGCGCCACACGTCGAGATGAACCAACAGGGCA:1 + chr2R 25170054 3' - gypsy2 198 2 66.36 CACACACACACACACACATTTACGTAAGCCCCAACTATTTCCAGTTATCGGTGAAAATGGAAATGGAAAAGGAG:1 - chr3R 27984693 3' + accord 186 2 78.38 TCTTATGGCACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGAGTTGGATTCTTTGGGGCACGAAGTAAGATCATGTACTAGGACTCAATTTCGGAAA:1 + chr2L 12578459 3' + pogo 317 1 62.38 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAAATGTGTAAAAAATAAAAACACAACCAGACAACTATCCCGATATGGCATGAGTGGGATACTCC:1 - chr2L 8900537 3' + jockey 4978 1 62.77 TGTACTTAACTTTGGCAGCGAGAGTGCCGCTGTCTAAGAGAGTCATGTGGACATAAAGATCGATCAGTCGCACTCACTAATGCGGGCTTGTAGG:1 + chr3L 12036092 3' - Tabor 7079 2 71.28 GACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACAGTGCTCCCACTTCCCCTTTCCGGTTTTAAACAACCCTCCCAATAATAAATATGCGTGAACCCCATTAACCCTTT:1 - chr2R 19684426 3' + 412 482 2 70.91 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGACATTTGTTGCCGTGTTTATTGGGAAAGCTCTACAAAAAGGAAGCGGGAAAATTATGCGGAAAAGCTTGGCGAGGAAGT:1 + chr3L 18030474 3' - Tirant 8113 2 75.45 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCAGCTTTTTGGTATGTTTTGTAAATTTTTTATTACAATTATCTTTGCCTTTGGCTGG:1 + chr3L 5971763 3' - pogo 8 1 68.48 GCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATGCATAACCACATAAGAACAGCAATACACAAAACGGCATAAAATAGCAATAATAGAATAGTTG:1 - 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chr3L 13048013 3' + P-element 385 1 47.22 AATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGACTGCAGCTACTCGACCAGGCCGACACATGTAAATACAGACCACACGAACACACCACCACCTCCAG:1 - chr3R 5335858 3' + Doc 4519 1 74.44 AATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTGAAAAAAAATTTAAACAAAGAGCTACGAAGGAGTGAAAAAGTCCTGCATATCGCAGACAATAGCAACAGTTGGCAGCAGATC:1 + chr2L 12508074 3' + invader2 4733 1 75.45 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACACATAAATACATAAATACATACATAAGACTGGGTGTTTGGTCCGCAGATGCGTGTTAGATTGTTGATGTGCAAAATA:1 + chr2L 11231928 3' + copia 249 1 59.09 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCA:1 - chr2R 9963502 3' - pogo 43 1 70.71 TATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACATGCATTGCAATGACAAACACATTGCCTAACGCCGCAACAGC:1 + chr2R 5932976 3' - copia 5036 2 56.96 TGCTAGAGAGAACTGATAAAGTCGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTATTCGCATGGCATGATGTACAGCTTATCAGGATGATAG:1 + chr3R 25073205 3' + flea 464 1 62.63 CTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACAACCGCCCACTAGCACACTCACAC:1 + chr3L 9289575 3' + accord 143 2 70.51 ACCTATATATTGCACACACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACTCGAAGATTGCCTCACTCTGTCGGTATAC:1 + chr3L 21502279 3' + HeT-A 5985 1 75.00 AAAGAAATGTATTGATTCGTTTACAAATTATTCGTGAAATTTCAAGTTGTAATCAAATTAACTTTTGTTTCGGCAGCAAGAAGTGTCAACAGA:1 + chr2L 5697293 3' - 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roo 16 2 66.06 AATTTAAATATGATAAATATATGAAAAAAGAGCGGCCAGGACCTTTGTTTCTTGCCATTTCTTATTTTTCCGGGGGGCTCTTGGAAAAACAAACAATTAACATTT:1 - chr3R 9146179 3' - copia 4671 1 72.38 TCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGGTCTTTTAGTATCTTGATCCAAGTGGCTGTGCTCTCATTGACTTCCACTCAGTTTTTCTCATTACAGCAT:1 - chr3R 13397589 3' - 1360 3163 1 66.36 ATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCATTTGCCGAGTATGTGTGTGCGAGACGACC:1 + chr2R 21440518 3' + F-element 4411 1 70.41 CCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCAATGGTCCGAGACAAGTGCGTATAATATATCTAGATCTAAGCTCGCAACTATAAACTTTGCCATGGGGG:1 - chrX 3659698 3' - R1A1-element 5260 1 70.75 CTTCATACATTTCCCTTCTTCAACATATTCTCTAATATCTATACACACTGGCGTTCACTACATTTTCACTATCACTTATCTTGTCAAAATCAACCCAAAGATGTATTTCA:1 + chr3R 25402481 3' - invader4 2976 2 60.00 TCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATCTAGATCTATTTCACGTCGCAATTTTTTACGTAAATTAG:1 + chr3R 4514591 3' + Tabor 441 2 64.22 CTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGCAAAAAAAAAAGGACACAAGGGACACAGGAATTGGCCACAAAAGATGCTAATGATTTATT:1 + chrX 7374557 3' + 1360 174 1 70.65 TTTGGTTTTTTTTTATTTTTTGCAGTGTGTTTGTTGCATACTGGC:1 + chr3L 17940274 3' - 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I-element 5016 1 57.80 TTTAAATATACGAATGACCTTACTTTTTAGAAAATCACTGAAATCTGTGGAAATAAAAACGTACTAGCCATAAAATTGTTACAATGACAACGGACAGGCAAATGGATAAA:1 - chr2L 13122192 3' - HB 290 1 72.73 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATCAATGCGATT:1 - chr3R 23861082 3' + pogo 2059 1 71.84 ACAATAAACAAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAAGGAGTAACAATTTTGAGCTGTTTGTAGACTTGAT:1 + chr3L 23127668 3' + Porto1 191 1 60.23 TGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1 - chr3L 23112569 3' - R1A1-element 4888 1 54.64 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTTAGGGTTCACCAAATCGAAACGCTGCTGGCCAGTGGAG:1 - chr2R 21361983 3' + Tirant 8474 2 58.59 ACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAACCGCTAATTATCGCCACGCCACATCGCTGTAAAAGTTGCA:1 + chr3R 13112625 3' + I-element 4879 1 60.00 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAGAGTTATCGACTGCATCTGTGTAAAGGTTCAATGCCAAGTAATCCATGTCTATTGATATTTTTTCCTATTT:1 - 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Ivk 303 1 82.22 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTATTATTCTAGTGTCTTTAGCCTGACCCACTGAAATTAAGT:1 - chr2R 4167456 3' - 1360 67 1 94.55 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCACAGTTGTGACCTAATGACCTAGCTGTGTACAAGCTTTTGTCGGCCTACTTTGC:1 - chr3L 18030796 3' + Tirant 8494 2 64.13 TAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGCGCCTCCTACGAGAGCTCTCTGAATGCCGAATGAAGAATTGACT:1 - chr2L 16975100 3' - F-element 4443 1 60.00 CTACCAACCCAGCGAATAAATTATGTTGGCTCTACTTTTACCCGCATGTGCCCTATGAAATGGCATATGCGATTG:1 - chr3L 9493456 3' + F-element 4535 1 68.00 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGAAGCAATGCAAAAGAGTCATGAC:1 + chrX 18483210 3' - pogo 48 1 74.04 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTCCAATAGCTACGATTAGAAGTAGTTGTTGCACTTC:1 + chr3R 28640001 3' + mdg1 399 2 60.00 AACTAGGAAAGTGGCACGTGTTTATATGGTGGGCAATAGAATTTATTTATTATGTTGTTAAAAATCGAAAAGCGTTGGGCAAACAACAACAAATGCAATTAAAATTTAAA:1 - chr3L 19222938 3' + NOF 4303 2 61.82 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGTACAGTGGCAT:1 + chr2L 14141343 3' - hopper 39 1 63.21 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCACTTAAACTCGCCTT:1 + chr3L 16496254 3' + P-element 2842 1 37.14 TATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATTGTAGCCGCCTATCACCTTTGGCACTTTCTCCCACCTGCACGTGTGTGTGTGTGAGTGTG:1 + chr3R 31219329 3' - Quasimodo 94 2 64.65 TGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGCGTGAATTTTTTTTTATTTCACTGCTCTTCAGGCAGCCAAGACTTGTTGGCGCTGATTTA:1 + chr2R 4137616 3' + HMS-Beagle2 7173 2 59.63 CAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCACGCCCCATTTGCATACCCTGCCCCTTTTCTTTTACCCCA:1 + chrX 405809 3' + INE-1 155 1 64.00 AAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAGGGCAAAGGTTGGGATCGATGGGAGAAATATGCGACCGAGGAGAGAACCTTG:1 - chr3R 31780416 3' + Bica 310 1 56.18 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAATAAATTAAAAGTTAGTTGCAAAATTCAGAAAGCG:1 + chr3L 14929011 3' + I-element 5296 1 74.55 TGCACACACACACACACACACACAGAACCGTGCGAAAGACACGCACGACAAGAAAACGAGGCAGACAGATTAAGAACATG:1 - chrX 980354 3' + accord 7028 2 67.50 CTAATCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACAAATAAGCTTACAAATAAGGACTGTTCCAAGCATAGTTCGAACGTGGCACAGGAAGAAAATTATAGGGAAAAATTACAG:1 - chr3R 16730139 3' - Cr1a 4071 1 63.64 AACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTACTTTATAATCAATCCCTTAGGTT:1 + chr2L 18567395 3' + I-element 4970 1 78.18 TTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAACTGATTAAGTCAACATACCCAATTTTGTTTGGATTCTTGTTTAAGATTGAC:1 + chrX 20262835 3' - copia 5050 2 54.55 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACTTGTGTACATACATACATATGTACCCAGTACATAACAAGTGATGACAC:1 + chr2R 9552367 3' + S-element 1705 1 62.07 AACAAAAGAAAAAAAGAAACAAGGAACCAAATAAAGGTCCTGCTTGTGGGTCAAAAATTGCCAATGCTACAAAAGCATTTCAAACCGTTTCCACTCCAGAACCTCTCAAC:1 - chr3L 16756893 3' + gypsy7 5009 1 67.27 GTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGATATGGTGGGACAGAGAGAACGAGTTG:1 + chr2L 9801826 3' + invader4 155 2 72.16 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTAACTAGCTATTTTTTTTATATC:1 + chr2L 19129371 3' - FB 59 1 79.05 TAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTTAATAAAAAAGTAAAAGGACTTAGATTCGGACAAACGGTGATACGGTATCAGCAAAAAAAAA:1 + chr3R 13596267 3' + Bari1 461 1 55.77 TCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATCAAGCGTGCAAAAAGAGCTTGTTAGCTTACTCATGTCGACGCACCCTTTTCTTTTTCTCGCAAAGAACGAGGAAATA:1 + chr3R 5216661 3' + INE-1 152 1 64.55 TCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTTTTTTTGGTTATAGCATTTAAACAATTTT:1 + chr2L 15731500 3' - Idefix 344 2 77.78 GCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACTGTAAGCATGGGTAATTCAATGATTTTCCAAGTACAGTTAGCTTGGAAAATTCTCTTG:1 + chr3L 13664960 3' - Doc2-element 4406 1 58.18 GGCGCTAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCAAATGAAATTTAAATTTGAAAAGGGAAAATAATACAATTTTGTATACAATGTTTGACCGAGATTTCATTTCCA:1 + chr3L 19006166 3' + accord2 7431 1 72.73 ACCGTATATGTGTACATCAAACACTTCTCAACATGACCCGGCAGCTGTGCGCAGTTCTAACGAG:1 + chr3R 28163836 3' - accord2 7208 1 65.62 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATCAATGCGATTAATTACGAAATGAGCAATGCCGCTTTCATCGCTCC:1 - chr3R 23861047 3' + pogo 2088 1 68.81 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCA:1 + chr2L 6243713 3' - 412 7098 2 73.40 ATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGGCACGCATACTTTTCAGCTTTCTTTTCTTTCCTTTTTGGCTGATTAGTGTTGATTGGTATTTCTC:1 - chr3R 27783309 3' - INE-1 170 1 67.31 AAATAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTACTTTCTCCTCTTCTGTGTACTGGACACTGCACATGGTGCATCTAGATCAAATCCGGTG:1 + chr2R 16213102 3' - TAHRE 339 1 50.00 TGGCCGTCACCAAAAAAGTAGCTAGTGTCTAGTGTCTTTGATAGAGCCTTTGTAGTTTAAGAACATATTTTATAAATTATGCAACTTCATTAAT:1 + chr3R 7049716 3' + 1360 3331 1 61.70 ATATATATATATATACATATTTACATATGTATACATATTTATAT:1 - chr3L 9218290 3' - G3 4505 1 84.09 ACATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTTTGAAAAATTTATAAGACAATAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTCCGAGGCAATCAATTTTATACTCT:1 + chr2R 15374793 3' + 1360 395 1 68.81 ATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGATGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGTGTAAAAGTCATTAAACTCTTCGGCTTGGGCATGCCAAAATAT:1 - chr4 270393 3' - gypsy7 310 1 66.36 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGAT:1 - chr3L 19951200 3' - Ivk 41 1 60.00 GGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATAT:2 - chr3R 17673763 3' - FB 43 1 64.55 CAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTCCTTCATCGCTCACGCAGCGAGCACACTGCCACTCACACTAACACACTCGCA:1 - chr2R 13539911 3' - Bica 96 1 69.14 TTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 + chr2R 5064835 3' - Stalker3T 203 1 49.09 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCGTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCA:1 - chr3R 13225521 3' - hobo 39 1 72.94 GAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTAAAAAAATAAAAAAAAACTAGGTTCCTTTCCGGGATTTCAACCCCTTGGTAAGCAACAAGCGGCATTTTGC:1 + chr3L 20818531 3' + Doc2-element 4751 1 50.51 TTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Rt1b 4989 1 54.93 TTGCATATATATAAAGACAGCGTTGGAGTACTCGCAGTCGTCAAAAGCCTGTAATATATGTTGCCCCTGTCTGTGTGTTGGTTAGAGTGTTGATT:1 + chr3L 13533011 3' - Helena 384 1 78.95 CACACACACACACATTCACATACACACACACAGCTGCTGTGGTTGGTGCACTCGTTTTT:1 + chr2L 12897016 3' + accord 7036 2 66.10 AGGTGGTGAAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGCTGCAGGTGCAGGACTCGGCTGGGAAAAAGGAAAGCAAACAACAATAAATTGAGTCACATTAAGCATACGAATGCGT:1 + chr2L 10543208 3' - Chimpo 4219 1 57.80 ATTATTATCATATTGTTCATGATCATTAATTTAAATTAATAAAAATCGATGTATAATAAAAACGTTAGCGCGGGGAAGTTCAGTCGCAGGGTCGACGGGTAAA:1 - chr3R 5395175 3' + Transib5 2570 1 59.22 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTAGGCAGCTATGTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGT:1 + chr2L 16067142 3' - 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rooA 46 2 79.81 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATATATACATGTTTGCTTATATTTGGTTTTAATTTGCATTGAAAT:1 - chr2R 18387119 3' + copia 213 2 63.64 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAAATCGTGCGACATATATAAAGGCACCTATAGCCGA:1 + chr3L 17530191 3' - Tirant 8139 2 65.06 GCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTTGGTAGTCTCTTGCTTTAGTTTTAAATAATTAATATTCTAACACCAATGACATAAGAATTTTAAATATATATAAATAAATTCTGTA:1 + chr2L 22018413 3' + INE-1 546 1 70.91 ATTCTAGTGTCTTTGGCTTAACTGAGGAGCAAGTGAAAATGTATTAGGGGAATATTGTAAAAAATTCAAATACTTTCTTCATAATAAATGAATATTGGTA:1 - chr3L 14813084 3' + Tc3 317 1 44.00 TGAAAATAAATTGTATTTTTGTATCGTCGTCGTCAGGAATCCTCCAGAGCTGAAACTCATTCATTCCGCAGAGCTCGGTGTTCAAACCGAATCGTCCGGGAAGCCAGA:1 + chr3R 5025273 3' - S2 1687 1 58.33 TATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACAAAGACA:1 + chrX 16983077 3' - Juan 4049 1 74.31 TCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCACCCCCCAATCCCAATCCCGTCTACGTTGGCAACAATGTCTTTAATTTCTT:1 - chr3L 17276558 3' + gypsy5 7012 2 55.17 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAAAATTTATCAATTAATTA:1 + chrX 8027468 3' - Juan 42 1 55.66 GGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGAAAAGGAGAGACGCATACAGAAGAACCTTTTG:1 - chrX 9405679 3' + invader2 4719 1 61.64 CAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATTATTGCCTGACGGCTAAGGTCAGGTGAGCATGGCGATTGGAAAGGGTATAAATTCCAAGAAATATA:1 - chr3L 7960713 3' - I-element 4990 1 67.27 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCATTGTTACCATTTGCAGCATGTGCAAGCGAATTTCCAAAGGTCTGTGTGTTTTTGGGCAGACGAACAAAAGTTTTCGTT:1 - chr3L 3751856 3' - roo 8668 2 78.18 ATTAAATTATTAATGTATTAGCGTATCCTTGCACTGGGAATGCGGTCTGTTGAACCAACAGCTGCTGGCAATTTGCTTTTGTTGAGCGTTCATTGTTTTTGTTTTTCTGG:1 + chr3L 458553 3' + Porto1 4559 1 65.45 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATAATCCACTAGCAGATCGTTG:1 - chr2R 19405888 3' - HMS-Beagle 13 2 60.00 CGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCGAACAATAAATCAGTGAATTATACCGGAGGTACGAAAAAAGGTCAACTCGCTAAACACA:1 + chr3L 6694230 3' + TAHRE 203 1 50.00 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAGAACAGCGTTGTTTACACAGCTTGAAAATTTCAACAAACCCAAGAATAA:1 - chr3L 15819334 3' - pogo 35 1 59.09 CTGCACAGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGAGCAGCCGAAAATGTCTGAACAGCACCACCACACTCTTCCACACCCAGACAAGTGTCACTTACAATGAGTTTTAGTC:1 + chr3L 7861667 3' + Chouto 308 1 64.55 ACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAACCAATAAAAACACCCAATTAAATGCACAGTCGCCGC:1 + chr3R 13214949 3' + I-element 143 1 74.07 AAAGAAACAAATTAAACAATATTAGTTCTAAATTTCAATGTTTTTTGTAATATAACTTAATTTGTTAAACGTAAACAAACTTAAAACAAGCTAAGAGCAACAAAGACATG:1 - chr2R 19296214 3' + HeT-A 5764 1 74.55 CTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGTGTTGTTCCAAGCTTGAATGCGCGGCGGATTTCTTTACTTGTTCAGTAAGTTGTGTATTTTAAACTGTTTTCCCT:1 - chr3R 21314084 3' - G6 380 1 62.73 AATAAAAAATAAAAAAAAAAACCTTTATAAGAAAAACACCCAGAAATCCAAAAGAAAACGCCTC:1 - chrX 20796567 3' + Doc 4694 15 78.12 TAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACTGGCGACAATTGTGCTTCGTGTTCGGGACAACTTCTTTTGTGTGTGCAGCGTGTCC:1 - chr3R 22312650 3' - R1A1-element 5098 1 55.45 TTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGCCAACTTTGGAGACACAATTTAGCTGTAAGGCATCACAGATTTGCGATTACCTTTTGTTATCTAAGCTCC:1 - chr3R 3344949 3' - 1360 233 1 63.64 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTAGGTTTTTACGATTTTAATTATTGCTTGCTTTGGGTTTTTTCCATTATGTGACAGTTGTACTTTTTTAGTAAAT:1 + chr3R 2275684 3' + opus 7494 2 74.55 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATAAATTCATTTCAATCGCTACGAAAATAGG:1 + chr2L 6757533 3' - Tirant 35 2 67.78 TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATTCGATATAACGACTAATTCGATCGATCATCCGTAAGACAAATGTGAGACTCTCTGTTGTTGGGTGCTAA:1 + chr2R 10129841 3' + Burdock 240 2 67.27 CAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTTCTCTGGCAACGAGATAAGGCGATAAGCTGGTCGAAAGATTTCATTTTTTTACCTCCGCATTTAAAACTTATTTTGGAAAACTTT:1 - chr2L 4670104 3' - G2 118 1 78.18 CGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAATCACTTTTCGTTGCTTTACTGCTTTTACACTTATGCATATGTCGGGGCACAATTATTATTCTCCGAA:1 - chrY 2617183 3' - Max-element 8259 2 59.09 GAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATCTTGATGCTGAGCTAGCGCCCGTGCTGACA:1 - chr2R 7683482 3' - Tirant 382 2 68.42 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTTTTCGGTACTTTTAAATGTAAAGTATGTATATCATCTAACCATTGTAACTATAAGC:1 + chr3R 25635983 3' + I-element 5331 1 51.38 CGTTTTTGAGGAATTTTGCTCCATGAATCCTTGACCAGACCCCAAAGATTCTCGTTGTTTTGTATCTCATTCCCAGTGAGAAAAGTCGCATTAAGCCAGCTGGAC:1 - chr3L 3996435 3' - Tc1 1254 1 56.19 GCACCAGCACGGTGAGAGGATGATATTTGGTCTGTCCGCGACCTTTCCGCTCGTCATACGCTGCGTATGAGGA:1 - chr2L 2507145 3' - Rt1b 221 1 63.01 CCGCACGAAGCAGCGCCCGAATGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATAGGGTGTATATACTGAGAAAAGTTCGG:1 + chr2L 4082465 3' - BS 106 1 67.86 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACA:1 + chr4 96892 3' - 412 27 2 51.43 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAATAAAGAGCTTTCAATGTTTTTGCGTTGTGCTTAAAA:1 + chr2R 24031529 3' - 1360 47 1 65.45 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGGGTTTTCAGTTGCTATCG:1 - chr3L 16496222 3' - P-element 19 1 36.51 TTTGTTTTTTTTTTTGTTTATATAAACGTAGTGGTTATATAGTGTGTGTATATATATATATTCCCAT:1 - chr3L 8282600 3' - HMS-Beagle2 482 3 82.09 TTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGAGGGATACTATGATTAT:1 + chrX 22824227 3' + Gypsy12A_LTR 2251 1 44.12 AAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGGAAGTACATAGTTCGCGTGTGCTACGCGCCATAAAGCG:1 - chr3R 12288214 3' - mdg1 7210 2 65.45 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAAT:1 - chr3L 7219717 3' + roo 9032 1 75.00 GCTTATTGTAAAATATTAATTATTTGAATTTAATCAGTGTAATGTTGTTTAGCAGTTTAATGCTCTTCGGGGTTTTGCTTCTACTTATCACACATTTTCCAGTATTAAAT:1 - chr3L 469013 3' - TLD2_LTR 109 1 60.00 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACATGGTCCTTCCAGCTATGCTATTAGCACGTATAT:1 - chr2R 22663347 3' + mdg1 7405 2 72.73 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCTGTTAAGTAAACTTTTTAAGGAATTTTCAATGTTTTCCTTATAT:1 + chr3L 7219770 3' - roo 39 2 62.04 CATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTTTCAAATAATAATAACGTTTTAAGAAAGCTACACATGAGGTTCTTCTGCCTATATAGACTCTAATTCTACTCTCTTGGTT:1 - chr3L 14523744 3' - 1360 336 1 60.75 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATTTTCTTAGATCCCGAGAAAATCTCAACCACT:1 - chr3L 21403588 3' - roo 8680 2 63.01 TGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGAGCCTACTCGAGTGTTAGTGGGTGTGTGTGGGGTATGCTAATTGCATACTCATTAAAACAGTT:1 - chr2R 21421516 3' - Quasimodo 41 2 84.78 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTATACACTGTGAGCCCTGTTAATATTTCTCACATCTAATAAAGTT:1 + chr2L 18239178 3' + opus 473 2 57.00 ATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGTCCATGCCAACTTGAGTAATATGCTTTCTTAAAGGCGAGCCCAAAAAAG:1 + chrX 5859390 3' - BS 42 1 53.33 ACATTAGAAACGAAGATATATGTACATATTGATTTAAACATAGATCCAGCTGAAGCTAAAAAAAAGCGAAAAAATTCATATGGTATGATAAATGCCTTGGCAGGACTTAT:1 - chr3R 31967802 3' + Porto1 4375 1 56.36 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACCACGTTTTAAAAAGTGTGGGTCTTCATTCA:1 + chr3L 13024054 3' - 412 52 2 71.56 CCTTCAAAGCGAGCAAACACTTGTTCCATGTTGCTGGGTTGCGGATCTTCAGGTGGTAGAGGGCAAGCATACGGTGTACCGCATGTCCGCTGC:1 - chr2L 21741695 3' - G2 167 1 60.22 GAGAGAGAGAGTGAGAGCGAATCAAGAGAGAGAATTTGAAAAGAAAAGAGGCAGAAGAACTAGATCAAGACAGTTTAAGGGATTGGCATC:1 - chr2L 15735904 3' - Cr1a 287 1 60.00 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCATATGTAGACCTGTTCCC:1 + chr2L 12591764 3' - roo 50 2 83.16 TTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTGTGAGAGGGTGGGAGAGTAATG:1 + chr3R 11118643 3' + Quasimodo 6935 2 66.15 GGAGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAGACTCAAGAGGGCAATCTTCAGGCACTGT:1 + chr2L 6952739 3' + Circe 7420 2 73.53 ACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGTGGGTGTATATGTATATTCAGCGGCTAATATTTGG:1 - chr3L 16630667 3' + Doc2-element 408 1 55.70 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTCTGTTTGTTGTTTTTAAGTTTTACAGCGCCTTTGGAACAGGCGCTCAGTTTTTCAAGCAGCGCTGCTGCACTTACAGATGC:1 - chr2R 17436667 3' + Tirant 398 2 77.78 TGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATCGTTTTTAGTACTTATATACTTCGTTTTGTTTATGTTTTTTCTTTTTTTCCCCCTTTTTTCGCCTGTTTTAATTTTCTCC:1 + chrX 6738390 3' + FB 749 3 66.36 TATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTCACGATCGCCTATCCATTTCCATCGTTCCCCGCTTCTTGCT:1 + chrX 5231112 3' + roo 90 2 62.73 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGAACACAGTAAAATTCATGGAAATATGAACGTAATGAAATGATGTAATGTT:1 - chrX 16693762 3' - 1360 35 1 55.45 TTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGATCCGGATGGAAAACTTTGGAGGACGAGTTGAAGAGGTG:1 - chr2L 12774608 3' - Circe 7376 1 59.79 TAGCATTCGACTGACTCCCTCTCGTTTTCCATTACTTCGTCGCGTTGTTTTTCGTGTTCTTGTTTCCTTTTCTGTCTTTCGCTGATGTTGTT:1 - chr3R 23887027 3' - invader2 152 2 77.17 GGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCTTAGTCATACATACCTAATTTATTTGGAATAGATCGTAAAATAGCATAAGAAAATAAAAA:1 - chr3R 26934387 3' + mdg3 5260 1 61.54 CTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTTAGGGTTCACCAAATCGAAACGC:1 - chr2R 21361998 3' + Tirant 8448 2 76.36 AATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Stalker4 388 1 43.64 TTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGATTTTATATTCAATTTGAGTCGTTTGGCTTTGAGGGTAGTTATTAAAGATTAATTTCCCCTTAATTATTGTTCATTTT:1 + chr2L 10836535 3' + gypsy6 136 2 62.73 AGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGTACATATGTATATTTGACGTTCCAATCAGTGAATTTTTGGGTTTCCCCACTCTACAAACATATTTGCCTTCAGA:1 - chr2L 5304807 3' - flea 4761 1 76.36 TGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCACCCATACCGTTCTTACACAAAGCGACAGGATCCATTGTGCTCAAGCA:1 + chr2L 11639511 3' + rover 99 2 60.76 GTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCAATAGACAAACACAAACAATGCATTTATTATTATAATCAACAACTATGCGCTGGCTT:1 + chrX 18750767 3' - BS 4796 1 80.00 GTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAACTTTTTGCCACGCCCTCTCTTCAGCCATTCCATGCATTACCAACCCAATCCTCATTCCCAACCCCATCCCCATC:1 - chr3R 13931153 3' + INE-1 301 1 68.87 TAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGAACAAAAAAACAAAAAAAAAACAGCGTGTAAGGAGAAA:1 - chr3L 9990397 3' + F-element 4453 1 68.18 GAACGAAAAAGAAAAAAAAAAATTAGCCCAAAACTTTTGGAGGCC:1 - chr2L 118430 3' + Doc2-element 218 4 53.33 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTTAGGGTTCACCAAATCGAAAAG:1 - chr2R 21361999 3' + Tirant 381 2 63.77 ATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAAATATTTGTACCAAAGGAAAAACTTGTCGTTGCTGACTTCCTTTGTGCGTGCAAGAACTGTTTTGTTGAAAACAATTTC:1 + chr2L 58351 3' + Ivk 5372 1 67.27 TTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 + chr4 1294993 3' - HeT-A 8 1 70.91 TACAAATAAAAAAAAATAAAAAAAAAACAAAATCAATCGAAAATGTTTGCTGCACTCAAATTAAAAACACAAACAAACAAATTCCACGCTAGTGTAAGAGTGAATGTA:1 + chr3L 12994221 3' + G2 3075 1 74.07 TATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAGGTTGAACTTGCACAAAAAACATATGTAGCATATCGCATATCGCCTTTCCGCGAA:1 + chr3L 22498753 3' - R2-element 308 1 56.36 TACCGTAAGGTTCGCCGGCTGAACCCTGTTGTAGTATGCACCTTCCAGCGCCATTAAATCATCATGGGA:1 + chr3L 6242843 3' - G-element 134 1 76.81 CAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACTTGTGTACATACATACATATGTACCCAGTACATAACAAGTGATGACACACTTTTACACACAT:1 + chr2R 9552381 3' + S-element 1696 1 61.82 TGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTTTCAAACTCTGTTTGTGTAAACTAACCTGTAGACCTCCAG:1 - chr2R 1427908 3' - F-element 37 1 59.09 GATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGCAAAAATAAAAGTAAAACACAAA:1 + chr3R 8704113 3' + F-element 4373 1 79.35 TTTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTGCGTAGAGGTTCTTTGGGGAAATGGAAAGAAATAAGTGCGAGGGGTTCTGGGTCCAGGGGATA:1 - chrX 20889214 3' - Porto1 448 1 71.13 TATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACCTTTTACATTTCATACTTCCAATACCAATTTCTGCAATTTTTCGTACTCACAATTATATGATATCAAAACT:1 - chr3L 10979771 3' - Bari1 1492 1 70.91 TACTTTTATGATACTTTAAAAAGACCCAAAAGATAGCGGTGACAACGTAAAAAAAAAAGAATCAAAATCAATTTTATGTTTATGACACTCTGTTTTTACGACCTCTTA:1 - chr3R 26804234 3' + looper1 245 1 82.41 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTGTTAAAAAAAAAATGGCTCATGTGTAGGGCGTTGGATTTCAGTATTTTTCGTAGCATACTT:1 + chr3R 7874886 3' + jockey 4968 1 51.82 GTTCCGAATATGAACTAAGACCCACCTGTGGGGCACATCGCTGGCGGTGAAGACGTAGGAAATGGAGTAAAAGGCGTT:1 - chr3L 21950348 3' - 17.6 7367 2 76.92 TAACGTCCACAAACCGCCCAAAACTGCCACGCCCAATCGCCCAGCGTTCAGTGTATGTTTTTACCATGTTTTTGCAGCCCTAAAAAGGAAACACGAAATGTGAGCAGGAC:1 - chrX 12282410 3' + INE-1 226 1 79.09 AAATAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAATAATAAAATAATAATAAAATAAAATAACTATAAAATAAGTTCCCTAAATATAAGTGCCTTTCATTAAAATTTTAAACA:1 + chr2R 7416317 3' - transib1 1900 1 54.55 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATTA:1 + chr3R 24867553 3' - roo 8709 2 70.37 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGAAGAGATGAGATGAGATGAGAAGA:1 - chrX 4186822 3' + Stalker3T 205 1 63.64 AGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACAAGGAAGCCGAGGAAAATAAAGAGGATCCAGCG:1 + chrX 6907137 3' + jockey 4695 1 67.68 ACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAAACACGCGGCACACACTTTGGAATCCCCTTTTCAAGTCACAGCTGTTTGTTTTGGTGACACTGGAG:1 + chr2L 157059 3' + Idefix 253 2 72.45 GTTTTTTGTTTTTTGTTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTTTTTTCTCTTTTCTTTTTTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTT:1 + chrX 4617443 3' - Porto1 161 1 65.26 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATCATCCACGAGCCAACACTCGATTCCGATGCCCCCCATTTTGTC:1 - chr3L 10723658 3' - Burdock 6163 2 56.86 ACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACAAACAATCATGACAGACCCACACACTCTAAAACAAAAATGG:1 - chr3R 25929049 3' + I-element 151 1 68.12 GTCGCGGTTCAAACTTTGCGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 + chr4 1294988 3' - TAHRE 185 1 64.62 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTATTTACAACTTACAAACACGTTGTATAAAGAGTCCGGTCCA:1 - chr3R 1142120 3' - 1360 42 1 61.47 TGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACCCATGCACATTAGCAACACGTGTCAAATGCACTATGTCC:1 - chrX 13175138 3' + Quasimodo 12 2 64.55 TTGGGGTTTGGAGATAGGCGCTCACTTACATAATCTGTGTGTGCGTTGGTGTGTGTGTGTATTTTTGGCGTGCGCGGCCATTTTTTCTTGTTGC:1 + chr3R 19164533 3' - gypsy3 456 1 62.77 AATTTTTGACTTTTTTAGATCATTTGAGCATTTGTTCTTGATAACGTGTTACTACCTACTTTTCTTTCAATTTTAGCGCGGACGGCAATTAAAACGTGAGCCGGCAGACA:1 - chr3R 10545710 3' + Tc1-2 269 1 59.09 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAACAACAAGCCAGGTCAAAGGCCACGAGTATCT:1 + chrX 19053695 3' + Stalker3T 201 1 62.73 GATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAAAAAAACAGCTCCACTTACCAAACAAACATAATAAAAGTAACGTCGACGTCGGCGTCGCG:1 - chr3L 7788166 3' + I-element 356 1 63.81 GAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCTATAACCCACAACAATGCTGCAGGAATGCCGCGTTACCGAACGATTTATCTACGCAAACTCCCAAGATAATGGCCTG:1 + chr3L 3929288 3' + G-element 4176 1 63.11 ATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATTTTTTTGAATAATACTTGTATTAAAATTTGAAAATAAATACTAAGCAACTCTTTTATAACCTA:1 + chr2L 14924475 3' + mdg1 7441 2 62.73 CCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCAGTTTATTGTTTATTAATAATGG:1 - chr3L 7737799 3' - micropia 5306 2 79.09 CTAATATTGCTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCATCTTGATTAGCCACCGATAATGACGTCAAAGTGACACATATAGAG:1 - chr3L 8029407 3' - HeT-A 5767 1 55.34 AAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGACGGCTG:1 - chr3R 19537506 3' - hopper 6 2 57.81 TAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACACAAAGAGAAGATCCAATAAATTTAATTTGCACTGGCACTGCTTGCTTCGCAGCG:1 + chr2R 20205940 3' + Doc2-element 4714 1 61.18 CGATCGCTTGCGATCTACAAAACGAAAAAGAAAACAGGACATCGGCAACAACGAATGCCCCAAAGGACATCACTTTGAATATAAAGCAAGCGAATAAAACACAACACA:1 - chr2L 12571304 3' + HMS-Beagle2 282 2 75.00 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACTTTTTTTATAAGTTTGACGTAAGGGCTAAAAAACCCATAGCCACTCCGCACTGTCTCAAGTTGAGTCAGTCG:1 - chr2R 16036002 3' - jockey 4678 1 70.87 ATTATAAGCTAACTCACCACGCCCAAGCCCCAAACTCACCCCTTGCAATGTAATACACATTCTCACACCATGGCAACGGAACCATGGAACACTATCAGCAACATAAGCCA:1 + chr3R 26670377 3' + HeT-A 5909 1 52.73 TGCACTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGT:1 + chr3R 13421968 3' - Gypsy6A_LTR 21 1 57.78 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATGTAGGTACTAGTATCTATGCCTGTTCCGCCCGATTGAATAC:1 - chr3R 19058376 3' - Burdock 6163 2 58.33 TAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAGGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGTAGAGAAGAGGTGCGCACACAGATACTGATTAGAAT:1 + chr3R 29257969 3' + Stalker3T 202 1 40.00 CGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGCCGCATTCTGTTTGGCCTGGATTAGCATTATGCTATTTATTGTTGTACTTTTCTTGTTGCCAGCTCTCATTGTTG:1 - chr2L 8559428 3' + Cr1a 201 1 74.53 CAGTTTCTTACAATAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCTAAATTTAAATATATTTGTAA:1 + chrX 17184985 3' + roo 9041 1 50.91 AGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATATTAATTGTGTTTAAAAAGGACTTTGGTATT:1 + chr3R 29362829 3' + F-element 4622 1 80.91 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGATGAAAACCACGAACAGAACACAAAAAAGTGTAGCATACATTTGTGCGCACGCAACATTCAAAATTCGAATTTCGAA:1 - chrX 7992494 3' - jockey 16 1 69.09 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTATTTTCTTATATCTTGGTTTTGTATCCCTTTAGTTTTAAGTCTAGTTGCAGACCA:1 + chr3R 4305379 3' + roo 386 2 57.69 TGTGGTGGTTATCCCGTCTGCTAGCATATCTCACCTTTTGTCGTAGATTT:1 - chrX 15043749 3' - G2 2850 1 78.00 AAGAATATCAGAGGCCTCGCCTACGTAATCCATCCGTCGATCGCCGTCGTCCGTCTTCTGGTCTTTGCTCGTATTTAACGAGGCTTTT:1 - chrX 11421138 3' - micropia 446 2 80.68 CCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGTCCGTTAATGTAGCATATTGTAGTGTAGCACTAATACAATAAATGATTGGG:1 + chr2R 545169 3' - I-element 4936 1 62.22 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATACATTGGTTTATTACAGTAGTGATTACTTTAAAAGTCATTAAAGACTTCTT:1 - chr3L 3611729 3' + blood 338 2 65.62 GCATTAGAAAAATAAATAAATATTTTGTGGAAGGTGTTGAAAGTACTGAGAATGCATTTAGATAGAAACGACTAAATGAATAACGGAAATAATTATTT:1 + chr3L 6398467 3' + mariner2 826 1 85.71 ATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGCGGAGGCGGAAGAGGCGACACCACAGACCATCACACAGGCGTTTGTG:1 + chr2L 7054487 3' + I-element 313 1 68.49 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGAACAGGGTATGCATTA:1 - chr2R 10091019 3' + roo 9024 2 70.00 GTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAACGAGTAAATTGAAGTTTAAAATAAAAACTTTGTGGCATCAAGAACATTATTTACACAGAGCTGTGGG:1 - chr3R 28617050 3' + Bica 196 1 75.82 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTTTAAAATCATGAACTTCAATTTTAATTTCGA:1 - chr3R 7049630 3' - 1360 23 1 59.63 TTAAAAAATAAATTAAAAAAAATATTTATACCTTTT:1 + chrX 14788972 3' + X-element 4714 3 69.44 GTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGCGTTTAAGGGAAAATCAAAAGCGCTTTGGTTGGCACTAAAACTTGATGAAA:1 + chr2L 14824146 3' + Dm88 370 1 53.64 AACCGCAAAAAACAATTACAAAATTGTGGCAGTCTGACATGACCTGACCCCGAGGTGTTTGCCCAACAATCGAGCGCACATGTAAATGG:1 + chr2R 21804568 3' + Bari2 917 1 57.30 TATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTT:1 + chr2L 21570263 3' - Dm88 28 2 59.09 AGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCA:1 + chrY 3648870 3' + Stalker4 7107 4 63.64 GCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCATAAATACGAATCTAGCTAACTTAAGCAAGCGCACACATTTTGCCAATTCAC:1 + chr2R 14940219 3' + accord 7006 2 65.45 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + 412 487 2 36.47 CTCCATGGTATATGATTAATCATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCTCTTGTAAAATTGGGCAAGAAGTTCATGAAG:1 - chrX 14390036 3' + G3 4293 1 68.75 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATAAAAGAAAAAAAGTGCGTGATTGATGTAATTG:1 - chr3R 3261966 3' + jockey 4948 1 77.89 ATTCATGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGCCCTGGAAGTGTTTCGCAATCTGTTCGCCAACGATGCTCCAACGGCACCGGAGGATCTGCCT:1 - chr2R 15473511 3' + INE-1 86 1 58.18 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAAATTGGCTTTCGCAAATTTCCATTATGCACTTATTTCATTTTTGGTGACGACA:1 - chr3L 13160638 3' - pogo 28 1 54.55 TCTGCTTGCCTGTGTGAGTAAAAACAATGAAACGAAGTTTTGGAGTTTTGGCCAATTTCGTTGCAAAACTTCAATTCTTGTGGCCGTGTCACGACTTTAGCT:1 - chrX 3703735 3' - 1360 3253 1 70.59 AATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTTTTAAGGCTATTTCGGGAAGAATTAATT:1 - chr3R 23263079 3' + Doc 4519 1 73.33 CGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCACTTAGCGCGTAAAATAAATTTGCACAATTTGTGACAAGAGTGCGACAAAACTAGAAACGGGGGGAA:1 - chr3L 18257410 3' + copia 5010 2 65.71 GCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAGTACTCTTGGGGCTTCACAATCC:1 + chr3R 22595855 3' - FB 63 1 77.27 AGAAATGCAAAGCTTTTTCTCTTCATGATCAAAAACCCAAAACCAAACACAAACCCAAACCGAACCCGGCCAGCCAACTATTTACGAGATAAAAGCACTTACGATTTCAT:1 - chr2R 11819451 3' + Idefix 365 2 73.64 TATTAGAGACGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAACAAATGCCGGCATCGAGGAGGAAATATGGGAGGAACCCGTCCAGAGGAAGG:1 + chr3L 6046476 3' - invader6 4522 2 59.55 AGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAACAAAACCAAATTCAGGCTATGCAGGCATGATACTCTCTTATCGTATAAATATTCT:1 + chr2L 2862981 3' + Bari1 1617 1 55.45 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCAATCACGGACTTAACTCAGGCGTCCACGGCCAGTTAGTTGGCCTAGCTATTTATTTGCATATGCATTTTGCCA:1 + chr2R 21592064 3' + Tirant 8480 2 52.88 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACAAGTTGTTTATGTTCTTGTTTCACTCAGGCTTC:1 - chr2R 7981118 3' - 1360 23 1 62.73 AAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAACAAAAAAGAAAAAAAAAATAAAGA:1 - chrX 14588384 3' + Doc 4427 1 80.73 ATCAGATCGATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACGTGGAGCATCCAGATGCGTTTGCATCGCCTGGAGAGCTTCAATTT:1 - chr3R 23089899 3' + 1731 444 1 69.51 TTCTTTTTTTTTATTATTTGAGAAAGTTTAGTATCACAACGACAAGTAATTTACCCAATTCAACTAAATTCATGCAACGCATTCTAGTTTACTTTCATTACTTCTCTCT:1 - chrX 5404017 3' - Rt1b 5145 1 37.61 CAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTTTCTTTTTGCTATCTTTTCATGCTTTTTTTTACTT:1 - chr3L 14725148 3' - 1360 3371 1 71.43 GAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAAATCCTGAGAAAATGAACATGCAAAAAAAAAATTAAA:1 - chrX 12633887 3' + TLD2_LTR 150 1 78.90 TTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCTGTGTGCATGTGTTCGAGTGTCCTGCACGGACTGCTAGT:1 + chrX 21183376 3' + S-element 1672 1 67.27 AAAGTTCCGAAATGATCATTATTTTCTAAAAAGTGAGTTTGGTTAAGTTAATTCGTATATTTAAAAGGGCAAAAGATGGGTTAATAGGTCTCCATATGGGAAGG:1 - chrX 20903691 3' + HB 247 1 71.15 CACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCAATTTTATTTGGCCTACACA:1 - chrY 3612773 3' - Ivk 34 1 76.32 ACCAATCGGTACCATACACCACCCCTCCATCGCTCGACATCCGCCGACTGTTTTTTAGGCTCCAGCATGAGGAACAACTGAACACCGTTCAGATACATCCACACACATAT:1 + chr3R 5117064 3' + ZAM 7971 2 80.91 ATCAATATCAATAGCCGAGTCGATCTAGTCAAAAAAACTTTTGGCCACACCCACTCTAACGCCCTAAAACCACCCAAACAACTCAATCAACTCATCTGCCGAAAATCGAG:1 + chr3R 22500641 3' + INE-1 93 1 67.27 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAATGAACTGGCAAAATATTGCAAGTTCAGAATGAAAATATAGCAAGCAACTAGTAGTGT:1 - chr2L 18911893 3' - hobo 29 1 52.73 TCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGCGGCCATGCGACCAGGCAATATAACGAGGGGTGCTTCAAGAGTACGG:1 - chr3R 27205279 3' - Quasimodo 444 2 60.00 AATCAAATAAATAATAATTACTATGCTAGGGCAACTATATCTGTATCTGATAGTTATAAATTACACCCACACCCACACACACACACACAC:1 + chr3R 27499994 3' + jockey 4828 1 76.67 GCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCACTCTCTCGCTCTCACTCTCACTCTCTGCGCTCGCCCCCATTAAAAAGAAAAGAAAACACACTGCATCATCTAA:1 + chr2R 21502789 3' + Cr1a 267 1 60.91 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATAGATTCCATTTCCACACTCTTTGGCTTAACTTTCCCAGCCAAAATAATAAAAACACATTTATTTGTATATCGGCG:1 - chr2L 17545799 3' + opus 493 2 74.55 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTATTTG:1 + chr2L 17785853 3' + roo 359 2 68.22 TTGAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCAATGCATTGCTTCTATTCATTTTTTTTTCTCTTTGGCTCG:1 - chr2R 20335212 3' - invader2 388 1 59.14 TTTTAAATTTATCTAAATTTGTGCAGCAAAGAAAAAAAAAACCCCGCTAAATATTTGACCTAACCTGTACGAATGCATTAATTCCCGAACCGCCATTTTTGAGAGTAGAA:1 + chrY 381102 3' - G4 413 1 76.36 CTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAAAAAAAAACAAAACACAAC:1 + chr3L 8578565 3' + F-element 4264 1 37.27 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAGGAGATTCCAACAGCG:1 - chr3L 5320589 3' - roo 22 2 55.00 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATG:1 - chr2R 6707699 3' - 1360 26 1 61.36 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTCTGCCTCGTAATGCGGTTCAAATGTTCACTTTTTATGTCGCTCTCCG:1 - chr3L 19063418 3' + P-element 2881 2 72.16 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGATCTTCTGTTGGACTTCGATTGGGTGATCCTCCCTGTGGTCAATCCCGATGGC:1 + chr3L 7400815 3' - roo 15 2 56.52 GCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATACAAAAGTGTGTGTGGTGATATGCGCTATAGGTTATAATATGTTAGCGTAATGCCGAATGGCACTCTGATGATGGGCGGAG:1 + chr3L 17220794 3' + opus 497 2 80.00 GCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGGCGCAGCGCAACACTCGAAATGGAGTACTGTATGTGTATGTGTATATACCCAGAAAACTGACGCGTCATCTGTTTATGCGAATG:1 + chr3L 16045407 3' - gypsy 7139 2 61.47 CCACTCTAACGCCCACAAACCGCCCAAAACTGTCGCGCACACACTTTTTAAAGACTGTCCTATTGGGATTCTAGTTTGGTCAAATGGAAAATTATACCTTTTATTTAAAT:1 - chr2L 18030324 3' + INE-1 220 1 60.00 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAATAAAAAAATGCGCATATTGTGCAATTTTATGTAGCACACTTTGAGGAG:1 + chr3R 17927499 3' + jockey 4966 1 57.89 TAATATTTTACAAAAAGCACACTTTCACACCTACTTTCATATCCAAGACATTAAATAAAACCGAACAATTTTATGCCAATTTAATTTACAATATTGTAAATTAGCTTGAA:1 - chrX 11299946 3' + TLD2_LTR 113 1 69.09 TTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAAGAGAAATTAAGTTATAAAATTTTAAGGACTATGCGCAGTTTACTTTC:1 - chr3R 22979347 3' - Juan 4115 1 56.88 AAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTGTTTGCACTTAAGAACTTTATAAACCAAATAAATGATTACAA:1 - chr3R 24260844 3' + roo 9068 1 78.18 CGTATGCCTTAATAAATAAATTAAATAAAAAAAAACGGCCATAAAATCCAGCGCAGACCCCATAGACCCCGCTGTCATAAATCAATC:1 + chr3R 16157054 3' + X-element 4706 1 63.22 TTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGATGATGCTGACATAAATCTGTGATCTATTGCCTTGCTGCTGTTGGACCGATAAATTTTCATCTCGACTCTT:1 + chr2L 18249074 3' - rover 6921 1 68.18 AGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCACCTCGAAAAAAAAAATATATATTAAATTGATCG:1 + chr3R 13810741 3' + roo 8661 1 60.00 GTCATAAACACACACACACACACAGAGTGGGAGGGGGAGAGATAGAGAGTGCTGAACAGCATTAATTTTCATTACGCGTCGTCCTAACGATTCGGTTAGTTGACCTGACC:1 + chr2R 21452580 3' + accord 178 2 55.45 GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGATTCCAGTATACCCTATTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGCCATACAGC:1 + chr3L 22721137 3' - INE-1 34 1 62.73 AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCTCTCTTTTAATTAATTGTCATGTTTTGTT:1 + chr3R 563974 3' - HMS-Beagle 6815 2 63.64 AAGAGAAAATGAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCAGGCTCAAGCCCTTAACCAATAATAATTACAAACCAATTAAACGCATATTTACATATTGTC:1 + chr2R 22792144 3' + I-element 114 1 60.55 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATAAAAATCGTG:1 + chr3R 13481225 3' - roo 8721 2 77.27 GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGAATGTACGTAAGTACACCAATCAGTTTTTAGGGTATTCAAA:1 - chrX 6866768 3' + S-element 1686 1 60.42 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCCGCCAC:1 + chr2L 17574446 3' - hopper 14 1 58.62 TACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAACTGGAAGGCAGGACGAAAATGCTGTGTGGCTTCCAGCCATATGGTCGGGAAAAACATTCG:1 + chr2L 9465724 3' - Bari1 1560 1 63.00 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGCGATATATCTATTAAATACTTTAATATGGGGG:1 + chr2R 12636265 3' - I-element 38 1 64.89 CGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTAAAAAGAATCAATCAATCCATTGCAGCTCCAGCAGTGTAATGCGCCTTTGGGGCAGTGGCA:1 - chr3L 13892046 3' + HeT-A 5731 1 55.43 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTCTTTTCTTAGATTAAATAATTGATTCAACTTATA:1 - chrX 14771743 3' - jockey 4721 1 70.00 ACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTTTTGTGTAGAATGTAGAATGTAGAATGTGTGTAGTGTAAGAATGAGTTTCCATTGGGGG:1 - chrX 18204297 3' - I-element 4991 1 48.18 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACAAAAGTCTGGTCAGGAAGGAGGCGTTTCCCAAAAGAGACCAACGAGAAATGAGAAACCCGATAGTGAGAAAG:1 + chr2L 18360003 3' - roo 12 2 70.00 TAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGTCAACATCAAACGAGGAAATCATAGATGCTGATGCACCATCCGTGGTTCGTCCTAACA:1 - chr4 200673 3' + hobo 419 1 66.67 GATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAGGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr2R 5064833 3' + Stalker3T 205 1 69.72 AAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCAGCAAGCGGCATCTGAACTTGGTAGATCTGTTGGAGCCCCAAAACAAAAGAAAGTTCGTGTTTGCTTAT:1 + chr2R 21033480 3' + 1360 376 1 51.43 CCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCACCAATCCTGGGTACATTCATTAATTTTCGCCACAAATTTTTGCAATTAAA:1 + chr2L 11679956 3' - micropia 196 2 60.91 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGAAATTTAAATTTATTTGAATTTAATTTGCCAAGCGATAA:1 + chr2L 17334561 3' - copia 4917 2 71.82 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATCTTACATATATATGAATACTTCACGGAAAATGTGCTTAAACTTTGTTTACGCCTT:1 - chr3R 20703190 3' + flea 4961 2 56.36 AAATAGGCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTAAAAAAAGACTATATATCTAGACCCGCTAGGAGATGTTGAGATTGTGAGTACTTCTTGGAATTTGGTTAT:1 + chr3R 19448321 3' + 1360 341 1 64.55 ATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAACGCACATTTAAGCTGCGTACGCAGTTG:1 + chr2R 5969311 3' - 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1360 3283 1 52.29 TACATAATGACTTAAACATAGAAACTATTAAAAAAGATAGCTGAACTTAAAAATTTACGAGGCTTGAGCGTCCTGTGGCCATAAA:1 + chr2L 15526930 3' + Porto1 4393 1 64.71 GACATATCCACAAGTCCCTAAGACTTAAGCACATGCCTACATACTAATACACTAATACACTAATACCAATACAACATACACAGCAGGATCCGGCCAGGAACAGACGAGCA:1 + chr2R 11400554 3' + Idefix 3 2 73.64 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAATCTTAAAATCTATTAACAAATGTAATACTTACAAAATTTTTAAT:1 + chr2L 9238873 3' + copia 215 2 61.82 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGGCTGCAGCTGGTT:1 + chr3L 15968238 3' + P-element 2879 2 57.97 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAATCGTGTTCTTATAGACACTAGATATCAAACTACATATATTACCCTGTATATCTTTT:1 + chrX 15026092 3' - FB 29 1 54.55 CGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCACTGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAG:1 + chr3L 20187406 3' + FB 683 3 51.89 CTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCTGAAAATTGGTTGTGGTCAGAACTGGCCGACTGCGACTTGGGAA:1 + chrX 14149817 3' - 297 227 2 64.55 GACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTAT:1 - 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mdg3 5139 1 60.91 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGTTGAGAGGTTGGCCCAGATCGCTGGCTATTAATTTGAGCTTAGTTCTGCG:1 - chr2L 20526029 3' - hopper 27 1 54.81 GAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCGATGTG:2 - chrX 17193328 3' - F-element 189 1 63.30 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCTAATTTAAGATTTTAAAATGTTTTAATTAATGTTTAA:1 - chr3L 17595315 3' - jockey 4715 1 66.06 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTCTGTTTGTTGTTTTTTAGTTTTACA:1 - chr2R 17436723 3' + Tirant 8493 2 60.94 TACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGCGTGAATTTTTTTTTATTTCACTGCTCTTCAGGCAGACAAGACTTGTTGGCGCTGATTTAATA:1 + chr2R 4137619 3' + HMS-Beagle2 7180 2 62.86 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGATTATTTTTTACCAAAAAACCCAAAATAAATAAATTGCAGAAAAGTGATATTTTTCATGGCCAAAAAGGTTACTTT:1 - chrX 11040459 3' - blood 6 2 74.77 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTTGGGCCCAATG:1 - chr3L 20167933 3' - 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I-element 40 1 64.89 CAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCACAAGGCCCACATACGT:1 - chr3L 25455110 3' - HMS-Beagle2 6916 2 55.05 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTTCTTCTGCTTCTAACGCTTCTATCCTTCAGATTGCCGTTAT:1 + chr3R 24095630 3' + 1360 3182 1 65.14 AATATGTACATATGTACATATACATATGCAATAATGAAATGAAACAAACGTTGGTAGAGAAATATATTTAATACGAAAAGTTTTGCAATAACGGAAATGAAATGGAAATG:1 + chr2L 11654874 3' + G3 4506 1 70.91 GACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACAACTTTGAGTGGCATAAACCC:1 + chr2L 20841995 3' + G6 2007 1 64.55 AAATAAATATATATTAAAAAAAATGCAAACATAAACAATGCGTAAACCAAACGAAAACCAAAGAAAAAACAAACAAGCAACAACAGAGCAGAAGA:1 + chrX 17162560 3' - S2 93 2 76.84 ATGTACAATGATTTAAGATAATATAGTTTCTAGTCTACTTACAACATAAAAGTGTAGCCAACTAACCGATTCAAAACAACTGTGAGTTTGCCGACAAATCAATCGGAATT:1 + chr2L 10240599 3' - Cr1a 4142 1 64.55 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGAAGTCATTAACCTTATCGATTTCTATCAAAAATCGTATTTTATAAACTAGAAAAATCCATTCTCCACTCGGTTC:1 - 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chrX 3003142 3' + I-element 133 1 55.45 AGGTTATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATAATAATGTTATTATTTAAATATAGCTTAGAAATAGTAATACATAATGTCACCTAATAAATTTAAAAAATTAATTAAT:1 - chr3L 16826471 3' - 1360 372 1 66.36 TAGAATTTGCTTGCTTGTGTTAGTAAAATCACTGAGCGCGAACGTGTGTGTAAGCGAGTGTGTCCGCCATTTTGTTAACATGCTAACTAGTGTG:1 - chr3R 25695054 3' - 1360 3258 1 62.77 TGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGTGTTTGTGTGTCAATCTGCTACACGCCGAAAAAGACGGGTAGATGGGAAGTGA:1 - chr2L 4049182 3' - I-element 5164 1 55.45 TCCTAAAGCTCTCTTTGGTTTTTACATGGACCTTAGCTTGGCTCTTTTGTCCCGATTGCATTGCTGTTTTCACGCTTCTTGCTGCAGCG:1 + chr3L 6979917 3' - Fw3 113 1 66.29 ACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCATTGAATAATAAGATAAAAGTATCTGCTTATTAGGTGAA:1 + chr3R 25628349 3' + opus 7350 2 59.76 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTATTGTCTTTTTTCAGTCAAATTATGAGAATACCAGAGTTTTCTGGGAATGCGTTTTACGCATTAGAAGTAAGTA:1 + chrX 16693868 3' + 1360 3381 2 73.64 GAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTATACGGCTAGGGCCGACAATTCGCCTTGCAGCCGCAA:1 - chr2L 10096100 3' - diver2 4884 2 68.27 GTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATACACTATAATAATTAAATATCCTACTATGACCTTTCGACCAAAAGTTACAAAAAGTTACAACGTCACA:1 + chr2L 12379026 3' + 297 6599 2 62.73 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7319 2 45.00 AAGCACTTTAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTTCTGGGAATTATTACGTTTACTGATTCAAATTTCTTGTATTGGGACAACCCTCTTGCCATTTTTTGGTACA:1 + chr3L 23937205 3' - Burdock 6167 2 76.36 AACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACCAGTGTTTATGTGATCTACATACTCCCTCCCACTTCTCACTTCATTTTTGGATTTACTAAGCCACATCGATTATGG:1 + chr3R 14013446 3' + roo 397 1 70.00 GTTAAAAGTTTTGTCATGGAAAACAGTAGCATAGGTATGTATTGTATTGTATTATATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGCATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' + transib1 255 1 39.81 TGTTACCAGTCCATGTTACTGCCAAAAACCTAAGTTTACAAAAAATACTTACCTCTTAATTTTATTTCGCTATTATACTACAATCTGAGAGTATTCTTGCCACCAAAA:1 - chr3L 18341092 3' + HeT-A 5859 1 54.63 ATGCTGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGCTAACGCAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGAGCTGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAG:1 - chrX 4186821 3' + pogo 1635 1 65.45 TTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTTTTACACAATCTATCACAATTTATTCCG:1 + chr3L 14253119 3' - Bica 486 1 74.55 ATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTAACCTATGAACAAATTTAAATGTACTTTACGTTTCCAAACAATACAAAGTAAT:1 + chr2L 21388432 3' - roo 8976 2 60.00 TTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAAAGAGCCACTGCGAAGAATGCTGAAAGTAATTTGGTTTGTATTTGGTCAGTTGCCATAAAATATTGCG:1 - chr2L 17393321 3' - FB 11 1 68.93 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATATAGAACTATATCTACCAAACCCCAACATAAACATACGCATGGAACCTAGATCGACTTATA:1 - chr3R 4514511 3' - Tabor 6847 2 66.30 TGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGAGCTTGGATTAACACATTTGAATTATCAAGAAACAGGACTAGAAAAACATGTGAAATT:1 + chrX 8047748 3' - Quasimodo 44 2 56.36 GTTAAAATTTAAGAAGAAGAAGAAGAGTATAATTTGAAACTGCAATTGCTTCGCCATTTATTATATCCCGATGATGATGATGGTGATTTTAAGCAGTAGCACAATCTGTA:1 - chr3R 25951106 3' - hopper 1185 1 72.73 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAATTTAAAAGAGCTAAACAAATGCAG:1 - chr3L 36319 3' + Tirant 353 2 75.00 TTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAGAGTTATTCTTCACAAAAGAACAAAAATGAAAGGGAGCA:1 - chr2L 618627 3' - FB 118 1 64.55 CACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAAACACCCCGACTAATGACGACTTCAGATGAAAT:1 - chr2L 3114717 3' + G6 1831 1 70.91 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATACAAAAGTGTGTGTGGTGATATGCGCTATAGGTTATAATATGTTA:1 + chr3L 17220758 3' + opus 461 2 60.00 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGGACGGTTTAAAACAGCG:1 - chr3R 15095588 3' + P-element 2841 1 19.10 AAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCGAATGTTTAAATA:2 - chr2R 8397417 3' + 412 7530 2 50.00 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCTAAGGTTCGTACCCACTTTGGGG:1 - chr3R 11474887 3' + hopper 1412 2 70.73 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGGACAAGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATTGCACAA:1 + chr3R 19446917 3' - roo 13 2 68.18 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACAATGTGTAACATTACACTTCTTGTTAAATCAGATAATAGCTTTATTAG:1 - chr2R 9953272 3' - pogo 35 1 58.18 TAATTTTGTAAATGTTTGTTGGGTGGATGGTGTTTTTGGGTGACTTTATGTCTTGATTGT:1 - chrX 4181986 3' - I-element 196 1 80.00 ACTAACATCAATTTAATTGCAACCGATTTTGGTTTTACTTAATTCTGTAAATGCCGATTCCAGTTTAAATATTTGCCCATATAAGTAAAATGCTGAATACATTAGTTAAT:1 - chr3R 30341539 3' - transib3 472 1 70.00 CGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTGATTTTTGTTATCGATAGCCGAGAGTTATCGCCCATTTTGCTCTTTACGCAATGAAA:1 - chr2R 21040761 3' + I-element 4925 1 51.82 ATCTTAGGAACTATAAAAACTAGAAGGTTGAGATTCAGCACACAGATTCTGGAAACATAGACGCACGTTGACAGCTTAACGTACATAATTAATGTGACAATCTAACGGAA:1 - chr2R 24231121 3' + INE-1 151 1 59.09 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCACTTAAACTCGCCTTATCAGCCGAAATGCTGCTACAGAGCGTTTTCT:1 + chr3L 16496286 3' + P-element 2870 1 63.30 TGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTGGACCGCCAATTGAAGGCGATCCCGGGCGTTTAATTTCTGGAGG:1 + chr3L 25186340 3' + Max-element 8104 1 53.19 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTCTTTTACCAGAAACCTTAAACTAATTAGTTTAATTAGTGTAATCAATCCA:1 - chr3L 12158431 3' + 297 367 2 57.27 AAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCTCAGTTCATATGGAAGGTCAGACCAAAGACACTAGAATAA:1 - chr3L 22016759 3' - INE-1 151 1 73.85 GGCGTGTGAAAAATTAATAAGGAAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCGTCTTAGGCATTAAAGTAGCCATAAATATCGAAGCGTTTTTAATTAGTCGCC:1 + chr2L 15400354 3' + 1360 431 1 59.18 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTTTAATAAATTATATCTTATTATGATTCATGGTAAGCTTTCGGAATCCACCTCCCTCGCTTCT:1 + chr2L 18749932 3' - pogo 20 1 66.36 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAG:1 - chr2R 9963494 3' - pogo 30 1 60.64 GATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTATCCAAGCTTCAATACTTTTCAAGATCTCAATGTTCTTAGTATTGCATACATTTTCG:1 - chr2L 19364077 3' - BS 4783 1 45.63 AGAGCGAGAGAGAGAGAGCGACTTGTGCGAGCACGATCGAGTCGGCCGCG:1 + chr2R 18232707 3' - Cr1a 288 1 86.00 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAGGTTGATTGATTAGATTCATTGAAATCGTTTTTTTGATTTCCCTAATTATGAGTTTCTTATATTT:1 - chr4 416471 3' + 1360 3378 1 70.87 AGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTTCATTTTTTGCCGCTTCTCTCATTTCCTCGCGGGTTTTCATTTCGTTTTTTGTGTTTTTTCATATTTTGGCGCATGTC:1 - chr3R 12264938 3' - hopper2 1331 1 74.55 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATATATTTATTATTTAGTATAACCAGGTATCATGTAGTCGACAAACTC:1 + chr2L 16230382 3' - blood 7048 2 61.82 GATCCTGATCAAGAATTTATATTCTTTATTTATGTACTTTAAAGGGTCAGAAACCCTTCCTTTTACCTGTTACACACTTTTCAAAGAGTCTAGTATACCCTTTTACTC:1 - chr3L 23746964 3' - INE-1 80 1 69.44 ATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAATGTCTGAAAGGATGCTGCGAGA:1 + chr2R 12687371 3' + accord 451 2 76.84 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCG:1 - chr3R 9481219 3' - roo 8714 2 75.00 GATAGTGACTTGGGGGGTCACTATTTACTGTATGTGCCAGTATTCTGGACTTGCAGGGAGTTGCGCAATTCGACAAGAATCGATTGGT:1 - chr3R 30102570 3' - X-element 119 1 53.41 ACCTCGCAGCGAATGCTGGATCAAAATTATTCCCCAGAAGGACGTGCAAGTAATAAAGTGATAAGTTGAAAAGTTTAACACCAATAAAATACTAAAAAATAAAACATTAT:1 + chr2R 5292539 3' + copia 4750 1 52.73 ACTTGGACTAGGACACACAGACATAACCCACCACCACAAAATCTCCCTAGGCCTTTTAGTGGCGCCCATGCACTTGAAACAAAGACACAAAACA:1 - chr3L 17647757 3' + I-element 4946 1 68.09 CGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCTACATAGAATTTGTGTGTGTGTGTATGTTT:1 - chr3L 7846452 3' - 3S18 5772 2 70.73 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCAATCACGGACTTAACTCAGGCGTCCACGGCCAGTTAGTTGGCCTAGCT:1 + chr2R 21592039 3' + Tirant 343 2 73.39 AAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCAGATCTCTTTCACAGAGCAAATCGAAACTATCGAGAGTAGATTAACTATCGCGTATTTTGTAGTGCGTAAGCTAACTAAACCA:1 + chr2R 15470817 3' - hopper2 240 1 58.18 AGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATATTTTTGTGTGCCAGGATGCGCACATCCGTGAGCAGCAAGGACACACATG:1 + chr2L 2608233 3' - F-element 4580 1 58.16 CAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCTATATGTCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAAT:1 - chrX 23406393 3' - R1A1-element 38 1 61.67 TCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAGATTGTGGCCA:1 - chr3R 9435801 3' + roo 411 1 78.41 ACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTAAGTGCTCGTTTGCTTGTATAAAGTAAAGTTTTCGTCAAAGTTGGAGATTTAAAGAGAATCTTTGGGA:1 + chrX 22489720 3' + S-element 1707 1 73.33 GTCGGTGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTGCTTTTCCTTTCAACGTGCGTAGTTTCCCAAATTGGCCAACAACGTTGGACAGGCGGAAG:1 + chr2R 22579640 3' + INE-1 568 1 53.19 GCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTCAAAACTGAAAAATCAGGGAGAGACTCAGTAGACTGAACTTTAGATTTTGACATAGTTTCTCTGTAGCTCGTTAATAAAGTAC:1 - chr3L 19302581 3' + 412 328 2 50.00 CAACAATAAACATTTAGTGACACGCGAAAAGCGAACAATTTATTAGTGTAATACTTGTGCAAACCGATATAGATATAGATATATATACTCCCCATAAACCCGCAATTTGA:1 + chr3L 15449023 3' + HeT-A 172 1 53.64 TATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAAGATTTCTCTACCGTTATTTCGGGGGGCGCTATAAGAATTATGTTATTATTAAAAATTAAAATCGTTAATGGC:1 + chr3L 21622845 3' - G5A 2673 1 66.36 CGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAATACTTAGTTAATGAACAAGTGAAAACGAAATATTTAACAAGCTAGAACAACAATATATACACATATAT:1 - chr2R 10515087 3' + invader2 112 2 70.00 AAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTTTAATCTTAATTCCTTACAATATTCTGAAA:1 - chr2R 12622284 3' + FB 24 1 72.73 CACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGGGATTTCGCATTATTTTTGTTGTGTGTTCTACCTGTGTGTTGGTAAACA:1 + chrX 3401671 3' + R2-element 3532 1 55.00 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAATTAAATTAAAAATTAAATAATACATAAAATATTA:1 - chr2R 4137700 3' + Juan 4160 1 76.36 TTATTTAATTATCTAGCTAATTTTTTTTTACAAATCGTATCATAATCATATCATCTCGGTTTTAAGTCCTGGCTAATCCGCTTAGGCACCTGTCCAGATGGTGACAACGC:1 - chr2L 5284379 3' - HeT-A 24 1 63.64 ATACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCCACCATCCATCCAGCCACCCTGCCATCCTGCCATCCTGGCATCCAGTGTTTTGCGGATTTGT:1 - chr3L 11361779 3' + accord 7102 2 87.27 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAATTAAAAGTTAATGTAATAATTAAATACATTCGCAACTGTCAATTAGCTCAGTAAACAATTAACA:1 - chr2L 16529175 3' - blood 7020 2 70.91 TAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGTTATTCGACTATCAGA:1 - chr3R 7838660 3' + Stalker3T 202 2 51.82 CATGACAGGCTGGAGCGCCTCAATCAAGGGCCAGCGCAGCGAGGAAGAGGTCATAAAGTT:1 + chr2R 5400215 3' + X-element 4419 1 75.00 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAAAAACCACACACTACATTC:1 + chr3R 14024754 3' + 297 6948 2 67.86 TGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATATTTAGCATGGAGTTGATGTGAAAAATTTATTTAACATAAAGGTTTCTGTCTTCG:1 + chr2R 6500150 3' - Idefix 7169 2 54.13 ATGCCTTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTGC:1 + chr3R 8165795 3' + 17.6 7085 2 64.62 AATTCTGTTCCGCATCCACGACTTATTTCGCCTTTGATTACAATGTATGTAGGTACACTTATTTGAATTTTTGAGATGTACATTGCGTGTTGAGCGAATTAAAGTGCTCG:1 - chr3L 21559422 3' - HeT-A 6024 1 70.00 AATGTTCGATTATTACCGAACTGATAGAAAAAAAACATATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTATGGCTCCGGTTGTCTCTTTGTATCTGGACAGGCAC:1 + chr2L 14529791 3' - Circe 449 1 73.74 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGTTATATTCATTTATTTAATTCATTTTATTTGTGTTA:1 + chrX 2419514 3' - Tabor 6901 2 67.27 TGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGCCTCTTCTGGTGACCTCTTCCGTTACCCTTCACCTTTTCCCTATCC:1 - chr3R 9183758 3' - invader2 5103 2 61.76 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGCGGGCAAAACAAGGCTGTGGAATGGGGTAAGGGGT:1 + chr3R 11315276 3' + hopper2 1560 1 65.45 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - 412 42 2 63.46 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 412 7088 2 62.11 AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGTGT:1 + chr2L 9171485 3' - opus 7149 4 69.32 CTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCCTGGTAGCTCAAGCGAAGCGGAACCAACAAACTCCCGAAATGGAT:1 + chr3L 217405 3' + roo 409 1 79.57 TGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAG:1 - chr3L 3240541 3' + diver 215 1 58.18 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAGC:1 + chr2R 9871549 3' - roo 8666 2 71.43 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCATTTCGGAAGGGTAAAAGCTACTGGTTTGTTTACCTGAAAATGGAATACCCTACTAAGTGCTAAAATTTCTGTTTT:1 + chr2R 22663433 3' - mdg1 10 2 68.18 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATAGTGTCCTATTCACATAATCCCACGCCAGTGTACATCACATCCGCTAATTGCTA:1 - chr2R 4789039 3' + 297 6946 2 59.09 TCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAACACACGTCCGCACACCACTACAATGCCGGCAACCTCTAAGCACACGCAT:1 + chr2L 14154709 3' - Bica 83 1 59.09 AATAAACATGAAGATCAACCTGACACAATCATAATGCAGCGGGCAGCAAAAGCGAAACGGCAACGACCGTTGCAAGTCGCTGACTAAAGCAAAGTCTGCCATTCCGTCGT:1 + chr3L 5609298 3' + Bica 140 1 76.36 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATACTTCAAAACAATTTGTAAAATTCCCTAGTACTCACCAGTTTGCTTTGGTAAATTGTAGAAGTCGAGGGTTTTGAT:1 + chr2L 20903034 3' - roo 9 2 71.56 TAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTCCGCAGTTTCTTTTCCGGCTTTCCCTGGAGCTTCTTCACTCTTTTCTTTTATTTT:1 - chr3R 10244222 3' - TAHRE 336 1 65.59 ATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATACTGGTCGGATGGTTAATATGGTTTCTTGCTTATTTTAAGAATATTTAAAAGCTACCTACACCTAAGTGTCA:1 + chr3R 6132139 3' + I-element 5347 1 69.16 CTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAAGCTGATTAGTTTTGCATTTCGTGCAGGAA:1 + chr2L 3425771 3' + R1A1-element 5228 1 75.51 TTGTAAACAAATCGTAAAGCCTGACCGAAGCAGTTTAGCCTGTTCTCTTTGATGCTTCTCCCAAACCAAATACAAAATCCGAATCTTCTTTCAGACGCAATATG:1 - chrX 16518828 3' + 17.6 204 2 63.46 GTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAGCAGAGAGAATGCATATTTATCCGATTGAGA:1 + chr3L 2547818 3' - invader2 4986 2 77.22 ACACACACACACACACATACTCACACTTGAGCACTTTGAGTGCTGCCAAGGCCAACAATTGCCGTTGTCGTCTGTAGTAACAACAATCCCGATTTCAGATTTTCAGACTC:1 + chr2L 9821139 3' + accord 7031 2 52.73 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGGACAATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTGTATAATGACAGAATTATACAAAAAATGTAT:1 - chr3L 8085876 3' - GATE 38 2 51.82 GTAATCAAAGGCAAAATAAATTGAGGTGTAAAAAAACTAATATTGATTATTAAACAAAACGAGTTCAATCGCCCTGCAAATCTTGTACTATTA:1 - chrX 9490228 3' + TAHRE 10374 1 77.42 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTAACTAGCTATTTTTTTTATATCTGCTCAGGGAGTTTATGTGTTCGTCC:1 + chr2L 19129397 3' - FB 21 1 52.69 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGTAGTGGTAGAAAAATAATACACTATAAGTCTAAGTTTAAAAAGAAAAAAAAATTAATAAAAGTAAATATAATAACGAAAG:1 - chrX 13953077 3' - hopper 8 2 71.56 CTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCTTTCGATTCAATACCAATATCATTTATGGGCACTGACCTT:1 + chr3L 14623753 3' + Tirant 8090 1 52.94 GCCAAGCACAGTTCCAAAATCTTGGAAATCCACAATGCCGCAACCAACAACAAAAACAAATCCAAGAAAAACAACAGGTCGGTTCAACAGCTGATTGCCATTCACGTGGC:1 - chr3R 9756458 3' + Doc4-element 147 1 58.18 ATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAATGAAACTTTCGGTTCACAATTCTTCTTTCGTTCTTTTTCTTTACGAAC:1 - chrX 11828716 3' - accord2 7325 1 56.36 TAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCT:1 + chr2R 10163635 3' - Juan 4096 1 61.00 GTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAACCCCACAACTTGGTTAGAATAAACACAGATAATGTGATAT:1 - chr2L 14934466 3' - invader4 2752 1 69.09 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGGATATGATTCAGTTGAACTGCAGACACATTGACGACTCTCTGCTCAATTGA:1 - chrX 18483148 3' + pogo 2064 1 56.88 TGCTATAGTCGAGTTCCACGACTATCAGATACCTATTACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACACGAAGTTTCATATATATATTTTTTTTTTTGGTTTTTTTACAGCCGACT:1 - chr2R 13604443 3' - INE-1 568 1 76.15 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTACAAAATCTGTAAATAATTTTACACATCAAAATGAGAAATGCTTAAAAGAACA:1 + chr2L 21089246 3' - flea 22 2 60.19 GGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGGCGGAATATAATCTAATTTATGAATAATTATCTTGG:1 - chrX 12926615 3' + R2-element 474 1 56.72 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - 412 7102 2 68.18 ACACACACACACACACACATTTACTAACACACACGCACACATAGAGGAGAATTTTGTGGTGACATCAAAACAGAAATATTTATAACAATTGCAATAACTAACAAAATGAG:1 - chrX 10235421 3' + accord 185 2 60.00 TACAAAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCAGGGCCGCAGGGCAAAACTACAGCTGCAAAAGCCAAACTCCTTTGGA:1 - chr2L 1788892 3' - Chouto 105 1 54.44 TATATATTCTTGATCAGGATCAATCGCCGAGTCGATCAGGTCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGATTCCAAATCGAAGCTGTGGCCAAGCCCAAAACTTTAC:1 + chr2L 3082002 3' + INE-1 81 1 61.17 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - Tabor 52 2 72.73 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCCATCGATAAGAAGGCAAAATCCAGTGGCCAAAAACTGGGAAAGACGACCATCCGC:1 - chrX 10300735 3' - 412 11 2 64.44 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATGCTAAGCTACACCGATAAGAATTCTAATTTCCAATTAAACTGTCAA:1 + chr3L 126334 3' + pogo 2097 1 67.95 TGAATAGTATATTCCAACACCTATGAATAGGAATATTTCAATATTAAAGAATACAGATTAATCCCTTTTGTAAAATCCAAACTACCTTCCTGCTACTTAGCGAAATGAAA:1 + chr3L 14811535 3' - copia 4867 1 74.55 CTCACACACACACATACACACTCACACGGCGACAATGACACCTTCATGCCTCATTAGATTCAGGTCCAGAAAAGGAAGAACCGGCCAAACATCGA:1 + chr3R 7103934 3' + accord 7101 2 63.16 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGTATTTAAAAACAATGTTATTAGAAATTGTGATTCTTGCAAATTTATAGAGCTTAGTTTTA:1 - chr2L 769969 3' + roo 9049 2 57.80 GAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGTGCCCAAGGTGTTTGTGTTTGCACGAGTCGTTTTTTTTT:1 - chr2R 17435699 3' - Doc2-element 4479 1 56.41 CGCCGACATCCGCCCAAAATGCTGACACCACATCCATATGCTTTTATATGTTTACAAATATACATGGATTCAATAATAGTTTCTCAAGTTCATACTAATACATACATAAG:1 - chr3L 15567357 3' + ZAM 129 2 74.55 AACAGCAAGTCATGCAATTCATAGGGAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATCTCCAGGCTCAGCGAGACGGAGTGAAAAGCTGG:1 - chr3R 6788096 3' + G6 1594 1 68.89 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTG:1 + chr2R 12416918 3' - pogo 57 1 78.18 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCCTGGTAGCTCAAGCGAAGCGGCACCA:1 + chr3L 217386 3' + roo 9055 2 54.95 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAATAGATTGTTTATGAACAGTCAAGCTGAGCAAACTAGTTATTGTTATATCGATTTATTATAAGGCATTTCTT:1 - chr2R 10163534 3' + Juan 4203 1 56.36 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Stalker3T 202 1 55.43 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAAAGGTTAAGGGAAAACGTTTAGCACATCTAG:1 - chr3R 24867507 3' + roo 9021 2 76.92 AGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCCTCTGGCCCAACCCCTTCCCCAACGGCATCCCTTTTTGCCTTTCTTGGCATGTACTTGTAGTTTAAGTTGTGC:1 - chr3R 10082819 3' - G2 222 1 70.91 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAATAACAGGTATGGTCGATATTAACTTAATTAGAGTAGGACTGCTGGCTAAATGCTCCGC:1 + chr2L 12036196 3' + 297 6957 2 65.45 CAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGCGAGAATCTGGCAAACTAATTACATTTATGGCCGCGTCGGGTTT:1 + chr2L 7488312 3' - 412 417 2 62.67 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTCTGCCTCGTAATGAGGTTCAAATGTTCACTTTTTA:1 - chr3L 19063430 3' + P-element 2857 1 51.38 CAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCACCCTG:1 - chrX 22726184 3' + Helena 1275 1 53.64 AATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAGAAGGCTCTCAGCGATTGCATAATCGGTAGACGCCCACAAACGCATGCAGAAATTTACG:1 - chr3R 7235329 3' + I-element 387 1 72.73 AAAGAAAAGAAAAGTAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + invader2 4746 1 26.36 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAACCGCCCACGCACACAGCCACACGCGTACGTGTGCTTAGATAGATATC:1 - chr2R 15725955 3' - hobo 19 1 55.32 ATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAATCGCTTGTGGTAGAATCAGTT:1 - chr3R 12311919 3' - Doc2-element 4363 1 70.00 CAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTGACTGGCTTATAATGGAATTGCGATTGTATCT:1 - chr2R 13286274 3' + 1360 3181 1 64.44 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAACTTGCTTGGCGCCATTGAAATGCGCAGTTTTTAATATTAGTGCCCCCCGCGAATTTATAGTTTTGCT:1 - chr2L 18693983 3' + pogo 2100 1 72.16 GTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGAAGTTCGCCGAACTTGGCCTGCAGTGCACGAGGAG:1 + chr2L 5436984 3' - Ivk 5030 1 56.79 GTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATTTCTCCTACTTGTGTAAGCATGGTGGTTTAGAGGGAGGGTTGGTGTATGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2R 1982173 3' - ZAM 73 2 61.39 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCTATAAGCCTATAGGGACACGGTAGTTTAGATAAGCGGAAAAAAATCGCAAAAA:1 + chr2L 10175080 3' - 1360 23 1 50.48 CACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTTTCCCACACAAAAGTCAACAGCATAAACAAGGCTCGAAAAAGTGGAGA:1 + chr3L 5336801 3' + Cr1a 283 1 59.77 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTATCAAACAA:1 + chrX 12271524 3' + pogo 2069 1 71.43 TGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGTCAAACAACAGCTATGGCCACAACTCACTCGGGCACAAAAAATCCAACGCAGAGCACCGAATCAC:1 + chrX 17387724 3' - accord2 7268 1 71.13 CAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCAGTTCTCGTACATTTTCACCTCTGTAGAATATGCAAATGTGAACCCATTTTCATAACAAACGGTAC:1 - chr3R 16441907 3' + Transpac 343 1 65.45 CATAACGGTTGTCCTGATCGTTCGGTTTTTTCGGTTTGAACTAATTGGCTGTGGGTTTGCTACTGATAAAAATTGTTGATATTTAAACACAATTTCCAAAAATTTAATTA:1 + chr3R 24097829 3' + Copia1_DM 166 1 56.36 TCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGTTACCATGGACTTTTGTTCATTTCGAAC:1 + chr3R 31681263 3' - I-element 4896 1 80.43 AAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Doc2-element 220 1 34.58 CAAATAAAACTTGTCATTGGGACAATAGCAGAGAAGAAACCGAAATCCATGTTAACAGAGTGCATTTGTATGCTGATAATATATCAAAGCACATTTTACTCCAAATACAG:1 + chrX 15532021 3' + Doc3-element 4459 1 72.73 ATGAACGTCTCGATCTCAGGAAAGGGACTGGAAACAACAGCGGCGAGCATCGGGAGGCAAAGAAAAGGGG:1 - chr2L 12765534 3' + INE-1 139 1 72.86 GATCCACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGGAACGGG:1 - chr3R 31045711 3' - INE-1 96 1 70.30 GAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAATAAACCAAAAGTTTCGTTGAGATTGATATTTTTTGGACTTATGT:1 - chr2R 13015126 3' + Bica 149 1 60.00 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAGTCTGCAATATAGACTTATCAATCTTGGGGAAGTCGGGAAAATTGTTTGACATATTTACGAATTCTTCACTTAACAAA:1 - chrX 15499933 3' - pogo 2 1 79.09 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGCCAACCGCCAGATGTGTCTATAAAACTTGCACATCCCCATTCATCCCATACGAACATTCAT:1 + chr3R 25859698 3' - 297 6584 2 74.73 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGCTTTAAAGTATTGTGAAATGGATGCCATCCAAGATCCGTATA:1 - chr3L 12300127 3' - 1360 23 1 58.14 TTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATAAAAAT:1 + chr2R 330188 3' - HMS-Beagle2 52 2 73.39 AATAAACTGTAATTATTTACTTATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTACCAAATAAACGTGGCTCAACGTGGTGTTTTGCCGGTTTGGTT:1 - chr2L 16067033 3' + HMS-Beagle2 7195 1 80.73 AAACCCATCCCTTTGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACATCTGCCATCAGTTTGGCCTCAATTGTATGTACCAACTAGTAGGCATGTAT:1 + chr3R 8789301 3' - Dm88 4257 1 66.36 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTAATAACGATTAGCTAAAAA:1 + chr3R 18626846 3' - roo 34 2 78.48 TGTTAGTTTTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATATTGTACTTTATTTATAAATATAAGAAAA:1 + chr2R 883120 3' + F-element 4643 1 73.03 CCTGTGGAGCCTTCTTGGTTGGCAAGCTCTGGACAGTTTTGGCTTGTTGATCTCC:1 - chr2L 117838 3' - BS3 1546 1 74.55 CGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGGGTGTGTTTAAAGATTTATATAACTTGTCTGCTGTTTACTTAGATTATTACTAAAATGTTT:1 - chrX 2679162 3' - accord 7063 2 66.36 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGAAATGTTGCTGATTTCATGGCGATTGCATAACTCGATTCTCTGCCCCCTTGT:1 + chr3R 11526866 3' - pogo 4 1 71.76 ATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAATAAACAAGACGACAAAAATTGTTACTCACCAAAATTAAAATCGAACAAGGAA:1 + chr4 91939 3' + F-element 4641 1 62.39 ATAATTGAAGTGGCCGGTTTGGACCACTCAAATACGACACTCTCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCGCCTGGGCGCTTTGTGG:1 - chr2L 8559724 3' - 297 6601 2 72.53 CTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGTGTGTGCGTGTTATGGTGAGAAGGTATACTATATTCAGTAAGAAGTATGTCGATCTAACCATCG:1 - chr2L 12322150 3' - 1360 3249 1 55.24 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGTATTTAAAAACAATGTTATTAGAAATTGTGA:1 - chr2L 769998 3' + roo 355 2 76.36 GGCAGAGTAAGTACTAAGAATATATTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCATGAAAGTTTAAAAATGCTGAAAGC:1 + chr2L 19846150 3' - Gypsy6A_LTR 234 1 68.24 GAAAAATTAATTAGGCAATAATTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGCAACGTTCTTCCAAAAAGGCAATAAAGTGCGTTTAAATTTACGCACGAAATCAATCTGGTAT:1 - chrY 946210 3' + 1360 438 1 78.18 AAAGTCTTCTTATTTGGGTTTTTACACCTTACGACCCTTTTACCCAAGGTATTAGGACTT:1 + chr2L 20398525 3' + roo 404 1 56.67 TACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGATGTAAAAAGAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTTTGGGACACCGGAGTTAAATGTTACCCATGCCC:1 - chr3L 9648381 3' - Q-element 549 2 78.72 CACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTACTCTGGTTGATTTTCTGACGATCGAAATGGGCGAAAGTAATTTGACTTTTGCGATTTCGGTTTTTGTGGTTTTGGG:1 - chr3R 17032490 3' + 1360 3220 1 76.36 AAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGTTCTTCACAAACAACAAGCCATCATAAAGTAATAATGTAAAAATTCTTTGATCATACC:1 - chrX 19228493 3' + I-element 119 1 52.73 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACA:1 - 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R2-element 45 1 70.91 GGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCAAGAGTCTGTATCCTGATCAAAATGTATTTCAAGGCTCTGTTTTAACTATATATTATATTGTG:1 + chr2R 5772651 3' - baggins 5313 1 54.13 GTCATTTTTTAAATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCGATTTAAACATCAAATAATCACAGGTAAATGGTAAAAACATAAAGTTTTGTACTCACAATTCTT:1 + chr3R 19226000 3' - 1360 370 1 61.82 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCCGCTTCTTTGAGCTTGTAACTAGCTATTTTTTTTATATCTGCTCAGGG:1 + chr2L 19129380 3' - FB 19 1 55.41 AGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAATAATACGTATAAAGTTTAGTTGTGTCACACGATTTATGCAGCCGTAAGCAATCTACATGTAAAACGTTCAAATATATGTGC:1 - chr2L 14006316 3' + I-element 372 1 79.82 ACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACGATGCCAAATATTTATCAATTAATTACATTGACGTATCAAGCAATTCGCATGAAT:1 + chrX 8027497 3' - Juan 14 1 62.07 ACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGTTTCCCTGAAGCACCTATAACCTGCAATGTTTAGACAAATTTCCCACA:1 - chr3R 19497892 3' + F-element 4398 1 59.09 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGTGCTGAAGGTGATTGATGTTTAGGGAAACCGTTTTTTTGCCAGTAAAAAAGCTTTAATTGCTCAT:1 + chr3L 12977721 3' - jockey 4683 1 79.57 ACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTACACACCCATTGAACTAATAAAAATAAAACCAATAGAACATAAGGACATTGTTAAACTAATATCAAATAATAATA:1 + chr3L 21843829 3' + gypsy 449 2 69.09 AACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACAAAGGTGGAAAGGATATGAACCAGGACTCACC:1 + chr3R 8516651 3' + pogo 348 1 73.96 TTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGTAGTTAAATTGAATAGACCTACTAGGGCCTCCTAGGGGTCGCTCCAGTATGAGTTAAAACATATTCAGCACATGGCGC:1 - chr3L 26722645 3' - Tc1-2 1542 1 61.82 CGGCGTGTTGTTGGTATATGCCACGAACTCCGACGATATTTTGAATTTAACAATTTTTCTTCCTCAATTCCAGCTTTTGAGTGCTTGCGGACAGTCTGACGCCAAAAACT:1 - chr3L 14616131 3' + accord2 301 1 50.91 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATCAGATAAGATAAGATAAGATGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAG:1 + chr3L 18417066 3' + Stalker3T 205 1 73.64 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAACAGTGCTCCCACTTCCCCTTTCCGGTTTTAAACAACCCTCCCAATAATAAATCTGCGTGAACC:1 - chr2R 19684439 3' + 412 7522 2 60.91 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTAGATGGTTTTAAATTTCCTTCA:1 + chr2L 21034149 3' - 412 10 2 71.03 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGGTTTTGCACATCAAATAACACAACTGTGCATAGCTT:1 + chr2R 23354344 3' + Tabor 437 2 65.14 AGCAGCAATAATATTGTTCAAAAAGGAAAACGAAAAGAAAACAGAGCGCTGCAAGTTGAAACCAAAATAATGCGGTTTTGTGGCCAAAAATCA:1 - chr2L 17031131 3' + invader2 480 1 75.27 TATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 10 1 62.22 ATATCGGGAGAGCTTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGAAAAGGTAAAATAAAAGTCCGATATTCAAAAAAAAA:1 + chr2R 7340477 3' - 297 6785 2 56.00 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCGCCCTCGCTGCCAACA:1 + chr3R 5910769 3' + roo 403 1 71.91 GCTCGGGATTCCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGAGTGAGAGGACTAGGCGAATTTGCATATGTAATACAAAAACGTT:1 + chr3R 29363890 3' + G2 2795 1 54.65 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCAT:1 + chr2L 9754861 3' - 1360 41 1 59.09 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAAAGGACTTGTGTTTTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGCCTGACTGCTTAATGACATTGTACGTGG:1 + chr3L 5720764 3' + 412 7492 2 66.97 GATAAGATAAGATATGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAATTCAAAATATGAAGACGGCTCGATA:1 + chr2L 21843584 3' + Stalker3T 205 1 70.00 GACAAGGAGCGGAGAAGTTGGAAGGAGCGGAGGACCTTCAGGATCATCAAGTCTTAAAACTCCCCACAAAGGAAAGGGGAAAGGGGCATAAACGTGGCTA:1 - chr2R 7775012 3' + gypsy8 4558 1 68.00 AATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTCGTATTCATAATATAGGTTCCTTCTTGGGTTTTATCATTTACTTTCTTGTAACACTCATCTCT:1 + chr3L 9145891 3' - 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INE-1 151 1 63.64 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGGCTGCAGC:1 + chr3L 15968233 3' - P-element 32 1 39.77 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACTACCGACTCTTACCCATAAAATATGCAAATAAGTGTGTGAATGCAGTTCAAACTTTACTTTTC:1 - chr2R 13934400 3' - FB 21 1 62.73 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATCAACAAGAAAAATGACAAAATCAAAACGAAAAACGTT:1 + chrX 17330167 3' - opus 7158 4 67.29 GTCAAATAATAAAAAAAACAAAAAACATACCCGCTGGCCCTTCCAA:1 - chrY 2720404 3' + Rt1b 5145 1 89.13 ATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAG:1 + chrX 21667918 3' - gypsy2 52 2 67.27 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAAACTCTGAGAGAATCCAAGAGCGATTGCCGCC:1 - chr2L 17751195 3' - jockey 57 1 67.62 CAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCATTCACAGCTTTCCAGCAAAATTTGCATTATTTTATTTTTTTTT:1 - chrX 20014893 3' - P-element 231 1 22.22 GGGTAGATTAGTCCCATATGCTACACTACGTTCGGCAGCAACAGTTATTTGCCACGCTGTTGCG:1 + chr2L 22497827 3' - Stalker4 6960 4 59.38 GGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCAGCCAATTGATAATGTTGACCAACAGAGATGACCTCAACGGA:1 - chr3L 6872882 3' - I-element 5094 1 58.59 GTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCAGATCAAGAATTGCGGAAGCAGACAATTCCAACTAGAGCGTGTGACTGCTGCGTGGATTTGCATACTGCG:1 + chr3L 21810115 3' - HMS-Beagle 6742 1 68.63 ATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATA:1 - chr3R 31045707 3' - INE-1 83 1 71.74 TCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTGGCAGCAACAACAACTGCAGATCCGGACGCTTGAAATAAATCTAGCAGATACTTTGTGT:1 + chr3R 21858769 3' + Tirant 8483 2 56.36 GAAAACTCACTCTAATAATATCCATCAGCATTAAAAAAATTTCCACGCCCGCAGATTATAATTTTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Gypsy12A_LTR 359 1 70.00 ACATATACTTACACACACACACATGCATAACCACATAAGAACAGCCTTTCTTCATTTTGCCTTATTTCACTTTCTTTTTTCCTAACCATTTGATTAAAGCGAAAGGATAT:1 - chrX 17801922 3' + Quasimodo 29 2 62.73 TCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGGCGTATTAGCTGGACGCTACAGAAGT:1 - 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chr2L 17103523 3' - 412 3 2 61.36 GAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAA:1 + chr2L 23295865 3' - micropia 4993 2 58.72 ATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGGTATCAAGAGTGTTTATGCAATACG:1 - chr2L 10750119 3' - X-element 4539 1 62.69 GCAAAAGGCAAAGAATCTCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGGAAACAAATCCCCAACCAAGCTCTAACCTCCGCCACCGAGCTA:1 - chr3R 19561116 3' + Bica 473 1 56.98 TGAACTTAACCTAATGTGTGTACAGGTGCCGTTCTCGCGGGGATCGGGTGGATAAGTGTCGGTGTTCGGGTGGCTAACTTCCTATGTGGCTGGG:1 - chr3R 29733757 3' - G5 4775 1 80.85 TCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCA:1 - chr2R 6984343 3' - HMS-Beagle2 60 2 78.18 TACAAAAGCCGAATGGTACATTATTAAATAAAACTTAAGAAACATTAAAAAACCATTTTCGTATACCCGCTGAGTAGCAAAACAAAAGTG:1 + chr3R 26236534 3' + Porto1 4358 1 78.89 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATGGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGGCTCTCACATGCATGTTATAGAGTAATCG:1 - chr2R 1373049 3' + blood 7354 2 65.56 CACCCGAAGACTGTGGAATGCTCTCTCCCCAAAAAAAATCTATATAGCAATGAAGTTTGTAACGAGTTAACCGAGTAGATGATATTTGCACCTAGAATTAATCCATTAAG:1 - chr3R 14995635 3' - Doc 8 1 65.45 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCAAACTGGCTAAAGCCGTTTCAGGG:1 - chr3R 26817613 3' - Tirant 70 2 63.08 TCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACGAACCCGTTTCAATAATTGC:1 - chrX 18700693 3' + Ivk 4973 1 76.47 CGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTCATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATC:1 - chr2L 8959914 3' - Ivk 5117 1 48.18 CCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATTAATTGCCTTCTCGCTACCTCCGTGAGCTTTGTATATTT:1 + chr2R 4242435 3' + I-element 4873 1 61.00 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTCATATATAAAATTCGTGCTGCCGAGGCAG:1 + chr2L 4674770 3' - I-element 37 1 73.12 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGCGTTTCTAGCGGGCACTCCA:1 - chr3R 23943209 3' + P-element 2825 1 25.69 GTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTC:1 + chr3L 15253229 3' - Penelope 652 1 27.27 AATCAAAAAATGTTCCTAGAAATTGTAAATCTTAAACCTACTTCTCTAACTAAAGCGCGCACACACGTTCATATCACACATGCTGCCTTCTGACATGGTTCCGGCT:1 + chr3L 10830400 3' + TART-B 10345 1 50.00 ATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGGAAATAAAGAATACAAAATCAGTAC:1 + chr2R 5485472 3' + HeT-A 6003 2 80.65 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGC:1 + chr2R 12416919 3' - pogo 56 1 77.27 GGTGCAGGGCTTGCTGATAGGGGTGCCCGTGTGTTTGGCGCTATGAAGGGAGCAGTTGATGGTGGTCTAAACATACCTCACTCTGTGAAACGCTTTCCTGGATA:1 - chr2L 22535774 3' - G2 15 1 79.81 ACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAAGAACCAAAGATTAAAGTTAAATAAAAATCAGCGAAAATTCTGCTTTCAATGCAGCATGGCATATGGTACGATA:1 - chr3R 17369310 3' + HeT-A 238 1 53.33 GTTCATTTTCTATATTAATATTTATTAAGATTATTAAGCACAATGATGATATATTGGGGAATATTAAATTCAAGGACATGCATCTACAGTTAAGTCTATTTGGTTGCGTG:1 - chr3L 3748119 3' + hopper2 23 1 60.91 CACCTCTAGAGCCACTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCCTCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTT:1 + chrY 311341 3' - 1360 58 1 72.62 CAATGGCGCGCAAAACTGCCGCAATGTAATTCAAAAATGAAAAAAAAACAAAGAAAAGAAAAGGGGGGAAAA:1 + chr3R 18837022 3' + TART-A 13211 1 54.17 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACCAAAACAAATGGGATCTGAAAAGTAACACTGCTCTATTTGGTGGAATAATAGATACTCTTTGAAATATGTAGAAATATTT:1 - chr2L 19808467 3' - copia 4873 2 77.27 GGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCA:1 + chr2R 12185417 3' - accord 21 2 56.19 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTATCAAACAAAACGTTGCGTGGGTGTGTGCGAGAGTGTTGAGCAAGTGAG:1 + chrX 12271564 3' + pogo 2087 1 63.21 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGTCCAAATTAATATATAGCACGAAATATTATAAAAGCTAATGAACAAATATGATAATTA:1 + chr3L 8011471 3' - pogo 27 1 56.36 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGCGAGGGAATCACGGAGAGCGTGGGCAGTGTAGAATTTAATGCC:1 - chr3R 13732953 3' - hopper 25 1 50.52 ACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCACCACCACCCACTCCCCTTTTTGCCATTCCCACAGCT:1 - chr3L 14591199 3' + F-element 4418 1 65.22 GGGATATGATCGTATGCTTTTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGTTTGGTTA:1 + chr3R 22500850 3' - invader3 5239 2 72.62 AGGTCTTGAACCTATTATGGTTATATTCCCGGAAGAGCTCGTGCGATTTCCCTCCACTTGCGATCATTTTCTTCCCTTTTGAGGTCCTCCTCTTCCAGTTGATTCTTGAG:1 + chr2L 13372382 3' - baggins 5074 1 71.82 ATTATAATTAATAATATTATTAATTAAGTAATTAATTAATTAAATTCTATATTTCTATATTGTATTCATACCATATCGACCTCTGATATTGGGCCCATGCTGCG:1 - chr3L 17831157 3' - mdg1 7080 2 50.96 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATTCCATTTTTTTATATTATTGAATGTAATTCAATATTTTGCCTTTGGGTA:1 + chrX 23283044 3' - HMS-Beagle 32 2 53.64 ATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGCGTGAACGCAGCGCCAGATCGATCCGCACGAGGTCCCGAAATC:1 + chr3R 8477589 3' + invader4 22 2 60.91 AAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 70.00 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGCGTCAGATTGACCGCATCTGCTAGAGGTGGACAATTGACGATAGGTCGATAGCTTTC:1 + chr3R 24814028 3' - P-element 6 2 70.00 GAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGTGCTGTTGCTCCTTCTCCTGCTCCTGCCGTTCTAATAACGTGCTCAGCCAGGTGGAGTTGCACG:1 + chr2R 7740284 3' - I-element 4978 1 74.73 CACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTGCACTCCAGGTATAATTGTAGGGCACGGCGCGACCGGCTAGCTTTGCGGCTT:1 + chr3L 22956724 3' + Ivk 4961 1 62.22 AGGTCTAGAGGGTTGGTGATGTTGAATATGTCTTGTTTGGCTGGCAGGAGGGCTGGGGAAAAAACC:1 - chr3L 17690266 3' - I-element 5095 1 77.27 CTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCCATTTTTTTTTCTCTCCATGTATGTGTGGGTCCTTTGTGCTTCCTTTTT:1 + chrX 9847960 3' - micropia 5288 1 46.99 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGGCTGCAGCTGGTTTAACTGGAAACATT:1 + chr3L 15968252 3' - P-element 17 1 58.70 AATATAATTCGTAGGCCATAGACACGACATCCATAAAAACGCAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACA:1 - chr3R 19449443 3' + gypsy7 5432 2 60.19 CGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATATCGGTTGTGGTAGATTCATCTGTGGTGGAATCATTAGTCTTTGAATG:1 - chr3R 12311665 3' + McClintock 6414 2 58.51 GCATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAAATTAAAAAGAATGCAGCGAAGAGAAAATATTTAAAAAGTTAATGGCAATGAAAGCCAGCAAATAGGGCAAAACAAATGCG:1 - chr3L 15698576 3' - hopper2 1413 1 68.18 TGTAGCGAAAAGGTATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCAAACGCCATGAGCTAGCGCCGGAATTCATTTGACAAGTTCGTCAGAAAGGTGGCCTCATAACTTTGCCAG:1 - chr2L 10894408 3' + Gypsy12A_LTR 2149 1 57.27 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCCATAAAGTTGCCAAATATTTACATAAAATTCCAATATA:1 + chr3L 19948937 3' - 3S18 21 2 61.82 GGAAGATGTGTGTACCGATCGAGCATAGGCAGCGCAATATGAAGAAGACCTGAACCCTCGG:1 - chr3R 20378059 3' + Osvaldo 455 1 57.38 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTCAGTTGAACTGCAGACACATTGACGACCC:1 - chrX 18483161 3' + pogo 2072 1 63.64 ATTGGATAAGGAGTAGAAAGTAAATTTTTATAATTGTACATACAAGGAGAAAAAACACAACATAGAAGCGATTTTGGTAAGGTTATGAAT:1 - chr3R 4552264 3' + invader2 4711 1 66.67 CTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - I-element 5207 1 27.27 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACCACGTTTTAAAAAGCGTGGGTCTTCATTCAACTTAAC:1 + chr3L 13024061 3' - 412 46 2 65.45 AGAGGCTTCTCCTCATTTTCCCTTTGTTTAATGTTATCTGTAGTTGATCACTCAC:1 + chr3R 10756054 3' + 17.6 313 2 69.09 AACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTAAAAAAAATACCAATCCCAATGAGGAGAACCTAAATTTTTAATTTAAAATAAACAGTGTGTATTA:1 - chr3R 6589544 3' + I-element 176 1 80.91 TTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAA:1 + chr2R 12185430 3' - accord 13 2 65.45 AATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCCACTCCACACCACTGCTCCGCCTCCAGGCAATTATGCGA:1 + chr3L 1482383 3' + Idefix 146 2 60.20 GCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGCATTTTAAGGCTCCTCTGGGACGAAAAACATAATGTGCGAGGGCATTATTAATGAATTTATTTTTTCGTAAACGCATCCAATAT:1 - chr3R 31633105 3' + opus 497 2 74.07 CAACGCACAATATTTGCACACTTCAACTTCTTTTTGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGTTCCAAAGT:1 + chr2R 5198474 3' - Bari1 1682 1 65.38 TTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCG:1 - chrX 17193333 3' - F-element 181 1 63.54 AGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGACAACTAATCCGAGTATGCAGGCAATTTGCGGCTATTAGACGCATACTTCAC:1 + chr2L 5352364 3' + Doc 4470 1 65.26 GAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTTAATTAATAAGTTGTTTGTCGACTGGAAGAGGTTTTT:1 + chr2R 5075720 3' - Stalker2 7 2 44.12 TGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAAATCATCGTTCCAATCTACAGAGAAGCCCACCCCCAGGGGCAAGTTGAGGGG:1 + chrX 5980959 3' + copia 153 2 64.77 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTGAAAGCGTATTCTTTGCAGCAACTTAAAAACAATGATAGTAACAAAATA:1 + chr3L 21403651 3' + roo 9037 1 55.45 GTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGCCGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACAAAATAAGAAAAAGACGAGGCACTCTTCCACTAATTGTT:1 + chr2L 12227737 3' + I-element 496 1 65.00 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTGTGTTCCGGGGACAGCAGCCATTTTGTTTGGCTGAT:1 - chrX 21183312 3' + S-element 1713 2 64.18 GTACCTGAAAAGAAACAAATTAAGCAACATCAGTCCTAAATTTCAATGTTTTTCTGTAAAATAATTTAAATTGTTAAAACTCGTTTCTGCCTTTGCCCATTATACCGTCT:1 + chr2L 10893197 3' + HeT-A 5756 1 70.91 GAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTG:1 - chr2R 6984321 3' - HMS-Beagle2 20 2 55.43 TGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Stalker4 42 4 63.64 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAGATTGTGGCCAAAACAGTGAGAGT:1 - chr3R 9435788 3' + roo 402 1 74.55 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTACACAAGTCCGCTCTACGTTCACATTTTTCTTTTTAATAGGAAA:1 - chr3L 14822850 3' + mdg1 376 2 63.89 AGAATATACACAGAGACTTGCAAATAAAACTTGTCATTGAGGGAATGGCAGCGCAAAGGAGTTTTGTGGAAAGCTGCTTATGGAGAAATAA:1 - chr2L 5628611 3' + Doc3-element 4439 1 54.95 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCAAGAATCTTCAAATCTTTCGGAAGACTTGACTATGGACACGTTCACAAC:1 + chrX 14853457 3' + P-element 2885 2 71.25 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGCAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCG:1 - chr3L 25455135 3' - HMS-Beagle2 58 2 76.15 GAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTCTTCTTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCTTTTTATAGATCCCTGCTCAATGG:1 + chr2R 8191598 3' + Bari1 213 1 79.09 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTAAAATTATGCCACATCAATGCTGAAACGTGTCCAAAAAGTATGCTATTATTTTGTAATCAATTTCACTGCATACCTTTGCA:1 + chr2R 13346005 3' - jockey 11 1 68.18 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTGGTTATTTCTTCTACTTGACTGGCACGCAGATGTGGGCCAGCGTTCCAGCCATAAGGCATTAGC:1 - chr3L 16301053 3' - mdg1 7060 2 57.27 GCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGGGGCTGTGTGGCATGGTGTGAGGGAAAGTTGTGGCAG:1 + chr2R 13952936 3' - Doc 4523 1 59.34 TTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGGGGAAAAACATGGGACAAGTCATGCTATTCCAACTATTT:1 + chr3L 21911822 3' - Doc 4606 1 64.22 GAGGGGACAGTTTTAAGTGGATGTGTATTCTAAAAGTTATTTGTGGTTGTTTTTTGTTTTTTTTCGTTGGGCTGTCAGGAGCAG:1 + chr2L 8572164 3' - TART-C 10751 1 55.95 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCAATCAATTCAGATTATGGATTTGGATAATGACGAAACATGTTGGGGATGCAAGAAGAAATTAAT:1 + chr3L 14261381 3' + mdg1 7445 2 63.11 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATA:1 - chr2R 20924233 3' + mdg1 7399 2 82.73 ACTTTTATAATTGGCGCCCAACGTAGTCGACTCACAGCAGCATGGGGAGTAGG:1 + chr2R 7230563 3' + gypsy 471 1 66.04 TTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCGTTAAGCCTATTTTAATTGAACATTTCAAGTTTCCGGCGAAGCATATTCCTAGGGGGAACCAAATCTTAGGTTACAAACC:1 - chr3R 16691923 3' - R2-element 3461 1 76.36 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - Tabor 14 2 38.10 AAAATATTTATTATTTATTAGGTAATTTTGTTGTTTTATAATATATTAAGATATCATATTGTATGTTATTTTTGGATATTCTTTTATGATTTTTACCACATTGCTATGAT:1 - chr3L 11480118 3' - Juan 4057 1 27.27 TAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAACCACAAATATACCGAACGAAATGCGCCAGTCGAATGCCACTTT:1 + chr2R 18236315 3' + Stalker4 51 4 61.11 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAAAAAACTTTTAGAACTGCAACGCCTTAGGTTCGAAGAATGACATTTACTTTATTATGCCAGCCAACAGT:1 + chr2R 10015735 3' + Juan 4195 1 54.55 GTCTTTACATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCACTTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAA:1 - chr3R 12623713 3' - roo 8676 2 53.33 CGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGAGCGACTGTAAAATCACCATTGTTTTGCGAACAGAGTGCGTTTCGCTTTGCATAAATGCATTTTACACGCGTTTAATT:1 + chr2L 5226734 3' + F-element 236 1 80.00 TTTAGGCTCAAGGCCTTCGTCATCTCGCTCCCAGCCAGCTAGTCCCAAATGTGAAAAGAGCAGTCGGCAATATTGGAACGGCATCTCTGTGCGGGTTGG:1 - chr3R 26975264 3' + G3 250 1 73.74 CACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCAAGAATCTTCAAATCTTTCGGAAGACTTGACTATGGACACGTTCACAA:1 + chrX 14853456 3' - P-element 1 2 71.79 GGGAAGTAAAGAGTAACACAAACCAAAATTGGTTAAGATAGGTCATCATTTCGAATTTCTGCCAAAAAAAACACATAAAAAATCGTGCGCAAATGCTAATTTTCATATTG:1 - chr3R 20967996 3' + transib1 2077 1 72.73 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCT:1 + chr2R 19405939 3' + HMS-Beagle 7009 2 80.00 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTTTATTATGACTCAATAAAACTTTAATAGACAAGCCAGCACTTATAAGAACAATGCGTGCTAAACTGTTTATTATGGCA:1 - chrX 3528536 3' - roo 8672 2 72.73 ACACCTTATGGAAGAATATTTCAATAGATTATATCCACAAGAGCACATACCAATACCAATAAATCAGTGTGCAAGAACTGACCAAATACAAGAAACGAAA:1 + chr2R 21589647 3' + Tc1-2 1269 1 64.00 CCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCTATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTTCCCCTTCCACTTTCTAGTCATTCTTCTCCTTTCTCC:1 + chr3L 17674827 3' - accord 477 2 68.81 CTCCGTATAAAATCGGTTGTTTTTTTTACCTTATTCATTCTAAATTTGTGTAACTTATACATATTTACAAGACCGCGCAGGCAAGTCA:1 - chr2L 22065253 3' + Doc2-element 42 1 81.82 TACCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - G4 3641 1 35.79 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAAAATAATTCAAGACGTCAGCCAGTCGATGAGTCACCCAGTTTAGCATTAGTGCA:1 + chr3L 9822332 3' - pogo 1 1 80.58 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTAAAGGAAGGCAAATGGAGCGTTGAAGGATAACTAAAATAGCTTAAGGGTTATTCTTGGCTATCAAATAA:1 - chr3R 16194486 3' + flea 5008 2 75.24 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGCACATATGCTAGTTTCTTTTTGCAGCTGCAATATTTTGCATTAATTAGAAAGTGGGCCATGTTC:1 + chr2R 14588930 3' - jockey 4758 1 75.58 ATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGCCGCCCAAACGGTAAGAAAAAGTCAATTTACCCTATCCCTTTGGGAGAAAGTGCACA:1 + chr3R 31154425 3' + Burdock 6360 2 57.27 GGAAAGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAACAGAGACATTCAGAAATGAAGGGGGAACTAAACCCCTGGCGCCTTGCAT:1 - chr2L 1438108 3' + Cr1a 4436 1 62.35 TGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATTATATTATATTATATTATATTACATTATATTATATAATATTATATTATATTATAT:1 - chrX 4545004 3' - 1731 4343 2 56.36 CTATCATATTTGCTGTGGAGACGACCTTCTACGATCGGTTCCAGTACTTCGTCAAGAATATTATGCCCCACTTCAGAAAGCCCGGTTTCTCGCACTGCATGCTATACGTG:1 - chr2R 23937894 3' - R2-element 3242 1 80.91 AGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACTTGTGTACATACATACATATGTACCCAGTACATAACAAGTGATGACACACT:1 + chr2R 9552370 3' - S-element 31 2 60.91 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATAGATATGGACAGATACGTGACCAGAGAAACAAGA:1 - chr3R 15198071 3' - blood 164 2 73.21 AATAAAAAAAAATATGTAAATATATATCCACAGAACATAAGATTGCGAAGATATTATTTTAAATCCAAACCAAATAGTTAT:1 + chr3L 16749975 3' + Transib5 26 2 64.20 CTCCAGTTAATATCGAAGTGTAAGTGCAAAAAAAAAGAATGACAGCAGCATCGGCTAAATGGG:1 - chrX 19550288 3' + Porto1 41 1 61.90 AAAGTCTTCTTATTTGATATTTTACGAACTGCAAGTTGATTTGTTTTGATGTGTATAAACAACCGAAAACCTCTCTGCCTGGCA:1 - chr2L 20398939 3' + roo 404 1 80.95 AATACGTACGTGAAATTTCAAGTAAATCGGACCACGACCACCCATACCGCCCATATTAGGATAATAACAAGGACTGCCTCTTAAAATATAAA:1 + chr3L 1282424 3' - transib3 2769 1 68.48 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCAAGTTTGGAAGGAAGCTATATATTTTCAAG:1 + chr2R 8397519 3' - 412 7068 2 65.05 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGCCGAAAAGAACGTGTGCAAAAAAATCGTATTGCATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTTTTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - 1360 65 1 50.96 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAATAACAGGTATGGTCGATATTAACTTAATTAGAGTA:1 + chr2L 12036173 3' + 297 353 2 69.09 AGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCCTTTTTTATATAGCATGATGTGGCTC:1 - chr3R 4066061 3' - S-element 1506 1 79.05 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAAATTGGCTTTCGCAAATTTCCATTATGCACTTAT:1 - chr3L 13160657 3' - pogo 47 1 71.82 TGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTGTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCAATAGAAGTTTTAATTGAAGTCCAATTTAAATAATAGTTAATTAATACTATATTA:1 + chr3L 20750150 3' - 17.6 7415 2 53.70 AACGATAAATACTAATAATGATAAATGTAAACATAATTCATTTTGTAAGATAAGTTTTATTGAGAAACTCTTTTTTTTTAATTTAT:1 - chr2R 19075832 3' - FB 366 1 81.40 TTGTTTTTTGTTTTTTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATT:1 + chr2L 9723026 3' - Porto1 163 1 43.01 CGGATTTTCTTTCAACATCAACAATCAACATCAATACAATAACAAATATTAATTAATAAAAAAAAAGACAATAACAATAAAAATTAATTCAAAGGCAACATTCACAATGA:1 + chr2L 7293358 3' + gypsy7 314 1 58.18 AGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATATTTTTTTTTGTGTATTTTGCATTCATTTC:1 + chrX 17877721 3' - roo 9037 1 72.73 ATACATAATGACTTAAACATACAAACAGTCAAGGAAACTATTAAAAAAAAGCAGCAAAATTGTTTGGATAATTTCCGAAAATTGCTAGAAATAAAACCGTAATGCTTTCC:1 - chrX 4311279 3' + Porto1 4392 1 56.36 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAGATTGTGTGCCGGTGACA:1 - chr2R 12839080 3' - jockey 4790 1 73.97 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGC:1 + chr2R 330205 3' - HMS-Beagle2 6919 2 58.18 TCTACCCGCGATAGGGGTACCAACCACAGCCAAACCACGTGAAACTCATCTCCACGCCACTGCCCTCCGCCGATGATGTTTTTGTAAACGCTGCGTCGGTA:1 + chr2R 9932075 3' - R1A1-element 5017 1 71.29 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACCGGCTTTTACTTTTGCGCGCTCTGCACATTCTGCAGCA:1 + chr3L 14755066 3' + P-element 2846 1 40.38 CAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAGTGCGGCATCAAATTTCCAATATTAT:1 - chr2L 17646143 3' + Bari1 71 1 55.96 CTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAAACTCTGTACAGTCAGTCTTAAGCCATAGAAAATTATTGAATTATGTGTACATCTTTAAGAT:1 + chrX 14117653 3' + rover 7122 2 66.06 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACACGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGTA:1 - chr2R 10090997 3' + roo 405 1 69.32 TTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTGCGAACGAACAGTAATGAGTTAAAGAATGAAAATTTACGCAAATGTGCAATAGGGGACGGCG:1 - chr2L 7419958 3' - I-element 5147 1 59.09 AACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCGAATGTTTAAATAT:1 - chr2R 8397416 3' + 412 7531 2 50.91 TGTGAACAATATAAACAAAAGAAACTAGTGAAAACAATAAACAAAACGAAAATATACACGTAAACCGAAAGCCAAACA:1 - chr2L 19140706 3' + Porto1 153 1 67.95 ACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTCGTTACTTTTTCAACGCGCTG:1 + chr3R 22050813 3' + transib2 2725 1 79.00 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCTGTCAGGAAGGAAATATTTTGCCCTCCCATCTTATTTTTCTGCCCTTCGCCG:1 + chr2L 13558246 3' - FB 21 1 56.70 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGACGATGACTAAGATGATGATTAG:1 + chr2R 15801127 3' + roo 345 2 80.00 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTCTGTACAAGTACAAGTACAATATTACAATAATAATTATCATGAATAATGTTGTAATTGTTATTATTTGAAAGATATAAT:1 - chr2R 883055 3' - F-element 20 1 60.91 AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:2 + chr3L 22908066 3' + Tabor 428 2 71.82 ATTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTTTTGGTGTTTTTTTTTGTCCAGCCCAGGTTTATTTGTAGGATTTTATTTATTTATTGTCTAATTTAT:1 + chr3L 11129177 3' - G4 98 1 62.37 CATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTATCTACGCAGCGAAAGCATCCAAATCACCCAAACCAGCCCCTCATCAT:1 + chr3L 7432162 3' + Doc2-element 4407 1 76.36 GATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGTTCCCTCATC:1 + chr3R 12040196 3' + HMS-Beagle 187 2 75.45 TCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCATATGCT:1 + chr3R 12040205 3' + HMS-Beagle 196 2 67.27 AACTATAACCACCAGTTGTGAAAATCTTTCCCAGAATTGAGACGGTCTCTGCAAATTAAATTATTTAATTTAGTTAAATGAAACGACATGCACGCCTGCCGTGAACCAT:1 - chr2L 25617 3' + S-element 446 1 75.23 ATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTGACTATTGTTTCCAATCTGGTTTTGCAGGTGGCTAAATTCGCATCGT:1 - chr2L 2214474 3' - 17.6 7121 2 56.99 ATATATGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - blood 7008 1 19.09 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACGATTGAGTAATCATAATTACGCTATAAATAATCCGCTCGTTCAGGAACTGATTGAGTAGAAAA:2 - chr2R 11273969 3' - Stalker2 10 2 66.33 TGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGACATCATGGGCACCATGGCCATTGGTTGGACAGACGACGATGG:1 + chr3L 12259091 3' + F-element 4344 1 79.71 TTTAAGCTTCAGTTTGAATTTGCATATGTCTGAATAAAAAGGGACAGCTCATCAACTCCGGCAGCAGCAATATGCGATCTCTACTAACCCCCA:1 - chr3L 4128376 3' + Gypsy6A_LTR 156 1 64.52 AATTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCATTTAGTTAGTGTTTGCCTGGGGTGTGCCGGCCGTATTATCTGCCCTTTTGATTGTCT:1 + chr3L 17627895 3' - Bica 146 1 60.87 AAATTTGGGTGGGATTGTTTGAGGTAATCGCACGTGTGTTACACATTCTGTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - I-element 4894 1 49.09 AGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACACACATCGTCTAATCTCCAAGAGTGAGTGGATTGAAGCAGGATGGACTGGGGAATTGGCAAAAGGAGGGAG:1 + chr3L 7036456 3' - Quasimodo 7185 2 75.00 CTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAATCTATTATGATAAATCAGCGAAATTTGCGGTTACGGTGGATTCGCGACAAACAAAATAACGGAAAA:1 + chr2R 11637505 3' + gypsy9 5040 2 58.00 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGCTGATTTCGGAATTAGTTCGGTTAACAGCCCCACCGATTTTGGAAAATCTACTTCGGC:1 + chrX 3528652 3' + roo 393 1 62.63 AGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATAATGCATGAACTTGTCTCTCGACAAAAGCCTTTTAAATGATGCGAGGGGGCAGGGGGTGG:1 - chr3L 412224 3' - Cr1a 4365 1 60.91 TAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAAATAAAAAACTAAAAAAAAATAAAAATAAAAGTGAACAAAATCATGCAAAGAGCGTAAT:1 - chr3R 9619369 3' - Tc1 1444 1 66.04 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAACTTTAACAGCTTGTCAAATAAACATTTACATACACGAGAACACACATTTTCAT:1 - chr2L 3225198 3' + mdg1 7409 2 52.73 ATAACTTGCCGTTAAAATTCTTTTGAAGTGGTTTCCAAGTTATATTCCACGAAACGAAGTTCGAGTCCAAGTCGAACTTTATCCATATAATGAATAAAC:1 - chr3L 20649329 3' - transib1 442 1 55.56 GAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGCCGGAGAACTCATTAAATTAGCCACGCGCGAATCACAAAATGA:1 - chr3L 8901402 3' + Doc 4478 1 56.57 TGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTTCTCCAGATGTTGTTGTAGTTGTTATAGCTCTTGTG:1 + chr3L 956815 3' - F-element 446 1 64.62 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATCGTAGGCTTGTCCTCCGAGAAACCTCATGGTGG:1 - chr2R 4137535 3' - HMS-Beagle2 6914 2 64.13 GAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACATTCATTTCTGCGCCAATAACCGCGTACAATAACAATAAGGCAA:1 + chr3R 14296663 3' + baggins 5391 1 52.22 GGAGGAGTTTTAGGTTTTTCCTAAGTTTGGACCTTTTCCTGATGAGCCTGTGGACCGCAGTTGTGCACTTGCAGC:1 + chr2L 10672229 3' - G-element 3863 1 64.00 AAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTGGTTTAGTTTTTACTTT:1 - chr2R 330096 3' + HMS-Beagle2 7188 2 74.55 AGGGGGAAACTGCAGAGTCGAGGGTCCTTCTACCTTGACAACGAATCATCATCTTAGT:1 - chr2R 15801132 3' - roo 450 1 74.14 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATGTTGTTGATGGCTTTGCCCACAAAATGCCGTGGGGATTAAGGTGTGG:1 - chrX 22769342 3' - 412 38 2 58.18 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCATTTCGGAAGGGTAAAAGCTACTGGTTTGTTTACCTGAAAATGGAATACCCTACTAAGTGCTAACATTTCTGTTTTATTG:1 + chr2R 22663437 3' - mdg1 7044 2 73.64 AAAAAAAAAAACATTCAAATTGAACTATTATTTGTTTAAAGTTTTTTATGATTGACATTTTTTGTGTGGTTTGCTCTACTTGCATATTTATTGCTCGTTCTCGTCATTA:1 - chr2L 9500675 3' - Tc1 1465 1 87.16 GATTCAGACGGAACAGACGCTCTGAACTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTGGCATTTCCAGCGGTTGGTGAGATTCTTCGGCGTTA:1 - chr3L 23236516 3' + Stalker2 353 2 64.55 TGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCAAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATGATTATACTTT:1 - chr3R 15697035 3' - 3S18 5802 2 53.21 CAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACGAGTTACATTTGACTTTGGCTTTGGGTTTGGCTTTGGCCCACTTCCGTCAGCTAATCTCCTTCC:1 + chr3R 18204696 3' - invader1 3828 2 64.55 TTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATTTTATCTTAT:1 + chr2R 5064834 3' - Stalker3T 203 1 76.15 AGTAAATAAAATGAAATAAAATTAATTGATGAAAATGTGCCAAAAACGCAGAAAAAATACAAAAAAATACAAATAAATGAAAACAAAACATAGAAAAAAGTTCACAATCA:1 + chr2R 21794691 3' - transib1 1900 1 73.64 GGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCATTTAGTTGTCAATGTTCTTTAATCTTATTTAGAGCTAAGAGCAGAAG:1 - chr3L 10293053 3' + Burdock 6130 1 56.36 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCACGCGGCG:1 + chr3L 131836 3' + P-element 2870 1 68.18 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACACGAAAACTTTTATTGTTTTCTTAAAGCCATTGTGGCATTT:1 + chr2R 8530841 3' + mdg1 401 2 44.55 TAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGTACCTTTTCCCCAGCCAAAGCAAGGAGACGATTACCCCAAGCCGGAAGT:1 - chr3L 4487096 3' + Idefix 226 2 51.65 TTTCTTTTGTTTTTTTTTAATAAAGTTTTTTTTTTGGGAATCCTTAAATTTGCGTAAATATACTGCACTTATCGCCGGACTCTAAATTTGTT:1 + chrX 17858459 3' + hopper 153 1 89.13 GTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCA:1 - chr3R 25051584 3' + 17.6 463 2 61.00 TTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATTAAGAGTAAAATAAGACAAAGAGAAGGCAGAATTTTTTTTGTGAATCGCCACCTAACGATCAAGCCTATTCTTGCAGAAATAC:1 - chr3R 22541823 3' + Doc 4667 1 78.18 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTTTGCGTTTATGGATTTTTAATGGCAGA:1 - 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transib2 329 1 54.55 GCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATTGCCTGGTTGATCTAAATCATTTTTCCGCCTTTTCCCATTTGCTGCAG:1 - chr3L 5488463 3' - 1360 486 1 56.12 ATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGA:1 + chr2R 6984430 3' + HMS-Beagle2 309 2 75.96 CTTCCACAGCAGCCGATATGCCAACAGACTTAGCGCCCACTCGAACACAACAACGCGAACAAAAATTAAGAAACCAAAACGGAATCGGTAATA:1 - chr2L 9907681 3' + G5A 2595 1 55.91 TAGACAGTTCTACGCGAAATTTGATATATTTCAGCTATTTTGGCCGCAGGTGCAAAACCGGAACACATAAAGCG:1 + chr2R 22784562 3' - Bari1 476 1 70.27 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACAGATTATTTTTTACCAAAAAACCCAAAATAAATAAATTGCAGAAAAGTGATATTTTTCATGGCCAAAAAGGTTACTTTTA:1 - chrX 11040457 3' - blood 7018 2 74.55 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTAAAATTACCCCCGCTTTTAAATCAACTAATATGTTTATTCAATCTAATTTCTCTCGGGACATTAT:1 + chr3R 17777682 3' + Burdock 6377 2 67.89 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAA:1 - chr2R 9963490 3' - pogo 34 1 59.80 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCGTGCTTTACTGCCATTTATAT:1 + chrX 8326751 3' - jockey 4695 1 67.61 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGCTAAATATTTTTATTCATAGTATTTGGTTTTAAAGTTGCTTATATTATAACTACATCTTGAGCTTGTTTTT:1 + chr2L 17263235 3' + Transpac 5222 2 72.73 GTGGAAAGTGTTGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGACTTCGCTTAGCTAACGAATACTCTTTTTACATTCCTTAGTTATTAGATATGTTTT:1 - chr2L 7445411 3' - Quasimodo 366 2 59.26 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - 412 47 2 70.30 GACGTCTTGCAAGAAGACTGCTATAACTCAGTAATCCCCGCCATAAGTACGATTCATTGAGACATCAATTGAGCACTTTCCAAGTAAAACCGAAACAGATCGCATAACA:1 + chr2L 12025097 3' - Helena 1276 1 69.72 TACCTCTCATTCACACACATATCAAACTACACAACTTGGATATCTACGCCTTGGTGCTTGCGATCCTGATATTCTTAGTTTTCCTAACCCGGCTAACTGTGAAATTTTTG:1 - chr2R 16843484 3' + Porto1 277 1 76.36 ACACGAGGACGTGTGATAGGTCAGGATGGCCGTGTCGCAGATCATTTAAATGAGTATTGTGGGCGAAAGTTGTAGTTGTATTTTGTAATATTTTCAAAAGACTTAATC:1 - chr3R 6968487 3' + invader1 3578 1 58.33 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTCTGCCTCGTAATGCGGTT:1 - chr3L 19063447 3' + P-element 2839 1 37.27 GGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCTGAATAATCACAATAACAAATTACAAATATCTTCGCAATTTTACAATGCATTC:1 - chr3R 17648721 3' + Porto1 4293 1 63.64 TATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATTCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGACCCTCTTTCCGAACGCGTTTCAAATG:1 + chr3L 11233611 3' + 1360 3041 1 70.48 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCTACGACTTGTTAGTATATTACATCTATATCCCTTTTGGTT:1 + chr2R 10241495 3' + I-element 5313 1 62.62 CACTAGAAACTATATACTCCTTATTTTAAATCTTATTTTATTTTAAATAGATCTAACTATGAGTTGCATGTTAATTGTGTTGCTTTTTGTGAAAATATTTTGATTATG:1 - chr3R 27472841 3' + Cr1a 4123 1 64.81 TACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAATATGATAATATGGCCAGATAAAGGTGGTTCCCCTTATTTGACATTTTGAT:1 - chrX 12135642 3' + BS 5066 1 50.91 AACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGTCCACGCCACTACTTCCCCACCCCCCAACCCAACCACCCTCTCTTATCAGTCCATCCCGCTCGCAC:1 + chr2L 7973728 3' + gypsy5 6989 2 62.26 AAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAACACTAAATATTAATTCTAAGTTACAGAAAAAATATAC:1 - chrX 4412141 3' + F-element 4626 1 75.45 AATTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACTGTTTACACACTTAACAAACAGCAACACAATCAACACAATCAGCAGCAGCAGC:1 + chr3L 1924347 3' - 1360 3013 1 58.65 TATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATAATAAATAATAAAATGAGGAAAAAAAACTTTAAAGGGTGGCAACAACTTGTTTGGATTAAGCCCTTCA:1 + chr3R 4549326 3' - 1731 4330 2 63.64 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTCCCACAAAAGAGCGAATCGAAGGACAGTCAAAAGGAAGAAGACCAGCTG:1 - chrX 711731 3' - 297 8 2 55.68 CCATACAGACTGGTATAGATCGATACATACAAATAAATAAAAAACTAAGCCCGCAAAATGCAGGCAAAAAAGAAGGGGATCGATGGG:1 + chr3L 18497979 3' + Fw2 6 2 67.82 AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACGTTCGGCAGAAACAGTTATTTGCC:1 + chr2L 22497816 3' - Stalker 59 4 75.93 ACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAAAAAAATAGTTTTATAAATAGGG:1 - chr3R 9113530 3' + Idefix 7051 2 74.32 GTTTTTGTATGTTATCTGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGT:1 + chrX 14544906 3' - I-element 5130 1 20.91 TACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCAGCCCAACCCACAGCCCATTTTCCAACAATTGCTCACGAGCACTTGGAGAAATATTTTCACCATTTTTTA:1 - chrX 14522610 3' + G2 2826 1 65.45 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGA:1 - chr3R 24260888 3' + roo 9024 2 65.45 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGTGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGA:1 - chr2R 8397444 3' + 412 7503 2 58.18 AATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCTGGGGGTGAACAGGGACATGTACATACTCGTACATTTGGACGGATACTGATATCAACAATCATTCCACTAGTCCGCA:1 + chrX 864632 3' + transib2 2823 1 72.38 TGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTATACGCATTGCTCGT:1 - chr4 463018 3' - I-element 162 1 75.00 CCTGTTCGGGGGCCAGTTATTAATTACAGTTATTCTTTTATAACCAAACCCTGCAAAAGTCGAGAACTTTTTCCTTCCTTCATTTTCCCCT:1 - chr3R 19675426 3' - HMS-Beagle 259 1 64.84 AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGT:1 + chr2R 330212 3' - HMS-Beagle2 29 2 54.55 ATATCACGTAAAACTGTGTACAATTAGGTAAAAAAAAAGGACATTGGATTGGGAATTTTGGAAGGATACACACGAAAAAACGTAACATTATTTAATATACATTTGCAATA:1 - chr3L 16769682 3' + Bari2 354 1 57.27 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATCTAACAGGTAGTGCTTGAAAATAGTTGGCTGAATCCCCAAATAGAAG:1 - chr2R 4547562 3' - S-element 5 2 64.10 ATCGACTCAGCTATTGATCCTGATCAAGAATACTTTTAAATGGTTGGAAACGCTTCGCTCTGCCTTTTAAATACTTTTTAACGAATCTAGTATAAATA:1 - chr3R 32031698 3' - INE-1 95 1 75.51 TTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCATATATATAGTCGTTTCATAAAAAACAAGAGAGAATGC:1 - chr2L 21820791 3' - invader4 2816 2 75.23 ATAAACAAATATTTCTCGCTATTGCGCATCCACTCAAAACGTAACACATGTGAGACGAGCTAGGGGAGCTTAGGGCTTTCAGAGACTAG:1 - chr3L 2302675 3' + Tom1 82 1 52.81 AAAGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGGACTTCTTTCTTGTCCACTATGGCCCTCGTTATGTGTCCGAACCTCTTCCAATATATCAGCGAGTATTTATAGAGCTGAAT:1 + chr2R 21979327 3' + Quasimodo 6947 2 76.36 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAACCCTTCATTCAATTCCAAA:1 - chr2L 21034078 3' + 412 452 2 78.57 TAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGTCAGTGTATGCATGCGCTCCTCTTATCGTTGCCTTGTCGAGCTGTAACTCTTGTTGTTGCCATGTTG:1 + chr3R 6194775 3' - jockey 4666 1 70.64 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTTGCGTTCCACATATGATAGATGTTAAATATTTTTTTGAACGAAATTCCCATTGTTATGTAACCCAAGAA:1 - chr3L 9419498 3' + S-element 1702 1 65.14 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGGGG:1 - chr3R 2772201 3' - 1360 16 1 93.10 ATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCGAGTCCGATCCAGGGTGCAGTTCGACGACTCGGCCTATTTTCGTTGTGTTTGTCAATTTTGTATACTTTATT:1 + chr2R 1398748 3' - diver 5743 1 67.31 TATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATTGCGTTTCGGTTTAT:1 + chrX 6866813 3' + S-element 1701 1 71.67 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTACTCAGAACTAAACTACTGTATGGGGACATGTATGGGCTTATACAGGCAG:1 + chr2R 892438 3' - Stalker2 7261 2 60.47 AAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACTTG:1 + chr2R 6984434 3' + HMS-Beagle2 7190 2 75.45 TTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATTGGAATGCACGAAAGCAAAATAAACCATGTGGCACAAGAATACAAATTGATCAAACACAACA:1 - chr2L 12852544 3' - Cr1a 164 1 69.89 CAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTAATTTTGAGGTTAGCTTTTAAGGTTTTTGATTTTTTGACGATATAAAGTG:1 - chrX 22860051 3' + 297 6844 2 54.63 TCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTAACTTAGCAGGCATTTTCATGTACTTC:1 + chr2L 17101244 3' + I-element 5055 1 76.67 TGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGCATGTGAGGGTAGTGGGTGCACGGGTACACTGCAGGAATTGGGAAGTG:1 - chr2R 5932911 3' + Stalker 241 6 61.17 GGTCCCTGTTCGGGGGCCAGTTATTAATTACAGTTATTCTTTTTCGTTTTGTAGATAGAAATCGATCTCGTTCCTCTAACAAACTGAATTT:1 - chr2L 17375675 3' - HMS-Beagle 263 2 61.54 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGTGAGTTGGTGTGCCAGGGACATAGGAAAAGAGGG:1 - chrX 22745176 3' - jockey 4791 1 60.67 GTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTACTCAGAACTAAACTACTGTATGGGGACA:1 + chr2R 892417 3' - Stalker2 48 2 71.00 ATCAAGTGAAAAGTGAAAATTAAGTGAAAATATTTTTTACCGCACCAGGCAGTGATTAGAGATTCAAGCCTTACGACCAAATTGAGAGTAGTTT:1 + chr3R 19445239 3' + Max-element 463 1 77.66 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTGAAAAATATACAAATATACA:1 + chrX 7904712 3' - F-element 62 1 85.26 AAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATTCGTTGTATATTTGTTTAAACTACTTCACAAATCTGAAAACTCAAAGGCGTTAATTCATGAGCTCGACACCCAAAAATATCTG:1 - chrX 14991296 3' - Cr1a 193 1 51.82 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGACTCTTAAAGTTAGATCAATTTTCGCATTTATTGGTTTGTACAAAAGAACTTACA:1 - chr2R 8086780 3' + 1360 3374 1 62.77 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGACCTGGCCAAATCCCTATCAAT:1 + chr3R 11474945 3' - hopper 55 1 77.67 GCCAGCAACAGCAATATTGACATCATAAAGCGAGCACAATCAAAGATTTTTATTACACACCTTTTTGGGGGTCTTTTTTTCCTTCGCCTCTGCGAAGGGTGACACTTTGG:1 + chr3R 10554752 3' + F-element 4295 1 59.09 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Tabor 7311 2 35.35 CGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGACAGCTCCAAGAAGGATTTACAGTCAAAAAAACAAAATAAAAAGGAGAACGCTTGGGAAAACTTTTTACGCTCT:1 + chr2L 3181698 3' + baggins 5122 1 77.98 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAAAATGCTTTAAAAAATTATCCACAGATTTCCAGAAA:1 - chr2L 5724293 3' + 1360 3365 1 50.91 TGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGTCATTGAAAAGGACAATTGTGTGTGCGAGTCGCGCATTTCGAAGCTGACGAACTGCTGACCTGAAG:1 - chr3R 14924470 3' - FB 87 1 70.00 ACGCATCGTCGAACCGAGGCTATGTAGAACAGAGCTGCAGCAGCTGGGGGTCCAAAAAAAAA:1 + chr2R 11557506 3' - invader6 4661 2 56.45 GGATTTATGTCAAGGCCCGGTCAGTCAGATCTTGGGGGTGGTGGTCACTGGCTTATCAACAGCCGACA:1 + chr3L 12535891 3' - jockey2 3204 1 58.82 TTCATCGGAGCTTGTCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTATTTTTCTCTCTGCTCTCTTTTCTTCTCCACACGC:1 - chr3L 22302196 3' + 3S18 77 2 70.48 TGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTAACCAACCACTAACCCAATAAAAAATTAAAGGGATAACCCCCGCCATCGTGT:1 - chr2L 18335247 3' - 1360 478 1 52.94 AGCTAAGCACAAGCATCCTAAAGTTTTTTTAATCTGCTCAATCGGTCGCTTCAGTCGCCAAAGAAAAATGCTAAATACCTAGAATATTAATTAAGCTATCGAGAATTAT:1 + chr2L 22239786 3' - Gypsy12A_LTR 50 1 75.23 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATATAAAGGCACA:1 + chr2L 10746708 3' + flea 4967 2 73.33 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAAAAATTAAAATTAAAATTACATATTTTCAAATAGTTTGTGTATACAAAATTAGAACA:1 - chr2L 19157500 3' + Juan 4182 1 55.45 GCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTTTTTCTTTTTTTTCGATCTTTAATATTCATTTTCATCGAGTGTATATGTTCTTTTAAAT:1 - chr3R 8721275 3' - Bica 495 1 57.27 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAA:1 - chr2R 12416880 3' + pogo 2075 1 69.33 AGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGGCCAGCACCACTTTTCGTCATCCATTCGCCGCTAAGCTCGCC:1 + chr3L 6047659 3' + F-element 4230 1 65.74 GCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCGCCAACAACAAAAGCAACCACAC:1 - chr3L 18030382 3' + Tirant 343 2 80.00 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATGAACATGTGTGCGAAGCGAAGAGCACTTGCAGACATTTTCGAACTTGTATTTACATGCTAGCAGG:1 + chr3R 28224853 3' - flea 13 2 68.81 GACAACCACCCTAACCATCTGGCTATTAACCTCCTGGACAACAGTGAAACAATCAGACCCTGTGATTTCAGTTTTCATT:1 + chr3L 25485128 3' + G-element 4108 1 70.89 CAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTATGCGGAACTAGTGATTGAGCTTGAAGACGAGAACGACAATAGCCCAAAGTTTTCGCAAAAGCA:1 - chr2L 644775 3' + jockey 415 1 65.14 TAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAAATCAAAGAAATGTCCATAGGTAATCA:1 + chrX 5515597 3' - copia 60 2 79.09 GCATACAGAAAAATGCGGTGTGCGGTATTGATGTGTGTGGTCTGCAAATTAAGTTTTGATCGCCGAAAAAGACAGACATGCCTCGCTCCCGAATTAACCGCGTCAGAAA:1 - chr2L 22490490 3' + invader1 3785 2 59.63 CACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCTAAGCTAAGCTCAGATTCCGACTTCTTTTTTCGGCTG:1 - chr2R 10119366 3' + diver2 120 2 72.82 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCCGACCAGTATACCCGAGGCCCA:1 - chr3R 6132075 3' - I-element 23 1 66.67 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGTGTATATATGCATACGTAGTTGTATGTGTTTTGGCCTGGCCCAAAAGTTGA:1 + chrX 15227696 3' + hopper 1406 2 66.29 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGCGTCAGATTGACCGCATCTGCTAGAGGTGGACAATTGACGATAGGTCGATAGCTTTCGATGTATGTGCTTACGTTTA:1 + chr3R 24814048 3' + P-element 2881 2 75.45 GATCACGGACTTAACTCGCGCACATGTGTGTGTAATGCGTATCGCGTGTGCGGAGATTC:1 - chrX 4262980 3' + Tirant 404 1 72.88 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCAGCGCGTGAGTGCGGGTTTTATGTATTGCTTATCGCTTTGGGTTTATTTTTAATTAAT:1 - chr2L 16101972 3' - accord 7029 2 76.54 AACTCGACTATAGCATTCTGGCTAAAAAAAATGCAACTTAATAAACATGTCCATCATGCAGAAATAAATATTCGATTTAATTGCTCTGCGCTAACGGCAAAATACAAATG:1 + chr3R 17730026 3' + INE-1 575 1 55.45 CTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCATTGCTGTTTCTGAATTTTTACTCAAGGTTGCTATACCTTTCTTTTCACGGGAATCGACAT:1 + chr2L 13303469 3' - Doc 4433 1 70.91 TAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAATGAAAATATTGCGAATCAAACGAGGCGAACTGAAACAAAGCCAAATGAAATAAAGGGGACTTCGAA:1 + chr3R 8442283 3' + micropia 248 2 79.57 TTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATCAGGGAACTGGGAGTGGGGATGTGGAGGAGGACCGGAG:1 - chr3R 4884810 3' - 297 203 2 56.94 ATAACAAAAATATCCACTTTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCGAAGTCCAGCTCAGTGAATCCCCAACTCCAGCTTGAAG:1 - chr2L 7358354 3' + 17.6 99 2 62.96 TATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGCTTAGACCAATATGCTACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' - Stalker 36 4 70.59 TTAAGCACATGCCTACATACTAATACACGAATATACACACAAGGAATCATATACAAATACACATAAAGTGCGGGGCATTAAGGACGCTCAACTTGTAAT:1 - chr3L 4010011 3' + Idefix 27 2 76.77 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAAATAAAGTTACCTAAAGTAC:1 - chr2R 9963471 3' - pogo 23 1 58.18 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGAAGAGGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 204 1 43.69 CGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGTGAATTTTCATTGGCAATTTATGGCGAATGATTGAAGTGCTTTCTATTCGAAT:1 + chr2R 20809895 3' - 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chr3L 15563172 3' - mdg1 9 2 70.91 TAAATTTATTGATCATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTTTAAATGACATCTGCGAAGCTACTAATGGTTTTTGCGTTTCTCGTACTACATTTCTGGATGACT:1 - chr2R 9894643 3' + hopper 339 1 74.31 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTC:1 + chr3L 3371205 3' - copia 61 2 79.09 TGTTTTTATTTTTAATATATTAACAGCTTATGTAACAATTTAAATTGTGCATCTTATTTGCGATTTTTTTGCTTCTACGATATTGCCAAATTTTTTATGATACCCTCCTC:1 + chr2R 14795028 3' - BS4 732 1 56.36 CTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATAGGTCACTATATATATATAATGATGTGAAGCTGTTGAGAGCCGCGTTAGATGACGATGACG:1 - chr2R 12540642 3' - 17.6 6943 1 57.78 GAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAAAGAAACCCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAAAATCAGAGTATCAACCCCGAACAC:1 + chr3R 435980 3' + Idefix 7143 2 75.26 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAGAAATTAAATAAAATAAAAATAAATG:1 - chr2R 15155177 3' + flea 4988 2 60.55 GCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATAAGCAATTCCCTTTACATAAAACTGATTAAAATACAAGTTAATGAAA:1 + chr3L 19373770 3' + I-element 5081 1 58.18 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATACATATGTATAAGAAACCTAAGCCTAACCAAAAATAAAGAATACTAAGCAA:1 + chr2R 14289313 3' + HMS-Beagle 7011 2 54.55 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTGTCCTTGTGGGGGGCAAAATANAAACACTTTCT:1 - chr3R 5671365 3' - 1360 12 1 68.81 AGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAACAATAGGGTTTTTACATAGAATGCCTC:1 - chr2R 7186698 3' - micropia 5185 1 78.10 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTGGGTTTGAATACTTTNCGCTCGAGCCCATTGAATATTTAAACATTACAATTGCTGT:1 - chr3L 10836514 3' + opus 475 2 59.09 GTATGTGTGTGTGTGTGAAGGTATGGAGGATGAGAAAATGCCAAGTGCAAGAACTCATCAATCAATCGGTGCGATATAAATAACCTTTGGGCT:1 - chr2R 23791917 3' - Quasimodo 35 2 61.29 AAGATAAGATAGGATAAGACAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGACGCCTTCGTCATTCGGGACGA:1 - chr2R 15941842 3' + Stalker3T 203 1 67.27 AATATTTATTTTAAATATAAATACACCTTTTGCTTTCAGTGTTTGATCTGCCTGCCTATTAGGTTTCGTTTGCCAACCGTATGAAATGAAGCCACTCAATCGGGAGTTGC:1 + chr2R 17961617 3' + S-element 119 2 53.64 ACTGCCAGCATCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTTGAATTAGTTTTTTATGTGCCACACATGTAGTGAAAATGAAATTAGATACGTGTTGGGTACGAGTTAATTTG:1 - chr2L 15203326 3' + G-element 3938 1 70.00 AGTTCTTAGACTTTAAATTTATATTATTTGTGATCAATTGGCACCACGCGAAAAATTCTAGCTGATTGCATTAGGCCCGTTTTGGTTGCCATTACAATTAGCCGGAGCTC:1 - 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INE-1 172 1 72.73 TACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACCCTCAACTCAACTCAGCCCAGCATATATGTATATATATATATATATGT:1 + chrX 13954550 3' + Porto1 4393 1 56.36 TAAACTTATTTGTTTTATTAATCATATTATATCATATCATGTGATATTAATCATATTTGTATATCTTTAACAACTGATACTTAAATATAAACTTAATTACAACTTTTCG:1 + chr3R 16163308 3' - TAHRE 60 1 51.38 TTATTGTTAATTTTTAAAAAACAGATTGTAATTTAAAGAAAAAATAATAAAAAAATGTAGAAATGCTGAGCACAGAGAATCATGAAAAATGTAAAGAAAGCAAAGAAAG:1 + chrX 6492223 3' + Porto1 4640 1 64.22 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGACAAAACAAAAGCCGATAATATAAAAGTGAAAAAATTTTACT:1 - chr3L 23145545 3' + HMS-Beagle2 276 4 57.94 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGAAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGT:1 - chr3L 5320612 3' - roo 54 2 77.06 ATTAATAATTTAATAGTTTAATTTTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCACCTCTGTCATCGGGTTGCTTTTGGGACCGAGGAAAAGGACATTGTCCTCAC:1 + chr3L 15037797 3' - Porto1 4551 1 63.64 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGTCTGCACACATGGCATCCGTGAGATACAAATACGCCCAA:1 - 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chr2L 4820677 3' + 412 7150 2 62.35 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCACTCATGACCACTAACAGCTTTATAGTCAACATGAT:1 - chr3L 25752802 3' - Transpac 4943 2 56.82 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATCCGAATCATATGACGACAAGCCCTCGGTGAGCTG:1 + chr3R 14688353 3' - pogo 4 1 67.89 GCATACGTTAAGTGAATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACCGGCTTTTACTTTTGCGCG:1 + chr3L 14755047 3' + P-element 2851 1 28.75 TATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTAACTTTGCTGGTTATTTTTAACTTTGTTTTTATTTTTGCATT:1 - chr3L 758709 3' - TAHRE 45 1 37.27 ACTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTCCAACGAGCCAGGTTGCCCAAGGCCCACTTCCCCTCCACCCACAAC:1 + chr3L 20418419 3' + G2 2609 1 64.00 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATTTTAAGAAATGCAGAAGGAATT:1 - chr3R 27816128 3' - Burdock 6183 2 74.76 CTGAAAACCCTTTTGTCACCTTGGTCGCTAATATATCAGTCCCTTCAGTCCTTCATGGCGCGCCTGTCGTGGAAAGGTACCGCTTATCGCG:1 + chrX 492945 3' - BS3 1731 1 68.13 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGTCTCTTCCATCAAATTAAGGCACATCA:1 - chr2R 7113644 3' - roo 47 2 76.53 CTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTGGAAGAACATTATCTCTTCGCCTGACTGC:1 + chr3L 22065739 3' - X-element 70 1 72.82 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT:1 + chr3R 21211613 3' + Stalker3T 205 1 35.11 TGTGTTTTGTTTGTTTTTGTAAACCCAAAATTCAACACGTTCGTTTTTTAAGTGCCTGCGTTTGTGCGCGTTTGCGTAGACAAACAGAAATTAGATGAAAATGAAAACGA:1 - chr2R 11180732 3' - Penelope 526 1 60.00 TATATTTTTATATTTATATTTATACTTCTGCAACTGTAAGTTATCAGATATTGATAAGCAATATAGTAAAAAAAATATATTAATTTTAGCTTCATTAAAACTAAAAGCTC:1 + chr3L 19514592 3' - Stalker4 88 4 66.36 TTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCGCCCCGTCGACGTCACTATCATTTGCTATTGTCATGATTTTTGGAAGTCTAAAAAC:1 - chrX 16675349 3' + FB 33 1 58.72 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTATAAACGGCGGG:1 + chr3L 17153615 3' + 297 6956 2 86.89 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCGAATGGGCGGCAGTGGTGGG:1 - chr2R 19677808 3' - hobo 31 1 71.43 TACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGATATATACATAAGCCGATCACTGAGGATTTCGACGATGAAAAACTGAAGGAATTC:1 + chr2R 18143831 3' + Stalker4 7112 6 42.70 CAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAAAAAATTCGAGAAAAATAAGGCAAATAGG:1 - chrX 6210424 3' + micropia 5179 1 82.73 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCTCGTCGATTATTCCTGGGGCCCAT:1 - chr3R 17271980 3' - hopper 58 1 76.36 AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTGGAATGAATATAAATGAAAAAAATTTGAGGAAAGCCTTAAAAAAGGTTGATCTCGAGTGGAAAGGTACGAC:1 + chr2L 16606853 3' - F-element 94 1 63.30 GCTTGACTCCGGCTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGGCACACACTTTGCATTTGGCTTTGGCCAGCGATTAGCTCCT:1 + chr3R 31545627 3' + G3 466 1 67.86 ATAATAATAATAATAATAATAATACACAAACCCCAAAGACTAGAACATAAATGGTGGTCGACTGTTAGCAAGACACCCTTTTTGTTGTAAAAGCCCAAAAAGGCACTCTT:1 + chrX 3379295 3' + mdg1 7067 8 76.36 GAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAAATACGAGTATGGATAAGCTCAATAAGTATGTGCACTTATAGATATAGTGCATTCTTTTGGAACTAAGCTCCTTTTAT:1 - chr2L 19977610 3' + HMS-Beagle 274 1 72.73 GAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGCGGCAGGTTATAAGT:1 + chr2R 13699507 3' - jockey 4756 1 79.38 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGCGGACAGACATAAACTTTGATTGCAACACTAATTACAGAAAC:1 - chr2L 13836513 3' - blood 8 2 62.20 CGATTGCTGTTGCTGACCGTTCGTGGGGCAGAGCGCTGAACTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGTCGTTATTTCTTTGGGGGCTTCTTGAAG:1 - chr2R 11266746 3' - gtwin 104 2 73.64 ACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATACCAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAACTAGGAGTCACATCTCAGAAACCG:1 - chr3R 6995009 3' + Porto1 4464 1 77.27 CACCTGCTGTGCAAACAAGAGTCACGACAAAACGCCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGCAAATGGGGGACGTCACCTATCAGATCAATTCAATAATAATGATGGCAA:1 - chrX 16556088 3' + mariner2 696 1 79.09 ATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATCCAATAAATCAACGCAAAGTGCAATGATTAATCAGATTTATTTGTCACTTTTATTTCGTGCTACAAGTGTCAAAG:1 + chr3L 5068716 3' + F-element 4641 1 61.00 TTTCCTTCAACATCAACAATCAACATCAATACACAGAGAACAGGAAAACGGGCAGAACTCAAAGCTACATAGATGGTATAGGGGTGTTGAATCAGTGTGTGTGTG:1 + chrX 4656217 3' + gypsy7 319 1 67.62 ACATTTTTGTTTGTTTATTTTCGATCACTCCCCCTGCAGGGAAGTGCAACTGGAATATGGCTT:1 + chr3L 15763726 3' - Fw3 3057 1 61.90 GAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAGTAGGTAATTCGTGGTGAGAGTCCTGACATAAAGTTCATAGTTTCATTAGCATGCTGGACGTG:1 - chrX 20390371 3' + R1A1-element 39 1 61.05 CGAAGTTTTTGGCGACTTAGAGTCGAGTTTGAATAGGTGGCGAGAGCATTTACAAAATCAAAGTATTTGAATTGGAAATATCCGTGGGAACGCTTGCATAGAGGCA:1 - chr3L 20316501 3' + gypsy7 499 1 60.38 CACACACACACAGATATTCACGCACACAGACGCAGGCACGATGATGGAGTGGATATACTCAGCATATGGGCAGGATATGTCATTATCCAGTTGTAATTGGTGAATTAAAC:1 - chrX 3202002 3' + accord 188 2 69.09 TACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTTATCAAGAGTGTTTATGCAATACGCCGGCTTA:1 - chr2L 10750111 3' - X-element 4574 1 70.91 CTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCATCTCGCACTGAAAGTAGTCGAAAAGCGGAAAATTAATGAGAGTAGGCTGATCGGTTTACT:1 + chrX 18407917 3' + 1360 3211 1 59.09 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTTTATTATGACTCAATAAAACTTTAATAGACA:1 - chrX 3528583 3' - roo 8719 2 77.27 TTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTAAGGTAACTTGTCATCCGCAGATGCAACTTTTAAGACCT:1 + chr3L 1399465 3' - Doc 4493 1 56.67 CTCGTCTTGCTCTTTTTGCCGCTGAACGCGCAATTCGCATTGGCTCATTTTATAACGATCGATTTGTTTTTTCCTCTGCTTTTCACTTTGTTTCTTCAAGAATTATTCCA:1 + chr3L 7774826 3' - Doc3-element 247 1 65.45 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATATTACAATAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAA:1 - chrX 23283148 3' - HMS-Beagle 6803 2 71.82 CCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGGATGTATCGCGGACTCGAAGAATCTTTTCGGACCACATAATTGCACTAATAATATTCTGTAGGTTATTTCAGATTTTTTATGTA:1 - chr2L 16920768 3' - Max-element 348 1 58.72 TTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 + chr2R 5064834 3' - Stalker3T 203 1 49.54 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCGAAATCGTTGAAGAAAACGGGGGAAGTGG:1 + chr2L 11211192 3' - hopper 25 1 57.14 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTTGCATGTTGTCTCAGCTTCGGCTCTTCCC:1 + chr2L 19808557 3' + copia 204 2 78.10 AAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCAAGGAATAGCAAAACAAGTGTTCTAGAAACTCAGTCGAGAGAAACGAAATCCAAATTAG:1 - chr3L 17625092 3' + Bica 217 1 60.55 GATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAAAAAGTGTAGGAATTTCCATAAAATTAGAATAACAGCAGCCGGAGCTG:1 + chr2L 17229323 3' + Stalker3T 205 1 47.27 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACATGAGCCATAAATTTATCTCCAGAATGTGCATCGG:1 - chr3R 7874833 3' - jockey 4680 1 54.17 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTATCGTTCATTTATTTTGCTCGTTATGTTCGCGTCGTCGTAGTCGCGAACTCACGCCAC:1 + chr3R 5774907 3' - I-element 29 1 54.55 ATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCTCATGCCCGCCTTGGATGGGAATATGGA:1 - chr3L 5660224 3' + R1A1-element 5125 1 63.16 GGAAGCTTTGCGATACAAATGTTTTTAGCCACCAATTCAATTGCTTAGCGCTTATCTAGTTCAACATCGGCAATG:1 + chr2L 12292471 3' + ZAM 79 2 78.67 CATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACAACACAACACAACACAACACACCACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + Stalker2 55 2 69.09 TTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTGGCGTTGGCAAAAATGAACTTTTGCA:1 + chr3R 15741408 3' + 1360 407 1 60.78 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCACAACATGTTTTGATATTCGGACAGTCTTACACCAATAACAACTAATTA:1 - chr2L 6757466 3' + Tirant 8474 2 57.27 GTCGCCTGTGAAGCACTTTGTACTTGATTTGGTTTTTCAATTTACTTATATTTCGTATTGCCCGTTTTTCTGTTTGCCCCGTAGGTGAATT:1 - chr2L 5241500 3' + accord2 7228 1 65.93 GTACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCATGTGCGACAGGTGACAAACAAATTAATGTCTCAGG:1 + chr3L 15720179 3' - 1360 460 1 60.67 CTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCGAGAGCGAGAGAGTGGAGAGCGGAACCACCTTGCTCTTACTTAAATATCTAGAATATTAGAAAGTTCTTGTAACTATTTTTATC:1 - chr2R 25186735 3' + 1360 81 1 57.27 GTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTCACATAACATGTCAGCCATGTTGGCCA:1 - chr2L 15194577 3' - invader1 315 2 68.49 TCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAACATTGAAATTCTAT:1 - chr3R 6937622 3' - F-element 184 1 69.16 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAACCACAAAAGCGTTGGAAAAAA:1 + chrX 7802794 3' - hobo 22 1 71.83 GTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGTTTGTAAGGAAAAC:1 - chr2L 19231210 3' - G2 2956 1 77.05 TGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTATAAAGTGGCATGGGGGTTGGTTTTTATAACACTCTGCCAACAAATTTGCCCGTAATAAACTGTTCAAACAAATTTCACCCAATTTGTC:1 + chr3L 2805001 3' - Quasimodo 32 2 60.00 GGCCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAACGTGGTCATAGGTAGGGTAGAGGTACAACAGTTCATTTACCTTTTCGGCGGAG:1 - chrX 20699896 3' + Gypsy12A_LTR 1923 3 56.25 TGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTATATGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGTTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - 1360 3243 1 71.82 AGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCTGCATTGGATATTGGTCGGCATGG:1 + chr3R 28926065 3' + F-element 4505 1 71.76 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCATATTGCATATTGCACACACAGCAA:1 - chr3R 21858697 3' - Tirant 14 2 69.23 AAAAAATAACTGTTCCTATGCCGATTCTTTGGAATATTCATATGGGGCACCTTTAACTAAACAGAATTTCAAAAACACAAATCACTTCA:1 - chr2L 1187037 3' + Bari1 152 1 49.44 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTATCAAACAAA:1 + chrX 12271525 3' + pogo 2084 1 64.29 AATTAAATAATTAAATAACTTAAATAATTAAAATAATCGCGCTTTGCTTGCCAAATACTCTCCCGCGCAAAACTAATTAAAATCAAATTTCAAGTTGACAAATAAATAG:1 + chr2L 18227444 3' + HeT-A 28 1 81.65 GGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - 297 6525 1 62.77 TTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTGTGTAAAAGAACAGTTTCTATTCCTCGAAGAACAGGAAGATTTTGCGCTGT:1 - chr2L 629179 3' + Tirant 325 2 53.64 TACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCAACACGTCACTCCCCTAAGTGCCAC:1 - chrX 8659591 3' - Bica 74 1 68.42 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACAAGTTGTTTATGTTCTCGTTTCA:1 - chr2R 7981128 3' - 1360 32 1 56.88 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTTGGGGCTGTCTG:1 + chr3L 5204452 3' - jockey 4674 1 67.47 CATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGCATTGATGACAGCCAGGCTGGCAG:1 + chr3R 11105401 3' - I-element 5038 1 75.00 CTTAAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATTATTGCCTAATTAATTTTTCACACTACGCAAGATTAATACCAAAGACCATAGATTAAAAGTATGTACTAAAAT:1 - chr3L 8937481 3' - 1360 473 1 72.73 TTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAATTTTTGTGAAAATTGCTGATTATGTGAATATGGGACATTGGTTGTATACAAGAGTGGTGGATTCTGTTCTTATTCTTATTTCTTTC:1 - chr2L 22076668 3' - 297 281 2 58.18 TACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAAAATGTGCAAATTTGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAACAGAGCGCGTGCCAAGTGCTCGAGTGAAAATGTTTACGCACAGAAGA:1 + chr3R 7658431 3' + HeT-A 6059 2 50.00 GGGCATTGCCTATATTCAACAATTTTTGGATCAATTTTCGCATTTTTTGTAAGAATGGGGGTCATCAAAATTTGCAAAGTATGGCCAAAAAATGTTATTTCCATTTTTGA:1 - chrX 14684558 3' - 1731 4312 1 68.18 TAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCACTGTATAAGAGGGGGCGGGGCGATAAATGATTACA:1 + chr3R 20629409 3' - Tirant 8419 2 61.11 ATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATATAGCTAAGGACAAGAATAGAATGTAACGAATCGATCGGAGCGATCGCTTAAACCACACAAGCTGA:1 - chr3R 22605662 3' + Bica 106 1 72.48 CACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGTCCATGCCAACTTGAGTAATATGCTTTCTTAAAGGCGAGCCCAAAAAAGTATGCTATGCTT:1 + chrX 5859402 3' - BS 26 1 63.37 TGAATCGTTTGACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTATGCTTGTCTGCAGAATAGCATTACTCTTACCTTGTTTGCTGCATTTGGACTTTCGCTTATC:1 - chr2R 13136827 3' - Doc4-element 338 1 52.94 ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAATTAAAAGTTAATGTAAT:1 - chr2L 16529222 3' - blood 38 2 70.65 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAAATAAGGTAAAAATAGCAACGAGGC:1 - chr3L 3688517 3' + Stalker3T 205 1 77.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATAATATTAATAACTATGCGCAAAATTAGACGGCAAACACAGTTTTATAAATATTT:1 + chr3R 17109010 3' + roo 9042 1 50.91 TAATAAATAATTCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTCATTAGTTGTAGCAACGAATACTTTTCCATCGGTT:1 + chr2L 23352280 3' + invader2 191 2 60.00 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATAACGATGCCATAATTTAATCTTGAGCTTAAAC:1 + chr3L 3611812 3' + blood 7375 2 69.09 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACACACGAC:1 - chr2L 9147971 3' - Doc 30 1 62.50 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATTTTTCCTGGCATACAAAACTAAATT:1 - chr3L 5971690 3' + pogo 2057 1 77.78 TGTGTATGTGTGTGTGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - accord 253 4 51.76 GAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAACCTTTTCCACACACGGTGTACCTAGCACACTGGTATCTCACGCCCG:1 - chr2L 22524648 3' + F-element 4395 1 60.91 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTG:1 + chrX 2426438 3' - roo 54 2 78.18 CTCCTTCGTACACTCTCCTGGACAAAAGTCCCCAAATGTTAATCAAGCGGTCAGTGCGGAATAGAGAACACTCGAGTTGTAGTTGCCTGCGGCGTGGGAGGTTTTTCCCT:1 - chr2L 1468431 3' - Tc3 1271 1 66.36 CAGCACTGCGAACACCGCGCAAAAAAGGGAGAGTAAAAAAAACACAAAGACGAAAAATGCGAAATACTAAACAATAACCATTTTTTATAAAAATGGTTATTGTATAGTGC:1 - chr2L 11674796 3' - Cr1a 229 1 61.82 GACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGACCCAATTCCAAATATGTGATTTGGTCAT:1 + chr3L 12861952 3' + Cr1a 4215 1 75.23 GAGGCACGAAGTGCGGACACAACCAAAACCTCAACCCCCCTCACCCTCCCCCTCACTTTGGGCACGAATCAGACAGAGCA:1 - chrX 17821706 3' - 1360 470 1 73.75 TAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAACTGCGATTTTAACAAACAACTTGGTTATCAAAATACATGGTAGAAATGAGAAAAACAAGTGCTGCTTGTG:1 + chr2L 3175448 3' + 1360 2958 1 54.55 TAACAATCTTTTTCTTATCTGGAATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTGGTATTGGTGATCGGTATAGGTCGAGGCTCTATGTCCAGATCAAAGCGAGAATGAG:1 + chr2L 1997779 3' - Idefix 111 2 56.36 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAG:1 - chr2R 15155202 3' + flea 4981 2 67.03 ATATAAAATGTATGGTATAATTTTTAGCACAATAAAACTAAAAGTACTGCTATCAAAAGCAGATTATGTATTATTTGATATGACTTTTGGTACAAAAGGGCTCAATCAAG:1 + chr2L 13230955 3' - invader5 3712 2 83.64 ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTACACAAAATAATAATTCATTAATGCGCATTAATTGTTGAGCTGCAGC:1 - chr3R 10964600 3' - I-element 42 1 60.91 CTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATGTTTCTCCATACCTCAATACATATTGCACGTC:1 - chr2R 2323713 3' - gypsy 49 2 70.64 GCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAGGACGATGCTCGGGATGCTGAGCGCAAAATGCATCTAACAGATGCACTTTCTCTGTGGGATAT:1 - chr3R 26886991 3' + Tc1 1257 1 53.64 CCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGACATGGTCAAAGGATTTTGCCGATTTAACTT:1 + chr3R 28354020 3' - accord 7148 2 67.71 TGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTTGCTTGTAGGAGGAATGAGAAAGTGCCAGTGAGCCAAAC:1 - chrX 9059140 3' - I-element 5114 1 77.08 CGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCCTTCTTCCATCCCTTTGTTTGTTTGGTTGGCTTGCACTTCACTTAATTGAATCAGTGTGATTGAAAT:1 + chr2L 13053967 3' + gypsy12 10159 2 53.76 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTACATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGGATACGAGTAGTTGCGATTGTTTTTTTTTTTACCCTTG:1 - chr2L 20398475 3' - roo 29 2 60.22 AATTGGAGTTCATCATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + 412 495 1 25.26 ATTTAATGTAGAATTCATTTGCGCCCAGTGTATAGCCCGTCTTCGGTCCATTTCCATTTTTTTGGGAGGTGGGTCCCGGCTCCTTGGTCGTATGCAAAT:1 + chrX 17357779 3' + jockey 340 1 79.80 AGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGTACATATGTATATTTGAAGTTCCAATCAGTGAATTTTTGGGTTTCCCCACTCTACAAACATATTTGCCTTCAGA:1 - chr2L 5304807 3' - flea 4761 1 78.18 TTGGAATTAAGATAAAAATATTATCCGAAAGGGTTGACATATTGCATTGAGAGGGAGTGTTGAAAATAAACAATGATAAGGAAAATCGAGTGATAAGTGCGTGTGTCTAT:1 - chr3R 16285906 3' + Dm88 4304 1 61.82 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTTGGGACTTTTACCTGGTAGGGGGAGGTCAGGGTCTCGCGCCAGCCAAGACATGG:1 + chr3L 18881098 3' - jockey 4808 1 70.59 CTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCTCTAATCAAATGTCAATTCGTTATTCAATAAAAATCGAAAAAATACGAGAAAAGTTCGCTGCTAAAGGA:1 + chr3L 3587349 3' + X-element 4406 1 64.55 ATAGCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGCAGCGCAACATCCGCGAGG:1 - chr3R 5756134 3' + Idefix 7250 2 69.12 TCTTACAGCAAATTGAACGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATGAGGAAATGTGGAAATGGGGGTGGTGCACAAGTGAAGAGAAG:1 + chr2R 13619833 3' - GATE 399 1 57.58 GCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGAGCTTAAAATACGGCTAAA:1 + chr2R 24435859 3' - Idefix 7026 2 63.27 AAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTCGATTTCAGTTCCACAACACACTC:1 + chr2L 8476799 3' + Juan 4211 1 70.91 TGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGGCAACAAGGACGACCGGCAAACAAACAAAAAGTAA:1 - chrX 11664501 3' + TAHRE 10420 2 68.33 AAAGACTCTAGAATAACCAGATGCGTACCGCCATAACGACTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCATCTCGTCCGTTACGCCC:1 + chrX 20023754 3' + 1360 2 2 77.01 GACCTGGTTGACTCCATGCCAAAGCGTTGCGCACCTATTATTGCTAATAAGGGATGGACTACCAAATATATACATATATTAGTGGGATGGACGCAGTTTTAATAGG:1 - chr2R 8107012 3' + Tc1 1283 1 73.58 AACTGAAACTGATATACATAAATATACTTGAAAAGTGCAAGAGTGGGAGAATAAAGTCAAAATCTCCGCAAAAGAAACCAAATGAAAACAAAAAAAAAAACATATATATA:1 - chr2L 15645181 3' - 1731 4463 2 74.55 GGGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATATTAACCGTGCTAATTACTCACCGACGGCATAACTCTGTCATGAAT:1 + chr2L 11433346 3' - G5 4602 1 55.88 GCGAAATTTCATAATTTTTCTGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATACTTCAAAACGAATCTAGTATACCCTTTTAC:1 - chr2R 4618504 3' - INE-1 514 1 73.49 AAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATATGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGAT:1 + chr3R 21211613 3' + Stalker3T 203 1 67.27 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTTTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACACACACTCACTCAAACGGACGCAAATA:1 - chr3R 13437148 3' + hopper 1407 2 56.00 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGACTCTTAAAGTTAGATCAATTTTCGCATTTATTGGTTTGTACAAAAGAACTTACAG:1 - chr2R 8086779 3' + 1360 3372 1 61.86 TTAAATTGTGCCCAAGAAATTCCCGTGAGTTAATAAAAAACAAAAAAAAATCACGGTCGGCAATATAGTAAAACAGTTTGCAAAAAATGGAAAGGAAACATGTCGATGAA:1 + chr3L 14481746 3' + HMS-Beagle 362 1 79.09 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGCCCAATTAAATTGTCAAAAATGCTGTGAGCGTAAATAATATGCTGAGAATTAAAATGTCGGTAAATGTTCTGCGGA:1 - chr2L 10128629 3' - copia 4872 2 76.70 AGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCATTTGACTCTCGGAGCAAATTGCAGCGCCATACTTCAG:1 - chrX 2822329 3' + F-element 4454 1 55.95 GTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCAATA:1 + chrX 18750714 3' - BS 4849 1 69.09 CTTTTATATGTAGGTATTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTTCGGTTTCGGTTTTGGTTTCGGTTTTTGGGATTTGCCT:1 - chr3L 10842874 3' - Juan 3924 1 57.45 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACGAACTGTACTTGTTTTATGATTTATTGTAATATACATCTATTTGAATCATGTAGAAC:1 - chr2R 18398016 3' - S-element 38 2 59.09 AGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGCGGACACAACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAAT:1 + chr3L 21484243 3' + 1360 400 1 90.22 CACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCCCAGAAAGCTATGTAAACAAATGAAAAGTGTAACACACAACCTTGAACGAAAAAA:1 + chrX 17477118 3' + F-element 4329 1 66.29 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATTTACATTTTCCCCCAAAATTAT:1 - chr2L 7841349 3' + jockey 4943 1 78.70 AATGGGGTTCGCAAATACAAATCATATGTGCACGATTTATCTTCAGTTTATTTCTCCAGTTAAATTCATTTATTTTGCCACAACATAAAAAATAATTGTCTGAATATGGA:1 + chrX 13057298 3' - diver 186 2 73.64 TGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATTCAAATGGGCCATTATGTTTTAACAATTACTATTTGCGCGTATATTTCCGTACTTTACTATTGCAACAAA:1 - chr2R 4582643 3' + 1360 3375 1 43.64 ATATAGAAAAGAGAACAGAAACGAGGAAATGAATATAATGTAAGCCATTAAGTGTAGCACACTCTTAGGCAGCTGAGGTAATGAGACGAATTTTGTGAC:1 - chr3R 26387826 3' - Cr1a 4349 1 65.66 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATATACTCATTAAATATTTTCACATATATTTAAATATTTAT:1 + chrX 12006794 3' + Stalker3T 205 1 44.12 GAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAACAAAAAAACAGATTTTCCGAAAGAGAAAAAAGGGCTAAACTGGTGGAGGTACTCTAATGCGAATGGAAAACATGTACATTGG:1 + chrX 22672970 3' + HMS-Beagle2 440 1 53.21 TCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAAAGATAGTGCTGAGCATATCGAATCAATTCGGATCGTATCGT:1 + chr2R 13416847 3' + Dm88 393 1 68.69 TAAATAGTTTCGTTGCCTGTTTCTCTTGGCTCACTGTTTAATTGTGGCTTAAAGTGGTAATAAACAAGCTTCGGCGG:1 + chr2L 15392930 3' - Porto1 4414 1 81.82 ACAGACATTAATAAATAAGGTCAAGAATTGAGCATGCTTGCGACAAAAGAGAATAGGCGGACCTGGACAGGTCTTTTATGGACAAGCCAGCAGTG:1 + chr3L 20736376 3' - Gypsy12A_LTR 2130 1 60.00 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTAAAATTACCCCCGCTTTTAAATCAACTAATATGTTTATTCAATCTAATTTC:1 + chr3R 17777668 3' + Burdock 226 2 54.55 CCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGATATTAAACGTATAGATGGGGTACATATGTACAGTGAATATATGTTAAAATATATTTGCAATACAACTTTAAGCAAT:1 - chrX 14062838 3' - Doc 404 1 73.64 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATAAAAATCGTGTTTATAGTTCTATGATTTAGTCGA:1 + chr3R 13481249 3' - roo 8692 2 54.29 AAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCGACAAACGCATAAAATTAGCTTGAACCTTTTGTTAACACAGAGGACAC:1 + chr3R 26775949 3' - Rt1a 14 1 50.57 AGGAAATTCAGATGAAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAACTTTAGCCCGAAAAACAAGTTCCCAAA:1 + chr2R 21112319 3' + Doc2-element 4520 1 67.07 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGGAAATCTTTTGGGCTAAAACATCATAAATCCTGAAATGA:1 + chrX 15500035 3' + pogo 2064 1 67.01 AAATTTTTCAAAAATGTGGGCGTGCCATTTTTGGGCGGTTTATGTGCGTTAGAGGTCCAAAACGCTATCCCTATCAATTACACGCCCAGAAAT:1 - chr3L 27338364 3' - INE-1 255 1 58.06 GAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACTCGACTCTTCTTCCATCGTGGCGACTTGCTGGCGAAGACTAGCGTTTTCCGCCTCCGCTTCCTTAATTTTGGCAATGTCCACA:1 - chr3R 12011514 3' + F-element 4442 1 79.82 GTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGCTTCCGACCATATATATTAACATTTATTTCAGCACGATTTATTCAAATATTTATTCGCACATCGATGTCCTAT:1 - chr2L 21707826 3' + INE-1 28 1 55.67 TAGCGGACAGCACTGCTCCCAGCAGAAAATAATGTACATACAAAGGAATCCAGGACAAGGCAAGG:1 - chr3L 3596375 3' + HB 356 1 52.31 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATCAACTTTTCAAAAAACCTCAACTAACA:1 + chr3R 11568698 3' - jockey 67 1 78.18 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCACCCACACGCGCTTTTCCTTCCACTTCAC:1 + chr2L 1291089 3' + 412 450 2 73.47 CTGGACCAAAGACACAAGAACCCAACTAACCCAAGTGTCATTTCATGGTCGGCAAAAGTCGACAGAAAGGGTGGC:1 + chr2L 21252130 3' - hobo 341 1 77.33 ACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGGGGGATAAACATAGGGATTAGGTTGTGGGCGGGGTGCAGTCATTA:1 - chr3L 4865013 3' - 1731 4362 2 52.13 ACACCAACACACACACACACACACGGTGGTAGTGATGTTAAATAAAATAATGTTTATGTGGCAACATAA:1 - chr3R 10986758 3' + gypsy3 420 1 85.51 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCAAGTTTGGAGGGAAGCTATA:1 + chr2R 8397509 3' - 412 32 2 55.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAGATT:1 - chr3R 9435808 3' + roo 9054 2 61.39 TTCAGTCTCCGGAGAAACACGAGACATTCGCTTTCAAAAAAAAATCGCTGCGTGGCAGCACATGGGTTGGATGGCCGTCGTAACAGTCAACTGCC:1 - chr2L 19287787 3' - X-element 432 1 69.47 AGAGGTTCTGAACTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Stalker4 365 2 70.21 GTGTGGAGTTACGTACATATCAGGGACCTTTGGATATGATATGTCCCAGCGATGTGTTTTTCACTTTCTCTGCGATGTAAATTAACTGATATGCTCACCTTGTGGAGGA:1 - chr3L 7719447 3' - Helena 1171 1 73.39 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCT:1 + chr2L 14141331 3' - hopper 55 1 73.64 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATTAGTCAAGATATGTCAAATATTTACATA:1 + chr2L 5338014 3' - F-element 65 1 72.73 ATAAACAGTATCGTAAAACTAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAAAAGCTAAATACACACCTTTGTGCAAAGGATTTAAAT:1 - chr3R 1706154 3' + diver2 4835 2 73.64 CGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCCCGTGGGCTCATCATATAAGCCTGGTGCTTACGTCATTT:1 + chr3L 19542879 3' - hobo 2735 1 56.25 ACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACTTCCTTTCAGCTATTCGCTACTTTGTGGTTTTTCGTTTT:1 + chrX 20916168 3' - R2-element 3520 1 63.55 AAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAGGGGCATTTTCCAGTTGTCTATCTATATGTCTGTCTGACGC:1 + chr3L 8457732 3' - copia 4995 2 62.73 TTGTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCTTTTCTTAGCCGAGGGCAAACATTTTGGAATTGCAATTTTCGACTTCAT:1 + chr3R 18027134 3' - gypsy7 5012 2 79.75 ATATATATTCTTGATCAGGATCAACTGCCGATTCGAACTAGACGTGTCTGCCTATCCGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATA:1 - chr2R 1751254 3' + INE-1 80 1 75.45 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTTTCGG:1 - chr3R 24813963 3' - P-element 37 1 35.56 TACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGGCTTTCACGCAATATATCCACCTCGG:1 - chr3L 15800612 3' + mdg3 5338 2 73.47 AGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGT:1 - chr2R 6438349 3' + Stalker4 375 4 58.82 TTAACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGCCTAAGAGCATGCAGATTTTGGAGACATAGACACTGATTATGTATATGTAAGTTACATATCAGATCATT:1 + chr2R 5783460 3' + INE-1 140 1 67.27 TGTGACACTCTTGTTCATCTTAACACTAAACCCACATGCCCACATATTAATAATGTTCGTCTTTAACAGTTTCCTTTAAAAATCTAATTGTTTATTTTGGT:1 - chr3L 2052169 3' + Circe 7335 2 76.24 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCTATGGTTCG:1 - chr3R 11474901 3' + hopper 1375 1 66.67 TTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGCGCGGCCTGTGGGATCTTGCAACCATACTTAAAACTCTTTTGTTAAACTCCAGCCAAAGTCAAATTCATAAAAAATCGTAT:1 - chr3R 30832800 3' - hopper 478 1 75.00 AATTTAAATATGATAAATATATGAAAAAAGAGCGGCCAAGACATTTGTTTCTTGCCATTTCTTATTTTTCCGGGGGGCTTTTGGAAAAACAAACAACGGCGATGCAGGTT:1 - chrX 2408876 3' - copia 4671 1 74.55 ATGGGTTAATTACTTCATATAACAATCTGAGCTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGACATATTTTCACAGGATTGGGTGGTGGGTGGTTGGGTTGCGTGCCTG:1 - chr2L 18918914 3' - Ivk 5283 1 46.15 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTAATGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATATGTATATGTATGTGTAATTATTTCT:1 - chr3L 10506763 3' + hopper 1377 1 56.36 AGTCGACTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGCAGACCAGTCTTTATTAGCCCCGAACCATTAATTTTGT:1 + chr3L 16936449 3' - Doc3-element 4556 1 65.45 TCATTGTTCAAACAATTTCTTGACAAACTATATATACATATTCTTACTAGCAAGGACGTTTCATGAGCCACTTCACAAAAATTCGCTAAATCATTCCACTAATTGAAGA:1 + chr2L 16427087 3' + S2 1706 2 60.55 AGTTATATAAGAGGACTTTGTACTCCAATATTAGGTGGAGTGCCGGTGTGAGAGATAAAGGAACGAGTATTAGGAAAGCAACAGTTGTGATGTTTTGAAAACGCCTGA:1 + chrX 2485987 3' - Doc3-element 4282 1 70.37 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAGTCAAATCTTTATTTAGAGCCGCTA:1 - chr2R 4481387 3' - copia 4930 2 80.00 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGATCTTGATACAGAAACGATCTAAAA:1 + chrX 22717186 3' + pogo 2071 1 67.47 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGCTACATCTTAAGGCAAATACTTTTGCTTCCTTATC:1 + chr2L 5304942 3' + flea 5002 2 70.00 AATCGGTGATCGAGCACCCTCAAATACGCGCCTAAAAATGATTTCTGCCAATGGCAG:1 - 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chr2L 9257512 3' + FB 761 3 75.24 AGTCTACAAAATACTAACTACTTTTACATTATTACTAACTATGTCCTTAGCGTTGTATTAAAAGTTATATTCGTAGTAGAATGTTTATATATTTAT:1 + chr2R 19848223 3' + TAHRE 10256 1 55.21 CAAATTATTTTTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATTTTTTCTAAACTAAGACGTAAACAAAGACAACAACACGCCTCGAAAGCCCGATTGCCCATACCC:1 - chr3R 28741262 3' - transib3 405 1 74.07 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGNGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - Tabor 45 2 64.42 AAAAACCTCCGCGTGCTCTTCTTCTTGCTCGCTCACC:1 - chr2R 24743985 3' - Rt1b 5021 1 91.89 AGCCATATACTGATCAGATATGCGCACCAATGGCCAGGCGTATTTTGTTACACTTTTCTAGGCCTCTAATTAATTGATAACT:1 + chr3R 22639197 3' - invader4 379 1 76.83 CCCATAAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACGGTGCCACGCCCACTGCCTCCGCACACATACATACTCACACAGATACGCACACTGAAAAATGGCTCA:1 + chr2L 767516 3' + Quasimodo 265 2 67.62 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAACATATTCTTCAAAGCTCTTGATTAATCTTTCTTTCTT:1 + chr3L 10836602 3' - opus 7152 4 67.29 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTACTCAGAACTAAACTACTGTATGGGGACATGTATGGGCTTATACAGGCAG:1 + chr2R 892438 3' - Stalker2 12 2 61.18 CACAGACATATTAACACCCACACCTGCTTCTCCACCCATTCATCTACCTTTCTAACCGCTTTCATTTTTAATAATTTCACTCATGAAACT:1 + chr2R 10390112 3' + transib4 2400 1 72.22 TATGTGTGAGTATGTGTGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGTGAATGC:1 - chr3R 22594687 3' - accord 7038 2 72.73 CAAAACATTTCCCAAAATAAATTCGTGTAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTTATCCAATAAAAAGTGGAACAGAAAATACTATATACACAAGTCGAA:1 + chr3L 18495690 3' + 297 497 1 73.00 GAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGAAAGACGATGACGTGGATGTCCATGTGGAAAACG:1 + chr3R 9117933 3' + micropia 5276 2 70.00 GACCGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTAT:1 + chr2R 16660294 3' - gypsy9 5048 2 49.09 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACA:1 + chr2L 19681479 3' - hopper 47 1 64.55 CAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCACTTTTGTCGGCAAGGGGGTGG:1 + chr3R 23670381 3' - Tirant 100 2 69.86 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTT:1 - chr2R 6707704 3' - 1360 39 1 69.79 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAATTAAATTAAAAATTAAATCATACATAAAATATTACAAAATCAATTACA:1 - chr2R 4137686 3' + Juan 4174 1 62.73 CAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGGGTCTTTGCCGCGACTGTGTCAACCAAATGCGTTCCAGGAATATCTTAGAGATACAGCACCGGCCATTCAATATGA:1 - chr3R 29292383 3' - 1360 3388 3 62.73 TTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTTTGGCTTGTTATTCGTTTTTGGTTTTTATTTTCTCTTGTTTTTGTCTTAATTTAACTTCTTAAGAAGTTATTAATATACATTGATAG:1 - chr3L 25152987 3' - I-element 415 1 59.63 TAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATATTGTACTTTATTTATAAATATAAGAAAAAACAATTTTTAAATCAAACCCT:1 + chr2R 883142 3' + F-element 4670 1 64.29 GCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCATCGGGGGATGACTGTCTCACCCTTTTCGTTT:1 + chr2R 13105586 3' - Doc 4545 1 69.23 ATGCTTTTCCTCCTCTTCTATAACTGTCTTTTTTCGAATATATTAATTTGCTTCCTCTGATTTTGTTTACTAGATCGTTTCAGGGAAATAGCCTTTCCC:1 - chr3L 725210 3' + Gypsy12A_LTR 2020 1 69.70 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCCTGGTAGCTCAAGCGAAGCG:1 + chr3L 217380 3' + roo 9036 1 62.50 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGAGTCGAATCGCGTGCACTGCAGGGCATTTTTGCGAAAATCGTAGCGTGCATTTAGGGGCGATTCGTAGG:1 + chr3R 8621758 3' - jockey 12 1 69.07 CGATAGTCGTGAAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATACTGCCGGGAAAAACCAGTTTTGGACGCCAGATGGAACAAACT:1 - chr2L 22699435 3' + INE-1 563 1 74.16 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATTAACTCCATTATGGCCAAGACAATCCAGCTAATGGAGCCAAAACAGAGCCAGGGAATA:1 - chr3L 2965827 3' + 297 378 2 66.06 TAGAACTGTCCTCTTCCGAAGATATTAATTTGCTTCCTCTCTATCTTTTGAATTCCATCATTGTACCTTATTTTGCCTTACTTTTCGCATCT:1 + chr2L 9838881 3' + Gypsy12A_LTR 2038 1 42.39 ATAAAGAGATTGTGAATTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGTGTTTATGAATGGCTG:1 - chr3R 22500807 3' + invader3 5423 2 55.96 AGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATTACAGTGCGAGGAAGACGGTTGAAGAGCAAAAGAGAGGG:1 + chrX 3677012 3' + invader2 460 1 66.18 GAAGTCAAAACGGAAGTAAACTTCAGAGCGCCACCCAACGGCAAAAAAAGTGGGAAAAGTGTGAGTGAAAGGGCGGAGGGCGGAGGG:1 + chrX 3549055 3' + Fw2 335 1 65.52 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTTAGCTGACTGCTACTCAACTTCAGGTAGCCACATGTAATACACTACTCTC:1 + chr2R 9953361 3' + pogo 2071 1 54.55 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGCCTGTTTTTACTATCGCTACTGGCAG:1 - chrX 1503351 3' - roo 22 2 68.92 TTGTTGTTTTTTTTTTTCTTTTCAATTCTATTTGCATTTTGTTTTAA:1 - chrX 7410944 3' - gypsy7 5012 1 63.83 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAATTTAAAAGTGCTAAACAAATGCAGAGTTGCAACTTTATG:1 - chr3L 36304 3' + Tirant 8465 2 63.64 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTTTGCCGACTAGGGTGTCCAACCCAGAGCTCTTCGTCTTCGACGTCTTCGTAGTGGAAAAT:1 - chr2L 14141258 3' + hopper 1392 1 59.09 CATCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGACCCATGCGAAAAAAAAAATTTAAATAA:1 + chrX 21509819 3' + Cr1a 4420 1 83.87 GTTATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGAGTGTGTGTGTGTGTTTGTGGGATAGTGTGTGTGTGTGTGTAGTTTGAGCGAGATGTCGGCTCTTT:1 + chrX 16523152 3' - Quasimodo 40 2 55.00 TATATTTTCTAAAGTATAAACTTTTTCAAAATTCTAATGGGTGGGCAAACGATGTTCCACTGTACAAAATAACAGTGGCATTAAAAAACGCAATGCCCGGCACTCAAGGA:1 - chrX 5935878 3' - FB 251 1 52.73 TCCATGCTACTGTCTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAAAAGTAAATCATTTTGATTTTAGAGTAAATATATCTAGCAGATACTCGAGCATTCACAGAATG:1 - chr3R 10914117 3' + HeT-A 5868 1 68.18 GTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCATACAGCATTTCGTAGAGTAAAGTTAGATCAAT:1 + chr2R 18557010 3' - 297 6508 1 78.18 GGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTTGCTTGACTCTTTCGTGTGGGGACTTCGGGGACTAGAAATTACATTTGACTCCAAC:1 + chr3L 18281816 3' + 412 112 2 57.41 TCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAACCCGTCAAACCCCACCTTATCGATATTTCACATTAGCCACCCAAGTCAGGTAGCCGCAT:1 + chr2R 7456950 3' + G2 44 1 45.45 AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGTTTTGTAAATAATTGTTCTGACCTCATCAGGTTTTCATTTAAAAGAGCTGTT:1 - chr2R 18523524 3' + roo 378 1 53.64 TATTTCTTGTCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTCTTTTACCAGAAAACTTAAACTAAT:1 - chr3L 12158456 3' + 297 6924 2 77.06 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 412 7076 2 42.59 TCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGATTAATTTTCATACAGCCTTGGCGACGAAGTTAAATTTTGGGATGGCTATATTGTTCCCCGTTCTGTGGAGGGGATG:1 - chr2L 8961845 3' - I-element 4896 1 68.63 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTTTCGGTCG:1 - chr3R 24813960 3' - P-element 34 1 38.89 GATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAAGTTGCCAATGACAAACGGGTCGGGGGCTTGC:1 + chr3R 27326801 3' + FB 428 1 64.77 TAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATTCTTCATAAGCTCTGTCGTTCTTATATATTATGTTTCGAAGTTATTTAAAGATCGACCTCGAAAGTGTATTTCCCTTCC:1 + chr2L 14248107 3' - mdg1 86 2 71.82 GATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAAAAAAAAAGAGTTTGGTACATTTTTCTGTCAATATTGTATACAT:1 - chr3L 20895117 3' + F-element 4628 1 70.91 ACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACTTGTAAGAGATGCCAACTGACTGATAGGGCCTGAAAAAGAGAGAACTCCCTAGCCGA:1 - chr3L 22176895 3' + Doc 4416 1 53.21 GCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTTCGTAATGGTATTCAATGCAAATCCTGCGGTA:1 - chrX 20113511 3' - blood 427 1 70.91 GCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTTGTCATTGCCCTAGTATAAGTGTGTCCCTCCTCTCCTC:1 + chrX 2201173 3' + copia 5018 2 68.06 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATA:1 - chr2R 19405907 3' - HMS-Beagle 33 2 65.93 CTGTTGTCAAAAGTATTTACACACAATGTTTAACTCCGAATTCTTAAACGGATTAATGGTTAGTGAAGCAAAGGAAGCCATAGTTAAAAAATTTGAAGAAAAAA:1 - chrX 16632164 3' - Bari2 975 2 28.85 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGCGGTCCGGAATGGATGGGATTTGCAAG:1 + chr3R 13503038 3' + hopper 1356 1 72.73 GATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCTCTCTGTTTATTTTTTGTTCGATTTTCGCCTTTGTTGTCTTCGCTG:1 + chr3L 2822866 3' - Doc 4501 1 54.95 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCTAAATTTAAATATCTTTGTA:1 + chrX 17184984 3' + roo 391 2 59.38 AGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATTTTAAGAAATGCAGAAGGAATTTCGTAGACGTCTAGGAGCATTTTT:1 - chr3R 27816104 3' - Burdock 30 2 56.36 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAG:1 - chr3R 11526780 3' + pogo 2067 1 57.14 AATACCTCCGCAAGACTCCCCGGAGGTAACTCGTGTCTCTTGCACCCGATTTCACGCCCGTGTTGTTTAAATTAATGAG:1 - chr3L 18347989 3' + ZAM 443 2 60.76 ACTCGTATATGTCGAAAATCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATCCGCGGGAACTCGAACACTTCCTCGTTATGTGTTGTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTATTATA:1 - chr3R 29894201 3' - Rt1a 46 1 58.18 CATAAAGAACAAAAGCTAAATCCACCAGCATAGTTAAAATAAATTAACAAATAAAATAAAAGCAAAGATAATCAAAATGGCAAGCCAACAAGTTTGCCGGCAAAAAGAGT:1 + chr3R 5515287 3' + HeT-A 274 1 56.36 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGTAAAAGTCGTCAGCCCATCAGCATCATCATTCCCCATCACAGATTTTCCCCCGTATCGGAATTCGTTTACATTTTGCTTCAATTTACAT:1 - chr2L 13324535 3' - jockey 4716 1 77.27 AAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATGAAATAATAATTAAATACGAAATGCCAGGCAAGGATTTTCATCTCCTTGCCCGTCCGATCACAGGCGAAACTCTTG:1 - chr2R 18482447 3' + Tc1-2 362 1 65.14 TTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTAAAAACTAATGTGACGAAAGGCTCCG:1 - chrX 15043127 3' + S-element 1672 1 75.00 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCCTCGCTAAGGCGGCAGCTCAATGACTTATCATATACAAATTA:1 + chr2L 20526105 3' + hopper 1397 1 54.65 CCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGCTTAGAAATAGTAATAGCCGAATCATAATATCACAAAATGAAATTTCAAAACTTATGACTTGGCCAACTTTAGCAGGAA:1 - chr2L 17837735 3' + 1360 308 1 76.64 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCTCTCTCCCCAAAAAAAATCTATATAGCAATGAAGTTTGTAACGAGTTAACCGAGTAGATGAT:1 - chr3R 14995662 3' - Doc 35 1 44.55 GCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGGCGTTATGCATCTTGTTATTTTTGTTTTTTGGTTGTGGTTTGGTTTACCAAACATACTCTA:1 + chr3R 9349998 3' - 1360 60 1 58.95 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATCAATTATTGGCCAAGTCTTTGTGCTATTTATGAGAGG:1 - chr3R 29635208 3' + mdg1 7417 2 67.62 CATCTTTGTGGCTCATATTGGAGCTTGGTGGTGCAGGGCTTGGAACCGGAACAGGATACGCGTGGAGTGGACAATGCCCACACGGTG:1 - chr2L 15757609 3' - G2 55 1 59.77 GTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTTTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTT:1 - chr2R 6526153 3' - jockey2 3185 1 53.85 TTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAAAGTAATGAAAGTTTTGACAGTGCAATGAAACCGAGTGAC:1 - chr2R 14613753 3' + hobo 2465 1 63.27 TGAGTAATTGGTATCTGATAGTCGAGGAACTGGACTATATAGTTCTCTCTGCCGCGAGTCTGCGTTGCTTTTTTTTTAACACATTGGGTTTTAGATTTAGTAGGTGTCGT:1 + chr3L 8135278 3' + INE-1 548 1 57.27 TCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTACTGCTATTGAGCTTTTTCACAAACTGATCTTGCAATTAACGTTTTTGGGCTTTAAGTTCCAACTCATCTT:1 + chr2L 7059973 3' - Bari1 161 1 68.18 TGCAGCTAAGCGCATTATACTGTACGTCCAAATTAATATATAGCACGCAATATTATAAAAGCTAATGAACAAATATGATAATTACACAATA:1 + chr3L 8011478 3' - pogo 1 1 73.63 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAGTCTTGTTAATTTCGATGTGCAAAAAATCTTTTAGCTGGAAGGTGCAGCGAAATATTTACACAGCTCGAGGTAGGAGTCGA:1 + chr2R 5266055 3' - opus 1 2 80.00 CATGCATATGCATATGTATTAACAATTATTATAATATGCTTACTTACCAGCCAGCAAAATGGGTGTGGTTGGGTCCTCGACATCCTTGCACGCTACTCGATTCGCGTGTC:1 - chr3L 432219 3' + Stalker 7092 4 80.00 GTTGTTTTTTTTTGTATTTTTTGTTTTTTTTTTCGCCAACCTCTCTCGTTGGGGTGCCAAATTTG:1 + chr3R 22060199 3' - gypsy7 5010 1 81.54 AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGCACATATGCTAGTTTCTTTTTGCAGCTGCAATATTTTGCATTAATTAGAAAGTGGGCCATGT:1 + chr2R 14588928 3' - jockey 4769 1 66.32 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATATCAGAAGAAAAACGAATCGAGAAAACTCTTTTCTTACTAGCATTTATACCCA:1 - chr2R 8530723 3' - mdg1 11 2 60.67 TTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCTATAGTTTCTCATAGTCATATATAGTTACGCATATGTGTTTATGATGTATATAT:1 - chr2R 16047029 3' - Doc 4494 1 55.88 ACACACACACTCACACATATCCAGCCACCCCCTTTTTGGCCACCCAGCGAAGGCCACCCTCTTTGGATTTTGCATATGCAT:1 + chrX 19056096 3' + accord 185 2 72.84 TAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACCTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTATGAACACCACATTCGAGTGCTCGACTATTTAATACCTCT:1 - 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chr3R 5774842 3' + I-element 5323 1 64.21 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAATTCTGCATAACTGTTCCACTCCAGTTTGGTCTCTTGATCTTCCAGCCGCATATCTC:1 - chr3R 31522426 3' + Tabor 7272 2 54.55 ATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAAACAACACAACGCAACACAACGCAACGCAACACAACACA:1 + chr3R 8339246 3' - Tabor 2 2 27.27 TGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAGCCATTTAGCACATGGCTTAATCTTACCGTGCAGTTTGTGTGCCATATGAATATGCTA:1 + chr3R 29840671 3' - F-element 4585 1 56.88 AGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCTCCTCTCTCGTTGAAGGATTGCAAAAAGCGAGAGGGAGAGGAAGACAGATAAAAGATAGAAAAAATCAA:1 - chr3L 21014822 3' + jockey 4738 1 69.09 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATGAGTGATGGATCTTGCCCAGAATCCACCTATCTCCGGCTG:1 + chr2R 17806161 3' + Transpac 5198 2 55.79 TCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGATCATCACCGCGCCTACGCAACGCCC:1 + chr2R 4722631 3' + Doc 4501 1 66.00 CTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - Tabor 5 2 24.55 AAGCTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTCCTCGCAGCAGGCTAGGAGATCCTTAAGTAACAGCTGGTATTTGGTGATCCTCTGC:1 + chr3L 1024907 3' + 1360 19 1 62.73 AAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTC:1 + chr2L 21570235 3' - Dm88 4416 2 74.55 TTATTTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 + chr2R 5064835 3' - Stalker3T 203 1 58.18 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGA:1 - chr2R 10091011 3' + roo 9032 1 62.73 TTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAAAAAGGACTAAACAAATAAAGTTGCTTGCAAATGATTGTTAAAAATCTGCATAAAATGTAACACATA:1 + chrX 6924084 3' + Bica 305 1 64.22 AGAGTTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGTGTGCGTGTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGCTTATTTTTCCTATTTTCCATTGCATATTT:1 - chrX 5197857 3' - 1360 3257 1 52.73 TGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACGTTTATCGGAGAGGAAAGGCCG:1 - chr2R 17915877 3' + P-element 2735 1 32.22 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAGTATTAAAGAAGATGTTACGTCACAAAAATATTGAAAGAAGAAGAAAATTGAACTGGATTTTG:1 + chr3R 15309428 3' - HMS-Beagle2 17 2 63.64 AAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTATCAATGGAACTCATCTAATATAAGATAATTCAT:1 + chr2R 1523005 3' - FB 692 2 68.57 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCTAATTTAAGATTTTAAAATGTTTTAATTAATGTTTAAAATGTTTTAGTAAAGATTTTCAAATTT:1 - chr3L 17595288 3' - jockey 4687 1 63.89 TTCCCGTTTATGTACGTTCGTATGTGGACAGAGACTCCTCAATTTGCTCACGCGTTTCTGACTGTGGGAATTCCGCGCTT:1 + chr3L 2075443 3' - Ivk 5008 1 72.50 GAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGAATGCAATTGAAATGGTATTGATAAGCGACTTAAGGGTTAGATAATGAAA:1 + chr3L 15193298 3' + invader4 2926 2 55.45 ATCATCCAAGAAACTAAGGTCCAAGTAAAAACCGAATGGTGCTTTGGTACTCTTGAAAATATTTCAATAGTTAAAACCACGGGTAATAGACATTTAAAAAGAAAAAAGAA:1 - chr3L 18301486 3' + Fw3 86 1 58.18 CTTCAGGGGGATCTTTGAGTCATGAAGAGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATAGAAACCCCAAAAATCGAAAGAGGG:1 + chr3L 18320607 3' + baggins 5368 1 81.11 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAACTGTTTTTGCCAAACTTTTTCCAGATTATTTCACTCTCCCTTTTTTGACTGATTTGTACGTG:1 + chr2R 9664071 3' + 1360 3316 1 70.97 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAGG:1 - chr3L 5320603 3' - roo 8694 2 62.77 AGTTCGAAGTGACGGCCATAGCGAAGGTAAGGAACCAGACCTCTCACAGTTTGTGTTCCAAACAGAATA:1 + chr3R 16973627 3' - Tirant 8077 1 66.67 GCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCATACCTCGTTTCGAAGTCCAACGAGATAAGG:1 + chr3L 20139771 3' - mdg3 5297 2 66.00 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTGTAATAG:1 - chr3L 7219695 3' + roo 9036 1 59.09 TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCCGATTTTAAACACTTTTCGCACAGAATCACACTCCAAAGTGGGTGAGGCAATTGTTTACATATTCAT:1 - chr2L 3524504 3' + Stalker 6934 4 67.62 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGATTTATACTGTACAAGAACAGCGTTGTTTACACAGCTTGAAAATTTCAACAAACACAAGAA:1 - chr3L 15819337 3' - pogo 37 1 59.63 TTTACAATTTAAATTATTTTGCAAAAACATTGAACTGGAAGTCGGTAGGTGTTAGTTGTTTTTTGGCTGTGGTT:1 + chrY 986902 3' - HeT-A 5810 1 55.41 TTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATAC:1 + chr3L 19339430 3' - Tc1 34 1 53.64 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTTGTTTAAAAACTCATTTCTTATTTGATTCCGATGTCGGATTAACTGTGTTTACTATA:1 + chr2R 9950553 3' + S-element 1707 1 70.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATCTAACAGAAGCTTCATATATACATATATGCTTTACCGATTTCAAATATGCTTTCCTTATAATATTTGGTGTACAAAGC:1 - chr3L 885697 3' + roo 404 1 76.36 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGTCTTTTATTAGATTAAATAATTGATTCAACTTATACTCTTGTACTCTTT:1 - chrX 14771729 3' - jockey 4697 1 53.00 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATACAACCTTGTGGCTTTCATATGACATGGCACACACGCCGGGAGAAGTAAGGCCA:1 - chr3L 9198443 3' + 1360 3377 1 58.43 TTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGACGTCACTGGGGGATGGTATTATCTCGGATGTGA:1 - chr3L 8798228 3' + S-element 1703 1 40.37 TTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTTCTCTTCGTTTTCTCGTCTCGTCTTCGCC:1 + chr2R 10583764 3' - 17.6 67 2 70.89 TAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGTTGATGTCGACGGAAAAATGCAG:1 + chrY 864945 3' + accord 7362 2 69.44 TATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTAATCTTCTCTTGTCTTGTCTTGTCT:1 + chr2R 22289382 3' - Stalker3T 202 1 27.50 TTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACAATAAATAAATAAATAGCTGACCCCAAAGTTCACGTCCACAA:1 + chr3R 20920081 3' + G4 3533 1 66.36 GTGGTACGCGCCGTAATTGTGACACACTACTGGAAGTGCAACTACCTTCTCTACGCGTAGATTAGACTTTGTGAGACTTTGATTT:1 + chr2R 3461090 3' + baggins 49 1 67.06 AATAACTTAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAAAGCCACACACATACACATAGGCCAAAACAAAAGACTTAGGCAACGAACTTGCAGTCGAGAATTT:1 + chr3L 3697532 3' + G4 3639 1 71.57 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATAT:1 - chrX 4789117 3' + opus 498 1 76.92 GGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAATCATGTGCACACCACATGAGTCAGTCACAATGGGTCCAAATCCCACCTTTATTGGCATCATATGGCTAA:1 - chr3L 7440067 3' + roo 8760 2 62.73 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGA:1 - chr2L 19129334 3' - FB 46 1 67.27 GGTTGAGTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGTGGTGTGTTAATAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGAGGCGGCCAATTCCTCGTCCTAG:1 + chr3R 24291652 3' - X-element 4483 1 65.17 AATTAAATTAATAACAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAGAAATTAAATAAAATAAAAATAAATGGTTAAAC:1 - chr2R 15155170 3' + flea 235 2 66.36 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATAAATGCACAGCTGCGGTTGAACTATAGGTCTTAATCAAGGCTATATAACTTATGGTTCTCATTGTCAGG:1 + chr2L 12910808 3' - Burdock 6140 2 74.29 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTT:1 + chr2R 13699464 3' - jockey 4812 1 70.00 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAGAAGCGAAAAATGACATTGTTGCTGCCCCTGTTGGCGACTAGCTGCCAAATAGCAACATATGTA:1 + chr2L 13482121 3' + jockey 4971 1 49.54 AATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGCTGGAAGGATGTGTGTTTATTGTGTGTGTTTTGGAT:1 + chr3R 26599446 3' + invader4 2630 1 66.36 AAGCGGACCAAGGTGGCTCCCTTGTGGGATACCGGATAGGATTGGGCGGGACAAAATATGCTCAAGTCGCCGTGCTTGGGAACCTCGGC:1 + chr2R 7355340 3' - Q-element 495 2 66.29 CAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCAATAGCAAGTAGGTACTGAAATCACAAAGTAACTGGGCTGAG:1 - chr3R 26282904 3' + I-element 4994 1 61.82 GGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:1 + chr2R 10572710 3' - F-element 4389 1 62.96 CTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTTCGTGCCGTTTTGTTGTACGCCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCATTGTGCGCATCATAATCGCATTTGTCAT:1 - chr3R 28625901 3' - Bica 409 1 73.39 TTATTCGTTTATATGTTTTTAACTTTAAGTAGTTTCATTCTTAATGTTTCAAAGTGTGTATGTTTATTATTTGAACACATCTTAAAGGTGATGATTAGGATTTTTTTGA:1 + chr2L 9162993 3' + S2 109 1 85.32 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGCGG:1 - chr3R 9481215 3' - roo 16 2 59.46 TTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAATAAAGTAATAATAATACCTTTAAACAAAAAGAGAAATAAAGAC:1 + chrX 5165516 3' + 1360 3254 1 63.64 AAAAATTATATCTTAGTGGGTAGAGAACCGGCACAACAGGCTACTAAAGAAAAAATTCCTAAAGATTCATTCTCAGAAAACATTTTAGAAAAGAAAGGAAAAGGAAAA:1 - chrX 835607 3' + HB 336 1 23.15 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTTGCCTGTTCATAAATTTATATTTGTTTCGTACTCTCTTGTT:1 + chr3R 7500926 3' - FB 40 1 61.82 ACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTTCGTAGCATTTGAATGCATTAATTAGTGACA:1 - chr2R 19098050 3' - copia 122 2 71.82 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCAAAGGGTAAATGTCACAAAAGCTAACATAAATTGCGT:1 + chrX 14736218 3' - Ivk 15 1 38.18 TGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTAATGATGTCCTAATTTAGAGATG:1 + chr3R 31145525 3' + micropia 183 2 75.00 CGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGCCAGCTTTTCGCCCATTCCACAACGCAACACAGCTGCTGTGTGCCGCGAGTTCCTTTGTAG:1 - chrX 16251080 3' + F-element 4487 1 70.97 ATAATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACAATTTCCCAATGCCTCCGGCCACCGGAATCGGTCCACAACTCACTGTTTTAATTATATTT:1 + chr3R 25795783 3' + rover 7067 2 56.36 GAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAGCCCATCTTAATAAAGTACATATAAAAATAAATGAAA:1 + chr3R 7241131 3' + baggins 5384 1 72.73 AGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAGCTAATGTGAGGATAAGGTTTCTCGGCTTGATGGCCGCGCCCGCA:1 - chr3R 444741 3' + Stalker3T 204 1 50.91 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGTAAAAGTCGTCAGCCCATCAGCATCATCATT:1 - chr2L 13324593 3' - jockey 4756 1 67.39 TATCTTATCTTACCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTACCTTGTCTTGTCTTGTCT:1 + chr2R 22289382 3' - Stalker3T 202 1 68.33 GGATTGGGATTTAGGCAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCTTAGTCGAACTCGTATTTCCAGGGAATCAGAACGTTATATTAATTTGAACCCCTCG:1 + chr2L 1067687 3' - I-element 4978 1 60.61 CCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCCTTGCGGTACGCCTGCCCAACCCAGATACAAAAAAA:1 + chr3R 27893046 3' + F-element 4480 1 53.25 TATAATATCCCTACAATATCAGAAGTGGTGAAAATATTGAGGAAAATTCCGAGTCTGCTACTACTAGTCAAGGAGCTACTGAGAATAATATAA:1 + chr3R 13421233 3' + invader2 252 1 76.34 TAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACCCCATTTGTTTTATTCATTAATTTTGCGCAGCACTGTTGATTAAAAAAAAATATTAAAATTTTAAGTTTTAG:1 - chrY 1447538 3' + G2 3060 1 52.94 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATCTGTGCGTTCCGGTTTTGTCAGTCTGTAT:1 + chrX 19010129 3' - Burdock 50 2 73.33 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTT:1 + chr2R 12336636 3' - pogo 49 1 75.00 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAG:1 + chr2L 21034125 3' - 412 7089 2 54.13 CGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGATCCAAAACTGCATCGGCAACTGGAGCACCGCAGAGTAATTAAAACTACAGCCA:1 - chr2L 13643512 3' + Doc 4405 1 51.38 ACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCAAACAGAAAATTCAAAACACCAAATG:1 + chrX 13214383 3' + Doc 373 1 72.34 TGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTAATAAAAATAACAATGCAACAGGGAAAG:1 - chr2L 21191994 3' - I-element 5188 1 68.18 GGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCAGCGTCAATAAGACGTTAGTCACACTGAAAGGTAGTTTCCAAACACGTTT:1 + chr2R 8567395 3' + Transpac 339 1 69.51 ACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTCGGATGCTTTTCAGAAAGTTTCAATGTGATAGGAGTGCTGT:1 + chr3L 5816345 3' - gypsy4 335 2 56.84 CTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTATTCTCGTAAATACCCTTTTTTATATAACCCGCGATGGCTCCTGTATCTATTTATA:1 + chrY 251485 3' - micropia 5288 1 58.18 CAACTCCTATGAAAAACGTCTCTCATTTGCCATTAGGGAAAGGGCCATTGATGTTGACTGGTTTAGGCCCGCTCACTCCCTGATTGATTGATTGATT:1 - chr3R 14174274 3' + Bari2 582 1 73.20 ATTCGCCGCATTCAAGCTGCCCAACACTGCGCCACATGCTCCACAAATTTTTTGTTGCCTTTTGCGGCTGATTT:1 - chr2L 9166455 3' + BS3 1349 1 71.62 TCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTTGTTTAAAAACTCATTTCTTATTTGATTCCGATGTCGGATTAACTGT:1 + chr2R 9950543 3' + S-element 1687 1 55.45 CAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATCAAGAAGATTCCACCAAATTTCCCATAGTCTCTGGATTACACTTATATGTACTCCCGATCTTTT:1 - chr3R 15309313 3' + HMS-Beagle2 7182 2 63.11 GCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGCACCTCGGCAGAAAAACTCAATTAAATACACCCACCAAC:1 + chr2L 7005184 3' + 1360 3266 1 67.27 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGGCCGGT:1 - chr3L 217333 3' - roo 8710 2 78.72 AATAGACGAACACTTTGGTTAGATTTTGCCTAAACTAAGACCTAAACAAAGACAACAACAATTACAACATGGAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' - transib3 385 1 73.58 GAGTTGGGCCACGCCCATTTTTTTAAAATATTCCCAATTGACTCATTTATAAAAAGTTCATCCTATTATTCATCTATTAACTCAGCATAAGGATATAAATCATGAGATAC:1 - chr2L 11090855 3' - hopper 115 1 71.82 CATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAATAAAAAGCCATTGAAGGCATTCTTACACCAGGCCG:1 - chr3L 12658072 3' - 1731 4545 1 60.00 GATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTAT:1 + chr2R 5173187 3' + Stalker4 351 4 75.45 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGAGCCTCACTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTG:1 + chrX 12649916 3' + P-element 2842 1 40.00 CCGCTTCTTAACCGTTTGGCTATCGTTTTTTTTGAATCTACCGT:1 + chr2R 6433219 3' + Circe 56 2 90.91 AAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAACAACTAAGTCGTCGGCCTACCATAGTAAGAAATTCGGAAAAAATCAGAAGAAATTTGAAGCCCATTTCATGGATTTTT:1 + chr3R 4945637 3' + Burdock 293 1 75.00 GTTTTCATTGAGTTCCGAAAAAAAAGGAAATTATGCTGCCACACCCGCACATTATATAGTCGGAAACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACATACCTTTCAACGAA:1 - chrX 16255048 3' + mariner2 867 1 77.14 ATTAAATATACAAGAAAATAAATAACAAATTCCAAGTTAACACACTTTTGAGACCACAAGCAACGATGATTTAATTTTCCAACACGCTTTCTACCACGCCAGCATAAA:1 - chr3L 9038247 3' - S-element 1556 2 53.70 AAAAAAAAGAAAACAAAAAAAAAAACCAAACCAAAACCAGAATATAAAAGCCAGCCACCCGCTGT:1 - chr2R 16329290 3' - hopper 148 110 83.08 ATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAACTCGATAAAGTCGAACGGGAAACTGTATTTTTGGTGAGAACTTCTTGTAATCACTGCGGCTG:1 + chr3L 18071914 3' + R2-element 7 1 59.05 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGC:1 - chr2L 19129351 3' - FB 27 1 74.32 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGGAAAAATATAAAAAAAAAATAAAATTTAATAGTTTTAATAATCTAAAAATTTAATTTCAATACAAT:1 - chrX 18021021 3' - Doc 21 1 45.87 AGGGGTTAAAACAAAACGACAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGGTTATTCAATGATGTGCCAGATTGTGAAAGGGATAATGGATGAAGAAAGGGAGGGATAATGG:1 + chr2R 20888553 3' - Transpac 163 2 55.66 CATCCAAAATATTAAGCATTGGATAGGCAACAAGAAAAATAAACGAAGACACAATTAAACAATAATAATAATTATAAGTGTGCACGGAAGTACAAAGTAAAA:1 - chr3R 10744551 3' + invader3 4988 1 74.51 CCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGTATCTTATTCGT:1 - chr3R 7049662 3' - 1360 56 1 77.27 ATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAAGNTTACTGACTCATCAAATGCCTAATAGTTTGATTAATTATAAAAAGTACAACTGCCTGC:1 + chr2R 22715462 3' - 1731 199 1 57.27 CTCGACATTCATACCGACAGACTGACAAACCATTGGCGGCAATTGGGACACATGGACACACACTATCGCAATGGGGCCAAAAACAAGAGA:1 + chr3L 2802459 3' - INE-1 129 1 62.22 GAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAT:1 - chr2R 5064832 3' + Stalker3T 202 1 74.70 AATTTTAACTTGCGGTCATACGGAATTTTGTTTTGTCGCGCGAAATATTGAAAATACGGCGAAATAATTCCGGCTTGTGGTTCCCGGCG:1 - chr3R 28105430 3' + gypsy12 303 2 68.54 CACACCTGCTTCGCCACCCATTCATCTACCTTTCTAACCGCTTTCATTCTACGTATTTTCATTCTTGTTGTTCTTTGTCTGCCTCTGTGTGTGT:1 - chr3L 14860923 3' + transib4 2418 1 56.38 CCATCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCCGGCTGAGAGGTGACCCAGCTGGCGTTTAGCCCAGATGGAAAGATGTTGGCTG:1 - chr3R 23255885 3' - Rt1a 4669 1 58.23 CTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATTAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGG:1 + chr3L 25232871 3' - accord2 7440 2 66.33 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGC:1 - chr2R 6984310 3' - HMS-Beagle2 6894 2 65.96 TTCTAGATAAGTTTGCACTCCTTTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATTTTGTTGTTGCTTAATAATTTAACAGTTTTACAAAGATTGTTTTACATTTAC:1 - chr2R 12522809 3' - Tc1-2 1220 1 54.55 GACTTCAGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGGAATTCGCTGGCTGGGTTTT:1 + chr2R 14650630 3' - jockey 32 1 64.29 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATACACTAGTGAGGTGGACTAAGGAATTATTCGAAGCTACCTTTCGCAA:1 + chr2L 14708936 3' - opus 37 4 57.27 CACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTCTTCATATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTACCGATTTGCAAAAAGGATTCTAAAATATCCGCCCAAAATTCCAGCAAAATAT:1 - chr3R 15159769 3' + INE-1 261 1 65.45 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATA:1 - chr3R 17673774 3' - FB 54 1 74.55 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGGATACCTACTATCTGACTTAATATGATGAAAT:1 - chr2L 7750563 3' - opus 7160 4 69.70 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTGCAAAAGTATTTGCATACTTTTTGGGGCTA:1 - chr2L 2484345 3' - jockey 4700 1 54.55 GCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATGTTTCTCCATACCTAAATACATAT:1 - chr2R 2323721 3' - gypsy 44 2 75.00 TACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAATACACTGGCTGGGGGG:1 + chr3R 16863322 3' + BS 5060 1 78.26 TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATAAAAGCCAGTTTATTAAGCTGTAAATTCAGGATCCCATTGAGAGAGGCAG:1 + chrX 22806752 3' + Burdock 6376 2 59.55 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGGCCG:1 - chr3L 217335 3' - roo 8713 2 81.05 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACACACGACGAGGAAG:1 - chr2L 9147964 3' - Doc 31 1 58.33 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTGCGTTTTCATTTTTTCATCTCCTATATAGCATATTTCTTTGCGCTCAATTTC:1 + chr3L 19347228 3' + jockey 4954 1 51.82 GCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATAC:1 + chr2R 330184 3' - HMS-Beagle2 6940 2 77.27 AAAAAAGTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATACAAAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGGGCAAGCGCAATAAACTTTTACGACGAGTGGCAAGTGTCAATCTAAATG:1 - chrX 12261382 3' - S-element 320 1 55.45 ACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACCATCACAGCCATAAAGTATATTAATAACTCAAGAACCAAACCAGATAAGAGCAAGAATCAAATTGAATAATA:1 - chr3L 2820187 3' + Doc 251 1 67.92 GATTCTTAAAGCTAAAACAATATTCTTAGGCTATTAATTGCGCTCTCGCTGCCTGCCAACGTCATCGATTTATAAGTTATGCAAAGAGCGG:1 + chr2L 12972964 3' - gypsy11 342 2 58.24 AAAAAAAAAACGAAAATAAAATAATAATAATAAGAGAAATATATAGAAAAATAATACACTTTTGTGCCATTGCAGACGAGCTCGGCGGCG:1 + chr2R 13754079 3' + Doc2-element 252 1 80.00 ATGCGTAGTTCTTAACTCTACACGCATTGCCAACACATCTAGAACAACCACAACAGAGTCATCGACAACATCCACGCCAATTCCAACATCGACG:1 + chr3R 6308517 3' - invader1 3863 2 61.70 AATTTTATGGAGGGAAACATTAACGTAGGAGGAGGATTTTTACTGTGCCGGGAGTATCCTTGTTGATTTTCGCCAACGTCAAAGCGATAATGGGAG:1 + chr3L 5506399 3' - G2 3008 1 70.83 TATTAGGCATGGACTGGGCCCATAACCTGTTGTAACTTAATGCTGGAAGTAGTGCATGATCCATATTAAATGAAAATACGTAAAAAGTATCATCCCTTCTCTCAATTTTA:1 - chr2R 5153637 3' - copia 282 1 68.18 CGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATAGGGACTATATAGAGCAGGAAACGACTCCATCTGTTTTACGTACTTCTGTTT:1 + chr3R 7436638 3' - gypsy3 10 4 66.30 AAAGCCGTGCGACCAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGACCCAGAAACCATCGAAATCCCAAAGACAAAGAGACCCACACACACAACGAATTGAAGAATA:1 - chr3L 14216147 3' + G4 483 1 57.27 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACGCACAAGCAGCTACAATTTGTTGCCTACTTTCGGGCGCTCCATATCCTTGCAACTTGCTCTCTCA:1 - chr3L 10702598 3' + hopper 1406 2 68.93 TAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGCCTTTATGTACGTGCATTCCTTTTGTGCTTTCTTGCTTTTTTGCGGCATCC:1 - chr2L 3925785 3' - accord 7125 2 61.18 TCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTATGTATAATACATACAGTTTATCTAAACAAAATGGTTCGATACCATCGAAA:1 - chrX 22489609 3' + S-element 1687 1 53.64 GACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATTACTACACTGTTCAACGAAACTTATAAAATATTGCTTACTGAAATTGATGTTTTTAG:1 + chr2R 21170773 3' + Gypsy6A_LTR 381 1 55.45 AACGTGGGAACGTGACGATGGGGAGAAGTTCAGGAGGAGTTTGTGAAAAGTAAAGAAAGTAAAACTTCAGTGTGCTCTACTACAATTAAGTT:1 - chr3R 20302465 3' - Idefix 236 2 77.17 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGACCTGGCCAAATCCCTATCAATCGGTCGGATTTGAATCCAATTCCCAGAACAATTAGTTCCGTCAGCTC:1 + chr3R 11474992 3' - hopper 15 1 67.27 AGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGAGCGCGCGCGCGCGCGAGCGCGCGAGAGAGGGAGCACATGAGGAGAGGAGAGAAGAG:1 - chrX 2255188 3' - blood 7179 2 39.13 TAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCAGCAGAATTTGGGTTCTTATTATTCTTAGTGTCTTTGTATTAAGCATTCAGTCGACCTTTTTATATATTAAATTCTT:1 - chr3L 24204086 3' - Quasimodo 154 2 53.40 AACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCGGGATTTATTGTCTTGCAGAATGCGAGTCCTGTGAATGCGGGGAATGGAAA:1 + chr2L 1351083 3' + F-element 4385 1 56.25 TTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGGTTAAGTTCCTAATTGAGTTTATTGTAGCTCCC:1 - chr3R 30521714 3' - G5A 2792 1 66.67 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATCATAACCGATACGGATTCCTGAAAGTGCTCTATAACGGATATGCCA:1 - chrX 8279770 3' - blood 39 2 60.75 CTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAACGAAGCGCTGGCAGCCAAAAAAGATACTAGATACGAGACACTTGAGCAA:1 + chr2R 20297745 3' + Bari1 1614 1 57.41 GCAGTATGTAGGGTAAAGCCATTGACCCTGAAGTTGGACCGGGAGGAGAAGCAGCTCAATAAAAGCGACGATTCCGACTAGAAAGGGCCACACTGAAAAC:1 + chrX 6510960 3' - G5A 161 1 53.00 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTTTTTTGGCATTCACATCCCCC:1 + chr2L 17574441 3' - hopper 8 2 60.53 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATTTTTCCTGGCATACAAAACTAAATTAG:1 - chr3L 5971688 3' + pogo 2070 1 72.73 AAGTGAGTCGTGAGAAACGGGAATGTCTGGCCCCCACCAGACCTTTTCCATCTGGCCCTTCACGTTCCGC:1 + chr3R 30551033 3' - rover 7134 2 61.43 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCGAATGTTTAA:1 - chr2R 8397420 3' + 412 474 2 47.27 TGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATCTGTGAATAGAGGAAAGGTTATAAGGCTATGAACTTTGTACCCGTTGACTT:1 - chr2L 12002543 3' - Quasimodo 163 2 69.33 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT:1 + chr3R 21211613 3' + Stalker3T 205 1 63.64 TACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCCACAGTTGCAAGGATCTCTACAGACGCTGTTCAGGC:1 + chr2L 4481953 3' - invader3 257 2 62.89 GATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTGCCGGTCTGGCTACTCGAATTG:1 - chr3L 10911491 3' - gypsy3 5 4 69.77 CAAGAGACGAGAACGCGTATATATATGTTGTGCATAAAAAAAGTACATATAGTCAAATGACGCACTTCAAG:1 - chr2R 17912612 3' - 1360 3229 1 56.34 TAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCTATGGATGAACGCTTTGATGGTGTGCGAGAC:1 - chr3R 19537511 3' + hopper2 1556 1 71.43 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATAT:1 - chr3R 13437147 3' - hopper 4 2 58.76 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGACAATCGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAAAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 203 1 50.91 GTGTTTGTCCCAGCGTTTCTGTATTTCTTGATATTTTTTCAGCAATTTGAAACTTTTGTCACTATAAAAGTGTACAAAATAATTTCAGGTTTTTATATTC:1 - chr3L 17654393 3' - Tc1 1605 1 79.00 TCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTTTCTTCTCTTTTCTTTTGTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTA:1 + chr2R 5064833 3' - Stalker3T 205 1 67.27 AAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGGAAACTAAAAGAAAACTAAAGCATATTATGTCAACTGTTAATTGAGTTG:1 - chr3R 15054934 3' + Bica 475 1 61.11 GGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - Doc 4538 1 80.49 TGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTAAGGTTGTGACCCCCGGAAGTCGGCGCCACAATCAATCAATAT:1 - chrX 17238144 3' - Idefix 174 2 61.82 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATCGTGTAAAATCTCTGGAAGAGTTTATCATTTCATTTGGCACACTTAATGTT:1 - chr3R 12452935 3' - roo 8692 2 55.24 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCAGCTTTTTGGTATGTTTTGTACATTTTTTAT:1 + chr3L 5971738 3' - pogo 51 1 70.00 GCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAATGGTTGAGTGGAAGAGAGTACTGGTTTTCGAAGTTAGATCAAGATGAAAGAAAAAAGGAAATTGAAAATA:1 - chr3L 17214453 3' - 17.6 167 2 38.18 GAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAATTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGTG:1 - chr3R 22500821 3' + invader3 229 2 66.99 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAGTATTAAAGAAGATGTTACGTCACAAAAATATTGAAAGAAGAAGA:1 + chr3R 15309410 3' - HMS-Beagle2 27 2 53.92 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCACCAGGCCCACATACG:1 - chr3L 25455111 3' - HMS-Beagle2 6898 2 64.44 AATTCAAATTCAAATTCAAATTCAAAGAATCGCTTGCCTACTTTTAGGCCAATTAACATTTATATTCTCATTGATG:1 + chr3R 21917746 3' + Rt1a 310 2 78.95 TATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGGCTAAGAGCAAAGCTACCACAAATGATGATGGTAATGATGATGGCG:1 - chr2L 21064913 3' - 3S18 5 2 66.67 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGGAGTGGATTCTAACCAGTTGATCAACTGTGATTTTTGGTG:1 + chr3R 19446512 3' - roo 8707 2 67.59 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCT:1 - chr2R 9871065 3' + roo 9044 1 72.50 CAAGCTGTGGGTATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTTCAAAATCGTTTCTTCGCGGTTTCTAGATAAAATCGGGGGTAAACAGAGC:1 - chrX 15547943 3' - Tc1-2 1291 1 80.00 TATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAAATTAAGAACTAAACATTGAGAATTAGAGTAAGCCCTAAGTATGCTGTGTATGTCTGGCAG:1 + chr3L 25508870 3' - Tabor 419 2 61.54 ACGCTCAGTTGGCCGTAAAAAGGCGCCTCCGGCTCCTGCAAAACAAGAACACAAGGTTACACTACGGCG:1 + chr2R 24130450 3' + Rt1a 4827 1 72.46 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Tabor 6871 2 55.10 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTTTAAAATCATGAACTTCAATTTTAATTTCGAATTTGGCGAAAAGTTTTAATTT:1 - chr3R 7049608 3' + 1360 3387 2 79.09 TGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATAACCCCCACCCCCCTTGGAATCATGATCTTTATACTTTAATCACCTCTTTGTCCTC:1 - chr3R 23729961 3' + Burdock 251 2 70.00 TTGAAGACGTGCGTACAAGTTCTCAGGTCCTTACAAATGAAAACAGGTGGTTTAGCATGATGCGATGCGATGGATCGGTTCTGATTTGCCTGCATTGCATTGGGGGATTA:1 - chrX 4989649 3' - Chimpo 3945 1 58.18 AGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATCCA:1 - chr3R 23020830 3' + INE-1 567 1 45.26 TGAACACGGGAAGTAATAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCAGGGCTCGCTTTCAGCTGTTTGGCAAGAATCATCACTGATACTC:1 + chr3R 23592129 3' + invader2 5036 2 60.00 CGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTATATACCAGGGAACTCCTGATATGCACTCAATAT:1 + chr3L 25551317 3' - Chouto 54 1 96.36 ATCTGTGTTTCGCAGGCGACAAAATTCTCCACCTTCTTCTCCTTTCAGCGAATTTTCCAAGCGCGGTGCTCTTGACAATGCCGAT:1 + chrX 20502458 3' + gypsy12 9946 2 52.94 CCTGGAGCCAGCTCTAGAGCCACCAGCCCGAAAAAAACTTTACGGCATGGATATACACACATG:1 + chr2L 3082022 3' - 1360 66 1 60.32 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACGGTGCTTCATCCACCTCCTGATGGCATCGCTTCGCGAGGGTGCTGAGGCCTGCTGCTGGTGGCG:1 + chr3L 22108203 3' - Transpac 2 2 77.27 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAGCTCTTGTTTTCATTCCGTTTTGAGCAGCGTGCGCGTACGGTGCTTTCCTCGCATGAAGAGTATAAACAA:1 + chr2L 20797753 3' + P-element 2876 1 71.03 AAATAAATATATTAAAATATTTAAATGTTTCGCATATTTTATTAACGCCAGCATTGCTATTTCATTG:1 - chr3R 19151987 3' + G7 1149 1 79.10 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCAGCTTTTTGGTATGTTTTGTAAATTTTTTATTACAATTATCTTTGCC:1 + chr3L 5971754 3' - pogo 35 1 55.45 AGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAAATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA:1 + chr3L 22908067 3' + Stalker3T 204 1 68.18 TCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATATTCTTTATAGGCACACGAACCGAGGAAAATCCTCTAACG:1 - chr2L 17439727 3' + S-element 1516 1 61.18 AACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCACACACACACACACAACCTTTAAAATACAGAGAAATACAAAAAAAAATAAAACGGAGTGGCAACGCACA:1 - chr2R 10579259 3' + FB 404 1 64.00 AAAAAAAAAATAAAAAAATTGGGGGGGAAAAAAAGTAAGCGAATTATGAAAAGAAAAGCCTTTTC:1 + chr3L 543287 3' - hopper 141 2 52.31 TAAGAAGATCAAGAAGATAAGATAATAAAGGAGCACAAAAAGCGGACACCCAAATCAAAATGAGAAATCGCCACCTTATA:1 + chr3L 6508706 3' - Ivk 117 1 73.75 AAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAGTTAAATTGCAAGCTAATCGATCCACATATCCTTGCAGTAACCATTCGCCAGTGCTGTCAGAC:1 - chr3R 17875521 3' + Doc 4461 1 67.01 TTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTCCTCCAGCGCCAGCAATTGCTGTTTGTCCGAGTTGATCTTGACCACCAGATCGTTACGTTGGATCTCCATCGCGGGCA:1 - chrX 18075344 3' + G5 4730 1 73.15 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGACCGGAAGCTGGTGACC:1 + chrX 13623832 3' - jockey 4745 1 70.18 CATATTCACATACAAAACCACATAACTGTTGCTGTGTCCTTTTATGACAATTTTGTCAGTACAGTTCATCTAAGGAATCGCTTTCCATAT:1 + chr4 671251 3' + 17.6 6 2 76.67 TATATTTGTATAAGTATATTTATATCCCTGCCTGAGTGTGTGGCTGTCGTTTGTGTGTGAGTTGTTTTTGGGGTTTTGTTTCGGG:1 + chr3L 963251 3' - Stalker 6937 4 76.47 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCTAACGCTTTTACTTT:1 - chr3R 25051571 3' + 17.6 466 2 58.18 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTGCGATGAGGTGGTGCAGTGAGCAACAAAAGCAGAGGCAAAGGTAAA:1 + chr3R 13437235 3' + hopper 1379 1 58.18 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATATCTAGATCTATTTCACGTCGCAATTTTTTACGTAAATTAGTT:1 + chr3R 4514593 3' + Tabor 445 2 61.68 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAACAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACCGGAAGTTGTATCACACATGTACATATCACACATTCAGCGCTTG:1 - chr2R 14661094 3' + hopper 1387 1 51.00 ATATACATAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Doc3-element 4442 1 69.79 CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAAT:1 - chr2L 19129346 3' - FB 58 1 78.18 CAACACACTCTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAAAAGGTAAGCGGAAAAGGGAATGAAAATATAGAAAGGTAG:1 + chr3R 9174696 3' - Circe 7397 2 64.55 ACGACAGGAATAACGGTGCCTGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGAGGTTAATTAGACTATTTGTTTTTTTCCAAGATCGCGATTA:1 - chr2L 4354670 3' - Chimpo 307 1 56.67 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATAATCCACTAGCAGTTCGTTGTT:1 - chr2R 19405886 3' - HMS-Beagle 16 2 61.05 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCAATAAATTTTGCAATCATTCTCGCATTTACTCACATTCCTCTGAGCAAGGGAAATATATTACG:1 + chr3L 14059953 3' + copia 5043 2 69.15 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGCCAAGCAAACGGCGCCCGTGCTTTGCTGTCAAATCT:1 - chr3R 12605023 3' + jockey 4948 1 67.31 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATCAATGCGATTAATTACGAAATGAGCAATGCCGC:1 - chr3R 23861059 3' + pogo 2090 1 66.32 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCT:1 - chr3L 7846481 3' - 3S18 47 2 79.57 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTATTGATGAAAAGTGAAAAAACCAGTAACAATAAACAT:1 + chr3L 8919696 3' - roo 8711 2 68.18 CTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCGACTTTGTATCGCAACGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCACTTGTGTAGGCGTCGGAAAATTGAGACAACAAAAGGTAGAGGG:1 + chr3R 19531583 3' - ZAM 8068 2 72.22 ACGTAAAAAACGTAATTTTTAGTTTAAGTGCATGCAAAAAAGAATGATGAAGTTATACAACAATCATGCGCTTTACTTTTTTGTGGATTCAAGATTCGTTACGTTATGT:1 - chr2R 6271509 3' + Circe 7026 1 84.40 AAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Doc2-element 226 2 64.55 AAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGTTCCGTGTGGTCACAATATGTTTTGTATGGAGTGCGCCAATCACATCTGTCTTTCTATGGATG:1 + chr4 685963 3' - 297 322 2 63.30 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGCGTTTCTAGCGGGCACTCCACCC:1 - chr3R 23943206 3' + P-element 2848 1 34.83 AAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTGTTACAGCAAAAGTTCCTCTAATTACCGGCACAAAAAAAAAACAAAAAAAATAATACAA:1 + chr3L 8472431 3' + jockey 4893 1 61.82 GGCGCGCATCCAGCGGCCGCAACAGCCACAAACAACTAACACCTACCTGCGATCGCTCC:1 - chrY 986881 3' + HeT-A 5648 1 88.14 CAAAGACCAAAAATTCTCTAGTCTTGGCTAGTCGCGAAAAAAGTCACAAAAATTGAGCGAAAAAAGAGAAAAACAAAACTTTTATTCAAATTTTATGCTTTACAACGAAA:1 - chr2R 23818567 3' + Tc1 336 1 78.18 GAAAAATGCAAAACAATTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAACCACACACTCGCACTTGGGGCAGC:1 - chr3R 9904712 3' - Cr1a 180 1 65.22 TAGGATCGGCGGACACAAGCACTCACTTACAAAAGCACAGTTTAAAGTGGACTACAAATAAAACAGG:1 + chr2L 15978966 3' + FB 1047 1 62.69 TGCCGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAAAGACGAAAATAATGGAAACCTCCATACGCAAGAACAATTTCTTTGCCGATAAATTGAGAACCGAACAGAG:1 - chr3R 11783885 3' + TAHRE 270 1 62.86 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAATTTCATAATGTAATAAAATAGTATTTTTATTAACAATGATTTTCCTGCATTTACCCCATCGTAT:1 + chr3L 18915235 3' + 412 474 2 63.64 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATGAGAACCAAACTAATTGAACAATTGGAGCTGACCAACTCGAGATACGAACAAATGCGAACGCATTACGAGGAAAAAC:1 + chr2L 10416795 3' + Stalker3T 201 1 72.48 TAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTCGCAATTTAGTGTTAAGAGTGTGGAATGATGAATACTGTATTTCTGAATACTCGAATACGTCGGAA:1 - chr3R 14806946 3' + invader2 191 2 70.00 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATCTCCTGGGGACAAAACTAAATTGTGTTTAATTATTT:1 - chr3L 15408466 3' - jockey 58 1 66.36 GAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATGTGGCGAGCGGGTAAAAA:1 - chr2L 12252642 3' + Tirant 480 1 79.31 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGGAATGTCAACGAATGACAAAGGAAAACATTTCG:1 - chr3R 5219242 3' - Doc 61 1 79.82 CGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAATCAGCCTATGTGTGTGTGCACGGGCAGCAG:1 + chr2R 1577802 3' + Quasimodo 252 2 66.67 AAACTTATTGTTAGTTCTTATTTAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTTGACTAAAAGTTGGCGAGGGTACCTCAAGTCGACACACACTTTTTCA:1 + chr3R 30255580 3' + F-element 4635 1 59.18 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTACACAAACACACACACACACAATA:1 - chr2L 3828520 3' - 297 1 2 80.73 TCCCAGCTATGGGGGAACGCCAGTAACAGCAGCGTAAAAATCATCCAACAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACAGCTCTATGGTACTGCCAGCAACTCAACTACAAATT:1 - chr2L 8734972 3' + Fw2 3560 1 53.64 TTAGAGTATTCAGCTTGTGACGTTTAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCCGATCCTAAAATATGTGAATTGGCACCACAACTTACAGTTATTACAT:1 + chr3L 23001102 3' + 1360 413 1 58.18 CTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTGTAGCAGTGCAAGTTTGTAAAGGTGTTAGTCTCAAAATAGATCA:1 - chr2R 4744034 3' - Idefix 343 2 56.99 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - copia 44 2 27.37 GTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTGAGCATTTTTTATCTTATTTACCGATTCGCTTATATTTAGCATTTGT:1 + chr3R 26998082 3' - I-element 5324 1 61.86 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCC:1 + chr2L 19681488 3' - hopper 38 1 56.36 CTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGAATTTATTTAACATGATTTGGTGTGTAGTTTATTCATCGTTTAAATGTTCTATAGTTTATACATATACATGAACTAGTTTCT:2 + chr3R 12623817 3' + roo 409 1 80.91 AAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCTCGCTTCTTCTTGTAATCATTACATTTGTTTCATTTTCGTTACTTATTT:1 + chr3R 1875772 3' + 297 448 1 55.45 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATAAAAATCGTGTTTATAGTTCTATGATTTAGTCGA:1 + chr3R 13481249 3' - roo 8679 2 61.96 AAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATCACGACTACTTAAAAGTTTATTGAACTGCATTTTTTTATGCATTCAGAAGGTGATGATGAAATTA:1 + chr3L 15815058 3' + Stalker3T 203 1 62.73 CATCCTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGCCACCTCCCAAATCCCGAATCCCAAATCCCCGGGCTAGAATCTCGTACCCTCGTCAA:1 - chr2L 8581775 3' - G5A 441 1 55.67 CTTGCTAACATTTTTGTTTGTTTCACTCTTTCATCAAAATACTTTTTCCTGCAACCTCTTGGTTTACTTTCGGTTCTGCTGCTGTGAAAATGTGTGGTAAATTCT:1 + chr3L 19781600 3' - Fw3 3064 1 60.00 AAATAGTTTTTAGGAGAAATCAACTCAAATTATTACCAACACCCATTTGTTCTCGACTTTAATTCCTGTTTTTGTTAATGTTTTTGATGTTATTCTATAGTT:1 - chr3L 4811968 3' - 297 6900 2 76.47 AATTGGAGTTCATCATTACACAAGGGGTCGGTTATTGAACCGCCTTTAAATCGCTTGAGTTATGTTGATGAGGGGCTGAGAGGGCTGTCAAAAGGCA:1 - chr2L 6243634 3' + 412 495 1 75.26 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCGAATGGGCGGCAGTGG:1 - chr2R 19677812 3' - hobo 24 1 72.73 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGCTGCACACAATCACACTCTC:1 + chr3L 13228539 3' - P-element 43 1 38.32 TTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTGTCGAATTAAAGAATCACATGAAATGATTAGCTTCTGATA:1 + chr3L 3673512 3' - 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G2 3016 1 77.27 CAAAAAAAAAACAAAAAAAACAAAAAAACAGATAATAAGCAGAGATCAGTCAGAGAGAGAGAGAAAAGGTGAAAAAGACATACTCCA:1 + chr3L 6704991 3' + R2-element 3585 6 77.01 TTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGGCGTTATGCATCTTATTATTTAAAATGTCCTTTTGTTGTCAACCTCAGACTTCTTGTCTT:1 + chrX 20550388 3' - 1360 76 1 64.55 CGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGTGCCATCGCTAGGAAGGAAAACAAAACAAACACTTTTTTACTTTTTCATCTCTCGGATCGTTCG:1 + chr3L 10664754 3' + invader1 98 2 69.39 ATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAAATACCATTTTGAAATCGATTCATCTGATGCAAGCTGCAATTTGTTCGTTCGTTGTGGTTGCGGGAATGTTTTGTGGTTG:1 - chr2R 16791506 3' - HeT-A 5973 1 76.36 AGCCTTCGCGTCAACCAACAGATCCAGATAGATATGGAGTACACTTTGTATTTGTTATTCTGTGAAAGCAAATAAAATACATTTTCTATCTG:1 - chr2R 18347500 3' - Gypsy12A_LTR 469 1 81.52 CAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCCTTATGTTTTTGTTTCATATTTTTAG:1 - chr3L 4346844 3' + 3S18 73 2 73.20 AAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATTCTAATTGTAATTGCATTTGCGACATTCGAGGATG:1 + chr3R 20180216 3' + flea 325 1 71.72 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTATTGATGAAAAGTGAAAAAACCAGTAACAATAAACCTGCGAGCAGCAGACAAACATTCAGAC:1 + chr3L 8919721 3' - roo 8686 2 60.91 GTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCGTTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTATTTTAATTTGTCGGGACATCTTTTCAATGTCTG:1 - chr3R 19445387 3' + diver2 4645 2 62.50 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAAGTGGATTTTGCAGACCACAAAATGGCTTAATAGGCGAGCCCAAACTTTGGGTTTCATTAGCATAAACG:1 + chr3R 13183309 3' - hobo 1 1 75.26 TAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTCCCTGGAGG:1 + chr2L 22225085 3' + G5 4784 1 79.09 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGTACAAATAAATATACATATTTTTTTTTTAATCTGTAGTATATC:1 - chrX 3091929 3' + opus 458 2 63.64 GTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACATATCCAGCGAAACAGGGCCGAAAACCGAA:1 + chr2R 13379729 3' - accord 7039 2 67.05 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATAT:1 - chr3R 9435819 3' + roo 9052 2 55.43 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTTGCGTTCCACATATGATAGATGTTAAATATTTTTTTGAACGAAATTC:1 - chr3L 9419520 3' + S-element 1679 2 61.82 AGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACCCACCCGAGCACCATGAGTCCATGAGTAATCTGTCTTTGGAT:1 + chr3R 22718253 3' + Quasimodo 4 2 59.22 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGGACAAGGATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAA:1 + chr3R 19446917 3' - 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chr2L 3118491 3' + G2 2866 1 54.39 ATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGAGAGAGAGTAGGAGAGCGAGCAGCTG:1 + chrX 11817849 3' + P-element 364 1 33.71 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTTTAGGGTGGCCGAGAAGGTGGGAGGGGGAGAGGGGTGCGGGTG:1 + chr3L 19457172 3' - jockey 17 1 57.69 AACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAATAAATAAAACTTTTTCCTCACATCATGCT:1 + chr3R 4554368 3' - Bari1 39 1 74.19 CATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGCAGTTAAATAGTGTAGCCCGGAATGTCGTGTCGGCATCACCCCAAGTA:1 - chr3R 5154116 3' + diver 123 2 61.11 TCTTATCGTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCACTTATATTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTC:1 - chr3L 22908067 3' - Stalker3T 205 1 20.00 TGGCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGTACGTCATTGCATCTGTGGGCATAACAATCAGCTATCAGACGGCCTTTTTGCTGAACAACCTTTCGGAC:1 + chrX 15974619 3' - INE-1 350 1 71.82 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATG:1 - chr2R 20924222 3' + mdg1 7416 2 71.15 TGCATCTAGTATGACCCTAAATTAGTGTGTCACAGCTGTCCGCACACACACAAACACACAATTTATCCGCTGTTGGATTGAAGTAGAAGTTGGCAAATTTCAAGTT:1 - 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F-element 4462 1 55.56 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAATTAAAAGTTAATGTAATAATTAAATACATTCGCAACTGTCAATTAGCTCAGTAAACAATTAAAAGATTT:1 - chr2L 16529170 3' - blood 4 2 75.45 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATGATTAT:1 - chr3R 15697040 3' - 3S18 42 2 59.63 TAAAATAAAATAAAATAATAATAATAAAATAATAATAAAATAAAATAACTATAAAATAAGTTCCCTAAATATAAGTGCCTTTCATTAAAATTTTAAACAAAGTATTGCGG:1 + chr2R 7416328 3' - transib1 1894 1 63.64 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAATTTAAAAGTGCTAAACAAATGCAGAGTTGCAACTTTATGGTACAGACTGAGGGTAAAAGAGCCATTAGAG:1 - chr3L 36273 3' + Tirant 389 2 70.00 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACACACAACACACACACAGACATAGAGAACATATACACCCACACAAATCCAGACCTGTTCCCAAATTCGAATCGGGTT:1 + chrX 11801144 3' + S-element 1711 2 75.23 GGAGCGAAGAAACCGCCTCTCCTACCCCCTCAGAACTCGTCGTGTGTGCCTAGCCTGAAAGCATATCCATTTCACGCCCACGTGCCGTGCCTTC:1 + chr3R 30614299 3' + Doc 424 1 75.53 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAATAGAGCTCAACTGGCTAAAGTATGAAGAATTCAAATAAAATGAATGAAGATTTGTTGAGACCAATAAATT:1 - chr3L 5400106 3' + jockey 4907 1 63.64 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATCATATAGATTGCTTTTAACTATAGAATG:1 - chr3L 13023970 3' + 412 7532 2 61.82 GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - Quasimodo 61 2 74.51 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATAAATATAACATGAAAACGTTGCAAAAAATGCAAAGCTCTTAATTACCAATTAATGGTTGGCCAAGGCAAAGCTTTTACGACTC:1 + chrX 3092044 3' - opus 7115 3 81.82 ACTCTCTCTCTCTCTCTCTGATGCACTGATAAAACATCGCTTTGAGACAACCTTCCGATCTGGGCTACCTTCTCATTACCGCCCACCTCCCAGAAATGCCATTGGGTAAC:1 - chr2R 21194789 3' + blood 7179 2 91.82 TAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGATCATTGAAATCAATGCCAAATATTGGATAGAAGTACCATATATATTCTAAATATCAAAAAATCAGTTTTGGTATA:1 - chr2R 15772060 3' - Doc 4571 1 75.45 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 205 1 70.21 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGAT:1 + chr2R 21735239 3' - blood 52 2 69.09 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATGATAAATAACCCGGTATTCTTCTCCTTAGACCTAAAAAGTCCATATAAAATTTTTGAAATGGCCTGTC:1 + chr3R 1023441 3' - F-element 16 1 70.10 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATGTATATATTTAAATTCCACTGAGTCTCAAATTTGGATTAATCTCAATTTAAATTTGTACAATT:1 - chr3L 5553171 3' + 297 6951 2 60.00 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 201 1 64.08 GAGTTCACCGACTATCAGATACCCGTTACTTAATTACAGCCAACAACAATGGCCACTTTTATCTGAGTCAGTGGGGATTTGATGCTTTTCTTCGCCGT:1 - chr3R 7229477 3' - INE-1 558 1 72.45 GTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTAACTCTCTCGCTCTCCCACACACACAGCCACATGCCCACACACGAATGCACACCACAACA:1 + chr3R 20973975 3' + Cr1a 255 1 62.38 ATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATAAAGTGTCGAACATTA:1 - chr3L 3240510 3' + diver 211 1 61.11 ACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAA:1 + chr2L 4016905 3' + TAHRE 10293 1 66.67 GGAGAAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCGTCATCTTGGTCGATTTTTTCGTCTGGGGTTTGCCGTCACTTAATCGTCTTTT:1 + chr2L 6770671 3' - G6 1709 1 61.62 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTCCCCAGGAGATGAACGTGATCCGCAAAAAGCCGCGTTGCGCG:1 + chr3L 15408513 3' + jockey 4969 1 53.33 AGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACGCAATTTTTTCTTTCGTGGGTGCGTGGCTGAAGGCAAACATATTCTTTATGCTTAT:1 + chr3R 30286769 3' + Bari1 205 1 59.09 GGGTACTATTAACCGTTTGCAGCCTGTTGGCCGTCGCCCTCGCCA:1 - chr2R 11278290 3' + Chouto 5999 1 66.67 TAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAAGAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGCACCATGGCCATCCTCTGCTCCTCGGGCACCAC:1 + chr3R 19779355 3' + Idefix 6982 2 68.18 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGACCCCTAAATTGCGATTGGAAACGCTCATACAAATCG:1 - chr3L 23257502 3' - blood 49 2 65.14 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTTTTTCAGTGTTTCCTTTTTTTTGTGGGGGCCTTGAACAGCTGGGAAAGCACACGCTGAAGAAGAAG:1 + chr2L 18694109 3' - pogo 7 1 60.95 TCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTA:1 + chr2R 5064833 3' - Stalker3T 205 1 58.18 CGGGATTCCATGGGTAGACGACGAGATCTATAGACATTTTCCGGCCAGTGACATTAGTACGAAAATGGAGAAGAG:1 - chr2R 21037668 3' + G2 2798 1 57.33 AAAACTATATAATGAAAAGGGTATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTTATTGTTTGATTAGGAAATGAATACATAAAAC:1 - chr3R 4682223 3' + micropia 257 2 69.09 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCCGACCAGTATACCCGAGGCCAATGGCTCCAATGCAAA:1 - chr3R 6132060 3' - I-element 1 1 64.52 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGTGCTATCAATCGATTTCACTGGTAATA:1 + chr3R 17272021 3' + hopper 1363 1 70.91 AAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTGCCACGTGCTCGGATCGATTTACAAAA:1 + chr3R 25737834 3' + S-element 1660 1 73.39 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTTCATTACCCAATGTGGTAAGTACTTTGTGTAAATTGTTTTTGCACCCTATAATTTTT:1 - chr3R 14559949 3' - F-element 40 1 59.63 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTTGCCTGTTCATAAATTTATATTTGTTTCGTACTCTCTTGTTTTTAGAAAT:1 + chr3R 7500935 3' - FB 31 1 53.64 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATTCCAACAATGTTGTGGGCAAAACTACACTTGCTCTAAATGAAAATTG:1 - chr3L 2815073 3' - Doc 52 1 60.91 CAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTCTTTTGTCTTTTGTCTTT:1 + chr2R 22311217 3' + hopper 458 1 75.00 AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7267 2 71.82 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCGCCAACAACAAAAGCAACCACACTC:1 - chr3L 18030380 3' + Tirant 8452 2 78.18 AACAAGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAATTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCAACATTATTTATTTTCTACATTCTCTGCCATCCAGCTAAATATGATTG:1 + chrX 7782394 3' - INE-1 258 1 60.91 CTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCATACATTTTTTAAAGTGAATATATATGCCGGCATGTTGTAGTTGCATATTTGTTGCATATACGTA:2 - chrX 13495488 3' - Max-element 22 2 61.82 GACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + I-element 193 1 39.56 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGAACTTTTTGATGCATTTAGGGCTTA:1 - chr2L 19129310 3' - FB 22 1 60.00 ACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTAATGTATACCAGAAATGATATAAAAATATCATATACTT:1 - chr3R 12396533 3' + FB 640 3 65.45 TCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATAAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCACGCTAATGGTGTCAACATCCATTTTTGCAACTGTCAG:1 + chr3R 16321198 3' - Tc1-2 74 1 73.20 TTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTCGTTGATGGGGCTTTGGATCGT:1 - chr2L 15107032 3' - I-element 4950 1 65.08 AAAGAAAAAAAAAGCATATAAATAAATTCTATTACATACGAACGACAATATTCATTGCAAATAATGTGAGTACATGCTCAATCGGATTTAGTAAAATAAATCTTCACG:1 + chr2L 12706847 3' - Circe 426 1 62.96 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATAAAAATCGTGTTTATAGTTCTATGATTT:1 + chr3R 13481243 3' - roo 36 2 59.81 GCCTGCTGACGGGGCCCGAATCAAAGGCAAATATTTTATGCTTTACGTGGTTAGGTTACTTGAGAAA:1 + chrX 7410100 3' - opus 172 4 76.12 AAAAATCAAAAACAAAAAAAAAAGAAAACGAGGAGGAAAAACTAGCAAATAAAAGGAAAAGCTAGAAAAAAAGAGGGAAAATGGCAGAATGAAAGCGAAA:1 + chrX 12157934 3' + Doc 4697 2 77.00 CAAGAAAAGACAAGAAAAGAAAAGAAAAGACAAGAAAAGACAAGACAAGAAAAGACAAGACAAGAAAGAGATGGCCAGATCGCCGGGGAGTTCA:1 + chr3R 21891006 3' + Penelope 651 1 31.91 AGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCATAAAATGATGTCAACTAGGCAATTAAGTTATGGCA:1 + chrX 14462718 3' - accord 210 2 68.54 TATTTGTGTTTTGTTTATTCTCCCTTATGTGCGTTGTTCTCTGTTTTCTGTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCT:1 + chrX 4617442 3' + Cr1a 203 1 46.24 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAAAATAATTCAAGACGTCAGCCAGTCGATGAGTCACACAGTTTAGCATTAG:1 + chr3L 9822328 3' - pogo 12 1 70.00 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAG:1 - chrX 4789133 3' + opus 7481 2 58.95 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCGGACTCACGAGCATTAAATTCATCTCCTATCTTCCAAGTCTATCTATCTTTAATATAAGCTACCAAAATCACAATC:1 - chr2R 15374737 3' - 1360 10 2 49.09 TGATGCAGCTCCTTTTCATCACAATTGTACTTAAGTGAGTAGAGTGAGAGAATAAAGAATAATAAAATGCCAATAAACAACTCCAAAAAGGTTGCTTTAAAATGGCTTTA:1 + chrX 10427742 3' + gypsy5 452 1 70.91 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCATCGAAAGCAGCTTACAAAAT:1 - chr2L 6311271 3' - hopper 61 1 79.09 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGAACTACACATTTTTTCGATACTCCGTCTTAATGTTATCGTTGTGGCAG:1 - chr3R 28958854 3' - accord 7031 3 76.25 TATCGATGCAGCTCAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGACGCCATGCACAAGTGCCATGACATCACCTGTTATCGGCCCA:1 + chrX 18483229 3' - 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chr2R 9754710 3' - hopper 27 1 50.53 GCACACACACACACACACATTCAGCCGAAAAGCACGTGCTCCAATGGAAACTGGGCCACACGGACAGAACCGTGGACGGACAGAAAATACGGACG:1 + chr3L 7032357 3' + accord 185 2 78.95 ACTGACTGATCTCTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGAAGGCAAACCTCCCCGGAGAGCAATCAAGCGACA:1 + chr3L 15690847 3' - invader1 3896 2 70.00 AAAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAAGAGCAAGCTGCTCACAAAAAAAATGCGCTAGTGACAATAAA:1 - chr2L 7537187 3' + Rt1a 5087 5 93.85 ATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATAAGAGAGGTAAGTACTTGGCCCCTTTGAGCCACTTTTCCAAGTGCCCCCATTGTGGCC:1 + chr3L 1257390 3' - F-element 4427 1 81.25 GAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACACATTGATGCTCTGCATAAGACGGGCCTTCAATGCTGCCTTTCAGCGGGTATAAATAAATTTA:1 + chr3R 14443040 3' + TAHRE 10410 1 40.00 ACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTG:1 + chr2L 23372628 3' + gtwin 7375 2 64.55 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7312 2 35.05 AAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTTTATGTTTCTATGCTTTGATTAGTTT:1 + chr2L 14687489 3' + Quasimodo 7159 2 76.36 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGTTTTTGCGCTCGCGAGTTATTTAAA:1 - 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Doc 4269 1 63.10 ATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGAAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAATTAATTGGTAATTAAGAAATGCGTTAAATATTTATATGAAATGGCTCAT:1 + chr2L 17030427 3' + hobo 479 1 53.21 CAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCTCGAGTACCGACTTTCGTTCGCATCTGATCATGTATCGATCATCCCCGTCGACCA:1 - chr3L 6616337 3' - Stalker4 7152 4 73.56 TGTACACCTAGCTAACTCTCTCACTGGAGAGAGCATAAAAAAATGGATTACAGAGTGGACGCATCATATGGAGAAACGGAATATTTGCAAGTGTATGCCGCTCTGCT:1 - chr2R 22060452 3' + invader3 5326 2 66.36 GAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCGAGGAGTTCAGGACATCCAACAATAAGAAATTGAAAT:1 - chr2L 13710642 3' + copia 252 1 77.14 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGACGAATAGACCAACTGCCGTTGTGTTTCTTTATTTTCTTTTTGCCCTGGCTTAAATCTCTTCTGCGCCA:1 + chr3L 21103503 3' - Doc 13 1 70.21 AAATATGCCTTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTAGATCAGTTTATAGTTGGCTCTTCCTCAATATTTGTTTTCTTTTATTTTCCTGAGTTCT:1 - chr3R 4747984 3' + 1360 217 1 57.27 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAAA:1 - chr2L 21735011 3' - Doc 34 1 61.11 CAAGCTAAACAAAAAAAAAAAGAAAAGTACAGAAAAATAAATAAGACAGCAACGAAAGAAAAATAAAACAGCAGCAAATTTCGCTGGCACAAGAAAGGTCCGACA:1 + chr2L 15774924 3' + Porto1 159 1 74.29 TGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACATTATTGAAATTAAAAATAAACTTTAAAAATATATTACGTATACGCCTCGTGTT:1 - chr3L 6268263 3' - hopper 216 1 79.27 CTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTGGAAGTTTCAAATAAAAATATTATTATAAATTAGTTTCATATC:1 - chr2R 16527719 3' - F-element 4438 1 62.73 AAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 71.82 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGCGCGCGAACATATCTGCAAAAAAGCTGGCAAAACGGCAAAATGGTA:1 + chr3L 12301263 3' + hopper 1403 2 50.60 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGTCATAAAAAATGCAAGTGCTTTGTATGCACGGCAGGCAAAAACTCGGAACCATCATCA:1 - chr2R 9754693 3' - hopper 25 1 58.18 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr2R 6629974 3' + Stalker3T 201 1 25.45 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATAACGATGCCATAATTTAATCTTGAGCTTA:1 + chr3L 3611809 3' + blood 7372 2 66.36 CAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTACTCTAGAGGTCTGCCATCTGGTTTCCCTTCGCCCTCTCCATCTTCTCATCCCTTGGCACCCACAGTCATCCAATCAAAT:1 + chr3R 30050252 3' - 1360 24 1 62.73 CACTTACATAATCTGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - gypsy3 434 1 36.56 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCGCAATAATTGCAGTCCCACTCCTGGCCCGAGAAAACATCTGGCACTCTAGAGGTGAGCTGTATCTAA:1 - chr3R 27795432 3' - roo 2 2 74.47 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATTTAAATTTTCCCCCAAAATCATTGTATT:1 - chr2L 7841343 3' + jockey 4977 1 65.00 GCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGAAATGCAAACAAGAATGTTTCGCATGGTGCCAATTGATAAGCGCACCAGCAGCAGTCCCG:1 + chr3R 20422012 3' - 1360 326 1 76.00 ACTGTCTGTCCGTATGAACGTCTCGATCGCAGGAACTATCAAAGGTAGAATTTTGAGATCAAGCATTCAGCATGATTGCTCGCCCGTAATCCACATCTCACTCACCTGTT:1 - chr3R 21665784 3' + INE-1 126 1 70.00 TATATAAGGGATAAAACACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTG:1 + chr3L 21085726 3' + Juan 4198 1 70.18 ACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATACACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCAACGCTTTTACTTTCAGTGTGTAC:1 - chr3R 25051561 3' + 17.6 476 2 65.45 CGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGGCATTAA:1 + chr3R 13423375 3' + rover 326 2 59.05 TAAGTATCGCAGCCCAAAGCCATCGGACAAGTACGAGAAGAAGATTAAAACGCCACCTTACCACATACATATATTACCATCAAT:1 + chr3R 23545699 3' + jockey2 3130 1 67.86 CCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTCACTCACTACCTGTGCGCTCTTGTTGTGCTTTTCCTCGTTTTTAGTTTTACTACACCCGAAAAATAATGCACATTATTAT:1 + chrX 13495607 3' + Max-element 291 2 63.89 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTATTTGATA:1 + chr2L 17785856 3' + roo 9026 1 65.42 AAAAAAAATTAGTAACAGATCTAATAAATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAAAGAACCACTAGTTCATGCTAGTCAATATGTG:1 - chr2R 9538586 3' - Tc1 1517 1 66.67 GGGGATATGATCGTATGCTTTTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGTTTGGTT:1 + chr3R 22500849 3' - invader3 5240 2 73.81 ATGTGGACATAAAGATCGAGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - Tabor 7035 2 25.45 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGT:1 + chr2L 9754872 3' - 1360 30 1 50.91 ATACGCGGGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCATCGATGTGTTAACAGACAGGCGTCGAGGAATCATATGGCATATGCATTAAGTCTGC:1 - chr2L 9812528 3' + invader3 188 2 73.03 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCACTTAAACTCGCCTTATCAGCCG:1 + chr3L 16496262 3' + P-element 2865 1 52.22 ACCTCTAGAGCCACTGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGGAGATCGTCTTT:1 + chr3L 23090533 3' - 1360 57 1 94.55 AAAGTTTTTTTTTATTTTTTTGTAGCTTTTTGTTTAGAGTTTGTGGCGGTTTT:1 + chr2L 18632126 3' - HMS-Beagle2 491 1 79.25 AATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAGACCGCAAATCAATTGTTACATGGGTTGGCTTTCAACAGACTATTTTCCGAATCAACGCCACAAATCTTGTCAAAGTTATATG:1 + chrX 6941066 3' + mariner2 233 1 57.27 GTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAGATTGTCCCTGACATACAGTTTGTTATTACTTGCCTGTT:1 - chr2R 25257614 3' + TAHRE 10396 1 55.56 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTACTGGCAGGAAATTCGCTTGTTAATGAAATTT:1 + chr3R 23621047 3' + roo 9020 2 71.82 AATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTCTGATTTACTTTTTATTTACTACTGAAACACAC:1 + chr2R 4137724 3' - Juan 42 1 71.28 CAGTGCCTTTCGGCGCTGTCATTTTATTGTACTCTGATTTTTTTTTTAATATTTTAAATAATTTTTAAATTAGTTTTCATTATTATGTACTACTTGGAAACGGCCCATTA:1 - chr2R 25200905 3' - TART-B 10606 2 66.36 AAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCCACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATCAACAAATGTTTTTTATATACCAAAT:1 + chr3R 2533249 3' - Max-element 8269 2 95.12 TTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACACACACACACACAAAAACACACACACACA:1 + chr3L 9410546 3' + Rt1b 5125 1 49.06 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGAGCGAAATCGTTGAAGAAAACGGGGGAAG:1 + chr2L 11211189 3' - hopper 46 1 67.65 GCGTAGGTTAGTGTTGGACCTAATATGGCTTTTATTAAGAGAGCCATAGTTGCCATATGGAGATGCTTGGGTGCTGGGATGTCGGCCATCAAGAGGGTATTACT:1 - chr3L 11440329 3' - G5A 2417 1 65.38 AAAAAAAACGGAAAAAGTAAAAAAAAGGTGAGAATTTTTATTAAGTATTAAAGATACGAAATACAAGTACTCGGCACTCCAGCATGCAT:1 + chr2L 20983873 3' + Doc2-element 234 1 55.06 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGGGACAACAATGAACAGTCA:1 - chr2L 20939486 3' + hopper 1410 2 76.36 GGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTATTCTTAATAATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGGTTAAAAGGGTA:1 + chr3R 5505243 3' - I-element 5163 1 59.09 ACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' - micropia 12 2 67.44 GCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACACCTGCGAAAAAAAATAAAACCATCGACACCTTTGGTTTCTGACAGTTTCTTTCTGTTTTGTAAACCAAAT:1 - chrX 7479532 3' - flea 150 1 66.36 AAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTCGCCAAACGGAAACTAGTTGCCAGCCAATATGGTCTTAATGGTCTGTGACAAGTTCAGGACTG:1 - chr2R 7290612 3' + Max-element 8528 2 68.09 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTATGCTAGTCGACAGTCGCCATGACATTTCAAATTTACGGGCTATGACAAAGTGAG:1 + chr3L 9198530 3' - 1360 21 1 56.86 TTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTCCTGGAATTACTAGGTTCTCCGAAAGACTCTGCTTAATTTTGGCAATTTCTTT:1 - chr3R 19448959 3' - I-element 453 1 54.55 TAACACCTGCTATGCTAACAAAAGACACGACAAACGCCAGAAATGGGAGACGTCACCTATCAGATTTAATCTTCAAAAAAATATAAATACAAAAATGATAATAAGAAGAG:1 - chr4 620183 3' + mariner2 693 1 80.91 ATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATATAATAAATAATAAAATGAGGAAAAAAA:1 - chrX 10256597 3' - 1731 4357 2 70.53 GGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCAAGCCTCAAAAATTTGCATTTAATGAGGTCAAAGTGCGGCCGAGGTGCGAACAAATG:1 + chr2L 6030617 3' + accord 323 2 50.00 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTGCATAATTGGATTGGCCCAAAAGAATGTGCTTATAATTTATGAGTGCTCAATTGATTGAATTGCTGCAACCAATTT:1 - chr2L 14924352 3' - mdg1 7047 2 72.73 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTTTC:1 - chr3R 24813965 3' - P-element 56 1 28.04 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGAGTTCTCAATTGGCGGCATATATTGGTTTATTACAATACTGTAAATATTGCAGGCTTAACTTCCTATTAAATGGCAATAAGAA:1 + chr2L 13836588 3' + blood 7354 2 55.24 ATCCAATACCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGGACCAAAGCGTTTTAACCATGTTGGAGAGGGTGCGGAAG:1 - chr2R 16266030 3' + HB 467 1 58.02 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTTTCATAAATTATCAAGATTTCACTGAAAACAAAAGAACCTTTACAGACACTA:1 + chr3R 30859512 3' - Burdock 23 2 50.91 ATCTGGATGAAGCCGATAACGAAGATAAAATTGCCAAACAGCCTTTAGCAATTATTAATTATGATTCCTATGAGCACGCTCCCCTCATGGGCCACCAATGAAT:1 + chr2L 23135979 3' - diver 323 1 92.23 CGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGGACACCTTCCGCTGAATTGTTTAAACCATATATTATGGAGAATATTGTTTGTGTAAAAAATTGGAATCT:1 - chr2L 5270876 3' + pogo 106 1 68.52 TTTTTTTCTCTTTTTGTTTGTTAATATAAATAAGTTCAGAGGTCATCTTGTTACGACCGTGCCGATTTTGCAGCTTTTGAAAATGAAAATTTAATTTTAAAATTAATTAA:1 - chr3L 22854142 3' - gypsy7 5004 1 69.09 ACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAAGTAGGGAAATGCGTGAGCGAACAATGAATGAAT:1 + chr3L 2989294 3' - Bari1 285 1 70.00 CTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGCCAAACGACGAAGCGCAGCAGAAAGACCGGCGAAACATAGAATCAAGCAAAAGTAGCAAA:1 + chr3L 8116417 3' - diver2 4775 2 66.30 AAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTCGATTTCAGTTCAACAACACCCT:1 + chr2L 8476798 3' + Juan 4211 1 70.64 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTATTTTCGAATAGCTTCATAAATGGTGGATCATGATCAAATTATATATAGAACTTAATTTCTACAGT:1 - chr3L 9822213 3' + pogo 2085 1 48.18 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGGAAAAA:1 - chr3R 25702166 3' + Tirant 8505 2 75.00 ATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCGTAGATAATGGAAATTTTCCATCGGGCAGA:1 - chr3R 11248426 3' + Stalker4 40 4 72.73 TAGAATTTGCTTGCTTGTGATAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGTGCTTGTGAGCCGGCAAAAGTCAAAACTGTGTGTTGGCATTGCGGCTA:1 + chr3R 25698462 3' - 1360 3258 1 59.09 ATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACCGACATTTGCGTGCCCAGTTTTACCCCTT:1 + chr2R 11760241 3' - R1A1-element 123 1 68.67 GCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTTTGATCGTTTTTGATTCGCAATTCGTTTTGGTGCGGGTAGAAAATTTCAAAGATTTTT:1 + chrX 11969467 3' + INE-1 534 1 67.37 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCCTATCTACTCGTCCCAATTCTCTCTT:1 - chr3L 10722977 3' - copia 4926 2 75.45 TGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCCTACACTCGAACTTGTTGGCACTTCCACTGACGCCGA:1 - chr2R 1320592 3' - flea 376 1 65.42 CGTTCGGAACGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATTATAACAGTCATCAATGCAATTTTAGAACGGGTGGTTGTTATCATA:1 - chr3L 9431431 3' + F-element 4372 1 79.27 CTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTCCAAAGTCTTAGAAACTTCGATGGTGCACTTAGAAAAATCTTAACTACATACAAAAC:1 - chr2L 5024369 3' + Idefix 204 2 54.55 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAGAAATTAAA:1 - chr2R 15155194 3' + flea 211 2 65.45 TCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGCACTATGGGGCATTTGCCCACTTCTTTTTCTTACATTGAGCGACATATTT:1 - chr3R 25418281 3' - 1360 104 1 61.96 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCT:1 + chr3R 563946 3' - HMS-Beagle 45 2 67.59 TACTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTTATAAAGCAATCGATTTTAACTTCTTTAATGCATAATAGAGTGTATCAGGAATTTTCGTTTCAATGCAATTCTTGAT:1 - chr2L 22685667 3' + Cr1a 4222 1 63.64 GGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAACAGGAAAGAGGCAAAGTCATGCGCAAACAATTCAAAACAAAATGCTAATCAAAACAGTGTTTTTTT:1 - chr2L 4113503 3' - 17.6 178 2 58.25 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAATAAAGAGCTTTCAATGTTTTTGCGTTGTGCTTAAAAGTTATGTTTTACTAAAACAACACATTAAGTACTTTGCAAGGCAG:2 + chr2R 24031573 3' + 1360 3386 2 78.18 TTTTATACGGAGATCGATGAAAACACGTTCACAGTTCACTTGAAATGCCACTGGGCCAACTCTGTTCCTTTCGAGGACCAATGCCCCA:1 + chrX 20288815 3' - Doc2-element 32 2 62.50 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATG:1 - chr2L 18675632 3' - 412 53 2 74.04 TCCTCACTATTCCAACGCATGGTGGCAACTGAACCGTGTAGGGACAAAACTTTGCAGTAGGCACTACTCGCACGCACACATCGGCG:1 + chrX 19637924 3' - mariner2 132 1 72.09 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAAATAAAGTTACATAAAGTAC:1 - chr2R 9963471 3' - pogo 7 1 65.96 ATCAAAAATATCTGAATTAAAATCATTCACATTCATTAAATGTTTAATAACCAACAGGCCATATCATCGCTGCGCAAATCCGTTTGGCTATCGCCACTTAACTACA:1 + chr2R 11137628 3' - transib1 1752 1 65.09 AGTTCCTAAGATCTCGACGTTCATACGGACAGTCGGACAGACGGATATGTCCAGATCGATTCGTCTAGTGATCCTTATTACAAGAGTCGTTTCATAAATTATTTGTGCTT:1 - chr2L 21204778 3' - INE-1 141 1 55.45 GAAATTTTGATTCGTTTTATTTCACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTGGCACGATATAACTCTGCAGAAG:1 + chr2R 11959902 3' + 17.6 394 2 77.45 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTTCAAATGCTATTGGAAAGGGGTAATATTTATTAGTTAAATGAACTATATATTTTTAAGGA:1 + chr3R 19915044 3' + P-element 2858 1 63.64 CTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTCTTTTTCTGAAGTTGTTGTTTTATGCTTGCCTTGAAAACAGAGGGTGCGTAGTCCTGCGCGGGG:1 + chr3R 21800087 3' - I-element 5203 1 68.09 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTCCCCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTT:1 - chr2R 11379739 3' - jockey 4717 1 69.00 TAAGTTCCGTGATTGCGTTGCAACTTCGACGACAGTATGAACGTACCACTCGTAGCCCTCACTAAGGATCCCAAGATGAAGAAGTCACAGAAG:1 - chrX 15244781 3' - F-element 4418 1 79.57 GGATAGGCAACAAGAAAAATAAACGAAGACACAATTAAACAAAGGGAATGAAAAATATAATGTGATTTTCCTATCATAACCAATCAAACTGTAGTTCAAAATAGAAACTG:1 + chr4 280713 3' + invader3 5008 1 65.45 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTTGGGCCCAATGTGTCGCCGGC:1 - chr3L 20167923 3' - 412 38 2 60.00 ACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGGACAGCTAAATTTGTTC:1 + chrX 18750703 3' - BS 4860 1 79.09 ATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTGCACTGTAACGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATCTGGGC:1 - chr3R 13423282 3' - rover 33 2 57.27 GGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGCCAACGAATGAGGAAAGCAAGGGAAAACTG:1 - chr2R 14307102 3' - 297 199 2 61.54 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTGCAAAAGTATTTGCATACTTTT:1 - chr2L 2484353 3' - jockey 4708 1 55.45 GACTGTTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTTGACCATAATTCCATCACCAGATTGAAAAATCAGCTACCACGAAAAAGTCTCCA:1 + chr3R 19949198 3' + copia 226 1 53.64 TACACATTTTTCAAAAGTTTGGGCGTCGCAGTTTTGTACGGTTTGTGGTCGTTAGAGTGTTTATATGGATCAATAAAGGTTGTGTTGTTTCCTTCATTATCACGTGTTTG:1 + chr3L 14211894 3' - INE-1 258 1 74.55 TTATCTTTGTTGTTTTTTTTTTTATAAATAAATTCATATATCAGGTGGATTCTTAATCTGTTCATTATGCATAATTACTAATTTTATACTTTCTATAGAGATCTGTGTGG:1 - chr3R 27954298 3' - gypsy7 5018 1 86.36 TGATATTATTATTATTTTTTAAAGTATTTCAATCATATGATATACAAGAGTTTTCACTGTCTAACCTTCTCATTGGCAACAAAGTTTCAGTTCTTGTCATAAATTATACG:1 + chr2L 3968858 3' - invader3 5042 1 52.73 TTATGTACAAATGCCTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - I-element 5199 1 28.00 AGCTTGAAAGAAACACGTCTTCACACGCGAAGTGAAAGAGTGGAAAGACCCAATTTACTTTAATTTAATGATTATTTGATGACCGAAATTTGGAAAAACAGATT:1 - chr3L 26882298 3' - Doc 29 1 34.62 GGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTGTTCGTGCGTGGAGCAGGT:1 - chr3L 7082121 3' - 1360 205 1 81.48 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTGACGTTTAAAATAAATTTCTTGGCCAAGAGAGCGGGGTAAAAAACACATTTACTCATCGTTGAC:1 + chr3L 17490743 3' + roo 9049 2 60.00 AGGCTCTGACTACGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTTGTCCAGTTTTTGGACATCT:1 - chr3L 20314667 3' - G-element 429 1 76.74 AAGAGACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTATTGTAAGCCATTGCCGAAATCACTCCAGTAACGACGCTTCATATAAAGCAGAGCTATATCAT:1 + chr3R 24289149 3' - 1360 3228 1 70.65 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGTAGATTGGAGCATCTTAAAGGTCCT:1 - chr2R 10090974 3' + roo 406 1 78.18 ATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTACACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGGCATTTAACCAAAAAAAAAACGTGCATATTTTGAACTGATTTTTG:1 - chr3L 18812740 3' + F-element 4620 1 64.76 AAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGGAGAGAAGAGGAGAGAAGAGGAGAGAAGAGGAGAGAAGAGGAGAGAAGAGGAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 203 1 59.09 TTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGGTGGAGGCACAAAACCGCAACCTCATGGAAATAATAAAAGGACATCTCTCCATCTCGTGGGGCA:1 + chrX 20740048 3' + invader4 359 1 71.56 CATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTGCCTTTTTCCGATTCTTTCCTCCTTCTCGTTTTGTAAAGTCAAAGTG:1 + chr3R 29300005 3' - R2-element 3483 1 57.27 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTG:1 - chr3R 24260897 3' + roo 356 2 72.38 AAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACATATTTCATATATTTATAATACCTCTTTAAAGCTCATTCGGTATGCCAGGCACAGGCCAACCGTCAAAAGGCCAAAAAA:1 - chr3L 17405657 3' + roo 9067 1 75.47 ATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATGCGAGCTGGCAGGAGAGTAAG:1 - chr2L 4945970 3' + micropia 263 2 77.17 GCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAGAAGTTAATTTTCAAAATTTTTTGACTTTTTGACTATTGACTATTATAAAGACAATTTCAAT:1 + chrX 22689423 3' - mariner2 48 1 50.47 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCCTGGTAGCTCAAGCGAAGCGGAACTA:1 + chr3L 217386 3' + roo 9037 1 58.72 TTTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTAATTTTGTGGCAAATTTGGATTTTGAATTTAAACAATGGCTTTCTTCTTT:1 - chr3R 8942902 3' + Cr1a 23 1 63.01 CCAAGAATTCTCTAGTCATGGGTCGCTTGCAGCAGCTTCAGCCAGTTCAATTCGCAAATGGAGAGTTATACGAATAGCTGCACCACCACCAGATATTGG:1 + chr2L 5518156 3' + Tc1 342 1 73.74 AGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + 412 7484 2 76.36 TTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCTATGTCTGCTTTTTCACGAATTTTCCTAGTTTCGT:1 + chr3L 16072896 3' - Bica 493 1 58.54 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGTAGAAACTATCTAGAACCAACCAATTCTAAAATTAACTATTCAACACAAACAGTCACTATAACTGGCTATACATTT:1 + chr2R 2146298 3' - Max-element 11 2 68.18 GACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGGCATTAAATGCATATTAAATATAAAAAAT:1 + chr3R 13423397 3' + rover 7294 2 74.55 TAAGTCATAAAATCATGTATCCAATTGCGAACCAAGGTAGGGATGGATACTCACCAAAGGTCCATGTCAACTCTGGTTTG:1 - chr2L 8107148 3' + Quasimodo 107 2 72.50 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGTTTATTTGGAATTCAAGTTTTAATGTTCTTCAATATTAGTAATTAGCCA:1 + chr2L 3138386 3' + copia 219 2 57.27 CTTGCATCGCATAGACCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTGCCACGGACTGCCTTTGCTA:1 - chr2R 4312766 3' - F-element 126 1 74.12 CTTGCCGACCATGGCTTTATGGCGTGATGCATTGGAGCCACAGTAGATTTATATTTACGTTGTATGACGGTAAACCGGTAAAACATTTTGGCCAAATCC:1 + chr2R 5526172 3' + gtwin 7092 2 54.55 AAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCAGCGGCTTAAATTTACTTCAAGGTTACCATGATGTGACACTTTCATTT:1 - chr3R 31533920 3' + 1360 3317 1 63.10 CGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAATTGAATATATATTTTTAACCTATCCTTATGTACTTTTTGTTTCTTTTGTTGTATGTTTATGCGCTACGCGTTTTTCCTACGATTG:1 - chr3L 19229833 3' - Ivk 2 1 68.18 AACACATTTTTAAAAAGTGTGTGAGAGACAGTCTTGTGCGGTTTGTGGGTTTTAGATTGGGAGTGGGAACGAGAAAGTTCAACATATGTATAATAACATGAATAAATTTC:1 - chr2R 10420236 3' - INE-1 258 1 58.18 ATAAATACCCTGGTTTTTAAATTGTGGCGTATCCTTAGTTTAGTCGTCTCCTTTATTTGCTTTTCCTCCTTTTCCAAAGCTGAACAATTCAATTAAATACTCTACGAAAT:1 - chr3R 11093416 3' - TAHRE 394 1 68.18 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATGTACAAATAAATATACATATTTTTTTTTTAATCTGTAGTATCTCATTTTAGAAATTCCGTTCGCAAAT:1 - chrX 3091905 3' + opus 484 2 64.81 TGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGCTGGTGTGCATGTCCTCTGTTCGCATAAGCGTCTCTTCTACCGTGTATG:1 - chr2L 2721407 3' - springer 63 2 68.13 ATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCAAAAGAATCGGGGCTAAAGGAAAAACACACACACACACACACAC:1 + chrX 7978950 3' + Quasimodo 9 2 57.00 TGGGCAGTAGTGGTGTGTAAGCATTGTTTTTAATAATTGAGATCATGACACAAAGTAAATTGTAAATACTTTTGGCACACGCGTGCATCTGGA:1 + chr3R 21851201 3' - looper1 1713 1 76.34 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGGTTAAAGGTGGGCGGATGTTTCACTCGAGGAACGCAGAAAGGAAGTCTAAACAAATAAATGCGTAAA:1 - chr2L 1291010 3' - 412 17 2 65.45 TAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACACTTTAGTTTGGCATCCTCAACCATGA:1 - chr2L 3993339 3' + I-element 4895 1 72.92 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTAGAC:1 - chr3L 25782375 3' - F-element 48 1 64.08 TTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTG:1 + chr2R 5674706 3' - S-element 63 1 77.98 ACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATAAACAAAATACAAATACAAACTAAACAGACTGGATCTGATAACC:1 - chr3L 22989306 3' + Stalker4 33 4 70.00 GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTAGACTGCGACATTTCCGTGAACTTTTGCCACCGTTCGCCGATGAGGATGATGCATTTCCCATGTTTTTT:1 - chr2L 19902095 3' - I-element 5144 1 68.81 GTTTTTTTTGTCAATTTCAATGAATATCATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTGGAGATGAAAGAACCTTAATGAAAAATTTTCCAAACATTTAAAGATATTGTATGTTTATT:1 - chr3L 3517158 3' + pogo 160 1 58.18 TGTGTGAGTAAAAACAAAAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGGCCTAAAACAAAAGCAAACAACAAAATTCCTCTGCGAAAAAAAAGAACTGGAAAATGCTCTGAACA:1 - chr3R 10539111 3' - 1360 3243 1 55.96 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGCACATATGCTAGTTTCTTTTTGCAGCTGCAATATTTTGCATTAATTAGAAAGTGGGCCATGTTCCGGTCCTCTTTCAACGCC:1 + chr2R 14588948 3' - jockey 4763 1 76.15 GATTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCCGCTGTCTGAAGCTTTCGTAAGATTTAATAAGTCAAAAAATTGTAATAAA:1 + chr3L 18709426 3' + G5A 2621 1 60.38 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGATCTTCTGTTGGACTTCGATTGGGTGAT:1 + chr3L 7400790 3' - roo 49 2 74.26 CCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAAAGAATAAGTAGAAAAATGTTCTTCAAAATTAAATGGTTAATGAAGAAAAATTAATCGTTAAATGAAAAAAATGTTAAT:1 + chr3L 7130250 3' - BS 4999 1 53.21 CAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCTATGCGAGAATTCCTGGATATTCCCGAAGAGGTAGCCGAAGTTTCAA:1 - chrX 985504 3' + F-element 4291 1 56.52 GGGAATGCTGACCATGCACTTATGCAGTTTGCTCACACACACACATGCACGCACACTAGCACGCGCGCGTTTTCTCCTACTTATTTTTTTGTTTTTTCATTGGGCGGCGA:1 + chr2R 13223545 3' - gypsy11 4147 2 74.55 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAG:1 - chr2R 24031490 3' + 1360 3357 1 73.42 GGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGAAGTGGAAAGTGGAGCCGGGCCAGAGATATCCCTGAA:1 + chr3L 5892282 3' + F-element 4288 1 66.36 CCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTGGAACATTTTTATTCGGAGTGTGTTGTTTCGGGTATTTGTTGTTTGGTT:1 - chr3R 22257894 3' - I-element 5186 1 55.45 AGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAGCAAAAGATTCCAAAAAGAAGAGAAAATGTCAGCAAACGCTAAAGAGCACTTCATGTACCCACGACACATCACGCAGA:1 - chr3L 21045164 3' + mdg3 5060 1 75.96 AAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTAGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAATGAGATTAAATTTGGAAAACCGGCAAATAATTCAGCAAC:1 + chr3L 16875780 3' - jockey 4550 1 73.03 GATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCACCAGGCCCACATACGTCACTCGCTCGCTCTCGAATTCAACTCCCCAT:1 - chr3L 25455079 3' - HMS-Beagle2 1 2 79.63 CATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGATAAGTCTGCCGTTACCCGCCATCTTGACATTCGCCTCGTCCAAGGCGTCCAGTCCCTC:1 - chrX 2604564 3' - G5A 2632 1 62.35 TCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTCTGCTCATTTTCCTGGTTTTCCTCGATTTTCCAGCACTCGTCAG:1 - chr3L 20867596 3' - pogo 1671 1 57.69 CACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTACCTACCCTCGACTGTCCGTCCCTCAGACTTACTATTTTGGTTGTACTTTTGC:1 - chr3R 6791136 3' + copia 73 2 51.82 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATACTAAAGAGACGCGTAAAAGTATGCAACGCCAAGTGGCAGGG:1 + chr2L 19602912 3' - hobo 6 1 63.51 CGTCGGCGATCGAATTGAATACACATATTCCATAAATAAATAAATAAAATTTATGGCAG:1 - chr3L 12640760 3' - F-element 7 1 40.68 ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAACACAAATAAATTAAAAATTAAAAAAAAAATATTTGGCATTGTATCAAGAACTTGTGGAATGCATCCCATAGCAGTCAC:1 - chrX 8027426 3' + Juan 4182 1 50.91 TTGTGTGATTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCATCCCGTTCGCGTGTGATTTGCATTTATGTGCGTGCCAGTGCAAGTGTGTGTGTCTGCCAAGATGGCAGCCACTTTG:1 - chr3R 4528200 3' + invader4 2694 1 70.91 GCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTGTGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCTGATAGGACATTTTATCTGGCACCATGC:1 + chr3L 15541572 3' + 1360 153 1 74.55 TTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCGTTCTGAACTTGGACAGTTTGTTAATTTATTTTGGGCACAAACATTTGTTTCATCATTTATATTGTAGGTACTTCTTG:1 - chr3R 13178107 3' + Tirant 312 2 75.93 GAATAAAAGAAAAAAAAAATAAATAAAACCTCAGCAATATATCTAGACCCGCTAGGAGATGTTGAGGTTG:1 + chr3R 19448296 3' + Osvaldo 1522 1 75.71 TAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCGAGCCATTCAACAATGCTAGTGGAAAAACTTCTGGCACAAACAG:1 - chr2L 15811765 3' + gypsy4 444 1 55.91 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTGTGTTCCGGGGACAGCAGCCATTTTGTTTGGCTG:1 - chrX 21183314 3' + S-element 1710 2 66.18 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCTGTGTGCATGTGTTCGAGTGTCCTGCACGGACTGCTAGTTGCAAAACCTGTA:1 + chrX 21183389 3' + S-element 1702 1 60.22 AAGTTATAAAAAATAAAAAAAAGTATTGTGGAATCTGGAATTACGCTTCAGATCGCGTTTTTAATGGGCTCTACTTGGAAAGAGCAT:1 + chrX 3091815 3' + TAHRE 10442 1 79.31 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTAACTGATGAGCAATTTGAATACACACGA:1 - chr2L 9147972 3' - Doc 35 1 65.22 GTCTACAAAATACTAACTACTTTTACATTATTACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATCCAAAAACATTATGATACCAATTTTTTAACATC:1 + chr3L 3997820 3' + TAHRE 10257 1 74.55 ACACAAAACAGCATTGCGAACAACGGTTAAGGAAATGACTGGGATTGGGGAGACCTTTGTTTTGCCTCTGGGACATTCGGCACACAAATTGTTATG:1 - chr3L 6269609 3' - Cr1a 237 1 77.08 AAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGGTAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 203 1 68.57 CAGGTTGGCAGTATGGGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCGAGCTTACTAATCTAAATCTTTATGTACTTTAAGATATTTCTTTTTTGTGAT:1 + chr2R 1778422 3' + Burdock 6022 1 52.73 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCGAGGAGTTCAGGACATCCAACAA:1 - chr2L 13710656 3' + copia 233 1 60.91 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAAGTACTCTCCTCTTTTCAAAATGCCCCTTGCATAGTCCTACGCTCGGAATTTAGTAATG:1 - chr3L 126238 3' - pogo 21 1 61.47 GCTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTAATAAAAACTAAAAACGCAGACGGACAAACAAAATTCGGAAATCAGTGAACTGGTCAGCAGCGAATGGAAACTAATTAAATT:1 - chr2L 10551736 3' + I-element 359 1 70.91 GTAAAAGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTATTTGATGCGATACTAAACATATTCAAATCTCTGTGCATAATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCAATAT:1 + chr2R 4122851 3' + rover 362 1 73.39 ACTCGACTATAGCATTTCCTCTTGTTATTATTTTTTGCTCAATATTCCCGGCAGCTCATTTCGGTTCTTTTTCTTGTTCTCGCTGATGATTCGTG:1 - chr3R 13823637 3' + INE-1 576 1 73.68 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATTATGAATTTTATTGCCCTTAATTGATGACATCCCAT:1 + chr2L 8557714 3' - roo 8730 2 64.00 GAAATAAAAAGTCTTGAGCCGAGCGTCCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGAAGGAAAACANAAGAAAAACATTTGTTTAGAACTTGAAAAATG:1 + chr3L 14814143 3' - 1731 4514 1 60.00 TTTTTTCATATTGATAAAAAACATATAAACACATAAATGAATAGTATATGCTGTGGTCGATGTTCTACGAAAATATTCCCAACATATAAGGATTTAAGATCTAAATA:1 + chr3R 6718590 3' - S2 123 1 66.36 CTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTTTTCAAATCTTATTATATAACTTATATTAATTACAAGCGTTTGTTGGTGTTTTAATATTTCTTTAATGTCTTAATTAGTTAATA:1 - chr2L 22305978 3' - Doc2-element 4730 1 56.36 AGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAAATAACGTATAACCTTGAACCTATTACATAGTATTCTCAGCCCAACTAGAAGCCTTGTTTATTGTTGTGTAAGCCGAGCAC:1 + chr2L 17024653 3' + Stalker3T 316 1 50.91 AGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGCTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Rt1b 5008 1 37.80 TCGCCAAATTCATCTGCGCGTACACCAACAACAACTTCCGATATACCAATAAACACACACTAATTGGTGTTAATTGCGGCTCTCCTTGATTCTTC:1 - chrX 21375132 3' + Porto1 415 1 64.21 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGTCCATGCCAACTTGAGTAATATGCTTTCTTAAAGGCGA:1 + chrX 5859379 3' - BS 40 1 58.70 GTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAGTCATCAAAAGCGAGCATTGAGTAGTAGTTGTGAAAGAGACGA:1 - chr2R 21199870 3' - Doc 322 1 56.52 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACATATTTCATATATTTATAATACCTCTTTAAAGCTCATTCGGTA:1 - chr3L 17405693 3' + roo 9027 1 68.18 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTTTCCT:1 - chr3R 5671393 3' - 1360 16 1 50.59 CGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGACAGCCGAGCAGAGTGGGAGAAATAGAAAATTTGAAAATGAGAGGGAGTGCAGAGAGAAAA:1 - chr3L 10756336 3' + G6 1836 1 75.00 GACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCATATATCAAGCGATCCAGCTCATGTGTCTGAGCCCTGTCGTGCGGTTGCCAACCGGCAGACG:1 + chr2R 21895268 3' - 17.6 7349 2 76.40 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATT:1 + chr2R 12336643 3' - pogo 48 1 70.00 GGGTACATCCGAAGTAGTGTATGTTGTATTGGGATGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGAATTTAGTTCGTCTTTAATGGCATCC:1 + chr3L 24308541 3' - Idefix 81 2 72.82 AGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAAGTATTTAAAATGAAAATGTTTGTACGGAATACTCTTTACCAC:1 + chr2L 19320512 3' - Juan 29 1 58.95 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGAACACAGTAAAATTCATGGAAATATGAACGTAATGAAATGATGTAATGTTTGTGAGATTTTCGAAATCATCAATCAACGAAA:1 - chrX 16693730 3' + 1360 3386 2 76.36 GAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCTACATAG:1 - chr3L 7846475 3' - 3S18 5823 2 77.27 ATTGTTCAAAAATGTGGGCGTGGCACTTTTTAGGCGTTTTAATGGCGTAAATCGTAAAATTTTCGAATCAATAGAAACCTTCAGGACTAAATAAATTTGAAAAAATATAT:1 + chrX 9724650 3' - INE-1 253 1 35.45 CATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATAAAAAAAATAATAAAAAGACATTTGAATTAAATAAGTTTAAAATTAAAATAACAGAGATACATATGTATGTAGTAATTGTTAT:1 + chr2L 9124765 3' - 1731 5 2 71.82 ACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAAACAAATGGTCGGAAAAAAGATTACTTGAGAGAGGAC:1 - chr3L 15324077 3' + Doc 4422 1 70.91 CAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACTTTAGGGAACGCAGTTAAAAAGCAATTGAAATGCTATTGAAACACGTCAGTTAA:1 + chr3R 15170014 3' - Stalker 469 1 58.18 GAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAG:1 + chr3R 934264 3' + Rt1b 4749 1 56.36 GAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGCTGTGAAGGATTCGAGGGGCATGGGGGCGTTGTAGGCGCTAC:1 + chr3L 5692300 3' + Gypsy6A_LTR 280 1 56.25 AACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAAATCCATGGAATATTAAATTGGAGAGTAAG:1 - chrX 7607517 3' + 297 6761 2 60.81 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATGTATATAGTAGTTGAACAGTCAATGCGGTCTTTGGTTTGTCTCTTTATTTTAGCCTTTCTCAATGTTTCCCCC:1 - chr3L 17220644 3' - opus 7115 2 81.48 ACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTACATACTTACATATTGCAGAATTTTCTAGCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTTCTCTCTT:1 + chrX 4617443 3' + mdg1 208 2 64.29 TTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGAAATGGTAATGGTAACAGGATGCCAAAAAG:1 + chr3L 14947766 3' - copia 194 2 71.43 CAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCTATCTCTTTGATATTCTCTTTTTCCCTGCTGACTTATTGTTAATTCCATTCGATTTTTCACGCTTGAGAGTTGCTGTCAGATAAATTA:1 - chr3R 25756930 3' - R2-element 3112 1 76.36 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAAGATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTTGAGTTCTGAG:1 + chr2L 3323297 3' - hobo 29 1 52.29 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTTCACTCATGACCACTAACAGCTTTATAGTCAACATGATTGGTTCGGCCATTTTT:1 - chr3L 25752786 3' - Transpac 30 2 54.55 ATTGATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATGCGTTTACCTTTTTTACTGCTGATTTGTGTGTTTTGCTTCTTGAATTTTTC:1 + chr3L 13190956 3' + Bari1 1246 1 58.70 TTATAGTTCCCGCGATCTCGACGTTCATACGGACGGACTGTTACATACTTTGTCCCATCTTGAAATTTTACACTATTTATTTCCTTTTTATTCT:1 + chr2L 16841888 3' - INE-1 145 1 54.26 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAATTTAAAAGTGCTAAACAAATGCAGAGTTGCAACTTTATGGTACAGACTGAGGGTAAAAGTGCCATTAG:1 - chr3L 36275 3' + Tirant 8494 2 70.00 CCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAATTAACATTTTCCGCCACCAATTTCAGGCAATTCACCACACAAAAGTGGTAAAATTTAAAAATTATGCAATTTAGAAA:1 + chr3R 30228908 3' - jockey 222 1 70.91 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7317 2 33.68 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACACAATAGTTAGAGTCGCTTGGCCGCTGAGGAAAATGCAAATAACTGCACGA:1 + chr2R 23230658 3' + 412 473 2 55.43 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTGACATTTATAAGACCTTTAATGGTCTTCTTTATACATCTTAGGCCCTTAAAAGTAGGCTACATATATTCTATGCACACAAGAAG:1 + chr3R 18202331 3' - jockey 4669 1 81.13 AAGACGACGCACCGTGAACTAACTGGACCTCGTAACCCAGCAGGACGTCCGCAAAAGGGAAAATAACGGGATCCCTGCGGCCTATAAAAGGACGGCGCAAGCGC:1 + chr3L 24300077 3' + gypsy8 251 2 54.81 GAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTCAATCTGTAGTGTGCGGCCGAGAAATGTGACAGAAATGGG:1 - chr2L 22534709 3' - hobo 2656 1 57.45 AACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCACCTTCTGCAGACAGCGAGCATCTGAACACGAATGTCAATCTGGAGTGCCTGAATCTGGCGGATAATAGCATTGGC:1 + chr2L 3868807 3' + Doc2-element 346 1 55.45 GCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTTTGCACGGTGAAAAATGCGAATTGAGCGGGGAAAATGAAGGAGGACGTGAAGAAA:1 + chr2L 3980306 3' - Cr1a 356 1 65.06 AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACACACATTATGGCATTTTTGCTAATTC:1 + chr2L 22497740 3' + Tirant 335 2 76.36 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTGCGTTTTCATTTTTTCATCTCCTATATAGCATATTTCTTTGCGCTCAATTTCCTGTATTTTGTTGC:1 + chr3L 19347242 3' + jockey 4973 1 64.76 ACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTTGTTTTTCTCGTTTTTCTTGTTTTTTTCTGGCGCTTTCCTCGCTTTCCCAGCCATATCTAT:1 - chrX 5446318 3' - invader1 191 2 73.91 CTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAGGGAATTGTGGCAATTGTTTGATGTTGTCCTGGGCGAGTCGCCTCACCCTGGCGTTCATTGGCTTTTTC:1 + chr2R 12531948 3' - Idefix 7058 2 59.09 ACCGCAAATTACGCTGATTTATCGCAATAGATTCGGACCGGATACTGACTACGGCCGGGGTTTTGAG:1 - chr2R 18054204 3' - gypsy9 70 2 73.13 CAATTGTTCGCTTTTCGCGTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - HeT-A 191 1 97.87 TATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGCCATTTCACGATTGATATTTCTCCACCGT:1 - chr3L 14261309 3' - mdg1 58 2 72.73 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCATATATCCGGCTGATAATCCCACCTGACAGTGGCCCTAAGATGGGCAGGAGCCCTAATTGGGCCACTTCGTACCATTCC:1 - chr3R 20058431 3' - mdg1 7044 2 75.00 TATTGTATTATTAATTAAATTTTGGCAATTCTGGTTAGGCATGGTTTGGCTTATGGTCCAGGTTACAATTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - TAHRE 53 1 66.98 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTGAAGGATGTAAGTACTGTGGAGTATCTTTCAAATGG:1 + chr2R 19405984 3' + HMS-Beagle 223 2 63.64 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTTTGAGGGTGGTGTACGATAGCCTTACTGCACTGCAGACAATACACTTAAAAAATTAATAGTTAAAACAACATAT:1 + chr3L 15419584 3' - jockey 4787 1 79.09 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAACCTACTCTACATACACATACCCACGCACACACACGCACAAGGTAGAGATGAGTAGTTGCTGGTG:1 - chrX 9642328 3' - S-element 7 2 71.43 CAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGGATCTTAAGTGCTTGAAAATGCCTTTCAGACCGTA:1 - chr2L 10514538 3' - invader1 104 2 62.35 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATCAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGAGAAAAAGAATAAATAAACAACAAACCGAA:1 - chrX 7437274 3' + Stalker3T 201 1 68.18 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCGCCCTCGCTGCCA:1 + chr3R 5910766 3' + roo 397 1 66.30 TACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCAGCTGCACCGCCACCTCCACCACGTCTACTCA:1 - chr3L 20156918 3' + Doc 4495 1 75.95 CATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGATACGCGACAACGGCTGACAGAAAA:1 + chr2L 1927784 3' + I-element 312 1 69.62 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAGATTGTGTGCCGGTGACAACCTTAACACCGAAATACTCAATTAAATAAAGTTCAG:1 - chr2R 12839043 3' - jockey 4761 1 71.60 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGATTCGAGCT:1 + chr2R 21735246 3' - blood 45 2 62.73 ACACGTCGGCGATCGAATTATTACGGTTTTTGTGCTTATTTGTTTATAACACATACGTCATGTTAGTTATTGATGAGCTTGCCATGTGCAGGCCATCAATTA:1 - chr3R 7588832 3' - F-element 10 1 75.49 AAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTAAGA:1 + chr2R 6984420 3' + HMS-Beagle2 7183 2 66.99 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7312 2 31.78 AGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTATTAGTCTTGTAAACTTTTCTAAAAACAATGACAAAAAGCAATGGGAAAAGAATAAATACGCTTTGTTTAAAATGCAATTTCAAG:1 - chr2R 15855630 3' - opus 110 2 78.18 GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCATAACTTGGATAACTACTATCTGACTTATTATGATG:1 - chr2L 7750567 3' - opus 7049 4 72.16 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATAATATTAATAACTATGCGCAAAATTAGACGGCAAACAGGCAAACATATAAACATTTGCATT:1 + chr3R 9481291 3' + roo 386 2 60.91 GAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAAAGGCAGCGTTTAGTGGTAAGTGTCCATCAAAATAGAGCAGGGAGTC:1 + chr3L 14155553 3' + Bica 468 1 55.77 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTATTGTCTTTTTTCAGTCAAATTATGAGAATACCAGAGTTTTCTGG:1 + chrX 16693839 3' + 1360 3355 1 58.88 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTTAATTCGTGAATAAGTAACCAAAAAAGCATTATATGTC:1 + chr2L 21784907 3' + I-element 5317 1 59.62 GATAAATCATGATATTTAACATTACGTAGAATGCAAAGCGGATTGATGTTGGTGTGGGGTGGCAAATAATGTTGTTTATGTGGGGGACCGA:1 - chr2L 21006559 3' - Chouto 6221 1 64.84 GTTTTTTTTTATTTTAATAATAAAAAGCGAAGATATCGAGGTTGGAAAATCAATTCCAACAGTGTGTTGCAGGTTTAAGGAGCGACTTTTTCTCCGGAGACCTTGGTCTG:1 + chr3R 16847101 3' + hopper 156 1 87.27 GAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACTTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGATTTTGTTTGACTGTTTTTCCTGTTTACGCAAA:1 + chr2R 19524042 3' - accord 284 2 60.67 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGTGCTGACTTACTTT:1 - chr2R 24031472 3' + 1360 3358 1 59.38 AGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGCTCTTCGCCTGGTCTTGTGTTTTATTCAAAACACAATTGTTTATG:1 - chr3R 14531482 3' - I-element 198 1 68.12 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAAAAAATAAAAAAACAAGAAGTGTTCGGTTTAACTAGTCTATTTGCTTTAACGCATAGCTAATTGTTTGGCCTGC:1 - chr2L 5114502 3' + I-element 5332 1 56.36 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGGCTGCAGCTGGTTTAAATGGAAACATTTGTGGTCCGTCGACTGCTCGAGATCATTG:1 + chr3L 15968281 3' - P-element 6 2 73.64 CACGCTCAATTTCTTAATCTTATTAATTGTTGTCTGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCCAAATGCTCACATGTTACATTTACTGTTTCTGT:1 - 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chr3R 31633117 3' + opus 486 2 67.29 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGTGTTGCCTGTGTTTGTTGTGTCTTTAACCTCTCGGACATTAG:1 + chr2L 9171524 3' - opus 15 2 66.97 ATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATAATATGATAGATTTGATTTGCCATCAGC:1 - chr3R 17777601 3' - Burdock 6144 2 58.06 TATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTATCCTAATATGTACCATGTAAATTACGCATCTTATTATTCTAGTGTCTTTGATGCAGGCCATGTGACTTTTGCTTAAATG:1 - chr2R 6463043 3' + 1360 3113 1 71.82 ATTTAACTACAATTACATAACAATCACAAGCAAAACACACAGACACACACACACATGCGCATTCCTGAATACATCCGTATATGAGTACACTTTGAT:1 - chrX 16457978 3' - X-element 4587 1 71.88 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGACATAGA:1 - chr3R 24260902 3' + roo 9020 2 76.00 GTTAGATCTATAGTGATTTAAGATAAGGGGTGTATAGTTTTTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTCGACTAAGCAATTCTGGTGGGGTCAATCAAAATGGAAATTTG:1 - chr2L 1416815 3' - Cr1a 4147 1 71.82 TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTAAAAACTAATGTGACGAAAGGCTCCGCAGATAAAGCGGTTTGTAATGGCACTATTTACCCTTTT:1 - chrX 15043089 3' + S-element 1704 1 67.27 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTTTGGGGGAATGGAGG:1 + chr2R 15419051 3' + hopper 1384 1 74.32 TAATAAGTCGACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTACCATTATCATTTCATATAGTAAGCCAATGTT:1 - chr2L 14540040 3' + mdg1 81 2 71.82 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGTTAAAGGGGAGACACACAGCTGCCGCCAGG:1 - chr3L 10542533 3' + hopper 1397 1 60.00 AATTGTAAAATGCCATAAATTGTAACTATATATTTTATAAAAAAAATCAGAGTACAATAAAATGACAGCGCCGAAAGGCACTGAAAATATTTATAAAAAAATTTAAGTG:1 + chr3L 18737634 3' + TART-B 10424 2 49.54 GAAGTAAAAAGTAACACAAACCAAATTTGGTGAAGATAGGTCATCATTTCGAATTTCAGCCAAAAACAAAAGCGCAAGAATCGTTGCCACTGACGTCATTTTCCATTGAA:1 + chrX 3636206 3' + transib1 2079 1 59.09 CCCTCATGGACTACACTGATGGAAGGGAGTGGGAGCCTCACATCCTGCCACCGAGCGAATGCTGCACAATTCAATCTTCTGGCCTGGTCTCAATATCATTTCGACTCAGT:1 + chr3L 17823290 3' + Rt1b 4921 1 66.36 GGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTTTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTATGTTTTTT:1 - chr3L 20402328 3' - Porto1 310 1 64.55 TATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTCATTAAAATGTACTATCTTATTTTTGACTATTTATGAATTGATTA:1 - chr2L 8928886 3' - invader2 4683 1 64.22 AGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTAGTTAGAGAAGTTCTCATTTCTGCCAGTCCTTGTTCTCAATTTCTCCCAGTTTCGGAGGCGCATGCTCGCCAATTTGT:1 + chr2L 17735708 3' - 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S-element 342 1 56.19 CCACCAACTCAAATATTGATATTCTACAACGCTACCAACCCACAAAAACTACAAGAAGGAGGAAGCAACAAGCAGAAGATTTTGATGATGACGAACGAGATGAGAATAAG:1 - chrX 6839716 3' + G4 3460 1 70.00 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAAGATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTCGAG:1 + chr2L 3323290 3' - hobo 36 1 54.13 AGCCTAAAAGATTTTATGGATTCTGATTGATACATGCCACTAAAAATAGATTCCCTTGCTGCTGTGCTTGCTTAATTTGCTTTAATAATTTATAACTTACCTGCACACA:1 - chr2L 4636991 3' - G5A 2766 1 74.31 CGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAAAGACGAAAAGAGGAAACCGATTGATTTTACTTCACATATTCTTAAAATTACGTTTCATATTTGCAT:1 + chrX 5006103 3' + TAHRE 273 1 52.04 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATCTTAACCATATAATTCATTTCACAATCATCACAGTTTATTAATGGCAAATAACAATACTTTTTTGCCACATCCTAATTTGC:1 - chr2L 14708822 3' + opus 499 1 77.78 TTAATGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATCACTTCCTTCAAATTATG:1 - chr3L 10506740 3' + hopper 1400 1 66.36 TCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTCCTTTAAGTAAACAATTAGTGGACAAAAGAAGTTCATGTATATCGGGAATGAATTTCATGTTCGATGCAATATTTGC:1 - chr2L 14178968 3' + Tc1-2 1538 1 59.09 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGGGTCACCCAGATATTAATGCCCGTGCCATAAATAAGCAGGAGAAACGATATGCCCAGGAGGCACAAA:1 + chr2R 21027360 3' + roo 390 2 44.55 GAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAACGAAATCCTAGGGCCGTCTAATATAAGGTATATAATAAGATTTGAATAATTA:1 + chr3R 23358443 3' + Doc2-element 4598 1 65.69 TAAGTAATAGAAATATGTTTAAAGTTTTACTAACATTTCTAATATGATTTCTGAAATACAACAAGTAATTTTAATACAGCTCTTATTTTAAAGTTCTAAACTA:1 + chr4 1120833 3' - Gypsy6A_LTR 227 1 64.08 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATC:1 + chr3R 11937285 3' - pogo 31 1 56.88 CGGCAGAGAGTAAAGATTACAGACAATAGGATTACGACTATTATAGTCAGAACAAACACGAATTGAATGA:1 - chr2L 13235038 3' - Cr1a 4231 1 75.71 AAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCCATGGCAATGCAGTCGAGTGTGAGTGCGAGTGTTCCATGTATATGTATGTGTGGGGCCATGTCCTTTG:1 - chr3R 11315193 3' + hopper 1408 2 71.13 CTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGCTCGGTTTTATGTTATATATTACCAGAGAGTTATATGAAAAGAGATAAATTTTAAATTTATCATCAAGATGCAA:1 - chrX 23283333 3' - Stalker4 199 4 68.18 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAAAGGTTAAGGGAAAACGTTTAGCACA:1 - chr3R 24867512 3' + roo 9034 1 77.91 CTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATGCTGTTGTATAACAAAAATAATCGC:1 + chr3R 11200778 3' + Tabor 70 2 77.06 TCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTATGAATAGGAATATTTCAATATTAAAGAATACAGATTAATCCCTTTT:1 + chr3L 14811494 3' - copia 39 2 57.27 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAG:1 + chr3L 18417066 3' - mdg3 5268 2 37.62 TGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAGTATTAAAGAAGATGTTACGTCACAAAAATATTGAAAGA:1 + chr3R 15309404 3' - HMS-Beagle2 6924 2 62.73 ACCGACAATGCGTCCAATTTCAGCGTAGGTTTTACCTTCAGAGATCATGTTTTCTGGTTATACGTTTTTTCGCTGCCTCAGCCGGCGAGATG:1 - chrX 22673594 3' - Tc1 436 1 57.61 GAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGCTCACCACCTAGCTCCTTGATT:1 - 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mdg1 24 2 59.09 TTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTCAGTCCAAACAGAAGTTAGTATGCTAAAAAGCT:1 - chr2L 11095539 3' - R2-element 3408 1 75.45 CCTAGGCGAAGCACCAGCCATCGCTCTGCTGGATGTGTCGTGCTACATGTGTTTACATGTCCTTAAACCTGCTCTCTCTTACAAAA:1 + chr3R 9284078 3' - Rt1b 337 1 79.07 TATCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGGAAATGCGAACGCGAAACTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAAATAGAGTGAGCGTGGCAACTC:1 - chr3R 31957637 3' - INE-1 546 1 72.04 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGTACA:1 + chr2L 14141336 3' - hopper 25 1 62.35 CTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCTAGTCCAACTCAAAAATTGTGTGGAAACACAAACCGCCGCCGCCTAAAAG:1 + chrX 14771695 3' + jockey 4566 1 64.71 CTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATAGTTGAAAGGTGAGAGTTATTTAAATTGTGTGTTAAAAACACCATTTTTTCAAGCTTCTTGT:1 + chr3L 18743677 3' - pogo 2083 1 55.45 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCATATGTAGACCTGTTCCACGCAGCTTATCA:1 + chr2L 12591776 3' - roo 8717 2 74.55 GTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCGGCCGCACACACCCTCCCAACTTCTCGC:1 - 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F-element 4318 1 45.26 GACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCGAAATGCATGAACTTAACCCCAAAGGGTTGTTGCCTTCAAAGTCACTGTCAACGGATCAG:1 - chr2L 18671594 3' + I-element 4945 1 59.09 TATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTAATTGTGTCTATTTGATATGTTTGGCTT:1 - chrX 18237384 3' - accord 7030 2 69.49 ACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAGATTCAATAAATAATAAAAAATTCTAGAGGGACTAATGTGTTTATGTATGATAAATAAATATGACTCAACTCCTTAT:1 + chr3R 21646722 3' + Doc 4649 1 56.36 AGGCTAGTGTTTCATTGTATTTTACATTTTTCTCTGCTTTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTTTATAGCTTGGCTTTGTGGAACTTTTCTGTTTGATTGTTGGCG:1 - chr3R 13376924 3' - Doc3-element 4501 1 59.05 AAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAAAGGGTAACAGAGAGACTCGAAAATAGCGCATGAAAAC:1 + chr3L 11084425 3' + Porto1 4361 1 60.22 AAATTTTTTTTGTGTTTTTGCATCTCAAGTTCGA:1 + chr2R 6979076 3' + Tc3 1549 1 79.41 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGCATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAACGCACTGAT:1 + chr3L 20039867 3' - Doc 35 1 49.09 TAATTGCGCTTGGTATGTTTTTCCTTTTTTTTTTTGATAATATTTTGGCTTTTCGACATTTTGGGCGACTACAAGGAATTTCCG:1 - 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pogo 22 1 63.89 ACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATTATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTTTTTGGCTGTGTGATGGGGGAGTTTATTGCTGCGCTCTGCG:1 - chr3R 11545443 3' + Tc1 1343 1 68.18 GATACTAGATAAGAATAAGACTGCCATAAAGATAATCATAACCAGGCAACGATAAGCAGTTGATAAATAATACAAACAGATCAAAGCATAATAA:1 + chr3R 24686664 3' + Idefix 107 2 74.47 TTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAACGGAGCTCAATTCCATGCAGCGGTTGCACTTGATATTGAG:1 - chr3R 4315964 3' - 17.6 265 2 60.24 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCCACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + 412 445 2 75.79 GTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATTATTTGAATTTTTGAGACCTCAACTGTCACTGGTATGCAAATCACGTTCA:1 + chr2R 20883516 3' - TAHRE 10387 1 69.09 TGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATCGATGTTTGTTCAATTGTAAGCGAAACTACAAA:1 - chr3R 30614731 3' + I-element 402 1 70.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCGCCCTCGCTGCCAACAAA:1 + chr3R 5910771 3' + roo 9047 1 60.00 TTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTGCCGCTCGAATTAGCTACCAGTCAGTCTGGGTTTTCAAACACATGCGAATAT:1 + chr2L 9502717 3' - 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invader2 352 1 55.45 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTGGATTTTTCTTTCTTGAGTTCG:1 + chr3L 3555522 3' - 412 7085 2 52.29 ATCATCGAACGCGTCGGTCGTCCCCACGCAGACATTGATTATTATTTCATAAACAATACAATTACTCACCCAATCCAAAGATGCATCACAGAGCTTTTAATATAACTGAC:1 + chr2L 20087607 3' + gypsy7 5359 2 54.55 GGGCATTGCCCATTGGTGGATCACATCGCAGACAGTAGGAAAAAAAGAAAACAAAGTGAAAGTAGAAACACAAATTAACATAAAGCAATTCGATTAGCTTTCAGGCATGA:1 - chrX 17014162 3' + HMS-Beagle 481 1 60.91 ATCTCGGCGTTCATACGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGGAATGGGATGGAAGCCTTAAAACTTGGGG:1 + chrX 7645000 3' - INE-1 131 1 79.78 ATAAGACAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAGGATAAGAGCTCTCCAATCCGAAGTTCGTTTAAGTTTCCATTGATCTATGGCCATTGTTACGAAGGACAAAT:1 + chr3R 31177794 3' + Stalker3T 201 1 65.45 GAATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACATAAAGTTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATCTACAAATTTTTTTAATATTTTGGGTAGAAACAATATCAG:1 + chr3R 13616732 3' - Cr1a 4010 1 63.64 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGGTAAGATAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAG:1 + chr3L 18417066 3' + Stalker3T 202 1 32.04 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACAAGTTGTTTATGTTCTTGTTTCACT:1 - 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chr3R 23861052 3' + pogo 2082 1 58.18 TGCTCATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTTCTGTACTTTTTGCTTCGAAGGTCCGGCGAGTGAATGAATGGGGCTTAACTGTTGATTTCC:1 + chrX 3028379 3' + diver 72 2 73.91 AACGTGAACAAGACGAGCGTCACCTCTCTTTAATAAAAAACAACCCAAACTTTCGCCCACGGAAGCGGAACAAACACAAGTAACCAGCAGCAGTAACAATTTAGCAATCA:1 - chr3L 15082992 3' + Doc4-element 26 1 60.00 CACCCGACTTTCTAGATCCCCCACCACCG:1 - chrX 6166816 3' + Rt1b 439 1 68.97 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGGTGTAAAATCCAGATTGTTGCATGTTCAATTAGTTGTACTACACTGCAATATAGAAACGGAT:1 - chr2L 17785777 3' - roo 8687 2 60.00 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACT:1 + chr2R 8086855 3' - 1360 43 1 61.82 TTATTATTATTTTATTTTATTTTATTTTATTATTTATTTACTTTTCAAGCCTACAGTTCACGTTTATTCGAAC:1 - chr2R 7416232 3' + transib1 1892 1 56.16 CTTATTTATATGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAGGGTATATAGAAAGAACAGTTGTATCTATAAATTTTTGGTTTTAT:1 + chr3R 30519843 3' - Tc1-2 60 1 78.90 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTACGGTTTTTGTGCTTATTTGTTTATAACACATACGTCATGTTAGTTATTGAT:1 - 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chr3L 10836513 3' + opus 485 2 66.34 TTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGCCCATCTCATTCGTTTAGGTCGAGTCAGCATTTTGCATTGCAAATATTT:1 - chr3L 14918676 3' + Tabor 97 2 55.45 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCAATCAATTCAGATTATGGATTTGGATAATGACGAAACATGTTGGTGATGCAAGAAGAAATTAATTTAAATTAACTACAT:1 + chr3L 14261396 3' + mdg1 415 2 74.55 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTACTCACATTTCCTCAAGCACCAATTAGCCATCTGAGTTATGGCTC:1 - chr3R 22595811 3' - FB 23 1 52.69 TGCAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAAAGACGAAAAGAGGAAAGAGTTTGGAATGCGTTTGCCGTGGGCATGAAATGCCCTAGTCGA:1 - chrX 18255300 3' + HeT-A 229 1 61.82 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCAATTTTATTTGGCCTACACACAG:1 - chrY 3612770 3' - Ivk 50 1 77.89 CACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGACAGTGACGAGGTCCATCGCCAAAGGCTAGGTA:1 - chr2L 5208957 3' + G2 2832 1 59.76 ATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCAGTTTTCAGTTTTCTGTTTGCAGTTTAGTACAAAAGTTGCTGTTCAAGGCGATTATGAT:1 + chr3L 14852234 3' - Juan 433 1 51.82 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAATTATTTATACATGAACGCCCAGACAGTGCAAGCTGACA:1 + chr2L 19681506 3' - hopper 20 1 60.91 TGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCACACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATT:1 - chr2R 5674636 3' + S-element 1519 1 55.45 CTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTGTTTTCTTGTATATTTAATATTTTCAATAACTATCCTGGACACACCCATGTTTTGTACCTTATTCGTCACCTCTGTG:1 - chr3R 6699265 3' + S-element 1526 1 55.45 GTTACTGTCTAAAAGCCAAGATTACAAAAAATACTAATTATAAACTAACTCACCACGCCCAAGGCCCAAACTCACCCCATACAATGTAAAACCAAAGACCCTAGAATAT:1 + chr2R 5876920 3' + HeT-A 5873 1 77.98 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGAGGGAGAAAATCTTGGTGATATGATGTGTATATATATTTTAATGCTAAGA:1 - chr3R 10202980 3' + roo 388 2 49.47 TGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAACCATCAGCAATGCATGACTCCGGCTTTAATTGGGATCCGTTCAAATGCTTGGCAACTT:1 + chr3L 18704906 3' + invader2 277 1 69.23 CATAGAAAAAAATCACAAGGGGGTAGATCGGGAGAGCGTGCGGGCCATTCCAAATCGCCTGGGAGAAACCCAACCTTAAGTCCCTCGAATATATGGGATGCCCAAGTACT:1 + chr3L 21159051 3' - mariner2 585 1 54.55 GTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATTGAACAAAAAGTCTTGTTTACAACTATTGTTAAGTTTATTTACCTGTATTAAAAGGAAA:1 + chr3R 17419782 3' + I-element 5335 1 57.27 CGCTTGAAAAGTAGGCCTTAAAGGCAAAGTCACGCTCTGAACAACTTGGCGGCCTCTTCATGATTTTGCGTTAAACGTCGGACGTGGTAAAAATAAAAACAGCGA:1 - chr3R 14673574 3' - mariner2 167 1 71.43 TAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTATCTATGATTTTTGGGAATTCGACAAACAAAAATGCCTACTCATG:1 + chr3L 16537185 3' + Tirant 8374 2 56.73 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTTTGGGGGAATGGAG:1 + chr2R 15419050 3' + hopper 1381 1 76.32 GGTATTTCCGTTTAAGGTTGTGATTAATTGATTAGCGCCTTACTTGAGGTTTGAGTGGTTACACAT:1 + chr2L 4530833 3' - gypsy5 320 2 71.21 TTCGTTAATTTAAAGGTCGTTATGAAAGTTAGAGATCTTATTAAGTAACCAATATGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - gypsy7 441 1 59.62 ATGTAGTGTGCACTAAGATTACATGTTTTTGGGCACTCGCAGTCCATTGTCGCCTTACCTTAAGCCACAGCAAAGCTACACTGCCTGCTTAAAGTCCTTTTTCA:1 - chr2L 12244087 3' - roo 141 2 70.19 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGCTGATTTCGGAATTAGTTCGGTTAACAGCCACAC:1 + chrX 3528628 3' + roo 9021 2 67.27 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - blood 7026 2 35.45 GTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACAATATAAGCTATAAAGCTTAGATTAACCATATGATATTAACCTAACGCCTAGTTTATATGCCACAGAACACAGGAC:1 + chrX 14577918 3' + INE-1 133 1 76.19 TTAATTTGCATGCAAAAAACAACACCAAAGGCGGTGGCACACTCAAAGTAAACGCCATGTCACGG:1 + chr3R 17600984 3' - Cr1a 258 1 69.23 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGGATTATACTGTATTTCCATCCGATGCCAGGAGCGTTTCGG:1 + chrX 21399457 3' + pogo 2081 1 61.97 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAAATCTTTGTT:1 - chr3R 11553647 3' - hopper 3 2 72.62 AATATAAAAATATTTTTTCTTTTTGCTATTTTACTATCATATTAGTATATCATCACATCCTAGATCCTAGATCCCATCTAGTTTTCATGTTCATCCCAT:1 + chr3L 18653088 3' + transib1 1957 1 55.56 TCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGAAAGTGAAAATTCGGAGTGGCATTCGTGGCGAAAAATATGATAG:1 + chr3R 22898590 3' - 17.6 7309 2 70.00 GTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAACAAAAAGGCGAACAGAACAATCGAAA:1 + chr2R 16845707 3' + 297 235 2 72.34 CACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACTCCCGTAGGCAACTACTCACTGGTCGCTGGACCAGTTAAAGTGTTTTCTC:1 + chrX 988905 3' + I-element 4961 1 59.57 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCT:1 - 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chr3L 18354240 3' + S-element 1267 1 67.27 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCGCCCTCGCTGCCAACAAAGTTGCCTTGGC:1 + chr3R 5910782 3' + roo 402 1 74.76 AATTTCACAATTCAAAGCACCTCTGATTTAGCTGACTTTGAAAGCGCTAAAAGTGTCGCGAGTGTCGAACTCCATTTATGTTAAC:1 - chrX 6755745 3' - transib4 177 1 78.82 CTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTAAGCTAGACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATTGTAAAATGTTTTGTAAAAACTGACCT:1 + chr2L 14669448 3' + G5A 2749 1 71.82 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAATTCATATGGTATGATAAATGCCTTGGC:1 - chr3R 31967811 3' + jockey 4955 1 70.79 TTGGTTAGATTTTGCCTAAACTAAGACAACAACAATTACAACATGGAACACATAATTATAAATCAGTAAGTTATATATGCCGGAGCAGCAACAACAATATGGAATGCATT:1 + chr3L 17642260 3' - transib3 371 1 69.09 ACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTGTTTGCACTTAAGAACTTTATAAAACAAAT:1 - chr3R 24260856 3' + roo 9056 1 61.82 CAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCGACAAACGCATAAAATTCGCTTGAACCTTTTG:1 + chr3R 26775933 3' - Rt1a 23 1 60.00 AAAAAAACAAAGAAAAAAACTTAAAATACAAAAAGAATGGCAACCCGCACCAGTCGAATCACACGCACAGGAGGATAGCCATCA:1 + chr2L 223801 3' + HMS-Beagle2 490 1 67.86 GGACATGGCCAGATCGACTCGGCTGGTGATCCCTTTTAAAAAAATTTTTTT:1 + chrX 21592681 3' - INE-1 107 1 62.75 TTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATATATCTTATTAAAGCTAGAAAACTATTTTCTTATAGGAAAGGTGAGTGATGTTCTTTCAGATTTTCTTTTT:1 - chr2L 16230279 3' + blood 7378 2 66.36 CATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTACACGAAAACACAAGATCAAAACTCTTAAGACGTGCTCTTTGTTACAAAACAATCATCAAAGCTATACTTTTCTGT:1 + chrX 12891572 3' - Cr1a 416 1 56.31 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAATAAAAAAATGCGCATATTGTGCAATTTTATGTA:1 + chr3R 17927484 3' + jockey 4936 1 77.27 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGTCAGCCACCAAGCACCAGTTGGTACA:1 + chr2L 9754897 3' + 1360 3384 2 70.91 TTTTTCTTTTTTTTTTTGTTAATTAACATGCGCGAAGGAGATTGTTAGTTATGCGATATTTGCATATTTGATGCTAGAGCAATCAATTGAAATTCACCAATTTTTCATTG:1 + chr3L 4638071 3' + hopper 151 5 59.09 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTA:1 + chr3R 27071912 3' + jockey 4948 1 69.09 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGATATCAT:1 + chrX 20433387 3' + diver 180 2 62.39 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACACGAAAACTTTTATTGTTTTCTTAAAGCCATTGTGGCATTTGTTCTAATTCTCT:1 + chr2R 8530854 3' + mdg1 414 2 46.36 CCACATATTAAACTCATGCCCATCCGTCTGTACGACATCCCAGACAATACTTTCGACTCCGATGACTCGGACGATGGCGAGGGCGATGACG:1 + chr3R 23682075 3' + I-element 5042 1 78.02 ACTCAAGGGGGCACCCAATCCAACAGACAAAAACATCCGCATCCGCATTGCCTCTTTCTACTGCTTTCTTTGAGTCTTGGGTTTTATTT:1 - chr2L 21237955 3' + Quasimodo 7007 2 53.93 AATTGTGGATGCGAAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAGTTAAAAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAA:1 - chr4 1294990 3' + TAHRE 10392 1 80.91 AGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCACTCGCACACACACACACACACACAGGGGCTGCAGCAGGAAAAGATGAATG:1 + chr2R 14765930 3' + Quasimodo 6999 2 72.00 ATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAGATGCCCTACAATATCTGGTGTGATGGATGCAAGAACCACATCGGCATGGGCGTGCGCTACAATGCGGAGAAG:1 + chr2R 18851130 3' - Doc 4266 1 72.73 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAAATGTTTACAGAATTAGCGTGAAGCCGAGG:1 - chr3L 16046881 3' - P-element 55 1 30.91 TTTTCGAACATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGAACTGGGCAAAAAAACTACTTGGTGGGCAATAATAAAAACAACACAAACTGTATCGTGTAA:1 + chr2R 21397953 3' - FB 139 1 70.91 AATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGCCAAATCATCGGGGAGTCGTTTGGGTGCACGG:1 + chr3R 17359900 3' - Doc 4624 1 70.91 CGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTCTACGAAATGGAGAGCCTGAAG:1 + chr2R 20645531 3' - 412 118 2 65.62 GTCTTGTAAATTTCTATCGATTTTCCAAAAAGCCGACGAACCAGAGACGCCCACAGACATCCACTGAGGTTCTATAGACAGATACTAGGTTCTGCTCGC:1 + chr3R 12992534 3' + INE-1 301 1 64.65 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACATCGTCAAAGTGTTCGAAACAGCCACTATAAAAAAAAAATGTCCCATGCTGGTACATTTCATGTTTG:1 - chr3R 14139049 3' + 297 381 2 69.44 AAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATGTAACGCTACATACACACTTTAGCCCATTTTGCGTGCATATACACTGCATGTGCGTACATAT:1 + chr3L 19992131 3' + Stalker 114 4 53.64 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGTTTTCCCCCCACAA:1 - chrX 8885518 3' - roo 8701 2 83.54 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATGTTGTTGATGGCTTTGCCCACAAAATGCCGTGGGGATTAAGGTGT:1 - chrX 22769344 3' - 412 26 2 54.17 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:2 - chr3R 21907535 3' - 412 56 2 72.73 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACATACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTATAT:1 + chr2L 21034131 3' - 412 7084 2 49.09 AAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGGAAGATTGTATGTAAGTTAACCAAAGGCAAATACGACAACAACGAACACTGCGATAAGATAAAACGATGTACGACCTTTATA:1 - chr3R 14709191 3' - rover 70 2 55.45 ATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTGACGTGACGATGGGGGTGAGGCTTAACCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGTCGTCTTGCTTATTATTTATTGGGGTCTTC:1 + chr3L 23514306 3' - Idefix 7108 2 72.48 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATCACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGATATCATAACT:1 + chrX 20433391 3' + diver 183 2 57.27 AAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCATCGTAT:1 - chr2L 21325114 3' + invader4 3055 2 80.65 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTAGGGATC:1 + chr3R 27071931 3' + jockey 4968 1 51.38 CATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATAAAAGTAATCTAGAAAGCGCGTACACAACCGGAAGCACGCAAAGGGCGCG:1 + chr3L 17706439 3' - Juan 13 1 60.24 GATTTTCCATATATTTATTATTTATTTATTGTATGTATTAGAATTTAAACCATTTTTCACCTTCGCATATTCGTTGACATTTGACAG:1 + chr3L 10723497 3' - Burdock 238 2 70.11 CCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTTGGCAGCACTTTCAAGATGCACTGCACTGGTAAAAATTATATTATAAATTATAAAATTATTATAAAAATTAAAAA:1 - chr3L 23569966 3' + F-element 4473 1 74.53 GGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACCATAGCATTCTCTATTGTTTTCGCAAAAGTATCTTACTGAATCT:1 - chr2L 887820 3' + INE-1 557 1 62.86 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACCGGCTTTTACTTTTGCGCGCTCTGCACATTCTGCAGCAGGATTTTGAGAT:1 + chr3L 14755078 3' + P-element 2861 1 53.47 TCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAAACATGTACAATGGCAG:1 + chr2R 16476431 3' - X-element 19 1 55.13 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACATGGTCCTTCCAGCTATGCTATTAGCACGTATATAACAACAATTTGCATATTTATTG:1 - chr2R 22663324 3' + mdg1 7429 2 52.29 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAAAGCCTTCTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Doc 30 1 54.55 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGCGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCCTCGTGCGCACGTACAAGNTTAATGGGAGTTCCCGCAAC:1 - chr3R 13503002 3' - hopper 49 1 64.08 GATATAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGAGCTGTGGCAAATAAAAAATACATTTTCACTTTTAT:1 - chr3L 9928213 3' + ZAM 8052 2 56.25 AAATAAATATTTTCCGATGACTACAATAGTTTTCATATATATAATACAAG:1 + chrX 15604879 3' + mariner2 839 1 72.00 CTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTGGCGAATTTCCAATTTGCACTGCAAGTGTCTTTAATTTTCGTTTG:1 - chr2R 7273067 3' + FB 396 1 59.09 CTTTTAGCTGTTATAGTTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTA:1 - chr3R 8005047 3' - INE-1 155 1 85.07 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATAATCTATACAATTAAATATAA:1 + chr3L 23456280 3' + 1360 3374 1 61.82 TTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTGGGGAAGGGACGCCAGATGGATGGGGC:1 - chr2L 2127629 3' - hopper 979 2 75.23 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGTAGAAACAAATTCTAAAATTTATTCTCAATAAAACACCAGGCAAAAGTACCA:1 + chrX 3352024 3' + I-element 5325 1 52.29 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTTTTCGGTACTTTTAAATGTAAAGTATGTATATCATCTAACCATTGTAACTATA:1 + chr3R 25635980 3' + I-element 5336 1 52.48 ACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCGAATGATCTGCGGCTGGGG:1 + chr2L 14484089 3' - R1A1-element 5068 1 73.61 CACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCCAAAATGGAAATGCCACCGGAAAATCTCTGAACACATGTTTGGCTAAGGTGGGAGTGCCACG:1 - chr2L 1488542 3' + roo 8819 2 62.75 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTT:1 + chr3L 5204441 3' - jockey 4710 1 62.04 TATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATCAGTCTGACCTGTTTGTTAGTCCTTCATGTGTCCTCACTTCTCTTGTCCACAGTTTTGAGTTTGCT:1 + chr3L 10723759 3' + Burdock 249 2 77.00 CAGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCAAAGGATGTGTGTCCTCGAATGTCAACG:1 + chr2L 624715 3' + Cr1a 347 1 71.74 TTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCGCTTTCTCTTTCTCTTTCGCTTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - invader5 204 2 73.58 AGCAAACCCAATCCAGATGACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATACCACAAAATTTACAAATTGCGTGAGCAGTGGAAACTATTTCCTAGCAC:1 + chr2L 7947958 3' + I-element 5121 1 62.73 CCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAACCGAAAAATCGCCCCCAAATCGTT:1 + chr3L 14436099 3' + mdg3 5247 1 78.18 CACGCCCACTCTAACGTCCACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACAAATTCAAAAAATGTAAATGTAATTAGACGTGACTTTTCCTCGAGTTCTACTG:1 - chr2R 20331551 3' + INE-1 215 1 72.00 GGGGATATGATCGTATGCTTTTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGTTTGGTTAGTCAAACGTTT:1 + chr3R 22500861 3' - invader3 54 2 64.58 TCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGGTGGTCATGTTGTTTCGATTGTAATTGTTT:1 - chrX 12642320 3' + R1A1-element 4972 1 61.97 GACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACCCACCGCTGGTGGCTGCCCAACAGC:1 - chr3L 16679261 3' + I-element 4916 1 72.22 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAATTTCATAATGTAATAAAATAGAATTTTTATTAACAATGATTTTCCTGCATATACCCCATCGTATAATACTTTCA:1 + chr3L 18915245 3' + 412 7544 2 73.79 GTGGGTGGCATGCACGATTCATAAACCCTAATGGTATTTTGAAAGCAAGTGTACTTCTTGTTTATTCCTTTTAATAAGTCTTGCATCGTTCAGGCCTTAACCCCACTTCC:1 - chr2L 1277462 3' - Rt1b 5077 1 70.00 TGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAATTAAATTAAGGGTG:1 - chr3L 18095523 3' + I-element 5293 1 83.64 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTTAAGCAACTTGTGCTAAATTTGCTTTCC:1 - chrX 20433337 3' - 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gypsy5 180 2 77.27 CTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - accord 7126 2 49.43 TATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCAACGCTTTTACTTTCAGAGTGGACTTACC:1 - chr3R 25051556 3' + 17.6 7412 2 74.53 TTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGTTGGTGCGAATTTAATGCGTTCACAAGTCGAACGGTG:1 + chrX 5776670 3' + invader4 2795 2 64.08 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATAACCCCCACCCCCCTTGGAATCATGATCTTTATACT:1 - chr3R 23729981 3' + Burdock 214 2 66.36 CCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - Stalker4 6932 2 56.36 CAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAACCAAAAAAAGGATTGAGGATGGAAGAGGATAAGGAAATATCTAATATCTTTGCCAAAAAAAATCAAATTTG:1 + chr3L 23063614 3' + mdg3 5076 1 67.27 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGATCTTGATACAGAAACGATCTAAAACATCCCATTCTTTGTAGCTAG:1 + chrX 22717207 3' + pogo 2097 1 74.36 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATAATGTAAACAAACTTGTACATCTATACAATTTCC:1 + chr3R 15524459 3' + pogo 2058 1 76.60 CAAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTACAATTAAAGGAAATGCGGGGAGTGGCGAAAATGCGTCGCTCAGCTGGCAAATGTCACTTAAA:1 - chrX 17436256 3' - Cr1a 4066 1 59.60 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGGAATGTCAACGAATGACAAAGGAAAACATTTCGTTTGTTAATAATTAGATGGATAATAGTTCTAGTGGCAC:1 - chr3R 5219204 3' - Doc 19 1 59.05 CATGAATAATAAATACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGCAAGCCAAACCCATAAATAACGATGATCTTTTGGGAAATTGGAAAATGAGATCTTGTCGCTTATGTTATTT:1 + chr3L 14961517 3' + Tc1 96 1 63.64 AATGTTTCTTGTAAAATAATTCGAATTATCAAATGTAAACATAATATACAATGTGATAATGTTACCAGTCCATGTTAAAAATACTTACCACTAAATATTAATACTAAATC:1 + chrY 2831537 3' + HeT-A 5800 1 66.36 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTTGGGG:1 + chr3L 5204445 3' - jockey 4697 1 54.55 TTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATAGCCACCAAAGTTTCCGTTTCTTAGTTTCTGCTCTCTTTGCCCTCCTTTTTTGAATTAT:1 - chrX 6117863 3' - flea 4608 1 57.41 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATCTAACAGAAGCTTCATATATACATATATGC:1 - chr3L 885745 3' + roo 9020 2 79.82 ACGATTTTCGGGCCAAAATCAATTTTGATCTATTTTAGATTCTAATTTTGATTTAAATCAATTTACTGTGAATTCTAAGTTTGTTTAACAACTAAATAAACCAAACATC:1 + chr3L 19939621 3' - 1360 3186 1 58.72 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTCTGCAAAAGTATTTTCATACTTTTTGGGG:1 - chr2L 2484348 3' - jockey 4699 1 50.00 AAACGTTTTTTATTGGAAATATTTATTTTGAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGTTGTATTTTAATTGTGGAAATCGGGTTGGATGGGGGGGTGGGGCTGGGATATGG:1 - chr3L 22107340 3' - FB 482 1 62.62 TTTTGCGCTGTGTAGACAGTTTTGTACTTTTTCCAACTCTGCAGTAGCCTCAAAAAATATTTAAGAAGCTTT:1 + chr3R 21255303 3' - S-element 13 1 88.89 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGTATTAAATAAAATTTAAACACCGGACGGGAAAAATGCACAAAACGGCG:1 - chr3L 17530128 3' + Tirant 373 2 56.73 AATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACATAAACATAACCTATAGGTGTTTTCCGTAAGTTTAAACGAAGCTTGGCTGAAAAAATATATATG:1 + chrX 902889 3' + I-element 4931 1 63.16 ACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGGGCACTGCTTATTAATATTTTGCCTTATTTTCTTCTTTTTTCCACCTTTTTTTTTAACTCC:1 - chr3L 16027223 3' - 3S18 5648 1 72.73 TGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAA:1 + chr3R 13423348 3' + rover 312 2 69.57 GCCACACCCAACGCCAACGAGCTAGAGCCGTCTAGCTAAAGCTTGCACCCACCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCACGTTAAACTGCCAGGCCACCTTTCTTCAGT:1 + chrX 21175368 3' + Gypsy12A_LTR 2181 1 55.05 TGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGAGAAAGGCAAGTGTATACACGTAGTTCGCCGCTACGCTTTACGGCA:1 + chr3R 12608327 3' - 1360 3247 1 58.06 CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATACAAAAGTGTGTGTGGTGATATGCGCTATAGGTTATAATATGTTAGCGTAATGCCGA:1 + chr3L 17220770 3' + opus 7480 2 60.38 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCTTTAATGGTCTTGTCTAGGAGCTTCT:1 - chr3L 25414193 3' + blood 355 2 70.27 CTCATGGATATAATAAGAACCATGCACGCACCGACAATTACTTAAGAGCAAAAGGCTTATTAGATGAAAATGCTGTCCTTGAATTCATCCTTGAGAGCTTACGTTTTAAT:1 + chr3R 8412734 3' + invader4 425 1 75.45 GTTTTTCTTCCTCTAGTGACTTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGGGCAAACAGTTGTTGTCACGTCAGAGCAAGCGGTGGGTGTCGG:1 + chr3R 25398240 3' - baggins 4990 1 51.72 TAATTAGATCCTACTAACATTAATATTTATTTGAGCTTCCTGCGAATGCTGCTTGTTGTTGTGGATGGCGGTGATTGCTG:1 + chrX 2840087 3' + Cr1a 4288 1 60.00 AAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCTTTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTCAACACCAACCATTTCCACAGCT:1 - chr2L 9470818 3' + Idefix 151 2 70.51 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATACAAAAGCTGCGAAAACAAGCAAGAAATCTAAGGTAGATTGCATCGACTTTGAGATACCCGCAAACCCCGGACAAACA:1 + chr3R 21612985 3' - jockey 10 1 76.19 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTACTTCTTTTTCGCTGTCAGTTGCCAGCTTCTTTGTGGAGCCGCCTTTATT:1 - chr2R 16061654 3' + roo 9036 1 57.27 CTCTGTAAGGGTCACGCAACTCATAGTTGTATTCACTCTCGTTCATTCATTATTTGTCTGCACGGAAAAAATAATTACTACTATAACCTTAAAA:1 + chr3L 10733606 3' - Cr1a 4172 1 70.21 GAGGAGTCTGCATGGCGCATGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAA:1 + chrX 22383291 3' - invader1 3655 2 74.19 TTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGATCGTCTTTTTTTTCGGTCCGCTGTTTTCTTTGCTTTGTTTATTTGGTTTTGCT:1 + chr3R 17341120 3' - I-element 234 1 51.82 AATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACATGATGTGATGATTTTCAAGTATTTATAGTTCTACTATTTTTTGGCCGTGTTCAGGTAAGTTTGCGGCAAG:1 - chr3R 8599444 3' + Dm88 4172 1 68.22 TAAAGTTGCCAGACAGATGATATGCAATCTTATATTTCCAACAGTGTGTTGTGTTGTGTTGCGTTGTGTTGCGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + frogger 163 1 44.95 ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCACTT:1 + chr2L 9754858 3' - 1360 34 1 58.00 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTCATTCCAATTAATATTCGATACAATGTCAACTTCTACGCATTGTTTGTCTTTT:1 - chr3L 6994441 3' - 412 31 2 51.85 CTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATAATTAAGGGAATTCGATGGAATTAAAATGAAAACAGAAAATGGGACACCGCAGTCACACTT:1 - chr3L 16757179 3' - Q-element 562 2 59.78 TCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAAAGGAAATCAAAAAAGGAAAGGCACGAAAAAGATAGCAAG:1 + chr3L 18902591 3' + I-element 80 1 61.84 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATCGTGTAAAATCTCTGGAAGAGTTTATCCTTTCATTTGGCAAACTTAATG:1 - chr3R 12452937 3' - roo 5 2 68.75 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTACGCTGCCCATTTGGATACGCAATTCCGTTGACAATGTGTTGCACAG:1 + chr2R 25118098 3' - Transpac 32 2 55.56 AAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCAGTTTGTAGGCTAGGGTGATTGGCTTTTTATAAATATTTAAGCACGACAACA:1 - chr2R 12272809 3' - INE-1 245 1 56.41 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATC:1 - chr3L 13023997 3' + 412 452 2 59.09 GAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGGCCGACACTAAAAAGTGGCTGGCTATGGACTAATGTAAATATTACCATTACGCATTTT:1 - chr3R 16717191 3' - 1360 221 1 68.60 GTACGCCGAGTGTACTTGGGTAGGGGCTAAGTATGATTAAGTATGGGGTAAGGGATCGCTCACAGTTATTTATTTTGTGCGGCGCCTGAAACGTTTTCGCATTTATTCT:1 - chr2R 17310685 3' - G2 2975 1 64.22 TATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAATTGGCGCCCATCGTGGGGCCAGCCCGATGCCTGTTTGGCATTTTTTGTTGCTCTCGCATTCCT:1 - chr3L 17194893 3' + Circe 223 1 66.29 GAAACTCTGTACGAAATAGAAAGTATAATTTACGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAACGAGATGAAAGGGAAGAAGAGGAGAAACTTTAAA:1 + chr2R 18733783 3' + mdg3 5039 3 68.81 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGTGTATATATGCATACGTAGTTGTATGTGT:1 + chrX 15227674 3' + hopper 1364 1 69.72 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAAAAGGTAAGTATAAAAGGAAGTAAAGATAT:1 - chr2L 4053060 3' - pogo 62 1 70.00 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATATTGGGCTTTTCCACGGCTAATTGAGAGCAAAGAAAATGGCTTTGTTGGCG:1 - chr3L 16291837 3' - jockey 4768 1 56.47 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCCGACCAGTATACCCGAGGCCAATGG:1 - chr3R 6132072 3' - I-element 21 1 62.86 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCACAAAACATGCTCACACATACGAGTATACTCGTACATG:1 + chrX 7763440 3' - hobo 27 1 61.11 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTCTTGATGAAAAGTGAAAAAACCAGTAACAATAAACCTGCGAGCAGCAGACAAACA:1 + chr3L 8919714 3' - roo 9 2 64.44 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTC:1 + chr2L 8476776 3' + Juan 4189 1 52.29 GCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATCCTTCAATCGATGGGCTAATGATTCCGACAAATAATAGCATGAGGCACGGCTC:1 + chr2R 549101 3' + Stalker4 7135 4 69.05 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATACCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGTTAACACTTTTCCGCGGTGAACAGGTTAACTGACACGATCCG:1 + chrX 22093355 3' + transib2 2787 1 57.01 GACCTTCTTAGCAAACCCAATCCATTTAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCACAAAACTAAATTATACAATACAATACAATACCATACAATACAA:1 - chr3L 21448026 3' + I-element 5112 1 70.41 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACATAAAAGTAATCTAGAAAGCGCGTACACAACCGGAAGCACGCAA:1 + chr3L 17706431 3' - Juan 48 1 62.73 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTGAGGCAAATAAAAACACTGTTAAATATACATAAAAGTACATATTAAAATTGATTGA:1 + chr3R 19058462 3' + Burdock 230 2 50.00 AATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATATAATTAAACACATTTAATGCGATGTACTTAACCTGACTCAGTCTTATGATTTC:1 - chr3L 13001351 3' - 17.6 7084 2 60.00 CAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAAAAATTATGAAAATAGTTGGTAAACTTTTGGCGAACTAAGTGGAAATTTTCTTTTAATAAACGCGTAAATTGTTTT:1 - chrX 8811302 3' + X-element 4695 1 77.27 AGACAAAATTCTAAGTCGCGGAGCAAAATCAAAATTTTGCTAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTGCCGTTTGCAGGATTCGAACAGTCGCCCTTTAAGCTA:1 - chr3L 306744 3' + HMS-Beagle 305 1 67.96 ATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACCACAAAAAACTACCCAAAGAATTGAGAACGACAAAAAAGAGAGCAAGGGGGAAAAAACACGCTGACGAAAACATC:1 - chr2L 11039962 3' + I-element 388 1 74.31 TTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTTTTTCTACCTCATCGGGCATGTTGATATCGCCGGCACGAAC:1 + chr3L 6242798 3' + micropia 5381 2 60.95 AATGGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGGCTCTCACATGCATGTTATAGAGTAATCGTTTTTATTCGCTTGCAGACAGCGAGAGAGTGCGGGTTAATAAAATATTT:1 - chr2R 1373000 3' + blood 371 2 74.55 CTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTATTTTATCTTATTTTTTCTTTTTTTATCTTATCTTTACTTATCTTTTCTTATCTTTTTTTATCTTATCTTATCTTCTCTTAT:1 + chr2R 5064834 3' - Stalker3T 204 1 66.97 TTTAGTTATCATATATTTTAAACATAATTGTTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGTGTGATTCTCTTTAGTCTTCGTTGGGGTTTCAACGCCATAGTTTCATTATAATTGGAT:1 + chr3L 17507181 3' + Cr1a 89 1 54.55 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGCTTCTCTTATCGCTCGAATTCAGATCCGTTGCATAGATAAACTCTATGAAGAACCATCTTAACGCTTCGATATTATATATGA:1 - chr2L 493962 3' - roo 8666 2 78.18 TGTCCTCTACCCACTAAAATATTGTATATATATATATATATAGTTAAATAGTTTTTA:1 - chrY 453434 3' - HB 343 1 59.65 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACACATGCATATTTCTTCTTTTGGTGCCGATTTCAATGCTTATCTGCGTGTTTTTTTTTCTTTTT:1 - chr3L 11085711 3' + S-element 1702 1 65.14 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATTGAACAAAAAGTCTTGTTTACAACTATTGTTAAGTT:1 + chr3R 17419759 3' + I-element 5321 1 60.40 CAAAAACAAAAAAAAAAACAAAAATGTGGAAAACAGGTTATAAAAACATGTGTAACTAGACGACTTACAAGGATCACGCACTCCAGTGACACTTAATGCCGCCAC:1 + chrX 20324134 3' + G2 3077 5 75.24 GTATATGCATGTACATGTGTATATAGAGTCCCCCTATCCGGCTCACAAAAACTATCCCCGAGCTGTGACTTAAGATCTTGGGAATTGGC:1 - chr2R 13333615 3' - Stalker2 252 2 55.06 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGCACAAG:1 + chr2R 8086862 3' - 1360 36 1 55.45 GTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGCTAATTGAGGTTAGCCGTAAATCGATTTCGAGTTTTCGGGTTTTTTATTATCTGTTTT:1 - chr3L 24541928 3' + invader1 3770 2 62.26 CAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGTTTACAAAGCAATCAGAATGTGTTAGGTACATGAATTATTTTTAAGGATTTTTTTGGTTACAAAT:1 - chr3L 12447799 3' - FB 83 1 72.38 TTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - Idefix 7154 2 69.84 ATATATACATACATATAATTAAATGGCAGCTCCAGCATTAAAATTATTTTCTGTTAAGCATCGTTCATATTCATTTGAAAA:1 + chr3R 25711797 3' - 1731 4407 1 77.78 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGACGAGGAAACAGCACTGACCGAAAAGTGAACCCTAATTCAGTTTACA:1 + chrX 1601071 3' + hopper 1402 1 59.77 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTCGAT:1 + chr2L 8476779 3' + Juan 4191 1 54.55 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGCAAAAATCAGAGTTTCCGAAGAGCTGGCTGAA:1 + chr2L 17751223 3' + jockey 4970 1 51.22 TAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATTGAGGTCCCACGCTCCGGCACACAGCTGAGCTGGAGGGCAAAGGACA:1 + chr2R 25014011 3' - roo 8962 2 72.53 TATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATACATATATGTATATAATAATTTGTAAATTAATGCATAAAATGCATAATACTTAAATT:1 + chr3R 4553324 3' + Juan 4196 1 59.05 TGTCTGTTTGTGTGTGTGTAAGACCTAAGACTACATACGAGCAAGCGGTTACCACCGACTACAGTACTTT:1 - chrX 18323692 3' - Quasimodo 36 2 75.71 TGATGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACAACAAAGGCTATCCTTGCATCGGGCGAAACAAGAACAA:1 - chr3R 23569653 3' + G6 1880 1 53.85 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAATTCCCAGAGAAGATAGGATCTTTTATTATATTGGTAGTTCCTGATTATCAAGT:1 + chr2L 13710753 3' - copia 16 2 58.95 TGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAACAACAGGTGCGAGGAGAAAAACACAACAACA:1 - chr2L 17982884 3' - Tc1-2 90 1 64.04 ACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTC:1 + chr2L 20935278 3' - INE-1 548 1 53.54 CCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCATCCGATTCTATGCCTCAGCCTAACACCTTAGCACTGCCCCA:1 - chr3R 11916222 3' - pogo 2080 1 54.35 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCATAGCAAACCGCAGAAAGTGG:1 + chr2L 9626907 3' - hobo 49 1 78.95 CAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGGCACAGCTCCGATGACGT:1 - chr2R 14120970 3' - accord 195 2 77.50 ACACAAGCACTCAACAATCATTACTTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATAACCCAAATACGAGTATGGATAAGCTCAATAAGTATGTGCACTTATAGATATAGTGCA:1 - 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chr3R 26319958 3' - R1A1-element 5137 1 71.82 CACTCCCACACTTTTGAAAAATGAAAACTTTTTGCCACGCCCACTGTAACGCCCAAAAACAGCGCAGTACCCACAAAATCAGAGGTGGGAAAGGTATGTCGTTTACTTGA:1 + chr3L 9288986 3' + INE-1 253 1 58.18 TAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACACACTGTACGCTCGGCTTAGGGGGCCACCGGGATCAGGATGC:1 - chr3R 13099029 3' + F-element 4438 1 62.50 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTTTTCTTGTTTACATGTTTTATTATGGGCAC:1 - chr3L 4264975 3' - Transpac 4965 2 65.71 CGAAGTACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGATGCTGGCCTGGAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAACAACGTAAATATCAAGTTTTACGCTCTCTCAA:1 + chrX 5086208 3' - GATE 264 1 69.09 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGCACA:1 + chr2R 8086860 3' - 1360 24 1 53.12 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTATTAAATATTGAAGTTCTAAAACATGTAGTTTT:1 - chr2L 17263140 3' - Transpac 50 2 70.00 TTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTTTCGTTGTCTTACACACTCGTATGGTTTCTG:1 - chr3R 9887002 3' - Doc 4649 1 71.82 CTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCAGCCACATCCTCCCCAGGGATAGATTTTTTCGCCACTCCTGACAGCCGCCTGTCGCTGTTCATTAT:1 + chr2R 13720132 3' + Porto1 247 1 54.63 GAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCCAGCCCAATCGGGCGCAGGGGGTTGTTGGTCAGCATTACTTTAATTGTTGTTCGGAGCGCTTTGTCG:1 + chr3R 13123768 3' + 297 6504 1 67.27 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGTGCTGCCATAGTCTGG:1 - chr2R 9138704 3' - pogo 43 1 71.57 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATACAAAAGCTGCGAAAACAAGCAAGAAATCTAAGGTAGATTGCATCGACTTTGAGATACCCGCAAACCCCGGACAAACAAAA:1 + chr3R 21612988 3' - jockey 12 1 75.45 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCCTCGTCGATTATTCCTGGGGCCCATGCAT:1 - chr3R 17271976 3' - hopper 49 1 71.43 GCTCCCACCTTTGGGGGAACGCGAGCCCCAACATAGACATTATAGAATATGTCAATCAAAGATTCTGCGAACTGTTAGTATCAAATTTGAATTGGCCGATGCCAA:1 + chr2R 13774977 3' + Fw2 3558 1 63.81 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTGTTTCTTGATTTTAAATGGGTTGCATTTGTATATCAGTTTTTTTTCCTACTTAAATGTTTATCAAAT:1 - chr3R 13481149 3' + roo 393 1 67.59 CACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCTTAGAAAAAATTGTGCACTAAAAATTCCATAAATTTATGTTTTTTCTTCCACGGCTGCTGTT:1 + chr2R 20736331 3' - 1360 161 1 63.04 CATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACAGAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTTACACAAAGTTAAGCTCCACTTTTGCTGGCCAACAACATTAAGGTCATT:1 - chr3R 29071824 3' - 1360 478 1 60.00 GGACGATATCTTCTGATATTGTCAGACTGGACACACTCTAAGTGCTCCGCGTTGATGAAGTACAATAACCACCTCCATCCACTTTCACTTTCCACTTTTCCACTTTT:1 - chr3R 30140060 3' + Chimpo 73 1 65.42 AACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAATATAAAAAGATAATACTTATCTAGCTTATAAAAAACATGAATTGGTATATTTAGTATGTGTATCGGCGCACA:1 + chr2R 10252527 3' + TAHRE 10406 1 70.00 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAAATAAAAGTTAATGTAATAATTAAATACATT:1 - chr2L 16529209 3' - blood 43 2 63.64 GTCCGGCTGGCGTTGCAGGTAGTTTGTTCCCACGGCGCGTTAACACTGATTTCCGAGCCACATACATTTGCTCATTTATACAAACAGATCCTTG:1 - chrX 22896177 3' - HeT-A 5611 1 71.28 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGT:1 - chr2R 9871050 3' + roo 9034 1 63.81 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTAACTGCGTATGGCAATAGCAG:1 + chr2L 494049 3' + roo 9045 1 73.33 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAAACTTATCAATATTTTTCTTAATTTTTTGCAGAATTAAATCGTCAAACAAAAGTAAGTC:1 - chr3R 11937183 3' + pogo 2081 1 60.91 ACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCGCATAATTCGCCATTATGCAGT:1 + chrX 20920668 3' + Doc 4490 1 78.22 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAACCACAAAAGCGTTGGAAAAAAAAATCGAAAATAAAAGTGGGTGAACAGGAAAGAAAGTAAGCAACAACAATG:1 + chrX 7802847 3' - hobo 3 1 76.70 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGATCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCCAAAGCATGTGAAAAGCATCCATCTCCTTTGAGGATTGGAAATTCTATG:1 + chr3L 16682071 3' - FB 33 1 51.89 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGCAATCAATTCAGATTATGGATTTGGATAATGACGAAACATGTTGGTGATGCAAGAAGAAATTAATTTAAAT:1 + chr3L 14261387 3' + mdg1 406 2 66.36 AAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATCTAGTTGATAATGCAGCCGCAGATTCATGTAATGTATAACATTAGAAAGCTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 24197393 3' + Doc 4599 1 66.02 GTAGACAGTGATACGGGAGATTCAAAAAAAACGATAACCAA:1 - chr2R 6433212 3' - Circe 7302 1 90.24 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTG:1 - chr2L 16742260 3' - 412 7102 2 75.25 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGCACCCAGATGACGCAGTCTATAAGTCGGGCACGTAGCTCGTATAAGTTAGTTAATATTTTT:1 + chr2R 11977330 3' + 1360 3370 1 64.76 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTTTGCCGACTAGGGTGTCCAACCCAGAGCTCTTCGTCTTCGACGCCTTCGTAGTGGAA:1 - chr2L 14141261 3' - hopper 12 2 62.50 TACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCAT:1 + chr3R 14357354 3' + Rt1b 5096 1 63.64 GCCATAGCAGTCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCGCGAAGGCAATTCACACGACTGCTTTGGTGCTGTCCAAT:1 - chr3L 23353339 3' + Helena 1271 1 58.11 GCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGCGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 1360 3283 1 78.18 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTATGTATAATACATACAGTTTATCTAAACAAAATGGTTCGATACCATCGAAACCATCGAAAA:1 - chrX 22489599 3' + S-element 1712 2 71.58 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCAATCGAAAGCAGCTTACAAAATGAATAGCACA:1 - chr2L 6311261 3' - hopper 37 1 65.62 CTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTAAGTGCTCGTTTGCTTGTATAAAGTAAAGTTTTCGTCAAAGTTGGAGATTTAAAGAGAATCTTTG:1 + chrX 22489717 3' + S-element 1699 1 67.27 GAAGAGCGCAAGACGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGTGTTGCCTGTGTTTGTTGTGTCTTT:1 + chr2L 9171507 3' - opus 7 2 66.67 TAACTCGTAAAAATTTTCTAAAATTATTATTGTTACTTAGGAATAAAAACATGAAAGCAATCACTCACAAAAAAAATTCCGGATTGAATAATGTGATAT:1 + chr2R 5462842 3' - transib4 115 1 63.64 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACCATTTGATCAAAATCTATTTAGTTCAATCAAAATTCTTTTTTGAATATTAAAC:1 - chr2L 14848362 3' - pogo 8 1 68.57 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACAGACGTCAAACGATTGCCTGAG:1 - chrX 20330533 3' - P-element 14 1 58.33 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATATTTGCTCTTCGCTTATCTAAATAACTCAGATTTGCATG:1 + chrX 19187376 3' + Transpac 5223 2 67.50 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGAAATATTGTAAGTGCCACAGAGTCCAATGACTTGACCACATCCTTTAAATTA:1 + chr2R 9963738 3' - pogo 31 1 54.55 ACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGATCGTTTAAAAACTAATTTTCACGACTAGC:1 + chr3L 21387075 3' - 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chrX 5018725 3' + roo 9032 1 68.37 CGGTGCGAAACCCCAGAGCACGTACTCTTCTCGTGCGAAAAAAATGCCGTGGAAAAGGCAGACGATGTGGCGACATTTTCCAAGTTCTACGCACTAAAAA:1 - chr3L 12601210 3' + Rt1c 5092 1 63.00 GCCTTATCTTAATTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACATACGGATGCCACAGTGGCCTTTCGCAAACGGGTTTTATTCGTATTTATGAACTTA:1 + chr2R 9898062 3' + mariner2 531 1 67.37 CCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGTGATATTTGCCTTGTGATATCGTTTAAGTACATTTTCTGGTTTTTGGAGGCGTGGCGAAAGCAAAAGTTTAACATGAAATTTTATG:1 + chr2L 18334678 3' - F-element 4412 1 79.09 TGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATCAACAAGAAAAATGACAAAATCAAAACGCAAAACGTTAAAGGTGAAGCAATCGGGCGCTGACTTG:1 + chrX 17330195 3' - opus 11 2 69.23 TACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATCTACTTTCTTTAAAAAAAATGTCAGAATGCCAATTGATTTT:1 - chrX 15169967 3' + I-element 5316 1 64.15 GAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACGAAGAAATCGCGAACAAAGAGTCTAAAAATAGAGAATATAGAA:1 - chr3R 12961353 3' + copia 252 1 56.12 AGTGCTAGTAGGATCTAATTATGTATTAAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAAAGCGGCAGGTGTCAGGGGTCCCAAGTACTTTGAAGAGTATACTAGTACAATTTG:1 + chr2R 18482630 3' - Cr1a 4287 1 55.96 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAAAAACCAAT:1 + chr2L 4016913 3' + opus 7476 2 54.84 CCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCAGCAACGGCAACAACAACAGCAACAGCTACGTCTACAACAAGCTACAGCAAG:1 + chr3R 20974145 3' + Q-element 138 2 60.00 GCCACTGCATGCAACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGGACAATTAAATATTTGACTACCTCCCACTGGGTCTAATATGTGTTGGCACTTTGAAAACTTTTCCTTTGT:1 - chr3L 6627296 3' + Doc4-element 2623 1 62.73 GCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAACGACTGCACAAATCACAAAAGAATCACTCGAAATCGACACTTGAACAACCGGCTACAA:1 + chrX 9703379 3' - Cr1a 213 1 68.18 TTATTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - TAHRE 10438 2 73.26 ATTACCAATGCCCACTACACTTCCCTTATGAACGTGTCCACAGAGCAGTGGGATCCTAAACTCTTTCAAACTATCGTTGCCCAAAATTTCATCACAAGATTTTAATGTGG:1 - chr3R 3073740 3' - accord2 7390 1 58.18 GACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACCCCATTTG:1 + chr3R 26557641 3' + G2 3047 1 82.35 GACCTCGCGCTAGGTGGTTGGTGTAAATTATCGTTGTTGAATCTTCTTGGCAGTTGTTGATAGTCGTTCATTCCCCTGTT:1 + chrX 12566362 3' - F-element 4472 1 80.00 TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGTAAAAGTCGTCAGCCCATCAGCATCATCATTCCCCATCACAGATTTTCC:1 - chr2L 13324575 3' - jockey 4722 1 61.84 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATTAAAGATTGAACTGCAACAAATACATACATTCCA:1 + chr3R 24867585 3' - roo 9 2 72.12 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAAACTTATCAATATTTTTCTTAATTTTTTGC:1 - chr3R 11937212 3' + pogo 2053 1 70.64 TACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAG:1 + chr2R 330204 3' - HMS-Beagle2 37 2 59.09 CGGGAACGACTGCTGAGCTGGGTTAGATTTCTCGCTAGGTGGTTGGGGATGGAGGATCGGTTGGTCTGCAGCCACTGGAAACAAACGGACGAAG:1 + chr2L 3802193 3' - F-element 4497 1 58.51 CACAACCACAAACACAAACACAACTCAAACACAAACACAACCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACACACACAAACACCTGCTACAACTGCGGCGA:1 + chr2R 4579751 3' + gypsy3 419 1 40.00 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGGATACGAGTAGTTGCGATTGTTTTTTTTT:1 - chr2L 20398484 3' - roo 42 2 73.20 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTTTACCGTTCTCCCCAGCATCCTTGGCTGACTCGGCT:1 - chr3L 17153576 3' - 297 8 2 61.64 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAGAACAGCGTTGTTTACACAGCTTGAAAATTTCAACAAACCCAAGAATAAAATATTGTAACATTTTGTTGTAAACGAA:1 - chr3L 15819306 3' - pogo 7 1 74.55 CAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTGAATTAAAGAAAAATGGCAAAACAAAAAATCGGTAT:1 - chr3R 23513396 3' + Bica 155 1 73.86 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACAAGTTG:1 - chr2R 7981145 3' - 1360 37 1 67.01 GGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAAGAGAAATTAAGTTATAAAATTTTAAGGACTATGCGCAGTTTAATT:1 - chr3R 22979349 3' - Juan 4118 1 59.09 GTGGTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTGTTCGGTTCTGATCTGATCTGGTTTCTGCATTTGTTTAACTGGTTCTGTTTCGTGTTTCGACTGCAACCTA:1 - chr3R 29598176 3' + invader1 3642 2 68.18 AGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACGACGACGACTACAACGTTTCAGTTCAGCGAAGGAGACGCCGTCAAAGCCGTCACCACTTTGTGAGATCAG:1 + chr3R 15141483 3' + I-element 4920 1 70.19 TATGCGTAATAATCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCACTAGGGAGAATACGAACATCACCTTCTTGTGCACGCAGAATAGCGATGCCCAGGATATGTTGTACA:1 + chr3R 16611969 3' - 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Doc 59 1 78.18 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGTGCTATCAATCGATTTCAATGGTAATAACTGGCATAGTCTACTTCTGTGCGCACG:1 + chr3R 17272049 3' + hopper 1402 1 66.67 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTATATACGAACCACATGCTGTAATCTAATAACCCTT:1 - chr3R 25434754 3' + opus 7457 2 70.64 CCCCAGTGATGGTTCTCAGAATGTTTGTTGCATGTTACACGTTTTCCCACAAATTGCCAAAATCATCTGCTTCTGCCGGCCCACTAGTCGTAT:1 + chr3L 2297209 3' - F-element 4340 1 80.65 TATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGTGTTTATGAATGGGTGG:1 - chr3R 22500806 3' + invader3 277 2 67.14 TAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACTGAGAGGGAGTCAGTCGAATGGTAAAGCTGTCCCCGAGCATTGTGGGAATTGTATGACTTTTATTTCATCGCTGGC:1 + chr2R 25052815 3' + invader2 4978 2 56.60 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAAATAAAGTTACCTA:1 - chr2R 9963477 3' - pogo 10 1 63.74 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGAGAATAGAAGAGAATAGAAGAGAATAGAAGAGAATAGAAGAGAATAGAATAGAA:1 + chr3L 24821494 3' - blood 10 2 36.78 GACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGCTTTGTCAAC:1 - 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mdg3 5263 1 39.29 TTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCTCATGCTTGATTACATGAATTTGTGCTTGGCTAATCCGACGAGTAAGGACCTCAAGATGCTTGTCTTTTGCCAGCAACTCCG:1 - chr3L 10601365 3' - F-element 490 1 75.00 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAAACGTATTTTATAGATCATTTTGTTCTCATATGAGTGTAAGCG:1 + chr2L 770057 3' - roo 34 2 59.05 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATAAACCATATATTTTTGCCCACTGTGAGTCCTGCGAGAGAGCGGGAGAGAGAATTCTCTCG:1 + chr2R 15155282 3' - flea 4773 2 67.29 TGGGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGAAATGAACTGAATGTGTTCAAAGAATGAATGAAGCCAATGAATTTTCAA:1 + chr3L 18463324 3' + gypsy5 297 2 55.45 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACTGAGTGGCACCAAAAGTTGAGTTGAGTAGGTGAACTGAATGAAAGTGCGCACACAACTTAAGCACACTCCAATGGACTA:1 + chr3R 24736627 3' - I-element 49 1 71.96 CGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAAAAACCATCGCCTCCTCGTGGTCCTACCAC:1 - chr3L 2041985 3' + Doc3-element 4432 1 69.66 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGATCTGACTGAACAATAAACAAAACGATGCGTTGTAAATAGACGTCGGCATCGCTGCCG:1 - 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chrX 3936293 3' + invader2 4759 1 63.16 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGGATT:1 - chr3R 27071873 3' - jockey 4703 1 67.74 GTTATATTGAACTACACTAGGCGGCGACACACTCACCAGCAGCAGCCAGAACAACATCAGATAATATGCTCAATGTCTGTCATA:1 + chr2R 13671723 3' + TART-A 83 2 66.67 TAGGTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGCGAGGGAATCACGGAG:1 - chr3R 13732980 3' - hopper 33 1 69.23 AGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTG:1 - chr3L 10911512 3' - springer 34 2 64.89 GATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGTTAAGAGAAGATAAGATAAGATAAACAATCTTCAGTTCCTTCAGTC:1 - chr3R 6435035 3' + Stalker3T 205 1 31.52 GTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTCCAGGACATTGAAGGCGCTCCACTCACCCTTCTGTTCAGGAGCACTAAGGAAGATATA:1 - chr2L 1982468 3' - GATE 132 2 62.11 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAAATTGGCTTTCGCAAATTTCCATTATGCACTTATTTCATTTTC:1 - chr3L 13160648 3' - pogo 27 1 59.60 AGTTATTTATTGTAACGACCTTAGACACATCACCGCTGACAAGACGCAGAGTATTCATCAAATTTACACAAAACAAAGGGAGCTAAGCGAAT:1 - chr2R 8249493 3' + I-element 495 1 68.48 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTTTTCTTGTTTACATGTTTTATTATA:1 - chr3L 4264980 3' - Transpac 4975 2 71.82 TATTATGTTCGTATATACTACAAAACAAACCACGATTTCGGCTAGGTCCGACCAACAAATCGACTATAAAATATAATATAATAATAAAACACGCGTTGATTGCCC:1 - chr2L 15228732 3' - mdg1 1 2 75.24 TTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACGATTGAGTAATCATAATTACGCTATAAATAATCCGCTCGTTCAGGGA:1 - chr2R 11273985 3' - Stalker2 4 2 64.47 GATAAGCTGGGCGATGGTAACTACGCGATAAGCAAATCGCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCAAAGAGAAATGCAGAGGAAAATGCGAAGGAAGGAAACG:1 + chr2L 7927457 3' - Ivk 73 1 71.82 AACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATCTGCAATATCAAATGATGCAGAGTATCGCTTGTGGCATGAGAGGTTGGGACATGTAAGTGTTGG:1 + chrY 1995293 3' + gypsy 7440 2 68.32 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Tabor 7318 2 27.45 GAAAAGCTTCAAATAATCGAGTTAGTGACCAACCGCAAAGCGAACCAAACAGAAAATAAAGCTAAAACCAAAACCAAATCGGTATGTAAAAAGTGATG:1 + chrX 6859003 3' + pogo 379 1 73.47 TTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGAC:1 - 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pogo 30 1 71.43 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGAACACAGTAAAATTCATGGAAATATGAACGTAATGAAATGATGTAATGTTTGTGAGATTTTCGAAATCATCAAT:2 - chrX 16693738 3' - 1360 11 1 69.09 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAAGACACAAAAAAAATCTGTGTAAGCTCGCATCTGTGGG:1 - chr2L 9754800 3' + 1360 3352 1 64.36 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCACGTACAAGTTTAATGGGAGTTCCCGCAACTTAAATTAGAATTTTTGTTTTCCTCATTGCCACGGGATGGATGTTGAAT:1 - chr3R 13502953 3' + hopper 1411 2 76.64 ATCAACCTACACACACACACACACAGATACGCACAGAATACAAAAGGTAACGACAACATATCGGTGTTA:1 - chr3L 12675505 3' + accord 250 2 78.26 TTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTTTTGTTTATTGTTTATTGT:1 + chr2L 9723021 3' - Porto1 163 1 43.21 CTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATTTAAAGGC:1 + chr2L 10746705 3' + flea 4959 2 74.55 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTGCAATTGTCCAGCGGCAGAAGGGGAATA:1 + chr3L 15614486 3' - jockey 4701 1 62.03 AAGCACGCTCTATTTCTTGATCTTATTCATTATTGTATGTAACGAAAAGATATCTGTACAAGTAAGACCACGACACAGAACAACACAATTTTTTCAACGACAAACAGTAC:1 + chr2L 16244710 3' + gypsy12 10070 2 67.27 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAATAAAAAAATAAATGAACGATAAAAAGCCAATAAAGAGCGGCATAAAT:2 - chr3R 5774844 3' + I-element 5308 1 68.52 CTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTGATTGGTATATTTTTGAAGATGAAGATGGCCATTGTCCTGGGCATATCACAAATGATGTTTGGACTGGGCCTGG:1 - chr2R 18909869 3' - I-element 251 1 55.45 CAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCTACATAGAATTTGTGTGTGTGTGTATGTTTTTTTCTGGTTGGCTTGTTCTT:1 - chr3L 7846431 3' - 3S18 1 2 79.38 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGGTTAAAGGTGGGCGGATGTTTCACTCGAGGAACGCAGAACGGAAGTCTA:1 - chr2L 1291028 3' - 412 35 2 54.55 GCAACCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTTATTTGGCTGTCGCATGCAATACCCACGGGCTTAAAGTTATATTTTACAACTTCGATCG:1 + chr2R 19674663 3' - X-element 4310 1 62.73 TATCTGTAATCTTGACTCACTGCCGCTCTTAAAAAACTCAATTTTAATTTGTTTAACGGCGATCGACATTATAAGGTGAACAATTGAATTTGCTTCTGAGGAAATA:1 - chr2R 4409432 3' + Cr1a 4228 1 54.72 ACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTACGATTTTGGTGTTTTTTCTCCAACATATATAT:1 + chrX 3693352 3' - accord 7293 2 70.00 CTATACCCAACCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTCCATCTTTTCCAACTCGAATTCGATTGGGTCCTCCTCCAAAGTGTACTCCT:1 - 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F-element 4315 1 47.31 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTTTCGGTCGTAAAT:1 - chr3R 24813955 3' - P-element 26 1 45.98 CTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAAGTAGATATAATTTTGTTCATATTTTATAATTTTATTAATGAGATAAATGTGTGAATCATAGAGCAGAAACTTAAATGTAAAT:1 + chrX 15170063 3' - I-element 2 1 77.27 TTTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAGTGCCACAAGAATTATTTAAAGTTTCAACACTATGCACTATT:1 - chrX 14827592 3' - G2 3059 1 61.82 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATTTAAAGGCACATCGAACGCGCCGTATTGACTTTT:1 + chr2L 10746731 3' + flea 4985 2 57.27 TATTCAATCTCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTGGCATTTCCAGCGGTTGGTGAGATTCTTCGGCGTTATTTTACTTCAATGATTTGATATCTGGC:1 - chr3L 23236489 3' + Stalker2 380 2 59.09 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAATTCTTCCCATCTGCCG:1 - chr2R 12416864 3' + pogo 2056 1 64.55 TATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATCCAAGCTCAACGAAATCGGGGCAAAAGAAAAACCACCAAAAAACACGAAAACGAAAGAA:1 - chr3L 11385712 3' + invader2 448 1 63.00 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATCTAACAGAAGCTTCATATATACATATATG:1 - chr3L 885746 3' + roo 355 2 80.73 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGGCCGGTTGCCTACCAGATC:1 - chr3L 217320 3' - roo 8676 2 54.79 ATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTTTTGTGTAGTATCTTTTGTGCGCCTCGGCTGCTCTTTATCTGTAAGATACGCAAAAC:1 - chr2R 16637420 3' - 297 6515 1 61.82 TTCTCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAGACATACAAATTCTAAAATACAGCAAATAAGCAACAA:1 - chr3R 14157296 3' + X-element 374 1 69.09 CACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAAGTCTAAGTACGTTATGGTCTCCAACGATTGCAGGGTATCGCCCAAGTCCATTAGATCTTTCGAGGG:1 + chr2L 5595577 3' + Max-element 286 2 65.38 CACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTATTTTGCCATTTTTGGTTGCCCCGTTAACT:1 + chr3R 10080173 3' - pogo 1682 1 60.81 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAAAAATTAAAATTAAAATTACATATTTTCAAATAGTTTGTGTATACCAAATTAGAACACTGTAT:1 - chr2L 19157494 3' + Juan 4188 1 50.00 CACCATTTAGAATTTTGAAAAAGCTGTACTTTAGAAAATACATATAAAGGCAATATCGGATTAAAACACCTTACGGGGCCTTAAAGATTTCGGAAATGGCAGG:1 + chrX 3634692 3' + FB 230 1 56.31 CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTAATAATCCGTACAACATGTAAATAATATTAAAAAGAGA:1 + chr3R 6263346 3' - diver 52 2 75.51 GATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACACTCCCTACCCAAGAAGAAAAAAAAAACATAAACCTCGAATACATTTTTTGGCAGCC:1 + chr2L 16840705 3' + Juan 3838 1 57.43 CCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTACTCCGCTTTTTCGCG:1 + chrX 6213642 3' - mdg3 5221 1 82.22 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGCTAATAAATTAATAACATTAATTCCCCATGAATTGCAGAAAG:1 + chr3R 19445674 3' - roo 8708 2 69.09 ATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGTGTTGATTAGAAATATGGCCAGG:1 - chr3L 18350707 3' - Bica 71 1 64.00 GATACTTAATATCTATGTGCTTAGTGCGTTTATGGTGTCCTGGCTGTTTACGCCGACTTGCTGACAGATTTCTCTCGGGAATGGCGG:1 + chr2R 16078836 3' - Copia1_DM 4127 1 57.47 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTTTGCCGACTAGGGTGTCCAACCCAGAGCTCTTCGTCTTCGA:1 - chr2L 14141277 3' + hopper 1408 2 61.33 TGATAAAATAAAACAATTTTTAAAAAAATTAAAGCTTTTAAAATTCGTTGGTTAAAATCGCCACTCGTTTATTTACGTATTTTGGTTT:1 + chr3R 4470978 3' - 1360 3096 1 73.86 GGAAGTAGCATAATATGCTTCTCATATTACGCTTACACAAACAGCAAATAGAGATAATCAAAAAGCAATTGCAAACAACAGCCAAGACTCAAAACGAAAAGAGGAATAGG:1 - chr2R 17346513 3' + rover 6949 1 67.27 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTACCAAATA:1 - chr2L 16067068 3' + HMS-Beagle2 276 4 57.27 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCTAAATTTAAATATCTTTGTA:1 + chrX 17184984 3' + roo 9040 1 52.73 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGATTCGGTATTATTTGATTTGGTTTGGCTTGTTGCACGGTTAACTTAAATG:1 - chr3L 17812150 3' - Juan 8 1 48.75 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATTTCCCTTGTTTGCAATGAGACATTTGTCCTCCACTATCTTAATTCAACTGTACTTAGACATTATCTTGACAA:1 + chrX 15046825 3' + S-element 1706 1 70.00 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGCGGTAACTCGTGCGACATATATACAGGCACCTATAGCCGACCGATATCGGCG:1 + chr3L 17530203 3' - Tirant 8118 2 59.46 CTATTTAACTTTCAGCGTCGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAAACTATTTAACTATATATATATTGTTACATTTTCCTGCCTAATTG:1 + chr3R 1292533 3' + McClintock 6379 2 76.85 AAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 77.27 ATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + Stalker4 402 1 38.64 TTTAAATCGCAATAACATTGTTTGCCCACACCTTGGAATTAAAAAAAAAACCTAAATCAAAAATCACCCAGAACGAAGACGCGAGACGCATTCA:1 + chr2L 16896810 3' + FB 194 1 55.32 GATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCAGGACCTGGTGGCGCCATCACCATGATGAACATGATCGAAAATGCCACGGACGTGCGGCTGTTTGACTGCATCA:1 - chr3L 8354518 3' + Tc1 1247 1 66.67 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTTTTTAATTCTAAGGTAGTTAAG:1 - chr3L 18915166 3' - 412 62 2 81.65 ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAAGGGGGAAGAACTGAAAAAA:1 - chrX 19187284 3' - Transpac 4943 2 59.09 CGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAAACATGTACAATG:1 + chr2R 16476427 3' - X-element 50 1 58.10 GCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGCATTATATACCAGTCCTCACTGCTGCCA:1 + chr3R 31633195 3' - 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INE-1 155 1 67.27 GTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCCCAACACAACCACGAATATGACTGCGCCTTCAATTTCACT:1 - chr3R 23433074 3' + Idefix 184 1 63.64 CCCGCTACCTCCAACAACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + F-element 410 1 21.15 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAACTAAATAAATAATACATATATGTATATAATAATTTGTAAATTAATGCATAAAATGCATAATACTTAAATTCAATTC:1 + chr3R 4553330 3' + Juan 4197 1 61.82 TAGTCTTCAGCACGTCATGTGCGGGTGACTGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTTCGATTGGGTTTTAAGTTAACACTTACAATGCAATAAAACTAC:1 + chrX 13165425 3' + Stalker3T 233 1 53.92 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAG:1 - chr3R 9435811 3' + roo 388 2 58.42 GAAGTTCTTAGGCTTCAAATCTATTTTATTTTGGATCAATAAAATTGTTCAAAAGAATGGGAGTGACCGGTCTGTCAGATTTCTTATTTATATGATGGTCGTAAAGCA:1 + chr3L 8852813 3' + 1360 236 1 73.15 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCAGGCAGATAAAACAAATGTCAATCCATCAGAAGCGAAGAGCG:1 - chr3L 17490659 3' - roo 16 2 52.44 CGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATCCACTCATACGGGTGAAGTACTCTACACCTGTCCCAACTGCCCGATGACATTCTTCTGCTCCGCCAAC:1 + chr2R 16324363 3' + accord 228 2 69.09 CGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAACAAATAGGACACCAGATAGCAAACCAGTTTGCTTAAAAGCTTCT:1 - chr2L 13472580 3' + invader2 458 1 60.00 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTCTTTTTTATATAATCTTAATATTGTTAGTGTTGTTCTTAGTTTGATGTGTTTTTGTGTTTGATGGTTTTAT:1 + chrX 22252871 3' + flea 5006 2 74.55 GTTTGATTTTGCTGCAATACCCCAGATGTTGCTGTTGGGATTGGTGTTGCTGAATTTGTTGATTAAACTGCTGCTGAGCTTGATG:1 - chr2L 195885 3' - BS 4692 1 71.76 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACATGTGTGTGTAATGCGTATCG:1 - chrX 4262995 3' + Tirant 379 2 71.01 GATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACGAATGCATTAAGTGCACACAGGAAAGCATTGCCTTAAGAAGAGAAATTTAAAAAACTTTAAAATTAT:1 + chr3R 22047966 3' - G6 24 1 56.36 AGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATGGAAGGCAGAAAGCTCAAAGACCCAGGGGAAGTACACATACTGAGAGGGCTATAACGAGGCAAAACGACAACATTT:1 - chr2L 4677531 3' + 17.6 7284 2 69.09 GTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCCGGAACATCAAACCATTCTG:1 - chr2R 6960213 3' - Doc 315 1 78.95 TTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCAAATGTCCCACTGTCCACTTTTTGTCCTGT:1 + chr2R 17310377 3' - X-element 141 1 73.15 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCATATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAATGGAGTTATCAAATAACACAAAATTCAATTGAAGTTTTTTA:1 + chr2L 20804709 3' - 1360 48 1 60.91 GCTTAAGTAAACATGAAAATACCCACAAAAAAGACAATGTCAAGCTGGGAGCACTAAAACTATAATACAATTTACTAAAAATAACACAAAGACTTGTT:1 - chr3R 10923994 3' - Transib5 392 1 75.51 TTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATCAAACTCGTGTTTATAGTTCTATGATTTAGTCGATCGTTTCAGAAACGCATA:1 + chr3R 13481267 3' - roo 8663 1 73.40 CAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAG:1 + chr3R 17673815 3' - FB 52 1 70.91 ACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTGATCTAAAACAGCGCCATCTAGTCAGTCGTATTGCGAA:1 - chr2L 3786329 3' + copia 4802 1 57.78 AATTATGTTAGTGATGTATATATATTCATGGTGGTAGGGCGTTTATAAGCTCTTTGGAAGGGGTGTTGTCGCCCCTTCTATAATTTCTG:1 + chr2L 112182 3' - gypsy11 66 2 74.16 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATGTCTCTATTTACATTTTGATAAAACAATTACAATTTTACAATTACCATACATACAAAGAAATTG:1 + chr3R 29970591 3' - pogo 16 1 62.39 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGCAGCCGACGACAAATGTACTTCCGCTTGTGCGGCAGT:1 + chr2R 14661160 3' + hopper 1405 2 57.53 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAGTATTTGTTGTAATGCAACAGAAAATTAAATGACGTAGAATGTAAAATCCAAACTGATTTCGAAGCGGAAAATAAAT:1 + chr3R 6966541 3' - pogo 7 1 72.73 TATTTTTTGAACAGTTATATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAGACGGCCCTAATAATGCATTCGCTTCTGGAAATCTTAGGGCGAAGGGCTGAGTTTTCCTTAGATT:1 + chr3L 22793866 3' - F-element 4592 1 57.27 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATGCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTAATATCTGGCAACAAGTTATTGTT:1 - chr3R 3915035 3' + I-element 5313 1 68.82 CCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCAAAACGAATACGAAAACAAACCCATTAAACACAAGCATATGTTCCTCCGCGTGCTTTGTT:1 + chr3R 7194522 3' + roo 204 2 71.88 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTGGATTTTTCTTTCTTGAG:1 + chr3L 3555518 3' - 412 37 2 56.36 TAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGTGTGATTTTAACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Rt1b 129 1 22.73 GTAATTGGTTGACTAGATGTGAAAAATAAAAGAAGCGGCCCAGTGCAAGGATACGCGTGTAAATCCGATTGACTTGAGCCCGAAGTTGATTGTTGTTGTCGTTAGTGT:1 - chr2R 22999352 3' - Porto1 4618 1 57.41 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAAATATATAAAAATACATACATTATATTA:1 + chr3L 4265012 3' + Transpac 5188 2 80.46 TAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAACGGAACAACTAAATACTACAAGCAAATTTAACCAGGAG:1 + chrX 8423209 3' + P-element 2699 1 40.57 AAAGAAAAAAAAACAAAATAATAAAAAACGAAATAAATTAAATGGTTGTGTCAACATCAACAACTGGGGAAAAACATGAGGTGCATGTGGTGCAAAAAGTTGCTGA:1 - chr2R 11744837 3' + gypsy11 3934 1 58.49 AATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTATTTGGCGCGCATGCAGACGACGACAACAAATTCGAGTGCCAAAT:1 + chr3R 29538990 3' + Cr1a 176 1 59.00 GTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTCCAAGACGCAGCTGTTTCCCAGCTCCAATTGGTACTTC:1 + chrX 10933871 3' - R2-element 3513 1 63.11 TAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATATTGGGCAGAGATGTAACCGGCGGCTTT:1 - chr3R 12040159 3' - HMS-Beagle 6802 2 55.00 TAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATATGGAGAAAGAGAAAGCTGGAGAAAGCAGGGGAAGCTAGCAGAGATATGGGCACGTAAGGCAGCACA:1 + chr3L 10722903 3' + invader2 488 1 75.79 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - Tabor 6882 2 61.90 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAAT:1 - chr3R 24260905 3' + roo 9007 2 80.91 TTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGAGGGGCGTGGGCCCCTTGAGCT:1 + chr2L 1326257 3' + flea 433 1 79.07 GGTGGGCAAACGATAAAAACTACTGATCATCTGCCAAGCAAAGGCGGGATTTT:1 + chr2L 17685715 3' - FB 374 1 69.81 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + 412 453 2 70.00 GGATACAAGGGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATAGTTTTGTTGCACCCAAATGCTGT:1 - chrX 17997791 3' - Idefix 318 2 74.65 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAAGAAGTGCAAGCACTCATAGAT:1 - chr2L 18675593 3' - 412 7073 2 62.73 GTCTCTTGTTTTTACTTGCACAAGCAAGCAAGTTCTATTTTAAGATTTCTTACGCTCTCGGCGTAAGCTAGCGTTTTTATTCTCGAGTGCCACG:1 - chr2R 24471411 3' + 1360 3243 1 77.66 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTTGACAAGGCCCTACGTCT:1 - chrX 12271493 3' - pogo 28 1 75.34 CAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGTACATGTACATATACAATCTTTCGCCTTATGCGGCCACAATTTAGGTCAGAATAATAGATATTCATCGCAGTTGGT:1 + chr2R 8240825 3' + ZAM 94 2 74.55 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAATTCCCAGAGAAGATAGGATCTTTTATTATATTGGTAGCTCCTGATTATCAAGTATCATGCGGAAGATCCT:1 + chr2L 13710770 3' - copia 3 2 71.72 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTAGGGATCT:1 + chr3R 27071932 3' + jockey 4968 1 50.91 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGCCCAATTAAATTGTCAAAAATGCTGTGAGCGTAAATAATAT:1 - chr2L 10128664 3' - copia 4914 2 66.36 CTTGCGATCTACAAAACGAAAAAGAATAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCAAACAGGGAGAGGGAATAGCGGAGAAACTCCCGTGAGTTAAAAAAAAA:1 + chr2L 22468214 3' + HMS-Beagle2 288 2 62.63 CACACACACACACATACATATACATCTGCATGAGTTGGGCCGCAAAATTATGTGTGTTTAAATTTTTAACCCGCATTTTCGGCTA:1 - chr2R 20492171 3' + Quasimodo 40 2 90.59 TAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAAAAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGTGTGCCATGTTATTTCATCATGGCGTGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTA:1 + chr3R 3985684 3' - invader1 3690 2 74.51 TGAATCGTTTGACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTATGCTTGTCTGCAGAATAGCCTTACTCTTACCTTGTTTGCTGCATTTGGACTTTCGCTTATCTCCTCG:1 - chr2R 13136821 3' - Doc4-element 338 1 57.41 TACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATAAGCTTCTTTTGGGAAATCTGGTAT:1 - chr2R 23354274 3' - Tabor 12 2 64.44 GATGTATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTTGACGGGATCTATGACGTTGAGATTACACAA:1 + chr2L 11082293 3' - jockey 66 1 70.00 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATTAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 205 1 59.09 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATCTTAACCATATAATTCATTTCACAATCATCACAGTTTATTAATGGCAAATAACAATACTTTTTTGCCACATCCTA:1 - chr2L 14708828 3' + opus 7494 2 70.91 CACCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATATCTCCATACCTTTTCGTTCAATTTGCTGCAGCTCTGTCTCTGTTATTTTCCCATCTTT:1 + chr3L 4519603 3' + GATE 263 1 58.89 GGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGAAGCC:1 - chr3R 902565 3' - R1A1-element 31 1 74.07 CTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCGACCGTTCCAAGAGCTCAGACTCTTGGACAAGCGGAGAAAAGG:1 + chr3R 4933402 3' + Tabor 220 2 55.67 ATTCTATTTCTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTGAGCAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAAGTGGAAAGTAAAAAAAACAAACACTGAGAACA:1 - chrX 13852476 3' + 1360 3274 1 71.96 TATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAAATGCTGGAATCCGAGCAACAACTGGATTCTTAC:1 - chr2R 15978395 3' + X-element 4579 1 70.00 GGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTTTCATAAATTATCAAGATTTCACTGAAAACAAAAGAACCT:1 + chr3R 30859500 3' - Burdock 35 2 61.82 ACGAGGAAATGAATATAATGTAAAACACGGAAAGTTATAAACTCTCGTCGGACTCCGGAGGACCCGCAACCCAAATAAAAAGGACACACAACAAAGTAACCA:1 + chr3R 22312930 3' - Cr1a 4329 1 79.41 TAACTCGTAAAAATTTTCTAAAATTATTATTGTTACTTAGGAATAAAAACATGAAAGCAATCACTCACAAAAAAAATTCCGGATTGAATAATGTGATATTTTCCGGATAT:1 + chr2R 5462853 3' - transib4 115 1 67.27 GTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAACTAAAGGGTTGAGATTCACCATATAGATTGTAAAGACATAGGCGCAGCGGAATAGCATAAATAAAATCCGAGA:1 + chr2L 13780740 3' + INE-1 133 1 78.18 GACCATTCCTTGGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCAGTGGGTGGGGGGGTTATGTCGATTTCATTGTGGGTTCTCCTGCCTCGCAGG:1 - chr3R 28573453 3' - G2 174 1 60.47 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATGAGTGATGGATCTTGCCCAGAATCCACCTATCTCCGGCTGAAGGTGCCAGCTTCATTG:1 + chr2R 17806179 3' + Transpac 291 2 56.44 ATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTC:1 + chr2R 18807876 3' + BS 5056 1 75.86 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTAT:1 + chr2L 17785850 3' + roo 9035 1 66.30 TGTGCTGAGAGCAATTGTTGGGTCTCTCTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTGTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGTTGTTTCATCTTATCTGCCGAC:1 - chrX 12285376 3' - Porto1 379 1 77.78 CTAAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTTGCTAATTACAACAACAACGTCACACGCCAAACGGAAGTTGTATACAAAGAGTTGCACTTAAAAAGCACACAAC:1 + chr3L 15782416 3' - accord 187 2 56.31 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCTTCTAGTGTCTTTGATCTGAGAAACAGGGATGAAATTGTTTTTAAGACAACAGAATGGG:1 + chr2R 1592003 3' + 1360 3355 1 75.00 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCT:1 - chr3R 25702191 3' + Tirant 351 2 68.18 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGACTCTTAAAGTTAGATCAATTTTCGCATTTATTGGTTTGTACAA:1 - chr2R 8086791 3' + 1360 3355 1 60.78 TACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGATAATTTTTTTCAGCTTGTGCTGAATGATGTGCG:1 - chr2L 8869822 3' + 412 7378 2 69.72 CTTCAGCGAACGCACTCAAAAATGCTCAGAATGTAAATGTGATGCGAAAATGGCACAGGGACATTGCATAGGGTTAAGGATGCCCGACAGTTGC:1 - chrX 10644895 3' + Porto1 4323 1 70.21 TCTTTTTAAGAAGACTCTAACAAGAGATGGGATGGTTCGACAAGGGGTTAGAGAGATGGTATGAATTTGGGCTCAGAGTAAAAACGGTTTCTGAACTCG:1 + chr2L 14830424 3' - frogger 496 1 54.55 TCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCCTTCATTGTCTTTTTCGCTTTTCCCGT:1 - chr3R 22338271 3' - Stalker4 169 6 74.53 TGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - hopper 991 2 50.00 GATAAGACAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAATTATGTGGGCGTGTTGGTTGCCAAATAAG:1 - chr2L 19228011 3' + Stalker3T 205 1 67.89 ATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACGTTCGGCAGAAACAGTTATTTGCCACGCTGTTGCGAGG:1 + chr2L 22497830 3' - Stalker4 11 4 58.11 TTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAATTGGCCGATGGACTTCCCATTCTCCAAAAAACTCGAGTTACCTCCTCAGCATACGCCCTCGGCAG:1 + chr3L 23470373 3' + Ivk 5363 1 66.36 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACCATTTGATCAAAATCTATTTAGTTCAATC:1 - chr2L 14848386 3' - pogo 34 1 59.81 GCACAGCCTTACACCCACGCGGCATATATTCCCCGATTTCACCTGGCAACCGGGGACTTCTCGACCGATGCCGATACACTTTCAT:1 + chr3L 3309740 3' - HB 1297 1 71.76 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAAGGGGGAAGAACTGAAA:1 - chrX 19187287 3' - Transpac 27 2 59.09 TCACTATATATAATAAGATTAAGCCCCAATTACTATATATAACATACCATATACCATGATAACAGATCTAGATCGAACATGATATTATCTTTTTTTGATGAATATTGATG:1 + chrX 19724308 3' - Tc3 280 1 71.82 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACCAAAGCCCAAAAGTTGTTTGTTAACAAGCACAATGTGTTAATTTAATTACAAG:1 - chrX 9432820 3' - roo 8695 2 59.09 AAATTTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTTTTGGGTCCCTTGTTAACCTTATTTTAGATGCTTGTTAATGCCAGCCATAAATAAATGGGAACATTTATCACGGAAG:1 + chr3R 9486087 3' - accord 185 2 55.34 CCCTAATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATAAGTTGCATGACCTTGTTCTTATTTTTTGTTTGCCCTAGACTCGTTGGCGTCGACTTTTAGGTTGTTGCACTTTGGTA:1 + chrX 306070 3' + Cr1a 4140 1 62.73 TGGAATTCTAATTAACTACATGGTCCTTCCAGCTATGCTATTAGCACGTATATAACAACAATTTGCATATTTATTGAAAACATAAGAAATACTCA:1 - chr2R 22663305 3' + mdg1 423 1 80.00 ATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACGGTGCTTCATCCACCTCCTGATGGCATCGCTTCGCGAGGGTGCTGAGGC:1 + chr3L 22108188 3' - Transpac 4918 1 78.26 AAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTTTGATA:1 - chrX 10119535 3' + FB 24 1 69.44 GGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGTGTTT:1 - chr3R 22500818 3' + invader3 5453 2 54.41 ATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGCCGTTTGCCTTTGGACCGCTTTCCTTTGCCCGTTTTGTGTTTT:1 + chr3R 19519967 3' + Cr1a 195 1 60.55 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAAC:1 - chr2R 7981151 3' - 1360 36 1 73.33 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGCTTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGTCGAAGAGAAATCGCGTCGAA:1 + chr2R 21362030 3' - Tirant 49 2 73.68 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCAT:1 + chr3R 12040200 3' + HMS-Beagle 6988 2 71.56 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCAGAGACACAACACA:1 + chr3R 23861147 3' - pogo 36 1 60.38 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACAAGATATAATTAATACGAATGAGACCTACAGTAAAGTAGAATAAAAAGCAAAGGAGTAATAACCACAAAT:1 + chr2R 6418948 3' - flea 11 2 74.55 ACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTGTACCGTCTCTCGTTGTAATCCTCAACAAAAACAATGTTGTCTCGAATA:1 - chr3R 29161743 3' + I-element 5081 1 64.04 CAGTAGTTTAAACAAATATACAAATTGTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGCACGTTTTTGCTGTTGCGGTTTTTTGTTTTTTGTTCTCT:1 + chr2L 2900808 3' + Cr1a 162 1 73.39 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGCCCCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTTCCGCGCACGAAA:1 - chr2R 11379725 3' - jockey 4693 1 50.00 TTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACAATTGTTTGACTTTTTTATTTTATGGTCTGTACTTAAATATACTTCGTTTTCTGA:1 - chr4 1132331 3' + rover 6975 2 54.55 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATAATAATTAACTACACAGGAGTTGGGAGCCAATTTAATGGGTGTGGGTGCTG:1 + chr3L 16301131 3' + mdg1 7432 2 56.98 CTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAATTGAACCTAGTTTTAGTTTATTATATTGAATTCGAAGATGGGTTA:1 + chr3R 6763699 3' - F-element 4438 1 77.78 CGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATACACGCATATGAGAAAATAAAAACATTAGCACAGTTCGGGATGTT:1 - chr2L 7088311 3' + rover 7260 2 60.91 CAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGACTTGCTGCATAAAAGCATTGGCCTCATCTCGCAA:1 - chr2L 5130493 3' + gypsy5 221 2 69.09 GGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGGGACAGGGCCAGAAGAACCAAAAGAAGTCGCCCTCTCG:1 + chr2R 24735451 3' - hobo 2705 1 59.14 ATGTATGTATATGTGTGTGTGTGAATGTGGGTGTTATGAGTGTGAGTGAGTCCCGCAGACAGACAAAGAGGCGGAGA:1 - chr2R 18482089 3' - accord 7037 2 58.44 CAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAAATGTGTGTAAGCTGCGCGTATTTCCTGTTTGCCTGTGTGTTTGTACGCAAATATG:1 + chr2L 18465398 3' + mdg3 5087 1 61.29 CGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACCAAGTGTACGGTATTGCTGCCATAATCCACCTTAATCCGGTGCTCCGGGGTATATAAGG:1 + chr3L 22988500 3' - 3S18 7 2 65.91 AAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGAAACTAGGATAAAAATTCAAAACCATTCACACTCTTTGCCCAGAAAAAGAGCAACACCAAAGGAGGAGATATAAAA:1 + chr2L 14771232 3' + I-element 417 1 73.64 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTGTCCTTG:1 - chr3R 5671391 3' + 1360 3386 2 67.57 AACAATAGACCAAAAAACATTAAAAATGTCGCAAGACAATTCGAGGACCGTCTCCTTG:1 - chrX 6342398 3' + baggins 401 1 58.62 GCTCTCGACGTTGAAATTAACATTGTTCTAAGCCGATAGACACC:1 - chrX 5224523 3' + accord 7075 2 63.64 TTAAAATGGGTAAAACAAAGGCAAGTATTTGAGAACATAAGCGGGCTTAGGAACATTAGATATACCTGCAG:1 + chr2R 5205069 3' + pogo 335 1 83.10 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATGCTAAGCTACACCGATAAGAATTCTAATTTCCAATTAAACTGTCA:1 + chr3L 126333 3' + pogo 2077 1 53.61 GCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAGACCTTGAATCGAAACATTTGCCAA:1 - chr3L 15525643 3' + Ivk 5321 1 76.36 CTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACATACCTCGTTTCGAATGCGGCTACAAAAA:1 + chr3R 5075240 3' + P-element 391 1 42.31 AATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTGATCAAGATCTATGTGAGGCTTGTATAAACGGCAAGCAATCTAGATTAAACTTTAA:1 + chr3R 3282379 3' - Stalker4 24 4 47.12 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGGATGCCGAAAAAGACAAATGAAGATGGTTTTATTCTATAGAGAAACAAATTACTTAACTACT:1 + chr3R 1313791 3' - Doc 40 1 55.45 AAATTGTAAATATACCATACAATATGATAATGTTACCAGTCCTAATTACTGTCAAAAGCCTAAGTTTACAATATACTAACTACTTTTATATGGTACACGTACTGTGCTTA:1 + chr3R 26155674 3' + TAHRE 10194 1 79.09 AGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGTTCCCCGCTCACATCTGCTTCTCCTTCTTGTAAGTCCTTTGATTTTCTTTCCAGTTCTT:1 - chr3R 5629854 3' - roo 300 2 59.63 CAACTGACGGGAAATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATATAAATAAAGAATCAATAATATTTTTTTAGTTTGCGGTCAATTACAACC:1 + chr2R 18860077 3' + 297 6947 2 58.18 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGTGCTGACTTACTTTCTGGGCTGCCCATTGCAAATTGGGTACA:1 - chr2R 24031444 3' + 1360 3386 2 79.17 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTAAAGGAAGGCAAATGGAGCGTTGAAGGATAACTAAAA:2 - chr3R 16194518 3' + flea 212 2 65.45 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCA:1 + chr3R 23861134 3' - pogo 37 1 69.15 CCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACTCCTTCGCATCCGCTGCCG:1 + chr2L 7811968 3' + Quasimodo 171 2 70.77 TTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAATTGTGGGGTGGCGGATTTAAACTCGCAGCTGTTTAAACAACTTCCATACGCAGCCGAAATGCAGTCAGAA:1 + chr2L 4035884 3' - 3S18 264 2 60.75 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGGACACATATATCTCTGAGCACGTACATAGAGAATTGCAGTG:1 + chr3R 11326946 3' + flea 5005 2 67.09 ATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCTGACACGACGGTGAAGTACGCATGGTTTCCGTTTTGGGCTGACGTTGCCACTGGAACTGCCATGATTTGTTGAATTTTCT:1 + chrX 4405045 3' - ZAM 7964 2 56.73 ATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTATTCTATTTTTTCCCGGTTCGGTTCGGTTTGGCTCGGT:1 + chrX 14622662 3' - F-element 141 1 66.00 CGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGTTTCATTGGTTTTTAAATGGTTCGTGTTCTTGTGTTGATTGTGTTGG:1 - chr3L 9965209 3' - Stalker 167 6 52.53 TGTACAACTGCTTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - flea 403 1 47.17 GATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATACCGTTCCCGAGGTATACTTACAAAAAACAACCGCTAAAAAGTCTTTGGTGCCTATATACTCGAAAAGTTGG:1 + chr2R 6726285 3' - 1360 332 1 69.44 TAATATTATTATTATATTATTTCGTAGACAAGTAATTCCATAAAATCGTTATAAGAATTGAACTTCAAAATGCCTATAATCACTGTTTTGTTTGAAAACCAATCATATCA:1 - chrX 7374057 3' - invader3 5053 4 65.45 CGTACCTCGACCAGCAAAGTTAAAACGTACCATCCACCGAGCATCTACTAAAACCAACTAAGGGCAAACAGTTCCATTTCCTGAGATC:1 - chr2R 10792541 3' + TAHRE 10426 2 72.73 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGTGGACAGACATAAACTTTGATTGCAAAACTAATTACAGAAACCGCCATTCAATGGCTAAACTCTAGTG:1 - chr2L 13836482 3' - blood 7 2 74.77 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAATATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTTGAGTTCTGAGTTA:1 + chr2L 3323300 3' - hobo 15 1 54.08 GCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAAATATTCATTTACGCATGGGAAAG:1 - chr2R 5990086 3' + Quasimodo 13 2 76.70 GTTTTTTTTATTTAATTTATTCTTGCTGCCAATAGTTTATTTTTATTCCTCAACCTAATCCACTACTATTTTCACCATTTTTGTGATGCGTTACCCATTTT:1 + chrX 7568351 3' - X-element 4719 1 72.28 CTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCTCACCATTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1 + chr2R 13944678 3' - F-element 310 1 74.49 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAAGTACTCTCCTCTTTTCAAAATGCCCCTTGCATAGTCCTACGCTCGGAATTTAGTA:1 - chr3L 126241 3' - pogo 24 1 58.72 TTTTTCAAAAGTGTGAGCATGATAGTTTTGTGCGGTTAGTGGGCGTTAGAGTGGTCTTGGAAACTTTTAACATTTGTATGAATATAATTTA:1 - chr3L 6921042 3' - INE-1 252 1 70.33 TTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGGTATGTTTTAAAATTAATAACAAATGTAACAAGAAGTATAATAACCGACGTGGAATGATCATCT:1 - chr2R 4694699 3' + Cr1a 470 1 52.73 CCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAGTCACTTGCGATGGAGTG:1 - chr2L 16921608 3' + F-element 4390 1 79.07 TTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTCTGCGGATGAAGGCTATCGAAAATTGGCGTCGTCCTGTGTGCCCCATTAGAAGTCCCCGTG:1 + chr2L 9307847 3' - F-element 4586 1 61.47 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATGAAAGAAACAGACGCAGCGAAAAACAGCCGAAAAGCCCACCCGCAGTCGAC:1 - chr3L 18029843 3' - flea 4770 2 64.52 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTG:1 - chr3L 23146495 3' - 1360 16 1 55.84 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTTAAGGTTATTTTTTTCAGAACTGCCAACGAGAGAGGTAGACAGACACCCTCTCTCAGCTGC:1 + chr3L 16046950 3' + P-element 2872 1 64.36 TTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATCAAGAAGATTCCACCAAATTTCACATAGTCTCTGGATTACACTT:1 - chr3R 15309333 3' + HMS-Beagle2 7155 2 63.64 TGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATTAGCAAATTTATAGAAACATGTTTATATGCCTAGAAAATCAGGAATGTGT:1 - chrX 16182712 3' - aurora-element 4223 1 57.80 AAAATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAAAGCAAACAAACAAAAAATTGAGAAAGAAAACGACGTTTCAATGTTGTTCATTTTCGGTGTAG:1 + chr3L 10591923 3' + I-element 101 1 62.96 TTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTAATCCCGGGAAGCATATCCACCAGTAGAAGGCTGGAGAAGTGGTGGACTGGGTGAG:1 - chrX 16560568 3' + S-element 1704 1 62.77 CCCACCCTACCTGTGGAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACAACTGCTTTACATACCCTCCACACATTGGCCTCCTCCTTAAATAATTTTATGATTTCCGTTTGTT:1 + chrX 15887663 3' - Circe 7188 1 57.27 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTTTTGCCATCAATTGATTTCAATTCAACTTGAATCTATATATTGAAGGGAC:1 + chr2L 18570555 3' - FB 19 1 56.99 TATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAATATGTAGGTACAATTATTTGAATTTTGAGGTTTACATTGCGTGGGGTGAGTTTGGGGATTGGGCAGGGACTCGCAAGTACA:1 - chr2L 17018416 3' - TAHRE 10370 1 80.00 AGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTCGTTTTCTTGGGAAAGTCTGCTGGGCTTTTTCAATTACCCAACCACCAGCT:1 + chr2L 13058610 3' - 17.6 211 2 55.96 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCCATGGCAATGCAGTCGAGTGTGAGTGCGAGAGTTCCATGTATATGTATGTGT:1 - chr3R 11315209 3' - hopper 35 1 53.64 AATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGAAAAAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATGTACTTGTTTACATATATCGTGTCAAC:1 - chr2R 8083783 3' + Idefix 7337 2 79.09 ACTAACAGATAGCCGTTACTCAGATACTGGGAGCTCGCTTAGAATCGGTTTGCATTTGGCGTGGATTGGGGCTAG:1 + chr3R 6389965 3' - INE-1 548 1 58.67 TAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATGAATCGAATCGAATTCACAATCTGAATTGATAAATATATTTGTAGAGTAGTATATTTTGTATATAAA:1 - chr2R 23415627 3' - F-element 25 2 53.33 AATATACATATATGTATATACAAATTTATGTATATGTATATATGGACAGTTTGTTCGCTTGAATGCGCGTTGTTATGCTTATTTTTGATGAAATTAGTTTGG:1 + chr2R 20401365 3' - INE-1 67 1 70.59 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGCAGGGTAAAAAAAGTTGGCAGAAGGTTTAGTTTTACCTGGCTTAGTCGGGCCAAGAAG:1 - chr3R 23620972 3' - roo 24 2 59.09 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACATGAGCCATAAATTTATCTACA:1 - chr3R 7874846 3' - jockey 4708 1 72.41 TGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGACGATGGCGCGGGAGGGAGACAGAGAGCAGCTGGGAA:1 - chr3R 20990469 3' + blood 438 1 56.98 GTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTACCAAACA:1 - chr2L 16067068 3' + HMS-Beagle2 7167 2 53.92 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGCGAGCGAACATTTCTGCAAACAAGCTG:1 + chr3L 12301244 3' + hopper 1405 2 58.06 GAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGTCTCGCACTTACGAGTACATTGAAACAGTAGACCTAACTTTGGACGAAGAG:1 + chr2R 21189102 3' + invader5 3890 2 77.50 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGTTTTCCCCCCACAAAAATTTTTCCGCACCGCTCT:1 - chrX 8885498 3' - roo 28 2 66.67 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACCGGAAGTTGTATCACACCTGTACATATCACAC:1 - chr2R 14661106 3' + hopper2 1558 1 66.36 GGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAATGGCAGACTGTCCCCATCTTTGGCTCAAGGTGCATTG:1 - chr2R 10963669 3' + jockey 4564 1 65.45 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACATCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - 412 7087 2 54.55 GTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTACACGTTGAAATTGTGCTGGCAAGCGCATTTTCCTAATTTTATTCATGGCAAAATGTACTCCAAAGTTATGGCGAATTAAAA:1 + chrX 8331300 3' + 1360 418 1 78.18 AAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGATAAAAATGATTTGTTCAGTTCAGTGGCTCAGCGAATAATTGAACCAGCGCGATGAACGTTCGGTTTATCAATAAGCTG:1 - chr3R 7745866 3' + Cr1a 467 1 64.55 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCTAAG:1 - chr3R 11474906 3' + hopper 1379 1 68.75 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATACAGATACAGATATCTATATAGTCATGTGGTTAAGGGGTTACGCATGGCGAGATATCGATTGCGAACA:1 - chrX 17837944 3' + S-element 1709 2 70.30 CGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTGTTCTTTGTTTCCCGGTGCTTAGTATATGTCGTTCTTGTAGTGCTGCTGTGCTTTTATTCACTTT:1 + chr3L 9233087 3' + accord2 262 1 44.55 AAAATACTTGAACTAATAAAATATATCAGTTTGCAGCTTGTCCGTCAAAAGAGTTGTGTCACTTTGAAAAAGTG:1 - chr3R 30255592 3' + G7 1162 1 50.00 AACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACACAACACAACACAACACAACGCAACGCAGCACAAAACAAAACAAAACAAAACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + G6 1863 1 49.09 TAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCACGCATAAGTATGCCGACTAGTGTACATAATAATACAAATAAACAT:1 - chr3L 18463437 3' + gypsy5 368 2 61.82 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGC:1 - chr2R 9963513 3' - pogo 25 1 74.29 CACTGTTTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCGTTGCTCTATCTGAACCGAAGTTCCGCAACGCCCTATGGTCATAATATTCCGTCGCTCCAAATCGGGACAGA:1 + chr3L 16915500 3' - R2-element 3519 1 64.22 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTTCAGAACGTTACATTA:1 - chr3R 6263304 3' + diver 6068 2 61.82 TATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATTT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 55.79 TACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCATCGTGCTTGCTCATGACCTTGACAAA:1 - chrX 20420619 3' - diver2 61 2 67.90 TTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGTTGTTAGTGATTATTTTTACACCTTGTTAAGCAGTATTGAGCATTATTTTGTTTCGGA:1 - chr2L 1922116 3' - mdg3 5360 2 67.42 GGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTCGAGACTGGACTGCGATTCTT:1 + chrX 16544457 3' - Porto1 310 1 77.42 ACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATACTCAACACCTACAGACGCTTTTCACATTGCATTGAAAAGGTTTTCCTCGTCGTCTTTTCCACCAGCAAC:1 + chr2R 14390308 3' + Stalker4 314 4 73.96 TGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGACGCAAGTGCAACTTGCGTTTACTTATATGATTGATCAATATGATATA:1 + chr2R 15855720 3' + opus 462 2 74.07 GCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCGACTCATTTCTCTTCTTCTGCTCTTCCCGCTC:1 + chrX 484489 3' + 17.6 242 2 69.52 AAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGATCTTGGTGTGGTGTGTGTGTCGTCGTGAGTCTGTGGGCGTCTTGTAGCTCCATCCCTATCTTGGATATTGCTC:1 + chr2L 622768 3' + flea 459 1 71.84 CAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCTACATAGAATTTG:1 - chr3L 7846469 3' - 3S18 5816 2 71.56 TGGCTGTTCCTATGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT:1 - chr3L 11777678 3' - Quasimodo 56 2 32.29 AGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGAATTAAAGTCTAAGAACTTCTTAGATGAAGGGCACCTTTATTCCACAAGTGCCTGGACACGGATTCTTGCATTTTTGTTGAA:1 + chr2L 4490852 3' - 1360 262 1 56.36 CATCGACCACGCTGGATCAGCCAGGCAAACTCGTACTCGCATACTCCCCA:1 - chr3R 27457102 3' + gypsy10 5717 2 88.00 CGAGATTTTTCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAGCCAACACATTAGCTTCCACTTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATCAATGCAATTAATAAA:1 - chrX 9453237 3' - gypsy12 17 2 59.62 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTACAGTCTTCTCAATTTGGGCTTTTACACAGGTTAAGGGAAAACGTTTAGCACATCTAGACTTCTTTG:1 - chr3R 24867498 3' + roo 9029 1 66.67 CGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTAAAGTGTACTGTTCCGTTTAAGGATCCGGGTCCTCGGCCTGC:1 - chrX 20980782 3' - Doc 4424 1 63.75 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACACA:1 + chrX 9845520 3' - F-element 26 1 63.77 AATTATGTGCTCCATGTTGTAATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTTTATTGTT:1 - chr2R 21358403 3' + transib3 324 1 33.65 AAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGGTAGAAGACAGTCAGGCACTAGGTGAAAA:1 + chr3R 4906738 3' - 1360 3262 1 79.59 AAATCCTCCATTTTATATTTCAAACGGAAGTATCCATAAAGACTTAGGAATCCCTTACGTTAAAGAAGAAATAGCAAAATTTAAAAAGGGGATTGGATTGAAAGCAGCTA:1 - chr3R 16628255 3' + G4 3521 1 76.36 CCAAAGCCATCGGACAAGTACGAGAAGAAGATTAAAACACCACCTGTCTGACCGACGACTTTTATGTGGCCTTCGTGGGCGTGATTAGTGGG:1 - chr3L 17755118 3' + jockey2 3143 1 58.70 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTGATAATGCACTTAATTTGGCTCAGTGTATTATATCTCTGCCTTTCTTATCGTTCTGTTTGGTC:1 + chr3L 3240603 3' - diver 5912 2 59.09 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTAATGTTGAACGTATTG:1 + chr3L 12677122 3' + pogo 2083 1 64.00 CGACTATCAGATACCTGTTACGTAGCAAGTTTGTAGCAAAGTACATGACGACATAAATACGCTTTTTCTATCTTTCACGGTTGCAACACCTGTCGCATTGTGGACATCAG:1 + chr2L 9173200 3' - INE-1 550 1 62.73 AATACTGTAGACAGTGATACGGTAGGTTCAAAAAAAACGATAA:1 - chr2R 6433216 3' - Circe 7308 1 90.70 AATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACTCAGCTATAAAAATCATTTGCGGTCATTTCGCGTTGGCAAAACAGAGTCAATACTAACAACAAT:1 + chr2L 15521060 3' + Doc 4626 1 60.91 TCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGGGTTT:1 - chr3R 18044124 3' - P-element 70 1 16.83 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCGGACACAAACTCGCGTCGATGCCCCGGAGCATCGGTTTAT:1 + chr3R 22541624 3' - jockey 4847 1 63.64 GAGTATCTGATAGTCGGGAAAATCAAGCTAAATTCATACAGTTTCCAGCATCCCCC:1 - chr3R 12247719 3' + INE-1 556 1 75.00 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGAACTGAAAACATATATAATTTTGTTTTTACCAAATATATATTTAATTACTGTGCAGGATTTCTTCTTAGCAT:1 - chr3L 18743366 3' - pogo 9 1 64.81 AACTCGTAAAAATGTTGTAAAATTATTGTTATTCTATCTTGTAACTTAAGAATCAAAAAATAAAAGATAAAATAAAATCACTTATGCGAGGCTACTTAGTTGCTAACGG:1 - chrY 475862 3' - transib4 114 1 52.29 GGGGATGTATTTTCTTCAGACGTCGGAGGGAAACGGGAAATTGGCTTGGTTATTCTCACTGGGTCGTCGGAAAACTCACGTTTCGCG:1 + chr2L 7755354 3' - G5A 2680 1 63.22 TAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCACCCAGAGATACAGATACAGATGCAGGGGGCATAGGCTTAAAACCGGAGTTTGAGCTGCTATTGA:1 - chr3L 11369082 3' - invader2 243 2 69.09 GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTGTATTAAATTAATTTCTTCTGACA:1 + chr2R 18398072 3' + S-element 1686 1 76.25 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATGCTAAGCTACACCGATAAGAATTCTAATTTCCAATTAAACTGTCAATAAAGCCAA:1 + chr3L 126343 3' + pogo 2074 1 54.55 AACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGGCCAAGCAAAACAATTAGTAAATAACGATAATCTGCGTGAGGAG:1 - chrX 3503037 3' + Stalker4 7008 4 59.63 ATAGTATATACATACATTTATACGTATACGTATTACACATCATTTCGCCCGCGACGATGCGTAAAGAAAACGGGAAAGAAAAACTGGCAG:1 - chr3R 26812730 3' + INE-1 65 1 72.22 ATCTATGCAGAAGGTAGTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACGAGATGATGCAGATGGTG:1 + chrX 5407556 3' - Bari1 1588 1 74.65 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGTACAGTATCTTATCAGGGGAAAAACATTTACAGTATTCATAAATCTAC:1 + chr3R 19996635 3' + copia 5086 2 59.09 CGATTACCTCAAACAATCCCACCCAAATTTTACCGGACTCGAGCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACAACACAACACAACACAACACAACAAAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + I-element 4886 1 70.00 AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCACCAGGCCCACATACGTCC:1 - chr3L 25455108 3' - HMS-Beagle2 6915 2 55.45 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTAATTTCTCTTGGTCTGGCATTTTT:1 + chr3R 22979388 3' + Juan 4163 1 78.10 ATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAATAGTGGGCAAACGAAAAAAAAACTAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAAAAATTTATTTTTAAA:1 - chr2R 17992830 3' - FB 464 1 77.27 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGATATCGTAAATTGGGGCACCCTCGAAG:1 + chr3L 18072781 3' - 412 51 2 71.84 GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTCCCTTGCTCTCATTTCCCTGTGATGCGCAATATTTCGTAGC:1 + chrX 5513368 3' - jockey 4742 1 68.18 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTACCTTATATATACAAAAGTGTGTGTGGTGATATGCGCTATAGGTTATAATATGTTAGCGTAATGCCGCATG:1 + chr3L 17220773 3' + opus 7479 2 59.09 GAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGCTGGAGAATCCGCCGCTGGTGGTGCTCCGCCTGAACTCCTTAACTAGCTTATTCGAGTTGGAGA:1 + chr2R 7468490 3' + micropia 344 2 73.68 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCGGGCATTATTGATTTATTTCTGGTAATTAATCATCAGAAATGTTCAATATAA:1 + chr2L 14917975 3' - hopper 30 1 50.91 ACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACA:1 + chr2L 20841975 3' + G6 2002 1 53.68 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTGTTAAAAAAACCAGCCCAATTGCCCCATAGTGCATTGTTGTTGACATCGAGCATTTATGTTCGAG:1 - chr2L 14917911 3' + hopper2 1564 1 64.29 TGGATCTTATGCCACTCTTCTAGTATAGCAGCTCTTTACGTGCTGCTCGCGTTGTTACCGTTTTATTTCTGCTTGGCCCC:1 + chr3L 20580484 3' - S2 1328 1 62.50 ATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTCACAGCTTTGTGGCGTCTCTCTGCT:1 + chrX 18951376 3' - opus 7395 2 72.83 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTCCATGTGTGAACAGCTTTATTATGACTCAATAAAACTTTAATAGACAAGCCAGCA:1 - chrX 3528575 3' - roo 8711 2 68.18 TCACGAAGTCGCTTACGCGAGCCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGGGTAAAGATTAAGATCTCTGAGGACAGCGAAAAACAAAGACGTTGAAATAATTCTGACAAAA:1 + chrX 16770116 3' + Doc2-element 4580 1 62.96 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATGATGGAATTCGGTGGATAAAAGATGAAACGGAGCAGGGATCACCTGTAAAG:1 + chr3R 12453025 3' + roo 397 1 71.28 TGTCGAGCATGAAGGCTCTACTCGCGATATGGGTACACATATGCCACCCAATTTTCCACCCGATTTTCCGAACCATTTTGCCCGTCCACTTT:1 - chrX 8359852 3' - R1A1-element 5033 1 65.22 TTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTCATTAACCGATCTTCCTGGGAATTTATGTATTCATATTGGCTG:1 - chrX 12994355 3' + Ivk 5253 1 56.10 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTTCCAAAAGTAG:1 - chr3R 6461719 3' + S-element 1715 2 76.92 ATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCTCGAAAGTATGCAATAAATTTCGAAAAAAAAATATATTG:1 + chr2L 1258710 3' - micropia 149 4 62.50 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTGACGTTTAAAATAAATTTCTTGGCCAAGAGAGCGGGGT:1 + chr3L 17490717 3' + roo 9023 2 70.91 CAACTGTTTGAGCCCTTCTGGCGTGAACAGCGACTATACTTAAGCCGGCTTCT:1 + chr2R 7290674 3' - Max-element 8 2 56.60 ACAATAAACAAAAAAAAAATCTAATATGCTTCCCCTATCTTCGCGTCATGATATCTTATCATATCATTTTAACATGCCATATTGCATCAT:1 + chr2R 16289144 3' + Porto1 191 1 61.11 TATTATTATTGTTATTATTAGTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATATAAACCACTTATAACCTGGTGATTCTAAATGAAATTCATATCAATAAGGAATCCTTCAG:1 - chr3R 28639897 3' - mdg1 7063 2 56.36 AAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAATTCATTCATTTATTGTTTTCCTTAGCGATTGTATTCAGCAAAGGGTGTTTGTGTATTTGT:1 - chr3R 11091951 3' + 1360 329 1 60.91 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCGAGCTTACACGTAAATTTCGCA:1 - chr3R 8426330 3' - roo 38 2 75.58 CTTTTCGCGTGTCACTAAATGTTTATTGTTGCCGCGGCTTTGTCTTTGCAGCCGGAAGCACAATATATATAAAAAAAAGAAGAATGAAAATCCCA:1 + chr3L 11670136 3' - HeT-A 181 1 63.16 ATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGGGGAGGGGGGAGGGTAAGGAAAGGGCTGAGGGGAATATCCATCGACAGATGTGTTGGC:1 + chr3R 14047432 3' - Ivk 5205 1 60.40 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCCGGAATGAACCGGAACAATATAAAAAGTAAAATTATTCTCTGTGCATCAATGCGTTGAGA:1 + chr3R 26398933 3' - Doc 16 1 52.58 TGGAGTCGCAAAATCTCCATTTTTCCTTGCTGTTCCTGTGTGCGGTT:1 + chr2R 6585265 3' + invader1 482 1 57.45 CCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGCACCCCAGCCAAATACT:1 - chr2R 18665349 3' + G2 97 1 81.52 GACTCAACTATTGATCCTGATCAAGATTATATATACTTTATATGGTCCGAAACGTGGCCCAAGCAACAAACATCAAATTAGCCAATCAAAGCAGAAAAACACAACCAT:1 - chr2L 20804979 3' - INE-1 92 1 52.78 GCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAGACTTTAATTCAGGATTG:1 - chr2R 3919683 3' - 1360 27 1 66.23 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTATGATATCGTTGTATAAAAAAGGGCGTGCGCCGTCCG:1 + chr3R 23730047 3' - Burdock 6162 2 59.57 TATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTATCCCATAGCCAGTTATAATTCCTCACTGCGTTCCAGAGCAATTTGTTCGACTGATTGCCGCG:1 - chr2L 7668038 3' + I-element 5346 1 72.16 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATTTAAAGGCACATCGAACGCG:1 + chr2L 10746717 3' + flea 4986 2 57.89 ATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAG:1 - chrX 4186821 3' + Stalker3T 206 2 65.45 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTGAAGGATGTAAGTACTGTGGAGTATCTTTCAAA:1 + chr2R 19405981 3' + HMS-Beagle 236 2 71.28 CTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGGATCAAATGAAAGGTGGAGATAATCCAGGTGTTAGATAAATAAAATAGTTCTCTTGTTAATTAAATGTAGGAGCT:1 + chrX 15607871 3' + micropia 152 4 57.27 GTTTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCAGATGGCTGTTAAGGGGTTTTAGTCGGGGTGTCTCTTTCACCAGCGACTTC:1 + chr2L 398828 3' + invader2 4631 1 52.08 GGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACACATATCGGTTAACCACTGTACCTATATGTATTCATAATACAC:1 - chrX 21852455 3' + gtwin 455 2 58.43 AAGTACTCCTCTACAATACCGTGCTTGGTATACATACATATATCTATTTGTTTGATTTTTATTTTCAGTGTTTAATTGTGTGTTCATGTTTTTCCCCAGCATGTAGAACA:1 + chr2L 2386736 3' + Doc2-element 4328 1 80.91 CCTTATATTTTAAATTAAGCATAGTTTTAAGATAATAAAAGTTTTGAGTTCTGCTGCTGAAACTTGTGGATTTATAGCTTGTGCAATAATTTTTCT:1 - chr3L 3763091 3' + Transib5 427 1 69.79 GAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGGAAGAGGAAGAGTGGACTTGGCCAGCGAGA:1 + chr3R 26831879 3' + invader5 3890 2 47.06 CTCAGGTTTTATAACCTGGCAACAATTTGTATAAAAGCAGACAAGCAACCAAACACATTAAGATACAGATACAGATACACACTC:1 + chr3L 5710964 3' - Cr1a 473 1 53.57 TTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAATGAATAAATCTGCCAACGGCAACAATGAACCTGGGAAAAATCA:1 - chr2R 25083489 3' + Gypsy6A_LTR 246 1 58.25 TAAGCCGAATAATCAAGTCGGGCCTCTCAACATCACCACCAATAAGCTTACCAACCGGGCTGCCAGGAAACTAACTAACTAACTGAAATG:1 - chr3L 2507334 3' - Cr1a 4079 1 56.67 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTAG:1 + chr2L 21034129 3' - 412 33 2 50.91 AAACAAGTTACAGTTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGGTGACTTGGCTTATTGCGATACGCGGATGGTTA:1 - chr2L 9695363 3' - 3S18 167 2 71.15 GCCATATCAGTCGATCTCCTCCTTAAGCTGACTCAAAATAATT:1 - chrX 10131746 3' + Chimpo 4079 1 58.14 ATGGTCGTTATGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTGTCGTTTGGGCCGCTCCACCCACAGCTCCATGATGGCCATGGTGTGGGGGTTGGCCAC:1 - chr2L 18567931 3' + 1360 3374 1 61.86 ATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGCATTGTAAAATTAACTTTTGCGGGCTGTATCATAACAGTTAGTGCATAGGAAAAAGCAAAAAGGTCC:1 - chr3L 6842160 3' + hopper 1255 1 75.45 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTATTTG:1 + chr2L 17785853 3' + roo 9025 2 67.62 AGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGATAGAGACTGGCCA:1 - chr2R 13303119 3' - blood 169 2 73.68 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCCATCGATAAGAAGGCAAAATC:1 - chrX 10300769 3' - 412 7118 2 83.64 ACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - G2 2986 1 64.13 TTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTTTCATAAATTATCAAGATTTCACTGAAAACAAAAGAACCTTTACAGACAC:1 + chr3R 30859510 3' - Burdock 6161 2 52.73 TTTAAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTCACAACACAACGCAACGCAACGCAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - mariner2 772 1 35.45 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCTAATTTAAGATTTTAAAATGTTTTAATTAATGTTTAAAAT:1 - chr3L 17595312 3' - jockey 4703 1 60.00 TATTGATCTTCTAAATGGGATTTCAAGCTGTCTGAATGGCAAGCCAAAAAATGTATTCACTCGATGGGAACTACGATTTTCCAAAGAAATCATTATTCATTGCTTGAA:1 + chr2L 19324675 3' + Q-element 387 1 61.11 ACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATCAAGAAGATTCCACCAAATTTCCCATAGTCTCTGGATTACACTTATATGTACTCCCGATCTTTTTATTCT:1 - chr3R 15309307 3' + HMS-Beagle2 7181 2 64.55 CAGGGTCTCTCGAATTTTTTTTAGAGAGCGAGAGAGCGCAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTAGCACATAAATTCTTGTTTTATTTTTATGTTATTTTATGCATTTGGCT:1 + chr2L 10564264 3' + 1360 84 1 54.55 AACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAACCAAAGCAAAAACCCAACACCGATTCCTGGAAGCGAATGCCT:1 + chr3R 19284627 3' + F-element 4636 1 61.18 AGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAAAACTTCAATGGACTTCATTAAAATATTCGAAACACAAGCAGTTTAAGCAC:1 - chr3L 20557365 3' + F-element 4298 1 65.12 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATATTGGGCTTTTCCACGGCTAATTGAGAGCAACGAAAAT:1 - chr3L 16291850 3' - jockey 4786 1 58.89 TAAATCTTGTCAATGAGAAAATTCAGAAGAAAAACGTCATCGGCAGAATCTGAATCAGTACCAGAATCAGAATCAGTACCAGGAGCAAAGTCCGAGAGCCCCAAGGATTG:1 + chr2R 17286447 3' + Doc2-element 4505 1 70.00 AACACACACACACACACATATCCACACTGTTTTTTTTTACATCGTCTCTTTTTGTGGCACAACCTGAAAATT:1 + chr2R 15014580 3' + accord 184 2 76.39 TATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTAAACATTTGACCAACCCCGATGCCTTAATGGCATGCAAACACATATGCAATCAGTATACGTAC:1 + chr2R 19542188 3' + INE-1 85 1 67.00 TATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACATGTTTAATGGTAACCATGGTCGCAAGACCACTTCCTTGGACTTTTTACA:1 - chr3R 13298166 3' + I-element 5346 1 60.47 ATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTGTGTGTGCGGACAGCTGTCGCAGTAGTTGGTTTTATTATCTATAAATAAGTATTAAAAAACTTTTCAGTT:1 + chr3R 9262363 3' - 297 6515 1 70.00 ATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATATGTTTTAAATATTTAAGGTTTTGGT:1 - chr2L 22544358 3' + Idefix 7275 2 75.00 GTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGTTAAGTTGGCGACAAGTTTCATGGCGCGAGGTCATAGAATTTCCACAAGGTTTT:1 + chr3L 10761980 3' - 1360 3274 1 55.45 AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTAGGCAGCTATGTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGGAATTT:1 + chr2L 16067158 3' - HMS-Beagle2 12 2 63.54 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACA:1 + chrX 9845518 3' - F-element 67 1 76.85 TTATTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTGTTTTTATGGAATAAATAATTGGTTTTTTTCCTATCAACCATTCATAGTGGGTTGGGCTTCATAGGTC:1 + chr3L 11345398 3' - Doc3-element 203 1 61.82 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAG:1 - chr3R 9435811 3' + roo 391 2 60.20 CAAGATAAGATAAGATAAGACAAGACAAGACAAGGAGCGAGATGTGTGGGCGTTTTGGAATCCGTCAGATGTTTTGCCAACTTCAGACCAAATATGCAAAAAT:1 - chr3R 17547265 3' + Stalker3T 202 1 72.82 CGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTAAATATGCCTGCGATTAGCATAAAAAAGCAGTTAACAATTTGTACAACATTTATATAGTTTTTCATTTAGCTCT:1 - chrX 17330074 3' + opus 484 2 66.36 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATTAAAGATTGAACTGCAACAAATACATACATTCCAGATTCTA:1 + chr3R 24867592 3' - roo 8 2 74.55 CACACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCCAGAGTATAATGGTATGAGTGACTGGGTGCTGACGTGGAAATATTAATGGATG:1 + chrY 3656445 3' + F-element 4467 1 76.25 CAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 4880 1 52.22 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGATATCGTAAATTGGGGCACCCTCGAAGTAATTGAA:1 + chr3L 18072789 3' - 412 7094 2 63.37 CGCACAAAGTGATAGCAGACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chr3R 4571526 3' + 1360 152 1 66.36 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACTCACACACACACACGAATACAAATTAATGGAATAATTACCTCAGATTAGAATTTT:1 + chr3R 30369754 3' - roo 17 2 63.00 TTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTATTAACTTTGCTGGTTATTTTTAACTTTGTTTTTATTTT:1 + chr3R 8158751 3' - TAHRE 51 1 40.00 TACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCTGACTCTCCTTCTCCTTCTCTTTCTCGCTCTCTCTCTCTT:1 - chr2R 18288821 3' - R1A1-element 44 1 56.18 TGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTATGTGTATGGCACATATGCTACTATATGTATATAATTAAATGCTTTTAATATTTATAAG:1 + chrX 22853296 3' - Quasimodo 92 2 43.18 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAAGACACACTGCAGACTTAGGTCACAACTCCGTAATGTACCGTAAACTCCG:1 + chr3L 27145283 3' + 1360 3384 2 67.09 AAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGTTACACGGGTAAAGCAAGAATGCCGGGAGATGCCTAAGTAAATGT:1 - chr3R 17636405 3' + Stalker3T 203 1 47.27 CACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTC:1 - chr3R 7049664 3' - 1360 58 1 79.09 CACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATGCATTTCCCAGCCCTACGCTCCATACG:1 - chr2R 18507851 3' - Bari1 55 1 75.23 GATTAGGTAGCGTTGAAAAAGGATGCAGGATATGTGAGCTGGTTTAGCCGTGAAGTTGTTCCCCCAACTCAGTTT:1 - chr2L 16426779 3' - 297 172 2 81.33 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - 412 7070 2 39.09 TCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCTGGCGAAGATCGATACATTATTGGACGCTATGGGGGG:1 + chr2L 23371605 3' - 297 6767 2 60.64 TATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTGGCATTTCCAGCGGTTGGTGAGATTCTTCGGCGTTATTTTACTTCAATGATTTGATATCTGGCGCGAAAG:1 - chr3L 23236482 3' + Stalker2 387 2 65.45 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTAACTGAAGCCCCAGGTTTTGTGTATTGAATAAAGACAGGGTGAAGCCAGCAAAATA:1 + chr3L 20325522 3' - blood 16 2 58.76 TTTGCATATTTGTGAAAAAATATTTTAGCATGCGATTTACAAATGTAACTAACTCAGCTTTCGTCGTTGGGTAAACATTTTAAATATATAT:1 - chrX 5570810 3' + hopper2 1570 1 64.84 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTATCTGGTGAGTCGCAGTTTCGAGAACGAAA:1 - chr3R 12669175 3' - Doc 4474 1 72.73 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGACGAATAGACCAACTGCCGTTGTGTTTCTTTATTTTCTTTTTGCCCTGGCTTAAATCTCTTCTGCGCCAA:1 + chr3L 21103504 3' - Doc 28 1 60.91 AGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGAATTAGGCAGTCTAAGATTCTCGTTTTGGCATAGAATTTTCTCAGCACGAGTGTGTGTGCTATTT:1 + chr3L 3495981 3' + baggins 4995 1 60.91 ATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATAAAAAATAAAGAAACGCAGACAGGTGGAGACGTTATTACAGTCGGAACTATGTAGATGCAACTAT:1 + chr3R 10881151 3' + HB 303 1 66.32 GAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGTCGCATCGTTTTGCTTATCGCATCCGTTATTCTCTTTTCGCTAATTATACAATCAGTTAGATT:1 - chrX 8570075 3' - F-element 113 1 65.45 CTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCATCACATTTATTTATTTCTTTATTCACACAATAATTCCATATTAAT:1 + chr3R 10566457 3' + I-element 155 1 56.52 TTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACCATGTTTCATAATTATGCTCACTAAAATGACATTTCAGTGCAAAGATTATTTTGACCA:1 + chrX 22861735 3' - Tc3 238 1 79.27 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACATGGTCCTTCCAGCTATGCTATTAG:1 - chr2R 22663356 3' + mdg1 7413 2 77.42 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATTCGATATAACGACTAATTCGATCGATCATCCGTAAGACAAATGTGAGACTC:1 + chr2R 10129823 3' + Burdock 223 2 55.05 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTTGTCTTGATTTCATTTTTGATTTTAAGGCACTTTATCTCTTGCCTAAACTGGTATTCTTGTTGTTATTATT:1 + chr2R 19462642 3' + roo 9058 1 64.22 CTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTAAGTTGTCTTTTAGTTTTTCTGTTTACCCTTGTTATATACATTCCTC:1 - chr2R 2018775 3' - invader2 4705 1 76.00 AGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCATACAGCTTTATGGTACTGCCAGCAACTACAAGAACCGGAAGTGCTTTCTTATAAGCCG:1 - chr2R 17335958 3' + G4 3362 1 72.73 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGGATTTAATTG:1 - chr3R 27071867 3' - jockey 4701 1 62.89 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCATTTCGGAAGGGTAAAAGCTACTGGTTTGTTTACCTGAAAATGGAATACCCTACTAAGTG:1 + chr2R 22663417 3' - mdg1 7051 2 62.89 ATGAAACGAGAGCGATAATTTATATTTAGGATTTTGTTAAAACCAACGATTTCAAGTGTACAGCTGAATACGAATAAGCTGTGGTGTGAGTACTCCGAGTATTCA:1 + chr2L 11844134 3' + roo 8732 2 70.48 CGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCTAATCTCGCTTGAATTTTGATCGCTTTTCCGTAATTTTGATAATGATTTTTTTATCGACTGC:1 - chr3R 16275072 3' + 1360 3222 1 60.19 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATTAACTCGATCCACAAGACGTTTGATTTTTATATTTC:1 - chr2R 14738426 3' + 297 6936 2 65.45 CTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAACAGCAGAGAAGCGAGTGTTTGGCAAAAGAATGGGGGGA:1 - chr2L 2849618 3' + Doc3-element 4412 1 75.45 ATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGGACTAGATGTTGCACGGGCTACAAGACTCTTCTACTAGATACTAAAGCAAATCTCTGTGAAAATGTTGGAATTA:1 - chrX 13282275 3' + Circe 7074 1 77.06 AAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAGAAAACAT:1 - chrX 23282933 3' + HMS-Beagle 7033 2 70.91 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAAATGTTTACAGAATTAGCGTGAAGCCGAGGGATTCGAA:1 - chr3L 16046873 3' - P-element 33 1 43.75 AAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGCTCTCTAGTGATAGACTACGGAAAGTTTTATAGCGTTAACGTTAATGCAAGCCTGCCGCTTAGTGTGTT:1 + chr3L 24010270 3' - Cr1a 4029 1 77.66 GAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTGTGAAATAAGTTACTTTTTATTATTT:1 - chr3R 31846351 3' - Transpac 4824 1 76.36 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGAATTTATTTAACATGATTTGGTGTGTAGTTTATTCATCGTTTAAATGTTCTATAGTTTATACATATACATGA:1 + chr3R 12623807 3' + roo 399 1 71.82 TATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTGGAATGAATATAAATGAAAAAAATTTGAGGAAAGCCTTAAAAAAGGTTGATCTCGAGTGGAAAGGAACGACACGGGCAGA:1 + chr2L 16606862 3' - F-element 86 1 72.73 TGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGACCATAGATCGACGTCAGCATCGCAGTCGTGTGTATTAATTTCACTCATATGGCTG:1 + chr3R 9947624 3' + R1A1-element 260 1 55.45 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAATGTGATTAAAAAT:1 + chr3L 9822282 3' - pogo 55 1 78.50 GATTTGTTAACTTATTGTTAGGCTCTACATACCAAGAGAAGATTCAATTAAATTTCACCACCCAATTCGCAAAAGAAAAACATAAATAAGCAACAGATCGTGTGTTGTCC:1 - chr3R 22721033 3' + Fw2 3898 1 60.91 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGCGGCAGG:1 + chr2R 13699499 3' - jockey 4759 1 77.17 TTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTTAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTAATCCCGGGAAGCATATCCAC:1 - chrX 16560603 3' - S-element 63 1 79.09 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTTACACGAGCAAAACAATTATATTAAATTTAAGTTTTGTTTTTAGTTTGTGGCAGG:1 - chr2R 19166615 3' - FB 31 1 50.91 AAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTAAAATTGCAGCATGTAGTTTTTTAATATTTAAATGCA:1 + chrX 9844320 3' - 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chr2R 19010406 3' - Ivk 7 1 41.98 GCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAATATGATAATATGGCCAGATAAAGGTGTTTCCCCTTATTTGACATTTT:1 - chrX 12135645 3' + BS 5070 1 50.49 AGTTTATTTGGCCTCCCAATGGTATGGCTGCGGCTGAGCAATGAAATGCATTTAAACATGGGCCCTGCCATAATCCTAATCCTTTCC:1 + chr3R 5554934 3' - G5A 2575 1 79.31 GAAAATTTCAGCAGCCGCCGCCGCTTTACGATGGGAAAAATGCTAACCCTCAGGAAAAT:1 + chr3R 31145861 3' + Max-element 8494 2 35.59 AAAGGAATCTTTCTGCCCACTCCATTTCAGTCGCCAAACGGAAACTAGTTGCCAGCCAATATGGGCTTAATGGTCTGTGACAAGTTCAGGACTGCATGTG:1 - chr2R 7290606 3' + Max-element 293 2 63.00 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGATCTTGATAAAGAAACGATCT:1 + chrX 22717182 3' + pogo 2040 1 79.09 GGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCATCGCCAAGGCCGCCACTAGGTCTTCGTCATCGTCCATCCACTTCACATCCATG:1 - chr3R 21482386 3' - Bica 423 1 56.12 CCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGAAAAGTTTAGTATTTAGTTTGTCTTCGGGCCGAGTATTCGAATTATGGGAATCATTTT:1 - chr3R 9803924 3' - Tirant 71 2 57.14 GTGCGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTCTGGCACGTTTTCAGGGCCTCGGCTCAACTCT:1 + chr3L 2877719 3' - 1360 31 1 64.77 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGAGCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACGGTTTTT:1 - chr2R 5214986 3' - F-element 62 1 71.43 AACGCATATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGACCTTTTATATCCGCAAGGAGAAAAGTTTGTAATATCTTGTGATGTTCCGGTTGTCTCAACAAATTG:1 + chr3R 8611562 3' - 1360 3218 1 65.45 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAGGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAAATAATAAGGAAACGAAAGGTCAGAG:1 - chr3L 2059114 3' + Stalker3T 201 1 37.27 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTATCGTTCATTTATTTTGCTCGTTATGTTC:1 + chr3R 5774878 3' - I-element 28 1 62.50 TTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGTACATACGAATATGATGTATAGTGTGCGCATATGTTGGGCATAAAGCTGCTTTATCCGGGG:1 + chr3R 19077375 3' + S-element 1703 1 66.67 TTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATAACATGCAAACGAGGCGAAATCAATGTAAAACGCGTTG:1 + chr3L 15745299 3' + FB 455 1 66.67 TGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTTAATTGTTTATTAGGCATGGACTGGGCTCAGACTTGGTTGTAGCTTTGTTGGGTTAATAAGTAGAAGT:1 - chr3L 9304978 3' - copia 332 1 62.73 CCAATTGATCAAAAATAATATAAATTTAAAGTCAAAAAACTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTT:1 + chr2L 21768293 3' - 1360 257 1 59.46 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTTAAGCAACTTGTGCTAAATTTGCTTTCCATGATTCGTTGTTAGC:1 - chrX 20433321 3' - diver 26 2 50.52 CCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGTGGACAGACATAAACTTTGATTGCAAAACTAATTACAGAAACTGCCATTCAATGGCTAAACTCTAGTGTAACTAA:1 - chr2L 13836475 3' - blood 7014 2 77.27 TTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGAATGTACGTAAGTACACCAATCAGTTTTTAGGGTATTCAAAAGCCGAGTGTCACTGGAAGGCACTGCAG:1 - chrX 6866740 3' + S-element 1700 1 64.55 AATCAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCATCTAAATCAAGAAGGCAAACAAAACTCTAAAAAAAAAATACTAAACCTAATTAATCTCTCTCACCTAGGCTAG:1 - chrX 7079538 3' + Porto1 256 1 70.91 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATTTAATTGTTTAAATTGAATTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 22720591 3' - F-element 53 1 73.74 TATAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTTC:1 - chr3R 6769705 3' - mdg1 46 2 58.18 ACGGGCAACGGTGCATTACCAAATAAATAAATATAAAAAAACACACACAAGGACAAGAAAAGAAACAGATCGTCCCAAAAACCAACACATAGATACTAATATATATTTTC:1 - chr2L 12394161 3' + Tc1-2 460 1 64.55 TTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGTGAGAGGTAGAGACCCGGGCAATAGATTACATAAAACCGAAATGCAA:1 - chr2L 16492464 3' - jockey 4816 1 57.27 GAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGTAAAATTGACAATAGTTGTTTATCAATATATACAATTATTTGAATACTTTTATGCACATTGTCGTAT:1 - chrX 9860202 3' + 412 7443 2 55.45 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTGAAGG:1 + chr2R 19405953 3' + HMS-Beagle 6996 2 71.57 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTTAAGGTTATTTTTTTCAGAACTGCCAACGAGAGAGGTAGAAAGACA:1 + chr3L 16046935 3' + P-element 2849 1 44.04 CGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTCACTCACTACCTGCGCGCTCTTGTTGTGCTTTTCCTCGTTTTTAGTTTTACTACCCCCGAAAAA:1 + chrX 13495591 3' + Max-element 8512 2 51.89 TCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCACTTATATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTC:1 - chr3L 22908067 3' - Stalker3T 205 1 64.55 TTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATG:1 - chrX 21474428 3' - 1731 57 2 73.64 GGCGGCGACACACTTACTAGCATCAGCAACAACAACAACAGCGG:1 + chr3R 21502400 3' + TART-A 102 4 84.09 TATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCGATGTGGTGGAATCG:1 - chrX 17193319 3' - F-element 162 1 58.24 ATTAAGGTGTTTGGAGTAGTCAAAATATTTAACAAGGAGGAAGGGAGGAGGAGGAAGGGGATCTTGAAGTTCCCAACCAGTTGAAAGTCGAAACTGAAGGAGGG:1 + chr3R 9173670 3' + invader2 4678 1 75.00 TTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGATTATTGTCTTGTATTGTCTTTTTTTGTTTTGCATTGTTT:1 - chr3L 9367657 3' + S-element 1501 1 74.74 CGCTTTTTAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTTCCGTTATTATATTTGCCAACGCCTTCGCTA:1 + chr3R 2876833 3' - invader2 438 1 74.55 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGATAAAGTGCCTTAAAATCAAAAAGGAAATCAAGACAA:1 + chr3R 19446844 3' + Stalker3T 202 1 42.86 GAAATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTGATGGGATTTAGCTGGTGAGGAATGTCGATAGACCGCGGGAAAATGTTTGAAATTCAAATTATAGTTTATATTTAGA:1 + chr3R 22302312 3' - 3S18 368 2 67.27 AATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCTTCTCTCACTGCGTAAAACAAAGAATTTGCCGCCAA:1 + chr2L 14296558 3' - copia 223 1 67.27 ACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAATTATAATTAATTACTAAATAATAATTATGAAAAAATTTCGGGAAATTATTTAAAAATGTGTG:1 + chr2R 10694880 3' + opus 489 2 69.70 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGC:1 - chr3R 11553674 3' + hopper2 1552 1 71.82 GAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGCGTCGACTACCACGGCAG:1 - chr2L 14368806 3' + Stalker3T 205 1 75.28 GATTCAACACGAATCCATCGTTCATCATCTGCAAACAAAAATATTCAACACACAATAATAGTGCCCCGAAAAAAGCCGAAAACCCAAGTGACATTCTTATAAGC:1 - chr3R 26018439 3' + gypsy5 477 1 53.85 CGTCTTTTAGCACAGCACGCACACATATGCGTCTCTTATTTTTACTCAAAAACTTAATCTGTCTGTGCCGCATCTTGTTTTCCCCCGTTTCAATTGTTTATCTTCAGCG:1 + chrX 9524186 3' + 1360 3205 1 60.55 CTAGCGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAGTGCCACAAGAATTATTTAAAGTTTCAAAACTATGCACTATTTTTGAGCATTTT:1 - chrX 14827580 3' - G2 3025 1 63.64 TAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAATCTCTTTCT:1 + chr2L 21762411 3' + INE-1 566 1 58.18 AATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTAATAATGTTGTTTTTGGCCCAAAAAGGAACTGATTTCA:1 - chr3R 8186619 3' - 17.6 471 2 65.45 TATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTTGACGGTATCTATGACGTTGAGATTACACA:1 + chr2L 11082292 3' - jockey 62 1 70.48 TTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATTATAAGCCAGTCCATCAACCAAATAGTGAAA:1 + chr2R 323738 3' - springer 7166 2 67.44 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAACCTTTACTAACGAAAAACTACCACCAAA:1 - chr3R 19530913 3' - 3S18 5818 2 72.64 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACTCATTGCTACACCGCACATATGACGTACACTTGGAGAAACAA:1 + chr2R 9138766 3' + pogo 2074 1 60.42 AAATTAATAAGGCAATGATTGTTAAGGTATTTGTCGCAGAAATAGAATGTTCAGATAGCCCACCGTGACATGGTTGTTCTTGCCGCGGCAGACGATGAC:1 + chr2R 22856395 3' + 1360 441 1 66.67 CTTTACATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAACAAATAATAAAGCCGCAGCCCT:1 - chr3L 4796644 3' + flea 200 2 76.56 AGGGGCGGCCTGCCTCTCACCCTTGTTGTTGTTTTGAATTCTT:1 + chr3L 17062469 3' - blood 496 1 90.70 CCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTGTATATACCCAGTGTTTTGTTACCCCAAGCTGAC:1 - chr2R 15445856 3' + opus 491 2 55.56 TATGTTTTTGAAGTAATTTTGCAAACACAAAAATTAACGACAAAAAAACAAAATATTGCG:1 - chr3R 3915409 3' - I-element 209 1 68.33 AAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCTTTTGGTTCCACGTCTAATTGCAGTG:1 + chr3L 13194854 3' - opus 386 2 74.00 ATGAAATCTGATAGGTGACATCCCCCACTCTCCACTTGGGAACACAAAGTAGCATTCAAATGGACATCGACACTTGGCTCGTCGGGCGGCAATTAAATGGAAA:1 - chr3R 20341823 3' - mariner2 765 1 77.67 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGCTGATTTCGGAATTAGTTCGGTTAACA:1 + chrX 3528621 3' + roo 9019 2 72.38 GCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAATTCCACCAAACGTAGAGATGCCCATCTCGTCCGCCGTTTGAAATGCTTTCCCATCATTGGAGCATTTCC:1 + chr3L 20008428 3' + BS 4671 1 70.48 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATT:1 - chr2R 10091020 3' + roo 359 2 70.91 TGCATCCATACCGTTCTTTTTTTATCGTTATGTTTGAATGCGAACTTTGATTGTGCCAGTTTCTTATCATTTGGTTTAGTGTTTTCCATTTTACTTATTCCTGCTGCCTT:1 + chr3R 6597867 3' + rover 127 2 82.73 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAATCGTGTTCTTATAGACACTAGATATCAAACTACATATATTACCCTGTATA:1 + chrX 15026086 3' - FB 35 1 54.55 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCTTACGGCCATGTGTTTCAAGTGTTTGGCGGGTG:1 - chr3L 14370099 3' - 1360 39 1 65.08 TAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAACAATACTCGTTAAAGAAATAGAAAAAAAAATCATATGAATTCTGAATCCCGTCTTAACTGCTACACTTAT:1 + chr3L 18200429 3' + F-element 4569 1 58.18 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTATTTTCGAATAGCTTCATAAATGGTGGATCATGATCAAATTATATATAGAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTT:1 + chr2R 10547831 3' + pogo 2098 1 45.71 CGTCAAGATCTCAGGAAGTATAAAGCCTAGAAGGTTGAGATTCGGCATAACATTACCAGAGACAAACACAAGCGCAAGCACATCTGTATATT:1 + chrX 22681157 3' + INE-1 144 1 78.26 ATAGGCAACAAGAAAAATAAACGAAGACCCCCCACCCAACATAAAATTCCTACCAAAGATCAGTTAACATAAAATGTGATCCTTACAAGTATGC:1 - chr3L 22982285 3' + invader3 5010 1 67.02 GCTTTTTTAATATGGACTTTGGGCTGTAAAATTTTAATGGGCTTTATTTTTTTTTGCTGCAGTATCTAGGTCAGTGATGATGATTCAGGAGGGGTTGTTCTCGAGGG:1 - chr3L 21024834 3' - Idefix 7225 2 65.42 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGCGG:1 - chr3R 9481215 3' - roo 39 2 69.07 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTTATTACAAACTTTTTAAAAATGAGATATATGTTAAAGAACTCTTTATTTTTTTTTGTTT:1 - chr3R 26733981 3' - hobo 24 1 58.72 TATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATAGCGCATTTTGCACTCAGATGAAAAAGGGAATTG:1 - chrX 3351923 3' + Burdock 6320 2 69.09 AAAACGTTTGCAAATGGTGATAGACGCTAAGGGAGGGTATATTTTGTATTAATTTGTTATAATTTTTAAATGACTGACATTTGCTAGCAAGTCGACATAATATACAAAAG:1 - chr2L 13144709 3' + Tc1-2 1327 1 60.00 TGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAA:1 - chr4 1294993 3' + TAHRE 10420 2 77.78 GGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTA:1 + chr2R 5924421 3' + jockey 4731 1 37.27 AATACTTTTAACCATTACTCTTACATGTCCATTACGTTGAGTTTTATAATAGTAAAGTTTGCCACCATTTGAATTATGCAAAATCATTTAAATGCGTCGTGCCCCGAAAA:1 - chr3L 11318222 3' - G4 277 1 53.64 ATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGGAATCGTTGGATATCCGTTTGTTTCTGGTACTA:1 - chr3L 23245675 3' - McClintock 217 2 56.90 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGTTAAAGGGGAGACACACAGCTGCCGCCCGGATATTGCCGATGCCAAACA:1 - chr3L 10542514 3' - hopper 14 1 60.00 TATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCTATTGTATTGTATTGTAATGTAATGTATTGTATTGTATTGTAT:1 + chrX 12946235 3' - hopper 974 2 56.76 CATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTTGGTGTGTGATTTCAAGTGAGTGGACAGAGCCGAACGGTCAGTGAAAGTTTTTGGGCACTTAC:1 + chr3L 21489070 3' - jockey 4950 1 66.67 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGTGCTGACTTACTTTCTGGGCTGCCCATTGCAAATTGG:1 - chr2R 24031449 3' + 1360 3368 1 65.14 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTATATATTAGTTAAAATTTAAAAAGTAGACAAGCCCTTGACTCTTTCCACATAAAA:1 + chr3L 16496773 3' - hobo 10 1 64.77 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAGG:1 - chr3L 5320603 3' - roo 8684 2 58.33 CTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGGACCTAAAAAGAATCAATCAAGCAATGTTAGTCTTCAATATAAGGTTCATTGGGCTTTTGGTT:1 + chr3R 7585393 3' + HeT-A 5729 1 71.43 TTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCTTAAGTTATTTATTATGTTTTTAACACTTGAATGTAATGCACATATTTATATTATATATTGAAG:1 + chr2L 16873456 3' - Burdock 276 1 63.64 CAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGTTTGGAA:1 + chr2R 6984413 3' + HMS-Beagle2 299 2 61.86 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAAGAAGTGCAAGCACTCATAGATCAGGAAAGGA:1 - chr2L 18675583 3' - 412 10 2 71.82 AGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACATATTTTCCTACTTGTGACTTTTTCTGCG:1 + chr3L 9419584 3' + S-element 1685 2 69.32 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCATACATTTTTTAAAGTGAATATATATGCCGGCATGTTGTAGTTGCATATTTGTTGCATATACGTACACTTTT:1 - chrX 13495481 3' - Max-element 7 2 73.53 CTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTACCTCTTTGTTTAGCTTTCTTCTGTTTTGCAGTGTGTTTTGCTGATGACAGCA:1 + chr3R 26969101 3' + hopper 284 1 59.00 TATGTATATTAAAAAGATACATAAGAAAAATTCAGCTGTGACTTTGGGTGGGCATAGTGGGTGGGTGGGTGTTGCTGGGGAGGTGTTGTCAACCAGTGTCAGGT:1 + chr2L 20470640 3' + transib3 2630 1 65.38 ATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGGGTTTGCATATGGTTTTTTGGGGT:1 + chr2R 15116479 3' - 17.6 7121 2 78.18 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAAGATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTTGAGTTCTGAGTTACCAGTTTTATCTCTTACCCCGAAT:1 + chr2L 3323324 3' - hobo 3 1 74.55 TTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAGGCGAAAATTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGAGAACAAAATGAGGGGAATGGGGGTGAGTCGGACTGGCGATGGA:1 - chr3R 9862321 3' - INE-1 533 1 73.64 AGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAGCTGGGGTTTAGATTGGATTGGAACTGGGTTCGGTTACCATGGTGTACACTTTCGGACTGCTACAA:1 + chr3L 17388751 3' - Idefix 184 1 56.48 CCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGTACCCAATCCAACAGACATAAACATCCTAATTGCCGAAGGTCCTGAGTCCCGTGGGCGTGCGAAAAACTATTAAAAGGCCGTTGGG:1 + chr3R 22640588 3' + Quasimodo 266 4 57.27 CTGCATAGTGCCAAACCAATTTATGGTCGTTACGCATCTTGTTTACTAGAGTGTATGGGTGTGTGTCTTTGGCTTTATATTTTCCCTTTTATATT:1 + chr3R 21435045 3' + 1360 3352 1 60.00 GGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACGAGGGATTGGTTGTGGCACATTTGACAGCCGAACG:1 - chr3L 19666881 3' - G2 87 1 62.77 CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACACACAAGAGAAAAATATTCACTTCAAGTGAATTCTGGTAGTGTATTTTAA:1 - chr3R 8811164 3' - 1360 32 1 54.55 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTGGCTTAGCTAAAGATAGTTTAGTGATAGTGATCTCCTTAGCAAAT:1 + chr2R 2534687 3' - 1360 39 1 61.82 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGTAGAT:1 - chr2R 10090994 3' + roo 9052 2 61.68 TAAGAGAAGATAAGATAAGATAGGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064835 3' + Stalker3T 202 1 77.27 AACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTGGTCGGCAACTGACGGTGCCACTGTAAACGTGACGCTAGAGGTAGACGAACGGGCGATGGCG:1 + chrX 5083056 3' - F-element 46 1 60.58 AGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAAAAAAAAAGAGTTTGGTACATTTTTCTGTCAATATTGTATACA:1 - chr3L 20895118 3' + F-element 4627 1 71.82 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACAAAAGTCTGGTCAGGAAGGAGGCGTTTCCCAAAAGAGACAAACGAGAAATG:1 + chr2L 18359982 3' - roo 8697 2 55.45 CCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCTCTTGAGATGTACGCCACTGACCCTAC:1 + chr2L 21795035 3' + Doc2-element 410 1 75.45 CAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGCCGTGTAAACACAACCGCAGGCAATTTTGGCAATT:1 + chr3L 20747496 3' + I-element 461 1 67.33 AAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACCAGCAGCTCGAGTCGGAAGCAGAAGAG:1 - chr2R 6438335 3' + Stalker4 387 1 58.65 AAAATCTTAATTATTTTAATTGCAATGCAATCATCAATGCCTGGGCCCCGAATATAATGCCTGCCATTAAGTGTGAATGGGAATGCTGGGCAA:1 - chr2R 17983583 3' - TLD2_LTR 100 1 77.42 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGTGCTGCCATAGTCTGGAAAGCGTCTGGTTTCTACATCTGTGGTACACT:1 - chr2R 9138672 3' - pogo 19 1 64.55 CGTCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTAAGTGCTTATGGCCAAAAATAAGAAATAAGACAGGGGGGAAATGAAAAGTCTCTAGAGGCCTTTAACACAG:1 + chrX 15241331 3' + 1360 430 1 61.90 CTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGGTGACCAGTAACCTAGTGAGC:1 + chr3R 29594106 3' - Quasimodo 6948 2 67.69 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCGAATGGGCGGCAGTGGTGG:1 - chr2R 19677809 3' - hobo 24 1 69.57 TGTGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCCTGTGCGTGTGGGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTG:1 - chrX 17971837 3' - accord 7034 2 80.28 GTCCATCAACTGAAAGATGGCCTACGGTTACCTAGGCGAAGCACCAGCCATCGCTCTGCTGGATGTGTCGTGCTACATGTGTT:1 + chr3R 9284045 3' - Rt1b 367 1 59.04 TTACGACTATATTTCGGGCGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATGTAGGTACTAGTATCTATGCCTGTTCCGCCC:1 - chr3R 19058386 3' - Burdock 18 2 58.44 GTGAATCGCCACGCGTTTCTGGGGAAATGGCTCGCCAGACGATTTGG:1 + chr2L 20543095 3' - invader3 444 1 74.47 AACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATGTCATTCGCAGACCAACGAAAACG:1 - chrX 5149472 3' - invader2 4939 2 65.71 CTTTTGTAATTATTGTGAGCATTTTTGATTGTTAATGAGTTGGGTATTATAATGTGTTTGGCCTTGGGCAGTTCTAATAGTACTAATGAGCATGGGTTGAAAATCTTACA:1 - chr2R 17082839 3' - Porto1 4344 1 77.27 TATTTTTGAACTTTTAAAAAACTTTGCTTTTAATTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTAACTTTGCTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 3125961 3' - TAHRE 12 1 56.99 ACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTAATCCGTTTGGTCACAGCTCAGTGATTTTCAATGATCTTAGGGATTACCG:1 + chr2R 13561850 3' - roo 8813 2 54.55 AGCCAGGGTATTTATACCTTTACAAGTATCGTTTTAACATAATAAAAACCAACATGTATCCTGTGTCCTGTATGTTCCCCGGATGCATAATTAAATCG:1 - chr2L 21205998 3' + TAHRE 401 2 58.16 ATCCAGCGCCTGCAACATAGCCCCAACCCAAGTACAACAGCTACAAGCGACGGGGCGTAGACGAAAAGGGAAACTGTGCCAATTACGT:1 + chr3R 21523778 3' + HeT-A 5655 1 60.23 GCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCG:1 - chrX 17193339 3' - F-element 193 1 71.57 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCG:1 + chr2R 330214 3' - HMS-Beagle2 6910 2 56.36 TAATTCATGCAGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGCCATGCAAACGGATACTCGAATGTGTGGATATT:1 - chr3L 18313971 3' + Dm88 396 1 66.67 ATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAGGGAACAAGGGACAAAAGCACAAGGAAATGAA:1 + chr3L 11747079 3' + flea 4820 1 61.64 CTTGCTGTACTATGTCGATGTTCCTTCTCGATGCGTGTGCTTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 17435963 3' - Doc3-element 4363 1 62.96 AATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGATAATCTGGAATCTATAAAGATAAAAGTTAAAAGAAGCCTGACATTTAACTACGCTTGT:1 - chrX 13107023 3' + invader4 2637 1 56.36 GAATATTTGTCATTAGAGTATTAATCTTGCGTCGTGTGAAAAATTAATTAGGCAATAATTGTTGTTCGTGCCTTAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAGTTAT:1 - chr3L 25671267 3' + 1360 401 1 83.64 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCCAAGGAATCCTACACAAAATGGCAACAACACAGCCACATTGCCA:1 - chr3L 6899824 3' + hopper 1413 2 66.22 TTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATATATATCTGACCAACCAGCCATTTCGTCCTGCCCGATTACCTTGCCCATGTGCAGTTCCATTTTGGTCACTGTTTGTTCTGA:1 + chr3R 24696654 3' - Porto1 4402 1 72.73 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCTAAAAATATATACAGGGTCTATAAGCGTTCACAATTTTGAATAGAAGTCTTAGGTTGTATTTTAGTTTGCAATTATCT:1 - chr2R 13514795 3' - 1360 48 1 72.73 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCTTCATTACACCCCACCCACACGCGCTTTTCCTTCCACTCCACTTACAATTTGGAAC:1 + chr2L 1291103 3' + 412 7534 2 55.56 GTTTGCCCAATCTTAAAAATAAATAAATTCATTTTCCTCCAAGCCTCTAGGCAAAACTTTCCTTTTCAGTTAACAACAATCCCAATGAGAAACTTGAGCTTTGATGCCGA:1 + chr3R 20117974 3' + FB 746 3 79.09 CTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGTCGACGTGACCCGGCTAATTACACACCACCATGGCATTCAAAATGGTTTTATAA:1 - chrX 12780399 3' + Stalker 7226 4 57.27 TTAGGGCATTAATGAAAAAAAATAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGCTTAAGATTTGAACACTTTAAGTCCGACCATTAATTACACAATGCTTATAAGA:1 - chr2L 15898048 3' + Doc 4582 1 66.36 CCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGGCATTTACAGTATATCATAATATTGAGATA:1 - chr3R 6973694 3' + ZAM 10 2 69.23 CACGCAAAAAACAACACCAAACAGCCCTGCAAAACGGCGTCAAGCCCGAAAAACGTGGACGACGTACCGAAAGTCAACGATAACAACAACGGCG:1 - chr3L 21553199 3' - Cr1a 250 1 70.21 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAAAAAAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 203 1 30.00 GAAGATAAGATAAGATAAGGTAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAGGATAAGAGCAAATGAAAATACCTAAAACGGAAATAACTCTAC:1 + chr4 190586 3' + Stalker3T 202 1 61.82 CTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCACACACAAACACATGGAGAACACTCGAG:1 - chr2L 18839378 3' + Doc 496 1 60.56 ATCACAAAAGCCGAATGGTACATTATAAACGAAGATATACATAATGACTTAAACATGAGACAATTTAGCACCCACGCGAACAAGTTTTCTTTGGCAATATTTAAGTGAAA:1 + chr2L 22096924 3' + Porto1 4356 1 55.45 CTGGTTGCGCAAAATTCGGGTGGTGGGTGGTGGATGGTTGGTCCGATTTTGAGTGGGTGGGTCTACGCAAAAGCTGGGGCTCCAGGGCCAGAATGCGACC:1 + chr3L 15664849 3' + R1A1-element 5069 1 78.00 TGGTAGCGCCGTTCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGTGTGTGTGCGTGCGGGAGTATCTATGTGAGTTGGCAATATGTCACTGGAGGTTAATAGATTTTCCTTT:1 + chr2L 4020455 3' - Ivk 5086 1 70.48 ATGGGGTGAGGTTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGGCTCATTGGATGAAAATCGGGTGAG:1 - chr3R 22277460 3' - Idefix 7036 2 71.91 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTTACCAATCTTGTTAACTGCGGCCAGACCCTTTTCCACAT:1 + chr2R 7981198 3' + 1360 3356 1 61.86 CGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATTCCACAAGTCATCAATGCTGAAGACCACGCATTCGGTTAACGGC:1 - chrX 13773363 3' + F-element 4381 1 63.38 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCTGCTTGCATAAATTAATTTGCACATTTTCGCCATGT:1 - chrX 9576538 3' - FB 50 1 70.91 ACCCAGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTCCTTTACTATTATGAATTAATTTTGTAATATTAGGTACACAAAATATG:1 - chr2R 15224242 3' + I-element 158 1 54.55 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGACAGCCGAGGGCAACATTTCAA:1 + chrX 18009540 3' - P-element 52 1 27.00 GGTGATGATAATGATGATAAACCCTCCGACATTAAACAATGGGTGGGCCGACAGGCGAG:1 - chr3L 7039907 3' + Juan 272 1 89.83 AAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAATTAAAAAAATGTTGGATCTGAATTACTTTTATACTCGGCATCACTCTCTACCGCGTCGGCGTAACGTTTTCTGAC:1 + chr2L 22490476 3' + Doc 4675 1 60.91 ACTTTACGTTGGTCAAAAGCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGTCTAAAACTTGTGATTTTGCTCAATGTAATGTAAAATGAAACAAAAAAATAATACAACAATTTGGC:1 - chrX 11384554 3' - HB 230 1 80.00 CTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTTCATTCAAATGTATTTTTCGCTTTGGCTGGCAA:1 + chr3R 10503211 3' - roo 8866 2 69.72 AAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCATAGAAAGCTGAGCTGGTGGGGAGAATCAGTCTGAAGATGTAGATGAGGCTG:1 + chr2R 13115041 3' + Bari1 1448 1 56.00 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATAAGCTTCTTTTGGGAAATCTGGTATTATCTGCCATTTGA:1 - chr2R 23354260 3' - Tabor 6857 2 65.45 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTGCAAAAGTATTTGCATACTTTTTGGGGCTATTAAGCTTT:1 - chr2L 2484336 3' - jockey 4673 1 75.00 GTGCTATTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGTGTCTCTGTTGTGGTAGTTGTAG:1 - chr3R 6308432 3' - Idefix 7127 2 67.53 TCCAAATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTG:1 - chr2R 6537909 3' + roo 9029 2 60.00 TTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTCTGCGTGGCGATTTGCAATGTATTATCTCGGCTTACT:1 - chr2R 8500510 3' - 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chr3L 22108064 3' + Transpac 309 2 78.00 TCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTGTATTCTTTCCAAAGGTTTTCTCCC:1 + chr3L 13330287 3' - P-element 88 1 28.43 TAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATGTATTTCGGGGCTTTTCAGTAAAGGTCCTGTCAAATTGCTG:1 - chr3R 20119547 3' + rover 303 2 65.45 ATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTTTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACTGATATATGAGCTTAATGGTAGTATAAGATTCAATTAAAATATAACAACTTTAA:1 - chrX 5283352 3' + baggins 5185 1 55.96 TTCTTAATTAGAGTTCATCATTACACAATAGTTAGAGTCGCTTGGCCGCTGAGGAAAATGCAAATAACTGCACGAACTATCTGTGAGATACGCGCATAAATTTACACTCT:1 + chr2R 23230693 3' + 412 490 2 76.36 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGAATTGGCAAATAGAGACCCAAAACGGAACGAACTCCTGATAAAAGTGTGGGGATATCATGTCATTAGCCCACACA:1 + chrX 8885593 3' + roo 401 1 76.36 TTTATCATATTGCTACGAAATTGGAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGAACTTTCGATATGAATATTTTACACGAAAAAAAGTCGCAC:1 + chrX 7568317 3' + 1360 3111 1 55.56 AAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCCGAGTGGGGGGTACTGGGGAA:1 - chrX 10637771 3' + micropia 258 2 72.37 GTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAATAAATAAAACTTTTTCCTCACATCATGCTAAGGCATTAGTTACATTCTTATTGTTATTAATACATTTT:1 + chr3R 4554407 3' - Bari1 5 1 72.45 AAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGAGGGGCAATTTGTTTTTAACTTGTTCATTCAAGTAGGAGTAGGGACGACTTTC:1 - chr2L 98911 3' + Doc 4254 1 56.88 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTAGGGATCTATTAAGCTTGTGTTGCAT:1 + chr3R 27071950 3' + jockey 4986 1 65.45 CCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTCGCTAAACAATTTCAGCGCAATGAAATTAGGCGATTGAATTTAAAAATATTCAAATATTTGTGAT:1 + chr3R 31910186 3' + hobo 2649 1 66.36 AAAGGAAAAATAATCAAGAGACGAATGCGGAAAT:1 + chr3R 6099515 3' - Circe 6959 1 88.24 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATCAACTTTTCACCAACCCTCAACTAACAGCTGCGCTCACCTAGTGCG:1 + chr3R 11568717 3' - jockey 12 1 53.33 CAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTAAAATTGATATAGCCATCAGATGACAGTTAAGTGAGTGGTTGGTTGGGAGGCGAATGTGAAAAACAAACTATACACAA:1 - chr2R 19096872 3' + flea 5012 2 74.55 GAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGGTTAGTTACAAGTCTTAAACGCTTTCTAAACGAATGGAAATGCCTGGAATTGATTGTTAGTTT:1 + chr3R 23114400 3' + copia 104 2 63.64 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTCCTTCCCTTACCAAATGAACTGGCAG:1 - chr3R 29345639 3' - roo 8699 2 70.11 TTCGTTGGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACAAAACAAAAAGACGAAAGGAAAAATCCAAATTTATTAGACTACAAATTTGAGTGCGGCAAGGCTATTAGCG:1 - chr2R 24698746 3' - 1360 2996 1 75.24 GGATCCAGATTTGGGGAATTGCAGCCGAATCTAATTATAAACGTATCCAGGTGATACAAAATCGCAACGAGAAAAATTCCCAAAATGCGACTG:1 + chr2R 19848901 3' + Helena 1079 1 70.97 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCGAGGAGTTCAGGACATCCAACAATAAGAAAT:1 - chr2L 13710648 3' + copia 242 1 68.81 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGTACAGTGG:1 + chr2L 14141340 3' + hopper 1412 2 64.18 ATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGTGAAAGCGCAGGAGGCGCTGGAG:1 - chrX 8703371 3' - INE-1 564 1 72.06 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTACGGTTTTTGTGCTTATTTGTTTATAACACAT:1 - chr3R 7588880 3' - F-element 61 1 78.10 CGGGGATATGATCGTATGCTTCGAGGGCCTTATGAGCGTTTATCCTACCACATATTGTAATAAAGTAATTGTCTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - invader3 55 2 57.14 TCTCTCTCTCTCGCTCTCTCGCTAGCCGCACGTGGCCTGTCAGGAAACATGCTAAGCAGCGGCTTCC:1 - chr3L 10811335 3' + Cr1a 293 1 65.67 TGTGTGTGTGTGTGTGTACATTTGGTAGGAACCTTAAGGCCTGGGAAAGTGCTGTGGCCTGCCGATGATGGGGTGAATGTTGGTGACT:1 - chr2L 6550188 3' - accord 180 2 72.73 TAATTAAAAGTAGTCTACTGAAATAAGGCGATAACCAGACGAAGGCATACCTCTACGCCCTGGGCGTGATCTTGACAAGCGCCTGCACCGTGCTCTTCATGC:1 - chr3R 19871630 3' - Cr1a 3977 1 74.51 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGATATAAGAATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCT:1 + chr2R 12416920 3' - pogo 45 1 72.00 GGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAAACATGTACAATGGCAGCCGCAGG:1 + chr2R 16476438 3' - X-element 16 1 60.98 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTT:1 + chrX 2426449 3' - roo 8707 2 68.18 TCTTAAGTAACCAAAACACATACACACCTACATATATAAGCAAAACACCAAATAAATATACAAACGTACATACTTAACAAAGGAAAAACC:1 - chr3L 13877440 3' + jockey 4906 1 83.33 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATTACATCTGCAATTTTTTTTTATTAGGTGACGTGGTGGG:1 + chr2R 12336680 3' - pogo 11 1 70.91 CATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTGGAAAAAATGTAGGGCAGGAGGGTAGCCACGTAGCTCGACCCGTATCTAGGGACCC:1 + chr2R 5225854 3' - Doc2-element 4364 1 60.00 AAAGTATGAATTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAAAAATGGGTGGTAGAATGAGGGGTGGGCGACTTTTGTGTTATCTGCAGT:1 - chrX 2878169 3' - I-element 5139 1 54.55 CGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTAACTACCGAAACAATGTCTGCCCGCCTCTGC:1 + chr3L 10109793 3' - hobo 2707 1 67.92 AGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGTCGACAAAAGGGGGAAG:1 - chrX 20099916 3' - S-element 31 2 54.55 CCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATATAAGAACAATTTTTCAATTCCAGTCACATTCGCA:1 + chr3L 17365064 3' + mdg3 5303 2 59.77 TTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCATCGATACCAAAGATTCGTGAAACATGTCAACTGTTATGATGCCTGACACTTGACGCACAACATTTGTCTCTATTTCCCT:1 + chr3L 22350847 3' - Bari1 78 1 76.92 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCCATATATATATATACCCATACTGGTACATGCTGCACAGATAGGACTTGCCTGG:1 - chr3R 7171247 3' + 297 6964 2 53.26 GAATAGAATAATAATAATAATAATAATATTGTGTAATTAGAAAATCCTTATTGCCATTAAAACCTAATGGGGAAATGAACTTCTAGATCAACAGGACACTAAATACGTCA:1 + chrX 19543054 3' + mdg1 7051 5 71.82 ATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACATTCACATCCCTAGACAACTGCTTTGTGTCATTCGTTACAGTTTCCAGCTTAAACAAGCACAGCT:1 + chr3L 23236597 3' - Stalker2 19 2 63.30 CAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCCCAATTTTCCTCCTCCCAATAT:1 + chrX 17174561 3' + F-element 304 1 79.82 TTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCAGACGTTTGGCATTTGAATGGGCCCAGCGGCGATTACGCAAAAATGCAAATGCAAAAAAAAA:1 - chr3R 14365140 3' + 1731 184 1 81.61 ATTTAAACAATATTAATCCTAATGTGTCGAAAACACAGTATGCACCACCACCTACCAAGATCAACGGATGCTCCACTACGGCCAATGAGGCCACTTTTAACATACGCTT:1 - chr3R 23257371 3' + HeT-A 5773 1 62.39 ATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGTGCAAGAATTCCACAATATTTCAACAAAAAAAATGAGTTAAATCAATGTTGTGAATTTAAAAGGAAATGTACACAATT:1 - chr3L 4681480 3' - micropia 170 2 70.91 CCTTTGTATTACTTAGTTTCCCTTGCACTGCTATTTTTCTGAACCTCGACTTATGCGCCTGTTCAAAATATATATAAATATATATTTTTATT:1 - chr2L 12902812 3' - HB 35 1 60.87 TTATTTATTTATTATTTATTTATGATTTTTATATTTTTTGATTTTTGTATTTTATAGAGAAAAGAACATCTTGCTCAGGTGGATATAAATACTTCACAAGTTCAATGATA:1 + chr2R 14142958 3' - BS 5093 1 74.55 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGGAAAATTGTAGCCAAGACAGCTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 12896993 3' + hopper 1382 1 57.58 ATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGCAATATAAATTTAAATGTAACTATATTTGAAATACAAATTAAATACTTAAACGTTCAATATCTTTATTTGG:1 - chrX 15887543 3' - FB 236 1 69.09 GGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTGCCGGTCTGGC:1 - chr3L 10911502 3' - gypsy3 6584 4 62.03 TAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGGTGGCTTCGAGGTTAACAGGGTGCTGGGGTGAGAGGTAATA:1 - chr2R 12959498 3' - FB 986 4 62.73 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAG:1 + chr3L 22693583 3' + Stalker3T 201 1 44.55 GTGTGTGTGTATGTATATGTGTGTTACTGCTTATGAGTGTGTGGGTACTACCCATACACTGGCATGTGTGTTTACGTTCCATTTAAAA:1 - chr2R 14443529 3' - Quasimodo 27 2 78.41 TTCTCTCAATTAACTGTTTAACACTCAGTTAATAGCTTATAAAATGCTTTAGTGAAGCCTCCTTTGCACAATTTAAATTACCTGCTCATTG:1 - chr2R 17894583 3' - transib2 171 1 65.93 TTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTTTTATGATTTTTTAGGTTTTTT:1 + chr3L 3523252 3' - Idefix 267 2 80.21 TGAATTAATAGAAAAAAAGGACACAAAGGGGCTCCAAGATTTTCCCATATGCCTTAATAAATAAAAAAATTTTTTTTTTTAAATTCTGCTCAA:1 - chr2L 20107004 3' + X-element 4661 1 93.55 AGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGAATTAGCGGTACATGAGCAAGGTTATTTTATTTCACCCTATTGCCCTCAAAAGTATGCT:1 + chr3L 21144028 3' + GATE 8434 2 45.00 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTCATATATAAAATTCGTGCTGCCGCG:1 + chr2L 4674766 3' - I-element 52 1 79.81 CTTAATAAAAACCAAATCAAGATAAAATGACCAACTGCTGGAAGACCATCTACCACCTGTTGGAGTTGTATGGTACAATGCCGGAGAC:1 + chr2L 16907057 3' + mdg1 7390 2 63.64 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATGCCACGGGGCGCAGTAGATGTTGCTGAACTAG:1 - chr2R 6707668 3' - 1360 12 1 68.57 AATTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACGCAAGTGGAAAACGCTGAGCGAGATGAGAGTGGCGG:1 - chrX 13472171 3' - Juan 81 1 55.56 TTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGAAGCTTTTGCTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGGATCAGCAATAGAATGCTAATTACCGAAAAATTTCTGCACTCATG:1 - chr3R 21846406 3' - Porto1 325 1 59.09 ATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTAATTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTATTTTGCTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGA:1 + chr4 1294989 3' - HeT-A 9 1 77.27 AATGTTACCAGTCCATGTTACTGTCAAAAACCTATTACGAAAAAAATACTAACTACGACCAATACTATTATTTATAACTTTATAATCTTTATAAAATAATATAAAAGCTG:1 - chrY 677330 3' + HeT-A 5857 1 69.09 GTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGTGAACGCTGAAACGTTCAAGACACCAAACATCCGAA:1 + chr2R 12762131 3' - copia 5071 2 67.27 GGTTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATACCCTTGCCTTTTACGAGGTATAAAAAGTGAAACAAAAGTGGAAATAAAACCCTGTGTATGTTTCTCATGAGCGTTAACT:1 + chr3R 14139181 3' - 297 5 2 77.27 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACACACGAC:1 - chr2L 9147971 3' - Doc 7 1 55.38 GCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTTTTTTTTCTCACCTCAAAGACATCTCCAAAAAAGATTCATTCATTCGAAGAACC:1 - chr3L 3058358 3' + 1360 3195 1 58.72 TCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGAATTTTGATCATGGTATCGTTCGAGAATTTCCATTTACTTCAGCTCTTCAGCGGATGTCTGTTGT:1 + chr4 140712 3' - Bari1 1499 1 69.61 TGTGTGGATGTGTGTGTGTGTGTGGCAGCCATTTTGCCACTTTAATGGGC:1 + chr3R 17982125 3' - accord 190 2 82.00 CTGATAGTCGGGGAACTCGACCATAGCGTTCTCTCTCTTGAATCTGTATGCGGAATCTAAACCTTTTAGATTTTCTAGTTCCTGAGATTTCGAAGTTCATACGGACAGAC:1 - chr2L 17982793 3' + INE-1 562 1 69.09 GCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGCTGTTGGTGGTATCTTTCGCGCACACACTCCTCTTTGTTTGG:1 + chr2R 17804134 3' - F-element 451 1 61.36 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATCTACTTTCTTTAAAAAAAATGTCAGAATGCCAATTGATTTTATT:1 - chrX 15169964 3' + I-element 5315 1 62.73 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCGCCCTCGCTGCCAA:1 + chr3R 5910767 3' + roo 406 1 73.81 ATAATAATAATATAATAATATCTTCATCTAAACATTCGCATAACTGCCAAACTACCGCCTGCAAGAGTATTTCAAACTTCCCAACCCGATTATATCCTTTCTTAATACAT:1 + chrX 13977283 3' + invader3 5049 5 70.00 CATTACACATATTTGTAATATATAGTTTTAGAAAGTGTTAGGCTCACCCACAGAAATCCACATACTCAGAACATACAGAACATACAACACAGCCAGAGAATACCCTACAC:1 + chr2R 11447808 3' - accord2 7523 1 74.55 GTGTGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTGGGTCCGCTGCTCCAGCCGCATTATC:1 - chr2R 11576432 3' - diver2 101 2 74.55 GCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTTGGGGCTGTCTGGCAGCCGA:1 + chr3L 5204460 3' - jockey 4668 1 72.94 ATAATCTTTTTTTTTTTGGTTTTAATAATTAGTTTACCCAATAAATATTTGGGCTAGATAAACCTGTTTGT:1 + chr2R 14520728 3' + Tc3 86 1 71.83 CTGTTCCAAGCATCGGTCTACGGTTAGGTAGTGCTGGAAGACCCTTATTCCCACAACCCTCTTCATTTAATATTTTTTCGTCTGAGCTTACGAATGACTTCTGTTGCTTC:1 + chr3L 18258539 3' - Cr1a 4019 1 55.45 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAAGTATAGGTTCGCTTGTTTCATTTTGTTAACTTTTTATTATTTGTTATTTTTTATTTTCTAT:1 + chr3L 17719087 3' + 297 6959 2 66.67 TACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTTTGCCGACTAGGGTGTCCAACCCAGAGCTCTTCGTC:1 - chr2L 14141282 3' + hopper 1368 1 66.36 TACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTACTCAGAACTAAACTACTGTATGGGGACATGTA:1 + chr2R 892421 3' - Stalker2 7281 2 62.92 CATTGATCCTGATCAGGAATATAGCGTCCGAAACGCTTCATATTACCTGTTATATACTTTCCAACAAATACAACAAAAAGGAATGACAAAGTGAAA:1 + chr3L 21176149 3' - INE-1 84 1 72.92 AAGAAAAGACAAGAAAAGAAAAGACAAGAAAAGACAAGACAAGACAAGACAAGATAAGAAAAGACAAGACAAGAAAAGACAAGATAAGAAAAGACAAGACAAGACAAGAC:1 - chr2L 21768293 3' + Penelope 652 1 24.55 AAAAGAGCAAGACAAAGTAGGAAAACAAAATATCTAAAGCGCTAGCGAAGTCATCCGGTTTCTTTTGGGCCAGAGTTGGGCTCATGAATGAGGAATTTTCTCTG:1 - chrX 732805 3' - S-element 244 1 70.19 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTATATTAATTTTTAAACCTTACTGTAAGCTATATTT:1 + chr3L 18743463 3' + pogo 2055 1 72.73 CCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTC:1 - chr3R 5671411 3' - 1360 59 1 75.45 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTTAATTTAGAAAATGTTTACAAAATTTCATAACTGCAATGTT:1 + chr3R 18769761 3' + roo 9029 1 65.14 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAAGTACTCTCCTCTTTTCAAA:1 - chr3L 126277 3' - pogo 55 1 77.88 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATC:1 - 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I-element 22 1 51.96 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTACTTGGGATTTTACAGGTATGAATATGACCTTTACCCAAGTGTGACAATGCCTTGGCACTCATTATGGGGGG:1 - chr2L 12591710 3' + roo 388 2 55.56 TTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGCGTGTGTTTGTTTACTTACCTTATCGGAAAATTAGGCCCACGAAACAGAGACACATGTTA:1 + chr3L 20006851 3' - accord 222 2 60.91 TAATAATAATAATAATAATATCGAAAGCATATAATCTATTTCTATTAACCGAACACAAACAACGAGTACGGTCCGTCTCGAGATCAGACATCGAGAA:1 + chr2L 3025549 3' + mdg1 33 3 60.82 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGGGCTAATTCAATTGAAAAGCCTGGGCGTGGTCATTG:1 + chrX 8364755 3' + jockey 4978 1 61.17 TTAAAAGAGGAAAGTTCTTCTCAACGTAAAAAATACTCTTCTGCTCCCCGGAATATTAAAAATACTCTTTCGCAGAAAGGCAAAAGTCAAGGACGAAGAACACGCGTTT:1 + chr3R 7136991 3' + Gypsy6A_LTR 274 1 56.88 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 412 65 2 80.91 GATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCATATCTCAGAACATTGCACATGTTTTTTAACCACACTTGAATCATTCTCA:1 + chr2L 11154966 3' + I-element 5085 1 48.42 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGCGGTCCGGAATGGATGGGATTTGCAAGGAAATCTAT:1 + chr3R 13503047 3' + hopper 1365 1 65.45 TCAGTCCGGTTAACTTAGTAAACTTATATATATAGGGACTATATAGAGCAGGAAACGACTCCATCTGTTTTACGTACTTCTGTTTTCATACTTCATAACCAATCTAGTGA:1 + chr3R 7436663 3' - gypsy3 6578 4 78.18 AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTTTTCTTGTTTACATGTTTTATTATAGGCACATGTTTCTTCATCTAGGATCAACTGATTT:1 - chr3L 4264946 3' - Transpac 4926 2 69.47 TGAGCATACGTGTGTACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTTCGCTTTCATTATCTTTCGCGCGAAAAAATC:1 - chr2R 7248791 3' - 1360 177 1 70.00 ACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGATATCATAACTTCATATCACAACATA:1 + chrX 20433406 3' + diver 6088 2 58.33 GATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTAGGCAACAGTACATTGTTACCATTCTAATGTGCATATAACTTACGAGTTATGGCCG:1 + chr3L 18687625 3' - F-element 4314 1 47.87 CCAAGAACACAGCAAACAAAGCGAAAACATGCAAAATTCTTAGGCCCACTCAGCGCGATGGCTTTCCCATGGCAGGAG:1 + chr2R 15836697 3' + gypsy4 480 1 74.36 CCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCACACCATTTAAAATTAAAGGTTCACTATAAACAAACTATTTTGGCTTGCCAATGAACTTATAACAAGCA:1 - chr3L 21597796 3' + FB 465 1 57.27 TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGCTACATCTTA:1 + chr2L 5304917 3' + flea 237 2 57.14 ATTCAGACGGAACAGACGCTCTGAACTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTGGCATTTCCAGCGGTTGGTGAGATTCTTCGGCGTTA:1 - chr3L 23236516 3' + Stalker2 7602 2 64.22 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAGATTGTGGCCAAAACAGTGAGAG:1 - chr3R 9435789 3' + roo 401 1 73.64 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATTAATTTGTGTACGCGCCGC:1 + chr3R 10964634 3' + I-element 5305 1 78.89 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATAACGATGCCATAATTTAATCTTGAGCTTAAACTAACT:1 + chr3L 3611817 3' + blood 368 2 73.64 CATCAACGACTTAGTCATTATAAAGGATGATAATCTACCACCAGCAGAACCGAGAACGTAGAACTAAGAGCTGAGCTTTCGCCACTGTTATTCGTCGGTAACAAAGTTTA:1 - chr3L 924597 3' + diver 5640 1 63.64 AAAAAAAAGAAAAAAAAACCTTCGATAATACTAAAAAAAAAGCAGAAGAAATGTTTGAAAAAAAATCCCCAATTGACATATGCGTAATCCCCCAAAA:1 + chrX 11155301 3' + HMS-Beagle2 490 2 74.23 TTGATTACAGTATGTGTAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTTACAGTTTTACATTGCATGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - HeT-A 5991 1 47.27 AAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCATATATATAGTCATTTCATAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 - 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chrX 14378360 3' - jockey 4705 1 76.36 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTATGATATCGTTGTATAAAAAAGGGAGTGCGCCGTCCGAG:1 + chr3R 23730049 3' - Burdock 21 2 56.04 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGAACTGAAAACATATATAATTTTGTTTTTACCAAATATATATTTAATTACTGTGCAGGATTTCT:1 - chr3L 18743375 3' - pogo 17 1 57.01 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACATTATGGATATATCAAAGCG:1 - chr2L 16742265 3' - 412 7100 2 78.72 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTTAACTATGATTTTCCAATT:1 - chrX 17184927 3' - roo 62 2 88.07 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGAACACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGGCGTATCAGGGGCGTGGCTAAAACGA:1 + chr3L 19063489 3' - P-element 50 1 16.67 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCTACGAATTGTTAGTATATTACATCTATATC:1 + chr2R 10241485 3' + I-element 5300 1 72.73 AGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAACGGGAGCGAGCGGAAGAGAGAAGCAGTTTGTTTGCCTAAATGCAACTCATGAA:1 - 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chr3L 17567072 3' - McClintock 1 2 62.73 AAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCAT:1 + chr3L 20187387 3' + FB 481 1 64.76 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGGCAATGGCAAGACAATAAAATAATAAT:1 - chr3L 12677075 3' - pogo 54 1 74.55 CATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTGGTGATCTTGTCTATAGAATTCTCTATTTTTTTGTTATTGTGCTTGGTGCGTAGTTTTTACGTTTGTCATC:1 + chr2L 16534408 3' + INE-1 535 1 69.16 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATCTTTGTATATGTATTCTGCAGATAGCAAAGGATAGATAAGGGGAACCCACAACAAAAATATTCCGGCA:1 - chr2L 14715060 3' + 297 383 2 64.55 CGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCGAATGTTTAAATATTT:1 - chr2R 8397414 3' + 412 7533 2 52.73 TTCGGAAGTGAGAACGCGCGGTCAAGACAGAAGGATCCGGCCACAACAGGTTATTAATGCGGTGGGCATTTCTCGTGTA:1 + chrX 1498688 3' + gypsy8 441 1 64.56 ATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTGTGTCCCTAAATAGATCGAAAGTAGTGGAGTTTGGCAATCAGAGGTTTATATATCGATTGTAAAGCG:1 + chrX 12007570 3' - 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chr2L 10012506 3' + McClintock 429 2 84.55 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGTGGACAGACATAAACTTTGATTGCAAAACTAATTACAGAAACAGC:1 - chr2L 13836510 3' - blood 33 2 53.64 AAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTT:1 - chr3R 6263319 3' + diver 6053 2 75.45 ACTGTCTGCAATGCCAATTTTGTGCAAATGGCTGTGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGTGCGACCTTTCGAGATAATAAT:1 + chrX 6703508 3' - baggins 5175 1 80.00 CATAATTTTTTAATGGACTTTTAATGTCTGCCGCTTGTGCGAGGGGGAATCTTTGGGTGTTGAAGATGGGTTGTTTTGGGTTCGGCAATTT:1 + chr2L 7867467 3' + Tc1-2 1384 1 57.14 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATG:1 - chr2R 20924222 3' + mdg1 381 2 70.30 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATCCCTAAAATTCCAAAGGAAAAGCATTTTGTATGCCTTTCTTATTTAC:1 + chr2R 20924286 3' - mdg1 7076 2 57.27 CACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGAGTACACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAA:1 - 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flea 47 2 72.73 CACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTAAAACAAGAACAATGTGAGCTTGGTGTCTGGCTGTTTATTTACCACATATCATA:1 + chr3L 14289369 3' - hopper 106 1 57.27 CGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTTACTTTATTATTTCGGTTATCGATTTGACAC:1 - chrX 22861664 3' - 1360 44 1 77.00 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATAAATGCACAGCTGCGGTTGAACTATAGGTCTTAATCAAGGCTAT:1 + chr2L 12910783 3' - Burdock 18 2 56.38 ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATCAGGTGATGCTTTAATTTCAGCC:1 + chr3L 19948900 3' - 3S18 44 2 69.79 CAAAAAAACAGATTTTCCGAAAGAGAAAAATATTATATTAATCTGTGACGGAAGGAACTTATTTTGGGTCGATTTCGAAATACATACATTTGCAGCTAAATGTGTGTTTT:1 - chr2L 4824941 3' + HMS-Beagle 439 1 78.18 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGGAACCGATTAGACGGCTTTAGGGCATTAGATTGTACGTGGGCGATGTTTTCCAGCGCATTTCGGTCGGATCGGGCTTG:1 + chr3R 3706715 3' - INE-1 255 1 52.00 TTAAGAAATAAGGGAAGAGCGTATCCTGTAGCTTCAATTCTGCCTCCCGAATCCGGACAGCTGGCACCGCTGCCCGCTGGGATAGG:1 + chrX 7156564 3' + gypsy7 97 2 77.91 ATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACTTTTTTCTCGAAACCTAGAAAAGCCTATGATCA:1 - chr2R 12390898 3' - Q-element 116 2 68.24 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Tabor 7317 2 26.36 TATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATTCTTAACGTTTCGCAGGTAAAATGCCTTAATTAATAAAAGTTTCATTCAACCGCCAGATATTTTGAAA:1 - chr3R 23722218 3' - Burdock 9 2 72.48 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGCACTCCCCCGTCATTGGAGCCCCACTATGACGGCGAG:1 - chr2R 16131189 3' - mdg3 72 2 55.70 GTTAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTTCAGAACGTTACATTATTACTTGTAGAACAAAGATGTACGTTTCCTTTACCA:1 - chr3R 6263268 3' + diver 216 1 76.36 TTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAAAAGAATTTTTCTAATTT:1 - chr2R 1320673 3' + diver2 4878 2 54.55 TTTAGTTAGTTTAGAATAAGATTTGAAAACTTACGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCTAGGCAACATCAAACAGATGTAGATTACTGTCGATCCATTGTAATGTAA:1 + chr3R 31997773 3' + Doc3-element 4651 1 55.45 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Tabor 478 2 32.22 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTAGGTTTTTACGATTTTAATTATTGCTTGCTTTGGGTTTTTTCCATTATGTGACAGTTGTACTTTTTTAGTA:1 + chr3R 2275681 3' + opus 7491 2 71.82 GTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTGTTTTTCTTTTGCTCTTCAACTCAATTAAAGTTGATGGCCATTTTGCGTCGTCTTGGCCAATATTGTTGACT:1 - chr3L 6339718 3' - F-element 4450 1 77.89 GAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTCGTTGGTTTTGGGTTTGGGTTTTCGTTTGGTGTTGGTGTTGGTGTACTGGTGGACAAAGGTATGGAAGGGTTTGCAG:1 + chrX 11935885 3' - I-element 5097 1 76.24 TTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTTGGGGGAATAGATTGAGGAGAGTGGGGAGC:1 - chr2R 14554861 3' - I-element 5155 1 72.73 CGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCAGAAACAAAGACGTTGACTTCCACACATGCACAGAAAACAATTGGACACCAGTTTCGTGGTT:1 + chr3L 3778524 3' + Chimpo 35 1 57.27 CGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTCAAACGCAAAATCAATTTTTTTTTTGTTGGTCTCTTTTAAATTGGCATTGTTGATGTTTTCCTCTTTAGCGGTATT:1 - chr3L 7869460 3' - invader2 453 1 54.55 ATCCACCGGTTGAACCACATACATATTAACACCCACATCTCCTTCGCCCACCATCCATCTCCCATTAAACACGCCGAATTCTCGAAAACT:1 - chr3L 1563086 3' + transib4 2385 1 65.56 CAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCCTGTGTCCGCTCGCTGCATTCGCTGCTTTGTAACGCGTATCTGTGTGTCTGCTTTT:1 - chr3L 17573938 3' - 1360 3333 1 57.95 CATCCAGGTGTGGGGAACTGCCGCCAATGAATCTCCACCCCGCTCCTACCACGCACTCTTTTTAATTTA:1 + chrX 20910172 3' + G5 4395 1 81.16 CTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTT:1 - chr3R 7049660 3' - 1360 53 1 75.23 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTCGACACTATGTATCGGGCGTGAATCATGCCGTACAGCTTTTCCTCATCT:1 + chrY 975907 3' - 1360 18 1 51.65 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTTGACAAGGCCATACGTCTAAGTAAGTTC:1 - chrX 12271483 3' - pogo 39 1 70.21 TACAAAAAATACTAATTATAATCTAACTCACCACGCCCAAGCCCCAAACTCACCCCATGACAGCGCTCATTGAGTATGTCAAGGCCATGAGGCACTCACTCCAAGAGATA:1 - chrX 14794498 3' + HeT-A 5895 1 51.82 GATCCACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGG:1 - chr3R 31045712 3' - INE-1 96 1 72.00 ATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - I-element 4892 1 49.49 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - 412 7101 2 65.45 AGGGAACTGTAAAGATTCCAGAGATAAGTTTACAGCAGTTTTTTCTTACTATTCAAAGTACACTATTTTGTTCGCAGTAAAGCTTCGCTATTTAAAA:1 + chr2L 10636339 3' - Q-element 21 2 74.23 AGTTCTCTTATATAATGATATTTTATATCTGTATGCTTACTACGTGCATTAAAAGTCTCATTTTTCACCGTTTCGACCACTGCAGCAGAAAGCAGGGCGACTGACTGACT:1 - chrX 6344067 3' - Dm88 4140 1 60.91 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTG:1 - chr2L 19129335 3' - FB 32 1 63.16 TTTTTTTTAATTGGCGCCCAACATGCACGGCTTCATCTGTAAATCTCTCGATGGGCAAAGTAGGTGCCAGCTAGCATGTTGTCTTGCATG:1 + chr3L 20954572 3' + gypsy2 342 1 73.33 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTCTCGCTTT:1 + chr3L 3371212 3' - copia 4923 2 72.73 TACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATAAGCTTTGGCATAATTTTGACAGTTTCCTCCTTCGTGGTGGAATGTTTAGATTTAT:1 - chr3R 9109490 3' - invader2 341 1 58.18 CGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATAAGTATAAGATTTGAGATTAGTTCGGATTCAAAACTAACAAAAAATATACAGGTTAGTAAATGTCT:1 + chr3L 2124917 3' - diver 6 2 71.58 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCTACGAATTGTTAGTATATTACATCTATATCCCTTTTGGTTTTATTAACACTT:1 + chr2R 10241507 3' + I-element 5322 1 52.73 TCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACACAGCA:1 + chrX 9845523 3' - F-element 12 1 56.90 AGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATTATTGGTTTTACTCTTCTGTTT:1 - chr2L 12397007 3' - Dm88 451 1 76.34 ATTTGTATATAAATAAATTTTTCACTTTATTTTCAAGGCTTGAAGAAAAATCGAAATTCTATTTAAATCCTAATTATAAATATAAAAAAAAA:1 - chrX 3530551 3' + transib4 2463 1 71.74 CTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCAATTTCTCTTGTTATTTGAATATGGAATGGAATATATTAAAATTTTTTTAAAGGTATTTGTTTACCTTTAAAATTAGATTTCA:1 - chrX 21387991 3' + INE-1 562 1 47.27 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTGTAATAGTTTTTCCTTAGCTTTAAATGCTCAAATAT:1 - chr3L 7219666 3' + roo 402 1 73.64 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACTAAGCCCCGACATTTTAGCAAATTGTTACACGAATGAT:1 + chr3R 10956253 3' - hobo 33 1 68.42 GACGATGATCACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGTCCGCCATCATAGCAGCTACAAATACTCCAACCACAATGCTTA:1 + chr3L 12821211 3' - Rt1a 4709 1 67.50 CATACGGCTGTGAACTATGGGGAAACGCTTTAAAAACCAACATGTTCAACTACTGGCAAGGGCAGC:1 - chr2R 10987691 3' + Doc2-element 4367 1 65.15 GATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCCTCCCCCTATGACTGTCATTCCCTGCACCACCGCACATGATATTACAAAGACACACATACATACATACGCA:1 + chr3L 17155606 3' + FB 776 3 67.27 AAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 63.64 ACTATGGGGAAACGGTTCAAAAACCAACATTGAAATTATCGCCATTTATCACTATTTGCAATGCAAACTTACATATATATGTACATATATACTGAAACATCAACAAATTA:1 - chr3R 4679969 3' + Doc2-element 4380 1 79.09 GATCTAAACTAAAAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTGGAAACTGGGCAGCCAAGGAGTCGAGAAGAGCACGAATGTTTGTTTGTTTGTACGGC:1 + chr3R 23424831 3' + rover 7211 2 65.98 GCGGAGACGTACGAAAAGTACGCGTTGTTTTGTTGCAATATTCGCATCATGAAATTTTCTCGGCTTTCGGTTCGTGCAGTTTGAATATCAAAATAAATCGTAAACA:1 + chr3L 3828210 3' - Doc2-element 358 1 67.92 CAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCTGTTTTTCTCTTCTTTTTTTTTT:1 + chr2L 14012895 3' - Bari1 188 1 79.27 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATAATTATATTTCTTCCCGAACTCGTGACTGTATAATTTTAGCTATTGGGCTTTTTTT:1 + chr3L 12158531 3' - 297 10 2 66.32 CCATGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAAACCTAGACTGTGCCTTCTGATTGTCTACTTAATTTGTTACTTCTCCCTGTGGAAGGGTATCAGAACTTCGGGCAAG:1 - chr2R 16560613 3' - Doc3-element 4404 1 63.81 TTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTTTATTTTTTAAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 + chr4 1294993 3' - HeT-A 1 1 69.90 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - 412 7098 2 65.74 CACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCTTACGTACTAAAACAAAGACAAAGAAGCTGCCAACGCACTATTTCTCCCTC:1 - chr3L 20518612 3' - Rt1b 5089 1 66.67 TAAATGTTTGGGTGGGGGGGGTGGTTGCATTAACTTAAGGGATTACAACGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGCTTAAGTTTTGCCGTCTT:1 + chr2R 22558809 3' - G-element 4261 1 75.23 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATCCGCCAAATGATTGAAGTGCATTCATTTGAACTTT:1 + chr3L 12064479 3' + roo 359 2 73.39 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAAAAATTATCAATATTTTTCTTAATTTTTTGCAGAATTAAATC:1 - chr3R 11937201 3' + pogo 2068 1 61.90 TAAAAACCTTCATACGTTTACGCCTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACATGTGTGTGTAATGCGTATC:1 - chrX 4262996 3' + Tirant 352 2 73.68 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAG:1 - chr2R 6984342 3' - HMS-Beagle2 35 2 70.93 ACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTTTTCGGTACTTTTAAATGTAAAGTATGTATATCATCTAACCATTGTAACTATAAGCAAAGATGTGTTTAT:1 + chr3R 25635997 3' + I-element 5344 1 61.82 TTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTC:2 + chr3L 15253229 3' - Stalker3T 203 1 59.09 AAAAAAAAAAAGAAGCGAAAAAGGGGGAAACGAGGGGAGTGGTCTGTATCGAATGGAGGG:1 - chrX 6488899 3' + gypsy2 406 1 85.00 AGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGGTATCTGATAGTCGAGTTTTGAGCTCTCTCTTGTTACAGTCGAGATCAAAAAGTAATATTTTCATATATATAT:1 + chr3L 11801931 3' - blood 193 2 75.24 CACTTGTTCTGAAAGCGCTGTATGCGGTTGCGGTTTGAGACGCTGGCAGTGCCCCACAGCAAATTAAACAACTGAAAAATATGGGAAAAATACTTGTTGCCATTACTGCG:1 - chrX 12473678 3' - G-element 3966 1 57.27 TTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTGTACAGTTAGTCTTAACGTGACATTTCTTAAATAAAGACGTTCA:1 - chr2R 3146462 3' + rover 98 2 58.51 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACACACAAGAGAAAAATATTCACTTCACGTGAATT:1 - chr3R 8811181 3' - 1360 49 1 70.00 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCT:1 - chr3R 11474909 3' + hopper 1362 1 71.82 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCCATCGATAAGAAGGCAAAATCCAGTGGCCAAAAACTGGGAAAGACGA:1 - chrX 10300743 3' - 412 8 2 63.29 GAATGCTATAGTCGACTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTTCTCGTTTTAAATGTATTAAAAAAAATCGAAGTATAAAAATCAAA:1 - chr2R 4819977 3' - INE-1 571 1 51.76 TGTGGTGCAGAGTGCGGATCGGACAGGGGATTTGGGTGGACCTAAACGCACG:1 - chr2R 15897943 3' - Chouto 280 1 71.15 TATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAATGCCGGCAAATAAAATATTTTCAAGCGCGTAATTTGTCAGCCTGGCAG:1 - chr3R 17983709 3' + gypsy4 400 1 53.40 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAGATTACTTTTATAAGTGAATTTGTTGCGGTTTTCCGCAACAT:1 - chr3L 17706379 3' + Juan 4174 1 66.36 TGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAAATCGTTCCCTTCGTCTTCCCTACTGATTTATGG:1 - chr2L 14762328 3' + roo 8787 2 77.53 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAGTCTGCAATATAGAATTATCAATCTTGGGGAAG:1 - chrX 15499978 3' - pogo 19 1 56.10 AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACGGTATAACATGTATGTTTAATAAATGAATTCAAGGAGTTATATGCCAGTTTCGATTTCGTTTAGGCATTA:1 + chrX 4789244 3' - opus 5 2 76.15 AGAATGCCAACTCGTTTCAGTCGCACAGTCCTTCCTGCTGTCGCCGCTCGTCTAGTTGTCGTTACACTTCCATGCATGGCATTTCTTTTT:1 - chrX 1496133 3' + pogo 241 1 81.11 CTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCTTTTCCATGTCTGACCTTAGCAAATCCCTTTGCATTCACATG:1 - chr3R 10208190 3' + I-element 4947 1 65.14 AAAATCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCTAAAGCCCCCTTTCCCATAAAAACCGGGGGAAAGAAAACACCACAAGAAACAGAGCA:1 - chrX 7619644 3' + Doc3-element 44 1 52.29 ACAAAAACAATCCTTGAAAATAAAGTGAAAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTTTTGAAGGGAGATGGAAGTGTAGCTTATAAGTTGAGGCGTGAAAAGTGGAGA:1 + chr2R 4015611 3' - transib4 2490 1 65.45 GTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCATTCTGTATACATTAAATGAAAGTTATGCAAAATTGGGAATGTACGTACGTGAGCGGATGTT:1 + chr2L 14868569 3' - Quasimodo 271 2 63.73 AGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCCACAAAGAAGAGCGCAGCACTGCGAGCAGAGGGTAAACTGAAACTTATTTATGAGTTTAGAGAAGCAGAAGATGAA:1 - chrX 19361167 3' + Porto1 4302 1 75.45 GATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCTTATGAGTATTTTTTATTAATAAGCTTGTTAGGTGGCATTTTTCTAAAATGATTGGATGTTTA:1 - chr3R 19446960 3' + roo 421 1 60.91 TTTTCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAACTCTGTAGAATCAGTTTTAAGCTGACATTTCTGAAATAAAGACGTTCACCGAAATTGTTCATG:1 - chr2R 3146447 3' + rover 7133 2 81.00 TGTCCTTAGTCAACTGTCGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATGTATGAAAAACAAAATCACTCCTCTTCGTTAGTCGTCATTT:1 + chr2R 17955548 3' + 297 356 2 68.18 CAAAAAAAAAAACAATTAAATTATATACAAGAACAAGAACAACAACAATCGAACCAACAAGTCGTTCGTCGATGCTTATCGAGTGGGAG:1 - chrX 12156662 3' + transib2 2644 1 62.92 TTGTTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATTATGAAAAAGTGTCAGAAAACACAGAAACGCTGGGTGACAGTGGGAGTGGGTGTGTGG:1 - chr3R 8025794 3' + Tc1 1533 1 78.90 CTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGAACAATATAATTTTTTAAAAATAAATTCATATAACTCAAATA:1 - chr3R 13600627 3' - accord 434 2 62.73 TGGTCGCGGGTAGGAGTGGGGCAAAGTGGGTCTTTCCATTTTACATTTAAATGCCAGAGAATAATTGCTTTTCCC:1 - chr2L 465509 3' + invader1 124 2 64.00 CAGTTTTTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGGCGTAT:1 - chr2R 6537900 3' + roo 9041 1 51.40 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCACCCACACGCGCTTTTCCTTCCACTTCACTTACAATTTGGAACAATTTCTACCACCCTCGC:1 + chr2L 1291121 3' + 412 7524 2 59.63 TTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAGAAAACTCGCTAAAGACGAAGAAATTGTGCGAAATGGC:1 - chr2R 8475908 3' - transib2 2751 1 64.18 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCACTTAAACTCGCCTTATCAGCCGAAATGCTG:1 + chr3L 16496270 3' + P-element 2870 1 59.14 ACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATCTACAACATATACCTGCCACTTTATATATTCTTTTACTTAGCAACAATAGAACATAGAACCAAGAATGCCTTAGCACA:1 - chrX 22000045 3' + gypsy 7441 2 73.64 TGCTCATCTCCCATGCGAATGATACAAAAGCTGCGAAAACAAGCAAGAAATCTAAGGTAGATTGCATCGACTTTGAGATACCCGCAAACCCCGGACAAACAAAAACTAAA:1 + chr3R 21612994 3' - jockey 6 1 76.36 ACTAAAAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTTTATTCATTTCCTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACATTTCGATCGGGATAAAAATCGCATCCCA:1 + chr2L 6040802 3' + Cr1a 4300 1 74.55 ATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTATTTCGTTTTTTGGGTGCATGATTTGTATAATTTTCCTCAAAAGAAAAACTAGATTTTTTGGGATAA:1 + chr3R 12247247 3' - Doc 4500 1 66.36 CAAGAAAAGACAAGAAAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACAAGACGATCGATGTCAATGAATTTGAGATGCATG:1 + chr3L 14147707 3' + Penelope 651 1 33.33 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAA:1 - chr2L 2484383 3' - jockey 4714 1 77.91 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTTGACCATAATTCCATCACCAGATTGAAAAATCAGCTACCACGAAAAAGTCTC:1 + chr3R 19949196 3' + copia 224 1 51.82 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCCAAATAGAAAAAGCCTGTGTGTGTGAAGGAT:1 + chr3L 6899888 3' - hopper 45 1 66.67 CGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCAACCATCCTAACGGATCAAATATTTTTGCTAGCGTTGATAACACAACGCGCTTATTTATATTT:1 - chr3R 19445877 3' - opus 323 2 78.02 CTCAGAATAATTACAAAAGCCGAATGGTACATTATACAAATGACTTAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1 - chr2L 16071771 3' + Porto1 4347 1 53.68 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAATTATAATTAATTACTAAATAATAATTATGAAA:1 - chr3R 14849055 3' + opus 7462 2 73.74 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAATAAAAAAATGCGCATATTGTGCAATTTTATGTAGCACACTTTGAG:1 + chr3R 17927496 3' + jockey 4949 1 66.06 TACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTTGTGTTATATTTTTAATAGTTAGTATAGTTAAAAAATTGAGACACAT:1 - chrX 7590792 3' - 412 289 2 55.10 TCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGAACTTTTTGATGCATTT:1 - chr2L 19129318 3' - FB 18 1 59.18 AATTTTTTTATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACTAAAAAGAAATGAAAAACTTAAGGTTGACTACACTAAATTCATGAATGAATACA:1 + chr3R 19445134 3' - S-element 1623 2 55.45 CACCCAAGAGATTGCAACGATAAATCAAAATAGATGACTTTTGCATACGTGCGACACAACCGCGTCCCTAAAGTGTGTTCACTACAAAGG:1 + chr2R 16375829 3' - BS 61 1 68.89 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGAAATATTGTAAGTGCCACAGAGTCCAATGACTTGACCA:1 + chr2R 9963724 3' - pogo 37 1 64.71 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACACACAAGAGAAAAATATTCACTTCAAGTGAATTCTGGTAGTGTATTTTAATGT:1 - chr3R 8811161 3' - 1360 29 1 54.55 ACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCTTTTGCATTCCATAAACCACAAAGTATGAGTAAGCACTTAACCCTTTCTTTGCACGC:1 - chr3L 3756992 3' + blood 7037 2 62.77 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTCATATATAAAATTCGTGCTG:1 + chr2L 4674761 3' - I-element 44 1 82.42 TTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGCATAAATAGTATGTTTGAATATATAAAATAAGCTTTTTAATTTCCATTCTTGTTATTCTTTTCG:1 - chr3L 15081242 3' - gypsy7 279 1 51.00 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTATGCATGCATTTTGGAATGGTTTTGAGATAAAAGTTGTTTACGAAACCAATTCAAACAAAGAAGCTTATAACGATA:1 + chr3L 8457239 3' + 1360 3380 2 69.09 TAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTAGGCAGCTATGTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCCGGTAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTCACTTTGACC:1 + chr2L 16067185 3' - HMS-Beagle2 6882 1 78.18 TAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATTCTTAACGTTTCGCAGGTAAAATG:1 - chr3R 23722262 3' - Burdock 41 2 77.32 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACACGTTG:1 - chr2R 7981145 3' - 1360 46 1 71.70 GAACTCACAGTTATGTTCCTTGAGTTGGTTTTCCATTTAAATGTTTAGTATTGCAGTGGCAAAAGTTTTGTAAGGGCAAAGTATCCCAACGCAAGTGCGTTTAATTGTTG:1 - chr2R 24062100 3' - Juan 487 1 79.09 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCAG:1 + chr3R 23861135 3' - pogo 52 1 72.73 ATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGCGTGAATTTTTTTTTATTTCACTGCTCTTCAGGCAGACAAGACTTGTTGGCGCTGATTTAATAGCCTATATGCG:1 + chr2R 4137630 3' + HMS-Beagle2 7186 2 70.00 TGTTACTTTAAAACTAAAACTACTTAAACTACTTAAATAAATTCAAAGGTCCCTTGACCTGATTAGGAGAAATGGAAAAAAAAAATAAATAATGCGCCCTTGTAATAAA:1 + chr2L 3180752 3' + TART-B 10199 1 77.98 TTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAAACCAGCCAGAAAAGCAGGAGTAATAAATTTATATACATTCATACGCCCCGTTGTACACGCTCGCCCAAAACATAGAAGACGCCA:1 + chr3L 2758614 3' + gypsy4 470 1 80.00 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTGCGAGCGCTGTGAAACAACAGCAATAATAACAATAATCGTGCCACATTTAGATAGCGCACACAGAGAAAAACGCTTTCAGC:1 - chr2R 21591949 3' - Tirant 8112 2 77.78 TAACCACACACACACACACATATGCATATTCTATGGTATAAAAGGAATAAAGCAAAACAAAAAATGGCAGACAATAAATGACCCAGATTTCTGAT:1 - chr2L 16670113 3' + accord 182 2 85.26 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACACATGCATATTTCTTCTTTTGGTGCCGATTTCAATGCT:1 - chr3L 11085736 3' - S-element 33 2 64.08 AACAACGGGTCAGACGCCGACATCCGCCCAATGCCACACACCTGACTTCCCTATTGATTTCGATGCAGACATCCGGCGGATGTGGTAA:1 + chr2R 20681079 3' + ZAM 115 2 56.82 ACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTGAAAACGCAACGTCTTCATCTGCCTCTGCCCTGTTTACCGGAGGTGATACGGCCGGG:1 + chr4 366573 3' - INE-1 12 1 66.67 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGTACAGTATCTTATCAGGGGAAAAACATTTACAGTCTTCATACATCTACCAATTCACTCATATATAATATGCC:1 + chr3R 19996659 3' + copia 241 1 61.82 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACACAGACCAAATGCCCCATAGTGCCATGGCAATGCAGTCGAGTGTGAGTGCGAGTGTTACATGTATATG:1 - chr3R 11315216 3' - hopper 25 1 52.69 TTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAGACCTTGAATCGAAACATTTGCCAAAATAGGCCAACCTTCGATTTGAAAC:1 - chr3L 15525618 3' + Ivk 5346 1 53.64 AGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAGTACAAACAAAGTAGAGTAGTAGAGTAACAACCATGGTTCTGAAGAGACTAT:1 - chr3R 16241814 3' + hopper2 1301 1 58.51 ATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTTCAGAACGTTACATTATTACTTGTAGAACAAAGATGTACGTTTCCTTCA:1 - chr3R 6263271 3' + diver 214 1 72.48 AATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAGATAAAAATAGCACCGTGGATTCCGCGGAACTTCGGGGG:1 - chr3L 3590335 3' + mdg3 5020 1 64.55 TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGTGAGTTGGTGTGCCAGGGACATAGCAAAAGAGGGCACAATGGCG:1 - chrX 22745166 3' - jockey 4780 1 48.86 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCATCGAAAGCAGCTTACAAAATGTATAGCACACTTTTTGG:1 - chr2L 6311253 3' - hopper 43 1 62.73 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATGCAGTTCTCCTCTCATTAAGGATCTCCGGC:1 - chr2R 20924193 3' + mdg1 401 2 64.55 TTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCAGTTTCCACTCATCCAGAAGCTTAGTTTAGCCTTTTCCTACCATTTTCTAGTCG:1 - chrX 14705650 3' + 1360 147 1 54.13 TATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTGTTTTTTTAACTTTGCTGGCTTTAAGAGCTCCTACCGTTTGATAAAAGCTAAAGTGGTAAACACGTCGACACGACAAATTGATG:1 - chrX 9407590 3' - G7 1146 1 61.82 GTGCTTGGTGAAAAATGAAACTTTCCATGCACGTAGTAAGCATATAGATATCAAAGGAGGACAGCAAGATGCTGGCTCCCCCACTAAAAAATGCTATAA:1 + chrX 9494759 3' + Dm88 4087 1 54.55 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTAGGTTTTTACGATTTTAATTATTGCTTGCTTTGGGTTTTTTCCATTATGTGACAGTTGTACTTTT:1 + chr3R 2275675 3' + opus 7496 2 73.74 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATTAACATATCCATTCTATACCCACAACTCCCCAACAACACACACTATCGTAAA:1 + chr2R 4189090 3' + S-element 1707 1 64.84 AGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATATTATCTGAGATATTATGCTTATTTATTTACAAAAATG:1 + chr2L 9464146 3' - 1360 228 1 67.27 TTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAATTTTGTTACTGGATGGGAATGGAT:1 + chr2L 14296366 3' - copia 174 2 74.73 AAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTAT:1 + chr2R 5674739 3' + S-element 1691 1 60.58 ATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATGATATCGTAAGTTTGTAAGTTAATGTTTAATTTGTGAATAAA:1 - chr2L 14337667 3' + F-element 4340 1 61.82 AAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGACAAAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGTACGAACAATAAACCGAACAGCC:1 - chr3R 25571219 3' - Cr1a 245 1 50.00 ACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + I-element 108 1 69.09 CTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTCCGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTGTGTTTGGGTTAAAAATTAGTTACACTCGTG:1 - chr3R 29735310 3' - Stalker2 7395 6 71.82 TCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACTTATTACTTATTACAACACATTGACCAGACAGTGACCCAAAATACTTCAGCCG:1 - chr3R 8570370 3' + Stalker2 7631 2 45.54 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACGGTGCTTCATCCACC:1 + chr3L 22108154 3' - Transpac 4970 2 70.00 CATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCATAGGTTTGAATTTGCAAAATGTACCGCAAGCAGTGGCGCAACTG:1 + chr2L 12962381 3' - Bari1 169 1 77.06 GGGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTCATTTATATGGCAATTGTCGCAGCTCGAAATACGAGTATTTGATTAAATTATGAATTTTTATTTGCTTGGGATTTGTTGCATATGTG:1 + chr3R 18556936 3' + BS 5006 1 70.91 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGGTAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAACCGGCGTCGCAGCAGCATTAGCAATAGCAGCAA:1 + chrX 9578845 3' + Stalker3T 201 1 61.82 TCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAAGAAGGAATAAAAAAAAGAATTAAATACTGTTTATAACACTCTATAAATGGCA:1 + chr2L 14196818 3' - copia 5032 2 64.55 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATTTAATTGTTTAAATTGAATTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 22720591 3' - F-element 25 1 63.38 TATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAAACATGTACAATGGCAG:1 + chr2R 16476431 3' - X-element 10 1 62.32 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATACACTAGTGAGGTGGACTAAGGAATTATTCGAAGCTACCTTT:1 + chr2L 14708931 3' - opus 7025 2 53.33 CTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAATTAATAATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATACATATATATTTTTATGTATATCTCCT:1 - chrY 361725 3' + flea 200 2 78.90 ATGCGTAACGGCCATACGTTGGTTTGGCACTGTGCATCCACTTTTTCGGCGCGTGTTCGTGTTGTGCAAATCACACGATAACAACAAAGGGAACA:1 + chr3R 12548839 3' - 1360 3367 1 54.74 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCCAAACTGTAAAAATATATGCACAACGTAAAAAATTAAAAAT:1 - chr3R 23653395 3' + pogo 2073 1 60.82 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAACCTACTCTACATACACATACCCACGCACACACACGCACAAGGTAGAGATGAGTAGTTGCTGGTG:1 - chrX 9642328 3' + S-element 1715 2 76.09 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTCTATTTCGGGTGTTTTGGGAATGTGTTAAATTACATACATACACATGTAT:1 + chrX 900504 3' - Burdock 6169 2 78.08 CGGTCGCTTGCGATCTACAAAACTAAAGAAAATGCCAAACTCATCAAATTTTTATGCTGCGGGTTTAGCAAACTTCAGGTCCCCATTTTCAGCGCGACTCAAAAAAATTG:1 - chr2L 5935121 3' + HMS-Beagle2 7165 2 79.09 TTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACACGTTTACCATGCACTGTACAAAAATTTTGCAGGGCATAGTTTCCCATTCCGCAAAATCATTGAACTTC:1 - chr3L 17608782 3' + Doc2-element 383 1 57.41 TATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATTTTCACACAAAGACAAG:1 + chr3R 20119595 3' - rover 15 2 73.85 CGCACACAAAATTGTAGGGCGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCGTTGCAGTTCTCTGGTTTTTATTACAAACTTTTTAAAAATGAGCTATATGTT:1 - chr3R 26734007 3' - hobo 41 1 59.00 GTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATATTTACATATTTTTATCTATTTCTAAAAATATATGGCAG:1 + chr3L 271992 3' - invader1 41 2 80.56 AGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCACTTTTGGCACTCGTCTTGCGGTCTAGCGCACATGTGTTCAAATTTT:1 + chr3R 12252853 3' + blood 430 1 55.24 CTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACTTTCTTCGTTTTAAAATGGATTTTGAAGTGTACTATGACTTTTATCGGATGCGG:1 + chr2L 8279953 3' + Doc 4244 1 63.83 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTACCTAACTAAACTCAATTCAGTTTGCAATTGAGAATCATTGAAAAAAATTGAAAATAAGTTGTTT:1 - chrX 8518920 3' + S-element 1699 1 62.96 GCGTAATATACCTCCCCCAGGGAAACCCCAAAATCCACCATAACCAGAAACAAATATAAACTCAGATTAGGGGAAAAAACACAGGTCTATATAAA:1 - chr3R 31734905 3' - Transib5 2682 1 64.21 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCACCCACACGCGCTTTTCCTTCCACTTCACTTACAATTTGGAACAATTTCTACCACCCTCGCATAGCGAGAAC:1 + chr2L 1291132 3' + 412 7540 2 72.12 TAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATTCCTTACTTTTGCCTCCATCACAAACAGTTGAGAATTCCTCCTAA:1 - chr2L 9660264 3' - I-element 5100 1 59.09 CGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATACTTATTACAGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' + Stalker2 7609 2 66.29 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCA:1 - chr2R 9963502 3' - pogo 28 1 65.48 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATGCCACGGGGCGCAGTAGATGTTGC:1 - chr2R 6707676 3' - 1360 20 1 60.95 TAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTTGGTGGATGTGGTGGAATTGGTCTGGGCTGAGGAAGGCTGCAGCA:1 - chr3R 26454865 3' - 297 6512 1 61.11 TAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTCTCCCTTGTCTATAAGCGTATTTAGGTTTGAGGCTGGAGATTTTCAGTATGATGATGATGAG:1 + chr2L 6718181 3' + INE-1 566 1 61.36 AGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGACACTGCACCCCACACACTTTTTGCGACCCAACTTATGCCC:1 + chr3R 9109830 3' + Doc 463 1 67.27 TGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGCATTTCCAAGTAAGCTTTATTCCAGGTTTAATACGTACATTATTGC:1 + chr3L 20897059 3' + Tabor 7286 2 58.18 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACACCATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCG:1 - chr2L 13710678 3' + copia 5086 2 62.50 GTTTCGCAACATCGGCTCAGTAGCAACAAGCATAGAGGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAATCAATACGTCGTGGCAAAAATTTGCATATAAAGTACGCGCT:1 - chr2R 6842313 3' + invader2 4958 2 62.73 ATATTTTTATATTTATATTTATACTTCTGCAACTGTAAGTTATCAGATATTGATAAGCAATATAGTAAAAAAAATATATTAATTTTAGCTTCATTAAAACTAAAAGCTCA:1 + chr3L 19514593 3' - Stalker4 7043 4 67.27 TAAAGGTTTTTTAAAGGGTGTGCAGTCCAAGGTGACTCCACGTCCATTCAGGCAGTAGTAGTACGCATCCTGACGCTTCTGGTGGG:1 - chr3L 13438845 3' - FB 390 1 82.56 AATAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACAAATTTATCTTAAAACGAACTTATTTTTCCGACTTCTTCTTTTTTTTATGAATAATACATTCCT:1 + chr2R 7514079 3' + Tc3 308 1 73.68 TAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAGNATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr2R 5064833 3' + Stalker3T 202 1 79.41 CGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTTCGCATTTATGCTGAGTCACCTGTACTTTGGATGGGTTACTTCTCTTGTTTAC:1 + chr3L 1910575 3' - Porto1 4482 1 54.55 TTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTGTGTAAGTTTTTTGCTCTTCGGTTTTGTTTTCTTTTGTATTTTTGTGTAATTTTTCGTCGTTAGCCTAA:1 + chr2L 7601606 3' - Doc 4495 1 67.27 CCAGCAAAGTTAAAAAAAATACATTTTGTGTGTTGAAATGCATCAGGCGGCGACACACTCACCAGCAACAGCAGCAACAACAC:1 - chrX 2052503 3' + TAHRE 10436 1 40.96 TGTTGCAGTGCGACTTTTGAGTAATGTCAGCATTCAAGCCTGAATACTCCATTGACCTTTGGTTTTTCTCAGTGTGCCAGAGAGCGCTTGTAC:1 - chr2R 8060896 3' - Tirant 8234 2 68.82 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGGCGTATTAGCTGGACGCTACAGAAGTG:1 - chr2R 6537879 3' + roo 9063 1 71.70 AAAAAAAGTAAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCCTCAGGAGAATCGCACTCTGAGCTCAGCCACGCCCACTTGATATCCTAA:1 + chr2L 17212380 3' + Doc2-element 4534 1 59.14 TTCTAATGAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTACTTAATAAACAAATTTTCTCATAAAATTACGTC:1 + chr3L 18280552 3' + 17.6 7090 2 64.95 CCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCACACTCCCTTCCCAACATGTCTCTCTATTCCATATGAATGAAACTGCAGCCGAGATGTGCCATAGCAAACCAT:1 + chr2L 12824563 3' + Idefix 7052 2 63.64 CACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGGGTAAAAGAGCTCAGTATGTCCATAAAACATTTTCTGCTGTGTGTG:1 - chr3L 10733794 3' + roo 8819 2 57.41 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATTAGTCCAGCTATGTCAAATATTTACATATGTCTCCTCCGATTCG:1 + chr2L 5338030 3' - F-element 28 1 51.69 TAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGCGCCTCCTGCTATCTCCCTGCTAATTGGGATGAG:1 - chr2L 6555313 3' + invader1 101 2 58.75 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAAATTGGCTTTCGCAAATTTCCATTATGCACTTATTTCATTT:1 - chr3L 13160650 3' - pogo 31 1 62.38 CGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGCCTCTTTAAATTTCTTCATTTGCCTTTCGGTCCGTGTGCAAGATCAAGTTTTTTGTCTGTTCCTCGTCTGACTCCTGC:1 + chr3L 13327228 3' - F-element 4403 1 69.23 CACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTGTCGTGCATTGCGTGCGAGAAAACGCATTTGCATTGGCCTGGGAAATGCGG:1 + chr2L 17793510 3' + 1360 3232 1 53.21 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAGTCAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACACGAAAACTTTTATTGTTTTCTTAAAGCCA:1 + chr2R 8530830 3' + mdg1 7428 2 50.91 TTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATCCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAAATAATAATAAACACAAGGATAAGGAAACCTTTATTGGCACATCGACAGCAAAT:1 - chr2L 12202064 3' + F-element 4639 1 65.45 ACAAAGGCTATCCAACCAAGTATTAGGCCCGAATTAACATATTAAAAAGAAAAAAAAATGTGGGAATACCTCAAAAAA:1 + chr3L 12254753 3' + HB 1325 1 69.23 AATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTCGTTCAATCTATCGTTCGCTTTAAGGTATAATACTTAGTTAATTT:1 + chr3R 21784399 3' + Circe 7001 1 57.94 CCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAAATCAACAAAAACTGCTTTCCCAGCAACGATTCTAGCACA:1 - chr2R 5641017 3' + 412 7218 2 58.51 TTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACGCATGAACACTCCGGCTGCAGTATGCGGCG:1 - chr2R 15693499 3' - HMS-Beagle2 6935 2 72.22 GTTTATGTGTGGTGACGATATAATATAATGGCTAAAGCGGTGACCGTAGCTAGCACATTTCGTACTAATTTTGCGATTATTTTCCCT:1 + chrX 22354453 3' - gypsy7 5170 1 56.32 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATATGCCATGGTTATATCCTTGCAAAGGCTGTTATCATCTTAGTTATTTGTTTACGATCAAA:1 + chr2L 15988788 3' - 412 25 2 56.36 AATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTTTGCACTCGTACGAAGACAAGCACTTGGTAAATGGGTCGTTGCTCGTCCGTTAGAGCAGCATTAAA:1 - chr3R 13254761 3' + Circe 7122 1 74.00 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTCCTTCCCTTACCAAATGAACTGGCAGCAG:1 - chr3R 29345636 3' - roo 8669 2 51.67 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAGAGAGAAG:1 - chrX 4617441 3' + Stalker3T 205 1 64.71 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAACTC:1 + chr3L 10606484 3' + Transpac 292 2 62.50 TACATACATACATACTACATACATAGTTGGAGTCGCCCTAAACTAGTTATCGCTCAAGCGATATCCCCCACCGCCTCAT:1 - chr3L 9983805 3' - Dm88 13 2 54.43 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTTTGACCATAATTCCATCACCAGATTGAAAAATCAGCT:1 + chr3R 19949180 3' + copia 208 2 68.18 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAAAGACAAATGAAGATGGTTTTATTCTATAGAG:1 + chr3R 1313771 3' - Doc 19 1 60.87 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGTGAAAAATTGGAGGCCATATTTGTACATATACACACA:1 - chr3R 11526756 3' + pogo 2086 1 60.00 TTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTTTCCCAGCCCTTACCTCTCCCCTTTCCCCCT:1 - chr3L 17224251 3' + mdg3 5279 2 71.82 CTCTAATGACAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATATTATTATATATATTATATTACATATTATTATATACTTACGTAGTTATTAAT:1 + chr2R 3146331 3' - 1360 397 1 57.27 ACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCAGCCGCCGACATCTCGTCCAAAAGAGGACGTAAAACACCCGGGGACATTAGTAGGG:1 - chr3L 8111936 3' + ZAM 8055 2 58.43 GTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCTGTTTGTGCTCCATTGGATCGTTATTCTCTGGGGATTCTCCAACAT:1 + chr3R 14051938 3' - 1360 3236 1 58.10 AATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCATACTGTATGCCACACGCTGCATGCAATCGAAACACCGAAAAGCGCACTGACTACAAAA:1 + chr2L 9632058 3' + 17.6 98 2 58.18 TTTGTGTTCTTAATTTTACTTTGAATTTTTTGTTAATTTGTTTTGTCTATTTGGTGTTTAGTTTTTTTTTTCGGAACGTGAGATAGCTTTTGGGTTGCGTTGTTTGG:1 - chr3L 12106886 3' - Tabor 465 2 60.75 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTGGTTATTTCTTCTAATTTATAAGTTCTCTTGTCTTTTTCAAAAAATGTCCTTCTTATGAACGTG:1 - chr2L 22689858 3' - mdg1 7060 2 50.00 TCGCAAGAAAACTAATCCGAGAACGCCGGAGCCAAGATACACATACATCAGCGGCTCAGGTACACTGCGGCTGAGCTTGGCTAATTTAAA:1 + chr2R 7756135 3' + Doc 4506 1 77.78 GTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAGGACTCTGTCTTGCCACAGATTTGCGCAGTACTCACGCGAGTTAAATGACCGCTTATT:1 - chr3R 3319628 3' + 1360 3377 2 59.57 GTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGTGCGACTGACAGGCTCTGTTCCCAGGCGGCAA:1 - chr3R 10837912 3' - hobo 201 1 58.97 TATTAAATCCCTGAATCACAATATTTAAAGACTCCAAATATTGTCCGGGCAAATGGTTAAGGCGAAAAGGTTTGCTGATTAATACGCAGTGACAGCAAGTCAGGCTAAA:1 - chr3R 17632628 3' - Dm88 273 1 68.81 TGGAACTACAATGATTTAAGATTAGGGGTAGTAGTTTCTAGTGAATCTGCTGGGAACAGAGAAGTTTAGCCGAGTTTTGAAACACTGGTAATCAAGATTATCTTAAAAAT:1 + chr3R 4484569 3' - Cr1a 4145 1 70.00 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - copia 4898 2 55.88 TACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAGCACAACACGGCACAACACAGCACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Tabor 7264 2 54.55 TGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTATATGTGCATTTGTATAGCCTGGCGTACGTGGACATCTATACTTTGGA:1 - chrX 4712450 3' - Quasimodo 30 2 67.27 CTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGAAGTTCCGGGTAAGCAAGCGGCTTAACTCATTGTTGCCGGTCATTCTCCATGTGGTT:1 + chr3R 31862072 3' + Rt1b 4884 1 76.19 TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCCCGCCACCACAACATCATTCGCTAC:1 - chr3R 23761798 3' - transib2 78 1 74.23 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGGTTGGTTGTTTCTTTTGTAGCCACGAAGTACTGTATTATATTTATAAACGTTCTGCTTGGCTGCCGCAGGCCGCC:1 + chr3R 14743224 3' - FB 4 1 63.73 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTGTCTGCTGCGCTTACATACATACTACAATACATACATGTTTTCCCCATACGGGTGGTCATTTAGC:1 - chr2R 23230566 3' - 412 5 2 72.34 GTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTTGTCGCCCAGCCGTGCTGGCATGCCACATGCCACACTATA:1 + chrX 3110286 3' - hobo 480 1 60.00 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTTTGCCGACTAGGGTGTCCAACCCAGAG:1 - chr2L 14141291 3' + hopper 1359 1 74.55 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATAAATATGTCATTGTTACGATTCAAAACATTTCTTTTGAAAACTTAAA:1 - chr2R 14883980 3' + mdg3 222 2 54.26 ATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACATTATTGAAAGCAACTTGCAGCAAAGTGAAAGATGCAAAAAAGACACAAAAAACTGTTGACGATGGAAAATATAAACA:1 - chr2R 13923851 3' - hopper 220 1 69.09 TCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAGATATGAATGAAATATGAAAAGA:1 - chrX 23282939 3' + HMS-Beagle 7027 2 63.64 ACTTCTGGTGGAAGAGGTAGTCGATTCTGTTTTCGAATGCGTCCCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGACAGCGGGGCCTAATGTGTTGTCAT:1 + chr2L 1552402 3' + hopper 298 1 74.74 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGAACTGAAAACATATATAATTTTGTTTTTAC:1 - chr3L 18743408 3' - pogo 52 1 77.06 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAATATATCACAACAAATAAATCTACCGCTTTA:1 - chrX 22593614 3' - I-element 52 1 73.33 TATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTGTCTTATCCTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTTCT:1 + chr2L 5352057 3' - Stalker3T 202 1 73.74 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAAAATACTTCA:1 + chr3L 9822288 3' - pogo 52 1 76.36 CTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTCAAATTCTTGGCCCAACTAATGACTTCATTTTTTGTTGTTTTTTTTTCACAAGGTGAATTGGACGAATCTCAAATATTT:1 - chr3L 13236131 3' - Dm88 4247 1 65.45 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGCATTATCTTCGAGATTATACACCAGCTGGTTAATCA:1 - chr3L 7400745 3' + roo 9024 2 67.27 GAATACTTTTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCAAGAATCTTCAA:1 + chrX 14853420 3' + P-element 2818 1 18.18 TTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGTATTTAAATGTCATTCAGTACTTTTTGACTTCTGTGCTAATTAGGTTAATTGGATGTCT:1 + chr3R 23647581 3' - TAHRE 10372 2 57.27 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAAAAACCAATGAAAACTCCTCTCAGAAAAGAAGAAAAA:1 + chr2L 4016941 3' + opus 495 2 73.74 CTCTGAGCAAGAAATTTTTAGTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTTTTGGTGAGTCAAGCACAGGCGCCAAATGTTTTGCCTATTTAAAAGTTAATAAAATCATATTATC:1 + chr3L 20548492 3' + Tc1 124 1 63.64 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTACTTTTGTTCCTACTTGATTTTTATGCTCTGTTTCAATTCACCCG:1 - chr3R 15524401 3' - pogo 37 1 61.82 AAAAAATTTAACAATTTATCACTTGTTGCTTCATCTTTAAATGAAATCAACTAGGCTCTCTCCAAAAAAAAGAAAATACATACTGAAATGTGTGTAAAAATTCCTATTTC:1 + chr3L 16988291 3' + NOF 4124 2 62.73 GTTCGCATTCATACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGGTGTTCGACTATAGCATTATTTCAAGACTAAAAATGTATTGCATTATATTACAAGTAGAGCAATTT:1 + chr2R 10426600 3' + INE-1 530 1 71.82 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGCCATCAGAGTTTAATTCCATAAAACGCAGGGTGAAAAAACTTCTTTGTCCATTCTCATTAAAGTCAATCCGTC:1 - chr2L 21208962 3' - diver 5 2 72.28 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - 412 11 2 45.12 ATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTGCACACACACACACACACAGACACACGCATATTGACATTGATAGTATGGGTGGAGGAGGATTTTCTCTCCCTA:1 - chrX 12861792 3' + Quasimodo 7 2 61.82 CATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGAATAATGTCATACAAATGCATCAATCACATGGGACATG:1 - chr3L 8857524 3' - roo 8972 2 64.81 ATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTTGTTTCCAAGTAGATTCACGAGAATCTTAAATCTTCTTTTCTCTATCGTTCCTCGTCTCTTTTTTGGTTTT:1 - chr3R 15400574 3' + Cr1a 4068 1 65.45 TAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACTCAAGGTTCGTAGGCTCACTAATTGCGTAGCATACTTTCCGGGGCTTTTAAAACGACTATTCGCAAG:1 + chr3R 13339048 3' + Doc 4449 1 69.09 AATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTATTCTATTTGTACCAATCGCCTAAGAT:1 - chr3L 4192696 3' - hopper 985 2 75.23 AGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTTGCCATTCACATATCATATAACACATATGTGGTGTTATATCGACTCACAAAGCAGCTGGTCACACTGCTTGAAC:1 + chr3R 8344409 3' - Bari1 1703 1 74.55 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGAAAGCAGATATAATTTTGTTCATATTTTATAATTTTATTAATGAGATAAATGTGAGAATCATAGAGCAGAAACT:1 + chrX 15170052 3' - I-element 13 1 63.64 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGACGAATAGACCAACTGCCGTTGTGTTTCTTTCTTTTCTTTTTGCCCT:1 + chr3L 21103481 3' - Doc 25 1 58.33 AAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAATTATTACACATAACGATGGAGATCATCATAGTAAAGGAACTATGAATGGGGTAACAAA:1 - chr3R 4554293 3' + Bari1 1706 1 70.11 GACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTAGCATATATGTAGATGGCAGAGAGCGAGAGAAGAAAGTAAGCCACACAAAAGCAGATA:1 - chrX 5394757 3' + Dm88 4339 1 69.15 TCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCAGTGCTGCGAGCGAACTTTCCGTGGACCAAAAGTGAAA:1 + chr2R 12780638 3' - flea 4934 1 68.93 AATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACATTTTGTACTTCTCTCCGCTATTTTTTGTGGTTTTTGCTTTTGA:1 + chrX 8519017 3' + S-element 1692 1 57.29 CGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGTCAACAAAGTAACTGGAATTCGAAAATCACTGCTGTAGCAGGTCGATATATTCTGACC:1 + chr4 580879 3' + Doc 4467 1 58.65 CAGGAGGAAAAGTTTGAGAATTTTGTTGCATGCGATTAATTCGGATCTATAGGCCAATAAACTGTGAGTGCTTAAGTGTGCTACTGCTGCTGCA:1 + chr2R 13269278 3' - Gypsy12A_LTR 2013 1 77.66 ATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAATAACATCGAATAACATTAAATAACATAGAACAACATAGAATAACATAGAATAGCATAGAATAATATAGAATAAGATACAA:1 - 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chr3R 11553667 3' + hopper 1375 1 65.35 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAATAAACATTTCAAGCTAT:1 + chr3L 18505774 3' - jockey 14 1 75.45 TAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGCTACATCTTAAGGCAAATACTTTTGCTTCCTTATCACTGTTCTTA:1 + chr2L 5304952 3' + flea 256 1 79.44 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTGTAATAGTTTTTCCTTAGCTTTAAATGCTCAAATATTCTC:1 - chr3L 7219662 3' + roo 406 1 77.27 TGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAAACACACACACACACACACACCCCCCTGCACCAAAAAGGAATGTTCA:1 + chr3L 21498667 3' + Rt1a 5015 1 57.80 GAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAATGACAACGTGCAGCGTTTGGCACATGTATTCCATTCTGCCCATCCTGAAGAACTTTAATTTTACGAACTTG:1 - chr2L 11647976 3' - Cr1a 4234 1 73.64 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCCGACCAGTATACCCGAGGCCAATGGCTCCAA:1 - chr3R 6132066 3' - I-element 9 1 53.12 GGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAAATGCTGCTCCCAGGCGTCGACAAATCATCGCGACTGGATGAGGATCCGGTGCGGCC:1 - chrX 134431 3' - FB 371 1 65.96 GCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAG:1 - chr2L 13292944 3' + X-element 4711 1 71.11 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACACATATTCAATAAATAAATAAATAAAATTTATGGCA:1 - chr3L 12640761 3' - F-element 19 1 47.14 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATACAAAAGCTGCGAAAACAAGCAAGAAATCTAAGGTAGATTGCATCGACTTTGAGATACCCGCAAACCCCGGACAAACA:1 + chr3R 21612985 3' - jockey 13 1 74.07 CGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTACATTTACTGGAAACTATATACCCCTTATTTTCATTTGAATTTTTTCATTTACAGTTTTGCCACATTTCGTAGTGATCCTTGACAT:1 - chr3L 7696434 3' + Cr1a 4094 1 56.36 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGTGCTGACTTACTTTCTGGGCTGCCCATTGCAAATTGGGTACAAAAATGCT:1 - chr2R 24031436 3' + 1360 3380 2 76.36 GTTGTCGCGGAACGCGAGTGTCGTTCTGGCTCATGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 16738182 3' - Doc2-element 294 1 93.33 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCTGCCCCTTTTTGTTATTATTTCGTTTATTTTCTTTGCCTTCGATATTTAAGCTAGCTGTTTTTAC:1 + chrX 12722071 3' - 412 7074 2 61.47 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGTCAGCCACCAAGCACCAGTTGGTAA:2 + chr2L 9754896 3' - 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chr3L 126250 3' - pogo 34 1 55.45 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGACATATATACAGGCACCTATAGCCGACCGATATCGGCG:1 + chr3L 17530203 3' - Tirant 4 2 65.67 CTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAAATTGAGTTTGGCCGAA:1 - chr2R 22774985 3' - jockey 4725 1 95.45 CATACAAATAAAACTTGTCATTAAGACAATAGCAGAGACGAATATATAAGAAATAGGGAAGATTACGGGAATTAAAGCCATAAACGGGTACGTTACAG:1 - chr2R 4634591 3' + Doc3-element 4455 1 56.12 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCTTTAATGGTCTTGTCTAGTAGCTTCTAGTAGCGGGT:1 - chr3L 25414183 3' + blood 7387 2 59.38 CGAAGGGCAGGTATCGTAGCTACACCGCACTTCGATTAACGCTTTTTGTTGTTGGCCTTTTGCCCACACCGCCCTCCTTCACGCCCGTCA:1 + chr3L 17428678 3' - BS 174 1 63.33 TCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGCGTGTAAATAAACAAGGTAGGTAATAATAAATAGAATTTCAACATCAATG:1 + chr3R 16799796 3' - X-element 4642 1 47.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATTTTTCCTGGCATACAAAACTAAATTAGTGAGAAAATTATTT:1 - chr3L 5971674 3' + pogo 2074 1 61.22 CTCTCGTTTTCTATTTTTATCAATAGTTCGTTGGTTTTTAATAAAAGCCCAAACGTTTTCAATGATATTAAGTTCTGGGCTTTTAGTTGCCTGCGAAATCAGCTTTT:1 + chr3R 27686612 3' - Bari1 1248 1 75.70 CGGAATGAAGAGGCCGATCCTGGTGTCTGGCCGGCCAGGTATACCTGGGGGGGGGAGAATGTTCACGCAAGAAGGGCGCAAA:1 + chr2R 4253306 3' + Max-element 8166 1 48.78 CTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAGCACGAAATGTGCTTATGGGCTTGCAATTTAAGGTGTTCAAAACCATTACGTACTCCTTG:1 - chr2L 20697589 3' + Tc1 1573 1 62.73 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAGCTGCTGTTGTTATGGCAACAAGGG:1 - chr2L 15492129 3' - Tirant 19 2 71.01 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATTAGTCCAGCTATGTCAAATATTTACATA:1 + chr2L 5338014 3' - F-element 43 1 65.91 ATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCATCAGGCAACACCTGGATCTTTCGCTCCGTCTCCTCCACAG:1 - chr3L 23523318 3' - blood 7377 2 65.22 ACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAACAAATTTTCACTCTTTAGAATGTATACTGTAGCTCAATA:1 + chr3L 8029644 3' + 1360 188 1 63.21 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCTGCATATGTGGCGCCTGAAGT:1 - chr2R 13648596 3' - hopper 45 1 76.84 ACATTGTTGCAAAAGCGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Tabor 6902 2 76.15 TACCATGGAGCTCCAGTAATGATTCCGACGTCCAAGACTGTTGTTTGTCGGCTGTCTTGGGATTTTGCCGGACTGAA:1 - chr3R 16664831 3' - Doc3-element 4406 1 72.73 CCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAACAATCC:1 - chr2L 23506318 3' + Max-element 8360 1 51.56 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAACTTTACGTCGAACTATGAGTCGTTAGGCATTTATTG:1 + chr2L 17123307 3' - roo 8713 2 67.27 GCTCATCTCCCATGCGAATGATACAAAAGCTGCGAAAACAAGCAAGAAATCTAAGGTAGATTGCATCGACTTTGAGATACCCGCAAACCCCGGACAAACA:1 + chr3R 21612985 3' - jockey 5 1 80.00 TGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTTTTTTTAACTTTGCTGGAGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 6051 2 85.19 TGTTTTCCATGACAACACTTTAAACTTTTTTAATTCTCTGAGGAAATATAAACCACAAATGTTGCACCAACAGTTTTCCAGCAGTGGAACGATATTTACACGCAAAATTA:1 - chr3L 5237816 3' - transib1 258 1 60.00 CTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGG:1 - chr2L 13292975 3' + X-element 4660 1 70.91 TCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCTTATTTGTTAATCGCTTAATTTATGATCAAATGCGACAGTAAAATTAAAATATCACAAACAGATACA:1 - chr2L 21916022 3' - F-element 4375 1 74.53 GGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGCGATTTGCAATGTATTATCTCGGCTTACTTTAATTGC:1 - chr2R 8500502 3' - G6 1742 1 51.61 GTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTCTGGTTCGCTTTTGTGGTTTAAATATGTTGGCATTTATCTATATAATTGAAGCATTTTTG:1 - chr2L 13420579 3' - TAHRE 10415 1 60.91 TTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTATAGTTTTCTCTGTGTGTCGGG:1 - chrX 457855 3' - Bica 438 1 77.17 TGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGCTGGGCCTGATGCTGCTGGTGGTAATCAAAGTACATGAAGCCCTATGAAGAG:1 - chrX 1643756 3' - 297 6509 1 62.37 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTAATTTCTCTTGGTCTGGCATTTTTGTGAACTTTTTGATTTG:1 + chr3R 22979405 3' + Juan 4190 1 57.89 AACAAAACACAAAAATCACGATCAAAGTAAAAAAAATGACAAAAATTAAACAAATAAAATGAATATATAAAATATTGATACAAACTTTGTAAACTTAACTAGTTTTATT:1 - chr3R 11269497 3' - pogo 294 1 77.06 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACATGAGCCATAAATTTATCTCCAGAATGTGCATCGGAT:1 - chr3R 7874831 3' - jockey 4683 1 53.25 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGCGGCAGG:1 + chr2R 13699499 3' - jockey 4777 1 64.55 CTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGACACAATCACGGAGGGCACAATCACGGGGGACACAACCAC:1 + chr3R 17029977 3' + Rt1b 4993 1 52.94 ATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAATCCGTTAGAAGTACAAAAAGGGGCTTCGACAACGCTGAAACATAACCGAAAATGGAAGAAT:1 - chr2L 15062068 3' + I-element 357 1 60.00 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGCATGCCGGAATGTCAACGAATGACAAAGGAACACATTTCGTT:1 - chr3R 5219240 3' - Doc 29 1 67.09 TCTGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAAAAAAAACGAGCAAAAATCAAAACCACTAACCACTCCAATAATATA:1 + chrX 15483105 3' + Doc2-element 125 1 59.22 TGTGCTTCTAGACCGACCGAGGTGGAGAATCCACTGCCCCCCACATCCTCC:1 - chr3R 19923884 3' - Copia1_DM 146 1 68.63 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATAAATATGAACCAACTCACCAACCAACTCTCTTATTTAATGTCTCATTCTTATAATCACATAACACGCCCAA:1 - chr3R 25163095 3' - mdg1 7049 2 69.81 AGAACGCTATAGTCGAATTTCCCAAATTTCAGATACCCGTTGCTTAGCTAGTTGAAGTGCAAATTCCTTTCAGCTTGTTATATAAATTCTCAATGACCTCCTTCTCCATC:1 + chr3R 6298209 3' - INE-1 572 1 57.27 AAAGTTGTGATTTTACTCAAGAATGTAAATAAAAAAGTAAAGTAAATAAAAAAGTATCAAAAATAAAAGAAAATCATTTAAGGTGGAATTACACTTTTCCGACTTGAGGG:1 - 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Tc1 108 1 67.27 TCAATAGTTTCGATAATATAGATTAAAGCAACATAAAAGGCAGAAATTCTGGTGTTCAATGAAATAGCAGAGTACACTTAAAACAAATTCTTGGGCCATGTTGCAGATA:1 - chr3R 20711928 3' - HB 1476 1 64.22 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTTACTTTG:1 - chr3R 25702207 3' + Tirant 8494 2 67.24 GCAAACGGTTGATCGAAAGGGAAAAGCAAGAAGACAATCGGCATGCTGACATCGGGACTGAAATCAGTAGTCAAGGGGAAAATTATTGTCTCATC:1 - chr3L 20279717 3' + Bica 490 1 71.58 CAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTACTTGAAGTTCAGCACTTTGTTGGCCGACTGCAGGCG:1 - chr3L 6535443 3' - Ivk 5196 1 68.00 AAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACACAGAAAGGACAAAACAAAAATGGGAAAGCGAAAAAATAAAGGAAAACACATACAAA:1 + chr2L 9752942 3' + micropia 252 2 59.43 CCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Stalker4 385 1 43.64 AGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTATGCCGTGAAAATATTTCGTTTTGGCTTTGCCTACTTTTGAGCGTTGGCGAATGAATTTTTTATGT:1 + chr2R 15621391 3' - G2 360 1 63.64 TGAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCTGTCTTTCCGTATACACGTCCAGATCTCAAGCTACTAAGCTTTTTTTATTAGCTGTTTTTTTT:1 - chr4 909245 3' + INE-1 94 1 60.82 ATATATACATAATGATTTAAACATAGAAAAAGAGTCCGATTCGCGTTCTGGTTCAGATGGTTCAGTTTTCAATTCAGTAAGAAGAGACAACGGCA:1 + chr2R 5009947 3' + Porto1 4388 1 35.79 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAGAAGAGAGAGCAACAACAAGCAGGGCCATACACAGTAAGCCATTAAGCAAAAGCGCGTTAGATTTTGCAATCGCA:1 + chr3L 23064581 3' + Tirant 8489 2 73.64 AATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATA:1 - chr2L 21089166 3' + flea 208 2 70.91 GGCCGTCAACCTTCTAGACCATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTCTCCGTTTTGGCCGCACAGATA:1 + chr2R 10924776 3' + G2 2879 1 73.17 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACGCACAAGCAGCTACAATTTGTTGCCTACTTTCGGGCGCTCCATATCCT:1 - chr3L 10702615 3' + hopper 1399 1 58.06 TCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAACAAACACATCGATGGACAAAATGATGATAGAAAGCACAACGAAAGGATTGATGTAA:1 + chrX 15220590 3' - copia 5032 2 57.29 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAAAAAACTTTTAGAACTGCAACGCCTTAGGTTCGAAGAATGACATTTGATTTATTATGC:1 + chr2R 10015724 3' + Juan 4191 1 49.51 CTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGACATTCTTCTAGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAATGAGATTAAATTTGGA:1 + chr3L 16875757 3' - jockey 4566 1 51.22 CACAACCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACA:1 + chr3L 11777678 3' + gypsy3 419 1 33.67 GCTATGTAGAACAGAGCAAAATCCGTTAAACTCGCATAACGGAACACAGCGAACAGGCGACAAGTTAAGTGGACAGGGGAAAGTGCGAGGATATCTAAGGAGCACTGAGA:1 + chr3R 29602037 3' - invader6 4643 2 53.64 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATAATATTAATAACTATGCGCAAAA:1 + chr3R 9481253 3' + roo 9011 2 79.09 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAGGCCACGTTACATAAATAAATAAAAATTGAA:1 - chr3R 20415784 3' - F-element 24 1 54.41 AACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGTATGCAGACACCAGAGACATATGCACCGCGAGTTTGTTGACACGCCCACAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTT:1 + chr3L 24300788 3' + INE-1 159 1 74.55 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGCGAGGGAATCACGGAGAGCGTGGGCAGTGTAGAATTTAATGCGGGAGACATGCAAAAATT:1 - chr3R 13732936 3' - hopper 21 1 58.18 GCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACGCATGAAAACTCCGGCTGCAGTATGCGG:1 - chr2R 15693501 3' - HMS-Beagle2 48 2 72.55 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCACTTAAACTCGCCTTATCAGCCGAAATGCTGATACAGAGCGTTTT:1 + chr3L 16496284 3' + P-element 2884 2 74.19 AGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACAACCTGACCTTCCATTTATTTAAGTAAT:1 - chr3L 12483120 3' + I-element 5024 1 79.09 GCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGATCTGCGAGAAAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGCATCTGCAACTTACGTTATACTAAAATGATGCT:1 - chr3R 27031047 3' + 3S18 226 2 70.00 TTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACG:1 - chr2R 330144 3' + HMS-Beagle2 7141 2 75.23 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTAGAATCGTCAATCGTTTGGTCTAAGGAATCG:1 - chr3L 27197155 3' - 1360 49 1 72.45 AACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAAAATATTGTACTTTATTTATAAATATAAGAAAAAACA:1 + chr2R 883124 3' + F-element 4636 1 74.00 CGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCATGCATTTAGTATATTTATGGATA:1 + chr4 617416 3' + R1A1-element 5031 1 65.71 TATATTTAAACTTGTAAGTTTATTGAATAATAATCAATGTCTGCAGATTCACGTTGACTGAATGCTTTCTGTCCTTCTGCTTTCTCTGCCCATTCTTTCACCCGCCCAAC:1 - chr3R 9109274 3' - gypsy7 170 2 63.64 ACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Tabor 426 2 73.64 ATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGGAAAAAAACTGGAGACGCGTGAAATTCTCTTCGAAAATATTAGCCTGAGTCAGAGGAAAAAA:1 + chr2L 13134948 3' - 1360 2955 1 66.67 AACATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGCTGCAGCTAAGCGAGTTATACTGTATTAGTATTTGTTGTAATGC:1 + chr3R 6966480 3' - pogo 49 1 79.12 ATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACATATTTTCCTACTTGTGACTTTTTCTGCGAGTGTACTTTTGGGCGCAATCCCTCGGCAT:1 + chr3L 9419614 3' + S-element 1693 1 60.00 ACAGCAAGCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACAGCTACAACCAACGAATTAGTTTGACTGTAAAGTATTTAGTCGTA:1 - chr2L 17916711 3' + Bica 4575 1 65.45 TAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTATTGTATTGTATTGTATTGTAGTGTATTGTACTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - I-element 5100 1 43.82 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTTGGGG:1 + chr3L 5204445 3' - jockey 4705 1 57.94 CCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCACCTCACCTCACCTTACCAGCGCTCCCTCAT:1 - chrX 1284419 3' + TAHRE 10307 1 72.73 AACCTGGTTTATTTTGGCCAACAACACAAAGTCTGCTCCGAGATTTTGAGCCACTAAGAAAGACGATTGACTGCTTTATAGTTTATCTGCCTATATTTATTTGACTAGAT:1 - chr2R 6078056 3' - G3 422 1 64.55 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTATGATATCGTTGTATAAAAAAGGGAGTGCGCCGTCCGAGTTTCCCAAT:1 + chr3R 23730058 3' - Burdock 6165 2 54.63 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTTTTTAAAAGCAATTAAATGCACGCTATGATACATGACGCCTGTCAAATGAAATCAA:1 + chr3R 25434839 3' - opus 7025 2 60.91 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTGTAATAGTTTTTCTTTAGCT:1 - chr3L 7219682 3' + roo 9049 2 57.27 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTTTTTAATTCTAAGGTAGTTAAGTGGTTCTCCCTTATGCAGATTCATCAT:1 - chr3L 18915139 3' - 412 7072 2 52.69 CATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCTAAGTGTATGGCTTTGGTGGCCATGCCAACGAATACAGCAACGTCTCCTTT:1 - chr3R 19447285 3' + hopper 1135 1 63.53 CCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCAATTAATTAGGCCCAATGATTAGGCAAATGTG:1 - chr3L 9189337 3' + G2 2805 1 70.91 GATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATGTATATACTTTATATGATACTTTTCAACGCATCTAGTAATACAGGTATAATTAAACTATGAGAACGTCG:1 + chr3R 23891577 3' - INE-1 96 1 62.38 AAAAATTAAAAAAGAAACAAAACAAGGAAATATCTAGAATATAACATAAAATACAAAAGCTAGAACAATTAAAATCCGTTTTAATGCATTCCCTAAGAAATTTTGGAG:1 + chr2R 10296424 3' + Doc 4697 1 67.59 ATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAAAATAGTAGGAAGTATCGAGTGGTTATCAGCTTGTAACAAAGACCTAAGCGTATGCTCGACAAGCGCGGAAG:1 + chr3L 23094222 3' + Bari1 1621 1 68.18 AAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAATTACTTTGTATATTTTTTTGAACTACTGCACAAATCACAAAGAATCACTCACACGGTACACATGACAGCCATTAGGTGCT:1 + chrX 19433637 3' - Cr1a 197 1 71.56 TTTAGGTTCACCTCATTGGGATTGGTATTTTTTTTAGAATTTTCGTGCGTGGTTTTTCTTCTCCTGTATTTGTTTAGTTATTAATAGAACACATTTCAACCCCTAAAAGT:1 + chrX 14341136 3' - I-element 234 1 75.45 TGTCCCAGCGTTTCTGTGTTTTAGTTTCTTTTGTGGCAAGATGAAGGGGGAACCCAAAAAA:1 + chr3L 10860666 3' - Tc1 1600 1 80.33 GAACTATAAAAGATAGAAGGTTGAGATTTAGCATGTTGCTATGCCCACTCTAAAGCCCACAAACTACGCAAAATCTGCCAGGCCACGACCATTGTTTTGTATGGATTCCA:1 - chr3L 20647955 3' + INE-1 158 1 70.91 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACCACCAGGAAGACCGCCAGCATATCAGCCTCCTCCGATTGGGT:1 - chr3R 17619499 3' - 412 44 2 60.91 ATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAGACATTTCCTTTTCCCATCAAACACTTTTCGTGACTTCCA:1 - chr2L 15740551 3' + Idefix 6978 2 55.56 AAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGT:1 + chr2L 9754863 3' - 1360 38 1 56.88 AAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTTGTGTTTCCTCAAATATTTGCGAGCGACTTGAGGTCTTCAGGCCTTCCCAGACGTCGAGCGTTTTCAAAAGCGCA:1 + chr3R 4845742 3' + copia 4969 2 74.55 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACCAAAGCCCAAAAGTTGTTTGTTAACAAGCACAATGTGTTAATTTAATTACAAGAACAATAAACATGAACG:1 - chrX 9432803 3' - roo 4 2 78.00 TGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATTTCGACGTTCACCTTTGTTTTAAATAAACATACATGAAATAAATTTGTATATATATGGCCTCCGGAGCAC:1 - chrX 15841147 3' - INE-1 169 1 54.55 CAAAAACAAAATAAAAATCAGGTCCATGTTCAAAAAATCAAGGGGGACCGGAAAAGTTTGCCTCATTAATTGAGTCGCTCTATTAGGCAGGCGACCCGCG:1 + chr2L 1306466 3' - Cr1a 37 1 55.00 GAATGTCGAGATCTCAGGAACTATACAATCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGCATTCTGTGAGGTAGGAAAATCCACTTCATTTTTTCACACTTTAGCAAATAA:1 + chr3R 15160057 3' + INE-1 141 1 55.14 GTCGTAATTGTCGTCGCCTAATTTTTCTATTTGAATTGACCCAATTCTAGATGCTACCCAATTGACGATTCTAGTCTTATGCGATAATTAACTTTTACTTTCTGCCGTTT:1 - chr2L 13126752 3' - Copia1_DM 355 1 69.09 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTAGATGGTTTTAAATTTCCT:1 + chr2L 21034146 3' - 412 15 2 66.97 GCCTAAAACGGGATGAGTGAGAAAACGAAAATTGTCAGAGACAGCAGC:1 + chr3L 19435685 3' + hobo 196 1 54.17 TGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAGATGAAAGATAGGAAAAACTATATACTTGTTGAGTTAGTGCGTAGAATGTTATTCTGACAGATCCAT:1 + chr3L 17829766 3' + Bari1 104 1 66.67 CAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTGACTGGTCGTGTGAATGTGTGTGTAATAGAGCGTCACCAAGT:1 + chr2L 3859497 3' + invader4 2948 2 72.73 ACCTTTCATTCACCCACATATCAAACTACACACAAAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAGAGAGACCCAACAGCACACACACATTCTGAAGCACTCGCACACTCCCAAAA:1 + chr2R 10789136 3' + Porto1 278 1 65.45 TCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTCGCCAAACGGAAACTAGTTGCCAGCCAATATGGTCTTAATGGTCTGTGACAAGTTCAGGACTGCCTGTGTGTTGGTGTG:1 - chr2R 7290596 3' + Max-element 300 2 77.67 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGG:1 + chr3L 15968226 3' - P-element 40 1 31.46 GAATTGTAGTAGGCTACAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACAATATGTACAATGGGAGCTATAAACTACGTTTTCTATTTGCTTG:1 + chr2L 11013439 3' + invader2 4855 1 60.91 AGCTACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATAGACCCATCCTTTCCCAATTCCTTCAGCTAGCAAATCGAAAAAAGCACAATCAATCCACCCATTTTGCCAT:1 - chr3L 7959092 3' + Tirant 8272 2 65.45 GTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCTGAATGAGAAGCAAGAGGTCCTGGACACGAAAGACAAATCTTCAGCGGCGG:1 + chr3L 12751405 3' - Dm88 156 2 60.87 ATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATCGAGTTCAGAATAATTGCATAATTGGTCCGATGGTTAAGATTGGAGAGTCAGTGGG:1 - chr2L 1925521 3' - F-element 4288 1 55.77 CCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGGCGTCATAAAATGAAAAACGTATCAGTACATTTAAATGAGTACATTTAATTGTGAGAGGAAAAAATATGAAATAAACTTTG:1 + chr3R 9898962 3' + F-element 4538 1 76.64 GGTTTTCAGCTACCCCGTACGCCTTAATAAAGTCTAACCAGGTTTTATACAAAATAGAGAATGTTTATATGTAGTATTCAACTATTTGCAGCTATTTATGAATTTGTCCT:1 + chr3R 27904174 3' + BS3 1744 1 75.45 TCTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAGGAACAACCCGCCCAAAACTTTCACGCCCACTTTGCTTTCACACTTTCACCTTG:1 + chr2L 20494086 3' + INE-1 81 1 77.32 GAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCTAACTTCTGGCTTATTGTTGTTTTGCTTAAGTTATTTATGATTGGTCAAAGAATTTCTTTCGTCGAGCCAAAGGT:1 + chr3R 8972211 3' - Tc1 1352 1 73.39 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCCACTGCAAGGAAAATAAGCAGACAGAATGCCTGGCCACTGTCAATTGTCTCAACTTGTTGCTCGCGCTTGTG:1 + chrX 2526974 3' + blood 7320 1 65.45 CCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATAGGGACTATATAGAGCAGGAAACGACTCCATCTGTTTTACGTACTTCTGTTTTCAT:1 + chr3R 7436642 3' - springer 7161 2 59.09 TAGCGGGGCTTGTGTCGGAGCTAGAAGTGCGGGAGAGCTCTTGCTCTCTTCATGATTTGTTGGGACAAGGAGGGCGTGCTGATGTTGGCCAGGACGAA:1 - chrX 2696343 3' - F-element 395 1 68.37 ATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAAAATGTGCAAATTTGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAAGAACCACAAAGAACTAAAGCAAAA:1 + chrX 3675278 3' + TAHRE 10412 1 61.82 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATTACATCTGCAATTTTTTTTTATTAGTTGACGTGGT:1 + chr2R 12336677 3' - pogo 14 1 66.36 CGAGCTGTTAAAAGAACCGCAAGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTATGGGGGAGCTGAATTTTTGGCGCGTG:1 + chr3R 30106034 3' - Cr1a 359 1 77.65 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGAACATATGTATATTTGAAGTTCCAATAAGTG:1 - chr2L 5304850 3' - flea 4782 2 64.77 TAGGCAACAAGAAAAATAAACGAAGGCACACTTCAATCGGGGTTAAAAGTACATAAATGCGATGGCTTACAAATTGGGAAATCAGAAATCAACATGAA:1 - chr3L 17455473 3' + invader3 5011 1 73.47 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATA:1 + chr2R 13699484 3' - jockey 4792 1 51.82 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAGGCGTAA:1 - chr3L 5320620 3' - roo 43 2 80.00 ACCAGGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAAAGCTTTAAGCTCAGCCAGAAGCGGAGCTCCAACTAGAAGTGGAGCCACAA:1 - chrX 5780731 3' - X-element 280 1 56.82 TGGATAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCCCCACCCACTTAGCGGGCTTTACGCCGTGTTTTCACGGTTGTCCGG:1 - chr2L 10635206 3' + G-element 4142 1 60.00 GATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCAAAACCAATGTGATGAACTAAGAAAACCGCAATAAATTATTTCAATGATAAATATCAACCTCAAACTATAGCTAG:1 + chr2R 19405789 3' - F-element 4300 1 67.27 TGGTTATATGGGATCCAGATTTGGGGAATTGCAGCCAAATCTTAATCCAAATCCAGGTGATGCAAAATAAGAGAACAACACTCACCACAATCA:1 + chrX 6130550 3' + Helena 1069 1 73.12 TGTAATGAATATAAGTTACATATCGAATCACAAATTATTTATGTATAGTATACATTTGTATTTTATGAAATTCCATATATGCTTAGATTTCGACGCACAGTTGCTTTTG:1 + chr2L 15343113 3' + Doc2-element 4691 1 37.61 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACTCATTGCTACACCGCACATATGACG:1 + chr2R 9138749 3' + pogo 2065 1 76.14 GAGATCTCGACGTTAATACGGACAAACGGACAAGGCCAGACACTGATAGCAGTAGAGGAGCCAATAAGCAG:1 - chr2R 10139929 3' - INE-1 134 1 64.79 AAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACCAACAAAAGGTAAATAAATTTTTTATATCCATCCA:1 + chr2L 8121 3' + Tirant 8403 2 61.11 ACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCAACTATGTGCAATTCTGCTTGCTCTGCGTATTTTTTTTTTGCGGTTTCATTTCGCATTCTC:1 - chrX 19376582 3' + F-element 4430 1 57.27 ACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTATCTGGTTATATAGACTACGAGTACGTAGACCTTAATCGCAAGGAATATGGTTACGAAGCGG:1 - chr2R 18680196 3' + copia 4889 2 76.67 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTAGTCTGTTACATGTAATTAATTTCAAA:1 + chr2L 19681468 3' - hopper 58 1 74.55 CAAAATATTTCCCTAAGTCCGTCGCAATCAAGTGGAGTCATCGCAGCGATCGAGAAATTGTCACTACTTCAAAGGGGCAATAAATAGTTTTATGATTTTTAAATCCTAAT:1 - chr3L 11478505 3' - HMS-Beagle2 222 2 77.27 TAAGAAGTCATTGTGAAATTCCTATTACTCAGTTTCATGTTAATTGCTCGTGGCCCGTCGCTTGTTCCAGCAATCTGCGCTAATTTT:1 + chr2L 9740852 3' + Copia1_DM 68 1 63.22 GCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCGACACTCGTTAACTGGCATGCAATTTGTTTGCCCAAAGACTTATGGACCATACATCTAACAAAAA:1 + chr2R 18783907 3' + 1360 3223 1 67.62 GAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATACGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 202 1 75.25 TTAGCTTTTAAAGTTCCTGAGATTTCGTCTTTCATACGGACGGGCGAAGATCGAATGCTAACTGTTACAAGTGTACTCTTCAATGAATAACAGATATGAATAATAATGGA:1 - chr2L 22159759 3' - INE-1 152 1 70.91 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAAATAAAGTTACCTA:1 - chr2R 9963477 3' - pogo 29 1 52.73 ATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATCTTTATGGGCAATAACTGATGAATAAACTAACATAGTTTGAAAGGTATGTACAT:1 - chrX 8712405 3' + INE-1 163 1 65.17 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGACAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGC:1 + chr2R 8086857 3' - 1360 41 1 60.00 TAATCTGTGTGTTCGTGTGTGTTGTTGTGGCTTTCCTTAGTGGGGCGCCAATTAATCTAATGATTGATCGCACCGTGTTGCATGACTTTGTAGTAAACCTGAAAT:1 + chr3R 30289489 3' - gypsy3 426 1 73.33 AGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCCCGCTCCTCCGCAAGGCGGAGCGCCCGCCCGGCACGCCAGCACTC:1 + chrX 10770844 3' + R1A1-element 5094 1 70.89 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACAAGTTGTTTATGTTCTTGTT:1 - chr2R 7981131 3' - 1360 28 1 56.86 TAATGTTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATATGTTTTTCATCTTTTTCGCGCCGTTCCTCCCGCAAACGTAAACAATTAAAGCAAA:1 - chr2L 16675825 3' - Juan 328 1 56.36 TATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACAGCACCCTCCAACCACAATGCGAACCTCAGCCTGATCAGCTTCCCCGTG:1 - chr3L 7803612 3' + F-element 4405 1 66.36 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAACCTACTCTACATACACATACCCACGCACACACACGCACAAGGTAGAGATGAGTAGTTGCTGGTGG:1 - chrX 9642327 3' + S-element 1712 2 73.96 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGGCTAAGAGCAAAGCTACCACAAATGATGATGGTAATGAT:1 - chr2L 21064920 3' - 3S18 5811 2 61.47 CCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCACAACCAGCAACATTTAAATCAACAACTTCATGCCCAACAACATCCGACTCAGACACAACATCAAGC:1 + chr2L 195871 3' + F-element 4364 1 75.53 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATTATTAAAGTAATTATATTGCTAATTGGAATCAGCGCGCAACA:1 - chr3R 7833120 3' - Doc 46 1 63.64 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAACATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCCGCGACGCCTATTTATAGGCCGGTTGCCTACCAGATTAAC:1 - chr3L 217317 3' - roo 8710 2 65.45 TAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTATTCTATTTTTTCCCGTTTC:1 - chrX 3102497 3' - F-element 134 1 61.33 GATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGAACATTTAACATAATAAGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGACACGG:1 - chr3R 19447207 3' - 1360 3368 1 60.40 AATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGAG:1 - chr3L 20189602 3' + FB 240 1 34.26 AAAAATAAATTTCAAAAATGACTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTAATCTTGCGGCGTGTGAAAAATAAAAATCCCGAAAGAAATAAAATATGGCCA:1 + chrX 8844339 3' + 1360 370 1 70.87 AATAATATTCTAGTGTCTTTGGTAAAAGCCTGATACATTTGAAAGATGATTCGTGACAGATGGTGGTTTCAGCTTTCAAGTTATTGATTTTCGACTGTATGTGCAG:1 - chr3R 28847870 3' + Tc3 311 1 75.47 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACAATGTGTAACATTACACTTCTTGTTAAATCA:1 - chr2R 9953289 3' - pogo 42 1 71.00 GGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTTAACATTTGTACTATAGAAACTTTGTTTGCTCG:1 - chr2L 5776566 3' - Doc 4471 1 70.00 CCCTCGATCGGTTGGGTGGGAGGTGTGGTACCAGTCCGAAAACAAAAAAATCTTGCTTGTTGTGCTGTATGGGTGGGTGTGTGGGACG:1 + chr2R 9970926 3' + Cr1a 4419 1 54.55 TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGCTACCCCCAGTTTAAGCAATTTTTTTTATGAGAAAAACAAAATGTGTAAC:1 + chr2L 10128735 3' + copia 233 1 52.08 TATTGCATAGGCACATACTACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' - 412 1 2 42.39 ATTGGATTTTGCTGTGAGATCATTTCCTGCAACTGCTGCCGCTGTTGTTGTTGTTGCTGATGCTATTACGCCGGCTCAACCCAAAAGACTGAGGCAAAAAACTTCC:1 - chr2R 24581680 3' - TART-A 162 2 52.83 GGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTACATACTTACATATTACACAATTTGCATATTGGGACCAGACGAACCGTACCAACCAGA:1 + chrX 18766589 3' + mdg1 196 2 62.89 TAAACACACACACACACACAAAACACTTGTGCTTGTGTGAGCAGTAATCAGGAATTCACCTATTTTCGATATTTTCACATTTCATATACGTTGCATTGGCACTTGATAAT:1 - chr2L 14301708 3' + accord 182 2 52.73 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATGTAATCAGAGTGAGGGCAGTTTGCGAGTCGGGATCAACACTTGAAGTAATTGT:1 + chr2L 4013083 3' - pogo 25 1 56.36 TTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGAAATTAACAAAGCCCGAATCCTGGACACATGTTGCATTCAAATGTCTCCTTTCGCC:1 - chr2R 12702005 3' - F-element 4551 1 69.23 TATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAAAATTACACATGTTTCTGTAGACTAATATCACCTGCCCATCTCCCGCGATCTCAC:1 + chr3L 15235282 3' - gypsy 432 2 55.45 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + 412 449 2 62.73 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - Tabor 39 2 70.11 CTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTTTGCGTTTTTTGCCTGTTCTGCTACTGTTTCGCTTGCAAC:1 - chrX 1623859 3' + INE-1 89 1 54.88 AGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACACCTATGCATGAGCATACGTATTAAGGTATTAAAGGTTTTAATTGAATTTTTGGT:1 - chr2R 10350383 3' + 1360 140 1 55.24 CTCCACTCGAACCTTGGGGTCTGGACTGGGATACCTTTGGTCCATGTTGATGGATTACATAACGATGTACATTCGTCTGCAGCCAACGAGTAAG:1 + chr3R 10828595 3' - Gypsy12A_LTR 417 1 59.57 TTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAA:1 - chr3L 15099561 3' + G4 3814 1 67.74 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTTTCGG:1 - 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chr2R 23212604 3' - hobo 213 1 54.55 AATAAAGTAAAAAAACAAAAAAACAAAACGACAAGGGAAAAACGGAAAAAAGGGGATAAATGTTAGGGACTCTTCAGCAAAACGAGCTCTTCAGCGAGCTTCGACTAT:1 - chr2L 15082944 3' + BS3 1769 1 78.70 TGTATATGTGTTAAAAACCTTATTTATATCTGTGAACAAGATGAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACA:1 - chr2L 9723026 3' + Porto1 123 1 49.09 TCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGACAGGCCGACAAGCCAACGAGAATAATTTTCGTTAAAGGTCGAATTCTATACCATCAAAAA:1 - chr2L 13558158 3' - FB 25 1 56.36 GTATGTACCCAACAGATACCAGATAACAATAAGACTGTCATATGATCTACACTATCTCCGCGGTTGTATTTATAT:1 - chr3L 15661217 3' + Idefix 93 2 62.67 CCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAAAAGATGCGGGCCAGAAGGAGGCCAAAATGTGTGGG:1 + chr3R 26808794 3' - micropia 5123 2 65.17 ATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATTATTTCTAGATTGCGTTTCGATTTCTTCTCAGTGTAT:1 + chr3R 17844843 3' - Stalker4 7091 4 67.27 TCTGACTCATCGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCGCTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCGATGTGGTG:1 - chrX 17193325 3' - F-element 180 1 54.37 AATAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGTCGCCGCCGACAATGGACGCTTACTTAAGCTAAAAGCTTTTGTGTATAAATTTTAATTAAAATGCAACAATTAAATGCACAG:1 - chr3L 6658808 3' + GATE 464 1 77.98 CTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATAAAAAAAAAGTAAAAACTACTAAGGGGACTCGAAAATACGATACTGAAAAAAATGCATATAGGAATTATGAGACAGTCATG:1 - chr3L 19183619 3' + GATE 434 1 74.31 TAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTTGCACAACACAAAAACCACTTATGTTTTCAATTCATAGTCGCTTAAGTATACCACTTATTCTATGAGTGTACGC:1 - chr2L 6349264 3' - transib2 366 1 64.55 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAATAAAAAAATAAATGAACGATAAAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGT:1 + chr3R 19444999 3' + I-element 5311 1 64.55 TTGTAGATCGCAAGCGATCGTTTATAATAAATGATTATTTGAAACTGAAACTAACATACAAAATATTTCCCAAATCCTCCTATCTCCACATCAATCAGTC:1 + chr2R 13602410 3' - HMS-Beagle2 280 2 71.00 CCACGCCCACATTTTTGAAAAATGTGTTGATATATTTTTACATGTTAATTAGACTTGTAAATTTCTATTGATTTTCAAAAAAT:1 - chrX 6688928 3' + INE-1 252 1 73.49 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 74.55 CCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTAATATGACTGGCCACGATAAATAGAGG:1 - chrX 13283910 3' + copia 21 2 75.38 CACCCGAAGACTGTGGAATGACGAATAGACCAACTGCCGTTGTGTTTCTTTATTTTCTTTTTGCCCTGGCTTAAATCTCTTCTGCGCCAACGAGGCATTTCCCTATTCAA:1 + chr3L 21103524 3' - Doc 8 1 79.09 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTGTCCTTGTGGGGGGCACAATAAAAACACTTTCTCTCAGGGA:1 - chr3R 5671357 3' + 1360 3385 2 75.23 CACGAAGTGCGGACACAAGCAATAAGGCAACAAACAAAACCAGGTAGACGAAGTGAAGCCGAGACAGACAGAATGCAGAATAAGTGAGTGG:1 + chr2R 6603308 3' - 1360 466 1 81.32 ATTTAAAATCTGTCCATGTGGACAATAATTAAATGTTTGGGTGGGGGGGGCGTAATGCACATGTCAATATTAAATGCGTTACCGG:1 + chr2R 22001922 3' - G-element 4290 1 60.00 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGAATTTATTTAACATGATTTGGTGTGTAGTTTATTCATCGTTT:1 + chr3R 12623777 3' + roo 9032 1 67.27 TAAGATAAGATAAGATAGGATCAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGAGAAGAAGATTGAGTAAGAGAGAGCCATGGACCAACGGTG:1 - chr3L 16660181 3' + Stalker3T 202 1 55.32 AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCACTTTTCATACAGTAATTTGCAATGTTGGAATGCAATAATGGTATAAAAGTAGATTACAGTTTCCTTG:1 + chr2L 8633452 3' + roo 391 2 52.73 ATTGATCCTGATCAAGAATAAGCCTTATAAGGATCCTCTATATCTATCCATTTTTGAGATGAAATGAAATCTTAGTGCAACCTTCACGAGAGAAAAATGTGAGCGACTTG:1 - chr2L 12285892 3' - INE-1 83 1 78.18 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCATATGTAGACCTGTTCCACGCAGCTTATCATTATCTACATA:1 + chr2L 12591787 3' - roo 8705 2 64.22 GGATGTAACTCTTGCCAATGTTGCCCGATTTGCGGAGCAAAGCCAACGCATTTAATGAATTCAGTTCCTGGCAAATTCTGTTTTCCTTCTGTACGGGTTCCTTGGAAATT:1 - chr2L 18023170 3' + transib1 1684 1 57.27 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATGATTATACTTTTGCCAGACAAAACGTACACA:1 - chr3R 15697015 3' - 3S18 5782 2 63.30 TTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTGCCGGTATTCACGCTAAATAGGGGAAATGCAGCTGTGCTCC:1 - chr3R 8192184 3' + diver2 4659 2 63.64 AAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAAGTAAATAATTTCGTTTGCCACACCCCCGAATTCATACCCCCCTTCCTCAC:1 + chrX 10106089 3' + FB 914 3 65.88 TTTCGCTGCGTAGATACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGTGAAAGGCTGAGCCTAATGACCGAGGCAGTGACCCCAGAA:1 + chr2R 20695263 3' - Doc2-element 4462 1 56.63 TTTCGGAAAATCTGTTTTTTTGTTTTTTATTAACTCACGGGAGTTTCTCCGCAAAAAAGGAAAGCGGGGAAAACGAGAAAATGTGACGACG:1 + chr3R 30910690 3' - HMS-Beagle 439 1 57.14 GCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTT:1 + chr2L 23295888 3' - micropia 4971 2 63.64 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAA:1 - chr2R 10091017 3' + roo 9029 1 67.29 ACGAGTTCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCCAGTTTGGTACTGCCAGCTTTT:1 - chrX 3696185 3' - micropia 5336 2 71.64 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAATACACGAGAGCGTGGGCTT:1 + chr2R 20096989 3' + mdg1 7068 8 78.41 CCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGACAAACATGTAACTAAACACCGAAATCAGGAAAACTGA:1 + chr2R 10932820 3' + 412 7268 2 63.00 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGATGATTTTGAGGAGGAGGATTCTAGAAACGATGCTGGCGCGTTTATGGGGGG:1 - chr3R 21120580 3' - jockey 4789 1 57.73 GTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCANCGATTTTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACT:1 + chr3L 23702276 3' - I-element 343 1 55.79 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTCTTCTTCTTTCTTAGC:1 - chr3L 27174936 3' + pogo 2064 1 79.76 AAAAAGTTGAAAAAAGCAAAATAAATAAGAAATACCAAATAAATTGCCCTGCCACATGACAAAAATCCAGCTCATTGGGGCAGGTCCAGG:1 - chr3L 7389494 3' - FB 167 1 56.67 CATGCACAAAAATGCACTTTGAGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATGCATTTCCCAGCCATACGCTCTATACGATATTGATTAAATGAAAGCGCACTGACATGT:1 - chr2R 18507820 3' - Bari1 25 1 55.45 TTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACCAAACCAGCCGAACATATCCATAGCTTTTTGTAATGACTCAATTCAGTTA:1 + chr3R 5968930 3' - flea 215 2 56.88 TTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACCGTTTTTATTGTTTCTCCTGAGCGACAGGTGGAAAAGTTCTCAGAGCCT:1 + chr2L 5568197 3' - Circe 7166 1 52.94 AGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - invader1 4003 2 59.63 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTG:1 + chr3L 3555501 3' - 412 54 2 71.82 AGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCAATCTTCAACTGCCTCAAATGACACC:1 - chr3L 11790513 3' - R1A1-element 5049 1 72.83 ATTTTTCCGTGCCCAGCTTCTTTGAGATGAGCACTTCCGTAGCTAGCACATTTCGTACTAATTTTGCGATTTTGCAACAGACGCTTGCCACACAGGGCATTCCC:1 + chr2R 12540496 3' - FB 7 1 68.27 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGTGGTTGAAGTGGTACTGTTATCGTTCATTTATTTTGCTCGTTATGTTCGCGTCGT:1 + chr3R 5774885 3' - I-element 46 1 62.86 CGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATACACACAATCCGCGGATTGGACCATCTGCAATCAGCAGCTCCCGATTGCGAT:1 + chr3L 10911589 3' + springer 7511 2 59.30 TGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTCTTTATCTGTTTGAAGGAGGGTTGCGTGGCGATTGTCGGGCAGATGGACTGTTGTGTGCCTCTTTGGTCGG:1 - chr2L 16097338 3' - INE-1 16 1 65.09 ATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAAGAGAAATTAAGTTATAAAATTTTAAGGACTATGCGCAGTTTAATTTCCAAATACCATGCCACCGCCAACCGT:1 - chr3R 22979322 3' - Juan 4091 1 68.18 CTGTACCCAAAGACAGCAACATAGGATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAAGAAGTCTGCAGCTCGAAATTGGTGGGAAATTGTTCTACATAGAAATA:1 - chr2L 10620790 3' + Stalker2 7559 2 54.29 TATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATAATATGATAGATTTGATTTGCAATCAGCTGAGCTTAGAAAATGGCCCAGTTAAGTATGCTATAATCTGTTGGCTT:1 - chr3R 17777554 3' - Burdock 9 2 69.09 TTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATCAATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACGTGGAGCACCGCTTGTGTGGGGCACATTT:1 - chr3L 7611327 3' + 1731 406 1 77.88 CTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAAATCAACCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGAACAAGAGACCTTAATCGGTGGTCAAAAGCGGGAAAAGTGCGCGCGTTGCTGGG:1 - chr3R 18950340 3' - Quasimodo 7142 2 54.55 AACCCACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTTTGCCACTTGCAGGAATATTGTGTGCATTGCTTTTATTTATTTTGTTGAATTCATTTCGCTGCTA:1 - chr3R 14588621 3' + Doc3-element 4570 1 64.55 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGCCTGTGATTTATGCACAGAGGAGGATGGCGCAACTTTGGGGTTTGCCTTGGGTTTCTGCCTTAGCAAACCGGGTCAGAGT:1 + chr3L 20168032 3' + 412 7542 2 76.36 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTTGAAGCATTTCGGTTGGGTCCTAAAGCTTTAAAAGTTGGCC:1 + chrX 722118 3' + INE-1 546 1 91.89 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCCTG:1 + chr3L 217363 3' + roo 9014 2 79.82 CCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTAAGATTGCTGGGGCTCAAATGAACGGAATGCTCCTAAATTACAGATGGTGGTTACTAGATAGATAGTTTACTTCTACAAATA:1 + chr2L 11207207 3' - 297 6554 2 76.36 CGGTTCTTTTAACAGCTCTCCTGAAAGTTTTAATCTTGTGTTTTTGTGCATAGTACTTTCATTTAAAACAATTTTACAGAGATTATCGTATATATCCAATAATAA:1 - chr2R 17365701 3' + Cr1a 362 1 52.38 CTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGAAAAGGGCTTTCCACTACCGGGGGAAA:1 + chr2L 18362598 3' - roo 231 2 74.47 GTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGGCTCCGTCGGTTGTGAACTAGATGTGGATAACA:1 - chrX 6616311 3' - FB 703 2 67.00 CGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATACACGCATATGAGAAAATAAAAACATTAGCACAGCTCGGGATGTTT:1 - chr2L 7088310 3' + rover 342 2 65.38 CTCTTCATCACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCCAGTTCGTCAATCCCATCACACCTCGTATTTACACCTTTA:1 - chr2L 14449587 3' - R2-element 474 1 63.74 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGGCTAAGAGCAAAGCTACCAAAAATGATGATGGTAAT:1 - chr2L 21064923 3' - 3S18 50 2 64.55 GAGGAAATATAAACCACAAATGTTGCAAAACGATTTGCCGCACTTTTGTCTTACGCATGAAAAGTAGGACAAGTGTCAAAATCACTTAAGTGCGAATGCAACGACAAAT:1 - chr2L 2509113 3' - transib1 219 1 54.13 TTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATTTCGACGTTCACCTTTGTTTTAAATAAACATACATGAAATAAATTTGTATATATATGGCCTCCGGAGAACTTTATTATAACTTGA:1 - chrX 15841132 3' - INE-1 154 1 66.36 ATCAGAATTTATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTACCACAACACGCACACATACACACGTTCTCGTCTCTAACGTCTTTCACGAAAAAGGCAAAAAATGC:1 + chr2L 12243481 3' + 1360 3179 1 70.00 TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATAAATGCACAGCTGCGGTTGAACTA:1 + chr2L 12910763 3' - Burdock 45 2 76.24 TGCACACACACACACACACACACACACACACGAAACACGCACACACACACACACAGGCAT:1 + chr3R 14467447 3' + accord 7028 2 88.33 GTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAACGCAACGCATCGAATCGGACGTGATTTTAGCTTCAC:1 + chr3R 11531957 3' - INE-1 571 1 61.96 CGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCAAATACCCCATGATCCCCGTTGACCCTATGTGATTTAGTGTTCCACTGATTTAC:1 + chr3L 5975058 3' - R2-element 55 1 66.36 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGGACACATATATCTCTGAGCACGTACATAGAGAATTGCAGTGGCTG:1 + chr3R 11326950 3' + flea 4998 2 63.33 TATTATGTTCGTATATACTACATGCCATTTCACGATTGATATTTCTCCACCGTAATAAGTAGGTGAGCTCAACTATTAACCAACCATAATTCAGTCATTGAAAATGAAT:1 - chr3L 14261253 3' - mdg1 1 2 77.98 GCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATACAAAAAAAAATATCCCTCGAAGGAAATACAAATGTAAAATTTGAAATTGTATGTAGTTTTGATAA:1 - chrX 14146670 3' - 1360 326 1 55.45 ATACATTTTATTTACTTAATTTTATATTATTTGGCTTAATATATAATAAGGAAATAAATAAAATATTCTTAATTTGATTGTAACATTATTTGTGTTATATTATAGATAGC:1 + chr2L 7437187 3' + accord2 429 1 79.09 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTCATG:1 + chr3L 12677110 3' + pogo 2069 1 80.52 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCCTTGCCTTTTACGAGGTATAAAAAGTGAAACAAAAGTGGAAATAAAACCATGTGTATG:1 + chr3R 14139162 3' - 297 6583 2 64.77 TTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAAAGATAACATATACAGATATAGATACAAGCCGCTTGAGCTGTCTGAACTT:1 + chr2L 17717648 3' + F-element 4624 1 56.36 TGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTGTAGTCGTTGTGGTGG:1 + chr3R 25399364 3' - gypsy3 421 2 59.46 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGAGTCGAATCGCGTGCACTGCAGGGCATTTTTGCGAAAATCGTAGCGTGCATTTAGGGGCGATTCGCAGGACGCG:1 + chr3R 8621763 3' - jockey 17 1 69.16 CGGCGTGTGAAAAATTTATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTCTCTGTGAAATTGCACTTCCCGAGTATCTGCAACACTTAATTAGAAACCACATGTGCAAAAGGAGC:1 - chr3L 12949435 3' + 1360 430 1 65.45 AATAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGGGAAATTTTACTATAGCACTCTCTCTTGTTTTTTTTTAGTGGATTCCTGGTTACATTTGTGTTATT:1 - chr3R 3626528 3' + INE-1 542 1 81.25 GAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAGTATTAAAGAAGATGTTACGTCACAAAAATATTGAAAGAAGAAGAAAATTGAACTGGATT:1 + chr3R 15309425 3' - HMS-Beagle2 20 2 60.91 ATAATAACAATAATAACAAAAATTTAGCTCTACATTTCTAATCGGTTCAGAAAAGCGGAT:1 + chr3R 20998016 3' + mdg1 7055 4 76.67 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAACGTTTATTCCTAAATTCGCAAATCCAGTAAAAAGT:1 + chrX 1523578 3' - jockey 62 1 67.27 CACACACACACACACACATTTTGACACCCGGAACCTCATCGCTCCCCATGGAATGTCATGCGAATCGATTTGATTAAATTCAATTAATAATGTATCGCTCATCAATTTGC:1 + chr3L 17856710 3' + accord 184 2 52.73 AAGTTATAAAAAATAAAAAAAAGTATTGTGGAATCTGGAATTACGCTTCAGATCGCGTTTTTAATGGGCTCTACTTGGAAAGAGCATTTACT:1 + chrX 3091820 3' + TAHRE 10442 1 78.26 GCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGACGAATTAACAAACCAAATGAATAAAATTTTTTTTACAGGTGGTC:1 + chr2R 639865 3' - Tirant 8179 2 52.22 GTGGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTATTGTTTTGTCTAAGTGTGGTTTGGGTTAACCAGGGGTTCCGATTGTGTTTGGTACATAATGCGCGAACTAACACTTTGCCA:1 - chr2R 16179106 3' + INE-1 568 1 74.55 TTTTCGTCCTTCGCGTCGAACAAAGCCTTTAGCTCAGCAGTGGAAAGTAGACTGTAATTACAGTATTGTAATGCCTACGAGTTTCCGCCAGATGTTATGAC:1 + chrX 17109536 3' - Dm88 474 1 69.31 TGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTTTTCTTGTTTACATGTTTTATTATAGGCACATGTTTCTTCATCTAGGA:1 - chr3L 4264957 3' - Transpac 4952 2 51.82 CACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTTACATTGTATGGGGTGTTGTCTGCTGAGTGAATCCGCAACA:1 - chr3R 26259770 3' - HeT-A 6008 1 73.64 CTTCGTGCCTCCAGATATGACCAAAGCAAAGACAGGTAGAATGTCAAAAAGCCTATTTAGCATATATTTACTGGCAAAAGAGGAAACCAAACAAGGCCG:1 - chrX 7787585 3' + 1360 481 1 70.71 CGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGCGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGATCTTAACGGCAGAAGTA:1 + chr3L 1885902 3' + 297 443 1 79.38 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAAGAAGTGCAAGCACTC:1 - chr2L 18675599 3' - 412 7079 2 57.27 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - 412 7100 2 66.36 ATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTCAGTTTTCCACACTTTTCCGCACTTTGACGGCGGCT:1 - chr3L 21123976 3' - Porto1 4222 1 64.04 CATCCCCCTACATCCCAACAGCCATAATTGCGAGAAATTTTTGTTTTGCACATTGTAACATTTATTGTAACATTTATTCAGAAGTTTATTGGTAAATAAATTAAAATTAT:1 + chrY 2413409 3' + GATE 253 1 38.18 GCTACAGAGATGCGCTGATGTCTACCCAAGTGCCTCAGAAAATCAATCCCAACCAAACCCCACCTGAACCGAAAGTGCACTTGATTAGTCACTATGGGGGACGACCGACT:1 + chr3L 8680608 3' + G2 65 1 55.45 CCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAATGCATATGTTTTCTGAAATTTCTAGT:1 - chr2L 10716775 3' + invader2 260 1 72.00 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTCAGTTGAACTGCAG:1 - chrX 18483176 3' + pogo 2069 1 77.63 TTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTATAAGACGCCTCTGCGTTAGTAAATGCAGCTGAGTTTTTTCTGCTTTTTGTAGTAGTTTCTGTCTT:1 + chr3L 631071 3' - rooA 257 2 75.51 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTTTTTCAGTGTTTCCTTTTTTTTGTGGGGGCCTTGAACAGCTGTGAACGCACACGCTGAAGAAGAAGA:1 + chr2L 18694110 3' - pogo 7 1 63.21 CTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAGACTATTAGGATGCGATTCTAGTCTGTCTCATTCTCATGTCCACTTTGGTATTTATTCTGCTCGGTTTTAAGACATTAAGCAT:1 + chr2L 17271269 3' - jockey2 3120 1 56.07 GACATTAGTTCGACTCAAAAAATCACAAAAAAACAGAGACAAAGATACAACAAATTGCGCCAAAAACGCTTTATTATGTCAAAACAAGATGAAAA:1 - chrX 15358698 3' + 297 6957 2 74.74 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATAATATGATAGATTTGATTTGCAATCAGCTGAGCTTAGAA:1 - chr3R 17777590 3' - Burdock 6148 2 55.84 ATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTGGGCTCACAGTTGGTACTGGCCTAGTAGTTTCTGTTGATTCTTCACTGGTTAA:1 + chr2L 4534072 3' - TAHRE 10396 1 63.33 CAGCAAAGTTAAAAAATAAAAGCAAAGTTAAATAAAAATTAAACAAATTCACATACCCTCAAATAAATGGTCAAATCACAATTGC:1 - chrX 5969434 3' + TAHRE 10437 1 55.29 ATAATAATAATATTTACGATTAGTAAGGAAGGTATTTCTAATATTTTTTTTTTTAACACATATATTAGAGTGAGAAACTCGTT:1 - chrX 22550904 3' + invader6 4392 1 85.54 ATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATA:1 + chr2L 5307482 3' - 1360 3336 1 66.67 TGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATATTTTCGAGCGAACTAAGAT:1 + chr3R 25051637 3' - 17.6 47 1 82.47 CAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTCGCCAAACGGAAACTAGTTGCCAGCCAATATGGTCTTAATGGTCTGTGACAAGTTCAGGACTGCCTGTGTG:1 - chr2R 7290604 3' + Max-element 8523 2 67.29 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTATATTTTTATTTAACTGTTGTTTTGTGCTAAATAAATCGCGAAAAATAAAATCATTTCAGTCAAGT:1 - chr2R 15497897 3' + roo 9052 2 66.36 GCCCTATCAACCTTCCACATAACTACCTGACCTGGGCAAAAAAATAAGGCTTAGCAGTGCGTGCCGAGGAAAATAGTGAAAAGACTTTTGTGTGATTTGCGCAT:1 + chr3L 16259030 3' + Transpac 5226 2 76.92 TGGGGGGTCACTATTTGCTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCAGAAATCTTTCTTCATTTTTTGGATA:1 - chr3R 19447836 3' - X-element 109 1 77.27 AAAAAAAAAAACAACTGAACACTATTCCAAAGGAATCGCACAACGCATCGCAACGCTAAGCATTGAATTGCAT:1 - chrX 18692463 3' + Porto1 171 1 86.30 AAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGCTAGATATTTCCTACGCTTTCGCAAATGAAAAAGCATAAAAAAGGTGTTGGTTG:1 + chr3R 28152608 3' - INE-1 511 1 61.73 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCCATGGCAATGCAGTCGAGTGTGAG:1 - chr3R 11315237 3' - hopper 63 1 77.27 AAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATACTTAATGTCAGTCGATTTGCAGCTTAAGCTTTACG:1 - chrX 15291966 3' + I-element 5296 1 68.18 CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + blood 351 2 61.63 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAG:1 + chr3L 217357 3' + roo 390 2 75.00 CCAAAAAATAGTATGGCGTTACGCATATTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACACTGTAAGACAGCTTTGAGCGCTGCG:1 + chr2R 8086842 3' - 1360 26 1 62.50 AATACCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATTATTCTCAATCTCTGGCGTTGGCACGATCGGAATTTGCAGCCCAGAGGATTGAACTCATTTCAACACGAT:1 - chr3L 19174389 3' + INE-1 102 1 73.39 AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCCATAACGTTGCCAA:1 + chr3L 19948913 3' - 3S18 5810 2 61.82 ATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAGCTGCCTCTAAGTCGATCAGGACACTCTGCTGCTCTCATAAACTTCCAGCTTGACGAGCGCCAACAGCGAG:1 + chrY 2971737 3' + TAHRE 10416 1 60.58 CTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAGTTACCGTATTGAGTGTAATTACTTATTTCTTTATATTTTGGTTTAAAATTTACAAACCGTTTAAGTT:1 - chr3R 12098677 3' - Transpac 4767 1 76.36 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCTCATTTCCATGTGATGCGCAATAT:1 + chrX 5513360 3' - jockey 4750 1 77.27 AAATATTAGTGTTACTAGGATCTAATTATGTCCTAAAACAGTTAAAACTTGGAACGGCTTTTAATTACAGCCTCGTCGTGCACGAGGTCGCCCATGTCGGGG:1 + chr2L 7945591 3' - Cr1a 4294 1 53.92 GTCGCTTGCGCTCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCC:1 + chr3R 12040191 3' + HMS-Beagle 7016 2 66.67 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATCCCTAAAATTCCAAAGGAAAAGCATTTTGTATGCCTTTCTTATTTACGATGAACTCAAATTAGTTGAATGTGG:1 + chr2R 20924312 3' - mdg1 7 2 73.33 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACAGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTT:1 - chr3R 24813967 3' - P-element 55 1 26.92 AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAGGTGATATGCCGGCTGTGCAAATGGTT:1 - chr2R 17512998 3' - jockey 4825 1 80.00 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACGCCAGCTTAGCTGTGTGGCATCCTGCGGTCAGGAGTCTCAACTTCTGCCTCTG:1 + chr2R 13313468 3' - hobo 8 1 67.78 CACCTCTTTAAAATAAAAATTTGTTACTGCGGCAACTCAAAAATTTATTAAAAATCGATGGGCAACTGCAGAACGATAATATCTGCTCCATCACTCTACTGCC:1 + chr3R 31875697 3' + FB 466 1 72.82 ATGATGAACGATGGATTCGTGTTGAATCTGTAATTACAGATGCATTAGTATGTGTTTATAATAAGCCAGTCGTGTATTTCTCATAATCATAAATATTTTTGTGCCCCCTA:1 - chr2L 3851037 3' - gypsy5 483 1 56.36 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAC:1 - chr3L 23583088 3' + copia 235 1 70.00 GAACGTAGTCTGGTCGCGGGCGGGAGCAAGAGCGAGAGAATGGGAATCCCGTTAAGAATTGGACTAGCAAGGAATTGACAAAAATGCCAT:1 - chr2L 22497743 3' + invader1 114 2 73.33 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGAAGCAATGCAAAAGTGTCATGACATCACCTGTTATCGGCCCAAATGAAATTGTATTAAATCGGTATG:1 + chrX 18483254 3' - pogo 10 1 65.45 GCAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCAGACTTCACCTTCATGCCCTTCTCCGCTGCATGTGCTTATAATT:1 + chr2R 17965040 3' + I-element 98 1 59.09 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATTGCGTTTCGGTTT:1 + chrX 6866811 3' + S-element 1712 2 76.60 TCAAAGAAGCTGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTTGAATCGTTTGCCCATTTTTTTACATGGTTGTTTTTGATTTCCCAATTTTATGGCATTAATC:1 + chr2L 13043920 3' + FB 4 1 62.73 AAATAAAAAAATTAAAAAAATAGAGAAATCATTTACTCCCAGATTTCTTACTTTTTAACC:1 + chr2R 8308095 3' + HB 321 1 90.00 TGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCAATATCAAAAGGTGAACACAGGTGAGTGTGCGTTGAAAGTGAAATTGAACTGGAGAG:1 + chr2L 10677122 3' - pogo 330 1 57.27 TATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGTTTTCCACTCTCGTCGGAGACGTCGTTTTTTAGCACTAAGTTCTCGATTTGCCTGTTCGTAGTCC:1 - chrX 23157596 3' - I-element 5010 1 63.81 AGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTATAACAACTGTCATAATTGAGGATACTGGTAGAGAGAACATAATTTCTTAGTAAATGGGAGAATTTAGTA:1 + chr3L 17589942 3' + invader1 182 2 54.55 CGAAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAATCCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCTAATCTTTTCGCCCACCCAGCCATCTGTC:1 + chr4 702618 3' + S-element 1330 1 76.36 AATTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGATATGCAGGAACCAGGTGCGGTGCTTGTCATGCTTATCGTG:1 + chr2L 6391239 3' - Chimpo 179 1 53.33 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACCATTTGATCAAAATCTATTTAGTT:1 - chr2L 14848391 3' - pogo 42 1 65.45 CAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGGTTTTGCACATCAAATAACACAACTGTGCATAGCTTCTGTCGAACTTGTCAGGTTGAGGAATTCTTTTGATGTGACATAGGC:1 + chr2R 23354390 3' + Tabor 483 2 72.48 ATCCTGATCAAGAATATCTATGTATACTTTATTTGGTCGGAATCCCCTCCTTCTACATTTTACATACTTTTCAACGATATAATATTCACAGAAATTATTATATGGGACCA:1 - chrX 22633260 3' - INE-1 79 1 62.73 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAGAAAGCGTCTTACTAAGGCGGACGTATTCCCG:1 + chr2R 4606298 3' - 1360 10 2 67.02 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCGAAGAAACCGAAAAACCCGAAAACTAAAA:1 - chrX 14853393 3' - P-element 52 1 33.64 AAAGCTTGCACCCACCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCACGTTACACTGCCAGGCCACCTTTCTTCAGGACGCGCGGTC:1 + chrX 21175378 3' + Gypsy12A_LTR 2217 1 53.66 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAACCCCAATGAGATCAGACCAGAAAGGAAAATGGAAATGGAAGGTTTTCCACGAAACGAATCAGTGATACTCT:1 - chr2L 1917462 3' + copia 245 1 61.90 AGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCGACAAACGCATAAAATTCGCTTGAACATTTTG:1 + chr3R 26775933 3' - Rt1a 22 1 59.49 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAATCGTGTTCTTATAGACACTAGATATCAA:1 + chrX 15026064 3' - FB 42 1 70.53 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGTTGTGGGTTTAATGTTCTTTGTATAGATAGTTCCAAAGGTAAGATACCAAAG:1 - chrX 13202582 3' - Tirant 8115 2 68.13 TATTCCATTTAAAACAATTTAAACACTTCAATGATTCGAAGCGTGTTTTAAATGCAATGAAATTCTCATTATTCTTGTCAAAATGAAAGTAGTACAAACTTAAGAAGATG:1 + chr3L 17109126 3' - HB 1520 1 70.91 CGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTTTTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAACCGAATCGAGAAAGAATGCGAAAAAATGAAATGAAATGAAAAAA:1 + chr3L 10515973 3' + Doc 4555 1 53.68 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + 412 446 2 73.96 GAATTTATAAAAAATGAAATAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTGGTGTCGGTGCAAACGCTTGTTGCTGCTTGTCTC:1 + chr2R 24302373 3' + Tc1-2 380 1 56.96 GCTGTGTACTTATAGGTACAGGGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTAACTGAAGCCCCAGGTTTTGTGTATTGAATAAAGAC:1 + chr3L 25414237 3' - blood 28 2 53.93 GACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCACTTTCTCCAATTCTCCGTGCTCATCCAT:1 + chr3R 5137396 3' - flea 4635 1 68.13 GAGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCACAAAACAGGTTGAACCACTCACGGGATTGCCAAACTGGTACCTGAATCAAGTCGGCCAT:1 + chr2R 20961529 3' + Tirant 8106 1 62.04 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACGGTGCTTCATCCACCTCCTGATGGCATCGCTTCGCGAGGGTGCTGAGGCC:1 + chr3L 22108189 3' - Transpac 6 2 73.00 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT:1 + chr3R 21211613 3' + Stalker3T 204 1 38.18 TAAAACTATGAGTTAGAAAGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCAGCTCTCAATTCAACTGGATATCCAGCACCTTCTATCATCCC:1 - chr2L 13801872 3' + F-element 185 1 73.27 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTAGGGA:1 + chr3R 27071929 3' + jockey 4965 1 53.64 AAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACAACCAATTTCATTCAGCAAAACGATTAATTTTTCCAACTAAAACTTTTTTTGCCCCTCACAC:1 - chr3L 8060142 3' + FB 401 1 53.64 TGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTCGTGTTGGGGGGTTATGNTTGTGTGATTTTGGTGATTTGTCGTG:1 - chr2L 15642904 3' - I-element 5023 1 77.14 ACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTACGTCATGATCGAGATGCTAAACGAGGAGCAGG:1 + chrX 2728228 3' - Stalker2 53 2 69.72 TGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTACCTTAGCCTTAGCCGGCCCCCATAATTAGCCAATTAAACCTG:1 - chr2R 11061332 3' - flea 4827 1 59.05 GCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATACTTTTTTTTTTTGGTT:1 + chr2L 9171473 3' - opus 7146 4 82.19 TGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATATTAATTGTGTTTAAAAAGGACTTTGGTATTAGAGATTCGTGACTACATTTT:1 + chr3R 29362850 3' + F-element 4643 1 61.82 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTG:1 - chr2L 2484374 3' - jockey 4673 1 57.41 CCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCTTCCGAACTGGGAGCCGCTGCTGGAG:1 - chr3R 12144421 3' + jockey 4684 1 56.67 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - 412 24 2 45.45 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGCCAACTGT:1 - chr3R 13225498 3' - hobo 11 1 57.50 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATGATTATACTTTTGCCAGACAAAACGTAAA:1 - chr3R 15697017 3' - 3S18 5782 2 64.49 TTATTATTATTATTATTATTATTGGTATTATTAGTTATTGAAAGTATTCCATAGTTTTCTTCTACTCTTCTTTTACTCTTGACATAATTTTTCTCTGTGTACTTTATGCC:1 + chr2L 19398872 3' - mdg1 41 8 73.64 AGACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGATGGTCCGTTGAAGGAAGGAGTTCGAGAGCTGGCCCTGCGAGCTGCCCTGGTTGTTGCTGCCGCTG:1 - chr2R 12921402 3' + gypsy8 393 1 52.69 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACCACCAGGAAGACCGCCAGCATATCCGCCTCCTC:1 - chr3R 17619508 3' - 412 7104 2 68.52 TCCAGTTAATATCGAAGATTAAGTGCAAAATTCAAGCCCAAGTGCAACCATCATATAAAATCGCAAAATATGTGAAGAAAGAGGTGGAAAAAGTAACAACAATGGCGATG:1 - chr3R 4570058 3' + Porto1 42 1 60.00 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATAAATTCATTTCAATCGCTACGAAAATAGGTTTTTACG:1 + chr2L 6757541 3' - Tirant 19 2 54.88 TGGGTAAACACAAGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGGTCTGCATAGTCTCCGCTGCCATTAACGCCAACGAACATTTAAAGAGCTTCAATACCCGCAGT:1 - chr3R 5028902 3' + HMS-Beagle2 53 2 77.55 TTTGGGGTATGAAATGAGAATGCCCTTTATTACAAAAGTTGTATGTTTCCCTCAAAATGTTTTTTTCCGAGTTCGTATTGGCTTTTAACCTTATTTCGTTTCCGTTTCTG:1 + chr3R 31146684 3' + accord2 59 2 67.27 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGGGGAAAATGTAAAGAGAAACAAGAAAATATCAAAAAAGCTCAATGTAGGTGCTTATATTTGGAAACC:1 + chr2L 7841404 3' - jockey 27 1 63.64 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCCGATGCCAGTGGAACTTGCGGTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACG:1 + chr2L 4016889 3' + opus 7458 2 72.41 CCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGCTCTGGTTGTATTCAGATTTGGATTATTCGCCTTCGCCATGGGTTTGGGTTTCATTCGAGGTGTTAAAATGCATTCG:1 - chr2R 21302916 3' - Doc 4566 1 69.09 CACTCAACAATTATTGCCTAATTAATTTTTCACACGACCCAAGATTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCAACAGCTTTGAGTGAACCATCATGGCGTATACTT:1 + chr2L 16926112 3' - 1360 447 1 69.09 AAGCATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCCCCATCACCATCCGGAGTATCACTCAGACATTTTTCACGCATCTAT:1 - chr3L 11817734 3' + gypsy4 6466 1 54.74 ACTGATTGTAAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTTGAAATAAAAACTATAATAAGTAAACAAGTTAAAAATAAAAAATACAAAAATAAGTGAATTATTGTTC:1 + chr3R 558208 3' - hopper 224 1 67.27 ACTCTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTCCTGCGAATTGGTGGCATCATGGACGGTTCAAGTGGGCGACCTGGATCAGTGCCTGCACC:1 - chrX 16071428 3' + roo 8603 1 56.73 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGTTAAGGGGGAGACACACAGCTGCCGCCAGGATATTGCCGAGGCC:1 - chr3L 10542519 3' + hopper 1414 2 65.28 TTGGACACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTGCCTACGTCTGCACTCATGTAGCTG:1 + chr3R 26502616 3' - Quasimodo 109 2 71.76 GTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTGTTTTCTCTTAATTAATTCCTTTTTAATTTATCAGTCAAGATTAATGTTAAACATG:1 - chr3R 15471752 3' + Dm88 4404 2 57.27 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATATAAATAAATATAAATAAATCTGTCTATAAATGGCACAAAATTTA:1 - chr3R 6309808 3' - F-element 51 1 60.00 TGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTATTTGCTGCAAACCGCTAAAATTTATAGAGGCTATAGTATAAGAAATGAGGACATTTTCC:1 + chr2L 17444993 3' - pogo 1788 1 56.36 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATAGGTCGACTAATTTCTAACCAACTGCTGCCAAAGAAAATACAATGTGAGCATCGCCAGAATGCA:1 - chr3R 18576894 3' + copia 232 1 60.00 TATTATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTGCGGCCGACTCCTGCCATGTCGATTTTTCCTCCTAAAAGGCTTGAGTTGATTT:1 + chr3L 13098010 3' + Cr1a 4208 1 66.30 CCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTAAGGACTCTTTAGGAGATTAAGGACTGATTAGAATGCATTTAAG:1 + chrX 15662192 3' - invader2 258 1 66.36 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAGATTACTTTTATAAGTGAATTTGTTGCGGTTTTCCGCAAA:1 - chr3L 17706381 3' + Juan 4172 1 68.18 ATAATAAAAATTCATGTATTTTGGCTCAAAATATATAAAGCAAAGTCAAAGCTACACATTTGTATATCTAATTAAAAATGAATAAAAACATGCATACATTTTAAATAATC:1 - chr2L 10302172 3' + S2 1633 1 59.09 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGACATATATACAGGCACCTATAGCCGACCGATATCGGC:1 + chr3L 17530202 3' - Tirant 8117 2 59.72 ATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCACGCCGTAAAAATGTACACCCCGCCCACTGATGTCTTTTCGCCAACA:1 + chr2R 11990898 3' + Doc 4340 1 57.45 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGGTCGTCCTTAACCTTTTGCAGTGCAAGCCTTGATACGGTGCACATGACGTCGGCGTGTTCCAA:1 + chr2L 18675703 3' - 412 7 2 68.42 TGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGTTATGTTGTTGCGCAACTTGGGGAGCA:1 + chr3R 14938287 3' - G-element 4178 1 60.87 CTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCAATAGACAAACACAAACAATGCATTTATTATTATAATCAACAACTATGC:1 + chrX 18750759 3' - BS 4804 1 72.73 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGTTTGCCTTGAAAAAGAATTTCGCGCAGTAAAATCTAAAGCG:1 + chrX 1599449 3' - hopper 25 1 53.76 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCATCCGATGCCAGTAGCGTTTCGG:1 + chrX 21399457 3' + pogo 2073 1 68.35 ATTAAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAGAACCAAAACAATGGGAAGAATGGAAAGAGGTAGAGGAGGGAGAGGACCCAAGCGAAACGAAACG:1 - chrX 11378240 3' - Circe 71 1 62.39 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGCGCTGCCATA:1 - chr2R 9138710 3' - pogo 31 1 72.62 TGTAAGCGATCTTGAGGCGACAGTTTTCTGAATTGTGGGCAATTCAAAATTATGTGGTCTACAGCATTGCAGACAGGCCACCACAATGGCATCCTCTTTTGCAGCTG:1 + chr3R 6451742 3' - G3 115 1 74.77 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTTGATAAGAGATCCTCACGCTGATAAAAGGCAAAAGCAGCACACACAGTTGTTGCTTAT:1 - chr2L 521201 3' + roo 393 1 63.00 GAATAAAAAAAAAATAAGAAAAAAAGCGATTAAAGAGAAGTAATAATAATCAAAAGAATAAAATAATAGTATAGCTCTATAGTGGCTG:1 - chr2L 14952423 3' + Osvaldo 1522 1 62.50 CAAAATATGCCCTTCACCTTACAAGTTTTTTGACTTTAAATTTATATTATTTTTGATCAATTGTCACCACCCGAAAAAAAACAGCCGCAAAAAAACAGTA:1 + chr3L 19056525 3' + 1360 215 1 72.00 GTGAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGTTATTATTATTATTTAAATGGCCATTAACGAAGTGCTTGCTCGCTTGGATATCATCTATTTGAAGAGAAG:1 + chrX 13310735 3' - G4 3680 1 63.16 ACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGATTGCTTGGTAAATTATGTGATTTCTGGGCAAATAACATTAAAAGACCTTAAAATCGTGTACAGGGGTAGTTGATCGTC:1 + chr3R 2160851 3' - copia 132 2 77.27 ATGTGATCCGTCCAAGAACCCTAAAAGATTTGAAAATTGCCTTATACTGCCTGGGTTTATAATGAGTTCGTGGATCCTACGCGTGTATATGTGTTTGCTTTAGCATCTGA:1 + chr2L 3181214 3' + mariner2 630 1 68.18 TTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCATCAGTAAACAGGCAAAAA:1 + chr3R 14357371 3' + Rt1b 5132 1 71.43 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCCAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTG:1 - chrX 21399409 3' - pogo 20 1 59.04 ACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACGTCTGTATAAATAAATTAATTAAATTAAATTAATCATTTCGATTATTTCTCATTTAAATTGCTACATTTAA:1 - chrX 19339665 3' - Burdock 6149 2 69.09 TGAGCGACGCTAATATGGACGGACGGACGGACGGCTAGGCCTCTGCTATTCTTAACCATGGTCAAAAGCTGA:1 - chr2R 15620049 3' + micropia 5401 2 70.83 GAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTAT:1 + chr2R 6984384 3' + HMS-Beagle2 266 2 71.43 TAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACACAAACATCAACTGAAACAGCCGCCAAGCAACATTGACAGATAATAGAATGGAGCTCAGTCACA:1 - chr3R 8062959 3' + 17.6 58 1 60.91 CATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATAAAAATTTCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGG:1 - chr2L 21936090 3' - INE-1 11 1 50.91 TTTCGCAAGCGAAAAATTCTCAAACTTTCCTCCCATCCTTCGATTCAGTATATTACTGTTTTATTACTTTAACCACTATAGGTGAGGAATAGATGCAATATGAACTACTG:1 - chr3R 13670878 3' + gypsy12 9953 2 64.55 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTGCAATTGTCCAGCGGCAGACGG:1 + chr3L 15614480 3' - jockey 4713 1 71.76 GAGAAAGTAAGCCAGGAGAAATTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTAATTAAAAAGACGATCTAAACTGGAGGATAAATTACAAATTAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGG:1 + chr3R 19444900 3' + TAHRE 312 1 47.71 GAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTTGGCGCTTATTTCCCAATGCCGATTGCCTAAGCTCGGGATTTGGTTTGGGTTTGGTTTTCAGATCTT:1 - chr3R 8702215 3' - 297 6778 2 69.79 AAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTCTTGTTAGTCTGCGTGCCAGAATTCGGAATAGAACAGATACAAATGGTAAATTACAATAGTCAGATGGTGAGCT:1 + chr3R 30018028 3' + roo 8730 2 74.55 TGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGAAATTATTTTTATTGACTCCCGTCCAGTTGGGCAATGGTCCGCTTG:1 + chr3L 21115821 3' + Dm88 384 1 71.01 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAAATTGGCTTTCGCAAATTTCCATTATGCACTTATTTCCTTTTCGGTGACG:1 - chr3L 13160641 3' - pogo 31 1 57.27 AACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGTGCGTCTTATACGTGTGCGTCTTATTTAAC:1 + chr3L 18463490 3' - gypsy5 43 2 70.83 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTATGAATAGGAATATTTCAATATTAAAGAATACAGATTAATCCCTTTTGTAAA:1 + chr3L 14811499 3' - copia 4903 2 52.73 CAAAATCTGTGTGTCTGTGTGTTGTGAGTGAGTGGTATAATTATGTTTACATCATTAGAACTAGCTTATTAGGTGATTAACTTGAATTTGGTTTTTTCTTTTTGGGCTTC:1 + chr3R 11249089 3' - gypsy3 428 1 80.00 GAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAATGGTACAAGAATATCTCTGTGT:1 + chr2R 5725154 3' + Bica 448 1 80.00 GTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGACGTATTTTTTCCGCAGTCAAGTTCGCGCCTTCATGACGTACAGTTCGAAACACTAAGCA:1 - chr3R 25623714 3' + gypsy4 419 2 54.72 GTGTTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCAGAAAAAGTTTCTCTGAAGAGGC:1 + chr3R 30394839 3' - blood 7181 2 57.14 CTATTTCCGTCTCGCTTTATGAATACAGAAGAAATGCCCCATAAAATATCCAAAAGCTTAAGCCAAAACCAAAAGCGCGGG:1 - chrX 15551959 3' - invader5 3781 2 65.43 ATTATTTGAAAACAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTGCTTACTAAGTTAATTGTTAATTGTTGTAGCTCTAACGAAA:1 - chr2L 12008059 3' + 1360 321 1 62.73 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTTGTTTTAACCAGTGTAAAGCAACAGTTAAGAACTGCAGTAAAGGCAAAGAATCCAT:1 + chr2R 19684537 3' - 412 7081 2 56.88 GCCACTCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACATCCCCTAATTTCTCTTTTGCCAACGCCCCTCAGCGAGTACACTCAAAGAAGGGAGGCGGAAAATTGCC:1 - chr3L 15877879 3' + F-element 408 1 63.64 AACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGGCCTGACTGCTTAATGACATTGTACGTGGCTATGTATGCGAGCGCTTGTGTATGAGTGTGTG:1 - chr3R 10453145 3' + 412 471 2 60.00 GTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTTCTCCACTCAGACAGACGCGTCCTTTGAATCGAAATTAAATGTTTGC:1 - chrX 10341077 3' + GATE 8269 2 58.67 ACACACACACACACACAGATGCACACTGAAAACAACAACAACAAAAAGTTGAACAATCGCACACTCCCAAATTGGCACAATTCCCGATAAACTTATCAATTTGATGGGCG:1 - chr3R 15674157 3' + accord 7031 2 53.64 CCCATTTTTTGTTTTTGTTTTTGAGGACTTGTAACAGCCTCGAAAACTCGAGATGATGTTGTATGTGAAGAAGACTCCACACCCACAGTACGGAAATTTCTCGTGTTGCT:1 + chr3L 22040525 3' + hopper 140 1 68.18 CAGTGGGTGACTTATCTAGAGTTGGGGTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGCCAAATTTATGAACTCTGGATTTT:1 - chr3L 20938160 3' - Idefix 162 2 78.30 TAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAG:1 + chr3L 18417066 3' + Stalker3T 202 1 34.38 AAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTACACAGCTAACCGGCGATT:1 - chr2L 14608669 3' + F-element 4445 1 75.64 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATCAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGAGAAAACAAGCCAAATGGCAAACAGCAAATAAATAGTAAAACAACCAG:1 + chrX 14985279 3' + Stalker3T 204 1 51.82 CCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACCCATATCGCGTTCTCGTCTGCGCATATTTCTTTTCCTCTGTACTTGGG:1 + chr3L 14644061 3' + 1360 3196 1 67.09 CTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCTGACGAGTTATGAATCGACATAGCGTTATAAAAAAATTAGCTTACAAT:1 + chr4 319803 3' - flea 152 1 56.36 GGGATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAAAAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAAAGACAAAAAAAAGA:1 - chr3R 17162149 3' - accord2 7333 1 62.50 TAGGCTGTTGGGGTGTACATTATATCGGCTGGGGGGCGAGGG:1 - chrX 7677144 3' - jockey 4666 1 52.38 CGTGTTCTAGCACAACACGTACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTTTTTTTTACAGACTTATATGTAGTAATGTAAACAGGGTGTTCCGTTTCTG:1 + chr3L 2062226 3' + 1360 3205 1 51.58 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGG:1 - chrX 18193726 3' + hopper 1399 1 57.14 TCTTGGATACAAGTGCTCTTAGGTTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCAATACTTTTGTTTTTTGGGACTGCGAAACGCCAAAACCATTGAAAATGGCGTACTATATTTG:1 - chr2L 1721223 3' - Idefix 7139 2 67.27 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTG:1 - chr2L 19129337 3' - FB 34 1 65.26 AGCTGCAGGTGCAGGGCTCGGCGAGCGTTTAGTTGCCCCAGCTGCTTCAAA:1 - chr2L 20472250 3' - Chimpo 4189 1 62.75 GTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCTTTAATTAATTGTTAAAATTGATTTTGTAATGTTTAATTTTAAT:1 + chr2R 649581 3' + gypsy3 133 2 62.75 CTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTCTCCTTGCCGTATTTAAATTTAAATCCATACATCTACTACATATTCTCGTTTAGGTTCAAGTGTTTTAAAATTGCTTTATCA:1 + chr3L 18752429 3' + McClintock 182 2 78.18 ATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTTATGCGTTGAAAATAAACAAAATTAATATGCAATTAATCGCCCATCACAAAGGAACAACACGCTGCCAATACAAAC:1 - chr3R 30295521 3' + 1360 163 1 63.64 AACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTTTTATGATTTATTGTAATATACATCTATTTGAATCATGTAGAACCCATGTAAATTTACAAT:1 - chr2R 18397999 3' + S-element 1697 1 62.96 TATTTTTGTATTAATATATTGTAACTAGAAAATTTTAATTTCCACACTGAATTGACAACCGTTTCTAAATCTCCGCATTATTATGAAGTGTCATTGTGAAATTAATTTTG:1 + chr2L 18291628 3' - hopper2 1541 1 78.18 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGTCCAAATTAATATATAGCACGAAATATTATAAAAGCTAATGAACAAATATGATAATTACACAATA:1 + chr3L 8011478 3' - pogo 20 1 62.73 TATCTGATAGTCGGGAAAGTCAACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTTATATTTATCATTAGTCATACTCCATTTATTGGAGCCGAAAGAAACCGACGAACC:1 - chr2R 5299390 3' + INE-1 559 1 77.14 ACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATTATTCCGAGAATCGTTTGGCGCTAGCTCGACCAA:1 + chr3L 10838949 3' - Bari1 1549 1 65.71 TAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAAAAAATATATGGTATATGTTGGATCTGAATTACTTTTATACTCGGCATCACTCTCTACCGCGTCGGCG:1 + chr2L 22490462 3' + HMS-Beagle 249 1 67.37 TACAGGCGCTCCTTGGTATATGAGGACCAGAGATATCGAAAGCGATCTGAATGTGACAAAAATTGGAGACAGGATTCAGGAAGGGTTTAGTAAATCTTCCTATGGAAAGT:1 - chr3R 12453681 3' + jockey2 2990 1 74.55 AAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCAACGGAAATTCAACTTCACTTCAAACATAACGAGGTATTGTTGCTGTCGATCCATTAACTATATTACTATTT:1 + chr3R 25087134 3' - copia 4837 1 72.73 GGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACCAGCACAGTTAAACTAAAATAAAATAAATTAAACAACTATTAACAAACA:1 - chr3L 13086389 3' + HeT-A 6029 1 69.23 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATTGCGTTTCGGTTTATATTGTGTAATCCTAAGCATATGATTGAATGAAAACACGTAGAACCTTTAATAG:1 + chrX 6866877 3' + S-element 1705 1 37.61 ATTAATTTTTGTAAACAAAACAGGCCAACTGCCCCATAGTGCAATGCCATCGAACGCAGCTTACACAATGTATAGCACACTTTTTGGGGC:1 - chr2L 6311250 3' - hopper 20 1 50.00 AAAATCGTATGGCGTTACGCATACGCATACGCATATTCTAGGGTCTTTGTTTTTATTGCAACACGTTGCACGTTGCTTCTTCCTTTTGG:1 - chr3L 14902400 3' - 1360 22 1 47.19 TATAGTTCCTGAGATCTCGAAGTTCATACGTTCAGATGGTAAGGTCGCCTCTGCTGGGTTTAAAAACTTATTCATGGACTTTAATTTTGTAGATCATTCGCTGGATTCTA:1 - chr2L 14163131 3' - INE-1 144 1 70.00 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGTGGACAGACATAAACTTTGATTGCAAAACTAATTACAGAAA:1 - chr2L 13836514 3' - blood 7030 2 58.70 TTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAGTGCCACAAGAATTATTTAAAGTTTCAAAACTATGCACTATTTTTGAGCATTTTTGT:1 - chrX 14827577 3' - G2 3044 1 53.64 GCATACTTGTGAAAAACACATTAATGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCAC:1 - chr3L 10506760 3' + hopper 1380 1 53.64 AATAATAATAAACAATCTTACATGTAGACTTCGTCTCGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + flea 5013 2 40.00 TTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTATCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGATTAACAG:1 - chr2R 9871027 3' + roo 410 1 76.40 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTATGATAATTTTGATTCCTCCGAACCTTAAATT:1 + chrX 8808799 3' - roo 8690 2 62.50 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTGCGTAAATTCCTAGAAACTATTCGGGGTCGTTGGTTGCTGAGAGA:1 - chrX 21399365 3' - pogo 3 1 76.36 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACGCACAAGCAGCTACAATTTGNT:1 - chr3L 10702641 3' + hopper 1363 1 75.73 AGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCCGAACATAAAAGTTTGTAAGGGTCGTGCAACTCATAGTTTATCTTCGGTGTAAATGTATTTTGGAATATTTGTCCTTGCTGA:1 + chr3R 16542180 3' - Cr1a 4211 1 60.91 GCCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTCTGTGTTATATATAATCCTCCATAAATTCCGATTATTGTTGCCTTAATATTTTATCATTTACTGTATGATAG:1 + chr2R 4954783 3' + 1360 3377 1 75.49 GTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAAGCTCACAAACAAACAGATAAATGGCAAACATGTCATAAAAGGACTTCATACGCAATGCCTCGCTCG:1 + chrX 19393582 3' - FB 918 3 68.57 ATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATT:1 + chr2L 21570255 3' - Dm88 36 2 56.36 CTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACACAAATGGAAAAGCAACAACAGCAACGGCAG:1 + chr3L 563910 3' + Burdock 6327 2 60.76 TTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAATATT:1 + chrX 21667913 3' - gypsy2 48 2 69.31 TATGAGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGTTTGGTTAGTCAAACGTTTGTTACATTTCGCTGGCTAAAAATACGGCA:1 + chr3R 22500890 3' - invader3 1 2 76.19 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGATATCGTAAATTGGGGCACCCTCGAAGTAATTGAAGAAAACCGTTGGCATCGATCGGTGGATGGCATCTTTCA:1 + chr3L 18072827 3' - 412 12 2 70.00 TGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCACCTCAGTGATCGTTAATGAAGACAACGCAGTCCCGGGCCCACAGCTCCGAAGCCT:1 + chr3L 290965 3' - roo 133 2 66.67 GGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGAAGGGATCCGAAAAGCATACAAGTCTGTCCGTCCGTATGAGCGTC:1 + chr4 958535 3' + R1A1-element 5281 1 93.94 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAATTTTAATTG:1 - chr3R 12623704 3' - roo 37 2 60.55 TAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACAACGTAGTGCGGCATGAAAAATGCGGCATGGACGTGGAACAGATCGCTGGATTTTCTAAATGAG:1 + chrX 8772152 3' + R1A1-element 251 1 71.88 GCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAGTACATGTATATAGAAAAAAAAATACTTTTATGGATTTTTCAAATATTTCCTATATGCATATATATCCATA:1 + chr2R 8083869 3' - Idefix 11 2 69.72 TGATGGGATATTTAAATCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCTCGTTAGCCACTCCCTCAAGCACGGGCTGGCACTCCTTGAGCTTT:1 + chr2R 1807321 3' - F-element 4393 1 51.09 ACTTTAAATCTAAATTATTTTTGATCATGAGTACCAGAGTATTCAGCTTGCGATGTGTGAGAAATTTATAAGGCAATGATTGTTGACTAGTTAAACATAATAAAACGATG:1 - chr3L 233349 3' + 1360 247 1 78.18 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGACCCATGTACGATTCAATTG:1 + chr3R 25125931 3' + 1360 3363 1 63.46 TATGTTTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTCTATGTC:1 + chr3R 22316301 3' + 412 7128 2 26.92 TAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTT:1 + chrX 21667916 3' - gypsy2 54 2 69.09 ATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACA:1 - chr2L 16067087 3' + HMS-Beagle2 264 2 72.82 TTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTAACAGAAATTTAAATCTTGTATACCCTTTTATTCTTTTTGCTGCTTAGCTTTTTTGCCCGTGGTTCTTCGCACAAGTGATCGAT:1 - chrX 6571933 3' - INE-1 312 1 53.64 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGCGTTCATGTGTGAACAATAAGCTTAAAATTTACACCTAGCTTACACATATAGA:1 + chr2R 15497976 3' - roo 36 2 72.34 CGCGAACACGATTCCACCTGTGTTTCGCCGGCGACAAACAACCTCTTCTCTGGGACTAGGTCCTGTGTGCACCTCTGTGTGAGATCCTTTTTTC:1 + chr2R 20819893 3' + gypsy12 9931 2 53.19 CCTACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATAGCTACCGGATTTAGGACCACAACGAAAAAAAAATCGCGACAAACGGATGCGAAACATAAAAACAAAAACAAA:1 - chr2R 14456288 3' + Porto1 4309 1 67.27 AAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGGGTTGCGGATGCGCAACATGGCCAA:1 - chr3R 18767114 3' + Stalker3T 203 1 36.56 GGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGGTCAGAATAAACACACGTTAAATTCAAAGTGGAGAGC:1 - chr2L 20146511 3' + Porto1 4293 1 69.23 GTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAACAACCTTCATACGTTTACGCCTCATATCTACTAATGGACTTAAATTAAAAC:1 - chr3R 15614336 3' + Tirant 8406 2 71.96 AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTAGTCAAATCTTTATTTAGAGCCGCTAGA:1 - chr2R 4481385 3' - copia 4928 2 78.18 AGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAATGGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACCTTGAAAAATTTGGTGACCACCCCATGGGC:1 + chrX 2153122 3' + Porto1 4238 1 70.91 AACAAATCATGCGCTAAAGTGTAAGCAAAAATGTGAATTGGTTTCATGTGTTGATGATGATGATGAGAATGATGATGCAGATGTGGGTG:1 + chr2R 16087049 3' - rover 7055 2 58.43 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACATTTTTCCTGGCATACAAAACTAAATTAGTGAGAAAATCATTTTACGAGCCCCAAAAACGAACTCGTTTAACCAA:1 - chr3L 5971642 3' + pogo 2094 1 70.91 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGTTGGAGTAGTTGTTGGTGTTGCTGTGTTGGTGTTTTGTGGGCTTATTATCCCATTGTTGTTGTGTGTTTTCCG:1 - chr2R 23796667 3' - blood 7023 2 70.91 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACCAGTGTTTATGTGATCTACATACTCCCTCCCACTTCTCACTTCATTTTTGGATTTA:1 + chr3R 14013426 3' + roo 9041 1 52.29 AATTGTATTAGTTAGAGACGGACCTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAGAATTTTTGCATATTCAACGGGAAGCCAATTTAATTAAGTTTCCGTCGCATTTTGT:1 + chrX 17611390 3' - Doc2-element 4660 1 55.34 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCG:1 + chr2R 9871533 3' - roo 17 2 65.22 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCGAGGAGT:1 - chr2L 13710672 3' + copia 217 2 60.91 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCG:1 - chr2L 16742258 3' - 412 56 2 75.45 GCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGGTCCAAAGCGGTCGTAAATGCAAAAGTGTGG:1 + chr2L 3777200 3' - Quasimodo 417 2 63.95 CTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACGTCAGATTAGTTTTATATTTTTATATATCTATATATCTCAATTCTTTCTTATAGACGCCAGCAC:1 - chrX 16790504 3' - Circe 7153 1 54.13 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGGG:1 - chr2R 24031484 3' + 1360 3374 1 60.29 GAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCCACGCGAGAATATCTTTCGGGAAGG:1 - chr4 833149 3' + roo 70 2 70.93 AGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAACGCCGGGTAGCTTCGTGAGAAGGGTGGGGGTGAGGCGCGGAGGCCCTCATAAAGTAAAGC:1 + chr2R 5865154 3' + Doc 4347 1 60.61 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTGCAATTGTCCAGCGGCAGAAGGGAAATAAATGTGGCTCCAGGG:1 + chr3L 15614501 3' - jockey 4717 1 59.09 TGGTCGTTGTCCAGTCTGCTAGTCCGGGCCAGGAAGGGATCGGGGGTGG:1 + chr2L 21923903 3' - G2 2848 1 91.84 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACGGTACTG:1 + chr2R 2427632 3' - Doc 13 1 68.81 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGTTGCAAAATAAATAACTATACTATATAATCAAAACTTCGATGTGTGTTACAATAAAAAACCCTCA:1 + chrX 3290061 3' - roo 13 2 64.55 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATTTCATGATTTTTAAGTATAAAGAGCTTAAAGATTGTACA:1 + chr3L 2987423 3' - blood 44 2 61.82 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCTCATCT:1 + chrX 4186821 3' - copia 24 2 55.56 TTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTTTGCAAAAACTTTTTGCCACGCCTACTCTAACCCGAAACGGACTCATCTGCATACGTTTT:1 + chr2L 13870454 3' + INE-1 298 1 65.12 CCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGGC:1 - chrX 20330505 3' + P-element 2885 2 77.00 TTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTTAACAAACATCGCTGTAAAAACGACTTCAAGTTGTAAAGACAAATATAATACAAAGGTGCTG:1 + chr2R 9712460 3' + Juan 4058 1 62.26 GATCCTACTAGCACTAATATTAAATATAGTTGTTTCGCAGGTGTTGTAATATTATTTGGAATTATGTTGGAATTTCTTGTTTTCTTTGCTCTCCGTTTGCG:1 - chrX 7416083 3' + Cr1a 4294 1 69.31 ATAATTTAAGCAGATCCAATTACCTTGAAATAAAAAAAAAGTAAAAACAACGACCACCTCACCAACAAAAGCAAGGCGAAATGCGGTCAG:1 + chr3R 21612761 3' + jockey 4938 1 71.11 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGAATTTATTTAACATGATTTGGTGTGTAGTTTATTCATCGTTTAAAT:1 + chr3R 12623781 3' + roo 9036 1 63.64 AGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAACAGAACAGATCAGAACAGATCAGAAGAGATGAGATGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGA:1 + chr3L 22908067 3' + Stalker3T 204 1 72.73 ACATGAACCTACACACACACATACACATCCATAGCCATAGCCATGTCCATGTCCTTGTCCAGATTTTAAAAACCAAGCGCTTACACATGCATGA:1 + chr3R 13346560 3' + accord 248 2 74.47 ATCCCCCAGGGAAGACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACATACATATTAACACCCACATCTCCTTTTGCCAGGTGCACCAGCGGGG:1 - chr2R 10754235 3' + transib4 2361 1 67.42 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATTGAACAAAAAGTCTTGTTTACAACTATTGTTAAGT:1 + chr3R 17419758 3' + I-element 5311 1 63.64 CACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGAGTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGCTGCTTTTGAGTATGTGCAGCGGAAAGG:1 - chr3R 21396789 3' - TAHRE 10377 1 74.55 ATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTCTTGTTCTCGCTGATGATTCGTGTGTTATGCAATCAATACGATAATTTCAACATTTCTACAA:1 - chr3R 13823598 3' - Stalker 6989 4 60.00 AGGCAGCTATGCGAATTATACTGTATTAAGAAATGAAATCAGAGTGAGGGCAGTT:1 + chr2L 4013051 3' + pogo 2099 1 49.09 ATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGTAAATGAAAGGAATAATAAATCGGTTGGATTGCCCGGTCCCAAAAGAAGAACA:1 + chr3L 7737861 3' - I-element 5037 1 58.59 ACAAGCACTCAACAATTATTGCCTAATTATTTTTTCACACGAGATTCTTTGGTTCACAAATGTAGGTGGCATCTCTCATCACTTCTTTTTCGATCACTCACTTCCTCTTC:1 + chrX 12298513 3' - 1360 452 1 68.18 AAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 85.45 AACAAATTCCAAGTTTGCACACTTTTGAGACTATATATAAACGTTAGAACATCACACAGATTTAAATACTTATGCATGCAAAAGAATA:1 + chr3R 11957291 3' - S-element 1533 1 68.18 AGACTAACTTAAATAGTCTAGCATTGGCTAAAGGGGCTACAGCTATATTGGTTTTAAATGCTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATAT:1 - chr2R 23607778 3' - I-element 5312 1 84.95 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTATGCTAGTCGACAGTCGCCATGACATTTCAAATTTACGGGCTATGACAAAGAGAGTTAAATGC:1 + chr3L 9198538 3' - 1360 21 1 58.18 CTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGACAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCCTTTTTCAGTAAATACATATTTATTTAACTGC:1 + chrX 21075094 3' + F-element 4502 1 67.31 ATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAAAAATTTCAATTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATAACGGAAAAA:1 - chr3L 8411632 3' + Rt1b 5088 1 60.00 TCTACTCCTTAACTTTATATCCTAATATGGGCGTATTGTGGGCGTGGCAAAAAGTTTTTCCAAATCGATACAAATTTACAAGACTAATAAATATATTTTATTATTAATAT:1 + chr2L 3539285 3' + transib3 2711 1 75.45 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGCGGCAGGTTATAATTC:1 + chr2R 13699508 3' - jockey 4762 1 76.92 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCTGTCAGGAAGGAAATATTTTGCCCTCCCATCTTAT:1 + chr2L 13558229 3' - FB 39 1 63.27 ATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCTGGGTTAACGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGCATTTGGTTCTCAGAGCAAGGGAAAATGA:1 - chr2L 15812310 3' - I-element 164 1 76.15 ATAAACTTACAAGCTCAAATATAATCCAAATATAATTCGTAGGCCATGCACGGCTTAACCCTCGAATGCCCACGATTTCAAATATATGCCCGTGTGCTACATTG:1 - chrX 11178543 3' + gypsy7 5404 2 64.42 GCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACCGCCGCCG:1 - chr3R 22413215 3' - micropia 5 2 64.44 ACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAGAATGAGTTAAAAAAAAACATAACAAAGGAAAGATGACGACTATGACTAGGCTAACAAATCTAGTTCATATACGTACA:1 + chr3L 8656941 3' + I-element 4958 1 78.18 AATATAAGTTATATAATAATATGCATCTAAATTTTGTGTCACCTTGGTATCATTTCCTTTACTGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGTTTTGGCTCCCTAATA:1 - chr2R 21444039 3' + Doc2-element 4698 1 78.10 TAGCAACAACGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATC:1 - chr2L 18675628 3' - 412 55 2 70.00 GCAAGCACACACACACACACACACACACTGAGACCGAAAACGCGCGAAAGCTAAAAAGGCAGTTAAGACGGCCTGGCACCTG:1 - chr3L 6779239 3' + accord 7025 2 58.54 ATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTACATACAAGGCTATTCTAGGCGCAATAAAGCGTGTTTTGTAAACTTTTTT:1 + chr2R 6652831 3' - 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Porto1 4205 1 67.03 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATGCAGTTCTCCTCTCATTAAGGATCTCCGGCCATAAATCCCTGC:1 - chr2R 20924180 3' + mdg1 414 2 75.45 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATATTTTTTTACGAAACTGTATTAT:1 + chr2L 14848445 3' + pogo 2073 1 75.00 GTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGATTTCTGACGTCCGTTGTCTACGAATATTTT:1 - chr2L 2277672 3' - Ivk 5060 1 65.17 GTGAGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACTAAATTAATGGGAATGAAATGTTCATCGCACATGCTGA:1 - chr3L 18878532 3' - FB 703 2 68.18 CAAATAAAAAGTATATTTTTTTAATGTTTTCAAAATTCTGATTTTAATATTAGTTTTACCTCAATTGTGACCACATTTTTTCACGGTGCATGGGCTGGATACGAATGGCT:1 + chr3L 9489959 3' + Idefix 7362 2 60.91 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCAAGTTTGGAAGGAAGCTATATATT:1 + chr2R 8397513 3' - 412 23 2 58.10 CTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCCGCTCCTCCCACCCAGATCCTATCCAGTTTCCTCCC:1 - chr2R 22033600 3' - invader1 182 2 78.35 AGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCCACGAACGAAAAAATGGGAAACGACAATTTTTCACAACAGAATCCTCCGCCGATGGGCTTCGCAACTGCA:1 - chr3L 10094663 3' - R1A1-element 5063 1 69.44 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGGATTTAATTGATTTCTGAGAATTTTAGA:1 - chr3R 27071849 3' - jockey 4696 1 53.64 GAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACTGGAAGAACATTATCTCTTCGCCTGACTGCAAAG:1 + chr3L 22065743 3' - X-element 47 1 61.90 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATCAATTATTGGCCAAGTCTTTGTGCTATTTATGAGAGGCGG:1 - chr3R 29635205 3' + mdg1 412 2 65.33 AGTTAACACAATCACAAAACACCCGTTCAGAAGACAAACGCAACAACTGGCCATAATAAAAACAACGAGCGAGTGAAATACATACATATATG:1 + chr3L 5612463 3' + Burdock 6137 2 78.26 TTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGATTGGGTGCCGTGAAACGCAGGTAAATGTCGAAGG:1 + chrX 11363050 3' - McClintock 6204 2 69.49 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGCTTTAAAGTATTGTGAAATGGATGCCATCCAAGATCCGTATAAGCCG:1 - chr3L 12300122 3' - 1360 25 1 55.91 CATGTGTATTCTAACATAACTCAATCTTATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATACTATCGCTGATATTTTTCTCTGTGTATGCGAGCTTTGGT:1 - chrX 3346407 3' - Transpac 4956 2 59.26 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCCAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTAATGTTGAACG:1 + chr3L 12677117 3' + pogo 2054 1 75.76 TCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTTTAAAAAGCAATGCAAAGCAAAAATAACGGAGCAAAGTGGTATTAAAATAAGATTCGAAAAGGGCAATACAT:1 - chr3L 604533 3' - S-element 334 1 61.11 CTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAATGCAGATTCTAGTGACCCCTACGTTGTGCACGTTTGTTTTTAGTTTTTCTATTGTTAGTTGTTCTTGAAAAATTTTTTA:1 + chr4 658812 3' - 297 177 2 72.38 ATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCAGTTATTGTTATTGTCCAGTTATTGTTCGCAGGATTTTTGATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGT:1 - chr2L 21637282 3' - Doc4-element 2761 1 59.18 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCCATGGCAATGCAGTCGAGTGTGAGTGCGAGTG:1 - chr3R 11315229 3' - hopper 45 1 69.00 AAGATTCAATAAATAAGCAAAACATGGAAAAGAAAAAAAAATATCAGCAAAGGTATTGTTGATTCCATTTAAATAACTATATTGAGACTTGGCAATCGTAATCTACACCT:1 - chrX 20507933 3' + Doc3-element 4708 1 67.27 ATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTTATCAAGAGTGTTTATTCAATA:1 - chr2L 10750121 3' - X-element 4558 1 73.81 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAAGTGGATTTTGCAGACCACAAAATGGCTTAATAGGCGAGCCCAAACTTTGGGTTTCATTA:1 + chr3R 13183300 3' - hobo 8 1 69.47 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACTTGTGTACATACATACATATGTACCCAGTACATAACAAGTGATGACACACTTTTACAC:1 + chr2R 9552377 3' + S-element 1705 1 65.98 CAATTTTAAGCCTTTTTTTCATGGAATGGATAAGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTGCAGTCATAAGCTGTTGACATTTTGTGGAGGATATATT:1 - 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chr3R 4344110 3' - Tc1-2 1279 1 56.19 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGGAGATTGTTTCACCCGGACTCCGCACTCCACCACTCGACCCCTTCTAACCAAGTCCAAA:1 - chr2R 15418365 3' - hobo 9 1 68.09 GTACATTTTGTTGTTAAATCACAAATAGTTTACATAAAAAAGTCTATCCTTACACTTTTCTTCCTAATTATTTCACGTACTAAAGATCTTTCAAAGTTTTTTACTGCATA:1 + chr3L 9878382 3' - transib2 2756 1 40.91 ATAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAATTCGATGCTAATTTCGGGCTAATAAATTATACCTTT:1 - chr2L 9602642 3' + gypsy7 5011 7 69.84 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGCATTTTAAGGCTCGTCTGGG:1 - chr3R 31633169 3' + opus 7489 2 67.27 AGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTATCCAAGCTTTAATACTTTTCAAGATCTCAATGTTCTTAGTATTGCATACATTTT:1 - chr2L 19364079 3' - BS 4784 1 47.06 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCAACGCTTTTACTTTCAGTGTG:1 - chr3R 25051564 3' + 17.6 480 2 70.87 GAAAGGCAGTACAGAGATTTTGCTCTGTGCCACCAGCTGTGTCATCGAGACGAGGGCGTCGTTCAGGAGCTTCTC:1 - chr2R 23805272 3' - 3S18 5715 1 86.67 TAAAAGGCTACACAAAAAAAAACCCCATTTGTTTTATTCATTAATTTTGCGCAGCACTGTTGATTAAAAAAAAATATTAAAATTTTAAGTTTTAGCGTGTCAAATGCAG:1 - chrY 1447524 3' + G2 3067 1 63.30 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAG:1 - chr3L 5320604 3' - roo 31 2 63.83 TATTCTTATTACTTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAAATGTTCATTGTTGTATATTACCGATACTAACACAATC:1 - chrX 17950266 3' + Gypsy6A_LTR 234 1 67.89 AAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTGGGAAAATTGGGTAGATTTTGAGCGCTTTTCCAGGGGGGGCGTTGCGAGGTGTTATGGTCCAACATTTTCGCGCATTT:1 + chr3L 6502769 3' - I-element 4989 1 73.64 TATTCTTGATTAGGATCAATAGCGATGTCGGTCTGACCATGTCCGTCTGTCCGTCCATTCATTTAAAGTTTATCACGCAGCTTAGTATTCGTAAAAATCTATTTT:1 - chr2R 15003594 3' + INE-1 85 1 80.00 CACACTAAAGTGAGGTCTTACTAGATGTAGCAAGAAGTAGCTAGAAACGCCATTGTCACCGGTTGGGGCACCC:1 + chr3L 19607766 3' + gypsy12 69 2 63.01 AAGAAACTCTGTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAAAAACTTGAGAAAACTGCGGTTTTTTTCAAGGACTCCATTGTGCTTGGTCAAG:1 - chr2R 25116977 3' + mdg3 5037 1 55.88 CATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCCCCCGTTCTTTTGGCACTCGGCATTCAACACACAT:1 - chr3L 17444932 3' - flea 4737 1 61.96 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATACATATATGTATATAATAATTTGTAAATTAATGCATAAAATGCATAATACT:1 + chr3R 4553318 3' + Juan 4185 1 50.91 ACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATTTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCCATTGTCGTCAGCTTAAGATTTTGATAAGC:1 + chr3R 22848179 3' - Doc3-element 4538 1 75.96 AAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTTCTTTGAAGATGCCTCATTTTATATTTT:1 - chrX 16067426 3' + FB 637 3 74.55 TCCCACTTCTGAAATGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTATATGTGTTATTTAATCACTGACATTAGTCACCTTTTTCGTTATCAAAATCGATCATA:1 + chr3L 11244742 3' - Bica 157 1 54.55 TCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACGAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACAC:1 - chrX 9845361 3' + I-element 5064 1 30.91 GACATAATGACGTGCAAGTGCAAATATACACAGATTTCAATACACTCTTGCACACCGAATGAATTTAAAATGAATTCCTGTTCAATTGAGTTTGGCGTGTTGTATGCGAC:1 - chr2L 9987958 3' - accord2 7280 1 78.18 AACGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTTAGCATTCTCTTATGTTTTAAAATACATTTGACATTCACAGTTCATTTTGTGACGCTGTAGATTTTAGGGGCACCTC:1 + chrX 21421895 3' + INE-1 553 1 88.99 TTTCCCTTTCTCTTTTTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - invader5 3890 2 88.17 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTGGTTATTTCTTCTACTTGACTGGCACGCAGATGTGGGCCAGCGTTCCAGCCATAAGGC:1 - chr3L 16301059 3' - mdg1 9 2 62.64 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTTATTACAAACTTTTTAAAAATGAGATATATGTTAAAGAACTCTTTATTTTTTTTTGTTTTTGCCTGCTGAAAAAT:2 - chr3R 26733965 3' - hobo 9 1 72.73 TAATTTAAAAATAAAAAGATATTATTTTTATCTTAAAGTAAATAACATTGATTTTCATTTCATGTTTGTGTTTTGACCAATGCTTTGCTGTAAT:1 - chrX 17681929 3' - P-element 2587 1 70.21 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGCCTGTTTTTACTATCGCTACTGGCAGGA:1 - chrX 1503349 3' - roo 8674 2 60.94 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACACGTTGTTTATGTTCTTGTTTCACTCAGGC:1 - chr2R 7981121 3' - 1360 25 1 58.72 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAG:1 + chr2L 9754842 3' - 1360 36 1 69.77 CCTTCATGCTCGACGTTTGAATTAAGTGCATATGGATAATCAAATGATCTTTTATTGATCAATCAGCGGGCGTGTGGAC:1 + chr3R 19803116 3' + R1A1-element 5040 1 77.22 CGTGCACGCTCCAGAAACGGTCCATCCTCACACGTGGCTGGGCGATACTGGGGGCGGATGTGTACATCGGCTAT:1 + chr3R 28695065 3' - Max-element 8146 1 67.57 CATTATTGTAAAAAACACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGTGTATATATGCATACGTAGTTGTATGTGTGTTGGCCTGGCCCA:1 + chrX 15227688 3' + hopper 1398 1 55.06 TGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATACTTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATTCTTTGTCTCCTGTTGAGGGCGTGTG:1 + chrX 14670739 3' - I-element 5201 1 73.83 TATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACATAAAACTGCCACCAATTGATTGAGATGTAATCAAAAAGGCGACCCAAACAAAAAACAAAGGGATGAGAGCTTT:1 - chr2L 18037612 3' + gypsy4 468 1 77.67 CGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATTTTAGCTTTTATACAACCGATATTGAGGGAAACCTAA:1 + chr3L 6090746 3' + F-element 4376 1 67.27 TGTATATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGGGAAAAAATTTCATAGGACATACATATACGTACATA:1 - chr3L 5651598 3' - blood 7182 2 80.60 GAAACCAATTTGGACCTATGACTATCAACAATGGGGAAATACCGGCAATATCAATATGGAAATCGTTCAATGAGCTCAATAATGGATCTAATAACGCCAAGTCACGTGGG:1 + chr2R 19206341 3' + F-element 4255 1 74.55 CATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCAACCGCCGCGTTTTGGCCATTCAGGCGAAGAAGAAGCGTCATAAGAACAGGAAGCGAG:1 + chr2R 15381966 3' + invader4 2987 2 67.00 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATAAAAGCCAGCTTATTAAGCAGTAAATTCAGGATCCCA:1 + chrX 22806739 3' + Burdock 6383 2 47.83 GGTTCTGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGCTCGACTCCGGTAAAATTTGGGTGGTGCTCGTGGTTGAGGTCGAC:1 - chr3L 9715835 3' - I-element 4952 1 73.33 AACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCATATACCTGCTAGAAACATAACAATATATGGAGTTTTTGAAATA:1 - chr2L 6940167 3' - 3S18 327 2 60.00 CAAGCAGAAACACGCAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTGGAATTTTTGACTTTAAA:1 - chr2R 12869195 3' - invader1 3633 2 88.18 TCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAACCATTTGGTTTTGAACTAATCCTTTAATAAGTAAATATAATCAATGTTAAATATAAAT:1 - chr3R 17933537 3' - G2 2752 1 61.29 GCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAATTTTGCTTTTTTAGACCACAGACACATTAGCACAACAGATCA:1 - chr2L 8194367 3' - R1A1-element 82 1 58.25 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGTTGAGAGGTTGGCCCAGATCGCTGGCTATTAATTTGAGCTTAGTTCTGCGGCGCTCGACAA:1 - chr2L 20526018 3' - hopper 16 1 65.38 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCACAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTAGATGGTTTTAAA:1 + chr2L 21034140 3' - 412 22 2 59.09 TAGCCTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATAGTTTCATCATCTATGCACACATGTACATCTGACAGCGTTTTATCGGTGCGGGAAGC:1 + chr3L 2121038 3' - I-element 26 1 46.08 CTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCACCACATTCGCAATAATCCTGATTTATTGCCGTTTTGT:1 + chr3R 10456622 3' + G-element 4141 1 64.52 AAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCTTTTAAAAATAAATTATTTCGTTCGCCACTCACCCTTTTTGTTTATTTGGCTTGGCACTTTGAGGCCTTTGCTTTTTTAATTT:1 - chr2R 17207331 3' + FB 668 2 56.36 GAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCTGCAATGTCCGGCCGATAAAAGTGATACGAAAAATCATACAAATTGTAACTGACCTGG:1 - chr2L 10030331 3' + opus 485 2 76.36 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCATATGTAGACCTGTTCCACGCAGCTTATCATTATCTACATACAACTATGGAT:1 + chr2L 12591798 3' - roo 31 2 54.55 AAGGTGTGGCCATCCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACCAAAACAAATGGGCTCTGAAAAGTAAC:1 - chr2L 19808520 3' - copia 57 2 79.09 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGCACCACCGCCGGCGGATTACTCGCT:1 + chr3R 23943235 3' - P-element 42 1 32.26 ACTCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGG:1 - chr3R 31045712 3' - INE-1 91 1 72.63 TAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATGAATTGGAAAGGTTTGGTCATGGACTGAGGGATATTCCCGCTGTTTTC:1 - chrX 16134788 3' + jockey 374 1 56.36 TAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAG:1 - chrX 4186821 3' + Stalker3T 202 1 75.23 GCTCAAAACTACCACGCCCACATATTTGAAAATTTTTTGGTCAGGTCCGTCTGTATTCGTTCCCATTTACAAAGTTCCAAAAACGCA:1 - chr3R 25640926 3' + INE-1 241 1 62.07 CACACATACATAACCACATACATACACAAAATCCGATCCCAAATTGATTCATTTTTCGGTGTCCCTTTGTATCGATTGTTTTGTGATCGCCTATGTTTACATTGGC:1 + chr3R 31542193 3' + Quasimodo 48 2 75.47 GTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATATATGCACAACTAAAACCCTACATACTTACCAACCATACACACGCACCACGTATCCGAAGACG:1 + chr2L 1422753 3' - 17.6 2 2 57.45 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTATATTAAATACTTATTTAATTACAGCATTTAATGCATTGGAATATACATTGAAT:1 - chr2L 19320449 3' + Juan 4180 1 58.18 CGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATCTATGTATTGGCAGACTCAGCATGTGAAAAACATGTG:1 + chr3L 23996567 3' + HMS-Beagle 228 2 55.42 GAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGCTTATTTGTACAATAAAAAAAAATAAACAAAAAAAAAAACTCGGAACAAAACACTCTCCATCCCTGCCTGCAA:1 - chr3R 15872450 3' + Doc 4647 1 74.29 CTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACAAGACAGTAGTCTATCTTGTTGATTATAATTGGTTTAATGA:1 + chr2R 5529033 3' + I-element 4986 1 62.73 TTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGTAGATTGGAGCATCTTAA:1 - chr2R 10090981 3' + roo 410 1 79.80 TGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTGTTTTTCCCTATTTGGTTGCACTTTGTTTTTCTACTCTTTTCGCTCATGTCGCTGTCGCTGTTGTTGTTCGTGT:1 - chr2L 10637608 3' - Porto1 4397 1 71.82 GACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTAATGGGGTTCCACTTGCATTTTAAGCTA:1 - chr3L 4582715 3' - F-element 4213 1 74.55 AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCGCCTTTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCATTTTGGTATTTCTTATATATTAACATCAATTACTTTGTGCAATG:1 - chr3R 11131322 3' - 1360 78 1 56.07 AATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATAAGTTTTTTTTTTAGCAAGCTCGGCAAATTGCGTATGAAGATCAATTC:1 - chr2R 18054365 3' + FB 31 1 68.18 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGTTTTGTAAATAATTGTTCTGACCTCATCCGGTTTTCATTTAAAAGAGCTGTTTGCTATTGT:1 - chr2R 18523515 3' + roo 9053 2 57.94 ATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATATTGGTGACCCCGCAATAAGCAAAACGCGAACCAGCGAATCGTTTGCCCTACGCCCATGGCCG:1 - chr3R 20193162 3' + Chimpo 161 1 65.14 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAAGATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTTGAGTTCTGAGTTACCAGTTTTATCTCTTACCCCGAA:1 + chr2L 3323323 3' - hobo 4 1 73.64 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATCGTTATTTTTCTATACTCCATAATTTATACAAATATAACTAAGTTGCTTAATCATTAGGTGTAAGTTTGAGAAAAGGA:1 + chr3R 25163224 3' + mdg1 7452 2 73.64 TCTCAGTGCGTTCGGGTCCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGCTGAGCGAGATATCCTCGGCGAGTGTTCTGCTCCTTGAGGCCGGTGATCAGGAGACATTCA:1 + chr3R 26135229 3' - Doc3-element 416 1 58.25 GATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGCCACTTTCTGACTCTGCGGTTGGCTTTAAATTAA:1 - chr3L 6343935 3' - Idefix 7037 2 69.31 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGAGGTCAGGACTAGGCGAAAGTTACAAACAAATCAATAGATTAATAATAAAAATAATAATAATAATTAAGAAATACATAAAAA:1 + chr2R 3262669 3' + 1360 3386 2 76.36 CTATTTCAAGTGTCTCTTTTATTTCGATCTGTACTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGGCCAAAAACGGGATGAGAAGCAATCGGGCATCGCGTATTTCAC:1 - chr3R 31827391 3' - mdg3 211 2 60.19 GAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAATAACCTCGAACAGAGCAGAACAACTAACAAAGATCATTACCCTCGTGCAGAGGGTTGATTTCCCAGTCCCGCG:1 + chr3L 17443665 3' + Stalker4 7268 4 54.55 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGGATCGTCTTGTTCGCCCGTTGCCCAAGG:1 - chr3L 4753170 3' + Stalker3T 204 1 60.00 CGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACAGGACGAAATAAGTGCTGTGACATATTTCGGGCCATGATAATAAAAAGTTATTTGGTTCCCTCTCTCTCAGGAG:1 - chr2R 19884790 3' + Cr1a 4427 1 77.67 CAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTCGGTGAAAGTGATGAATAAAAAAGTATGCAGATGAGTCCGTTTCGGGTTTGTTATGATTATTACAGAT:1 - chr2L 13870426 3' - I-element 4999 1 62.73 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAAACAACTGAAAAGGCTGTTGGGTTCA:1 - chrX 14953429 3' + Stalker3T 202 1 31.31 CTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGCTGTTATAGAACACACTGTGAAGG:1 + chr2L 21809447 3' - G6 1865 1 68.00 CCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTCAGCTCTGCAGGATTGCCAATCTCATGCACAACCATGTCCAGGCC:1 - chrX 1541602 3' - flea 4707 1 72.86 TTAAAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCAGAAAAATCAGACAGCGACAGTTCCGAGACAGGAAACTGCGGAGGGAGGATCGACAGGTGAA:1 + chrX 17095469 3' + 1360 337 1 72.34 TGTTTGTGTGTGTGTGTGTCAGTGTCTGTCTGTGTGTGTGTTTAGTTTGGTCGCAGTGAATCGGATTGCTATGATGGCTATTGACGCACCCGTTCTGTT:1 - chr3L 15194272 3' - Quasimodo 36 2 51.52 TTCCAGGCACTGGATAGTTTAAATAATAAAAGGCCCTGTTTTAGCATAGACGTTTCTTGTTGGGTTAATTGTTTTCTTGGCCGTTTTTGG:1 + chr2R 19568588 3' - Tc3 1473 1 56.67 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATATTGGGCAGAGATGTAACCGGCG:1 - chr3R 12040164 3' - HMS-Beagle 31 2 72.50 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTGTTAAAAAAAAAATGGCTCATGTGTAGGGCGTTGGATTTCAGTATTTTTCGTAGCATA:1 + chr3R 7874883 3' + jockey 4966 1 54.13 AGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGAAAAGACGGACACGGTCGGACATGGCGGGGGATGGGGGGACATGGAGG:1 - chr3R 6645126 3' - INE-1 141 1 66.27 CATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACATCCTTCCCCGCCCCGAAGGTCATGTTTAA:1 - chr4 1006350 3' - invader1 3803 2 76.84 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGGGCTAATTCAATTGAAAAGCCTGGGCGTG:1 + chrX 8364748 3' + jockey 4964 1 51.82 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGCGG:1 - chr3R 9481215 3' - roo 8683 2 61.04 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAAACAAATGAATTATGAGTTGCTGGCGG:1 - chr4 907885 3' + 1360 3353 1 74.16 TTATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTGCAGTTGTGCAATGGCATTTTATATGC:1 - chr2L 2828710 3' - mdg3 5144 1 75.23 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGATATTTATTGCTTGATGGATGATAAGTTTGATGTTGTTTGTCACTTGGCCCAGACAA:1 + chr3L 15819428 3' + pogo 2085 1 63.37 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGACTCATGGCTAACTTTCAGTTCCAAA:1 + chr3R 24260931 3' - roo 8706 2 73.91 GTTTTCCTTTTTTTTTTACTTTTAGCACTTGAATGGCAGCTGCACGGCAAAGAGGAAGGGAGCACACCCAGCCAGGTGAG:1 + chr2L 16010968 3' - Doc2-element 247 1 51.25 TGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGACAATCGCCCCGAACAACATTTAGATAAAATTCCATTCCACTTTCATTCCAAGCCAAGGAAT:1 - chr3R 26482958 3' - mdg3 448 1 61.96 CGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCG:1 - chr3L 19951185 3' - Ivk 12 1 65.62 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGTGAGTTGGTGTGCCAGGGACATAGGAAAAGAGGGCACAATGGCG:1 - chrX 22745166 3' - jockey 4802 1 59.09 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGGACAAGGAT:1 + chr3R 19446885 3' - roo 8709 2 68.18 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATCTACTTTCTTTAAAAAAAATGTCAGAATGCCAATTGATTTTATTTCACTTTTTTGCTTGAGTCTT:1 - chrX 15169943 3' + I-element 5336 1 60.91 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCACAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGAGTGCAGCTTGCAGCGGC:1 + chr2R 14446889 3' - 1360 63 1 78.18 ACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGCAATTCCACAACAACCCACGTACTGTGGGAGGCTAGAAACAA:1 + chr2L 14678331 3' + Bari1 1592 1 63.54 AAAAGTAGTCTACTGGAATAAAGCGAAAATTTAATATTTGCAATCTTAGCGTGATACCCTAGGGTAGCAAATAACCCATACCCTAAAGATGTGGTCTTCACATCTAAGTC:1 - chr2R 11809434 3' - Cr1a 3972 1 78.18 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGCTAATAACTATTTTTATGACTTTATATTTAGATTCCGATAA:1 + chr3L 885800 3' - roo 8707 2 65.45 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAACGCACTGATACTTCCCGTATAATTTAGTTAT:1 + chr3L 20039889 3' - Doc 11 1 50.00 CTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCTTTTTGGCCCTGCTGTAGACTATAACCACTTCCACCTCTTACAGCATACC:1 - chr3R 9228401 3' - blood 474 1 53.27 CCATGGGTAGACGACGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATAAACTAAACACTGCACAACATGAATTGAAAACAAACGCACTTGTTTGCGATTATTTGAGCCAAAACACAC:1 + chr2R 12530751 3' + G2 2805 1 64.55 ATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCCAAAAACATTAACCATGGCCCCCGGGCCATGGAAGCCCCCATCTGCTTCACCCTTCTTGT:1 + chrX 11243933 3' + Ivk 109 1 71.03 TTAATTTCGGGAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACTACCTAATAGTAAGTCATATTTT:1 - chr3R 3377201 3' + Max-element 8483 2 76.53 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTATCGTTCATTTATTTTGCTCGTTATGTTCGCGTCGCCGTAGTCGCG:1 + chr3R 5774895 3' - I-element 26 1 50.53 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTTTGTTATTTTATCATGTCTCAAACACTCACGCACTCACACA:1 - chrX 2334999 3' - P-element 38 1 22.62 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGCACTTTCACTTTGTAGAGCACATCGTGCTCGAAACCTAAAGTCC:1 + chr2R 6707759 3' + 1360 3379 2 60.76 CATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTCGAAATAATACAAAACTTTAAGATAAACTTTCAGTTCTTTCAGTT:1 + chr2R 11599403 3' + I-element 5062 1 53.19 ACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAGATTGTCCCTGACATACAGTTTGTTATTACTTGCCTGTTACATATATACTTTT:1 - chr2R 25257600 3' + TAHRE 10407 1 56.99 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAAAAAAAAATGAAATGATTAAAATAAAGTGGAGCTTGCATTGCGCAACAATTGCACCGGCGAGGCAAAAGGCAAAGT:1 + chr3R 16601912 3' - pogo 7 1 71.82 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGAACACAGTAAAATTCATGGAAATATGAACGTAATGAAATGATGTAATGTT:1 - chrX 16693762 3' - 1360 29 1 53.85 TTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 297 6533 2 72.04 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCACAACATGTTTTGATATTCGGACAG:1 - chr2L 6757490 3' + Tirant 361 2 75.00 ACACACACACACACACATATATACTCACTCGATATCATGCCGATCTGATGGAGAACAGGAAGCATTACTGAGATAAAAACGCCATAAATGGCGATT:1 + chr3R 13822403 3' + accord 7031 2 86.46 TTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACACTTACTTGGAAAATTCAGGAAAAAGGGACG:1 - chrX 3123298 3' + Copia1_DM 144 1 66.67 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATGCCACGGGGCGCAG:1 - chr2R 6707686 3' - 1360 13 1 61.36 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTG:1 - 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chr3R 4992594 3' + Doc 371 1 66.97 GCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAAACAGTGGACATAAGGGGACTACTTGGTGGTGCCCAGAAGCAACTTGACACATGCCC:1 + chr2L 18529375 3' + Tirant 118 2 68.24 ATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAATTTGTAAATATGTATGAGTGCGAGCGTGAGTGAGTTTGTGATCGTGTCAGCATGGGTGTGAATGAACATTAGA:1 + chrX 11619829 3' - 412 7539 2 72.90 AGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATAATCCACTAGCAGTTCGTTGTTAATGGTGTATACTCACTATAACCCTTAT:1 - chr2R 19405858 3' - HMS-Beagle 6799 2 76.36 AAATATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGACACGCCCTAACATACACACA:1 + chr3R 24084701 3' + mdg1 7203 2 81.82 TTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCAGTGGAAAAGTGAACTATGTATAAATATTGCAACGAGGGTATGGGGGAAAATGTGGCCAAACCAGTAGATGGAGCGA:1 - chr3L 5286096 3' + 1360 3018 1 75.45 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCTAACTGCGTATGGCAATAGCAGCT:1 + chr2L 494051 3' + roo 9025 2 75.26 TGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATAGAAGGGTGCTGATTTGGTTTAAAAGGAGGAACATACTTCGATGGAAGGGAAGG:1 + chr3L 6952115 3' - accord 7316 2 63.27 AGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATTAAAAGGGGTACTTTAATTTTGTACATAAAGTAAGTGAGA:1 - chr4 187660 3' + F-element 4505 1 56.32 ATGTGATAATGTTACCAGTCCATGTTACTGTCGTGGCTCTTGGTCACAAACTTCTGGCTGTTCAGTATGGGCTGTTATATTTAATTTTAAA:1 - chr3R 30897660 3' + HeT-A 5850 1 65.93 CGTCGAGAATATGGTCAACGGTGGGCTTGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTAGCGCCGTTCTCATAAGTAAGTGTTCATTTTGATTGCATTTTGAGGGCAACAATTCA:1 - chr3R 26570370 3' - Ivk 5135 1 70.91 GGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAAAGCTTTAAGCTCGCAAACAGCTGTTTGCGCGCCAGAATGCAACTATTAGTTTCACATAGCTGGGCAGC:1 - chr2R 13648483 3' - X-element 276 1 59.80 CAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGTTGGAGGATGATGAACTGGAAGATGATCCACTGTTCGACGAGGAA:1 + chr3R 17156734 3' + baggins 5189 1 61.29 TAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTAGTTGTCTAGTGTTTTTTTGTTCTCATAAAGCAAGACAATCGGTCAAAATAAAATATT:1 - chr3L 14396970 3' - BS 5023 1 50.00 TGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATATGGCCCCCAATCCTGGCTCCCCCCGGCCC:1 + chr2R 6903487 3' + Tirant 342 2 55.38 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCAGGTTGATTTATATATATGTATATATTGAGCATAAGGATATATATAGTGGGCGGTGGACTTTGAGTAC:1 - chr3L 16258908 3' - Transpac 4939 2 63.64 TTTGTAGCTTCGCAGATCTCGTTCAAAGAGCAATGGATACTTCGGATTCCATAATATCATCAATAAATTTAAAAGGGGCCCAAGAAAACAGGGCAAAAA:1 + chr2R 9629860 3' - hopper2 226 1 73.74 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTGAAGGATGTAAGTACTGTGGAGTA:1 + chr2R 19405972 3' + HMS-Beagle 7007 4 56.36 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTTTTTCAGTGTTTCCTTTTTTTTGTGGGGGCCTTGAACAGCTGTGAACGCACA:1 + chr2L 18694095 3' - pogo 10 1 55.32 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTCTTTAGCCATAAGTTTCTGAAGAGTCTCTTTTATATTTTTAAAAAAGCAAACAAACAATAATTAAGTTGTT:1 + chr2L 17393435 3' - FB 15 1 67.27 ACCCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAAATCACACGACCAAACCTTTGAGAAATGTGTTAATGTTTTTACACATTTGTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGC:1 + chrX 23005472 3' + INE-1 218 1 70.91 CACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGACTGATGTCAATATTGTGTTGTACTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTG:1 + chr3L 21448027 3' - F-element 4347 1 66.33 TAAGCCCAAAACCCTTATCAACAACATCTTGATAAACAAATATCAACCACACAGAGGAGCAGTCGGCAAAGCAACAC:1 - 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chr3R 24260900 3' + roo 9012 2 76.36 GGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCACATGTTCATGTCCATTACTTTGAACCCGAAGCGCACAGGCTGCATGAATGCC:1 - chr3L 15057938 3' - G2 87 1 41.57 TATTGAATAAAAATTAGATTTAACCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAATGACCCACAGGCAAGTGAAATGAGCTGCAGGAGCGAACAGACCAGAACCCAAACATTG:1 + chr2R 20649047 3' + Bari1 327 1 61.82 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTTAACTATGATTTTCCAATTTACTTGTA:1 - chrX 17184919 3' - roo 8719 2 80.91 GCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAACTCGGAGTAAGATATTTCCGATACTGGTAGACAAGGTTG:1 + chr2R 18546673 3' - F-element 4486 1 64.55 TCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTTCGGTGTCGAGCAAATTATCATGGCTGTG:1 - chr3R 22861891 3' - G2 2970 1 61.33 GGATCAATAGCCGAGTCGATCAAGCCATGTCCGTCTGTCACAGGCGCAGCGCAAGTTTGTTGTCCCTGGGTTCGTGTAAATTAACGTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 14976226 3' + INE-1 97 1 66.67 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGG:1 + chrX 12271514 3' + pogo 2077 1 78.79 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTATTT:1 + chr2L 17785852 3' + roo 355 2 70.00 CACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGCGAACTGTGGCAAACAAAGAAAATGTAACAACGAAATGTAT:1 + chrX 13702049 3' + gypsy4 294 1 77.27 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTGCGTAAATTC:1 - chrX 21399400 3' - pogo 31 1 60.19 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACCACGTTTTAAAAAGTGTGGGTCTTCATTCAACTTAA:1 + chr3L 13024060 3' - 412 7100 2 66.36 TGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTGTATTGTATTGTATTGTTTTGTTTTGTATTGTATTGCATTGTATTGTATGGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - I-element 4947 1 40.45 AGTTGTGTGTTTTTTTTTATATGAGTCTACAGATGGTAATAATTATTAAATAAACCAACCCATATCTAGTTTTAATAAAAGTGTGATACTTTAGGCCTAATGAGTTTATT:1 - chr2R 18327571 3' - Tc1-2 490 1 61.82 TGGCCGTCACCAAAAAAGTGACTACGTAAATGCCGTTATGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACTCAACTAATAAAAGCAATAAGAGCAGGTA:1 - chr2L 21394592 3' + 1360 3331 1 61.00 AACCACAATAATTAAAATTGTTGTCTCTTAATTTATATTATTTTGGGGATTTTCTTGGTTTTCGTTTCGCTATTTCTTTATTTTTTGTTCACGGTCCTCGCAGCGGAAAG:1 - chr2L 1322485 3' + gypsy4 6820 2 59.09 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATAATATTAATAACTATGCGCAAAATTAGACGGCAAACAGGCAAACATATAAACATTTGCATTTTCA:1 + chr3R 9481295 3' + roo 9054 2 65.14 AGTACGCCGAGTGTACTTGGGTAGGGGCTAAGTATGATTAAGTATGTTGGCAAAATGCCCAGGGGTTTACTGTATGCGATCGGACGTGACAAGGG:1 - chrX 11392018 3' - G2 2976 1 52.63 ATACCCTGGCTTTTAATTTGTGGTGTCTCCTCTAGTTTAGTTCTTCTCCTTTATTAGTTTTTCCTCCTTTCCTTTTTTGTTCGGTTGTTTGGTTGCTTGGTGTTTT:1 - chr3L 21319150 3' - TAHRE 390 1 73.58 TTGTTCAGCAGAGAGGCAGTACAGCGATTTGTTGCCCCAACATCCACACATCTAATCTGGATGCGAGTGGTGCATCTGTGTGGGTCAG:1 + chr3R 23330847 3' - 3S18 5725 1 70.45 AAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAATATGTAGTTAAAATAATGTCGATTAATACAGTCATTCTCTCGGTACCACTTACTATGTTGTCGAACAAACTTTATAAGGTTACT:1 - chr2R 15202376 3' + Dm88 4355 1 78.18 TGGGTAAACACAAGTGCTCAAAATGCTGACCAGAGGTCTGCATAGTCTCCGCTGCCATTAACGCCAACACAATCCAATCAAAATTTATGCAAAATCAACACTTTACGCTA:1 + chr2L 8851239 3' + HMS-Beagle2 6936 2 61.82 ATATAAATTATAAATTACAACAGTTTGCATGTTGTCTCAGCTTCGGCTAT:1 + chr2L 19808553 3' + copia 255 1 52.00 TTTATAAGTTTTTTTTTTCTAATTAAAAATAGAATTCGTGATACAGATAACAGAGTTTTCGTGTCCTCCGAGCATAAAATATTAATGAAGTTAC:1 - chrX 17996883 3' + Circe 426 1 77.66 GGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTAGGCAAACACACAAAGGGAAAAAATATACGA:1 + chrX 1760693 3' + Tc1 205 2 53.85 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTACGACCCTTTTACCCAAGGTATTAGGACTTCGCAAAAATATCTTTTCCGCTTTGCTG:1 + chr2L 20398552 3' + roo 9044 1 53.64 CGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCGAATGTTTACATATT:1 - chr2R 8397415 3' + 412 480 2 50.46 ACAAAAAAAAAAATGAAAAAAATGAAAAAAATAGTTCTGAGCCCTACCATAGACGATAGACGGGCATCTATGTCTATGTATATGG:1 - chr3L 11276101 3' + G2 3076 2 64.71 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGGACTTGCGTTAACTTAAATGTACAAATAAATATACATATTTTTTTTTTAATCTGTAGTAT:1 - chrX 3091932 3' + opus 471 2 59.57 GTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCTCCATTTCATTCCACTTCTACTGCTGCTGAGAGCAA:1 - chr3L 18031625 3' + rover 7077 2 62.11 TATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTGTCTTATCTTATCTTATCTCATCTTGTTGTCTCTATCTATCTTGTTGCATTTCAATTTTCCTCTGCCGT:1 + chrY 1642715 3' - Stalker3T 202 1 53.68 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCTGTTAAGTAAACTTTTTAAGGAATTTTCAATG:1 + chr3L 7219758 3' - roo 8696 2 67.42 GTATGGAAAAAATTAAATTAAAATGCAAATTAGGCATTCCTGCCGAGGAGTCTGGCCTGCAGTCTGCGATCCCCTTTTGCATATGTAAATGTGCGTTGTCCTCGTCGTTG:1 + chrX 16180712 3' - Tc1 315 1 72.73 AAATTATAAATTACAACAGTTTGCATGTTGTCTCAGCTTCGGCTCTTCCCGCGACCACTTTCCCCAAATTTTCCC:1 + chr2L 19808582 3' + copia 259 1 76.00 GTCCGCATACACCAATACTAATGCAAACTGCATTTTTCTGTACGCTTCCGTTATTCGTGCAGACATCTACTTCCCCTCCACTCGACTCCGCTGCTGTCGTTCTTT:1 + chr2L 15593648 3' - invader1 199 2 72.38 CGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGAACGGAAACCAGATTTGCGCCGGCCATGAAGAACGGGATACCTGTGC:1 + chr2R 15693561 3' + HMS-Beagle2 292 2 56.38 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATTAGTCCAGCTATGTCAAATATTTACATATGTCTCCTCCGATTCGAGCGCTCGAT:1 + chr2L 5338040 3' - F-element 19 1 62.22 TGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTTCACAGCTATTGCCACACATTTGTCACATCTTCATGCGCCACCAACTTGGCCGGAAGCACATGTTGTGAAGGACTTTT:1 + chr3L 12449802 3' - INE-1 563 1 77.27 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTGCAAAAGTATTTGCATACTTTTTGGGGCTATTCAGCTTTGCGA:1 - chr2L 2484332 3' - jockey 4685 1 65.74 GCTCTCCCTCACTACTGTCACACTGTACAGACTGGAATGGATCGCTACATAACAACAAAAAGAAAACAGCATGCAGCATGCAGGGAACGCC:1 + chr2L 5870856 3' + Doc2-element 463 1 45.05 TTAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAATCTGATATGTACATTAGTATATTAGTTGTATTTATAACAGTATTGGACTGTATTTATTTGATA:1 - chr3R 19450148 3' - roo 8649 1 88.76 TTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAAATGTTAGATGTGAAAATCAGTAGATAGATGCTATTTGAATTTG:1 - chr2L 11857611 3' + 1360 267 1 65.45 ATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAAACACACACACACACACACA:1 + chrX 7978949 3' + Rt1a 5018 1 75.95 AACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCACGATGACCATTTTGGGCACCCTCTCGGACCTGGTCTGGCGTAG:1 + chr2R 15297889 3' + Quasimodo 228 2 67.16 AATTTGGACGTTATTTAGAGTTTAGAGAGAGTTAGAGAAGGGAAGAAAGTGGGGAGAAATCTCCTTGGCATACAAAAGGCACTTAAATAACCAAAGATATTTTTGGATAT:1 - chr3R 19769093 3' - Doc4-element 2388 1 79.09 TTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTAAGTGCTCGTTTGCTTGTATAAAGTAAAGTTTTCGTCAAAGTTGGAGATTTAAAGAGAATCTTTGGGAC:1 + chrX 22489721 3' + S-element 1703 1 70.91 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGTATCAACTTATATCATCATCATCGTGCCAGAGAGCAACAAACTTGGCCAAAGCCAGACCAAGCCCATTTTTCAGACTTTTCG:1 + chr2R 11770889 3' + jockey 4959 1 76.36 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - Tabor 35 2 51.82 ACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAAGCGGTAAGAGCGCCCGCGCGGGAGAGGG:1 + chr3R 11773857 3' - GATE 8352 2 79.80 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATGTAATCAGAGTGAGGGCAGTTGGCGAGTCGGG:1 + chr2L 4013062 3' + pogo 2075 1 57.78 AGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAGTTACTGCCTAATTAATTTTAGCAGTAAGCCGCGTGAAGGTCACACTTCAACA:1 + chr3R 31213415 3' - 1360 495 1 66.36 TATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Quasimodo 20 2 59.63 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTTCGTCCTTTCTGGCACTGCGTGTG:1 + chr3R 13733011 3' + hopper 1406 2 54.69 TGCAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCATAAAGACGAAAAGGGGTGGACCGAAGAGAAGTGGGGGGCGAAAGCATA:1 - chr2L 9041436 3' + HeT-A 229 1 63.16 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGC:1 - chr3R 13437153 3' - hopper 12 2 51.52 TGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATACACATATTGTCCACACGGCTTTTGTTGTTCATGGACTGTTCGTGTGCTTCCACCAGTCGTAATTG:1 + chr3L 18833512 3' - Idefix 325 2 66.36 ATCAAAAATGGTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGACTTAAACATACAAACAGTCACAAAAACCGTATGTATATTCTTTC:1 - chr3R 21190079 3' + Porto1 4337 1 78.18 GGTATCTTTAGAATATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCGAATAATAAAAAAAAAAATAAACCCAACCAAAAATCAAGAGAAGAGGCCGCAGAGAAACTAAGCTCTCTGC:1 + chr2R 5729299 3' + Rt1b 5110 1 54.13 GTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATGCACACACACATACACGTACACACTGACACACACACACGCAGAGCAGTGAAAACATGGAAAACAGAAGACGAAC:1 - chr2L 3930609 3' + invader1 2 2 76.47 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGCAGAAGCATGGAAAAATTGCGCAACGGACAACAACGTGATTTG:1 - chr3R 9716947 3' - 1360 25 1 76.67 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATGTATGAAAAACAAAATCACTCCTCTTCGTTAGTCGGCA:1 + chr2R 17955545 3' + 297 353 2 72.73 TAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCAACTTGTCCGTTTTGCGAATGTTAAATTTTCTCTATCCCCCCCTTCAAATTTCACCAC:1 + chr3L 18148703 3' + I-element 4954 1 61.82 AGAAGCGTTGTAAAAAGGAATGCAAAAGACAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAAAAAACGGAGCCAGACAAAGGACGAGATGGC:1 - chr3R 28052798 3' - S-element 307 1 69.57 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTATTTACCTTCTTATCGCATGGAA:1 - chr2R 24031493 3' + 1360 3373 1 70.00 GAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTAAAACGGCAACTTCTAGGGAAACTACGAATAGCAGGGAAAAGAACTAAATACGAGTAAATAGAAGGGAACAA:1 - chrX 18933367 3' + invader2 316 1 79.38 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCGGCTTAACACTGTTGCATAGTATTTTTGAAGCCA:1 + chrX 16893453 3' + roo 9020 2 71.82 GATTTTCGAAAAAGTGGGAAAATGAAATGTCTTCGTCAAAGTGAGGGGAGAACTTTTAAAAGTATTAAGACTGAAAAGAAGGCTGGCCTAATCTGTCAAATCTATAT:1 - chr3R 11085468 3' + FB 129 1 54.21 AGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAAGTCTAAGTACGTTATGGTCTCCAACGATTGCAGGGT:1 + chr2L 5595547 3' + Max-element 271 2 58.43 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAATAAAGAGCTTTCAATGTTTTTGCGTTGTGCTTAAAAGTTATGTTTTACTAAAACAACACATTAAGTACT:1 + chr2R 24031562 3' - 1360 14 1 68.18 TTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATGACTATTTCCCTCTTCAATCAGCCGTATCCATTACACATCCGCCCCAAGCTGTGAATGATTTA:1 - chr3R 22140389 3' + FB 409 1 67.02 CAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTCACTCACTACCTGTGCGCTCTTGTTGTGCTTTTCCTC:1 + chrX 13495564 3' + Max-element 282 2 51.35 TTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTATTCTATTTTTTCCCGGTTCGGTTCGGTTTGGCTCGGTT:1 + chr2L 12361788 3' - F-element 136 1 69.79 AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAAAGAATAAGTAGAAAAATGTTCTTCAAAATTAAATGGTTAATGAAGAAAAATTAATCGTTAAATGAAAAA:1 + chr3L 7130241 3' - BS 5002 1 59.22 GAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGGTAGAAGACGATTTTCGAACCGAAATAAATTCTGATGGGCTACAGGATATGTACCTTGTTGATATAAGAATCATGCGAAAAATG:1 - chr3L 14612676 3' - 1360 3219 1 56.36 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTTTTTAATTCTAAGGTAGTTAAGTG:1 - chr3L 18915164 3' - 412 7114 2 80.00 GCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTTTGTGTGTGGGTGCCTTTT:1 - chrX 1641786 3' - Ivk 5039 1 67.80 CTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTGTGCAGGTATTTGATATTTTCCTCATCCGTATGATCACCTCCTTCGTAGGCCTCCAAATCATTCGCTATAAAGTTGAA:1 - chr3R 20505500 3' + 412 74 2 72.73 AAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTCTCTATTTATACGATTTTTTTGAATTCATATAATGT:1 - chr2L 14712609 3' + FB 401 1 67.27 TCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATCACAATAATTGTCTATGTCAATTGATCGAGTTGAG:1 + chr2R 16128119 3' - FB 108 1 68.18 CATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGACAATATCGACGCTGGAATGGGCAGATGTGCATTGCCCGAAGGCAAAGTA:1 + chr2L 8133159 3' + F-element 327 1 63.22 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTCTCGCTTTCTCTCGCTACTTTTCGCTTTGGGAGGTAAATAAAGTTCA:1 + chr3L 3371251 3' - copia 15 2 67.27 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACGCCAGCTTAGCTGTGTGGCATCCTGCGGT:1 + chr2R 13313444 3' - hobo 52 1 71.82 ACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAAAAAAAGATCACGGAGCAATAAAGTCGAGTTTTATAACAATTTTTAGTTAATTTCTGTTTATATGGCCCATC:1 + chr3R 13925518 3' + I-element 108 1 68.18 AATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGGAAAGCAAACACATTAGAAAACATTCTCCTGGGCCATCGGGCGATGCAACGATGGTGCGAAAATATCTTTAACGGAGTCATTAT:1 - 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Cr1a 4296 1 58.82 TATGCATAAAATTTGTATGGGTGGAAGAATTTTTGTACTCAATTAACATTATTCAATTTATATATATATTTTTTTTGCTTTGGTTATTATTTAAATTACATTTA:1 - chr2R 5860853 3' - hobo 2679 1 75.96 TAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCTTCATTTACCATTTCGGGATATTCGTTTTTGGTTATATATTTGTAATTTATTTAAATTTTACATCCTCAT:1 + chrX 3726781 3' - G4 152 1 67.31 TCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATTTACATAGCCTGAATCTTGAAAAGCGAACCGCTAAGTGCTCCATGTTT:1 + chrX 15043201 3' + S-element 1687 1 57.80 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTCTTTTACCAGAAACCTTAAACTAATTAGTTTAATTAG:1 - chr3L 12158444 3' + 297 6935 2 68.18 TAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTGTCTTTGACTCATTCGTATATCCCTTTTCGAGTTGAAATGCTGTATGGTGGCACTTTTTCATTGGT:1 + chr2L 20227301 3' + TAHRE 10193 1 66.36 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGAGGGAGAAAATCTTGGTGATATGATGTGTATATATATTTTAATGCTAAGATATAGTCTCTC:1 - chr3R 10202969 3' + roo 9047 1 50.00 GGACCTATTGGAACTTATATAATTTATCTACAACATATACCTGCCACTTTATATATTCTTTTACTTAGCAACAATAGAACATAGAACCAAGAATGCCTTAGCACATAAGA:1 - 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chr2L 16217660 3' + Tabor 215 2 56.36 GTTGTTTTTTGCATACACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTCTCTTAAAAAGGCCAACTCCTTCCTCGCCATTTTGTATGTTTT:1 + chr3R 27513966 3' + Cr1a 257 1 56.60 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCG:1 + chr3L 13228543 3' - P-element 29 1 48.45 TCATATGTGCTTGTTGTAAAATATTATTTATTTGAATTAAATCAGTGTAATGTTGTTCAATTGTATTGTATTGTATTATATTGTATTGGATTGTATTGTATTGTATTGTA:1 + chrX 12946234 3' - TLD2_LTR 117 1 66.36 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACATGGTCCTTCCAGCTATGCTATTAGCACGTATATAACAACAATTTGCATAT:1 - chr2R 22663330 3' + mdg1 7422 2 57.27 AAAACTACCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTAAAACTATAGCTACAAAAAGCAAACACGATAACATCTGCTCAGCTAATTGACTAAA:1 - chrX 12146149 3' + Doc3-element 4512 1 66.32 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTCTTAGGGTTCACCAAATCGAAACGCTGCTGTCCAGTGGAG:1 - chr2R 21361983 3' + Tirant 8468 2 60.95 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAAAAATTGGCTTTCGCAAATTT:1 - chr3L 13160672 3' - pogo 44 1 81.52 AGCATTGGATAGGCAACAAGAAAAATAAACGAAAACACGGGCGATAAATATTCCTTTGCGTAGGTATTGCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATT:1 - chr3L 6131897 3' + invader3 5002 1 73.64 TTGGCTCATTTTATAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTTAGTTTTACTTTATTATTTATGGCCGTCGTTCTTTGGCTTTTT:1 - chrX 12236721 3' - Doc3-element 208 1 72.22 GGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCTACATAGAATTTGTGTGTGTGTGTATGTTTTTTTCTGGT:1 - chr3L 7846443 3' - 3S18 5785 2 64.42 TTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTAAAACTTAGAAATGTTTTCCCACACTCATTACAAGTATTAAAGCTAA:1 + chr3L 16313086 3' + Tirant 8390 2 62.73 ACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACACATGCATATTTCTTCTTTTGGTGCCGATTTCAATGCTTATCTGCGTGTTTTTTTTTCT:1 - chr3L 11085715 3' + S-element 1698 1 61.47 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATAA:1 - chr2R 23354297 3' - Tabor 6894 2 73.64 AACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCGCTGGTATGTCACCATTTTTTGATCCCAGAATACGT:1 + chr4 200827 3' + Porto1 4191 1 67.27 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCGAATGGGCGGCAGTGGTGGG:1 - 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flea 4616 1 50.00 TATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGGGTGCTTATGTTCGCACTTCGTGTCTCAAGAAATCATTTTTGCAATAAACAGTCAACGTATTTA:1 - chr2R 5126515 3' + 1360 419 1 70.00 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGGCCGGTTGCCTACCAGATTAAAGCAATTGATTCTTTGAA:1 - chr3L 217300 3' - roo 8674 2 64.84 TAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTGAACTTATGTGTACCTCTAGCCTAATA:1 - chr2R 1234689 3' - invader2 218 2 73.00 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCAGTTACATCTTTTTATTCTAGTGTCTTTGTCTCAACCTTATCCGACCGGGC:1 + chr2R 3941857 3' - 1360 56 1 72.45 TGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAAACGGAAGTTTACTCTGTGCATCAATCGAATAATTTGCTGGGAGGGAGCCTCATATGGC:1 + chr2L 10587463 3' + R2-element 447 1 70.33 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTTAAAGAATAAGTAGAAAAATGTTCTTCAAAATTAAATGGTTAATGAAGAAAAATTAATCGTTAAA:1 + chr3L 7130234 3' - BS 5016 1 68.18 CTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Rt1b 4988 1 43.01 TAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064835 3' + Stalker3T 202 1 77.27 GGAGCCACCTCTAGAGCCATGGCGAAAAACTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGAATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGGATACTCAAGAGACGAATAAGC:1 + chr2R 901987 3' - 1360 63 1 74.55 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCG:1 - chr3R 13225495 3' - hobo 22 1 54.26 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGGCGACCTTAATGGTCAAATTTAGGTATGTGCTTGTGCTTGTGCTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTG:1 + chr2L 16071771 3' + hopper 1412 2 62.39 GACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGTGAAAGCGGAGCTCGAGACTGGGTATTTGAATTTCTGTT:1 - chr3L 1086040 3' - Quasimodo 354 2 62.35 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCGTGCTTTACTGCCATTTATATTTATGTGTG:1 + chrX 8326760 3' - jockey 4720 1 69.52 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATTTAAAGGCAC:1 + chr2L 10746707 3' + flea 202 2 72.73 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACATTTTGTACTTCTCTCCGCTATTTTTTGTGGTTTTTGCTT:1 + chrX 8519013 3' + S-element 1674 1 64.55 CTCTGTGGTGACCAACACCACTGAATGTTTCTGGCCCTCTTGTTGTTCTTGCTTTCGACGGCATATTG:1 + chr2L 16269783 3' - baggins 4954 1 63.24 AGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCCGCAACAACAGCAACTGTGAGCCGGGTTAACAAAGCCGGCCTGAGAG:1 - chr2R 13356939 3' + Doc 4525 1 75.71 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAG:1 - chr2R 9963498 3' - pogo 29 1 62.92 CTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGCATTTCCAAGTAAGCTTTATTCCAGGTTTAATACGTACATTATTG:1 + chr3L 20897058 3' + Tabor 7285 2 59.09 TTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATA:1 + chr2R 6801692 3' + McClintock 430 2 70.91 AGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCAAGCCCATTTGTCAGTGACTTGCAGGAGTTGATGATGATGCCACT:1 + chr3R 24096175 3' + flea 4602 1 56.00 TTTCAATCGTTAGATAAGAAAGACACGAGCCAAGGAAGAAGTCAAAAGAGAAATCGTGAAGGAGGAGGAGGAGGAAGAG:1 + chrX 4269702 3' - gypsy10 5565 1 79.75 CACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGCTTTCGTCCAGCACCGGAACAGACAGCATATTAAAAATGTGACTATAACCTTGGCTTCCAAACA:1 + chr2L 2678434 3' - invader1 3799 2 56.60 ATAAATAAATTAATAATAAAAAAAAATGAATATGGGATTTCTAAACCCTTTGGGTTATATCACAATGGCTTTTT:1 + chr3R 8451743 3' + flea 4992 4 64.86 GTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTACTCAGAACTAAACTACTGTATGGGGA:1 + chr2R 892415 3' - Stalker2 7308 2 75.45 TGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAAGTTACATTTCTACAGGAGATAGCGATTTTGTTCTTTTGATAAAGGGAATTAGTCGAAAAATACCTAGAATTAA:1 + chr2R 17785789 3' - Idefix 232 2 71.82 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAAACATACATACATTATATTACCGCCTTTTTGTTATTCATGCATTTAATTAATAATAACATAGAAGAAATG:1 + chr3L 4265062 3' + Transpac 296 2 64.55 TCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCTTATGTATCGACGGCGTCAATGTGGTGTCTTCATCACTTAACATACATAAAAATATGTTTGCTTAGT:1 + chr2R 22661320 3' - Transpac 13 2 68.81 GTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATGCTTTCTTTCGCGCTTGTAATTTTGTTGTTGTTGTTCTCTGGATCACAGAATTT:1 + chr2R 10981812 3' + diver 39 2 69.72 CTAGGAAAACTCACTCTAACAAAATACCAAACGCTGGGTCTCCACCCCACCAGCTACCCAACCATTCGCCACCCACTTACTCCCA:1 + chr2R 21470851 3' - Gypsy12A_LTR 363 1 77.65 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTG:1 + chr2R 8086840 3' - 1360 53 1 74.29 ATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATGTTTTGGTGCGGCAAGGGTAGTTACTTACCGAAAGTCCTCGAGTTACAACATGAAAGTAGTCG:1 - chrX 10677722 3' + FB 777 3 68.93 TAGATGGAACGTTATTTCGCCATGCTTCCGTTCTATCCACGGCTTGAGCCAATTGCCCCGATCAGGGACACAGAGAAACAAATATCACACCTTTGTTTTGGGCCTCGGAT:1 + chr3L 3848869 3' - Rt1c 4977 1 58.18 GAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAGAAAACGATGGGCAGCCTTCGTTTAATTACCAA:1 - chr3R 29907129 3' + Doc2-element 318 1 70.48 AAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCACATGCCCCATAGCTATCCGATTATCTGTGAGATAATCGAGTCCAGACCCATCTCAGACTCATAA:1 + chr2R 11797357 3' + F-element 4439 1 69.70 GTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCCGTGTTTGCATGTCGGACTGTGGTAATTTTTGC:1 + chr3L 22495537 3' - Quasimodo 318 2 60.71 TCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCCAGTGGCCTTCACCCACGACGTGG:1 - chr3R 28743488 3' - Doc3-element 4627 1 74.74 AGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTTGGTTGATGGCCGAATTCGGGTATCGGTATGGGGATCGGGTATCGGCTAAGGAGTTAGAAGTTATG:1 - chrX 19820354 3' - 3S18 6054 2 64.49 TTACGCATCTTGATATTCTAGTGTCTTTGGATCGATACTAATCAGTAATTCGGATGCAGGACGAGACAGGAGCCTCCCTG:1 + chrX 1514482 3' + 1360 3381 2 90.00 AGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAGTTTAGTTTTTATTTAGGAACGTGCTCAAGTGCAGATTCATTGCAATTTGG:1 - chr3L 18436824 3' + invader2 208 2 62.73 TGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACGTCTTACATGGGTCCTTGTTTGAAAAATCTACCTTAT:1 - chr2R 4265363 3' - flea 4793 2 62.00 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACGCCAGCTTAGCTGTGTG:1 + chr2R 13313432 3' - hobo 37 1 77.11 TCTTCGCGACTTCTAGCTAAGTTTGCACGCCTTTTTGTGTTGTCGATTAAAGTACACAAATGTCGGCAG:1 - chr3R 17738020 3' - Tc1-2 1230 1 56.52 TAGGTACAATAATTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTAACAACTCATAGTCAATTTCCCCTTATAA:1 - chr2L 6620248 3' - TAHRE 10337 1 74.77 GCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATCTCTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTAGCTTAAAAC:1 - chr2L 12104063 3' - G4 3684 1 50.00 TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Tabor 7308 2 43.33 AACTTATATTAATTACAATATGAAGTAATTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGCTTTCTTTGCTTAGGACGTTGGCAGAATGGAGTACCGCACCACCCATCG:1 - chrX 3929194 3' - Doc2-element 4686 1 63.11 CTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCACCCACCTGCCATTACTTTTGCAGCGCCCAGGAAAGTTCAG:1 + chr3L 15709577 3' + mdg3 5276 2 66.36 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTCCAATAGCTACGATTAGAAGTAGTTGTTGCACTTCCATCG:1 + chr3R 28640006 3' + mdg1 404 2 64.55 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTACACAAATTAATAATTCATTAATGCGCATTAATTGTTGCGCTGCA:1 - chr3R 10964602 3' - I-element 44 1 62.73 CTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTACCAATTATCGCTATATTTACGCATTAACAACGTAAAACACATTTGAAAGAAAACGTCAGAAA:1 - chr2L 5990436 3' + R2-element 3525 1 62.04 CATTCAGCGTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATACAACAAACAGCGGGGCGAGCATTGGGGAAAAGGGAAAAGTTCAAGGAACAGCCAAAGCGAAGAACAGGACT:1 + chrX 19549662 3' + TAHRE 10017 1 68.57 AACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACTTCCACATGAATGTATATATTTATTTTGTAGTGCTTTTGGTTTTTTTTT:1 + chr3R 9393497 3' + jockey 4702 1 55.45 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAGAAATGTAATCAGAGTGAGGGCAGTTGGCGAG:1 + chr2L 4013057 3' + pogo 2086 1 55.41 TTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTTCAGAACGTTACATTATTACTTGTAG:1 - chr3R 6263294 3' + diver 190 2 52.73 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGATGCTGCAG:1 + chr3L 15968232 3' - P-element 54 1 29.36 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATTACATCTGCAATTTTTTTTTATTAGGTGACGTGGTGG:1 + chr2R 12336679 3' - pogo 11 1 70.64 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACAAACCAAAACAAATGGGATCTGAAAAGTAACACTGCTCTATTTGGTGGAATAATAGATACTCTTTGAAATATGTAGAACT:1 - chr2L 19808471 3' - copia 4874 2 73.83 TTGCAAAACCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCAATACTATGTACGTGGCACCTTGATCAGTGCGTTCTTATC:1 + chr3R 6107597 3' + BS 4732 1 72.73 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGCGCCGCGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGCTAACTTATATATATACTTACGTAGTTATTA:1 + chr2R 3146329 3' + opus 7457 2 78.89 TAGACTAATCGTATGGCGTGCTTACAGCCAAAGCTGCAGTCAGTCACAATTTCGATTGGACAGACGGTCAAAAGCGAATCAACATAACATGCG:1 + chr3R 8852421 3' + 3S18 5965 2 51.61 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCGCTCACGCCACCCGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 4334776 3' - 1360 79 1 78.26 GGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTTTGTTGGTGTTCTTAGTTCGTTATACTCTGCTGGTGGTTATTTGTTTAAGTTTCTCGTTTGCTTTCTTCGCTC:1 + chr3L 16372281 3' - Porto1 4565 1 65.45 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATGCCACGGG:1 - chr2R 6707692 3' - 1360 41 1 62.73 GATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCAGATAAATGTAAAAACCAAGTTATTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGA:1 + chr3R 19445618 3' + invader4 42 2 77.27 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTTTGGGGGAATGGAGGGCCGACTTGTGTATTTACTATGGCGTGGCCAAAATAATTCCTGAC:1 + chr2R 15419096 3' + hopper 1400 1 65.05 TAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGTATTATTGCATCATCTAATATTATTGCATCTTATTTTGGCTTTTAATTCCAAGATGTGTTGTTTACATTATCGTGGT:1 - chr3R 14103482 3' - Quasimodo 149 2 75.45 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTA:1 + chr2L 21034128 3' - 412 7087 2 51.82 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACCACGAAAATAGCACCTTTTTAGTTACTGACTG:1 + chr3R 1061210 3' - roo 8691 2 63.86 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACACATCATATCCTTATCCACTCAAAACTTTTCTAACTTTAAATTAAATTAAGAAGT:1 - chr3R 12039921 3' - 412 7083 2 53.64 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGTTGTGGGTTTAATGTTCTTTGTATAGATAGTTCCAAAGGTAAGATACCCAAGTCAAATACTTAG:1 - chrX 13202570 3' - Tirant 8122 2 69.09 TGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATTCAGCCTATAGTGCATTCCACACACTGTCCTCCGCCCTCACAACCGCAAAAGCTATTAATGAAATCTTTGCCGAAACG:1 + chr3R 30284019 3' - Transib-N1_DM 24 1 63.64 GAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTACGACAAGCAACAGCGGACTGTGGTAGTATTCTCGCCCGATGGAAGGGTATTATTCAAACTAATACTATATAGTACTA:1 - chr2L 21102138 3' - R1A1-element 4868 1 64.55 ATTTATATTTTAAGCTTTTTCATTAATACTCTAAATACTTACAACTTTGTCTGGATAAAGATCCTGCATATATCTATTAAAACAAAAAGCGCATAAAGAAGTTTCGTGTT:1 + chr2L 18356100 3' - copia 5051 2 47.27 TGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACCAACAATTTCTAAGCTGTGGTGTTTTTGCCACTGCCATTGCCCCT:1 + chr3L 10485732 3' + jockey 145 1 76.14 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACATATTTTCCTACTTGTGACTTTTTCTGCGAGTGTACTTT:1 + chr3L 9419594 3' - S-element 38 2 64.76 TGTCTCCTTCCGAATAGATTAATTTGTTTCCTCCGATTTTGTTTACAAGCTCCTATATTCTTAATTGTTGTGTTGTCTTTATAAATGTTTCGGAATTTGTGTAAAA:1 - chr3L 13540674 3' + Gypsy12A_LTR 2044 1 63.21 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAAAATAATTCAAGACGTCAGCCAGTCGATGAGTCACCCAG:1 + chr3L 9822317 3' - pogo 23 1 61.82 AAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATAAATGTTTGCATATTTGACGTCGGCG:1 - chrX 10341061 3' - hopper 1182 1 64.38 CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACTACCGACTCTTACCCATA:1 - chr2R 13934445 3' - FB 41 1 74.12 ATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCCCAGCGACGGAGGAACAGAGGCAGAAAG:1 - chr3L 10943282 3' + Quasimodo 456 2 65.75 TGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAATTGTTTACGGTTGGGGTTTAGCTTAGTATGAATGCATAATTTTCTATCACAAAAGCTTCCAATTGGATTGCGG:1 - chr3R 17325943 3' - Quasimodo 7123 2 71.82 GAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTACAAAGCCAACTGAAACTGGCCCAAAAG:1 + chr3L 16674738 3' + Burdock 6161 2 63.64 ACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACAATACAAGAACGCACACCTGACGGCCGGCTGGAGTGAGCTCATCAATGGAATGGA:1 + chr2L 5225544 3' - Juan 118 1 61.96 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGCACATGTGTGTGAGTCCTTGTTGCAGGACGTGTAACGAGG:1 - chr3L 10109742 3' - hobo 14 1 56.25 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACCCCACCAACCACCTGGCCATCGTATCTTAGCCCCCCCTTTAACTACCACATCAGATTCATCCCCTAGAACCAT:1 + chr3R 21793843 3' - 1360 2 2 78.00 TATTGAGCCTGATCCAGAATATATGTATACACTTGATATGGTCGGTCGATACGCTTCTTACTGCCTTGAACATACTTTTCAAGGAGTAAAAACGAAAGAAAAAGCCATTT:1 + chr3R 4277266 3' - INE-1 84 1 77.27 CATTCACACACACACACACACATCCAATGGCATGGCTATGGGATTAGCAATAGATCCTGGCCCAC:1 + chrX 16222448 3' + accord 7026 2 89.23 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGTACATATGTATATTTGACGTTCCA:1 - chr2L 5304857 3' - flea 35 2 75.82 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGATTCGAG:1 + chr2R 21735244 3' - 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chr3L 15375995 3' - R2-element 3110 1 78.75 TCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAACATTCTTTTCTCCTGGGGCTGTGGTTAAGCTTTCGTGGCATTTGATTTTCATTAGCTAACTAGTAGAACC:1 - chr3R 25946923 3' - HB 395 1 60.82 AATTCGTTTTTTAGATCAGAATTGATTTCGGCAATAGTCTTTTAGCACAACCCGCACACAGAACCCAAACACAATTTCCAGTCTGCTCCTGAGAACCGAGGACTTTATGA:1 - chr3R 18492291 3' + 1360 3165 1 59.09 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATAAATATGAACCAACTCACCAACCAACTCTCTTATTTAATGTCTCATTC:1 - chr3R 25163118 3' - mdg1 7076 2 54.55 AAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGTTTGCACGCCTTTTTTTGCTTTGCTGCTGCTCTGTTGATTCTGTTGTGGTGGTTGTCTTATGAAATT:1 + chrX 5738744 3' - Tc1-2 1239 1 54.64 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACGCGCTAAAATTCCAACACACTCTCGCTCTCTGCG:1 + chr2L 4906809 3' - hopper 28 1 51.43 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTAAATATGCCTGCGATTAGAATAAAAAAGCAGTTAACA:1 - chrX 17330111 3' + opus 7459 2 68.32 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - Tabor 6857 2 36.36 ACTTTGAGACCAATCTCGGCAAGCACAACACATGTACACCTCTGGAGACTCGTTTGCATGTGCTCCTCTCGTGAGAG:1 - chrX 4045291 3' - R1-2 190 1 72.73 TCTTTCCTTTTTCCATTCTGACAAGGCAGTTTTTGTACGTTGACGCATGATCACCACCGCAGCTGATGCAAAAGATACCTATGTAAACGCATATAAGCGTGCTGCATGCT:1 - chr2R 15530133 3' - jockey2 496 1 63.64 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTAAATATGCCTGCGATTAGCATAAAAAAGCAGTTAACACTTTGTACAACATTTATCTAGTTTTTCATTTAG:1 - chrX 17330078 3' + opus 7484 2 63.30 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGAGAATAGAAGAGAATAGAAGAGAATAGAAGAGAATAGAAGAGAATAGAATA:1 + chr3L 24821491 3' - blood 7044 2 51.40 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAATTCTTACCATCTGCCGGCACTCC:1 - chr2R 12416857 3' + pogo 2078 1 51.58 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGCACAGTG:1 + chr2L 14141339 3' - hopper 31 1 62.77 TCGCTGGAAGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGGCTGTTGGCGTTG:1 - chr3L 21782780 3' - TAHRE 10071 1 70.45 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGCGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTT:1 + chr2R 13699489 3' - 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chr3L 13539730 3' - 1360 3262 1 70.71 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCG:1 - chr2R 8397429 3' + 412 465 2 48.18 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAACATATTCTTCAAAGCTCTTGATTAATCTTTCTTTCTTTCTCAATTGCTTGGCATAATA:1 + chr3L 10836623 3' - opus 3 2 74.74 GGCACAAACCATTTCTCACTCCACAATATAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATAAAATAAAGTAAAA:1 + chr3L 6640631 3' - transib3 409 1 32.56 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCCAAGCATTTGGCTCGAGCAGCGAAACCGATGGGAGACGAGCGCCACCCGAGAGA:1 - chr3L 131736 3' + P-element 2879 2 66.67 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGA:1 + chr3L 15968224 3' - P-element 41 1 29.55 AAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGTGGAAAGATCATAAGGTTAGTCTAGCCAATTCTTTTGGTATACAATTTACGC:1 + chr3R 17023143 3' - I-element 5013 1 52.73 CGGAGAGCGCTACAGCGAAAAGCTCTTTTCACATCTGTTTCGAATAGCATAGCCATATGATCTAATTTGAAAAGCAAATGCTTAAAATTTTTGTGAGCTCAGCAGAATCA:1 - chr3R 19093153 3' + 1360 120 1 75.45 TAGATGTGAAAAATAAAAGAAGCGTCCAGATAACTTTTAAACGCATTGATTTCGGTTTTTGCCAAAATTCGTACCTTAGCCAGTGTCCACATGACACGGAGTGATATTT:1 + chr2L 13800463 3' - Porto1 4605 1 53.21 AAGATTTTTATTTTTTCTTTGTTTCTCCGTTTGCTTTGCGCTTCTTAGAATCCCAAAATAGACATACCTTTTCAGGGGTGCTGTAGGTGACCGTCAGACT:1 - chr2R 14383523 3' - I-element 111 1 52.00 GACTCAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTGGGGGTATTTAAGCTTTAATGTTGGG:1 - chr3R 5429820 3' - F-element 478 1 67.09 GATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAGATAGATAGATAGATA:1 - chr2L 759207 3' + Stalker3T 205 1 76.36 CCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAATCTTCTGAACGTGGTATATGTTCTTGGGAGATGGCTTTTTCAAACGCTTGGGCGTGAAG:1 - chr2R 17853616 3' + Transpac 317 1 67.74 AACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACCAGTGTTTATGTGATCTACATACTCCCTCCCACTTCTCACTTCATTTTTGGATTTACTAAGCCACA:1 + chr3R 14013436 3' + roo 9055 2 63.81 AACCGACCAAGAACCCTACAAGATTTGAAAACCAACATCCAAAAGGAAATTACCAACATAACACCTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACTTCAATGGGCTAATGTA:1 + chr3R 22552106 3' + mariner2 635 1 74.55 CAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGAAGTAACAGCAACTGAATGCTTAACACTAATTACTA:1 - chr3R 909273 3' + I-element 414 1 74.32 GAGCAAGAACGTGCTCTTTCTTGATTTTCCCGTTTAGGTCGATTGCAGTTATCGACGTAATTG:1 - 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chr3R 902548 3' - R1A1-element 9 1 56.31 GTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCATCAGTAAAC:1 + chr3R 14357362 3' + Rt1b 5104 1 56.36 AACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATTCTGTCGAATGTGTGCCACGTCCACACTTTTGCTCACTGTGTTTTGTGTGAAGAACCTGTTTTAAGGATTAATTGTAGAGGTGCAT:1 - chr3L 24206606 3' - INE-1 32 1 60.91 ATAGTTACACACACACACACACACATATATACTCACTCGATATCATGCCGATCTGATGGAGAACAGGAAGCATTACTGAG:1 + chr3R 13822379 3' + Quasimodo 33 2 55.00 TTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' - Tabor 6855 2 43.14 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTTCGTCCTTTCTGGCACTGCGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 13733019 3' + hopper 1378 1 60.00 ACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCATAAATAATGTGTTGTCAAAAATAATTCCATTACGTCTTCTTAGTGAATATTTTTTATATTA:1 - chr3R 29250039 3' - Max-element 433 1 61.90 ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCCTATCTACTCGTCCCCATTCTC:1 - 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chrX 4617443 3' + Stalker3T 204 1 55.96 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATATATTTATTATTTAGTATAACCAGGTATCATGTAGTCGAAAAACTCAATATTTCCGC:1 + chr2L 16230393 3' - blood 7031 2 60.58 TTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCAACATAGTCGGCATGACGGGCGACGGG:1 + chr3L 22783592 3' - micropia 5250 2 68.24 GTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTCATTGGGATTGGTATTTTTTTTAAGTAATTTTATTGTGGTGGGTTTCAGGTTTACTTTTTTTTCAAGTG:1 - chr3R 31956380 3' - I-element 261 1 71.56 CACACACACACACACTGCGTACGTAGTAGGTGCGTACCTGAGTCTCTCA:1 + chr3R 18398618 3' + accord 261 2 89.80 ACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCCCCCTACCCCCTTCCCAGTTCCATCCAAACTGTTGCCAAAAAAAATTCTTATTAAATGTGATTAGTGCCCAACAA:1 + chr3L 14168836 3' + 3S18 10 2 70.19 GATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACCACGCTGCTCGAAAGATACAAATTCATTGAAAACAATTTTCCCAAATGTCCTCCTCAAGACACTCAC:1 + chr2R 11505299 3' + G2 3051 1 78.12 GCAATATGTAAGTATGTAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATTTTTGCCATGGGAGTAATCCTGATTT:1 + chrX 17347842 3' - mdg1 230 2 76.15 TCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGAAAAAGTCTATATTCGGACTTCCGTCCTTCTTAGGACCCAGTGTGTTCATGTTGC:1 + chr3R 15972796 3' + F-element 4492 1 69.79 TGGTTGACTAGCCTTAAGGGCACTCAATAACGGAGAGACGTTCTCCCATCGTATCTTCTAATTTGGAAACCTTAAAGCCCCATTCACA:1 - chr3L 11754569 3' + gypsy6 7662 2 71.59 CTGTTATAGTTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTA:1 - chr3R 8005047 3' - INE-1 148 1 86.67 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAACTAGTGGAAATGCGAACACGAAATTTCATCATATTTCTGAATTTTAATTTTTCATTGTCC:1 + chr3R 4692760 3' - INE-1 557 1 79.35 CGCTTCATTTACATAAGATATGACCGGAGCCCAACATTGTAAGTCTTTAAAAATACTGAATGGAATCATGTTACGTCAGAGGAT:1 + chr3R 19446447 3' - roo 8718 2 53.57 AAAACACTAAAATAACAAGATGCATAACGCCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTGCTGCAAACCATCTTGAGTCTCAGTT:1 - chr2R 13864705 3' - 1360 3386 2 65.43 AAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGACAAACTAATCTCTGAACTGGGTGGCACCAATTTGGTGGCCGAGATG:1 + chr2L 14928718 3' + Doc 4479 1 66.23 AGCGTCAATACATTGGGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCTAAAAGACCACTCAAGCAACAAATCACTCGCGAAATCGGAACGGAAG:1 + chr2L 12441068 3' + Stalker4 7013 4 67.00 AGTCAACCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTAAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCCGATAATGCTCATTTTTCGAATTCTCCTCTCGTTTTTGGGCCATCTG:1 + chrX 2970065 3' + Idefix 6988 2 55.05 TGCACACACACACACACACACACACACAAATATTTATACGCGCAGATACACACATCTTGGGATGCAGATGAGGCAAAAGGATTTTACACGTACTACTCACCCAAAGCGAT:1 + chr2R 9537241 3' + accord 182 2 60.00 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGCGG:1 - 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chr4 553027 3' + invader2 490 1 72.73 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAACGCAAAAGTAGAGTCAACCCTAT:1 + chr3R 19446209 3' - Doc 69 1 77.27 ACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAAAACTACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACACACACAAACACAAACACAAACACAAACAC:1 - chrX 9845361 3' + Tabor 482 2 40.00 TCAATCGAAATAAAAAAAAAAGAAACAGATCTAATGGATATTTTAAAAATATTTGGTAAAAATAGAGCAAACATTTCAATTAGGCA:1 - chrX 8619446 3' - Tc1 1527 1 66.28 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGGAAAAAAAAAAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCCACCCCGACCCACATTTTT:1 + chr2L 17574420 3' - hopper 40 1 71.59 TTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATAATAGTTAATATTAAATTAGAAGCGATAACATATGCCATTTTAAAACAAAGGTTTCAAACAGGTCGATA:1 - chrX 10740606 3' + Cr1a 4278 1 65.45 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTGCGTAAATTCCTAGAAAATA:1 - chrX 21399390 3' - pogo 9 1 67.03 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' - Tabor 53 2 73.64 CAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAATATGTATGTAATGTAATTTGATGGGGTTGTAGTGTTGATTAACCGTGACAGTGCTGGACAGCGACGCAAGC:1 - chr3R 24401311 3' - 1360 282 1 73.64 GTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGGGTGGGAGGTGGGAGCGAGGCAGGAAGAAGGCTAGAGCGAGAGGAAGAG:1 + chr3R 14347215 3' + flea 4853 1 53.66 TATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTAGTTCGTTTTTAGTTTTGGCTCCGTTGCTTAAGTTTTTGCTGTTTCTTTGATAGCCAATT:1 + chr3L 7732770 3' - Doc 4432 1 60.00 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCAAGTTTGGAAGGAAGCTATA:1 + chr2R 8397509 3' - 412 32 2 55.45 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAAT:1 + chr2L 8476746 3' + Juan 4164 1 71.15 ATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGATCGGTATCTGCCCCCTTGCCCCACTATTTTCCAACCTCACTATTCTATATA:1 - chr3R 13742163 3' + Ivk 5054 1 53.76 GAAAGTTAAACACAAAGTGCAAAGTGAAGTTCTTACAATTATTGACTATAGTAATTAAATAATATATATGATAGATTTAAACGCGAATTTCTCTATTCTAGCGTCTCCAT:1 + chr3L 4627598 3' + Doc 87 1 59.09 TACACACACACACACACATTTTTGTTGAAGACAAGCTGCCGCCTTTGGCATTCAAAGTCACTGAGATTGTCAGCGTTTTCATTTTTATTGCTATTTATTGCTATCTTGTT:1 - chr2R 1597384 3' + accord 184 2 69.09 TATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAACCCTCTACAGTTAGTGTTGTGAGCGTCTGTTTTTGTCGTGCGGTGGTTCCGACCTAAGCCTTA:1 - chr3R 19758468 3' - I-element 5123 1 53.26 TTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAAAAAACATGAAATGTGACAATAA:1 - chr3L 14760529 3' + F-element 15 1 75.27 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATA:1 + chr4 96889 3' - 412 35 2 56.36 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAAACGTATTTTATAGATCATTTTGTTCTCATATGAGTGTAAGCGGA:1 + chr2L 770059 3' - roo 24 2 54.64 GTAAGCATATAGATATAAAATATCATTATATAAGAGAACTGAATAAGACACAAAAATTTAGAATTTACTTTCAAATCACAGTGCATCATGGTAACCAAAT:1 + chr3R 20501516 3' + Dm88 4122 1 55.00 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAATTCCCAGAGAAGATAGGATCTTTTATTATATTGGTAGT:1 + chr2L 13710738 3' - copia 31 2 62.11 GGAAATAATAAGAACCATGCACGCACAGAGCGACACAACTTTCGTTTTACTTATACACGACGTTCGCTCGAATTTCTCTGCTATTTTTCGGT:1 - chr3R 20593324 3' + invader4 430 1 75.00 TTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTCACAATGTCCTGTTCGCTGCGATGCGAATTGCCCGATGCGCTGCCTGCCGAG:1 + chr3L 9632031 3' - flea 4974 2 55.34 TTCTCACTAGCTGAGTAACGGTAATCTGATAGTCGGAGTTGTCAGATGCATATTAATAAACATGAATATTGTCAATGTGGGTCAGGCAAAGAAAAAAAAA:1 - chr3L 2751089 3' + INE-1 537 1 67.00 GCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATGTGCTCGACTGCACAGGGCAACGGCGAAAATTCTGCGGCCCCTGATCATGTGGTTCTCCGCT:1 + chr3L 14814204 3' + FB 965 3 60.00 ATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGACATGTCCGACCGTCCGTCCGTCCGTTCGTCCGTAAAGTGTCAATGCACTTGTTCTTGTTTCAACCGTGCAG:1 - chr3L 21253524 3' + INE-1 93 1 65.00 TGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTCTACCTTTAAAGTCAAAAATTCCAATTATTTCACAGTGTGTACAGTGACAAACTGTACATGTATTTCCAACTTGCACCT:1 + chr3L 11085785 3' - S-element 72 1 78.18 AGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAAAAAACTGAAACTGAACAACATTACTTGATTCCTCGGGGGTTCACTTTAG:1 + chr3L 15520046 3' - 1360 3279 1 71.43 TTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTACATACAATATTAATCTGTTATTATTATTATTATATTATTATTATTGTTTCTCAGCTCGCATATCGCAGTTT:1 - chr3R 10983977 3' - invader3 5110 1 80.00 CAGAAACTCTAGCGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAGGCGTCTGCGGCATAAACGAGTCAAAACTTGCGCAAATGTTGATGCTCAAAGTTTT:1 - chrX 14455034 3' - invader1 90 2 65.00 CCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAACATCGTATGGCGTTATGCATCTCTATAGGAAGTCACAGTAAAATCTTGAACCCAGAACAACAACAACAAC:1 + chrY 880219 3' - 1360 59 1 47.87 GAATTCACACTAGCGGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAATAACGCTTTCTCTCTTGTTTGTTTTTTAGTTTTTGTGATACTTCATGTTTATAAATTGTTT:1 - chrX 14670473 3' + INE-1 534 1 74.55 AATTGGCGCCCAACATGCAATTGGCCAATGCCAGCCGAACCTCTAGATATCTTGAAATATGTATTCAAAAACTCTACGTGAACTTTCAATTTG:1 + chr2R 18672694 3' + gtwin 492 1 52.69 ATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAGCCAACGCAACCGATCAATGGAACTGTCGCACGCGCTGCGCATAAGGTTACCTGCTGT:1 + chr3R 21858490 3' + hopper 54 1 58.18 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTGCGTTTTCATTTTTTCATCTCCTATATAGCATATTTCTTTGCGCTCAATTTCCTGTATT:1 + chr3L 19347235 3' + jockey 4961 1 55.45 TGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATACAGTCAAACCCGGCTGCATCGCTTACAAACAGTTCATAGTGCGCCTCTCTCCGCGCCT:1 + chrX 16456785 3' + Doc 4485 1 61.54 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTATATTAATTTTTAAACCTTACTGTAAGCTATATTTAGGTAATGTAAT:1 + chr3L 18743475 3' + pogo 2073 1 59.62 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCGAGCCACCAAACCGGGCTCAAAACAATTTTATGCA:1 + chrX 12145211 3' - 412 7088 2 62.77 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTTATCATGAGCTGGCGTATCAGGTGCGTGTCTAAAACGAATC:1 + chr3L 19063492 3' - P-element 45 1 17.00 AAGTAGTTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGAATGTTTCTATGCTTTTCTATGTTATGCTATTTTATTCTATGTTATTATATTTTATTCT:1 - chrX 1133425 3' - Porto1 4449 1 60.00 ATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGCAACTTAAGGAAAAATACCATTTCGTTTCGTACCCAACCCCAGTCCCCGATGACACCAAAACCCCTCTCTCTCTCTCC:1 - chr3L 40450 3' + F-element 4406 1 56.19 CCCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACAAAAAAAAAGAAAATAAACATAAAAAAGGCGAACTTCAACCACTT:1 - chr2L 5509710 3' + gypsy2 340 1 72.22 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTTGCCTGTTCATAAATTTATATTTGT:1 + chr3R 7500910 3' - FB 56 1 76.36 GGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAAGAAATTCCACGAAATACAAGTGC:1 - chr3R 21619066 3' - micropia 103 1 78.90 GTCTTGTACATTTCTATCGATTTGCTGAAAAACTTTTTGCCACGCCCACTCGCTTTTGGCCAATCCACATTGACATCCTTAAATGGCCAAATGTTTTTCGGCACAACG:1 - chrX 10506862 3' + INE-1 301 1 63.89 CTCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATACCAAAAAATCTGAAAACAAAGCAGGCAAATTTACGCGAATGTTGATTGGGCATG:1 + chrX 16153475 3' + I-element 5127 1 76.36 GAACACACACACACACACACACAAAGGCCAACTGAAACTGAGGCAATATAAAC:1 - chrX 6030531 3' + accord 183 2 81.13 ATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAATAAAATACCCCAGACAGAGATCGAAAAAAAAAACTGGCAAAATGCGAAAAAAG:1 + chr3R 20261031 3' + invader2 315 1 55.56 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACA:1 - chr3R 13437178 3' - hopper 38 1 71.11 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGTGACAAACCGGATCTTGTCAATGATTTTTGGGCTCTATATAAATTAAATCCCTTAACAT:1 + chr4 734645 3' + blood 7318 2 56.88 CCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATCACATTGCATAGCTCTTATACTTTATAATAATATAAAACTTTGGTGTCG:1 + chr3R 11858964 3' + F-element 4419 1 68.35 AAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTA:1 + chr2R 5173192 3' + Stalker4 7312 4 70.91 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACTAAGCCCCGACATTTTAGCACATTGTTACACGAATGATGCGGCGCGGG:1 + chr3R 10956263 3' - hobo 18 1 55.56 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATTTACATAGCCTGAATCTTGAAAAGCGAACCGCTAAGTGCTCCATGTTTGCAGTTGCC:1 + chrX 15043210 3' - S-element 5 2 72.34 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAATAATTTCATAATGTAATAAAATAGTATTTTTATTAACAATGATTTTCCTGCATTTACCCCATCGTATAATA:1 + chr3L 18915239 3' + 412 478 2 67.27 CCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGGAAATCGAGAAAATCAAAAAGTAAACAACTGCAGGCCGAAATATGAAAAT:1 + chr2L 841187 3' + Doc 4302 1 59.60 AGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTGGATAACAAAAGGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGAATCAATACGTGTGCCAAACTTATTTTTTTTTAGCATTTTC:1 + chr3R 10744883 3' - diver2 178 2 64.55 TATTTGATATGAATGGCCACCCCCTTGAAAAAGTCCTCTTAACACACAAGCTAAAAAATTGAGAAGAAAAGAAAACCTGAAA:1 + chr3R 19760087 3' + copia 54 2 79.27 GAACGAGAGGGAGCCATCATTGCAATAGCCGAGGATGATGATCAACGATGGTTAAGATGGGGATATGCCCAGAGTGTGTGTTT:1 + chr3L 9742702 3' + Bari1 1261 1 68.67 GGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCAATA:1 + chrX 18750714 3' - BS 4824 1 60.00 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATATATATAAGCTTGTGAGCTATACCTTAACTTTATTTTTATGTATATTTATT:1 + chr2L 2484418 3' + jockey 4954 1 55.45 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCCTTTCTCCTGCTTTCTCTTTCCAAACTACCCATGTAGATATGTTTGCTTGTGTGCTTAA:1 - chrX 16994085 3' - roo 8664 1 75.29 CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTA:1 - chr3L 3240542 3' + diver 6089 2 67.65 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTACAATCAAAT:1 + chr3R 11937289 3' + pogo 2076 1 57.01 ACCCCATTACTATGATGCCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAACGTTTGTAGCCCCCGAACCATAGAGATACCACACCATGCCCACAAATGCCCCTCAACCACCCGA:1 - chr3L 3855772 3' + diver 6088 2 50.93 GGCGAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTATATTCTAGTGTCTTTGCTCAGATGGTTGATCGTCATTTCCCGCTTTGAAAATATGAGTTCTAGTTTCTCCAAGGCGT:1 + chr3L 24162243 3' - 1360 28 1 53.64 GATCTTCTTACATTTCCCTTCTTCAACATATTCTCTAATATCTATACACACTGGCGTTCACTACATTTTCACCCACCTCTAAACGATCACAGGACTTTATTTAAGTCCT:1 - chr2L 12293782 3' - invader4 220 2 69.72 TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCG:1 - chr2R 6984315 3' - HMS-Beagle2 6910 2 54.29 ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACAC:1 + chr2R 8530783 3' + mdg1 7400 2 79.09 AACACTCAAAACTAGAATTACATAATAATATAGCAATTAGTTGGGGCTCAAAAATTCTAAAGCAAACTTTGTCGGAAGGCAAGAAGAAGAATAAAAACAACAACAGCGG:1 + chr3R 11477875 3' + Porto1 4207 1 69.72 CAAGTAGTTTGCACACAAAGTTTGGAGTCTTAACTACTGGTATGACTCAGGAGGCAAAGAAGTTTTATTTTTTGTGAGATTTTTTTGAGCTTTTTTTCACAGAAGTTTAT:1 + chr3R 1272013 3' - transib2 2735 1 69.09 GAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCATATACTGCTAGAGATTCCAATCTCAAATAACTGATGAAACGTTGGAG:1 - chr3R 22253823 3' - F-element 4227 1 58.49 ACTTAAGCATATGCCTACACAATAATACAACATCTTAACCCCACAAAGNCGAGCAATTTCTAATCAACAACACCGTTCTTAACCCTTTTCAGTTGTTCTTCTTCGTTTTC:1 + chr2L 4032419 3' + Idefix 25 2 75.45 ATAATAAAAACTTCACAAAAAAAAGAAGGCGGAGAAAAAATATGGAAAAT:1 + chr2R 13769719 3' + jockey 4992 1 48.00 GGCCAGATTCCCTTTTTTTGGCATAAAGTTAAATATTAAAGCTAGAGCTGCATTTTTGTAGAATTGGTGCATCTGACATCAACACCATTTTTGGGCTGAGCTGCAGCGGC:1 - chr2L 16278436 3' + transib3 8 2 70.00 CAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Tabor 7266 2 73.64 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 204 1 39.74 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAATTGATGGAAATAGTTTTGGTTCT:1 - chr3L 17787021 3' + pogo 2054 1 75.76 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTTCAG:1 - chr3R 6263316 3' + diver 174 2 71.15 TCAGAATTGATTTCGACCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCCTGTTTTAAACTCACCCGTGGAGCACTTTGATTTGTGTTAT:1 - chr2L 13274091 3' + 1360 3180 1 72.48 TTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTATTTATTTTTTTTATCATTTACGTGGAGGAATAGGGAATAGCGGAGATCTACTGATAATGAGCAG:1 + chr4 566323 3' - Quasimodo 469 2 60.55 GGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGGGAATACAACAAAAATCTGGCACAAAGCCTACTGAGTCGACTGATTCGAATCGAG:1 + chr3L 20170789 3' + F-element 4288 1 64.13 TTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTTATATTTTAAACATAATTATATTAAAGATCCGTTTCCGCCTCGAATTGCCATTTATTTTTCAGT:1 + chr3R 19487547 3' + Cr1a 43 1 70.00 CTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAAATAAATGTATCTTTATCCGCCCACTAATGCATCGTTG:1 + chr2L 15209874 3' + Ivk 5331 1 70.37 CAGATACCAGATAAGAATAAGACTATCATATGAACCTTAAGACAAGGTTGAGTGTAATAAGCCCAAATTCCAAAAAAGTCATCAAGTGTCTGCGCCACCTAACAGATACG:1 + chrX 2652174 3' + Idefix 6921 2 73.64 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCTTTTTGTGCAAAAAT:1 - chr3L 13228504 3' + P-element 2820 1 20.00 ATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACATATAATATACAAAGCAGGACGAGAGAAGAGAGTAGGGAGTTAGGCATATAGGGATAGCTAGGGACGGAGG:1 + chrX 9172468 3' + Bica 81 1 72.92 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTGACGTTTAAAACAAATTTCTTGCCCAAGAGAGCG:1 + chr3L 17490713 3' + roo 9020 2 74.31 CAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCGCTGCACACAGGGCAACACCCCGCCACTGACTCCCCTTGTATCTCGAC:1 - chr2R 16406020 3' + Tirant 8441 2 70.13 TCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTCATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTA:1 - chr2L 8959918 3' - Ivk 5121 1 51.82 CGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAAGGCAATAACATTATAAAAGCATTCAATTGTTCTGTCCAATAAGAAGAAGTATTAATTACCAACTCATTTT:1 - chrX 22218849 3' - Max-element 12 2 69.81 TGTGTGGGAGAGCGAAAGAGTGAGAGCGAGAGAATAGGTGAGCAGTGTAGTAAAGTACTCAAATTTGCAAAGATAAGTGTGCTTTATTGAGTATAGCATATTATATACTT:1 - chr3R 21312566 3' - Cr1a 304 1 62.73 TGCAGTTTTTTAAAGAAAAAAATAAGAAGTATATATTTTTATCTACGATTATATGGTATTAGCTTAAAACAAAGTGTACTAGTTCAACTAATGGCAAAACGCATGGAGTT:1 - chr3L 9761457 3' + flea 313 1 53.64 TTGGTGTTTTTTTTTTTCGTTTTTAGGTTGGGAAAGAA:1 - chr2L 8032010 3' - gypsy7 5012 1 78.95 TAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTATCATTTATTTTATGCATGCAACGCGCTGTCTTCCCAAAACTCAGTTCTTTATAGCCACTAGATTTTATAATCAAATGGCA:1 - chr3L 19510681 3' + Cr1a 78 1 60.91 CGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATTCGGGATCCAGCAAGCCGATAACAGCTACTCCCCCAAATACAGGAGGCGG:1 + chr2L 9426009 3' - accord2 7578 2 60.22 ATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTATGATATCGTTGTATAAAAAAGGGAGTGCGCCGTCCGAGTTTCCCAATGTAAGCCCCATTCTGCGTAG:1 + chr3R 23730078 3' - Burdock 8 2 71.03 ACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTATTCTATTTTTTCCCGGTTCGGTTCGGTTTGGCTCGGTT:1 + chr2L 12361788 3' - F-element 144 1 64.42 TTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACCAACAGCTTTTAATACCAATAAGACTGTGTTTCTGAAGTAAAC:1 - chr2R 13046653 3' - Circe 7092 1 60.91 TATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATTTACGTAATTTTGTGCCAAGTTCACATACTTAT:1 + chr3L 14781888 3' + 1360 257 1 69.72 CGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGAAGCGCGTTCAATGTAATAAAACTAATACACTACTAGCTAGTGTATGCATAATATGG:1 + chr3L 21839582 3' + hobo 288 1 57.28 CCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTTAAACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAATAAATAAATATTAAACAAATTAAATAAATAAATTAAATAAATAAAACAA:1 + chr2L 4192083 3' + TAHRE 10430 2 67.33 AAAGTAAATTAAAGCAAAGCAATCGAAGAGGCAAAAAGCAAACAAACGGAAACAACAAAACGGCAAATGACATCCTAATGGTTAACACGTCGTG:1 - chr3L 1364262 3' + TART-A 13142 1 75.53 TGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCGGCTCACTCCCGCTGCGAGCGTAAGAAATCAAAAAGCTAAGCAAATTGGTAACTCGATATTTTCGCTGGA:1 + chr3R 13886415 3' - 1360 3318 1 58.51 GTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAATGAAGGACGGAAGTGGG:1 - chr3L 5074851 3' + 412 7137 2 79.52 AACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACTTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGA:1 + chrY 652806 3' + Stalker2 7607 2 82.73 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTG:1 + chr3L 13228559 3' + P-element 2883 2 71.59 AAACCAAATTATACCACAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAAAAAGCCAGCAATTCCGTAAGAGAATTTTGAACTTGTTGATCAAGCAATTAATGAAGTAT:1 + chr2R 22195533 3' + I-element 5170 1 58.18 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTGTATATATTTCCCTTGTTTGCAATGAGACATTTGTCCTCCACTATCTTAATTCCACTGTACTTAGAC:1 + chrX 15046812 3' + 412 474 2 60.00 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATCAATGCGATTAATTACGAAATGAGCAATGCCGCTTTCATCGCTCCATTATACACCC:1 - chr3R 23861036 3' + pogo 2099 1 78.90 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACCATTTGATCAAAATCTATTTAGTTCAAT:1 - chr2L 14848387 3' - pogo 38 1 61.82 AGGAAGACAATTTAGGGACTCTGGTACTCTAGTTGGTCAAGAATATCAATGAGTAACAAAAAAAAACACAAGAGAATAATATAGTCGAGATTCCGCATCCTGGCGAATTG:1 + chr3L 12599743 3' + Tc3 1291 1 82.73 TCAAAAAAACCAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAACAAATGTTTTTAAAAGAAAATAACGAAGTTCCTGAAATATCTTCGATCATAAA:1 + chr3R 21311441 3' + I-element 5164 1 54.55 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAATAGTCTTTAAAGGATTATATTTCTTATCGCCCCTTTTCAAGGCAAAAAGG:1 - chr2R 21735406 3' - blood 34 2 54.55 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTGTTAAAAAAAAAATGGCTCATGTGTAGGGCGTTGGGTTTCAGTATTTTTCTTAGCATACT:1 + chr3R 7874885 3' + jockey 4984 1 46.24 TATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACAGACGAACAGGACTCCCAGCTGTGGGTTAAATGCAGTTCCTGCCACAAGGTCCCATTTACATAGAAGAACGAAAG:1 + chr2L 11863347 3' + Idefix 34 2 70.64 TTTTATTTATTTTATTTATTTTCGTCGGTGTTTGTTTGCTTTTCTTTTTTCGGCTTGGGGTTCG:1 + chrX 20071330 3' - HeT-A 1 2 76.56 GGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTTTGGGGATATGGATGTACCTATATTCTTTTGGTTTGTGTTCTTAACACACTTG:1 + chr3R 29250171 3' - F-element 365 1 52.73 ATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGCAGCACCGGGAGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATGTAAATAATATTAAAACGAGAATAGNTA:1 + chr3R 6263353 3' - diver 5945 2 70.00 AAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGGTTTTTGAAGGGGATTCGATCAAAGGCTGATTTTTGAATAGATAATTATTTAAATATTAGTAGGGGAAAA:1 + chr3L 16463179 3' + flea 263 1 53.21 TATCGATGCCGCTAAGCGAATTATACTGTAATACAATGTGTAACATTACACTTCTTGTT:1 - chr2R 9953295 3' - pogo 7 1 57.63 TTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTC:1 + chr3L 15253229 3' - Stalker3T 203 1 21.82 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGTATTAAATAAAATTTAAACACCGGACGGGAAA:1 - chr3L 17530144 3' + Tirant 8474 2 69.15 TGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTGCGGCTGCATAGGCAAACAA:1 - chr3R 23870324 3' + P-element 2532 1 42.86 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTC:1 + chr3L 131819 3' + P-element 2857 1 54.72 AGACATGCCTCGCTCACGTGCCAACGAACTTAAAGAGAAAAGAAACAACTTAGGATTTACGGATTTTACAAGTCTGTCAGACCTGGACTGACCAGA:1 - chr2R 17560951 3' + invader1 333 2 79.17 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGGTTTGTATGGGAATGTCACTATATATACTTACGTAGTTATTAATTTT:1 + chr2R 3146334 3' - 17.6 6962 2 90.12 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACACATCATATCCTTATCCACTCAAAACTTTTCTAACT:1 - chr3R 12039940 3' - 412 49 2 67.27 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTT:1 + chr3R 27071924 3' + jockey 4966 1 55.77 AGATTTCAGGAACTATGAAAGCTAAAAGGCTGAGATGATGCATGCTGATTCTAGAGCCCACTTTTGAACAATTTGTATTTTTTTTCCATTTTATTTTCCAATATCTATCG:1 - chr2L 21862343 3' + INE-1 149 1 54.55 GGTATCTGATAGTCGGGCAAGTCGACTATAGCGTTCTCTCTTGTTTAACATTATTATTTACTATTCCCAATGCAGTCATTCCTTTATTGTTCTCTCGATAAAACCAATGA:1 - chrX 20774076 3' + INE-1 557 1 71.82 TGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGCGTTCAAGTCGTGTTTTAAATTGGGTTTGCGACCAAGCTCCGATACCATAATGCCATTA:1 + chr2R 18291755 3' - Rt1b 4943 1 71.59 AAATTCTTGATCAGGATCACTAGCCCAGTCCTTCTGGCAATGTCCGCCTGTCTGTCTGTCCGTATAGACGCTGGGATCTGCTTTATAAAATTGTACTATTAAAACTAAAT:1 - chr2R 12391769 3' + INE-1 84 1 46.36 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCGTATCGTTCTCCTGCTCACACGCTG:1 - chr3L 14274278 3' + P-element 2848 1 33.33 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACACATCATATCCTTATCCACTCAAAACTTTTCTAACTTTAAATTAAATTAAGAAGTTAT:1 - chr3R 12039918 3' - 412 27 2 56.36 GTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGTGTGTGCGGTGATATATTAGTGAGTGTATCGGAATGGGAATGATTCTA:1 - chr3R 15589985 3' - 1360 3240 1 50.00 ATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGAACCCAGCCATTGGGCAAAGGATCATGTGCTGAGTTGTTTGTTGAATTCAAAAGTATGTGCATGTTGGGTGTCGAGCAGGCT:1 - chrY 3606500 3' - 1360 201 1 71.82 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTTGTCTTGATTTCATTTTTGATTTTAAGGCACTTTATCTCTTGCCTAAACTGGTATTCTTGTTGTT:1 - chr3R 19446800 3' + roo 9051 2 63.64 CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACAACGGTGCTTCATCCACCTCCTGATGGCA:1 + chr3L 22108165 3' - Transpac 4959 2 60.00 ACCCGCTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCACAGAGTATCCCCTGTTGATCCCCTTTTCAGTCAGT:1 - chrX 865445 3' + GATE 8262 2 71.26 CATCGTTCTACGGTAAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAATTAAAAGTAGTAAGGTTAGCATACTTTTCGGGCGCTCTGTAAAGTCGAATGCAAATGCTTCCGTTTCCGTC:1 + chr3R 27816568 3' - Cr1a 4009 1 48.18 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAAAAACCAATGACAACTCCTCTCAGAAAAGAAGAAAAATAA:1 + chr2L 4016944 3' + opus 487 2 69.09 ACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACTCGCACACCCCCTCACATTACTATAATACAC:1 - chr3R 29334342 3' - Bica 97 1 65.17 TCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTTTCATCTCTCTCTAACACACCATCACACGACTTTTTTATT:1 - chr3L 77038 3' - invader4 2957 2 74.12 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTGCTGTCTAATTGTACAGAACGTCACAGACGTGCACTAAATGGTTCCATAAA:1 + chr3R 11173287 3' - Transpac 4951 2 53.21 TGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAACAACAACAGTACTAATACTACAGCAATCAATGGAACGGGGTA:1 + chrX 6183959 3' - 1360 328 1 58.00 AATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGATAAGGTGGCAACACTGGAGAATTTGAAAGCAACGTTTTCCCCATTACGTAATG:1 + chrX 8894567 3' + Cr1a 176 1 53.64 TTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTGTGTACACATACAGTTGTCTGCTGTCACTGTATGCGTAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACC:1 - chrX 3464190 3' - 1360 232 1 70.91 ATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAACTTATTTCAATCTAAATCGAATGCGATTGTTTTTTCTTATTTGGATTATTTTCAAAGTTATTTTACAGTGTTA:1 + chrX 21006619 3' - transib2 2496 1 67.27 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGCGAGCGAACATTTCTGCAAACA:1 + chr3L 12301239 3' + hopper 1364 1 76.53 AAACTATTCTACCTATCATAATAAAAATAAAAAAATAAATGAACGATAAAAAGCCAATAAAGAGCGGCATAAATAAATGCGTAAATATCGAGCGTATACATTATAT:1 - chr3R 5774812 3' + I-element 5342 1 70.75 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - Tabor 6872 2 56.73 AATTTATTTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCCTTAAACGATCGCATCAACCTCATCAACAGAACACCACCAGAA:1 + chrX 11696208 3' + TAHRE 54 1 53.93 GTAAAAATTTTCTAAAATTATTATTGTTACTTAGGAATAAAAACATGAAAGCAATCACTCACAAAAAAAATTCCGGATTGAATAATGTGATATTTTCCGG:1 + chr2R 5462849 3' - transib4 109 1 70.00 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGATTCGAGCTGATTGGATGGGAACACAAGTGAATTACGACAATTTAGA:1 + chr2R 21735284 3' - blood 7017 2 73.39 TATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTCGGCCGTCACTTTAAAGGAGAAACAATGTGATGGCATAGGAATA:1 - chrX 3897362 3' + 1360 3278 1 68.04 AGCAAGGTGATTAGGAGGCGTGTTGTTTGTTTCCCGGTGCTTAGTATATGTCGTTCTTGTAGTGCTGCTGTGCTTCTATTCACCTTTGTATTTTTTTTTTTCGTGTTTT:1 + chrX 2004824 3' + accord2 286 1 72.48 AAGAAAAGCAAAAAGGAAAATAGGAAGGAAGAGATGGAAAAGTGAGAGCCAGGCGCTAAGGACAACTTTTGGGGGCAGCTG:1 + chrX 5255305 3' + Doc2-element 248 1 56.79 CAATTACTCTCAGCACAATAGCGCAGAATGCGCGTCAAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCCTTCATCCAATGCCAATCTCTTGAAATGACACA:1 + chr3L 14755277 3' + Porto1 384 1 62.14 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATGCAG:1 - chr2R 20924219 3' + mdg1 7413 2 70.00 GCTCCCAGCGAATCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTGCCCGAAAAGAAACAAAATAAACAACTTTATTGGAACCAGCAAAATTTAAATG:1 - chr3R 24925116 3' + HeT-A 5718 1 63.44 CATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATAAAAACCCAAAATATGAACATATTTATGCAAAATAACCCAAGGCTGCGAGGAATGGAGCACTTGACAAACA:1 + chr2L 13320554 3' + I-element 5153 1 70.91 GCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATA:1 - chr2R 5582172 3' - Cr1a 455 1 57.27 TATAATTACCGCATTTAGAATTATGTGAACCACATTTTGGTGTCTGACAAATGTTTCGCTTATCAGCTCGAACTAGTGTACACGTAAATTCCCCTTCTTATATA:1 + chr2R 21301089 3' + flea 4964 2 76.92 GTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCACCACACCAACCTTTCAACCCAACGGACCAACGCGTCGCAATAA:1 + chrX 10992243 3' + F-element 348 1 58.95 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCCGACCAGTATACCCGAGGCCAATGGCTC:1 - chr3R 6132069 3' - I-element 15 1 56.72 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTATTGTCTTTTTTCAGTCCAATTATGAGAATACCAGAGTTTTCTGGGAATGCGTTTTACG:1 + chrX 16693853 3' + 1360 3366 1 58.18 TGTGTTTTAATTAATATATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - hopper 1115 1 63.75 TGAGAGAAGCTTATTGGTGTTTCGGCGCCATTTATTCAGTCGCTTCTGAAAGGCCGTGTCATGGGAGGAGAATCGGGGTCTTCTGTCGTTTATTTTTTGTTGGATGGGTT:1 + chr3L 9161370 3' + R1A1-element 221 1 78.18 ACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAGTGGAAATGCGAACGCGAAACTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAAATAGAGTGAGCGTG:1 - chr3R 31957644 3' - INE-1 548 1 78.41 ATTGTAATACATACATACATTTCTTCCTCTAATTACATACATTAAAAATTTAACTCTACGAGTTATCCTGCCAATGCTTAACACATTTCCCAAACACACGATAACTTGGC:1 + chr2L 10867701 3' + ZAM 8227 2 70.91 GCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCA:1 + chrX 18750711 3' - BS 4827 1 63.53 CAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGTGAAATAATTATTAACAAAAACAAGCGGCAAACATGGAACAACAGATGCTCCGGCGGACGAGACGGGAAAACCCTCA:1 + chrX 3973850 3' + I-element 84 1 73.64 TGATCAATATTTTCTAAAAAGTGAGTTTGAATTTGAATTTGAATTTGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAATAAATTAGATTCCAAATCGAAGCGTTTGGCTT:1 + chrX 8456907 3' + HB 259 1 74.31 CGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTAGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGAAAGCAAATTAAATTATAATCCGGGCCGGCGGAACATAGTTCAATAT:1 - chr3R 16576363 3' + 1360 3205 1 66.97 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATT:1 + chr3R 24867552 3' - roo 48 2 71.82 TTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCACGCACCCACCCAGCGCTCGAGGAATTGGGAAAATGGGGTGGCCACCTTTACTCTTTCTATCCAAT:1 + chr2L 21821875 3' + FB 367 1 76.84 AATACAAAAATTTCATGAATTTACGAATTTACAAAGAGACACAATATTTTTAAATCTACACAATAAATGAAAAATCACGGCATCAAAGAAAATAAACAAGGTGTGAAA:1 + chrX 5377895 3' + S2 1632 1 62.96 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTTTGCGTTTATGGATTTTTAATGGCAGAACTCCTAAAACTAAAC:1 - chr3R 18769696 3' - roo 16 2 53.57 TTAGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAAAGATCAACAATAACACACTCAAGCGGCCTGGCTGGCTTACTCACACACTGACACTTTGTCCATGGGTC:1 + chr3L 5577588 3' + micropia 247 2 67.27 TTAAAAAAAATAAAAAAGAAAAACAAAAACAAAAAAATTAATTCAATAAATAA:1 - chr3R 27842162 3' + Doc 4702 4 66.04 AGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGATTCCTTCAGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACAGAAAGTAAAAATATTATGATTACATACTTAGCA:1 - chr2L 9141340 3' + invader4 206 2 68.81 TAAATTATAAATTACAACAGGGTACCTATTTATATTTTTTCTACTCTTGCAAAAGGTTGCTGTAATTTGGTTAGAAAGTTGGTCGTGCTCTGCAGTTATCTTAGTTGCCA:1 + chr3R 30298417 3' + copia 258 1 72.73 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTCCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACCAACTAATAAAATCTCTCGATTTTT:1 - chr2L 15988719 3' + 412 449 2 70.10 AAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATC:1 + chr3L 19339404 3' - Tc1 60 1 70.91 TACCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTACCTTACCATAAAACGATACTTGGAACAGTATTTATTTGTAATTGCATTTGCATAGGACAGCGC:1 - chr2R 8292171 3' + Cr1a 3976 1 78.00 TATTGACAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAG:1 - chr2R 1320687 3' + diver2 4892 2 58.54 TAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 202 1 43.27 TTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCACTTATATTCTCTTATCTTATCTTATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 + chr2R 5064835 3' - Stalker3T 203 1 47.27 CAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCTCTTCACTCGGTCGCTGTCTCTA:1 + chrX 7135091 3' + 412 7230 2 77.67 TGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGCCCAATTAAATTGTCAAAAATGCTGTGAGCGTAA:1 - chr2L 10128671 3' - copia 4920 2 72.48 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCATCCGATGCCAGTAGCGTTTCGGGTCTCTCCGGCTTCA:1 + chrX 21399472 3' + pogo 2062 1 61.90 ATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGG:1 + chr2R 6801699 3' + McClintock 447 2 61.00 ATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAATGGCACACAAAGCAGCCGCACGGCATTTAAA:1 + chr3R 27406537 3' + F-element 4224 1 74.55 TGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATA:1 - chr2R 23354298 3' - Tabor 56 2 74.55 TTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAATAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAAAGATGATATCGAGTCTGAAATCTGTGAAAATAAATTTAT:1 + chr3R 19444958 3' + Bari1 361 1 77.27 GAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGACGAACAAGTTCGAGGATTTAATGCTGCCTATGGATTTAATTTGGTTTTATGCTGCGA:1 - chrX 185059 3' - micropia 58 4 74.42 AGTTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAACTAAAGGAAAATGCTGGAAAGAGGGTGAAAATGCTACTTTGAGTGGCAATAAACAATGCATAATGAGTTGAGAGTC:1 - chr2L 8741802 3' + HMS-Beagle2 7153 2 64.55 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATTTACAGGC:1 + chr2L 10746705 3' + flea 207 2 72.82 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATCAAACAACAATTTTACTATCTACATTTCAAGTTTGTTGCTGTTTG:1 - chr3R 25859629 3' + 297 372 2 67.61 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAAAGATAAATAACCCGGTATTCTTCTCCTTAGACCTAAA:1 + chr3R 1023409 3' - F-element 14 1 57.14 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTAATGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATATGTATATGTATGTGTAATTATTTC:2 - chr3L 10506764 3' + hopper 1376 1 57.27 ACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCTTTGCCCATATAAGCCCACCGTAACATGTGTTTACTGTACTAAAAGTAAAGTTACTAAAAGTGTTTATTACATTTTATTCA:1 - chrX 22614922 3' + blood 433 1 80.00 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 70.91 AATATTTAAAAAAAAAAACAGCAAAGGTCACCGCATTGAAGGCGCAGCAGGCGAAGAGAAGA:1 - chrX 13290800 3' + TART-B 10509 1 74.19 GTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGATCTCTCAAACTACATTGTGGGAATACAATTGAATTTAGATCTGGTAGCCACACAGCTTGACCTC:1 + chr2R 19653850 3' - copia 4757 1 66.36 GAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGAGAACGCATACATACATAAGGAGGGGAAAAAAGGGATGCTGAGCAACATGATAAAGGCA:1 + chrX 11286728 3' + Stalker3T 205 1 51.82 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAAAAATAAAGTTTTTGCCACACAGAACACAAGAAATAAAGAATGGAGAAAGAA:1 + chrX 9845550 3' - F-element 26 1 47.47 GGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGCGC:1 + chr2R 13699495 3' - jockey 4757 1 76.74 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATG:1 + chr3R 11937272 3' - pogo 20 1 60.00 GGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - Stalker4 3 4 32.63 CAAATAAAAAAAAAAATGGGAAAAAAATGAAA:1 - chrX 6862612 3' + Bica 335 1 81.25 AGCGGCACGACGTGCATCTGGGCTACACAGGATGTAATGCACTTGATCGAGCATTTGGAAACCACCACAGAAGCGAAACTTACGACACCACGCACG:1 - chr2R 8949583 3' + G5A 2502 1 72.92 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGGATACGAGTAGTTGCGATTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 20398482 3' - roo 8697 2 68.89 CAAAAAAAAGGCAACTAAAAAAAAAAGAGCAGTAAACCAACCAAGTAACAAACAGAAAACGCTGAAAAAAAAGTGTGCAAGAACATACAAAATATCTTTTCACTAATTC:1 - chr3R 21375958 3' - Tc1-2 1389 1 69.72 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGCAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTCAATTATAGCATACTTTTATGCGGCAG:1 + chr2R 13699498 3' - jockey 4767 1 66.67 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTTGAATTCAGTAGTCATTTATTTGCATTTTTATTATAGAAAAATATATTCC:1 - chr2R 14624443 3' - roo 34 2 58.18 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGGTTAAAGGTGGGCGGATGTTTCACTCGAGGAACGCAGAAAGGAAGTC:1 - chr2L 1291030 3' - 412 37 2 56.36 TTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCCGAAAGAGAGCAATTTTGGCTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTA:1 + chr4 311166 3' + 1360 3251 1 77.06 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCCAATCAAACAGATCGCTGCCTTTTGTATTTATGCATAAATAATGAGTGA:1 - chr2R 15419000 3' - hopper 21 1 57.14 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCATTTCGGAAGGGTAAAAGCTACTGGTTTGTTTACCTGAAAATGGAATACCCTACTAA:1 + chr2R 22663414 3' - mdg1 7063 2 54.72 AAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACACACACAAACTGAAGCAAATCAACACACTCGTAATCGTAATGAGAAAATTTAAATGAAAACAGCAATAAAAATGTT:1 + chr3L 5747559 3' + 1360 3200 1 76.19 TTAATGTTTTCAAACAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCACCAAGCAAACGTGCACCACCACAATCTAGGA:1 + chr2R 7171777 3' - P-element 109 1 29.49 ACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGATGCGTTGTAAAAAGCAAGTGCTGGTTCAAGGGGAAAGGGGGTGGTGGCAGAAAAATAAAGG:1 - chr3R 23036785 3' - S-element 353 1 60.00 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATACACATGTATGTATGTGTATGTACATACTCTATAAG:1 + chr3R 9339698 3' - Burdock 6165 2 67.37 AACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTTTCACATTTTTAGGATTTTGCTGTGGGTCTTTTGCTTTCAGTTTTGGTCTTGGGCTTGGA:1 - chr3R 12712895 3' - hobo 2473 1 64.55 GTTCACGTGTATTCATTTTTCGGCGACCACACACATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAG:1 - chr3R 22500823 3' + invader3 268 2 46.77 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGCACTTTCACTTTGTAGAGCACATCGTGCTCGAA:1 + chr2R 6707748 3' + 1360 3368 1 62.03 TTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGTATGTAGATAAATTTCAGTCGTCTTGCGCTTTAAAACTGGCAC:1 - chr2L 22340319 3' - HMS-Beagle2 6927 2 61.82 TCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCGACTGCGCCAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGGTTATAAAAAATATTTGTATTAATCAAA:1 - chr2L 12155367 3' - 1360 104 1 59.26 AGAGAGAGAGAGAGAGAGCATGACAAAAGTTTTCCTCCAGACGTCTTGGAATTTCAGTGGATTGTTGTTGGTCAGCCGCGC:1 + chrX 21495541 3' - blood 7176 2 74.07 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCTGGAAAGTCAAGCTTGATTAGTGCGGACTTTCATACTTCACAACTATTCTG:1 - chr2L 17123239 3' + roo 9038 1 53.64 TATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGTTTGCTTGGTACAAAATAAAGTTA:1 + chr2L 11762229 3' - mdg1 7099 2 78.18 TCATCAGGACGCCCTTCTTCCTCTTCACTATTCTCGTTAATAGACCGCAATTTGCTGCCTTGGAAAACCTATTGAAGGCGGCAGTGGGC:1 + chr2L 21062909 3' - invader1 392 2 60.67 TGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCTCGTTGGCCTGCGCCGAGAACTTCG:1 + chr2L 14617122 3' + Doc 4529 1 61.54 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATAGATTCCATTTCCACACTCTTTGGCTTAACTTTCCC:1 - chr2L 17545838 3' + opus 7462 2 66.67 AAGCCTTTTTTTCATGGATTGGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCGCCTCTTTTGAAACATTTCGTTTGGATTTTGCTGACCTATTGGGCGTTAT:1 + chr2R 14612759 3' - S-element 1378 1 54.55 TATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTTTTATTTGCACTTATGCTTCACCTTACCTTTTATTTATACAACTCTCTTTTTACCCGCGTTTTT:1 + chr2L 14375466 3' + accord2 7222 1 62.14 AACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGCCTCAACTGCAGCTGATGGCATTTACGATAAATTTACGCAAGTCATTTGACAACGCTGCAACTGCAGCATCATTATGCAGGCGA:1 + chr3R 13847778 3' + P-element 2775 1 80.91 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCTAACTTGTATGTATACATGAACTTACATACATATGTAGCTATTGATAAGCATATCAAGA:1 - chr3R 31965168 3' - 1360 26 1 52.73 GTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATGTACAAACAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTAATCAAAAATAATAAAGTCTAA:1 + chr3R 11969461 3' - 1360 370 1 47.27 TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Tabor 7275 2 74.74 TGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - accord 7034 2 36.47 TATTGATCCTGATCAAGAATATACAGACTTTATATGGTCGGTAACTCTTCATTCGTTCAACTTAATTTACGTTTTATAACTTTTGTAATCATTACATGTTGCATTTACT:1 - chr2L 4175636 3' - INE-1 84 1 66.97 TGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTCCCCACGATACCTAAACTTTCTCATTTCGCAAATCAGATTTGAAAACTG:1 + chr2L 15148708 3' + FB 61 1 58.70 CGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTTCATTTTGTTCAAATAAGCAATCAAT:1 - chrX 12861204 3' + G2 2837 1 76.36 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATACATAAATACATACATATACAATGAAATACTTACATTCCCTTCTTAAGGAACTAGTTTCATCTGCCAGTCGTTGCTTAAAG:1 - chr2R 1368563 3' + S-element 1713 2 78.18 AAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTAGCTATGTGCCTGCCTAGTGACTGGGTTAGGGGATTCGGATCGGGGCTCCGCTTGTTGTCTTTTGTGCCACCGCATCACA:1 + chr3R 12174491 3' - Tom1 160 1 56.73 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCACAACATGTTTTGATATTCGGACAGTTTTACACCAATAACAACTAATTAA:1 - chr2L 6757465 3' + Tirant 382 2 60.42 CGTTTCCTTCTGCCTGTGACATACTTTCCAAAGAATCTAGTATACCCGGCAATGGCTAGTTCAAAATTAA:1 + chr2L 3872111 3' - INE-1 30 1 88.57 AACTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTGTGTATTTGCGAAGCAGAG:1 + chrX 18758011 3' + 1731 97 1 71.64 ATTGCAAAAAAAAATTACTTCCATTTAAAGTTATTTAATTAATCTTAAGAGAGGATGCTCAAATGAAGTGATGTAAATAAAATGTAAACACAT:1 + chr3R 11526670 3' + pogo 1864 1 80.65 TACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAACAGAGGTGACAGAATGAATGGAGGGCATAAATAAAACTAGAAAACTAGGAAACGAATGAGAAAA:1 - chrX 1140952 3' + Doc 73 1 64.52 ACTATGCAGCCACTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCTAAATTTAAATATCTTTGTAATGCTT:1 + chrX 17184990 3' - 1360 3339 1 67.74 GGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACGTTAACCATATGAGAAAGA:1 + chr2L 21369509 3' + Rt1b 5099 1 59.09 GCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGCTGGTCAGTGTGGCCAGGTCAGCACTGCACCGAAACGTCCATTTCC:1 - chr3R 31221224 3' + Dm88 374 1 58.24 CAGAGCTGATCTTAAAACTTGGCATGTAAAGGACTTTGATAAACCGAAAAAATATAGAAAGTTGCGAAAAAAATCACGACTAAGTTTTGCCGGAGCTCATATGACCTCGT:1 - chr2R 5312385 3' + transib1 1857 1 61.82 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACACAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATA:1 + chr2R 13699479 3' - jockey 4790 1 53.40 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATCTACTTTCTTTAAAAAAAATGTCAGAATGCCAATTGATTTTATTTCACTTT:1 - chrX 15169957 3' + I-element 5322 1 56.36 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTATTGATGAAAAGTGACAAAACCAGT:1 + chr3L 8919684 3' - roo 59 2 79.09 ATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTATTAGTAATTGCACTTTTAGTTCGCTTTAAAAACACAATGAGCGTCTTTATTGGTTTTTTCCTGTAAATTATT:1 + chr3L 18195904 3' + 1360 378 1 74.55 AAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTTTCGCTTTTATAGAAAAATTTACATATTG:1 + chr3L 4721008 3' + invader1 4004 2 73.64 AAGATGGCCTACGGTTACCTAGGCGAAGCACCAGCCATCGCTCTGCTGGATGTGTCGTGCTACATGTGTTTACATGTCCTTAAACCTGCTCTCTCTTACAAAATAATGCA:1 + chr3R 9284085 3' - Rt1b 354 1 68.18 CTCTGAACTTAACCTATTGTATGTATAAATGTATATAAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTGTCTAGTGTAAACGTGACCTCAGCGGAAC:1 - chr2R 4516550 3' - G5 4778 1 80.00 ATTGTTTGAGGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTCGTATTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTTTCCTTTATTTATGCCTCACAATTGTGTTTTTTTT:1 + chr2L 10655842 3' - I-element 4881 1 78.18 AAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTTGGCAAACGATGTTATTGCTCATTTTTTGGTGTCAATGAACAGTTTTAACATATTAGCAAAGTTTCTTAAAGTACACATAAATATG:1 - chrX 7386929 3' - FB 223 1 64.55 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCG:1 + chr3R 5910754 3' + roo 9040 1 60.00 AAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGGATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAA:1 + chr2R 16476415 3' - X-element 46 1 61.80 TCTATGCTTGTTGTTACAGGGCCGATGCTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCTGTCATGAAAGCCAATTGCCGCTATTTGCCCACGACTCTCAAAGGAAGCAGAAAAATTT:1 - chr3L 3877655 3' - invader2 4972 2 58.18 GACAAACGGCGAGGAATCGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAAAAAAACAAAAAAGGGCCAGCAAAACAGGGCG:1 + chr3R 14167857 3' + Bica 455 1 78.26 ACTAAAATTTTGGTAAATTTTTATAAAAATAAATGTAAAAACATTAATGATAGGTGTTCGAGGAATTTCCAAATGAGAAAATGGCCAATCGAGGACGCCAACGAAAGTCA:1 - chrX 6386003 3' + looper1 1787 1 60.00 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATGTAGGCACTAGTATCTATGCCTGTTCCGCCCGATTGAATCCCGCTCAT:1 - chr3R 19058369 3' - Burdock 33 2 56.88 TGCATGCCACCTACGGACGGTCGGTGGTCGGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Rt1b 5085 1 32.50 AAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCTGCGGGTCGGATATTTTCACCACTTGGCGCTAGATTTCCCAGCATATTTCTACACAGAA:1 + chr3R 23434221 3' - 1731 4479 2 56.88 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATACATTTTGTACTTCTCTCCGCTATTTTTTGTGGTTTTTGCTTTTGACCATGCGGTCATCGC:1 + chrX 8519032 3' + S-element 1705 1 67.35 CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATAGATTCCATTTCCACACTCTTTGGCTTAACTTTCCCAGCCAAAATAATAAAAACACATTTATTTGTATATCG:1 - chr2L 17545802 3' + opus 490 2 71.82 TCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTTTCAGACCTAGTCTTTCCTACAGGCCGCCCATTTCG:1 - chr3R 11881067 3' - Bari1 1469 1 68.52 CAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCCACTTTCTCCGCCTCCCTCCACCGCCTGGCCCATGGAAATACTTTAAAACGCATAAAAATTCCGACACG:1 + chr3R 6553205 3' + F-element 4216 1 77.66 AGAATTCCCGAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTGTGGATTTGGTTTCTCACTGAGCCGCAGCGCATGATGCAT:1 - chr2R 20992398 3' - blood 459 1 56.04 CGCAGATCAAAAACCACTTACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCGTAATACAGAGCTTCAAACTTATTGTTCCGAATGAATGAAACCACCACCTAA:1 - chr3L 11740925 3' + Q-element 226 2 63.83 ACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACAAGATATAATTAATACGAATGAGACCTACAGTAAAGTAGAATAAAAAGCAAAGGAGAAATAAC:1 + chr2R 6418941 3' - flea 18 2 66.36 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - blood 18 2 45.16 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTAATGTTGAACGTATTGACTGATCTGCAA:1 + chr3L 12677134 3' + pogo 2083 1 55.17 CGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTCATTTAGGATTTCAATTGTGCAATCCTTCTTC:1 - chr3R 14163674 3' + jockey 367 1 62.35 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATAAGCTTCTTTTG:1 - chr2R 23354287 3' - Tabor 45 2 64.55 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGAACTGAAAACATATATAATTTTGTTTTTATCAAATATATATT:1 - chr3L 18743396 3' - pogo 41 1 66.36 ACAAAATTGTAGGGAGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAATCTACATGCGTAGAAATTAAGCTGACAAATTGTATTGGATTAGGCTA:1 - chr2L 18181041 3' - hobo 36 1 51.82 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACGAGGCCTAGAGTTACCCAGACCAACGGTCCTGCAT:1 + chr2L 6243764 3' - 412 10 2 71.82 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTATTGATGAAAAGTGAAAAAACCAGTAACAATAAACCTGCGAGCAGCAGACAAACAT:1 + chr3L 8919715 3' - roo 19 2 60.40 TTCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGAGCGCGCGTATTTTTACTTGCACATGCCGCATAC:1 + chr3L 13601483 3' - Quasimodo 39 2 50.88 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAA:1 + chr2R 21735234 3' - blood 7068 2 73.64 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTATAGAGCCACGGCACAAATGCTGCCCAAGATGCATGTGGTGGCCAATAAAAAGACGATATGTAAGTTTCTCACA:1 - chrX 15057086 3' - 1360 85 1 63.21 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGTATTTAAAAACAATGTTATTAGAAATTGTGATTCTTGCCAATTTATAGAGCTTAGTTTTAAAA:1 - chr2L 769966 3' + roo 9053 2 62.96 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1 - chr2L 16071771 3' + Tabor 7297 2 53.19 CATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATCTATTAAATGGAATTTGTGTGCAAAATATGTGTACTGGTTGTGTTATGTCTAAACGTGATCGGTTTT:1 - chr3R 11928599 3' - Doc2-element 4364 1 64.55 CACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAAAAGAAAAGAAGAATAAACCCGATGAGCAGACAGCTGGATTCGGGGAGTGG:1 - chr3L 7316253 3' + Doc 4650 1 61.82 CGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTA:1 - chr3L 19951221 3' - Ivk 62 1 79.09 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGTGGTGACTTACTTTCTGGGCTGCCCA:1 - chr2R 24031460 3' + 1360 3367 1 58.59 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTTATTGGAGTTCATCATTACACAAGGGGTCGGTTATTGAACCGCCTTTAAATCGCT:1 - chr2L 6243676 3' + 412 452 2 64.29 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGC:1 - chr3R 9481217 3' - roo 8708 2 72.00 CGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACGAC:1 - chr3R 31045699 3' - INE-1 88 1 74.29 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGAGGGAGAAAATCTTGGTGATATGATGTGTATATATATTTTAATGCTAAGATATAGTCTCCCATTTGCTA:1 - chr3R 10202961 3' + roo 393 1 59.63 GGTGGAAGAGGTAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTAAAATTTATTGATGATTCTCTGGGTTTCGGTTTCGGATTATCTTTACATTTAATATCTTCAATCTCTTTATAATT:1 + chr3R 5272140 3' + hopper 304 1 59.09 CAAAATTCAACTTGACCTAGAACTAAGTTAGTTTTTCTTTTTATACCTGCCCATACATCCGGTCAATTGAGATATTCAGCAATTGAGTGCTACCTTCACTCAAAT:1 + chr3L 12495404 3' - HB 1388 1 57.14 ACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATTGGGTGGCTTTGGGTGGTGAAAACCATTCGCTGCGATTGCAACTGCAAATGGAGAAGTG:1 - chr3R 15948644 3' + Bari1 1592 1 59.09 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTAAAATATTTTTAATAAAAGATAGCAATTAAAGTGACTTAATGGTAATTGGAGGTAACCCAGCA:1 + chr3R 14996727 3' - roo 17 2 64.22 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTGATATTCATTGCTTGATGGATGATAAGATTGATGTTGTTTGT:1 + chr3L 15819412 3' + pogo 2071 1 62.63 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGTACAGTATCTTATCAGGGGAAAAACATTTACAGTATTCATAAATCTACCAATTCACTCATATA:1 + chr3R 19996650 3' + copia 232 1 55.45 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCACAAGGCAGCAAACAAGAAGTGTGTGTGTAAAGTCGTGTTATGCTTTGCG:1 + chr2R 18309410 3' - hobo 10 1 63.53 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCATTTCGGAAGGGTAAAAGCTACTGGTTTGTTTACC:1 + chr2R 22663392 3' - mdg1 54 2 67.27 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTTTAAAATCATGAACTTCAATTTTAATTTCGAATTTGGCGAAAAGATTTAA:1 - chr3R 7049611 3' + 1360 3384 2 70.91 TTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTTGTCTTTTGATTTATTTTACCTTTTGCATATGTGCATATAT:1 - chrX 11864481 3' - flea 4750 1 62.73 CAGCTATTTAAAGTGAAAAACACGAAACGCAACAACAAAATGGACGGCCATAATGGATTTCTTTAATTTATAATTTATTGATGTTACCGAT:1 + chr3L 20916887 3' + TART-C 167 2 64.84 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCTAAATTTAAATATCTTTGTAATGCTTGC:1 + chrX 17184992 3' + roo 9048 2 59.09 GTGTTGTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATTTCGTTTATTGTAGTGTTATAAAATACATTCTAGTTGAATGCAAAATTAAGTATATTATG:1 - chr2L 9948942 3' - Porto1 4190 1 54.55 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCAACGCTTTTACTTT:1 - chr3R 25051571 3' + 17.6 466 2 60.00 TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGGCTAAGAGCAAAGCTACCACAAATGATGATGGTAATGATGATGGCGG:1 - chr2L 21064912 3' - 3S18 5776 2 62.20 CCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTGCCGGTCTGG:1 - chr3L 10911503 3' - springer 24 2 55.91 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTATCCAGGTGGCTTTGGCGGCGG:1 + chr3R 17619544 3' + 412 478 2 61.90 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATGATTATA:1 - chr3R 15697039 3' - 3S18 42 2 59.09 AGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACGTTCGGCAGAAACAGGTATTTGC:1 + chr2L 22497815 3' - Stalker 57 4 76.19 TATAAAAGCATAACATTTCCTCCGGTATGGCTCCCGGGCTCTCCAGAGACCACAAGAAAAGGCAATACCTGCTGAGATACCCACCC:1 - chr3L 21090115 3' - Circe 410 1 55.81 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATTCCAACAATGTTGTGGGCAAAACTACACTTGCTCTAAATGAAAAT:1 - chr3L 2815075 3' - Doc 54 1 62.73 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATACAAAGAGGACGCCTGGTCGCGCTTAACGAGTGCCAGTGAAAAATGAAAATCAATGACAGTA:1 + chr3R 7171335 3' - 297 6585 2 72.63 CGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAGAGGAAAAGTCTTGCGAAAAAACACGACAAAAGGGGCGTCTGCCTCGCAGTTTCCTG:1 - chr2L 12569040 3' - rover 7126 2 61.82 AAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATGTAAATAATATTAAAACGAGAATAGTTATGGAACTAAAAAATGTATCATTATAAACCTTTTTG:1 + chr3R 6263388 3' - diver 5910 2 60.91 GTTTCTGAGATCTCGACGTTTATACAGACGGACAAGCTGACCAACGGACAACGCATACTTCATAGGATTGATTTGCACACTTTTCATGGCATCTATGAACTATAGAGTGT:1 + chr2R 11575203 3' - INE-1 140 1 72.73 AAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGAACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATGCAAATGATATTCAAATTGGGGAATCGCGTGGA:1 + chr2R 23966892 3' + micropia 5301 1 67.89 CATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGGCATTAAATGCATATTAAAT:1 + chr3R 13423388 3' + rover 7285 2 68.18 CCAACGCAATCAAGGAACTTAAGGAAAAATCACAGAGATGAGCCCTCGGATAACGACAGTTCCAATACGGACAATGA:1 + chrX 249664 3' + F-element 4419 1 68.83 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGAGGGAGAAAATCTTGGTGATATGATGTGTATATATATTTTAAT:1 - chr3R 10202987 3' + roo 9029 1 63.64 CGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGCACTGTGGTTTTTTATGTGTGCTTTTGGCAGAAATTCGAAAAGATGACCTACCTTCACCAAGGAGGAGAACACACGAAATATCGAG:1 - chr2L 16735023 3' - 1360 134 1 77.27 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACCACCAGGAAGACCGCCAGCATATCCGCCTCCTCCGATTGGGTATCCACCG:1 - chr3R 17619491 3' - 412 36 2 53.64 AAACCGCTTGTTTTTAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTGAACTGCAAGAAAATTAAATCATGGAAGGAATTTCTGAGCAATCAAAACTCAGTTCACTCGCATCTCGG:1 + chrX 8746861 3' - R1A1-element 114 1 69.09 TGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAGAGGCAAATGAAGGGGTTGAAGGTCAGTCGGGTCTCGGGAAATGTAGAGTCTACTGCCTACTTTGCATACGGGCA:1 + chr3L 20644117 3' - gypsy7 312 1 81.37 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATCTTTTGGGCTAAAACATCATAAATCCTGAAATGACTTTAG:1 + chrX 15500041 3' + pogo 2073 1 61.70 GCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATATGTAAATAAACAACGGGAAGTTATGCGAGGTCCAG:1 - chr2R 2752373 3' - copia 49 2 74.55 TATTATTAAAAGAAAAAAAACAACTCTTTCGAAAGAACATCACCATTTGTCATAAAAATGCTTAAAATATATTCAAACTTAAAAAAACACCTAAAATATAAATTTTCAGT:1 - chr2R 16279764 3' - hopper 156 1 52.73 TTATTAAGTTTAATAATTCGCTTAAAGCACGTTTGATCAAAAAAATTCTCAATAAAAATGTAGAAATCCCACACTCAATTAAATTGATTAACGCTGCCATAAAACGACGA:1 + chr3R 20003109 3' - S-element 381 1 66.36 GATCATATAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGATAGCTTCACTAATCGTTTTATGAGCTTTTAGCATACGGGCAATAAAGAAACAAATTAACTGATGATCAGTGTC:1 - chr2L 15459747 3' + transib2 93 1 60.00 TCCCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACATCGTTGCCATTTGTTTTGGACGGCTTTAAAAACCTATAAAACTTTTGGCACACATCAATTAAAAAACGACGTCAG:1 + chr3R 13946743 3' - 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chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 36.84 ATCGTATGGCGTAACGCATCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTC:1 + chr2L 21768294 3' - 1360 19 1 67.50 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTAGGTTTTGGTTTTGGTTTCCGCT:1 + chr2L 11205890 3' - blood 7177 2 55.56 AAATAAAAACTGTTTTTTTGGCCCCGTTTGCAGTTGATGTATTCAAATTCAAATGGTGAACTCGATTTTGGCGGTTGTCG:1 - chr3R 24161079 3' + looper1 1622 1 78.75 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATAATTTTCGGTTTATTGGACAAAATTAATTGGGCGCCAAGATAGAGGCATT:1 - chr3R 29282785 3' - accord 182 2 76.00 TAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTTAGAGTACAGATTCCAGAGATTCATGTTGCCACGCCGCACAACCGCACAAACTATCACAGGGATCACCTGGCTTGCCG:1 - chr2L 7819241 3' + INE-1 158 1 72.64 TGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTGTAAGGTTGTCGGGCGAAATGTCAACGGACTTGTACGCATTTCTGGGTGCAGCTCAGACTTTGGCTTTTGCCTCACC:1 + chr2L 3488317 3' + 1360 3375 1 75.45 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGCATTATCTTCGAGATTATACACCAGCTGGTTAATCAGATAA:1 - chr3L 7400740 3' + roo 9048 2 54.95 GAAATTTTCCACTCCGCACGTTTGGCATCTCGCTTGGGGCTTTCCTCTCCAGCAGTGACCTGCTTTCCATTGGTGGGCATGTAGGTTATA:1 - chr3R 13702379 3' + R1A1-element 161 1 77.78 AACGAGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAGGACAAGCGCAGACTCTCTTGCTGTCCAGCAGGATTCGTACATGGGGTTGGCTAAGGATTATATAATAGTTACTC:1 + chr2R 16759679 3' + Doc3-element 228 1 56.88 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAGGTTTTCCTCGATTGCGAAATCAGAAAATA:1 - 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FB 36 1 63.64 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGCTAAACCAAAGCAAGTCCAGTTAAAGTTTGGCCATAAAC:1 + chrX 16994166 3' + roo 9027 1 65.45 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTT:1 - chr3L 20167943 3' - 412 7086 2 71.76 TGCGATACTTTGTCGTCTAGCTAGACTATTAGGGTGAGATTCTAGTCTGCCATTGTATTTTTGGGTGCAGTTTGCTTC:1 - chrX 18917995 3' - jockey2 3119 1 74.36 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGCCCAATTAAATTGTCAAAAATGCTGTGAGCGTAAATAATATGCTGAGAATTAAAATGTCG:1 - chr2L 10128645 3' - copia 4895 2 57.27 AAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGCTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAG:1 - chr2R 1320693 3' + diver2 4858 2 54.55 GCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGT:1 - chr3R 20627938 3' - gypsy 3 2 91.67 GTCACTCGTAAATGTAATTCCTAAATTAACACTTGTAACTAAGCGCGTATAAATACCGCAAATCCAAAAATGTAAAAAAGACCGTAAAAAAAGCAGAGGG:1 + chr3L 5295245 3' + TART-C 10940 1 76.00 GCTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGTGATAAAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGGTTTTAATGTTCGAACAATATACGAAAAGAAAAACGTTGATATGTA:1 - chr3R 4296780 3' + Cr1a 472 1 74.55 ATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTATCTTTGCTGGTGGTGTGAAGTTTGGCTGTGTCCTCCATTTCCG:1 - chr3R 17030133 3' - HeT-A 5 1 47.27 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTTTTCCAGCCTCCTTTCTGCCCGACTGTATGTGTTCGTGCATTTCCCCGCGTGGAAATGCCGG:1 - chr2L 7142000 3' - Transpac 16 2 74.16 AGGCTTCAACTTGTAGCTAAAGCCAATGGGAAACATACTACATACCAAAACTATTGGTACATTAAAGGGAGAAAAGTGTTCAGACTTATTTATACCTACTTCCTA:1 + chr3L 21716038 3' + S-element 1394 1 57.14 CTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACACACACATATTCACTGAGTTACCCCATTTTGGTC:1 - chr3R 6921794 3' + 1360 3148 1 76.15 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGT:1 + chr2L 9171483 3' - opus 2 2 58.18 GAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAACAGCAGAGAAGAAAAGTAAAATACAATGAAAAACATATGATCTAATTATACAGAGCCTAG:1 - chrX 2278130 3' + Doc3-element 4434 1 76.36 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCTGTCAGGAAGGAAATATTTTGCCCTCCCATCTTATTTTTC:1 + chr2L 13558234 3' - FB 45 1 62.39 TTCTGTCCGCCTAAAATGTTAGAGCCTTCGCGTCAAGGGTGCCATGCGGTAAAAGTTAGCGGGGCTGAACACCAAGTAGATAAACTTCCGCAACAGGCTGCGGG:1 - chr3L 23046 3' - Gypsy12A_LTR 491 1 71.15 TAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATAATCCACTAGAAGTTCGTTGTTAATG:1 - chr2R 19405882 3' - HMS-Beagle 6802 2 67.42 TACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTGGCTTTGCGACGGCATTTTTGTATTTTCTGTACCGTAGTGTTTGCTCGTTTGGCCTT:1 + chr2L 3658366 3' - 1360 399 1 64.52 GGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAA:1 + chr3R 4947794 3' - INE-1 87 1 79.09 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATC:1 - chr3L 25455130 3' - HMS-Beagle2 6919 2 68.48 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACGATTCTGGGTGACTGGCCATAAATTCAGTCTGAAATCACTTGCACTTGC:1 - chrX 15026011 3' - FB 12 1 58.82 GCACACACACACACACACACATCGCACAACAAAGGCTTACATTTTTAATGCCGAGCAGACGGTTAAGCATAATTATGTTTGTCGATGGGGCG:1 - chr2R 9620091 3' + accord 183 2 60.87 GACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCTATGCATATTCTGCTTTTATTTTCGCTGGGTTCCGTTCCGTTCGGTCCAGTATAGGTATGGTTTGCTCGATTTCCA:1 + chr3R 24772893 3' - S-element 1505 1 75.45 CATAGACATAGACATAAACATAGACACAGACATAAACATAGACACAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACACAGACATAGAC:1 + chr2R 11403836 3' - 412 7128 2 31.07 TAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACATCTAGGCGCCTTGAGAACCTGTGCACCGAGATGTGCCAAAGC:1 + chr3R 18220779 3' - pogo 313 1 64.20 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGTGGTTGGTTCTTCTGTTGTCTTATGGGTTGTTGTCTTGCGAGGGG:1 + chr2L 9898995 3' - jockey 4678 1 55.00 ACAGTTGGCTCAGTGCATGAACCACTGTTCCAAGCACTTAAGTCCCGAGCATC:1 - chr3R 15360943 3' + Gypsy6A_LTR 26 1 47.17 TGAGTAAAAACAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGTACGTGTTGCTCGCTCGAGTATAGAAATTTCTAATGATTTTTGGCCTGTTCC:1 + chr3R 4660207 3' - 1360 3239 1 69.47 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCTACGAATTGTTAGTATATTACATCTATATCCCTTTTGGT:1 + chr2R 10241494 3' + I-element 5309 1 64.55 AATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCCGGCAGCTGGACCTT:1 - chr2L 18977100 3' + Quasimodo 175 2 72.73 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTCCAATAGCTACGATTAGAAGTAGTTGTTGCACTTCCATCG:1 + chr3R 28640006 3' + mdg1 418 2 73.96 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGGGATACGAGTAGTTGCGATTGTTTTTTTTTTTACCCTTGTTTCTGTTTCCGTTTTTAATCAATTT:1 - chr2L 20398449 3' - roo 18 2 63.89 TATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGATCACTGTGGCGGAAACCCATCCGCAGATTTCGATTCACATTGAAA:1 - chr2L 16775491 3' + F-element 4284 1 63.64 TTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 14317416 3' - HeT-A 6022 1 75.45 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGGGGTCGGTTATTGAACCGCCTTTAAATCGCTTGAGT:1 - chr2L 6243671 3' + 412 445 2 64.55 GCACACTTGCCACAGATTGGATCCTGGAGACAATAGTTTTTGGAGTGCCCAAAATGTTTCCTGCGCCGAGTGCAGTAAACAAATGTAATCGACATCCTGTGTAG:1 + chr2R 19965339 3' - jockey2 377 1 70.19 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTTGGGCCCAATGTGTCGCCGGCATCAAAGATTAAACTTTGC:1 - chr3L 20167904 3' - 412 10 2 69.31 AACAATAAAATATTTAATTATATAAATTTTTTATTTATCAATTAATCAAGAAAAGTTACTATTAGCACGTTCGCCCCACTTACATCCCATAAGTCGATTTATGTATATG:1 - chr2L 12835562 3' + transib1 1931 1 55.96 GAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGAAAGAGCTGCCGAACGAGGAGGGTGAAGGAGAATCGTAGG:1 + chr3R 9201435 3' + invader5 3890 2 59.15 GGTTAACTTAGTTAACTTCTACATTTTTGCAGAGTCTGTTTTTCCAAATTTCGGTCATCAAAAAATCATTTATTTTGCCACAACATAAAAAATAATAGTCTGAATATGGA:1 + chrX 13057298 3' - gypsy3 6571 2 59.09 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTATGAAACTATGTCAAAATAAAATTCGAA:1 - chr3L 2120983 3' + I-element 5302 1 70.64 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATATGTATGTTTTCATAAATTATCAAGATTTCACTGAAAACAAAAGAACCTTTACAGAC:1 + chr3R 30859508 3' - Burdock 27 2 54.55 TGCTTGTACAGATACGTTTTCGCTACAGACATTAATAAATAAGATCGAGAATTGAGCGGGCTTGCGACAAGGATATTTCGGTTGATAGCGGGTCATATTGGGCACACAG:1 - chr3R 26310155 3' - Gypsy12A_LTR 2154 1 62.39 GCTATTTTCATATTTTTTTTTTGTATTTATGTTAAAATGTTTAAATACTTTACCATTAAATTGTACCACATTTAGCTG:1 - chr3R 26978216 3' + FB 172 1 85.90 AAAAAAAAAAATAGGAAAAAGTTTGTCCTCCGGTTTGTGTTCGTGATTTCGAGATGGGGAAAGCGGGTGATCACAGCTGAAAGGCTGCTCAAGCGACCAGACAAATGCG:1 - chr3R 28937308 3' + Doc2-element 230 1 61.47 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGGCATTATTGCTTATATTAAAGGAGGGAG:1 + chr3R 3211963 3' - roo 8699 2 75.00 TTATGAAATATAATTAAGCAATATTTATTTTACTTATAAATTAAAAAACAAATCCAAATAATAATCAAAACTTCACTGGAGGCAAACTTTCTATTTAATTTTAATTAGAA:1 - chr2L 5692212 3' + S-element 100 2 60.91 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGGTACAATATAAGAATTTCACATTATGAAACACCGAAGGACTCCTCAAATTTTGA:1 + chr3L 17787089 3' - pogo 28 1 55.45 AACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGATATCATAACTTCATATCACAACATA:1 + chrX 20433406 3' + diver 6087 2 57.80 AGATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGAAAATATTTTTTTCAAAGAAGTGGGCAAATGTTAAAAACTAATTTTAAAGGATGGACAATATTATTCTTTTTGAAGATATCGACGA:1 + chr3L 7565037 3' + FB 39 1 80.91 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCCCCGCACGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGCACAGAATC:1 - chrX 1599387 3' + hopper 1413 2 61.54 AGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCGTTGTTCGCGCATTTCCCTGACGCGATATGCACTTCCT:1 + chr3R 7478657 3' - blood 431 1 60.00 TCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACTGAAACCGAAGCAGTAAACCTCCACTTAACCCC:1 - chr3L 532707 3' + G2 55 1 68.75 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATAT:1 - chr4 96892 3' - flea 4767 2 50.00 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGTGACACTCACACCAGCAGCAGCAACACCAG:1 - chr3R 17471677 3' - 1360 12 1 56.25 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGGTATTTAAAAACAATGTTATTAGAAATTGTGATTCTTGCCAATTTATAGAGCTTAGTTTTAAAAGGCTGCACCAT:1 - chr2L 769955 3' + roo 404 1 75.24 CCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTTTTTTTGTTTTGATTTTGTTCCTTTTTTCGATTTTTCTATTTTGTTTATTTTTTCTTTTCCAATGCGACTAAAAATAGACA:1 - chr3L 3448034 3' - F-element 4511 1 57.80 CAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAATGCAATAAGTTAAAAAAATAAAAAAAAAACTAGGTTCCTATCCGGGATTTCAACCCCTTGGTAAGCAACAAGCGGCATTTTGCTG:1 + chr3L 20818533 3' + Doc2-element 4743 1 46.36 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACACAGATCATTAAACATACATTCACACAGATACTACCACGCATACACCTTCCACATTATTTATTACGCCACGGGGC:1 - chr2L 3907381 3' - hobo 4 1 75.49 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCACAACATGTTTTGATATTCGGACAGTTTTACACCAATAACAACTAATTAAATGGGATAA:1 - chr2L 6757456 3' + Tirant 377 2 60.91 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCGCAGAGCCCTATAGTGTCAAGCGGG:1 - chr2L 16742234 3' - 412 22 2 57.00 GTTCCATCTAACGCAGCTGATCAGTGGACATGGCTTTGGACATGAGGAGGCGGATGATTGCCCATGGGGCAGTTCGCTTCTTTACTTCCG:1 + chr3R 26072752 3' + Rt1c 4989 1 74.44 CATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGCCTTACNTAAAAGTCAATTCCCAAATCAGCACA:1 + chr3R 6584358 3' + F-element 231 1 69.72 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATTCGTTTTAGACATCTCTATGTGTATACATATGTACATACCA:1 + chr2L 4916783 3' - S-element 37 2 62.73 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGTACAGTGGCATGAACTCGATGAAA:1 + chr2L 14141356 3' - hopper 17 1 60.82 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATATTGGGCTTTTCCACGGCTAATTGAGAGCAACG:1 - chr3L 16291855 3' - jockey 4796 1 66.32 CCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATACGTGCTGTAATAGTAAGGATACGGCGTCGTCTGATAGTAATAGTTGTTCAAACTGGAGAATGTGGGGCT:1 - chr3L 3268664 3' - F-element 4267 1 66.97 ATTCATCATGGTGATGATGATCTCTCTTACTCTTATTCCTAGAAGATTAACTATTTGCATGACTACT:1 - chr2L 191070 3' - Rt1a 4721 1 80.60 AGACTGTGGCATGCCGAATGTCCGGAATGAACCGGAACAATATAAAAAGTAAAATTATTCTCTGTGCATCAATGCGTTGAGATGGCACACAAAAAATAGGTGATAGAAA:1 + chr3R 26398960 3' - Doc 1 1 71.56 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATTTACATAGCCTGAATCTTGAAAAGCGAACCGCTAAGTGCTC:1 + chrX 15043194 3' + S-element 1684 2 62.86 TGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGAGTGTTGCCAAACAGACTTTATTTGTCAATAAAGCTGTCACTTCATTACGCGCAT:1 + chr3R 17995020 3' + micropia 5305 2 50.91 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGATCTGACTGAACAATAAACAAAACGATGCGTTGTAAATAGACGACGGCATCGCTGCC:1 - 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chr3L 25443432 3' + invader1 231 2 54.55 AGTTGTACAAGATCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGAGGAAAATGGCAAACAAAACTAGTGAGGGGAGGCGAGGTTCTGAAAA:1 - chr2R 8167919 3' + Bica 418 1 57.27 AAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATGCATGCGAGTACAGTGCGTTTCGCAAGTG:1 + chr3R 20261543 3' + 1360 3164 1 71.88 TGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATTATTGCCTGGTTTATTTATTTTTGAGCCACATTCGACAGTTGTTCAGGCGAAGAATATT:1 + chrX 11018846 3' - 1360 487 1 60.00 TCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATATATATCTCATTATTCTCTCCACAACCCACGATGGTCTCAATGAGTTAAATTTCACCCGCTTCAAT:1 + chr2R 22149753 3' + FB 324 1 65.45 CTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACAGCAACAAGAGCAACAACGGCG:1 + chr3R 24178652 3' + I-element 4893 1 76.40 TTTTGAACTTTTAAAAAACTTTGCTTTTAATTTTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTTAACTTTGCTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTTCTCTTTTATTTTTTGCTGGTTT:1 + chrX 7401238 3' - TAHRE 9 1 54.55 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTTGAGCAACAAGAAGGCGAAAAAGCACGAAAAATGTCAACAACAA:1 - chr2L 13320923 3' - jockey 20 1 61.73 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTAATATGCTTTGTCAAAAGAGATGAGACATTTTACAATGGCACATTGCACAAAAAAGGAAGGAAAAACAGTAA:1 - chrX 442454 3' + copia 251 1 49.50 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCATATATCGGCTTAGAGCCTTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCGTTTTAATTGAA:1 + chr2R 21199712 3' - jockey 36 1 48.62 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACATATTTCATATATTTATAATACCTCTTTAAAGCTCATTCGGTATGCCAGGCACAGGCC:1 - chr3L 17405678 3' + roo 390 2 59.60 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' + 412 7542 2 40.96 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAAT:1 - chr3R 24260905 3' + roo 344 2 80.73 TATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAG:1 - chr3R 13423301 3' - rover 7003 2 74.55 GATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCCCAAACACTCTACACCAAAAAAGTAGTTATCAAAAGTTAAAGTCAAACGAA:1 + chr3L 4838813 3' + Tirant 404 1 53.64 ATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGG:1 - chr2R 6537905 3' + roo 9034 1 55.96 ATAAAACAAAACAACAAAAACAAGAAAACAAAAAAATACGACACAGTCGAGTGGCACTTGGGGCGTGGAGGTCCTTCAGGCGGC:1 - chr2R 15170184 3' + gypsy9 451 1 64.29 GGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGAGTGCCGTGGGCTTCGAGTCGGACAGAGGGCAAGTGGACTACAAATGTGGCGG:1 - chr3R 4242035 3' - gypsy4 304 1 62.96 GCGACTAGGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGAAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAGTCATTGAAGTACTTACAGCGTTTGTGTATCCTGGGGCAG:1 + chr3L 2629142 3' + invader2 4780 1 60.40 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACAATGTGTAACATTACACTTCTTGTTAAATCAGCTA:1 - chr2R 9953285 3' - pogo 32 1 64.89 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACATCAAATAATCATTTATTTTGCCACAACATAAAAAATAATTGTCTGAATATGGAATGTCA:1 + chrX 13057304 3' - mdg1 10 2 57.61 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAAGAAATAAGAAATAATATGTTGAGTGCCAAAAACCACACAATCCACATCCACTCATCCTA:1 - chr3L 23607955 3' + roo 8984 2 57.27 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATATCAGAAGAAAAACGAATCGAGAAAACTCTTTTCTTAATAGCATTTATACCCACATAGGC:1 - chr2R 8530716 3' - mdg1 20 2 58.10 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTAATAACGATTAGCTAAAAATCTAGT:1 + chr3R 18626852 3' - roo 8723 2 80.00 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTAACTGAAGCCCCAGGTTTTGTGTATTGAATAAAGACAGTGTGAAGCCAGCTAAATAAAAGG:1 + chr3L 25414262 3' - blood 7034 2 60.55 CAACGGTGTATTTCCAAATAAATAAATATAAAAAAATAAAAAAGTGAGTACAAAATAAATGCTGGCCAAAATGGGCAGTGCAAGCAAATTGCCTTTTTATTGTGTTAGGG:1 + chr2L 11723098 3' + Tc1-2 465 1 75.45 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGGCCGGTTGCCTACCAGATTAACGCACTTG:1 - chr3L 217310 3' - roo 29 2 57.00 CGGCCCATTGCCGAAGTGTCAAGAGATAGGTCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGATGCATTTACCAACAATTTTTATGTTACATTACATACTTCATAAATACT:1 + chr3L 26223189 3' + rooA 7356 2 68.18 TCTTGCCGACGGGACCCCCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCAAGCATCTTCACATCTTTCGGAAGACTTGACTATGGACACGAT:1 + chrX 14853451 3' + P-element 2871 1 51.14 AAAACGGAGTTATATAAGAGGACTTTGTACTCCAAGCTTACGGGAGAGTGAACGTTTATAAGCCAGTGTAGATCCCTTGCTTTTCGAGTTCGGTGCTCCGCTTTTTGTTA:1 - chr3L 13060041 3' - Doc3-element 4289 1 76.36 TTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTACAGCGTGTGTTGGCCGCTGTCGTAAGCGTTTTTTATTGGCCATATTCCCTCT:1 + chr3R 18437237 3' - invader1 3880 2 52.73 CGTAATATATGTAGTCATTTTTAAAAAAATTATTATTATTTTTTTTCTATTATTTTATATTTTTGCTAATTTTCCTTTCTGTGAACCGTTCATATTTGTATTATTTCTTT:1 + chr3L 14089342 3' - Stalker2 7206 1 66.36 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGTCATAAAAAATGCAAGTGCTTTGTATGCACGGCAGGCA:1 - chr2R 9754713 3' - hopper 32 1 54.64 ACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTGGTGTTCCACATTTTACCCAGCTGACGCGAAAATTTATCACATTTCTTTTTCTGTTTTTCCGCA:1 + chr3L 12866946 3' - Stalker4 6915 2 64.55 TAAACTTCACACTGATTTTGAACTTCAGGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTTGAAAACTATACGGTTGCTAACAAAACTAATATTTAAGTTTATGAAGACTTCAATGTGA:1 + chr2L 13088399 3' + Tirant 8374 2 56.36 TATTAAAAAATATATAGACAGACTAAGAACACATGTTTGGTAAATAATAATAACATAAACAACAATCACAATGGCCAACAGTCACAAAAATCTCAGCAACAGGCG:1 - chrX 10519630 3' + G4 3602 1 57.14 TGCCTAAAATAGGTTTCATTGAGTTCTAAAAAAAGGAAATTTTGCTGTCGCACCCTGTAGTTGGGTTAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + mariner2 856 1 66.36 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAA:1 - chrX 23282942 3' + HMS-Beagle 229 2 65.14 TAAACTTATTTGTTTTATTAATCATATTATATCATATCATGTGATATTAATCATATTTGTATATCTTTAACAACTGATACTTAAATACAAACTTAATTACAACTTTTCGG:1 + chr3R 16163309 3' - TAHRE 60 1 50.00 GAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCAGCTGCCTCGGCATCGATCGTTTT:1 - chr3R 19042768 3' - ZAM 8104 2 68.97 AATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAGACCTTGAATCGAAACATTTGCCAAAATAGGCCAACCTTCGATTTGAAACATA:1 - chr3L 15525615 3' + Ivk 5349 1 52.73 CGTTCATATCTTACGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACAAGGTTAAGCAAGCGGAGCACAAGGCCCGGG:1 + chr3R 7907751 3' + roo 8714 2 67.68 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCTGCTTGCATAAATTAATTTGCACATTTTCGCCATGTGAT:1 - chrX 9576535 3' - FB 27 1 61.11 GTCCAATGCACTGTGAAAATGCTTAAAAATGCAAATTATGCGCCGCAAAATGCACCGGCTGCGAAATGTATAAAATTATTTGTTGTGCATTCAATTTGG:1 - chr2L 4789438 3' - baggins 5347 1 66.67 TATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCAATAGACAAACA:1 + chrX 18750722 3' - BS 4840 1 61.47 ATGGAAAATCTATTAAAATGACTTATATTTCACTCGTAAATTTCAACAAAGATTTTTTTTGCGTGTACGATGAATGGAGTCGAAAGAAAGGGGTATTATGGAATATA:1 - chrX 22934104 3' + Burdock 6386 2 60.75 ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCAGAGATTATTAATGGCACAAACAAACGACAGTGTTATCAGCATTCTTAACTGCTTTTATTTTTCA:1 - chr3R 6088522 3' - transib2 16 1 66.36 GTCGAAAAGAAATACGAAAGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCACAAGAAAAAAATGCAGGAGCGCCGTGCCCGAC:1 - chr2L 12096027 3' - Bari1 1572 1 71.95 GCTGTTATAAGCACACTTCGCATTAAAATGCTCCATACGTCGTAATTGTCGCCGACTAACAACATTAACAAGAGCCAGTTCAGCTATAACCAACCAAGACCCAAGCCCG:1 - chr3R 13209525 3' - Copia1_DM 393 1 55.05 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTGTTAAGAGAGTGAGTATAATATTGGTACCCCATTGTCCT:1 - chr3R 30369676 3' + roo 9062 1 58.11 CGTTCGTTTCTACGGAAACGCTCAAGCCCTCCAAGCGCATTTGGAGCGAAGATTGCGCTTCCCCAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACACAAACTT:1 + chr2R 18885050 3' + Doc4-element 80 1 54.55 AACTCCTACCTTTCATTCACCCACATATCAAACTACACACAAAATTCTAAAATCTTTTACCCCACCCAAAGAACCGCGATGAGTTTTAAG:1 + chr3L 18399952 3' + Porto1 271 1 53.33 GTCGAGTTCCCCGACTATCAGTTACCCGTTACTCAGCTAGTTGAATGGGAAAGAGAAATTTCAAAAATTTTCTGGGAAAGAAATAATAAAACAAACACAATTTTTAAGGT:1 - chr4 211037 3' - INE-1 561 1 63.64 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGCTAAACCAAAGCAAGTCCAGTTAAAGTTTGGCCATAAACACAAAAAGCCAAAT:1 + chrX 16994180 3' + roo 391 2 59.79 CTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCA:1 - chr2R 15155205 3' + flea 4959 2 75.45 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGGGGCAGCGAACCCCAGGGGGTTTGGGGTTCATACACCGCTCTCTGAGTCTTTCTTCTCGTCGTTTTA:1 - chr2L 17574345 3' + hopper 1407 2 65.38 TGGACATTTTGTTTTGTTTGGGTATTTCTTCGGTATTCATAAAGGCAAGGCAAAAATAGCAGAGAAAAGCGTACCAAAAGCAATTCGAAATGCAAATGCACAGTGGGCAC:1 + chr3R 31058963 3' + invader5 3745 2 53.64 CAATATGAAGTAATTGTATTGTATTGCATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - Doc2-element 4671 1 46.15 TTGAAATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACACTGTGAGAAAAGCGGGGAGGTTCAATTTGGGCAAGACGAACCC:1 + chr2L 12115730 3' + Doc2-element 4409 1 57.14 TATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATTT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 75.79 GGATAAGATAAGATAAGATAAGATACGATAAGATAAGATAAGATA:1 - chr2R 5064833 3' + Stalker3T 204 2 42.22 TACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATTTTCACACAAAGACAAGGATGGCGAAACCACAAAAACGCAGCTAAA:1 + chr3R 20119624 3' - rover 6981 2 57.80 GTAGTCTGAAATCTGACATCATTTCGAGACCCATTTCAACAACACCATCACCATCATCATCATCACCATGTTCATAAACATCCTGCGAATCCTGCTATTTATGCGCTT:1 + chr3L 6018708 3' + gypsy4 6378 1 69.44 GGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTTAAGCAACTTGTGCTAAATTTGCTTTCCATGATTCGTTGGAGCACAGCCAGAGCAACAGTGTTCTCGCTGAGATTGCTG:1 + chr3R 4762748 3' - diver 4 2 41.82 AGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTGCTGCCCCCCACTTCATCACATTTTGGTCAGAGTAAACTGATGACTCCAGATGATT:1 - chr3L 11471766 3' + jockey 4736 1 53.64 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCTAATTTAAGATTTTAAAATGTTTTAATTAATGTTTAAAATGTTTTAGTAAAGATTTTCAAATT:1 - chr3L 17595289 3' - jockey 4672 1 73.91 ACAACAAGCCCCAGCCAGAATGCCACAATTACTCACCTGCAATGACAAGCGAACATTTTGCATAAGTACCCACATGTTGCCACATGGGATACCACCCCCACTGAGACTAG:1 + chr3L 18351467 3' + TAHRE 10029 1 64.55 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGTCAGCGACCAAGCACCAGTTG:1 + chr2L 9754892 3' + 1360 3379 2 66.36 ATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATGAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGAT:1 + chr2R 4270284 3' - gypsy9 1 2 68.18 TCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTGCTGGGAGAAAAATCAAAAGCGAAGCGAAGGAAAAAACGATGGTTCGAAGAAAGAAAAACATTTTG:1 - chr2R 16449345 3' - INE-1 536 1 71.59 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATTTCCCTTGTTTGCAATGAGACATTTGTCCTCCACTATCTTAATTC:1 + chrX 15046798 3' + S-element 1681 2 60.19 TCCTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTCATTTTGTTTGCAGTGAGTGAGCAGTGAGCAGCTAAGCTAGATTTTT:1 - chr2L 4300152 3' - Idefix 6915 2 56.84 TGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTGTCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCACAGCTGTTCGGGCTGAAAAATTGTGACAGCTATTGAGACAA:1 + chrX 4300072 3' - Transpac 5044 2 61.82 TGAGCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTTTC:1 + chr2L 21768294 3' + Chouto 83 1 66.10 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCTTTGAATTCCTAATCAAGTGTCATTAATCACGGGGTCGCTTTGATTTTGGCATA:1 - chr3L 20642677 3' + roo 397 1 64.13 TCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGTAACCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTTTGGCTGACTTTGCATTTCTTTATGGTTGTTCATGTTGGTTTGCCATT:1 + chrX 8979483 3' + 1360 3241 1 54.72 TTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTGGGAATCAGCTTCCCAGTACGAG:1 + chrX 6183220 3' - I-element 193 1 66.67 GCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTCGTATAAATTGTTCTTTCTATATTCTTT:1 - chrX 2638238 3' + FB 275 1 74.55 GCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACTGGGAAAAAATATATTTTATTGGGGA:1 + chr2R 11632380 3' + Tirant 393 2 67.74 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATAATTATATCTTATTAAAACGTTGAGTTGAGTT:1 - chr2R 11784272 3' - pogo 48 1 72.73 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCATAGGTGTGCGTGTGTGAGTAGGTGAGTGTGTGGGTGGCATTGGCAATGTCAAAGGCAAGGCGCGACAGA:1 + chr3L 17930069 3' - hobo 17 1 64.55 TGAATGTGTGTGTGTGTGTGGGGCCGAAGGAGGGAGGAGGAATGTGTGCGCATAGAGAAATTGTTCTTCCAGCTTG:1 - chrX 708372 3' - accord 7032 2 63.16 GTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGATGTTTGAATCTAACTGACTCGCTACTGCGAGCGCTTCGCCTTTTTACTCATTTTCCGAGTGTTCTGCCG:1 + chr2L 19415401 3' - rooA 347 2 72.45 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGT:1 + chr2L 9754872 3' - 1360 29 1 50.46 AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTAAAATTGATATAGCCATCA:1 - chr2R 19096931 3' + flea 4952 1 80.91 ATATACATGTATGTATATACAATATACATATATATATATGTATCTGTATCTAACTGAAACGAACAAGTTTACAGCTGAAATACCCTCAATAAAATATAATAAGTG:1 + chrX 3084504 3' - INE-1 66 1 89.52 GTATCTGATAGTCGGGAAGCTAGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCGGTGGTGTTAGCGTAAATAACGGTATAACAAAACTCTGGTGCGCAAACGACTTTGTGG:1 + chr3L 27364166 3' + INE-1 558 1 55.66 TTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTATAGGAAAATGATGATGGAGATGGAGGATCCTGGCAGAAGTG:1 + chr3L 14938141 3' + I-element 206 1 62.50 CTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGCTGATAAAGTAAAAATTCTGTGTACTGTAAAAAAATCCAAAT:1 + chr2L 21243383 3' - INE-1 566 1 55.06 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATAGGTTGGCATTTGTCGGCAAATTTTATG:1 - chr2L 21089139 3' + flea 4994 2 61.82 TCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCTCCTGCTCTTTTTTCATTGTGTTTCATTTTATTTTTATCAACGTTTATTGTTTTGTGACTTTTGCGGTTGG:1 - chr2R 13937538 3' + diver2 4647 2 74.04 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGAATTTATTTAACATGATTTGGTGTGTAGTTTATTCATCGTTTAAATGTTCTATAGTTTATACATA:1 + chr3R 12623800 3' + roo 392 2 65.45 GTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATT:1 + chr3R 13423364 3' + rover 7261 2 60.00 TGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACGTTTTTTTCTTCTTTTTACTTCTCTCGCCGCACCGTTTTTAATTTGCAGCTTTTTGTTTCAAGTAAATTTCACAGATTT:1 - chr3L 17392278 3' + rover 48 2 70.91 GTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTGGAATGAATATAAATGAAAAAAATTTGAGGAAAGCCTTAAAAAAGGTTGATCTCGAG:1 + chr2L 16606839 3' - F-element 109 1 51.82 TAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTACACTGCGATACGGCG:1 + chr2L 19923733 3' + FB 913 3 64.44 CCACCAGTACAGGTTCCCTTGCCTTCCATCACGTTACACTGCCAGGCCACCTTTCTTCAAGACGCG:1 + chrX 21175373 3' + Gypsy12A_LTR 2228 1 54.55 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCTTCTGGGTGTAGCCTCAA:1 + chr2L 4600354 3' + Tirant 8452 2 76.62 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' + 1360 3372 1 67.65 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGCCAAGCAAACGGCGCCCGAAAGTATGCTAAATAGAATTCTAGAATTCACTAGGCGCGAACTTACAGTGA:1 - chr3R 21993191 3' + jockey 4976 1 66.06 TAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 14317416 3' - HeT-A 5968 1 69.52 CTCTCCCCTAAGACTGGAGTACAAAGTACTCTTATATAACTCCGAAAGATAAATACCCAAATGTGCGCGTGAGACAGTCATACAAATTGATAATAAGAGAGTTTTCAGCA:1 - chr2L 9448302 3' + Doc3-element 4263 1 64.55 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGGACCAGCTTCAGTTTTGAGTTCGGCGTGTGCTTCGCCAGGTGCTCTCAGCGCAGTCGCA:1 - chr3L 13925325 3' + P-element 2878 2 65.96 AAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACACTAAAGGAAAAGCTTCAAATAAATCATATTTTACGATTTTGTGCAATTCGCTCAGCAATAAAATAGCATAAAGAATGATAAAAA:1 - chr2L 20125654 3' + pogo 347 1 56.36 ATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGATCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAGATCCTACTAGCACGAAAGCCATTATATGCGTTTTCC:1 - chr3R 10205530 3' + Cr1a 4221 1 79.09 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGTGAGTTGGTGTGCCAGGGACATAGGAAAAGAGGGCACAATGGCG:1 - chrX 22745166 3' - jockey 4800 1 58.33 TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACGGCGATTGTTTGAAAAGCGCGGCTATTGCTT:1 - chrX 17456064 3' + jockey 4970 1 57.33 AACTCTAACGGTTGTCTGCCGCGCATCAGAAACACGAAATATCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTTAATACTTCTGTCTAAGATACGAAAACTTACGCTTTACC:1 - chr2R 5044039 3' - invader1 3695 2 71.82 TCAAGTTACTGCGAACAACTCAGCGCTGCGGCCCAAGAAACCCAAAAGCCAAAAAAAATCATTTGAAGAGCCAACCGTCATCGGTTTTC:1 - chr2L 8701024 3' + G-element 217 1 76.40 AAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCGCAATTACTTTTTTACTGCGCTTAGATCATTTAAATAATTAAATTAAATAGCATT:1 - chr2L 23333249 3' + 297 6603 2 52.73 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAA:1 - chr2R 20924226 3' + mdg1 7406 2 76.36 GGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAACTCGCAGCAGCAGCA:1 + chr3L 17212300 3' + F-element 4274 1 70.00 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTACGGTTTTTGTGGTTATTTGTTTATAACACATACGTCATGTTAGTTATTGATGAGCT:1 - chr3R 7588855 3' - F-element 16 1 61.18 CCCTGGATCGGACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACGAAATCTTGGGAGGCAACTGAGATTGAGCTCCACGGTTCA:1 + chr2R 4406612 3' + diver 5718 1 59.76 CAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCTACTTATTTATGGTTGTATCGCCGCTAATCGAAGCTTGATTGCGATTGTCCAAG:1 + chrX 10886382 3' - 1360 25 1 57.69 TCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGGCGTATTAGCTGGACGCTACAGAAGTGATGAAG:1 - chr2R 6537873 3' + roo 9071 1 78.85 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTTATTACAAACTTTTTAAAAATGAGATATATGTTAAAGAACTCTTT:1 - chr3R 26733995 3' - hobo 38 1 56.88 GTCCAATAAACGAATTAAAAAAAAGATATCTATATATACTAGTTATATTTGCACGGAAATTCGAGCAGGAGCAAAATCAAGTGGAAATTGTGAGTATCTGACGGCTTTGA:1 - chr2L 15261697 3' + Rt1c 5419 1 57.27 GTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGCATGTTGGTTTGGATGGGTCGG:1 - chr3L 10216257 3' + invader4 2916 2 81.52 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAA:1 - chr2R 8397446 3' + 412 448 2 63.64 ACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCTCATCAAAAGAACAGAAAAGGCAGCTGCAGACTTAATGGAAAATGTTTAAGCCGG:1 + chr2L 18213322 3' - invader1 3707 2 62.92 GACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGAGGTAAGGTGAACGTGGCCAATTAGCAGCTGCGCCCA:1 - chr2R 20213372 3' + 297 166 2 56.47 GTTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGGGCCAGTTATTAATTACAGTTATTCATTTATGCATTCAATTTAATTGCGATTTCAGCTCATATTTACAATAAACCTTTTATGCCT:1 - chrX 14655226 3' - HMS-Beagle 274 1 56.36 AAAATGTTGTAAAATTATTGTTATTCTATCTTGTAACTTAAGAATCAAAAAATAAAAGATAAAATAAAATCACTTATGCGAGGCTACTTAGTTGCTAAAGGA:1 - chrY 475861 3' - transib4 106 1 28.43 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGG:1 + chrX 8364720 3' + jockey 4936 1 77.27 CCCGAAAAACGTCTTCAAGCACAACACGCACACTCGCACTCGTCTCTTGTTTTTACTCATACTAACCCATTTATCCACGAAAGTCATCGAAATATTATTGTTATTATTAT:1 + chr3R 26235178 3' + 1360 3196 1 56.36 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTATTTGATAATTAGTTACTCTACTAATGGGCACTTAA:1 + chr2L 17785884 3' + roo 389 2 71.56 TTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCATATGAAATGAAAGTTTGTAAAATGGGGGTAAAGATTGATTTATTGCA:1 - chr3L 5489572 3' - G2 72 1 57.27 ATGTTCACTTGCTGTAACATCCACATCTGCAATTTTTGGGGTTTTCAGTTTTTGGATTCTACCAATTTGGGGCTAATAAGGCCTGGCATTAT:1 - chrX 7609302 3' - I-element 450 1 65.22 GCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAATCTAACTCACCATTTGTAAACCCAACTCGTATCGCTTTATTTAAGTAACCCATATGTATCTGTTGTGAAACGTTTTTCTTT:1 - chrX 17931196 3' + HeT-A 5887 1 64.55 TACAATGCAAATTCATTTCTTCGATCAGAAGTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACGTTTCTACTTTATTACCGTCCGTTTCTCCACCAC:1 - 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I-element 51 1 79.57 GGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAAGAAAAAAAAAATAGAAATAGATGTACAG:1 - chr3L 10233720 3' + HeT-A 6014 1 80.00 CAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAACAACCCAGGGAGAGTGTGTCGGATTTTATGCTCCCAACTTC:1 - chr3L 13082189 3' + I-element 167 1 55.17 TCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGGTTGGTTGTTTCTTTTGTAGCNACGAAGTACTGTATTATATTTATAAACG:1 + chr3R 14743199 3' - FB 18 1 49.45 TGTTGCTATACATTTTTAAAAATTCATTCTTTTAGGTTAACAAACTTACCTGAGTTAATAATTGATTATTTTTAAAAAAGAACCTCTGGGCCTTGAAAACCATCTAATA:1 - chr3R 13515559 3' + TART-C 11028 1 42.20 TCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTACATGCAATACCAACATTTAAAATGACAATCGACATAAATACGATAAAAAGCAGGGAAGATGATCCTTTTATCGGGTTTATTA:1 + chr3R 9093800 3' - invader1 3871 2 66.36 GGCACTGCTATTCCTATGAACAGCCTAAAACTTGCGATTTTGCTCAAGAATGCAAATAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTTTCAAAAGGTTTTCTATCAGTATTCCATTA:1 + chr2R 6909187 3' - HB 209 1 51.82 GGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGGGCTGCCCTGAACGGAAGTGGATG:1 - chr3L 22223437 3' + micropia 276 2 68.00 GTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTCAAAATTTTTCTATTAACAAATCAAGAAAATAATTGATTTAAATGAAATAATTTAAAAATATTAAATATAAATGTTA:1 - chr3R 18798764 3' + X-element 4588 1 32.73 AGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCACACACAGGCACATGCACACGCACACCCACTATCTATAGGTATATA:1 - chr2R 16702570 3' + Idefix 186 1 51.09 ATTGTTATTAGTTTTTATCGTTTTCCCACCCTTAAAACACCTTTAACAAAAAAATTTTTTTTTTCGATTGCCAAATCACCGACGACCCCCTATCC:1 - chr2L 19312958 3' + FB 366 1 75.79 GATATTTAGTTAGCTTAGAATAATATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAAAAACTGCAAGACTGTAAAATTAG:1 - chr3R 14752007 3' + Doc3-element 4647 1 76.92 TGGTATATGACTAATCATGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCCCTTCTCGAAGGATGACGCTCCTTCCACTGGATAATGGTGCC:1 + chr3L 7065357 3' + G3 4298 1 55.81 TGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATATAGTCAAAATGGATGGGATAGGGTTTCGGTTACGTGGAATTTAATATTTGGG:1 - chrY 132171 3' - Stalker 6863 4 71.11 GATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGTATGTGTGTTAGTGTTTTAGTTGGAGGCAGC:1 + chr2L 5076878 3' - accord 263 2 79.09 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGCATATTTGTGCGCCAGTTGTCTGCATGGGAGCAAGTACTTGGCGGAGCTTATGAA:1 + chr2R 6537988 3' - roo 29 2 51.82 GCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGCGTGAATTTTTTTTTATTTCACTGCTCTTCAGGCAGCCAAGACTTGTTGGCGCTGATTTAAT:1 + chr2R 4137618 3' + HMS-Beagle2 7174 2 60.91 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAACAAATATATTACGATTGCATCACAC:1 + chr3R 27071899 3' + jockey 4955 1 76.67 TAGCAGATACCCGTTACTCAGCTACAGGCAGTGCTAGGGAGAAATGCCAGAGATTCGCCCAAAAAGCCCACATCCCTCGATCTGTCA:1 - chr3R 11741254 3' - INE-1 546 1 52.87 TTAAGCAAAAAACACTTAATTTTTAGCTTTAAAGTAAAAAATTCAACTTATTTCACAGTTTGTTTGGTTACGAATAGCTCCTGGAACCGGCGAATGTTC:1 + chr2L 13176229 3' - S-element 63 1 59.60 GAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATGTGGTGTGCCGGAAGGAGAGAAACGTGACAGTTCGTCATCACCTGCAGGGTTATCTCATC:1 - chr2L 20857601 3' + R2-element 28 1 63.64 AATAATAAAAAAAAAGAATAAAATTCCTAATAATGAAATAGTTGATCCAATAGTTGATACAATATTTCATGTTGTGTAAGCATCTGTGAGCGCTGAAATAGCGCAGTTTG:1 + chr2L 11633377 3' + Rt1b 5149 5 25.45 GATTGTTTTCACTTTTTTTTTTGATTTTTTTTGTTATGTTTTAAAAATAACACTTATTACTTACAAATTCAACTCTTT:1 + chr3L 14213063 3' - Porto1 175 1 62.82 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAATCCAAAAATTAAATGAAATCAAATAAAATTATTGCCCCAGCAGGAGGTCCTTGGTGGGCAGG:1 - 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chr2L 20494730 3' + 297 6951 2 68.18 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAATATCTGTGAAAATACACTTGAGGCCAAGATACTGCACAGTGGGCGCCATAGAAATACGGCACTATAGAAAAGTTTTAGGTGAAC:1 + chr3L 10363088 3' + Stalker3T 205 1 80.00 CACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGACAGTAGGGTGAAAGGTTTAAAAGGAAAACAAAACATAGACAAGAGGCTTTTTG:1 + chr2L 8640324 3' + rover 163 2 55.34 TATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCAAATAACCGCAGCTTGAAAACCGGTTGCCATCGTCATAAATGCGCCGTTG:1 - chr3R 29312572 3' - R2-element 41 1 63.64 CCTTTTCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCATTCTGAAGCCCAAGGCAGCAG:1 - chr3R 21670850 3' + I-element 75 1 78.64 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGGACATAAATCT:1 - chr3R 11553652 3' - hopper 3 2 68.35 GTTCGTTGACGTTGATGGCTGCGGAAACTGTGCAGCCCTCTTAGTCAGCATTTTGGAGCACCAGGGTTTTCTTATTTCTAAGTACTATTAAATTAAGCTTAATTG:1 - chr2R 24072466 3' - HMS-Beagle 54 2 56.19 TAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTTAAGCAACTTGTGCTAAATTTGCTTT:1 - chrX 20433339 3' - diver 34 2 65.52 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGGTCGTCCTTAACCTTTTGCAGTGCAAGCCTTGATAC:1 + chr2L 18675676 3' - 412 48 2 66.06 CTGGTAGAGGTACGGAGACAGAATGATTCCGCATCCACACTTTAATTTTACCTCCTTTTTTCCATTATCTTCTGATTGATTGGCTTTATGCGGTAATTCTTTGCTAATTT:1 + chr2L 10000521 3' - HeT-A 6049 2 56.36 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATTTACATTTTCCCCCAAAATTATTGTATTTCGC:1 - chr2L 7841339 3' + jockey 4971 1 63.33 CTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAATTGAACCTAGTTTTAGTTTATTATATTGAATTCGAAGATGGTTTAA:1 + chr3R 6763700 3' - F-element 4438 1 76.15 CCCCTAAACCCCCACGCCTACACCACTGAACACATCGACGCCCATGGGCACTCCGGTACAACGAACCGGGAAACGAATAAAAAATTGTAAAAGATAGCTGACGTATTTGA:1 - chr4 365430 3' + Tirant 17 2 76.36 GAAAGTTCATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTTTTATTTTTTAAAGCAAGTGCATTTAATAATGATATTTTCCGCCAACGAGCTGCAAAAAGTGTGCGCAATAACAC:1 + chrX 9427590 3' + Tc1 38 1 56.36 ATTGTATGTTTACAATTTATAATTGAGGTACCCCGCCGGTTCATTTTCCACCACCTCCTCAACTGGTTTCACTGTAGTTGG:1 - chr3L 3296879 3' - TAHRE 10190 1 60.49 CCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAACCTATCATTTTTTTTTTGTTCTCAACTGCCTTCTCTACTTTGTCCTGCAC:1 + chr3L 18353463 3' - invader2 4670 1 71.82 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCA:1 + chrY 3648870 3' + micropia 426 2 70.65 AACAAAGGCTATCCAGCCAAATATTAGGCCCTAATTAACATTAAAAAGAAAAACTAGGGAAAGAAATAAGTACTATATAAGGTGCTGTGTTATGATTCGGAAGGCGACA:1 - chr3R 17948511 3' + HB 1324 1 59.63 GGCCTCATATGGTCGCTTGACATCACGTTACAATAGCGTCGCTTAGTAACAGTGTGGTCTGGCAGATCTCTTGCATTCCCGTACTTACTTTTCCTGCTTTGCTTGCTCTT:1 - chr2L 18963541 3' - Bica 4835 1 60.91 GTACCCTGATGCAAGCGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTATATTTTTTCTGTGCTCACTCTAGAATGTCCTGTGCACCGAGCTA:1 - chr2R 20436707 3' + opus 7490 2 64.04 TGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTTTTTTACTCGCATGTGTGTGAGTATGTGTGTGAGTATCTGTGTGTG:1 - chr3L 18244072 3' - Rt1a 4845 1 61.43 ACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + accord 152 2 47.57 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAAAATAATTAAAGA:1 + chr3L 9822291 3' - pogo 29 1 64.44 GATGTTACCAACACCATAACCACGACCCAAGCTAGTTGTTGTTCGACTACAAACTCATATACTATGGTAGTAGCA:1 + chr3L 24710034 3' + jockey2 269 1 80.00 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAAACGTATTTTATAGATCATTTTGTTCTCATATGAGTGTAAGCGGAAACACAAACACAGGCTGCCA:1 + chr2L 770079 3' - roo 8679 2 67.59 ATCCAATTCCTCCAACTCCTCTGCTGCTGATCCAATTGCAGACCCCACTGCAGCTCCAAAAGATCCTCATCCGCCCGCCGATCTTTCGC:1 - chr3L 12447971 3' - invader3 488 1 67.42 GAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTGTAATGATTTCTTTTCTGGGAACTTCTA:1 + chr3L 6264355 3' + Dm88 4365 2 74.55 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACACACGACGAGGAAG:1 - chr2L 9147964 3' - Doc 30 1 57.89 CGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACAACTGACGACCCAATTCGATGCGTTGTCAATTAATTCGGGCAG:1 - chr2L 21191731 3' + gypsy3 401 1 65.71 CAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACTCATAAATATGCATAAATTTAACAGCTTATTGCATTTACACTCAGGGTTTTAAAATCTTT:1 - chr2L 19264001 3' - Cr1a 4228 1 60.00 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGGTTGGTTGTTTCTTTTGTAGCCACGAAGTACTGTATTATATTTATAA:1 + chr3R 14743196 3' - FB 40 1 60.91 CAATATGATGAAATAAAATAATTAAAAAGTAGCAACAATCAGGAATTTCAGCCAAATGTTTTAGGAAGTTCAATGAAAGCAGAGAGACGCAAAACGCACGACAAAAATT:1 - chr2L 3342011 3' - 1360 3101 1 65.14 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAAGATAAGACAAGACAAGCCGAGAAGGAGCGAAAAAGACGGCGAGAGCGAC:1 - chr2L 3773647 3' - copia 4887 2 45.65 GTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATGTATGCAACGTATTCTCACTAAAGTTACTGTATTGTATTATTTGATTTACAACATTTAATGAATGTTAT:1 + chr3L 220804 3' + accord2 65 2 69.09 TATGGATATTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTAATACTTTTGATTGGCACCGGAATAAGCCTGAACAATTTGGATGG:1 - chr3R 19449124 3' - G4 3537 1 68.42 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACGAG:1 + chr2L 6243732 3' - 412 7072 2 54.02 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTTGACGGTATCTATGACGTTGAGATTACACAAAAACGAGT:1 + chr2L 11082301 3' - jockey 58 1 64.55 TGCGAATATGTGTGTGTATGTGGTGTGTGTGGCGGCACAAACAGTTGCAGCTGG:1 - chr3R 18778029 3' - accord 7034 2 92.59 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAGAAGCGTCTGGTGTGGGTGCCACACGAGAAC:1 - chr2R 25010383 3' - 412 16 2 58.90 TAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAG:1 - chrX 21087589 3' - mdg3 5285 2 58.00 TCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTACCAAATAAACGTGGCTCAACGTGGAGTTTTGC:1 - chr2L 16067043 3' + HMS-Beagle2 310 2 75.25 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGGTTGCAATTGTCCAGCGGCAGAAGGG:1 + chr3L 15614481 3' - jockey 4714 1 67.82 TAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064835 3' + Stalker3T 202 1 56.36 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTATATGTGCATTTGTATAGCCTGGCGTACGTGGACATCTATACTTTGGATACATGTGTAGGC:1 - chrX 4712437 3' - Quasimodo 12 2 69.52 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTTGCGTTCCACATATGATAGATGTTAAATATTTTTTTGAACGAAATTCCCATTGTTATGTAAC:1 - chr3L 9419505 3' + S-element 1706 1 65.31 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGTTTTCCCCCCACAAAAATTTTTCCGCACAGCTCTTGT:1 - chrX 8885495 3' - roo 44 2 69.72 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATCCAAAAAACACGAAAATAAGACAGAAAAGATTCCCGGTAAAGCTCAAATCCTGTTTACTTCCTTTTTGTGCTA:1 - chr2L 9171393 3' + opus 7496 2 74.55 TCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTTT:1 + chr2R 6801716 3' + McClintock 479 1 76.47 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGGTTTTGTAAATAATTGTTCAGACCTCATCCGGTTTTCATTTAAAAGAGCTGTTTGCTATTGTTTGCTAGC:1 - chr2R 18523507 3' + roo 395 1 61.82 ATATAAAAAATAAAACAATAAATTTAAAAAATGTAGCTTTCAATGTTTTATACATGATCAATTTGTTTCTCTGTACTTTTACACACATGATTACGAATGTTGCGGTGTAC:1 - chr3L 2410973 3' + gypsy11 3929 1 49.09 AAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACTGGCCCGACCTGACCTACATCAAAATCGGTTCCCATTTCATGGACCTGCAACATGTTGCAAATTTGT:1 + chr3R 31635194 3' - invader1 23 2 67.27 ACTAGAAACTATATACCCCTAATCTAAAATCATTCCTGATGTGTAACGCAATCGTTGGATTTTTGGCTATATATGCCAGTGCCAACATTACCAAATTTCCAACTGCTGAG:1 - chr3R 3353688 3' + Cr1a 4124 1 69.09 CAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATGTCCTAGATCTCGGCTTGGGTTTGTCAAGTGTCTAT:1 - chr3L 13131388 3' + Gypsy12A_LTR 204 3 75.00 TTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAAGGTGGCCGTCAAGATACTCAATCGTCAGA:1 + chrX 1376074 3' - X-element 4586 1 65.52 GTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGCCGTGTGTATTTTGACATCAGTTTTTCATTACGTTT:1 + chr2L 2538179 3' - accord 216 2 62.92 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTCTTGAGAAAATGAAATCATGTAAAGTAGCTCGATCTTAAAGAATTTAAGAACATAAGTTCTTTTGAAAAGCCCTCAATA:1 + chr3L 23257596 3' + blood 7382 2 73.64 CAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTACCTACGCAGCGAAAGCATCCAAACATCCCACCACCACAAATGCCCCCACCAAACTTATTC:1 - chr3L 5701327 3' + Doc2-element 4420 1 64.55 ATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAGCATTTGAATTAACTTCATCACCCTGCTGCTGAACATGAACGAGAAATATTTTAAAACATACCTTA:1 - chrX 6940707 3' + Burdock 289 1 65.45 GTTCTGACTATAATAGACTTTATCCAAGTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTTTCTGTTTTTCGGTTTTGTTTTCG:1 + chr2L 11434387 3' + Cr1a 4200 1 72.48 GACAAATGGTGCTCTTTGGCCCAAACGACGTTACCAATCCTTCCATTGCCTTCTTCGCAGCTGCCAGTCGTGGGCATCGATTTCCGTTTCGC:1 - chrX 5845453 3' - Osvaldo 1316 2 75.00 AGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACAGGCGCAGATAAAGTACACAAAACGCAAACAAAAAATTTAATTAAATTT:1 + chr2R 15032553 3' + Stalker4 6950 2 56.36 GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7259 2 79.09 ACAACAAGACCTCTTTAAAAATTCTTTATCATCTATTCTCCGAGTCACATCCGGTGTGACAAAGAGAGGAAGATTGGAAATCGAAGTGCGAAAGGGAGGGAAGGCGATAT:1 - chr2R 14341950 3' + Q-element 432 2 56.36 GCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATCTTGTAAGGGAAAGCGAAAGAGTGAGAGAGTGATAGCGAAAAATTCCACGTCAAAATGCAAAATGACAAAAAAAA:1 - chr2R 14313250 3' - Cr1a 341 1 70.00 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAGCTAATTTAAGATTTTAAAATGTTTTAATTAATGTTTAAAATGTTTTAGTAAAGAT:2 - chr3L 17595298 3' - jockey 4699 1 53.64 CTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAGGTATTTCCCTTTAAGGTTGTGATTTTATCTAGTTTGCTCTGTGGTGGCTTTGGCCATGCCG:1 - chr3R 26731586 3' - gypsy5 7307 2 70.00 ACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCATGATTATTTGTCC:1 - chrX 22726190 3' + Helena 1274 1 48.57 AACTTCTTTACTCCTTATTGCCGCTGCTCTCCTGCTGATGCAGTCATTTAGACTCCTGGAGGAACCCCTCATCTTCAGTGCCAGTCAAAAAAAAAAATTGAAATC:1 - chr3L 4078460 3' + G7 59 1 67.62 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAGTACTCTTGGGGCTTCACAATCCAATATTAC:1 + chr3R 22595863 3' - FB 50 1 68.57 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGCCAAGCAAACGGCGCCCGAAAGTATGATAAATAGA:1 - chr3R 21993225 3' + jockey 4942 1 69.72 TAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACAATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATG:1 - chr3R 25051592 3' + 17.6 445 2 70.00 CTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGA:1 - chr3L 15099554 3' + G4 3804 1 63.64 TGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACCCAGGCATCCCCTCCAGCCACTTGGTCCTCTCCTTAGCTGCCTGTAACATTATCTAAGCTAACA:1 - chr3L 22536710 3' + Idefix 222 2 71.13 ATCGATATCCCAAAAAAATTATTAAATTTTGGCTTCACACTAGCTGAGGAACGGG:1 + chr3L 23210710 3' + INE-1 504 1 92.73 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATCGAACGTAAAACAAAGGAACACCGCACACACCATAGACAAATGACAAAATCTTTCTGGGTCTCGCTTTATC:1 - chr3L 2430074 3' + 297 373 2 75.70 ATCGAGATCTCAGGAACTGTAAAAAGCTAAGAGCTAGAACTGTAGTAGCTAGATTCTAGAGACATAGACGCAACTCAAGTTTCAAAGATGTTTAATGTTTTGCCTGTGCA:1 - chr2R 25190015 3' + INE-1 145 1 74.55 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGA:1 + chr2R 8397486 3' - 412 36 2 71.43 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1 - chr2R 981617 3' - 1360 64 1 66.06 GAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCTTTGGTAGGATGGTGATTTTCGCACAGTTCGTGCTTAAATACAAAGTAAGCTGTTAGAACAATTTGCTTTTCGGT:1 - chr3R 25090473 3' + Bari1 1267 1 72.73 AATTTCAACATAAGAATTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAATTCGCTTCTAATGTCGGTCTGTATGATTT:1 - chr2L 21368010 3' - Bari1 1419 1 72.64 CGAAATTTTCAACTTATAACTATTACATTGTTCCTAGTCGCTATTTGTTTAAAAATTTTTTCCGCTTTTTGTCTTTAACTGTGGCATATTTCTTTGCCTCCCCCCTCCTC:1 + chr3L 1582414 3' - invader2 4799 1 55.45 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - blood 13 2 37.00 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTTGCCTGTTCATAAATTTATATTTGTTTCGTACTCTCT:1 + chr3R 7500922 3' - FB 44 1 65.45 TGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATA:1 + chr3R 2628863 3' + R2-element 3193 1 78.85 ATAAACACATGAAACCAATTTACAATTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCAAATTATTGTTGTCTGCTTTTATTGTTTGACTTCTGTCTGCCGCCCCAGAC:1 - chr2R 21439336 3' + rover 7022 2 52.73 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTATATACGAACCACATGCTGTAATCTAATAACCCTTAAAATTATTTTTAACCGCAGAC:1 - chr3R 25434732 3' + opus 7494 2 70.21 CGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCCACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTCCATATTCAGACAATTAT:1 - chrX 13057301 3' - Max-element 54 2 75.51 AGCAAAAATGGGCCAAAGATATTGCTTTACCGTCTTAGACAATAGGTAAAGGTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTGAGAACCCGTTCAAAAGGACGTAGAAAGTACA:1 + chr2L 5169842 3' - transib2 494 1 75.45 TTAGCTGAGCCCAACATCAGCACACATTGACCATTCAACTCAAGCCTTGTCATTCAATTTAGATTTACTGTTGTAATATGGCCAGTAGCTAAACATTTTT:1 - chrX 9516815 3' + Stalker4 306 4 74.00 ACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAGTAGTTGCAAAATTAAATACTTTTTCCTAGAGGAAACCCATGAGAATTGCGTCAAAGGTTTAGAATTTGTCTGACCTTTA:1 + chrY 3561670 3' + Quasimodo 7363 2 80.00 ACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGCCGTATTTATGCCAAATTATTT:1 - chrX 11226094 3' + gypsy12 9835 2 59.57 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTTTAAAATCATGAACTTCAATTTTATT:1 - chr3R 7049635 3' - 1360 29 1 54.55 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGAAAATAAAGTTAC:1 - chr2R 9963480 3' - pogo 32 1 53.64 TATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCTGGGCAACACATCCGATCTGGAGTGCGAAAAG:1 + chrX 6237500 3' - Doc 4454 1 70.09 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGCTACATCTTAAGGCAAATACTTTTGCTTCCT:1 + chr2L 5304938 3' + flea 245 2 70.19 ATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGACTTTTTGAAGCGTTGCTGGACTGGTGAGTGTGTGTATATATATATATAAATATGCAATAGATGCATTTTGGCATTTGGATTTT:1 + chrX 13382696 3' - I-element 5157 1 78.18 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGTACAGTGGCATGAACTCGATGAAATGAGTCAGGATAATATTGGAAAATG:1 + chr2L 14141381 3' + hopper 1413 2 78.50 AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCGAGGAGTTCAGGACATCCAACAATAAGAAATTGAAATGAAAAAC:1 - chr2L 13710635 3' + copia 254 1 80.00 AAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGCCAGCTGGTTGGGTTGCCTCGCAAAGTTACGCTTCCACGAAATCATATTT:1 + chr3L 9908168 3' + Doc 4604 1 59.57 CGTTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAACAATTTTTTTTCGGTTTACGCTAAAATTTCCATTTTTCGCTTTGACTTTTTATTGGTGATTTTAAGTACTGAATATGT:1 + chr4 567570 3' + FB 384 1 67.27 ATAAACAAATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTACTTGTTTACAAATTAGCAGCGTCAGACAGGCCACCAGCAA:1 - chr3L 6620054 3' - Tc1-2 1493 1 74.39 TAATATGTTTTAATTTGTTTCTTGAATAACTGGAAATTTAAAAGCTCACATATTTCATTGAATTTTCCCCTCGTACTTTTACATTTATTTATCGCTCCCCGTTCTAATCA:1 + chr2L 12275330 3' - HeT-A 5766 1 60.00 TTATATAAAATAATAAATTAAACACATCACAACCTAAAAAAATAACGCAAAATAATATTCTTATAAATAAAATTCTCGCATATTCAAAATCATAACAGAAAATGATGGAT:1 + chr3L 3396044 3' + HeT-A 341 1 30.00 CCACATACATATTAACACCCACATCTCCTTCGCCCACCATCCATCTCCCTTTAAAGCCGCTTTCATTTGTATATATATATATTTTTCACTT:1 + chr2R 15947171 3' + transib4 2399 1 82.42 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACGCAACAAAACACGTAATACTCGGTGGTAACAAGCAA:1 + chr3R 9159541 3' + jockey 4947 1 67.27 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAACTTATTTTTATATTTATATTTTTTTAATATTTTTCTTCGCCATTTGCGTACTTTGCACGCATA:1 + chr3R 8811261 3' + 1360 3380 2 69.70 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATAATAATTAACTACACAGGAGTTGGGAGCAAATTTAATGG:1 + chr3L 16301119 3' + mdg1 7412 2 73.40 CTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACGAAGTTAAATCGTTCAACGAACGGTTTTCATTGATTGGAATTGATGGGCAGCACGAC:1 - chrX 6184688 3' + 1360 2988 1 72.62 CAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTATTTTCTCTGTTACTTTTTGGCTTTTGTTTTGTTTTATGTTTGATAATTAATTTCTACGTCGCATGCTGATGTTGGCA:1 + chrX 15300951 3' + 17.6 7310 2 77.27 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGTTTATAGAAATCTTTTAACGTTTCG:1 - chr3R 24813964 3' - P-element 49 1 30.69 AAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGATTTTTCGAATGTTTAAAT:1 - chr2R 8397418 3' + 412 7529 2 49.09 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATCATATTCTTCAAAGCTCTTGATTAATCTTTCTTTCTTTCTC:1 + chr3L 10836606 3' - opus 148 4 65.45 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCACAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTATGATAATTTTGATTCCTCCGAACCTT:1 + chrX 8808794 3' - roo 8717 2 72.73 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAAGTGGATTTTGCAGACCACAAAATGGATTAATAGGCGAG:1 + chr3R 13183279 3' - hobo 33 1 57.58 TGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATG:1 - chr3R 15697045 3' - 3S18 5802 2 60.61 TGAAAAATATATTTATATACAAATGAAAGCGGCTTTAAAGGGAGATGGATGGTGGGCGAAGGACGAAGGGAGGAGACATGGCATTCATTACAGCAATTGAAATGGACAA:1 + chr2L 1972170 3' - transib4 2465 1 50.46 CACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTATATCCACTTTCATCTCGTTCATTATAATATACATTATTTTCGACGAATATTACACGTATTGGAT:1 + chrX 9518636 3' - Transpac 4810 1 59.09 ACACACACACACACACACTTCGCTGAACACGTAATGACCTCCCGCTTTTGCAAACCACACCCAAACTAAGAGCCCAGGCAACAAGCAAGCAGCAAAAATCGCATTAAGTG:1 - chr2L 4293367 3' + accord 258 2 60.00 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACGAATTAAATATTAATAATAAAAGTCGTCAAA:1 - chr2L 21784866 3' - I-element 25 1 65.82 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCTCCAAGGAATCCTACACAAAATGGCAAC:1 - chr3L 6899842 3' + hopper 1380 1 67.42 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Tabor 45 2 66.36 ATCTCGAAGGTGTTTGAGAGACTGATTGCAGCCCGGATGGTCAGGATTATGGGAAAAAGGGTGGAGCACTCTTAAAAAGCCATCGAGAACGGTAACATTTCGAAGTGTGC:1 + chr2L 18350907 3' + BS3 461 1 56.36 ATACCAAAAAAAAAGAAAAAACGAGGACGGAAAGGAAAGATAGTTAATGTCTGACTACATTATACTAGAATCTATATATTAA:1 - chr3L 5670744 3' + gypsy7 5002 2 54.88 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTATGTATAATACATACAGTTTATCTAAACAAAATGGTTCGATACCATCGA:1 - chrX 22489611 3' - S-element 31 2 55.45 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATGTATTTTTTAAACATCGAAAAAGTTTCAGAA:1 - chr3R 6263314 3' + diver 6068 2 68.00 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTCTGC:1 - chr3L 19063461 3' + P-element 2842 1 29.03 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTTTGCGTTTATGGATTTTTAAT:1 - chr3R 18769718 3' - roo 8707 2 78.65 ACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTAAAACAATAATAAAAAGAAGCAAATCAGTCAATTGGAGTTTCATTCACTTCCGA:1 + chr3L 12255041 3' + Tabor 7321 2 68.18 GACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGATCAAAGCTGCTTGAGGAGCAAGTGCGTCAGTTGTTTGAACATAGGCGGAAT:1 - chr2R 12576874 3' - F-element 4213 1 75.64 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTTCCCCATTCCATACATTCAAATAACACACACGAACACGACCG:1 + chrX 4216622 3' + I-element 5331 1 52.69 ATAGAATTTTCTTGCTTGAGTGAGCAAAACGTATTGCACACTAAATATGAACAGAAATTTGTGTCTTGGAATTGCGGTTAATAACCTAAGCAACGCCGCCTACA:1 + chr3L 19389548 3' - 1360 3259 1 80.77 CACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCATATCCAAACCGCAAAAAGCTTTTAATCTAGCCAGCTACTGGACATCCAAAGTCGTAAAGCCTTATCATAAT:1 + chr2R 14663185 3' + 17.6 6951 1 65.45 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCCCATATTGCATATTGCACACACAGCAAGAACAAATGAAATGGAAAAGAAAACATCTGGCA:1 - chr3R 21858664 3' - Tirant 8112 2 73.03 TGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATTCAGCCTATAGTGCATTCCACACACTGTCCTCCCTCACACTCTCTTCGCCACTTTCTACACGACTTT:1 - chrX 10194797 3' - Transib-N1_DM 24 1 73.74 GATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGGTAAGATAAGATAAGATAAAAAGCAGGCAATCACAACAACAGCA:1 + chrX 4968950 3' + Stalker3T 205 1 70.00 CGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAGTCTGGGAGGATCTTCGATTATGGC:1 - chr3L 13751878 3' + I-element 364 1 68.75 GTCTAAGATTTTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGATTCAAGACCCCAACTTACCCACCACCCCCACCCGCACCCTCACACCC:1 + chr2L 8084590 3' + baggins 5049 1 55.95 GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACCATTTGATCAAAATCTATTTAGTTCAATCAAAATTCTTTTTTGAATATTAAAC:1 - chr2L 14848362 3' - pogo 13 1 65.45 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATCAGTCTGACCTGTTTGATAGTCCTTCATGTGTCCTCACT:1 + chr3L 10723732 3' + Burdock 232 2 57.78 GAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATCGTAGGCTTGTCCTCC:1 - chr2R 4137552 3' - HMS-Beagle2 31 2 78.67 CATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAAATTCAGCATTAACTCATCATATACTATCAAAAACTTTGGGTTCGTAGA:1 - chr2R 21474590 3' + 1360 386 1 56.36 CTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Stalker3T 204 1 54.55 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACATTAGCAAAACGGTTGCGATTCTGCTTTGCATTTTGCGAATT:1 + chr3L 18126661 3' - copia 42 2 66.36 TGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCACCCTTCTAGACCACAGCCAATAACAGCGCTAATAGAGC:1 - chr3R 24136713 3' + G2 2846 1 75.95 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTGCGTAAATTCCTAGAAAATA:1 - chrX 21399390 3' - pogo 28 1 55.45 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGTCTTCGTACTATTGAAAATGTTTGCTAATAATTTTTTTTT:1 - chr3L 22399745 3' - FB 37 1 65.35 GCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATGTTAAGGGAAAGGCAAAACGCCACCTAGCTGCTATTCCACGCACTACA:1 - chrX 7466546 3' + I-element 66 1 54.72 GGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTCCTTTTTTTATACGTATTCTTACTGTCGATACAGACTGGACTGG:1 + chr3L 15262391 3' - I-element 4898 1 53.19 ACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATAGGTAAAGTGCTTGCTGGCAGTATAAG:1 + chr2R 18507893 3' + Bari1 1652 1 74.07 ATTTCAACTGCAACACCAGCACCAAAAAGAGAAGACAAAATAAGTGGAAGGAAAAATGTATTTTTTGCCAACTGCATTTTTCAACGTACGAAATTGCGCTGAGTG:1 + chrX 17053259 3' - copia 166 2 72.38 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTCTTTTTTATATAATCTTAATATTGTTAGTGTTGTTCTTAGTTTGATGTGTTTTTGTGTTTGATGGTT:1 + chrX 22252867 3' + flea 5002 2 70.91 TTTTACAAAAATTAATACCTCCTAACCTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATTTAAAAGTTATTTCGGTTTTATTACTTTTTTTGTGTGTGGTTTTGTTTTTC:1 - chr3R 31230853 3' + hopper 26 1 54.55 TACATTGTAATACATACATACATTTCTTCCTCTAATTACATACATTAAAAATTTAACTCTACGAGTTATCCTGCCACTGCTTAACACATTTCCCAAACACACGATAACT:1 + chr2L 10867697 3' + ZAM 8224 2 66.06 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATAAAAATCGTGTTTATAGTTCTATGATTT:1 + chr3R 13481243 3' - roo 8699 2 59.43 TATTAATTTTTGTAAAAAACAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGCTTCCTGTGTAGCATATATTTGGGGGCGCG:1 + chr3R 11553720 3' - hopper 21 1 50.60 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Tabor 470 2 40.43 CAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC:1 + chr3R 29013340 3' + Porto1 187 2 41.82 CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATAAGCGAGGAAAGGGGGCGAAAGCACTCGCTTCCACACCCCC:1 + chr2R 22533908 3' - jockey 4988 1 62.73 TTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTCGACGAAGTTGGAGCAGC:1 - chr2L 12318712 3' - F-element 4224 1 71.88 TAATAGTAATAATAATAATAATGTAATGCAACCGCGTTCGTCGTTGTTTGGTTTTTCGTTTTCGATTAATTTTATTTAAATATATATTCTTATATATTTTTTGTGTTTT:1 + chrX 6120457 3' + mdg1 27 10 61.47 GGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGTGATAAAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGCAAATATATTGACTGACAGGC:1 - chr2L 11730822 3' + Cr1a 479 1 73.08 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGTGGGTACATAAATCTTTGTTTAAAGACACATGCA:1 - chr3R 11553633 3' + hopper 1413 2 77.32 AGCTGCTAAACGGGTTTAGCATTACCGGGGCTCACCACGAGGGGGCGGGAAGTAGAGAAGGTGAAAAACGGGG:1 + chrX 22655145 3' - R2-element 157 1 54.79 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGCACCAACACCATCTCCATCTCCATCCATCCGCGATTTCCGTATTTCGCCA:1 + chr2L 16254094 3' - FB 17 1 57.78 CAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCGATCAACTATCCACGGATGTTTCCCTTTCCGAGAGCATGACCTTCGACTCCTGTAGCCTGAACGAGA:1 - chr3R 23116634 3' + F-element 4456 1 70.48 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGATTATGAATTATGAATTATTAAATTTAACAATG:1 + chr3L 19294593 3' - F-element 64 1 84.55 ATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAATAGTATTAAAGAAGATGTTACGTCACAAAAATATTGAAAGAAGAAGAAAATTGAACTGGATTTTGAGATGAATTGCTAAATG:1 + chr3R 15309445 3' - HMS-Beagle2 6883 1 79.09 ATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAATGTGCATATTAAGATAAGAATGCAATGGTCAGTCGGAGAATTCGAGACGCTGAGTTACCGACTGCCCCAAAAGAATC:1 + chr3L 12109034 3' + Stalker3T 201 1 77.27 CTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGATATCATAACTTCATAT:1 + chrX 20433397 3' + diver 6077 2 53.64 ACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCTTTCCTTTTTTTTGGGGTGGTTGCTTGG:1 + chr3L 1062773 3' - transib2 2739 1 67.82 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGCACAACATGTTTTGATATTCGGACAGTTTTACACCAATAACAACTAATTAAATGG:1 - chr2L 6757461 3' + Tirant 8484 2 59.05 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTCTGTTTGTTGTTTTTAAGTTTTACAGCGC:1 - chr2R 17436719 3' + Tirant 367 2 66.67 ATCGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTTCGTACCTCCACCAGTAAAGTTAATAAATTCAGAAAATTAGGCGAGAGCCGTGCAAAACTTTTCAGCTGGC:1 - chr3R 14194023 3' + HeT-A 6024 1 52.43 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCT:1 + chr2R 2427619 3' - Doc 15 1 63.27 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTATCAA:1 + chrX 12271520 3' + pogo 2059 1 77.78 GAAAAAAAAAAGCTATTTCACAAGAATGTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCATATAGTTACTGGGGGCAATATTAAATGGT:1 - chr2R 21472729 3' - copia 368 1 68.09 AGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAAGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCGTGGAAATGGAAAACATGTGACCAGCGCTCCCAGAGGGTGG:1 + chr3L 14662180 3' - Quasimodo 448 2 56.99 TTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGAGTGGGCGTGGCAAATAGTTTTTTGGCCAATAGATAGAAATGTAAAAGGCTAATAAAAGAAAAAATATCAAAAC:1 + chr4 856873 3' - I-element 5077 1 77.00 CACCTTTGGGCAGCATCTCAAAAACACAGTAAAGAAATGTGATCACAGATCACAACAGCTAAGATGGCTCACGACGACAAACACCAAAAAGAAAATGAGGAACAAGTTT:1 - chr2R 14556449 3' + Helena 930 1 77.06 ATGCGTCACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGCGCGTGCCCCACCATCCACCAAAATCGAAGAACTCCCCCATGAAATTGAGGAGAATGTAAAAATTTATTGT:1 - chr3R 13968186 3' + hopper 83 1 56.36 GGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTACACTTGCAAAAATGTCGGCCACAGAGCTTCATGCATATGCAAATTGCATTTTC:1 + chr2L 17071729 3' + copia 4874 2 55.88 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACGATTGAGTAATCATAATTACGCTATAAATAATCCGCTCGTTCAGGAACTGATT:1 - chr2R 11273979 3' - Stalker2 7263 2 59.14 CCACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACTACGAATTAAAATGCTCCATACGTCGTAATTGTCGAAAAATCCATGGCACTATAATTACCAGCACAGCTC:1 - chr3L 15681835 3' - Copia1_DM 417 1 66.36 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCATATATCGGCTTAGAGCATTCAGTTCCATGTTCA:1 + chr2R 21199689 3' - jockey 13 1 47.62 AGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGACGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGAGATCGAGCTGTTCAATTAATGAAC:1 + chr3R 17942651 3' + Doc 238 1 81.31 TCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATAATCGCATTAGCACGTAAACCTTAGTCTATTAACAG:1 + chr3R 16194581 3' - flea 4802 2 68.18 CGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCT:1 + chr3L 23678126 3' - Osvaldo 15 2 68.89 TTCCCACGTTCAAAGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCACACGGAGACAAATGAGTTTCCTGTGTCAACGGCGCCCAAAAAACAATCAAATCGA:1 + chr3L 17635642 3' + Idefix 7065 2 53.64 GTATGTTATCTGGATTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTATGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - I-element 5124 1 28.89 AATAATACGACTTCGACTAGGACACAACCCAACACAACACAACACACCACAACACAACACCACACCACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + I-element 4937 1 39.56 AACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' + Cr1a 4024 1 50.54 AGAATCTTAATATTTGAGTTGCTGGCAGGCCAAAAAAGCGAAACTAAAATTCCAAAA:1 - chrX 10570693 3' - G4 3463 1 56.14 CAGCCACCTAAACCGCAGAGCCCTGCACAATGGATCTCTGGTCGCTGGACTTTTTGAAATGATTGATTATCGAGGA:1 - chr4 843637 3' + Chimpo 4175 1 75.00 ATTGTTATTGTTGTTATTATTGTTCGCTTATTTGTAGTTTATTTGGTTTTCACTTAGTTTAACTGTTATAATTGTAGTTCACTTAGTTGTGGCAAAGACACTAGAATAAC:1 + chrX 22898815 3' - mdg1 24 2 60.91 CTTACCAGAGGAGGGATAATAATTTTTATCATATTGTTTATCATCATTACCTTAAAATTGCAACAATTTAACATTTCCTCACCATTGTTAGTTAAGTATGTGTGTTTATT:1 - chr2L 23174338 3' + Transib5 2549 1 73.64 AACAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + gypsy7 5004 1 24.24 CTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTTGTTGACCCACCTTGCCACGCCCACTCATACGCCCAAAAACAAAAGGTAACGTTATATCTAGGACCCTAAACTCTACAG:1 - chr3R 4194139 3' + INE-1 170 1 68.52 AGTATTAAATAAATGGAATGTTTAGTAATATTTAGAAGATTTGAAGATTGAAATGGGAGAAGAAAGCAGAAGATAGGAGAGAAGGATTCCGACGTAGAGATGAAG:1 + chr3R 30368508 3' - jockey2 3260 1 65.71 GCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTTATCAAGAGTGTTTATGCAATACGTCGGCTTATTTAAATGCGACTGCAATTCATATGGC:1 - chr2L 10750084 3' - X-element 4529 1 71.74 CACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATTCCCT:2 + chr2L 22225080 3' + G5 4779 1 74.55 ATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAGTGCCACAAGAATTATTTAAAGTTTCAAAACTATGCACTATTTTTGAGCATTTTTG:1 - chrX 14827578 3' - G2 3042 1 54.21 AACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCCCAAAAACGCCGATACTCCCCCATTGTTACAGTTAC:1 + chr3R 13822055 3' + I-element 5094 1 70.75 TCTTTCCGACAAACAGCAGTGCTTTGCGGATCATTTTGCTTGACCAACCGAAAATGCTTACTATTTTCAGTCGATCATTTTTATTGGAGGTTT:1 + chr2L 22343522 3' - Tc1 482 1 61.29 CTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGATGCATGAGTAGGGTTTTTTTTTGTTGAATAAACATTGAGGGGGTATTAATTGCAGTGGATTTTCCAAGTAATCCTATTATAA:1 - chr2L 1124048 3' - mdg3 105 2 79.09 GGTTAAATGGTTTTTATTTTTTGAGTCAATAAGGTGCTTAAATACTTGGTTTATATATTAGGGTTAAGAAACTAAAGTTTGGAAAGCACATAATATCTCAGATTAGCGCA:1 + chr2R 22132422 3' - McClintock 415 2 76.36 TGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGGGGACTGTGAGGGCAGAACATACGCAATTTGTGCTGC:1 + chr2L 15185461 3' + Stalker4 7250 4 66.36 CGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTTTTCTTCAATTTCTTTAGTTGGTCCTACTTATAGACGC:1 - chrX 12015572 3' + Doc 257 1 55.70 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTACTGCATTATGTTTATCAAATCAATGCGATTA:1 - chr3R 23861081 3' + pogo 2053 1 72.73 ATTAAAGACGTACAACAATACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGATTAAATCACACCTATCTTCAACTTGAAAATAA:1 - chr2R 20527517 3' + Bica 243 2 67.27 CTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTAATATCCATATTTTATAAGATTTAAGTGTTTCGTGTTTTTATTTGTTTTGATTTCACAGAAACAT:1 + chr3L 4367440 3' - gypsy5 383 2 57.27 GAAAAATAAAAACAACAAACTGCGGCCTATCACGTCACCGCCACCCACATAGTCACACAAAGCATAATGGACACCAGATCGCTGGCGAAATGGATCTAACCCCACATT:1 - chr2L 8413441 3' + gypsy7 5016 1 62.96 CCCTAATAAGTTTATTGCTGGGAACGGACCATGGAGCTTATGCATATTTATGCCGCAAGTTGTTACATTCTC:1 - chr2L 14060022 3' - Doc 4566 1 80.56 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGACACCGGGTTCGCCTGCATTATCTTTCATA:1 - chrX 15227628 3' + hopper 1404 2 55.88 CTCTTTATTCTGGTAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAAAGGAGAAGAAGTAGGCAGAAGAAGGCAGCCCCAACGGTA:1 - chr3L 16753734 3' - Gypsy6A_LTR 175 1 56.04 TCTGTCCGTATGAACGTCTAGAACGTCTAAGGAACTAAAAACCCACGCCCACTCTAACCTTCTAACCAGCCAGCGTCTAAGCGCCAACAAATGAACCATAAAATCCAAAC:1 - chr3R 30357980 3' + INE-1 130 1 60.91 AGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGGAAGAGGCAAATGAAGAGATCTTAAAGATGTTATGATTCAAGGCCCCAAGTCCTTTCAACAATATGT:1 + chr2R 3118445 3' + Bari1 135 1 60.00 GGTGAGTTTGGGGATTGGACATAGATTTAGTATTAATATTAAGTGGTTGCGCAGGATGAGGTTTTAGGTTTAGGTTTTTAGGGCGTAGGTTTCTGGATTCAGGATTCGG:1 + chr2R 16375903 3' - TAHRE 10296 1 63.30 TAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAAGTGCGTTCGCACTCGATTAATTAGCACAT:1 - chrX 10628206 3' + G2 2911 1 67.42 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATATTTACATAGCCTGAATCTTGAAAAGCGAACCGC:1 + chrX 15043185 3' + S-element 1675 1 71.43 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACATATTTTTTTGAATAATACTTGTATTAAAATTTGAAAATAAATACTAAG:1 + chr2L 14924457 3' + mdg1 385 2 60.91 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGAT:1 - chrX 21087593 3' - mdg3 5253 1 62.50 CGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGCAAAATTCGAAGGGCCAAAGAAATGAAATCCCTGACTTATTTTTCG:1 - chr2L 17891382 3' + invader4 339 1 65.17 CCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTAGTTTTAGGCATCTAATAGAGTTCATAAAAACATGTGAAAACGTGCTATGTTATGCGTGCTATCAGATACCCGTTACTTAGCTT:1 + chr3R 29588500 3' - Transib5 2938 1 51.82 CAAATTTCACAATTCAAAGCACCTCTGATTTAGCTGACTTTGAAAGCGCTAAAAGCGTCGCGAGTGTCGAACTCAATTAATGTTAACAAA:1 - chrX 6755742 3' - transib4 179 1 75.56 AAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATCAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCCCGACTAGCCCCATCTCGCTTGCACAGGATGTGCT:1 + chr2L 19519881 3' + FB 347 1 56.47 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGGCAATGGCAAGACAATAAAATAATAATTCGGAGACCGGAAAC:1 - chr3L 12677060 3' - pogo 33 1 58.65 GTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTAGATGGTACAGTATAACAACAGACTCCAGATCACTTCGATGACAC:1 - chr2L 2384626 3' - 1360 3201 1 66.35 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTGTTAAAAAAAAAATGGCTCATGTGTAGGGCGTTGGATTTCAGAATTTTTCGTAGCATA:1 + chr3R 7874883 3' + jockey 4965 1 54.55 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATTACATCTGCAATTTTTTTTTATTAGGCGACGT:1 + chr2R 12336674 3' - pogo 14 1 65.42 GGACACACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAGACTTTTATTTGTGGCATAAATCATATTAATTAGCCACAC:1 + chr3R 9124474 3' + Chimpo 101 1 57.45 GATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTGTATTAATGGGTGGAGGCCATGGGCAGGGCTTGTTGTCTGTGTGTCAGCTTAATTTGTTCTTGCCGTTCGTTCCATGGGG:1 + chr2L 7043020 3' - I-element 5112 1 76.70 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTGTTAACTGACTTTTTTTCCCACCTGGGTAATTTCCGCTTAATTAGTGCAATGACAGGGACCAGCAGTCGTGG:1 + chr3R 10203080 3' - roo 3 2 71.29 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTT:1 - chr3L 19063467 3' + P-element 2839 1 23.33 TAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATCTTTGTATTTCGGTTTGCCTACTTTGGGG:1 + chr3R 26743233 3' - 297 6842 2 77.50 TATAAGAATATTTGTCATTGGAGTATTAATTTTGCGTCGTGTGGAAAATTGGCAGCAAGAAAGTGGGAGTGGGTTTGCCACTAATGGAGTTAACTAAACTAAA:1 + chr3R 14632951 3' + 1360 396 1 61.17 AAAATCGTCTTCTACCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAACCAGATCAACTTCTACAATAACTCCGAGATCTACCACACCTTCA:1 + chr2L 21574947 3' + 1360 3200 1 60.91 ATTTAAGTTTTATAATAAGATTGGTACACTTTTTTTAGAATTTATTATAACTACAAAATTAATTTGGTAATTAAGTATGAACATATTTGATTTGCAGTGTTCCGCATA:1 - chr2L 16222977 3' + Doc2-element 4699 1 75.00 AAACGTTTTTTCTTTTTTTTTTATTGCGATTCATGGCAGTTGGCTTGATTTAGGTCCCTTTTTTCTGGCTTTTTAAAGATAAGCAATGGAAATTT:1 - chr2L 3754094 3' - HMS-Beagle2 492 1 71.58 TATAAACACACACACACACACACACGCACACGCAACAGCGACTGTAACTTCAAAGAGCAAAAGCCCCGATTCCGTTGGCTTTATG:1 - chr2L 6813661 3' + accord 180 2 58.82 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAAGACACAAAAAAAATCTGTGTAAGCTCGCATCTGTG:1 - chr2L 9754802 3' + 1360 3371 1 57.50 CCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAAATTTACAAAATATAAGAAAAATAGCTGGAGAGATAGTGAAACACCAGCAGCG:1 + chr3R 12939622 3' + roo 466 2 57.58 TTCATGCGGAATTATGGGGAGTGTGTGAAGTGGCTGGTTTGTAGGTTTAAGTTGCATTTGCAGCACGGGGATGTTAAA:1 - chr2L 9033267 3' + Dm88 399 1 75.64 GTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGTGTGTTTCCTCTGGAGGGGAAACATGCAGGGGAGAAA:1 + chr3R 27953347 3' - G-element 4193 1 67.65 CGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTATAACTTTCAACTTAAGACAAAACACAAATGATTGATATGAAGAACGGAGTGTAAATGGTGTCACTAACTAAG:1 + chr3L 19301610 3' - McClintock 302 2 56.44 CGGCCCTAATAATTTATTCGCCTGTCAATGCGTTGTTGTCCTGCGAGTCACAATGCGCTTTCTCGCCGCTCGCACTCCTCACAAATTTGCAGCTCCTTT:1 - chr2R 5846919 3' - F-element 4545 1 80.81 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAAC:1 + chr3L 20039859 3' - Doc 43 1 59.09 TTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTGTGTTCCGGGGACAGCAGCCATTTTGTTTGGCTGATGCTGTTGATGC:1 - chrX 21183301 3' + S-element 1704 1 62.07 ATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTGCATGGGGTGAGTGTAACGAATCCATACGCCTCGATGC:1 + chr3R 13732769 3' - HeT-A 6004 2 77.06 CCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGCGGAAAAATCTGGAAAAATCCCACTACATTCGCACAGAAGT:1 - chr3R 27875519 3' + G-element 3905 1 69.01 AAATAGTATAAGCAAGTAGTTTTACACCTTCAAAAAAAAAAGAAAATACAATTATTGCAAATAACCATTTCATTTTTCAAACTTACGT:1 + chr2R 9086358 3' + Doc2-element 187 1 57.95 TTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAAAGCACTAACACTAAAGAACGGATCGGGTGCGAATAGAGAAGCCATTGCATG:1 + chr2R 24768601 3' + 1360 3283 1 65.93 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTCGATTTCAG:1 + chr2L 8476784 3' + Juan 4197 1 59.63 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAGGTGATTCGAGTTTGGA:1 + chr2R 8397498 3' - 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chr3L 7996712 3' + Doc3-element 4661 1 66.67 GGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGT:1 - chrX 10119542 3' + FB 15 1 61.82 CAAGAAATCCGAAAATGTAATTTGCCACAAATTGTCACTATATATTTTTAAGCAAAAATCAGAGGACAATAAATGCCGAATAAATAAACAAAAAAACAAAATCTAACATA:1 - chr3R 30068949 3' + TART-A 13309 1 70.00 TTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGCTGTAAAAAGCTGGAAAAAGGGAGTTATGCATTACTTTTGAACAGGGAAAAGGCGCATTCAAG:1 - chrX 12627163 3' - S-element 336 1 57.58 GAAACGCAGATCAACAACCCCGAAGCTCCCGAAGAGCAAACACCTGTAAAAGGCGCAATAACAACA:1 + chr3L 3282616 3' + Q-element 222 2 77.27 CACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATAAAGCCAAGCACACA:1 + chr3R 8947673 3' + hobo 2486 1 78.57 TGGTTGTTTTTTTTTTTCATTTTGGGCTCGTCGCAACGGATTTGA:1 - chrX 9714090 3' - gypsy7 5012 1 51.11 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGA:2 + chr2R 12416923 3' - pogo 52 1 73.64 TTTTGGGCGGTTGTAGGGCGTTAAAGTGGTCGTGGCAAAAAGTTTTTGCCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTATGCACATACATTTTTTAAATTTAAGTTCTCACTTT:1 - chr2R 5119898 3' - INE-1 344 1 60.91 ACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCATCCCAGTACCAATCGTTCCGGTTTTGTTACTTTCAGCACCCACAGTTCCATGTCGTGTGCTTC:1 + chr2R 25052969 3' + Idefix 188 1 59.09 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTC:1 - chr3L 19063464 3' + P-element 2864 1 35.29 ATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCGACTTAACCGATTTTTGTCTCGACTTTTCAGCCGAAGGCTTTCCCAAGTGCAAACGGGACGCGAACTTCGACAAATG:1 + chr3R 24526623 3' - jockey 109 1 73.64 CCAAACAGCACTGCGAATAACCCACAAAAAAGCCCCCAAAAAACCAAAATTCCTATAAACTAACCCATCTAATTGTCAACTAAACGACAAGCATT:1 + chr2L 7760817 3' - Cr1a 234 1 75.79 TCGGGGAACTCGTCTATAGCATTCTCTTTGGTTTTCTATTAGTCAAATAAATGTAGAAAGAAAGCAGATGGCCTAAACGAACACATTTATTCCCATACCCATACACGTAG:1 + chr4 1090578 3' + INE-1 569 1 59.09 AGATTCAATAAATAAAAGCAAAACGCCAGCAAACCGGGCTAAAAAACAAAAAAAAAATATATATATACGAAAGCAGAATGAAATTG:1 - chr2L 12808333 3' + F-element 4662 1 75.58 TCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAAGAGCTCTAAACAATTTAAAAGGCCTGCAAATTGCTTGAACATGGCAG:1 - chrX 14207293 3' - R1A1-element 5290 1 56.99 TTAGCGTCTATCACATTTTGCAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGAAACTAATTGCATTAACCACGTCAGCAGAAGCGCCT:1 + chr2R 10051936 3' - 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HMS-Beagle2 8 2 53.97 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGTGCTGCCATAGTCTGGAAAGCGTCTGGTTTCTCCATCTG:1 - chr2R 9138681 3' - pogo 6 1 68.18 ACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACACACACACGCACCTATTATTATTGTTTTTAGACATTTTGG:1 + chrX 13202671 3' + Tirant 8480 2 55.10 CCCACCAACACTACCTAAATCCCAAGTCATTACCAACCAACACAAACCAGCCCTTCATACACCACCACCTACTCGTGTTTTTTCATCAAAATATTCGACTCCGA:1 - chr2R 15272454 3' + I-element 4972 1 69.23 TTGCCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGCAAGTTACGGCCCTCCCCACCGAAAAAAAGGATTTCCACCCACTTCTACGAGAAGCTTAT:1 + chr3L 18387895 3' + FB 717 3 72.22 TCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCAGCAGCAACACCATCAACAGCCCCCAACAAAAAAACGGAAATACTC:1 + chr4 534784 3' + jockey 497 1 58.75 CTGAGTAGCCAAAAATGATTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTAAGTGCGCTGCTTTTAATGGCCGAAAAAGTTTTGTGAAAAGCTACAAAAATATTTGGTTC:1 - chr3R 19481756 3' + Cr1a 490 1 72.73 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGAATTTAATGAAACT:1 + chr2R 12416936 3' - pogo 24 1 55.79 AGCCAAGTCGATCTGGCCATATCCGTCTGTCCGTTTGAACGTCGAGATCTCAGAAAATGTAAGTTATCCTCTGTTAAAAGACTGATTTTAGGCCTGATTTAAGTGCATAT:1 + chr2R 15896474 3' + INE-1 105 1 56.36 AACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCATCTTTTGATATTTATTTTTTCCTCTTAGTTGCGACAATTTTAAAGTCTTTGTTGTTATCTTTTTTACATTTTTTTT:1 + chr2L 6252094 3' + Doc3-element 4514 1 78.10 GTGAGGTCCGATCGGGTTGTCAAGAATAGTGTGTTAGAGGGAGATGAAAATGTAGTGAACGGCTTTCTCATAGGGTCGAGTTCCAGAGCAAGTTC:1 + chr3R 29137584 3' + invader4 2886 2 64.21 TCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCGCTGCGTTCGAGATTGTTATTTTGTTTCGTATTTATTTTGCACGGAGAGCCTAGAGGAG:1 - 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FB 8 1 70.41 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACATTTCATGATTTTTAAGTATAAAGAGCTTAAAGATTGTACATCTTTAGTTCAT:1 + chr3L 2987435 3' - blood 32 2 52.73 AACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATGTAAATCTTAAAGTTCTTAACTAATCTAATTTTAAGTCAAGACTACGATTAGCA:1 - chr2R 8797869 3' + Doc 4648 1 58.72 ACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAACAGCGTGGAAAAATGCGACAAAAAGTGCGGAGGCGGCAATGTGTATTACTCTTCAGAGGCTA:1 - chrX 21379157 3' + I-element 111 1 73.40 TCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTTCGA:1 - chr2L 21325133 3' + invader4 3027 2 80.39 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAACACACACACAAACACA:1 + chrX 7978947 3' + 412 480 2 49.40 CAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCAACTTTCACTCGTACTTTTTTTTGAGATTTTTTTTTTCTTTTACCTAGTCAACGCGCCTGA:1 + chrX 12650402 3' + F-element 4413 1 59.63 ACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACACCTACAAGCCCATCTTAATAATAATAAAAAAGTATTAATGGTATATATGATAATACCAAAAAAAAA:1 - chr3R 13011375 3' + baggins 5402 1 64.49 TAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATTCAATTCTTCAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTGTGAAATCATCGTCGACTTGCAGATTGT:1 + chr2R 13294383 3' + rover 384 1 74.55 CATCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCCCTCGCACACACACACACACACACACACAGTAAGGAGGAGGGGCGGAAAAACGCTTT:1 + chr3R 12565770 3' - Stalker 483 1 63.04 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGTTGTCTTTTGTCTGTG:1 - chr3L 14755033 3' - P-element 52 1 22.34 ATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCCACTCACTTTACATCTTCTGTTCATTTTTGTTCCTTCCTGCTGTTTTCATTCTACGTCTTT:1 - chr3R 11129353 3' + 1360 3287 1 59.09 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACA:1 + chr4 96892 3' - 412 18 2 50.00 CGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTTTCTCGTCTTCGTTATTTTTGTCGTATTTTTTGAGTGAATTTAGGCTTTCTGTTGTGCTTCGGCAGATGTTT:1 + chr3L 15037220 3' - invader2 4799 1 72.12 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATGCAGTTCTCCTCTCA:1 - chr2R 20924208 3' + mdg1 7424 2 60.00 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAACATCGTCAAAGTGTTCGAAACAGCCACTATAAAAAAA:1 - chr3R 14139080 3' + 297 6930 2 65.14 GTTTCCGAAGCCAAACCCAATAATAACAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGATGCCAAGCACGCAAAGCCATAAAAAAGGAGGAGCACACTGAGAGAAAAT:1 + chr2R 19969817 3' + Tc1 1196 1 57.80 AATGTTTTATGTTCACTTGCTCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTTTGCTTGGCGCAGTTTCGTTTGTGGATTCGCTGATGGTTTTGGCTT:1 + chr2L 12119092 3' - I-element 458 1 65.45 GTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGAGATTTGAGTTCTGCGTTCCATTCATTTTGATTCATATTTTGTGTGTGGGTGTGCGTAGATATGGCAAAA:1 - chr2R 10463169 3' - Idefix 193 1 69.44 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTCTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACATTAATAATTTAATATTTTAAATCTCCAACTAGATATTTATCAACAAATATATAAGACATAT:1 - chrX 7080010 3' + 1360 3370 1 45.87 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGGGTTGTGGGTTTTATTGAATTACAGCAATTCGAAGTTGG:1 - chr2R 23771395 3' - Tirant 19 2 50.57 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTACACGTTGTAGCTCATGTGCGATCTTGCGTTCGTTACACTTTTCATTTGATGCGTGAAGA:1 + chr3R 18973364 3' - 1360 25 1 58.72 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTATGTACATATTTGCTCTTCGCTTATCTAAATAACTCAGATTTGCATGCCACT:1 + chrX 19187381 3' + Transpac 5217 2 64.84 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 205 1 34.34 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGA:1 - 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G6 1989 2 75.23 CACATACACTCACACACACACACTCCCAGCACGTGTGGCAAATTGCT:1 + chr2L 18267832 3' + Quasimodo 28 2 91.49 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGCACAAGTTCAATTA:1 + chr2R 8086870 3' + 1360 3379 2 66.30 TCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTTTCCTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Stalker3T 202 1 52.04 CCATAGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGACTTACAAATAAAACTTGGGTTCTTATCTCAGCTCAGAATAGCTCAATATTTGATTCTCGATTTTGG:1 + chr2L 7813922 3' + Doc3-element 4420 1 50.51 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAATGAACAAAACCAGGAATTGTGTGCGCCCTG:1 - chr3L 20139733 3' + mdg3 244 2 55.56 TGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAAGTGTCTCTTTATTTTGCACATTTTAAGTGAATGCGTTAGTCGAAAGAGCAGAGAGAAATA:1 + chr2L 13103552 3' - mdg3 252 1 60.00 GAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTGGCTGCATTCCCCCATCCCCTTGTGCACTGCCC:1 - chr2R 16030468 3' + Gypsy6A_LTR 82 1 67.74 CTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGTGAGCGTAGAGGGATCGGAGAGCGGGGGACAGTCCACTTCATTTGTGGCGAAAAAAGAGCCCCATCATTAGCCAAA:1 - chr2L 13864998 3' - GATE 73 2 56.60 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAAATACTTATTTAATTACAGCATTTAATGCATTGGAATATACATTGAATTTTTAAAAACATCT:1 - chr2L 19320435 3' + Juan 4194 1 57.27 ACGCTCTGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCACAATCAACAGGGAATTCACTGGCTGAAGACGATATTCGTCCTTTTTCCCAGCCTACAGAGCC:1 - chr2R 19513154 3' + F-element 484 1 67.02 GGATTCATCGGATCCTTTAGTTTTAAGACTAAATATAAACTAAAAGATCGTCTCATAAATAAATAAATAAATAAAGCCACCACTTAACATTTGCTTCTTATCTTGAT:1 - chr3R 13065157 3' + transib3 2397 1 59.81 ATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGAAGATGTAGGTAAGTTAATTTCGGCAGTAATTGAGTCGGA:1 - chr4 565700 3' - Doc 4480 1 64.55 GAAAAATTAACAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGAACCTTATTGAAATAAGCCGACATCAAA:1 + chr3L 12838847 3' + 1360 438 1 71.13 GCAAGGAGCGCTGGTAGTATCAGGATGTGTCGGTTTAATCCGGCTTGAAGGACCACCTTTTAACTTTTCTCTTC:1 + chr3R 27683319 3' - Max-element 346 1 71.62 GCGAATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTGCGTGGAAAGTGTTGACCCTTAAAGCTGTCTAATTGTCATTCGGTGAAGAAATTCTTTGTTTCGTTCTATACGTGACA:1 + chr3L 170729 3' - Quasimodo 400 2 50.00 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCAATTAGCAGCGATTATAGCAGCAGCATTTTAGCAAA:1 + chr3R 29635263 3' - mdg1 7063 2 62.79 AAAAATTTGATATTCATCAAACAACAGAATAATGCGAACCATTTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTTACTTTTTTTACTTTTTTTTTTTACTTTTTTTTTGGTAATTTT:1 + chrX 3772355 3' - Tc1-2 254 1 59.09 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATAATCCACTAGCAGTTCGTTG:1 - chr2R 19405888 3' - HMS-Beagle 13 2 62.22 TAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACCGCCGCATGCAGGTGAAAAACTATTTGGCTATTGGGGTTACCTTAATGAAATACGTG:1 - chr2L 18245814 3' - Doc 30 1 51.92 GAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATTCTTCATCCTCTGATGAGGACGATGAGGA:1 - chrX 2241178 3' + Stalker3T 202 1 31.82 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATGTATTAACTCCATTATGGCCAAGACAATCAAGCTA:1 - chr3L 2965854 3' + 297 6931 2 70.91 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGCCCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGGGTTTTCAGTTGCTATCGACCTCCATGGCGATCAAGTCGCATC:1 - chr3L 16496197 3' - P-element 33 1 45.10 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGTTTATTTGGAATTCAAGTTTTAATGTTCTTCAATATTAGTAATTAGCCATTAGTGGCTTAATTTCA:1 + chr2L 3138403 3' + copia 237 1 63.30 CGAAGACTGTTGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAACGCACTGATACTTCCCGTATAATTTAGTTATCCTATTTGG:1 + chr3L 20039898 3' - Doc 4 1 71.82 ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTAAAATTACCCCCGCTTTTAAATCAACTAATATGTTTATTCAATCTAATTTCTCTCGGGACATTATTCG:1 + chr3R 17777685 3' + Burdock 6384 2 73.33 TGTTAAGTCTCTCGCAAACCTGTTCGGATGGGCACGTAGTTTGTTGCGATATTTTTCCTCCTTGCTATTTTGTCTTCTCGCTGAAATATTACTTACCCGGGCGAAAATA:1 + chr2L 15086463 3' - Fw2 3760 1 57.80 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATATATTTATTATTTAGTATAACCAGGTATCATGTAGTCGAAAAACTCAATATTTCCGCTAG:1 + chr2L 16230396 3' - blood 23 2 60.00 GTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACTCTTTCAATAAACATGTTTCATATTTTTATTTATTATATAAATTTTTATTTTCTA:1 + chrX 6193415 3' + 1360 472 1 87.06 AAAAACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACATATGCAAATGTCTCGAGCACCTGCTAACAACATTCACTAGCAGGCAGTCCACACATACATACGTATGT:1 + chr2L 12769139 3' + Porto1 4448 1 65.45 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAAAATTGGATTTCGCAAATTTCCATT:1 - chr3L 13160667 3' - pogo 57 1 79.09 TTACCTTCAGAGATCACGTTTTTAATCAAATTTCTTTTTTCAAGATGTTTGGTATTTTAAAATACTCTTGAGTGTTCTGTAACGTCTGTTTTCGCGTTTTTTTAAAAGAC:1 - chr2R 1523090 3' - Tc1 405 1 62.73 TTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTCTCCCCCTACCAAATTTCGCCGCAGGCTGACAATATTGTTT:1 - chr3L 4999509 3' + roo 417 1 67.42 GTTGAAAATTTTTTCAAACACCTACATGTTGACACAACTTACTTCGCTTGATAGTATCTTACTATCTTTATAAACTTCACCGTTCTCAAATCGGTTCTTTATTTCCTGAG:1 - chr4 1189579 3' + hopper 1035 1 70.91 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATATTTTTTTAAGAAACTGTATTATAGTACAG:1 + chr2L 14848452 3' + pogo 2050 1 75.45 AATGTATGTATGTATTACAATGTATTACAATGTATGTATTACAATGAATGTAATTCCTATTAGAGGAAGAAAAATATCGATCATAATCATTAGCCGTATTCGTATCCTG:1 - chr2L 10867592 3' - ZAM 264 2 48.62 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTT:1 - chr3R 15697051 3' - 3S18 5817 2 69.44 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTGGATTTTTCTT:1 + chr3L 3555511 3' - 412 7096 2 62.39 GAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTTGGTGGGCTGTCATTACGCGTAAGCGA:1 - chr2L 19692386 3' - Doc 343 1 75.45 TCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCCATTTTTAGATTTTTTTACGCTCTCCGCTCTCCCGCTCTCTCGCTCTC:1 + chr3R 24565866 3' + 1360 3239 1 71.26 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATATATATTTGTGTATTTCTGGTTTAGTA:1 - chr2R 19692426 3' + Transpac 5194 2 76.34 TCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGGACAAGGTTTGATAACAGGGAGCGAGAGAAGTAGGC:1 - chr3L 15365050 3' - Idefix 7123 2 66.32 GAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCGATGTGG:1 - chrX 17193327 3' - F-element 189 1 62.73 AGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGTTACTGCTTTTCCTTTCCCGGCAGCACTGGTTGACTTAATTGATTAGAGCA:1 + chr2R 22314411 3' - flea 4969 2 57.27 AATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGATTAAAACTGATTGATGAATCAAAACTTCTCGAATGAAAAGGTAATTAAATAAAAATTGTAATTCTGTGTTCGAGA:1 + chr2R 14623992 3' + flea 267 1 69.09 TTCAAATGATCAGTTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAACTAAAGTCAAAAGCAACAAGAATTTTACACGACTTGAACGAAGATATTGGAG:1 + chrX 18159408 3' + HMS-Beagle2 7142 2 54.64 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACACATCATATCCTTATCCACTCAAAACTTTTCTAACTTTAAATTAAATTAAGAAGTTA:1 - chr3R 12039919 3' - 412 28 2 55.45 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGCTCGGGGCAGCTCTTAAGAGCTAGGAAA:1 - chr2R 22775001 3' - jockey 4716 1 89.41 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTATGATAATTTTGATTCCTCCGAACCTTAAATTACTATTTATTTATTGCGAAAAATGATTTG:1 + chrX 8808828 3' - roo 8680 2 63.55 GTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACAGTCTTTTGAAGATCCTTATCACCGCTGCAATCCACACACATCGCCGGATGCACAGAGAGAAATGCCTC:1 - chr3L 7552782 3' + HeT-A 6052 2 49.00 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCGCAGAGCCCTA:1 - chr2L 16742248 3' - 412 36 2 63.00 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGTGTCCCGTAAGGGATTCCGTGTGGACCAGGCACT:1 + chrX 9432890 3' + roo 9024 2 65.14 TACAATATTACTGCTCGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGGAAAAATAGAGGAGGAAAGCCGCACGGGAAAAGGAAAATATTTGCTCATAGAAGCCAGCAAGCCG:1 + chr2L 19618983 3' - Dm88 4501 2 60.91 AAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCACACTGCAAATAGGGGGCGTGGCAGAAGAAAAAAAAACGATAGAAGGAGATGAG:1 + chr3L 9664843 3' + Doc 4536 1 65.88 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTGTAATAGTTTT:1 - chr3L 7219691 3' + roo 9050 2 56.00 TATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCT:2 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 70.00 AACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGAGGGGCAAGCTGAAAGTGCTGGCTATAAAATG:1 - chr3R 28633306 3' + jockey 4637 1 65.22 TCTGTGTTATCTGCGTGTCGATCGTCTATTACTCTCTCACAAGGTCCAGCTCAGCTGATCAATCGGAAAAGGAAAAAGCTAAGAATTCACAATGATTCA:1 + chr2L 5978158 3' + McClintock 6099 2 67.68 CTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAGACCTTGAATCGAAACATTTGCCAAAATAGGCCAACCTTCGATTTGAAACATAGTAATTTGACCGATATGATAC:1 - chr3L 15525594 3' + Ivk 5370 1 71.82 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAGACCTTGAATCGAAACATTTGCCAAAATAGGCCAACCTTCGATTTGAAACATAGTACTTTGA:1 - chr3L 15525606 3' + Ivk 5361 1 60.75 GCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGAGAGCTCGGGATCAACCTTTCCACAGCGTAG:1 + chr3R 18300979 3' + F-element 245 1 67.74 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAACCTGTCAAAGATATTGGGGCCCTGGACGCAGACTCTC:1 + chrX 15137191 3' + jockey 4951 1 66.36 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACATGAGCCATAAATTTATCTCCAGAATGAGCATCGGATACAGG:1 - chr3R 7874826 3' - jockey 4671 1 62.86 ATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTTCTTTGCTGTTGCCGATTTT:1 + chr3R 25351951 3' + 1360 395 1 77.53 GTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTTTTGGTTACATTTACCTTTCACATTTTTGTGGGCCATTAACAATTAGCTACAACTACAATTAG:1 - chr3R 22683533 3' - accord 6978 2 70.97 CATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTGTTGTTTGCATGTTTGTTGGCCATTAATGAGCGCTGTTTCCCCCATTTCATTC:1 + chrX 8540936 3' - micropia 5007 4 51.82 ACAAAAAAATTAAAATTAAAATTATGAAAAGGACCTACTTAGAAACATTAAAATTCTACTATAAATTTCTTTCCTATCCTGAATACATCCTCATCCTCAAGAAATGCGGT:1 + chr3R 16818470 3' + P-element 2636 1 81.82 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGGTTAAAGGTGGGCGGATGTTTCACTCGAGGAACGCAGAAAGGAAGTCTAAAAAA:1 - chr2L 1291023 3' - 412 11 2 62.64 CAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGGCGCTGTACTTCTTCATCAGCTCGCCCAGCTCCT:1 + chr3R 16070727 3' - Bari1 259 1 67.78 TTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTATTCTAT:1 - chr3R 6937617 3' - F-element 159 1 56.32 GTAGCCACTCTCTGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACATCAATTTAAATACACTTTAAAAACA:1 - chr3R 10705029 3' + Tirant 249 2 76.15 TTATACCACAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAAAGCTAACCATTCTCATTCACCCAATTCACCTTGACCACCACAATCAATATACTAACCAAAAGTTGTA:1 + chrX 5379423 3' + I-element 5178 1 67.27 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGATCCAGCCGAACGCCA:1 - chrX 20330556 3' + P-element 2877 2 45.61 TTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTACTCACATTTCCTCAAGCACCAATTAGCCATCTGAGTTATGGCTC:1 - chr3R 22595811 3' - FB 6 1 64.47 TAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTG:1 + chr2R 6984375 3' + HMS-Beagle2 255 2 80.37 CTCCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGCGATTTAACAACAAAATGTTCAAGTCTGATCGAGTACCGCACACAATCTTGTTTGCATTTCCCACCCTAATGGCCATATAATC:1 + chr3R 10520380 3' + transib2 2730 1 53.64 GCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGCAAAGCAATTAAACCCATGCCCTTCTCAATCCAAATCCA:1 + chr3L 18261796 3' + F-element 4290 1 64.55 TGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATCCTCAATATCCGATGAATTACAATCACTTGACATACAATTCTCAATTTAACCCACCGTTGCT:1 + chrX 7653850 3' + INE-1 31 1 58.72 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTATCAA:1 + chrX 12271520 3' + pogo 2057 1 78.26 TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATAAGCTTCTTTTGGGAAATC:1 - chr2R 23354280 3' - Tabor 6877 2 58.18 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTCTTTTTTATATAATCTTAATATTGTTAGTGTTGTTCTTAGTTTGATGTGTTTTTGTGTTTGATG:2 + chrX 22252864 3' + flea 240 2 68.18 TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCTCAATAAAATATACCAAGTACTCTACTCTTATTTAAATTAATACATATTTGTAAGCATTTATTATATGTTTTACA:1 + chr3R 12040034 3' + 412 7538 2 71.82 CAACACAAAACAGCATTGCGAACAACGCAAGAAAGATAGAGTAAACAAGACACACACATGCGTACACAGGAGCGCTTATCGCACTAAAGTCTAAACTTTTGTTTAC:1 + chr2R 14693332 3' - Cr1a 239 1 55.66 GTACCTACGCAGCGAAAGCATCCATAGAGACCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATCCAGATGAAAAAAAGAATTCTTCACAGTTCGCTGACAGAACCTGTTTAAA:1 + chrX 18938385 3' + Doc2-element 4467 1 68.18 TGCGTAGAAAAGAGCTGTTTGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCACCACGCCTTCATTCAGCATCATTCGATTCGAT:1 + chrX 13642045 3' - 1360 134 1 58.75 GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGATTGGTTAGTCAAACGTTTGTTACATT:1 + chr3R 22500869 3' - invader3 18 2 51.25 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTATATACGAACCACATGCTGTAATCTAATAACCCTTAAAATTATTTTTAACCGCAGACTGCAATTAGT:1 - chr3R 25434722 3' + opus 7488 2 69.09 ATACTCTATGCATAACATGTTCTAATACTTAATACCTGTCCGGGAGATCTAGCACGCGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTACATATTTTGGATCTCTA:1 - chr2L 8776842 3' - G4 3735 1 89.09 CGCATCTTGTTTTTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGCGTTCCGAACAAGTTGTTTAT:1 - chr2R 7981140 3' - 1360 5 2 64.29 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACACA:1 - chr2L 9147975 3' - Doc 30 1 65.48 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTATAGTTTCATAATATATGCACACATGTACATCTGACAGCGTTTTATCGGTGCGGTAAGCAATTTTCTGAATAATTAAGGTG:1 + chr3L 2121060 3' - I-element 12 1 66.36 GGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGAGGAGATTAAATGAATGTGAGAACCTGGAATTGTAAACTTGATACGGGAGACTGGGTG:1 + chr2L 12427126 3' + Bica 26 1 68.13 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGACGAATAGACCAACTGCCGCTGTGTTTCTTTATTTTCTTTTTGCCCTGGCTTAAATATCTTCTGCG:1 + chr3L 21103500 3' - Doc 22 1 59.00 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAG:1 + chr2L 21034108 3' - 412 54 2 70.00 TGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTGTCTATTGTCTATTGTCTATTGTATATTGTCTAT:1 - chr3L 11230458 3' + S-element 1505 1 70.97 TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATATCGTTGAAACATTATAATACCCCATATAATCCACTAGCA:1 - chr2R 19405896 3' - HMS-Beagle 6835 2 61.11 ACTAGGGCCAAGAAATCTACAGCCCAACTGAAGGAAGTTCTCGCCCAAATAGGGTCAGCCGATGGCGGCCAGTGGGACATGCTGGTCAATCTGGT:1 + chrX 8439646 3' + springer 7049 1 71.58 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTCGACACTATGTATCGGGCGTGAATCATGCCGTACAGCTTTTCCTCATCTCCGGAGACACAGTCCATAGA:1 + chrY 975927 3' - 1360 17 1 64.55 CATACACGCACACACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Stalker 441 1 55.00 GATGGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTATCCAAGGACAGCTACAACAAAGGTAAAAATAATGCAAACAATTGCAAACATATCGAG:1 + chrX 16291105 3' + Dm88 4210 1 55.45 GATGATATTCTCATAATTGTTATAATGTTAATTGTTATATTTTTTTCTGCCCTAAGTAAATAGGGCCATAGAAATTTTGGGCCTGTGAG:1 + chrX 12750050 3' + BS3 1620 1 60.67 TAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAATTGAACCTAGTTTTAGTTTATTA:1 + chr3R 6763677 3' - F-element 4462 1 56.36 TCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCAACATAACACCAATGATTTATTAGAATTTTCACTAAT:1 + chr2R 15373252 3' - 1360 75 1 92.73 TTGTCCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGTTGTTGTTTTTTTTTACCTCATTCTGAAGCACATGCACCTGGAAGTTTTTGCATATTTTTCAATATAGAAATGTGTTGTGCTCA:1 - chr2R 18386154 3' + Cr1a 229 1 61.82 ACCCTCTTTCATGACTTCTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCCTGGCTCCCCCCTTTTTT:1 + chr2L 3382693 3' - 1731 4149 1 78.08 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACGAGGCCTAG:1 + chr2L 6243738 3' - 412 36 2 54.55 AGAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAGAAGAAACGAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAATAAAAGA:1 + chr3L 3992028 3' + mdg3 5102 1 44.55 CAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATATATTTCTTTTTCTTCGGGGGCGCCAAGCCAAA:1 + chr2L 7088381 3' - rover 28 2 69.15 CAAAGAATCTCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGAAACTGGTCAAAAGAGCGAGAAAACAAAAAAAGAACTGAAATCAGAAATCGACGACAATAAGA:1 + chr3R 11937589 3' + Bica 481 1 57.27 CATAGACATAGACATAAACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAAACATAAACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACA:1 - chr3R 22316301 3' - 412 75 2 29.09 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGGAAAAATATAAAAACAAAATAAACTTTAATAGTTTTAATAATCTAAAAATTTAAT:1 - chrX 18021032 3' - Doc 12 1 49.44 AAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAGAGCGCAAAAACAAATAAATTAAGTAGGCGTTAAAATAGTTCATATTTCATTTGGCCTCCGGTTCTGTGGAAAAGCCCAATCG:1 + chr3R 30713558 3' + Porto1 4305 1 79.09 TCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGACACCCATAAATTAAATTAAATCTATTTCATTGCTGAAAAACACTTTGAAACTAATTAACA:1 - chr3L 14290227 3' + Idefix 7017 2 65.93 GCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATTGAAAAACTTGCTGCAAGTATAAGCGCAAAG:1 - chr2R 13241645 3' - 297 396 1 74.29 TAAAAATGGGCAAACGATTCTATTTTTCCGTGCCCAGCTTCTTTGAGATGAGCACTTTCTGCAGCTGTCCAGATTCGATCTCGGATTCGTCCACTCATATTAGAATATCA:1 - chr3R 31822273 3' - FB 51 1 53.64 TACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTGTGCTCCTTCATTCAGAAA:1 + chr2R 18807881 3' + BS 5060 1 68.18 AGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTACGACGACGTGACCGCCTCGGAATTCGCAACAATTGTGAAACCCATG:1 + chr3L 19835424 3' + 1731 4443 1 57.27 ATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTCACTCCCTACCTGTGCGCTCTTGTTCTGCTTTTCCTCG:1 + chrX 13495565 3' + Max-element 263 2 60.64 ATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACCCAACCTAACGACCCATTACCATTTTTAGATGATTTGGT:1 + chrX 6897364 3' + I-element 5029 1 69.09 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCGAAGAAACCGAAAAACACGAAAACTAAAA:1 - chrX 14853393 3' - P-element 52 1 31.82 CGACGGGACCACCTTCTGTTATTTCATCATGAGCTGGCGTATCAGGGGCGTGGCTAAAACGAATCATTTGCTGTTAAA:1 + chr3L 19063505 3' + P-element 2877 2 55.13 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACAATTTGATCAAAATCTATTTAGTTCAATCAAAAT:1 - chr2L 14848381 3' - pogo 27 1 54.29 AGTAAAAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGATTGAATATGCGGGCGGTCGAAGAGTTGGGGATAGAGAAAGAGAAAGGG:1 - chr2L 7125531 3' - pogo 269 1 62.20 AGATAAGATAAGATAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATA:1 - chr2R 5064833 3' + Stalker3T 204 1 24.55 GCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCACTTGGTGTTCGAGTTTATTTTCGATCTGCAG:1 + chr2R 15499275 3' + Ivk 4949 1 70.00 CTGTACTGCCTCTCTGCTGAACAACCGTTCAGGGGGGCCGGCGGAGAATATCGATAG:1 - chrX 9060950 3' + 3S18 5723 1 71.93 AACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTAATTTCATTATAAAAGTTTACATTACCATCGACGATGGCCGGCAAACAAAGGCCGAAA:1 - chr3R 13820951 3' + Tabor 7224 2 60.75 AGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCTGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGATTTATGCTTTTAAAGCCATTGAAACTTTTCCAAG:1 + chr2L 12674907 3' - 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chr3R 23861036 3' + pogo 2099 1 77.06 CAAACATGGGCAGAAAATGGACAAACGATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAACTTATGTGATGCAGCTCACGTT:1 + chr3L 27987607 3' - FB 62 1 77.27 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTATGCTAGTCGACAGTCGCCA:1 + chr3L 9198495 3' - 1360 64 1 82.73 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - blood 7017 2 27.27 TCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTAGGCAACAGTACATTGTTACCATTCTAATGTGCATATAACTTACGAGTTAT:1 + chr3L 18687620 3' - F-element 4319 1 48.94 AATTTTATTTTAATTATTTAAAAAACCTTCCTGGTATCAGTGCATTTTATAAAATCTATCTCTGATGATAAATTTCTTTCTAGAACCCTTTTTAAATTTTTTTGTCTAAT:1 - chr3L 6462282 3' - G7 1146 1 67.27 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGACATATATACAGGCACCTATAGCCGACCGATATCGGC:1 + chr3L 17530202 3' - Tirant 8113 2 63.24 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACGGTATAACCTGTATGTTTAATAAATGAAT:1 + chrX 4789203 3' - opus 7039 4 69.70 CTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCATTGAACGTTGTAGCCAGACTTCTAATGGGAGTGAGATACATG:1 - chrX 14592825 3' - Idefix 7124 2 69.09 AGATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTAAAGTCTAATACACTGTATAAATGCCAGAATTTTTTTGTAGAACTAGAATTAGGTACTTAAAAACCAAACA:1 - chrX 18212610 3' - baggins 5387 1 69.44 TATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGAACTCGCACTTTAAGGGCTTCTCCTGTTTCTCCTCTCTTTACTTTTT:1 + chrX 526282 3' + Stalker 6955 4 65.91 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATACACAAGTGTGTGTGGTGATATGCG:1 + chr3L 17220738 3' + opus 7467 2 72.41 GTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAACCGGAAACATTCGCCCTGCTCTAAATATGTAAATAACGAACTTTCGAGAATGCGGC:1 - chr3L 5130676 3' + gypsy5 7241 2 53.21 TTTTTTATTTTGCTTTTTTTTACATTTTCATTTTGGCCAAAACTTTTATGAATATACACTTTTAAATGGCAATGTACAGTTTTTTCCATTATTATGGAAGGTATTTGGG:1 + chr2L 15561895 3' - Doc2-element 253 1 69.72 TTTCGGCCCGCACATCGTCTTCTAGCCCAACACACACACGCACACACACTCGCAG:1 - chrX 12258305 3' + 1360 3190 1 60.00 ATATAAAGTAATTTTTAAAAGTTGTTTTCAAATTAAATAATATAATAATGTGATCAGATAATAGCATCCTTCTTTACTGAGTGTTCACTGTGATCGAATTCACATGAAAG:1 + chr3L 3787084 3' - 1360 377 1 90.00 TTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACTAGTTGCTTGTTCTTCCCTTTATCAAACCTACACACACAATTCTTCCTTCACAAAAAA:1 + chrX 18038830 3' + FB 734 2 58.18 TTTTTATAAAATATAATTAAAAAATATTTAGTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAAGAAAATCCACTAAAATCGTCACTGTTTGTTACGTGGGAAGTTGGGTAG:1 + chr3R 26034063 3' + S-element 97 2 60.00 AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATAGCGTACTTGTATTTATCCACTGCTCGTGTGTAAGAAGTGGGCGTGGGACTGACCAA:1 - chrX 8321568 3' - mdg3 5337 2 62.11 TACTGTTGCAGCTCCAACGCGCACCGTGCTATCCTGCCGGAAGGACTTTCGGTGATATTCAGCAATTTTAGATCCATA:1 - chr2L 12584823 3' - Osvaldo 174 1 55.13 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGTTAACACTTTTCCGCGGTGAACAGGTTAACTGACACGATCCGCGT:1 + chrX 22093358 3' + transib2 2791 1 55.56 AATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTACTCACAATCACACACACACAGGCAAACTAGCACACTCATAATTGTATATTTTTTTGT:1 - chrX 17076804 3' + F-element 251 1 68.13 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTAAAAACTAATGTGACGAAAGGCTCCGCAGATAAAGCGGT:2 - chrX 15043114 3' - S-element 37 2 64.55 AATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATACTTTGATTAATATGTTTTCTTTAGAGCCAGCGATATTTTATAAATACTTTTTACATTGCAGAGGCCAGGGCAATGATTGTG:1 - chr3R 7084748 3' - hopper 1180 1 76.36 CACACACACACACACACAGATTATACAATGCGAATCGGATGAAACTGTGCCTTGTCAAACCCGCCACCGCAGAAACTACACGCCTCTTTGCCTC:1 + chr3L 10594906 3' + gypsy3 425 3 51.06 AATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGCGGTAGGTTAATGAACCTCAAATGAGGCAATTGTTGTGTGTCAGATATGATGGGATCTTTTATGTATTTTTAGGTGAGATGAGAT:1 - chr3L 15747587 3' - hopper 1069 1 56.88 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATATATCTTATTAAAGCTAGAAAACTATTTTCTTATAGGA:1 - chr2L 16230312 3' + blood 348 2 60.00 TGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTTATTCAAAAAAAAAACCAATCGAATGCGCTAAAATGGGAGTAGTGCGAGTGGCGAGGACGAGG:1 + chrX 823565 3' + Stalker4 311 4 64.44 AGAAAGAAAAGACAGCACACATAAGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGGCGGGACCCATCGTTGTTGTGTAAACTAGAA:1 - chr2R 9364017 3' + Osvaldo 1448 1 64.56 TCACTAGAAACTATATACCCCCTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCACTGCTCAGTTTATTTATTTTCCATGAACATCTCGATATTTTGTTTT:1 + chr3R 11071381 3' + Cr1a 4122 1 57.27 AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTTATTGTTATTGTTATATGGCTATTGGTAGTGCTGTTGCCCGTATCGCCGACTTTCCGC:1 + chrX 13321420 3' - 1360 35 1 65.38 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACACTGATTTTCGTTCAAAAAATAAACGGTCTTTTGTTCATAAAAATATAAATAAATATCCAAT:1 - chr2L 9120137 3' - mdg1 23 2 58.18 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGACACATATACAGGCACCTAT:1 + chr3L 17530185 3' - Tirant 8112 2 68.00 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTTACCAATCTTGTTAACTGCGGCCAGCCCCTGTTCCACATTGGTCACACAACCTCGGGCGAAG:1 + chr2R 7981221 3' + 1360 3386 2 71.11 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCTAACCACAAAAGCGTTGGAAAAAAAAATCGAAAATAAAAGTGGGTGAACAGCAAAGAAAGTAAGCAACAACAATGGGAG:1 + chrX 7802851 3' - hobo 6 1 73.64 CATTTCCATATACATACATATACATATACATCTCCATATACATTACATATCGCAGGCCATAGCAATGCCATTGCTTACTCACTTTCAGCTGTCTTCAATACTGTTTGCTC:1 - chr2R 7255530 3' + ZAM 190 2 62.73 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCCAAACCGAAACCTCGAACCGCCAAACCGCAAAGCTGTCAGCGTCGATTTTAATAAGCCTAATTAATAGCACACCGCA:1 + chr3R 24497424 3' + hopper 1408 2 77.27 AATCGAAATTAATATTAAATTACATATATGGTTCAAGTTTATTAAGAAATGATTAGAAATTTAAACATTGGTATATTGGTATATCCCTTTTGCCAGCTAAATTCACTTTC:1 + chr3L 14480895 3' - Rt1b 129 1 60.91 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGTTTG:1 + chr3L 13228559 3' - P-element 17 1 62.38 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATATATCTTATTAAAGCTAGAAAACTATTTTCT:1 - chr2L 16230319 3' + blood 7341 2 71.03 AGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGTAGCGTTACATCGTATTCCTGGGCAGCGATGTGGGCGATTTCCGGCTGT:1 - chrX 8566293 3' - Stalker4 7149 4 63.83 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATAATATGATAGATTTGATTTGCAATCAGCTGAGCTTA:1 - chr3R 17777593 3' - Burdock 48 2 69.09 CTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGCTTATTCTGAAATTCCCCGGTGGCGAAATCGACTCAAACGAACTTTTAGAGGAAATA:1 + chrX 16560672 3' + S-element 1699 1 63.81 AAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAAAATCAACCACAAAGAGAAAATGAAAAACTCAACAACAAAAACAACAAGTGCGAACTAGACGAACTACCGTCACCGAAC:1 + chr2L 21253858 3' + I-element 71 1 70.00 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGCAGGGTAAAAAAAGTTGGCAGAAGGTTTAGTTTTACCTGGCTTAG:1 - chr3R 23620985 3' - roo 8679 2 59.09 AACTGAATAGGTTTAAAAAATCTTTCTCACATTTTGTTCTATACCTAATCCTTGGTCTCTATTTATGTTTTTACACTTGGGTCATTTACTAAAATTTGTTTGTACAAGGT:1 - chr3R 32016384 3' + Tc3 12 1 68.18 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTGTTAACTGACTTTTTTTCCCACCTGGGTAATTTCCGCTTAATTAGTGCAATGACAG:1 + chr3R 10203064 3' - roo 24 2 54.72 GTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGACTCCAAAAAGGCCACATCGTTCTCATCCCGTAAAAAGTGGAGCATAAAGTTGTTCTCCGTCTCAAT:1 - chr2L 233282 3' + copia 138 2 67.27 GAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGCTCTTTTCACAGCTCCCAATTCCAA:1 + chr2R 10545427 3' - 1360 3238 1 72.83 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTACACAAGTCCGCTCTACGTTCACATTTTTCTTTTTAATAGGAAAAACACGTCTTCAGT:1 - chr3L 14822836 3' + mdg1 7426 2 51.82 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGGGCTAATTCAAT:1 + chrX 8364731 3' + jockey 4948 1 66.97 CCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATGGATGTGGATGCGGACGTG:1 - chr2R 17496873 3' + Quasimodo 6994 2 69.35 TAATAAAATAAAGAAAATTATAATTAATGTGCGCCCACTAAATTGAAAACAGCGCCAGAGCAAACACCCATATACAAAAAAAGAAAATAAGGAGGACTAA:1 - chr3R 22909924 3' + TAHRE 34 1 57.00 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTACCGACGGCAAAGCAAAAAAAAAAAGGATTTGCAATACCGACTATTTCATAGTTAATTT:1 - chr3R 6966414 3' + pogo 2080 1 58.18 CATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAACAAAATAATTACGAGTGCGAGTGGTGGGGANTTTACAATTTTACAAGTT:1 - chr2L 3118610 3' - 1360 3141 1 60.00 TGTATTTATATAAAATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAACAAGTGATAAATGTGAAAATTGCTAAACAATGCTAACTGAATGTGAGAATTTTGTATAAAAT:1 - chr2R 9434839 3' + Bari1 1402 1 62.73 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTAATCAGTTTGCAGTGACAGAGGAGTTCAGTTTCAGTTGACTCGGCTT:1 + chr3R 5671464 3' + 1360 3383 2 65.82 GATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGAAATAAAGGTACTTAAGATTGCTCAATTGGGCTAGTTCGAAAAAAAAGATAGT:1 - chrX 1833672 3' - G2 91 1 58.72 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTCGCATCGTTTCAGCCGAAAAATACCGAAGCATGCTGAAACTTCGAAAAATACCGCAAGCGAGA:1 - chr2L 20797639 3' - P-element 20 1 63.64 GAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGCGTTTGTGTTGGGGGAAAAAGCGAGAAACAGAAACTTGTT:1 + chr3L 10898492 3' + FB 22 1 40.21 TATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACATGTTTAATGGTAACCATGGTCGCAAGACCACTTCCTTGGACTTTTTACAGTGG:1 - chr3R 13298162 3' + I-element 5346 1 62.22 GTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTTGCTAGGATTCCCTCCACACACACACACACACACACACC:1 + chrX 17971843 3' - 412 7265 2 58.95 AATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATACAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCCACTGTGACGACGCGACGTTGAAATTAAGTTAACTAGACTAGAG:1 + chr3L 672077 3' - 1360 3376 1 60.00 AAACGCTTCCTTCTGCCTGTCAACGAATCTAGTATAATGAGCTCCGATTCTTACAGCCAATGGTTTGTCCCCACATGTCTTGCTCGTTTTTGAATCCGACCTATTTATTA:1 - chr2R 18118657 3' - INE-1 33 1 46.36 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTGCGGCCAGACTGTGACACAATCACATGACAGAGCGTATTCTCATACGTGTCCTACCTTTATATGTATCCGACTGTGTCT:1 + chrX 1672853 3' - accord 185 3 69.09 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTACACAAGTCCGCTCTACGTTCACATTTTTCTTTT:1 - chr3L 14822860 3' + mdg1 365 2 73.39 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGGTTAAAGGTGGGCGGATGTT:1 - chr2L 1291057 3' - 412 7097 2 76.67 ATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTGAAGGATGTAAGTACTGTGGAGTATCTTTCAAATGGGACTTGT:1 + chr2R 19405991 3' + HMS-Beagle 7026 2 68.18 TATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTACACATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - Doc 4315 1 70.83 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACACAGCACACACG:1 + chrX 9845529 3' - F-element 58 1 69.09 TTCTTGGATCCAACTTTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTTTTGTGTGTTTTTTGCTGTTTATAGGGGGTAAGGTAACCGATCG:1 - chr3R 25496721 3' - Porto1 4504 1 78.70 ATATTACACATATTACACAAAATCCCCGGGGTCAAGCTGGCTTGCAGCGTTGATTGCAGCCG:1 - chr3R 14349421 3' + 1360 2929 1 80.65 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCCTATCTACTCGTCCCCATTCTCTCTTTATTTTCTGTGAAAAGC:1 - chr3L 10722960 3' - copia 4909 2 60.00 CCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTACTGAGGTTTGTTGTTTCCGTTGCTTTGTTGCATTTGACATTATGCGCATTAA:1 - chr2R 10380366 3' + roo 8713 2 55.05 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTCCATAATATGATCTGAAATTAACTACCTTTGAGATGCAAATTGGTAAACTTAGTT:1 + chr2L 7750627 3' + opus 483 2 54.35 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATACCGTTAGTCGA:1 - chr2R 981622 3' + 1360 3380 2 60.91 CTCTGATTAGACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAACGGGTGGGCAAATGACCTAAGACCTTTACACATTGGCAG:1 + chr3R 30813377 3' - FB 283 1 73.15 TACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTTTGTTGTTTGTCGC:1 + chrX 18004777 3' - F-element 4350 1 78.46 CCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTGTGTGTGAGTGAGCGTGTGTGTG:1 + chrX 992166 3' + hobo 2587 1 74.16 ATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTTAATTAACAGTCAACTCAGGTAACGCCTTCGAAACCACTCAACTCAGGTAGCCTTCTCTCGCTCGCTCA:1 + chr2L 3539025 3' + blood 96 2 78.35 AAGTGTAAATAAAACAAAGGAAACAAACAAAATCAAGTACAAACTGCTTCACAGGCGACCCAGTGACTTCGATTCGGGCCTACGGAATAATAGCACTAAAAGAAACCACA:1 - chrX 8583014 3' - accord2 7265 1 52.73 CAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTTTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTTGCGTC:1 - chr2R 6526148 3' - jockey2 3183 1 50.00 ACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGACAACTTTGAGTGGCATAAACCCA:1 + chr2L 20841996 3' + G6 2008 1 65.45 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATCGAGAGTTCTGAAAGTGGTTTAAAATCAAATAAAATAAATTAATTGGAAAAATCCAGTGTACAA:1 + chr3L 18505757 3' - jockey 31 1 60.00 CTCAATATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACTGAA:1 + chr2R 4402686 3' + 1360 489 1 59.09 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + 412 450 2 71.28 TACAAAAAAAAATAAAAAATAAATGGGGGAAAAAACTCATAATGAGGCGTTAGAAGTAAACCGAGAAAGAACTAGAAAACAATCCATTAATGGAGGTAAAATCGGAATAA:1 + chr2L 3783320 3' + G2 3075 1 65.45 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACACGAAAACTTTTATTGTTTTCTTAAAGCCATTGTGGCATTTGTTCTAATTCTCTTGCT:1 + chr2R 8530858 3' + mdg1 7456 2 50.00 CTCTCTCGCTCTCCCACACAAAAACTTAAGTTCTGAGCGGGCCGACTGCTTTCATACGGTACATTTAAGAAGATGATTGCATGTTTTGATGCCTTTATGTATCGAGCACA:1 + chr3R 29572721 3' + Cr1a 306 1 78.18 GGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAAAGCGACATGACACCTAAAAAGGACAAATGTGTTGGGAGAGTCCTGTAGAAGTCAAGGATA:1 - chr3L 5962854 3' + jockey 35 1 57.29 AGCAAACCCAATCCAAATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAAACAAATTATACCAAAAAATCTAAAAACACACAATTGCAGAAAAGGAGTAGATTTGGA:1 + chr3R 23460135 3' + I-element 5121 1 80.73 AACACGTGTTCTCAATGGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACAACACAACACAACACACCACAATACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + blood 358 2 46.81 CTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGGCCCACCACTCCCCGCTGCACTGTTTTATAATGCAAATGGAAAATTCTATTAGG:1 + chrX 871382 3' + F-element 374 1 63.95 GTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTTTAATTTAAGTTCCAAAATAAATTAGAAT:1 + chr3R 25218680 3' - Porto1 4526 1 73.64 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGACACTCACACTCAAATCCACACACACACTTGCGTTCG:1 - chrX 18009500 3' + P-element 2858 1 46.24 TTTAATTATCATATATTTTAAATGTAATTATTAATTATATTCGCTTCGCATGGTGATTTGCGACAATGGGGAGTCCTCTGCAAAGTGCGTCAAACTTCGATGACCCAATT:1 + chrX 14088651 3' + Cr1a 89 1 59.09 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAAAATAATTCAAGACGTCAGCCAGTCG:1 + chr3L 9822304 3' - pogo 20 1 58.51 GCAACCGACTCGACGACAGGAATAACGGTGCCCGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCACCAGAGGCATCGCTGGATCTAGTCCCGTAATCCTTGGCAGCATAA:1 + chr2L 16833053 3' - Chimpo 319 1 59.80 TACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGACTATCGTAGTTAAATTGAATAGACCTACTAGGGCCTCCTAGGGGTCGCTCCAGTATGAGTTAAAACA:1 - chr3L 26722662 3' - Tc1-2 1559 1 54.55 TGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAGAGAGCGTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGCCCCTGCACATGTATGTACATATATGTACATATAAGT:1 + chrX 20664346 3' - 1360 151 1 66.36 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCTCTTATCCATTCCAATGCATACTTTCATATCTTGTAAAACACACATTCACACAAACACTTCCACATAA:1 + chr3L 10506872 3' - hopper 6 2 50.50 GTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCTTTAATGGTCTTGTCTAGTAGCTTCTAGTAGCG:1 - chr3L 25414186 3' + blood 7388 2 61.67 CTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTCAAAGAAGTTACCACCTTTACTCCTTGAAGGAGCTGCTACACGCGATTCCCATTTTGGGCCAC:1 - chrX 13124488 3' - invader1 155 2 78.89 ATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCGTCGCTCCATCATCAACCAAATCAAGCGAATTTAATTG:1 - chr2R 23759537 3' + P-element 2691 1 38.18 TTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAATTTAAAAGAACAACAATTAGAAAACGCAATTAAAAGATAAATATACCCG:1 - chr3R 31188726 3' - copia 5049 2 53.33 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTAATTTCTCTTGGTCTGGCATTTTTTTGAACTTTTTGAT:1 + chr3R 22979402 3' + Juan 4172 1 66.36 TTTATTTAAAAAGAAAAAAAAATTTAATGCAGAAACCATTTCCTGTATATAATTACTCCTGTATATGTATATATAATAAAGTCAAAATAATCAATTTGGAAATGGGAAAT:1 - chr3L 21372734 3' + transib2 2634 1 59.09 TGATAAAAAACATATAAACACATAAATGTAAATAAAAAAATCCATAAAGGTAAACAAAACAAAGGCGGCTACAAAAAAAGGCGAAAA:1 - chrX 4569202 3' - S2 112 1 67.82 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAGTCACCCTGTAAGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGCACAAGT:1 + chr2R 8086863 3' - 1360 17 1 58.70 ATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATGGTCGCATGAAACTGGTTTGCCGCTCGATGTGTTG:1 + chr3R 8855151 3' - I-element 4976 1 69.31 ATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCTCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATATATCTTAAGGTAGAGGAGAGTTA:1 + chr3R 8816672 3' - F-element 4299 1 79.57 TGGGAGAGCGAAAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCACTTTATGTGCTCGCAAAAAAACAACAACAATAGCAAGGGCAAAGTCACATCGATTACTCTGCTTATTTC:1 + chr3L 5057264 3' - Cr1a 300 1 60.91 TTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTACTTTTTCACACTCGCTCATCATGGTTTTAAGATCGTAGGCATTGCCAGAAACC:1 + chr2R 12937962 3' - 1360 480 1 60.00 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCTAAGGTTCGT:1 - chr3R 11474900 3' + hopper 1397 1 57.14 CTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTGTTGTTTTAGGAATAATATTTTACATATGAA:1 - chr2L 21936600 3' + INE-1 562 1 73.85 GCAGAAAATGAAAAAAAAATATAATCCATAAATGTGTTTAATCTTTAATTTCTGCAAATAAATCTGATATATTGCCTGAATTCAACCATGCCATTTAAG:1 + chr3R 15109791 3' + transib1 30 1 60.61 TGCACATAAACTGCACTCTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCCCTCACTTTTCCTTATCTATACCGTTCCCTCTGCGGTTTCTGCCGCTT:1 - chrX 20481715 3' + Cr1a 270 1 75.82 CACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + ZAM 154 2 33.33 AAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 203 1 51.82 AGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAAAGAGGAGGAGAAGTATCACAGCGAAGTACTGGATATTATCCAACGTTTGAAGCGTAACTAATTGGCAAATTGATATT:1 - chr3R 9347722 3' - F-element 4218 1 77.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTTAATTTAGAAAATGTTTACAAAATTTCATAACTGCAATGTTCTTTCACCTTTCAAAAACCTCC:1 + chr3R 18769783 3' + roo 387 2 60.91 TGAATTTTAAAACTAGGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGGAAAGGTGGAGATGGTCTCCGCTTAGCTCATTACACACAATTTGCAGTTAGGTGCGAGCATATAAA:1 + chr2L 5418470 3' - jockey 4799 1 71.82 ACAGCACTGCGGACAACGCACCAAAGGAAGAGTATAAAAAGAAGCGTGAGGAAGCGCACTTGGAG:1 + chr2R 9887821 3' - Cr1a 230 1 60.00 GAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTACAGTAGCTGCAGCCC:1 - chr2L 8049963 3' + P-element 393 1 29.63 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAACAAACTTGTACATCTATACACTTTCCATCCATTCCACACCGA:1 + chr3R 15524475 3' + pogo 2058 1 67.27 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAAGAAGTGC:1 - chr2L 18675607 3' - 412 34 2 52.73 CAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATACCGATTCTACAGACAAAGTCATGTCTGCAGACAAAAACTCCCCCAAGCTGAATTCCAACTTTAATTCATA:1 - chr2L 15935778 3' + INE-1 158 1 73.33 ATGGACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACTTGACACTGTGTTCTAAATAATAAAAGAATATCAACTTTCGCAC:1 + chr2L 6395188 3' + Porto1 4268 1 60.00 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTTTCCCACAAAAGAGCGAATCGAAGGAAAGCCAAAAGGAAGGAGACCAGCTGG:1 - chrX 711730 3' - 297 6585 2 61.18 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATCTTAACCATATAATTCATTTCAAAATCATCA:1 - chr2L 14708872 3' + opus 463 2 68.09 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTTAATTTAGAAAATGTTTACAAAATTTCATAACTGCAATGTTCTTTCACCT:1 + chr3R 18769770 3' + roo 9039 1 56.48 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATCACATCTTATAGAAATAACAATAATATTTTACAATTTTGAAGTTTAAATTTTAATATTCGATTAAATTC:1 + chr2R 19010492 3' + Ivk 5361 1 36.70 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCCAGCTAAACCAAAGCAAGTCCAGTTA:1 + chrX 16994150 3' + roo 9041 1 68.75 GAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGAGCTGAAGCAGAAGATCGAGGGCAGCGTTGTACACAAAAAGATAGATGGAAGGTCGAG:1 + chr3R 4932391 3' + baggins 4989 1 55.96 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATCGTGCCGCGTTTCTAGCGGGCACTCCACCC:1 - chr3R 23943206 3' + P-element 2864 1 39.73 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGTATGCTAGTCGACAGTCGCCATGACATTTCAAATTTACGGGCTATGACAAAGTGAGTTAAATGCATTT:1 + chr3L 9198542 3' - 1360 7 2 70.00 AAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATATTAATTGTGTTTAAAAAGGACTTTGGTATTAGAGATTCGTGACTACATTT:1 + chr3R 29362849 3' + F-element 4661 1 60.44 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGACAAAATGCCCCATAGTGCAGACCCGCGATTCCTGTGTAGCATATATTTGGG:1 + chr3R 11553714 3' - hopper 46 1 64.71 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGCATTGTGTCTTCAAGCAATGTCCTTTTGGCG:1 - chr3R 12346436 3' + Stalker3T 201 1 61.43 ATAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATGAATCGAATCGAATTCACAATCTGAATTGAAAAA:1 - chr2R 23415660 3' - Doc2-element 16 1 46.58 GTTAGAGGGAGATGACAATGTAGTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGAGAATATGTAGAAGAAGTGAAATTTGTGTTCGAGAAATAACTGAAGATGAAAGGATTGTTT:1 - chr3L 21411736 3' + invader4 2918 2 63.64 ATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTACATATTTTTTCTATCTGTAGTTATCTTTGCACCTTATCTCTCT:1 + chr2L 1956551 3' + hopper 342 1 68.18 TCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTAATCCCGGGAAGCATATCCACCAGTAGAAGGCTGGAGAAGTGGTG:1 - chrX 16560579 3' + S-element 1695 1 54.35 CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Tabor 6901 2 80.00 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGTGCTGCCATAGTCTGGAAAGCGTCTGGGT:1 - chr2R 9138691 3' - pogo 20 1 54.35 GAGGTGGGCTAACGAAATTGGGTGTATTTTAAAAGTGGGCAGGGGGGCCAAATGCAAACGATGTGTTTTTAAGTTCGCTTACATTT:1 + chr2L 7856150 3' - FB 450 1 58.14 CTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTTCCTGTTCACTTTTTTTGTTTTCCGCCTTTTTTCCTCTTTCAAATTGTTTTGTTTTCGCTTTTCTG:1 - chr2L 11906671 3' - Doc3-element 4382 1 59.00 GACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAAATATAAATAAAATAAATATGATCGTTATATTTTCTTGTATTGCATTAAATAACTCTTGATCTAAA:1 - chr3R 19447461 3' + 17.6 7402 2 48.62 TAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTATTCACCAA:1 - chr2R 4673561 3' + Quasimodo 7360 2 67.37 TAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTAGGTACTCACATCCTGCCCTTTTCGATTTACATGCAGCATGCATTAAAAATAGAACCTTCG:1 - chr3L 23027532 3' + INE-1 566 1 58.18 CTTTATTCTTGGTCTTAAATAAGCTAACAGTGAATATGTATGTGTGTGGGTGTTAATTAAAAAATGTTATGCTTGGATTTGCACTCCCCGAAGTTGCTACTAAATGTCTG:1 - chr3R 29567956 3' - ZAM 8260 1 62.73 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACCACGTTTTAAAAAGTGTGGGTCTTCATTCAACT:1 + chr3L 13024057 3' - 412 12 2 54.17 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACTACCGACTCTTACCCATAAAATATGCAAATAAGTG:1 - chr2R 13934428 3' - FB 44 1 62.86 TGGATTTTCGAACCTTTGGCTTAACCAATCCGTAACAAAACCGAATCCGAAGCCCAAA:1 - chr3L 16340161 3' - GATE 376 1 77.59 AGTCTAGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACAGCATCCCCCTACAACCCACCAGTCACTTACGGAACTGCATCTGCACAAT:1 + chr3R 19445509 3' + GATE 8429 2 71.82 AAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGTGAGATGAGGTCGATGATATGGCCCAGACCTTGGCCCCTCAAAGGC:1 + chrX 17336909 3' + R2-element 449 1 70.83 GCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGGG:1 - chr3R 22500821 3' + invader3 270 2 51.61 CTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGATTCAAATTCGGCGATCGGAGTTGTATTGAATTTAACGCCCAGTTTGTTTACCTTGTAG:1 + chr2L 20752074 3' - micropia 5122 2 60.91 GAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTAAATATGCCTGCGATTAGCATAAAAAAGCAGTTAACAATTTGTACAACATTTATCTAGTTTTTCATTTAGCTCTCTC:1 - chrX 17330071 3' + opus 487 2 70.91 AGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTTTATTTTTAATTGGTTTCGTTGCTGTTGGATTTGTACTTTGTGTTTTTATTTCGGACCCATAATGAGCCGGTTGCCATGC:1 + chr2L 17540245 3' - 297 6817 2 77.27 ATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGAGGGCGAGAATTATGCAACTGCTGTGCTGTGGAAGCCAC:1 + chrX 4259392 3' + Doc 11 1 73.44 CGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTTCGACAAAACAGCAAAAAGCCAACAAAAAACAAAACA:1 - chrX 12160084 3' + 412 7372 2 63.37 TACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTGGCATTTCCAGCGGTTGGTGAGATTCTTCGGCGTTATTTTACTTCAATGATTTGATATCTGGCGCGAAAGAAGAAGC:1 - chr3L 23236475 3' + Stalker2 394 2 71.82 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCCTGGTAGCTCAAGCGAAGCGGAACCAACAAACTCCCGAAATGGATTGGATCAAAA:1 + chr3L 217415 3' + roo 407 1 80.00 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTTGCAATTGTCCAGCGGCAGAAGGGGAA:1 + chr3L 15614484 3' - jockey 4693 1 57.97 GGGTGAGTTTGGGGATTGGACATAGATTTGGTATTAATATTAAGTGGTAAGTATTTTTTGTTAACTTAGGTTTTTGAAACCACATTTGGTCATTTACTTTTTCCATTTTT:1 + chr3L 18443804 3' - TAHRE 10297 1 70.00 TATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTGCTCTTATCTTATCTTATCTTATTT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 36.84 ATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGCGCATGGATGTTCATTTGCAATTAATGCTTTTGATTACCTTTTTTTGTTCCTTTGATTATTTGAGATCTTAGGGGTGCAGAGTGG:1 - chrX 21032543 3' - I-element 4881 1 79.09 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGAAGCAATGCAAAAGTGTCATGACA:1 + chrX 18483211 3' - pogo 53 1 74.55 CCAAGCACTGGAAACTCTGGTTGTCGCTATAAACCTTAGTTGCCTGTGTTTCACCAAAACCCAATTTCCTCACCTCATAGGCAAGCAACTGCTTGGCGTCCACGAATTGG:1 - chrX 11328371 3' - Dm88 4073 1 62.73 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTCCAATAGCTACGATTAGAAGTAGTTGTTGCACTTCCATCGTGCTTGTTGATC:1 + chr3R 28640018 3' + mdg1 7454 2 75.45 GACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGAGATGGAGATGGAGATGAGATGAGATGAGATGAG:1 - chrX 4186821 3' - mdg3 22 2 55.70 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGAAGCAATGCAAAAGAGTCATGACA:1 + chrX 18483211 3' - pogo 33 1 68.89 CTCTGAGGCTTCTCCTCCCCTTCAGAATCCACGAGCAATGCTCTCCCACAAACACTAACATATTCCTCGCCGGCTTTT:1 + chr3L 19000374 3' + 17.6 235 2 73.08 TTAAAAAAATAAAAAAAATTATATAATGCTGGCGG:1 - chr3R 19160092 3' + HB 323 2 94.29 AAGAGCAAAGAGAGATTCGAAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAAAAGGGAAAAGAGGAATAGTAAATGAAGTAAAAGTGAGCCGAACGAGACCG:1 + chr2L 8115687 3' + Bica 290 1 72.22 TTGTTGTTATTATTATTGTAATTGTTAGTTCGTCGTTCGGTGTTGTTGTGTGTTGGGGGGTATGGGTTTCTAATGAGAAAAGTTTCCTCACAGACAAAGAGAGGAAGCG:1 - chr2R 20541792 3' - mdg1 20 3 65.14 ATAAGATAAGGTAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAATAGAATAGAATAGAATAGAATAG:1 + chr3L 24821492 3' + Stalker3T 201 1 70.00 CTCCTCCCCTCCTTCCCTACTCCGGGACAACATGGACTGGCACGTAGCGCTCGACACTCAAGTGTCCAAGTGTTGAAAAAGCCGTGCATAAAAACTAACACGTACGCACC:1 - chr2L 12337076 3' + G-element 291 1 65.45 TTCATTTATTTATTTTTGCTTTGCTTTATTATTTGTTTTGCCAACACTTTGCACTGCGGCCGGCCATGTGAATAGAAAGTTTATTCAC:1 + chr3R 23214359 3' - Juan 4210 1 68.18 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTTGGGGCTGTCTGGC:1 + chr3L 5204454 3' - jockey 4689 1 58.00 TCTCCGTACCTCCACCAGAAAAGTTAAAAACTCCGTACCTCCACCAGTAAAGTTCAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGTAAAGTTAAAACAAAGTTAAAAA:1 - chr4 1294980 3' + HeT-A 6053 2 47.71 TCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCAACGCTTTTACT:1 - chr3R 25051573 3' + 17.6 7391 2 58.18 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTAGTCAAGTTTAATTTTTTGGTTGAGTTCATGCGACAATTGCAAA:1 - chr2L 14903303 3' + hopper 1402 1 60.71 ACACAGACGATGTTAAATTATACCTTCAGTATAAGGACATATCTTCCCAGGTGGGTTTACAATCAGATCTACAGAGCTTTCAAAGACAAGGGGGCACTAAAATGGAGGG:1 + chr3L 4623758 3' + Q-element 578 1 75.23 TTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTCCCTTTTTCGTTTCGTTCTGTTCACTTTCCTTTTTCATAAGT:1 - chr3L 12275426 3' - invader2 347 1 65.45 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAG:1 - chr2R 12416885 3' + pogo 2076 1 73.91 AAAAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTGCACACTTTTGAGACTATATATAAACGTTAGAACATCACACAGATTTAAATACTTATGCATGCAAAAGCATATGCAAAAACC:1 + chr3R 11957301 3' + S-element 171 2 63.64 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGGGTCGTGTTGCCTGTGTTTGTTGTGTCTTTAACCTCTCGGAC:1 + chr2L 9171519 3' - opus 7114 3 75.86 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAAGGGGGAAGA:1 - chrX 19187294 3' - Transpac 34 2 65.45 ATCTCTAATCTTAGCGATGGTAACCTTCAGACCGGCTTTTTAATCCTTATCACACTCACATTCTCACACAAAAGGACACGCGGCTTTTCCGACC:1 + chr2R 12458269 3' + Ivk 435 1 74.47 GAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGG:1 + chr3L 23176368 3' - INE-1 575 1 61.46 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCTCATTTCCATGTGATGCGCACTATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGTGCATTTCCAATGCATTGCAATGCCACGCGCACA:1 + chrX 5513424 3' - jockey 4686 1 80.00 GCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACAC:1 - chrX 10119561 3' + FB 12 1 52.13 GTTTAAATACGGCTCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATAAATATAATTTCCTATCTCTGAATAGTATGTCTCACGC:1 + chr2R 19330345 3' + McClintock 6338 4 60.67 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACACGAAAACTTTTATTGTTTTCTTAAA:1 + chr2R 8530826 3' + mdg1 386 2 58.18 GTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGAGTTTATCGGGCGTACTGGAGTGCTTAACTGAGTAAGTTTTGATGTGGGACGCAATTTGAATGCGTTGC:1 - chr3R 27045802 3' + hobo 2880 1 48.51 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGCCTGTTTTTACTATCGCTACTGGCAG:1 - chrX 1503351 3' - roo 37 2 74.16 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTGAATATATCTTGGACCTGTCCTGTGGTC:1 - chr2R 16462330 3' + roo 350 2 70.91 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGATCTGACTGAACAATAACCAAAAACGAATCCGAAACCAAACCGTCAACCGCCCATGGGCCATGTGATGTCGGGACA:1 + chr2L 4698664 3' + P-element 2879 2 51.82 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT:1 + chr3R 21211613 3' + Stalker3T 202 1 38.18 TGTTTAAAACAACCGAGATTGCATCCTCCTCTCCGGTTTTGTCTTTTGATCCAACATTTGGTCCAACATTTCATCCCGATGCCATCAACCCTCTGGTTCCACTCCGCTGG:1 - chr3L 19244105 3' - R2-element 3293 1 47.27 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCATCGAAAGCAGCTTACAAAATGTA:1 - chr2L 6311268 3' - hopper 58 1 76.36 AACGCAGAACTCCAACAAAATTAAACTATTAAATTATTAGTGTATTAGCGTATCCTTGCTGCATTAATTCAAATTCCACTTCAGCTTCTACCC:1 - chr3R 17711146 3' + Porto1 4532 1 61.29 TCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATCTGCAATATCAAATGATGCAGAGTATCG:1 + chrY 1995257 3' + gypsy 410 2 75.93 TAAGATACGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAGTCCGAGGAAATCCAAAGAAATCGCAAGCTTATTACAGCCCGCATTA:1 + chr2L 3538894 3' + Stalker3T 202 1 63.64 ATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATGTAAATA:1 + chr2L 21570280 3' - Dm88 4370 2 75.23 CGCTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAGCGATTTTAGTATACACTTTCACGGGTATAATTTGTAAGAACGGTGGTACATTGCAATTTACATGCAAACAAACA:1 - chrX 7720261 3' - INE-1 30 1 63.81 GCTTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCCTTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTC:1 + chr2L 21762373 3' + INE-1 528 1 76.36 TAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACACTCAGGCTGTTTCTGGCCAAAAATCGCTCAAAATAAACAGAACTAGTTAAAGATA:1 + chr3R 21527211 3' + Quasimodo 3 2 55.45 TGCAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATT:1 + chr2R 5924401 3' + jockey 4711 1 50.00 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTT:1 + chr2R 6984378 3' + HMS-Beagle2 277 2 72.73 CATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCTCAAGCAAGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGT:1 + chr2L 20120407 3' + invader1 3936 2 68.57 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTCTCGCTTTCTCT:1 + chr3L 3371216 3' - copia 4902 2 63.44 GCAATATGTTAATGTTACCAGTCCACGTTACTGTCTAAAAGCTAAGACTAGAAAAAATACCAATTATAAACTAATCCACCACACGAATAGTTCTCAAAAATCCACAAAGA:1 - chr2L 4733508 3' + HeT-A 5847 1 74.55 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCT:1 - chrX 16983076 3' + copia 204 2 71.82 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTATGTATAATACATACAGTTTATCTAAACAAAATGGTTCGATACCATCGAAACCATCGAAAACTAACCGTTCTAAAA:1 - chrX 22489584 3' + S-element 1713 2 76.15 TGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAAT:1 + chr3R 6763655 3' - F-element 4484 1 66.36 TAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGATAAGTATTTAAAATGAAAATGTTTGTACGGAA:1 + chr2L 19320499 3' - Juan 55 1 75.93 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCATGTTGCCAGCTAAATGTGGATGTGCATTGCTTTTCCCAAC:1 - chr3L 12301197 3' - hopper 42 1 60.38 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAATATAAATAAATATAAATAAATCTGTCTATAAATGGCACAAAATTTAAACCGCACATTATACGCTTCTAT:1 - chr3R 6309785 3' - F-element 24 1 39.62 AGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAGAAGAAAACTGGTGGCAATAAAACGAAATGAAAGCCAGGCAAAAAAAATGAAAATTCTGAAAAA:1 + chr2L 10550075 3' + X-element 4697 1 75.76 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTTGCCTGTTCATAAATTTATATTTGTTTCGTACTCTCTTGTTTTTAGAAATTTGA:1 + chr3R 7500939 3' - FB 27 1 56.36 ACAAATAATTATTTTGCGAAGAGTAAACAATGCTGCGGCTGGCCGTAGATAAACCTATTGTCATCGTGCTTGGTTTTGGATGGCTGTG:1 - chr2L 6637593 3' + looper1 282 1 64.77 GAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGATTTGCCTTGGCTCTTGCTTTTTGGTTGCCAGGATAAACGGGAGCGCCGTTTAAA:1 + chr2L 4070249 3' - 17.6 7238 2 55.96 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGCTACATCTTAAGGCAAATACTTTTGCTTCCTTATCAATGTTC:1 + chr2L 5304949 3' + flea 250 2 76.36 CGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTATGCGAGTTTAACGGATTTGCGAGGGCTTCACATTGCTTGGGGGGAATG:1 + chrX 15240695 3' + invader6 4571 2 71.70 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCAGAGACACAAC:1 + chr3R 23861144 3' - pogo 43 1 64.55 TGCATGGAAAGTTTCATTTTTCACCACCCACCTAGCAGCTCTGCTGGCGCTCTGCTTATGCCTCGTTTCATTTACAACAATTCATAATTTTA:1 - chrX 7718057 3' - Dm88 4096 1 75.00 AAAAGCCGAATGGTACATTATACAAATGAATTAACACGCTATAGAAGCTGTCAGAGAAACAAAAAAAAAAAGGCCAAAAAAAATAGTAAAAGGAGAAAA:1 + chr2L 10799453 3' + Porto1 4361 1 67.68 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACCACGTTTTAAAAAGTGTGGGTCTTCATTCACCTTAACATATTTTCAGGAAATGAAT:1 + chr3L 13024080 3' - 412 26 2 53.21 ACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTAATAAATCCCCGTATAAGGCACTCCAATGCAAGTAAATATTCTGCTACCATGCACA:1 - chr2L 15992447 3' + I-element 5126 1 54.55 GCTCGGTTTGGTGTCAAGATCACGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCAC:1 + chrX 21907815 3' - accord 384 2 53.40 AGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTT:1 - chr3R 15697053 3' - 3S18 5821 2 71.82 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGACTCTTAAAGTTAGATCA:1 - chr2R 8086817 3' + 1360 3349 1 82.93 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAACTTTACGTCGAACTATGAGTCGTTAG:1 + chr2L 17123297 3' - roo 48 2 73.74 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCGGAATATATTGAAATGGTTTCTTCAG:1 - chr3R 27071882 3' - jockey 4697 1 74.36 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGACGATGACTAAGATGATGATTCGTTG:1 + chr2R 15801130 3' + roo 9026 1 73.96 CATTTTTTAAAATTGTGGGCGTGGCAGTTTTTAACAATTTTTGGCCGCTACAGTTGTCTCTAACATCTGTATGCTCAATTTCAACCTTCTAGCTTTT:1 + chr4 829440 3' - INE-1 254 1 89.69 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTGTTAACTGACTTTTTTTCCCACCTGGGTAATTTCCGCTTAATTAGTGCAATGACAGTG:1 + chr3R 10203066 3' - roo 15 2 60.61 TTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAAAAAAGGTGTGGAGGGAAACAAGGATGATAGTTATCTCGCGGATTTATAACCGATTCG:1 + chr2R 23839943 3' + F-element 4639 1 55.96 GCAACCTACGCTGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTTATATTTAATTAATTTATATATCTTGAAACCCATTCTCTGTAGCTAAATTGAT:1 + chr3L 16727224 3' + springer 351 4 62.37 AAGGTAATAAGAAGGGGACCAAGGTGACTCCCTCGTGAGACACCGGATGTGACTCGTCCGAAACCATAAGCTGTCGAGCAGAGTTTAAAAAATAGCTTATTAATATGAA:1 + chr2L 7284908 3' - Q-element 506 2 51.38 GACAGACCAAGAACACATGAAAATAACTTAGCCTTAAATTTGGTGAATAATAATAACAACGTCAGAAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTAAGATATTGATATAAAGAAAA:1 - chr3L 22531906 3' + G4 3618 1 80.00 TTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCCTTCTCTTTCTCCTTCT:1 - chr3R 10451877 3' - Stalker3T 203 1 44.94 ATTAACAAATAAACCAAAAGCAACACTCCATGACAACCAGAAAATCAAACTCAGCAGGCAACGCAGGTAAAACAAATTCCATCCACAGTTTACAC:1 - chr2L 15066568 3' + HeT-A 316 1 91.58 ATGCTTCGTGGGCCTTATGCGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGTTTGGTTAGTCAAACGTTTGTTACCTTTCGCTGGCT:1 + chr3R 22500878 3' - invader3 16 2 57.47 GCACACACACACACACAAATATACACACACATGGCGGGGAAGAACATTTATGGGTTCCAGCAGCAGTTGCCTTCCTCAACAACAACAACAA:1 + chr2L 7823862 3' + accord 183 2 82.42 GAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACA:1 - chrX 21087596 3' - mdg3 30 2 61.11 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACATCAGAAGTGCCTGGTAGCTCAAGCGAAGCG:1 + chr3L 217380 3' + roo 9031 1 64.22 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGATTTGGCC:1 + chrX 9845515 3' - F-element 40 1 74.36 ACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACGGCTTTCGAGGCACCAAATCCACTC:1 - chr3R 24508134 3' + Doc2-element 408 1 58.33 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGAC:1 - chrX 21399414 3' - pogo 34 1 70.65 TTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAAAAATTCAAGAGGAAAACGACAATCGCGATCAATAGCAGCTACAAATACTCC:1 + chr3L 12821197 3' - Bari1 1476 1 53.64 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATTGCGTTTCGGTTTATATTGTGTAATCCTAAGCATATGATTGAATGAAAACAAGTAGAACATTTAATAGGCTA:1 + chrX 6866881 3' + S-element 1715 2 40.78 TTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATCTGCGCCATATGCGATAGATAGCCA:1 + chr3R 14703940 3' + 297 6919 2 74.55 GTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGACCAAGATTACTTCAGGCGGTGCAGGATCACAGGATGCTGGGGTTTGGGGCCATCAAAGTCGTTGC:1 - chr3R 11726251 3' - G2 3022 1 66.36 AAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAAAGGATAGGAAAAAGGGGGTTTCTCATTAACACAAGCGACATTTTCCCTTGTCAAAGGGACTCGGCTTAATTGAAA:1 + chr2R 16729033 3' + Stalker3T 203 1 74.55 TAAATTATAAATTACAACAGGCTACCCCCAGTTTAAGCAATTTTTTTTATGAGAAAAACAAAATGTGTAACCATTTGTCGAAAGTAATTGGGCATCCTTTGCCATTTGTT:1 + chr2L 10128774 3' + copia 258 1 75.45 TGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGTTGACA:1 - chrX 20099927 3' + S-element 1675 1 63.30 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGCGAGCGAACATTGCTGCAAACAAGCTGGCAAAACGGC:1 + chr3L 12301254 3' + hopper 1403 2 50.00 AAACAGCCCAAATGCCCCATAGTGTACTGGTCCGTCCGCCTGTCTGCTTTATGCGAGTTTGTTGTTAAACCATCACAAAA:1 - chr2L 19681408 3' - hopper 3 2 70.00 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAATTTTAATTGAATTATTAATTTTGTTT:1 - chr3R 12623687 3' - roo 14 2 66.02 TCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCCTTCGTGACGCTTTTTCCTTTACGAGCAGATGTCTAATGTAGCCGAAGGAAAAC:1 - chr3R 29972327 3' + 1360 3244 1 50.91 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGTGTTGCCTGTGTTTGTTGTGTCTTTAACCTCTCGGACATTAGGTAC:1 + chr2L 9171528 3' - opus 7 2 73.33 TTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:1 + chr2R 10572710 3' - F-element 4383 1 60.78 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTGCAAAAGTATTTGCATACTTTTTGGGGCTATTAAGCTTTGCG:1 - chr2L 2484333 3' - jockey 4678 1 72.00 TTTTGGTGACGGCCAGAATTGCCCTCTCTTACTCACATCGACTTGGGATCAACTATCAACAGTTAAATACATTGGTTACATACATATACATACAGGG:1 + chr2R 18836923 3' - 1360 3324 1 75.26 CTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTCTTTGTTTCTTCTTTCGATCCCGTTGTTTTTCGCTCTCTGTCCGGATGCTGTTTCCC:1 + chr2R 8083551 3' - invader2 4780 1 68.09 CATTTTTCGTCTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGGTTGTGTGTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Cr1a 194 1 28.70 ATCAGGAGGAACACACTCCTGGGCACGTATGTAGTCCCACGGTAAACAATTGCAGCCCTGAACCGATCCAACTCGACCAAGCACAGGGAA:1 + chr2R 17437177 3' + baggins 5269 1 71.11 GGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCGGTGTAAGTGTGTGGGGTGCACGATGGGGTTGGAGTATCTTTTACCACCTAGAGAGAGATGCAAATAGGCGAATATTC:1 - chr3L 17121515 3' - F-element 4451 1 74.55 TTCTTTTCCCTTTTTTTTTTTGTCTGTCACATTAGCGACGCATCGCAGCCTAATATTTTTGCATAGCATACTTTTGCGGGCTTGGG:1 - chrX 7480776 3' - Doc2-element 231 2 55.81 TATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACTTAACCCATCATAAGCCCCCATATATGAACTTAA:1 + chr2L 1870892 3' + rover 6973 2 67.62 GTCGAATTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTTTAGAGACATATGCACCGCTCGCTTATTATTCATGATGCCCACTCTAGCC:1 - chr3L 9262190 3' + INE-1 145 1 70.19 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGTAAGTGATTCGGGATTCGAGGAATGAGAACTAGAGAAGCACGCGTCGTAACAATGTAA:1 + chr2L 13252421 3' - Tirant 29 2 65.98 CCTCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTATTGTGAATGCGATCGAGAAATGTCATAATTTTTCTGTTTGGCTAGATTTTTTCATCCACCTGCCTTTCG:1 - chr2L 1598280 3' - INE-1 553 1 67.00 AAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACATTGCTTGTTGGAGTGCTCTTATAATTCAATTTCTTGGTGCTCTTGTTGGGGGCTTCCGAAAAATTTGTT:1 + chr3R 27816218 3' + Burdock 244 2 68.81 CGAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCATGTGCCTTATTAATTTTTAGATTTGATGCCTACTTAATAGACCCGCTTGATACC:1 - chr2L 14480380 3' - 1360 82 1 54.72 TCATGCACAGTTAATTGAATATGTGCTTCCTCATTTTTGCTGTTAAGTGGTGCAGTGGTTCGGTGGCTCAGTGACTTTGTCTTCGGTTGTTGTCGCACGTCGACTGTTAA:1 + chr3R 14116925 3' + McClintock 24 2 60.91 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTTGCGTTCCACATATGATAGATGTTAAATATTTTTTTGAACG:1 - chr3L 9419526 3' + S-element 1673 1 67.27 CATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACTAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATACATATTTTCAACACTCCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTC:1 - chr3L 22908067 3' - invader1 3645 2 73.64 GCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTGGGTTTGAATACTTTCCGCTCGAGCCCATTGAATATTTAAACATTACAATTGCTGTGGTGATTTCTGGCCATTTTAAT:1 - chr3L 10836492 3' + opus 497 2 80.00 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTAACTAGCTATTTTTTTTATATCTGCTCAGGGAGTTTATGTGT:1 + chr2L 19129391 3' - FB 17 1 51.81 CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAATAAAGTATATATATTCTTTATCAGGATCAAACGCCAAGCAAAGTAAGCAGCTACAGCTGTGAAACTC:1 + chr2R 1763729 3' + INE-1 12 1 68.00 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGCGAGCGAACATTTCTGCAAACAAGCTGG:1 + chr3L 12301245 3' + hopper 1358 1 73.64 GACCACATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCAACAAGACTAACAACAACCATATAAACCTCACCTTCCAGCACCCCACATTTTT:1 - chr2L 7761195 3' + Quasimodo 25 2 52.34 TTATTATTTTATTATTATTGTTGATTTTACCTTTTTTTGTATTTTTTAAATGTGATCTAAATTGTTTGCTCTATTCATATACGGCCTTTTAATAATTTTATTGTGCTTAA:1 + chr2R 15153793 3' - invader3 5045 2 71.82 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATAACGATGCCATAATTTAATCTTGAG:1 + chr3L 3611805 3' + blood 358 2 63.89 AAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATTTTTCGCTTTTTCGAATGTTTAAAT:1 - chr2R 8397418 3' + 412 7529 2 47.27 GAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTAATTGTGACGAAAACAGAACGAAATGTGCGTGTAATGCTAGCGAAATGGGGAGACAAATTATCAT:1 - chr2L 20904257 3' + Porto1 4294 1 69.89 GAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCGGAATTTTGTTGAGTTCTTAGTTGAATTAGCGGTCGATTT:1 + chr2R 18089156 3' + Idefix 423 2 65.75 TATATTTTTGAAGTTTACTTTTAAGATTAAACTATTTAAGAGTATTACAAAATTTTACATCAAAAAGGGTGCTCTTGGCAAAATAATTTTATATTTAGTCTCCCAATGCA:1 + chr3L 4676151 3' + hopper 176 1 55.45 CTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCAACGAGATTCTAGGGAAAATGACGCAACTTTTGTGACATTTTGCCACGCCCCCGCCCACAGCG:1 - chr3R 25464981 3' + INE-1 153 1 59.00 GGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGAAAAGGAGGAGAGCTGGCTTAAAAAACCTGCCGGCTATTAGCAGTGTG:1 + chr3R 17934835 3' - Max-element 8372 2 66.67 AAACGTCTTCAAAAGGTGATACACGCTTCACAGTTCGAACTAGGCCACTTTTATTGATTTTGTGTGGCTT:1 - chr3L 11984925 3' + Tc1-2 1328 1 62.86 CAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCAATAAACGCACGTAAACGCACATTACTCTTTTTTTAATTTTGAGTTTTTAGTTATGATT:1 - chr3R 20376009 3' + G6 1980 1 47.27 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACACCAGCTTCTTTGAGCTAGAATCGTGTTCTTATAGACACTAGATA:1 + chrX 15026060 3' - FB 61 1 76.36 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTACGATTGAGTAATCATAATTACGCTATAAATAATCCGCTCGTTCAGG:1 - chr2R 11273987 3' - Stalker2 16 2 56.98 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAGTTCAGATTGTGGCCAAAAAAGTGAG:1 - chr3R 9435791 3' + roo 404 1 73.33 TCGGTTGTTCAAGCAAAATGATCCGCAAAGCAGTGCTGTTTGCCGAAAAGAAACCGAAAACACACCGCGAAAGCAAAAAACAAAACAAACAAACAA:1 + chr3R 15416054 3' + Tc1 453 1 57.29 ATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACACACAACACACACACAGACATAGAGAACATATACACCCACACAAATCCAGACCTGTTCCCAAATTAGA:1 + chrX 11801136 3' + S-element 1702 1 60.91 TGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTAAAAGAAGGGTGTGAGGGGGTACCAGCACCCATCATCGCATATGAAATGACAAGAAAAAATTGCTGACA:1 - chrX 12120307 3' - copia 158 2 54.13 GGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTTGGGAACTTGGTAATTTATTCCTTACAACAGAGAAATATTGCGACAGGTT:1 + chr3L 22490429 3' - F-element 4478 1 67.50 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCATCCGATGCCAGTAGCGTTTCGGGTC:1 + chrX 21399460 3' + pogo 2065 1 68.89 AAAGTACGACAATAAGCAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATACGTTTTAC:1 + chr3L 15099649 3' - G4 3811 1 40.91 CACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCCTGGCAACCGCTGATTTAATGAAGAGTGATGTA:1 + chr2R 24388346 3' - BS 26 1 59.77 CGCTATCGCCACAAGGCTAGTGATAATAATTAAGGGTGCTCGTCAAGGAGTATGAAATTAACACATTTCTGCGCCATGTTGAACCTCGATTAGTGGAAAAAGTATCTCGG:1 + chr2R 15209312 3' + gypsy 7308 2 71.82 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCT:1 + chrX 17184965 3' + roo 9021 2 70.00 CGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACTATATATATAATGAACAACGATGTATGTAAGTACCTCTTAATTACTTATGTTAATTCCTTTTTGAGTGTTTTCGCTGCTGATC:1 - chrY 2413485 3' - diver 5894 2 66.06 TAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTGACGTTTAAAATAAATTTCTTGGCCAAGAGAGCGGGGTAAAAAACACATTTACTCATCGTTGACACA:1 + chr3L 17490746 3' + roo 9066 1 71.88 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCTCTCTCCCCAAAAAAAATCTATATAGCAATGAAGTTTGTAACGAGTTA:1 - chr3R 14995676 3' - Doc 17 1 42.31 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAGGATATTACAACAG:1 - chr3L 5320591 3' - roo 8668 2 66.25 ATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAACTGATCATTTCACCCATTATACCACACCATACCAAACCGTACCACCGTCATTATGGCCATCATCATCGACTTCTCGTAGTCG:1 + chr3L 16480756 3' - HMS-Beagle2 7157 2 70.75 TATCGACTGGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATAAGAATACTTCATATGGTCGGAAACGGACCCCACCCTGGTTGGGGAAAAAAAATAA:1 - chr2L 13605304 3' - INE-1 96 1 72.22 ATGTTTGGCGGGTCTGTCATGGTTGTTGGAACGATCAACACTTGCCAGATTGCTTTGGCATTAAAGTGGCAGCAAATATTTCGGATTCT:1 - chr3R 25817781 3' - I-element 185 1 74.16 CCGGCTTTAAACCTAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAATTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTCCGAGTAACTCATTTCTCATGTCTTTACTTTCAGCTCT:1 + chr3L 4347459 3' - Bari1 422 1 62.26 ATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTCTTTTAGAGCCTGCTTCGCG:1 - chr2R 20996722 3' - 297 6515 1 81.40 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGTAAGTCTATTAGGAGGCACTAGTAGCTG:1 - chr3R 19949135 3' - copia 44 2 72.92 TTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAATGGTGGTTGTGGTTGAGGTAAGGGTGCTTTTCGATTAGTGCGCCTTATCGGCGTTACAAAC:1 + chr3L 5539819 3' - FB 927 3 57.58 GACGTGTCGATATAAAGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGAATTTTTTTAAGTGCATATTGGTGTGTTTTTCCCCGCCCGCCTTTCGATGGCCGG:1 + chrX 22808060 3' + R2-element 458 1 62.63 TGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTCCCAAGCGTGCAGCATTACTTTTGGATCGTCTTATGGTTGCTTTGCATCA:1 - chr2L 11084289 3' - F-element 4479 1 75.00 TATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAAACAAACTATATATATCTTAAACATATATGTGAAATCCTATGACTATATGACTTTGCCATATAATATACAAA:1 + chrX 9172411 3' + copia 4883 2 76.47 GAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTATGTCGATTTTTTTCTTGTGTAACTCCATTCACAC:1 - chr3L 7462855 3' - F-element 4219 1 76.36 TTCAAGACTTGCCCGTTTGCCTTAATAAATAAATTATAAA:1 - chr3L 26246019 3' + X-element 4693 1 90.00 CCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATACTATTTATTTCTTACAGTGCTCGTCCGTACTAGACCAAACCATTC:1 - chr2L 5433466 3' - blood 7221 2 56.67 TACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGCCTTTTTGTATGATTATACTTTTGCCAGACAAA:1 - chr3R 15697024 3' - 3S18 5768 2 72.09 AGTGCCGTGCATGCACCTAGCAGCTCAAGTGATTAAGATAAGATAAGATAAGATAACAAACACGATTCCCAAAAACAGCAGCACCGGAATGATTTATCA:1 + chr2L 15415847 3' + Stalker3T 169 1 62.63 TTAATATGATAAAATAAAATAATTAAAAAAAAAATATTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATTTTTTTTAAACACTTTT:1 - chr3L 12138566 3' - 1360 3102 1 52.88 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGGGCTAATTCAATTGAAAAGCCTGGGCGTG:1 + chrX 8364748 3' + jockey 4967 1 52.34 CACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATAATTGTGATGGTTGAAACATTTGTAGCGTGGTGCTGACTAAAAATATAAAAAACTCATGTGCTTAAATGCAGT:1 + chr3R 8240958 3' + 1360 368 1 65.45 TCTATTTTTAAGTCATTATGTATATCTTTGTTTCTAATTGACCATACTTATCATGTTAACGATGATTCCATTTAGTTTATGCTATTAATTGCACCCTTTTTTTTCACTGT:1 - 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1360 32 1 52.73 CCCACCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCTACATTTGCACAGGCCTATTGGCGAATCGCAAATTTGCATTAATGGATAGAATTGCC:1 + chr3L 14618216 3' + FB 997 3 75.90 CGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGGACGAAACGAGCGAGTAAGGCTGTGAAGCGAATCT:1 + chr2L 20971056 3' - accord 7032 2 48.10 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGAAGCAATGCAAAAGTGTCATGACATCACCTGTTATCGGCCCAAAT:1 + chrX 18483232 3' - pogo 32 1 55.45 AAAAAGGAAAAAGAAATAACGAAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGGAGTGGGGTGCATATCAACGGATATCAGCGGAAAATGAGTAATGAAG:1 + chr2L 14073673 3' + invader2 499 1 58.59 CCTTTTAGCTGTTATAGTTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTA:1 - chr3R 8005047 3' - INE-1 156 1 85.29 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGCGGTCCGGAATGGATGGGATTTGCAAGGAAATCTATAATCGCAGAATATA:1 + chr3R 13503061 3' + hopper 1397 1 55.43 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTCTGGAAAGTCAAGCTTGATTAGTGCGGACTTTCATACTTCACA:1 - chr2L 17123248 3' + roo 9037 1 58.82 AACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCTAAAGAAACTGAAATAAAAAGGGTGTATAAGCAGCGTAATAGATAAAGAATGAACTGAGCTGTATTGGATAAGGGAA:1 + chr2L 8361247 3' + Doc 4475 1 72.73 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTAATGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATATGTATATGTATGTGTAATTAT:1 - 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chrX 3321714 3' + Stalker3T 203 1 54.44 GTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - I-element 170 1 71.88 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGTCGCATCGTTTTAGCCGAAAA:1 - chr2L 20797682 3' - P-element 38 1 29.41 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACTCATTGCTACACCGCACATATGACGTACACTTGGAGAAACAAGCACATTCC:1 + chr2R 9138775 3' + pogo 2069 1 57.27 ACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCTATTCTTTGCAGCTTTCTTAG:1 + chr3R 7848774 3' - blood 65 2 86.36 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAG:1 + chr3L 20039852 3' - Doc 50 1 65.45 GCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAATCGCCAAACCGGGTAAAAACACAGCA:1 + chr3R 8533464 3' - copia 5026 2 71.11 AATATGTTAATGTTACCAGTCCATGTTACAGTGTAAAAGCCAAGATTACAAAACAAACAAACAAACAAACAAACTGGAACTCCAGCTCCAAAATAAGTCCAAAAAATATA:1 + chrX 3927087 3' + HeT-A 5849 1 54.55 AACATAGCAACAAAGTGCTCCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAG:1 + chr2R 8397482 3' - 412 59 2 78.18 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCCCTGTACAGTGG:1 + chr2L 14141340 3' + hopper 1413 2 62.12 GATTTTGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACAGCTTGGATGTGGGCTCCCTGCTGCTGCTGATGGCG:1 - chr2L 10901381 3' - 3S18 5700 1 60.00 CGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTTTTCTTGTTTACATGTTTTATTATAGGCACATGTTTCTTCA:1 - chr3L 4264964 3' - Transpac 4959 2 57.27 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTATTAACATTCCGTAATAGATTTTGTATTTAAGCATAACCATTCTACAACTCATTAAACTATTAAACATAAGCCCCCG:1 - chr2L 11762148 3' + mdg1 7450 2 72.73 TACATAACACGTGCAGACGCACAGGTGTTTCTGGGTTTATATAGACCAAAAATTGCTTTTCGAATTCATGGCA:1 + chr2R 16900890 3' + NOF 58 2 75.34 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATAATTAAAAACCATTTCGTAATTCACTTATT:1 + chr2L 16529263 3' + blood 335 2 70.41 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCTAAGGTTCGTACCCACTT:1 - chr3R 11474892 3' + hopper 1379 1 60.00 AAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGACAAAGATGCCAGGACCATTTTGATTATAAAAATAAGTTGGGCAATTTCACAAGCAAATATAATTCATGCGTCGAGGGTTG:1 + chr3R 8264411 3' + micropia 5301 1 76.85 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTCTGTTTGTTGTTTTTAAGTTTTACAGCGCCTCTGGAA:1 - chr2R 17436711 3' + Tirant 390 2 55.56 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGTTCATCATGAAATCCTCGTTATTGATTGTATTTGATAATTAGTT:1 + chr2L 17785863 3' + roo 9030 1 60.00 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTTCGTCCTTTCTGGCACTGCGTGTGTGTGTGTGTTCCTGGGCAATTAGGGCTATGACATTCTG:1 + chr3R 13733049 3' - hopper 14 1 63.55 TTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGATCGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTA:1 - chr3L 15099558 3' + G4 3813 1 68.04 GAGCCGTACGATACATGACAGCGCCCCTCCGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCCGCGGTACCCGTGCGGAAAAAGAAAAATAATAATAATAGAATTAGAATTATAAAT:1 - chr2R 8033664 3' + Cr1a 4395 1 65.74 CATTATTTTCTAAAAAGTGAGTTTTTAGAAAAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAAAATTTTAAAATTATATTTTAGTGGGTGGAGGACAG:1 + chr2L 21252400 3' + HB 263 1 63.33 TTTTTGTTTTTTTTTTTCTCTTATTTCCCTTCCCTTTTTTTTT:1 - chrX 7986059 3' - gypsy7 5012 2 86.05 AGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCATCTCCGCTTCCATGTCTCCCCGCTGATTCATCCCGCACATTAATATTTT:1 - chr2L 20519547 3' + F-element 4440 1 55.45 TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATTCGATATAACGACTAATTCGATCGATCAT:1 + chr2R 10129801 3' + Burdock 220 2 70.00 CGTAACGGCCATACATTGGTTTTACACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGTGTGTAAATTATGTTGGGCAATATTTACTCGCCTATAAGCCA:1 - 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chr2L 769980 3' + roo 9039 1 59.26 ATGCATGTGCAAGATTGTATGTTGCTGGAGCTCATACTAACGTGGTTGTGGTTG:1 + chr2R 4704872 3' - rover 7002 2 74.07 AACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAAAGGTTAAGGGAAAACGTTTAGCACATCTAGACTTCTTTGCCGTGAGTATACCCATTACCCCAC:1 - chr3R 24867474 3' + roo 9060 1 67.35 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACAT:1 - chr3R 17673752 3' - FB 30 1 53.70 TTATTTTATCATATTGCTAGGAATTTGTGAAAACTAGGCAGAAAGTTATATTCATTTTGGGCACAACAGATACACTTAACAAACACGCGAGGATAGAACTTGCGTCAAAT:1 + chr3L 9163278 3' + 1360 3107 1 81.82 AAAATCCACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCAACTCACACAAAGTTCTACTTCTGCTGCGGCTCCATGAATTTTGTTGCTTTTT:1 - chr2L 21013564 3' + Burdock 6390 2 56.57 GCGCTTGGGATAGCCTAACTAATTAGAATAAGCAGCAGTGTAAAAACTAACCACAGCGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCACAAAACACACAGTGGATGAAA:1 - chr3R 15506804 3' + GATE 100 2 77.14 TTTGCTTTTGGAATGCAGAAATTACAATGCGTGCAATTTCGTAAATATATTTAGATGGTTAATTTTACCTTCGACAAACATAGAAATTAAATTAAATTTTATTGCGATTT:1 - chr2L 10382836 3' - Transib5 200 1 55.45 ATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTTTTCAAACGCAAAATCAATTTTTTTTTATTTTGTACCCTCAGGCGAAGAAGACGACGGAACCGAAG:1 + chr2L 16080478 3' - invader2 417 1 61.70 CGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGCTGCGGGGATTCATTTCAGTACTCATCACTAGATATAGAGTCAATT:1 - chr3R 26493002 3' - TAHRE 10413 1 57.80 ATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGAATCGATCTGTGTGAAGTCGTAGAAATGCAATTTGTGGTTTCAAAGCGTCTTGAATGAAAGCCCCATTCAGGCTCAACGCT:1 - chr3L 2391817 3' - Idefix 7094 2 79.09 GGACAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAG:1 + chr2L 23295855 3' - micropia 31 2 60.22 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTATTGTCTTTTTTCAGTCAAATTATGAGAATACCAGAGTTTTCTGGGAATGCGTGTTACGCATTAGAAGTAAGTA:1 + chrX 16693868 3' + 1360 3382 2 72.48 CGCACACAATAAACAATATATTAATTACAACAAAAAGGACGACAGCTGAAATGAGTACAACAAATCAGGAACCAACATCCGTAGAAACTACTACCAATTCATCGAATCAG:1 - chr2L 9898301 3' + hopper2 1307 2 76.36 GCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCGTATTATAAATATATATATTGTAACATATCTCCCCAACCACACACACTATTGTACACAATCACACACACGCATTAATGTC:1 + chr3R 3375514 3' + opus 7500 2 78.18 GCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGAAAGACAGAAAGACAGCTACAAAATCACGTTCGTTTATAATCGC:1 + chr3R 11057963 3' + micropia 5373 2 58.49 AGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAGAAGAAAAGATAAGAGAAGAAAAGAGAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAG:1 + chr2R 6629974 3' + Stalker3T 204 1 30.39 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCATTCAACTTATATTGTTAAAGTAACGAGAACTTGGTTTAGCGATTAAGTTG:1 - 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F-element 11 1 63.64 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAAGTGAGGATTAAAATTAGCT:1 + chr3L 18077311 3' + Transpac 5197 2 72.86 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGGTATTTTCGAATAGCTTCATAAATGGTGGATCATGATCAAATTATATATAGAACTTAATTTCTAAAGTTA:1 - chr3L 9822211 3' + pogo 2087 1 51.82 TATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACCTACAAACGAATGGTTTACACTCACAAAAAAATCAGAGATATCGCCCTTGATCTAGCAGACG:1 - chr3L 13540226 3' + Idefix 7 2 60.00 AGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGTCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAAGTCTTTGGCCAGACCCAGCCTTTATATGCTTAATTGAAACGT:1 + chr3R 25809633 3' - 1360 49 1 71.43 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATGTTTATTATTCGATGATATGATTATTAATTGTTTTATTATAAAATAAAATCTGTGACGTGTGTAATAAATATG:1 - chr3R 14996606 3' + roo 397 1 73.64 TTTGATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGCGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTTTTTTTAGTTCCCATGAAAGCTTTCCAATTATCTTGTATTTCGACAGATT:1 - chrX 8658524 3' - I-element 249 1 52.73 AGAAAAAAAAAAGAAGTGAAAAAGAAAAGGAAAATGGGGTGCACAATCCTAAATGTTCCATTTGAATGCCCAACAGACTCGACAC:1 - chr3R 18200633 3' + gypsy2 405 2 71.76 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAGAGTTTCTTGGGGTGCTGCCATAGTCTGGAAAGCGTCTGGGTTCTAC:1 - 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micropia 451 2 71.82 ATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACCGAAATCAGAAAGCGATAATATTCTAAG:1 + chr2R 16649836 3' + F-element 4319 1 71.13 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTGTCCTTGTGGGGGGCAAAATAAAAACACTTTCTCTC:1 - chr3R 5671362 3' + 1360 3387 2 77.45 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAATTGCGTTTCGGTTTATATTGTGTAATCCTAAGCATATGATTGAATGAAAACAAGTAGAACATTTAA:1 + chrX 6866874 3' + S-element 1709 2 38.24 TTTAAATAATAAATAAAAGGCTACAAAAGTGCGCTTCCAGGAGAAACAGAAGGAAAAGAAAACAAACACCACAACCTACAAAACAAGCAAAGAGAAACTCATCCGACA:1 - chrX 15741570 3' + G2 3054 1 77.78 CTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGTGCCTATATCTTTTCGAAATCGACTCCGTGGTGACTCAGCTAAAGAAGAGCGGTGGTCGTGCCTTT:1 + chr3R 4239636 3' + Cr1a 4346 1 55.91 GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACT:1 + chr2R 8315514 3' - FB 85 1 66.67 CCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTTCCAAAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACA:1 - chr2L 16071771 3' + 17.6 7178 2 67.27 TTCTTGGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCTCCATGCGAAACAATCGTGTGCCAAAAAATCGTAGTGTCTTTGGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTC:1 - chr3R 4487815 3' + 1360 240 1 59.09 GTTAGGTCATGTCTCTGCTAAGAGTGCTGGATAATCGTAATTTGTCGGAACTCGCTTGCAGGCTGATGAAGGATGTTTGAAGGCGGAAATTGA:1 - chr3R 14657004 3' + baggins 130 1 56.99 CAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTGTTTTCAGGGGGTTGCTTTAACCATTGAGTTAATGTGGCGTATGAGTGA:1 - chr2L 9408155 3' - Doc 4637 1 60.00 ATTAGAATATTTGTCATTAAAATATTCAGCTTGCGACGGGTGAAAAATTAATAAATTATAGCAGTAGCAGCAGGTCGAG:1 - chr4 779497 3' + 1360 397 1 68.35 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAGCTCTTGTTTTCATTCCGTTT:1 + chr2L 20797704 3' + P-element 2841 1 31.18 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAATTTACATTTTCCCCCAAAATTATTGTATTTCGCGATATTTTTAAGTGTAAACAGCACAAGGTG:1 - chr2L 7841309 3' + jockey 4981 1 55.45 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGGGTAACTGAAGCCCCAGGGTTTGTGTATTGAATAAAGACAGTGTGAAGCGAGCT:1 + chr3L 25414252 3' - blood 7045 2 50.91 GAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTGTTTGCACTTAAGAACTTTAT:1 - chr3R 24260865 3' + roo 9063 1 69.15 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTAAATACTTATTTAATTACAGCATTTAATGCATTGGAAT:1 - chr2L 19320460 3' + Juan 4169 1 71.82 TCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGTGCGCCGCCCCTTTAAGTACTTTGAATTATTATCAGCAGCAGACAC:1 + chr2L 14014707 3' - invader1 392 2 50.00 AGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGACCAGAAGTGCAGAGTCTGTGGAATAACAAAACAAATCAAATCAAGGCTGGACTTAAA:1 + chr3R 18428076 3' + Tabor 108 2 62.04 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGTCTGTACAAGTACAAGTACAATATTACAATAATAATTATCATGAATAAT:1 - chr2R 883086 3' - F-element 29 1 45.45 CATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACAAATGGCTGTCATGTAGGTGGCTTCCGATAAATTCGCTCACTCGACCACTGTTAA:1 + chr4 1062226 3' + I-element 5062 1 77.78 TATTACCAAATAAATAAATACAAAAAACACACACAACCAAAAACGTTGCTGTAGCCTAAGTCTAAATTGAAAACTGCCTGAATGTTGGGATAGGGTACTCGACAA:1 - chr2R 7360892 3' + Tc1-2 473 1 58.10 TATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAGGCAAATGCAAAACGCAACAAAACAAAGCAACCGAAAACATTTCAATTTTCCTGACAACTGCCAGACCAAA:1 - chr3R 19545968 3' + F-element 4640 1 66.06 CTCTAGCTTTATTATTTGACTTTACGCCAAAAAGAAGACGGTGGTGCCCGTCTTGGATCTCAGCCGCAGCAATATTCAGACCGTCGAGG:1 - chr3L 11150583 3' + transib3 2829 1 70.79 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGCCATTTCACGATTGATATTTCTCCCCCGTAATAAGAAGGTGAGCTCAACTATTAACCAACCATAATTCAGTCATTGAAAATG:1 - chr3L 14261256 3' - mdg1 7043 2 70.91 GGGGGGAGGTAGATGTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTTGCTGTGGAGTAGGGGATTTAAGTGGATAGGATCTGATCT:1 - chr3R 21009287 3' + invader1 143 2 63.64 GAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGTTGTTGTTTATATTTCTGTAGAT:1 - chrX 12968791 3' - F-element 4494 1 64.52 TGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTTTGTTATTCCTGTTGATTAGATTTAGCTTTTTGTTTTCGGCTTTT:1 - chr2L 3907596 3' + hobo 2789 1 54.55 GAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACTTCACAGCCCCGGGGGAAATTTTAATGTTAATGGGCATAAAAGCG:1 + chr2R 19233085 3' + micropia 5235 2 59.09 TCGCTCACGCGCCAGAAAACGTTATGCAACAACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAATAGTGTCCTGATGACTTCGACATATGCATGTTTTTTTCCTTTTTTTTTTGTAGGT:1 + chr2L 17393648 3' + invader1 3951 2 76.15 CTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTACCACAAATTTTGAACATCAGTTGTTCACAAGAACACAGGATACACGAAATA:1 - chr3R 13181162 3' + Doc 305 1 55.43 CGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAATTCATATATAAAATTCGTGCTGCCGAGGCAGGAG:1 + chr2L 4674773 3' - I-element 34 1 69.89 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGTTTTTATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACA:1 - chr3R 19450017 3' - copia 4903 2 53.64 TCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGCTTTGTCAACATAGAAA:1 - chr2L 13292953 3' + X-element 4694 1 56.12 ATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTTTTCCCCATATTTTCGTTTCGTCTGGTCAGCGCGTGCTGCAAAATAG:1 + chr3R 8480535 3' - hopper2 1169 2 60.00 CTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATATTTTCGAGCGAACTAAGATTGTAAAGAGATAGCGTATATGGCGTAGTTTATTTTTTGCTTCGC:1 + chr3R 25051681 3' - 17.6 6943 1 69.09 CCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTAGCACTGAGTATTTAGCCTGAAGACTGCTCAATTTTCTTCAATCT:1 - chr2L 5443782 3' - R2-element 3467 1 59.09 AAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTATGATATCGTTGTATAAAAAAGGGAG:1 + chr3R 23730036 3' - Burdock 53 2 75.45 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTATTAAACGTATTTTATAGATCATTTTGTTCTCATATGAGTGTAAGCGGAA:1 + chr2L 770060 3' - roo 19 2 58.06 CGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATCTCCATGAGGTTACGTAAATGTGCCAATAAAAATACTTAAACTTCATTAATAAACAATTATGTGCCCCGTTATTGCT:1 + chrX 7369007 3' - invader4 445 1 60.00 TTTTTAATTTTTTTTTTAAATTTTACCCAAACTTAAACATAAGAAATGATCAAATACGAGATATAAAGACCCGAAATAACAAGAGAAAATTTAAATGCAAACAAAAACGA:1 + chr2L 9148102 3' - TART-C 11098 1 63.64 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTTTTTCAGTGTTTCCTTTTTTTTGTGGGGGCCTTGAA:1 + chr2L 18694079 3' - pogo 22 1 57.78 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCTCTCTTTTAATTAATTGTCATGTTTTGTTA:1 + chr3R 563975 3' - HMS-Beagle 18 2 64.55 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTAGTCTTGTTAATTTCGATGTGCAAAAAATCTTTTAGCTGG:1 + chr2R 5266013 3' - opus 7024 2 55.68 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATATGTAACTAAACAACGGGAAGTTATGCGAGGTCCAGGG:1 - chr2R 2752371 3' - copia 4916 2 68.18 ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGCATTTCCAAGTAAGCTTTATTCCAGGTTTAATACGTACATTATTGCCTT:1 + chr3L 20897062 3' + Tabor 450 2 55.45 AAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGCTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACAT:1 - chr2R 1320699 3' + diver2 4854 2 59.26 GTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACGACAGTAACAAGCTTGTAAATAATTCAGGCCCCACCTCCCGCACTTTAAATGGTT:1 - chr2R 14345802 3' + Juan 69 1 54.55 TCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGATACCGATACCGGGACTCAAAGCGAATCCGA:1 + chr2R 18225769 3' + Dm88 4480 2 71.19 ACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAAGATGCTTATAAAATCAAACAAAAATGTTAAAAGCAAAGGAAATTCAATAAAGGAAAAATGAGTAATTATT:1 + chr3L 10777605 3' + flea 273 1 66.97 TGAAGTGAACACCAAATAAAATAAACCAAAAAGTGCCAAAAACGTTTGCAGGCAACAATAACAGCAGTAGCAACGCCAGCTGAATGCAACAAA:1 - chrX 19112024 3' + F-element 76 1 76.34 ATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCGAAAAAAGGGGT:1 + chr3R 902598 3' + R1A1-element 5296 1 60.95 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCATGGCCGATACGCATCTTAGAGATTATATTGGTCTTTGGTAATAACTAA:1 + chr2R 24919329 3' + transib2 2791 1 67.89 GTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGTTATGCTAAATCTATTCAGTTCTTAATTTAATTTGATTTAGTGCGACTTGACCCGGGAAGTGGAT:1 + chr3L 11243828 3' - I-element 5106 1 71.43 CACTCGAAGGTTCTTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTTGTTATTTAGATTTATGGCGCTTTGCTCTTTGTTGTTGCCAACATTTAT:1 - chr2L 19614341 3' - 297 444 1 60.91 TCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATTACTAAGCGTCCCAAACATACAAATGCGAAAATGTTTATAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chrX 4942272 3' + Doc 4431 1 59.60 AATAATTAAATTAATAATAAATAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAGAAATTAAATAAAATAAAAATAAATGGTTA:1 - chr2R 15155173 3' + flea 232 2 63.64 CGCAATATGATAATGTTACCAGTCCATGTTACTGTCAAAAATCTAGTGCGGAAAAAATACTAACTAGGACCAATACTATTATTTATACCTCTATAATATTTATAAAATAT:1 - chrX 12113312 3' + HeT-A 5846 1 75.45 GTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTTTTGTAGTGCATTTACAGTATTTGCGCATTTACAGTTTTTTCTTTGCTTTTTGTTTTCCCCAGCATTTTGACATAAAAT:1 + chr3R 28449758 3' - 297 6508 1 78.18 GCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAAGTCTAAGTACGTTATGGTCTCCAACGATTGCAGGGTATCGC:1 + chr2L 5595552 3' + Max-element 8513 2 51.72 TAGATCACTTTTGCATACTCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTGGCAACCGCTGATTTAATG:1 + chr2R 24388334 3' - BS 31 1 76.25 TTCGATTGAAAATCATTGTAGCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATTTTGTTGTTCATAAATCAGTTGCAATTAAAATTA:1 - chrX 19876498 3' + Tc1 1540 1 55.56 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATATATATAAGCTTGTGAGCTATACCTTAACTTTATTTTTATGTATATTTATTTGAGCTACACAAC:1 + chr2L 2484431 3' + jockey 4967 1 50.91 GTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGAGGCGACGCAGCAGAGCCACCGATTTGTTTTTGGACG:1 - chr2L 14635379 3' - 297 6761 2 58.89 CGCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGGAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGCTACCATACATTTTATACCCGTTACTCGTAAAGTGAAA:1 - chr3L 27367104 3' + Chimpo 128 1 72.48 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCAGAGACACAACAA:1 + chr3R 23861146 3' - pogo 19 1 61.36 CCGCTCTGCCTCGTCATCGGCCTGCACATTAAAACCGCACAAAATATGGGACAGATGTTTGGTAGCGAAAGGGTCTTGGCTTGCG:1 - chr3R 29267166 3' + F-element 452 1 78.82 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGTTCGAAAGGTTGAGATTCGATTTCGTTTCTAAGGTTCGTACCCACTTTGGGGTTAGCATTTATCGGGGCA:1 - chr3R 11474869 3' + hopper 1405 2 71.03 TCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr2R 5064833 3' - Stalker3T 205 1 50.91 AGAGCCTACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAAAAAAACCGAAATAAATGTAAAATAAAAACGAGGAAGGACAGAAACCGCAAAAATATATAAAA:1 - chrX 4978633 3' + Doc2-element 4610 1 64.00 CGACGAAATCTAAAGACACAGTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCCGGCCAACCCCCCGCCACTC:1 - chr2L 14021935 3' + G2 2816 1 77.66 TAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 412 4 2 31.46 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTATATTTTTTCTGTGCTCACTCTAGAATGTCCTGTGCACCG:1 - chr2R 20436712 3' + opus 7475 2 61.62 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATCAACAAGAAAAATGACAAAATCAAAACGCAAAAC:1 + chrX 17330164 3' - opus 154 4 68.93 TTATACATATACATATGTATGCAGAAGGTATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGATGCCAATGATAGAGACGAAAATAATAAATGCAAAAATTCAAGTAT:1 - chrX 8094222 3' - Stalker4 7198 4 73.15 GTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTCCATGTTGGGCTTGATGGTCGGATGTGTTGG:1 + chr3R 25911442 3' - Rt1b 4955 1 70.51 CACAGTTAGCACCGTTTAAAGACCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGGAGAAACGCAGTTGCGGGTGGGAAATTGCCAATGGCACA:1 + chrX 8343109 3' - Stalker 471 1 58.95 GTGTTCATGTGTGAACACTCTTGTTAACTGACTTTTTTTCCCACCTGGGTAATTTCCGCTTAATTAGTGCAATGACAGTGACCAGCAGTCGTGG:1 + chr3R 10203080 3' - roo 8660 1 78.72 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGAACACAGTAAAATTCATGGAAATATGAACGTAATGAAATGATGTAATGTTTGTGAG:1 - chrX 16693756 3' - 1360 25 1 54.72 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCCATCGATAAGAAGGCAAAATCCAGTGGCCAAAAACTGGGAAAGACGACCATCCGCGGCAAG:1 - chrX 10300729 3' - 412 13 2 65.31 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGTTTTTCCTTTTAAGCTGGAATACTTAAAATACATTAAAATTT:1 + chrX 5018781 3' - roo 43 2 65.45 TTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATATTAATTTAGAATTTGTAGAACTAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATT:1 - chr3L 19339316 3' + Tc1 1636 1 66.36 TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACACATGAGCCATAAATTTATCTCCAGAATGTGC:1 - chr3R 7874838 3' - jockey 4723 1 70.91 TACGTTGGTCAAAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAGTTGTGAATTTGCTCAAGAATCTAAATAAAACTAAGGAAACGGATGAAAAGTTGCATCTGCTG:1 + chr2L 6609776 3' - HB 226 1 80.00 ACCCACTCTAACGCCCACAAACCGCGTACGCGCAAACGAAGCAAAGCCAATAGATCGGATCTGAACAACTCATCCTCCA:1 - chr3R 24624672 3' + INE-1 218 1 78.48 TATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACACGGGGAGGAAAACACCAACCCCCTGCCACCCCTTTC:1 + chr3L 13226834 3' - Cr1a 256 1 61.90 ATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAATTTGTGACCAAATATTTGATAGGGTTAATTGTATTCTAGGAAGGCATAATAAAGTAGAA:1 - chr2L 12467462 3' + INE-1 536 1 65.22 CATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCGATGTGGTGGAAT:1 - chrX 17193321 3' - F-element 183 1 57.27 CATACGATTTTTTAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTATGTATCTATGGATTTAATTTAACTTTTTCCGTTTTGATTTTAATATGTATTTGATT:1 + chr3R 24695506 3' + 1360 33 1 54.55 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATCATATAGATTGCTTTTAACTATAGAATGGTCGACTTTGA:1 - chr3L 13023959 3' + 412 490 2 71.82 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATATACTGTTCCTATTCTCTTAATCAACTTAGCCTCCACTTCTATTGA:1 + chr2R 2752433 3' + copia 227 1 54.64 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGGAAGTGGGAGTTGTTGCAAATGGTAGCGGAAATGG:1 + chr2L 1777400 3' - FB 67 1 52.70 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTAGATGGTTTTAAATTTCCTTCACGT:1 + chr2L 21034152 3' - 412 10 2 71.82 CCGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTCCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACACCAACTAATAAAATCTCTCGATTTTTCTTTTCCACTCA:1 - chr2L 15988707 3' + 412 7516 2 54.74 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCGAGCCACCAAACCGGGCTCAAAACCATTTTATGCAAGCAAG:1 + chrX 12145217 3' - 412 34 2 58.59 GCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGA:1 - chr3R 6937630 3' - F-element 191 1 76.42 CGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCAACCAACAACATTGCCATTGAAATATTCGAAAACCTGCCCATCGGAACATTTGTT:1 + chr3L 20014371 3' - invader4 2750 1 52.78 TTGTGAATTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGTGTTTATGAATGGGT:1 - chr3R 22500808 3' + invader3 246 2 52.53 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGCACATATGCTAGTTTCTTTTTGCAGCTGCAATATTTTGCATTAATTAGAAAGTGGGCCATG:1 + chr2R 14588927 3' - jockey 4785 1 56.36 AAATGTATGTATGTATTACAATGTATTACAATGTATGTATTACAATGAATGTAATTCCTATTAGAGGAAGAAAAATATCGATCATAATCATTAGCCGTATAAGTATCCTG:1 - chr2L 10867592 3' - ZAM 265 2 48.18 CAATTTATTTTGCCTTTGATTACATAGAATGCAAATCGCAAAAGGGGTGGGAATGTTTGTGCAAAGTTTGTGGGGGGAGGCGCAAAGGGTTGGG:1 + chr3R 18204429 3' - TAHRE 10375 1 71.28 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATA:1 + chr2L 4016898 3' + opus 7449 2 74.29 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATAATAATTAACTACACAGGAGTTGGGAGCCAATTTAATGGGTGTGGGTGCTGCAACAG:1 + chr3L 16301137 3' + mdg1 389 2 55.67 TGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTGGTATAAATTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTGTATTTTCTGTTCCGATACGATTTATTTGGACACTGTCC:1 - chr3L 18495656 3' - I-element 5196 1 70.91 TAATTTTGTCCCTTATAAAATGATATCTGTTTTGTAGGCTTGTTACTCTGCCATTTTCTTTGGCCAGCAGTAAATCTTTCATAACCTTTTTTGGGGTGCTTCACTTTCTT:1 + chrY 68049 3' + frogger 356 1 60.00 AGTGGTCAATGCCTTATGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATAGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGAGGTTATAGAAATAATGGTGGAG:1 - chr2R 5975318 3' + Stalker4 7181 4 77.67 CGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGG:1 + chr2R 5173209 3' + Stalker 379 4 52.88 GTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTTTAACAAGAGAAATTACGTTATAAAATTTTAAGGACTATGCG:1 - chr3R 22979359 3' - Juan 4128 1 66.36 CCCCAGAGTGCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCAAGTTATCAAGTATTGCGATTATTATTTGGGACTCGGGGGCGAAAGTCCCTTATTGTTAGTTTTTACA:1 - chr3L 6199354 3' - Porto1 4273 1 67.27 CTTCTCGCGAATCGAGCCCGACGGAAGATGTGGCCAGAAGAGGTGGTATCGNGAGACAAAATAAATTTGGGAATATTT:1 - chr3L 1270601 3' + Cr1a 4382 1 61.54 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATTGTTCACGTTACTTATATTTTCACATTCAATCCACTGCCATTCGCA:1 + chr3L 8811580 3' + diver 6073 2 57.27 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTAAGGGTATAGATTAGTCTGCCTTACAGGGCATGTAATCTTATA:1 + chr3R 11937282 3' - pogo 21 1 54.17 GCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTTCCCACTTTTCCTCCTCATTATTGGCCTATCAATGTGCGCTGTGT:1 + chrX 4306150 3' + FB 626 3 61.68 AATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCACCACGACGACAACGTGTACTCCAACGACGACAACTACCACTACGACCACAACGACAACAACGAC:1 - chrX 20394796 3' + F-element 4307 1 60.00 TATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTCTATTAAACAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTATTCTATTCTATTCTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' + invader6 34 2 66.67 TTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATT:1 - chr3L 21773111 3' - INE-1 154 1 77.50 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGACTCATGGCTACCTTTCAGTTCCCAACATTTGCATTTAAATTAT:1 + chr3R 24260949 3' - roo 29 2 56.70 ACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCATTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTTATCCCATGTAAAAACAGATTGAGGAACTGATT:1 + chr2L 21007703 3' + I-element 4979 1 72.73 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATCAACAAGAAAAATGACAAAATCAAAACG:1 + chrX 17330158 3' - opus 38 4 72.34 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGGTTGGTTGTTTCTTTTGTAGC:1 + chr3R 14743170 3' - FB 59 1 81.55 ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAATTCCATTTTTTTATATTATTGAATGTAATTCAATATTTTGCCTTTGGGTAAAAA:1 + chrX 23283048 3' - HMS-Beagle 28 2 52.73 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGGACTTTTTGGCTTGAAGTAGGGAAATGTAGGAAAATGTTACTATCA:1 + chrX 9213690 3' - jockey 4804 1 58.18 TGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTGC:1 - chr3L 10911511 3' - springer 7164 2 62.50 GTTATGGTTCTCAGAATCTTTGTTTGTGCTCGCTGTTTGATGTCAATATTGCTGATGCTTGTGTTGCTGTGCTGTGCGCTGTTGGTAGTG:1 - chr3R 24291555 3' - F-element 4335 1 82.22 AAGTGGTGTTAACATGTAGTTGTTTGAAACATATTCTGGGCTGATTTATGCAAGTGTGTTTGCATATATATATATGCTATGTAGGCGGTGATTAAAATGG:1 - chr2L 6890544 3' - hopper 1053 1 34.00 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAG:1 + chr3L 131817 3' + P-element 2884 2 72.73 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGACAGACTAGGTGATTCAAGTTTGGAAGGAAGC:1 + chr2R 8397505 3' - 412 32 2 57.55 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACTATAAACGGCGGGGTATTTGGTATCGAGTTGCCCAAGGG:1 + chr3L 17153641 3' + 297 6968 2 64.00 CAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAGAACGCGATTTGCAAAAACTCTTGAAACAAAAATACATTTTGTGCCAGACGAGGAACGACAAACA:1 + chr3L 8736404 3' - Cr1a 229 1 65.45 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTCTTCTTCTTTCTTAGCCA:1 - chr3L 27174934 3' + pogo 2060 1 78.89 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCATCCGATGCCAGTAGCGTTTCGGTTCTCTCCGG:1 + chrX 21399467 3' + pogo 2091 1 56.34 GCATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGGGTGGATGGTCGCCTGGGCATGCGGGGGAAGGCCATCGAAGCACCCATGGACG:1 + chr3R 29036669 3' - accord 7031 2 64.29 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAGTATTTATTTTATTAAGTTACTTGAATACA:1 - chrX 22717143 3' - pogo 54 1 75.45 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATCTTACTATATATGTGTATGTAAGTATGCTGAAGAAATTGATTACTTTAAAAATTTCGTAAAAATG:1 + chr2L 9488238 3' + 297 6945 2 58.18 TAAGATAAGCTATGATAAGATAAGATAAGATATGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGTGTCATCTAAATACC:1 + chr4 1261006 3' + Stalker3T 202 1 73.42 TTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTTGACTTTATTAACGGTGCAATTTGTACCGACAACTGCCAGACGGGAACCAACTGGCAGTCCGAAACTCTTAACTCTTT:1 + chrX 6637108 3' - flea 305 1 77.27 CGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAAACTAAAACTATTGGCGTCTTAATTAGCGTGCGTGTTCAATTACAATCGAGAGAGCTACTGTTGCCACG:1 - chr3L 7224652 3' + Porto1 222 1 68.18 TATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 16.36 CAATACCGCTAATCCGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGGATTGTTGTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1 + chrX 13284569 3' + I-element 147 1 62.50 CAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAATCGTGTTCTTATAGACACTAGATATCA:1 + chrX 15026063 3' - FB 17 1 60.87 CGCAATCACGGTACTTAAGGCAAAATACCGTAGGAAAGCACACACACTCGAACCAGCCTCC:1 - chr2R 16051478 3' + F-element 4423 1 67.21 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATAAAAGCCAGTTTATTAAGCTGTAAATTCAGGATCCCATTGAGAGAGGCAG:1 + chrX 22806752 3' + Burdock 241 2 60.23 TATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCTGGATGTCGGAGGATGTTCTATGTTGGGTGGGTGGTTGATTGCAGTTCAGCTCGG:1 - chr3L 12864821 3' - Idefix 284 2 72.84 GAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAAATCACCAAAAAATATATACATTACAATAATGGCA:1 + chr2L 5353885 3' + R2-element 3520 1 73.33 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGACTTTTGAGTACATTTTTGCTGTCTGGGATAATTGCGAGGTAATTGGTTA:1 - 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Idefix 7145 2 58.10 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCCCTTAAACTCGCCTTATCAGCCGAAATGC:1 + chr3L 16496268 3' + P-element 2851 1 46.36 GATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTTGTGGCCAGCCCCGAGAAGAGTTGGCTTG:1 + chr3R 22850365 3' + accord 7012 2 69.88 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGTCCAAATTAATATATAGCACGAAATATTAAAAA:1 + chr3L 8011446 3' - pogo 38 1 69.79 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATAGCATTTCCAAGTAAGCTTTATTCCAGGTTTAATACGTACATTATTGCCTTCCA:1 + chr3L 20897065 3' + Tabor 7293 2 52.29 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAGCAATATGAGCGGCAATATTACAAATCAAATATCAGAGCCACAGGATG:1 - chrX 4691185 3' + Tabor 7288 2 64.71 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCACTAAGCTACATCTTAAG:1 + chr2L 5304919 3' + flea 220 2 58.18 CGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTTTGCTAGATCTCAATCTCTACTTTATTCTCAGCTGCCGCTGTGATTTTTACACCAGAAATACTACAGCATTTT:1 - chr2L 13712089 3' - 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G-element 4197 1 66.25 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTC:1 + chr3R 28639967 3' + mdg1 373 2 74.51 GCTTAGCGCCATGAGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCTTATGTATCGACGGCGTCAA:1 + chr2R 22661273 3' - Transpac 46 2 72.63 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAACATATTCTTCAAAGCTCTTGATTAATCTTTCTTTCTTTCTCAATTGCTTGGCATAATAAATAACAATTGCACA:1 + chr3L 10836638 3' - opus 3 2 76.36 TAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTTGTGCTGCCAACTAGAGTCTGACTGCAGTTAAATTACAATTGTTCGCTT:1 + chr3R 17821645 3' + micropia 117 1 55.45 GCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACGCGAAATAAAAAAAAGTCTTGACTAACCAGCTAACCGAGACACTTTT:1 - chr3R 9711053 3' - 1731 4546 1 62.34 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTCTTTACTATACATACTTAAAAAGAAGGGGGTTCATAA:1 - chr2L 18749842 3' + pogo 2089 1 56.41 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCTCAATAAAATATACCAAGTACTCTACTCTTATTTAAATTAATACATATTTGTAAGCATTTATTATATGTTTTACAC:1 + chr3R 12040035 3' + 412 7539 2 71.82 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGA:1 + chr2L 9754866 3' - 1360 36 1 54.55 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGCCTATATATGTACGCTGCCCATTTGGATCCGCAATTCCG:1 + chr2R 25118079 3' - Transpac 9 2 53.03 GAAAATTTTTTTATTTTTTTTATTTTAAATGTTTTTTAACTCACCGCGTAAACAGCCTATCGATCTGTTCATCAAGACTCAGCTAATAAATTTTGC:1 + chr2L 7535387 3' - HB 324 1 71.88 AGATTAGTCCAATATGCTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACACCACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' - Stalker 6849 2 31.11 GTCTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATATTTTTAAAAAACGATAAAACTTGTGTGATATCGGGTAATGAAACTTTACTAAAAACATAAAAACACTACATACA:1 - chr4 1081268 3' + HeT-A 5879 1 71.29 ACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGTAGCGTTACATCGTATTACTGGGGCGTTGTAGTTTCTAATTATGATTTA:1 - chr2L 21684648 3' - Stalker 209 4 76.36 CATCCACACACACACACACACAGTCGCACACAGTCGGAGCTAAAAAAAGGATCGTGTAAAGAGA:1 - chr2R 23874140 3' + accord 7026 2 71.88 TGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTTGTCGCGGACGGCACTGTGTCCCTATTTAGATAGGAAAAATAGACG:1 - chr3R 12398245 3' - I-element 207 1 51.58 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTATATATTAGTTAAAATTTAAAAAGTAGACAAGAC:1 + chr3L 16496752 3' - hobo 48 1 70.48 AAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGGAGGAAATCCGGAACCGTAGTCAAAACAAACGAAAGCGTTGAGTTAAGAGCTGTTGGATGAAAGC:1 - chr3L 5846797 3' - pogo 296 1 67.89 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCCTATCTACTCGTCCCCATTCTCTCTTTATTTTCTGGGAAAAGCAATCAACCTG:1 - chr3L 10722950 3' - copia 20 2 57.00 CAATTCGGAATCGCTTTAATTTAGCCCCGTTTGCTCTCTTTTTTCTCTACTTTCTTTTCACCACCACCAAAAAAAAAATCGACTTAAACCCTGCCGACCGATCGTTCAAC:1 + chrX 14926125 3' + mariner2 216 1 68.18 CAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTAGTTTTAGGCATCTAATAGAGTTCATAAAAACATGTGAAAACGTGCTATGTTATGCGTGCTATCAGATACCCGTTACTTAGCTTG:1 + chr3R 29588501 3' - Transib5 2937 1 50.91 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTTTTTCACTTTTTCAGCTGCGTATTGTTAGATGCTTTCCTCTTTATTTCCTTGCAATACACACTACATTAAGTTAT:1 + chr2L 5942806 3' - X-element 52 1 54.64 AATACTTGAACTAATAAAATATATCAGTTTGCAGCTTGTCCGTCAAAAGAGTTGTGTCACTTTGAAAAAGTGTGTGTCGACTTGAGGTACCCTCGCCAACTTTTA:1 - chr3R 30255559 3' + G7 1164 1 50.48 CAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGTCCATGCCAACTTGAGTAATATGCTTTCTTAAAG:1 + chrX 5859375 3' - BS 47 1 64.21 TACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATTCAAGCAAAATTTTAAAAGAAATTTCAGCAACTTGCTCACATATTT:1 + chr2R 21795441 3' - R2-element 3534 1 58.18 AAACCGGCAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCCCAGCTCTGCGCCGTCAACTCTCCTGACCCTGACAAATTTATGCGCATCATTAGGG:1 - chrX 21243419 3' + G6 454 1 58.18 TAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGTATGGCAAGGTAAATATGGTAGTATCAAAACAAACTAAAATTATATGACAAATCT:1 - chr2R 22957694 3' - 17.6 236 2 54.55 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGTGGACAGACATAAACTTTGATTGCAAAACTAATTACAGA:1 - chr2L 13836516 3' - blood 11 2 63.41 CGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATAGGTAAAGTGCTTGCCGGCAGTATAAGTGTCTGGGGAAAATGAACATATCTGCGAGGCTCAAAA:1 + chr2R 18507930 3' + Bari1 1699 1 68.37 TGTGGTGTCGTCTAAGTCTATCACTATATCTGCTATTGTGCCAAGAAGAGGGAATGCATAGAAAACCGGCAGACCACAGTGCAGCAACGCGTAGAGCTGCAGCGCATC:1 + chr3L 258695 3' - BS 4858 1 70.37 CGCCCTAAAACCGCCCAAGACTGCCACGCCCACATTTTTGAACCATTTTTTCCTCTGTAAATATTGCATGTCGGTGGCTCCTG:1 + chr2R 16620905 3' + INE-1 346 1 62.65 GTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTGAAGGGGGAGGGGAACGGGAACGGGAAG:1 + chr3L 19418674 3' - F-element 4593 1 72.55 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATTTCCCTTGTTTGCAATGAGACATTTGTCCTCCACTATCTTAATTCCACTGTACTTAGACATTATCTTGACAA:1 + chrX 15046825 3' + S-element 1706 1 71.82 GAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCAGTACACCTACAAACAGTACACCTACTTCTTGGCCACAATGCATGATGCACAATGCTACCTGCGGCT:1 - chr3L 8687952 3' + baggins 5384 1 60.95 GCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGTCTTTCTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTCTTTGTC:1 - chrX 16983077 3' - F-element 4435 1 60.91 CATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGCGGTGTATTGGCCCAAAAACTTGTTGGCCATCCGTTTCAGATTA:1 - chrX 6635512 3' - I-element 5038 1 60.00 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTGTTCTACGGTACCACAGCTGGGCAGCATATCTTTCGTTATCTAAG:1 + chr4 909016 3' + 1360 3363 1 95.65 TTTCTGGGATATCGATAGATATTGGAGAACAAAATGGGTTAAGTTGGTTGGGCTGATGTCATTTCAGTTGATTATTACCACGACGTTGGGCAAACATAATTTAAAACGTG:1 + chr3L 2010925 3' - INE-1 498 1 69.09 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAGCAGACGCCTATTAATATAGACCCCAC:1 + chrX 9576576 3' - FB 39 1 75.56 GAAAAAATACAAACTAAATACAACAAAACAAAACAGACGACACATTAAACATGCATCCT:1 + chr3L 10386805 3' + Penelope 247 1 93.22 TACATTTCCATATACATACATATACATATACATCTCCATATACATTACATATCCTAACAACAACTACTTTTCCACTCTACACTCCCAAAGATGGTTCCATTCACTTGCTC:1 - chr3R 18623550 3' + ZAM 188 2 50.91 GGTAAGCTTCGGCTTTCGCCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACACTCACACTCTCTTCGTATG:1 + chr3L 13228547 3' - P-element 26 1 50.00 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACTTTTTTTATAAGTTTGACGTAAGGGCTAAAAAACCCATAG:1 - chr2R 16036034 3' - jockey 4684 1 53.25 ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAATTAAATTAAAAATTAAATCATACATAAAATAT:1 - chr2R 4137702 3' + Juan 4159 1 77.06 TTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTATGTTTTTGTTTTGGTTTTACGTTTTCCATTTTATGCGATTTTCGATTACACAACG:1 - chr3L 6018524 3' - Doc 4628 1 60.91 GGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGTCAGGGTCGGATGGGGTGGGGTTTTCATTGGGGAGAGT:1 - chr3R 20792629 3' - FB 916 3 63.37 AATAGCTGAAGAAAGTTTGTTTAGTTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACACCAGCTAGGGCCGACAAAAGCTGAACTCTTTAGAACACTCGGTAA:1 - chr3R 30513517 3' - diver2 322 2 76.92 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAAT:1 + chr2R 13699475 3' - jockey 4801 1 60.00 AATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGTTTGTTTAAAAAGAAATTGTATAATTGTGTGCGATTCCACTCTCGTATT:1 + chr3L 11715169 3' - FB 353 1 60.44 TTTCTACGCATACCGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACCTTTGCCCTTCAGTATGAGAATGTTTCAAATTATGCTTGA:1 - chr3R 27614184 3' + 1360 146 1 74.55 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGAAATATTGTAAGTGCCACAGAGTCCAATGACTTGACCACATCCTTTAAATT:1 + chr2R 9963737 3' - pogo 17 1 60.00 AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGTATCTCAGTATTATCCATAGTCATT:1 + chr3L 1636147 3' - mdg3 18 2 40.91 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGGTTTTCCTTCAATAGGTTTGTCTTAATTATTGTGGAGTCT:1 + chr3R 1220379 3' - copia 4916 2 65.45 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAACTGCAGTATATAATCGTGCAAAATCCGTGGCAGTAAATTCAATTCGCCGAGGCGCG:1 - 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roo 47 2 69.44 GTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCTTGTTGCTTCGCATGTAGTTAAATTGTTTTTGCCACTGCCATTGCCCATTGCATCCGCCCTTTC:1 + chr3L 10485747 3' + Cr1a 202 1 74.04 AAATGTAAGCAAGTAACATTCACACTTAACCGGCAAGACTACCCTTCGATCACTTTGAACAACAACGTCCTCCCGCAAGTAGGTGAAACAGCCGC:1 + chr3R 31488873 3' + Fw3 3073 1 76.84 TTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCTTCAGACCCAAAGCGCCCCATTATCCTAGAAACACACCAAACG:1 - chrX 20780334 3' + Tirant 5 2 54.12 GAAATATAAATTATAAATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + copia 252 1 27.37 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGACCTTTTTG:1 - chr2L 19129326 3' - FB 19 1 52.75 TTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATATTTTCGAGCGAACTAAGATTGTAAAGAGATAGCGTATATGGCGTAG:1 + chr3R 25051664 3' - 17.6 6957 1 58.88 ATTAAATATACAAAAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTGCACACTTTTGAGACTATATATAAACGTTAGAACATCACACAGATTTAAATACTTATGCATGCAAAAGCAT:1 + chr3R 11957290 3' - S-element 1556 2 73.64 ACGGAACAGACGCACTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAATTTATTTATTTATTTACTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA:1 + chr2L 17158908 3' + Stalker2 7608 2 54.55 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACTCTGCGGTACCCCAGCCGTGCAGCACATTCTTCGATTGATTTCTTCTCTAAGACCTTTGCTTTCTTAGGCTTA:1 + chr2R 15971987 3' - 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I-element 5110 1 77.14 TCGACTAGGACACACAAGCATACCCACCAATACTACCTAAGTCCAAATTGAATTTTAAACCAAAAATATTTGCCCGGCAAATATGATAAAATTAAGCG:1 - chr3R 23262236 3' + I-element 4949 1 52.04 GAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTCGAGCAACTGCAACTGTAGAGCTGAAGCTTATTGAAAATTATTGTAATTCGCCGGAA:1 + chr3R 30315784 3' + flea 4836 1 55.45 TGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGGCGTAAAAAAGCAAGTGCCCCCC:1 + chr3L 2002040 3' + gypsy5 409 2 53.06 AAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTAGTGCTTATCAAATCTTTTATTTACTTTTATAAATATTAATTAAGTAATTTTAGAAGCTGTGTAGATTACAGAC:1 + chr2L 10554389 3' - G2 267 1 69.72 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAGCTAAATAGGAGTTATTTTCCTGAATTCATTTTGGTTT:1 + chrX 12314711 3' + Tabor 460 2 42.73 ATGTTTTTATTACTTAGATTTATTCATTGCTCAATATATTTAAGTCTTCCTTTTCTGTAGAAGATTGGACAACTCTATTCTACTATTATACTAATACCAAGTGTCACATT:1 + chrX 19882621 3' + hobo 2490 1 81.82 GTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCGACACGGGCATAAATCAAAGCACAACTCGAGACTTATCAAGATATGGCAGAG:1 + chr3L 19182133 3' + Rt1b 4908 1 61.39 TTGCCAACATAACACCTGCTATGCTAACAAGAGTCACGACAAACGGATGATGATCCACACAATGAGACGAAACTTGAAAAAGCCGCGTCAGCAGAAG:1 - chrX 7616879 3' + mariner2 684 1 57.73 CATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGTGTACAACACAACACCACACAACACAACACAACCCAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + Rt1b 4925 1 34.04 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACG:1 - chr3R 13225509 3' - hobo 42 1 67.00 TTTAAAGGTGAAGTCTTAAACAGCTGATTCGGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGCTTACTTTTAAAGTCAGTAGTTCTGTGACAAATTTGATTT:1 - chr2L 15435243 3' + transib2 157 1 68.69 AGAGTTTTTGATCGGCTTGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGGATGTCTCAATTCAGGAAAAACGACACCATTTTAATATATAATTACGTTGGTGAATT:1 + chr3R 19950582 3' - rover 202 2 55.67 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATACGTATACCCCGTAACTTGCCCCATGAAGTTAAAACGACGCAGTTGTAAGAGAAACCA:1 - chr3R 9339616 3' + Burdock 229 2 53.64 GACCACCCAAATACGTCACTATATATATACAAAGAGGACGCCTGGTCGCGCTTAACGAGTGCCAGTGAAAAATGAAAATCAATGACAGTAAGAGACAAATTGTGCGCCA:1 + chr3R 7171354 3' - 297 6580 1 80.73 TCCGTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTCTCTGCCCCTTTTTTGTTTTTGCTAGCCTGCCCCGCTCCAAGTTGC:1 - chr2R 19157703 3' - Doc2-element 224 1 91.43 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTATATATTAGTTAAAATTTAAAAAGTAGACAAGCCCTTGACTCTTTCCACATAAAAAAAAAT:1 + chr3L 16496779 3' - hobo 24 1 56.48 AATGATATAATAATAATAAAAAAAATGGGCTAAAGTCAGAGTGGGGTTGGTGGGTGGGCTAGATGTTATTATTTTCGGTAAGGTAGGTGTGTTTCGATGTTTGCG:1 - chrX 17167795 3' + invader3 5054 2 84.76 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAAAAGCCAAAAGCAAAAAGCCAGAAGTAAAAGC:1 + chr3L 17405748 3' - roo 8695 2 67.78 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTCCCCAGGAGATGAACGTGATCCGCAAAAAGCAGCG:1 + chr3L 15408506 3' + jockey 4951 1 65.35 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGCAGGGTAAAAAAAGTTGGCAGAAGGTTTAGTTTTACCTGGCTTAGTCGGGCGAAGA:1 - chr3R 23620974 3' - roo 8679 2 61.62 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAAAGGTTAAGGGAAAACGTTTAGCACATCTAGACT:1 - chr3R 24867504 3' + roo 9023 2 74.29 TTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCTCGCATAGAAATGAATAATAATTAAATTATATTGCAACTG:1 - chr2L 19787307 3' - Ivk 5146 1 63.30 ATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTCTGAGAACGGCGAGATCTTAGGAAATATAAATGCTAGACGGTTCAGATATTAGCACTTTTGAGATACTTAATCACCTTCTGGCACCT:1 + chrX 10289677 3' + INE-1 103 1 52.29 TGGAAAAGATTTTCCCAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAACTTAATCTCTTTCCAGGCATTTCATAATTTTATCAACGGCATCAGCCACAAACA:1 - chr3R 30919171 3' - S-element 457 1 70.64 GTAACTCCTCCCTCCCCAGTTTGGCGGGCGATAATATGGGTTGG:1 + chrX 7688946 3' - ZAM 7947 1 59.09 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTATTGTTTTTTTTCAGTCAAATTATGAGAATACCAGAGTTTTCTGGGGATGCGT:1 + chrX 16693847 3' + 1360 3371 1 56.57 TTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGTCTAGCAATAAATCTTCTGAGTGCTGCTAAAAATGCGTCTGAAGTTAGATCGCTTACCATTTCTAAGTGTATGGTTT:1 - chr3R 19447322 3' - Doc 4670 1 72.38 CCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACACGCAATCCGAAATCTATTTCAATCAATCTTTGCGTAATTGTAAATACTTT:1 - chr3L 20596752 3' + Idefix 7046 2 64.13 TGCTCAGAATAATTACAAAAGCCGAATGGTACATTATACAAATGACTTAAACAAGCGCAAAAAACTTTTTCGAATCAAATGTGAACTGCAAA:1 + chr3L 10489108 3' + Porto1 4345 1 57.61 TAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCTTGCACGTCACACTGCCAAAACATGCACATCACTGTCAGCGAAAGA:1 + chr3R 11110543 3' + invader4 421 1 77.27 CTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACAGCATCCCCCTACAACCCAACATCATTGAAGAAGACGGAACAATTTGCCTTGCACAGATCCTT:1 + chrX 20879311 3' + GATE 8442 2 69.09 CTCGAGGCAGCTGAGCGAATTATACTGTATATGATTCAGTTGAACTGCAGACACATTGACGACTCTCTGCTCAA:1 - chrX 18483152 3' + pogo 2095 1 63.51 CGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGGGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Rt1b 5003 1 32.47 TAGTTCAGCGAACGTAATCAAAAATGCTCACACTCCGCAAACAAAATTCAACGGGGAACCCACGAAAAGAGCTGACACTAATCTTCACACGTA:1 - chr2R 24071712 3' + Porto1 4321 1 70.97 CAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGGTAGAAGACGAGGGCGGGTATTGAACAACTTTTGTATACAAATTTCTATCAAA:1 - chr3R 27458228 3' - 1360 3229 1 58.43 ATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCAGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCCCGTTTCGCCCTCTCTTTC:1 + chr2R 15649059 3' + Quasimodo 268 2 77.17 GTACCTCCACCAGCAAAGTAGATTGTCCCTGACATACAGTTTGTTATTACTTGCCTGTTACATATATACTTTTCAAAGAATATAAA:1 - chr2R 25257587 3' + TAHRE 10427 2 76.74 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTGCAATTGTCCAGCGGCAGCAGGGAAA:1 + chr3L 15614484 3' - jockey 4713 1 68.54 CTAATAAAAGAACCATTTAATAATAAAAACGTATTTGGTTGAATTTCATATACTTAAAAAACTTGAAAACTGTTCGGTAGAAAGACATTAATTATGGATTTTAATCACTT:1 + chr3R 17915184 3' + gypsy10 320 2 70.00 GCACTGCAAAAATCCGAGATATCTAGTGGTCTCATCAAAAAACAATCAAAGTCAGATGCAGTACAAATATTAGACAATCGATTCTTTGAATAGTCATTAAAGAATATTGT:1 + chr2R 9283554 3' + Ivk 314 1 67.27 AGCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGTGAAAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCCAGTGTGTGTGTGTTTCTGCCTTCCTGCGTCTGTATGTGAAGGCAGCTG:1 - chr2L 9854515 3' - Cr1a 294 1 55.10 TTAGTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGCCAGGAGCAGTCCGAGCTGGGAACTCGGTAGGTGGATATG:1 - chr2L 10623394 3' - gypsy7 334 1 56.04 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACGCCAGCTTAGCTGTGTGGCATCCTGCGGTCAG:1 + chr2R 13313447 3' - hobo 10 1 56.34 GTCTTCTAGCACAACACGCACACACACACACATGCACGCACACACACACACACAAATTACACTCTGTATGCCCACACATAAAGGTGCACCTG:1 - chr3L 9813959 3' + 1360 3206 1 66.30 ATCTCTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATAAACCTTCCACATAACTATATATTTCTATATTTTCATTCAATT:1 - chr3R 11173231 3' + Transpac 275 2 70.73 CGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATCCTGTACTCAGCATGCCAGCACCACCCAGTAGCAGAGATTGAACCACCACCACCCACCCAATAATTACATACGCGC:1 + chrX 10000020 3' + I-element 5014 1 77.27 AATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGCTTCCATGGGTAGACTTTCAAATCACAGACACCGCGGACCTAAAACGGAC:1 + chr3L 21930995 3' + G2 2775 1 64.94 ATAAACGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACACCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCT:1 - chr3L 3240543 3' + diver 6046 2 77.27 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAAA:1 - chr2R 9963489 3' - pogo 41 1 61.82 CCTCCACATAAACCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAGTAAACACCCAGCCCCGCCCACTCCACGCCCCCAACGGGAGCTGATG:1 - chr3R 4473014 3' + Doc2-element 4497 1 56.04 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTACACAAGTCCGCTCTACGTTCACATTTTTCTTTTTAATAGGAAAAAC:1 - chr3L 14822847 3' + mdg1 7415 2 61.82 AAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + Tabor 7324 2 23.00 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATGTACATAATATTAAAACGAGAATAGTTATGGAACTCAAAAATGTATCATTATA:1 + chr3R 6263378 3' - diver 5914 2 50.96 CAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCAACTCAACAGAAACGTAATAAACCAAAGACAGC:1 + chr2L 20174927 3' - Stalker4 60 4 73.64 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTACAGAAATCAACCAACTGGCATAAACTTTG:1 - chr2R 5911814 3' - 412 51 2 75.00 TTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATTTTCACACAAAGACAAGGATGGCGAAACCACAAAAAAGCA:1 + chr3R 20119618 3' - rover 6988 2 63.64 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCTATAAGCCTATAGGGACACG:1 + chr2L 5724356 3' - 1360 31 1 76.25 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAAGATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTTG:1 + chr2L 3323288 3' - hobo 36 1 55.14 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCGAATGGGCGGCAGTGG:1 - chr2R 19677812 3' - hobo 34 1 76.32 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCTTTAATGGTCTTGTCTAGTAGCTTCTAGTA:1 - chr3L 25414189 3' + blood 7368 2 66.23 GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTAAAAACTAATGTGACGAAAGGCTCCGCAGATAAAGCGGTTTGTAAT:1 - chrX 15043107 3' + S-element 1686 1 58.18 GTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAAACATGTACAATG:1 + chr2R 16476427 3' - X-element 20 1 52.00 GTCAGCATTTACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAAAGAAGAGGTTAATACAAAGATATATATATTTATTTGTTCTT:1 + chr2L 11434328 3' - jockey 4705 1 55.79 GGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTGATAGCTGTTTATGGCCAAGGGAAATGCCGTTTTTCATTTTTGGTGGTGAAAAGGGGCAG:1 - 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chrX 6866763 3' + S-element 1677 1 60.91 AGCAAAGAGAGAAACCAAGGATGATGTTAAAGGAACTTAAGTAAGAAGTGTAGTGCCTTGATTTCTTTATTTGCAAGTCCATTGGGAGGTGAAGGTTGGCTAGAGGACAG:1 - chrX 14633736 3' + Bica 429 1 53.64 GAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGAATCGCATAATGTTTATCTAGTCTCATGGCA:1 - chr2R 17287082 3' + invader1 3988 2 71.82 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTATTTCATTCATTATGTTTTCGTGTTGTAATAAATAATAACTGAAGTAAGCTTAGCTGGGTTC:1 - chr3L 2987340 3' + blood 353 2 52.73 GAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACAACAATGCCCGTCGATTGTTAATCAGTTAGATATAAAACAAAATAAAAGAAGAAGA:1 + chr3L 15227819 3' + F-element 4442 1 65.22 TGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - I-element 5145 1 36.54 GTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + 412 7542 2 36.00 TATTATTATATATACATACATATTACATACGTATTTTCAGCAAATTTGAATACTATGTTGAGAAAGATCGCTTATTCTTCGTCGGTTCTCTGATTAAGTTCCTTTCGTCG:1 - chr3R 18362078 3' - Dm88 4381 2 67.27 ATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGCTTGGGCGTGGTGAGCGATGTAATGGAGTAGTGTTTGGTTCCGGGAACAGGAATGTTTAGCCTTCGTGTATCATAAGTAGGTCAATGA:1 + chr2L 15783004 3' - HeT-A 5936 1 71.82 TTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATATTAGTCGCCTGCATAATGTACAATAAATGGCAAAATAATACAAAAGGCAGTGAGCGGCA:1 + chr3R 27856502 3' + Tabor 431 2 69.89 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATATTTTTGGAAAATTCGCTTAGCTACATAGAATTTGTGTGTGTGTGTATGTTTTTTTCTGGTTGGCTTGTTC:1 - chr3L 7846433 3' - 3S18 16 2 69.09 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACATACACATGCATATTTCTTCTTTTGGTGCCGATTTCACTGCTTAT:1 - chr3L 11085733 3' + S-element 1706 1 56.63 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACCAAAGCCCAAAAGTTGTTTGTTAACAAGCACAATGTGTTAATTTAATTACAAGAACAATAAACATGAACGCAAA:1 - chrX 9432799 3' - roo 8674 2 74.55 TACACATTATTTTCGCCCCGACACGGCCATTCTGTCATACCATTTCTTAGCTATTTTGTGTTAGAATTCCCGTCTGGTGGTGTAATTATTTGGAAATGCTTTTTAAGCGA:1 + chr3L 10353865 3' - micropia 2 2 73.64 CCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAACTCTGTCGGACACCGAACCGGGAAGACAAACTCCCAACCATAGGCGTCTATAAACACGCCAG:1 - chr2L 12032495 3' + gypsy5 25 2 61.11 AAAAAAAAAACAAGGGAAAAAGAACCCAAAGAACCAAAAAAAAAGGATATATGTGGCAGAGGAACAAGAGAAGGCTGAAGATGACGACGATGATG:1 - chr2L 7207145 3' + Doc2-element 229 1 51.58 GACTGGACACACTAAAACTTCAGCTCCGCGCGCAACAAGCGGTTTGCGTATATAGACACAGAATTCAAAAGAAAATTTCCAAA:1 + chr2L 21629540 3' + Chimpo 97 1 61.45 GCACGCCCACACTTTTGAAACATTTTAAAATTTTCTTTCCCAGTACCGATCGATACTTCAGAAAAAATATGAATTTATGTGTTTACTAATGGGGTTTCCATATGTATGTA:1 + chr3L 2633895 3' + INE-1 252 1 64.55 TTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 6053 2 64.79 GTGGTCAGTCGTATTCTGATGCACTTAAAAAAGAATAATAATTATTATTTGTCCTAACTTTATAATTGTTTAATGGCGAAATAAGTAACCGC:1 + chr3L 38236 3' + gypsy9 5273 2 67.39 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGCTAAAAAATCGTATGGCGTTACGAATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGATG:1 + chr3R 6534572 3' + Tirant 367 2 54.55 TTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACAGGCGGAAGCGGTATTTGGTCGAAACCTTCCGTTCCGCTGAATG:1 - chr2R 20406045 3' + micropia 415 2 67.53 GTTTCTTGATCAGGATCAATAGCTGATTCTATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGATCTTTAATCTATTCTTTTATAT:1 + chr3L 7466100 3' + INE-1 85 1 70.00 TATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTCAGCGAACGCACTCAAAAATGAGTAAAGGAAAACACAAACAAAACCCGAGTCGACATAA:1 + chr2R 22525782 3' + Porto1 4275 1 61.00 TGTTAATTGTTTTGTTTGCAATGCAAAATCCCGTGAGGTCGTTAACATTCCCGAACTCTTCCTTTCGTCATGTCATATCTAATCTAGAATCGAAGACAACCGAAAA:1 + chr2L 8530409 3' - Doc4-element 384 1 62.26 TATCGACTTGTATGTCTCCCAATTTGTGTCTCAACTGTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCAATTATTAAATAATAATTTAAAAA:1 - chr3L 23211212 3' - Helena 1232 1 63.37 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTTATATTTTTTCTGTGCTCACTCTAGAATGTCCTGTGCACCGAGCTAC:1 - chr2R 20436706 3' + opus 489 2 65.91 AGTTGATAGGTGTAGTAGTTTTTGTGGAGGCAGTGGTGGTCGTGGGGGATTCGGTGG:1 + chr3L 17834966 3' - Fw3 156 1 61.40 CTCGCACCCCAACCACCTAGCGAGAAATCTAACTCAATTCAGTGCAGTAATATAATAGGATAAATGGAAAACAAATGATGATGATAACTGGAAAT:1 + chrX 4240896 3' + F-element 4465 1 62.11 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGGTACCTATTTATATTTTTTCTACTCTTGCAAAAGGTTGCTGTAATTTGGTTAGAAAGTTGGTCGTGCTCTGCAGTTATCTTA:2 + chr3R 30298410 3' + copia 251 1 66.36 ACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGCATAACATAGCTTCTATAAATAAAATAAATTATAAGCAGAGGCCACGCGTGCACTGACAAATTATTCGTGGGAA:1 + chr2R 6050629 3' + Stalker4 6970 4 62.39 TAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCCGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAA:1 + chr2L 22224574 3' + Rt1c 5402 1 50.00 GGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTGAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGGTAAAGTGAAGAAATCCGGGGTGAGGCG:1 - chrX 3739585 3' - I-element 5113 1 69.39 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAGAAATTAAATAAAATAAAAA:1 - chr2R 15155183 3' + flea 4981 2 55.45 GTTATAGTCGGATATGGTTTTTGGCCTCAACAACTGGTAACTTTCATATTTAGAAAGCGTTTCTGGGATGCATTGCATATCCAATTGGTAAACGCTGATACG:1 - chr2R 12539090 3' - Ivk 362 1 77.45 GCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 297 6529 1 62.50 AAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCTCAATCACGCTAGTAAGAATTAAGAACTCGAAAATGTATCAAAAA:1 - chr3L 415006 3' + I-element 4910 1 59.09 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACGATCTTGATACAGAAACGATCTAAAACATCCCATTCTTTGTAGCTAGCATAAA:1 + chrX 22717213 3' + pogo 2088 1 68.82 TTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTTTGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTCACGGGCATTTTTGCGGCCACTTCT:1 - chrX 11600071 3' - I-element 5233 1 68.24 CCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGCGAAAAAGTTGAGAGCGGGGAAAAGTGCTGCTTCTGTTGGAAAAGCGGAAGCCGGCAGCG:1 + chr2R 20496164 3' + invader2 260 1 64.29 GCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGTTGTTTTTTGTTTTTCTGTCTATTCTGGTTATATGAGCCACTCCCCTGTACGGTTCTGATCTAAACTATGATCCTCAT:1 + chr3L 27177740 3' - Doc 4434 1 76.36 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACGAG:1 + chr2L 6243732 3' - 412 7094 2 59.63 TTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTGTGTTCCGGGGACAGCAGCCATTTTGTTTGGCTGATGCTGTTGATGCTGATGTCG:1 - chrX 21183293 3' + S-element 1705 1 65.96 AACAGACCAAATGCCCCATAGTGCCATGGCAATGCAGTCGAGTGTGAGTGCGAGTGTTCCATGTATATGTATGTGTGGGGCCATGTCCTTTGTAAGAATTCAT:1 - chr3R 11315182 3' + hopper 1413 2 77.67 GGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGGACATTAGTCACGCGGC:1 + chrX 7544221 3' + flea 4779 2 68.52 TATTCATTTTTCGGCGTCCACACAGATGAGCAGGCCAAAATGGATGGGGCCAGTGTTTATGAATGG:1 - chr3R 22500810 3' + invader3 277 2 68.18 TAGTGGACAATAATTAATTTTTTTGGAGGGAAACATTAAAGTAAGGGGAGTACGTCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTGGCTGAGTTGGAAGGGGCAGG:1 + chr3L 15362623 3' - G2 3024 1 72.16 TAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCTTCATGTGTATATTGTTCGACCGAGAGCGGGCTTTCGTCACCAACTTGGACTTCCGCCCCATAGTTT:1 + chr3R 9701357 3' - Bica 173 1 57.27 TACCGTTTACACATTTGTATTTGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCAGACACTTTTTTAAAAGCGAATTTATTACAGCGCTTGGTCGAAGCTACGTCGCCGC:1 - chr3R 14706752 3' - 1360 2965 1 64.08 ATCAAGAATCACAAGGAGCCTTCATGCTGGACGACGCATTCGCGAGGCGGCAATGAAAGGCCAATGCAAGGATGAATGAGGCTCGCCAGG:1 - chr3R 28490744 3' + diver 5838 1 61.11 ATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATTTTAAGAAATGCAGAAGGAATTTCGTAGACGTCTAGGAGCATTTTTGACTTTATTCCGTACAATTT:1 - chr3R 27816084 3' - Burdock 6146 2 69.09 GACGCTATGTTATGCCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAGTCATAAGGGTCATCAAAATTTGCAAAATATGGCCAAAAAATTTAATT:1 + chr2L 14421049 3' - Stalker4 6997 4 58.18 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCGGGCATTATTGATTTATTTCTGGTAATTAATCATCAGAAATGTTCAATATAACTTTTCTTTGAGCAAC:1 + chr2L 14917991 3' - hopper 14 1 64.55 ATGAATTCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTGCTTAAGACTTCTTTTTCGCTCTTAATTCTTATTTTCGGTTGCTTGATGTGGCTGGTG:1 + chr2R 19568401 3' - Stalker3T 269 1 54.29 GATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTGTATCCAAGCTTTAATACTTTTCAAGATCTCAATGTTCTTAGTATTGCATACATTTGTGG:1 - chr2L 19364076 3' - BS 4783 1 45.19 TCATTAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAATAGTTTCGAAAATTTTTTTTATTAATTTATTTATTAAG:1 + chr3L 26246017 3' - HB 1528 1 73.40 CGCCGCGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCATTTCCGTAACAACCATACAAAGATACAAATGTGGC:1 - chrX 1080565 3' + baggins 5115 1 57.83 GAACTATTTCAGGCAAATCGGACAAAATGCACAGATTCTCCGTGGACAATATCATGGAAATGAAACACGACGCCTATTCCAAGGGAAAAATGGCAATGGAACTCAGTAGC:1 - chr2R 23093718 3' + Bari1 1625 1 75.45 AAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCTAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCATAATAATTTATTGACTATTCCGTTGAGGGGTTTT:1 - chr2R 17457748 3' - F-element 4595 1 71.11 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTTGTTGCCTGTTCATAAATTTATATTTGTTTCGTACTCTCTTGTT:1 + chr3R 7500926 3' - FB 35 1 60.00 GCTATAGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGATTCATTCTGCCTGTAGCATACCCTTTTACTCTAAGAGTAAC:1 - chr3L 22884338 3' - INE-1 86 1 77.78 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCACCAAAGCCCAAAAGTTGTTTGTTAACAAGAACAATGTGTTAATTTA:1 - chrX 9432828 3' - roo 39 2 60.91 TTTTTTTTATTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGACATACGACGGCTTTTCCAACTGAGTTTT:1 + chr3R 9829740 3' - F-element 4678 2 68.13 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAATGATTTCTATGTCATGAATTTTAATTTTTTT:1 - chr2L 4692090 3' - F-element 64 1 70.00 CGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGCTTTACATACCCTTTGTTGCCTGCCCTGCAGCTGGTGGCG:1 + chr3L 8519693 3' - Circe 7164 1 68.18 CTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATTTCTAAACCGTTTCTTTGGCATTGATAATTTGAAAAGCGAACCAACTAGTTGTTTTTCCCAGTGCACCT:1 + chr3L 11032063 3' - F-element 4326 1 56.44 ATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGGAGATACACTACACTACGATTGAGTAATCATAATTACGCTATAAATA:1 - chr2R 11274002 3' - Stalker2 40 2 65.26 TACATACACACACACACACACACTCATTCAATCTCGGGTAGAATGTTTTGGTGAAACTGGTCAGATTCCGGAATCTCTGTTTCATTCGC:1 + chrX 11981282 3' + Quasimodo 34 2 60.67 CACCAACACACACACACACACAGCAAAACATATGGGCACCCACTCCCATTCCAGTTAAACTCACTTTGTGTAGTAGAATTCTGTGACGTGACAAGTTCCCGAGTCACTCA:1 - chr2R 16946146 3' + accord 180 4 70.91 GCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAATATAAGAAAATAGAAAACAAAACTACAGTTCGACTTTGATAAGCACGATATGAA:1 + chrX 4239068 3' + invader2 291 1 56.86 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTGTCCTTGTGGGGGGCAAAATA:1 - chr3R 5671377 3' - 1360 25 1 58.18 AGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGAACAAAAACTTCCATCAGGTCGGGATTATATA:1 + chr2R 15507015 3' - 1360 333 1 73.39 TCGATCACGGACTTAACTAGGGCGGTGGGCGGAGCAGTTGGTCTGCAACGCTTAACTGGTTCTTGGCAACCAACTTGTTTTTTCTGTAGAT:1 - chr2L 9496348 3' + Tirant 402 1 75.82 CCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGTAGTTGTTCGATATCATTGACCATAGTGACTCCTCGCGCGGCACAAACATCCAGTAGCTGAAGGCCAGCATAA:1 + chr3R 8654024 3' + R2-element 3182 1 73.47 TATATATTTATTATTAAGAAATGAAATAAGTTTATAAAGTTACAAATTTCTACAATTGAACACAAAGTATTGTGTTCGATTA:1 - chr3R 23165009 3' + copia 5098 1 70.73 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTCAGAAA:1 + chr2R 18807881 3' + BS 5039 1 76.15 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGATCTGACTGAACAATAAACAAAACGATGCG:1 - chr3L 15968193 3' + P-element 2852 1 38.46 CCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAAGATAACAGACGAACAACCCGAAATGCCTCAAA:1 + chr3L 5742292 3' + I-element 5004 1 73.64 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGACGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACA:1 + chr3L 20039845 3' - Doc 44 1 65.98 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGGTTCCGCTACAATGCACGCTATTTACTGGATTCCATG:1 + chr2R 9408235 3' - FB 22 1 57.32 CAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGTTTAACACGACCTGTCGCCGAAAGTG:1 - chr3L 14683932 3' - F-element 4216 1 75.00 GTCGCATTGTCGGTTGTTTAAACAAAAATCACACGCGCGCAGCTTGAGAAACCGGCGAAAAAAAGTATCTTAGAAATTCTGGATTGGAAG:1 - chr3R 14361532 3' + Tc1 444 1 75.56 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACGCCAGCTTAGCTGTGTGGCATCCTGCGGTCAGGAGTCTCAACTTCTGC:1 + chr2R 13313463 3' - hobo 33 1 54.55 TAAATTGTAATTATTTACTTATATGCGTGAATTTTTTTTTATTTCACTGCTCTTCAGGCAGCCAAGACTTGTTGGCGCTGATTTAATAGCC:1 + chr2R 4137622 3' + HMS-Beagle2 7197 1 78.02 TATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTTTGTGCCCTG:1 - chr2R 1320709 3' + diver2 4843 2 68.81 ATACGGTCCCCATTGACGAGAGCCAGGAGATGATGATGATCTCGCATCTGTATCTGCATCTGCAGCTGCAACTGCATCTGTATCTGTATCTGGTT:1 + chr2L 14451627 3' + BS3 1589 1 58.95 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGGTTGGTTGTTTCTTTTGTAGCCACGAAGTACTGTATTATATTTATAAACGTTCTGCTTGTCTGCCG:1 + chr3R 14743215 3' - FB 21 1 54.55 AGGTTCTCCTAATTGGGATTGGGAATTGGATTTTGTGAGTGGGTTGTCGCTTTTGAGTTATATATATATTGATAAATTTTAATTTACATTATAGAGAAGTAGTTTTAAA:1 - chr3R 16753954 3' - I-element 231 1 72.48 AGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - I-element 279 1 73.39 CGGGTTAGCTGAGCCCAACATCAGCGCACACATTGGGCATTCAAATAAACAACATTACCCTACGACTTTTCGCTTTAGAAGAACTTAACAACTAAATACAGAA:1 + chr2L 8169171 3' + Stalker 7151 4 52.43 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAATCCAAAACTTAAATGAAATCAAATAAAATTAT:1 - chr2R 23477863 3' - F-element 48 1 70.21 AACACAGCATATTTGAGTGGCTGGGGTTTCATCTTACAGTCACAAACGCC:1 - chr3R 28602600 3' + Gypsy6A_LTR 103 1 62.00 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGTATTGTCTTTTTTCAGTCACATTATGAGAATACCAGAGTTTTCTGGGAATGCGTTTTACGCATTAGACGT:1 + chrX 16693863 3' + 1360 3376 1 65.45 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGGGACAACAA:1 - chr2L 20939496 3' - hopper 15 1 67.27 TAATTTGGCGGGAATTGCCTACTCTCCATCAGCTGTTTAACACTTCACCTTTAAAAGATCATAAAAAGATTTAGTGAAGCTTTTGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATT:1 - chr2L 12534745 3' - transib2 190 1 89.09 GACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTATATTATTCTATATTATATTCTATTCTAATTTATTCTATTCTATTCTATTCTATTATATTCTATTCTATTC:1 - chr3L 24821493 3' + G2 2642 1 46.36 ATAAACCAATGTATGCCACCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATA:1 + chr3L 3611781 3' - blood 373 2 48.18 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTTCGTCCTTTCTGGCACTGCGTGTGTGTGTGTGTTCCTGGGCAATTAG:1 + chr3R 13733034 3' - hopper 17 2 55.79 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGCGCAGTTTGCTTGGAATTGGATTTTGGATTCGATTGTAATCGTCAATG:1 + chrX 14221722 3' + 1360 3362 1 62.22 GGGAAGATATCCACGGAGGGTCGTTTCGATTGCATCAGATGAGGTGCGAATCCCAATCGGAAGCTAAATCAGTGCTAAAAAAAAAATAATAATTAAATTGAA:1 - chr3L 6915759 3' - R2-element 296 1 78.43 TTTTAAACTTATTGTATGTTCTTACTCAAGAAGATTCATGAAATAAAAGCCAAATTAAACCAAAAAAAAAAACGACAATATATGAATTTAATCAACGGCTGACAGTTGGC:1 + chr3L 12612483 3' + F-element 4631 1 65.45 ATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATCTGATCCGTAACCATCCACCCACTAAACCACCCGAATTTCCAGCAATTCAACAACAACGACCAATGC:1 + chr2L 16570102 3' - Quasimodo 98 2 60.91 AAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGGTTGAAAACTAAGAAGTTTAGAGACGTG:1 + chr2R 6984434 3' + HMS-Beagle2 307 2 71.82 CGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTATATATATACTTGCAAAATACCTGAAATATTTCAGCAGCAGCTATGACGGTG:1 + chrX 711828 3' + 297 386 2 69.89 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTGGATTTTTCTTTCTTGAGTTC:1 + chr3L 3555521 3' - 412 7087 2 53.64 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACTGAATATATCTTGGACCTGTCCTGTGGTCCTTAGGGCTGAAGGGGC:1 - chr2R 16462313 3' + roo 398 1 57.50 AACACTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTTAACACAGCTGTACATATATCTAGAGCATTTCCCCTCCCAAAACTCCCCCACCTCCTTTCACGCGATTTTCCAGCCAT:1 - chrX 5922760 3' + HB 1606 1 63.64 AAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTTAATTGTTTGCCACGCTCCGCTTTGTCAAGAACAAAAGAAATTTAATTTGCTTGCGCTGCTTTTTTATGTTC:1 - chrX 17913693 3' - Stalker4 372 2 70.00 GCACTTCTGTGTTTTTTTTTTGCTTTTTTGTATTTCTAA:1 - chr2R 24335253 3' - gypsy2 402 1 89.74 ATAAAATCAGTTTTTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAG:1 - chr2R 6537907 3' + roo 9034 1 57.01 TAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAGCGAATCCTTCCGATATGTCGTCCCTTTTGAACGCTACCGTCCTGGCAACCGCTGCC:1 - chr3R 31761430 3' - flea 211 2 54.55 TCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGCAATTATTTACTTATATGAACGGAAACCAGATTTGCGCCGGCCATG:1 + chr2R 15693542 3' + HMS-Beagle2 295 2 58.33 TTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCGGGGTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGACTCCTGCTCCTTTTGCTGCACTTGTTTATTATTGTT:1 + chrX 4911657 3' - I-element 395 1 58.51 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - blood 7058 2 64.55 TTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCTGTTGGTGTTGATGAATTGCTATTGCAATGCAAAACATCCTTGGCTAAA:1 + chr3R 10031252 3' + Porto1 4404 1 55.45 AAAGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACCATGTTTCATAATTATGCTCACTAAAATGACATTTCA:1 + chrX 22861714 3' + 1360 3347 1 64.49 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCGTATTATAAATATATATATTGTAACATATCTCCCCAACCACAAACA:1 + chr3R 3375480 3' + opus 468 2 66.67 GAAGCCTAAGATTTAGTTTTAGGCATCTAATAGAGTTCATAAAAACATGTGAAAACGTGCTATGTTATGCGTGCTATCAGATACCCGTTACTTAGCTT:1 + chr3R 29588500 3' - Transib5 2926 1 45.92 CATCCTGACATTTAAAATCACCTGATCTTGTCGAAATTTTCTTAGTCGCTATAAGTTTAATTTTTACAATATTCTCATCCTTTAATAAAACTATTTGCCCTTCTTCTAT:1 - chr3R 19447933 3' - invader2 4830 1 72.48 GGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTCTCTAATTCATATTCTGCACCGCCCGTCGTCGCCTTCTTCTTCTTCCTCCTTGTTGT:1 - chr3R 25259103 3' - micropia 118 1 66.32 ATAAGAAAAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTTTTACACAGATACAAATCAAGCCACAGACACAACACACATAAA:1 - chr3L 2069881 3' + Idefix 115 2 45.37 TTTTAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGTGTTCTCTAGTTAGGATCCAAGTATCATGGGAGTTGTGTAT:1 - chr3R 20318912 3' - I-element 5176 1 62.73 GTATTACTAGGGCGTTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGGGTGATTTTTCCAGGAAGAGACCTAACGTTGGAGGTGGCTGAGAGTTCGGACAATTTACT:1 + chr3L 192191 3' - Stalker 6986 4 67.33 CTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCCTATGTTATCCTATCTTATCTTTTCTTATCTTA:1 + chr2R 5064833 3' - Stalker3T 204 1 71.19 TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTAAAGGAAGGCAAATGGAGCG:1 - chr3R 16194535 3' + flea 202 2 79.61 CTGAGATCTCAACGTTCATACGGACGGACAGATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTA:1 - chr2L 22724136 3' - INE-1 136 1 68.33 GTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGTCGCTCACTGGGCACGTGAAATTAATACGACTTCCGCCGTTG:1 - chr2L 9299202 3' - Doc 309 1 65.45 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAACGCAAAAGTAGAGACAACCCTATAAAAAATAGGAAG:1 + chr3R 19446222 3' - Doc 35 1 59.09 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCGGCACCACCGCCGGCGGATTACTCGCTTC:1 + chr3R 23943237 3' - P-element 42 1 33.68 ATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTGTCCGCCAGCAGAGGCTG:1 - chrX 16395119 3' - micropia 5230 2 79.31 TAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAATAATGGGTCTGCCACGGGACTTTGAAAAAG:1 + chrX 17626220 3' + Quasimodo 58 2 72.48 ACCAGTATTATTAGTTTTTAACGTTTGACCACCCTTCAAAAACCTTTAACAAAATTTTTTACGATTGCCAGAATCACACTTAAGTTCCTTAGCCACACCTCCAAAGCAT:1 - chr3R 27001804 3' + FB 363 1 68.81 GTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCTTTCATCAACACTCGAATGATTCATATGGAAACCTAA:1 - chr3L 16727153 3' - springer 13 2 53.09 TGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAACCGAATGGCAAAAAGCGAAAAACAAAACCCAGATATGTAGTGCAAATTAAGGTACCCATTCCAAGGATGGCAAG:1 + chr3R 12567837 3' + Bica 206 1 73.79 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTTTTTAATTCTAAGGTAGTTAAGCGGTTCTCCCTTATGCAGATTCATCATGTATGCCTGTGCAATGATGGATTA:1 - chr3L 18915115 3' - 412 12 2 64.55 ATTTTTGAAATTTTTTTTGTGATATTATGATTTGGCTATTACTATTCCTAAGCTATAAACTAAATTAGAATAAAATTAAGTTAATTGTAACATTGAAAATCAATTTATT:1 - chr3L 21926673 3' - 1360 367 1 52.29 GCAGCAGCAAATATTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGGCACTGCACTTCCCAACTTTTGACCACGAAAGGCACAA:1 + chr3R 9499426 3' + Bica 4582 1 57.78 AATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATGCATTTCCCAGCCCTACGCTCCATACGATATTGATTAAATGAAAGCGCACTGACATGTCAACGGCAAT:1 - chr2R 18507810 3' - Bari1 15 1 68.18 TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTCTCGCTTTCTCTCGCTACTTTTCGCTTTGG:1 + chr3L 3371234 3' - copia 12 2 63.33 TATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACATCAATAATGATAATAATGAATAAAAAGCATCGCGATATCATAAC:2 + chrX 20433390 3' + diver 182 2 60.00 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCTCTCTTTTAATTAATTGTCATGTTTTGTTATTGGTTTTC:1 + chr3R 563984 3' - HMS-Beagle 8 2 73.39 GTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGACAAAGAGAGGAAGATTGGAAATCGAAGTGCGAAAGGGAGGGAAGGCGATATG:1 - chr2R 14341949 3' + invader1 3770 2 66.67 CCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCAAACACAGACAGCATACACTCGCATATGTAGACACA:1 + chr3L 14038496 3' + Doc 4488 1 61.29 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATACTTTCCAACCAATTGGATTCGATTGAAGACTCACCTTT:1 - chr2L 14018623 3' - pogo 35 1 64.00 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATAATGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTAACAAACAA:1 + chrX 12271524 3' + pogo 2047 1 75.47 TTTCTGGAATATCGATAGATATCGGGGAATAAAGTGAGAAAAAAATTAAAAATTGCTTAAAAGTGGGGGCGTGGCAGGGGGCGGTGAATAAGATGTGCAATG:1 - chr3L 16434708 3' - INE-1 498 1 74.51 GGGGCAACGCATCGAGAAGCAACATCGACACACCCAGCGAATCAAGAACAATAAAAAGCGGCGCGAAAGCAAAGAGCACAAGCAGAAGCA:1 - chrX 18056191 3' + Doc3-element 4343 1 72.22 TGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTTACTTATATAGGCAATGCTCAAGTAGTACACAGTAGAAAGGATCGTGTCGCAGAAGCACTTAAATGAGGTTGGGAG:1 + chrX 6122537 3' + S-element 364 1 73.08 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTCTTCTATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' + blood 341 2 57.14 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAACTCAATAAGC:1 + chr2L 5304908 3' + flea 209 2 68.18 CTGAAGTGTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATCTGTATTGTATTATTTTTTTGTTTTAATTTTTCAAATAATGTCAAATAAGCGAAAACATTGTCCCCCT:1 - chrX 18176852 3' - rover 7042 2 67.27 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAATTAAAAGTTAATGTAATAATTAAATA:1 - chr2L 16529213 3' - blood 7058 2 67.27 TGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCATGCGCAGTATGGCATTTTTCAAAAGTAGAACACGAGAGAAACA:1 - chr2L 16198414 3' - micropia 5270 2 64.55 AAGAAAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 203 1 36.70 GACGTGGACATAATGATTTATATATTTTAAAACGATACTTGTGAGGTATAAATACCCTGGTTTTTAAATTTATACTCAGCACTCAAAGTATTATGATAAACTTTAAAGGG:1 - chr3R 13451110 3' - TAHRE 442 1 63.64 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTCTTTTTTTATGTCTTTTACTTATAGTCCTGAAATTAAAGCTATTGATTAGGTTTTTAAAAATCATGATT:1 + chr2R 4547664 3' + S-element 1701 1 65.45 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCCTGGATCAGAGTAATGTGCTTATATA:1 + chr3L 15968221 3' - P-element 44 1 26.14 TAATAATAAGACAACCAATAAGTAAACTTAAGAGCACCCTAGATCCTTAAATCCATCCTAAACCTAAATATGCAAAATCGTGAGAACAATGCCAGCCTAGATTCATTTAA:1 + chr2R 10315343 3' + mdg1 7116 2 69.09 GCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCTTAGAGACAGCGATGGCGATGTGTTGTTTGGACGGATTTGACGGGTGGCGACGGAAGCGGGTGG:1 + chr3R 25402163 3' + invader2 4963 2 65.56 TTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCTTAGCTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTTGCTACTTTTCGCGATAATCAATTAGCAATGC:1 - chr3L 25887121 3' - hopper 983 2 73.39 TTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTTACATTGTATGGGGTGAGTTTGGGCCTTGGGCGTGGTGAGTTTCCAGGACCTCCTCT:1 - chr2L 18991587 3' - HeT-A 5992 1 80.91 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGAGCGTGCTATCAATCGATTTCAATGGTAATAACTGGCATAGTCTACT:1 + chr3R 17272037 3' - hopper 11 2 63.53 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATGGTTTTTGTGCTTATTTGTTTATAATACATACGTC:1 - chr3R 7588875 3' - F-element 55 1 75.96 ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATATGAATTTTTCAACACCAGC:1 - chr2L 4674746 3' + I-element 5288 1 87.27 GTTGGAGAAAGTATGGCTTTGATTAAAAGAGCCTTGGAGCTCATTTGTAGTTTGCTGGAGTGAAAGAGCCAGTCGAGGTTTTTTATACGATTTTTCATTTTAATATTTGT:1 + chrX 17548020 3' - G5 4361 1 77.27 CCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCTGCTGAAAATGCTCGGATTTATGTACCTATTTTATAATCAAACACTGAGATAA:1 + chr3L 15822044 3' + F-element 4296 1 61.29 TATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATATACAATAAAAGATTTCCGAAATGACCGCCAACGTAAAAATTATTCG:1 + chrX 12883839 3' + Quasimodo 8 2 64.89 GTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATGTGATTTTCATCGCAAACTTGGAAATTTTGACAGGTTCTATTATGTTCTGTGAGTGTCTCAACT:1 + chr2R 9576619 3' - 412 7429 2 65.45 TTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTGCACGTTAATTGGTAAGTATTGTAATTCTACCAATGGAAGAACTTTAACTACCTCAAGTT:1 + chr3R 25221292 3' - 17.6 87 2 63.30 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGCATATGTACCTGACGGACCATTTGATCAAAATCTATTTAGTTCAATCAAAATTCTTTTTTGAAT:1 - chr2L 14848369 3' - pogo 20 1 59.09 GGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGTTCGTCTGGCAAAGGATA:1 + chr3R 25702230 3' - Tirant 8112 2 58.33 TGAAATCGATCTAGATCGGATTGTAAGTCTAAACGGCACGCGGAGGCATAATTTAACATCGTCTCGATGCG:1 - chr3R 29403391 3' - Q-element 638 1 78.87 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTGCGTTTTCATTTTTTCATTTCCTATATAGCATATTTCTTTGCGCTAAATTTCCTGTATTTTGTTGC:1 + chr3L 19347242 3' + jockey 4971 1 59.81 GGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCTTTGAAAAAGGTTCTTTGGCCTCGATAGATATTTACAAAATTTATAAAAAATCAACACATTTTTCGAAAGTG:1 - chr2R 5212081 3' - 297 6779 2 66.97 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAACTTGCTTGGCGCCATTGAAATGCGCAGTTTT:1 - chr2L 18694019 3' + pogo 2075 1 62.79 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATCGTAATTTTGGTTTTAACTATAATGCGGATATATATATTTTACACATTGAGAT:1 - chr2L 21647221 3' + I-element 5324 1 53.64 CAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGATGCGTGCACATAAAACAGCAACGTCAATACGCACAAATATACATTGTAGATTGCTTGTAAAGTATATAT:1 - chr2R 14393250 3' - Doc 477 1 66.06 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGAGCCGGTTAAGCGGTTAACCG:1 + chrX 8279815 3' + blood 7367 2 70.59 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATACGCAAAACTTTACACAAATAATGCGGCGGAACTATGTATATGGAAAGTTCAAATAGAAATTGGCAACA:1 + chrX 9522240 3' + opus 7495 2 73.79 GGTGCCTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTTGGTTTTTAGAGATTTGTCACGTTTGGCAGGCAGATGATAATTAGCTAAGATAAAATATATA:1 - chr3L 9501295 3' - F-element 4451 1 59.63 TGTAATTATTTACTGGCGCCCGAACAGGGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATATAAAATTCGCGATCGGCATAATTAATGCTTATTAAATAATTTTGGTGGTCCTATTTGGT:1 + chr3L 25297239 3' + HMS-Beagle2 319 1 63.64 CACTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACATCGTATGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCTGTCAACCCTTTTAGCCTCTCTGTTAGCCATTTGAACGGAT:1 + chr3R 12182608 3' - 1360 88 1 75.45 GTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTAATGCTATTTAGCTTAGATTCGAGTTCAATCTTATTG:1 - chrX 9184344 3' - Porto1 307 1 66.06 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGCATAGCAAACCGCAGAAAGTGGTGCGTTTCGCATTCTGTAGTCTGCTTTTCAGCGCACTTCTGCGGGATGCGAG:1 + chr2L 9626959 3' - hobo 9 1 71.96 CGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGATGCGTGCACATAAAACAGCAACGTCAATACGCACAAATATACATTGTAGATTGCTTGTAAAGTATATATTTATAACTATAAAGTG:1 - chr2R 14393234 3' - Doc 461 1 80.73 TTAAGTAGGTCCACACATTTTCAATGGGGTTCAGATCAGGAGCTGAGGGGCGTGAGTGGTACGAGCCAGGTGAACGCCAG:1 + chrX 1059340 3' - S-element 1250 1 60.00 TTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGTCTCGGGTCTCGAGCTAAACAACAGCCTCAGTCCTCACATCAATGGCTGTCAAACTGTCGATGG:1 + chrX 2536825 3' - Idefix 289 2 68.37 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCCAAGGAATCCTACACAAAATGGCAACAACACAGCCACCTTGCCAGGTCTCTAAATATACCTTTGCGGAGCGGCG:1 - chr3L 6899794 3' - hopper 8 2 73.64 GATTCCATGGGCAGACGACGAAATCTACAGACACAGTGTGAGATATGCTAGCACGAACTGGCACAAAAGCACCGAG:1 + chr3R 13240837 3' + G2 2801 1 67.11 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGGAATGTCAACGAATGACAAAGGAAAACATT:1 - chr3R 5219245 3' - Doc 7 1 63.46 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGGGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCTCAATAAAATATACCAAGTACTCTACTCTTATTTAAATTA:1 + chr3R 12039999 3' + 412 450 2 68.18 GAATGAGTAACCTGTATCAGATCAATAAGCTGGAGGATGGATCCTATGAAACGTGGAGCATCCAGATGCGTTCAGTGTTGGAGTTGTTGGAGTCGTCGCCTCGG:1 - chr2L 6604927 3' + 1731 429 1 75.96 TCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACATGAAAATTTGGGGGGGAAATAGTGTGTGGCGAACATATTTTAGCTGCTGCGGCTA:1 - chr3L 10831359 3' + Dm88 4222 1 61.18 GTCGCGCGAACCATAACGGGCGTGCGTTCAATCGCCAAGCCACTGGCTCTTCAAAGACCCCAAGGCCACCACACATC:1 + chr3L 1211742 3' + invader1 3971 2 80.52 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTCCGGGGACCTCAGAAGTGCC:1 + chr3L 217361 3' + roo 9012 2 81.65 CTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACTTGAGCAATTTGGCAGAGCGCTTTCAAACGAAAA:1 + chr3R 28406941 3' + accord 6999 2 69.09 AATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - 297 6502 1 41.18 AATATAATTAAACAACATTTATTTTAAGTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATGCTAATTGTAGTGGGAAAATTTGGGACCTTGAGAAAATCGACGGCTCGAAATCTGA:1 + chr3R 32024917 3' - S-element 1610 2 52.73 AAAACATTTTTTTTATTATGTTCAATTTTTTGTTAGTTCAGTATACAACACAATCTCGCTTTTCAAATACTAAATGATCTAAACTAATTGGCAATCCTACTTCGATACCC:1 + chr2R 22277367 3' - Stalker2 7178 1 42.73 ATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTTCATATCAG:1 - chr3R 6769698 3' - mdg1 39 2 64.55 TATTAAGGCATACGGAGTAGCTGAGAACCCCTTTGTGACGTTGGGGTCTATTACCTCTCAGACTTTAAGTGAGTTCTTAAAGATGCAGTTCTATCAT:1 + chr2R 8851716 3' - BS3 1751 1 45.36 TGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTTTAAGTAAAAAGAAAATTTTAATTATATTTCATAAAGAATTGCTATCTTTCTGGTCAGCGCAAGGTAATTATGTG:1 - chr3R 15507909 3' - S-element 162 2 69.09 CTCTTTTTCATTTGCTCCCGGATTTTTTTTTTTGTTGGTTATTCGCCAGGGTTGGAAAGCAGTTTGGCTGATTAATTTTGGTTTATCTTGTTC:1 + chr2L 12055844 3' - G5 487 1 67.74 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACCCAAAAACACGACACAGAGATATCAG:1 - chr3R 9435816 3' + roo 9037 1 55.45 ATTCGGTTATCATTGTTGGGCATGTTAGTTTTCTATCTTGTTATGTCACAATTTATTTTTGATTTATTACCCATTGATACGTTTTTGAAACGGAATTGCTTTTCTTGCCT:1 + chrX 17514099 3' - Fw2 123 1 62.73 TTCAACTTGCGGCGTGTGAAACATTAATAAGGCAATGATTTGTTGGCCGTGTTGTTGTGCCCGATGGGGCC:1 + chr2L 12774215 3' + 1360 421 1 57.75 TGCTGCAAATGAATAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATGGCTGAAGAGTAGAGAAGGCCTCAGACCTTTTTGTGTGTACTAA:1 + chr2R 21707534 3' - Q-element 158 1 67.05 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTCTATCAG:1 - chr3R 5671416 3' - 1360 40 1 75.58 CCACTTGCTAAATGTACACATTCTTAGAAAAGCGCACTCATCATAAAAATAAATAAGCCACGGCTCATGCTGAGCCAT:1 + chr2L 19598138 3' + hopper 1069 1 69.23 AATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTATCTATTGATTTTTGCTGTCAGAACCAACGTTCGCCTAATTGTTCGTTTTTAAATGATTTAATCTAAAAATTATTCTTATG:1 + chr3R 30617028 3' - R2-element 3116 1 69.72 CTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATAAATATATAAATGCACAGCTGCGGTTGAAATATAGG:1 + chr2L 12910767 3' - Burdock 50 2 71.82 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTT:1 + chr3R 17673825 3' - FB 42 1 61.82 GGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCATATTATAAAGTTGTATCTGATCCTAACTTACATGATATTCCAACGATTTTA:1 - chr3R 25051575 3' + 17.6 462 2 56.36 CTCAGAAACTATAAAAGGTAGATTCTAGAGACAATGACGCAGCGCAAGTTGGTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCAAACCCAAAAACCCCATGTCCCAATTCAAGA:1 + chrX 20996096 3' + INE-1 153 1 71.30 ATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAGCCCAGTCAGCAAAATGGGGCAAGGGGCTGTG:1 - chr3R 28037932 3' + invader2 446 1 70.91 GCACCCACACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAAGTGGATTTTGCAGACCACAAAATGGCTTAATA:1 + chr3R 13183273 3' - hobo 46 1 64.15 CTTGGGTAGGGGTTAANTATGATTAAGTATGTTGAGTGAGGTCAAGCGGGTGTGGGCACATGAAGCCAATGGAG:1 - chr3R 22480629 3' - G2 2961 1 68.92 CCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTATGGCCGGAGATCCTTAATGAGAGGAGAACTGCATATTTGCATTATTTAATTGACTCGTACCTTTC:1 + chr2R 20924234 3' - micropia 5293 1 60.91 CCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGTTCAGATACAAAAGTCTGGAGATGCGCAGAATATGC:1 - chr3L 7608544 3' + 297 6610 2 65.38 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATTCCAACAATGTTGTGGGCAAAACTACACTTGCTCTAAATGAAAAT:1 - chr3L 2815075 3' - Doc 51 1 61.68 TGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTACTTTACAAAACAACACAACAAAACACAACACAACAAAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' - X-element 4632 1 47.78 TAATTATAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTATTTTTAGTTTAAATCGACGCACCAAACAGCGCATAAAGTAAGTG:1 - chr2L 219996 3' - Porto1 4205 1 69.86 TCATAGTTGGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCCAGTGAATCTACTTTCATAGCTTTATCAATCGAAATGGTAGATGGAATCAGCTT:1 + chr2R 16801493 3' - Cr1a 4152 1 60.00 GGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGGGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Rt1b 4941 1 79.09 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCTTTAATGGTCTTGTCTAGTAGCTTCTAGTAGCGG:1 - chr3L 25414185 3' + blood 7372 2 61.04 TGAACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGATGGCTGAAAGGGGTGGAAATACACTGAGCATGGGTGGCGATGGGGGTTTTCGGGAACTACATTCTGCGCTCA:1 + chrX 21185656 3' + S-element 1239 1 69.44 AAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGATGCTGTTTTTGTTCTCCATGAATCTTCGTCAAGAGCTTCC:1 + chr3L 27970820 3' + jockey 4647 1 59.41 TGTGTGTGTGTATGTGTTCGTGGGTAAGGGAATGCCTTGGCTGATAAATAA:1 - chrX 14979264 3' - accord 7026 2 68.63 TCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCATATATATAGTCATTTCATAAAAAACAAGAGAGAATGCT:1 - chr2L 21820790 3' - invader4 2794 2 70.45 CTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTACACCTTGCTCAAGTTTGATTTGGAATTTATATTGATTTGATTGGTGTTTCC:1 - chr3R 9486469 3' - F-element 4420 1 52.73 TATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAGAAAAAAAAGAGTGAAAATAAATATAAGTTTCGAGTCGAATTCAATAATCCGGGCTAAATTAGTTTACGGCCTCGC:1 + chr2L 6999966 3' + R2-element 3554 1 69.72 GTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTGTTATTTCTGAGCTGTGTTTGCTCTCGGGTTTTGTGTACAGTTTCGAAAGTTAACTGGG:1 - chr3R 31701799 3' - F-element 4450 1 72.83 GACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCATAGATGTTGGATCCCTAACAAACACCTCACAGGGGGTTGCGGAGTCAACGGATTGAGTGACAG:1 + chr3R 7028078 3' - hobo 338 1 65.71 TTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCATCTTTTGCTAACATGTGTGTGGGTCATAAACATGGCATGCAATTAAATATTTGTGTGCTTATGATG:1 - chr2L 5711125 3' - I-element 453 1 72.00 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCAGAGATTATTAATGGCACAAACAAACGACAGTGTTATCAGCATTCT:1 - chr3R 6088541 3' - transib2 35 1 57.27 ATTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGGCATCCCCTTTTCTTTTCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - invader3 232 2 62.73 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACAATGTGTAACATTACACTTCTTGTTAAATCAGATAATAGCTTTATTAG:1 - chr2R 9953272 3' - pogo 20 1 54.74 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTTTTTAAATCTAC:1 + chr3R 27071913 3' + jockey 4949 1 68.18 TCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGCTCTAACGTAAGTTGCACCATTTTGGCA:1 - chr3R 29740398 3' + F-element 398 1 72.94 CGTTCATACGGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTA:1 - chr3R 8005047 3' - INE-1 124 1 88.89 TTTTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTTAATTGTGCTTTCGTTGAATTTGCTGTAAATTTTTTGTTTATTTCTTTGTAGATTCATTGAAAAT:1 + chrX 10309440 3' - invader2 365 1 57.27 GAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCGATTTTCCTTCGTGTCTGAGAGTCCTTGGAAATTGCATTTCATTTCCCGCT:1 - chr3L 16222688 3' - blood 7178 2 67.12 ATAATTCCACGTTGGAGAAAGTATGGCTTTGATTAAAAGAGCCTTGGAGCTCATTTGTAGTTTGCTTATGTGGGTTGTTTGAATCATTTTTGATGTGCGCATTTCGAATT:1 + chrX 14803033 3' - G5 4371 1 60.00 CAATTGGTGGCCTATATTGGTTTATTACACTCTTCTATTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTC:1 - chr3L 22908067 3' + blood 370 2 41.43 GAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGTTCCGACCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGGGCAGATACATACAGTTAAGGCTATTTTTAA:1 - chr3L 10822117 3' - Idefix 280 2 69.47 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAATAATATATAAGTTTCATTTGTCACAAATTCACTTGTCTAAATTGTAATAGTTTTTCCTTAGCTTTAAATGCTCAAATATTCT:1 - chr3L 7219663 3' + roo 405 1 76.36 CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTT:1 + chr3L 19948895 3' - 3S18 47 2 74.47 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATCTTACTATATATGTGTATGTAAGTATGCTGAAGAAATTGATTACTTTAAAAATTTCGTAAAAATGTGCACAACCATTA:1 + chr2L 9488251 3' + 297 6958 2 46.36 GAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTAATAATACCAAACTGCACAATCATTTGGGCCAATTTATTCAAATCCTAATCGCATTT:1 - chrX 2320266 3' - mdg3 5282 2 59.09 ACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCGAACGCAAATTGCTGGCAATGGACAACGGGCTCACACACACACATGAGGAAA:1 - chr2L 14655538 3' + Quasimodo 41 2 59.00 TTAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTGTAAATGAGTGTATATTTAATTATACTCGTATAACGTTCTAATAATCTATTTAATTGTGTATACGT:1 + chr3R 6450274 3' - HeT-A 5903 1 66.67 TTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAAGCAGGAATAAGTTATAGAGTTAACTTACAAAACATCGTCAGCAGATGCCGCAATCTCCTGGCTCTCCGTGAAATACTTTATA:1 + chr3R 18365440 3' + gypsy4 472 1 77.98 AAGGAAAACCTAGAGAAAAGAACCCACAACAAAAAAGGAAACCCTAAGAAACAAAAGCCAAACAAATTGAATTAAGCGCGCAG:1 - chr2R 22279032 3' + invader5 3602 1 78.31 CATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCATATATATAGTCATTTCATAAAAAACAAGAGAGAATG:1 - chr2L 21820792 3' - invader4 2796 2 68.18 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTGAGTGCGTGAGTGCTAATCTGGCCCGCCAATAACTGCAAATTAGATTAGCAACG:1 + chrX 4263061 3' - Tirant 5 2 72.73 ATTAACTATAACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTTTCCTGTATCCCAAGAAGCAAATGACTGCCACAGCGGCACCGACAA:1 - chr2L 21356213 3' + S-element 443 1 63.27 CACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCGTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTCGACTGAACTGATCGATGTGGCGTGCACTTAATTACACTTTGGCAATA:1 + chr3R 23624346 3' - S-element 1514 1 55.34 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAA:1 + chr3L 20039849 3' - Doc 49 1 66.98 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATTCGTTTTAGACATCTCTATGTGTATACATATGTACATACCAGTATGTATATAACCAAGTAAT:1 + chr2L 4916804 3' - S-element 6 2 75.00 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCTCCTTATGTATCGACGGCGTCAATGTGGTGTCTTCATCACTTAACATACATAAAAATATGTTTGCTTAGTGAGC:1 + chr2R 22661324 3' - Transpac 9 2 72.48 ACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGTTTCTATACTATTGTATACTATTGTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 + chrX 124082 3' - 1360 3316 1 78.18 GAAGAAGTAAACAGCGACTACACCTAACGATACGTAGACGATCTGGTTATCCTTGAATCCAGCATCTCCGAGACTCCGTTCATCGTAATCCGAGGTCAAC:1 + chr3R 24645304 3' - micropia 4984 2 77.00 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATGCAGTTCTCCTCTCATTAAGGATCT:1 - chr2R 20924198 3' + mdg1 7440 2 64.42 AGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCATGGTTAGATATTTTGCTATTATTTTTTGCTGCCCTCTCTGTCGCTCTGCCGATC:1 - chr3L 17119375 3' + Tirant 3 2 71.95 CTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTATCAACATCAATACGACCCGTAGCCCCTTCTTAAATAATATCTATAAAAATTAAATCATAATAACATGTAAAACAAT:1 + chrX 6340748 3' + gypsy7 291 1 60.91 CACTCGCGAAGCGAACGGATCTTAAATAATTATGTTTCAGATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAGCCGAAACAAAACAAAGCGACAGCAGCTGCATTTATGAGA:1 + chr3R 25956874 3' - Cr1a 123 1 66.36 GGTTAGGGTGGTCATGAGGGTGGTGGCGCTTACTTTATTTGCCACGCCGCGTGTCAATGGCCCAGAGACCAGCTGCCACCTTG:1 + chrX 12508029 3' - jockey 4763 1 73.49 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - 412 35 2 59.09 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGTTAAGCGAATTATAATGTATCATAAAAATTCCCAAATCAAATTAAA:1 + chr2L 21825807 3' + pogo 2076 1 66.67 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTAT:1 - chr2L 23372630 3' + 1360 3372 1 62.34 TCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATTTTTCACAATCTCTTTTT:1 + chr3L 13347288 3' - R1A1-element 354 1 67.27 TAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAATCGGGGAACTCGACTACATCATTCTCTCATGTTTTATATCAAATCAGATCTTATTTACTAGGGGAAAAAATAGTTAACTCAGTG:1 - chr4 959198 3' + INE-1 544 1 66.97 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGATTCGAGCTGATTGGATGGGAACACA:1 + chr2R 21735263 3' - blood 7028 2 61.62 CTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGAGCCACATAGGAAAATGTGACATTTAAGTGCCGGGGGCCAGCATCCTCAAAC:1 + chr3L 2736184 3' + hopper 1026 1 52.29 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAATAAAGAGCTTTCAATGTTTT:1 + chr2R 24031513 3' - 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chr3R 23020814 3' + INE-1 578 1 56.00 AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAACTAACTGTAAATCGGTCTTCAAGCGACGACGCTTAATAAATATTAAATAATTGGCGTGA:1 + chr3R 23665092 3' + 1360 3365 1 58.18 CTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTTTTTACTCGCATGTGCATGATGTGGAGCTGGTATATGGCCAACGAAATGCAGTTTTATGTGATGGC:1 - chrX 144588 3' - Rt1a 4852 1 57.73 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTAAATATGCCCGCGATTAGCATAAAAAAGAAGTTAACAATT:1 - chrX 17330108 3' + opus 7453 2 68.18 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGTTTATTTGGAATTCAAGTTTTAATGTTCTTCAATATTA:1 + chr2L 3138375 3' + copia 5077 2 67.27 CGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATGGCCCAAGTCACCGCCAACAACAACAACCACACATCGGCA:1 + chr2L 8089597 3' + F-element 289 1 60.49 TAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGCCAAAAATACCGGAAAAGTTCATTGACCTATCATAGATTAACAAATGATATCGATGACTAAAAAATCGTTTAGCACTGGCCT:1 + chr3L 17819801 3' - S-element 308 1 63.64 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAACCCTTCATTCAATTCCAAAATCAAACCACAATCCTCAATAGTTCCCATTTTAGATTGAAGTTTCTGATAGTTCGGAAG:1 - chr2L 21034019 3' + 412 488 2 79.44 ATCTCACCCACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAAAACCCCCCGCTACACTCAAACTAGGAGCCGACTGCTGGGCGGGGCTAATGCA:1 + chr3L 1260813 3' - gypsy12 9 2 65.48 ATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGCAGACCTGGGGGACTCGGCCCAGCAGGGAG:1 - chr3L 21847922 3' - accord 7027 2 71.26 AGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGGAGGTAGACCTTGCTTTTTT:1 - chr3R 6476158 3' - accord 291 2 70.59 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAATTAAATTAAAAATTAAATCATACATAAAATATTACAAACTCAATTACAGAGAGCTTTG:1 - chr2R 4137676 3' + Juan 4197 1 54.64 ATCTTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAAAAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' + Rt1b 5122 1 56.52 ATCTTGGTAATGCAGTTGGGTTTATATCTTGTGTTTCCATAATTGTTTTTGTTATTTTTTGAATTTTTGAATTTTTATTCACTTTTTCTGTGGCTTTTCTGTT:1 - chr3R 21298459 3' - rover 6870 1 57.28 GTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGACTTGGGGCTGTGGGCCTAGAAGGCGGCTTCGGAGAAGGCATAGAGCAGGAACAACAGGAAGGCCAGGATGAG:1 - chr2L 16840329 3' - G2 2931 1 75.79 TCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTATTTGAACGGTAACGGTGTGTCTTCGGGAGATTGTCTGTAGTTTT:1 + chr2R 2970311 3' - 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mdg1 385 2 69.70 ACAATGCCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGAGATTTAATGTAGTAGAAATCTAGGGTTAAGGCTTTACGGCA:1 - chr2R 22337399 3' - accord2 7386 1 65.45 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGTCAGCCAC:1 + chr2L 9754879 3' - 1360 22 1 56.88 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATATACAAAACGAAAATAAAAGAAAACGCATAGGGAAAAATAAAACGAATTAAAGACACTGTCAGAG:1 - chr2L 14402867 3' + jockey 4966 1 60.00 GTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTCACGCCTTCAGTCTTCAGACATCTTCGACATCCTTGC:1 + chrX 6493329 3' + Stalker4 81 4 66.36 GCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTC:1 + chr3L 23678123 3' - Osvaldo 11 2 59.04 GGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTAGTGCTTATCAAATCTTTTATTTACTTT:1 + chr2L 10554343 3' - G2 312 1 74.07 GCATATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAACCGATCATTTAAAACTAAAACTAAAATACAAAATTTTAATTTATTTAACAAAATTAAATATACTATA:1 - 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ZAM 211 2 53.64 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGGCTGCAGCTGGTTTAACTGGAAACATTTGTGGGCCGTCG:1 + chr3L 15968264 3' - P-element 14 1 63.37 CGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGCTGACGAGAGCGACAACATCGTTGCAAGCGACTTCCAATTAT:1 - chr2R 14020886 3' - Doc 4530 1 53.33 GAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTTCGATTGCTCATTGTTTTGCCGTTGCCGTTCTCTGTAAAAGGGAAATTGAAAATTTGAAATTTTGCCT:1 + chr2R 18898024 3' - S-element 1543 1 67.31 TTAAACATAGAAACAATCAACAAAACTAATAAAAAGAGCAGCAAAAAAAAAAATTGTTTACAATATATGCGTACCAATTCAACTTCCATATACGACTAAGACTAAATAGC:1 + chr2R 19162890 3' + Porto1 4404 1 61.82 AACCTACGCTGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTTATATTTAATTAATTTATATATCTTGAAACCCATTCTCTGTAGCTACATTGATGTAAATAATTGTACATTTT:1 + chr3L 16727243 3' + springer 7490 4 50.91 TTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATACAAAAGTGTGTGTGGTGATATGCGCT:1 + chr3L 17220740 3' + opus 7447 2 76.15 TGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGGATACATGACTATATACGTTTTCTTGTTTACATGTTTTATTATAGGCACATGTTTCTT:1 - chr3L 4264966 3' - Transpac 35 2 54.37 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATTATTAAAGTAATTATATTGCTAATTGGAATCAGCGCGCAACACATACTTAAAGTGCAAATGAGGACCTTAT:1 - chr3R 7833091 3' - Doc 15 1 70.37 AGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATAAATGTTATCGGCCTAAAAATACAAAGAGGGAGTTTAGGGTGATGCATAAATT:1 + chr3R 26172189 3' + 1360 415 1 69.88 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACGCACTTGTTTGCGATTATTTGAGCCAAAACAAACACGATTTCCTGTGAAAAAGTATTCTGAAATCGAAGA:1 + chr2R 12530787 3' + mdg1 7386 2 69.72 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAATTAAAAGTTAATGTAATAATTAAATACATTC:1 - chr2L 16529208 3' - blood 7043 2 59.00 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCA:1 - chr3R 11553669 3' + hopper 1380 1 64.89 GAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTGTTTGCACTTAAGAACTTTATAAACCAAATAAATGAT:1 - chr3R 24260849 3' + roo 9063 1 73.64 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGGCAATGGCAAGACAATAAAATAATAATTCGGAGACC:1 - chr3L 12677066 3' - pogo 3 1 64.71 CTCTAACAAAAATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTCGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAG:1 - chr2R 25203782 3' - 1360 88 1 61.82 AGACTAATAAAATTATGAAAAAATATACAACAATTTTTCAAAAATGAGGGCGTCGTAGTTTGTAGTAGTGTGTGCCTTACAGGACGCCAAAGGACGCATTAAAAGCCAAT:1 + chrX 12077366 3' - INE-1 403 1 65.45 ATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTGTTGATCCACCTCGAAGTCCTTGATCTGGGCTGGATATTGAATGGCGTGCTC:1 + chr3L 710977 3' - X-element 4503 1 61.45 GACAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAGCAAAACAAAGTGGGAAAACGCCCAGAACAGACGCTCTGCTTTTAATTGCGATTTATTTAAC:1 - chr2L 10113297 3' - S-element 280 1 59.62 GAAGTGGTCATTACCCACTATGCCTGACACTAAAATTGGTAACCAAGTTGTGGGTGGAGGAGTTTTGTTGGTGGATGTTGGAGAGCCAG:1 + chr2L 16416910 3' + invader3 305 1 66.29 CGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACTAGTGTGAGCCATGAGACCTTTAATTTACGAATTTTTTTGTTTCT:1 + chr3R 589926 3' - Idefix 7043 2 63.30 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGGACACATATATCTCTGAGCACGTACATAGAGAATTGCA:1 + chr3R 11326943 3' + flea 5009 2 69.44 AAGATAAGATAGGATAAGACAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr2R 6629974 3' + Stalker3T 203 1 55.43 CATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATATAGAGCTGTCCGTCTCGCCGCCGTCGAACAATACAAATG:1 + chr3R 11945302 3' + 412 192 2 59.57 ATAAATTATAAATTACAACAGGCTACCCCCAGTTTAAGCAATTTTTTTTATGAGAAAAACAAAATGTGTAACCATTTGTCGAAAGTAATTGGGCATACTTTGCCATTTGT:1 + chr2L 10128773 3' + copia 257 1 72.73 ATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:1 + chr2R 10572710 3' - F-element 4391 1 63.64 ACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGTAGACGCGAGCTATTCGCGAAGGATGCGGTTCTAAGACACAATATAAATTCTACATAGGTGAA:1 + chr3R 29934467 3' - Cr1a 4354 1 71.28 CGAGCAGCTCTTTTCTACGCATAGGTGACAGTCGACAACACACGTATGCTCATGCATGTACATAACCTGCTTTTTGCATTTTATAAACCAATTGAACGCCACATGCTATG:1 + chrX 16086694 3' + 1360 135 1 51.82 TACTATTGTACATGTATTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - G6 1935 1 26.51 TTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAATGCAAAAATAAAAACAAAGTTAAAAATAACCAGCAAAGTTAATAAAAGTTAAACAAAAGAAAAGTTAAATA:1 - chrX 5343780 3' + TAHRE 10417 1 57.14 CAAATTCTATTTTTAAATTTCCTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGACAATTTTGGTCATTTCTTGTATGTCTATAACACCATTGCCATCGACATC:1 - chr3L 19995449 3' + 1360 3271 1 60.78 TTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACCGTGGCATTTCCAGCGGTTGGTGAGGTTCTTCGGCGTTATTTTATTTCAATGATTTGATATCTGGCGCG:1 - chr3L 23236486 3' + Stalker2 393 2 64.00 TACCAAAGACCCTAGAATAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACAAATTTATCTTAAAACGAACTTATTTTTCCGGCTTCTTCTTT:1 + chr2R 7514057 3' + Tc3 240 1 56.82 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAATCGTGTTCTTATAGACACTAGATATCAAACTACAT:1 + chrX 15026071 3' - FB 50 1 68.18 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAAAATACAATACAAAATATATCCCGCGATCACCACCAGGCCCACATACGTC:1 - chr3L 25455109 3' - HMS-Beagle2 6898 2 65.22 ATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCAACCGAACTCCCTCCGTTCCTAATTTAACTACAAATTGGTTT:1 + chr3L 13108301 3' + G5 4624 1 60.81 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAGAGGGTTGTAGATCCGTCCACTTAAAATCGCCTTATCAGCCGAAATG:1 + chr3L 16496267 3' + P-element 2850 1 45.45 AATTGGTTTCATGTGTTTATGCAAGTGGAAAATTTTCGGCGAGTTGATAGAGATTGATTGATGGCTCCCAGTTCTGTACTCCGAAAAG:1 + chr3R 8537514 3' - rover 7020 2 77.27 TCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAATACATTAGGAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCACACAATATAAAT:1 - chrX 23291014 3' + Stalker4 390 1 57.58 ATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGAACTTGAACGCGCCGGCAATCGCGGC:1 - chr2R 6984301 3' - HMS-Beagle2 17 2 58.72 ATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTGCGCGTGGGAACGTGGCGATGTTGCGAGCGCTTAAGCAAGGAATGTTTAAATTTTTTATGACACTAAAATATCG:1 + chr2L 13044861 3' - Idefix 7090 2 79.09 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACACAGCACACA:1 + chrX 9845527 3' - F-element 50 1 68.00 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATATACAGATATATATATATATATATGTATATATATATATATATGT:1 + chrX 13954550 3' + Burdock 6353 2 60.00 GAATTTATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTACCACAACACGCACACAGCCAAGGGGTTAAGGTCGGGGAAGGGAAGGGGGAAGGATAGACTGG:1 - chr2L 2945486 3' + 1360 3183 1 56.99 CATGTTTATTGCAGCCCATAAATAGAACATTTTTATAGTTTACCTACTTATCATATCTAAACACATATTAAGGCATTCCCTTAATGGTCCCCAATCCTCCCATAT:1 - chr2L 3184076 3' - rooA 54 2 78.10 ATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCACATGCCTACATACTAATACACATACAACTTGTGCATACACCCCAATACAACATACACCCCTCACGGAAAATAGCTTTTCTCT:1 - chr3L 8039442 3' + Idefix 6 2 77.27 GATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCAAGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGATCAAAGGTGGTTTAAACAAGGAAAATCGTGTTTTCAACATTCGACCTAGAAAT:1 - chr3L 23818682 3' + Bica 237 2 62.73 ACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCATACATTTTTTAAAGTGAATATATATGC:1 - chrX 13495525 3' - Max-element 36 2 66.67 TCTTTCCGCCCACTCCATTTCACTACCTAATAGTAAGTCATATTTTTCTGAAAAATTGTGAATACAGAATGTTTGCTTAATGGAACAAAGATTGCTTGGTTGAAATGAAA:1 - chr3R 3377161 3' + Max-element 300 2 80.00 CAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Tabor 7322 2 23.53 GATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTGCATTTAAGTTTTGAGGTGGGTGAAAAATATACCTCAGTATATTAATTACAGGTCGTGAATGGTATGATGATATTCAATAAA:1 + chr2L 3841955 3' - I-element 215 1 77.27 CAAAACGGAGGCATTCCCCAAATCCGCTGGGTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATCATCCACTTGCCATCTTGTAGCAATTTTTATTGTTTGCGGAAAGAG:1 - chr3R 11913729 3' + gypsy5 186 2 56.60 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATATTTATCGGAAGAATTTCGTCGGGCTAGCTTTTGCTTTGCAAAAAA:1 - chr2L 20902933 3' + roo 9046 1 55.32 ATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGGGTGTTGGAAATTAAAGCCAATTAA:1 - chr2R 22976406 3' - I-element 5026 1 80.00 GTAATTATGCCTTCCTCATAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCGATCAGTTGTGCAACGGAATACCCACTTGCCAAGATGGCAGC:1 - chrX 2496502 3' + Tom1 7 1 55.68 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAAAA:1 + chr2L 4016907 3' + opus 450 2 67.27 GAACCAAGCAGATTAAAACGCAAAATGCGAGCCACTTGCGCATAAATCGCTATGTTTTAAACAATTAACAGTGGCCA:1 - chr2L 5894815 3' + Porto1 4516 1 75.32 TGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGCGATAATTGAGTTGTGAGTGCGTGTTACAAGACAGTTATGGGTGATAAAGAAGCGACACGACAAGATGT:1 - chrX 12721170 3' - accord 7026 2 61.29 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATACACCAGTTTTTCCACTGCACACACACATATATGTACATGTATA:1 + chrX 9455823 3' - S-element 35 2 58.88 AAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGGAGGGAAAATGAAGAGTGGCAAAGATTTTAAGGGTAAGTTTACCCATCTTATTTTAAAGCAGAACTAAGTTAAACAA:1 + chr3R 6088651 3' + transib2 2818 1 73.64 TTTAAAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGATTTTGGGATAAGTTATAAGTTTGAGTTGCGATGAATTGTG:1 - chr3L 20031456 3' - flea 498 1 65.09 GGGCGACACACTCACCAGCCGCAGCAACAACAACAGCGGCAGGCGG:1 - chr2R 24942449 3' + TART-A 104 2 82.61 CTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACATGTGTGTGTAATGCGTATCGCGTGTG:1 - chrX 4262989 3' + Tirant 375 2 65.82 AATAACATTTTAAATTAATATAATAACAATCGGAAGGACTTGGTCCTCGCAATCACAGTGGCGCACGCGATAAGATTACCTGACTCACGCCAGCG:1 + chr2R 13047471 3' + I-element 5269 1 77.89 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACCGGCTTTTACTTTTGCGCGCTCTGCACATTCTGCAGCA:1 + chr3L 14755066 3' + P-element 2865 1 49.41 TGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATA:1 - chr3L 3240525 3' + diver 176 2 64.55 ATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGAATGAAAACAAGAAAAGAAGGGCGTTAAATAAGGACATTCCGCGGGTTGGCTGGCAAATGCTGGCAAA:1 + chrX 11232815 3' + Bica 470 1 73.74 TATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCTGCCGTAAAGTGTCAGAGTCATTAAGCGCGATTAAAGTCTCCTTTTTATAATATAATTT:1 - chr2L 19976069 3' + Dm88 33 2 63.64 TAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTAGCTGAGAAGAGTACATGGTCGAATGTGGTCAGGTTTGGT:1 - chr3L 17516309 3' - I-element 5173 1 63.64 CGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Rt1b 4952 1 22.73 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTCGATTTC:1 + chr2L 8476782 3' + Juan 4197 1 58.88 GCTGCGTGAGGTCCGATCGGGTTGTCAAGAATAGTGTGTTAGTAGGTAAGTGATCAGAGCGAACTTTCTTCTTTCCTTCTTGTAGTAAGAACTTTTTTCCGGAATGTCTG:1 + chr2R 13206483 3' + invader4 2881 2 66.36 CAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGTTTCATCCGCTCATTCTACACTCGAAATTAAGTCTCTTTTATCCTCTATTTA:1 - chr3L 15445898 3' + F-element 4303 1 61.80 CCTTCTAAGAAGAAGGCTGTCCACAGACTTCTTGAGAAGGTTTATGTGTGGTGACGATAACATTCAGCGAGTTTACGTTGCTCGTTTCAAATGGTTTTCGCTTCGCACCT:1 - chr2L 6156424 3' - Burdock 6110 1 58.18 TTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGAACTTTTTGATGCATTTAGGGCTTATTTATGAAAAA:1 - chr2L 19129299 3' - FB 6 1 73.33 TTCGCATTCACACTAGCAGTGTAACGGGTATTTGATAGACGGGGAACTTGTCTATAGTATTCTCTCTTTTTTATATTTAATTAATAGGAGTGAAAAATGTGCGCGACTAA:1 + chr3R 19549119 3' + INE-1 531 1 74.55 GAAAATACTATTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAAACACTACGAGCGAAGACAAGGAAAAAAAGACCCACAGAAATATAAAACCGAATAAATGTGGAA:1 + chr2L 7566130 3' + Bari1 1477 1 60.91 AATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCACTGACACCGGTGTTGATGAATGTCCTCGAAAAGAGGGGATTCCT:1 + chr3R 4380727 3' + Doc3-element 4502 1 59.09 TTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACACACATGGACACACACACACA:1 - chrX 10730490 3' + Cr1a 264 1 80.00 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGTGGTTGAGAGGTTGGCCCAGATCGCTG:1 - chr2L 20526055 3' - hopper 40 1 67.03 TACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTTTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTTCGTAAGTAAGTTCATTGATCTAATTTCCATTTGCGATCGGTAAGT:1 - chr3R 14962937 3' + copia 4976 2 56.36 AGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGGTTTCGCTCGAAGCTATCGACACTG:1 + chr3L 17240923 3' + jockey 431 1 77.06 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATAAATATAACATGAAAACGTTGCAAAAAATGCAAAGCTCTTAA:1 + chrX 3092003 3' - opus 153 4 64.55 AATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCCGGCAGCTGGACCTTTTCG:1 - chr2L 18977096 3' + Quasimodo 6903 2 67.80 GAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGTGTATGCACAGCTAAATTTGTTCATATGCCAATAGAAAAACACAAACAATGCATTTATTATTATAATCA:1 + chrX 18750749 3' - BS 4814 1 61.82 TTTCAATTGTTTGCCAACAAACGTTCTAGTGTTCTCTGAAATATTACATTTGTATGGCACAAAGAAGCACCAAGGGTAAAGTTGTACGTTTTTAAGAAATATATGTGTAA:1 + chr2R 11860828 3' + transib4 373 1 68.18 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGAATGCACCTAAGAATAAGGTAACAC:1 - chr3R 9435840 3' + roo 9019 2 75.96 TCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGTTGTGGTTGCT:1 + chr3R 17673842 3' - FB 10 1 68.42 GTTAATTCGGGCCTAATACTTGGCTGGAAAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACTGAATAAACGCTTAGGTATATATATACGTATAGATAA:1 - chr3R 13760545 3' - HB 1341 1 61.05 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATAAATAAAAAAAATTAAATTATATATGACCACATTAAGGTAATGTTTTAATTTCTT:1 + chr3R 23722333 3' + Burdock 6366 2 63.89 CTTACAACATATACACCCCAATACAACATACATATATAGCACCGTCGGAATGGCAGTCACATATGGCAGCGGG:1 - chrX 14709459 3' + Idefix 54 2 65.75 ACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATAAAGTGTCGAACATTATTCCTCAAA:1 - chr3L 3240501 3' + diver 200 2 58.18 GCCATGTAATAAACCAATGTATGCCACCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGACTGGGTCTTAGTAATATTATA:1 + chr3L 3611773 3' - blood 381 1 48.18 TGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTTATTATCCACCTTCATGTGTCGCTCTTCCGGTAAATCTCCTTTAAACCTGCTGAAGAAAAGAGAATCAATTAGTAT:1 - chr4 565381 3' - roo 8804 2 74.29 AACGAACAAGAGACGGCAACCTGTTGCTAAAATGAAAACAGCCACCGAAACTGAAACACCAAGTGGATAAG:1 - chr2L 4757570 3' + I-element 362 1 69.01 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAAAACAACACAACACAACACAA:1 - chr2L 16217659 3' + 412 436 2 76.47 ATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACCTTTATTTTTATTTGTATAATTTTCCCCAGAAGTCACGATCTTCAAGAATACGATTTTGTTCAAGCGTAGAGACTAAAAA:1 - chr3L 16567218 3' - 1360 2983 1 66.36 GTTATAGTTCCTGACATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAAGACGGACATGGCTA:1 - chr3R 8005047 3' - INE-1 146 1 87.93 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTTGGGCCCAATGTGTCGCC:1 - chr3L 20167926 3' - 412 7094 2 62.73 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATGTAGGTACTAGTATCTATGCCTGTTCCGCCCGATTGAATCCCGCTCATATCCGCGATCCTCGATCCGCGTTTGTGATT:1 - chr3R 19058339 3' - Burdock 6140 2 68.18 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACGAATTAAATATTAATAATAAAAGTCGTCAAAGTCTTTTCCATATTTATA:1 - chr2L 21784848 3' - I-element 35 1 57.94 CAGATACCCGTTACTCACCTAGTGGAACTGGAAAACTGTGGGGTGGCAGGAAAATTGGGAAGCCGGCAACGCACAACGCAAAA:1 - chr3L 1113981 3' - INE-1 543 1 75.90 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGG:1 - chr3R 13225470 3' - hobo 3 1 76.00 TTTGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAAGTAATAGTGCTCTCTGTTTTTGTATTTACGCCATCTTCTCTCATTTTCTTTTACTCACCGTATTATAGCTAT:1 - chr2L 21285319 3' - Stalker2 405 1 61.82 CGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCATCAGTCTTCCATACTTCAACCAAGTAAATCGCGCGTCAGCCAAAGTTTTTGCCATCCCGCAGCTGCAGTT:1 + chr3L 8828924 3' + G2 2882 1 68.81 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCATGCCACGGGGCGCAGTAGATGTTGCTGAACTAGTTTGGAAC:1 - chr2R 6707660 3' + 1360 3380 2 72.73 GGTATGGATGCACAACAAATTATGCGCTTTTGAGCAAATTAGATTTCCTAATTAAATTTTCTAGTGAAATGCGC:1 - chrX 5548862 3' - rover 117 2 79.73 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - blood 7048 2 55.45 TACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTAATGGTGAACGTATT:1 + chr3L 12677121 3' + pogo 2093 1 59.38 CAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGACAAAACAAAAGCCGATAATATAAAAGTGAAAAAATTT:1 - chr3L 23145549 3' + HMS-Beagle2 269 2 62.73 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTGCGTTTTCATTTTTTCATCTCCTATATAGCA:1 + chr3L 19347207 3' + jockey 4933 1 70.91 TTATAAAGGATGATAATCTACCACCAGCTAAATGGACTACACTTCAAGGTCGAACGAATGCACACATCGA:1 - chr2R 7749105 3' + diver 5657 1 58.57 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTA:2 - chr2L 18675630 3' - 412 7110 2 73.64 GCAAAGAGTTAACTAGACAGTGATAAAGTCAAACTTAATTAATAGTGAAGAATAAGTAAGTAAATAAAATTCAAAGTTGCAAATGTGATCCCGGCTATGCGGGTCCAAAC:1 + chr2L 103058 3' + looper1 297 1 75.45 AAGTATTTTTTCCGATTAAGAACACAACAAACCAACAAACACAGCGAACACAGTACCCAGAATACAGAATACTGAATACAAACAGAAACCGAGTT:1 - chr2L 20876793 3' + gypsy4 465 1 60.00 TTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATTCGTTTTAGACATCTCTATGTGTATACATATGTACATACCAGTATGTATATAACCAAGTAATTGA:2 + chr2L 4916807 3' + S-element 1703 1 70.91 ATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTAAGCCAAGGGTGGACGAGGTTACTGGCTGGG:1 + chr3R 30747897 3' + R1A1-element 31 1 71.82 TAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGGGATCGAAGGTTGTCGTTTGCTATTGGGGGGGTTACACGGGGTA:1 - chrX 12074924 3' + copia 4810 1 60.00 CGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCACTCACTCACTACCATTTAAACCACATTTTTCCTTAATTTTTCCAGCAGAAG:1 - chr3L 27357810 3' + Max-element 274 2 53.19 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGCGTCAGATTGACCGCATCTGCTAGAGGTGGACAATTGACGATAGGT:1 + chr3R 24814017 3' + P-element 2864 1 54.17 TAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATCATCGAGAGCAACGGGTTTGGCTAGGGGTAAGG:1 + chr2L 4501657 3' - G5 4648 1 60.71 TGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTACATATATCTATTTGGCTTCTTTTCGGGTTTCGAGTTTATATGG:1 - chr3R 4671292 3' + Dm88 4403 2 60.55 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAGTCTGCAATATAGACTTATCAATCTTGGGGAAGTCGGG:1 - chrX 15499973 3' - pogo 42 1 62.73 CTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGCCCGAGCTCAACTGTTTGCAAGTCTTAGCCCATCTCCTGCCAACACTTTGTT:1 + chr2R 17911863 3' - diver 146 2 56.70 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAATTTTAATTGAATTATTAATTTTG:1 - chr3R 12623690 3' - roo 24 2 59.09 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACCCTTTAATGGTCTTGTCTAGTAGCTTCT:1 - chr3L 25414193 3' + blood 7355 2 74.42 CTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCCTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTAT:1 + chr2R 5064834 3' - Stalker3T 204 1 74.55 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACGCACAAGCAGCTACAATTTGTTGCCTACTTTCGGGCGCTCCA:1 - chr3L 10702621 3' + hopper 1376 1 59.09 GATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAAAAAAATGCGAAAAAAAATGCAAAGTAGCTTGAGGGGCAGGGAGCATGCGGATG:1 + chr3L 12383012 3' + R2-element 3565 1 65.82 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAAATGTTTACAGAATTAGCGTGAAGCCGAG:1 - chr3L 16046882 3' - P-element 56 1 30.00 GAGGTGGCCAATCCAATGTTTTTATGCAAAATTTATTCATGGGAAAGTTCAAAACAAACAGAAATACGCACCAGAAACATAGAGCTGAAAAAGTATGGGGCGCAAGAAAA:1 + chr3R 7971366 3' - Tc1-2 1145 1 78.18 CACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAACATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATCAAGGTGTCTACTATGCCGGACAGGAGCTATCCGG:1 - chr3R 7809080 3' + Quasimodo 40 2 67.27 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCACGTACAAGATTAATGGGAGTTCCCGCAACTTAAATTAGAATTTTTGTTTTCCTCATTGCCACG:1 - chr3R 13502968 3' + hopper 1408 2 68.42 TGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCCATAAAGTTGCCAAATATTTAC:1 + chr3L 19948921 3' - 3S18 37 2 54.55 GATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAATGAAAACCGTAAAAAATGCAGCCAACAAAGGGCACAAATGCATTTATTAGATGGAAATAAAGAGGAAC:1 - chr3R 13899886 3' + F-element 4339 1 65.45 TGGTCAGCAATTTGACCGGCGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTGCCGGTCT:1 - chr3L 10911505 3' - springer 39 2 60.38 ACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATAAAGTGTCGAACATTATTCCTCAAAATTCGAAT:1 - chr3L 3240493 3' + diver 208 1 65.45 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTGCACTGGAACCAATAAAATATGCACAAATTGAGAAAAATTGGAGGCCA:1 - chr3R 11526776 3' + pogo 2077 1 50.51 CAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAAACCATTTCTGAATTAAAGAGATAAGAATAATGACGAATACGATGCTGATAAGAAATAC:1 + chr3R 28670649 3' + gypsy10 5941 2 57.78 TTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTTTCTTTTCTTCTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 + chr2R 5064835 3' - Stalker3T 203 1 77.27 GCTTACACACACACACACACACACACACGTGTTCTGTGCGTGTGACGTCAACAAATGGAGCT:1 + chr3R 30528477 3' + Quasimodo 35 2 75.81 CAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCGACAAACGCATAAAATTCGCTTGAACCTTTTGTTAACCCAGAGGACAC:1 + chr3R 26775949 3' - Rt1a 18 1 52.75 CATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAATTGGTATTTGTTAAGAAAGTGAAAAATATTCACATTTCTATATTAATTTTATTTTACAATACATGCTCCACCTACT:1 - chr2L 21191321 3' + 297 391 2 79.09 TATCTACAATCAGACCACTGTGCACCAAAACAAAGACCCCATTC:1 - chr2R 6598712 3' - Cr1a 410 1 70.45 TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCTCTCTTTTAATTAATTGTCATGTTTT:1 + chr3R 563971 3' - HMS-Beagle 22 2 60.91 ACGGCTTCGGGTCGCGAAACTTATCAGCCACTAACAAATTTCTCGCCATTGTTTACTCGGTTCAGAGGGCGTTCAGAGTC:1 - chr2L 11585049 3' + jockey 157 1 60.00 AGCTAACTATAGTTAGCCGGCCACAAAGTGGCTCCAAGATTTCCCCGCATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAA:1 - chr2L 17611656 3' + X-element 4626 1 68.35 GAGTATTTTTGCAAAAACCCATGTGTTTAATGGTAAAGCCATAAGTATTTCTATTTTACATTGGGTTACTTTTATCATTTTGTTTCCTTTTATTTTTATATTATTACTTG:1 + chr3L 16260336 3' - hobo 247 1 56.36 AACTAACTCGAAACTTTTGCCCCCAGCAGAGCCCACAGCCTCCACTCAAGCTCAACCCAATTAGCAAACATATTGACAACAATCTCTGCATCTA:1 - chr3L 5504296 3' + Doc 341 1 79.79 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAGCAGACGCCTATTAATATAGACCCCACAAATCAATGGATCGGCAAACAACAATATGTATGCCCCATATTTACA:1 + chrX 9576622 3' - FB 13 1 69.09 TCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTTTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr2R 5064833 3' - Stalker3T 205 1 50.91 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTCTGTACTGTAATGTAATGAAATCATCGTGATCCGGAGTTCAAGCTAACCATTTCCAAACA:1 + chr3L 25322719 3' - copia 4894 2 51.38 GAACACACACACACACACGCATACAGTGGAATAATTTGCCTTATTTTCTGACCCTGGGACCTTGGCGACA:1 + chrX 2985588 3' + accord 183 2 60.00 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGTTTATTTGGAATTCAAGTTTTAATGTTCTTCACTATTAGT:1 + chr2L 3138377 3' + copia 210 2 65.45 GCAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAACAAAGAAGTATAAAAAAATTGGGAAAG:1 - chrX 7305023 3' + invader2 462 1 63.64 GGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAATAAAATCGAAAACAGGACATCCGCGTTTAGAACGAGGATATATGGAGTCGAAGATG:1 + chr3R 12160512 3' + TAHRE 10404 1 61.86 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTCTTTTACTCTTTATTATCTTTGTAATTTATTGTAT:1 - chr3R 14435034 3' + 297 362 2 67.00 AAATTACACACATAATCCGTTAACCATGCGTTGACCCTGTTGCCCTTTGACCCATCTCTCTCTCTTACTCTTACGTAACTTTAGTCTTAATACTCAAT:1 + chr3R 24676353 3' + Doc4-element 210 1 74.49 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTTTAATAAATTATATCTTATTATGATTCATGGTAAGCTTTCGGAATCCACCTCCCTCGCTTCTTTTACAAAT:1 + chr2L 18749941 3' - pogo 11 1 74.55 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACGGTGCTTCATCCACCTCCTGATGGCATCGCTTCGCGAGGGTGCTGAGG:1 + chr3L 22108187 3' - Transpac 4937 2 64.55 AGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTAACTAATTATTTTTCCAACTGCACCACCCACTAGGCTATAAACCGTTATATTAGA:1 + chr2R 20201311 3' - Stalker 119 4 56.36 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - blood 7022 2 31.82 AGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAAAACCCGCCTCGTAACGATCCACTTTTTG:1 - chr3L 562927 3' + F-element 330 1 69.35 TGAACGAGAAAAACAACTAAATCCGAGTTTGCACAGATTTGACAGCCAAGAAAACTATGCGCATCTCAAGTTCCTGTAGATTGCAGTCAGA:1 + chr2R 8688552 3' - S2 1545 2 58.24 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAAGACACAAAAAAAATCTGTGTAAGCTCGCATCTGTG:1 - chr2L 9754802 3' + 1360 3357 1 63.83 CACACACACACACACATACTGAGAGGGGCTGG:1 - chr2R 14444070 3' + accord 7032 2 84.38 GCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAGTTTACGATGACATGCGTCACCACCCACGTC:1 - chr3L 9012113 3' + accord 121 2 63.53 AAGATAAGATAAGACAAGAGAAGAAGATAAGATAAGAAGGATAAGATAAGATAAGTTAAGACAAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAGATGAG:1 - chrX 4186821 3' + Stalker3T 203 1 56.36 ACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATGAATCGAATCGAATTTACAATTTGAATTGATAAATATATTT:1 - chr2R 23415653 3' - F-element 18 1 41.67 ATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTAAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCTAGTGCAGGGCCTGTTGACATGTCCCGAAATGTTGAAGAGCTTGGTG:1 + chr2L 6061543 3' + Transpac 147 2 53.33 AAATTTCGCGTTCACACTAGCTGAGTTAAGGGTATGTGGGAGTGGGGGAAGGGTGTCTTGGGGCATATTGTATT:1 + chrX 7336607 3' + INE-1 527 1 64.86 GGAACTATAAAAGCCAGAAGGTTGATATTAAGAATACATATTGCCCGTTGACCCATGTTGTCACGCCCACTCTAACGTCCACAAACCG:1 + chr2R 1764017 3' + INE-1 157 1 68.18 TAAGTTTTAAATCAATTTTTAAATATATATAACATTTATGCAGAGTCAACCTATCAGCACACAGTGCGACCCAT:1 + chr2L 16552351 3' + Juan 3781 1 55.41 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTT:1 + chr3L 5204439 3' - jockey 4696 1 57.61 TGATAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATAAGCTGGGCGTGGCGCGTGGGCGTTTTGAGTATCTG:1 + chrX 13463369 3' - Ivk 117 1 68.67 ATAATAGTAATAGTAATAATAATAATAATATTAAAATAGTTGAAGAGGTGTTGGGCAAGCGGCGGAAAGACAGGAAATACGTTTGGCCAACTAAACAGGGAAAATGCCGT:1 + chr3L 13263456 3' + mdg1 41 2 67.27 TATACAAATATACAAAAAGTGCATCACCAAAAAAAATACAAAGAAACTTAATACAAAT:1 - chr4 105252 3' + Stalker 98 4 77.59 GTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTATGAATTATACAATATTGAAATTAAATGGCTTGACAAGCCCACGAAAAACTA:1 - chr3R 10917293 3' - hopper 267 1 40.48 AGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGCAGAGGTTGGTCAGTTGTTAGGTGTTTATTTAGTTG:1 + chr3L 8014331 3' - Doc 4539 1 69.00 TCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACAACGGTGCTTCATCCA:1 + chr3L 22108152 3' - Transpac 4947 2 63.53 CCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTTCTTCCGGCGGCACAGTGAACGCTCGCAAATCGAAGCCAC:1 + chr2R 21709672 3' - Doc 4270 1 56.96 AACGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCCCATTACTCTGCTTTGGTAAGGCATTTGGGAACCTAAAGTTGCGACCTAAAAAGGGTAATTACAAAAAAAAA:1 + chrX 22579637 3' + Copia1_DM 51 1 63.64 CCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTAGAAAATAGCACAAGCTTAATGAGCCTGTGCAAAATCATTTTCAATTTGAAAAAGGAAATATTTTGAA:1 + chr2R 17034520 3' - Doc3-element 4394 1 64.55 GCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGAGCTTACGGATCCTTTTCACCACACGCAAAGCCGGGGACG:1 - chr2L 17522961 3' - Rt1b 5066 1 59.18 TGGTTTTATTATCGCCCTGTATATTCTAATTCTAGTTTTGAGTGTCTTCCTATTAGCCAGTTTGCGTGCGTGCGCATTTTTATGCGTTGCCAGTTGCATTTTTCATATTT:1 - chr3R 28233382 3' - Porto1 4244 1 56.36 GGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCGATTAACCCACACCTGTGCTTGCCTCTCTT:1 + chrX 1267707 3' + 297 6579 1 72.73 TCGTAAAATCATGGCGAACATAACCGCCGCCAAGCAAATCAAAAAAAGAGCGATTTCAGTCTGCAATTACTGCAAATTGTGGCG:1 - chr2L 14679082 3' + TART-B 10309 1 52.38 GAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAACTGGGCAGACAAACACAAGGAAACTTAAAAAAC:1 + chr3L 19320425 3' + Doc 4406 1 70.00 CAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGATGCGTGCACATAAAACAGCAACGTCAATACGCACAAATATACATTGTAGATTGCTTGTAAAGTA:1 - chr2R 14393255 3' - Doc 477 1 64.42 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATTAAATAAATTTACAACTGAAATGATCAAGGTCTTTTGTACTGGATGTGT:1 + chr2R 14884056 3' - mdg3 35 2 50.91 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - 412 59 2 77.27 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAATTTTAATTGAATTATTAATTNTGTTTT:1 - chr3R 12623686 3' - roo 20 2 61.82 TATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTTCATCTCCGAAGATCGCAGTTCGTTTCCTGAGTCTTTCGAGTCTGGCCGTTGGTTTTTTTTATTTGTGC:1 - chr3L 4692605 3' + blood 7166 2 80.00 TTTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGCCGCAGGGGCATCAATAAAAATCATATTTGCCGAATGGCAGG:1 - chr3R 18956348 3' + copia 113 2 53.33 CCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCGTTTTGAACTACAACGCCATTTAAAGATGTTTGCACTTGACCAG:1 - chr2R 5327486 3' + I-element 5069 1 60.00 GACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTAATTACAAATGCAGCGTTTAACCCTGCCAAGCCCCTTCTCAACATCTCATTCATCGCGGGCGC:1 + chrX 19057068 3' - McClintock 294 2 54.37 TTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACCCAATGCGAGTTGGCCAACTTGGCCAGTTGTAAATGTCAAGCAAATTTGGCTCGCTGCATTTTT:1 + chr3L 14345838 3' + Stalker2 7367 2 73.12 AGCATTGATATATAAAATGTTTAATATCAAGTAATGGTTTGAAAACTAAAGGTACTTGGGTTATTGGGAAATATTCCTAGAATTTTTAGAAAATAAGTCCAAGAAAGTTA:2 + chr2R 16260757 3' - 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chrX 6234704 3' - HeT-A 5930 1 69.14 GATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATA:1 - chr2R 5064833 3' + Stalker3T 205 1 60.55 ATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCAATAACTCAATAGGCATTCGACAAGGAAAACAGAAATAAGCGCACAG:1 + chrX 3770907 3' + P-element 405 1 44.55 TCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATTTTTTTTTAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGATTTAATAAATATACTAAATA:1 - chr3R 25504188 3' - 1360 2975 1 67.62 TGATAGTGTTAATTTGCATGCATTAATTAATGGGACTTCTTGAGCGGATTGCGGATCGTGTGGCCACCAGAGAA:1 - chr3L 16927297 3' + diver2 401 1 55.41 ATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCGCCAAACTTAACCCCGAGCTTTCCGCTGCCTTGGC:1 - chr3L 51738 3' - Circe 7191 1 67.89 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGGGCTAATTCAATTGAAAAGCCTGGGCGTGGTCATTGTTTTCGA:1 + chrX 8364762 3' + jockey 4978 1 63.64 CACACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAACAGAGAAGAAAATGAAATACCTAGAAAAAGATCATAAGTAGAAAGTTAAAGTTTAG:1 - chr2L 11608984 3' + Doc 4411 1 72.00 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGATCCGAGGAGTTCAGGACATCCAACAATAAG:1 - chr2L 13710652 3' + copia 239 1 65.74 TATCTAATTTGCTAAGTAATTGCTGTGCTTGTTATGTACATTTGCCTCTTTCGCTGACCCGTCTATGGGCTGTGGTTTTCATGATTTTGTAGTCGCCTGCGGTTGTCCTC:1 + chr3L 21330814 3' - I-element 5229 1 67.27 AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAACAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGCGTGCTATCAATCGATTTCACTG:1 + chr3R 17272015 3' + hopper 1358 1 73.39 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATTCTTAACGTTTCGCAGGTAAAATGCCTTAATTAATAAAAGTTTCATTCAA:1 - chr3R 23722236 3' - Burdock 20 2 59.80 CGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGGGACTTGTGTGAGTTGAGGAGCTTTGGTCATG:1 + chr2L 12244011 3' - 3S18 5840 2 70.79 ATGTATTTAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAGAAAGATGCAACAAATCTCTAGTTCACTTTTGAATATTTATGATAAAAAGATTG:1 - chr3R 24102778 3' - Bari1 299 1 57.27 GGTTGATTTTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGTATGAGATATTGTTATTAGGCATTGGTATCAGATGCAATAATCGATTTGAAAGCGCGCG:1 + chr3L 12615876 3' - I-element 89 1 65.96 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGACGATCAATGCAAGTGAAATGGGACTGGTGGGTATACAATTTGTTCATAGGAATTCGCATTAAG:1 - chr3R 4305268 3' - roo 8680 2 56.73 CAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCAGTCCTCATTTGCAACACCTTTGTAGATCATTTGAAATGCCAAGTGAAAATA:1 + chr3R 9055851 3' + Q-element 105 2 78.18 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGTGTGTGTGTGTGTTTGTACTTTTTGGCACGTGACAATAAATTGTTGTTTGTTGTCTCCCACCGTGTATTTGTTGTTCGT:1 - chr3R 25467819 3' - 1360 5 2 73.64 CTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTTTTTTACTCGCATGTGTGTGAGTATGTGTGTGAGTATCTGTGTGTGCTTGGCCCACTGAGTCGCTTTCGAGTTTTTTCGAT:1 - chr3R 22569815 3' - Rt1a 4849 1 69.72 AAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACAGAGAAGGCACACACCTAAAATGCCAGAAATGTTTAACAAA:1 - chr3R 26387585 3' + Doc 4575 1 70.27 CTTCATCCGCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCACGATTTTCTTCGATTTCCCTCGATTTCTC:1 + chr2R 21957051 3' + Ivk 5038 1 68.69 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAGGGTTTTGCACATCAAATAACACAACTGTGCATAGCTTCTGTCGAACTTGTCAGGTTGAGGA:1 + chr2R 23354368 3' + Tabor 480 2 65.56 TAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGGTTTTATTATGTGTTTGGTGTTTGTCTTGTCAGTAATGCTAAAGGTCGTGATGTCTTT:1 - chr2L 22748644 3' - hopper 1176 1 59.09 CTGATATGGACGGGCGGACGGGCCGCGGGGCCCCAGGTATTCTTAACCCGACAAATACAAATATTTTAAT:1 - chr3R 10116118 3' + micropia 5410 2 70.00 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTAATACTAACGAGACGCGTAAAAGTATGCAACGCCAAGTGGCAGGG:1 + chr2L 19602912 3' - hobo 33 1 63.37 ACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + Tabor 480 2 24.77 GGTATACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACCTTCTGCGCCCTTTTACGCGAAATTAATATCATGTACAAACAAA:1 - chr2L 14455246 3' + Juan 66 1 58.18 ATTTTTCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAGCCAACACATTAGCTTCCACTTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATCAATGCAATTAATAAATCAAATAAA:1 + chr3L 5178357 3' - gypsy12 13 2 65.14 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACTACCGACTCTTACCC:1 - chr2R 13934448 3' - FB 24 1 70.77 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTTACTGGCAGCAATTTCGCTTGTTAATGAAA:1 + chr3R 23621044 3' + roo 398 1 57.58 GCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTGTTTTGGTACCATCCCCCTTCCTACCCGCTTTCCCCTGGGGAAAAGCCTTTAATCAAGGGG:1 + chr2R 13063296 3' - 1360 3357 1 62.37 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCC:1 - chr3L 26852646 3' - 1360 26 1 59.04 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTTTGCTCCTTCATTCAGAAAATCGTCAAGCAATTA:1 + chr2R 18807896 3' + BS 5053 1 64.55 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGC:1 + chr2L 5304908 3' + flea 209 2 68.18 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCAAATGTCACCCGGTTCGTGGGGGTATGCCTGTGGTGGAGAGATATTTTCCGATTC:1 + chr2R 13535537 3' - Tirant 3 2 60.22 TTCAATGCAACTTTTCGGCCAGTTCTTTTTTTTTACTTTACTTTTGCTTATTTCAGTGGAACAGGGAAGTGAGTGGCTTTTGGGGAAAA:1 - chr2L 13312877 3' - Bari2 425 1 73.03 TTACCTGCAACCTACGCTGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTTCTATTTAATTAATTTATATATCTTGACACCCATTCTCTGTAGCTAAAT:1 + chr3L 16727220 3' + springer 345 2 65.26 CATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAGCTACGTAAGCACTCCAGCGTTATTTTTGGCCATTCCACCATAAATAGCT:1 + chr2R 11721869 3' + Stalker4 7023 4 70.91 ACATAAGATAAGAACGGAACCCAAAACTGTAAGTCGTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAGCACATATATTCAAATATTTTTAATAAA:1 - chrX 3632479 3' - roo 8708 2 72.22 AAAAAAAAAACAAAAAAATGGGCATCCCCCTTCCGCGGGCCCGAAAAAAACCCCTGTTTACTTTTGGGGTGGTT:1 + chr2L 13063459 3' - hopper 140 1 66.22 GCAAGGACAGCAACAGCAATATTGCCATACTTCAGCGAGCTCGAGAATAACCCTAAAATATATTTAAAAGTTGACAAAAGTTTAATATATAAAAAATAATCGATAAAATT:1 + chr4 1226481 3' + F-element 4290 1 68.18 GAAGGGATTACAACCACGGCACACACACACCCACACACAATACATGCCTGATTTCTGGTCTTTTTTCCATATTAAGCTGCTCATTCTT:1 - chr3R 7468038 3' - R1A1-element 5282 1 75.00 AGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAACATATTCTTCAAAGCTCTTGATTAATCTTTCTTTCTTTCTCAATTGCTTGGCATAATAAA:1 + chr3L 10836625 3' - opus 16 2 66.36 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGACTTTATAGCTTAATGTCGTTTA:1 + chr2R 330218 3' - HMS-Beagle2 18 2 60.95 ACAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCGCCATCGAGCGCCAAGAAGAGAAACATGCGTATG:1 + chr2R 23525695 3' + gypsy5 7175 2 68.52 CCAGTTATTAATTACAGTTATTCTTTTTCGTTTTGTAGATTGCAAGCGATCGTTTATAATAAATGTTTTAGGTTTTCTCAGTCCACGTTTTCTTTTTTCCTAGACCGACA:1 - chr2L 15821403 3' - HMS-Beagle 247 1 59.09 CTGAGAACTCGACGTTCTTACGGACGGAAAGACGGACATGGCCAAATATGTAAATGATTTAAAAAATGGAAAAGAAAATAATGTGCATGCACTGCTTAATATTCATAACT:1 + chrX 6303434 3' - INE-1 136 1 61.82 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAA:1 - chr2L 21735015 3' - Doc 32 1 63.10 ATATATATACATATGTACATATGTATGTGTGTTACTTACAAAGTATGTATGTGTCTATATGGCCTGACTGTTGCGTAATCTGAGCTGAATGCAAAGGG:1 - chr3L 18895979 3' - G3 4507 1 48.98 AATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTTCCAAAAGGACAAACTTTTGATTTGTCGCACCTCCCAGGAACTGGAG:1 - chr3L 7897194 3' - baggins 5037 1 63.29 CGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTG:1 - chr3R 28831801 3' - accord 186 2 48.48 AAACACGTAGTCTTAAGCACGTCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAAAAAAAATATAAAGAAAATCAACCAACGATCGAACGTGCAC:1 + chr2R 11658069 3' + Stalker3T 226 1 63.64 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTTAATGCTATACATTAAAATCAAATCAATAAGCTACATCTTAAG:1 + chr2L 5304919 3' + flea 220 2 58.18 TAAGAAGCGGACAAAAAAGTATACCTATTAAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACACTCTCTGGCTAACCCAAGTCCGACTCATTTGAATACCG:1 + chr2L 21787071 3' - Circe 44 2 64.55 GGGTTCGGAAAAATCTAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCTAGATTTTTGTGGTTGTTTTGTCAATTGGATAATATTTGTTTATAAAAATTTATTTATAC:1 - chr3R 23652872 3' + FB 15 1 60.00 TGTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTATTTACCCAGAGACCATGTAGAAACACAATATGTATACTAACGATCATCAATCGACGTCATCAATCTT:1 - chr4 812467 3' - HMS-Beagle2 65 2 61.29 ATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAATTCACACAAATCCTCTGACTCGACAATAAATAATATCAGTCGCACCCCGA:1 + chr2R 12825899 3' + 1360 3160 1 58.18 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATACATTTCTAAAAAACTCGCA:1 - chr2L 21941810 3' + I-element 5311 1 75.27 TTGCGTCGAGTGAAAAATTAATTAGGCAATAATTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGCAACGTTCTTCCAAAAAGGCAATAAAGTGCGTTTAAATTTACGCACGAAAT:1 - chrY 946221 3' + 1360 427 1 68.18 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACCGGCTTTTACTTTTGCGCGCTCTGCACATTCTGCAGCAGGATTTTGAGATTTCAGA:1 + chr3L 14755084 3' + P-element 2879 2 67.42 CTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTATTTCGCTAGATAATTTGCTTTTGGCTTAGAAGCCAGGTCTCTTTGGTGAGAC:1 + chr2L 1008485 3' - I-element 149 1 52.73 GGGGGTGAGGCTTAACCAAGGAATTGTTTAAATAAGTAAATTGCGATATGATGCTTTTAGCATTGTTTTGATTGGCCAAGCCAATTGTGGGCTTTT:1 - chrX 9740048 3' - Idefix 218 2 52.08 CCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTTCTTTGTTCCAGTCTATTACGCCTCAGTAAACTGCGTGTGCGTCAGTTTACTGAGGCG:1 + chrX 16964676 3' + X-element 4476 1 50.46 TACCGCATTTAGAATTAAATTAATAATAAACATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGATGATCAAAATTTGCGTGAAGCCGTTTTCACATGAATC:1 + chr2R 4265423 3' + flea 211 2 59.09 TTATGGTTCACAGGATTTTTGATTGTGCTAGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCAAGTGAAAGTGTTTAGCAGGCCCTTTGGAAAATTATAGAAACGTGTGTG:1 + chrX 7604046 3' - Doc4-element 2668 1 56.36 AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATCTTACATATATATGAATAATTCACGGAAAATGTGATTAAAC:1 - chr3R 20703204 3' + flea 4947 1 69.09 AAGCAGTTATTGATGCCAAAGGTGGTGTTAACTGGGTCAATTGGAAAGTCGGTTTATTATCTCTGGGACTCTTATTTTTCGGGTTTCATATCTGCGATCGGGACGTGCG:1 + chr3L 524425 3' + Bari1 1358 1 76.15 CACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGGCGCCATTAAGGTGCAACAAAATGTG:1 - chr2L 18030732 3' - Stalker 280 4 76.36 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGTCTGCAATATCTACCAGAACCCTGGTAGCCAAATATGGTGCAGATGCAGTTCCG:1 - chr3R 19445511 3' + roo 394 1 70.21 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTGTTTGCACTTAAG:1 - chr3R 24260873 3' + roo 9039 1 51.82 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAATCTGATGAGGAAATGTCATAAAAATCGTGTTTATAGTTC:1 + chr3R 13481235 3' - roo 8711 2 68.18 GTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGCCCAGCGTAAAAACAACAATG:1 + chr3L 15272192 3' + Tirant 8413 2 78.90 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCTGGACACCTAAAACTCTTTACTTTACTTTACTTTATATTTACTTTACTCGAGTG:1 - chr3R 13543852 3' - 1360 29 1 52.78 ATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATTGAACAAAAAGTCTTGTTTACAACTATTGTTAAGTTTATTTACCTGTATTAAAAGGAACCA:1 + chr3R 17419784 3' + I-element 5347 1 63.00 AAAAAAATAAAATAAAATCAGAAATATTATTGATTATGGAGTTTTTAACTTATAAAATGTATCAAACGATTGAAATGTTGAGTATATTTCAATTGTTTGATACATTTTAT:1 - chr3R 25501098 3' - transib1 1896 1 34.55 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCGCAGAGCCCTATAGTGTC:1 - chr2L 16742241 3' - 412 16 2 57.47 AGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGGCGTATTAGCTGGACGCTACAGAAGTGATGAAGAAGT:1 - chr2R 6537869 3' + roo 9069 1 78.18 GATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATACACAAACACAACTCACCTGGAGGCCAACACATATGAAATTCTCTAACCTAAACTTTCATAAATCGAAGCCCATGTCATG:1 + chr2R 15445950 3' - opus 7120 4 77.27 ATCAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGGTGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTCGTTATCGTTTCTGTTGTT:1 - chr2R 22404188 3' + Dm88 325 1 73.97 ACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGCCATGAAAAGTTCCACATGCAAC:1 - chr2L 9043872 3' + I-element 137 1 71.25 AAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGCAACTGTGCCCCAAACTGGGTTAAGGACGCTGCACAGCA:1 + chr3R 23513243 3' + P-element 2701 1 47.37 GCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTGTATTAAATTAATTTCTTCTGACAACCAATGTTCCTGAGTTCACAG:1 + chr2R 18398094 3' + S-element 1678 2 62.73 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAACG:1 + chr3L 20039860 3' - Doc 30 1 53.06 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAGAACAGCGTTGTTTACACAGCTTGAAAATTTCAACAA:1 - chr3L 15819346 3' - pogo 47 1 70.00 TGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACAGCTCTGTCCCTTTTAGACTCCCCGCACCCCAC:1 - chr2L 1847906 3' + 1360 3161 1 65.26 TGTCCGTCTGTCCGTACGAACGTCTCGATTTTAGGAACTATAAAAGTTAGAATGTTGAGATTTAGCATGCACCTTCCTGTTGCGAAAAGTACCTCCGAAGGACTGAAATG:1 - chr3L 19594299 3' + INE-1 124 1 73.64 TTCCGCCTACACTGTTGCAACATGAGGGGACAACGAAAGAGTTGGTCATCTAGTGGTAGAAAGGGGGGTTGAGTTAGCGCGTGTTTCCCAAGTGGGGGGTACGACCAGAG:1 + chr2L 3857081 3' - gypsy5 7094 2 71.82 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCCAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTCCCCAGAGAAAGAGAAAGCATTTAAAA:1 - chr2R 11379746 3' - jockey 4724 1 74.00 GATCAGGTGCTCTTAAATGTCAGGATGATCTGCACAACGGACTGCTGGAGGTGCTGACGGCG:1 - chrX 21336250 3' + invader2 4825 1 62.90 ACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGCTTTGTCAACATAGAAAA:1 - chr2L 13292952 3' + X-element 4683 1 50.91 TATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTTGCTTATGATAGCTAATGCTTAA:1 + chr2R 10163638 3' - Juan 4103 1 58.18 GACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGGCAGCCTCAAACAACAAGAAGAACTATCAAACAACTTTTTTTTCACAGCATACCGCAGAG:1 - chr2L 11761470 3' - FB 91 1 72.94 TGAAATCGGCATGACCACACACGCACACGAAGCCAAAAGTACGAGCAGCAGCC:1 + chr3L 5523123 3' + accord 171 2 66.04 ACACCAGAGCCCCTGCTTAGGCACCAGGACGGTGAAAGGATGATATTCGGTCTGTCCGCGACCTTTCCGCTTTTCCGCTCCCCTTTTTGCCATTTCCCGATTTTA:1 - chr2L 15566070 3' - Rt1b 241 1 69.52 ATCTAGAATTGGGGTTTTTTCTATTCTCGAGGATCGTATAACAGTCTTTTTCTTATCTGGTATCTCAGTTGGAGCCTGCGTGGAAATAGTGTCCGT:1 + chrX 656445 3' - Idefix 149 2 71.88 TCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATTTATATACATCAGACATCGCGACTGTTTTGGGTTTTCGG:1 + chr2L 19236234 3' + Stalker 7189 4 56.67 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACA:1 + chr2R 9958609 3' - hopper 38 1 61.54 GTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - springer 450 1 48.91 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTTGACAAGGCCATACGTCTAAGTAAGTTCCAAGTTATGGTTTACTTATAAACATTT:1 - chrX 12271456 3' - pogo 11 1 61.29 TAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATAAAACGTTCAAGTCACTGCTCTTGCTCCACTCTTGACAGCGAG:1 - chrX 1733960 3' - Ivk 5029 1 62.67 GGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACTGAAAAGACGGAGAGCAAATTCACAAGGGGTTTTCCACAGGGGATGGGAAATGCGGAGGCTTCTCGAA:1 - chr3L 7744472 3' + invader2 477 1 53.64 AAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAAAAAACACATAACATTGGGTGTATGAGTATAGAAAGCCGGCAAATTGAATTGCTGGCAAACAAGCAGCTCCTGCAGGA:1 + chrX 7505144 3' - FB 78 1 75.45 CTGCAGCATTTCTTCGTTTGACTAGTGAAGAAAGGGCAGGATTAAGGCTGCAGGGGCAAGTTGACGAAGGCACCGTGGCCGATCCTACTC:1 - chr3L 8957490 3' - Chouto 6126 1 84.44 CACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAAC:1 + chr3L 23839693 3' - 17.6 54 1 77.27 GGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACGAGTATAGCGAATATATCAGTATCAAACTGTGCCGGTCTGGCTA:1 - chr3L 10911500 3' - springer 7175 2 59.09 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTGATTTTGTCA:1 + chr2L 9754874 3' - 1360 22 1 54.81 GGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGCTGCGGAAAAGTAAGGGCTGTAGTAAGGGGGTGAG:1 + chr3R 9882372 3' - Doc 4482 1 63.16 AAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAAAACAGAACATTGGTCAGCTAAATTAAATGAATACAATTTTGCCCAACCAACAGCAATGTTA:1 - chr2R 5988081 3' + P-element 2602 1 65.38 AACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGG:1 + chr3L 23176368 3' - INE-1 580 1 61.39 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGTCATAAAAAATGCAAGTGCTTTGTATGCACGGCAGGCAAA:1 - chr2R 9754711 3' - hopper 25 1 50.00 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTGTTAAGAGAGTGAGTATAATATTGGTACCCCATTGTCCTTTTCTAGGACAATGGCAGTTAGTTGGGAAGCGTGCTTA:1 - chr3R 30369637 3' + roo 9064 1 70.91 TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGCTGCTCCAACCGCGAGTGCATTCGAAGAGTGTTGCAT:1 - chr2R 6707700 3' - 1360 32 1 64.52 GAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATATAAGGACGATAGATATCTTAAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGAATATAATAATAAAAAAAAAACTAGAAAAATT:1 + chr3L 21809129 3' + Rt1a 5000 1 78.00 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCATGTGG:1 + chrX 20330606 3' + P-element 2875 1 62.07 CGGGTAGGGAGATAAGTGGGGTAGGGAGTCGCAAACAAATTATGAGAACGTTTCGGGATCAAGTCGACAAGAATGTTTTCT:1 + chr3L 10771673 3' - G5 4652 1 71.60 CACTGCGAAGAACGCACGAAAGAGAGAGTAAACACAAGAGAAAGACAGAGAGATATGGGGTGCACATATATAGGTAACCCACACATCGATAGTATGCGATAATTTCTGT:1 - chr3L 7772400 3' - Cr1a 226 1 57.80 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATTCGATATAACGACTAATTCGATCGATCATCCGTAAGACAAATGTGAGACTCTCTGTTGT:1 + chr2R 10129831 3' + Burdock 6366 2 58.18 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAAAAACCAATGACAACTCCTCTCAGAAAAGAAGAAAAATAAAAAACTCCAGAC:1 + chr2L 4016956 3' + opus 499 1 80.00 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAATTTATTGCACCAGGTATAGGGACACGAAAACTTTTATTGTTTTCTTAAAGCCATTGTGGCATTTGTTCTA:1 + chr2R 8530847 3' + mdg1 7448 2 41.12 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTTG:1 - chr3L 20167942 3' - 412 7109 2 77.06 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGTACATATGTATATTTGAAGATCCAATCAGTGAATTTTTGGGTTTCC:1 - chr2L 5304835 3' - flea 26 2 57.69 GTCGGGGAAGTCGACTATAGCACTCTCTGCATGCTTTTGTAATATATGTGGGCGCTAGAGTGGGCGTGGTCTTTGGCATTATGACAATGTTGT:1 - chrX 7332373 3' + INE-1 568 1 73.12 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGTATTAAATAAAATTTAAACACCGGACGGGAAAAATG:1 - chr3L 17530140 3' + Tirant 8462 2 70.00 GGCAGATGTTCTAACCAAGAATTTGAATAGATTTAAACCCAAAAAGAGGGACGCGGGATTATTAGATTACCAAAAGGATTTCGAGATTTTAGAAAACATCAGTAAGATA:1 - chr2R 4518974 3' + Dm88 4213 1 66.97 TTTTTAGTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTGGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATTATTCTGCTAGTTTTTCGAGTTTGCAGTTGCTGGTTCTGGGGGAGACA:1 + chr2R 20614863 3' - Idefix 7323 2 62.04 CATATCTCCCAATCTAGGAGAAGAGGTCTGCGGCAACCGCCCTGCCTGAGTAAGACATTTATCTACGACTCCTACGCTTCCGACTGATGGGGCTA:1 - chr3R 23587013 3' + springer 7412 2 57.89 AGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACAATATAGCAAACGTCGAATAAAATAAATGAAAAGTGTCTGAAAAATGTAACTTTAATAAGCTCAAGAATGGTAAGACAAAAA:1 + chr3R 20063960 3' + Bica 293 1 60.00 ATTGTTATATAGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGGGTGAGAGCTTCAATTTCTGTCCTTTGACTATGCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGA:1 + chr2R 4802891 3' + mariner2 272 1 38.18 CATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTGCGTCTCTTTTTCGAAAATGTTTGTAATGGATAATGAAAGTGTTAAACTGGGACTATTAG:1 - 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chr2L 21919294 3' - 1360 408 1 65.14 TTTTTAAACCATTAATTTGTCAACTTAGAACGATTTTAAATATTTTTAACTTGATTTATTTTTATGTGCTCAGCGATGCGGCAATGCGAATGGAGTGGGCTGTAGAGTG:1 + chrX 6214181 3' - HeT-A 121 1 55.05 TAATCGCAATAACATCGTTTGCCAGCAGTCCTTTAGCTGCTGAAATAAACGGGGAGAGG:1 - chr2L 13767056 3' + FB 197 1 67.80 AGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 204 1 84.40 ATTCTGTTGGAGTTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTGTCATCGGTATTTATTGTATTTATATATTTCGATAGCTTATTAAAATTCTATCAATTATAAACTGAAG:1 + chr2L 17130606 3' - Porto1 4531 1 53.64 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACAATCTTAAAATCTATTAACAAATGTAATACTTACCAAATTTTTAATTTTGTA:1 + chr2L 1611456 3' + copia 221 1 56.36 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTTAAGGTTATTTTTTTCAGAACTGCCAACGAGAG:1 + chr3L 16046922 3' + P-element 2835 1 33.64 AAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 15054714 3' + I-element 390 1 70.00 AGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCATCAGTAA:1 + chr3R 14357360 3' + Rt1b 5106 1 56.60 ACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATGTTAATTAAAGAAAACGTCTACTCGAATTGCGCGGGGCATCAGAAAGGCAAAGGACGAAGC:1 + chr2L 15886685 3' + Bica 157 1 57.80 GAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTATCACTTTATTGGGGCTAATAAATATCTATATTATATAGTCGACTCCAGGACAATTTCTCATCCAGTGTAGTTGTTGGCA:1 - 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roo 8720 2 76.36 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTACGCTGCCCATTTGGCTACGCAATTCCGTTGACAAT:1 + chr2R 25118087 3' - Transpac 37 2 63.73 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCCAAAGCATGTGCAAAGCATCCATCTCCTTTGAGGATTG:1 + chr3L 16682060 3' - FB 40 1 62.75 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTAACTTATTTTTATATTTATATTTTTTTAATATTTTTCTTCGCCATTTGCGTACTTTGCA:1 + chr3R 8811255 3' + 1360 3363 1 57.27 TGTATGGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCAGAACTCTGTCATGCCCTTGCAGATGGGAACTCTAGACTCGAAACGAAATGGAAAGTTCGATAGTATGA:1 + chr2L 17645673 3' + 1360 3371 1 75.45 CTCGGGACACTACGTAGCGGTTTCAGTCTTTGTGCGTCGCCTCCGCTC:1 + chrX 5156656 3' - G-element 88 1 62.50 GATCAGAATTGATTTCGTCACGAAAATCTAAAAGCCACTGGATCGCGTCCTCCTTATAGATAAGATCTAGACCTTTTGATTTAATGTTCAGCTGAAAGCG:1 - chr3L 12757278 3' + 1360 3178 1 75.00 TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAATAAAAAAATAAATGAACGATAAAAAGCCAATAAAGAGCGGCATAAATAAATGCGTAAATATCGAGCGTATACATTAT:1 - chr3R 5774814 3' + I-element 5336 1 66.36 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAATAATATTAATAACTATGCGCAAAATTAGACGGCAAACAGGCAAACATATAAACATTTGCATTTTCAATGTTAGGACAGAG:1 + chr3R 9481309 3' + roo 404 1 71.82 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCA:1 - 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chr2L 21739438 3' + INE-1 552 1 74.31 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAAAGACAAATGAAGATGGTTTTATTCTATAGAGAAACAAATTACTTAACTACT:1 + chr3R 1313791 3' - Doc 30 1 53.00 GTATGAGATTAGTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGACCCCACAAAAAAATTACTAAAAAAAAGTAATAACAGAAAAATCTTATATATATTTTTGAAGCTAAAAA:1 - chr3R 1283442 3' - diver2 27 2 88.07 TTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGTCCCTACAGCCGTCCCTCTCACTTTGTGCGTTTCGTATCCCGCATT:1 + chrX 18539087 3' - 1360 217 1 54.00 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGCCTGTTTTTACTATCGCTACTGGCAG:1 - chrX 1503351 3' - roo 8678 2 65.15 CGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTGTTGTTTTTTTTTATGTATATTTGTTAAGCTGCAATTGTTCCCCTTTCGCTGACCCATTAATGC:1 + chr2R 20361459 3' + INE-1 555 1 90.48 TGATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGTCCGGTTGCCTACCAGAT:1 - chr3L 217321 3' - roo 50 2 69.09 TTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGACAAATGTTTTAATAACCTTACTTG:1 - chr2L 20029755 3' - I-element 5119 1 80.91 AATTTGATTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTA:1 + chrY 2720350 3' - 1360 3255 1 73.64 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATT:1 + chr3L 131808 3' + P-element 2843 1 43.12 AGCATCCAAAATATTAAGCATTGGATAGGCAACAAGAAAAATGCCAAACGACTTGGGCAGGAATGGCTGAGCGGCGG:1 - chr3R 29703507 3' + invader3 4986 1 61.04 TGAGTAATTGTGGCATTCTGGCTGGGGCTTTTTGTGGACTCTGGATAAATGCAGATCACTTTGACG:1 - chr3L 15529158 3' - TAHRE 10042 1 66.67 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATACATTTCCTTTTACCTAATAAATATTTATAAATACTCATCACATTTCTTATTCTCACAGT:1 - chr2L 11573274 3' - Juan 60 1 60.55 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATCATTGCTACACCGCACATATGAC:1 + chr2R 9138748 3' + pogo 2067 1 76.47 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGATTCGAGCTGATTGGATGGGAACACAAGTGAATTA:1 + chr2R 21735272 3' - blood 9 2 68.00 TATGACCGCAAAATTACAAGAGCGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATATAAAATGTTAACAATCATAACAAATGACGTCCTTATATTCCACTA:1 - 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chr2L 15469507 3' + 1360 174 1 77.63 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCTCTCTTTTAATTAAT:1 + chr3R 563960 3' - HMS-Beagle 6828 2 55.05 TTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAACAAATCGAATAGGGTTGCTTACACTTAACTGCTAA:1 + chrX 16903362 3' + invader2 5090 2 74.55 TAAATAATTTAAAATGGGTGTTCTTTAGACGTTTTATAGCCCCTGCAATATGGGC:1 - chr3L 3766725 3' + Transib5 260 1 92.73 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATTAA:1 + chr3R 24867554 3' - roo 46 2 70.00 GCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAAAAGGAATAAATACGAGGGGAAGGGATGGGGCGAAGAGCAGTAGAGAAAGAACTTGGCACATTGTTAA:1 - chrX 17345839 3' - copia 148 2 72.73 CAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACAGATCGTAACGAATTATAAATGTATTTAAGCTTGAACCTTTGTTTGAATTAAAAAA:1 - chr2L 9378489 3' - 17.6 105 2 54.55 GAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTGTTTCCATTTCAAAGGTCATTG:1 + chrX 12984558 3' - 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Idefix 7386 2 70.91 TAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACCGGCGTATACACGCCCTGGCAATAAACCTTTCACTCTGCTGGCC:1 + chr3R 10274743 3' - HB 1328 1 55.91 TTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGACTTAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTGTGCAATCCACGCGGTTAGCTAATCGTCAAATACT:1 + chr2L 11690353 3' + McClintock 366 2 67.29 AAAATACATTTTTTCGTTTGCCCACCCTTTAGAATTAGTTTTTTTCGTTTGCCCACTATTCTATTCAAAAATTAATATGTTATATGAGCAAAAAATACTACTCGGCCAAA:1 + chr2R 1523051 3' + FB 700 2 54.55 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGACCTGGCCAAATCCCTATCA:1 + chr3R 11474943 3' - hopper 39 1 75.29 AATTCCACGGGCAACGGTGCATTACCAAATAAATAAATATAAAAAAACACACACAACCAAAAACGTTGCGCGTTGTGCGAAGTTTATTTGCTTTCGGGACGCC:1 - chr2R 5874861 3' + Tc1-2 454 1 70.87 TTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 + chr2R 5064835 3' - Stalker3T 203 1 65.45 CAAAACCCTTTTCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCGGG:1 - chr3R 28445693 3' + I-element 69 1 66.67 ACCATTCGCCACTCTATCGCGACATCATATCCAGGTAGTAACTATTCAGCTGACTACAAGCAGCATTACTACAACGCTGTGCCACTCGCCAAGAACATTCCCTTCGGCAA:1 - chr2L 3406460 3' + G5A 249 1 55.45 TTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATCTTATAATTAATCTTAATCTTCTCTTCCGTTCAGGGGATTGCAACTTAAATTATTTAAAAAACCATACATA:1 - chr2L 19559594 3' - G4 3829 1 60.91 TGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGCTCGGTCTCCGCGAGCTGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAAATTAAAAAA:1 - chr3R 10672726 3' - invader4 328 1 53.85 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATAACATATTCTTCAAAGCTCTTGATTAATCTTTCTTTCTTTCTCACTTGCTTGGCATAATAAATAACAATTGC:1 + chr3L 10836635 3' - opus 6 2 71.82 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGAAATGTTGCTGATTTCATGGCGATTG:1 + chr3R 11526840 3' - pogo 20 1 64.00 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATAATGCAAATATGCAGTTCTCCTCTCATTAAGGATCTCCGGCCATAAATCCCTGCCA:1 - chr2R 20924178 3' + mdg1 7454 2 77.27 ATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGCCGGCTATCTGAACTTGGACTCTATTAAAAATGCTTACAAATG:1 + chrX 3979048 3' - R2-element 3127 1 75.36 GGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAATAAAAAAAAATGAATATGGGATTTCTAAACCCTTTGGGTTATATCACAATGGCTT:1 + chr3R 8451740 3' + X-element 4690 1 54.08 CTTGTAAGTTTATTGAATAATAATCAATGTCTGCGTGGCGACGCCGACGCAATCACAGACGACGCAGGCACAGAGATACTAAGCGACTTCATCA:1 - chr4 1082519 3' - gypsy7 160 2 59.57 CAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATCTTTTGATCCTGTTCAGCAGCGAAGTTCTGGAGCAAACGCATCACAATCT:1 + chr2L 17965365 3' + copia 4785 1 54.55 TGTAAGCAAAAGCAACAGAATTTTGCTAAGTTGCTTGGATTAAATTAATTTTCGTTTTACATCACATATATATAGCTTTGTGGTTTATTGGTTTCCTTTGAGTTG:1 - chr2R 12045447 3' + Copia1_DM 4241 1 74.29 ACCGCGACAACAATAAACATTTAGTGGACAAACGAAGGGAGAACAATTAAATTGTGTAAATTTTAGGTCAAAATGCTGGGGAAAACAAAAAGCAAAGAAAAAACTGTAAA:1 - chr3R 28449729 3' + HeT-A 165 1 56.36 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTTGTTTTAACCAGTGTAAAGCAACAGTTAAGAACTGCAGTAAAGGCAAAGAATCCATTA:1 + chr2R 19684539 3' - 412 7080 2 58.18 GTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGCGAACAAGGAAACGTGAGCATTTTTATTTAATTTTG:1 - chr3L 10055218 3' - accord 7142 2 61.29 CCATTCGGACTCCACCCTAATATAACCACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCGCGTTTCCTTACAGAAATCAAATG:1 + chr3R 17007071 3' - Circe 7169 1 74.49 CGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGAAAATGAAACATGGCTAGAATTCGTTTTTTAACATTTTTTCAATCTGAGAAAAAAATTCCGATTAGTCTT:1 + chr3L 64581 3' - F-element 248 1 73.40 TAAATAAAAAAATTAAAAAAATAAAATAAAATAAAATAATAAATTCTATTAAAATTGCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATTAACTACCTTGTTTAAATATTT:1 - chr3R 16799769 3' + HB 320 1 65.45 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATCTTAACCATATAATTCATTTCACAATCATCACAGTTTATTAATGGCAAATAACAATACTTTT:1 - chr2L 14708841 3' + opus 478 2 59.09 AAGATAAGTGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 55.29 GAACAGACGCTCTGAACTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTGGCATTTCCAGCGGTTGGGGAGATTCTTCGGCGTTATTTTACTTCA:1 - chr3L 23236506 3' + Stalker2 363 2 57.27 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACTCATTGCTACACCGCACATATGACGTACACTTGGAGAAACAAGC:1 + chr2R 9138768 3' + pogo 2062 1 63.64 CTTTAATTATCATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTCATTCTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Cr1a 88 1 67.62 GAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATAATTGCTGCCTGGTATTTTGCG:1 - 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roo 8706 2 78.95 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTAAAAACTAATGTGACGAAAGGCTCCGCAG:1 - chrX 15043124 3' + S-element 1674 1 72.38 CTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGACCACCAAAAACTTATATGAATTAAACCAGCAAAAACTGGGCTCAGCTCGTTGACTTCCTTTTTTTTTT:1 + chrX 8544351 3' + Stalker 6926 4 55.45 AAACTACCTAGCCACCAAAACTAAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAGACCGTGTGGAATCTATACCCTTTATATAATTCGAAATTG:1 - chr3R 26282509 3' + Porto1 4462 1 63.64 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATCTTTTGGGCTAAAACATCATAA:1 + chrX 15500023 3' + pogo 2066 1 78.31 ATGATGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTTGAGCTCGGATTATTGTATCGTACCCGCACTCCCTTT:1 - chr2R 12664682 3' + Dm88 351 1 67.27 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTGCGTAAA:1 - chrX 21399403 3' - pogo 41 1 60.91 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTAACTAACCTTAGCGTAAGGTGCGCATAAATGTA:1 + chr3L 10882710 3' + pogo 2068 1 64.58 TTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATTAGACTCTGGGGCCGCATAAAATTCAATT:1 + chr2L 18498908 3' - Burdock 252 2 76.36 GTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACACACACACACACACACACACAAGCAGGCGCACGCACACATTCGCATTCAGTGAGATGGGCATGCAAAAGCGCTGCTATTTTAT:1 + chr2R 7887263 3' - Stalker 467 1 80.00 AAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTGGAGACAGCGCTAGTTTGTTGACCCAAACCACCCAAAATCCCACAAGCTGAGTAACGGGTACCTG:1 + chr2L 7232137 3' + INE-1 174 1 70.65 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTCTGCCTCGTAATGCGGTTCAAATGTTCACTTT:1 - chr3L 19063433 3' + P-element 2853 1 50.00 TTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCATCAGTAAACAGGCAAAA:1 + chr3R 14357370 3' + Rt1b 5116 1 60.38 TCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGCATTTGACTCCATTTAAAGTTTGTTTCGCTTTATT:1 - chr3L 21252484 3' - accord 281 2 72.16 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACACACAAGAGAAAAATATTCACTTCAAGTGAATTCTGGTAGTGTATTTTAATGTATTTATGGGCTATA:1 - chr3R 8811147 3' - 1360 15 1 67.27 TGAAAAAGCTGGACTGGCTTTTCCACTCAAGCCAACCCAAACAACGCAACCCAAAAGCTATCTCACGTTCCGAAAAAAAA:1 + chr3L 12106908 3' + G5A 2342 1 58.75 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTATATACGAACCACATGCTGTAATCTAATAACCCTTAAAATTATTTTTAACCGCA:1 - chr3R 25434735 3' + opus 7475 2 57.27 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGATATAAGTATCATTAAAAACAAGCAAACGCTGCTAGAATTTAATGAAACTAAAGTCT:1 + chr2R 12416943 3' - pogo 22 1 57.00 GTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCCTTTGCCAAATAGCATGCCAGTTGGCAGTAAGCGAGAAATAATTATTTGCC:1 + chr3L 6014145 3' + R1A1-element 5307 1 58.95 GAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGTTGATGCCCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGAGGTTCAGAGCCACCTACAATCG:1 + chr2L 17179529 3' - rover 6913 1 77.78 CAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATATAGCAAACAATGATAAAAACAAAAGCAGAAAATTGCAAAATGAAACCCAAAATTTGGCAAATGCAACATAAACAAAACGGTTGA:1 + chrX 6134422 3' + Bica 417 1 73.64 TTTGATTTGGGCAGCGTGAATGCGGCAAATTTGGCTGTCGCAAGCCAAGCCCTTTCTCCTTTAACCAGATATCCTCATTGGTTTTGT:1 - chr2R 19391572 3' - BS3 1357 1 59.77 TACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACCAGTTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATAATTTGTTGTTTATATATTGTTATTTTTACGCAATCAATTTTTTCT:1 - chr3L 5377270 3' + rover 54 2 67.27 TCTAATATATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAACGGCAAAAATAACGAACAAAAGCTATAGTTTAGTTGAACTTATAAGGTCATTGTCATATTTGGTCATCTGGTC:1 + chr3R 6402230 3' - 1360 320 1 70.91 GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTGCTATATGCTACACACATGCATGTGGATCATAAGGAA:1 - chrX 2552053 3' + blood 329 2 65.45 AAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGAGTAAACGAAGGGGAAACATAAAGCAGACAAAGCGGGTCTCCGAAATTGGG:1 + chr2R 15910807 3' + Doc 4513 1 56.88 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGGCAATGGCAAGACAATAAAATAATA:1 - chr3L 12677077 3' - pogo 46 1 74.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGTAGATTGGAGCATCTTAAA:1 - chr2R 10090980 3' + roo 400 1 72.73 TTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTTGATTTAGTTGCTGGCGCTTTGCTATTTAAGTATGTGCTGTTTGTTGGGTAGTGATTCCAT:1 - chrX 21570925 3' - G4 3357 1 72.38 AAAAACGTACAAGAAGGAAAAAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATTAAAAGGAGTCAGGGATGGAGGATGAAGGGGAACAGGGTAATT:1 - chr3R 26420309 3' - copia 126 2 63.64 AGGCTAGAGCGCCACAGAAATCACACGCTCATCATTCGAAGGCATTCGAACGCAATGTT:1 - chr2L 2439836 3' + BS3 1496 1 71.19 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCAATCCTTCCACCACTTTCACTCTTGTTTCATTTATGGTT:1 + chr2L 9804804 3' - blood 7071 2 67.27 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATATTGGGCAGAGATGTAACCGGCGGCTTTGG:1 - chr3R 12040157 3' - HMS-Beagle 6825 2 65.88 TATGTGTGAGTGTGTGTGTTAATTTTTAATTGTGCTAAATGTGCACATAAATTCACAATAACCGCACGCCAATAGCGTTCACAATTCGCAATTCACACTTCACCATATTT:1 + chr3L 16873756 3' - accord 7028 2 58.18 CACACTTTTAAAAAATGTTTTGATACGTTTTTATTATTTTTGTAAATTTCTGGCGATTTGCAAACTAAATTTTGCCACACACTTCCGCACACTTTTACCCTGACAATTCC:1 - chr3L 1265998 3' + INE-1 259 1 72.73 AAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAATCACGTAACCAATGCACCAAATGTTACCTAATGTTTATAGGCTGATTATTTAAACCCTAGATAGGATCAA:1 + chr2L 9463410 3' + Doc2-element 448 1 67.27 CGATATATGCACATACTACAATACCATATAAGTTAATTAAAAGTTAATGTAATAATTAAATACATTCGCAACTGTCAATTAGCTCAGTAAACAATTAAAAGATTTTGATA:1 - chr2L 16529165 3' - blood 7010 1 80.00 AATAATTCAAAGTAATTAAGTGGACTAACACGCGTCCGGTTGAAACTCGAAATAAATAAAAACAATTTTAAGGCACAATGTTCCATGGAGTAAA:1 - chr3R 13037903 3' + Copia1_DM 243 1 71.28 AAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAAAATGACCAGAACAATATTTTTATAGCAATTCACACACAGAGTGTAATAAATTATTCACTTAAAGTTTGTTCTGTACGCGCA:1 + chrX 9886853 3' + micropia 251 2 78.18 TCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTCTCTCTTTCTCACCCATCCCGCAGCGCACGCATTTTTCGGCAATGTTGCATG:1 + chr3L 10666608 3' + FB 426 1 52.53 TATATATATACTATATATGATCCATAGCATCGGATAACTTTTCACGGGCACAGAGCTC:1 - chr2R 13979113 3' - INE-1 57 1 86.21 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGATCTGACTGAACAATAAACAAAACGATGCGTTGTAAATAGACGTC:1 - chr3L 15968178 3' + P-element 2867 1 54.95 ACTGAAGGGATCTTCTTACATTTCCCTTCTTCAACATATTCTCTAATATCTATACACACTGGCGTTCACATCGATCATCAGGACACCATG:1 - chr3L 20485925 3' - invader4 2987 2 76.67 TATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTATGAATAGGAATATTTCAATATTAAAGAATACAGATTAATCCCTTTTGTAAAATCCAAAC:1 + chr3L 14811507 3' - copia 11 2 56.84 ATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACATTCACATCCCTAGACAACTGCTTTGTGTCATTCGTTACAGTTTCCAGCTTAAACAAGCACA:1 + chr3L 23236594 3' - Stalker2 21 2 61.11 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTCTCCTGGTCGGGTGAATGCGAAATGCGAATGCATTTCAATAATT:1 - chr3R 9934618 3' - 1360 26 1 57.95 AAATCGACTTTTTATCTAATAAGACTATCCTAAATATAAAGAAACCATACATTTTTCAGATAATAAATTAGAGCATGCGATAAAAAGCATTTGACCATTAAAATGTGTTT:1 + chr3L 16636544 3' - transib1 99 1 55.45 CGGTGAATCTTCGCCGTTTGCTTTTAGAGATTGGATGGTCATTAGATGGACCAATAACCATATGTGGCGGGGGATTCTGTCTATTGCTATGCTTGCTTTTCTTCT:1 + chr3L 21160703 3' + Copia1_DM 4005 1 63.81 AGAGGCACGAACAGCCTCCGCAGCTGATTGAGGGGCTTTGTGGCGTTTTCTGCTG:1 + chr2L 13679769 3' + invader4 2859 2 60.00 TCTACCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATATAAGAAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATA:1 - chr2R 6085997 3' + 1360 3210 1 65.45 TGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTGTAATTTATGACGAGAACATGCATTTTGGTAA:1 - chr2R 14570843 3' + blood 113 2 69.09 CTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTGTACACACACACACACACACACACACCATCGCATGTCAGAGTACTTGAGCAAATACCAGACGATCCG:1 + chr3R 24433975 3' + accord 256 2 63.30 TTTCAAAGTTTTTCGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAACATCTCGACTACTGCAGCCGC:1 + chr2R 13696069 3' - Tc1 273 1 78.12 ACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGTGCGTGCGTGCGTGTGTGATTGTCTCTTATTTATTTATTTTGTTTGC:1 - chr3R 18934961 3' - 297 6568 1 57.27 GAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTATTTTTGGTCTGCCCGCGATTTGCTTCTGCCACCACTAAGATAATTAGAATAGTGAG:1 + chr2R 7085334 3' - Ivk 284 1 62.75 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGTTTAATAGTTAGATGGTTTTAAATTTCCTT:1 + chr2L 21034147 3' - 412 15 2 67.27 AGTTGATGAGCTGCCGCTCTTTATTCAGACAAATGCAAATTGAAAATGAATTTTATCTCCCAATTCTTCAAATTATTTCCAAATTTCACAAGTTGCTAATCAAGTTTTTG:1 + chr2L 12287112 3' - Gypsy6A_LTR 191 1 77.27 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAATGCACTGATACTTCCCGTATAATTTAGTTAT:1 + chr3L 20039889 3' - Doc 12 1 62.39 AAAAATTAATTAGGCAATAATTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGCAACGTTCTTCCAAAAAGGCAATAAAGTGCGTTTAAATTTACGCACGAAATCAATCTGGTATG:1 - chrY 946209 3' + 1360 439 1 79.09 AAATTGTCAGCAAACTATTTTCATTGTTCAAAGTAGGTACAGTAAAACTGCTGTATATCTAATCAAGCTTCTTGAGCTTAATTTGTTCGATTAAATATTTGTATTTCGTC:1 + chr2R 14873532 3' - invader1 460 1 71.82 AAACATAGCAACAACGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTACTATTGCATCGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAACGC:1 - chr2L 16742266 3' - 412 7113 2 77.36 GCTAGGCCACTCCCCTACACGAGATTTGTGGAGAGTCTTAAAACTCCTCACAAAGCTATATAAAATACTGTGTCTACGTTTGGATGAGCCGTTCGG:1 - chr2L 23332205 3' - gypsy8 4680 2 88.54 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCAGCTGTTCAATTCACTTTTCTG:1 - chr3L 19063462 3' + P-element 2824 1 23.64 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACAGATCTGCATTTCTTGTCAGCCAGCGTTATTTATTTAGCTTA:1 + chr3L 20642756 3' - roo 40 2 61.11 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACACTCACACACACACACGAATACAAATTAATGGAATAATTACCTCAGATTAGAATTTTTCTAGT:1 + chr3R 30369760 3' - roo 4 2 74.19 CGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGAATAAAGTCGAATGATGAATGCTCTTTTAATGCAGCGAACAGATTTGTGATGCTCTCTAGTATTTTTGAAAATTAAAATCT:1 - chr3R 30640412 3' - Cr1a 4231 1 74.55 CAAATACGTTTGTATTATTAAATGGTTCTTTTCTGCGCGGCATCTGCATTGAATTCCTTGAAGCAATTGCCCCACACATCCAACAGGTCGATCCGTAGATCCTCGACAGT:1 - chr2L 10518357 3' - gypsy10 5977 2 70.00 CATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAACGACTTTTGATTTCAAAAAGTTAAATATAATATCCGTGCCAGACAGCATC:1 + chrX 7548188 3' + roo 8673 2 55.45 TTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAAATAAATGTATCTTTATCCGCCCACTAATGCATCGTTGCGGCAAACTTTAATTGAC:1 + chr2L 15209892 3' + Ivk 5347 1 54.55 TATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAAGTGCCACAAGAAGTATTTAAAGTTTCAAAACTATGCACTATTTTTGAGCAT:1 - chrX 14827583 3' - G2 3043 1 53.40 GATACATACATTATACATATTTGTAACAAAGAATTCATTATCATTCTCTTTTATTTCTCCTGCTTAACGGCACTCTACATCCTGTTTTTCTTACTGTCCTTCCCCTATCA:1 - chr2L 9356502 3' - accord2 100 1 59.09 CCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCGGGAGTATGAGTGCCATCATCGCTTTCCTTT:1 + chr2R 6132228 3' - Ivk 5005 1 73.47 ATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAAAAAATAGGCAATAATGAGGCAGCATAAATAAGTAAA:1 - chr3R 17761159 3' - R2-element 3339 1 61.70 AGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAACCACCTCTGTTCTTTAGGCCAAA:1 + chr3R 9741750 3' + jockey 19 1 67.09 AGAGGATTTTCGAGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCCCATCCAGGACACGGGCGAATAACGGTACCTCGCAC:1 + chr3R 17666470 3' - Doc2-element 4559 1 60.42 CAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATAGAAATAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAAAGATGATATCGAGTCTGA:1 + chr3R 19444937 3' - copia 4986 2 64.55 TTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAATATGTCATTGTTACGATTCAAAACATTTCTTTTGAAACCTTAAACTAAACTACATCAAAT:1 - chr2R 14883964 3' + mdg3 248 1 72.62 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACTAAAGTGAATTGAGT:1 + chr2L 21034118 3' - 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Transpac 4937 2 60.20 AGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGTTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCACCTGCACTTTTTGCTCCTTTTCACCTGATATTTCTCCTTCAG:1 + chrX 9892550 3' - 1360 154 1 59.09 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGTAAATAAAGAGCTTTCAATGTTTTTGCGTTGTGCTTAAAAGTTATGTTTT:1 + chr2R 24031539 3' - 1360 24 1 53.61 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTAAAAACTAATGTGACGAAAGGCTCCGCAGATAAA:1 - chrX 15043119 3' + S-element 1674 1 69.09 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGGAATGTCAACGAATGACAAAGGAAAACATTTCGTTTGTTAATAATTAGTTGGTTAATAGTTCTAGTGGCACAACTTTGT:1 - chr3R 5219196 3' - Doc 16 1 67.27 ATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATACACGCATATGAGAAAATAAAAACATTAGCACAGTTCGGGATGTTTTATATACCCAGCATATGCCGCAAAA:1 - chr2L 7088285 3' + rover 7286 2 70.91 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGTCCAAATTAATATATAGCACGAAATATTATAAAAGCTAATGAACAA:1 + chr3L 8011459 3' - pogo 34 1 60.00 TCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATAAAGTGTCGAACATTATTCCTCAAAATTCGAAAAATT:1 - chr3L 3240489 3' + diver 217 1 67.62 GATCCAGTTATTTCCCCTTTTGCGCACAAACGCACACCGCCTCCAAAAAGTAAGTATGTGCATGTCCGCCTGAGTTGGGTCCATAAATTCACCTACAAGCGTTTT:1 + chr3R 11903430 3' - gypsy8 313 1 78.10 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTATATATCCAAATGTATATGTCTTTAAATATATGGAAATGGCGACAATAGGACACACATGCCGACA:1 + chrX 7518575 3' + roo 9064 1 70.10 CCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTACTCAGCCGTGATACGGGCCGAAGCGACCG:1 + chr3R 902587 3' + R1A1-element 5298 1 67.39 TTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATGTATACTATATAATGCCCGGTTACTTGCCCAAATGTCGTTAACGATGCCGGCAATTAAACAGAAGTGTGC:1 - chr3L 9767858 3' + FB 214 1 62.73 TAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCATATGCTGAACCTT:1 + chr3R 12040212 3' + HMS-Beagle 7000 2 60.55 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATCATATAGATTGCTTTTAACTAT:1 - chr3L 13023976 3' + 412 476 2 57.94 ACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACAATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTCCGCATATGTAAAGCAGAGACGCGCCAATACGGCATCAACATT:1 + chr3L 27613507 3' + Cr1a 4003 1 53.26 GCTGAGAACTCGACTGACTGCTACGCTGACTTCCACTCCCCTCCACTGCTGCCTTGCATCTATTGTATTTCGCCAGTGCTATCAACTAAA:1 + chr2R 14698505 3' - flea 147 1 58.89 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAATTAAATTAAAAATTAAATCATACATAAAATATTACAAAATCAATTACAGAGAGCTTTGATC:1 - chr2R 4137673 3' + Juan 4187 1 52.73 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATATTCTCTGGGGACTGTGCGAAATAATTAAAGACGCCCAGAA:1 + chr2R 11379781 3' + jockey 4974 1 53.33 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGCTTATTCTGAAATTCCCCGGTGGCGAAATCGACTCAAACGAA:1 + chrX 16560657 3' - S-element 36 2 63.30 GTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTATATTTGCAAGTTGTCCTTAAATAAGGAAGTTAATAAAAAAACATACAAATTATCAAATTTTGGTGAGGAATGA:1 + chr3R 6684178 3' - F-element 109 1 70.91 AAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCACTCGAGTGTTGACTCCGAAAGCGTTTCCGAAATCGATGTGGTGGAATCGCCTCCACTGCTTCGATATATTTGT:1 - chrX 17193295 3' - F-element 157 1 70.00 CATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACATGGCCCATATGGAAGGA:1 + chr2R 10535820 3' + Ivk 5018 1 78.57 AGAGGAAGAGCATGACAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGGGTGCTCGAGTTTTGTGAAAAAGAAAAAGGGAAACGCGCTGCCAAGATATTTTT:1 + chr3L 10365204 3' + Bica 6 1 56.36 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGTCAGCATATAATAGATAGGAAATAGAATCTGGTTAGATGATTGTTTGCACTTAAGAACTTTATA:1 - chr3R 24260864 3' + roo 385 2 60.00 ACGCTTTGTTTTACCCATTTTAATAACTTTGTGCCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGAACTTAAGGAAAAGTGTGCAGAGCAAG:1 + chr2R 13670339 3' - pogo 336 1 75.45 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGTTTTTCCTTTTAAGCTGGAATACTTAAAATACATTAAA:1 + chrX 5018777 3' - roo 8711 2 69.09 GCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTACCTTTTATATCAACAAGAAAAATGACAAAATCAAAACGC:1 + chrX 17330159 3' - opus 7141 4 70.73 GGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + F-element 4377 1 39.29 TTATGTTTACAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACATCGGCTTAAATTAAAACCCATTAGTCTACTTTTAACACGCATTCAGGGAATCTATGTTTGTTGTTG:1 - chr3L 20710044 3' - Cr1a 94 1 58.18 GATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCATTTACCATTTACCATTGGCCACCAAAGAAAAAAGGCCAAGCACCACTGACCACCACAAATACG:1 + chr3L 12033505 3' + I-element 4887 1 69.07 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAACGTTTATTCCTAAATTCGCAAATCCAG:1 + chrX 1523570 3' - jockey 64 1 73.08 GCTGGTTTTTTCTTCTATGTTCGCCGATGTTTTTTTATACCTGTTACATGCTGTCGGTGGTTTTATGATACCCC:1 - chr3R 31381402 3' - rooA 435 1 74.32 TAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATCGTAGGCTTGTCCTCCGAGCAACCTCATGG:1 - chr2R 4137538 3' - HMS-Beagle2 6897 2 58.33 TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACG:1 + chr3L 22108140 3' - Transpac 4963 2 78.65 AAAAAATCTGAAAACGAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGAAATTAGTTAAGCTTAAGTCGTATAAAAATAGTTAGAACTTTTTTTTTTAAATACAACTCCAAAT:1 + chr2R 4013936 3' + F-element 107 1 54.13 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTTCGTCCTTTCTGGCACT:1 + chr3R 13733004 3' + hopper 1388 1 66.67 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATTAGTCCAGCTATGTCAAATATTTACATATGTCTCCTCCGATTCGAGCGCTCGATGATCAC:1 + chr2L 5338046 3' - F-element 33 1 56.36 ATCCCAGAAAAATTATGAAATTTTGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCT:1 + chr2R 5321193 3' + INE-1 510 1 54.55 TGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGCTCGGACACTTAAAAAAAAAAGAGCTTAAAGGTTATGTCTGAAACATGTGGAAAATAGCTCA:1 - chrX 4581978 3' + diver2 102 2 65.96 TAGATTCCTACATCGTATAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACTACCATGCGGAGTGTGATTCAACAACGGGGCTTCTGCACAACTCGGATAAGAATCGACAAAC:1 - chr3R 24961856 3' + 3S18 453 1 76.47 CGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGTATTAAATAAAATTTAAACACCGGACGGGAAAAATGCACAAAACGGCGAGAAAATCGAGAACAAAACTGCAAGAG:1 - chr3L 17530101 3' + Tirant 403 1 76.24 TTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGCTCGCTTCTGCTCCTCGACCTTCTCCTCTCGTATACATC:1 - chr2L 2658320 3' + Cr1a 75 1 67.02 ATTTAAGTGTGGTATGAAAAAAAAACAGTTTTTAAATGTTTTGCATGCCCGAACAGATTTATTTTACTTGATTGATTGATAACGCTAGATCTAACTGATAAACGATAAAA:1 + chrX 3339991 3' - looper1 1637 1 74.55 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTTAGAGAACAGATTAATCACCATTCAAGTCGCTAATGAAGCGGGCGAAATGAAAATGAAAGGACATAA:1 - chr2R 19032052 3' + 1360 3379 2 66.00 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTTCGTCTGGCAAAGGATATGGGGCGCTTTTTAAGCGGGTCCCCAACTTTTTCGC:1 + chr3R 25702266 3' - Tirant 8107 1 70.89 TCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTACAAAATAATTGCAGACCAAATCAACACATCCGACAAGCAGCTCGAGTCGGAA:1 - chr2R 6438344 3' + Stalker 7227 4 55.77 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTACCTTCTTATCGCATGGAACAGCAGGGGCTGACTTACTT:1 - chr2R 24031473 3' + 1360 3362 1 58.24 TAATTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGCCGGGACTATGAAGCTAACTATGCCGGAATTATAACAAAACCACAGGCACAAAGTATCCCT:1 - chrX 13016682 3' - TAHRE 10328 1 62.73 TGTTTATGTCTGTTGGATTCGGATTTGATGAGTATGTGTGTGTG:1 - chr3R 10658278 3' - Quasimodo 7020 2 72.73 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATCGTATTATAAATATATATATTGTAACATATCTCCCCAACCACACA:1 + chr3R 3375478 3' + opus 475 2 65.62 ACTTGTGTTCTTAATTAGAGTTCATCATTACACAATAGTTAGAGTCGCTTGGCCG:1 + chr2R 23230631 3' + 412 483 2 60.00 GATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAAGATCACGCTGACGCGCTGAAACGTTATTTCAACTAATTTTTGCTCGGT:1 + chr2R 6173191 3' - I-element 4882 1 55.13 TACAATACTGTAGACAGTGTTACGGTAGATTAAAAAAAAAAAGATAACCAAAAGGTTAA:1 - chrY 793372 3' - Circe 7311 1 88.14 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGCACAAACCAGCAAAAGGAAACTGTAACAGATTAAACTTGGCACTTG:1 + chr3L 15385747 3' + Transpac 5211 2 55.79 GGAGTACATCCAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTCATAGATTATAGGTAAGAGTGTTTTGGGTTGGTTAGTAAC:1 - chrX 12607570 3' - G2 2978 1 52.94 TTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAGTGTTTCCAGCATGGTCTCCCGGTCATCCTTCGACC:1 - chr3R 29027627 3' - hobo 222 1 67.27 ACGATTATAATAAAAGCTTGAAGTGTCCGTGGCCAAACGAAAAATACAATAAAAATAAAAATGGTAAAAACAAATAGCATGGCGAGACGAGTAGTTGTACTACAAATTAG:1 + chr3L 1073974 3' + Stalker4 466 1 70.91 AAGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGATAAGTCTGGCGGCTTATCGATACTAATTTGAAATAGTATGTATGTATATCAGGATTTGCTT:1 - chr3L 9681123 3' - G5A 2637 1 59.14 AAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTAACATTCACTTTAACACATTATACACCGGAGCAACCATTTTTCTTGTTTCA:1 - chrX 14173788 3' + Idefix 6968 2 55.05 GATAACATAACTTTATTTCGGTTGGATATATTTCTTGAAATTATTTTGATCTCTTAGGAATTTTTGTTTCTTCCTATTTAATGAAAGATCGTATTTTCCGAACTCTAACT:1 - chr3L 2818415 3' - Chouto 148 1 66.36 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGCCGTATCGTTCTCCTGCTCTCACGCTGAATATGCGCTCGTTCGCT:1 - chr3L 14274260 3' + P-element 2850 1 41.28 GGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAAATGTATAATTATCTGGCG:1 - chr3R 27224584 3' - R1A1-element 5078 1 71.43 ACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAATCAGTGTAGATGACATCTGTTTGAAGATTACCTGTTTTGGCATGACACTTTCCTGCTAATTTGGCTCAATTGCCGATGATGTCCTT:1 + chr2L 4825273 3' - Q-element 320 2 56.36 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTTATCGTTCATTTATTTTGCTCGTTATGTTCGCGTCGTCGTAGTCGCGAACTCACGCCACCCAACTTATTT:1 + chr3R 5774918 3' - I-element 1 1 76.34 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACAGCTGCCGCTGCAACTCGTAGAAGAACGAGATATTGTTGCCTACTTTTC:1 - chr3L 12241681 3' + jockey 4956 1 54.63 GCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCCTGGCAACCGCTGATTTAATGAAGAGTGATGTATTGACTAACGACTTT:1 + chr2R 24388361 3' - BS 19 1 51.58 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATAATAATTAACTACACAGGAGTTGGGAGCCAATTTAATGGGTGTGGGTGCTACAACAGGTATCCACAAG:1 + chr3L 16301148 3' + mdg1 7426 2 50.46 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATATGTATATGTATAGGACGGATAGAGAACTCCGAAGCGTTGAGTAAAGATTGGAGAA:1 + chr2R 20436805 3' - opus 2 2 71.28 ATTGATCCTGATCAAGAATGTATATACTTTATATGATACTTTTCAACGCATCTAGTAATACAGGTATAATTAAACTATGAGAACGTCGGTAGTTCGTAATTAGAATCATA:1 + chr3R 23891599 3' - INE-1 83 1 64.55 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAAAATTAGTCCAGCTATGTCAAATATTTACACA:1 + chr2L 5338014 3' - F-element 28 1 58.90 CTGTTCCTCATGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATAAAATGTGTGCAGAGCTCTACTCAATATAGCAATGTCCTTGCCAGTTCAATTCAATGTATTTTTTTGGCTGACT:1 + chr3L 16547299 3' - baggins 5261 1 72.73 ATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATATGAAAGAAACAGACGCAGCGAAAA:1 - chr3L 18029871 3' - flea 4800 2 74.74 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGCGTTTCTAGCGGGCACTCCACCCACAGAGCTTTTCGGTGAAAAGTTT:1 - chr3R 23943182 3' + P-element 2868 1 59.14 GATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATCTTTCATCAACACTCGAATGATTCATATGGAAACCTAAGGCTT:1 - chr3L 16727148 3' - springer 5 4 57.69 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATTAATTTTGTTGTTGTATTTGTTTAGTTTTATCTCTCTTTTATTTATTTGTCATGTTTTGTTATTGGT:1 + chr3R 563980 3' - HMS-Beagle 13 2 65.45 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCAGAGACACAACAAATACAACATTTTCTTCAATTAAA:1 + chr3R 23861169 3' - pogo 18 1 70.00 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATATATTTATTATTTAGTATAACCAGGTATCATGTAGTCGAAAAACTCAATATTTCCGCTA:1 + chr2L 16230395 3' - blood 7035 2 59.09 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCACTCACACTAACAAAATTGCGCTGCCTGCTCCTTTGAATTTATTTTGATGTATTTCCGTTTGTCAAGC:1 - chrX 14704991 3' + INE-1 500 1 47.27 GCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTCCCAAATCCCGCACTCTTATCCCTCTGCTAGTATTTCCCTGATCATTTCTTCAATTTATGTTTACCTT:1 - chr2L 8193378 3' - Bari1 407 1 75.96 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGCACATGTGTGTGAGTCCTTGTTGCAGGACGTGTAACGAGGAAGTG:1 - chr3L 10109737 3' - hobo 24 1 53.68 AAATACACACACACATACACACTGCCGCACATGGAGTCATCCAATAAAGCCACCATCCATCCAGCCACCCTGCCATCCTGCCATCCTGGCATCCAGTGTTTTGTGGATTT:1 - chr3L 11361781 3' + accord 7100 2 89.09 CTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAATTTGATGAGCAGCTATGAAAATCTTTATTTTAAACTGTATGTGTAAAGACAGTTTATATA:1 + chr3L 16869905 3' + I-element 5118 1 59.09 TAAATTAAAACTAAAAAACATATGAAGATTATTAGTATGTTTCTGTAAATTGTTTTATTCTTATTGTTTAACATTTCTATGGCAATCGGTTCTATACACTTTTGAAAACC:1 + chr3L 13848960 3' + Doc3-element 170 1 70.91 TTTTGGGCGGTTTGTGGGCGTTATAGTGGGAAACATGGATCTCTACGCTGCGTCTATGCTTCTATGCCTTTCAATTTTGGTCCATTTAAGAGTAATCATTGAGCGATCCG:1 + chr3L 25106526 3' - INE-1 344 1 60.91 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCTCAATAAAATATACCAAGTACTCTACTCTTATTTAAATTAATACATATTTGTAAGCATTTATTATATGT:1 + chr3R 12040028 3' + 412 7532 2 67.27 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAAGTATAGGTTCGCTTGTTTCATTTTGTTAACTTTTTAT:1 + chr3L 17719063 3' + 297 6933 2 69.09 ACATAATACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTACGAATAATTACTGGAGCTTCATGGTATCTTCGGAACGCAGATAAAAAACATGTAAGGGTAACTAAAGAAAATGAATAT:1 - chr2L 15889263 3' + Doc3-element 4370 1 60.91 TCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATCAAGAAGATTCCACCAAATTTCCCATAGTCTCTGGATTACACTTATATGTACTCCCGATCTT:1 - chr3R 15309315 3' + HMS-Beagle2 7178 2 60.00 ATTTCTTAAAAACGTACAACTTTACCCTTGGTGCTTCTTTGTGCCATACAAATGTAATATTTCAGAGAACACTAGAACGTTTGTTGGCAAACAATTGAAAATACTCACAA:1 + chr2L 19399572 3' - transib4 451 1 75.45 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTCCTTCCCTTACCAAATGAACTGGCAGCAGCTAGAATCCATCCTACCCACAACCTGTTGGTCCTGC:1 - chr3R 29345600 3' - roo 8683 2 58.18 CACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTGCATACGAGGATGGAAGATAAAGTATTGGGGCGTTTGGTTTTTGCAACTCCGCTTAGTCAGCGATATAT:1 + chr2L 13571506 3' + 412 207 2 70.91 GTATAAAGGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATGAAGTACAGAAGGAAAAATGTTGTTAAATTATGCAGCAGCACCAACAGAAGGAGCTG:1 - chr3R 31947948 3' - G5 4756 1 60.00 AACAGCAAACACTTCGGCTTGCTTTATATCAGTCCGGCACCATTTGTTTCAACATCCATTATT:1 + chr3L 20058507 3' - BS3 73 1 65.08 ATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGGCCTTTTTGCTATTTTTTTGTTTTTGTTTAT:1 - chr2R 13585874 3' + 412 7090 2 59.32 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTCATTGATGAAGAAATCAAAGACCTACT:1 + chr2L 21034104 3' - 412 57 2 73.39 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTATTGATGAAAAGTGAAAAAACCAGTAACAATAAACATGCG:1 + chr3L 8919699 3' - roo 44 2 65.45 TTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAATAAAAAGAAAAACAGCGAAGCCAAGCCGAAAAACGCACACACTTAATTGGCGCAATTTCAACG:1 - chrX 9750804 3' + G5 4821 1 72.28 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATAATAATTAACTACACAGGAGTTGGGAGCCAATTTAATGGGTGTGGGTGCTG:1 + chr3L 16301131 3' + mdg1 7414 2 64.42 AACACAGTTCTAAAACCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACAGCAACATTTACCGTAATACTGCAATTTTTACATCTTGCGTGAATTTT:1 + chr4 102792 3' + Doc4-element 2578 1 69.44 AAATTAATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCTTTGCTCTGTGAAAGAGATCTGCGAAGCTACAAATACGTTGGCAATTTCAATGCAAATGCATTAGTTATTTATG:1 + chr3R 32045923 3' + hopper 340 2 67.27 TGGCATATATTGGTTTATTACAATTGCTATATGCTACACACATGCATGTGGATCATAAGGAAGAGTATGAAAAATAGAAAGGGGAACACAATGCTAATGAGAACAAAAGA:1 - chrX 2552005 3' + blood 377 2 74.55 GTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAAGTGGATTTTGCAGACCACAAAATGGCTTAATAGGCGAGCCCAAACTTTGGGTTTCATTA:1 + chr3R 13183300 3' - hobo 1 1 75.00 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAAAATCATACTTTT:1 - chr2L 21735000 3' - Doc 43 1 58.18 TAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAATGGCAATGATGGACAGAATTAGGTGGAAGTGGGGAGAAAAATTGAAAAAAAA:1 - chr3L 7802285 3' - pogo 316 1 53.64 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTATATATATACTTGCAAAATACCTGAAATATTTCAGCAGCAGCTA:1 + chrX 711820 3' + 297 6951 2 61.39 GACTGGAGCAGTCACAGGTTTGTGAGAAGGAGATAGCACAAGGAG:1 + chrX 8362384 3' + Gypsy12A_LTR 431 1 51.11 GGACCTACCAACCCAGCGTATCAAATCAAGCCGCAAACAGAGGCGCACAGGTATCGAAATTCGGTGGGTCCTTGTCAAGTGGGGCTCCC:1 + chr3R 28350107 3' + F-element 4531 1 82.02 CTTATAAGAAACTGTACCTTGTTATTAGATTAGATAGATAGATTAAGCTTTAGAGATAAGAACTCGATTCCTGTTAAATCTCTCCATCAGCATCATTA:1 - chr3L 13666254 3' + Burdock 6213 2 55.10 TAAAATAAAATAAATAAATAAATAACTTAAAAAACTAGTCTCTGAAATCCCTAAGCTCCCCTAGCTCGTCTCACATGTGTTACTGGAAAGTTTGTGGTT:1 + chr3L 2302718 3' + Doc3-element 78 1 69.70 AAAAATTGTTTTAAAAATTATGATCTTATTGGATATTGATAATTTAGATTTACGATTTATTAGAGGGTACAGTGTGTTAGTGCTGGCCCGTTGCTAAAATTATTATTTTT:1 + chrX 17831022 3' - Juan 3779 1 69.09 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGAACAAAAACACTTTTCAACACTGCAAATGACAGTTG:1 - chrX 21399409 3' - pogo 41 1 64.42 GGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGATGCGTGCACATAAAACAGCAACGTCAATACGCACAAATATACATTGTAGATTGCTTGTAAAGTATATATTTATAAC:1 - chr2R 14393243 3' - Doc 460 1 79.80 TGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCTTGGCGATTCACTTCGATCCCAGCAATGCTCCAAATTCAAATGAAATGATGAGAAAAGACG:1 + chr3R 15677349 3' + Ivk 4959 1 60.00 TGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCTGCCAGCGATCTCATTGCCAGACAAACTGACGACGCTTATCACACAATGTACAAAAAGCGCTCCAAACA:1 + chr2L 2424157 3' - copia 5053 2 74.77 ATACCATCGTTTGCCCACTTTTTTTTTTTGAAAATTTGAAAAAAGCTGTAGAAAATGTAGAAAAAGCTTCAGAAAATATAATACATTAACTTCCGAAGCCCACAAATCAA:1 - chr3R 21837074 3' + FB 205 1 77.27 TGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTAGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAATGA:1 + chr3L 16875744 3' - jockey 4607 1 71.82 TAGCTGAGTAACGGGTATCTGATACTCGGGGAACTTGACTACAGCATTAGCATTAGTCGTTCTCTCTTGCAAACAATCTAATTTTCCTTTTCCATGCCCCAAGGAATTAC:1 + chr3L 23286656 3' + INE-1 544 1 79.09 ACTAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGAAAAAAGAAAGCAGCGAGCACATTAATTATTGAAATGTCATTAAGAGGAAGGCCCGAGCTGACATCCTC:1 - chr3L 18394804 3' - FB 717 3 75.53 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAGTATTTATTTTATTAAGTTACTTGAATAAAGTTTTTCATATAACTCTTTTTAAATAAATAGTTAAAAGTCAGTAATGCTTA:1 - chrX 22717092 3' - pogo 3 1 75.45 ATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAAACTTCCATAATAGTGGCACTAATGATAAA:1 + chr3R 10927155 3' + Juan 39 1 76.36 CACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCCCACTGACTGTGCAATAAACTCTCACTTTCATTTATATGTATG:1 - chr3R 13327253 3' + Stalker4 119 4 60.91 TCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGAGCAGAGTGATAGCGCAAAGGGCGTTG:1 + chrX 6853644 3' - accord 215 2 65.38 TATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACATTTAATTGCCCAAGCTAAGAAGGTGCTCAAGTTTTACGTCCCAAAA:1 - chr3R 10181598 3' + Quasimodo 32 2 53.06 TTGGTGCATGGGAAGTCGGCGTTGCCGTCCTCACCAGCAAGACGGCGATTGCTGCTGCTGCTTCAAAAAGTTTGTCCTAGTACTGCATT:1 + chr2L 7529531 3' + R1-2 2775 1 66.29 ACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAACTTATACACCACACCTATCTGTCCACACCCCCACCGTCATTAGCCCTG:1 + chrX 5885803 3' + mdg3 5286 2 62.73 TTAGTATTGTATTTATATAAAATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAATATTCTTAAATCGTTTCACTCATGTTTTTGAATTTCGCGT:1 + chr2L 15519592 3' + Bari1 1395 1 63.64 CGTTGGTCAGAACCAGACACTGCTATTCTTATGAACAGCCTAAAAATTGTGATTTACCTTTGTATTACTTAGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTAC:1 - chr2L 21675224 3' - HB 224 1 50.91 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGAACTTTTTGATGCATTTAGGGCTTATTTATGAAAAACAATGCT:1 - chr2L 19129292 3' - FB 4 1 76.36 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGGTCTGGAGCAACGAGTTCTGGGCAACGGCGTGCATGCAAGCG:1 - chr3R 11553665 3' + hopper 1391 1 55.17 GAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGCAACAGCAAATACAAGCCCAACGTCGACAGGCATTGTTGGGCAATGTC:1 - chr4 861824 3' + Bica 448 1 56.36 CCACTCTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAAAAAA:1 - chr3R 20726785 3' + FB 906 3 78.26 AATTGGCACCCAACTCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACTCAAACAGAGGTAAAAAGCT:1 + chr4 203429 3' + springer 401 1 77.53 GAACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGCACAATCATAAATCCGCCACTGCGCCACCGCATTCACTACCCGTTCTCA:1 - chr3L 13627004 3' + Doc4-element 2634 1 57.69 CTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACACGTCCACACCCAGCCCCGCCCACCGCCTCTGCCGACGCCCTTGCTGCATTCTGCTTTCGGTGGTAGCATCTTT:1 + chrX 9833370 3' - Dm88 448 1 60.91 TATCCTGACAGTGTCAAATCTGTGCAAACTTGGATATAGTTGTTTTACTTTGTTGCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAGG:1 - chr2R 6271495 3' + S2 1512 2 56.25 GTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAAGGTATAAACAAAATACAGCTCAGCAAATAATGGGTAACTTGCCAAAATATAGAGTGACGATGACATTCCC:1 + chr3R 19447187 3' - 1360 194 1 76.92 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACGACAAAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGTCAATTCCATTCAAGGAGGATGTC:1 + chr3R 19445022 3' + jockey 4968 1 67.74 TGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACAAGATATAATTAATACGAATGAGACCTACAGTAAAGTAGAATAAAAAGCAAAGGAGTAATAACCACAAATTCC:1 + chr2R 6418951 3' - flea 4765 1 77.27 ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATAATA:1 + chr2L 8476750 3' + Juan 4172 1 66.00 ATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACGAGGAACGAGAAACGAAACGAAACGGAATGGAACG:1 + chr2R 23042745 3' - micropia 50 4 55.13 AAGTTTGCACACTTTTGAGACTATATATAAACGTTAGAACATCACACAGATTTAAATACTTATGCATGCAAAAGCATATGCAAAAACCGTGTCTTTTATGAAAACTAAAG:1 + chr3R 11957323 3' - S-element 1523 1 49.09 TCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAATGGATACACTACATTTTGCTACAGGAGAACC:1 + chr2L 6890085 3' + Stalker 7203 4 59.09 TACACACACACACACACATTCATAAAACTGCCTCCTTTTTTGGCCATTTT:1 + chr3L 20177956 3' + accord 186 2 86.00 TGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGTC:1 - chrX 20099931 3' + S-element 1675 1 65.71 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGACATTTGCGAGGCCCGCACACAGATACATTTACGGTTACAGATACAGATACAGCTATAC:1 + chr3R 15430749 3' - 412 21 2 60.00 ATAATAACAATCATAATAATAAAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAATACAA:1 - chr3L 21448026 3' + mdg1 7067 3 36.71 GCTCTTCAGATATAATCCATTTGTTTAATTTTTCCTTTTATTTCTGTGTTAATTATTAGCTTCCGCCTCGAAGGGAACACGCTGCAGGGATTCCAC:1 + chr3L 16434969 3' + Tc1 1370 1 65.62 TAACTGTCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGTAATTTAATGATGAATTTTCCTGGTACACAGCAAGTTGAGTTCGAGGAGTTCAAGGTCGCGCCGGTAGAAGAAGTTAT:1 + chr2R 20843949 3' - Gypsy6A_LTR 255 1 70.00 ATAAATTATAAATTACAACAAGTACAGTATCTTATCAGGGGAAAAACATTTACAGTATTCATAAATCTACCAATTCACTCATATATAATATGCCACATCTCTTATCTAGA:1 + chr3R 19996675 3' + copia 257 1 74.55 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGACGAGGAAACAGCACTGACCGAAAAGTGAACCCTAATTCAGATTACAGATACCTAATAAA:1 + chrX 1601084 3' + hopper 1394 1 62.04 TAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAAACAATCTATTATATATTTCGCAATAAGTTTAATTTATATTT:1 + chr2R 10163616 3' - Juan 4125 1 71.82 TTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGCAAAGTTAAAAATAAAAAAGCAAAGTTAAAAAAAAGCAAAGTTAAAAGTTAATAAAAATAAACAAATTAA:1 - chr3L 6940077 3' + HeT-A 6044 1 77.27 AAAAGAGAAAAAAAAAGTAGGAAAAATACCTCTGATTTGTATTGTATTGTTTGATGCTGTTT:1 - chr3R 13653803 3' - S-element 244 1 58.06 TTTCCTTTTTTTTTTTAAATATGATTCCTGAAGGACACATGCAAGCCCCTCAAAAGTTTAAGCCTTGGC:1 - chrX 3649595 3' - TART-B 10631 1 81.16 CACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGTCGAGAGACACATTCCTGCGGGTGGTTACTGAACATTTTCCCACACACACACACAC:1 + chr2L 5777186 3' + Doc 414 1 51.40 ATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTACAGAAGCAAAACCAGCTGAAGAAGATTACGGCGA:1 - chr2R 11870343 3' - rover 7099 2 52.17 ATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACCCTCTGCAAAAACTGAGCCAACTGATGCCGCCGATGACGAGTCGCTGATGGGGAATATGGCT:1 - chr2R 12719316 3' - flea 4963 2 60.00 GAGACTACGTTCGGCAGAAACAGTTATTTGCCAATGTCAGAGCGCCGCCAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACAC:1 - chr3L 10013622 3' - invader1 3713 2 74.26 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATCTTTGTATATGTATTCTGCAGATAGCAAAGGATAGATAAGGGTAACTCACAACAA:1 - chr2L 14715073 3' + 297 6952 2 57.80 GGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACAATTCGAAAAAGTTTGTAACCCAGATTCCTTTACCCTTTCGCTGCCAATTTTTCACCAATTTTGT:1 - chr2L 8621169 3' - 297 105 2 63.30 ACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATCGTAGGCTTGTCCTCCGAGCAACCTCATGGTGGCTGACCGCAC:1 - chr2R 4137525 3' - HMS-Beagle2 6886 2 67.57 GTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGACATCAACCATTGGGTACGTTGGTACGGCCCTTTTGGCATGCG:1 - chrX 455144 3' - R1A1-element 5149 1 50.59 ATGAAAAAAATTCCCAACAATTTTTTACAAATGTGGGACGATGTTTGGCTATGGGCGGGGAATTGTTAAAACAGATAGCATTTCAGGGG:1 + chr2R 14634166 3' - INE-1 389 1 67.42 AATATTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTAAATATAAAAAATAGGAGAATACACGGTAGGAGGAGCAGAGTCCGGAAAAAAGCTTGCTGAAACTGC:1 - chr2L 17656692 3' - gypsy12 9755 2 55.45 CATATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAGCCAAACTAGACATATTTGGGATATATATCTCGCCTTAAACACGCACATCCTCACATTATCCTCGTCATAGCTCACC:1 - chr3L 2517303 3' + I-element 5043 1 57.27 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATTCCAACAATGTTGTGGGCAAAACTACACTTGCTCTAAATGAAAATTGAAATTTCTGTCAGTAGCAGC:1 - chr3L 2815053 3' - Doc 32 1 58.18 CCCAACTCCGCCCCAATTTTTTTTTTTGTTTTTTTCTGTTTGC:1 - chr3L 17855275 3' + hopper 129 1 76.74 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATACAAAAGTGTGTGTGGTGATATGCGCTATAGGTTATAATATGTTAGCGTAATGCCGAATGGCACT:1 + chr3L 17220778 3' + opus 481 2 65.45 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATGTTTTCGGTACTTTTAAATGTAAAGTATGTATATCATCTAACCATAGTAACTATAAG:1 + chr3R 25635982 3' + I-element 5330 1 48.62 CCCAAACTAATGGGCGTGGCAACAAAAAAGGGGTCATGGGGCGCGACGGGCGTGGAGGGGGTCAACGGAAAGGGGGCGGTGAGCGGAGG:1 - chr2L 12833325 3' + looper1 1765 1 82.02 CCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCATTGAAGGGTAACAGGTAAAAATATTAAATCATTTCTAAAAATTGTGGGCATAAAAGCTTCTTGCTT:1 + chr4 526942 3' - INE-1 18 1 59.09 CATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTATTCTATTTT:1 - chr3R 6937614 3' - F-element 173 1 60.58 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTAACTAGCTATTTTTTTTATATCTGCTCAGGGAG:1 + chr2L 19129382 3' - FB 51 1 69.44 GGGTTCATAAGTACACGCGAATATTTTATTACTAAACGATAGCTTCAATGCCAATAAGGTACGTGTGCTGGTTTTATAAGGGGTGTGTGGCTATTTATCATTT:1 - chr3L 16374815 3' - Q-element 560 2 67.96 ACACAGCCTTACACCTACGCGGCATGGAGTTCACCAGGTCCTTGCAACGCTCCATTGCGTTGGTAAATGTTTTTATGCTTTCGACG:1 - chr2L 4032488 3' - HB 1297 1 55.81 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCCGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGCG:1 + chrX 20330594 3' + P-element 2877 2 52.05 CTATTTAAAACGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAAAGGTTAAGGGAAAACGTTT:1 - chr3R 24867518 3' + roo 9009 2 86.67 TGGCCTACGGTTACCTAGGCGAAGCACCAGCCCTCGCTCTGCTGGATGTGTCGTGCTACATGTGTTTACATGTCCTTAAACCTGCTCTCTCTTACAAA:1 + chr3R 9284077 3' - Rt1b 350 1 66.33 TTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTTATTACTAACCTTTTTATTCCGCCTAATTGAATAACCA:1 - chr2R 19032390 3' - accord 7154 2 66.67 CATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAGTAAACCAGGAGAAATTAATAATTCAGCTGAGGAACCCATTACAATAACATTC:1 + chr3R 22894992 3' + TAHRE 276 1 46.32 TGTGAACACGTCCACTCGATCGCTCATCTCCCATGCGAAACGTTTATTCCTAAATTCGCAAATCCAGTAAAAAGTAAAACTCAATATTATCCATTAATTAATAATTATAT:1 + chrX 1523613 3' - jockey 26 1 64.55 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCGAGTCGAATCGCGTGAACTGCAGGGCATTTT:1 + chr3R 8621719 3' - jockey 59 1 70.19 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCAGAGATTATTAATGGCACAAACAAACGACAGTGTTATCAGCATTCTTCAC:1 - chr3R 6088537 3' - transib2 11 1 62.22 TATCTCTGTCTACAATATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTTTCCTGGAAAATTAGTTTAGCCCTTGGCTCGCCTCTTA:1 - chr3R 17958617 3' + Circe 100 1 63.64 GTCAATGCACTGTATCTCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGTGTAGTAATGCAATAAGGAATTA:1 + chrX 8989886 3' + Dm88 52 2 79.09 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGTTACACGAGCAAAAAAATTATATTAAATTTAAGTTTTGT:1 - chr2R 19166632 3' - FB 48 1 77.27 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGCTAAATATTTTTATTCATAGTATTTGGTTTTAAA:1 + chr2L 17263198 3' + Transpac 5193 2 62.75 TATTAATTCAGCCCTTTCAGGCTGCAATCTCTGCTTCAAGTTTCGCTTTGGTCACTTTAACCCCCAGCTGGTTCGAAATTCAAGTGGAATTTTTTTTTTATTTT:1 - chrX 14923016 3' - BS3 1703 1 75.00 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATGTACAGCAGGTCCCTTTTAAACATATACGTTTA:1 - 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blood 5 2 31.18 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTGTTTTCCCCCCACAAAAATTTTTCCGCACCGCTCTTGTCTAGCCGTTTTTTCTGTTCGG:1 - chrX 8885474 3' - roo 23 2 59.63 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGGTGCTGGGGCTTGGGCATCGCCCTTCCTCCTCTGCTAGTC:1 - chr2L 16254029 3' - FB 19 1 51.19 AGCCGGGATCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCGCCAAACATTTACAAAATTATCTGATGCTTTGGATAAATTAAATATTCA:1 + chrY 1653318 3' + I-element 158 1 69.66 GAATAAAAAAATAAATAAAAAACTAAAAATATAATCAATTCTCTAAATACCAAATATAAGTATAAATTTCAACCCAATCCAATCCACTTTGTGGCCGCCCGATCTCAAG:1 + chrX 3020302 3' + Osvaldo 1522 1 53.21 TTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 6053 2 77.03 GCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGAGAGCCCGAAA:1 - chr3R 7872898 3' - gypsy6 61 2 79.49 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTGGATT:1 + chr3L 3555505 3' - 412 7103 2 68.18 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACAAGTTGTTTATGTTCTTGTTTCACTCAGGCTTCCCCGTAATGATCAA:1 - 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Cr1a 242 1 70.91 TTTCTTGTCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTTCTTTTACCAGAAACATTAAACTAATTAG:1 - chr3L 12158453 3' + 297 345 2 74.55 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGCGTTTCTAGCGGGCACTCCAC:1 - chr3R 23943208 3' + P-element 2825 1 26.36 AATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCAACCTGGCCAAGTCCGTCCGTCCGTCTGTCCAGTTTTAACCCTCCAGTGCCTCATCCCTATTC:1 + chr3R 9349764 3' + INE-1 83 1 63.83 AATATGATGAAGAAGGGACATGTGTTTCAGAGTGCCAGAACGGTAGTTAACTTATGGAAATGCAGCCAGCTACTCGAAATCAAACTTT:1 - chr2R 21751295 3' + invader4 2969 2 79.55 GAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATGGCTTAAAGGGGAATCATGAACCGGAAAGCAGACTCAGACAACTTGGCAGCGGAATGCAATTGCCATT:1 + chr2L 13465670 3' - Doc 4540 1 65.45 GAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTATGAAGATTCCTTCAATTTTTCTGGTCACTTCACTCAACTGTACATTTATTAATCTATTTATTAATTCAATTGTCAGGTTACGT:1 + chr2R 764083 3' + invader4 2968 2 67.59 CGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAAGATGTGATATATAAACTTACCACTTAGGCTATATTTAAAGTTAAGGTTAATTTCGTATTAAAATCAAGTAATC:1 - chr2R 19010384 3' - Ivk 12 1 58.33 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGGATTATACGTATAAAAATGTACCGTGGAGAGG:1 + chrY 3239768 3' + pogo 2074 1 74.29 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGAAGGCAATAACATTATAAAAGCATTCAATTGTTCTGTCCAATAAGAAGAAGTATTAATTATC:1 - chrX 22218859 3' - Max-element 8261 2 56.36 GGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGAACGGATGTATAGTCTACCAGTTAAGTTGACATTTCCGGCAGGGC:1 + chr2L 17134838 3' - Idefix 231 2 76.29 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAATTTTAATTGAATTATTAATTTTGTTTTTCAACA:1 - chr3R 12623680 3' - roo 14 2 68.18 CAGGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATACATACAGCTGCGAAAACAAGCTAGAGCAAGGCAAGGGATGCCCATATGTTGATTAATAAACATTGATTGGATATTG:1 - chr2R 1369928 3' - INE-1 98 1 64.42 ATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGTGTAGGTAATGGGAATCGACCAACGGTAGCTGTTTAAAGAGGTATTGTTAAAGTTGGGCGTGTAAGCTATTTTTTTTTTTAAA:1 - chr3R 13311350 3' - 297 464 1 77.98 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAATGTGCAGGGTAAAAAAAGTTGGCAGAAGGTTTAGTTTTACCTGCCTTAG:1 - 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Rt1a 22 1 50.53 ATCTACTAAAATGATAATTTGTACATAGAGTACATGTTTAAGTGTATGTGCAATACATTTTCAGGCTCACTATTATTACATTATATGCATCGGAAAATGTGCAAGATGGG:1 - chr3R 30859355 3' + Burdock 257 1 69.09 TTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATTATTATTTCTATGCGTTTTTCTTGTTTTTTATGCAGCTACCAGAGTTTGAAAAGCAGTGAGTAATAAGCAGCGAGAGAATGAA:1 - chr2L 7419837 3' - Porto1 4407 1 77.27 TTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAATAGACCAGACCAACTTGAACCGAGCTTTGAGCCAAGTTGAA:1 - chrX 7565501 3' + F-element 4461 1 62.73 TAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAG:1 + chr2R 6801697 3' + McClintock 6336 4 60.64 TCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAAGTCAAAACTGGACGATGCGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTTCAGTCTTCTCCTTTTCGCAAGGAG:1 + chr2L 2910383 3' - 297 178 2 72.22 GATCAGGATCACTAGCCCAGTCCTTCTGGCAATGTCCGCCTGTCTGTCTGTCCGTATAGACGCTGTGATCTGCTTTATAAAATTGTACTATTAAAACTAAATTCATTG:1 - chr2R 12391763 3' + INE-1 92 1 54.63 AACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAATGTGCATAAATCGAGCAATTTAT:1 + chr2L 11334323 3' + P-element 129 1 25.45 CAACGCAATCACGGAACTTAAGGATAAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACGTAGACGCAGCGCAAGTTTGTTAGCCGATGTTGCCACG:1 - chr3L 11294508 3' + F-element 4420 1 73.33 TAAACAATTCGCAAAATTAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATGCGCCGACAAACTTGGAATTGTTAATGCGTGTTAAAGATTTTGCATTA:1 - chr2L 17680167 3' + diver2 288 2 56.36 CATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAAGGAAATAAAAATGACACTGATATCATCATTATCCACAAGAGCGAAGAATTGACT:1 + chrX 18342223 3' + Quasimodo 267 2 66.29 TGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGAGTCGAGACTGAGAGTGCGCGGATTGGCAAAGGCGATCACGAGGAACTCCGAGTAGTGGAAAAGG:1 - chr3L 13018798 3' + R2-element 447 1 74.47 TGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTTGCAAGGAAACGTCGAAATCCTCGGGCGGCAACAGCAGCGGGG:1 - chr3L 21000917 3' - G2 2965 1 61.90 GATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAGAAATCTGAAGCAGCG:1 - chr3L 16656892 3' + Stalker3T 205 1 61.90 AGTTATATTCCATACGTCCATATTAGTTTTATTAACGCCTTGTATTTTGCTATTTTATTAGCCAGTTAAGTTGTCCTTCTGTTGTCTCCTGTTCTAAGTTTTTCTTTTTT:1 + chr3R 25696007 3' - Porto1 4267 1 68.18 ATAACAAAATCCTCCATATAATAGTAATCTTACTTAGCCCGACTACAAGCCCAAACAAGACCCGCATATC:1 - 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chr2L 18570478 3' - FB 30 1 52.83 AATCCTTGAAAAAAAAATGAAAAATTAATTTAATACAGCGCAAAACTGAGTGACTGAAGACGGCAGAAGCATTGCAGCGAAACTTTGCGCCGAGCAATGGGGAACATAAA:1 + chr3R 6125500 3' - transib4 2482 1 60.91 TTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATATACATATGTATATACATGGATTCAACGGTATATACAT:2 + chrX 13869246 3' + copia 4998 2 66.36 GCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTAGTGCTTATCAAATCTTTTATTTACTTTTATAAATATTAATTAAGTAATTTTAGAAGCTGT:1 + chr2L 10554376 3' - G2 281 1 57.27 CACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATATGCATTTCCCAGCCCTACGCTCCA:1 - chr2R 18507855 3' - Bari1 46 1 76.04 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCTGGACACCTAAAACTCTTTACTTTACTTTACTTTATATTTACTTTACTCGAGTGTT:1 - chr3R 13543850 3' - 1360 29 1 51.82 TGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAATCACATTTAAAAACGATTTCTAGCAAGCCAAGCTAGATAAA:1 - chr3L 3240523 3' + diver 195 2 55.91 TTTATTCTTTTTTTTTATTATTTGAGAAAGTTTAGTATCACAACGACAAGTAATTTACCCAAGTCAACTCATAGCAGTCGGCAGTAGCTTCG:1 + chrX 10867833 3' - BS 5099 5 36.96 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAATTTCTTCTTCTTTCTTAGCCACTTCAGAAATTGATTAATCCAATCAAGA:1 - chr3L 27174906 3' + pogo 2083 1 56.84 GTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCCTCGTTTTCACCGACATTCTGAATTCTTACGTGGATTTAGTTCAACT:1 - chr3L 19262785 3' - invader1 199 2 60.00 TTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGCTGTTATTGCGATTAAAAAAAAAAGGAAAAAACTGCATGAACGGAAGTTGCAT:1 + chrX 10514747 3' - FB 230 1 74.19 ACATTGGATAGGGAGTAGAAAGGAAATTTGTATAATTAAAGCCGAAGAAAAGCATTTGCAAGAACAATAGTAAAAGTCCCAGACGGATCGACA:1 - chr3L 20505285 3' + invader2 4709 1 59.14 ATCTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTACTAAAAGTCGAAGTTGGAAAAACTGGAAACTGGAACGGAGCCAAATCTATTTCCCCTTTTGATTT:1 + chr2R 11529577 3' - Bica 146 1 59.62 ATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAACCAATGACGCATCAAGGCCAGAAAAGTAGTATTTCCTCTTCGTCTTCGGA:1 - chr3L 13013432 3' + Porto1 209 1 54.55 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGTTACAGAGTATAGAAATGTAGCCAAATAAGCACTTGTGAACTTTTTGATGCATTTAGGGCTT:1 - chr2L 19129311 3' - 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Tc1 1 1 58.18 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCA:1 + chr3L 19951269 3' + Ivk 5345 1 53.64 GTACCTCCACCAGCAAAGTTATAAAAAATACATTTTGTGTGTTGAAATGCATCAGGCGGCGACACACTCACCAGCAACAGCAGCAACAACACCAG:1 - chr3R 28416060 3' + TAHRE 10427 2 50.53 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACAAGATATAATTAATACGAATGAGACCTACAGTAAAGTAGAATAAAAAGCAAAGGAGTA:1 + chr2R 6418936 3' - flea 19 2 66.04 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTCCAATAGCTACGATTAG:1 + chr3R 28639983 3' + mdg1 381 2 61.82 GGGGAGGGGGGGGGGGAGGATTTATACACCTGGCTCAAAGAATTTCAC:1 + chr3L 10228384 3' - accord2 222 1 45.83 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACGAGGCCTAGAG:1 + chr2L 6243740 3' - 412 7083 2 51.89 TCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr2R 5064833 3' - Stalker3T 205 1 49.09 GTTAAGCCGACTAAGCAAGTCGGGACTCTCAACTTCAAAGAAACAGCCAAACCCCGACA:1 + chr3L 985825 3' - Cr1a 4081 1 59.32 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATCATATAGATTGCTTTTAACTATAGAATGGTCGACTTTGAA:1 - chr3L 13023958 3' + 412 7544 2 72.73 GTTCCAAAATCTTGGAGCGAAGAGTGCACTTCCCCAATGCCGCAACCAACAAACTGGTTTCCCACCGTCGAATCGAATGCTGCTTCTTCTTT:1 - chr2L 12004930 3' + Doc4-element 157 1 56.52 AGGCAACAAGAAAAATAAACGAAGACACAATTAAACAATAATAATAATTAAATAACTAAAAACGAAAATAAGCATGCACGTCGACAGACAAAGACTATTGTGTACAAAA:1 - chr3R 9479688 3' + invader3 5012 1 57.80 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAA:1 + chr2L 9754856 3' - 1360 46 1 63.64 CCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCAAGGATCAGGGTTGTGTCTTTACCGGAGACACTCTCC:1 - chr2R 11387669 3' - F-element 4268 1 68.27 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTA:1 + chr3R 5910744 3' + roo 9032 1 69.39 TTAAACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAGTGCCACACAAGACCATTGTGAATATTCCGTGTGCCGAAACTAATTGATAATACAAAACCCCAACCCCAACACCAAAACA:1 + chr3R 18782639 3' + Stalker3T 140 1 73.64 GAGGGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATAGTATGAGGGTACGCATCTTTTTATTTTAGTGTCTTTGGTAT:1 - 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chrX 16739226 3' + 1360 374 1 59.09 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGCAATCGAATAATGCAAAACTATAGCAGCCAGAGACACAACAA:1 + chr3R 23861146 3' - pogo 20 1 60.67 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGGGTTTTCAGTTGCTATCGACCTACATGGCGATCAAGTCGCATCCGTGCGGT:1 - chr3L 16496189 3' - P-element 33 1 50.91 CCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGCCTTCTCATCGTTTTA:1 - chrX 16155456 3' + invader4 378 1 83.33 CACACTTACACACACACACACACCGAACCAAAAAACATCTACTACTTTCTTTTCGAAAGGGAGCTGCTGTTTGAGAAGAACGCAGCGCACTTT:1 - chr3L 12565976 3' + Quasimodo 32 2 78.49 TACTTAATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAACATCTCA:1 + chr2L 3588608 3' + Tc3 277 1 74.55 ACAAGCCTTCGACAAAGTATGGCATGTTGGATTATTGTGCACGAGAAATGGAACGACAATGACGACAATTTACACCAAGAGAAAACACGTTCAGTTTCCAAAATACGCAA:1 - chrX 3278059 3' + Helena 405 1 66.36 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCAAGTCTGCAATATAGACTTATCAATCTTGGGGAAGTCGGGAAAATTGTTTG:1 - chrX 15499962 3' - pogo 31 1 52.73 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGACAGATCTGCATTTCTTGTCAGCCAGCGTTATTTATTTAGCTAACCCGTTA:1 + chr3L 20642763 3' - roo 8685 2 57.29 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGAGCACATTACAGTGGTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - Tabor 6881 2 61.39 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGATTTTTAAAGGCCTAGCAGACGATACCTAATCAGTGATTTTCAAAAATATTTTCCCCAAAGTGCATAAAA:1 + chr2L 18813068 3' - jockey 14 1 58.25 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCCTTGCCTTTTACGAGGTATAAAAAGTGAAACAAAAGTGGAAATAAAACCCTGTGTATGTTTCT:1 + chr3R 14139167 3' - 297 6590 2 71.00 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTAATGTTGAACGTATTGACTGATCT:1 + chr3L 12677130 3' + pogo 2069 1 63.92 GGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGAGACTTGAAATCCATTTGCAGAAATAACCAAAAACTAAAAACATATGTACCAAGCCCATGAACG:1 + chr3R 32005627 3' + F-element 4441 1 61.82 ACTTATAAATATTGCAAGAATTTAATTATATATATAAATACATATACAATACATACACACGTACTATATATATTAAGAACATTTCTCGCTCAGTTCAGTTCAATGCGACT:1 - 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chr2R 16220988 3' + F-element 4379 1 56.36 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCATAAATTCATTTCAATCGCTACGAAAATAGGTTTTTACGATGCCAC:1 + chr2L 6757548 3' - Tirant 24 2 54.26 AAACAAAAACGGACATGCGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATCACAAGGGAACGCGACGAAGTCGTTCGAAAGAGGCAGGG:1 + chr2L 165518 3' - pogo 264 1 61.39 AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAGAGAAATAAATATATATATTGCTGTTTATCCTGGAAGGAATATATCGCAGTTGAGGCTG:1 - chr2R 25118002 3' + Transpac 5207 2 61.82 TAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGA:1 - chr2R 5064835 3' + Stalker3T 202 1 82.73 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACCGGAAGTTGTATCACACATGTACATATCACACATTCAGCGCTTGTG:1 - chr2R 14661092 3' + hopper 1405 2 63.10 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTGCTATATGCTACACACATGCATGTGGATCATAAGGAAGAGTATG:1 - chrX 2552046 3' + blood 336 2 59.09 CTACAGGGCCTACAGCTATATTGGTTTACAATTATATCTTAATCTAGTTAATATCTAATTTTTAAAACCAATTTTGTGTTTATATTTGGCATAATAGCTTTTGTTTTGAT:1 - chrX 8885940 3' - I-element 5285 1 59.09 TATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTTT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 80.00 CACAACCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACA:1 + chr3L 11777678 3' + gypsy3 419 1 30.00 ATAAAATAATAATAATAAGAGAAATATATAGAAAAATAATACACTTTTGTGCCATTGCAGACGAGCTCGGCGGCGAATTACAATTGTTT:1 + chr2R 13754093 3' + invader3 5058 2 79.78 AATCAATCTTTGGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTTATGTGCTTAATTTTCAATAGGACATTTTGCGGTAGCTTCTGCAAAAAGATGCTCCTTT:1 - chr2L 15819386 3' - hopper 1138 1 62.26 GTTTTTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACCACTCGTACTTGGTCTTCGCATACCCTGTGCTCTTATGAGGACTGAGGGCGTAT:1 - chr2R 6537900 3' + roo 9043 2 52.38 CGTTCCTGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTAGTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCATGTGCGATCGGTTACGATTGAAAATAATTTATGCGC:1 - chr3R 23914257 3' + 1360 3236 1 72.64 GCTTAAGACTAAAGATCAAATGTAAATCGGATTGAGGAGAAGTCTCAGTATTTGAACAATATTTATAGGCCACGGAGTTTGCGTTCTTTTTTGTTTGCGCCCAGCTTCGC:1 - 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chrX 4712452 3' - Quasimodo 26 2 70.19 GTTATGTACAAATGCCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - I-element 5200 1 27.38 TGACGGGCCGTACATGATAAAGAAATTCACGTCACCAGTAATATGCGTCCTGGAATACTAACTCGATACGTGAAAAGGATACCCAGCACAA:1 - chr2L 20511676 3' + Osvaldo 1380 1 60.44 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGCGTCAGATTGACCGCATCTGCTA:1 + chr3R 24813994 3' + P-element 2833 1 27.88 ATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTC:1 + chr3L 19339401 3' - Tc1 44 1 68.13 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATAGTTGAAAGAGGCTAGGTGCAAAAGCCTCTTGGAAACTTCATTAAAA:1 - chr2L 6519800 3' - diver 14 2 56.98 AAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCAGTCCGGCCGGAAAATGCTCATAAACCTT:1 + chr3L 7511370 3' + micropia 345 2 73.64 GTGGTGAAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGCTGCAGGGGCAGGACATGTTTCGGCGTGGGAAGTGAAATGGTTCTCTCAAGGGTTCTACTTTGC:1 + chr2R 14682401 3' - Chimpo 4217 1 55.32 GTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACATGGCTTATATGCCATAAATATTTTCCATGTTTGCATTACTCACCAGATTTTTGCAAGTGATTTGCAACG:1 + chr2L 13482944 3' - hopper 1038 1 69.09 AAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTTATCGAAGCGAAGTAGTTGTCAAGATAAGCCGCGCACGGCATAAAAAGTTTGGCAAGCAACATGCAGGGTTTTGA:1 + chr2R 23864500 3' - Tc1 1354 1 73.39 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCAGAGATTATTAATGGCACAAACAAACGACAGTGTTATCAGCATTCTTAACTGATTT:1 - chr3R 6088531 3' - transib2 22 1 57.94 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACATGTTTAATGGTAACCATGGTCGCAAGACCACTTCCTTGGACTTTTTACAGTGGCTG:1 - chr3R 13298159 3' + I-element 5334 1 56.19 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCCATAAAGTTGCCAAATATTTACATAAAATTCCAATATAATAAA:1 + chr3L 19948942 3' - 3S18 5771 2 72.00 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGCTCATCATTACATATTGTAATGATAATGATATTGATATTTATTCGCTAAATTAAGATT:1 - chr2R 8397442 3' + 412 453 2 57.80 CATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACCGACTTTTGTCCTACAGATCCTGCGCGTCCACAAAAAGTCGCAAATTCCCTGCCACCCTCCTCTGCGATTGCGAAGACACCAG:1 - chr2R 12302736 3' + G2 350 1 68.18 CATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTGTTTGTACTTTTCTTTCCGCTTTTCGGTTCGTTTTTAG:1 - chrX 21439145 3' - Bica 72 1 67.27 AAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCATGATTATTTAATGGGTTTGGCGGCAATGAACTATTA:1 + chr3L 2902807 3' + Stalker4 387 1 66.36 CATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTTCTTTGCGCAAAAAAACCAATTATAATGAAA:1 - chr2L 12367492 3' + P-element 125 1 31.82 TGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCAAAACAAAGAGTAAACGAAATAAATAACTAACCAAGTTGTTCATAATATATATAATTTT:1 - chr3L 5816014 3' + Doc2-element 129 1 53.64 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGCATATGAAAACATATTTGACCTAAAATCACACAAATATTTCGTAAAAGGCGGCATAGGAAAAATATTAT:1 + chr3L 18367441 3' + copia 250 1 68.18 GGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGCCATGCGTCTAAGGCCAAAGGCGGAAAAGCAGGGGGAGATGTTGAGGAGCATGAGTTGA:1 - chr2L 20571086 3' - F-element 4344 1 59.09 CAATATGAACCAAACGCAGCGGCAGCAAATGAAGAGGCTGGGGG:1 - chr2L 5681281 3' + R2-element 325 1 68.18 CGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCATTAAATAACTCTTGATCTAATTTTCTTGCAGCTCCTAAAAAATTTGACCGATTTTTTTAACATTTAACATAATAAGGACCTGCGTC:1 - chr3R 19447231 3' + G2 2665 1 42.73 TCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCTTTAATTACCGCACCACGGTGCTTCATCCACCTCCTGATGGCATCGCTTCGCG:1 + chr3L 22108175 3' - Transpac 13 2 63.44 CAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGTTGTTGCCTTGGGCTTTTTGTGACGCCGCCTGCTGCTCATTGATTTTCC:1 + chr2L 9556024 3' - Doc2-element 4422 1 60.67 CGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACTGCAATTTTATTTGGCCTACACACAGCAG:1 - chrY 3612767 3' - Ivk 62 1 75.45 CTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCGTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 204 1 26.09 TACCGATGGGTCGGTAACTCCGTCGGGGTTTTAATGTTTTCTATGTCGCAAATGGATTT:1 + chrX 21668381 3' - ZAM 7960 1 50.85 GATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGTGAAATTTTATAAATAAATGATGCAAAACGAAATGAAAGAATACACAAAAATG:1 + chr3R 19775426 3' + blood 424 1 55.88 TGCGTAGAAAAGAGCTTTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCCCTAACAAAAATTCGAGCACGCCTGGAGCAGGATGGATACGATCAACA:1 - chrX 10060681 3' - 1360 134 1 73.68 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATCCTACATTATATCAGAAGAAAAACGAATCGAGAAACCTCTTTTCTTAATAGCATTTATACCCACATTGGC:1 - chr2R 8530716 3' - mdg1 7062 2 55.96 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCACACAATCACACTCTCTTCGTATGTGTATGTGT:1 + chr3L 13228556 3' - P-element 10 2 65.93 ACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACAACAAATGCAAACTCGCTTGGCGTTAATAATATTCAAACGCGTTACCTTGCTCACCGCC:1 + chrX 19668389 3' - pogo 294 1 70.87 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Tabor 440 2 68.69 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACGAGGCCTAGAGTTACCCAGACAAACG:1 + chr2L 6243755 3' - 412 10 2 64.36 TGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAAGCGCGACGGCCGATGAGTTGGTATTGCTGCCGTCAATGTAGGCG:1 - chr2R 14511015 3' + copia 5020 2 57.83 AGATAAGATAAGATAGGATAAGATAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAG:1 + chr3L 18417066 3' + Stalker3T 204 1 62.67 CAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCTCGTTCGTGCTTTCATTGGCACCCAACTTAA:1 + chrX 15204364 3' + I-element 4963 1 65.93 TGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCATAATGACATACCACCATATTTCTACATAATATGT:1 - chr3R 19678660 3' - R1A1-element 150 1 68.52 TTTCAAAGTTTTTCGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAACATCTCGACTACTGCAG:1 + chr2R 13696065 3' - Tc1 273 1 77.97 TGCATGCCTTCTGCATACATATGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTAT:1 + chrX 12946235 3' + Stalker2 238 2 38.37 CATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATCAACTAAAAGTTTATTTGTGTTTATGTTGCGTGGGCGTGGCAAATGAC:1 + chr2L 20841974 3' + G6 1986 1 51.82 ATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTTCTTGCGCGCCTCGTCCAGAATTTGCATTTGTTTGTTCAGCATTGGGATCTC:1 - chr2R 11857391 3' - G2 348 1 52.73 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCATATGTAGACCTGTTCCACGCAGCTTATCATTATCTACAT:1 + chr2L 12591786 3' - roo 8689 2 58.70 TTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACACACCTCGACAAACGCATAAAATTCGCTTGAACCTTTTGTTAACCCAGAGG:1 + chr3R 26775945 3' - Rt1a 29 1 55.10 CTTCGACTCGAGACTTAGGGGTTAATTACTTCATATAATAAACTAAGCTTTTTGGACTATTTTGTGACTGCCACAAAAGGTGGCTTATCTTT:1 + chr3L 13174445 3' - Ivk 5299 1 68.48 GTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGCTGTTGTTGCTGTTGCGCTTGAGCCTGCACTTGGG:1 + chrX 2118973 3' - F-element 4335 1 60.00 ATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCGCTTAATTTTCAACCCCGTTATTACTTTAT:1 - chrX 5202316 3' + Doc 4500 1 70.59 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATCTCATCTTATCAATTTAAGATTTATTGC:1 - chr3R 15697056 3' - 3S18 53 2 73.08 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATGGTGGCAATGACGATGATGATGATGAT:1 + chr2R 23136772 3' + Stalker3T 205 1 28.18 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATAAGGAAAGGTACGAGTCAATTAAATA:1 - chr2R 20924233 3' + mdg1 7409 2 81.00 AAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAAAGCAGTTCTGGGTATAAATATAAATAAAAAGTAATG:1 - chr3R 26314729 3' + Doc 4427 1 67.27 TTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTTTAATATTTACATATGTTTTTTATATATTTTTTTTTGTATTTCTTCTGTGACTTATTGTATTTAATCTTTAATT:1 + chr3L 6811798 3' - Tc1 1602 1 77.27 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCCGCCCGCGATTGCAAAATAAAATGCCGTT:1 + chr3R 15095613 3' - P-element 32 1 38.37 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCCGGAATGAACCGGAACAATATAAAAAGTAAAATTATTCTCTGTGCATCAATGCGTTGAGATGGCACACAAA:1 + chr3R 26398944 3' - Doc 13 1 59.05 GCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGAGGCGAACTTTGGAGGGAGAGTAGGTATT:1 + chr2L 21018717 3' - F-element 4270 1 70.53 GAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGAAAAAGAACTGTATGAGCAGAGTGTGCCACTGTCAGGCAAACGCTTTGATGTGTCAAG:1 + chr3R 8052637 3' - rover 7114 2 57.55 CTTCTATTGCAATTTTTTCACTTTGCTTGTGAAATTTTGTTGATCTAACGTGCTTAAAGCAAATTAGGCAAGGCAAACAAGAAATCCGTTGGGATAGCAGG:1 + chr2R 8699394 3' + S-element 324 1 63.37 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACGACAAGATCCGGAATCCAAAAGAGTTATATGTCGCGCACGTCACTTGAGTTC:1 + chr2L 3323293 3' - hobo 34 1 51.82 CGGTCCTTTAACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGAATCGCACGACAGGACTTGCTGGACAAAATGCGTTTCACACTGCCATATAGAAA:1 - chr3L 22067712 3' + R2-element 382 1 62.11 ACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTACGCATGAGATAAAATTCTTTCATTCCGCTTGGTAGAGAGTTTGTGCTCAGTGCACTCACAATGCCCACCGC:1 + chr2R 12245935 3' + I-element 4981 1 68.18 AGAAATTGCGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGTGCAAATAAAAGCAGCATACATATTCCTGTCGAAAAAGCGTTAAAACTTGTTCTTGGCCCCAAGAGA:1 + chr2L 6588252 3' - Bari1 246 1 59.09 TTTTTCAAACAACTACATGTTTGGGCGTGTTATTCCTCCTGGAATTACCAATAGCCGAC:1 - chr3L 11945357 3' + hopper 1044 1 76.27 AGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGCGGTGATTCTGGTTGCCCCATGAAAATTTGTAAGCATTTCGAGTCCTTTCCTCTTTT:1 + chr2L 18037776 3' - I-element 5235 1 58.18 GGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCAAATGGGTAAAAAGTGGGTGGAAAATGGGTG:1 + chr2R 18722802 3' - hobo 2522 1 72.83 TTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGATAGGTAAAGTGCTTGCCGGCAGTATAAGTGTCTGGGGAAAATGAAAATA:1 + chr2R 18507914 3' + Bari1 1678 1 52.43 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCGCGCTCTCCCGCTCTCTCTCCCCTGCGCGCGTGTGTATTCGAG:1 - chr3R 14723844 3' - Tirant 3 2 67.65 TTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCACTTATCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 + chr2R 5064834 3' - Stalker3T 203 1 64.22 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTTTTTAAAAGCAATTAAATGCACGCTATGATACATG:1 + chr3R 25434818 3' - opus 43 4 72.73 AATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAACCATAAATGAGAGCAGAAGTATTCAAAATGGAAAAAAGAGGGCTTCTTCGCGTCGTCGTAAGTCTCT:1 + chrX 8281894 3' + Quasimodo 7150 2 61.62 ATGATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTGTTAAAAAAAGCAGCAATAAACACACAAATCAACTCTTTCCACCGTATAAACCACTAAATGCTCCTATCCCA:1 - chr3L 15353209 3' + Porto1 4399 1 61.54 ATAAGACCACATATACTTATACACACACACACACACAATCACGCACATAAAAAGCCCGCGTTCTGTCACATAAATTTCTCGGCGACATTCC:1 + chr3L 16660087 3' + Quasimodo 21 2 69.23 ATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATGCAAATTTGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAAGAACCACAAAGAACTAAAGCAAAA:1 + chrX 3675278 3' + TAHRE 10412 1 61.68 ATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTAGGGGTAATGGAACGTCTTCCATTTCTATTTGTTGTGCTGTGTTTTATTTCTTCGTTCTTCTTCTTTGCCGCGTTTTAGTT:1 + chrX 20764620 3' - 297 6537 2 70.91 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCACTAAGCCCCGACATTTTAGCAAATTGTTACACGAATGATGCGGCGCG:1 + chr3R 10956261 3' - hobo 13 1 60.24 TTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTAGGGACATTTATAAGACCTTTAATGGTCTTCTTTATACATATTAGGCCCTTA:1 + chr3R 18202296 3' - jockey 4698 1 50.00 TTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTTTATTATCTCGCTTTCGAGTTTATTTTAAGAAATT:1 + chr3L 13974914 3' - invader2 344 1 66.99 TCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGACAGTTTTAAAATAAAGACGCTCACTGTGCGCTGTTTCGCTTTTTTCTTACTTTTTCTTTGTTTTATTGAT:1 + chr2L 7941791 3' + 17.6 325 2 59.26 TAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGCCAAAGATCATGCCGATAAAACTCA:1 - chr3L 8532762 3' - hopper 426 1 74.49 ATTTTACTAACACAAGCAAGCATATTCTCTTATTTAGTTGCCATTTCTGACATTGATTTAATGTGGCTTCC:1 - chr3R 19449246 3' + 1360 3251 1 73.24 TGACTCCGCTCATAATCCGTACAGTGATAATGCACTTAATTTGGCTCAGTGTATTATATCTCTGCCTTTCTTATCGCTCTGTT:1 + chr3L 3240598 3' - diver 5890 2 69.88 TGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGACTTCGGACAAGCTTAGTAAAGTGATAAAAGTTAGTTGGTAAAACTGTTAGGAAACCAACTTGGCTATTGAGAGG:1 - chr3R 20278671 3' - Idefix 7098 2 75.25 AGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTTATCAAGAGTGTTTATGCAATACGTCGGCTTATTTAAATGCGACTGCAAGTCATATG:1 - chr2L 10750086 3' - X-element 4549 1 56.36 CGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGTCGGTTCGTAGCTTAGATAAGGTTT:1 + chr3R 3374266 3' - F-element 4465 1 78.79 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATAAAATAAAATAGGAATAAACGCTACGTGTGGGCTAATTCA:1 + chrX 8364729 3' + jockey 4965 1 62.22 TGAAAGCGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATCTCCAACTAAACACTGCTCCACCTTGCACTGCCTGC:1 - chr3L 11281094 3' + Doc3-element 433 1 58.46 AATACATATGCAAAACATGAAAAAACCTGGCTTCCCTTGACTCCTTTCGCATTCCGGCCATAAATAAACATTTAATAAGCCAGCCATAGTTCAGTGTCCAAAAATATAT:1 - chr3R 22503188 3' + Doc3-element 4715 1 55.05 CAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGCCAGCTGAGTGACGCAATTTCAGAAATGTTGACAAAAGATTATTTAA:1 - chr2L 5116352 3' - Stalker 60 4 60.00 CATAAACAAAACACGATACAACTACACAAAAACATAACACACACACACGCACACATTCTCGTGTACGTGATTGTGTCAGTAACAACA:1 - chrX 6923859 3' - transib1 344 1 56.32 GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACCATGTTTCATAATTATGCTCACTAAAATGACATTTCA:1 + chrX 22861714 3' + 1360 3351 1 66.02 GCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGTGTTGCTCCGATAGTGTGCAGTGCATTCGACT:1 + chr2L 4769978 3' - I-element 5000 1 60.00 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGATCTTAACTTATATATATATACGGAATAACATGTATGTTTAATAAATGAATTCAAGGAGTTAT:1 + chrX 4789215 3' - opus 23 2 55.10 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAATTTAAGAGACGATGAACTATGAAGTGCTAAAGA:1 - chr2L 13710682 3' + copia 220 1 65.98 TGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTAAGTGTCTTCTTTAATATTTTTCGTTTATGTAATTTTCGTTATTTGTCTATTTTATAATTTTTT:1 - chr2R 3564303 3' - Quasimodo 163 2 76.34 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGGCAATGGCAAGACAATAAAATAATAATTCGGAGACCGGAAAAGTCCG:1 - chr3L 12677055 3' - pogo 24 1 55.00 GAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGATATTCT:1 - chr3R 6937624 3' - F-element 189 1 71.82 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGATATCGTAAATTGGGGCACCCTCGAAGTAATTGAAGAAAACCGTTGGCATCGATCG:1 + chr3L 18072810 3' - 412 7082 2 54.55 TCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Rt1b 4973 1 64.71 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATTTACAGCCATTAAATACGACTAGTCAATTGAAACACTAAAACTTCGCATAACTTATTTATATAAGTATGTGCTTAT:1 - chr2R 18296840 3' - pogo 4 1 70.00 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACTATTTACAGCCATTAAATACGACT:1 - chr2R 18296895 3' - pogo 52 1 78.64 TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTATGAAACTATGTCAAAATAAAATTCGAAGCGAAAATATGAAAAACATCTCGCGTGTGGCG:1 - chr3L 2120951 3' + I-element 5333 1 59.09 AGAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCTTAGACGCTTGGCGGTCTT:1 + chr3L 4405426 3' - Bari1 180 1 74.39 TGAAAATGTAGAATGAAATGAAAATTGTTTCATTCTAATTAGAGCAGCAACATTTTGCGCTGAGACAGCACAAAGTGAGTACCCGAGCGAATAACCATTCCAACTATGCA:1 + chr3R 13099865 3' + Copia1_DM 4159 1 63.64 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAGCACTTTCACTTTGTAGA:1 + chr2R 6707732 3' + 1360 3361 1 80.00 ATTGATTTCGGCCCGAAAATCGCCTTCTAGCCCACACGCCCACTGCAGAATGCGGACAC:1 + chr2R 9693118 3' + 1360 3185 1 62.71 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATACTAAAAAAAAAAGAAAAAAATACTAAACGTATACCAAA:1 + chrX 13947243 3' + jockey 4966 1 74.16 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGGACGAGGAAACAGCACTGACCGAAAAGTGAACCCTAATTCAGATTACAGATACCTAA:1 + chrX 1601080 3' + hopper 1388 1 57.27 CTACTTTATATTTGATATGGATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTGTAGACTTTCTCCCCTTTCCC:1 + chr3R 6218037 3' + copia 46 2 75.00 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 202 1 29.52 AGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Rt1b 4998 1 27.27 AGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATA:1 + chr2R 12185419 3' - 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mariner2 199 1 65.31 GAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGAATCCAAAACAATTACAACAGTAACCACCACAACACTATCAACTGAGTCTATCAGCGAATCTGTTACTCCAATGG:1 + chr2L 5170113 3' + Burdock 6389 2 71.82 CGGTCGCTTGCGATCTACAAAACTAAAGGAAAAGCGCCGGCTAATGTAATAATTTTTGCCCACGGCTTTGTGAAGGGGAACTCCTGTTGCTCT:1 - chr2L 1647714 3' + HMS-Beagle2 7165 2 74.19 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTTTGGACCATATATAAATTGGCTTTGTGGTCTTCCATTTAATTCCCATGCTAATTATTTGGATTAGGACTG:1 - chr3L 16681977 3' - FB 16 1 67.27 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATCAATTATTGGCCAAGTCTTTGTGCTATTTATGAGAGGCGG:1 - chr3R 29635205 3' + mdg1 400 2 57.47 ACATCATACAGAACATGTAAGTGGGCCCGCTGGCCAAACCTTTTAAGTCTTCGACACAAACCATAGTTTACCAAATAAAAGTTTTACCAAAACACCGTCTTCATGAGTTG:1 + chr2L 15520619 3' + gypsy6 441 1 60.91 GTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTTTAT:1 + chrX 12946235 3' - 1360 3207 1 72.12 TAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATGCCAATTAAGGATGATGCATTAGGAAGCCAAGCTTAAGTGACAA:1 + chr3R 9204099 3' + Cr1a 276 1 58.49 ATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCAGGGGCAATGCAATTAAGCCAGCGGTGAAGGGTGCAGAGTGGGATAATGGATA:1 + chr3L 487474 3' + invader2 42 2 60.78 ATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTATG:1 + chr2L 21570274 3' - Dm88 4377 2 69.09 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATAATAGATTGTTTATGAACAGTCAAGCTGAGCAAACTAGTTATTGTTATATCGATTTATTATAAGGCATT:1 - chr2R 10163538 3' + Juan 4199 1 53.64 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAATTCCCAGAGAAGATAGGATCTTTTATTATATTGGTAGTTCGTGATTATCAAG:1 + chr2L 13710752 3' - copia 27 2 52.38 ACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAATGATTCCCCTTAAAAAGGCAAAAGGCAAATCC:1 - chr2L 15974929 3' - micropia 74 2 64.04 TGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCAGCTCGCCTGGTTCTGGCTTTCTGTTCTCGGATTGGGCAGTTAGTTAATGTTGCTTTTGGGCCAGTTAAA:1 - chr3R 24980421 3' + jockey 108 1 69.52 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATTTTCTTAGATCCCGAGAAAATCTCAACCACTTCTAATGGAAATTCGAATTTGGTTTTTATTTTTCATAATAGCA:1 - chr3L 21403545 3' - roo 8665 2 78.22 TCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTG:1 - chr2R 9408166 3' - FB 10 1 66.30 CACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCTCCATTCTCGGAGTTGCCTCTATCGGGCTCCACTTTATGTGTTGCACTGTGTTCTTTTTT:1 + chr3R 16392117 3' + rover 64 2 59.09 GTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGATAACGA:1 - 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F-element 64 1 71.82 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTTTAAAATCATGAACTTCAATTTTAATTTCGAATTTGGCGAAAAGTTTTAATTTT:1 - chr3R 7049607 3' + 1360 3388 2 80.00 AAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAACAATTTAATTACGAAGTCT:1 + chr3R 30081761 3' + Doc 4479 1 75.95 CTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCTCGGCAATTTAAGTTAACAAAATACACAAGAATGCGAAT:1 + chr3R 15262244 3' - aurora-element 4218 1 72.48 CCAATGTATGGTCGTTATGCATCTTGTTATTCTAGGTACACCTGTAGCGAGCAATAAAGGCTGAATTTGCTGTTTTTCGCAATATTGAA:1 + chr3R 1444815 3' + 1360 3367 1 76.40 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGTCCAAATTAATATATAGCACGAAATATTATAAAAGTTAATG:1 + chr3L 8011454 3' - pogo 44 1 66.36 TTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGACATATTGTAATTATAAACATATTCTTGATCATTCTTGA:1 + chr2L 6292884 3' + HMS-Beagle 391 1 65.45 CTGTGCGATGCACCATCGCTCGAATACATATTCTGTGTTTGAAATAGTATAAGCATAAAAAAAAACCCTCAAAAAAAGAAACAAAAAGTCA:1 + chrX 12734824 3' + Doc2-element 126 1 76.92 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTATTCATGTGTGAACAATACCCATATGTAGACCTGTTCCACGCAGCTTATCATTATCTACATA:1 + chr2L 12591787 3' - 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chr3R 14995667 3' - Doc 40 1 49.09 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTAACCAAGGAAGGTGGATCACCTTCACGAACATCATCATGCATGTGGGCGCCAGACAAATTAACGTCACGAT:1 - chr3R 31965115 3' - 1360 14 1 69.09 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCTTACCTCTGCACCACCGCACCACACACACACACTCACAAACACTCACTCAAACGGACGCAAATATTTGCC:1 - chr3R 13437142 3' - hopper 2 2 64.00 AAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCAAATTGGCTGACTAAATGCTGCATCAAAATAG:1 + chrX 14643775 3' - hobo 374 1 67.37 CTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATTTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Stalker3T 204 1 81.05 GCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTGGTGCTCTCTCTTGGGATCACTGAAGTGGTAGTG:1 + chr3R 4161687 3' - 412 7332 2 68.22 TTAATTTACTTTACTTTTATTTGCGAACTTGTTTCTAAAGCCTAATAATAAAAAGCGATAGAAAAAAAACCGAACAATTAATTGCTAAACAAATGTCTAATCTTTGGCAT:1 - chrX 18951230 3' - TART-A 13132 3 73.64 GCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTCCCACCATTTAAAAATAAATAATTTCGCTTGAATCAAAACCTATCTCCCAGTCATAGACACTCCGTCT:1 + chrX 131313 3' + FB 463 1 61.47 AAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTCGTTGCCTACCTTTAGGGCGACGCCTAGTAACGAAATGTGGGGAAATGCGATTATTAAGTGGGTG:1 - chr3L 2166900 3' - INE-1 246 1 73.86 AAAAGAAAAAAAAACAACAAACAGAAACAAAAACAGAAACAGGAAGAGAAACAGAAGCATCCCCAAGCCAGCATTGCAGATTATGGATCTGCGCCAGCAATATTA:1 + chrX 20010899 3' + gypsy7 5014 1 74.29 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATTACATCT:1 + chr2R 12336649 3' - pogo 42 1 64.55 GTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCGATTCACTTGTCCACTTTTGTCCTGCCGACCAAAACCCAAAAA:1 + chr3R 11925567 3' + McClintock 6182 2 69.70 TTTAGCTACCAGCACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTGCACCTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAG:1 + chr3R 19447018 3' + Doc3-element 481 1 59.09 GAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAGTTGTACAATTATTAAACTTCCTCAATTTTCAAATCAAAACCCGAATTTCAAAAAAAAGCAAATTAT:1 + chrX 15712412 3' + mdg3 5072 1 67.96 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATATTTTTTAATTCTAAGGTAGTTAAGTGGTTCTCCCTTATGCAGATT:1 - chr3L 18915145 3' - 412 7095 2 62.73 AGAAAGGAAATATAAATTATAATTGCGGGCGCATTTGGAAGATTAATGGATTTTAATTAGAAAACGACCAAATAGGCAGCCGG:1 + chr2L 17334234 3' + copia 246 1 78.31 AGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGCGAGGGATCCCCTGCCACCCCCAATTCCCTCGATTTGAATTGTAGATTCA:1 - 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Tirant 5 2 73.63 TTAATATATTTACGCATAAAGTAACCAAATTGTCGTCTCCAAATAGTCAAAATATTTCCTTCATTGCCCCGATAATCGATTCGGACGATATGAACTGTAAGAATTTTAAT:1 - chr2R 1365679 3' + Transib5 42 1 57.27 AATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTG:1 + chrX 21907825 3' - accord 7206 2 73.03 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGAATGTACGTAAGTACACCAATCAGTTTTTAGGGTATTCAAAAGCCGAGTGTCAATGGAAGGCA:1 - chrX 6866746 3' + S-element 1715 2 75.28 TAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAACCTCTTATTTGGTGACGGCCAAAAGTGCCCTGCCTCTGGCTAGATTTAAGCTGCTTTTGAGACGTT:1 + chr3L 18409076 3' - 1360 3374 1 72.73 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAGTCAGTGGGCTAAAATGGTATGAAGTGGCCTGGAAGGGCGGTTTCCGTCGGCTA:1 + chr2L 15894618 3' - BS 5081 1 65.48 CATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATATTATCGAATATTGATTTATTTAATTATTATTTGAAATGAAAAGTATTTTATTTCTTCCATTTTGT:1 + chr3L 10484361 3' + mdg3 5295 2 60.91 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGACTGCTATGCATTTATGGATCTTATTCGTTTTAAAATCATGAACTTCAATTTTAA:1 - chr3R 7049636 3' - 1360 30 1 55.45 GCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCTTTTACTTTTGTTCATTTTTAATATGACTTCTTTGCCTTCGGGCCATTCCC:1 - chr3R 13079476 3' - 412 372 2 70.67 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTTGTACGCCAGCTTAGCTGTGTGGCATCCTGCGGTCAGGAGTCTCAACTTCTGCCTCT:1 + chr2R 13313467 3' - hobo 29 1 54.55 GTATCTGATAGTCGGGGAACTTGACTATAGAATTCTCTCTTGTTTTATATTCAATTGCTAAAGTGTTTTATATAGCAAGATAAAAATTAC:1 - chr4 544289 3' + INE-1 558 1 67.78 ATCAGTCTCTCAAACACCTTCGAAATTGAAGGGAGGAGACTGATCGGCCGGGAGGTAAAACTAATTTGCCGGGGTTTACTAT:1 - chr3L 13347862 3' - BS3 465 2 62.20 TTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAATAAATAATACATATATGTATATAATAATTTGTAAATTAATGCATAAAATGCA:1 + chr3R 4553311 3' + Juan 4178 1 56.36 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAATACTGGTCGGATGGTTAATATGGTTTCTTGCTTATTTTAAGAATAT:1 + chr3R 6132112 3' + I-element 5327 1 54.00 AACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGT:1 + chr2R 5173183 3' + Stalker 7196 4 79.09 CTCAGCTAGTGTGAATGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGGAATGGGGATATGGCTGG:1 + chr3L 17069007 3' - INE-1 530 1 75.71 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAAACAGGGGGACAGACATAAACTTTGATTGCAAAACTAATTACAGAAACC:1 - chr2L 13836512 3' - blood 35 2 55.45 TACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCCTGGCAACCGCTGATTTAATGAAGAGTGATGTATTGACTAACGACTTTCATTTGCAAAT:1 + chr2R 24388372 3' - BS 16 1 58.25 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGA:1 + chr3L 18183175 3' + Transpac 303 2 56.84 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTACGCTGCCCATTCGAACCGCAGAAATTATAGCAGCCAATGGACC:1 + chr3L 15762468 3' - Transpac 27 2 55.00 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTTTAGCTGACTGCTACTCAACTTCAGG:1 + chr2R 9953336 3' + pogo 2068 1 71.59 TGTTTTTTTTAATAAATAATAATTCAATTTACACGGTTATCACTGCAAACTCAAAAGATTAGTGGAATTATAAACATTTCT:1 + chr2R 11614906 3' + Juan 4050 1 71.60 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGAAATATTGTAAGTGCCACAGAGTCCAATGACTTG:1 + chr2R 9963720 3' - pogo 29 1 64.44 CTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGACAAAGTTTGAAATGCCATCATCCACAATCATCTCCCGCCCGCTTATTGCGCTCTATCTC:1 - chr3R 4305488 3' + I-element 5054 1 72.83 AATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAATTATTTCCCCGTTAAATGCTTGAATATAAAATGACTGCCTCTCATTCTCTGT:1 + chrX 22383374 3' - invader1 9 2 32.73 TATGGCCGTTACGCATCTTTTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAACTAACTGTAAATCGGTCTTCAAGCGACGACGTTTAATAAATATTAA:1 + chr3R 23665079 3' + 1360 3373 1 59.55 AGTTACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCTTATCGTCTCTTTCGCGCACACTGCTTGGCCCT:1 + chrX 8946905 3' + Idefix 6988 2 70.71 TAACCATCTGGCTATTAACCCTCGACTAATAAAAAACAAGAGACCCGGCG:1 + chr3R 6986204 3' + G-element 4119 1 54.00 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGCGAGGGAATCACGGAGAGCGTGGG:1 - chr3R 13732972 3' - hopper 21 1 60.81 CTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTCTGTTATCGCCTGGAAAAATTATCTCCCTGTGTGTTTGTGTATTTGGTAAGTGGGCGGTTGGCAGTTAATTTGTTGCCACTTT:1 - chr3L 3928514 3' + diver2 4663 2 78.18 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATAGGTTGGCCTTTGTCGGCAAATTTTATGTAATG:1 - chr2L 21089134 3' + flea 240 2 68.18 TTAATTAATGCATGCAAATTAACACGATCACGTCGGGGTCACCAAATGTTTAGGCAATGAGCTTTTTCATTGACATTGAGAAATAGAGTGACAATTTATGAACACGGTAG:1 + chr3L 24050748 3' - diver2 409 1 74.55 ACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGCGGCTATTTTCCGCTTAACAAAAATCTCCTTTTTTTTATGTTGAGTTGCTATGTTTCGAGTTGCTTTT:1 + chr2L 7340654 3' - 297 6535 2 71.88 CCCGCCGTCACCCAGGACGCCTTTTTAGATAGAAATATTTGTAATTTGCTATTAACTTTTTAACTTTTAAAGTCTCGCCTCAAGGAAGCACGGAG:1 + chr3L 15020651 3' - Rt1b 4835 1 76.84 GAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + flea 458 1 37.37 ACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATACAGCTGATTCACCACAATCGTCACGAGAAC:1 + chr3L 7498585 3' + F-element 4242 1 79.09 GGTCCAAACTTAGGGAAAACCTTAAACTCCTCCTGTACAAGACCATCCTGAAGCCATATTGCGACTAAGGGAAATGGGCGCTGAGAAAAATGCGATTAAAGCGAATGCAG:1 + chrX 19560533 3' + G-element 3852 1 52.73 ACATGTTATGCATAGAGTATGACTACTGCCTCTGTTCATTTAAGATTAATTATAAAATATACTTATTGTCATACTTTTTTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAA:1 - chr3L 15099602 3' + G4 3737 1 73.39 TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAACTGTATTAAATTAATTTCTTCTGACAACCAATGTTCCTGA:1 + chr2R 18398086 3' - 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chr2R 15855660 3' - opus 7143 4 51.82 ATGTTTAAAATATACGGTAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCAGGCATGGTTTGACAAACACGAAATAAAAATTAAATTGCCTTTACGGTATGCACTTTTTATAATACCC:1 + chr3L 13138097 3' - Cr1a 92 1 66.36 CTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATACTATA:1 + chr3R 6763653 3' - F-element 4485 1 67.89 ATGTATGGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTAT:1 - chr2L 23372630 3' + 1360 3370 1 58.72 AATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATTAAAGATTGAACTGCAACAAATACATACA:1 + chr3R 24867580 3' - roo 8684 2 63.64 TTCGATCGTTACGCATAACAGACATGCCTCGCTTAAGCCCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGGGGGATAAGAGGGATACACGGAAAG:1 + chr3L 10711403 3' + invader1 314 2 72.64 GTGGGCAATCGAAAAAACATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAATCGGCGGAAAAAACTTCATCC:1 - chr2L 6621660 3' - FB 416 1 72.22 GTTCATTTAAAGAAAAAAGTGGCAAAAAGGTCAGCAACCAAACCCCTTTAAGTAGATAACTTTCGTTTGGCCAAT:1 + chr3L 10439983 3' + S2 1261 1 49.33 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACATGTTGTTGATGGCTTTGCACACAAAATGCCGTG:1 - chrX 22769357 3' - 412 53 2 71.82 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGAGGCTTCTGACACGGATTGTCATTGGAGGAGTGCACGGGGAGAAACCAGAC:1 + chr3R 10933576 3' - 1360 3254 1 55.45 GCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATTCCATCGTACGGGTGTGCAGAAATATATGTTTTTCGACGGATGACGCACGGAAA:1 - chr2R 9274784 3' - hopper2 1207 2 61.70 AAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATATAATTTTATGTAATATACATATATCTGCATTATTTTGGTTTGAAAAGCCT:1 - chr3R 16893128 3' - I-element 5191 1 53.64 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTGACGTTTAAAATAAATTTCTTGGCCAAGAGAGCGGGGTAAAAAACACATTTACTC:1 + chr3L 17490734 3' + roo 9042 1 54.63 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTCTACTTTTGTTCCTACTTGATTTTTATGCTCTGTTTCAATTCACCCGCATGAATCTGAATGCATGAAT:1 - chr3R 15524380 3' - pogo 16 1 60.00 GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAG:1 - chr2R 6984327 3' - HMS-Beagle2 26 2 56.52 GTTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCCCCTACTTAAGGTCAGCGAAAATATAGCTCTATTGTAGTAAAA:1 - chr2R 6174445 3' - diver2 274 2 52.87 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGTTCTCGATTTCAGTTCCA:1 + chr2L 8476789 3' + Juan 4201 1 63.64 AATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTATTTTAGCACACACACGCACACAGCAGCATGGCAGGAATATTAGGTAACGCTGGC:1 + chr2R 6147416 3' + 1360 3184 1 58.23 CTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGTTATCCAGGTGGCTTTGGCGGCGG:1 + chr3R 17619544 3' + 412 7545 2 53.06 AAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCAGAGATTATTAATGGCACAAACAAACGACAGTGTTATCAGCATTCTTAACTGCTTTTATTTTTCACAAAGCTGTT:1 - chr3R 6088512 3' - transib2 6 1 75.45 TTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTATGATATCGTTGTATAAAAAAGGGAGTGCGCCGTCCGAGTTTCCCAATGTA:1 + chr3R 23730061 3' - Burdock 25 2 57.01 TACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGATGGAAGTGCAGTGAAGTTGAAGAAATGCACTGCAATGCAAGTAAAGCGATTTCGATTTTGTTTATAACTTCCACTCTTGTG:1 + chr2L 20935288 3' - INE-1 549 1 49.09 GTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGGAAAAATCGTGTAGGAGTATTCAAATGAGGGCTCTCAAATCAATGAAACAACTAAATCAACTGCGATCTAC:1 - chr2L 4637501 3' - F-element 4335 1 76.36 AATGTCTTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCAGTGTGCCTCTGTGTTGGTGTGTATCTGTGTGTGTTCAGAGCTTAGCATATATTTACCTT:1 - chr2L 20935551 3' - Tc1 1289 1 70.79 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACCATGTTTCATAATTATGCTCACTAAAATGACATTTCAGTGCAAAGATTATTTTGACCAATA:1 + chrX 22861738 3' + 1360 3368 1 61.82 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACTCATTGCTACACCGCACATATGGCGCACAATTGGAGTAACAAGCACATTCCAAACAATGCG:1 + chr2R 9138785 3' + pogo 2088 1 58.42 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGCATATTTGTGCGCCAGTTG:1 + chr2R 6537952 3' - roo 8689 2 75.71 GGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATATATATAAATATGTATATATATATAT:1 + chrX 10693419 3' - McClintock 35 2 89.13 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGAGTGTATATATGCATACGTAGTTGTATGTG:1 + chrX 15227673 3' + hopper 1378 1 65.96 TAAATTTGTATGTTTTTTTTTTTGAACCCCCTTTTCTTTTATCCCCATTCTCGTGCGCCACTGTTGACACTGTTGACTCCTTTATTCCTTGCTGGTCAGCTGGCT:1 - chr2L 13744292 3' + Tc1 1464 1 74.29 ACGGTGGCTGGGCGCCTGTACTTATATATTTTCACTTAATTTTCACTTTTCATCAGTTTTTCTTTCTCACAGTGCATTTG:1 + chrX 9538671 3' - Max-element 488 1 62.50 GAGTGCCGAGAACCCTGACGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTG:1 - chrX 4789138 3' + opus 7481 2 58.89 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATAAAAAAAAGTTAAATAAAAGCTAAATAAATTAAATAAAATAAATTAAACAAATATTAACAAACAATAAATAAATAATAAAT:1 + chr3R 15793505 3' + TAHRE 10426 2 61.82 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAAAAGCCAAAAGCAAAAAGCCAGAAGTAAAAGCGTGGGCTGGAGCCAATTAATTGAGAAAC:1 + chr3L 17405776 3' - roo 23 2 67.27 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATATATATAAGCTTGTGAGCTATACCTTAACTTCATTTTTATGTATAT:1 + chr2L 2484413 3' + jockey 4949 1 60.00 CTTATTTAAATTATAACGTAATTTCAACAAATATACAATTAGTTGTTTCTTATCTTTATTTGATTTAGTTTTTGTGATTTGTTCTTGCTCTGCTCCTTCTGTGTGTTTTT:1 - chr3L 18341325 3' - Copia1_DM 8 1 67.27 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCAAATTCTCTCTTGATGTCTATATATCCTATATCCCATATCCCATATCC:1 + chr2R 17504783 3' - accord 183 2 47.14 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - Tabor 37 2 54.63 GAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAATGCAATCACGGAACTTAAGGAATGCATATATCCTGGCATAAAAATGCTCACATCCCAGATGCATTAT:1 + chr2R 17379493 3' + F-element 4382 1 58.33 ATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' - Rt1b 4705 1 27.27 AAAAAAAAAGAAAAAAAAAAATGCCCTTTGCACAGCAGTTTCACGTATGTAAATACGTTAAATTTAAACATTTTAGGCAACGAATG:1 - chr2R 16720148 3' + gypsy7 5007 9 87.21 CAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAGACAAATATTCTAAGTAGCGGAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAATCAGAGAAGAAAAAACAGCCACCCACGCAG:1 + chr3L 16760769 3' + HMS-Beagle 277 1 80.00 AACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAGATTGTCCCTGACATACAGTTTGTTATTACTTGCCTGTTACATATATACTTTTC:1 - chr2R 25257599 3' + TAHRE 10406 1 56.84 TAGCACAACACGCACACTTATACGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATAACTTAAAACAAAAACTTCTAAGGCAAACAA:1 - chr3L 6144615 3' + 1360 3212 1 69.39 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTGAAAGCGTATTCTTTGCAGCAAATTAAAAACAATGATAGTAACAA:1 + chr3L 21403647 3' + roo 9039 1 56.73 ATGAACCTCGAGATCCCAGGAACTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTCACCATACAAATTCTCGAAACAAAAGTTTCGCTTTAGTTAAGACAGCCACGC:1 + chr2R 20580361 3' + INE-1 139 1 65.66 TGGAAGTTTATTTAGTCTGCCAATGGGAAAACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCTGTTGCTCAGGCTTTTCATTTAATTTTTGCTGCGGTTTTTT:1 + chr2R 6218687 3' - G5A 2579 1 66.67 AAACCTTCAACATCTTTAATTAAAAAATCATTTCTTATCCTATCGTTTTTTGTGCAACTCATTTCGCATTGGCTGTCTCTATTTGGCAAGAAATACTAAATGA:1 - chr3L 2075795 3' - invader2 4636 1 76.70 GGGTTGTCGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGTACATATGTATATTTGAAGTTCCAATCAGTGAATTTTTGGGTTTCCC:1 - chr2L 5304834 3' - flea 4772 2 64.89 TTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGTTGTGGTTG:1 + chr3R 17673840 3' - FB 11 1 67.02 TTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTGACGTGACGATGGGGGTGAGGCTTAACCAAAGCATGGAAAATGGCGTGGAAAGTGGGAAAGTGTAGAATGTGGAGAAATG:1 - chrX 8313766 3' - Idefix 7107 2 53.70 TGATCCTGATCAAGAATATAAATTAAGCTTAAAGCTTGGTAGTAAGAGCAGGCGGGTGTGGGGTAGGTGAGTGGGGTGGCACTTCCAGAACGACC:1 + chrX 4070024 3' - INE-1 81 1 52.63 AATTGCTTATATCTATGTATTCTTATATAGTAGCATAATATGATTCACATATTACGCTTACACAAGCATTGTACATACAATCTTGCACATGTATTTAGATAATTTACATT:1 + chr2R 19882622 3' - Stalker4 7230 4 80.91 CGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAGAGCTTGAGGGATGTAAGACCCGATGCCTCTTTTATTTATTTAGAACAAAATTAATGTGTGTG:1 + chr2L 12881736 3' + P-element 485 1 52.83 TTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATC:1 + chr2R 5064835 3' - Stalker3T 203 1 64.55 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTATGAATAGGAATATTTCAATATTAAAGAATACAGATTAATCCCTTTTGTAAAATCCAAA:1 + chr3L 14811506 3' - copia 26 2 48.62 GGAACAGAGAAGTTTAGCCGACTAACCAAGTCGGGACTATCAAAATATAAGTCTCAAAGCCTCACTCACTGCTATTGCTGTTGTTATTGTTGT:1 + chr3L 10987205 3' - Cr1a 4092 1 75.27 ATACACAGAGACTTCCAAATAAAACGTGTCATTGAGACAATAGCAGAGACCGAAATCCCGTTGCCCCCCAGGCAATCAGCTGGGAAA:1 - chr2L 7509194 3' + Doc3-element 4444 1 56.32 GTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGTTTAATTATATTGACACCCCCCAACTCAAACCCTTTCATGCTTGCAATAATTCAA:1 - chrX 1146706 3' + 17.6 7000 2 69.09 ATCAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGCTGGAGTCGATCCCTTGGGCAGGCAGATCTTCAGGAGGCTGGTGCAAACCTGTCCGTCGGG:1 + chr3L 8803921 3' + Stalker3T 201 1 68.13 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTTTGCGTTTATGGATTTTTAATGGCAGAATTCCTAA:1 - chr3R 18769704 3' - roo 40 2 67.00 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATTTTATTTCATCATGGTCTGACAGCCGAGGGAAACATTT:1 + chrX 18009537 3' - P-element 44 1 24.72 CACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTCAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCAATGGCCAAAACGAAAAGGATAAAAAGCA:1 + chr3R 31798273 3' - R1A1-element 5129 1 66.67 CGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACACGCAATCCCAAAAAAAAAATAATATCTCACACTTTAGTAGCCACATAGTGTGGCTTACTTTAAATAAAAATTACTCCGTT:1 - chrX 7007929 3' + Idefix 241 2 64.55 ATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAACATTCAAGTGACAAATAGATGTTCACATAAGGAAACGCTTTGTCAACATAGAAAATTTAGAAGTTTAAATAACCATATCAA:1 - chr2L 13292926 3' + X-element 4709 1 74.55 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACACACGACGAGGAAGTGAATATGTG:1 - chr2L 9147954 3' - Doc 19 1 56.38 GCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACATCCGCAGCCGGAGTTATATGTAATATG:1 + chr2L 4334553 3' + Quasimodo 7000 2 78.26 CTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATCTGATTTCCACTTCCCTCTTGGGTGGTTAGTTTTTCAAGTTTTT:1 + chr3R 21445216 3' - Bica 4604 1 67.02 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGGGGGTTAAAGGTGGGCGGATGTTTCACTCGAGGAACGCAGAAAGGAAGTCTAAACAAATA:1 - chr2L 1291020 3' - 412 7080 2 56.36 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGCTTTGAATTCCTAATCAAGTGTCATTAATCACGGGGTCGCTT:1 - chr3L 20642690 3' + roo 9041 1 56.12 CGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCGAACCAATCTCTTTGCAGCACAAAAGCATGTAATGCCAACTGCCTATATGAGAGTAGGCAA:1 + chr2L 19208894 3' - 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chr3L 11777678 3' + Tabor 7322 2 25.77 CATAAACATAAACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGACATAGA:1 + chr3R 22081601 3' - 412 7128 2 21.88 AATCAATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTTATATTTAATATAGTTATTTTACATTATAATCATTACTTTTAATTGATTAACTACTCTTTGTTT:1 + chrX 12775317 3' + Cr1a 4263 1 73.64 ATAGCCACGACATCTATAAAAACATAACTCTATTAACTGGCGCCCAACATTCAATTTTCATTCATCGATTCCCCGATTCCATTGACCCAATTCTAGAGGCTACCC:1 - chr2L 13126803 3' + gypsy7 5449 2 52.38 GAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGGGTTGGTGGTACGCGTATGAGCAAAC:1 + chr3R 11748106 3' - 297 6546 2 74.51 GTGTGTAAGCATTGTTTTTTTATAATTCACAGAATATGAAATATTTTTCTTTATAATAACAATTTAAGTGTTTAATAATATTGGTGACACATTCATTTTTTACTTCTTTA:1 + chrX 7475565 3' - looper1 1701 1 64.55 GGAGTTGGACTCTTTGGTTTATTTGATACTTTCCGTTTCAGCTCTGCGTATTTAAACTATTCGTACGTAGGGCACCACTTTCAGG:1 + chr3L 14158796 3' - invader2 5055 2 58.82 GATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCTAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTGAA:1 + chr2R 19405951 3' + HMS-Beagle 202 2 70.41 ATTCGTTTCTTGGATCAGAATTGATTTCCTGCCAAAAAATCTGCAATAAAGAAAGCGTGAAACTTTCCCAACACTCCCGGAAGTATGCTTCAGTTCTACAAACCCGCACA:1 + chr3L 2316261 3' + 1360 3166 1 75.45 CGTATGGCGTTATGCATCTTATTATTTTAGTGTCTTTGGTCCTGTCAACCCTTTTAGCAAGTGTCAAAAAACCTGGCTAAAGTCTACACCAGGAA:1 + chr3R 13520857 3' - 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Idefix 41 2 66.36 TCGACTATAGCCTTCTCTCTTGTATTGAATTAAATTGATATCTGCTAATAAAACGCAATAAAACAAGCGAATTACTGGGAAGTCCGCGGCACCGGCCGAG:1 + chr3R 12153087 3' + INE-1 578 1 61.00 GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTCAAAGGGGGGATGGGAGAATCAAGGGAAATATAGTGAATGTCGTG:1 + chr3R 5196681 3' - FB 67 1 58.62 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCACCCACACGCGCTTTTCCTTCCACTTCACTTACAATTTGGAACAATTTC:1 + chr2L 1291109 3' + 412 7539 2 64.63 AGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCTCGACGACGCCATACAACCGAAATTTGTATAATTTCTGATCGCCGTTGTTTTTACTGGCATTGTTTAAAAAAAA:1 - chr2L 9524831 3' - invader1 19 2 71.82 AAGCGGCCCTTCCCAGTGCAAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGTTGGGTAACCCATCAACGGAAGGTATATACACGTATGTATGTGTG:1 - chr3R 25558991 3' - Porto1 4586 1 61.32 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGG:1 + chr4 311580 3' - 1360 47 1 65.45 CACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATGCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCGTATTTACCCTATTTCGCCGTTT:1 - chr3R 7080460 3' - micropia 5305 2 77.27 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTGATTATGAATTATGAATTATTAAATTTAAAAATGTCAACCGAA:1 - 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chr2L 7410330 3' - TAHRE 392 1 59.00 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAAGGGGGAAGA:1 - chrX 19187294 3' - Transpac 4941 2 61.22 TGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - Tabor 40 2 56.36 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCATACCTCGTTTCGAAGTCCAACGAGATAAGGATGCCTTGTTCGGTCCTTTGGTT:1 + chr3L 20139794 3' - mdg3 5283 2 48.62 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGACG:1 - chr2R 9963494 3' - pogo 32 1 61.46 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGTGTTGCCTGTGCTTGTTGTGTCTTTAACCTCTCGGACA:1 + chr2L 9171520 3' - opus 7 2 69.07 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGAAGTTTGAATGAAATTCAATTGT:1 - chr3R 12623709 3' - roo 39 2 64.15 ATACCTCCATATCTTAAATGAGCACGCATTCACCTCAGGAAATAGACTGTTCTCCACGAAAAAAAAACTTCACAGCTATAAAATCTTTGGCGCTTATCAAACTATTTACA:1 - chr3R 13374853 3' + Bari2 853 1 61.82 CAGTATGTCCCCCATTGGCTTTCGCTGCAAGTTTAAGCCATTTTTATCAGATTAAAAAGAGGTAAAAAAGCGAAGAATAGAGCGATGGCA:1 + chr3R 6461306 3' - S-element 1412 1 81.11 ATATATGTATATGTATATTTATATAATCTAGTAAGGTTTCCCCGTCTGGACGACGTCTGCTAACTTCGTTCGTTTGTGTACGCTCATTTT:1 - chr2R 19264059 3' - Stalker 6936 4 64.44 AAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAACCAATAAATAATTAAACACAA:1 - chr3L 3616173 3' + accord 490 2 72.00 CGTGGGCGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAG:1 + chrX 21667937 3' - gypsy2 8 2 74.12 TTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGATTTTAGACTAGGCGTCGATGACATCCACGTGG:1 - chr2L 6037587 3' - 412 456 2 73.56 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGCCGCCAGCGG:1 + chrX 20330590 3' + P-element 2864 1 43.90 GCCTTGTATATTGCTATTTTATTGTGTAATCCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTGGTCGAAATTTGTTTTTCATTTAATTAAGTTTCATGCACGCAGA:1 + chr3L 5415347 3' - Porto1 4231 1 76.36 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAGCAACAATACACAGTTCATCGAAACACAGAAAGCAACGAAACCTACATTGTCAATTAGCTTTTAAAAACGGCTTACGTGGGCA:1 - chrX 12919838 3' + 412 7543 2 48.18 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCTCAATAAAATATACCAAGTACTCTACTCTTATTTAAATTAATACATATTTGTAAGCATTTATTATATGTTTTACACCCTT:1 + chr3R 12040039 3' + 412 7543 2 75.45 TCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCGCTGTCAGCTGGGCTAGGACCTTTAATAGTTTGTTTAATATTGAAATTGGGGTG:1 + chrY 520247 3' - 17.6 106 2 61.80 ACACACACACACACACACATTCATCTTCGGTGCAGACGATGAGGAGAAATTTAGTCA:1 + chr2R 19162006 3' + accord 185 2 77.19 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTATATATATCAGCTTGTGAGCTATACCTTAACTTTATTTTTATGTATATTTATTTGAGCTACACAACCAGTGTACCTTTTGGACAC:1 + chr2L 2484450 3' + jockey 4987 1 66.06 CTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGAGGTGTGTGGCCATTAATTGTGCAAAGTCAGTGCGGCTGGAAAAGG:1 + chr2L 15546098 3' + Dm88 361 1 63.81 TAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTAGGCAGCTATGTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTT:1 + chr2L 16067164 3' - HMS-Beagle2 6882 1 77.53 TATTCAGCGTGGTTAGTTTTTATTTTATATCATTTACGGACAGTGATTGATTTAGGGACAGTGTTTTCTACCGACTCGCGGTTAATTTTTTCATTTTTATTTTTAATTTT:1 - chr3L 6796119 3' - GATE 8375 2 64.55 TGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATAAATGCACAGCTGCGGTTGAACTATAGGTCTTAATCAAGGCTATATAACTTATGGTTCTCATT:1 + chr2L 12910802 3' - Burdock 6136 1 75.79 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAACCACCAGGAAGACCGCCAG:1 - chr3R 17619523 3' - 412 50 2 79.35 AGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCACGCATAAGTATGCCGACTAGTGTACATAATAATACAAATAAACATAATAAAACACAAAATTCGACTTACCTTC:1 - chr3L 18463409 3' + gypsy5 396 2 66.36 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGCAAAAATCAGAGTTTCCGAAGAGCTGGCTGAAAATCTGCAAAGCCCAGAGAGAG:1 + chr2L 17751245 3' + jockey 4980 1 51.06 GTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAACGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTTGGTTTGCTAATTCTTCTGACAAGGCGCTAAGCAGCCGCG:1 - chr2R 19844391 3' - I-element 5178 1 70.00 CTTGTCTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTTCTTTAGGACTTTGAATTCGATAAGTGCACAGAGGACTTTATAAATGTGCGCT:1 - chrX 5515539 3' + copia 223 1 51.82 ATTAGACTGTGTTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGTTTTTTTGCTATTTTTCCTATCTCTTTCTTTTAAAAAAGTTTTGATTTTTCTTCGTTTAATTGTTT:1 + chr3L 23747053 3' - transib2 2480 1 71.82 CCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCTCAGAGTCCGCTTCTCTTTTTATTTGTTGGTTTCCTTTCCTCGGCTTACTTTCTTCCT:1 - chrX 20888004 3' + GATE 8273 2 51.38 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATGAGTGATGGATCTTGCCCAGA:1 + chr2R 17806142 3' + Transpac 265 2 74.44 ATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGTCTTGCTATTATTGAAAGGGTAGATATCTCACTTACTTTATGTACAACATTAAAGTACCCCTTTTTATTTTATT:1 + chr4 187686 3' - F-element 4320 1 68.18 TTTTCCTACCGTAAGTCAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACA:1 + chr3L 11777678 3' + Rt1b 5131 1 35.11 CAGCAAAGCAGTTGCAGTCGGATATGGTTTTCCTTGTAGTTGAGGTACTTCTTTTCGCTCTCTGGTTTGTTTAGGATGTTCTTCAAGGAACTAAATAATTTTGATCAAAG:1 + chr3R 20068246 3' - Ivk 372 1 76.36 ATAGCAGTGTCTGGTTTTGACCAACGTAAAGTTCCGAAATGATCATTATTTTCTAAAAAGTGAGTTTTTAGAAAAAAAGGGCAATAGATAAAAAAAAAAATTTTAAAATT:1 - chr2L 12058283 3' + HB 220 1 60.91 AAAATCACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCCCTCAAATATTAACCCTTTCAAAGTTCAATAACCGCATTTGCCATATATAGCGATGCT:1 + chr3L 6302112 3' + Doc3-element 44 1 60.91 GATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAGTACTCTGTAAGGGTCATGCAAGTCATAGTTTAGTGCGGTGTGCGTGGGTGTTCCAGTTTGTGGTTTCAATCATTAGTCGAGA:1 + chr2R 11770046 3' - Cr1a 4202 1 53.64 CATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTCTTTTTACGAGCCAATAAAATTTATTTTACGACAATTTAAATGGTTTCATTCTCTACTTTGTGGTACG:1 - chr3R 16743174 3' - pogo 1685 1 70.87 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGTTTGCTTGGTACAAAATAAAGTTACAAATAATCAAAATTGCTCCACTGAACTTTCAT:1 + chr2L 11762262 3' - mdg1 25 2 57.94 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAATCCAAAACTTAAATGAAATCAAATAAAATTATTGCCCCA:1 - chr2R 23477856 3' - F-element 49 1 65.69 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTGAATACAAACGACGAG:1 - chr2L 9147968 3' - Doc 49 1 67.27 TACACGCATACTCATTATTTTCGCACGCTACTCGCTAGCGGTTCGAGTGCTTTTTTGGTGGTCCACGCTGGC:1 + chrX 9058948 3' - micropia 10 2 70.83 CGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACCCTCTTCATGTCATAAATTCGTCAACTATTGGTGG:1 - chr3L 159201 3' - Dm88 411 1 63.16 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCGAGCAGTTTTCGCTTTGCTTTTCATTTGCTTTTCATTTGCCATTTGCGTCACGCTTCGCTCTGAC:1 - chr2L 4012971 3' - pogo 17 1 65.45 CAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAATAAATAAAACTTTTTCCTCACATCATGCTAAGGCATTAGTTACATTTTTATTGTTATTAATACATT:1 + chr3R 4554405 3' - Bari1 19 1 64.55 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCCAAACTGTAAAAATATATGCACAACGTAAAAAATTAAAAATTCTC:1 - chr3R 23653391 3' + pogo 2064 1 61.82 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGGGCGATATCCTGCTAAACTGGAAGGACAAGGGCTATGTAGAGCTTCTACGGCTT:1 + chr2R 11225207 3' + hobo 2892 1 59.80 TCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCCCCGCTGCCTCCAAAAACAACACTGAATGAATTTGACAGCATTATAAATGCAGAATTATCAAGGTACAC:1 - chr3L 14845637 3' + F-element 383 1 59.38 CAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Rt1b 4997 1 42.47 AAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGTCTAGGAGAAAGGAACCTACGTACTGATCATATGATGTT:1 + chr3L 22496201 3' - Cr1a 4258 1 62.11 ATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATAAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCAAACAATACATAGATACGTCTGTTTAATATTAATTGAGAGACAA:1 + chr3R 10125426 3' - 1360 3169 1 59.81 CTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTACATACATGCCCATTTCGATTCGTTGGGGTTAGTAACCCCAACGAATCGAAACCGCCGCCTTCCTGGCGACGCAGCAAATACTA:1 - chr3L 2153845 3' - baggins 5302 1 45.79 TGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCCCTATCTACTCGTCCCCATTCTCTCTTTATTTTCTGGGAAAAGCAATCAACCTGCAAAAA:1 - chr3L 10722944 3' - copia 4893 2 57.27 CATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATTTCCCATAGCAATCGTTAAATAAATGCTGGCACCAAAAAACTAAGCTAATAGCATAA:1 - chr2L 388534 3' + F-element 308 1 58.72 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACATGGTCCTTCCAGCTATGCTATTAGCAC:1 - chr2R 22663353 3' + mdg1 7412 2 75.26 AAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCCACTACCGACTCTTACCCATAAACTAT:1 - chr2R 13934439 3' - FB 50 1 72.00 CGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATTTTAGTTGACTGCCCCAG:1 + chr3R 11445581 3' + R2-element 3420 1 80.43 AATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTAT:1 - chr2R 5582167 3' - Cr1a 450 1 61.82 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCATTTTATAAACTTCCAGATAAACAGAAAATACACATAACAAACCAACTAA:1 - chr3L 15124292 3' + roo 8982 2 58.18 TTCAAGCTAAACAAAACAAAAATAACAATCTCAAACACCTTCCAACGGGCAACGGCAG:1 - chr3L 10749792 3' + Porto1 248 1 72.41 GAACAAGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATGTATTGTGCGAAGATTGTCAATGAATTTTCCACAGATTCCTGGACATGCACATGTACATAACAAGTG:1 + chr2R 16315871 3' + R1A1-element 5310 1 65.45 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATCTATTTATATATGTACATATCTCAACTGTATACCTGGACATCTGATGCGCG:1 + chrX 10433106 3' - flea 11 2 69.89 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTGTGCTCTATCAGTTTTTCGCGACCAAGCCATCTTTGTCAACG:1 + chr2L 6243730 3' - 412 7080 2 54.84 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTTTATATCTTAACCATATAATTCATTTCACAATCATCACAGTTTATTAATGGCAAATAACAATACTTTTTTGCCACATCCTAATTTGCG:1 - chr2L 14708821 3' + opus 498 1 77.27 ATAGCTTTTATAGTTCCTGAGACCTCAAAGTACGGAAAGGCGGACATGGACAGCTTGATAAAGCGCCAACGCTATATGTGTA:1 - chr4 994791 3' - INE-1 152 1 68.29 AAGGTTTATGTGTGGTGACGATATAATATAATGGCTAAAGCTTTCGAGCCTGCGGATGAAGATCATTTAGGTTGCTTTGAAAAATATACAATTTTCTGCATATCTAGTTT:1 + chr4 142284 3' - gypsy7 5173 1 64.55 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCGCAGAGCAC:1 - chr2L 16742250 3' - 412 7101 2 68.18 GCTACAGACATTAATAAATAAGGTCAAGAATTGAGCATGCTTGCGACAAAAGAGAATATAAAAAAAATATTGCTGAGTGAATATGACTATATTGAGAAAAAAGAAGGACA:1 - chr2R 15977565 3' - Gypsy12A_LTR 2133 1 54.55 GAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCATAAATTCATTTCAAT:1 + chr2L 6757518 3' - Tirant 8122 2 70.91 AAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCGCAAACAGCAGCCGTTGG:1 - chr3L 3871076 3' - 1360 3262 1 82.24 GCGATTAGCTCAAACAATCCCACCCAAATATGGATTTTTTGTATTTAACCGAATATATCAACAACAAATAAAAGATTTATGTAAAATATTCAAAATATTGATATTAAAC:1 - chrX 7385717 3' + I-element 4885 1 77.06 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATTCGATATAACGACTAATTCGA:1 + chr2R 10129793 3' + Burdock 217 2 77.65 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGCACATGTGTGTGAGTCCTTGTTGCAGGACG:1 - chr3L 10109752 3' - hobo 50 1 72.64 GATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTTCCTCTGTCCGTCTGAATGTCGAGATCTCAACTTATTGCTTCTCGTTATTTATTTTGTAGCTGCAGCC:1 - chr3R 18377617 3' + INE-1 98 1 60.82 GATATGGATGTGATGTCTTTGCTGATTTAGGTAAGGGCTCAATTTGGACGGCTTCCACAATTTTGCATATCAAATTCGCCGCTTATTCCC:1 - chr3R 15767604 3' - Ivk 418 1 57.78 AAACAAACATTTCTCGATACTGCGCATCCAATCAAACTGTAACCAAAACCCAGCACATTTGAATAGTTTCCCCGGTCGCAGTGGAAG:1 - chr2L 3342405 3' + Tom1 84 1 62.07 CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTCCTTTCGTCCTTTCTGGCACTGCGTGTGTGTGTGTGTTCCT:1 + chr3R 13733024 3' + hopper 1373 2 59.09 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGAAGATTGGA:1 - chr2R 10090990 3' + roo 390 2 61.82 CATTGCGTGGGGTGAGTTTGGGGATTGGACATAGATTTAGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTCTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - HeT-A 5937 1 52.38 CTGAATTGGAGTTCATCATTACAACAGTGCTCCCACTTCCCCTTTCCGGTTTTAAACAACCCTCCCAATAATAAATCTGCGTGAACCCCATTAACCCT:1 - chr2R 19684428 3' + 412 492 2 79.59 CTTTAAGGATTGTTTTTGTGGGCAGTTGTGAAGGCGTGGTCAGATAAAAAAACAAACAAAATCCGATATTCTATTTAAATCCTAATAATTAATATATAAAAATCA:1 + chrX 17562751 3' + transib4 2493 1 67.62 GTAATTATTATTTTTTTTTTTCATTGCTCGCCCTATCAAAACGTGCGAAATTTTGTGAT:1 - chr2L 3706376 3' - invader6 4387 2 81.36 AACGAAATCAAGTTCAAATATCTAAAGGATTATTCGAGCAAAATTCAATGACTATTATTTTATTACTAGTCATAGTTATTAACTTTAGATATCTTATGAATAGATTATAA:1 + chr3L 16257994 3' - accord2 7240 1 61.82 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATATTGGGCAGAGATGTAACCGGCGG:1 - chr3R 12040163 3' - HMS-Beagle 6826 2 71.25 AAACACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAAAGGAGACAAGACAAGAGGAGCCTCCTCATC:1 + chr3L 3712210 3' + I-element 107 1 72.73 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGTAACTAGCTATTTTTTTTATATCTGCTCAGGGAGTTTATGTGTTCGTCCCATCAACTTTATGATTT:1 + chr2L 19129414 3' - FB 16 1 60.95 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACATATTTCATATATTTATAATACCTCTTTAAAGCTCATTCGGTCTGCCAGGCACAGGCC:1 - chr3L 17405678 3' + roo 9042 1 56.36 TTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTAGTGCTTATCAAATCTTTTATTTACTTTTATAAATATTAATTAAGTAATTTTAGAAGCTGTGTAGAT:1 + chr2L 10554382 3' - G2 255 1 76.67 GGCGCGCATCCAGCGGCCGCAACAGCCACAAACAACCAACACCCCACAGCGATCCCTCATCCTTGCACCATAG:1 - chr3L 6875159 3' + HeT-A 5648 1 50.68 TATGTGTGAGTATGTGTGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGTGAATGCGGCTC:1 - chr3R 22594682 3' - accord 192 2 75.00 AGCGGGAAATACCCACCCGCCCACATCATACAGAACATGTAAGATGGGCGCTTTGGAAATTACAGACTATTGGATACCCAGTTATAACTTT:1 + chr3R 17484451 3' + gypsy6 419 1 58.24 CGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCTGTCACACTCGCAGGATGCATTAAATTTTAT:1 + chr2R 13673577 3' - 297 6781 2 66.27 TGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGTATATATTTGGTGATGATATTTATGGGTA:1 - chr2R 10471211 3' + P-element 162 1 33.64 GTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGCGAACTCGGATCTTAGCAAATG:1 - chr2L 1668281 3' + Stalker4 7325 2 77.66 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATTAATTTCTCTTGGTCTGGCATTTTTGTGAACTTTTTGATTT:1 + chr3R 22979404 3' + Juan 4185 1 60.61 TAATGTTACCAGTCCATGTTACTGTCAAAAACCTATTACGAAAAAAATACTAACTACGTCCAATACTATTATTTATAACTTTATAATAGTTATAAAATAATATAAAAGCT:1 + chr2L 15164079 3' + HeT-A 5856 1 69.09 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTGAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTATTTTCTTATATCTTGGTTTTGTATCCCT:1 + chr3R 4305353 3' + roo 9041 1 67.44 TGAGATCTCGACTTTCATACGGACAGACGGAGAAGGCTAGATAGACTCGGCATACACCTTAACAGGGG:1 - chr3L 8199338 3' - INE-1 135 1 75.00 TTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCAAAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr3R 17689624 3' - blood 168 2 79.17 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCAAGAATCTTCAAATCTTTCG:1 + chrX 14853428 3' + P-element 2848 1 31.82 GAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATCAGTCTGACCTGTTTTCATTCTACGTATTTTCATTCTTGTTGTTCTTTGTCTGCCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGG:1 - chr3R 27499989 3' + Burdock 6389 2 64.22 TTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAATTTCATCGATAGAAACTAGACCCACTTGGTATTAATACCTTAAGGTCAAAA:1 + chr2L 11033366 3' - pogo 319 1 54.13 GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATCAAAATAAAACCGAATGGAAAACCATAACAACCATGACGCAGCTCGAAGAATTGTCGCA:1 - chr3R 10214048 3' + 412 410 2 69.47 GCCCACTCTAACGCCCGCAAACAGCGAAAAACAACTACGCCACCCTTCTGAAAACTGTTTTATTATATTTCTCGATATATTTGGCATAAACATTTAAGCCACATATTTAT:1 - chr2L 19121142 3' + INE-1 218 1 60.91 ACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCCTGGCAACCGCTGATTTAATGAAGAGTGATGTATTGACTAACGACTTTCATTTGCAAATGGCTGGGAAAAACAGAGA:1 + chr2R 24388390 3' - BS 3 1 72.22 GGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGACATATATACAGGCACCTATAGCCGACCGATATCGGCGATTAAGGCATGTG:1 + chr3L 17530216 3' - Tirant 8106 1 76.00 AGCTAATTTGGATGCAGAAGTACAAGTCTTAAGTTTAGAGACAATCTCTGCTCGATGCCCACCCTATTACTTCCTTTTTTTTTTCACTTTTAAAATT:1 + chr3L 19590786 3' - Bari2 320 1 62.89 ACCTTATATTTAATTAATTTATACACACAATCCGCGGATTGGACCATCTGCAATCAGCAGCTCCCGATTGCGATCTCTCATCACTCACTTATGGCGG:1 + chr3L 10911612 3' + springer 7523 1 76.29 GAATTCATTCGAATAAACCTCTTCAAGCAGAGCAAAGGCTCTGAGCTCCAGAGCCACCACATGTCACTTACACAACTACTAAAACACTGAACCCCTCCGAACGCCAAACT:1 + chr3R 22077522 3' + Stalker3T 283 1 54.55 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGTAGAACTTAATTGTCTCAAAATTTCAAAGAAATTAAATAAAATAAAA:1 - chr2R 15155184 3' + flea 221 2 56.36 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTA:1 - chr2R 9963491 3' - pogo 36 1 61.17 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - 412 18 2 42.86 CGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATTGTCAGACTGGACACACATCCATCCCACCACCACCCATAAATCACATTACATCCACAT:1 + chrX 13543718 3' + Chimpo 54 1 60.42 TATTATGTTCGTATATACTACAACCATTTCGGAAGGGTAAAAGCTACTGGTTTGTTTACCTGAAAATGGAATACCCTACTAAGGGCTAACATTTCTGTTTTAT:1 + chr2R 22663435 3' - mdg1 1 2 74.76 ATGAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAAAACTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + Tabor 7312 2 37.93 CCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGATCTGGTTTAAATTGAAAAGAGAAATAAAAATGATATGTACGTTA:1 + chr3R 4602738 3' + P-element 25 1 44.55 TGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACTACGTTCGGCAGAAACAGTTATT:1 + chr2L 22497812 3' - Stalker4 7003 4 77.17 GCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTGTGGATGGGGGGGTGGGTATTTCCTATTTGGTCCGGGTTTGGTCCCTTTATTTGTTTGTCCCTTTCC:1 + chr3L 10833043 3' - accord 7042 2 76.36 CAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCCGCATGCAAGTTACACCAACAAACGCAAGCG:1 + chr2L 2174903 3' + F-element 4420 1 58.67 GAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGAGAGGGTACATGGGTTACACATTTATATATGGCTTATTG:1 - chr3R 23960353 3' - 1360 3278 1 59.57 AGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGTCCATGCCAACTTGAGTAATATGCTTTCTTAAAGGCGAGCCCAACA:1 + chrX 5859387 3' - BS 49 1 56.88 AATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTCCATGTGGGAGGCAGTGGGCGTGGTTGCCGCGG:1 + chr3L 11182213 3' - I-element 5190 1 66.33 AAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGAACCTAAAACACAACAAAAAAAAGCAGTAAAAACAATGACAAGACAAATGTTGGGACAAGCAGCAACA:1 + chr2R 16724640 3' + S-element 1251 1 55.05 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT:1 + chr3R 21211613 3' + Stalker3T 204 1 50.00 GCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGATGGAACCATCTGGCCATGTCAAAAGCCAAACACAACCAACCTGAAGAAAAAATCCAGA:1 - chrX 3212404 3' - Doc 4332 1 61.82 CTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGCTATCCTAGGCAGCCAAAAGTGACTCAAAAGTGATTATATAAGTCGGATGCGAAAAAA:1 - chr2L 7189492 3' - aurora-element 4214 1 60.19 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGATGGAAATTAAAATTATTATTAGCATCGATGGTGAGCAATCTTAAGGGCCTCGGCTATCGCATATTTTTTATATCA:1 - chr3R 9646771 3' - copia 4922 2 73.64 AAATATAACAACAAAAACAACAACAGCATCAGCAAGGGCTCCAAAGACCAACAACCAGCGCATCGTCCAATCGTTCAATAATCAATGGCTA:1 + chr2L 5595314 3' + I-element 127 1 54.95 AAAGCAAAGTTTTATAAAAGTTGTCCAGCAAACACCCAACGAATCGAAGACAAACAAGCAGGCCGAGGCGTTCAGGGCAAACACAAGAATCAGAATCGATTATCTAATAT:1 + chr3R 8212661 3' + TAHRE 4 1 80.00 CGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGATGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATGTTTGGATGTGTTTGCATGCTTTGTGGGATTTTG:1 + chrX 18085123 3' - Idefix 245 2 67.02 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCCAAGGAATCCTACACAAAATGGCAACAACACA:1 - chr3L 6899836 3' + hopper 1375 1 67.00 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATATGATGGAATTCGGTGGATAAAAGATGAAACGGAGCAGGCATCA:1 + chr3R 12453016 3' + roo 9035 1 60.91 AACAGTTGGTTATGGGCCTTCAGCAAGCTAAGTTTTCGGTTTGGGAAAAGAAAAAGGATGCAGAAGAAGAGTCCTTTTTAAATTGGCTG:1 + chr3R 7631107 3' + Copia1_DM 200 1 56.18 TGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCTTTTGATGTCGCCTGCACATTTTTTTTTCATACAGATAACTTGGTCTTT:1 + chr3L 17162828 3' - P-element 377 1 59.09 TTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCACTA:1 - chr3R 23020804 3' + INE-1 578 1 60.00 TTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTGTTGTGCCTTCGATTCGTATGGCTTTCCTTTGTTTCCTTTCGTTT:1 + chr2L 22342541 3' + invader1 30 2 59.78 TGTTAGTGTTAAGGTAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' + Max-element 8408 1 26.09 AATTAAAAATAATCTTGAAAAAAAAAGAAAAAAATACTTCAGAAGGCGAAGCGCAATTAGCACCACACAAATGAGATTGCCAAGACTCACAAAAAATTG:1 - chr2L 21072849 3' - hopper 180 1 70.71 GAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCAGACTTCAGTCATTACAATATCCA:1 + chr3L 9683315 3' + Doc 4512 1 70.00 AATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCACATCCACATCCACATTCACGT:1 - chrX 4075229 3' - R1A1-element 36 1 71.79 TTAATTGTTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTTATTTTTTAACTCAGGAAGCTTCGGGTCGCCAATTTTGCGATCGTTTATTCGCCAACTGTCT:1 + chr3L 15657806 3' - HeT-A 8 1 50.46 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAACAAACTTGTACATCTATACAATTTCCATCCATTCCACACCGAACATTC:1 + chr3R 15524481 3' + pogo 2064 1 61.82 GGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACAAACGGCACAAGCAAACAAAGAGCGGCAAAAGGTATCATCATAATCA:1 + chr3R 8139051 3' + I-element 493 1 61.45 ACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCATCGCACCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTCAACTGATAGATGAGCTTGCCGCCTG:1 + chrX 7535682 3' + 3S18 5821 2 76.36 GAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACTGAAAAGACGGAGAGCATAGTCCACAGAAAACAAAAAACATTTTTAGTAGTTA:1 - chr2L 9809596 3' + invader2 462 1 69.09 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCGATTGAAGCAATGCAAAAGTGTCATGACATCAC:1 + chrX 18483215 3' - pogo 23 1 61.90 ACAACTTTACAATGCATGAGCATACATGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCTCAGCGCCATGCAGGAAGTCAATTATCGCCTGG:1 - chrX 18663861 3' - 1360 193 1 66.36 ATGAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTTGTCGAAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAATGGAATTACTTAAACTAAGGAAAAGCTATGAATTAATTGCCAGCCAAGTAA:1 - chrX 2126509 3' + invader2 449 1 54.55 ATATATACATATACACATATTTTACAAATATACATATGTATATTTGGGAAGATTTATATATTTCACTGTCGTGTTGCTGTAGTGAAGTTAAATTTAATATTATTCTTAAG:1 - chrX 728481 3' - G3 4505 1 32.73 CCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGTAACAGCGCCAATTTGTCTACAAAAACGTTGACCGTAGACCACTCCACAAACCAC:1 - chr3R 17243484 3' + Tirant 33 2 58.00 CTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGACTATAGCGTTCTCTCCTCTTGCTCTTTGGTTTTTGGCTTACCAGAGCGAGGAAGCAAAGCAGTGGCACACG:1 + chr3L 6315551 3' + INE-1 543 1 92.73 ATAAAAACACACACAACCCAAAAAAGAAGAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGTGCTAGGACACGGAAGCACATGAGAGCATTTGCTGCTTATT:1 - chr3R 28359368 3' + Tc1-2 494 1 78.49 GCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATCTCCACTCGCCGATATTCTCAACTTAATTGCAGTGCTTAA:1 + chr2L 13990814 3' + accord 113 2 63.64 TATTCTAGATCAGGATCAATAGCCGAGTTGATCTGGCCATGTTCCTCTGTCCGTCTGAATGTCGAGATCTCAACTTATTGCTTCTCGTTATTTATTTTGTAGCTGCAGCC:1 - chr3R 18377617 3' + INE-1 85 1 55.45 ACACAAGCACTCAACAATTATTGCCTAATTAACGAATTTTCGAGTCTAGAGTTCCCATCTGCAAGGGCATGACAGAGTCCTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 - chr2R 1982173 3' - 1360 454 1 70.91 TAGATAATGACTTAAACATAGAAACAGTTAACGAAACTATTTTAAAAAAGCAGCAAAATATAAGGAACACA:1 - chr3R 29658995 3' + Porto1 4393 1 77.46 CTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTATCAGCTAAGTAGACACGAAATG:1 + chr2L 10503487 3' + I-element 56 1 78.00 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTGAAAGCGTATTCTTTGCAGAAACTTAAAAA:1 + chr3L 21403632 3' + roo 354 2 72.73 GAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTATAATATGATAGATTTGATTTGCAATCAGCTGAGCTTAGAAAATGGCCCAGTTAAGTATGCTA:1 - chr3R 17777568 3' - Burdock 23 2 56.36 AATTCGAAAGACTATGTGTACCAAATAATTGAGATCTAATTGAGTGCAATGTGGGTTTTTTGATTGTGTGGGTTTCGATGGTGTTGATGT:1 - chr2L 4990138 3' - Ivk 5195 1 55.56 AATAACGTTAAGGCAATGCAAAGCAACAATTAGTTATGCAAAATAGGAAAAAAAATATAAAATTGCAAATTTGCAAATGCTCAAAGTACCTGCCAG:1 + chr2L 16115885 3' - 1360 299 1 71.88 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTTCTGAGCTGTGGATAACATGGAATGATTCATTGGA:1 + chr3L 3555503 3' - 412 7079 2 60.71 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAATAAAAAAATAAATGAACGATAAAAAGCCAATAAAGAGCGGCATAAA:1 - chr3R 5774845 3' + I-element 5305 1 68.18 TGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGTTCCTTGTTGTGTTTCGGGTTATGTATTTTGTGTGTTCGGCTGGTAATTTGCTTTTAT:1 + chr3R 30217300 3' - 17.6 100 2 53.92 AGCTTTTCGTTATACTTTGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTAAATAGAACATTTAAAAAA:1 + chr2R 3091293 3' - Doc 4464 1 81.82 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACGGTGACTCTGAAAAGTTTTCCGGAAGTTCGGCTGACTCTCTCTTTTTTTCTTATTATATATGGGGGGATGTACTA:1 - chr3L 65386 3' - 1360 7 2 62.73 GAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGGATATTCAATGTCATTCCGTATTCTGCACGG:1 - chr3L 8178799 3' - 1360 50 1 72.94 CATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCCCTGGCAACCGCTGATTTAATGAAGAGTGATGTATTGACTAACGACTTTCA:1 + chr2R 24388363 3' - BS 18 1 53.12 TAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTTAAGCAACTTGTGCTAAATTTGCTTTCCATGATTCG:1 - chrX 20433329 3' - diver 5930 2 61.90 AACGCCAAATAAAATAAACTAAATAACAAATCCGAACGACAACAACCCCAACCACACACATTCCCATCCTCATCCGCATTCTGCCCTC:1 - chrX 14515934 3' + F-element 83 1 52.27 CTTAATTATTATTATTTTTTTTGATAATTTGTGTTGCATTCTGCTCCTGAACTGAAGATCCCCTTAAACGCACGTATGGGTTGTAAAAATCTGCAGCAGGAAACCCAAAG:1 - chrX 14755353 3' - invader6 4388 1 82.73 TATTGAGGTCTTTATGGAGTGTAGAGAAAAAATGTTGTCTATGAAATAACTAGCAAAACTAAGACGTAAATGCAAAAACTGAAATTTGATATTTCGTTGATGTGTTTTGT:1 + chrX 8733483 3' - Helena 1189 1 77.27 TATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGTATATCCGTCCCTTTTCGACTTTGCAATTTTATTTCTTTGATTGCCGGCACTAACAAAC:1 + chr2R 24045522 3' - copia 5048 2 55.45 GGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGGTAACTCTTACAAACGGCTA:1 + chr2L 11516351 3' - F-element 277 1 66.10 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAATATTCTCTGGGGACTGTGAGAAATAATTAAAGACG:1 + chr2R 11379774 3' + jockey 4948 1 67.89 ATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTAGTACAACCGTTTTGCAAGAGGGCATCCATAGAA:1 + chr3L 2447006 3' - Bica 481 1 81.82 TTGTCTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTTCTTTAGGACTTTGAATTCGATAAGTGCACAGAGGACTTTATAAATGTGCGCTT:1 - chrX 5515538 3' + copia 224 1 53.64 AGTTCCGAAATGATCATTATTTTCCAAAAAGTGAGTTTGGTTAAGTTAATTCGTATATTTAAAAGGGCAAAACTTCTAGAAAGCATTTTGTGATTCTTAATTAGGTATTT:1 + chr2L 10618730 3' + HB 249 1 63.64 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGGAATGTCAACGAATGACAAAGGAAAACATTTCGTTTGTTAATAATTAGTTGGTTAATAGTTCTAGTGGCACAACTTTGTTGAAAAAA:1 - chr3R 5219188 3' - Doc 7 1 75.23 TAGCTGAGTAACGGGTGCCTGATAGTCGGGGAACTAGACTATCAGATCAAATATAGATATAGGGAAATACTATCG:1 + chr2R 5259430 3' + INE-1 544 1 76.00 GGCTCGATTTGCGAGAAGATATAGACGCGATATATTCAAAGGGGTTTTATAGTCTATGATTTTATGAGATTCAAGTAATA:1 - 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ZAM 8196 2 76.62 GAAAAAAAAAAGCGAAAATAAAAGTTGCAGTTGGTCAAATATATAAAGAAGAGGCAAACTGTTGCAGCCATTGAATTAAAGCCCCAATTTCGTGGTGCAGCGTTTTCAG:1 + chr3L 7497466 3' + Doc2-element 250 1 73.39 GTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTACTCTGCAAGTAACGGGCAGTGGAAAATATTCTAGTAGAGAACGGAATGTTTCGAAGGTTTTGAAGATTATTGCT:1 + chr2R 1112706 3' - INE-1 15 1 60.91 AGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTTACTTATGCGAACTTTATTTCGATTGGA:1 - chr3R 24113991 3' - Doc 4242 1 70.83 ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTGGCTAAGAGCAAAGCTACCACAAATGATGATG:1 - chr2L 21064928 3' - 3S18 5767 2 61.40 GGGATTCCAAGTTCCCTATGTATGGCGATTTGCAATGTATTATCTCGGCTTACTTTAATTGCAGCTTGGCCTAAAGCCA:1 - chr2R 8500485 3' - G6 1742 1 62.03 CAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAAT:1 + chr2R 5924419 3' + jockey 4741 1 39.80 AAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCTAACAAGACTGCCGCGAAGAAAGGCCGACGAAGACGGAGAGGCTGAAAGACTGAGCAG:1 + chr3R 16496168 3' - diver2 4669 2 68.09 AAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAAACAAAATATGAAAAACAAGAGATCGGAAAAAACGGAACGATGCGACAAAGAAACGCATGAATGA:1 + chr3R 11131172 3' - 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P-element 5 2 73.91 CCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTGGAACTGGGCGCACTTAATTATGCGTAAATCTTGCAGGCACTTTTCCAAATTTTCCCTGCGTTTCTGTCTCATTTTACACCAAA:1 + chr3R 30221139 3' + hopper2 1273 1 67.89 GAGCGCATCTTTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGGTGGGCAATGGGAGGTGGGGTGTTGTCTAAGGGTATTTGAGGCCAACAT:1 - chr2R 10618629 3' - G2 60 1 54.35 TATATATGTGTGTGTGTGTATAAATAATGTAACAGTAAATTAGCGTGTTTGACACACTGTGGGCGTGGCAGATTTAGCGATTTTGGGCAT:1 + chr3R 11720010 3' - Quasimodo 38 2 76.67 CCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAATATATACACCCACACTATGTACTCTAACACAGGCTCATCCCCCACTAGTACACAAAAGAAAAAA:1 + chr2R 17365028 3' + Idefix 19 2 63.21 TTTATTTTTTTATTTTTTTGTGTCGAAGTGATGGAAATGAGGTTTCAATGGCAGAGTTTCCCTAATTTTTATAATAATTTCGATATGCTTTATA:1 - chr3L 6652662 3' - Juan 4214 1 79.79 CCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - Tabor 6868 2 54.00 GATTGTGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGTCATTAGGCAAAGCGCCATTTAAATGGATTGGCCTGGGCAACAGAACATAGC:1 - chr2R 22200777 3' - Idefix 7073 2 70.65 TGGAATATGCTCGATCAAAAGGCCCTGGCAAGTTTTTAAATTTAAAAGCAACGCAGAGCAGACCGGAGTCCATTCAGAGACCCCGAGTAGAGCAAGTAAACA:1 + chr2L 11931984 3' + Copia1_DM 482 1 54.90 TCACAAAATCCGAATTACGCGTAGTTCTTAACTCTACACTCATTGCCCCCACATGGAAACCCATTATCGACAGCGCTACTCAACATAATGACAAAACTTC:1 - 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pogo 9 1 72.73 GTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTATCATTTATTTTATGCATGCACATAAACTGCACTTTTCCCAGCTCACTTCGGGGATGCTGATAAATGGCCCTTTG:1 + chr3L 19136681 3' + Cr1a 73 1 66.06 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTTTTTGTCCTTGTGGGGGGCAAAATAAAACCACTTTCTCTCAG:1 - chr3R 5671360 3' + 1360 3387 2 75.96 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGCCATTTCACGATTGATATTTCTCCACCGTAATAAGTAGGTGAGCTCA:1 - chr3L 14261291 3' - mdg1 7073 2 54.29 TGGACCACCCAAATACGGCACTATATATATGTTAACACCAAAAGAATTTGCAACAACCATCTGCGAAAGCTTGCACGCGCATCAAACCCATCATATTTGCGAGTCGAGTC:1 - chr2R 1460783 3' - 297 1 2 80.00 TGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGTCAGTCCGTCTGTCCGTATGAACATTCATCGGACAGCAAGATTCCCTGAAATGCAAGCCGCAAAATTA:1 - chr2L 12842474 3' + INE-1 91 1 56.52 TGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTTGACCCAATAAAAAAAGTGATATATATGCACACACGGGGATATCCATACATACAGACACAGAACAGAGA:1 - chr3L 10572817 3' - accord 253 2 91.21 AAAAGAAAGAAAAAAATGAAAAAAAAATATATATAAATAAATAAAACCAACTTCAAGGCAGAGCAAACACAGAACAACACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + Doc2-element 246 1 80.95 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATAATAAAATTAATCAATAAAACATTCAATTCAGTTTTTTTATTTAATTTT:1 - 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mdg1 7150 2 58.18 CTTGCTGCGCTGCCGCACCAAATTACAAACAAAATAAAAATTGTGCGTATACGAGGCCTTAACATCGAAAAAGTGAAAACAAAATACATATTGTGACAATTGAA:1 - chr3L 23198505 3' + invader4 3037 2 70.19 GTAAAAAAGAGAACAGGAACGCCAATTTTCGCTTCAAATCAATTAAGAAAACCTATATATAAAGCTTGTTATTTTACAGGGTATGTGACATG:1 + chrX 13167118 3' - Cr1a 4347 1 77.17 TGTGAAGTTACCAAAAATAAAATGCGGACCACAAACATGGGAGATTTGCTTCAAAGGCTTAAAACAAACTGCTAC:1 + chr3R 17454528 3' - frogger 2185 1 65.33 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCCTGACAGAAAATCCTGCACTCAGTATTAATAAGCTTCTTTTGGGAAATCTGGTATTATCT:1 - chr2R 23354269 3' - Tabor 6863 2 58.88 ACAGAATTACATATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACATCCACACTCACCCATTAAC:1 - chr2L 17885042 3' - 1731 4362 2 64.55 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAATAAAAAAATAAATGAACGATAAAAAGCCAATA:1 - chr3R 5774859 3' + I-element 5307 1 79.79 ACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAGATTCAATAAATAATAAAAAAATTAAAAAAAAAATACTCGAAAAGGGGGAAGAAATTCAGCCATGTGCCTACAAAATCA:1 + chr2R 16814232 3' + Doc 4651 1 61.82 CGCTGAGGAAGAATTCTTCACCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACATCTTCTGGCGCATGTTGGTCAGCTGCTGCAGATTCTG:1 + chr3L 19573618 3' - 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chr2R 19096851 3' - TAHRE 10337 1 55.45 CTAAGTCTACAAAATACTAACTACTTTTACATTATTACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCCAATAATAACCGTTAAACTAAGTGAAATCTAAATAA:1 + chr3R 2301829 3' + TAHRE 10253 1 63.27 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGTGTGTGAGTGAAGTGCAGAGACGCTCCGAAAAGAATAATATACGACAAAAAAAAATAAAGGCCAAACAATCTAAGCAAACA:1 - chr2R 11632284 3' - Tirant 1 2 73.83 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAAGAAGTGCAAGCACTCATAGA:1 - chr2L 18675594 3' - 412 12 2 67.33 CGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAAACCGTGGAGCCACGGAGCAGGTTCAATGACAGCCCCGTTCCGCGATAACCATCATCATCGCATCACACAGC:1 - chrX 3815044 3' - Bari1 238 1 80.00 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATTCTTGATCAACAGCAAAGTCGATATAGCCTTGTCCGTTTCAGAGTAAACTTGTTGATACTTTCCCAA:1 - chr3R 6461725 3' - S-element 3 2 76.00 AGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTTTCAGCTTATCCTTTTCACATTTTTCTCTTGCTGCCAGCTCT:1 - chr3R 7061380 3' + 17.6 7193 2 60.76 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACACAACACAACACAACACAACGCAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - 412 7088 2 54.55 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTCTCATTTCCATGTGATGCGCAATATTTCGTAGCATACTTTCAGGCTCTTAATTGGCGCATTTCCAA:1 + chrX 5513401 3' - jockey 4690 1 71.43 ATGGAAAATACTCTATTAAACCTTTTATTAGTTCTATTGTAAGTAGTTGTGGAAAAAAGCGAAAACAAGACAACAAATGGGGTCAGGAAAATAGAAATCTTGAATCGGAA:1 + chr2R 20204265 3' + ZAM 494 1 57.27 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAGAACGAATTCCAGGAGCAGCATAAGCAACATATTACGCCAGGTG:1 - chrX 3048130 3' + jockey 4948 1 55.32 AAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGGGACACCGGATGGTCGGACGAAGCATTGACAGTTGTAAGCCATAAACCACAGAAAATTGGGCATTATATTAGTTAAGATGCT:1 + chr2R 21948309 3' - Q-element 495 2 69.44 GGTGTTATGTTGGCAATTTCTTCTTGGGCTGTATGATCGGTCTGACTTTGTTCGTCGGCGTGGTCATTGCCAATTATTCGGAGAACAAGGGCACCGCCCTGCTGAC:1 + chrX 14272721 3' - mariner2 678 1 79.25 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACCATGTTTCATAATTATGCTCACTAAAATGACATTTCAGTGCAAAGAT:1 + chrX 22861724 3' + 1360 3354 1 59.09 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCTACGAATTGTTAGTATATTACATCTATATCCCTTTTGGTTTTATTAACACTTTAACACCTTTCCTAGTCA:1 + chr2R 10241525 3' + I-element 5340 1 69.09 CAATATGTAAAAAAATAATAACAAAGCTATAGTTGCAGCCTCTGAAAGTTTAAGACAATCGCCGATCCGATCGGAAGCGG:1 + chrX 3720270 3' + S2 132 2 72.50 GGTCCTTTAACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACACTCAGGCTCTCAAGTGGGCTCACG:1 - 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Stalker3T 204 1 72.73 TTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATGCCGGCTGTGCAAATGGTT:1 - chr2R 17512998 3' - jockey 4808 1 78.49 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGCTGATTTCGGAATTAGTTCGGTTAACAGCCCCACCGATTTTGGAAAATCTACTTCGGCCCATTCGGAAAGCCCCAAG:1 + chrX 3528671 3' + roo 401 1 73.64 AATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCATATATATAGTCATTTCATAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCG:1 - chr3L 24797354 3' - invader4 2801 2 67.65 GCATACTCGGATTAGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCACTTACCCCGCATTTTGATTTGAGGCCAGTTTTG:1 + chr3L 1472924 3' - Doc 4510 1 56.36 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCAGGCAGCGAAAGTGTGCCAAGTGTGTAAGTGTGTGTCAAAATGAAAGGATATAAAGCCATGAAAGAATAAACAAATTCAGCGA:1 - chr3R 25752742 3' - 1360 72 1 77.27 AGTTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTGGAATGAATATAAATGAAAAAAATTTGAGGAAAGCCTAAAAAAAGGTTGATCTCGAGTGGAACGGA:1 + chr2L 16606848 3' - F-element 94 1 59.62 AAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTATATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATAAAACTAGGGAAGAGCATTCAAAGTCAAATCTACACAAT:1 + chr2L 4176752 3' - S-element 406 1 63.64 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGGGAATGCCGAATGTGGCGCCTCTCACTGATGAGCAATTTG:1 - chr2L 9147983 3' - Doc 59 1 78.10 CCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGGCAGACGGCTAAATCAGGGTTTTCCGTTCCATTTC:1 - chrX 16620260 3' - diver 7 2 56.25 AAAACTATTTATTATTTCTTGTCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACACTTTTACTATATATATTTTTCTTTTACCAGAAAC:1 - chr3L 12158467 3' + 297 6912 2 83.64 GAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGGTATAGTCTTTAACAGTTAGTAAAGCCGTGAATAGGGACATGCACATCTAGTTGCCTTTGTAAG:1 - chr3L 12742216 3' + flea 308 1 60.55 CACGCAGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGAGAGCGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAATGCGAAAGAAAATCGTTTGGGTTTGGTTTTGAG:1 - chr3L 18846271 3' - Cr1a 325 1 64.76 GGAAAAACACCGTGCACATTTTGACTGGCCTTCTTTCGGAGCAAACTTCTTTTAAGCCAACCTTTTTAGGAGGTGGCCAATACCCGATGGGGAAAAA:1 + chr2R 14393670 3' + baggins 5108 1 71.13 ATCCACTCTTAGTTTCAGTTAGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGATCTCGGGAGAGTTCCGGAGCTGGGACCGATGGGGCCAATTTAATTTTGATTAATTGCG:1 + chr2L 9367110 3' + Circe 331 1 65.45 GTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAATCACAGCACATTTATCGGGCC:1 + chrX 20438985 3' - Ivk 356 1 80.91 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGATCTTCTGTTGGACTTCGATTGGGTGATCCTC:1 + chr3L 7400794 3' - roo 8702 2 68.09 TGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAGGAAAGTTATTTATTGTAACGACCTTAAACACATCGACGAACTCAAAAAAACAAAACACATAACCAATGAAAAACAGGATGCG:1 - chr2R 10675706 3' + I-element 465 1 59.63 CAATGGTTAACGGATTATGTGTGTAATTTGCATGTAGTGGAGCAACGACTTTTCGTATATCATTTGCTTATG:1 - chr2R 24315650 3' - Doc4-element 217 1 69.44 AAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGACTGCCAACGACATTTAGCCCACTTTTTACGCAGCAAAAGGCACCACAGGAACCGGAGTACGGAATGGAACCTTCA:1 + chrX 20976474 3' + Doc 4510 1 74.31 TGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTCATCTGTTTTAGAGCTCCTTTAGATTGACTATAGATTGACTTTGGCTAT:1 + chrX 17358618 3' - Doc2-element 4545 1 64.20 CTACATATACTTACACACACACACGGACATACTTTACCACATTGCAACAGCCACATTCACCCCACCAAACCCCTCCCAAACAATCCCTACGTTGCACATGTACACACGAT:1 + chrX 13748651 3' + Quasimodo 27 2 55.45 ACTCAATAAGAGATTACCTTAACGTAAATAACGTAATTTTCGATCTGAAAGTCTTTCTTTTTGGAAAATAACCTATTAAATTGTCGTTTTTACATTATAAAATATCTGAG:1 - chr2R 23277609 3' + Circe 7005 1 63.64 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCATATGCTGAACCTTTTCCCCTGCTGT:1 + chr3R 12040224 3' + HMS-Beagle 7011 2 52.73 GCGATGTTCGCGCTGCCTGCTGCATTTTCTAATAAAATGCGTTTGAGTAAAACAAGATAACTGTGCACCAAACCAGATTGGGTTACAATAATTTCCCCATAAAAATGTCG:1 - chr2L 7325193 3' + Stalker 499 1 72.73 TAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAACGGATCCCCGAGGGTGACTATTGAAAATGTGTCAAATTGAGG:1 - chr2L 1671296 3' + invader2 4717 1 56.47 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATAAATGCACAGCTGCGGTTGAACTATAGGTCTTAATCAAGGCTATATA:1 + chr2L 12910786 3' - Burdock 6167 2 57.27 TACGATAACCAAATTATACCAAAACCTTCCGTGTACAGCTGATGTAAAATAAATTGACATTTAGTTGTCGATGTACCCGGAGCACTTTCCACCT:1 - chr3L 18967001 3' - Gypsy12A_LTR 168 1 63.83 GGTTTAGGAAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAATGAACATCGGAATGGGAGCTATATAGCTTGTGGCGTTCTGATT:1 + chr3R 24636213 3' + Circe 7059 1 63.00 CTTCCTCCGAATTTGTATACCAGCTATATTCTATATTCTCTTGCACTTCAACATTAACCAGCTAACTTTGGTTTGTCGTGAAGGAAAACAATTGTACGCATCTTAATATT:1 + chr3R 7003246 3' + Gypsy12A_LTR 2070 1 66.36 CCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTAGCAAACCTGCCTGAATTCCAAATTAAATGAGATTAAATTTG:1 + chr3L 16875755 3' - jockey 4589 1 59.22 TTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAGTTGGTGTTCAACTGCGCCAATAAGAATGCTAAGCTACCCGCCCACATTCCAGCAACTACTACTC:1 + chr3R 16443761 3' + TAHRE 10413 1 68.63 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGTAGGCATATTTTAGAGAATAACCCTAAGTTTCACAAATCGTTGTTAGCTGAAGTTAG:1 - chr2R 22994149 3' + P-element 2818 1 61.54 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAATAAATTTTTAAATTGTAACAAACTGTTTTTCTTGGTTCTGCTCGCTAAGACTTACAAAGGCT:1 - chr2R 5214954 3' - F-element 31 1 53.77 TGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGGGCCGATGCTGCGAAACAGAGCGAAAACCAAAAAGAGCGCGAGAGAGAGTTTAAAATGAGCGCACAAAGTGCATTATTATTTTGCTG:1 + chr3L 15511912 3' - invader2 118 2 64.55 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTACGATGGTTTGCAGCCTGCGGCCACGTTTT:1 - chr3R 18763408 3' - hopper 24 1 66.22 CTGCGACACGGCCTTCCTGACCCTCAGCCACGCCCACTACACACCACGCTACACTGAACAAACAAAGTTAAAGGCTATTTGCCACCAGC:1 - chr3L 18975648 3' - invader1 3596 1 80.90 AACCTCCCGCGGTATAGCCGTGAAGCATTAAAAACGCGAGGCAAGCCCCAAGATTCCTCCACTCCTTTTTTTATATTGCCCACTGCTAAA:1 + chr2R 9976222 3' - Rt1c 5341 1 73.33 GATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGCCAAGGCCGCAGAAATGAAAACTCAAGTGAAAAACGCAAAAACTCAGAGCGACA:1 + chr3L 21570393 3' + Stalker3T 205 1 54.55 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTATCTAACAGAAGCTTCATATATACATATATGCTTTACCGATTTCAAATCTG:1 - chr3L 885726 3' + roo 9038 1 62.73 AGTTTTTTTTTTATTTATTTTTTTTTTTGTTGCAAGCGCGGGGGATACGAATCGATGGCTTAATGCACATTTTGTTTGAAAGAGGCTTAAGATTATTGGGTTTTGT:1 - chrX 17579134 3' - HMS-Beagle2 489 2 55.66 AACTATTAAAAAAAAGCAGCAAAATACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATTACTCTTGATATCTACAAGAAAGTTTAAAACATACCT:1 - chr4 1053055 3' + Porto1 4427 1 66.36 TTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTATCAAAAATTACAAGTTGATTTCCTTCCGTTTCGAAAAAAAAAACAATTCAACAACAAATACAACTAGAATACACA:1 + chr3L 19939876 3' + Ivk 244 1 55.66 TCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATAATATACCCGTAGTTGTACAATTGTGACACGCACTGTCAACAGTCTTTGTTATTTCCCCCGGA:1 + chr2L 17108588 3' + G6 1877 1 60.00 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTACGGTTTTTGTGCTTATTTGTTTATAACACATACGTCATGGTAGGTATTGATGAGCTTGCCAT:1 - chr3R 7588849 3' - F-element 33 1 51.85 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAGTATTTATTTTATTAAGTTACTTGAATAAAGTTTTTCATATA:1 - chrX 22717131 3' - pogo 37 1 62.86 AATGCAATTGATATTTACTAAACACTCAACAATGAGGCAACCAGACACGTGACGAATAAATAGCCATC:1 - chr2R 16316367 3' - jockey 292 1 63.24 AGGCGTTGCAGGTAAGTAGTTGTTGTACTTGGGTTGGGGCTATGTTGCAGGCGCTGGATGCGCGCCACTTGCAACATGTATGTCCGGCCGGCGGTCCCCTGCTTC:1 - chr2L 21821227 3' - HeT-A 5690 1 80.95 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGTTTTATTGTCTGGTGTCCTGGTATTCACGTTTAGTCGCTTTTTTTTTGCTCCTTTTTTA:1 + chr3L 22980362 3' - S-element 1 2 61.90 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGGATTTAATTGATTTCTGAGAATTTTAGATTTTTTAGAACAGATATGTATG:1 - chr3R 27071827 3' - jockey 4673 1 72.48 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGACCGGAAGTTGTATCACACATGTACATATCACACATTCAGCGCTTGTGTTTATGCCACAAATATTTAAGGGAA:1 - chr2R 14661067 3' + hopper 1404 2 70.91 TAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACCATGAGCAGATAGGGACACACACACAC:1 + chr3L 10723014 3' + copia 5068 2 73.64 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGCGG:1 - chr3R 9481215 3' - roo 8677 2 57.75 CATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAAAAATGCGAAAATTAACCCAAATAA:1 + chr3L 2076779 3' + Quasimodo 76 2 79.09 CTAACAGATACCCATTACTCAGCTAGTTGGAAAACCGGTATCTTTATATCGTTCTCATGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - INE-1 547 1 60.00 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTT:1 + chrY 311341 3' - 1360 23 1 48.18 ATTTCTATAGATTTGCAAAAAAAAAAATTTTATGCTAACACCCACCTCCCAA:1 - chr3L 5496761 3' + INE-1 310 1 55.77 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTAAGTGGATTTTGCAGACCACAAAATGGCTTA:1 + chr3R 13183270 3' - hobo 18 1 56.00 AGAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATAATTTTAAGATCCCAAGGCACAATGAACCAATTTGAAAATCACCTTTCTCGCCTGCAAATTGCTTTGTCAGCTTCCCCCG:1 - chr2R 20085037 3' + G5A 2764 1 62.73 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATATTGGATATAGAGACGAGAACCAGCAACATACGGTAAAA:1 - chr2L 5638521 3' - jockey 21 1 56.41 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGGTCGTCCTTAACCTTTTGCAGTGCAAGCCTTGATACGGTGCAC:1 + chr2L 18675683 3' - 412 7095 2 60.00 CTTATCTTATCTTATCTTATCTTATGTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTGCTCTGCTCTGCTCTGCTCTGCTCTGCTCTGCT:1 - chr2R 17130516 3' - Stalker3T 204 1 58.18 GGAAAAGTATGAGTTTTTGTGTGTTATCTGGATTGGGTTTGCCCTCGTTTTTCCCTCGAGGTTTTGGTTTG:1 - chr3L 12998002 3' - I-element 5142 1 56.34 ATATTTTTATATATACATATATAATATAAAGACGCCCGCTTTC:1 + chr3R 7043263 3' - Dm88 22 2 65.12 CCTCCTCCGCTTTGGCTCACGTTCTGGGCGTCCATTAGTTGTTCTTGTTGCTGCT:1 - chr3R 22271046 3' - TART-A 12951 2 85.45 ATGAAGCAAATTAATATTTTCGGAAGGGCAGTTTTAGAAGAAGAGCTTGAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCAAAAACAAACATCTGTGGT:1 + chr3R 19448669 3' - Gypsy12A_LTR 2054 1 60.91 CCACGTTCAACGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACGAAAGGCAGCAAAAATGTAATTGTGTGGGATGA:1 - chr3R 10631526 3' + Idefix 251 2 53.62 TGTTGCCATTGTGTGCTGGCGTGCCCCGAAGGCCAGGAGATCCGCCAGACTCATGTACTACGCC:1 + chr2R 23722815 3' + gypsy2 6377 1 75.00 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTAATAACGATTAGCTAAAAATCTAGTAATAAAAAATGTCCAACTAAGGTTAAATGAATTTATATTAT:1 + chr3R 18626893 3' - roo 18 2 58.18 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCGAGCCACCAAACCGGGCTCAAAACCATTTTATGCAAGCCAGCAGCAGCAGCATCAGGAG:1 + chrX 12145235 3' - 412 9 2 68.48 TTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGTTGGACTCATTTCTGGTGAGGATGCTATTTTTGGGAGCTCGTTGCTCGAGGATT:1 + chr2R 10844391 3' - I-element 233 1 55.05 TTATTTACTTCTTCATATTGCATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - Quasimodo 7205 2 36.23 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTAAAGAGGATTTGGGGATGAGAGATATTGAAGTGATTCGAGCTGATTGGATGGGA:1 + chr2R 21735258 3' - blood 7029 2 58.95 TTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAACTTCGCCAAATTATTAGCTTACTGTTGCACGCTGCATGTTGCAAGCGCGGCATGTGGCACTTATTGGC:1 - chr2R 16017955 3' + transib2 172 1 60.64 CCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAAACATATACCAATTATTAAAAAAATAATGTAAGTGCATAACGTATTAAGGTCACTTGCGAGTTAATT:1 + chr2L 18301835 3' + Quasimodo 75 2 58.18 ACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTATACGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAGCCGAAGGCCCCCCAACTCCAATTAATGCCCTG:1 - chr2L 5485782 3' + Idefix 85 2 70.00 GAATTGCATCATATTTAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGAAGTGCGCGACCTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3L 11720529 3' + Ivk 4984 1 52.73 CGTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTAAATGGATTGGGTTTTCGGTCAGGGGTTTGCTGGTAGTTTGC:1 + chr2R 10702736 3' - I-element 5186 1 75.45 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATATTTATCGGAAGAATTTCGTCGGGCTAGCTTTTGCTTTGCAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 20902928 3' + roo 9053 2 55.43 TTTACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCAAATCCATTTGTAGTTTAAA:1 - chr3L 22340907 3' + F-element 4461 1 77.91 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTTTTTACAAGCAATTAAATGCACGCTATGATACATGACGCCTG:1 + chr3R 25434825 3' - opus 139 4 63.00 GGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTTGTTTTATTTTGTTTTAATGGGTTGTATAATTCCAAGATTTCTGGGTTTTTTTCCAACATCCATAAATTAA:1 + chr2L 21762402 3' + INE-1 557 1 54.55 TCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCT:1 - chr3L 22908066 3' - Stalker3T 205 1 61.32 TATTGTAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTAACATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTTATTTGAGGTTGAAATTGAAATAAACCGTTGAA:1 - chr2R 17250533 3' - Cr1a 4193 1 70.00 GGGACTTCTTCGACACATATTGTTTAATGTCCCCCTACAGGTTTTCAATCGGGTTTAAATCGGAAGATGGAAACCAGGACATTAAATAGATAACAATTAGGGTCTGCTTT:1 - chr3R 26386364 3' - HB 1186 1 63.64 GAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAACCTCACCTCCAAACTCTTTAGTTTGTAATTCTATTTATATGCACTCGCTCCAGAGTATCCCTATGTACTCGGATCTTGGGT:1 + chrX 661043 3' + Doc3-element 4491 1 70.91 AACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATAACAAGCCAAAAAAAACCTTGCAAACTTAAACATATGGCACTTAGTAAGCATAAATTCTTAATT:1 + chr2L 7994991 3' + I-element 366 1 55.24 GGTAACAGTGCGTTGATCAACTAATAAAAACATCATCGTAAACAGCTGCCGCTGCAACTCGTAGAAGAACGAGATATTGTTGCCTCCTTTTCTGCGCAG:1 - chr3L 12241674 3' + jockey 4972 1 41.41 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGCGTGGTTTACTGCCATTTATATTTATGT:1 + chrX 8326757 3' - jockey 4705 1 66.67 CACAGTAGATTTACATTTTCATATTCTTTTGTATTCAGTCTTAAGCCAAACCTGTAAAATGTCCGACAACGATGATGATTTTATGTGCGACGATGATGAGGACTATGGAT:1 - chr2L 8997212 3' + gtwin 7130 2 60.00 CCCTCAATCACGGACTTAACTCAGGCGTCCACGGCCAGTTAGTTGGCCTAGCTATTTATTTGCATATGCATTTTGCCATCCACATCTAGAATTTATTAGCAAT:1 + chr2R 21592089 3' + Tirant 399 1 75.73 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATCAATTATTGGCCACGTCTTTGT:1 - chr3R 29635223 3' + mdg1 360 2 79.82 ATTGTTGTCTGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGGAAAACGAAGAGAAAAGGCCA:1 - chr2R 21898463 3' + gypsy12 10098 2 73.75 ACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGGATGAAGCTGAGCCAATGCAAATATGGCAACATTTGA:1 - chr2L 14575639 3' + pogo 419 1 72.48 GATATGCGGCTTCCAGGTAAGTCGCCTATCGAGGGTGATACCGTTATATGTCATTTTCAGGGATTGTGGGTTAATCGTTTCATACGCTAAGCTAAGCCTAAGTCTTGGTT:1 + chrX 7957143 3' - G7 716 1 61.82 CGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGTGGAGTGCATATATGTATAAGTTTGTGCGATTATAACGCATACGC:1 - chr2R 9741959 3' - Stalker 7021 6 59.57 TAGCTTTCGAACCTGATAACGATTCTTCAGACTCTGTGAATGATGTGCTCAAACTATAAACTTTTAATACAATAAAAAAATTACTACCTGAGTACTAGTGAAGTACTTAT:1 - chr3R 15748334 3' - hopper2 97 1 70.91 ACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGAAGGTAAAAGGAAGGTGAAAGCATAGACAAAGAAAGGGTTAAGTGCTTACTCATACTTTGTGGTTTATGGAATGCAAAAGCAAGGAA:1 + chr3L 3757035 3' + INE-1 160 1 52.73 ATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAACATCTCACCCTCA:1 + chr2L 3588614 3' + Tc3 283 1 71.82 TTCAGTGATTGGTTTAGAGTGACAAGTGCCGGTTTGTTTGAGGTATAAACAGGGGGGTTT:1 + chrX 10632611 3' + Bari1 270 1 66.67 ATATAGTCAAACTTAGTTAATAGTGAACAATGGCCACAAAGGACATGCAGGACACCATTCAAAGCTAGCCCCATAATCGCC:1 + chr2L 1260430 3' + looper1 319 1 69.14 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAGGATATTCCAACAGCGGTGG:1 - chr3L 5320585 3' - roo 8692 2 55.45 GGCATATATTGGTTTATTACAACACAAGTTGTCATCGATAAGCTGTGAAGCAAAGTGATACCTATTGATATGAACGTGACTAAATCAGACGCTCACAACTAC:1 - chrY 3286667 3' + blood 378 1 79.41 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTCTCGCTTTCTCTCGCTACTTT:1 + chr3L 3371225 3' - copia 4884 2 57.14 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTATATATTAGTTAAAATTTAAAAAGTAGACAAGCCCTTGACTCTTTCCACATAAAAAAAAATTATTTATTCATTA:1 + chr3L 16496791 3' - hobo 13 1 67.27 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAGAAAGCGTCTTACTAAGGCGGACGTATTCCCGGTGGATCAC:1 + chr2R 4606307 3' - 1360 17 1 64.55 CAAATATCAACCACAAAGAAAAAATAAAAAAACTCAACACAAAAATTGTTAGCCTTAAAGTTTAACCCTTTGCATTTGCTTTCTTTAGCTGGCTTTTCGCATCGTTTCAA:1 - chr2L 17442313 3' + I-element 99 1 67.27 AAGAGGAACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTTCGGAACCCTCCTCATCC:1 - chr3R 29037362 3' + Transpac 470 1 75.00 GTCGGGGAACTCGACTATGGCAATTTCTCTTGTTATTTGAATATGGAATGGAATATATTAAAATTTTTTTAAAGGTATTTGTTTACCTTTAAAATTAGATTTCA:1 - chrX 21387991 3' + INE-1 568 1 50.00 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCAAGTATAGGTTCGCTTGTTTCATTTTGTTAACTTTTTATTATTTGTTATTTT:1 + chr3L 17719076 3' + 297 6955 2 60.40 AAAGAAAAGAGAAGAAACGAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAAGAAAAGAAAATAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Penelope 651 1 42.20 AAAAAAAGGGAATGCTATAGTCAAGTTCCATGACTATCATCAGATACCTGTTACTCTAGTGGAAATGCATTTAAGTAAATTTGCACAAATTGCTCTTTGTTACGGCAGTG:1 - chr2L 19860980 3' - INE-1 580 1 61.82 ACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAAGGAAGCAAAAATAGACGAGCAAAAAATTAAGTGAGACAAAGTGTTTTG:1 - chr2L 16162940 3' + INE-1 35 1 51.38 GTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGTGGGAGGCAACCTAGTAGTTGTTGTAG:1 + chr3R 17155700 3' - TAHRE 10291 1 66.67 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTCAATATACTTTCAGTGTATGTGTTGACAGCTTTTGATTTTGTAATTAAATGATG:1 - chr2L 17334490 3' + copia 246 1 80.68 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATA:1 - chr2R 9871031 3' + roo 385 2 59.09 TCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTATACTTTTCATTCTGTGCCTGTTCTCTCCTGTTTGGTTTTTCTGCTTTTCTCCTGCCGGGCATGTTAATG:1 + chr2R 14126059 3' + 17.6 178 2 74.00 CAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCAATGCACGCACACAAACAGCTGGAACAGTGAAATAAACAA:1 + chr2L 3926685 3' + 1360 3158 1 66.36 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATAGTTGAAAGAGGCTAGGTG:1 - chr2L 6519828 3' - diver 5913 2 72.46 GATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAAGAACCTTCTGCGTGGAGGTAAACAATATTGGCGTCATCGGGTGGACGCCAAAGAAATAGAAAACCAAATAAAAAAATA:1 - chr3L 4411928 3' + 297 429 1 69.90 AATAAATAAAATAAATAATAAATAAATAATAATTTATTTAATAATTTAATAAATAATTTGTCGTGATGCATGTACTCGGAATCCGAGGCGACAAAAGGGCAT:1 - chr3R 25667850 3' + X-element 4716 1 52.94 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTAGGCCACGTTACATAAATAAATAAAAATTGAAAACTTGGAG:1 - chr3R 20415775 3' - F-element 14 1 56.72 TATTGATCCTGATCTAGAATATATGTACTTTATATGTTCAGAAAAGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATAATAAAGCAGAAATCATATGACT:1 - chr3R 18084398 3' - INE-1 84 1 72.73 GCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACTAATATTATTAGACCACAGAAGTTACCTCGATGCG:1 - chr3R 29998198 3' - 1360 91 1 57.83 TTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTTGTTAACTGACTTTTTTTCCCACCTGGGTAATTTCCGCTTAATTAGTGCAATGACAGTGACCAGCAG:1 + chr3R 10203074 3' - roo 8663 1 74.73 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATGATGTTAAGCAACTTGTGCTAAATTTGCTTTCCATGA:1 - chrX 20433333 3' - diver 5939 2 67.27 AGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTTCCATTAATGGGAACATATATCATACTTTAATTCATGTGACATAAATGTCAGATTTTTCTTAT:1 + chr3R 14862271 3' + Cr1a 4076 1 61.82 GGGTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTGTCTTGTCTTGTCTT:1 + chr2L 21768291 3' - Doc3-element 4500 1 66.67 TAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATATTAATTGTGTTTAAAAAGGACTTTGGTATTAGAGATTCGTGA:1 + chr3R 29362841 3' + F-element 4634 1 70.00 ATGGATATAGTGTGGGAAATGGCGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTGTTGGTCGGTGTTGCGTCTAT:1 + chr2R 1439621 3' - 297 6519 1 75.53 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATATGTGGATGTGAAGATGAGGAGGCCACTGCAGCGGACGTG:1 + chr3R 22800190 3' + Burdock 6367 2 59.78 ACTTGTGAAAAACACATTAATGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCAATAATTGTGTATCTATATATGTATATGTATGTGTAATTATTTCTCACATC:1 - chr3L 10506757 3' + hopper 1384 1 52.73 TGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGGGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGCCAAATGGGGAGGCGCAAGGATACACATGCACACAGAG:1 + chr2L 14037953 3' - 1360 3281 1 62.38 CGGCGCAATTAAAAGGGTAGTTAAGTGAAGTAAAAGAACCAACCAAGGGTACAATGTTTGGATGCTTGAGAGTTAGAAGTACTG:1 - chr3R 20642043 3' + invader2 331 1 53.57 TTAAATTTGTTTTAATTTTTGTAAACATGTTGGCATTCGGATATGTTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' + 1731 4267 1 33.94 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACAC:1 + chrX 9845519 3' - F-element 33 1 68.00 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTGAGGCAAATAAAAACACTGTTAAATATACATAAAAGTACATATTAAAATTGATTGAAATGCAGCGCTTACAGA:1 + chr3R 19058479 3' + Burdock 247 2 65.45 AAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCCTGCTTAAGCCCCTCATTTCGTCTCATTTCACTTGGGCTCTGC:1 - chr3R 8864477 3' + Idefix 6970 2 73.64 AATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGGAAAAGATAATCAAAAAGAGGAAATTAGAGAGTAGCGAAGAAGGATTAAAGTAGAG:1 - chrX 809581 3' + Stalker4 7060 4 70.59 TAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGATGATTTAGATAATTTCTTTATTTCGATATTTGCTGGTGGCCGCACGAATTTGAAATTTGATTTCTTTTGATTTGGCTTTGTG:1 + chr2L 5799227 3' - Circe 7101 1 77.27 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCCTCGGCCCCCATCCTCCCAAACTAT:1 + chr2L 9496422 3' - Tirant 8136 2 74.67 GATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGAAGTTCAAAAGCTTAGTTTCACGTAAAGATATTT:1 + chr3L 27365166 3' + flea 425 1 69.09 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTTTACATTCTCTTTTCCTAATCGCGTAT:1 - chr3L 738753 3' - Burdock 6211 2 75.45 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACA:1 - chr2L 16217660 3' - Tabor 6866 2 50.00 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCCCACCCACACGCGCTTTTCCTTCCACTTCACTTACAATTTGGAACAATTTCTACCACCCTCGCA:1 + chr2L 1291122 3' + 412 471 2 60.00 TAACGTATTTCCAATGTANNAATACTAAAATACTTCAAANTTGCATACTTGTGAAATTGCACGAAATGAGTTTATACCTTGGC:1 - chr3L 5253133 3' + hopper 1338 1 63.86 CTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAACTCGGCCATCCTGACTAGCTACTCCCCGCTGCATTTTCGTTTGATTT:1 - chr3L 14166084 3' - invader3 21 2 70.00 CGCATACAGTGGTAGCAGACAGCTGTATGAGTGCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCGTTTTTGAAATTTATTTTGGGATATT:1 - chr3L 4379006 3' + 1360 152 1 67.89 AATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTGTTTCCAAAAGGACAAACATTTTTGCATTTCTCACAGTTCGTGTTGTTGGCTTTCCTTTTACTTTCGTGTCTGCATTCTGA:1 - chr2L 7199409 3' - baggins 5037 1 59.09 GCAGTAAAAGTAACATAACAGCGCAATCAACATATAAAAGATCAAGAAACACATTGATCGCCAATACTAATAACTTGTGTTTAA:1 - chrX 17143784 3' - BS 5050 1 88.10 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCGCAGAGCCCTATAGTGTCAAGCGGGCTA:1 - chr2L 16742231 3' - 412 7082 2 54.55 TGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGGGTTCGATCGCGACTGAAATCATATACATATGAAAATGAATATTTATTATATGTATATGGAAAAATGTTGAA:1 - chrX 16243795 3' - G6 28 1 50.48 ATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCATGCGTTTCAACTTGCCAAATTACTC:1 + chr2R 23754581 3' - mdg1 7439 2 76.36 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGAAGTCAAAGTCTCGCCCGACCATAGTTTCTTATTGGATTTCAAACCAGTCGCTTCGTGCACGCGGCGTTCGACTA:1 + chr3L 131844 3' - P-element 9 2 75.45 CCATATCAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAGTCGGGCGTGTCCATCCAAA:1 + chr2L 14034869 3' + Idefix 7232 2 73.91 TTGTTTATTGAAATCAACACTTTTGTTTTTCGGGATGCGAGTCCGAGCTTTGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGAATGTTTTAATTTATTTAGTTAAAAAATTGCGCTTACG:1 + chrX 130802 3' - Idefix 7106 2 78.18 CGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCATATGCTGAACCTTTTCCCCTGCTGTCACCG:1 + chr3R 12040229 3' + HMS-Beagle 7024 2 61.76 TAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTCACCTTTTTCAACCCCATCGTCTGCACCTCATTTGCTATATAACTCGCCTTTGCTTCGCTTCAAC:1 - chr3R 10942091 3' - F-element 4229 1 70.71 CAAGCCCTGCACCACCAAGCTCCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAAAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACTATTTAAATTAAACACCCGTTTTAAA:1 - chr2R 8625240 3' + G2 24 1 76.36 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCACGTACAAGTTTAATGGGAGTTCCCGCAACTTAAATTAGAATTTTTGTTTTCCTCATTG:1 - chr3R 13502973 3' - hopper 17 1 62.00 GGAATCCCTTATGTTAAAAAAGAAATTGCTGAGGACAGCTCAATAAAAACTACAAACGATTTGCGCGTGCCATCTCGACAGGGATAA:1 - chr2L 2016346 3' + G4 3567 1 74.71 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGCATTAAAAATTGATGAACTACAAGGTAGATTGGAGCAT:1 - chr2R 10090986 3' + roo 395 1 67.89 CTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAAGTAAAGAAAATCAAGAGGCGTTGCTGTGTGAACAGCAAAG:1 - chr3L 20607466 3' - hopper 1219 1 58.59 GAGATCTCAGGAACTATACAATCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGAAATACCCGCAGCTCAATCAGTGTATTCATCTTCCTGCGTCCCATTGCCTTT:1 - chrX 11243261 3' + INE-1 148 1 64.22 TTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGTGTTTGCCCCCC:1 - chr2L 16500456 3' - G2 3077 4 79.41 ACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCTGTCGCAATGGCGCCCAGTGCAAGGAGCTCTGGAGCAGCTTTAAGTGCGTCTG:1 - chr3L 4650978 3' + jockey 4590 1 55.45 CATATACTTACACACACACACACACATACATAACCACCATCAATGATGTCATTCACTGCGAGCCATCGAGTCACATGTTCCGATTTGGATGTGCGCGCGAAAGA:1 + chr3R 21151325 3' + Quasimodo 30 2 64.42 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATATATATAAGCTTGTGAGCTATACCTTAACTTTATTTTTATGTATATTTATTTGAGCTACACACCCAGTG:1 + chr2L 2484436 3' + jockey 4975 1 55.14 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTCAGCTTTTTGGTATGTTTTGTAAATTTTTTATTACAATTATCTTTGCCTTTGGCTG:1 + chr3L 5971762 3' - pogo 7 1 68.89 AGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 204 1 47.06 CATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGTACAACCAAAAGTTTTTGTGTATCTTTATATGTATGTATTTTAATTATAATTA:1 + chr2R 2916923 3' - gypsy 7017 2 53.64 GAAATGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGACAATGTGGTTATTACATCATACATATGTTTTACCTTACGTATACATA:1 - chrX 13283459 3' - 1360 463 1 57.27 AGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGA:1 - chr2R 12185325 3' + accord 7372 2 53.41 TGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTT:1 + chr2R 330216 3' - HMS-Beagle2 6890 2 69.57 TACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCCAAGATTTGGTGCGTATTCTGGTTGCTTTGGCAATGAGAAAGCCTTTTGAGG:1 + chr3L 11839365 3' - accord 6917 2 53.92 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATAACATATGTATATATAGCTATGCAAACGTCTGACAAAAATTTAAATACATTTGGCAAGGGCATGAAAACAAC:1 - chr3R 11549787 3' - 297 6588 2 75.45 GCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCACAACTAAGTGAACTACAATTATAACAGTTAAACTAAGTGAAAACCAAATAA:1 + chr3R 2301829 3' - 1360 42 1 55.45 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAGAAAGCGTATTACTAAGGC:1 + chr2R 4606285 3' - 1360 37 1 59.26 ACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAACACACCAAGCATACGCCACGTTGCACTTGC:1 + chr3L 2630383 3' - Rt1b 5091 1 71.15 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTAGAGAGCATCGAAGCGATCCCCTCTATATGGAGTGGAAAGGCATATG:1 - chr3R 27403690 3' - hobo 24 1 52.13 GTTTTTAGTTTTTTGTATAACAAGAGAAATTAAGTTATAAAATTTTAAGGACTATGCGCAGTTTAATTTCCAAATACCATGCCACCGCCAACCGTACCACCAAGACACAC:1 - chr3R 22979307 3' - Juan 4076 1 81.82 AATTAATAAGGCAATGATTGCTGAGACCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATTTTTTCTATTGTTTTTCCTTTTTAATTTATTACATATTTTTGGCTTTCTTTTC:1 + chrX 3745080 3' + 1360 442 1 60.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTGTTTCTTGATTTTAAATGGGTTGCATTTGTATATCAGTTTTTTTTCCTACTTAAAT:1 - chr3R 13481160 3' + roo 9043 1 56.36 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTACGCACAAGCAGCTACAATTTGTTGCCTACTTTCGGGCGCTCCAT:1 - chr3L 10702620 3' + hopper 1410 2 63.64 AGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACACATAAATACATAAATACATACATAAGACTGGGTGTTTGGTCCGCAGATGCGTGTTAGATTGTTGATGTGCAAA:1 + chr2L 11231925 3' + copia 246 1 57.27 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATTAATTTGTGTACGCGCCGCCGT:1 + chr3R 10964637 3' + I-element 5309 1 75.28 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGGTCGTCCTTAACCTTTTGCAGTGCAAGCCTTGATACGGTGCACATGACG:1 + chr2L 18675689 3' - 412 36 2 54.55 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTATATCCCACGCACTTTGTAGAGTGACAAAATCCGGAAACAACAAGCGACAGGCAGCGGGCACTCATCTTCAATGCATA:1 + chr3R 18851098 3' - flea 4758 1 76.36 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTATCTCCTTCTAATGTTGAACGTATTGACTGATCTGCCATAGCTGAGCTCTGATA:1 + chr3L 12677150 3' + pogo 2096 1 68.89 ACATGCCTACATACTAATACACTAATACACTAATACCAATACAATTGTCTGGCCATTGGGGTAGTACTAAAACGCTAGCTGGATCAACTTGACATGCAGAACGTTGGAAA:1 + chr3L 8580076 3' + Idefix 33 2 69.09 TTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTATTGCACAAATGTTGCCCGCGGAGG:1 - chrX 4903165 3' + 1360 3171 1 81.82 AATGAACGCACACACACACACACACACAGATACCCCAAAATCCTCATAATCTAGCTGAGGTTCCACCGCTTCACGATCTTCACCCTGGCCAACATACCTC:1 - chr2L 5597100 3' + accord 180 2 68.00 AAATCAAATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCATATGCTGAACCTTTTCC:1 + chr3R 12040216 3' + HMS-Beagle 237 2 62.50 GAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAGATTATTATTAAAAAGCGCCATGGGTTATATTATATAGAGAGTCAGTGGAAAAAAGAACTTAACACA:1 - chr2R 23933421 3' + invader2 407 1 53.92 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTAGTTGTCTAGTGTTTTTTTGTTCTCATAAAGCAAGACAATCGGTCAAAATAAAATATTAACAACATTGAAAAA:1 - chr3L 14396955 3' - BS 5008 1 57.27 AAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATCAAGAAGATTCCACCAAATTTCCCATAGTCTCTGGATTACACTTATATGTACTCCCGATCTTTTTATTCT:1 - chr3R 15309307 3' + HMS-Beagle2 7183 2 65.74 ACCCGGATCACAATAGGTCTGCATTGTCACACTATTGCCGGAAGTTTTATTCAACCTTCGTACCCTTCGTCAACCTTTGACGCTGATTGTTCTTGGAACATCATCCCAT:1 - chrX 14706369 3' - flea 4708 1 80.73 TGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGGTGTGTGTGCCTGTGTGTGTTTCGAGGGTTTTCGAGCTGCATTCGCTCCTGGAAGCACACTCGAAAT:1 + chr3R 18960772 3' + Stalker 445 1 70.33 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATATTGGCCTAATGGCAACGACAATAATAGACATAAAAAACAATGACAACTCCTCTCAGAAAAGAAGA:1 + chr2L 4016937 3' + opus 485 2 65.71 AGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGACTGCAGCGAGGGATCCCCCCTTGCAGGCCACCACCACCATTTTTAAGTCGCACATGGCATGTGAC:1 - chr2R 19213521 3' + Gypsy6A_LTR 272 1 66.67 TGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCATACATTTTTTAAAGTGAATATATATGCCGGCATGTTGTAGTTGCATATTTGTTGCATA:1 - chrX 13495494 3' - Max-element 28 2 56.36 TTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTCACACATGAG:1 - chr2R 1320696 3' + diver2 343 2 48.89 AATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTATGTTTTTGTCCATTGTCAGGAGTGGAAGGGTAG:1 + chr3R 18634276 3' - TAHRE 10397 1 73.39 TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAAGTCAGTGGGCTAAAATGGTATGAAGTGGCCTGGAAGGGCGGGTTCCGTCGG:1 + chr2L 15894615 3' - BS 5077 1 64.94 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATATAATAATAT:1 - chr2L 15490094 3' + roo 9036 1 58.18 CGAAGACCACCACGAGGATCTACCGACTGACCAACAGATAATCGTTTATTTTTCAGATAACTGATAACTATTTAAATAAAAGGCCACATTCAAATATTCCATCCCAGTTA:1 + chr2L 1443306 3' + Chimpo 4132 1 69.09 TGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACCTAATCTCCATAAACAAATCGACAAGTGGAAGGCAAACACAGGAAATGAA:1 + chr3R 15153510 3' + gypsy 7328 2 60.92 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGCGTTTCTAGCGGG:1 - chr3R 23943216 3' + P-element 2849 1 26.92 AAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAGATAAATAATTGAAAAACAAATGGAAAAAGAGCGAGAGACACACACGAGCGCCAAAGCACTGAAATAAA:1 - chr2R 21531929 3' - Circe 7113 1 60.00 TTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGCTTATTCTGAAATTCCCCGGTGGCGAAATCGACTCAAACGAACTTTTAGAGGAAATAATA:1 + chrX 16560675 3' + S-element 1703 1 67.31 TGTGTGTGTGTATGTGTTCGTGGGTAAGGGAATGCCTTGGCTGATAA:1 - chrX 14979268 3' - accord 180 2 59.57 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTAAAATTACCCCCGCTTTTAAATCAACTAATATGTTTATTCAATCTAA:1 + chr3R 17777664 3' + Burdock 237 2 58.95 TTTACAATAAGCATATATGAAAATTTCTAGGAGAAGGAGAAGAAGAAGCAGAAGCAAAAGATGGGGGATATGTCATTGTACTGTTGTTCTCATGCCTGTCCATGACGTT:1 - chr2R 13336626 3' + TLD2_LTR 119 1 74.31 TTCCACTCCGCACGTGTTGTTCAGCTTCAGACTAGTCTAATGGC:1 - chr2R 15979041 3' + R1A1-element 167 1 68.18 GGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCGCACCTACAACTGCAAGATTTTCCTTGAATACTCTCGA:1 + chr2L 21716403 3' + blood 280 2 75.51 AAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATATTCAAAAAGGAAAAGTAAATGGAAAACGGCAAGGAAAATGCACACAACAAAGGCAAAACGCTGATGACGTTGACGACGA:1 - chr3L 21883100 3' + invader2 466 1 65.14 CGCAACAATGTGTTTCGTTTTAATTTTAGCTCTTCATTTTAATTCTTGTATTCGTATATTTAATTCTTTTCGTAATCGCACACGTCCGCTTTG:1 - chr3R 13338093 3' + gypsy2 140 2 74.19 AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATATTCGTTTTAGACATCTCTATGTGTATACATATGTACATA:1 + chr2L 4916780 3' + S-element 1677 1 65.14 CGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGCACCCCGGCTTTCTGTGCCAAATTGCTGGCGTGTCGGAGC:1 + chr2L 17854236 3' - F-element 4403 1 56.99 TAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCCATAAAGATGCCAAATATTTACATAAAATTCCA:1 + chr3L 19948932 3' - 3S18 5790 2 55.96 AAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGCCATCGCAGGGAGGAGAGGGCGGGGCGTTTAGGAAA:1 - chr2R 6138711 3' - G2 2994 1 67.27 TACCTGGTTAGTCGCGTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGGCGTCTCGACGGCCATTGACAAAGTTTTGTTTTCCAAAAACCCGAGGAGAAAATTGC:1 + chr3L 3984176 3' - G5 4485 1 58.33 TATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGAGAGAGTAAACAAAAAACAAAGACAAAAAATTTAGAAGCAGCGGACATGCCTTTGCCCACTTTG:1 - chr3L 18445897 3' - Cr1a 250 1 70.00 TCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTGTAATAAATTGTTGCAATTTGGAGTATCTTTATTAAAGTTTTTTTTTTGTTG:1 + chrX 12890643 3' - I-element 351 1 53.64 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGAACAATCGCCAAATATGTAATAATGAAATCGAACCTAACGACTTCAAAGACCAACTAAAAACGCATAATATATATA:1 + chrX 17456139 3' - jockey 4685 1 67.27 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTTTCTCAATTGAGTCTGCCCAACCACCGAGACCTTG:1 - chrX 507373 3' + roo 8997 2 75.45 CTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAATATTAGGGGTATGCAGTTTCAAGTTTAAATTTAGTCACAGACTAGA:1 - chr3R 27068708 3' - Cr1a 4170 1 75.56 TGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGAAGTGCCAGGCAATTATGGATTTCGCAGATCCAGGGGCGTTAAGTGTGACTAAATCGCTTTGATTGATTATCT:1 - chr3L 3346955 3' - I-element 207 1 71.03 GTACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTTAGAACCCTAGATTTTGTGAGGCCATCCTCAAGTGTAATTAGAGTGCTTCGGAATGGGCAAAGTTAATTCAATGAACAGCTTC:1 + chr2L 6025699 3' - Cr1a 346 1 66.36 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATTTATATATATACTTGCAAAATACCTGAAATATTTCAGCAGCAGCTATGACGGTGGCTCCAA:1 + chrX 711835 3' + 297 6958 2 66.06 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTGACATTTATAAGACCTTTAATGGTCTTCTTTATACA:1 + chr3R 18202283 3' - jockey 4703 1 64.13 CTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCCCTCTCTCCACCGATGTTGCTCTCCAGTTTCATCCCCGTCAAATTTGGTTTAGTATTTTCGTTTTTCTTCGTGTTCGTTTGGCTGTCGA:1 - chr3R 14282808 3' + Cr1a 298 1 57.27 ACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAA:1 + chr2L 21570267 3' - Dm88 24 2 62.73 TTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAACACAAAAAAAAAAACAAGAAATGCTTATATA:1 - chr3R 6894514 3' + Doc 4638 1 81.52 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACACCAGTGTTTATGTGATCTACATACTCCCTCCCACTTCTCACTTCATTTTTGGATTTA:1 + chr3R 14013426 3' + roo 9040 1 51.82 TATTGATAATTAAACAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCCGTTTACCTTCTCCATTATCCATTCTACGTGTGTGTTTGATGTTTGGGCTGCGT:1 - chr2R 21594401 3' + Tc1-2 87 1 69.09 AGAGTTTGCCAGGCTGGTGGCCCTGCTTTGCGTGCTGCCACTTCCGGAAAGTCATTGCTGG:1 - chr2R 15845374 3' + baggins 244 1 77.05 AACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGAAA:1 - chr2R 330147 3' + HMS-Beagle2 267 2 75.26 AGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAAGAAAAAAGAGAGAAGAAAGCAGAAAAAAGTAAACCAGGGCAAAAGAAAAAAAACACGTTCCCACGCCAAAA:1 - chr3L 2590120 3' + TAHRE 267 1 70.41 CTACCTAGCCACCAAAACTAAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAGCGCAGAGCTCCAACCAATATCATTATCAAGTGCGTCAAACG:1 + chr3R 26952432 3' + Porto1 4465 1 75.45 AGATAACGGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATAAAATAGTATCGGTTAAGCCAGATTCGAGAGGCT:1 + chr3R 24063369 3' - Bari1 1554 1 56.00 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGCCAAGCAAACGGCGCCCGAAAGTATGCTAAATAGAAT:1 - chr3R 21993223 3' + jockey 4946 1 67.29 ATGGGAGGTAAGAGAGGGCGTGGTCGGACAGAGACAATGATATAGGGATAGAAAGAGAGATACATATACATACATATATGGACAATTACACGCTAC:1 + chr3R 8072582 3' + transib2 2698 1 66.67 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAAAAGCCAAAAGCAAAAAGACAGAAGTAAAAGCGTGGGCT:1 + chr3L 17405755 3' - roo 8708 2 67.27 TTTCGATTACCTTGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGACGTGCAGCTCTCGACTTAACCCCGAGACCCCATGAACTTAAGGCTTACACTTT:1 + chr2L 1944031 3' - G5 4492 1 63.00 AATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGATGAATGACAGCTGACATAGAGACAAAAGTGTGTGTGACACAGTCACATTCTACTCTAAAAT:1 - chr2L 14046018 3' - Tirant 86 2 57.27 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTAAGTGCTCGTTTGCTTGTATAAAGTAAAGTTTTCGTCAAAGTTGGAG:1 + chrX 22489699 3' + S-element 1681 2 58.18 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAAAATCATACTTTTATTCATCTGCATATAGC:1 - chr2L 21734983 3' - Doc 26 1 60.91 CAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGACCGACAGCCCGGCAAACCGGTCCAGATGGTTG:1 - chr2L 5593657 3' + F-element 403 1 71.23 TGCGTTTCTCTTGGATTCAATTGCATTTGCTCTTGGATACAAGCGCTCTTAGATGAGGTGGAATTTGATTTATATTTAATACACGCTGAGAGAGTGAGTTTATAGTTATT:1 - chr2L 22685984 3' - Idefix 352 2 57.27 TTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGG:1 + chrX 21667927 3' - gypsy2 6531 2 61.82 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGGCTGATAATTAGCAACTGAAATATCGTTCAAAA:1 - chr2L 16445265 3' - 1360 204 1 68.57 GAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGTCTACGCCTATCGTTTGTTAAATATGGACTGCGATCTTAGTGTCAATCTGGAGTTAATAGATATCT:1 + chrX 7765537 3' - F-element 355 1 65.45 CTAAATAATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTAAAATGTGTTGGACTTAAGAGGCGT:1 - chr4 203883 3' + FB 795 6 79.52 TATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGGATGTGAATATGTCACTATATACCTAAAATAAATGTTGCGAAATGTCTTAGCTTCA:1 + chrX 23280396 3' - 17.6 6966 2 70.71 AGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACAGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGCACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATT:1 - chr3L 23456278 3' + gtwin 430 2 62.04 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTAAAATTATGCCACATCAATGCTG:1 + chr2R 13345952 3' - jockey 29 1 64.29 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATATATCATATATAAATGTAAATTTTGTTGTTTCGAAAAAGGGGGA:1 - chrX 19187297 3' - Transpac 37 2 68.18 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTTGCGTTTTCATTTTTTCATCTCCTATATAGCATATTTCTTTGCGCTCAATTTCCTGTATTTTGTTGCCGTCG:1 + chr3L 19347247 3' + jockey 4973 1 66.36 TAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGACAAGATAAGACAAGATAAGACAAGATAAGACAAGATAAGACAATACAATACAATACAATA:1 - chrX 12946234 3' + Stalker3T 202 1 75.00 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAG:1 + chr2R 13699480 3' - jockey 4796 1 55.45 ATCAAATTATAAGAATCTAACAGCACTTGTACCCAAGATCGAAAGCACTTGAATCCAAGAGCAATGCAAAGGCCAGAAGTTCTATGAGAGTGGAATACT:1 + chr4 1172188 3' + Idefix 7123 2 73.74 GTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACTTATTGATTGAGCAGCTCAACAAAATGGCCATAAAGCAGCTAATCCATG:1 - chr3L 21341874 3' - Bica 100 1 55.45 CACACGTCGGCGATCGAATTGAATATTGAGCAACAATAAAGTTTTGGCCACACAGCACACAAGAAATAAAGAATGGAGACAGAAGCGACAACCCAAAAGGAAAGA:1 + chrX 9845571 3' - F-element 11 1 77.14 GGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCACCACCAACAACATCACCAGCATCGTCATCATCG:1 + chr3R 25003950 3' - R2-element 3529 1 69.44 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTGTGACTCTTAAAGTTAGATCAATTTTTGCATTT:1 - chr2R 8086805 3' + 1360 3350 1 72.04 TTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATACAGATACAGATATCTATATAGTCATGTGGTTAAGGGGTTACGCATGGCGAGATAT:1 - chrX 17837956 3' + S-element 1703 1 62.11 TGAACGAAATTGGATGTTCGACCCTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGTATGGAGATTTCGTACTTATCTTAATACAATACAATACAATACAATACA:1 - chr3L 21448027 3' - GATE 386 1 74.75 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCTTGTCTTGTCTTTTCTTGTCTTGTCTTGTCTT:1 + chr2L 21768291 3' - mdg1 18 2 58.11 TTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAGCAATGCCGCATTCTTTCTGTTTGCCTGTTCTTTTTTGTTAGTTGAGCCCCTT:1 - chrX 1975392 3' - R2-element 3337 1 54.29 AAATTCCAAGTTTGCACACTTTTGAGACTATATATAAACGTTAGAACATCACACAGATTTAAATACTTATGCATGCAAAAGCATATGCAAAAACCGTGGCTTTTATGAAA:1 + chr3R 11957316 3' - S-element 1530 1 51.82 AAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAACTTATAACTAAGTCAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCACGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACA:1 + chr2R 1234687 3' + invader2 4761 1 51.82 TTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAGCAGCACAAAAATAGAATCTGAAAATGGAAAAACTACGTTCCTATGAGGATTTCATCTTCATGGCCAACA:1 + chr2R 12393507 3' + Porto1 4419 1 72.34 CCCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGGTCAATAACCACAACAAATTCAAAACCGGATTGGAAGAGAAACGCTGGTCACCTGTGAGGAAAGCCCCCA:1 + chr2L 14712523 3' + Tc1-2 1171 1 75.00 TTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTCTTGTCTTGTCTT:1 - chrX 2912172 3' - gypsy7 5004 1 63.27 AAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACACGCAAATGTACGTAATAAAATAACTTAATACTTGAAATATAAACGATTCGAAACTTTATTTTTGACACAA:1 - chr3R 23932697 3' + I-element 5167 1 53.21 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTCTTGGTCTAATTGCCCGCGGCGG:1 + chr2L 4291369 3' + P-element 2857 1 36.49 GTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTGGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATATTACATAATAGTTTTTGAGTGTTGCATATTGAATCATTACTTATG:1 - chr3R 1541568 3' - I-element 5324 1 61.82 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACGGTATAACATGTATGTTTAATAAATGAATTCAAGGAGTTATATGCCAGT:1 + chrX 4789223 3' - opus 140 4 56.36 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTCTGGGGTTTGGGTTGAAAACTTGCAGCAGCCAAGCAAATCAGTTCACGTCGTTGAAAAGAATCTCAGCAAAC:1 + chr3R 9126571 3' - Tirant 39 2 70.00 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAAGTCTAGAGGGGTTTTTTGCCTTTACAAAGAGCCATATTAAAAGCATAAATAAATTTGAACTTGCAACACCTACTGCCTGGCG:1 - chr3R 13544006 3' + Tc3 312 1 42.59 GTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTATGCATTTAAACGACTCTATTTACCACACAATGGCTGCCAAACAACAACA:1 + chr2R 15652544 3' - accord 207 2 69.15 CGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCTGTCACGAGAATTCCAAACTACTTTTGAATAATTTCATTTATTTATG:1 - chr3R 6125516 3' - micropia 419 2 62.73 TATTATGTTCGTATATACTACATTATCCCTAAAATTCCAAAGGAAAAGCATTTTGTATGCCTTTCTTATTTACGATGAACTCAAATTAGTTGAATGTGGTTGCTTACATT:1 + chr2R 20924323 3' - mdg1 1 2 80.00 ACATCAGTTATTAGTATTGGGCTCAAGTTGGCACAAACCATTTCTCACTCCACAATAGACGACAACACACAACACAATTTACCTATTTTTTTTTATGTA:1 + chr3R 17928014 3' - transib3 438 1 76.77 TAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAATCATTTCGTTTTCGCATAAATCAAACAGGAGTTGCG:1 - chr3R 13351758 3' - 17.6 270 2 64.42 GGATAACACAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGTCGGCGTAACGTTTTCTGACGCGTTTACTTCGGG:1 + chr2L 22490490 3' - Dm88 4458 2 54.79 TTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAACACACACAAGCAGTATGTGTGTATTTTGTATCATTCCCCATTTCCATCAGTAAACAGGCACAA:1 + chr3R 14357370 3' + Rt1b 5132 1 68.89 AAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCAATCTACACCACTCTGGCCACCACAACTCCCTCAAC:1 + chr2R 18792498 3' + G2 2708 1 60.67 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATCGTTTACCTTGGACTCCTTCATGCTGAC:1 + chrX 21386417 3' + Burdock 237 2 73.33 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGCTCGTTTAAATTATCCG:1 - chr2L 23372627 3' + 1360 3353 1 67.68 GGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATATATAGGGACTATATAGAGCAGGAAACGACTCCATCTGTTTTACGT:1 + chr3R 7436628 3' - springer 38 2 62.73 CATATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCACTTATTTGGTACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chr3L 11720529 3' + Ivk 5144 1 58.18 TGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATAACGATGCCATAATTTAATCTTGAGCTTAAACT:1 + chr3L 3611813 3' + blood 7376 2 70.00 CTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTCTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATGTGACTGTAATCTAAATCCGGCGA:1 - chr3L 8000526 3' + F-element 4520 1 77.00 TGAGTAATAGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATATTTCTACCAAATCATTTTGCTATTTATTTTTTCCACCGATGTAATTGTGCAATCAACACATTTTCATAATCG:1 + chr3L 10039873 3' - Copia1_DM 77 1 70.91 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCAATTAGCAGCGATTATAGCAGCAGCATTTTAGCAAAAGCAACACTGGCAGCCACA:1 + chr3R 29635282 3' - mdg1 19 2 59.60 AAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAAATATAAGGCATAAGTAGATGGATGAGTGGCTG:1 - chr3L 5261023 3' + Stalker3T 203 1 60.00 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGTCCCCAGAGAAAGAGAAAGCATTTACAACTTTCTTTGCCGCGCACGAA:1 - chr2R 11379726 3' - jockey 4685 1 58.02 CATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACTCCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCTCATGATCTACAACACACCATGACCT:1 + chr2L 20295948 3' + I-element 5062 1 73.74 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCCGGAATGAACCGGAACAATATAAAAAGTAAAATTATTCTCTGTGCATCAATGCG:1 + chr3R 26398927 3' - Doc 29 1 51.92 GGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCCTGGGCTACACTGAAGGAAGGGAGGGCGGGGACAACACAACACAACACAACACAACA:1 + chr3R 21907535 3' + Rt1b 4882 1 63.37 GCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTATTTTTTTATTATAATTTCTTCTTTGTTTTTATTTATTAAAGTTTTCCGACAGTTTTCAGGTTATAATCTCTTATAATTTTAAA:1 - chr3R 558311 3' + Cr1a 4 1 78.18 GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACTCTGCCAAAATTCGCCCTCCATTAATATCCCATTGAAGTTGCAAC:1 - chrX 16996545 3' - Quasimodo 54 2 59.09 TTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCAGCCACACCCACTTCCGGTGTTTGTCCAGGTAAAGCTGGGGGCCAAAACGCAAACCGCAACAACCGCCA:1 - chr3L 10599473 3' + F-element 15 1 66.67 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTGACGTTTAAAATAAATTTCTCGGCCAAGAGAGCGG:1 + chr3L 17490714 3' + roo 356 2 73.64 TGTATTTATTTTATTTTATTAAAGTAAACCCATATGCGTTTTATTTATTTGGCTAAAAGCAACAGTTTCGTGGCATTGGAGGTGGTT:1 + chr2L 19840610 3' - Doc3-element 74 1 57.47 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGAATTGAGCTTGAATTTACTTCGCAATTTATACATGAAAAGACATAACGCAC:1 + chr3L 20039863 3' - Doc 29 1 51.00 AAACCAATATGGACATATAGATGTCAACTATGGGCCACTGCATGCAACAGCAACATTGAAATAATACAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAA:1 + chr2R 21358403 3' + Doc4-element 2590 1 66.36 CCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTATAGAGCACTAAGCTTCAATACGCTTGCACG:1 + chr3L 22756426 3' + G2 2864 1 64.77 GTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTT:1 + chr2R 6984378 3' + HMS-Beagle2 7140 2 77.78 ATCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAATCCACCTACACTAACTAAATCCAAACTCATTGCGGCATAAAGGCCATTTCCTGTCCTTGCC:1 + chr2R 21209397 3' + I-element 4923 1 70.91 AAAATTTCGCTTTTTTCAAAATTTTTTTTTTTAAATCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTGTCGTACATCCGGTATCCCAGCTATTTCCGGGTGAAGC:1 + chr2L 19837074 3' + FB 164 1 65.45 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCACGACAGTCCGTCGTTCAATGTTCTCCTGTA:1 + chr2R 15969244 3' - jockey 4814 1 68.42 ATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTACATAAAACGAAAGACCACCGAATAGGACATAGC:1 + chr3L 11452744 3' + accord 7297 2 67.00 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCG:1 - chrX 4789124 3' + opus 7489 2 65.62 GGCAATGCGCGCACACGATTCCACCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTCAAACTTTCCTCCCATTCTAGAACTGTCCGCTCCCGAAAGCATTCGATTTGGGTCGCTGTT:1 + chr3L 21642211 3' + gypsy12 9924 2 77.27 ACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAAGAGGGAAAAAATAGGAGGGGATAACGATTGTCAAACAA:1 - chr3L 14442272 3' + 1360 3216 1 65.14 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATATATGTTTTCTTACCCAATCCGAGTCCAATAGCTACGATTAGA:1 + chr3R 28639984 3' + mdg1 7438 2 53.26 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAAAATTATTAATGTTAT:1 - chr3L 99149 3' + Tabor 7318 2 26.92 CCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTTCTTGTAAAAGCTGCTGACCA:1 - chr3L 20936887 3' - Stalker 7024 4 75.00 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAACTTGCTTGGCGCCATTGAA:1 - chr2L 18694031 3' + pogo 2074 1 73.33 TTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGGGCTATTTTTGCCATCAATTGATTTCAATTCAACTTGAATCTATATATTGAAGGGACTTTCTATAACATTGAAAAACTA:1 + chr2L 18570577 3' - FB 6 1 72.55 TATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCAATTAACTCCTATTATACAGATGAAATTAACATAATGAATATTTATAATATGTTCATGTTTAGTTCATTCTAAT:1 - chr2L 17896456 3' - Porto1 4217 1 68.18 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATCTGCGCCATATGCGATAGATAGCCAGGGGCAGTGCGTTTC:1 + chr3R 14703955 3' + 297 354 2 60.55 CAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTTCAAATATACATACTATGCGAGTGTGCTCATGGGGAAACAGGAATTGGACTG:1 + chr2L 8628742 3' - 1360 248 1 59.26 CAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCAACTGGAGATGGAAGTGGAAGTCATTAATATCGATATACAAGAAGTACAATAACAGTAAGTTATTACCTATTTT:1 + chr2L 19185775 3' + 1360 3301 1 70.64 TTCGTTTACCCACCCTTAAAAATAAATAATTTTGATTGCCCACCCCTTACAACATATCCGCTATGGAGCCGAAGTGCTGCTCCTGGCA:1 - chrX 19026017 3' + FB 865 2 55.68 TGTTAAAAAAGAAATAGCAAAACATAGTAAAAAAAAATATATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGCAAATAATAATAACAAAGGAGAACAAGGGTGAACCGCGCATCA:1 - chr3R 4913133 3' + G4 3578 1 77.27 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGCGTCAGATTGACCGCATCTGCT:1 + chr3R 24813993 3' + P-element 2827 1 25.69 GACCAGGATCAATAGCCGAGTCGACCTGGCTGTGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTCGAAATATCAGGGAAGAGGGAAACAAACGGAAGGCAAATGCAA:1 + chr3R 7396744 3' + INE-1 92 1 73.47 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGATCAGAGTAATGTGCTTATATATGAGGCTGCAGCTGGTT:1 + chr3L 15968238 3' + P-element 2883 2 61.54 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATCAATTATTGGCCAAGTCTTTGTGCTATTTATGAGAGGCGG:1 - chr3R 29635205 3' + mdg1 7436 2 58.43 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGCTTCTCTTATCGCTCGAATTCAGATCCGTTGCATAGATAAACTCTATGA:1 - chr2L 493995 3' - roo 8678 2 61.80 AAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGGATCAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 203 1 54.55 AAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGGTGGTTTTGTTTAAAAAAAAAATAA:1 - chrX 8607581 3' + hobo 450 1 50.98 ACAATGCAGTAATAGTAACATAACAGCGCAATTAACAAGAAAATGATTAAACTAAACCTCGTACTAAAATGTAAATGAAGAGAACGAACCCCTGTCTCTCCAAAATGCCG:1 + chr3L 12789486 3' - BS 5055 1 64.55 ATAATGTTAATTGTTATATTTGTATTATAGTTTTGTACAGCTACCTCTTGTTTGCCGGCGCGTGCTAGCATATTTATTGCGTTTAGTGTTTCCCAAAGTC:1 - chr2L 8350805 3' + BS3 1641 1 68.00 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACTGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCA:1 + chr3L 22744693 3' - FB 45 1 73.47 GCCGAATATATTAATTTGCGTCCTCCGATTTTGTATACTAGCTCCTATATTCTTTTTTCGCAAGCACTCTCACTCTCACGTTTTGCACTTTTGCGGAAAATTCTGTCTGT:1 + chrX 9933565 3' + Gypsy12A_LTR 2052 1 65.45 ATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGGGCGTTTAGCCTGAGTACATTG:1 + chr2R 19405949 3' + HMS-Beagle 188 2 77.27 TATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATGTTCTCATACCTAAATTGTTTTCTCTAGTATGTTTGGCTAGTTTGTTCTAAAGTTGCTGTTGT:1 + chr3R 21907271 3' - I-element 4919 1 75.00 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTAGGTCGTCCTTAACCTTTTGCAGTGCAAGCCTTGATACGGTGCACATGACGTCGGCGTGTT:1 + chr2L 18675699 3' - 412 7079 2 55.45 TAAAGGAGTCGTCAAAGAGTCAAATAGCAATCAAAACCAAAAATTTAATTTTCTTAGTCCAGAAGGCATTCTGTCATGTTGCGAACCCTCGTAATTAGTTTGTTTACATA:1 + chr2L 3644814 3' + Tabor 361 2 83.64 GCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTTTGCTATTGCCAGTGCCACAATGAACGCCTTGACTGAATGTCAAG:1 - chr3L 4375793 3' - F-element 4255 1 57.14 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAACCAATCTACATGTGTAGAAATTAAGCTGACAAATTGTATTGGATTAGGCTAATGAAACGAAACTGACGCCGAG:1 - chr2L 18181019 3' - hobo 8 1 70.19 TTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAACTACGAAGGTGTAAAACAACAATAGAAATCGTCGCAGCTAAGTTTTGGGTTATCTATCAA:1 - chrX 7737033 3' - S-element 378 1 59.09 TGATTTCTTTGTTGTGGCGCCATCTATCTAAATATTACTGTTGGCGGCTGGCTAGGG:1 + chr4 464112 3' + Transib-N1_DM 362 1 59.65 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATCATATAGATTGCTTTTAAC:1 - chr3L 13023979 3' + 412 7531 2 57.84 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTATTGATGAAAAGTGAAAAAACCAGTAACAATAAACCTGCGAGCAG:1 + chr3L 8919704 3' - roo 39 2 60.91 TTAAATATATCCGTGTTCATGTGTGAACACACACACTCACACACACACACGAATACAAATTAATGGAATAATTACCTCAGATTAGAATTTTTCTAGCTTAATTCTTACAA:1 + chr3R 30369773 3' - roo 8672 2 72.73 TGTGAGGCCAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTTTTCTCTGCTATTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTT:1 - chr3R 29013339 3' - Doc3-element 4505 1 69.12 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTTACCAATCTTGTTAACTGCGG:1 + chr2R 7981180 3' + 1360 3371 1 70.31 CGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAGGGTGCTTACGATAAAAACACCTTATTTCGGCGGTGCGATTTGGACTAAGAAAAAAAAAAGAAAGAAAACTAA:1 + chrX 1649380 3' - Chouto 185 1 47.00 TTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGGTCCAGAGCCGTGGTTCTTTCCGGGGACAATGACAGCGAAGCTGATGAGGACCA:1 + chr3R 9514435 3' + Stalker4 321 4 58.18 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGAT:1 - chr2R 5064834 3' + Stalker3T 203 1 67.27 AAGCGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTTCCCTCCCCTTAAAAGGAAGCTTATGCTTGTATTGGGCTTTTCTTTATTTGGCTGCGTTAAAAGCTTTTTTAAGCCGTT:1 - chr3L 18728604 3' - rover 6961 2 64.55 CCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGCAAAATAGATACCGGAATCCTTGGTAGGGATTAAAGA:1 + chrX 527900 3' - Stalker4 7131 4 61.05 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTTTTATGAGCATTTCTTGTTTGGATGATGCGGCG:1 - chr3R 9481216 3' - roo 14 2 59.15 TACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATCGTTTTACTCTAAAAGTAACGGAAAATTGCAATGTTGGAAAATAAAAATAATAGTGACAGCTGTTAC:1 - chr3R 21644332 3' - INE-1 13 1 78.95 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTTAAGGAATTATACTGTATATGATTCAGTTGTACTGCAGACA:1 - chrX 18483173 3' + pogo 2074 1 64.86 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGCGGCAGGTTATA:1 + chr2R 13699504 3' - jockey 4761 1 76.77 TGAGAATTTGTTGCCAGCGAAACACCGGTGTCATTGTGTTCGCGGTTTGCCCTACCCTTCCACCTTTGCCGCTCCCCAGCGAG:1 + chr2L 12327713 3' - Gypsy12A_LTR 1999 1 73.49 ATAATAAATATTTTAAATATGAAGTATTTAGTCCTGTTAAAGGGCAAGAACACAATTGAACTGCTTTAATTTTCGCACTGTTTTGTTTGAATG:1 + chr3L 2963815 3' - NOF 343 1 81.72 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGGCGTCAGATTGACCGCATCTGCTAGAGGTGGACAATTGACGA:1 + chr3R 24814012 3' + P-element 2869 1 54.65 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGCATAGCTATGAAGCACCCAAGCACGCATCATTTAAGCGCTAAATTATAGCATACTTTTATGC:1 + chr2R 13699493 3' - jockey 4783 1 59.09 GGTCTAGAGGGTTGGAGTTGTTGAATATAGATTTAACTGTTGAAGAATCTGAAGAAGGGTTCCACTCCTGTACGTATATCTAAAATAAAAAAAAAGTATTTAAAGTAAT:1 - chr2L 17175733 3' - I-element 5094 1 81.65 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTCATGCAACTGACCCTTTACTGGACCGTTAGAGATAAGTTTATCAATTTTGTAAAATAGTTTTCAAAATCAGCATCCTTGT:1 - chr2R 25203739 3' - 1360 10 2 71.82 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATACACTAGTGAGGTGGACTAAGGAATTATTCGAAGCTACATTTCGCAAATCAG:1 + chr2L 14708941 3' - opus 7035 4 52.73 ATCAAATGTGGGTGGTGTGTGTATGGGCTGTATTTTTATTGGCAGG:1 - chr2R 9649868 3' - copia 4789 1 78.26 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGGGGGTTTGCCTTGAAAAAGAATTTCGCGCAGTAAA:1 + chrX 1599439 3' - hopper 52 1 66.36 CCTCGAGAATGGAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCTACTTTATGGCTGTGTCCTGCAGCTTTATCCTGTTGCTCGGGCT:1 + chr3R 19345537 3' + Idefix 139 2 60.00 AGAGACTTACAAATAAAACTTTTCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCAAGATGATGAATACACGGCGGATAGCTACCAATCGTGG:1 - chr2L 15048835 3' + Doc3-element 4450 1 65.09 TTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCCCATTGACAAGATTTACTCTAGGAACCATTAATAATTTATTTTTGTTTAAGCATTGCGGAAGCCGTATTTTTCG:1 + chr3R 23456865 3' - Doc2-element 4535 1 51.82 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATGCATTTCAAGTGATTTGAACTGAAATATATATTTCTATCAATCATATAGATTGCTT:1 - chr3L 13023984 3' + 412 7518 2 50.91 ACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAATCCAAAACTTAAATGAAATCAAATAAAATTATTCCC:1 - chr2R 23477859 3' - F-element 45 1 66.32 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGAATTTATTTAACATGATTTGGTGTGTAGTTTATTCATCGTTTAAATGCTCT:1 + chr3R 12623786 3' + roo 9041 1 59.09 AGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAAAGTCGGACTAACTAGAATGCAAACA:1 + chr2L 11086974 3' - S-element 281 1 67.09 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACTTACCAATCTTGTTAACTGCGGCCAGACCCTGTTCCACATTGGTCACACAAC:1 + chr2R 7981210 3' + 1360 3388 2 71.43 CCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTCCAATCCTCATGCTCTCCTTCGACTTTGTAGTTTGCCGCATTTTTGAATTGGTTTTTT:1 + chrX 9715300 3' - F-element 4412 1 57.41 GACTCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAAATCGGGCGGGAGGAAGGAAACTGCGCAGAGATAAGCAACAAATAAAACAAGGGC:1 + chr2L 20566514 3' - GATE 8310 2 70.00 AATATACAAAAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTGCACACTTTTGAGACTATATATAAACGTTAGAACATCACACAGATTTAAATACTTATGCATGCAAAAGCATATG:1 + chr3R 11957293 3' + S-element 164 2 70.64 TATAATATTATACACATGCTATAATGTTATTATCAACGCCTTTACGATTATTAAATAGTAAACCAACATGGTCCAAAATGATTCGTGTCATCAATGTAAAGCGTTTGTGT:1 + chr2L 8075952 3' - transib1 467 1 73.64 TACGCCTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACATGTGTGTGTAATGCGTATCGCGTGTGCGGAGATTCCGTGCCG:1 - chrX 4262973 3' + Tirant 8477 2 52.00 ATGAAATATTAAAAGTTAAAATTTTGTAATCTTTATGGCATTTGAATTCCTTGCCATGGGATATTTTTGCAATTATTTAAATGGCATGTCATAATATACTTCCA:1 - chr2R 19692491 3' + TAHRE 154 1 87.50 TGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTCAATGATATCTACTTATAATATACAAATAGGGATGAATTT:1 + chr2R 330200 3' - HMS-Beagle2 6924 2 62.73 TTTCGAAAGGGACACGGAACTATTGAACAGGTCCACAGACTGGTGAAACACATATTACAGCCTAGTTTTCCGATTGCTAATAGTTGTT:1 + chrX 21005246 3' + Helena 298 1 68.18 AAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAATAAGATAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 203 1 62.73 TATTTTACTCATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAATCAACAAATTCCATTTTCACCCACTTTCCCTCCGCACTTTTCACTTCCC:1 - chrX 14972447 3' + S-element 125 2 65.71 CAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGTGAACTGTGACAAGCAAATTATAAGTGCAAAGCTAATTAGAGGACAAAGGCAATCGATACGAAAACGGAAACTTG:1 + chr3R 10983655 3' + gypsy4 340 1 66.33 GGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGGGTACGGATTTGGAACTGCAGTCCGTCGTGCTGCTGGTGGCAAAGTAAGTAG:1 - chr2R 15486521 3' - Max-element 8337 2 77.22 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAACTTGTTAAAAAAAAAATGGCTCATGTGTAGGGCGTTGGATTTCAG:1 + chr3R 7874867 3' + jockey 4972 1 60.92 TAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCATTATGCAGCCACTTTTTTTGTGACTGCCAAAATAAATAGAATAATGG:1 - chr3R 19483293 3' - 1360 3374 1 80.72 AAAATGTATTTATATACAAATGAAAGCGGTAGGGATGAAATAGGATGGGATGGAAAGCCAGGATGACGATGGCATTGCCAAAGTGTTATGGCAAATGATTCGGTCTCGCC:1 + chr3R 15499927 3' - transib4 2462 1 72.73 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTACTTGGGATTTTACAGGTATGAATATGACCTTTACCCAAGTGTGACAATGCCTTGGCACTCATTATGGGTGGGTCTGCACCACC:1 - chr2L 12591698 3' + roo 389 2 62.73 GATTGTGCTCGCTGAATGATGCGAAAATTGTTACGAGATTCAGAGACAGAAACACAACCATGCACACACTTACCCCCCAAAAAAAAACCTAACCATAGAATA:1 - chr3R 26471636 3' - F-element 4314 1 82.35 CAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCCAAGCATTGCTGCTCTCTAGGAGATGAAGATTTGGGCT:1 + chr3L 16281173 3' - F-element 4596 1 65.45 CATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGAACAAGAAACTAAAGACGAGGCATACA:1 - chr2R 13993266 3' - P-element 134 1 29.09 GCACAAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCTCTTTGCTGCAACATTCGTTAATTCCATACGCCTT:1 + chr3R 21985176 3' - 1360 467 1 61.05 GCCTTCTATATTGCTATTTTATTATATAATTCTAATATGTGATATTTTCTATCAGTTTAATTTTCTGATATCGCACTTTGGGGCCTCAGCCCTAAACAATTTATTTCTAT:1 + chrX 2042838 3' - Porto1 4231 1 70.00 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTACTTTCAGCCATAAAGTTGCCAACTATTTACATAAAATTCCACTATAAT:1 + chr3L 19948939 3' - 3S18 5781 2 59.81 AAAGCTTTAAACTCGCAAACAGCTGTTTGTGCAGTCGCGTGGCAGCGTGGAGCGACGATTTGGAGCCTGGATTGGCGG:1 - chr2R 17429525 3' - X-element 244 1 57.69 TATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCATAATTTTTAATAAGTATAGGTGGTGTGGAACAT:1 + chr2L 14442487 3' - jockey 4973 1 70.77 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTGATTTCGGAATTAGTTCGGTTAACAGCCCCAC:1 + chrX 3528628 3' + roo 9021 2 69.09 AAGATAAGATAGGATAAGATAGGATCAGATAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAGAAGAAAAGAGAAGATAAGAGAAGAAAAGAG:1 + chr3L 22908066 3' + Stalker3T 203 1 39.09 GTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTTCCAGGTAGATTCTACTACTCGTACCAACCTGGCGGAGTCGATGAAAG:1 + chrX 5783413 3' - F-element 406 1 84.29 CCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACATTCTTAGCAAATCAAATCAATCACAATCCATCACTTACAATTATTTGCATTTTG:1 - chr3R 17614000 3' + I-element 5060 1 64.55 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAAAACTTGCTTGGCGCCATTGAAATGCGCCGTTTTTAATATTAGTGCCCCCCGCGAATTTATAGTT:1 - chr2L 18693988 3' + pogo 2083 1 62.39 CCGCTATTTCATCAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAATGTATTTATACTCGTTAATTTTAAACGGAAAGATGTTTGATGTTACCTACATATGTACATATGAATTT:1 + chrX 23074011 3' - mariner2 45 1 56.36 TGCCACCTTCACCAACATCAATCCGCTTTGCATTCTACGTAGTGTTAAATAGCATGATTTATCAAGCTGCAAAGTGGAGCCTCGACGCGAATCATTAAATGACAGGTG:1 - chr2R 11389838 3' + Chouto 6180 1 75.00 CAGTGGCATAAGTATTTGGACCAATTATTTAAATGTTATAAATTTGTATAATAATTCAATTGATTAATTAAAGAAGTACTATTCCCGTCAGCTGTAGAAAAAAGCGCTCG:1 + chr3R 25458020 3' - Tc1-2 1435 1 72.73 AGACTTTATTAACTACCTCAGAAGTATTGGAATAATAATTAACTACACAGGAGTTGGGAGCCAATTTAATGGGTGTGGGTGCTG:1 + chr3L 16301131 3' + mdg1 396 2 53.57 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCCGGAATGAACCGGAACAATATAAAAAGTAAAATTATTCTCTGTGCATCAATGCGTTGAGAT:1 + chr3R 26398934 3' - Doc 26 1 48.15 CAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAAAAAGCAACGGCAATTGTCGGGGAAAGGGGAAAAACCGACGAAG:1 + chr3R 19550054 3' + Idefix 7090 2 62.20 AGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGATAAGATAAGAGAAGTCAAAGAAAATGCATGAAATGCAATGAAATTCAAGATAAAATATTCCA:1 + chr3R 14044438 3' + Stalker3T 204 1 48.18 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATGCCGGCTGTGCAAATGGTTTGTTATCACTTACTTAGCCTCC:1 - chr2R 17512976 3' - jockey 4770 1 54.55 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGCAGGCGTGAAATTCTTAG:1 + chr3R 31458500 3' - jockey 20 1 74.55 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCACCTGCTGCCTAATCCGTTGCCTCATGTTTATGCA:1 + chr2L 19253817 3' + blood 301 2 61.73 TTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGTAAAAGTCGTCAGCCCATCAGCATCATCATTCCCCATCACAGATTTTCCCCCGTATCGG:1 - chr2L 13324565 3' - jockey 4727 1 62.64 GCTTCTACACTCATACACCCATCCTTAACATACAAATATAAACGCCGCAATAAAAAGGAACACCGGC:1 - chr3R 26328580 3' + mdg3 81 2 55.22 TAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGAGTTTTACAACTAGAGACAGACTTTCATTAGCAAAATATTGTACTCGGATGTTCAGCGCGTGCG:1 - chr3L 3089641 3' - 297 6746 2 61.82 ATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATAATTTTGAATTTTTTATTTTTATTATTTTTTTTTCCCAATTTCTACCGATATTCCAAAAAAATATTGAAATGAGTAAC:1 + chrX 15903328 3' + INE-1 86 1 59.63 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGCGGGGCGCAAAGAGGCACGCAACAGAC:1 + chr2R 13648633 3' + hopper 1361 1 71.82 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAAGAAATGACACTCTATTATTATTATTATTATTATGTATTAT:1 + chrX 124327 3' - copia 30 2 63.16 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTCTTGAGAAAATGAAATCATGTAAAGTAGCTCGATCTTAAAGAATTTAAGAA:1 + chr3L 23257568 3' + blood 7367 2 54.64 GAGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTAAAATTAAGCAGCGCAAGTTTCTTTCACGTTGCCACGCCCACAGTTCTGAAAAAATACTTGAAATTTGTCATTGTT:1 - chr2R 20538300 3' + INE-1 146 1 80.00 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATACGGTATAACATGTATGTTTAATAAATGAATTCAAG:1 + chrX 4789208 3' - opus 7158 4 68.18 CGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGGGGTGTTCGTCTCGATCTCCTCCGAATTCATTGTCAGTTCCGA:1 + chr3L 8054806 3' - I-element 4905 1 62.77 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGTTACGTAAGCCCATATATTTTATGATACCAAAAA:1 - chr2L 21735012 3' - Doc 55 1 74.55 AATTTTCGGGCCGAAATCAATTTACATATTTGGATTTTTGGCCAATTTCGTTGCAAAACTTAACAGGGTACTGGTGAGCAACTGTATCCCTGCGCGGAGGAC:1 - chr2R 4508549 3' - 1360 3184 1 76.47 AAAAAACGCAATTGGACCAAAGAAAGAAGACTGCCTGAAATGCTTGAAAGAATAGAGTTGTCCAAAACA:1 + chr3L 19954060 3' - Tc3 61 1 72.46 CAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATATGTACATATTGATTTAAACATAGAAATGTAGCTAAATCACAGTATCAGTGGTATTTGCAAACA:1 + chr2R 11066452 3' + Porto1 4349 1 56.88 TATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACACACTGTATATGTAAGTGCTCGTTTGCTTGTATAAAGTAAAGTTTTCGTCAAAGTTGGAGATTTAAAGAGAATCTTTG:1 + chrX 22489717 3' + S-element 1701 1 68.52 CTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCCACTTCCCAAGATTCCCATGCCACACCCCCTGAGATACGTACAAGTACAGCTCCTGTAATCCATTG:1 + chr2R 14293821 3' + Circe 28 2 69.47 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + Tabor 7283 2 64.00 ATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAATTCTTCTTTCATCTGACTCTGCACGCGATGCAGTGTGACTTTAATCTGCTTTAGTTTCTGT:1 + chr2L 9819700 3' - Bari1 176 1 65.45 GATTCCTGTGCAACTACTTGCAATCTGTTGGAATGAGCATGATTGCTACCAGTTTTAGACAGGGAAAGTGTTGGCTGAAACTGTTTGACATTCGATTAAGTGC:1 - chr2R 24457544 3' - G3 327 1 64.08 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGCGAAATGTTGCTGATTTCATGGCGATTGCATAACTCGATTCTCTGC:1 + chr3R 11526858 3' - pogo 36 1 58.72 CTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATGTAAATAATATTAAAACGAGAATAGTTATGGAACTAAAAAATGTATCATTATAAACCTT:1 + chr3R 6263384 3' - diver 5903 2 63.64 TTGGATGTTTTCGTTCCGAACGTACCATTGATTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1 - chr3R 21907534 3' - F-element 4372 1 46.75 AACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATAGATCTATTCGTTTTTTGGTATTTTTGTTGCAGTTTTTTGCTCGGATCCCTTTTCATC:1 - chr2L 12910689 3' + Burdock 231 2 57.27 ACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATTTATCTTTCATCAACAATCGAATGATTCATATGGAAACATAAGGCTTTG:1 - chr3L 16727146 3' - springer 25 2 51.00 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAGATACAGATACAGATATCTATATAGTCATGTGGTTAAGGGGTTACGCATGGCGAG:1 - chrX 17837960 3' - S-element 8 2 63.95 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTTAATTCGTGAATAAGTAACCAAAAAAGCATTATATGTCTAAGATTGGTTTAACAGGAA:1 + chr2L 21784927 3' + I-element 5346 1 67.37 CTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATAAACTGATGAAATGCCTTAAACAGCCTCTGTTTGTTTG:1 - chr3L 8919638 3' + roo 409 1 62.50 CAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTAGAACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCATGAAAGTTTAAAAATGCTGAAAGCAGAGTCGAAAAGGCAG:1 + chr2L 19846166 3' - Gypsy6A_LTR 232 1 54.55 GTTACGCTTCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAATGGTGTTATGCAGGCCTCTAGTACGTGTGGCCGTCTTTTTTCAATT:1 - chr3R 21217226 3' - 1360 9 2 52.44 GTTTTATGAAACGCAGATCAATAACTACTAGCCTCTTGTTCTAAGCAAAATAGCAGCTAAAAAAGTAAGAATAATGCTTAAAATAGTCGGCGGCACTCAGAAAAGGTTGT:1 - chr2L 3312736 3' + Q-element 215 2 72.73 AAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCACAACGACATTATCGGCGAGGTTCGCATCTCTGT:1 - chr3L 15017301 3' - invader4 16 2 61.29 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATAACTTTTCTAACCCGACATATTTAAAGGCACATCGAACGC:1 + chr2L 10746716 3' + flea 4970 2 64.55 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGACGGGGCATCCTTGTACGCCGCTGCTCTGTACAGTGGCATGAA:1 + chr2L 14141346 3' - hopper 28 1 57.14 TGAACTATCTATGAACGGGACTCTGCTTAAATAAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGCTCCTCCGGAGGCATCTCCTT:1 - chr2L 12309266 3' + micropia 5154 2 72.00 AAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACTGTGTTGTGTTGTGTGTGTGGGGGTGTGTGTGTG:1 - chr3R 28240377 3' + blood 7363 2 56.79 CCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACCCCCTCTACCGTCTGCCATTGTTCGACGGTCGATGCAGACG:1 - chr3R 31880317 3' + Quasimodo 6994 2 64.71 TAAATATTGTTTAATTATATTTTATCAAAAACTCGTACAATTTTAGCAAATATTTTTTATTTAAATACTTTTAATATGTTGTCAGCATGTGAAG:1 - chrX 8519346 3' + S-element 1611 2 75.53 CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATTTCTCCTAAGACCGCAAAAGCTGAAAAAGGAAACACACGCTAATACTGGGAAATATATATTTTTAACA:1 + chr3R 12863684 3' + TAHRE 10426 2 71.28 TTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAATAGAAATAGCCAAATCTATATTATTCTTGATCAATTGGTACCACATTTTGGTTATACGAATGCCAAACTGTG:1 - chr2L 15100527 3' + 1360 300 1 54.55 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTGTTTCTTGATTTTAAATGGGTTGCATTTGTATATCAGTTTTTTTTCCT:1 - chr3R 13481168 3' + roo 9035 1 59.09 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTATATATTTATTATTTAGTATAACCAGGTATCATGTAGTCGAAAAACTCAATATTTCA:1 + chr2L 16230391 3' - blood 7039 2 54.55 TTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAACAGCAGAGAAGAAAAGTAAAATACAATGAAAAACTGAAAGTGATGTTCCATAAGGCAATGCAAGAGACGAGTGCCAGAAAAC:1 + chrX 16061604 3' + Doc3-element 4456 1 57.27 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTACACCCAGTAGTCTTTTTCAACGTAGAGAGGAGTATTCAATTCATGTTG:1 + chr2L 9754865 3' - 1360 37 1 55.45 CACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAACAGAAACACACACACACACACACTCGCATACACACTCGCCAGCATATGTCGCTCTCAATGTGTGC:1 - chrX 7770315 3' - Rt1a 4995 1 60.91 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTAGCACATGTGTGTGAGTCCTTGTTGCAG:1 - chr3L 10109756 3' - hobo 39 1 72.53 CGTAGTAAGCATATAGATCTAAAATATTATATAAGAGAATTGTATAAGAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAAACGAGAAATTAAAAGTTATGCGAAA:1 - chrX 12662901 3' + Dm88 4118 1 76.36 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGCTTCTCTTATCGCTCGAATTCAGATCCGTTGCATAGATAAACTCTATGAAGAACCCT:1 - chr2L 493987 3' - roo 8666 2 74.12 GCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCCGATCGATCCATTTACGTAGCTCT:1 - chrX 256014 3' - R1A1-element 407 1 74.74 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGTCTGTAAATTAAAAGCGTTTAAAATGCGTGCTGCATACTTTTTG:1 + chr3L 5204442 3' - jockey 4697 1 56.25 AGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTCTACATGTTGATGGAGGGAGCTGGAGGGGAGTG:1 - chr3R 31684512 3' + R2-element 27 1 64.89 CGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCAGTTGCCGTGAACGGATGAGATTGATTACTTCCTGATTGCTAAAACCGTAGTATGGCTAAAAGG:1 - chr2L 10254377 3' - GATE 8282 2 80.43 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTGGGTTTGAATACTTTCCGCTAGAGCCCATTGAATATTTAAACATTACAAT:1 - chr3L 10836520 3' + opus 478 2 57.43 TAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAAAAATTGACAGTGCTTGAAAGGTCACAATTGGATTGGAAAATATTTAAACAAGACGA:1 - chr2R 1344496 3' + Stalker3T 202 1 58.10 TCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTTTGTGTT:1 - chr3L 11777678 3' + R1A1-element 212 1 67.07 ATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCCAGCCCAATGGCCACCAACTTCGCGGTGACAATCATAGCACGTTCATCC:1 - chr3R 13294777 3' + hopper 1376 1 55.32 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTGTGCG:2 + chr3R 5910754 3' + roo 388 2 55.06 CCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCCGCCAACCGAAAATTTTCGATGGGCCAAGCAATTGGGGTAAGAAAAAAACCGAGGAA:1 - chr3R 8207549 3' + F-element 4510 1 65.06 TGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATAATGGAAATTTAAAAACGTTATGTAAACGTTATTGTCTAAGTAGCTGCACTTTCACTGTTG:1 - chr2R 330112 3' + HMS-Beagle2 7173 2 60.55 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTTAACTATGATTTTCCAATTTACTTGTAAATGCCAA:1 - chrX 17184911 3' - roo 8711 2 73.64 ACTCCGCTCATAATCCGTACATGCCGCCCGCCAATGCGTCGTCCAGCTTGTCTTTGTTGTGG:1 + chr3R 25876044 3' - diver 5888 1 75.81 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATTTCAAGTTTGTTGCTGTTTGAAAGCTAAACGATTCCTTTTTTTCCTAGCTGTTGCAT:1 - chr3R 25859592 3' + 297 370 2 54.55 GCGCTCCAAATGGACTTGCCGATGCACCCGATCAACCCATAGACCAATGAGCTTACGTCTCGCTCTAGTTTTGGTCGTCTTTTTGAAAAATTTAGATCGGAA:1 + chrX 18142740 3' + BS3 173 1 59.80 TATTCGTGTTCATGTGTGAACATACATGCTTATTTCAATTGCGGGTAGTTTGAATGAAATTCAATTTTACTTGAATTATTAATTTTGTTTTTCACCAAGGTGGATATATT:1 - chr3R 12623667 3' - roo 1 2 76.36 CAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTACCGAAAAACATAGATTAACCTG:1 - chr2L 20684716 3' + I-element 5123 1 73.75 CACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCGTCTACATTAAATTTAAACATTACGTATGGACTAAACCATACGTGCTTCG:1 + chrX 4631511 3' + R1A1-element 4944 1 58.06 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAAGTAAGGGCCAGCCCAAGCGTAACCGAGAGTCCTGGCAGGATATTCA:1 - chr3L 5320596 3' - roo 8688 2 55.79 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTGTTGTATTGTATTGTATTGTATTGTATTGTAT:1 + chrX 12946235 3' - Tabor 6876 2 62.11 CCATACGATTAGTCTAGCATAAGACGGGAATAAAACGCCGAACGGAACACGTTGCGCGTCAAGGCCAGAAATGCTGTGAGAAAGATGG:1 - chr3L 13760658 3' - 3S18 5959 2 76.14 GTGTCTTTTTTATTTTTCCTTTCG:1 - chrX 21234387 3' - Doc2-element 259 1 83.33 GCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGACTGGTTCCAGAAGCACTGTGGACGATTCCGCGCTGAAATCT:1 + chr3R 31400038 3' - I-element 5271 1 61.47 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTGGTTATTTCTTCTACTTGACTGGCACGCAGATG:1 - chr3L 16301084 3' - mdg1 16 2 61.64 CCATGAGTGATCCACTCAAGAAAGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCAAAGGAAACGACAGACACTATTAATAACGCATTGAT:1 + chr3R 13340035 3' + Quasimodo 6994 2 61.05 AGCTTTAAAATTAAAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAAAATTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAAT:1 - chr2L 21307777 3' + 1360 3025 1 70.64 AAAGAAACACACAACAACACACACCACACCTAAAGAATACCGACATAATGATGGGGATG:1 + chr2R 11093057 3' + gypsy3 410 1 74.58 ACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCTGCGCCAACAACAAAAGCAAACACACTCGTGGAAACT:1 - chr3L 18030371 3' + Tirant 8472 2 66.67 TGTGTGTTGTTCTGTGTTTGCTCTGCCTTGAAGTTGGTTTTATTTATTTATATATATTTTTTTTTCATTTTTCCCATAAATTAGCCATTTGATGGCTGTGTGCAAAGC:1 + chr3L 1708694 3' - gypsy3 411 1 62.96 AAAATAAAATTAAATTAAATAAAATAGAATAGAATAGAATAGAATAGAATAGAATAGAA:1 + chr3L 24821494 3' + NOF 3960 1 52.54 CAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAGCA:1 + chr3R 21907535 3' + Tabor 483 2 39.24 CTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATTTCAATGAAGCATAAAGTCCTGCTGCTCGGAATC:1 - chr2R 17922199 3' + hopper 1026 1 60.00 TGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTAGGGATAGGTTTGTGCAAGTATCCGGGTTGGGGTGGGGGTTGCGGAAGTGGAGGAAGAGGGACAGCCCGTGCTC:1 - chr3L 21060468 3' - Porto1 4207 1 80.61 AAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAACAATAACACCGTCAAGTGCGACTTGCTGTTCACCTGTGTGCGGCTGAAGAGCTCGAGCTGGTTTATCTGTGGCGGTGGTAAAA:1 - chr2L 4475608 3' + Doc2-element 235 1 62.39 TGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - accord 247 2 72.94 TTTATTACCGCGAAAACTAATTTCCTTCACTGTGGCCTGGCCGCTTTTCCTTTTATTTCACGTACGAACCCCTTGGGGGTGGATTTAGTTTTGGATTTT:1 + chr3L 753914 3' - X-element 58 1 77.78 CACCAAAACGATATTTAAAAACATTTACATCAGTACCACTTCCACCGCATCCCATAAACATTGCGTGCTGATCCCGCTGCCTCATTTTCGCAGGACATCGAGGAGCGTGA:1 + chr3R 31199716 3' + transib3 102 1 64.55 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATATTGAACAAAAAGTCTTGTTTACAACTAT:1 + chr3R 17419750 3' + I-element 5331 1 64.63 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' - 412 7090 2 55.96 GCATTGCGCTACCCTACCTTAGACCACTTTCCTTAAGAGCATAGCTCTAGCGGCCCCTTTCGCCAGTCATGATGATTGTG:1 + chr3R 25306310 3' - gypsy12 9910 2 75.00 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTCTTTCATCATGCGCGGCACCACCGCCGGCGGATTA:1 + chr3R 23943229 3' - P-element 20 1 36.92 TAGGATGAGATTCTAGGCTGTCATTGTATTTTTTCGTTATTTCCTGAATCCTGTCTCCACTTTTCGGTGTTCGTTTCGCATTTTTTCTGGGTCCTAAACTCATCGGTGGC:1 - chr2L 11540345 3' - jockey2 3090 1 59.09 ACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACAGTTGGTTATGGGCCTTTTAAATCGCGTTGCTTTATTTGGATTTGTATTTTGTTTCATTTCTATGAGCACTTTACGA:1 + chr3L 14130995 3' + Copia1_DM 170 1 55.45 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACCTGATTTTCGAGGGTATCAAACAAA:1 + chrX 12271525 3' + pogo 2090 1 60.94 CGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATCAAGAAGATTCCACCAAATTTCCCATAGTCTCTGGATTACACTTATATGTACT:1 - chr3R 15309324 3' + HMS-Beagle2 282 2 55.05 TGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCGTAGTGCTTATCAAATCTTTTATTTACTTTTATAAATATTAATTAAGTAA:1 + chr2L 10554363 3' - G2 294 1 56.36 TGTGTGACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAATAAAGCAGGAGTTTGTATGAACTCATGATAATTCAGTTCTTC:1 + chr3L 7746477 3' - hopper 73 1 60.00 AGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTAACTCCGAAATGAGCTGCCGCCCCTTAAGAATTCTTATGAAAATCGTCTTTTCATTGCTCGAAAATGAATAATTCTATCGAT:1 + chrX 20097043 3' - Gypsy6A_LTR 225 1 67.27 CAAAAAAATAATTTGAAAAAAGGTAATTTGTCAATAGTATACAAATATGGATAGAGAAAATTACAAAAAAATTTATGCTTTAACCAAAACATCTAAAACTGTCTATCTT:1 - chr3R 30923335 3' - FB 173 1 53.21 TGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAATTGAAC:1 + chr3R 6763660 3' - F-element 4479 1 61.82 AAAAATTCTCTCTTAATTTTAGTTTTAAGATAGGTTTGCTTTGGAGTCATTGTCCAAAAAGCGTATTACTCAAATTAAAATATTGTGAAACCACTGTTAAACCATTTTG:1 - chr3R 7348871 3' - G4 225 1 70.64 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAACATGTAAATAATATTAAAACGAGAA:1 + chr3R 6263347 3' - diver 40 2 73.56 ATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' - 1360 3259 1 62.63 AAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTACTCACATTTCCTCAAGCACCAA:1 - chr3R 22595833 3' - FB 48 1 77.08 AATTTATTTCGTAACACGTTACAAAGTGAAAGCAATTTCCTGTCTATCCGTACAGTAGATACAAAAAGATCTACGATCGAAAAGTAACTA:1 + chrX 12722687 3' + Gypsy12A_LTR 2258 1 70.00 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACCACATAGTTGAAAGAGGCTAGGGG:1 - chr2L 6519828 3' - diver 51 2 77.89 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGCTCGCTGATAACTTTAAAAATCAATTTGGGCCCAATGTGTAG:1 - chr3L 20167928 3' - 412 40 2 63.55 ACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCAGCACCACGTGCACGCCCCAACA:1 - chr2L 16013505 3' - pogo 277 1 69.23 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTAAATGTTTACAGAATTAGCGTG:1 - chr3L 16046890 3' - P-element 41 1 28.74 GAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCCAAAATGAACTAATCTGATGTTATGTTAATGGCGACCATCGGCAGGGGAAACTAAGAGCAGCTATCG:1 + chr3R 30703429 3' + Circe 7078 1 58.00 TTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTCGTAATATATTGAAATGGTTTCTTCAGTTGAGGATTTAATTGATTTCTGAGAATTTTAGATTTTTTAGAACAGA:1 - chr3R 27071835 3' - jockey 4682 1 64.55 AGGTTAGGGAGGTCATGTGGGTGGTGGGTGAGTTGGTGTGCCAGGGACATAGGAAAAGAGGGCACAATGGCGG:1 - chrX 22745165 3' - jockey 4764 1 63.01 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCGAATGGGCGGCAGTGGTGG:1 - chr2R 19677809 3' - hobo 27 1 70.83 CGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATACGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGATAAAAGCAAGAACGTTGGCGAGGGCAA:1 - chr3L 5157913 3' + Stalker3T 204 1 24.55 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCATATATCGGCTTAGAGCATTCAGTTCCATGTTCAATCGACAATTCGTTTTAATTGAATT:1 + chr2R 21199714 3' - jockey 35 1 47.27 CAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGT:1 + chr2R 6984382 3' + HMS-Beagle2 269 2 72.00 GAATATAAGTGTGTGTGTGTGTGCGCGATGGGTGGATGGATGGGGTAAAGGGGCCAAGTCGAAGACCGTGCTCCAGTTTCTCAAGATTG:1 + chr2L 4096991 3' - accord 7031 2 66.29 AGATACGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATACGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGAGAGAGCGCGGGCGAAAAAAAATGAA:1 + chr2R 10577848 3' + Stalker3T 204 1 31.48 GAGAAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGCGGTCAGCTGTGAGAATTCACAGACCAATTTG:1 - chr3L 13887913 3' + gypsy12 26 2 69.35 CGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCACCAAAGCTGAGATGTACATTTGGATATTAGTTGCTTTCTACGTACTGATCCTAAAAATGTAACTCATAATCACGTA:1 + chr2R 8159152 3' - roo 8661 1 60.00 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAGGAAATTCACATTCGAAGTTGAATTCTTACCATCTGCCGGCAATCCCATGAG:1 - chr2R 12416851 3' + pogo 2091 1 64.77 AATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGCGTGAATTTTTTTTTATTTCACTGCTCTTCAGGCAGCCAAGACTTGTTGGCGCTGATTTAATAGCCTATATGAGGGAAC:1 + chr2R 4137635 3' + HMS-Beagle2 308 2 74.55 AAAGTGTGGGCGTGACAGTGTTGGCATTGGTATGGGATATGGGGGCGAATTTAACGGAAAAGTGCAACGAACTGCCATTCCAATCATTAAGCTGG:1 - chr3L 7252816 3' - INE-1 245 1 80.00 ACTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTTAAAATAAATTCATAAATATAATTGTAAGCACAATTTTGATTTGATTCACCCCCAACC:1 + chr3L 17064440 3' + I-element 172 1 58.88 TTGAAACCAATCTGGACCTATGGTTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAATTTTTTTTTCACCATGACTATTAATAATAATTTCATGCTGGGGAAATGTATGGCCATAGC:1 - chr3R 19134754 3' + F-element 4253 1 65.45 AGCATTTCGGGCACTTGTGTTTACTCAGAAACAATGTTGGAAAACAAAATGTGGAACAATCACTTGTAGGGCAAAACTTATGTACATATAACAAGATTTTGGTATAAAAT:1 + chr3L 13304524 3' - HMS-Beagle2 58 2 76.36 TTTTAATTATTCAGTTAATTGTAGGTCCTAATAGTCCACAGCTAGAAACTTCAAAATCTTATTGAGTATATCTCGGAGTTGGTACAAATGTGTA:1 + chr3L 11521326 3' - HeT-A 22 1 86.17 AGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGGGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGTTTGGTGGAGATTTTTGGAGAG:1 - chr2L 8105476 3' - I-element 5153 1 79.12 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACTCCCAACCATCGAGTCTGGCAG:1 - chr3L 6638129 3' + blood 7315 2 73.17 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG:1 - chr3L 3456093 3' + Stalker3T 205 1 37.27 TAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGACCCACCCGTAGACCGGTTTATTACCATATAT:1 - chr3R 23665019 3' - 1360 52 1 71.82 AGGCTGTCATTGTATTTTTTCGTTATTTCCTGAATCCTGTCTCCAATTTTCGGCACCTTTAGTTCACGTTTTATATCTCAGCTTAATATACCTTAATCCATGTAAATCCT:1 + chr2L 8507861 3' - jockey2 3076 1 71.82 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGCGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGCATTATACTGTAAATCTTTTGGGCTAAAACATCATAAATC:1 + chrX 15500026 3' + pogo 2050 1 75.49 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAGATAAGAGAAAAGTTGACCAAGAGAGCTTGCAATGATTTTGTTAAGAAATCGTACGCTTTTTGGTTACGAG:1 - chr2L 9744709 3' + Stalker3T 201 1 60.00 AGCTAAGAAAGGAAGGAAAAACATACAAGGACATTCAAAAAACCCCGAAAGAAAGTAGTAAGTGATGAGATGGCTTAGACTTTAGGATTCTGGAGGCGAAAGTTGCACTA:1 + chr2L 15633989 3' + HB 400 1 60.91 AAAATGTCTCTCGTAAATGTAATTCCTAAATTAACACTTGTAACTAAGCGCGTATAAATACCGCAAATACAAAAAGAAATACAAAAAAAACTATAAAAAAAATAATATAA:1 + chr2L 4931128 3' + TART-C 10935 1 66.36 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGGATAACTACTATCTGACTTAATATGATGAAATAAATTGTTGCTGGTAAATAAAAAGCATATTAA:1 - chr2L 7750520 3' - opus 8 2 40.00 TAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCGCTAAATAGTTTATATTAGACAAATGCTACAATATTATTAAATAAGACGGACACGCACATAATTATACACATAAACATAA:1 + chr3L 26031375 3' + roo 9066 1 64.55 ATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - I-element 214 1 26.21 GGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAAGTAGAAGAAGTCGAACTTATTGTCTTCGGTATGCGCCTTTGTAGCATATAAGATATTGTGGCTTTTTTTATTCTTTCTAAATAT:1 - chr2L 8848724 3' + gypsy7 463 1 67.27 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCTTGACCTGGCCAAATCCCTATCAATCGG:1 + chr3R 11474948 3' - hopper 41 1 71.74 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACCTAACATATAACATATAACATATAACATATAACA:1 + chr4 96892 3' - flea 4787 2 67.06 ATGAATTTTTATACAATATTAAAATTGAAAATGAACTTTGGACATAAAATATAAAAAAAAATAAAATTGGGTGGAGTTGGTGGCGCCCCCCAAAAATAAACAGCAACAAA:1 + chr3L 13911643 3' - hopper2 37 1 70.00 GATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGATAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 205 1 37.38 GTTTATTTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAACATATATAAACCCGGAACAAAATAATAACAATAAAACAATGTAAAA:1 - chr3L 17474848 3' + Copia1_DM 138 1 62.73 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCTTTGACATCTAGGAGTTTATGCTCTGTTTCTAACAATTA:1 + chr3R 24867553 3' - roo 46 2 70.64 TTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCCACATCTCCAAGCAGCATTTTGTACATAGCATATCCCTAAGAAGTCCCACAGAACACTCTACTTCAGCAGCTCTCTCG:1 - chr2L 1950594 3' + FB 33 1 68.18 ATTATATGGGGTCGAAAATGAGGGAAATCAGTTGATACGGCAAGTGAATAAAGATTGATAAGGACGCAGTGGAAATGGTTTATCTATGGAAATGAAGCGAAGGATAAGGC:1 - chr3R 15678589 3' + Circe 7098 1 80.91 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCGGCATTATCTTCGAGATTATACACCAGCTGGTTAATCAGATAAGTAGCAGCTGGCGGTG:1 - chr3L 7400724 3' + roo 408 1 66.67 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACAATGCAAAAGTACTAAAAAAAAAAACTATAAATTGCATTAAAGTTAATTCGAAACACAAAAAAAAAAATA:1 - chr2L 17188011 3' + blood 7339 1 69.23 CTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGTAGATTTAAATAGAT:1 - chr2L 9371267 3' - 297 6557 2 79.73 ATCTTCGGAACGAGAATATACACAGACGGCAAAAGATATAGGTATGTATATATTTGGTTATAAATATGGTCATATAGTTGGGTAGGTAGTTAGACGATTAAACACAGATA:1 + chr2L 9812666 3' + Doc3-element 4427 1 80.91 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + 412 7480 2 79.09 TATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCGGACTGTTTTCGCTTTTTTCTCCTCTGGGGCTTCTTTGCT:1 + chr3L 2055094 3' + pogo 48 1 61.90 AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTCCATCAAACTTACAGAAAAGCCCTGGACCACGCTTGACCGG:1 - chr3R 12801783 3' + jockey 4918 1 65.74 GTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCAATTTCTCTTGTTATTTGAATATGGAATGGAATATATTAAAATTTTTTTAAAGGTATTTGTTTACCTTTAAA:1 - chrX 21388002 3' + INE-1 551 1 50.91 AGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTAATTTGTCATACCTATTTGACATGCAGTGCACAAGGGGAGGAATGGGATAGTCAA:1 + chr3R 11692245 3' - TAHRE 10411 1 62.50 GAAAATATTTAAAAAACAAGAAATACTGTGTAATATGCGATATTGCAACGAAAATATTTAAACAGGTAAAAGGAATTAGATGGCATATCTGAAACTTCAAAGAAAAGCT:1 + chr3R 18364589 3' + TART-B 10627 2 55.96 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATACTAATCTACGAATTGTTAGTATATTACATCTATATCCCTTTTGGTTTTATTAACACTTTCACAC:1 + chr2R 10241513 3' + I-element 5329 1 55.96 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAAATTAAATTAAAAATTAAATCATACATAAAATATTACAAA:1 - chr2R 4137696 3' + Juan 4164 1 71.82 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGCTAAACCAAAGCAAGTCCAGTTAAAGTTTGGCCATAAACACAAA:1 + chrX 16994171 3' + roo 9033 1 61.47 CATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTGGTTTTCGTTCAGCAGATAAATAAATTTTGCAGCTAGTTA:1 + chr3L 11248597 3' - Doc 4509 1 63.64 CTATCAGATACCCGTTACTCGGCGAGTATGATTGCAAACTCGAAATTTCATCATTTTTTTTTTGATATCGATCAAAATGAGTTAGGCACTGTTTGGTAATGGTT:1 + chr2R 1860626 3' - INE-1 547 1 70.19 AAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAGCGTAGAACCAGCAGAAGAAGAGGAGAAGTGTGAAGAAGAAATCAGTCCAGTTCAAGATGAAGATTCAGCGAAAAGCC:1 + chr3L 12818649 3' + blood 7176 2 55.45 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAGCCTAGTTATGTAATGATCCTGAAAAATGCTTT:1 - chr2L 5724319 3' + 1360 3350 1 72.45 CGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTTTTCTTGTTTCGGTTTGTTTTTTGCTTGTTAGCCGTTGATTTCTTATTGCATTTACTGTCCCTGTACA:1 - chr2R 5918601 3' - Doc 297 1 74.74 TGTAACAGACAGAAGGAAGTGTTCCCGACTATATAAAGCATATATATTTTTGATCAGGATCAATACTTTAAAGCCCACAAACCGCACAAAA:1 - chr3R 8143539 3' + INE-1 31 1 59.34 TTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTCATTTCTGTGTACGAGTGTATTGTACAGTGAAACATGTACAATGGCAGCCG:1 + chr2R 16476434 3' - X-element 23 1 54.12 ACTTACCTGCAACGTCTCCAGAGGCTCCCAGCAAATCCAAGCTCTGGCGCTCGCGCAAGAGGTAGAATCGAACCATGAAAGATATGGAGGCGTGAAGGAAAAA:1 + chr3L 23706452 3' + HeT-A 5695 1 72.82 GAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGGGGTTTTCGAGCCTTTTAAGCCATCCCTGCGACATCCAATTAGAATAGCAAGCGC:1 - chr3L 159287 3' - G6 1857 1 63.64 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCTGCTTGCATAAATTAATTTGCACATTTTCGCCAT:1 - chrX 9576540 3' - FB 32 1 66.67 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCCATAAAGTTGCCAAATATTTACATAAAAT:1 + chr3L 19948928 3' - 3S18 29 2 54.13 CGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATTGGGTTTGAATACTTTCCGCTCGAGCCC:1 - chr3L 10836543 3' + opus 484 2 62.50 CATAAGTCCAAATTGGCTTCAGGGTGGCACTATAGGCCGAGAGAAGGTCTTCCACCCTTC:1 + chrY 1419238 3' - G-element 3899 1 71.67 ACAAAAAAAAAACAAAATAATTAATTTCTGCAAAAATATTTATTATTATTA:1 - chrX 7637922 3' + gypsy11 3935 1 66.67 AAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTG:1 + chr2L 16217660 3' + Tabor 7314 2 41.03 TGCATTTAAAAAAAATTTTTTTGAAATCGGAAAGAACTAATTGAAATTGGTTATTTGTTTTCAGAACCATAAATATTATATATGAACTTTAAATGTGCAATTCATATAT:1 - chr3R 24075544 3' + Transib5 2726 2 81.65 ATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGCGACCGCACGGAATCCCTAATAAGTATAACCTGGGCTTGAGTTTTATACGTACACCTACAATGGAA:1 - chr4 517754 3' + F-element 4310 1 71.15 TCTGACAACTGATAAAGATCTCTTCATTTGCCTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTTTTTCAAAATCAATGCTCTGGCAATTAGAATGCAAGC:1 + chrX 18677432 3' - Bari1 193 1 68.75 ATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAAACGGACAACTGGACAACTGGACAAGCGGACAAGC:1 + chr2R 13465690 3' - INE-1 170 1 69.47 GGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGATTGAGAGATATGAAAGATGGCAGATTAGGAAGCCT:1 - chr3R 13276571 3' + invader2 477 1 67.27 ACCGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACTGTTTGGTGCATTGATAAATCGAACAGAATAGTCTTAGCCTATAACTATTAGGACCTTAGTCTAGGAAATAACCGAAAT:1 + chr2L 20685980 3' + 1360 157 1 78.18 TAATCTCCTTCTTCTTCTTCTTGTCTTATCTTGTCTTATCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTCTTGTTTTGTCTTTTCTTTGCTTTTTTTTTCTTGTCTTCT:1 - chrX 10540747 3' + hopper 1175 1 35.58 TCCTGCCTTTATGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGGTGGGAGAGAAAGCGCCAGAGAAGGTAAGGAAAATCAAGAGAGAGAGAG:1 + chr2R 14954617 3' + invader2 5074 2 56.36 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTACCTAACTAAACTCAATTCAGTTTGCAATTGAGAATCATTGAAAAAAATTGAAAATCAGTTGTTTCAGAT:1 - chrX 8518915 3' + S-element 1702 1 68.18 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATAAATATAACATGAAAACGTTGCAAAAA:1 + chrX 3091988 3' - 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chr2R 23740702 3' - S-element 1380 1 63.92 AATAAATATAAATAAATAATAAATATAATAAATATAAATAAATTTATTTTTCATATTTTTTTAAATAATTTCCTAACACATTTGGCCACTTTTGTGGGGTGCGCAGTGAG:1 + chr3R 26106805 3' + Burdock 311 3 61.82 GATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGAACCGATAATTAAACCTCCAATTCGTGAATCATCGATGGGTTCACAGCAGCATGCGAGGACA:1 - chr3L 256304 3' + TAHRE 10399 1 66.99 AGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACACATGTATGCAGAAATTTGTTCAACAAGTCTGCTTATGTGCACCCTCTCG:1 + chr3R 16798821 3' - Stalker 7139 4 65.45 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCTCAATAAAATATACCAAGTACTCTACTCTTATTTAAATTAATACATATTTGTAAGCA:1 + chr3R 12040016 3' + 412 7520 2 56.36 AAATAATAGAAAAGAAGGACACAAATTAAAAAACAAAACCAAAAAAGTAGCCAAAGGAAGATGACAAGCAGCAAAAAG:1 + chr2R 11263839 3' + X-element 4663 1 37.18 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAAACATTATGGATATATCAAAGCGCCTTGCGCAGAGCCCTATAGTGTCAAGCGGGC:1 - chr2L 16742233 3' - 412 31 2 52.73 TCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACACATACGTACATATGTATATTTGAAGTTCCAATCAGTG:1 - 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mdg3 5261 1 53.23 GCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCTTAAGCAAAAACACTTGAAAAAAAAACGATGAGTAAACTGAATTGAATTGCAATTC:1 + chrX 15652335 3' + F-element 86 1 54.55 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTAGGTTTTTACGATTTTAATTATTGCTTGCTTTGGGTTTTTTCCATTATGTGACAGTTGTATTTTTT:1 + chr3R 2275676 3' + opus 7487 2 66.97 AACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCACGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTTTCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAAATGGGGCAGGTGGTAAG:1 + chr3L 16402118 3' + 1360 3012 1 80.91 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAACGTTTATTCCTAAATTCGCAAATCCAGTAAAAAGTAAAACTCAATATTATCCATTAATTAATAATTATAT:1 + chrX 1523613 3' - jockey 26 1 64.55 GCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGTACTTGTTGTTTTTGGTTATCATACTTAAGAAACAATTTGGCATGAAA:1 - chrX 15105757 3' + Cr1a 193 1 63.64 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAATTTCCCCATTCCATACATTCAAATAACACACACGAACACGAACGTAAATACTTTTCCGAACGCTGCAGGC:1 + chrX 4216648 3' + I-element 5340 1 64.55 GAACTAAGCACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCG:1 + chr2R 3341943 3' + Copia1_DM 4122 1 65.45 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAA:1 - chr2R 6984308 3' - HMS-Beagle2 5 2 71.11 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGACGCTGACTAAGATGATGATTCGTTGTCAAGGTAGAAGGACCCTCGACTGCCAGTGCTCAGT:1 + chr2R 15801166 3' + roo 394 1 62.38 GATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATAAGTGTA:1 + chr3L 22016848 3' + INE-1 148 1 53.85 GTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATGGAGGCCCAAAACACGTTTCTAAAATTGAAATTCTAT:1 - chr3R 6937622 3' - F-element 185 1 69.44 CTTGCGTCGAGTGAAAAATTAATTAGGCAATAATTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGCAACGTTCTTCCAAAAAGGCAATAAAGTGCGTTTAAATTTACCCACGAAA:1 - chrY 946222 3' + 1360 426 1 65.45 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAAATCCAAAACTTAAATGAAATCAAATAAAATTA:1 - chr2R 23477864 3' - F-element 47 1 70.65 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTT:1 - chr3L 19951203 3' - Ivk 44 1 62.73 ACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGGATATATGCATTTCCAAGCCCTACGCTC:1 - chr2R 18507857 3' - Bari1 45 1 75.27 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGAAGTATGCGTTCGTGCTGTTGCAC:1 + chr3L 13228525 3' - P-element 32 1 35.37 CACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGGCGGGGGAATTGACTAAAACATTCTCTCTTTTGTTTTTAAGTTAATCCAGCAATAATTGCCGCATAACAATGAGTTTATATG:1 - chr3L 21858363 3' + INE-1 541 1 90.91 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAACAAAATTGTGTATTTAGCCGACTCTACT:1 - chr3R 7500878 3' - FB 57 1 76.85 TTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAAAACTCGGAAACCCCAGGAAAGTAAGAAAAACGGACTGTATTTTCATTAC:1 - chr2R 14311278 3' + Tc1-2 1425 1 70.97 TACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCGTTCAATGTTTTGCGTTGTGACAGTG:1 - chr3R 10039908 3' + pogo 104 1 76.36 CACAACCACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACAAACACTAACACAAACACACACACAAACACAAACACAAACA:1 - chrX 9845362 3' + gypsy3 419 1 31.82 ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATCTAGGCAGCTATGTATATATATGTGGTGGTTGGATAT:1 + chr2L 16067137 3' - HMS-Beagle2 6929 2 66.06 ATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAGGGTTTTTCCCTCCCCCCACCCTCCCTACCTTGGCATTTGCCAGCCGCCACTAACATGAAA:1 - chr2L 13150198 3' + FB 27 1 65.17 GAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCAGCAGCTAAGTGAGGGCCAATTGACATGCCGAAAGTGTTTGTTTTTTGTTTTGATAAAA:1 + chr2L 10009622 3' + invader4 88 2 50.56 TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTACATCAGTCTGACCTGTTTGATAGTCCTTCATGTGTCCTCACTTCTCTTGT:1 + chr3L 10723740 3' + Burdock 6356 2 57.27 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTAATTACTGTTTCTTTGCAATATGATGATGAAGCTAAATTTAAATATCTTTGTAATGC:1 + chrX 17184988 3' + roo 9044 1 55.45 GGATGTGGTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTTTTTTCCTCGCATGGGGGTGAGTATGTGTGTGAGTATCTGTGTGTG:1 - chr3L 18244072 3' - Rt1a 4877 1 55.34 TTTTTTTTTTATTTTAATAACAGTACACGCAGAAAGAACATAATTTCCATAA:1 + chrX 8728214 3' + hopper 156 1 82.69 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTGAACACAGTAAAATTCATG:1 - chrX 16693794 3' - 1360 27 1 77.14 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGGTCAGCAATTATTTTACGTTGAGGTCGCATTAGAGGTG:1 + chr3R 5910750 3' + roo 9039 1 62.89 GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACATCGTAGGCTTGTCCTC:1 - chr2R 4137553 3' - HMS-Beagle2 11 2 72.22 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAAGAAGTGCAAGCACTCATAGA:1 - chr2L 18675594 3' - 412 7074 2 61.82 TAAGATATAATAAATAAATAAATTTAGTACTTCCATTTATAAAAGTAAATAATGGGAGCAGCTGAAAATTGAGGTTACAACTTTTCAACGATTT:1 + chr3R 24285044 3' + Doc3-element 78 1 78.72 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGTGACGCCTATTTATAGGCCGGTTGCCTACCAGATTAAGGCAATTGATTCTTTGAAACT:1 - chr3L 217297 3' - roo 8690 2 56.36 AACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCAAGGGCTTTTGAAAACATTAATG:1 - chr3R 4688062 3' + Doc 4403 1 80.00 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGGACTGACGAATTAAATATTAATAATAAAAGTCGTCAAA:1 - chr2L 21784866 3' - I-element 26 1 63.75 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGGAGTTCATCATTACAGTTTACCGGCCCTGTCGGTGTGCAG:1 - chr3R 20293073 3' + 412 7502 2 71.74 TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATCTACGAATTGTTAGTATATTACATCTATATCCCTTTTGGTTT:1 + chr2R 10241496 3' + I-element 5311 1 62.73 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGAATTGGCAAATAGAGACCCAAAACGGAACGAACTCC:1 + chrX 8885554 3' + roo 9025 2 69.09 GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATATATTTTAAGAAATGCAGAAGGAATTTCGTAGACGTCTAGGAGCATTTTTGACTTTATTC:1 - chr3R 27816094 3' - Burdock 6156 2 60.00 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGGTTACGTAAGCCCATATCTTTTATGATACCAAAAAAATCAT:1 - chr2L 21735006 3' - Doc 31 1 56.52 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTCTGCTTGCATAAATTAATTTGCACATTTTCGCCATGTGATTGGCCTT:1 - chrX 9576528 3' - FB 40 1 61.82 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATCTACTTTCTTTAAAAAAAATGTCAGAATGCCAATTGATTTTATTTCACTTTTTTGATTGAGTCTTTAGATT:1 - chrX 15169937 3' + I-element 5343 1 65.14 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTTTTTTAAAAGCAATTAAATGCACGCTATGATACATGACGCCTGTCAAATGAAATCAATAAAATTTATGA:1 + chr3R 25434851 3' - opus 10 2 71.82 TATTCTTGGTCAGTATCAATAGCCGAGTCGAACTGGCCATGTCCATCCGTCTCATTCACCATGAAGGCTAGAAGGTTGTATTATATTATTATATAGAAGATG:1 + chrX 3395851 3' + INE-1 85 1 76.47 AAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAATGCAGTCCTGCATCGAAATGACAATGGAGTGTGAGGTTGGGAAAAGCGGAAGACACAGAAATAACACGAAAATGTTTTGATAAA:1 - chrX 10119533 3' + FB 24 1 70.00 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCCAAATAGAAAAAGCCTGTGTGTGTGAAGGATACACAAATACAA:1 + chr3L 6899900 3' - hopper 27 1 52.53 TGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAAC:1 + chr2L 23373494 3' + Tc1-2 1570 1 74.29 CGCACCTGGCTCTACGCTCTGCACGCGGAATGCAATTCGCGTTAATTCGCTTTGTTTGGAAGGCCG:1 - chr3R 6383679 3' + jockey2 408 1 60.61 CGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCCATCTACCGATTTTCACTTGTACCAAGAA:1 + chrX 19451888 3' + GATE 438 1 67.78 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTTCTGCGCGTGTAAAGTGATTAAACATAATTCAAGACGTCAGCCAGTCGATGAGTC:1 + chr3L 9822311 3' - pogo 29 1 54.55 CGAACATAATAACAATAATAACAATTGGAAATTAATCAGCACTACTTGTATAGTAGCAGTAGCGGACAAAAGCGTTCCGAGCCACGGAAGCATTGTTAACTCAGACGGGA:1 + chr3R 24509385 3' + mdg1 7050 2 77.27 ATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGTATTTATAGGCTCTGCGGCGGG:1 - chr2L 14662884 3' + TAHRE 10358 1 74.29 CAAATTATTTAAATGTTATAAATTGAAAAAAAAAAACAGCAACAAAACACTCAACAAAATGAAAACAAGAAAACAATCGAAAAATAAACAGAAACGACGA:1 + chr2L 14116546 3' - Tc1-2 1415 1 73.00 ACACACACACACACACATATATATATATATATATATACACACATAGATAAGTATTCTTTATGTGTGCGGAAAATTTTCGGAGATT:1 + chrX 2661492 3' + accord 185 2 76.47 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATATATATAAGCTTGTGAGCTATACCTTAACTTTATTTTTATGTATATTTATTTGAGCTACACAACCA:1 + chr2L 2484433 3' + jockey 4969 1 52.73 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATATTATTATTAGTCCTTGAAAGACTAG:1 + chr2R 8397482 3' - 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Quasimodo 298 2 56.36 TTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTCAATGATAAATAACCCGGTATTCTTCTCCTTAGACC:1 + chr3R 1023405 3' - F-element 63 1 70.37 GTACTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGTCCTCCACTACTGAAAACGGTTTAGTAACTGAGACTGAATTGACGCGCGAACG:1 + chrX 16091525 3' - baggins 5382 1 69.72 ATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTAATTCCTTCTTTGTTAAAATTTGATCCTTTTCAAAAGTATTATGTATTCCATTCCTTAATTATAAAATCATC:1 + chr2R 10236856 3' + FB 66 1 73.64 TTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAATAAAAAAATAAAAAAAAAACAGATGGGTATTAGAAAAGAAGAAAAAGCA:1 + chr3R 31084496 3' - S-element 365 1 58.70 TATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTCTCTTATCTTATCTTATCTTATTT:1 - chr2R 6629974 3' - Stalker3T 202 1 50.53 AGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTT:1 + chr2L 23295877 3' - micropia 4982 2 53.64 TTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCACGATATGACCCAAACAAAGCAACGTTCTTCCAAACGGGCAATAAAGTGCG:1 - chrY 958600 3' + 1360 470 1 89.04 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATTTTAATAAATTATATCTTATTATGATTCATGGTAAGCTTTCGGAATCCACCTCCC:1 + chr2L 18749924 3' - pogo 28 1 59.09 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGTTGTTTTAACCAGTGTAAAGCAACAGTTAAGAACTGCAGTAAAGGC:1 + chr2R 19684526 3' - 412 7093 2 63.64 GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTTATTAAATAAATTTACAACTGAAATGATCAAGGTCTTTTGTACTGGATGTATAGCTAAATTTGGAGAACTTTTAATTACACG:1 + chr2R 14884086 3' - mdg3 5257 1 77.27 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATCTTTTGGGCTAAAACATCATAAAT:1 + chrX 15500025 3' + pogo 2074 1 74.03 CAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAA:1 + chr2R 6984413 3' + HMS-Beagle2 299 2 63.92 TACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTACACAATACATGGATAGACGGGGGTGTCACTCTTATCGGGCGTACAGCAGAATAAATATT:1 + chr2L 15228853 3' + mdg1 7435 2 58.18 ATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATTTTTTCTTTTCTTCTGGGTGAGACAACAAACTGCAGCTG:1 - chr2R 12596986 3' + Doc3-element 335 1 71.82 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGAATTCACAAGCTTGAAACTGCGAAACTCACTGTGCAAAAGTATTTGCATACTTTTTGGGGCTAT:1 - 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chr2R 13209655 3' - mdg1 7090 2 75.73 GATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATCTATGAACATGTGTGCGAAGCGAAGA:1 + chr3R 28224810 3' - flea 4814 2 76.36 AAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTG:1 - chr2R 982346 3' + rooA 7540 2 64.95 CGGATGAGCGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGGTTGAGATTAAGCGTGCAAAAAGAGCTTGTTAGCTTACTCATGTCGCCGCGCCCATCCTAATGACCTCTAACTGC:1 + chr2R 5865761 3' + INE-1 136 1 88.99 AAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACACAAAAATGCCAGATCCAGTATCCAAAATAAAG:1 - chr3R 4239339 3' - micropia 4998 4 70.00 ATCGATAACTGTAATCATTAACTTGTATTTCCATTAGCTTCCGATCCCTCATCTCATATGCTGAACCTTTTCCCCTGCTGTCACCGATG:1 + chr3R 12040232 3' + HMS-Beagle 7040 2 74.16 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGTTTTCTCCAACTATCAGATACCCTTTACTCAGCGGGTGCGAGTAGAGAGACGCTGG:1 - chrX 1655924 3' - INE-1 578 1 67.53 GGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATCTACAGGTACTACAAGTTCATAACCAACCAAAAACATTATATTTCTGTTTATCCATTA:1 + chr3R 17714001 3' + Stalker4 47 4 56.36 TTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATGCCGTATTAATCCAGCTAACCAACCGATAATTCGAATCGCTC:1 + chrX 17838045 3' + S-element 1700 1 58.43 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACATATTTCATATATTTATAATACCTCTTTAAAGCTCATTCGGTATGCCAGGCACA:1 - chr3L 17405682 3' + roo 9038 1 58.18 TAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATTCAAGTGGTTTTCGGTTTCCTATTGATTTATGAACTTTTCTCAGGTTAATCGTTTCCT:1 + chr2L 18199789 3' + Ivk 5352 1 55.05 TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - Tabor 32 2 51.92 TTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTTTTGCTTGTTACGTTATTATGTCTAGTTCGAGTCATATTTTCTTCAGAGCAGGCGCTGTGT:1 + chr3R 23108658 3' - I-element 5105 1 63.73 GTATGACTTCGATGAGCAGGATGTGAAGCCAGGTCACAGCAAAGCCTTTGCTACCGCCACCAGCAAGATTTCCCAAGGGAAACACAAAA:1 + chr3R 1140844 3' - Rt1b 4966 1 76.40 TTAATATGTTTTGCTATTTCTTCCTTAACAGCCATGATCATGGGATCTACTTTCTCCGCATAGTCGGCTAGCTGGGGTTCGCTTATGGCCTTGCATGATTCCGATTCTTT:1 - chr2L 8383458 3' - G4 3586 1 80.00 AGAAAAGATAAGATAAGATAAGAGAAGATAAGATAAGAGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA:1 - chr3L 15253229 3' + Stalker3T 204 1 54.37 GAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAGAAGAAGAGGAAAACGGTAGGAAAGCGCCTGGTTAAATTAAAATAAATTAGC:1 - chrX 3595300 3' - Cr1a 4364 1 52.73 AGTTTGTAATATATAGGTACAATAATTGATTTTAAAGGCAGCTTCAGGTTTTTTTTTATTTTTTTCTTTT:1 - chrX 11762016 3' - TAHRE 10350 1 64.29 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAATAACAGGTATGGTCGATATTAACTTAATTAGAGTAGGACTGCTGGCTAAATGCTCCGCG:1 + chr2L 12036197 3' + 297 6958 2 66.36 ACATATGTAAATAATAGGAGTACAGAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTGTTTGCTCATAACCGCAACACATGCTTT:1 - chr3L 13681455 3' - Transpac 4848 1 70.21 TGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTGAGAATAAATGTCAGAGTCAACATGT:1 + chr2L 19594150 3' - accord 7311 2 76.36 TACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATTAAAATGGATCTCAGAAAGTTGTGGTACTGCCTTGTTGTAG:1 + chr3L 23447314 3' - R2-element 3445 1 62.04 TACACAACTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTGTATCCATTGTGTGCTTCTGTGGATTTCAGTTCGGATTCTGGAATATATACCTAGCAA:1 - chr2L 2336167 3' + Quasimodo 7086 2 55.45 AAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAGTACATGTATATAGAAAAAAAAATACTTTTATGGATTTTTCAAATATTTCCTATATGCATATATATCCATAAAATT:1 + chr2R 8083874 3' - Idefix 7 2 73.64 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCACGTACAAGTTTAATGGGAGTTCCCGCAACTTAAATTAGAATTTTTG:1 - chr3R 13502985 3' + hopper 1405 2 61.73 GGATACCTCCATATCTTAAATGAGCACGCATTCACCTCAGGAAATAGACTGTTCTCCACGAAAAAAAAACGCACAACACAACACAACACAACACAACAC:1 + chr3R 21907536 3' + Bari2 851 1 73.74 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGAATGTACGTAAGTACACCAATCAGTTTTTAGGGTATTCA:1 - chrX 6866770 3' + S-element 1671 1 66.97 AAAGGGAACATGGGGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCA:1 - chr2L 19479165 3' - micropia 42 4 55.00 TTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTATGTATACGTGTAGATATGTAGAATTGGAATTTA:1 + chr3R 3031035 3' - I-element 263 1 70.00 AGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGAAAGTATTCGCTTTGTCGAATGTCCCTTCACATTAATGCGTGCCTAGTTTATGGTGCGTGAATAAATGGATG:1 - chr2L 22082608 3' + INE-1 550 1 58.33 GTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGACGCGTTGAAATGCCAAAACGTTTAAGCGCAAATTGTGGCAATTAAAAAAGCGTTGCTG:1 - chr2L 16376176 3' - G2 2926 1 72.53 CACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACATAAGCAAGCAGTGGAATCTCCAGCGCGAGCAATTTAATTAACCAAAGCACCAGCATCAACATTTCA:1 + chr2L 186365 3' + 1360 3224 1 60.95 ATTTATTTTGCCTTTGATTACAGAGTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTGCATTTTTGAATGTAACATTACATGTGTTGTAGTGTGTTGCATTGTATTGTATTGTATT:1 + chr3L 21448026 3' - TAHRE 10373 2 70.91 TACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTTAAAGTATTTAAATATTTTCTGTTG:1 - chr2L 5595507 3' - Max-element 37 2 73.56 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCACACACACACACACGCACATATTATTATTGTTTTTAGACATTTTGGAAAAGAAGGGCATTTTTCTTGGTTG:1 + chrX 13202696 3' + Tirant 390 2 69.81 CTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGGTTTCGACGGTGAGTGCTAAGTGGCAAAACCTTTCAAAGTCACAGACAAACAAACATCTTAT:1 + chr3R 9000555 3' - R2-element 3432 1 76.77 CATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACCCATCCATTTGAACGAGAAAACGAGCCTGACAGTGACTAATAACAGAAATAACCTT:1 + chr2R 14355608 3' + mdg3 43 2 54.55 TTTATGCTGCAACTTTGTATCGTAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGAGCCTGATTGAGGGAAACTTTCCACTCAATTGAGA:1 + chr2L 8423221 3' - ZAM 89 2 57.95 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTTTCATTGTGTGCTCCTTCATTCAGAAA:2 + chr2R 18807881 3' + BS 5039 1 74.31 TCAAGCTATACCTCATAGAAAAGAAACTCTCCGAATGAAAGTTTGCATAGTGAAAAATCGAATCCAACAATGAAAAGCCCCCTCCCAAATAACAGTAATTTAGTGGAAAC:1 - chr2R 24695787 3' + Ivk 4911 1 70.91 CTCTTCCTTGCGCATAGGAACAGTTATTGTTTTCAACCGGCTTGTTTGCCCTCGTTCTAGTTATTGTTTTATTTGCAGG:1 - chr3L 22122031 3' - Bari1 162 1 69.62 ATGTACAAATGCCTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - I-element 5197 1 30.00 TGTTTTTTGCGTGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTCTCGCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCAGCTCTGTATGCCGCAATGTAGCTATCTCTTTCTGAT:1 - chr2R 20919907 3' + Cr1a 259 1 66.36 CACACCATAGAAAAAAATCACAAGGGGACAGCTCAGTCGCGGCTCGGGCTTTTTTCTTTCCCAGCAACCC:1 - chr3R 15743579 3' - mariner2 590 1 57.14 GAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGAATTGATAACAGATTCAAAAACGAAAGGACCAGACACA:1 - chr3R 16848299 3' + F-element 4326 1 57.78 ATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAATTTAATAATTGTTTAATTT:1 + chr3R 1960331 3' + gypsy9 5229 2 88.18 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGCTCCTTCCCTTACCAAATGAACTG:1 - chr3R 29345643 3' - roo 8696 2 72.50 TAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAAGAAAAGAAACGCCGAAAATATGCTTAGGGTTAAGTGTTCCCGTTAG:1 - chrX 14020396 3' + Doc 4614 1 60.00 AACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAATAGCCAAACAATCAGATACCGATACTTAG:1 + chr2L 18573878 3' + G6 1828 1 74.14 ACAGTTTTTGTAATATATAGGTACAATAATTTCGAATTTTAGATTTTAACATTGCATGTGGTGAGGTGGGGACGACAGAGTATCTCAGTTAATGATGTGCTAGGGTAAAG:1 + chr2L 14266812 3' - TAHRE 10354 1 61.82 TAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGTTCTAGGATGGGGAATGGCATTGGTATTTCGATTTGGATTGGGATCGGAGAGTAGCCCGTAGGCAGGACAATGAAGAGGAG:1 + chr3L 8364484 3' - Ivk 408 1 72.22 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATCTACAATATACAGGGAGCAGTTTCGGCTCAG:1 + chr3L 6542912 3' - Quasimodo 31 2 73.68 ATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACACGCAAAGCAGCAACATCGTCAACGTGCAAGTCGAAAAGTTGTAATTTTAATTTAGCCTCTAACTGCTTCAAAG:1 - chrX 9821598 3' - copia 166 2 70.00 ACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGAGCTTGAATACTGGGGCTTCTTCTTGCTGAAAGGTGCCAAGGTGCGCGTG:1 - chr2L 8955234 3' - G2 74 1 57.43 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAGTATTTATTTTATTAAGTTACTTGAATAAAGTTTTTCATATAACTCTTTTTAAATAAATAGTTA:1 - chrX 22717109 3' - pogo 19 1 60.55 GCTTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTAGCTTGCCTGTCTGAC:1 - chr2R 9408164 3' - FB 8 1 68.48 GTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTTTGCCTTTAGAGTTTTATTCGCTAAAAATTTTACCATTTTCAAGTTTTTAACTACA:1 + chr2L 18159901 3' - F-element 4450 1 54.55 TCTCAATTGATGGCATATATTGGTTTATTACACTACAAAACAAAGTCTGGGTCTTAGTAATATTATATACCCATAACGATGCCATAATTTAATCT:1 + chr3L 3611801 3' + blood 7379 2 68.42 AAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTTGCAATCGTCATAACATTTAAAACGATTTAATTTGGGTAAATCGACCAAGC:1 - chr3R 18265871 3' + Ivk 263 1 55.14 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAGTGTAATCTGAACAAATAGAGTTCCGAACACGTTGTTTATGTTCTTGTTTCACTCAGGC:1 - chr2R 7981121 3' + 1360 3379 2 68.09 TATATATATATTTATTATAACAAGATCTTATTCTTCTTGTTAAATATTTTCAATACCTTGATGTAAACAATTATAAATTATAAATTAAATTTGATACAAGACG:1 - chr3R 23357125 3' - Stalker4 80 4 90.29 AAGCCGAATGGTATATTAGAAATGAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACTATTAAAAAAAAATCGAGCAGCTCGAGCAACACATAATTTTGCAGCAATGAAT:1 + chr3L 9978765 3' + Porto1 4363 1 56.48 GGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAAAATCCCATAAAATTAGATAATGTTATAAAATTATAATCCTTATCATATTTTTTGTGT:1 + chr2L 8476772 3' + Juan 4205 1 59.55 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACACATAAATACATAAATACATACATAAGACTGGGTGTTTGGTCCGCAGATGCG:1 + chr2L 11231903 3' + copia 224 1 51.82 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACAAAATTCACCCGAAGAAGGAAATTTTTTAGCACAATGCGCAT:1 + chr3L 22744727 3' - FB 23 1 73.64 TTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTCTGTTATTTCTTCCTGCTCCCCAATTATTTCT:1 + chr3L 2083856 3' - Bari1 1403 1 70.37 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAAACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' + copia 236 1 38.18 AAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATCGACACACACACACACACGCATACATACTCACTCAAGAGAGCCATGACACATTGTATTGAAGTG:1 + chr3R 28300070 3' - Copia1_DM 81 1 66.67 CCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGATAACGAAATCGAAAAGTTTGTACTTTTTTTT:1 - chr2L 20928047 3' - Chimpo 16 1 63.64 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCTATGAATAGGAATATTTCAATATTAAAGAATACAGATTAATCCCTTTTGTAAAATCCAAACTACCTTCC:1 + chr3L 14811515 3' - copia 4878 2 61.39 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATGTATGAAAAACAAAATCACTCCTCTTCGTTAGTCGGCATTTGGTTGGCATCAGTCGCAATCATTTTGTATTTG:1 + chr2R 17955580 3' + 297 6969 2 75.45 AGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTGCTACGGAGGGCTACTCTCACA:1 + chr3R 18624840 3' - 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hobo 14 1 60.23 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGGAAAAATATAAAAAAAAAATAAACTTTAATAGTTTTAATAATCTAAAAATTTAATTTCAATA:1 - chrX 18021025 3' - Doc 26 1 47.27 ATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAGTTTGCTTGGTACAAAATAAAGTTAC:1 + chr2L 11762230 3' - mdg1 60 2 77.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTACTTGGGATTTTACAGGTATGAATATGACCTTTACCCAAGTGTGACAATGCCTTGGCACTCATTATGG:1 - chr2L 12591714 3' + roo 9052 2 56.38 AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCATGTTGCCAGCTAAATGTGGATGTGCATTGCTTTTCCCA:1 - chr3L 12301199 3' - hopper 32 1 57.45 CACTAATAAAATCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTACGGGAAAAACCTGTTAGCGCCGCTCTGGCCGG:1 + chr2L 14673445 3' + accord2 7340 1 58.57 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTTACGACCCTTTTACCCAAGGTATTAGGACTTCGCAAAAATATCCTTTCCGCTTTGCTGCTTTTCAATAGCC:1 + chr2L 20398565 3' + roo 407 1 76.29 AGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTGAATGGAATTGAAAAATATATACTGAAAAGTTATTTTTCTCAGTGTCAATTGTT:1 - chr3R 23387035 3' + invader2 456 1 57.29 CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGTCAACTGTGTTTAAGATCATATTTTATAAATTATGCAACTTCATTAATTT:1 + chr3R 7049718 3' + 1360 3352 1 58.18 AATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAAAT:1 + chr2R 6984416 3' + HMS-Beagle2 7195 1 72.41 TAAAAAGAAATAATCTTACCAAATAACTCCTTAACTTTATATCCTAATATGGGCGGTATGGGTGGTGTGGGTGGCGTTTCAGCTG:1 + chr3R 18743067 3' + transib3 2688 1 78.82 GGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTAAAGATATACTTGTGACCTTTAAATTATTATTCTATAATTGAACCTAGTTTTAGTTTATTATATTGAATT:1 + chr3R 6763686 3' - F-element 4453 1 64.55 TTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTGGGCGTCTCTTTAAAGTCTCTTTCTCTCGCTTTCTCTCGCTACTTTTC:1 + chr3L 3371227 3' - copia 4891 2 53.76 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTAAACACACAAGAGAAAAATATTCACTTCAAGTGAATTCTGGTAGTGTATTTTAATGTATTTATGGGCTA:1 - chr3R 8811149 3' - 1360 17 1 65.45 GTTAAAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGGAAACGAAGGCAGAT:1 - chr3L 21821456 3' - Tc3 317 1 69.49 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCGTGTCCCGTAAGGGATTCCGTGTGGA:1 + chrX 9432881 3' + roo 395 1 61.54 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGT:1 - chr3R 21907536 3' + Tabor 479 2 25.45 CAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAACGAGTGGAGAACTTGGGCGTGAACTTAGCATTTAAATAAAGCGGCGGCAGGG:1 - chr2R 19841374 3' + Bari1 1610 1 55.24 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - 412 31 2 50.00 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGACTCTTAAAGTTAGATCAATTTTCGCATTTATTGGTTTGTACAAAAGAACTTACAG:1 - chr2R 8086779 3' + 1360 3382 2 68.97 ACAGCAGCTAGGCCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAGCCGAACGCTACGCGCACAG:1 - chr3L 681591 3' - diver2 267 2 79.75 CTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAAAGCGAAAAAAAGGGACAGGGAAACAATTAACAACTAATTTAGGCCTCTGCATATAATTTTATGGAGAGCG:1 + chr2R 13566048 3' + jockey2 3121 1 75.00 GAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTTGGTATAATTTCTTGATATGCTTTCG:1 - chr2R 12507513 3' - Juan 405 1 76.36 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACAGATAACTATAATCGACAAGTACAGGGTATGC:1 - chr2R 10091023 3' + roo 9026 1 72.12 TGAAATATAAAATTGAACATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTTGAATTGCTCTGCATTGTGGCTTTTGTTTGCGTTGTTGCTTTGCATGCATTT:1 + chr3R 25807230 3' - G4 3521 1 53.64 GTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGACACCAAAACAAAAAACAAAAACGCAAAAAAAATCAGCCAAA:1 - chr2R 10599339 3' + F-element 269 1 61.82 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTACTCACATTTCCTCAAGCACCAATTAGCCATCTGAGTTATGGCTC:1 - chr3R 22595811 3' - FB 9 1 62.03 GTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTACTTCCGCCCGAGGCCATGATAAATCGCCAAGGCAAATCAAAATTGTTTATA:1 - chrX 18954015 3' - invader1 3817 2 52.73 TACCTGTTCAAGCAAGACCACCACACCCAATCGCCATCGAGTGCCTCGGCCAGCAATTCAACAGTCCAC:1 - chr3R 30793407 3' + Gypsy12A_LTR 2162 1 60.87 TGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATACACACAATCCGCGGATTGGACCATCTGC:1 + chr3L 10911566 3' + springer 369 2 57.35 CCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCAAAAACACACGCCGCAAATGCACTGCGAGAAATTCGCTTGGAAAATT:1 + chr3L 16533990 3' - R2-element 62 1 60.00 CACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGGGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACAATAAACA:1 - chr2L 9723026 3' + Doc3-element 4447 1 57.27 TATATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGGGGGTGGGAGTGTGAGTGTGAGGATGAGTGTGAGTCAGTGTCTGTGTGTAGTTTTTGCCCCACGTTTTCCTCTTATTAACGC:1 - chr2R 8272629 3' - accord 7030 2 58.33 CACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGCAGTGTTAAATAAAATTTAAACACCGGACGGGAAAAATGCACAAAA:1 - chr3L 17530133 3' + Tirant 8504 2 66.67 AAACGAACTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAAAACTCGGATGGAGTTGCAGTGGGAGTATT:1 + chr3R 13956548 3' - springer 140 2 57.38 GTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTCTAGTTCGTCTGTGTGATGGTGGCCTGCCAACGACATGTCTGG:1 + chr3R 17746986 3' + flea 290 1 58.65 TGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTGCATTTTAAGGCTCGTCTGGGACGAAAAACATAATGTGCGAG:1 - chr3R 31633148 3' + opus 493 2 62.32 CGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAACAAAAACCAATTGTGAAAAGTGTAAAGTTTAGAGCGCAGCG:1 - chr3R 29503450 3' + Doc 4541 1 64.36 GACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAGAACTCATACTTTTTAAATTGATAACTTTTGATATGAACTACATTTATTCCAATCAAAACTTATATAAAGAACA:1 + chr2L 7528707 3' + I-element 5112 1 60.91 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAACTAACTGTAAATCGGTCTTCAAGCGACGACGTTTAATAAATATTAAATAATTGGCGTGATGCATGCGTCAATATCAGCA:1 + chr3R 23665112 3' + 1360 3385 2 78.18 TGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGGTTTTTTTTTTCGGGAACCACTTGGATGGATAGCTAGTGCCTATAGAGAGTTTCTGCTT:1 - chrX 7320763 3' - Doc3-element 4547 1 61.11 ATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGATAAGAAAAGAAAAGATAAGATAAGAGAAAGGTAATAAGAAGATATTTCATTCAA:1 - chr2L 15933246 3' + Stalker3T 201 1 33.68 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGGATAACTACTATCTGACTTAATATGATGAAATA:1 - chr2L 7750562 3' - opus 164 4 71.96 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCGACGTATGTGTTCGTGCTGTTGCACAC:1 + chr3L 13228527 3' - P-element 48 1 18.00 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAAAGTTTTACATGGAACAGAAGGATATGTATCTTCAGCGAATCAAA:2 - chr2L 18675614 3' - 412 41 2 59.09 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCACCTTTCGAACAAGAAAAACTAATAATGACAAAATTAAAAAAGCTCTCGAGAGGCTAGGCTAAGTCTAGGGAG:1 + chr2R 7175858 3' - FB 61 1 71.15 GCACTCTTCATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAAGTATACCGACATAATGATGGGG:1 + chr2R 11093054 3' + Ivk 4949 1 77.32 CCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACCCATCCATCTGCCATCCACACCCGTTGTTGGCAGGAAACTAGGCCAACG:1 + chr3L 461301 3' + Quasimodo 6993 2 64.37 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGACAGCCGAGGGCAACATTTCAAT:1 + chrX 18009541 3' - P-element 19 1 41.18 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAATATATTACGATTGCATCAAACTTGTTTAAATCTACTTGCATACTTTA:1 + chr3R 27071925 3' + jockey 4986 1 57.65 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGCATTATACTGTAAATCTTTTGGGTTAAAACATCATAAAT:1 + chrX 15500025 3' + pogo 2041 1 80.00 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTTTTTTTTTTGGTTTTTGTGTCGTGTTGCCTGTGTTTGTTGTGTCTTTAACCTCTCGGACATTAGG:1 + chr2L 9171525 3' - opus 112 2 78.72 GTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATATATTTTCTCTCTGTGCACTAGTTGCTG:1 + chrX 4509856 3' - R2-element 3508 1 75.23 ACCTCAGAAGAGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTGAAGCCTCGCCCAAAACACAAACAAAATTCCACACCGCTA:1 - chr3L 2393458 3' + I-element 14 1 57.53 CATGTGTAACCCATTAAAAAAAATCATCCAAATATCTCCCGTAGTTTAGTAGCATTAACTCGATATCTAAAAAA:1 + chr2L 5500937 3' - hopper 75 1 66.22 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCACGATCGGAATTCTCTGCGATATGCACCACAAGGAAGGTAAATA:1 - chr2R 9963487 3' - pogo 39 1 60.00 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGGACACATATATCTCTGAGCACGTACATAGAGAATTG:1 + chr3R 11326941 3' + flea 211 2 70.64 AGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAACAAATTACACACAAGCTCACACAATAAGCCCCATTCGCGCG:1 - chr3L 14005270 3' + I-element 4920 1 55.32 ATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTGAAATCAAAAATAAACCTTAAAAATATATTATTAAAAAGAAAAAAAAAAAGCCCAATGAGACACGATCCCCG:1 + chr3R 19770919 3' - hopper 220 1 80.00 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTTTTTTTTTCAGTGTTTCCTTTTTT:1 + chr2L 18694064 3' - pogo 42 1 76.60 CGGGGATATGATCGTATGCTTTTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATCTGTCAGCTGGAGTTTGGTTAGTCAAACG:1 + chr3R 22500858 3' - invader3 5241 2 67.02 GTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAACTGCTTTTTATTGTTGCTAATCGCTTCCATTATATCTTGGGCTCGCTTCGCTACTATTTAT:1 - chr3R 14011380 3' - invader2 401 1 72.53 ACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTTGCTGGTGTTTGCTGCCAAGGTTTTTACATAATTTGGTG:1 - chr3R 23485907 3' - F-element 4582 1 62.77 CTAAATTTGAAGGTTTTTTTTGTTTTACTAATCATTTTTAAAGTATCCATTTAATCCGTAACAATTTTGCTTTATACCAAAAGAATTCTTGTAGGTGGTATTCATCGCAA:1 - chr2L 9087538 3' + Tc1 1463 1 53.64 ACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGAGCTAAGCCTCGTCCTGGCTGATTTCA:1 - chr2R 11736880 3' + hobo 326 1 64.00 AAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGACGACCATCCCCTCTCATCAGCGCCTCTTCAGCGGCAACTCTACGTCAAAGGTGTCAACTCGCCAAATCTGCAACC:1 + chr2L 15018128 3' - Rt1a 4948 1 78.64 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGCTAAACCAAAGCAAGTCCAGTTAAAGTTTGGCCATAAACACAAAAAGCCACATTAATCATGACTCGACCCGTCAT:1 + chrX 16994202 3' + roo 400 1 69.09 ATGTGTGATAGGTCAGGAAGGCCGCGTCGCAGGTCATTTAGTATTTATTATTTAATCTTTCTGGGCGATTGCTCGTATGTGTTGATATTTCACGAGTTAATAACTTGAGT:1 - chr2L 7285847 3' + invader1 3586 1 69.09 CGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAAAAACTCCTACTATGACGCAGCTGCTGCTG:1 - chr3L 8513615 3' + 412 7360 2 59.15 AATAACAAGATGGGTAACGCCCTTCGATATTTTGCACACGATTTCTTCGTGCTGGCTAAAAAGCTGGTTTCAGGCTCTCTCGAAGACCTCTATAGCAATCCCAGTCAAA:1 - chr3L 23250441 3' - 1360 3376 2 68.81 ATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAGAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGTATGCTTGTTTATGATTATTTTATTCTTCGTTCTT:1 + chr2R 11775761 3' - hopper 1102 1 68.18 GAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGATCTCAACTGATCTGATCTGATCTGCTATTGAATCGCAAAACGCGTTGTTGCA:1 - chr3L 4490666 3' - F-element 369 1 63.04 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATTCCAACAATGTTGGGGGCAAAACTACACTTGCTCAAAATGAAAATTGAA:1 - chr3L 2815071 3' - Doc 48 1 58.33 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATCCTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTGGTGTTGTG:1 - chr3R 21907535 3' - 412 10 2 30.77 CTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCCTATCTTATCTTATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTC:1 - chr3L 22908067 3' - Stalker3T 204 1 30.95 TAGTTATCTCGTAACAGACCAGAATTCAGGGCAGTTGGCTCTAAGACCTTGCCCAAAGTGCCGGTGTCTAATTTTAAACTCGGAAAACGAAAACAAACGAGAAATCGGAA:1 + chr2R 20231798 3' + gypsy10 5922 2 61.82 AACCAATGTATGGCCGTTATTCACTTAGAAAAAAAGTGGCTTCTT:1 - chr3R 31919430 3' + 1360 3365 1 73.33 GTGTGAGTATGTGTGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGTGAATGCGGCTCGTGCGG:1 - chr3R 22594676 3' - accord 189 2 76.19 CCCAACCAGTATTATTAGTTTTTAACGTTTGACCACCCTTCAAAAACCTTTAACAAAATATTTGTTCTTATACAGTAGGAACTCTAAAGTAATTCATACAAGTCCATATA:1 - chr2L 1483569 3' + FB 359 1 53.64 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTACAGCGCAGTCAGAGTTTATCAGCTCTCCCTTCTTTTT:1 - chr3R 5671401 3' - 1360 39 1 65.00 GGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGATCTTCAAATACCTAAGGAAACCTTGTACTTCTTTACGATCTACAAGGAGGATACTTCCTGACACACTTATC:1 + chr3L 16083328 3' + F-element 4359 1 67.89 TGTGACGATGGGGTGAGTCTTAAGCAAGGAATTGTCGCACTGATGATTCTGTATCGAGTCCTCCCACATATCATGGGGCTGGCAATAAACTGGGACATAAGATTTACTAA:1 + chr2R 19710062 3' - Idefix 226 2 76.36 CAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTGGGGTTTTCATTTTAGGGTGGAGAAGGGGTGGGTGTTAAGTGTGTACGTGTGTGCGC:1 - chr2R 21208765 3' - 1360 3229 1 75.82 ACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCACATGTATGTACGTCTAGGAATTCTGAAAGTTAATCTCATTA:1 + chr3R 22730484 3' + roo 116 2 57.27 GCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCACGCTACTGTAATTGTTTTAAAAATGTA:1 - chr2R 546711 3' + F-element 379 1 61.67