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TTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAA:1	-	chr2R	19050286	5'	-	roo	376	1	50.00
TTTATTGAATCTTCTCTTGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGT:1	+	chr2R	5284495	5'	-	Doc4-element	2636	1	75.34
ATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAACA:1	+	chr3R	3922957	5'	+	Cr1a	91	1	72.60
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TTGTAGCATCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGAA:1	+	chr3R	25454034	5'	-	Quasimodo	7287	2	78.08
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TGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGTTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGCGCGGGTGCTACTCGCCAC:1	-	chr2L	15833050	5'	+	hobo	56	1	77.23
AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCCAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTG:1	+	chr2R	2007459	5'	+	1360	58	1	50.69
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AAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	+	chr2R	16945300	5'	+	jockey	69	1	66.67
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TTCGCAAGTTTCCATTTCTTGGACTTTCATCATAATTTTTGGGCGTTAGAGTGGGCCAGTGACACTGGGTCAATGCGTCTATGACTCTAGAATCTGTACGCCTAATATCAACCGTCTAGCATTTATAGTTCCTTAGATCTCGA:1	+	chr2R	25240229	5'	-	INE-1	146	1	67.83
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TTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTA:1	-	chrX	23182906	5'	+	Idefix	78	2	73.97
GAGCACGAATATCGATACGATATATTCACTAATATACATTTAACGTGTTAATCTGAAAACACGCGATTTAAAAAATTCTGCAGTGTTTAATTGAACACGGAGAGATTATGCTATATTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTC:1	-	chrX	19664541	5'	-	G5A	2690	1	65.07
AGTCCTGCCAACGGGCGAGAGCGTTTAAGATGGCTAAGGCAATTGAAACATTAAATTCGGTGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAA:1	+	chr3L	2325681	5'	+	I-element	5110	1	59.59
ATTTTCCCTGAGCAGAGAAGCTTTCAAGTGCATCCCAAAAGTATGCAATGAACTCGAGACGTCATCTTTTCGCTGTAATTGTCCGCGAGCTTGCCCAGTACTTTTCCAAACTTCTAACTCCCTTCT:1	-	chr3R	13239974	5'	+	3S18	152	2	59.52
ATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1	-	chr2R	20194282	5'	+	Max-element	51	2	61.86
TGTTGTGGTCAGCCTTTGTAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1	+	chr3R	22821948	5'	-	mdg1	7449	2	71.92
TTAGAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3L	21817930	5'	-	roo	9053	2	71.23
CACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACAC:1	+	chr2L	12290675	5'	+	1731	4384	2	64.38
TGCAATAGATTCAAGAGTTCGCCGAGTGGCTTGGAAAATCACTAAGGGGAAATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTC:1	-	chrX	11296468	5'	+	BS	5063	1	64.14
ATTATTAATAGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCT:3	+	chr3R	18339034	5'	-	roo	9062	1	77.40
CACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCA:1	-	chr3R	17478432	5'	+	copia	4867	1	59.57
GTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1	+	chrX	5107976	5'	+	accord	7104	2	62.96
ATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	-	chr2R	19050333	5'	-	roo	399	1	69.57
GACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1	-	chr3R	17316314	5'	+	opus	7025	2	61.45
ACATAAGAAAGGATACAAATAAAAGGTCACAATGGGAAATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGA:1	-	chr3L	25322836	5'	-	Transib5	2979	1	67.81
AGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chrX	10640010	5'	-	roo	9014	2	55.48
AGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1	-	chr3R	29361031	5'	-	mdg1	7372	2	78.77
GCAAACAGAAAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1	-	chrX	18030328	5'	+	opus	57	4	76.27
GGGTAAGTGTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1	-	chrX	14824769	5'	+	jockey	4734	1	63.56
TGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1	+	chr2R	12835026	5'	+	jockey	64	1	55.86
GTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGTCG:1	+	chr3L	18368907	5'	-	opus	471	2	58.33
CGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGTCCTGCAGAGGAGCAGAG:1	-	chr3R	11547815	5'	+	G2	297	1	68.31
TAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTCATATTGATTTAAGATTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAG:1	-	chr3R	11547784	5'	+	G2	295	1	56.88
GACACAAGCAATTAGAAATTTGAATATTAAAAGAAATATTCCAATGCCTTGGATGATTTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1	+	chr2R	20944327	5'	-	pogo	2062	1	54.55
ATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGGTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1	+	chr3L	7588436	5'	-	hopper	1362	1	72.22
TGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAG:1	-	chr2R	24218622	5'	-	412	463	2	53.98
TTATGAAAATATTGATTTTGGCTCAGCAATATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1	-	chr3L	3477539	5'	-	mdg1	383	2	58.90
TGTATGGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCC:1	+	chr2R	9220991	5'	-	opus	280	2	63.70
GTTTGTCTTGGCATACTCAACTAAGCTATGATGCTCAGAATAATCGTAAATTTTTTTAAAAATATCATATATATATATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGC:1	+	chr2R	9463370	5'	-	rover	308	2	56.25
GCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1	-	chr3R	11496617	5'	-	1360	3340	1	56.82
CAAAACAGCAGTTGATTTCGTTTAAACATATGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1	-	chrX	22838787	5'	-	INE-1	543	1	57.66
TTCCGTCGCCAATCTCTGAGTACTCGCACTCGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAT:1	+	chr3R	13199433	5'	-	roo	39	2	78.77
GATAGGAGACAAATTTCGCTGCCATTAGCGGAATTCAAATATAATTGTCCGGGAAAAGAATCCGCCAACTGTGGGGCCATTAAAAATCACTCCAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTGGCGCTGCGTAAG:1	-	chr2L	4410907	5'	-	Quasimodo	233	2	65.07
TATAAGCACAAACACATGCACATAGAACCTCTGGCAAGGACGTGCAGGATGCCAAGCACCAGTTCACTTTTATGAGTAGACAGGGTCAGAGGTTTCCATGATTATGCCCACTACTGTATGTATGTATGTATACT:1	-	chr2L	16230571	5'	+	1731	98	1	76.12
TAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGATGCGAATATTAAATAGCCGATGAAAGTT:1	+	chr2R	1320677	5'	-	diver2	327	2	46.40
GGCCGCGGTCCTCTCGATTCTCGGATGGAACGGGTGACTGGGGTAGGCTCCATTTAAATTTGGGTTAATCAGCGATAAAGCGCGCATTGCCATTGACAGCTCCACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACG:1	+	chr2R	23803288	5'	-	roo	8714	2	66.67
ATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1	+	chr3R	25339989	5'	-	mdg1	7378	2	72.60
GATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1	-	chr2L	20840503	5'	+	Transpac	4982	2	63.77
ATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGGAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCT:1	+	chr2R	23465990	5'	+	Doc	498	1	58.46
AGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAGTTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGCCACG:1	-	chr3L	20066954	5'	+	gtwin	83	2	71.53
TATCGCACGTTGGAACACAGTGGGTGCATCCTTCAAGCCGATAGGCATAGTTAAAAATTCACTCTTGACTGACAAACGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGATCTTGTAC:1	-	chrX	14068217	5'	-	Bica	422	1	67.50
CTTAGCAAATTTGCATGCCTTGTAGCATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1	+	chr2R	13585359	5'	+	412	14	2	74.66
GAGGTTATGTAGTTCCGATAAGAGAGTTTGTTCGTCCCGCTTGTCGGAACAATGCAAGTAAACAAAAGTTGTGACAGGAAATATGGACGCTAAAGACGCCCAACAAATAAATGATAAGTTTAACCAAAGACACTAGAAT:1	+	chr3L	23445705	5'	+	Tc3	236	2	61.87
ATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCACTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATCTCTGGG:1	+	chr3L	7292441	5'	+	HMS-Beagle2	6918	2	61.43
CATGCATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAA:1	-	chr3R	21276655	5'	-	BS	5065	1	55.86
CACATAAATACGCTCCCATCTGGAGCTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACATT:1	-	chr3R	10182191	5'	+	blood	34	2	56.84
AGAATGTGTAATAACACCAAATTATTTAGCGATTCACGAAGACGAAATGTCTTATTATAAGGAAAAATATCAGTTTATAAGGAATATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAA:1	-	chrX	22118662	5'	+	gypsy	7022	2	61.64
GGATGCGTGTCCTTCGGATGATGGCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chr2R	19050157	5'	+	roo	8683	2	67.16
ACGCTCCTTGATGTTGGTGGAAATCGAAGTGCGCTGGAGCACCCTGCCCATCTGCTCGGCGATGCTCATGAAGCGATGGCTAAAGATGCTCAGATGGACTCTTCATTAAATAAAAATTACTTGAATATTAA:1	-	chr2R	22481280	5'	-	blood	6921	1	75.57
AACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1	-	chrX	23182957	5'	+	Idefix	11	2	65.07
AGTGCTCTCCCCAATTTTTGGCCATAAACTCTTTTTTATTTCATTTTATATTCCCATTTCTTTTTTCTGTGTGTTTCATTTGTTTTATTTGCACTTGCACGTCATTATGTTTCAAT:1	-	chr3L	10824874	5'	+	accord2	7285	1	57.76
AATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr3L	22437932	5'	+	roo	53	2	73.39
AGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1	+	chr3L	18368906	5'	-	opus	446	2	58.90
AGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1	+	chr3L	13845134	5'	+	opus	7163	4	64.52
AATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTC:1	+	chr3R	2527742	5'	-	INE-1	549	1	57.27
AAGACATTTTATCATCAAATTTACTATTTTACCATATCGCTGCTTATCATTTGATTGGTGTTGGAACACCAGGCCCATCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAG:1	-	chr3R	23229142	5'	-	jockey	4685	1	52.45
CCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1	-	chr3L	17560362	5'	+	pogo	34	1	61.00
AAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTC:1	+	chr2R	5284541	5'	-	Doc4-element	2601	1	48.89
CTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1	-	chr3R	10274024	5'	+	HMS-Beagle	63	2	69.23
TTTTAAAAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1	-	chr2L	6863374	5'	+	pogo	75	1	70.55
GTTTTTCGGTGTATCAGTTTCGCACACTCCACGGATCTCAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAGAACAAAAACCTCCGTACTAAAACACAAACCTGCTCTCCAGTCCTTGCTCGC:1	-	chr2L	18802679	5'	-	Rt1b	5009	1	70.92
GAGTGTCCTCATTTTCACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3R	7100950	5'	-	roo	396	1	71.23
GTAAACCCGGCTTTTTCACTGCCTTTTCGCCACACTTTCCTTTGACTTCTGTGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCTCTT:1	+	chr2R	10582365	5'	-	Juan	4203	1	66.37
CATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chrX	2444332	5'	+	roo	8706	2	53.79
AAAAACTAAAAAGAAATGAAAAACTTAAGGTTGACTACACTAAATTCATGAATGAATACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGAAGGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAA:1	+	chr3R	19445096	5'	+	R2-element	3394	1	76.56
ATCTATGACAAAATTATTGGTATTCTAGATAAAGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1	-	chr3R	17831934	5'	+	F-element	22	1	69.86
ATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1	-	chr3R	11496589	5'	-	1360	3329	1	74.78
ATATTCAAGTTTCAAGTTATTTTACCCTCAAGTTCGTCGTCGTCTCCATTGTCGTTTTACTTTATTGTTTATGCCCGAATTGTGTTTGAGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATA:1	-	chr2L	2687465	5'	-	copia	229	1	65.71
AGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1	-	chr2R	2427619	5'	+	Doc	63	1	61.64
AAAAGTTTTTCATTTAATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	+	chr3R	28624534	5'	-	roo	9036	1	60.69
TATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1	+	chr2L	18419147	5'	-	412	7479	2	62.86
AAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATCGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAG:1	+	chr3R	2169839	5'	+	gypsy11	4090	2	66.43
CATTAGCTCGGCAAAACGTTGGAAAAAAGAGAATGAATGAGTGGGGCTTGTGCCTGCGATTTGGTTTTACGATATTTCTTTCTGCCTTTTATTTTGTTGTTTTTATTTTCCTTTTGTTTTTTCCTTTTTTTTTT:1	+	chr3L	7880090	5'	-	Doc2-element	233	5	60.45
ATTAATTCAACTTTTCTTTGAGTATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACGCACCCAGAGGCGCCTGGGAGATGCGTAATCGAGTGGACGTG:1	-	chr2L	11674430	5'	+	jockey	20	1	61.29
AATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCACAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1	+	chr2L	23068820	5'	+	1360	5	2	73.87
GTTTAAAAGCACATGACAGCTACACATGCAGAAGAGTTTCNATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGT:1	+	chrX	21585229	5'	+	mariner2	255	1	73.10
ATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr3R	28624550	5'	-	roo	9019	2	55.48
GTTGTTTTTTGTAATATTTTCAGTGCCCTTCGGCGCTGTCATTTTATTGTACTCTGATTTTTTATAAAATATATAGTTACAATTTATGGCATTTTACAATTTCGGATCAGCGGCAGTTGTGCGCGCTTTACTTAGAG:1	-	chr3R	6968499	5'	-	TART-B	10388	1	77.37
ATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATAT:1	+	chr2R	7898079	5'	+	roo	8735	2	71.23
ATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1	+	chr3R	28758283	5'	-	mdg1	7412	2	50.00
CTCCCATTATCTTATATAGGTGCTATAGAGGTATTTTCTCNATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1	-	chr2R	16945346	5'	-	jockey	4925	1	68.22
AATTGTATTGAATCAATTGCAACATTTCTAGATTTTTTAATCTCCAGAGATTATTTTAATATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1	-	chr2R	9221152	5'	-	opus	487	2	74.44
GTGGGCTGAATGAACGCGATAAGGATCTAGTCAATAGTGCAATTTAAATAAATTTTCACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1	-	chr3L	17685247	5'	-	mdg3	216	2	43.15
AAGGTGAGAGATTTGAGCCGCGGATGCACCACAATAGAGTGGGTTTTTGAGGGGGGCTTAATCAATTCAAAGGGCTGCAATTGTTTTCCGTGGGACTACATACATGCCGAGGAGTCTTTTCCTCCT:1	-	chr3R	30163018	5'	-	baggins	5272	1	63.49
AACTAGTTTTATTTGCATCCGTTCAAGAAAGAGATTTTTTTAGATTTGTTTGATAAATTCATTGCTATGGCTTCTAATAAATGTGAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1	+	chr3R	31109619	5'	+	I-element	28	1	62.86
TTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1	-	chrX	6522079	5'	+	F-element	43	1	56.15
GACATTGATTTGTAGCTATTATTTCTTATAGAGCAAATATCCCTTTCTAGACTTTAGTTACGAACCCCCTTTATCTTAAACCATAGACACCCATGCATGTTACGCCGCAGTTGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAA:1	+	chrX	12074462	5'	-	412	493	2	73.19
GGGCTTTTGGGATTATTGATTTGTTCTCTGCTCGCCTGTAAACTGATATTTGGCATTTGAAATGCGAGCAATTCTGTATATTTCCTTCTTTGTCAACTAGCAAGATAACTAAGGGGGCGCAGTCAAGCCCTCCAACGTAATCTT:1	+	chr2L	20992051	5'	+	gypsy	364	2	65.28
AATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	+	chr3L	23635037	5'	+	roo	37	2	60.00
GCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1	-	chrX	6522032	5'	+	F-element	50	1	65.56
ACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr2L	3114556	5'	+	roo	73	2	72.26
GCAAGCAGAATTTTAAGAAACGGTACTTAGGAAAAGCAAATGACGAAAAATGTTCACATTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCCAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCGTC:1	+	chr4	290940	5'	-	rooA	7538	2	67.91
AGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:1	+	chr2L	13585840	5'	+	Tabor	40	2	56.14
CTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr2R	8585418	5'	-	roo	354	2	54.11
ATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTG:1	-	chr3L	23702257	5'	+	G4	61	1	56.16
CAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATATGTGACA:1	+	chr3R	18339097	5'	-	roo	9003	2	64.08
CAAAGGGAAAAACGTAAAAGGAACGCAGAATATTTGGCCAAGGATTCCATTCAATTTTAGTTTGGCTTCAACTGAATGCCACTCAAATTGGGCGGTCTTTTCGATAAGGAATGGGATAAGGGTTATTCATGTGTATGTATGTATAT:1	-	chr3L	17448932	5'	-	1731	78	2	60.27
TGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGGTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1	+	chr2R	20496921	5'	+	blood	70	2	66.20
AAGGTAAAATTCAAGTAAATGGGTAAAAGAAGTGGAGCCACAGCTAAAGTAGCTGATTTTGGGGGATGGAAAGTGCTTGTTAAAGATTTTGATATGTTTTTCATATTGATATTGATGATTGATATTTTCACATTTTGATTAGTC:1	+	chrX	15434976	5'	+	INE-1	282	1	67.36
ATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTTAATTATTTTATTTTAC:1	+	chrX	13066525	5'	-	jockey	4928	1	70.31
ACCATTAATTTTCGAATATTTAAGTCTTTACTGCACTAAAATTTAATAATAAAAAAATATGAAATTCATAAATTATACATGGAATATATTGAAATAAATAAAGACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1	-	chr2L	20808465	5'	-	HMS-Beagle	7028	2	75.86
CCTGGGTGCCCCCCAAAAATACTGATACATATATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAA:1	+	chr3L	6388898	5'	-	17.6	438	2	74.78
CCAAACCGGCAAAACACCACGTTGAGCCACGTTTATTTGATAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATATCTAGGCAGCTATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGA:1	+	chr2L	16067035	5'	-	297	6966	2	72.59
GGCAAAACATCTCGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGTCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	-	chr3R	22276802	5'	+	jockey	35	1	69.35
CGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1	+	chr2R	9791563	5'	+	412	46	2	54.79
CTACCACAATTATATCAACATGTCATGTGTTGGGAGACCTCAATACGTAGTTTACTCGGACCGCATTAAATCGGTCTAAAAAAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATA:1	+	chr3L	24007281	5'	-	blood	155	2	64.39
GTGTTCGATTTACATTTACTTAGCCGACTGGCCCTGCGACTCCTGCTGCGGCGGCACTTAATTCTAGAATGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGCACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1	+	chrX	5662810	5'	+	P-element	4	2	79.41
CGCAAAACAATTTCAACTCGGCCAGCAGCAATTTCCAATGATTTGCCATAAGTTTTTCTCGCTTCTGATTTAGAGTGACGGATGCGCTTGTTTTTTTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTTTGTTTATCTTGTT:1	+	chr3L	9302344	5'	-	Porto1	157	1	58.82
ATCCGCGAAAAATGGGTGAAGGAATCCGATAATTCAATTTATTCTAGCGGGTTGTTCGCTCTACAGCCAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1	-	chr3L	23728777	5'	-	HMS-Beagle	7027	2	74.10
AGCATCTGCGATATCATGAAAGTTCCTGAAGGTGAATCTCAGCCAGACGAAGGCGAACCCAGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAATGTCTCAAAA:1	+	chr2L	17411498	5'	-	mdg1	391	2	55.56
AATCTTTTTTTTTAAGTTAAGCTTAACTTAACTTACCTTTTGTATGCTCACAAATCCATGCTTCACATTAAAACGCTTATCCCGAACACCCCTCAAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGA:1	+	chr4	770538	5'	+	Helena	859	1	59.50
ACGAATAACCCTTTTTTGTAGCATCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACG:1	+	chr3R	25454019	5'	-	Quasimodo	7302	2	67.81
CGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1	+	chr2R	20496908	5'	+	blood	61	2	58.90
GACTGGTTCAGTAGGAGGCTGATATCCGACGAACTATTGAAGAGATCCTGTATTCCCATCTGCAAATTTAGAAACATGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1	+	chr2L	7888092	5'	-	pogo	2100	1	73.33
ACAGAGAAAACCAGACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1	+	chrX	13504162	5'	+	412	7127	2	67.12
TGGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chrX	2295986	5'	+	Tirant	15	2	60.67
AGCACATGACAGCTACACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGTG:1	+	chrX	21585236	5'	+	mariner2	263	1	68.49
GCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1	-	chr2L	7945387	5'	+	roo	90	2	78.77
ATGGATCGGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1	+	chr3L	15995906	5'	+	297	39	2	55.94
CGTCAGATAGGGCGATAAACAGATGTTTGTGAAAAAACAAATTGAACAAATTAAATCAAGCATGGGTGATAGATTCGGGTATGAATTAATTGTTGCTACTTAGGAGTCAAAAAGGTGTTTACAAAATTATGTTAGTGATGTATATA:1	-	chr2L	106728	5'	-	gypsy11	66	2	63.70
ACTCCGGTGTGCACATCAAAGCGGGCACTTGAATGCAGACAGTCGAGTGGCCGAAGTACTGTGGTCAGTCTGTCAGTCAATATGCTTTCCATTCAAATGCGCTTAGCTATGCAGTTTGGTTATAATTTAATAACATTTTAAATAAA:1	+	chr2L	12351235	5'	+	I-element	5265	1	80.82
GCTGCTGCTGTCAAAGGCGCTAGCCCTGGCCCATATTCTAAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr3R	12886882	5'	-	roo	8999	2	73.91
ATATACACACATATATATTCGATTTCAGCGTAAACAACTGCTATATAATGTCCGTCGCCATCTGACAGTGGTCCTAACAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTT:1	+	chr2R	10126235	5'	-	P-element	17	1	54.79
AATTGGTTAAATATTATATGTTATATTTGTAGAACAAAATCTGTATTAAAAACGATATGATTATATATTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAA:1	-	chr2L	15845829	5'	-	roo	8764	2	53.42
CTGAAACTGATACACATAAAAATGCCACCTTCATGCGTCTGCTTATTTGCTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGCACGAAGACTCGCTCCG:1	+	chr3R	20627939	5'	+	gypsy6	35	2	60.27
TATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1	-	chr3L	11441848	5'	-	roo	9028	1	56.16
TTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCAC:1	-	chr3R	11496626	5'	-	1360	3348	1	54.89
AAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr2L	17420231	5'	+	roo	8739	2	74.10
ATGTAAATGGCACTACTACAAATAATAATATTTAAACGAATTTAGGCGTAACAGCCATAGAGAAAATTTTGAAAAAACGACAGTCTGTTATGAGATATGGATTAGTTATGTTTTTGAGCACTGCACATGTCGCCTTAGATAACAAA:1	-	chr3L	21321230	5'	-	roo	8764	2	73.29
CATCGGGCAGCGGAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1	-	chr2L	14892318	5'	+	transib2	40	1	54.81
AGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1	+	chr2R	2016810	5'	+	1360	27	1	60.33
TAGTTACTTGGAGTTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1	-	chr3R	6611314	5'	+	HMS-Beagle	27	2	64.18
CTCATGAACCATCATCACCACCATCGCCAGACGGAACCAAAGAGGCATCCCGCAAAGATGTACCCGCAAGTTTACATACTTTTGAGACTGTCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTAAATCTA:1	+	chr2R	9871795	5'	-	rooA	7563	2	48.63
AGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGC:1	+	chr3R	20499749	5'	+	mdg3	61	2	56.55
GTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	+	chr2R	16945289	5'	+	jockey	74	1	62.76
AAACTTCAATCTTATGATGTAGCATAATAAGATATAGTGCTATATCTATATAGAATTCTATTATGATTGAATATGTTGAAATGATATAGAAATCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1	+	chrX	8347536	5'	+	412	7081	2	52.05
GTTCCGACAAAAATCGCAACCAAGGCAATTATCACGCAACAAGGCTTTTGGTTCGCATTCAAGCACATTGTAGTTTTATTTTTCCAAATCGATAAAAATTTACAAGACAAATAAAAACGTAAAAAAAATAACAAAACATTTTTCAA:1	+	chr2R	19944872	5'	-	INE-1	266	1	59.59
ACCTAACCTTATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	+	chr3L	14603214	5'	+	jockey	18	1	75.17
AAAATTTCAAAGAAATGCCTAATTAAATAAAGTATCTTTCAAAAGTAAGTTATAGTAATCAAGCTAACGAAATGGCTTTAAATTGTATGCAACATTTTGGAACTGCACATGGTCGCGTAAGTATGTTAAATATCTGGTTTATAGAA:1	-	chrX	18670336	5'	-	I-element	5033	1	78.77
GAATTGTCTTTAAAGCTGCGGACAGGCGTCTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTCCTACATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1	+	chrX	4214913	5'	-	flea	220	2	59.59
ATTTCATATATTAAATAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACAT:1	+	chr2L	4953911	5'	+	Quasimodo	33	2	62.33
ATGTCCGGATGTTCCAGTTGCTCCGGCAACTGGCAACTGGCAACTGGGAAGGACATCAGTGGGGCAAATCGTAGAGGGCGAGTGGCGGGCTGC:1	+	chr2R	6919847	5'	+	hobo	2929	1	74.19
ACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chr3R	17817892	5'	-	roo	339	2	65.07
GAGGAAAAACAAGTTTCAGGCCAAAAATATTTCAGCATGAATTTCGTTGTCACAATATGACTGAAACATGGGCAAGGCATGCCGCATTCGAGGGGTATGGGGTTCCCCGACTATCAGATACCCAT:1	+	chr3R	14706851	5'	-	INE-1	554	1	77.60
GGTTATCTAACAAATTCTTCATATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTATACCAAATAAAATATGATACAAGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGATCTTGTTTTACGTGGCGGGTTCCACACTGAAGGG:1	-	chr3R	19448626	5'	-	R1A1-element	5298	1	58.22
GCCACTTAATTTTGGCTAAGAAGAAAGAGAACTCTGTGCATTGGGAGACTAAATATAAAATTATTTTGCCAAGAGCACCCTTTTTGATGTAAAATTTTGTAATACTCTTAATTAGTTTAATCTTAAAAGTAAACTTCAAAAATATA:1	-	chr3L	4676187	5'	-	hopper	176	1	65.07
TTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCG:1	+	chr2L	10365212	5'	+	micropia	4970	2	73.79
CATATACTTCGATTGGAAACGATTTCAGATCTAGCATCACTGTGCTGCTTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGGTGATAGGGCCTTCCGAG:1	+	chr2L	20840377	5'	-	Transpac	299	2	75.38
AAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGA:1	-	chr3L	2485980	5'	+	jockey	4531	1	35.11
ATATTATATTATATTATATTATCGGCATTCCACAGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1	-	chr2L	15950935	5'	+	Doc	58	1	81.42
TGATCAACCTAAAATGTTTAAAAGCGCTGCAATGAAAATAATGCAGTAAGGTACATAATGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATT:1	-	chr2R	2565016	5'	+	gypsy	7040	2	54.29
ACTTGCAACACAATCGTTGTTGCTTTTTGGGTAAGTGTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1	-	chrX	14824797	5'	+	jockey	4724	1	51.47
AAGTTCCGTTTTTGCGTATGGAAAGCTTAGTTCATGGACTACATTTCGAGTAAAATTTCGCAATTAATTGAACCACATTTTGTGTGATGTTGTTGTGTTGTGAATTTTTAATAGCCCACCACCTAAAATAAAATAATTTTTTAAAA:1	+	chr2L	4895186	5'	-	1360	3092	1	77.40
GTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	-	chrX	6486794	5'	-	roo	338	2	68.06
GTAGCATACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chrX	17054175	5'	+	jockey	27	1	64.80
ATATGTAATAACAACATAATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1	+	chr2L	8986083	5'	+	412	7078	2	67.12
ATCTGTAACAAGTTATTAGGTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCTTCGAAAGCC:1	-	chr2R	8146168	5'	+	P-element	16	1	70.68
ATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGT:1	-	chr3R	16076876	5'	-	roo	343	2	61.64
ACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	-	chrX	14336473	5'	+	roo	63	2	81.98
CCAGGTTTCCGCAAATCGTGATAATAATATTGAAATCAATCAAGGCCGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATTG:1	+	chr2R	6487868	5'	+	copia	48	2	57.39
CCGACAAGGAAAAAGAAGTCGACCCCGAGGTCCCGGGTGGCTGGTTTTGGGCCTCTCGTATTTAGAAGCATTCTCGGGAGAGACCCAATAGAAGGGCTGGCCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTG:1	+	chr2R	1462278	5'	-	Stalker4	75	4	70.63
AAAATGTAGCATACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chrX	17054170	5'	+	jockey	20	1	69.11
CAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:2	-	chrX	10640093	5'	+	roo	8746	2	74.66
AGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGCAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGA:1	+	chr2R	15064348	5'	-	412	7476	2	64.38
AAGGCTAAAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1	-	chrX	7256192	5'	-	412	7479	2	68.15
AATCTTACAAATTTAATTAGGCATTTGAAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr2R	18336284	5'	-	roo	9051	2	72.22
AATAAAGTCAAAAAGTAGAAAATGATAGGAGCAGCATGGAATACTTTTAAGTACCACTTATTTTTTTTGGGATATCGAAGGATATTGGGAAATAAAATGAGAAAAAAGTTTAAAAATCGGTGAAAAGTGTGGGCGTGACCGTTTTG:1	+	chr2L	5214197	5'	-	INE-1	244	1	60.96
AATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1	-	chrX	6486821	5'	-	roo	9027	1	50.00
TATGGCTTATGGAGTTTTAGAAACTTGAGGAGACTTTGCTTACGATCTAATTTCACATGCTCAGAGTATGTAAGTATAGTTGGGGGGGTGTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1	+	chr2L	1517579	5'	+	jockey	4701	1	64.96
CCTGGCTGGTTGGTTGGCTCTGGAACTGGTTCCCCCAAAACACGCGATGTGCCGGGACTTGTTTATGTGCCAATTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATCACGCTACAATAGCGTCG:1	+	chr3R	27416416	5'	-	Bica	4816	1	50.00
TATCTAATCGACAACTGAAATGGAGTTGGGATTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGACGTA:1	-	chrX	1899734	5'	+	P-element	32	1	61.31
ACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:3	-	chrX	23439052	5'	-	P-element	2495	1	63.31
TGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1	-	chr2L	12483808	5'	+	P-element	63	1	35.38
CATTGAGGCAAACAGTTTTCCTTATTATCTTTAAGCCTGCAAATACAGTGGTTACTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1	+	chr3L	6978092	5'	+	pogo	15	1	73.29
CACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTAGTCCCTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAAT:1	-	chr2R	4339503	5'	-	G5A	2790	1	73.03
GATACTTAAGAAATTTTTCAGCAATGCAAAAGTTTAAGAGGTGAAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAA:1	+	chr3L	19521654	5'	+	I-element	213	1	69.86
CAAGTTATTCGGAAAATAGACATTAATGTTGTAAATGATTTCATATTTGTTCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1	-	chr3R	29421052	5'	-	roo	9037	1	57.27
GATTTCGTGCAAATTAACCCGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGCAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chrX	10639991	5'	-	roo	9051	2	60.94
AAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACG:1	+	chr3L	6978151	5'	+	pogo	74	1	69.18
ACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1	-	chrX	10521757	5'	-	Tabor	451	2	59.59
TCGGGTGGTTTTTTTTTTTGTAAAAAAAACACAACAGCGGTAAAAC:1	-	chr2L	8529672	5'	+	hobo	2826	1	73.91
AAATATTGGTTACCTTTTTTTCTGGCACAGAGATGGAAAACGGTTCGCCACGAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1	-	chr3L	18369060	5'	+	opus	7022	2	67.81
ATGTTATATTAAAGTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1	+	chr2L	524197	5'	-	mdg1	7384	2	68.49
GCACAGCACGTGTGTTTCTTAAATGGATAATCAGCTAGGAAACATACATTCATAAGTGTCTTTGTATCTTGTTCTGCACGTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACAT:1	-	chr3L	15514282	5'	-	pogo	1710	1	58.16
TGCGAGCTGTCACCAGGGGTGCGGATAGCTGTTCATCGTTAGACGACGAGGAGTTGTTGTTGGTTGTGGCACTGG:1	+	chr2R	8141294	5'	-	Doc4-element	190	1	89.33
TATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr3L	20654480	5'	+	roo	69	2	66.44
ATCTTCTTTACTGTTTTAGAAGTTGTTTAAAAAGTGCCACAATGTTTTTAAGTCCATGTATCATCTAGAAGGTGNCTATTTTAAACTACAGGAAAACGTATCACTTAGTTTTGGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTAC:1	-	chr3R	5171726	5'	+	Tc1	1438	1	69.18
CTCTAAGCACCGGGGAGCATCACATACGACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1	-	chr3R	17316341	5'	+	opus	147	4	54.92
AGCAAATAGAAATCACACCTACAGTGATCGCTCGCTAAGCGAAGCATTGTAGTGCTCATGTTTTAGAAAATAGATTATCTTGGAGAAGAAGAACAAATAATAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCT:1	+	chr3R	14284562	5'	+	1360	469	1	68.49
AGAAACATTTGCAACACTAATATCTTATATCATATTACAGTAACTGGCGGGTCTTATGATTTATTTTAAAACTTTAAGGACGTAATGTACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTT:1	-	chr3R	13237417	5'	-	3S18	307	2	58.22
AGAGCCAGTCTGCCGTAACCTTGCCAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGTTCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATTTCATTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGC:1	-	chr2R	5364480	5'	+	GATE	437	1	80.28
CTCCGGTGTCCTTATTGCATAGCTTCAGGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAACACTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	-	chr2L	6059318	5'	-	roo	350	2	56.85
GAATTTTTTCAATACTACTATAGCAGTTTGTTCAGCAGTTTGATCTAGTTTCAACAACAAAAATATGAGTTATTTACTCAAAAGGTAGACTTGATGACGGAAGTGGCCAACAACACAAAATCTGCTCCG:1	-	chr3L	24033647	5'	-	G3	404	1	71.32
TATTGCTTTATTAATTTCCTGTATTTCATGTGATCGTACTGATTATGTAGAAACACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr2R	23802948	5'	-	roo	345	2	63.19
AGCATGGCTATTATAGCAATAAGAAATTATTATTTCAATTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACGCCCAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTA:1	+	chr3L	16787105	5'	+	Chimpo	172	1	65.07
TTTTTGATCTCAAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1	+	chr3R	14651180	5'	+	P-element	25	1	64.34
AGGAAATTGTGAATTAGAAGCAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGAGTTTTCCTTGCAGTTG:1	-	chr3R	9922105	5'	-	blood	7357	2	63.01
CAAGGGAATCCTTTTTCGAGAGCTCCTGCCCGGAAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chr2R	21228967	5'	+	jockey	20	1	73.68
CAGATTGCCGGGTCTGGAATACAATGAAAATTAATTAATTAATTATATACTTCAGCATATCGCATTATATTATTGTCAACATATATCAAGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAC:1	+	chr2L	9906431	5'	+	invader3	18	2	63.57
GCTTGCAAAGCTAACAAATGAGGGAAGAGGACTGTTCATTTGCTTTAGGTATATATATATAGAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1	-	chrX	17756683	5'	-	297	6952	2	56.64
CATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAA:1	+	chr4	1152027	5'	+	transib2	85	1	73.29
AGCCCAGTGAAATGGCGGCCATCGAGCGCGAGGTGGATCCAGCTCAGCAGCCATTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAAAAAATTATTAG:1	-	chr2R	24487742	5'	+	F-element	4540	1	68.63
TACGTATACGCCATGTGTTACAGCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	-	chr2R	9328727	5'	-	roo	9041	1	63.45
AGAAAAATCAGTTAAAATTCTACCAAATCGTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1	-	chrX	10694579	5'	-	I-element	5323	1	49.32
GTATAAACTTCTTCACAACAATAATTCTCTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCA:1	-	chr3L	19014050	5'	+	invader3	15	2	71.01
ACACTGCGAAAAATATATACAATAAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATGATTTTATTTTACAATGTGTC:1	+	chr3L	18555886	5'	-	jockey	4920	1	69.86
AAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1	+	chr2L	16091865	5'	-	roo	9040	1	59.59
GACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGAAGGAC:1	-	chr2L	22063437	5'	-	INE-1	125	1	60.69
TATACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTNCTGTTTGTGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTG:1	+	chr3R	13237275	5'	+	3S18	47	2	52.74
ACGCTCGCTGAGGGCGTTGGTTCCCACAGATACGGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCACGCAAATTCTATTTTTA:1	+	chr3L	17886252	5'	+	1360	3264	1	64.71
ATTTATGGCCGGCCAGTGATATAGGATATTATGAGCCGATGGAACATTAAGAACAATTAAATAAAAAAGCATAGTAACTTATGGCAGCGCTTT:1	-	chr2R	16785386	5'	+	412	7101	2	45.16
ACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1	+	chr2R	19499320	5'	-	P-element	2870	1	55.17
CAATCGGAATCAATTTAAATATAAATTATATAAGTTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATG:1	-	chrX	20870166	5'	-	gypsy	386	2	69.18
CTACGATCCTGAAAATCTTCGCAAGAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACACTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1	-	chr3L	11321528	5'	+	mdg3	5260	1	67.52
ATTTCATTAATTTCCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	-	chr3R	30344717	5'	+	pogo	60	1	60.69
CGTGAAATAATCTGGATTTTACTCATGAGTATTGAAGATATAAAAGTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGGAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTGACACACTAAAGTGAGGTCTTACTAGATGTAG:1	-	chr2L	15227357	5'	+	gypsy12	77	2	71.03
AGGTTTCTTCATTGGAGGAGGCTCCTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chrX	18193612	5'	+	jockey	15	1	76.09
TATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAG:1	-	chr2R	4601640	5'	+	HMS-Beagle2	66	2	65.07
TTTTATAACAGCGCTTCGCCTCAAGTTCCCCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCAGGAAGTGCGGACATAAGCACTCAACCATCA:1	+	chr3R	2211374	5'	-	1360	456	1	69.03
TATACTGTATATTCTATACAGACTCGAAACCCGTTACTCTAGTATTACTCTAGTAATACAAAGTTTCTAATCTATTTTATTTATAGAATCCTATTTGATTTAATATTCCAAAGTCTAACCAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAA:1	+	chr2R	9501902	5'	-	G5	4720	1	30.14
CATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1	-	chr3R	22276760	5'	+	jockey	85	1	61.36
CCCCATTTTCGGAATCAGGCATATATAATAAGTCATGTATTTGAGCTGGCCAAATCGGAGAAATCCCTGCGCTTAATCTCATCTCTAATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAA:1	-	chrX	11468266	5'	-	hopper	37	1	54.11
TATGATATACAGTTTGGTCCCGACTGCAACTCCTCGACTGGCTCTTCCACTCCAGTAAACTACAAATAAGCTCTAAGGCCCTTTAAATCAAAGCCATACTTGCTCCA:1	-	chr3R	896647	5'	+	G5	4359	1	70.09
TTCACGCTTGAAAACAAACAATAAGTACCCGGATTTCGTGCAAATTAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	+	chrX	10639960	5'	-	roo	401	1	77.40
TTTTGATAGCAAATTTTTTCTTTTTTTTTTAATAAAAAAAAAAA:1	-	chrX	14222448	5'	+	transib2	2633	1	61.36
TTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	+	chr2R	20596463	5'	-	roo	9004	2	64.38
TCTAAAATATTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	+	chr3L	4948041	5'	-	hobo	2921	1	57.73
GATTCTAGTGCCAGACTGGTTCAGTAGGAGGCTGATATCCGACGAACTATTGAAGAGATCCTGTATTCCCATCTGCAAATTTAGAAACATGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1	+	chr2L	7888079	5'	-	pogo	2080	1	65.22
AGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1	-	chr2L	1665025	5'	-	hobo	2913	1	70.67
CATTATCTGCAGTCAGTTCAACTCACTTTTTGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1	-	chr2R	21145949	5'	+	pogo	77	1	79.14
TAAGTTTATTCTATTTTTAATGCTGACTCGGCTGATGTTTCTCCTGACGTAGGCCACTAAAGGGGCCGCTAGAGCTATGCTCGTAAGGAAAGTGGTCTAA:1	-	chr3L	11296258	5'	+	gypsy12	9892	2	78.00
GTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTT:1	+	chr3R	14049325	5'	+	transib2	55	1	54.11
GTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTT:1	+	chr2R	11363770	5'	+	Bari1	87	1	80.14
TCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr3R	22956042	5'	+	roo	69	2	64.38
GACATTGTTTTGCGGGCAAATATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chrX	5274388	5'	-	roo	345	2	62.33
AAGGAACTGGCACTTTAATCAGATTCCAGCACGCCGAACGAGATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1	+	chr3R	28758241	5'	-	mdg1	7454	2	62.33
TACTTTTTCTATTTTTTTACGTAAAGGTAAAAAAAAATACCTTGCTCCATCATAACTAACTGCATATTATTGTTGTTGATGTTATAACTTAATGTATATAATTTTGCATCTAAATGCGGTAATTATATACAGTATTCTTAGTTTG:1	-	chr3R	17105937	5'	-	flea	4946	1	69.66
AGATTCGTTAAAAATTATGTAACAGGCAAAAGGTAGCGTGTCCGGTCATATAAAGTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGGACGTCGAGATCTAAGG:1	-	chr2L	17178546	5'	+	INE-1	137	1	71.85
CCTGGCGAATGCCACCATCGATCCGGTGCCAGTGGGATCCAGCAGTGAGTCTAGCCTTCCGTCTACTCCACATGCCCTTCTAGCTACTAAGATACTTAACTTATTTTCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCC:1	-	chrX	20477288	5'	+	R1A1-element	5020	1	76.26
ATGCACAGCTCGGTGCCCCTTACTTCACACCCGATTCGAAACTAAATAAATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1	-	chrX	10201266	5'	+	transib2	26	1	69.18
GAAATATATTACACAGGCATAAACAATAAATATCGATTTGCTGGTGATGATTTCGTTTAGAATTTCCATCACAAGTCATAAAGCTATGATTTCATTCAAAGCACTTAGCATAGAACGTTTTAAGGCATATATATTCTTGATCAGGA:1	+	chr2L	8095968	5'	+	INE-1	78	1	69.86
TGAAACGACAGCGTCACAGATTCAGATCCCCTCCACCATTTATTTTCCATATAGACCACGTTTTTCGTGTGTCATTTTGATTTAATTACAAACAATTTGACAACTAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAG:1	+	chr3L	14596827	5'	-	jockey	161	1	78.57
ATATCAGAATAAAAATGGGCGTAAAAGCTTCTGAATTTTATTCAATTATAAGACAAGTCATGACTTTTCGGATTCTCGATATCGTAAATTACCCTGACTGGATCACTAACACGATCAAATTGAAAAAACAATTTTTCCTTTCTAAA:1	+	chr3R	29533088	5'	+	Stalker	6765	2	78.77
CTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGTCTTCGAGGCAATAAACATGCAC:1	-	chrX	23108336	5'	+	BS3	1456	1	53.96
GTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAAT:1	-	chr2R	5173547	5'	+	gypsy	36	2	57.04
ACTTAGAAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	+	chr2R	9328569	5'	+	roo	8673	2	73.33
GCATGCACAGAACATAACGTAACGAAACTTGAAACCTGCAACAAAGTAAAACACATGATCATTGTATAACTTCTTCATTCTTTTTGTATGCACTTAAACTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATG:1	+	chr2R	6271498	5'	-	F-element	466	1	70.00
GATTTGTTTTTACTCATTAGGATGTTTTAGCATTTGTATCCATTTTTACGCTCGTATTTATCGTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1	+	chrX	10794232	5'	-	BS	5105	111	59.55
CAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGGATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATGCATC:1	+	chrX	5274297	5'	+	roo	53	2	55.38
CATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1	-	chr3L	22968410	5'	-	mdg1	365	2	67.50
CAAAGGATTGGAGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACC:1	-	chr2R	21298847	5'	+	jockey	254	1	55.22
AACAGCTGCACAGACAAAGGGAGAGATAGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGAAC:1	-	chr3L	21855574	5'	+	blood	7034	2	69.86
GATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGA:1	-	chr2L	19310368	5'	-	Juan	4127	1	76.71
GCCATAAAACAGTTGACTTTTAATTATGAGCTGCCCGTTCGGGCTATTGCAAAGGCCAGCACTTTTTCAGCCAAGTTTCTTTCATTAGTTAACTCACTTGAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTTATTACGGGGTCACCAA:1	+	chr3L	4767087	5'	-	Chimpo	208	1	69.86
CCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2R	8585417	5'	-	roo	9019	2	53.42
TTGCGATAGTGTTAATACGAAACTGTAAACATTGCAGTGGTAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1	+	chr2R	20899885	5'	+	hobo	64	1	71.32
AGCAGAAACAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGTACACGAATATAT:1	+	chr2R	9632065	5'	+	roo	8668	2	77.31
CACTGGTGGATGGGTGTTGTTGTGAGTTTTCTGAGTGGAGTGTAATGTTTTGCATTTTAACAAAGACTCTAGAATAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1	-	chrX	23052579	5'	-	1360	3361	1	60.00
AGCATGCCCAGATTCTCCAGCTCGTATGGCCGTATGTTGAGCAACGCCCGTCCGCCGATCTCCTGCTTGGAGAACTCGTACAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCACAGC:1	+	chr2R	17419139	5'	+	gypsy	265	2	68.00
AATTAGACCTAAACTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1	-	chr2R	16248042	5'	+	BS	4	1	72.31
CAGGTTTTGATTAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	-	chr2R	20596568	5'	+	roo	8708	2	53.90
AAGTGCTGAAAATGTTCTTTATTGTTGAATTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAG:1	-	chrX	7887152	5'	-	297	328	2	80.15
AGACATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCCTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATTAGTAATCTATAAGTAATCAGGAGCAATAGCCGAGTCGATC:1	-	chrX	14815848	5'	+	INE-1	96	1	76.71
AGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1	-	chr3L	18368993	5'	+	opus	161	4	75.93
TTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1	+	chr2L	13763158	5'	+	pogo	70	1	68.28
AATTCTCAATAAGACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTA:1	-	chr2R	4270301	5'	+	gypsy9	5033	2	58.22
AAAAAAAAATGCTAATATCATTGTTGATCTGTTCTGTGCTGTCACCTGTTGCTTTGTTGTTCTGCAGCTGCCGCTAAATGCTTCTTAAATTCCTTTTGTTTTTAGCTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAG:1	-	chr2L	13095680	5'	-	Juan	4057	1	77.70
GCAATAGTTGCCTTCGTTAATTGCGATTTTGGCCAGTCGAGTGCACAAAGAAATTGGCAAGTGTACGAAAATAATTCGCCAATGTATTTCGGGAAATTGGACGACGTGACTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCC:1	+	chr3L	9054006	5'	-	Doc	4312	1	80.74
ATTATTTAAAATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1	-	chr2R	19050346	5'	-	roo	404	1	74.66
TCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1	-	chr3R	7835196	5'	+	roo	57	2	68.29
TCTTGGATTTTTTTTTTCATAGTGGTTAACTAGAACGTCTNATATTTTCTAAAGTATTCATTTTTTCAAAATTGAAAAGACTGGCCAAACGCGGGCAAATAAAGACAACAAATGAGAAAACGATTCCAGCTTTCAAATT:1	+	chr4	474803	5'	-	FB	40	1	75.54
ATCATATTACAGTAACTGGCGGGTCTTATGATTTATTTTAAAACTTTAAGGACGTAATGTACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTT:1	-	chr3R	13237389	5'	-	3S18	6049	2	59.57
AAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr3R	18339104	5'	-	roo	9010	2	67.19
CAAATTGCCTTGTACTTCAACTTTATCAATTATTCACAAAAACCTTTACCCTGAACTGAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAACACTACAACAGTATA:1	-	chr3L	9673136	5'	+	Doc	63	1	52.41
AGGTGAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACA:1	+	chr3R	26659715	5'	+	HMS-Beagle2	24	2	63.70
GATGGTTCCATAAAAATGAAATGATTTTAAATGATGACATGTTCAATGGAATTATAACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACGGCGATGGTGACTCCGCTGCTTAAA:1	+	chr3R	5157998	5'	-	gypsy4	6412	1	53.97
ATGAAAGCCTTTTGGGACTGCCACATAACAAATTCAATTGCATAGATGGGATTTCTAGTGGTTTTCTCATCACTGAGCATTTCAATTGATCTATTTGTGCCGATTTTATATTGGGAATGACCTACTAACACTAATATTTAATATAG:1	+	chr3R	26149271	5'	+	Cr1a	4301	1	78.77
CTCATTTTCACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	-	chr3R	7100943	5'	-	roo	9054	2	70.83
ATAAAACAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGGTCGTC:1	-	chr2R	5209694	5'	-	gypsy	7389	2	56.64
CCATGCTTCTTCTTTGCACCTCTCGCCAGGCGAGGTAAACAATTTACAAAGATGTATGTAATAACTAAAGTATGTTTAAATGTAAATTTTTATGTATTTTTTAATACCTCAAACGCGAAAGGCAAAACAAAAAAAAAGAAAAAAA:1	+	chr3L	21425784	5'	+	gypsy7	5002	2	71.03
AGTAAAGTTTAGAATTAGACCTAAACTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCG:1	-	chr2R	16248054	5'	+	BS	1	1	76.26
CGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1	-	chr3L	15600320	5'	-	roo	9030	1	54.55
TTGCGCTTCAAAAATCAAAGTGGACAGAAAGCGGGATTAACATACCTGAAAAAGAGAGCAGAAAATGGAAATAAGTTGTTACGTTCCATCGAAACCTAAAGACAATATATTATCTATTTCAGTTTTTGTTTTCTTTTTTTTTTAA:1	-	chr2L	10556263	5'	+	hopper	151	5	65.52
ATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chrX	6486807	5'	-	roo	349	2	59.59
CAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTATAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCGA:1	-	chrX	6522067	5'	+	F-element	68	1	53.85
CCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1	+	chr3R	9921993	5'	+	blood	60	2	70.87
GAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	25448449	5'	+	roo	8712	2	53.10
AAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3R	25448442	5'	+	roo	42	2	53.79
AACACGAGTCGCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr2L	3886256	5'	-	roo	9022	2	50.68
TGCACATACAAAAAGGTAGGAAGTGGGCTGAATGAACGCGATAAGGATCTAGTCAATAGTGCAATTTAAATAAATTTTCACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1	-	chr3L	17685269	5'	-	mdg3	5490	2	56.85
TGGTGGGGGAAATATGAGGAAAAACAAGTTTCAGGCCAAAAATATTTCAGCATGAATTTCGTTGTCACAATATGACTGAAACATGGGCAAGGCATGCCGCATTCGAGGGGTATGGGGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTAC:1	+	chr3R	14706836	5'	-	INE-1	551	1	77.62
TTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1	-	chr3L	11441846	5'	-	roo	9026	1	54.79
AAAAAAAGAAATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	+	chr3L	11393445	5'	+	roo	23	2	67.86
TTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1	+	chr3L	10647918	5'	-	412	421	2	66.44
AAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr3R	7835211	5'	+	roo	8728	2	62.76
AGTTGACAAATTGCAATCGAGAACAAGTGAAGTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGC:2	+	chr2L	2122372	5'	-	Stalker	363	4	51.37
GGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	+	chrX	13504135	5'	+	412	47	2	53.42
AATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGAATGGG:1	+	chr2R	4887636	5'	+	jockey2	3023	1	67.59
AAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1	+	chrX	17054209	5'	+	jockey	77	1	65.00
AAATTGTTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTNTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1	-	chr3L	12879845	5'	-	roo	361	2	52.05
TTTTACATACTAAACTCGAACAGCTTAATATTTTGAGTTTAATTTTAAAGTATCATTTAGTTTTTAACGCTTTTGAAAAAGCGAAAGCGATGGGGCAACGAATCGAGAAGCAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGAT:1	+	chr3R	18815577	5'	+	Doc3-element	4376	1	58.22
AACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACA:1	-	chr3R	11547806	5'	+	G2	310	1	60.27
AGGAGGCTCCTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chrX	18193627	5'	+	jockey	17	1	72.00
ATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chrX	8543514	5'	-	roo	8989	2	75.35
CCGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2R	19004216	5'	+	roo	60	2	68.99
AAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr3L	21817968	5'	-	roo	9015	2	58.90
TTTTGGAAAATTTACGTTTTAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCCGTTGTATTTGCTTTAATGGTTTAGTATATTTATAAAGTCATTTGACTTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACAT:1	+	chr2L	20531083	5'	-	hopper	1080	1	62.33
CATTTCGTGTTTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1	+	chr2R	20496855	5'	+	blood	7018	2	77.93
CGGAAACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2R	25118781	5'	-	roo	357	2	57.55
AAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1	+	chr3R	14651235	5'	+	P-element	96	1	19.31
ATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr2R	12835034	5'	+	jockey	35	1	55.96
CTAGATGTTTTTCAAAAGCTCTACGCAACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr2L	6059179	5'	+	roo	8684	2	69.29
CATAGCTGACAGCAACTGTCTGTCAATTGAAATTTGACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAAT:1	-	chr3R	25423336	5'	-	3S18	6092	2	72.59
ATAAGGCTCGTTGGGGCTGTCCAGCGATGTTGGTTATTCGACGTGCGGGGATTTTTTTTTACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGT:1	+	chr3R	19210930	5'	-	diver2	4667	2	65.52
TTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGTACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCCCTAAACAAATCA:1	+	chr2L	16223108	5'	+	Tirant	8133	2	51.00
ATTGAGCTTGGATATAAGAAGTATAATGTGTACACGCCGGTGCTTGGATTGGTTCCCGCGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCC:1	-	chr4	419646	5'	-	roo	267	2	60.00
CAATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGCTGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1	+	chr3R	25826648	5'	-	mdg1	377	2	53.42
CAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1	+	chr3R	11496524	5'	+	1360	65	1	61.64
TGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTA:1	-	chrX	10694547	5'	-	I-element	5308	1	57.36
TGAAGTTTTTGGCATATTCAAAGTTGGAAAAGTTGCACTTTGAGGCTGCTAACCAAAAAATATAACTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	-	chr3R	11083989	5'	+	412	40	2	52.99
CATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	-	chr3L	22437946	5'	+	roo	76	2	70.55
ATGGTAACATTAAACGTCTTTTTATCAGAGAGAAACTCTAGAATCTCAATTTTTTCTTTTAAAGATCATTACTTTACCCATCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGTAAGCGGTTTTG:1	+	chr3R	4138186	5'	-	Quasimodo	6953	2	57.14
TTTAAAAAAATTGTATTGTGCGAAGTCCTAAAACGCCCAAAAAATGTGGTATGAGTACAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGCAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATG:1	-	chr3L	24766400	5'	-	rover	66	2	62.14
TTTTTCGATTTTCAGGTAGAAGGCAAACAATGTTAAGCCAACCGCAAAGTCAGAGGAATTTATTTGTATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1	+	chrX	8814717	5'	+	pogo	42	1	52.86
ATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACACACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1	+	chrX	17054223	5'	+	jockey	95	1	74.31
ATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAA:1	+	chr3R	4357517	5'	-	Tc3	1658	1	52.05
TTTTCATTAGTGGGTGGCACTAAAGGTAATTTGTACAGCCAACCCGGCTTTTGCATTGGTGGCAACAGACATAAGAGAGGCAGCTCGTCAACTCCGACTAAATGTCACATTTTTATTTCTTACTCTGCCAGACCACAAC:1	-	chr2L	18689563	5'	+	Gypsy6A_LTR	244	1	58.27
GGGTGAAGGAATCCGATAATTCAATTTATTCTAGCGGGTTGTTCGCTCTACAGCCAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1	-	chr3L	23728764	5'	-	HMS-Beagle	7019	2	67.16
CGAGCTCCTACCGAACACTATACTATACTTTACTATATGAGAGGACGTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1	+	chr3L	10056065	5'	-	transib2	2798	1	66.44
GGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGG:1	+	chrX	10521619	5'	+	Tabor	30	2	59.20
GGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGGGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1	+	chr2R	977552	5'	+	F-element	84	1	73.68
GCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	-	chr3L	11530956	5'	-	roo	9014	2	70.00
CGTCCTTGGCTCCATTTCCTGTGTCTCTCTGCACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1	-	chr3R	7482859	5'	-	412	465	2	62.22
AATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGATGTTACAATTTACCTTACAAGAAAACCG:1	-	chr2R	21298802	5'	+	jockey	255	1	61.11
ATAGGGGGTGAAATCAGAGGCGGCAGCAGGTGCAGGGAAACGTCGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	+	chrX	5274245	5'	+	roo	6	2	78.52
CGCGTTCGGGCATTGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTACGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGG:1	-	chr2R	24218635	5'	-	412	7519	2	58.54
CCAACACTTTTAGTCTTAATTATATTTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACTATATTGTGTGCGGGTGC:1	+	chrX	3308302	5'	+	hobo	46	1	51.61
TAAATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1	+	chr3R	17478355	5'	-	copia	5075	2	53.42
AGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1	+	chr2L	11732245	5'	+	Doc	8	1	65.83
TTCAATATTATTACATTTCTAGTTGATGGTTTTCAGAGCGATTTACAGGCTTGAGTATTGAGATCGATACATTCGTGTATTCCAATCCTACAAAGTCAGCGTAATTTGAGTCTGTATATGCCTTACTAGAGGAGGGATAATAC:1	-	chr3R	3854703	5'	+	Transib5	2549	1	65.03
AGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGGAACGCC:1	+	chr3L	11257352	5'	+	1360	12	1	59.02
TAATGATTTTAGAGCCCAATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1	+	chr3R	25826632	5'	-	mdg1	393	2	64.38
TTCCTCTTCTTCAGCTTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chr3R	29258901	5'	+	Tirant	15	2	66.09
AGACATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAGTAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1	+	chr3L	23818350	5'	-	copia	213	2	67.36
GTGGAGGGGGGAAGGAGGGACAGAGGATAATGGAAGGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCACCTAAACCCCCACGCCTCT:1	-	chrX	2296020	5'	+	Tirant	16	2	70.16
ATTCAAAAGAGTGCAGTTTGTTGTGCATAAATTGTTTATGTTGGCAAACCTGGGCCGTGTTTGTTTTTGTGTTGCTGTTCACTGTTGTAGTGCAGCGCGCGAGTCCGAAGTGTT:1	-	chrX	15275965	5'	-	gypsy10	455	1	55.26
GTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGTACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGTATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1	-	chr2L	14588753	5'	+	Tabor	6868	2	63.01
GAAGTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGCT:1	+	chr2L	2122400	5'	-	Stalker	335	4	60.96
GGTATACCAAGAGGTATTGCAGACTGCAGTACACTTGTGTCAAGTGGGGTCAAGAGCATGCCTCTGCAGAGTGTAGAATCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1	-	chr2R	4502774	5'	-	HMS-Beagle	233	2	60.94
CCGTTTACAGGTTTTTCATCCAATTTAGTAAAGTTTTATTTACAGCGTTTTATTTACATTTTCAGTAACCAATTTTTACGGCTTAATCAAAACCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACA:1	-	chr3R	31939737	5'	-	opus	221	2	62.50
TCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1	-	chr2R	2529355	5'	-	1360	3344	1	52.67
CTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr3L	9998025	5'	-	roo	398	1	50.77
ATTGATTTGGAGGGATTTGTTTATTTTTCAGACCTACCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGG:1	-	chr2L	4951923	5'	-	Quasimodo	6926	2	69.35
ATGTATGTGCTCCATGCATCCTGCTCGCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATT:1	-	chr2L	21008648	5'	-	invader3	236	2	55.00
AGGTATCTTGTGGCCAAAGGTATCTAGTTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1	-	chr2R	4977096	5'	+	1360	58	1	74.14
AGAACGCTAGAGGTGGAGTTCCATTTCTGATTGCCGGTTGCAGGTTGCATGTTTCGGGTTGCAGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr3L	16342557	5'	+	roo	8709	2	48.63
ATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	-	chr2R	20596527	5'	+	roo	8687	2	69.62
CCCAAATTAAGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGAGGTCAATGCTGACCCT:1	-	chr2L	13914189	5'	+	jockey	4708	1	48.06
ATTTGCCTGTGCGTGACAATGGGTCACTGGGGGCAAGACAAGCAAAAAATACTTGTCCACATTAGTTTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1	+	chr3R	26685995	5'	-	Juan	4155	1	53.42
CAAACGCAACAAACTATAACTAACAACCCCAATTCCTCGTTAAATAAACAAACATTTCTCGATACTGCGCATCCAATCAAACTGTAACCAAAACCCAGCCACTACTACGCCGTCACATAGCCACGTAGTACATAAGAATTATTTTT:1	-	chrY	520271	5'	+	Tom1	160	1	75.34
TATTTATCTGCTTTTCATCATATATTAAAGAAATATACAATTTTTTTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1	+	chr3R	11105928	5'	+	Doc	16	1	34.75
AACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	-	chr3R	20427497	5'	+	jockey	27	1	67.44
CATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTC:1	-	chr3R	15364018	5'	-	flea	4954	1	60.27
CTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGCTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chrX	18193674	5'	+	jockey	86	1	67.81
AGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAA:1	+	chrX	6499826	5'	-	Quasimodo	234	2	64.58
GGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr2L	7945377	5'	+	roo	48	2	79.79
CACGAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1	-	chr3L	18369012	5'	+	opus	7057	4	69.92
GCGACTAACCAAGTGCCTGGCCTGGCCCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGC:1	+	chr3L	4755204	5'	+	jockey	4668	1	77.78
ATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTG:1	+	chr3L	17558019	5'	-	jockey	4922	1	69.18
TCTATAGAAATAGGTGTAAAATCGCGGCGGTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGGGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTG:1	+	chrX	17833003	5'	-	Tirant	334	2	71.20
CTTAAAATTTCCCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACA:1	-	chrX	6499052	5'	+	Quasimodo	36	2	56.20
GTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATTCACGCAGTTAGGCC:1	+	chr2R	9791606	5'	+	412	89	2	79.45
ATGATAAAAAAGAAATTCTAGCATAACTGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	+	chr3R	22955938	5'	-	roo	358	2	50.68
ATTCGGGAAAACCAAGGCGATGCAAGCGAGCCGCTTCTAGGACTTGTGAACCACGTAGCTAAGCAATTAGGACCCTCTCGTGGAGAGTGTAGTTGCACTTCCAGTAATGTGTCACAATTACGGCGCTTACCACCG:1	+	chr3R	16087902	5'	-	baggins	47	1	53.33
ATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1	+	chr2L	21367231	5'	+	Doc	82	1	68.97
CGCAATGTAAAAATAACAAAAGCACATTAAGAACAAAAGCAAAACCAGAGAAAAATATGTAGGCAGTTATGTATATGGTTCACATCCAAATTTGAACAAAACGGAGACGAAGAATCATAAAGAACAAAAGCTAAATCCACCAGCA:1	-	chr2L	15647093	5'	+	HeT-A	282	1	69.66
CTTTAATGCATATTCATAAAAAAAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1	-	chr3R	28075448	5'	-	jockey	4975	1	69.86
AATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAA:1	+	chr3L	23456274	5'	-	Gypsy6A_LTR	274	1	66.13
GTGTTAAAGCTTTTATTTCAAAATTTCCATTTCTGCAGTTGGAAATTTCTCTTGACTTAGTATGTAGTATTGCTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACA:1	-	chr3L	18555215	5'	-	jockey	4711	1	57.89
AATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATATTCTAGATCTGGATCAATAGCCGAG:1	-	chrX	19192430	5'	+	INE-1	90	1	79.45
CAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1	-	chrX	21667914	5'	+	gypsy2	6548	2	71.93
AGTATGGCCAAAATGTAGCATACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chrX	17054161	5'	+	jockey	27	1	66.91
TTGTCCCCAATGGATCCATAGGCCTCGACCTGATATTCTATGTGGCCTGGCCATATTGAATAGCAGAATTATGCAAAGTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGA:1	-	chr3R	23235608	5'	+	jockey	4804	1	56.16
CAAAAATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAA:1	-	chr3L	8249137	5'	+	jockey	4562	1	52.67
TTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1	-	chr3R	17243231	5'	-	hopper	1388	1	60.47
AACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr3R	7482742	5'	+	412	42	2	54.17
TACAAATTTAATTAGGCATTTGAAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	-	chr2R	18336279	5'	-	roo	9044	1	67.81
CGCCGGAAAGGCTATCGGAGTTGCGAGAGCGAAGCAGAAAAAAAAACCAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1	+	chr3R	11196322	5'	-	hopper	147	103	52.86
CACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCCTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr3R	18339189	5'	+	roo	58	2	60.96
ATACTTNAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	-	chr3R	7100874	5'	-	roo	8999	2	74.62
AATAAATTTTTTTGTTAGTGGATGTCCTTTATATTTTGAGGGAATTCAAAGCATAATGCAATTTTAAGCAAAGTCCATTACACAAATAATTCCAAATACTAAAAAAACTCATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTCAGATTGCAT:1	-	chr4	1035331	5'	+	Tc1	77	1	73.79
CACAATGTAGTATCCTTTCTTTGCTTGGTGTCCTGCGTCACATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTACGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCG:1	+	chr2R	21104010	5'	-	P-element	30	1	28.06
ATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGACCGACGTCAGCAG:1	-	chr2R	23332599	5'	-	invader4	3018	2	76.98
GGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGCGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTATTTCTGTATGAGCACATACATACATACA:1	+	chr2L	12290695	5'	+	1731	71	2	69.60
AAGCTCCATGTTTTAAATGGAACGTAAACACACATGCCAGTGTATGGGTAGTACCCACACACTCATAAGCAGTAACACACATACATACACATACACACACACACAC:1	+	chr2R	14443519	5'	+	Quasimodo	31	2	75.47
TATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1	-	chr3R	28075379	5'	-	jockey	4955	1	63.92
CTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1	-	chr2L	15991415	5'	-	mdg1	7409	2	52.74
TAAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chr2L	3886145	5'	+	roo	8714	2	56.72
CCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGAATCGCAGCAAAATCCAACTA:1	-	chr3L	5102508	5'	+	BS	4694	1	47.27
GTTCATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1	-	chr2L	15991422	5'	-	mdg1	378	2	54.79
GAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAACCAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTCTTTGGAAATATCTTCGGTT:1	-	chr3L	12879828	5'	-	roo	352	2	55.07
GGAGTTTTACTAAGCTGTTGTTTTTGCACAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGCGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1	+	chr2L	12483759	5'	-	P-element	2814	1	25.98
CAGACTGCTGCATATTTGGGCGAGCACTCATTTCCTGCGTGCCCGAAAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chr3R	13360249	5'	+	jockey	20	1	76.71
AGACTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr3R	18582244	5'	+	roo	8728	2	64.38
TAAATGCGCAAATTTTGTAACAAATAAAACAAAATGACGGAAGTAGCGATGCGTGGCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTAT:1	+	chr3L	12308316	5'	+	hopper	63	1	58.22
CGTTGTGTACAAGTGCGTTCAGAGTCATAGACTGAATTGAACCCAGACGGGTGGTCCGTGAATGGTACTTTTCCCGCACCATCTACTTCATAAAGCCTTCTTATTTTGGTGAGTAATGTTTACAAAATTATTTTATTAAAAAAAAA:1	-	chr2L	8991745	5'	-	hopper	162	1	54.79
CATTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1	-	chrX	2518094	5'	+	P-element	91	1	20.55
AATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	+	chr2R	8585446	5'	-	roo	326	2	73.29
GATGGAGGTTGGATGGGGGTTTCGCCTTAATTTTGGAACAACTCACCAGGCCCAACCCCC:1	+	chrX	16619789	5'	+	HeT-A	5918	1	65.00
CACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1	+	chrX	17756569	5'	+	297	46	2	55.80
TGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTACTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1	-	chr3R	15072672	5'	-	pogo	2062	1	53.38
CACACGCCGGCAAACAGTGACTGAAACAACGGCGGATGCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr2R	21908026	5'	+	roo	16	2	64.22
GACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGA:1	+	chr3L	7588413	5'	-	hopper	1347	1	65.07
CCAATCTCTAATAAAAAGTGAAATTAGAACTAACACTTTGCGGAATTCAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGATGATAGGGCCTTCCG:1	-	chrX	21016883	5'	-	Transpac	301	2	68.80
CTTTACTAATTTTATTTTGAGATGTTTCTAAAAATCGATTTATCATAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTG:1	+	chrX	21668847	5'	-	F-element	4362	1	69.18
AAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTG:1	+	chr3R	26431981	5'	+	opus	7188	4	73.19
ACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTC:1	-	chr2R	23332601	5'	-	invader4	250	2	78.83
AGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	-	chr3L	12861799	5'	+	pogo	65	1	68.84
ATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1	+	chr3L	4536717	5'	-	roo	321	2	75.34
TCATACAAATACGAGCACGGAATGTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1	+	chr3R	14981117	5'	-	mdg1	408	2	72.39
AAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTT:1	-	chr3R	17605718	5'	+	Tabor	76	2	67.12
TAATACTTGGATGGTTTCCCATTCTCTATTGTAAGGACCTGAGAACTTGTACGCACGTCTTCAAGCGAGTGGCATCTGTTAAGAAACCAC:1	+	chr2L	9355953	5'	+	Chimpo	3971	1	68.89
GTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGC:1	+	chr3R	26659763	5'	+	HMS-Beagle2	72	2	67.81
AACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1	+	chr3R	6290933	5'	+	Doc	19	1	70.97
GCCAACCGGAAGGGGCGTGGCAAGCGGGAGGGGGGGTGTACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTTTTACAATAATGTGT:1	-	chr3L	12308397	5'	-	hopper	1395	1	50.57
GTACAACATTTATTTGAATTGTGAAAAGCTAAGTCTGAAAAGAATGTATGTATTTGAAGTTTACTACGAAGTAGGGAAAGAAATTAGCTCAAGGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1	-	chr2R	22145602	5'	+	FB	40	1	55.48
TATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1	-	chr3L	16015370	5'	-	1360	3374	1	70.14
AATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATG:1	+	chr2L	22315560	5'	+	frogger	2323	2	60.00
GTTGACGAAAGCGATTGGAGATTGCAGGGAATGCAATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTACAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1	+	chr2L	11518356	5'	-	412	7528	2	69.92
TATAGCTCATAAAATATTTTTCGCACATTCATTGTCCCTTGAACCCAAAAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1	+	chr2L	2687325	5'	+	copia	42	2	51.45
ATTCTAGGCGCGAGCCAATTGACACAATCAAATTCGAACCCCGCAAATTCGCTTAATGCGCCGCGAGACAAAAACAAAAGCAGCAAAAAATATTTCATAAATAGGAACACGCA:1	+	chr2L	3665187	5'	-	micropia	71	2	76.11
ACTCATGTCCTGCATGCTTCCGTTTTTCCACTTTTCCACTTTCTCTGCCTTTTCGGCCACCGGAAACGACCTTTTCTTTCTGCATAATTTCTGGAAATATTATTATTATTATTATAGATAGAA:1	+	chr3R	6524771	5'	-	I-element	5348	1	79.67
GTTACTGCTGGTACTGGTACCACACGGCGTATGGGTGATGGCGAGCGGGCCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTAGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAA:1	-	chr2L	9564536	5'	-	transib2	2754	1	64.38
GGTATTTGTATTTGCGGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGCGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAA:1	+	chr2R	10124164	5'	+	P-element	89	1	15.38
GCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACA:1	-	chr3L	5102494	5'	+	BS	4740	1	70.42
GAACCTCATTACGACACTTTGGTCATTCGCCACGCATTCAGAACCGACTCTCTTTCAGAATCGAAGAATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGT:1	-	chr3R	17950689	5'	-	roo	36	2	51.80
AACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1	+	chr3R	7835109	5'	-	roo	9033	1	51.94
TAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAA:1	-	chr2L	22775552	5'	-	pogo	2024	1	73.72
GGGTCTGCTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr2R	13710588	5'	+	roo	8735	2	67.12
ATCGATGTCTCGTGAACCGCAACGAGTTAGTTGCGTTTTTGAGCGCGTTACCAGCGGACGAACAACGACATGGAGCTGCCAATAGTCCAGGAGAGTGTACGAAGGAGGAAGACAATTTAGTGACACTGGGACCCTAGTTGAAGCAA:1	-	chr2L	7778033	5'	+	Tc3	1310	1	58.90
AGCATATTCTAGCTTTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr2R	21920633	5'	+	jockey	18	1	73.76
CATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCTGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr3L	15177233	5'	+	roo	71	2	70.90
TTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAATGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1	-	chrY	3648914	5'	+	Transpac	40	2	61.64
AATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1	+	chr3R	25826649	5'	-	mdg1	7425	2	57.04
ATGCGCAGCAACGAAAAATCGGCATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1	-	chr2L	12892687	5'	-	roo	9034	1	68.42
AATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGAAATAATTGATGAATAGGCTTTATTTCTTGTTTTCATCTGCACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACG:1	-	chr3R	19446774	5'	-	roo	8971	2	71.05
AACTGACTGCTCCAGTGACACACAAAGCATAAAGAGACTTGAATATGTGGCGCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTG:1	-	chr3L	20879980	5'	-	1360	3220	1	63.89
TATTTTAAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1	+	chr2R	977510	5'	+	F-element	39	1	60.00
CGACGAACATTTTGATAATGTAGAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTTAGGCAGTGGCAGCTTTGGGCGGTTTTAGGGCGGT:1	-	chr3R	3625097	5'	-	INE-1	344	1	78.26
TAGCACTGGGTTTAAGTAGACTAATAGATTCGTATAGGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1	+	chr2R	7452856	5'	+	pogo	81	1	75.34
CTCGAATTGGGAAAGTCAGAAAAGCTGTTCAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1	-	chrX	21430265	5'	-	hobo	2911	1	61.45
ATCGGGTTCAGATCGGAGATAATTCGACGTAAGCTGAAGAAGGAGGTGGCCCAGTAATTACCCCTGGAAAACGAGCCCCCTGCTGCGTTCGAACGTTAATAATCCCGGCCAGAACATATACTAGTCTGTAATGTTTGTAAT:1	+	chr2L	20374890	5'	+	gypsy7	5092	1	76.60
GGATCAAAAGAACTTTGGTTGATTCAGATAAATTCAGATAAATTGGAAAAACGAAGATTTCTGCCATTTTTAAATGGCTATAACGTATAATCGTAGTTTATGCACCTTCAATAGTATTTTCAAATATTTAAATTTTAAGATTTTTT:1	-	chr2R	18831622	5'	-	1360	3037	1	65.07
GTATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chrX	18193681	5'	+	jockey	73	1	68.25
GTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATT:1	+	chr3R	16076769	5'	+	roo	52	2	54.79
GTTCGATGGAATGGCTAGCGCCAAATTTGAAACGATGATGGAATATTTTGGTTTAGAAGAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTAT:1	-	chr3L	12861297	5'	-	pogo	80	1	59.59
ACATGTCAGTCATAGTAGCATTAACAATTCCATAAAGCTAAACTGCCGTAGAGCGCAGAGCTTTCGTAGCGATTTAAGTCACGTAAATAATAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTT:1	+	chr2R	21299720	5'	-	jockey	4895	1	73.39
CACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACGCATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	+	chr2R	19050200	5'	+	roo	8722	2	61.54
AATGGATATATGTAGATATACATGTACATGTATACATGGATATATGTATATGTAGATAGGGAAAAAAAAGAAAATCCGGTTAGTTTTTTCCTTTCCTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAGCAATTTTTAGTCTGTTCATAAGA:1	-	chrX	9205305	5'	+	HB	198	1	56.85
ATTTGCATCCGTTCAAGAAAGAGATTTTTTTAGATTTGTTTGATAAATTCCTTGCTATGGCTTCTAATAAATGTGAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1	+	chr3R	31109629	5'	+	I-element	28	1	58.46
AAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	-	chr2L	11518499	5'	+	412	37	2	53.73
GAATATTACAAAAAATATTAATTAGGTGCGTCTTTGTATATAAAGTAATGCGAAAGCTGTTCTGCATACTAAAAAAATACAGTAATATGATTTCTGCTTTGTTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGTA:1	+	chr3R	18084319	5'	+	INE-1	30	1	86.30
AACTAGCACGTTTCAAAAACTCAATCATAGGCGTTTCAATGAAGTATTAAATTCTTCTGCAAACGTGCTAAATTGTAATTAAGGCAAGTCTTATCATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGA:1	-	chr2L	6863476	5'	-	pogo	1820	1	72.44
GGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACACACCTAATTATACATAGCC:1	+	chr3R	20499755	5'	+	mdg3	5298	2	52.42
AAAACAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTG:1	-	chr2R	5209692	5'	-	gypsy	411	2	56.06
AGTTCTTAAAAAAATGCCCAACCTTTTAACATTTTCTCTCTGTGCATCGTATATTCCAGTCGGATGTGTGTGCATCGGCGCTGAGCGATTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAAT:1	-	chr2L	7851778	5'	+	Juan	126	1	60.27
CGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAAC:1	+	chr3L	11115123	5'	+	micropia	5026	2	60.71
AGGGACAAATATTTGCCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTGTGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTAT:1	-	chr3L	10013686	5'	-	hopper	1367	1	51.37
CTCCTCCTTTTCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1	-	chr3L	20888837	5'	+	1360	21	1	68.49
CAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chr2R	21229028	5'	+	jockey	17	1	60.00
TTTTCGTTTATATACACATTAATTATTCATTTAATTTATTATACATCCTTGAGTTTATAGTGTCATTGGATTTTGCAGAAATACCCCAGACCTGTATTCCGTACGGCCA:1	+	chr3L	27423900	5'	-	BS	4669	1	62.39
AGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATT:1	+	chr3R	19589915	5'	+	BS	5058	1	58.90
TGGATATTTTGACAAAAAAAAGTCATGCGATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1	-	chr3L	17558148	5'	+	jockey	4679	1	78.62
AGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1	-	chr2R	13585489	5'	-	412	7470	2	69.93
CAGTGGAACATCCTATCACAAAGTATGTCCCTAAAAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCCTTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1	+	chr3R	11207234	5'	+	FB	67	1	72.22
GATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	+	chr2R	25118683	5'	+	roo	8732	2	65.75
TGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTNTTATTAGATTAAGTTATGTT:1	+	chr2L	15247918	5'	+	Transpac	4944	2	56.57
TTATCAATAAACGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr3L	22437862	5'	-	roo	389	2	58.25
CGTCCGTGGCAGAAGGACATAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACA:1	+	chr2L	12290688	5'	+	1731	4383	2	72.73
AATCATGTTGCACTACCACTTTCACTACTATTTTTAATGCATGTAACATACACTTGCATTTACGGAGCTGCATACGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1	+	chr2L	18404500	5'	-	hobo	2920	1	64.71
AATATGTATATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1	+	chr2L	11732226	5'	+	Doc	8	1	69.06
TGCCGCTTCAATTTTTAAGCCTTGTTTTTGGATTGTTTACCGAACGCATTAGTTGACGAAGAGCTAAGCATTGTTACTGTTATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAAC:1	+	chr2R	16251646	5'	-	BS	5020	1	58.52
GCATATAAAGAAAGAAATCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2R	13585383	5'	+	412	7094	2	52.31
AATGGTTCATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr2L	7898418	5'	-	roo	394	1	71.88
AGAAGAAGAAATGGTATTTAATTTAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1	+	chr2L	13053728	5'	+	BS	5040	1	51.72
TATTAATATCTAAATTCAGCCATTTTGTCCAGTCATTTCTTTTAGAGTTTTTATTTATTTCGGCGGTTATCTTAGTTCAAATACGGATTATTTATTCAACTCAACACAAAAACTATTT:1	-	chr3R	1224235	5'	+	Tom1	385	1	69.49
TAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGAAACC:1	-	chr3R	11547748	5'	+	G2	356	1	78.36
ACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACC:1	-	chr2L	12290776	5'	-	1731	4578	2	51.37
TAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAC:4	-	chr2L	6007626	5'	+	1360	460	1	69.86
ATTTATATTAGCATTATATATACATGTCAAAATGCACTACGACTTATGCCCTTAAACTTGAACGAAATTGGGTGTATTTTAAATGTGGCCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGAGCAAACGATAAAAAC:1	-	chr2R	3592347	5'	-	FB	376	1	57.53
GTATTTGCAGAGACATCGTCTGGCTTGATTTCTGTTTTAATTATGCCAACTAAACATCCATCCACAGTGGTGCTAGGCAGACGTACAGTCAATGCCTTATGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATAGATAGATAT:1	+	chr2R	12835506	5'	+	Stalker4	7222	4	60.27
TTTATTGTTTTATTATTGTTTTTATAGTAGTAGTTTTACCACAATTTATTTTGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAAACGTACGATCCATACCAGTCTGCATGACC:1	+	chrX	11294325	5'	-	Doc4-element	462	1	73.08
GATTTGCTAAGGAGATCACTATCACTAAACTATCTTTAGCTAAGCCAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1	-	chr2R	2534688	5'	+	1360	51	1	65.04
TTTGGTTTGCTTTTTGGTTTGATTCGAACTTAAACACTATTACTGCACAATTTTGCCTGAATTTTGGTTTCGGTATATAACCTGAATATGACTAAAGCTGTATATGATATTATATTTCGTGCACTGAGCCAACTG:1	-	chr3L	911594	5'	-	Gypsy6A_LTR	27	1	76.30
AAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	-	chr2L	16016417	5'	+	412	44	2	54.26
ACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGC:1	-	chr2R	10582471	5'	+	Juan	3864	1	56.85
AAAAATTCGAATTACATCTCAACCAGTAGATCATAAATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chr2R	16945234	5'	+	jockey	12	1	74.10
ACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2	+	chr3L	20831268	5'	-	roo	357	2	56.55
AATATTGTTGTTTCGTAAAATAGTTACTTGGAGTTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGG:1	-	chr3R	6611334	5'	+	HMS-Beagle	17	2	73.61
TTTGTGTTCAAGTTTCAGTGGTTGGCCTGTCCTTGGGGGCTGTCGCGACCCATTAATCATACATTGACCAAAAAGGGTGTGTATGTGTGTGTGATCGTACCACGGTGGCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGT:1	-	chr2R	18923568	5'	-	F-element	4330	1	64.75
AAGTTCAAACCACTTTGCGAGCGGTGCGCAGGGAATATGACTTTTAAAAAGTTTCCCGCTTTCCCAAAGGCGTAGGGTTGGGGGGTTAACACATTCAACGAGCAGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCAATGAAGCTTTCA:1	-	chr2R	10976854	5'	+	gypsy7	35	2	57.55
AACAGTGCTTATTTTTATTTTTTAGACAACTGTTACTATTTATAACTTATACTACAGTGAATCATAGGTGTATATGAGTAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAA:1	-	chr3L	25008184	5'	+	X-element	58	1	45.89
ACGATACCAAAAATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTT:1	-	chr2L	15332572	5'	+	jockey	4550	1	60.32
CAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr2R	9632097	5'	+	roo	8720	2	59.71
GAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCT:1	+	chr3L	25482867	5'	+	accord	25	2	64.34
GATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr2R	13585437	5'	+	412	7127	2	78.12
ATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGCATGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATA:1	+	chr3R	2169841	5'	+	gypsy11	92	2	60.34
CGAGAGTAGGCAATTTGAGACTTATCTGCGCTTTTTTCTGCTCCAGCATGTGCAACAAAGTGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAATTGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTACATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chr3L	3263687	5'	-	accord	7030	2	80.69
TCTAATTAAATGATATTGTATAATTTATTGCAAAAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCCGGTAACTTAAAAATGCAGCGAACT:1	-	chr3L	15519832	5'	-	pogo	2047	1	67.23
AAAAAAAGGCAAGCGAGAGCAACTCGATGTCTTGCCTGCGCAAACATTTGCATAATAAATTAAATTAACGGAGAAAAAAGGAGAAAAAAAAGATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr2L	17322682	5'	+	roo	89	2	53.42
AAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGC:1	-	chr2R	4774731	5'	-	baggins	5320	1	76.71
GTTTCCTCTGTGTTTAGGGCTCAATAAGTTTTATATCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1	+	chr2R	6172948	5'	+	pogo	23	1	69.44
ACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGC:1	-	chr3R	1446144	5'	-	1360	3377	1	27.40
TTTCATAATAAAACTGATTATTTGGATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATG:1	+	chrX	20870074	5'	+	gypsy	7017	2	62.33
AAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1	-	chr2R	21920611	5'	+	jockey	28	1	65.12
TATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1	-	chrX	13504223	5'	-	412	469	2	62.20
ATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTATGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1	+	chr3R	19589885	5'	+	BS	5028	1	58.22
CCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	-	chr3L	20888826	5'	+	1360	32	1	60.96
GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATA:1	+	chr3L	25232774	5'	-	accord2	147	2	65.00
AATTGCTTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTCTCTTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr3R	26222863	5'	-	roo	352	2	61.36
TGAATATTTAGTAACATATCATAGTAAAATATTTTTTCAACGTATTTATTTTTATTTCATATCCCTTTGTGCATTATTGCACTCGATACCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGCAAGCGG:1	+	chr3R	4134932	5'	-	Quasimodo	230	2	63.01
ATTAAGATCGGTAATTGTAAACTGGCTTACAAATTTTAATTAGACAGCTTAAGCTTAGTTTAGTTAAGCCAATTTAGTCAAAGCACTGTCGAATGTAAAAATAGAGTTGTTGAAGACTGAATGGTTTTAATGTAATTTTTTT:1	+	chr3L	17206676	5'	+	transib4	26	1	54.23
GTATTGACATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGT:1	+	chr3R	19968060	5'	-	roo	397	1	74.63
TAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chr3R	25448451	5'	+	roo	31	2	59.23
ACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCCTTGGCTTTAAAGTAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGG:1	-	chr3R	11547792	5'	+	G2	303	1	57.60
CCTTTATTCCGGTGACTACTGGGCCATAACCAGGAGGATACTTATTCGCCCACAAGATACTTGCTATCTGGGGCAATCCAAACGCACATGCGCAAACGACCAAAGACAATAGAATAACAAGATGC:1	+	chrX	18129955	5'	+	1360	4	2	76.80
TCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCAGTCAT:1	+	chr3L	27356089	5'	-	Tc3	1628	1	71.23
CAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACACCCCTCAACAACCACCTCCGCC:1	-	chr2R	3760470	5'	+	accord	24	2	54.65
AACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATCT:1	-	chr3L	4605732	5'	+	pogo	48	1	53.42
TTGCAAGCTCGTCGGCTCATCAGTTGGCTCAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1	+	chrX	7195063	5'	-	P-element	2843	1	32.32
GGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAACGA:1	-	chr2R	11164487	5'	+	roo	8714	2	68.38
ATATTTAAGTCTTTACTGCACTAAAATTTAATAATAAAAAAATATGAAATTCATAAATTATACATGGAATATATTGAAATAAATAAAGACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTT:1	-	chr2L	20808450	5'	-	HMS-Beagle	216	2	65.07
TGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	-	chrX	8543548	5'	-	roo	397	1	66.67
GTTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATG:1	-	chr2R	14388038	5'	+	roo	43	2	54.79
AAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTA:1	+	chr3R	23020816	5'	-	INE-1	574	1	54.90
GAAGTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATCGCCCTATAAGTTATCGTCCCCCATCTTATATCTC:1	-	chr2R	4601686	5'	+	HMS-Beagle2	20	2	74.66
TGTGAAAACCAAAACGAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1	-	chr2L	11661056	5'	+	F-element	34	1	56.16
CAAAAGTCAAAATCTCAATTAAGCTTTGGGAAAATCTAGCAAAACATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATT:1	+	chr2L	20139879	5'	-	jockey	4937	1	62.99
ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTATACACATAGAATATTAACTAACAGAGTTGAATCCAAGAGAAACGTAAAACAATTAAAGTCAGAAGCTTTCTCTCTTCACGATCAGAACCGTAAAGTTTAGAAAAGCTAGATACCGAG:1	+	chr2R	1982173	5'	+	Idefix	419	2	67.12
GTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr2L	18294218	5'	-	roo	323	2	79.72
AATAACCATCACCTGACAGGAAGGTGGCTGTGGCAAGCCGAATCTTATTTACCCTTGCAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1	-	chr2L	10986876	5'	-	1360	3361	1	55.05
GGTTTTTTTCCAAGAGAGTTATGTCCCTGGTGCCAGAAGCCTCTACCTCGAGAGCGCCCAAGTACTGCTACTTCTTCAAGACCCTGCTGGTGGAGGAACTGGATGTCTCTGAATCTGTATGCCGAATCTCAACCTTCT:1	+	chr3R	18255596	5'	-	INE-1	172	1	74.64
CAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACTATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	-	chrX	9540105	5'	-	roo	9004	2	64.14
TTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1	-	chr2R	16373542	5'	+	Max-element	8276	2	64.08
CCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1	+	chr3R	12618588	5'	+	F-element	21	1	61.82
AAGCAGGAGTACGAAGCATGCCATCCTGTCGTGTGTCAGCGAAAGAGAGGCAGGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGCAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1	-	chr2R	21101823	5'	+	P-element	53	1	39.23
CAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCGACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1	+	chr3L	3799802	5'	+	copia	4911	2	64.29
TATCTTATCGGGTACATAGCGTGGACCCCGTTTCCATTCCATTTCCAGCAGACACAAATATTTAGTAGTTTAATGAATCTAATTTTATTTTTAA:1	+	chr3L	1789574	5'	-	NOF	3957	1	59.57
GTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1	+	chr3R	10182123	5'	-	blood	7369	2	56.25
AAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1	+	chrX	21016767	5'	+	Transpac	4992	2	73.57
GGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr3R	27994185	5'	+	roo	60	2	62.86
TGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1	-	chr2L	15833054	5'	+	hobo	59	1	78.70
CGCTCGGGAAATGTTCTATATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACACTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACCATTT:1	-	chr2L	16092035	5'	+	roo	8685	2	70.55
CCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1	+	chr2L	17295873	5'	+	Doc	36	1	69.14
ACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1	+	chrX	13504162	5'	+	412	7102	2	60.33
ATTTAAACATGGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	-	chr3R	20427526	5'	+	jockey	15	1	79.45
CTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr2R	19050182	5'	+	roo	8720	2	54.79
GCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	-	chr3L	15600319	5'	-	roo	9004	2	64.38
AAATACAAATGCAGCGTAAACTCCGATTGCCAGCCACATGGCTACACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAG:2	-	chr2R	9500124	5'	+	G5	4695	1	71.23
TGAGTGCAGAAAAAGCGACAGAAACAGGCGAAGCATGTGGNACAGTGGTACCTGGCTAACGCATCCCAGCATTATTTCCAAATAACATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATT:1	+	chr3L	11534918	5'	+	roo	396	1	52.34
ATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1	-	chrX	14749678	5'	-	copia	5075	2	72.60
TCTGTGGTCGCCAATGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGGTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCCGCGCACGGACACTAGAATAACAAGAT:1	+	chr2R	2016817	5'	-	1360	3387	2	65.17
AAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr2R	14542238	5'	+	roo	8720	2	58.22
ATGTGTAACAATAACGTGACACAAATGTAGAATATAAAGGCACGAAAAAAACGCATACACATATGTACTGGCATAAGTTCGCAGGACTATGTGGCTCTGTGAATGTGTGTGTGTGTGT:1	-	chr2R	21272751	5'	-	accord	7035	2	80.51
TTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1	+	chr2R	20496865	5'	+	blood	18	2	70.55
TCCTAACGAAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1	-	chr2L	6623073	5'	+	Burdock	6162	2	67.81
CGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGATATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1	+	chr3L	7292433	5'	+	HMS-Beagle2	6916	2	65.75
AAAAATGTCTTTGTCTTATATATATATCTTATCTTCCCGGTTCGATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGATTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCT:1	+	chr3R	2833319	5'	-	ZAM	7960	1	70.00
CACACTCTCAAAAAAGGTCGTTGATTATTTTTCGGCTTTGATCTATTTTAATTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1	+	chr3L	17115452	5'	-	blood	7317	2	64.38
GAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACATTTGAGCA:1	+	chrX	17054229	5'	+	jockey	81	1	73.39
GCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1	+	chr3L	22400265	5'	+	1360	38	1	52.54
AAAAATATGCCAAAAAATTAGTTTTGTTAAGTCCTGCGACTCCGCACCGTCAAATTCACACTTTACATTTTCATTTCAAATAGCCATCACTGGAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1	+	chr3L	15490285	5'	-	copia	225	1	63.01
GACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGCGGTGG:1	-	chr3R	11547810	5'	+	G2	306	1	63.01
AACATGTTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGC:1	+	chr2L	14892197	5'	-	transib2	2815	1	71.15
GCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3L	15600172	5'	+	roo	8677	2	42.72
CATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATG:1	-	chr2L	20117972	5'	+	invader4	2796	2	54.11
TACCAAATCATCTAACTATTTTTCACATGTCGGTAAAAATTTGTTTTATATTTTTTTACGGTTTTATTGACTTAGTAATAACAGTTGAATATCCAGACCTCATTTAAATTTATTGTAAGTATATTTCAAATTCAAATTCAAATTT:1	+	chr3L	14920328	5'	+	Rt1a	311	1	53.79
GTTGTATGATTTATTGTATGCAAATACAATAGCAGCATCCAAACATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGA:1	-	chr3L	10222179	5'	+	springer	7211	2	68.49
GCTGTCCCTCACAATTATTATAATAAACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGAAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	-	chr2L	13763222	5'	-	pogo	2039	1	79.49
ATTTTCATATGTATTAAAGCGGTGTTTTATTGTTAAGGTTCATCATAGTTGGATCCTCAATTTAAAATTGATTTTAGAAACATATGTATTATTCATATGTTTCTCGAGAGTGGAAAAACCCCAACTCTAGATAAGTCACCCACTGG:1	+	chr2L	22183980	5'	+	Idefix	6979	2	63.01
AGCAAAAGTAAATCGCGATTTCATTCTAAAACAAGTTTGCGATGCTGTAAATACTATTAGCGATGTTGCCCAAGGAAAGTCATCCCAACCGAGAGTCCCGAATTGATTAGTCAACTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATT:1	-	chr3L	23330821	5'	+	Cr1a	4101	1	65.71
TGACTAAATATTACTTGTAGGTATTTTCAACTAAAGTTAGTTGAACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGGGGCGAGTCGATTCGTCGATAAGTTTCTCG:1	-	chr3R	5060147	5'	-	mdg3	123	2	67.12
AAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATA:1	+	chr2R	18336117	5'	+	roo	1	2	77.19
TCTAGTGCTATTCAGCTCTTATATTTAATTCGATTCGCCTTGATTTACACTCGAAGACGAAACGAAAATCGAAGATATAGCCGCTATATATCCTCCAAACGTAACAAACATAACTCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTGC:1	+	chrX	12946302	5'	+	I-element	4983	1	73.97
CATAAAATAATATTCAAATGAGCCATCGAAACCGAAGTTATCAACTATTGTAGTTTCCGCTTCCCCCGTTGACCC:1	+	chr2R	24589586	5'	-	opus	7274	2	78.67
ATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	-	chr3L	17115503	5'	+	blood	7075	2	78.18
AACCAGTACTCGGAAATGAAGAGTTTACATTAAAGAGGATGGAAAAAACCATAATGTGCTAAAACGTTTATTTTACTCAATATAAGGAGTTAAACTAGTTTAAAAACGTACTCGAACAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTC:1	-	chr3R	17242883	5'	-	hopper	940	1	77.46
CAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCT:1	-	chr2R	16248002	5'	+	BS	55	1	60.28
CATTATCTGCAGTCAGTTCAACTCACTTTTTGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1	-	chr2R	21145949	5'	+	pogo	83	1	80.00
AATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTT:1	-	chr3R	17243213	5'	-	hopper	1365	1	55.97
AAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATCAACACTC:1	+	chr2L	15833001	5'	-	hobo	2909	1	50.94
AATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	-	chr2L	11674431	5'	+	jockey	10	1	75.00
CCAGCATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATTAGTGC:1	-	chr3R	14651292	5'	-	P-element	2838	1	46.51
ATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1	-	chr3L	21484243	5'	+	Tabor	6887	2	51.03
AAATCAGAAGAGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1	+	chr3L	15519728	5'	+	pogo	25	1	68.46
ATCTAACAACGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1	-	chr3R	21434959	5'	-	412	418	2	70.55
GATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3L	20831405	5'	+	roo	20	2	68.94
CCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1	+	chrX	2518058	5'	-	P-element	2810	1	26.15
AAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	-	chr3R	19449486	5'	-	roo	385	2	72.14
TCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGGGGAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1	-	chr3R	10182173	5'	+	blood	7027	2	64.41
CATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGGACACAGCAACAC:1	+	chr3R	9921980	5'	+	blood	7044	2	53.98
CCTGGGATCTCTTTTTTGTCTCTCTGACAAAGTTATTTCCCAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGA:1	-	chr2R	3381766	5'	-	GATE	372	1	71.92
ATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1	+	chr3L	14603271	5'	+	jockey	25	1	54.74
GTCTTAATTTGTGTCAATGAAAAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chrX	8543580	5'	-	roo	394	1	71.43
ATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	+	chr2L	3114495	5'	-	roo	328	2	71.92
AAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chr2L	15833443	5'	+	jockey	27	1	61.68
CTTCGCCGTTAATGAACTAAACCTGTCCTTTGGAGTCCTTCGACTACATCAAAAATTAAACGTGTGCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1	+	chr2L	5844971	5'	-	transib2	2770	1	55.48
AAAACAAGGTTGTTGAAAGTATTATGAAATATATTTAATGATCTTTTTATTCAATATAGATTATATTTAGTTAACGAAAGCTGTCTTTATTTTTAAAGATTTTTATTATTTGAACATTGTAGATCTGTAAGGGTCATGCAACTCGT:1	-	chr2L	18736569	5'	-	Cr1a	4170	1	73.29
AAAAATGCAAGCGTTACACTTTTTATGCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTCTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTCGGAAACATACTAAAGCAATAGAGAGTGCTATAGTCGAG:1	+	chr3L	27560	5'	-	INE-1	577	1	75.00
AGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGGGGAGGGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGATGCTATGTTTATGTTT:1	-	chr2L	16016407	5'	+	412	66	2	63.83
TAGATCAAAAAGACGAAAAACTCTTACAAGAAACTAAAAGTGGTCGCAGACAACTATATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTACATTATTT:1	-	chr2R	3492430	5'	+	1360	245	1	73.97
CAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCT:1	-	chrX	23182946	5'	+	Idefix	19	2	58.74
CACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1	+	chrX	17526855	5'	+	roo	8751	2	80.14
GGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	+	chrX	13504125	5'	+	412	7090	2	60.27
AATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1	+	chr3R	15363912	5'	+	flea	19	2	61.11
CATTTATTCTCTCTGTGTATACACACCAGAGAACTGCAGCNCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAAACTCGGTACTC:1	+	chr3L	7188568	5'	-	hobo	2902	1	73.81
GATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr2R	21907906	5'	-	roo	9054	2	65.79
TACTTTTTCAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr2L	18294317	5'	+	roo	8699	2	60.00
CATGTGTTACAGCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAG:1	-	chr2R	9328716	5'	-	roo	409	1	78.64
CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	+	chr2R	2007458	5'	+	1360	32	1	55.46
ACAGTTTTATTCGCCTAGAACGGCACATCCGCCTTCAAAACGGGTCTTACAGAGAATTCTTTTGTGCGCACGTTTTGTTTAATTTGCGCAAGTTTAGAGCTTTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGAACAC:1	-	chr2L	13477749	5'	-	1360	2911	1	67.59
AAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1	-	chr3L	10574378	5'	+	Tabor	24	2	48.62
CCGCTATGTAACGGCGCCGCTTTTCCGATGCTTGGTTGTTTGCAATAATAATACAGTAAATAACAAACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGG:1	-	chr3R	3522517	5'	-	X-element	4519	1	74.44
ACAACAAATAAGCCGAATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1	-	chr3R	9039066	5'	-	Juan	4202	1	76.03
GATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAA:1	+	chr3R	17605659	5'	-	Tabor	397	2	75.34
AAAAACCAAGACATTGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1	-	chr3R	29361085	5'	-	mdg1	7452	2	72.97
GACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAAATGCAAGGGTGGCACTGTTTTATCACTCGACTCTCACCCTACAATTTT:1	+	chr2R	6919697	5'	+	hobo	34	1	60.76
ACAGTGAACAATATTAATTGTCTGCATTTTATTTGTTTTTAGCTTGTTTGGCTTGGACCTGTCCCTTCACATGACAGTTCGGATTGCACAACAATATTAATATTTAAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAA:1	+	chr2R	19517227	5'	+	Cr1a	366	1	70.55
CGTGGCAGGTTTTTGCCATTTTTTTTAAAAAAATGTCAACACATTTTTCAAAGTGTTTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCGATCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGA:1	+	chrX	13478175	5'	-	INE-1	146	1	76.52
CACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	+	chr3R	22844193	5'	+	roo	8719	2	63.08
GCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1	+	chr2R	2016808	5'	+	1360	37	1	56.39
TAGAACCTAACCTTATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chr3L	14603210	5'	+	jockey	14	1	77.24
TTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1	-	chr2L	14081398	5'	-	1360	3323	1	66.21
GAAGTTATTTACGATATATTGAGATGACAAGATCTTCCTTGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAT:1	+	chr3L	15178071	5'	-	roo	8719	2	73.29
TGCCGAGAATCTCCAGAGTGTCTCAAAGTTCTTAGACGGCGTCTTCGGTGCGCCCAAGTTAAATGGAAATTTGCATTTCACTGGACAGAGGAGTCATAACTTGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTC:1	-	chr3L	18579749	5'	+	Cr1a	4084	1	67.81
GCTGCAAGATAAGATTTGATGTTGATATTCTTCTCATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr3R	17818036	5'	+	roo	10	2	77.40
GAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1	-	chr2L	17079851	5'	+	jockey	4693	1	64.60
GATGCAGGACCTCTGCCTCCCACTTCTGGGGTCTGCTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	+	chr2R	13710560	5'	+	roo	8707	2	58.90
GGGGATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	+	chr2R	13084590	5'	+	roo	67	2	64.38
GGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chr3R	27994181	5'	+	roo	50	2	58.21
GACAGGAATATATGCGTTCCAATTGACACACGTGTGCGATGACCAACAGACATGACCTTAATTTGGATTTATCGCTTCCATTGTTTTTCCCTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTG:1	+	chr2R	20384666	5'	-	jockey	4760	1	61.38
GGGGTTTTTTTATGTGGGCAGACAGAGGGATAGTGCAGAACTGCAGAACCTTAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTT:1	+	chrX	21430984	5'	-	hobo	279	1	53.98
CATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCG:1	-	chr4	829126	5'	-	INE-1	147	1	66.44
GGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGGATATTTATATTTATTATGAGAAATT:1	-	chr2R	2879464	5'	-	Stalker4	7032	4	56.16
CCATTTAGCGGGCGATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1	-	chrX	11471684	5'	-	hopper	1391	1	63.71
GAAATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAA:2	+	chr2L	23020626	5'	-	Transib5	2945	1	51.72
CAATTTGTTTTTGGAAAAATGTGTTCAGATAGTAAGCCAATGTTTAAAGTCTAAAGAAGTAAGGGATTTCAGCATATTCTGTAGGCCCCGAACTTCACAATGTATAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAATTAGGACCACG:1	-	chr2L	20517054	5'	-	gypsy4	6436	1	68.49
GCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGCAGCCCAAAATTAGTGGAGAGAGTAAGTTGATAAGCCAGTGAAACCTAC:1	-	chr2L	16856994	5'	-	Doc4-element	2513	1	62.32
GATGGCAATACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAA:1	-	chr2R	5198495	5'	+	INE-1	82	1	64.38
AATCTTTAATGCTCCAATGCCCCACCAAGGAAAATATTTTGCATTTGGGCTCGGGATTGTATGTTATGCATGCCTACCCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1	-	chr2L	17081885	5'	+	jockey	4684	1	65.52
GATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAACTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1	-	chrX	21014884	5'	-	copia	237	1	67.69
TTAATCGGCAAATAAACGATATTCTCACCGCTAAGTACGTTACCAAAGTTTCTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGACATGTCCGACTGTCCGTCTGTCCATATGAACGTTGAG:1	-	chr3L	24242038	5'	+	INE-1	129	1	64.06
TGTGCAGAACGTTAAAAAAATACCAAAGTATTCCGTTGCANTACTTACTATGCCACTCTAACGCCCTAAAGACGACAAACCGTCCGCAAACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTC:1	+	chr2R	5203704	5'	+	INE-1	558	1	57.48
TGGCGATACCCTTCATTACTTAGGAAGCCGAGCGCATAAGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGGAAAAACAAGAGACG:1	-	chr4	56127	5'	-	1360	3242	1	65.18
ATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACATCTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGG:1	+	chrX	20870099	5'	+	gypsy	55	2	54.79
GATTACACTCAAATAAAATCGTTCCTGTTTCTCAGTTTGTATGCCTGCCTTCTTTCAAGTGTATCTATCTACTCTGCGAGCGAGCATTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACA:1	+	chr3R	14717425	5'	-	Stalker4	7254	4	41.78
AGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTCCAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCAT:1	-	chr3R	4604451	5'	+	hopper	1410	2	57.86
CTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATTAGCCGAGAACTTGAGCGGCGTAAGT:1	+	chrX	6499832	5'	-	Quasimodo	232	2	62.94
AGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAC:2	-	chr3R	25454132	5'	+	Quasimodo	29	2	52.05
GGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTATGTTCTTGGCCTGTTTACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTTACAATCTT:1	+	chr3R	27994182	5'	+	roo	22	2	56.19
GTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr2R	8585440	5'	-	roo	9002	2	67.86
ATGCATGTAACATACACTTGCATTTACGGAGCTGCATACGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1	+	chr2L	18404536	5'	-	hobo	2900	1	64.08
CGGTGAAGTCAAATCGAGGGGGCCCAAAATCTGACAAAGGCATTCTTGTATAAGCTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATGGATCAAAAACTTAAGCGA:1	-	chr2L	4412651	5'	-	Quasimodo	7322	2	57.03
GAAAAAGAGTTTGTCTTTGTTAATTTTATTTTTAACGAAACCAGACTCTTCAGCCATTATTGAGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCT:1	-	chr2R	6916346	5'	-	hobo	420	1	74.00
ATGCATTATTTTCAAGTTCGTACAATTTTTGAATTTGTGTATATGGTAGGGGTTAAAATGATTTTATATATATATAGTCTTGATCAGGATAGATAGTTACATGTACATGTCTTTATTATTTTAGAGATCTCGAGAACTATAAAAGC:1	+	chr3L	18917789	5'	+	INE-1	149	1	54.79
AAACCAAAGACAAAGCGAAAGAGGTTGGAAGAAATTGAATTTCTTTTGCACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1	-	chr2L	1665091	5'	-	hobo	2935	1	78.99
AATGCATTAAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1	+	chr2L	13584661	5'	-	pogo	2059	1	63.30
GGAGAAAATGGGAATTTGTTGTTTCGGCAGACATTGAAAAGATGTACCGACAAATTAAAATAGATAATAATGATCAAAAATATCAATATATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTG:1	+	chr3R	19445360	5'	-	roo	8817	2	71.53
CTTATCATAAGCAACAGTTTTAGGCACTTCAGCATAGAACCAAACACAATCGGAACCCCTGGTTAACCCAAACCACACTTAGACAAAACAATAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCCACTATCAGATAC:1	+	chr2R	502984	5'	-	INE-1	558	1	76.92
AGAAGTCACCAAATGTCAAATGCAGCAAAAGCAACAAAAAAAATGGAATACGCACCAACAAAAAATAAAGCCTAAATTGCAGGCAAAGGAAAAATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATT:1	+	chr2L	17296729	5'	-	pogo	1972	1	57.53
TATCTTATTTATTTAGACGTTGTAGACAAATATTATATACTTAGGATCAGGAAGATATTGGCAGGGTCTTTGAGCTGTTTACAGATACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAA:1	-	chrX	22876764	5'	+	jockey	303	1	58.22
AAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	+	chr3L	22437877	5'	-	roo	8994	2	71.23
AACATAACAATAAAAATTTCATGCCTGTAAGGCCCTTGACTCTCACCCCAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAG:1	+	chr3R	25454688	5'	-	Quasimodo	6983	2	57.69
TTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACCTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1	-	chr3R	17831893	5'	+	F-element	49	1	46.97
AGCCCATTTAAAGTTGACATAAAATTCCACTTAAACACCTGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1	-	chr3L	3501074	5'	-	opus	7483	2	73.29
GCTGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCG:1	+	chr2R	5173422	5'	-	gypsy	414	2	53.33
CCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr2R	19050195	5'	+	roo	15	2	56.52
ATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCAAAA:1	+	chr3R	1418287	5'	+	BS3	232	1	61.47
CATTAAATATGTTTTATGCCCAGCTGACGGTAGCACTTACCTTGAAATTTGCAGATCTGTGCTATTGACCTCACCCAGTTGCCAAAACCAAATTGAAAACCTTCCCTCAAAAAAAAGAAAAATAAATAAAATAATAAAATAAAAAA:1	-	chr3R	28502384	5'	+	BS4	725	1	56.85
TACAAAAATAGATAAAGTATATTTGTTCCCTTACATAATTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCT:1	-	chr3R	2630705	5'	+	1360	3191	1	75.17
AGCTGGGGGCCTGTCATCGACAACAGCTGCTGCTGCTTTCATGTCTGTTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACC:1	-	chr2L	9412090	5'	+	jockey	4525	1	60.98
GGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chr3R	19968102	5'	-	roo	9006	2	64.38
ATATGCAGATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chrX	6486840	5'	-	roo	9046	1	61.64
GTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr2R	9632182	5'	-	roo	8998	2	67.59
TATTAATAGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTT:1	+	chr3R	18339036	5'	-	roo	9060	1	76.03
CTACTAATAAATAGCAAAATTAATTCCAAATGCGCGATAGTAAAAACCAATTTGTTTCGAAAAAACAAACGCAGAAGAGGAAAAACCACAAACCGATATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGG:1	+	chr2R	13006385	5'	-	3S18	314	2	65.75
CAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1	-	chr3L	16750752	5'	+	Tirant	8141	2	53.39
TTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1	-	chr3L	10574384	5'	+	Tabor	55	2	52.74
ATGATATCATGCTAATCACTTGTATCTATTTGATAGGCCTTGATGCGCGTGTCGCCAGCAAAAACTCTGTCAATTCGACAAGCAAATAAAACAATTTGGGTCACTAACTCGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAAC:1	-	chr3R	11814361	5'	-	pogo	361	1	67.12
TGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGT:1	+	chr3R	17420395	5'	+	roo	31	2	57.14
AAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	7835199	5'	+	roo	8680	2	56.47
ATGGGGGAATGTTTATAGTCCAGTGAAAATGACGATTTATGTCAAGTTCCGGTCAGACAGGTGGTGTTTTAATCTTCTTCTCGTACTTGTCCGATGGCTTTGGGCTGCGCTACTTAGTCGTCT:1	+	chr3R	4509877	5'	-	jockey2	3123	1	71.54
TGATTGTATCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3L	11441707	5'	+	roo	8677	2	69.75
GGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAATGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1	+	chr3R	21706012	5'	+	297	6644	2	77.39
GGGGCTCAAATCGACTTTCATACTTGCTGGCCGGAAGGAAATAAAAGGCCAGGGAAAATACTGTGGCGACTTTAGGTAGGAGAGCACAAGTGCTGAAATAGACCATTTTTTTTTTAAATACAAACACAA:1	-	chr3R	25593258	5'	-	Stalker2	496	1	67.44
GCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1	-	chr3L	17205271	5'	+	hobo	1	1	69.23
TTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGCACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTG:1	-	chrX	21564727	5'	+	diver	89	2	78.08
CTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1	-	chr3L	17205279	5'	+	hobo	38	1	60.91
ATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:2	+	chr3R	19446118	5'	+	297	6623	2	56.16
GGAATATAAATACAACACGACAGATATGTACGTTCTATACAAGTCGATATGATTTTAGTTGCAATACACAACTTTTCTCCCGCCTAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGT:1	-	chrX	12517166	5'	-	Cr1a	4407	1	65.45
TTCACTTCTGCTTTCGAGGGGAGTGCGCTTCATTACTATTTCGATTTTACTGCGACTGTATAATGCTACCCATGTTTGCAATAAGTTCGCGTTTAGTAGTGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTA:1	-	chr2L	3154001	5'	+	R1A1-element	5274	1	73.33
AGCAGTTAGTACCCATGTATTCGCTATTATTGAACCACCGCACCACCAACTGCCTATTTACGTTGTAACTTAAAGAGTAAGCCATAAAGAATAGGACTTTATAGAAAGATTCCAAAGCAAACATTTGCTTTTATTTTATTTAAT:1	+	chr3L	6034363	5'	-	HeT-A	319	1	61.11
TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAGTGGGAGTATCTGCGTTTTGGTTCTTCGCCGTTGTATGGCAGTGTGTTCGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1	-	chr2L	17599966	5'	+	1360	21	1	35.61
ACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCCGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1	-	chr3L	17560393	5'	+	pogo	40	1	54.74
CTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1	+	chr3R	10546101	5'	-	hopper	1337	1	72.60
ATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1	-	chr3L	10574398	5'	+	Tabor	6880	2	48.63
AATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAA:1	-	chrX	21667913	5'	+	gypsy2	6515	2	61.25
GATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAGTAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1	+	chr2R	20496936	5'	+	blood	89	2	78.08
CGATAATCATGCCGAATACAAAAGGCAATTTACGTAAATTACACAAAAAAATCGCAGAAAATTAAACAATTTACAAAAGACAAGCCCCCTGTTCATACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr2R	18349280	5'	+	roo	20	2	67.69
ATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr3L	16343298	5'	-	roo	345	2	62.04
GGCTGGCTGGCTGACAACCTGCTCATTGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr2L	3114437	5'	-	roo	388	2	71.03
TTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	-	chr3R	25448416	5'	+	roo	8735	2	74.07
CGCTTGATTGTGCGGCTTGTGTGACTGTTGCTGGCTATAAAAAGTGTGCACCACTCATCCAACCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTT:1	+	chr2L	9564440	5'	+	transib2	57	1	54.79
AACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAG:1	-	chr2R	5531222	5'	+	1360	53	1	77.39
GTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTA:1	-	chr2L	12290739	5'	-	1731	4541	1	74.66
GCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	17817910	5'	-	roo	323	2	77.08
CAGCTACACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGAGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCATATCAATTGTTATATGGGTC:1	+	chrX	21585245	5'	+	mariner2	265	1	64.03
TTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	+	chrX	9540025	5'	+	roo	8738	2	74.66
AAAATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATG:1	-	chr2R	5173253	5'	-	Stalker4	397	1	72.31
ATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr3R	18339181	5'	+	roo	8679	2	61.05
AATTAGCAAGTGCGTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTG:1	+	chr2R	23465972	5'	+	Doc	477	1	74.02
AATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3L	11441797	5'	-	roo	9001	2	81.15
TATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1	-	chr3L	10574390	5'	+	Tabor	6867	2	50.40
GCCATGTTATGGTAGTCCATGTGGTCAACAATTTTTCGGTACTTCGAGCTGTCTTTCGGCATTATTCTTACCCAACCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTTTGTCTACTATTTTGACCGGC:1	-	chr2R	1282403	5'	-	Circe	178	2	78.87
ATATCATAAACATCAACATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1	-	chr3L	11393625	5'	-	roo	395	1	70.34
TATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1	-	chr2R	5485199	5'	+	blood	72	2	66.90
ACACGCCGGCAAACAGTGACTGAAACAACGGCGGATGCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTAT:1	-	chr2R	21908025	5'	+	roo	42	2	51.49
ATATATTTTTAACCCAGGGTACCTCCCTACTGTTTATATAGATGGAAGAAGCAATGTCTCCTATGTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTATAGGGATATATATACTAGATTCGTTCAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTTGTG:1	+	chrX	5853558	5'	+	INE-1	581	1	79.31
ACAAAAACAAAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1	+	chr2R	11629708	5'	+	Tirant	3	2	81.30
CCAGTTATAATCAATAAAATCAGAAGAGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1	+	chr3L	15519712	5'	+	pogo	25	1	71.92
GAAAATGATATTGTATGCAAAATAATATTGTTGTCCTCACACCGTAGACTTAAAAATAAGAATTGTAATTTGTAACACCAAATTATGCGTACACTTAAGTCATTTTTCGCTTTTGGGTGGCATTCTCTCT:1	-	chr2R	1954702	5'	+	invader2	78	2	73.85
AAACAAAACAATTGCACTTGATATTGAAAAACAATTTAGGCTTTTCAAGTGCAATTTGCTGCTAAAATAAAACTTGAACTAATTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGCGCT:1	-	chrX	13550129	5'	-	gypsy4	6637	2	60.63
AATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1	-	chr2L	5254360	5'	+	roo	70	2	68.06
AGAAGAAATAGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCAT:1	+	chr2L	21008553	5'	+	invader3	5260	2	70.50
TGGCTCCTCTGCCATCCTGCTTACAATATCAATTCATTTGTATTTATAAAATATACGGCTATTACTATTTCTAAGCTATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGG:1	-	chr3L	7943165	5'	-	1360	281	1	59.17
TACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAG:1	-	chr3L	24789696	5'	+	1360	139	1	52.86
ACCAGGGCCACCTCTACCAAATCCTGCAGCTGCACTTCAACGTTGAACTTGTACTTCTTCTTTTTCATCATAAAGGCCATGCCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAAC:1	-	chr2L	21273684	5'	-	blood	273	2	66.67
AATATTATTTTCTAATGCTCGAAGACACAAACAAAGCCAGGAACCGAGCGCAAAAGAATAAAATTTGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAA:1	+	chr3L	12309437	5'	-	hopper2	1293	1	67.12
ACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTC:1	+	chr3R	13237278	5'	+	3S18	49	2	51.72
CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGACAGAAGGAAGTGTTTCCGACTATATAAAGTATATATGTATATTCTNGACGAAATTTCACTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAG:1	-	chr2L	22211544	5'	+	INE-1	566	1	86.30
TATAGTATTTAAGCAAAAACGAAATGAATATTAAGCGATTTAATTTCTCAAAAGTCATTTTAAGCCTTTGCAGGGTATCAAGATGAAGAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTA:1	-	chr2L	16965123	5'	+	Quasimodo	166	2	61.11
AATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	+	chr3L	4536716	5'	-	roo	8986	2	74.66
CATGCTGTTGTTTTTGCTATTATACGCACAATGGGACAAACAGACTTTCGGTTTTAATTTTCTTACCATAATTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1	+	chr3R	31720472	5'	+	pogo	45	1	54.79
TATAATTGAACAAAGAAAACAAATAATAGATGTATATAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTG:1	+	chrX	22897593	5'	+	Bari1	19	1	60.00
GAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTTGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAATATTTTTCCATTTTT:1	-	chr3R	14979885	5'	+	pogo	50	1	56.06
AGAACACAATAATTAAAAATCAGAACTCAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCAGATATTAATGTTTACATT:1	-	chr3L	24359559	5'	-	Quasimodo	175	2	74.82
GAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1	+	chr2L	17295832	5'	+	Doc	21	1	56.07
AATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1	-	chr3R	31817554	5'	-	roo	9035	1	58.96
TGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCNTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAGATTT:1	+	chr3R	27994203	5'	+	roo	8737	2	77.04
TCTGTTCAGTTCAGTTTTCGTCAGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1	+	chr3R	25339937	5'	-	mdg1	7430	2	65.07
GTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1	+	chrX	10521633	5'	+	Tabor	6904	2	59.59
TTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTACG:1	+	chr2R	4447998	5'	-	invader1	327	2	69.86
TAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1	+	chr2R	977519	5'	+	F-element	47	1	53.49
GAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGG:1	-	chr2R	21298798	5'	+	jockey	222	1	50.94
AGTTGTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr3R	20469573	5'	+	roo	14	2	44.80
ACAGTTAGTTGATACAGAAAACATCGAAAACATCGGGTTTATTTTCCGTCTTTTTGAAAGATACAAATGAATGCATGGAACAAAATCCGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAA:1	-	chr4	220067	5'	+	Tc1-2	1244	1	69.23
CTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	+	chr2L	14771999	5'	-	roo	401	1	76.00
TGCATTTATCGCGCATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTA:1	-	chr2R	11629278	5'	-	Tirant	276	2	62.50
GTGGTCATTAATATACATATAATACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCC:1	-	chr3L	19339470	5'	+	Tc1	30	1	67.81
GGATGTTCATCTTGGAATTGCTGGCGGGGCGCAGCAATGGCAGACTAAGACGATGGATGGAGTGGGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCA:1	-	chrX	12375651	5'	-	Stalker	7052	4	60.38
TGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1	+	chr4	311180	5'	-	1360	3341	1	52.74
AATTGTAAACAGCAATTTCTGCCTTCCTCTGCCTTCAAGCCAAGCAATTGCAAATCTAAAGAGTCGAGACTCTTCGCTACCAAAGCTGAACACAGCTAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCA:1	-	chr3R	3862613	5'	+	INE-1	20	1	54.69
AAGATACTTTTATTTTTTGTTTAATTTATGTTTTTTTAAGATTATTTTTTAGGCGTATTTGGTTGTCGAATGTTTTCTTACTTCTCAATTAGCAGCTTCAAACGATCTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTTAAATC:1	+	chr3L	8078694	5'	-	Circe	7190	1	60.27
TGAAGAGATCCTGTATTCCCATCTGCAAATTTAGAAACATGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1	+	chr2L	7888129	5'	-	pogo	2035	1	77.44
ATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAGGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGGTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTACTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAA:1	+	chr2L	13053780	5'	+	Tc1-2	479	1	81.51
GACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1	+	chr3R	9921968	5'	+	blood	1	2	76.34
CGTAATTCTTTGTATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	+	chr3L	20654439	5'	+	roo	8676	2	74.62
GGAGAGGCTATGCAGCAGATCTATTTGCAATTAACAGCACTGTATATTTAGAATCCATTAAATCATTGGGAGCAGTTAAGTTCTGTACTTAATTGGCATTCTTGAAATTTAGAACTAATATTGTTTAATTTGTTTCT:1	-	chr2L	15412762	5'	-	HeT-A	5766	1	70.80
GTATAGCGAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAA:1	+	chr4	419960	5'	+	roo	8711	2	59.69
TGCACTGATCTGGGATACTCAGATGATTCTCGGAGACTATTGGCACTTGTTGTTGTTGTGGTTGTTCCATTGTTCTTTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAG:1	-	chr3L	25414416	5'	-	Doc	235	1	66.41
GGTGTTAAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1	+	chrX	5629088	5'	-	jockey	4955	1	57.93
AAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAA:1	-	chrX	22715128	5'	+	Bari1	68	1	70.68
GCGGCTGCTACACAAATTGCTTATACTTTTTAATAAATAATCCGATTGAAATGGATGGAGATTTATAATCAAAAGTCAAAATCTCAATTAAGCTTTGGGAAAATCTAGCAAAACATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1	+	chr2L	20139803	5'	-	jockey	4987	1	34.93
GAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr2L	21153514	5'	+	1360	37	1	72.09
AAATTAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1	-	chr2L	15833127	5'	+	hobo	24	1	69.18
ATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATT:1	-	chr4	1152076	5'	-	transib2	2735	1	77.40
AGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACAC:1	+	chr3L	16343203	5'	+	roo	8660	1	81.61
AAATATTCAAGTTTCAAGTTATTTTACCCTCAAGCTCGTCGTCGTCTCCATTGTCGTTTTACTTTATTGTTTATGCCCGAATTGTGTTTGAGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCA:1	-	chr2L	2687467	5'	-	copia	225	1	63.01
GTTCCATTTTCAGTGTCTGTGCTTGTAATTGTGAAAGTGTTGGTATGTGCTTTATTTGACCTACGACCCCATTAGGCATTTGCATCTCGTCTAGACGAAACACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAG:1	+	chr2L	9272719	5'	-	I-element	285	1	67.83
ATGACATTCGATTGCTGCAGTGGAACATCCTATCACAAAGTATGTCCCTAAAAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1	+	chr3R	11207217	5'	+	FB	67	1	65.03
CAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1	-	chr2R	14388034	5'	+	roo	8711	2	53.42
AACACTATACTATACTTTACTATATGAGAGGACGTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1	+	chr3L	10056078	5'	-	transib2	2785	1	57.53
ACCGCATGGGAATCCAACTCGGTGCGAGTCTCAATCAAACAAAGAGCCGTTGTTGTGCATTAAAGTCTGGGGCGTCCTGTTTTCCTGTTTTCCAGCTTGCTGCCCTAGACCTAAAACAAACGATAATGCTATACTCGAGTTCCCCG:1	+	chr3R	12025656	5'	-	INE-1	570	1	56.16
CGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1	+	chr3L	3500934	5'	+	opus	147	4	55.26
ATGGGAGTGAACTTATTACACCCACCAGCCTTTATGACATCGACGCCAGTGGGATACCAGCGCTCGCCACAAGAACACACACAAACACAC:1	-	chr2R	9297540	5'	+	gypsy3	420	1	75.56
GTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1	-	chr2R	8146149	5'	+	P-element	48	1	51.37
CCGGGGAGCATCACATACGACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1	-	chr3R	17316332	5'	+	opus	138	4	55.77
GACAGCACGCATAATATTAATAACATTTAATAAGTTGCTGGAATTAGTGGTAAATGGGTAGAGAAATGGCAAAAAATGATTTGGTAATTATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1	+	chr3L	12978313	5'	-	jockey	4951	1	63.70
GGCAGGACTCCGGTGTCCTTATTGCATAGCTTCAGGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAACACTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2L	6059325	5'	-	roo	9021	2	52.05
ACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGCGATGAGCAATCGAG:1	-	chr3R	20427492	5'	+	jockey	12	1	75.23
CAGTGATTAAGAACAAGTTTTTAAGTGCTGCAAAAAAGAAATCAAATAATTCATAAATAAATAAATAAAGAATAAAGTGGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1	+	chr3L	17685101	5'	+	mdg3	5293	2	44.14
TTGTAAGAAAGTGTGTAATAAGGACCTGGCTGAAAAAAACATATACGTGCGCCATAAAGTCCTTAGCGATTGAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr2L	12153168	5'	-	roo	9026	1	52.74
ATAGACGGCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAATGCCACAAA:1	-	chrX	12074623	5'	+	412	129	2	53.57
AAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTACTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1	+	chr3R	20499764	5'	+	mdg3	5329	2	65.75
TAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATATAAATTTATACACACAATAGGTTAAGT:1	-	chr2R	9500042	5'	+	G5	4772	1	65.07
GGGTTTAGGCAACCATAGAATTCAGCAAAAGCATTGGGCGNACGGGCGTTATAATGAACCATTTTGCTGCCGAATGGAGGAAAAAATAATTAAACCAGATCAAAT:1	-	chr3R	22111460	5'	+	jockey	4936	1	83.81
TCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chr3L	14603287	5'	+	jockey	86	1	73.38
TGCGGGAACGGTTGGAACGGGTGGATAGGTAGGCAGTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1	+	chr3L	11957081	5'	+	blood	23	2	68.49
CATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	-	chr2L	7898411	5'	-	roo	9044	1	63.43
ACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	-	chr2L	12892709	5'	-	roo	9005	2	64.38
AAGTCCGGTTAACAAATAAATTCAGACTCATGGTGAGTTAAGTATTATGCCGTAATTAACATATTAAAAAGAAAAAGAATTTCTGCCTATTATGCTGTTTTAATCTACACTTTTGAAACTATTGAAGGAATAAATG:1	+	chrX	21629178	5'	+	HB	1487	1	68.38
ATGTATTGACATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr3R	19968058	5'	-	roo	388	2	70.34
ACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr3L	22437969	5'	+	roo	45	2	54.35
ATATATTAAGCCCACGGACATTCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACA:1	-	chr4	394006	5'	+	I-element	184	1	80.87
GGCAGCAAATGCATGATGCACATTGTAGTTGCAAATTGTTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chrX	5643627	5'	+	roo	8672	2	77.08
CCTCGAACACCCCACCAAACCAATCCAAACCCAACCC:1	-	chr2R	18303210	5'	+	G2	103	1	86.49
TGGCGTTGCTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	+	chr2L	14771991	5'	-	roo	400	1	76.87
AATGTTNTAGAAGGTTGTTAAAGTTCAGTAATTTCCTTACAGTAAAGGGACGACTGTCAACCTTTTGCACATCGTATAAATCAATTGTGTTTCGACGATCTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGG:1	-	chr3R	12007879	5'	+	Q-element	95	2	76.15
GGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1	+	chr3L	7292459	5'	+	HMS-Beagle2	41	2	55.47
ATTATTTTGTATATCTTGCTGCAGCTCACTCTGTCCATTANTTACAAATGTGGATTTATTCAATTGAGTGAACGCCATAGTGATTTGTTCTGTCACTGATTGTAGCATGCTTGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGG:1	-	chr2L	13500340	5'	-	R1A1-element	5317	1	77.40
AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAACAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTC:1	-	chr3L	4469445	5'	-	invader1	3990	2	68.12
GTAATAATTATTTCAACAAATTTCAGTGTGTACTTGACAGAAATTAGGTATCATTTTGAAATAACAAATTACTTAACCGGTCCGCCTCGATATTGCGATATTATTATTGTTTATTAATAG:1	-	chr3R	12254212	5'	-	flea	242	2	63.33
AAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGNACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAA:1	-	chr2L	12290747	5'	-	1731	263	2	61.67
GATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chr3L	20831405	5'	+	roo	8697	2	62.76
CCAAAAGTAGGCAATTATTTTCGTAATATATTCAAGTAAATGGCACAAGGGTACTTTAGGATAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1	+	chr3R	9456618	5'	+	jockey	4679	1	61.00
CGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGGAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1	-	chr3R	18339173	5'	+	roo	70	2	69.72
AAAATCTTTTTCCTGTGAACCACAAAGTGGAACTTAGGACTGAATGCGGATAAACTCTTCTTAGACAGCGGGCCTAGTCAATAAAATAATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGGCATCCGGGTCGGATG:1	-	chr3R	7365239	5'	+	flea	4714	1	55.48
AGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAGTAGGCATGTGAGTATAATACACCTTCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAAT:1	+	chr3L	14944526	5'	+	G5	4782	1	49.32
TAAACCAGAAAAAAAAACTATTCAACGGCAAAGCAAGCCAGCAGAAACTTTCAGAGTCAGCAGTTGAAGAACAAAACCTCCAGCGAATCAATAAGGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1	-	chr2R	18686707	5'	-	jockey	4976	1	76.23
GTATTGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1	-	chr2R	24218626	5'	-	412	7541	2	70.65
GTCGGTTGGATTGCCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTATAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1	+	chr3R	15072517	5'	+	pogo	19	1	69.18
GTACGCTATCTGAGAAATCCGGCAATAGGGGATAAATAAGCGCATTAAACTTGAATGCCTGACAGGCAAGGGAAGGCTGGGAGGACGGGACAGGGGGATGAAGACAGAGCGGAAACGGACTAGCAATCAAGTGTGGGCG:1	+	chr3L	20883883	5'	-	HMS-Beagle2	204	2	56.83
AATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	+	chrX	17526822	5'	+	roo	48	2	53.42
ATCCTGCTGGGAATACCTTGTGTATTGCCATATTTCGATGATATTACGATCATGGGAAAACCTGAACAGGTGCTTAGTAAATCACTCAAGTCGTATTGCGGTAAAAATCTGTCGAGCTCTGCGGCAGAGGCACGGACAGC:1	-	chr3L	23592688	5'	+	invader4	93	2	69.29
CAGATGTTGACACAGTTTCCTTGAGCTCCGTCTGAGCTCAGCACAAAATGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1	+	chr2R	9662711	5'	-	412	7514	2	52.34
AAGCTATGTCCAATGCCGACAAACAGCCGTATTACGAAGAACAGTCAAGGCTCTCGAAACTTCACATGGAGAACGTTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGTGGAATTTTGTATA:1	-	chr4	801734	5'	-	Tc1-2	447	1	51.37
GTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGAGCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTC:1	-	chr3L	2485993	5'	+	jockey	4539	1	35.65
TGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGACGAGCAATCGAGTGGACGTGATCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	21229013	5'	+	jockey	73	1	67.50
AACTTTGGAGTCGCGAGTGGCAGAGGAACTTTAAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	+	chr2R	14387908	5'	-	roo	358	2	51.37
GTTATCAGCATTAATTTCATTAATTTCCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1	-	chr3R	30344730	5'	+	pogo	48	1	52.05
GAATAAAAAAACCTGGAGTTGGCAGCAATCTAAGATTTAAAATAACTGAACAACAATAAAGTCGCGACGGTATGTATGTTTATTTTGTCTTTTACGTTACGTTTTCTTAGATATTTATGTATTTATTCGGTGAAATAAATGTAACA:1	-	chr2R	12989065	5'	+	INE-1	16	1	44.52
GGTTCTTAACAAAAAATGTACATTTTTTTCTCTAAAAATAGAACAATTGGTATTTGAGTAATTACTCCCCGTAATTGTGTTTGTGATTAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1	+	chr3R	30248079	5'	-	Juan	4190	1	65.07
TTTCACCGGCATACCTTTTGAGTTGTCTGCCACTCTTGCGTAAATAGCCACCGCAAAGGCACGACATAAGGCATCGAAGAAAACACACAGTTGCAAGTGTTGAAAACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACA:1	+	chr3L	26345239	5'	+	Quasimodo	10	2	68.49
CCACCAAGGAAAATATTTTGCATTTGGGCTCGGGATTGTATGTTATGCATGCCTACCCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1	-	chr2L	17081864	5'	+	jockey	4678	1	61.80
CTTCCCTTGACCCCTGATTCCTGGGCTAACCTTCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCT:1	-	chr2L	2122532	5'	+	Stalker4	6961	4	77.78
AAAAAACATCCTTTACTCTCGATTCGATTCTTCAAGAAGTCGGCCCAGTCGTTGTTCGAGAAACGTGTAATCCACATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTT:1	-	chrX	2517558	5'	-	P-element	408	1	62.69
GAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTT:1	-	chr2R	6085998	5'	+	1360	407	1	58.90
GGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chr3R	22844202	5'	+	roo	8744	2	73.29
GTGGCAAATGCAGTGGCCAAAGTGTGGGCGCGGCAGTTTTGGGTGGTTTTAGGGC:1	-	chr2L	3786946	5'	-	INE-1	347	1	67.27
TCCTGTCATTACCACTTTTTTCTTCATTTTTGTGCAAGTTGCGTCTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCT:1	-	chr3R	9298854	5'	-	F-element	4505	1	57.32
GGCTTTGAAATTGCTTTCGTGTCGAAGGCTGCAACACTCTGGGTTACTATTTCATGTTCGTTTCCCTTTTGAACTATAGCTTCTAGGCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCATCATATGCTCACTTGTGGG:1	+	chr2R	10175625	5'	+	R1A1-element	5252	1	50.35
GACTCGGTTCCCACGCTGCTTTTAATTTGCAAGACTCTTTCGCTCTCCGTTTGAAGTCCACTCCAAAGACCAATTCATTATTCATCGGTTTGCATCGTATGCTGTATATACGAGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chrX	9748251	5'	-	accord	186	2	66.91
TACACAAAATATAAACTCGTCCTTGCGCCGCAACCCCTTTCCCACTCCCATGCCCTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCACCTATTATAATTCTCCCTAT:1	-	chr2L	6570019	5'	+	jockey	4859	1	60.96
ATCAAAAAATTTAAAGATGGTGTTGAAACTCAATAATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1	+	chr2L	21884462	5'	+	pogo	15	1	76.71
TCTTCAAATGTCTACAAGTTCAAGCGTGCAGACTTCGCTCATACGCACTGTTCGACGAAGGATCATCATATGATAGATGAGATGCTCACTCGAAGCTTAGGGGTTAATTACTTCATATAATAAACTAAGCTTTTTGGACAATTTT:1	-	chr2L	21612112	5'	-	Ivk	5258	1	66.21
AGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	-	chr3R	18582221	5'	+	roo	8742	2	78.83
TTTCAGTTCCGCCGCGTCTTATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	+	chr3R	10266041	5'	-	1360	3380	2	77.17
ATCGTACTACAAGCTTTACTCTCCTCAACGTTGATTTTATATTTTATTCTTATTTCGTAATATTTTATCTTGCCGCGACATTGTTTCCAAATAATATTTAGTAGTTTAATGAATCTAATTTTATTTTTA:1	+	chr3L	1789239	5'	-	NOF	3958	1	72.09
CAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	+	chr3R	28624571	5'	-	roo	334	2	69.86
CGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGGTTTTCACAA:1	-	chrX	11471658	5'	-	hopper	1386	1	51.46
TCCAAAACATTAAATAAAACCGAACAACTTTATGCCACAAATAAAAAGGAATTGTTGGCAATAGTCTGGGCTCTTAAAAATCTCAGGAATTACTTATATGGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1	+	chrY	3572696	5'	+	Max-element	15	2	73.91
GGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1	-	chr2L	19965039	5'	+	Doc	58	1	64.22
AATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGCCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTT:1	+	chr2R	23266046	5'	-	mdg1	7397	2	69.17
GCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr3R	13360301	5'	+	jockey	73	1	60.27
AGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCCGCAGGCGACTCGGGG:1	+	chr3L	3500952	5'	+	opus	68	4	73.08
GATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1	+	chr2L	17081783	5'	-	jockey	4930	1	61.64
AAGGTCCACCAACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTGACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCA:1	+	chr3L	23933519	5'	-	Cr1a	253	1	55.81
CAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	-	chr2R	9632188	5'	-	roo	340	2	63.45
TATTAAAAATATTTAAGCACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:2	-	chr3R	14364717	5'	+	roo	42	2	55.48
CATCGACAACAGCTGCTGCTGCTTTCATGTCTGTTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAA:1	-	chr2L	9412076	5'	+	jockey	4529	1	69.91
TATATCATAAACATCAACATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1	-	chr3L	11393626	5'	-	roo	395	1	70.55
TTAAAAATCAATTATATTATATTCTTAATAATGACATGTATCTTAAATGTATATCTCTGTTGAAAATAATGTAACTCCTACAGCATCACTCATACGCACTGTTACACATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1	+	chr2R	12834232	5'	-	jockey	4944	1	76.12
TTACTGCAGGGGACATTTGAGTTTAGTTGTCATTGAGATGAGCTTTCATGCTAAGATCCTTGGGGCATCGATGTCCTTAAATTTATTATACGGAATGAATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATATT:1	-	chr2L	7154342	5'	+	R1A1-element	12	1	68.35
CATTGTTTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTA:1	+	chr3R	22388936	5'	+	G2	2625	1	68.31
ATTCCCTCATCCATTATTATTCGAATTGGATGAGTTGCAAGGACGAAATAACAGGATTTCGTTGGGATTTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1	-	chrX	17431847	5'	-	hopper	1392	1	69.66
TGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2	+	chr2R	8585439	5'	-	roo	8997	2	68.49
GTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCG:1	-	chr3R	25423295	5'	-	3S18	276	2	61.64
CACACGTTCTGAATTGGAAACTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr3R	25448314	5'	-	roo	9033	1	57.53
CAAAAATATCAATATATTTTATGGAGAAATTCTCCAAAAGAAAAAATTAAAACATATAAATTAACCACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCG:1	+	chr3R	19445434	5'	+	roo	8758	2	54.79
CGAGCTCCTACCGAACACTATACTATACTTTACTATATGAGAGGACGTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1	+	chr3L	10056065	5'	-	transib2	2799	1	66.90
AAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1	+	chr3R	22821976	5'	-	mdg1	383	2	45.21
ACAGTGACTGAAACAACGGCGGATGCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr2R	21908013	5'	+	roo	22	2	55.88
GGTTATGAAAATATTGATTTTGGCTCAGCAATATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1	-	chr3L	3477541	5'	-	mdg1	7423	2	60.27
AGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTCTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGG:1	+	chr3R	27424868	5'	-	blood	288	2	77.40
AATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:1	+	chr3R	5061808	5'	+	mdg3	5284	2	63.89
CCATCAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGCTACCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1	-	chr3L	12861806	5'	+	pogo	50	1	58.46
ACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGCATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	9662791	5'	+	412	7094	2	60.87
ATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCAT:1	-	chr3R	22232287	5'	+	1360	392	1	55.17
AAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCA:1	-	chr2R	4774749	5'	-	baggins	5345	1	62.59
GAAAGTGCTCTTGGGGACGTTGAACCCTTGTTAAAAAAGGGAAATGCATGCCCAACACTGCGAAAAATATATACAATAAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1	+	chr3L	18555832	5'	-	jockey	4974	1	68.49
AGAAACATATTCTGTTGCAAGAAAAATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	-	chr3R	16076907	5'	-	roo	401	1	72.50
TCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	-	chr3L	20888827	5'	+	1360	17	1	68.18
TATGTGCGGTTATTGTGTGCTGTTGTTGTTATTTATCTGGGCTGGCTTGTGTTCTGGTTTGTTGGCTGCGCTTATTAATTGTGTAGTTTGATTTGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTG:1	-	chr3R	11861081	5'	-	Porto1	259	1	64.62
GGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1	+	chr2L	13585847	5'	+	Tabor	46	2	61.95
AACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1	+	chr3R	25423196	5'	+	3S18	5797	2	52.10
CCATTTAGGCCACCAGGACGACATTCCTGCGGGTAATCGTGCTGTGGATGGAGTATATTAAAATATCCAAATCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1	-	chr2L	13634563	5'	+	F-element	26	1	60.19
CTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chr3L	15600340	5'	-	roo	9047	1	48.39
ACACCAAATTATTTAGCGATTCACGAAGACGAAATGTCTTATTATAAGGAAAAATATCAGTTTATAAGGAATATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCC:1	-	chrX	22118649	5'	+	gypsy	7034	2	51.72
GTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr3L	15177281	5'	-	roo	8997	2	78.46
AACATATCATAGTAAAATATTTTTTCAACGTATTTATTTTTATTTCATATCCCTTTGTGCATTATTGCACTCGATACCCATTAACACCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCG:1	+	chr3R	4134944	5'	-	Quasimodo	237	2	66.67
TTTGATTCACAGCCTTTTGGGGGGAATACGTGCTGCCAAAGTTAAATGAAATATTAAAAGTATAAAAATCTTCTTAGTATACCTTCCTTCTGGCTTTCATGCGGGCAGATGGACATACGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTG:1	+	chrX	18842914	5'	-	INE-1	101	1	46.58
CTATACAGTATTGATACATCCTAAGTCTCTCTTCACCACCATAGGTTCGGATACAAGTCGCTGCAATTGTTGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGAGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTACTCTAGTG:1	-	chr2R	3340144	5'	-	baggins	4994	1	57.86
TAAGAGATATTTATTGTGCCTCATTGAACTAAGGGTCGTGGGCGTGGCAAATACCCAATAATTGCACTTACGTTGCAATTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGCTTACATATTTATATTTATGTTCATAA:1	+	chr2R	19475876	5'	-	1360	2955	1	55.48
AAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGCATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1	+	chrX	17756577	5'	+	297	62	2	62.33
AACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	-	chr2R	5531222	5'	+	1360	59	1	73.55
CTTATTGAGTTATACAAAAAACCGAATTTTTGTCCAGGTTTTGATTAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr2R	20596602	5'	+	roo	15	2	73.97
GCAACGAACATGGCGACCATCAGCACAAGCAACTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTACGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1	+	chr3L	22911760	5'	+	jockey	4709	1	62.89
TACATTAAAGATTTTGAATACATTACTGGCGACTCGGTCGCAACTCGGTAATTGAGGGTTCAGGAAACGGGATCCTGAAAGGACGCCAGTTTGGGCTTAGATATCCACTCTGTTGGCCATCTCGCCTGATC:1	+	chr2R	19890723	5'	-	Rt1b	4792	1	63.36
GTTTTGTCTTGTATATAAGACAATATATCAGATGATGTTTAATCAGGGGAAAGTCGAGAAACGAAAATTTGTTTCTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCAAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTAC:1	+	chr3R	18717919	5'	-	diver2	4847	2	50.68
AGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1	+	chrX	13504134	5'	+	412	36	2	57.04
AGTTCGCCATTGTTTTTAGATTTCCGCTCTAGTAAAAGTTGTTTGTTTAATTTCTATATAATAATATTGCTTAGGCGTGGCAATGTTAGCTAACTATTCTTTTAATTGTTTTTTGTGTT:1	-	chr3R	19704344	5'	-	Bari2	918	1	71.43
GGCTAATAACTGAGTTATCAATCGTTTGGCGTTTAAATTTGGAAATTCAAATTTTTTTTTTTATTTTTTGTAAA:1	-	chrX	8959927	5'	-	TART-C	11100	3	82.43
TCCCAGATTAAATTGCTGATAGTAGCGAGTTGCGAATTACGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAA:1	-	chr3R	25826744	5'	+	mdg1	7120	2	72.41
ATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGATAGATATTAAATATGGCATTTGTTATAAATAATTTGATTAAAAAGTGGCAGCCGTGTGTCAATCCCTTCGCATATGTATATGTGTATGTGTGTGTG:1	-	chrX	15408742	5'	-	accord	7032	2	66.43
ATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTT:1	-	chr2L	23034040	5'	-	FB	344	1	65.07
GAATGATGATGTCAATCTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1	+	chr3R	10546085	5'	-	hopper	1354	1	61.38
TGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1	-	chrX	10521736	5'	-	Tabor	430	2	54.11
TATTATAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAA:1	-	chr2L	589568	5'	-	Copia1_DM	92	1	75.34
GGGGTGCAGCGTTCTATGCTTTGTCATTAACACAAACACGCACACTCGCACACCCGCTCACGCACACAGAGGCAGTCGCACCAACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACTATAATGTGTTT:1	-	chr2R	21572222	5'	-	hopper	1393	1	60.45
GGGGGCCTGTCATCGACAACAGCTGCTGCTGCTTTCATGTCTGTTTCTACGGCCTGCAGGTCTACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTA:1	-	chr2L	9412086	5'	+	jockey	4528	1	62.30
ATCATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1	+	chrX	13704733	5'	-	invader4	302	2	65.47
TTCTAGAGGAAACTGAAAACTATTTGCATACCAAAAGTTGTTGCCAACAAGAGCAAAATCATTTTGCACACGAAATGAACAGCGACAAAGACAGACAGCATTTCAAACAGCAGCCACAAACGAATAATAATAATAATAATAATA:1	+	chrX	6129729	5'	+	mdg1	7075	10	65.97
CGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1	-	chr2L	18419268	5'	+	412	7082	2	58.57
AGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:2	+	chr2R	2016831	5'	+	1360	52	1	61.60
TAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTTAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1	+	chr3R	26431967	5'	+	opus	150	4	54.70
AATCATACTCATCCATCGTAATTTGGATTCGAGTATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1	-	chr2R	16944284	5'	+	jockey	4710	1	70.80
ACGTATCCTTCGCTGTGAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1	-	chr3L	11957219	5'	-	blood	353	2	57.41
GCTTTTCTTCCTCTTCTTCAGCTTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1	-	chrX	17833101	5'	+	Tirant	10	2	70.94
CCTTGTACTTCAACTTTATCAATTATTCACAAAAACCTTTACCCTGAACTGAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1	-	chr3L	9673129	5'	+	Doc	35	1	47.27
ATTTAAAATGCGACGAAGCGTGGCACACACACACACAAACACAGAAAAAATCCGGAAAATGCCTCGAATATTTCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTCTGTGTGCGGGTGCTAC:1	-	chr2L	1839334	5'	+	hobo	49	1	51.72
GCAAATTTAGATCTTTCCTGCTGGTATCCTGCTGGCCGCCACGAGAAAACTGGTGGCTCAGAATCCTAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	+	chrX	1517500	5'	+	1360	9	2	72.34
AAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAA:1	-	chr3L	5498501	5'	+	Doc2-element	249	1	36.43
TATTGAATCTTCTCTTGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTG:2	+	chr2R	5284497	5'	-	Doc4-element	2634	1	73.97
ATCTATTAAAGAGAACAACAGAAGATGTTAACTCCAATTTTAGAAGTATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAAC:1	+	chr3R	19448705	5'	+	Cr1a	4017	1	66.67
AGTAAAATCATCAAAACGCCGAGAAAAAGTGTCATATTGTTAAACAATAAATTAAACGAAGTTGATTTTGACAAGAAAGGCGAGGAGAGGAGAGCAGTTAAAAGTTGACCCTACAATCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGC:1	+	chr3R	14036290	5'	+	1360	3215	1	75.34
CCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1	+	chr3L	17558031	5'	-	jockey	4946	1	70.00
CATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGC:1	-	chr3R	934289	5'	-	Rt1b	4738	1	59.59
GCTCCAAGAATTTTCGCTTTGAGTTGTTTGTCTCCTTTATCAGTCTGTTGCGATCTTTTTGATGTGGCGCTCATTTTCGCCAACTGCAATTCACGCTCTCCTTCTCTTCGCTC:1	+	chr2L	16496885	5'	+	Max-element	8330	2	64.60
AAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGCGTGGACGTGTTCACAGTAGTCGC:1	-	chr3R	22276779	5'	+	jockey	34	1	64.36
CATGTGCACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATAC:1	+	chr2L	12328647	5'	-	hopper	1342	1	66.43
CATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAG:1	+	chr2R	23465989	5'	+	Doc	492	1	61.60
TTTGTTTTTGCTAATTTTTATTGGTATACCAAAAACACTAGCCACGCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAA:1	+	chrX	2820067	5'	+	INE-1	500	1	62.33
CCGGCAAATGGAGTCCCTGTGAAAATTTTACTTACATACATATGTATGTATGTGAAAGGTGTTTCTGTCTATTAAAACAGCAGAAGCTTATGTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1	+	chr2L	588313	5'	+	FB	28	1	58.22
TTTAATATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1	-	chr2R	9221098	5'	-	opus	450	2	65.52
AAGAATATAATTTAAGCTTGCTTTTTATTCTTGAGTTCTTGGTTAAATAGGTTAGCATCTGCTTGTTCCCTTTTTTTTTTTAATT:1	+	chr3R	22151240	5'	-	Bica	337	1	62.35
CAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTG:1	-	chrX	21564757	5'	+	diver	59	2	60.27
CTACTTGTAAAAAGCTCTCCTAGAAATTAAAATTAAGCTATGAATACTTAAAGTAACTGAAAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAG:1	+	chr2L	22393141	5'	-	Rt1b	4956	1	51.97
CGACTCGTTTTTACAATGTTAGATGTTCAGTCGCATGTTCGATGCGAACTGGAGCCGACGTTATCAAGCAGATACTGAAACGAGTTGGCATTCTTGCCATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTG:1	+	chr2L	7544660	5'	-	pogo	190	1	54.11
AAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1	-	chrX	14749674	5'	-	copia	5071	2	75.34
AGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTGATATAAAGGCAAGGTGGAGTGAG:1	+	chrX	23202005	5'	+	R2-element	468	1	64.00
ACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	-	chr3L	15600348	5'	-	roo	9033	1	45.89
AATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACTCTCTTATTAGATTATGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1	-	chr2R	19798129	5'	+	Transpac	41	2	53.73
TACTGCAAAGGAGTCGGATAGAATGAGATAGTGGGTGCGGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAA:1	-	chr3R	14650796	5'	+	P-element	307	1	33.33
CTACAGCCAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGATAATAATTACAGTTATCGTTTTTATTT:1	-	chr3L	23728717	5'	-	HMS-Beagle	7033	2	58.90
ATAACAAGAAATTCAAAGGAAAAATATTTATAGTTGAAAACAAAACAAACAAACAAATAAAAAAACCCGGTCAATTTGGTTGCGTATTTGTATACCAACGTTCTGTGTTTCTTACCACTTGTGGGGGAAACAACAGAATCATTCGA:1	+	chr3R	28090287	5'	-	rooA	484	1	67.12
GTATATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1	+	chr2L	11732231	5'	+	Doc	14	1	65.00
CCCTTCGAGCCCTGGCCACAAAGTGTTGCGTTGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:1	+	chr3L	19035991	5'	-	Tirant	333	2	65.71
TAAATTACAATTAATTAAGTGCTTAGCCAATAAAAAAAAAAATTTGCAGACAAATTTTTCATAAAATGTTAAATTGCTAATTTAAAAAATAAATACAATACTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGAT:1	-	chr3L	14520979	5'	-	Doc	4520	1	67.81
TAGCGTCTGGAAGTGTAAGGAAATGTACATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAG:1	-	chr2L	20117999	5'	+	invader4	7	2	74.13
AATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1	-	chr3R	16404564	5'	+	pogo	56	1	61.59
GCTTAGTGTTTTGATGGTGATGATTTTGGGTAAAATGATTCTTTGGATTATGATTATGGTGAGTTTCGTTGAAAAGTATGTAACCGGCAGAACGATGCGTTTCCGACCATACAAAGTATATGTATTCTTGATCAGAATCAATAACC:1	-	chr2L	22685883	5'	+	INE-1	87	1	56.16
CAACAACAAATTCCTCTGACTCTGGGGTTTTGAAAAGAGATACAAAAAGAAATTGGTTTAATTTGAAAAGGTAGTTGAAAGGTTAGTAAAAAATGACATTAGTTAGGAGACAAGGTTAGAATGAAAATAAAAAAAATTTATGAATT:1	-	chr2L	18378976	5'	+	S2	1631	1	77.40
CAGGAGCGAAGGCTTCCGCAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAA:1	+	chrX	10521586	5'	+	Tabor	6856	2	72.41
ATGCATGGAATATATACAGAGGCATCGCATTTGGCAAGATTACACCTTTTTCCATGGACTTTCTTTGGGGTTTTGGGGGCAAGTTGTTTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGTCCGAAAATCTTCTAGCACAACACGCACAC:1	-	chr3R	22595276	5'	+	1360	3207	1	60.27
TAACATACACTTGCATTTACGGAGCTGCATACGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1	+	chr2L	18404543	5'	-	hobo	2920	1	60.53
AAATTACAGTATTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTATTTATTTATTATATTTTTTAAGTCATTTGACTTAACTAATTTTGTGGGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTAAGATTCTACGACGCTACCAATCAAAAAAATTAA:1	-	chr2R	6886123	5'	+	G4	3489	1	50.68
AGGTCATCTTAAGATTGAGTTCGTCAAAAATGTACTTTGCCCAAAAAAAGAACAAACTATGAATGCTAATAAAAAACTTAAGGCATGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATT:1	-	chr2L	8576281	5'	+	G5	4724	1	56.16
TTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1	+	chr3R	19968080	5'	-	roo	9028	1	54.79
ATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr2L	17420144	5'	-	roo	352	2	58.22
ATTAAATTGATTTGGATTTTCCTTCATGCTTATTAAAACAGCTTTCAATTTCCTTGTTTCTGCATTCTCAAGCGTGGTCCTTTGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGC:1	-	chr3L	14164770	5'	+	micropia	5178	1	54.79
GAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTT:1	-	chr3R	14979861	5'	+	pogo	88	1	78.08
AGCAATAGAAAGTGTTACAGACGGCACGAAAATTAAATTACGGGTATTGTTTTGAGTATGTATGTCATTAATTTAAAACAAGAGAGAACGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCAAG:1	-	chrX	22852602	5'	-	INE-1	543	1	65.19
CAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGA:1	-	chr3L	11530973	5'	-	roo	341	2	62.33
ATGGCGAACTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chr2R	15004726	5'	+	jockey	12	1	44.52
AAACTGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGATAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1	+	chr3L	21855422	5'	-	blood	364	2	68.47
TTAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1	-	chr2L	15833124	5'	+	hobo	25	1	68.06
AGGATAAATTAGTTCTGGTCTTGTAACCACGCTAAGTCTACTTTTGATTCTTTATGGTCGTAGTGTAAAATTTTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCGGTT:1	+	chr3L	18982268	5'	-	1360	137	1	50.34
ATGATAATAATAAGTAATATGTTTATGTCTAACTTTCTAAAGATTAGATGATCTTAAAGTAACCGCCACTAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAGTTGAGGCCCGGGCTGGTATTGTTGCTAGGTTTAAAGC:1	-	chrX	22897226	5'	+	Bari1	419	1	52.05
ATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	-	chr2L	18339054	5'	-	pogo	2039	1	68.94
GTTGAACAAAAGCCATGAAAACTTGGGGATAGAAATTCAATGTGAGGCTATAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTAAGTTTTATGTGAAGTCTCGGTTAGTCAGGTCTTGAGG:1	-	chr4	623977	5'	-	jockey2	3189	1	66.67
GTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1	-	chr2R	3066001	5'	-	P-element	2814	1	38.36
ACATGGTTATATCATAAACATCAACATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:2	-	chr3L	11393633	5'	-	roo	402	1	75.34
ATATCTTAAGCCCAAGAACAACCAAACAGGCCATCCAGTTTTTCTAGCCCAACATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCGATCTT:1	+	chr3L	11442307	5'	-	roo	242	2	51.46
GTTTCTGTGCAAATAGATGCATTGAGTTAGAAAAGCCAGACAACTTAATATGGCAAATAACAATGATTTGGACTTGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGAC:1	-	chr2R	13816185	5'	+	412	194	2	50.00
TAAAAGCAATCAGCGTTTTTTATACGACATAAATATTGTGTTTTTGCAAAAATGGGGTTAAAACAAACGGTCTTCTCATAATAAGTTACTACTATACAACTAAGTCTAAAAGATAGCAAGAATGCAAACTCGTTTCAGTATCTGC:1	-	chr2L	7743688	5'	+	pogo	246	1	63.45
TAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	+	chr2L	12892637	5'	+	roo	8746	2	76.39
ATTATTCATATTATTCCAACATAATCCTCGGCGCTGAGAAGTGGGTGAGTTGTGCTATCTATCTAGCCGTCTGTCTTGTGCTAATGACTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCC:1	+	chr2R	17074275	5'	-	roo	213	2	69.11
GTCTGCTACTACTGGTGGAGTCAACTTGGATTGCTTGTAATTCCTATGTCAGGCTGAAATTGAATTCCATTCTCAACCACAGTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAAT:1	+	chr3R	27895247	5'	-	Quasimodo	7172	2	58.22
TAACAATAACGAATAAAAAAAATGTGGACTTAATCACAGCCGGAAGATGTCACGCATTACAAAAAATGCAGACATTATGAATTCATTTCTAATAAGGTCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAGACATTGG:1	+	chrX	6702651	5'	-	1360	3367	1	61.64
GGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATAGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTT:1	-	chr3R	23021005	5'	+	INE-1	580	1	41.10
AAAATAATATAAAATAAAATAAAATAAGACACACATTGGTGAGTGTTCACACATGGACACGAATATCTTTAAAGAGTTACAATTTTGGGCTCC:1	+	chrX	14635202	5'	+	roo	8693	2	59.14
AAAATTGCTTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	+	chr3R	26222861	5'	-	roo	9005	2	66.21
AAACGTTTTATTTCAAAATAAATAAATTATTGATTAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1	+	chr2R	15064308	5'	-	412	463	2	65.75
CAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1	+	chr3L	14603290	5'	+	jockey	80	1	73.85
TGTCATTCTCATCCAGAAAGGTTAGTAGCGACGCAATAGAGCTTAGGTTTTTGACAATTCCCTTAAATGCAAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAAAGCGGACACAAGC:1	+	chr2R	2509561	5'	-	1360	468	1	50.71
TTCAGGTAGAAGGCAAACAATGTTAAGCCAACCGCAAAGTCAGAGGAATTTATTTGTATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1	+	chrX	8814727	5'	+	pogo	58	1	62.33
GAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	-	chr3L	15177309	5'	-	roo	9026	1	56.59
TTAGATCGCAACGAGACCAACGTTAGGTATCGCAAGCACAGATACCGCGTAGTGGAATTCCTCCCGGAGGAAAGCGTAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATC:1	-	chr2R	24974940	5'	-	invader4	215	2	55.48
GAGATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTACGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1	+	chr2L	544759	5'	+	412	38	2	54.81
AATTGTAATGTTAACCATTGTAATCCTTTGGCATACTAAAACATCTGGAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1	-	chr3L	17555862	5'	-	jockey	4987	1	38.81
CTTTGGTATTGGTATTTGTATTTGCGGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1	+	chr2R	10124154	5'	+	P-element	77	1	23.44
TATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCTTATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGTTGATTGGGTATAACATAACGTCAATACATATTTACACTTAGTCATAATAAATATAAATATACAA:1	+	chr3R	9714408	5'	+	Stalker4	83	4	66.43
AAAGCGATTGGAGATTGCAGGGAATGCAATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGCCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1	+	chr2L	11518363	5'	-	412	7535	2	70.59
AAACAGAACCAAAAATTGCAAAGCGTGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGCGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACACTG:1	-	chr2R	5485250	5'	+	blood	7021	2	75.37
CTCAGGGTGTGGGCCAAACACTTTCCGCACTGAGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACC:1	-	chr2R	13006541	5'	+	3S18	5785	2	69.05
TAATGAGAGGACACGATGGTGACACCCCTATAAGGAGAGGCTGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATCATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTC:1	+	chr2R	5173383	5'	-	gypsy	443	2	72.41
ACAGCCCCGAATGATATTAGGCGGTGGAAACTTTGCCATTGGCCAAAACAATCAACATTTGTCTCCCAACATGTCACAAAGTCGCGAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAAGCACGAAGTACGG:1	-	chr4	953637	5'	-	1360	476	1	41.78
AACTTCAAAAAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACA:1	+	chr3R	24455348	5'	+	Quasimodo	34	2	55.81
TTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGTACATTGGGAACACTCACATTGTAGCACAT:1	-	chr3L	10574388	5'	+	Tabor	6890	2	45.89
GTTGACCAGTGAAGCAGCAGGTACCCAGCTGCTTCGCTCGGCTCTCCTTAGGTCCGGCCTTGTTGTTGGGTCGGTGTTGTCTCTCTTTGCAGTACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACCCC:1	-	chr2R	19015490	5'	+	accord2	205	1	73.11
TAATAAACAACAAAGAAATGTTGGCCTTTTATATTTGATTATATATTTTTGTTCGCATTACTTTTATACTGCTATACAAACAATCTGCCAATTTAAATGAGATAAATATGAACGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGG:1	+	chr2R	10267457	5'	-	R2-element	3549	1	70.55
TCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr3L	4536774	5'	+	roo	8743	2	72.60
AGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1	+	chrX	21014780	5'	+	copia	60	2	59.59
AAGAAGTTGTGCCAAAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCGGAAGGGCGCAAACAGTTGCGCGGCAGTG:1	-	chr2R	16373567	5'	+	Max-element	8253	2	63.81
ACATCGCAAAACTGTAACAAATTTGATGGTGGAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAACATATGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCG:1	-	chr3L	23342133	5'	-	1360	152	1	73.15
CAGCAGAAAATTCGGATCATAAAGACAGAGTCAAGTTTACCAGTAGTAAAAGAAGTCGTCGAGGGATGAAGTCTGAGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATG:1	-	chr2R	3188500	5'	+	frogger	2308	2	65.83
GCGAATCCCTGGATTTTCATCTCCTTATTGGAGGGAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1	+	chr3L	388764	5'	+	opus	7023	2	60.71
AAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1	-	chr2R	15064432	5'	+	412	7122	2	65.75
CATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGCAGAGTAAGAAATAAAAA:1	-	chrX	7701626	5'	-	Gypsy6A_LTR	236	1	72.41
AAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATACATAACCACA:1	-	chr2L	10037431	5'	+	Quasimodo	44	2	55.48
CAAAATAGTTGCGAAAATGGTCTGACCCAATGCCTAATAAAATCAAATATTAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATCTTTTT:1	+	chr3L	4601999	5'	+	pogo	52	1	53.42
TTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGG:1	-	chrX	22643328	5'	+	Tc1	1620	1	52.05
TGCACTTATTCGAAGGGGCCACTGGAAACTTGTACACTAGAAAAAACCAAGACATTGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1	-	chr3R	29361119	5'	-	mdg1	420	2	76.71
GAAACTCCTGGCTAATTGTTATATCATTTTCTGGGCAATTTTAAAGGGGTGGGGTCGCTTTAAGAACGGGGTCGAATCCTCGTGACTTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACA:1	+	chr2L	9745736	5'	-	1360	204	1	65.89
TGCTTGTGGCCCAGATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGATCGTCTGTT:1	-	chr3L	2362420	5'	-	Stalker2	364	2	54.03
GGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAATTGTGATCCA:1	-	chr3R	20427478	5'	+	jockey	64	1	54.11
CATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	-	chr3L	11530955	5'	-	roo	8987	2	74.66
AATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAAC:1	+	chrX	10521622	5'	+	Tabor	6872	2	56.80
CACCGGGGAGCATCACATACGACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1	-	chr3R	17316334	5'	+	opus	7047	4	58.40
GTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGTACGAATTTT:1	-	chrX	1899674	5'	+	P-element	93	1	17.39
ATCTTTGCAACTTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1	-	chr2R	16785457	5'	+	412	19	2	71.11
GTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chrX	5643447	5'	-	roo	399	1	73.77
GCCGCGTCTTATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1	+	chr3R	10266051	5'	-	1360	3351	1	60.27
CTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr3L	23635041	5'	+	roo	75	2	72.22
TAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTCTGGTCAATGC:1	-	chr3R	18722950	5'	+	jockey	4701	1	52.22
GGACCAACGCTTCCACTGGAGCTTCCCTCTAGGTAATTTCCGCTATCGTCTTCGCTGTGAAGTTCTAGTTGATGTTGATCGCTTAATTGGAACTTAAACTAACTGTTAACAGGTAAGTTAATAGATAAAACTAAGCATATAATTTG:1	+	chr4	898772	5'	+	Bari2	229	1	61.64
ATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCACCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439047	5'	-	P-element	2495	1	64.93
GCAAGGACCTGCGTGTCTGAGAGGGTCAGTGGTCGGCAAAGGTGGTCCCACGTCGAGCGTTGCCTCAACCCGTTACTTATTGTTAATTTTTAAAAAACAGATTGTAATTTAAAGAAAAATAATAAGAAAAAAAAAAACA:1	-	chr3R	2975761	5'	+	Rt1b	5149	4	52.52
GACCATAGCCTCCTCCATCGATAGCCTCCGCACAGACGTGGTTTTCCCAACTTGCAATGCAGCGAATTAACGGATGTAATGCGACGCATAGCTTCCCGATTTCTGGAACATGAAATACAGATATTTTTCCATGTCCCTCT:1	-	chr3L	22071858	5'	+	HB	54	1	77.14
TATATTACCTTACCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGC:1	-	chr3R	5061943	5'	-	mdg3	192	2	56.16
CTTAAAAGTTTTCTGGACATTGTGTTACGAAAAGTAAATGGCAAGATTTACGAACATTACCTAACAAAGACTTTTTATGTGTTAAAAACAGAAAAACACACATTGAATCAATTTGGCCTAAAATTTATATATATTTTATTAGGTC:1	-	chr3L	5615527	5'	-	TAHRE	430	1	62.07
TAATGAAAACACCGACTTTGTTGCCGCCTGGGTCAGCGAACAGGCTACTCCCATTTGCAATGATCTGATCGGATATTGTTTTACAGGCTTAAGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1	-	chr2L	13843016	5'	-	Tabor	474	2	50.00
CTGTTACATACTTTCCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGTCATACATTGGTTTTGCACTTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTGTACACATATACTG:1	-	chrX	124083	5'	+	rover	152	2	63.01
TAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:2	-	chr3L	11441835	5'	-	roo	351	2	58.22
ACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTC:1	+	chr3R	25454090	5'	-	Quasimodo	6928	2	69.49
ATTGATGTTAAACTTAAAAGACTTCCTCATAACTTTAATAGTCAAAAAATGGGAAAAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	-	chr2L	12153280	5'	+	roo	44	2	55.12
ACTGCGCTTTCTATATACAGTAACTATCTAAAGATTTTCATAGTTAAGCTCGTTAGATCCAACTAAAGACATCAGAATAATTATAAACGCATCCAGGTGATGCAAAATCGCGCATGTACGCAACTCTACACTCCATA:1	-	chr3R	7476159	5'	+	Helena	1177	1	63.50
CGTTGGTTGTATTGTCGTGACAAATGCTGTCTGGAACAATACGATGTGTATATATATATATTATGCATATATAACCATAATGTAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1	+	chr2L	1664932	5'	+	hobo	27	1	40.00
GATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2L	21132332	5'	-	roo	355	2	58.96
GACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATCTTTT:1	-	chr3L	4605729	5'	+	pogo	51	1	53.42
CCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCA:1	-	chr2R	16248026	5'	+	BS	20	1	60.00
TAAAGATGGTGTTGAAACTCAATAATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1	+	chr2L	21884473	5'	+	pogo	26	1	69.18
ATTCAGGGAAACGAGGTCATTAAATGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGT:1	-	chr3R	13349186	5'	+	BS	5000	1	78.77
AAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	+	chr2R	18336150	5'	+	roo	8722	2	64.49
GTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCAT:1	-	chr2R	17259332	5'	+	jockey	4750	1	71.53
CTTTTCACACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr3R	25448309	5'	-	roo	9060	1	73.39
AGCAATTCAACGCTTTACAAGCAGCGTAACTCAAAGCAGTAGCGTCACCACAACAACGGTGACATTTACTAGTGCCAATAACAGCACCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAA:1	-	chr2R	14855340	5'	+	Bari1	33	1	63.70
AATTACTTGTTTTGTCATTTTCGCAGGCTTAAAAACATGAACACATTTTTTGCTGAACTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTATTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTACTT:1	+	chr3L	4605613	5'	-	pogo	2042	1	58.22
ACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGAT:1	-	chr3R	9714461	5'	-	Stalker	7184	4	71.22
TTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1	-	chr2L	9399534	5'	-	Transpac	5204	2	53.00
GTTTGAAATACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAATAATCATTGCCTTATTAATTGTTA:1	+	chr3L	24996079	5'	-	1360	438	1	58.90
TTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAAC:1	+	chr3L	23797670	5'	+	Helena	1159	1	49.23
TCGGCAGATTTGTTGTTGTATGGTTTTTGTTAGGAAGTTTTGTTTTGTATAGAATTTATTCTTAACTTGTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGTGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACA:1	-	chr2L	22975186	5'	+	Stalker	308	4	54.29
GAGGCAACGTGACTATTAGTGCGCCATTTAACGCCTTTAATGTGCCACTGAGCTGTTCTCTATGGTTCTGGGCACGTAGTTAGCATTCTGCAGCTGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGC:1	-	chr3R	17524432	5'	+	1360	265	1	64.38
ACTGCCTCTTATACCTACCTGTGTACAGGTGAGGGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1	+	chr2L	6569945	5'	-	jockey	4946	1	59.06
TTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1	+	chrX	17054226	5'	+	jockey	85	1	75.57
GGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1	+	chr3R	10462582	5'	-	opus	463	2	59.59
AATTAATTTCTAATTTCTTTTACATTACAAGCAGCTAAACAGATATACATATATTTCATTTAAGTTCTATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTATCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGT:1	-	chr2L	22170895	5'	+	Cr1a	4020	1	52.74
TCATGGAATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGC:1	-	chr2R	20497051	5'	-	blood	379	1	72.80
TTTTTAATTATACCCGGACCTCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTT:1	-	chr3L	27670271	5'	-	I-element	5343	1	56.85
AAAGTTCTGCTCACAGTACCCTGTTAAGTTTTGCAACGAAATTGGCCAAAAATCCAAATATGTAAATTGACCTCTCCCCGCTCGTGTGAAATTGAGAAAAATCTAAAAATTGAATTTGCGTGCTAGAAGACAATTTTCTGGCCGAA:1	-	chr4	431416	5'	-	1360	3191	1	56.16
TGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2R	19004135	5'	-	roo	355	2	57.46
GCCTTGTCAATTTGTTAGCTTATCAAATGCTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGAC:1	+	chr2L	5307108	5'	+	jockey	4739	1	75.20
TGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAGTAGAAAAGTTGTAC:1	-	chr3R	14979875	5'	+	pogo	73	1	65.52
GTGCTAAACGATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:1	-	chr3L	7943755	5'	-	Burdock	6375	2	53.42
AATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGCTCCCAG:1	-	chrX	2842561	5'	+	Tabor	6927	2	76.03
GAGGAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1	-	chr3R	25454141	5'	+	Quasimodo	18	2	59.03
ACAAATAAAATAAATAATATGCGATGGTCAGACGGAAGCACGGAAAATCGTATTGGGAATGCCAACTCGAAATTTCATTATTTTTCTGACTTATCGATACATATTGGTGAAAATAATGCGAAAAAATTAAAAAATGTTTATA:1	-	chr3R	4615101	5'	+	Tc1	56	1	55.63
GGCTCCATTTCCTGTGTCTCTCTGCACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCGCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1	-	chr3R	7482852	5'	-	412	7501	2	54.11
AAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGCCACT:1	-	chr2L	16067180	5'	+	297	12	2	67.68
ATTTGGTTTTCGAATGAATTTGTTTCTTACAGTGTATATTTGTGGCAACGGCTGAGTTTAGCAGGTGAATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTACCAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTA:1	-	chr2L	7670266	5'	+	transib2	398	1	52.05
CGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCCTTTCACAGTCTTCGGG:1	+	chr2L	11732247	5'	+	Doc	6	1	66.38
GCTGGACTCACGGTTTCCTCTTCCTTGAACGTATAGCGAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	+	chr4	419930	5'	+	roo	8682	2	70.00
GATGCTTAAGTTAGTTTCATTAGCTTATCGATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1	+	chr3R	15363866	5'	+	flea	11	2	76.71
GAATAGCGGGTTCTTGCACTTTCGCCGGCACAAAGTACACAGTTTTTCTCGTTTAAGTTAAATTTAAAGTACATTTAAGATTTTCTCACACCATTTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATCAAT:1	+	chrX	11611267	5'	+	Tom1	287	1	52.38
TTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGAC:1	-	chr2R	4601645	5'	+	HMS-Beagle2	61	2	61.64
TGTTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCAAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATT:1	-	chr3L	12879841	5'	-	roo	374	1	56.59
CACCATCGGCATGGGTCTGCGATCGTCTGAGCTTCCGGGAGTTGCTAAAACTTGCCGAAAAATGTCTCCGGATGAGAAGTGGCGACGCTAATTTGCGTGATGTGAGGCATGAACACACACACACACAC:1	-	chr2R	22296037	5'	+	accord	179	2	71.09
ATTGATGTGCGTGGCAATTGCAAACAGCACTACAAAAAAATTTAAGTAATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATG:1	-	chr2L	21884643	5'	-	pogo	2073	1	64.83
AATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1	+	chr3R	10462610	5'	-	opus	7445	2	64.29
GTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	-	chr3L	3863508	5'	+	blood	7075	2	69.05
AAATAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr2R	22117313	5'	+	roo	17	2	57.89
AAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2L	9668195	5'	+	1360	55	1	69.60
TTTTTTTTAACTTTGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTTTTTTTTTAACTTTGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACCATTTATTTTTCCTTTGATTAC:1	-	chrX	12944662	5'	-	HeT-A	6005	2	74.48
ATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1	+	chr2L	13585855	5'	+	Tabor	87	2	76.03
GTCGGAATCCGAGTTGTGTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGTGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1	-	chr2L	15875856	5'	-	hobo	2931	1	74.78
CAAAAACCCAATTTGTCCGTAGCAAGTTGTGAAAGTGCCACCGACCTGCCACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGCGTGG:1	-	chr3R	14940232	5'	+	jockey	15	1	77.46
GGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1	+	chr2R	5248237	5'	+	1360	52	1	60.00
AATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1	+	chr2L	8986100	5'	+	412	36	2	57.86
AGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATT:1	+	chrX	13039470	5'	-	roo	9038	1	53.64
AAAATATCTTACTCCACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1	+	chr2R	3065929	5'	+	P-element	63	1	37.31
TTAGGATAGTAATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGGACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATA:1	+	chrY	680440	5'	+	invader2	4889	2	63.89
AGCTAGATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTNCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCT:1	-	chrX	22643352	5'	+	Tc1	1594	1	53.47
CTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr3L	19334350	5'	+	roo	8717	2	60.69
CCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	+	chr2R	21229004	5'	+	jockey	70	1	65.08
CTGGATGCAGGGGAGCGGCCTAGCAACAGCGAAGACATCCGCGATGCAGGAAGAATCAAGGGCACAGGGGTCCAACGGTAACGGTGCG:1	+	chrY	32454	5'	+	gypsy8	4786	2	76.14
CACCAACTTATTCCCTTACACATTACACCTAGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCC:1	-	chr2R	5323576	5'	+	Quasimodo	7044	2	68.69
GTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACAT:1	+	chr4	1301736	5'	+	1731	74	2	65.07
ACTTCCTCAACATAAATTAAAAAGCGAACGAATTCTGCACCCCAAATGTAATGACCTATAAAAGGCACAACATGACAGTTACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1	+	chr3R	21434852	5'	+	412	7089	2	54.23
CCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATTCGAAGTATTTTAGCATTAATAC:1	-	chr3L	10013671	5'	-	hopper	1353	1	57.24
GAAATTCAATTTGTGTGTGTTTGTTTTACTAGCTATTGTGCCATTGATATATGTATCTTGTATTCATCTTTTCTTAAGGGTAAATTAAATTAAAATAAAATTAATGTGCTTGCATGCAATTATAATTTGATTGTTATTTAATTGTA:1	+	chr2R	20633901	5'	+	X-element	4580	1	68.49
ATAAGTATGTATATATATAACGTATTTAGATGTAAATCATATACTTATTTAAGTATGTGTTTGTATATAGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATG:1	+	chr3L	9396041	5'	+	Juan	122	1	53.42
GTTTAGTGTGTTTCTGCGATTGAACCGTTCAATCCAGAAATACAAATTCTAAGAGCGTTGCTCCTTATTGTTTTATTAGTTCCGTTTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGCAGCCAATAGAG:1	-	chr3R	1682736	5'	-	F-element	388	1	70.00
GCTCTGAGCTAGATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACGTATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAA:1	-	chrX	22643358	5'	+	Tc1	1590	1	56.16
ATTTGGTCATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTATGATAGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCG:1	-	chrX	21587779	5'	+	INE-1	127	1	45.21
ACTGTATCATATTATATTTTCTTTAGATACGCCCATTTGGTATGCCCAATTTTCCTTCCCTAAGAGACGCAGCTTAAGTTTGTTGATCCATGTTGCCACACCCACTCTAACGCCCTAAAACCACCCAAAAC:1	+	chrX	20678974	5'	+	INE-1	345	1	50.38
GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGCTCAACGAAGAT:1	+	chr3L	25232768	5'	-	accord2	155	2	57.63
GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTT:1	+	chr3R	17660025	5'	-	micropia	392	2	66.42
CTTTGACCGCATGTCACAGATGGCGATGGAGATGCACTCGTCAAAGGTACAGTTGGCACTCATAAAGAAGTTTTTAATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1	+	chr3R	16404444	5'	-	pogo	2085	1	69.17
AATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1	-	chr2L	9399527	5'	-	Transpac	5151	2	72.60
CTAATCTGTACATTTGGAACGGTAGCCGCACTTCATACAGAATCATGAATGTTCGCATAATTGGCAGAGTTTTATGAATCTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTT:1	-	chr2R	9258565	5'	-	3S18	6077	2	54.48
TGGAACGACTGATGTGCATAGCTTACTTGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACTTGAGACAAAGACGCAGGGCAATTTTGTTGACCCATGCTGCCACGCTCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCAAAA:1	-	chr2R	6946066	5'	+	INE-1	343	1	77.95
ACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAA:1	-	chr2L	10037423	5'	+	Quasimodo	50	2	54.11
ATCTTGTCCAGCTCCATGGAGTGCTCGTAGCAGCGCTTCAGCTTGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGACGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCC:1	+	chr3L	10646993	5'	+	412	234	2	67.86
GGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	+	chr2R	9632092	5'	+	roo	58	2	58.22
AATACGTTCAATTTACATATTTCAGCTGTTAGTCGAGCTAGGAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGATCGGCAGCTCGTCAACTCCGACTAAGCGTCGTAAAACATATTTTTATTACTTACTCTGCCAGACCAC:1	-	chr2L	22320951	5'	+	Gypsy6A_LTR	241	1	70.83
CGAAAAGGGAAAACTCATTTGCATGGCTTATTCCCTTCACAGCTCGAGCTGCCATGGGCCATAATGAAGTGATTGACGCGCCCCACTCGCATTCGCCATTATTATTATTATTATTATT:1	+	chr3R	20336532	5'	-	mdg1	7078	12	60.17
CATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1	+	chr3L	23906351	5'	-	1360	3354	1	61.64
AGTGTCCTCATTTTCACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1	-	chr3R	7100949	5'	-	roo	395	1	72.60
TGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTAAAAGTCAAAGTGTGGCATCAAAGTTTAATACCAAAGACACTAGAATATCAAGATGCCTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1	+	chr3R	4571527	5'	+	1360	28	1	40.74
AGAATTTCCTTCAGCTATGAAAATAATTTTGAGTTGCCTTGCAAATGATAATATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACC:1	-	chr3R	11832084	5'	+	jockey	352	1	64.14
GCTTAGTTATCGTTTTGAATTTATCGTATCTCTGTCTACAGGATTGTAGCTGTGACACTCTTGTCCATCTCAACACAAAACGCAC:1	+	chr3R	3253008	5'	+	Circe	137	2	92.94
GTTCGCCGAGTGGCTTGGAAAATCACTAAGGGTAAATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTTCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:1	-	chrX	11296452	5'	+	BS	5076	1	74.65
ATCCTTGAGGAACGAGACGCGGATCGAGGGCGACTGGGCCAACTACGAGACAAATGAGGCTCTCACCGATCGGTGAGTGTCCATATCTTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGC:1	+	chr2R	23075395	5'	-	Stalker2	7586	2	73.73
CAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACAC:1	-	chr3R	6611278	5'	+	HMS-Beagle	75	2	69.18
CCGCAGATCAATCTGGCCGACACGTCGCGGGTGCAAGTCACCAAGCTACTAATGGCAGACGTAACGCTTGCACGAAAAAGAATTCTGTTCATGCTATGCTGAAGTTCTTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATT:1	+	chr3L	23452961	5'	-	HMS-Beagle	7008	4	77.24
CACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	-	chr3L	16343283	5'	-	roo	8988	2	74.13
GGGGATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1	-	chr2L	19965074	5'	+	Doc	60	1	50.68
GCCCTTATATATCTAGTATCTGCAGTGCTCATCCAAAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGAACACCCCATACCATGTAGCATAGTGCACATATATTGTACTTTGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTCGCAAA:1	-	chr3L	17220962	5'	+	invader1	472	1	66.90
AAAATAAAGGCAATTTTTATTGCAATTTGCATTAATAAACTATAAAATAAGCATATAAATATAAATAATGTGTGTTGCCACAGTTACAACAACAAAAACGAGAATAACGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1	-	chr3L	2841047	5'	-	copia	242	1	73.29
TTTATTTCATAATAATGGTTTTTGCATCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCAACGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTGGGATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1	+	chr3L	13142234	5'	-	transib2	2761	1	62.22
TCATTTTAAAATACAACATTTTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	+	chrX	9539976	5'	+	roo	8689	2	66.44
CCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	-	chr3L	27391413	5'	-	1360	3370	1	64.39
GAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1	-	chr3R	11496609	5'	-	1360	3376	1	63.64
ATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCC:1	+	chr3L	23456282	5'	-	Gypsy6A_LTR	265	1	72.80
AAACAACCGAATGACGATAATCACCACAAAAACACTTGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1	-	chr3R	12717831	5'	-	297	6943	2	57.89
GAATGACTCACGATAAAAAATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr3L	4536645	5'	-	roo	9060	1	71.33
CAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chrX	9540096	5'	-	roo	330	2	70.55
GTTTTGGACTTGCAGTTTAATCAAATCATGTAAATAAATGCTTATAAAATATATAAATTAAGTTTAAATTCTGAAATACTAAGATACTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1	+	chr3R	14337370	5'	+	copia	36	2	60.96
CGTTATAAGAAAACGTTACATCAATTTTGTAGCATACATTTTGGGGCATGTACTACTGAATGTACTGCATGTACCGTAGAAAACTACTTCTATTGCCCGAGGTTGGGTTTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTAT:1	-	chrX	20266416	5'	+	BS	5036	1	76.98
AATATTCATTAACTTTTATCACTTCCTTGATAAACATTTCTTCTCGCTGACTGGAAAATTTTCATTCGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1	+	chr2L	3164938	5'	-	412	7488	2	55.48
GATCGAGAAGCGGCGAAAGGAGGCATTGCGTAAGAATGAAATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGC:1	-	chr2L	17531216	5'	+	G2	2901	1	73.57
ATTGTAAAAAACAGAGAGATAAAATAAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAGACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	+	chr2R	18336092	5'	+	roo	8672	2	76.03
GGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCACTTTGCACATGTGCATATGTAATTC:1	+	chr2L	12290650	5'	+	1731	47	2	53.42
GTCCGCATTTCATATGAGCGGCACATGCATGTCGCACAGATCCGAAAGGAGTGGGATTACCTCGATTCTTGAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1	+	chr2R	6919615	5'	+	hobo	19	1	71.23
AAAGCAGATCCAATGGGATAAGTAGAACCTTCATCTGGAGCAAGCTGGTGCATTGTCCGCACTGACAAGAAGGAAGCTGTCATATTTTTAGATTTTTTTAATTTCGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAA:1	+	chr2R	1530602	5'	-	1360	3251	1	55.48
CGTACATCGTCCGACTGTACAAAAAGTCGCCATCGATGTACGATGTACGACCTTATTGCCACATAAATGAGAGCCTAAGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCC:1	+	chr3L	17081569	5'	+	Quasimodo	7213	2	47.79
GTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1	+	chr3R	21706005	5'	+	297	6617	2	67.37
ATTTCCACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1	+	chr3L	17205229	5'	-	hobo	2913	1	71.05
CAGTTTCAGGTGCGGATTAGTTGGCTTGTTTAGGTCGAATAAAATGTATCTCTTTGACTGTTGCCTCTCCGACTGTCTTCTGTCATTTCTTTTCTTTTTTTTTTT:1	+	chr2R	7749877	5'	+	hopper	142	2	86.67
TCATTATTAATTGCAAGGCAATTAATCAGTTTTACTTGCAATCAACGAGCAGAAATGCAAACAAGTCACATTTACACTTAATAGCTGTAGCTGTAGCTGTAGCTGTCCCCATTTACTCTAAATAACGTCCAAA:1	-	chr3L	1362794	5'	+	Doc4-element	2386	1	73.68
TGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGGCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1	-	chr2L	5845062	5'	+	transib2	77	1	70.34
CGTAAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chr3L	11441867	5'	-	roo	9047	1	67.81
TAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATC:1	-	chr2R	23332609	5'	-	invader4	270	2	70.40
AAAATATATGTAATTGGATGGGTTAACATATCATATTAAAGAGCCAAGTTTGTTTTTGGCACAGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	+	chr3L	19334205	5'	-	roo	386	2	69.66
ATCGAACACTTATTGAAATTGAGCGAAACTATACAAGTGTCAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGA:1	+	chr3R	5764472	5'	+	Stalker4	7118	6	69.03
GTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1	+	chr2L	17420131	5'	-	roo	9031	1	54.86
GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTT:1	+	chr3L	11115124	5'	+	micropia	24	2	59.14
CTTATATTATTCTTTTATAACAGTCTATTCTAATGACCAAGAAAAATTCGTATATATACTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1	+	chr3L	20324663	5'	+	297	59	2	66.44
AATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr3R	17817961	5'	+	roo	8683	2	58.75
GGTCGTTGGCTGGTTCATCTGATCTCCAGCCACCTGACGAAATATCAATATTTCGACTGGGTTCCTCATTATACAATAAATCGTCTCTTGCTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTT:1	-	chr2L	9426591	5'	+	1360	3269	1	61.54
GAAACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTNGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGACGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1	-	chr3R	20499879	5'	-	mdg3	5467	2	63.01
CAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATGTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGGGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCG:1	-	chr3L	22016759	5'	+	1360	115	1	92.68
TCTTATATTTGTTCTGTGAAAAAAATGAATTAAGTGCTGAAAATGTTCTTTATTGTTGAATTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1	-	chrX	7887183	5'	-	297	346	2	60.42
AAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGCCGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCA:1	+	chr2R	5209593	5'	+	gypsy	6999	2	64.29
AAATTTGTTTGCGCTGTGGCTAATGAGGCAGTCCAATGCAGATACAGAAGCTATAAACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATA:1	+	chr3L	7943609	5'	+	Burdock	6197	2	64.14
ATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr2R	11164536	5'	+	roo	20	2	69.85
CATCAAACTCAAAAACTGGTAAATTTTGCTCACTCTTCCGCTAAACTTAAATATCTTAATTAAATATCTTTCTAGTTCAAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTA:1	-	chr3R	31947336	5'	-	Transpac	101	2	53.10
ACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGC:1	-	chr2L	12290755	5'	-	1731	4568	2	60.74
GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGAGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGT:1	+	chr3R	17660024	5'	-	micropia	422	2	56.19
TTTATGATGGCAATTACTTGTTTTGTCATTTTCGCAGGCTTAAAAACATGAACACATTTTTTGCTGAACTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTATTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1	+	chr3L	4605602	5'	-	pogo	2053	1	57.53
GAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	13585396	5'	+	412	7095	2	52.55
AAAAAAATGAAAATGTTATTTATATTCTAGCTTAATCTATTGGCTGTTATAAATTTCATAGGGTGTATGGATGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGGTGTACACATATACGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTT:1	+	chr3R	26477952	5'	+	accord2	7240	1	60.27
CGCGAATTGTGCTCCATGCGCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3L	233232	5'	+	roo	8718	2	58.57
CACACAAAGAGCCGGGAAGCGAGTTGCACATTGCACAGTTACCGCTCGAAATGGGATTTTTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	-	chr2R	6919755	5'	-	hobo	2921	1	60.19
TTATCGATTTAACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1	+	chr3L	1534510	5'	-	pogo	2053	1	54.23
ATGTTGGCATTAATAAAGTTTCAATTAAAGGATGTACTTAAAAAATGTATGTAAAATGAGTTTGTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCATTAGTCAGTAGGAACCGTTCAGTTCCTTCTCAACTTAACCTAATGTGTATC:1	-	chr3R	4200239	5'	-	G5A	2785	1	64.38
TTTATTTAACAAGGTTCTAAAAATTACACTGCCCCTAGGCGGAGTGCTTGCCAACCGAACATTTCCTTTGGACATAAACCAGATGGTAAGCAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCT:1	-	chr2L	17001574	5'	+	297	340	2	63.70
TAAAGAATTGTCCTTCTTTTAGGTGTTTTAAATATTTGAACATTCTCGATTAAAATAGTTTCAACATCTTTGTAATTGGTAAAAGTATTTGGCGAGCTTTGAACTTTTCGCCGTTGGGTAGTGTGTCAATATGTGTGTGTGTGTT:1	+	chr3L	21006849	5'	-	accord	188	2	65.52
CGACCACCTATGCTCATGGCCGAGGGCCCATTGTTATTTTTATTTCAGCAAATTGAAAGCATCAACATATCAAAACGGCAGTCAGAATATAACGACGACGCAGGAATGT:1	+	chr3R	8055554	5'	+	Bica	4906	1	54.13
ACATCGTTAAGCGAGTAACCAGTGGAAGTGGCAGCTGATCCGTCAAAGACAACGCGAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAACT:1	-	chr3L	2424349	5'	+	diver2	194	2	66.67
AATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr3L	15600163	5'	+	roo	8680	2	46.09
CTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTG:1	+	chr3R	17817868	5'	-	roo	9041	1	62.12
ATGTAGCTGGCCACTAGGACGGTTCTTAGAGCATGATTTGTGCGAGATAGGGTAATCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGTAAG:1	-	chr3L	19802650	5'	+	Chouto	153	1	71.30
CGTTACTGGTGTTGTTAGTGAATTAATTTCCAGTGAATAATTAATGCTGAATTATTTTGGACGTATTACTGCTTTACATACCCTTTGGTGCCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGA:1	-	chr2L	3671132	5'	-	Circe	7086	1	53.79
ACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	+	chr3R	22822001	5'	-	mdg1	358	2	61.64
AATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1	+	chrX	13066518	5'	-	jockey	4917	1	70.55
ACAGTGGCATTTGTCGCAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	+	chr3R	22844129	5'	+	roo	8671	2	76.71
AGGCATGTTTAATACATCCGCTTAAATATATAAAAGGAATTTAAAATCGTATTCGGTAAATAAATTTATTATTTCTACAAATTCTAAATTAATATGTATATAATATGTATATGTTATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCAC:1	+	chr3L	19339279	5'	-	Tc1	1641	1	73.97
CAAAGCCATACAAAGATACTTTTTAGTATACTTTGCCATACTTCTTGTCGACTTTCAAGATTGTATTGTTATTGTAAGTTAAAAATAATAAAAAAAAACATTAACCCCATTTTTGAAATACTTTTAAATATTAAACTAATATATTT:1	-	chr3L	12062045	5'	-	INE-1	411	1	30.14
ATCGGTTCTGTCTAGTTTTTTTACTCAACTCTTTTTTACTTCTTATTTAAATATTTTAAGGTGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATAAAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTTCACTT:1	+	chr2L	21795709	5'	+	HB	79	1	62.33
ACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGAC:1	+	chrX	13066530	5'	-	jockey	4905	1	78.77
CGTTGCTATAAAGGGATATAAACAAATACAAGAAAGAGTTAAAATAAACTTGCGGAAATACAGCTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTCGGACCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTATAATATTATTAGGTATTT:1	+	chr3L	26229875	5'	-	HB	1537	1	60.96
GTGTTGAGTGATAATGATGGCCTTTAGTTTAATTATAATTTTTACATTACTGTTTGGTTTAAAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGCGACACAGTGCATTGACGTTATTACATATTA:1	-	chr2R	2959081	5'	-	Dm88	4398	2	51.11
TACGTTGTCAGTGGAAAATTTTTAGAACACATCGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCAAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1	-	chr2R	19499422	5'	+	P-element	27	1	58.78
GCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	-	chr3L	11530956	5'	-	roo	8988	2	75.34
AATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1	+	chr2R	9221042	5'	+	opus	39	4	75.79
AGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:1	+	chr2L	13585845	5'	+	Tabor	77	2	69.18
GATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1	+	chrX	2518070	5'	-	P-element	2811	1	18.80
AAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1	+	chr2R	11629717	5'	+	Tirant	20	2	70.23
AGTTCGAATTCAAATTCAAAATTCACCGCTCAGACTTTAAGTAGAGGTCAATGTTGAAGTGGGTGGGGAAGTCTCATTAAAGGCGAAAATGGAATGCTTAAAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAA:1	+	chr3L	16868184	5'	+	FB	19	1	71.03
AATTAATCAAAGCGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:1	-	chr3R	10274061	5'	+	HMS-Beagle	6838	2	56.85
CACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACA:1	+	chr3R	4604451	5'	+	1360	482	1	63.70
CTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAA:1	+	chr2R	1320696	5'	-	diver2	334	2	53.54
GGTCCCGCTGCTGCTGCTTCTTCTCTTCTGCCACTCGCTGGAAAGAGCACCCACTCTATTTGCGATAACCGAATTATCCCAAAACTTTCCGTGTGTAGCTGAATTGGGTTGGAACTATGCAGCC:1	+	chr2L	5538774	5'	-	1360	3350	1	61.29
AAAATGTGCATTGGCATTCCATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1	-	chr2L	11674475	5'	+	jockey	28	1	73.29
AGGTAAGAAAACAAAGGAAAGCAGTTGGCCTAAAGCTTAAGTCTGTTGGCGGGGGCTTATAGAAGGCTTATACCACGTAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAAA:1	+	chr3L	6534257	5'	+	mdg3	5104	1	54.11
ATATATTCAAGTAAATGGCACAAGGGTACTTTATGATAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAA:1	+	chr3R	9456643	5'	+	jockey	4734	1	67.69
ACCATACATAGAATATGGTACGAAAATTGGGACCAGGTTACAATTCCTAACATAAACTTTTTAAGCCCCAAAAACATTAATACCATATGATTCCACATATATTTGTAAAAACATACAACTTTAAC:1	+	chr2R	5472203	5'	-	transib4	447	1	60.80
GTGTGTCGTGCTGGTAAATTGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1	+	chrX	2842448	5'	-	Tabor	465	2	71.53
GTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTT:2	+	chr2R	20194216	5'	-	Max-element	259	2	61.47
AAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1	+	chr3R	25339965	5'	-	mdg1	7402	2	56.16
TTAGCTATTTTGGCCCGAGGCTTAACGGCTTATCGAGAGCACTAAGCATTCAATTCAATTTAACTCAACCCGAATTCTTAGAATTCCAATATCCATTCTTTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	+	chr2R	9627809	5'	-	roo	326	2	74.07
GAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1	+	chrX	21016732	5'	+	Transpac	37	2	56.83
ACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCACACACAACATCA:1	-	chr2L	10037403	5'	+	Quasimodo	68	2	64.58
AGTGGAAAATTTTTAGAACACATCGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1	-	chr2R	19499413	5'	+	P-element	47	1	49.30
TAAACAAATGCCCTGATAGCGGGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGCAGG:1	+	chrX	18386393	5'	-	invader4	3001	2	75.00
AGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1	-	chr2R	4601662	5'	+	HMS-Beagle2	6927	2	58.22
GTGTGAAAAGCACCTAATTCTTAGGGAGCAATAAAAGATTGATGCGGAATATTGTTCGTTGTTGCTGATGCGAGGTGTCAGGTGGATTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACC:1	+	chr2R	12344818	5'	-	opus	7268	2	72.88
TACATTATGAATGAGCTCGTTAAAGTTTAGTTTTAAAGCCTACCCAACGTCAGATGAGCATTAACGACTGAGCTAGAAGAACCCCTTGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATA:1	+	chr2R	9799665	5'	-	1360	262	1	64.62
ATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr2R	8585447	5'	-	roo	325	2	73.97
CTTTAATTTGTTCTAGGGGAGAGTGTGGAACTCAGCTGTTGCATGTTCTGGAGGATCACGGGCAACGCGAGTGAGTCGTGACTCAGGTAATACACCGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTACCGAAATAC:1	-	chr4	802105	5'	-	Tc1-2	420	1	59.31
AATCCTACGATTCTAACTGCTTTACATTTTTTTTTTGGAAAAAAATTGTATGGTTTTACCGAAATTTAAAAATTAAAAAAAAA:1	-	chr3R	17421196	5'	+	TART-C	11097	1	42.17
GTATAGTAAAAGAGTATCTAGTATCATTGAATCTAATATCATTGAAATGTATTTAGCAGACATAAGGAACCGTTCCCAATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGC:1	+	chr3L	26417934	5'	-	Quasimodo	6969	2	52.74
ATGTGACTGTACTCGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1	+	chr3R	9210635	5'	-	mdg1	7386	2	67.12
TGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTAGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAGG:1	-	chr2R	5209663	5'	-	gypsy	377	2	75.91
ATTCAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr3R	7835223	5'	+	roo	41	2	54.48
ATTGGCTAGCTGCTAAATTTGCTTTTATCTAAGATAGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1	+	chr2L	9399416	5'	+	Transpac	4942	2	65.67
AATGAATTTTTGTTTTATGCGTTTTTATAATGGGAGAGGGCATTTAATAAAAAATGTTGAGATTCAGAATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCAAAAGTTTGCTGAAACATGTTGCCCCGCCAACTCTAACGTCCACAAAC:1	+	chr3R	32048610	5'	+	INE-1	218	1	64.58
TAAAATAAAGGCAATTTTTATTGCAATTTGCATGAATAAACTATAAAATAAGCATATAAATATAAATAATGTGTGTTGCCACAGTTACAACAACAAAAACGAGAATAACGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1	-	chr3L	2841048	5'	-	copia	243	1	75.34
CAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATATTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1	-	chr2L	10037418	5'	+	Quasimodo	43	2	53.73
CGGTGGTTCCGAAATAAATACACTCAGTGAAAATCAGTTTTCAAATATAATGGACATGATAAGGGGATCAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1	-	chrX	8347665	5'	-	412	452	2	52.94
TAATATGCAAATAATTCGGTTAACATGTTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCT:1	+	chr2L	14892176	5'	-	transib2	2794	1	65.07
GAGCTTCATAATCGGATTTCCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATCTATGCGCATAAG:1	-	chr2R	20499976	5'	+	blood	147	2	77.78
CGCCAACTACAAACGAATTTTTTTGCAAAAAAAAACAAAAAAAAAGGAAAAA:1	-	chr2R	22386141	5'	+	Doc2-element	228	4	53.85
GGCCACCTGGGTGTTAAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1	+	chrX	5629079	5'	-	jockey	4964	1	64.14
AAACGCACCCATACATACAGATGCGAGGGCACTTACAGATACAAAACATACCGACATTGTCGTATTTTAACCTGACTTGTTTTTCTCTATTTTATCAAGCGGGTATAGAAAGGCAATAGCAATAGCAATAATAACAATAATA:1	-	chrX	6700934	5'	+	mdg1	31	2	73.24
GGAGAAAATGTTCGGGCGCATCCGTGGGAACTCGTAGTTATGAGCTGTTAAAGTTTTCCCTTTCACTTTAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAA:1	-	chr2R	15289009	5'	-	hobo	2627	1	55.08
CTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1	-	chr2L	11518483	5'	+	412	65	2	60.96
CTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGC:1	-	chr2R	13585485	5'	-	412	7463	2	73.29
ATATATTGATAGATTTAACCAGAGCTACTAAACAAATGAAATAGTAAATATTATAAATTATAACATATTTAGAGCTGTAAATAAATATTAATTTCAGACGCTAAGGGAGGGTATATTTTTTTATTAATTTGTCATAATTTTTTTT:1	+	chr2L	12065078	5'	+	Tc1-2	1375	1	66.21
GATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr3L	9998014	5'	-	roo	394	1	45.52
CTTTCAATAGATATTAGGATAATTTTTTTTTGCATTGGGTACATATACAAGTTAATAGATGTGTGTTTTCACGTACATATGTCGTCGAGGATGCATTCCGACCATATCAATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCT:1	+	chrX	22908669	5'	+	INE-1	97	1	55.48
CGTGTTAAGACCTCGGCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1	+	chr2L	17081765	5'	-	jockey	4956	1	52.90
ACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:2	-	chr3R	14364699	5'	+	roo	60	2	60.27
AAAATATAATCGTTCGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAT:1	+	chrX	22601884	5'	+	INE-1	83	1	54.11
ATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1	-	chr3R	17831887	5'	+	F-element	38	1	49.57
TTTTACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTGTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTGTCATCCGTCAGGTTTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGG:1	-	chr2R	3104466	5'	-	Gypsy6A_LTR	339	1	69.44
GTAATATGCAAATAATTCGGTTAACATGTTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1	+	chr2L	14892175	5'	-	transib2	2795	1	65.75
CAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1	-	chr2L	9399528	5'	-	Transpac	5174	2	66.94
CTTGAGAAGGGTCATCAACAATATCCACGTTGAGGTGGCCATAATAGGGGTCAGACGACTTACAATGATCGTGCTCAACTGGTCTGTTAATCAACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCA:1	+	chr3R	2211168	5'	-	1360	486	1	63.01
ATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1	-	chr3R	18873667	5'	+	micropia	5092	4	52.74
ATTCTAGAATTGATTGGTTGAATTGGTTATTTATGTTTTTTAATTTTTTGATAAGTAACTAGTGTTTAATAGTCGAATTCAACGATATGTACATCTATGCATTGAATGACTTGGTTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACG:1	-	chr3R	16094402	5'	-	Idefix	198	1	79.45
AAGCGCTGCAATGAAAATAATGCAGTAAGGTACATAATGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGC:1	-	chr2R	2564995	5'	+	gypsy	7067	2	69.86
GAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr3L	12879792	5'	-	roo	8994	2	79.03
ATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTA:1	-	chr3R	11547744	5'	+	G2	341	1	78.26
TTTCATATATTAAATAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1	+	chr2L	4953912	5'	+	Quasimodo	34	2	61.64
ACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTCCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGC:1	-	chr2L	21657033	5'	+	invader1	3641	2	74.71
AAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1	+	chr3R	9921951	5'	+	blood	7025	2	70.73
TAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1	+	chr3R	22821966	5'	-	mdg1	393	2	49.32
AAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	-	chr3L	15600307	5'	-	roo	8992	2	72.60
AATTGGTTTTGATTCTGTGCAAAATATAATATTTCAGCTTTTCTTTATCTGAATATTTATGATTCTTTGATTTAAATTGAAAATATTGCTCAATAACTAATATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:2	-	chr2R	20944488	5'	+	pogo	14	1	69.18
CGGATAGATGTCATTGTCATGATGGTACTGATAGGCTGGAACCATCACGGTGACTCCGGGTTCCAAGTCCAGGGTTTTATCATCCCCCAAATCGATCTGAGTAGGCTTTTAATTATTTTTCCTTTATTTTGTCGTGGATAAGCAAA:1	+	chr2L	2563239	5'	+	Circe	6980	1	71.23
AACTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATAGGTTGTGTCGCGCGTATGCACAAGTGATCTA:1	-	chr2R	16248031	5'	+	BS	31	1	56.85
GCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chrX	13504140	5'	+	412	7095	2	53.68
TAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	+	chrX	17526820	5'	+	roo	46	2	50.68
GTCTAGCCCGTTGGCCATAAATAAAATCTAGCCCGCTGGCCAGGGAATAGAAAAATCCAAACTGGCCAAAAGGATTTATGCAAATAAACATTTTCTATCAAGTTTTCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTAC:1	+	chr3R	9834302	5'	-	Q-element	323	2	64.38
TTAAAAACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTG:1	-	chr2R	5531227	5'	+	1360	73	1	67.14
AGTCCAGCGAATGCTTGCTGATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1	+	chr3R	10182093	5'	-	blood	348	2	62.22
ACCAAACGCACCAAGTAAAAGTGCTTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATCTATTTAT:1	+	chr2L	2794137	5'	-	Burdock	6378	2	70.90
ATTAAATGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1	-	chr3R	13349168	5'	+	BS	5017	1	66.90
TTTCAAAATAAATAAATTATTGATTAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1	+	chr2R	15064318	5'	-	412	7515	2	62.77
TTTCCAGCAAATTCATAATACAACAAAAAGAAAACAGAAAAAAATTATACAAAATTAGGCCGCAGGCTGGGGAGTGAGAAAAAACCAAATTATACCAAAAAATCTGAAAACGAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGAAATTA:1	-	chr3R	22159708	5'	+	I-element	5213	1	56.85
TCTTATCTGGTATATAGGATCTCAGGCACTACCTGCACTACCTTATCGGTTTCTCTTTTCTCCAACTGTTAGAGCATTTGCAGTATCGTGTGGGTTATCCTCTGTCTGGTGTTCCCTGCACAGTATGTGGCCGGTCCTTTAACATC:1	+	chr2L	7526366	5'	+	R2-element	375	1	76.71
AAAGGATTCCGAGAAATATGACCTCAAAGATGAAGGTGAAGCTGTTGATTAATATAAAAAAATGCTTTATTTCCAGCGATATGACAATTAAATGTTTGAATTTTTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAG:1	+	chrX	20453686	5'	+	INE-1	547	1	79.31
TCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAT:1	-	chr3R	13349124	5'	+	BS	5047	1	58.02
GGAGGTTTCTTCATTGGAGGAGGCTCCTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chrX	18193610	5'	+	jockey	15	1	76.43
TTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCC:1	-	chrX	23182950	5'	+	Idefix	18	2	60.27
TAATTGTATAGATGATCTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1	-	chr3L	23456273	5'	-	1360	3340	1	58.39
AAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACAT:1	+	chr3R	9714374	5'	+	Stalker	6897	4	51.80
GAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1	+	chr3L	11957154	5'	+	blood	7033	2	70.83
CGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2L	14081323	5'	+	1360	53	1	66.67
GTCACAGGACTACGTATTTTTTAGTAATTTCGGTATCCTACCTAATATTAATAAGTTAGTCTTAGAAAACAACAAAAATAATTCATTAGATTATACACAAGCAATGTCAACTACAATACAAACAAGAGAGAATGCAATAGTCGAG:1	+	chr3L	25006973	5'	-	INE-1	577	1	69.66
ATGGAACCATCATCATTAGTCGCTGCCGGAGACATTGAGACACGTTTGATAGCAGCCCATAGGATGCAGCACGCTATTGCAGCGGAGAACTGACAATGCTGCTACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1	-	chr2R	16299322	5'	-	blood	331	2	45.26
GGACGAAATGGAAAACTAAATTCGGTTTACATAATATAGCTCATAAAATATTTTTCGCACATTCATTGTCCCTTGAACCCAAAAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1	+	chr2L	2687291	5'	+	copia	4884	2	72.41
GCTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1	+	chr2L	14771998	5'	-	roo	402	1	76.80
ATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTACGTGCATGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1	-	chr2R	5485193	5'	+	blood	59	2	63.49
AGGTAAGTTAAAAATTCAATTGAATCCTTTAGCTTGTAGTAAAGGTCACTAATTTTAAATTATTTCTGGTTGTTAGTAGCCAATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTATTCACAGCAAAAAACGTACAAGA:1	+	chr2R	7105610	5'	-	copia	134	2	56.16
ATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAGTAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1	+	chr3L	23818354	5'	-	copia	5078	2	70.14
TTCCTCCAGAAGTATAGGTGAAATTACATTTTTAATTAAAAAGGTCTTATCTGAAAGAAATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1	-	chr3L	1534785	5'	+	pogo	28	1	66.44
CACTGAGAGAAATAACAAAGAGATATCAATTTATTGGCATAACGTATACCAATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTCTACGATG:1	-	chr3L	25485705	5'	+	Doc2-element	114	2	48.63
TTTATTGGTCGCATACTGTAGAGAAACAATAACAATTAGGCTTAAATAAGGTCCGGCTACTGTAAATACCCCTTATCGAGATGGGTGAGTTCTAAAAAGTAGGCATGACCAGATCGACTCGGCTATTAAT:1	+	chr3L	17313281	5'	-	INE-1	99	1	76.15
TGGCAATGTTAGTGAGTAATATCATGGGTTTACATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTAC:1	+	chr3R	4504010	5'	-	INE-1	551	1	74.66
TTCCATCCTGGTAAGGATTTATTCATGAAATTGTTGTAATATTATCTATCTTTGTGTCAGAATTAGTTTGTTATAAGTTTGTTTTTTTTTTAACTTTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTT:1	-	chr3L	11715011	5'	-	Bica	483	1	49.32
GGTACTCGTTGATATTTTTGTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr2R	19004108	5'	-	roo	389	2	69.53
GGCAGCACGTTGGGCAAAGACAAAGTCGAGAGAGTGGGTAAATTTTAAAATTGTTTAATGCATTCTTGCTTGTTTTTTTGATTTTTCGTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTT:1	-	chr2R	10155189	5'	-	gypsy7	5009	1	66.95
CAGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAAGAGCGCTACAG:1	+	chrX	14317409	5'	+	1360	113	1	73.39
GGTTAAGACCTAACCGTAAGACAAAGACGGTCTATAATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1	-	chr3L	24208257	5'	+	Quasimodo	12	2	73.97
GGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTC:1	-	chr3L	25401034	5'	+	Doc	3	1	67.54
ACCTGTATCCGAAGGGGGTTGTTATCCCCCCTCTTCCACGGCTCTGTCCGAACGCATTCCACAAATGTTATCGCATATAACAAAATCTTTTGAATAGTTTGAAGGACACTCAAAAAAAACTTTAAAAATTATTT:1	+	chr3R	20292783	5'	+	P-element	2697	1	59.70
TTTAGTAGAACCTAACCTTATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	+	chr3L	14603205	5'	+	jockey	10	1	79.45
ATGGGTATTTTCCAAGTGGCTTAGTATTTTATAAGCGTGAGTTGGCAGCCCAGATGCCAACAAGTATATTTCATTTGTTGTGTGTGCTATATAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1	+	chr2R	23877680	5'	-	297	372	2	69.86
ATGAGGAATTGACCCTATATACACACACACACACACACACACACACACACATATA:1	+	chrX	9749551	5'	+	accord	7030	2	83.64
TCTTAAAATATTCGCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAATGAATCAAA:1	-	chrX	2842617	5'	+	Tabor	17	2	76.34
AAAATATGATATGTTTTTTCAAACATGGAAAGAAAAACAATTAAAGTCATGGAAAATGTAAATAGTTTGAAGTTTTGATATGTAAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAAACAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATACTTA:1	+	chr3R	13703793	5'	+	invader4	2628	1	72.60
CATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1	-	chr3R	10182189	5'	+	blood	7096	2	75.69
AAAGTTGACATAAAATTCCACTTAAACACCTGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1	-	chr3L	3501065	5'	-	opus	471	2	67.12
TAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr2R	21907904	5'	-	roo	394	1	69.03
CTCGGCGCAATTGTTCAGAGAATTCTAAGTGTGAAAGCATTATTATACAATAGATAAGTGCGATCTTTGATCGTTTTATTCAAATTATGGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr3L	21964334	5'	-	roo	9052	2	74.81
GAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr3R	25448324	5'	-	roo	9060	1	69.72
GGGATGCGTGTCCTTCGGATGATGGCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGCGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1	+	chr2R	19050156	5'	+	roo	3	2	74.79
AATAACGTTCTTCATTTATGTTTTTATCTCTTCATGCAAGATGCAAGATGCATGTCCTCATTAGCTTAAATAAACAAATTATTGGCATAAATTACAATCGGAATCAATTTAAATATAAATTATATAAGTTCCAATGGATCCAGAGT:1	-	chrX	20870232	5'	-	gypsy	7441	2	56.85
AGTTAGGACCGGGATATCCCACGGTTGGGCCAAAAGTGGAAAACTGGCAAGGAGAGCCAATAACAATTAAAGCGCACCTTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGTTCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGACAGACTA:1	-	chrX	1424775	5'	+	BS	4845	1	50.68
GAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chrX	8543547	5'	-	roo	9019	2	53.10
AAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCCCCTTGATATGA:1	+	chr3R	10462608	5'	-	opus	7454	2	59.40
AGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAATGGAATCGTTC:1	-	chr3L	14944676	5'	-	G5	4809	1	63.01
CTGCGCGCTACACCCGATCCCTCGCCCGGCTCGTCTTTGAATGTCACCTTTACTCTGTTGAATGTGATGGGCGGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTAGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTC:1	+	chr3R	9716777	5'	-	Stalker4	73	4	54.11
TGTTCCTGACCCGACTTTATTTGCTGCTGGCTGGGCACAATCTGTAGACTTGGAATGGCCACAATAAATACTCAGATAACGAGAGATTTAGCTGTGGGGCACTGCCAGCGTCTCAAACCGCAACCG:1	+	chr2R	577084	5'	+	G-element	3942	1	69.05
TTCTACTCTGCAAGTGACCCTCCATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCCGGTTTTGAGCTAGAAAGGCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1	+	chrX	10644432	5'	+	jockey	4807	1	49.61
ATCGTTAATTCATTTCATTCCTCACTTGAATAATTATTTTTACTGGCAGAACCAAACTACTATCTGCAACTCCACCCTAAAGGCACTACCGTGATGTGCAATCCTCTACATAACATTGTTATTCAACGGTATAGTGAGG:1	-	chr2L	21357784	5'	+	BS3	328	1	58.99
CGCATGCCGGCTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr2R	9632225	5'	-	roo	389	2	69.40
AGAGCTAAACTTTTTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATGTCCTTTCTTAATAAA:1	-	chrX	21014901	5'	-	copia	239	1	73.79
TCTGTCCCTATTTTAGATCCGTATCTAGGAGATATATGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAA:1	-	chr3R	10461214	5'	+	opus	7359	2	71.55
TACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439057	5'	-	P-element	2495	1	61.11
AATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	+	chr3R	15072547	5'	+	pogo	49	1	54.11
ATTGAGCAGCAGGCTCCAGTCTATCTATGTATATATGCGTGGTGTGAGTTGGGAAAAGTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAA:1	-	chr2L	18248846	5'	+	flea	461	1	59.26
ACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAA:1	+	chr2R	23465997	5'	+	Doc	483	1	63.89
GAGTGTTGCACACATACCTTTTGCAAAAAAACTGACCGTGTTGGCACACATAATTTTTGAAAATAAAATATTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGC:1	+	chr2R	3289612	5'	-	flea	117	1	52.05
ATTAATCAATTAGGCCAACTTCAGTTAGCTGCAAATAATCTGTGACCGTGTGTCGCAAAGTCATGCAGTAAAAAATACATATGTACACATTTGCCTGCCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACACGC:1	+	chr3R	20426739	5'	-	accord	7025	2	62.31
AGCCTGTTTCGAATATTGGGTGCCATTGATTAGGGCTAGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTACCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTG:1	+	chr3L	23603128	5'	+	F-element	11	1	70.64
AGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAA:1	+	chr3R	3922954	5'	+	Cr1a	88	1	70.55
TCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGTAGTGAACGCCAAAT:1	-	chr2L	11661006	5'	+	F-element	71	1	58.65
TTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCATACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAATTGATTCGA:1	+	chr3R	16076772	5'	+	roo	55	2	50.68
GAAGTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCACTTTCT:1	+	chr2L	16016338	5'	-	412	431	2	65.60
CAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1	+	chr2R	5485139	5'	-	blood	7313	2	79.55
AGTACCACATAAAAAAACAACGTCTTATCCACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTT:1	+	chr2R	2843404	5'	-	1360	439	1	76.15
GCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:2	+	chr3R	25826681	5'	-	mdg1	7382	2	69.18
TGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGAACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1	-	chr3R	17243247	5'	-	hopper	1387	1	61.64
TTCGTTTCATATGTAAATATTCAAGTTTCAAGTTATTTTACCCTCAAGTTCGTCGTCGTCTCCATTGTCGTTTTACTTTATTGTTTATGCCCGAATTGTGTTTGAGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGA:1	-	chr2L	2687481	5'	-	copia	240	1	74.48
TTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1	-	chr2R	15064444	5'	+	412	7110	2	57.53
GCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1	-	chr3L	1534717	5'	+	pogo	58	1	78.70
GAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTA:1	-	chrX	5629204	5'	+	jockey	118	1	53.79
ACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATGATCAGTCATTTGTTAAATATCAA:1	-	chr2L	22077699	5'	-	Tc3	1614	1	81.16
CTAAATTATCATAATGAATCTCGCAACTACTTGAGTTTTGTTTGCCCAAGCGGCAACTCAACTCGGTCCGAGGAGGGTTAAGCGATGGCTCTTTTATTATAAAGAGCTAAGCGGAGCTGTAGCGTCGGAG:1	+	chr3R	11364698	5'	-	gypsy2	215	2	70.77
TATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1	-	chr2L	9399552	5'	-	Transpac	5203	2	59.66
CATAAATCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGGGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1	-	chr2R	17259363	5'	+	jockey	4718	1	51.47
GATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATATAAATTTATACACACAATAG:1	-	chr2R	9500049	5'	+	G5	4765	1	60.27
AGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1	+	chr2R	12835031	5'	+	jockey	25	1	62.75
GTTTGGCTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr2R	20596420	5'	-	roo	9046	1	66.44
AGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTATCGTAGGCAG:1	-	chrX	7256175	5'	-	412	7461	2	77.94
ATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	+	chr3L	20831285	5'	-	roo	340	2	68.28
GTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	+	chr3R	22844174	5'	+	roo	44	2	51.45
CTTTTTGCCAACAGTTCAAATAAAGCAGCCAGCGAGAAACGAAGCAATACTTTTTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGCTTTATAAC:1	+	chr2L	21355463	5'	-	mdg1	316	2	53.33
AAGAAATAATAAAGAGTTTACAAACAGATAATATAGTAATTTTAATGCATTAATTTGGTATTAAGAAATATATAATATAGTAGCATATGTGCCATAAAATAAGACCACATATACTTACATACAGACACACATACATAACCACATAG:1	+	chr3L	23345946	5'	+	Quasimodo	47	2	57.53
GATGTGCACAGCACACCACAATTGTGGTTGCAGACGAGCGTTTATATATTTGCGTATAATAATATTAAATATGTGTAGGTTAAATAGCTATCACTTTATGTGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTC:1	-	chr3L	25078548	5'	-	1360	124	1	71.54
GAATGTTTTTCATTTCTCGCATAATTCAATTGATGTTGGCATTTCCATTTAAAAGCAAAAAGATTGAAAACCAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1	+	chr3R	26519846	5'	+	G2	3077	4	61.29
GTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr2R	19004127	5'	-	roo	9046	1	60.87
ATGGCAAAACATAGCCTTAATCTTAGTTGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1	-	chr2L	5845089	5'	+	transib2	34	1	58.14
ATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAGTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	+	chr2L	14772043	5'	-	roo	356	2	59.20
GAAATGATTAATCATGTAAACAAAACTTGGCTAGCTTATACATTTACGCCCAACTTTCCTGGCCCCTCACGAATCTCAAAAACTTCAAAGGGCCAAACAAACATATAATTAATAACAAAAGCTAAGAGGCCAAAAATCAAAAAAAC:1	-	chr2R	21884897	5'	+	Transib5	16	1	78.77
AAATATAAATCAAACTTTAAACTGTATTTAACCTTTTACTACATTTAATTCGATAGTTTCGTTATTAAATTGCAGCAAAGCCCCACAGTTAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATC:1	-	chr2L	10036630	5'	+	Quasimodo	142	2	58.90
ATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATTGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAAT:1	-	chrX	10201209	5'	+	transib2	83	1	73.29
GGACTCGGGAACTTTTGTCATCGCCTTCGCCCAGCCATTTGAACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1	+	chr3R	28075297	5'	+	jockey	4687	1	66.09
GGAAACAAAGCATATACATAGCAGATATGGAAAGAGAGCGCAAATTATATAGATAACTACAGCATCACACTCATCAAGAACAAAACCGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGT:1	+	chr2R	9540442	5'	-	opus	101	2	74.22
GTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chrX	16717914	5'	+	roo	8694	2	66.67
ATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1	-	chr2L	15991393	5'	-	mdg1	353	2	65.49
AATTTGTTATGGCCTTTTGCTCAATAATTTAAGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1	+	chr2L	18419109	5'	-	412	7517	2	63.57
ATTTTACTTTAAGACTAGTTTTTGCACCCATTATGCAGCCGTTTAGTCACGAAACTAGAACCGAAAAGCCTGAGAAGCCAACGGAGTTAACAAATAAATAAAAATATGAAAA:1	-	chr2L	17650945	5'	+	G3	4494	1	70.54
GTGTTATAACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1	-	chr3R	17478455	5'	+	copia	4932	2	67.41
TAGTGAGCCAGCGCTGTTAGAAAATGCTAATTAATATTTTAGGTATTTTTTAAATAATATTTTCGCTGCAAAAATACATTTTGAATGCAACTCCCTGCTTAATTATATACACATAAACCGCAGTCTAAGCAAAATAAAAAAAAAAA:1	+	chr3R	21675903	5'	+	F-element	4680	1	50.68
TAGACGTGAGAAAAAAAGTTCTGTATCATTATCAATAGCCGAGTCGTTATTGCCATGTCCGTCATTTTGTCTGCCCAGCGATGCTCTTGAAGTTTGGGCTG:1	+	chr3L	23649800	5'	-	mariner2	477	1	70.30
TATTTAATAAAGTTCTTTATTCTTCTAGACCTATAATAGGACTCGATACACTGACACAAAGAAATGCAACATCAAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACG:1	+	chr3R	2449076	5'	-	Tabor	370	2	55.38
CCTTAAATTTGCTCAATTATCGTCCATCGATGTGCCCTCATCTCCTCCGGCTCTTTGGATTAACTTGCCCCTGCCATGCTACATTACACTCAAGCCAACTCTTACACACACACACACACACA:1	+	chr3R	10443203	5'	+	Quasimodo	36	2	61.48
CATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	-	chrX	23280949	5'	+	roo	37	2	45.21
TCATGAAATCGGAAACTGGCTTGGCCATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	-	chr2L	17471733	5'	-	roo	397	1	74.82
TTCACTTGCATTCCACAAAGACGCACGCACACACACACGTGCACAGAATGACCCTTACAGGGGGCTTTGGTATTGGTATTTGTATTTGCGGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1	+	chr2R	10124089	5'	+	P-element	10	2	74.40
ATATGTATATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1	+	chr2L	11732227	5'	+	Doc	16	1	65.07
CCAGCAACATTGGATCTTGGAATAATCGAAATTTACAAAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATACTTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCATT:1	-	chrX	14749721	5'	-	copia	249	1	58.22
GTTCAAAGCGTTTTGCGTGGGTGCCATTGTAGAAACACATATATATGTATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1	-	chr2L	2794262	5'	+	Burdock	6204	2	71.92
AATACACATTAAACAAAAGTTTAATGACGATAAATAGCCGAAAAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTACTTTGAGAATTGTTTACTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTTTACCG:1	-	chr2R	5041329	5'	-	diver2	233	2	77.37
CTATGACTTTTTTAATCACAAATGGTGAAACTTTTTCAAAATTTTTCCCATCTGATGTGCTAATGACAATAAATAACGGCCAATAATAACGTTAAGGCAAGGCAATTGATAAAAAATAATATATATTTAA:1	-	chr2R	4638574	5'	-	1360	250	1	68.46
CCACGTTCGGGTTTTTATCTGAGATTGTGAATGATAAAGATTGGTGGGCTGTTTGTATTTCTATACCAACAACACCATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGG:1	+	chrY	1122079	5'	-	Max-element	8511	2	61.29
TTTTATGATTTTGCTGTTTAATGGTTCATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAACATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr2L	7898437	5'	-	roo	396	1	76.55
TTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr2L	8986137	5'	+	412	68	2	70.37
AAAAATATGCCAAAAAATTAGTTTTGTTAAGTCCTGCGACTCCGCACCGTCAAATTCACACTTTACATTTTCATTTCAAATAGCCATCACTGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATACATAGTCA:1	+	chr3L	15490285	5'	-	copia	225	1	63.01
TCTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr3L	19334351	5'	+	roo	8717	2	60.27
CGATGATCCCAGATCCCCGACCAACCGCGCTCTAAATCGAATGGATGGGGGGTAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCTGACTAGCG:1	-	chrX	21558751	5'	-	diver	5732	1	57.94
TAAGAAATTCTAAGACTTAAGGAGACTAGGCAATTCTAAGAGATCAAAATAATAAAAACAGATTACTTACTTTTTATTAATGTAATGATGTACATATGTATAAATAAGGTAAAAGAATTCATCATACAACTAAGCAATCAATGTAA:1	+	chr2L	21008742	5'	+	invader3	5127	1	62.33
AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAGTCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439059	5'	-	P-element	2495	1	58.90
AGTGGAGTCTGTGGACGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCATA:1	+	chr2R	2016810	5'	+	1360	15	1	65.14
TCCTACGATTCAGCGCCCGGTTTTGGCAATGCCTCAAACGACAAGCTGGCCTGCACTGAAAACAAATAGCATTATACTTAAAGTATTTTTGAATTTTTCCTTTTCTACTCAATAATTAAGAAATCACTTGGTCTCATAT:1	-	chr2L	18907760	5'	+	G5	4746	1	64.03
CCCCCCGAAAAGCTGCAAGCTTTTAAATTTTCTACCAGCAAGAAATAACAAATATATATTTCAACAGGATAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1	-	chr3R	12598568	5'	+	hobo	2708	1	78.72
CAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr3R	7835220	5'	+	roo	8720	2	56.85
CACACAATGGTCACACAAGATACAAAGAAACAATGGCACGCAAGCAACAGCTGCGGGCACAAAAGTAGCACCTAAAGTGGAATCTATAAATTGAGTCTGTATATGTCTTACTAGAGGAGGGATAATAATTTTTATCATATTGTTCA:1	-	chrX	9060389	5'	+	Transib5	2567	1	62.33
AGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1	-	chr2L	15833070	5'	+	hobo	81	1	73.29
CGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGACGACGTTT:1	-	chrX	6522057	5'	+	F-element	20	1	60.00
GCTGATATGCATTGAGTGCATTAGTTGCATGTGTGTACACTGATCGAAATGCTTTTTGATCACGAATCAAAATTAGTAGGAACTGAGATGAGACTGTACATAAGTAAGATAAAATGCTAACGGTATGCATACAAAGTATTATAAT:1	+	chr3R	7481397	5'	+	S2	1422	1	75.86
AAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGAGTAGTATGTGCCTATGCATTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1	-	chr2L	16016415	5'	+	412	38	2	51.24
CGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAA:1	+	chr3L	25232773	5'	-	accord2	158	2	60.91
AAACTATATATATACATATAAAAATATATTTTCATGAGGAAGGGTTTCGCCAAAACACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAATATGAGACAAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1	+	chr2L	9570138	5'	+	BS	4999	1	71.65
ATGTACACAATAAAATCTGATTTTACGAATGATTAAATTTATGTACATACATACATGTATGTATATATCGTCATAGAATAATTAGATCCTACTAACACCTTTATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCT:1	-	chr3L	24724588	5'	+	Cr1a	4333	1	58.62
TGAGTCTCCATAGTTCCCCGCCTCCTTCACAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTA:1	-	chr2L	12336776	5'	-	hopper	936	1	78.03
GCCGCTTTAAGAAGGCATAATTAATTAGTTATGGCCGATGGTTGGGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1	-	chr3R	27424983	5'	+	blood	7043	2	69.18
CGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr2R	14388000	5'	+	roo	35	2	66.00
AATCACTTGAGATTGAAATTAAAAAAAAGAACAGAGAACGCTATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAACTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAAGGCAATTTTG:1	+	chr4	1169528	5'	+	1360	3311	1	71.23
TCTAAGATCTTTCTTATCCAAAATCACCAATCATTCAAGGGTCATTTGTGTAACGTCTGTTCTGTTTGATCTCTAAATGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCATTTTTAC:1	-	chrX	17366289	5'	-	1360	205	1	54.79
ATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTCTG:1	-	chr3R	7482809	5'	-	412	7477	2	77.17
GCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGC:1	-	chr2L	544861	5'	-	412	7519	2	54.00
CTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGC:1	+	chrX	21949006	5'	-	412	7373	2	82.35
CCATCAAGGCAATTAGTACACATTGTGCAGGCCCATTAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTC:1	+	chr2L	10037916	5'	-	Quasimodo	6928	2	68.60
ATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr2R	20596536	5'	+	roo	8738	2	76.26
GGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr2R	7898067	5'	+	roo	8686	2	58.72
CTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3L	20831368	5'	+	roo	8724	2	65.93
CATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATTGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1	+	chr3R	9921980	5'	+	blood	7068	2	62.04
AAAATTTAAGTAATATCTATCAAATCTGCTAGTGAATTACNTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1	-	chr2L	21884607	5'	-	pogo	2040	1	64.08
GGTTCCTAAACGTATTATGTCTAAATACCACAGATAAAAAACAAGTGAAAAGCCTTTCTCGAGTCCCTCGCGTACCTGCAAATTGGAAGTGGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAACC:1	+	chr2R	6885265	5'	+	flea	4772	2	74.81
GCAGAGAAAAATCAGTTAAAATTCTACCAAATCGTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGGATTTATATATTCCCAACTGGCTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1	-	chrX	10694583	5'	-	I-element	5327	1	49.32
CAGCCGAATGACACACGCATTTTAATTGAAAGCCGAGCGGAGCCGAGGCCCAGAGAGTCCTGCTGGAAATGTTCAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1	-	chr3L	2709643	5'	-	P-element	2847	1	38.85
GGAAGGCGTTCACCAGTTCACTGGATACATCCCGCTGCGGTGTCTCTAACAATTGATTGACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGCGAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAGGTAATAATAGAACTC:1	+	chrX	7733063	5'	+	gypsy4	388	1	59.59
ACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1	+	chrX	12214065	5'	-	opus	470	2	62.39
ATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGCCGGCAA:1	-	chr3L	19036052	5'	+	Tirant	8160	2	70.75
TATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGACGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACCCTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAT:1	-	chr2R	5485194	5'	+	blood	63	2	63.36
AAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATG:1	-	chr2R	6271506	5'	-	blood	7164	2	64.83
ACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAAC:1	-	chr2R	9463493	5'	+	rover	64	2	63.45
ACATGTGTAAAGTTGAAAATTTGATTCTGCTTTCTGGCATGATTAGGTGAGTCGGATGTAAATTTTATTTCTGGATTCTG:1	+	chrX	22919646	5'	+	hopper2	289	1	91.25
GCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr2R	14388023	5'	+	roo	58	2	60.96
AGACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1	+	chr3R	26431968	5'	+	opus	64	4	65.03
AGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3L	20831300	5'	-	roo	8988	2	78.77
AATGTCATCAAAATAATACGGAACATAAGAACATAACGAAGAAACCAAAGGCAAATCCAACTGCATCACCAAGATTGCGGGCATCAACACCAATAGAAGGAGTGGAAGCATAAGCTTCCCTTTTAAAGGGAGGGAAGTAACATAA:1	+	chrX	8173474	5'	+	rover	6940	1	65.52
AGGCAAGTTGCTAAATGGCACTGACACTTGACCTCCCTCACCACGCACACACCTATAAATATTTAGATGCTCCGTGCTTGTTTTTCCACAGCCACACACACAGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chrX	2899098	5'	-	accord	7105	2	69.75
TGGAAGAAATTGAATTTCTTTTGCACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	-	chr2L	1665066	5'	-	hobo	2921	1	63.89
ATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	-	chr3R	11496624	5'	-	1360	3380	2	71.72
CGATGAGGTGCGTACATAGATAGTTTACCAGTTATTCCTAGAAATATCCATCAGCCAAACTCGATACTAATTGGATTTAGAAAAGAAGCCCTACACGAAGTAGTGGCTCTATAGGAATATTATTATTATTATTATATTATTATAAA:1	+	chrX	15899068	5'	-	invader3	5049	5	51.37
CCGCCTATATAAAATAATAAATTTCTTAAAATAATTTCATCGCTGGATTCCTGCGCCACCACAAATTACTTTTAGAATACACTTAAAAACTGTACCCACTAATGCTAAAAAATTTCTCATACAATGTTACTTTAAAGCTAAAAGTA:1	-	chr2R	11250719	5'	+	TART-B	10199	1	80.82
TCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	-	chr3L	11530960	5'	-	roo	328	2	72.60
CAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1	-	chr2R	9791696	5'	-	412	7518	2	61.54
ATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAACTAAAATAGCATATTAACTTATG:1	-	chr2R	15064463	5'	+	412	7091	2	57.53
ATATTTACCCACGCCAGTTCACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTTTTTATTTATACTAGATAAGGCAGAGGGAAGCGTTTCAGACCATATAAAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCTGAG:1	+	chr2L	20413486	5'	+	INE-1	90	1	41.10
ACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1	+	chr2R	11629735	5'	+	Tirant	8115	2	73.27
AAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGT:1	+	chr3R	25423230	5'	+	3S18	85	2	77.54
CCACCACGCCCCCTCAATCACTGTTAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chr2L	11679893	5'	-	accord	7032	2	82.22
CAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATAT:1	+	chr3R	18346662	5'	-	INE-1	82	1	57.53
GTCAGTTCAGCCAGGGCCAGCAAGGGGCTCGCACCAAGATTACAATGGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCT:1	-	chr3R	15356753	5'	-	flea	54	2	65.69
GCCTTTCAAGTTATACAAGTCTTCTTATAATCCTTTTGCTAATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1	+	chrX	13066451	5'	-	jockey	4984	1	74.66
GAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chrX	13066575	5'	+	jockey	36	1	55.67
AATGTTAAATATTCAGGCTTCCCTAAAAATGAAAATCACACGTTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTCGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTA:1	+	chr2R	9499956	5'	-	G5	4789	1	52.74
TAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	-	chr3R	12886988	5'	+	roo	8708	2	61.90
GGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTCTCCGC:1	+	chr3R	26659776	5'	+	HMS-Beagle2	6966	2	72.22
CTTCGGGCTGCTTGACGTTTTACGCCATCCCGTGAATTTAAATACGTTAACATCGCGCGACCAAATATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1	+	chr3R	14979775	5'	-	pogo	2063	1	53.79
CAGCAGCACAGCGGGTTGTCCCATTCAAGTGGCCATGGCTGTGCAATATCTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	+	chr2R	17626834	5'	+	opus	145	4	54.95
AAAGGTATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGA:1	-	chr3R	25448476	5'	+	roo	11	2	75.56
TTAAAAGCTAATTACATTTTGATGCTGTACCTTTAAAGTAACATATAAACTAATTGCGGAAATATTCAATTCATATAATAATTTAATATACTAATAGGTAAAATATAATGATAAAAGAAAATGAGTTAAATGTACAAAATGCTAGA:1	+	chr2L	12584442	5'	+	hopper	1075	1	63.70
GCGAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAG:1	+	chr2R	7586157	5'	+	I-element	5064	1	55.79
AAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1	+	chr2L	544766	5'	+	412	48	2	50.72
GTTTCATTACCCTATTTCAAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	-	chr3R	22122796	5'	+	roo	38	2	54.62
GGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1	-	chrX	2842600	5'	+	Tabor	6888	2	56.85
CTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr3R	18339085	5'	-	roo	9011	2	58.22
GAAGTGCCGAAGATTATTTGGGATCCGCTGAAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAATTTGAACGATTGAATAATGAAATTAAATTTATGAAAGAGAATCTTAACCTATATACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCA:1	+	chr3R	19449646	5'	+	Tc1	12	1	69.18
TGCGATGCGTTGAGTGCTTGGCTAAGCCGAATCAATGCGATTTTTATGCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTC:1	+	chr3R	11496938	5'	+	1360	3224	1	67.12
AAGGATTTCTGTGACACCCCTAATACGTGGATCATTATTGAGTGCACAGATTTAAGGAAATGTATTTCTTGAATAAAGATGTTTCTATAAAACTGGGTACGAATCAATACAAAACAAACCAATTTAAATTATTAAATAAAAAT:1	-	chrX	15902508	5'	+	Bari1	319	1	57.34
GTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1	-	chr3L	18368992	5'	+	opus	33	4	72.83
AGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1	+	chr3L	11393473	5'	+	roo	57	2	60.96
ACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1	-	chr3L	16015358	5'	+	1360	3	2	74.17
CTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1	+	chr2L	15832996	5'	-	hobo	2896	1	55.65
CGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	+	chr3L	3500950	5'	+	opus	7171	4	70.59
AGACGACTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAGAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chrX	14336409	5'	-	roo	9010	2	61.64
AGCTCGAGCGGAAGTGGGTCTATTGGGGGGGTTTCCTGATGCGTGGACTTATTCATTGACGTTGACCCAAACTAAAAACCTCAAGATTCTTTTGTATCTTTTGCTTTTTATATTTATACTCTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAA:1	+	chr3L	9999364	5'	-	roo	464	2	53.42
TAAGTATCTTTTTTATGTGCAAGCATCTTGCCAATGATATCATCATTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr3R	26222941	5'	+	roo	53	2	65.32
TTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTA:1	+	chr3L	7292449	5'	+	HMS-Beagle2	14	2	72.07
CTCTGATCTGAAATAAATCATTTGCTAATTTTGTTAAAGACAGCTGGTCGTGGTTCAAAGGCTGGAATCGCTCCGCGAGATGAACAGCAAACACTTC:1	-	chr3L	23953985	5'	-	BS3	80	1	60.82
AATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTGAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr3L	23635037	5'	+	roo	8737	2	68.49
GGTAGTTGACGTAGTAGTCATTTGCACGTTGGAAGACCCCTATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr2R	25118637	5'	+	roo	16	2	68.57
ATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1	+	chr2L	16091923	5'	-	roo	8982	2	79.45
TGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chr2R	11164525	5'	+	roo	33	2	60.14
AGCGGGCTTTCACAGATTTACACAAAATAATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGCTTATGCACGCAGTTAGGCC:1	-	chr2L	3165021	5'	+	412	7142	2	75.86
AAAGGGAAATGCATGCCCAACACTGCGAAAAATATATACAATAAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTA:1	+	chr3L	18555867	5'	-	jockey	4939	1	58.22
AAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3L	20831303	5'	-	roo	8987	2	80.56
ATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGGTACAATTTACCTTACAAGTAAACCG:1	-	chr2R	21298832	5'	+	jockey	255	1	49.17
CCTGAAAAATAAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr2L	17420113	5'	-	roo	9054	2	69.78
CTCAAATACAAAGCGAAACCGCAAAAACACAAATATAGTTCATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1	-	chr2L	15991459	5'	-	mdg1	7453	2	80.14
TATCGTATAAAATGAACAATTAATGCAATTTTAAATAAATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1	+	chr3R	17478320	5'	-	copia	241	1	75.34
GAACTCACGAGATATGCTCATCCCTATATGTGCGCATCCCTGGTTTTCTCCAAGAATCAGCTGATAGACGCCAGTAGGTAGACCTCGCAAAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAAC:1	-	chr3L	3197655	5'	-	R1A1-element	5015	1	57.53
AAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGT:1	-	chr2R	6885384	5'	-	flea	4949	1	62.33
GTCCGTATTAACGTCGAGATCTCAGGTACTTTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACTATTCTAGATTCTAGACGTAGCGCAAGTTACACAAGCATCGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAAC:1	-	chr2L	227178	5'	+	rover	7015	2	65.94
GAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr3R	19968111	5'	-	roo	351	2	66.41
AAATGGGGTTTGTGTAGGGTTTGGGTTTTTCGGGTGCTTGAGATTGGAGAGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTAAAAGGAAGGAGCACATATATTCATTTTTCGGCGTCCACAC:1	+	chr3L	20898304	5'	+	invader3	278	1	59.35
TTCTCCAGCTCGTATGGCCGTATGTTGAGCAACGCCCGTCCGCCGATCTCCTGCTTGGAGAACTCGTACAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCACAGCCGCTAAACACAATTGTTCTTATTTACA:1	+	chr2R	17419151	5'	+	gypsy	292	2	52.14
AAAAGCTGCTGACTGCTTAAAATGCCGTAATCATAAACAAAAACAAGAGACACCGCGATAGTATCGTCGACTATCAGATACCCAGTACT:1	+	chr2L	18126061	5'	-	INE-1	550	1	67.42
AAAATATGGTTAAATATTATAAAGAGAATAACAAATGCGAAAGATATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAAAAACGTCAGTT:1	-	chr2L	14891986	5'	+	transib2	438	1	69.18
ATATTTNGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr2R	18336169	5'	+	roo	8736	2	77.44
TAAATGTTTTACCCAAATTAAGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1	-	chr2L	13914200	5'	+	jockey	4693	1	50.40
ACTATTTCTAATCCGTGTTCCTAGAGCCTTTGAACAATTTTAAAAATTTTTCTTATATTTTTCCCCAATATCTCTCGATATCCCAGAAAAATAATGAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACTGGTATTTGATAG:1	-	chrX	141158	5'	+	INE-1	547	1	79.17
ACTAAGTTTAAATTTGATGTGCTGCAGAAGGTAGCGTTTGAACAGTTAAAAGTAGCATTAACTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1	-	chr3L	23866737	5'	+	copia	4928	2	63.70
ATACTAGTAAGTTTCGCAATATTTGTGTGTGAGTAAAATAAAGTATGCTTAAATGATTTAAGTACAAACAATTGTTTCGGGATCGTATTTTTCCGTATGAACGTCTATATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGGGATTCAG:1	+	chr4	545289	5'	+	INE-1	167	1	60.96
ATTTCCCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1	-	chrX	6499046	5'	+	Quasimodo	51	2	65.38
CCAACGCTTACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCG:1	-	chr3L	24789704	5'	+	1360	100	1	59.63
AAAGTCAAAGGCCCTTTATTATGGAATGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1	-	chr3R	19265869	5'	+	I-element	72	1	77.24
TATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	-	chr2R	20596539	5'	+	roo	8742	2	75.34
GAAGAAGTTGTGCCAAAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGT:1	-	chr2R	16373568	5'	+	Max-element	19	2	63.55
ATCAGCTCGTTGGGAATTTGATTTTATGGCATGCTTGACTTAAACGAAGGTCTGAGTGCGTATACTTGATATGCTTTAAGAATGGCTTTAGCTTTGACTTTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATA:1	-	chr3R	26615228	5'	+	gypsy12	24	2	67.81
AACCATTAATTTTCGAATATTTAAGTCTTTACTGCACTAAAATTTAATAATAAAAAAATATGAAATTCATAAATTATAAATGGAATATATTGAAATAAATAAAGACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:1	-	chr2L	20808466	5'	-	HMS-Beagle	234	2	75.69
GCTAACCTTCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGT:1	-	chr2L	2122508	5'	+	Stalker	40	4	56.85
ATCAGCGTTCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1	+	chr3R	26431955	5'	+	opus	7151	4	55.91
ATGTTTAAACAGATCAGCACAATTGAAAAAATACAATTTAAAATGTCAAAAAGACAAAAAAAATTTTTTTTAATAATAAAATAAAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGC:1	+	chr2R	5043335	5'	+	gypsy11	3965	1	80.74
AATGATTTTAGAGCCCAATAATGGGGGCTTCCAATAGTTAAGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1	+	chr3R	25826633	5'	-	mdg1	392	2	62.33
GATGTGTGTGTGCGAGTGTATTGAGCTTCTTTTTTTTTTTGGTGTTC:1	-	chrX	11981760	5'	-	gypsy2	399	1	93.62
ATTATATGGGTTACCATCGCGGATGTGAAGGCTAGGGGAAAATGGACACCCATGTACCTTTATTGGCCCTATCAAGTTATTAATTTATATGTGGAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAG:1	+	chr2R	22859152	5'	-	baggins	5214	1	72.41
CTCCTTTTCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	-	chr3L	20888834	5'	+	1360	17	1	69.78
CACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCTCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGA:1	+	chr4	1301729	5'	+	1731	56	2	55.56
TCAGACTTTAAGTAGAGGTCAATGTTGAAGTGGGTGGGGAAGTCTCATTAAAGGCGAAAATGGAATGCTTAAAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1	+	chr3L	16868213	5'	+	FB	43	1	52.86
TTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGTTGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr3L	16015240	5'	+	1360	55	1	62.02
AAGTAAGCGACTTTACAACTATTTTTTGAAACAAGAATCACTCATGAAATATGTTCTATGAGGCTTGTTAGGGAAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATT:1	+	chr2L	6622885	5'	-	Burdock	245	2	77.40
GAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACA:1	-	chr3R	7100861	5'	-	roo	339	2	80.53
CCGAAGGAATTTTCCTCTCTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGTGTTGTACTTGATTGTGGCATAATTTCTCACTCGCCTCCATAAACACATGTGTTTGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1	+	chr3L	10849864	5'	+	blood	12	2	60.28
ATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1	-	chr3L	10574395	5'	+	Tabor	6883	2	46.58
ACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1	-	chr2R	19540447	5'	-	jockey	4919	1	70.55
CAAAGCGAAAGAGGTTGGAAGAAATTGAATTTCTTTTGCACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1	-	chr2L	1665081	5'	-	hobo	2928	1	72.41
ATTACGCAGACACGATCATCTATGTATAATTCGCAGATGAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCAGACAAGCAAGCAAATTC:1	+	chr2R	2953298	5'	+	1360	3256	1	70.71
TTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1	+	chrX	3309643	5'	+	jockey	94	1	78.08
GGGCGTAAGAGTGGGCGTGGCAAAAAATTTTAGGCACATCGATAGAAATTTACAAAACTAATAAGATTGTGAAAAAATATAGAAAAATGGTTCAAAAATGTAGGCGTGTCAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGGTT:1	-	chr2L	2545704	5'	-	INE-1	343	1	67.41
CTATATTTGTATCTCCACAATGAAAGGGAATACTTCCTGGTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1	+	chr3R	14035387	5'	+	1360	56	1	71.67
TACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3R	25448431	5'	+	roo	8724	2	64.03
GTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1	-	chr3R	14651261	5'	-	P-element	2796	1	20.71
ATAGAACACTTTAATAGTTTGCTTGTCTTTTGTCAACAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr2R	23803073	5'	+	roo	22	2	71.11
TATTGTTCGAAAATCGTACTAATATATTGTCTCCCGTTATCAGTCCGCAGATATTTTAGGAAACCTAAGCGACAAAATATTTTCTTGTTACTTACTCTGCCAGAGAACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAG:1	-	chr2R	2923642	5'	+	Gypsy6A_LTR	266	1	61.65
GCACGGTAAAGAGAGGGGGGCGGGGGAGGGGGGATATGCCGGAAGAATGAGAGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chrX	16717842	5'	-	roo	9016	2	58.39
CGTTTACAACAGCAGAAGTGGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1	-	chr2R	2906086	5'	+	1360	74	1	74.62
AAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	+	chr3L	11393504	5'	+	roo	77	2	79.26
ACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr3R	17420368	5'	+	roo	8681	2	70.55
TTGCCTCTTTTTGTTGCCTCTTGGCTTCTGGGCTGTTGGCTGTTGGGTCCTGGGTGTTGGGTCTACGGTGCCGCTAATGTATGCTCTTTCATAATATGTAGTTAAAATACAATTTACAAAATTGCTTGACTT:1	-	chr3R	8486891	5'	-	transib3	34	1	56.82
AACACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1	-	chr3L	26011947	5'	+	F-element	32	1	54.55
ATCGGGNCAACTCCACATGCCGCTCACATGTGTGGCTGTGCCCAAAGCCGATTGCCACTTGAGATCGGACTTGCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGG:1	+	chr3R	30770408	5'	-	copia	4939	2	69.23
CTTTGCCCACAAATTACTGCAGTCAAATTGATCGATTGTCTCGTGCAGGCAACACGTAATGCCGTTGCTAACAAGCCAGGAGTTTGGGATAAAGCCAGAACTATTATATATATGTATGTATATATATAAG:1	+	chr3R	28402143	5'	+	1731	4412	1	63.08
TCTTTCATATAATAACATTTACAACATTAATCATAGTAGTTATTATTGTAATATTGTACTTTATCAATAAATATAAGACTGTACCCCAAGTTAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGA:1	-	chrX	22218722	5'	-	1360	271	1	52.74
GCACAAGTACCCCTTCATTTTCTACTCGTAGCCCTAACAAGCAGCAATCCAATGGATTGGGCAAGAATACCAGCTCTACCACCACTTGTGTGGGTTAAATTTAGGCAGTTCCTTCAGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGT:1	-	chr3R	32057848	5'	-	INE-1	11	1	59.59
TTAACCAGTCACGCAATCTTTCAATAGAGCACTTTTGAGTGCTTGGCTCATACACATTCACATACCTTAAGCCGTATGAAATCACAACTTTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTG:1	-	chr2L	20127393	5'	-	invader4	2870	2	65.07
CCAGCATTTGTTCCATAGTTCTTCGTGGATATCTTATGGCTCTGGCGTGGATGATTGCCCCTACGATTTCTCTATTAGCCATAACCAGGGTAAATAGGCAATTGACTTAGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCC:1	-	chr3R	18087030	5'	-	F-element	4377	1	72.60
CTACCTAGCATTGTGTCATATCATACAAAATACTTTATTTCTATCAGTCAATAATGTACATATTTTCTCTTAACCCCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAA:1	-	chr2L	18341775	5'	+	pogo	1975	1	54.79
GAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1	+	chr3R	30344634	5'	-	pogo	2055	1	69.09
GTCAATGACTCTAAAATTAATCTCTGTAAGTTAATTAATTGTTTTAAACATTTTTTTAGGGTGAAGATATAAATGCCTATTTATTCAGTACTAACTTTTAGCTCATTGGCTTAATTTTTTTTTTCTATTTTTTTTTGTAG:1	-	chr3R	18009710	5'	-	G2	3074	1	64.29
TGTGATCAAGGGTTTAACCTACAGAGCGAATCTGAAAAAAGTGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3L	4536819	5'	+	roo	20	2	64.89
CAACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACG:1	-	chr3R	1446146	5'	+	1360	10	2	29.45
AATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGGTTTTTCACTTGATTTTTTTTTT:1	+	chr3L	16184115	5'	-	Porto1	171	1	66.13
AATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	+	chr3L	12879737	5'	+	roo	8671	2	69.77
GCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGAA:1	-	chr2R	9662808	5'	+	412	7097	2	54.07
TTTCTCAGCTTTTCTTGAGAAGCATGTGCGCTTGAGATGCTTATTGTAGTGATTAACAAGTTGTAATAAAATGCAGATATATATGTAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1	+	chr3R	6664915	5'	+	I-element	30	1	64.58
CAGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1	-	chr3R	16404568	5'	+	pogo	4	1	73.33
GAAATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAG:1	+	chr2R	1881362	5'	-	Stalker2	248	6	52.74
CATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAACTTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1	+	chrX	10644454	5'	+	jockey	4838	1	71.74
GCCCATTTAGCGGGCGATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1	-	chrX	11471686	5'	-	hopper	1389	1	63.28
ATGTCTTCATTGCAGCCAAATTGAATCATACACACACAGCTGCTGCACATGGCCAACACACACACACACACATACTCAT:1	+	chrX	8010362	5'	+	accord	187	2	63.29
GACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1	+	chr3R	11496537	5'	+	1360	72	1	69.29
GGTAAGTTTACATTTGTTAATTACATACCGATCAATAATTTTGTAGAATAACATTAGTTAGTGTGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACAC:1	-	chr3R	10900756	5'	+	R2-element	3513	1	56.16
AGCAATTAGATTAAAGCTCCTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACA:1	+	chrX	3096274	5'	+	blood	169	2	89.09
AGCAGATCCATTCGTAGTCTGGTTTTGACTTCTATCCGTTAGTATCTCCTCAATATTTTTAGCATCCCCTTCATCTGAGACACATTTCTGTGGTTCCTCAAACAATGCATCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGG:1	-	chr2R	22930784	5'	+	G2	2650	1	73.97
AATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1	+	chr2L	17295841	5'	+	Doc	58	1	57.78
TAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1	-	chr2L	15833102	5'	+	hobo	46	1	53.15
TCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	-	chr2R	9632181	5'	-	roo	332	2	68.49
GAATACACACACACATACTCATCATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	-	chrX	3308384	5'	-	hobo	2921	1	58.51
AATTTAAAAAATAATTGCCTAAATATGGAAAGTCATATCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1	+	chr2R	7596300	5'	+	roo	85	2	78.08
ATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr3R	25448417	5'	+	roo	8745	2	72.60
ATGGGCACTACCAACCAGAAAAAGTCGTCGCAGTTATTGAACCTGAGAGTACAAAGCGGCCTGAACCCGTATACATTTACTATACTATCTGTATATTTATACACTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAG:1	-	chr2R	15474614	5'	-	1360	92	1	66.44
TATATGCTGTGTATGCTTAAAATTCACCATTTGATGCGTGAAAATAATTCTAATTCTAAGCTTCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1	+	chr2L	17607596	5'	+	hobo	54	1	54.55
GTGGAACAGGTTCTGTGCCCGGCCTGAATAAACAAATGCCCTGATAGCGGGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1	+	chrX	18386365	5'	-	invader4	3043	2	52.31
GTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1	+	chrX	21016770	5'	+	Transpac	4995	2	75.71
GGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	-	chr2R	19004204	5'	+	roo	8707	2	72.00
TGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACAC:1	+	chr3R	9714397	5'	+	Stalker	56	4	64.52
ATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACA:1	-	chr4	1152076	5'	-	transib2	2740	1	76.60
AGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATG:1	+	chr3R	4357537	5'	-	Tc3	1638	1	65.07
AGGCAGAATGGAAAAAGGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1	+	chrX	12214027	5'	-	opus	7491	2	73.64
AAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2R	19004211	5'	+	roo	60	2	71.77
GTAATTCTTTGTATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr3L	20654440	5'	+	roo	8678	2	73.28
TCTTAATTATATTTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCANTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTCCTCGCCACGCAC:1	+	chrX	3308315	5'	+	hobo	60	1	63.20
CATCCCGTGAATTTTAATACGTTAACATCGCGCGACCAAATATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1	+	chr3R	14979800	5'	-	pogo	2059	1	63.96
TGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	+	chr4	419975	5'	+	roo	7	2	62.16
GCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGG:1	+	chr2L	11732246	5'	+	Doc	9	1	65.00
GATATTTTTGGCTGAATGCCAAGAGGCAGTTACCAAGTCGACTTGTGGGGGTAGCTCGAAAAGGTAGGGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTG:1	-	chrX	17974374	5'	-	Quasimodo	28	2	57.89
TAACTCGGACATTTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1	+	chr3R	12618567	5'	+	F-element	14	1	71.77
AAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr3L	11441864	5'	-	roo	9045	1	66.21
TCAAGAAAGCCATTTCAATTTTATTTTATACCCATTTTCCAAGCCACGCTCTCAGGCTTGGGCTCAGGCTATCCACCCACCCATCAGGCGGCAGTGGGGGAAAATAGATTTTGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGT:1	+	chr2L	20668895	5'	-	hopper	1129	1	71.23
CTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr3R	17817893	5'	-	roo	9002	2	65.75
GCTGAATTTTGGCAATTTCTTTTTTAAGCTGATTTGGCCTGAGAATATTTGGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAAC:1	-	chr3R	19448959	5'	-	roo	8767	2	66.43
CGCGGAAGTTAAGTTTAGACGATCATAAAGTTAGGTTCGTACACATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAACTGTGCAAACAAATTATAAGTGCAAAGCGAATTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATA:1	-	chr2R	17703744	5'	+	gypsy4	424	2	72.60
AACAATGTTTCTCACTCGTTTTAAAACCAAAAGCAAAGGCTTTTAGTGGGATTGGAGGCATTTTTTGGGTCACCACAGAGTGCGGAGCTTACTGAAGAAAGAAAAACCAAAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTC:1	-	chrX	21269968	5'	+	baggins	5001	1	54.14
AAGGGGTTCCCTATTCACCGCTGCCGGATTCGGAAACTTGTGTTCGTACAGTGGGTGCAGTACTGCTCAATAAGTAGTTCAAAATAAGGACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1	-	chr2L	12250163	5'	-	1360	3359	1	64.38
CGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1	+	chr3R	22821979	5'	-	mdg1	380	2	47.26
GCATAATATGAAATTGCCTTATGATAAAAACCAGGCGTCAATTTATGCCACACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1	-	chr3L	7188654	5'	+	hobo	25	1	68.38
TTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1	-	chr3R	17831894	5'	+	F-element	39	1	50.41
AGTGTCTTTGTAAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1	+	chr2R	6086303	5'	+	pogo	52	1	58.22
CGGGGTTATGAAGGACCGTGCAGAATCAGATCAGATCAAGTGCAGATCGGTTGGCCAAACGAGCATTTCACTACTCATACTCAATCAAATTAAATCCAATCAAATCAATCAGCCATCTCCCACAAGGGAGCCATTTTGGTCCGCTG:1	+	chr2R	15996512	5'	+	Q-element	495	2	50.68
ATGTACATCAGATTTATAAATGCTACAGCGTTATAGTTATAGTTTATTTATTTTTGATTTGTCACAAGTCTTTTCTGTTTTCTGTGTAGTCATGGACTTTAGCTAGGGATGCTCTCTTTGAACACTTCCTAATCTTAAGAACCCAA:1	-	chrX	13168086	5'	+	297	184	2	69.18
TATGTAATTGGATGGGTTAACATATCATATTAAAGAGCCAAGTTTGTTTTTGGTACAGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAC:1	+	chr3L	19334211	5'	-	roo	379	1	63.70
TGTATTGAGAAATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATAT:1	+	chr2R	1881354	5'	-	Stalker4	248	4	58.22
GTTGAGGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	+	chr2L	16091856	5'	-	roo	9050	2	65.07
AAATCCAGGGAGGATTACATTATTCCAAAAGTGTACTTGGCAATTGTCATTAGAAACTACGATGAAGAGTAAGCACATGGACCTTCCACAGCCGCACGATAGCCATTCCTATAAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTCTGAACACA:1	+	chr2R	25181087	5'	-	HB	10	1	76.03
ATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1	+	chr3R	18339067	5'	-	roo	9029	1	56.16
GAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1	+	chr3L	11393503	5'	+	roo	87	2	81.51
CATTTGAAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	-	chr2R	18336263	5'	-	roo	9028	1	56.85
ATTAATTTATGTAGATTTATAAGCAGCTGAACAAGGTTTTTAGTGCTTGTGCACTACATTTGTGTAAAACATTTATATATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCT:1	-	chr2L	17810134	5'	-	Stalker	190	4	56.85
ATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1	-	chr2L	15833072	5'	+	hobo	63	1	68.46
TTAACGTTCTGTTGACATCGCCGTGCCAACCGAATGCCATCAGGCATTTCGTCACATAAAAATACATGGCCAATATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATT:1	-	chr3L	7292578	5'	-	HMS-Beagle2	7185	2	71.82
ATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATACTTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCAT:1	-	chr2R	12835054	5'	-	jockey	402	1	68.99
AAATTGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1	+	chrX	2842463	5'	-	Tabor	7287	2	60.27
GGCCAAAGAGAATTGATATGCAGATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	-	chrX	6486855	5'	-	roo	398	1	71.92
TTTGTTCTTACATTTATGTGACCCTATCATCATCTTTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCAAATCCTGATCGTCCTCGCGAAGCAATGCTTCACAGCCATACCGCG:1	+	chrX	21035323	5'	+	Rt1c	5334	1	69.29
ACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACG:1	-	chr2R	2994305	5'	+	gypsy8	130	2	50.00
ATATTATTCTTTTATAACAGTCTATTCTAATGACCAAGAAAAATTCGTATATATACTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1	+	chr3L	20324666	5'	+	297	6632	2	65.93
TAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1	+	chr2L	21367222	5'	+	Doc	74	1	63.01
AGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1	-	chr2L	12483822	5'	+	P-element	62	1	41.96
AAAATAATATAAAATAAAATAAAATAAGACACACATTGGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chrX	14635202	5'	+	roo	8737	2	75.18
AGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAA:1	-	chr2L	10037412	5'	+	Quasimodo	50	2	58.52
CCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	+	chr2L	13763136	5'	+	pogo	49	1	54.11
GTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAAT:1	+	chr2R	23465985	5'	+	Doc	481	1	68.64
ACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	-	chr3R	20427490	5'	+	jockey	14	1	73.39
GCTTAAATGAGGTTGGAGGGGACCCCGAGGACCTCCGGCTATCATCAGCTGCCGCTGCCTGATTACTTTAAGATGCGATTCTCAT:1	-	chr3L	13070976	5'	+	roo	318	2	72.94
ATGGGAAATTCTTAAAATATTCGCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGCGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1	-	chrX	2842626	5'	+	Tabor	21	2	75.69
GTACCAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1	+	chr3R	7641046	5'	-	hobo	2925	1	56.18
ATTACGGCTTGTGGGCATTAGATTACGCAAAAACAAGTGTCAGAAAATACAGAAACGATGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATT:1	+	chr3L	24030433	5'	+	Tc1	1630	1	64.21
AAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTACGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAG:1	-	chr2R	4774755	5'	-	baggins	5344	1	58.90
ATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1	+	chr3R	16076802	5'	+	roo	85	2	77.40
GCTTGCTTCTAGATCTAGACTGTATCCGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTCGGATATATCT:1	-	chr3R	19448518	5'	-	roo	358	2	44.52
GCTACGCTTGCGCTGTGATAATACGGGATCACTAAGTCAGGCTTAGTGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAA:1	+	chr3L	23797907	5'	+	Doc	40	1	54.29
TTGGGCAAAGTTTTTGTTTTCTTAATCTTAATCTAGCTTTTAGAATATACATATATAGGAATATACACACATATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTACGCATATGC:1	-	chr3R	4132589	5'	+	Idefix	17	2	70.08
GTGAGTGTCCTCATTTTCACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2	-	chr3R	7100952	5'	-	roo	398	1	74.66
AGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGCTATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1	+	chr2L	21884513	5'	+	pogo	32	1	54.46
GGTGCTGGTCAACGACCTGGTGGATGATGCCACTCTGATGGACGATGCCAAAAGTGAGACCTCATCTAAGTATTGCGGTATAAATTATATTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCA:1	-	chr2L	7191675	5'	-	Copia1_DM	145	1	50.68
GCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGGAATATGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAG:1	-	chr3L	2362390	5'	-	Stalker2	374	2	60.71
TTTAAGAACCAAATTATTTCAAAAACTACATATATTGTTATGTTTCTAGCAGGTTTATGAAAGTATAAAACAGTGAAATTAAGAGTTTGGACAAATTTTTCTATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCT:1	+	chr2L	6940153	5'	-	Stalker4	6954	2	70.55
AAATCAAATAAAATAAAATCATATTAAGATGTATATGATGGTGTTTTTTCTTCAACTTGTCCAACGATCTATTGCAACTTAACAAATGTAGCTGTGTTTCGTGGAATATAACTTTTGTATGGCAAACCACTTAAAAAAAATTTTAA:1	+	chr3L	18521332	5'	+	transib1	431	1	58.22
TGGTCAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1	+	chr3L	3500920	5'	+	opus	7055	4	55.48
TCTTAACTGATGAAAAACGTTTTAATTTAGATGGCCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1	-	chr2R	6487925	5'	-	copia	170	2	75.86
CGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCGGCCATCAACGCCAACGAACG:1	-	chr3R	10274032	5'	+	HMS-Beagle	6851	2	61.54
TTTAGGGGACTAGGAAAAGAATTTTGGGCGCTTGACAGTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACA:1	+	chr3R	29360978	5'	+	mdg1	7122	2	73.10
GTAGCCAAACACCTCGTCATTAACTACTATAATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCTCATATTGTTCAAAACGTATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTC:1	+	chrX	23431004	5'	+	Transpac	5	2	76.92
ACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTTTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	+	chr2R	9328596	5'	+	roo	6	2	67.78
CTTTAAAACGGTGAAAAACCTTGCCAACAGAACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1	+	chr2L	20808302	5'	+	HMS-Beagle	46	2	54.11
GATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAACT:1	+	chrX	13504122	5'	+	412	7087	2	62.33
GCCATCGAATTTTGTTCAACAATTAATAGGGTAGCAGATATTCTGTGTTATATTGCCAAATCGATACCTTGGGTTGGCTAAGGAAACAAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAAC:1	-	chrX	16526107	5'	-	rover	7074	2	68.80
AATGCCGACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAA:1	+	chr3L	24272049	5'	+	gypsy11	51	2	70.37
CGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr2R	20596548	5'	+	roo	8717	2	65.38
AATTCATCATTGCTATTATGTTATGTTTGTTACCTTTGTTAGTTTATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTCACGCCATACGATTTGTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTACAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAA:1	-	chr2R	1880438	5'	+	1360	76	1	67.81
GGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGCCACTCAACC:1	-	chrX	2295985	5'	+	Tirant	8147	2	56.64
TACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTAT:1	+	chr3R	27994168	5'	+	roo	42	2	53.24
CATAAGACAACTGTCAAGATGTTTTACTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTTCAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAG:1	+	chr2R	9669942	5'	-	412	324	2	79.10
ATACGCATAAGGAAGCCCCAAAACCAAACAGCTGTTGACCATGTTTGGTTGTGGCCACACACTTTGTCATAATAACTATAAATATACAAATATACAAAAAGACTACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGA:1	+	chr3R	23296989	5'	+	Stalker	139	4	57.24
GCCTTGTTTGTCATATATACATTTTTCTATTGCCTTTCTTTCTTCTCTCCCCAAACACAAAAAAAAAGTTAATTTTCTTTCACTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATG:1	+	chr2R	11556482	5'	-	copia	4803	1	65.12
AAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr3L	22437960	5'	+	roo	61	2	60.69
GGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1	+	chr2R	2016807	5'	+	1360	23	1	63.33
ATGGGGTTCGGTAACTGAAACAAGTACCATGCTTCAAATATAAAAAGATAAATAAAAATACCTTTAAAAAAGTATAAAAACAATCCAAGGAATCAGACAAACAAATTCTGACAAAGACATTAAGAAGACCCCTAAGCCGCCTCCAA:1	+	chrX	13245339	5'	+	Fw2	197	1	71.23
GTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAACTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	-	chr2R	21920570	5'	+	jockey	70	1	71.32
GATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACCAT:1	-	chr2L	5254379	5'	+	roo	19	2	58.04
TTTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAATTAATTTTATTTGGAACTATCTT:1	+	chr3L	22437856	5'	-	roo	357	2	52.14
AAAAAGAGCTGAGAAACAAATTTGAACGGATAATAATAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1	+	chrX	23457618	5'	+	Doc	69	1	65.97
CAAAGCCAAATGTAAAAGCTTCAATTAAAACTTACGAACACACCGAAAAAGCTGGACTGGCTTTTTCACTCAAGCAAACCCCATATGGCAACTAAAGCTCTCTTATTAAAAGCCATATTAGGTCCAACACTGACCTACACCATCCA:1	-	chrX	22741130	5'	+	G5A	2423	1	70.55
GATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTG:1	+	chrX	20870098	5'	+	gypsy	7041	2	55.48
TGCGTGAGTTACCAAATTGCCTTAGATCGACACGTAAGACAAACAAGGAAATAATAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGCTGTCAGGTTATA:1	-	chr2R	5395167	5'	+	Cr1a	464	1	56.84
CGGTGTAGTAAGTTTCGTACGACAACTCCTCGGTTCTTTCTTTTTTTTCCCCCCATTTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1	-	chr3R	23319169	5'	+	hopper	148	103	83.33
AAACCATTTCTCACCATTTTCTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1	-	chr2L	14081455	5'	+	1360	10	2	78.08
TAACAAGGATTTGGAAATACCCGAAAAATTACATCCTGATTAGTTGAACACTCTTACTGCCAATTTGTTCAGTTTAATCACAATTGTCTTAAGGATCAGTCGAGAACAATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGG:1	-	chr2L	13673322	5'	-	G5	4658	1	80.74
GAACTGAAGACCCATTTTCATAAAACAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATT:1	-	chr2R	5209713	5'	-	gypsy	445	2	68.07
GTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr3R	17817887	5'	-	roo	357	2	57.89
ATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATACTTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGGAATTCTCCTTG:1	-	chr2R	12835074	5'	-	jockey	426	1	56.00
TAACTAACTATTTTGTATTTTTCACTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATA:2	-	chrX	22511482	5'	-	Tc3	316	1	73.97
GAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1	-	chr2R	2016903	5'	-	1360	3313	1	68.49
ATAGAAATCAACAGAAAGTGAAGGTGAAAATCGCCGCGAAAGTCAGTCAAATCGATGATCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTTTAGTTTTTTATTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTT:1	-	chr3L	2536569	5'	+	Tc1	1436	1	60.27
ACTTAAAACTCCATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1	-	chr2L	544901	5'	-	412	7513	2	60.27
GGCGTGGGTGAAATGGGCCGAGCAGGGGGCGGTGGCTGTGGTGGGGGGCGTGGAGCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGGGCCTTCTTGAGTGG:1	+	chrX	8728390	5'	-	Quasimodo	277	2	55.45
GAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chr2R	9328611	5'	+	roo	8740	2	71.03
TTTCTCGATGGCTTCTCCTTGGCTTAATGTGTGTGCCCAAGGGGCGTTCTTGAGGATTTTGCAGCCCCTTTCGCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACC:1	-	chr2R	9233080	5'	-	Circe	7199	1	65.14
CAGCCATTTGAACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1	+	chr3R	28075328	5'	+	jockey	4686	1	54.22
CACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACA:1	+	chr3L	27415237	5'	-	transib2	2740	1	76.03
ATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAACTGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAA:1	-	chr2L	18339054	5'	-	pogo	2025	1	69.86
GCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1	-	chr2R	13585491	5'	-	412	7470	2	68.97
AGCCGAACGAAGCCTTTGGGCATATAACGCATAACCATATAGTACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGTGTGCTACTCGCCACGC:1	+	chr2R	15289133	5'	+	hobo	58	1	67.19
AGTTCACTTCATCGCTTTTCAATGTAATTCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTCC:1	-	chr3R	10462723	5'	+	opus	42	4	54.68
GTTTGAATTTATTTATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAG:1	+	chr2R	23352141	5'	-	Stalker	221	4	65.00
TTTTTTTTTGTATTTTTCGATTTTCAGGTAGAAGGCAAACAATGTTAAGCCAACCGCAAAGTCAGAGGAATTTATTTGTATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1	+	chr3L	17952466	5'	+	pogo	24	1	55.97
AACGAATATTATTTGTCATTTTAACCGAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAA:1	-	chr3R	12887009	5'	+	roo	8663	1	78.43
TTGGATGAGTTGCAAGGACGAAATAACAGGATTTCGTTGGGATTTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1	-	chrX	17431822	5'	-	hopper2	1559	1	52.05
AATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr3R	16076865	5'	-	roo	8998	2	70.14
AATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	+	chr3R	25448325	5'	-	roo	9034	1	55.97
TTGGAAATTTAAATACACGTATCTGTGGGCTGCACCTGAAAGTATGCTATTCTTCCCACACACATGGAGATTCTCTTGGGAGATACATACATTATACATATTTGTAACAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACAACTCAAAC:1	-	chr3R	16192535	5'	-	accord2	58	2	51.03
CCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCC:1	+	chrX	6499854	5'	-	Quasimodo	6981	2	67.35
ATCTTATCGCTCTTATTTTTGCTATCACATATGTATCTTGTCACGTAGCTGATAAGTATCTTTTTTATGTGCAAGCATCTTGCCAATGATATCATCATTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	-	chr3R	26222993	5'	+	roo	23	2	67.81
GACTGTGTCTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1	+	chr3L	10574274	5'	-	Tabor	433	2	50.68
TTTCTTGAGAAGCATGTGCGCTTGAGATGCTTATTGTAGTGATTAACAAGTTGTAATAAAATGCAGATATATATGTAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAATCCTCGCTTCGCGT:1	+	chr3R	6664925	5'	+	I-element	42	1	56.85
GCCGGAGGACGACATTGAAAGCCGAGCGGAGCCGAGGCCCAGAGAGTCCTGCTGGAAATGTTCAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1	+	chr3L	2712736	5'	-	P-element	2865	1	59.09
TGTTTGAAGCTCACCGAATCTCCTGGATACGACAAAATCGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCCCAAACTCGGCTGATCTATATCC:1	-	chr3L	26644899	5'	+	Quasimodo	7122	2	69.63
GGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1	+	chr3L	11957119	5'	+	blood	7063	2	59.12
TTTTAACTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1	-	chrX	13504245	5'	-	412	7492	2	60.45
GCCAAGTTTATTAAAAGAACTATTAACAGAATGGGCTTTTGAAGAAATTTATTTGAGTATCACAAAATAAAAATACTGTCTATCTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTC:1	-	chr3R	27989786	5'	-	roo	115	2	60.96
TTTTTTTCATTCGAGAAAATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAGATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGGAT:1	-	chr2R	5173268	5'	-	Stalker4	402	1	76.43
TAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCTG:1	-	chr2L	6007626	5'	+	1360	457	1	70.55
ATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1	-	chr2L	12892707	5'	-	roo	9039	1	54.55
ATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCT:1	-	chr2R	5206900	5'	+	G4	3767	1	59.59
GATTCAAAAAAAACGATATCCAAACGGTTAAGAAGCTGACAAAAAAGAGTACCT:1	-	chr2R	6433213	5'	-	Circe	7250	2	85.19
TACACAAATTGATGTGGGGATTGTTATGTTATGGGTTGACATTTTGCCGCATTACGTAATAAAAACGAGTGATTTCTCCCAGCGTCGTGATAACTGTGTTCTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1	+	chrX	7893533	5'	+	297	56	2	68.49
GCTACACATAAAACTTCATGCACCAGAATGGATGTCACGTTTGAAAGTCAACGACAATGCTAATCTGCATACCTGTGCTACTGTTTTCCATGACAACACTTTAAACTTTTTTAATTCTCTGAGGAAATATAAACCACAAATGTTGC:1	+	chr2L	15094139	5'	-	transib1	215	1	56.85
ATAGTTACTTGGAGTTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGACTCCGCTGCC:1	-	chr3R	6611315	5'	+	HMS-Beagle	38	2	59.59
TTTGTGCTGGCTTTGCTTCCACTTCAATCATAACTGTGTTCAATTGTTGCATTATTAATTTATATTATGCGCAATTGTAGCAAACTGTGGGCAGAAGGTCCTCGCACACAGATGCACACACACACACACACAC:1	+	chr2L	8612337	5'	+	accord	181	2	68.42
CGGGTATAAAAATATCTTACTCCACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1	+	chr2R	3065921	5'	+	P-element	64	1	40.56
GTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr3R	7835123	5'	-	roo	338	2	66.44
GTTGTTGCTGCTGCTGCTTTGCGTACAGGCACGCCTCATTTAATACTGAATTTAGGTTGATTATGTTGGAGGGCTTGACTTCCCCCCC:1	+	chr3L	15592924	5'	-	gypsy	7341	2	63.64
AAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1	-	chr2L	16016415	5'	+	412	7116	2	60.96
ATTCGCAGTAGTTTTAATTCATTTATGGTTCCCATGTAAATGAACTGATCTCATATTAACAAATTCAATATTAAGTTGATACAACAAAACGGCACGGAA:1	-	chr3R	4297711	5'	+	Bica	251	2	79.80
CACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1	+	chr3R	22822000	5'	-	mdg1	7403	2	60.00
AGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr2L	5254345	5'	+	roo	80	2	77.70
ATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCATATCTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTT:1	-	chrX	14336497	5'	+	roo	8678	2	54.65
TTGTTTTATTTGAAAAACGTGGCTGCAATTTTAAACAAATTTGGGATTTAGGTTTTATTGCACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAA:1	-	chr3L	15996032	5'	-	297	6919	2	60.96
GCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chr2R	20596547	5'	+	roo	8691	2	57.28
AACCAAAAATTGCAAAGCGTGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1	-	chr2R	5485244	5'	+	blood	26	2	66.67
AGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	+	chr2R	11164367	5'	-	roo	9049	2	60.69
AAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGC:1	-	chr2L	17079838	5'	+	jockey	4720	1	59.06
AGACGCTGCATGAAACGGTCCCGAAGAGATGCCCACATGCATTCACATACATATAAAATGCGAGCATACATATAACATATATGTATGTATAGATATGTATGTACGTACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1	-	chr2R	15289259	5'	+	hobo	2708	1	82.54
ATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	-	chr2L	12892707	5'	-	roo	9004	2	65.52
AAAAATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1	-	chr3R	16076886	5'	-	roo	9017	2	56.16
CCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCGA:1	+	chr3L	23250430	5'	+	1360	3379	2	72.36
TGGGGCGGTCATAGAGGGGTTGGGTTCCTTCGTCGGGATTGCTGCGCAGATTAATGCTGCATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCT:1	+	chr3R	10273939	5'	-	HMS-Beagle	6982	2	61.64
TATATAGTGTATGCCAATAATTTTTTAATACTAAATAAAGCATTTAAAACTTTTAGGGTATTATCTAGTCATGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1	+	chr3L	18635081	5'	-	roo	304	2	51.37
AGAGGACTGTTCATTTGCTTTAGGTATATATATATAGAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1	-	chrX	17756658	5'	-	297	313	2	82.88
CGAAGTTCGTAGTTCGTTTCGAGTAACGAAACATGAAATAATGGGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1	+	chr3R	6611154	5'	-	HMS-Beagle	221	2	68.49
TAAGAGATAATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1	+	chr3R	5061800	5'	+	mdg3	5263	1	76.34
ATAAATGATAACGTAATGCACCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGAGTGATATAAGATCACCCATTT:1	-	chr3L	17115507	5'	+	blood	7101	2	78.57
AACGATTCAAAATTAACTTTGCCTTGCAATGAGCACCGCCTCACCTCCTTTTTGCCAGGATTCAGCCAGGATCTGGGCGAAAAGTTTCTTTGGCGGCGTTGTGGCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCG:1	+	chr3R	22826419	5'	-	Bica	399	1	75.89
CCGCAGCAGCCGCCGCAGCGGGAAAGCAGATTGAAGGCGAGTGCCACATGAATATTGATGAGTTTATCGATCGACTTATTTCGGCTATATATATTACACACTTATAACAAATAAATTA:1	+	chr2L	12304560	5'	+	gtwin	33	2	56.78
TAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	-	chr2R	23803029	5'	+	roo	77	2	71.23
CAATGTAAGCCCCCACCACCACGCCCACACAGCCCGAAAAGGGATGCTTCGATTTTCTTGTCATAAAGT:1	+	chr3R	16736554	5'	-	transib2	2808	1	57.97
ACGCCTNTCGCACGAGCTCCATTTGATTGTCCGGGGCGGGGATGAGCTGCTTGGCCTTGGCTAAAACAAAGCGAAACAAAACAAAACAACAACATCGAAA:1	-	chr2R	22544339	5'	+	gypsy9	454	1	62.00
AGACAGATCTGCCAATGCACCCGCCAACCTCGACCTTACAACACACACAGATATGCACACATACATACATATGACATACATAT:1	-	chr2R	11657583	5'	-	Dm88	9	2	55.42
AAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCACCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1	-	chrX	8543559	5'	-	roo	404	1	72.48
ATACCTTTGAAGTTCCCAATAAAAAAAGGCATTCTACTTGCTGAAGATGCGTTTAGCTAAAATGTCAAAATGTATGTAATTACTAGTAATTCTTATTTACAATCAAATCGCTATCGCCACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGG:1	+	chr3R	29189163	5'	+	gypsy	7324	2	60.96
TTGGCCATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	-	chr2L	17471713	5'	-	roo	9033	1	57.53
TGAGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1	-	chr2R	13817728	5'	+	412	51	2	54.68
AAATGGCGGCAAAGTGGAAAAGTGAAATAAGCGCAGCTTTATATGCACAAATACACATACATATGTACACACAAATATATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAACAAAGTATTTTTATTGATCAAAAA:1	+	chrX	6498920	5'	-	Quasimodo	7331	2	57.24
AATTGTGAAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1	-	chr3L	11257444	5'	+	1360	4	2	78.81
GCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1	-	chrX	2842604	5'	+	Tabor	6884	2	59.59
GAAAATACAAAGCCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1	+	chr3R	20499729	5'	+	mdg3	5279	2	63.36
AAAGTTGGCGGGTCTGTGTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr3R	22122716	5'	-	roo	8984	2	77.93
AGGTTGAAATTTCAATGGGACCGTGAAAATGAGGCGCTGAAGTGATAGGAAACTTCCTATCAAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1	+	chr2L	6863222	5'	-	pogo	2095	1	82.19
GTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	+	chr2L	8986103	5'	+	412	7097	2	53.79
CAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1	-	chr3L	27415331	5'	+	transib2	45	1	54.79
ATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACATGAG:1	-	chr3R	22844264	5'	-	roo	8999	2	71.01
TAAAGTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1	-	chr3L	10841540	5'	-	mdg1	346	2	72.99
GACTTTTGGTTGCGCAAATTGGTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chrX	5643423	5'	-	roo	399	1	78.08
ATTTCGGCAGCGAACCGAAGAGTCTGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACACGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr3L	15600417	5'	-	roo	8997	2	67.12
TATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1	-	chr2R	15064449	5'	+	412	52	2	54.11
ACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1	-	chr3L	23906479	5'	+	1360	44	1	56.82
TGTTATTATTTTGACGTATAAGGGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1	-	chr2R	4601637	5'	+	HMS-Beagle2	6915	2	55.96
GTAGAAATATCACAATGTCAACATTTTTTCCCTTCTTATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACT:1	+	chr3L	17557969	5'	-	jockey	4972	1	64.38
CCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1	-	chr3L	22400360	5'	+	1360	1	2	74.71
GGACAGCTTTATGACATGCATGCGCATATGGACGTACATATAAATATAAATTCAGCTTGAAATCGTTTAATATGCATCATTGTCCTGCCTGCGCAAAGCGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACT:1	-	chr2R	22767710	5'	+	Cr1a	4187	1	71.65
AAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1	+	chr3R	12618598	5'	+	F-element	24	1	56.31
TAATTTAAACTATTAGTATATGATAGAAGAAGAAATGGTATTTAATTTAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1	+	chr2L	13053704	5'	+	BS	5017	1	67.12
CTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCT:1	-	chr3R	20499824	5'	-	mdg3	159	2	74.66
CGTGTCAAGCAATCGCATAGCCCAGGTCGTAAAAGCCCAGACCTCGGCCCCATTCGATAACCGAATGCACAGAGAGAAATTGTGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTTTG:1	+	chr3L	12305965	5'	-	G2	69	1	72.66
GTCTTGCGCGTTTTATTAATTTTAATTTTTAACCTTTGACTGATGCAATTGCAGTTGGCCGAGTGGGGGTGTGGACAGCTTGGGTTGATGCTCACGTAGTTGCTGAATGTGTGTTGCGGCACGTTGCTG:1	+	chr3R	16628650	5'	-	Chouto	343	1	68.22
ATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGCCTGCCATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1	-	chr3R	7482814	5'	-	412	7475	2	74.63
TGTTAGTATAGCACTGGGTTTAAGTAGACTAATAGATTCGTATAGGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1	+	chr2R	7452848	5'	+	pogo	73	1	69.86
CTCAACCATTTACCACCAAATAACAAAAAAACACCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATGTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTC:1	+	chr3R	2216722	5'	-	1360	499	1	72.60
GGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1	+	chr3L	21855437	5'	-	blood	350	2	57.27
TTGTAAAACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	-	chr2L	17420269	5'	+	roo	43	2	56.55
AAGGAACAAAGCAGGACCACAAGCGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTT:1	+	chr3R	9985711	5'	-	jockey	4647	1	81.40
CAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:1	+	chr3R	14651234	5'	+	P-element	61	1	26.13
GTCCATCGTCAACCAATTCATGCTAATCACTGAGTAAAAAGATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTCAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAAT:1	+	chr2R	5277133	5'	-	Quasimodo	7291	2	71.92
CTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGTG:1	-	chr3L	16343293	5'	-	roo	9006	2	63.70
GCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3L	9998201	5'	+	roo	8680	2	65.05
CCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1	+	chr3R	27424870	5'	-	blood	7329	1	74.56
ACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1	-	chr2L	12483825	5'	+	P-element	62	1	43.15
GCATACAAAATCAAAAATATCCAGTATCCGTAGAGAAAGCTAATCCACAACTGTAAACGTAAAACAATTAAAGTCAGAAGCTTTCTCTCTTCACGATCAGAACCCTAAAGTTTAGAAAAGCTAGATACCGAGGCTTGAACGTCAAT:1	+	chr3R	3136592	5'	+	Idefix	7250	2	63.01
AATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1	-	chr3R	17831885	5'	+	F-element	36	1	49.55
ATTTTCCTTTCGATAAATGTACCTCAATAACCAAGCAAAGGTTTTTGATCTCAAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCACGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1	+	chr3R	14651136	5'	+	P-element	1	2	82.88
CAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCTATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACATTTCGT:1	+	chr2R	20496896	5'	+	blood	7049	2	53.33
AGTTTAAATATTTCCACGAACATAGCAAAAAACACATGGAAAGCCACTTTCAATACTATTAAACTTTATTAAGCTTTTTTTGTGTTTTTGAAAAAATAAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACT:1	+	chr3R	4946163	5'	+	Tc3	1592	1	60.74
AAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1	+	chr2R	21229009	5'	+	jockey	81	1	70.45
ATTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTTTATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACATTTAACTTTGCTTTTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAG:1	+	chr3L	17978631	5'	-	TAHRE	10423	2	60.69
GGACTGCCATAACTTATATATATAAATATATTACCTCCACAAATCCGCAATTCACTTATATCGTCCCAGACTGGTTTATTTGTATTTTTAATATTTTAACACTGGTCTGAAACTATGGTTTGTGTCGAAG:1	+	chr2R	1486867	5'	-	gypsy6	463	1	49.23
TACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTG:1	-	chr2R	5206899	5'	+	G4	3768	1	58.90
TATTACCCAAAACATCATATAATTTTTTTTTACTTGTAATATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCA:1	+	chr3R	10183253	5'	-	blood	7071	2	73.29
GTTTATTGTTGTGCTTCGTGGAGCGCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1	-	chr2L	18404615	5'	+	hobo	58	1	56.55
ACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:1	+	chrX	2842484	5'	-	Tabor	7273	2	53.24
CAAATATGTAATAACAACATAATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1	+	chr2L	8986080	5'	+	412	7075	2	69.18
GCTCTATCAGAAATGCACAAAAAATAATACGTATACGCCATGTGTTACAGCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTT:1	-	chr2R	9328754	5'	-	roo	404	1	80.14
AGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATNTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	-	chr3R	25448450	5'	+	roo	25	2	61.79
AATCACTTTATATATTTTCACAATTTCCCTCGAATTTTGTTATTTGCAATACAATAAAAGTTACATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1	-	chr3R	20868209	5'	+	BS	5042	1	55.22
TGCGTAGATGATGGGACAGTTTTAGGTGTAAGCATATGAGTCATTTTGTTTTTATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1	+	chr2R	21145863	5'	-	pogo	2045	1	67.12
CGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTACATTTAGGATTT:1	-	chr2R	21907985	5'	+	roo	8744	2	81.06
CTATGTGACTGTACTCGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:2	+	chr3R	9210633	5'	-	mdg1	350	2	65.75
AATTTGGTTTTAGTACAACATATTGTTGTACGTATTAGTTGTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAA:1	+	chr3R	20469537	5'	+	roo	8663	1	61.64
CCCAACGACCTCTAAACCCTGGACCGCAGCCCCTTTGGTTTCAGAAACTAATTAAGCATGTTGTGCGCAACAACTTGGCATCATCATTGATTCTTTCAAATCCGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCA:1	-	chr2L	4292302	5'	+	rover	7265	2	56.85
TACGCGGCAGGAAATTGTGAATTAGAAGCAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTGTTCCT:1	-	chr3R	9922113	5'	-	blood	353	2	68.49
TCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chrX	17526811	5'	+	roo	20	2	54.26
CTGTGACGAGCACCGATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	+	chr3L	12879714	5'	+	roo	18	2	69.17
GAATTTATGAATTGTTGAGGAAAGTACACAGAATTGCATTCAGGAAGAAAAAGGATGTTTATAAAAATTGTCCTTAAAACGGTTTTTATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACA:1	-	chr3R	25432981	5'	-	3S18	5766	2	55.48
AATGGCAAAACATAGCCTTAATCTTAGTTGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGTATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1	-	chr2L	5845090	5'	+	transib2	50	1	52.05
GAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	-	chr3L	10292911	5'	+	roo	52	2	54.11
AATTTATTAAAAGCTATGAGCAGTAAGCGATTCAATATATAAGATACATTTTTATGAATTTTAATGTGCATCAAATTGTGTGTAGCTTTTGTATTTTATGTTATATTCTAGATATTTCCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTTTG:1	-	chr3L	15012711	5'	-	Doc	4696	3	78.77
GTAACTCAACACTTAAGCATATTCCTTGGCGTTGGACGCAGCAGCTGATACCCAACCTCAAACCGTGGCTAGAACGGAAGCATGGCGAAATAACGTTCCACCTAACGCAGCTG:1	-	chr2R	20380507	5'	+	Rt1c	4986	1	71.68
ACCCCATCCCCTTCCAATTGCCAATCTTTGTGTGCTTGGGAATTAAAAAAAAAAGGAAACCAAGAGATTTCTGCGTAAATCCGCCACCCTCATTAAGTCATTTGACTTAATGTAAATGTAAAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCAC:1	-	chr2R	15364151	5'	+	1360	3319	1	61.38
AAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1	-	chr3L	10574378	5'	+	Tabor	6894	2	55.00
TAATTTTCCCTTGATAAATATTTGCCTTGCCCAAAAAAGTATGCTACACATTTTGCTCACCACCGAGTATGAAATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1	+	chr2L	1839212	5'	-	hobo	2909	1	60.16
ACACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr3R	25448315	5'	-	roo	9033	1	58.62
ACTCAACGCATACAAATTAAGAGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGT:1	-	chr3R	25423284	5'	-	3S18	6078	2	54.08
TTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1	+	chr3L	4948064	5'	-	hobo	2909	1	60.47
CATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1	-	chr2R	9662779	5'	+	412	84	2	78.77
ATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAG:1	+	chr2R	8585437	5'	-	roo	335	2	65.75
AAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1	+	chr3R	5061811	5'	+	mdg3	24	2	66.92
ATATACTTATTTAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chr2R	14542264	5'	+	roo	8672	2	70.16
AAGGAATTATTTAGATTTGATTATATTTTGGTGGAAGCTCTATATATTTTCCTACTAAGCCAATATAATTAAATGGTAATATTGATTATTTAGAAGCGATGAATCCATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCA:1	+	chr3L	15840245	5'	-	BS	5047	1	61.59
ATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGAT:1	-	chr3L	23702233	5'	+	G4	59	1	66.67
TATACCCTTAGCCTGTTTCGAATATTGGGTGCCATTGATTAGGGCTAGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGACGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAA:1	+	chr3L	23603119	5'	+	F-element	39	1	60.27
CGGGTAATTCAACGTCGGCGTGCTCAGGCTTCTTTAATCCCAAGCAACTACTAACCTTTTGGGGCTAACTTCCTTTGTAATACAGAGTTTAAAAAATAATCTTCAAACAGATGTCATCTACAGTGACTTTAGTAAAACATTTGACT:1	-	chr2R	952427	5'	+	Q-element	316	2	71.23
AACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr3R	12886987	5'	+	roo	8723	2	66.43
GCTGTGGGGCTTTTCAATGCCTACACAAGTTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATC:1	+	chr2L	19470777	5'	-	roo	252	2	78.42
TTAATAAATTTATGATTCCCGAACTGTTGCCCAAAAAGTGTTGACACAACAAAAAGAAAGAGACCGATGTAAATGCAACAACCGCAAAAGGACAAACTAAAAGCTGCAACACGACAGTGCATTATTATATTATTATTATTATTAAT:2	+	chr3L	3138002	5'	-	mdg1	52	4	75.34
CATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAACAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1	+	chr2R	13121956	5'	+	pogo	23	1	57.24
CTTTAGTTCATACAAATACGAGCACGGAATGTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1	+	chr3R	14981110	5'	-	mdg1	411	2	75.36
GTGAATGATATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1	+	chr3R	17420354	5'	+	roo	8667	2	80.14
AATATTACACAAAATATTGTAACATTGAGCGGAACTTTTTCTGCCCGATGACAAAAATGGCCCGTAAAGCCATACACCAATTAGGCAGGAAAATGTAACAATATATATATACAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1	+	chr3L	15509686	5'	+	mdg1	7087	2	75.34
AAATCTTTTGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATT:1	+	chr2R	23332528	5'	+	invader4	42	2	61.48
GTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCCTATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3L	12879746	5'	+	roo	8718	2	64.52
CACAAAGAAGCGACCGTCTGTCCGGCGAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAA:1	+	chr2R	7586133	5'	+	I-element	5032	1	78.16
GGTCAAACAGCCATCCTGTTCCAAGGATCAAAAGCTTAACAGTGCCAAACTATTTTAAAGTTATCCATCTAACTATTTATAATTAAAATAAATGATCAATAAACATATTGAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTC:1	+	chrX	15838598	5'	-	INE-1	549	1	78.87
GACTTAAGGAAACATGCAAATAATCGACTTTTGCGGGCAGGGGAATTAATTTTATTGCCCGTGTCAGGAGCACACAAAGGAGTGATATAACAATCTTTTCTAATACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCAC:1	-	chr3R	16166276	5'	+	TLD2_LTR	111	1	56.16
AGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGGAAG:1	+	chrX	6499826	5'	-	Quasimodo	6961	2	64.38
GACTGGCCCTGCGACTCCTGCTGCGGCGGCACTTAATTCTAGAATGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1	+	chrX	5662835	5'	+	P-element	2	2	79.82
GTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1	-	chr3L	17560413	5'	+	pogo	28	1	65.52
AATTATTTAAAATTAATGGTCAAAGCAAAATTGGCCAAATTGTTAAAAATCAATTGTTTCTAGTAATATTTGTGATTCTCTGAAACGAGAATTTATTTGTTTAAGCTACTTTTTCGTAAGTTTTATAATATATAATAATAATTGTT:1	+	chr2R	11930103	5'	+	Tc3	256	1	63.01
GTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	-	chr3R	14940168	5'	+	jockey	74	1	65.44
ATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1	+	chr3L	23906344	5'	-	1360	3372	1	71.85
GCTTGCCTGCATTACAGTATAATATTTAATAATATTCCGGTGATCTTCATATCCTTCTTCTTTTGGATGCTCTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACT:1	+	chrX	22426794	5'	-	invader3	231	2	55.07
ATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2L	16091995	5'	+	roo	8724	2	62.76
CAGAGAAAAAAAGTTGTTTCTAAATGCTTTAAAACGGTGAAAAACCTTGCCAACAGAACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1	+	chr2L	20808276	5'	+	HMS-Beagle	20	2	71.92
CATCTGTTTAGAAAAAATATGCACAGAACCCAAATTCAGTTTTTCATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1	+	chr2R	16785301	5'	-	412	7530	2	68.00
AAACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	-	chr2R	25118778	5'	-	roo	9011	2	61.64
ACAAGACACCAATCCACGGATCCGATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1	-	chr2R	13084706	5'	-	roo	405	1	76.36
GTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAA:1	+	chr3R	3922955	5'	+	Cr1a	88	1	71.03
ACACATATATATATATACCATACATTCGAGACATATGACGTCGATGAGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGATTG:1	-	chr3R	26687684	5'	-	P-element	2848	1	48.72
TAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chrX	10640105	5'	+	roo	69	2	66.21
AATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr2L	16091996	5'	+	roo	48	2	58.96
CTGAATTGTTTGCATAAAAAGAACCACAAAACCTAAACCACCATTGTAATCCAAACCAATAAGAATAGAACATACTGTATTTAGCACTGAAAAACTGAGACTGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAA:1	-	chr3R	30248251	5'	+	Juan	4206	1	63.01
GGGCGGAAGGTATACCTTTTTGAATCGTGGATCAAACAAAGATGTTTTGACCAGTGTTTTGGTTCTTTCCTTCGTTACAGCTCCTTCAGAAGAGGTTTACAATTATATCTTAATCTAGTTAATATCTAATTTTGTAAATAATTGCT:1	+	chr2R	5607691	5'	-	I-element	5227	1	43.84
TATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	-	chr3L	16015367	5'	-	1360	3370	1	67.59
AAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1	+	chr3L	14638598	5'	+	1360	40	1	53.60
GAACGGGGTACTTGCAGAATTCATATACAGGAAAAAAAATATAATCGTTCGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTT:1	+	chrX	22601848	5'	+	INE-1	32	1	77.86
TAGCCTTAATCTTAGTTGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1	-	chr2L	5845078	5'	+	transib2	61	1	60.69
ATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAA:1	+	chr3L	4840745	5'	+	jockey	4734	1	67.20
GCTTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1	-	chr3R	8696233	5'	+	Tirant	8120	2	63.00
TCACCGAAAGTCACTGCGATGTGTGCACATATGTATGTAAGTTAAGAACCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1	+	chr2R	9544045	5'	+	opus	157	4	69.90
ATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATCTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1	-	chr2L	19965070	5'	+	Doc	55	1	49.64
CCGGAGGAGTTACCCATAAGTTTGTAGAATAAAACGACTATAATAAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTC:1	+	chr2R	5209549	5'	+	gypsy	6993	2	78.68
ACATAATTAAAGCTTGGCTTACTCATGATTAATGGATGCCCCTGTCTCAACTAAATCGATAATACCGAGTCCGAATTTCAGGGACTAAATTGGGGGAAGACTGCCTTATTACAAAGGAGAATCA:1	-	chr3R	17236423	5'	-	gypsy5	7195	2	71.77
CTGGCCTAGGAAACACAGCTGGTACGCGCACTACCCACTACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAA:1	-	chr3L	22349326	5'	+	jockey	30	1	69.66
TAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr2R	11164513	5'	+	roo	53	2	56.85
CGAAACTGCATATAGTCTAGACATTCGAAATATTAGACAATACTTTATGGTTTTATCTACTGCAACTTACCACAGATGAGAAATACATATGCATTTAAATTATTAATACATAAACCCGTAATTCAATATTGATATAAATATATTAC:1	+	chr2L	6955187	5'	-	Tc3	298	1	55.48
GCATGTTCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTATTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCCTCTAAAGATACCATCTAAAGTCCTTGGATGGC:1	+	chr2L	4352075	5'	-	Rt1a	5020	1	73.12
ATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	-	chr3R	7100903	5'	-	roo	9044	1	54.39
AAAGCATTGTCTGCTAATGCCCCTAGATCCTAGTTTGCTCCAAGTTAGCTTTATAAAAATAAACATGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCACGAGCATCAGATACCCGTTGCTCAGCTAGTGTGACTG:1	+	chr2R	1231069	5'	-	INE-1	535	1	58.59
ATACAAAATACATACCATCGCCTTGAAGTATGCACTACTTTTTTCAAACTATTAGCTCCGAAGAACTTCTTATCCTAAATACTAACCTTTCGGTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATATTACTGTTATTGCATTGTATTGATT:1	-	chr3R	13770158	5'	+	BS	5062	1	62.33
CAAATATTAAAGAATCTTATTCTTGGACTTAAAAAGTTAATAGGCGAATGTAACCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATAG:1	-	chrX	6191225	5'	+	FB	37	1	52.73
CAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAAT:1	-	chr3R	19449423	5'	+	roo	8664	1	67.16
CGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1	-	chr3R	17243216	5'	-	hopper	1372	1	52.31
CAGGTAACGAATCGACTGGCAAACGATTAAAGCCATAAACACGAGCACGACAATCACAACAACTTACATACAACACAAACAGCTACAACACAAACAGCTACCAAATAGACATCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTGT:1	+	chr3R	14283578	5'	+	Cr1a	242	1	70.37
GGTGCGTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGTCGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCTTTCCTTTCAA:1	+	chr3L	19013894	5'	-	invader3	5443	2	68.03
CCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTA:1	+	chr3L	25482907	5'	+	accord	26	2	57.78
GTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1	+	chr3R	9038931	5'	+	Juan	4074	1	60.96
TTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGCCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1	+	chr3R	14981157	5'	-	mdg1	7407	2	57.14
TGTGGATTTGCTTTCTTTTTTATACGCAAAATCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr3R	17420541	5'	-	roo	394	1	67.69
AGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr2R	14542144	5'	-	roo	335	2	68.49
ATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1	-	chr3R	17831858	5'	+	F-element	98	1	76.03
CGCCGCTATTCTAAGCGCACATGAAATAATATGTATTTCTCAAATTAAGGGTGAGTTTTCGCTTTCGGTAAACAAACTGCATCTATGACTCTGAAATCTGCATGCCTAGTCTCATCTTTTTAGCTTTTAAAGTTCCTGAGATCTCA:1	-	chr3L	27291793	5'	-	INE-1	147	1	63.01
TACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2R	5248262	5'	+	1360	55	1	75.00
GCAGCCTGAATTAAGAAAATCAAATGTTGAGAGATTATTTTTCAGAGACGCATTTAAGAAATACCGACATATCCAGATACCAGATAAGAATATGATTGTTACATGATCCTCGAGAATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCG:1	-	chr3L	13466542	5'	+	Idefix	178	2	51.37
CATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1	+	chr2L	21367233	5'	+	Doc	84	1	70.34
ACGCTTACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAG:1	-	chr3L	24789701	5'	+	1360	120	1	49.21
AATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1	+	chr2L	22121334	5'	-	opus	485	2	39.37
AAATGCATTAAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1	+	chr2L	13584660	5'	-	pogo	2035	1	69.40
AGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGA:1	-	chr2L	12290745	5'	-	1731	4548	1	70.34
CAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1	-	chr3L	17115541	5'	+	blood	62	2	57.53
AAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1	-	chr3L	27415334	5'	+	transib2	42	1	56.85
TCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCCA:1	-	chr3R	934290	5'	-	Rt1b	4745	1	62.86
GGCTTATATGCATGGTTGTAAAATTAAGATATACTACAGAATCCGGCAGTATTACCCGAAAAGAAGAAAAGAAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTT:1	+	chr2L	12267587	5'	+	jockey	4833	1	50.68
CTCCTGTCAGACATTTTCATATTCATGAGGCTCCATCACCATCCCCATTCCCATCTCCTTCTGCATCAAATAACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1	+	chr3L	10841865	5'	+	mdg1	14	2	53.79
TGATTATTTGGATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGC:1	+	chrX	20870088	5'	+	gypsy	44	2	54.11
CAAGAAAGCAATCAGCCAAGTTAAACTTTTTCATTTGATTTTAACTATGATTTTTCACATGAGAAGGATTGTTTCTAGTTTGCTCAATTTCTAGTTTGCTTTTATGTGTTTTCTTTTT:1	-	chrX	20802275	5'	+	Circe	422	1	50.00
GTAACACATAAACCACACATTTTTGTAAACTCATTAAAGTTTAAATCACACACACACGTTTTGAAAATAATATTTGACGTCGTCTTTCCGATTCTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTT:1	-	chr3R	1438179	5'	+	Cr1a	243	1	55.00
AATAAAAAGATTTTCCATTTGTAAAAATACCCCTGGCTCCCATAAGACTACTAAAAATATGAAAAGGTATCAACACATTTTGGTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGGCTTAATCTAAACCTACTAGCTTTTATA:1	+	chr4	205184	5'	-	INE-1	162	1	68.15
GTTCGGGTTTTTATCTGAGATTGTGAATGATAAAGATTGGTGGTCTGTTTGTATTTCTATACCAACAACACCATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTG:1	+	chrY	1122083	5'	-	Max-element	279	2	63.25
GCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAACATTTGTACGAAAATT:1	+	chr3R	15072578	5'	+	pogo	80	1	73.97
CCTGAGTTGGGGGAGTGAAATCCAGTTAAGTCGAGAAATAAAACCGAACAAAAAGTGGTCATGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAA:1	-	chr3L	16760260	5'	-	Tirant	316	2	56.16
CTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	+	chr2R	19050215	5'	+	roo	89	2	77.40
GTGTGCGTGTGTGTTGTTTATTGATTTAATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTC:1	+	chrX	18214948	5'	-	1360	117	1	79.10
TTACTTTGACCACTGTTAATCCATGCTAAGGTAATCGTGGAATCACTCCAAGCATATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGA:1	-	chr3R	19446368	5'	-	roo	233	2	51.75
AATTTAACTCTGTTTCGAACCGCAGAAATAAACAACCGAATGACGATAATCACCACAAAAACACTTGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1	-	chr3R	12717860	5'	-	297	6957	2	70.54
TTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAA:1	-	chrX	2295966	5'	+	Tirant	59	2	75.22
GGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGATCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	+	chr4	419983	5'	+	roo	51	2	71.82
TCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr2R	20596456	5'	-	roo	354	2	57.55
ATGGGAAATTCTTAAAATATTCGCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGAGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1	-	chrX	2842626	5'	+	Tabor	23	2	74.66
TCCACGTCATGTGTTCTCAGGCAAATCGCAGTCTGAAGAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGATCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACC:1	-	chr3R	4357635	5'	+	Tc3	1684	1	69.18
GTCATCCTCCTGTTCTGCAAGACACAAATTGAAGTGGGAGGAAGGGGTATTGATTAGAACGCTCTGACTGATTGATTGCCCAAGAGGATCCGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAG:1	-	chr3R	21365996	5'	-	Quasimodo	7081	2	66.20
AAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1	-	chr2L	17079845	5'	+	jockey	4685	1	67.68
GTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3R	18339108	5'	-	roo	8988	2	73.97
CGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1	-	chr3R	20499831	5'	-	mdg3	166	2	69.86
AATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATCTTTT:1	-	chr3L	4605709	5'	+	pogo	51	1	61.90
CCCTGGCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAA:1	+	chr3R	12886905	5'	-	roo	333	2	67.59
TATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1	+	chr2L	22121344	5'	-	opus	461	2	51.06
AATAAGTTAACAAAAAGCGCAGCCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1	-	chr2L	10037455	5'	+	Quasimodo	18	2	71.92
AATTATTAAGAATATACAACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1	+	chr2L	12892613	5'	+	roo	8698	2	52.50
CTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAGATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1	+	chr3R	19450107	5'	+	roo	8669	2	76.56
AGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1	-	chr2L	16016401	5'	+	412	71	2	69.29
GGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1	-	chr2L	19965056	5'	+	Doc	78	1	63.01
GCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr2L	14772114	5'	+	roo	8743	2	71.23
AAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:1	-	chr2R	20194310	5'	+	Max-element	49	2	50.00
AATAAAAATATAATAATAAGATAAGATAATTAGAGATTACTTAAATAGTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1	-	chr3L	4969806	5'	-	P-element	2861	1	70.55
TAATGGAAATTTCCCGGAACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	+	chr2R	9091805	5'	-	1360	3370	1	68.75
AGACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTTTTTACTTAAAGCAAAATTGGTTAATACTTTTTTTAATAATAAATTATGACAAATTAATAAAAAATATACACTCCCTCAGCGTC:1	-	chr3R	3736167	5'	-	Tc1-2	1349	1	60.27
GGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCAC:1	-	chr2L	21008606	5'	-	invader3	209	2	72.80
CTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr2L	14772119	5'	+	roo	18	2	55.56
ATTAAAAGCCTAACACGAATTTGCAATTACTTGTAATCTGGATTAGAAGGCCATATGCTCCTTATGTGCTTAGTATTAGAATTAGAAGTTATACTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTT:1	+	chr2R	9325366	5'	+	BS	5001	1	64.80
GTCTGAGTGCGTATACTTGATATGCTTTAAGAATGGCTTTAGCTTTGACTTTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGAT:1	-	chr3R	26615179	5'	+	gypsy12	30	2	52.43
TTGATATGATAACAAGTTCATTATTATGTTAAAAATGTATTTAATAATGTCATTTGCATTTATCGCGCATTTTATTAACGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAG:1	-	chr2R	11629332	5'	-	Tirant	341	2	71.72
AGCCAAGAGAGGAAAGTATGCAATATAGAAGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	+	chr3L	13845105	5'	+	opus	7035	4	47.10
ACTCATATCTCACCCTCTCACAGACGCACATTTGCATGAATTTATTTATTTTATGTCTCCTCTATTATATGTTTTCGCCGTTTGCTTTTAGAGATTGGATGGTCATTAGATGGACCAATAACCATATGTGGCGA:1	+	chr3L	15280055	5'	+	Copia1_DM	4053	1	55.22
GCATGTTGAGCAGTTTATTCTGCGGCCTGAACATCACTGATTTGCATGTGCACGGCTTAAATCCCAGATTAAATTGCTGATAGTAGCGAGTTGCGAATTACGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1	-	chr3R	25826805	5'	+	mdg1	7057	2	71.33
ACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATTGTT:1	+	chr3L	19487636	5'	-	Stalker4	421	2	77.27
TCTCAATAAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1	-	chr2L	11518506	5'	+	412	30	2	58.96
AAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATT:1	+	chr3R	4160064	5'	-	invader2	196	2	55.40
CGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATCAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATGTT:1	-	chr3R	7835195	5'	+	roo	8745	2	71.23
AATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1	-	chr3L	10574396	5'	+	Tabor	43	2	47.26
CTCCTGTCCTCATTAAGGCGTCTCAAACGTACTGTTTATGCACCGCGAACTGTGTGCCTCCGCCCATTGGTATCCATCCACTCGGAAAGGGCACCCTCCTTTGTTATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACG:1	-	chr3L	22602460	5'	+	Bica	243	2	75.00
ATGGGTTAAAAAATGTGCACAAAAAATTTAATTAAATTGAAATGTAAAACAATTTTCCATTGAAAACCTCGTTCTGCATTTGTTTTCCTACTGCTCGCCCTTTGCAGCTTGGCAACGGGTTTTTATTTTTTATTTTTTTTTTG:1	-	chrX	4878811	5'	-	G2	3077	7	72.73
TGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1	+	chr3L	11957117	5'	+	blood	59	2	60.27
GGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGCCGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGGGTT:1	+	chr3R	17817878	5'	-	roo	392	2	62.96
TTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1	+	chr3L	11393501	5'	+	roo	8749	2	80.14
TGTTGTTACTGCTGGTACTGGTACCACACGGCGTATGGGTGATGGCGAGCGGGCCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTAGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACC:1	-	chr2L	9564540	5'	-	transib2	2758	1	61.64
GGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTC:1	+	chr2R	5209614	5'	+	gypsy	7053	2	67.18
CCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGCA:1	+	chrX	6499877	5'	-	Quasimodo	210	2	62.18
AAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCC:1	+	chr2R	18336117	5'	+	roo	29	2	61.97
GCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1	+	chr2R	20496895	5'	+	blood	41	2	53.96
AAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTT:2	-	chr3L	27415319	5'	+	transib2	57	1	56.16
AATGTCAGGCTCAGATGATCAAGCAATCAACAAGCGAAGGAGGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chr3L	15600186	5'	+	roo	8683	2	48.42
AAGCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATT:1	-	chr2R	9463516	5'	+	rover	4	2	75.93
ATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCA:1	+	chr3R	9714361	5'	+	Stalker4	6998	4	56.85
CTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:2	+	chr2R	20496872	5'	+	blood	7036	2	65.75
CTGAATGAACGCGATAAGGATCTAGTCAATAGTGCAATTTAAATAAATTTTCACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAG:1	-	chr3L	17685242	5'	-	mdg3	247	1	52.73
GTCAACATTTTTTCCCTTCTTATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1	+	chr3L	17557985	5'	-	jockey	4976	1	61.42
GAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1	-	chr3R	15072675	5'	-	pogo	2070	1	58.59
GTTATGGCCGATGGTTGGGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1	-	chr3R	27424956	5'	+	blood	38	2	59.20
ATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	-	chr3R	28624634	5'	+	roo	8750	2	80.14
ATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1	-	chr2R	20194282	5'	+	Max-element	53	2	62.50
CTCCCAGACGCTAAGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chrX	13039457	5'	-	roo	9015	2	56.85
AGAAACAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	-	chr3R	25448447	5'	+	roo	8715	2	54.79
CCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1	-	chr3R	14940150	5'	+	jockey	76	1	75.83
CTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1	+	chrX	7256109	5'	+	412	53	2	57.66
GGAGTCTTATATTATTTCCACATTTTTCTGGGATATATCGGCAGATATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCGTGTCTTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAATAGCTTTATTGAAATAGCTTTAATTAAATAGCTTTAATTTAGCCCCGT:1	+	chrX	22518822	5'	+	mariner2	224	1	50.00
CCTTGACCCCTGATTCCTGGGCTAACCTTCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATA:1	-	chr2L	2122528	5'	+	Stalker	6861	4	73.19
ATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1	+	chr2R	20496903	5'	+	blood	7067	2	56.85
AATCAATAGACACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1	+	chrX	17756559	5'	+	297	6597	2	64.41
ATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr2R	9328589	5'	+	roo	8681	2	64.81
AGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATAC:1	+	chr2L	21008553	5'	+	invader3	30	2	56.84
CATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAAAACCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATTCAATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGTAGC:1	+	chr2L	23069852	5'	+	Stalker	200	4	81.15
ACTCCCGCTGCTTTGGCTACTGCTGAAAAGCAGACAAACGTGGGGGGTTTTTAAATGTCAGCCGTTTGCAGTTGAGTTCACGGTCTTTCCGCTTTACCCTGCACCGCG:1	+	chr2R	9924376	5'	-	gypsy8	4708	2	68.52
AGGAAATAATCATAATAATTAATAATCAAATTTTATGTGTAACTGTATTATTTACAGTTCTACAACAGAAATATAATTTTGATCTTTAATTACTGGTTTTAAGGTTTTTAGTTTTGGCGTATACAAAATGTTTATTTATTTTTATT:1	-	chr2L	12389157	5'	-	mariner2	830	1	80.14
CTAACTTGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCATCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chr2R	13710651	5'	-	roo	8984	2	75.86
TTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chrX	9540029	5'	+	roo	8742	2	74.66
TTTTTCTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3R	17817863	5'	-	roo	9053	2	69.60
GAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	-	chr3L	15177298	5'	-	roo	347	2	66.17
ACGTCATGTGTTCTCAGGCAAATCGCAGTCTGAAGAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGATCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAA:1	-	chr3R	4357632	5'	+	Tc3	1687	1	69.86
GTTAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGCGTGCGGGAGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1	+	chr3R	12598469	5'	+	hobo	72	1	67.81
GTCACTGCCCGCACACAGACAGATGTTGACACAGTTTCCTTGAGCTCCGTCTGAGCTCAGCACAAAATGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1	+	chr2R	9662692	5'	-	412	7517	2	56.91
ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTAACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCGATC:1	-	chr2R	17373248	5'	+	gypsy6	17	2	66.67
GAGAAAAACCTTTCGCTGGAGGTTCTATACACAAAGAGAAAACTATTGCAATCCATAAGATTCGAAAATATCTTGTATATATGCCTTGTATATGCCTTGTATATCTACCAGTTTAAATTTAATTGATCACCTCGCGGAGCGATT:1	+	chr3L	12435976	5'	+	BS3	90	1	52.08
GAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATTTTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCCT:1	+	chr2R	5039339	5'	-	gypsy11	307	2	59.59
AGAATATAAAACATCTGGTAGAGTTGGCTTTATTTAAGCTGTAGTTTAAATGTTTTGCTTGCAATATTGAGCAGTTTTGTGCAGCAGCTGGTTGATGCAACTGAAAAGGGGGACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAAC:1	+	chr3L	3554768	5'	-	FB	354	1	77.93
GGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1	-	chr3L	10848721	5'	-	blood	7333	1	69.17
GTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chr2L	7898379	5'	-	roo	351	2	61.83
AAGATTAAAGATTGAGATTAGGCATGCAGATTTTATTTCAATGTTTTGCTTATTTATTTAATCTTCCCTTTTTCTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCAAATCTTATTCTAAACTAACTAAATATCATTTT:1	+	chr3R	1549270	5'	-	Doc3-element	4642	1	70.23
CCAGGATTGGGGCGATGTCCGTCCCACCACGCCCCCTCAATCACTGTTAATGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chr2L	11679916	5'	-	accord	7034	2	87.88
GAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCC:1	+	chr3R	27994176	5'	+	roo	8693	2	55.93
ACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chr2R	18336131	5'	+	roo	8709	2	52.78
CATAGAGGGGTTGGGTTCCTTCGTCGGGATTGCTGCGCAGATTAATGCTGCATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1	+	chr3R	10273948	5'	-	HMS-Beagle	218	2	55.24
GAGGCGACAGTGGACGCATCCCATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1	-	chr3R	22844315	5'	-	roo	395	1	71.54
AGGTGGGATAAAAACTTAATTTAAAATATATAAGTATTAACACTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTAAAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr3L	21162038	5'	-	roo	345	2	65.65
TTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAA:1	-	chrX	21564723	5'	+	diver	5923	2	72.73
GATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1	-	chr3L	20831405	5'	+	roo	8698	2	62.33
TATACAACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	+	chr2L	12892625	5'	+	roo	8723	2	65.41
TCTCACAAATTGTCGAAACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1	-	chr3R	20499893	5'	-	mdg3	238	2	76.64
CATTTGCCGGCATGTCATCCCACTTAAACTCATAGTCCATTCCTCAAAAGCATGGCCCTAGTGGCCCCTTTGGTACCCTATGTCCGATGAAACATCAGCCGAGTTCAGTATTTAAGTTTTTAGAAATTAATTTTTTT:1	-	chrX	19602895	5'	-	gypsy12	9807	2	59.85
GGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATA:1	-	chr3R	19446205	5'	-	roo	61	2	78.77
GAATTTTCCATGTGGCGAAATTGTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTCT:1	-	chr2L	21580591	5'	-	INE-1	172	1	58.22
AGTAGGCTGTCCTGTCCACCACTGGTGCCATCTCATTTCTGCGTGCACGTGCTAAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGT:1	+	chr2R	19503999	5'	+	P-element	62	1	37.67
AGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGC:1	-	chr2R	13006509	5'	+	3S18	5826	2	60.74
TCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	-	chr2L	14772120	5'	+	roo	8731	2	65.71
AAAACTGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGC:1	-	chr3R	11547835	5'	+	G2	281	1	80.14
TTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATG:1	+	chr3L	11441718	5'	+	roo	8707	2	53.62
GCGAAACGAGGTCATTAAATGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAG:1	-	chr3R	13349181	5'	+	BS	4996	1	78.83
ACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGAACACAGCAACACTTAGTTGCA:1	-	chr3R	10182199	5'	+	blood	42	2	57.66
AGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chrX	23362222	5'	+	roo	8681	2	72.18
AATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	-	chr3L	10292886	5'	+	roo	8732	2	69.34
ACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGC:1	+	chr2L	21325094	5'	-	invader4	3040	2	74.22
GCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr3R	18582224	5'	+	roo	8709	2	70.09
GTGCTGAAATCAAATTACTGGGCGAGATTTTAAGCATGATTGCACACCTGTGAGGGCAGTATCTGTATCTGAGTTAGAGGTGGCAATTCAATTTATCACGAGCTTCAGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTC:1	+	chr3L	16298976	5'	+	Burdock	6085	1	78.57
GGCGCGTGCTAAAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGGTTTTATTATTTGATCAA:1	-	chr2L	15833537	5'	-	jockey	4984	1	58.82
GAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAA:2	-	chr3L	10574379	5'	+	Tabor	6899	2	56.16
CAAAACATTAAATAAAACCGAACAACTTTATGCCACAAATAAAAAGGAATTGTTGGCAATAGTCTGGGCTCTTAAAAATCTCAGGAATTACTTATATGGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1	+	chrY	3572698	5'	+	Max-element	8248	2	74.63
AAGAAATATTCCAATGCCTTGGATGATTTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1	+	chr2R	20944359	5'	-	pogo	2037	1	76.38
ATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTT:1	-	chrX	21564728	5'	+	diver	88	2	78.77
GTAGAGTAAAAGGGTGTACTAGCATGTAAGTATGTAACAGACAGAATGAAGCGTTTTCGACTGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTTGATATAGCCATGTCCGTCTGTCCCTATGAACGTCGAGAACT:1	-	chr3R	2473817	5'	+	INE-1	133	1	78.08
AATATTTAAAACTAAAATCAACATTATTTTAAAAATAAAAAAATCGACACTAAGAAGGAAGGAAGAGCTGAAGGCATACCGCGCAACAGTTAAATACAAAAAAAAAATGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1	+	chr4	1151230	5'	-	transib2	2770	1	77.37
GCGGGTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTTTTGGCTTGGCGAGCAGAGCATAAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCAAAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1	+	chr3L	17136043	5'	-	hopper2	1559	1	57.14
CATTACTGGCGACTCGGTCGCAACTCGGTAATTGAGGGTTCAGGAAACGGGACCCTGAAAGGACGCCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTG:1	+	chr2R	19890743	5'	-	Rt1b	4811	1	66.30
CAGACAAACAATCGCCTGAAAACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTAC:1	+	chr3R	14649834	5'	-	P-element	369	1	20.55
ATAAGTGCACACAATTTAATGCAATCAGAGCTTACAACTGATGATGACTTTAAATTCAAAGCGAATCGGAACTAAATCCGAGACCTCCTTCAGCTTCGATTATTCCATACCTCCGCGATCAAAA:1	-	chr2R	9636727	5'	+	R2-element	3568	1	77.42
TTTTGAATTAACAGACTTTATATAGTAGGGTATGAAGACATTAGTGCTCAAATATGTATCTTCAAAAGCGGTCCTAATATACCCTTTCTGTAGTTAAGTAGATACTACTCTTAAAAGCTGAATTTGGTTTTTGTATACAAATTAA:1	+	chr2L	2765876	5'	-	Transib5	296	1	57.24
GAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAATTTTTGCAGCTGAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTGTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTG:1	+	chr3L	25782382	5'	-	17.6	7353	2	64.38
ATGCGTATATAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1	-	chrX	14066879	5'	+	HMS-Beagle2	482	2	93.10
CAGAGCATCCGCACACAATTCCGGGCCGTTTGTACGTGCATCTAATTATAGGCTTATCGGGAGAGCGAG:1	+	chrX	13504415	5'	-	412	246	2	73.91
CACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr3L	16343283	5'	-	roo	9022	2	66.06
ATACTTCAGCATATCGCATTATATTATTGTCAACATATATCAAGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAA:1	+	chr2L	9906469	5'	+	invader3	5251	2	66.92
ACGAGCACGGAATGTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1	+	chr3R	14981127	5'	-	mdg1	403	2	67.44
ATTTTTTGCGAACAGTTGTCCCATTTGCATAGGTTGGGGACACACATTGGTACCAATCAATTAATACGAATACCTCACACATGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAGAACCCACCAACACTACCCA:1	-	chr3R	2974654	5'	+	I-element	4967	1	67.59
TTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1	+	chr3R	21705976	5'	+	297	58	2	58.90
CAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	+	chr3L	14603266	5'	+	jockey	70	1	59.72
CTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1	-	chrX	22511410	5'	-	1360	3333	1	71.11
GGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATCTTTTTGTGTG:1	-	chr3L	4605719	5'	+	pogo	57	1	61.27
GTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAG:1	-	chr2R	6271499	5'	-	blood	148	2	60.84
CCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1	-	chr3R	25454117	5'	+	Quasimodo	32	2	47.76
AAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTTATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTG:1	-	chr2L	2436615	5'	+	invader1	24	2	55.48
CATAAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGATTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCAC:1	-	chr3L	3924264	5'	+	G6	73	1	75.83
AATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGATT:1	-	chr2R	4886045	5'	-	INE-1	576	1	53.42
TATATTTTAAAAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1	-	chr2L	6863378	5'	+	pogo	71	1	67.81
AGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAAGCG:1	+	chr3L	4840747	5'	+	jockey	4737	1	69.05
CTGTGCCACAGTCACAGCGACGGCGAGTTTCCACTGTATCGAGGTGAGTCCGCAAGCGGGTGCCCACTGTAACGTAGTGCGTTCCCAGGTGGATCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1	-	chr3L	3799907	5'	-	copia	252	1	77.87
AGGCAAGACCGTGGCGTGTCGTAAGAGTCAGTGGAGTCAGTGGACGGTACCGTTAATTCACGGTCTCTCCGCTTTGCCCTGCACCGCGGCTAT:1	-	chr2L	23191452	5'	-	gypsy8	52	2	56.99
TATAATTATTACAAAAAAAAAAATAATTATCATTTAAGAATTTTTTGTTGCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	+	chr3L	24407255	5'	-	roo	9050	2	38.19
AAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGC:1	+	chr3L	25482894	5'	+	accord	23	2	56.00
CGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTA:1	+	chrX	13504155	5'	+	412	67	2	62.33
GTATAGGTAATGCATTATTATTAATAGTACGATATGTTCCACTCAATAAAATCTCTTTGAAATGACAGCAATATAATATATATGCGAATAATGTTACATAGCATATTAGTTGATGTAATATATATGTATATACA:1	-	chrX	7850399	5'	+	Dm88	4375	2	48.51
TGCATTTACTTAGCTAAGCATACATTTTTAGTTAGCTTAGCAAAAGCGTGAGTTTGATTTACAATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3L	11530837	5'	+	roo	20	2	71.92
CATCGCATTTGTCCAAGGGCTGCAAGGAATTGATTGGCGGGGTGAGTTGGAAGATGTTTCCTTTGAGATCCATTTATTGAACAGGGATTTCAATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCG:1	-	chr2L	10857090	5'	-	blood	7172	2	72.44
CAGTCGTCAATTATTTATATATCGCTAATTTTTTTATTTGTGATATAGAATGCTGAGCTTAGCTTGCTTTGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATATTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCAGTG:1	-	chr2R	4402684	5'	-	1360	453	1	47.22
GACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTT:1	-	chrX	8543510	5'	-	roo	9016	2	70.27
CAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAGATTAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGACGTTAAGCTGAAATTTACTACATTAAGTTGAGTGAAAATA:1	+	chr2R	545171	5'	+	Bari1	1462	1	52.05
ATTTATAGAAGATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	+	chr3L	15177217	5'	+	roo	31	2	52.73
TGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCG:1	-	chr2R	5173515	5'	+	gypsy	72	2	64.38
TGGACGGATGATAATCATGGATGATATTTACGGATTATTAGAGTGAAAATCATTTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTAT:1	-	chr3L	19521856	5'	-	I-element	5288	1	63.70
GACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr3R	25448404	5'	+	roo	8723	2	79.28
AAATGTCAGTTTAAATTGCCATTAACATTTATTTCTCGTTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGC:1	+	chr2L	586024	5'	-	FB	62	1	70.08
AAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1	-	chr2L	18404589	5'	+	hobo	29	1	58.89
CTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chrX	18193636	5'	+	jockey	27	1	64.29
GCCGAAGCAGCCCCCACCGTAGTTTCAACTTCATATGCAAAGCCAAATAACATACACACTCACACAAGATTGATTTATATATCACATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGTCGAAC:1	-	chr2R	4576729	5'	+	Chouto	5948	1	51.59
ATAAATAGTTTTCTCTTGTTTTCAGACATTTTAACAACAGCAAAAACCCATTTTCGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chrX	6486645	5'	+	roo	8677	2	41.78
GTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGGTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1	-	chrX	21016818	5'	-	Transpac	273	2	74.16
TTGCATTTACGGAGCTGCATACGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1	+	chr2L	18404553	5'	-	hobo	2912	1	72.97
CAATCTCGAGTATTTTGTTTACCATTCTTACCTTTTTGGTGGTTTTCCCTGTGGGAATTGTTGCACAAACCAATCGATCAGAAATTGATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAA:1	+	chr2R	16950121	5'	-	jockey	4809	1	64.44
TAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chr2R	7898171	5'	-	roo	9013	2	62.07
ATCTTCAAGCAATTAAAATATGTTACACGTCTGGTGGGAGTAAGATAGAAAAATTTCAATAGAATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1	-	chr3L	21361	5'	+	Quasimodo	60	2	56.85
CGTGTGTAATAAGGACCTGGCTGAAAAAACATATACGTGCGCCATAAAGTCCTTAGCGATTGAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr2L	12153177	5'	-	roo	9016	2	56.85
GTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGC:1	+	chr2L	15833007	5'	-	hobo	2925	1	54.76
GCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1	-	chrX	13066589	5'	+	jockey	66	1	59.29
CTCAAACTGAAAATAAACAAATTCAATGCAATCCCATCATACTAACAAATTTAACATGTTTAACCTTACACAAGTTTTAGTTTTAGCACATGAGTGGATCACTCATGGGTGCTGATCAGCCG:1	-	chr3L	23974283	5'	-	Quasimodo	252	2	74.59
ATGCTGATGACAACAGCATCAGCAGTTACAACCGTAGCCGGAATGATGAGTTATGAGTCGAGTGCTGCGCTGAAGACACCGTCAGGATTGACGAAGCGGGTAGTGCAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAAC:1	+	chr2R	1247390	5'	+	baggins	5417	1	76.60
AAACCAATCATAAATTTAAGTCTTTTATTTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGGTTTTATCGTGCTC:1	-	chrX	6522107	5'	+	F-element	31	1	69.18
GTTTAAGTTTCCGCAGTGATTAAGAACAAGTTTTTAAGTGCTGCAAAAAAGAAATCAAATAATTCATAAATAAATAAATAAAGAATAAAGTGGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1	+	chr3L	17685088	5'	+	mdg3	17	2	45.52
GATGTGCTAATAATTTTAACTCCCACCTATTTTCCAGTGCTATTGGCCACTTCACCGTGACGATGTCGAAGACATCTAAACAAAAATTTGGTGCTTGAGTATTTGTTTTATTTTGTAATCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTTT:1	-	chrX	14776367	5'	+	Circe	318	1	79.45
TTCAGTCGGAATTCTCGTTCTCATCGCCCAAAAACGCGCGCAGAAAGTTGTCGTAGCTGCTGGAGATCATAAAATGACTTTTTATTCACCATCATTATTATTATTTTGTTTTTTTTTT:1	-	chr2L	6987710	5'	-	gypsy11	3934	3	61.02
TCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGGGTTATCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCAACCTTTTTATTTGCTCTTTTCTCTTCGAGTAGCAGAAA:1	+	chr2R	5485136	5'	-	blood	7302	2	71.23
TAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTA:1	-	chr2R	5531216	5'	+	1360	52	1	76.85
GGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATAT:1	+	chr3R	9714406	5'	+	Stalker4	87	4	76.03
GTGCGTCGAACTTAAAAAGTGGCAAGTGTTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chrX	14336555	5'	+	roo	8680	2	74.66
GTCATCAATCACTGGCTTTTGATTGAAGATAATCGACTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAACCAAATAAATAATA:1	+	chr2R	19543494	5'	+	jockey	4822	1	73.97
AAAACTACAAAAAATCCACAATGCGAGCAAACAGAAAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1	-	chrX	18030354	5'	+	opus	156	4	58.46
TCCATTACTACATATACTATGGATGGGGACAAATATCCTGAAAATAGCTTTCAAAGAGCATTGCATACTTTTCAGATATATATTTAAAGGATGGTAGAGTGAA:1	-	chr2L	15354910	5'	+	invader2	338	1	83.50
TTCACATAAGTTTAGGTTCTATTAAGTCAAATGACTTAATGCATAAGCATACGTGTGCACACATACAATTGTCTGCTATCACTGTATACGTAGAAAAGAGCTATTCGCTGTAGCGCTCTCCACTCTCTCGCTCTC:1	+	chrX	18132074	5'	-	1360	107	1	71.11
TACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1	-	chr2R	21920568	5'	+	jockey	67	1	73.39
AGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chr3L	15177311	5'	-	roo	9037	1	52.50
GAAAAGCAGCGAGATCGCCGAAGGAGTTATAAAACATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACGTA:1	-	chr2R	4294599	5'	+	McClintock	82	2	76.03
GGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAAC:1	+	chr2L	13585847	5'	+	Tabor	58	2	65.60
GTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTA:1	+	chr3R	25423206	5'	+	3S18	5834	2	62.33
TATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1	-	chr3R	30344689	5'	+	pogo	19	1	61.84
ATTTTCTATCAGTGGAGTAGAGCAAGAAATGCGTGGAGAATCACTAGGGACGGTCTGTAATTGCAACGACCCTTTGACACATTTATTGCATTTCTTGCTCTACTCCACTGATAGAAAATAAACATAAATTTTTAAGGAAAAATCAG:1	+	chr2L	12269483	5'	+	TART-A	13349	1	73.97
ACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1	-	chr2L	6623057	5'	+	Burdock	6178	2	56.85
GTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	+	chr2R	16945289	5'	+	jockey	75	1	63.01
AGGCACCCACAAGTACCGTCCCGGAAGACATTTGCGATCCTAAAGGGGTTTTAATCATAATTCAGTTTCAATTCCACTTAAATTTACCAAGCAGTGGTCTACGAAACAAACACAAAACACAACAACAAA:1	+	chr2L	70075	5'	+	TART-C	184	2	48.06
GAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	-	chr2L	5254364	5'	+	roo	68	2	65.75
AAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAGACA:1	-	chr3R	11547759	5'	+	G2	354	1	70.63
GCATCTATGAAACTTTTCCCCGATTCCAACCCACATACCATTTACCGCCTTACCATGGCCATAATCGTGATGATATGGCTGCATATACATGCTGCAAGTGGCGCGCATCCAGCGCCCGCAACATG:1	-	chrX	11257041	5'	+	HeT-A	5652	1	58.40
TATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATA:1	-	chr3L	19014021	5'	+	invader3	5235	2	51.75
AGCACGGTGCACTGCACGAAAAGGTTGAGTCGGTAGGCAAAACAAAACTACTGGCTAAGCCCAAGTCCATTAATCCGCCTTAAAGGACCAAATAGTTCATTCAGTTCCATCAGCTATAGCTTTTTCATTAATATTATTATTATTAT:1	-	chr3R	13671929	5'	-	mdg1	38	2	79.45
AATCGAGACAGATCAAATCAGAAACGTAACATAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAA:1	-	chr2L	7808976	5'	-	P-element	75	1	30.83
TTTGTGCAAGGCCCTTATGGTAAATTGAAATATCTTAGGTATAGCCTAATTATAGTGCATAATTGATCAATTTTTTAATTAAGCTATTCCTAATGACGTAGGACCAAATACATTAGAATAAAAAGATGCGTGACGGCCATACATTG:1	+	chr3L	22722113	5'	-	1360	3368	1	63.70
TTTTTTCTGCTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1	+	chrX	7256100	5'	+	412	53	2	54.11
GCAATTAGATGGTGAGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1	+	chr3R	30344601	5'	-	pogo	2069	1	57.36
AGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGGTTATG:1	-	chr3L	10647968	5'	+	412	7122	2	83.33
CAATATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTA:1	-	chr3L	3477513	5'	-	mdg1	357	2	65.75
ATGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCC:1	-	chr2L	21403564	5'	+	G5	4420	1	50.00
TTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGA:1	-	chrX	21667906	5'	+	gypsy2	6555	2	78.76
ATCAGTGAAAAGTCTCTGTACTTAGCCTAATAAAAGTTATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1	-	chr2L	22775623	5'	-	pogo	2085	1	73.29
TGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAACTGTCTCACGTG:1	+	chr3L	10848652	5'	+	blood	7077	2	60.71
GAAAATATCACTTATTGCTAATTTGTTTATATTATTTCGGAGCGAGATCGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1	-	chr3L	25482978	5'	-	accord	7345	2	57.89
AGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1	-	chr3R	25454132	5'	+	Quasimodo	21	2	55.07
CTTGGTCAGGACACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1	-	chr2L	2703599	5'	+	hobo	41	1	55.71
GGACCCTTTTCACACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	+	chr3R	25448304	5'	-	roo	401	1	76.80
TATGTGTGTAATGTAAAGATTCTTGGCATTACAAATAATTAGTTGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCC:1	+	chr2L	19965367	5'	-	Doc	482	1	60.00
ATGGAATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1	-	chr2R	20497049	5'	-	blood	7374	2	65.00
CACAGTATCGAGTTGTCTAGATGGCTAGAAGTTATGCTTCTATGTCTTCGATGATAAAGATAGTTAAGTGAACTTGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAG:1	-	chr3R	11104885	5'	-	Doc	267	1	52.74
ATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	+	chr3R	7482722	5'	+	412	7100	2	51.72
TGAAGCTGAAGCTCTGGCCAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1	-	chr3R	10182226	5'	+	blood	31	2	59.84
CGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chrX	2444336	5'	+	roo	28	2	57.48
AGGGGTTGTGAACGAGATGAAATCGATGCGTCAAACTAAAGGGGCTTGTTAGGACTGAATAACAGTTTTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1	-	chr2R	12912612	5'	-	1360	3344	1	54.01
CCCAGGACCCGCCAACCGGAAGGGGCGTGGCAAGCGGAAGGGGGCGTGTACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1	-	chr3L	12308407	5'	-	hopper	1375	1	54.70
TATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr2R	20596528	5'	+	roo	61	2	78.81
GAACTTATTTTAAATTATGTATGTTTTATACGGTAAAAAATTATTTGGTATTGTGCCAGATGGAAATGAAATTATTACTTGGTCGAGCAAACTATTAATTTCATTTTATTTTGAAACA:1	-	chr2R	9260223	5'	-	NOF	3954	1	61.86
CTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTATGGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	+	chr3R	19450107	5'	+	roo	4	2	78.74
ATGGTGTGAGACAAGACATAGGATTATCGATATGTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGCGCGGACGT:1	-	chr2L	22685247	5'	+	Ivk	13	1	76.71
TACCTCGTAACAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1	+	chr2L	22699405	5'	-	INE-1	577	1	78.10
TTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	-	chr3L	11393607	5'	-	roo	9039	1	57.53
CTTCATGTCAGTTCAGTGCATTTATTAACAACATAAAGTGCCAAATCACGACAGGTGCCAAAATCTCGTTAAAGAAAAAAAAAAACTGAAATAAACTTTTGCCAGCTAAAATATAGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACCCGTTA:1	-	chr3L	4630592	5'	-	INE-1	552	1	69.18
TTGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGGTCCGTTTGAAT:1	-	chr3L	2362395	5'	-	Stalker2	7602	2	70.64
AATCATAAATTGTGTGTAGAGAAACTAACTAACTAACAAGATGCAGCTAGTTATTAGATCTAACAACGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	-	chr3R	21435016	5'	-	412	480	2	75.18
AAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATTTCTGATGTAGTTAATAATCTCTCATAACGCAGTTGGTCATTGTATC:1	-	chr3L	22968430	5'	-	mdg1	372	2	45.86
AATACTAAGTTTAAATTTGATGTGCTGCAGAAGGTAGCGTTTGAACAGTTAAAAGTAGCATTAACTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1	-	chr3L	23866740	5'	+	copia	56	2	61.64
CAGCTGCTGTTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	-	chr2R	14388046	5'	+	roo	8693	2	62.86
TTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	-	chr2L	18419263	5'	+	412	37	2	53.85
GGCTGGGGACTGGGCGCGTGCTAAAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCG:1	-	chr2L	15833549	5'	-	jockey	4966	1	53.79
ATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGT:1	+	chr3R	18717468	5'	+	Cr1a	218	1	81.62
TTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2L	544763	5'	+	412	7095	2	51.85
GTTATGTAACACTTAAGCCCAATATTATACTATGTGTGCGTAGTAGATAGATTTTTGGGACCGAAATCAATTTTGATCTAAGAAACGAATTTACAAATTTGGGGTTTAGGGAAATTTCGTCATTTTTCTGGGATATCGATAGATAT:1	-	chrX	20782034	5'	-	INE-1	498	1	76.71
GGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1	-	chr3R	17243246	5'	-	hopper	1387	1	63.45
AAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCTAGACT:1	-	chr2R	4774752	5'	-	baggins	5341	1	58.22
AATTTATTTTACTACTGGAAATTTTGAATACGCGTCAATAAGTTAAGAAAACAAGATTTTGCGCTTCGCTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1	+	chr3L	26540652	5'	+	F-element	62	1	54.11
GCTGCGCTTTTGTGTTGCATGTGTGAGAGACAAATGGCACATAGACACACACATTGTATTTGCCGCTCTGCCAAGTAATAATAAAAATAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCG:1	+	chr3L	4880882	5'	-	jockey	228	1	68.00
AAACAGGAAAACAGGACAATCCAAGGGGATTGGAAACGAGNGTTGACAATATCCTGCTTAGTTTGAAATTAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAAT:1	+	chr3L	19937888	5'	+	Stalker4	369	2	61.74
AGAATGGCTTTAGCTTTGACTTTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGTGTCAGCTGTGACAC:1	-	chr3R	26615150	5'	+	gypsy12	50	2	76.60
TTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr3R	19968080	5'	-	roo	9054	2	66.67
GCTTATTTTGATATTTATGAGGTGTTTAGTGATTTTTATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGA:1	-	chr2L	12483865	5'	+	P-element	11	1	76.30
CTGCGAGGAGTGTTGAGATGAGATGAGAAGAAGAATAGGGATTGGAGAAGTCATTAACCCCACCAGAAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:1	-	chrX	5652454	5'	+	Quasimodo	3	2	50.00
TTGCAATCGAGAACAAGTGAAGTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGA:1	+	chr2L	2122382	5'	-	Stalker4	354	4	49.66
TTTAGCGTTCAAAGGTTTTCTTTAGTTGAGGTTAGACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1	+	chr2L	16091832	5'	-	roo	410	1	79.45
GAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1	+	chr3R	9921950	5'	+	blood	14	2	71.77
GATACCTTATAAATTTATTTATAAAATCACTACTCAAATACCAATTTGAAAATTCAAGCTTTTATAGTTCGGTCATACGGACATGTCCGGATATGCTAGTGATCCTGATCAAGAATATAT:1	-	chr2R	13259693	5'	-	INE-1	82	1	58.33
AGTGGCATTTGTCGCAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	+	chr3R	22844131	5'	+	roo	8673	2	75.34
GAGTGAGTTTTTATTCGTTGCAAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1	+	chr3L	22863360	5'	+	412	43	2	54.79
CAAGACAAGCAAAAAATACTTGTCCACATTAGTTTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATAT:1	+	chr3R	26686028	5'	-	Juan	4122	1	76.03
ACCGTCATACGGAGCAATTGATTATCGTCACACTTGGAACATTTTTGCACCTATGTTAATTGAACAAGAGTTTCCTAGATCCCAATAAGCATTATTAAATTACATTTTAATTAAAATGGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATG:1	+	chr3R	6111430	5'	-	R1A1-element	5024	1	79.72
GTTGCTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	+	chr2L	14771995	5'	-	roo	401	1	76.74
TATCGATTTAACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1	+	chr3L	1534511	5'	-	pogo	2064	1	51.54
GTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATT:1	+	chr2L	12290642	5'	+	1731	25	2	65.15
CGATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGT:1	+	chr2R	20194204	5'	-	Max-element	284	2	58.33
GATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr2L	17420251	5'	+	roo	45	2	56.59
GTTTGCTTACATGCCAACATTGGAGACACACTTCAACTTTACTGCATCTCAGCTGTGCAGCAATATCATCGTTATCTATAAGTGCTTTGACTAATTTTCTGAATTCTTCAATACTTTTAACCATTACTCTTACATGTCCATTACGT:1	+	chr3L	23704185	5'	-	G4	262	1	54.11
ATCGATTTTTAAGAATTTAACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTC:1	-	chr2L	22130798	5'	-	INE-1	580	1	45.38
CATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	9791565	5'	+	412	42	2	55.71
AGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1	-	chrX	2842577	5'	+	Tabor	72	2	66.44
CTATGTTATAGTATAATTTTTGGTTAAGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	+	chr3L	20831238	5'	-	roo	9050	2	71.23
AAGCTGATTTTGTATTCTACTCACTCAATTTGCAATATTTCAATGCCTTTTTGTAGTCCTTTAGCATCACGGCGGACAGGAACTGCAGGAGAATCGCTTTTTTGGGACTTTAATGTAATAATTTCTTTAATTTATAATTTATATTT:1	-	chr3R	14617012	5'	-	copia	253	1	65.75
AATTAATATAAAATGCCGGGTCTAAGCCAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGC:2	-	chr3R	29397535	5'	+	jockey	4610	1	52.74
GCTCAAATATCGGGCCACCTGGGTGTTAAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1	+	chrX	5629067	5'	-	jockey	4975	1	71.92
GTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATCAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1	+	chr3R	14981153	5'	-	mdg1	360	2	58.90
TTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAAT:1	+	chr2L	4412565	5'	+	Quasimodo	74	2	69.86
TCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr3R	7100912	5'	-	roo	357	2	51.37
CATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	+	chr2L	3114506	5'	-	roo	8994	2	77.44
AACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:2	+	chr3R	15072560	5'	+	pogo	62	1	63.01
AATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1	+	chr3L	23325978	5'	+	pogo	59	1	65.07
AGATAAATGTAAAAACCAAGTTACTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATAACATTAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGATTC:1	+	chr3R	19445562	5'	-	Q-element	116	2	97.18
TATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr3R	31817530	5'	-	roo	342	2	68.35
ATATTCCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1	-	chr3R	1433200	5'	-	mdg1	7376	2	72.60
TAACTCGCAGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTAC:1	+	chr2L	2916629	5'	+	hopper	151	15	77.14
AGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1	-	chr3L	10574404	5'	+	Tabor	26	2	56.20
CAGTGGCAGTGGCAACAGAATACTGAATACTGCACAATGGTGAATGGAATGAAACCGAAAGGAGCTGAATGGAACAGAACAGTCAATTAAGTTCTCACATGATTAGTGAGAGGTTCGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1	+	chr3R	18194738	5'	+	BS	5032	1	42.47
AGAATGGTGCCAAATTGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTCTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1	-	chr3L	10574430	5'	+	Tabor	6848	2	70.55
AAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCAATCGACGTC:1	-	chr2R	23332590	5'	-	invader4	3023	2	82.14
GTGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr3R	7835140	5'	-	roo	335	2	75.76
CCTGTTGGAAGCTTTGTTAATGTTAAGTTAACATGACCAGAATTCGGAAAATTTCGCAACGATCAGTAACCAGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1	-	chr2R	24561543	5'	-	P-element	2837	1	50.00
CTTTTAAACAATTTTTAATTTTGTTCTCATATTTTCCTCACAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTGAAGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAAATCACCAGGGTTCTAGCCAAAA:1	-	chr3L	24073175	5'	-	X-element	283	1	69.40
TAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:2	+	chr3R	28758299	5'	-	mdg1	358	2	60.96
CCGCTTCAGTTTTTTGGAGTTTTATTTTCTTTTTTCGACTGTCTGCTTTTATTCTCGTATTTTCCCCTTTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTT:1	+	chrX	3310467	5'	-	Doc2-element	237	2	71.72
GTCATCGTCACTCTATATTTTGGCAAGTTACCCATTATTTGCTGAGCTGTATTTTGTTTATACCTTGCACACGTTACACATATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACG:1	-	chr3R	19447181	5'	-	roo	307	2	55.48
ATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr2L	3114487	5'	-	roo	337	2	66.21
TCATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTATCAAGAGAGTACGCTATAGTCGACTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTG:1	+	chr2L	18177002	5'	-	INE-1	541	1	74.13
CTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACATACAGTAGTTATAATAATTTATATTGTTCTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCA:1	-	chr2L	6007627	5'	+	1360	471	1	68.49
GCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACC:1	+	chr3R	17478397	5'	-	copia	165	2	81.51
GCACATGTTGTATTAATTAAATCTTTATGGTCAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATATTTCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGTACTC:1	+	chr3L	3500893	5'	+	opus	17	2	67.39
TCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1	-	chr3L	17560405	5'	+	pogo	35	1	60.42
CCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTGCTACGCGTAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGTGAATAAAACTTTTTAAAAATTTTTATATTGTTCCAAAGTGTGGGCGTG:1	-	chrX	15903347	5'	-	INE-1	253	1	72.95
AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1	+	chr2R	2007459	5'	+	1360	39	1	52.00
TTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	+	chr3R	13360329	5'	+	jockey	75	1	71.67
GAAAAATCATGGCCATCTGGTCATCTGTTTGCCTCGAAAGGGAATTCAAATTATATCTTATATATTATAGATAAGATAAGAAAGGCAGCTTTCATATTTAAGTTCATCAAAAAATATATATCAGTAGTGAGTAAAATGAAGAAAAG:1	+	chr3R	13945864	5'	+	Tc1	1571	1	79.45
GGTGGAAGTCCTCCAGAAAACTGAAGCGGTCCAAGACATGGCTTGAATGTGTATATGACGGCGACGAAAATGCCACCAAATTTGATCTTGATAAAGAAGTAAAAT:1	+	chr2L	1727795	5'	+	P-element	2569	1	58.10
TTTTCATTTATATTAACCAATGAATGCAAATCTTCAGGTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGGTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACAGTAGCA:1	+	chrY	3630506	5'	-	HeT-A	5872	1	73.97
ATAATTAATTAGTTATGGCCGATGGTTGGGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1	-	chr3R	27424967	5'	+	blood	45	2	59.44
GTGCAAAAACATCTTGCTGAAGAGGGTAGTTTCGATATCGTGGCATGTTTAAAATGCATGTTTATACCATAACTTAATAGCTAGAAAATGAAGCTAAAAACTGCATTTTTGAAACTATAAGGTATAACCAAAGACCCTAGAATA:1	+	chr2L	14798733	5'	-	Tc3	316	1	79.17
CTATTCTTAATCATTTTGCAATTTAAAGAAAGCTTTCTATGGACGGATGATAATCATGGATGATATTTACGGATTATTAGAGTGAAAATCATTTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1	-	chr3L	19521895	5'	-	I-element	5328	1	64.83
CTTGTTTATTGAACTAATCAATTTGAGCTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chrX	2444342	5'	+	roo	8681	2	58.18
ATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAACCCTCAAGCTAGTCTTCGAGGCAATAAACAAGCACTC:1	-	chrX	23108309	5'	+	BS3	1458	1	62.28
CCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1	+	chr3R	7835094	5'	-	roo	9031	1	56.16
GAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	+	chrX	13504167	5'	+	412	66	2	67.67
TCATTTCAACAAAATGTTAAAAATTTACCAAGTTATTTGCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1	-	chr2L	4410115	5'	-	Quasimodo	192	2	67.41
CTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	15005080	5'	+	jockey	73	1	66.41
ATTTTCTTTTTTGCTTTGAATTGAAATGATTAAAATCGTACGCAGGGTTAAAACATAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGT:1	-	chr3R	3734936	5'	+	1360	3217	1	60.69
ATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:1	-	chr3L	20168431	5'	+	mdg3	5327	2	70.29
ATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTATCAAGAGAGTACGCTATAGTCGACTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCA:1	+	chr2L	18177004	5'	-	INE-1	548	1	66.42
GCAGGCGTGGGACGCAAATGTGTCCATGGAGCTCGGAGATGCGCTGCGGATGTTTATGTCTGGTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGG:1	-	chrX	21025482	5'	-	Quasimodo	414	2	60.20
TATTCGCATATCACTCGCATTCGCTTTCGCACTCGTCTCTCTAGTTTTATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGCGCGC:1	-	chrX	18386457	5'	+	invader4	2831	2	68.49
AAATTGTGTATATTGATGTAAATTTGTAGTTTCCGTTTCATTCATTAAAATTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAAACGCTATAATCGAGTTCACCGACTATCACATACCCATTACTCAGC:1	+	chr3R	17733212	5'	-	INE-1	546	1	69.66
CTAACTGGATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1	+	chr2R	20194198	5'	-	Max-element	8509	2	56.25
GCAAAGATTTAGTCGGACCAACGCCAAGTTTCTGGCCATAAACTTGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTT:1	+	chr3L	20893389	5'	-	1360	3140	1	69.18
TCCGGGCAACTGCCCGTCACATTTGTGGGCGTTATGGCGCCAAAGCAGAAGGCGAAGGTTGATATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATA:1	-	chr3L	3190433	5'	+	McClintock	6132	2	56.36
TAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1	-	chr3L	10574394	5'	+	Tabor	41	2	47.18
ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATTTTATACTATCCTCCGGTTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAG:1	-	chrX	10664377	5'	-	G5	4626	1	59.02
AAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCCTTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1	+	chrX	21016746	5'	+	Transpac	56	2	59.72
AGCCCAAATGGAACTTGCAGTTGAAAAATGGGGCTTGCAAAGCTAACAAATGAGGGAAGAGGACTGTTCATTTGCTTTAGGTATATATATATATAGAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1	-	chrX	17756715	5'	-	297	383	2	69.63
TTAGGCATTTGAAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	-	chr2R	18336268	5'	-	roo	9033	1	60.27
GAGTTGGCTGCTACCTAAATTAATGACTCTTAAAAAGGCTAAGAATTTGTATATACTCGAACATTTATTACATCCAACCTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGGCAGCGCAGCAAGT:1	+	chr2L	20129880	5'	-	invader4	277	2	62.12
AAACTGTTTTTTTTTCATACCACACTTAAATTGTTATTATAAAGAAAAATTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGAGTGTGCAAAACTGCAACGCCGATGACCAAATGCCTTAAATGCAAAGTCCATCTGTGCTGCAAGAA:1	-	chrX	3765117	5'	+	looper1	1600	1	61.43
GAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAACAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr2L	7945316	5'	-	roo	9051	2	60.95
AAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	+	chr2R	7898092	5'	+	roo	8748	2	81.51
GATTACTTATAATTAATAATGATTAATGAACGTATACGCCACTGTTACTATTTTCAGTTTTGAAGTACATATTTATTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGCATGCCACCTACGGACGG:1	+	chr2L	10134272	5'	+	Rt1b	5083	1	45.93
AAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCG:1	+	chr2R	2832927	5'	-	1360	3314	1	79.69
GATGACAACTTAAGTGAAAATTCTGCAATTATTATTTAAAAATTCCTAGGAAAAGGAATGAATCATTCGCTTCCATATATTTTGGAGATATTTTCACAG:1	-	chr3R	30314169	5'	-	Ivk	5233	1	90.91
CTAATTAGTACTATCTGTTTACTATACCAGCCTATCCAGTATTTATGTATGAGTATTATTTACTTAAACATACATCTAATAGAAGTACTTAAATTAAAAATAATATATGAATACACTAGGTTCCTACATGATAAAAATAAATAGAT:1	-	chr3L	4168316	5'	+	mariner2	825	1	69.86
AATACATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGT:1	+	chr3R	18339040	5'	-	roo	9056	1	71.92
GAAAAAGCAGTAAGCTCCAGCAGGAAAAAAAAAGAAGGCAAAATAAATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATA:1	+	chr3L	10385841	5'	-	Burdock	184	2	70.55
GGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr2L	3114514	5'	-	roo	345	2	80.00
ATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chrX	9540022	5'	+	roo	8735	2	69.86
AAATGTTTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1	+	chr2R	19726842	5'	+	1360	38	1	54.17
GGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr2R	18336161	5'	+	roo	8677	2	58.54
ATATTTAGCAAATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr2R	11164552	5'	+	roo	8678	2	76.03
ACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	-	chr3R	20427446	5'	+	jockey	73	1	74.80
AACGATTAAGCTTCTCTAAGCCCATAGCCAAGCACACGTGGCGGTACCTCGGCGAGCTGTCGTCCACGAAGGAGAAGAAACCCATCCATTATTATTAGAAATTTTCTATCGTTTTGCCAAGAAACTCCCTAAAATCGCCCAAAA:1	+	chr2L	22699160	5'	+	INE-1	344	1	56.94
AAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2L	11518499	5'	+	412	42	2	51.80
ATGTGTTACAGCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCG:1	-	chr2R	9328715	5'	-	roo	399	1	71.43
GAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1	+	chr2R	6919685	5'	+	hobo	75	1	73.48
TGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATGTTGTTATCTAA:1	+	chr2R	9328624	5'	+	roo	90	2	78.77
AATGGTTATATCATAAACATCAACATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	-	chr3L	11393632	5'	-	roo	401	1	73.97
AGGAAACAATCAATAAATGCAAAGGTTCATTCCATCAATTACAGTCTTAATATATTCGTAACATGTCGGCTCGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATA:1	-	chr2R	1533832	5'	+	invader4	129	2	53.91
AAGTTCTTCGAAACCAAATGAAATAGAAAACTCCAACTGAAGGCCAGCGAAATCTGAGCAATTGAATGACAATCACCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGAAGAACACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCA:1	+	chr3L	5228819	5'	+	Rt1b	5038	1	53.73
TTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chrX	9540029	5'	+	roo	28	2	65.62
TTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTATTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACGGAGTGAATTCTGTTCCGC:1	+	chr4	1294991	5'	-	HeT-A	6033	1	61.54
GTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr3R	7835133	5'	-	roo	347	2	69.29
GGGGTTGAACTACGCTTAATGTGTCATTGCCAACGGTTTTCAGACTGTTTTCACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chrX	8543409	5'	+	roo	8678	2	74.42
AATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	-	chrX	13039540	5'	+	roo	8747	2	77.40
ACGATTTATTGTTTGGTTTCTGCAATGTTTGCATATGAGCTGATTATGTCTGTGGGGAGTTTTCAAAAGGCATAACACACTCCCCCTTGCTGAGAAGCGAGATCTACCTAAAATCTC:1	-	chr2L	7119635	5'	-	R1A1-element	5111	1	65.81
TGTTTATTTTTTTTAAATGTATAATTTTTCCATTTGCCTGAATTCCTGTTTTTTGTCTTTTTTTTTTATTT:1	+	chrX	13846096	5'	-	F-element	4687	5	76.06
ATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAAT:1	-	chrX	7256181	5'	-	412	7457	2	78.08
TTTTCCTACTATGAATATTAAAACTTACTTACAGTTAGCTTAGAAACACTGCAAATATATCATTCTGAACAATTTTTACTCTACTGCATGCCTTTCCTTTTGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTCCTC:1	-	chr2L	2789804	5'	-	Burdock	6133	1	76.03
CTTTAGGATTTTCTTGAGCCTTCAAATATGTTAGGATAAAAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1	+	chr3R	1207488	5'	-	copia	5077	2	73.29
GTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACA:1	-	chr2L	19965032	5'	+	Doc	102	1	79.45
ATTTTTTCGTTATGTATTTAAAACTATTTCTAGTATTGCTCGTAATTGCCTTCCGTAGTTTCTTGTTCATTATATTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAG:1	-	chrX	21096947	5'	+	S-element	37	2	71.22
AAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGGTGATTTGAGTGAAGTG:1	+	chr2R	977516	5'	+	F-element	61	1	50.00
TAATAAGAATTAATAATATAAAATATACTTATAAGAAGGAATATCTATTGCGAGTTGCGAGTCTTCTCTTCTGCATCCGATTTGGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAG:1	-	chrY	385895	5'	+	hobo	341	1	45.24
GAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGCGCCTCTGGCGATGTGTGTATATATGTGTGTGTG:1	-	chrX	9023560	5'	-	accord	190	2	50.77
AAATATGAGGCACAAACGCTTTTATTGTGTTCTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1	-	chr3R	11083021	5'	-	412	467	2	44.06
GAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr3L	15600175	5'	+	roo	17	2	42.31
TAACGCATTTATTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCTAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1	+	chrX	7480750	5'	+	Doc2-element	231	2	64.86
ACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTG:1	-	chr3R	19450143	5'	-	roo	221	2	55.12
AATAAAATAACAAAATATACTGGTTTTACAATATTTTTGTAGAAGAACTCCAATCAGACAATATTCTTTGCTTAGGTTACCCTACGCGACAATGCATCGCGCCACCAAGACATGAGCGGCAAGCCGACTCAGCATTTCTTGCGGC:1	-	chr2R	2190401	5'	-	gypsy	7134	2	66.21
CGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr2R	19004236	5'	+	roo	56	2	58.62
GAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATCAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1	-	chr3L	12861802	5'	+	pogo	61	1	66.42
TCAACTCCCCTTTCCCGCAGGATAATTATGAGCTATGCATGGGGAATGGCGGGGCCACAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1	+	chr3L	20888698	5'	-	1360	3352	1	52.42
ATACAAAGTTATTCGATTTAAGCCCCGCCCACACTCTCATGAATAGAAGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	-	chr2L	23068958	5'	-	1360	3380	2	73.21
TAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1	-	chr3R	20427458	5'	+	jockey	84	1	70.55
ACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAG:1	-	chr3L	25995962	5'	-	Gypsy6A_LTR	360	1	76.14
GTTTGGTATTTACTCTCCTTGCTCATTGTGTAGTTAACCATTAATCTCGATCTTTGCTCGACTTTACTTGTAGGTTAAAGATAAAAACAATTCGGAAAATAGCAGAAGAAGCGTTTGTGCCTAGCACAAAATAAAAGAAAAAAAAA:1	+	chrX	16461790	5'	+	gypsy7	5004	1	63.70
TAACAAATGGATTTTCACTTGTTGCCCAGCCAGACGAATGAAGCCATCCACACACACAAATACACCAACACACACACATACTCAC:1	+	chrX	6205103	5'	+	accord	7100	2	67.06
CGATCCTGAAAATCTTCGCAAGAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1	-	chr3L	11321525	5'	+	mdg3	5292	2	54.79
TTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	-	chr2R	8585526	5'	+	roo	37	2	57.80
AGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1	+	chr3L	23603165	5'	+	F-element	84	1	65.52
TTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTGAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr2R	20596543	5'	+	roo	8737	2	67.59
GAAAAACGTAAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr3L	11441873	5'	-	roo	390	2	71.92
ATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1	-	chrX	3308359	5'	-	hobo	2913	1	64.94
GAGGAAACACTCGAGAACTCGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAA:1	-	chr2R	8145885	5'	+	P-element	180	1	20.00
CTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	-	chr2R	21920579	5'	+	jockey	73	1	68.79
GATAATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1	+	chr3R	5061805	5'	+	mdg3	30	2	65.52
AAAGTTAAACATAAATCCAAAAACATCGTAATTCAACATACATTTTTTGTATAATTCTGTCATTATACAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATTGTCCGAGTTACGGGGCTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTT:1	-	chr2R	17651800	5'	+	GATE	36	2	64.83
AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:33	-	chrX	23439059	5'	-	P-element	2495	1	60.27
TAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGANTTCGATTTTTTTGGCATAAAGCCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACTTTT:1	-	chr3R	14049394	5'	-	transib2	2770	1	72.28
GCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1	-	chr3L	25401027	5'	+	Doc	42	1	47.95
TAAAAAACTTTAGCATAAAAACGATGAAAAGTATGTAACAAGACAGAAGGAAGTGTTTCCGACTATATAAAGTATATATGTATATTCTTGACGAAATTTCACTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGCATCTGATAGTCGGG:1	+	chrX	21272965	5'	+	INE-1	552	1	70.55
GGACAAAGTTAGTGTAGATGAAGAAAGTATCACCTCTAATTCATCTGAGCCTTTAGTTTATTTCTAAGTTCTAGAGCAGAAAAACTGAATCCCCAATTAAAGGTAACACAGCTCGCAGTTATTTTAATAAAATTTTTAAACAATT:1	+	chrX	17032978	5'	+	Tc1-2	1547	1	44.83
GCAATGGCTAAATTTTATTAACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGGGGTCCAGTATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1	+	chr3L	27415168	5'	-	transib2	2809	1	75.34
AAAAGCTTTACTAATTAAAATATATGTTTTTTATATTATCGATTTAACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1	+	chr3L	1534474	5'	-	pogo	2090	1	70.00
AGGGTTGCTAAAAATAGATTATAGTATTTCAAAAGCATAATTTTAATGGGTTATTAATGGCTTTAAATGCCTTGATCTCCATACAACTAAAATGGCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATT:1	+	chr3R	24615681	5'	+	roo	396	1	63.70
ACAATATACGTAATACAATAATAAAATAATAATTAATTAGTTGCATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACA:1	-	chr2L	22575678	5'	-	Quasimodo	7295	2	76.03
ATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chr3L	14603224	5'	+	jockey	27	1	68.75
AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTGTGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439059	5'	-	P-element	2495	1	60.27
AAATTTTTCGAATAGATATTTTTAGTTTTATTCCGCCGATTTCGTTGCTTTGGAAAGTTGGCGGGTCTGTGTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	+	chr3R	22122663	5'	-	roo	9036	1	60.96
AAAAAGAAATTCTAGCATAAATGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1	+	chr3R	22955944	5'	-	roo	9029	1	51.88
TTTTGATAGAGAATGGAATGTGTGTGCTTTCTGAGGAGCATGGCGAAATGCTTTCAGTTTCTACGAACCACTTGGCTTGGGGGTGCCGAGACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAAT:1	+	chr3R	8354003	5'	+	jockey	286	1	62.76
CTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCATAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	-	chrX	13066588	5'	+	jockey	73	1	60.27
TAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCAC:1	+	chr3R	27424857	5'	-	blood	7338	1	64.41
AAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chrX	10640037	5'	-	roo	355	2	66.67
GTTCCTTCGTCGGGATTGCTGCGCAGATTAATGCTGCATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1	+	chr3R	10273962	5'	-	HMS-Beagle	163	2	77.40
ACTAATAATTTATTTCCGTACATCGGATGTTCGAACTCAGAGTTTGTATAGAAATTGTATGGGGAAGTGCAGCGGGTTTCATACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGTGTATGAAAAGAGGGTGCGGAAGCATATCTTCC:1	+	chr3L	18975521	5'	+	mariner2	2	1	55.48
GCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAACGGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1	-	chr2L	12892705	5'	-	roo	9023	2	56.45
TTTTAGGGTGGGATCGATTATTTAATTTTTTTAGTGCCGGAAATGTTGCCTTTACCTGATAAATATTTTTTAACAAAGAAAGCTAGACAGGCAACGATTTGGGCCGTGGCAAAAGTATTTAGACACATTTAATTAGTTCGCATTG:1	+	chr3R	3584684	5'	+	Tc1-2	225	1	55.17
TGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGC:1	+	chr2R	23332548	5'	+	invader4	2829	2	79.23
AAGGGCATACTGTATCGAGATCTAAAGCTGGAGACCGGAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTT:1	+	chr2R	16941999	5'	-	jockey	477	1	60.00
ACATGGCTACACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTA:1	-	chr2R	9500089	5'	+	G5	4725	1	48.63
CTGCTGAAAACAAAGTTAAAAAAAAAAATGTTATAATT:1	-	chr2L	17491131	5'	+	Stalker2	7182	1	89.47
CCGTGCAACGGTACTCGTTGATATTTTTGTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTGAC:1	+	chr2R	19004099	5'	-	roo	402	1	79.03
GACATCACATACTAAAATGAGCATTTCAATAAATCAACGAGCCAATTAAACCATTTGACTGCACTTTACGCATCGCAAAAGGAGGACCTGAATTTTATTAAATTTTTGCATTTTATTTTATTTTTATTTTATTTTTTATTTTATTT:1	+	chr2L	13334753	5'	-	HeT-A	310	2	69.86
AAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCT:1	-	chr2R	9500073	5'	+	G5	4741	1	47.26
CGTGACATACACGTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTG:1	+	chr2L	12290630	5'	+	1731	12	2	74.81
TCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr2R	21907944	5'	-	roo	8984	2	77.40
CCCCATACCCATACCCATACCCATACCCATACTCATACTCATAGTACTACCCATACCCATAGCCGTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAA:1	-	chrX	3539278	5'	+	I-element	5176	1	55.48
AAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr2L	14772116	5'	+	roo	8722	2	65.35
ATTTTCATGGAATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1	-	chr2R	20497055	5'	-	blood	7374	2	60.96
TTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGAATAGTGAAAGTTAAACACA:1	-	chr2R	5031008	5'	+	Doc	79	1	77.24
CAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATAATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr2L	14081314	5'	+	1360	37	1	56.64
AGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chrX	2444428	5'	-	roo	9001	2	73.68
ATTTTTATGATTTTGCTGTTTAATGGTTCATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCT:1	-	chr2L	7898439	5'	-	roo	397	1	77.40
GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAATACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTG:1	-	chrY	311346	5'	+	1360	46	1	56.52
TGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2L	16092006	5'	+	roo	8714	2	55.48
AGTTTTTCAATAATGATTTACAGGATAAAAGTTTATTTGTCGCATCATACGTACCTCTCCAACTAATAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTGGTCGGAGAAATCAGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAAT:1	-	chr2L	17077037	5'	-	GATE	398	1	55.48
GTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGT:1	-	chr3R	1844825	5'	+	Cr1a	195	1	76.03
TGTGTTTGGAACTGTGTGAATACTGTGAGAATTTTTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGT:1	-	chr2R	19502494	5'	-	P-element	432	1	24.31
CTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1	+	chr2R	15004751	5'	+	jockey	37	1	44.52
AATTGTTTATGATACAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCGTGCTCCTTTCGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATATTTTATTTGGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTA:1	+	chr3R	19448504	5'	-	roo	8941	2	70.40
GGGGAAACGTCGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	+	chrX	5274278	5'	+	roo	23	2	62.18
GTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1	-	chr3L	10013650	5'	-	hopper	1332	1	74.48
AAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1	-	chr3R	17605746	5'	+	Tabor	6885	2	52.08
TATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGGCTCCGCTCATATCTTA:1	-	chr3R	12887000	5'	+	roo	41	2	54.07
GGGGAANACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1	+	chr2R	15004737	5'	+	jockey	23	1	44.52
ATAACACCAAATTATTTAGCGATTCACGAAGACGAAATGTCTTATTATAAGGAAAAATATCAGTTTATAAGGAATATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCG:1	-	chrX	22118652	5'	+	gypsy	7032	2	50.00
CAATAACACGGCGGCCGAAACAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAGGGGG:1	-	chr2L	8627512	5'	-	hopper	139	1	64.58
AGTTTGTATATGTTTGTTAGTATAGCACTGGGTTTAAGTAGACTAATAGATTCGTATAGGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1	+	chr2R	7452834	5'	+	pogo	59	1	60.27
TTTTTTCATTCGAGAAAATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATA:1	-	chr2R	5173267	5'	-	Stalker4	401	1	77.14
CCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTT:1	-	chr2R	9500078	5'	+	G5	4736	1	45.21
AAATAAATGCTTATAAAATATATAAATTAAGTTTAAATTCTGAAATACTAAGATACTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1	+	chr3R	14337401	5'	+	copia	67	2	69.86
TCGGAGAGCTCTATAGAAATAGGTGTAAAATCGCGGCGGTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTG:1	+	chrX	17832994	5'	-	Tirant	329	2	69.06
AAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGA:1	+	chr3L	11257359	5'	+	1360	1	2	62.79
TTTAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGATTCTT:1	+	chr3R	22167019	5'	+	Doc	22	1	54.55
TTAATTTTACTAAAAGGCCAATATTCAAGACATTCTTTACATAGAAGTTTTGTTATTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGCCATGGTCAAAATTATTTTCACAACGTGCATTTTGGTGCATGGGT:1	+	chr2R	11363711	5'	+	Bari1	28	1	65.75
AATCGCTTGAGTGCATTTTACCTAGAGGTTAAACTAATGTCTTAGACAAAACACCCTACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGCGCG:1	-	chr3R	5169662	5'	+	Tc1	177	1	61.64
AGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAAC:1	-	chr2R	2994307	5'	+	gypsy8	123	2	45.79
ACTAAAAAGTGTAACATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTAT:1	-	chr3R	17615224	5'	-	mdg1	32	3	71.72
GTAAATCACAGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1	-	chr3R	16404576	5'	+	pogo	51	1	55.17
GGCTTCCGCAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGCATCAAATCAGA:1	+	chrX	10521596	5'	+	Tabor	6861	2	67.86
AGATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chr3L	15177226	5'	+	roo	8740	2	69.86
TTTTTCGAAGGGGTGAAGCCTTCTTCCCCCCCTACTTCCAGGCAAACATGATATCTGCTATTGGGAATTCGAACGCAAAATTTCATCATTTTTCTGGTATATAGGAGTGGGGGTGGCAAAAAGTTTTTTTGCGAATCGATAGAAAT:1	+	chr2R	1112211	5'	-	INE-1	310	1	69.18
TAGGAAACAAAAAAATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1	+	chr3L	23325965	5'	+	pogo	46	1	56.16
TAAAAAGCGATTCAAAGTCAGATTCTCAAATCGAATCAGAATCGATTAAAGCAAAGTTGTTTATGGCACAAAGTTCAACAGATTGAACACAGCCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chrX	6458548	5'	+	roo	8683	2	75.00
TATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTTAAGCTACGAATAGC:1	+	chr2L	17295821	5'	+	Doc	38	1	52.59
GCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGAACTGTATCAATTCAGAACAT:1	+	chr2L	13585813	5'	+	Tabor	6865	2	63.78
CATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCCCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	+	chrX	6486726	5'	+	roo	82	2	73.29
GAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1	-	chr3L	17560401	5'	+	pogo	41	1	56.85
ATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1	+	chr3L	15519752	5'	+	pogo	54	1	60.74
GAAAATAGTTTAATGCTCACTGCAGACAGACCCGCCGAAAGCAAAAAGCGAAAAGCACGAAAATATATAGAATAAACATTTATATACATCTAGGACAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1	+	chr3R	20004988	5'	-	297	6955	2	65.91
GGCGGGTATTTGGGGCGGTCATAGAGGGGTTGGGTTCCTTCGTCGGGATTGCTGCGCAGATTAATGCTGCATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1	+	chr3R	10273929	5'	-	HMS-Beagle	7023	2	65.22
AAATTATTGGTATTCTAGATAAAGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1	-	chr3R	17831924	5'	+	F-element	32	1	63.01
GAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	+	chr3L	15600175	5'	+	roo	59	2	58.90
TAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTAGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1	-	chr3L	11441801	5'	-	roo	8981	2	80.14
GGATAACAGCTGAATAAATTCCTGGATTTCAAAGTCTGGACAAGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1	+	chr3R	11514956	5'	+	I-element	79	1	66.92
ACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGC:1	+	chr3R	22388978	5'	+	G2	2671	1	65.75
CTGTTTTACAAAAAAAAAAGAAGCACGTTTATACAAAAAAGAAAGGCTACATACATACAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATA:1	-	chr3L	27390880	5'	-	1360	191	1	57.84
GACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAA:1	+	chr2R	3338787	5'	+	Juan	57	1	57.86
TGATACAAAAAAGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	+	chrX	17526797	5'	+	roo	8687	2	57.53
CGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGT:1	+	chrX	13704751	5'	-	invader4	3036	2	55.48
TAGAGCAGTGATTCTATATTCTTTTTAAGACCATTTCTACCTTATTATGTAGTATAGTACGAAATACGCGTCCACCTGAAAGATCATAATCCATTACTTCGTTATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAAC:1	+	chr2R	5648915	5'	+	1731	311	2	67.81
GTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAGTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr3L	21817954	5'	-	roo	9052	2	65.04
GAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTCTATATGTT:1	+	chr3R	19589899	5'	+	BS	5022	1	57.94
AAAGAACAACAAAAGCAAACAATAACAAATTCCCAGCATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGGCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1	-	chr3R	14651324	5'	-	P-element	2854	1	63.45
TGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1	-	chrX	10640085	5'	+	roo	8698	2	67.78
AATTTGAGGCTTTTGTGCTGGATGTGCTGGATGGCCAGTATGGATATGGAACGCTCGCGGATTAACAAGGGGCTCTGAGGAGCTTCGGATATTCCTCAGCGATCACGATATAGACGTAATGCTTCTTAAAATTCATTAGAATAAT:1	-	chrX	3309105	5'	+	jockey	4809	1	53.79
AATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1	+	chr3L	18368917	5'	-	opus	7438	2	66.44
GTCAATCACGTCAGGGTCACCAAATGTTGACCTAATAATTTGACATCGATGTGCGCATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAA:1	+	chr3L	23728639	5'	+	HMS-Beagle	53	2	60.74
AGGTGGATTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1	+	chr3R	19446088	5'	+	297	12	2	76.71
TAAGGAGCACAAAAGCAGTTCTAGAACTACTTAAAATCACTTTATATATTTTCACAATTTCCCTCGAATTTTGTTATTTGCAATACAATAAAAGTTACATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATG:1	-	chr3R	20868243	5'	+	BS	5020	1	67.12
GGTGAATGATGGTTTCATCTATAATGGCGTAATTATTCGATGGCGACTTTTCAATTTTCAATTCAATACAATACTTTAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGG:1	-	chrX	20134444	5'	+	R1A1-element	4971	1	65.71
GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATANTTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTG:1	+	chr2R	981624	5'	+	1360	46	1	62.07
ACCCATTTAGGCCCACAGCAGGCCAAATAGATAGAGCTCACCAACAAAAAAAAAAATATGAAAAAAAAGGGGACAGACAAAATGAAGGAAAAGCTTGAGAAAGCTGTGGAATCGTGTTCGCGGATTGCCCTACCCTACCTATGACC:1	+	chr3L	9239927	5'	-	Gypsy12A_LTR	1953	1	59.59
GGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAAATTATATTT:1	-	chrX	13039542	5'	+	roo	73	2	73.19
CGGATAGATGCAATTGCGACTAAAATAGTATCACTTTGGCTTCCAGAAAATTTTCAATATAAGATTACATCTCAAAGCAATTTATGTGGCGTTTCTTTTGCTATATAGCTGCACAACAAAAACGTTTTTCTTTTTTTTTTT:1	+	chrX	2497046	5'	-	HMS-Beagle2	492	1	85.82
GCTCAGGAGTGTTTTTTGTGTAGCGCTGAATTTACATAAATCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1	-	chr2R	17259397	5'	+	jockey	4688	1	73.57
CAATTTTGTAGCATACATTTTGGGGCATGTACTACTGAATGTACTGCATGTACCGTAGAAAACTACTTCTATTGCCCGAGGTTGGGTTTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATG:1	-	chrX	20266395	5'	+	BS	5037	1	74.79
ATTGAGGCAAACAGTTTTCCTTATTATCTTTAAGCCTGCAAATACAGTGGTTACTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1	+	chr3L	6978093	5'	+	pogo	16	1	72.60
TCCTCTTCACTTTCTCCCTCGATATCTTCTTATATTTCTACCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1	+	chr3R	25454746	5'	-	Quasimodo	192	2	68.15
GTGGAAGGGTGCTATTTTTATGGGTTGGATAACTTGCATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTAGGAGAAATAGTTTCAC:1	-	chr2R	611203	5'	-	297	6894	2	74.66
TGGTCTCTTTATTTGCATTTAAGATCGTCCAGATAGAGCACGCAAATGATGGGCCCATGGAACCCACGAAATAAACGATCAAACTACTGAAGAATTATTATGTGCTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAC:1	+	chr3L	10013776	5'	-	hopper	1091	1	71.92
CTTTAATTGTGACTCATCTGTGGGCGACGCGTGTCGCCACAAAGAAGCGACCGTCTGTCCGGCGAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATG:1	+	chr2R	7586096	5'	+	I-element	5038	1	80.77
AGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTTCTTCTTTCTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGCTAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTTGG:1	-	chr2R	14871481	5'	-	INE-1	547	1	74.42
ATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1	-	chr2L	9399539	5'	-	Transpac	5169	2	62.86
ATACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATGTATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCAA:1	-	chr2R	5198488	5'	+	INE-1	89	1	59.59
CAAATTTTCATGGAATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1	-	chr2R	20497058	5'	-	blood	365	2	62.33
TAGAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr3L	21817931	5'	-	roo	9052	2	70.55
CATTACCTAGCTGCTCTTTTACGTATTTGCCAAGACTTAATTGAAAAATGTTTCCCCGTATTTTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1	-	chr3L	10056210	5'	+	transib2	52	1	53.42
AAAATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTACAATCCCAAATAAGAAGACTT:1	-	chr2R	19050339	5'	-	roo	405	1	73.91
ACGTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCGTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGATTAGCTGCATCGATAGTT:1	-	chr3L	17560415	5'	+	pogo	10	1	73.64
GTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTACACACATATCGAACAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1	+	chr2L	13585836	5'	+	Tabor	6863	2	56.86
GCATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr3R	7482716	5'	+	412	7095	2	55.48
TAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1	+	chr3R	11083893	5'	-	412	419	2	67.12
CGCCCTGCCCAGGCAATTAAAGTTGGAAGCAACGCCTTTTGTCTCCGTTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chrX	18189123	5'	+	jockey	73	1	53.00
TGTTGTTTCGGCAGACATTGAAAAGATGTACCGACAAATTAAAATAGATAATAATGATCAAAAATATCAATATATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr3R	19445376	5'	-	roo	320	2	61.54
ATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTA:1	-	chr3L	11321502	5'	+	mdg3	5304	2	54.07
CACCAGAAGATACACAACATTAAATGATATCCCGGATGGCCAAAGAGTCCAAGACACACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1	-	chr3R	17531448	5'	-	1360	3353	1	53.33
AATGTACATATTGGTTGCTAATATTTTTAAAGCAACATCCGCTTCATTAGGTGACCTTAACTTAAATGGCTTGGAATAAACGTTTGAAGTTTAACAACAACTTTAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTG:2	-	chr2L	1592073	5'	-	roo	7	2	67.81
TTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGA:1	-	chr3R	9714486	5'	-	Stalker	7203	4	55.17
CGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1	+	chr2L	14081333	5'	+	1360	62	1	74.79
CAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGC:1	+	chrX	13704768	5'	-	invader4	3040	2	61.60
GCCGATCTCCTGCTTGGAGAACTCGTACAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCACAGCCGTTAAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAATCGCTATCGCCACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGGCG:1	+	chr2R	17419192	5'	+	gypsy	7326	2	77.40
ATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAGTCGAGAG:1	+	chr3R	20469596	5'	+	roo	58	2	58.22
ATGAAGGCAGCAGAGTAACAAACGGCTCAGTCTGACCTAGCAAGCCCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1	-	chr2L	13585979	5'	-	Tabor	7312	2	75.34
CAGAGCACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1	-	chr3L	22968447	5'	-	mdg1	7414	2	52.74
ATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1	+	chr3R	22821984	5'	-	mdg1	375	2	50.68
TGGAGCACTTTAATACTGGTGGCGATAACACGGACATGGACACATCACCAATACTCGCGCACGTACACCCACCACCGCGGTGGAACTCTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATA:1	-	chr3R	31812926	5'	-	roo	9033	1	58.90
GTATAATAACCTTGACGGAGTTTGGGGTGAGGTCTGGTTACCAGCATCGCCGCAGGTATTTCCACGGATTAAAGCACGCAGGCCGTGTCATTTGACACCACTCGGAAATCCATGAAGACAAAGGTCAATTAAAAAAATTAAAAAAA:1	-	chr2R	5741640	5'	+	HB	319	1	75.34
ATTTATTGCTTTATTAATTTCCTGTATTTCATGTGATCGTACTGATTATGTAGAAACACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr2R	23802945	5'	-	roo	347	2	61.38
AAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCACATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATTCATGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAA:1	+	chr3L	21484243	5'	+	1360	309	1	69.86
CAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTCTTTCGCGGCACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1	-	chr3R	10182208	5'	+	blood	18	2	56.25
AGATGCAGCTAGTTATTAGATCTAACAACGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1	-	chr3R	21434978	5'	-	412	459	2	54.84
TGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTGGGGAGCTAGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCG:1	-	chrX	6963755	5'	-	F-element	4423	1	70.67
CGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAA:1	+	chr2L	12290649	5'	+	1731	4356	2	54.86
ATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTGTATTCCCTAATATATATGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGGTACGGGTATCTG:1	+	chr3L	22848494	5'	+	INE-1	543	1	54.84
ATCCTTTTGCTAATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1	+	chrX	13066480	5'	-	jockey	4962	1	58.99
TATAGCTTAAGCTAATATAAAGCTAAGCCAAGAGAGGAAAGTATGCAATATAGAAGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1	+	chr3L	13845080	5'	+	opus	15	2	61.64
TTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1	+	chr3L	18368942	5'	-	opus	7474	2	71.76
CCTGCACTAGGAACTTGTGGGAGAGACTTGTAAACCCACCCACGCTTAAAACAAAAGTTCGGCGTGAGAAAAGCAGCATCATTTTGATCATGAACTTGAAGAAGGTAAAGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACCAAATTC:1	+	chr3L	9627522	5'	-	Q-element	316	2	71.43
GCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr2L	14772114	5'	+	roo	72	2	68.35
GCCATTCTAGACGAGGAGCCCGATGTGGGAGCTGGTGTAGCGAATGCTTTGCGATTGGCGCTGTCCAAGGGTTACCTTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCTGTTAGACAA:1	-	chr2L	11985149	5'	+	G6	1835	1	64.34
AAATATGTTATATTAAAGTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	-	chr4	1079066	5'	-	mdg1	7388	2	65.75
GTTCCTCAAATTCGGATCTGAAATATTTGTTAAATATTTCTTTTGGAGAGGCCTAAAAAAATCAAGAAATACAATTGACAATAAATTCTGGTGATATATGTTGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1	+	chr3R	12854051	5'	-	Quasimodo	6993	2	65.97
GACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTCCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCCCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCAC:1	+	chr3L	19013926	5'	-	invader3	5395	2	64.49
TTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACAAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATAT:1	-	chr3R	12886970	5'	+	roo	71	2	74.81
AACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1	-	chr3L	12861782	5'	+	pogo	72	1	78.12
ACTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1	-	chrX	22511459	5'	-	1360	3371	1	58.22
AGCTATAAATATTGATGTCGTCGCAAATACCTCAATCCGGTAGTCGAGAAATTAAAATCAAAACAAAAACTGTTCAAACTTCCTTATGGCAAGGACAAAAAATGCAAAGCAAGGCACAAAAAGTATATAAATATACATATATACA:1	+	chr2L	8797730	5'	+	Stalker	90	4	53.79
ATTGTTGGGAAATGTTACGTTGTAGTTGAAGAACCCCATTAATGAATATATAGACCGTTCGAATAGAAAAATGTTTGTTTCACCCGTTCTCTTGAGTGAAAGTTTGAAGACTAAATCGCTTGGAGAAAATTTAGT:1	-	chr2L	17415023	5'	-	Bica	4456	1	63.70
CGATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGGCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAT:1	+	chrX	13504121	5'	+	412	7086	2	61.64
GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGAGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATC:1	+	chr3R	17660025	5'	-	micropia	5412	2	54.55
GTGAATCCCGGCGTGATCATCACCGAGCTGCAGCGTCGTGGTTGTGAAATTCAATTAAATTTAATTAACTGTTAATTTGTTATTTTATCCAAATACTATGCATATACATATGTATGTATGTATGTATATTAA:1	+	chr3R	5634238	5'	+	1731	100	1	70.45
AACTCGTAACTGTCGCTTTTGCAAATTGGGCTCTGAGAGTGTGGAGTGTCGGTGTGTCGGTCTATCTGTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1	-	chr2R	20913988	5'	+	hobo	54	1	55.48
CCTTGTGCCGAAGTTGTGAATATACATACATACATACGTGGGCATACGTGTATCCATCCACATTGACCACATAAATGATTCATTCATTCAGTTAATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGC:1	-	chr2L	15024648	5'	-	R2-element	3544	1	68.15
GTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	+	chr3R	7482745	5'	+	412	7098	2	56.67
AAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTG:1	+	chr3R	10462609	5'	-	opus	437	2	65.07
TTTTTCCTAGTCCATTTCCACACACAACAAGTGAAAACTTAATCAAATTTGGAAGCGAGCCGAAAAAAGTCACTATATCGACTTGTATGTCTCCCAATTTGTGTCTCAACTGTGTGAATATTGAGGTCTT:1	+	chr3R	23784731	5'	-	Helena	1199	1	51.54
CATATCTTTTATAATACTAAAAATTGTGGTCGTAGCACCTCCCCCTTATATGACAATTACGGAATACTCTAATGACCAATATTCTAGTCATTTTTGAAGTAGGTTGTCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTG:1	-	chr3L	21766594	5'	-	1360	246	1	69.78
ATAATTCGAACTTTGCCCGAACCTTTTAATGCAAAATACCGATGTGTTTGTGAAATTTACAATGCATGAGCACACGTGTGCACACACACAGATGTCTGGTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGTT:1	-	chr4	39954	5'	-	1360	133	1	62.88
GTGCTTGTTGTTAAATGTAATTTGTTAGATTTTGTTTTTTCATTGCAATGGGAACAAAACTTATAAAGCCGCATTAGAAGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAGCCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACT:1	-	chrX	23086016	5'	+	roo	9037	1	54.48
ACTGGGAGTCGGAATCCGAGTTGTGTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGTGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1	-	chr2L	15875863	5'	-	hobo	2928	1	74.40
GGAAATTATGTATGATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTG:1	-	chr3R	9714519	5'	-	Stalker4	386	1	69.18
GCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	-	chrX	13066589	5'	+	jockey	35	1	51.82
GGATGAGTTGCAAGGACGAAATAACAGGATTTCGTTGGGATTTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1	-	chrX	17431820	5'	-	hopper2	1557	1	50.68
CCGAATGATGATGTCAATCTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAAT:1	+	chr3R	10546083	5'	-	hopper	1355	1	60.27
ATGGGGATACGAACTGGGGGCAAGAAAGGAAAACTTTTATAATTAAGCCAAATGCAAATGCTAGGCTCGCAGAGTGCTGTCTGTATTGGGTGTAATGTGGTAAGTGTATTAGAATGTAGGCATA:1	-	chr2R	13718237	5'	-	Idefix	34	2	72.58
AAATTGGGAAAAGTGGGCAACGGCGAGGGCGTGTCGGCGCTAAACATGTGTGTTCGCAGGATGTGTACTGCTATACTCGAATGTATGTATGTACGTACATATATACATACATACACATATGTACGTACATACATACATACATATCT:1	+	chrX	16775210	5'	+	412	7279	2	58.22
GGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1	-	chr2L	11518463	5'	+	412	71	2	71.97
ATTATTAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGAT:1	-	chr2R	4886044	5'	-	INE-1	577	1	53.47
CAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1	-	chr2L	2703548	5'	+	hobo	15	1	74.60
AGATATTTCCAAAATTAGGTTTAGTTCTTTTTCCATTTTTTAACCTGACTTTAATAAAGCTTTAGAATATTAATAACTTAATTTATGCCTCTTCGTGCCATTTAGACTTACAATCCGATCTAGATCGATTTCAAATAT:1	-	chr2R	3346225	5'	+	Q-element	643	1	60.14
AGGTGATTCACCAATCAATTCAAGATGTTTAGAAATATGCGAAATTGTAATGATGATAATCAAAAAAAAATAAAAGTAAGAAGCATTTAACTCGTTTGTATTATTAGTAAGAGAATAACTCTATTTTATTATCCATTGAATAATT:1	-	chr2R	11653312	5'	-	Fw2	62	1	36.55
TGCATCATATATCATATTTTTAATGATATATCTATCATATCTACCTATATCTATCTATCTATCTATCATTTAATATATTTTCTATAAAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGCTGCGTAACG:1	+	chr3L	11257269	5'	-	1360	3379	2	73.97
TGGGGACCCAACGAGTTTTGCGTTGAGTGGCGGACGCCTTGTCAATTTGTTAGCTTATCAAATGCTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1	+	chr2L	5307073	5'	+	jockey	4686	1	62.62
AGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr2R	14542248	5'	+	roo	19	2	59.66
AGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1	-	chr3R	17478439	5'	+	copia	69	2	77.60
ATAGGAAAATATTTCTGCCTGCACTTTTGCACTGGCATATAATTTTTTCTCATTGTATTCACCAATATCTATTGATGTCCCAGAAAAATGATAAAACTTCGCGTTCGCATTCACAATAGCTGAGTAACGGGTATCTAAAAGTC:1	-	chrX	22628269	5'	+	INE-1	549	1	69.93
GGGAACTTTTGTCATCGCCTTCGCCCAGCCATTTGAACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1	+	chr3R	28075303	5'	+	jockey	4688	1	63.64
AAATTTTTTTTCTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCCGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	+	chr3R	17817857	5'	-	roo	9038	1	62.33
AAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATAT:1	-	chr3R	21276628	5'	-	BS	5037	1	55.48
GGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1	-	chr3L	10848707	5'	-	blood	333	2	75.53
GAAAATATTTAATGGATCGGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACAAGCCACTTCCATTATTTCAA:1	+	chr3L	15995895	5'	+	297	6606	2	65.00
AAAATACAACATTTTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	+	chrX	9539983	5'	+	roo	8696	2	61.64
GGTTTAACCTACAGAGCGAATCTGAAAAAAGTGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr3L	4536809	5'	+	roo	45	2	51.37
AGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1	+	chr3R	30344615	5'	-	pogo	2038	1	65.07
AATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGATTTT:1	+	chr2R	5284548	5'	-	Doc4-element	2589	1	55.71
GATCCACTGCTCGTCCTTCCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTGAAAGCCTAAGAACTTC:1	+	chr3L	27130705	5'	-	1360	236	1	66.67
CCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAAT:1	-	chr2L	21153535	5'	-	1360	304	1	73.97
TCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCA:1	+	chr2R	7586175	5'	+	I-element	5082	1	74.74
CTCCAACTGATATCGCATGTAGTGTGTTTGCTGGTGTGGCAAACGCCACATGAGCGTGGGACTTTGTTGGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTT:1	-	chr3L	20046971	5'	-	F-element	4439	1	54.35
AGTATTGATATTTGCATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1	+	chr2L	13585792	5'	+	Tabor	10	2	77.27
ACCAATCTCTAATAAAAAGTGAAATTAGAACTAACACTTTGCGGAATTCAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCACTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1	-	chrX	21016884	5'	-	Transpac	303	2	66.94
ATGCAAAGTTTGGAGTGCACATATGAACTTTGAACGTTGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCT:1	-	chrX	10521783	5'	-	Tabor	7316	2	77.40
ATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATACATTCATTCAATTTCTTCTTT:1	-	chr2R	9791673	5'	-	412	7479	2	61.64
ACCCGCAAAGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGATACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTCTGT:1	+	chr3R	31817442	5'	+	roo	44	2	53.91
AATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr3R	18582236	5'	+	roo	8705	2	61.74
GGCAAATATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chrX	5274374	5'	-	roo	9015	2	67.46
AAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr2R	19004220	5'	+	roo	8686	2	58.95
GAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr2L	17420247	5'	+	roo	20	2	60.00
TCTCTTTCCCTTTTTCCCTTTTTCCCTTCGAGCCCTGGCCACAAAGTGTTGCGTTGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCG:1	+	chr3L	19035968	5'	-	Tirant	403	1	77.42
GTAGAGGTGCGACACCGACGTATTCCTAATGTGCGATGTCCGTAAAGTTAATGGGGTTGTTTACCTTTTATTTATTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1	-	chr2R	4009147	5'	-	Juan	4166	1	52.41
AAAGGAGGGAGAATAAATGTGTTGGTAGAGGGATTTGGTCGGAATACATTTTGTAAATGGTCAGCGAAAGCACAGGCAAGGATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACC:1	+	chr3R	3211974	5'	+	Doc	4403	1	54.23
ACTCAATAATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1	+	chr2L	21884489	5'	+	pogo	20	1	70.16
TTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr3L	9998033	5'	-	roo	394	1	52.38
TATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr2R	23803019	5'	+	roo	82	2	77.30
AAATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGC:1	-	chr3L	23940543	5'	-	Cr1a	4397	1	67.41
GGCCAGAAAATATCATTATTAAACAGATCGAACTGGCACCCAACCGGTTTGCCATTAAAATCAGCATCCGAGTCTCAGAACTCAGAGATCAGAAATCACTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGC:1	-	chr2L	5444547	5'	-	1360	3000	1	67.12
GCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1	-	chr2L	14892296	5'	+	transib2	56	1	65.89
GTGGCGCCCAGGAATATCCAATATGACAGCCCCTGGCGAAGTGAAACCGAAAGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGGGCACGCTTTAGAGGCC:1	+	chr3R	26615100	5'	-	gypsy12	10148	2	54.84
CTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1	-	chr2L	14081435	5'	-	1360	3359	1	64.38
ATATGGCGATACACATCGACGGAAATCCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAACC:1	-	chr3R	22538776	5'	+	gypsy7	5007	4	88.00
AATAAACAAGCAGCCGCAACCGCCGAATCAATTGTTTCGAGACCCCAAGGAAAAGCGAAAGATCCGGCGATCCGGGAATGCGTATACATTTTATACGCATTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACA:1	+	chrX	20645790	5'	+	1360	340	1	63.45
CTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1	+	chr3R	11083856	5'	-	412	482	2	72.50
ATCCCATCGTGGAACAGGTTCTGTGCCCGGCCTGAATAAACAAATGCCCTGATAGCGGGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1	+	chrX	18386357	5'	-	invader4	3057	2	61.29
TTAAGCTATAAATTTGTATGATATCTGTTAGGTATTGGGAAAGAGTATCATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAACCATAATAATAAGTCAACT:1	+	chr2L	15991313	5'	+	mdg1	72	2	65.75
GGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	+	chr2R	7898067	5'	+	roo	59	2	64.38
ATTAAGAGATCACAATGAACACTTTAGGTCAATTCTAACACGGATGTTTTGTTAGCCAAGTGGTTTTGCTAACCAACGGTTATCTTAGCTATACCCGTATAGTAAAAGTGTATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATCAATATC:1	+	chr2R	8227683	5'	+	INE-1	86	1	56.16
AACAAACAAAATTACAAAAATACAAAATTTGGGAAAAACAAAAAAAAAAAGGCAAA:1	-	chr3R	17843604	5'	+	Doc2-element	246	3	57.14
GATTAAATTAGGAAAGTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	+	chr3R	7835077	5'	-	roo	387	2	68.75
CATACGTGCCATTTAAGCAAAAAGTTTATTTGCAAGCTGTTTGCCAAAAGCAGGCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGCACGAAACCACAAGATCAAAACATTCAAGAGAGC:1	+	chr2L	22731498	5'	-	Cr1a	376	1	60.00
GTTTTTTTTTAATTTATTTTACTACTGGAAATTTTGAATACGCGTCAATAAGTTAAGAAAACAAGATTTTGCGCTTCGCTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1	+	chr3L	26540642	5'	+	F-element	52	1	50.68
CACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAAAAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1	+	chr2R	13121963	5'	+	pogo	31	1	53.42
TTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAA:1	-	chrX	21667929	5'	+	gypsy2	6536	2	64.10
ATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2L	17420253	5'	+	roo	8724	2	60.27
GTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	-	chr3L	10841536	5'	-	mdg1	7388	2	74.42
ACCAAAAATCAACTTCAAAAAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACC:1	+	chr3R	24455338	5'	+	Quasimodo	41	2	55.48
GGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCTCACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTAC:1	-	chrX	22386800	5'	+	hobo	71	1	54.40
TTTTATTTAAATAAATATCTATAAACAACAAACAACAAGTTATAGAATTTTTTAACTTTTAAGGAAAAATAAATAATAATAATAATAAAATAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGA:1	-	chr3L	26375429	5'	+	Doc	221	1	45.89
ATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1	-	chr3L	23456278	5'	-	1360	3372	1	47.14
CGGAGAACATGACCATGTGGAGCACGAAATCTTTTGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1	+	chr2R	23332502	5'	+	invader4	34	2	60.00
ACCGGGGAGCATCACATACGACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1	-	chr3R	17316333	5'	+	opus	35	4	55.65
AAACGGAAACGCACTGGAAACTTCATTAATGAATTGTAAGTATCTGTCAACTTGGGATTTTAGAACTTAACATCTTGTCTTTTGTAAGCAATTGGAGTTAATACCAAAAGCTTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGC:1	+	chr3L	7467041	5'	-	R1A1-element	34	1	75.34
CTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr2R	20596455	5'	-	roo	9014	2	58.33
AAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	-	chr3R	22844260	5'	-	roo	8996	2	75.18
CTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	+	chr2R	14542116	5'	-	roo	9038	1	56.30
CATCTCTGTACTGTTTTTCTAGCTGAATTCAGGCATATTTTCTCGCATGGACTCAGAAGACAGGTCTTGTGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAAC:1	-	chr2L	22079794	5'	+	F-element	4329	1	50.75
CATTTTGAACTCCCATTTCTTTGGCATTTATTCTCTCTGTGTATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1	+	chr3L	7188544	5'	-	hobo	2926	1	59.52
TTTAGTTCATACAAATACGAGCACGGAATGTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1	+	chr3R	14981111	5'	-	mdg1	7440	2	70.55
CTCGTCTTTTGGAGAACTAATTTGAAAGATGTGCGTGCTTAGCATACATATTTGGCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1	-	chrX	10537434	5'	+	I-element	65	1	59.59
AGCAACTGCCATGTTCGCATTTTCACTTCACTCTAGTCGTATGAAACTTTTGATTTCGATTGCGAAACTCGGGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTA:1	-	chr3L	15122562	5'	+	jockey	244	1	46.27
ATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCAT:1	+	chr3R	25554217	5'	+	micropia	4989	2	59.42
CACTCGCGCGTTGTGCAATTAGATGGTGAGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTTGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1	+	chr3R	30344587	5'	-	pogo	2066	1	60.27
ATTGGGGGTCTCCTTTGTGTTGTTGCACAATGAGTTTTTACGCGATTTATGCTCCTACTTTTCCAATACATAATACTTCCTTTAATAGTGTAGTTCTGTTGGAGTTCTGCGGTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTA:1	-	chr2L	19460453	5'	-	Porto1	4499	1	51.37
AACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1	-	chr2R	5485213	5'	+	blood	7070	2	57.53
CTTTCGTGACATGTGAAGATGTGATTTATCAACGCTACAAAAGTAGCTTGAAAATTACACTTTTAAAAATATAAGGACATGAAAACGAACAAAAATAATACCAATAAAGAAGTCAAAATGTAACAACAATTGAGAACAATAAACAA:1	+	chr3L	10483476	5'	+	Porto1	180	1	78.08
GGCAGATAAATGACAAAGGCAGCCACAGCGATCACAACATCGTCTATATAAGTGAAGTGAAGGCTGTCATATATTTACACACACACACAC:1	-	chr3L	9338288	5'	+	Quasimodo	31	2	67.78
ATTTACCCACGCCAGTTCACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTTTTTATTTATACTAGATAAGGCAGAGGGAAGCGTTTCAGACCATATAAAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCTGAGTC:1	+	chr2L	20413488	5'	+	INE-1	92	1	42.47
GGGTTTCAGCGAGGGAAGGGATGGCCCCTTCAAGGTCTTGGCTGCCCATTCATCTAATTGGTGACACCATTCATGGTGGTGTCTGGCGTTAATCTCTTAGCATCAACGACTTAGTCATTATAAA:1	+	chr2R	21202514	5'	+	diver	5642	1	71.77
CATTAATTTCCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	-	chr3R	30344713	5'	+	pogo	65	1	63.70
ATCGCACCAAAAGTTCACTTCATCGCTTTTCAATGTAATTCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1	-	chr3R	10462734	5'	+	opus	7154	4	58.22
GAAAATTCACAAAGTTGTTATTCAATTTAATGTTTCGGGATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1	-	chr2R	6086399	5'	-	pogo	2034	1	69.63
GGACATGCCTGAAATGGAGAAACAGAGACGGGCAATCATCAGTGGTGTCCATCATTTAAATAAATTGGACTCACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCG:1	+	chr2R	20825545	5'	+	1360	3173	1	56.80
TGTTTATTTCAAGATGAACAATATATATTCGCAACGCGTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACAGACATTCATGTCAACAATACATAAACACTAAGTTACCACATATAAGCAATGCTGACGCGCTCTGCGCTACAAACGGTCAGCAAC:1	-	chrX	23291282	5'	+	gtwin	7012	2	56.16
CTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	-	chr2R	19050280	5'	-	roo	9023	2	57.60
CAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chrX	17526815	5'	+	roo	19	2	53.23
CTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTACGCG:1	+	chr3R	14981163	5'	-	mdg1	350	2	65.07
CAGATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:1	-	chr3L	2362409	5'	-	Stalker2	7596	2	65.89
AAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	-	chrX	13066574	5'	+	jockey	75	1	68.66
ATGGGGCAACCGAGCTGATACCGGAAATCTTGAAGTTCCCAGTAATGGTATTCCGAGGTTGGTAATGTTCATACAACGTTGGGATCCTTGGCGCGCCTGGCTTGACTCCGGCTCGCAACTACATATAATCACC:1	+	chr4	1233454	5'	+	G3	478	1	57.14
GTTTGAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1	+	chr2R	2016797	5'	+	1360	16	1	69.92
AAGACCATCGTAGTGGCGATAGAAGAGCAGATTACGATGGCCGCCGGTCAACCTGATCGGCCAAATTTTATGACAAAAAACTTGAAATGGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTG:1	-	chr3R	3399201	5'	-	Doc	374	1	77.88
ACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCG:1	+	chr2L	20808333	5'	+	HMS-Beagle	6867	2	70.71
AAATCAAAAAGGAAATAGCCTAGAGATAGAAGCCCCGAAAACCTCTCAAAGAAAAGCTCTTTCACACACAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACATTGGGTAGGGGGAAACTGC:1	-	chr2L	7894086	5'	-	roo	459	1	54.69
GACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATA:1	-	chr3L	20168438	5'	+	mdg3	74	2	66.67
AGCCTCCGGGCTAGAATGCCCAGCAACATTTGACTTATCAGCGTTCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1	+	chr3R	26431919	5'	+	opus	7	2	79.26
AGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATA:1	+	chr3R	16076787	5'	+	roo	70	2	67.12
TGGGCCGTATTAAAAATTCCAATACCGAATTCATTGCGCAGGTCTTTAGTTAAATCATAAGTGGTTGAAGATTTACCGAATTCAGAAGAATCAGTATGATCAACATCATCATTATTTACAAAGATTATATGATTAAGAGTATTAA:1	+	chr3L	7074198	5'	-	jockey2	3274	1	73.79
GTCAATAGCATAAAGCATACCACGGTTTAATAATTTCATGTGTTGAGTGATAATGATGGCCTTTAGTTTAATTATAATTTTTACATTACTGTTTGGTTTAAAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGCG:1	-	chr2R	2959120	5'	-	Dm88	67	2	69.66
GCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAA:1	-	chrX	2842589	5'	+	Tabor	60	2	58.22
ATTGTATGGGATCGAGAGCCAATGTAACCATAGAAGATGTTACATAAATCAACGCCGCAGCAGCCTGCAATGGAGGAAGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCATGTG:1	+	chr2R	19816747	5'	-	R2-element	415	1	63.57
ACTTTCTCTGTTTGGCTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr2R	20596411	5'	-	roo	394	1	73.61
CCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1	+	chr3R	26431964	5'	+	opus	7153	4	55.00
ATAGTATATAGCTGAACAAGGTTTTTCCATTATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAAT:1	+	chr2L	16017774	5'	-	412	22	2	77.21
ACTCCACTGTCCCTTTCGACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1	-	chr2R	2016949	5'	-	1360	3371	1	71.64
TGGACTCGGAAGTTGTTAGACTCTAGTTTCTGACACTTGGCCATCATCAGTTTAAATCTAACACTCTTCCCTGGAAAAATCTAATTTATTACAATTTTATGTACTTATTATTAGTTACTATAAATATTGTTATTAATTATAAGTGA:1	+	chr3R	2391526	5'	+	Gypsy12A_LTR	1819	1	32.88
TTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr3R	16076875	5'	-	roo	9006	2	63.70
TAGGGGAAATATTTGTTGTTTTTAAAAACTTCAAACTGAGGTAGAAAGCCAATGTTCTAAACAGAAAATCAATTATTTGGTGGCTAAATAGTTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTA:1	-	chr3R	12150119	5'	-	Porto1	4411	1	52.74
AATGAGCCACGCCCAATTAGCAAGTGCGTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATA:1	+	chr2R	23465958	5'	+	Doc	482	1	73.97
TAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTAGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr3R	25448409	5'	+	roo	8753	2	76.71
GAATCGGGATGCAGCAGCACGTGCCAGAGGTGTTCCAGCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1	+	chr2L	10023010	5'	+	Doc	79	1	70.15
ATGTCGGGCATGACGTTGATGGCGTTTTGGTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCG:1	-	chrX	13067001	5'	-	jockey	386	1	76.74
GGAAATGAGTTCCGGCGCCTGGCTGGATGACCTCAGTTTCTGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1	+	chr3R	11496491	5'	+	1360	13	1	71.65
CGGCGCGCTCTTCCCATTGAAGTTCTGACGCGCTAATTCCATGGCACGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACA:1	+	chr3R	10182510	5'	-	blood	497	1	53.19
TCTGAGCTAGATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACG:1	-	chrX	22643356	5'	+	Tc1	1592	1	56.16
AAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1	+	chr2R	16945300	5'	+	jockey	62	1	64.75
CAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCA:1	+	chr2L	16016350	5'	-	412	7462	2	78.52
AGGCATTGGCATTACCCTACTGCCAATTTTTCACTTGCCTATGCAATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1	-	chr2R	19798173	5'	+	Transpac	4928	2	79.45
GCTGACAACCTGCTCATTGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr2L	3114446	5'	-	roo	394	1	72.31
TGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	+	chr2R	15004736	5'	+	jockey	10	1	48.51
AGCCAACAACTATTCTAATGGGTCTGAGCAATAATGTTCGCTATTCTCTGTCTATATATATACAATTATACAAGATATTTAGCTGTAAAATATTAAAACAAACAAACGAGTGTATGCTATAGTCGATACCCGTTACTCAGCAAGTG:1	-	chrX	6782217	5'	-	INE-1	541	1	60.27
ATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGGTGTTACAATTTA:1	-	chr2R	21298820	5'	+	jockey	239	1	53.26
ACGATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1	-	chr2R	13084685	5'	-	roo	9035	1	52.46
AATGGAAAAAGGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1	+	chrX	12214033	5'	-	opus	7468	2	60.96
ATTCTAGGTTAAGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGA:2	+	chr3R	9714338	5'	+	Stalker	6868	4	72.60
CATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr3R	17818002	5'	+	roo	8682	2	67.50
GTTGAAACTCAATAATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1	+	chr2L	21884483	5'	+	pogo	16	1	72.22
TATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATG:1	-	chr2L	15622432	5'	+	micropia	4	2	73.47
GACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1	-	chr3L	16750720	5'	+	Tirant	10	2	53.23
GATCTAAAGATCTTTAAATACTTTATGAGTTTTTACAAAGTTCTCAGTATCGTTATAACGATTTCCTAATATTTCATGAATCAATTAAAATGCTTTCCTTTTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTT:1	+	chrX	13039651	5'	-	roo	475	1	69.86
CCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGCA:1	-	chr3L	9998176	5'	+	roo	45	2	65.42
AAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCT:1	+	chr2L	4412571	5'	+	Quasimodo	78	2	73.61
CCTCTTCTTCTTCATTTTCTTCATCAACCTCCGCCTCCTTCTCCCTTCCCACCCACAATGACCCACATTAATAAAGCTTAGGGAGCTGCTATGCCAAAACCATTCCTCACGTCTTTTTTTCAATTTTTTTTTTT:1	-	chrX	8791327	5'	+	FB	173	1	69.40
CGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCC:1	-	chr2L	21008617	5'	-	invader3	5397	2	66.42
TGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr3L	15600322	5'	-	roo	9010	2	58.74
TTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1	-	chr2L	13585924	5'	-	Tabor	7257	2	60.96
ATCTAAATAGCGTATATTCCTATTATCCGCGGAGCCAAGTCCCGTGTTCAAAAAGAGCTGAGAAACAAATTTGAACGGATAATAATAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1	+	chrX	23457569	5'	+	Doc	22	1	71.92
TGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTTTTGGCTTGGCGAGCAGAGCATAAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTCTTTCACAAGTACGCAAATTT:1	+	chr3L	17136017	5'	-	hopper2	1567	2	57.64
ATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chr2R	7898088	5'	+	roo	80	2	78.77
ATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3L	11441847	5'	-	roo	9051	2	66.39
CAAGGAGATTCTGGGCAGGTAAGAATCGAACTACACTTGCCGTGATCTCAAACCTCTTATCAAATCCCTAATTGATCTTGCACTTAACCATTCAAATACGTTTCTTTCTATTTTCACTTCAAATAATTAAAAT:1	+	chrX	11696523	5'	+	TLD2_LTR	97	1	48.87
CTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTCCTACATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAG:1	+	chrX	4214942	5'	-	flea	4950	1	63.70
ATTCAAGACATTCTTTACATAGAAGTTTTGTTATTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1	+	chr2R	11363733	5'	+	Bari1	46	1	53.52
ATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	-	chr2R	20596554	5'	+	roo	8727	2	65.07
ATAAACTATTAGTATATGAGTAAAAATGAAAACAAAGTAGATCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGGAATTTTTGCCCATGCATCCTGCACAACTTGCCAAATCTGAGCC:1	+	chr3R	5367351	5'	-	HB	1218	1	70.42
CACTTCCCAAAAAAGCGTTATTTATTAAAAAGTTTAATTACTAAAATATCTATAAACTATCAGTATCCTTACTAGCTAAAATAAAAATCATAGATATATATAATATAACAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr2L	5254224	5'	-	roo	398	1	27.59
ATCATCGATAACTGGCTGGCTGGGAGGACTTGGAGGATCGTATGGATTTCTTGCCACGATTGCGTCGAATGTCTCAAGTGGCTCTGACCAAAGACACTAGAATAACAA:1	-	chr4	748733	5'	-	Tc3	312	1	81.48
AGTAAGGCAGAATGGAAAAAGGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATC:1	+	chrX	12214023	5'	-	opus	7490	2	73.88
AATGTTGACATTTTGAACTCCCATTTCTTTGGCATTTATTCTCTCTGTGTATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1	+	chr3L	7188536	5'	-	hobo	2894	1	57.26
CTTGGCACAAATGTGAAAACCAAAACGAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACG:1	-	chr2L	11661067	5'	+	F-element	17	1	66.43
TATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAGGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1	+	chr3R	12717735	5'	+	297	62	2	66.67
TCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1	+	chr3L	23603181	5'	+	F-element	67	1	69.64
CTGCTTTAGTGGATTTCCCACTTTTTCTGCTCATTCTCAATCAAGTCCATATTTGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTATGAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTC:1	+	chrX	10653120	5'	+	Idefix	7301	2	66.42
TAATATTTAGTGATAAATATATTACTTCGGGACTGATAATCTTATGAATATACGTGTGAGATTTGGCGATACCCTTCATTACTTAGGAAGCCGAGCGCATAAGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTG:1	-	chr4	56190	5'	-	1360	3271	1	73.97
AGAAACAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	+	chr2R	9632068	5'	+	roo	25	2	64.96
GTTTTATTCCGCCGATTTCGTTGCTTTGGAAAGTTGGCGGGTCTGTGTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1	+	chr3R	22122687	5'	-	roo	348	2	58.22
GCATAAATGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chr3R	22955958	5'	-	roo	342	2	63.38
TCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr3R	17420415	5'	+	roo	8716	2	61.19
CAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGAGGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1	+	chrX	5629133	5'	-	jockey	4925	1	68.46
ATATATGCATTCTACACATTATTATTATATTCGAATAGGAAAAATACCCAGAACTATTTTTAAAAATTTTATTCGAAAATATTGCGTTATTTCGGTGCAACCTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1	-	chr3L	1534668	5'	+	pogo	16	1	73.29
CTGACCATGGGAAAACTAACAGACTACATCGAACAGGACTTCAACTGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTG:1	+	chr3L	26386182	5'	+	roo	8900	2	68.09
TGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGAATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr3R	7482730	5'	+	412	7095	2	50.76
GTCGCATAGGTTTACTTGCATAACACTGCCTTAAACTTGCCGTTTCTGCTGAAAATGTGAAATACCACGCCCACTCACACGAACAGACACTCCACCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGGAATT:1	+	chr3R	29732741	5'	+	invader4	2801	2	74.29
ATTGCAACATTTCTAGATTTTTTAATCTCCAGAGATTATTTTAATATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1	-	chr2R	9221137	5'	-	opus	7473	2	63.70
CAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAAAGGTGA:1	-	chr3L	11530973	5'	-	roo	9005	2	62.33
GGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACACCAGTATAGTGAAAGCTAA:1	-	chr2L	19965052	5'	+	Doc	74	1	60.87
AGATTCGGACGTCTTAATTTGCTGACGGAGATGGAATCCCGCAACGTCATCCGCTGCACATGCATCAATGTCCCATTATAAAAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGC:1	+	chr3R	29970755	5'	-	Tirant	499	1	61.54
GTGAGTCGTGAAAGCGAAAATACAAAGCCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1	+	chr3R	20499714	5'	+	mdg3	5259	1	77.78
TGTGGAGATATTATGTTAAAAGAGATGAAAGGAAACTCGCCCAAAATCAGTTTATACTGTATGCTACGTTTCCGACTTATTTTGAACCAATTACTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGG:1	-	chr2R	6191315	5'	-	I-element	5239	1	63.70
GTTGCTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr2L	14771995	5'	-	roo	9051	2	69.72
TTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	+	chr3L	22437857	5'	-	roo	356	2	55.71
AAGCGAACAAAATATTGAAATTTGTAATGAAAAGAATCAAACTATAAGTAACGTATTTCTCTTCTTTAAAGCCACTTCGCCTTCAATTTACACACTTTTTTTTTTCTAATTGAAACATTAAGATTATTAGTATTATTGTTATTATA:1	+	chr3R	20305829	5'	-	mdg1	7054	4	69.86
AGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1	+	chr3R	12717720	5'	+	297	49	2	58.22
GAACACTTTAATAGTTTGCTTGTCTTTTGTCAACAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr2R	23803070	5'	+	roo	22	2	70.45
ATGCATAAATATTTATTTAATTTTAACACCCTTAGCCAGGGGCTATTTTAATATCAAAGACAAATGTTGCCGCCCGAGAAGCAACCCATCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAACAC:1	+	chr2L	17857659	5'	+	Idefix	7082	2	63.64
ATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATCCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1	-	chrX	6522077	5'	+	F-element	39	1	55.65
TACAATGTTTATTGTTGTGTTTCGTGGAGCGCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1	-	chr2L	18404621	5'	+	hobo	35	1	54.69
AACATAGTACAATGTTCCGAAATTGTCGATGATCATGCTGCGACTGCTGCCCAGAAGACTGCCCAAATGTGTGAGTTTAATGCTATTGTTAATTGGTTTGCTTGCTAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1	-	chr3L	15521444	5'	+	pogo	25	1	78.77
TTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1	-	chr2R	15064454	5'	+	412	4	2	72.82
AAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCCTATCTTATGTCAATGATTCGAGAGCG:1	+	chr3R	16076781	5'	+	roo	8724	2	59.15
TTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1	+	chr3L	7292439	5'	+	HMS-Beagle2	6922	2	61.64
CAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTT:1	+	chr2L	9399464	5'	+	Transpac	66	2	72.87
AGTACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	+	chr3R	18582148	5'	-	roo	9036	1	52.54
GTCAGTAAATACTAGAATATAAAATATTGTAAAATATAACCTTTAAAACACCTATTAGTAACATGAATCCAGATAGTATTAAATTGCCTCCACATATGCAACCAAAAACATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATG:1	+	chr3R	13528932	5'	-	accord	180	2	75.69
CTTTAAGCCTGCAAATACAGTGGTTACTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1	+	chr3L	6978120	5'	+	pogo	43	1	54.11
AATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr2R	14542113	5'	-	roo	9046	1	60.77
GGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGCCTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr2R	11164488	5'	+	roo	58	2	69.84
ATCATAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGCTTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1	+	chr3R	19589879	5'	+	BS	5022	1	63.70
GTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAAGACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATCGAGATTCAGT:1	+	chrX	2842468	5'	-	Tabor	7284	2	56.25
CATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTAT:1	-	chr2R	4774739	5'	-	baggins	5336	1	69.57
ATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAA:1	-	chr3R	11547771	5'	+	G2	318	1	56.30
AAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	+	chr2R	6086317	5'	+	pogo	60	1	66.43
AGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGCCG:1	-	chr2R	20497007	5'	-	blood	335	2	55.20
GAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATA:1	-	chr3L	17251146	5'	+	412	258	2	67.12
AAAGTCGAACTTAAATTGGCTAGCTGCTAAATTTGCTTTTATCTAAGATAGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1	+	chr2L	9399402	5'	+	Transpac	4940	2	69.86
TGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:2	-	chr3L	15177286	5'	-	roo	8986	2	77.40
ATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACTGCAG:1	-	chr2R	5924416	5'	-	jockey	4710	1	45.24
ATAAAATTTGAACTTCAAGTTTTTAAACTTAACTTAAAATGTTTTATGATGATTATAGAATAATTATAAATTAAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTA:1	-	chr3L	15089045	5'	-	Doc	229	1	50.00
AAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCACTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTG:1	+	chr3L	23456277	5'	-	Gypsy6A_LTR	262	1	69.17
TGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGCTACATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGTGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1	-	chr3R	13349162	5'	+	BS	5022	1	57.64
GATGCAGGAAGGATATATCACTAGACCCATTACTAAAATTTGTCCCTTGGAAGGAATAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr3R	19448055	5'	-	roo	9014	2	60.15
AAATTCGTTGGAGTAAACTGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1	+	chr3L	21855408	5'	-	blood	7355	2	63.01
AGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTGATATAAAGGCAAGGTGGAGTGAGGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGG:1	+	chrX	23202005	5'	+	R2-element	499	1	51.89
GGGACTCCTCTTTTGCACTCGCAAAAAAGCTTTCATATGTACTGTGTGTGTTATATAAACTACCGCGCAACATGCGAAATTCTCACGCAACAGAGCAAGACGCTGAAAAAAAATAATAAAAAATAAAAAAAAC:1	+	chrX	5026117	5'	+	Doc	4691	4	76.69
TTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTT:1	-	chr3R	13349139	5'	+	BS	5007	1	66.04
GAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chr3L	11393457	5'	+	roo	8683	2	66.94
AATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1	+	chr2L	17295841	5'	+	Doc	8	1	62.35
CAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAA:1	-	chr2R	21920560	5'	+	jockey	70	1	75.83
CCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	+	chr3R	17817871	5'	-	roo	9036	1	58.96
CTCATAATCCCAAAAGCTTTAATTTGACTAAACATTTTTGTAGTATCGAGCCTACAATTATCAATACTTTACTTCTTTATTTGACTGTACTATGAACAGCATAGCCCGGTAGTTGCAAGCTAATGGTG:1	-	chr4	221199	5'	-	Tc1-2	25	1	57.03
TTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1	-	chr2R	16373524	5'	+	Max-element	55	2	80.81
CTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chrX	5643496	5'	-	roo	325	2	76.03
GTCAGCAGGGAGATCAAAATGTTGGTCAGTGCCTCAATAGTGTCGCCCACAAAAAGTTCGTAGACCCACCACAAAATGAGAAAGATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAG:1	+	chr3L	10625006	5'	-	mdg1	307	2	55.48
GAACTGGAGATGAAAGTAACAGATGATACCTTATAAATTTATTTATAAAATCACTACTCAAATACCAATTTGAAAATTCAAGCTTTTATAGTTCGGTCATACGGACATGTCCGGATATGCTAGTGATCCTGATCAAGAATATATAT:1	-	chr2R	13259717	5'	-	INE-1	80	1	64.38
CCGCCGTCAAATTTCTGCGTAGATCAGTGAATTATATGAATATTCCAATTTTTTTAAAATGTCAGTCCGTTTAATTTGTCAGCTGAATTCGGTGCTCAGGCCATGCAAATTATTCTCTAAAACTATATGTACATATGTATAAATT:1	+	chr3R	10900776	5'	+	invader3	5087	1	51.03
ATATGAACATAGTTAATGAGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:2	-	chr2R	13817744	5'	+	412	7095	2	56.85
AGCGGGTTGCAGCAGATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAAT:1	-	chr2L	5254393	5'	+	roo	8664	1	71.96
AATTCTAAGCAACGCGTAACGATAGTTTTACGGACTACCAACCCTTATACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGA:1	-	chrX	15084766	5'	+	Stalker4	7052	4	67.36
ATAGTCGAATAACCAAAATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCTCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1	-	chr3R	19529213	5'	+	jockey	4688	1	51.08
TTAAAAAGGTCTTATCTGAAAGAAATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1	-	chr3L	1534750	5'	+	pogo	21	1	59.62
GAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1	+	chrX	10521609	5'	+	Tabor	6849	2	71.30
GGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGG:1	+	chr3R	24383240	5'	-	rover	278	2	65.07
AAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1	+	chr2R	13585434	5'	+	412	7131	2	77.04
TATATATATATTTTTTTTCTCTCTCTTCTTATTTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATTGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATC:1	+	chr3R	3692225	5'	-	G4	3722	1	81.25
GGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCC:1	+	chr3R	5061859	5'	+	mdg3	79	2	71.43
AATACAATGTTGCCAGATCGTTGTTATGAACTTTACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGA:1	-	chr3R	2690596	5'	-	diver2	41	2	76.71
CGCGTCCTTGCCCTGCTCCGGTTTATGATTTTCAGCTCTGTGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTAATAGATTAATTTTATATTTCAAATGAAAGTATCCATTAGACTTAGGAATCTCTTATGTTAAAGAAAAA:1	-	chr2L	21920828	5'	+	G4	3569	1	39.29
TTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chrX	5643589	5'	+	roo	48	2	54.79
GAAATCTTTTGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTG:1	+	chr2R	23332527	5'	+	invader4	2823	2	66.90
TATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTT:1	-	chr3R	28075387	5'	-	jockey	4914	1	70.55
AATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAG:1	-	chr3R	29397504	5'	+	jockey	4588	1	59.14
CGTCCCTCTGGCCCAAAAGCTCGAACATTGCAGGACGCAAATAGTTGCGGCCATAACTTTTAAATACGAAGATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chrX	14335057	5'	+	roo	8686	2	70.97
AAACTCCCCCGCACTACGCCCTTCACCTTCGAGCTCTTCAGCCAACTTCTTGGGTTACCCAATTCGAATACAGTACGCTATCTTATCGATGGACTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTG:1	+	chr3L	1093270	5'	-	R1A1-element	245	1	76.03
AGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAAC:1	-	chr3R	11547756	5'	+	G2	322	1	65.74
TAGCCAATTGATTGGCCTTCATGTGTTAAATACTCTTGTCAATGCGAAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1	-	chrX	6279450	5'	-	P-element	2833	1	48.63
AGGATTATATGCCTGGCTAATGCAAATATCAATTAGACAATCATCGGAGTTTCGAGTGTGGCTAAATAGTTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATATC:1	+	chrX	17640202	5'	-	Porto1	4389	1	60.96
ATTCCTGTTCGCCTGGTAATTAAAACCGAATACTCACACAATGTGCCTTAAAAACAATAAAACACCTTTTTTTAGGGTTTAAATCATTTTTTATTATTCATTAGGAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAATGTGTAGCTTAAA:1	+	chrX	6952083	5'	-	G5A	2780	1	62.50
CGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1	-	chr2R	9662783	5'	+	412	7133	2	76.03
AAAACAATTACACAGAAGGCCAATGTGCTGATTTAGATTTCCATTGAAGCGTATTGTTGGGTAACCCAGAAAAGATCGCCCACGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTC:1	-	chr2L	6988841	5'	+	mdg1	490	1	56.94
ATAGCAAGTAATTCATCAATTAAAGCGTAGCCCAAGGAGCACGCGAAATCTAAAAAAGGCCAAAAAACATAATTTCTTTAATTGGTGCTGGTAAGTGGCAAAAAGTCGGCAGCGTCGCAGCAGG:1	+	chr3R	5252817	5'	-	HMS-Beagle2	7068	2	83.06
AACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATT:1	-	chrX	12074601	5'	+	412	7195	2	68.70
GCAAAAATGTATTGACATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	+	chr3R	19968052	5'	-	roo	393	1	73.97
TTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1	-	chr3R	6611294	5'	+	HMS-Beagle	6823	2	57.89
CTGAATTTGATTTCACATAACCATTTTTTTCTTTAGTTCCATTTACCAGCATAGGCACCAAATATTTCAAAACATCAATGCTACTTTGATTTGCTGCCAAATTTTTGATGAGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCC:1	+	chr3L	27967513	5'	+	invader1	92	2	73.38
GCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr2R	9328606	5'	+	roo	8724	2	64.93
AAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3R	12886977	5'	+	roo	75	2	74.66
ATTAAATATGCATTCAGAAACAATAAATGTCACCCACTCACTACATGCAAATAGTTTAGACTGCATTTATTTTAGTTGGTTCCATTATTTATTCAGCTATCGTATATTACGCAATGTGTGTGTGTGTG:1	+	chr3R	19219923	5'	-	accord	261	2	58.59
AATGGGTTCCGTTTATTTGTTTGGTTCTAAAGCGAGTGATGAGCGACTTAATTGTAGATTTTTGCGGATTCCGTTTAATTTGCCGTTTTCCCTAAAAAAATAAGCTCATTAACCAAAGAAAAATATATATATTTATTTGTGGTATG:1	+	chr3L	24349666	5'	+	Transib-N1_DM	383	1	68.49
AATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATACATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTTTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCA:1	+	chr3L	25782379	5'	-	Stalker4	7028	4	59.52
ATAAGAAAAAGGTTCTATCACAACCTGCTATATAAGCAATATAAGTTCTTGAATCAAAACAATCTCAATCTCAAGCTGAGATACTTTATAAGTAATTACAAATTCCAAATGCTTTACTAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGG:1	+	chrX	19536884	5'	-	Q-element	239	2	71.92
CGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1	+	chr3R	20499754	5'	+	mdg3	67	2	60.27
AATACAAATTCGGTCTCGCTGTCTCACCAATACTTCTCCCAATATGACGAGTTCGTTCTTTTCCAGATTTTCTTTTGTCCAGCTACATTTAACTTAACAGCTAACCATAGAACGATGCTTGGCACAGTCTTT:1	+	chr3L	25442985	5'	+	Cr1a	4024	1	58.33
CTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTGGCATAAGAGTGCCGCCGCG:1	+	chr2L	22315533	5'	+	frogger	3	1	64.96
ATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chrX	5643498	5'	-	roo	9010	2	73.17
GAAATCACTTCTCTTTTTAAAGAGATGATCCTTTACAATATGGAGGATTTAGTAAGGGTTCGACTTACTTACACACAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAA:1	+	chr2R	4186729	5'	-	copia	79	2	54.79
GTGGGCGTCTGTGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAG:1	+	chr2L	19310277	5'	+	Juan	4087	1	65.07
TTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCC:1	-	chr3R	29397490	5'	+	jockey	4613	1	76.92
ACTGCACTAAAATTTAATAATAAAAAAATATGAAATTCATAAATTATACATGGAATATATTGAAATAAATAAAGACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1	-	chr2L	20808436	5'	-	HMS-Beagle	7004	2	57.86
AAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr2R	20596552	5'	+	roo	8728	2	66.21
TCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1	+	chr3R	19446112	5'	+	297	36	2	60.27
ACAATTCGGTGCAGATTTCAGAAGATTCACCAGGGCGCTCAATTCCACAACTGTGACTCGCAAAAGAGCTTTGCAGCTTGCCAGTTTTAGCAAGCAGATTAGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTT:1	-	chr2R	23482887	5'	-	F-element	4348	1	67.59
TAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1	+	chr3R	18339061	5'	-	roo	9035	1	58.90
CACACACGCACACGCAGGCGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGC:1	-	chrX	18214939	5'	+	1360	91	1	77.91
ATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1	+	chrX	13066525	5'	-	jockey	4910	1	75.34
CCGCGAGAAAAATTATAAACATTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1	-	chr2R	17965798	5'	+	hopper	141	4	70.00
GAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTA:1	+	chr3R	9210649	5'	-	mdg1	357	2	72.36
CATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCATGTGAGCGTGAT:1	-	chr3L	21855523	5'	+	blood	74	2	67.81
CACAGAGCCGGAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1	+	chrX	21016722	5'	+	Transpac	34	2	60.96
AAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1	-	chr2R	2016923	5'	-	1360	3333	1	54.79
TTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1	+	chr2L	16223108	5'	+	Tirant	12	2	62.79
AGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1	-	chrX	21016825	5'	-	Transpac	249	2	76.67
AGAAAAACGTAAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	-	chr3L	11441874	5'	-	roo	9054	2	71.23
CTATATTTTTAGCCGAGTGTTTAATGTTGGTCAAATTAGATACCATGTTTATAAATTTTGTATTTTATTAAGATATATTTCCTCGTTACTCGTCAAATAATATGGTATACTAGATTCGTTGTAGGTAACAGGCAGAAGGAAGCGGT:1	+	chr2L	21362214	5'	+	INE-1	32	1	54.11
GATTCTGTCAGTGCATATTCTTACCTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGG:1	-	chrX	7193152	5'	+	P-element	120	1	19.26
GTAAAACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr2L	17420267	5'	+	roo	8699	2	59.26
GAGTGCAAGTAGCAAATGTCAAAAGACAAATGCTGTTGGCAAGCGAAAAAGTAAGGGAAACGAAATGAAACGAAACAAAACCCAAATAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAA:1	-	chr3R	22955597	5'	+	roo	8728	2	64.44
ATGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1	-	chr3L	20033766	5'	+	blood	7031	2	48.35
CAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCACTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1	-	chr2R	15064433	5'	+	412	7115	2	62.14
GTGTTTCATACATTCATATATATGCATATACATATACATATGCCTATATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1	+	chrX	2734362	5'	+	flea	4792	2	63.30
GAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chrX	23362225	5'	+	roo	22	2	68.89
GCAAGATAAGATTTGATGTTGATATTCTTCTCATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr3R	17818033	5'	+	roo	13	2	75.34
GCTATACTTGGCGCGTCAAATCAGTACGTCTGACGATATTCAAGAGTGAGGGAAGAGAAACTGCGGTACGTAAAATTCAGAACTTGTATACTTTATAAGTTAACAACTGAAAGTATAACTTACAGCAACTAAGTAACTTTGTATAA:1	+	chr3R	1869858	5'	+	gypsy	31	2	58.22
AAACCTCCACTTTCCGTACAACCGGACATTACCAAACGGCAAGTATTGTCTTTATGTTTTGTTTACTCTCTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCA:1	-	chr3R	2747070	5'	+	Cr1a	263	1	65.38
GACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTCATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCG:1	-	chr2R	4270289	5'	+	gypsy9	5045	2	54.11
CTTGTGCGCAGGTCATAAAAAACTCCATTTTATGCTCCCCCATTCATAAGGCGAGGAAAGTCCTTAGCTCCGAAGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGT:1	-	chr2R	14764927	5'	-	P-element	288	1	52.05
AATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAA:1	+	chr2L	13907313	5'	-	baggins	5126	1	39.04
GTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	+	chr2R	11629727	5'	+	Tirant	15	2	70.69
ACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCA:1	+	chr3R	4604452	5'	+	1360	433	1	62.33
ATGTGGCACATATAAACTTCAGCCAAACCAGCAGCACAGCGGGTTGTCCCATTCAAGTGGCCATGGCTGTGCAATATCTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCA:1	+	chr2R	17626806	5'	+	opus	134	2	67.19
GTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATATGTACACAGCAACACTTAG:1	+	chr3L	11957116	5'	+	blood	37	2	52.00
ATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1	-	chr2L	15991418	5'	-	mdg1	7413	2	52.41
AGCTTCAGGTTAGCACAAGGAAATGTAATATCCCGGCAAACCGCATACACATATATACATATATACATATATACATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGA:1	+	chrX	6485639	5'	+	roo	421	1	57.50
AGCTAGTACTAGCATGCTTTTTCTTGTGATAGCTGCACAGCATTAGGTTTAAAACATCGTCTATATTTACCCTAGGGGCCCACAAGTCAGTCAAAAATAAACGGGATTTCATTTTTTCCTATCTACACATTCCATTTTAC:1	-	chr2L	21672596	5'	-	HB	107	1	71.43
CTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCGTG:1	-	chr2R	20194307	5'	+	Max-element	8270	2	54.33
GCCCATTTAAAGTTGACATAAAATTCCACTTAAACACCTGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1	-	chr3L	3501073	5'	-	opus	7482	2	72.60
TTTGGTTAAGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr3L	20831256	5'	-	roo	388	2	67.72
ATGTACTAAGGTTAAAGTTGGCGAAATAAAAATACGATTAATTGATCCAAAAGAAGCAAGAAGTACATAAGTTAAAATCAACCAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAGAAAATCCAAAAAAATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACGC:1	-	chr2R	3203545	5'	-	invader1	4011	2	67.81
ATTTCCAATTCTTGAAAGAAATCTGTTTAAATAGGAATTTGGGAGGGACAACGGTAACGGTGCAGACTTTGGACACAAAGAGGACAGGAAGGGCACCGTGAACTAACGGGAATTTAGTGGGACTTTGTACCCGAGCGGGCCGTGCG:1	+	chr2R	5275211	5'	+	gypsy8	291	1	66.44
ATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr3R	12886914	5'	-	roo	9018	2	68.70
AACTGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGG:1	-	chr3R	11547833	5'	+	G2	280	1	80.42
ACCTTATCAAGATGTATTAAGCTCTAATCATAGACGTTGATTTACCAGGCCAAAGGCAGACCCAGTTCGCGCACCCAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATG:1	-	chr3L	7940821	5'	-	Burdock	57	2	66.39
CAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr2R	23803037	5'	+	roo	8725	2	63.77
CTTTAAACACTGTGGACACTGTCACTGTCGCCATGTAAAATGTTAATTTTTATAAGACTAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTATTAATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGC:1	-	chr2R	1531562	5'	-	Stalker4	7246	4	84.25
TAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATA:1	+	chrX	21087581	5'	+	mdg3	5295	2	54.11
AACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATA:1	-	chr2L	12290777	5'	-	1731	4601	1	61.29
AGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1	+	chrX	10521605	5'	+	Tabor	6874	2	59.72
CGCTAACAGCAGACGCGACGAAATTACGTATACGCCACGTTGCTGCCACGCCAACTGTTGCAACCCCACGTAGCCACCATGGAGTGCCTCAAGGTTGTCCCGAAGCAACTTTCAACTTTACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGG:1	+	chr2R	14556509	5'	-	G4	3494	1	78.77
ATGTTGACATTTTGAACTCCCATTTCTTTGGCATTTATTCTCTCTGTGTATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACCCTCGGCACTCTATGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTT:1	+	chr3L	7188537	5'	-	hobo	2871	1	61.64
CGATATTCACTGCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1	+	chr2R	20496935	5'	+	blood	52	2	70.00
TGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTACA:1	+	chr3R	21705945	5'	+	297	6597	2	68.89
GTAAATCGAAACCATAGTATTAACAAAAGTCCATTGGTGAATCATTAAATAATGAACACAATAAATGTTAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGA:1	+	chrX	13084074	5'	-	jockey	4803	1	57.24
TTTGAAATAAAATAAGTTCACTTTTCATAGATTACGAAAATTTTAGAAGATAAGTCAAATAATTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1	+	chr2R	9258354	5'	+	3S18	5772	2	77.93
CTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1	-	chr2L	15833076	5'	+	hobo	56	1	64.57
AAAAGGGTATATTCGATTCGTTCAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAGGCGTTTCCGACTATATTGAGTATATATATTCTGGATCAATAGCCAAGTTGAGATCTCAGAAACTATAAAGGGTAGAAGGTTGAGATTCAGCAGACAGA:1	+	chrX	14957088	5'	+	INE-1	175	1	87.67
CAGGTCCAAGCCGATGAAGCTGAAGCTCTGGCCAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCCACACTTA:1	-	chr3R	10182240	5'	+	blood	36	2	61.64
TAGTAGGAGTGTACTAATGCGTTTGCAACCTGCTAATCAAGAGTGCAAAACTATGCACATGTTAAAGTTTGATGGCGCATTGGCCTCTTTCAAGCGAATGTACTAATAAAGACATTCTATAAAATATTAATTTATTTTTATCA:1	-	chr2R	22997958	5'	-	mariner2	829	1	62.94
AAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1	+	chr3R	12618630	5'	+	F-element	42	1	62.92
CAACACCAGCACACATCACTGCCTCTTATACCTACCTGTGTACAGGTGAGGGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1	+	chr2L	6569928	5'	-	jockey	4963	1	53.54
CCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAAT:1	-	chr2L	13585934	5'	-	Tabor	7268	2	53.79
GCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1	+	chr2R	11629737	5'	+	Tirant	34	2	57.60
CAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTATCAG:1	-	chr3R	11547754	5'	+	G2	351	1	74.07
TTTAGAAAAAATATGCACAGAACCCAAATTCAGTTTTTCATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1	+	chr2R	16785307	5'	-	412	7537	2	70.54
GACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGTGCAATCGAGTGG:1	+	chr2R	12835018	5'	+	jockey	15	1	73.33
GGAAAAGAGAAAGGTTCTTTAGAAGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGNAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1	-	chr3L	15600385	5'	-	roo	407	1	69.86
CTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGGGTTTTCCTTGCAGTTG:1	-	chr2R	20497020	5'	-	blood	345	2	48.44
ATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGC:1	-	chrX	21014831	5'	-	copia	5037	2	78.77
TTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCA:1	-	chr3R	14979867	5'	+	pogo	82	1	73.97
ATCAACGTGGCAGTATGATCACACTTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTA:1	+	chr3R	18346547	5'	-	INE-1	544	1	35.62
GCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCAT:1	+	chr3R	21276528	5'	+	BS	5052	1	54.11
ATAAATACTTTTTATTGCCTAACTCATAAAATAATACTGCATACCTTGACGAAATAAATTTGCGATGCATACCCAACATAACTTATTATATTGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAGTAAATAAATA:1	+	chr2R	919649	5'	-	copia	229	1	67.12
AGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	-	chr3R	7835187	5'	+	roo	26	2	63.86
AAATATGCCAGCACAAATATAGACATTGCGAGCAAATCTGCAAAGTAGTTGAGAGCCATGCAAATAGCCAATTCCAGACTGCTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATAAA:1	-	chr3L	12911172	5'	-	P-element	2573	1	54.11
TGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCTGCACAAAATCTGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1	-	chr3R	17831882	5'	+	F-element	61	1	54.14
CATTCAGTCCCATTTTCGCTTCAGGGTGCAAAGGTTTGTATTCAACGCAATGCTCCTCATTTTTAGCATTATTTGGTTCATTATTACACCACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCG:1	-	chr2L	4411668	5'	-	Quasimodo	237	2	63.57
GTAATGGAGTAATGAAGAGTATCACTATTGATTCACGCTTTACGAAGCAATTGCTAAATGTGAGGAATCCTAAAATTCTCGTCTATCTCGGATTCTTGGACTGTGTTTCAGGGAGGTCTGAGAAATCAACTTGT:1	-	chr2R	558062	5'	-	Ivk	284	1	58.96
GCCCATGCTCTCTTTTACGTGGTTGCGTCAATTTATATTAAATATATGTATTTTCATACATACATATGTACGTATAAATATGTATTTATTTTTTCTTTTTTTTTT:1	-	chrX	1569468	5'	+	hopper	143	13	55.24
CGCCAGTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	-	chr3L	9998226	5'	+	roo	8693	2	65.25
CTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATTCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chr2R	9632215	5'	-	roo	9037	1	59.71
AAACGGTCGAGTTAGCAGGTAATGGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	-	chr3L	10773181	5'	+	412	39	2	59.31
AAGCACGCCCAGCTGTAGCTGAGCTGCTCCTCTCGCGGCAGCCTTGCACTGAGGATATAGTCGTGCACCGTATAAGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCTTTTGAAAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCG:1	-	chr3L	2298374	5'	+	invader3	5359	2	54.14
ACAGGTTGCCCCAGCTAACTCATCCATTTATCCATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1	-	chr3R	21706088	5'	-	297	6921	2	60.96
CGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	+	chr3R	27994179	5'	+	roo	8713	2	57.04
ACATTTATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACCACTCCCGACGGTCCTCCGCTCCGGTGTCTCTTCACATAGGCAGCCCCCTCGTTCCATCCAACTTCTCCGCTCGTTGTCCTG:1	-	chr3R	3389443	5'	-	gypsy8	4555	1	67.52
CACAAGTCTTTTTGTTTTTATTGCAGGCTGACTTAGGTTTTTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGG:1	+	chrX	21948946	5'	-	412	312	2	83.56
AATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1	-	chr2L	9668251	5'	-	1360	3318	1	77.34
TTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTAACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr3L	9998205	5'	+	roo	8682	2	65.14
TTCATCATATATTAAAGAAATATACAATTTTTTTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1	+	chr3R	11105941	5'	+	Doc	57	1	55.48
TTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1	+	chr2L	14892226	5'	-	transib2	2744	1	73.29
CTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCATCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGTGCCCTGT:1	+	chr3R	26431984	5'	+	opus	164	4	64.91
AATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1	-	chr3R	17243213	5'	-	hopper	1394	1	57.14
GTTCACAATGGGGCGTTAAAACACCCCATAATTCCTTGACGCCCATTTAAATAATCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1	+	chr3L	5152256	5'	+	opus	64	4	50.91
GTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTAGTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTAAATCTCAACCTTCTAACTTTTATAGTTCCTAA:1	-	chr2L	7088857	5'	-	INE-1	154	1	78.77
CACACACTTAACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCC:1	-	chr2L	12290786	5'	-	1731	4589	1	58.62
GAGTTCCCGGCTCTCAGAAGCAATAAAAGCCAAAGCGTAAATATTTAGTGGTATTCAGCTGGCAGCTCTTCTATATATGTATGTGCTTCTAGATAAATTCCCGTCATTTCCCCTACGTTGCATTTTGTTACACTTTTTTCATAGCA:1	-	chr3R	31886692	5'	+	HB	1407	1	78.08
CTTCGAGTACCTAGTTGAAACTGAACTTGATTCCGCATAGCGCACAATTGACGATCGATAATAATCGCGCTGTATGTATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAC:1	+	chr2L	14110715	5'	+	Quasimodo	40	2	61.64
GAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATA:1	-	chr3R	22822125	5'	+	mdg1	7096	2	54.79
CTTGGTGCGCTTTACGGTGCCCTCGCCAACTCCAACTATCGGTTCCACAGCAACGGCGACTCCTTCGATTACATTGCAATTGGAACTGCGCTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGCTCTATTGTACTACCCC:1	+	chr3R	24940428	5'	-	baggins	5394	1	70.23
TTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr3R	28624551	5'	-	roo	354	2	56.16
TATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1	-	chr2L	15833073	5'	+	hobo	65	1	68.42
GTGCCGTATGCGTAATATTAGCGCATTAATATGTGCCACATAGCCATGTGTGTGCATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTG:1	-	chrX	18185275	5'	-	Quasimodo	34	2	69.44
ATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGATCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1	-	chr3L	20831353	5'	+	roo	70	2	74.62
GCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATATGTGACATG:1	+	chr3R	12886910	5'	-	roo	9001	2	69.12
AACTGAAACCGAAACCGAAAAACAACTGAATCTAATGTGCATTTTAAATAATATATTAAGTGAAATTACTTAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGCGTTAATCGATCAAAAATAATATAGAT:1	+	chrX	11558632	5'	-	1360	254	1	50.36
ATTTGCAAGCGCCTTCTTCTGCACAGAGAGAAAAAAGGTTCTCGAATGCAAGTACTACCACTCAAATCAGTTAGATATTATACTTACCTAACATCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCT:1	+	chr2L	1863059	5'	-	F-element	313	1	78.15
AACGCCGTCTGGTGACAGAAGCGGCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1	+	chr3L	10773062	5'	-	412	7507	2	55.37
ATGTGAAGCGCTTGGCAAATATGACAGTGAACCAAATGTCCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAAC:1	-	chr3L	15490395	5'	+	copia	4940	2	73.33
GTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3R	17420408	5'	+	roo	56	2	59.31
GTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1	+	chr2L	15832972	5'	-	hobo	2902	1	57.04
TGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1	-	chr3L	10574380	5'	+	Tabor	6898	2	55.48
ATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	+	chr2R	9791590	5'	+	412	7119	2	68.35
AGTCTTTTATTTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1	-	chrX	6522089	5'	+	F-element	43	1	59.29
GCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1	-	chr2R	14388001	5'	+	roo	8669	2	60.56
CGATTGTTGCAGCGGATAAAACAGCTGATAGCGCAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGAGCAAGACG:1	-	chr2L	22373929	5'	+	Doc3-element	245	1	55.84
ATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCACTCACACTAACAAAATTGCGCTGCCTTTATGGCCCTGTAAACTGTGTTCTTAATGTCAACCTTCTAGCCTGTACAGTTCCTGAGATCACGACGTTCATACG:1	-	chr2L	7112792	5'	-	INE-1	136	1	64.18
ATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACA:1	-	chr3R	21276631	5'	-	BS	5040	1	53.42
TAAGAAACCAAGTAACAAGTTGAGCTTATAAGCGTAGTAATGAAATTTATATGTTGAGTATAGAACCATCCAATTAGTATGCCTGAAGACGTAATGTATGTCTTCAGTGAAGGAACAAGTTTTTAAATCAAAATTAAATTAGAATT:1	-	chr3L	4881448	5'	-	Rt1b	124	1	58.90
ATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGGGTAAGCGGCCAATGCTTGCACTCGAAGCTCC:1	-	chr2R	16373522	5'	+	Max-element	8283	2	76.67
AAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATTTAATTTAATTGCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTG:1	+	chr3L	21484243	5'	+	1360	466	1	73.97
AAACTAAACATGGAGAATAAAGTAATGGAATTACTTCAACAATTTTCCCACGCCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTCTACA:1	-	chr3L	25827838	5'	+	roo	9071	1	63.01
ATTTTGTTGCCAAGTTTCCTGAATTGTTTTTGTTGCTGTGGCTTATTATTGTTATACGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1	+	chr3L	2840913	5'	+	copia	4929	2	61.43
AATGAAGTACTCATTAGTCATGCAGGGTCTGCGGCACTTGAAAATTCAGTTTACACACCTCGACGAGAACAAACGATACGAAAATACGCAAAGAATATGGTGTGGTGGGCTTGCTTGTACAAATACCTTTTCCCTAC:1	-	chr3L	9585012	5'	-	Gypsy12A_LTR	2150	1	70.07
AACTACACAAAATTGTCGCTGTATTGGCTGCCGTGCTGGGGAAAAAAGAGGTCAGTGGGTGGGCTTTGGTGGATCTATATACTTGTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTT:1	+	chr3R	24078708	5'	-	I-element	5139	1	71.05
GACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCCAGCCACGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTA:1	-	chrX	21575415	5'	+	INE-1	142	1	45.89
AACAAATAAAACCGGTAAAATATAGTAGCTTAGCAAAGTACAATATTCTTTTTAGGCTATTAATTGCGCCTTCGCTGCCTGGTGAAGTCGGCAGAGAAGCGGCTG:1	+	chr2R	2777455	5'	-	gypsy11	4258	2	67.62
CACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATA:1	+	chr2R	1857480	5'	-	Tc3	316	1	69.05
ATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1	+	chr2R	21229007	5'	+	jockey	33	1	52.87
CGGGTGGATAGGTAGGCAGTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	+	chr3L	11957098	5'	+	blood	7044	2	59.71
ACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCA:1	-	chrX	22715160	5'	+	Bari1	30	1	60.63
GGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	-	chr2L	11518450	5'	+	412	47	2	74.74
GATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr2R	14387999	5'	+	roo	8733	2	72.18
TTCTTTGTTTTATTGTCTGTCTTGCCAATTTATATCGGTATACCAAAAAAAACTGTACCCTTCTCCCACTACACTCCCCTCTCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCTTAGAGCCACCTC:1	-	chr3L	24787898	5'	-	1360	74	1	66.39
CTTCATTGCTCTAGGGAGCGAGTATTTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAG:1	+	chr3L	27349079	5'	-	roo	304	2	64.47
AAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr3L	9998214	5'	+	roo	40	2	57.14
TGGCAATACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAAT:1	-	chr2R	5198493	5'	+	INE-1	83	1	63.45
GCCGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGTCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1	-	chr3R	14979890	5'	+	pogo	59	1	58.22
GGCCCTGCCTAATTCAAATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	-	chrX	13066631	5'	+	jockey	17	1	73.13
ATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATATTCTAGATCTGGATCAATAGCCGAGTTGTTCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTC:1	-	chr2R	19878795	5'	+	INE-1	126	1	76.03
ACAATTATGAAGTATCCGGCTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCGAAGTTTTTTAGGCCTCACTGGATATTATCGAAAATTTGTGCGAAATTACGCAAAAATTATTAGCTATACTTATACAACCTTGTGTCAGGTTGATCTTCATGT:1	+	chrY	3572309	5'	-	Bica	145	1	75.34
AAATGCAAAAAAGTTAATTGAATGACTATCTGCAAACTTCAAAATGTATATTATATATCATTAAAGATATGGGCTGGTGTAAGGCAATGCAAAAAAAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGTGGTCAAATTT:2	-	chr2R	16581825	5'	-	Transib-N1_DM	10	1	81.51
AACGACTTCAGATTCCGGGAAATGTGAGGCAAATAGAATTATTTAAACTCATTTGCGCTGGTAATGAATTGCTAATTCAACCAACATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1	+	chrX	13060786	5'	+	jockey	98	1	61.64
CATGTTTGTGGTGTTGTTAGCAACATCGCTGTTGTGCCCTCCAGTGCAGCAAATGACATTATTAACCCAGTTTCTCGTACTTTAAGCTCACAAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAGTAAAAGTAATATAAAGAAC:1	+	chr2L	13586609	5'	+	Tabor	460	2	63.70
TGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1	+	chr2L	3114463	5'	-	roo	9024	2	52.74
AATGTTCGCATAATTGGCAGAGTTTTATGAATCTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATC:1	-	chr2R	9258518	5'	-	3S18	253	2	76.03
CAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1	+	chr3L	18368921	5'	-	opus	7448	2	65.91
TAGTTATTAGATCTAACAACGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1	-	chr3R	21434969	5'	-	412	7481	2	63.70
GCATATATTTTTTTTTAATAATTATAAAAACCAAATGTAAAATTGAGCGGAACCTTTCTGTCCGATGAGAAGTTCGGAAACCTGTAAATTCATACGGATGAATTAATTTAACAACAAATACAAAAAAAACAAAACAAAAAA:1	+	chr2L	11903336	5'	+	G2	3076	3	40.43
ATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1	-	chr3L	10773143	5'	+	412	7113	2	67.97
TGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chr2R	9632198	5'	-	roo	349	2	56.85
CCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTT:1	+	chrX	6499863	5'	-	Quasimodo	245	2	59.60
GATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2L	21132332	5'	-	roo	355	2	57.46
CAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAACCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGTGGAC:1	-	chr3L	21855516	5'	+	blood	7017	2	59.15
AAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTGAGCGATAAATTAT:1	-	chr3L	19334317	5'	+	roo	8733	2	78.12
CGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1	-	chrY	2720357	5'	+	297	61	2	74.63
GGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chrX	6486778	5'	-	roo	320	2	79.45
AATTAGATGGTGAGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1	+	chr3R	30344603	5'	-	pogo	2050	1	56.85
AACTATTCGTAACTGCTGGCTGAGTTAGTTGGGTCTCATCTTCTGGTAAGTGGTGGGATCCCATCCGCACATCATCGTCGTCATCTTCCTGCCTAAGTCCTGGCAGGTGTTCCCAAAAGGACAGAAGTTTTTCT:1	+	chr2L	7207076	5'	-	baggins	5004	1	65.67
GCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACC:1	-	chrX	17833049	5'	+	Tirant	63	2	78.45
TATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCA:1	+	chr2R	9258418	5'	+	3S18	72	2	65.75
AGAAATGTATACTTTTTCCGGATAGAGCTGTCTAGAAACCTGTTAATTTTTTTCTTTCCAAATCTGTATTCGGTTAATTTTAATAACTTGTCCAGTTAAATTTAAAACCAGAGAGAATGATATAGTCGAGTTC:1	-	chr3R	7040272	5'	-	INE-1	574	1	23.31
ATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1	+	chr3R	25339987	5'	-	mdg1	7380	2	71.23
AAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:2	+	chr3R	7835119	5'	-	roo	342	2	63.70
GAAAGAAATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTAGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1	-	chr3L	1534733	5'	+	pogo	20	1	52.33
CCTCGACAAAGCATCTTTAACCACATTTAAACGAGGTGGTGGTGGTCATGTTATATTTGGTTTAACAAATGCTGATACTTTTACGGGTGGAAGAATATTTTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCTCAATCT:1	+	chr3R	3860274	5'	+	Transib5	2862	1	67.88
GTTATGGTAAGCAAAATTATTTTAAGTAAAACTATGTATAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1	+	chr3R	2461587	5'	-	mdg1	338	2	73.97
AAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCCCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCA:1	+	chr3L	19013938	5'	-	invader3	221	2	69.30
ATTGCAAACGAAACACCAAAGGGTTTTAGGCATAGAAGTTATTTGAGTGTTAGCCTTTTCCAGGCAGAGTATTTCTTTGATAATAATTACTGGGACGGGAGCCAACGGGGCTAAATTAAAGCGATTCCGAAATTCAAGCTGTGTTT:1	+	chr2R	5499354	5'	-	mariner2	204	1	60.96
AAATCGTATTGTCGATGTTTTCAGGATGTGTAGTAAATGTAACTTTTGTTTTTGAATGATCGATGGTATGAACTACAAATTAGCTACCACCACGGTTATCTTATCTTATATTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGCATGCTC:1	-	chr2L	7021164	5'	-	Stalker2	193	3	65.71
CTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACG:1	-	chr3L	19014022	5'	+	invader3	10	2	66.67
CTTGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1	-	chr2R	20194334	5'	+	Max-element	16	2	71.11
TGATATGCAGATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chrX	6486842	5'	-	roo	388	2	64.34
GTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chr2R	19004218	5'	+	roo	8672	2	68.35
GATACACAAGGGCGAGACCCTGATCACAAACGGCGATGTTGAGGCCGGCGTGGAGCATCTAATCAACGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCG:1	-	chr3R	10735616	5'	-	X-element	4434	1	65.14
AAGAGTTGCTTTTTGCATCGTTTTTCAAGTGATTTTAAAACCATTGCACTAAAAATAATATAGATCTAAAGCCTAAGAACTTCTAAAGTGGCCATATTTTCTCAAATTTGGAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACACTTGT:1	-	chr2L	20098733	5'	-	1360	170	1	66.44
GCCTCAATTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATA:1	+	chrX	21564650	5'	-	diver	178	2	54.41
AACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATT:1	-	chr2L	13585900	5'	-	Tabor	395	2	77.24
TGCTGTTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	-	chr2R	14388042	5'	+	roo	37	2	58.33
AATTGCACACGATAGTAGAAAGCAAATAGTCATTTCCGCCAGGAGCAGAGCATAAAGTAAATTGCGATCATTACATTTTACAAAATATGACCTTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATG:1	+	chr3L	23227905	5'	+	1360	264	1	52.74
GATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	-	chr3L	16343299	5'	-	roo	9020	2	58.27
GGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATCGAGAACACGTGTTTTCC:1	+	chr3R	10182128	5'	-	blood	354	2	52.13
GTGGGATTACCTCGATTCTTGAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1	+	chr2R	6919665	5'	+	hobo	68	1	60.69
AACTATCTACCTGCATCGTTCTGGTTCCTAGAATTGTTATTTGAATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATTGCAATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTGTCCTAT:1	-	chr2R	3515246	5'	-	Porto1	4200	1	65.08
AGAAGAGCTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTTACAATGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATTTATGTATTCTTTATTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1	-	chrY	3648931	5'	-	297	6950	2	67.81
AAGCAAATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACAT:1	-	chr3R	24383321	5'	+	rover	74	2	68.49
TATTCTGTATTTTAATAAAATCATCGTCATCCAGAGTTCCAGCGACTTCCATTTACAAACAGGACCTAACTCCTTACACGTATGATAAGTACATATGTGTACACTATAATTAA:1	-	chr3L	24230644	5'	+	G5A	2737	1	56.64
GTTTGTNAAACAATTTTATCATTCATTTTGAGCAGTCTTCTTCGTATCACCTCCGTTTGCCACTGAATATTTTTGGTCATTTTTTGTTGGCTCCTTTGTGTTTATTGAATTTTTTCCAAACGAAGACCAAAAAATCTCT:1	+	chr3R	26503954	5'	+	Tc1	333	1	76.26
ATGGGATGTATATTTTTAAATTCTTGTTTATAGTCAAAGTGTGCTGCCTTATTTTCCTACAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACCTGAGATCGTTCCCCGCCTCCT:1	-	chr3R	18580346	5'	+	roo	8838	2	57.53
TGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chrX	6486800	5'	-	roo	9006	2	64.38
CGATGAGTGTGTGATCCTGGATGACGACGATGAAGAGGATGAGGATCATGTGTACGACGATGAGCCCCAGAGCGGTGATGGCGATGCCGAGGGGAAAGCTCAGGACGATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATGTAAATATAC:1	+	chr3R	24818104	5'	+	Stalker4	81	4	74.66
GCGAAATACCAGTGGGAACTATTTTCGATTAAAAATGTATTGCCCAACACCTTTGTGAGAACGCAACTTTTATATTTTAGCCTTGTCAGACACCTCTTGAAAAATCTCAAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTC:1	-	chr3R	7228614	5'	-	copia	64	2	76.22
GAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATA:1	+	chr2R	7586161	5'	+	I-element	5118	1	73.79
CCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1	-	chr3R	30344704	5'	+	pogo	40	1	60.71
CCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGTCATGAGAATCGCATCT:1	+	chr3R	12886912	5'	-	roo	8989	2	72.60
AACATCGATCGCAAGGAGTTGCACCGGGAGCTCAAGTTCAATGCCAGAGTGTGAGTATTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGG:1	+	chr2L	20813308	5'	-	copia	109	2	60.42
GATTCTACGAGACACGTATCCTTCGCTGTGAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1	-	chr3L	11957232	5'	-	blood	7340	1	52.05
ATAAAAGTTGATATATTTATATATGCTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGGCTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCAATAGCCGTCTGTCCGTATGAACGTCG:1	-	chr3R	21951947	5'	+	INE-1	127	1	80.30
AATTTATGCCACACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1	-	chr3L	7188615	5'	+	hobo	66	1	69.57
GGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1	+	chr3R	26431986	5'	+	opus	162	4	70.91
GACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTT:1	-	chr3R	25423300	5'	-	3S18	6049	2	57.34
GCCGATCCGCAAAATGTCAAAAATTACAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAG:1	-	chr2R	4183312	5'	-	mdg3	5290	2	63.01
TCCCAAAGGACTTTTCTCGCCCCACGACTTACTTCATTTTCCATCCAATACAGTCTCAAACACTCGTGCCACCAGCAAACAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGATTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAACTC:1	+	chr2R	20725556	5'	+	mdg1	7447	2	56.16
TTGAAACGCATTTGCAGTGCAGCCGTTGCAAGTGCGTTCACCGACACACTCTCACACACACACACACACACACCAGCTTACTCACACACACACACACACACACCACCTTACTCACACACACACACACACA:1	+	chrX	19111067	5'	+	Quasimodo	34	2	70.00
AAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAG:1	-	chr2R	4032632	5'	-	micropia	5122	2	68.94
ATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGAGGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCG:1	+	chr3L	19013940	5'	-	invader3	191	2	76.76
AGCTGGGAGCGTCTGTTTATGAATACAACGTTGGCAGGAACGGAAAGGGGATACAGTGGATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATG:1	-	chr3L	22921698	5'	+	accord	6997	2	57.14
TATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGGGGGTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAATGAGACTTTACTC:1	+	chr3L	9998019	5'	-	roo	400	1	46.27
GGGTATAATATATTGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTG:1	-	chr2L	23034072	5'	-	FB	392	1	40.00
CGGTCGGACCGACACGTCGTCCGTTGTCAAGGAGTACACGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	+	chr3L	23645865	5'	+	1360	63	1	56.41
ACACAACACACTAGTTTTGATTCCCCTCACTGTTTGTCGGCCAGCTCACTTTCGTTTTAAAGCTGCCAGTTGAAGCCAATAAGCCAAAGTAACTGGGAAACAATTGCACAGCTGGCGCGGCGTTGGGAGCG:1	-	chr3L	22349956	5'	-	jockey	438	1	77.10
ATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1	+	chr3R	13360328	5'	+	jockey	78	1	75.00
TGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAACACTTA:1	-	chr2R	20596525	5'	+	roo	15	2	65.22
AGATAAAATTAACGGTCACAATACAGCGATTTTCTATAAAATAGCATTTTTACTCACCTTAAACAAACAAAAAGTATACATGGATACATTTTTAAAAGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATT:1	+	chr3R	11199893	5'	+	FB	72	1	67.81
AAGTTATTCCGAGGAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACA:1	-	chr3R	25454151	5'	+	Quasimodo	10	2	65.07
ATTTGGCGGAATCGGAAATCACTCTATTACGTTTTCTGAATTTAACATTTATTTTTCTTGCAACTTTTCGAATCTTTGAAATTAAGCGCTTAAACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAGTGCCGAGCACGCACCTAGCAGCTCA:1	-	chr3L	19143580	5'	+	Stalker3T	174	1	57.93
TTTACACATGTTGCTAGTGTTTTAATTCGAATTTAAACAATAAATAGTATAATCCAAGGAGATTTATCTCTGTGCAATCCCCAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGATACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:1	-	chr3R	29390435	5'	+	jockey	4778	1	51.37
CTGATTTGCCGGAGTTGGGAGCTCCTTCGATGAGAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAACTTGGACCAGACTCGA:1	+	chr3R	13835273	5'	+	I-element	4906	1	75.34
GCTCCATCCAAGCGTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGG:1	+	chr2L	21936054	5'	+	INE-1	18	1	42.47
ACTAGATAAACCATTTTTCGTCGTCGTTCAGATCGGGGTATTTCTTTCATTTGGCGACGTTGTTGATAGTGAATGAAATAGTTGATGTTGTCTCGAATTTTTGTTCAAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCTCTACAGC:1	+	chr3L	8991396	5'	+	1360	114	1	67.41
ATTTGTCACAGCCCGCCAAAGTATGCAATAGATTCAAGAGTTCGCCGAGTGGCTTGGAAAATCACTAAGGGTAAATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTT:1	-	chrX	11296491	5'	+	BS	5008	1	67.26
AGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chr3L	15600362	5'	-	roo	9047	1	54.79
ACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr3L	20654567	5'	-	roo	9006	2	63.45
GGCGGTCCTAATCCCGCTTAACGTTCTGTTGACATCGCCGTGCCAACCGAATGCACTCAGGCATTTCGTCACATAAAAATACATGGCCAATATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGAC:1	-	chr3L	7292595	5'	-	HMS-Beagle2	284	2	63.45
GTTATTCACGTACTATAACACGATACTCACAATTAAACGGGCTATGGCACTAAAGGATGACAGTACTAAGGACAAACAAGGACATAGCAAAGACCCTATAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTG:1	+	chr3R	17615056	5'	+	Tc3	310	1	57.04
AATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAA:1	-	chr4	829110	5'	-	INE-1	153	1	65.32
TGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr2L	16091971	5'	+	roo	8733	2	76.92
TCAACACTTAAGCTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTGGACTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1	-	chr3L	22721178	5'	+	INE-1	29	1	67.12
TTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACT:1	+	chr2L	11985791	5'	+	G6	1704	1	72.65
TTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1	-	chr2R	4601669	5'	+	HMS-Beagle2	33	2	64.79
CAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1	+	chrX	13066517	5'	-	jockey	4927	1	67.88
GCTTACCGTTATGGCGATTCGAATTTAAGTTAATTAAATTGAGTGATACTGAAAAATGAAACACTAAAGCTAGATAATTGAGAACTCAGTGACTACATATATTACGCCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACT:1	+	chr3R	443880	5'	+	Stalker	6844	2	55.94
GAGCAGCCAGCCTCGAGCGCGAAGAACGTTTAAGTGCATGTGTAAGTAGCCGGCCATATTTGTATATGCACAGGGGACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTA:1	+	chr3L	7175094	5'	-	mdg3	5022	1	74.76
GTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr3L	15177300	5'	-	roo	357	2	60.80
AAATGATGCACATTAGTAAATGATTTTTTTGGAACCTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1	-	chr3L	6978249	5'	-	pogo	2047	1	56.16
TGGTTCATTATCTTCTTGTCTATTTCTGCCATCTCATGACTCACAACTCGTACACCAAAAACATCAACAATAATAATAACGACAACATCGACAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTC:1	+	chr3L	9781403	5'	+	I-element	4929	1	66.44
AAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAGATTCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3L	11441864	5'	-	roo	388	2	69.06
GGATTGCCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1	+	chr3R	15072524	5'	+	pogo	25	1	66.21
GGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1	+	chr2L	15832978	5'	-	hobo	2892	1	50.68
TGATGCCGCCAATCCTCCTAGTCCCCAGACTCTCGACTTTCCTTTTTCAACGAAATACACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCA:1	+	chrX	10513697	5'	-	Tabor	6887	2	57.14
TTTGTTTCTTTTTTTGTACCCCAGCCTAATTAAAACAACTACTTACCTGCAATGTCTCCAGAGGCTCCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGAGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAA:1	-	chr3R	21851592	5'	+	HeT-A	5758	1	81.60
AGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	-	chr2L	16016413	5'	+	412	7092	2	54.17
ATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAA:1	-	chr2R	4774761	5'	-	baggins	5350	1	56.16
GTTGCTGGCCCCGTCATTTGCATTGATTTGCAAATTTTTTATTGGCCGTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1	+	chr3L	18628720	5'	+	FB	54	1	62.99
AACCCAAAAGCAAGCTTTGTGTGTTGGTTTCCTTTTTTCCGACTGCCCATGTGTGTTTCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTG:1	+	chr3R	17246820	5'	+	hopper	1384	1	58.09
AGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAACATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr3L	22437873	5'	-	roo	9009	2	64.44
AAAGTCAGAGACGTCAGTGGGAAATTTGCATAAAATACCTGAGTCGCGAGTTCGAGATTCGAACTTCTGGCAGAGATCCATAAGACAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTAACAT:1	+	chr2R	7777237	5'	+	TART-A	13160	1	51.37
CACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chr2L	15833475	5'	+	jockey	14	1	54.84
ACAGCCACCTACTCAACTTCGCTGCCAGCTGCTGTTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr2R	14388071	5'	+	roo	8674	2	77.40
TATCATATATATTTTTAAGCCAGTAGTTTTAAAACTATAAGTAGATTCAATTAATATCAGAAAGGCAAAAGCCGAAACTTACAATTTTCATTTAATTCCTTTAAACCCTTGTATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGG:1	+	chr3R	15024043	5'	-	jockey	472	1	79.58
ACTTTTCCGAGCATGTGATCTGTAATAGAGCGAAGCTTATTAAAGTTCTGTAGATGTTTTTCAAGAAAACATCGATCTTGCCTCATCATCCTCACCAATGCTTATGACTGCACGAAGTGAACCCTAACGCAC:1	-	chr3L	10663787	5'	+	Doc3-element	411	1	57.58
CTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1	-	chr2R	21920616	5'	+	jockey	34	1	63.57
TGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATNGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr2L	16092006	5'	+	roo	8677	2	68.81
ACAAAGAGCAGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1	+	chr3R	12717711	5'	+	297	6594	2	72.27
CAAGCTTTATTATCCTGATTCAAACCACATCAGTTACTTTAGTGCTTGGGTGTCCCCAGATCATTTAGCAAAATACATGAAAGTTTTAAACGTTTTATTTTATAGCCGACCGTGAATTTTGTTTGTTAATAACTCGCGGGAGTTT:1	-	chrX	13849809	5'	-	HMS-Beagle	378	1	64.14
CGATCTGAGGAAATGAGATCGAAAAATGGGCAAAAACACTCTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGTATGTCACACA:1	+	chrX	10201939	5'	-	transib2	346	1	70.34
CCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATT:1	-	chr2L	13585934	5'	-	Tabor	428	2	54.11
AAAATATTTTAATTTGCCAACTCGCCAGAGTTTTGATAAATAATATATCCGTGTAGTTTAAACAAATATGTGTTCAATAATCATGTACTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAAA:1	+	chr3L	3835023	5'	-	baggins	5350	1	60.14
CGTCTCGGCATACGATCAAAATATTTGCATAAGCAGCAGTCACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGCACAATCACAAATCCTGCGAACAATAACTGGTGCGCCTTGGTACATCCGGAACGCGAACATCCACCAGGACC:1	+	chr3L	13408422	5'	+	Doc4-element	2713	1	69.29
CGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGA:1	-	chr3R	11547791	5'	+	G2	325	1	50.68
TACAAATGGATAAGGAATCTAAAACGCTCTTACTCCAATTTAAGTTTGTCCACAGCTATTATATTCACCTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1	+	chr2L	5928006	5'	+	I-element	46	1	53.57
ACTTTAAGGAGAATACACACACACATACTCATCATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCACTC:1	-	chrX	3308394	5'	-	hobo	2902	1	52.85
TATTCTGTATTTTAATAAAATCATCGTCATCCAGAGTTCCAGCGACTTCCATTTACAAACAGGACCTAACTCCTTACACGTAAGATAAGTACATATGTGTACACTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCT:1	-	chr3L	24230644	5'	+	G5A	2758	1	50.75
GGAGGGTTACAATCCAGAATGCACGTCAATATGCTCAACTAACTTTAGTTGAAAATACCTACAAGTAATATTTAGTCACTCGCTACTTAACTTAATGTATTAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATT:1	+	chr3R	5060091	5'	+	1731	98	1	65.07
CTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGNCATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGATTATATTTAATGACTTACAATTT:1	-	chr3R	18339185	5'	+	roo	21	2	58.10
TTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCA:1	-	chr3R	11547822	5'	+	G2	294	1	71.23
TATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3R	18582159	5'	-	roo	8997	2	69.18
CATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr3R	16076795	5'	+	roo	78	2	72.60
AGCAGGTAATGGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGTACTTTGTTGC:1	-	chr3L	10773168	5'	+	412	7106	2	53.42
CATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:2	-	chr3L	20654565	5'	-	roo	9003	2	65.07
TTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTCTGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAA:1	+	chrX	2842514	5'	-	Tabor	7236	2	74.66
AGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	-	chr3L	23906482	5'	+	1360	17	1	61.11
GTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1	+	chrX	13066496	5'	-	jockey	4940	1	55.17
CTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACACACAT:1	-	chr3L	22349284	5'	+	jockey	74	1	56.85
AGAAAACCTCAACTGCAGCTGGGTAATGGGATGGGTAAATGAAGGCATGGTTAGCCATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGCTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGGTGGGGTCAGCTAAC:1	+	chr2R	20569383	5'	-	Stalker4	7261	4	57.53
TGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGA:1	+	chr2L	3672973	5'	-	roo	8967	2	51.72
TATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGCGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCAT:1	-	chr3R	11547745	5'	+	G2	331	1	73.58
TTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr2R	18336245	5'	-	roo	346	2	60.96
ATTAGGTTGAACCGAAGTTATCGCCTTAGAAAATCATACAACCCACAATCGAATGAAAAAAAAAATCAAAATTCCCAGCCTTTCTCAATTGCTGAATCACAGTTTCGCATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1	-	chr3R	16402449	5'	+	pogo	10	1	75.34
TGTTAATACGAAACTGTAAACATTGCAGTGGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTTC:1	+	chr2R	20899894	5'	+	hobo	28	1	66.67
ATAGACATACAATTTAGAGGGCAAAATTAAAAATGAACCTGGAGATATGTTTATTATAACATAAGATAAAATAATGTAAAATATAATTCATTCTCTTATCGGCTTAGCTTTGTATAATTTGTTTATTTTATTAATTTATAAATATC:1	+	chrX	16193293	5'	-	G7	1140	1	41.78
AAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1	-	chr2L	16092009	5'	+	roo	47	2	54.11
CTTGTGCCGAACTGGAGCTGCCGTCCAGTCGACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGTGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTT:1	+	chrX	11471602	5'	+	hopper	90	1	76.60
GTGTATGGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1	+	chr2R	9220990	5'	+	opus	7041	4	59.59
TCGTTAGTTCTAAAATAATAAATCAAGGACTTTTGAATGTAGCCATCAGACTTTTAAATCTATTTAATTGCGTGGTTTAAAGATTTTGAAACAATTTTAGTTGTGAATTGGGTATTTGTTGTTTTTTTTTTTAATAA:1	+	chr3L	5390214	5'	+	hopper	154	1	40.88
ACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGC:1	-	chrX	21667942	5'	+	gypsy2	41	2	55.28
GATTTGCGTGTCACGCAGCATCGGGCAGCGGAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1	-	chr2L	14892336	5'	+	transib2	25	1	66.67
ATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTAC:1	-	chr3R	24383315	5'	+	rover	80	2	72.60
CCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATT:1	-	chr3L	14638680	5'	+	Tc3	315	1	55.48
TTTTTTTTTCAATCAAAACTGTTTCTATAATCTAATGATGTCAATGTTTTTTCACGCTTACGAAATAAAGGGAAATCAGAGGACAGCGTATAAACCTTTAAATTATTTACTTATAGATTACTTTATTACTATTAATATTACTATTA:1	-	chr2L	1534273	5'	-	mdg1	7080	2	69.86
ATTGGATAAGATTTAAAAATTTATTTTTTCTTCATATGTTCATATATATCCTTAATAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAG:1	+	chr3L	27131112	5'	-	1360	256	1	49.32
GTTTTCGTTTGAAAATCAATGCAAAGTTTGATCGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATT:1	-	chr3L	2486026	5'	+	jockey	4537	1	50.68
AATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	+	chr2L	21884496	5'	+	pogo	49	1	54.79
AACTGCAGTAGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTAGGTGGAGTGAGGAAGAGAAGTGGATGATGGCG:1	+	chrX	23201996	5'	+	R2-element	489	1	60.22
AATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1	+	chr3R	12618594	5'	+	F-element	23	1	58.49
GGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATTCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAA:1	-	chr3L	8249090	5'	+	jockey	4587	1	76.15
GAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	+	chr3R	11496532	5'	+	1360	9	2	63.41
TTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAAATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCGCCCACGGGCG:1	-	chrX	21667929	5'	+	gypsy2	6500	2	65.43
ATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCA:1	+	chr2L	21325114	5'	-	invader4	280	2	68.81
AGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1	+	chr2R	2016825	5'	-	1360	3379	2	64.04
TAATAAAAAAAAAGAAAAAAAAGATAAACAAGGAAACCGTAAATGTTTTTTGCGTTTACAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACT:1	-	chr3R	14108121	5'	+	Cr1a	469	1	83.53
TCTATTATAAAGCATAGAAAGATCATTACAAAAATACGAAAATCGTACAGTATTACAAAAAAATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGACTTTAGTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAGTAAGAAAACTTGATC:1	-	chr4	883988	5'	+	Q-element	352	2	61.64
GATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATC:1	-	chr2R	5173223	5'	-	Stalker	351	4	56.85
GTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACGCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	+	chr3R	17420375	5'	+	roo	8671	2	72.87
CAGGACGTCTGTACAAATATCGCATCTTAGCAAAAAGGCAGTATTTTCCGTGTCCCTCGCGGTAATTATCCTCAGTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1	-	chr3L	17556042	5'	+	jockey	4764	1	61.90
CGTGCTAAACGATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTA:1	-	chr3L	7943756	5'	-	Burdock	6376	2	71.23
ACGGCATGCATATATGCAAATACGTATGTGTGTTCTATGGATTCCTTTTTTATTGCTTTGTTATTTCAATTAAAGTTGTAAAAATTCGATTATATCGCTGCCGTCGACAGCGGCAG:1	+	chr3L	17684643	5'	-	blood	7224	2	65.52
TTTTGCGAAAACCAGAGCACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAAATAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1	-	chr3L	22968459	5'	-	mdg1	7427	2	61.38
TTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1	+	chr3R	19446111	5'	+	297	33	2	61.81
CCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAATGACTTACAATTTT:1	-	chr2L	7945411	5'	+	roo	8686	2	57.84
ATTGCATAGCTTCAGGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAACACTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chr2L	6059305	5'	-	roo	349	2	59.70
GTTCGACGCTCAGAAGGAAAACATCGAGCGTTCCCGCATGCACTTATCCGCGCTCTGCTTCACGGCCATTGATCCTGATCGAGAATATACTTTACATTGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTATAT:1	+	chr2L	21261563	5'	-	INE-1	30	1	52.34
GTGCGTGCTGAAATGCAAGATACGATCCAGTGGGAATTGAAATTGCATGGCTCCGGGCTGTCGAAAGATGAGAAAATGACTGAAAAAGTTAGCTGAAATGAGGTGGGTATTGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCG:1	-	chr3R	29396781	5'	-	jockey	4730	1	71.94
AAACTATTACCTCATCGAAAACTTTAAAGTTTGAGGTCTGCTAGCTATCGCCTCCTTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCC:1	+	chr2L	5255192	5'	-	roo	120	2	49.56
GATCATAAATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chr2R	16945262	5'	+	jockey	15	1	65.79
GAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1	+	chr2L	7945316	5'	-	roo	9040	1	55.17
ATATGTATATATATATGTATGTATGTATGTATGCATGTATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGCTAAGCGCGACAT:1	+	chr3R	12609230	5'	+	HMS-Beagle	69	2	70.37
CCTCAACAGCATTCATACCAACCCCATCGAATAAGGTTACTTATACCCATTTGATTCTTCTTTTGATTTTAGAGTCGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGCTTTTTCAGTTTTTAATATATTTGGA:1	-	chr3R	21794748	5'	-	412	343	2	60.27
ATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTACGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAG:1	-	chr2R	5924416	5'	-	jockey	4722	1	40.35
AGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:2	+	chr3R	22955979	5'	-	roo	8981	2	78.77
ACTAAAAGGCCAATATTCAAGACATTCTTTACATAGAAGTTTTGTTATTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAG:1	+	chr2R	11363719	5'	+	Bari1	9	1	73.95
GTAGGAGGCTGATATCCGACGAACTATTGAAGAGATCCTGTATTCCCATCTGCAAATTTAGAAACATGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1	+	chr2L	7888102	5'	-	pogo	2049	1	60.96
AAAAAGTTAATTGAATGACTATCTGCAAACTTCAAAATGTATATTATATATCATTAAAGATATGGGCTGGTGTAAGGCAATGCAAAAAAAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAAACTGGTCAAATTTTCCATAG:1	-	chr2R	16581818	5'	-	Transib-N1_DM	3	1	80.82
AAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCT:2	+	chr3R	13237284	5'	+	3S18	56	2	53.42
CGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCACTTTATCTTTATTTGGTTTTTA:1	-	chr2L	15991401	5'	-	mdg1	7395	2	60.96
ATTTAACGGCAAGTTTCAGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGG:1	-	chr3L	14944693	5'	-	G5	4827	1	73.79
GTTGCTGGCTATAAAAAGTGTGCACCACTCATCCAACCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCA:1	+	chr2L	9564466	5'	+	transib2	76	1	69.78
TAGCAGCATTAAGATTATTCCGCATTGGTTTATGGTTAACATGCCCAAATTACGACCTACCTCAATATTGGGTTTTCTTTTGTATGCCTTCAAAAACTGAAAGTTTTTTTTTTCTTTTTTGTTAAATATTT:1	-	chr2L	18418104	5'	-	TART-B	10629	3	57.25
GTTGTGGGTTAAACACAAGGAAAAACGTAATCAAATTAACAATGTTTTCGGGGACATAGCCAATTGTCAAGTTGATTTAATTTGAATTTCTTTCTCGCTCCTCTTTATTTTTTTATTTTTTATTAAAT:1	-	chr3R	25444736	5'	-	transib4	2275	2	54.69
AAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1	+	chr2R	2016803	5'	+	1360	38	1	57.55
TGTGCAATTAGATGGTGAGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1	+	chr3R	30344598	5'	-	pogo	2076	1	61.60
TCTGACTTCTGTCTGTGTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1	+	chr2L	1377649	5'	-	hobo	2907	1	63.83
GGTGGGTGGTTTGGGTTGTCCTCCATGGATGGATGCTGTACGCTCCTGCTCCTGCTCCGGTTTCCCTGGCGAATGGGCGTTTGCCATTTCAGATTAATGCCCGGCGGCGTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1	+	chr2R	19797962	5'	-	Transpac	5225	2	80.00
ATGATGTATATATGCTGGTTTTATCAATAGCAGTATGCAAAAGGCGGGGTGCCAGCGAGAACAACAACAACAACAACAGTACTATCGCATCAACAATGTATTATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGA:1	-	chr3R	27270689	5'	-	rover	341	2	54.11
TTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1	+	chr3L	23146482	5'	+	1360	58	1	62.12
CGAAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCACTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1	-	chr2L	6623067	5'	+	Burdock	6161	2	65.47
AGGTATAAACTTCTTCACAACAATAATTCTCTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAG:1	-	chr3L	19014052	5'	+	invader3	21	2	68.49
CATTTACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAACTCCATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1	-	chr2L	544927	5'	-	412	7539	2	78.08
GCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	+	chr2R	9791612	5'	+	412	7119	2	81.20
ATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTAGACTGTATTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGCAACTAGTGTGGCCCTAATAATTATCGTTGGGTTGGCATATCATTACGACGAAGTCGGGTTCGGCTAGATAGCCGTGTT:1	-	chr3R	19450169	5'	-	Fw2	3778	1	52.52
TGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATACCTTATGTAAA:1	-	chr2L	14772134	5'	+	roo	8711	2	52.24
AGTTTGCCGTAAAGGTCAAACTCTGCCCTTTGCCTGGTATTTTTTTCCCCCTTTCTTTGTTTGAAACTAAATTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTT:1	-	chr2R	16891390	5'	-	hopper	1096	1	51.37
ACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1	-	chr3R	7482827	5'	-	412	7513	2	60.55
TTTTGAATTAGTTTATCAAGGTTGTTCTGGTTATCTAACAAATTCTTCATATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTATACCAAATAAAACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGA:1	-	chr3R	19448654	5'	+	jockey	4569	1	68.49
GTAAAGAAAACATCAATACGTTCATGTCTTATAACACAGGCTATTTTATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCTACTGGAACAG:1	-	chr2L	21272366	5'	-	Cr1a	3973	1	69.18
TCTTAATTATATTTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1	+	chrX	3308315	5'	+	hobo	65	1	66.92
CTAACCTTCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTC:1	-	chr2L	2122507	5'	+	Stalker	6890	4	56.16
TGCAATTTGGACAGAAAGTCCATAAGAAACTGATGCCTACTACGTAGTTCTTCTATACTGCGATTCTTTAGCTTGGCGCGCATACGCCGAATGAGCTGCTCTCGATCCCGTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1	+	chr2R	16948726	5'	+	jockey	4749	1	76.03
CAAGCTCAACACTTTTTCACTATCAAAACACAGTTTTGGGTCAGTAACCCCGATTCGAAACACACACACACACACATATATACACTTTTGTATGTATGTATGTATACCCTGTAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATGT:1	+	chr2R	11100392	5'	+	invader3	121	2	78.26
GGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr2R	19004234	5'	+	roo	18	2	66.67
AAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr3L	12879741	5'	+	roo	71	2	67.81
CCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1	-	chr3L	27391420	5'	-	1360	3374	1	68.15
TAGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTTCAAATTCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1	-	chr3L	21855548	5'	+	blood	7012	2	73.47
TTCTTAACCGATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGGCAGGCCACCTTTT:1	+	chr3L	3863446	5'	-	blood	7333	1	62.40
ATATTTTCACAATTTCCCTCGAATTTTGCTATTTGCAATACAATAAAAGTTACATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1	-	chr3R	20868198	5'	+	BS	5043	1	60.48
AGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTT:3	+	chr3R	18339043	5'	-	roo	9053	2	71.23
CGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1	-	chr3R	19529171	5'	+	jockey	4691	1	76.00
AGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGC:1	+	chr3R	7641070	5'	+	hobo	2708	1	54.17
ACTCTTCTTAATTTATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1	-	chr2R	5019814	5'	+	Doc	73	1	44.44
TGGCATGCAAAGCGGGTTGCAGCAGATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGCATATATCTAAAGACTTACAAT:1	-	chr2L	5254403	5'	+	roo	8683	2	63.97
GCATTATGTAACTCCCATTAACAAATCCATCCAAAAACGACACTGAAAAGGGAGCACACTTGCATGCATTTATTTATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGACGGGCTGACCT:1	-	chr2L	8986239	5'	-	412	7501	2	53.42
ATTTTAATTACTCCTATTATGAATTTGTAGTTAAAAGTGATACCATTTTATTATAGTATATTGGTTGCAAGTTAAACGTAATTCATAATAGGAGTAATTAAAATGTATGGCCTAATAATACAGGAGTGTTATTATATTCATATATA:1	-	chrX	7746839	5'	-	mdg1	6	2	80.14
AGACTTTAGTTACGAACCCCCTTTATCTTAAACCATAGACACCCATGCATGTTACGCCGCAGTTGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1	+	chrX	12074511	5'	-	412	437	2	54.79
CATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGA:1	-	chr2R	5924449	5'	-	jockey	4729	1	49.29
CAAATTTGGTGGTTGGCCGCGTTTTTATTTTTTTTCGTTATCTGAGTACTTGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGG:1	+	chr3R	25457642	5'	-	Quasimodo	7005	2	55.26
AAGGGCAGAGAGCCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCA:1	-	chrX	22715185	5'	+	Bari1	23	1	68.97
CCAAACTTCCTTTCTACCATTTTATTTGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr2L	14772170	5'	+	roo	8681	2	72.14
GTAGGAACACAAGGATGTGCCATAGGCGCCGTCGTCGTGTCGAAACAAAAAAAAAAGAAAGGGATCGGAAAACCCGCAACGTTTTTTGCTAAGAGGGTATTGATTTATAATGACTAAGTCGTTGATGCTA:1	-	chrX	19831129	5'	-	diver	5637	1	77.69
ACTAGAAAAAACCAAGACATTGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1	-	chr3R	29361091	5'	-	mdg1	385	2	59.59
TATATATACAGGAGGGAAAAAAGTCTGCTGATATTATATAAATGTGTAAATATATAGACTAATATAAATAAGTTACATACATACATACATACTTTAAGAAATTAGAAAAAAAGGTAAGAAGGTAAAAGATAATTTTCAAACATTTT:1	+	chrX	22922412	5'	+	transib4	106	1	29.45
AGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCG:1	-	chr2L	12290740	5'	-	1731	4549	1	72.66
TTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATA:1	+	chr3R	4357519	5'	-	Tc3	1656	1	53.42
TGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr2R	8585425	5'	-	roo	9011	2	58.90
AGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCT:1	-	chr3R	11547800	5'	+	G2	316	1	56.16
TTGAGTTGATGCACACGATTTAGTTTCCTTGTTGAACCTAAGTAGTTTGGCAAGCAAACTTTGAAGAAGTTTTTCGGTACTCCGTATCACTCATTACTTAATTAGTCGCAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATG:1	+	chr3L	12974014	5'	+	jockey	4751	1	73.97
ATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGACTCGCATCTT:1	-	chrX	5274367	5'	-	roo	324	2	75.34
ATTGTTTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTC:1	+	chr3R	22388937	5'	+	G2	2630	1	65.75
TAATATCATGGGTTTACATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTACTGGGAATG:1	+	chr3R	4504026	5'	-	INE-1	535	1	63.70
ACATCTATTTTACTTTTCAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1	-	chr2R	9791713	5'	-	412	466	2	66.44
AAGGGTGAACCCAATTTTTAATATGCTTTATTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAATGAAGCTTTTCCGACCAGGATCAGGATCAAGAGTCGATCTAGCCCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGTAA:1	-	chr2R	25211391	5'	+	INE-1	139	1	77.78
GGGAAGGGCAGAGAGCCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTG:1	-	chrX	22715188	5'	+	Bari1	21	1	70.55
GCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1	-	chr3L	10848714	5'	-	blood	7308	2	78.26
ATTAACACCCTGAGGGGCGCACAAACTGGAGCACTCGGGCTGCTAATTAAGAAATAAAGCCTTATCGGGCGCAGCAATGAAAGTTTATCATTTACTATATATGTATATATATCAACAATAACAAAACAAATGGAAAAAT:1	+	chr3R	16129441	5'	+	Fw2	3710	1	55.40
AACATAAGAGCGGACCAAAGAGCGAACGCTAAGTTGAAAAGATTGATTAGAGAAGCCAAGAAAGCATATTTGCTACAGTCCAATATATTAGGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTACCAGCC:1	-	chr2R	5076231	5'	-	Gypsy6A_LTR	265	1	63.20
TGCATTTCTTATTGATGATAAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1	+	chr2L	13763113	5'	+	pogo	26	1	67.81
TAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	+	chr2R	25118692	5'	+	roo	8712	2	64.96
CTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTG:1	+	chr3L	10574282	5'	-	Tabor	427	2	55.56
AAACTCCCGAAAAATATACCAAAACGGTTGAGATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1	+	chr2L	544730	5'	+	412	20	2	70.55
GTCTTTAGAAGCAATGCCTCTCAATTTCGTTTGGGCTACAAAATATTCATCGAGTTTCTGCCGAACGAAGTCTGGTCGTGGGTAGGAGCGGGGGGAAGTAGATGTCTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGTG:1	-	chr2L	22759964	5'	+	invader1	3783	2	64.08
TAGAAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTAC:1	+	chr3R	2527712	5'	-	INE-1	551	1	48.55
AAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1	-	chr3L	27415330	5'	+	transib2	46	1	54.11
CATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCCGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1	+	chrX	13066524	5'	-	jockey	4918	1	71.94
TGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr3L	22437858	5'	-	roo	9013	2	58.22
GGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1	+	chr2L	21884514	5'	+	pogo	67	1	66.44
AACTTTAAGTTTTGACTTTGGGCGGGAGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	-	chr2R	11164511	5'	+	roo	4	2	69.47
CTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATC:1	+	chr3R	13237315	5'	+	3S18	5845	2	73.38
CTGCTCTGACCTGACGCCCCTTTTGCATATCCTGCAATTTCCACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCGGCCACTC:1	+	chr3L	17205193	5'	-	hobo	2937	1	73.86
TGAGTTATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1	-	chr3L	20033823	5'	+	blood	7029	2	63.01
CTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCG:1	-	chr2R	16248029	5'	+	BS	12	1	64.80
AGATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr2L	5254380	5'	+	roo	41	2	51.11
CAACAACCTCGAATTATTCACAATTTGAACGCAATTGAACTTTTCGCATACATTTTCGTGGCAAGAACTCCGGACCTTTTACTTTTTTTTATTTTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTT:1	+	chrX	22841106	5'	-	HB	309	1	71.79
TATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTATACGCACGGGCAAGCAGC:1	+	chr3L	1149315	5'	-	accord	337	2	75.00
TTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1	+	chr3R	15072542	5'	+	pogo	44	1	53.42
CAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1	-	chrX	21564757	5'	+	diver	53	2	58.57
ATCGAGTGAATCTCGACGGCGCAGCACAAGCACTGGCCAGGCATATACACGCATCCTTCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAG:1	+	chr3L	9728837	5'	-	G2	2974	1	55.73
TGCGGACCCATAGGCGCATCTTCCGGCGAGCTTCACATCGATATTCAAATCCACAACGTAGTTGCCGCATGGAGGTCTATTGTATATTTAATATTATTAATTTGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATATATATTGTTTAATTATATT:1	-	chr2R	2094225	5'	-	S-element	106	2	57.53
ATTTTTGGTTAAGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr3L	20831253	5'	-	roo	394	1	71.77
TATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTCAAAA:1	-	chr3R	11547795	5'	+	G2	321	1	52.74
CCTGATTCCTGGGCTAACCTTCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGGGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACACTAAGAATACAATAG:1	-	chr2L	2122520	5'	+	Stalker4	18	4	66.91
GTTCATACCTGCAGAAGAAGCACTTAGAAATATTTTAAAAGTTTCATATAAGTGATTGAATTTTTTATAAATTCGAAGTCAATAGGTTTTACTTGTACTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1	+	chr2R	24561395	5'	+	P-element	22	1	70.55
ATTTAGAAGAAAAGGAGGAAAACCTAACAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCTGACCAGCCCCGGTCACATTGCTGACCAAGCATTGTTAGCTTTACGCAGTTCGTTTT:1	+	chr3L	11389078	5'	+	gypsy3	116	2	77.24
CGGCAAAGTGGAAAAGTGAAATAAGCGCAGCTTTATATGCACAAATACACATACATATGTACACACAAATATATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAA:1	+	chrX	6498926	5'	-	Quasimodo	7326	2	54.86
CATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAAAACCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATTCAATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTT:1	+	chr2L	23069852	5'	+	Stalker4	7151	4	82.05
CCGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	-	chr2R	19004216	5'	+	roo	8689	2	57.45
GAGGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGA:1	+	chr2L	16091859	5'	-	roo	9046	1	63.70
AAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3R	28624572	5'	-	roo	8997	2	70.55
CCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1	-	chr3L	22349286	5'	+	jockey	72	1	56.85
AACCGTGTTGCATTTATTTTTGTACTGTGCCGTCGCAAAGCACAAAACACGAATTGCCATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1	-	chr2L	18339112	5'	-	pogo	2083	1	71.92
CTTTGGGTAGATGTAGCATTTTTCCCCATCCGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1	-	chr2L	18419298	5'	+	412	4	2	75.86
CGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	-	chr3R	17817980	5'	+	roo	8730	2	64.38
AATTTCTTACCCAACAAACAAATATAATCCTAAAGACCTAGTTCTTAGTTAGCTTAGATTGCCTAATTTGCTTATAGTTTCACAATATCCCTAAACCCCATTACTGTGATGCCGAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATTGGTG:1	+	chr3L	23325383	5'	+	diver	230	1	63.70
CATTTTTAATAATTTAGCACACATATTTTCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTT:1	-	chr2R	10968360	5'	-	roo	8906	2	76.47
AGCCAAAGAGAAGGAGCTCCAGAAGGTCCAAGTCAAGAAGGAGGACATTGAACTGATTGTACGTATGCGAAACTACCAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1	-	chr3R	14035480	5'	-	1360	3349	1	54.29
TATACGGAATTATGACAAGCGCGTGTCTATCCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1	-	chr2L	21891826	5'	-	mdg1	370	2	54.11
GCTCTTCCACTTTTAAGTTATTGTTAAGTGGCGCACAATGCCCCATAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1	-	chr3L	7588483	5'	-	hopper	1376	1	57.27
AATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCATAAAAATAAATTTCAAAAATGACTT:1	-	chr2R	6085997	5'	+	1360	372	1	58.90
AATTTTACTTCGGAATTTAAATAGTAAAATGGACGCCTCTTGTTATATATCGGCAATGATATATGCCAAATAAAATCGAAGGGACTCTTCATCACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGA:1	+	chr3L	19409967	5'	-	R2-element	456	1	66.13
AGCAGCAGTCAACTTGCAACACAATCGTTGTTGCTTTTTGGGTAAGTGTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1	-	chrX	14824808	5'	+	jockey	4702	1	64.80
TCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1	-	chr2L	3114551	5'	+	roo	87	2	77.40
AAAGTAGCAGTCATATATATTATTTTATTTCAAAATATATAATTAAAGTAGTAACCTTTTTTAATTAATGTTAATGCTTTATACTTATTTTATCATTATAAAAAATTTTTTTTGGAAAATAATTTA:1	+	chr2R	13507377	5'	+	HeT-A	5801	1	75.40
AACAGAGAGTATGATTAAAAGAAATAAAAACACATATTATTTAAAGACGTAGAAATGAAGTAAACAAGCCTAGTCGATCTAGACATGTCCGTCTATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAACAGCTAGAAG:1	+	chr2L	13140257	5'	+	INE-1	155	1	47.95
ATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr2R	13585413	5'	+	412	7121	2	64.38
CAAATTTTAAAAGCGGCAAAAGTATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTA:1	-	chr3L	10647996	5'	+	412	7126	2	70.55
ATTAGATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3L	20831409	5'	+	roo	8680	2	71.97
GAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAC:2	-	chr3R	25454138	5'	+	Quasimodo	23	2	56.16
CAAAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1	-	chr2R	19540464	5'	-	jockey	4936	1	58.90
TATGTTAATTTCCTAAAATTATTTAGAAAAATGTCTTTTGGAGTTGTGGATTTTCGGTATTTGGTTGGTTGCTTTGGGCAATAAATTAAAAATATATATATACATATATGTATATATTAGATAGGTAGAGGACAGCACAGCTCCC:1	-	chr4	512184	5'	+	HB	354	1	54.48
TACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1	-	chrX	22511408	5'	-	1360	3320	1	76.03
AGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCA:1	-	chr2R	6271513	5'	-	blood	159	2	69.18
AGATCTGTAACAAGTTATTAGGTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1	-	chr2R	8146170	5'	+	P-element	20	1	69.06
AAATTTAATTTGCAGTTGGCTTTTAATTAAAAGCGAACAAAGCTTTATTAAAAAAATAGTTTGCGCCTGCTAATTTTTAGCATGTGATTTACATAATTCAATTAAAATGAAGAACTATGCACAGCGCCAATTGGATAAGTTTGTTG:1	+	chr3L	10615422	5'	-	gypsy7	5028	1	76.71
AAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAAACGAGTGGACGTGT:1	+	chr2R	21229010	5'	+	jockey	21	1	56.94
AGGCCAGAAATTAATAGCCTCATTCTTTGCCCATCGGATATATGTGGCTCGCTCCGCTATCACTCCGATCGAAATTATAATATGAATCATAATAATAAGGCAACTAATAA:1	+	chr2L	8425179	5'	+	mdg1	77	2	68.18
TGTATCTTGTGGCCAAAGGTATCTAGTTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1	-	chr2R	4977095	5'	+	1360	77	1	78.36
CTTCAGCATATCGCATTATATTATTGTCAACATATATCAAGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTC:1	+	chr2L	9906472	5'	+	invader3	83	2	72.41
TTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr2R	20596453	5'	-	roo	357	2	55.40
AATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	+	chr3L	11393462	5'	+	roo	8710	2	53.42
CATCATTTTAAAATACAACATTTTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACGACTTACAATTTTG:1	+	chrX	9539974	5'	+	roo	8687	2	67.81
AGCCAAAATAGAAATATGACAAGAAGCACTTGAGTTGTTATTTCAAGATGCATACCATGTATTTCTTCCACATGCGTATTCTTTTTTGCTTTCAAGATTAAGCCTATTTTGTTTTCCTTCCTTTTATTTTCTTTTCTTTTTTTCTT:1	+	chrX	1006262	5'	-	Doc2-element	248	1	67.12
CGGAAAGTAAAAGTTGACAGGCCCAGAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTTGATGGTGCGCACACCACACGTGTGTGGTGTTGTAGCTCTATTTAAAGTT:1	-	chr3R	10546184	5'	+	hopper	1016	1	57.02
AAACAATCAAATTATTTGTATAAACAGGCATGACATCAGCAAGTGCTGACAGCTGAGTAGAGTTGAGTGGGAGTTGCATGGTTGCAATGGGAGCGAAGGTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCG:1	-	chr2L	18459182	5'	-	invader3	5216	2	77.95
TTTCATTCCATTCGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCA:1	+	chr3L	7292421	5'	+	HMS-Beagle2	21	2	73.97
AGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTG:1	-	chr2L	14588754	5'	+	1360	443	1	55.68
ACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTTTTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	+	chr3L	20831268	5'	-	roo	9020	2	56.85
GGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCCCTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATAGTTCAAGACTTACACTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chr3R	27994171	5'	+	roo	42	2	50.74
ATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACTAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTTATACATAAGCCGA:1	+	chr2R	545173	5'	+	Stalker	162	6	74.31
ATTTTCCGTAAGTATCTTCAACATAACTGTTTAAGGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCG:1	+	chr3L	13848272	5'	+	opus	342	2	70.83
GCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1	-	chr2L	15833111	5'	+	hobo	40	1	58.22
GTCGTACAAGATATACATGTACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1	-	chr2R	17626893	5'	-	opus	7460	2	78.65
ATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:2	-	chr2R	20596534	5'	+	roo	83	2	78.77
ACCTGCCACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1	-	chr3R	14940189	5'	+	jockey	31	1	58.26
AATAACAAATTTATAGTTGCCGATGTTGTGTGGGTCAACGAGGTTTTTATATAACTGAGGTGGAAAAGGGATGGTCGTCTAAAAATATATGTATATAGTACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATT:1	-	chr2R	14641725	5'	-	3S18	6085	2	71.23
AAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATG:1	-	chr3R	25423292	5'	-	3S18	273	2	63.70
GAGACAATCTTCGATACAACAGTGCATTTTGAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCAC:1	-	chr2R	16238885	5'	+	BS	4766	1	72.81
AGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGC:1	+	chr3R	22388966	5'	+	G2	2658	1	57.24
CGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr3R	31817517	5'	-	roo	8989	2	78.32
AGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:2	-	chr3L	10574404	5'	+	Tabor	6874	2	52.74
TATAAATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTTT:1	+	chr3R	17243118	5'	+	hopper	57	1	58.52
ACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr3R	18339112	5'	-	roo	320	2	76.71
TGTGTGTGTTTAAGTATATATATATAAGTATTCTATGATTCCTTTGTTCATGCCTCAGTCAACATGTTGAATATCAACGTGTTCTGTTGAATTGCAAAATGCTCCAAATGTAATCAAAAAAAAAATATATATATACATATATACAA:1	+	chr2L	6894556	5'	+	Stalker	6940	4	76.71
TGTGGAAACACCTCTGGTGAAGATTACTACAGTCTCAGTATTATACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1	-	chr2R	6173123	5'	-	pogo	2087	1	72.39
TATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1	-	chr3L	4605737	5'	+	pogo	7	1	74.55
AGCCTGTTATTATTTGCCTGTGCGTGACAATGGGTCACTGGGGGCAAGACAAGCAAAAAATACTTGTCCACATTAGTTTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1	+	chr3R	26685984	5'	-	Juan	4166	1	52.74
AAAAAGCAATATTCTGGAGTGTGCTTTATTTTCTGGTTTCGCATTATATAGTTGGGCCAATTGTTTGGATTTTATAATATTTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTC:1	-	chr3L	2192922	5'	-	Bica	100	1	76.03
CCAAAACGTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1	-	chr3L	17560420	5'	+	pogo	8	1	77.27
CATCGGGCCGCTGCTCGAAGGACTCGTCAATCGCCGTGTTGTCCAAGTACCAGGTGACATTAGGTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGCATACTGGCACACATA:1	-	chr3R	13457516	5'	+	X-element	91	1	63.64
AGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAG:1	-	chr3R	9714451	5'	-	Stalker	7169	4	79.17
GAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGGTT:1	-	chr2R	5173214	5'	-	Stalker	7205	4	57.58
AAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1	+	chrX	10521648	5'	+	Tabor	80	2	69.86
AATGGCACCATGCTTTGGCATACCCTATGCTCTAAAGCGGTATTACCCATTTCGATGTCCTTTCCAAGTCTCAAGCATTTCCTCCTCTTCTAGAACTCTCTTCTTCCGAATATATTAATTTTCTT:1	+	chrX	10517049	5'	+	Gypsy12A_LTR	2051	1	52.80
ACTTAAGGCGGAATTTGCACTGTATTAAGGATAATATTGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGCAAAGAGTAAAGGAAAAGGGTAGAAGGAGCAGC:1	+	chr3R	16113662	5'	-	mdg3	5261	1	73.97
GCTTTTGTTTGTTGCTTGATTTCTTTTGCATTTTTATTGTTAATTGATTGAGCCTATTAAAGCGATTTTTAGATATTTTTCGCAGCCAATAGAAGAGAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTA:1	+	chrX	5137140	5'	+	flea	401	1	66.44
AGTGATACAACAATTGCTGCTATCCATTTGCTTAAGGTGCTAAATTTTGTTGTGCTTTACCCAAATTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCTTTTTTTTGGTGACGG:1	-	chr3R	32030610	5'	-	1360	3334	1	54.11
GTGGCTGCCAGGGGGGGATTACTGTACAGTGGGACGGCCTCATTATTGAAACATGTTGCTAACATTTGTTATGCAATTATGTATGGCTCTGTGTTGTCGCGAATC:1	+	chr2L	3934128	5'	-	gypsy5	7162	2	72.38
AGACCAATGGGAACCAGGCACGGCTCCTACAGACGTTCATGCTGAATCTGCATATAAAGGTCAAGGTATGCTTAATATAGATATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGTTCCATGTTGTATTTGCTAACGTCTTAGTTTAGGCAAA:1	-	chr2R	2365633	5'	+	transib3	361	1	65.07
TGACAGCAACTGTCTGTCAATTGAAATTTGACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAA:1	-	chr3R	25423330	5'	-	3S18	310	2	63.01
ATTCCTCAACGCTTTGTTTTGGATATTAAGCAAATCGGTTNACTAAAGTGCCATTTTATGCGAGCCACTTGGAAAATGAATAATATTTAACTATATTGACATTTAATTGGAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGGTTTA:1	-	chrX	17855823	5'	+	BS	5009	1	68.28
AACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1	+	chr3R	6290933	5'	+	Doc	41	1	60.27
AAATAAAACATCATTATTATCATTGTACATATATTCACGTTGAAAGGCAGATAAATGACAAAGGCAGCCACAGCGATCACAACATCGTCTATATAAGTGAAGTGAAGGCTGTCATATATTTACACACACACACAC:1	-	chr3L	9338333	5'	+	Quasimodo	31	2	78.52
ATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	+	chr3L	4536702	5'	-	roo	336	2	65.07
GTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTT:1	+	chr2L	21930797	5'	+	INE-1	158	1	72.14
ATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAA:1	-	chrX	21564760	5'	+	diver	5944	2	58.22
GCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1	+	chr3R	13360301	5'	+	jockey	33	1	56.07
GAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACNTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chr3L	15177309	5'	-	roo	349	2	60.56
AACAGTTCGCCTAAAAAGTGGGCGTTTGTCAGGGCTAATCTTTATCTGGCTGTTGACACTCCATTGAGCTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAA:1	+	chr2L	526836	5'	-	Bica	4731	1	63.83
AGTGTAACATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTATTAT:1	-	chr3R	17615217	5'	-	mdg1	29	8	69.50
GCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATTTTAACTTATGGCA:1	+	chr2R	9791612	5'	+	412	7094	2	73.91
ACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGT:1	+	chrX	23078695	5'	+	INE-1	548	1	80.95
GTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTG:1	+	chrX	6499821	5'	-	Quasimodo	6988	2	79.20
GCTATCAGCTGTTTTATCCGCTGCAACAATCGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	+	chr2L	22373919	5'	+	jockey	69	1	73.04
AAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1	-	chr2R	9662771	5'	+	412	76	2	82.31
TTGTAAAAGGTATAGCTAGCAGCCTTCTATCAGTACGAGAAGCGTATGACCTATCTTCCAATCACTTACCGCTTATCGCTTTACTCACAACGTCACCCCATATTATTTCATAATATTTCTGGGATATCGA:1	-	chr3L	27339255	5'	-	INE-1	505	1	75.38
GTCTTGATGAAATCCGCTCCGGCCATCATGCAAACCATTGCTGCTTTGTAGACCTAAAGAAAGAAATGGATTGGAATGGTATTTAAGTGTAGTGAGTA:1	-	chr2R	12426493	5'	+	Tc1	1558	1	73.47
CATTTATGTTTTTATCTCTTCATGCAAGATGCAAGATGCATGTCCTCATTAGCTTAAATAAACAAATTATTGGCATAAATTACAATCGGAATCAATTTAAATATAAATTATATAAGTTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCC:1	-	chrX	20870220	5'	-	gypsy	442	2	48.63
ACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCCTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGCGGAACACCTCCTACAAACA:1	-	chr3R	11547792	5'	+	G2	323	1	51.03
CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCTTAAATTACATATGTATGTATTACTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGC:1	-	chr2L	22211544	5'	+	INE-1	168	1	96.58
GTGAGTCGTGAAAGCGAAAATACAAAGCCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTCGTCATACA:1	+	chr3R	20499714	5'	+	mdg3	5279	2	67.12
AGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCCCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr2L	3114548	5'	+	roo	8753	2	77.93
AAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGACATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr3L	21817974	5'	-	roo	9009	2	61.64
CCGACAAACTGGGAGTCGGAATCCGAGTTGTGTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGTGAGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1	-	chr2L	15875870	5'	-	hobo	2934	1	77.78
GGGAAATAAACACCATTTATTTAGGAAGTATTCTTTCAGTGCACCTCAAATTCATATAAGCCCGCTGGAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1	+	chr2L	16016314	5'	-	412	7530	2	66.02
CATATATTCGTAAGTTAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1	+	chr3R	12598456	5'	+	hobo	59	1	61.64
GTTTGAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAA:1	+	chr2R	2016797	5'	+	1360	33	1	61.43
TTAAGAATTCCCTTTGTGGGGGCCAGGGATACCCAGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGAGCTACTCGCCACGCAC:1	+	chr2L	15875762	5'	+	hobo	60	1	73.11
GTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:2	+	chr3L	17558024	5'	-	jockey	4917	1	72.60
AGAATAAGTAAAATATATAAAAACAAGAAAGAATGCTTTAATCGAATTCCCCGACATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAATACGAGATGGTCAACAGAGTGGATGTCTA:1	-	chr2L	20331183	5'	+	Rt1b	4804	1	52.17
AATAGAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTGTCAGATACCCGTTCCTGTAAACATTCTAAAGTCTGACCTAAGGAGATTTGACTGCTCTCTTTGAATCTTCTCTTAATCATAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTC:1	-	chr3L	24797362	5'	+	17.6	258	2	60.27
CATTTCAAAATGTCTATTTTGAATAAATCCGTTTATTTGGGGTTTTTCATTGCAGAAAATGTGTTCACCATAGACAAAAATTTTAATTATTGCGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAAACTAAAGACA:1	+	chr3L	26370959	5'	-	gypsy4	6777	2	50.35
AAAGACTTTACAACATAATTAAGATTGTTGCGAGCGACTTGAGTGCGTTTAATGAGGAACGGCCAAGGAATCGAGTGGATTTATTAATGTGTTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAG:1	-	chr2R	9783522	5'	-	Bica	66	1	54.11
AAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	-	chr2R	20596551	5'	+	roo	8730	2	67.12
CGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1	-	chr2R	9791648	5'	-	412	417	2	79.23
AAAAAAAAGTATATTAAAAACGAAAGAAAAATTCCATTTATTTATGCGGCTACTGGTCAACGAAGGAGAAACGCAGCGGGCTTTCACAGATTTACACAAAATAATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	-	chr2L	11795379	5'	+	412	16	2	65.75
GCCATATTGAATAGCAGAATTATGCAAAGTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACAATGTTATATCAACTAT:1	-	chr3R	23235559	5'	+	jockey	4844	1	75.91
TCACTTCCCAAAAAAGCGTTATTTATTAAAAAGTTTAATTACTAAAATATCTATAAACTATCAGTATGCTTACTAGCTAAAATAAAAATCATAGATATATATAATATAACAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:2	+	chr2L	5254223	5'	-	roo	398	1	27.40
ATTCCACGTCGCGGCTAATTAATTTCTGCTGGCCAGGCCATCAGGCCCATGGCTGGCCAATCTCCCATCATAATCGTTTAGTGTTTTTTACTCGCCTTCTGTAAGTTGACCGCTTATGTTTATGTTTATGTTTATAT:1	+	chrX	18623195	5'	+	412	76	2	51.09
CCGCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chr3L	16750758	5'	+	Tirant	8122	2	65.71
TTCAAAGTTCATACCATAGATGGTACTAGGGATGGGTACAAGGAACAACCCTATGAAATGAGTTAAACTAATTAAGAAATGGTATTGTCAATGGTAATGTATTGTCAGCTTACGCACTTTTGTTTGAAGACTCATTTTCCTGCC:1	+	chr2R	11481521	5'	+	Rt1a	5047	1	38.89
TGGCGAAGTGAAACCGAAAGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGC:1	+	chr3R	26615133	5'	-	gypsy12	10145	2	77.66
TACATCACATGCTGAAAATTAGTTTGTTTTATTTGAAAAACGTGGCTGCAATTTTAAACAAATTTGGGATTTAGGTTTTATTGCACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1	-	chr3L	15996055	5'	-	297	6942	2	69.18
TTTAATTAATTGTTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTTATTTTAACTTTGCTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGA:1	+	chr2L	12355487	5'	-	HeT-A	6045	1	41.38
CCTTTTACCAGCCAGGAATTGGGGAATATTAACCACGCTTTTAAGGTGAGGTTTCAGTAATAGTCCCTATTACAATTTACAAATAAGATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAA:1	-	chr3R	24294001	5'	-	pogo	30	1	63.01
CCATTATTATTCGAATTGGATGAGTTGCAAGGACGAAATAACAGGATTTCGTTGGGATTTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTG:1	-	chrX	17431837	5'	-	hopper	1396	1	69.47
GTACTCGTTGATATTTTTGTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGATGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr2R	19004109	5'	-	roo	9033	1	60.27
ATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1	-	chrX	13504222	5'	-	412	7503	2	70.00
AATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	+	chr2R	25118700	5'	+	roo	79	2	76.43
TTGTTAGTGCCAGTCTAGTTTATTTCTCTTACTATCTCAGTTTTCTATCAATTGATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCG:1	-	chr2L	4951973	5'	-	Quasimodo	6921	2	62.33
CGAACTGTTAGAATTAAATGTATGTTACTTTGCAAACAGAACCAAAAATTGCAAAGCGTGCCCTCAAAGTAACATATATTAACTACATACTTACGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCCATATTTTACTATAATTCAT:1	-	chr2R	5485283	5'	-	transib2	254	1	53.42
GCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1	-	chr2R	5531206	5'	+	1360	69	1	63.48
GTTATCAGCATTAATTTCATTAATTTCCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1	-	chr3R	30344730	5'	+	pogo	38	1	55.15
CAACGGGTTGCCTTTCTCAGTTGGTGTTTTTCCACTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1	+	chr2R	17623928	5'	+	hopper	142	3	81.48
AGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAAT:1	+	chrX	10521641	5'	+	Tabor	61	2	61.94
GAATGGGCGTGCGTGCATCTGCATATATTTAAAACTTTTTACAATATTCTTTGTTTATTTACTTAGTTGTGCTCGTGTTTGTTTTCCGGATCAAAAGAACTCGCAACGGAAAATATTTAATTAAAGAACAACAAACAAAATAACAG:1	+	chrX	5506129	5'	+	gypsy9	407	1	58.90
TTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1	+	chr3R	25826679	5'	-	mdg1	7384	2	67.81
CACTAACCAGTATCCAGTCAGAGGCATCATGCGCATATGCAAATGAACTTCAGCAGACACTCCACAAATGTGGACAAAGCCTGCTGTCGACATACATCGACCATCGAATATATATACATACATAT:1	+	chr2L	9809987	5'	-	1731	4413	1	60.00
AAAACTGGCTTGAAATTTTAGATATGAACAAAATGCAAGGCCTTCGTATTTAATAATATTGTATTTATGGAATTTTCTTAAGACATTCAAAGGGCTTTGCTATGTAATACTAACAATAATAAAAATA:1	-	chr3R	14988617	5'	+	mdg1	7066	2	58.27
AATCGGTTTTAAATCAATTGTGCGTCATTTTTGTTACCATGTCAGTTTCTTGACATTTTTGTAATGTAATGTAATGTAATTTTCATTAGCGAATTTACTTGGAATATGATTGTAGTGCCTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1	+	chr3R	18615344	5'	-	297	6937	2	38.36
GGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATTTTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCCTGGTG:1	+	chr2R	5039343	5'	-	gypsy11	4279	2	56.85
TCATTATAAAACTGTCAACTGCATTCAGCAACTGTATTGTGGCCATCTCTGATACATAATGACATTTTTTACTTGCTTTTACAATATCGAACGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTT:1	+	chr2L	15876363	5'	+	hobo	372	1	61.64
CGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGACTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1	-	chr2L	15991407	5'	-	mdg1	363	2	56.85
CAAAAAAATCGCAGAAAATTAAACAATTTACAAAAGTTTCGCCGCAACAATATTTCATGTTTATTAATGGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1	+	chr2R	18349323	5'	-	roo	9024	2	49.66
CTCTTTTTCTGGAAAAAGAAGCCGCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCTAAC:1	-	chr3L	16750779	5'	+	Tirant	8126	2	69.23
GTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAAT:1	+	chr3R	19589941	5'	+	BS	5084	1	76.71
ATTTGGGGGGAAGAGAGATCGAATATAGGAGTTATAGCGCTCCGAGCAGTCCGGAGCAAGATAGTAGGAGCAGCGGATAAAGTCCTAGGATTCTGAGAATCACTGGAGCTCCGTGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGAC:1	-	chr2R	5038245	5'	+	Doc3-element	4434	1	58.90
GGGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1	-	chr3L	25401040	5'	+	Doc	16	1	62.41
GAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGGACCTATAAGAACACAGCA:1	-	chr3L	21855546	5'	+	blood	7040	2	59.68
CGACGACGAGGCGAAGCCAGGACGACGACTTCGCCCGAGGACCTCTACGAACCGTTAGCCAGCAACTAAATTTAAAAAGTTTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAAA:1	+	chr3L	22638037	5'	+	G4	3370	1	56.15
AATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1	-	chrX	2842581	5'	+	Tabor	6898	2	61.31
AATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGTCCAAAAGATCGT:1	-	chr2L	9399567	5'	-	Transpac	5191	2	58.90
AGACTTCTACAAACAATTTCATAAGTACGGAAAATTTGTTCGCACGCCCAATGATAGAGAGAGACAGCGACTGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	+	chrX	10002384	5'	-	blood	7180	4	63.03
TGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1	-	chrX	17678734	5'	-	flea	4953	1	61.64
TTCAGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1	+	chr3L	9998010	5'	-	roo	402	1	46.81
ATTGCACTAATTTCCAAATACATCTTGGTTTATTTATGACTTTGCTAACTCGGCACGAATTGACCCACAATGGCAATCCTTACCTTAAACTTACCTTGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTTATTAGTCGGCTTAACTTTTCG:1	+	chr3L	21490386	5'	+	Cr1a	4087	1	67.36
AGCACTGCCCGCGTGCAGTTCAATTGAATTTTAGTGGGGAACTTGTGCTGCCAGCTCACCTTCTCCCACACCATCCACCACCCACCACCCACTCCACCTACACCTATACACCCATACACACACACACACATACTT:1	-	chr2R	17929287	5'	+	Quasimodo	37	2	76.30
AAAAGGACAGTTTCCTAAGTAATTTTTTATTGAATTTGTAAGTTCGTTTGTTATTTTTGTTAGTTTATTAAGTCTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTT:1	+	chr3L	26377529	5'	-	Doc	4428	1	49.32
TATTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACACGAGAAACACTC:1	+	chr3L	4948048	5'	-	hobo	2909	1	48.04
CGCAGATTTGATGATATATAGGCACACTTTATAGGGTGGAGTCCCACAAAACTGATTGAAACGGTGCGGGGGATCAAAGATACTAATGACCATAGGCTCGACACAATGATGAGCATATGCTTGATATGAGTTTATTTTGTTTTATT:1	-	chr2L	2435579	5'	+	transib1	1896	1	34.25
AAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGNACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1	-	chr3L	15177312	5'	-	roo	360	2	55.97
TATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTC:1	+	chr3L	11321413	5'	-	mdg3	185	2	60.74
CGACATCCGCAACTCTCGAATTGGGAAAGTCAGAAAAGCTGTTCAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACA:1	-	chrX	21430279	5'	-	hobo	2862	1	68.49
ATTTCCCATCGATAGCTGTTGTCTTGTGTTTTCATTATTTACCTTCAGGGAAATACACATTTTCCTCACATGAGCATACGTTCGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGCGT:1	-	chrX	7660264	5'	-	accord	7100	2	76.55
GGAAGGAATCTCCTACCGAATCCATAGTCCTCGGTGAATTCAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	7835260	5'	+	roo	8680	2	75.34
CTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	-	chr3R	20469662	5'	-	roo	322	2	75.34
AGTTATTCTCTTTATAAATAGAAACATTACCATTTATATTGATAGCGATGTAGATTTCGAAATTATTCAAAGAGCACACATGGAAATTATTAATACCACCTACACGTGATTAACTATTTGCTTCACTAAAACCAAGAGATTT:1	-	chr3R	851883	5'	-	Doc3-element	45	1	61.97
ACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATC:1	+	chr2L	6059206	5'	+	roo	53	2	53.42
GAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	+	chr3L	11393496	5'	+	roo	68	2	74.63
TCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATTTATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCGTATGTAAAT:1	-	chr3R	28624639	5'	+	roo	48	2	64.60
AGAGCTCCTGCCCGGAAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr2R	21228985	5'	+	jockey	35	1	59.46
AAAAAAATTTAAGTAATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	-	chr2L	21884610	5'	-	pogo	2039	1	64.38
ATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAAC:1	+	chr3L	17307313	5'	+	gypsy	7020	2	64.38
TAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1	-	chr3R	17831886	5'	+	F-element	25	1	55.45
CAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGATTAACAAGATACGTAACGGCCATACATTG:1	-	chr2R	4939195	5'	-	1360	3368	1	30.50
GAGGCACCTGACTAAAACGTTCTTCGTTGTTTTTTATTCAATTCCTTCAATTTCCTTTCTCGAAAATGATAATATTTCCAGTTATTTTAAATTTACCAATAACATTTACATTTGTAGCATAAACAAGAGAGAACGCTATAGTCGAG:1	+	chrX	341889	5'	-	INE-1	577	1	52.05
AATGTTTTTCTACGTCCGTTGAATGCATATGTCTTTATATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGG:1	-	chr2R	5953707	5'	-	I-element	4985	1	69.49
TAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1	-	chr3R	31817563	5'	-	roo	9043	1	65.19
GGATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTG:1	+	chr2R	20194204	5'	-	Max-element	8505	2	51.82
TGGGTGATATTAAATTTTCAAGTCGCTCACATTTTTCACTCGTGAAGGTTGCACTAAGATTTTATTTCATCTCAAAAACTGATAGATATAGAGGATCCTTATAAGGCTTATTCTTGATCAGGATCACTA:1	+	chr2L	12285874	5'	+	INE-1	84	1	79.84
TTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1	-	chr2R	20596526	5'	+	roo	91	2	82.88
CGAGGCGTGTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGA:1	+	chrX	6499813	5'	-	Quasimodo	259	2	71.28
TTTGAGGTTTTCAAGACAAAAGACATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAG:1	+	chr3L	23818330	5'	-	copia	243	1	51.49
GAAAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTT:1	+	chr2R	5070918	5'	-	Doc2-element	226	1	34.55
ATAGCATTATTTATGAAATTATATGGTCATTTTAGTTCTTTAATTGGAATTTAATTGAAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1	+	chr2L	12498325	5'	+	pogo	55	1	63.01
TTTAATTTGTTTGATATTTATTTAACTTTGCTTTTTAAACTTTGTTTAACTTTGCTGGTTTTAATTTTTTTTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTTTTTTTAACTTTGCTGG:1	-	chrX	20386849	5'	-	TAHRE	10436	1	60.96
CCTGAAGAAAATGTTTAATATTAGTAATGAATGTTTAATAATGAATGTTGTAAAAAGTTATACTTCCAAACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCA:1	+	chr3R	28321279	5'	-	baggins	4954	1	48.84
AATATTTAATGGATCGGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1	+	chr3L	15995898	5'	+	297	6595	2	69.84
GTAGTGAAGGGAAAATCCCAACAAAATGTCGAGATAAGCTTCCTGGAATAGCAAGAGAAATAGTAAATCTGCCCGAAAATCAGCAGAGTCTGAAGA:1	+	chr3R	21262713	5'	+	hopper2	74	1	77.08
GATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2L	18419252	5'	+	412	42	2	48.91
ACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACG:1	+	chrX	21564682	5'	-	diver	6024	2	78.08
TCTAACCCACACCGTCACTTCATTAAGACAGTAACTAACACGGCCAGATCTTGGATCACCTCGACTAATTCCACATTTTTCCATGTCCTTTTTCGGAATCGACTTTTT:1	+	chr3R	5356327	5'	+	HB	70	1	80.56
GTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGCAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	+	chr3L	20654490	5'	+	roo	8712	2	65.22
CGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr2L	11674436	5'	+	jockey	18	1	70.10
ACGATTTTTCTGTTAGTTTCACAGCTAAATGGTGCATTATATGCTTTCTCATTAATAGGAATTTAATTTTAATTTTGTTCGTTAACTAAACTTTTATGAAACGCACTGAACACTGGTTTAAAGTATAATAATACAATAATAATAA:1	+	chrX	16993531	5'	+	invader3	5051	7	81.38
AAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1	-	chr3R	29361036	5'	-	mdg1	339	2	75.34
GATATTCCCTAGTGTTAAACCAGATCCCTCTCTTTACAAAGGCATCAAATCAGGAAAATGCAATTTTTACATTTCTTCCTAAATGCACTTTTGTATTTACTAAATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTT:1	+	chr3R	12097170	5'	+	1360	281	1	63.70
AATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAG:1	-	chr3R	29397504	5'	+	jockey	4641	1	73.97
AAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1	+	chrX	12214050	5'	-	opus	466	2	56.25
AGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATATA:2	+	chr3R	18346663	5'	-	INE-1	81	1	57.53
AGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACACCTGTTCACACACGAACACGAATACATTTAAAGAC:1	+	chr3R	22844146	5'	+	roo	8676	2	69.40
GATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGNTATTGCCCTATAAGTTATCGGCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGCGGAAACACAAGTGCCCA:1	+	chr3R	26659742	5'	+	HMS-Beagle2	51	2	48.63
GTTTGTTAAGCCTCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGCTAATATTCGAATACTATTTCAATTGTCTCTTTTATTT:1	-	chrX	21087660	5'	-	mdg3	209	2	52.73
GCACTGAGAGGAAGTTTGTATCCAATAATGAATTTGTAAGACCGTTTGAGATTTTTTTCGGTTCAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAATCAGTTAGATTCAAGCA:1	-	chr2R	5238112	5'	+	rooA	318	2	55.81
TCAGACTGTTTTCACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	+	chrX	8543448	5'	+	roo	8702	2	57.02
TGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGGTA:1	-	chr3R	11547765	5'	+	G2	347	1	67.61
TTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTATAAAATGTT:1	+	chr3R	6611213	5'	-	HMS-Beagle	6967	2	72.99
AACAGCTGCACAGACAAAGGGAGAGATAGAGGGAATTCAGNTAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1	-	chr3L	21855574	5'	+	blood	6	2	78.29
TGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	-	chr2R	9632185	5'	-	roo	9033	1	55.75
CCACCCGAGAAATACGCCGAAAAGTATGCAACGAACATGGCGACCATCAGCACAAGCAACTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGA:1	+	chr3L	22911733	5'	+	jockey	4729	1	57.64
TTCGGTTCCGCATTCCATATGGAACGCACTTGATTGTATCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr3L	11441677	5'	+	roo	8674	2	77.40
CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATTTTCCTA:1	+	chr3R	8287384	5'	-	Circe	7063	1	69.66
TTTAAAAGAAACGATAAAGTAAATCGTTTCCATTATCAGCACTTGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACG:1	-	chr2L	18417276	5'	+	412	7266	2	69.86
GTGCAATCGAGCAAGGCGTCGAATGCATTCTACAGATTGACTCATTGACAAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1	-	chr2L	7491365	5'	+	FB	35	1	55.56
GGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCTTTTTTGTGCATG:1	-	chrX	22715140	5'	+	Bari1	25	1	55.88
TGCCAAATTTGGCTGCTCTGTTTTCTGGCTTGCTAATTTCCTTTGAGCTCCAGTTGCAGCTTCAGTTTTCTGCGCTCAGTACTCAATTTTAGTCAACTTGTCGCCCCGTCAAATTATGCAGAACGTATATATTTAGGCATGAAAGT:1	-	chr3L	15774210	5'	-	transib3	2415	1	58.22
AAAACAGCAAAAGCAGCAGAAACAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr2R	9632051	5'	+	roo	17	2	72.60
CAAACTTTAAAAGAAGACAATTATTCAATAACTTGAGGAGAAAAACAGATGTTCCAAATTTGTCTCAAACTTTTACTGCTAAGTCGGAAAAAAATATTTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCT:1	-	chr3R	4133020	5'	-	Quasimodo	7299	2	69.18
GCTTTTTGGGTAAGTGTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAGAGAAGACTCAAGCGACACCAC:1	-	chrX	14824776	5'	+	jockey	4744	1	61.48
AAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	-	chr3R	7100893	5'	-	roo	339	2	62.76
ACAGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr3L	19334265	5'	-	roo	8989	2	76.71
AGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1	+	chr2R	20496931	5'	+	blood	7095	2	74.66
TTATTGAAAAAAAAAAAGCAAAAAGAA:1	+	chr3L	15637263	5'	+	Doc2-element	231	1	81.48
GATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	-	chr2R	23803035	5'	+	roo	8735	2	67.12
ATAAAATCGTAGGTTTGGCCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGACTTACATATATAGACGGCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGATTATGTTTATGCACGCAGT:1	-	chrX	12074663	5'	+	412	7136	2	69.18
ATACAATTAAAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1	-	chr2R	15064475	5'	+	412	7079	2	65.75
AAAATGTCTCCAAAAATGTTTCAAATATGTGGGAGTCACAGTGGGCGTATCAACCTTCCTGTTAATTTTGTTCGTCAAAACTGCAAGATCTTTAAGATATTTTAGAGAATTAAAAAAGCCTCCGCTCTCTCTCCTCTC:1	-	chr2R	5490086	5'	-	Rt1a	4947	1	53.62
AATAAATGCTTATAAAATATATAAATTAAGTTTAAATTCTGAAATACTAAGATACTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAA:1	+	chr3R	14337402	5'	+	copia	4937	2	70.55
GGGGGTGTCCAAGGATTAATATTATTATTTTTAAAGCTTACCGCCTTATTTATAGAATTTAATTACACCTTAAGGTGGATAAAGCTGATAGAAACCTGTCAGCCGATGTTTAAACTAATCAGATTGATTTAAGAAAAATTACTCT:1	+	chr2R	10014188	5'	-	Tc1-2	1469	1	45.52
TTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chr3R	22956054	5'	+	roo	55	2	55.56
AGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGC:1	+	chr3L	25482885	5'	+	accord	36	2	53.28
GTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAA:1	+	chr3R	3922955	5'	+	Cr1a	89	1	71.23
AAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr3R	28624559	5'	-	roo	9010	2	61.64
AAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1	+	chrX	21016735	5'	+	Transpac	47	2	52.74
GTCCGGGAGTTTGAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTAAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATTTTCCTTTTAGGCTA:1	+	chr2R	5039327	5'	-	gypsy11	4304	2	70.80
TTGTGACTGTTACTTGCTTCGTTTTTCTTGAGGGGGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTCCCTTGCTAG:1	+	chr3L	17558821	5'	-	jockey	4685	1	71.93
CGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1	+	chr3R	19446141	5'	+	297	49	2	62.31
GGGAAATGTTCTATATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr2L	16092030	5'	+	roo	20	2	71.43
AAACGGAGCAAGCTACGTGAGTATAAGTCCTTAATTTGCAAGAACCGCTTTACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAA:1	+	chr2L	10037264	5'	-	Quasimodo	7351	2	68.97
AAATAACTAACTTACAAAAAAATATTATTAGGATAAGCTATTCCAGTTAATAAGTTTCCTAGAATTTTGTAAATCCGCTGGTGTTTATTATTATTACATTTGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAA:1	+	chr3L	26696305	5'	-	gypsy7	296	1	74.81
GCATGTGTGTATGAAACTTTTCTTTGAGGGGAAAAAACGTATAATTCTGGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTTAATGACACACGGGA:1	+	chrX	12761128	5'	+	baggins	5089	1	51.06
AAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGATGGCAATGTTTTTTTTCCATTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr2R	19050330	5'	-	roo	388	2	59.59
CCCATGGGTCTCTCGCCAGTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3L	9998239	5'	+	roo	21	2	70.55
CTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	-	chr3R	7100931	5'	-	roo	9055	2	68.70
ATCATATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAG:1	+	chr3R	4357512	5'	-	Tc3	1663	1	48.63
TCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATGGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGATCATAT:1	-	chr3R	25448461	5'	+	roo	8701	2	61.64
GTTTATGATACAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCGTGCTCCTTTCGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCT:1	+	chr3R	19448508	5'	-	roo	310	2	59.70
AAGGGGATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAA:1	-	chr3L	22437959	5'	+	roo	8710	2	55.04
CAAATTCACACTTTACATTTTCATTTCAAATAGCCATCACTGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAA:1	+	chr3L	15490335	5'	-	copia	175	2	71.92
GCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1	-	chr2R	9662804	5'	+	412	59	2	61.64
CTGAAGTAATATTATTTATTAATAATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	-	chr3L	15177340	5'	-	roo	9042	1	63.19
GGAAGCTCATACATAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCC:1	+	chrX	21772480	5'	-	gypsy3	6570	1	52.22
TTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGC:1	+	chr2L	2794161	5'	-	Burdock	6349	2	51.08
AACAATAATTCTCTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGA:1	-	chr3L	19014034	5'	+	invader3	20	2	64.57
TTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGATCACA:1	-	chr2L	11674425	5'	+	jockey	26	1	60.64
AAAACCCATTTTCGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chrX	6486699	5'	+	roo	22	2	53.10
ATGTATAAGTTTATTGTTAACCGCAACTCAATATAACATATGTTGCGAAACATAAGAATCTACTAAGAAGTTCCTATAGAATTCCATTTGACGCAGCTGATCAGTGGGCACGGGTGCTTTCGCAG:1	+	chr4	539804	5'	+	Rt1c	5012	1	66.40
AAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAACACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chrX	5643472	5'	-	roo	394	1	63.73
CCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATATACAACAAACACCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr3R	19450113	5'	+	roo	17	2	64.03
GGGCGGTCATAGAGGGGTTGGGTTCCTTCGTCGGGATTGCTGCGCAGATTAATGCTGCATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAG:1	+	chr3R	10273941	5'	-	HMS-Beagle	184	2	63.01
TTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1	-	chr2R	3065973	5'	-	P-element	2786	1	19.18
ATTCCATTCGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1	+	chr3L	7292425	5'	+	HMS-Beagle2	6902	2	74.29
CAACTTTAGTTGAAGAAATGTTAGAATTATATAAATGTAATTGTGTAAGTATAAAATTTTTTTTATTTGGTGTGTGTGTGTGTAAATTTACGGGGAGCAGAATATTATTATTTACGTTGAGAGGAACTTTCCCTT:1	-	chr3L	25851375	5'	-	Gypsy6A_LTR	279	1	65.19
CAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCT:1	+	chr3L	25804310	5'	+	gypsy	7127	2	82.93
AAGTCAATCAAAATGTTTTAGTGCCCCTTCACATTCAGATATTGCTACTGCACTTTAAGTAACACATACAGGAGTAGTGCGACAACTGATTCAACATAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1	-	chr3R	26376312	5'	+	jockey	4682	1	68.31
CAAATAATAAAGGCTTTTCTTTGCACAACTGCAACTTTAATGAAAAGGAAAGTTAGATCAATTTAAATAACGGATATTGGCTTAAATAAACAATGGCGTTCGACGGCGTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAC:1	+	chr2L	4766215	5'	+	blood	7181	2	54.29
ATGTGTGTGTACTGAGCACAGATGGGTTATGAATTGCTTGATTATAAAAACAAAGTTCTGAAGCACATAACTTTTGATATCTTTCGAAAAAAGTACCATGCACATTTATTATACTAATAATAATATTATTAATAATA:1	-	chr2R	14445598	5'	+	mdg1	7078	2	59.85
CAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCT:1	-	chrX	21564730	5'	+	diver	5973	2	77.24
TTTATTTATTTTATTTTAACTTTGCTTTAACTTTGCTGGTNGATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTAC:1	+	chr2R	21199545	5'	-	TAHRE	10374	1	70.83
GTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTCTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1	+	chrX	21087537	5'	+	mdg3	15	2	70.15
CGTCCGTAATCGATTTCTGCGACTCTGGGCGGGAATCGTTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	+	chr2R	24218484	5'	+	412	18	2	70.42
TAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATCCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1	+	chr3L	17560272	5'	-	pogo	2045	1	56.85
GACTTTTCCGAGTGCACTGCATCAAAGTCAAAATGGCGGTCGAGTGTGTTTGTGGACGAAGTGAGACAAATACCGCCATAATTCCTGCCTAAAGTGGCATTAGACATTTAATATTTATGCATTTTTTTAAGTTAATTGTAATTCAA:1	+	chr3R	19533145	5'	+	Juan	4008	1	76.71
GAATTCAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1	-	chrX	21016840	5'	-	Transpac	5165	2	68.84
GTTTGATAATGAAACGGCGAATGGAGGTGGGGGGGGGCTATTTGGGGATCTGGCCTCGGGACCGGGCTCTGTCTGCTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACC:1	-	chr3R	13843532	5'	+	I-element	5107	1	72.82
AAATTTATATGAACATAGTTAATGAGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1	-	chr2R	13817750	5'	+	412	7089	2	60.27
AGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	+	chr2R	11629739	5'	+	Tirant	8122	2	67.31
AACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGA:1	-	chr3R	11547806	5'	+	G2	296	1	66.67
AGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1	-	chr3L	12861799	5'	+	pogo	73	1	69.18
AGTTATTGCTTTCATTTCCCTTTAGTCGCTCCCAGACGCTAAGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chrX	13039429	5'	-	roo	9046	1	69.93
GTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1	+	chr2R	5485068	5'	-	blood	7370	2	69.18
AGGGTATAAAAACGGTCGAGTTAGCAGGTAATGGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAACTAAAATAGCATATTA:1	-	chr3L	10773190	5'	+	412	31	2	65.07
GTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGTACTTTGTTGCTCTCTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1	-	chr2R	13817696	5'	+	412	7131	2	72.39
CCGGAGGAGTTATCCATAAGTTTGTAGAATAAAACGACTATAATAAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTA:1	+	chr2R	5209549	5'	+	gypsy	16	2	74.66
CAAATCGCCGCTTTCGTTGCACTAGCCCCCAAACTTGCTACCGTGACTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTT:1	+	chr3L	7588364	5'	-	hopper	1411	2	79.39
TTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chr2R	14542147	5'	-	roo	332	2	70.55
GCCGCTCCAGTGGTTCACACCTCCTATGCCGCTGCTCCCGTTGTCCACACCAGTTACGCTGCTCCTGCTCCCGTTGTTCAGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGAT:1	-	chr3L	16305500	5'	-	jockey	281	1	59.70
GGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCA:1	+	chr2L	21008537	5'	+	invader3	5194	2	67.42
TTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGAC:1	+	chr2L	14588754	5'	+	1360	370	1	58.27
AAATTCACATTTCGGTTTAATTACTCATTTCAATTCAAAGATGAAAAGATTCCTTACCGTACTTCGCAATCCCTTGGATTTTTATTCGTTTACATATAGATAATTTGTAAATACGCCCATTACTTTTCTAGTGAATCTGCTTGGCA:1	-	chrX	5565798	5'	-	Cr1a	4110	1	48.63
GTGAGGGAGGTCAAGTGTCAGTGCCATTTAGCAACTTGCCTCTCACACACACACACACACACACACTGTG:1	+	chrX	2899079	5'	+	accord	258	2	70.00
AATACGCGTCAATAAGTTAAGAAAACAAGATTTTGCGCTTCGCTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1	+	chr3L	26540678	5'	+	F-element	88	1	71.92
ATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATATAATAAAATAAAATATAATATAATATAATATAATATAATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATA:1	+	chr3L	20525229	5'	+	Quasimodo	46	2	62.33
AGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1	+	chr3L	13845134	5'	+	opus	139	4	57.28
TACCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGTACCCCACACTTATATTAATTTACACATGCTGAATAAAAACCAAATAAAGATAAATATGACCGATTGCGTTTTGACTCCTATTTAACTACATGGCGACCGTGAC:1	-	chrX	21907828	5'	+	mdg1	434	1	56.85
CACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	+	chr3R	27994199	5'	+	roo	62	2	70.31
GAGACTGAACGATAGAGCGACAGAGATGGCACTCTCACGAAAAAAAAGACAAATCAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCACGCTGAGATCTCGACGTTCATACGGA:1	+	chrX	5256494	5'	-	INE-1	134	1	48.74
TAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	-	chr3R	31817539	5'	-	roo	9008	2	63.70
GTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGG:1	+	chr3R	24383242	5'	-	rover	7229	2	65.97
GTCAAATGTCTTTGTAGTTTTTACCATAAAATATTCATGTAAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCACATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	+	chr2L	18294141	5'	-	roo	401	1	61.54
ATCAATACGTTCATGTCTTATAACACAGGCTATTTTATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTAAATTTATTAAAAGTAGTCTACTGGAACA:1	-	chr2L	21272355	5'	-	Cr1a	3974	1	67.16
AATCGAGATATTAAAATGTCACAGTTTTATTATTCTAAAAAAAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1	+	chrX	18478591	5'	+	I-element	80	1	75.00
CCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr2L	18294270	5'	+	roo	82	2	77.24
ATTTTACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCCCTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAG:1	+	chr2L	20117889	5'	-	invader4	278	2	57.78
TGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chr3R	25448350	5'	-	roo	9003	2	67.14
CTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chr3L	20654467	5'	+	roo	8714	2	55.71
CAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTT:1	-	chr2R	5209688	5'	-	gypsy	7387	2	61.15
AGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAA:1	+	chr3R	24455360	5'	+	Quasimodo	63	2	66.44
AAGATCGAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1	-	chr3L	3863548	5'	+	blood	7053	2	56.25
AGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTATACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATG:1	-	chr3R	17243241	5'	-	hopper	1381	1	58.90
CATTTAGTTGAGGACAGATGCACTTATATATTTATACAATATATATACGTACATATATGAAAGGATCTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAAT:1	-	chr3L	13558348	5'	+	hobo	443	1	54.11
CGGCCAAAAACACATGTCAAACGGCTGCCATAAACGCGAATCTCGTTGAATGGCCACAAATTGGCAGGCCCCCCCGCGCACCCAC:1	+	chr3L	4737988	5'	+	G6	330	1	69.41
CAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1	+	chr3R	27424867	5'	-	blood	303	2	75.76
ATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1	-	chr3L	11393608	5'	-	roo	405	1	72.03
TATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1	+	chr3R	6290979	5'	+	Doc	79	1	75.36
GTTGGCTAAAAGCTTAGCCTGAAGCGTATTATACATTTTAACAACAGTTGCTGTTGTGTAGGAACGAAGATGGAAGAAATAAATTTTATAAAATTATACACATGCAACATATGTACCTACATATGTATATTTATGTACA:1	+	chr3L	13939851	5'	-	1360	2958	1	56.83
GAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr3R	18339088	5'	-	roo	9011	2	59.44
AGAATATTCAGGACTCCGGAATTAGTTAACGATTTTCAGTGCATTTCACAAAATTTGGTAAGGTTTTTAACACATATAAATATGTGTTAGCGTCTTTTCGATTTTATATGATGGTTGCACTTGGGCTTGAATTTTGCACTTAATCT:1	-	chrX	11836257	5'	-	Porto1	57	1	60.27
TTTCTTAACCGATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1	+	chr3L	3863445	5'	-	blood	7313	2	68.49
AAATACTATTTCAAACTTTAGAATACACGATCTGCATCCTGGCAATCTAGCCAGCCCAAGTATTATATCAGAAGGCAATGAATAAATTATACACATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGG:1	+	chr3L	17211143	5'	-	hobo	383	1	61.64
CTAAACTTTTTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTTCTTTCTTAATAA:1	-	chrX	21014897	5'	-	copia	240	1	73.57
TATTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATGTTAAGTCAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATA:1	+	chr3R	29011379	5'	-	1360	3108	1	41.10
AAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	+	chr2R	9328575	5'	+	roo	8696	2	59.85
GTAGGGAATATTAAATTATTAATCCAATCAGCGAGTGCAGCTGATGCCACGCCCACAATTGTTGGTATCGTAAAAGATATGACCTAGTGTAAACCAATACAAAAAACAGAAACTAAATATGTTATTAATTTTGGCCACAAAAAGG:1	-	chr3L	17877958	5'	-	Transib-N1_DM	20	1	70.34
ATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTGTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTAG:1	+	chr3L	10532422	5'	+	roo	399	1	72.58
CATGTTCTTGGAAAATGATACCGTGTTATAACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1	-	chr3R	17478477	5'	+	copia	4921	2	54.79
GGGGACCTGTTGACCAATCCTGGAGAGAGTGGAAGCCTAAAACGGCCCAACGAGATCTCGGGAAGTCAGTATGGACTAAATAAGCTGGATGAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGG:1	-	chr3L	17553940	5'	+	jockey	4869	1	67.81
ATTCCGCATAGCGCACAATTGACGATCGATAATAATCGCGCTGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATA:1	+	chr2L	14110744	5'	+	Quasimodo	46	2	67.20
CGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1	-	chr3R	20427507	5'	+	jockey	11	1	78.86
GAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1	+	chr3R	28624558	5'	-	roo	9032	1	54.40
ACTGACGGAACGTAACCTTCATCGAGGTGGGAGACATCTTCGAGAGCGTCTAAAACAAAGAAAAAAGCAATGTGTCTGATTTCAATAATTGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1	-	chr3R	15358566	5'	-	flea	4978	2	60.96
ACATAGATATTGAATTTAGTATCAAGTGTTTTCTAACCTTCCTTCCATGTTTGAGGACTATGACCGCGCTAATCACCTCCCGCGAGGTAATGTAATATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTTGT:1	-	chr3R	4415921	5'	-	rooA	98	2	68.49
ATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1	+	chr3L	14603234	5'	+	jockey	32	1	64.03
AATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCT:1	+	chr2R	4260436	5'	+	micropia	5207	1	48.80
ATCAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1	-	chr3L	12861804	5'	+	pogo	68	1	66.44
TATGAACGACGCACACAAAGAGCCGGGAAGCGAGTTGCACATTGCACAGTTACCGCTCGAAATGGGATTTTTTACCAGAGAACTGCAGCCCG:1	-	chr2R	6919766	5'	+	hobo	2707	1	79.35
ATTTAAATAGGAGTAAGTATTGGTCGCATAATGGTAACAACATATTTTAAGAAAGAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAC:1	-	chr3R	31720590	5'	-	pogo	2044	1	59.29
AAAGTGCTTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGGGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTATATTAATTACAATA:1	+	chr2L	2794154	5'	-	Burdock	6353	2	54.93
GTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGCACCTCTGCTCT:1	-	chr2R	5173232	5'	-	Stalker4	360	4	50.00
GCGCTCTCTTAAATTGTCTTTCTCTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1	-	chr3R	18585691	5'	+	P-element	41	1	57.24
TTGCTATCACATATGTATCTTGTCACGTAGCTGATAAGTATCTTTTTTATGTGCAAGCATCTTGCCAATGATATCATCATTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3R	26222975	5'	+	roo	20	2	66.40
GAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCG:1	+	chrX	19983072	5'	+	blood	7081	2	72.44
ACCCGCTTCAATGTCCTTAGTGCAGTAGAGGCCTCGTCCATGGATATGGGATCTGAAGACTCCAACATAATCCTTGTAAGTTTCCTTATCCTTTGGCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGG:1	+	chr3R	14265419	5'	-	Stalker4	405	1	66.17
CTTCGTACAATGTCCTTGTAAGCGCGGTGAACAACAGTCGTTGTCCGGATGCACCGTGCAGCGAGTACGGAATCAAAGAATAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGAT:1	+	chr2L	3313970	5'	-	Juan	39	1	56.74
CGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1	-	chrX	6499040	5'	+	Quasimodo	70	2	72.73
CCATATCTTTTACGATACCAAAAATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGG:1	-	chr2L	21735014	5'	+	jockey	4541	1	67.97
TGCACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAAC:1	+	chr2L	12328651	5'	-	hopper	1335	1	69.86
CAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGAACTCTACGTCCAC:1	+	chr3R	7641050	5'	-	hobo	2922	1	52.27
GGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1	+	chr3R	25826656	5'	-	mdg1	369	2	52.05
TTTTTCTAATTAAATGATATTGTATAATTTATTGCAAAAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1	-	chr3L	15519836	5'	-	pogo	2036	1	70.90
ATTGTTACAGGTGACACTTCTCGCTGGGGTCGGCCGCTTTTGGGCGGTGGAGATATTCTTGTCTTTATGAGACTTGACGTTGGCGTTTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGATTGTGG:1	+	chrX	10591684	5'	-	pogo	458	1	63.70
CCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr3R	19449420	5'	+	roo	14	2	73.79
AAGCTTGAACCCTTAAGCGTTTAAAAAAGGTTTCCATTTTACTCAACAGTAATCATAAGCTAATTAACAACTACAGCTGAACTACGGACTCGGAACTCTCATTTAACGTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAG:1	+	chr3R	13348993	5'	-	Tc1-2	478	1	80.43
GTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chr2R	8572311	5'	-	roo	8996	2	71.92
GAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1	-	chr3R	14979885	5'	+	pogo	64	1	63.01
GATGACGTGAAATAGAAAACCCATAGTCGCAGGGGTAGATGCTCACTTTGTCAGTGAAGGGATGTAAGAGAAAGTCCTACTCTTCAGTCGTTCGGCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr2R	25119393	5'	-	roo	9052	2	72.46
TCTGATAGTCAAAATAAATTTACGGCGCTTAAAAACCGAGTTGTAATTTAAAAAATCATGACAACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGT:1	-	chr3R	25443549	5'	-	roo	8672	2	54.11
GTGAAATGTTCAACAACCGCACAACTTTATGTGCTGAACGAACGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGC:1	-	chr3R	18593723	5'	-	roo	306	2	70.55
GCGAGCTTCAGAGCCCTTCACTCCCCATACCCTTCACTCGTTGGATGTGTCGTGCGAGTGTCATCGCAGATTAAAGCCCAGAATTGATGGGGCAAAGGTGGTGTTACAAAATATTAGGATTGTATTTATA:1	+	chrX	1756802	5'	+	Bari1	1390	1	70.00
GAATGAATGAATGTGTTCTCTGCATTTGCAAGACTTTCAAATTAGTTTCGATTGAATTGATGAAGGTAAAAATGTGAGAGAAATTAAGTTCCTTTTTATAGCGTTTTAAAATATTTAATATATACTTTTTAAG:1	+	chr2L	14039301	5'	+	hobo	2462	1	51.88
AGGGGGATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1	-	chr2L	19965076	5'	+	Doc	41	1	57.36
AGACATAGGATTATCGATATGTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:1	-	chr2L	22685234	5'	+	Ivk	10	1	76.15
TATGTTATATTAAAGTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	+	chr2L	524196	5'	-	mdg1	7388	2	67.13
CAGGGAATCTATTTCAAGCAGAGGTATACTTTTTCAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr2L	18294345	5'	+	roo	10	2	75.34
TTAAATAAGGTAATTGAATGAAATTACTTTTGACATCTTTTGGACAGCCAAAAAGAAAAATAAAAATCTGAAGCATACAATTGAAGTTCGTTTGCCGTATGTACATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1	-	chr2L	659373	5'	-	Quasimodo	39	4	73.81
GTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACACCCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTG:1	+	chr3L	23773162	5'	-	roo	9041	1	43.84
TGCATGGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1	+	chr2R	9220991	5'	+	opus	39	4	57.53
GACAGTGGACGCATCCCATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3R	22844310	5'	-	roo	388	2	66.67
CAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAACACGTTGTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr3R	7835095	5'	-	roo	388	2	63.20
CACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAACACATATTGTG:1	-	chr3R	17478448	5'	+	copia	4948	2	72.22
ATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3L	9998206	5'	+	roo	48	2	53.57
GACTTTCCCCCTGATTTCTTGTGCTGCTGTGACGGTAAGCACTTCCACACACGCATACGTACGCACACGGATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1	-	chr3L	18970158	5'	+	Transpac	4957	2	58.27
GTGCGGTTTATTTAGTGCATTTAGATAAAGCGAGCGAAAATGTCAACTCTAGCGACTATTTTTCGTGTTCGTAAGTTTGTTGGGACTGACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATGTTTCAAT:1	+	chr2L	14526373	5'	+	accord2	7285	1	61.64
GATCAAGATTCGGCCGGCAGCCAATGAACTCACATTCTTGTAGCTCTGATCGCAGAACACATCCAGCTTTTTCTTCTGATCCTCGAGCAATTGGATTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATATAATTATATAATGCAGCGCT:1	-	chr3L	11158998	5'	-	rooA	248	2	64.38
ATAAATGATAAGGAGACTCATTTCCAGCCAGTCTCATTGATACAAATGTATTTCTAGTGGAATAATTGAATTATTATTGGTGTGTTCTTATAAATACCGTGATTAAATCAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTT:1	-	chr2L	16651273	5'	+	invader2	451	1	72.60
TTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1	+	chr3L	24291995	5'	+	1360	66	1	74.80
ATACGCACGTCAAATTCCGTAAATGTTTTACCCAAATTAAGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGAAGCT:1	-	chr2L	13914219	5'	+	jockey	4677	1	68.75
CATATGTAGCGCCATCTGTTGACTGTTTGACGCACTTCGATGCAGTTCCATTCATTAGTTTTCAGTAGTTTATTACCACCTAGTATTAATCGTAGCTAAAGCATAATCATTACTTTTAACTTTACTTTACTTTCATTTACTTTT:1	-	chrX	1772762	5'	-	TART-A	13141	1	74.31
AGCATAGCGTGCTGTCTTCCCATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr2L	3114582	5'	+	roo	48	2	53.62
AACTTAAAAGACTTCCTCATAACTTTAATAGTCAAAAAATCGGAAAAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr2L	12153270	5'	+	roo	73	2	67.81
GTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chrX	5643477	5'	-	roo	346	2	61.11
ATACTCCGAAATGACATCATTAGCAGGTAACAAGAAGTCAAGCTGCATTTTTTTTGTTTTTTTATAAA:1	-	chr2L	19846269	5'	-	HMS-Beagle2	480	1	77.94
ATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTTAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	+	chr2R	25118678	5'	+	roo	8694	2	52.21
CTCGCACTCGGATTGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1	-	chr2L	20840527	5'	+	Transpac	36	2	59.26
AAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:3	-	chr3R	25454089	5'	+	Quasimodo	72	2	71.23
AACCTTATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chr3L	14603218	5'	+	jockey	17	1	75.00
ACTGTACAAAAAGTCGCCATCGATGTACGATGTACGACCTTATTGCCATGAGGAGTCGGAGTCCGTTGCCTACTGGCACTTGCGATATGCCTGTAATTGCAAAAAAAAGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAATATGAGCGCATC:1	+	chr3L	17081582	5'	+	Porto1	200	1	55.86
CCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1	-	chr2R	13817707	5'	+	412	53	2	65.00
AAACAAACAACAATTTTAACAAGTATTATTTTAAATTAGCTAAAATGCAACTGAAAATCATCCTTTTATACATACATTTTGACAATTTCTATATAGATAGAAGCAATTGTTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACT:1	+	chr3R	7047754	5'	+	INE-1	562	1	52.05
CCTGCGCTTTGTACGTGTCCTGGGCCTCTGTTTAAATGTTATTTAACGCTGGCCCAGAAGTGTCATGACTGCCTGCCATTGTTGAGGATGTGTGTGTGTTCTTGCTTTCACTTCAAGAACACACACACACACACACAC:1	+	chr3L	19512914	5'	+	accord	7029	2	71.74
TAGGGGTATTTATGAATAAGATAGAAAGAACAGTTTTGGGCGGTTTTAAGGCGTTAGAATGGGCTTGGCAACATGGGTCAACAAACTTGCCCTGCGTCATGGCCTATAGAATCTGGAGGCTGAATCTCAACCTTTTAGCTTTTATA:1	-	chrX	9316802	5'	-	INE-1	162	1	73.97
AATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr2L	12892729	5'	-	roo	394	1	70.18
TCTGTATATTTTTATACCCATTTTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGCAATTTCACAT:1	+	chrX	15408722	5'	+	INE-1	516	1	81.82
ATATGTTGTTTGAAAAAACTTGGCGAATAGATCGGCTATTGCCTGATCCGATGTTACCGTAGTGTTTTCAAAAAATAGCGAGAAAGGGTAAAAACTTGTTTTTCGCTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr3R	13357530	5'	+	roo	15	2	76.71
GGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chrX	5274312	5'	+	roo	8724	2	69.67
TGGGCGCTTACATTTAACTCTGCAGATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTACAGCTAAGA:1	+	chr2R	4601549	5'	-	HMS-Beagle2	7129	2	61.38
ATGCGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTA:1	-	chr2R	5031017	5'	+	Doc	86	1	74.82
AGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGT:1	-	chr2R	4939192	5'	-	1360	3366	1	33.57
ATGGGTTATACAATATTATAGTTGTGCCTAGTGGGGAGTCCCAACGTCAAACAAATTTTAAGCAATAAAGGAAAGCAAGCTTATAGACTATTATGTTGTTTAACAAGATAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1	+	chr2R	5453538	5'	-	INE-1	557	1	77.40
CAAAGTGGAAAAGTGAAATAAGCGCAGCTTTATATGCACAAATACACATACATATGTACACACAAATATATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAA:1	+	chrX	6498929	5'	-	Quasimodo	7326	2	56.03
GGTTGTTTATTTATTTGGCTGCCAAACTAAACTAAATGCCCTGGCCACACACTTTAGATGTATGCGTTTCAATTAACTTGCAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGATTGCCGGAATGAGTAACCTGTATCAGATC:1	+	chr3L	7181772	5'	+	1731	430	1	56.55
GCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1	+	chr3R	19589920	5'	+	BS	5042	1	56.00
AGAATCCGATTATAATCTGTAATCATAATCCAGTCTGCAAATCTATATAATGCATGTTAACTGTAGGCGCGGGGCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATG:1	-	chrX	5626905	5'	+	jockey	4950	1	55.81
CCATTTTGGTCTGTGCCAGAAATGAAATCTATTGTCTGCCAAAAAGTTAACGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACG:1	+	chr2R	18344149	5'	-	roo	8845	2	60.47
CTCATTATTCACACTACCAACTGTTTATCGACCGTACAAAATCAGATTCATAAATTAAAACTATTAAACATTACCCCTTAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTT:1	+	chr2R	3334256	5'	-	Quasimodo	219	2	53.42
TTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGT:1	+	chr3R	22388983	5'	+	G2	2661	1	65.65
AACGTACTGGTCCGCCCGCCACCCCCTCTGTTTTTTTTCTTTCCCGATCCCTCCCTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1	+	chrX	12534947	5'	-	Doc2-element	232	1	87.67
CAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATATCTAGGCAGCTATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAG:1	+	chr2L	16067090	5'	-	297	319	2	73.97
GATATACTTTTGTTTAATTGATAAAAAAAAAAACAATTTATTTTTAAAAATAAAATTTAATT:1	+	chr2R	20422612	5'	+	NOF	3954	1	75.81
GATCTCAGGTAGCACAGGGAGAAGTGCATATTGTTCGGTCGCATCCCTCACTTAAACCACTCTCCACGGTACATACATATGTATACACTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAAGTTCAG:1	-	chr2L	21344901	5'	+	G5A	2786	1	54.79
AGTGCATTAATACTACGTATTATAGTTATTATATACTACGTATTAGTGCAAAGTAATATATAAGCAAAGCTGACCTGATTTATACTATGTAATTATACAATGCAATGCAGATAACGACAGGTCTTTTGTTGTTTATTTTCTTGAAA:1	-	chr3R	23381548	5'	-	S-element	167	2	75.34
CTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr3R	17817893	5'	-	roo	352	2	60.61
GCAATCAATAATTTCGAATAAATTTGATAAATGTTCCTGTGTCTTTAAGCCATGTAATGTATTGAATTCATATTTATTGGCCCACACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTC:1	+	chr2R	10677858	5'	-	1360	416	1	57.93
CTCAATGGGGCAACATAAAAACTGAAAATTGACCGCACTTAAAACGGGCGGCGCACTAACACTACTGCCACTCAAAACGCACACACACACATACACACACAAACACCTACATA:1	-	chrX	6944836	5'	+	Quasimodo	38	2	78.76
GTTTCGTTGACATCACTGTTCCTGATGGAATAAGGGTTGGCTTGGCTGGTGGGTGGGTGTTTCATACATTCATATATATGCATATACATATACATATGCCTATATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1	-	chrX	4215085	5'	+	flea	4773	2	63.01
ATTCAACTTTGAGATTGTAGCAAAGTTGCCCTTTGCCCCGCCATCCTCCTCCTCACCATTCTCCTCGTCCTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTT:1	+	chr2R	8290871	5'	+	micropia	57	4	69.44
CCTTGGCTCCATTTCCTGTGTCTCTCTGCACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1	-	chr3R	7482856	5'	-	412	452	2	56.85
ACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATCTCTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1	-	chr2R	24218590	5'	-	412	408	2	75.74
AATTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTCACACAAAAAAATGGAAAAAAA:1	-	chr3L	12215923	5'	-	pogo	57	1	85.19
CCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAACAATGCAGCTAACTTAT:1	-	chr3R	15072629	5'	-	pogo	2044	1	76.85
AGCCACATGGCTACACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATA:1	-	chr2R	9500093	5'	+	G5	4721	1	51.37
ATCATCGGAGAAACATTTTTCACTTGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGTCTCTAAAC:1	-	chr3L	19036079	5'	+	Tirant	20	2	60.00
TATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGGGGTTCTCCA:1	-	chr2R	9221093	5'	-	opus	427	2	72.39
GATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1	+	chr3L	3863455	5'	-	blood	7322	1	71.65
AACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2L	17420263	5'	+	roo	50	2	53.42
AGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1	-	chr2L	18294263	5'	+	roo	8751	2	81.82
TTCCGGCTCTGCGCCAATTTCAAAGGTAAACACGAGTCGCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	-	chr2L	3886284	5'	-	roo	9050	2	69.86
ACCTCATCTGGAAAAACTTCTTGTGGATGATGCGACTGCATCACATGTAGATTATACCAGAAGGATGTGGGTATTTTGTAATCAGGAAATTTTTATTTTTTAGGTTAGAGTTGATTAGCCAATGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATC:1	+	chr3R	26355985	5'	-	Burdock	339	1	50.68
AATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1	-	chr3L	17115531	5'	+	blood	72	2	64.38
TCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATA:1	-	chr3L	7943711	5'	-	Burdock	6353	2	54.84
AACTATCACCAAATATGTGGCCCATTCTTTGCCCATATTAAAATATTGTATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAA:1	-	chr3L	14638732	5'	-	1360	56	1	67.39
TAATACACAAGATCCATAAAAATCAATAGACACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1	+	chrX	17756539	5'	+	297	24	2	65.75
ATAGTTTCCCCCCATTTTTCCCTTTTCAAACGTCATTTTGCATTTAAAACTATTTTTAAACAACTATGTATGTTTGCCAGATTCGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1	+	chr3L	16750624	5'	-	Tirant	399	1	77.27
GGGGCTTTTTAGTATTTGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTTTTACAA:1	-	chr3R	17243263	5'	+	hopper	12	2	73.97
ATCTATTTTACTTTTCAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1	-	chr2R	9791711	5'	-	412	7530	2	71.43
AGCCAACTTGAAACCATCTATAGCTTATCAGCTTAAAAAAATATGTGCTTAAGTAATCGATATAGTTCGAACTTTTTAAATTATCAAGACAAAGAGTGAAGTATGTTTAAACTTTAAAATATCTTTAATTTAATTTTATTTGTAAG:1	+	chr2L	16374062	5'	-	NOF	3956	1	43.15
GTAATTCTTTGTATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	+	chr3L	20654440	5'	+	roo	29	2	65.75
CTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCACAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAACTTATT:1	-	chr3R	28075410	5'	-	jockey	4937	1	53.42
AAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTGCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	21229010	5'	+	jockey	73	1	69.11
AAACTCAAATTGAGTTTATATATTACCTTACCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1	-	chr3R	5061961	5'	-	mdg3	210	2	59.59
ACAACCGGCGGGAAAAAGGGAAAACCGGGGCGTGGCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTCACAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAA:1	-	chr2L	2712752	5'	+	I-element	417	1	70.29
GGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:2	-	chr2L	19965039	5'	+	Doc	80	1	71.76
TAACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTTAAGTGAAACTGAGT:1	+	chr3R	11162682	5'	-	Copia1_DM	94	1	76.26
TTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	-	chr2R	9662797	5'	+	412	7119	2	66.44
GTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCGCGCCACC:1	-	chr2R	2308825	5'	+	McClintock	5986	2	68.66
TCTGTGGATTTGCTTTCTTTTTTATACGCAAAATCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3R	17420543	5'	-	roo	9051	2	65.22
GGTCAAAACAAATGAGAGCTCAGGTCTCTATAATTTGAGTGGCGTGGCAACATAGATCAGCAAACATTCGCTGCGTCGATGTCTGTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1	+	chr2R	14787237	5'	-	INE-1	156	1	68.85
TTATTGAATGATTTTAGAAGATTGGGACGTTGTGTTGGTTTCTTCATGGAACCTTAATGTGAAATAAGGTTTTATTTCATTTAATATAAATTAACTAAGATATAAATTATTTAAATTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTG:1	+	chr2L	21647800	5'	+	1360	256	1	77.62
AGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCCGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGA:1	-	chr3R	21434942	5'	-	412	416	2	78.63
CATCTGTTAAATCTCAATTGCCTGCTGACCTAAAACTATGTGACTGTACTCGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1	+	chr3R	9210598	5'	-	mdg1	392	2	61.87
AAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTCAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1	-	chr3R	18585636	5'	+	P-element	86	1	20.74
GGATGGATGAATGTTGTACTCCTCGAGCATGCAAATTAGTTCTTGATTTGTCCCATAATGAGCCTGTGTTTTTGCACTGATAAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCC:1	+	chr3L	10000089	5'	-	roo	112	2	57.53
GTGCACTGACACCGAAACAAAGATCGAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1	-	chr3L	3863567	5'	+	blood	24	2	68.97
GCAAGTGTTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chrX	14336534	5'	+	roo	30	2	63.31
ACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1	-	chr3L	4605728	5'	+	pogo	36	1	56.15
CGGCTACTGGTCAACGAAGGAGAAACGCAGCGGGCTTTCACAGATTTACACAAAATAATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATATCATATTAACTTA:1	-	chr2L	3165049	5'	+	412	7089	2	47.50
GGTTCAGGTTCAGACACTGCAAGAAATAGTCCTGCCAATGATTTATTCTATTCTGTTCTTTAAACAAGAGAAAACGCTTTAGTCGAGTGTCGCGACTATCAGATACCCGTTACT:1	-	chrX	17816749	5'	-	INE-1	550	1	40.35
GCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2L	16092005	5'	+	roo	50	2	55.86
TTTTACAATCCCTCTTTATATTTATTAATTGAAAGCAATCAAGAAACAGTTTACTTATTTGCATACCGTTTAAATAGCTCATTTAAAAAAATCATATCTTGAAGCACGAAGAACGGACACAAGCACTCAAC:1	-	chr3R	27717650	5'	-	1360	461	1	67.94
GTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGCGTAGTATGNGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1	-	chr2L	18419247	5'	+	412	7073	2	55.45
ACCAATCATCATAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1	+	chr3L	17560261	5'	-	pogo	2056	1	55.48
CTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGCCACTCGCTGCCGCATACCTCACTTTGAGATGACAACCAACATGC:1	-	chr3L	3500997	5'	-	opus	7442	2	75.45
GTCCGAAACCGGAACACGAACCATAACCGTTGATTTTTTTTCTGTGTGCTAAAAGCTGTTCAGTGCCAAATAATATGTTTTTTTTAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATA:1	-	chrX	5662739	5'	+	P-element	462	1	57.53
GAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTA:1	+	chr3R	25448359	5'	-	roo	324	2	73.97
ATTAATGCATCTATAATTACAGTTCTACACGAGGAATATTAATCCATCACCACTAATCAGCATCCAAAGCACTGATTAAATGGCAGTAGCGCGTGTTATCTGAAGAAATGCGGCTGCATGGAAATTGC:1	+	chrY	511688	5'	-	Chimpo	404	1	53.91
ATTTGCATTTATCGCGCATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAG:1	-	chr2R	11629281	5'	-	Tirant	289	2	61.64
CCCAGGTGAGTAAGTGCCGCTGACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1	-	chr3L	20168459	5'	+	mdg3	42	2	52.63
CAAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAATTGG:1	-	chrX	8480357	5'	-	hopper	141	2	90.00
CAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:2	-	chr3L	21855537	5'	+	blood	60	2	59.59
ACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1	+	chr2L	9399457	5'	+	Transpac	76	2	71.23
TCAATAACCGATATTTGTTCTGTTCTTATCAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAAACGCTATAATCGAGTTCACCGACTATCACATACCCATTACTCAGCTA:1	+	chr3R	17736258	5'	-	INE-1	544	1	47.06
TGTATCCTTCACAGTACGAAAGGGTAATCGAATCATGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1	+	chr2R	3504640	5'	-	297	346	2	63.57
CGTATCTAATGTTAATGCATTCAACATATTCGTCTAAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1	+	chr3L	17559124	5'	-	jockey	4924	1	68.28
GCATAGCGCACATGTCCTTTGAAAAGGATTGGTGTCTGTTGGCAGAATTTATGACAGCTCCGGTTCAGTCCAGTCGCTTATGTTTTCGTCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATC:1	-	chr2L	5940407	5'	+	hopper	344	1	57.85
CAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:2	-	chr3L	10013670	5'	-	hopper	1351	1	60.96
ACTGCGATGTGTGCACATATGTATGTAAGTTAAGAACCTCATCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGT:1	+	chr2R	9544057	5'	+	opus	78	2	83.20
CTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATT:1	+	chr3L	10574310	5'	-	Tabor	400	2	74.83
CCTCTAACTTATTAGGCTAATTTCAACTCATTCTTGTCACTTTTTCGTAGACGATTTTGATTGAGAGTCTTCGTGACTCGTACCTTGTGTGATTAACTTAGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1	-	chr2R	19797137	5'	+	Transpac	4935	2	67.59
TTCCCCATCCATTCGCATGCCGGCTACTTAAGGTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAATTTACTCGTTG:1	-	chr2R	9632238	5'	-	roo	396	1	74.29
TCAAACTCAAATTGAGTTTATATATTACCTTACCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1	-	chr3R	5061963	5'	-	mdg3	5465	2	61.38
ACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATATAAA:1	-	chr2R	9500065	5'	+	G5	4749	1	51.37
TATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3R	14364684	5'	+	roo	21	2	53.26
AATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	-	chrX	14336520	5'	+	roo	8715	2	58.22
AACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1	-	chr4	829132	5'	-	INE-1	156	1	72.03
AATAATGTCATTTGCATTTATCGCGCATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTC:1	-	chr2R	11629290	5'	-	Tirant	8393	2	54.79
AAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAAT:1	-	chr3L	10574378	5'	+	Tabor	6900	2	56.85
TATTGATGTTAAACTTAAAAGACTTCCTCATAACTTTAATAGTCAAAAAATGGGAAAAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr2L	12153281	5'	+	roo	8720	2	58.57
GTGCATTAATACTACGTATTATAGTTATTATATACTACGTATTAGTGCAAAGTAATATATAAGCAAAGCTGACCTGATTTATACTATGTAATTATACAATGCAATGCAGATAACGACAGGTCTTTTGTTGTTTATTTTCTTGAAA:1	-	chr3R	23381547	5'	-	S-element	167	2	75.86
CAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGCGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	+	chr3L	14603232	5'	+	jockey	10	1	74.79
GCCGGTTGCATGTTGTTGCCGGTTGACATATGAGCAGCAGCAACATCAGTTGCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAGCGGCAGCAACAGCGGCAGCAACAGCGGCAGCAGC:1	-	chr3R	26062764	5'	+	TART-A	422	2	66.36
AATTAAATCAAAACAGCACTTCTTTTGTTTGGGTCATATAGGCAGATTGGGATTGCTTAAGAGCGAAGCTTAAGAGAATAAAGTTATCAACGTCTATTCTCTCAACCTTCTAGCTGTTATTGTTCCTGCGATCTCGACGTTTATAC:1	-	chr2R	18278185	5'	-	INE-1	137	1	48.63
AGAAATATCATTCAATTTATTTTAGCTAAATTCAGAGAAAAAAATGTTTTCATTTACTTATTGAAATTTAAAAAAATATATAAAATACTTTTTACTTTTCTATTGAATATTTCTAACTATATTTCGTATTTATTCTTCGACTTAA:1	+	chr3R	18496586	5'	-	ZAM	8264	2	71.72
AATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTGTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1	-	chr2R	9791644	5'	-	412	7461	2	81.48
TGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTGCGTTTGATTT:1	-	chr2R	13585483	5'	-	412	7473	2	69.40
TACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1	-	chr3L	11530953	5'	-	roo	8985	2	77.40
GGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGA:1	+	chr3R	25826762	5'	+	mdg1	433	1	68.49
AAACTATTAATTCATTAAATGTTGCTTACACAGATTTTCCATGTCAACACCTTTACTTTACATTTTATTAGATTTCCTAAACTGCCTTTGGAAAAAGACTACCAAAAACTACG:1	+	chr3R	14249639	5'	+	Stalker4	7067	4	80.53
TATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr3R	16076857	5'	-	roo	8989	2	75.86
TTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCC:1	+	chr3L	23797670	5'	+	Helena	1149	1	53.33
AAACATATTCGGTGTAATCCAAAATGAAATATCCAATTCCACTTGTAATTCTGCAAGATACAGATAAAGTATATTATTAAAACATAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCA:1	+	chr2L	23166587	5'	-	1360	45	1	57.53
CAATGAAGTATTAAATTCTTCTGCAAACGTGCTAAATTGTAATTAAGGCAAGTCTTATCATATATATTTTAAAAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1	-	chr2L	6863440	5'	+	pogo	9	1	75.34
TTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAA:1	-	chr2R	24218616	5'	-	412	7489	2	59.70
GTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACTTGCGAATCG:1	+	chr2R	20596473	5'	-	roo	8994	2	64.38
AAAAAACTGTAATATCTTGATCTTAATTGCAGTGCCAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAA:1	-	chr3R	22822172	5'	+	mdg1	5	2	61.43
TTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	+	chr3L	16015221	5'	+	1360	32	1	51.20
TCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATC:1	-	chr3L	3863537	5'	+	blood	7009	1	78.65
AAGTGAGCGAAATGGGGAAAAAAACAAAATCGTAAGGGGGGATCCCAGCCGTTCAAAGCGTTTTGCGTGGGTGCCATTGTAGAAACACATATATATGTATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAA:1	-	chr2L	2794315	5'	+	Burdock	6143	2	75.56
ATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	+	chr3R	17420363	5'	+	roo	12	2	73.97
AATAGTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1	-	chr2R	3066005	5'	-	P-element	2818	1	41.10
CCGTAGCACATTCAGTGTGTGAACGGGTCCGAACTGCTCGAACATTTGGCGTAGCCTCGTCTCGTCCCAGGTCTTCGGTTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAG:1	-	chr2L	12358215	5'	+	R2-element	3478	1	56.83
GAACCGGAATACCTCGGATTATCGTATCGAATTGGATTACAAAACACCGAATGTGTTTTCATACCAATCCGATTTAAATTTTGTAAAAATAAAAACTCTAGAAAGGTGCTAGATAATAAAAAAAAATTATAAAATATTT:1	+	chr2L	16767017	5'	+	Tc1	53	2	69.06
AGTTCCGGCGCCTGGCTGGATGACCTCAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGTCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTT:1	+	chr3R	11496498	5'	+	1360	39	1	57.53
TGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1	+	chr3R	25423187	5'	+	3S18	5815	2	49.32
AATTGGGTTTACCCGCAGTAGTTAATGTTAAACAAACAACATGGACACAATCCAGCTGGAAATTTAACTTTAGAAAATATAAGACTTTTAAGTTTACCCCGATCGAATCAGAGGGTAATCCTTTGCCCACCTCTTAAAACCAAATA:1	-	chrX	17980219	5'	+	FB	317	1	55.48
CGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGTACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCCACGCGAAGGCAAA:1	-	chrX	12074599	5'	+	412	7212	2	70.55
CGATGTAATCCCGCAGAGAAGAGGACACCGCACTCACACAGGAAAGGCACATACACACACACACACACACAGAAACAGGCGAGACACGCACACATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1	-	chr2R	16891942	5'	+	hopper	13	1	58.46
ATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCG:1	-	chr2R	19727744	5'	-	R1A1-element	5129	1	57.25
ACCCCATTCGACACTCCTCTTCACTTTCTCCCTCGATATCTTCTTATATTTCTACCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGC:1	+	chr3R	25454732	5'	-	Quasimodo	238	2	55.24
TAACTCGTTTTACTTAGAGGAGAACTTTTCTAGTAAATACTGCAATAGCACTAAACAAAAATTCACTAACTTAAAAACGATTGATGGAAATATATGATGCAAAAGTTGTTTGAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAG:1	+	chrX	17623318	5'	+	INE-1	85	1	77.78
CATTTCCTGTGTCTCTCTGCACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1	-	chr3R	7482847	5'	-	412	7496	2	56.85
TTTGGATGTTATAGAAATCTTTTTTATGGTTTCTTTTTTTAGTATTTGTTTTTTTAATTTTGAATTTTTTATTATGGTGATAGACCGTTGAGTCCAAAGACACTAGAACATTATTCTAGTGTCTTTGGT:1	+	chr2R	18042824	5'	-	Tc3	241	1	31.78
TAGCAAAAGCGTGAGTTTGATTTACAATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3L	11530874	5'	+	roo	56	2	61.38
AAGTTTTGTAAAATGTTAATTTCTTTGAAGTAATTTGTAATAAGTAATTTTAAACTGTTTAGTTTTTAAAGAATAGAAGAGCTTCTGCTGTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAACGCCCAAAGTGCGCTGAAGTTGTGTTCAGCTATC:1	-	chr3R	14843601	5'	-	Stalker4	7261	4	69.18
CTAGCTGCTGCACAGAGATAAATTCCGTAAAACTTAATGCCAGATATCAAAAAACGATTTTATGCAACTACAGAAATTAAAATTAATCGATTTAAAGTGCAGCAGATAAGCGGGCAGAGCTTTCATGCTCGACG:1	+	chr2L	11387366	5'	+	R1A1-element	5033	1	73.88
CTTTGGCTTTTTAAATCTGGAATTTAATAAACGTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACT:1	+	chr2L	11985756	5'	+	G6	1687	1	50.37
TTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGCGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr2R	7898089	5'	+	roo	69	2	77.61
CTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr3R	12886984	5'	+	roo	8723	2	67.88
CCTCAATCGTGCACAGAGAAAAATTTGTCTGGAGTTGAAATAAGAACGTGGGCGAATTCTTCAGCCTAAGCGATTAAGGTACAACTCGTTTCTTGAGGTACTCCGGCGGAGATTTTTTTTTTTGTTTTTAAACA:1	+	chr2R	9739592	5'	-	TART-B	10632	1	76.87
CCATCAAGAGTACTAACCAAATCCATACTGTTCCCATTTGAAAATATCATTTAAATTAAGCGCCGAAGAAGCTGCAATAACGCATTAAAAAGCCAATCAAATTCAAAGTTTCCTGCTTTTGCCATTAACATTATTATTAATATTAT:1	+	chr2R	9993820	5'	-	mdg1	47	2	68.49
AAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGGGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAAT:1	-	chr2R	16248011	5'	+	BS	51	1	54.11
ACTCCCGGGGGACTCCGTCGACATGTATAATCTGATAAAATTGCAGTCGCATATTTCAGAAAGAATTATGCAACTGCTTGTTACATTTTAGCCGTTACTCGTAGAGTAAAATTGTAAAAATATGTAACACGCAAAAGGAAGCG:1	-	chr3R	18376896	5'	+	INE-1	30	1	51.05
TTAATTTAGTTTTAGTCCGCTCTACTCGGGTTCATCGTAGGGTTTTTGTCAATGAGTTTAAGTCGTGTGGCTCGCATTGCTTTTTGCGAAGACAACTCAGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGGT:1	+	chr3R	25456374	5'	-	Quasimodo	7124	2	77.60
AACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGAGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTATAGCATTAATACATTGGAAATACGTTA:1	-	chr3L	10013642	5'	-	hopper	1338	1	74.05
ATTGTTTTTTTTTTGCGTATTTTCATGTTTACTTAAACTTTTAGTTGTATTCCTCAAAAATGTAAAGAATTAAATTAAAATGCAGAATATTAAATTAAGCATAGCATTAAGCATAAGCATGCAATAAAAGTGTTGAGTTCAGC:1	-	chr3L	7273956	5'	+	Transib5	459	1	36.36
TGACAATAAATTCTGGTGATATATGTTTGAATTAGTGAACCCCAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGC:1	+	chr3R	12854132	5'	-	Quasimodo	6925	2	64.62
TCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGACCATAATTCGAGTTCACACATGAACACGAATATA:1	-	chr2L	7945398	5'	+	roo	8667	2	60.00
TGACACTCTTCAAGTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGG:1	-	chr2L	23034090	5'	-	FB	395	1	49.66
ATAAAACCCGCCTGAAAATTACACAATTTAAATGAACGGATCGAAAAGCAACTTTAGAGACCTTAAAACGGATTCTTAATGTGAATTAAACAACAAATCAAAAAATAGTCGTCCCGAGCGAGGAAAATAATATATGAAAAACAAA:2	+	chrX	21032240	5'	+	BS4	728	1	70.34
AGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	+	chr2R	21907900	5'	-	roo	9038	1	60.29
CTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAG:1	+	chrX	18193636	5'	+	jockey	30	1	62.79
CGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1	-	chr3L	17205270	5'	+	hobo	63	1	73.02
CTGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr3L	11531013	5'	-	roo	9045	1	66.44
AGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chr3L	11393486	5'	+	roo	45	2	63.64
ATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCTCGC:1	+	chr3L	25482873	5'	+	accord	36	2	57.46
GGGATGCGTGTCCTTCGGATGATGGCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	+	chr2R	19050156	5'	+	roo	4	2	75.83
GTTTGTAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1	+	chr3L	10848622	5'	+	blood	1	2	79.05
GAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr3R	7100901	5'	-	roo	346	2	58.90
CGTGTGTATTTATATTAGTGGACAACGAAGGTTGTCTAATTGCAAACCAACAAAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1	-	chr2R	19540514	5'	-	jockey	4986	1	74.66
GACCTCAGCTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAA:1	+	chr3R	11496519	5'	+	1360	33	1	52.94
ATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1	+	chr2R	16785353	5'	-	412	7475	2	74.42
TGACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCG:1	-	chr3R	25423301	5'	-	3S18	282	2	57.53
CTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTAC:1	-	chrX	23182909	5'	+	Idefix	68	2	70.50
CCATCGGCAGCCCGCATAAAAATACTCGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGCCTGTGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGACT:1	+	chr3R	17531348	5'	+	1360	20	1	59.81
CTCATTGTTTTTTGAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGACAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1	+	chr3R	25423171	5'	+	3S18	34	2	58.22
TTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAA:1	+	chr3R	9714395	5'	+	Stalker	76	4	68.49
CGTCATGACGGCCACCCAGTCAAAGTACGGAGAGAGCTCAAACACATTGTACCCGGCATCAATAACCATGAGATGCATGACCCTTACATAGTATTATGTTCTGACTATATCTCATTATCCCATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGC:1	+	chr2L	23000237	5'	+	Cr1a	4229	1	56.16
CTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chrX	14336415	5'	-	roo	9010	2	63.57
ATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1	+	chr2R	5485077	5'	-	blood	7384	2	74.80
ATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chrX	17526819	5'	+	roo	45	2	50.00
TATACGCCATGTGTTACAGCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	-	chr2R	9328723	5'	-	roo	9036	1	60.27
CCGCATAAAGTCAACTGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	-	chr3R	28624657	5'	+	roo	8727	2	64.38
ATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1	-	chr2R	20194275	5'	+	Max-element	53	2	66.37
AGTCTGTGCTAGGGAGCAACAACTGTCACTCTAGTTGCTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1	+	chrX	3301313	5'	+	hopper	147	108	71.67
ATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr3L	16015227	5'	+	1360	50	1	56.20
AATTAATGAACTCGTAACTGTCGCTTTTGCAAATTGGGCTCTGAGAGTGTGGAGTGTCGGTGTGTCGGTCTATCTGTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTGACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGG:1	-	chr2R	20913996	5'	+	hobo	45	1	48.97
TCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr2R	20596471	5'	-	roo	331	2	69.86
CAGGCAATGTTATTATGCAACCATTCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1	+	chr3L	4840696	5'	+	jockey	4703	1	62.24
TATGTATTTCAATATTATTAGTGTAGTTGCTTTTATTGCTTTTAAGGAATTTATAGGTGTGTAATGATCTATTCCAACGACAGCTCTGTCCTATCTATTTCGTACGGATTTTGTGATAATTGGATAATAAATAATAAATATTCGTA:1	-	chrX	22824638	5'	+	Juan	4059	1	75.34
GTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTG:1	-	chrX	21667930	5'	+	gypsy2	40	2	56.36
AGATAAGATAAGTGCATTTCTAAACATAGATTATAAGACTTAATGCAGCGATAACATATACTTATGTATGTATGTATGTATATAAAGAGCGACCTCTTCGCTACCCTAATTATGTAGAGTAGAGTTAATA:1	+	chr3R	9550480	5'	+	Stalker3T	52	1	76.92
AGAAACAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr2R	9632068	5'	+	roo	8686	2	66.42
TTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCG:1	-	chr3R	1844823	5'	+	Cr1a	181	1	74.62
AATAAAATTATGAAAAAATTTGGATAAAATGGTTCAAATGTTGCTTGGCAACATGGGTCAACAAACATGCTCTGCGTCTTTAGAATCTGAAAGCTAAGTCTTAACCTTCTAGAATTGATAGTTCCTGAAATCTCGACGTTCATAAG:1	+	chr3L	7889286	5'	-	INE-1	136	1	69.86
TTTTTACAAATATTACTATATTCAAGTATGGGCGTCGGCAGCGAAGCAGTGGCCGTTAGAGGCGGAGAAGTGCAGATGATTGCACTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGA:1	-	chr3L	14876100	5'	-	HMS-Beagle2	89	2	49.58
GTTGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTC:1	-	chr2R	23592061	5'	+	micropia	28	2	60.45
ACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr2L	3114556	5'	+	roo	8743	2	73.43
GTTGTCATTATATCGAATCTAAAAATTGTTGAGTGCTTAAATGTCGCTTTCGTGTGACTTAGTTTAAAATTGCTTAGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTA:1	-	chr3L	3989128	5'	+	flea	428	1	56.85
GACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCCAGCCACGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAG:1	-	chrX	21575415	5'	+	INE-1	136	1	45.00
ATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATATAAATTTATACACACA:1	-	chr2R	9500053	5'	+	G5	4761	1	59.59
ATCGAAAAGAATAGATTTTTATGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1	-	chr3R	7100898	5'	-	roo	403	1	63.22
AGGGCTAGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:1	+	chr3L	23603159	5'	+	F-element	78	1	61.38
CATTCGCATGCCGGCTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr2R	9632229	5'	-	roo	396	1	74.05
AGTTGCTCACTGCTAAAGTGAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAACATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chr3L	10292930	5'	+	roo	8691	2	64.29
AATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	-	chr3R	7100899	5'	-	roo	9008	2	60.27
CGTCAACTAAAAGGGCAGGCAGGAAAATACAGTAAAAAGAGGGGGGTATTAATAAATATACGCTCTTTATGTACGCTTTCGCGGAGAATAAGAAAAAAAACAACGCTTTAAAATTGCTGGAAATTGTTTATAATCAATTTTCTTTT:1	+	chr2L	14996427	5'	-	Tc1	389	1	79.45
TGATTCTGATTGCAGCTAGAGATTAATGCAAAGGGATGGTATATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1	-	chr3R	14337521	5'	-	copia	220	1	61.64
GCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1	-	chr2L	11661018	5'	+	F-element	51	1	48.00
GGAAAGAGTACGCTGGATTAGGAGTGCATTATGTATGCAACAGATTAGACCAACTTCAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATT:1	+	chr3L	17564125	5'	-	jockey	4840	1	61.64
AATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1	+	chr3R	9210650	5'	-	mdg1	364	2	71.30
CGCAAGTAGATTTTTGAAAGGTTTCTGGATGCGGAGTGGCGCTTTAATTGCATTTCGTTGCGTTGCCTTCGTTGCCGGCGTCTTGTTGATGTTGATGCTGTTGCAGTTGTTGTGCAGTAGATATCGTGATTGC:1	+	chr3L	4784294	5'	-	Doc3-element	497	1	66.92
GTTGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr2R	19004238	5'	+	roo	8705	2	56.06
AGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1	+	chrX	17054189	5'	+	jockey	28	1	59.82
GGTCGCTTACAAAGTTTAGTGTGGGTGGATATATTGAAAACTTCCAGGATATCGAATTAACCTTAAGTTTTATTCGGGCACATTTAGGATAATTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAA:1	+	chr3L	19125978	5'	-	BS	5028	1	72.44
CTCCTATGTACTTCGTATCTGCAAGATACTTTTTTACATTTTCCTGCTTTAATTACACAAATTCTGGTTTATTACAAACGATCGGGGTTCTTGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1	-	chr2R	9544159	5'	-	opus	7481	2	69.72
GCTCTGGCAGCTTTGCGGTATTGTGAATAATCCCCAGTTTATTAATCAACGAAAAACTGTGTGAGTTTGTTTGATTGCAAATAGACGATGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTATAGTCTTCTTAT:1	-	chr3L	20630149	5'	+	roo	395	1	63.01
ATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCTGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1	-	chr3R	10462678	5'	+	opus	40	4	76.09
GTTCACTTTTTTGTCATACAGCTTCTTGTTCTTTGTGGAAATATTTTTTTTCTGCTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1	+	chrX	7256048	5'	+	412	8	2	45.21
AGGAAAACAATTATAAAAACTATAACAATACCATTAAGTCAAATGATTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATGGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATC:1	-	chr2R	3938945	5'	-	1360	494	1	78.08
CAAGTGCTAACTAGATTTAAATAATGCATTAGTCGCTGCTGTCGTGAGCATTCGACTGCTCATGGTAGTCTACCATGAGTGGATCACTCCTGGGTACTGATCAGCGGAGGACTTGAG:1	+	chr3R	12853835	5'	-	Quasimodo	242	2	64.10
GGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGC:1	-	chrX	21994002	5'	+	McClintock	5999	2	54.61
CAACTGGGAAAAGTCAAAAAGTACAACTGAAGCAAAGGTTCCTACGACTATGAAACGGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCA:1	+	chr2R	21148166	5'	-	pogo	1866	1	54.03
AGAGTGAGCGAAGTGCTCACTGAGAGCAGCCGTCAAAATTATTTCAGGAAATGCATTAAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1	+	chr2L	13584612	5'	-	pogo	2080	1	63.50
GAGTATCCTTCGCATGGATCGTTTACAATAATGCATATGAAATGATATAGGATTTAGTTTATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGG:1	-	chrX	14812991	5'	-	jockey	4774	1	61.38
CTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3R	17817998	5'	+	roo	8685	2	64.71
TCTAGATGTTTTTCAAAAGCTCTACGCAACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr2L	6059178	5'	+	roo	8678	2	72.59
GAGTAGGGAACAAAAGCTCCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1	-	chr2R	9662838	5'	+	412	25	2	67.81
AAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	+	chrX	5643462	5'	-	roo	9023	2	52.74
TTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAG:1	-	chr2R	6271498	5'	+	blood	7221	2	78.57
AAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr2L	17420123	5'	-	roo	398	1	71.31
TTATTCTTCCCGAGTTAGGGCACCACAGTATATAAGAATACTAAAGGACCCAGTAGCTATTAGCAGGAGTTAGTAAAATACGAATGTTCTGAATGTAGAAAAGGTAAGCTGAATCTGAACCTTCTCGCTTTTATAGTTCCTGAGAT:1	+	chr2L	22689417	5'	-	INE-1	151	1	70.55
ATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1	-	chr3L	20033811	5'	+	blood	7041	2	54.79
TACCTACTTTTGTCTAAAAACCTATCCTTCTGTTTTGCAAAAACAAAATATTGGGTTAAACAAAACGTAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCT:1	-	chr3L	8957633	5'	-	roo	8907	2	59.32
CTGCCAGGATAAATGCGTGGCATATGCCGGCAGCCGTTGTCCAGGTGACAGGACCTCCTGCGCAACAGCACTTTCTCCAACGCCACCCAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGCGGTCTAAT:1	-	chr3R	26293912	5'	+	F-element	4476	1	67.97
CGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chrX	13066602	5'	+	jockey	20	1	63.89
TGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCC:1	-	chr3R	934250	5'	-	Rt1b	4710	1	47.41
ACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3L	9998031	5'	-	roo	9053	2	50.00
ATTTGTTTATTTTTATTAACTTTATTAACTTTGCTGGTGGAGTTTTTTCTCTTTGCTTTTTTTTTATCTTTGCTGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTAACTTTGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATA:1	+	chr3L	13958677	5'	-	TAHRE	10415	1	60.96
CGGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGGGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chrX	8543466	5'	+	roo	14	2	54.17
CTCTTCATTTAATCATGTAAAAGTGTGTGTTGACAGTCAGATAGAAAACAATCGTTGCATACTTTTAGACCGCGTTATTTAAAATTTCTAGCCACTAGTCGCTTTAGTGGCTTATAATAAGATAAGATAAGAT:1	-	chrX	18051125	5'	+	Stalker3T	201	1	59.40
AGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGCGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1	-	chr3L	10574404	5'	+	Tabor	35	2	51.37
CTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1	-	chr3R	20427442	5'	+	jockey	79	1	78.40
AGTGCACTTAGAAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	+	chr2R	9328564	5'	+	roo	29	2	64.14
ATTATTTTGAAGGCCTGCTTCCGAATGTTCATATTAAAAATATTTAAGCACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr3R	14364748	5'	+	roo	11	2	75.34
AACTAAAGAATGAAAACTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1	+	chr2L	12250033	5'	+	1360	51	1	53.42
CACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	+	chr2L	15833477	5'	+	jockey	36	1	62.20
ACAATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	+	chr3R	16076763	5'	+	roo	8710	2	56.16
AGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTTTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGATGCCATGTTATA:1	+	chr3L	25782389	5'	-	Stalker	49	4	51.80
GGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGGGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1	+	chr2R	2016807	5'	+	1360	29	1	58.73
CGCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr3L	233250	5'	+	roo	73	2	71.63
AACAAACACGCACGGTAAAGAGAGGGGGGCGGGGGAGGGGGGCTATGCCGGAAGAATGAGAGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chrX	16717833	5'	-	roo	9047	1	57.39
AGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATA:1	-	chr3R	14979865	5'	+	pogo	84	1	75.34
GATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAAATTATCTTTAGGATTTTGTTATC:1	+	chr3L	16343241	5'	+	roo	8751	2	77.86
GCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCCCAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGC:1	-	chr3R	10274016	5'	+	HMS-Beagle	6860	2	73.98
GAAATCGAAATCGAAAAACTCGCTCTCTGCGGCGGGGAAATCTCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTG:1	-	chr3R	18121902	5'	+	P-element	1	2	68.12
GAACTTAAAAAGTGGCAAGTGTTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACATCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	-	chrX	14336548	5'	+	roo	8687	2	68.49
TTCAAAGCGGTAACAGGTTGCCAAAGGCGCATAACAACAATAAGGAAAATTTCTAGTTCTTCGCGCGGATAAGCCGTATAAATTTTATAGATAGTCAAGAAAACTATACAGAGACCTGAAACTAGCAAC:1	+	chr3R	9158515	5'	+	X-element	4360	1	82.95
GTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	-	chr2R	11164518	5'	+	roo	26	2	62.10
CGTGCGACCTACACGGTGTACAAAGCTGGAGGCAGTTGATGGTGGATCCCACTGCACTACCCACTCGATCTCAGTTACAGGAGAGGAACTACTTTGCAACG:1	+	chr3R	8268769	5'	+	Osvaldo	36	1	76.24
TAGACACTGGCAAACATCGATGATTTAAAGTGTTTTCGATAAAGAAACAAAGAAAAGTTCATTGCCTTGCATGGCTAATAGAAATGTACTAAAAATGTCCCAAAAAATTTTACCAATAATACGGTCAGAAA:1	+	chr3L	22127001	5'	+	Helitron	504	1	54.96
CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTG:1	+	chr2R	4260424	5'	+	micropia	5209	1	45.32
GAACATTATTTGGTTATTTTCTCAGCTTTTCTTGAGAAGCATGTGCGCTTGAGATGCTTATTGTAGTGATTAACAAGTTGTAATAAAATGCAGATATATATGTAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1	+	chr3R	6664898	5'	+	I-element	12	1	76.92
TTTGATTCCGATTTGGATTCTTCTGAATCCTCCTCTACAACCACATCAATAGATTCCTTTACGGATTGCAAAAAACCTTTTGTCGTGCCAACCCAATACGCATG:1	-	chr3L	12953038	5'	+	Q-element	694	1	71.15
CGTTTCATTTATTTTTTTTTAATATACTGCTAAAATAACCATCACCTGACAGGAAGGTGGCTGTGGCAAGCCGAATCTTATTTACCCTTGCAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	-	chr2L	10986911	5'	-	1360	3357	1	61.64
ACAACATAATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1	+	chr2L	8986093	5'	+	412	35	2	60.27
CTTGATAAGCTCATTGCGTGAATTGTCTTTAAAGCTGCGGACAGGCGTCTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTCCTACATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1	+	chrX	4214894	5'	-	flea	4999	2	73.10
ACAATTATTATAATAAACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1	-	chr2L	13763212	5'	-	pogo	2086	1	80.00
TTTATGCGGCTACTGGTCAACGAAGGAGAAACGCAGCGGGCTTTCACAGATTTACACAAAATAATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAATT:1	-	chr2L	3165055	5'	+	412	7087	2	48.39
ATTTAATTTAATTGCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATAAGGGGTATACAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCGGAATAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAAT:1	-	chrX	9151941	5'	-	Cr1a	4058	1	62.76
CTACACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATA:1	+	chrX	21585248	5'	+	mariner2	259	1	69.23
AAATGCATCTTTTTTAAATGTACGTTTAATGGGTATAAAGGTGGAATTAATTAAAACCAGAAGAGAAAGGGAAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAACGTATATATGTTTTTGATCAGTATCAATAGCCAAGTCGATCTGGCCA:1	-	chr3R	4166106	5'	+	INE-1	102	1	55.17
GGTTGCCTAAACGAACTTCGGAAGTCAGTCGATTATCCTGCCGGATCACAATTTGATCGATGGTTTTCATGACCTCATACTTGATGTCTGACTTGATTTTTCCAAAAT:1	+	chr3R	30714518	5'	-	transib4	267	1	83.33
CATTTATTTTAATTTGCCGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1	-	chr3R	14979905	5'	+	pogo	39	1	57.45
AGATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chr3L	20831406	5'	+	roo	8697	2	63.01
CTTCTGTTTGCTTTTGACCCCTCACATTTCTTCTCGCTTGGTTGCATGTTTGCTCGTGGATTTTGGCATGCTCGGAGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1	-	chr2R	19562096	5'	-	Tabor	412	2	52.74
TTAAGCTAACTGACAAACCATTGTCTCAATCTAGAGTCAGCTTCTTCGGTTACACTAGCAGACGACTTCGGCAGAAAGAACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTATTTACCCAGAAATGAGGTTGAAATATAAGATGTGGGAC:1	+	chr3L	23237510	5'	-	HMS-Beagle2	23	2	51.37
CCCTCCCCCAACCGTTTTATAGTGCTTAAGCTTAAGGCTGAGATAAACCAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGTCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATT:1	-	chr3R	10734243	5'	-	X-element	4654	1	53.64
CTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTT:1	-	chr3R	9714490	5'	-	Stalker4	7313	4	52.74
CACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1	+	chr2R	5485086	5'	-	blood	363	2	67.48
CGGGTTGCAGCAGATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr2L	5254391	5'	+	roo	8685	2	60.32
TGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr2L	14081310	5'	+	1360	50	1	59.23
TGGTCTTGTTTGCGGCCACATAATTTACTATCTCCGCTTATCAATAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTT:1	-	chr3L	7943053	5'	-	Burdock	6153	2	64.00
GAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCAC:1	+	chr2L	14081293	5'	+	1360	29	1	59.52
GGGTATTCAGAGCTACACTTTATTTCTTATAAAAAACTTTTCAAAGTCTGGAGGGGAATATAATCAGCTACTTGCTTTTATAGTTCATGAGATATCGACGTTCTTACGGACAG:1	-	chr4	1113292	5'	-	INE-1	131	1	69.91
TTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	+	chrX	5643487	5'	-	roo	334	2	69.86
AAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1	-	chrX	14749684	5'	-	copia	213	2	68.28
AAGTAAGATTTAAAAATATTTATATCGTGATGGGAAGTGTTTCCGACCATTTAAAGTATTCTTGAGCAAGTCTTGCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGA:1	-	chr3R	20500865	5'	-	Doc	4399	1	54.48
CCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3R	18582229	5'	+	roo	8739	2	73.94
GTTTTGCTCCCATTTTATGCTGCGCTGCGTCGCAGCCCGCGTCGACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1	-	chr2L	15181440	5'	+	jockey	4801	1	58.72
ATGCCGAATTCGAACCAGGTTATGAAAATATTGATTTTGGCTCAGCAATATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGNATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAATTAATA:1	-	chr3L	3477558	5'	-	mdg1	7440	2	69.86
TTTCATAAAAATATGATAACTAGAATTATTCCAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAA:1	+	chr2L	6007626	5'	+	P-element	71	1	37.67
GTTGGGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1	-	chr3L	25401043	5'	+	Doc	8	1	67.19
GTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1	+	chr2L	17420131	5'	-	roo	9041	1	58.96
ACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCAAGGAAC:1	+	chr3R	28075339	5'	+	jockey	4683	1	49.28
ATTCAAAAGGTTATGGGCCCAGTCACATTTTCGGCCAGGCGGTGAAATATTTTAATTGTGCAAATAAGAATAATTAAAATAAATAAAAGTGAATTTTCTTAGGTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTG:1	+	chr3R	1684153	5'	-	Cr1a	3979	1	71.53
ATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTGACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAGTAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCC:1	-	chr2L	14081391	5'	-	1360	3315	1	69.86
ATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATAGATATAGTTGCATATGTGCCATCGTATAAGACCACATATACTTTCACACAC:1	-	chr2L	10037415	5'	+	Quasimodo	25	2	55.75
GTCCTGTTCCATCAATCCAACCTGATTGCGATTTGATGTGAAGCGCTTGGCAAATATGACAGTGAACCAAATGTCCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1	-	chr3L	15490430	5'	+	copia	41	2	57.14
CAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1	+	chr3R	7641056	5'	-	hobo	2934	1	57.14
TACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAA:1	+	chr2R	20496918	5'	+	blood	63	2	63.77
CGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr2L	14772113	5'	+	roo	64	2	68.46
GTCGATTGTCGAGAGGTTCGCCTTACAGCCTTATGTACGTCTCCTTTCGCTGGTAATGCGCTAATTAAAATGCCTGCGCTGTAGCAAAAAGCCGATAGAAAGGATAAATAAGAAATAATATAAGAAAAAAAAATGTTTTAATTAAT:1	-	chrX	20889426	5'	+	Stalker2	7185	1	63.70
TTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAANATAATCGTGCACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chr3R	16076874	5'	-	roo	9046	1	52.38
ATCAAGTTTAATGGCACAAATATTCATTAACTTTTATCACTTCCTTGATAAACATTTCTTCTCGCTGACTGGAAAATTTTCATTCGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1	+	chr2L	3164920	5'	-	412	460	2	60.43
GAGACGTTTGTGTTTACATTTTTGACAAGTAAAAGATCTGCCGTGTGCTGTTGTTGTTTTAACCGTTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTTACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCA:1	+	chr2R	14515359	5'	-	gypsy4	463	1	65.07
TAGGACCTTAATTCAACAAATTCTAATTGAATACAGTTTTAATGATGCCCCAATTTGGCGGTGCCATGCAAATTCCAATCTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATA:1	+	chr2L	4751617	5'	-	R1A1-element	30	1	54.11
GCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	-	chr2R	9328705	5'	-	roo	9048	2	60.34
CGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	+	chrX	6486711	5'	+	roo	67	2	64.38
TATATGTTTAGATTTTTTCTAATTAAATGATATTGTATAATTTATTGCAAAAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1	-	chr3L	15519849	5'	-	pogo	2037	1	64.38
ATTATAGTAATGTAAAAATGTCTTTCTCCCTCAAACTTCCTCAACATAAATTAAAAAGCGAACGAATTCTGCACCCCAAATGTAATGACCTATAAAAGGCACAACATGACAGTTACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1	+	chr3R	21434818	5'	+	412	6	2	76.03
GCCGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1	-	chr3R	14979890	5'	+	pogo	48	1	56.30
AAATTTTTTTTCTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr3R	17817857	5'	-	roo	396	1	74.40
CTGAACTCACATGGCCAGAAAAACCAGCCTCTGCATTTGTATCTTTTAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1	+	chr2L	18338945	5'	+	pogo	41	1	56.16
ACTTTAACATGCAGACAGATATTGAAAATCACCCAAATATTTCATAACCTGACTGAAGGATACTTGGAGGACACTTAGTGGAAAATTTGGTCAAGGAAAATCCAGATCAAGTTAGGAAAAAATTCAATTAA:1	+	chr2L	13051858	5'	-	Tc1	316	1	58.78
CAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTATATGAATCGAG:1	-	chr2L	14772126	5'	+	roo	56	2	57.04
CTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATGTATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	-	chr3R	7835216	5'	+	roo	8707	2	52.71
TTTACTGAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTAT:1	-	chrX	5629210	5'	+	jockey	113	1	50.00
TGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGGCGCATACCTCACCTTGA:1	+	chr3R	10462589	5'	-	opus	7459	2	54.79
GGAGCGCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1	-	chr2L	18404596	5'	+	hobo	47	1	61.74
ATAACAAATTCCCAGCATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTTCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1	-	chr3R	14651303	5'	-	P-element	2862	1	61.21
GCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr2R	9328606	5'	+	roo	8736	2	67.81
AACACAAAGACAAAAAATTTAAATGTTTTGAAATGCTTAGAACATCACACCTTTTGGTAAATCGGAGTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTTTACTATTCTTTTGTCGCAAGCACGCTCAATTCTCGATCTTATTC:1	+	chr2L	21657686	5'	+	Gypsy12A_LTR	2118	1	54.79
CAGACCTGTCCCTCTTTTTCTGGAAAAAGAAGCCGCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1	-	chr3L	16750790	5'	+	Tirant	8119	2	75.37
ATGGACGAAGCAAAGTCGTATATGCCAAGCTAACAACCCCGCTGCTAATAGCCGCACCACAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGG:1	+	chr2R	16946359	5'	+	jockey	4869	1	52.25
ACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1	+	chr2L	18419151	5'	-	412	452	2	56.36
GAATTATTAAGAATATACAACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chr2L	12892612	5'	+	roo	28	2	55.65
TAATTAATAATCAACTGAACTGGCTGGCAAATGAGGGTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	14364621	5'	-	roo	8987	2	78.77
AACAAAATATGTGGGGACTGGAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGGGAGCCGTTACAATTACACAGTTTTTGTTGGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1	+	chr2L	7810022	5'	+	P-element	49	1	50.68
GGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTCTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1	+	chr2L	13585848	5'	+	Tabor	34	2	56.00
CAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1	-	chrX	21016835	5'	-	Transpac	5172	2	69.84
TATGCGTGTTAAGACCTCGGCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1	+	chr2L	17081761	5'	-	jockey	4953	1	53.10
AGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	+	chr2R	19050209	5'	+	roo	8747	2	73.29
AAAAAAAATAATTACATTAGTTTCCATTACATTTTCGTTTATATGTTTAGATTTTTTCTAATTAAATGATATTGTATAATTTATTGCAAAAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1	-	chr3L	15519888	5'	-	pogo	2076	1	66.44
GGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1	+	chrX	13039493	5'	-	roo	315	2	80.14
TTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGAT:1	-	chr2L	23034037	5'	-	FB	341	1	67.12
ACCAAGTGCCTGGCCTGGCCCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1	+	chr3L	4755211	5'	+	jockey	4683	1	64.29
TACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1	-	chr2R	20497017	5'	-	blood	345	2	48.80
CATTTTNATTTCGTTTTATGCGATGCGATGCGTACTCGTAAAATTTGAGAGAACGAAAATCACATTCACACTCATACATACACTCCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCAC:1	-	chr3R	27802668	5'	+	Doc	4528	1	59.59
GTTAATAGGTTGCTCAAATATCGGGCCACCTGGGTGTTAAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1	+	chrX	5629056	5'	-	jockey	4987	1	80.00
AGCTGAAGAGAACGGTCCAATATGATTGCACTATTGTATTTTTTCTTATAACACACTTCAAAATAATTTCAACAGCCCGTTCATAAGGTACTAAAAAAAGCTGGACTGGCTCTTCCACTCAAGCAAACTCCATAT:1	+	chr3R	4206090	5'	+	G5A	2363	1	50.37
AATTAGAATCAACATTTTATCAAAATCCAGATAATCTAGATAACCTCTTTCGCACAGCTACTGTTCATGAACTTAGTTCGTTGCTAAAACGATGGCTGCGCGAACTTCCTCAACTGAGTTACGGGTATCTGATAGTCTGGGAACTC:1	+	chr2R	4757255	5'	+	INE-1	558	1	77.40
AACAATAAGTACCCGGATTTCGTGCAAATTAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAA:1	+	chrX	10639976	5'	-	roo	385	2	66.44
AGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTAACTATATATTTTGAAAGAGC:1	-	chr2L	22684603	5'	+	transib3	68	1	53.42
GGTACTGAGTATATATATATATAGTAAAGTAACTATGCCTTTCTTATAATTCACTTATACAAAAGACCGACCGCGGTGGTCCGCCGCATCGATTCCTGTAAAATAAACAAACATTTCTCGATATTGCGCATCCAC:1	-	chrX	3626212	5'	+	Tom1	93	1	73.33
GTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1	+	chr3R	19589896	5'	+	BS	5039	1	52.05
TTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1	-	chr2L	15833074	5'	+	hobo	77	1	70.55
TAATGATAGAAAGAAATGTATACTTTTTCCGGATAGAGCTGTCTAGAAACCTGTTAATTTTTTTCTTTCCAAATCTGTATTCGGTTAATTTTAATAACTTGTCCAGTTAAATTTAAAACCAGAGAGAATGATATAGTCGAGTTCCC:1	-	chr3R	7040283	5'	-	INE-1	572	1	26.71
GACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr2R	8585426	5'	-	roo	352	2	56.43
CTCTACGCAACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	+	chr2L	6059197	5'	+	roo	8708	2	54.11
CTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTC:1	-	chrX	21534512	5'	+	1731	165	2	75.00
ACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3R	22956021	5'	+	roo	8739	2	76.34
CCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGGGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1	-	chr2L	19965061	5'	+	Doc	51	1	50.81
AAATAAGCCAAATTATGGGTGGGTGTTGAAATTGAAGTATGGTGAATTGTGAATTGCGGATTGTGAACGTTATTGGCGTGCGGTTATTGTGAATTTATGTGCACATTTAGTACAATTAAAAATTAACACACACACACACACATACT:1	-	chr3L	16873790	5'	+	accord	7030	2	67.12
AGTAATTTACAGCTACTCTTTGTTGCCTCGGCTTTCGCTGATGATCTCAAGCACAATCGTGCCTTGACACAGATATATATATTAATGTAATATAAGTAAGATAATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:2	-	chr2L	22209368	5'	-	flea	5003	2	79.45
CAGTGTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1	-	chr2L	1377710	5'	+	hobo	63	1	67.16
CGAAAAATCCATCACAAAGCCTCGCCTCTTGTCGCACACATCTTGCATACGAAATTACGAATTCCCACGGCAAACTCATCCTGACTGACTGACAAAAGTCAGTATCTTTGATTGGGCCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1	-	chr2L	8554780	5'	+	gypsy7	5006	1	69.78
AACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGCTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATA:1	-	chr3R	1844846	5'	+	Cr1a	160	1	56.06
CAGAGCTAAACTTTTTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAA:1	-	chrX	21014902	5'	-	copia	239	1	73.97
ATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1	+	chr3R	6290936	5'	+	Doc	44	1	58.22
GTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1	+	chr3L	10848645	5'	+	blood	7064	2	56.72
AACCATTCAACGTGCTCAAACACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chrX	9540155	5'	-	roo	9059	1	75.71
CACCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATACATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr2L	7945420	5'	+	roo	8685	2	60.00
AGATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATA:1	-	chr3L	27415341	5'	+	transib2	35	1	61.64
AAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	16785426	5'	+	412	41	2	53.17
ATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1	+	chr3R	11496541	5'	+	1360	81	1	73.10
CGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAG:1	-	chr3R	1844855	5'	+	Cr1a	165	1	55.48
AGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTATGATTTTGTT:1	+	chr4	419980	5'	+	roo	84	2	78.08
ATACATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCA:1	-	chr3L	24486374	5'	+	Quasimodo	92	2	60.00
CCAATAAATAACAACAAAGAGCAGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTATTGTGTGTATATAGTGACGTATTTTGGTGGTCCAAACCAGCCA:1	+	chr3R	12717698	5'	+	297	6591	2	75.19
ATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGTCTTCTGAGCAGAGACCGTT:1	-	chr2L	9399536	5'	-	Transpac	288	2	55.56
ATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTAT:2	+	chr2R	20496939	5'	+	blood	92	2	81.51
GACCAAAAATCAACTTCAAAAAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATTGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGAGCCATAGTATGAGACCACATATACTTACACACACACA:1	+	chr3R	24455337	5'	+	Quasimodo	28	2	59.70
CCAGAAACTATCCACCCGAAATCAGTTTTTTGCCCAAGGAGACCGTCTATTTTTATAACTCCATTTTGCAGAATGTGAGTATATACGTCTGCTCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATT:1	-	chr3R	19444826	5'	-	roo	38	2	67.12
CGCCTACTCTTCGACTTTTGTGTTCCATTAGTGGTGGTCAAACCCGAGCAACATGGGAGGATGTTACTGGATCAACACCGTTGTTCGTTATATTCATATATCGGCTCA:1	-	chr4	117956	5'	-	Bica	4890	1	77.78
CTCTGATGCGGAATCAGGTCCTGAGCCTTGGAAATTAAATAAGATGTCCTGTCACTGTCACGAGCCCAGCGTTTGTTGTTTGCCAACTGTGGCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTT:1	-	chr3R	19522009	5'	-	jockey	4895	1	80.51
GCAACAAAAGTACTACCTATTCTGTTCAGTTCAGTTTTCGTCAGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1	+	chr3R	25339917	5'	-	mdg1	7450	2	78.77
GGCCAGGACGACCGTTGTCAAGGAAGCAATAGCTCAACGGTTCGGAGAATTCTAACCAAAATTCAGGGAACTCCAGGAACTCCAAAAAAAACAACACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1	-	chr3R	21177746	5'	+	Doc	81	1	71.77
AGTGTTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chrX	14336531	5'	+	roo	8684	2	67.46
GCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGGTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAAC:1	+	chr3R	2833315	5'	-	ZAM	2	2	72.31
ATGTTTTAGGAACTTCATTGCTTTCTATGATCCTGTAGCTATAACTCAAGTTTATACAACACAGGACCAAGATAATCCCGGAATGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCA:1	-	chr3R	12341769	5'	+	1360	487	1	62.88
ATAAATATTATAATATTATCACATATTTTCACTGCGAAAAAATTTAATAAACATCATATAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAGCGCTCCACGCGAAGAACGCCTGGCAGCGGAAAGCTGATACT:1	-	chrX	21739582	5'	+	gypsy	102	2	58.90
GTCTAGAAGCTAAAATAAAGCAGAAACAAAACACTCAGAAAAATAACTGGTATATATATTCCATAGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1	+	chr2L	15247853	5'	+	Transpac	8	2	78.08
CGCCGAGTGGCTTGGAAAATCACTAAGGGCAAATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGGTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1	-	chrX	11296449	5'	+	BS	5032	1	66.32
TATTGTTGTTTCGTAAAATAGTTACTTGGAGTTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGT:1	-	chr3R	6611332	5'	+	HMS-Beagle	15	2	74.29
GGAGGGGGTGTGGCAGGGGCAGTGTGTGGATGAGGGGGTGGAGCCTTTGGTGTAGATATGATGTGTAAAT:1	-	chr3L	19035374	5'	-	Tirant	8474	2	55.71
ACCCGCCTTGTCATCCAATCGAACTCCACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCG:1	-	chr2L	3163852	5'	-	412	290	2	66.67
GCACCGATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chr3L	12879723	5'	+	roo	53	2	55.48
TGCCACTTAAAGTGACCGTTTCTTTTGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1	+	chrX	6279375	5'	-	P-element	2857	1	40.00
GAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAA:1	-	chr2L	2122488	5'	+	Stalker	6892	4	52.71
CGTTGAAATTGATAAAAGCAAGGAAAAAGGCAAAGTGAATTTGGGGACTCAGATCGAGACTGAACGATAGAGCGACAGAGATGGCACTCTCACGAAAAAAAAGACAAATCAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAA:1	+	chrX	5254294	5'	-	INE-1	562	1	70.90
CTTCTGCTGCGGCTGCACTTCACTTTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTAAGAAACTAATT:1	+	chr3L	22437833	5'	-	roo	9038	1	61.64
GTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATTTTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCCTG:1	+	chr2R	5039341	5'	-	gypsy11	306	2	58.62
GAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chr3L	10292908	5'	+	roo	55	2	56.16
CTAAAATAAAGCAGAAACAAAACACTCAGAAAAATAACTGATATATATATTCCATAGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCT:1	+	chr2L	15247862	5'	+	Transpac	4923	2	75.19
AATTATTTATAGACCAAACTTTCTACCATGACTTTAAGTTGTCTTTCATGGCATTAAATAATCAAAACAAAAACGTGACAATCGCACAAATCAAATCATGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATAT:1	-	chr2R	25138581	5'	-	Stalker	6940	4	65.75
TAGTAGGGGAAGATCATGGGCAGGGCGAAGCAGCAGATGGGCATAACCACAAAGTACATTCTACGGAAATAATAGGTGTTATAAGTACATATATAATTGAAATGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCAC:1	-	chr3R	13283331	5'	-	baggins	5119	1	60.96
TGGGTCGTAGCTTATGGGAATTTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATAT:1	-	chr3R	19968222	5'	+	roo	37	2	60.96
CAAATATGCAAAGGTTTTAGAAAATGTATATTATTTTTTAATTCAATGCTGGTCTTTAAAGGTCTTTTTTGCAATCTTTTCTCATTTTATTCATTTATATTCATTTTATTCATTTCCACTAGCTGGGTAACGGGTATCTGATAG:1	+	chr3L	22645330	5'	+	INE-1	547	1	54.17
AGTGCTATGCTGTTTATTGATATTGCAAGCTACAACTGCGACCAAAAATTCGGAACCTCGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTT:1	+	chr3R	3617227	5'	-	F-element	422	1	50.00
ACACTTCCCCTTCAACATTTAATGAGATAACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr2R	7898202	5'	-	roo	9045	1	63.89
AAAACAAACTCATTTTCTTCACAAACAAAACAAAAAATTTGAATTTATACTTTGGACTCCCACTAGCTGAGTAACGGAGTAATCTGAAAAAGCTGGACTGGCTCTTCCACTCAAGCAAACTCCATATGGCAACTA:1	-	chr3R	4200549	5'	+	G5A	2371	1	52.59
AACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGAGTGATATAAGACAACCCATTTATGCTT:1	-	chr3L	3863496	5'	+	blood	7107	2	77.40
CAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	+	chrX	5643457	5'	-	roo	9028	1	54.79
AATTGGTTATATACATGCAATGCATTGGATATTTAATCCATTTGTGGTTTAAAGTTTAATTTCAATTCAAATATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGGTACGCATCTTGTTATTCT:1	-	chr2R	1523278	5'	+	1360	3378	1	49.66
GGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTA:1	+	chr3R	17817883	5'	-	roo	9035	1	54.47
TAGGCCTGCTTTTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1	+	chr2R	16891803	5'	-	hopper	1379	1	59.59
CATATTTTATTCGAATAAAAAGAATACAACCAGCCAATATAATTGCCAAACAAACAATAAGACCCGAAAAAACAGCGGTGCAACTCAACCCAAAAGACCGTGTTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATAGTAAACATAAT:1	-	chrX	6726723	5'	+	Cr1a	95	1	60.96
CAATGAATTCAATCCTAATTCGATTTGATTCTGTTTTATTAAAAAATAATAATAATAATATCATCGCTATGAAAAAACGCACATTGTATTTTTTCATATTTTTTTTTTTG:1	-	chr3L	23210021	5'	+	FB	174	2	43.64
GATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr2L	11485272	5'	-	roo	8989	2	74.66
GGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCTGC:1	-	chrX	22386756	5'	+	hobo	96	1	69.81
AGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGCCTC:1	+	chr2L	14081294	5'	+	1360	50	1	51.37
TTTTTCACTTGCCTATGCAATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1	-	chr2R	19798147	5'	+	Transpac	4954	2	61.64
GGACGGAGTTACCCCGACGTTTCAGAACATGATGCAGCAGGGACTCGTTCAAAGCCCAGTGTTTTCATTTTTTCTGAGGGATAACGGCAGTGTTCTTTTATCTTTTCTGTTTCAGGCTCTATC:1	-	chrX	436810	5'	-	P-element	383	1	78.05
ACAGCAATTGCGTCTCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTGGCGGGACAGACAGCC:1	-	chr2R	5627664	5'	-	diver2	196	2	74.29
GATGTATATATTTTGACAATGCTTGTAATCCATTGTAAAACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATATATAGAC:1	-	chr2L	17420291	5'	+	roo	12	2	70.55
AGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr3L	15600192	5'	+	roo	71	2	68.09
CTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1	-	chr3L	10574413	5'	+	Tabor	19	2	61.87
AGTGCTATCGTACTATTCAAGCGCAGTTCTATCCAATGTTTCGAAAACATGTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1	+	chr3R	23495615	5'	+	copia	4904	2	61.11
ATACCTCGGTCGAATGGAAACATTGTAAGCTCCGTTTTCCAATAACTCTCACCCATGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAA:1	-	chr3L	15518622	5'	-	pogo	1778	1	60.29
TAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTT:1	+	chr3R	18339054	5'	-	roo	9054	2	69.40
AAAAAATTGTAATCACACGTACTCCTGCCATTTGACTTAGACCCACTTTCGATATTGACAAATTTTCAATGGTTTTACATTTTTTCCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCG:1	+	chrX	2295292	5'	+	Tirant	29	2	73.60
TAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	+	chr2L	21884512	5'	+	pogo	65	1	65.07
CAGCATGAATTTCGTTGTCACAATATGACTGAAACATGGGCAAGGCATGCCGCATTCGAGGGGTATGGGGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1	+	chr3R	14706883	5'	-	INE-1	556	1	71.43
ATGAAAACATTTTTATTGAATATTCCGACAGATATACACGAAGAGGTGGGCAGATATTTATGTACGAGTAGGTGCGTGTAGGGTTGTGTTCCTCAGGTACCATTCGGTAATCATCCTGGCGATTTTGTACTGGGC:1	-	chr3R	6489962	5'	-	BS3	1367	1	60.00
AACATAACACCAAATTTTTAAACAAAGACCAAAAAGATTAGCCTTTTTGGGAAAATATGTCCCGAATGACTGAGAATTACGTTTTTGATACATAATCGCCAAATTCTTTTCTCACTTGATTTAGCAAAGTAAATAGTTAATAACAT:1	+	chrX	1200055	5'	+	Doc3-element	62	1	76.03
GTTAGACGGTGTTCCAGGAGAAAGAGGAGCGCACGTGGTCCTGCTCACATGAAGGTATTAGCCCGGAACATCGCTGCCATGGCACCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGC:1	+	chr2L	5942356	5'	-	Quasimodo	7048	2	70.91
CCAGTGACCCAAAAGTTGAATCAGACACCCGCGTCGTACAAGATATACATGTACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCCTGATATGACAACCAAC:1	-	chr2R	17626925	5'	-	opus	443	2	60.74
TTTAACTTGTTTTTTTTTCGTTTATCTTGTGATAAGGTTTNATCACATATAAATATGTGTTAGCGACTTTTCGCTCTTAAATAATGGTTAACTTTGGGCTTAAATTTCGCACTTAAACTT:1	-	chr3L	15843059	5'	-	Porto1	56	1	57.50
CCGGACGTAAATGTGCGAGGTCTTTGCTATATGGGCTTTAAAAATGCAAAAAAGTGCATGGGATGAGCTTAAGAAGTGCACTGAAAAAGAATAACCTTAGGATAAATGTCTGCTCCTAAGACCATGGATACGGT:1	-	chr3L	13185046	5'	-	GATE	8058	1	65.67
AATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1	-	chr3L	21855541	5'	+	blood	7061	2	55.00
TCCATGCATCCTGCTCGCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTAT:1	-	chr2L	21008638	5'	-	invader3	5423	2	51.94
GTCAAATTAGCGGCAAAGGCTGATTTACTGTCATGGAAACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTT:1	-	chr2R	25118814	5'	-	roo	391	2	73.38
CCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGT:1	+	chr3L	7292486	5'	+	HMS-Beagle2	86	2	79.45
AAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr3R	19450056	5'	-	roo	354	2	54.11
AATAAACGTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTC:1	+	chr2L	11985781	5'	+	G6	1649	1	58.33
TATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTAT:1	+	chr2R	9258418	5'	+	3S18	70	2	65.28
CGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chr2R	20596472	5'	-	roo	332	2	70.34
AGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGCATT:1	+	chr3L	24291988	5'	+	1360	78	1	71.92
CTGTAACTTTCTCCCTGCTCACCACGGCACTTTTCCACTGAAGAGTCCTGTTAAGGAGGCGGAAAAAAAAAAACAAAAAAATAA:1	+	chrX	9539601	5'	+	gypsy11	3933	3	73.81
AAAATTGAATCCGAGAACGGATGCCAGCACACGAAATTAAGCGGAAACTCTGAAATTTATTTTACCATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2R	13696383	5'	-	roo	355	2	53.42
AGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chrX	13039569	5'	+	roo	54	2	57.53
GGAATCATAGGAATTATTGGAATGTATAAGGCGATCCAGGGTCTGTAGACTCCT:1	-	chr2R	2009041	5'	-	invader5	327	2	92.59
ATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAATACAGATAGACAACGAACGA:1	-	chrX	17501198	5'	+	Doc3-element	184	1	77.40
TGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	-	chr3L	15600315	5'	-	roo	9000	2	67.12
TTGAGTGATGGTGAAACTGTCGCTGTCCCGCTCTGCTGCCTCTTCTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTATCCACTCGAAGGTTCTTTTTATTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCCG:1	-	chr2L	16079001	5'	-	297	413	1	61.94
CCTGAAAAATAAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chr2L	17420113	5'	-	roo	9047	1	66.44
CCTTCAACATTTAATGAGATAACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1	-	chr2R	7898194	5'	-	roo	9035	1	57.53
AAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTGTAAGTACACAG:1	+	chr3L	11957123	5'	+	blood	27	2	53.70
TTTTGAATATCAGTGCTATCGTACTATTCAAGCGCAGTTCTATCCAATGTTTCGAAAACATGTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1	+	chr3R	23495604	5'	+	copia	4893	2	72.92
GAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACAC:1	-	chr3L	17205269	5'	+	hobo	83	1	77.24
AAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAAGCCGGAACGATACTCGCGTTCCGCGACAACGCGAGCA:1	-	chr3R	24457049	5'	+	Doc2-element	301	1	79.37
AGGTAAACACGAGTCGCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTCCCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1	-	chr2L	3886261	5'	-	roo	9027	1	52.74
GTCGTCGTCCTAGTTCGAGCCGCCTAGTTCCCGCCTCCTTCCGCGTAGCTGGGTACTGTCAGAGTTTTCCCCTAGTGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACCTCCTTGGATGGCATGCACG:1	-	chr2L	2940266	5'	-	Rt1a	5013	1	58.20
CGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGAGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTG:1	-	chr3R	14979858	5'	+	pogo	90	1	78.62
GGGCTTTTTAGTATTTGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1	-	chr3R	17243262	5'	-	hopper	1403	2	73.79
CTCTCTCTAGCTATCGAAGATATGAAATTACGTGCATGATNTCGAGCAGTATGCTCCAAGGTCCGAAGGCCTGGTTGGTAAGTATGTAGGGTTTTAGTTGTGCATATATGTATATAGCGACATATTCACATACAAAACAACATAAC:1	-	chr3R	7909557	5'	+	17.6	10	2	47.95
TAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	+	chr3R	18339068	5'	-	roo	9034	1	57.86
ATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	-	chr2L	16092016	5'	+	roo	29	2	63.70
GACACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	+	chr2R	9791542	5'	+	412	18	2	72.66
GTTAACAAAAAGCGCAGCCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGAAGCATATGTGCCATAGCATAAGACCACATATACTTACACAC:1	-	chr2L	10037450	5'	+	Quasimodo	23	2	68.49
AGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chr3L	21817982	5'	-	roo	344	2	66.91
ATGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1	+	chrX	2842466	5'	-	Tabor	456	2	62.22
TAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATA:1	+	chr3L	27356079	5'	-	Tc3	1638	1	65.75
AGAGAGCCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1	-	chrX	22715179	5'	+	Bari1	24	1	67.14
GCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1	+	chr3R	18339063	5'	-	roo	9025	2	52.05
CCATTTATTTAGGAAGTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGGCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1	+	chr2L	16016326	5'	-	412	422	2	62.33
TCTTTTCTTATTGAGTTATACAAAAAACCGAATTTTTGTCCAGGTTTTGATTAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	-	chr2R	20596608	5'	+	roo	8673	2	78.08
AAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGTGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1	-	chr3L	17115532	5'	+	blood	7081	2	62.07
CTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGACCTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1	-	chr2L	15833076	5'	+	hobo	66	1	65.69
GAAACAAAACATCTATTTAATGAAATAGCAGGTTTAGAATCCGACTTATTAATTTGGCACAATATATTAAGGGAAATATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGA:1	+	chr4	1152182	5'	+	transib2	358	1	55.00
CTGATAAATTTAGGAAAGAGTCAAGGTCGGCCGTGTTGCTTGATAGTTTTACAAAGAAGTCTTATTGATTACCAGTATTTAGGTTTATTCCAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCC:1	+	chr3L	15525707	5'	-	pogo	1825	1	63.01
TCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATCTATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1	-	chr3L	7943728	5'	-	Burdock	221	2	55.47
CAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	-	chr2R	18336230	5'	-	roo	8996	2	71.03
TAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1	-	chr3L	10574394	5'	+	Tabor	45	2	45.89
ATCAAAGTGTCTAGCTCAAATATATTTTTGTCGATAAATACTTTTTAGAAAAAGTAAATAATAGGCAGTCATTTCAATCCTATCAAAATTTCTTGGCTCACATGTCGTATGCGTAATATTATTTTTGTGTCTTCGTTTTTTTTTTT:1	+	chr3R	14009738	5'	-	invader3	5020	1	81.51
GCGACTATTTTTGATGTTATGGTAAGCAAAATTATTTTAAGTAAAACTATGTATAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1	+	chr3R	2461572	5'	-	mdg1	7391	2	64.38
ATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:1	-	chr2R	20194297	5'	+	Max-element	8278	2	52.00
ATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1	-	chr3R	10462685	5'	+	opus	34	4	70.97
CAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1	+	chr2R	2016809	5'	+	1360	12	1	69.16
GTGCGTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAA:1	+	chr3L	19013895	5'	-	invader3	5444	2	68.33
CGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAAC:1	-	chr3L	27391412	5'	+	1360	9	2	68.60
AACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCA:1	-	chrX	12074601	5'	+	412	140	2	68.22
ATAAAGCATACCACGGTTTAATAATTTCATGTGTTGAGTGATAATGATGGCCTTTAGTTTAATTATAATTTTTACATTACTGTTTGGTTTAAAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGCGACACAGTGCA:2	-	chr2R	2959111	5'	-	Dm88	57	2	63.01
ACCCGGCTAAGTTGGCAGTAGTCACCGATCTCTGGCCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATAC:1	+	chr3R	19268612	5'	+	I-element	4983	1	68.75
GGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr3R	7835194	5'	+	roo	8746	2	74.66
GCGCAACATAGATTTGTTCCTGATAAGCAAAAATGGCATAACAAAGATGAATAGCATCAACCTGGAGTCCCTTAGAGGGGATATCTTAGCTGGTCCCAAGCACACACACACACACACACACACACTGCA:1	+	chr2L	2653722	5'	+	accord	258	2	78.29
GGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chr3R	27994171	5'	+	roo	8683	2	62.83
AATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCA:1	-	chrX	16876075	5'	+	Doc3-element	277	1	54.55
CTCACAAATTGTCGAAACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1	-	chr3R	20499892	5'	-	mdg3	5480	2	71.23
CGGAAATGTCTATTAATGTTTGATATATGATGAATGCCAAAATGCATGCAGAAACATCGTTTGACAGGCAGGAGGGACAAAAACAATATAATAACAGCAACAAAAAATTATTAAAAAACATAAAAAAAAA:1	+	chrX	7570677	5'	-	hopper	153	1	53.85
CTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	-	chr3R	7100933	5'	-	roo	9042	1	63.01
ATAGAGTTAAGGTATAATAATGCAAATTCTTTAAACATATTTAAGCATATAAATATTTTTAGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1	-	chr3R	11207304	5'	+	FB	28	1	54.46
AAATATATAAAAGGAATTTAAAATCGTATTCGGTAAATAAATTTATTATTTCTACAAATTCTAAATTAATATGTATATAATATGTATATGTTATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTC:1	+	chr3L	19339302	5'	-	Tc1	1618	1	58.90
CTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	-	chr2R	19050280	5'	-	roo	344	2	62.14
GGTATGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGTGTAGCACACTACATAAGTGCATGGTCAGCAATCCCACGCTAACCAAATTC:1	+	chrY	1732327	5'	+	gypsy11	186	2	73.97
GACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr2R	13084669	5'	-	roo	345	2	69.70
AGCTACGCTTGCGCTGTGATAATACGGGATCACTAAGTCAGGCTTAGTGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGATAAACACAA:1	+	chr3L	23797906	5'	+	Doc	80	1	65.07
CAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1	+	chrX	10521640	5'	+	Tabor	72	2	64.38
AATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1	+	chr3L	15177242	5'	+	roo	8754	2	80.56
AAAAAAAACAAAAATTTGCATTGCATACACCTTGTAATTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAACTTGATCTGCTTACATTATT:1	+	chrX	4447055	5'	-	jockey	4937	1	67.80
GGAAACGTATAGAGAATTTATTTTTATAGTGGCAAACATTAAATGCTGAAACGGAATTTAGATAACCTCTAATATGCTTATTTATGTACATCATTTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATGGTTCTTATTATTTCC:1	-	chr3R	4227473	5'	-	invader4	430	1	65.22
GAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1	-	chr3L	10574403	5'	+	Tabor	6852	2	61.79
CGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1	-	chr2L	1377701	5'	+	hobo	84	1	76.03
TTTTTGTTGCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGT:1	+	chr3L	10292805	5'	-	roo	9007	2	65.07
AACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1	+	chr2L	20808332	5'	+	HMS-Beagle	6841	2	63.48
ATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATCTCTGGGTA:1	+	chr3R	26659728	5'	+	HMS-Beagle2	37	2	54.79
TCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1	-	chr3R	10462695	5'	+	opus	144	4	63.00
AATGTGAATAACCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1	-	chr2L	12892735	5'	-	roo	9032	1	57.93
AATGACTACCAATCGTTTATTTTTAAAGAAGGGCAAGCCATGAACACACATTAACACGTATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr2R	25118700	5'	+	roo	15	2	47.37
GCCCACACTCTCATGAATAGAAGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	-	chr2L	23068932	5'	+	1360	63	1	62.86
CCATGCATCCTGCTCGCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCAC:1	-	chr2L	21008637	5'	-	invader3	5411	2	53.57
GAAGTGTGTATACTTTCGATCGGAATAAACGGGAATTGGATGTTCGATCGGAATGATGTTAAAGGTGGTGTTTTCTGGAAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAA:1	+	chr3L	19693265	5'	-	gypsy2	6674	2	62.10
CGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr2R	13084667	5'	-	roo	8993	2	73.97
ACACAATAATAACACATCAATTTCGCTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCACA:1	-	chrX	16103169	5'	+	R1A1-element	85	1	68.18
ACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1	-	chr3R	25454118	5'	+	Quasimodo	43	2	51.37
GCGTTCGGGGATTGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTG:1	-	chr2R	24218634	5'	-	412	470	2	60.17
TCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	-	chr2L	17420227	5'	+	roo	86	2	78.08
TTATTTTGTTTATGACAATATTCAATTTTAATTTTGTTCTCATATTTTCCTCACATATCTATCGCGTTCGCTTTCATAGTCGGGGGAACTCGACTGTAGCATTCT:1	+	chr3L	23285509	5'	+	INE-1	572	1	76.19
AAATATTAAAATTTACAGATACAAATGAAAGGAAAATATTAAATAAATTGTTAAATACACCTGCATAGAACGTATCTAATAATAAACTTAAAAGGTACATCTTGAAGTGAATTATGACGCTTTCTCATTCTAACCAAGCAGCGCAA:1	-	chr2R	14536543	5'	-	micropia	5219	2	63.70
TCTCGTTGTTTCCCAGTTCTAGCAAATTTCTCGCAGGTTATTACGCCAAATTAGTTGTATTTTAAATGTTGCCCTTAGTAATTATCACATTACCAGCGCACATCGAATTTTTTTATTTTATTTTATTTTTAA:1	+	chr3R	10832761	5'	+	transib1	1901	1	72.73
AACAAATTCGTTGATGCTCCAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1	-	chr3R	20005155	5'	+	297	23	2	69.86
GGTTCGACCAGCGATTGTTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTC:1	-	chr2L	10641195	5'	-	P-element	2678	1	20.55
TGTATGTTAGGAATATATATATATAGGTACAGTGATAAACCGATATGTGTGCATACTACAACAATTTTGCATTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCAT:1	-	chr3R	3181084	5'	-	Cr1a	4170	1	51.03
AGAGATTGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCAT:1	-	chr2R	6164617	5'	+	Tc1-2	40	1	52.78
CGAAGTTAAATTACACTTATCTAGAATTAATGGTTTTGTGTGAAATTCAACCCTGAAGTTCTGTAATCTCTCACTCTTAATAGCTCGTCTTTATCTAAAAATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGA:1	-	chr2R	4374480	5'	-	gypsy12	10105	2	71.03
CGCACCGATAAAACATTATCTTTCATCATAATAAACGGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACCTGTTTTCCTTGCAGT:1	-	chr3L	10848757	5'	-	blood	347	2	60.00
ACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1	+	chr3R	7482743	5'	+	412	43	2	55.00
AACATGTTAATAGCTTTTGTGATCAAGGGTTTAACCTACAGAGCGAATCTGAAAAAAGTGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr3L	4536836	5'	+	roo	18	2	69.86
GGCTATGAGTACTGAACCGTGCCAAGTGCCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr3R	18582297	5'	+	roo	11	2	75.34
CGTGGAGAGCAACCTGCGTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTG:1	+	chr3R	17774550	5'	-	Gypsy6A_LTR	185	1	66.04
TTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chrX	9539996	5'	+	roo	8709	2	52.74
GCATATCCTGCAATTTCCACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1	+	chr3L	17205217	5'	-	hobo	2928	1	56.16
GTGACCAAATATAACGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr3R	12887021	5'	+	roo	14	2	72.87
AATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr2R	19050337	5'	-	roo	394	1	67.81
GGGAGCAGAATCCACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGGGTA:1	+	chr3L	10773090	5'	-	412	7466	2	79.10
ACATACCCGCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCAGGAAAGGGGCAGAGAACCCTCTAATTGGGCCCGAACCATTCTGTGGTGTTGGTCACCACAGATTACGGGGCTTAC:1	-	chrY	2720404	5'	+	baggins	4966	1	62.20
CCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1	-	chr2R	16373540	5'	+	Max-element	8253	2	55.13
ATAGAATAGAATTGGTATCTTAAGTCCATTAAAGCTTTTAATCAAATTAAGTTCAGAGTAATTGATCTAAATAACTTTTTACATTCATCTGATCACTTAAATTCACCAGTTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTAC:1	+	chr3R	17819933	5'	-	roo	141	2	67.12
GCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1	+	chr2L	18419171	5'	-	412	408	2	79.10
TTTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACG:1	-	chrX	6522080	5'	+	F-element	17	1	70.48
AAATTCGAGTGAGTTTTTATTCGTTGCAAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	+	chr3L	22863354	5'	+	412	7090	2	58.90
ACGATTGTGCTTTGCAGTTATGGCTGAGCAAACGGAGTGGACGCAGTTGATGATTTGGCTTTCGATCTGCCGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGC:1	-	chrX	19283189	5'	+	Doc	260	1	53.12
CGTACGTATGCTTGGTAAGCTTCAATGACTGATTTATATCGTATGGGGTGCTTAATTGATAAAGTGAACTTTTAATTATTTTTAAAAATATATCAAATAGAATATTATAATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1	-	chr2R	23878292	5'	+	297	6589	2	80.82
TATCTATAAAAGCAAAAAGGCCAGAAGTGAAAGAAAATAGACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGA:1	-	chrX	21575454	5'	+	INE-1	94	1	62.76
GTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1	-	chr3L	23906486	5'	+	1360	38	1	52.63
CTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3L	4536757	5'	+	roo	8738	2	81.45
TTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1	+	chr3R	12618579	5'	+	F-element	29	1	60.63
GTTGGAAGACCCCTATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATG:1	+	chr2R	25118664	5'	+	roo	49	2	51.37
AAGTATGCTACACAAAATATAAACTCGTCCTTGCGCCGCAACCCCTTTTCCACTCCCATGCCCTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATT:1	-	chr2L	6570027	5'	+	jockey	4851	1	56.85
GATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1	-	chr3R	6611290	5'	+	HMS-Beagle	12	2	65.26
ATTTACTTCAAAGTAAGCCATCGAAATTAGATTTATGGTTGAAAAAACACTGAATACATTAGAAAATGTATTTAATATATTCCACACTTAAATAAATAAAATTACTATATATATATAAGTGAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1	-	chr3L	13845280	5'	-	opus	491	2	75.17
TGAATAGCGACGAAAACTACGAAGGATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1	+	chr3L	18368871	5'	-	opus	488	2	76.26
AATGATAGAAAGAAATGTATACTTTTTCCGGATAGAGCTGTCTAGAAACCTGTTAATTTTTTTCTTTCCAAATCTGTATTCGGTTAATTTTAATAACTTGTCCAGTTAAATTTAAAACCAGAGAGAATGATATAGTCGAGTTCCCC:1	-	chr3R	7040282	5'	-	INE-1	571	1	26.03
AATTGTTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTTGAAATAT:1	-	chr3L	12879844	5'	-	roo	360	2	52.05
GCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTTGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:1	+	chr3R	14981180	5'	-	mdg1	344	2	74.81
AACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	-	chr2R	7898174	5'	-	roo	352	2	60.00
AACGCCTACAAACCTCCCAAAAGTCAATTTATTCTTTTTCCGTTTTAATATTTATCTTGCCAATTTCTGACGACCACAATCCAAACAAAAATGTCACCCGAACACTTAAAAAGTTATTGGTATTAGTTATTATTATTGTTATTAA:1	-	chr2L	22805230	5'	-	mdg1	17	4	53.79
CTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr2L	3114490	5'	-	roo	333	2	68.49
CGTCCTTTACGTATATATTATTATATATTATATTTTCTGTAAAACTGGTAACAAACTTATTTTTCATTAAGTTTACGTTAAAAATACCCTAGCAACTAAGTAGCTTCACACGAACAATGCTGATGCGCCCCAACTGAGTTCAGCGC:1	+	chr3L	24131124	5'	+	gtwin	72	2	54.11
AGCCCCGACTCGTAAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAT:1	+	chr3R	13457890	5'	+	X-element	55	1	48.15
AAAAACAAGCACGGAGCATATAAATATTTATAAGTGTGTGCGTGGTGAGGGAGGTCAAGTGTCAGTGCCATTTAGCAACTTGCCTCTCACACACACACACACACACACACTGTGT:1	+	chrX	2899035	5'	+	accord	7105	2	79.13
TTTCAATTTGTTTGTTTTGTTATATGCTTTTTGGTTTTTTTGTTTTTTCGGTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1	+	chr3L	22293543	5'	-	jockey	4930	1	73.79
AAACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chrX	23280952	5'	+	roo	35	2	43.84
TTTTATTTCAAAATAAATAAATTATTGATTAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1	+	chr2R	15064313	5'	-	412	7518	2	65.47
GTTACTTTGCAAACAGAACCAAAAATTGCAAAGCGTGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1	-	chr2R	5485260	5'	+	blood	7022	2	77.24
GATTGCAGCTAGAGATTAATGCAAAGGGATGGTATATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTACATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1	-	chr3R	14337514	5'	-	copia	213	2	56.85
AGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAACTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr3L	233316	5'	-	roo	330	2	72.41
AAAAAAATTTAAGTAATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTA:1	-	chr2L	21884610	5'	-	pogo	2045	1	62.86
CGCCATGTAAAATGTTAATTTTTATAAGACTAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTATTAATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTT:1	-	chr3L	26745415	5'	-	Stalker	7111	4	88.36
GCAGTTTTTGCGGCTTTTGGCTTAGTTAGCGAATTATGAAAATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTA:1	+	chr3R	14937485	5'	-	I-element	5279	1	71.92
CCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1	+	chr3R	14981173	5'	-	mdg1	7378	2	73.29
ATTAAGAAAGCTTTGAAATATGCTTGAACTGAATTTCAATTGAGTTGGTAAAAATATAACTTAATTTCTAAGCCCAAACACATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAAG:1	+	chr3R	6690790	5'	+	G4	3664	1	58.65
CAATTTATTAAAAGCTATGAGCAGTAAGCGATTCAATATATAAGATACATTTTTATGAATTTTAATGTGCATCAAATTGTGTGTAGCTTTTGTATTTTATGTTATATTCTAGATATTTCCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTATTTTTT:1	-	chr3L	15012712	5'	-	BS	5098	111	77.40
AAGCTAGAGTGTTGAGAATTCCAGTGTCACAAGGCGCGTTGCAAGTTTGTTTATATCTGTAGCCACGCCCACTCGACCGCCCGCTTAATACCGCTCCAAACTGCAAGGCCCACACTTTTAAAAAATGTT:1	+	chrX	21125659	5'	+	INE-1	256	1	69.77
CACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1	+	chr3L	9998030	5'	-	roo	9040	1	43.15
GAGAGTGCTTTCAGGGCATCAACGAAGGGGCCTTTAAGCCTGGCCAACAACTGTGCGCGTGCGCAGAACCGCCAACCTGGCAATGTGTTCATTTCGGTATTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGC:1	+	chr3L	20951997	5'	-	roo	8647	1	67.81
CGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1	-	chr3R	10274015	5'	+	HMS-Beagle	6846	2	71.30
GGTGGAGATTTCATTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTTGCTTTT:1	+	chr2R	22201865	5'	-	gypsy7	5011	2	80.49
GTTCGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAT:1	+	chrX	22601895	5'	+	INE-1	83	1	50.37
GGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGGATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTT:1	+	chr2L	13585842	5'	+	Tabor	64	2	63.97
ATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr2R	7898156	5'	-	roo	334	2	72.41
GCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1	-	chrX	17833049	5'	+	Tirant	8169	2	78.26
TTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAGAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr2R	8585500	5'	+	roo	8744	2	74.82
TGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr3L	20831403	5'	+	roo	8681	2	70.08
CACTCAACGGAAATATGACTTTTGAACCTATTTCATGGAATTTCACAAATTTTAAAAGCGGCAAAAGTATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1	-	chr3L	10648029	5'	+	412	7074	2	56.83
ATGTGATGCCTAATATGTTATGCTTAAAATTATATTAAAATTCAAA:1	+	chrX	17957914	5'	-	Rt1b	120	1	91.30
ATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTCATGATTTATATTT:1	-	chr3R	23495735	5'	-	copia	194	2	64.08
AAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAA:1	+	chr2L	18417992	5'	+	hobo	2715	1	65.08
ATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTT:1	-	chr3L	7943712	5'	-	Burdock	6333	2	60.96
GTTAATAAACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chrX	23280958	5'	+	roo	8692	2	39.04
AAATAAAAATATAACAAAAAATACTTGTATTTTTTCATATATTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3R	22261178	5'	+	roo	8718	2	56.85
ACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTATTAGGTGGCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	-	chr2R	16785424	5'	+	412	16	2	63.64
TGCGTATTGCAGCTAGCCAATTGATTGGCCTTCATGTGTTAAATACTCTTGTCAATGCGAAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1	-	chrX	6279463	5'	+	P-element	41	1	57.53
TAATGAGCAACCGAAATTACCTCTTTGATCAACCTAAAATGTTTAAAAGCGCTGCAATGAAAATAATGCAGTAAGGTACATACTGCATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACA:1	-	chr2R	2565041	5'	+	gypsy	7021	2	60.96
CGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	-	chr2L	7945401	5'	+	roo	8740	2	70.55
GCAACGAACATGGCGACCATCAGCACAAGCAACTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1	+	chr3L	22911760	5'	+	jockey	4705	1	63.44
TTGTACATACTTATATACTTGTTAGGTGCTTGTTAGCCAAACTTTTTTTTTCGGTCCGCTTAAGTTTGCTGATGCTCCGTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTT:1	+	chr3R	25455577	5'	-	Quasimodo	227	2	58.70
GGTGTGAAGTTTTTGGCATATTCAAAGTTGGAAAAGTTGCACTTTGAGGCTGCTAACCAAAAAATATAACTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr3R	11083993	5'	+	412	7095	2	52.14
ATGCCCAACACTGCGAAAAATATATACAATAAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAATTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTAC:1	+	chr3L	18555879	5'	-	jockey	4928	1	64.83
GCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1	+	chr3L	10773085	5'	-	412	7507	2	68.37
TCAGAGCAGAGAAAAACAGCGGATTCGTTGTCATTAGTGGTTATGTTCTGTTTTTTCTTTTTTTTTTGTTGT:1	-	chr3L	7625316	5'	-	G2	3076	2	77.78
ATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	-	chr2R	9328703	5'	-	roo	352	2	53.42
GTAATTCGCCTCCGTTCAGTCTTCTCTGCGCACGGAATTTTTACTCTTTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCGGTAACAAAAATAGCACCGATTACGTATTTGCTGAATAAATTTAATAGGAGTGATTGCT:1	-	chrX	19694447	5'	+	Tc1	245	1	69.18
ACCGTTTTCCGATGGGAACGTAACACTGACGCTGCATCATGATTCGGTGTCTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCTGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTG:1	+	chr2R	6625521	5'	+	invader1	267	2	65.07
AGTTGTTTGTTCTGCTGGTCCTCGAACTGGAAACCAAGCGAAAGGCGAAAGGCGACGAATGTTGGGCCATAAGTGGCAAGCGAGAAATTGAAGCGTGTAAGCGCTTAACTGGCGATGTAATGACACCGACGCACACACATACACAC:1	-	chrX	17963109	5'	+	accord	254	2	71.92
ATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chrX	13039565	5'	+	roo	8722	2	60.27
TGTGTGTGTTTATGTGGCGAACATGCATGCATAAGTAGTAATTCATTCCGTTTCGATTCGTTTCATTGCGTTTCATTTGCAATTTGCTGCTGAGCACTGCATAAATCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1	-	chr3L	4948178	5'	+	hobo	15	1	75.17
GTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1	+	chr2R	6086327	5'	+	pogo	76	1	71.92
GAATCACAAACAACGAAGCAGCGAGAAAGAGGGAAGAAAAGAGAAGAGAGTATCAGAAGACACTACGGATGAAATGTAGCAGAATTCTTCCTCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAAC:1	+	chrX	10931110	5'	-	opus	7108	2	75.61
GCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr2L	5254339	5'	+	roo	8738	2	80.31
TCTCATTCTCTGTCTTATATTACCGCAAACCCAAAATGACAATGCACGACAGAGAGAGCAAGATATTTAGATTGCCTCTCATTTGCTCTCCCATATTATAGGGACTGTAATGTCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chrX	22383383	5'	-	roo	9053	2	71.03
GGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1	-	chr2L	16067185	5'	+	297	34	2	57.14
AGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATGATGCCGGATGTCG:1	-	chrX	21667924	5'	+	gypsy2	6554	2	66.15
GCTTGCAGCACTTTAGCACTTATGTGTTTGTTAATTCCTTTTAACTTTATTTCATGATCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCC:1	-	chr3R	1691817	5'	-	blood	227	2	57.78
ATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chr3R	16076793	5'	+	roo	8740	2	71.23
TTGCTCCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGACTAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTGTGTAAACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGAATTATAAGTAAAAT:1	+	chr3L	16973354	5'	-	S-element	126	2	52.74
CATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTGACCG:1	-	chr3R	18585639	5'	+	P-element	27	1	39.24
AAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTAGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr2R	18336257	5'	-	roo	9022	2	50.68
CGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGCA:1	-	chr2R	5031014	5'	+	Doc	61	1	69.37
TAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCC:1	+	chrX	21772493	5'	-	gypsy3	6543	1	68.57
AATATATCTTATATATTCACAATGTTTCAAAAACCATTTATGAGCTTTTTAAAGAATTCAATTAAGTTAAGAGTACTTAAAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTG:1	+	chr2L	11317858	5'	+	R1A1-element	4970	1	72.22
CTTGTGGATAGCCTAAATCATATCATAGACTAGGCTTCTTTGATTTGCTAGAAAGCATCGCTTCAAAGGCTAAAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	-	chrX	7256257	5'	-	412	480	2	74.66
TATAACAAAAAAAGAAAAACAAACTGAAAAACAACTGAATCTAATGTCTATTTTAAATAATAAAAATGGATCATTAACATACATTAATTATATTAAGTCAAATGACTTGCCAGAATTTTATTGAGGTTCAGGGCTGCACTTGTTTC:1	+	chr3R	20266307	5'	-	baggins	5311	1	73.29
GATGCCTATTCCCATATCGCACCGATTTGTAAAACCCGACACCTTTACCCAAGAAGCATGTCGCTTATATTCGTGGTTGTTGCCATTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTT:1	-	chr3R	17463033	5'	+	pogo	258	1	56.85
ATCGAAGCACTTTCTCCCAGTGAATCTACATATGCGTCGACAACACAGAACAGAAACTCAACAGGAGCCTTCAAAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGGCACTGCACTCGTTCTTGCAGAGTTACAGTTACCCGGG:1	-	chrX	22794016	5'	-	Doc	479	1	55.30
TAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	+	chr3L	16015225	5'	+	1360	32	1	50.41
TCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	-	chr3R	25448461	5'	+	roo	8701	2	59.59
CTATCCGCATTATCTGCAGTCAGTTCAACTCACTTTTTGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1	-	chr2R	21145956	5'	+	pogo	77	1	75.34
ATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCG:1	+	chrX	12657098	5'	+	blood	7081	2	65.28
TAGCCAAACACCTCGTCATTAACTACTATAATAGGTAGGCAGTGGTTGCCGACCTCTCATATTGTTCAAAACGTATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTAT:1	+	chrX	23431005	5'	+	Transpac	4941	2	67.81
AAGCGGCACAAAATATGTCTCTGTTTACATTAAAAACCTATGTACTCTTAAGACCTACACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAAAA:1	-	chr3L	25824648	5'	+	X-element	4719	1	59.03
AAGAATATAATTCTACTCCAAGATAAAAGAATGCCTTAGCATAAAATTCGTATGGAAAAATAACGACGTATTGAAAGAAGCACATTTTACAATAAAATTAAATTTAAAAAACAGAGTTCGATACTAGTTACAATATAATAATAGTC:1	-	chr3L	14557922	5'	-	Burdock	461	1	63.01
TTCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	-	chr3L	20888828	5'	+	1360	9	2	72.80
AAATTGTTTGAGAAAAAACAGATTTTCCGGAAAAGGAAAATACTTATCGGCATAG:1	+	chr3R	16693554	5'	+	HMS-Beagle	462	1	94.55
AATTTTTAAAAATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1	+	chr3L	1534622	5'	-	pogo	2066	1	57.53
AATCCGGAAAATGCCTCGAATATTTCACAGAGACCTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGGATAAAT:1	-	chr2L	1839286	5'	+	hobo	92	1	80.71
ATAAACTAAGTTTCAATATTTTATTCAGATGGTGATGCATGTTAAAAAGATTTCAACATTATTTCTCTGATTTGGGTATGAAGTTGTCATCAATTTGGGAATTAAAATAATTTGTTTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1	-	chr3L	20454084	5'	-	BS	5074	1	78.77
TTGCAGAAAGAGAATAACGCTAAATCAATAGAATTATGATGATTACTCTTCTAATTGATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACGC:1	+	chr2L	19082692	5'	-	micropia	114	1	56.30
GGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAATGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGC:2	-	chrY	3648908	5'	+	Transpac	4965	2	57.53
AAAATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAG:1	-	chr3L	8249135	5'	+	jockey	4566	1	50.38
AAGATGTGTATTGTGTGCAAGGGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	-	chr3R	22844260	5'	-	roo	9018	2	70.43
AGATCCTTCAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr3L	23906329	5'	+	1360	55	1	57.86
GTCTAATAAATAGTTTTCTCTTGTTTTCAGACATTTTAACAACAGCAAAAACCCATTTTCGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	+	chrX	6486640	5'	+	roo	8	2	41.78
ATGAAAATAAGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	+	chr2R	21907891	5'	-	roo	9039	1	63.19
ATGGGTCTCTCGCCAGTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr3L	9998236	5'	+	roo	17	2	71.94
TCCACAATGAAAGGGAATACTTCCTGGTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr3R	14035400	5'	+	1360	37	1	73.86
GGCTAACTGCAGTAGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTGATATAAAGGCAAGGTGGAG:1	+	chrX	23201992	5'	+	R2-element	464	1	72.62
AAACACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTATACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	-	chrX	9540138	5'	-	roo	9042	1	63.57
ATTAGCAAGTGCGTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACC:1	+	chr2R	23465973	5'	+	Doc	497	1	63.70
ATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1	-	chr3R	25448412	5'	+	roo	8749	2	75.86
CCTTCTCCAAGCGATACATCTGCGCCAGCAGGACTTTGTGACCCCGCATGCTGGCCAAATCCAGGGGAGTTTGCTGTAGACCACATAATTTTGAATTGCCCACAATTCAGAAAACTGTCGCCTCAAGATCGCTTACAGGAGGCAAA:1	-	chr2R	9474676	5'	+	G3	124	1	51.37
AGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATCGCATAA:1	-	chr3L	21855547	5'	+	blood	50	2	51.37
ATCAGTTGAAATTTTTCTATGAAAAATCGAAACTCCTAACTGAAACCGAGGCTGTCATACCATTATTTTTTTAAGTTTCAACTTAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTT:1	-	chrX	5637476	5'	+	roo	393	1	56.16
AAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	+	chr3L	22437878	5'	-	roo	329	2	71.92
CGAAGACCGTCGCTAAGTCAGGATCCACAGCAATCGCAGCAGCAACCACCGCCACCACCACCCTACTATCCCACGGGAACTCTGGACTCCAAGGACATTGGCAATGGGTCCCGGAGGATCAATATGAACCAA:1	-	chr2L	3917186	5'	+	R2-element	316	1	78.79
ATACTAGATTCGTTAAAAATTATGTAACAGGCAAAAGGGAGCGTGTCCGGGCATATAAAGTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTG:1	+	chr2L	23075092	5'	+	INE-1	98	1	81.19
AAAAGCTGCAAGCTTTTAAATTTTCTACCAGCAAGAAATAACAAATATATATTTCAACAGGATAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1	-	chr3R	12598561	5'	-	hobo	2904	1	53.60
GGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1	-	chr3R	9039016	5'	-	Juan	4153	1	62.76
TGGACGAATCCGCTCCTGAAACGGGCGTTCATGTAGCAGTAGATGATCGGATTGTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGA:1	-	chr3R	27056953	5'	-	jockey	4768	1	58.46
GGACCGAACAAACAGAATTTTCTGTCTTTGGATTTAATTTTGAGTTTTTGGCCCATATAAAATATTATAGACGGTCTTAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCAACGATTTCTT:1	-	chrX	15484325	5'	-	I-element	316	1	59.59
TGTGCCTGGAGGGAAATTTCTGAATATTTATTTTGCTAGGAAAAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTAT:1	-	chr3L	2325781	5'	-	I-element	5282	1	71.83
AGAATTGATATGCAGATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCTCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chrX	6486847	5'	-	roo	390	2	66.44
CTGCCACCGTCGCTTAAAACCGGTGGCCAAATAGCCACCACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTATATACACGCGTCTCTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1	-	chr3L	6389000	5'	+	17.6	6952	1	65.15
GTGGCAGAGGAACTTTAAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2R	14387924	5'	-	roo	9019	2	56.39
TGAATTGATTTTGAATGCGCTCTGTCTGACTTCTGTCTGTGTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	+	chr2L	1377625	5'	-	hobo	2921	1	62.50
GGGCTGTGTTCGAACGGATCAGGAAACGTTATCGCCGGGCACGATGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTG:1	+	chrX	18478966	5'	-	I-element	4878	1	60.87
GGCTGGATGACCTCAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1	+	chr3R	11496511	5'	+	1360	52	1	52.74
CAATAAAAATTTCATGCCTGTAAGGCCCTTGACTCTCACCCCATTCGACACTCCTCTTCACTTTCTCCCGCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTT:1	+	chr3R	25454695	5'	-	Quasimodo	219	2	49.63
ATTGGAAAATGAATTCACATAATAGAACTGACCAAACGGAATCGAAATCGGAGTTTTGTCTCTGATTGTTACTACGTGGTTTTGGCTTTTTTTTTTCTAGTTTTTTCCCCCAGTTTTCTATTTTTTTCAACTTTTTTTTTTT:1	-	chrX	17344067	5'	+	FB	173	1	82.39
ACTATATACTATATATATATTCGGGAGTTAAAAACATACTATTTCTCCATGGCTTCCACAACGCCAGTCATGGTATTTGGTACTACAAATAAACTAAACATTAATGGCTCCAAGTGTAAATTTATGACCTTTTGTCGAG:1	+	chr4	1183668	5'	+	Q-element	677	2	62.59
AGCACAACCTCCTCGCTCGGCTGTCGAAAAGCGTCTGATGGAGGCCGTTAGCAGCTTCGCACTTATCGCTTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1	-	chrX	7195142	5'	+	P-element	9	2	73.33
TTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCATGCCCATCTGTCCCTATGAACGTCTAGATCTCAGGAACTATAAA:1	-	chr2R	5198431	5'	+	INE-1	146	1	76.71
AACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr3R	19968180	5'	+	roo	79	2	75.34
TCCCTTCCCTTCGCTCATCAGTTCATTTAGTTGAGTCGCCGTTCCGTTCTGCAATGTGCCATTATCAGTCACATATAATATGTGCAGAACTCTTCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTC:1	+	chrX	19501367	5'	-	baggins	5191	1	53.85
CGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTATTTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTGAGCGAGTGTACAT:1	-	chr2L	21891792	5'	-	mdg1	7379	2	72.34
ACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGGAGAGCACC:1	+	chr2L	11985802	5'	+	G6	1656	1	56.90
TTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACAGAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATCCCT:1	-	chr3R	25454083	5'	+	Quasimodo	78	2	72.60
AGGGAAACGTCGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:2	+	chrX	5274278	5'	+	roo	50	2	51.37
AACGAAGCGGTTAATGTGGGCAGTGCAATTATGAATTTATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1	+	chr3R	22813278	5'	-	mdg1	7452	2	37.24
CTCCAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1	-	chr3R	20005139	5'	+	297	6619	2	59.31
TCTACTGTACTATGTACTAACACTATAACAATACTTATGCCTAAGTCTAACAGCAGAATTAATGAGTAATCTGATAGTTGTATATAAGTGATTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGAT:1	-	chrX	8087772	5'	+	F-element	185	1	62.76
ATACATTTATATTCGTAAAAGGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAA:2	+	chr3R	24383220	5'	-	rover	7249	2	51.37
AAATAAAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTG:1	+	chrX	17446519	5'	+	gypsy11	110	2	65.96
GAAAAAATTGAAAAGGGCAAATTTTTGATTTTGATGTTGAGCTCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACA:1	-	chr2R	5311568	5'	+	Tc3	240	1	45.60
CATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGAAACAA:1	-	chr3L	23702237	5'	+	G4	81	1	69.86
ATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1	-	chrX	6522070	5'	+	F-element	49	1	50.39
GTGTATACACTGTTAACAGCCATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAATTATCTTCGGTT:1	+	chr3R	19449040	5'	-	roo	9016	2	54.11
GCTGATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1	+	chr3R	10182109	5'	-	blood	335	2	51.52
CACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAACC:1	-	chr2L	1665043	5'	-	hobo	2913	1	54.84
TGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1	-	chr3R	11496621	5'	-	1360	3362	1	59.65
AGGTCGTTGATTATTTTTCGGCTTTGATCTATTTTAATTGTAATGAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1	+	chr3L	17115466	5'	-	blood	7314	2	71.85
AGTTACNGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chr3R	22956056	5'	+	roo	55	2	54.79
ATATTATATTATATTATATTATATTATATTATACTACATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1	-	chr2L	15950935	5'	+	Ivk	50	1	86.30
ATTTGGGCGAGCACTCATTTCCTGCGTGCCCGAAAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chr3R	13360262	5'	+	jockey	15	1	77.34
TTGTAATAAAATGCCTTGTTTATTCGCCATCAAAGGATGCAACAACTTCGATGGCTGTTAAACAGAAAAAGCACCATGACACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCT:1	+	chr3R	20507390	5'	+	BS	4648	1	77.95
TGCCACCGCATAAAGTCAACTGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr3R	28624662	5'	+	roo	58	2	60.96
TGAAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1	-	chr2R	18336259	5'	-	roo	360	2	54.11
AAGTAGTTGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2R	19004243	5'	+	roo	8714	2	54.11
AAAGGTATTCCTTGAAAGAGCATTAGCTTGACCTAACGGATGATACACCTTGCCCCCATAGCATCCTAAGCCCCATTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCA:1	-	chr3L	24290587	5'	-	1360	193	1	57.35
TGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCT:1	+	chr3R	5061858	5'	+	mdg3	5336	2	71.92
AATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAATCTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3R	28624554	5'	-	roo	9026	1	53.33
GTGTCGCCACAAAGAAGCGACCGTCTGTCCGGCGAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAAC:1	+	chr2R	7586126	5'	+	I-element	5084	1	51.37
CAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACG:1	+	chr3L	25482892	5'	+	accord	6912	2	63.45
TTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCC:1	+	chr2L	11985797	5'	+	G6	1710	1	77.78
TAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	-	chrX	13039534	5'	+	roo	8715	2	75.00
ATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGAC:1	+	chr3L	10574296	5'	-	Tabor	411	2	65.75
CAGCAAGGTTCAAAAATCTGAAAACAAATTAGTAAAAAAAAAGCACATGTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCT:1	+	chr2L	22313763	5'	-	Quasimodo	91	2	66.44
AAATTCCCGGCCCCAAAGGACCCTCGCACACACACATATATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTA:1	-	chrX	17963933	5'	+	jockey	4843	1	74.66
TATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCAC:1	-	chr2R	19727745	5'	-	R1A1-element	5142	1	51.26
CATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1	+	chr3R	9921955	5'	+	blood	41	2	57.53
ATGATGATGTCAATCTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1	+	chr3R	10546087	5'	-	hopper	1351	1	63.01
GACTGCCGAGGCGTGTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGTTTG:1	+	chrX	6499807	5'	-	Quasimodo	6953	2	54.90
AAAGACCAAAGACCAAGAACGCTTCTAGGAGCACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAATGCCCACG:1	-	chr2R	4677399	5'	+	invader3	5196	2	76.98
TATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	+	chr3L	20654451	5'	+	roo	40	2	58.22
GGGTTAACTTATTAGGGTTATTAGGGTTAACTTATATAGTGACATATGTAATGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1	-	chr3L	25078413	5'	-	1360	3323	1	68.49
TCCCGAAAAATATACCAAAACGGTTGAGATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1	+	chr2L	544734	5'	+	412	7076	2	68.28
GAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	-	chr3R	7835190	5'	+	roo	8750	2	77.40
TTTATTTTATGATGTGCATGTTGTTGATTTTTATTTTATTAGACCTTCTTGTCGTCTGTCCCTTTTTTTTAGCTTTTTGGCAAGGGGTCTGCGGCTTGTTGTTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTCAACATTAACATC:1	+	chr3R	25455782	5'	+	Quasimodo	6899	2	66.44
TTTCGAATAAAATTTTTAAAAATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1	+	chr3L	1534612	5'	-	pogo	2076	1	64.38
ATTGATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTACGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCT:2	+	chr3L	24757194	5'	-	Cr1a	4260	1	56.16
ATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTT:1	-	chr3R	21706055	5'	-	297	6888	2	82.07
CATTAGCAAACTACCCGTTTCGTAACGAGCTCTCAGCTCCTTTTTAGGAAAAACCGTAAAGTCTTTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGACGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCC:1	+	chr2R	2945262	5'	+	1360	43	1	50.37
AATATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1	-	chr3L	3477512	5'	-	mdg1	356	2	66.44
ATGTTGACCTAATAATTTGACATCGATGTGCGCATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGC:1	+	chr3L	23728662	5'	+	HMS-Beagle	6879	2	78.87
AGTACCAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCCACC:1	+	chr3R	7641045	5'	-	hobo	2921	1	54.26
CACCTGGTTGGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCATTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1	-	chrX	2518132	5'	+	P-element	53	1	46.58
GTCACTGCCCGCACACAGACAGATGTTGACACAGTTTCCTTGAGCTCCGTCTGAGCTCAGCACAAAATGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1	+	chr2R	9662692	5'	-	412	441	2	52.05
GAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1	-	chr3L	20033789	5'	+	blood	7062	2	51.72
TTCTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTG:1	+	chrX	21669994	5'	-	Stalker2	366	2	50.42
CGAAATATTAACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1	+	chr3R	6290924	5'	+	Doc	14	1	75.78
AAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	-	chr2L	3886229	5'	-	roo	331	2	69.18
AAAATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCAC:1	-	chr2R	4774769	5'	-	baggins	5358	1	50.68
AGCAGCATATGATCCGCTGGAAGTACATCCGGAACCTAAAAATATAAATATAAGTTAGGAAAATATATTAACACCTTTAACTTCGTAATTTCTCCAGGGCTTTAAAGCAGAAACAAGAATGTCACTACCCAAGTACACTCGATGT:1	+	chr3R	10738725	5'	+	G2	2973	1	53.10
GTCGCTTAAAACCGGTGGCCAAATAGCCACCACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTATATACACGCGTCTCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1	-	chr3L	6388992	5'	+	17.6	6951	1	64.00
AAATTAAAGATCTGTAACAAGTTATTAGGTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAG:1	-	chr2R	8146177	5'	+	P-element	20	1	70.55
TCTGATGCTGGATGAATGTGGCTTCGGATGGGGTCTGCGGGTGGATTCTGCTTCTGAGCCAAGAAATACACGACAACAATAACAAAAATAAATAAAGGCAATGACAAAAGTAAATTTCATGAACATTTCAATTAAAATAATTAATA:1	+	chr2R	13366946	5'	+	TLD2_LTR	96	1	77.40
GGACCTTTTTTCACGAGGGTGGCAGCACCGTCGTCATTGAAATTCCCGCATGATGGCGTCCCCCTGCTGACATAAAGCTGAAATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTCGCTGCCTCGAG:1	+	chr3L	12861652	5'	-	pogo	2095	1	80.14
GCAATATTTTCGAATAAAATTTTTAAAAATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1	+	chr3L	1534605	5'	-	pogo	2083	1	69.18
GTACATAAATCGAGTTATATATATAGCTGGGAGCAAGTTGACTAAAAGTTGGCGAGGGTACCTCACGTCGACACATTTTTCAAAGTGACACAACTCTCTTGAGCTGACAAGCTGCAAACTGATATATTTTATTAGTTCAAGTATTT:1	+	chr3R	30255519	5'	-	G7	1163	1	58.90
TGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1	-	chr3L	3501023	5'	-	opus	7448	2	63.85
AACTATAAACTTTAATGGGACTTTAAAAATCTAATAACATTTTAAATCGTTATAAATACGTATATTTCGCTATCATATCAGAAGATTCAGTTGGCTTGTGTTGCATTTTTGCACTGTCT:1	-	chr2L	4089330	5'	-	looper1	1554	1	74.79
ATAACTGCTTGATTGCAGAGATATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chrX	13039594	5'	+	roo	8692	2	68.28
AGCCGAACGAAGCCTTTGGGCATATAACGCATAACCATATAGTACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1	+	chr2R	15289133	5'	+	hobo	76	1	72.60
GAGAGCACATTTCGAATTCTGCCTACTCCACAGCTGAGTTCCTTTTCCTGTTTCTTAAGCTGTTGCTCCATGAATGTGATGCTTAGATTCAAGTTGTGCATGCGCAGAGGTCGAGTAAGTTCCTCAGGGGACAGATCGGAAGAGCG:1	+	chr2L	809818	5'	-	mariner2	569	1	67.12
ATGAAGTGTTAGCATAGAGGGGCCTACGCGGGATTCTGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACTAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1	-	chr3L	23219317	5'	-	1360	3327	1	59.59
CATATCCTAAGAATTATATTTATAGACTTAGATATCTAAGATAAAAGTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1	+	chr3R	9293190	5'	-	297	331	2	67.59
TATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGTGCACGGTTGC:1	-	chr2L	12483829	5'	+	P-element	58	1	45.89
CAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	-	chr2L	18294309	5'	+	roo	8702	2	56.43
GCTAGATGTTGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGC:1	-	chrX	22643351	5'	+	Tc1	1593	1	52.82
AGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCTATC:1	+	chr2L	15832990	5'	-	hobo	2921	1	60.00
CATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATT:1	+	chrX	6499849	5'	-	Quasimodo	201	2	76.15
GACGCCGTTCATATGACATTATGTAATCAAGCGAGATCCACAAATGATGAATTTTGTTCAGCTAGGCAATAGTCCANATATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATA:1	-	chr2L	22574615	5'	-	Quasimodo	20	2	69.64
AGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGCCAGGACTCACCAGCGC:1	+	chr2R	9221018	5'	+	opus	138	4	56.19
ACTGCTAGTTCCAATATCAGTTTAGTTACATGCATCAAAGAGCTTTCATTTCTCTTGCCAATTGGTTTAGAAATGACGAAGAAGTTTAAAATATCCTCCCAGCACTTCCTTTAGCTGCTTAATGGGTATCTGGTAGTCGGGAAACT:1	-	chr2R	7316215	5'	+	INE-1	557	1	85.62
ATTCAATTAAAGGAGAAAGTGAGCGAAATGGGGAAAAAAACAAAATCGTAAGGGGGGATCCCAGCCGTTCAAAGCGTTTTGCGTGGGTGCCATTGTAGAAACACATATATATGTATATATATAAGTTAACACAATCACAACACACC:1	-	chr2L	2794331	5'	+	Burdock	6138	2	80.82
CGGAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1	+	chrX	21016730	5'	+	Transpac	4942	2	63.78
AATTTATGGGTGAAAAAACTGGTGCTGCCGGAGAGGAAAAAAGGTGGT:1	-	chr2L	16794140	5'	+	HMS-Beagle2	6722	1	58.33
TATAAGTGTGGCTATTTTGTTCACTCCGCACGTGTTGCGANGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAG:1	-	chrX	10127270	5'	+	R1A1-element	198	1	71.43
TTCCCAAATCCCATTTAAGAATTCCCTTTGTGGGAGCCAGGGATACCCAGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1	+	chr2L	15875748	5'	+	hobo	51	1	64.52
TTCCCCATCCGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1	-	chr2L	18419277	5'	+	412	7078	2	62.76
AACAGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTTT:1	-	chr3L	24368827	5'	-	invader2	199	2	61.64
AAACCATTTGAGAATAAGACCAAGTGGGAAATTCCACGATTGAACCATTCACTCGAATTCAAACTCAATTGGGCTAGAAAAAAGTGAACTAATGTTTAAAAATATTGGCGAATATTTATATTTATATTCTTGATCAGGATCGCTAG:1	-	chr2R	7459166	5'	+	INE-1	85	1	46.58
GGACTGGGAGGTTTGGTAAGAAAACAAAGTTCGTTTTTATACCCGTTACTCTTAGAGTAAACGGATATACTATATTTTTTAAAATGTATGTGTATTGGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACT:1	+	chr3L	27421000	5'	-	Idefix	15	2	65.12
AATAAAAACTTTTAACAGTAAGTGTAAAGTGCCGACTCTTTCCAAACCTGTGAGAGGTTAAAATAGAGTATATATATTGTTGTTGGCACATCCGGTCTTGGAGGGCATTTCGACGGGTCGTTGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTT:1	+	chr2R	473285	5'	-	gypsy10	5647	2	53.42
AAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACC:1	-	chr2R	5173240	5'	-	Stalker4	7324	2	55.48
TATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:2	-	chr2R	7898159	5'	-	roo	336	2	70.55
GAACACGCCAGTTTCTTGTTCCTCCACTGCAAGGATCCACTGCTCGTCCTTCCATCAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAG:1	+	chr3L	27130672	5'	-	1360	256	1	49.32
GATTCCCACTGCTTTGCCGCCTTTCAGGTCGAAGACGTGTACCTTTTGCTTGCTTATCCTTACAAAGCGCGGAGTCTTTGATGTTGTTGCTAAAGGTGCAGATGCAGTAGATATCGTGTTTGCTGTAAT:1	+	chr3R	2208105	5'	-	Doc3-element	491	1	60.47
GACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTCATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	18582261	5'	+	roo	8680	2	64.35
GGCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1	-	chrX	2842604	5'	+	Tabor	14	2	73.91
GGATGGGAATTTATTTTATGTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1	-	chr3R	23495760	5'	-	copia	5084	2	57.53
TCTACCAGCAGCAGAAGCAGCAACAACAACGACATCAGCTAAGTCAAAACAAGAATTTTCTGTTTATCCAAAGACACATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCC:1	+	chr2L	20346768	5'	+	17.6	34	2	64.08
AATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1	+	chr2R	16945303	5'	+	jockey	89	1	72.60
GCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCTAT:1	-	chr2R	21298792	5'	+	jockey	286	1	79.28
CGTAAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGGTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAG:1	+	chr3R	13457900	5'	+	X-element	70	1	55.71
GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATA:1	+	chr2L	21580876	5'	+	INE-1	546	1	54.11
AAGGACAAGACCAACGACGAGAAGCGTCCACGCACCGCGTTCTCCAGCGAGCAGTTGGCCCGCCTCAAGGAGAGATTCATAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCG:1	-	chr2R	11525175	5'	-	F-element	469	1	70.75
TTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCT:1	+	chr2L	12569981	5'	+	micropia	4982	2	63.97
TACAAACTAATAAATTAGGAAAAATGTATTTGTATGATAGCATGTCATTCAAAAACAAATTATTTATAACATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1	-	chr2R	13122107	5'	-	pogo	2053	1	54.11
CGTGGTAGCACACGAAAAACAAATTAAAGTCGACTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAA:1	+	chr3L	9988642	5'	+	roo	8597	1	63.04
AAATCCAATTTCAATTTGTATTCCAAAAGTGTGGCTCTATGAACCGAAATAAAGATCTGATTACAATTTAACTATAAGTGTACCGTTTTATTTTTGATTTCTGGTGGGTTACCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAG:1	-	chr2L	8665258	5'	-	accord	7340	2	73.29
AAAATGGAGGAGCACGGACTAAGCCCCAAAATGGCCACAAAGCACGTTCACAGTTTCATCTTCCTTTAAAATGTCACATAAAATGCTCCAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTT:1	+	chr2R	15288540	5'	-	hobo	494	1	66.44
AAAGATAAAAAGAAAATTATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACAT:2	-	chrX	21564778	5'	+	diver	5926	2	60.27
GTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	-	chr3L	22437973	5'	+	roo	43	2	56.43
AATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3L	20831379	5'	+	roo	60	2	60.96
GGAGGGACAGAGGATAATGGAAGGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACCAATCAT:1	-	chrX	2296007	5'	+	Tirant	8134	2	60.66
TGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACG:1	-	chrX	21994019	5'	+	McClintock	7	2	75.42
TCTATGNGTTCCTCCGTAAAGGCCGCGAACATGCCAGAGGCGTTGCGTCACATGCTTGTAAAGACCTTTGCACGTCTTTACAAAGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAAAAATTTGTCTTCATATTT:1	+	chr2R	5548234	5'	-	G4	3502	1	59.23
TTTTGGAAAACTACGACGCGAATTGTGCTCCATGCGCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr3L	233216	5'	+	roo	8680	2	69.49
TAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAGTAATACATACATATGTAATTTAAGCTTCCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAACGAAT:1	-	chr4	260885	5'	-	INE-1	16	1	96.00
ATTGCGGCAATTGGAGGCGCAACGAAAGCAACTCAAAAGTCTAAAAACGAAATTAAACAAACATTGCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGTGGAACGC:1	+	chr3L	6452993	5'	+	Doc	4299	1	51.52
GTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	+	chrX	9540032	5'	+	roo	8745	2	76.71
AATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGA:1	-	chr3L	8249109	5'	+	jockey	4605	1	71.23
GAACAATATTAATATCTAAATTCAGCCATTTTGTCCAGTCATTTCTTTTAGATATTTTTAATGCGATTTTTTTAACTTTCAGCACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCC:1	-	chr3R	1224241	5'	+	Ivk	5050	1	60.27
GTGCCCATGCTTGTGGCCCAGATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGC:1	-	chr3L	2362427	5'	-	Stalker2	7619	2	58.06
GGGCATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr3L	22437957	5'	+	roo	8728	2	62.76
CAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:2	-	chr2L	18294309	5'	+	roo	44	2	54.11
TGGTCGATTTTTCTTCGTTTTATTGTTTATCTTGCCAATTTTTAATTTTTTTCATTTCATTCCTCATTTATATTATTCATTTTATTCTCATTTTATTTTATTCATTTATGAATAATTTCGCATTCGCAATCCCACTAGCTGAGTAA:1	+	chr2R	5780411	5'	+	INE-1	533	1	79.45
CCATAAAGCCGGTTGGTTGCTCGACAAGATCAAGTAGTTTGCGCCTCCCTCTCGCATCTGGGTTAAAGAGTTTTTGTGTATCTTACTTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAACTAACTTCACAATCTC:1	-	chr2L	9906576	5'	-	invader3	242	2	59.59
ACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1	-	chrX	9540134	5'	-	roo	9034	1	59.03
ATTTTTCACTTGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1	-	chr3L	19036065	5'	+	Tirant	8146	2	60.00
TTATAGCTTTTCGCTTAGTGCATTGGACGCTAACTTAAATCGCCGCTCAATTGAATAGCAAGATCTTGCCCACTTTTCCCGCTGGCATTTGTACAGCATTTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTACTTCTCTTATCTT:1	+	chrX	5281535	5'	-	invader2	4747	1	68.53
TGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1	+	chrX	13504178	5'	+	412	7135	2	76.81
CAAAATTATTAAGAATGCACACAAATGAGTAGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCATCCACCTGCAAGG:1	+	chr2R	20498663	5'	+	blood	334	2	61.96
AGAAGTCCGGGGACTTGTGAGCCCAAGCCAGTAGGATTAGCACTTCGATCGCCTAACACCCTTTTCCTTTCGTGGAGATGTGGAAATTTTTGAGAGTTTCCACCTGACCTAACTAAGAGCCTGTTTCCAGCCGCCTTC:1	+	chr2R	23351627	5'	-	baggins	105	1	52.17
AAATTTAAGTCTTTTATTTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1	-	chrX	6522096	5'	+	F-element	42	1	61.64
TGGATGCGAGCGAAAGTCAATCTTCAAGCAATTAAAATATGTTACACGTCTGGTGGGAGTAAGATAGAAAAATTTCAATAGAATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1	-	chr3L	21380	5'	+	Quasimodo	35	2	60.00
CGGCTATTTTGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1	-	chrX	23155291	5'	+	blood	7046	2	61.38
AATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTG:1	-	chr2R	4774767	5'	-	baggins	5356	1	52.05
GGCGTTTGCGGAAACGTTGCGAATAGTGAATATTAGATTAAAAAAAAAAA:1	-	chrX	15967133	5'	+	BS4	730	1	78.00
GCGATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTATT:1	-	chrX	11471673	5'	-	hopper	1410	2	72.34
AAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAATAAAATAGCATAT:1	-	chr2R	15064466	5'	+	412	7082	2	62.14
CAGCTCCCCTGATTCCTTTCTCCCAGACGTTTGCCATAAAAATGCAAATGAAAAACTCCACTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAAGCCGCACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGCGCGCTGGCAGG:1	+	chr2R	20205683	5'	-	Max-element	350	1	55.48
GTGGCGAACATGCATGCATAAGTAGTAATTCATTCCGTTTCGATTCGTTTCATTGCGTTTCATTTGCAATTTGCTGCTGAGCACTGCATAAATCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1	-	chr3L	4948165	5'	+	hobo	17	1	71.64
GATAATTTCGGTGGTTTTTACTTTAAATAGTTCAAAGACATGATCAAGTTGGTCAATATCAAGAGAATCGATCTATAAATAGGAAAAACACTTGAGGATTACGACTATATTTCGTCTGTTTGGTGATTGTGTTAACTCC:1	-	chr3R	2208397	5'	-	Burdock	6135	1	51.80
CGGTTTATTTTCCTTGCCTTTTTTTTGGTTCAAATTGGAGACGCGCATGGCCAAAAATACGTACGCATAAATTTAGCTATATGCACATAGTACATATACATATACACAGCTTTAGGCCCACCTATATATATATATATATGTGTATG:1	-	chrX	14589975	5'	-	Stalker2	7499	2	53.42
CGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1	+	chr2L	4412583	5'	+	Quasimodo	44	2	73.47
CATAATGTTTTCTTTGCTTTCAAAATAAATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGC:1	+	chr2L	23068793	5'	-	1360	3377	1	73.79
CATTTGTCTCACTTCCTTTACCTTTAACTACATCCCGGATGCTCCCGAAAAAAACCAACAGCCGAACTGCACTAAATGCAAACTTACAGAGGCCAGCGACAATGAGCCAGTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTG:1	+	chr2R	18666382	5'	-	F-element	4303	1	74.31
GACACACAAATATATCGAGAGATAGAAACAGACACCCACGCACAAAGAACCGAGAGCAAAAAGCGCGTAGCAAAAATAGCAGGGAAAAAGAATAACATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTC:1	-	chr3L	13669081	5'	-	roo	31	2	66.91
CTGCTCTCAATTTACTTTTAATTTGATTTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1	-	chr3R	27425272	5'	-	blood	7347	2	51.54
GGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	-	chr3L	11530968	5'	-	roo	336	2	67.12
AATTTTATAATTTATTTTATTCGGATTGTGTGGCCTTTTGTTATTGTTTTCTTTATCCAAGCAAACTTATTTGAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr2L	12713267	5'	+	roo	11	2	66.44
TTATTTATGAAATTATATGGTCATTTTAGTTCTTTAATTGGAATTTAATTGAAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1	+	chr2L	12498331	5'	+	pogo	61	1	67.12
GTGGGAGCACTCATTGTTTTTTGAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAATCACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTA:1	+	chr3R	25423162	5'	+	3S18	5790	2	65.75
GGCTGCGGCTGCCACCGTCGCTTAAAACCGGTGGCCAAATAGCCACCACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTACATACACGCGCCTCTATAAATATAGTGACATATTCACATACAACACCACAT:1	-	chr3L	6389008	5'	+	17.6	7	2	67.74
AGTGCGTACCAGAGCTGTATGACCATCAGTGCTGTGCTTCCCTTCCGCGCTCAGAACTCATATAGTCACTTCCGATTCCCCTTGACTTGTGTGAAAGTCATAAGTCAAAGTCATAAAGTCATA:1	+	chrX	2089961	5'	-	Transib-N1_DM	109	1	69.92
GTGTTGAGCACTTAAATTTAAAATGTGAATACAGGCACTCTTTAAGCTTTGCATTCTTGTTTTTTAATACCAAAACCATTCGGAGTATCCATCGATTTACCCGCACATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATG:1	-	chr2L	3884814	5'	-	roo	337	2	69.86
ATTGAACATATTTACATATATTTTACAAGTCTTACAAGTCTGCGTATTTACTTAGGATGCATAATATATATGCATATATCCTTATCGGCATTTTTTGATCTATCTTAGTTTTCTTAGTTTCTTTATATACTTATGACCTA:1	+	chr2L	19880314	5'	+	BS4	111	1	48.57
TGAATGATATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	+	chr3R	17420355	5'	+	roo	8668	2	79.45
AGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCACGCCACAA:1	-	chr3R	3080555	5'	-	gypsy9	5164	2	84.93
AACTTATAAACAAGGTAGTTATATTTGTCAGAAAATGTTGTAAAAAAATTAAATTCTTCAGTTCAAAAGTTTAAAGGGGTATACAGTTTCTAGTGAACCTACTTGGAACCGAGAAG:1	+	chr3R	20283618	5'	-	Cr1a	4102	1	63.79
GGATTGCGAACTCGTCGCAAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTAACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGAATCTTTTCCTAATATTAAGAATCCAAGAGCGAGGCTCA:1	-	chrX	3663236	5'	+	297	6777	2	78.08
GATAAAAAACAAGTGAAAAGCCTTTCTCGAGTCCCTCGCGTACCTGCAAATTGGAAGTGGTATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1	+	chr2R	6885297	5'	+	flea	16	2	66.35
AAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1	+	chr2L	15833444	5'	+	jockey	26	1	61.90
CAATTAAGCTTTGGGAAAATCTAGCAAAACATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTA:1	+	chr2L	20139894	5'	-	jockey	4903	1	78.08
CTCAGCTTTTAAAATATGTGTGTGACCGAAAATTAAATCGTTAAAAAAATAAACAACTTACTCAGATAAACATAGACAACATCCCTAGACAAATTAATTTTCAACTCCAACACTGAAATATTCCAGAGATACCAGTCTATGAC:1	-	chrX	285950	5'	+	G3	4251	1	69.23
ATAACAAAAATAAAACATCATTATTATCATTGTACATATATTCACGTTGAAAGGCAGATAAATGACAAAGGCAGCCACAGCGATCACAACATCGTCTATATAAGTGAAGTGAAGGCTGTCATATATTTACACACACACACA:1	-	chr3L	9338340	5'	+	Quasimodo	30	2	80.14
AATTTGCCATTTGACAATTACTACATGAGCATGTGGAGAGGAAAGGTTGCGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAATCATTAACCCTTACGTGGTATATAAAAAAATGAA:1	+	chr3R	18596238	5'	+	P-element	136	1	37.04
GGATGTGTTACAGACATGTGGTTGTGTATCTTTGGGGACATGCTGTTGTTTTTGCTATTATACGCACAATGGGACGAACAGACTTTCGGTTTTAGTTTTCTTACCATAATTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1	+	chr3R	31720434	5'	+	pogo	7	1	78.08
GGCTATAAAAATCAAATTTAAATTAATTTAAATTTTTATCTAGACGCCCAATAGAGTTTTTCCGAACAGGAAAAAAAAACCTGAAATTATGTTAATAACCATTCACTTCACTAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGAAGAAA:1	-	chr2L	14668407	5'	-	Doc2-element	32	2	58.90
AAAAAATATCTAGGTAAGGTATCTTGTGGCCAAAGGTATCTAGTTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1	-	chr2R	4977112	5'	+	1360	60	1	65.67
CGGAGCCAAAGGCAAAGTCAAAGGCCCTTTATTATGGAATGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1	-	chr3R	19265882	5'	+	I-element	80	1	71.53
TGATTATGCAATTTTCAAATTGATATGGTTGCAATTCGAATGCGAACCGCAATTCTTTTGCGGTTAACTTGGTGGCAGATGCAATAAATAATGGTTAATTCAATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCC:1	-	chr2R	13275730	5'	-	Tirant	433	1	70.34
CATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr3R	7482766	5'	+	412	74	2	75.78
ATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTANCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTT:1	+	chr3L	24213777	5'	-	invader2	173	2	65.07
AGATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chrX	6486834	5'	-	roo	389	2	62.69
AGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGTTTCAGAATCAACACGAGGTATTTTTT:1	+	chr3R	24383248	5'	-	rover	270	2	70.55
TGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTAGGTACCCCGAGAACTGGTGTAATGCGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAACTCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAAT:1	+	chrX	10521635	5'	+	Tabor	61	2	56.43
ACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr3R	26222882	5'	-	roo	325	2	80.00
AAAAAGTTAATTGAATGACTATCTGCAAACTTCAAAATGTATATTATATATCATTAAAGATATGGGCTGGTGTAAGGCAATGCAAAAAAAGTTGGAGTTATTGAGTTATTAATTTTGGCCACAAAACGTGGTCAAATTTTCCATAG:1	-	chr2R	16581818	5'	-	Transib-N1_DM	3	1	80.82
AATTGTTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGA:1	-	chr3L	12879844	5'	-	roo	408	1	77.55
CCCGACCCACAGCTACTAACTTGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	-	chr2R	13710666	5'	-	roo	9039	1	54.29
GTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	-	chr3L	15600314	5'	-	roo	335	2	67.81
AATGGCAACAGTATTGATATTTGCATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1	+	chr2L	13585783	5'	+	Tabor	15	2	76.03
GTTCAGTTCAGTTTTCGTCAGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1	+	chr3R	25339940	5'	-	mdg1	7427	2	63.01
AGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	-	chr3R	20427499	5'	+	jockey	9	1	78.76
GGCGTCAAAAAGGGTTGGGCAGGGGGTGGGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGAGATCCACTCAAGAGGGTTCCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGACG:1	-	chr3R	2077977	5'	+	Quasimodo	7030	2	73.04
ATGCTCTACACGCCATGATCAAAACAACTGTTTTGCATTTGTGCTTGCATTTCATTTCTAGCCCTTCAGGCTACAGGACCCCTGTCCTGCCTGTTTCAACAGTTTAACTTTTAATATTTTAACT:1	+	chr2R	3191617	5'	-	TAHRE	152	1	31.45
GAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTG:1	-	chrX	5629196	5'	+	jockey	90	1	47.71
AAATTCATCAGACGTGAATTGTTTTCCGTTATCGGAAACTAATGTATCAACTAAGCCATTTCTACAGAACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1	-	chr3L	23818440	5'	+	copia	54	2	55.48
TCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1	+	chr2R	2016837	5'	+	1360	73	1	70.00
GAGTCGTGAAAGCGAAAATACAAAGCCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTT:1	+	chr3R	20499716	5'	+	mdg3	5264	1	74.42
AGAAGATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr3L	15177223	5'	+	roo	8680	2	55.06
CGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACA:1	-	chrX	21667962	5'	+	gypsy2	26	2	68.75
GGGGGGGTGGTTGTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chrX	10640122	5'	+	roo	8717	2	54.79
CTTTTGTAATTCTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTT:1	+	chrX	21669985	5'	-	Stalker2	7596	2	53.42
AAGCCGATGAAGCTGAAGCTCTGGCCAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1	-	chr3R	10182233	5'	+	blood	10	2	73.45
TTAATGCTAGATAGTTGGTTTGACTTAAACGTACATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chrX	2444299	5'	+	roo	8674	2	74.66
AGATGAAACATATTTGGCAAAATAAGTGAAAGAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGA:1	-	chrX	22497199	5'	-	INE-1	578	1	93.10
AATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1	+	chr3R	11105983	5'	+	Doc	75	1	75.78
AAGCATGCCTTTACATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGCAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTG:1	-	chr3L	23702311	5'	+	G4	7	1	75.34
CCTCGGTGAATTCAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	7835232	5'	+	roo	16	2	69.49
GGCCTGCTTTTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGANAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTAGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1	+	chr2R	16891805	5'	-	hopper	1380	1	58.74
CAGGCGGCAAGATGTTGCCCCTTCCGGAATGGTTTTTTATTTTCTTTTTTTTTATTAACGAAACTATTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATC:1	+	chr2R	6527571	5'	-	jockey2	3340	1	71.30
ACCTCTTGAGCAATAAATAGGTTTAGTAAAATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1	-	chr3R	20469700	5'	-	roo	9025	2	49.66
ACTGTCCCTTTCGACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1	-	chr2R	2016944	5'	-	1360	3363	1	66.42
AAATTATTATATTAGCTAAGAAAGAGAATAACAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGG:1	-	chrX	10939941	5'	-	INE-1	135	1	80.14
GAATAGAAATTGCAACTTACTGTTATTGAAATCAAATACGTTGACCCAACTCCTGTGTCCTGAGTCGGCGTAGGTGTTCCCTCTGTCACATTTTTTGCCACTCGACTCACACTCAACAATTTT:1	+	chrX	22765805	5'	+	hobo	34	1	28.46
GATCTTTGCAACTTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1	-	chr2R	16785458	5'	+	412	23	2	69.29
GGCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	+	chr3R	12886909	5'	-	roo	328	2	71.92
CAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGACTATAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGATCGTCTTAGACACTGTTTATG:1	+	chr2R	5173451	5'	-	gypsy	386	2	70.15
GTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	+	chr3R	17420419	5'	+	roo	26	2	53.85
ATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chrX	23280894	5'	+	roo	8686	2	43.20
TTAATGAGGAGCATATTCTAGCTTTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	-	chr2R	21920642	5'	+	jockey	12	1	78.47
ATCTTTTAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1	+	chr2L	18338985	5'	+	pogo	50	1	66.09
CAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTAATTCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAAG:1	-	chr2L	22224602	5'	-	Rt1c	5395	1	51.37
GTGGCCTTTTGTTATTGTTTTCTTTATCCAAGCAAACTTATTTGAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chrX	16717960	5'	+	roo	8704	2	58.22
GGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1	+	chr2R	16945276	5'	+	jockey	62	1	54.11
GCCCATTTAAAGTTGACATAAAATTCCACTTAAACACCTGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1	-	chr3L	3501073	5'	-	opus	7488	2	75.71
TATGATTATAGTTTTATTTCAAAAGTATGTTGTATGGGATGTTATGTGAGATGTTATAATTATGAATAGTTCCCGCTTTCACACCCGATACAAGTTATTGATATGCTAAAAATTCTACTTATATTGTGGT:1	-	chr3L	4341650	5'	-	S-element	26	1	79.23
ATTGGTTTGTAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1	+	chr3L	10848618	5'	+	blood	35	2	60.84
AATCGGTCAGTTTGAGATATTTTTCTTTGTAGCAGAGACAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCT:1	-	chr2R	7586218	5'	-	I-element	5305	1	53.10
TGAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1	+	chr2R	6919684	5'	+	hobo	56	1	68.42
GAGTATAGGAAATATGAAAAAAGAAACGGGACAAAGACGAAAGAATTTGATTAATCAATGTTAGAGAGATACTTTTATTTTGATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTAAGTGAGTAAAATGATGAAAAAG:1	+	chr2R	22336330	5'	+	Tc1	1572	1	62.32
AAGCAGTAGACGGCGCTACATTTAATCTAATCTTTGTCAGGGCGCGAATTTTAAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCT:1	+	chr2L	9672383	5'	+	1360	3154	1	73.08
GAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1	-	chr3L	3863542	5'	+	blood	10	2	70.75
CTCAAATCCAAATCCCTTCTATACCCAAAACAATTCAGAACAGCAGCACAAGCATAAAAAATGCAAATTTCTCTGCATAAATCTAAAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAG:1	-	chr2L	17535642	5'	+	F-element	121	1	59.59
ATTTCGTGTTTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGCTACAC:1	+	chr2R	20496856	5'	+	blood	8	2	77.24
TAAATGAAATATTAAAAGTATAAAAATCTTCTTAGTATACCTTCCTTCTGGCTTTCATGCGGGCAGATGGACATACGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCC:1	+	chrX	18842956	5'	-	INE-1	97	1	38.89
TTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	16785446	5'	+	412	41	2	58.22
ATTGATATTCCAAGGCCAGCTATTGTTGCTTCATACAGTAAAGGTATGCAAAGCCTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACT:1	-	chr2R	2242894	5'	+	G2	340	1	69.93
ATAAAAAATTTTTTTTTAATATCATTAGGTTTTTAATTTTAAACAATTCAACAAGTGTTTCACTTAAATTTCTTAAAAAGTTTCGAAAATATAGATTAATTCTGATGTTCACTGAAATAGCAGTGCTATAAAAAAATAATAACA:1	-	chr3R	377394	5'	-	HB	1408	1	70.14
AATATAACAATTTGTAGAATTAGCGTGTCGCTTAATTTATTGGATTATTTGAAACCTTTTTGATAAACAACAGCAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCACAAGCACATTTCGAGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACT:1	-	chrX	5155771	5'	-	Tc1	1592	1	50.00
AAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGGGAGCGAGTGTGTGCAATGCGAGCGAGTTACCACCGCACCCCCTAAACCCCCAC:1	+	chr2R	11629733	5'	+	Tirant	8117	2	68.57
TTAAAGGATGAAAAATGTTTCAATATTTCAACAAAAATTGATAAAGGAACACCAAGCACCAGCAGGACAATATTGAAACTAAGTTTACCCTCGAGCAATGCATCGCGCCGCCACAAGTCGGCAAGCCG:1	-	chrX	22443113	5'	-	gypsy	166	2	52.34
GAAAAAGGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATAT:1	+	chr2L	21008531	5'	+	invader3	50	2	54.01
GTTTTTGTTTTAACGTAATCTTCGCCACTGTCGAATAACTTATTAGCCTGAACATATTTTTGGTTCCAAAAACATGAACGAGAAAAACTACAAAATCCA:1	-	chr3L	21951690	5'	-	S2	1542	2	78.79
CAGGCAGACATAAATTTATGTTGGCTTGCAATTTTCCAACACCAGCACACATCACTGCCTCTTATACCTACCTGTGTACAGGTGAGGGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1	+	chr2L	6569892	5'	-	jockey	4980	1	71.23
ATTTAAATTACCATTAAAGTTTTTCAGTTAACTTTTGTGCGGTTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTGTGGGACACATGGTTCAACGAACTTGCGTTGCGTCTTTGTCTCTAGAATATGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAG:1	-	chr2L	21688585	5'	-	INE-1	170	1	77.78
TATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	-	chr2R	9328657	5'	-	roo	9036	1	68.29
TCTAGGAATAACGTTGTCCTGATTTGCACTCATTCTACCGAAATAAGATGTCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAGCAAAACAAAAACAACTCCTACCGCTTATTCACCCACAAACAATTATCAAAGCCTACACCCTCACA:1	+	chr3R	2404850	5'	+	Porto1	316	1	62.14
GTTTAATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1	-	chr2L	17079867	5'	+	jockey	4685	1	73.55
TCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1	-	chr3R	17831861	5'	+	F-element	83	1	73.13
GTATACAAGATGGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCTGCACATGTTAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAT:1	+	chrX	23093526	5'	+	INE-1	95	1	93.94
AAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1	-	chr2L	15833089	5'	+	hobo	29	1	55.75
TATTTTCTTAGAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr3L	21817923	5'	-	roo	397	1	76.03
ATGAGGTGTTTAGTGATTTTTATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1	-	chr2L	12483849	5'	+	P-element	38	1	59.59
TGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATATCTAGGCAGCTATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1	+	chr2L	16067087	5'	-	297	6924	2	67.20
TGTTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chrX	5643591	5'	+	roo	30	2	59.23
ACCTGCCACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	-	chr3R	14940189	5'	+	jockey	14	1	68.37
CTTTCCCTTTTTCCCTTTTTCCCTTCGAGCCCTGGCCACAAAGTGTTGCGTTGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTGTTTAAGTTT:1	+	chr3L	19035971	5'	-	Tirant	347	2	52.05
CAGGGTGTAGGGTGAGTTCGCAGTCGGCTTGGCGGGTTGTTAAGCTGTTAAGATGTCGATCCTGACGACACGCACTGACTTAATCACTTGTCCAACCGATTGCGATTTATATTTATCTATAAAACGGATAAGTGCATTAATTAATG:1	+	chr2L	10938349	5'	-	diver2	421	1	51.37
TACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGNAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1	+	chr3L	14638607	5'	+	1360	22	1	57.14
GCAAGACAAGCAAAAAATACTTGTCCACATTCGTTTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAA:1	+	chr3R	26686027	5'	-	Juan	4125	1	75.00
CTTTTTGGGATTACACCCGGAATGCCGGTTCTGGCCGGTTCCAACCCCTAAGCCTGCTCATTCCGTGGATTAATTTATCACCCGTCGCAAGCTGAATATTTTAATGACAAATATTCTA:1	+	chr3L	2807252	5'	-	1360	399	1	57.63
ATTATACCAGCTTGTGGGCAAAAATAACTGAAATACAATTTTCAGAATGAAAAACAAGGTTTCTCTACTCCCTGCAAACCCAATAACAATAAAAATAAAAAAGGAAAATCAGGAGGAAAAGTATGATTTTTTTT:1	-	chr3L	10866226	5'	-	I-element	5144	1	64.18
ATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGT:1	-	chr2L	9399536	5'	-	Transpac	241	2	66.44
TTTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	+	chrX	9539995	5'	+	roo	8708	2	53.42
CCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATACGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTCACGATTTT:1	+	chr2R	4193300	5'	+	1360	37	1	78.08
TATATTTGTCAGGAATTTTGACAGTTATGGCGTGCGATATATTGTTTTTATGATATGTCTTTATGGTGTTATAATAAAAAGAAGTAGTATTGTGGAAAGATACGTTATTGAGGACAAAATAAATAAATACATATTATATATGTACA:1	-	chr3L	14161674	5'	+	412	7270	2	36.30
TAGCCACGGCTTTTCCAACATTTTTTTTTTTCGACATTTTCCTTCAAGGGCAGCGGCTTCATTTGCCTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1	-	chrX	5457929	5'	+	hopper	145	108	51.11
TGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1	+	chr3L	21855449	5'	-	blood	303	2	67.81
TATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	-	chr3R	25448469	5'	+	roo	8693	2	65.07
TTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1	-	chr2L	15833075	5'	+	hobo	65	1	67.41
AACAGTATAGTGTTGAAAAAAAACAGCTGTAAAGTCAGCTGTTGTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1	+	chr2R	3338734	5'	+	Juan	9	1	77.60
ACTCGGATTGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1	-	chr2L	20840522	5'	+	Transpac	4934	2	68.81
TGAGTTCCGGCGCCTGGCTGGATGACCTCAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTT:1	+	chr3R	11496496	5'	+	1360	37	1	61.64
ACTCTTACTTATGACCCTCTCTCAACATGTTAAGTAATTATTAAAACTTGTAATTGTAATGAGGAAATGTAGGTCAAGTCAATTTTGATATTGATACACATATTAAATCGCTCTTCCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTGA:1	-	chrX	2758464	5'	+	Cr1a	320	1	73.29
ATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chrX	13039544	5'	+	roo	8724	2	70.87
TGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	-	chr3L	20888773	5'	+	1360	59	1	75.00
ATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTAC:1	-	chr3R	19449970	5'	-	roo	64	2	64.38
AATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATTAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1	-	chrX	13066615	5'	+	jockey	8	1	73.39
GGGAATCGTTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCGTATTAACTTATGGCA:1	+	chr2R	24218514	5'	+	412	41	2	51.85
TAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1	-	chrX	3308353	5'	-	hobo	2900	1	75.00
TTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr2R	11164514	5'	+	roo	8679	2	66.97
TTTGCGGGCAAATATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACATTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAGACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chrX	5274380	5'	-	roo	9001	2	64.38
TGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	-	chr2L	17471685	5'	-	roo	352	2	60.00
AGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGCATCAAATCAGAAC:1	-	chr3L	10574415	5'	+	Tabor	6863	2	59.59
GAACGAAATGGATCTGTCATCATGCCATATTATTGAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1	+	chr3L	23219245	5'	+	1360	71	1	74.62
AGGTCACAGAGAACAAACAGTACAAAATTGGTTTAGGTTCTTTCTATTTTAGGGCTATAATTCGTTCTAAATGTAAATAAATCAAATTTTGATATCATATATATATATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAG:1	-	chr3R	9625078	5'	+	1360	3292	1	72.60
GAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCNTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATACATCA:1	+	chr2R	12835060	5'	+	jockey	67	1	71.05
CTTTATTAAGAGCAGACAAATAAACCTTTTCTCGTCTTTTCTTTAATAATTTGTTTTAGCTAGCTTTGCTTTCCTTTTCATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAAT:1	-	chrX	18473754	5'	-	I-element	405	1	53.42
CGCACCACCGATCAAACGGAATCTGGGCCTCCGATTAAATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1	-	chr3L	20548155	5'	+	297	6632	2	73.44
AAACAGACTTGCAAAGCAAATCTTGTTAACAAACTATACAGGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	+	chr2R	7898020	5'	+	roo	8	2	78.17
AATGGATAATGGGTAAGATTATATTAACACCTCGTAATCAAGTGAACTAAGGCATCCATAATTTACAGAGCCCTTGTCCTTGCCTCCCCGGAGATCCGCTTCCATATATATAACCTACATATATCATAAGTACAC:1	+	chr3R	24335500	5'	+	accord	439	2	77.04
TTTTAATTTCAGTTTTTGTCGATCGCTGTCTGGGTTATGGTTTGGGAAATTCGTGTCAGCATTTTGACAAAAGAGTTAATAAGTTGTGGGAACGCTCTGGGAAATCAGATCATCTATATTCCGAAAACAATAATAATAATATAATA:1	+	chr3R	10558517	5'	+	invader3	5044	1	65.75
AATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGGGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTGTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACACTTTGAGTTTTTGTAAGAACCTAATTTTAT:1	+	chr3L	21817951	5'	-	roo	9034	1	54.86
AGTTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGG:1	-	chr3R	6611303	5'	+	HMS-Beagle	17	2	66.37
GTTGGGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1	-	chr3R	27424943	5'	+	blood	54	2	49.22
TGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTACTCTTCACCCAAACTCAGCGC:1	-	chr2L	12290749	5'	-	1731	4566	1	62.60
GAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	+	chr2R	981617	5'	+	1360	32	1	60.87
AAAATGAAGTAATATTTCCATTCTCTCAAAGATCACCAGGACAAATTCCAGTTTCTGAACACTGCGACCCAGCCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCT:1	+	chr2R	7501759	5'	-	baggins	5372	1	53.04
AGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1	-	chr3L	15600328	5'	-	roo	9024	2	51.85
ACTTTCCCGGGCGAAAAGTCGACTTCATCGCCTTAAAATTTCCCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATTCTTACACACACACACA:1	-	chrX	6499083	5'	+	Quasimodo	30	2	58.90
GCAGTCTCTCCACAGTCAGTTTCTTCACCAGCCATTCCTTTCTCTTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGC:1	+	chr3R	4133949	5'	-	Quasimodo	6982	2	61.04
AGTTTCATCGAATATGAAAAGTAGCAAGCATTTCAATTACAAATACCTTTCACCACTTTTCTTAACTTAATAAGAACATTTTTGTGATGCATAAAACGGACAGGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATATATAT:1	+	chr2L	8337683	5'	-	INE-1	80	1	64.38
TAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACCCGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	-	chr3L	23906461	5'	+	1360	55	1	63.20
AAGTTCTGCTCACAGTACCCTGTTAAGTTTTGCAACGAAATTGGCCAAAAATCCAAATATGTAAATTGACCTCTCCCCGCTCGTGTGAAATTGAGAAAAATCTAAAAATTGAATTTGCGTGCTAGAAGACAATTTTCGGGCCGAAA:2	-	chr4	431415	5'	-	1360	3190	1	58.22
TATTATTTGAAAGATATGATTCGTCTGATTGTGTTGTTTGATTATTTCTTTTGCCTGAGTGTATTCAAGTGGTTCAAGTTTTGTTACATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTATAGAGTTTTATGTT:1	-	chr2R	883053	5'	+	Cr1a	4181	1	65.94
AATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTACACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1	-	chrX	22511456	5'	-	1360	3368	1	54.11
AAATGTAGCGCAGGTTGGTGCGGCTTTGAAATGAAACTGATTATTACAATTGTTGTTACGCCCGCTGGCGCTGTTGTTAGTGCGAAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAA:1	-	chr2R	8329132	5'	-	hopper	956	1	58.90
AACCAGGCGTCAATTTATGCCACACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1	-	chr3L	7188626	5'	+	hobo	63	1	63.70
GATACAAAAAAGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATTCTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chrX	17526798	5'	+	roo	8677	2	60.00
ACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chr3R	18582151	5'	-	roo	344	2	62.94
TATTCTTTGTATTTAGTATTTTCCGTCTTATCAGCTGTTCGGAAGGTATATGCAAGCGTTCGAACGCTGGTCTTTCCCTCTCTTGAAAAAAAAAACAAATAGAAACGAACATATCGATCGTTCTAAAATGAGCCACCGCG:1	+	chr3R	2844010	5'	+	Doc3-element	212	1	60.00
TCTAATAGTTTCATGTATGGCTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATG:1	+	chr4	311142	5'	-	1360	3379	2	78.77
ATATCTAGGTAAGGTATCTTGTGGCCAAAGGTATCTAGTTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1	-	chr2R	4977107	5'	+	1360	77	1	71.92
TTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGATATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAG:1	-	chr3R	11547821	5'	+	G2	295	1	70.55
TAAATTATTTATTTTCTTAGAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACTAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1	+	chr3L	21817914	5'	-	roo	406	1	80.82
GTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1	+	chr3R	13360325	5'	+	jockey	88	1	75.18
ATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1	-	chr3R	15363997	5'	-	flea	4934	1	74.48
CAGGTAAATAATTAATTTAAGAGGTATTTCTTAAGTAGGTAAACTATAAAAATGTTCTATTTATGAACATGCAATAAACATGTCACCGGACAGTATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTG:1	-	chr4	281929	5'	+	rooA	7352	2	74.48
GGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	-	chr3L	20654571	5'	-	roo	9020	2	57.78
ATTCAGNGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCT:1	-	chrX	21564760	5'	+	diver	5942	2	57.64
CTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	+	chr3R	14981163	5'	-	mdg1	7388	2	66.44
CATACAAATGCAGTGCTGCGCAGAGTTGCCACACATCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1	+	chrX	1899638	5'	-	P-element	2839	1	37.84
ATTAAGCACCAACAAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1	-	chr2R	652356	5'	-	copia	217	2	65.07
TATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1	+	chrX	10640012	5'	-	roo	9012	2	56.85
CTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	+	chr3L	15600195	5'	+	roo	79	2	72.60
AAGTCTTTGAACTTCTTCCGCTCCACAATTTAAATCGCAGTCAAATGTTCCTGGCACGGTTGCTGAAAGAGGTTTCCCTATACGAACTTAAACGCAAAGACGAACAGGATTCGGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTAT:1	-	chr2R	21500839	5'	+	1360	298	1	76.03
ATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:2	+	chr3R	18339099	5'	-	roo	8997	2	67.81
GTTTCCTCTGTGTTTAGGGCTCAATAAGTTTTATATCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1	+	chr2R	6172948	5'	+	pogo	19	1	71.43
AAGCGANAGATCCGGCGATCCGGGAATGCGTATACATTTTATACGCATTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCAT:1	+	chrX	20645842	5'	+	1360	392	1	67.81
AAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTACTGG:1	-	chr3R	11547757	5'	+	G2	345	1	71.21
CACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACCTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1	-	chr2L	2703588	5'	+	hobo	27	1	58.26
ATTATAATTGAACAAAGAAAACAAATAATAGATGTATATAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGC:1	+	chrX	22897591	5'	+	Bari1	47	1	54.62
CAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	-	chr3R	18582267	5'	+	roo	7	2	73.21
ATTTAGGCATTTTAAGGCACCGCATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAGTTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAC:1	-	chr3R	25454136	5'	+	Quasimodo	23	2	52.78
AACCTGTGCAACCATTTTGTTTTCTTTATATTATTAGTGACAGTCGATCAAGCAGTAAGACGCAAATCGATGAGGACACCTCTCGCGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAG:1	+	chr3R	20290925	5'	+	1360	473	1	66.67
TATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chrX	5643479	5'	-	roo	342	2	64.38
AGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	-	chr2L	14772128	5'	+	roo	39	2	53.33
ACTACGACGCGAATTGTGCTCCATGCGCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chr3L	233225	5'	+	roo	53	2	55.48
GTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chrX	5643567	5'	+	roo	27	2	57.28
AATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTACAACTGCAG:1	-	chr3R	15072668	5'	-	pogo	2053	1	50.00
CTATACCAGATGATGAATCCTAACAAACTGGAAATCAGTAGGCAATTTATTAAATTCTATACACCTCATATAAAATAAACGTAACTGCTTGCACACTTTTTGATATCAAATTCATTGCACAAATAGCTTTAAAAATAATAAATTTT:1	+	chr2R	21266335	5'	+	1360	3025	1	61.64
GGCCACAATATTGTGAAAGGTTACATTACTCATAATAGGCACTTTCTGCGTAAATATATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1	+	chr3L	11321357	5'	-	mdg3	231	2	70.55
ATCGTTGGCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCTACTCGATGGCCACAAAGTAT:1	-	chrX	12074586	5'	+	412	7186	2	71.96
GGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTCACATTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTGACCAACGCAATCACGGAAC:1	-	chr2R	10572710	5'	+	F-element	4415	1	68.66
GTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr4	419969	5'	+	roo	8737	2	71.92
ATTTTCGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGTG:1	+	chrX	6486706	5'	+	roo	56	2	57.86
ATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAA:1	-	chr3R	9714503	5'	-	Stalker4	370	2	58.22
AGGTATGTGTGTTTTTTCCAAAGTTATCTACCCGAGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCAC:1	+	chr2R	21909032	5'	-	roo	255	2	71.54
CACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATCTTGTAGTCAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1	+	chr3R	22821994	5'	-	mdg1	7426	2	47.15
GAACCGCAGAAATAAACAACCGAATGACGATAATCACCACAAAAACACTTGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1	-	chr3R	12717844	5'	-	297	6949	2	61.98
GGTCCCGCTGCTGCTGCTTCTTCTCTTCTGCCACTCGCTGGAAAGAGCACCCACTCTATTTGCGATAACCGAATTATCCCAAAACTTTCCGTGTGTAGCTGAATTGGGTTGGAACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1	+	chr2L	5538774	5'	-	1360	3331	1	66.43
GGGTCTTATGATTTATTTTAAAACTTTAAGGACGTAATGTACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATCACTTCGACACCGATGCG:1	-	chr3R	13237369	5'	-	3S18	6036	2	69.40
AAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGCTTATGGTTATGTTTATGCACG:1	-	chr2L	11518461	5'	+	412	79	2	71.74
GTGTAAACAAAGAAGTACCTATTAAAGTAGAGACTCTAGAAATACACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGCTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGC:1	-	chr3R	1048079	5'	-	Quasimodo	197	2	62.96
CCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTAGT:1	+	chrX	10640008	5'	-	roo	9053	2	59.63
AAAAATCGGGAAAATCTTAGACGACGCTGGGTGAACAGCAACGTCATCACATTATAGAAATGTTAATGGAGCTCGCTATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTA:1	+	chr2R	19545447	5'	+	jockey	4883	1	51.72
TCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1	-	chr3R	18585648	5'	+	P-element	73	1	29.85
GTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1	+	chr3L	22400255	5'	+	1360	18	1	63.89
AAGGGGGGCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCGAAACCAGCCACCTCCATTATTTCAAA:1	-	chr2L	16067190	5'	+	297	26	2	60.98
AGTTGTAAACTGTTTTTTTTTTCTACTTTCCGAATAATATTAAGTGATATTTATTTTAACTTGAAAGGAAATATTTTGAATCATTGAAATACTAAGGAATAAAATATAAAAAAAATTAT:1	+	chr2L	11747631	5'	+	transib4	2279	1	85.71
TCGCTACAAAGTTTGGGATCAACCTTTGCTTGTCCCCCCACGAGCCTTCCAAATTGCCTTGTACTTCAACTTTATCAATTATTCACAAAAACCTTTACCCTGAACTGAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTC:1	-	chr3L	9673186	5'	+	Doc	3	1	74.63
ACGGATCCGATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTT:1	-	chr2R	13084691	5'	-	roo	9053	2	64.55
GGAAGTGCCGGTGGAAGGCTGTCCTCTCCAGGGGCACTAGGCCAAGTTGTTCGAGTTTGGCGATGACGTCAGCAATCTCGCTGGGAGTGATCGGTTGCATCGGCAAGACCATTT:1	-	chr3L	23300723	5'	-	BS3	180	1	52.63
CGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAG:1	+	chr2L	12290643	5'	+	1731	19	2	67.20
AATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1	-	chr3R	31817554	5'	-	roo	9040	1	61.24
AGGACACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1	+	chr2R	9791540	5'	+	412	7076	2	70.55
GCAACAGCCGCCATAAAAGCCGCATTGCAAAATTTTTTAAAACCCGTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTATTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCCGTGCTGTT:1	+	chr3R	2470898	5'	+	Cr1a	231	1	62.79
ATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1	+	chr2L	13763163	5'	+	pogo	76	1	71.92
TCCAGCTGCATTGAATTACATTAAATTACCAGTTGGCAGATTACCTGCATCCAAATCCTAAACCACATATCCCCTTCTGAAAAGAAAGCCCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr3L	9999048	5'	-	roo	392	2	77.50
ATGTGGCACATATAAACTTCAGCCAAACCAGCAGCACAGCGGGTTGTCCCATTCAAGTGGCCATGGCTGTGCAATATCTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGAC:1	+	chr2R	17626806	5'	+	opus	128	2	70.49
CTGTTCTGCTTGACAAGCAGTGGCGGGGGCAATGTAGAGTAAACATATTGAAAA:1	+	chr3L	27428211	5'	+	17.6	6958	1	66.67
GGCGTTGCCGGCAAGAATCCCATCGAGCATGTCCACTCCCAGGGACGTGTGCTGGGCGATCGATCGGTGCTGTACAAGTACATCAACCCTAATTAAACCAAAATGCAGAGTGGATATTTT:1	-	chr3R	7904518	5'	-	17.6	105	2	77.50
TGCAATCGGGCCCAATTCGATTAACATTCATAAGAGCTTTGGGTAAGATATGCAAATCTTATTTCTTTTTATTCAATTTTATGAAAATATATTTAAAAAGGGTATTTGTTTAAGTTAATTCGTACATTTAAAAGGGCAAT:1	-	chr3L	17242282	5'	+	HB	298	1	75.00
ATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1	+	chr3R	26431966	5'	+	opus	39	4	56.67
AATTGCGGACGGAATCGGGATGCAGCAGCACGTGCCAGAGGTGTTCCAGCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGGTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1	+	chr2L	10022999	5'	+	Doc	48	1	53.51
AAATTGTTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chrX	5643595	5'	+	roo	42	2	55.48
GCAGATTCTGGGAATCGGTGCAGGAGATGAAGGCGCTGCCGCAGTCGGAGATCAAGGAGTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGC:1	-	chrX	16841409	5'	-	Doc	4530	1	56.19
ATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGAGACAGTT:1	+	chr2L	17295866	5'	+	Doc	72	1	67.74
AACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1	+	chr2L	17295861	5'	+	Doc	78	1	72.59
AATATTTATTTTTTTATATATTTCGTGTTCTGTTTCTTTTCTTTTTTTTCAAAATATGCTTTGGCTTGTACCACTACTCGGCTCCTCTTTTAGAGCTTATAATTCGTACAGTAAAAGGAAATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1	-	chr2L	15845732	5'	+	INE-1	13	1	71.92
AACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCAT:1	-	chr3R	13349134	5'	+	BS	5052	1	55.48
GAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATGTAAAT:1	-	chr3L	22437964	5'	+	roo	8712	2	53.68
GGTTCTTTACCCAAGAAAATGTATGTTTTAAACTTAGCTTAGAAACACTGAAAATCTCTGTTACCACCGGAAAGGTGTTGAAAAGTTATCAAAAACATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAA:1	-	chrX	10587724	5'	+	pogo	1652	1	75.00
TAGGTGGCGTTAGTGTGCAATCTCAAAAGCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTT:1	-	chr2R	9463542	5'	+	rover	6961	2	77.14
AGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3L	11393473	5'	+	roo	56	2	60.69
CGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	+	chr2R	9791568	5'	+	412	47	2	53.52
ATAAAAACGGTCGAGTTAGCAGGTAATGGAATGGGTATCCNTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1	-	chr3L	10773185	5'	+	412	15	2	71.20
AAGAATTAGAACAAAAAATAAGCGATCTTTCTCAACATAGTATTCAAATTTGCTGAAAATATGTATGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1	+	chr2L	9123340	5'	+	297	6615	2	55.81
TAATAAGAGCAAAAAAAAACATACTGAAATATTATTCCCATTTTGAAACAGCAAATCGCTGAACAGAATATTGGCAAGAAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACT:1	+	chr4	123913	5'	+	Tc1	1642	1	65.67
GATTGTATCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3L	11441708	5'	+	roo	8684	2	65.60
GATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chrX	6486833	5'	-	roo	9047	1	60.14
GCGCTTTTTTCTGCTCCAGCATGTGCAACAAAGTGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAATTGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTACATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chr3L	3263660	5'	-	accord	7032	2	77.59
AAACGGTGAAAAACCTTGCCAACAGAACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACG:1	+	chr2L	20808307	5'	+	HMS-Beagle	51	2	54.11
CAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1	-	chr3R	9922085	5'	-	blood	7344	2	51.80
ATTGCAAGTCATTGGGAGTCGGGCCATATCCAGAACACACGTCACTCTGTCTAGGATAAAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCTAATT:1	+	chr3L	6371777	5'	-	Bari1	338	1	57.55
ACTTTCCCGGGCGAAAAGTCGACTTCATCGCCTTAAAATTTCCCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1	-	chrX	6499083	5'	+	Quasimodo	30	2	58.90
AAATGCACATAAATTTAATGGGTTAGCATTTGGCTTGGACTTTAATCTCAGTCCTTTTCTTTCGATTCGACCTGAATCTGTAAAATATTTGTACTGTCGAACGGGAAATTGCACTATATTTTCCACTATTAAAAAAAATCAGGAAA:1	-	chr2L	14239937	5'	+	Porto1	4428	1	82.88
AAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGC:1	-	chr2L	19965035	5'	+	Doc	99	1	77.40
CATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1	-	chr2L	2703567	5'	+	hobo	63	1	73.08
CTTGACAATAACTCATTATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	-	chr3R	31817581	5'	-	roo	387	2	72.60
ATGAACATAGTTAATGAGCTAACATAGTTGTTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGAATGTGCCTATGCAATATTAAGAACCATGAAATAAAATAGTATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	13817742	5'	+	412	41	2	55.24
GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTCCTATCTACTCTACTACGCAAGTACTCGAATTGCTACCG:1	+	chr3L	23112571	5'	+	R1A1-element	5163	1	58.82
GTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGGATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1	-	chrX	10694550	5'	-	I-element	5324	1	50.00
AAATACATATAAAGCAACTGAAACACATCAGCGACGAGCCAAGCGGAAAACTGGTACGAGAAAAATCCAGTTGACATTTCACTGAAATGTGGCAATGTGGGAAAGCCGCCTAATTGAGGCAGTTGAAAATTGAAAAAAAAAATA:1	+	chr3L	18721612	5'	+	TART-C	11093	1	61.81
AACAGTGACTGAAACAACGGCGGATGCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	-	chr2R	21908014	5'	+	roo	8676	2	62.37
ATAAATATGGCCGCAGGCCTTCTTTTTATGCTGCGGCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGGATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCA:1	-	chr2R	10215759	5'	-	Quasimodo	7304	2	65.14
TAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr2R	14542253	5'	+	roo	8674	2	66.09
CCGATCTCAACGAGAAATTAGTAAAAACCAATCGGCAAAACGCCAATAAGGAGCTATCCACCACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTG:1	+	chr2L	18295432	5'	-	roo	8671	2	56.16
ATAAATTTTTGACTGCAGGCGAAAGTCAAAAACGTATATGCATATATGTGAGTATAGTGTAATGATGAACTCCGATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1	-	chr3L	22863473	5'	-	412	7479	2	63.01
GAATAGAATCAGACTCGGTCGGGTGTGAGTATTTTTATACGAAAATATTTCACAATTTTTTTCGCTTTATTTTGATCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAG:1	+	chr2R	6119486	5'	+	R1A1-element	205	1	56.39
CTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1	+	chr3R	15072540	5'	+	pogo	37	1	56.74
CTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	+	chrX	9539998	5'	+	roo	8710	2	53.10
ATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr2R	8585452	5'	-	roo	8999	2	74.81
TTTAACCGTTTTTATCAGCTGTTGGACACAAAGAAGGAAAAAGCGGACAAAGAAGAAACGTAGAGAGCGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGA:1	+	chr3R	19491503	5'	-	blood	7181	2	53.33
TATAAACTGTATTTATGTCTTTAAGTATGGCCAAAATGTAGCATACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCG:1	+	chrX	17054138	5'	+	jockey	10	1	78.62
CTAACTCATGGAGAAATGTTTGCGTTTATATAGGTAGATTGGTATAGCTTAAGAGCGAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACAATATAGCAAACGTCGAATAAAAAAAAAA:1	-	chr2R	693984	5'	+	Bica	328	1	54.55
AAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	+	chr2R	13585390	5'	+	412	7098	2	53.42
TTTGAATAACTTTCAGCAATTAACAAATTTTCAATTTGTTAAAGGGATTAACTGTAGCGTTTGCTCTTGAAATTTGTAAATTTACTTCTGTACTTGCAATACTTTATATAAAAAATATGGGGAAAAAATAAGACAAATTAATAAAA:1	+	chr3L	6621644	5'	-	Tc1-2	1370	1	79.45
ATTGGCATTCCATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	-	chr2L	11674466	5'	+	jockey	27	1	72.06
AGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1	-	chr2L	14892300	5'	+	transib2	56	1	63.91
GGTTATATAATAAATATGTTGACATTTTACTTCCAGATATTTTAAGAATTCATTTTATGGTGTTTTTTTATTGTTCATTTTGAGGAATTTTCGACCAGTGCTTGAATTTCTCCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGA:1	-	chrX	7399280	5'	+	F-element	4377	1	73.29
GTTAATGCCTAAACTTCAATTGTAAACGTGTTGCAATGCGAAACTTATTTTCCAGTAATGCATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGACACTGCTAATTTGTAAGAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATA:1	-	chr4	807570	5'	+	Tc1-2	1486	1	58.90
GTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGTTTGTTGAGCGG:1	-	chr2L	12483792	5'	+	P-element	69	1	25.00
AAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chrX	9540120	5'	-	roo	9019	2	54.48
AGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2R	19004229	5'	+	roo	8724	2	62.68
AAAGAAATAACAAATCACTTAAAGGCAACGCATATTTAAACGTGTTTGAGCTTAGGGAAATGTTCAAGATTCGGCGGAAAAAATTAAATTTCTTTTTTCGACGGTAAAATGCTTGCCGCGACCCATGACTAGAGAACTTTTGGTCT:1	+	chr2L	18122609	5'	-	Tc1	339	1	61.64
AAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr2R	25118759	5'	-	roo	8993	2	74.48
TGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTCCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCATAAC:1	-	chr3L	10574415	5'	+	Tabor	6863	2	58.90
ATATTTTATTTCCTCATTAACAAAGCACCAGATGCATTGGTGACAATTGCGTGCTCTTAACACATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCT:1	+	chr2L	15237159	5'	+	jockey	4887	1	53.33
GATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr3L	15600334	5'	-	roo	355	2	52.74
TCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	+	chr3L	11441715	5'	+	roo	8712	2	54.11
AAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGTTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAGTCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1	-	chrY	2720379	5'	+	297	6632	2	58.90
TGTTAACAAACTATACAGGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chr2R	7898043	5'	+	roo	8699	2	60.27
AATTGGCAAAACAAACAATAAAACGAAGAAAAATCAAAACAATTTTCAAAAATGTTTGTGGGCAATAGAGTGGGCGTAGCAAAAAGTTTTTTGGCAAAAAAATTGTTGTTATATTTTTTTGAGTCGAACTAATG:1	+	chr2R	9158093	5'	-	McClintock	400	2	71.64
GACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCANTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTGTCGGGCCCCG:1	+	chr3R	26431974	5'	+	opus	163	4	62.60
TAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1	+	chr3L	4840743	5'	+	jockey	4697	1	54.44
AAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTA:1	+	chr3R	9714373	5'	+	Stalker4	1	4	76.34
TCTCATTGTCTTGTACAATTTTGGAATATAATACAGAGTATTCTTGTTGCTGTATTTCATTTTTTTAATGAAAGGCTGATATATTAGCGAATTTAACTCTGTTAAGAGAGTTAAATCTAAGACACTAGAATAACAAGATGCCTAAC:1	+	chr2L	18824120	5'	+	1360	9	2	68.49
ATATGATTGATTGCCTGATGGTTATATGGATTTCTTGTTTTTAGATCTGATACTAACTGCTGCGCATTGCGTAACGTCCAACTCAAAACTGTAAGTAACTGCTCAAATCGATGAAAAAATCTTAAATGAATAAATGTTTATATTTT:1	+	chr2L	14768917	5'	+	Tc1	60	1	41.78
AGAAGGTCCAAGTCAAGAAGGAGGACATTGAACTGATTGTACGTATGCGAAACTACCAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1	-	chr3R	14035460	5'	-	1360	3343	1	58.73
GGTGGAGGTTTCGTACGTGGCTAATCCCGGCTAATATTGTATCATGAGGCGCAACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGCCACTCATGTTGCTG:1	+	chr2L	22209942	5'	-	flea	56	2	54.03
ACACATCGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1	-	chr2R	19499396	5'	+	P-element	52	1	40.77
GGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1	-	chr3L	25401034	5'	+	Doc	34	1	53.10
ACTTCGAGCTGTCTTTCGGCATTATTCTTACCCAACCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTTTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGG:1	-	chr2R	6486759	5'	-	Circe	7371	1	70.00
AGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1	-	chr2L	11661024	5'	+	F-element	44	1	42.74
TTTAAGCTGATTTGGCCTGAGAATATTTGTATTTAGCCTACCGTGATTAATATCAATCAACAGGCTTATAATGCCTGCTTGAATTTTTTCGCCTTCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAT:1	-	chr3R	19448937	5'	-	roo	39	2	65.75
GAACGTATAGCGAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr4	419956	5'	+	roo	60	2	63.01
GCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3R	22955980	5'	-	roo	8988	2	78.26
AGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGT:1	-	chr2R	2427617	5'	+	Doc	65	1	63.01
CGGATTGATGGATCGCAATCGCCCCTGATACTTTTTGAGATGATCGTCGCTGAGCTCGCGGCATTCCTCCAAGTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCC:1	-	chr2L	13817290	5'	-	R2-element	76	1	59.17
AGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATT:1	+	chr3R	9714349	5'	+	Stalker4	24	4	67.86
TTTTTAACTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1	-	chrX	13504246	5'	-	412	461	2	52.21
GACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1	-	chr2R	2016932	5'	-	1360	3356	1	42.42
ATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCGACTACTGTTTTATAGATGCAGTTCGGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAG:1	-	chr3R	19449441	5'	+	roo	8859	2	63.01
CGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	-	chrX	13066602	5'	+	jockey	12	1	69.00
TATTAGCAATTTTATATATTTTTCTCATAATATATATATTTAAATAGCATCATTATGCTGAAATAAAGAAAATGTTATTGGCTTGTCTTAATGGCAAGTGAAAATAGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1	-	chrX	21973970	5'	-	pogo	2100	1	73.88
TTTTTTTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATAGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATT:1	-	chr3R	23021015	5'	+	INE-1	570	1	47.26
ATGCCCAGCAACATTTGACTTATCAGCGTTCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCGTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1	+	chr3R	26431934	5'	+	opus	33	4	63.01
GAAACATATTGATGTTAAACTTAAAAGACTTCCTCATAACTTTAATAGTCAAAAAATGGGAAAAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	-	chr2L	12153287	5'	+	roo	49	2	53.96
GTAAGCTGCCTTTTGTTCGTCACGTTGGCGTCGCGAAAGTGCCAAAGTTTTTCATTGTAATACCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCAC:1	+	chr3L	11317874	5'	-	R1A1-element	5187	1	62.00
GTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATAAAGATGGAAACCGTAA:2	+	chr3L	24796711	5'	+	Cr1a	426	1	53.85
AGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTCCAAACACACAGTATAA:1	+	chr2R	6919686	5'	+	hobo	90	1	75.34
GTTAAGATAGTGGGTTATATTATAACCCTTTGTTAGCTCAAATCAACTAAGCTAAACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1	+	chr2R	19499265	5'	-	P-element	2866	1	69.86
CATTTTTATTAAATTAAGTTTTTAAGTTCTAGAAATTTCTGAATTAAAAGTTCAGTTTATTAATCCCAAATTTTGTCGATTTCGTTTTCATTGAAGGCACTTTCTTGCCATTAATTAAATTGGATCATTAATACTTTACTTATTTA:1	+	chr3L	11423049	5'	-	Tc1-2	74	1	83.56
GGCGGAACTACGGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCNATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1	+	chr2R	5248226	5'	+	1360	34	1	51.22
CCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr3R	7835217	5'	+	roo	8704	2	52.76
CCGTGTTATAACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1	-	chr3R	17478457	5'	+	copia	4927	2	65.15
TGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	-	chr3L	11531012	5'	-	roo	9044	1	65.75
ATTTTGAAATAAAATAAGTTCACTTTTCATAGATTACGAAAATTTTAGAAGATAAGTCAAATAATTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1	+	chr2R	9258352	5'	+	3S18	5771	2	78.77
GTGTAAATAATAATATTAATCATTTTAGAAAACAGTCAGAAGGAAGAGGTTCCTATTTTATAAAGTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTTCGTATGAACGTCGAGATCCC:1	-	chr4	958585	5'	+	INE-1	134	1	76.81
AGCCGACGACTCGGCTCCTTGAGCACACAAAAGGGAAGGGTTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGAAGCGTAAAGCCATACGATTTT:1	+	chr2L	14081273	5'	+	1360	22	1	62.59
TATTCGTCTCTTGAGTATCCTAGCAAAGCCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCGTACGATTTTTTGGCATACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1	-	chr2R	901984	5'	+	1360	64	1	75.93
TTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr3R	18339117	5'	-	roo	355	2	72.64
CTCGCACATGTTTCAGTTTGGCAATTATCTAAGGAAATCAAATCAAATCATTGATGCAGCTGTTACGCCATATATATATATAGTAGATAGATAGATGAGCACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1	+	chr3R	22217794	5'	-	hopper	1396	1	71.23
AGTTGACCAAAGAAAAACAAACAATAAATAAAGACGTAGGCTGCAGTGTCGACATGTTCCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCGTACATTGGTTTTGCACTATGCAGCTACTTTTTTAGTGACGGCCAAAAT:1	-	chr3R	801962	5'	-	1360	3327	1	70.55
TGGTTAGGAAAGGGTAAATTTCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCATG:1	-	chr2R	13637469	5'	-	accord	180	2	65.45
CACGAGGAATATTAATCCATCACCACTAATCAGCATCCAAAGCACTGATTAAATGGTAGTAGCGCGTGTTATCTGAAGAAATGCGGCTGCATTGAAATGGCGCTTCGATCGGCACAAACCATAACCG:1	-	chr3R	2785108	5'	-	Chimpo	378	1	74.80
AGTTAAATGTGAGCAATTTAAATGCTGTAGCAGCAGAAAATAACCATTATAATCTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGA:1	-	chrX	9539350	5'	+	roo	421	1	63.01
CATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCA:1	+	chr2L	13585806	5'	+	Tabor	6877	2	60.27
CAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTACATGGAATCACTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439051	5'	-	P-element	2495	1	60.87
AATCTGTAAATGCATTCGCCAGGTGGAAATTTACCCGAAATTTGAAGTCGAGACTTCGTGGCAACATGGGTCAATAAATTTGCGCTGCGTCTATGTCTCTAAAATCTGTATGCTTAATATCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTG:1	+	chr4	924834	5'	-	INE-1	155	1	60.27
GTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1	+	chr3R	23495665	5'	+	copia	78	2	74.45
CCCCCTTGCACCGCACCGATAAAACATTATCTTTCATCATAATAAACGGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1	-	chr3L	10848768	5'	-	blood	345	2	62.24
AATGGTTAATAACGTTAACGTTACGATCGAAAAGCACCATAGTTTTTTCAATGTGGATGTAGGGTTACTGAATGTGTGTTGCGACACGTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGCCGCCTCTGCAGCGGCGG:1	-	chrX	11702242	5'	-	Chouto	302	1	51.11
CAAAACAAAAGGGAAGGCGCTCCAAATCGAAATCTCCAAACGACCATGTTGTGCGGCAGGGTAAGTATACAAATAAATTAGCTATTATTAATATGACAGAAGTGTATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCCCTTTT:1	-	chr3L	8135930	5'	-	Gypsy6A_LTR	276	1	70.80
ATCTATCTCAATCATTGAATCACCGAGCATAGCGTGCTGTCTGCCCATCCAACATTTCCAGCTATCTGCAATGCTTTCCTAACCCCAATGCTATTGGTCACACATGAACACGAA:1	-	chr2L	3114607	5'	+	roo	8663	1	78.95
TCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1	+	chr3L	14603287	5'	+	jockey	67	1	67.50
GAGGGAAAAGCGGTTGCCTTATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1	-	chr3L	4605756	5'	+	pogo	24	1	69.18
GGAGGAGGAGGAGGAGGAGCAGGAGCAGGCTTCCCAGGAGGACACTCCCAAGGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1	-	chrX	10464890	5'	-	P-element	2872	1	47.29
AAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:2	+	chr2R	9632108	5'	+	roo	8736	2	68.75
TCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	+	chr3L	11393499	5'	+	roo	83	2	78.77
CGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	-	chrX	13066590	5'	+	jockey	70	1	60.00
AATAAGTATTTATAGAAGAAGGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	-	chr3R	16076883	5'	-	roo	398	1	63.64
AGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGAAAAGGCCGAATGAGT:1	-	chr2L	12290740	5'	-	1731	4542	1	72.60
CATCCAGCAACATTGGATCTTGGAATAATCGAAATTTACAAAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTACCTTTCTTAATGTAGTAATTTATAATTTATATTTC:1	-	chrX	14749724	5'	-	copia	252	1	60.27
ACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2R	21907910	5'	-	roo	9019	2	53.79
TGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGACCG:1	+	chr3R	11083881	5'	-	412	7533	2	63.92
CACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1	+	chr2R	5485108	5'	-	blood	7376	2	61.00
GTAAACTCCGATTGCCAGCCACATGGCTACACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCT:1	-	chr2R	9500109	5'	+	G5	4704	1	65.00
AATACTAATGATAGTATTAATAATATATTTCATACGGAAATGTGCTGTGCAACAAAGAATGCAAGCAATAACCTTTGCAGGTCCGTTGCCAGTACTATAAATATCAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCT:1	+	chr3R	19449813	5'	-	roo	310	2	75.86
AAAAAGAAGAAAAATTAATGAACTCGTAACTGTCGCTTTTGCAAATTGGGCTCTGAGAGTGTGGAGTGTCGGTGTGTCGGTCTATCTGTGCCAGAGGACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1	-	chr2R	20914008	5'	+	hobo	28	1	59.29
CGTTCAAACACCCGGATCCAGCGACCAGTGATGCCGCCGGCCTACTGGTAAATCCGTGTAATACCATCCGGCAAATGAGTAAGTAGACTGACGTGTCCGAAGAAAGCAAGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATT:1	-	chr3L	11480422	5'	-	roo	38	2	70.55
ATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1	-	chr3L	10574385	5'	+	Tabor	54	2	52.05
CAGGGTGTGGGCCAAACACTTTCCGCACTGAGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGC:1	-	chr2R	13006539	5'	+	3S18	5773	2	75.89
CAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1	+	chr2L	11732287	5'	+	Doc	59	1	61.24
ACCACCACTGCGATTCGTTTCGTTTCGAACTCGGATTCGGCTTTCGGGTTTCAGCTGCACGATATTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAACAAAGCTGAGATGTAAATTTGTATATTAGTTGCAT:1	+	chr3L	16411618	5'	-	roo	8613	1	56.16
AGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGG:1	+	chrX	6499893	5'	-	Quasimodo	212	2	71.00
AAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	-	chr2L	6863368	5'	+	pogo	65	1	72.31
CAGCAGCACAGCGGGTTGTCCCATTCAAGTGGCCATGGCTGTGCAATATCTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACC:1	+	chr2R	17626834	5'	+	opus	7136	2	58.59
TTTTAACTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1	-	chrX	13504245	5'	-	412	7480	2	63.70
AGCGGCGGATAACAACAGAGGCGAAAGGTGCAAATAATGCCAGGCACCAAAAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGCCTCACA:1	-	chr3L	917230	5'	+	hobo	22	1	69.18
TAATGCAAATAGCATAATGCCGCGATATATACGAGTCTTGAATATTTGCTCAGGTGCTCAAGGGAGGGGCAGATAAAATAATTTGTAAAAATTCGCGGCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGT:1	-	chr3L	7419125	5'	-	1360	3009	1	50.72
GCACGTGGCCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATATGTATGTGTGTGTATGAGCATGTCTATGTGTGTTTGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1	+	chrX	21009372	5'	-	pogo	2085	1	68.60
GTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	+	chrX	5643444	5'	-	roo	9041	1	63.70
TTCTGCTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1	+	chrX	7256104	5'	+	412	43	2	52.27
GATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	+	chr3L	12879728	5'	+	roo	8722	2	58.90
TGGAATGTCCTCAAGGCCATGTTATAGTTGTCCATGTGGTCAACAAATTTTCGATACGTCGAGCTTTCTTTCGGCATAATGGGATCTGGGACAAAAGTGGTTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTGTTA:1	-	chr2R	3998799	5'	-	G2	337	1	57.14
CAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTA:1	+	chr3L	7319826	5'	+	1360	345	1	76.30
AAAGTTTTTCATTTAATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	+	chr3R	28624535	5'	-	roo	9034	1	59.59
CGATTAAATTAGGAAAGTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	+	chr3R	7835076	5'	-	roo	386	2	67.81
AACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGGAAATG:1	+	chr2R	19004164	5'	-	roo	314	2	79.45
TATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTNGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGG:1	-	chr2R	5924417	5'	-	jockey	4726	1	39.64
GTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACAGCCATACGATTTTTTCGCACACA:1	+	chr2R	2016811	5'	+	1360	32	1	57.60
ATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	-	chr3R	20469666	5'	-	roo	8990	2	73.29
GCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCCGGGC:1	-	chr2R	6164610	5'	+	Tc1-2	28	1	51.20
ATAAACATCAACATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATGATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr3L	11393620	5'	-	roo	389	2	66.44
GAGAAAAAACACATCGTATATTTGTTGTTTTTGATCGAAAAGTGATTGTATCAATAATAGTTTTTACTTAATATTTAGTGCAAGGGTATTTAAGCGTCGGCTTGGCAAAGCGTAACGTCCAAATTCCACGAAATGAT:1	-	chr2R	8612245	5'	+	Doc4-element	2400	1	74.45
TTTCAATGTGTCAAAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	-	chr2R	9632191	5'	-	roo	9028	1	54.84
TGTTGCTTAAAATTCATTTGAGGTGTTGCAGATACTAGCAGCTTTTGTTATTATCGACTCAAATGTTTTTACAGAATTTTCAATATGGGGTGGCGAAATTATATTGAATCTTCTCTTGGTATATAGAGACTAACAATAAGTTTACA:1	-	chr2R	1191498	5'	-	Doc3-element	4674	2	52.05
GTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGT:1	-	chr2R	5924413	5'	-	jockey	4733	1	37.00
GGTGAAAGCGAACAAAATATTGAAATTTGTAATGAAAAGAATCAAACTATAAGTAACGTATTTCTCTTCTTTAAAGCCACTTCGCCTTCAATTTACACACTTTTTTTTTTCTAATTGAAACATTAAGATTATTAGTATTATTGTTA:1	+	chr3R	20305824	5'	-	mdg1	33	2	63.70
AATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGTGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATACACAATAATGTTC:1	+	chr3R	2169840	5'	+	gypsy11	105	2	61.54
CACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGTCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	-	chr3L	16343283	5'	-	roo	326	2	72.34
CTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTC:1	+	chr3R	9714378	5'	+	Stalker4	6997	4	51.56
CATGTAATTACGCGTGCCCGAAAATGAACAAAATTAACAAAAATATAAATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACATC:1	+	chr3R	17243075	5'	+	hopper	25	1	68.49
TTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCC:1	-	chr3R	934260	5'	-	Rt1b	4710	1	44.14
ATTTGAATATTCTAATTCAAAGTATACATGTTCTTATTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCA:1	+	chr3L	17945178	5'	-	Juan	4132	1	75.34
AAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGCAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAA:1	-	chr3L	5498507	5'	+	Doc2-element	249	1	39.26
GGCGTATTGATTTTAATTACACACACAGTAGGCTCTGGACCTATGTTGTTGACAAATACAAGTAGTTGACTGGGTTTGTTGTCTATTGTATTTGCTTATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGG:1	-	chr3L	23840541	5'	-	17.6	7057	2	80.92
ATCATATGTGCAACTCCCGGCACAGTTCACTTAACAAATGCTCAACTATGGCGCCCCATCAGAAACCGAGCTATATATAAGTACAGATATAGTACGGATGCGGGACTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAGCAGGCCTCAACG:1	-	chr3L	13154090	5'	-	mariner2	166	1	72.41
GAGCACCTCGCGGAGGTGCTGAAGATGCGTGTAAAAAATGCGCAAGCCTTTCTGACATGTTTATGGGGCCCTGTCCGTCATGAATTATGCCCCCTTATAGTTGTTATTATTGTTATT:1	+	chr3L	19664900	5'	-	mdg1	19	4	68.38
GGTAGATGTAGCATTTTTCCCCATCCGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1	-	chr2L	18419293	5'	+	412	2	2	76.09
AAAAAGATAGAACACTTTAATAGTTTGCTTGTCTTTTGTCAACAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr2R	23803079	5'	+	roo	16	2	75.56
CGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1	+	chr2R	977543	5'	+	F-element	61	1	64.71
TACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1	-	chr2R	2427624	5'	+	Doc	58	1	58.22
AATGATATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	+	chr3R	17420357	5'	+	roo	6	2	78.08
ATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAAT:1	-	chr3L	5102502	5'	+	BS	4736	1	65.75
CCGATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1	+	chr3L	3863453	5'	-	blood	335	2	63.46
ATTATAATTTATACACTAAAATCTTTTACTTGTAATCGAAAGTATAAGTATTCTCATGAATGTTTAACAGCAATACCAAATAATCATATACTAGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAA:1	-	chr2R	2311798	5'	+	hopper	380	1	68.49
AAAACGGGGGATGATATCAAATTGGAGTGGGTGATGAAAGGCGGTTGGCTGTGGGTATGGTGCACCTCAAGGTTGCGCCGCAAAATATCTTCACATTGTTTTTGCATTTAAGAACTATTTTTAAAGAATCTTAATA:1	-	chrX	5142599	5'	-	Tc1	1349	1	77.21
ATTCATCGCGATCAGTTGTGGAATATAATTTAATCTATTCTTTAATAAATCCAATTAAATGCTGCTAGTTATGAATTTTAATAGTAACAATGTTCCATGTTACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGGTTGGTTGGG:1	+	chr2R	23385661	5'	-	G2	112	1	61.64
CGGTTTTCAGACTGTTTTCACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chrX	8543442	5'	+	roo	8706	2	55.65
GATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTG:1	-	chr3L	2362407	5'	-	Stalker2	357	2	64.41
CTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAC:1	+	chr3R	16076771	5'	+	roo	46	2	55.07
ATTACAGTTTTTTTTATTGAAATTGTTTAGGTTTCACAATGATTTCACTGATTGATCGGGGGGTCACTATTTACTCTATGTGCCGGTATTCTTTGCAAGTTGTTCAGCTGAAATTATTTAATTTAATTGACTAGCGTACTATTACC:1	-	chr3L	25873832	5'	-	jockey2	3364	1	56.16
TATTTATGTATTTCGCGATTAGCATTAAGCTATATTATTTCTTATACGCATATCACGTCGGGGTCACCAATCAACTTTTTCATTAGCTTTTGTTTTTCACGTCTTTATTTTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATG:1	-	chr2R	1081254	5'	-	297	6851	2	65.03
ATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGT:1	-	chr2R	4774766	5'	-	baggins	5355	1	52.74
GAATTTGCAACCTATTAAATCATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTT:1	+	chrX	13704715	5'	-	invader4	313	2	74.66
GATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAGTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr3R	16076792	5'	+	roo	8739	2	70.55
AAACACTTTGTTTAAATTTGAAATTTTTTTTTATTTTAAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr2L	3886110	5'	+	roo	8674	2	71.54
AGCAAAAACTGAACGTGCAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATACAACAAAAACGTAATTG:1	+	chr2R	16950667	5'	+	jockey	57	1	53.73
CCGCCACGCAAACCCACCTCAACATCGACCTCTTTCCCGGCCGATCCCCCTCTCCCATTATCTTATATAGGTGCTATAGAGGTATTTTCTCGATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1	-	chr2R	16945397	5'	-	jockey	4985	1	65.83
AGAACAGTACAAGGGTAAGCAAAACCGAAATAATAACAGAAATAAATATAATAATAATAAAATAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCT:1	+	chr3L	26375986	5'	+	Doc	249	1	57.53
CACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1	+	chr2R	6086330	5'	+	pogo	32	1	65.66
GAAAGTGAAAGTTCGTGTAATACAATTAATAAACTGCCACTTGGAGAGCGTTAAACACACAAGACTAAATGGCATGTTGGTCAATCTGATTTGATTAACTTTAGGGTTCTGATCGTGAAGAAAAAAAGCTGTGCGTTTCTCTTGG:1	+	chr3R	14399283	5'	-	Idefix	7177	2	56.55
AAGGAATACAAATTTTGCTTATTTTCTTGTGTGCGAGTGGGTGTGCTTGTGTGCCGCACACAGAAAACTTTTTGCGCCTCCCAACCACACAGACACACACACACACACACAGCG:1	-	chr3L	17448440	5'	+	accord	258	2	78.95
GTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGACTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	-	chrX	13066584	5'	+	jockey	69	1	62.32
GCAGAGAGATCACCGGAGGAGTCAGCTGTGAAAACTGTACAATAAATCGACTTTAATTAGAATATCTGCTTTTCCTTGGTCGGGCAAACACAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAG:1	+	chr3R	1363283	5'	-	Doc	362	1	68.66
AAAAGTGGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1	+	chr2R	5485093	5'	-	blood	372	2	71.03
CTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chr3R	20469583	5'	+	roo	45	2	50.68
AACATGGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chr3R	20427521	5'	+	jockey	20	1	76.03
CGAAACTTTGCAACAAAATTGCATTTGAATGAGCAGCGGGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1	+	chrX	2295911	5'	-	Tirant	8455	2	67.80
GGCTGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTT:1	+	chr2R	5173421	5'	-	gypsy	7407	2	54.62
AATAAAATTATGAAAAAATATCCAAAAATTGTTCAAAAATGTGACGTTCATACAGGCGGACTGACATGACTAGATCGACTCGGCTATTGATTATATATAGTCGGAAACGCTTCCTTATGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTA:1	+	chrY	1803444	5'	-	INE-1	13	1	58.22
ATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTTTTCTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATCGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTACATTTATTT:1	-	chr2R	7586178	5'	-	I-element	5280	1	75.38
TATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGT:1	-	chr3R	22232288	5'	+	1360	458	1	56.16
CAGTTTAGCAAAGGTCATGCGGAAAGTAAAAGTTGACAGGCCCAGAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTTGATGGTGTGCACACCACACGTGTGTGGTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAAATTTTTCAAACA:1	-	chr3R	10546203	5'	+	hopper	1033	1	58.90
GCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTG:1	-	chr3L	8249125	5'	+	jockey	4551	1	52.78
ATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr3L	11530987	5'	-	roo	355	2	54.11
ATAATCAAAAGTCGAGCACACAAATGGAGATGGAGGACGAGTTCTACTGACCGGTCTGCTCCAGCCATGTGTACACGATTTATTTAACAATAAAAGTCTGGCTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTTTTGGAAATTTTCCACTCC:1	+	chr2R	23893070	5'	+	R1A1-element	154	1	68.97
ACTTGCAAGTTGAATTTCACGTAGTTCCTGATGAGGATATGGGTTTTGATTCGATTTTAGGAAGAACAATCTTAAACAGCGTGGATATGAAAGTAACCAAAGACACTTGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1	+	chr3R	2573622	5'	-	1360	3369	1	68.84
AATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1	-	chr3L	21855541	5'	+	blood	53	2	55.94
TCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1	-	chrX	10694539	5'	-	I-element	5306	1	61.79
GTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	+	chr2R	14542145	5'	-	roo	334	2	69.18
GGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1	-	chr2L	11661022	5'	+	F-element	43	1	42.98
CGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1	+	chr3R	9210648	5'	-	mdg1	336	2	75.86
AAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1	+	chr3R	13360295	5'	+	jockey	67	1	56.16
CAGTTTTCCTTATTATCTTTAAGCCTGCAAATACAGTGGTTACTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1	+	chr3L	6978104	5'	+	pogo	27	1	65.07
TCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1	+	chr2L	20840426	5'	-	Transpac	253	2	66.93
AGGATGAGCTGCAGGATGGAGGAGCAATCCTTCGGCCGGGTGACAATGCAGTGATTACATCTTTTGAGCATACATATAATATATACACACACATACGAAATTTGTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAA:1	-	chr2R	15892863	5'	+	1360	3116	1	68.38
CACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:3	-	chrX	23439053	5'	-	P-element	2495	1	62.86
AATTTAGTGAACATAAAAACATTTCATCTACGCCGAAATGCCAAAGGTGCAGTATTCCCTTAATGTATAGCCGTTGCTAGAGTAAAAGGGTATGCTAGATTATGTAGCAAGCAGAAGGAAGCG:1	-	chr3R	4129724	5'	+	INE-1	30	1	66.67
CAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATATTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAA:1	-	chr3L	12861794	5'	+	pogo	78	1	71.23
AATCTTTCCAGATGCAGAGAGCTTGTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTA:1	-	chr2R	5173571	5'	+	gypsy	16	2	70.55
TTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	+	chr2R	7898089	5'	+	roo	8738	2	71.94
ACAAATTCGTTGATGCTCCAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1	-	chr3R	20005154	5'	+	297	6605	2	69.18
GCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1	+	chr2R	16891830	5'	-	hopper	1352	1	58.90
AATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:1	-	chr3R	25454085	5'	+	Quasimodo	75	2	73.79
CCATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACNCACCCAGAGGCGCATGGGCGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chr2L	11674457	5'	+	jockey	20	1	73.33
TGGTATACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTAT:2	+	chr3R	13237272	5'	+	3S18	5809	2	55.48
CTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1	+	chr2L	13763148	5'	+	pogo	61	1	62.33
AGTGGCGCCTGGGAAATACGCATCTTGTATTTGGCACCGCACCACCTGGCTTCAGTCGGATCCTCCAACTTTAACTTTAAATCCCAAATGTACTTATTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTATTATTAAT:1	-	chrX	22824990	5'	+	gypsy12	9764	2	63.01
CGTGGCTTCAGACCAGCGAACCCGCAAAGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr3R	31817423	5'	+	roo	22	2	64.00
AACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1	+	chr3L	16015208	5'	+	1360	40	1	52.74
GGAAATGTTCTATATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr2L	16092029	5'	+	roo	8685	2	70.71
GCAGAACGAACAAGTCGAATGAGCGCGCTGCCTTAATGCGACTTGACAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCACTGGTGTGCCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1	-	chr3L	13574545	5'	+	hobo	28	1	61.07
GCGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTCAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	-	chr2R	19004216	5'	+	roo	8735	2	70.00
AGTTTGGGATCAACCTTTGCTTGTCCCCCCATGAGCCTTCCAAATTGCCTTGTACTTCAACTTTATCAATTATTCACAAAAACCTTTACCCTGACTTGAAATGCAGTCGTCATTTCACAGTCTTCGGGT:1	-	chr3L	9673177	5'	+	Doc	7	1	68.99
GACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	19968121	5'	-	roo	323	2	77.40
GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTG:1	+	chr3R	17660024	5'	-	micropia	381	2	68.49
CGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTC:1	-	chr3L	17558055	5'	+	jockey	4720	1	73.12
AATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1	+	chr3L	10574289	5'	-	Tabor	418	2	60.96
AAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGAATCGCATCTTA:1	-	chr3R	22844260	5'	-	roo	8987	2	75.34
CCTACCAAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chr2L	15833436	5'	+	jockey	12	1	73.74
GGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTCCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1	+	chr2L	12892647	5'	+	roo	8755	2	81.82
CTCCCTCCACACACACACACATGCGCTTGGGCTTTTACGCCCATCACTTCGCACTGCGTGGCATGCCCCTTTCACCACCCTCATGACCTCCCTCA:1	-	chr3L	22917707	5'	+	jockey	4761	1	74.74
GTGGCCCAGATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCG:1	-	chr3L	2362415	5'	-	Stalker2	7609	2	59.02
GAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:1	-	chr2R	20194289	5'	+	Max-element	8284	2	57.72
ATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCTGAGCTCAGAACCTCTGCTCT:1	-	chr2R	5173216	5'	-	Stalker	7209	4	55.38
GTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1	+	chr2R	2016864	5'	-	1360	3384	2	75.56
CGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGTATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1	+	chr3L	27415192	5'	-	transib2	2785	1	58.90
ACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGCTACGTAACGGC:1	-	chr3R	1446144	5'	-	1360	3377	1	27.40
ATGCGCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr3L	233247	5'	+	roo	75	2	70.55
TAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTCA:1	-	chr3L	11441807	5'	-	roo	8987	2	76.03
ACTAGGTGCTCCATTCTAGACACCAGCTTCTTTTTTACCCCGTAGTTGTCGCTAATAAATGGCGTTAGGTCGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTTGACCCTCTGG:1	+	chr2R	4783085	5'	-	Quasimodo	7067	2	49.65
ATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTA:1	+	chrX	13066507	5'	-	jockey	4929	1	62.76
AAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGC:1	-	chr3L	11957199	5'	-	blood	296	2	74.66
TTTTAAAAAATGTTTTGATTTACTTTGTTTTATTGTTTGTCTTGCCAAAATCCATCGGTATGCTAAAATCACTGTGGGCATCCTTACACCTTAAAAACGACTAAAAAAGGTTTGCGTTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAACGGG:1	-	chr3L	22707433	5'	+	INE-1	537	1	34.72
ATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1	+	chr2L	7945312	5'	-	roo	9039	1	56.20
ACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1	-	chr3R	22276769	5'	+	jockey	88	1	58.33
AGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1	+	chrX	6499826	5'	-	Quasimodo	235	2	65.75
ATATGATGGATTACGCACACCCCCCCAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCAG:1	+	chrX	13537731	5'	+	HMS-Beagle2	6886	2	60.27
AGTGTTAGAAAAATACAATTAAAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCACTATTATGAACAATTA:1	-	chr2R	15064487	5'	+	412	14	2	73.97
GAAGTGGAGAAGGTAACAACAATGACGATGACGAAAAAGTGGAAAACGAAATTGAGACAGCTGTTCCCTGCTCCCGACTTAGGTGTTGCTTCTCGATGCGGTGTCCCATAGGTGCCATAGGTCCATATGGGTTTC:1	+	chr3R	958251	5'	-	Doc3-element	4311	1	65.19
AAGGTCTAAACTATAATACATTTTTCTGGCTAAAACTTTCATTTTTTCGAGTGAATGCAATTAAACGTTTATTAATTACAGAGCTATATAGAATTTTCCCCACTTTATTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTT:1	+	chr2L	18624960	5'	-	invader1	376	2	71.23
GGAACAAGAACAAGAAAAAGAACCGTAGTTAACACATAGAACAGATCTATTGAACCGATACCAAACCGATTCCTTTAGTTTTCAACCGACAAAGATCTTGATGAGGACAGCCAGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAG:1	+	chrX	7677998	5'	+	R2-element	3443	1	77.40
GCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGA:1	-	chr2L	6623035	5'	+	Burdock	6200	2	63.01
TATCTGTATAGGTATGAGCGACATTTCGTGACCAGAAGTTGACATTTTGAAAGCCAACTGGAGCGCGATTCTTTGGCATTTTCAAATATTCATATTTAACAATTTTTTAAAGAAATGATGTAAAA:1	+	chr3L	6998701	5'	-	Stalker4	6929	2	67.20
ATAAATGGAAACTGTGAAGCCTTTTGCATACCAACGATATCATTTCCTTCGCTCCATTCAGCCACGCACACGGACACATTTACAGATAGAGAAACATCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTATAATCTCTAC:1	+	chr2R	22264132	5'	-	R1A1-element	5108	1	70.59
AACATTTCTAGATTTTTTAATCTCCAGAGATTATTTTAATATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1	-	chr2R	9221132	5'	-	opus	7500	2	78.64
ACTATTAGTATATGATAGAAGAAGAAATGGTATTTAATTTAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTCGAGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1	+	chr2L	13053712	5'	+	BS	5025	1	61.64
AAAAGACATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTCATAATTTATATTTCCTTTCTTAGTAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1	+	chr3L	23818347	5'	-	copia	214	2	64.38
AGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1	+	chr2L	9399451	5'	+	Transpac	4977	2	64.18
GGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTCGTTAATATAAACAAT:1	-	chr2L	22121652	5'	+	gtwin	44	2	42.47
GTTCATACTTATGCATATGTAAAGTTCGCAATAATCAATCAAAATGTGCTCCTAAATCGTTTGCCCACCCTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCTTTCAAATTAGTTTTTTTCGTTTGTCCACTCTTAAAAATAAATAA:1	-	chr2R	10799049	5'	+	FB	750	3	60.69
AATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1	-	chr2R	11164542	5'	+	roo	8688	2	69.18
CAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGG:1	-	chr2R	19947143	5'	-	INE-1	127	1	71.54
TTTTGATTATCTTTTGAGCCTTTGCTCAGTCTGCTTCCTACATATTATATTATAACTCTAATTTTGGCTGCACGTTTTCCAAGCTAATTTATTAGAATCTACCTTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1	-	chr3R	16340263	5'	+	roo	85	2	71.92
GCCTTATTTTTGGGACTCTCGTATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1	+	chr2L	4412535	5'	+	Quasimodo	30	2	56.83
CCGTACTACTTGTTGAACCTATCACATGGCGACCGTGACAGGACCATTGCAGGACGCACACGAAGTGTTTAAAGTATTGTGCTAATAATTAAAGGTTGGGGGAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGC:1	-	chr3L	24104300	5'	+	Idefix	17	2	66.67
CCATTGTTTCCGCATTCGATTAAAAATGATAAATGCCTCGCTGCGCTCAAGTGAAAACAGCACGGGGAAGAAAAAAATATATAAGTATATACATATATATATATAAGTTAACGCAAGTCACACTTGCATCAGTGTTCTCGGCACTC:1	-	chr3R	26432104	5'	-	opus	478	2	69.18
GTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chrX	17526809	5'	+	roo	19	2	55.38
GATTGCAAGGTACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	-	chr3L	20654588	5'	-	roo	9028	1	54.86
GAGAAAAAAAGGCATATGAAAACCCGAAATAGAACTGGTTTTGAAATGCAAAAAGCCACCCACACGATGATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCT:1	-	chr2R	13992200	5'	-	Idefix	395	2	54.11
CCGACATTTAATACGAGGAAGTAAAACAAGGTAACTGGCACACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGCATGCGTATAAAAGAGCTTTTCGCTGTAGAGCTCTCCACTCTCTCGTTCTTTAACAAAAA:1	+	chr3L	25843204	5'	-	1360	98	1	76.80
CTACAAAGCTTAAGCAGCTGAGAAGAGCAGTGGAATTATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAACAAAGTTAA:1	+	chr2L	17946322	5'	-	Cr1a	4271	1	78.08
ATTTTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chrX	9539993	5'	+	roo	42	2	54.79
GGCGGGAATCGTTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	24218511	5'	+	412	7095	2	52.52
TATTTTCTTTAGACGGCCAGCTAAATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTAT:1	+	chr3L	10647863	5'	-	412	7530	2	60.69
TAAACACGAGTCGCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATAT:1	-	chr2L	3886258	5'	-	roo	360	2	52.05
GAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	+	chr2R	9328611	5'	+	roo	46	2	63.48
CTATTGTTGGGCAGCAAGTCTGGGCACACTGCAACTTTGCGAATAGCAAAATCGCGAAACGCAAAAAATTATATTACTCCCATAACATGCTATCTACTGCCTTTGAGGCAATAAACACACACTCCAGCCGGTACCAGGACAGACTA:1	-	chrX	8142244	5'	+	BS3	1480	1	58.22
TTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr2L	17420249	5'	+	roo	8722	2	61.43
GAAGCGACCCAGTTTGACATCGCCTTCAGTGCAAGAATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1	+	chr2R	14542078	5'	-	roo	402	1	76.71
CTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	+	chr3R	19968118	5'	-	roo	8990	2	75.34
TTTTTTACACACTCGCACACTCAACAAAAATATAGGCACATTTCAGATGTAAAGACAAACGGAATTAGGTCAAAACACAAAAAAAAAAA:1	-	chrX	21283839	5'	-	Tc3	90	1	92.13
ATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1	-	chr3R	20427465	5'	+	jockey	77	1	65.75
TTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr3L	20831291	5'	-	roo	351	2	68.75
GAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr2L	5254347	5'	+	roo	21	2	59.76
AGTTGTGCCAAAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGCGCAATGCTTG:1	-	chr2R	16373563	5'	+	Max-element	8270	2	53.39
TTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1	+	chr2L	13763146	5'	+	pogo	27	1	57.89
GCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	+	chrX	17526829	5'	+	roo	8719	2	58.22
CAGTGAAGATCCGCAATAAAGCATCAGCTATGTTAGTCTATTCGTTTTTTATATTTCATAGATTTTTTAAGCCAGTTATTTCTAAGTACGGAAAGTAGCCAGTAGAAAGATCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCT:1	+	chrX	11204417	5'	+	roo	8948	2	46.85
GGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1	-	chr2R	5031013	5'	+	Doc	84	1	76.69
TGGGGAAATAATGACTAATTGGTTAGTATTTTACTAAAGCAATTGCTCTGATTCTGACGCCTGAAAGTATGCAGAGAAATCCAACCTTTTGTTAAGACTTTAAGCCTTGTAGTAAATTGATTTTGCCGCATGGGTAACAGTG:1	+	chr2R	18687692	5'	+	jockey	4960	1	43.66
TTTTTAAGCAGAGAAAAATCAGTTAAAATTCTACCAAATCGTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1	-	chrX	10694590	5'	-	I-element	5334	1	56.85
AGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3L	11393473	5'	+	roo	8718	2	60.14
AAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTCTTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1	+	chrX	5629094	5'	-	jockey	4970	1	62.90
TTTTTGTATTTTTCGATTTTCAGGTAGAAGGCAAACAATGTTAAGCCAACCGCAAAGTCAGAGGAATTTATTTGTATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1	+	chrX	8814709	5'	+	pogo	40	1	49.32
GGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1	+	chr3R	15072545	5'	+	pogo	47	1	52.74
TAGAATTTTATCGTCGGTTCTTGCCGTACAATATGGCGCAATGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATGAGGCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGAC:1	-	chr3R	19449555	5'	+	roo	8847	2	69.78
AGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1	+	chr2R	2016810	5'	+	1360	51	1	52.41
CGGCACGCGAACGTAAGTCCTTCGGGGTCCTTGGGGCTCTTGGTGTTCAGGGTAGTCCTTGGTAGGACTTGGGCAATCAAAGTTTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1	+	chr2R	13817598	5'	-	412	490	2	78.07
AGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr3L	20831293	5'	-	roo	8995	2	73.97
AGCTATTTTGAAGCAAAAATCTGGGCAGCTTAGCTAGATAGTTGAGATTAGACATGAAGATTGCGCAAGTTTGTTTCTATATATTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAACCG:1	+	chrX	21306947	5'	+	INE-1	220	1	74.56
ACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2L	14081299	5'	+	1360	55	1	56.16
GTTCCGGTTCAGATTGCATGAGAAACGGGTTGGCCGCTGCATCGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCCCACATTAACAACTGGTATGACTC:1	+	chrX	22992590	5'	-	transib2	2678	1	53.26
GTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1	+	chr3R	16076807	5'	+	roo	90	2	80.82
AATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chrX	6486828	5'	-	roo	9046	1	58.21
TCTACTNTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3R	25448433	5'	+	roo	8724	2	63.12
GTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	+	chrX	10640011	5'	-	roo	9039	1	51.67
ATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	-	chr2R	9632171	5'	-	roo	347	2	70.25
CAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCA:1	-	chrX	22643307	5'	+	Tc1	1639	1	65.97
TGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTG:1	-	chr3L	19036055	5'	+	Tirant	56	2	71.43
TGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTCATT:1	+	chr3R	21705970	5'	+	297	52	2	53.42
ACTATTCAAAATTTGTAAATAATTTTCCACAGATAATGAGCCCGTTGTATAAAATATAGCAAAAAGATGTAAAATTTCAATGCTCCGATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCA:1	-	chr2R	3649456	5'	-	Stalker4	203	4	61.64
AAGTGAGAGTATGCGCTATTCGCATATCACTCGCATTCGCTTTCGCACTCGTCTCTCTAGTTTTATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTG:1	-	chrX	18386473	5'	+	invader4	2810	2	57.45
AAACCTAAGACGGTTCAAATATACTTCGGTTTTACGTTTAAGAAACTGTATCTTATCAGAAACAGATGAAAGGGTAGGCACATCAGCAAAAAAGCCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGAATATTTTGCCAAATATACAATG:1	+	chr3L	27291505	5'	-	1360	201	1	60.28
ACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr2L	14772047	5'	-	roo	331	2	69.18
AAAGCAGCAGAAACAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr2R	9632060	5'	+	roo	8679	2	71.85
GGTCATTGGAGTATTGCAAACGCTGGTTCGTCCAATGAACTGCGGATAGGAATCGGTTTCGTCGAAATTTATTGATGCAATGCCAGACTCCGCTGATCTAGAATATATGTACTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAA:1	-	chr2R	17688496	5'	-	INE-1	17	1	63.89
ATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATT:1	+	chrX	13704782	5'	-	invader4	298	2	65.96
AGCGAAAGAGGTTGGAAGAAATTGAATTTCTTTTGCACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACGCTACGTCCACC:1	-	chr2L	1665078	5'	-	hobo	2921	1	67.50
AGAATATATATATATACATTTCTAATGAGTTTAAACAGCCGAGACGATTATAGTATTCCTTTCTCTACGCCAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGTGATAGTCGGGGAACTCGACTATA:1	+	chr3R	18030717	5'	+	INE-1	565	1	69.18
GGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGACATTTT:1	+	chr3R	25826658	5'	-	mdg1	7413	2	49.28
GGTTGCACATGCGAGTGACACACAATGACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1	+	chr3L	3799774	5'	+	copia	4929	2	57.64
AAGTAGCTTAATGACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAAACTAGCAAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGATACCATGA:1	-	chrX	17262569	5'	+	X-element	4402	1	53.98
GTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATAC:1	-	chrX	21667968	5'	+	gypsy2	6526	2	64.38
CCATAGCTGACAGCAACTGTCTGTCAATTGAAATTTGACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTAT:2	-	chr3R	25423337	5'	-	3S18	6082	2	67.81
GCTATTTTTGGGCATTTCAGTAGCAGGACCACATTGCTCCATTGTTTGCGGACAAATCCGCACAAAAACGTAAAGTAACGAAATGAAACTGAGAGCGTAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGT:1	+	chr3L	8033658	5'	-	1360	3256	1	61.76
CGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1	+	chr2L	14081323	5'	+	1360	56	1	67.48
CAAAGGGAATGAAAAGCAGTGGTTATATTAGGGGGGAGTCCGAATGGATTTAAC:1	+	chr3L	4252074	5'	+	Circe	7176	1	85.19
GACCACCGCCTCCTCCCTCCTGATCACCAGGTAATCCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAAAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCAT:1	+	chr3L	20162397	5'	-	copia	4931	2	74.66
GACGCTTATCAAAATGCCTGACAAGGTACACATGTCGAACAACATGGTGAAAATATAGTGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGC:1	-	chr2L	13582932	5'	+	pogo	482	1	61.64
AGTACTATCTGTTTACTATACCAGCCTATCCAGTATTTATGTATGAGTATTATTTACTTAAACATACATCTAATAGAAGTACTTAAATTAAAAATAATATATGAATACACTAGGTTCCTACATGATAAAAATAAATAGA:1	-	chr3L	4168310	5'	+	mariner2	824	1	72.66
GTGCAATTAGATGGTGAGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1	+	chr3R	30344599	5'	-	pogo	2070	1	58.46
CATCTTCGTACGCATAACAAAAATACTTGCGCAAACTTTTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1	-	chr3L	17205339	5'	+	hobo	14	1	77.40
TAGCAAGCCCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATACTTGGAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1	-	chr2L	13585942	5'	-	Tabor	7297	2	60.48
TTCAGGTGCTTCATAAACCGAAAATTGAGACTATTATTATCTTCAAATTTGGTTCAACTATTATTTACTTCACTTTATTCACACATTTAAGAGCTAAAGATGTACTTATGCACGCAGACGATGTTTAATT:1	-	chrX	18440817	5'	+	Q-element	575	2	76.15
AAAACCTAGATAAGATAAACGAAATAAGTACAGCATTACTCACCGAAAGTCACTGCGATGTGTGCACATATGTATGTAAGTTAAGAACCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1	+	chr2R	9544006	5'	+	opus	34	4	62.88
TAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	-	chrX	13066587	5'	+	jockey	74	1	62.33
GTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAACATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr2R	20596473	5'	-	roo	9009	2	66.41
TTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1	-	chr3L	10841535	5'	-	mdg1	332	2	78.08
TATTTTAACAGCGAATCTTATATGTTTGAAGTATTTATAATCTAATGGTGTCCTTAGGAACAAATGAAAATCTTAGTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACA:1	+	chr2R	11147616	5'	+	invader4	2850	2	52.78
AAATAATTAAAAATAACCGTTTTTCCGGCACAACAACAGGACTTGCCTTCAGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTT:1	+	chrX	10796198	5'	-	Doc3-element	4545	1	74.68
CCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTGCTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATCGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	+	chr2R	13585401	5'	+	412	40	2	50.77
GAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1	-	chr3R	22844283	5'	-	roo	402	1	69.23
CTAAGCTAGTTCGTGTTGAATTTTAAAAGAATTTATTTGTCCCGTTTTCGGGAAATTCCTGCTTCTTAGTAGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTT:1	-	chr3L	26309577	5'	-	mdg3	5119	1	65.05
ACAGCAAGAAATAGAATACTAGAATAATGGCTTGTTTACTTAAAGCAAAATTGCTTAATAATTTTAGTAAATGGGTAGACTATTGTAGTTAAATTAGGTAACATAAACATATGGATAACTTCATTTTTGATTTAACAA:1	-	chr4	800492	5'	-	Tc1-2	1479	1	73.19
AAGCGAAGAACCGCGCGTCCTGGAGAATGGTGGCCTGGCAGTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATAGAAGGCAAGGGAACCTGTACTAGTGG:1	-	chrX	21175386	5'	-	Gypsy12A_LTR	2228	1	87.23
GGTGCAGCGTTCTATGCTTTGTCATTAACACAAACACGCACACTCGCACACCCGCTCACGCACACAGAGGCAGTCGCACCAACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1	-	chr2R	21572220	5'	-	hopper	1385	1	59.29
GCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCCTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr3R	18339158	5'	+	roo	89	2	82.19
AAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1	+	chr2R	9091852	5'	-	1360	3316	1	74.07
AGAGCATAATTTTTGGGATAAACACCAAGTACAACATGCATACAAGCTAGCTAAAACACATGTTTGCACTGAAAAAAAAAACAACTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGC:1	-	chr3L	18570288	5'	-	R1A1-element	332	1	60.47
TTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:1	+	chr3L	24213781	5'	-	invader2	180	2	68.89
GTCTAATTGCAAACCAACAAAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1	-	chr2R	19540481	5'	-	jockey	4953	1	53.42
TGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	-	chr2R	11164485	5'	+	roo	63	2	74.22
ACATGGAAAGAGGAAAATTCGGCCGGGGAAAGGAGTCCTGTTACGTTGTTCTGAAGGTAAAGAAAGGAGCAACCTTTTTGTTTTTGGCAGCCAATCTTCACTGGCTTATTAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTGCAATACAAAGT:1	+	chr3L	15396722	5'	+	Doc2-element	4310	1	60.69
GGGTCGTAGCTTATGGGAATTGAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	-	chr3R	19968221	5'	+	roo	8676	2	71.67
ACCAAATCTTACACCATTTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTA:1	-	chr3L	19014004	5'	+	invader3	5254	2	63.70
CAAATGGCGAACTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	+	chr2R	15004723	5'	+	jockey	9	1	44.52
TCTTTTTATGTTCGCAGAATAATTTATGCATTTGTTTTTATGCGAAAATAGGTGAGTGGATTTGGCTTGTCAAGCGGAATTTGTACTCTGTTGAATATTCGGATCCCACTAACAAACAAAAAAATTTTTCTATTATTTTTTCTTTT:1	+	chr3R	19971905	5'	+	Tc3	79	1	52.74
ATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1	+	chr3R	25826653	5'	-	mdg1	7410	2	50.00
CCGGGCTGCCAGTCTGCCAGTCAGTCAAGCCAAGTCAAGTGCATTAAAGCCTCTTGGACAGCTGCATTTCCAAACAGTTGGACAGCCTTTGCAACACAACGAACGTCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATC:1	-	chr2L	12331747	5'	-	hopper	461	1	67.81
GCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGTGG:1	-	chrX	1899684	5'	+	P-element	84	1	24.46
TACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTAT:1	-	chrX	21014849	5'	-	copia	186	2	66.44
GACCTTATTTTCTTGCTAATGATTTTAGAGCCCAATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1	+	chr3R	25826616	5'	-	mdg1	410	2	75.86
GAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGCAGCACTTTTGCAAC:1	-	chr3L	10574379	5'	+	Tabor	58	2	54.17
TAACAGTGTATACACTTCCTTAAGTTAACATTTTAAAATATGGATCCATTTTATAATAGATAACCAAATTCCAAGAAGTACTCACAATCTCAACATCTCCTAGCGATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCG:1	-	chr3R	19449033	5'	-	roo	8744	2	56.55
CCTAACACGAATTTGCAATTACTTGTAATCTGGATTAGAAGGCCATATGCTCCTTATGTGCTTAGTATTAGAATTAGAAGTTATACTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGC:1	+	chr2R	9325374	5'	+	BS	5030	1	50.00
AAGCGCTGCAATTTCCGCTCAAGTTAGTAGAGCGACTGCTTCCGCTACGCAGCTGCCAGTGCATGGCATATTATTTAGTATGTTATATGTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCA:1	-	chr3R	12951005	5'	+	jockey	4743	1	63.87
CGTTCTCCCCTGCCAAAGGAGAAGCCAGTCAGTCCGCCCAGCTTGCCTAGGAGTCCCAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTCCCCCCCC:1	-	chr2L	11437090	5'	-	invader1	142	2	61.64
TTGGCAATTGTTCGAACTGAAACAATACCTAGAAGGGTACTATTTTGCGGTAGTGACGGATCACATGACTATACAAGACCATAATGACATACGGGAAAAACACCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTT:1	-	chr2R	4525980	5'	+	baggins	5139	1	52.05
ATGAAATGATTAATCATGTAAACAAAACTTGGCTAGCTTATACATTTACGCCCAACTTTCCTGGCCCCTCACGAATCTCAAAAACTTCAAAGGGCCAAACAAACATATAATTAATAACAAAAGCTAAGAGGCCAAAAATCAAAAAA:1	-	chr2R	21884899	5'	+	Transib5	14	1	78.77
AGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTCGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATAGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	+	chr3R	17420383	5'	+	roo	8675	2	68.00
CGTTATTTCGGTGCAACCTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1	-	chr3L	1534584	5'	+	pogo	47	1	80.65
AAGAACCTGATAAAAACCAATGAAGCAATGCATCTGATTTGTTGTAGCGACCAATGAAATGACTACGGGGAAAGTGAAAGAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAAACAATTCGACAGACTAT:1	+	chr2L	20264553	5'	-	Ivk	5202	1	59.70
TTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCTGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1	-	chr3L	17205301	5'	+	hobo	52	1	52.05
TATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAG:1	-	chr2R	21298824	5'	+	jockey	248	1	50.48
CAAACGATATTTTAAGGCCGCTTTGTAAATGCGCAAATTTTGTAACAAATAAAACAAAATGACGGAAGTAGCGATGCGTGGCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTCAACTAT:1	+	chr3L	12308291	5'	+	hopper	34	1	58.45
GAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGCTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1	-	chr2L	15991410	5'	-	mdg1	375	2	51.82
ATTGTGGTATTTTCTTATATAGAACATTTTGTTCCTTTCCATTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTACTCTACCCTAAGAATACAATAGATGAT:1	+	chr2R	5173087	5'	+	Stalker	23	4	67.14
AATAGCTCAATGCGGTCATTGGTCCCTCTCGCACACTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTTCATTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1	+	chr3R	18585568	5'	-	P-element	2831	1	48.97
CATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACG:1	-	chr3R	25423276	5'	-	3S18	6032	2	72.79
TAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTAC:1	+	chr2L	17081801	5'	-	jockey	4912	1	73.97
GCGGCAGCAGGTGCAGGGAAACGTCGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	+	chrX	5274264	5'	+	roo	8689	2	65.93
TTAAAGAACTTTATTTCTTATGGCTTTTCCTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1	+	chr3R	28076940	5'	+	jockey	4829	1	78.08
TAAGTTCTTTCTTCATTCGCCAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGCTTT:1	+	chr2R	9260238	5'	+	3S18	329	2	68.92
GAGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAATTGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTGCTGGCTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTG:1	-	chr3L	24796712	5'	-	gypsy4	460	1	56.84
GTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTTGTTA:1	-	chr2R	19540441	5'	-	jockey	4913	1	73.29
CAAGTCTTCTTATAATCCTTTTGCTAATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1	+	chrX	13066466	5'	-	jockey	4975	1	68.57
ATGCTGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3L	11531016	5'	-	roo	396	1	74.07
GCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGGTGGGAGGGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAACTCCT:1	+	chr3R	2833315	5'	-	ZAM	7960	1	68.66
CATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCG:1	-	chr2L	20117941	5'	+	invader4	2826	2	69.86
AATTGTNTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGAATGGGA:1	+	chr2R	4887636	5'	+	jockey2	3024	1	67.81
TATTTATTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTTCGGCGTGTGAAAA:1	-	chr3L	5125982	5'	+	1360	421	1	82.19
ATAAACACAATCTGCCTGACTTCGGAAATCTGCGCTATCAACCATTGCAAACGTGTGTTAAAGTCATTTTCTTATCATTTTTCTAAAAATAAATGTAAATT:1	+	chr3L	12260284	5'	+	looper1	1806	1	71.29
CCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chr3L	20654545	5'	-	roo	8984	2	78.62
AAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1	+	chrX	5629094	5'	-	jockey	4948	1	53.42
ACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCCGCAGAGG:1	-	chr3R	11547803	5'	+	G2	290	1	69.11
CTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	+	chr2R	15004749	5'	+	jockey	9	1	54.17
AAACTTTTCATCTTTTATTATTAATTTTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1	-	chr2R	18325599	5'	+	I-element	53	1	70.37
GAAGGGCCGAAGAGGAAGCCAAAAAAGGGCCTGAAGAAGATCTTTGCGAATTAAAGAGACAGTGCGCAAAGATGGCCAAGGAAGCGAGAAAGACTTTAACTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAGAATCTTAGACTGCC:1	+	chr3R	7063251	5'	-	baggins	5045	1	66.91
CCCTAATCTTGAGTCAAGGCTTCACTCTTATCTTGAAAGCTTTGGGCGCTTACATTTAACTCTGCAGATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGC:1	+	chr2R	4601507	5'	-	HMS-Beagle2	287	2	68.49
GACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1	-	chr2R	2016932	5'	-	1360	3355	1	42.86
AATATAATAAATTTTAAACGGATAACATTTTTTAAAAATGTTGACATTTTGAACTCCCATTTCTTTGGCATTTAGTCTCTCTGTGTATACACACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1	+	chr3L	7188500	5'	+	hobo	2708	1	75.00
ACTATTTCGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATGAG:1	-	chrX	2444435	5'	-	roo	335	2	69.01
ATGAGAGAAATAAAACGGAAAGAATGAAGTCAACTTGTAACGTAATGAAATAATGGTCTAGTCTTTCATTATTAATGGATCGTCACCGAAACATCAACATGTGTAAAGTTGAATGAATCCATATTGCTGTTCTTGGGTACAGCTAC:1	-	chr3R	1439746	5'	-	Stalker3T	257	1	75.34
CTTCCTCCACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1	-	chr3L	23906514	5'	+	1360	5	2	76.56
ATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1	-	chr2L	544889	5'	-	412	448	2	53.42
GGAGACTTATCCAAAAAATGAAGAAAGATTTCTGGGTTAAGTGGAAAAGTGAATATTTGCATACGCTCCAGCAAAGGAATAAATGGAAAAAGGAAATTTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTC:1	+	chr3R	19447829	5'	+	R1A1-element	5023	1	79.67
ATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1	+	chr3L	15600187	5'	+	roo	5	2	40.00
TCTGAAAGTCTTTCTATTAGAAGCACTGCTTCGAGCGCAGTCCAATTGAAATGCTTTCGAATATATCAAAATTAGACGTCATCGTTTCGAATTGCTGCC:1	+	chr3L	20603620	5'	+	transib1	2118	1	71.72
AATAAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	-	chr2L	11518502	5'	+	412	7098	2	51.72
CTTTTCTTTATCTGAATATTTATGATTCTTTGATTTAAATTGAAAATATTGCTCAATAACTAATATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1	-	chr2R	20944451	5'	+	pogo	51	1	56.85
ATGCGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1	-	chr2R	5031017	5'	+	Doc	93	1	76.03
CGGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2R	5248236	5'	+	1360	53	1	59.85
ACACCGTTTGTTAGTGATATATTTTCACCGATCTATTTTTTCTATGATCTATTTTGAGACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	+	chr2R	4743990	5'	+	roo	12	2	55.04
CATATAATGCCACGCTGATGAAATACGTGCGGCGTCGGCTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1	-	chr3L	10626138	5'	+	accord	183	4	65.52
GCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1	-	chrX	13066565	5'	+	jockey	80	1	74.62
TCCAGCAACATTGGATCTTGGAATAATCGAAATTTACAAAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1	-	chrX	14749722	5'	-	copia	250	1	58.90
TGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCACGCTGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGGGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTC:1	-	chrX	21994004	5'	+	McClintock	10	2	66.04
TAATACGTATACGCCATGTGTTACAGCATCCGCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGGT:1	-	chr2R	9328730	5'	-	roo	397	1	73.64
TTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGA:1	+	chr2L	4412560	5'	+	Quasimodo	49	2	61.11
TCTCTGTGAAGCTCTGCTTCGATTATTTTCATTTTTGTTTATTTTGTTGCCAAGTTTCCTGAATTGTTTTTGTTGCTGTGGCTTATTATTGTTATACGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTACACAACA:1	+	chr3L	2840873	5'	+	copia	4893	2	59.72
AAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1	-	chr3R	20427500	5'	+	jockey	29	1	67.16
GAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCATGATGAAATAACATAAGGTG:1	-	chr3L	13727325	5'	+	P-element	1	2	18.49
GGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTACATTTAGGATTT:1	-	chr2L	7945384	5'	+	roo	80	2	78.95
GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTTGTACTTGAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGTACATAGTGCGAAGAACTTTGT:1	+	chr3L	23112569	5'	+	R1A1-element	26	1	59.69
AACCAATTATTGCCGCACCCCAAATCGTTGCGCTGAGCGACAAAAACCATGCTGAAGCCCCAGAGTAAGCAGGCAAAACTGCTTTGGTTATTTGCTTTGGGGTTGGGATTTGTTTACATGAATGGCTAAGTA:1	-	chr2R	3913754	5'	-	17.6	191	2	53.03
GCACACATCACTGCCTCTTATACCTACCTGTGTACAGGTGAGAGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1	+	chr2L	6569936	5'	-	jockey	4955	1	51.97
TAGTGTGCAATCTCAAAAGCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1	-	chr2R	9463532	5'	+	rover	26	2	67.12
TTAGGCTATAGTTCACCAACTGCTAACCACGAGTCGAATTAACAAAAAAAAAACAAGTTAAAACAATAAACAAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAA:1	+	chrX	11703062	5'	+	Porto1	247	1	68.35
TGATTAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1	+	chr2R	15064338	5'	-	412	7508	2	53.23
CAAAACGTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1	-	chr3L	17560419	5'	+	pogo	23	1	69.18
GTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATACGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGCCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAAC:1	-	chrX	21667923	5'	+	gypsy2	6516	2	56.04
GCTGAAGTTTGAAGTTATTGCTTTCATTTCCCTTTAGTCGCTCCCAGACGCTAAGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGT:1	+	chrX	13039417	5'	-	roo	392	2	73.29
TTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1	-	chr2R	21920619	5'	+	jockey	37	1	63.01
TATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGT:1	+	chr2L	19817855	5'	-	G4	3828	1	68.75
AAACATATTCAATTCTCTGTGTGTCATCCGCTAAAGAAATGTTAACTCTTTATTCGTTTTTTGTACATTGTAATCAGCAGAGTCTTTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chrX	23362218	5'	-	roo	9053	2	44.52
CGTACATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chrX	2444328	5'	+	roo	8703	2	56.16
TAATCAAGTAAATTTTCAAAAGTTTTGGTGGCTTTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGGCGGTTTGTTTGTTTGTTTTTAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTACACAGGCATGCTCATGCATTGTAAATTTCACAAAA:1	-	chr4	953099	5'	+	1360	198	1	78.62
TGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1	-	chr3R	17605758	5'	+	Tabor	6875	2	59.59
CGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1	+	chr2R	981623	5'	+	1360	35	1	60.74
AATATAATATAATATAATATAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCG:1	+	chr3L	20525228	5'	+	Juan	3	1	62.22
CCGTTTTCTGACTGTTTGCCTTCTCTATCCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTGATCGGCGCTCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCGAGAACCATTAGTTCGTAGGCCCACATCTGACCACCT:1	+	chrX	22413358	5'	+	gypsy5	62	2	54.11
ATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATCGCGTTACGCATCTT:1	-	chr3L	14638683	5'	-	1360	19	1	46.03
CTCAAAGCTAATGTAAATATGGGAGCTCTATTTGCCAAAAGCAACTGTGCGTCGAAATCTAAGCATATATGGAATTTCATAAAATACAAATGTATACTATACATAAATAATTTGTGATTCGATATGTAACTTATATTCATTACA:1	-	chr2L	15343148	5'	-	Doc2-element	4691	1	51.39
GGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	+	chr3R	25826675	5'	-	mdg1	350	2	65.07
GGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chr2R	15004738	5'	+	jockey	12	1	48.51
GGAAAAATAAATAATAATAATAATAAAATAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCGCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTT:1	+	chr3R	28556518	5'	+	Doc	275	1	78.26
GCGGATGTTTAATGATCGAAAACATCACAAACGCAGCAAACGTGGTGCCAGCAACAAGGTGAGCGCCTTCATTTATTTTGTATTCGACGTTCTGTAAAATAAATTCCGTTTATACAAAGCTATA:1	+	chr2L	21124316	5'	+	G4	3395	1	70.16
CATATTATGTATATTTAAATAGGAGTAAGTATTGGTCGCATAATGGTAACAACATATTTTAAGAAAGAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1	-	chr3R	31720602	5'	-	pogo	2051	1	55.17
CAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	22844183	5'	+	roo	20	2	57.14
AATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2R	9632200	5'	-	roo	9021	2	52.14
AAAATAAATTTTGTTCAAATTTTTTTTTCCTTTTTTTTTT:1	+	chr3L	10485969	5'	-	Doc2-element	233	10	95.00
TTAATAATTATTAGGTGCGAAAAAATGCAGCTTCTCCTTGTGGCACATTAAATCACAGCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCAC:1	-	chr3R	7832153	5'	-	roo	8929	2	53.33
GGCTCGAAATCAAAGAGAGTGAATTGCCGAGAAAATTAATGACGGGTGGTTGGGCGTTCGTTGGTTGTCCAATCAAAATCAATACACTTGGCAAATTGCTGATACATTAAGTATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCAT:1	+	chr3L	12357992	5'	+	17.6	180	2	77.40
ATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1	+	chr3R	7482718	5'	+	412	30	2	59.85
CCTGCCCGGAAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1	+	chr2R	21228991	5'	+	jockey	77	1	60.96
AAAAGAGCTATTCAAAAATTAGAATAGCATGGAAATAAACAGCATGATATCAATCGATTATTGCTGTGTGAGCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCTAATTTTTAT:1	-	chrX	22894792	5'	-	Bari1	333	1	50.68
ATTATTTGCATTGCCAGACTCCCGAACAAGCGCCCAATTTGTTGTGCACTTCCTTCCATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAATGAGCC:1	-	chr3L	8258910	5'	-	jockey	4564	1	59.59
AGTGCTCGTGTTCGCTAGTGCTCGTGTTTAGCCAAAACTAGCACCCTGGAGAAGCATAACAAGCGCGCCCATAAAAAAAAAGTAATCACGGTGGCTGGGCGCATG:1	+	chrX	19523009	5'	-	Max-element	492	1	67.62
CTCGATTGTTGGCTCGTTGTGGATTTACAAAGATTTAGTTGGCTATTCCGTCTGGTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCA:1	-	chr2L	16497113	5'	-	rover	7068	2	62.33
ATTGAATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chrX	23362227	5'	+	roo	35	2	62.33
CTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr3R	17817914	5'	-	roo	8989	2	78.99
GGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr3R	27994182	5'	+	roo	52	2	59.26
GACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1	+	chr2R	19499342	5'	-	P-element	2825	1	24.55
ATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATG:1	-	chr2R	20194312	5'	+	Max-element	8266	2	57.81
GGCTATAAAAAGTGTGCACCACTCATCCAACCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAA:1	+	chr2L	9564472	5'	+	transib2	88	1	75.17
ATGGCCAGAAAAACCAGCCTCTGCATTTGTATCTTTTAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1	+	chr2L	18338955	5'	+	pogo	30	1	59.20
TTTATATTTTTTCAGTGCACTTAGAAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAGTATATTT:1	+	chr2R	9328551	5'	+	roo	6	2	78.52
GAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chrX	14336521	5'	+	roo	50	2	56.16
ATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1	-	chr3L	3501002	5'	-	opus	466	2	70.45
ATTGTAAATTTCGATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	+	chrX	13504110	5'	+	412	18	2	72.54
GAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGTACTCCAATTAAGAACACAAGT:1	+	chr3R	11083885	5'	-	412	7536	2	64.44
ATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1	+	chr3R	10266102	5'	-	1360	3322	1	75.00
CAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:1	-	chr2L	13585914	5'	-	Tabor	7257	2	65.44
ATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTCCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1	+	chr3R	25826650	5'	-	mdg1	7424	2	56.30
CTTACTTTCTCTGTTTGGCTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2R	20596408	5'	-	roo	396	1	75.17
CGGGAAAAATATATTTACAATGTTTATTGTTGTGCTTCGTGGAGCGCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1	-	chr2L	18404636	5'	+	hobo	37	1	60.00
CAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAATTCAGGGCACGTTTG:1	+	chr3R	14651215	5'	+	P-element	57	1	38.10
GATTTTTGTCCAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATAT:1	-	chr2R	2879485	5'	-	Stalker4	7053	4	48.63
TTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr2L	7945386	5'	+	roo	8746	2	79.56
GGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:1	+	chr3R	14049349	5'	+	transib2	78	1	70.34
AAGGGGAAACGCCAGTTTTGCAAATTATTGAACCCACATATGTTGGTTAATTTAATCAAGTGTTTTGTTTAGTTTATTTTAGTATTACTTTTAATTTATCATTTGACATCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCA:1	-	chr3L	14518502	5'	-	Tc1-2	167	1	71.23
AAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGC:1	+	chr3R	13237283	5'	+	3S18	5820	2	52.74
GGGAGAGGCTGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTT:1	+	chr2R	5173415	5'	-	gypsy	7431	2	67.86
AAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1	+	chr3R	26431981	5'	+	opus	7168	4	68.64
GTTTGAAACTATTTGTCACTTATTGTGACATTTTGTTTCGGCTCTATATCCTTCTTATTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGA:1	-	chr2L	17603934	5'	+	hobo	449	1	61.36
ATTTGAGTTATATTTGGGTTTTATTATTTTCTTTTTTCGTTATTGTGGCGTAGTTTGAAGGTGTAAAACTACTTGCTTATACTATTTATATACTTAGTATACTTATATACTACACAGAATAGGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCA:1	+	chr2R	4026401	5'	-	Doc2-element	129	1	69.18
ACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:3	-	chr3L	20654551	5'	-	roo	325	2	74.66
AGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATATTCTAGATCTGGATCAATAGCCGAGTTGTTCTGGCCATGTCCGTCTGTCCG:1	-	chrX	19192404	5'	+	INE-1	116	1	71.92
ACATTTTAATGGAATTTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTCAGCA:1	+	chr2L	18159023	5'	+	INE-1	169	1	48.44
TATTGAATATAACAAAAAAAAACTGAAACTGAACAACTGAATCTAATGTGCATTTTACATAATAAAAGTGGATCATTTAAATACATCATATTAAGTCAAATGACTTAGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATT:1	+	chrX	14901979	5'	-	F-element	251	1	73.29
AACATTTCGGTCATGATTCCCGCTTCTCGTCAGGTCGTCATAATTTGATTTATGATGCGGTGAATGCCTCTCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGC:1	-	chr3L	21903593	5'	+	G2	2916	1	67.57
GGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1	-	chrX	2295983	5'	+	Tirant	8145	2	58.72
TCTCGAACATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr2R	8585429	5'	-	roo	345	2	61.11
TACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAACGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1	-	chr2L	16067176	5'	+	297	51	2	62.69
CATTTTAAAAAGATAACAATTGTCAATTGGTGGAAATTTGGCGCAGAATTCACAGAACAGAATTTTGCAGCTAGCAATTAAAATGTTATCTGTATTCACTTCTATATGTCTAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTC:1	+	chr2R	16896135	5'	+	accord2	114	1	65.75
GCTTTAAGTAACAAATTACCTATTTTTTATTTTTGACCACATTTAGATATTCCAAAGTAATTTGGTATTCTTAGGCACTTCAAACCACGACATTTTTTTTATTTAGGTGTGGTAAGACAAAAAACAGTTTTTATCTTTATTGCAGC:1	+	chr3L	23284054	5'	-	looper1	1612	1	71.92
ATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATCGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1	+	chr2R	20496937	5'	+	blood	72	2	74.22
AATCTGGGTTAAGACAATGGAAAATTTTAGTGCCTAATCAGTTAATATCATTTTAATCTCTAGTTAGTTTCAAAAACATTAAGAGACTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr3L	2029871	5'	+	roo	8699	2	60.96
TTAGCTTAATTTTACTAAAAGGCCAATATTCAAGACATTCTTTACATAGAAGTTTTGTTATTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTG:1	+	chr2R	11363706	5'	+	Bari1	11	1	75.37
GACTTTAAGGCAAAGAAATTCGTTTACCCTGACCTTTGTGGCTTAAAAATTGCCTTTAATTGGGACTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTT:1	-	chr3L	6336044	5'	-	roo	9036	1	44.52
TTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTGTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAACTAGAGATTCAGTATGATAT:1	+	chr3R	17605674	5'	-	Tabor	7277	2	72.22
ACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chrX	9540124	5'	-	roo	358	2	52.05
GTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTCTCTC:1	+	chr3L	21855446	5'	-	blood	306	2	64.38
ATTCTAGTGTCTTTGATATGACCTTTGCAATAAACAGTAATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCAATTGACTTGATTAGAAATAGCCAAAACTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTTAAAAATGACTTTATA:1	+	chr2L	14588753	5'	+	1360	376	1	50.68
AAATCAGTTAAAATTCTACCAAATCGTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATA:2	-	chrX	10694575	5'	-	I-element	5319	1	46.58
GGTTTATTTTGCTTATTTATACTATGATAGACGAAAGACAAAAATCTGTATTGGGAATAATTAATACAAAAATAATATAAAAGAAGAGAGAATTCAATAGTCGAGTTCTCCGAGTATCAGATACCCGTTACT:1	-	chr3L	27859900	5'	-	INE-1	550	1	52.27
TATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2R	13585386	5'	+	412	41	2	56.16
ATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	-	chr3L	11530958	5'	-	roo	326	2	73.97
CGATACGGATATGGATAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCT:1	+	chr3R	11496539	5'	+	1360	49	1	64.35
GAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1	+	chr2L	9668205	5'	+	1360	73	1	78.95
ATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGGCAATTCATCAATCACCAGCGCATATAAATTCGCTCTCTTA:1	-	chr3L	23702233	5'	+	G4	49	1	58.18
AGAAGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr3L	15600365	5'	-	roo	390	2	58.04
AATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr2R	14542205	5'	+	roo	8753	2	80.82
GGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1	-	chr2L	1377694	5'	+	hobo	11	1	57.58
ACATCAAAATCGACAAAGAAAAATCAGACTTGACAAAAGTAAAATTATCTAGAATCTGCGTTTCGATACGAAATCATGACACCCCGATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGTAAGCG:1	-	chr3L	22794232	5'	-	Quasimodo	6959	2	62.14
CTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCAGCATCGGCAAGATATCTGAATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATA:1	+	chr2R	6173007	5'	+	pogo	68	1	70.77
TATAGCTCTGTTATTTTTGTTGTCGTTATTTGTTGCTATAAATAGCTCAATGCGGTCATTGGTCCCTCTCGCACACTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTTCATTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1	+	chr3R	18585528	5'	-	P-element	2870	1	76.03
AGAACTTTTAACAGCATTAATATTAAGTTCATCAATATTAATGCTGTTAAAAGTTCTGCTCACAGTACCCTGTTAAGTTTTGCAACGAAATTGGCCAAAAATCCAAATATGTAAATTGATTTCGGCCCGAAAATTGTCTTCTAGC:1	+	chr4	431430	5'	+	1360	3194	1	77.24
TGAACAGCACAATATTTCAGTTCCGCCGCGTCTTATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1	+	chr3R	10266027	5'	-	1360	3375	1	76.71
CCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTGAGCGAGTG:1	-	chr2L	21891796	5'	-	mdg1	7384	2	72.14
CATTAGCAAATCATTGCAAAATAATTACAAGAATTGGACAGACCCCATATCAACCTTAGTTGGTTTGTTTATTAAAGCTTCTCATTATGAGAAGTTTACAAATCTTAAAAAGTACTTAACTAACAGTCACTATTGCAACTGATATG:1	+	chr2R	3097482	5'	-	Fw2	3856	1	60.27
ACGGTTTCCTCTTCCTTGAACGTATAGCGAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	+	chr4	419939	5'	+	roo	8707	2	56.16
TTCATGAGATCCATATAGTATGCTATATAAAGAAAGCCGTTTTATTAGAGAATGTGCTAAGAAATTGTTTTTAAATTAATATAATATGTTGATGCAGATGAGGCTTGCCATGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTT:1	-	chr2R	20501247	5'	+	pogo	1638	1	56.16
TCCCTCATCTGCTTGACCAGTTCATCTTTCTCGAGTAACACAAAAATAACATGAGCCCAAAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTT:1	+	chr3R	25454567	5'	-	Quasimodo	6947	2	51.20
ACAGTTGATTGCCTGAAAAATAAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1	+	chr2L	17420102	5'	-	roo	402	1	77.70
CGAAAGGACATGTCGGAATCACACCGCAAGGAATCGCCATGGAAATGAACATTATGCACGGGTCCGAGCTTGGAACGTGGGAACGTGAC:1	-	chr2R	14441041	5'	-	Idefix	242	2	70.79
ACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3R	7100934	5'	-	roo	9051	2	67.39
TGCTGCGGCAGAAAATGATATTGTTTGCTTTTTAGTCGTAAGCAGTTATTAAAATCGTGATTATCAAAGAAGGTGGATCAAAAACGCTTAGTATAAATTGTGGGCGGTGTGTTTTCTGGGCTTTTGATCCTTATCAAGAATATATA:1	+	chr2L	22719455	5'	-	INE-1	81	1	71.23
GGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1	+	chr2R	16891834	5'	-	hopper	1375	1	52.94
CAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chrX	5274322	5'	+	roo	42	2	71.28
ATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1	-	chr3L	27415339	5'	+	transib2	37	1	60.27
AGCGTGCGGTTCGGTCGACGGGACCACCTTATGT:1	+	chr2R	21101945	5'	+	P-element	2874	2	64.71
AATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATCTGTACGAAAAT:1	+	chr3L	6978156	5'	+	pogo	79	1	71.23
AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATGTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439059	5'	-	P-element	2495	1	58.90
TCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGC:1	-	chr2R	16373526	5'	+	Max-element	8234	1	62.22
CATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGGCAATGCTGACCCT:1	-	chr2R	17259356	5'	+	jockey	4708	1	52.10
GCGGCCAGCCCCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1	-	chr2L	9266265	5'	+	accord2	223	1	81.82
AATTAAGGCAACGTCGGCGGTCATCAAACAGCATTCTGGCCACATTGTTGCCGCTCGTCTTTTAGCCAGTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1	+	chrX	5645103	5'	-	roo	8985	2	57.72
TGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACTGC:1	-	chr2R	5924438	5'	-	jockey	4712	1	39.73
GCTATTTTACAAATGCACTGCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGC:1	+	chr3R	23817298	5'	-	Quasimodo	232	2	68.00
TCCATTTGTTCGAGGAAAGATTCAACATTAAGGCCAGAAAATTGCATCACTCATACGCCGTGTGGCCTTAAAGCATTCGATGTTCATTTGTTCGCACTAGCTGGTATAAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTC:1	+	chr2R	13057638	5'	-	jockey	4595	1	71.92
GGAAATNTTTTTCAATATACTCGAGATGCACAAAACTAAAGCAAGTAAATGGGTCGCGTATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACA:1	-	chr2L	9411030	5'	+	jockey	4902	1	59.59
AAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGA:1	+	chr3R	14651238	5'	+	P-element	100	1	17.12
CCATTGCCATCATAATCGCGAAAAGTCGTAGGCTGTGACCAACTCCGTGCAACACCGGCAACATTTCTGAGGGGGGAGTAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTC:1	-	chr3L	7581670	5'	+	gypsy6	7439	2	55.00
ACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	18582260	5'	+	roo	48	2	52.05
AGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chr3L	9998213	5'	+	roo	8	2	73.83
GAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATACAACAAAAACGAAATTGTGATCCCTCACAA:1	+	chrX	17054203	5'	+	jockey	70	1	53.96
TGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1	+	chr2L	15833008	5'	-	hobo	2923	1	52.94
AATTTAAAAATCATCATATTTAAGGAACATATAAGTTAACGCAAGCTCCACTTGCATCA:1	+	chr3L	18368946	5'	-	opus	7496	2	55.93
AAAAGTTAAAAATAAAAACAGCTTTTTAATTAGGGAAGAAATTGGTGTTTGTTTACAGATATGCGCATTGTAGATACATGCATATATATATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAAC:1	+	chrX	13408001	5'	+	1360	293	1	60.96
CAGCAAACCTGTAAAACCGGAAAGTCATGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1	+	chr2R	8146069	5'	-	P-element	2798	1	20.28
CCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTCACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1	-	chr3R	25454117	5'	+	Quasimodo	44	2	52.05
AAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGCCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGTACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1	-	chr3L	10574378	5'	+	Tabor	6871	2	44.44
AACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTC:1	-	chr2R	23332602	5'	-	invader4	250	2	78.26
CTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGAAATTTTT:1	-	chr2R	5531197	5'	+	1360	81	1	54.24
GAGCGAGAGTAGGCAATTTGAGACTTATCTGCGCTTTTTTCTGCTCCAGCATGTGCAACAAAGTGAGGTGAATAGGCAAGAAAGTAAATTGGAAAAGCGGGGAAAATTATTTCACGTACATATGCGCATATGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chr3L	3263690	5'	-	accord	186	2	80.82
AAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCTGTGGCTCTAG:1	-	chr2R	5531210	5'	+	1360	53	1	74.76
TATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAG:1	+	chrX	20870131	5'	+	gypsy	7062	2	74.63
TTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1	-	chr2R	15064455	5'	+	412	46	2	52.05
GTATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3R	25448472	5'	+	roo	8684	2	70.00
GTTTGAATTTATTTATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATT:1	+	chr2R	23352141	5'	-	Stalker	232	4	70.54
GCCGGAAAGAGGTAAGGCAGAAGCTGAGAACCAGTTCAGCAAACGGACTAAAAACAACAAAGATCGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAG:1	-	chr3L	8013719	5'	+	Bica	4914	1	78.65
TGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCT:1	+	chr2R	10582407	5'	-	Juan	4129	1	75.86
ATGTAACTCCCATTAACAAATCCATCCAAAAACGACACTGAAAAGGGAGCACACTTGCATGCATTTATTTATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1	-	chr2L	8986234	5'	-	412	443	2	55.48
CTGGATAAGAAGTCTACTTTTCGGGACAATCGCCTACGCAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chr2R	9629406	5'	-	roo	8984	2	71.72
TTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	+	chr3R	26222869	5'	-	roo	334	2	71.53
AGGAAATTGTGAATTAGAAGCAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1	-	chr3R	9922105	5'	-	blood	345	2	63.01
TAAAGCATTATCTGTTTCGTTTCATTTATTTTTTTTTAATATACTGCTAAAATAACCATCACCTGACAGGAAGGTGGCTGTGGCAAGCCGAATCTTATTTACCCTTGCAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1	-	chr2L	10986928	5'	-	1360	3382	2	77.54
GATCTAACAACGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1	-	chr3R	21434960	5'	-	412	419	2	69.86
AAATATGTTACACGTACATAAATGTGTTGCAATTATGCTAGCACTGAGGTAAGGTCCTCATATTATTATATATATTTGCATAGCGAATTACATTTGTCATTGCCATTTCAAGTTGATAAATTAAA:1	-	chrX	4971895	5'	+	TAHRE	145	1	50.40
AGCAAAAAATTAGCATACGTACATATGTATGTGCGTGTGTGTGTACTTGTGAGCCAGGCAGCGGAAACGGAAGTGCGTAGCACTCTCACTCACTCACTCACTCACACACACACACACGTAC:1	-	chr3L	12312565	5'	+	Quasimodo	35	2	54.55
AGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGTCCG:1	-	chrX	17833050	5'	+	Tirant	74	2	78.12
GCCAGAAATAGCAGAAGTGTGGTGCGACTTCGGACGTTTTTAATTATTTTTATCTTGACTGTGGCTTGGGTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGCATTATAATAGTTGATATAACA:1	-	chr3L	8244242	5'	-	jockey	4851	1	55.56
TTTCATATCCAAAACATTAAATAAAACCGAACAACTTTATGCCACAAATAAAAAGGAATTGTTGGCAATAGTCTGGGCTCTTAAAAATCTCAGGAATTACTTATATGGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1	+	chrY	3572689	5'	+	Max-element	8251	2	74.66
TTTCCAGTCGGAGGGGACATCAGTTTTTGGCGCCTGGAAAACGCGTGCATGCAGGACATACACACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCG:1	+	chr3L	2362860	5'	+	Stalker2	7398	6	54.84
GCGGGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGAAGGGTAACGCCATACGATTTTT:1	+	chr3L	26852643	5'	+	1360	23	1	54.22
CAAACATGGATCATATAATTAATCAAAGCGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGGAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGACTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1	-	chr3R	10274077	5'	+	HMS-Beagle	26	2	66.44
TGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATC:1	+	chr3L	14603262	5'	+	jockey	66	1	55.56
AAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr3L	4536707	5'	-	roo	9014	2	63.78
ATCCTGCAATTTCCACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1	+	chr3L	17205221	5'	-	hobo	2905	1	67.39
CAAGAGAACAGAACGCAGATGTCCTTTTGGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1	+	chr3R	27424815	5'	-	blood	7352	2	58.22
AGATATCGGTTGAATATGAATATATATGAATGAGATCTTGGTTGAGATATATTTAAAAAATTAAACAAGAGCTGGAAGTGTGCAGATTTTATTATTTTCTGGAATTTCGGTAGAAATTAGGGGAAAGATCGGAAGAGCGT:1	-	chr3L	20344845	5'	-	mariner2	568	1	48.57
ATAAAAGTGTATCTGCCTTATTTTTGGGACTCTCGTATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGGGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAC:1	+	chr2L	4412521	5'	+	Quasimodo	23	2	63.70
ATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTGATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCGAAACTGCTGACCA:1	-	chr2R	4601630	5'	+	HMS-Beagle2	63	2	64.66
AATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:2	-	chr2R	19050334	5'	-	roo	9055	2	66.44
AATGAATTTAAAATGTGCATTGGCATTCCATCGACTGAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr2L	11674484	5'	+	jockey	18	1	78.62
AAAAAATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGC:1	-	chr2R	4774771	5'	-	baggins	5360	1	49.32
TGCAACCATTCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1	+	chr3L	4840711	5'	+	jockey	4694	1	62.18
CACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	-	chr3L	15600318	5'	-	roo	9003	2	65.07
TAAGTCGTGTGGCTCGCATTGCTTTTTGCGAAGACAACTCATTACTGCTCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAAC:1	+	chr3R	25456432	5'	-	Quasimodo	206	2	60.00
TACCTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1	-	chr2R	9632214	5'	-	roo	9029	1	54.79
ATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATTAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1	-	chr3R	17605724	5'	+	Tabor	70	2	61.64
CCCACGCTTTGAACAATTTATAAATTTCTTCTCATTTTATTCCCCAATATCTGTGGATATCTCAAAAAAATGATGAAATTTGCGTTCGAATTCACACTAGCTGATTAAC:1	-	chr3L	20033448	5'	+	INE-1	534	1	74.31
AATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3L	21817964	5'	-	roo	390	2	62.50
GGAACGAGTTTACCCGCCAGGCATTGTATGAACTTACATAATTAGCCAGCTGTTGATGGCTGGGACATTCTGTAAAATAGCGAAAGATTAAATCATTCCTTAATAGTTTAATTTTGTTGGAGTTCTGCGTTTTATTCTTCTTGGTT:1	+	chr3R	22836681	5'	-	Porto1	4517	1	67.81
TGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr2R	9632106	5'	+	roo	54	2	63.28
GAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAA:1	+	chr3L	24272058	5'	+	gypsy11	4040	2	61.87
ACAACAATCCTCGAACATGAGATGCGGTCCATGACTTAGGGATTAGGGTGCTTTGGAAATACACATATGCGAAAAATTTAAAAGTATTATATATATTTTTAAATTTCTTATGAAAAATCCCATTAAAAAATTTAAAAAAATTTATT:1	-	chr2L	8081000	5'	+	transib4	2280	2	55.48
ATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATG:1	+	chr3R	16076766	5'	+	roo	49	2	54.79
CACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCACCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1	-	chr3L	16750718	5'	+	Tirant	8147	2	67.78
CGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1	-	chrX	21016822	5'	-	Transpac	242	2	79.84
AGTGCCAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGGATACGTATGTATGCGCATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAA:1	-	chr3R	22822142	5'	+	mdg1	29	8	41.10
ATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATAT:1	+	chr3R	18346660	5'	-	INE-1	84	1	58.90
CAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCA:1	-	chr3R	11547812	5'	+	G2	294	1	69.12
AAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1	-	chr3L	16015375	5'	-	1360	3377	1	72.60
TTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr3R	12886998	5'	+	roo	8718	2	60.27
AGCAGTGTGAACCCACAATTTAGGTGAGTTTTCGTCTTAGTTTTTGGTATCCCCCTCTCCAACCCATTGAATACTTTCTTCAGCCACGTACCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1	-	chr2L	7810163	5'	-	P-element	2857	1	65.07
AATGACTTATTAGCCAAACTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAAACTAGCAAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCG:1	-	chrX	17262560	5'	+	X-element	4416	1	54.24
AAATGCAAAAGCTATCACTGTGAAGTCCAGTTATTAAAAAGTAATTGAAAAAAAATTATTTCGAAACTTCGATGATCAAGAAGAAAATACAAAGATGTTGTCATAAAATTGCAACAAACATTAATATACGATTAAAAATT:1	+	chr3L	8211559	5'	-	Juan	3794	1	73.57
GAATACAGCAACGTATCCTTTAAATGTTTTTTGGCCACGATTTTTTGAACATTGAGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTCATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr3R	19447284	5'	-	roo	9010	2	57.53
GCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGAGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	+	chr3R	17817895	5'	-	roo	336	2	65.75
ATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:2	+	chr2R	15004742	5'	+	jockey	28	1	44.52
AATGAAAAGGGGGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1	-	chr2L	16067196	5'	+	297	43	2	56.85
GCAAATCTTGTTAACAAACTATACAGGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGTACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTCCACACATGAACACGAATA:1	+	chr2R	7898035	5'	+	roo	1	2	78.33
ATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chr3L	14603234	5'	+	jockey	12	1	74.79
ATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGATCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	+	chr3L	233270	5'	+	roo	8730	2	78.95
GCCTTTGTCGGACCTGTTAAGGCAAAATACTAAGTTTAAATTTGATGTGCTGCAGAAGGTAGCGTTTGAACAGTTAAAAGTAGCATTAACTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1	-	chr3L	23866765	5'	+	copia	4900	2	64.38
GCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2R	2016839	5'	+	1360	55	1	66.67
GTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1	-	chrX	21014873	5'	-	copia	223	1	59.40
ATTGATATTTGCATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1	+	chr2L	13585795	5'	+	Tabor	27	2	67.81
GATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTT:1	+	chr3R	18339044	5'	-	roo	389	2	70.55
TCACAACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTA:1	-	chr3R	1446149	5'	+	1360	7	2	27.40
GGCAGATTTATTTGCTCGCTCTCTCGCATGCAGACGTGAACAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1	-	chr2R	13585557	5'	-	412	482	2	76.71
GGCAGCGAATCAGTGGGCGTCAGCGGCTACGCGGCGGCGGTGAGCAGATGATCGCACTTTTAGCT:1	-	chr3R	16552146	5'	-	HMS-Beagle2	116	2	84.62
AGTTTGTATATGTTTGTTAGTATAGCACTGGGTTTAAGTAGACTAATAGATTCGTATAGGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1	+	chr2R	7452834	5'	+	pogo	58	1	60.00
GGTCGCGAAGATGCAAAACGAATCCGGGATAAACAACGGGCTCGAGTGAAACAAAATCGCAAACGGAGCGCTCGATCGTGTGCTTGGCTCACAAACAAAATCTATTTTCAGTCACTGCAT:1	+	chr3R	16202966	5'	+	jockey	128	1	62.50
GGCCTTTTGTTATTGTTTTCTTTATCCAAGCAAACTTATTTGAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	-	chrX	16717958	5'	+	roo	9	2	73.45
AGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTT:2	+	chr3R	16076790	5'	+	roo	8737	2	69.18
AAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATTAATCGAGAGGG:1	-	chr3R	14364677	5'	+	roo	8724	2	66.13
GGCGAGTCTGTGATTTTGTTACCAAAATTTCGAGATTTTGATGACAATGATTTCCGTTAAATTAATTATTAGACAGTGATGATATTTGAATTGGATTGGTTAAGAAGAGTAAGTAGCCAAGGTTTTTATAGACAGACTAAGAACAC:1	+	chr2R	4789807	5'	+	G4	3612	1	77.40
TTTGTAATTCTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:1	+	chrX	21669987	5'	-	Stalker2	359	2	50.38
ATAGATGTAATATACCATGTGGATGTAATATTTAGAAAACAACAAAAATTATAACGGCTTAAGTTTCATTTCATATTTTATTTGAATAACGATTTTTTTTGTCGCACGAGTCCCACGGCCACACTTCCCGCCCAACCGAC:1	+	chr3L	26851890	5'	-	Cr1a	4425	1	59.29
TGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1	-	chr3R	17831882	5'	+	F-element	49	1	52.89
CAAGGTCCAGACTTAGGACTCAATACCATCCCGATACAATATGTTATTTCAATATTGCGAGTCGTAAAAGATTAAAATTACATGTGTAGGTGCGTCTGCACGTGTGTGAGTTTGACTTCCTCGGGTGCGACATGTT:1	+	chr3R	13177864	5'	-	invader6	313	2	57.35
GATTCGGAAACTTGTGTTCGTACAGTGGGTGCAGTACTGCTCAATAAGTAGTTCAAAATAAGGACATACCAAAGACACAAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1	-	chr2L	12250137	5'	-	1360	3359	1	56.67
AATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAATTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTGGTAAGAAACTGATTTTATTGGGAACTATCTTCGGTTTA:1	-	chr3R	16076883	5'	-	roo	9014	2	52.74
AGTTGTTGTTTTGTTGGCTGTTTGCTGCCGTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAA:1	-	chr3R	10266200	5'	+	1360	8	2	76.67
CTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACCCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATA:1	-	chr3L	19014009	5'	+	invader3	64	2	59.59
TTATTTAACGGTAAGTTTCAGACATAGGGGTAAAGATTTTGTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGTCATTTTTTTTAATTAATCATTCTATTTA:1	-	chr3L	14944695	5'	-	G5	4833	1	76.60
CCTACCAAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACTCACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1	+	chr2L	15833436	5'	+	jockey	6	1	76.34
GCAAAGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	+	chr3R	31817446	5'	+	roo	8725	2	62.41
GGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGCTAATTGAATATTC:1	-	chrX	21994003	5'	+	McClintock	5978	2	60.33
TATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGT:1	+	chrX	13504159	5'	+	412	71	2	63.70
AAAATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	-	chr3R	16076885	5'	-	roo	9016	2	56.85
AGATAGTCCAATTGTGGGTGACTAATGATATACATTCGAGTGCAAACAGGTGCAGAAAGCAAGATATAAGTGCTGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTA:1	+	chr2L	1669585	5'	+	R1A1-element	5302	1	50.68
TCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTCATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr2R	14542128	5'	-	roo	9015	2	56.16
ATAAACAATAAAATAATATAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCG:1	+	chr3R	19449926	5'	-	roo	74	2	54.55
GTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1	+	chr2L	15833455	5'	+	jockey	8	1	71.05
CCCAACTGGTATACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACAT:1	+	chr3R	13237266	5'	+	3S18	38	2	59.59
ATCGTATTGAGGTAACATTGAATGACCTTGGTAAACTGCACTTACTTGATGCAATTAATGTAAAGAATTGTCATCATTTAACAAAATTAAAATATATTTTAGTGGGTAGAGGACAGTACTGCTC:1	-	chrX	22840244	5'	+	HB	352	1	72.58
CACAGCCACAGCCACAGATACAGATACACGACAGATGCTGATACAAATATACAAAACCAAAAGCTGACAAATAAACAAACCAACAAACAAACCGAGGAAAGGATGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGT:1	-	chrX	15396302	5'	+	P-element	118	1	50.00
AAATTATGGGATCAACAGTTGGTCGAAATCAAAAGACATCCAATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTG:1	-	chr3R	16076374	5'	-	roo	37	2	53.76
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GTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1	+	chr2L	11732252	5'	+	Doc	16	1	59.50
TTATGTTTAATATTAATTAATATAAAATGCCGGGTCTAAGCCAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGATTATGAGAACAAGAGACATCGCA:1	-	chr3R	29397549	5'	+	jockey	4576	1	67.46
GGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1	+	chr3R	20499755	5'	+	mdg3	5320	2	60.96
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AATTAATATAAAATGCCGGGTCTAAGCCAAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGTGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1	-	chr3R	29397535	5'	+	jockey	4592	1	54.26
AATGCTGCAAAGCAGATGAGCAAAATATCTTACATTAAATAACTAGTGCGTTTTATAATTTTCAAATTTTATTTTATTTACTGAACTGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGA:1	+	chr3R	4092998	5'	+	I-element	383	1	74.80
ACGAATCGTCTCCCTACGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr3L	16343185	5'	+	roo	10	2	74.79
CTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1	-	chr3R	18585668	5'	+	P-element	40	1	49.59
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TAATGTTCTGACAATTTTACTTTAACTTCTTACTTATATAGAAAATTCACAAAGTTGTTATTCAATTTAATGTTTCGGGATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1	-	chr2R	6086439	5'	-	pogo	2070	1	62.59
GGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTT:1	+	chr2R	3338786	5'	+	Juan	62	1	58.90
ACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATACCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGC:1	-	chr3R	19449484	5'	+	roo	8627	1	71.22
AAATTGCATTTTGAGCAATCATTTATTCAGATGTCTTATAGAAATAAAATTGTTGCATAAATTTAGACACGATTAAAAGCTTGGAACAACCATGATATTGCCATGCTTAAAAGTTAGTATATCTTTTTTTTTAATTTGCATTATTT:1	+	chr3L	3480912	5'	-	Doc	4690	1	37.67
ATTTGCCGGCTTCTGATCTCAGACACTCTCTCTCTCTCCTTCTCTTCCCCACTCTCACTCTCTCCCATCGCCCGTTTGTTTATTTTTTTTTTATTTTTTTGTAC:1	+	chr2R	16130324	5'	-	G2	3074	2	67.31
GAAGATGGCCAGATTTTTGAGTTGTCATTTGGCCTGCGGTTTAACAAAAGAGTTTTAAGTATGGTTGCAAGATCCCACAGGCCGCGCTTCCGTGCAGCTTGA:1	-	chrX	3468243	5'	+	hopper	471	1	61.76
AGTTGAGCCAAGGCAACTGGATGTCTGAAGACGCCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCCAAATCCAACTACA:1	-	chr3L	5102542	5'	+	BS	4696	1	54.48
GAACAAACAACGAGATGTGCATGTGGGGAGGTTTTGGCACGTGTGCATGTGTGAATTGGGAACAGGGGATTGGGAAGAGGTGCATCCAATGGACATTATGATGTATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAA:1	-	chr3R	26996362	5'	+	Cr1a	4191	1	69.57
ATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTAC:1	-	chr4	651046	5'	+	micropia	4978	2	62.28
CCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1	-	chr2R	5485222	5'	+	blood	50	2	51.37
TGCCGCAATGAAAAGGGGGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1	-	chr2L	16067202	5'	+	297	6614	2	62.68
GGGCGTTTGCCATTTCAGATTAATGCCCGGCGGCGTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAG:1	+	chr2R	19798042	5'	-	Transpac	5151	2	74.29
TTTGTAAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:2	+	chr2R	6086309	5'	+	pogo	58	1	62.33
TGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1	-	chr2L	3886233	5'	-	roo	9007	2	63.04
GGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr3R	27994192	5'	+	roo	73	2	67.81
GTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAA:1	-	chr3L	20033761	5'	+	blood	7074	2	65.89
AGAATAAAAAACATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1	+	chr4	1152016	5'	+	transib2	74	1	65.75
AATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1	+	chr3R	22821972	5'	-	mdg1	7426	2	55.86
ATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chrX	18193640	5'	+	jockey	35	1	59.23
AGCGACGAAAACTACGAAGGATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1	+	chr3L	18368876	5'	-	opus	480	2	71.13
CATTTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1	+	chr3R	12618576	5'	+	F-element	44	1	55.17
ACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1	-	chr2R	16785419	5'	+	412	32	2	52.73
GATGAAGTGATAGTGCAAGGAGTACAAGTTAGTCAAAAAAACAAAAAGTGGCCAAGAAGTCGCAGAGGCAGCCTTAGATTCAGATCCAACTCGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTG:1	-	chr3L	10419863	5'	-	Stalker2	7575	2	73.98
AGTTATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1	-	chr3L	20033821	5'	+	blood	13	2	64.75
AAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAATCAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr2R	18336126	5'	+	roo	13	2	65.81
GGTGTTTAGTGATTTTTATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCGTTTGTGCCATGATGAAATGACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1	-	chr2L	12483845	5'	+	P-element	40	1	56.25
GTCGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAG:1	+	chr2R	4260422	5'	+	micropia	5214	1	46.58
GCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr2R	21907989	5'	+	roo	8736	2	80.47
ACCGAAATAAGTCATCCAAATACAAAATACATACCATCGCCTTGAAGTATGCACTACTTTTTTCAAACTATTAGCTCCGAAGAACTTCTTATCCTAAATACTAACCTTTCGGTCTTTTATATGTTAATCGCGCTGTTATATTACTG:1	-	chr3R	13770177	5'	+	BS	5043	1	75.34
AATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAA:1	+	chr2R	1320674	5'	-	diver2	4875	2	54.46
CTGTGCATGTTTATTTCTTATGTTGACGAACTATATATTGAACTGTAAAAATATTTTTCCAAGTGCACAGCAGAGAACATGAAACTAAATGTTTAGGTTTGAACCGTTGTAACTAGGTTATATGCAATCCAATTTAAGCGAAATAA:1	+	chr2R	12493643	5'	-	Tc3	1655	1	55.48
GCTAGGTGGCGTTAGTGTGCAATCTCAAAAGCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTTAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAAAATAATATGCTTCTCATATTACGT:1	-	chr2R	9463544	5'	+	rover	6959	2	77.14
CAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	-	chr2L	14772140	5'	+	roo	8708	2	51.82
ATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1	-	chr3L	3477509	5'	-	mdg1	7391	2	68.49
AAGACCCTAGAATATTCTAGTGTCTTAGGTGTACATTCTTATCTCTTAACGATAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAACAATAATATTCTTATTCCTAACGGGGATATGAT:1	-	chr3R	4215896	5'	-	invader3	5251	2	74.55
AACTGCAGTAGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTGATATAAAGGCAAGGTGGAGTGAGGAAGAGAAGTGGATG:1	+	chrX	23201996	5'	+	R2-element	483	1	57.58
CAAAAAATATCGAAAACCACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCA:1	-	chr2R	23332629	5'	-	invader4	3042	2	57.58
AAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAA:1	+	chr3R	4322610	5'	-	INE-1	90	1	73.33
TCCGTCATGTCCAGTTATTTGCCCGTAAGTGCCAGTAATTTTACCAAAAACCAAATATAAATAATACAAAAACAGTACCACTACACATATATTATCTACATACTTACGTTAAAAACAACATACCTTGGCTTTTATTTTCCATATTT:1	+	chr2R	5485416	5'	-	transib2	267	1	56.16
TATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1	+	chrX	18193680	5'	+	jockey	80	1	69.40
AACGACGCACACAAAGAGCCGGGAAGCGAGTTGCACATTGCACAGTTACCGCTCGAAATGGGATTTTTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	-	chr2R	6919762	5'	-	hobo	2921	1	62.73
GTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACATTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1	+	chr3L	11957121	5'	+	blood	34	2	52.14
CAACGTGTACTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATNAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:1	-	chr3L	24213405	5'	-	invader2	180	2	66.67
TATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr3L	16343219	5'	+	roo	71	2	66.44
AATAAATAAAGGGCTCGCTGACGCACTACCACAGTACACACAAGGGGGCTTTGAGAATCGAACGTTATAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCA:1	-	chr2R	1439593	5'	+	F-element	4454	1	57.72
AGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1	-	chr3R	16404567	5'	+	pogo	61	1	61.64
ACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1	+	chr2R	15004744	5'	+	jockey	30	1	44.52
ATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1	+	chr4	311190	5'	-	1360	3343	1	55.22
CCTTCGATAGGAAACTGCCAAGGAAGCCTGCAAGACAGGATAACAGGGAAATGGCTTAGTAAAGGAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGC:1	-	chrX	13706153	5'	+	micropia	339	2	53.24
ATTTTGTTGCCAAGTTTCCTGAATTGTTTTTGTTGCTGTGGCTTATTATTGTTATACGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAT:1	+	chr3L	2840913	5'	+	copia	66	2	63.01
ACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGT:1	-	chr2R	5173199	5'	-	Stalker	7176	4	73.29
ATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr2R	7898169	5'	-	roo	9010	2	63.70
ATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCT:1	-	chr2R	3262649	5'	-	R1A1-element	5102	1	71.33
GGACAAAACTTTCAAATATTTAAATTTCGAATCCACCTGACTAAAGTCGTTTCATCCGTTCTCCATCCAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGA:1	-	chr2L	1515417	5'	-	jockey	4768	1	62.62
TGGTAACAACATATTTTAAGAAAGAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTTCACAATGCCTCG:1	-	chr3R	31720559	5'	-	pogo	2076	1	67.53
ATAAAATATATTTTTTTGTCATTCGATTTTCAAACGCACTGTATCCAAAGTGAGATATGCATAAAATGTGAAAAATAAAGCATAATTTATGTCCGTAAATCTAGGCTAGACATTGCACACACACACACATACATAGACAC:1	-	chr2R	10600451	5'	+	Quasimodo	43	2	59.29
AGAGAAGGGGACAGCGTAGGTGTTCACTCTCTCTTTTCGCCTTATTATGTAAAGCGACTCCATTTTTTTCTTTTTTTTTTTGCTGCTTTCTTTTTTTTTTGTTCG:1	-	chr3R	8938976	5'	-	gypsy2	398	1	60.95
AGGGGGGAGGGGGGTGTTTGGTGGGAAAATAATGGAAATGGAAAATAGTTGAAAATTACGAAGTGCGCCAGCGTATGTAAACCGAAACCTCATGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGG:1	+	chrX	9528153	5'	-	roo	468	1	47.26
ACTTGGACGAGGTAAAAGCTTCTGGAAGAAGTCCAAGAAGAAAATAAAAAAAATAGGTGGCCTGACTTAATGCCGCGAAACGCAGTTCAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1	+	chrX	10253156	5'	+	hopper	8	2	74.40
GTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	-	chr3R	17817996	5'	+	roo	8689	2	61.98
CTTGAGCTCCGTCTGAGCTCAGCACAAAATGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1	+	chr2R	9662730	5'	-	412	421	2	75.00
TGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTGATATTTATTTAACTTTGCTTTTTAAACTTTGTTTAACTTTGCTGGTTTTAATTTTTTTTTTTAACTTTGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1	-	chr3L	1332295	5'	-	HeT-A	6056	2	65.67
GGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1	-	chr3L	22400364	5'	-	1360	3384	2	71.58
CAGGCCTTCTACGCCGGTCACTTTGACCTCTACAGGCGGTCTCCTTCCATATTCCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1	-	chr3R	1433248	5'	-	mdg1	386	2	60.96
TTAAAAGAATATATTAATCTTAATATAAGTGTTTGTAATTATTCATTACATATTATAAGAATCCTGAAATAGCAGTTCCCTATTTAGCCATAACTTCTAACGTTTAAGAACTGATAAGTCAAAAATACAGTTTAGTTT:1	+	chr3L	10700206	5'	+	S2	1685	1	79.71
CAAGTGTGTTGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chrX	3309570	5'	+	jockey	12	1	77.94
TAACCTTCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCA:1	-	chr2L	2122506	5'	+	Stalker4	42	4	55.48
CACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:2	+	chr4	158193	5'	+	Tabor	41	2	55.86
TGGCCAATTTTAAAATATTTACTTAAACTTGGACACCATACACACACACACACACACAT:1	+	chr2R	9770518	5'	+	accord	181	6	71.19
TTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTCG:1	-	chr2R	15064436	5'	+	412	49	2	56.92
AGTGGGGAGTCGATTTTTCTCTAAACTTAGATCGAACGTAAATAGTTAGATCTTACTTTTCTTAAAATTTTCTGCTTTTATATTGTTTAAAATTCACCTATAAATAACAAAAGAATATATAAATAATACTCAGTTTCAATTAAACC:1	+	chrX	16695503	5'	+	Copia1_DM	91	1	72.60
CAACTAAATTATTCATTTTGCATAATAATTTTCAAATCTGTCAAAAATGTACACACACCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATT:1	+	chr3L	17132542	5'	-	hopper	35	1	60.96
TAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chr2L	12892637	5'	+	roo	8740	2	75.36
CATACTATAAGAGGTCATATTAAGTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAA:1	-	chr3L	23702298	5'	+	G4	20	1	67.81
CACTAGCCCCCAAACTTGCTACCGTGACTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1	+	chr3L	7588383	5'	-	hopper	1408	2	73.91
GCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1	-	chrX	8543536	5'	-	roo	9035	1	51.69
AAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1	-	chr2R	5485217	5'	+	blood	7059	2	52.52
TGATTGAATTTTTTATAAATTCGAAGTCAATAGGTTTTACTTGTACTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1	+	chr2R	24561447	5'	+	P-element	74	1	34.93
CACTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTGTTCATTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTA:1	+	chr3R	11656078	5'	-	P-element	2821	1	31.15
GGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACT:2	+	chrX	10521618	5'	+	Tabor	6889	2	51.37
CTGCATGCCATGCAGATAGGCTATGAAATACGGAAACTATGAAACCGTCCGTATTATTGGGCACAATAGCTAACACGCTTCTACCAAAGCAATTAGAATAACAAGATGCGTACC:1	+	chr3R	22733007	5'	+	1360	9	2	79.82
TATCAGTTCGTTCTGTTCACTTCGTCGTGGCGCACGGGAATCAGACGCCCAGCAGCGCAGAGCTCTCGTAATGGTAACCACCCAGTAGTTATCTCAATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAA:1	+	chr3R	9768068	5'	-	Doc	178	1	72.18
AAATTTTTAAAAATAGTTCTGGGCATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1	+	chr3L	1534621	5'	-	pogo	2080	1	62.41
TACTATATCGTATAAAATGAACAATTAATGCAATTTTAAATAAATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1	+	chr3R	17478315	5'	-	copia	246	1	78.77
GGGCATTTTAAACAATGTGCTAGCTTTGCAGTCGCTCTTTGCGGTGCTACACTTGTACCCGCGCCAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTCATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATAT:1	+	chr2R	1070953	5'	-	1360	3151	1	53.79
CTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1	+	chr2R	13585422	5'	+	412	7128	2	70.14
AAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3L	21817987	5'	-	roo	333	2	71.72
GTATTGAGAAATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATG:1	+	chr2R	1881355	5'	-	Stalker	7096	4	57.53
GTCAGGGTCACCAAATGTTGACCTAATAATTTGACATCGATGTGCGCATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGC:1	+	chr3L	23728648	5'	+	HMS-Beagle	62	2	67.41
CTCAACACGGCCTGTACACCTTGCGGCATTTAATATTTGTGTTTCGCCCGGCACACGGGCATTTTCCACCCATTTTTCCAACCATTTGCCACCCGCACTGTACCCACACACACACATACACATT:1	-	chrX	6438219	5'	+	accord	7101	2	75.81
TAGTGCCATAAATCCGATAAATATTCAGTTGTATGTATTTAAACGACATTTCCTTGATATTAAAATGTTATATCTGCTACTGCAGGTGGAAAGTTCATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTTTTATTTTTTAAAGTCAGATTGC:1	-	chr2L	18116402	5'	+	Tc1	75	1	56.85
GTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGGATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr3R	22844288	5'	-	roo	357	2	54.29
GGCCAAAATGTAGCATACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGA:1	+	chrX	17054166	5'	+	jockey	11	1	74.58
AATAAGACAAAAACAAAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1	+	chr2R	11629702	5'	+	Tirant	9	2	77.78
CGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1	+	chr3R	21705978	5'	+	297	60	2	60.27
TTTTGAAAACTCGCCTTTATTAATAAACTTTATCGTATTTTCTGCCTTGTTAGATTTCCTTAAGAGTAAAAACTGCGGGATACGGATTGAGTCTTCCATTCGTTAAATTTTGCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGC:1	+	chr3L	22828221	5'	-	Quasimodo	6982	2	77.40
GATCAGCGTAGCTGGGCAGATGCAACATGGTCTCCTCCCCATTATCCATGGCATTTGCTGTTATCAAAATTTAGGATGATCGGGAAATCAAGGGGAAGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAG:1	-	chr2L	14762888	5'	+	roo	129	2	64.83
CAATGTTAGTGAGTAATATCATGGGTTTACATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCA:1	+	chr3R	4504013	5'	-	INE-1	548	1	72.60
AGACGAGCGCTTGATTGTGCGGCTTGTGTGACTGTTGCTGGCTATAAAAAGTGTGCACCACTCATCCAACCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1	+	chr2L	9564433	5'	+	transib2	3	1	75.76
GAAAGTGTGCCATGTGTCAGCGGTGAGTTGGAGTTAGACAACCAAACACATTGTGGAGGTGGATGCCACGGCCCAGCCCACGGAGCAGAGAGTATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGC:1	-	chr2R	21554288	5'	+	accord2	132	2	76.92
GCTTAGTTGTTTTAAAACATTGTTACTTTAACCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTATACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGATA:2	+	chr2R	16193767	5'	+	INE-1	546	1	46.58
GTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1	-	chr3L	20033809	5'	+	blood	7019	2	63.93
GGCTCATGAAATTGCTTGACATTCGGGGAAAATGCGGAAAAAAAATGGGCGAAAAAGGGCGGCAAGAGAAATAAAAGTTTTTCCTCCCTCGAGTCAAAAGAAGACTCACGCGACACCACC:1	+	chrX	17054904	5'	+	jockey	4745	1	71.67
GGCGTGTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGC:1	+	chrX	6499816	5'	-	Quasimodo	6925	2	66.67
GTTATGGCCTTTTGCTCAATAATTTAAGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTCTATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1	+	chr2L	18419114	5'	-	412	454	2	56.55
ACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1	+	chr2R	15005085	5'	+	jockey	96	1	73.97
ATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3R	25448456	5'	+	roo	42	2	56.16
TGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr2L	7898405	5'	-	roo	9053	2	66.39
GCTCACTGCTAAAGTGAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:2	-	chr3L	10292926	5'	+	roo	37	2	60.27
ACGGATCTCCTCGATGCGTCGACGGCGCTCCTCCTCCTTTTGTTCACGGTACCGCTGGGCGGCCTCCGCAAGCCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCC:1	+	chr3L	4132055	5'	+	Cr1a	3988	1	55.65
TCTACGAGACACGTATCCTTCGCTGTGAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAGTTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1	-	chr3L	11957229	5'	-	blood	7337	1	52.74
GTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1	-	chr3R	19529181	5'	+	jockey	4721	1	75.71
CTATACTAACTTAATGTACTTTAATAATCACTGCAAGGGTATATGAAATTAAAATGTATTTGAAAACCGACCACAAAGGTGACAAAATATTTTTGTGCATTCCAAGTATTTCATCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTAC:1	-	chr3R	5172831	5'	+	412	208	2	77.40
AGTAAATAGGAAAAAGATTTTACCTCTTGAGCAATAAATAGGTTTAGTAAAATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3R	20469721	5'	-	roo	9051	2	63.57
GTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGGGATCTATT:1	-	chr2R	16248007	5'	+	BS	33	1	50.81
AAAATTGAAATTTACTCTGCTTACTGGAATGTCATAAAAACGGCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1	-	chr2L	8812254	5'	-	Max-element	8509	2	60.91
GAGTGGATGTGGATTGTGCGGTTTTTTCCACTCAGCATATTCCTTTTTCTGTGGACAGGGCTAATTATGTGAACATTTTGGTCCTTCGAGAAATTCTGTTGTTTTCCCCCATCAGTGGTCAGAAACACAGAAG:1	-	chr2R	5226067	5'	+	rooA	424	1	51.88
TGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCA:1	-	chr3R	11547830	5'	+	G2	286	1	76.71
TTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr2L	3886220	5'	-	roo	9022	2	67.27
CTTTGTTCTTTATTTCTTTTTAAAAATGGTTTTCCAAACCAAATTAAAAGTGTAAACATGGAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1	+	chr3L	20168351	5'	-	mdg3	5480	2	61.54
AATATTGAAATAACTTCTATATTTCAGAACGTTTAATGTCTATTGTCAGTTAGGTTGATTGATAGATAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTA:1	+	chr2R	7586265	5'	-	I-element	5245	1	54.79
AGTAGGCAATTATTTTCGTAATATATTCAAGTAAATGGCACAAGGGTACTTTATGATAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCCGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1	+	chr3R	9456623	5'	+	jockey	4721	1	53.28
GTAAGACAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3L	15600151	5'	+	roo	13	2	52.42
TGAAGGCCTGCTTCCGAATGTTCATATTAAAAATATTTAAGCACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	-	chr3R	14364741	5'	+	roo	8670	2	76.87
AAACAGCCACCTCTGTTTTCCAGTTTTCGCTTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGC:1	+	chr2R	16893621	5'	+	hopper	382	1	76.00
ATATCATAACACAGTTCGATAGACTGGTGAGCTTGCTTTACTGAATCCATTGGTATTCTAATATTCCCATTCGATATCAGTTGACTGCTTACAGGGAATCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTA:1	+	chr2L	12915829	5'	+	I-element	5326	1	32.19
ACAAAATCCTTTTCGATCGAATCCTTTGCCAGCAGGCTGCATTCGATCAGCTTTTCAACTCACCAAAATTCATAAAAACATTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGT:1	+	chr2R	17683330	5'	-	Stalker	7168	4	56.85
GGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	27994182	5'	+	roo	20	2	59.22
GGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1	+	chr3R	25339959	5'	-	mdg1	7408	2	52.05
CTATTAGTTTTTTAAATTTCTAATGATATGCCAAAAAAAAAAGTTGTGAAGCCCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGCCCTGCACTATGGGTAAAAAGCCGGAAATTT:1	-	chrX	2244039	5'	+	transib4	5	2	46.09
CACTAAGCTTTTATATAGCGAAAAATAGGTAGATGAACATAGCAGCATTTGTTTGCTTATCATTATCAACTTTCACCCCCAACCCTGCACACACACACACACACACACATAATT:1	-	chr2L	15918476	5'	+	accord	7031	2	56.14
GAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	-	chr3R	7100890	5'	-	roo	8999	2	66.44
TGCATTTCCTTATTTGTATTGATAATACCCAATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAATGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTTAAAA:1	-	chr2R	5265178	5'	+	Q-element	430	2	51.43
ATTAATTAAATCTTTATGGTCAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1	+	chr3L	3500904	5'	+	opus	16	2	69.05
CAGTAGATAAAACAAGTTGGGACTAACTGGATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCG:1	+	chr2R	20194176	5'	-	Max-element	8509	2	61.94
ATGTATTTGAGCTGCATAATATTTATTATCTCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTG:1	+	chr2R	12840437	5'	-	jockey	4646	1	69.00
ATCTTTGCAACTTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	-	chr2R	16785457	5'	+	412	18	2	71.64
GTCTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTG:1	+	chr3L	28063318	5'	-	Stalker	6968	4	76.71
GTTGGGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTC:1	-	chr3L	25401043	5'	+	Doc	20	1	61.43
CTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1	+	chrX	13504158	5'	+	412	54	2	60.00
AATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1	-	chr3L	18369005	5'	+	opus	154	4	66.37
AAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGG:1	-	chr2R	4939193	5'	-	1360	3367	1	32.86
CAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTCGTCTGCGGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATC:1	+	chr3R	25423228	5'	+	3S18	5845	2	72.59
TTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAACAAACTCATAACATAGTTGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	-	chrX	5643579	5'	+	roo	52	2	54.29
AGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1	-	chr2R	20194317	5'	+	Max-element	1	2	76.70
ATTGGTATCTGAAATTTTAAAGTAATGTATTAAAAAGCCCAGTTTTTGTTATTATACAAAAATTTAAATATTTANATGGCCAGTAAGGGTGTTTAGAATTGGGTAAGCACTTCTGCTAATCGAGTAACGGGTATCTGCTAGTCGCG:1	+	chrX	17816554	5'	+	INE-1	552	1	44.52
TGTGAATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTGTTCGGGCCCCG:1	-	chr2R	18609424	5'	+	opus	7166	4	75.96
CTTACAACATGTTGCAAGTTGCAAGCTCGTCGGCTCATCAGTTGGCTCAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGCGCGAGTG:1	+	chrX	7195045	5'	-	P-element	2833	1	39.37
TAAGCAATAAAGAAATAAATATTTTATATTGCTTCATTAGCATTTTCAAACGATACTTAAGAAATTTTTCAGCAATGCAAAAGTTTAAGAGGTGAAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACA:1	+	chr2R	5693610	5'	+	I-element	162	1	66.44
GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCCCTGTCCGTCTTTCCGTATGAACGACGAGATCTCAGGAACTACAGGGTACGGCAGCATAATTACCTTTTTTCAGAACTCAATAAAAACTTTTGTAG:1	+	chr2R	5250069	5'	-	mariner2	859	1	84.13
TAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	-	chrX	9540121	5'	-	roo	9055	2	65.45
GATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1	+	chr2R	5485134	5'	-	blood	329	2	70.64
ACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chr3L	233253	5'	+	roo	80	2	74.48
CGGTCAGTTTGAGATATTTTTCTTTGTAGCAGAGACAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1	-	chr2R	7586215	5'	-	I-element	5301	1	55.48
GTCGTGCTGGTAAATTGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTG:1	+	chrX	2842452	5'	-	Tabor	7299	2	68.28
ATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATAC:1	+	chr2R	16891841	5'	-	hopper	1342	1	64.83
ATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	+	chr3L	20654481	5'	+	roo	8707	2	56.30
GGAGAAACATTTTTCACTTGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chr3L	19036073	5'	+	Tirant	8122	2	60.67
TGCCGAAAAACATTTCCATTTTGATAACTCGGCTCTGTCTCCGGGTTTCCCTCGGTTCTCCACTTGCGTAATTTGCAATTATGGCCGTTACGCATCTTGGTATTCT:1	-	chr3R	30091369	5'	+	1360	3378	1	76.42
TACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1	-	chr2R	5311502	5'	-	1360	3344	1	59.35
AATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATCACAAGATGCGTAACGC:1	+	chr3L	25406608	5'	+	1360	11	1	67.61
GAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTT:1	-	chr2R	23332596	5'	-	invader4	251	2	81.68
GACTAACCAAGTGCCTGGCCTGGCCCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1	+	chr3L	4755206	5'	+	jockey	4699	1	57.14
CATCCTATGCAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCCTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATTAGTAATCTATAAGTAATCAGGAGCAATAGCCGAGTC:1	-	chrX	14815845	5'	+	INE-1	92	1	75.54
GTCGTTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1	+	chrX	13066496	5'	-	jockey	4951	1	51.49
ATGCAATCAGTACAAATAATATTTCGATAGTTAAAACAAATTATTATAATTGAACAAAGAAAACAAATAATAGATGTATATAACCATTTAACATTCAGGCGAATACATTCATGGTCAAAATTATTTTAAC:1	+	chrX	22897549	5'	+	Bari1	5	1	71.54
AAGTTCGTAGTTCGTTTCGAGTAACGAAACATGAAATAATGGGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACC:1	+	chr3R	6611156	5'	-	HMS-Beagle	219	2	67.12
AATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1	+	chr3L	1534670	5'	-	pogo	2035	1	72.87
ATGCCAACGGACAGGAGGTGACCGTCACCTACAAGGCCGATGACCACGGATTTGTACCAGAGGGCGGAGCATCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGA:1	-	chr3L	21666616	5'	+	Cr1a	4014	1	71.00
TATTAGTAATGAAATTCTGAAAAATGTCAAATGTCTTTGTAGTTTTTACCATAAAATATTCATGTAAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGA:1	+	chr2L	18294116	5'	-	roo	411	1	56.55
CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGTAGCGTTACATCGTATTACTGGGGCGCTGGCGTGCTTACGTAGTT:1	-	chrX	12657099	5'	-	Stalker4	126	4	93.15
TGTGAACTCTTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGGGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1	-	chrX	10521746	5'	-	Tabor	442	2	52.08
CTGTGGGTGGGGTGTGGTTTTTCTGGGTGGGTTCTTCGAATGAATGAATCTATTTTGGAGATGTCTTTGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTA:1	+	chr3L	3058329	5'	-	297	426	1	62.86
ATGAGATACGAACAGACCATCAATCTATATCTTTTACAAAAACTTTTTCTTTTATAAAAACCCGAACGTAGAAATGAAAAGATGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATAT:1	+	chr2L	22305354	5'	-	copia	4922	2	56.74
GCTCTTAACCCCTTCGTGTCACAATCTGCATCACAGCTGCAGGTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCGGT:1	+	chr3L	12982847	5'	-	jockey	4680	1	56.06
GGGTGCTTGCCAACGAATTGCAGATGCCCTGGAAAATGTAACAATGGTTTTAGAAACAAATATACCTTCTGACAGATTTTCATATACCAATTGCTAATTGGTGTATGTATGCGAATCATTATTAATATTTTTTTAAAAAAGAAGAA:1	+	chr3L	18423628	5'	+	TART-C	11035	1	76.71
GTTGTGCAGGTGAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATAT:1	+	chr3R	26659708	5'	+	HMS-Beagle2	17	2	68.49
CGAGTGCTTTTCAATGAGTACACAGCAGAAAAATTAACTGCTTTAATCGTATGTAGAACTAATATTATATGTCGCACTTTTAAAAGATTATTCAGATTCAGATTCGAGTTC:1	+	chr2R	22406767	5'	+	transib2	2539	1	43.24
CAAAAGCGTGAGTTTGATTTACAATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	+	chr3L	11530877	5'	+	roo	59	2	63.45
CCACAAAATAACATAACATGTTTTGATATTTTTATTTCTATTATTACTTGTTGGCTACATGTTTTGCAATTTAAAATACGATGTTATTTCATGATTTCAGCAGATGTTCGCTTATGTTGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAAT:1	-	chr3R	7482444	5'	-	412	7278	2	77.40
AGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1	-	chr3L	17560384	5'	+	pogo	58	1	58.22
AAGACTTGATAGAAAAGTAAGATTAATGTTAGAATTAATAAATAAAATCATTTATGTTTATTAAAACAAGAAAGAATGTTTGATTGGACTTCTTCGAGTAGATAGTCGACTGACGAACTGTCGTAACGTGTAACGAAATAAATTGA:1	+	chr2R	5600941	5'	-	Gypsy12A_LTR	2256	1	56.85
TTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr2R	20596438	5'	-	roo	9052	2	64.75
CTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1	-	chr3L	233323	5'	-	roo	353	2	65.12
CTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr3R	7835111	5'	-	roo	9014	2	58.22
GCACTTAGTGCAATTGGATACTTACGCAGCTTTGCAATAATTAAAGGACACTGCAACAATAGCCACACCAGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1	+	chr2R	25249959	5'	-	HeT-A	6061	2	73.68
AATAAAAATTCGTTGGAGTAAACCGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTGGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTCTTCCTTGCAG:1	+	chr3L	21855403	5'	-	blood	348	2	63.70
CATGGAATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGA:1	-	chr2R	20497050	5'	-	blood	7381	2	67.91
ATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1	+	chr3R	25826666	5'	-	mdg1	7397	2	58.90
AAAATACAATTTTTTCCACTCATTTCTCATTTCATTCATTTTTAAATAATTATAATAAGCATAGGCTGCATAATAATAAGTTTTCTTGTAAGAGGAATTGGATGTAAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTAT:1	-	chr3R	1522822	5'	-	Doc3-element	4483	1	56.85
ATATTTTAAGGCCGCTTTGTAAATGCGCAAATTTTGTAACAAATAAAACAAAATGACGGAAGTAGCGATGCGTGGCCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1	+	chr3L	12308297	5'	+	hopper	44	1	54.11
GGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGTGTCAAAAG:1	-	chr2L	17079818	5'	+	jockey	4725	1	69.64
AGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTACGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr2L	5254337	5'	+	roo	58	2	77.06
CACACTCGCACACCCGCTCACGCACACAGAGGCAGTCGCACCAACACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1	-	chr2R	21572182	5'	-	hopper	1375	1	60.71
GAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	+	chr2R	18336147	5'	+	roo	8727	2	64.38
CATTCGGCATACCGTTTTCACCTTGGCTTGTCATGTGAAATATTTGCCCAGGTGTTGAGTCTCCATCTCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1	+	chr2L	20138988	5'	+	jockey	4773	1	54.26
TCAGTATCGGCTTAAAAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1	-	chr2R	6885420	5'	-	flea	227	2	55.17
AGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGTGCGATAAATTATAT:1	-	chrX	10640104	5'	+	roo	8735	2	65.75
TAGAAAATATTTAATGGATCGGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1	+	chr3L	15995893	5'	+	297	6610	2	63.70
CTGACTTTTCTTAAAAGTGACATAAAATCGTTATGACTTATGACCAGAAAAATTGACGCCAGTCAAAGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGGGATGCCAAGTCGCACTCCATCTTCTTTTGCGATGTACAGCAGC:1	+	chr2R	5488009	5'	-	Rt1a	4851	1	57.46
GCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGTGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACTAC:1	-	chr3R	11547774	5'	+	G2	342	1	60.96
CGACGACCGGAAATCGATGGCCTGTCTGTATCACCACGGCTCACATTGGCACTTCTCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1	-	chr3L	16343314	5'	-	roo	405	1	68.82
CATGCTTGTGGCCCAGATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1	-	chr3L	2362422	5'	-	Stalker2	358	2	56.82
GGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTTTCCGCTCGCTCAC:1	+	chr2L	23372628	5'	-	1360	3305	1	75.34
AAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3L	15600162	5'	+	roo	20	2	45.00
GTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGATCTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1	+	chr2R	20596473	5'	-	roo	353	2	62.60
TTAAACTAATTTATTGTATTTAAACGACCTTTCCCGGCCACACACACGGACAATGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTCTTCGC:1	+	chr2R	16880921	5'	+	1360	42	1	56.91
AATAAATAAATAAATATGGCAATATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1	-	chr3R	12780918	5'	+	hopper	5	2	81.69
CCCAGTTGTGCAGGTGAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATC:1	+	chr3R	26659704	5'	+	HMS-Beagle2	11	2	72.22
ATATGTGTTATAATTTATATTTTAAATACCTAAAAATTCGACTTTAAATTTAATACATATATTTTTTGGTGGAATAAATGTGGTTACAACAGCATTTTCAAATTAAAACAAGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCTGACTATCAG:1	+	chr2L	22407685	5'	-	INE-1	562	1	52.74
TTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1	-	chr3L	20033814	5'	+	blood	7037	2	57.24
GTTACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGT:1	-	chr2R	5924453	5'	-	jockey	4733	1	52.14
GGGCGGGGGTCGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGCGAGGGTATTGTATTGTGCACACATATCGAACAAGCA:1	+	chr2L	13585842	5'	+	Tabor	7	2	60.76
ATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGCGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	-	chrX	6486827	5'	-	roo	9036	1	52.45
GTTAATTAAATAAACTTTGTCATCTGTCGAATACAACGTGGAACTCTTTGAATTATATGCTCTTATAATTCAAGATGCAAGCCTGCAGTTATTGGAAAATGTATATATGTATTTAGTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3R	15835936	5'	-	roo	9026	1	36.30
TTAACTTGGTATTTTATGGGTATTTTCCAAGTGGCTTAGTATTTTATAAGCGTGAGTTGGCAGCCCAGATGCCAACAAGTATATTTCATTTGTTGTGTGTGCTATATAAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1	+	chr2R	23877665	5'	-	297	387	2	78.77
AGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACAGCAAGTGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACACTAC:1	-	chr3L	17205266	5'	+	hobo	28	1	58.62
CAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	+	chr3L	15600157	5'	+	roo	33	2	43.48
AAGCGTGAGTTTGATTTACAATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTT:1	+	chr3L	11530880	5'	+	roo	32	2	54.78
GCTCTTTCATTTATCAATTTTATTCATACTTCTCTGGAAATTTGTGTTCATTGGACATTTTCTCATGAACGATGTCGATTCGATTTTCTGCAAGTGCAGAATACAGCACCCTACCTCTGGTACGCATCCTGTAATTTCCCCACCA:1	-	chr2L	18626586	5'	-	G5A	442	1	53.79
ACAATCACAATCACATGAGAGAGCAGTGTGTGAGTGTGTGTGTA:1	+	chr3R	28560671	5'	-	accord	7103	2	90.91
GATATATATAGTCCTGTTCCATCAATCCAACCTGATTGCGATTTGATGTGAAGCGCTTGGCAAATATGACAGTGAACCAAATGTCCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAACATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1	-	chr3L	15490440	5'	+	copia	4906	2	61.64
ATTTGCAATTACTTGTAATCTGGATTAGAAGGCCATATGCTCCTTATGTGCTTAGTATTAGAATTAGAAGTTATACTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTA:1	+	chr2R	9325384	5'	+	BS	5040	1	47.95
ATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAAT:1	-	chr3R	17831854	5'	+	F-element	71	1	74.78
TGAAGAAGTTTTTCGGTACTCCGTATCACTCATTACTTAATTAGTCGCAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1	+	chr3L	12974075	5'	+	jockey	4812	1	67.12
GTTTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2	+	chr2R	20496863	5'	+	blood	7027	2	71.92
AAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGACATGTCTG:1	+	chr2R	5617524	5'	-	invader1	3941	2	79.03
ATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGACCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTCCG:1	-	chr3L	8249091	5'	+	jockey	4540	1	55.56
CATCATGACAAGAGAACAGAACGCAGATGTCCTTTTGGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAG:1	+	chr3R	27424807	5'	-	blood	348	2	63.01
ATGCAGAGAGCTTGTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAG:1	-	chr2R	5173560	5'	+	gypsy	21	2	65.71
GAGTGCTCTTGCTTTTGTTGTTGTTGGTACAGCGGAATTGTACACCGCTGTCGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAG:1	+	chr3R	11020189	5'	-	F-element	472	1	58.40
CTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	+	chr2R	12835043	5'	+	jockey	75	1	66.19
AAGAGAGGAGCTAAGAAGATCGATGTTAAGATTGGCGGCAGAACATTCATGAGGAACGTTGCACACCTAACACAGTTCACTTCGCACTTT:1	-	chr3L	25725603	5'	-	gypsy4	352	1	77.78
TTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chr3L	15177230	5'	+	roo	80	2	72.60
AAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	+	chr3L	11441725	5'	+	roo	32	2	54.17
AATTTTCAACAATTATAATTATGCGGATTATATTATTCTATATAAAGATATTATCTATCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1	-	chr2L	15248009	5'	-	Transpac	266	2	54.26
GTGTAAAATGTTTGAAATACATACACACACACATACACA:1	-	chr2R	14014157	5'	+	Quasimodo	38	4	64.10
GCTTCTTTGATTTGCTAGAAAGCATCGCTTCAAAGGCTAAAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1	-	chrX	7256224	5'	-	412	455	2	55.07
GTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr3L	14603236	5'	+	jockey	35	1	62.14
TTAGTATTTGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1	-	chr3R	17243255	5'	+	hopper	12	2	72.46
TCATATTTATCGAAAACATTTTGACTAGAACTGTATTAAAAAGACGCCGTTTGTTTTGCTTTGCGTTGATATACGTTTTTAGAAATATGTAACCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTCCATGTTAC:1	-	chrX	13704381	5'	-	G2	155	1	61.64
ATCTGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chrX	13039572	5'	+	roo	8714	2	55.17
ATACTATACTTTACTATATGAGAGGACGTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1	+	chr3L	10056084	5'	-	transib2	2779	1	53.42
AAGCATATGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGTAGGACCTCATGTTAATATAATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCCCCATATGCTCACTT:1	+	chr3R	19446152	5'	+	R1A1-element	5247	1	58.97
TCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1	-	chr3L	20033794	5'	+	blood	35	2	47.01
TCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACT:1	-	chr3L	9907367	5'	+	BS	5048	1	54.11
ATCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTCTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCC:1	-	chr3R	934291	5'	-	Rt1b	4740	1	59.59
GTAATCGATTTCTGCGACTCTGGGCGGGAATCGTTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGCATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1	+	chr2R	24218489	5'	+	412	7078	2	65.97
TACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1	-	chrX	6522054	5'	+	F-element	65	1	58.27
AAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1	+	chr3R	24455357	5'	+	Quasimodo	60	2	67.12
TACATAAGGAGTATCAAGAGAGCACCATAATATAGCAGAAAATCGAATTGACTTTTTCAAGACTTTCCTCACAGTTCTAAAACTGTTGCCCACAATCTCGTGTATAGGGGGAAACTGAAGAGTCGA:1	+	chr2R	24896084	5'	-	roo	451	1	77.78
CCTTGCTAAGACGCAGTGTGCGCCTCTCCACAATTACCGCATGTGGCAGGAGCGTCTTTGGTCTTAGCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1	+	chr3L	26645880	5'	-	1360	3364	1	50.44
AGATCATTAGAGATTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	-	chr2R	23803036	5'	+	roo	46	2	59.84
TTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1	-	chr3L	20033814	5'	+	blood	7031	2	59.71
AATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1	+	chr2R	15064343	5'	-	412	449	2	53.60
GTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chrX	5643482	5'	-	roo	339	2	66.44
ATGTGTGTTTGTGCAGGTCCCCCGCAGAAAGAGGGAGCGAGACAGCGGCGAGAAAGAGAGGAGCGGAGAAGTGGCACCAGCCAAAACATATTAAAACATTAATTATAATACATAACAAATAAAAATAAAAAAACA:1	+	chrX	7317379	5'	+	Tc1-2	481	1	60.00
ATATAATATTTCAGCTTTTCTTTATCTGAATATTTATGATTCTTTGATTTAAATTGAAAATATTGCTCAATAACTAATATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1	-	chr2R	20944465	5'	+	pogo	37	1	54.79
AATACANTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAG:1	-	chrX	2842561	5'	+	Tabor	88	2	77.40
TTTCGACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1	-	chr2R	2016936	5'	-	1360	3346	1	56.85
CAACTGCAAACAGGGCATTTTTGGCAGGCTGGCGCAAAGTGACAAACAAATAGCCAACCGAAAGTGGGCAAAGATATGGGGGCCACAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAAT:1	-	chr2R	23721660	5'	+	I-element	4918	1	66.92
ATAATGTTAATGGTGTAAATGTTTTAAAATTCACACCATTTTTAGATAATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCC:1	-	chr3R	9702318	5'	-	Stalker	6861	4	61.60
AAAGAGGGCAGGCAATGGGGACCCGGTTCACTTTTTCCCGGCCTAGCAAAATTCCCGGCCCCAAAGGACCCTCGCACACACACATATATCACCACACTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1	-	chrX	17963981	5'	+	jockey	4795	1	60.96
CCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTACGTGAAATTAGTTTGCGCGGT:1	+	chr3R	13457927	5'	+	X-element	52	1	61.05
ATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTG:1	-	chrX	21667912	5'	+	gypsy2	6528	2	67.39
CGGGGAAAATAAAAGCGATGAGAAGGGAACTGTTTCTTCTGAGCCAAAGGCTCTCAGTGTTACCAAAAACAAAATCGCCGATGATAAATCTTCTGATAACGCAACCAATGGCCGTAAGAAGCAAAAGAAAAAGGAAAATAAAAAG:1	-	chr3L	5498513	5'	+	Doc2-element	253	1	40.69
TAATATGTAATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAG:1	+	chr2L	22315552	5'	+	frogger	2315	2	53.85
AAGGGTTCAACAAAAATATTTTCAACCGAAACAAGCCAAACAAAAAAAAAA:1	+	chr2R	18723242	5'	+	Porto1	157	1	88.24
TACCAACGTACCGGTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	+	chr3L	22400242	5'	+	1360	17	1	68.33
GCACTAGCCCCCAAACTTGCTACCGTGACTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACTAGTATGCAA:1	+	chr3L	7588382	5'	-	hopper	1378	1	58.90
GTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr3R	7835092	5'	-	roo	394	1	68.85
CACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCA:1	-	chr2R	23332612	5'	-	invader4	263	2	70.37
AATTAGAAAAAATTGAAAAGGTCAAATTTTTGATTTTGATGTTGAGCTCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1	-	chr2R	5311573	5'	-	1360	3375	1	39.04
AAATACATTTTTTTCTGCAAAGTTTGTCATTGTCACTGTGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAAT:1	-	chr3L	17557742	5'	-	jockey	4820	1	73.79
CACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1	+	chr3R	28758309	5'	-	mdg1	348	2	67.81
ATCACTTCAGCTTAGACGTCTATTTGCACAAGTTTTCATGCATCATTATCCATAGTTGAAATCATAATGGTATATTTTGTCCAAACAGACGAAATATAGTCGTAATCCTCAAGTGTT:1	+	chr3R	7193226	5'	+	Burdock	30	2	68.38
GAATACACACACACATACTCATCATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1	-	chrX	3308384	5'	-	hobo	2911	1	52.88
ATATTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1	+	chr3L	4948047	5'	-	hobo	2917	1	52.63
TACTAGAATCTTTTTCTATCATATTTAAATTTTACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTT:1	+	chr2L	20117861	5'	-	invader4	3055	2	44.14
GCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAACCATCGGACAC:1	-	chr3L	16750756	5'	+	Tirant	34	2	54.92
ATTAAAAGTTTGCGTTATTTGTACATATGTACTTTATAGAATCAGATACGCTCCCTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGG:1	-	chr3L	26640460	5'	-	Quasimodo	213	2	57.03
TTTGTCGCACAATGTGCACTTTGGGACCTTTGCCCGAAGTTCTTCCTCACCTTCAGGCATTTTTGGTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:1	+	chr2R	1569148	5'	+	jockey	4778	1	51.91
AAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chrX	10640029	5'	-	roo	8996	2	68.28
GAACCCTTCTAACTTTGTAACACTAAATTTCAAAGTTGAAGATACTTAGTGATGAGTCATTCGGGCTAAATGGTCCAACTTGGCCCATCCGAATAGCCAAAAAAAAAAACAAAAATGTGG:1	+	chr3R	24272305	5'	-	hopper	139	1	51.67
ATTAAACAGTAAACACTTCAAACGTAATCGAAAACTTACAGTCTTCCATTAATATAACTTGGGTGTTATCCATGTTTGTACTAGATGCAACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAACACGGTTTTACGAAACGCAGATCAA:1	+	chr4	270521	5'	+	Q-element	214	2	60.96
ATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	-	chr3R	17420493	5'	-	roo	338	2	72.26
GTTTGAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1	+	chr2R	2016797	5'	+	1360	39	1	58.90
TTTGTAAAGACACGGCTACTCGATCATGAAATAAAGTTTAAAGGAATTAACAAAGACACAAGTGCTGACCCAGCATCGGGCCGGAAACCC:1	+	chrY	676872	5'	+	Gypsy6A_LTR	67	1	73.33
GGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAA:1	-	chr2L	23034071	5'	-	FB	377	1	44.14
ATAGAAATAGGGAAAGATTACTTAGCAAAGATGGTAAAAAAAAAGGTTACCCACCAATCCTATATACACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCAGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCA:1	+	chr2L	5409963	5'	+	I-element	166	1	54.17
GTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCCACCGCCCAACCGAC:1	-	chr2R	1949129	5'	-	Cr1a	4425	1	79.17
ATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1	+	chr3L	16015245	5'	+	1360	77	1	71.23
GAATTATTACCGATATGGTCAAATCATTTTGAAATTGTATCTCGTACCGTAATAACGGTAATTTATCTCGTATTATACCCGTTACTCGTAGAGTAACAGGGTATACTAGATTCGTTTTAATGTATATAACAGGGAGAAGGAAGCG:1	-	chrX	151651	5'	+	INE-1	30	1	58.62
GAGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCGGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1	+	chr3L	15519737	5'	+	pogo	50	1	53.42
AATGCGACTTGACAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCACTGGTGTGCCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1	-	chr3L	13574511	5'	+	hobo	60	1	65.89
AAATATTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1	+	chr3L	4948045	5'	-	hobo	2913	1	51.49
CTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGCG:1	-	chr2L	15833110	5'	+	hobo	41	1	57.53
CAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr2L	3114549	5'	+	roo	8737	2	76.15
TCAACACTCTAGCTTCAATAGATCCTGAGATCGACGGACAGATCAGGAATATATGTACATACATACATATGCATGTATGTACATTACATGTACATACATACCGTATAAGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTT:1	-	chrX	21125652	5'	-	INE-1	34	1	77.04
AGCATAGCGTGCTGTCTTCCCATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	-	chr2L	3114582	5'	+	roo	44	2	53.73
AGCATATTCTAGCTTTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1	-	chr2R	21920633	5'	+	jockey	21	1	72.22
ATACAAGTCTTCTTATAATCCTTTTGCTAATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1	+	chrX	13066463	5'	-	jockey	4972	1	67.81
ATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAA:1	-	chr2L	17471707	5'	-	roo	9045	1	60.94
TAGAAGTTTTGTTATTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1	+	chr2R	11363752	5'	+	Bari1	57	1	64.93
GTTGAACGTACATATAAAGGGTGTGATATCACAATTATTTTCGATGACTTCGTTTAATGTTGGAAAAGTAGACGGGAATGCATTACATCGAAGTGAACTATTTAACTTTATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1	+	chrX	2297029	5'	-	Tirant	343	2	72.60
GATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1	+	chr3R	17817884	5'	-	roo	9012	2	59.31
ACAAGATCCATAAAAATCAATAGACACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1	+	chrX	17756545	5'	+	297	6611	2	61.64
CTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	-	chr3L	16343293	5'	-	roo	331	2	67.81
ACTGAGGTAATCGTTGATGGCCAGTGGCTTCAGGTTGGGAAGCAATTGGCGAACGAGAAAGGTGGTCTCCAGCAGTGGACTTCGGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTT:1	-	chr2R	13671157	5'	-	Bica	4646	1	55.40
TAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1	+	chr2L	8986138	5'	+	412	7132	2	73.10
CCCTGCTCTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAAC:1	+	chr3L	2362319	5'	+	Stalker2	60	2	55.86
CAACTCCTCCTTTTCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	-	chr3L	20888840	5'	+	1360	17	1	71.03
TTTTTTAATAATAAAATAAAATAACTACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGAGGTAGGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAAAATAATTACATACGCATTGGCA:1	+	chrX	3074843	5'	+	gypsy11	4057	2	68.80
TAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATCGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGA:1	-	chr2R	5173231	5'	-	Stalker4	371	2	53.73
AACTTGGCTAAATAGATCAAGAATATATATAATGTATCATATAGAATTTTACACATTTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCT:1	-	chr2R	545108	5'	-	Stalker4	6994	4	53.45
CGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAA:1	+	chr3R	22388959	5'	+	G2	2652	1	52.74
CGGATCTTGCCGGGGAAATGAGTTCCGGCGCCTGGCTGGATGACCTCAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1	+	chr3R	11496478	5'	+	1360	19	1	73.97
GTCATTGAAATTCCCGCATGATGGCGTCCCCCTGCTGACATAAAGCTGAAATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1	+	chr3L	12861684	5'	-	pogo	2080	1	65.89
TATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGA:1	-	chr3L	20033818	5'	+	blood	7011	1	70.73
AAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAA:1	+	chr2L	13584669	5'	-	pogo	2020	1	75.71
GATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr2L	2007439	5'	-	roo	334	2	69.93
CTGTCCGTGATTCATGGGATTCATGCCACCACAGACATTCCCGCAAACTAACATGTGCCCGCCGGTTCCTGGAATTGAAGACTGCCCTTTGATGTTATGTTTCATGCACTGAGCCAACTGTTCT:1	+	chrX	16810894	5'	-	Gypsy6A_LTR	23	1	63.71
AGTACCCCAATGATGACGGTACCGCCACCCGCCCTCAAAAAAAAAAATTAAATAAAAAAAACAA:1	-	chr2R	13308786	5'	+	Doc	4697	1	40.62
TGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGAT:1	+	chr3L	22437858	5'	-	roo	352	2	55.94
AATTCTTATATTATTCTTTTATAACAGTCTATTCTAATGACCAAGAAAAATTCGTATATATACTTTATATAGTGACGTCTTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1	+	chr3L	20324659	5'	+	297	6636	2	62.33
CTAGCCGACGACTCGGCTCCTTGAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1	+	chr2L	14081271	5'	+	1360	11	1	74.62
AATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGAT:1	-	chr2R	20596555	5'	+	roo	8726	2	63.01
AATGCTTGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACA:1	-	chr2R	20194338	5'	+	Max-element	8239	2	78.74
TTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr3R	16076858	5'	-	roo	8989	2	75.34
ACCAAGAACGCTTCTAGGAGCACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACA:1	-	chr2R	4677388	5'	+	invader3	27	2	66.21
ATTTTCGCTAAGTGCCCGAGTAGCATAGAAAACTTTTACTTTTGGCAAGCTCGCTTTTCAACCTGTGTGACACGGACATTTTCCAGTATTTATGTCAGTTTGTTTTTTTTTTTGTTATTTT:1	-	chr3L	2427624	5'	-	gypsy7	5009	4	61.16
GACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCC:1	+	chr2L	20117896	5'	-	invader4	260	2	66.44
AAAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGCGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1	+	chr2R	11629716	5'	+	Tirant	8108	2	80.53
CGGGCGATGATGCCATGCAGCTCTCAGCTTGATTAAATTATAAAAATTGTATTATGATGGAAGTCAGTGCCCAAAGGCGATTCCAGATTCGGATTTCGTCGAGTCACAAGAAGACTCAAGCGATACCACCCTCATGACCTCCCTA:1	-	chr3R	29391977	5'	+	jockey	4760	1	68.28
CACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr3L	14638617	5'	+	1360	55	1	66.94
CACCGAAAGTCACTGCGATGTGTGCACATATGTATGTAAGTTAAGAACCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	+	chr2R	9544046	5'	+	opus	7058	4	73.45
TGTGGATTTGGTGTTGTCAGGTATTCCCCGACTGTTCCTCCGTTTCCTTAGTCACCAATTCTTCTTATTCTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAATA:1	+	chrX	21009999	5'	-	pogo	69	1	51.03
ACAGGACTGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1	-	chr3L	22400376	5'	+	1360	2	2	76.92
AATTGCAATTTCCACGCCCAAGTTTCGGGCACTTTCACTTNACGATGCTCGCCCCACCTCCAAGGACCCAAAAAGCAACCCCATTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTTTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACGTAG:1	-	chr2R	14703783	5'	+	baggins	5024	1	56.55
CTGAAGCGGCACAAAATATGTCTCTGTTTACATTAAAAACCTATGTACTCTTAAGACCTACACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAAA:1	-	chr3L	25824651	5'	+	X-element	4718	1	57.53
TATCCATTCCATTCAGATTTTAATTTAATATAGATATTACTTTTGAGTATTTTTCTACAAATGGAAGCTATCAAAATAATAATTTTCAGCAATCATAGCTAAAAAAAGTTGAAAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCT:1	-	chr2L	11504640	5'	-	flea	310	1	71.92
CGCCGAACGAGATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1	+	chr3R	28758272	5'	-	mdg1	385	2	42.47
TCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:2	+	chr3R	15072532	5'	+	pogo	34	1	60.27
ACCCAGTTTGACATCGCCTTCAGTGCAAGAATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2R	14542084	5'	-	roo	396	1	71.23
CTTTTACGCCCATCACTTCGCACTGCGTGGCATGCCCCTTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATA:1	-	chr3L	22917676	5'	+	jockey	4836	1	74.10
AAGATCGGAATCATTATGGCAATGTTGTTGTTTGTGTTAAGTTGTCAAGTTTCTAGCGCATTACCTAAAGATATAGCACCAAGATATTCTATAGACAAAATCCTAAATATAATTTATAGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAT:1	+	chr3R	19448182	5'	-	roo	8719	2	72.92
CTATGGCTTCTAATAAATGTGAAATGTCAGTACCACTTCAACCTTCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTGGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCATATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAAACACA:1	+	chr3R	31109684	5'	+	I-element	92	1	75.71
ACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCGATACGTAGCC:1	-	chrX	21667919	5'	+	gypsy2	6564	2	72.59
ATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chr3R	13360328	5'	+	jockey	86	1	76.52
TTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGATCCGAGTGTCCGC:1	+	chr2R	913745	5'	-	rooA	7127	1	67.67
GCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTT:1	+	chr3L	15519757	5'	+	pogo	69	1	66.90
AAGGACACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1	+	chr2R	9791539	5'	+	412	15	2	74.82
TAGAAGGCCTGTTCAAAACACTACAATTATTAAATCTGTATATTTCAAAACAAAAATAAATAATAAAAACGGTGACACCCACACCTTTTAACAATTTTTACATTTTTTCTCATTTTACTCCCAATATCTATCGATATCCCAAAAAA:1	+	chr3L	23689577	5'	+	INE-1	499	1	45.89
GCGTTTAAGTTGACAAATTGCAATCGAGAACAAGTGAAGTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAA:1	+	chr2L	2122365	5'	-	Stalker4	7326	2	56.16
CATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1	-	chr2R	16785408	5'	+	412	64	2	68.70
TACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	-	chr3L	16015364	5'	-	1360	3380	2	71.97
ATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1	+	chr3L	3863456	5'	-	blood	298	2	74.82
GGCAGAAAGACACTCAGATAAACTGGTTCCATTGTAGTCTTAAAAGAAAGCTGCCTTTAAACTCGAGGGTATATCGCCTTTAGTGGTATTTGTCTTCTCACTTCTCGAGTGCATCAAATTTACACAACTCGCTGATGAAATCTCG:1	-	chr3R	30095142	5'	+	G6	1764	1	55.86
TTATGATGGGCAGCACTGTGTCCGCTAGGTGTCGCCACCTGATCATATTAATCCATATTACGTTTCTCATATTTCATATTTTCATATTACGTTTATAAAAAAACAGAAAAAAA:1	+	chr2R	12521373	5'	+	HMS-Beagle2	480	1	74.34
AGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	-	chr2R	9632208	5'	-	roo	359	2	52.05
TGTCAAAGGCGCTAGCCCTGGCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1	+	chr3R	12886890	5'	-	roo	9027	1	53.85
GTTTTTATGAAATGTTCAATTGAAACCCATTTGATACATAATCTTTTTCTTGGTATTAAGTATTAGATTACTTGATGGTATGTTTTTTAAAGTGTAGGCGTGCACGGACATATCTATATACGGTCTGTATGTATGTATATATATTT:1	+	chr2R	14520644	5'	+	1731	99	1	46.58
AATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTC:1	-	chr2R	9500072	5'	+	G5	4742	1	47.95
AAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1	+	chr3R	14651191	5'	+	P-element	42	1	53.33
CATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGA:1	-	chr2R	5173545	5'	+	gypsy	41	2	54.48
ATATACTTATTTAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chr2R	14542264	5'	+	roo	8694	2	59.59
CGATATGTGACACTTGCCCATACACGAGCACACGGACGCACGCACAAACACTTGCCAACAAACATGTGAGTTGAAAACTTTTAAGAGGAGGGTCCAAATAAAAAAAAAAAGGAAAA:1	+	chr3R	17280980	5'	+	Doc2-element	246	1	56.90
ATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	+	chr3L	15600177	5'	+	roo	44	2	55.04
ATCTGTTTGAAACGTTAGCTCTACCTTCGATTTTGCGTGATAAGTCAAACAAAAACGTTACTTTCTAATCGAAACAGCGAATTTAAATTAGACACCTTTGAAACAAAAAAAGAGAGAAACCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAG:1	+	chr2R	5217637	5'	-	INE-1	562	1	75.34
GCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1	-	chr2L	9668276	5'	+	1360	7	2	66.29
ATATACTTATTTAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGCACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr2R	14542264	5'	+	roo	22	2	63.04
CAACGCTGATAAAGGCCAGTCCATGACTACCGACTTCCCTTCGTTCCTGCCCATTCATTTCGATTGAATTACGCGTAATCGTTGCGAGTGCTTAAAAATTAAATTAAAATTTT:1	-	chr3R	18833122	5'	+	1360	3045	1	72.57
TAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr2R	20596542	5'	+	roo	8718	2	68.80
AAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGCCAGCAGGCGACT:1	+	chr3R	26431990	5'	+	opus	176	4	75.00
GCTGGCAACAAAAGCTAATGATTAATAACAAGCTGGCAGCAAAACACACTTTAGTTGACACAGTTTACACATCCAGAGAAATATGTAAATTAAAGAGCTGTCAGAGTCAGCGCCCAGGTATGTACATACATACATGTATATGC:1	+	chrX	304268	5'	+	INE-1	68	1	76.22
ACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGCAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1	-	chr3L	20888822	5'	+	1360	12	1	68.03
CTTTCTTTGGGAGCGGTTTGACTACAGTCAACACACCATAAAGAGGACTAAAGTGTGAGGGTACTGTACAGTCATACAATTAAAGAATCATCATAAATATCAGTGAGATATATCTGAACGAGAAAAACAACTAAATCCAAGTTTGC:1	+	chr3R	18913086	5'	+	S2	178	2	80.82
GTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATATGTCGGTGGCCGCCGAATCATTAAATGAAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTA:1	-	chrY	418189	5'	-	Stalker4	395	1	37.08
GGCAGTTACCGAGTCCGGAGATCTTTACTTTATAAATCACATTGATCGAACGACTTCATGGAATGATCCCAGAATGCGTAAGTCTCGTTCCACCACATGTCGGCAGTTCCGTAATTATTATTATTACTATTATT:1	-	chr2R	24066616	5'	-	mdg1	43	2	71.64
ATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCAAAAAAAAGCTCCAGGACATGAT:1	+	chr3R	1418287	5'	+	BS3	247	1	64.06
GCGTTGCAGGAAAAGCAGCGAGATCGCCGAAGGAGTTATAAAACATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCT:1	-	chr2R	4294608	5'	+	McClintock	72	2	69.66
AAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1	+	chrX	10640029	5'	-	roo	9012	2	64.34
AGCGAACCGATAGAGAAATCAAGTTTAATGGCACAAATATTCATTAACTTTTATCACTTCCTTGATAAACATTTCTTCTCGCTGACTGGACAATTTTCATACGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGCTTTAAGTT:1	+	chr2L	3164903	5'	-	412	471	2	66.21
ATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATA:2	-	chr2R	9500069	5'	+	G5	4745	1	50.00
AAAAACATATATTCAATGTAGACAAAAGTATGTTTTGTTTTAGGAGGTTGATATATCCGCAGGCAAGCCTAAAATCCAAATGGCCGCCCGAATTCGGTCATGCAGACTGGATCGCTACGTTTTTGCAAAACGTCAACGGAGTCCGC:1	-	chr2R	5205775	5'	+	Doc4-element	496	1	56.16
TTAAGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1	-	chr2L	13914183	5'	+	jockey	4695	1	50.91
TGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1	+	chr2R	13710605	5'	+	roo	8751	2	78.62
ACATATGAAAAAATACAAGTATTTTTGCCAAAATCGCTGTACTGCCTCTCTGCTGAACAACCGTTCAGGGGGGCCGGTATGTTTGGGAT:1	-	chr3L	23635038	5'	+	3S18	5754	1	71.91
GTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1	-	chr2R	3065979	5'	-	P-element	2808	1	26.15
ATGCGATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1	-	chr3L	17558124	5'	+	jockey	4692	1	68.66
GAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGCTTTTGTTATC:1	+	chr3L	11393503	5'	+	roo	87	2	80.14
CTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTCAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTAAATAATTAAGAAACCAC:1	-	chr2R	9500061	5'	+	G5	4734	1	48.82
CAACAAAATTGCATTTGAATGAGCAGCGGGGGCGCGAGATATGGCCGTGATCGAGGGCGGCGCCTTTTGTGAAGATATG:1	+	chrX	2295921	5'	-	Tirant	8484	2	48.10
TGTCCAATTTGGAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1	+	chr3R	9921939	5'	+	blood	25	2	68.49
ATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACCTAATTTTATTTG:1	+	chr3L	21817952	5'	-	roo	9031	1	56.16
CGCTGAAGTTTCAGTGTATCCACCCCATCCTCACCTTTTCCGTTATGTGAGGCTCAACGCTCAGCGGGCCATGTTTTTATTGGATTTTTCCTCTTGTTTTCAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTG:1	+	chr2R	22372743	5'	+	Circe	486	1	77.52
CCGGCCTAGCAAAATTCCCGGCCCCAAAGGACCCTCGCACACACACATATATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATA:1	-	chrX	17963944	5'	+	jockey	4822	1	64.71
ACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGT:1	+	chr4	158192	5'	+	1360	389	1	55.17
AAAGAGCGTGGCGTTCGACCCGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1	-	chr2R	10124178	5'	-	P-element	2786	1	16.44
AGTAGCTTTATGATGGCAATTACTTGTTTTGTCATTTTCGCAGGCTTAAAAACATGAACACATTTTTTGCTGAACTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTATTTTGCACAATGCTTCGATGCAGGTAACTTACA:1	+	chr3L	4605596	5'	-	pogo	2060	1	62.07
GATGCCTTCTAATGTATCGGCATAACTATCGTACACACACATTATTTGGTAAATTTTAAATTTTTTGATTATATGAGTTACAGCTTACTCATTGCCACTAAGTTCCCATACTGCCAACTTGGTACTGCGTTAAACCATCG:1	+	chr3L	17907883	5'	-	Burdock	6003	1	52.86
GAACTTCATTCTAACGCAATATAAGGCAAACTGGTGGAAGTTCCATTAAAGTATCTGAGAAAAAACTCGCATTTGAAATTGATACTTAGTGTAAATAATAGTTAATAGCTAAGTTAACACGAGCCAACGAACTAGTACAGTT:1	-	chr2L	18666312	5'	+	Gypsy6A_LTR	10	1	69.01
ATATATTACATACATACATATGTATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGTCTTTTCTGTTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTT:1	+	chr3L	16145263	5'	+	invader1	3696	2	74.05
TAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1	-	chr2L	17079853	5'	+	jockey	4703	1	60.00
CATCAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCTC:1	-	chr2R	3760473	5'	+	accord	23	2	54.55
AAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	-	chr2L	16091988	5'	+	roo	8732	2	66.44
CTTGTGCAATGCCACAGCCACCTTCACATGGTGTGGGTCCACAACAGGGCCAGGGGCCACTCAGCGACATGATGTTTTGTTACAGCTAACTTTTGTTAGCCGGCGCCCCTTAAAGGGCTGAATTA:1	-	chr2R	5611704	5'	+	BS3	1700	1	60.00
TATTTATAAGTGTGTGCGTGGTGAGGGAGGTCAAGTGTCAGTGCCATTTAGCAACTTGCCTCTCACACACACACACACACACACACTGTG:1	+	chrX	2899059	5'	+	accord	258	2	76.67
GAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	-	chr2L	18419254	5'	+	412	45	2	49.30
CCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTA:1	+	chrX	21772478	5'	-	springer	7137	2	49.43
ACAAAAAGCGCAGCCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACAC:1	-	chr2L	10037446	5'	+	Quasimodo	27	2	65.75
AAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1	+	chr3R	7641057	5'	-	hobo	2917	1	53.49
TTTGAGGCATTTCTGTGCCTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1	-	chr3L	22400343	5'	-	1360	3332	1	65.08
AAAATTGGATAGTATTACAAGAATCTAATTAAAAGCCTAACACGAATTTGCAATTACTTGTAATCTGGATTAGAAGGCCATATGCTCCTTATGTGCTTAGTATTAGAATTAGAAGTTATACTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTG:1	+	chr2R	9325339	5'	+	BS	4994	1	73.10
GCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	-	chr3R	14940154	5'	+	jockey	9	1	55.17
AAATAAGCTGCGGCAATCCGTTAATGACTCGAATAGACTAATTTTACCACTACTACCTCCCCACCAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCT:1	+	chr3L	10057401	5'	-	transib2	288	1	55.08
AGTTGGGAAAATTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1	+	chr3R	10462569	5'	-	opus	476	2	67.12
TTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr3R	19449410	5'	+	roo	13	2	75.37
GAAGAAGCGTTTGGGGAGCGTCCTGGTCTTCCATTCATTTAATTCCAGTTCACTTGAGTTCAGTATCAGGTTTGGATTCTGTTTTTTTTTTGTATAGAGGCAAAAACAAAAAAAAAAACACAAACTTTTG:1	+	chr3L	4615528	5'	+	HMS-Beagle2	493	1	63.08
GCCTTGAACTCGACGATTGAAGTATGCCATCCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATACCCA:1	-	chr3L	15378249	5'	+	accord	7032	4	53.16
AATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATCACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTCATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGTTCTACTC:1	+	chr3L	25008302	5'	+	297	370	2	75.00
GAAGATACACAACATTAAATGATATCCCGGATGGCCAAAGAGTCCAAGACACACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1	-	chr3R	17531443	5'	-	1360	3335	1	61.65
AATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTT:5	-	chr2R	6085997	5'	+	1360	372	1	58.90
GGACTGGGCGCGTGCTAAAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACATTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1	-	chr2L	15833543	5'	-	jockey	4963	1	50.39
ATGATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGATTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCT:1	-	chr3R	9714508	5'	-	Stalker4	375	2	61.64
ATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTAC:1	-	chr3L	23940541	5'	-	Cr1a	4400	1	68.46
GGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATACAATAGCATATT:1	+	chr2R	9791549	5'	+	412	30	2	65.28
GATCAGCTTCGAAACTTTATTTTCAGTGTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1	-	chr2L	1377733	5'	+	hobo	16	1	64.55
ATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:1	-	chr2L	6623055	5'	+	Burdock	6167	2	60.90
AAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTC:1	+	chrX	21564684	5'	-	diver	134	2	79.45
GTTTCTGCTGACAAATAAGGTCAAGAACGCAGAGCGTTGAGCTGGATTTAAGGGAAATTCAAAAAGTGCTGACAGATCATTTCGGGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGC:1	-	chr3L	23593645	5'	-	G4	62	1	58.22
GATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2	-	chr2L	2007442	5'	-	roo	334	2	68.49
TCAACCCGTTTGAGCGGGCTTAGTAACAAAATTAAAGTTGCGCCTGCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAA:1	-	chr3L	17195533	5'	+	hobo	2682	1	69.86
GCATTTCTTATTGATGATAAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1	+	chr2L	13763114	5'	+	pogo	24	1	68.53
ATGACTCACGATAAAAAATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr3L	4536647	5'	-	roo	392	2	68.49
CTCCGTGCCAAACTTCCTTTCTACCATTTTATTTGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr2L	14772177	5'	+	roo	8680	2	73.97
GTAGCCATGATAGACATAAGTAGGAATACTATCAACTGTGGTCTATACTAGTCAATAATCAGATAATGAAATAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCACAAACTTAAGCGAA:1	-	chr2L	4954056	5'	-	Quasimodo	7321	2	53.42
AATTCAAAGGGAAAAATACATCGTTTCGGCTTCGGTTTTTGGTTTTTGTTCAGCCGACTTTCAAAGCTAACGTAGTGTCTTTAAAGCATAAATACATAAAGCATAAAAATAAATAAATATT:1	+	chr2R	12786081	5'	+	mariner2	828	1	63.64
GCCCTAGGAGTCCTCTCATTTCCTTTCTCCGGCTCCAGATCCCTAATCCCTAATTGTCAGCCACCCGGTAGCAGTAAAATGTTTTTATCCAGAACTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCGAAATTTTTATGTAAATATATCGTCCTTT:1	+	chr2R	9405437	5'	+	transib2	46	1	59.59
TATAAACTTCTTCACAACAATAATTCTCTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAG:1	-	chr3L	19014049	5'	+	invader3	13	2	71.85
AGAGTCACAGACCTACTTACAATTTACATCAATTCCAAGCGAACTAGACACATATATCCTCATTATAAACAAGCAAATTCTATTTTTAGATGTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAA:1	+	chr2L	3622386	5'	+	1360	3322	1	52.74
CCTGCTCCCCGCCTCCAAATCCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chr2R	8585397	5'	-	roo	9047	1	66.67
GTATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr3L	20654450	5'	+	roo	39	2	58.90
CATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCATTTTGCCATTTAAAATGATGTAATGATGAACTCCAATAAAGA:1	-	chr2R	9791685	5'	-	412	491	2	70.97
GACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTT:1	-	chr3R	18585664	5'	+	P-element	23	1	56.00
TTCAGTGCACTTAGAAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr2R	9328561	5'	+	roo	16	2	71.11
ATTGGCATCCACAAGTTTCTTTTTTCGTCTGCTCTAGCAAACATTTTTATCTTTACTGCTTTACACATTTAATTTGATTTCTTTTTGATTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAA:1	+	chr3L	19672199	5'	+	1360	3325	1	60.27
TGACTAAATTCGAGTGAGTTTTTATTCGTTGCAAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1	+	chr3L	22863349	5'	+	412	7084	2	62.76
GTGGGCCACATATGCTGAACTCACATGGCCAGAAAAACCAGCCTCTGCATTTGTATCTTTTAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTATCTGCAGCGATAGTTAGCTG:1	+	chr2L	18338931	5'	+	pogo	15	1	71.64
AGCGTCTGGAAGTGTAAGGAAATGTACATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAAT:1	-	chr2L	20117998	5'	+	invader4	11	2	71.92
TTATTTAAAATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1	-	chr2R	19050345	5'	-	roo	403	1	73.97
CAAGCTACGTGAGTATAAGTCCTTAATTTGCAAGAACCGCTTTACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTT:1	+	chr2L	10037272	5'	-	Quasimodo	7343	2	64.83
AGGTTATAAAAAAAAATCCAGAGTTTTCCCGTTCCCTATTGGATTCAGGTGGGATAGATAGACTTATGACATACAAAGACAATGAAAAATAAGAATTTTTGACATGGTGCCAATTGTTCAAAAATACTATAGATTTAAAGTCCA:1	+	chr2R	4608875	5'	-	1360	244	1	55.56
TGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1	+	chr3R	12618603	5'	+	F-element	31	1	50.48
ATCAGGTCTTGGAATATTTGATTGACAAAGTTCAGCTGCTGAATTTACGAAGCCAAAAAGGAAAGTCATTCTTCCTTTGCAAAGAGATAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATG:1	-	chr2R	949652	5'	+	Tirant	485	1	59.59
AAAATGATTCCGGTCTTATAGCTAAAAAGGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATTAGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTG:1	+	chr2R	5581264	5'	-	diver2	84	2	77.94
CAGATAAAGTAGATATTTGTATGTTCCACAAATGAAGAGTCAAATTAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACAT:1	-	chrX	159391	5'	-	Cr1a	4198	1	63.03
GTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1	+	chr3R	14981153	5'	-	mdg1	382	2	53.23
AAACAAGCTCCATGTTTTAAATGGAACGTAAACACACATGCCAGTGTATGGGTAGTACCCACACACTCATAAGCAGTAACACACATACATACACATACACACACACACAC:1	+	chr2R	14443515	5'	+	Quasimodo	31	2	76.36
ACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAACTCCATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1	-	chr2L	544922	5'	-	412	7534	2	74.66
AAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr2R	20596481	5'	-	roo	8989	2	76.22
AACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr2L	3114557	5'	+	roo	69	2	70.90
CATTTACATTTAACATTTCTAGCAATTGCGTGGTTCTACTTCCCCCGCTCCTACCCGCGAACAGACTACGTCCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCG:1	+	chr3R	11290616	5'	-	invader1	87	2	64.00
TATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1	-	chr3R	17605715	5'	+	Tabor	6918	2	69.18
GTACTCGTTGATATTTTTGTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr2R	19004109	5'	-	roo	9033	1	60.27
AGTATACATATATTATCATGTTCCTATATTAGAGTCAGTCTTAAGTTAACTTCGGTTAAGTCTTAAACCGATATTTAATAAAAAACAAAACCGAATTTATTCAGTGTTTAATTTATTTCGGAGTTGATCCTAGTTTAAATACGGAT:1	+	chr2R	102210	5'	+	McClintock	6330	2	61.64
TTCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1	+	chr3L	4840739	5'	+	jockey	4705	1	55.88
AGGCTAACTGCAGTAGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTGATATAAAGGCAAGGTGGAG:1	+	chrX	23201991	5'	+	R2-element	464	1	78.82
ATCCGTCGGGCCATCCATTTATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1	-	chr3L	17115566	5'	+	blood	37	2	58.90
TTGATGATAAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1	+	chr2L	13763124	5'	+	pogo	25	1	65.67
ATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr3L	20654555	5'	-	roo	329	2	71.92
GTTTGAATTTATTTATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCA:1	+	chr2R	23352141	5'	-	Stalker	7076	4	67.91
GCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1	-	chr2L	9668276	5'	-	1360	3331	1	62.86
TTTAAGGCAAGTGTGTCGTGCTGGTAAATTGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1	+	chrX	2842438	5'	-	Tabor	473	2	77.40
GCTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACCGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1	-	chr3L	10848706	5'	-	blood	372	2	59.26
CAGATGAAATAAGCTTGGTCCAAATATTTGTGTTATTATAAAACCTTGAACGAAATTTAATTTATTTAGTTAAAAATATGCTCAACAATTATACAAACTATTAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1	+	chr3L	23840137	5'	+	1360	1	2	80.00
CATGGAAATGAGATATAAATAAGAAAACGAATTGCTGTTGCAAACTTAAAAGACTATTCAGGTCATAAAAATGTTTAGTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCAT:1	+	chr3L	20758805	5'	-	1360	455	1	54.11
TGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGG:1	-	chr2L	7898380	5'	-	roo	354	2	58.91
CAGCATGTGGAAGCCGCTGCTTAGCATGTTTCCTGACAGGCCACGTGCGGCTAGCGAGAGAGCGAGAGAGAGAG:1	+	chr3L	10811327	5'	-	Cr1a	294	1	70.27
CATCTATTGAAATAAGATACGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAA:1	-	chr2R	9500064	5'	+	G5	4729	1	47.20
GGAACGGTTATTGTTTATTTTAAATAATATTTATGTAAACTCGTAAAATAATAATAACGTTCAGGTAATGCAAAACAAGAATTTTTTTCATGTTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTATGAACTTCTAAGGTGA:1	+	chr2R	903492	5'	-	1360	228	1	69.18
TCTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGT:1	+	chr3L	10574281	5'	-	Tabor	7265	2	55.48
AAGGAGAAAGTGAGCGAAATGGGGAAAAAAACAAAATCGTAAGGGGGGATCCCAGCCGTTCAAAGCGTTTTGCGTGGGTGCCATTGTAGAAACACATATATATGTATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1	-	chr2L	2794322	5'	+	Burdock	6147	2	74.66
AAACTATATTTTTTCATTTCCTAACGAAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAAT:1	-	chr2L	6623091	5'	+	Burdock	8	2	80.14
CTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTT:1	-	chrX	22715120	5'	+	Bari1	89	1	78.77
TAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1	+	chrX	23457654	5'	+	Doc	19	1	81.03
GATGATAAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1	+	chr2L	13763126	5'	+	pogo	39	1	58.90
ATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1	+	chr2L	17295820	5'	+	Doc	37	1	53.33
GAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr2R	9632107	5'	+	roo	71	2	68.06
CATTGGTTCGTGGGACGAAGGTTGGCCAAAATAAATCAGCTAACAAGACCGAACAGCAATTAAACCAAACGCAAAATCATATTTGGTCTTTTTGACCAAATTGGGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATACCAAAACTTTTTGAAAAT:2	-	chr3R	8049023	5'	+	Q-element	135	2	59.59
TGATAAATGCCAACCAGTCAGCGCACACTCTCACAAACATACCCATCACCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAAC:1	+	chr3R	12854889	5'	-	Quasimodo	6934	2	58.46
TTAAATTGTTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3L	12879847	5'	-	roo	9051	2	65.29
GGCGAATAGTCGTTGGACTCCTCCAACATCTTGTAGAGCTTGGCTCGCATCGGAATGAGTTCGGGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	+	chr3R	18272074	5'	+	1360	17	1	71.11
CTATATCGTATAAAATGAACAATTAATGCAATTTTAAATAAATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1	+	chr3R	17478317	5'	-	copia	244	1	77.40
AAGCTGTACCGCAACATTGTTGACTACTTATCCAAATGCCAGGGAAAAGGCAAGACCCTAGAACAAACTTGCGCTGCATCTTTGTCTCTAAAATCTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTACCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGGCG:1	+	chr3L	22725237	5'	-	INE-1	144	1	58.22
CTGTTCAGTATCATCACCACCACGAATCATCTCCCTACGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	+	chr3L	16343164	5'	+	roo	4	2	80.60
AAAACCATATCTGCAACTCGAAAAGGGCTCGTAAATAATCCTCAAGACTCCCATAAACGATGTCATCGATAAGAATGGAGGAATCACTCTACCAAAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCAAGTATCCATAACGACTTAGGAATC:1	+	chr2L	4950808	5'	+	G4	3551	1	63.70
TGTGATATCACAATTATTTTCGATGACTTCGTTTAATGTTGGAAAAGTAGACGGGAATGCATTACATCGAAGTGAACTATTTAACTTTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACG:1	+	chrX	2297050	5'	-	Tirant	8412	2	59.59
GTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1	-	chr3R	14940168	5'	+	jockey	71	1	64.66
TACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAATTAGAATATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTTATGTCAAATATTCTAATTGTTCACACATGAACACGAAT:1	+	chr3R	19450200	5'	+	roo	8664	1	41.13
ATTGGACTCGCTCCTCCGCTCATTCGCGAAAAAAAAGGTGGGGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGGCAGCAT:1	-	chr2R	19539640	5'	-	jockey	4719	1	52.38
AAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAT:1	+	chr3R	20499760	5'	+	mdg3	73	2	64.38
TCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTAAGTAGGTG:1	+	chr3L	22437865	5'	-	roo	9006	2	55.48
TTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr3R	31817541	5'	-	roo	9022	2	58.96
TGTTAGCTGTCAATCAAAGTGGGAGCACTCATTGTTTTTTGAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1	+	chr3R	25423144	5'	+	3S18	5772	2	78.08
CTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTC:1	-	chr2L	6007627	5'	+	1360	463	1	71.92
CTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2R	20596426	5'	-	roo	396	1	71.65
AGGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCAACCCCCAAAACCCC:1	-	chrX	2295986	5'	+	Tirant	8114	2	67.90
GAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1	-	chr3L	17205298	5'	+	hobo	34	1	57.60
AGCAAGTAGTTTTATATTTTGCTTTTGAGAAATGAGATTTCTGAAATTAAATTTCATTTTGCATAGCTTAACAGCAATCAATATTCATTATTTTTGTTTTTTTTT:1	+	chr3R	28042126	5'	-	transib2	2641	1	49.52
TATTTCAAAACGAACTGAATTCAGTTATTCACGCATTACAAAGCTTGCGGTCAGATTTTACACACTAATTTAGGGTCATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTATTTGGCAAACGATTTTTTCGCCG:1	+	chr2R	2508191	5'	+	1360	44	1	71.92
ATATTTTTTTAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTATGAGGAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAAATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTT:1	-	chr2R	21963198	5'	-	Q-element	82	2	60.96
AAAACATAGCCTTAATCTTAGTTGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1	-	chr2L	5845084	5'	+	transib2	56	1	56.85
AGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1	+	chr3L	1534531	5'	-	pogo	2053	1	63.64
ATGAAGACCATAAAAAGAATTCTTGCGACGCAGCGCAAGTTTGTTTACTCATTTCGCTACCACAATTTTTTTTTGCTCTATTACCTGTTGTACGTTGCGGACTCCGTTGACGTTT:1	+	chr2R	5201062	5'	-	Doc4-element	499	1	54.78
GATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAG:1	+	chr2L	13585854	5'	+	Tabor	6920	2	74.47
AGCACATTGGCCAAGCCAAATGCACTTGAACAAAAGTAAATTGGGAATTAAGAATTTAAGTTAATGAAATGTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTG:1	-	chr2L	19308823	5'	-	Juan	4149	1	49.29
CTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGCAGACGGCAACTGGAACA:1	-	chr3L	19036048	5'	+	Tirant	61	2	75.45
TTATGAAAACTTTGGCAAGGAAGCAAGAAACATATTTAAAGAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAAC:1	+	chr3R	14939466	5'	+	I-element	5078	1	71.92
GGGCAAGGTGCTCTGGAGCAACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTCTGCGGA:1	+	chr3R	10735511	5'	-	X-element	4540	1	75.31
CTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chr2R	9328586	5'	+	roo	21	2	63.48
AGGGAGTTTTACTAAGCTGTTGTTTTTGCACAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1	+	chr2L	12483757	5'	-	P-element	2800	1	24.48
TTGATGTTATGGTAAGCAAAATTATTTTAAGTAAAACTATGTATAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1	+	chr3R	2461582	5'	-	mdg1	343	2	70.55
AGGGAAAGTTGGCAGTACACACATTTATATACATATGTACATATATATGAATGCGCTGGAAGAAAGGGAAGAACAATATTCGCATATTTGCACATTACAAATATGGCACTGAAGACGATTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1	+	chr2R	23267887	5'	+	F-element	42	1	76.76
CGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGAGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1	-	chr3R	19968168	5'	+	roo	91	2	82.19
GCCAGGATTGCCTTCCCAACTGGTATACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:1	+	chr3R	13237252	5'	+	3S18	24	2	69.18
ATTTTTGACTGTCATAGTTTAAACGAATTTAAAGCATAGTATGCTTTAAACACTCCTTGAAATGCAAATGTTTTTCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAA:1	+	chr3L	15149614	5'	-	diver2	4659	2	48.28
AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCCCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAAT:1	+	chr2L	10450247	5'	+	1731	157	2	67.13
ACTATTTACAAGCAAGGTATATCTTGCTGTGGGAGGAGCTCGCGTACGTGACCCACTCGGCAAATCTTTCAGAATACATGCGCGTAATAACAATAATAATAATAACAG:1	-	chr2R	4181246	5'	+	mdg1	7070	2	51.85
AGTGTTAAATTTGCCAATCAGAAAAAAAGAAGTGTTAAAGGAATTACACGAATGGCGAAGGGGGTCAGGAGGTCGACCCTGCCATCGGTG:1	+	chr3R	1560745	5'	+	R1-2	72	1	73.33
ATTTGCCAGCTAGTGTAGGAGTATAATTTTTATAAATAAGCAACACTAATCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGG:1	+	chr2L	16123097	5'	-	accord	7009	2	55.65
AATGCATTAAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATA:1	+	chr2L	13584661	5'	-	pogo	2022	1	71.23
AATACAGAGTAATGATTTAGTTTTAACATCCTTTGCCTTAATCCTTTTGATATGTAAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTG:1	+	chrX	13702970	5'	+	invader4	2645	1	67.41
TATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	+	chr2R	6173000	5'	+	pogo	60	1	68.22
CGCGTCTCGAATGTGGGTGTTTCCACTGTACAAGCAATTTGTATACATATGGAAAGCTCTTTGTCCAAATTGGTAAATGGCTAAATGTTTTTGTTGTTTTTGTTGTTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTAT:1	-	chrX	11137757	5'	-	I-element	94	1	62.33
CATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1	+	chr3R	9921973	5'	+	blood	7063	2	58.99
GGCTGTGTAATTATTTGTTCTGTAAATGGCCTCATTAATATATATTCCATCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACTACGCATTAAAAT:1	-	chr2R	3009545	5'	-	Copia1_DM	386	1	71.72
CACTTCATCGCTTTTCAATGTAATTCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1	-	chr3R	10462719	5'	+	opus	7038	4	56.25
CCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGT:1	-	chrX	22643336	5'	+	Tc1	1612	1	46.58
CAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGCACATACCTACGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGAGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	+	chr4	419979	5'	+	roo	83	2	70.55
AAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	+	chr3R	17420443	5'	+	roo	8753	2	82.07
GATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1	+	chr3R	10182112	5'	-	blood	7363	2	57.52
GGTTACACTATTATTATTATTGTTCGTTTATTTCTGGCTAAGTTTATTTATTTTTGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCAC:1	+	chrY	3649227	5'	+	rover	7132	2	66.44
CATTTATACACACCGCCACACTCAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACC:1	+	chrX	3313420	5'	+	jockey	459	1	77.88
GCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr2R	19050180	5'	+	roo	8677	2	63.81
TCCAAATCCTGGCAATGGCTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAAGTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACCGTAAAATCCCAAATCAGAAGACTTTACTCGATGAG:1	+	chr2R	8585410	5'	-	roo	9057	2	63.48
GAGAAATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGT:1	+	chr2R	1881360	5'	-	Stalker	246	4	55.63
CATAATCATAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTGTTATCTTTTATA:1	+	chr3R	19589875	5'	+	BS	5018	1	65.75
GAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTC:1	+	chr3R	13237290	5'	+	3S18	5814	2	54.89
TCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:2	+	chrX	5643449	5'	-	roo	9036	1	60.27
GGCAGCGGAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1	-	chr2L	14892313	5'	+	transib2	52	1	57.04
GGACCGAATAATCAAATTGCAGTTTCCAGCTGTCATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACAA:1	+	chr3L	4949382	5'	-	hobo	139	1	73.85
ACAGCGAAAAAATTGTGAGCATTTTATGCATATATTCGTAAGTTAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1	+	chr3R	12598428	5'	+	hobo	25	1	67.86
AATCTAATCAGCCTTTCACTTTTCCAACCCTTTCAATTATCCATGGAGTAAATATAGCACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCA:1	+	chr2R	4344532	5'	-	roo	119	2	62.31
TTGCAGGATTTCCGTTTCTGGCGCCAAATGTAGGCACATTACAAAGAATCCCCATTATGGAAGTTAAGGCGCTCTGAAAAATGTGTCCCTTTAAAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGT:1	+	chrX	21582864	5'	-	mariner2	483	1	58.33
TTTCAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1	-	chr2R	9791699	5'	-	412	458	2	59.29
CTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	-	chr3L	16343289	5'	-	roo	8991	2	70.55
GGATGGGAGGATTCTTAAAACTCCACAAACCTGGTTGCGGAGAAGCGGCCTAGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGC:1	+	chr3R	2446798	5'	-	1360	3324	1	61.64
AACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	+	chr2R	9791583	5'	+	412	44	2	58.87
CGTGGCAGGTTTTTGCCATTTTTTTTAAAAAAATGTCAACACATTTTTCAAAGTGTTTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCGATCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCAT:1	+	chrX	13478175	5'	-	INE-1	139	1	77.87
CACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAG:1	-	chr3R	14940183	5'	+	jockey	27	1	58.10
GTTGATAACTGCTTGATTGCAGAGATATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chrX	13039598	5'	+	roo	21	2	72.54
ATCTAATGTCTTTGCTTATGCTTGCCGGTTTGAGGGCGTTAGAGCGATACAAAAACTTTTTAGCGAATCGATAGAAATGTAAAAGACTAATCAGAATGTGAAAAGAACAACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGATAGTTTTGCG:1	-	chr4	54426	5'	-	INE-1	242	1	69.86
CGTCAATTATTGATAACGGACACTGTGAATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	-	chr2R	18609447	5'	+	opus	7148	4	57.80
TGAAGGCAAAAATTATTTATGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATACGTCCTCAAATTTGGACGAAAATACGGATAGACGCACAGACGGAGATGGCTAGATCGACTCGACTATTGATCCTCATCAAGA:1	+	chrX	22806280	5'	-	INE-1	88	1	58.99
ACCTCTTGAGCAATAAATAGGTTTAGTAAAATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1	-	chr3R	20469700	5'	-	roo	9032	1	49.28
TACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3L	20654465	5'	+	roo	8718	2	56.16
CTTATGATGTAGCATAATAAGATATAGTGCTATATCTATATAGAATTCTATTATGATTGAATATGTTGAAATGATATAGAAATCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1	+	chrX	8347546	5'	+	412	7091	2	45.21
AGTGCAAGAATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr2R	14542105	5'	-	roo	389	2	64.39
TCCTCATCGAGAAACATATTCTGTTGCAAGAAAAATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chr3R	16076916	5'	-	roo	9047	1	65.75
GTTTCGAAAAATACATTTATATTCGTAAAAGGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCAAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGC:1	+	chr3R	24383210	5'	-	rover	7259	2	58.22
CAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1	+	chr3R	19446121	5'	+	297	6626	2	54.11
AGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr2R	2016831	5'	+	1360	50	1	60.98
CTTTAAGCACTTGAGTTTAATTCGTTAATTTCATCTCGATTGTCACTCGACTTCAATCAGCTTCAACAGAACCAGCATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAA:1	+	chr2L	10041426	5'	+	Quasimodo	112	2	53.79
CAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	-	chrX	8543520	5'	-	roo	327	2	71.92
AGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGAGATAAATTATATTTA:1	+	chr3L	16343235	5'	+	roo	8738	2	73.68
ATTTACGTACTACGAGTATACATATGTATATGTGTGCGGAAGACCTCGCTTTTGTCTGGGTCCCTGAGAGCTCATCCTCATCCGAAGTATAGCTTCATGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGAT:1	-	chr3R	5028439	5'	-	Chouto	15	1	63.64
ACATAATAAGCACAGCAAGAAATACAGAGTGGCGAATCCCACACAATGTCTTAAGCTAAGATGAATAGAATAATGACGTGATAACTATTTCTCCGATAATTTTAGCGTTGTCATTAGTCAACTGACGGGACCTTAGTTCTACTCA:1	+	chr3L	25008298	5'	+	297	6952	2	77.24
ATTGCGAGTCTATTAAATTTGCTTATTTATCAATTTGTTGTGCGTGCTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGA:1	-	chrX	13017401	5'	+	micropia	5172	1	65.29
ATTAAAATGGAAAGCCCTGACAGTACTACATTACGTCTTAAATATATATATACAAATTTAAATGGAAAGCCTAGATAACGCTAGAATCTATTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATGACAATAAGTAT:1	-	chr2L	8777148	5'	-	G4	3814	1	84.93
AAGCCAATCTGTGTACTTTCTTTGAATAGCTTCAGATTTCTATTGCAAGCAGTCCATTTTTGCGACAATCTGTAGCACAAGTTTTTGCAATGTTTTTTAATTCGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGTCCAACCGACCGATGGGCGC:1	-	chr3L	18591683	5'	-	Cr1a	4415	1	67.81
AGCTTGTGGGGATTCATACATATGTGAATAAAAAATATGTGCACCCCTCTAACTTGCTCGTGTTAACTCCTCCTTGTCTTAAGATGAATTCGTCCCCGGATTTAATAGTCTTAGATGGTTGTTGACGTTTGGCTTTCAAACGGTAG:1	+	chr3L	23515295	5'	-	gypsy10	5574	1	67.12
CAGAGGTCACAGGAGAAGACAACCGACAACGAATGGGGCGGTGAAGCAAGAGAAGTCCCAGCCACCGAATACACTGCATTCAAAGTTGTCAACTTATATCGACCACTTTCAACACAGTTTAATTTAATTTAATTAATGGTTTAATT:1	+	chrX	21475933	5'	-	flea	223	2	76.03
GCTCATAGAAGATGAATATTAGAATATTAGTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGCGTTCACACATGAACACGAATATATTTACA:1	-	chr3L	22438002	5'	+	roo	9	2	76.30
CAGAGCAGCAACTTCTTCGTCACACGTGTGTTGGGTGTTGTTGGTGTGTGTGTGGAATGGCAGAATATGCATTTTCGCTCATTTTCATTTTTTGTAGTTCTTGTTATATTAAAGGTTTACAAATAAAAAAAAAAACAAAAA:1	-	chrX	5902703	5'	+	R2-element	3585	10	81.56
GTGGCGAAATTGTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAG:1	-	chr2L	21580580	5'	-	INE-1	161	1	65.75
TACGTATAATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1	-	chr2L	9399574	5'	-	Transpac	279	2	63.70
ATGAGATATTTGAAAATGGCGCCTTTTCCGTTCTTATGATGGGCAGCACTGTGTCCGCTAGGTGTCGCCACCTGATCATATTAATCCATATTACGTTTCTCATATTTCATATTTTCATATTACGTTTATAAAAAAACAGAAAAAAA:1	+	chr2R	12521340	5'	+	HMS-Beagle2	480	1	80.14
GTGACCCTCCATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTATAATAATCAAATAAATA:1	+	chrX	10644445	5'	+	jockey	4819	1	62.50
TACAATAAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGCTGTTTTTATTATTTGATCA:1	+	chr3L	18555903	5'	-	jockey	4985	1	57.81
GCCGCTGCAGCCTCCGCAGCTGTGGTATCCACAGGCGAAGGAACTACCCAAAGTAACAGCGCCATCGACACTAAAAAAGGCCGATGATTAATCGATACTATCGACAGTGCCCATTCGGCCGATAGCTAAACAAAAAACAAAAAAAA:1	+	chrX	23106707	5'	+	G-element	4325	1	53.42
ATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1	-	chr2L	21884595	5'	-	pogo	2033	1	71.53
TTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATAC:1	+	chr3R	9714365	5'	+	Stalker	46	4	54.11
GATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1	-	chrX	13504230	5'	-	412	7471	2	72.86
GCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTAGTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGAT:1	+	chrX	10445569	5'	-	INE-1	500	1	76.69
AAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGACAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGAATAAAATTAAATATCACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTA:2	-	chrX	15690634	5'	-	Cr1a	4284	1	73.29
ACATTCTCAATTTCAGATCAGCGCCACATCAATTTGATTCCGGAACTAAAATTATATGAACTAAGAGAGAAAGCGTTATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGGTACTCCGCTAGTGTGAAT:1	-	chr3L	25844102	5'	-	INE-1	536	1	53.60
TACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1	+	chr3R	25826671	5'	-	mdg1	354	2	62.33
GGCGCATTTTGTGAAAAGTCAATTATTTATGCATGTCACGTTATTTTCCGGAATAAGAGCACAAAACCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTA:1	+	chr3R	17839676	5'	+	F-element	171	1	56.16
AAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1	+	chr3R	10546106	5'	-	hopper	1332	1	76.03
CACTTATTGAAATTGAGCGAAACTATACAAGTGTCAAAAGACCAACAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGG:1	+	chr3R	5764478	5'	+	Stalker	168	6	72.57
CGTGCAATTCTCCTTTAAATTGCCAGCTCCTCCAGCCGCAGCGCTGAAATGACCTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGA:1	-	chrX	21562537	5'	+	diver	6066	2	63.70
TGGGCCAATTAAATGCTTAAGCTGACTTTCGGGTTCGAGCTTGTCATAAATTTTGACTGATTATGCGTATTCGTCTTTGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACT:1	-	chr2R	20905694	5'	-	hobo	305	1	54.48
GAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCATACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTG:1	-	chr3R	433135	5'	-	1731	237	1	68.49
AGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3R	16076870	5'	-	roo	9001	2	68.49
ATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1	-	chr3L	17205294	5'	+	hobo	27	1	59.65
GTTATAAATAATAATAATAAAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:2	-	chr3R	17605781	5'	+	Tabor	6852	2	75.34
GTTTCATATAAGTGATTGAATTTTTTATAAATTCGAAGTCAATAGGTTTTACTTGTACTGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1	+	chr2R	24561435	5'	+	P-element	46	1	48.46
GAAAGAACAACAAAAGCAAACAATAACAAATTCCCAGCATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1	-	chr3R	14651325	5'	-	P-element	2854	1	63.70
ACATGCAGCAAAAAATATCGAAAACCACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTTGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1	-	chr2R	23332637	5'	-	invader4	280	2	58.74
AGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1	+	chr3R	14651224	5'	+	P-element	50	1	35.45
TGTACACTAGAAAAAACCAAGACATTGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1	-	chr3R	29361096	5'	-	mdg1	411	2	73.60
TCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr3L	11441826	5'	-	roo	9006	2	64.38
CAGCTAACTCATCCATTTATCCATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCATCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTAG:1	-	chr3R	21706077	5'	-	297	329	2	65.07
ATATTTTATTTTCTTTAGACGGCCAGCTAAATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1	+	chr3L	10647857	5'	-	412	7535	2	64.38
AATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr2L	544796	5'	+	412	74	2	71.64
GAACCGAAAAAATAGCAGGGAAGCAAAACCGAAACCCCAAACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACT:1	+	chr3R	23661034	5'	+	I-element	4962	1	72.41
TAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr3R	16076789	5'	+	roo	8736	2	68.49
TTTGGGCGCTTACATTTAACTCTGCAGATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAG:1	+	chr2R	4601547	5'	-	HMS-Beagle2	7130	2	62.33
ATATACATAATATATACATATATACATATATAAATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1	-	chr2R	24523597	5'	+	HMS-Beagle	6835	2	56.85
CCATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2L	3114563	5'	+	roo	8724	2	65.65
AAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	+	chr2L	3886146	5'	+	roo	63	2	60.96
AATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1	+	chrX	12214051	5'	-	opus	447	2	62.33
GGGAGCTTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATCAACTAAAACACACAAAGGCA:1	+	chr3L	24213772	5'	-	invader2	219	2	49.52
GGTGAAAATTCAGTCAAGTCTATTTTCCTTTCGGCACGAGTGTTTTGATTTATGCAGTTTTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACAA:1	-	chrX	18029464	5'	-	opus	445	2	58.22
TCAACATAACAATAAAAATTTCATGCCTGTAAGGCCCTTGACTCTCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATT:1	+	chr3R	25454686	5'	-	Quasimodo	201	2	63.08
GGCCAACAGCGCTGTAATAACAGCTTCGCCGGCGGCTAACACCGACACTGTTAATTTTATTACAAAACTGTTAACCGGTTTACATAAAAGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGA:1	+	chr3L	22408463	5'	-	1360	3176	1	62.14
GGCACGAGTGTTTTGATTTATGCAGTTTTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1	+	chrX	18030274	5'	-	opus	438	2	77.69
TCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAA:1	+	chr3R	25454042	5'	-	Quasimodo	7321	2	76.92
ATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1	-	chr2L	15833115	5'	+	hobo	18	1	69.53
CAAAGGTACAGTTGGCACTCATAAAGAAGTTTTTAATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1	+	chr3R	16404485	5'	-	pogo	2050	1	70.18
AAATATCTTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1	-	chr3L	11257437	5'	-	1360	3377	1	72.27
GAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1	-	chr3L	10574408	5'	+	Tabor	6870	2	55.48
CGGTGATCAATTATGGAATATTACAAAAAATATTAATTAGGTGCGTCTTTGTATATAAAGTAATGCGAAAGCTGTTCTGCATACTAAAAAAATACAGTAATATGATTTCTGCTTTGTTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:1	+	chr3R	18084304	5'	+	INE-1	15	1	87.67
ATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr2R	14388021	5'	+	roo	58	2	61.81
CAGCACAAAATGCTCGCCTAATGGCTTGGAATTTAATTAAATCGCTGTAGGTTGTATGTGATATGGAGTCCCATGTGTAATGTCCTGATATATGATATGAATCGAAGGAGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCG:1	-	chrX	12941138	5'	+	mdg1	7241	2	71.92
ATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATA:1	-	chr2L	22684594	5'	+	transib3	56	1	54.40
AAGAACAATTGATTACAACATTTTTCGGAGTTATATTCAATATAAATTTTTTCTCATGTGATTCCCCAAAATTGATATCCCAGAAAATGATAAAATTTCGCCATCGCATTCACACTAGCTGATTAACGGGTATCTGATAGTCGGGG:1	+	chr2R	2844508	5'	+	INE-1	553	1	70.55
CCATATTTATTTCTTCTGGTGAGCTTCAGCGATGTATGTGCTCCATGCATCCTGCTCGCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACG:1	-	chr2L	21008679	5'	-	invader3	5459	2	80.60
GTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTC:1	+	chr2L	2122403	5'	-	Stalker4	7322	2	53.57
GTTCTAAACTGTCAAGAGATTTTACTAAAATAATAATTCAGAAGACGTCAACAAAGTATATGTCCCCAATGGAATTTTTTCTGTGCACATACGTATACATATGTACATACTACAT:1	-	chrX	16157142	5'	-	invader3	5083	1	69.57
ATGTTGATGGCAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1	+	chrX	2518022	5'	-	P-element	2833	1	48.95
TCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAG:1	+	chr3L	24213786	5'	-	invader2	5035	2	72.18
GAGCAGCCTATGGGACCGCAGTTCGATCCCAACGAGATCGATTGTACCAACCGTGACTTTGTACCACATCCCAATTGCCGAAAGGTTAGTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAG:1	+	chr3R	13770010	5'	-	BS	5062	1	62.07
TAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGTCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1	-	chr2R	19798110	5'	+	Transpac	4976	2	64.12
CACCGCCATTAGTAGTTTCCCGCATCCCGACACCGCCACCACCACCACAAACCACCCCACCAAC:1	-	chr3R	22787881	5'	+	HMS-Beagle2	6794	1	75.00
GGGGTCACATCTTATTAAATTCTATTCTTTGTAATTGTCAAATTGTCAAAATTTTAAAATGTAATCGAATCTAAATTCATTGCTTTATATAAAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCAT:1	+	chr3R	22820544	5'	+	mdg1	7232	2	74.63
AGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACC:1	+	chr3L	25782384	5'	-	Stalker	6896	4	49.32
GCTGTGCATGCACGTGTGATTTCGCAGGACTTTCGGATCTGGCGTCCAAACGGCCCACCCGCTGCCACCCGCTGTCACCCACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCC:1	+	chr2R	13455704	5'	+	GATE	8278	2	49.12
ATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1	+	chr2L	5069689	5'	+	flea	4782	2	58.93
CGTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAAC:1	+	chr2R	23465984	5'	+	Doc	484	1	67.21
ATATAATGAAGACATTAAAGAAATATTGTATTAAATCACCAACAAAAGCCTGTAATTATTGCAGATTTAATGGATATGTCTGCATTCAAAATTTACTACATAAAAAAACCCGGGACGGTCGTTTGGCG:1	+	chr2L	23020952	5'	-	Doc	465	1	82.03
AATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGAT:1	-	chr2R	6085997	5'	+	1360	438	1	58.22
ATAATTTTAATTTTAGTGAAATATTTTGATATATCTACTTGGTTTTTGGAAACTTTTATAAATTCAAAGTTTCTAAAGTTAATTTTCAATTTTAATACTATATAAAATTTCACAGTCGTCTTCCTCTTCACAATCAGCAC:1	+	chr3L	26658807	5'	+	hopper2	64	1	53.57
AAATTGAGTCGAGCGGACTGTTCGTTATGTTTTATTTGCCCCAATCCTTGTAGGCACTTGGAAAACTGTGGAAGGACATGGAACAGCGCAAAAGAAATAGGTATAAAATTCTTGTTTCGCATTGCCTTAACGTTATTATTATT:1	+	chrX	8293193	5'	+	1360	305	1	69.93
ACCGAAAAAACTGTAATATCTTGATCTTAATTGCAGTGCCAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:2	-	chr3R	22822176	5'	+	mdg1	7	2	61.64
CATATTTTTCAGCGATGAATATATGTATGTTTGTATTCAACTTCATTTACATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATA:1	+	chr2L	10685318	5'	-	I-element	5287	1	69.18
GAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTAACCTCAACTAAAGAAAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr2L	16091879	5'	+	roo	8683	2	37.67
AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGCTGCCAAGCCCCATCTTCGATTTATTTTGATTTTAACTTTTGAGTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTCGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439059	5'	-	P-element	2495	1	56.16
ATTTGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	-	chr2L	14772147	5'	+	roo	46	2	53.42
CAAACTTCCTCAACATAAATTAAAAAGCGAACGAATTCTGCACCCCAAATGTAATGACCTATAAAAGGCACAACATGACAGTTACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1	+	chr3R	21434849	5'	+	412	11	2	66.67
CCAACACAGTAAATATTGGTTTATCCCTTTAAAAGGCAAGAAAAATAATAATTGTATGTAAGAAAACTATGCTTAGTTAGTTCCCTAAGAGATACACAACAATAATCCGCTCCGGTGTCTCTTCCTTCCAACTTCTCCG:1	+	chr3L	10644495	5'	-	gypsy8	4567	1	71.22
TATGTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1	-	chr3R	23495744	5'	-	copia	199	2	60.27
TTACTGAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTG:1	-	chrX	5629209	5'	+	jockey	88	1	54.17
AGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chr3R	19968101	5'	-	roo	9008	2	63.45
TCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1	+	chr3L	4840720	5'	+	jockey	4709	1	52.00
ACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1	-	chr2L	16067162	5'	+	297	58	2	73.23
AAGGCAAACAATGTTAAGCCAACCGCAAAGTCAGAGGAATTTATTTGTATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1	+	chrX	8814736	5'	+	pogo	67	1	66.44
TCTTTGATTTGCTAGAAAGCATCGCTTCAAAGGCTAAAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	-	chrX	7256221	5'	-	412	480	2	66.36
TTAGATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chr3L	20831408	5'	+	roo	31	2	64.38
TTTAAACGTTCTATGTTCAAAGTATACTCCTAAAAGGCGCAACGCATAACAAATGTTTCGTGCTCAAAACAATAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCTCGACTATCAGAT:1	+	chr3L	13428179	5'	-	INE-1	560	1	37.61
ATCATTNATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAGTCCGGTCAGC:1	-	chr3R	973196	5'	+	Rt1a	55	1	52.14
AATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chrX	6486828	5'	-	roo	9045	1	57.78
CTGTAACAAGTTATTAGGTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1	-	chr2R	8146166	5'	+	P-element	14	1	71.32
TGAGTTCCGGTACCCAAAAGGTCAATAGACACATTTAGATTCCTCCAATTTACGGAAATAGCTTAAGACGTTGGGTAAGGCGTACATCATGCACCCAAATGAAAGTATATTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGAT:1	-	chr2R	24279256	5'	-	mdg1	7361	2	70.55
ATGGCAGCCATTTGTAAGAAAGTGTGTAATAAGGACCTGGCTGAAAAAACATATACGTGCGCCATAAAGTCCTTAGCGATTGAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chr2L	12153157	5'	-	roo	9047	1	63.70
CACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATGTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGGGCGAGAGAGCGAAGAGC:1	-	chr2R	1982172	5'	+	1360	106	1	96.12
GCCCGAAAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr3R	13360289	5'	+	jockey	35	1	59.50
CGGTGGTGCTTACTTTATTGATTACTATGAGTATGTAAAATGATGTATGAATGAATGACATAATGCCACATGACATGTCAAAGCTTTTAATCAGCTTTCTCTCAATGAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCC:1	-	chr3R	22844068	5'	-	roo	284	2	71.23
TAAATGTAAAGCATTATCTGTTTCCTTTCATTTATTTTTTTTTAATATACTGCTAAAATAACCATCACCTGACAGGAAGGTGGCTGTGGCAAGCCGAATCTTATTTACCCTTGCAGCAACGACACTAGAATAACAAGAT:1	-	chr2L	10986934	5'	+	1360	2	2	79.14
ACTCACTTTGTTTATTTGCATCATCAATCACCAATCATCATAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1	+	chr3L	17560232	5'	-	pogo	2085	1	75.34
TTTTGGTTTTTCGAGTGCATTAGGCCCTCATTATCGCCGCTACCCCTGTCGCTTGCTGGCCTGTCTGCAATGCTGTAGACCACATAATTTTGAATTGCCCACAATTCAGAAAACTGTCGCCTCAAGATCGC:1	-	chr2R	10790552	5'	+	G3	110	1	77.10
AAATCCGTGTTACCAATCCTTGTAGTTAAGCAAACCAATCATTTACTGATCAGGATACAGTTATTGCTACTGTTATTAAGCAATAAACTTATAAATATGTAAATAAAACATCTTAACGAACAAAAATGTAAGCAAGTAACATTCAC:1	+	chr2R	4239380	5'	+	Fw3	3074	1	78.08
AGTAGATGTGTATTTTTGCTTTTGCCGTAGCTGTTGCTGTGTATCTCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACG:1	-	chr2R	19004473	5'	-	roo	8971	2	68.49
CCAAAGGTATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3R	25448478	5'	+	roo	20	2	71.23
CTTCGACTTCTTGCCATCTTTAGCAGTCAGTTTTGGCAACAAACAGAGCTTTAAGCCCGAAAGCAAAGAAAGTACAGGAATACCGCTCTGGACCTTGGACTCCAGCTGGCCAAGGGCAAAGAGGTCGAACG:1	-	chr2R	12811698	5'	+	gypsy8	212	2	61.07
ATGGTGTAAGAGAAAAGAAGAAAAATCACTAATGGCATTGATGTATAAATAATAAAGAAATATATTGTATATATATATATAAATACTTTATAAAACACGGTATAGATAAATTAACGTGCCTACGTTTTCTATCGCGCTCGCTCTC:1	-	chrX	8919648	5'	+	diver	361	1	67.59
GGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1	-	chr3L	10773158	5'	+	412	7103	2	57.89
GATGTCCCATACTTCGACATATATCGCTGCCTTTTCATAATTATAGGGATTTTTTGCAGTGTACTAGGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAATGCTAGTAAGCCACTCCCACTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAA:1	+	chr3L	223334	5'	+	INE-1	343	1	54.11
TTTCCTCATTCGGTAGGCAAAACATCTCGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGATTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chr3R	22276817	5'	+	jockey	36	1	73.57
AGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1	-	chrX	16717915	5'	+	roo	70	2	76.34
CTAACACCCTTGTTTCTTCACATTTTAGTTGTATCTCAGAAATGGTGCTCAATATTTCAACAGCTAATTAGTCGGGCGTTTTACAATAATTCCGACAACTGTTGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACT:1	+	chr3R	14652752	5'	+	P-element	2776	1	69.18
GCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1	-	chrX	13066569	5'	+	jockey	71	1	70.40
TCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCTCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1	+	chr2L	17295872	5'	+	Doc	74	1	76.67
CTCCAAAAGTCGGATGGAGGCAAGGGCAGCTGCATACAGANCACTCGAAGAAAATAAAAACCACATTATTATTTTGTTATGATATGTACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTATT:1	+	chr2R	12724810	5'	-	1360	331	1	56.52
TTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGG:1	+	chr3L	28063329	5'	-	Stalker4	7077	4	75.94
ATATTATTCAATAATTCTCTAGCAGGGAATCAGATAGAAGAGGAAATCGAGTATAGCGTTCTCTCTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTTTACTAGATTCGTAGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1	-	chr2L	21203872	5'	+	INE-1	30	1	54.61
GGCGCCGAGTTACATCAGTTACATGGGGTTGAAACCTAAGTCTTTTATCAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTGAAA:1	+	chr3L	27132925	5'	-	1360	249	1	52.74
GCATCAAAATTTCAGCGTTAACAGAGCAGTTCAGGTTTAATCTGGTCATATCTTTTCATAACGACCTTTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAAGGAGAAGAAGACGAAGTTTTAGGCG:1	-	chr2R	11067985	5'	+	gypsy7	491	1	58.02
CATCGTATATGGCATTACGTTCATATCATAAAGGCAAATTCTTCTTATACCCTTAGCAGAAACTGTGTCAACCTCATTCCAGATGCTTAATACTGCATTTAATATGACCCCAAATAAGAATTCAAAAGCTAAGAGCAAGCTTCCTA:1	-	chr3R	3353820	5'	-	Gypsy12A_LTR	52	1	56.85
TGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTG:1	-	chr2R	6885379	5'	-	flea	4944	1	66.44
GCTAAGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATTTTATTTGG:1	+	chrX	13039466	5'	-	roo	9030	1	54.10
CTTTTAGTCTTAATTATATTTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1	+	chrX	3308308	5'	+	hobo	39	1	54.95
GCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAAT:1	+	chr3R	14049333	5'	+	transib2	63	1	59.59
TCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1	-	chr3L	22349257	5'	+	jockey	101	1	76.71
CATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCAATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTACTG:1	+	chr3R	4504046	5'	-	INE-1	541	1	61.67
GAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGGTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAATTCTCAAAACGCAGTT:1	-	chr2L	15991410	5'	-	mdg1	384	2	51.56
ATATTACTGGCATCACTACGGCTTTCAATTGTGATAGTACATCAAATTATATAGTATAGAAGAGCTTAAGGATTACATTAGTATAAAATAAACTATACATATCCCAAAAGTAGCTAAGTACCTACATTTAAATCTTATAAATTGAA:1	-	chr3L	9955320	5'	-	Tc1-2	1410	1	48.63
GCTCTACAGCCAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATC:1	-	chr3L	23728720	5'	-	HMS-Beagle	229	2	54.76
GCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGCTACTCGTACAGTAAAAGGGCATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1	+	chr2L	21936089	5'	+	INE-1	16	1	46.79
TTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCGCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAGGCCAAAT:1	+	chr3R	24300515	5'	+	F-element	71	1	75.45
AGACTTGTGCTATAAGAAGGCTGAGTTTATTGCATAGGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1	-	chr2L	17607675	5'	-	hobo	2891	1	66.36
AACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCAT:1	-	chr3L	5102488	5'	+	BS	4703	1	63.64
CACCGCACCGATAAAACATTATCTTTCATCATAATAAACGGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1	-	chr3L	10848760	5'	-	blood	7372	2	67.50
GGAACAGATGCAAGTCAAGCGATTGCAAGGGACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATTAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3L	20654608	5'	-	roo	9059	2	72.93
GAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTGGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	+	chr3L	11393469	5'	+	roo	44	2	54.01
CGGATAATTATGAGCTATGCATGGGGAATGGCGGGGCCACAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTCTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1	+	chr3L	20888716	5'	-	1360	3316	1	68.31
GTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1	+	chrX	3309606	5'	+	jockey	57	1	52.74
ATTTGCAAGCGCCTTCTTCTGCACAGAGAGAAAAAAGGTTCTCGAATGCAAGTACTACCACTCAAATCAGTTAGATATTATACTTACCTAACATCCTGGGCTATGGGTTATTGAC:1	+	chr2L	1863059	5'	-	F-element	317	1	80.87
GGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr2R	13084670	5'	-	roo	9019	2	66.67
AAATATGTATATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTC:1	+	chr2L	11732225	5'	+	Doc	3	1	71.85
CTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGCATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTCAAATCCCAAATGAGAAGACTCTACTCGTTGAG:1	-	chrX	9540113	5'	-	roo	9057	1	62.00
TCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATACAGATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTTAT:1	+	chr3L	24796712	5'	+	Cr1a	443	1	48.63
CTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTT:1	+	chr3L	11257357	5'	+	1360	3386	2	47.12
GATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACAT:1	+	chr3L	15177227	5'	+	roo	8730	2	66.67
TGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1	+	chr2R	24218543	5'	+	412	7088	2	60.00
CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCACGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTG:1	+	chr2R	2007458	5'	+	1360	47	1	50.00
CGCTTTGGAAATAATTAAACAAGTTGCAAATGCCGCCTGCCAAGTGAGAGATTGTGAAGGATTTAAATACATTTGTGTGAAAGCTCGGGGATATTTTTAAAGTTTATTTTAAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCT:1	+	chr2L	924707	5'	+	hopper	211	1	60.27
ACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	+	chr3R	17420413	5'	+	roo	62	2	63.01
ATTAAGGTTTTTATAGAGAAAGAGAAAAGGCTAAGAGAGAGCATAAACTCACAAGAGGAAGCAGGCAGCAAGGTCAATTTCATGTTTAAGAACTTAACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTAATGCACAAATC:1	-	chr3R	1849019	5'	-	Cr1a	154	1	69.86
TACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1	+	chr3L	12861737	5'	-	pogo	2040	1	81.03
TATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTAT:1	+	chr3R	13237310	5'	+	3S18	70	2	68.66
AAAAGTAATATTTAAATATTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1	-	chr3R	11496644	5'	-	1360	3362	1	66.42
TAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr2L	18294279	5'	+	roo	73	2	71.03
GAGCTCCTGCCCGGAAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chr2R	21228986	5'	+	jockey	20	1	68.42
AAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr2L	16091921	5'	-	roo	323	2	77.62
ATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATA:1	-	chrX	23182954	5'	+	Idefix	14	2	63.01
TTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATGTCG:1	-	chrX	21667929	5'	+	gypsy2	6554	2	67.41
ATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGAC:1	-	chr2L	9778710	5'	+	INE-1	561	1	79.76
AAAAAAATGATGCACATTAGTAAATGATTTTTTTGGAACCTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1	-	chr3L	6978253	5'	-	pogo	2087	1	66.36
ATAGGTGAGATGGAATTCTAGATGAAAAATCCTCAAAGGGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGGCCACTTGA:1	+	chr2L	7263650	5'	-	Stalker	7071	4	76.03
TGTTTTGTCATTTTCGCAGGCTTAAAAACATGAACACATTTTTTGCTGAACTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1	+	chr3L	4605620	5'	-	pogo	2098	1	79.52
GACTTAGTATGGTTAGTATGGCTTATGGAGTTTTAGAAACTTGAGGAGACTTTGCTTACGATCTAATTTCACATGCTCAGAGTATGTAAGTATAGTTGGGGGGGGGTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1	+	chr2L	1517563	5'	+	jockey	4694	1	69.86
AGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGCA:1	+	chr3R	12717720	5'	+	297	49	2	56.85
GAGCGGTGACAAAATAGAAGCAGGAGGCCGCCGGGACGAACTCGCCGACAATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATA:1	-	chrX	21947768	5'	+	mdg1	49	2	65.07
ATTATGCGGATTCTTTATTCTCGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATCTAACAAATTAGTTAATAT:1	-	chr2L	22121659	5'	+	gtwin	6953	2	42.47
ACAACGACCGAATATTTAATTTATAATTTTGAGATATATTCCTATTACATAATGACGGAAGCCACATTAAATCTATGCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAG:1	+	chr3R	19449190	5'	+	HB	473	1	73.91
CGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr2R	21907902	5'	-	roo	389	2	66.67
TATCGTTAGGTGTTTTATCTAATCGACAACTGAAATGGAGTTGGGATTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1	-	chrX	1899749	5'	+	P-element	14	1	73.88
TCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCA:1	-	chr3R	934290	5'	-	Rt1b	4746	1	63.31
ATAGAATAGTAAAATAGTAAAATGAAAGCGACATAACTCCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGTCAAGATA:1	+	chr2R	6086866	5'	+	pogo	28	1	44.03
CCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGGCATACATACCT:1	+	chr3R	20499741	5'	+	mdg3	32	2	57.26
AGTGTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACT:1	-	chr2L	1377709	5'	+	hobo	13	1	59.04
ACCGCAAATGGATTTCAAGTTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	-	chr3R	22956073	5'	+	roo	38	2	54.11
CCTATGCAATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1	-	chr2R	19798136	5'	+	Transpac	18	2	66.95
AGGGATCAGATGGCCAGTGTCAAGGCGGATAGGGATAAGANAGTGAGGCAGCGCATAACATTCTGGCATCCGACTTGAATCCAATCAAAAACCTTTGGGCGGACGAGGAAAAAAGGTTTCTGAAGCCAAACCC:1	-	chr3L	19484696	5'	+	Tc1	1192	1	52.63
GGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr2R	19004204	5'	+	roo	75	2	78.79
AACGGTTAAACTTGTCGAGGAACAGGACTATAGCTTTCTCTCATGTTATACCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGAGAATACTAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATACATATTCTTGCTCAGGATCAAT:1	+	chr2R	5081154	5'	+	INE-1	83	1	61.65
ATCGACTATCGCAAACTAAACGAAATTACTATTGATGACATTTCAACGTTGCACCAACAATCTATTAGAAGACCTAATTTATGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAATATT:1	+	chrY	680451	5'	+	invader2	44	2	73.29
CTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chrX	14336430	5'	-	roo	9003	2	72.73
ACATGTTATTTGAAAACTTTAACTATGGGCATTTATTATATAGCATAAGCTGAGCTCATCAATCAGATATTTTTGTTCTTTTTTTAAATTTTATCCTTTTAAAATATACCCGATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGA:1	+	chr2L	10041293	5'	-	Quasimodo	6979	2	76.71
GACTTTAAGTAGAGGTCAATGTTGAAGTGGGTGGGGAAGTCTCATTAAAGGCGAAAATGGAATGCTTAAAACTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1	+	chr3L	16868216	5'	+	FB	35	1	55.04
AAGTGGAATATCACAGTAAAAAAAAAGAATTGCGAACCGAAATAGTACGATCTTCGATTATTCGGATGTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTATTTTTTTTTTT:1	-	chrX	2667483	5'	+	hopper	145	103	68.32
GAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACAT:1	-	chr2L	10037429	5'	+	Quasimodo	37	2	56.83
AAAATGCTACTGGCAAAGATTTGTATTTGCAGCTAACAGTATTTAGCCGAAGTTATCTTTAACTTTTCAAAGGTCTATGCCCCACTGATAACCAAGTTCACTTGAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr2L	16094888	5'	-	roo	399	1	69.18
TTGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCTGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTCGAACA:1	-	chr3L	19036056	5'	+	Tirant	61	2	68.64
ACTTTGCAACAAAATTGCATTTGAATGAGCAGCGGGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1	+	chrX	2295915	5'	-	Tirant	8459	2	67.27
CTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCTGAG:1	-	chr3R	11547768	5'	+	G2	302	1	50.00
AGGAGTCATATTTTTCATTCACATGACCGGTGTGGCACGAGGCTGGCTAGGAACCCCAGCATCCATTGACTCTATATTCGATCGGTGTAAACGCAGTTTTGCGTGGACAACGACAGAGCTAATCTCACGCTT:1	+	chr3R	11579454	5'	+	R1-2	377	1	73.48
ACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTC:1	-	chr2R	5173243	5'	-	Stalker4	7337	4	61.76
TATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTTACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATCAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1	+	chr2R	5485062	5'	-	blood	7379	2	73.43
AGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3L	11441821	5'	-	roo	9001	2	67.81
ATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1	-	chr3L	20888779	5'	+	1360	61	1	71.88
GGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1	+	chr2L	3114464	5'	-	roo	9030	1	54.68
ATATTTATCTGAAACCAGACCACTGTGCACGAAAACACAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAA:1	-	chr3R	15198189	5'	-	Cr1a	149	1	70.87
CGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	-	chr3L	22400353	5'	-	1360	3357	1	54.95
GGCAAAGTAATTTTTTCGGATTACTGTATGTAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGCGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCT:1	+	chr2R	2564944	5'	-	gypsy	7388	2	57.14
ATCTGTAAGCCAGAAAAATGTCTCATAAATATACATTTTTATTCCCTGTGTATCAATAGAAGACGAAGTCACGCGTGTAACTCCTTGTAATTCGATCACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1	-	chr3R	30443031	5'	+	1360	67	1	77.78
GAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chrX	2295982	5'	+	Tirant	15	2	60.00
AAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAG:1	-	chr2R	4774755	5'	-	baggins	5344	1	60.27
AAGAGCCATAAAGAAGTCGTCGCAAAGGAGCGTCATCTCCAGCCCCATCCGCACCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTC:1	+	chr2L	7898462	5'	+	roo	8619	1	61.15
AATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr2L	16091922	5'	-	roo	8984	2	78.62
GTATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	-	chr3R	25448472	5'	+	roo	8690	2	67.12
AAAAATAAATAAACGAATGTAGATGTGTTTTCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAG:1	+	chr2R	4906413	5'	+	INE-1	148	1	70.45
GATCGCTTAAAGCACCGATAGCATGACGCATTCCATAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTAT:1	+	chr3R	19265835	5'	-	I-element	5270	1	75.34
TAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	+	chr3L	4536712	5'	-	roo	8991	2	71.72
TTTTTTTTTAACTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAACAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1	-	chrX	13504250	5'	-	412	462	2	50.86
GGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATGTGTACG:1	-	chr3L	12861798	5'	+	pogo	74	1	68.49
ATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1	+	chr3L	16015248	5'	+	1360	52	1	66.95
AAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCA:1	-	chr2R	5260085	5'	-	1360	467	1	51.37
GCTAGAGATTAATGCAAAGGGATGGTATATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1	-	chr3R	14337507	5'	-	copia	207	2	52.41
GTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1	+	chr2R	14542161	5'	-	roo	8982	2	80.14
ACCGTTAATAAACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chrX	23280961	5'	+	roo	8672	2	44.44
GGTACGCGCACTACCCACTACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACAGAAATCG:1	-	chr3L	22349306	5'	+	jockey	33	1	63.28
GGGGTATAAAAACGGTCGAGTTAGCAGGTAATGGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1	-	chr3L	10773190	5'	+	412	31	2	64.38
AATGTTTGTTTTATTTTTCAGCAAATTGCCTTTGTTCATATTCTGTCAGACGGAAGAAAGTGCAGTGAAAACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCC:1	-	chr3R	6237187	5'	-	X-element	4508	1	52.05
CAAATATTTCTGTAATTTCTTGTCAACAAAAAAACCCATATTGTTAGGGCGTTAGAGTGGGTGTGGCAACATGGATCAACAAACTTGAGTTGCGTCTCTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTCTTATAGTTCTTGAGCTCTCGAC:1	+	chrX	20672599	5'	-	INE-1	145	1	66.44
ATTTAATTAGTTCTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAGGTAAGTACAACATATATAAGCGTATGTAAACAGATGTAAACGTACTATATGTGAAAAGAACTGACTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGT:1	-	chr2L	22315556	5'	-	Stalker	7178	4	74.31
GTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1	-	chr2L	11661021	5'	+	F-element	21	1	47.96
AAAATCTCTTCTTTGTTCAAATAAACAGATAGACTGGGTGAAAACGTAGCCTTATAGGATCAGAACATTTGAATATGATATCCAAATGAAATGCAAGTAGTACAATCGAAATATAGATAAAACCAAATTTAGAATTATTAAAAAAA:1	+	chr3R	27733530	5'	+	I-element	253	1	91.78
GTTCGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1	+	chrX	22601895	5'	+	INE-1	88	1	50.71
AGAAAGCCTTATAACAAGTATATAATTTCCCCAAAAGCTTAATCCCAAATTAAACTAATTTATTAAAAATGTATCAAAAGTGTGGGCGCGGCAGTTTTGGGTGGTTTTAGGGCGTTAG:1	-	chr2R	4563148	5'	-	INE-1	342	1	51.69
GATAATAAACCAATTAGTTTTGCAAGCAGTGCATTAAACCACCTCGATCAGAATTACATTACAATAGAAGAAGAATTATTAGCAATTGTTTGTTTGGGCAACCTTTTTTTTTATTACTTCAAACATACGGTTTGGTAAGGAATCAT:1	-	chrY	627095	5'	-	Tc3	1380	1	70.55
GTGTATGGCTTTGGTGGCCATGCAAACGAATACAGCAACGTATCCTTTAAATGTTTTTTGGCCACGATTTTTTGAACATTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTT:1	-	chr3R	19447311	5'	-	roo	8799	2	54.79
GAATAATTTGATGATGTTCTCGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATCGAAGGCAAGGGGACCTGTACTGGCGGGGGCATGCTTT:1	-	chr3L	23758669	5'	-	Gypsy12A_LTR	2217	1	71.43
CATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1	+	chr3R	26431976	5'	+	opus	7037	4	60.00
ATGGGCATGGACATGGACATGGGTTACATGACTTAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTG:1	+	chr2R	23339402	5'	+	invader4	2677	1	76.55
CTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	+	chrX	17526857	5'	+	roo	8753	2	81.51
GCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1	-	chr2L	21400374	5'	-	mdg1	339	2	70.55
CACAAAAACCTTTACCCTGAACTGAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1	-	chr3L	9673102	5'	+	Doc	81	1	75.97
CGCAGACATTGTTTTGCGGGCAAATATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chrX	5274392	5'	-	roo	9013	2	59.59
CTGCCAGCTGTTTACTCGCTTCTGCTGCGGCTGCACTTCACTTTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	+	chr3L	22437815	5'	-	roo	393	1	73.29
ATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTACT:1	+	chr3R	4504047	5'	-	INE-1	542	1	61.02
AAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1	-	chr2R	5485218	5'	+	blood	54	2	54.11
AGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGC:1	-	chr2R	4939192	5'	-	1360	3377	1	35.66
GTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr3L	12879731	5'	+	roo	8724	2	60.69
CCACACAACTGAAACTAATCGGAGAGAAAGAGCCAAAGAGCGCGGAAACAAAACAAAATCGCAAAGTGTATACATATGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCACAGAAATCAGTAATGCA:1	-	chr3R	12720871	5'	+	297	41	2	65.87
GTAGTTGACGTAGTAGTCATTTGCACGTTGGAAGACCCCTATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGCCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTG:1	+	chr2R	25118638	5'	+	roo	23	2	63.70
GAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCA:1	-	chr2L	13585904	5'	-	Tabor	398	2	74.66
CTGAATTATTTATGCAAATATTCACCGGCTTGCGACCTTAATGGCACTTTAATGCCATACCACCGACTCACAGTTCACTTTATCATCGCACCCACTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTC:1	-	chr2R	12829272	5'	-	jockey	348	1	63.49
AACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTT:1	+	chr3R	17605640	5'	-	Tabor	7255	2	62.33
GAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGCAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATC:1	-	chr2R	21298806	5'	+	jockey	283	1	69.67
ATTCTTCTATCCATACTTCGGCTGGAATAGTGTTAGTGCCATCATAACTGAGTATGCTCTCTTCTACGTCGCGAAAATTGATCGCATTCTATCATTTTCTGTAACTACGTTGCGTCTACTCCTT:1	+	chr2R	1340890	5'	+	gypsy5	6884	1	54.03
TATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACNCTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAG:1	+	chr2R	5617502	5'	-	invader1	341	2	64.23
AAGATTATTATTGCTTAGAGAGTGTAATTTTTTAATTGATCAAGAATAATGGCTAATGACTAATGTAATATAATGTATATAAGACGTAGTATTAAGTTATCTTAATTTATTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAG:1	+	chr2L	8380343	5'	+	Cr1a	4140	1	69.86
CTAAACGATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1	-	chr3L	7943752	5'	-	Burdock	6373	2	68.97
CTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGTTAAATTATATTTAGGATT:1	+	chr2R	25118705	5'	+	roo	8743	2	77.78
CTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGAC:1	+	chr3L	24213787	5'	-	invader2	163	2	75.34
CAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGAGTGGGCAAAACTGCAACGCCGATGACCAA:1	+	chr3L	26696870	5'	+	looper1	1564	1	85.05
GAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCATCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1	+	chr3R	26431972	5'	+	opus	158	4	60.00
TTTTGTGTTTAACGTAAACTTTTTCAAATTTATTAAGGTTACGTTTATACTAATACACTAGTGGGCGTAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGAT:1	-	chr3R	556530	5'	+	Tc1-2	72	1	62.33
AAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1	+	chr2L	6863283	5'	-	pogo	2034	1	69.86
AAATGAATTAGGTAAAGAAATAAATTTTGTATGGTTTGATCTGAGTTCTTAAGGTTATGAAGCTTAATTGATTTTACACTGATCGTAATTTACTCTACATAAAAGTATATATGTACACATATTCTTGATTAGGACCAATAGCCGAG:1	+	chr2L	18795483	5'	+	INE-1	90	1	71.23
ACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1	-	chr3R	20427474	5'	+	jockey	34	1	56.64
AAAACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1	-	chr2R	5531224	5'	+	1360	60	1	73.39
TACGGTTTGTTGTGTTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAG:1	-	chr3R	3953141	5'	+	invader1	100	2	77.70
CATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAACTAAAAGAGCATATTAACT:1	+	chr2R	9791589	5'	+	412	34	2	54.63
CAGACTAATGCGATTAAACCGAGATCCTGAGTCAAAGAAACTTCTATACCACCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCTCATCGTCAC:1	-	chr2R	3290379	5'	+	Idefix	7042	2	63.31
GTATATGCGTGTTAAGACCTCGGCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1	+	chr2L	17081758	5'	-	jockey	4977	1	64.52
TCGTATATAAAAGTGTATCTGCCTTATTTTTGGGACTCTCGTATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1	+	chr2L	4412515	5'	+	Quasimodo	17	2	67.81
GGGTTTTCTGCAGCCCTTTGGCGTTTTAATATGCAAATACTTGGGCATCGGTATTCTATTATTTTTCTCAATTGACGTGTTTTTTTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTCGGTCAAAACCAGGTTAG:1	+	chr2R	25138361	5'	-	jockey	4779	1	61.36
AGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1	+	chr3L	7292453	5'	+	HMS-Beagle2	33	2	59.52
CCACCTACTCAACTTCGCTGCCAGCTGCTGTTTCAATTCGNTTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr2R	14388067	5'	+	roo	8678	2	73.97
ATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACT:1	+	chr2L	21325114	5'	-	invader4	252	2	72.26
CAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1	+	chr3R	19446101	5'	+	297	12	2	74.44
GCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGCACATCGC:1	-	chr2L	18404591	5'	+	hobo	65	1	67.97
CCCCTTGGTTTATTTACGCGCCTAAGAACGACCTTGGATGCTCACTGGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTAT:1	-	chr3R	29326875	5'	-	accord	181	2	75.90
TAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	-	chr3L	11530981	5'	-	roo	9020	2	56.12
GTACGCAATCACTTAGAGTGTTTGGAGTATTGGGGCAGACGACGCGACACTGTATTCAGACCAAAACAAATTAAGTTACCGTCCCTAGCTAATCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATGTGTAAGATTATTCGTGGGGATG:1	-	chr2R	10359051	5'	+	Cr1a	4049	1	53.10
TAGGTTAAGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGAT:1	+	chr3R	9714342	5'	+	Stalker	23	4	69.86
AAAAATAACAGGCAAATAACTGAAAATAGCAAACAGTGCAAACAGCAAGCGCATAAGACTCCTGTAAAAATACTCTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1	+	chr2R	652288	5'	+	copia	4906	2	60.00
CATCATTTACGAAATTTTCGTCTAACCGCGGGCGTTTTGTTAGCCGTCAAAATATTTTCCTGCCTTTGCTTTTTCAACTTTTCATTCCATTGACAAGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTT:1	-	chr2L	8643483	5'	+	1360	296	1	65.75
TATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1	-	chr3L	10574390	5'	+	Tabor	6888	2	48.63
ATCACAATGTCAACATTTTTTCCCTTCTTATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGC:1	+	chr3L	17557977	5'	-	jockey	4964	1	58.90
TGGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGT:1	-	chr3R	20427517	5'	+	jockey	22	1	74.31
AAGGGGGGATCCCAGCCGTTCAAAGCGTTTTGCGTGGGTGCCATTGTAGAAACACATATATATGTATATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGC:1	-	chr2L	2794279	5'	+	Burdock	6187	2	60.27
AGCCTTCCAAATTGCCTTGTACTTCAACTTTATCAATTATTCACAAAAACCTTTACCCTGAACTGAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1	-	chr3L	9673143	5'	+	Doc	47	1	47.06
ACGTCATTCTCATAACTATGGTGTAAGCTATTATTTCGGTCGAACCCTCGAAAGAAACATTCGGTTCGTTAAGTTGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAATTAAGAATACATAGATATAAGTATTGTATGTG:1	+	chr2R	20040604	5'	+	Stalker4	280	4	63.01
CTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1	-	chr3L	6978214	5'	-	pogo	2033	1	76.80
TATGTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGTCGAAACAATATAATGTTACCGTTATCAGTGACAAGCAGTTACCGACTATCTCTCTTC:1	-	chr2L	22685217	5'	+	Ivk	1	1	71.15
ATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1	+	chrX	17054207	5'	+	jockey	79	1	64.58
AACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTCTCTGCAGCTT:1	+	chr3R	25423196	5'	+	3S18	5822	2	53.47
AAGTTGTGAAAGTGCCACCGACCTGCCACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGGCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chr3R	14940209	5'	+	jockey	36	1	60.71
AGCTAAAAGATTAATTAATCTCAATTACCTTCTTGCTAACTAAATTACAATCACACACATATACGCGTTCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGTGAGCGG:1	-	chr3R	29571350	5'	+	1360	3295	1	63.70
ATTGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr2L	3114461	5'	-	roo	397	1	70.54
CCTATGGGACCGCAGTTCGATCCCAACGAGATCGATTGTACCAACCGTGACTTTGTACCACATCCCAATTGCCGAAAGGTTAGTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGA:1	+	chr3R	13770016	5'	-	Tc1-2	477	1	76.36
GCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAATCTCCCGCCACCG:1	-	chr2L	21008622	5'	-	invader3	207	2	62.24
TTTTATGATACAAATTACTACCATTTTACACAAATTAGAGAAATTAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAATGAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAAGATGAGCGCCGACTC:1	-	chr3R	1511976	5'	+	Doc3-element	256	1	67.86
CAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1	-	chr3L	3501012	5'	-	opus	434	2	72.31
GAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr3R	16076866	5'	-	roo	334	2	69.66
GGTAGCTGGTCAAGTACCACATCATTGAAGCTGGCAGCTTAACTTTAGCACCTCACTTAAGCATCCAATGCCTCCCCAGGCGAATTTGTTTCACATCACATATTGCTACGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACTATGTAA:1	-	chr3L	154120	5'	+	1360	3144	1	65.75
CACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:1	-	chr2R	23332612	5'	-	invader4	275	2	67.48
GTTGATTGCCTGAAAAATAAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr2L	17420105	5'	-	roo	9055	2	71.92
AATGATATCCCGGATGGCCAAAGAGTCCAAGACACACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCCCTCTTTCCGCTCGCTCAC:1	-	chr3R	17531426	5'	-	1360	3305	1	75.34
AAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGATTATGTAAGACTT:1	-	chr3R	17605718	5'	+	Tabor	6915	2	65.75
CTTGATATTTAAAGATAACTTTTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACTCACT:1	-	chrX	7194397	5'	+	P-element	273	1	21.05
GGATGTGGATGTGGAATTTCCTAGCAGCCGTTGCCATTTCACTATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATA:1	+	chr2R	15005988	5'	+	jockey	4914	1	69.72
GCTCGCACTCGGATTGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1	-	chr2L	20840528	5'	+	Transpac	18	2	68.64
GAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chr2L	7898385	5'	-	roo	9015	2	59.12
GAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTC:1	+	chr3R	9210649	5'	-	mdg1	339	2	75.89
TCTGCACCACCACTTGCCGGGGTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTT:1	-	chrX	10022382	5'	+	hopper	144	110	86.67
TTTCTCACCATTTTCTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1	-	chr2L	14081449	5'	-	1360	3375	1	75.00
ACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTA:1	+	chrX	21670001	5'	-	Stalker2	347	2	60.31
TAAAAATTTGACTCTTCAGCTTTTTTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCG:1	+	chr2L	17295779	5'	+	Doc	4	1	76.22
TTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCATCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1	+	chrX	21087551	5'	+	mdg3	5272	2	64.00
TATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	-	chr2R	7898159	5'	-	roo	9036	1	60.91
AAGTGGTTGAATTCAAAACCGAACAGCATTTTGAACTAACATACAAGAAAAATAGAGCGACAGTAGCAGCGTCGTGTATTCCGAAAGACCAACGAGTTTAATAAAAAATAACTATAGTTAGCCGGCGAGCCCAAATG:1	-	chr3R	3457145	5'	+	X-element	4636	1	81.02
CACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACC:1	+	chr3L	19013919	5'	-	invader3	208	2	64.38
AGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chrX	5274298	5'	+	roo	53	2	60.47
TTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1	+	chr3R	19589897	5'	+	BS	5032	1	54.35
GGTCAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1	+	chr3L	3500921	5'	+	opus	7153	4	55.38
TACATACGCTGCAGCTTAAAAATGCTCATGATATATAAAAAAAAAAAGTAATTCATAATTTTAAATAGAGAAAAACTGGTCTTCCTTAGTTGCTGCAATGTTTTAATTTAAGGGGAGGGAAGTAGCATAATATGCTT:1	+	chr3R	14111065	5'	+	rover	6947	1	76.64
GGTGCCCCTTACTTCACACCCGATTCGAAACTAAATAAATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1	-	chrX	10201255	5'	+	transib2	30	1	64.75
AAAAAAGAAAAACGTAAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATCATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3L	11441879	5'	-	roo	396	1	74.66
TGGTAATATTTGATATAGCAAGATTTGGCTCCTGTGTCGCTAATATTTTTAGTTGTTATTTTTTTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1	-	chr4	1152144	5'	-	transib2	2821	1	79.07
AAGTAGTTGGTTGTTTAAGGTTCCTGCTCCCCGCCTCCAAATCCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr3R	19449432	5'	-	roo	398	1	63.01
GAACTAGCGCCTTTTTCGGCTGGTTTTCAGTTACCCAAATGACTGTTAGCATAGGCTCGAGTAGTTCTCTTTTCCTTGGATTAATATGCTCAACGCACCGTCGTTTTTCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCG:1	-	chr3R	10186431	5'	+	Max-element	8347	2	79.26
CTTGAAGTATGCACTACTTTTTTCAAACTATTAGCTCCGAAGAACTTCTTATCCTAAATACTAACCTTTCGGTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATATTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAA:1	-	chr3R	13770137	5'	+	BS	5083	1	49.32
TTTTAGAAGTTTTCGTTATGCTTTCTATGGGAAATACGTCATAGTCCCCCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTT:1	+	chr3L	29487	5'	-	Quasimodo	226	2	51.35
ATATCAGAATTGTTTGTAACAATTGTTTATCAACAACAGTGTGCTTAAATGAATTCAAACACTAGTATAAACCTTCTTAAAAATTGTCGATTTCAAATTGAAAGAGGTAACAACTTACAGTGTCTTGCGAAGAATGCCTGGCAGCG:1	+	chr3L	13496542	5'	+	gypsy	89	2	77.40
AATATTCTGATCTAACGATTTATCATGCCGTGTTGTGGATTTTTGTTCAAGTTGCTTAATTTCATGGCAATTTATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1	-	chr3L	16769342	5'	+	FB	37	1	56.39
AGTTAATACACTGGACAAAAAATAGGCCATACATAGGAAGGCAGCTTAGTAAATATTATTTAAGATTTTGTCTAGCCCTAACTTTCAGATCTCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGCATA:1	+	chr3L	1408222	5'	+	Doc	4454	1	54.17
GAAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1	+	chr3R	2527714	5'	-	INE-1	541	1	48.63
AGGATAATTATGAGCTATGCATGGGGAATGGCGGGGCCACAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1	+	chr3L	20888716	5'	-	1360	3343	1	64.35
GTTACAGGTTGCCCCAGCTAACTCATCCATTTATCCATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1	-	chr3R	21706091	5'	-	297	343	2	58.90
CACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1	+	chr3R	22822000	5'	-	mdg1	7413	2	56.92
AGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATA:1	-	chr2L	21153548	5'	-	1360	317	1	65.07
GCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTATGGTGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGT:1	+	chrX	23202018	5'	+	R2-element	122	1	67.83
GAAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTAC:1	+	chr2L	6622957	5'	-	Burdock	176	2	77.78
TACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1	-	chr2R	16785436	5'	+	412	32	2	59.06
TACCATGTTTCATTACCCTATTTCAAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	22122802	5'	+	roo	48	2	54.11
GGACAATTATACGTTGCATGCTCTCGAGTGGGTAAACCATCCAGTTTGTTTTTGTTAGCAAAAGATGGACGATCATAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTATATGGTTATCTAGGGAAGGTTAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAA:1	+	chr3L	24009157	5'	-	Cr1a	3976	1	50.68
GGGGGTTCGTCCAAGTTTCCCCCTGCTCCCCGCCTCCAAATCCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr2R	8585376	5'	-	roo	399	1	78.47
TGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGT:1	+	chr3R	4160060	5'	-	invader2	193	2	54.79
TATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1	+	chr3L	22863408	5'	+	412	65	2	75.00
CTTAACAAAAAATGTACATTTTTTTCTCTAAAAATAGAACAATTGGTATTTGAGTAATTACTCCCCGTAATTGTGTTTGTGATTAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1	+	chr3R	30248083	5'	-	Juan	4189	1	63.64
CGGATAGAATGAGATAGTGGGTGCGGAAAAGGGGGATATTCGGATTTGGATTGGGATCTAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATG:1	-	chr3R	14650782	5'	-	P-element	2758	1	59.05
GATGCTGAGCTTGCTGAATTTTTGCCAATATTTTGCATGGGCCACTTGAAAGTTAATTACAAGATTCGCCCCCTCATGTACCAATGAGTGTTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAG:1	+	chr3L	8923670	5'	-	Quasimodo	36	2	76.67
CTACGATTTACTTTTAATCTGACTAAATTCGAGTGAGTTTTTATTCGTTGCAAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1	+	chr3L	22863330	5'	+	412	12	2	75.86
ATTATTACATATTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGT:1	-	chr3L	23529727	5'	-	Stalker2	233	2	66.44
CGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGT:1	+	chr2L	12290688	5'	+	1731	85	1	73.29
CTGCAAGCAGCTGTTGCAACTTCCCCACAAAATTGAATCCGAGAACGGATGCCAGCACACGAAATTAAGCGGAAACTCTGAAATTTATTTTACCATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr2R	13696355	5'	-	roo	399	1	76.15
GGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1	+	chr3R	6611197	5'	-	HMS-Beagle	178	2	65.07
AGAGGCGAAAAGAAGCAATCTGCCGTGGTTTTCCTCTCCTTCGATTTTCCACCAGCCTTCAGCTTTTTTTATCATATTGCTATGGAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATT:1	-	chr2R	24049855	5'	+	1360	3170	1	55.48
AAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chr2L	12892711	5'	-	roo	9013	2	60.00
ATATATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGGAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1	+	chr2L	22121303	5'	-	opus	497	2	49.32
CACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATATACGAG:1	+	chr2R	2666331	5'	+	Rt1a	45	1	52.50
ATATCACAATGTCAACATTTTTTCCCTTCTTATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGGTTTTATTATTTGATCAACG:1	+	chr3L	17557975	5'	-	jockey	4982	1	67.69
TCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1	-	chr3L	27391421	5'	-	1360	3364	1	63.70
AATAAGTTTGAGATAAAATTGCAAAAATACAAAATTCAAATTTAAATTCATCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGT:1	-	chrX	9820281	5'	-	412	281	2	65.75
TGATAACTGCTTGATTGCAGAGATATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chrX	13039596	5'	+	roo	27	2	69.18
TTATGGTACGCTGTTTTCTTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTAT:1	+	chrX	22596369	5'	-	INE-1	565	1	57.69
AAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACCCTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1	-	chr3L	17115532	5'	+	blood	7048	2	50.89
GAGTTTATTGTGCGCCTGTTTCGGGTAAATAGGTAATTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTA:1	-	chr2R	1567955	5'	-	jockey	4929	1	59.59
ATGAAATGCGATTATAGTGCATTTGCATGGGTCGTAGCTTATGGCAATTTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr3R	19968249	5'	+	roo	10	2	76.71
ATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAG:1	-	chr3R	20427431	5'	+	jockey	4	1	52.50
CAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTATTTCTTTTTAAAAATGGTTTTCCAAACCAAATTAAAAGTGTAAACATGGAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATATCACGTGACTC:1	+	chr3L	20168320	5'	-	mdg3	5469	2	65.07
GCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr2R	19050205	5'	+	roo	60	2	66.14
CAATTCTAGGTTAAGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGACTACAATA:1	+	chr3R	9714336	5'	+	Stalker	6866	4	73.97
CGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3R	17420407	5'	+	roo	8720	2	58.90
AATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1	-	chr3L	21855528	5'	+	blood	7072	2	63.77
TTGTGTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGTGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1	-	chr2L	15875843	5'	-	hobo	2898	1	54.07
AGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	+	chr3L	15519747	5'	+	pogo	60	1	60.27
AAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1	+	chr2L	9668195	5'	+	1360	13	1	55.42
CGGCACTTAATTCTAGAATGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAGTAGT:1	+	chrX	5662861	5'	-	P-element	2822	1	43.15
ATAACAAAATAATGTTTTTTTATATTCATAATAAGACAACAAGATTATTATATGTACGTTCAGTAGTCTTCTCTCATTTATGCGTTTCCTCCGGATATAAATGACCAATATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGATCCG:1	-	chr3L	24535830	5'	-	rooA	7136	1	58.04
GTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr2R	11164492	5'	+	roo	8738	2	72.60
ACCACACATTTTTAATATGCACAAAACATGTGACTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATACGGAGGATTATAATAGTTGATA:1	+	chr2L	5516491	5'	-	jockey	4856	1	66.67
AGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGGGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1	+	chr3L	10848632	5'	+	blood	7012	2	74.74
TAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1	+	chr3L	16015251	5'	+	1360	67	1	72.31
AGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1	-	chr3R	16404567	5'	+	pogo	54	1	59.71
CGCTTATCTTTAAACGTTTTGCGATTTGCCCTGCCCTGCCGTGATACACAGCTGTGTTTTTTGAACCCACTCCAGGGAATCGTCGTCCTCGTCCTGGCGGTTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACCGTAGCTAATTC:1	-	chr3L	20166620	5'	+	1360	2973	1	68.06
CATACTCGTCAGGGTTGCATTGGAACCCTCCGGCAAAAAACAACAGCACAAGGGTGAGTACTAAGAAATACACATTTGTTGCACCATCCTGTTGGTTCCATTTCCCAAGTCCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTAT:1	-	chr4	855287	5'	-	1360	447	1	73.43
CTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCCCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATT:1	-	chr3L	10590623	5'	-	1360	2972	1	54.31
AATGAAGTTGACCATCAGCATAGTGATTGTGATTACATTGTATCTCATGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1	+	chr2R	16946528	5'	+	jockey	4813	1	67.12
CAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTG:1	-	chrX	12074615	5'	+	412	7196	2	62.33
CCCAGGCATACATATGTTCCCTTTCGCTAATTTCCCGTAAAAACAAAATAAAAAAAAAAA:1	+	chr3L	7109523	5'	-	hopper	149	109	76.67
GTATTAATTGGTGATGGGATAAACCTCGGCGAACAAGAATAAGCGACTAAAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGTGTCCTC:1	-	chr3R	395236	5'	-	accord	7371	2	76.71
AAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr2R	19050331	5'	-	roo	396	1	67.63
AGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGC:1	+	chr3L	25482876	5'	+	accord	23	2	62.71
AAACCAGACACAAAATGCTCGCAATGATCAGTTTTCGACGAGCCTTCACATCCACGCCCTCGCTGCGGGCACGATGACAATGATCCCGGACTGAAAACAAAAAAAATATAGGAATTAAATTTATGTATGGTAAAATATGGAAAATA:1	+	chr2L	15241432	5'	+	transib2	259	1	77.40
AGCACTCTGATGCATGTCATGCATGTTATGATGTTATGCAGCCCTCTAGTGCGCACTGCTGCCGTTATAGGACATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAAATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGG:1	+	chr3L	23600497	5'	+	invader4	3000	2	48.87
CAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1	-	chr3R	20005097	5'	+	297	6635	2	68.07
CTTGGAAATTTGTTTGCGCTGTGGCTAATGAGGCAGTCCAATGCAGATACAGAAGCTATAAACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1	+	chr3L	7943604	5'	+	Burdock	11	2	68.00
AAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATA:1	+	chr2L	12290684	5'	+	1731	18	2	53.01
AGAACATGACAGAAGTTCTTAAAGAATATCTTGGTGCTATATCTTGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCC:1	+	chr3R	19448768	5'	-	roo	8932	2	70.45
CTGAAACCGAAACCGAAAAACAACTGAATCTAATGTGCATCTTAAATAATATATTAAGTGAAATTACTTAAGGGCAAAGGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACGGTCTGCGTAG:1	-	chr3L	624506	5'	-	1360	149	1	45.89
TATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr2R	7898159	5'	-	roo	342	2	69.29
CAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGACCGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr2R	13084678	5'	-	roo	346	2	65.00
AAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	-	chrX	13039546	5'	+	roo	77	2	73.29
TAAACACTGTGGACACTGTCACTGTCGCCATGTAAAATGTTAATTTTTATAAGACTAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTATTAATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGATCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTA:1	-	chr2R	1531559	5'	-	Stalker	287	4	82.88
TTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	-	chr2R	21920569	5'	+	jockey	70	1	73.44
GATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACGACAAC:1	-	chr3L	5102503	5'	+	BS	4698	1	51.38
GACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1	+	chr3L	23146455	5'	+	1360	45	1	54.79
CGGGCCATCCATTTATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1	-	chr3L	17115560	5'	+	blood	43	2	54.79
CCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGTAGC:1	-	chr2R	9662820	5'	+	412	43	2	56.16
AACATATCATATTAAAGAGCCAAGTTTGTTTTTGGCACAGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTACTTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3L	19334229	5'	-	roo	362	1	54.48
TTTAAGCTAGGAGAATATATATATTTGCCAACACTTTTAGTCTTAATTATATTTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1	-	chrX	3307188	5'	+	hobo	34	1	44.60
CTCTGGCTTTCGGCCCTGCTCTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1	+	chr3L	2362306	5'	+	Stalker2	7261	2	67.57
AGGCAAATGGGGCATAATCCCATCACAGGCTTTGGATAGGATTGGTTCCACATTACAATGCGCACACAAACACACACCCAGAGACAATATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTCTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAG:1	+	chr3L	3121494	5'	+	Cr1a	224	1	58.90
GGAAACTTTGCGTTTTTCAAATCGCCGGTAAAATTGGTTTGTGCAACTCACCTTTGGGTCTTGAGATATCACAGAATGGTTTTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCC:1	+	chrX	16857390	5'	-	R2-element	32	1	58.87
TGAAGGGTTCCTCCTTTCTCACCCCTAATATCAAAATCCCAAACCGGAAAGGAAAACCACGAAGCTCGGCTTATAGACTTAACTCTAGTCCGAGGGCCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTG:1	+	chr2R	19538593	5'	-	jockey	4681	1	51.77
ATATGACTTTTGAACCTATTTCATGGAATTTCACAAATTTTAAAAGCGGCAAAAGTATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	-	chr3L	10648017	5'	+	412	39	2	47.59
CAATAAAGAAAGCTCAATCACCAACCAATATTTAATTCGGATCCACTTCTCTGTGCCAAGCAAATTTACTAGAATCTACATACCCCTAATCCTAAATCATTTTATATCTAACTAAGAGTTGCATGACCCCTACAGAGTATTATGTT:1	-	chr4	267663	5'	+	Cr1a	4181	1	69.86
AGCATGCCATCCTGTCGTGTGTCAGCGAAAGAGAGGCAGGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1	-	chr2R	21101809	5'	+	P-element	30	1	41.94
AGTTGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGAGCTCCGTACATATCTTATTGAAATGAATCG:1	-	chr2R	19004239	5'	+	roo	54	2	51.37
AGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAA:1	-	chr4	158193	5'	+	1360	429	1	64.38
ACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGAGACATG:1	+	chr2R	5617498	5'	-	invader1	3945	2	64.38
AGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1	-	chr3L	21855536	5'	+	blood	7071	2	60.00
AGACAAGAACGTGAAAACATAATAAACTCTATCATTATTGTTTTTATAGCAGTAGTTTTACCACAATTTATTTTGGCTCTGTTAACTGTTGTGTGTTGCAGACTCCATTTACGTCTTACAAAAAC:1	+	chr3R	1966483	5'	-	Doc4-element	490	1	53.60
AATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTCACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACC:1	-	chr2R	4802883	5'	-	mariner2	253	1	33.88
TGCCTCAATTTGTCAAAGACGACTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chrX	14336393	5'	-	roo	9026	1	55.48
AAATTTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTA:1	-	chrX	23283051	5'	-	HMS-Beagle	185	2	64.38
CAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATACGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCCTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAAT:1	-	chr2R	4774732	5'	-	baggins	5362	1	62.86
TTGCAAATTGTTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	-	chrX	5643599	5'	+	roo	38	2	58.22
CATCGCTAGCATGTGAATGTCTTTTTAGTTTTTTTTTACGTCAGTATCGGCTTAAAAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTG:1	-	chr2R	6885460	5'	-	flea	253	2	80.82
GGAAACTGAGGCAGCCAGCTGGCCGACTGTTATTATGCGAGTTCCTATTTATAGTCAATGTGTGAGGATGATTAGATGAATTATCTATGAACGTG:1	-	chr3R	20467914	5'	+	micropia	5151	2	60.00
TTCTACCAGTTGCATATTTCGCCCCATTGTTGCTGAGAGCGGACGAGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTCGTATAGCGGAAGTTGTTG:1	-	chr3L	20876255	5'	-	Porto1	443	1	76.56
GAACATATATCTCTGCCAGACGATTAAAATCCATCGCACTGGGCCAAACTCAAATCCAAATAAAACGTAAAATAATCAAAAACTGCAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCAC:1	+	chr3L	9673529	5'	-	Doc	110	1	58.22
CTGAAAATTATCGGCAGCAAAATTTGAAAACACAAGAACACACAATTCAAAACTCGACTTGTAAAATTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAA:1	-	chr3R	17532495	5'	+	1360	3144	1	54.74
GGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATT:1	+	chr3R	14049348	5'	+	transib2	71	1	68.35
GATGCGACGCACTCGCTATGGAATGATAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAAACAAAACCCCCCAAA:1	+	chr3R	1418286	5'	+	BS3	231	1	59.63
CCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr3L	4536765	5'	+	roo	88	2	77.40
ACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr2R	20596431	5'	-	roo	394	1	69.35
ATTTGCTTTTATCTAAGATAGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1	+	chr2L	9399432	5'	+	Transpac	4970	2	54.11
AAGGAAAAATGTTTGAAGTTTCATACATTGCTGTTTTCCCACTTTATTCCGTCTTGGTTAGAGTATTCCAAAACCATTGATTTATGTTTATTTATGTTT:1	+	chr3L	17481458	5'	-	Stalker2	78	2	70.71
CATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGATCCCGAATAATCTTCGGCATCTACTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTC:1	-	chr3R	19449717	5'	-	mdg1	447	1	71.77
GAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:1	+	chr3R	14981169	5'	-	mdg1	7382	2	70.55
ATTTAATTAGAAAAAATTGAAAAGGTCAAATTTTTGATTTTGATGTTGAGCTCTTATGTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1	-	chr2R	5311577	5'	-	1360	3379	2	39.04
TTTTACGAATAACCCTTTTTTTGTAGCATCTTTTATATAGGTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGGATTTTTATTGATCAAAA:1	+	chr3R	25454015	5'	-	Quasimodo	7332	2	55.37
GTAATGACACCAAAGAAACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr2R	8585552	5'	+	roo	45	2	49.65
ACACAGTTGATTGCCTGAAAAATAAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1	+	chr2L	17420100	5'	-	roo	409	1	82.09
ATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1	+	chr2R	9791547	5'	+	412	7083	2	65.75
ACAACACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1	-	chr3L	26011949	5'	+	F-element	31	1	52.81
GGAAGAAAGTTATCTATGGGAAACTAAAGGAGGAATTCTAAGGGAAATGGTGCTTATGCAAGGAACTATATTTGTATCTCCACAATGAAAGGGAATACTTCCTGGTAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:2	+	chr3R	14035322	5'	+	1360	17	1	63.01
CCATCTGTTTAGAAAAAATATGCACAGAACCCAAATTCAGTTTTTCATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTA:1	+	chr2R	16785300	5'	-	412	474	2	66.67
GAACAGCAAAGAAAACTGGCACTAAGTTGTCCTTAGCTTTAAACTTGAAAACGAACCACTTAAATGTGTGGACGCCGAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTTAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCC:1	-	chr3L	20892749	5'	-	invader3	225	2	55.71
AAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	+	chr3R	18582153	5'	-	roo	9004	2	64.83
GAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1	-	chr2L	15991400	5'	-	mdg1	7394	2	63.01
CAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1	+	chrX	5629126	5'	-	jockey	4927	1	65.93
TTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1	+	chr3L	18368919	5'	-	opus	448	2	64.12
GATAAAAGTTGATATATTTATATATGCTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGGCTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGCATCAATAGCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAC:1	-	chr3R	21951948	5'	+	INE-1	140	1	80.14
TCACCGNTACAGTTTCATTCCTTTGCCGACGCATCCATGAGAGCTTATGGAGCTTGCTTTTATATTCGTAGCTAAACTGCCAAAGTTTATAAAAAACAAGAAAGAATGCTAAAGTAGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACT:1	+	chr2R	3144704	5'	-	INE-1	550	1	63.01
CAACAAATTTGTTGTACATCAGAATTGAGAAAAGCGCGTAAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGC:1	-	chrX	13704854	5'	+	invader4	2837	2	72.60
GCAGAAAAGGAACGAGGCGGAGTAGTTCATTTCCGCAGGCAGGCAGAGACTTAAATACCCTGTAAGCGTACAAGCGTATCTATCGGAGTGAAGATATACAAAGTTACTTCATACAATAAAATTAATAATATTAAT:1	+	chrX	19409312	5'	+	mdg1	36	2	71.11
ATTATTATTATTCTAGTGTCTTTGTAAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1	+	chr3L	21253104	5'	+	pogo	38	1	59.59
GAGAACGGATGCCAGCACACGAAATTAAGCGGAAACTCTGAAATTTATTTTACCATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTT:1	+	chr2R	13696395	5'	-	roo	372	1	52.14
GAGATTACTTAAATAGTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1	-	chr2R	3066016	5'	-	P-element	2829	1	48.63
AGTTTCCATTTCTTGGACTTTCATCATAATTTTTGGGCGTTAGAGTGGGCCAGTGACACTGGGTCAATGCGTCTATGANTCTAGAATCTGTACGCTTAATATCAACCGTCTAGCATTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGT:1	+	chr2R	25240235	5'	-	INE-1	143	1	62.86
CATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	+	chr2R	7898098	5'	+	roo	89	2	81.38
TTATTGATAGAACTATTTCGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGT:1	-	chrX	2444446	5'	-	roo	351	2	59.85
AAATGAGTGGATCAAACTTAATGACGAACGGCTTCTCCAAATCGATTATTTGCAAATTCATGCACGCGGGATTATGTAGACTACACATGGCGTTTGAATGGCTTTAAAATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACG:1	+	chr2L	14726857	5'	+	roo	9042	1	78.95
TTTCTTTTTCGGACCGTGCAGTTTGTAGTCCAATTCCCAGGAGAAAAAAATGTTAATTCTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAGCATATAAGGACATTCAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAA:1	+	chr3R	31899674	5'	+	HB	460	1	76.39
CTCTTCTGCATGACTAAAAATTAATTTTTCCAAAGCTGCACGCTTTTATTCCACATTATTATTTGCCAAAGTCACCACATCATAACCATGGGCATTCGTGGGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAG:1	+	chr2L	13440330	5'	-	roo	232	2	76.87
GGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	-	chr2L	17471665	5'	-	roo	322	2	76.55
TTTTTGAAGTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCTAGTTCTACTTGCATCGGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCACACCTCACC:1	+	chr3R	17316231	5'	-	opus	460	2	52.34
AAGAATTATAATGTTTTTAAACATTTCACCAAACATTACCAAAGTATTTGCAGGACAACAATAGTTTTCAATTCATTTATTTTAAATTTTATTTATTCGGATTTATTTCTACGATATTATTCTCTATTATGTTTTGCTATTTATTC:1	-	chr3R	26669753	5'	-	G4	3585	1	78.08
ACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1	-	chr3L	16015363	5'	-	1360	3378	1	70.68
AATTGGGGGATCCCCAGCGTAAGCCTACCAAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1	+	chr2L	15833413	5'	+	jockey	11	1	79.34
CCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	-	chr3R	18582229	5'	+	roo	67	2	72.39
GGGACTACTCACTTTTTGGTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr3R	7835054	5'	-	roo	396	1	65.75
AGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGG:1	-	chr3R	7482804	5'	-	412	402	2	86.11
CAATCAACAGTTTGCCAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGACAGGTTGTGTGCGGACGAAGTGTTTTTT:1	-	chr3R	18121697	5'	+	P-element	98	1	15.00
ATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATAC:1	+	chr3L	25782386	5'	-	Stalker4	7004	4	49.65
ACTGATCAAACAGAATGTGACAAACAAAAGTATGATTGTGTGAATAACAACTTTACAATATTAGATACAAGTTGTATCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr2L	3114275	5'	+	roo	8728	2	54.11
CGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCGTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTCTCCATTT:1	-	chr3R	14979888	5'	+	pogo	48	1	54.14
CAGCCTTTGTAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1	+	chr3R	22821957	5'	-	mdg1	402	2	55.48
AAGAAAATAGACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCCAGCCACGCCCGTATGAACGTCGAGATCT:1	-	chrX	21575424	5'	+	INE-1	133	1	41.78
TTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1	+	chrX	13066522	5'	-	jockey	4920	1	71.94
ATACTGGAATACCTTTCTATTAATTCGTAAATAGGATCATCTATTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTC:1	-	chr3R	19446653	5'	-	roo	75	2	69.18
GGCACTTCTGCTGCTCGCACTCGGATTGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGGTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTCGATTAAGTTATGT:1	-	chr2L	20840540	5'	+	Transpac	4943	2	66.91
GGGGTTTCAATTGTAGTGAGTTTGAGGGAACATAGAAAGTATCTAAAGGTCGTTTTTTTTAAATGTAAATTTGAAAGACTAAAATTGAGTGAAAGAGAATGCTATAGTTGAGTTCCTCGATTATCAGATATCCGTTACTCAGCTAG:1	+	chr2R	5679500	5'	-	INE-1	543	1	77.40
CAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	+	chr3R	28624578	5'	-	roo	327	2	74.66
ATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1	-	chr2L	22685190	5'	+	Ivk	44	1	55.83
GGATGCCAGCGACTATGGGCTGGCCGCCTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGG:1	-	chr3L	23678133	5'	+	Osvaldo	16	2	71.43
CCAAAGATGCGTTTTTTGTTCGTCTTTTATTAATCATTTGTTCTAGGAATTTACTGCATTTTTATTGAGGCTAAACCAAAGGCTTTATTCGTGGTTTAGTTTATAGTATTTGGGGCTGTCAGAGTCACTAGAAACTATATACCCCT:1	-	chr3R	24967244	5'	+	Cr1a	4122	1	57.53
TAATTACTTCTAGTAATGTGGTGATGAATTTATTATACCCGTTAGTCGTAGAGTATAAGGGTATACTAGACTTGTTGAAAAGTATGATACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCATTTAAGGTATATATATTCTTGATCAGGACCA:1	+	chr2L	22130376	5'	+	INE-1	81	1	63.01
GCTTGTGATTTCCCAAATCCCATTTAAGAATTCCCTTTGTGGGAGCCAGGGATACCCAGAACAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1	+	chr2L	15875739	5'	+	hobo	23	1	58.10
GCTTGTAAGGCCTGCAAAAGGCTTAAAACGGTAAAAAAAAATATTTAATTTCAGCCAGCAGGCGGAAATTGTGAAATAAGCCTAACTACAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1	-	chr3R	31716850	5'	-	pogo	2072	1	65.41
ATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1	+	chr3R	26659726	5'	+	HMS-Beagle2	18	2	63.57
AGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1	+	chrX	12214067	5'	-	opus	7444	2	71.32
AATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1	-	chr3R	31817554	5'	-	roo	360	2	54.48
CATAATGGCATAAAAGATTGAGATGGAAAACAAATTCATAGATAGCCAACAAATTGATGGTTACACTGCTAGAAAACAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACCCATAAAGTTGTCTGCTATCACT:1	-	chr2R	17407933	5'	-	1360	159	1	56.49
ACTTGCGGTTTTATTAATGTTCCTGCTTCTGTTTCTGAGCCCTGAACGTCTTAAGGAACTTTTGCTCCTGCGCAGAATTTTTCAAGTTTATTTCAGCCTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACACTCGGACTAGCGTCCAAAGAAGACT:1	+	chr3L	22348679	5'	+	jockey	4731	1	71.92
GAGTTCGGGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1	+	chr3R	18272130	5'	+	1360	84	1	77.40
ATATTTTGACAAAAAAAAGTCATGCGATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1	-	chr3L	17558145	5'	+	jockey	4683	1	76.03
TAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTTCTTCTTTCTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGCTAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTTGGCTAG:1	-	chr2R	14871483	5'	-	INE-1	543	1	75.56
CCTGAGGGCGGCAATGATGAACCCTCCGCATCCAATTGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTAT:1	-	chr3L	11323642	5'	-	mdg3	58	2	72.59
GTTACTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	+	chr3L	6978142	5'	+	pogo	65	1	65.07
ACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAAGTGTGATCCATCA:1	-	chr3R	20427474	5'	+	jockey	67	1	57.93
ACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTT:1	-	chr2R	5924450	5'	-	jockey	4742	1	54.69
CCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGGACATTCCAGATC:1	-	chr3R	1433195	5'	-	mdg1	333	2	74.66
ATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1	-	chr3R	20427482	5'	+	jockey	60	1	51.37
ATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	+	chrX	18193681	5'	+	jockey	75	1	68.75
GCCTTACCATACTCAGCATCCCGAAACATCCTGAGCATCCTTAGCATCGTGGCAAGCATAAAAAAAAATTCATCCTAATATCTCCAATAGTTTATGAGGTATTAATTTTTGTAGAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTG:1	-	chrX	9432060	5'	+	hopper	1414	2	57.04
GATATTTGTCGCAAATCCAAAAGTTTCGAGTTGAAGACTTTTAATTAAGTTAAAAATTATTTAAATTACAGATACGTAAGTCTATGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACA:1	-	chr3L	20505831	5'	-	1360	181	1	62.69
AACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1	+	chr2R	11629730	5'	+	Tirant	8123	2	69.30
CAGTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	-	chr3L	9998223	5'	+	roo	8701	2	60.96
GTTGGCTAAGGCCAAAGGGGCGGGAAGGATTGTCAGCAGTCAAAGGCAGCCAGTGTGCGTGTGAGAGTCCTGTGTGTGATTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chrX	8817787	5'	-	accord	190	2	75.53
AATGAAATCATTTAATTAGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr2R	11164542	5'	+	roo	19	2	71.63
TCTGGAGTCAGAGTTGATGAGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGCTAGGCGACATCAGCAAA:1	-	chr2L	23352614	5'	+	accord	57	2	55.48
GTTGTCACCAAGGCTCATGCTTATCCCCCAATATTGTATAATATCTATACCTCATATGGCCGTCACTTCGAACTGGGGGGGGAGGAGTTACCACCCCACCCC:1	-	chrX	22927806	5'	+	Tirant	8105	1	52.94
AAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGATCCATAACAAACA:1	+	chrX	17054205	5'	+	jockey	73	1	59.29
CGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACG:1	-	chr3L	27391423	5'	+	1360	10	2	70.68
TACATTTCGTGTTTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGT:1	+	chr2R	20496853	5'	+	blood	4	2	79.86
TTCGAAACTTTATTTTCAGTGTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGCCTCACACCCTACAATGTTGTGTGCG:1	-	chr2L	1377726	5'	+	hobo	41	1	50.00
AACCCAAAAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGC:1	+	chr2L	2687366	5'	+	copia	4932	2	73.73
GGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr3L	20831362	5'	+	roo	15	2	57.14
GATATGATAATCGATTAGCCACAGCAAGGCTGCTAATCTTCTCGAATTTAGCATTAAACGGGCAATAAGCAGCACTTTAAGATGGGGAGAACAGAGGAACTCTTTATATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTG:1	-	chr3L	18962224	5'	-	F-element	144	1	74.66
CCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGAT:1	-	chr3R	11547769	5'	+	G2	335	1	62.69
GCATATAGTTCGAGACCCCAGAGAGGCGAGACCAAGTGTTGAAATGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTAAAATGGA:1	-	chr3R	22217650	5'	-	hopper	1161	1	61.84
ATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTA:1	-	chr2R	9500048	5'	+	G5	4725	1	52.38
AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCC:1	-	chr3L	4469445	5'	-	R1A1-element	5184	1	75.38
TAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGGTTTCAGATAAATATGGAAACCCTAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGC:1	+	chr2R	24795820	5'	+	Cr1a	455	1	50.00
ATAATAGACCAGTGATTCATGCCGCCCAGTGACCCAAAAGTTGAATCAGACACCCGCGTCGTACAAGATATACATGTACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1	-	chr2R	17626950	5'	-	opus	7461	2	57.93
AGTATTTGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1	-	chr3R	17243253	5'	-	hopper	1393	1	67.12
GCAAATATATTATTGAAATTTTTGTTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGATTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTATTTCTTTATAATTATTC:1	-	chr2L	6619979	5'	-	Burdock	310	1	80.77
CACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAG:1	-	chr2L	12290758	5'	-	1731	4560	1	61.64
ACAAAAAATCCACAATGCGAGCAAACAGAAAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1	-	chrX	18030348	5'	+	opus	35	4	58.62
ATTTCGAACGAAATGTTCCTATTGAGTTTGGCGATTAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAG:1	-	chr3L	25263138	5'	-	17.6	224	2	75.00
GTAATCAGATATCTGTTTTGGCCCTACACCAACTGCTCGGCGAGCATTTAATGCAATTTATTTAATTAGTTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCA:1	-	chr3L	19034999	5'	-	Tirant	8392	2	54.81
ACTTGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1	-	chr3L	19036058	5'	+	Tirant	8155	2	67.29
TTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1	+	chr2R	20496874	5'	+	blood	27	2	64.38
ATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTT:1	+	chr2R	5284516	5'	-	Doc4-element	2615	1	60.96
TGTATTTTCTTTAATAATTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATCTATGTACATTATATTATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTTAAAAGGCATTATTGAGGGCTAGTGTCCGCATTTCGTGCCTCAA:1	+	chr3L	11398727	5'	+	1360	472	1	58.90
TCTGAAAGAAATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1	-	chr3L	1534736	5'	+	pogo	30	1	57.58
CATAAAAAAATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAG:1	+	chr3L	27356034	5'	-	Tc3	1684	1	77.93
GCACTTTCCCGGGCGAAAAGTCGACTTCATCGCCTTAAAATTTCCCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:2	-	chrX	6499085	5'	+	Quasimodo	28	2	60.27
TTACGTTTCATAAATTGCAGTTTTGTTTATCCCATAAAAATTTTTTGTATTTCCTTTTGTGTGTATATATTGTTATTGTTATAAAAAAAACAAGTTCAGTTGTTATCACTATTTGAGCAATATTTTGTATATTTAATGTTAT:1	+	chr3L	8902058	5'	-	Juan	341	1	71.13
TGGCTGAAAAGTAAATATGGAGGATTCAAATTGTGAAAGTTTCGAGCACGCAAATGGACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1	-	chr3R	19963174	5'	-	roo	9037	1	47.76
AGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGACTAAGCACTGTATCAAATAAGAACA:1	-	chr3L	10574404	5'	+	Tabor	25	2	56.62
ACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1	-	chr2R	2529357	5'	-	1360	3331	1	56.16
AGTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1	-	chr2R	3066002	5'	-	P-element	2839	1	46.72
GGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAACTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr2R	18336224	5'	-	roo	8989	2	73.97
TTGCGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATT:1	+	chr3L	7292475	5'	+	HMS-Beagle2	6958	2	71.92
TTTTTTTTGTCTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1	-	chr2R	11910649	5'	+	micropia	4962	2	80.82
AATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATC:1	+	chr2R	23266046	5'	-	mdg1	7371	2	77.40
AATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	-	chr3R	17420502	5'	-	roo	341	2	67.13
AATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr3R	19968187	5'	+	roo	8736	2	70.55
ACTGGCCTCAATAATTGTGTCACGTGGCGCGTGAAAATACGGCCTTGTCATTCGGTCCATTGGATTCCTGATGATGACCGTGCTGATCCGCCCACCTAAGTACTTATTATATAACTTATATTAATTACAATATG:1	+	chr2L	10112615	5'	-	Doc2-element	4686	1	74.63
GAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chr3R	22844283	5'	-	roo	9046	1	57.27
CAAATTCAGTCTGCTTACATTTTAGCTTATATTTGAAGCACATGCAATATTCATATTTTTGGATATCATACATATACATCTATGTGTGTCTGTATTTCGAAATTAATTTTTGTAATTGTTTAATTTTTTTTCCTTTTCCTTTTGTT:1	-	chrX	5053712	5'	-	Doc2-element	236	1	73.97
TTGGACAAAGCATAAACTTTATGGGCCCAGTTGTAAAACTCTAGATATGTGGGTGTGATAATTTCGTGTTCTTTGGGGGGATGTTGTTGATTGTTGATGTTG:1	+	chr3R	26938257	5'	-	gypsy7	326	1	77.45
CCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTACGACTCATTAA:1	+	chr3L	10574303	5'	-	Tabor	404	2	69.18
AGCCATTTAATTGCCAGGAAACACTGAGAAGAAACAGGATTAAGAATCTAGGAATCTGTGCAGTTGATTTGGCCAGCTAACAAAAGAAGCGGTGTATCTTTTAGAGATTGGATGGTCATTAGATAGACCAATAACCAT:1	+	chr3L	12455096	5'	+	Copia1_DM	4044	1	50.72
CTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAATGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1	-	chrY	3648916	5'	+	Transpac	38	2	63.01
GACTTCATTAACGCAGATTGTAAACCCGGCTTTTTCACTGCCTTTTCGCCACACTTTCCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1	+	chr2R	10582346	5'	-	Juan	4189	1	67.12
CGGATTAGAAAACGGCGTTATCTTATCTACATTTATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACCACTCATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGTTGGACAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTAT:1	-	chr3R	3389471	5'	+	Rt1a	4777	1	53.42
AATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTATTTCTTTTTAAAAATGGTTTTCCAAACCAAATTAAAAGTGTAAACATGGAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTAAC:1	+	chr3L	20168315	5'	-	mdg3	5476	2	69.44
GTTTGTTAACAGTAAGTTTATTTTTAAGTGCTGCGAAACAAGAAACTGAGCAGTAAACGGATTTATATACTGAATATAAATATAAACAGGCTGGGAATCGCAACAACAGCCTTTGCCCATCCTTAGAATTTTGAAACAATTTATA:1	-	chr2L	13077190	5'	+	FB	237	1	64.14
AAGAGCAGCGAAATCTATCAATCACCATCAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACG:1	+	chrX	4218168	5'	-	flea	144	1	66.67
TGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGAATCGAGTTCGTATCTTGTATAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chr3R	7100928	5'	-	roo	9037	1	58.22
TGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCAGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCG:1	+	chr2L	3672973	5'	-	roo	234	2	76.55
GGCCATTAACCCATGGAGGCCCAACAAGTGAGAGTCGTACGTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1	+	chrX	13126464	5'	-	jockey	4918	1	71.53
AAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTG:1	+	chr2L	18294194	5'	-	roo	388	2	64.08
AGAGCTGTCTGGTGTGAGATTTCAGTGTTTATAAAAACAAACTTAAATAAATTTCTGCATGTTGCAAAAGAGTGCTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAAC:1	-	chr2R	599267	5'	+	F-element	80	1	58.22
GTTTCAAATGAAAGCAAAATACAATTTGCCAATTCCTTTTGTGATTTGAATTAAAATTTTTCTTTTTAGTTCAAGTTATCTGTAGACGTTGAGCGGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAAT:1	-	chr2L	12499159	5'	+	412	7477	2	47.95
GCTGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chr3L	11531014	5'	-	roo	9046	1	67.12
CACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr3L	20831267	5'	-	roo	9021	2	56.16
TCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGATAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	-	chr3L	21818068	5'	+	roo	8730	2	65.75
CGTTATATGTAGTTATATCACCAAAGAGATATACAATTTCGGGAGCAACTTACTCATCATGCGTTTTGGACCCAGAGCCCGCAATATTTCGATTAAAAAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATA:1	+	chr3R	10756973	5'	-	INE-1	559	1	56.16
TGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr3L	12879745	5'	+	roo	71	2	69.72
TGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGGATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1	+	chrX	3309579	5'	+	jockey	30	1	65.52
TTATATTTTCTGTAAAACTGGTAACAAACTTAGCTAAATAAGTTTACGTTAAAAATACCCTAGCAACTAAGTAGCTTCACACGAACAATGCTGATGCGCCCCAACTGAGTTCAGCGCTCTGCGTT:1	+	chr3L	24131151	5'	+	gtwin	6996	2	73.60
GTCATGTGTTGTTTGTCTGTCTCCGCCTTCGTCTCCGTCTCTGGATTAGATCAACATTTGTGCTAAGCCCGGCGGAGTAGCGAACGGAGCTGGATTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCC:1	-	chr3R	11492037	5'	-	pogo	1741	1	75.81
ATGGCTACATTTAGGAAATGATTACTGGGAAATAAAAATGAAACGAACTTCCAAATGATGCAGAAAAAAAAGTTTGCTGAAAAAGTTTGCATTACAAGGACAGGAGAGGCTTAAAAATAAATATTAATA:1	+	chr2R	16729054	5'	-	NOF	3869	1	54.26
ACGGTGAAGTCAAATCGAGGTGGCCCAAAATCTGACAAAGGCATTCTTGTATAAGCTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTCATCAAAAACTTAAGCGAATGTCG:1	-	chr2L	4412652	5'	-	Quasimodo	7316	2	58.52
TTTAATCGTGTATGGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAANCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1	+	chr2R	9220983	5'	+	opus	31	4	63.70
GGGGGGGGTGGTTGTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	-	chrX	10640123	5'	+	roo	6	2	65.00
TCCTGACAAGTGAATGAAAGGCCGAATGATGATGTCAATCTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1	+	chr3R	10546062	5'	-	hopper	1376	1	55.48
GAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	+	chrX	17054231	5'	+	jockey	74	1	76.52
TAAGCCAAACAAACAAAAGCATTAATGTAAACTTAAATACCAGTATTTGCATTCCTATCTTGATTATTTTTCCTTTATTTTATCGTCTTGTTGGGCGCCAATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAAC:1	-	chrX	2306861	5'	-	Circe	7415	2	67.81
AGTCAAGAGAAGTGTAGCTTTTTTCGGCGGCGTTTATTCTTTCCTTCCATCATCTATTTCATCTACATCCACAACAGCACCTTGTAGTCCAAACGTGAGCGTAAGTTGATAAGCCAGTGAAACCTACTGGCGTTC:1	+	chr3R	1166199	5'	-	Doc4-element	2505	1	54.07
GAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1	+	chrX	13504167	5'	+	412	7132	2	70.55
CTCGTCTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1	-	chr2R	5531235	5'	+	1360	60	1	75.56
ATGTGGAAACTTTCAGCGGATGCAGTGCAGTTGCAGTGGGTGTCTAAAAATAAATGCAATAATACAGAGCATAATTGCATTTATTTTGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAATTAAGAATACATAGATATAA:1	-	chr3R	8355411	5'	+	Stalker	7117	4	41.78
TTTTAAACTGGTTTGTAATACCAATACTAAAAGGAATTTAATGTTGGAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1	-	chrX	21509997	5'	+	pogo	34	1	55.36
ACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr2R	19050201	5'	+	roo	75	2	67.81
ACTTTGCTCAATGCTCAATTTATCGCCCCGCAGTGTTATCGGCGAGTTATCAGCCGCGTGGTCGTTATCACCGGCGTTTTTAAAAAACTGATTGCGGCAATTAAGGTAGAGAGTGATTGGAAAAAAGAAAAGAAATGAAACGAAAC:1	+	chr2L	15059174	5'	+	Penelope	652	1	65.75
CAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1	+	chr3L	3500924	5'	+	opus	20	2	62.73
ATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	-	chr3L	20888797	5'	+	1360	50	1	60.00
TGCTCCCCAGCATGGAATAAGATATTAAATGCATTTCAGGAGTTCCCAGGAGGCGTTGAAACATTTGGAAACAAACTTGCGCTGTGTTTATGTCTTTAGAATCTGTATGCTTGATCTCAACCTGCTAGCTTTCATAATTCCTGAGA:1	+	chr3L	25515815	5'	-	INE-1	152	1	65.75
ACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1	-	chr3L	16750719	5'	+	Tirant	3	2	55.56
GTCCACGAAGATGACTCCGGCATTCAGCTGCTTGTAGTCCACCACCACCCGCTGGGCCACGTGGTCGATGACCTTCTGGTCGGCGAAATCCATATCAAGGTGCCTGGAGTAGTC:1	+	chr2R	24451285	5'	+	invader2	4677	1	75.44
AGGTAAAACACTATAGCAATACAACTAAAGATAGAAACAGACTTGCACATTACTTCGAAATGCCCGACGGGCGTTGAAACCAGCCCAATAAATTTAAAAAAGAATACCCCTTAAATTAAATCATTCTAGATCTAACTA:1	-	chr3R	27414981	5'	+	Cr1a	4149	1	73.91
ATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCGGCACTT:1	-	chr2L	18419209	5'	+	412	47	2	70.71
ATGGAAGAGGACCTCCCCAGATCGAGCGCGATGTGTTCGACTCGCGGGATGGATTTGGATCATCTTACCGCAACTTTGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAG:1	+	chr2L	19965202	5'	-	Doc	343	1	53.79
ATGCTAGAAAATACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTTAAGACTTACA:1	+	chr3R	27994157	5'	+	roo	8681	2	68.00
TTTAATTTGTTTAATTTTTATTTAACTTTGCTTTTATTTTTTATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACATTTAACTTTGCTTTTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGA:1	+	chr4	941836	5'	-	TAHRE	10422	2	61.38
ATAAGTTTTTGCCCTCTGAAGGGGAAACGGCAAGGATAAGGCAAACAGCTGTCTGCCCGGAATCCCCTCTGCTGGTCGGTCACGTAGTCCTGGATATAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTTCT:1	+	chr3R	7105780	5'	+	Cr1a	4326	1	74.42
AAAAGAATATGGGACAGCTCGACTCGTCTTGTGATCCTGGACTTACAGGGAACTCAATACACACATATACCAACCTACTTGCAGAAAATCAAAAGCAAAACATTTAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCG:1	+	chrX	21631220	5'	-	Cr1a	362	1	75.59
ATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1	+	chr2R	9091830	5'	-	1360	3327	1	60.96
ACGAGGAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1	-	chr3R	25454143	5'	+	Quasimodo	18	2	58.90
CGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:2	+	chr2L	13585847	5'	+	Tabor	79	2	70.55
ATAATGACCCCCTAGTTCCGAGGCACGGGTGATATAATCAGAGACACACGCCGGCAAACAGTGACTGAAACAACGGCGGATGCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1	-	chr2R	21908070	5'	+	roo	8667	2	80.00
CCTGTGCCTGGGCTGCATTCTTATAGCAGTTGGCATCTTACTTACCATTAAGAGGAAGTGGTATGGTCAGGCCGAGTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGTGCCTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGT:1	+	chr2L	18083301	5'	+	Cr1a	237	1	52.05
CAAACAACATTTGCGCAAATATTTATTTACATATTTGAAAATAAATTATTGATTAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1	-	chr2R	15061774	5'	-	412	7538	2	53.85
AATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr2L	12892688	5'	-	roo	342	2	75.00
AATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chrX	6486722	5'	+	roo	78	2	71.92
TGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCG:1	+	chr2R	23332551	5'	+	invader4	67	2	80.65
AAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATG:1	-	chr3R	25454086	5'	+	Quasimodo	75	2	73.29
GCCTTACATTTTTACAACCCCTTGTGGCACTGATAAACTTAAAATGGGGGTGTAATATATATTATTGGTATAAAAACATGATATTATGTTGATTTTATAACTTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGG:1	+	chr2L	15227233	5'	-	gypsy12	10183	2	70.50
AGTGTATGCAACTATCTACGAGTTCCAGTAAATGGTAACTTGAGATCGTCGCATTATCAGCGTGCAGAAATGTGTGAAAAAAACCAGGTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCAC:1	-	chr3R	8127318	5'	+	roo	8987	2	67.69
CATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr2L	16092002	5'	+	roo	53	2	57.93
GGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	27994186	5'	+	roo	20	2	58.59
GAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:1	+	chr2R	2016801	5'	+	1360	43	1	56.16
TGGGGAAATAATGACTAATTGGTTAGTATTTTACTAAAGCAATTGCTCTGATTCTGACGCCTGAAAGTATGCAGAGAAATCCAACCTTTTGTTAAGACTTTAAGCCTTGTAGTAAATTGATTTTGCCGCATGGGTAACAGTGCG:2	+	chr2R	18687692	5'	+	jockey	4962	1	43.06
CACTGTAATACAAAACAATCAGATGCCACTCAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCG:1	-	chr3L	27390924	5'	-	1360	120	1	78.77
ATTCAAGAAATAGAGAATGACCCAAAGATGTTGCAATAATTTTCTAGATCATTATAAGTTAACTATATCATATGAGTTGAAGGTGCCTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTT:1	+	chrX	16215020	5'	-	I-element	5195	1	60.96
TCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr3L	11393499	5'	+	roo	8735	2	76.87
ATTAGGCCAAAGTGGAATTAACAATTACTCAAACTTATCTCCTAAAGAATCTATAATTATGGCTTTGAAGTTGTCGGCCTGGCGTTTTGTATTTTATTTATTTTTATCTCCAAGCCTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGT:1	-	chr3L	7786762	5'	+	flea	4577	1	77.24
AAGAAGTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1	-	chr2R	4601688	5'	+	HMS-Beagle2	6901	2	76.03
GTCAAGGTATGTAAACTTAATAAAGCCATTTATGTGCCCATAGACCATAAATGGCTTTATTAAGTTTACATACCTTGACTGTTTTGACATCCAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAT:1	+	chr3R	1693999	5'	-	F-element	14	1	43.84
GAAAAAAACAGTTAGCTTAATTTTACTAAAAGGCCAATATTCAAGACATTCTTTACATAGAAGTTTTGTTATTCTGTGATTTGTTAACGTTTTTGAACTTGGTTTTAACATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGC:1	+	chr2R	11363695	5'	+	Bari1	12	1	76.03
GCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCA:1	+	chr3L	23456269	5'	-	Gypsy6A_LTR	268	1	65.19
GAATATATTCCATTTATAGAAGATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAACTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3L	15177206	5'	+	roo	8720	2	53.42
TGAAGTAATATTATTTATTAATAATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	-	chr3L	15177339	5'	-	roo	9039	1	61.64
GACGACNTTCGAACTACCGACTGTTTATGAGTGTGGGCACACATACAGTGGTCGGCTGTGGCTGTATGCGTGCAAGAGATCTGCTGCCTCTGGAGCTCTCTGGCTTTCGATCAAAAATTCGAGAGAGCC:1	-	chr2L	20117591	5'	-	1360	86	1	76.74
GTAATGTCTTCTTTTTTTTTGTACTTCCTTTAAATATTTAGTATATTTATTAAGTCTTTTGACTTAATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGACAAGTGAGTGGTGATTTCGGTGATAGTGGCTGTG:1	+	chr3R	23074847	5'	+	diver2	498	1	54.26
TTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACT:1	+	chr2R	16891848	5'	-	hopper	1334	1	69.86
ACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chr3L	11530983	5'	-	roo	9015	2	56.85
CTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	-	chr3R	22844267	5'	-	roo	338	2	70.29
TATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3L	20831354	5'	+	roo	48	2	70.64
AAAGAATATTTTTCAAACTTTATTGTTATAGGCCGTACAATAAAAACAAAAAAAAAAA:1	-	chr2R	19556048	5'	+	G2	3076	8	79.31
AATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCGTCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATACGACAACCAAC:1	-	chr3L	3501021	5'	-	opus	7446	2	62.31
CTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	+	chr3L	12879733	5'	+	roo	8727	2	62.33
GAAAGGGAATTTTTTTAATTAATACCATTTGCATTTATCCGTTTATCTTAAAACAGCTGTAAAAATAATCATGGTTCAACAGAAAATACACAATAGATGATAAGAACTTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGAAGCAG:1	-	chr3L	8697363	5'	+	rooA	297	2	65.07
AAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTTTTGGCTTGGCGAGCAGAGCATAAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1	+	chr3L	17136036	5'	-	hopper2	1558	1	55.97
GATGCAGTGCAGTTGCAGTGGGTGTCTAAAAATAAATGCAATAATACAGAGCATAATTGCATTTATTTTTAGACACCCACTGCACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCAA:1	-	chr3R	8355393	5'	+	Circe	7367	1	41.74
TTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCG:1	+	chr3R	17420381	5'	+	roo	30	2	61.64
ATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr3R	17817964	5'	+	roo	8744	2	75.00
CTGGTTTTTCGTATTGGAAATGCCAACACCATGTTTTTTCCCCGTGCAATTGTCGCCTTTATCCTTCACTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGAG:1	+	chr3R	29383753	5'	-	Quasimodo	36	2	77.89
ATGCTAACTGAAATATTTTCATGCTCTTTGGGATCGGGGTGGCATTTCCCGGGGGGTGGTGATGTTAGGGCGAGAGGAGCCAGATCGCAATTTTTTTATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAATAA:1	+	chr3R	19495582	5'	+	S-element	129	2	58.22
ATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATATACCCATCCTTAACATAC:1	+	chr3R	20499779	5'	+	mdg3	5344	2	76.03
GAAAAATATGAATAATCTTTTGTATCATTTGTGGCCGGGCAGAAATGCTTTTTTGTGGGCCCACATTTATATTATCTACACATTCCATTTACCAAAAATAAGTGGAACAAAAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATACCT:1	-	chr2L	1258268	5'	-	HB	54	1	51.37
CGACAGAGCGAGAGAGCGGGGAGAGCGAGAGCGGGACAGCGAGCTACGGAGCGGCACGTCCTTCGCGTTGCACGCACAAATTTCGAAAAAAGTACCATGCACATTTATTATACTAATAATAATATTATTAATAATAT:1	+	chr2R	14432248	5'	+	mdg1	41	2	63.50
AACCTTGAACTTGTGTTTTGAATTTATGTATTAACTTTAGTTTAAACATTGTGCCATAATGTACGATGTACACTGTATGTATGTGTATATAT:1	-	chr2R	7738027	5'	+	1731	97	1	73.91
AAATTGCGATAGTGTTAATACGAAACTGTAAACATTGCAGTGGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1	+	chr2R	20899882	5'	+	hobo	67	1	71.85
CAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	+	chr3R	22844145	5'	+	roo	12	2	71.11
CAGCCATTTGAACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1	+	chr3R	28075328	5'	+	jockey	4688	1	52.94
TGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTATTTCTTTTTAAAAATGGTTTTCCAAACCAAATTAAAAGTGTAAACATGGAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1	+	chr3L	20168328	5'	-	mdg3	5478	2	67.44
AAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAAT:1	-	chr2R	16248011	5'	+	BS	51	1	55.48
TATCACTTTTCTATATGGAAAATTATTTATAACTTTTGACATTTTTAGTGCTGTGCTGCTGTGTATTAGACGGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTG:1	+	chr2R	12104991	5'	-	gypsy3	421	2	60.00
AGCTGAGAAACAAATTTGAACGGATAATAATAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGCCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1	+	chrX	23457624	5'	+	Doc	61	1	65.38
AGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1	+	chr2L	8986140	5'	+	412	7135	2	74.66
GTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	+	chr3L	21817978	5'	-	roo	9005	2	65.75
GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTCCGATACATT:1	-	chr3R	20617764	5'	-	Circe	7069	1	72.86
CTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCA:1	+	chr3L	10590622	5'	+	1360	459	1	67.05
TTATTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTATTTAATGTTAACTTTGCTGGTTTTTTTAATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTT:1	-	chr3R	545841	5'	-	TAHRE	10387	1	78.77
ATTATGTAATTTTCAACAATTATAATTATGCGGATTATATTATTCTATATAAAGATATTATCTATCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1	-	chr2L	15248016	5'	-	Transpac	5175	2	54.79
AAAAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATATACTTGATCAGGGTCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTC:1	-	chr3L	25482719	5'	+	INE-1	106	1	77.98
ATAAAAAATATTATACAAGCAGATGCGGTCATTTTACATATGTATATCTTTTCATATTTTGTAAATACATACATATGTATATAGTAAAATTACTTGTGATATTTTTGAGTCGAACTAATGTAAAGACAACGCTAAGAAATAAAAAA:2	+	chrX	3662917	5'	-	297	338	2	76.03
ATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1	+	chrX	21016764	5'	+	Transpac	4995	2	72.60
AATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAAC:1	-	chr3R	11547779	5'	+	G2	322	1	54.20
AAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCG:1	-	chr3R	11547757	5'	+	G2	333	1	68.33
CATGCAGCAAAAAATATCGAAAACCACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCACGTT:1	-	chr2R	23332636	5'	-	invader4	3035	2	56.85
TATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTT:1	-	chr2R	19540435	5'	-	jockey	4910	1	78.32
AACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGNTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAGGCGCGACATCGAC:1	+	chr2L	20808332	5'	+	HMS-Beagle	73	2	68.53
AGCTGAGAAACAAATTTGAACGGATAATAATAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAA:1	+	chrX	23457624	5'	+	Doc	50	1	63.87
GGAACTGTCAAAGAATTCTCACAATACACTCATCTAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTC:1	-	chr2R	20496650	5'	-	blood	270	2	72.39
ATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAACAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3R	7835128	5'	-	roo	8997	2	68.49
ACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAAC:1	-	chr3R	22822112	5'	+	mdg1	7109	2	63.70
TCGTTTCAGACAACACATTTTTAGCTGGTGACACAGACAAAATATCATCGTCAGAACTTTCATTATCATCCCTTAAAGTCAAAGAACTTTTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACAC:1	-	chr2L	22584653	5'	-	1360	180	1	50.68
ATCTTTATCGGCACTCTGTACCTCTCCAAGCGGATGTGCATCGTCAAGTACGACAACTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATT:1	-	chr3L	17886197	5'	-	1360	3273	1	61.54
ATGGTATACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCCCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	+	chr2R	9328589	5'	+	roo	48	2	53.96
AAAGTGTTGCGTTGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGCGTAAATGTATGAAGGATTTTAAGTTTCAGCAGATAGTT:1	+	chr3L	19036010	5'	-	Tirant	8442	2	70.59
GGCGCGACAATTTTCCAAAGCTGCTGATCGTCCCACTTGGTAACTTGTGCACTGGGAAAAACTGTGTGTGAGTGCAGCTAGCTTGATGGTGTCCTCCGAGCCGGATATATGTGTAACTCATAAATATACAAATATACAA:1	+	chr3R	29534538	5'	+	Stalker4	91	4	52.52
CTACAGGAAGCTTGGAAACGCTTGCAGCCAGAAATCGTAGAAGCTATACCCCAAATTTGCCTAGGAGATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAG:1	+	chr2L	2707914	5'	-	hobo	266	1	48.85
CGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAATTAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1	+	chrX	2518059	5'	-	P-element	2829	1	30.00
CATTCCACAAAGACGCACGCACACACACACGTGCACAGAATGACCCTTACAGGGGGCTTTGGTATTGGTATTTGTATTTGCGGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1	+	chr2R	10124097	5'	+	P-element	26	1	63.91
GAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAAT:1	-	chr3R	25454094	5'	+	Quasimodo	66	2	67.59
GTGTGTGTTGTGTGTGCTTTGGGGGAGGAAGTGTAAGTGTGAGCTTGAACCATGAGAAATGCCATAAAAATTCCTCTGTCTACCAGTCTGTCTTCCTCTTTGTGGGCTTACTAATGCGAATACCCCATTTTTTATTTTATTTTTTT:1	-	chr3L	12054513	5'	+	hopper	141	1	72.60
GGGTGGATAGGTAGGCAGTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1	+	chr3L	11957099	5'	+	blood	22	2	64.57
ATGCACTTATGCACCTTAACTGTCTTATTTTTAGGTGAAGAAACCCAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGCCTCTCTGCCGGCGCAGACGGATTGCATT:1	-	chr2L	13587239	5'	+	Tabor	298	2	60.00
ATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTT:1	+	chr3L	24213777	5'	-	invader2	5057	2	61.67
GTTTGCTTGTTCGAAATCATTTTCTGCACTTCTTGAATTAATTCTTTTCTTTTAACAAACCTTCTCCTCTTAACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGC:1	+	chr2R	5038888	5'	-	invader1	339	2	51.24
CATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTACCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCC:1	-	chr3R	1446143	5'	-	1360	3376	1	30.82
ATCAGTTTTCAAATATAATGGACATGATAAGGGGATCAAGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1	-	chrX	8347633	5'	-	412	7505	2	61.54
TGCCCAAGCATAATATGAAATTGCCTTATGATAAAAACCAGGCGTCAATTTATGCCACACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1	-	chr3L	7188661	5'	+	hobo	28	1	68.49
CTGTCCGTATTAACGTCGAGATCTCAGGTACTTTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATCCTATTCTAGATTCTAGACGTAGCGCAAGTTACACAAGCATCGTACATACAATCTTGCACATGC:1	-	chr2L	227180	5'	+	rover	7000	2	72.80
AAAACATTGTTACTTTAACCGCAAAAAGCAGTCATTTTACTATTACTATTATACAATATTCGTTGCTATGCCAACAAATTTTTAGAGACATCTTCCTGGCACCTCCCTCTAGTTGAGTAACGGGTATATGATAG:1	+	chr2R	16193780	5'	+	INE-1	547	1	51.49
TGGGCAATGCACTGCGATTGCAATACTAATCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGT:1	+	chr3R	23056946	5'	+	opus	51	4	72.12
TTATTTAAAAAATTATTTCATAAAAACCTAATGATTATTTGGCCTCTATTCTTTCGACTTTATAGAACCACTCCAAACGAATATCTCTAACGAATGCATTTTATTCATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1	+	chr3R	13846064	5'	-	I-element	5342	1	75.86
ATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	-	chr3R	12886968	5'	+	roo	78	2	80.00
AACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	27994177	5'	+	roo	20	2	60.19
GAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGA:2	+	chr2R	7586159	5'	+	I-element	5116	1	72.41
ATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	+	chr3L	14603234	5'	+	jockey	36	1	62.24
CTAATATTAAATATTGGCTTTATTTTACTGCGTGTACTTAGCATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr2R	19003796	5'	-	roo	9010	2	61.87
TGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1	-	chr3L	3501035	5'	-	opus	492	2	71.58
CTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1	+	chr3L	7588410	5'	-	hopper	1358	1	60.87
TGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr3L	9998194	5'	+	roo	8699	2	53.91
GTATTATTTTTTAGAAATATATTTCATATATTAAATAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAT:1	+	chr2L	4953891	5'	+	Quasimodo	13	2	76.03
TTATATTATTCTTTTATAACAGTCTATTCTAATGACCAAGAAAAATTCGTATATATACTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1	+	chr3L	20324664	5'	+	297	60	2	67.12
ACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTAGAGGCACGAAGTGCGGACACAACAACGCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACAATGTATGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1	+	chr3R	4604452	5'	-	1360	3369	1	63.01
TTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATACTTACAA:1	-	chr3R	19968201	5'	+	roo	18	2	64.15
CCTGCTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr2R	9632219	5'	-	roo	389	2	66.93
AATATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGATAAAGAACTACAACTTCAATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACAATTGGTTCAAAAAAGAACGGTATAGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATG:1	-	chrX	23362217	5'	-	rover	7044	2	65.94
AATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	-	chr2R	19050337	5'	-	roo	398	1	69.93
ATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1	+	chr3L	10647917	5'	-	412	442	2	60.32
GTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1	+	chr2R	12835051	5'	+	jockey	72	1	69.53
TCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACACCGGTTCCCACATGAACACGAATATAT:1	+	chr3R	22844158	5'	+	roo	4	2	72.81
AAGATATGTATGTAGGTAGAAAAAATGTTAAACTTTTCATATTTTATTATTAATTTTTTTTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1	+	chr3L	2192956	5'	+	I-element	51	1	54.81
CCAATGAAGAAACAAAACGGGGGAAGCAGAGCGAAATACAAATCAAATGTACCGCAAAACTGAATGAAGTCAACAAAGGATGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAAAAGCCAAATCTATGTACATATTA:1	-	chr3L	22493121	5'	+	1360	345	1	56.85
GTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGA:1	+	chr3R	17420380	5'	+	roo	8662	1	79.13
GTAAATAATATTTATTCCTTTTGTACCAAATGTTCATTGATTGGAGAGTCCTTCATACTCCAGCAGGATAATAGAAAACCTCTGGTCATATATAAAACAAAAAAAGGCGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTG:1	+	chr2R	5505330	5'	+	Tc1-2	1240	1	76.03
TTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1	-	chr3L	10574382	5'	+	Tabor	56	2	53.79
GAAAGAAAGCTTATCTACAATTAGCTCGAATTATTTAAATAGTAGTCATATTTATTGATTATGAAAATCAATTTGTTATGAAAATCAATTTGTTAAGTAATACAGCGATAGGTTCACATAACCATGCTTGTCGGAGCAAAAG:1	-	chr2L	15635173	5'	+	R1A1-element	4892	1	54.23
GTTTCCACACGGGAAGAGCGCCCAACAGCTTGTCGATATTCGTTGCCACGGTCACGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1	+	chr2R	19726846	5'	+	1360	51	1	58.91
CAAGTTATTCGGAAAATAGACATTAATGTTGTAAATGATTTCATATTTGTTCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3R	29421052	5'	-	roo	9001	2	67.81
TGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1	-	chr3L	3501019	5'	-	opus	447	2	65.32
ATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chrX	2295975	5'	+	Tirant	8122	2	56.41
AATGATATTGGCACTGTATGTCCGTTTTCATGATTCGAGTGGAATGAGTTGTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	-	chr2R	19726978	5'	-	1360	3380	2	78.36
AAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTG:1	-	chr2L	23084409	5'	-	accord	7336	2	56.92
ACTAGTTGCCTTGCAATATATCTAACTCATATCATTAACTCATATCTATCTCATTTGAGTTTGTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCATTAGTCAGTAGGAACCGTTCAGTTCCTTCTCAACTTAACCTAATGTGTATCT:1	+	chr3R	4201634	5'	-	G5A	2784	1	62.33
AACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTATGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr3R	17420367	5'	+	roo	8680	2	69.86
GTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr2R	14387950	5'	-	roo	9002	2	74.19
GTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1	+	chr2L	16016341	5'	-	412	7472	2	71.64
GGCTGCAGGACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1	+	chr2R	12835010	5'	+	jockey	29	1	66.93
GAAAAAAAGAAATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chr3L	11393444	5'	+	roo	28	2	65.75
TAGATGCCTGAAAGTGGACAGCAGTGCGAGCGGAAAACAAAGCTTTTCATTTTAAACTGAAAATAGTTGGATTTTAATTAAAAACTTTGCTCTTTCCACACTGAAGGGATTACAATCACGGCACC:1	-	chrX	18125032	5'	-	R1A1-element	5281	1	72.80
CTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCTCTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTATATATATATAAG:1	+	chr3L	2362326	5'	+	Stalker2	26	2	50.96
ATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1	-	chr3R	20499857	5'	-	mdg3	5480	2	65.77
ATTTGGTCTTTGGATCTGCGAGGGATTTATGAATGGCGGTAACGAATTTTTGATTGGGGTGGGAGTTTTTGTTTTTATTTATATTAATATTGGTATTGATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAG:1	-	chr2R	4135395	5'	+	Dm88	4297	1	66.44
TTTGATTCTGATTAATCGTTTTACCTGGGTACCCAGAATGCATTGTCATTTGCGACTGCTGCGAATCTGAATCTGAATCCGAATCTGGATCAGAGTTACAGTAGCAGTGTACATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1	+	chr2L	2703404	5'	-	hobo	2930	1	39.73
GACGAAAGCGATTGGAGATTGCAGGGAATGCAATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1	+	chr2L	11518359	5'	-	412	7524	2	67.16
AGTGATTAAAGAACATTATTTCAATATGCAAAACAAGTCCAAAGAATTTCCTTCAGCTATGAAAATAATTTTGAGTTGCCTTGCAAATGATAATATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTA:1	-	chr3R	11832126	5'	+	jockey	306	1	68.09
GCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chrX	10640103	5'	+	roo	8736	2	67.81
CTAATTAACAACTACAGCTGAACTACGGACTCGGAACTCTCATTTAACGTCTTTTTTTTTTATATATTTTTTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1	+	chr3R	13349052	5'	-	BS	5025	1	65.07
TTAATAATTCTATTGACTTACAATACTATTCTGAGTGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCCTCGTATAAAATCGGTTGTTTTTTTTACTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAATA:1	-	chr2R	5348417	5'	+	Doc2-element	82	1	71.11
AAAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1	-	chr2R	16373554	5'	+	Max-element	24	2	55.10
AGAGCAGCAGGATATAAGTTTAGAACTAAACTTATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTA:1	-	chr3R	1431538	5'	-	mdg1	7231	2	62.92
GCTTACAACATGTTGCAAGTTGCAAGCTCGTCGGCTCATCAGTTGGCTCAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1	+	chrX	7195044	5'	-	P-element	2833	1	39.84
ACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1	+	chr2R	977529	5'	+	F-element	72	1	61.11
ACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1	+	chr2R	15005085	5'	+	jockey	84	1	71.64
TTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr2R	23803024	5'	+	roo	82	2	74.66
AGGTATATTCACTTCTCTATATGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTACTTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTATGTGTATTGTTCACACATGAACACGA:1	-	chr3R	25448474	5'	+	roo	8662	1	73.33
CATATCATATTAAAGAGCCAAGTTTGTTTTTGGCACAGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	+	chr3L	19334231	5'	-	roo	359	2	53.42
GTGTATCCTTGCTCCTTGGCTACCTTTGCACTAATTCACATTTGATGTTTTGTTGTCTGCGCTTGTTCTCCTCGATACAAGAGTTTTCCTCTGTTTCCTTAACGAGACGCTTTCTGGCAC:1	-	chr2R	8325772	5'	-	invader5	279	2	55.83
GGAATTATTTTCATTTCAGTGGATGCACTTTGTATAAACACCCAGATTTACTAACTTGATCGATACGACATATTATCTTATAGAGCTTAAATAAGCTGGGTTCGGAAAAATCGAAGTTTTCAAA:1	+	chr2R	9682646	5'	+	FB	20	1	91.94
GGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1	-	chr2R	5031013	5'	+	Doc	87	1	77.21
GTTTTGTGCTCATTGGGGCAACTTTAATCGGGGACTGTGTTAATTGAAAATGCAATTTATTATTATTTACCAAACTTACGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTACTCTGTCTATATATTTTT:1	-	chr3R	5438224	5'	-	G4	3607	1	54.47
GGCCCCGTCACCCACATCCTGTTCGGTGGTCCTGCTCCTGATCCTGCTGTTGCCTTTGACGTTGCTCCTTCAACCAACTAGGAGCTCTCACGCTGCCTTGCCTTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGGA:1	+	chr3R	12611109	5'	+	1360	2965	1	78.03
CAACGCTGGCACTACTTTCATTTACACAATGTACTAACTATATATTTACACAATAATGTGGTGCTTTTAATACAATACATCTCTAGATATAAGAACAGATCACGGTACAGAAGAGTTCCTCGACTAACAGATACCCGTTACTTAGC:1	+	chr2L	14381318	5'	-	INE-1	546	1	58.90
TTCGGAATTCTGAACTTATTTGGCAGTTGTCATTTTGACAGCTTGTGACAAAATTCGAATGAGATGCACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAA:1	-	chr2L	21888618	5'	+	mdg1	7249	2	56.85
AGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	+	chr3R	27994213	5'	+	roo	61	2	78.76
AATTTGTTACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACT:1	-	chr2R	5924458	5'	-	jockey	4738	1	55.71
ACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1	+	chr3R	26431983	5'	+	opus	7151	4	64.65
ATGTTGTTATGAATTTGTGTTAATTTATATTTGATTGTTTATCTGTAAACGAAACAGGTAATTTTGGTGTAAATAGAAATCAATTTGTTTAGTTTGTTTATGGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAA:1	+	chrX	10260330	5'	+	hopper	348	1	78.77
TATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1	+	chr2L	8986104	5'	+	412	7099	2	52.74
CATAATATCTCGATTAAAGTTTTATTTAAATGTTAAATACATAATTCCATTGCACTTAATGCCAGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTG:1	+	chr3R	16350896	5'	-	invader2	33	2	55.56
TTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3R	12886970	5'	+	roo	8739	2	78.42
AAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chr2R	12835030	5'	+	jockey	27	1	61.90
ACTCAAATTGAGTTTATATATTACCTTACCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTT:1	-	chr3R	5061959	5'	-	mdg3	5460	2	58.22
AGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1	+	chr3L	15995920	5'	+	297	56	2	59.59
GCAAATGCATTTCACGCGAAATTTATGTAGTTTGCTCTGGCCCTGGGTGCCCCCCAAAAATACTGATACATATATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAA:1	+	chr3L	6388857	5'	-	17.6	7375	2	54.79
AACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	+	chrX	10640030	5'	-	roo	330	2	69.18
CCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGATG:1	-	chrX	21667927	5'	+	gypsy2	6551	2	66.15
TATTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1	+	chr3L	4948048	5'	-	hobo	2928	1	59.04
TACACAAATGAATGAATAAGTGCGCACACAGACCGCACCCGAAAGGGGGCCCGCCCCACCCAAAACCCACCACCCTCAAAGTGATAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTC:1	+	chrX	21242223	5'	+	Porto1	371	1	57.78
GATGTTCTCTGCCTTCCAGCGTATCCTGTTGCTTGCGAAACGCAACCAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1	-	chr3L	2712828	5'	+	P-element	56	1	41.67
CGTAAATATTTTATTTTCTTTAGACGGCCAGCTAAATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1	+	chr3L	10647852	5'	-	412	487	2	67.12
ATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGAGGAGCAATCGAGTGGACGTGTGCACAGA:1	+	chr2R	15004742	5'	+	jockey	28	1	44.52
TTGTATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	+	chr3L	20654448	5'	+	roo	37	2	60.27
AATCTCACAAATTGTCGAAACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1	-	chr3R	20499895	5'	-	mdg3	5483	2	73.29
GGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATCTCTTG:1	+	chr3L	7292434	5'	+	HMS-Beagle2	6917	2	65.07
GATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1	+	chr3L	18368895	5'	-	opus	7495	2	73.87
CCTTGAATGAACCGAAATGCGCGTAGCTAAATGTTTGTTTTATTTTTCAGCAAATTGCCTTTGTTCATATTCTGTCAGACGGAAGAAAGTGCAGTGAAAACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACC:1	-	chr3R	6237216	5'	-	X-element	4538	1	48.28
TTCGATTAGCCGCACCGCTCGAACGCTCAGTCTTCAAAGAGATCTCGACCGAGCAACAAGTGAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCG:1	-	chr2R	8145984	5'	-	P-element	47	1	71.74
GAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	+	chr3L	21817963	5'	-	roo	9023	2	54.55
GTATCCGAAATGAATGAAATCAAATAGCATTATTTATGAAATTATATGGTCATTTTAGTTCTTTAATTGGAATTTAATTGAAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1	+	chr2L	12498302	5'	+	pogo	32	1	57.53
AACCTTGCTTGCATGCAGCTTGTGCCAACGTCTGGAGGAGCTGTTTACTCGATTTTATGGCCAGGATGGCAATCTGGAAGAGGGGGAAAAGCTTGAGAATTTTTTGCCTGCGTGATCGTTTTCGCGGATTGCCC:1	-	chr2R	15064692	5'	-	Gypsy12A_LTR	1969	1	57.46
ATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGTTTTT:1	-	chr2R	24218611	5'	-	412	419	2	63.70
GAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGC:1	-	chr3L	11321504	5'	+	mdg3	5313	2	56.16
TAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAA:1	-	chr3R	14049408	5'	-	transib2	2738	1	73.97
ATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1	+	chr2R	20496905	5'	+	blood	46	2	54.48
AACCGCAACTGGAATTGCAAGTGCCGCAGCTGATGATGAGGATTGAGATAATGGTAATAATGACGAGGGCGGGAATGTGGGGCAGAATGGTCATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATA:1	-	chr3L	17222138	5'	+	Doc	176	1	60.14
TTTTCGGCCAGGTCCAAGCCGATGAAGCTGAAGCTCTGGCCAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1	-	chr3R	10182248	5'	+	blood	7038	2	67.59
ACTAATAAATAGCAAAATTAATTCCAAATGCGCGATAGTAAAAACCAATTTGTTTCGAAAAAACAAACGCAGAAGAGGAAAAACCACAAACCGATATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTAT:1	+	chr2R	13006387	5'	-	3S18	317	2	66.67
ACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr2L	14772057	5'	-	roo	325	2	75.35
ATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1	+	chrX	21016756	5'	+	Transpac	51	2	62.79
GAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACNGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACT:1	-	chr2R	6085998	5'	+	1360	371	1	58.90
ACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chrX	5643484	5'	-	roo	337	2	67.81
AAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCA:1	+	chrX	21014791	5'	+	copia	4934	2	65.71
CTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1	-	chrX	13504236	5'	-	412	7480	2	67.88
AATCCATGATCGGCTGCAAATTGCTTAGCTCACCAATTAATTGCGGTTCCCTGCTTTTATTTTCCATATTTGTTTACACTTCTCATGCTAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	+	chr3L	20831614	5'	-	roo	393	1	76.52
GATTCGATTGACTATCTGTGACGAGCACCGATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr3L	12879699	5'	+	roo	8686	2	70.50
AATGTTCTATATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	-	chr2L	16092026	5'	+	roo	23	2	69.06
ATGTGAAAGGTGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1	-	chr2L	19310438	5'	-	Juan	4197	1	71.23
GAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chr2R	25118774	5'	-	roo	342	2	65.07
ATAACAAGAGAAGAGCTTCTGCTCTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAATGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1	-	chrY	3648939	5'	+	Transpac	4934	2	78.77
CTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1	+	chr3L	4948062	5'	-	hobo	2892	1	65.71
TAAGTTAAATTATGCATGCATGCCACGCCCACTGTTAAACGAGGGGCGGACCTCACCTGCACACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACAA:1	+	chr2L	9289223	5'	+	Cr1a	4007	1	76.14
CCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATATGTATGTGTGTGTATGAGCATGTCTATGTGTGTTTGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1	+	chrX	21009386	5'	-	pogo	2076	1	59.48
GTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATTTGCCCACCA:1	-	chr3L	46998	5'	+	FB	69	1	62.33
ATATTTTTAGTTTTATTCCGCCGATTTCGTTGCTTTGGAAAGTTGGCGGGTCTGTGTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTCGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr3R	22122678	5'	-	roo	357	2	50.68
ATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCTTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1	-	chr2R	17259318	5'	+	jockey	4713	1	73.26
AAGTCACTTAGCAAATTTGCATGCCTTGTAGCATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1	+	chr2R	13585353	5'	+	412	8	2	77.40
AATCGTAAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGATTTTTAATTATTCTAATGTCATTAAGCAGAAATGCAAACAAGTCACATTTACACTTAATAGCTGTAGCTGTAGCTGTAGCTGTCCCCATTTACTCTAAATAACG:1	-	chr3L	2292145	5'	+	Doc4-element	2380	1	54.79
ATATCTTCCCAGACAGGCTAGACACCGGGGAACAGGACTTTAGAACCAGGCACTCTCGGTTGTCAACATATAGTAAACAAGTGGAATTTTCGCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCA:1	+	chr3R	16083440	5'	-	roo	8657	1	64.58
ATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTA:1	+	chr2L	19310312	5'	+	Juan	4121	1	50.34
GTTTTCACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chrX	8543455	5'	+	roo	71	2	70.00
TGATATTCTTCTCATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	-	chr3R	17818014	5'	+	roo	26	2	66.43
CACAGCTGGTACGCGCACTACCCACTACCCTATACCCCCTAGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCG:1	-	chr3L	22349313	5'	+	jockey	33	1	63.70
GCTACTCAGAATCGAGAAACTATTAGAATTTCAAAAAGAAAGCTTACTCTAGTTGAAAATAGTTTTTTTTTTAGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTCCAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1	-	chrX	18478676	5'	-	I-element	5311	1	48.63
AATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATATGTATGTATATGGAAATGTATATGTATATGTATATACATTTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATA:1	-	chrY	2720372	5'	+	ZAM	8150	2	77.40
AATGCTAGAAAATACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr3R	27994156	5'	+	roo	16	2	68.80
TGTTTGACTAACTCGGACATTTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGA:1	+	chr3R	12618559	5'	+	F-element	12	1	74.62
TGATCGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGA:1	-	chr3L	2485998	5'	+	jockey	4531	1	41.07
AGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACGCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr3L	11393468	5'	+	roo	8716	2	56.16
AAGGAGTGGGATTACCTCGATTCTTGAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1	+	chr2R	6919660	5'	+	hobo	54	1	55.88
CTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCGTTCATATATTATGTA:1	-	chrX	13039526	5'	+	roo	45	2	75.53
ATATGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATAAGAAACATTGTCATAGTTGGGTTACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCTG:1	-	chr3R	1048002	5'	-	invader3	303	1	51.20
CATTTGTGCATTTTTTTAATCATACACCTAGCTTTTCCAAATTTCTGTATTATAAAGGTTAAAGGTCACCATTAGTGAGAAGCGCAATTTGTTGTAGGGTCTGTCATGATTGTTGATTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAG:1	+	chr2L	8979215	5'	-	I-element	155	1	64.75
TCCTGAAAATCTTCGCAAGAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1	-	chr3L	11321522	5'	+	mdg3	5295	2	52.74
GTATCTCTTCTAGAAAACTGAGATGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTACATGTATTTGTGGCGGGTTTTTTATGTGTT:1	-	chr2L	22201065	5'	-	G6	1917	1	71.59
CCGACCTGCCACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCA:1	-	chr3R	14940192	5'	+	jockey	6	1	75.27
GAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1	-	chr3R	20499854	5'	-	mdg3	189	2	54.11
GCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGT:1	+	chr3R	12717740	5'	+	297	63	2	70.71
GTGAAGAGCAAACTCTGGAAGTGGAGATTGATCCTTGGAGTGGCTTACTAGCATTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATG:1	-	chr2R	4520382	5'	-	INE-1	122	1	56.57
CACCATTTTCTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1	-	chr2L	14081444	5'	-	1360	3382	2	78.03
AAACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATT:1	+	chr3R	4604450	5'	+	1360	401	1	62.33
GTGGTGAGGGAGGTCAAGTGTCAGTGCCATTTAGCAACTTGCCTCTCACACACACACACACACACACACTGTGT:1	+	chrX	2899076	5'	+	accord	259	2	70.27
AAGTAATTACTATCTTATCGAATGCCATGTCGCGGGTGGCCTATAAAAGTAGAGAAATTGCCGGCAATCGGGCAAAGAGTTAAGTGCCAGCAACATGTCCGGAATCCTTAATACCTTCGGAAGAGGACAGTTCTAGA:1	-	chr2R	14678532	5'	-	Gypsy12A_LTR	2036	3	78.10
AGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGG:1	-	chr2R	4774735	5'	-	baggins	5324	1	73.97
ATATAATAATAAATAAGGTGCAAATATTTCAGAGCATAGTTGTGGTTTTATTTCACCTATCCGCATTATCTGCAGTCAGTTCAACTCACTTTTTGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1	-	chr2R	21146012	5'	+	pogo	21	1	68.49
AGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1	-	chr3R	17831902	5'	+	F-element	32	1	56.45
ACCTGGGTGTTAAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1	+	chrX	5629083	5'	-	jockey	4961	1	61.81
ATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr2L	17420224	5'	+	roo	89	2	80.14
CTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1	-	chr3L	7943727	5'	-	Burdock	220	2	54.74
CCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1	+	chr2R	12835048	5'	+	jockey	76	1	68.89
ATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAA:1	-	chr2L	22685190	5'	+	Ivk	53	1	58.91
TCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATGTTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGC:1	+	chrX	13704742	5'	-	invader4	286	2	54.79
TAAGTAGCAATTATTTGTAAGGTAATATTTTTAGGTAATCAATTTAATTAATCTATCAGCTTTTATAGTTCCTGGGATCTCGAGGTTCATACGGACAGACGGACATGGCCAGATC:1	-	chr2L	22212702	5'	-	INE-1	114	1	52.17
GATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1	-	chr3L	17115535	5'	+	blood	7077	2	61.11
TCAATGCCAGTACAAATGCTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1	+	chr3R	18582140	5'	-	roo	406	1	72.04
CAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr3R	25448347	5'	-	roo	9001	2	66.21
AATGGCACAAATATTCATTAACTTTTATCACTTCCTTGATAAACATTTCTTCTCGCTGACTGGAAAATTTTCATTCGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1	+	chr2L	3164929	5'	-	412	465	2	60.00
ATGGCTTGTCAGCCACGACAAAGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGTGTTTCGGACTATAAAAAGTACATATATTCTTGATCAGGATCAATA:1	+	chrX	22790774	5'	+	INE-1	84	1	74.74
TCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chrX	6486783	5'	-	roo	325	2	76.03
GCGTGTTGTTTGGAAATTGGATTTGTGCACGTTTCTTGCTTTGCATTTCCGTTTATCGGCATGATTCCAGCTTCATCTTGGCCAAGGCTCTTCCCTTTTTTTTTGTTATTCT:1	-	chrX	4812000	5'	-	Bica	335	1	84.82
GACTTTCTCAAATTGTTTAAATGAAGGCAAAAATTATTTATGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATACGTCCTCAAATTTGGACGAAAATACGGATAGACGCACAGACGGAGATGGCTAGATCGACTC:1	+	chrX	22806259	5'	-	INE-1	109	1	48.20
AAAAAGAAAATTATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1	-	chrX	21564772	5'	+	diver	44	2	56.16
GTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTA:1	+	chrX	13066496	5'	-	jockey	4939	1	55.48
AGCTCTGGCCAAAACGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGTG:1	-	chr3R	10182217	5'	+	blood	7014	2	72.22
TTTCAAGTTTTCAAATATGGCATTGACAAAACGGTTAAACTTGTCGAGGAACAGGACTATAGCTTTCTCTCATGTTATACCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGAGAATACTAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATACATATT:1	+	chr2R	5081125	5'	-	Dm88	4379	2	74.66
CTGCTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1	+	chrX	7256106	5'	+	412	33	2	49.17
ATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr3R	31817533	5'	-	roo	9022	2	62.70
AGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1	+	chr3R	19589895	5'	+	BS	5038	1	52.74
TTTGGTAAATCACAGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1	-	chr3R	16404580	5'	+	pogo	46	1	54.17
CGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1	-	chr2L	10037384	5'	+	Quasimodo	73	2	78.46
TAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1	-	chr3R	6611292	5'	+	HMS-Beagle	6845	2	55.97
GTGTTGTTCGGGTAGATTTCGAATGGGAGGTTGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTA:1	-	chr2L	9123963	5'	-	Porto1	230	1	75.95
TTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1	+	chr2L	21153448	5'	+	1360	31	1	61.64
GACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCATAGAATATACGGACAGACGGACATGGCTA:1	+	chr3L	23871824	5'	-	INE-1	118	1	73.75
CAAAGCACAAAATACGAATTGCCATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1	-	chr2L	18339077	5'	-	pogo	2048	1	56.16
TGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1	+	chr2L	21153456	5'	-	1360	3384	2	76.79
AATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1	-	chr3L	17560387	5'	+	pogo	54	1	55.86
ACATTACAAGTCTTGATTTAAAATATGGATTTTGGCAATTCCCTCTTGATTTAGCGAAGTAAATAGTTAATAACATAAAATATATAAACAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTATAAAATTT:1	+	chr3L	27058213	5'	+	Doc3-element	132	1	69.86
GCCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1	-	chrX	22715174	5'	+	Bari1	25	1	65.44
AAAGGGTCAGTGAAGTCAGTGGACAGCAAAGGGTGTTTTGCCAACGTGGTGTTATTAGTAAGAGTAAAAATATCAATAAAATATTTGCAATGCATGAGCTCTCTCCGCTCTCTCGTTCTTGAAAAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAG:1	-	chr2R	4708598	5'	-	1360	81	1	42.47
AAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCA:1	+	chr3R	5061819	5'	+	mdg3	23	2	65.32
GTTATAAGAAAACGTTACATCAATTTTGTAGCATACATTTTGGGGCATGTACTACTGAATGTACTGCATGTACCGTAGAAAACTACTTCTATTGCCCGAGGTTGGGTTTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATGATACTAT:1	-	chrX	20266415	5'	+	BS	5044	1	76.71
TGTGCAGGTGAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1	+	chr3R	26659710	5'	+	HMS-Beagle2	18	2	67.59
CACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGGTTTCCTTGCAGT:1	+	chr3L	21855428	5'	-	blood	347	2	59.02
CCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	-	chr3R	14940170	5'	+	jockey	17	1	58.54
AAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTCCAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAA:1	-	chr3R	4604452	5'	+	hopper	1401	1	62.12
AATGTTTTTCAATTGAATTGATTTTGAATGCGCTCTGTCTGACTTCTGTCTGTGTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	+	chr2L	1377612	5'	-	hobo	2921	1	66.67
TGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1	-	chr3R	17243247	5'	-	hopper	1396	1	67.15
AGATTCATGTAACGAGCTATCGCTTGTTTCTTTGAATCTCCTAAGGTGACATCCTCCTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	-	chr3R	19445069	5'	-	roo	356	2	53.91
TATGTTTGTATTATGAGTCTTGCAAATCATGTAGTTGTAAATACGAGGGCAAAAAAAAAAATTCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCA:1	+	chr2L	8243316	5'	+	Quasimodo	6925	2	56.25
AAGCGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	+	chr2R	14387948	5'	-	roo	8990	2	75.36
TCTAGCTGAATTCAGGCATATTTTCTCGCATGGACTCAGAAGACAGGTCTTCGCTGCGCCAATGTCCCTAGAATCTGTATGCTGAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCGGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGGCGG:1	-	chr2L	22079777	5'	-	INE-1	127	1	62.77
AATAGGAAAAATACCCAGAACTATTTTTAAAAATTTTATTCGAAAATATTGCGTTATTTCGGTGCAACCTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	-	chr3L	1534635	5'	+	pogo	49	1	52.74
ACATATAATACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAAAATTAT:1	-	chr3L	19339456	5'	+	Tc1	44	1	58.22
CATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCACAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTATTAT:1	-	chr3R	17615210	5'	-	mdg1	7067	8	67.91
TACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTTATTTTTTTTGGAAATATC:1	-	chr2L	7898394	5'	-	roo	359	2	51.45
TTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1	-	chrX	21014888	5'	-	copia	225	1	64.38
GCATTCAATATAAGTGCATTTTTAGGATAAATACTACACCCTTTGTACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1	-	chr3L	24766061	5'	-	1360	3330	1	66.93
AATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATTTCTTATGTAAATGAAT:1	-	chr3L	10292876	5'	+	roo	52	2	69.37
AATTGTTCACTACTTACTAAAACTATTTTCAACAAACAACAAAACTCAATCGTGCTGACTGTAAAGGGTAGAATAAAGCACTTTCGACCATATCAAGTAATCATGATCACGATCGAGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAG:1	-	chr2R	20538537	5'	+	INE-1	156	1	42.47
AACCTTATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1	+	chr3L	14603218	5'	+	jockey	23	1	71.92
ACCTGCTACTGCGCGGCGTTTTTAGGCCTGCTTTTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATA:1	+	chr2R	16891781	5'	-	hopper	1401	1	74.66
GACACTTAATTCTGTTACCGCCTTTCATTCATCGTCTCAGAAAAAAACAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1	+	chr3R	19532515	5'	-	jockey	4925	1	68.42
GAGGAAGACAACCCTTATAACCCAACCTTAGCTCTAAAAAGCTGTCAGAGTTGCGAAGCTGTGACATTCGAATAGGGTCATACTAAATGCAGTGAAATGCGGGAATATACTAAACGGGATGCAACCCTTATCAGCTGCACCCG:1	-	chr2R	4978643	5'	+	gypsy12	131	2	60.84
GAATAAATTTTTGACTGCAGGCGAAAGTCAAAAACGTATATGCATATATGTGAGTATAGTGTAATGATGAACTCCGATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1	-	chr3L	22863475	5'	-	412	7481	2	61.64
TTCACTTTTCATAGATTACGAAAATTTTAGAAGATAAGTCAAATAATTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:1	+	chr2R	9258370	5'	+	3S18	5789	2	66.44
AGCATTTTCAAACGATACTTAAGAAATTTTTCAGCAATGCAAAAGTTTAAGAGGTGAAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAA:1	+	chr3L	19521641	5'	+	I-element	182	1	55.47
AATTCACATTGAACATTGAGACAAATATGAAACATTTGAACAAATAACTTTATGTCGTATTGCCGCATATTATAATATTTATATTAGTTTTGCACGTGGTATTATTGTTAATATGCATCCATAAATTATAGTAAAATATGGAAAAT:1	-	chr2R	19003591	5'	+	transib2	258	1	53.42
GCATAGCTTCAGGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAACACTGCTGTAAAATCGCCAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	-	chr2L	6059302	5'	-	roo	398	1	62.65
AAACTCAATAATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTCTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1	+	chr2L	21884487	5'	+	pogo	40	1	58.90
ACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATATGGCCATACATTCTTGCCCAGCCAGGACATTGGAATTGGATAGGCGTTTGTGTAATCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATT:1	+	chr3R	22647897	5'	+	1360	305	1	50.00
GAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	-	chr3R	16076866	5'	-	roo	339	2	68.57
AGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTGACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chrX	5274288	5'	+	roo	19	2	60.95
ACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTA:1	-	chr2L	7898393	5'	-	roo	9014	2	54.79
AATAGAAAAGCTTTTACATTTCCAAATGTCAACACATATGGAATTACCTTTGAAACAGATGAGAAATTTTGTGCAAAATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTAAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCA:1	+	chr3L	17652890	5'	-	S-element	1675	1	54.11
CACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGGACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATG:1	+	chrX	21585251	5'	+	mariner2	261	1	63.57
TAGACAATTGTAAATTTCGATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:2	+	chrX	13504104	5'	+	412	16	2	74.66
CCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAT:1	-	chr2R	5173242	5'	-	Stalker4	393	1	67.48
AATGGTTTTGATAGGTATTTACATGTTAAATTCGTTTTCTTATTTCACATGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACAT:1	+	chr3R	14366943	5'	-	roo	62	2	65.75
CTCTTGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTCGCAGTTGCATGCATTGCC:1	+	chr2R	5284508	5'	-	Doc4-element	2623	1	66.44
AGTTTCCACTGTATCGAGGTGAGTCCGCAAGCGGGTGCCCACTGTAACGTAGTGCGTTCCCAGGTGGATCGATGTTGTAATTTATAATTTATACTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATT:1	-	chr3L	3799882	5'	-	copia	254	1	54.26
CCATTTATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1	-	chr3L	17115552	5'	+	blood	7031	2	62.61
AACTATGCAGAAGTAAGCTGAAAGTTTGGCCAGGACTATGACCCCATCTAGCCCATAATTTCTCTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTT:1	-	chr2L	16072482	5'	-	297	446	1	78.16
GGACCGAAAGTCAACCAGCCCAGAAAGGTATGAGAATAAAAAACATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1	+	chr4	1151984	5'	+	transib2	42	1	56.85
TCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	-	chr3R	10266170	5'	+	1360	63	1	59.31
ATAAAAACTTATAAACTTATAAATAATAATTTTGGCCAGCTAAAATCATATAAAACTTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCC:1	+	chr3L	26019234	5'	-	invader4	97	2	53.66
AATATCATGGGTTTACATACATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTACTG:1	+	chr3R	4504027	5'	-	INE-1	541	1	66.19
GCAAACTGTTGCAATATACCCAATCCACCACAGCGCTGCAGAAAATCCCCCAACGTGCCCGCGAAAATGTTTGCATTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGT:1	-	chr3L	10572689	5'	-	Tabor	7256	2	52.74
GACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATCTA:1	+	chrX	21670000	5'	-	Stalker2	7581	2	61.64
ATTTTTATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTCA:1	-	chr2L	12483834	5'	+	P-element	46	1	51.80
AGGGTCGGTGTTCGAGTTGGGGTCACAATACGCCCTCTCAAAATTAAAACAATAAATTATAAAAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCT:1	+	chr3R	9550678	5'	-	pogo	1740	1	56.85
TGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr2L	14772111	5'	+	roo	42	2	63.21
AAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGA:1	-	chrX	6279404	5'	+	P-element	100	1	17.12
AGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTT:1	+	chr3R	13237296	5'	+	3S18	68	2	61.64
TTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGATGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCAAAATAAAATCAACTAAATAAAAAATCTG:1	-	chrX	6522027	5'	+	F-element	95	1	74.62
GGAGCGAAGCATTAAGAATGTTATGCTCATCTACAGCCGAACGAAGCCTTTGGGCATATAACGCATAACCATATAGTACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTCCCACACGACTCACACCC:1	+	chr2R	15289099	5'	+	hobo	25	1	64.34
GTTTACACAGAAAAAGCGGCGAGGTGCGGAATTAATACTTTCAAGAAATCGGCTGGCCAACGAAGCTACATATCCAGTCTTCAGTATACATCTGCCTT:1	+	chr2R	12736633	5'	-	Bica	84	1	74.49
TCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTT:1	+	chr2R	3338794	5'	+	Juan	68	1	63.89
GCACAACGTTTCGAAAATAGCGGGCAAAGTGCAAAATCAATCTTCCATTGGCCGCATGTCCGTGGGGGAAGTCCGTGCTGAGTGCTTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACT:1	+	chrX	2094104	5'	+	Cr1a	488	1	71.30
ATCTCTGTATATTTTTATACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1	+	chrX	15408719	5'	+	INE-1	549	1	86.30
GTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1	+	chr3R	7482762	5'	+	412	7113	2	70.34
TAGAGCGTTGTGCACCCCAACGCACTCTGCCTACTATTTTAACCGGCATGCCCAGGCAAAATGGGC:1	-	chr3R	3415704	5'	-	Circe	7370	1	84.85
ATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGCAGAGTGA:1	-	chr2L	19965067	5'	+	Doc	67	1	48.63
ATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr3L	23146481	5'	+	1360	53	1	60.16
CTGACTAAATTCGAGTGAGTTTTTATTCGTTGCAAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1	+	chr3L	22863348	5'	+	412	31	2	63.01
GCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCT:1	-	chr2R	16248015	5'	+	BS	38	1	51.09
AGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATACATATACATAATACATAATAATAATATAATATAATAAAATATTATAAATATATTAATTTTTCACATGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACCAATATTCTAATGTAAAGTCATTTTT:1	-	chr2R	4284691	5'	-	1360	383	1	55.48
CGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1	-	chr3L	3863527	5'	+	blood	52	2	56.39
AAGCTGAAGCTCTGGCCAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1	-	chr3R	10182224	5'	+	blood	7059	2	52.11
TAGAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	+	chr3L	21817931	5'	-	roo	400	1	76.30
GTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATTAATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1	+	chr3R	17316256	5'	-	opus	497	2	57.58
ATATTTTTTGGTGTTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1	-	chr2R	15064422	5'	+	412	7132	2	72.60
ATTATTTATGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATACGTCCTCAAATTTGGACGAAAATACGGATAGACGCACAGACGGAGATGGCTAGATCGACTCGACTATTGATCCT:1	+	chrX	22806291	5'	-	INE-1	96	1	61.67
AGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATACACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1	+	chrX	21016733	5'	+	Transpac	37	2	55.07
TATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTTAGAACAATTAAATAAAAAAGCATATTAAATTATGGCAGCAAT:1	+	chr2R	24218541	5'	+	412	46	2	55.75
GGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1	-	chr3R	27424939	5'	+	blood	17	2	67.82
ATGCGAAAATGTGGGCGTGGCAGTTTGGAGCGGTTTTAATGCCTGTGTGGAAAAATATCAAGACACATGGGTCAACTAACTTTCGCTGCGTCTCTTTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTTTAGCTTTTATAGTTCCT:1	-	chr3R	27355506	5'	-	INE-1	156	1	55.48
AATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1	-	chr2R	8146105	5'	+	P-element	81	1	22.96
GGACAGGCGTCTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTCCTACATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1	+	chrX	4214932	5'	-	flea	4960	2	56.85
CCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGTGATGT:1	+	chr2L	8986116	5'	+	412	58	2	54.11
TGTCGAAGAAAATAGCGGTACCACAGTACATTCCGACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCC:1	+	chr2L	22575607	5'	+	Quasimodo	77	2	76.22
GGAAGATCTCCTAATATATGGAAAATATAAGGAATTTTTAATCGTTTTTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTT:1	-	chr3R	9702171	5'	-	Stalker	6974	4	57.89
ACGGAGTAACCGTGTTTGTATACCCAAAAAATACCGTTAAAAAGCCGTTTTAATCACACAAGGTGGGACTGGCTACACTAAGCGCAAACAAGTCTTGCATTTTGCAATAAATTATTCATGCAATCTGACTTTAAAAAAAATAAACA:1	+	chr3R	7810487	5'	-	Tc1	70	1	76.03
AGACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1	+	chr3L	16015204	5'	+	1360	36	1	55.48
GCGGACGAAATGGAAAACTAAATTCGGTTTACATAATATAGCTCATAAAATATTTTTCGCACATTCATTGTCCCTTGAACCCAAAAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1	+	chr2L	2687289	5'	+	copia	14	2	73.29
GCTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chr2R	9632216	5'	-	roo	9047	1	64.62
GTTTCTTTAGTTGGAATTCCATAATGAATGACACAGTGAAACATTTTTGAAGGTTTCAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	+	chr2R	11164359	5'	-	roo	9056	1	65.75
GAAGGAGTAGGGGTTTAGCTCCTGCATGCGAATCACCTCTGGAGCCATCCATAAAATACTGCCCGTGGGTTGATTGGCTTGCTTTTCACCCGACCATCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCAC:1	-	chrX	2343011	5'	+	blood	170	2	73.13
GTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATCTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2R	9791606	5'	+	412	7094	2	69.39
CGAAAGATCCGGCGATCCGGGAATGCGTATACATTTTATACGCATTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAG:1	+	chrX	20645845	5'	+	1360	395	1	69.86
CCAAGTGCATCATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1	+	chr3L	25406615	5'	+	1360	16	1	73.57
GTAAAAACGCTGCCCCCACTCCCATGCACGCCGCAAGATGAATAATCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAA:1	+	chr2L	358667	5'	-	1360	325	1	79.86
CACAATTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGCGTTAGGCGTTAGGTTAATATCATATGGTTAATCTAAGCTTTATAGCTTGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGA:1	-	chr3R	4507783	5'	+	Quasimodo	114	2	53.42
TTTTCTACCAAGTAGCTGCATATATGAATTAATTTAAAAAAAAAA:1	-	chrX	18474118	5'	+	jockey2	3406	1	66.67
AAATAGTCGGGCCTATCGATTTTTACTAACTCACTTCTTCTTCTTCTCATTCGCCATCCCGACTGCCTCATTCATATGAGGCAAAGCTAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	-	chrX	2353579	5'	-	blood	169	2	71.96
GGACCGTGAAAATGAGGCGCTGAAGTGATAGGAAACTTCCTATCAAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1	+	chr2L	6863239	5'	-	pogo	2085	1	74.10
AGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCT:1	+	chr3R	7835125	5'	-	roo	9016	2	62.31
TGCGAAAACCAGAGCACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1	-	chr3L	22968456	5'	-	mdg1	385	2	58.90
TACGATATTTTAAGTTTTTTTGATTCATTTCGCAAAAAATTAGATGGTTTACTCTTAAATCTTCTATTGTTATATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGTCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAA:1	-	chr2R	4241593	5'	+	1360	3326	1	54.48
GAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1	+	chr3R	24455373	5'	+	Quasimodo	70	2	75.71
ATTTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGTGCAGTAGGCTTGAGGTACACATACATAATATCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTATGTTTCGCTACATCGGCTCTGTAG:1	+	chr2L	22076767	5'	+	invader2	4959	2	76.03
CGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1	+	chr3R	9210648	5'	-	mdg1	7373	2	76.03
AGCTACCAATCTCTAATAAAAAGTGAAATTAGAACTAACACTTTGCGGAATTCAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTG:1	-	chrX	21016888	5'	-	Transpac	285	2	62.33
AAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr3R	16076868	5'	-	roo	9045	1	56.00
TTTCAAAATAAATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1	+	chr2L	23068810	5'	-	1360	3360	1	64.14
ATGGGCATGGACATGGACATGGGTTACATGACTTAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTT:1	+	chr2R	23339402	5'	+	invader4	2657	1	72.80
CGTACAAGCTATAGGAATAATAAATTAATAGTTATTAAAGCTGGATCAAAAATAAATTAAAGAGTTAAAGCAAAGACACTAGCATATTCTAGTGTCTTTGGTT:1	-	chr3L	21821519	5'	+	Tc3	313	1	66.02
AATTGATCCTTTTAGTCTTTGGATTAATTCACTAAGCAGGTGAGCTGCACACAGCTCGAGTTTGGGAATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr3R	19446294	5'	-	roo	8998	2	74.66
GTGTAATAACACCAAATTATTTAGCGATTCACGAAGACGAAATGTCTTATTATAAGGAAAAATATCAGTTTATAAGGAATATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCT:1	-	chrX	22118657	5'	+	gypsy	7026	2	58.62
TATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1	+	chr2R	20496904	5'	+	blood	7068	2	57.53
GCATGGGTCGTAGCTTATGGGAATTTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chr3R	19968225	5'	+	roo	33	2	63.45
CAACTGCAGATGATGCTGTTCTATTCCCATCAGAGTCATTGTTGTTTCGCTTATTTTTCACTGGCGGCCTGCAGCAGGACTTTATAATGGAGGTTTACATGAACGGAACGACACGACATCCCAAAATTTCAAAATCAAAGTGA:1	-	chr2R	20472907	5'	-	S-element	341	1	59.44
TATTCCGAGGAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1	-	chr3R	25454147	5'	+	Quasimodo	6	2	65.94
TATTCGTAAAAGGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAAC:1	+	chr3R	24383229	5'	-	rover	7261	2	52.80
TTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1	-	chr2L	9399555	5'	-	Transpac	260	2	53.42
CAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	+	chr3R	22844183	5'	+	roo	8687	2	55.56
ATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATAAGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr3L	11393455	5'	+	roo	39	2	56.85
GGATGGGGCGTGGCAAGCGGAAGGGGGCGTGTACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATT:1	-	chr3L	12308390	5'	-	hopper	1358	1	67.52
AAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGT:1	-	chr3L	9907355	5'	+	BS	5060	1	61.64
GTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1	+	chr2R	15064346	5'	-	412	467	2	55.77
ATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGAC:1	-	chr2L	15991418	5'	-	mdg1	380	2	54.29
CTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1	-	chr3R	20427442	5'	+	jockey	79	1	76.80
TATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTCGGCTCCGTTCATATCTTATGCAA:1	-	chr3L	19334302	5'	+	roo	46	2	85.56
CGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1	+	chr2R	24218548	5'	+	412	7139	2	76.03
AATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1	+	chrX	17526822	5'	+	roo	47	2	53.10
CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAG:1	+	chr2R	2007458	5'	+	1360	55	1	49.30
AGTGAATCCCGAATTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCGATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1	+	chr2L	544792	5'	+	412	20	2	48.81
GGAAAAGAGAAAGGTTCTTTAGAAGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1	-	chr3L	15600385	5'	-	roo	408	1	71.03
AACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCC:1	-	chrX	12074605	5'	+	412	145	2	67.39
CGCATGCAGACGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1	-	chr2R	13585533	5'	-	412	7519	2	65.22
AACTAAATAAGTTAAATTGTCAATTCTGGCATCACCAACTTAAAGAAGAAAAACCCTACAGAGTAGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTA:1	+	chr3L	19131927	5'	+	jockey	168	1	55.48
GGCTGTAAAAGCACAAAAACCTAGATAAGATAAACGAAATAAGTACAGCATTACTCACCGAAAGTCACTGCGATGTGTGCACATATGTATGTAAGTTAAGAACCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	+	chr2R	9543991	5'	+	opus	145	4	67.59
ACCAGAGTTTAACATGAGCTACTTTACTGAGATCAGCAGCACGCCAAGATCAAACGTCGTAGGTCAAACGGAAGTATTCCAAGTTATTTTTGATCAATTGGCACCATGTGAAAAATTCTTGTCTTGCATTGCCTTAACGTTATTAT:1	-	chr3R	16312334	5'	+	1360	301	1	56.85
GACATATTTCTGATGAACTGGCAAAACAAACCCAGCCGAAATCCAAAACAATAACTGGGTCTCCGAGAGAAGGCCGGCAATGTGCTGTTCCCACGCCAAGGATTCGTTTGCTCTTCCGATCTGAAGAAATTGAATAAATATAT:1	+	chr3L	14974873	5'	+	412	7481	2	75.52
GAAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACG:1	+	chr2L	6622957	5'	-	Burdock	6311	2	77.93
GTCCATTTGAGACAAAACAAAAAATGCAAAGCGTTTTAATTTGGCCCTTTGTTGTTCAGAGTCTGGCCAGAAAGCTCTGGGTTTTATGGGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTAAACATTC:1	-	chr3R	12666644	5'	-	roo	8662	1	61.64
AACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chr3R	26222881	5'	-	roo	332	2	78.36
AAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1	+	chr2R	977520	5'	+	F-element	65	1	55.48
GCAAATTTAGATCTTTCCTGCTGGTATCCTGCTGGCCGCCACGAGAAAACTGGTGGCTCAGAATCCTAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	+	chrX	1517500	5'	+	1360	32	1	58.12
GGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCCTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	-	chr2L	7898403	5'	-	roo	9038	1	58.33
CACATATGTATCTTGTCACGTAGCTGATAAGTATCTTTTTTATGTGCAAGCATCTTGCCAATGATATCATCATTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	26222968	5'	+	roo	8712	2	52.05
TTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	-	chr2L	18419263	5'	+	412	7093	2	52.74
GCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1	+	chr3R	14981167	5'	-	mdg1	7384	2	69.18
AAAACCAGCCTCTGCATTTGTATCTTTTAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCACGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1	+	chr2L	18338964	5'	+	pogo	52	1	55.07
ATTTCACTCGCAGTTCTTTTTTTCGGATACCTTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATAGTTTTTATTTTGAGTCGAATTAAGATCAACGCCGAAATAAATA:1	-	chr2R	23761311	5'	-	Tom1	340	1	66.36
TACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1	+	chrX	15408736	5'	+	INE-1	549	1	84.50
TTCTCGCTAGATTTGAAACAATACTAAGTAAATCTAAAGATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAAT:1	-	chr2R	4673653	5'	-	Quasimodo	7291	2	73.29
AGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr3R	22844197	5'	+	roo	8739	2	69.86
AATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1	-	chr3L	15177317	5'	-	roo	353	2	56.16
AGAGGTATTACAGTTTGAAAATCCTGTGCATTAGGTAATTAATGGTATTTTAAACGTAAACTTTCTATGAAATAACTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAA:1	-	chr3R	14335998	5'	-	copia	146	2	53.42
AACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1	-	chr3R	20427444	5'	+	jockey	87	1	78.52
CTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1	-	chrX	22511458	5'	+	1360	7	2	62.69
ACAGGGAATCTATTTCAAGCAGAGGTATACTTTTTCAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chr2L	18294346	5'	+	roo	8672	2	76.55
AATGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	+	chr2L	21153508	5'	+	1360	63	1	74.58
GCATTGCCCACCGTCGATTGAGGCACAAATAGTGTATTTAACTGGCATTCTGCAAATGCACTGACATGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAA:1	+	chr3R	7489372	5'	+	412	475	2	50.37
GGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1	-	chr3L	25401034	5'	+	Doc	35	1	52.74
GTGCCAAATTGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1	-	chr3L	10574424	5'	+	Tabor	6854	2	66.44
GTCGAACATAGTTACTTCCTGTATAAATACAAAATACTCATTAAATTCAAAATACTCAATAAATGCAAAATACTCAATGCAAAACAGTAATCTAAATCATAGTTTTTAAGCATTTGTATTATATAGAAATATAGAAAAAAAAATGA:1	-	chr2L	19796180	5'	+	Penelope	619	1	77.40
CTCAATGTCAACTGATTTTTTGCCCCACTCGCATGTGTAGTGCTCATAAATTGAGTCAGTGCTCACCGCACAGATAAATCATCTTTTGTCTGGCTTTGGGTCTCGTGAGTTAATAAAAAACAAAAAAACAGATTTTCCGAAAGAGA:1	+	chr3R	30189079	5'	+	HMS-Beagle	443	1	70.55
AAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1	-	chr3L	17205268	5'	+	hobo	54	1	72.17
AATAATAATAATATCTTAATCTAAATAATAATAACAAAGTGGGTTTGTAGGTATACTGCGACCCAGTCGGATCTATTTTCCTACCCCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTATAA:1	+	chr3R	8690982	5'	-	baggins	5351	1	72.31
CCTGGCCCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1	+	chr3L	4755224	5'	+	jockey	4707	1	55.96
GACACACAATGACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1	+	chr3L	3799790	5'	+	copia	16	2	55.95
TTCTTCATGATTTGTTTTTACTCATTAGGATGTTTTAGCATTTGTATCCATTTTTACGCTCGTATGCGAAACGTTTGTGCAAATAGATTTAATTGTGTTTTTTTTTTT:1	+	chrX	10794224	5'	-	transib2	2643	1	56.48
AGGCGTCCGTAATCGATTTCTGCGACTCTGGGCGGGAATCGTTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1	+	chr2R	24218481	5'	+	412	8	2	76.30
CTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1	-	chr2L	14081412	5'	-	1360	3344	1	55.80
TATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr2R	20596539	5'	+	roo	40	2	66.67
CATAAATGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr3R	22955959	5'	-	roo	337	2	65.07
CTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACCTAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1	-	chr3R	18585668	5'	+	P-element	58	1	43.17
AAGGGTTTAACCTACAGAGCGAATCTGAAAAAAGTGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTATCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3L	4536812	5'	+	roo	20	2	61.29
ACATTTTTAGTTAGCTTAGCAAAAGCGTGAGTTTGATTTACAATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACACTTTTGGGCTCC:1	+	chr3L	11530858	5'	+	roo	8693	2	62.69
ATATCCGCCCTTTTTGCGTTACGCAAACTTAAGATTACATATTTATCAATTTTAAGAAAAAAATGTATATTTTATTGTGTACTAGGAAACTATTCCAAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTT:1	-	chr3L	10656349	5'	-	412	39	2	72.86
ACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1	-	chr3R	14049448	5'	-	transib2	2779	1	53.42
CTTAAAAACATGAACACATTTTTTGCTGAACTACAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTATTTTGCACAATGCCTC:1	+	chr3L	4605640	5'	-	pogo	2077	1	61.90
AGACTACTTACAGGGGAAGGGGAAAACTTAGTGACAGCAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTG:1	+	chr2R	16373487	5'	-	Max-element	279	2	52.38
AATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr2L	5254360	5'	+	roo	40	2	59.65
ACAAAAAAAAAAAGGAAAACGGCTGGCAAGGGGGCACCCCAAAAACAAAAAAAAAGAGAAAAAAA:1	+	chrX	2995374	5'	+	gypsy7	5004	1	60.00
AAGGGAATGGTCGAGCCGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTT:1	+	chr2R	1320634	5'	-	diver2	365	1	77.69
AATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCATACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTCT:1	-	chrX	2842565	5'	+	Tabor	6892	2	64.35
AGCTCATAGAAGATGAATATTAGAATATTAGTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr3L	22438003	5'	+	roo	8683	2	73.29
ACAGATTTCCCATATTACGTTGCTCACGTTGCTTATTTTTCTTTATTCATAATGTTGATGTATTTTTGTTTTCCTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTGTTTACTCCTCTTAGATTTGTTGCTATGTGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	13943897	5'	-	Quasimodo	40	4	77.40
AACACAGTTGTGGTTTTTTATATATTGTTAAACGTTTTTATTAATTTCAATAAAGGAAGAACTATGTTTAAAGACTCTTAATATTTGGATGCGTGACCTTTTGTTGGCAATGACAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCACCA:1	+	chrX	22905673	5'	-	Tc1	1287	1	58.90
TACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTG:1	-	chr2R	2868545	5'	-	Rt1b	4700	1	62.71
GAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1	-	chr2L	11518462	5'	+	412	7122	2	72.09
GGACGCATCCCATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr3R	22844304	5'	-	roo	9052	2	65.60
ATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTGCAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATGTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1	-	chr2L	15833072	5'	+	hobo	57	1	66.13
ACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2R	5248240	5'	+	1360	55	1	62.31
TCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1	-	chr3R	7482807	5'	-	412	424	2	81.60
CATCGACAATGAATCTTTCAACAGCATCGATTTCGATGCCGAAATCACAATTGCCGGCAGCAAAGAGCATGATTGTGAGAACTATATCTAGGACACTAAGCTACGTTCGGAACGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATT:1	+	chr3R	28701874	5'	+	F-element	4387	1	50.00
TATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	+	chr3R	16076803	5'	+	roo	8750	2	78.08
TGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1	+	chr3R	9038932	5'	+	Juan	4075	1	61.64
AGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1	+	chr3L	10848632	5'	+	blood	7040	2	59.35
AAAAGTGCTTTGAAAAAGTCAGTATTTTAATACCACTGTTTATCCAAGGCCACACGTCCAGCGTTGGACGACTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1	-	chr2L	542640	5'	-	412	455	2	63.01
TCCCTGTTGGAAGCTTTGTTAATGTTAAGTTAACATGACCAGAATTCGGAAAATTTCGCAACGATCAGTAACCAGTACATGATGAAATAACATAAGGTG:1	-	chr2R	24561545	5'	-	P-element	2886	2	75.76
ATTTTCGTAATATATTCAAGTAAATGGCACAAGGGTACTTTATGATAAAGATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1	+	chr3R	9456634	5'	+	jockey	4716	1	58.68
ACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACGTGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAGGCGGAGGTCTAAGTAAATAGTCCCCG:1	+	chr2R	19004197	5'	-	roo	8946	2	48.11
ATGCATTTGCCTCGAACGTGACATGACACTGACAGATGCAAAACGACGACCAGGACCCACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCC:1	-	chr3L	18326948	5'	+	I-element	4972	1	66.67
AGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1	+	chr3R	19446122	5'	+	297	6613	2	59.09
ATAAATGCAACTAATATACTAATGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chr3R	19450176	5'	+	roo	8706	2	47.48
ATTTATCTGCTTTTCATCATATATTAAAGAAATATACAATTTTTTTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1	+	chr3R	11105929	5'	+	Doc	28	1	38.76
CTATTCAGTTGAGACAAAAAAAAAATGAATGAATTGAAAAACAAAAACAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTTATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGAT:1	+	chr2R	4723309	5'	+	Tc3	1653	1	69.18
CATTAATGAGGAGCATATTCTAGCTTTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCACAACATTCGCATGGGAGATGCGCAATCGAG:1	-	chr2R	21920644	5'	+	jockey	12	1	77.40
GTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTG:1	-	chr3L	20033769	5'	+	blood	66	2	62.86
AAAGTAAAAGAAGAAGAAGAAGCAGCAGCAGCAGTCAACTTGCAACACAATCGTTGTTGCTTTTTGGGTAAGTGTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1	-	chrX	14824831	5'	+	jockey	4697	1	67.81
ATTTGGTTATTTTCTCAGCTTTTCTTGAGAAGCATGTGCGCTTGAGATGCTTATTGTAGTGATTAACAAGTTGTAATAAAATGCAGATATATATGTAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1	+	chr3R	6664905	5'	+	I-element	21	1	71.03
CAATCGCAGCCATACTGACAACCATCAGGTTGCGAGGCAACTTTAATTGATGTATATCTGCGTGGAATTAATAAATAATGAGTTTGAAAGTTCAGATTCGAGCAATGATTTGTCTGTATAATTGTCGAGATCTCAGGAACTATAAA:1	+	chr3L	23614816	5'	+	INE-1	146	1	74.66
GCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:2	-	chr3L	10574414	5'	+	Tabor	25	2	59.59
GTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr3R	17420408	5'	+	roo	8716	2	58.16
TGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACA:1	-	chr3R	10274034	5'	+	HMS-Beagle	68	2	65.52
CTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1	-	chr3R	20499859	5'	-	mdg3	5467	2	59.52
CGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTTTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCATCACAA:1	-	chrX	13066590	5'	+	jockey	70	1	57.24
CACAATAATTTATCAGTACGTGGATCACCGAAATTTCCAGCGCCTGAGCGCAGCAGTTCCAGCGAAGCGTTCATCTATCGTGTAATACAATCCGTGCGTAACATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTT:1	-	chr3L	12066608	5'	-	1360	216	1	52.05
GCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATA:1	-	chr3L	27415298	5'	+	transib2	78	1	70.55
GTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chrX	5643567	5'	+	roo	8733	2	69.66
GACTTCTGTCTGTGTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1	+	chr2L	1377652	5'	-	hobo	2913	1	63.53
AATGCTTGAAAAAGCGAGTAAACGGGATATAAGCAGCTAAAGAATATTCATGTGCCTCAATAAACCGAACAGAAAAGATGTCCTTTTTGCGCCAGGCACTAAATGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACAT:1	-	chr3L	2964362	5'	+	roo	8805	2	70.63
TACTTATGCATGGCAGAGTGGCGTCCGAAGGATTCGTAGGATGCGAACTAAAGAAATGCAGCCCGAAAGCTGAAGAGGCAGCTGGAGAATATTATCACAAAATAAATTTCTAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAG:1	-	chrX	4462459	5'	+	1360	397	1	58.22
TTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATCTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1	+	chrX	2842474	5'	-	Tabor	451	2	58.33
TATTAAACAAAATTATTGACTAGTTAAACATAATAAAACGATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	-	chr3L	233370	5'	-	roo	385	2	68.97
AACAATAAGACAAAAACAAAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	+	chr2R	11629699	5'	+	Tirant	8122	2	75.00
ATGCTTCCATTTAAGCAGAAGAAATTTCGGGTTGGCTTAATCGAATCGAAGACTAAAGGTGGACGAGCTCATTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCT:1	+	chr3R	29643313	5'	-	P-element	386	1	48.63
GGCCAATTAACGTCTAAGAGTGGTCGATTAAAAACTTGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCG:1	-	chr2L	8983302	5'	-	412	298	2	58.33
ATTCTTCCGGTGCGGCTACTGCGGCCCAAAACACCATGCTGATTTTCGCTCATAATCGGCTTGTTGCTGGCGACCCACTTTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATT:1	+	chrX	2084642	5'	+	Stalker	6839	2	78.10
GACAAGCGCGTGTCTATCCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1	-	chr2L	21891813	5'	-	mdg1	7407	2	59.70
TGGCATTGACAAAACGGTTAAACTTGTCGAGGAACAGGACTATAGCTTTCTCTCATGTTATACCCTTTACTCGTAGAGTAAAAGAGAATACTAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACATACATATTCTTGCTCAGGATCAATA:1	+	chr2R	5081142	5'	+	INE-1	84	1	64.38
ATGTGGAGCACGAAATCTTTTGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGG:1	+	chr2R	23332516	5'	+	invader4	54	2	59.59
GTAAACATATTAATCCAGTCAAGATCTAGCAAAACACCTTTTTGTTTATCTTCTTTTCCCCACAGTTGCATCGCGTAGGTCCATACTGGCTTTAGGACTGCTTTATACAGCCG:1	-	chr2R	5299114	5'	-	G3	4166	1	52.21
AATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3L	9998196	5'	+	roo	60	2	61.27
TATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCT:1	-	chr3R	18722952	5'	+	jockey	4755	1	70.55
CTAGATCTGGAAAAACTGTCGAGCCACCGCTGCTGGCATTCTAGTTCGATTTTCAATCCGGTAGCAGGTTCTGATCCTGGTGAACCAGTCACTTATTTTTTACTTTTTAAATAATTTGTTTATACTTTAGGTTCTTTTTAAAGTAT:1	-	chrX	16792116	5'	-	looper1	255	1	76.03
GCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1	-	chr3R	10182193	5'	+	blood	83	2	73.29
GTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr3L	9998198	5'	+	roo	54	2	58.70
ATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1	+	chr3R	6290980	5'	+	Doc	82	1	75.00
CATCATTTTCAGCACATTGCATTTATCTCGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAG:1	-	chr3R	5675886	5'	-	INE-1	89	1	60.64
GCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1	-	chr3L	10574414	5'	+	Tabor	6857	2	62.59
ACTGCAACAATAGCCACACCAGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGTAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCC:1	+	chr2R	25250008	5'	-	HeT-A	6029	1	71.79
GACATTGCTCTGTTTATATCCATACGTGTACTTATGTAAATATGTTCAATGAAACATTTTTTTGTAAAATGGAATGTGTAGATAGAAAAAAAAGTCCCCTTAGTTTTTCGTGTTCTTATTTTCTTTACATTCTTGAGAAAATTCAC:1	+	chrX	22509767	5'	+	HB	176	1	82.19
TAGCCGTCCTTTTCACGCACGGATGTAGGGGTGTGAAGTTTTTGGCATATTCAAAGTTGGAAAAGTTGCACTTTGAGGCTGCTAACCAAAAAATATAACTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1	-	chr3R	11084022	5'	+	412	5	2	74.24
CACTTCCTTGATAAACATTTCTTCTCGCTGACTGGAAAATTTTCATTCGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAATTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGA:1	+	chr2L	3164957	5'	-	412	7469	2	67.12
TAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chrX	10640005	5'	-	roo	355	2	50.68
GTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr2L	14772040	5'	-	roo	354	2	60.00
GACCATTTCCCATTACCGCGCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	-	chr2L	21400393	5'	-	mdg1	358	2	58.22
ACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCTCAGTTCATATGGAAGGTCAGACCAAAGACACTAGAAT:1	-	chr3L	22016845	5'	-	Tc3	317	2	71.22
TATCCCTTTCTAGACTTTAGTTACGAACCCCCTTTATCTTAAACCATAGACACCCATGCATGTTACGCCGCAGTTGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGCACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1	+	chrX	12074500	5'	-	412	7518	2	58.91
TTTGAGAAAAAGTCCATTCCTCAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGACGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1	+	chrX	17054226	5'	+	jockey	85	1	74.05
GTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	-	chr2R	9632184	5'	-	roo	8999	2	66.44
TCGTACATAAATCGAGTTATATATATAGCTGGGAGCAAGTTGACTAAAAGTTGGCGAGGGTACCTCACGTCGACACATTTTTCAAAGTGACACAACTCTCTTGAGCTGACAAGCTGCAAACTGATATATTTTATTAGTTCAAGTAT:1	+	chr3R	30255517	5'	-	G7	1165	1	60.27
TACTACCCAAAACCAATCTTACCAAACGTAGGTAACCAACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTC:1	-	chr2R	1574955	5'	+	1360	390	1	71.72
ATTTGAAAATATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	-	chr2R	18336262	5'	-	roo	9038	1	60.74
AATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1	+	chr2L	21367201	5'	+	Doc	33	1	54.40
CTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACCCATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTT:1	+	chr3R	25826660	5'	-	mdg1	7403	2	53.42
CAGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr3L	9998012	5'	-	roo	396	1	45.52
GTAGCATTTTTCCCCATCCGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGGATGGGCCTATGCAATATTAAG:1	-	chr2L	18419286	5'	+	412	6	2	74.07
CGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTG:1	+	chr2R	20596442	5'	-	roo	377	1	57.69
ATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1	-	chr2R	16373549	5'	+	Max-element	18	2	56.32
ATAGTGGTGCAAAAATGGGTATTTGCTTCTTGTTTCCCATTTAAGCGACGAATAACATAAGCCACGCACACAGATGCAAAGCACACGCAGCCACACAAACGATACACATGCACACACACACACACACAC:1	+	chr3L	16510510	5'	+	accord	181	2	51.94
ATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	-	chr3L	15600342	5'	-	roo	385	2	49.60
GGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTAACACACACACACA:1	-	chr3R	25454131	5'	+	Quasimodo	30	2	51.37
CATGCTGTCAATAGTCGAATAACCAAAATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1	-	chr3R	19529223	5'	+	jockey	4678	1	53.24
TTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	-	chr3R	18582240	5'	+	roo	8732	2	67.12
TTTGGTGAAAAGTAATATTTAAATATTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1	-	chr3R	11496651	5'	-	1360	3367	1	70.50
ATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCTGATCTATT:1	+	chr3R	14981184	5'	-	mdg1	329	2	79.45
GACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1	+	chr3R	9921968	5'	+	blood	54	2	57.53
AAATGCCTTTTAATTAGATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr3L	20831421	5'	+	roo	18	2	73.29
CGTTAGTTCTAAAATAATAAATCAAGTACTTTTGAATGTAGCCATCAGACTTTTAAATCTATTTAATTGCGTGGTTTAAAGATTTTGAAACAATTTTAGTTGTGAATTGGGAATTTGTTGTTTTTTTTTTTAATA:1	+	chr3L	5390215	5'	+	hopper	153	1	42.22
TCTTTTTTCGACTGTCTGCTTTTATTCTCGTATTTTCCCCTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1	+	chrX	3310494	5'	+	hopper	139	2	81.03
GCCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1	+	chr2R	12835062	5'	+	jockey	85	1	78.46
TTTTTCCAGGTCAGGTTTTCGGGTATGGATCAGTAACATAATCTTGAATGTGTTCATGTGTTGAATTAAAAAAAATTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACC:1	+	chr3R	25878142	5'	-	G2	2810	1	52.90
ATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGTCCAAAAGATCGT:1	-	chr2L	9399566	5'	-	Transpac	5191	2	58.62
CTAGCGGCAAAAGCTCCTATGTACTTCGTATCTGCAAGATACTTTTTTACATTTTCCTGCTTTAATTACACAAATTCTGGTTTATTACAAACGATCGGGGTTCTTGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATC:1	-	chr2R	9544172	5'	-	opus	7490	2	76.71
CTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACCTTGTTGCTATGTT:1	+	chr2R	13585445	5'	+	412	59	2	79.05
CAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAGAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1	+	chr2L	14081300	5'	+	1360	29	1	55.46
GAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1	-	chr3L	20033789	5'	+	blood	7047	2	46.15
TATGACAAACCATTTATCCTGCAGTGTGATGCTTCACTACATGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1	-	chr3R	524108	5'	+	blood	7048	2	63.73
GGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1	-	chr3L	16015345	5'	-	1360	3358	1	57.78
AGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACA:1	-	chr3L	20168424	5'	+	mdg3	89	2	76.55
GAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:2	+	chrX	5643459	5'	-	roo	9026	1	53.42
GAAAGAGGTTGGAAGAAATTGAATTTCTTTTGCACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAGCTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1	-	chr2L	1665075	5'	-	hobo	2924	1	68.42
TGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATATATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr3L	22437938	5'	+	roo	82	2	72.92
TCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGGCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTT:1	-	chr2R	16248017	5'	+	BS	39	1	49.29
TAAGTTACAAAATATATTTCGTTAAAACGAAAAACGAAAGTTACCGGGTTCAAAATTAAGATCCGGTTTAGCGGGAAAAGTATTTAAATTATGTTAAGAATAAAAATATTTTGTCGTGCTTTGACGTGATCTTTTTTATATTTA:1	+	chr3L	18128715	5'	-	transib4	2581	1	69.44
TATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAA:1	+	chr3R	22388963	5'	+	G2	2637	1	55.12
CTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACT:1	+	chrX	10521643	5'	+	Tabor	75	2	66.44
AAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	+	chrX	14336436	5'	-	roo	400	1	59.09
ATTGGCAACATTGCTGCGGCCTTAAATGTTGATGGCAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1	+	chrX	2517997	5'	-	P-element	2869	1	70.45
AAAAATAAAAAAAATGGGGGGGTTTAATTAAAAAAAAGGAGAAAAAAA:1	+	chr2L	7026646	5'	+	Porto1	4431	1	60.42
GAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGATTCCGAGC:1	-	chr2R	5173214	5'	-	Stalker	7225	4	50.00
CATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTTAAATCGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAGGT:1	+	chr3R	17817917	5'	-	roo	8983	2	75.89
CTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1	-	chr2R	9632215	5'	-	roo	9031	1	57.24
AGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	+	chr2R	9328576	5'	+	roo	8672	2	72.32
CAGCTACACATGCAGAAGAGTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTGGTCCCACATGGTCCCACACCGCAAATCAATTGTTATATGGGTCACTACAT:1	+	chrX	21585245	5'	+	mariner2	272	1	62.33
TTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTA:1	+	chr3L	24213778	5'	-	invader2	172	2	69.18
AATCAAAGTTAATGGAAAGCATAAAATCAAAATTTAATCCCAAAGTCCATTCTCAATAGAGCTAGTAAATTTGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTATACGCACGGGCAAG:1	-	chr3R	26275309	5'	-	accord	7187	2	49.32
GGGAAAGTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGACGACTTTAC:1	+	chr3R	7835086	5'	-	roo	402	1	74.17
AGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr2R	14387941	5'	-	roo	325	2	71.92
AAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	-	chrX	9540093	5'	-	roo	332	2	75.18
AACTGACTGTGTCTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1	+	chr3L	10574270	5'	-	Tabor	7276	2	49.32
AAGTTCCAAAATGGGCCAGATAAATACTGCTAATATCGAATGCAATTCAATGAGGAAATAGTAATCAATCAGTGCTTTTGCCTTGGGCTGTTATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACC:1	+	chr2L	12555157	5'	-	baggins	5418	1	54.69
AAACAAGAATCACTCATGAAATATGTTCTATGAGGCTTGTTAGGGAAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1	+	chr2L	6622913	5'	-	Burdock	6356	2	60.84
CTTCTGAAAAGATCTATTCTAATAACAGAAATTGCAAACAAAAAAAAGAAAAAAAAAACAATCAAAAAACAGAGAATGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCACT:1	+	chr3L	11837979	5'	-	1360	133	1	69.90
CCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTC:1	+	chr2L	21325112	5'	-	invader4	257	2	70.15
GGTGCGGTTTATTGGTTTGTAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACGGTACCTATAAGTACACAGC:1	+	chr3L	10848608	5'	+	blood	7039	2	66.44
TTTCATAGAATACGAATGATATGGTTTCCAATTTATTATTATTTATGATTAAATGTTAAGCCTCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACC:1	-	chr2L	4952102	5'	-	Quasimodo	6950	2	51.97
GCACGCGAACGTAAGTCCTTCGGGGTCCTTGGGGCTCTTGGTGTTCAGGGTAGTCCTTGGTAGGACTTGGGCAATCAAAGTTTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	+	chr2R	13817600	5'	-	412	480	2	71.31
TATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chrX	5643466	5'	-	roo	355	2	55.48
ACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTT:1	+	chr2L	10037315	5'	-	Quasimodo	7345	2	63.00
CCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1	+	chr2L	11518411	5'	-	412	443	2	67.27
CATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTAACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chrX	5643485	5'	-	roo	9001	2	66.90
GTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chrX	6486794	5'	-	roo	342	2	67.14
AAGCTGAAATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCATAGCTGCCTCGAGAACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1	+	chr3L	12861726	5'	-	pogo	2036	1	71.76
ACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCG:1	+	chr3L	19013920	5'	-	invader3	234	2	58.82
AATAGTGCAATTTAAATAAATTTTCACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAA:1	-	chr3R	27948577	5'	-	mdg3	243	2	32.18
AATACAATTAAAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATCAAAT:1	-	chr2R	15064476	5'	+	412	17	2	70.29
ACGAAAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1	-	chr2L	16016426	5'	+	412	7105	2	53.42
TTTTATCGATCCGATCCGAGAGCCCCTTCTTTATTATAGTTGGCGAGTGTGTATGTGTGTGTACGTGGCAATTGCCACATACAAATACAGACATATATAGGGGGTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTG:1	-	chr3L	17081475	5'	+	R1A1-element	72	1	59.29
AATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1	-	chr2L	21884596	5'	-	pogo	2034	1	70.80
ACTAATGTTATATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1	+	chrX	21509942	5'	-	pogo	2079	1	81.54
AGAAACTATTAGAATTTCAAAAAGAAAGCTTACTCTAGTTGAAAATAGTTTTTTTTTTAGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCT:1	-	chrX	18478662	5'	-	I-element	5297	1	59.59
CCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTA:1	+	chr2L	19310315	5'	+	Juan	4125	1	52.74
TTCCACCAAACTGCTTCTTGGGAGTCCGACGGATATCCTCTTGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTAC:1	-	chr3L	17678232	5'	-	mdg3	5254	1	69.44
TTATTTTATTATTTTTCCACCTGGTTTCGATTCAATGCTTATTTGGTTTTCTAATAGTTTGCTTAATATACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATA:1	-	chr3L	14165094	5'	+	BS	4834	1	55.48
AAATGTTGTTTGGTTATGCAGCCAGCAGCAGCTCATCATAAATTTGAGTTATTTAATTTATCACTCTTATAGCTATACCGGTTACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGG:1	-	chr3L	25996452	5'	+	1360	26	1	56.16
AAAGAAAACTTCATTTCAGTGAGTCAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATGTGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGGGCGAGAGAGCGAAGAGCG:1	+	chr2R	4262577	5'	+	1360	107	1	76.26
CCAGAAATTTTTATGATTTTTCTATGCAAATTTCCTTTTTACGTTGATTTTTTTCAAGTGCCGCACAGGTGGCTTATTTAATTTATTTTATAGTGAACATTTTTTCCTTTTTTAGAAATATATA:1	-	chr3L	428402	5'	-	TART-C	11034	1	70.16
TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGCTATGTTAT:1	+	chr2L	23069854	5'	-	gypsy	446	2	73.81
AGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1	+	chr2R	12835023	5'	+	jockey	32	1	61.54
AATATTCTAATTCAAAGTATACATGTTCTTATTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATTTGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGA:1	+	chr3L	17945183	5'	-	Juan	4127	1	77.40
GCAGGCAATGTTATTATGCAACCATTCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1	+	chr3L	4840695	5'	+	jockey	4676	1	76.92
GAGGAGCATGTATGAAACGAATAGGATGCTAACCCCCTCGCGTTGCAATTTTGCCAGCCCGAATTGTGGGTCAGTTAAGTGGGAAATGTTGGAATGGAATTAAGTACACTCTATTAAGAACAATCATAATAATAATATCATAATAA:1	-	chr3L	18756233	5'	+	invader3	5048	6	62.33
CAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCACGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATTGAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1	-	chrX	23280917	5'	+	G-element	26	1	51.92
GCAGAGGAACTTTAAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chr2R	14387927	5'	-	roo	339	2	62.33
GCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1	+	chr2R	20496895	5'	+	blood	7057	2	52.08
CTTCATACTTTAACATTGTTTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCT:1	+	chr3R	22388923	5'	+	G2	2611	1	78.01
CGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAG:1	-	chr3R	27424914	5'	+	blood	7111	2	73.10
CAGGAAATGGCAAAAGGGCGGAGAAATCCGGCAGAAGAAAGCACAAACATGTTATAAAATGCCTCAATAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATT:1	-	chr3R	11494340	5'	-	1360	386	1	53.42
AGCAAATCCCCGAAATTAAAACTTGGCAATTGAAGATAGTTTCTTAGTCGGGATGTAAAATGTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTT:1	+	chr2R	9854312	5'	-	Transpac	422	1	54.74
ACATGTGCGCCATCTAGCGACAGTTTCAATAATAGCTTCGACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr2R	9868656	5'	+	roo	22	2	62.18
ATTCATTGTCCCTTGAACCCAAAAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1	+	chr2L	2687351	5'	+	copia	76	2	68.49
ACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCTCCACGCACATCGCGGGT:1	-	chr3L	7188603	5'	+	hobo	69	1	73.85
ATACAACTAAATAATTTATGGCCCGGGCAAAAGTTGAACTTTCCAAGCAAGATATTCTATTCAAAATGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGA:1	+	chr2L	7486977	5'	-	FB	713	1	55.07
AATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAACTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr3L	21817975	5'	-	roo	345	2	62.07
AAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTGCACACATGAACACGAAT:1	-	chr2L	5254361	5'	+	roo	8664	1	62.67
TTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chr2R	14388037	5'	+	roo	8691	2	61.24
CCTGACAAGTGAATGAAAGGCCGAATGATGATGTCAATCTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATT:1	+	chr3R	10546063	5'	-	hopper	1375	1	54.79
CTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1	+	chr2R	13585432	5'	+	412	7140	2	77.40
GAGAAGGAACAACATATGGGAAATCGAAGGGGGTGGTAGGAAACTAACAACTAATCTCTCATCAATTCGTTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTC:1	-	chr3R	3736421	5'	+	1360	3226	1	55.48
TAATAAATGCTTAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAAAGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGAT:1	+	chrX	22633224	5'	+	INE-1	79	1	48.63
TCCAATTACTCATACCACATAAAAATTGAAAATAATTATTCGCGGAGCAACGGAAGATTATTATTTACGTTGAGAGAAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCTTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCGTTGTGGTCTGGC:1	-	chr2L	18689250	5'	-	Gypsy6A_LTR	253	1	72.41
AAGTTCTTTCGTCTCCTCTTTGTTCTTTATTGCCCTGACATAAAACCGGCGCATAGTGACGAGAGAATACCCTAGAATCGAAACATGTATGAATAAAATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCA:1	-	chr3R	3267450	5'	-	Quasimodo	7242	2	69.47
ACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTCGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAG:1	+	chr3L	27356083	5'	-	Tc3	1663	1	62.39
CTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1	-	chr2R	16373525	5'	+	Max-element	55	2	80.00
ATGCCATGATCAAGGCGTATGGAAGGTGTGGCGATGTGGACACCGCCTACATGCTGGCCGACGAAATGATGGAGCGCCAGCTGGAACTAAAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGAC:1	+	chr3L	5137256	5'	+	Gypsy6A_LTR	356	1	73.95
GTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1	-	chr2L	1377697	5'	+	hobo	57	1	73.04
AAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1	+	chr2R	11629733	5'	+	Tirant	34	2	58.91
AGCGGGCTTTATTATACAGCCTGTTATTATTTGCCTGTGCGTGACAATGGGTCACTGGGGGCAAGACAAGCAAAAAATACTTGTCCACATTAGTTTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1	+	chr3R	26685967	5'	-	Juan	4186	1	65.73
GCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACG:1	+	chr2R	9091844	5'	-	1360	3335	1	65.32
ATGTGCTCACGAACTGGCTCTCGCCTTTTTTTTTATTTTTTTTTCATTTT:1	-	chr3L	16834436	5'	-	F-element	4686	3	90.00
GAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1	+	chr3L	21855460	5'	-	blood	7315	2	73.13
CAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTGC:1	-	chr3L	5102485	5'	+	BS	4746	1	76.26
AATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATACTTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTG:1	+	chr2R	4260433	5'	+	micropia	5209	1	48.46
AGCGTTTCCTGCGAAAAGTGCGCTGCATAAGGAATTTTATTAAGACAACTGCAGCATGGGAAGTGGATGTGGAAGTAGCTTCGCAGTAACAATTTGAAGGACCACCTTTTTTCCTCTCCG:1	-	chr3R	26653215	5'	-	HMS-Beagle2	6724	1	76.67
ATTGATAGAACTATTTCGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chrX	2444444	5'	-	roo	346	2	63.57
TATATGGTCAATTATAAAAGTGATTTATGTAAAATTGTTAATCATCTGGCATTTTTATGGAAATATATGCTTGTGATTTGAGGTTCATAAATATTTAAAAAAAAAATATGGGGGCTGCATAGTGCAAAACCAGTGTATGGCCGTTA:1	+	chr3L	10701950	5'	+	1360	3362	1	76.71
AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAG:1	+	chr2R	2007459	5'	+	1360	53	1	48.92
AGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCAGCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACA:1	-	chr2R	5173233	5'	-	Stalker4	407	1	72.00
AAAGGACTTCCCTCAAAAATCCCGCTTGGTTTGCGAAAAAATGAGAGACTTCAAGGACTACTGGGATTCCTTCGGCACGACAATACGGACAAAAATTGACAACATCAAAGAAAAAGGCAAAATACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:1	+	chr2R	4860148	5'	+	INE-1	11	1	73.79
ATCTGGTTAAGATAGTGGGTTATATTATAACCCTTTGTTAGCTCAAATCAACTAAGCTAAACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1	+	chr2R	19499260	5'	-	P-element	2874	1	74.83
GCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCATTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1	-	chrX	2518115	5'	+	P-element	69	1	35.17
AGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTG:1	+	chr3L	24213775	5'	-	invader2	182	2	65.47
CAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTT:1	+	chr3R	17243143	5'	+	hopper	56	1	71.56
CAACGTTTCACACGCTGCAAGTGGGGGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCAGCAGCAACAACAA:1	+	chrX	6054619	5'	+	Max-element	269	3	80.00
AGAGATATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chrX	13039578	5'	+	roo	13	2	72.81
TTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1	-	chrX	1899703	5'	+	P-element	38	1	47.32
GGATGGTGCCACAAATCATTCAGTGGCATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	+	chr3R	7482691	5'	+	412	16	2	73.10
AAAAAAAACAACAAAATAATTATTTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTCGAATATATATGTATCGAACATATGTATATATCGAACATTGGCAGTGCTAGAATAAACAATAAAGTTCAAGTGG:1	-	chr2R	22201875	5'	+	gypsy11	111	2	54.68
GTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1	+	chr3L	27415230	5'	-	transib2	2747	1	71.23
AATATCGAAAACCACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTC:1	-	chr2R	23332624	5'	-	invader4	264	2	64.38
GTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGA:1	+	chr3L	11474689	5'	+	gypsy	142	2	69.52
GAACATGCAAACATAAGGCCACCATACATACACTGCAAATTGTATCCTAAACTAAAGAATATGCATCTCATTTTTCTAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTCATGTGTGGCGATTATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTG:1	+	chr2R	19534552	5'	+	HB	10	1	53.42
AATGGTGGCCCTGCCTAATTCAAATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATTGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGC:1	-	chrX	13066637	5'	+	jockey	5	1	79.69
ATTTGGAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1	+	chr3R	9921945	5'	+	blood	31	2	64.38
TACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAG:1	+	chrX	15408736	5'	+	INE-1	566	1	86.30
CTTTTCAGTTTGTTGTGACTGAAAGAATCCCATTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAAATCCAAATAAGAAGAC:1	+	chrX	13039848	5'	-	roo	407	1	74.66
AATAAATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTAT:1	-	chrX	10201222	5'	+	transib2	55	1	61.83
GAATCCGAGTTGTGTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGTGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1	-	chr2L	15875852	5'	-	hobo	2902	1	58.57
CGACAGTTGCCAGGCTGTAAATAAAATTTAATGAAATGATACGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTG:1	+	chr3R	12854326	5'	-	Quasimodo	302	2	66.40
CTGGTTAAGATAGTGGGTTATATTATAACCCTTTGTTAGCTCAAATCAACTAAGCTAAACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1	+	chr2R	19499262	5'	-	P-element	2875	1	75.00
AAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACATCACCTTGATATGACAACCA:1	+	chr3L	18368945	5'	-	opus	7448	2	78.70
AGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	+	chr2R	16945288	5'	+	jockey	74	1	62.33
TCAAAACAGCAGTTGATTTCGTTTAAACATATGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAAT:1	-	chrX	22838788	5'	-	INE-1	536	1	59.31
TGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1	+	chr3L	15519743	5'	+	pogo	45	1	54.81
TGAGGAGACTTTGCTTACGATCTAATTTCACATGCTCAGAGTATGTATGTATAGTTGGGGGGGTGTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1	+	chr2L	1517604	5'	+	jockey	4687	1	63.27
ACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1	+	chr2R	981625	5'	+	1360	36	1	60.45
TCATAATTTTTGCCCTAGTTCAGTGTCTATAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTATTAATTTTATTCAGTAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCC:1	+	chr3L	19341543	5'	-	Tc1	205	2	73.94
CAGCTAGTTTCCTTTCCTTTTCATTTTTCTCTTTTACCTTCAGGACCAGGTGTTCTTCTAACCACTTTGAATAAACTTGTGAGGAGTTTTAAAACTCCCCATAAATCTCGTGT:1	+	chrX	2550483	5'	+	gypsy8	4664	2	61.95
ATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTCTTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1	-	chr3R	15364017	5'	-	flea	4953	1	60.96
CTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	+	chr2L	16091913	5'	-	roo	8992	2	72.60
GTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTT:1	+	chrX	13704777	5'	-	invader4	3010	2	73.29
CTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr3L	19334350	5'	+	roo	8718	2	60.96
CCATTATTTACAAGTTTGAAAATTGTTCAACTCCGCTGTCGACCTGTAAATGGTTTTAGGTAGCGTGCCGTCGATCGAAACCTTACTTCATCTAAGGAGTTGATGCTATTTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTC:1	+	chr2L	22092812	5'	-	G5A	2685	1	67.81
TGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr3R	25448419	5'	+	roo	8743	2	71.23
AAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTCACATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chr3R	28624579	5'	-	roo	332	2	71.43
CCCAATTAGCCGCATTTAAAATTTAAAATCTTTGCCAAAATGTCGGTGGTGCTGGCACAAACAACAGAATACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTCATTTGTAAGTCTCGGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATACC:1	-	chr2R	21787505	5'	-	Doc3-element	4424	1	52.74
GCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACG:1	+	chr2R	23466033	5'	+	Doc	485	1	58.11
GCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGAATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAATAAAATAGCATAT:1	-	chr2R	9662786	5'	+	412	29	2	57.14
ATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	+	chrX	14336420	5'	-	roo	9005	2	67.14
GAGTAAAAGGATATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGACAGAAGGAAGTGTTTCCGACTATATAAAGTATATATGTATATTCTTGACGAAATTTCACTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGG:1	+	chr3L	23746964	5'	+	INE-1	551	1	80.14
GAGCGAGGGCCAAAAAAAATTTGCATAATTGCGTGTTGTGAGAGAGGCGAAATCGACAGGTGAACCAGGCAGATGAAGATTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGC:1	+	chr3L	21401586	5'	+	roo	8768	2	53.79
GTTTTTCCACTTTTCCACTTTCTCTGCCTTTTCGGCCACCGGAAACGACCTTTTCTTTCTGCATAATTTCGGGAAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTA:1	+	chr3R	6524792	5'	-	I-element	5341	1	72.48
AAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTANAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1	+	chrX	14336436	5'	-	roo	9029	1	70.00
CATTTACATTTAACATTTCTAGCAATTGCGTGGTTCTACTTCCCCCGCTCCTACCCGCGAACAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGC:1	+	chr3R	11290616	5'	-	invader1	3695	2	66.34
AAATCAAGTACTTTTGAATGTAGCCATCAGACTTTTAAATCTATTTAATTGCGTGGTTTAAAGATTTTGAAACAATTTTAGTTGTGAATTGGGAATTTGTTGTTTTTTTTTTTAATA:1	+	chr3L	5390233	5'	+	hopper	153	1	45.30
GTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGG:1	-	chr3R	11547826	5'	+	G2	290	1	73.97
AAAAAAAATTTGTAATGATATAAAAAGGGAAATTTATTTACAGAGCGTTAATTTATTAAATGTTGTATCCCATACTTTCAAATGATTTTTTTGCGAGGTATAGACCTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGA:1	+	chr3R	14938601	5'	-	jockey	4858	1	71.92
CCACACATGTAGAGAAAAAGTTTGTCACGCTGTAAGACAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	+	chr3L	15600120	5'	+	roo	8668	2	65.75
TTTATGGAATATATTTAAATTTGTCGCTGACCATACATATTAAAGTCAAGAAATTTCTAGCATCCTACTATTCCATAAGCTAAGGCCAGCCTTTACTGCAAAAATTAACGTTTGGATAATAAAAAAAAATAACTTTAAAAA:1	+	chrX	16295499	5'	-	1360	3093	1	52.48
TTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3R	18339117	5'	-	roo	324	2	78.83
AAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1	+	chr2L	13763133	5'	+	pogo	46	1	54.11
AAACAACTATGTATGTTTGCCAGATTCGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTG:1	+	chr3L	16750681	5'	-	Tirant	327	2	81.60
GATATTCTTCTCATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	-	chr3R	17818013	5'	+	roo	8671	2	76.67
AAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr2R	19004220	5'	+	roo	56	2	65.89
CATTTTAAAATACAACATTTTCTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAGT:1	+	chrX	9539977	5'	+	roo	8664	1	80.00
TGTTGATTTTGGTTGGTTCGGTTCATTACAAAAGTTTCGCCGCAACAATATTTCATGTTTATTAATGGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2R	18349414	5'	-	roo	9021	2	51.37
TACATCTCCATCGCCATCGCCATCGCCATCGCCATCGCCATCGCCATCGCCTTCCACATCCGCATCTCTATTCGCATTGGTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3L	4973684	5'	-	roo	8997	2	51.82
ATTAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chrX	10640003	5'	-	roo	9021	2	50.68
TGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr3R	22955965	5'	-	roo	331	2	69.18
ATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATATAAATTTATA:1	-	chr2R	9500059	5'	+	G5	4755	1	55.48
CCATCCAAGTACATTAAATACTTTTGTAGAGAGTTTAACTAAATGTGCCACACCCTTTATATTATTGATCAAGATCAATAGACGAGTCGATCGTGCCAAGTCTGTCTGTCCGTATTAACGTCGAGATCTCCGGAACTATA:1	-	chr2R	5186724	5'	+	INE-1	144	1	67.86
CAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr2R	9632073	5'	+	roo	8680	2	68.29
ATTTGGATATTTTGACAAAAAAAAGTCATGCGATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1	-	chr3L	17558151	5'	+	jockey	4677	1	80.14
ATTCAACTAAAGAATGAAAACTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr2L	12250029	5'	+	1360	37	1	47.06
GGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	-	chr3R	19968167	5'	+	roo	76	2	82.31
GGGTTAATTACTTGCTATGGGTATAGAAAAGTTGTCCAGAGACTTTTCGTATTCAATACACATAATGTGATTAAAGTATAACTTTTCCTAAAGTAAATAAATAAAGTTGGTTTTTGGAAGTTTAAATAATAAATACTAATAATAAA:1	-	chr2R	14457724	5'	+	flea	5003	2	73.29
ATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr2L	16091968	5'	+	roo	88	2	80.14
GATTTCTTGTTTTTAGATCTGATACTAACTGCTGCGCATTGCGTAACGTCCAACTCAAAACTGTAAGTAACTGCTCAAATCGATGAAAAAATCTTAAATGAATAAATGTTTATATTT:1	+	chr2L	14768945	5'	+	Tc1	59	1	33.33
CCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chrX	17526830	5'	+	roo	56	2	58.90
ATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAA:1	-	chr3R	2520349	5'	-	Tc1-2	1605	1	59.59
TGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr3R	14364674	5'	+	roo	8746	2	76.92
AGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:1	+	chrX	2842476	5'	-	Tabor	7274	2	51.37
ATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1	-	chr3R	31817564	5'	-	roo	9033	1	60.96
GTACATACATACATATGCATGTATGTACATTACATGTACATACATACCGTATAAGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACA:1	-	chrX	16243143	5'	-	INE-1	31	1	55.95
GTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGT:1	+	chr3R	9714359	5'	+	Stalker	40	4	58.22
GGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1	+	chr3R	25339962	5'	-	mdg1	7405	2	54.11
GAACCGTGTTGCATTTATTTTTGTACTGTGCCGTCGCAAAGCACAAAACACGAATTGCCATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1	-	chr2L	18339113	5'	-	pogo	2084	1	72.60
CATTTGGAACGGTAGCCGCACTTCATACAGAATCATGAATGTTCGCATAATTGGCAGAGTTTTATGAATCTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAA:1	-	chr2R	9258555	5'	-	3S18	290	2	50.68
GTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1	-	chrX	13066584	5'	+	jockey	37	1	51.40
TAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3L	4536715	5'	-	roo	323	2	73.97
TATTTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1	-	chrX	6522082	5'	+	F-element	56	1	52.05
CATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCG:1	+	chrX	6499849	5'	-	Quasimodo	237	2	58.33
ATCTATCGCCGGCTCATCTCTCCTCTAGCGCAGCAGCCAATTAATTCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAG:1	-	chr3R	6146552	5'	+	F-element	4463	1	61.86
CTTCTTGGCGTCAGAATTTCAAGTTCGAAACACTTTATTTTGTGGCATACAAACAGGATTTTAGGTAAATTTCGTGAACTTTTTTAAAAGGTTGAATAAAACAATGTTGTATGTATTTCCCAATCTATAGATATCCCAGAAAAATC:1	-	chr3R	12363731	5'	+	INE-1	502	1	73.97
TCTACGAGACACGTATCCTTCGCTGTGAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1	-	chr3L	11957229	5'	-	blood	7374	2	66.06
ATTTGTTGGGTATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACACCCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr3L	23773148	5'	-	roo	9055	2	52.74
TTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTG:1	+	chrX	2842498	5'	-	Tabor	7266	2	61.36
AAGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	+	chrX	17526807	5'	+	roo	8697	2	50.68
AGTGGAATGGAGTGCTTGGTACCACGGCGGGGATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr2R	13084562	5'	+	roo	8681	2	69.35
AATATATGTATTTTGATCAATTACAGACTGGCATAGGATTGTACAATTTCTAATGTGTCTATGTTATGAAAAACCAAATCTATAGATATAATGACATTTAGACACATCCTTAAAAATGTATGTAAATATGTATAAAT:1	+	chr3L	22131640	5'	+	invader3	5086	1	56.93
ACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGGGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	-	chr2R	16785403	5'	+	412	66	2	71.88
CTGCAATACAAACACACTTTGGAGACTTACTTCACTCCACACACACACTAATACCAACACACATTAAGTCATTTGACTTAGAGGAAGGAGATAGTGCGGCGGAGC:1	-	chr3R	4565291	5'	+	gypsy8	405	1	60.95
GTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGACATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATA:1	-	chr2R	2427625	5'	+	Doc	36	1	54.40
TCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1	+	chr3R	26431963	5'	+	opus	7156	4	55.65
CTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chr3L	22437968	5'	+	roo	27	2	59.66
GTGGGGGGTGGCAGGTGGAAAAGCGGTTGGTGGTGACCTCGACCAAGAATAACCCACATGCCGCGGCACCAACATTCACTATGTCCAACTCCCAAACTCACCACATGCAATGTTAAACTCTAAAACTCAAATTATTGTACCTATAT:1	-	chrX	20806701	5'	+	TAHRE	10340	2	50.68
TTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTCACTTCATTTTTTTTTTTAAGGAAAAATAAAGAATT:1	+	chr2L	13584674	5'	-	pogo	2015	1	76.43
CAACGATTTAATTAATTTAAAATATTAGTTCGTTTTTTTACAGATCGAATTTCTAGTTTATGAAAAATTCGCAAATCTCCACAGAATTAAAAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTT:1	+	chrX	14593172	5'	-	Transpac	4881	1	59.59
ATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr3R	19968098	5'	-	roo	399	1	65.96
CAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1	+	chr3R	7835095	5'	-	roo	9039	1	59.12
AAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1	-	chr2L	14081393	5'	-	1360	3354	1	59.63
AAACAAAATTGACAACATTGGAGATGTAGAACGGGCCGAAAAAGTGTATTCAATTTGGGAATCTCTTAAAGCCGGAATGCATCAGGCCGAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1	+	chr2L	20140222	5'	+	jockey	4669	1	69.70
AAATCGTAGGTTTGGCCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGACTTACATATATAGACGGCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1	-	chrX	12074660	5'	+	412	7130	2	71.53
TTATCTGCTTTTCATCATATATTAAAGAAATATACAATTTTTTTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCACTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1	+	chr3R	11105931	5'	+	Doc	47	1	47.26
GTGTGACCAACTTAATTAAACCAGCACAGAAAGAGACACAAAGACGCGAACAAGTGAACATTCAAATGGGAGCCGCGATCGCGGAGGGGGGGTTTTCGTTTATTTTTTTTTCTCATTTTT:1	-	chr3R	16946701	5'	+	INE-1	472	1	76.67
GTGCTAAGGCCTAGTTTAAAGACAACTTTAAAACCAGTTTAATGGAAAAGAACTTATCGAATCCAATGATTAAAATATAAATTTCGGTAATAGCAGAGTATTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGG:1	+	chr2R	22014635	5'	-	F-element	4390	1	69.18
GAGGCAATGTTATTATGCAACCATTCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1	+	chr3L	4840696	5'	+	jockey	4690	1	67.69
ACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAG:1	-	chr2R	5206898	5'	+	G4	3730	1	71.43
ACATTGCTAAAATTAAGTCGGTCTAGTAAAATGACTTGCTTGACTTACTCCCCTCAGCGTAGTAAATAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGG:1	+	chr3L	22532205	5'	-	Cr1a	4223	1	77.93
TTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1	-	chr3L	21855520	5'	+	blood	77	2	71.23
GACACGGACTCTTCCCTCACATGGCCGCCTTGGGATGGACGCAGGGCAGTGGCTCCAAGGATCAGGATATAAAACAAAAATCGTAGATCAACGAAGGCCAATAAATAAATAAATAAAA:1	-	chr3R	13040963	5'	+	Juan	4215	1	55.93
GTAAAACAAACACGTTTCCATTAAAAAGTCTGCGTTTGATGGCAAGCCAAGAAATTCGGTGTATGTAGGATGATGAGCCAAACATTTTAATAATAGCAGAAAAGGCTGAATGCCCAAAAAACCGAACCACGCCATCATCTCCGCCC:1	-	chr2R	19074584	5'	-	transib4	2512	1	52.74
AGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1	+	chr2R	16891829	5'	-	hopper	1353	1	58.22
CTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chrX	8197933	5'	-	roo	345	2	63.70
ATTGTTTCGAATTATTTACATAAAAATTGAGAAATTGAATGCATGCAATGGATTTGATTTGTTTGCCTCGCGATTCGATTTTCCAAACGTCTCATATACTCATGCACATAGCACATACGGGCAACTGGACTATAGCATTATCTCTT:1	-	chr3R	13335153	5'	+	INE-1	577	1	66.44
TCATTTTGAAATGTCTTTTAACTTTGCTGTACGTACAACTGAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTATTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCAAGAATGGAA:1	+	chr3R	4159719	5'	+	Idefix	6947	2	70.55
TATTTATTAACTTTTTAACTTTGCTGGTGTTTAACTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACATTTTTTGTAATATATAGGTACAATAATT:1	-	chr2L	9318776	5'	-	TAHRE	10345	1	81.51
CCGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGTGCTCACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCACCAATTTCGTGTGCAGGTGCTAC:1	-	chrX	22386817	5'	+	hobo	49	1	69.17
GGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGACACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACG:1	-	chr3L	8249121	5'	+	jockey	4578	1	58.78
TAAACAACTTTGCGAAATGGCGGACAATTATGGGAGATTCGCCGCCGCCGGTTGGCAGTGCTATCTGCGAGATATACTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTC:1	+	chr3R	29096971	5'	-	R1A1-element	5051	1	62.79
AATGTTATTGCTATTATAAGAAGCTTGTTTAAATCATAAAACCATTAACCTTCCAGCTCATATACAGGGTGCGGCAGCATAACTTCCTTTTTTTAAAATGCGCGCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCG:1	+	chrX	22689673	5'	+	mariner2	49	1	75.56
ATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGTATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr2L	17420260	5'	+	roo	53	2	54.11
AACTGGCGAAAAGCTTTACTAATTAAAATATATGTTTTTTATATTATCGATTTAACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1	+	chr3L	1534466	5'	-	pogo	2093	1	73.10
GGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCCCGCACA:1	-	chr2L	2703550	5'	+	hobo	61	1	81.98
TAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGA:1	+	chr2L	23069854	5'	+	Stalker2	151	6	76.69
ATCTGATTTGAAATTAGGGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGTTAGCTTATTGTGTAGTATGTGCCGATGCATTATTAAGAACAAT:1	+	chr2L	544777	5'	+	412	12	2	57.14
GTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTGCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1	-	chr2R	8146122	5'	+	P-element	57	1	37.50
ATAATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr3L	15177319	5'	-	roo	355	2	54.79
GAATATTTATGATTCTTTGATTTAAATTGAAAATATTGCTCAATAACTAATATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1	-	chr2R	20944438	5'	+	pogo	18	1	55.00
CAGTCTCAGTATTATACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTT:1	-	chr2R	6173094	5'	-	pogo	2046	1	63.01
AATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTAT:1	-	chr2R	5173251	5'	-	Stalker4	402	1	74.80
TAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGACCAATGCTGACGCGCCAGAATTGGG:1	+	chrX	20870100	5'	+	gypsy	56	2	55.48
CATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCG:1	-	chr3R	19450178	5'	-	roo	237	2	71.92
TTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGT:2	+	chr2L	14892203	5'	-	transib2	2767	1	57.53
ATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAACCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1	+	chr3L	4948071	5'	-	hobo	2915	1	60.27
CAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCACTATGCTAC:1	+	chr2L	1432060	5'	-	Stalker4	6958	4	78.77
AAATTAGCCGATAAATATTTGTTAAAATTTGTATACAATCAAAAAAATTAAAGTGCGTTTAAAAACATCATTATGTGGTGTGAGCAAGAAGGTTATACCAAAAACCATAAGAATATTCTAGTGTCTTTGG:1	+	chr2L	16672919	5'	+	Tc3	311	1	74.62
GGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAATCGAGAGCG:1	+	chr3R	22844200	5'	+	roo	60	2	66.41
TGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGTATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGTGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1	-	chr3L	10574380	5'	+	Tabor	59	2	52.74
GAAGTGCACGTGGCCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATATGTATGTGTGTGTATGAGCATGTCTATGTGTGTTTGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1	+	chrX	21009367	5'	-	pogo	2097	1	77.19
CTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1	+	chr2R	20496872	5'	+	blood	24	2	66.21
TTCCGCCTCGCATTGATACCGATTACAATGGGCGATTTGGGCGATAGAAGGCGGAACTGCAATATAAACAATAATGGGGAAGATGATCACGTGAGCCCCATCCCAA:1	-	chr3R	16561646	5'	-	Rt1a	4703	1	67.92
AATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr3R	12887005	5'	+	roo	41	2	55.71
AGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr2R	9632179	5'	-	roo	8994	2	69.86
ATTTCTTGACCTTAAACTTTAGTTAACACTTTTATCATAAGTTTACATAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTT:1	-	chr2L	588432	5'	+	FB	76	1	68.49
CTAGTGTCTTTGTAAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:2	+	chr2R	6086301	5'	+	pogo	50	1	56.85
ATGAAAAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCACGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chrX	8543564	5'	-	roo	390	2	65.62
GTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATA:1	+	chr3R	9038911	5'	+	Juan	4042	1	56.72
TAATTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	-	chr3R	31817524	5'	-	roo	9000	2	72.66
ATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGCAAACGTTT:1	-	chr2L	23034046	5'	-	FB	350	1	60.96
CGCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1	-	chrX	2842605	5'	+	Tabor	6882	2	60.69
TGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr2R	11164493	5'	+	roo	54	2	67.72
TAATGTGAATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGGTAGTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr2L	12892736	5'	-	roo	394	1	70.25
CAGCCCCTGGCGAAGTGAAACCGAAAGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAGAGGCCGGC:1	+	chr3R	26615126	5'	-	gypsy12	10145	2	72.28
TTGTATTTATACGTGTTTGTGCTTAACTAAATTCTTCATAATTAAGTCATTTGACTTGTCAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGCCGATTTTAACAAACGAATTTTAAAAG:1	+	chr2L	22407699	5'	+	1360	3005	1	58.90
CTTTTTATGATCCAAATTTGTTTGCTAGCCAGAGAAAATAGGAATTCTATTGAAGTTAATAGTATAGTATAGTATAGATCATTTGCTTTAAAACCTTTTATACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTT:1	-	chr3R	17751555	5'	-	Gypsy6A_LTR	103	1	68.49
GATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAATTTTAAATATTTTAAAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGCAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGT:1	+	chrX	21948999	5'	-	springer	413	1	71.64
TAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr3L	19334270	5'	-	roo	320	2	80.14
CTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr3L	22437968	5'	+	roo	53	2	55.17
ATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:2	-	chr3R	25454136	5'	+	Quasimodo	25	2	54.79
CACATATTATCCTTACCTATAGGATTGTGAATACTAAATGGGGTCAAAGGATTGGAGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGG:1	-	chr2R	21298891	5'	+	jockey	222	1	79.45
GACCCAGTTTGACATCGCCTTCAGTGCAAGAATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr2R	14542083	5'	-	roo	398	1	73.79
GCACATTCATTGTCCCTTGAACCCAAAAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1	+	chr2L	2687347	5'	+	copia	4933	2	63.77
ATTATGGGAAATTCAATATAGTGTTAATAATTAGTGTTATCGGTCCTTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGATAAATATTTTATATATTTGTTTAAACTACTGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATACT:1	+	chr3R	2532676	5'	-	Cr1a	93	1	67.81
GTGAACTTTAACAGTTCTTATGCTTTATTTGTCGCAAATATTGCGCAAACACGACAACACCAAAGGGTGCACCTCTGCCCCTCACGCCGCAACTCCATGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGC:1	+	chr2L	18873013	5'	+	McClintock	30	2	66.44
GGCGGAAGGGGAGCCAGGGCACAGGGCCAAGGCGAATGGCTTAACGGGATTTTTCGATACCAATAAATTTACAGGCAAACATAAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATG:1	+	chr2L	21244433	5'	-	1360	303	1	56.16
AAGTAGTACACTGAGGAAAATATAAGGAAATGTTCCTGATATAACTGCTTTAGTTATTAAACTATTACCAAGATTTTAAAGTATTTTGTATCCTACATTTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATAGACCACTT:1	-	chr3L	3826790	5'	-	Stalker4	224	4	66.21
AAATCTGCTAAAGAATGTATGGAAAATTATATAAAAAAAAAGAAGAGAGTATGCTACAGTCGAGTTCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCCTTCTAGCATTTATCTCAAATAGCTTTTATAGTTCCTGCGATCTCTACGTTCA:1	+	chr2L	15004807	5'	-	INE-1	140	1	82.19
AGACGCCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGC:1	-	chr3L	5102513	5'	+	BS	4724	1	57.93
ACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTATATACACGCGTCTCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTA:1	-	chr3L	6388961	5'	+	17.6	66	2	76.03
ATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATG:1	+	chrX	13066511	5'	-	jockey	4924	1	65.75
AAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAATTAAAATAGCATATTA:1	-	chr2R	15064466	5'	+	412	7084	2	61.27
ATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1	+	chr2R	16785346	5'	-	412	430	2	68.75
GCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1	-	chr3R	28075419	5'	-	jockey	4946	1	50.00
TTATATAAAATATAATACTGTATAGTAATAACCGAATTTCAGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATG:1	-	chr3L	15513587	5'	+	pogo	321	1	71.92
GCTCAAATCAACTAAGCTAAACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1	+	chr2R	19499300	5'	-	P-element	2843	1	50.00
ATCGGGCAGCGGAGCAGGGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1	-	chr2L	14892317	5'	+	transib2	52	1	55.48
ATGATGCACATTAGTAAATGATTTTTTTGGAACCTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1	-	chr3L	6978247	5'	-	pogo	2070	1	55.37
TATGTATGTTTGCCAGATTCGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGCTGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTATGTTTCAGCAG:1	+	chr3L	16750688	5'	-	Tirant	341	2	78.85
GAACAGGCTCGTTGACTGTCCGAGCTGGAGAGTGGGATACACAAACAATGAAAGAGCGTCTACCCTATTATGAGTGGATCACTCATGGGGACTGATCAGCCG:1	-	chr2R	3469541	5'	-	Quasimodo	6980	2	67.65
TGTTGCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chr3L	10292809	5'	-	roo	9003	2	69.18
GTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1	-	chrX	21016818	5'	-	Transpac	5170	2	81.08
GAATATTCTAGAATTTAATCAACTTGAATTTATTTGAAACAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCATTCGGGTGTTGAGTGAGGATCGTGCCTTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAAGTGGGTGTT:1	+	chr2R	1776158	5'	+	mariner2	173	1	65.28
ATAAATTTAAAATTCATACTTTGGTGTTTTTATTGCCTGAAAATCAAAATGAAACTTAAAACTACTTTCTCGTCAAACACCATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTTCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAG:1	+	chr2L	22577249	5'	+	Quasimodo	7078	2	54.79
TTAATGAAAACAATTGGGAAACTATAATCAAATAGATAAATTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTT:1	+	chr2L	15737079	5'	-	jockey	4585	1	70.50
AAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1	+	chr2R	977516	5'	+	F-element	61	1	52.74
ATTTTTATACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGCAACGGGTATCTG:1	+	chrX	15408729	5'	+	INE-1	543	1	83.08
TTTATTGATAAAGTACAATATTACAATAATAACTACTATGATTAATGTTGTAAATGTTATTATATGAAAGATATTAGAAGATATTAAAGATCCATATATAGATATGGAAGAGTAGTTGATGTTTCACTACAAAAAGACTAGGCAA:1	+	chrX	22218673	5'	-	jockey2	27	1	52.41
GGAACGTTCTTCGTTGTATTGTTTTTCTTGCCAATTATTAAGTTTTTTTTTCATTTTACTCCCCAATATCTATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGTGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAA:1	-	chrX	22959247	5'	+	INE-1	533	1	64.84
GACTCTCTTGCCTTTGTTGTTTACGGCCAACTGTCAACGGTGTCAACAGCACGCTACAGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATTCGAAGTATTTTAG:1	+	chr2L	2909647	5'	-	hopper	1362	1	55.40
CAAGACAAAAGACATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAGTAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:2	+	chr3L	23818341	5'	-	copia	220	1	61.64
AGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCG:1	+	chr2L	22315564	5'	+	frogger	3	1	52.33
ATAATAGACATACAATTTAGAGGGCAAAATTAAAAATGAACCTGGAGATATGTTTATTATAACATAAGATAAAATAATGTAAAATATAATTCATTCTCTTATCGGCTTAGCTTTGTATAATTTGTTTATTTTATTAATTTATAAAT:1	+	chrX	16193290	5'	-	G7	1143	1	43.15
ATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGT:1	-	chr3R	22232287	5'	+	1360	452	1	53.24
GTTTGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1	+	chr3L	22400255	5'	+	1360	14	1	66.35
ATTATGCTGCGACTGCCGCTGCTCTAAGAAAGGAAATTCAATTGGCCAAAAGGATGGAGAGGAAGTGGAGCTGGAAAGGTTCTTCCTGCATTAAATTAGCTGCTTAAAGGTGGGAGGAAAATATATATTTATACATATACATATA:1	-	chr3L	12683950	5'	-	Stalker	247	4	80.00
TTATTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATAGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTC:1	-	chr3R	23021010	5'	+	INE-1	575	1	43.84
AAAAGGATTCAATCAGAGCATTCATTCAACAACAAATCAAAAACTTTTGAAATTACTATTCATATGCTATATTCAAATAATTGGAACGTTAAGGCAATGCAAAACGAGAATTATTTTGATCAATTGATCAAAAATAATATAGATTT:1	+	chr2L	23020058	5'	-	1360	252	1	69.86
GTGAGTATAAGTCCTTAATTTGCAAGAACCGCTTTACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAA:1	+	chr2L	10037280	5'	-	Quasimodo	7334	2	58.90
CCTTATTAAGTACAATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:2	+	chr3L	14603220	5'	+	jockey	25	1	70.55
ACCGTCTGTCCGGCGAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCA:1	+	chr2R	7586145	5'	+	I-element	5042	1	65.88
TTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGCGACATGAGAATCGC:1	+	chr2L	18294209	5'	-	roo	329	2	71.23
GCTTTAAGTTTCTGCCGAAGTTTCTTAACCTTTTTCTTTGGCTTTTTAAATCTGGAATTTAATAAACGTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTG:1	+	chr2L	11985721	5'	+	G6	1661	1	70.83
CTATATTTGTTAATTGGTCCTTTTAGACAGCCTAATAGCTTGTGCCCAATTTATTATATACTTTCAATCGAATATAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAATATAGAATAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTA:1	-	chr3L	16738193	5'	+	Tc3	316	1	42.07
TGTCGTGCTGGTAAATTGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1	+	chrX	2842451	5'	-	Tabor	7301	2	69.44
AAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCC:1	-	chrX	12074614	5'	+	412	7166	2	53.04
GTCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1	+	chr2R	2016826	5'	+	1360	32	1	54.55
TAATGCCGCGAAACGCAGTTCAAACATTGCACTATGGGGCATTTGGCTTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCG:1	+	chrX	10253225	5'	+	hopper	66	1	78.45
CAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	+	chr3R	22844145	5'	+	roo	11	2	71.64
GAAAAGGAGTCTGTGAGTCCTGCGATGGCTCGGCTGCATTTTGCCTCAATTTGTCAAAGACGACTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAAAAAGAAGACTTT:1	+	chrX	14336343	5'	-	roo	404	1	82.88
CAGTTGTTGTCGTCGAAGCAAACTTGCATAAATTTACCAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACGAAATTCGTGAGCAACGTCAGCGTGAACAAGACGATCGTGGGTCTCTTCAATCAAAAACAACGCGTATTTCTC:1	-	chr3R	1025097	5'	+	Doc4-element	59	1	72.26
CCCCTTTGAATTTCGCCTTGCATGTAAATGTTGTAAAAGTTTTTACGATTTGCCAAACTATAAAAGAGGGTAAGGCCTTTCAAGCGGGCGGTACCGAAAAAAAAATCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATC:1	-	chrX	7457607	5'	-	pogo	1682	1	72.14
AAATTTAAGAAGTATATGTGGGAATTCAAAGGGAAAAATACATCGTTTCGGCTTCGGTTTTTGGTTTTTGTTCAGCCGACTTTCAAAGCTAACGTAGTGTCTTTAAAGCATAAATACATAAAGCATAAAAATAAATAAATATTTTT:1	+	chr2R	12786059	5'	+	mariner2	831	1	72.60
ATGAAATCGGAAACTGGCTTGGCCATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	-	chr2L	17471731	5'	-	roo	9054	2	71.33
AGTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1	+	chr3L	11957115	5'	+	blood	40	2	53.49
AAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr3L	12879740	5'	+	roo	69	2	66.90
TTCAAAAATTCCCTCTCCAATAATTTTTCCTTCACACCTTTATTTTTGTTTCGGCTTTCGTTCATATTTAACGGCATTGGATACCATTTTGTCAAAACAAAACAGTCCTTTATATATTTTCCCTTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTA:1	+	chr2R	1732253	5'	-	HB	391	1	66.44
AACGGTAAGTTTCAGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCA:1	-	chr3L	14944689	5'	-	G5	4822	1	71.92
TGGGAAATTCTTAAAATATTCGCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1	-	chrX	2842625	5'	+	Tabor	24	2	73.97
AAAGGCAGCAAGCAGCTAAAGAAGCTAACCAAGAATGTAAGCCCCGACTCGTAAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGAC:1	+	chr3R	13457851	5'	+	X-element	20	1	71.94
TGTAATTTCAAAATTATTATTATTTGTATAATGCAAAAAAATACATTCTAGCTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTG:1	-	chr3R	30217978	5'	-	P-element	243	1	15.07
TCCATTGAGGGAATCCATTTCTTTTGATCAGCTTCGAAACTTTATTTTCAGTGTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1	-	chr2L	1377758	5'	+	hobo	27	1	64.38
GACTTAAAATACTATAAACAGAACATATCAGGAAACTGGTTAACTTATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTACTGTTTATGGGCCAAAAATAGAAGCATTTAACTGATCCTTGCCTGTTGACAAAAGTATTTACACACAATTTTTAC:1	-	chr2R	4815024	5'	+	Bari2	80	2	64.38
CTCGTTGCGAAATACCACCTCGAAGTCCTGGGGATTGTGGGTGCTTAGGAATGGTGGGTTACCCATAATACCTGGCATAAAGAATATATCGCCGTAGTCCTGTCGTGCCAACTGTATCAAACTTTTTTATTAAGTAGTAGACAGTT:1	-	chr3R	19135696	5'	-	Bari1	489	1	71.23
ACAACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAAC:1	-	chr3R	1446147	5'	-	1360	3380	2	29.45
TTAATTAAAAAGGTCTTATCTGAAAGAAATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1	-	chr3L	1534754	5'	+	pogo	59	1	58.90
GTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr3L	11530948	5'	-	roo	334	2	78.12
ATAGCTGGGTTTACAATATTTAGTTTTGCCAAGGTTAGGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATA:1	-	chr2L	21556213	5'	+	17.6	354	2	72.86
GAATGAAATCAAATAGCATTATTTATGAAATTATATGGTCATTTTAGTTCTTTAATTGGAATTTAATTGAAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1	+	chr2L	12498313	5'	+	pogo	43	1	54.79
AAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:2	-	chr2R	6885405	5'	-	flea	4970	2	49.32
GGTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	+	chrX	5643443	5'	-	roo	9042	1	64.38
GGGCAATTGTCCCCCAAGGCAGTGTCCTTGGCGCTCTGCTATACAATGCATACGCTGTCGACCAAACCAAGCCAACCAGCGCCTCAAGAAATATTATAGGCTAATAGGAAGAAGATCGAAGTTACCGACTTCGT:1	+	chr3L	25847788	5'	+	G7	798	1	51.49
CAATAATAAAAAGCATAGGTACAAATATTACCAAATTGGTGATCCACAGGATCACTGAAGTTACCTTGAGATGGTCATTATATGATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAAGCGCTTCTTCGCGACTTCTAGATC:1	-	chr3R	10462335	5'	-	Tc1-2	1233	1	61.15
GTAATTCGAAAACCATTCATACTGCTCGTTGGCTGATGCTGCTGCAGCTAGTTTGTTTAGGTTTCAGCACTAATTGAAAATCATTGAATGAGGTTTTCTCATCAGCATGTGTCTGGGTAATTTGTTTTCTTTTAATTAATTTAT:1	-	chr3R	19524746	5'	-	jockey2	3406	1	75.00
TTTGAAAAATTGTTGGATATTTTTTCATCATTTTGAACAATTTTTATTCTCCAATATCCATTTTTCTGGGATAAATGATGAAATTTCGCGATTGCATTCACACTAGCTGTGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACC:1	+	chr2R	1652249	5'	+	INE-1	562	1	48.95
GAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1	+	chr2L	15832983	5'	-	hobo	2922	1	63.06
GGCCAAAAACTACAAAAAATCCACAATGCGAGCAAACAGAAAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1	-	chrX	18030359	5'	+	opus	28	4	59.17
GTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGCCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1	-	chr2R	3065979	5'	-	P-element	2854	1	40.48
AGGGACTGAAGCCAAATCGAAGGCGAAAGCCGAAAGCTGATGCCATCGAAGCCATGAAGAAGGAATTTCCTCAAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAA:1	-	chr3L	13551278	5'	+	Quasimodo	167	2	71.84
GGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTCAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTAATTCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAA:1	-	chr2L	22224604	5'	-	Rt1c	5397	1	51.37
CATGTGTCAATGGAATGAAGCTTTTTACGTCAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chr3L	21818103	5'	+	roo	8694	2	64.83
ATCTAGATCTATTTCACGTCGCAATTTTTTACGTAAATTAGTTTTTGTTTATTTTTCTTTATGACATAAAGAATATTATGTTTTAATCAATATTTTCTAAAAAGTAAGGTCATTCGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAA:1	+	chr3R	4514572	5'	+	HB	310	1	64.38
ACCTACACCTTATATTGTTGCATACTGCAAATATGCCAGGTTCATCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAACGAATCAGTGGTCGTCAGCGGC:1	+	chr3L	23239454	5'	-	HMS-Beagle2	7037	2	63.41
TTTTTTAGAAATATATTTCATATATTAAATAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1	+	chr2L	4953897	5'	+	Quasimodo	18	2	72.41
AATGTAGATGTGTTTTCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGCTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAGCTAGA:1	+	chr2R	4906428	5'	+	INE-1	153	1	66.39
AAACTATCAATATTAAATCATACTGAGGAATTTGAATACGAGCTCAACTAGATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3R	19449676	5'	-	roo	9053	2	46.81
AAATCGATTTCGGATTACAACCGATCGCGTCGACGATTGGTATTACAATATATATTTGAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGG:1	+	chr3R	451599	5'	-	F-element	114	2	56.12
AGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1	-	chr3R	17831902	5'	+	F-element	31	1	56.91
GCTTTAAAAGGAGGGAAAAGCGGTTGCCTTATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1	-	chr3L	4605766	5'	+	pogo	12	1	76.39
ATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTC:1	-	chr2L	12290732	5'	-	1731	259	2	72.48
ACAGATATCTGTCTACGAGACTATTTTATCGGTGCAAGAGTTTAAGGTCCTATACAATTTTACTATTGCGTTATTATTTTGTTGTTACGTTCTACTTTGTTGTTGTCTAAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTTGTAA:1	+	chr4	334763	5'	+	Tc1-2	1446	1	78.08
TATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGA:1	+	chr2R	8747029	5'	-	R1A1-element	5105	1	71.74
GAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1	-	chr3L	17205269	5'	+	hobo	60	1	72.95
ATTAAAACGCATATGCATGGTAAATACACTTATTGTCAGCACTGTAAGCCGTCTGAAATGCCCCCGGGGCATCGGGATGCTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCA:1	-	chr2R	16522174	5'	+	Rt1a	4976	1	74.07
CTGCATCCACCTGCTCTCTTGCCGAAATACGAAAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1	-	chr2L	16016454	5'	+	412	24	2	69.18
TCTTTAATTGATTAAACAATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	+	chr3R	16076748	5'	+	roo	31	2	66.44
AGTGTCAGGCAGACATAAATTTATGTTGGCTTGCAATTTTCCAACACCAGCACACATCACTGCCTCTTATACCTACCTGTGTACAGGTGAGGGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGGTTTTATTATTTGATCA:1	+	chr2L	6569887	5'	-	jockey	4985	1	74.66
ATCAACCTTCTTCTTACCCATCAACACAATGATCTTGTCCTCGGCTATACGATATTCACTGAGGGGCATGGCATCCTCCATAATGCGGCCACTGTATATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACA:1	-	chr3R	24107661	5'	+	F-element	4223	1	69.18
AAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCG:1	-	chr2L	9435800	5'	+	GATE	8314	3	61.64
TAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr3R	25448409	5'	+	roo	89	2	78.08
TCCCAAAATAATTGGTTGATAACTGCTTGATTGCAGAGATATCAGGGATAGTAAGTTAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGGATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chrX	13039612	5'	+	roo	11	2	77.40
TGGTAAATAAAGCGACCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1	+	chr3R	12618640	5'	+	F-element	56	1	74.19
TGAGAAAAACATCTTAAGATTAAAACAAGGGCGTGGCGCTTTGGTGGTGTTTGAGTGGGCGTGGCAAAAATTGATTATGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATACAAATTAGCCTTTATTGTTCCTGAGATCTCG:1	-	chr2L	23026409	5'	-	INE-1	147	1	62.59
GTTATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1	-	chr3L	20033820	5'	+	blood	7031	2	61.38
ACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1	+	chr3R	28758310	5'	-	mdg1	7386	2	68.28
CCAGATGCAGAGAGCTTGTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCT:1	-	chr2R	5173564	5'	+	gypsy	7010	2	65.75
TGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAT:1	-	chr3L	3501035	5'	-	opus	441	2	59.59
ATTTCGTGTTTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:2	+	chr2R	20496856	5'	+	blood	9	2	76.71
ACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGA:1	+	chr3L	27415188	5'	-	transib2	2789	1	61.64
GTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTAT:1	-	chr2L	1377697	5'	+	hobo	88	1	78.77
TGCTATATTCGCGACTATTGGATGTACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGATGTACATACATGTACACTAGTGGGCATAGCTATTTAGACACCATTAGCTTCCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAG:1	-	chr2R	6164611	5'	+	Tc1-2	47	1	57.24
AAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1	-	chr2R	8146106	5'	+	P-element	91	1	21.92
CAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAG:1	+	chr2L	22975389	5'	+	1360	120	1	52.88
ATATCAACACGTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTTGTAATTTTGTAGGCGTGGCAACATGGGTCAAAAAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATACTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACG:1	-	chr2L	22104717	5'	-	INE-1	144	1	91.78
ATTCAATGTCTAAGAACTAGGATACGCTCTGTCAGAAAACCAATTGGCCTTACTTTTCAGATTCACTGCTAAACTAAGTGTGGATAGGAAAATATTGTATTTTTTTATTCTATTTGGCACTATGCGCCCACTTTT:1	+	chr2L	5668632	5'	-	1360	3344	1	73.33
AAGGGGACAGGAGGAGATATAGTTATTACTCAAGGTTCCACCGCCGAAGTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATT:1	-	chrX	18566670	5'	-	accord	7026	2	71.95
TCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGATAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1	+	chr3L	25406614	5'	+	1360	14	1	69.78
CGGACTCTACGATCCTGAAAATCTTCGCAAGAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCCTAGTCATACATACC:1	-	chr3L	11321534	5'	+	mdg3	31	2	59.59
GAAACTGGTCATCTCCCGTTGCATCTCGGCTTAAATCTCTTATTGATTCAATATGCAAAACAGATTGAATCCAAAGGATATCGTAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAGCACGCCA:1	+	chrX	20836238	5'	+	R1A1-element	5298	1	67.20
ATGAGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2R	13817729	5'	+	412	42	2	51.91
ATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATNTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGTCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1	+	chr3L	17558006	5'	-	jockey	4935	1	58.22
GTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACT:1	-	chr3L	10574354	5'	+	Tabor	6914	2	74.62
GACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAA:1	-	chr2L	2122463	5'	+	Stalker4	83	4	75.00
TTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1	-	chr3L	21855519	5'	+	blood	67	2	69.63
TATTTAATTTAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGT:1	+	chr2L	13053742	5'	+	BS	5055	1	61.64
AAAAAGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGACTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chrX	17526804	5'	+	roo	19	2	55.56
ATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACCTTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1	+	chrX	21087593	5'	+	mdg3	55	2	60.27
TTCATTCGAGAAAATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATA:1	-	chr2R	5173263	5'	-	Stalker4	392	1	71.72
CGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACC:1	+	chr3R	26659753	5'	+	HMS-Beagle2	6945	2	60.96
AAATATTAACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTNAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1	+	chr3R	6290926	5'	+	Doc	31	1	65.73
TTTCTGATTAGCAGCAATTTGAATATATTATCATCTCGTTCGTCCGTCGCCATTTTGTTTGTCAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCG:1	-	chrX	22383290	5'	+	G6	20	1	64.38
AACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1	-	chr2R	16785420	5'	+	412	32	2	53.15
ACATGTCAGGCTCGTGGCTTCAGACCAGCGAACCCGCAAAGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr3R	31817411	5'	+	roo	14	2	71.32
CGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	-	chr2R	2016904	5'	-	1360	3357	1	53.40
TTCAAAGTGATTAACGTCATCAGCGAAAGTGCATTGATTTAGCTGCAGAACTGGCAGATGGAAATATGATGCGAAATGGATAATCAATCTACAGGTTTGTATTATGTGTTTCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTAC:1	+	chrX	17429959	5'	-	hopper2	1299	1	52.74
ATTGTTTTCGCTGGGGAAAACTTTGAACTTTGGAGTCGCGAGTGGCAGAGGAACTTTAAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr2R	14387883	5'	-	roo	394	1	73.53
CCAAAGGCAAAGTCAAAGGCCCTTTATTATGGAATGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCA:1	-	chr3R	19265877	5'	+	I-element	86	1	75.17
TATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGC:1	+	chr3L	11474691	5'	+	gypsy	7126	2	70.00
AACGCTCCCATCCATACGGTTAGGATTATAAAACGGTGGATTAAAGACCAAAACGTTAAATTGCTCGAGTGGGCACCTTACTTCCCTGACATTAACATCATTGAAAACATTTGGGGACTTTTG:1	+	chr3L	27358255	5'	+	Tc3	1249	1	85.37
GCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGCGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr2L	7945387	5'	+	roo	8753	2	78.62
ATGAATTACAGCAATGACATCTATTTTACTTTTCAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGGTGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1	-	chr2R	9791729	5'	-	412	484	2	77.08
AAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1	-	chr2L	13585931	5'	-	Tabor	7300	2	58.18
TTAATTTGTACAAATTGCACAATTTTTGGCCAAGTTATCTTAAAAAAAACTGGAAAAGATACCTATTGCGGTTAACGCTGCTGTACGACTCTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1	+	chr3L	20533433	5'	+	jockey	4691	1	67.44
ACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	+	chrX	17054195	5'	+	jockey	69	1	56.85
GGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	-	chr3R	16076862	5'	-	roo	331	2	72.22
CTACACAAATTGCTTATACTTTTTAATAAATAATCCGATTGAAATGGATGGATATTTATAATCAAAAGTCAAAATCTCAATTAAGCTTTGGGAAAATCTAGCAAAACATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCA:1	+	chr2L	20139810	5'	-	jockey	4980	1	68.49
CCCTATTCACCGCTGCCGGATTCGGAAACTTGTGTTCGTACAGTGGGTGCAGTACTGCTCAATAAGTAGTTCAAAATAAGGACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	-	chr2L	12250155	5'	-	1360	3370	1	67.72
ATATCGATAGATATTGGAAAATAAAATGGAAAAAAAATACAAATTGTTCAAAAGTGGGCTCTAGAATCAGCATGCATCATCTCAGCCTTTTAGCTTTCATAGTTCCTGAAATCTGGACGTTCA:1	+	chr3R	22375655	5'	-	INE-1	140	1	56.10
ATCCATTTATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1	-	chr3L	17115554	5'	+	blood	7043	2	57.36
ACTTTTTTACATTTTCCTGCTTTAATTACACAAATTCTGGTTTATTACAAACGATCGGGGCTCTTGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCGCT:1	-	chr2R	9544132	5'	-	opus	475	2	61.02
AAAAGTGGCAAGTGTTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	-	chrX	14336541	5'	+	roo	9	2	76.00
CGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1	+	chr3R	25826673	5'	-	mdg1	7390	2	63.70
GTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACG:1	-	chr2R	6271494	5'	+	blood	206	2	80.30
GCCATATGAATTCATCAATGCCAGTACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1	+	chr3R	18582126	5'	-	roo	9031	1	55.86
GCTTATTACACATTGTATATATTATTTGAACAATAATTCAAACTATTCATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAA:1	+	chr3R	17478936	5'	+	copia	304	1	69.29
ATCATAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1	+	chr3L	17560268	5'	-	pogo	2079	1	63.79
AGTTCATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCAAATACTTCTGATGAAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1	-	chr2L	15991423	5'	-	mdg1	389	2	59.56
GCGCCACTCGCATTCTCAATAGCATTTGCTGCCACCGCATAAAGTCAACTGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATAAATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCC:1	-	chr3R	28624691	5'	+	roo	29	2	64.38
AGCGAAGGCGGGCAGATCGAAGATGGCCACACAATACATATACTCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTCCTCACACAATCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGC:1	+	chr4	56505	5'	+	1360	3283	1	68.14
GGAAGATAAGAGTGCTTATCTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCCTCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATA:1	-	chrX	21087720	5'	-	mdg3	5485	2	71.92
GCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	+	chr2R	9221038	5'	+	opus	55	4	76.52
CAAAAACCCATTTTCGCCGCAAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGGTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACAAGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chrX	6486697	5'	+	roo	8681	2	52.73
CCGAATCGCCATAAGTTGGTAAAGTTTCTATTTAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1	-	chr3R	9039054	5'	-	Juan	4190	1	67.81
ATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1	-	chr3R	19529196	5'	+	jockey	4670	1	52.88
CTCGCGTACCTGCAAATTGGAAGTGGTATGTATGTAACATNGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCG:1	+	chr2R	6885331	5'	+	flea	4838	2	80.00
AGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr2L	3886222	5'	-	roo	325	2	73.79
AGCTAATTGTTTCAGTAAAAAGATTATGCGGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACA:2	-	chr2L	22121681	5'	+	gtwin	15	2	58.90
ATCTCATTATTGACTGCGATAATTGCACACTGACTGGTCTTCGCAAAGTCTTTGCTCCAATGTTCGAAGCAGATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTT:1	+	chrX	19068206	5'	+	Stalker	312	4	50.68
TCTGAAATGTCACAAAAATGCATTTCATAATCGGTATTTCTGAGGCATGAAATTTGAAATCGAACCATAGCCATAAAGTTGACTTAAAAATGTGGATTTAGAGACGTAATTTCTATAAGCAATGATTAAAATTAAAAAATTATAAT:1	-	chr3R	28507641	5'	+	1360	3056	1	64.38
GTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr2R	11164492	5'	+	roo	73	2	72.41
GTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCAC:1	+	chr2L	11985788	5'	+	G6	1703	1	70.59
TTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGGGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATGTTATTTGGAAATATCTTCGGTGT:1	+	chr2R	20596463	5'	-	roo	9015	2	57.78
GTATACTTAATTTGACTTGGGACTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACACGGTCTTGCTCTACA:1	+	chr3R	18089111	5'	+	F-element	4223	1	62.50
CAAAGCCAAAGCCATCTACTGCGACAATGAACCATCATTAAGATCGCAAACAGTGGTGGCTATGCTGGAAAACCATTTCGGCGTCAGCATCTCAAATTGACCAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1	-	chr3L	9825731	5'	+	F-element	20	1	72.93
CGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr2L	7945335	5'	-	roo	333	2	73.57
TTTGCTTGTCTTTTGTCAACAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr2R	23803056	5'	+	roo	8677	2	72.48
TTTAAATTTAAAGCTGATTTTTATAAATAGGTACCATTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAACTGCCGATTCGAACTAGACGTGTCTGCCTATCCGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAAA:1	-	chr2L	14885060	5'	+	INE-1	146	1	59.59
GAAAAACGTAAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAGTCATACTCCTAAGAGGGCTCGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr3L	11441873	5'	-	roo	390	2	69.18
TTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGAGAACGCCAAATAAAATAA:1	+	chr2R	977534	5'	+	F-element	78	1	63.45
TCTCTAAGCACCGGGGAGCATCACATACGACACAGAATTGGATTTGGTGTGGGTGTTGCGATTATATAATTCAAGAACTCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCTTCAGCGCTCGGCTCTCG:1	-	chr3R	17316342	5'	+	opus	35	4	50.81
ACCATCAAGATTGGCCAGTCAACAACCAATCAATATGCTTGCTTAGTATCTTGAAGTATGTATAGCATATAGTATGTGTACAAACAGATAATAAAATAAGAGAGAATGTTACAGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACC:1	-	chr3L	23174294	5'	-	INE-1	557	1	63.31
AGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	-	chr3R	17817982	5'	+	roo	8726	2	62.50
GATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGGGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1	-	chrX	6522056	5'	+	F-element	82	1	59.59
CGACAGGCAAAAATCGAAGTTGAAAAATAAATGGGAGACAATTTCGTCAGGACCAAAACGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chr3L	10293842	5'	+	roo	8683	2	48.33
CTAATAATTTATTTACAGTTAACATTTTATAAGCCCAGGACATCCCCCTCCCACACACACACACACGCACACACCTACACACATTCAATGCGATTGAGACCCCCGGCTGCCATTTGATTTCACAAATATTTG:1	-	chr3L	10504452	5'	-	transib4	468	1	51.52
GTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1	-	chr2L	15875804	5'	-	hobo	2902	1	68.48
TCGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCA:1	-	chr2L	2122500	5'	+	Stalker4	42	4	53.57
GGATGCAGTCCTTCGTGGGAGAAGCTCCTTGCCTTCCCGCACTAGTTCCCCAACAGGAACCTGCGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCG:1	+	chrX	22958591	5'	+	Stalker	445	1	75.24
CTTTTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1	-	chr3L	17205304	5'	+	hobo	28	1	62.40
GAAGAGGGAAATGAAGAGCGGGTAGTTGGTTGGGTGGAAGATGCAAACAAGCCGTGTGAAGGGGTCCATAGATTATCTCTGAAATCTTCACAGTTCCCTCATATATGGAAGGATTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAG:1	+	chr2L	9270819	5'	+	Q-element	68	2	50.68
CGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1	-	chr2L	15833094	5'	+	hobo	57	1	56.85
AAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGTGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAA:1	-	chr2R	23332595	5'	-	invader4	3013	2	81.89
ACCCATGGTAAAAGTTTGTGCGGTAATTTCTTGGCACATTTTGCATTTCAGCGCCACAAAATGAAGACTCATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATG:1	-	chr2L	12286568	5'	+	1731	53	2	62.81
CTGTGAATTTCTTTAAAAAAGAAATCAATAAATCAAATTCAACTAAAGAATGAAAACTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1	+	chr2L	12249993	5'	+	1360	11	1	63.70
GAAAATAAGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr2R	21907893	5'	-	roo	9053	2	69.53
GTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAAT:1	+	chrX	21670004	5'	-	Stalker2	7584	2	64.03
TACTTAGCCTAATAAAAGTTATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1	-	chr2L	22775605	5'	-	pogo	2076	1	64.96
AATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTCGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGA:1	+	chr2R	1881364	5'	-	Stalker2	7495	6	50.34
AAGAAGCGCTGCGTAACACCTCTTTTCCTCGACACTTTCACGTTACCATCGATTGAATTAAACTTACCAGATTCTTCTCTTGCTGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1	-	chr2L	22708681	5'	-	1360	3325	1	43.15
CCAAAAAGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGATATCCTCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTATACTGTACCTATAAGT:1	-	chr3R	10182209	5'	+	blood	7032	2	51.00
TTTTAATTGTAAATGAGTTTGCAAATGGACAGCGGATCTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATAC:1	-	chr3R	22270957	5'	-	jockey	4573	1	73.97
AAAAGTGCTTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1	+	chr2L	2794153	5'	-	Burdock	6350	2	54.11
CAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1	-	chr3L	12861802	5'	+	pogo	23	1	55.56
GGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1	-	chr2L	15833070	5'	+	hobo	67	1	70.45
CACAAAGAAGCGACCGTCTGTCCGGCGAGAAGATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACGCATGCCCATCCCTC:1	+	chr2R	7586133	5'	+	I-element	5048	1	66.02
GCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr2L	16091970	5'	+	roo	74	2	78.36
GAGGGCTGTCCCATTGCAAAGACCTGTGCGGATACAAAGTACGGTTGTTGCTTGGACGGAGTGTCTCCGGCTAAGGGCAAGAATAACAAGGGTTGTCCCATTTTCGGTACCACGGGTTGAACAGCTATCCAAGACTGCTCCTTGAG:1	-	chr3R	28527463	5'	+	R1A1-element	4958	1	68.49
AAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATAAACGAGAACGTGTATGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGCAGGTCCAGAGATCCTCCTTCTTTCGCTG:1	-	chr3R	20683403	5'	-	gypsy	7398	2	54.29
GGAAAGTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	+	chr3R	7835087	5'	-	roo	9038	1	60.96
AAGGATAACAAAAATCCTGTAAGCACATTGCATTCGAATTGTATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGGTGGAA:1	+	chr3L	12308866	5'	+	hopper	289	1	70.55
CGATCAAACGGAATCTGGGCCTCCGATTAAATATATATATATATATATAGTCACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1	-	chr3L	20548147	5'	+	297	6601	2	68.54
GATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1	+	chr2R	20496936	5'	+	blood	89	2	79.45
CTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCAATTACAGACTG:1	-	chr3L	5102493	5'	+	BS	4745	1	71.92
ATATCCATTTCCTTTTTTTTTTAATTTTT:1	-	chr2L	11207259	5'	-	Doc	4697	2	86.21
AGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1	+	chr2R	2016831	5'	+	1360	46	1	59.66
CTCTGTACTTAGCCTAATAAAAGTTATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATCAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1	-	chr2L	22775610	5'	-	pogo	2072	1	63.01
ATTTGCTGCGAAGGAGCAATTGGTTCTGTAATAAAGCTGGTGATAGGGGACTTAAAATCCAATTGCGTTATAAACACCCTCTGCACTGAGCTCAAAAAAGCTGGAAGCTGAAAATATTCATTTTAAAGAGGTGGGCTAAAGA:1	+	chr4	786716	5'	-	FB	457	1	62.68
TTGTCACGTAGCTGATAAGTATCTTTTTTATGTGCAAGCATCTTGCCAATGATATCATCATTGTGTGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGTCTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTAATGTAAATAAATCGAGAGC:1	-	chr3R	26222956	5'	+	roo	59	2	51.72
TTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAATCTACGTCCAC:1	+	chr3L	4948050	5'	-	hobo	2922	1	54.02
TTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGTT:1	-	chr3L	11257429	5'	-	1360	16	1	53.42
GCGCATTTAGTTTATATAATGTGAATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	-	chr2L	12892752	5'	-	roo	9049	2	71.03
ACTGCAAGCAGCTGTTGCAACTTCCCCACAAAATTGAATCCGAGAACGGATGCCAGCACACGAAATTAAGCGGAAACTCTGAAATTTATTTTACCATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chr2R	13696354	5'	-	roo	9047	1	68.49
GGAGCGATGCCCCTACAGATCCTCTTCAATACTACCATATTTCCACAGACAGGTGCTACATATATTACAGGCTTTTGACGACTG:1	-	chr3R	2724330	5'	+	Helena	350	1	57.14
GTTAAACATCAACGACATGCAGGTAAAGAATACAGCAAGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1	+	chrX	5629091	5'	-	jockey	4951	1	55.48
GCCTCCGTGCCAAACTTCCTTTCTACCATTTTATTTGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr2L	14772179	5'	+	roo	8678	2	75.34
GAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr3R	19968106	5'	-	roo	352	2	63.64
CCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	-	chrX	9540097	5'	-	roo	331	2	70.55
CTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGACCGCA:1	-	chr2L	6007627	5'	+	1360	459	1	70.55
GTATTAATTTAAACTATTAGTATATGATAGAAGAAGAAATGGTATTTAATTTAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTT:1	+	chr2L	13053700	5'	+	BS	5013	1	69.86
ATGCATGTATGTATGTATGTATGTATTTGTCAAAGGATCGTTATCAACATTTAAGCGCAAAGGTGATGTATCTAATCCTCTTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTT:1	+	chrX	18325602	5'	-	Bari1	1681	1	58.96
TGCTTGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGG:1	-	chr2R	20194336	5'	+	Max-element	25	2	67.12
ATTTTTCTTGTTGTAACGAGAGGAATTGTTAGACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGTTTGATATGTGGGCGAATGGGAGGTTGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTA:1	+	chr2L	23436149	5'	-	Porto1	230	1	78.08
ATAAAATTTAAATAAAAAAATGATATAAAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTA:1	+	chr2L	12971723	5'	-	Cr1a	4401	1	47.79
ATATGTAGTTTTATTTAATTAATTGGAAATTTATGGGTATATTCGATGCAAACCTTTCACTGGTAAGAAAGAGATTCAAAAAAGAAATACAAAAAGAGTGAATAAGTTACTTTTTCTTTAATTTTTTTTTATATTTTTTTTAAGAT:1	-	chr2L	16791901	5'	-	mariner2	785	1	52.74
GGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chrX	13039493	5'	-	roo	9018	2	74.77
TACCGCAAATGGATTTCAAGTTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chr3R	22956074	5'	+	roo	31	2	57.14
CTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1	-	chr2R	3065998	5'	-	P-element	2811	1	36.30
AGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr2R	9328602	5'	+	roo	13	2	62.64
AAAATCCTAAAATATGCGTTAGACTTTGCAGCGTGTTTTAAATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAG:1	-	chr2L	12281823	5'	+	1731	4455	1	71.92
AGTTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGGAT:1	-	chrX	13039540	5'	+	roo	78	2	75.18
TATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1	+	chrX	18193682	5'	+	jockey	76	1	69.53
CTTTTTGAAGGATTTAGGGAAATTAATTTTTCGATCAATTTTCGCATTTCATTTCGCATTTCATATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1	-	chr3L	23941245	5'	+	F-element	41	1	50.85
AAGTATTACTAAGTACCAGACGCTATATTTTGAGTAAGAAGAGCAAGCAGAATTTTAAGAAACGGTACTTAGGAAAAGCAAATGACGAAAAATGTTCACATTATAAACTTGTGCGTACACTTAATGAGTTCAAT:1	+	chr4	290898	5'	-	rooA	7580	2	67.91
GGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	+	chr2L	16091861	5'	-	roo	9044	1	62.33
ATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTAAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGACATAAATTTG:1	+	chr3R	4357526	5'	-	Tc3	1650	1	35.86
GATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTCTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	-	chr2L	2007439	5'	-	roo	338	2	69.06
AGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chr3R	22844199	5'	+	roo	8699	2	59.62
CTGCGTCGTGGCAAGCGTTATCTCCAATTCAGCAAGGACTCGTCGGCCAGGGCCATCGGGACATCTGGATCCAGTATAAGTTCCAGCGCGGTTCCGTTAGGTCACGGTCTTTCCGCTTTACCG:1	-	chr3R	24384644	5'	-	gypsy8	66	2	63.41
ACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1	-	chr2L	15833095	5'	+	hobo	56	1	56.16
ATTACAAGCATAATATTATCAATGTAAAATCGTATGTAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAG:1	+	chr3L	20835964	5'	+	roo	441	1	66.07
AGAATATTTAATTTAATTCTGAAGGCATATATTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTATCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTG:1	-	chr2L	23381797	5'	-	Ivk	285	1	54.11
CTAATCTTGAGTCAAGGCTTCACTCTTATCTTGAAAGCTTTGGGCGCTTACATTTAACTCTGCAGATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGC:1	+	chr2R	4601509	5'	-	HMS-Beagle2	291	2	70.00
AGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1	+	chr3R	6290947	5'	+	Doc	8	1	74.75
TCGGGATGCAGCAGCACGTGCCAGAGGTGTTCCAGCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGCTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1	+	chr2L	10023013	5'	+	Doc	50	1	61.76
AAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTTACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3L	22437960	5'	+	roo	8685	2	62.86
TGTTACCGTTTATTAATTATACCAGCTCCAGTTCGCCGCTGCTTTATGGACTGACTGGGTCGTGAATTTGATCAATTAAAATTATTATTAAAAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAG:1	-	chr2R	8336868	5'	+	invader2	460	1	67.23
GACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCGCACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1	+	chr2L	9668201	5'	+	1360	57	1	71.90
CAGTGCATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTGATTGTATTT:1	+	chr2L	7945306	5'	-	roo	9032	1	55.22
GACGAAGTTAGGCAAGAAATATAATATAACTACCTCAAAAAAAAACGCATATTAAATTAAATTAAAACCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCCTG:1	+	chr2R	8106953	5'	-	Tc1	1280	1	49.59
AAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATAC:1	+	chr3L	25782383	5'	-	Stalker4	7004	4	50.00
CACTATTACTTTGGCCAAATCAAACATTGTAAATCCCACGATTCTTGACCATGCCGACTTGAAGTCTCTTGTATTGACGCTAAGTTATATCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTT:1	+	chr3L	18793577	5'	-	Stalker	6841	2	51.37
TACATCGAAGTGAACTATTTAACTTGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCT:1	+	chrX	2297112	5'	-	Tirant	251	2	76.42
TAATAAATAATAATAATACAATAATAATAAGAAGAATAATAATAACAATAGGAATAAGAATAATAATAATAACAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATAAAAACAAAAATTATAATAATAATAGTAATAACAACAATAATA:1	+	chr2L	18548951	5'	+	mdg1	25	2	73.29
ATGTAATTAGAACTACTTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTAT:1	+	chr2L	22315556	5'	+	frogger	49	1	60.00
CCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACA:1	+	chr2L	12290665	5'	+	1731	59	2	56.64
ATTCATAGAGCACGTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1	+	chr3L	24291982	5'	+	1360	67	1	68.09
ATGAAACTGCAATCGAATCAGGAAAGACGGGAAGAAACCCATAAACTTATACCATCAGAGGGTCAACAAATTTCCAACGCTTTGTAAACAAATTTATTTAATAAAACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1	-	chr3L	12861857	5'	+	pogo	15	1	68.49
GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAA:1	+	chr3L	25232774	5'	-	accord2	170	2	56.70
ATGATCAATTTATCGTCGATGAATAAACCCCCGTGAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1	-	chr3R	19449071	5'	-	roo	8978	2	74.66
GTTTATGAAATAACATCCTTATGTCTCACAACTTAATCTTTCAACTGTTTTCTACTTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATA:1	+	chr3L	4544289	5'	-	roo	8752	2	61.64
GTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1	-	chrX	2842599	5'	+	Tabor	6848	2	78.10
ATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGAAATGCACT:1	+	chr3R	12717726	5'	+	297	43	2	57.46
CCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATCAAACAAAAACGTAATAGTGATC:1	-	chr2L	11674442	5'	+	jockey	62	1	50.68
ATGGATGCAGGGACTGTGGACTTGGGACTTTGGATTTTGGAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGG:1	+	chrX	15388086	5'	-	Quasimodo	315	2	56.99
CTTTTGGTTGCGCAAATTGGTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chrX	5643425	5'	-	roo	397	1	76.71
TTTTAACTGACAAGCTGAACACCTACTTCTCCCCTAAACAAAACTCTACATTTGAGAGGCATTTACTTCGCAGCTTGGCTCCGTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTG:1	-	chr3L	25730935	5'	-	1360	229	1	58.22
AAATATATAAATTAAGTTTAAATTCTGAAATACTAAGATACTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGA:1	+	chr3R	14337416	5'	+	copia	4951	2	73.29
GCGTGTTTTGCTTGCGATGTACACAAAAAAATATATGCATTTTCTTTTGTAGTACCTGACTTTTTAAATAGCTGTTAGAAGAATAAAAACGAAAAAAATATCAACACATCCTTTAAAAGTTTCTGAGATCTCGACATTCATACGGG:1	-	chr3L	24074344	5'	-	INE-1	134	1	63.01
ACACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1	-	chr2L	2703589	5'	+	hobo	55	1	60.42
TAAAGACGAATTTACTTTCTTTATGTGAGACTGGAACATAAACTTTTATTAGAATACCGCTTATTAAGTAAATCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1	+	chr3R	4090763	5'	+	copia	51	2	56.16
ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGC:1	+	chr3R	1875807	5'	-	Rt1b	4702	1	52.55
GACAGTCTGAAGTTATAGCCGAGACCAAAGACACTAAAAAAACTCGTAACTCCATTCGATTCTTTTGCACACGAAATTTTTGTGCTGGCTCTCTCGAATTTTTGAT:1	+	chr2L	20117412	5'	+	1360	84	1	51.89
TTATGAGTGCCGAGTGTGATCGGCGCTCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGAC:1	-	chr3R	1465943	5'	+	gypsy5	57	2	74.77
CGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGTACTATGCAG:1	-	chr3R	11496616	5'	-	1360	3352	1	53.78
AGTCCCATGGGTCTCTCGCCAGTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr3L	9998242	5'	+	roo	8675	2	76.26
CGCCTCTCAAATTTTTTTTCTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr3R	17817849	5'	-	roo	9046	1	69.18
AAGTGTTCGAAAAATACAATTAAAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTGCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTCTATACATTAATTAACCAGTGTATAATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1	-	chr2R	15064488	5'	+	412	12	2	71.03
AGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1	+	chr2R	9221018	5'	+	opus	137	4	56.73
TCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGAC:1	+	chr3L	24213791	5'	-	invader2	159	2	78.08
ATAAACTTCACTGATGACTCAGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1	+	chr2L	21153442	5'	+	1360	16	1	70.07
ACAGAAACGCAAAGACTAGAACCACATTTTGTAAGCTGGATCGATTGAGTGATGGATTGGTGTGTGTGCATACACACACACACACACACATCTCC:1	-	chr2R	16625864	5'	+	accord	7031	2	65.26
TTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1	+	chr2R	21229015	5'	+	jockey	78	1	73.17
CGAAATTATTTTTTGAAGTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATATGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1	+	chr3R	17316222	5'	-	opus	481	2	66.38
GCTTCGTCTTTCATTGGGACGTTAAACGATAACTGTGGTTNCTCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATATTCTTAATAGTGATTAATACCCAAGTCGATCTGGCTCTGTTCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGG:1	+	chr2L	22724073	5'	+	INE-1	137	1	65.07
CCAGAATGGTGCCAAATTGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1	-	chr3L	10574432	5'	+	Tabor	7	2	71.92
ATGCAGCCAATTTGTCAACGCGGCGGCAGCATGTTGCTGCTACATGTAAGTTGTCAACGTTTTTTTTATAGATGGATTAGGAGCTAATGTTGAATTTGATTTAAAAAAA:1	-	chr3L	11021540	5'	+	Transib5	2793	1	57.80
CCTAGCNATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1	-	chr3R	20427460	5'	+	jockey	82	1	66.44
CCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATGTTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1	+	chr2L	8986116	5'	+	412	7111	2	56.85
ATACATCATCGAAGTCGCCAGAATGCAACAGCTCATCGGCGAACTGGATAAAGAAGTAGGTGAGATGACCGATAGACGAATGGCCACTTTAATAACGCACTACTAGTGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATTTAAATAAAACACA:1	+	chr3R	3758995	5'	-	invader2	5085	2	63.70
GCCGAATCTCCTTTGTGGTCCTGTGACTGCCGAGGCGTGTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCAGAGTGGATCACTCATTGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCG:1	+	chrX	6499783	5'	-	Quasimodo	6965	2	59.84
ATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:1	+	chrX	13704736	5'	-	invader4	3056	2	62.41
TAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	+	chr3R	31817454	5'	+	roo	40	2	59.82
ACAATTAAAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1	-	chr2R	15064473	5'	+	412	28	2	64.38
GTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATA:1	+	chr2L	12290642	5'	+	1731	4351	2	58.90
TTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTGGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCA:1	-	chrX	13066554	5'	+	jockey	99	1	75.17
AGAACGATAAGATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1	-	chr3L	27415350	5'	+	transib2	26	1	67.81
TTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:2	+	chr3L	10848663	5'	+	blood	83	2	72.60
ATATACCGCAGACGGATTAACAACCACGACTTCCACAACACTGGCTCCAACATACGAGCCTCAATAAAGATTGATATAAATATGAAATTATAAACACATACTAATGCATCTGTAATTACAGATTCAACACGAATCCATCGTTCATC:1	+	chr3R	12311562	5'	+	gypsy5	481	1	59.59
CAAAAAGGACCTAAACAAACAGCAGGCGAGAATTGGCTCGTAATTATTCAATAACAGTTTATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGAAATC:1	+	chr3R	27501332	5'	-	Circe	7016	1	53.45
GTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chr2R	19004214	5'	+	roo	28	2	60.00
TCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	+	chr2R	20596456	5'	-	roo	9044	1	56.25
TGTATACTCGTTACTCGTAGAGTAAGAGGGTATACTACAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAGGTGTTTCCGACTATATATTATGTCGAGTCGTTCTAGCCATATCCATCTGTCCGGATG:1	+	chr2L	21112332	5'	+	INE-1	120	1	59.40
GTAGTTTAATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1	-	chr2L	17079870	5'	+	jockey	4707	1	63.01
TGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr2R	19004135	5'	-	roo	352	2	58.39
CACGCCCATTTTTCCTGAGCATGCCGGTCAAAAAAGTAGACAGAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGAGTAGGGTATGTAGTAGTTAGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGGTCTCT:1	+	chr3R	2993042	5'	+	Circe	366	1	71.33
ATATCTTTTACGATACCAAAAATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGCATT:1	-	chr2L	21735012	5'	+	jockey	4537	1	69.67
TAAGTTAATATATAAATTTATTAGTATAACATTTTCTCGCGGCTGTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGA:1	+	chr3L	9909524	5'	-	BS	4999	1	69.18
GGTCGGGGTTCTTGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1	-	chr2R	9544080	5'	-	opus	498	1	65.12
CAGGGTAGTCCTTGGTAGGACTTGGGCAATCAAAGTTTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1	+	chr2R	13817645	5'	-	412	7464	2	71.92
ATTGGTTGCCCTAACAACAAAAAAAAGCTAACTTGAGAAAAGAAAAGGTAACCAAGCATTAAATTAAAGACTTTAACAAAGTTTCTTTTTTCGGATTTAAGAAAAGTCGTATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGA:1	+	chr3R	25420964	5'	+	1360	2982	1	73.79
TAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1	+	chr2L	21884517	5'	+	pogo	70	1	67.12
ATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr3R	18582235	5'	+	roo	73	2	70.55
ATGTTGGGTATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACACCCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTT:1	+	chr3L	23773150	5'	-	roo	390	2	51.37
TAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGATACGGCAG:1	+	chrX	21949009	5'	-	412	303	2	80.81
AGAGGAACTTTAAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr2R	14387929	5'	-	roo	337	2	63.70
CTCTCTGTCTCCTTGGCTCTGTGTGTGATAACTTCGTTAAGTTGTTGACACGCATACATACATATATAAGTCCGCATATGGGGGTAAATAATAATAACAATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1	+	chrX	4215467	5'	-	flea	213	2	69.18
AACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTAAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGT:1	-	chr3R	19450108	5'	+	roo	8813	2	56.16
GCTAAGTTTACCTGTAATATCCACATGAACCGTATGCCACGGGATGTCAATTTTAGGAATGGGATGGAGTTCGGATTGTATTTTGCCAGACGGAGGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1	-	chr3R	1632090	5'	-	copia	241	1	73.48
ATATTATATTATATTATATTATCGGCATTCCACAGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1	-	chr2L	15950935	5'	+	Doc	40	1	75.79
CAATGTTTCGTCGTTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATAACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1	+	chrX	2842493	5'	-	Tabor	7272	2	55.73
CATATCCTGCAATTTCCACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1	+	chr3L	17205218	5'	-	hobo	2895	1	68.57
GCTGGCTGACAACCTGCTCATTGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAA:1	+	chr2L	3114442	5'	-	roo	9045	1	67.12
CAATATTTCTTCTCTGTGCACTTTTATACTCCGAAGTCAGGTAGTTTGTCTTTGGTCGTTTTGTTCTTTTTTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCC:1	+	chr3R	3019368	5'	-	Rt1b	5071	1	51.80
AAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1	-	chr2L	13585913	5'	-	Tabor	7246	2	68.49
AAGAAAAAAATATGCAAAAATAATCCTTAACACTTGAATCCCCTGGCGATTCTCTGGAATCGGAAGATGTTTAATGTGTGTTCGTAATTCAGCCTTATTCCTTTTCCAATAAGTGTGTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAACACTGTG:1	+	chr3R	9359386	5'	+	diver2	8	2	20.55
TTTTATGTTTAACTTTCTTAGAAGAATATATATGTCGCAGATCATTTAAATATAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCATGCGCCATAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGG:1	-	chr3R	3953127	5'	+	invader1	105	2	72.31
TGCTTTGGAAAGTTGGCGGGTCTGTGTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	+	chr3R	22122708	5'	-	roo	8991	2	72.60
AGTGATGGCGAGGGGGAGCTGAAGTGCCGGTCGGATGGCAGCGGCACAGAGGGACACTTGTAGCCACAAAATTTAAAATTAAGCTTAAAATTAAACCGTTGAAATTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGCTACTG:1	+	chrX	16124038	5'	+	Rt1b	139	1	52.17
ATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1	-	chrX	22511455	5'	-	1360	3367	1	55.48
TGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAGTTGTACGAAA:1	+	chr2R	6086328	5'	+	pogo	77	1	71.23
TTATGGCTTGATGACTTATGACTTATTCCACATAAGTCATTGAGAGTTTTTGAAAAAACACAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGATGTTGCGAATATTAA:1	+	chr2R	1860485	5'	-	diver2	4875	2	70.75
TTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGT:1	+	chr3R	18339076	5'	-	roo	9056	1	66.36
AAGTGTATCTGCCTTATTTTTGGGACTCTCGTATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:1	+	chr2L	4412525	5'	+	Quasimodo	11	2	68.46
GGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGTTGTAGT:1	+	chr3R	22821968	5'	-	mdg1	407	2	53.85
GACCACAGGACCTTCCTTTTAACCGATTAATCAAATATGCATGACCAGAGTAATTATGTTTGATTAACAAACCCATATATACATATACATATATATTTCTTTTAATTATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGA:1	+	chr3R	15074227	5'	+	pogo	1647	1	45.89
AATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1	-	chr3R	17316307	5'	+	opus	152	4	73.12
TTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGT:1	-	chr3L	16260407	5'	-	hopper	1397	1	70.00
GTCATATAAAGTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGGACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAATGC:1	-	chrX	10233970	5'	+	INE-1	149	1	79.61
CTTAAGGCAAAAATAATTAAAAACTCATTTTCGCTGTTTAAAAACGGAATACTAAGATAGCAACTTCAAAGAGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTCATATTTGATATGAATGG:1	+	chrX	14749596	5'	+	copia	4917	2	50.69
CTTGAGCGCAAGGACTTCCGCTGAGCTGCTCAAGTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTT:1	+	chr3L	10018858	5'	+	hopper	1163	1	76.71
AGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTT:1	+	chrX	10521632	5'	+	Tabor	64	2	58.90
TAGCGGGTTGTTCGCTCTACAGCCAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTA:1	-	chr3L	23728733	5'	-	HMS-Beagle	6987	2	60.74
CCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTATTTTTGACACCCTACTTGCGGC:1	+	chr3L	4948059	5'	-	hobo	2866	1	69.40
CTACTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1	-	chrY	311463	5'	+	1360	1	2	58.90
CTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	-	chr2R	13817724	5'	+	412	45	2	54.26
CCGAATGCCATCAGGCATTTCGTCACATAAAAATACATGGCCAATATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATA:1	-	chr3L	7292549	5'	-	HMS-Beagle2	237	2	69.18
TAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTCCG:1	+	chrX	2444335	5'	+	roo	8694	2	57.69
ATTATAAAGATCTAGTCAATATATCTGGGGAATTTGCTAAGCATCATGTTGGGACAAAAAAATCATTTTTCTATGATAGTTTACTTTATATAATATAAATATTCAAATTCAATATTTTTATTCTAAAAAAATAATTATTAATAATA:1	+	chr2R	11534690	5'	+	gypsy9	293	4	52.05
TAATAAATAAGGTGCAAATATTTCAGAGCATAGTTGTGGTTTTATTTCACCTATCCGCATTATCTGCAGTCAGTTCAACTCACTTTTTGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1	-	chr2R	21146006	5'	+	pogo	22	1	68.09
CACTTATTTTCGTTTCGGCCGCGACAGCGAATATGCAATTTTCAAATAAGGAAAAACCGGATAATGCTCGACTAAATATGTTTGTCGGCATAGATAAAAGACCAATTGAATGGGGGAAAACCGGCACACACACACACACACACAT:1	+	chr3R	21097469	5'	+	accord	7029	2	75.86
GATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATATTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chr3L	20831405	5'	+	roo	8692	2	63.57
AATGATTATTACATAGCTATTCATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAAAAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1	+	chr2R	13121935	5'	+	pogo	3	1	71.23
AATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATCTTTGATATGAATG:1	+	chr3L	3799810	5'	+	copia	4916	2	71.58
GGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCT:1	-	chr2L	21400367	5'	-	mdg1	332	2	75.34
AGCTGGCAAGTATTCTATTGCAAATTGGTATAGAAAAACTTTGCACTTCTGGATACCTAGAAAAATGAGTGTGCACAGCGTATTAGCTATTGAAAGTTAGTAAAATTAAATATGAGTAATAAATATATAAAGTAAAGTAGAGTAAT:1	+	chr3R	9078245	5'	+	TART-A	13108	1	74.66
AGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1	-	chr3R	11496608	5'	-	1360	3369	1	58.51
AATCAAATAGGGGGAGAGATCTACAAATTTACCCACTTTTTCTAACCAAAACACATTTTCTGAAAGTCGTTCGATCATTAGAATATTAAATGCATGCATTCATCGCCGAGGGGCGCTACCGTATATCGTACGGC:1	-	chr3L	23940542	5'	-	Cr1a	4397	1	67.16
ATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chr3R	25448470	5'	+	roo	8692	2	65.75
AACTGCAGTAGCTGCAGGCTACGCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTATGGTGTGCGGCAGGGGAATTTTACTCTGTAACTTAC:1	+	chrX	23201996	5'	+	R2-element	82	1	57.73
CTATCACATATGTATCTTGTCACGTAGCTGATAAGTATCTTTTTTATGTGCAAGCATCTTGCCAATGATATCATCATTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr3R	26222972	5'	+	roo	8681	2	67.23
GCTTTTTTCCGCTTACACAATCTTGTTTACACTCTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3L	19334383	5'	+	roo	21	2	71.23
TTCGTCGTAGTTCACAACGGCATCATCACCAACTACAATGATGTAAAGACTTTTCTTTCGAAGCGAGGTTATGAGTTTGAGTCGGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1	+	chr3R	4133592	5'	-	Quasimodo	6920	2	63.08
AGATTTCTTTGTTGTACATCATTTTCTTTTTTAATTGGAATGTTCGAAATGTTTGAACGGCGTCAAACTTATTTTACTCTTAATTTAAAGTTGTTTCGTTTCTCTTCCATCGCAAAAAATACGAAAAATAAATAAACAAAACGAAA:1	-	chr3L	10974934	5'	+	Doc3-element	84	1	65.75
AAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGGCACTGGTAAATTACAACTACCT:1	-	chr2R	4999690	5'	-	Max-element	8419	1	71.25
GTTATTAAATTGCAGCAAAGCCCCACAGTTTCGCACTAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACGTCCGCTGCCGTATCAGTTAT:1	-	chr2L	10036570	5'	+	Quasimodo	189	2	71.43
GAGTAACTTCCTAACGTGGCCATGAACTATTGAATATGCCTGAAGTTGTTGTGAATTGCGAATGGTTTTAACAAAGACACTAGAA:1	-	chrX	22896829	5'	+	Tc3	235	1	72.94
TAATGCTCACTGCAGACAGACCCGCCGAAAGCAAAAAGCGAAAAGCACGAAAATATATAGAATAAACATTTATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1	+	chr3R	20004998	5'	-	297	6931	2	55.48
CGATTGGAAACGATTTCAGATCTAGCATCACTGTGCTGCTTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1	+	chr2L	20840386	5'	-	Transpac	5209	2	68.46
GTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3R	7100919	5'	-	roo	396	1	67.83
CAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1	-	chr2R	20194267	5'	+	Max-element	8276	2	67.74
GGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1	+	chr2L	13585847	5'	+	Tabor	6918	2	70.55
ATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	-	chrX	6486798	5'	-	roo	340	2	65.75
CGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAGTCCAAACTTAGTGGAGAGAGTAAGTTGATAAGCCAGTGAAACCTA:1	-	chr2L	16856993	5'	-	Doc4-element	2514	1	66.91
ATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1	-	chr3R	10182184	5'	+	blood	7072	2	73.91
ATTGAAACATTAAATTCGGTGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAACA:1	+	chr3L	2325722	5'	+	I-element	5149	1	69.44
CACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTTTGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	+	chr2R	24218562	5'	+	412	7097	2	74.44
ACTTCTCCACCTTCTGCTCTACGATTTTCAGAGTAGTTTCCAAGTTTCTTTCCAGGATCTGCTCCAGGTCCTCAACTCCGTACAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCG:1	+	chr2L	19965946	5'	-	Doc	310	1	60.77
ATTTTTTAAATTTAAAGGTTTGCATTGATACACTTCAAATTAATTTTAATGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTCAAATTCGCAAGCTAACATTTCAATGACTTCTGG:1	-	chr2L	12325586	5'	+	hopper	284	1	72.60
TTATTTTAAAGTTTCTGCGTCTTAGGTGAATGGGTGGTGGAAATTGTAGCCTCCGAGAATTCCGTGAGTTTCCTTTCTCTATTTTGCCCTCTCACTCTCTCGCTC:1	+	chrX	6421960	5'	+	Cr1a	287	1	73.33
ATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1	-	chr3L	20033817	5'	+	blood	24	2	58.90
ATTTCAGCTTCAGCTTAAACTAAGTGAATATATAATGTAAATGTTGGCTCGTGTTTGCTTTTCGTGTTTTGGTGTAAAATGTAATTGATTGTTTGTTTCTTTGTTGTTGTTGTATTTGTTGTTGTCTTT:1	+	chr2R	13945245	5'	+	transib3	338	1	70.54
CAGCGAATGCTTGCTGATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1	+	chr3R	10182097	5'	-	blood	333	2	54.79
GTGCGTGTTTTTTACCACTTACTGCTTAACCTAATTAAGTTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAG:1	-	chr2L	7893310	5'	-	roo	8959	2	72.60
TTGCAGGCGATTGTTTTTCATGTGTGCGTATGTGACACTCGTTAACACGAAGCGAAAATGCGCGAAATGCGATATTTCACACGATTTATGCACGGACAACGACAAAAGTTGCAAAGATTTCGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATA:1	-	chr3L	11020692	5'	-	1360	323	1	78.08
CAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	+	chr3L	15600197	5'	+	roo	25	2	57.78
AATTGCCGCATGCAAACTAATTTACAAAATCAACATAATTGATGCCAATTGAAGCTAAATGCTTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	-	chr3L	888174	5'	-	mdg1	7396	2	58.90
GGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1	-	chr3R	9922046	5'	-	blood	303	2	77.69
TCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chr3L	20654463	5'	+	roo	8709	2	52.52
CAGACACAGTACCCCGAACCAAAGACCCTAGAAAAAGCAAAATTAAAAATTAAAATTATTATTTAAAATTACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCAC:1	-	chr3R	2648491	5'	+	1360	3196	1	55.48
TGAATATGTTACAGCTTAAAGTTAAGACTAGCGCTAATAAATAAAAATATGATTGTTGAGTGCTTGTGGCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAA:1	+	chr3L	16015897	5'	+	1360	499	1	60.53
AGCCTCCGGCAGAATATCGTCCGACACAATGTATATCATGGCTCCGGCCGCAAAAGACAAAGCGTATGGCAGGATCAGGTTGGCACATATGTAGTTTTTCTTCTCCCTTTTCTGAATCGACTTT:1	-	chr2R	11900879	5'	+	HB	68	1	65.32
TATATAAATGCAGAGGCTATTTTTGAGCGCTAGCATTTGTAGCATTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTT:1	+	chr3R	7484114	5'	-	412	181	2	69.18
TTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1	+	chr2R	20496875	5'	+	blood	7039	2	63.70
TCGGATTTGCGTGTCACGCAGCATCGGGCAGCGGAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTA:1	-	chr2L	14892339	5'	+	transib2	27	1	66.43
TTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATA:1	-	chr3R	1844836	5'	+	Cr1a	158	1	61.67
AATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1	-	chr2L	19965068	5'	+	Doc	66	1	54.79
ATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:2	-	chr3R	25448439	5'	+	roo	8723	2	60.27
GTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1	-	chr2L	16016394	5'	+	412	48	2	67.27
CGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCAT:1	-	chr2L	10037402	5'	+	Quasimodo	69	2	68.06
AAGGTAGTCTTTGGCCCAAATTACCTGCTTGGAATAGACGTTCAGATACAGACAATCCTCGCCGCCTTCGATTTCACGGGTCAGTAAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATCTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	+	chr3R	7535922	5'	-	roo	326	2	58.22
AAATTTCATAATTTTTCTGGGATATATCGGCAGATATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCGTGTCTTTGCCGTTGAGGCCTACTTTTCAATAGCTTTATTGAAATAGCTTTAATTAAATAGCTTTAATTTAGCCCCGTTGGC:1	+	chr2L	7112791	5'	+	mariner2	228	1	59.71
TTAGAGGGGCTGGTATTTGACCAACAGGAATGTTCTCTAGTTCTATCGGAGATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTGAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCA:1	+	chr4	863263	5'	-	Cr1a	4248	1	66.44
TCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGG:1	+	chr3R	26659758	5'	+	HMS-Beagle2	67	2	64.38
GCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAA:1	+	chr2L	17550617	5'	-	Transib-N1_DM	440	1	79.02
GTAAAAGGATATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAAGACAGAAGGAAGTGTTTCCGACTATATAAAGTATATATGTATATTCTTGACGAAATTTCACTTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGG:1	+	chr2R	4618504	5'	+	INE-1	551	1	81.25
CCTGCGTGCCCGAAAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chr3R	13360282	5'	+	jockey	15	1	73.15
TAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr3R	7835104	5'	-	roo	399	1	68.57
AAGACACAGGCGCGCAACTATATATGTATGTGTGTGTATGAGCATGTCTATGTGTGTTTGTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1	+	chrX	21009391	5'	-	pogo	2072	1	55.65
ATTTTAAACACACACACAAGGCTCAGGATCTCATTCCCTTCGCCCTAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1	+	chr3R	9975107	5'	+	jockey	4687	1	61.68
GGGAAATTCTTAAAATATTCGCCTGGGTAAGGAGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1	-	chrX	2842624	5'	+	Tabor	19	2	73.57
AACTCTATATATCACGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chr3L	16343214	5'	+	roo	8699	2	53.04
CAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1	-	chr2R	4939195	5'	-	1360	3363	1	34.25
ACTTACTCTAATTAAAGCGGCGTCCCTGGCCTTTGTGTGTAATATTTATTTATTATTGTCGGTGATGAAGCCGATCTTCACCCTTGTGATTTTTTTCTATGGGGTTTCTTGAAATCCCG:1	-	chrX	22515578	5'	+	mariner2	603	1	50.42
GGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTAT:1	+	chr3R	13237326	5'	+	3S18	70	2	77.97
ATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	-	chr2R	21920582	5'	+	jockey	75	1	67.81
CACATCAATTGATGTACACGGGTTAAGCACTTAAAAATATCACGAATACTCTGCCAAAAGTGTCAACTCAGACAGCCGAAGGGTTTAATTTATAAGATAACAACATTGACATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGGAT:1	-	chr3L	20524816	5'	+	gypsy2	62	2	62.32
GTATTGACATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCCTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTGTACTCGTTGAG:1	+	chr3R	19968060	5'	-	roo	394	1	71.53
CCCAGCGCCGAACTCCGATCGCAACTCTTGGATACATCCACCAGCAATTGCAGACCCAAAATTATATGCCATCCAGCGCATTCATTTCCATTTCAAATGTGAACCAATCATACAATAAAAACGCAGAAGCCAAAAATAAGAAAAAA:1	-	chr2R	17081776	5'	+	Transib5	16	1	62.33
GTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCC:1	+	chr2L	11985788	5'	+	G6	1710	1	72.22
AATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	-	chr3R	14364676	5'	+	roo	83	2	76.03
ATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTG:1	-	chr2R	5424283	5'	+	1360	3333	1	61.18
GATTCAAAATCTCGTTCTCTGAAACCAATAAAAACATATCGTTAGAAATCGCTAAATAAACCTCGTCTTTTAATTGCAAAAGTCATATCAAATACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGTTCATATCTTGAGGCACGAATT:1	+	chr4	909167	5'	-	1360	480	1	49.32
GGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTANGGCACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACCCGCG:1	+	chr3L	25889021	5'	+	gypsy8	319	1	73.08
AAAACTGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACTAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGC:1	-	chr3R	11547835	5'	+	G2	281	1	78.77
CAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAA:1	+	chr3R	21276553	5'	+	BS	5074	1	70.63
AGAGAAAAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1	-	chr3L	17560379	5'	+	pogo	25	1	54.63
CTCCATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTACGTTTTAAGTT:1	-	chr2L	544893	5'	-	412	7524	2	63.78
ATATTTCAAGTGATAGATAGTTTTAAATTTAATCGAGATATTAAAATGTCACAGTTTTATTATTCTAAAAAAAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1	+	chrX	18478561	5'	+	I-element	52	1	54.79
ATAGCTTTAGTTTAGCGTTTGAGAAATTGTATTTTCATGGAGGGTAAGATTAAAGACTCTTTAAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGA:1	+	chr3L	17118738	5'	-	blood	222	2	62.63
AAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATNTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1	-	chr2R	16785394	5'	+	412	52	2	73.33
ACGCACAATGGGACAAACAGACTTTCGGTTTTAATTTTCTTACCATAATTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGGTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1	+	chr3R	31720495	5'	+	pogo	62	1	67.14
TTGATTTAATTGGGTCTTAAGGCCACAAATCAGAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTGCCTAGCTTCCTTGCTAGTCTGTTGG:1	+	chr2R	19546782	5'	-	jockey	4677	1	74.66
AAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1	+	chr2R	2016847	5'	+	1360	9	2	57.58
ATGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAA:1	-	chr3R	21276650	5'	-	BS	5059	1	52.05
ATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTC:1	+	chr3R	13237307	5'	+	3S18	58	2	64.00
TATTGCGGTTAACGCTGCTGTACGACTCTCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1	-	chrX	13126501	5'	+	jockey	4702	1	68.83
CATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAA:1	+	chr2L	21325113	5'	-	invader4	3003	2	73.29
CAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACACA:1	+	chr3L	14603266	5'	+	jockey	71	1	58.62
CAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:1	-	chr3R	22822137	5'	+	mdg1	46	2	46.58
GCTTTTTTCCGCTTACACAATCTTGTTTACACTCTTAGGATTTTTAACAGTGAATTGAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3L	19334383	5'	+	roo	21	2	69.86
GGTGGACGCCGCTCAGTTGTGCAAGGCGAACAGCATTCAGGGCAACAAGGTGAACAACCTGGAGGTGGTGTACACCATGTGGGAGATCCCCAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	+	chrX	7014177	5'	-	roo	9037	1	63.70
TATCCCTCGGAGCGAAGGGTATCAAACGCTATGCACTTGGCCTTTCTCCCTTGGCTATCAAATATTTGCGTTGCCAGCTAAATTCGCTGACTCAAATGGTTACACAGTGCAAATTGAGGATTAGTCTTTGATTTGCATTGAGTAA:1	+	chr3L	4045922	5'	+	Bari2	139	1	66.90
ATGGATATATGTATATGTAGATAGGGAAAAAAAAGAAAATCCGGTTAGTTTTTTCCTTTCCTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAGCAATTTTTAGTCTGTTCATAAGAATAGCAGTGTCTGGTTTTG:1	-	chr2R	7638255	5'	+	HB	217	1	76.92
GAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAAGTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAAT:1	-	chr2L	14892306	5'	+	transib2	63	1	61.64
GAGGCAACCTTGTCATTTACTTTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1	+	chrX	5107937	5'	+	accord	7104	2	74.74
AATCCTGTAGTCCTATTTTATAAAATTAAGAGTTGTCCCGACAGACACTGAGATTAACATTTACGAGGTTATCTAAAATCAGACTGCAGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGC:1	-	chr3L	20304472	5'	-	Cr1a	361	1	52.86
ATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	-	chr3L	22349282	5'	+	jockey	75	1	59.31
GTGGGCATGGCAATTTTGGACGGTTAGTAAACAAATGATGAGGGGAAAAAGTTGCCCGAAGGGCAGGTATCGTAGCTACACCGCACTTCGATTAACGCTTTTTGTTATTGGCCAAATGC:1	-	chr3L	24300772	5'	-	BS	133	1	68.07
TATCAGAGATACAGAATATAATTTGCTGAGAGTCAAGGCACCTGCCACCCACAATGACAATGGCACCAAACCACCATGACTTACCTTCTCTTGAGTACTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGCTATAAAACATGAGCAGCCAAAA:1	-	chr3L	5032396	5'	+	Cr1a	482	1	39.04
ATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1	+	chr2R	20496887	5'	+	blood	7051	2	56.85
TTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGA:1	-	chr3R	6611301	5'	+	HMS-Beagle	52	2	53.42
TTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3R	17817968	5'	+	roo	42	2	63.64
AGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGATCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr2R	11164493	5'	+	roo	72	2	71.72
GCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTT:1	+	chr2R	5617462	5'	-	invader1	3985	2	60.27
GGAAGGGCAGGGAACATCATCAACAGCAACTTAAGTAGCTCAATAAATCTTGAGCTTAACATTTGTTGAAGCTTTTGAATAGTGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAA:1	+	chr3L	5405249	5'	+	1360	3119	1	57.04
GAATGAGAACACGGCCACTGACAAAATATTCCAATTTGCATGCTCAGGGCAAACATTTTCGATTCGACAGAATGAGAATCGCATCTTAAAGTAATTGGCCTACGCAG:1	-	chr3R	14534972	5'	-	roo	304	2	67.29
GTTATTATGCAACCATTCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1	+	chr3L	4840704	5'	+	jockey	4693	1	64.80
GTATTATTGTATAAGTGTATATGTACAGGCAGGAGCTGATCCTGGTCCGTAGGTCGCCTCATTTACGGGTGTTTACTGAGTCAGATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAGGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTA:1	-	chr3R	27771366	5'	-	X-element	4666	1	58.62
GGTTTAAATGGGTTTTCTAATTTGCCTTTCTGTAGTGGACCTTTTCTGTTTCTTAAATTTTGACTTATAGTGAACGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1	-	chr2R	2127183	5'	+	mdg3	25	2	66.94
TATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr2R	8585502	5'	+	roo	8723	2	70.83
ACAAAAAGCGCAGCCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACAC:1	-	chr2L	10037446	5'	+	Quasimodo	27	2	65.75
ATGACTGATTTTAAATATAAGGTTAGCCCTGAGGTGGTGGACACTGTCTACATACAAGGAGATGTTAAACTTTGGAATGTAACGCTGGAAAAAAATCAGATGATTAAAGGCAAAATTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCC:1	+	chr2L	75943	5'	-	F-element	336	1	78.77
ATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1	+	chr3R	18339053	5'	-	roo	9043	1	64.38
TTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1	+	chr3R	28758284	5'	-	mdg1	373	2	50.68
ACCCCAATTCTAAAAAAAAACCCAAATTCTAGATAAGTCAACCACTGGTAGACTTAACATCCGTCCCCTAATTACAACAATTCCTT:1	+	chr3L	19077870	5'	+	Idefix	7018	2	89.53
TTTTAAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1	+	chr2R	977512	5'	+	F-element	49	1	55.07
GTGGGGGTAAAATTAAAAGAAGTTTACGCAATGTTTGCATAAAATGCACAGCGACATATGCAGGCAGGTGAATAAATATGTATTTGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCCGAACCCA:1	+	chr3R	22355379	5'	+	Stalker	7146	4	50.00
GCATTTGCATTGCAAATTAATGACTGATTTCCTTGGCTTGGGTTCTCGCCCCTTTTTTCGCCAGGCTGCAAGACATCCCAACGGCAGGTCGGGG:1	-	chr2L	1502234	5'	+	mdg3	411	1	64.89
AGGAGGCGCAACACTATACATTCAATATCTGCTATTCTGTATTCCTCTTTCAAACACGCGATTTCCGAACCAATTTAGACACTTTATGTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTAT:1	-	chr2R	8624887	5'	+	Juan	4060	1	60.96
GGGATTGATTTACCTTGGTACCCTGCAACTACAAGAATTGAGGTAAATGACATACTGTTTCAATAACTAATTAGAAAGATATTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1	-	chr2R	10976498	5'	+	1360	69	1	70.69
ACCGTTCCACAAATTCCGAGGGTTTCAGACACAAGCAAGGATAGTGATGGGAAAATAAAATAATCATTGCATAAAAAAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGC:1	+	chr3R	8209500	5'	+	opus	7284	2	69.37
TTGGCTCAGTTCGTACCTGAACAAGAACCAGTCTACATCAGTATCTCGTGGTTCACAGTACTCTGGTCATAATGCTGGATCGGCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTA:1	+	chr3R	30490069	5'	+	Doc	4275	1	56.25
GCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	13585407	5'	+	412	42	2	53.97
GTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2R	19050287	5'	-	roo	357	2	55.22
CGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	+	chr3R	11496539	5'	+	1360	63	1	68.22
GGCGCAGTGAGTGTATCGATTTATCTGCGCTTACTATATACATATCTACTATTTAAAACACTTTGGCTTTGGCTTAACGCAAATGCCCAAGTAGCGCTATAAATAGTAAAAAAGTCTATATATATAAATATACACATAT:1	+	chr2R	24342103	5'	+	Stalker4	7043	4	69.06
AAATACTGTTTTTTTAATACTGTATATTGTTAGATACAAAAACACTTTTGGAATTACAAATCCAGATGGAATTATTAANAAAAAATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTA:1	-	chr3L	17653041	5'	+	S-element	34	2	61.64
AATGCATGATGCACATTGTAGTTGCAAATTGTTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chrX	5643620	5'	+	roo	17	2	71.23
CTGGCCATTAACCCATGGAGGCCCAACAAGTGAGAGTCGTACGTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGCTACCCATGTGGCAACTTAATTTGATCTACTTAAATTATTTT:1	+	chrX	13126462	5'	-	jockey	4935	1	62.02
CGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1	+	chr2R	12835040	5'	+	jockey	61	1	60.94
CAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1	+	chr3L	3799802	5'	+	copia	76	2	75.00
CTCGCCTTCGCCCTATTAAGAAAAATATTGCCCGGCTTTCCTTTCCCTTTGCTTAATTAGCACAAAAAGGCTGGCAACTGCCAAGAGTTTTTGGCAAAAGGGCATTACCAATTATTTTTAAAATATCCATTAGATCTGTTACTATT:1	+	chr3L	20049407	5'	+	Tc1	1510	1	71.23
CTTTTGTCATTTGTCATGCACAACGTGACGTATGCGTAATGAATCATTAACAAGCCAATTTGAGGCCAATCCCCCCACTCTTTTTTCGCCCAAAAATCCGCTTTGTTGCTGTTTTTGTTTTATATAAAACGATTTCACTGTTAAT:1	-	chr3R	29327890	5'	-	gypsy9	421	1	66.21
CACCATTTTCTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1	-	chr2L	14081444	5'	-	1360	3368	1	70.55
CATATATAGACGGCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAG:1	-	chrX	12074628	5'	+	412	130	2	53.42
TTCTCGAACTGAAGACCCATTTTCATAAAACAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCC:1	-	chr2R	5209718	5'	-	gypsy	7429	2	67.72
ACTTTGAAATTAAAAGTCATGCCAATGCTCGCTGGTAGTCCTCCTATAAATATTAATATTTTTCCATCCTATTTCGATAGCAGCTGACTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTT:1	+	chr2L	19823411	5'	+	G4	3814	1	61.15
ATTTCCCCATTTTCGGAATCAGGCATATATAATAAGTCATGTATTTGAGCTGGCCAAATCGGAGAAATCCCTGCGCTTAATCTCATCTCTAATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAG:1	-	chrX	11468270	5'	-	hopper	52	1	61.48
ATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAA:1	+	chr3R	22388945	5'	+	G2	2637	1	60.69
CAGTGAAGGTTTTCTGTTTCGAAAAATACATTTATATTCGTAAAAGGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAA:1	+	chr3R	24383195	5'	-	rover	340	2	77.52
TTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTA:1	-	chr3L	12879839	5'	-	roo	371	1	54.62
GGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAG:1	-	chr3R	9714463	5'	-	Stalker4	7286	4	71.23
TCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCA:1	-	chr2R	17259357	5'	+	jockey	4721	1	53.38
AGATCCAGTGTTTGGCCACAAATTTGCAGTTCTCAGCCATATGTCACCACAATATTCAAGATGGGTTTTGCCCAATTGTTTTAACAAATGAAAAACATTTACGCAATACTTGATTATATTGTATTTTAATTTTTTTTCTACTTTT:1	-	chr3R	10061624	5'	+	INE-1	471	1	66.21
CAAAAAGCGCAGCCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTCGCATATGTGACATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1	-	chr2L	10037445	5'	+	Quasimodo	28	2	65.07
AGCTCTAATTATGAAATTAAATACAAATTAAAAAGCCCATTCAAAAAATATGCCGTAATATAAACGATGTGAGCGGAGATGAAACACGCCTTCAAGATCAAAAATTCTATGTAAATCCTAATTATAAATATAAAAAAAATCATGAC:1	-	chr2L	11299308	5'	+	transib4	2581	1	54.11
TTATTTATATATTTCAAATTCAGTTAGTGTATAATCATTTGTTATTAAATCCAATAAGGGATAGACAATGATTTGGCGCAATATTCTTTTCAGCTTCACAAAGAACTTCTTCCATATATGAGGGAACTGTGAAAATTCCAGAGATA:1	-	chr3L	19868994	5'	-	Q-element	17	2	67.12
TAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chr3R	25448355	5'	-	roo	342	2	68.94
AAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTA:1	-	chr2L	4039201	5'	-	roo	371	1	52.05
TGCGACCCACTGTGCGACTTGTCTTGCGTTTGAGAGCAGATATCTGCTAATGAAAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAAT:1	+	chrX	17299726	5'	-	1360	318	1	67.12
CTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATC:1	+	chr3R	13237317	5'	+	3S18	80	2	74.45
CGTATACCAAAAGAGACAGCCGGGAAGTAATTCATAATTAACATAATTGAGGCACCCGGCCGTTGAATGTTTTTGTGCTTTGATGAGCAGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTT:1	+	chr3R	11946725	5'	+	invader6	109	2	65.93
AGCAAACACGCGTAAATTAGAAGTAACAACAAAAAAGTATAAAAACACACAAAACAAAAAAATTTGTTTGATTGCGTAAAATTAGGAAAGGCAATATTATTATTTTTCCTTACCAAATTGTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAAT:1	-	chrX	7690805	5'	+	G4	3524	1	66.44
TTGTGAAACACACAAGACAAGTTTCTCTAGAAAATTGCATTTTTGCGCTTAGTTAAAAGTTATATATAACTATGATACATTTAAATTAAACATGCATATATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1	-	chr2L	12498480	5'	-	pogo	2097	1	76.52
GGGGGGCTTTTCGTTTATTTTTTTTTCTCATTTTT:1	+	chr3R	16944551	5'	+	INE-1	472	1	91.43
AAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	+	chr3L	15600185	5'	+	roo	48	2	60.00
AATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1	+	chr3R	17478357	5'	-	copia	204	2	54.79
CATTGTGGCTGTTGCTCCTGTTGTTGCTCCTGCCTTGGATGGCTGACACACATACACAAATACACGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1	+	chr3R	8065196	5'	-	297	345	2	60.00
AATAGCGTTCACAACATCTACGTTTACAAATTCTTTAATAGATCCGTACAGAGATTATTCCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGG:1	+	chr3L	27549311	5'	-	invader4	2757	1	56.93
CAATCTATTTATATTCAGTGTCACCTTTAAACTACTCTCTTGAGCAAAGAATTTCCGCACAAATGAATTTCTTTCGCTTAGGTTAACTTGTGGGAGATCTGACAAGTATATAGTAGCATAATATGCTTCACATAT:1	-	chr2R	17694203	5'	+	rover	3	2	52.59
GTGGCAAAAACCGCACAATCCACATCCACTCATTGTATACAGTCAATATCCCAAGCGGGCGATCTCGCTCCCGAAATAATATAAACATTAAGTACTTGTTCGCTTTCGGGT:1	+	chr2R	5226058	5'	+	invader2	4924	2	78.38
ACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGNATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1	-	chr3L	20888799	5'	+	1360	43	1	56.15
GGTCTTTTAAAAAAATAACTCAGTGTTTCAAAAGTCAAGGGACATTTATTAATATGGCACATATAAAAGCGAAATCAAAAATTTGCTTGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTG:1	-	chr2R	22483061	5'	+	mdg1	7234	2	66.17
TTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1	-	chr2L	544878	5'	-	412	7505	2	52.67
CTTCGCTGTGAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1	-	chr3L	11957212	5'	-	blood	7369	2	56.70
CGTTTGCCCATCCCAGCGTCGCTGGCTAACGTTTTTTATTGATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	+	chr2R	6034698	5'	-	pogo	2039	1	72.31
AATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGA:1	-	chr3R	20499827	5'	-	mdg3	173	2	70.37
GAATATGAACATGGTGCCCATGCCCGCCCCAGTTCCGGCCAGCGAATACGGAGTGCCCAGCACCACCGCCTCATCCTACGATCCCAGCAGCTGGGTCTTTTTCTTTTTGTTGTTTTTTTCTTTCTTTTTT:1	+	chr3R	6340856	5'	-	gypsy7	5010	1	71.54
TGCATCATTGTTTTCGCTGGGGAAAACTTTGAACTTTGGAGTCGCGAGTGGCAGAGGAACTTTAAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2R	14387877	5'	-	roo	396	1	75.71
ACACACAATAATTGTAATCTACCCCAATGGTGTAATGGTAACTATTGTATTATTTTGTAAAATGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCG:1	-	chr2R	15002427	5'	-	jockey	438	1	50.78
ATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	+	chr3L	24292003	5'	+	1360	59	1	78.57
ACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTANTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCT:1	+	chr3R	13237278	5'	+	3S18	50	2	50.68
ACTAAATGGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAGT:1	+	chr2R	5284575	5'	-	Doc4-element	2558	1	66.44
GGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1	+	chr3R	21705946	5'	+	297	6597	2	68.66
ACCAAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1	+	chr2L	15833439	5'	+	jockey	23	1	65.42
GGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1	-	chr3R	11496620	5'	-	1360	3329	1	58.90
GGCCAAAAACTACAAAAAATCCACAATGCGAGCAAACAGAAAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1	-	chrX	18030359	5'	+	opus	22	2	62.28
CCAATTTGGAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1	+	chr3R	9921942	5'	+	blood	12	2	74.62
GCAAACCCACCTCAACATCGACCTCTTTCCCGGCCGATCCCCCTCTCCCATTATCTTATATAGGTGCTATAGAGGTATTTTCTCGATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1	-	chr2R	16945390	5'	-	jockey	4976	1	60.66
AATGTTTATTGTTGTGCTTCGTGGAGCGCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1	-	chr2L	18404618	5'	+	hobo	14	1	66.35
GTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGAAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTATAAGTTGAAGGCAGCCGT:1	+	chr2R	15064346	5'	-	412	7512	2	50.00
GATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCAT:1	-	chr3R	19450061	5'	-	roo	68	2	66.44
GCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	+	chr2R	9632078	5'	+	roo	30	2	59.85
GCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTAAAGGCAAGGGGGAGTGAGGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAA:1	+	chrX	23202018	5'	+	R2-element	493	1	52.44
GACAGTCTGCTGTCACCTTTTTGGCAATATTTTGCTGAATATTTTTGATATAACCATAATTTCCTTGATTGCCAAAATGGACACACAAATATTTATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1	-	chr3R	14981287	5'	+	mdg1	28	2	65.75
CTGTTCTTTGAGTGAGCACAAGTGTCAATTTGAACACTTTAGAAACATGATCTCATCGGGTGGCAAGATTCCTGCCTTCTTGAAAGGTTCTTCAATCTTACGTGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACG:1	+	chr2L	1903811	5'	-	R1A1-element	5002	1	64.38
AAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chr3R	19450152	5'	+	roo	8692	2	77.78
GAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:1	-	chr2L	11661041	5'	+	F-element	18	1	58.26
TCTTTATTTCTTTTTAAAAATGGTTTTCCAAACCAAATTAAAAGTGTAAACATGGAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAG:1	+	chr3L	20168357	5'	-	mdg3	180	2	61.38
GTACTCGTTGATATTTTTGTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2R	19004109	5'	-	roo	396	1	73.33
ATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3L	15600177	5'	+	roo	8684	2	44.76
CTAGAATTCCCCAAGGGGTTCCCTATTCACCGCTGCCGGATTCGGAAACTTGTGTTCGTACAGTGGGTGCAGTACTGCTCAATAAGTAGTTCAAAATAAGGACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1	-	chr2L	12250175	5'	+	1360	6	2	79.10
CTAGGGAATTATTTATTAGCAAAACAACGATTGCCGGGTTAACTATTATATAATACATATATATATAGTGACATCCATAAGTTCAAAGTCTGTCCATAGAATAAACCCAAAGACACTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATCT:1	+	chr2R	3928471	5'	-	1360	493	1	73.29
CGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1	-	chr2R	5031014	5'	+	Doc	62	1	71.43
ATCGTCAAAGAAATAGTTTTAACTTCACAACTTACAACTTAAGGATCTGAATCCAATAACAAATATAACAAAATCGTCGAATCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGT:1	-	chr2L	7263556	5'	-	P-element	124	1	54.39
AAGCTCACTGTAGTATGTCAAACCATTAGGAAAATCTACGAAAAACATGATTGGTACAAACAAAATACATAACATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAAT:1	-	chr2R	9091939	5'	+	1360	3014	1	48.63
TCAAGCGATTGCAAGGGACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTTAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	-	chr3L	20654594	5'	-	roo	397	1	70.34
TATATTCGAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGGCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3R	14364684	5'	+	roo	75	2	69.18
TTTGTGTTGTATTATTAAATTTCTACATTGTAATTTTTGTTTTATTTTTATATGTTGGTTTTAAAACTTAGTTGCCTTTGGACTGAATGGATTACAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTTTTT:1	+	chr3L	6536326	5'	-	297	450	1	67.44
TTGAGTTTCGACAGCATATCCCCATACACCGATGATGTTTAGCACTAAGCAAATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTG:1	-	chr3R	24383367	5'	+	rover	6979	2	65.07
CCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCTCAAATAAGAGTACTTTACTCGTTGAGTTTTGGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr3L	20831275	5'	-	roo	9013	2	56.16
CACTAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACATAATTCGTGAGCAGCGTCAGCGTGAACAAGACGAGCGTCAGCTCTCTTCACTCAAAAACAACGCGCATTTCTCGTTCGTTT:1	+	chr3L	16995274	5'	+	Doc4-element	67	1	80.36
ATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTGGCTTTATTGTTGCAATTT:1	-	chr2R	16248009	5'	+	BS	53	1	55.48
ATGTTTTGAACAAGAATTCCGGGATAAGCCCCAACTAATTTATATTGTCTTTAACTATATATTATGAAAGAGCATACATTAGGGACACCAAAACGATATTTAAAAACATTTAAGTTGCAACACTGAATTTTTTATGCGATATC:1	-	chr2L	22688157	5'	+	transib3	138	1	63.64
TAAGCTGGCTAACTTGGTACAAAGAAGATCTGCACGAGGGTTATTCCTATGCTTGCTCTGTCGAGGATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCG:1	+	chr3L	12886199	5'	-	roo	260	2	52.86
CAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATGAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1	-	chr3L	21855537	5'	+	blood	60	2	58.22
AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGA:1	+	chr2R	2007459	5'	+	1360	54	1	49.29
CTTTTACTCTACGTGTAACAGGTATAGCTCAGACTCGTATAACAATCTTTTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGAGTATTAGTATGTA:1	+	chr3L	25842115	5'	-	Idefix	40	2	72.73
TAATAATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1	-	chr3L	15177321	5'	-	roo	9032	1	53.33
TTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr2R	20596470	5'	-	roo	8997	2	69.18
AAATAGAAACTGACTGTGTCTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1	+	chr3L	10574263	5'	-	Tabor	445	2	54.48
TAATCAAAGCGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1	-	chr3R	10274058	5'	+	HMS-Beagle	45	2	54.79
TCATGTACATATGTACGTACATACATATGTCAACAAATTTAAAAGTTGTGCTAAACTCATCTCTTTTTGATTTTAAACATACACTTACATTTAATTGCTTGCAGGGTTCAATCAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGG:1	+	chrX	6624936	5'	+	Tc3	311	2	47.26
ATTATTGACTAGTTAAACATAATAAAACGATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCTCATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	-	chr3L	233359	5'	-	roo	401	1	73.73
TGGCATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	+	chr3R	7482714	5'	+	412	7092	2	57.24
ATCTAATTAAAAGCCTAACACGAATTTGCAATTACTTGTAATCTGGATTAGAAGGCCATATGCTCCTTATGTGCTTAGTATTAGAATTAGAAGTTATACTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1	+	chr2R	9325361	5'	+	BS	5017	1	57.53
CGTCTGATCAGGTCCTGGTACCTTTATGGCTTTAAGGCTCTCGAGCCAAATCTAGGGGATGAGTCCTGCGCAGTCTTCGGCGTTGTTCACTATTGTCCAGTAGGAAGATGGCCGTTATGTTGGAATGCCTATGAAGCCTCTTTATG:1	+	chr2R	4932735	5'	-	G7	968	1	74.66
GTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTTATTATCATATATT:1	+	chr3R	3922955	5'	+	Cr1a	84	1	70.21
CTCCTTTAAATTAATTAATTCAATGCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGAGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1	-	chr3L	26011934	5'	+	F-element	36	1	59.49
AGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1	-	chr3R	10182203	5'	+	blood	37	2	55.45
GCAACGCTCGCTCCCGACGCTCTCAGCGTTTCCAACGCTTACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAG:1	+	chr2L	22975335	5'	+	1360	105	1	62.07
GGCATTTTAATCAACATTAAGCAAAAATGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACA:1	+	chr3L	18374539	5'	-	opus	205	2	78.05
GCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATC:1	+	chr3R	25423217	5'	+	3S18	80	2	69.86
CAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGCCGTCAGGCCACATTGTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1	-	chr2R	20496994	5'	-	blood	303	2	67.59
GCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1	-	chrX	6486776	5'	-	roo	8982	2	80.82
AAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1	+	chr2L	14081346	5'	+	1360	44	1	80.68
AATTGCAATTTGTTATGGCCTTTTGCTCAATAATTTAAGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGCTTTAAGTTGAAGGC:1	+	chr2L	18419103	5'	-	412	7518	2	65.52
AAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCCTATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr2R	19004232	5'	+	roo	61	2	60.27
CGTCTTGCCGGCTAATTAGCAAACTTAAACTGACAACATCTTTGGCCAAGTTCCATAAACTTCAGCTCTTCTGGAGTTAGTTAATTGAAAAAAGTGAAATTTTTGATTTTCGGAACTTTTGTAACTTTTTCGAAAATTCATATCT:1	-	chrX	20116184	5'	-	FB	122	1	49.66
AAGATGACATACATTGCAATACGTTTTATTTGATCTAGGTTTTAAATTTGTCTATATTAAACAGAGGAAAGTGTATTTTACATCCCAAGCGCTCCAAATTGACTTGCCGATGCAACCGATCACTCCCAGCGAGAGTGCAGACGTCA:1	+	chr2R	2074864	5'	+	BS3	209	1	58.22
GTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTTATAAAGTCT:1	+	chr3R	14981140	5'	-	mdg1	396	2	60.16
AAATAGGGGCACAAATTTGCCATTAGAGGAACTTCGCACANTTATTAATAAGTTCTTGAAGTTAGAAAACTTATTTAAAAATCCAATTA:1	+	chr2R	9629473	5'	+	HeT-A	361	1	68.54
CTTTTGAACAATTTTAAAATTTTTTCTCATTTTATTTCCCAGTATCTATCGATATCCTAGAAAAATGATGAAACTTGCTTGTTCGCATACACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGG:1	+	chrX	20360190	5'	+	INE-1	553	1	80.00
CCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGCTTTTTTGGCACACGAT:1	-	chr3L	23906467	5'	+	1360	34	1	57.27
ATCGTATTTGTTTTCCCCCCTCGTGCGTTGCCCCAACCCCAGCTCGATCCCAACTGGATCCCGGCTCCCATCATCGATGACCCCATCGGAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1	-	chr2L	19322370	5'	+	1360	38	1	75.21
TTTTACATTTTCCTGCTTTAATTACACAAATTCTGGTTTATTACAAACGATCGGGGTTCTTGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1	-	chr2R	9544128	5'	-	opus	7469	2	56.91
AAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1	+	chr3R	9921986	5'	+	blood	39	2	61.06
TTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAA:1	-	chr2L	20117950	5'	+	invader4	58	2	63.70
ACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGAGGAAGGTTGACAGGGCCTTCCGAGCAGAGACTGTTGTGTCC:1	-	chr2L	9399516	5'	-	Transpac	5201	2	58.82
AAAAAAAAAGGAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGCGAATCGCATCTTAAAGTA:1	+	chrX	14336437	5'	-	roo	318	2	79.45
AACAAAGTAATTGTAAAAGACCATTTCCCATTACCGCGCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTACTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1	-	chr2L	21400411	5'	-	mdg1	388	2	58.96
TAAAACGTTTGCAATTTTCGAGCGACTTTACGAGTTATATAAAGAAGAGGCGAAGCTCTCGTCTTGTTCGTCTCAGTGCCCATTTTCTTAATCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATTTTCCTTGG:1	+	chr3R	7941452	5'	-	Bica	443	1	65.75
ATGCTAGATAGTTGGTTTGACTTAAACGTACATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chrX	2444302	5'	+	roo	8677	2	72.60
CACACCACACATATATTGGAAAAAATATTTCTCGGATTGGTGGGCCAGCTCAAAGACAGGAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGC:1	+	chr2L	22125867	5'	+	gtwin	6928	2	46.58
CCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCC:1	+	chr2L	19310315	5'	+	Juan	4118	1	50.36
AGAAAACCAATATATCTGCAGGCAACCAGTACCAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1	+	chr3R	7641018	5'	-	hobo	2912	1	58.46
CTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTATGATTTTGTT:1	-	chr3L	20831355	5'	+	roo	8748	2	76.03
TATTTTCTGTGCACTGACACCGAAACAAAGATCGAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1	-	chr3L	3863575	5'	+	blood	7028	2	73.97
CCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1	-	chr3L	22968413	5'	-	mdg1	343	2	71.03
TGATTTTATTATTTCCCCAACGCCACTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCG:1	+	chr2L	10037593	5'	-	Quasimodo	199	2	76.58
TCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGACTTTAAACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAAT:1	-	chrY	3631960	5'	-	Stalker	7201	4	60.96
TATTATTCCGATTTTAACCATTTCGGGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCTCACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCAC:1	-	chrX	22386824	5'	+	hobo	60	1	66.67
CTTGAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAGTTTTTGGCCGTG:1	+	chr2L	14081290	5'	+	1360	46	1	53.42
TATCAGGCCGCTTCGTTATCGCTGATGGGGCACTAGAACATCTAACAGCATAATCAAAATGATTTAATATATTTGCCTGTGCAAACAAACACACACAAGCAAGAAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAG:1	+	chr3R	26237300	5'	+	1360	3292	1	65.75
CTGCCATAAAATCCGAATGATTTTTTAATTGAATTACTGCAAATTGTAGGAATAAATGAATTTGAAATGATTTTCGCTGTCTTTTGGAATTACTAGTACCATATAATAGTCGCCCTAATTATCGAATTAATGGATTAAACGAAATT:1	-	chr2L	13807047	5'	-	jockey2	3395	1	76.03
AAATCAATTGAGGAACCTTGCTTTTTATAAGGAGCATCCAGAAGGTCCACTTGGCAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATA:1	+	chr2R	1657823	5'	-	copia	4923	2	54.17
ACACAGTGAAAACGAAGGAACAAATTATTCTGGGAACACACGGGATAAGTGCGCCTCCTTATATAAAGGTAGTTCCGCCTGTTGTATTCTCCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCCATCTTGGTTCGCTTC:1	-	chr3R	7737969	5'	+	Q-element	496	2	59.12
GAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCGCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	-	chr2L	16091986	5'	+	roo	8716	2	63.28
GTGCCTATATACTCGAAAAGTTGGTCACGATTAATGAGTTGAATGCTTTGGTCGGCCTTCTGTTCGAGAATCCAGTTACTCGTAGAATAAGAGGTTGTACTTGACAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1	+	chr2R	6726283	5'	+	INE-1	246	1	60.16
AGTGCGCACCTAAGATATTATTTAACAAAGAATAACAAACTTAACTAAAATAGAAGGTAAAGAGTGACTTTTAATACCTTTCAACTACTTACTTTTTTTTTAATATACTATTCT:1	-	chrX	11547826	5'	-	BS4	728	1	89.47
GCCAAAAGCGTCACTTAAAAGCGAATCAACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATAGAT:1	+	chr2L	2547971	5'	+	blood	92	2	78.62
TTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTGCATGAATAATAAGTACCAT:1	-	chr3L	19339406	5'	+	Tc1	93	1	75.86
AATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1	+	chr2R	12835054	5'	+	jockey	72	1	69.60
AGTGTAGCCCACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGCGGTCCAAACCAGCCAC:1	+	chr3R	21705930	5'	+	297	6592	2	73.10
AGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1	-	chr3L	16750738	5'	+	Tirant	8146	2	56.88
CTCAGCTTATTTGCATATGTGGCAGGTTTTCTTTACCACCCGATCCTACCACATCAGCCCACCCCACTCCACTTCATGCCATGCCATCACGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATTGTAATGCATT:1	+	chrX	2843629	5'	-	Tabor	487	1	68.70
TAGATGATGTTTTCCTTACCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGAC:1	-	chrX	22643349	5'	+	Tc1	1599	1	50.00
TTGGCCTTCATGTGTTAAATACTCTTGTCAATGCGAAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTC:1	-	chrX	6279439	5'	+	P-element	4	2	70.59
GGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	+	chr2L	12892647	5'	+	roo	8726	2	78.95
TCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1	-	chr2R	15064434	5'	+	412	63	2	63.38
AGCAGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCTAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1	+	chr3R	12717717	5'	+	297	6627	2	54.79
GTGGGCGTCTGTGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACA:1	+	chr2L	19310277	5'	+	Juan	4077	1	69.85
AACAATTTTTCGGTACTTCGAGCTGTCTTTCGGCATTATTCTTACCCAACCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTTTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTAA:1	-	chr2R	6486773	5'	-	Circe	7359	2	75.34
AGCATTGAATGTAATATATACCAAAACCTTCACTATTTATAGTTTAAAGCGTTGGTATTCAATGCAATTGTATTAAATTATTTAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACAATCAGATATCCGTTACTCA:1	+	chrX	17252945	5'	-	INE-1	548	1	59.70
TATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCGGACGTGTGAAGACGTGTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1	-	chr3R	17831878	5'	+	F-element	39	1	44.86
ATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTTTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTATACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATA:1	+	chr2R	7586165	5'	+	I-element	5123	1	75.34
ACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1	-	chr3R	18585640	5'	+	P-element	69	1	26.23
ACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1	+	chr3R	15072568	5'	+	pogo	57	1	65.41
ATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGACTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr2R	12835034	5'	+	jockey	35	1	55.96
AAGGATTGGAGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTAC:1	-	chr2R	21298845	5'	+	jockey	240	1	61.02
TTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAGTTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAAACTGAGTTCA:1	-	chr2L	22121627	5'	+	gtwin	6984	2	60.69
GCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGC:1	+	chr2R	5209620	5'	+	gypsy	7058	2	71.54
GAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1	-	chr3L	22968425	5'	-	mdg1	7392	2	63.01
ACTGATAAACTTAAAATGGGGGTGTAATATATATTATTGGTATAAAAACATGATATTATGTTGATTTTATAACTTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCCGGTGCACGCTTTAGAGG:1	+	chr2L	15227261	5'	-	gypsy12	10150	2	48.61
CCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1	-	chr2R	2016930	5'	+	1360	4	2	76.24
AATCTATTTTCAAATATTCTAATATATATTCTAATCTATTTTCAATAACGTTTCTAATAACGTTAGGGCAATGCAAAACAATAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTATGG:1	+	chr3L	12978984	5'	-	1360	231	1	71.23
GGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTGTTGTGCATGGGTCA:1	-	chrX	22715165	5'	+	Bari1	30	1	62.12
GAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTA:1	-	chr2R	5532367	5'	+	G4	3776	1	52.45
GTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGACTTTAAACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATC:1	-	chrY	3631957	5'	-	Stalker4	7307	4	62.50
AGAGTGCCTACCTCAATAAGTTGCGCAATTGCTGGTCAGCCGGGATTTGCCCGGCTGAACTTCCTGTTGCCGGGCTAAACCAACCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCG:1	-	chr2L	14103845	5'	-	Quasimodo	6980	2	72.88
AAGCAATTGCAAAACAAACATAATATGAAATGAATTAAAGAAATAAGCGAAATACTTACATAGATTAAAGATTAAAAACCAAACCAGGAAACTGATGACGAACTGCACACACAAGCGAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGT:1	-	chrX	22452434	5'	+	1360	3276	1	76.03
GATAGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1	+	chr2L	9399448	5'	+	Transpac	58	2	62.77
TTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTG:1	+	chr2R	16891849	5'	-	hopper	1349	1	68.46
GCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCCAAACCCCCACGC:1	+	chr2R	11629737	5'	+	Tirant	12	2	68.32
AACATTTTTGAAGTTATCGAATGCATTTGCTTATGATATGAAATCTTTAAGACTATGCATCTCTGTGTTCTTGTTTATGTCATTGAAGCTATCTGAAAGACTGGTTTTGGGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCA:1	+	chr2R	16105359	5'	-	R2-element	3346	1	73.97
AGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCNTGAATGTAGTGACCCATAT:1	-	chr2R	4802885	5'	-	mariner2	278	1	38.78
CACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCG:1	-	chr2L	22685212	5'	+	Ivk	48	1	52.74
TTGTGTCTAGAGTGGGCTGCACTTGTCGCAAAAAAGCTGCAAAAGTTTGTGTTTTTTTTTTGTTTTTGCCTCTATACAAAAAAAAAACAGAATCCAAA:1	-	chr3L	4615667	5'	+	transib4	2538	1	59.18
GAAATGGCTCTTTTTTAATTCATTTGGAAAAATTCAATGTTCCTAATGGTTATGTTTTAATATGTGCTAATAATGTTAGTTCTCACTGTTATTTACAACACCAGTGATACAGAAACAATTAGCTACATAACAATTATGAGATCATC:1	-	chr3R	4484472	5'	-	BS3	1623	1	67.12
AATAAAGGCAATTTTTATTGCAATTTGCATGAATAAACTATAAAATAAGCATATAAATATAAATAATGTGTGTTGCCACAGTTACAACAACAAAAACGAGAATAACGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:1	-	chr3L	2841045	5'	-	copia	240	1	73.29
CTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	-	chr3R	25448460	5'	+	roo	8702	2	58.90
ATCAAANTGCCAATCGGTTGGCGGATCCATTTCATCCAGGTTGCCACTAACACGAAGATCTATGGAGGAAGCTCCAAATGCATGAATGGCCATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACTTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCT:1	-	chr2L	9644830	5'	+	Cr1a	496	1	62.33
AGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCC:1	+	chrX	21087541	5'	+	mdg3	5283	2	63.01
TGATCGATTCCCTTTTTTATCGCCCGTTTTGAGCTATTAGCACAAGCCGATGAAGACGAAATGCATGATCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCT:1	-	chr2R	8775098	5'	+	Cr1a	4233	1	59.29
ATACTAATGAACCAATATTTGCATATCCTTGCTAGACAAGAGTCTTTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGAAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTG:1	-	chr3R	27979817	5'	+	mdg1	7412	2	70.55
CGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1	+	chr3L	7292433	5'	+	HMS-Beagle2	6916	2	65.75
CATCGGGCAGCGGAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1	-	chr2L	14892318	5'	+	transib2	46	1	53.19
GCTGCAAGCTTTTAAATTTTCTACCAGCAAGAAATAACAAATATATATTTCAACAGGATAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1	-	chr3R	12598557	5'	-	hobo	2898	1	51.18
GATGGATGCTGTACGCTCCTGCTCCTGCTCCGGTTTCCCTGGCGAATGGGCGTTTGCCATTTCAGATTAATGCCCGGCGGCGTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGGTGTGTC:1	+	chr2R	19797989	5'	-	Transpac	283	2	63.97
GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTT:1	+	chr3R	17660024	5'	-	micropia	393	2	65.67
ATTCTAATTCAAAGTATACATGTTCTTATTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAA:1	+	chr3L	17945186	5'	-	Juan	4126	1	78.77
CTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAA:2	+	chr3R	9714351	5'	+	Stalker4	6988	4	63.70
ATAACACTCATTTCGGGCTCTTTGACTAGGAAATGCTGATCAAAGAAACATTGAAAATTTAAATATCTAGATAAATTATTCTGCCTTTTTGATCTTATATTTTTATTTCTTTTCTTTTTTTTTAGCTTTAAAACTAAAAAACTTT:1	+	chr3L	6837583	5'	+	1360	3025	1	50.34
CCCGGCTCTCTTCGCCTCTTTTGGAGCTCGCTCTTTGCCGAACGGAGAACCTACCGCAATTCGTTTCGTGGTAGATTAATATAATATTATTGTAAATGCATGCATTCATAATTGAGCAATGTTTATTTCTGTATACCAGAAATAAA:1	+	chr2L	2956123	5'	-	Transib-N1_DM	390	1	51.37
AGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACNNNTATATTTAAAGACTTACAATTNNGGGCTCCGTTCATAT:1	-	chr3R	17817973	5'	+	roo	8701	2	54.55
GATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr3R	19968076	5'	-	roo	9054	2	67.74
AAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:2	-	chr2L	5254350	5'	+	roo	82	2	75.34
GAAACTGGCTTGGCCATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1	-	chr2L	17471722	5'	-	roo	9043	1	64.14
CTTACAATACTATTCTGAGTGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCCTCGTATAAAATCGGTTGTTTTTTTTACTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACTAATAA:1	-	chr2R	5348401	5'	+	Doc2-element	83	1	78.33
ACCACTGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTACA:1	-	chr3L	16343282	5'	-	roo	321	2	73.79
CCTAACTGCCACACACTTTAAAGCATCCTCCCAACCATCAAAGTAAAAAAAAAAA:1	+	chrX	14742805	5'	+	TAHRE	10435	1	92.73
GCCGAGATCCGAAAAAGGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCC:1	+	chr2L	21008521	5'	+	invader3	5192	2	73.79
ATATGGGTTTTTTTGTTGACAAGAAATTACAGAAATATTTGTTAGGGCGTTAGAGTGGGTGTGGCAACATGGATCAACAAACTTGAGTTGCGTCTCTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTCTTATAGTTCTTGAGATCTCGACAT:1	-	chrX	20672618	5'	-	INE-1	143	1	69.18
AAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	13585394	5'	+	412	7095	2	53.24
ATTGTTGTACATGTCCAAATAGTTTCTAAGCAAAACCTCATCATTTAGGTATTGTTCGCTGACCAATCAATCGAATATACAAGACTATCAAAAATATGAAAAATATCAAAATATTTTTCAAAGGTGTGGGCGTGACAGTTTTGTGC:1	-	chr2R	21096056	5'	-	INE-1	241	1	52.05
ACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATG:1	+	chr2L	12290658	5'	+	1731	53	2	52.08
GGGGCTTTGGTATTGGTATTTGTATTTGCGGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATT:1	+	chr2R	10124150	5'	+	P-element	91	1	23.29
TCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1	-	chr3L	7943711	5'	-	Burdock	6332	2	61.64
CGACACATTATTTAGCATAAAACATACACATCTAATGGAATGGCAATAATATCGATATATTAATTTGACATTTTCTATCATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTG:1	-	chr3R	19271889	5'	-	I-element	41	1	64.18
CTAACTTGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	-	chr2R	13710651	5'	-	roo	8990	2	76.26
TGTAAATATTTTATTTTCTTTAGACGGCCAGCTAAATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1	+	chr3L	10647852	5'	-	412	7540	2	67.81
ATTTAATTTAATTGCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCCATGTACATATCATAACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTG:1	-	chrX	9151941	5'	+	1360	374	1	52.46
ATGCTCAGCACTCCGTTAATATAGTCATTCGATAGCTTTTTGTTCAGGGGGGCCCTTTTCTCTGGCCCTTCTACTTTCACTGGAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTC:1	+	chr2L	14532661	5'	+	1360	470	1	59.26
GCTATCTTATCCATAGAGAGTTATATTTCTTTCCTTTAGGGGCGTCTGGCCACACTTTTCCTAACTTCATTACATTTACATCTACTTTTGCCACCGCCAAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAA:1	-	chr2R	3181558	5'	-	Tc1-2	152	1	61.64
TAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3R	17817974	5'	+	roo	8685	2	55.79
TATTAAATAACATTCAACGGCAATAAATAAAATATTTCATACACCAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACATAACCACTATCAACTTTAAGTCTAGCATGTTGGTACGCCCAAGTTGGTAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	-	chr3L	27174121	5'	-	1360	3370	1	62.33
ATTATTATCAATTGTGAAGTATTAAATTTTTAGTGAATGTGTTTAAAATTGTATGCCGTAGGTAATTGTGAACGGTTCTTACCTTCTCAGTAATCTATTTAAAATCTTTGTAAATAGGTAAAAGCACTTTTCATTTTTAAATCTTT:1	+	chr2L	9982575	5'	-	Dm88	4239	1	60.96
ATTGAGGCAAACAGTTTTCCTTATTATCTTTAAGCCTGCAAATACAGTGGTTACTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1	+	chr3L	6978093	5'	+	pogo	15	1	73.10
ATTTAGTTCTCGCTGCAAACTAAGTTAATAAAATATAAATAATAACGAAAATCAACAGAATTGACAACCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCAATCCGTTTCAGTTAGGTATTTCATATTCCGTCCTGGAATTTATGATATCTGG:1	-	chr3R	16057291	5'	+	Circe	368	1	54.79
ATTAGAATATTAGTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr3L	22437985	5'	+	roo	18	2	70.08
AAATGGATTTCAAGTTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACTCATGAACACGAATATATT:1	-	chr3R	22956068	5'	+	roo	5	2	68.52
TCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1	+	chr3R	14981148	5'	-	mdg1	365	2	56.16
GTGCAAATTAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	+	chrX	10639997	5'	-	roo	9028	1	52.41
GGTCAAATTGCTTTCCAAGGTGCCAAAGGAGTTCAGCCACTCGACAAAACGTTCTGCCGACTGTGGAGATGGGAATTTTAAGGTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTT:1	-	chr3R	8770443	5'	+	HMS-Beagle2	7003	2	56.85
TTGGTATTTGTATTTGCGGGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAG:1	+	chr2R	10124162	5'	+	P-element	66	1	20.18
CCATAAGTTTGTAGAATAAAACGACTATAATAAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTACGTAGCTTTGTA:1	+	chr2R	5209562	5'	+	gypsy	28	2	66.21
CAAGCATGTTAAGTGTCCGATTATCTTCGAACTGTCGTGTACCGCAACTTATCGAGTGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGAATTTGACGAAATAAACA:1	+	chr3L	23295695	5'	+	X-element	4380	1	56.00
TGAATAGCGACGAAAACTACGAAGGATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCA:1	+	chr3L	18368871	5'	-	opus	7484	2	72.60
CTGTCTTCCCATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr2L	3114571	5'	+	roo	8709	2	57.26
ACCAAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTATGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTGACCAGA:1	+	chr2L	21702342	5'	-	Tc1	1237	1	77.86
GTGGGCNTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTC:1	-	chr3L	8249129	5'	+	jockey	4585	1	57.53
TTGAACACCAACTCTGAGTTGGGATATGGAATATGGGTTGGGATGGGAATTTATTTTATGTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1	+	chr3R	23497205	5'	-	copia	255	1	57.53
GTATAAGCGGACTTTTAATACATTGATTTGTATACTATTGTTTAGGTCTTAAGTTAAATGGACAGAATAACCAAATATTTAAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCT:1	-	chr2L	5507293	5'	-	jockey	4748	1	47.95
GTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1	+	chr2R	21907903	5'	-	roo	9032	1	56.83
CGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAACACAGAGG:1	-	chrX	6499040	5'	+	Quasimodo	48	2	64.46
GGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGCTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGGTTCGTTCTCTCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCGTCGATAGTTAGCTGCATCG:1	-	chr3L	17560383	5'	+	pogo	20	1	53.27
CCTTCCATATTCCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:1	-	chr3R	1433206	5'	-	mdg1	7382	2	68.49
AATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGCCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAAT:1	-	chr2R	13006489	5'	+	3S18	5848	2	74.45
CTCCTCCTTTTCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1	-	chr3L	20888837	5'	+	1360	19	1	69.44
ATTTCGTTGCTTTGGAAAGTTGGCGGGTCTGTGTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1	+	chr3R	22122701	5'	-	roo	9027	1	59.83
GAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr2L	17420233	5'	+	roo	8744	2	73.97
GTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCT:1	+	chr3L	25804307	5'	+	gypsy	140	2	83.53
TATGCTGCGACTGCCGCTGCTCTAAGAAAGGAAATTCAATTGGCCAAAAGGATGGAGAGGAAGTGGAGCTGGAAAGGTTCTTCCTGCATTAAATTAGCTGCTTAAAGGTGGGAGGAAAATATATATTTATACATATACATATACA:1	-	chr3L	12683948	5'	-	Stalker4	245	4	78.62
GTTTCCCGCCGCAGAATTTTGTGGGCTCAATTTACTTTTTATTTGGATGTAGCGATACATTCCAGTCTGCAGGGGACAAACAGAAGCCAAAGCTTCTTTTTTTTTGCTTTTTGTAAACAAAATAATTGAA:1	-	chr3R	2399637	5'	+	Fw3	19	1	56.92
ATTTTGACAGTAGCTTAAATGGCTTTTTCTTTCGTTTTTACTCCTTGAAAAGTATGTTCAAGGCAGTAAGAAGCGTATCGACCGACCATATCAAGTGTATACATATATTCTGGATCAGGCTCAATAGC:1	-	chr3R	4277282	5'	+	INE-1	86	1	78.91
CTGCAAGTGTGTTGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chrX	3309567	5'	+	jockey	14	1	77.30
GGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGC:1	+	chr2L	4412568	5'	+	Quasimodo	76	2	70.34
ATTTAGGACCATTAGCCAGTTCGGCACATGTTAGTATGGTTCACAGGGTAACACTGGAAAGCAGAGGCATAACTGGTGTCATATTAACTACCTCTTTGCTAAAAAAAAAAGAAAATAAA:1	+	chr2L	973563	5'	+	G-element	4325	1	74.79
GGACCCTCTGGTGGGCCAAAAGTGATGGGGGACCTAAGCTGTGGGATCGTTGAATCAATTGGCCCAGCGGGGGTTATGTGGCCAGAGCTGTATGTGCTAAGGGTGCTTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCT:1	-	chr2R	11145272	5'	+	Cr1a	298	1	74.29
ATTCGGGCAATTGTCCCCCAAGGCAGTGTCCTTGGCGCTCTGCTATACAATGCATACGCTGTCGACCAAACCAAGCCAACCAGCGCCTCAAGAAATATTATAGGCTAATAGGAAG:1	+	chr3L	25847784	5'	+	G7	775	1	57.39
ATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1	+	chr2R	20496901	5'	+	blood	54	2	55.48
TAGGCCGCGGGGATACCGTTATTTCCCCTTGTGCGCACGGCCC:1	+	chr3L	23797535	5'	-	gypsy8	303	1	90.70
CGACTAACCGACTGTTCTATTAATATGATCGCTTAAAGCACCGATAGCATGACGCATTCCATAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:1	+	chr3R	19265809	5'	-	I-element	5296	1	57.53
ACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACG:1	-	chr3R	11496593	5'	-	1360	3304	1	74.31
GTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCAC:1	+	chr3L	19013922	5'	-	invader3	209	2	65.49
ATTAAAGCAAAGTTGTTTATGGCACAAAGTTCAACAGATTGAACACAGCCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chrX	6458592	5'	+	roo	8724	2	65.41
ATATAAAGTGGTTAGTGGTTATGTAAATTAACAGACAAGGCTTTTGGGTATTGAGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAATGTTGATGATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGGTCTGCAG:1	-	chr3L	27874121	5'	-	gypsy4	6356	1	64.38
AAACAGAGTTCCTAATTCGGAAACAAATCTTTGTAATTGCATTGTGAATATGTATTGTGAAAATATAATTATGTAAAAAGCATTGTAATATATTTTGTAATCCATAAATTGTTACAAATCATAAAAATAAAATAAATAAACAAAAA:1	-	chr2R	10927265	5'	+	X-element	4719	2	44.52
ATATTCATTAAATGGAATTACGGCATTCCGGTCTGTTTATTTTGTTAATGTGGGTTATGTTTGGGTATTTAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACCATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGT:1	+	chr3L	14549483	5'	+	R1A1-element	160	1	51.37
AATGTGTATATATATATGTGCAATTTTTACACGTAAAAATTGCACATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1	-	chr3R	23565171	5'	+	Quasimodo	43	2	62.18
CCTCATTCGGTAGGCAAAACATCTCGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1	-	chr3R	22276814	5'	+	jockey	33	1	74.63
AGAGCGTTTAAGATGGCTAAGGCAATTGAAACATTAAATTCGGTGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAA:1	+	chr3L	2325698	5'	+	I-element	5127	1	54.79
ATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1	-	chr2L	6623018	5'	+	Burdock	81	2	74.66
AAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr3L	22437960	5'	+	roo	8709	2	55.81
GTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	+	chr2R	20596473	5'	-	roo	330	2	71.23
AAGCTATTTTTGAATTAGTTCAAATAAAACGGAATAATATATAATAGTTAGAAATTATGGTGTACTTTATTATGGAAGCACCACGGCCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGG:1	-	chr2L	15752187	5'	-	copia	123	2	52.42
CAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTG:1	-	chr3L	5102485	5'	+	BS	4723	1	71.55
CTTGATCTTAATTGCAGTGCCAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1	-	chr3R	22822157	5'	+	mdg1	26	2	48.63
TGCAATCAGTACAAATAATATTTCGATAGTTAAAACAAATTATTATAATTGAACAAAGAAAACAAATAATAGATGTATATAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGC:1	+	chrX	22897550	5'	+	Bari1	22	1	68.49
GTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1	-	chr3R	17831901	5'	+	F-element	32	1	56.10
GTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAGTGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr2R	19050287	5'	-	roo	9009	2	64.38
AGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCTCT:1	+	chr2R	5070934	5'	+	Tirant	16	2	30.60
TTCATTACCCTATTTCAAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	-	chr3R	22122794	5'	+	roo	8713	2	56.12
GATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGT:1	+	chr3R	14651218	5'	+	P-element	78	1	31.25
CCCTTTTTTGTAGCATCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACAC:2	+	chr3R	25454027	5'	-	Quasimodo	7294	2	73.29
AGCATTTTCAAACGATACTTAAGAAATTTTTCAGCAATGCAAAAGTTTAAGAGGTGAAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTC:1	+	chr3L	19521641	5'	+	I-element	200	1	60.96
ATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1	-	chr3L	21855534	5'	+	blood	60	2	60.84
CAAAAGATGCCAATTTAATCTAGTCCCTGCTGGCCACATGGGACACTTGCTCGTAAAATTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATAAGTCTTCAGTATACATCTGCCTTCATCGCTCACGCA:1	-	chr3R	30620767	5'	-	Bica	71	1	50.41
AATGAAAAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	-	chrX	8543565	5'	-	roo	9036	1	59.59
CGTCCATGATGGAAATTTTACAACAAATGCATTACACTCAGTTATATATAATACTTAAGTTTCATTATTTGACTGAGTGTGATGGGGAACAGAAGAAAATGTCGTTAGTTTTCTATGCTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAG:1	-	chrX	8456845	5'	+	HB	167	1	35.86
TTAAACATGGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	-	chr3R	20427524	5'	+	jockey	14	1	79.72
CAAAATTATTGGTATTCTAGATAAAGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1	-	chr3R	17831926	5'	+	F-element	23	1	67.63
GAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1	-	chr3L	25401033	5'	+	Doc	36	1	52.05
GAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	-	chrX	13066610	5'	+	jockey	10	1	72.64
ACTGGCTAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1	+	chr2R	9069776	5'	-	hopper	149	103	89.66
GTGATTTCCCAAATCCCATTTAAGAATTCCCTTTGTGGGAGCCAGGGATACCCAGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1	+	chr2L	15875743	5'	+	hobo	18	1	59.38
CTCCAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATAAAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1	-	chr3R	20005139	5'	+	297	6614	2	60.00
CATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTGCATACTTACACTAATTGTACATACAATC:1	-	chr2R	9463502	5'	+	rover	39	2	55.04
ATATGTGCATCAAATATTCCTTACTACATATTAAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1	+	chr3R	11087100	5'	-	412	412	2	76.69
TGGTTGTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chrX	10640115	5'	+	roo	33	2	50.42
AAAATCAACTTCAAAAAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCAC:1	+	chr3R	24455342	5'	+	Quasimodo	43	2	56.25
ATCAGCGTTCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1	+	chr3R	26431955	5'	+	opus	7147	4	57.72
TCCAGCCAATCAACAGTTTGCCAGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1	-	chr3R	18121703	5'	+	P-element	87	1	20.00
AATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1	+	chr2R	21229029	5'	+	jockey	23	1	65.45
AGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCGTGCAGTTGGGTGCA:1	+	chr3L	21855434	5'	-	blood	339	2	53.23
CTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1	+	chr3L	7588422	5'	-	hopper	1350	1	68.66
GCCAACAGGGACCTTTGATTTTCCGATCTAAGAGGAATCTATCGAGTGCATTGGTGGTGGCGCCGAATATGTGTGCTATAGAATATATTTATTAGTGTAGGTTTATTAATTATAATAGGGCTTGTGCGGTCTGCACTTAATGAGGC:1	+	chr3R	21669915	5'	-	Burdock	6325	2	58.22
AGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr3R	7835135	5'	-	roo	338	2	70.90
CGCAAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTAACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGAATCTTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAAATACAAATA:1	-	chrX	3663221	5'	+	297	211	2	78.08
GGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATT:1	+	chr3L	2362347	5'	+	Stalker2	76	2	72.93
CTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1	-	chr2R	3065998	5'	-	P-element	2818	1	38.13
GATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:2	-	chr3L	7943746	5'	-	Burdock	230	2	64.38
CATAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAA:1	+	chr3R	19589881	5'	+	BS	5024	1	62.33
CGCTGGCACTACTTTCATTTACACAATGTACTAACTATATATTTACACAATAATGTGGTGCTTTTAATACAATACATCTCTAGATATAAGAACAGATCACGGTACAGAAGAGTTCCTCGACTAACAGATACCCGTTAC:1	+	chr2L	14381321	5'	-	INE-1	551	1	59.42
ATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1	+	chr3R	22821984	5'	-	mdg1	406	2	46.96
TGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1	+	chrX	17054214	5'	+	jockey	34	1	52.69
CTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1	-	chr2L	15833076	5'	+	hobo	61	1	65.91
CACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1	+	chr3L	24291992	5'	+	1360	64	1	72.66
GAAACGGAGACCACCAATCCGGGCTCGCCAGAGGATGATGATTCAACCACAGCCGAGGCGATCACCGAGATTCATACATAGATTCGGCTATTTCTAAGCTATATTTAAATTATAATAACGTTAAGGAAATGC:1	-	chr3R	12970105	5'	-	1360	302	1	53.03
TTCATCTTTGACTCTAGGCTTCAAGTCATCGACTTGCGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCATGCACGATTAATAACCCTCAGCTGAGGGATTATGCCTACGGACTAAACA:1	+	chr3R	1203176	5'	-	Rt1a	4971	1	72.26
ATCTTATCTACATTTATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACCATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTATGTTGGCG:1	-	chr3R	3389452	5'	+	Rt1a	4784	1	66.15
AACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1	+	chr3R	26431982	5'	+	opus	7165	4	68.42
TTTTTCTTGTTTGCATTATGATATTGGGAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTAAATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1	+	chr2L	17295800	5'	+	Doc	11	1	68.22
GCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGCAGACGGCAACTGGAACACCG:1	-	chrX	17833049	5'	+	Tirant	8171	2	76.92
AAATTTGTTTGCGCTGTGGCTAATGAGGCAGTCCAATGCAGATACAGAAGCTATAAACATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1	+	chr3L	7943609	5'	+	Burdock	56	2	62.86
GCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATGTTCGGTTTAAATAGGTGACATGCGA:1	+	chr3R	7835153	5'	-	roo	8998	2	80.83
AAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1	-	chr2R	13817699	5'	+	412	48	2	68.22
TACGCATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGTCAGTACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1	+	chr2R	1982172	5'	+	Doc	5	1	80.00
AAAAAGAAATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2	+	chr3L	11393447	5'	+	roo	8684	2	68.89
ACTGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTAGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTG:1	-	chr3R	11547832	5'	+	G2	284	1	76.71
TTTAACAAAAGTGACATGAATTTGTTGTGTGAAAGGTAACCCCTTACCTAAGTTCAGAACGAACTTAGTTTTTTTTTAATGTGTAAATTATCTAATTATCTAATACTTGGTTGGATAGCCTCTGTTAGCCAACACAGGCTTACACC:1	-	chr2L	21703737	5'	-	HB	1304	1	66.44
TTTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGC:1	-	chrX	23283048	5'	-	HMS-Beagle	183	2	66.21
TCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3R	25448461	5'	+	roo	20	2	67.44
TGCTACACAAATTGCTTATACTTTTTAATAAATAATCCGATTGAAATGGATGGATATTTATAATCAAAAGTCAAAATCTCAATTAAGCTTTGGGAAAATCTAGCAAAACATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1	+	chr2L	20139808	5'	-	jockey	4982	1	69.86
AAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr2L	12892726	5'	-	roo	9045	1	62.60
AAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chrX	10640098	5'	+	roo	8738	2	70.63
TTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATA:1	+	chr3R	19589934	5'	+	BS	5077	1	71.92
ATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGAACCTATAAGTA:1	+	chr3R	9921953	5'	+	blood	7033	2	66.67
CTCTGGTCATTACCTGTGCGCGTACTGTTACTAAGAAGTCGCTGTGAAATGAAAAAATTGGTGTAAATTGCATTAGTTTCGACTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGACTTTAAACGGTCGCCATGTAATTGTTTTA:1	+	chr2R	14764197	5'	-	Stalker4	418	1	56.16
GAGAAGATATTTACCCACGCCAGTTCACCCAGTTGTCAATATAGTACGCTGGACTGGTATTTTTATTATTTATTTTTTTATTTATACTAGATAAGGCAGAGGGAAGCGTTTCAGACCATATAAAGTATTCTTGATCAGGATCAATA:1	+	chr2L	20413480	5'	+	INE-1	84	1	36.99
CAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr2L	14772129	5'	+	roo	20	2	58.82
TCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	+	chr3R	22844210	5'	+	roo	8741	2	75.56
ATGGAATATATATTCCTGGATAACAGCTGAATAAATTCCTGGATTTCAAAGTCTGGACAAGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGC:1	+	chr3R	11514939	5'	+	I-element	63	1	54.48
AGTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATATTATGTTATATTATATTATATTATATTATATTGTATAATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCA:1	-	chr3L	20525229	5'	+	McClintock	11	2	77.93
GCTTAGCTTTATAAAACAATAAAAAAAAGATAATTATATGATTTTAAAGTGTCAATAATTATGTATATATTTTTTCAGACCAATAACAATAGCAATACCGAAAAAAGTTCATGTTTTGTTGTTTTTTTTTCTTATGTTTTGTTATT:1	+	chr2L	15546276	5'	-	gypsy7	5001	1	77.40
GCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTC:1	+	chrX	21087603	5'	+	mdg3	5307	2	66.18
GAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1	-	chr2R	24218592	5'	-	412	7474	2	75.20
TATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCT:1	-	chrX	21564725	5'	+	diver	85	2	80.00
AATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAGAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1	+	chr3R	13360309	5'	+	jockey	71	1	63.24
CACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	-	chr3R	20427493	5'	+	jockey	12	1	75.45
GATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1	-	chr2L	19965055	5'	+	Doc	66	1	60.15
CAACTAAAGAATGAAAACTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr2L	12250032	5'	+	1360	50	1	52.74
AATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1	+	chr3L	1534632	5'	-	pogo	2056	1	50.68
CCTGGAGTTGGCAGCAATCTAAGATTTAAAATAACTGAACAACAATAAAGTCGCGACGGTATGTATGTTTATTTTGTCTTTTACGTTACGTTTTCTTAGATATTTATGTATTTATTCGGTGAAATAAATGTAACAG:1	-	chr2R	12989054	5'	+	INE-1	17	1	39.71
AAAATTAATGAAACTGCTTAATTGCAATGCATGTATCTGCCAACTAGCTGCACAATAAATACAATTCAATTTGGCTCTAATAGTTATTATTTCGGCAGGTAGAAGGGTCTTTATCTTGCACAATAATCCAACATGCCATACTTTGT:1	+	chr3L	11307396	5'	-	Helena	416	1	60.27
AAGGATAAGTTTACGGCAGCAAGGATATTTAGCACTCCGCATCGTGATGAGGTTTATACTTTGTTCATTTCCTTGGGGCTTCGTGTTTGTGTTTTTTGCTTTTTTTTTTT:1	+	chr2L	9881762	5'	-	Porto1	4434	1	80.91
GGCCTTTGGAGTCACATTGCTATACTGTCTGATAGTTAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGTAAAGCTCTATTAACATCTAAGGTAGTAAATGAAGGACAGCCCTAAAAAAAAAAATTGAAAGAAGTGAAATTTTTGATTTTCGGA:1	-	chrX	21976894	5'	-	FB	153	1	65.28
GGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1	+	chr2L	9668204	5'	+	1360	60	1	76.03
CAAGATCAAGTAGTTTGCGCCTCCCTCTCGCATCTGGGTTAAAGAGTTTTTGTGTATCTTACTTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGC:1	-	chr2L	9906552	5'	-	invader3	5404	2	56.16
CGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATAT:1	-	chrX	17971844	5'	-	Quasimodo	31	2	55.56
CATTTAGTTTATATAATGTGAATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr2L	12892749	5'	-	roo	9045	1	68.49
ATAAAATAAAAAATAAAATATTTCTACTTCCACCTCTTTCGATAGAAATATTACATCTACACATATACACTAGAATTACAATATGCATATTATCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGAAGTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTC:1	-	chr3R	26900180	5'	-	baggins	5130	1	36.30
TCGCAAAGTGAACTATTTTCGAGTTGTGATTAACTCACGCATCCTTCGGGACACAAGCAATTAGAAATTTGAATATTAAAAGAAATATTCCAATGCCTTGGATGATTTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1	+	chr2R	20944278	5'	-	pogo	2097	1	73.97
GGCGAAAAATGAATTTAATCGGTCTAGCATAATTTTGGTCAGTATTTGAATTTTCTTTGTTCGCATTCAGCGGAAACCATCCACAAGAAATATTATTTAGAATCCTGTCGTAACGAATATCTAATAAATATTGAAATATGTAA:1	+	chr2R	14434452	5'	+	Penelope	156	1	82.52
ACGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAGTTCCAATTAAGAACACAAGT:1	-	chr2R	13585524	5'	-	412	483	2	72.32
CATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTTCAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCA:1	+	chr3R	22388979	5'	+	G2	2636	1	55.45
GCAGAATTTTAAGAAACGGTACTTAGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCCGGTGACAAGTTTATTGCAGCCCCTAAATAGAAAATTTTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCT:1	+	chr4	290944	5'	-	rooA	18	2	81.43
CGAGGCTTTCATATGGACAGAAATGCATATATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGCATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1	+	chrX	22511305	5'	+	1360	14	1	60.42
GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTTACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTG:1	+	chr2L	21580876	5'	+	INE-1	543	1	53.15
AAGCGATGTTAGCTGGAGCGAAGCCGATGGTACTGGAACCAGAGAACCGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1	-	chr3L	17205267	5'	+	hobo	25	1	63.53
AAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGAAGATCG:1	+	chr2R	21229009	5'	+	jockey	86	1	70.07
TTTTATGTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1	-	chr3R	23495747	5'	-	copia	202	2	58.22
ACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCT:1	-	chr2R	6173079	5'	-	pogo	2031	1	71.92
AATAATGACTAATTGGTTAGTATTTTACTAAAGCAATTGCTCTGATTCTGACGCCTGAAAGTATGCAGAGAAATCCAACCTTTTGTTAAGACTTTAAGCCTTGTAGTAAATTGATTTTGCCGCATGGTTAACAGTGCGTTGATCAA:1	+	chr2R	18687698	5'	+	jockey	4970	1	42.47
TTCATCATTTTAAAATACAACATTTTCTTTATGCAAGCTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACACGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chrX	9539972	5'	+	roo	21	2	67.81
AAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1	-	chr2L	9399524	5'	-	Transpac	5161	2	72.18
GGTAAAGAGAGGGGGGCGGGGGAGGGGGGCTATGCCGGAAGAATGAGAGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	+	chrX	16717846	5'	-	roo	9039	1	52.73
CTCTGACAACGGCACGTCATCATCAGCAGCATCGTCAAGCTTGATGGGCCGCACTCACTGGAAAGGTTACACAACAAAAAAATCCAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAA:1	+	chr2L	669223	5'	+	Idefix	7144	2	58.22
TATGTTTAAATACATATGTGCACATATTATTGCAGTTGAGTTTCTGAGGACACCGCCAATTGTGAGTATCTGAATATCTGAATGTGTGTAAAATAAGCCCAAAGCGATCGAATAAAAATTAGTCGCTCCCACGGGTGTATGAAATA:1	+	chrX	13529024	5'	+	gypsy2	21	2	43.84
ATATGCTGCGTCCGTCTTTGACCGCATGTCACAGATGGCGATGGAGATGCACTCGTCAAAGGTACAGTTGGCACTCATAAAGAAGTTTTTAATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGCACTTTGCACAATGC:1	+	chr3R	16404429	5'	-	pogo	2080	1	70.00
ATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	-	chrX	6486832	5'	-	roo	9038	1	56.16
AAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1	-	chr2R	4206660	5'	+	1360	316	1	75.00
CAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:1	+	chr2R	2016809	5'	+	1360	43	1	53.62
AGGATCTGCTCCAGGTCCTCAACTCTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGGCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGATACCCGGGACGG:1	+	chr2L	19965999	5'	-	Doc	475	1	69.79
AACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	-	chr3R	20427475	5'	+	jockey	9	1	73.03
TAGTATAATTTTTGGTTAAGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr3L	20831246	5'	-	roo	397	1	75.00
ATTCATATTTTGTTCCATCTCTACTTAGTCCTATTTATGTTAATTTATGGCGGAAATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAA:1	-	chr2R	4545273	5'	+	Quasimodo	376	2	60.71
AAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	+	chr2R	20596481	5'	-	roo	8986	2	76.71
ATTCGCAATTCGATTCGATTGACTATCTGTGACGAGCACCGATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	+	chr3L	12879688	5'	+	roo	8682	2	74.66
CGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1	+	chr3R	14981168	5'	-	mdg1	345	2	69.86
TATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGA:1	-	chr3R	28075379	5'	-	jockey	4906	1	76.03
GTTTCGCCGCAACAATATTTCATGTTTATTAATGGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	-	chr2R	18349381	5'	-	roo	8988	2	73.97
ATCGCCGCTTTCGTTGCACTAGCCCCCAAACTTGCTACCGTGACTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1	+	chr3L	7588367	5'	-	hopper	1393	1	69.18
CACGTAAAAGTAAAAGCAAATTTTTGCACATCTGTGAATGTAGTCCTACAAATGCGAGTGTTTCTTTGCTTTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAG:1	+	chr3L	10001865	5'	-	roo	295	2	52.05
GAAATACTGCCGGTTGTTACTAAAATCTCAAAAATGTGAATATTGAAAATGTTTGCTTTAATATGAAGCTTTATTCGCAATTCTTTTTTTAAAGCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATT:1	+	chr3R	20957313	5'	+	P-element	319	1	68.70
TTTACATACTGGATAGCTTGATTTTACTTATCTTTAATAATGGTATTTTAAGCTCACTGTAGTATGTCAAACCATTAGGAAAATCTACGAAAAACATGATTGGTACAAACAAAATACATAACATCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1	-	chr2R	9091988	5'	+	1360	1	2	80.82
CACCGATCACTGAACACCGAACATGGCTTACGTAATGAGCGACCCGGAGCCAAAGGCAAAGTCAAAGGCCCTTTATTATGGAATGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1	-	chr3R	19265926	5'	+	I-element	24	1	63.64
CTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATC:1	-	chr3L	19014022	5'	+	invader3	51	2	52.05
CATTTCCTAACGAAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGT:1	-	chr2L	6623077	5'	+	Burdock	13	2	75.18
GTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTT:1	+	chr3L	24213784	5'	-	invader2	192	2	67.50
TGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chr3R	26222872	5'	-	roo	9006	2	71.43
CCAGCCTTTGGACCCAACCATGAGAAGGGAACCGAAAGTGAGCGGTGGATGGGGGTATGAGGGGACGTGGGTCCATTCCCGCCTGTTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATG:1	+	chr2L	524511	5'	-	roo	9	2	58.90
AAATACACGAGATGATTAATTGAATATTGGCAGTTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGACTCAT:1	+	chr3R	14860680	5'	+	BS	5065	1	72.66
GTATAAATAAAAGTGAATGGGATCAGGAATTATCCATAGAAGATAAAAATTACAGCAATGCAGCTCGAGCCGCTGCCACACCCGTGGAATCAGGCATCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGTT:1	+	chr3R	19445984	5'	+	GATE	41	2	41.94
TTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTAAATTTCTTCTT:1	+	chr2L	18419159	5'	-	412	427	2	66.93
GACAACTGAAATGGAGTTGGGATTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1	-	chrX	1899725	5'	+	P-element	49	1	51.72
CTCAACGGAAATATGACTTTTGAACCTATTTCATGGAATTTCACAAATTTTAAAAGCGGCAAAAGGATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1	-	chr3L	10648027	5'	+	412	7081	2	52.08
TTGGGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1	-	chr3L	25401042	5'	+	Doc	4	1	69.11
CTATGACCACATATTTACAGTTAATCGGATGGACGGGCGAGCGAGCGGTCCCCACACCACTAGTATAGGGATAGGGCTACCATTATATACACCTTGTAGGTACTTCTATCTCTATGCATATGTATGTATATGTAATACT:1	+	chr3L	3081159	5'	+	Dm88	20	2	55.40
AGAACACATCGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGGCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1	-	chr2R	19499399	5'	+	P-element	10	2	59.34
CCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGC:1	-	chr2L	21008604	5'	-	invader3	212	2	73.33
AAAATGATTTTGAGTACGTATCAAGCGCTAGTTAATTTGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAACTTATGGTCTCTCAATGTAAAGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGC:1	-	chr2L	18112808	5'	+	Tc1	166	1	70.37
AATATATCTGCAGGCAACCAGTACCAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1	+	chr3R	7641026	5'	-	hobo	2923	1	61.26
ATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAG:1	-	chr2R	5924448	5'	-	jockey	4722	1	46.58
CACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTAT:1	+	chr3R	4604451	5'	+	1360	346	1	73.60
ACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1	+	chr2R	3065944	5'	+	P-element	68	1	28.23
AGTACTGTGAATTTCTTTAAAAAAGAAATCAATAAATCAAATTCAACTAAAGAATGAAAACTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1	+	chr2L	12249989	5'	-	1360	3382	2	66.44
CTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	-	chr3L	11441824	5'	-	roo	347	2	64.03
GCCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAG:1	-	chr3L	10013672	5'	-	hopper	1370	1	54.26
ATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCG:1	+	chr2L	14588753	5'	+	1360	410	1	56.94
GATTTTGTCTGCTGATTTGGCCTGATTGATGTTTAAAACCTTGATCTTGATGAGAGCTATTTAAAAAATCCGTTTAATTGAACCGATTTGACCTCCCTATTTTCGATTGCGTTCGCTGAACTAGCTGTAA:1	-	chr2L	1889926	5'	-	Porto1	4314	1	73.08
TATTTAATGGATCGGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1	+	chr3L	15995900	5'	+	297	6617	2	58.90
GGATAAGCACCTGAAAGTATGCACTTTCTGTCCCTTCACTCTTTCCTTCTAAACTTTTTAACATTTCGCTACGCTTTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATT:1	-	chr3R	17520923	5'	-	roo	38	2	68.70
GCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGCTAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1	+	chrX	18193678	5'	+	jockey	84	1	67.86
AACTTCGACATTAGTTGCGTTTTGTGAGATGACGGGCTGAAAACATTGAAACCTCTTTTGTAGAGCTTTATCATTGAATGTTTCGTATATGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1	-	chr3L	6248422	5'	-	accord	183	2	66.67
TTTAAATGTAAAAATAAAAAAATAGTAATAACTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGACGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGTAAACTATTTGTGGTTTAAACACGATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTA:1	+	chrX	14702277	5'	+	transib2	2773	1	68.18
AGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGGGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1	+	chr2L	13585840	5'	+	Tabor	6906	2	64.54
GATTAAACAATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	+	chr3R	16076757	5'	+	roo	40	2	60.27
ATGTCATTCAGTCGGAGCCGGAATACCATCCCGTGCTCTTTTCCGAGGCATCGTGGAATGTCCGCAACAACCGCGAGAAGCTAACCGATTGATTCTCCTTTTTAATAAGGCAGTCTTAAGCT:1	-	chr2R	17430400	5'	+	gypsy5	267	2	72.13
GATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACACAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1	+	chrX	21014773	5'	+	copia	43	2	50.00
CAGACAAGCCTCCTCATTCTCTATATTGACAAATTAATGATATATTTGTCATAGAGCGCGGCAGACAAATGTCTCTAATTTAAAGAATTTAAATTTTTCTAGAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGA:1	-	chr2R	17705749	5'	-	TLD2_LTR	104	1	52.41
TTGACTTATCAGCGTTCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:1	+	chr3R	26431948	5'	+	opus	8	2	72.90
AGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGAGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCAT:1	+	chrX	17054202	5'	+	jockey	65	1	55.56
GACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTA:1	+	chr2L	12290655	5'	+	1731	4363	2	50.34
AGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1	+	chr3R	6290972	5'	+	Doc	28	1	56.38
AATTATTTGCCACATGCACACACACTCACTCAAACACACACACACACATATATA:1	+	chr3L	5016056	5'	+	accord	7030	4	62.96
AATTCGGAGTATGTGCCAGAGGTTGTACATACAAAAGCACCCTCAATATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGA:1	-	chr4	418594	5'	-	roo	8937	2	68.49
AATAACGTTAAAAATTAATAAGGAATCCCACAATTAACCCAATGAAAACAAAAAAAAACATATGAAAAAAGTTGGGTGTCATTTTGCAAAATGAAAATTGACACCCAACTTTTTTCATATGTTTTTTTTT:1	-	chr3L	7814242	5'	+	FB	173	1	74.62
AAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGC:1	+	chr3R	19589925	5'	+	BS	5068	1	65.75
GTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1	+	chr2R	2016820	5'	+	1360	16	1	63.00
GCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1	+	chr2R	2016808	5'	+	1360	29	1	60.00
AAAAGAAGCCGCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1	-	chr3L	16750766	5'	+	Tirant	8114	2	73.33
ATTTTATTTATTATTTATTTATTGTTTGTTAATATTTGTTTAATTTATTTTATTTTATTTAATTTATTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTATCTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGTAGGTACGGAGAC:1	-	chr3L	18452049	5'	-	TAHRE	10421	2	63.70
CATGTGTAGACAATGAATTTTTGAGTTGCTCGAAAGCCAGGCAATCGGGGGGGATTTGACTTTAGTATAAAGTTGGAAATGCTCGAAATTGTCTTAAGAGTTGCTTACTCATTTGTGGTATTCACCAATGTATATGTATAAATGTA:1	-	chrX	20895260	5'	+	Stalker4	247	4	45.89
CAACCCCCTGACACCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chr2L	7945431	5'	+	roo	8694	2	59.23
ATTTTCCCTTCTCTCTAAGCTGAAGCTTTAAACTTTTGTATATATAAAGAAGCTATAGAAGTGATTACAAATTAGAGAATGTAAAAATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCTAGTCAGTAAGATTCAAACACCCGAATTGA:1	+	chr2R	9160452	5'	+	rooA	328	2	54.11
CCGCAATGAAAAGGGGGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1	-	chr2L	16067200	5'	+	297	6619	2	60.00
ATGGCGACAGTGACAGTGTCCACAGTGTTTAAAGTGATGTGCGAATAATTACAGTCGATCAAAGTTCGACTATAAAAATGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGAC:1	-	chr3R	3177918	5'	-	1360	3179	1	56.80
GGTCGAGCCGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAA:1	+	chr2R	1320642	5'	-	diver2	343	2	64.58
AACTTTTGTCATCGCCTTCGCCCAGCCATTTGAACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1	+	chr3R	28075306	5'	+	jockey	4680	1	67.68
ATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATC:1	+	chr2L	21325114	5'	-	invader4	270	2	68.07
ATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:1	-	chr2R	20194300	5'	+	Max-element	45	2	51.54
AGTGTATACACCTCCTTAAGTTCCGTACCTGACCGTTTTCNTGGAATTACTAGGTTCTCCGAAAGACTCTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTT:1	-	chr3R	19449029	5'	-	roo	134	2	61.61
ACAATTATTTCAATTCTCGCTTATGCATGCTGCCAAACTTCGTAAGTTCGTCGTTTATTTTCGCAAATACAGAAAATAAAAAAGATTATTACACATTTTACTCATAAATAATTATCAACATAAATATAAATATGTAAA:1	+	chr2R	2494469	5'	+	1360	2960	1	39.86
ATCATAGGGTGGTGGGCTAAGACGCGATTTCTACGAAAAATAGCCTCGTAGAGTAAATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCGGAAGGAAGCATTTCCGATTATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1	+	chr4	868935	5'	+	INE-1	82	1	67.91
GTTTTGCACTAAATTGCATGCGACATTCGTTGGTTGTATTGTCGTGACAAATGCTGTCTGGAACAATACGATGTGTATATATATATATTATGCATATATAACCATAATGTAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1	+	chr2L	1664905	5'	+	hobo	6	1	48.94
TTTACCTTTTAAGTATCAACCTTTGGCTCAACCACTACATAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	-	chr2R	9631742	5'	-	roo	9026	1	64.42
CGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1	-	chr4	311571	5'	+	1360	61	1	74.78
TTTAATACACAAGATCCATAAAAATCAATAGACACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1	+	chrX	17756537	5'	+	297	6603	2	67.12
GGAGACATTGAGACACGTTTGATAGCAGCCCATAGGATGCAGCACGCTATTGCAGCGGAGAACTGACAATGCTGCTACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCTAGCAGC:1	-	chr2R	16299295	5'	-	blood	7307	2	46.58
ATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAGCC:1	+	chr2L	15832985	5'	-	hobo	2920	1	61.26
CAATTACTTTCATATCCAAAACATTAAATAAAACCGAACAACTTTATGCCACAAATAAAAAGGAATTGTTGGCAATAGACTGGGCTCTTAAAAATCTCAGGAATTAATTATATGGTTGTTCACGCCAGACGTGCGCAAACAGTTGA:1	+	chrY	3572682	5'	+	Max-element	9	2	76.71
GAGTGACACACAATGACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATA:1	+	chr3L	3799786	5'	+	copia	74	2	66.44
GGTGTGTTTTCCCCACAGTGAAAACCATATAAACTTGGGCGTTGCAGTTTTGGGCGTTTTGTGGGTATTAGAGGGGGCGTAGAATGTGTATGCTTATTCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACAG:1	+	chr3R	4131034	5'	-	INE-1	135	1	76.03
AAAGAAAAAGAAATGAGAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATACCTTATGTAAATGAATCGATAGC:1	+	chr2R	10968654	5'	+	roo	59	2	75.00
AGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTCCGCTCATATCTTATGTACATCAATC:1	+	chr3R	27994191	5'	+	roo	8717	2	54.33
ACAACCAAATATTCAAATATTTCGAAATTAGTACTTTTATTAACTCTGTGAAATTACACATTATTAAGTGTAAGTTATACTCTACCCACTTTACTTTTCAATTAACTATGTTTTCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAATGCG:1	+	chr2R	18761372	5'	-	INE-1	533	1	67.12
ATTGAATCTTCTCTTGGTATATACAGACTAACATTAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGC:1	+	chr2R	5284498	5'	-	Doc4-element	2633	1	73.29
TAAGTTNCAGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAATGGA:1	-	chr3L	14944684	5'	-	G5	4816	1	67.81
CACAAAGCTAATATTAAAATAAATACACTAGCCCGTTATGTTTCTCTCTCTCTTCGCTCTCTCACTCTCGCTCCAAAAGAGCGTGGCGTTCGACCCGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1	-	chr2R	10124253	5'	-	P-element	2872	1	73.33
ATGGGAACATCTGGGGGTTGATCCTGCTGCCACTTAACTGCAACAAATCGCCAAATAAGTGGAAAATATTGCAGGCCACAAATTGCTATGTCTTATCTCAAGCTCCTGGTCTACAAGGCAATTCTCAAGCCAATCTCGACCTACGG:1	-	chr2L	1252525	5'	+	G2	2650	1	67.12
AAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACGAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chrX	3309635	5'	+	jockey	86	1	71.23
TGTTGTTTTTAGGAGCTCTGCTTTTTGCGGTACTTGCCACGCACCACCGATCAAACGGAATCTGGGCCTCCGATTAAATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1	-	chr3L	20548194	5'	+	297	6599	2	71.64
AACAGGCACATATTAACTAGAAGTCAAATAATGTTCAAAACAGATAAGCAAAAAAAAACCTATTAATAAATTCAGTTAAAAGCCACATGGTAAAGAAAAATCAATGACTCGCTACTGCGAGGGCT:1	-	chr2L	7968329	5'	-	rooA	305	2	80.00
GCTGCAACGGAAGAGGTTAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAGTTAATATAAACAATGCTGACGCGCCC:1	-	chr2L	22121622	5'	+	gtwin	6972	2	59.38
AAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACA:1	+	chr3R	13457903	5'	+	X-element	68	1	57.78
CTGTGAAAATTTTACTTACATACATATGTATGTATGTGAAAGGTGTTTCTGTCTATTAAAACAGCAGAAGCTTATGTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAATCT:1	+	chr2L	588329	5'	+	FB	30	1	52.27
AGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCACTGCATAA:1	-	chr3L	21855547	5'	+	blood	7061	2	51.37
AAAATCCAGGATAATATAGTGCTCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1	+	chrX	21014747	5'	+	copia	14	2	50.38
AAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1	-	chrX	7256185	5'	-	412	420	2	73.13
CCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAG:1	-	chr2L	13585934	5'	-	Tabor	435	2	51.80
GGGGTATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTTTGGATTTTCCTCGAACACCCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr3L	23773154	5'	-	roo	9052	2	49.65
TGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCA:1	+	chr3L	7292473	5'	+	HMS-Beagle2	73	2	70.55
AATCCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1	+	chr2R	8585414	5'	-	roo	406	1	75.76
TTGTAATTAACTACATAATACATATAAACTCAAGATGGTGATGTTGTATAGTGTTGTTGCTAAATAATAATAACAACGTCAGAAGACTTAAAATATTTCACGTGCTAGTGCCTATAGCACTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTCATC:1	+	chr2L	22343653	5'	+	Doc3-element	11	1	61.64
CTTCTTAATTTATATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1	-	chr2R	5019811	5'	+	Doc	80	1	48.20
TGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCACCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTT:1	-	chrX	13504238	5'	-	412	7473	2	67.12
ACTCAAAGAAGAAGACGAAGACTTTGAAGTCTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACAC:1	-	chrX	23352760	5'	-	R1A1-element	322	1	76.15
GAGCAAGCTACGTGAGTATAAGTCCTTAATTTGCAAGAACCGCTTTACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAA:1	+	chr2L	10037269	5'	-	Quasimodo	7351	2	69.29
TAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTATAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTAT:1	-	chrX	22643320	5'	+	Tc1	1626	1	55.56
AAGAAGCAAATCACAGAATATTTAAATATGAAGCACAGCTTATTATTTTGGCGACCGAACAGGGACTTTGATTGACCAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAAACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	+	chr2L	7900074	5'	-	roo	9028	1	49.66
TTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1	+	chr3L	14603245	5'	+	jockey	22	1	66.10
AATTGAAACAAAACAACTGAGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAACAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAA:1	-	chr3R	14650448	5'	+	P-element	158	1	25.51
AGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTATAGTGTGTACCAAAACGTCTTCAATTGGTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGC:1	+	chrX	6683692	5'	+	Tc1-2	1430	1	79.45
CGAGAAAATTGCGGACCAAGACGAAGCAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTATAGATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAACATGTAACAGGTATAGATGTAATAGAGTTGG:1	-	chr2R	5173257	5'	-	Stalker4	385	1	63.01
ATGAGTATTGCAGCTGGATTGGTCTTTGTTCTCCATTCAGTTTGCGAACCTGACTCATATGAATCACTCACAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2L	20301517	5'	+	roo	8714	2	52.74
ATTAAAATTGTGTATATTGATGTAAATTTGTAGTTTCCGTTTCATTCATTAAAATTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAAAGGCTATAATCGAGTTCACCGACTATCACATACCCATTACTC:1	+	chr3R	17733208	5'	-	INE-1	549	1	70.55
CATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chrX	9540080	5'	-	roo	8997	2	79.53
ATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chrX	9540091	5'	-	roo	8989	2	73.97
ATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTGTAAAT:1	-	chr2R	5532320	5'	+	G4	3830	1	69.86
ACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGAC:1	+	chrX	6499862	5'	-	Quasimodo	223	2	50.83
AGTTATTAATGGCTTAGTGCTTCCATAAAAAAAACCCACAAAAGTGTAAATCAACAGCGCCATGAACTCTCCGATTTCATCCCATTTCCATTTATTTAAGCCAAACAAACAATTTTTAATTTTTTTTTTAAATTTTATTAGTTATT:1	+	chr3L	12093739	5'	-	Doc	4687	1	54.79
AATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1	+	chr3L	10647886	5'	-	412	464	2	48.15
AACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATATGTCATTAGA:1	+	chr3R	4604451	5'	+	1360	396	1	64.29
AAACGGGTTAAGATGGTGCGTCAATTATTGATAACGGACACTGTGAATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1	-	chr2R	18609465	5'	+	opus	11	2	67.92
GTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chrX	13039558	5'	+	roo	21	2	61.76
CGTTATTCAAACTGCGCTGCAATTTAATTAAAGACACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTT:1	+	chr3L	17685401	5'	-	mdg3	195	2	52.41
TGTCCCTTTCGACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1	-	chr2R	2016942	5'	-	1360	3374	1	71.77
GCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	+	chr2R	9632116	5'	+	roo	8746	2	74.66
AAACTCCATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1	-	chr2L	544896	5'	-	412	455	2	56.85
TTTAATGGATCGGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1	+	chr3L	15995902	5'	+	297	11	2	70.59
CACAAAACCAACAAAAAAAAAAACGAAAAAAA:1	-	chr2R	12773829	5'	+	G2	3076	4	84.38
ATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAACTTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	-	chr3L	10292871	5'	+	roo	86	2	77.86
TGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTT:1	-	chr2R	5173248	5'	-	Stalker4	387	1	65.93
GTAAAAATGTCTTTCTCCCTCAAACTTCCTCAACATAAATTAAAAAGCGAACGAATTCTGCACCCCAAATGTAATGACCTATAAAAGGCACAACATGACAGTTACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	+	chr3R	21434829	5'	+	412	7069	2	68.97
AACTGTGGTCTATACTAGTCAATAATCAGATAATGAAATAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGA:1	-	chr2L	4954023	5'	-	Quasimodo	7288	2	76.03
CCCTGCCTAATTCAAATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGCGTGGACGTG:1	-	chrX	13066629	5'	+	jockey	20	1	71.11
ATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTG:1	-	chr2R	4774766	5'	-	baggins	5356	1	52.41
AGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2L	12892725	5'	-	roo	357	2	53.42
CGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAA:1	+	chr3L	2362346	5'	+	Stalker2	84	2	73.94
TTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr2R	9632192	5'	-	roo	346	2	60.14
TACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1	-	chr3L	17205281	5'	+	hobo	45	1	63.87
ATTATTACATAGCTATTCATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAAAAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1	+	chr2R	13121939	5'	+	pogo	6	1	68.97
AACTTTTTGCCAGTGCATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTATTTGG:1	+	chr2L	7945296	5'	-	roo	9030	1	57.53
AGTTTCCGAACATCAATCCAACGCAGCCTTCCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1	+	chr2L	21153462	5'	+	1360	44	1	52.41
TGTTAAACGAATGGACGTTAAGATAATAAACGATATTTGATATTAAACTCTTATATATAACTTTATTATTTTTCAAGATTTCAAATAGGTTGTGCAATAATAAAATATACGTAAAGATGTAAATGGTTTACAAATAGATAGAAATA:1	-	chr2R	22012231	5'	+	G3	4488	1	63.01
TTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1	+	chr2R	20496865	5'	+	blood	14	2	72.54
CTGTGGCTTTGCAGTTGCCCGAGAAAACAGCATACCTTTCAGCCCAAAAATAACAAAACGAATGAGAAATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCCAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACT:1	+	chr3L	3198958	5'	-	invader4	3006	2	50.00
AAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGA:1	-	chr3R	9714455	5'	-	Stalker	7171	4	76.71
ATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr3L	10292885	5'	+	roo	8725	2	68.22
ATAAAGCCAATTTACATTTGTGCTTTTGCTTTTCAATTTCAATTTTCAATGTGAATCAGTAGCATTTGATGCTAACAAACGCACTTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTA:1	+	chrX	8820156	5'	+	pogo	116	1	58.22
CATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	-	chr3R	22122758	5'	+	roo	8741	2	82.44
CCAAGACTTAATTGAAAAATGTTTCCCCGTATTTTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATATAAAATTGATCATAGAA:1	-	chr3L	10056181	5'	+	transib2	81	1	71.92
CAGGTTGAAATTTCAATGGGACCGTGAAAATGAGGCGCTGAAGTGATAGGAAACTTCCTATCAAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1	+	chr2L	6863221	5'	-	pogo	2096	1	82.88
GCTTATGGAGTTTTAGAAACTTGAGGAGACTTTGCTTACGATCTAATTTCACATGCTCAGAGTATGTAAGTATAGTTGGGGGGGAGTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1	+	chr2L	1517583	5'	+	jockey	4691	1	66.67
CAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAATAACCCTCTTCTTGCGCTCATCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	+	chr3L	3500924	5'	+	opus	55	4	55.17
AACTTGGAATTTCAAAATAAGTTGTGGATTATGAGTAGTCCCTTGTGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGG:1	+	chr3L	15600874	5'	+	roo	8857	2	68.49
ACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr3L	23635040	5'	+	roo	60	2	68.46
AGTGAATGATATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATAT:1	+	chr3R	17420353	5'	+	roo	8666	2	80.82
ATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACC:1	-	chr2R	20194262	5'	+	Max-element	67	2	78.07
TGGTCAAATTAGCGGCAAAGGCTGATTTACTGTCATGGAAACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	-	chr2R	25118816	5'	-	roo	386	2	71.23
GGTGGGTGAGAGTCTCATTTTCTCTGCGCCTGCTCATAGGACCCTTGGGCTTTGGATACGGGCTAAGGATGTGGGTCTCGGTTTCGGTTTCTGTCAACGCAGTCTGGCATGGGCATGAATGGGACGGACAGAGTC:1	+	chr3L	19580905	5'	+	invader5	143	2	66.67
ACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGA:1	+	chr3R	18582157	5'	-	roo	336	2	66.21
GTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGGTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr3R	20469577	5'	+	roo	8686	2	39.53
ATGGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	-	chr3R	20427518	5'	+	jockey	17	1	77.14
AAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1	+	chr2L	17295840	5'	+	Doc	32	1	49.09
TTAATTCTTTGTGTTAACATCTTTGAATTATGTTGGTTTTCTTTAACTACGTGTGCCATTTTTATAGCAATATGATGAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGACCTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAA:1	-	chrX	20645622	5'	-	1360	3044	1	54.79
AGCTTTTGTGGTCTCGGTCCTGTTTTCTCGGAGGTCGACCTCATTTAAGGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr3R	27994271	5'	-	roo	389	2	56.84
CACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTACTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGC:1	+	chr4	158193	5'	-	1360	278	1	53.42
ACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAGTGAATAGAGCGCGCTAGATTATATTTAGTATTTTGTTAT:1	+	chr2R	9632132	5'	+	roo	8750	2	73.13
CACGTTNAGCCACGTTTATTTGATAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATATCTAGGCAGCTATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1	+	chr2L	16067052	5'	-	297	381	2	65.57
GGGTAGGCTAAATACAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTG:1	+	chr3R	19448916	5'	-	roo	8905	2	64.80
GAAACTATCTAGATGTTTTTCAAAAGCTCTACGCAACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	+	chr2L	6059171	5'	+	roo	12	2	75.00
TGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGGCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1	+	chr3L	22400270	5'	+	1360	3	2	66.67
AGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAA:1	+	chr2R	16891836	5'	-	hopper	1346	1	62.33
TAGCCATGATAGACATAAGTAGGAATACTATCAACTGTGGTCTATACTAGTCAATAATCAGATAATGAAATAATATATAATTCTAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAA:1	-	chr2L	4954055	5'	-	Quasimodo	7321	2	53.10
AGTTCCGCCGCGTCTTATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1	+	chr3R	10266045	5'	-	1360	3375	1	73.44
AAAGTGCCCAATTATCCCGAAATTACCCAAACAAATCCCCCTTTCGTAGACACAGCAAGTAAATTGTTTATTGTTATTTATGTAGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGCCCTGGCAGAGTAAGTAACAAGAATA:1	+	chr3R	18121112	5'	-	Gypsy6A_LTR	234	1	52.74
GGATATTTTTCATTTTCATTTTCGGCCTATTTGCCTTACCTTTTCTTGGTCTTGTTTGCGGCCACATAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGCGAAAAGAACTTGAGGCTTACGACTATATTTCG:1	-	chr3L	7943099	5'	-	Burdock	24	2	50.00
TAAATCTCACAAATTGTCGAAACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1	-	chr3R	20499897	5'	-	mdg3	233	2	74.66
AATTGTGAGCATTTTATGCATATATTCGTAAGTTAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTCTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1	+	chr3R	12598438	5'	+	hobo	29	1	63.43
AGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCAC:1	+	chr3R	22388975	5'	+	G2	2668	1	63.70
TTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1	-	chr2R	18336241	5'	-	roo	361	2	58.27
CGGGCGAAGGACTCGTCAACTTTCCAAAAGCGCATTACTTGCTTTGGGAACAAGAGAAAATAATAATAAAAAAACAAACACAACGCAATCGTTTTTGCCACACAGGCACACACACACACACACA:1	+	chr2L	12501540	5'	+	accord	180	2	87.10
TGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCG:1	+	chr2R	20194228	5'	-	Max-element	277	2	63.29
AATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTG:1	+	chr2R	23466036	5'	+	Doc	494	1	65.00
ATATACCAAAACGGTTGAGATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1	+	chr2L	544743	5'	+	412	7086	2	61.64
AAAGCTACCAATCTCTAATAAAAAGTGAAATTAGAACTAACACTTTGCGGAATTCAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTCATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1	-	chrX	21016890	5'	-	Transpac	287	2	63.70
CATCCTATCCCATAGACATCGTTCCACCCCCCCCCAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTG:1	-	chr2L	4412196	5'	-	Quasimodo	6942	2	64.49
AGTAGGCTATGAAATCGCCTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAATGGACGCGTTCACAGAA:1	-	chrX	13066585	5'	+	jockey	29	1	52.00
TTCATGTTTTTAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGC:1	+	chr3R	6611207	5'	-	HMS-Beagle	183	2	68.70
ATATGCGTGTTAAGACCTCGGCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCACTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1	+	chr2L	17081760	5'	-	jockey	4953	1	52.74
CAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTC:1	-	chr3L	5102496	5'	+	BS	4705	1	59.63
GCATTACCCTACTGCCAATTTTTCACTTGCCTATGCAATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAA:1	-	chr2R	19798165	5'	+	Transpac	17	2	73.97
AAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1	+	chr3L	14603291	5'	+	jockey	91	1	76.43
GTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAA:1	+	chr2L	21367196	5'	+	Doc	49	1	50.00
GAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	-	chr3L	17560382	5'	+	pogo	60	1	59.59
AAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	+	chr2R	9791582	5'	+	412	39	2	56.67
ACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr2R	9632213	5'	-	roo	9052	2	66.39
AACAAACGCAGAAGAGGAAAAACCACAAACCGATATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAA:1	+	chr2R	13006448	5'	-	3S18	6016	2	77.40
TATATTTTAAATTACAGTAGTTTTAATAATTTAGATTGTACTTCCTTTAATTATTTAGTAAATTTATTAAGTCATTTGACTTAATGGAAACCGTAAATGTTGCCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGCTATAAACCCTGAGCAG:1	+	chr2L	20629510	5'	+	Cr1a	476	1	52.74
TGACTAACTCGGACATTTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTG:1	+	chr3R	12618563	5'	+	F-element	11	1	74.40
CCTGGCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATAT:1	+	chr3R	12886906	5'	-	roo	347	2	63.08
TGGGGATAACCGAACCAAACCAAAGTAGAAAAACAAAAACGTTGATGAACAGAAAACAAATGAATACTGATTTTATACATATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAA:1	+	chrX	16624119	5'	+	jockey	4910	1	52.74
GTTTGTATATGTTTGTTAGTATAGCACTGGGTTTAAGTAGACTAATAGATTCGTATAGGGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	+	chr2R	7452835	5'	+	pogo	60	1	60.96
ATATGAATTCATCAATGCCAGTACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACCGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	+	chr3R	18582129	5'	-	roo	9028	1	53.79
CTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATAATTTCTATTGTACTTCCTTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCA:5	-	chr2L	6007627	5'	+	1360	459	1	70.55
GAGCTATATCCGAATGGGGGAAACCCCGGAATATGTCTCTCTTTATTTTTCACTTTTTTTTATGCCTTCCTTTTCGATATTTCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGG:1	-	chr2R	17259997	5'	-	jockey	4916	1	63.31
GGTTACGAGTTACTGGTTATTCGAGTCCGTTTCTCTAACGGCTGACTACGTGTTCCCACTCCCGTACTCCTTATTCACTGTCTGCGCATATTACCACTCTAACGCCCACAAACCGCAAAAAACTGTCACGCCCACACTTTTG:1	+	chr2R	5188834	5'	+	INE-1	247	1	59.86
AGGATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1	+	chr3L	18368893	5'	-	opus	7477	2	64.12
ATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTACGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTTA:1	+	chr3L	24757198	5'	-	Cr1a	4257	1	53.79
GGAAGGAATTTTCCCCATGCCACACATACCGCAAAATAAATATCGATAGCTATCGCCGTCTCACAAATTAAATTAATGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGGCAGGATTTGCCATGCCACGGTAAAGGTTTTACCTATAACAAC:1	+	chr2R	4008989	5'	+	Helena	38	1	54.11
AAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1	-	chr2L	15833526	5'	-	jockey	4936	1	60.43
TTTATGCTTTTTGAGGCTTTGAAAGATTTTGCCCTTCTGGTTTCAATTCGGGTTTGTAGATTTCCATGCCAAGCGCTCCTAAAATTGGAGCATATTAACCATAGTTGCATTAAAAGTTTGTTTTTTTTTTCACATTTAGTCA:1	-	chr2L	5820786	5'	+	Porto1	4609	1	80.28
AGGCGACGCGTTGCCATATTAATCTGGTTAATGATGAAACTGAATCAGCGTTTTTTGTTCGGCTGTTCGGTTATCAAAACACAGCGTGCATTTCGGAATCACTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCCAG:1	-	chr3L	22655539	5'	+	mariner2	239	1	59.40
AAAACACAAAACACTGAGTGTGAGGTCAATGGGAATTGCAGTTCAGCAGGCCGGACAGAGTCGTACAAATATAATAAAAATCAAGGGAATATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGC:1	-	chrX	22767886	5'	-	diver	6006	2	64.38
GCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1	+	chr2R	15004748	5'	+	jockey	22	1	48.51
GCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1	+	chr3L	10848656	5'	+	blood	7066	2	62.40
CGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1	-	chr2R	19499390	5'	+	P-element	32	1	45.19
GTTTGTGTTTGAAATGGGATAGTTCTCAGTAGTACTAATAGATGGTTGAAATGGAAATTATGTAAGCGTCCTTAAACTACATTTAACTTCCGTCACACTTAAAACTTCTTATGAACAGAATATTAATTTTAAATATAAAAAATAT:1	-	chr2L	17104700	5'	+	transib4	2575	1	48.28
TGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAAC:1	-	chr2R	5173525	5'	+	gypsy	62	2	57.53
CTCCTCTTCTACACAATCAAATGTCTGTTTGCTCTTCTCTATTTAAATTGGGCATTACCAAAATCGAAACTATTAAAAAAAAAGCAGCAAAATACACACAAATAAACTACTTAGCCACCAAAACCCAAACTTGAGACAAATACCGA:1	+	chr3L	16701266	5'	+	Porto1	4483	1	54.79
AGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGACCCATTCCCATTGAGAGCGAGTTGTGGTTCTCCCTGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGGCAAGAGACAT:1	-	chrX	12649915	5'	-	P-element	2866	1	57.14
AGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1	-	chr3R	16076867	5'	-	roo	361	2	62.18
CGTGCCAAGTGCCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3R	18582280	5'	+	roo	22	2	67.86
GTGTACAACATCCAATACACACGTTTGTTCGTCGTTAAATGACCCATACGCTATATTGGGAATACATTATATCGCAATCGGTTGGACAAGTGAG:1	+	chr3L	26169536	5'	+	diver2	472	1	68.09
CAAAAAGGTGGTTTTTTTTACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTGTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTGTC:1	-	chr2R	3104481	5'	-	Gypsy6A_LTR	381	1	49.14
AACTAGAGACGAGTTCTCAACGATTTTTATTGTGGAATCACCGAGCTCTGCTTACAACGCTTTGTGGCAGAAATCCGCCAAAAATCAAGGAAATAGTTGGATATGTGCCAGCAGGTACATTTTAAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTT:1	+	chr3L	491081	5'	-	accord	7030	2	79.45
AACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTAATTTCATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	+	chr3R	18582181	5'	-	roo	329	2	77.34
AATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1	+	chr3R	21705992	5'	+	297	58	2	66.15
ATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1	-	chr2R	20194273	5'	+	Max-element	51	2	66.97
CTCAACACTTAAACACACACCCAGAGACAGTTGGGGTCACNTTTTGCTAGCGGGGTTGGGATGTGTGCGAAAGTAACTAATTTGGTAACTCATTGCTGGCTTGTT:1	+	chrX	19973852	5'	-	I-element	5219	1	71.43
TGGCGAAAGTTATACGTTATTGCTGGGGCTTTTTAGTATTTGGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCCCTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTT:1	-	chr3R	17243287	5'	+	hopper	6	2	47.26
GTTTATTCGGTAAATATGAATATGAAAACACTATATATCTACGACAAACATGTTTTAGTTATTTGGTCTTCAGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTATCTGTAATGCAAAATGACTTAAATAACAATATTGTCATCCGGGTCGGATGATG:1	+	chr2R	12224479	5'	+	flea	4717	1	81.51
AGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	+	chrX	10640027	5'	-	roo	8998	2	66.90
GTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATATGCATATATCGAGGGTACGCTGTACCTATAAGTACACAGC:1	+	chr3L	11957116	5'	+	blood	28	2	56.03
GATCAGCTGTTTGGTTTTTTTTAATAATACATTGGATTTGTTATTGTTGCGAGTCAATCATAAAAGCTTTCTAAAGACAACTCTCAAAAGTGGCCCCGTTACCGTTCGACCTCTT:1	-	chr3R	7128016	5'	-	gypsy8	4784	2	80.00
AGTTTAATTCGCAACAGATATAGTAAAAAATTGAGCTTTATTCGATACATCTATAATTATTCAAATGTGTCAAGATTGTTAACTACAAATTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCA:1	-	chr3R	18307311	5'	-	copia	153	2	63.01
AAAATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1	+	chr3L	23325976	5'	+	pogo	57	1	63.70
GATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTAT:1	+	chr3R	26659742	5'	+	HMS-Beagle2	15	2	61.82
GGTTGGACTGTAAAATATGCAAAAATAATTATGCGCCAAGTGCAACCAAACAGGCAGGACTGTACCGCCTCGCAGTGAATCGCTGCATGAATGCAGTTGTAAATGTAATTTCTAGAAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGACA:1	-	chr2L	19239256	5'	+	invader1	3643	2	73.10
GCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1	-	chrX	22511411	5'	-	1360	3374	1	61.05
TAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr3R	31817454	5'	+	roo	60	2	65.91
TTCAACCATTCAACGTGCTCAAACACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACCTTACTCGTTG:1	-	chrX	9540158	5'	-	roo	9059	1	76.22
AAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr2R	9632122	5'	+	roo	73	2	76.34
CTAAAAAGTGTAACATACTTGTTGGGATCACCACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTATT:1	-	chr3R	17615223	5'	-	mdg1	37	10	71.72
CGAAAGAACAACAAAAGCAAACAATAACAAATTCCCAGCATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1	-	chr3R	14651326	5'	-	P-element	2855	1	64.38
ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGAGTCGGC:1	+	chr2R	1982173	5'	+	gypsy	148	2	65.83
CTGATTTGTTGTTTAGCCAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAGTAAACCAGGAGAAATTAAGAAGACAAGGAGGAAAACTTATTTAAAAAGACGATCTAAACTGGAGGACAAATTACA:1	-	chr2R	22337746	5'	+	TAHRE	372	1	65.07
AAATAAAACCATATCTTTTTTAAACTTTAAAAAAATATGCCAAAAAATTAGTTTCGTTAAGTCCTGCGACTCCGCACCGTCAAATTCACACTTTACATTTTCATTTCAAATAGCCATCACTGGATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1	+	chr3L	15490253	5'	-	copia	255	1	76.03
GAAGATAAGTCAAATAATTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1	+	chr2R	9258399	5'	+	3S18	5818	2	52.74
AGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1	+	chr2L	17420128	5'	-	roo	9032	1	56.16
GGGGGATGGAGTAAGGGGAGGGAATGGAAGCTGCAGTTCACCAACAACAAGTTTGGACCGATTCCAGGTCCAAGGACTTCCAGTGACCATTCGGAGTCGGACAAAAAATTAGCTAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTTTTATG:1	-	chr2R	6970780	5'	+	1360	3275	1	63.01
GATTTTTTTCATTCGAGAAAATTGCGGACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCCGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGA:1	-	chr2R	5173270	5'	-	Stalker4	399	1	75.17
CACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCACATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATTCATGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTA:1	+	chr3R	4604451	5'	+	1360	318	1	63.45
AACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1	-	chr3R	20427475	5'	+	jockey	25	1	61.90
AATCTATTTTCAAATATTCTAATATATATTCTAATCTATTTTCAATAACGTTTCTAATAACGTTAGGGCAATGCAAAACAATAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTA:1	+	chr3L	12978984	5'	-	1360	234	1	71.33
AGTATATCCTTGATTAGGATCACTAGCAAACTCGATCTGGTTAGTTTAAGTTCTCGATGTTTAAACATTAATACAATCGGATTATTTGATTATGATTTAAATATTAAAATATTTAAAATAAAAAAAAAA:1	+	chr2R	11925522	5'	+	TART-B	10630	1	72.87
AGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr2R	9632114	5'	+	roo	8733	2	71.11
GTCACCGCGTCCTTGAGTGCTGCAATCAAACGAGATTCAAAGTTGAGTCAATCAAGGCAAAAACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAAT:1	+	chr3R	14523704	5'	-	R1A1-element	347	1	53.33
AAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1	-	chr3L	20888819	5'	+	1360	23	1	63.08
AGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGC:1	-	chr3R	11547782	5'	+	G2	328	1	55.00
ATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1	-	chr3L	17205283	5'	+	hobo	44	1	60.83
GCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1	+	chr3R	12717747	5'	+	297	6640	2	73.64
GGAAGTGGCACAGCTAAAAGGTGCACGATCCAAGCAAACAAATTATATTTTTAGATTTCTCACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAA:1	-	chrX	3122513	5'	+	1360	3345	1	76.12
TGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1	-	chrX	17833042	5'	+	Tirant	43	2	79.78
ATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATT:1	+	chr3R	17478366	5'	-	copia	5064	2	60.96
AGAATATTAGTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr3L	22437982	5'	+	roo	8704	2	60.27
GCCCATTTAGCGGGCGATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1	-	chrX	11471686	5'	-	hopper	1398	1	68.07
GTCCAGGTTTTGATTAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr2R	20596571	5'	+	roo	17	2	65.81
GCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCG:1	-	chr3R	11547755	5'	+	G2	333	1	69.49
CATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1	+	chr2R	13585384	5'	+	412	7082	2	61.76
TCATGTGTTAAATACTCTTGTCAATGCGAAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1	-	chrX	6279432	5'	+	P-element	59	1	39.85
AAATAAGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	+	chr2R	21907895	5'	-	roo	9045	1	64.93
ATTAAATAAATTGTATATATTATATTCAAAATTGCTTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1	+	chrX	22617211	5'	-	roo	9031	1	56.16
ATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATACTGAT:1	+	chr2R	5284565	5'	-	Doc4-element	2592	1	60.83
GTAAAAAAAGGACGTGCTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACAT:1	+	chr2R	3338777	5'	+	Juan	53	1	52.74
ACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1	+	chr2R	5248256	5'	+	1360	80	1	76.26
GCCCCCCAACTATCCTTTATTCCACTCCACTCTGGCAAACAATTGCGAGGTGCCGCCTTTTCAGAGGGTTTGTAGATGTTTGAGAAACATGGGGTAACAAACGTACGCTGCGTCTTTGTCACTAGACTCTGTATGCTGAATCTCAA:1	+	chr2L	16122308	5'	-	INE-1	178	1	44.52
GAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2R	5248238	5'	+	1360	53	1	60.77
ATTAAAATATTGTATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATT:1	-	chr3L	14638696	5'	-	1360	13	1	45.52
CGTCCGTCTTTGACCGCATGTCACAGATGGCGATGGAGATGCACTCGTCAAAGGTACAGTTGGCACTCATAAAGAAGTTTTTAATAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1	+	chr3R	16404437	5'	-	pogo	2087	1	72.00
AGCCGATGTGATACTTTCTATCTTTCCACGAAATCCCTCTCACTTTTCGGCAAGTTCTTTTATTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGG:1	+	chr3L	4944139	5'	+	hobo	2925	1	56.85
ACAGAATGTGTAATAACACCAAATTATTTAGCGATTCACGAAGACGAAATGTCTTATTATAAGGAAAAATATCAGTTTATAAGGAATATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAAC:1	-	chrX	22118664	5'	+	gypsy	7020	2	63.01
TGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAG:1	+	chr3R	22388975	5'	+	G2	2657	1	60.74
ATGATAAGCTGAAGTAATATTATTTATTAATAATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3L	15177348	5'	-	roo	396	1	73.33
ATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTTAAGTCACCTTTAAGTCTGACTGTCTTAACGTTATTATTATTTGCAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTAGCCAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAG:1	+	chr3R	4571525	5'	+	1360	395	1	33.56
GCTTTCGATTGGCGCAGAAGAAAGCTCGGCTCTTAATTAATAATCAACTGAACTGGCTGGCAAATGAGGGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	+	chr3R	14364588	5'	-	roo	385	2	61.02
AATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	-	chr3R	20469671	5'	-	roo	331	2	69.86
GAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGCCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAATTAGTTGCATTGCATAAA:1	-	chr3L	21855546	5'	+	blood	7062	2	52.05
CGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTATGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	+	chr2R	9328578	5'	+	roo	31	2	57.89
CCGGAAGGGGCGTGGCAAGCGGAAGGGGGCGTGTACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1	-	chr3L	12308392	5'	-	hopper	1332	1	72.41
GCTGGAGAATCTGGGCATGCTGCGCATTGGCCATCAGGAGATCGTGCTGGAGGCGGTGGAGAACTTAAGAAACTTCGCCCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTG:1	-	chr2R	17419138	5'	-	gypsy	332	2	74.04
GAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2L	16091986	5'	+	roo	50	2	62.70
GGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr3R	27994192	5'	+	roo	72	2	68.97
CGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCAC:1	+	chr2L	12290649	5'	+	1731	30	2	60.77
GTTTGATCTTATCGCTTATTTTTCTTGTTGTAACGAGAGGAATTGTTAGACTTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAT:1	+	chr2L	23436132	5'	-	Porto1	411	1	56.67
AATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1	+	chr2L	15833026	5'	-	hobo	2910	1	68.75
AGAAATAGGTGTAAAATCGCGGCGGTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAG:1	+	chrX	17833008	5'	-	Tirant	8431	2	77.69
GTTTCCAATTGCCCTTAAGTAAAAGGCCTTAATAAAATCATAGAAACGTTTGTGCATATGCCTGTCCTTCAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGC:1	+	chr3L	27350360	5'	-	roo	443	1	52.05
GGCCTGGCCCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTCTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTATAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1	+	chr3L	4755222	5'	+	jockey	4742	1	64.38
GAATGTGTAACGTGTGCAAGGTATAAACAAAATACAGCTCAGCAAATAATGGGTAACTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAA:1	+	chr3R	19447120	5'	-	roo	8705	2	56.25
GTTTGCTTGCCCGAAATTTCGCTCCAAGCTTTTGGAAAACTACGACGCGAATTGTGCTCCATGCGCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr3L	233187	5'	+	roo	15	2	76.03
GCCACCCAGACTTCTATAACCAGAGATCTCTGCTTAGCCATTTGTTAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATCATGTACACACTTTTATTTAAAAAAAAA:1	-	chr3L	10054049	5'	+	transib2	2628	1	59.82
ATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTA:1	-	chr2L	9778710	5'	+	INE-1	563	1	79.07
CGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	+	chrX	18193657	5'	+	jockey	69	1	56.16
GCCAGTCTAACTAACACAAGCGAAGTTATGCATGAATATTTTGACTAAAAAATAGGTAAAAGAATTCATCATACAACTAAGCAATCAATGTAAACCATGATCAGGGGATCAGCTAGTC:1	-	chr3L	19007352	5'	+	invader3	5152	1	57.63
GAGCAGTGAAGCGGTTATTAGTGGATTATATACCCTATATAACACTCATCAGAAAATTAGAAGACATATCATACAACATACATTACTCCAGATGTACCCAACAGATACCAG:1	+	chr3R	1685395	5'	+	Idefix	93	2	63.06
TGATCCTGGTCAAGAATATATATAGTTTATCTTGTCCGAAACGATAACTTCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCCATACGAGTTACGGGAATAATTAGTAAGATTTAAATTTGTAACAAAAAAAGTTATAATTGATTGCTTT:1	+	chr3L	24757196	5'	-	Cr1a	4258	1	54.79
ACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1	-	chr3R	20499876	5'	-	mdg3	5485	2	72.00
GTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGTAGTTGGGT:1	-	chr3L	11957189	5'	-	blood	7354	2	67.42
TACGGAACAAAACCCAGAACACCGATCACTGAACACCGAACATGGCTTACGTAATGAGCGACCCGGAGCCAAAGGCAAAGTCAAAGGCCCTTTATTATGGAATGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1	-	chr3R	19265945	5'	+	I-element	17	1	71.53
TAGCCGTCCTTTTCACGCACGGATGTAGGGGTGTGAAGTTTTTGGCATATTCAAAGTTGGAAAAGTTGCACTTTGAGGCTGCTAACCAAAAAATATAACTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1	-	chr3R	11084022	5'	+	412	19	2	67.12
AATTATTTGGTAAATCACAGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1	-	chr3R	16404585	5'	+	pogo	43	1	56.85
CACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr2L	3114472	5'	-	roo	9015	2	56.16
GATGCAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACAT:1	+	chr2R	7586164	5'	+	I-element	5122	1	76.03
GGCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1	+	chr3L	10773084	5'	-	412	7470	2	76.47
CCTTGTACTCGTAAATAAACCATGGTGGAAGCCGGAATGAAAGGCAACCGAAAACAATAAATCGCATAAATCATATTAAATTGACATATCAGGCTAAAATTGACCGCAAGCAGTGTGGATGTGTGTGTG:1	+	chr3R	18765846	5'	-	accord	7105	2	72.87
GTATTTTATTAAGAACTCAAGCGTAGGGAAACACTCCTCATTAATGATTAGAGCAGACAATTTAGTACCCTTTCAAAATAAGGATATCGAATATTTACTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAA:1	+	chr2L	16180280	5'	+	G6	1919	1	54.79
GCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGATTCCACATAGTCTCCGCTAACATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTG:1	-	chr3R	10274016	5'	+	HMS-Beagle	6876	2	72.66
CGAAAAGTTGTGATGTGCTCTAGGCAAATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1	-	chr3R	14049482	5'	-	transib2	2813	1	76.71
GTAAGTTAATGCTTTAAGTCATATTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1	+	chr3R	12598465	5'	+	hobo	60	1	65.94
CCATGCAAAAAGGTCCTCAAGGGACTTATGTTATATAAAAAATGGAGTCTTCTAAATTCATTCTAATCTAAATTCATCATTCATTCTTCTAAATTCATTCTTCTAATTCATTCATTCATTGGAGTCAAAAAAAATAAAAAAAAATA:1	+	chr3R	17433821	5'	+	R2-element	3584	1	44.52
TATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1	-	chr3L	10574390	5'	+	Tabor	6881	2	46.04
TTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr3L	22437861	5'	-	roo	9010	2	58.90
AAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCCTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr3R	18339167	5'	+	roo	80	2	74.66
GGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr3R	16076862	5'	-	roo	330	2	72.41
CGTCAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr3L	21818076	5'	+	roo	8722	2	60.96
CTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	12835064	5'	+	jockey	73	1	75.86
AAAATACAATTATTTTGAAGGCCTGCTTCCGAATGTTCATCTTAAAAATATTTAAGCACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATA:1	-	chr3R	14364756	5'	+	roo	3	2	79.45
AAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	-	chrX	13066574	5'	+	jockey	9	1	62.32
AAAGCGGTTGCCTTATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1	-	chr3L	4605750	5'	+	pogo	30	1	65.07
GTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr3L	4536761	5'	+	roo	8753	2	81.12
AGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTAT:1	+	chr3R	9714349	5'	+	Stalker4	6986	4	65.07
CGTCATTTTGCATTTAAAACTATTTTTAAACAACTATGTATGTTTGCCAGATTCGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTGTAAGTTTCAG:1	+	chr3L	16750654	5'	-	Tirant	8451	2	61.48
AAGGCGAAGGCAAATTGTCTACAAACTAGTGGGATGCCATGCCTAAAGTAGCAAGTCTGTCTATGGCTAGGCATTTATTTGCTTTACAATTTTGTTCATACTTCTATATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGT:1	-	chrX	9622205	5'	-	Doc3-element	4679	1	67.81
GTAAGGTATCTTGTGGCCAAAGGTATCTAGTTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	-	chr2R	4977099	5'	+	1360	53	1	71.05
CAAAACAGCAGTTGATTTCGTTTAAACATATGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATG:1	-	chrX	22838787	5'	-	INE-1	535	1	60.00
GTTTTGTTGGCTGTTTGCTGCCGTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1	-	chr3R	10266193	5'	+	1360	20	1	68.00
TATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATT:1	-	chr2R	6885402	5'	-	flea	4967	2	51.37
ATTCTTATAGTGGGTTTGAGGTAGATGGATACGTCAACTACATATCCTAACGTATTTAATAGTTCATAAAACCCTTGGCTACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAA:1	+	chr2R	17923347	5'	+	R1A1-element	4890	1	60.32
CTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3R	17817950	5'	+	roo	8686	2	69.44
TCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	+	chr2R	19050216	5'	+	roo	8726	2	72.88
GAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTAAATTGCGCTGTTATGTCACT:1	+	chr3R	19589899	5'	+	BS	5042	1	50.00
GTCGGAGGAGACATGGCTGGACCGCCGCCAGGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACTGG:1	-	chr3R	19007524	5'	-	hopper	141	1	86.21
ATGAGCCACGCCCAATTAGCAAGTGCGTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGTATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAA:1	+	chr2R	23465959	5'	+	Doc	483	1	73.29
CTCACTCTCGGGCGGTAGGTTACTTTGTTTTCGCTCTCTGCCACTTAAAGTGACCGTTTCTTTTGTCTAGTCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1	+	chrX	6279337	5'	-	P-element	2835	1	49.66
CACTCCCAGGATCTCTCCTCGCTGTAGTGATCCTCACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1	-	chr2L	23197598	5'	+	Transpac	4995	2	75.36
GACTGACATCCATTTTGACGGAAATACTCAACGCCATGACCTGGCTGGCAAAGGAGGAACAAAAATTGGCTAGGCACATATTAACCTAGAAATAACAAGAGAGAATGCTATAGCCGATTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATT:1	-	chr3R	4590409	5'	-	INE-1	550	1	55.56
CCATCTTTTTCCGCCAACATCAGCTCATTTTTATCACACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTTCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr3R	18339225	5'	+	roo	8683	2	72.73
TGAAAGCGAAGATTCAAGAAATTTCTTCATATGGAACTTTTTTTGTGGTTTAGGTTACCGCGACATCCGTAAGTGCCGTGGAATTATTAGTCCACCCTGAAGTCCAGGATGCCACGCACACACTTTTGAAAATTGTG:1	+	chr3R	4511203	5'	+	INE-1	256	1	66.42
ACCTATTAAATCATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTAT:1	+	chrX	13704724	5'	-	invader4	315	2	74.07
ATATTCCTGGATAACAGCTGAATAAATTCCTGGATTTCAAAGTCTGGACAAGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAT:1	+	chr3R	11514948	5'	+	I-element	84	1	64.38
GTTGCTATTGTTGTTTTTTTTTCTCTTT:1	-	chrX	9285399	5'	-	gypsy7	5013	1	96.43
TAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr2R	20596557	5'	+	roo	59	2	62.76
ACTCATTATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1	-	chr3R	31817571	5'	-	roo	9041	1	66.21
GGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1	-	chr2R	2427612	5'	+	Doc	51	1	61.42
AACATACCAAAACAAAACGGGAAAGAACCAAACCTATACCCCCCAATAAAACTAAAAAAAAAAATAAAAAAAACGAAAAAG:1	-	chr2R	15068467	5'	+	Doc2-element	229	1	71.60
GCTTGCGAAACGCAACCAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAACTAAATTCAGTGCACGTCTGCTTGTTGAGAG:1	-	chr3L	2712798	5'	+	P-element	68	1	21.93
GCAGAATGGAAAAAGGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1	+	chrX	12214029	5'	-	opus	7488	2	71.54
ATTAGTACTATCTGTTTACTATACCAGCCTATCCAGTATTTATGTATGAGTATTATTTACTTAAACATACATCTAATAGAAGTACTTAAATTAAAAATAATATATGAATACACTAGGTTCCTACATGATAAAAATAAATAGATATT:1	-	chr3L	4168313	5'	+	mariner2	828	1	71.23
GTGGGCCCCAAATGAATTTGTTTCCCTTTCGTTTCATTGCGTTCAATTTGCGCTCGTAGGTTGAAAATGATTTCGAGTGTTCACACATGAATACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr2L	16086796	5'	+	roo	8675	2	71.56
TCTGCCGAAAAAGCAGTAAGCTCCAGCAGGAAAAAAAAGAAGGCAAAATAAATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGA:1	+	chr3L	10385835	5'	-	Burdock	6326	2	66.90
AAATAAGTTCACTTTTCATAGATTACGAAAATTTTAGAAGATAAGTCAAATAATTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGT:1	+	chr2R	9258363	5'	+	3S18	16	2	71.72
TTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATAT:1	-	chrX	23182953	5'	+	Idefix	15	2	62.33
GAGTGCATTTTTTTCAATTATAATTGAAACATTGTTATAATAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGGGTACTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATA:1	+	chr2R	705577	5'	+	Bica	76	1	65.65
ATGTAAGCCTGACTTTGGTTAAGTTGAAGACAATGCATCTCTTAAATTAGAACCTCATAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTT:1	-	chr2R	3382296	5'	-	GATE	390	1	61.38
ACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr2L	12892631	5'	+	roo	8742	2	72.60
AACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chr2R	7898174	5'	-	roo	351	2	60.27
ATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr3L	20831280	5'	-	roo	345	2	64.83
CTCTACGAGTTTAAATGTATGTAAACGAGAGGAGGTAGTTAGTTTCAAAATGTTTCAAATGTTGTTGGTAGCTGCATATTGCATTCTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGT:1	+	chr3L	26169810	5'	+	TAHRE	10401	1	56.52
TATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAACA:1	+	chrX	10693438	5'	+	hopper	14	2	72.87
GGAGGCGTCAAGAAACCCGCCAGTGCCGATGCTCCTTGTTTTCGTGGATTGGCATCTCGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTT:1	-	chr2L	10757846	5'	+	1360	3309	1	63.01
CCACGAAAAGAGAGACGGAAACACAAGCCCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCTATACGA:1	+	chr2L	9668188	5'	+	1360	18	1	53.68
CGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	-	chr3R	12887007	5'	+	roo	8709	2	54.79
GTGGAGGCGTGACAGGGGCTGGGGACTGGGCGCGTGCTAAAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAAC:1	-	chr2L	15833565	5'	-	jockey	4983	1	66.41
CTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr3R	31817526	5'	-	roo	9051	2	56.67
AAACATTTGCAACACTAATATCTTATATCATATTACAGTAACTGGCGGGTCTTATGATTTATTTTAAAACTTTAAGGACGTAATGTACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1	-	chr3R	13237415	5'	-	3S18	305	2	56.85
GTCGAAGAAAATAGCGGTACCACAGTACATTCCGACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1	+	chr2L	22575608	5'	+	Quasimodo	70	2	75.56
AGTGTATCTGCCTTATTTTTGGGACTCTCGTATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1	+	chr2L	4412526	5'	+	Quasimodo	28	2	60.27
ACCCACAATTTAGGTGAGTTTTCGTCTTAGTTTTTGGTATCCCCCTCTCCAACCCATTGAATACTTTCTTCAGCCACGTACCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1	-	chr2L	7810153	5'	-	P-element	2856	1	62.04
CAAAAGATAGTCGAGCTCTGATTAAAGTTTGGTCTAAGCCACTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAG:1	+	chr2L	3115534	5'	-	roo	8952	2	67.19
ATGAGACTAATGCAAATTTGATGAATTCATAAACGAGTTTCTTGTTAAACAAGATTTTAAAAGGCGCGATTAAAATCATTACTTCTTCATATTGAGCGTACATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCT:1	-	chr3R	14532101	5'	-	Quasimodo	434	2	60.47
ATGTAGAGAAAAAGTTTGTCACGCTGTAAGACAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGTATATATT:1	+	chr3L	15600126	5'	+	roo	8669	2	63.83
ATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTT:1	+	chr3L	24213777	5'	-	invader2	173	2	68.49
ATAGGAAAAAGATTTTACCTCTTGAGCAATAAATAGGTTTAGTAAAATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chr3R	20469716	5'	-	roo	9046	1	60.00
AAAGGGGGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1	-	chr2L	16067191	5'	+	297	6622	2	56.12
GTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chrX	5643444	5'	-	roo	388	2	68.38
ATCACGCGAGTTTATTGTGCGCCTGTTTCGGGTAAATAGGTAATTTATTATCTTGCGATTGTTGCAATATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTT:1	-	chr2R	1567962	5'	-	jockey	4936	1	54.79
TTCCTTTTCTATACAATATACAATATGCTTTTTTAAAACATTGTCTCCAGCGTCGATTCTAAGTTTGTATAAGTCCTCTACAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1	+	chr3R	4569411	5'	-	1360	3347	1	56.94
ACTAATTACGAGCCAAAATACGCGAAAGAGAAACACATTCGAAGTTGTCAATGCGTTGGCGTTAATGCACAGATTTCACACTGCAAATAAATTGTTTGCACACTTTTCTTCTGTTTTCTATTTTGCTCCTATTCCGAGGAATTTCG:1	-	chr3R	7256013	5'	+	S2	256	1	51.37
AAGATTAATAAAAATATAATAATAAGATAAGATAATTAGAGATTACTTAAATAGTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1	+	chr2L	18278526	5'	-	P-element	2867	1	74.66
CTTGGACTGTGAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1	+	chrX	21087529	5'	+	mdg3	5268	2	72.73
TCTGTAACAAGTTATTAGGTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGCGGTC:1	-	chr2R	8146167	5'	+	P-element	4	2	77.50
TGCCTCGAAGCGAGTTAACTTTTTCTCATTACACGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr2R	21907990	5'	+	roo	42	2	73.74
TTTTGGAATGTACAATAAATAAAATGTGGCAGGGTGGGGGGAGAGAAATCTGCAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACT:1	+	chrX	14336830	5'	+	roo	8801	2	62.33
ATAGACCAAAAAACATTAAAAATGTCGCAAGACAATTCGAGGACCGTCTCCTTGACGGAGAGCGGCCT:1	-	chr3L	9381154	5'	+	baggins	475	1	69.12
AAGTCGGTCTAGTAAAATGACTTGCTTGACTTACTCCCCTCAGCGTAGTAAATAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATA:1	+	chr3L	22532219	5'	-	Cr1a	4208	1	79.45
AAAGTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1	-	chr3L	10841539	5'	-	mdg1	336	2	75.34
GAAGCGAGTGGAACCGGAGCAGGTTAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTAGGCCTGATCCCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTG:1	+	chr2L	10038819	5'	-	Quasimodo	214	2	51.85
CTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1	-	chr3R	19529183	5'	+	jockey	4714	1	73.33
ACAAAAGGGAAATTCCTCTAGCCCATGACGACGTGATCTCGGGGTTAGCCGGGGTTAGTCAATCCGCAAAATACAGAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGG:1	+	chr3R	19269874	5'	-	I-element	160	1	62.40
CTGTATCGAGGTGAGTCCGCAAGCGGGTGCCCACTGTAACGTAGTGCGTTCCCAGGTGGATCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1	-	chr3L	3799874	5'	-	copia	229	1	56.85
AAATTCGTTGATGCTCCAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1	-	chr3R	20005152	5'	+	297	26	2	67.81
TAATGAGCCACGCCCAATTAGCAAGTGCGTCACATGCGAGACTCGCAAGATCCAGGAGCAGCTTCTATTGCTCCTGGCTAATGGATTGGAAAATGGAATTGAAGGCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGGAACTGTAACACTGCAAT:1	+	chr2R	23465957	5'	+	Doc	481	1	71.92
ATGCTGTACGCTCCTGCTCCTGCTCCGGTTTCCCTGGCGAATGGGCGTTTGCCATTTCAGATTAATGCCCGGCGGCGTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1	+	chr2R	19797994	5'	-	Transpac	5208	2	65.60
AAAAATGACCATCAAATACACTGACATGACCCAACAAGACATCAGATTAGTTCATTTTCTACCCCATATAATTGAAGATACAGATAATATTTCGATACATTTTTCTAAACCTAAGAACATCTCTTATTGAGTTATTTTGCTTATCC:1	+	chr2R	3350704	5'	-	Circe	6991	1	80.14
TTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1	+	chr3R	15072537	5'	+	pogo	39	1	56.85
TATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGTGTATATATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCT:1	+	chr3L	25245595	5'	-	Bari1	1624	1	76.03
TTCAACAATTATAATTATGCGGATTATATTATTCTATATAAAGATATTATCTATCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGT:1	-	chr2L	15248005	5'	-	Transpac	5164	2	62.33
TTTAAGAACTATTTGCTCAAACTTTAAAAATCTTTTTGGAGACCCGGACGAAAAACTGACATACACAACAAGAGTAGAAACAACTTTAAGGAGTACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGATCGACGCAAAACACGCACAAC:1	-	chr3R	3876214	5'	+	Bica	4627	1	69.18
AAATCACTTCCCTAGTGTTTAGAAATGTGTAGTATTTACACGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAGTCTGTACCAAA:1	+	chr4	975359	5'	+	Tc1-2	1308	1	68.22
GGTTGGCAGGGAGTACAGGTGTGAGTACTAATACCCGGTGGTTCACTAATACGAACAGGTGCCTCAGGGAGCCTACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACACAAA:1	-	chrX	16157823	5'	+	17.6	87	2	59.35
GGCGTGTTTGAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1	+	chr2R	2016792	5'	+	1360	23	1	67.41
CCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTC:1	+	chr2R	10582403	5'	-	Juan	4133	1	73.10
CCCAAAAGTTGAATCAGACACCCGCGTCGTACAAGATATACATGTACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAAGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1	-	chr2R	17626918	5'	-	opus	428	2	67.83
GCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	-	chr2R	20596547	5'	+	roo	49	2	64.80
AAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr2L	16091997	5'	+	roo	53	2	60.00
ATAATAGATGTATATAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTGTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCA:1	+	chrX	22897615	5'	+	Bari1	51	1	66.36
AGGCTAGAAGTCAGCATTAGTTACAGTTCCGAGTTCTCAGTGCCTCGAATTTGGTTTATTAAAAACATCCTCCAGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTTGCAACAG:1	+	chr3L	6333530	5'	+	diver2	4869	2	50.68
CTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1	+	chr4	311185	5'	-	1360	3336	1	55.48
CACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTT:1	-	chr2R	5173226	5'	-	Stalker4	387	1	59.29
ACTTGAACTTGCACTTCTCCTCGTTGTAGGCATACAGGCACTGGCGGGCATAGATGATGATGTTGTCCCGCCTCTTTCGAATCTCCTCACTACTATATTAATCACTTGAGCTGCTAGGTGCATGCTCAGC:1	-	chr3R	19177406	5'	-	Stalker2	190	2	71.54
ACTGCTGGTGGGCCAAGGGCACAATTGTCGAGTGTGCAAATGATGTACGTATGTATGTACAATGTACAACGCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTG:1	+	chrX	3449431	5'	-	S-element	1	2	50.00
AAATAATAATAATAAAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1	-	chr3R	17605776	5'	+	Tabor	7	2	77.78
GTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr3L	15600189	5'	+	roo	73	2	68.49
GTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1	-	chr2L	14588753	5'	+	Tabor	7	2	75.81
AAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATTTAATTTAATTGCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGAGGGGTATACAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAG:1	+	chr3L	21484243	5'	-	Cr1a	4105	1	72.22
TGTGTCCTCGCTCCACTTGGGGATACTAATAACAAGGACAAGGATGGCGAAAAGGAAGCAGGTAAGTTCAATTATTTATATCCCAGACAGCATTAGTTCTTAATGCCATATATTTTCCTTTTTTTCTTTC:1	+	chr2R	17873064	5'	-	Doc2-element	250	1	75.38
TTAAGTCCTGCGACTCCGCACCGTCAAATTCACACTTTACATTTTCATTTCAAATAGCCATCACTGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTA:1	+	chr3L	15490311	5'	-	copia	5068	2	55.48
CTGATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1	+	chr3R	10182110	5'	-	blood	7348	2	51.54
AGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCC:1	+	chr2L	21008550	5'	+	invader3	54	2	63.93
AGGCGCTGAAGTGATAGGAAACTTCCTATCAAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1	+	chr2L	6863253	5'	-	pogo	2089	1	73.55
CCTGGCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1	+	chr3R	12886906	5'	-	roo	9027	1	61.40
GTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGA:1	+	chr3R	4504086	5'	-	INE-1	561	1	55.00
ACTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1	+	chr3R	11083855	5'	-	412	7510	2	60.27
GGCACCGCCGAGCACGTTAAGGACCCCAAGGACTTGCATCGCGCAGTAAGTACTTGCCAACTATAATTATAATCTAGACCATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTC:1	-	chrX	18391021	5'	-	invader4	125	2	62.41
ACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	-	chr2R	13084668	5'	-	roo	9041	1	58.59
ATGAAAATAAGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2R	21907891	5'	-	roo	396	1	73.39
TGTATAGTGTAAATATGTTTGTATGGATGTAAAACATTTTTGTTCGGCACCTTTTAGCTCCGATCTGCCATTATGGTACTACTCCATTGAATCAGCTCAAAAAGAAGTTACAAATTCGATTTATTTATTTTTATATCGTA:1	+	chr3R	17395704	5'	-	mariner2	825	1	77.14
AACAAATCTAGTACCCTTTTAATTGTCGAAGAAAATAGCGGTACCACAGTACATTCCGACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAG:1	-	chr4	897196	5'	+	Quasimodo	47	2	58.09
CGTTGATGCTCCAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1	-	chr3R	20005147	5'	+	297	6609	2	65.73
ACCGAAACAACCTCTGTTCCAGCAATTCAAGCCCTTCAAATCCTGCAACACCATCATTATTAAATCATACTGCTTCGTGTTAAAATATTTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACG:1	+	chr2R	6282456	5'	+	GATE	8274	2	40.71
CGTTACACAGAAGATTGAAAATGCTAATGCCACCAAGCAGTCTGAATCAGCCGGCTGTCGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACAC:1	-	chr2R	25118519	5'	+	roo	8800	2	72.73
CTGGAATTTAATAAACGTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTA:1	+	chr2L	11985772	5'	+	G6	1685	1	56.41
AAAAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTC:1	+	chr2L	4177208	5'	+	GATE	8293	2	54.33
GGGGGAAAAGAGAAAGGTTCTTTAGAAGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1	-	chr3L	15600388	5'	-	roo	410	1	72.60
GCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGATCCATC:1	-	chr3R	14940180	5'	+	jockey	66	1	56.43
ATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1	-	chr2R	15064463	5'	+	412	7091	2	57.53
ATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1	-	chr3L	10647973	5'	+	412	7108	2	80.95
AGATACCATAAATCAAAATAACTGTCATTCAATGAATGTCGTAATGAACTCAATGGGTCCCCGAATGCTGAATCCTAAAATGTGCGTAGAAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTG:1	-	chr4	438619	5'	-	1360	72	1	71.77
AGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGCGTTTAGTA:1	-	chr2R	21298836	5'	+	jockey	277	1	54.11
GCTCCTCCATGCATTTGGCCCACAATTTTCTCGTCTCCATCGTATGTCTGGTCCAATTAGCGGACGACCCAAAAAACTTTGCAGCTTTGCATTCGGATAATTTAAGAATTACATTTATGAG:1	+	chr3L	16071427	5'	-	TART-C	10944	1	62.81
TTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1	+	chr2R	5485072	5'	-	blood	354	2	66.44
ATCCTTCAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1	+	chr3L	23906331	5'	-	1360	3377	1	75.52
GGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1	-	chr2L	18419266	5'	+	412	34	2	55.94
AAATATAATACCCAATGTGAGTCATATCCGTGTTTTTGTATCTTTGACTGTAAGACTGGTCAATGTTCTTAAAATGGAGTTCCAACATGAAGTCAAACTATTACCCCTTTTGACCAAATAATAAAGTAAAGGAAATTAAA:1	-	chr2L	14694418	5'	+	TAHRE	34	1	55.71
AGAAGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1	-	chr2L	23068914	5'	+	1360	74	1	74.44
AGATGTTCAGTGAAGGTTTTCTGTTTCGAAAAATACATTTATATTCGTAAAAGGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAA:1	+	chr3R	24383188	5'	-	rover	7288	2	76.98
ACCAGTCCCATGGGTCTCTCGCCAGTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	-	chr3L	9998245	5'	+	roo	8673	2	77.86
GTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCT:1	+	chr3R	26659769	5'	+	HMS-Beagle2	6941	2	67.46
CATCTGTGTTTCCTCTGTGTTTAGGGCTCAATAAGTTTTATATCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1	+	chr2R	6172941	5'	+	pogo	18	1	73.29
TTAATTGATTAAACAATTGTCTTACTTAGAAAGTATAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3R	16076751	5'	+	roo	8677	2	73.60
TACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1	+	chr3R	9921971	5'	+	blood	32	2	56.20
GTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTA:1	-	chr3R	9039005	5'	-	Juan	4141	1	70.55
CCGGTGTCAGTCACCGAGAAGTGGGCACACACTAGTTGTGGCCACATGGCATTTTCGTCAAAAAACAAATACCAACTCCGAGTCACATCCGGGGTCCCACAAGAGAGCCATCTTGGTCCGCTTCC:1	+	chr2L	21768368	5'	+	Q-element	497	2	60.00
GAGTGGTGCGGTTTATTGGTTTGTAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGTTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1	+	chr3L	10848604	5'	+	blood	7013	2	79.84
CATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	-	chr2L	3114555	5'	+	roo	8747	2	74.66
ATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATTCTTCATCAGGATCAATAGCCG:1	+	chr2L	21582258	5'	+	INE-1	88	1	73.97
AATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAA:1	-	chr3R	19446228	5'	-	297	6903	2	69.18
CAAATAAATCAGATTATAGCAAATAATTGTGTACGCATTATGCAAATTCCAGCAATAGTTTTGTGTCTTTTCAAGTGATTAATTTATGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATACTAACAATAATAATAATAATATTA:1	-	chr3R	9210751	5'	+	mdg1	34	2	60.27
GCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1	-	chr2R	24218614	5'	-	412	443	2	58.40
CACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	18339111	5'	-	roo	323	2	75.69
GTGACATACACGTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAGTATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGC:1	+	chr2L	12290631	5'	+	1731	28	2	66.44
AAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chrX	6486731	5'	+	roo	73	2	75.76
GGAAATGCGATCGCGAAATTTAATAATTTTTATAAGATATCGAAAGTCCGATACATTAGCAAACTACCCGTTTCGTAACGAGCTCTCAGCTCCTTTTTAGGAAAAACCGTAAAGTCTTTCCAACCAAAGGCACTAGAATAACAAGA:1	-	chr3R	4185852	5'	+	1360	1	2	71.92
TAGAAATTTAAGAAGTATATGTGGGAATTCAAAGGGAAAAATACATCGTTTCGGCTTCGGTTTTTGGTTTTTGTTCAGCCGACTTTCAAAGCTAACGTAGTGTCTTTAAAGCATAAATACATAAAGCATAAAAATAAATAAATATT:1	+	chr2R	12786056	5'	+	mariner2	828	1	69.86
GTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:2	-	chr3R	20427506	5'	+	jockey	35	1	65.75
GCCTACGAAGGATAAAGAATAAAAGGTGGTATACTCGAAGTACAGCTGTGTTCTTAAAAATAGCAGTGCTTCGGATCTGAGAGTTTAAGATAAAGAATTCCTATGATTTACAGTTCTAATGGAACATTAAATCATAGGAATTTTTT:1	-	chr3R	7141080	5'	+	HB	1578	1	81.51
GGGGAAGGGCAGAGAGCCACATTCGGAAAACAGGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAG:1	-	chrX	22715189	5'	+	Bari1	9	1	77.04
AAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGC:1	-	chr3R	9039007	5'	-	Juan	4143	1	69.18
TGTCTGGTGAACTAGTTCCCGAAAGCTGTAACACACTTCCTTCGGCATCCTTCAATGTAAACCAAGACCATCCCGAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGTTGCGTAAGCG:1	-	chr2L	22572479	5'	-	Quasimodo	231	2	58.46
TAGAAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGNTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chr2R	9328572	5'	+	roo	8699	2	58.74
GATTGATAATTGTGCTATTGTTTTGTGTCTGTCGAAGCCTCTTGCAATATACAGCTTTTTTCGATAAGTAATTACACAAATTCTATTTTTAGATTTATTACGCTCTCATCGTAAGCGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGGCAC:1	-	chrX	18357614	5'	+	1360	3319	1	48.63
AGAAGGACACAGAGCCGGAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAG:1	+	chrX	21016715	5'	+	Transpac	4946	2	65.75
GGTATTCTGACAGCAACATTCTCCAGGGAATAATGAAATAATAACAAATATTAATTAATAAAAAAAAGGATTAACTTAACTTCTGTAAGTACAACGCATATTGATTACTTAATAAGATCTCTAACTTTCATAACGACCTTTACATT:1	+	chr2R	4895780	5'	+	gypsy7	435	1	69.18
GAGCGAAGGCTTCCGCAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1	+	chrX	10521589	5'	+	Tabor	6860	2	69.86
AAACACCATTTATTTAGGAAGTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1	+	chr2L	16016321	5'	-	412	7480	2	60.27
ATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	-	chr2L	5254378	5'	+	roo	38	2	50.77
TTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTG:1	-	chr3L	10574384	5'	+	Tabor	6893	2	52.41
CAGGGAATGCAATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1	+	chr2L	11518380	5'	-	412	7508	2	53.49
ACAAAAAAACATAAACACGATGTAAATGTTGATTTATGACAACCACAAGCACACGCAAATGCCACTGTGCGTATACGTAATCACACATTGTTGTGGGTTATAGGGGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTT:1	-	chr2L	9287318	5'	-	G-element	4177	1	66.14
GTCATGCTGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3L	11531019	5'	-	roo	396	1	74.64
TAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr2R	21229008	5'	+	jockey	35	1	54.55
AGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1	-	chr2L	6623024	5'	+	Burdock	74	2	70.34
ACACTTGCATGCATTTCTTTATATTGTAATGATGAACTCCAATTA:1	-	chr2L	8986181	5'	-	412	494	1	57.78
GACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr2R	11164498	5'	+	roo	60	2	66.67
ACGAATGTTCGAAAATGTTTGTATGGCGGGAAAA:1	+	chr2R	22600500	5'	+	Transib-N1_DM	302	1	67.65
CGGCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:1	+	chr3L	10773083	5'	-	412	7482	2	73.60
ATTATTTTAATATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1	-	chr2R	9221103	5'	-	opus	443	2	64.84
AATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chrX	5643464	5'	-	roo	9021	2	54.11
ACTTTAATCAGATTCCAGCACGCCGAACGAGATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1	+	chr3R	28758252	5'	-	mdg1	7443	2	54.79
GAATGGGATAGTCAATATTGGTGTCACAACTGTTATGATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACA:1	+	chr4	546151	5'	+	R2-element	3514	1	71.54
GCGCATTTCATTTATTCATGCCTCCTTGACCAGTACTCTTCCGCTCTTCCCCTTTCCATCTCGACCCATCTCCATTTGTTGCGCTTGCCCCTTTCCTTTTTCCTTGGAAGGAATTGTCTGCTTTTATAAAAAATGTTGCC:1	-	chr3R	10949351	5'	+	Cr1a	456	1	80.71
AAATGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1	-	chr3R	13349165	5'	+	BS	5021	1	64.38
AAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTTTNACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAA:1	-	chr2L	23034075	5'	-	FB	379	1	42.47
ACACAATTACGCGGCAGGAAATTGTGAATTAGAAGCAGCGCCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1	-	chr3R	9922120	5'	-	blood	7376	2	73.94
CGGTAAGCGGCTTAACTGAATTTTCCAACTGGCGACAACACACAAAACAAATTTCAAACTATGTATTTACTTAAGGCATCAGGCATCAGATTGTGTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATA:1	-	chr3R	31027726	5'	+	roo	351	2	66.44
ATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTT:1	-	chr2L	21153572	5'	-	1360	341	1	49.32
TATTAAAAGCTATGAGCAGTAAGCGATTCAATATATAAGATACATTTTTATGAATTTTAATGTGCATCAAATTGTGTGTAGCTTTTGTATTTTATGTTATATTCTAGATATTTCCTTGTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTTT:1	-	chr3L	15012707	5'	-	Doc	4697	1	78.01
TTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1	-	chrY	2720351	5'	+	297	6641	2	77.95
GGGCGATTTTCCCATTTCCAAAGCCAACGCAAACCGTTTACCAACTCGATTGTAATTGGCTGACCATCCTCAACTACTTAGTAGATTGAAAGAGTATACTAGATTTGTTGAAATGTATG:1	+	chrX	183251	5'	+	INE-1	11	1	75.63
CCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATA:1	+	chr3R	20499757	5'	+	mdg3	58	2	58.96
ATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	-	chr3L	21855540	5'	+	blood	33	2	55.74
GCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1	+	chr2L	15247919	5'	+	Transpac	55	2	67.97
AATCGAATTCATTTGCATTTTAGTGCAATGCGTGAGTGCTCTTTTTCTGCCAATCTCATAAAAATTAATAATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1	-	chr3L	2193051	5'	-	I-element	5306	1	51.37
CATGCAAAAAGGTCCTCAAGGGACTTATGTTATATAAAAAATGGAGTCTTCTAAATTCATTCTAATCTAAATTCATCATTCATTCTTCTAAATTCATTCTTCTAATTCATTCATTCATTGGAGTCAAAAAAAATAAAAAAAAATA:1	+	chr3R	17433822	5'	+	R2-element	3584	1	44.14
CTCCGCGAGTCCGTTTATATATTTATTATTTGTCTGAGATGAGCCCAATCGAGATTAGGCCTCTTACATGTTACAACTAGTTAAGTTTTTGTTTTAGTTTTGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAG:1	-	chr2R	12801490	5'	+	R1A1-element	4936	1	69.86
ATTAGATGGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTCCACACATGAACACGAATCTATTTAAAGACT:1	-	chr3L	20831409	5'	+	roo	13	2	73.64
AACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	-	chr2L	14081433	5'	-	1360	3357	1	63.01
GTGGAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1	+	chr2L	22121329	5'	-	opus	479	2	39.13
ACGATGGTGACACCCCTATAAGGAGAGGCTGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCC:1	+	chr2R	5173395	5'	-	gypsy	442	2	72.39
GTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1	+	chr2R	9791600	5'	+	412	7136	2	76.71
GGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	+	chrX	5274312	5'	+	roo	8748	2	74.66
TATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCTCGT:1	-	chr2L	22685209	5'	+	Ivk	51	1	50.68
ACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTAGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1	+	chr4	158192	5'	+	Tabor	6880	2	54.79
ATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1	+	chrX	18193640	5'	+	jockey	33	1	60.16
GCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTACGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGACT:1	-	chr3L	19334325	5'	+	roo	8743	2	75.34
TATGGATCGAATAAGTAAAAGGAGTCCCAATCAATTTAAACACCAGTTCTAACGGGTATAAAAATATCTTACTCCACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1	+	chrX	18819853	5'	+	P-element	9	2	43.57
ATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	+	chr3L	10292830	5'	-	roo	9042	1	72.09
GCTTTTAAAGTGGTACAACTTATATAATTTTACGAATAACCCTTTTTTGTAGCATCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATA:1	+	chr3R	25453988	5'	-	Quasimodo	7358	2	75.83
AGTAACGCTTACGTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCCCTAC:1	+	chr2L	19817842	5'	-	G4	3760	1	70.55
ACCTAGCAAGCCCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1	-	chr2L	13585945	5'	-	Tabor	439	2	53.42
ATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTGTTATTTCTTCTTATC:1	+	chr3L	21855444	5'	-	blood	7319	2	63.01
CAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr2L	5254351	5'	+	roo	8718	2	68.91
AATCCCATCCCTGGGTAGCTTGTATTGTAGATTTTCGAAATGGAACAGGACTCGTGTCATAGTAAATCACCTATCTTTTTTAGTCATTCCCGTGTGTCATTAAGGTC:1	+	chr3L	18496836	5'	-	baggins	5091	1	80.37
ATTAAAATGGAAAGCCCTGACAGTACTACATTACGTCTTAAATATATATATACAAATTTAAATGGAAAGCCTAGATAACGCTAGAATCTATTTTTTTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTTCTAAAAAAGTATG:1	-	chr2L	8777148	5'	-	G4	3825	1	83.70
AAATGGTTCAAAAGTATGGGCGTGACAGCTTTGTGCGGTTTATGAACGCTGAATCTCAACCTTCTGACTTTTATAGTTCCT:1	+	chr2R	5722314	5'	-	INE-1	156	1	50.62
TTTTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAACTTTGAAG:1	+	chr2R	16891812	5'	-	hopper	1370	1	53.42
AACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTCAAGCGCG:1	+	chr2L	20808332	5'	+	HMS-Beagle	6861	2	67.41
CCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCTTAAGTTTATTAATTA:1	+	chr2L	2794165	5'	-	Burdock	6358	2	53.17
GAAGATCGAACATCTTAGAGTTTAGAAACAAGAAGAATACCCTCATTAAAGGCGTAAATGTGGATTAAGTTCCTGAAAAGTAAAGCTCTGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1	+	chrX	21430202	5'	+	hobo	32	1	39.04
GCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1	-	chr3R	27424901	5'	+	blood	28	2	56.67
ACCTTATGGAAATTATGTATGATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAA:1	-	chr3R	9714526	5'	-	Stalker4	393	1	73.97
CTCTTAAATTGTCTTTCTCTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCC:1	-	chr3R	18585686	5'	+	P-element	16	1	67.83
TTGTTGCAGGAACAGTGGGCGAAAAAACGCTGCCCGGTCAATGACAAATAAGGCATTCAAGTGTAATAGCTAGCGAAATGGGGGATGTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAA:1	+	chrX	827572	5'	+	Quasimodo	7008	2	60.27
CCAGCGAACTGGACTTGGAGCTGCTGTCCAGAGACTCGCAGCGGCCACTCAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGC:1	+	chr2L	6036721	5'	-	Gypsy6A_LTR	93	1	58.11
GAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCG:1	+	chr3R	13237290	5'	+	3S18	5827	2	57.53
ACTTTTCCACTTTCTCTGCCTTTTCGGCCACCGGAAACGACCTTTTCTTTCTGCATAATTTCGGGAAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1	+	chr3R	6524800	5'	-	I-element	5306	1	52.21
AGACAGTGTAAACATGTGCACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1	+	chr2L	12328635	5'	-	hopper	1351	1	58.90
GTCATGGAAACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAACAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGTAGACTTTACTCGTT:1	-	chr2R	25118785	5'	-	roo	397	1	68.27
GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGCAGCTGTGC:1	+	chr3R	17660025	5'	-	micropia	5365	2	69.18
GAACTAAAAGACCCATTCCGAAAACTCCAAACCCTGCCATCAGCATCCATTTGTTTCTTGGATTCCGGCGTGTTACGTTTCATTTTCAATTTTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAC:1	+	chrX	855032	5'	+	P-element	2758	1	71.88
AGGTATCTTGTGGCCAAAGGTATCTAGTTGGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGTTGGCT:1	-	chr2R	4977096	5'	+	1360	61	1	73.11
GTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1	+	chr3R	17316239	5'	-	opus	457	2	60.16
GCCATGGCTGTGCAATATCTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	+	chr2R	17626865	5'	+	opus	7148	4	76.25
TTCTGTTCAGTATCATCACCACCACGAATCGTCTCCCTACGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACAAGAATATATTTAAA:1	+	chr3L	16343162	5'	+	roo	9	2	79.43
CTCTGGCTGATGTTGTCGTCTTCTTTTCCTTGTTTTTTTTCGGACAATTTGACGCTTTATTTTAATTAAAGTAATTAGCACCCCAGTTAATTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTAGAATATTTGATATAACATAGAAAT:1	-	chr2L	20077955	5'	-	jockey	4844	1	63.38
TATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACA:1	+	chr3R	9714366	5'	+	Stalker	47	4	53.42
CTCACAGTTGCCACTCTCGAGTTTTGTAGGTATCGCAATTTGAACAATTTCGAAAACGTTACAGTTTGAATTGCCGCCATCTCTAGGTTCTGTAGCCGAAGGG:1	-	chrX	19717693	5'	-	X-element	495	1	64.08
AACTTTTCTCGAACTGAAGACCCATTTTCATAAAACAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGT:1	-	chr2R	5209723	5'	-	gypsy	7436	2	72.80
AGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:2	+	chr3L	15519738	5'	+	pogo	51	1	54.11
AGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1	-	chrX	2842595	5'	+	Tabor	43	2	57.78
CACGTTACAGGGCTACGAGGTACGCTATTAACTTAACTACACATATACAAATAATTCTAAAGAACATAACATTAAAAAAAGATATTTTTAGATACAAGCGAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAG:1	-	chr3R	23412146	5'	+	Bari1	115	1	46.15
GCTGGCCTCCCGAGCGGACTCCACCCAGCGGATCCGGTTGCAGTCAAGGATCATTAAACTTCGGAGGCACCCTCAAACAAATGTAGAACATATTAATAATGAACATTTTTTTGG:1	-	chr3R	6223624	5'	+	transib3	2516	1	68.42
GTAGGCAGTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1	+	chr3L	11957109	5'	+	blood	10	2	68.57
TGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	+	chr3L	16343229	5'	+	roo	8731	2	70.45
ATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGT:1	-	chr3R	20427453	5'	+	jockey	89	1	73.97
AAAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCC:1	+	chr2R	5070919	5'	+	gypsy5	26	2	26.03
GGATAATATAGTGCTCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1	+	chrX	21014755	5'	+	copia	4904	2	42.47
TGCACTACAAAAACAAAATATGTGGGGACTGGAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGGGAGCCGTTCCAATTACACAGTTTTTGTTGGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGC:1	+	chr2L	7810011	5'	+	P-element	15	1	67.48
AGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1	+	chr3L	20831264	5'	-	roo	360	2	54.11
ATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTATTTATTACGCG:1	+	chr3R	14981184	5'	-	mdg1	7388	2	74.40
AATCTTAATTTAAATAAAATTACACAGTTTTGGGCGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGTGTTGCAACATGGGTCAACAAACTTTACTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCA:1	+	chrX	22905345	5'	-	INE-1	147	1	67.12
AAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1	+	chr3R	11496533	5'	+	1360	74	1	67.81
TAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chrX	2444347	5'	+	roo	54	2	59.86
AAAGAAACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr2R	8585541	5'	+	roo	59	2	58.22
AGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTCTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr3L	15600362	5'	-	roo	394	1	57.35
GCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGT:1	-	chr2R	19050325	5'	-	roo	9054	2	63.77
AGCATTACATTTGGCTCCTGAAGGGCACCGTACCCATCATTACACTAAAAAGTATGTAACAGGTAAAAGGAAGCTTTTCCGACCAGGGTGTCCGTCCATCCGTATAAACGTCAGGATCTCAGGAAATATAAAAGCTACA:1	+	chr3R	4629516	5'	+	INE-1	153	1	64.75
GAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	-	chrX	13039547	5'	+	roo	76	2	72.60
TCATAACGGCATCATCACCAACTACAATGATGTAAAGACTTTTCTTTCGAAGCGAGGTTATGAGTTTGAGTCGGATACTGATACAGAGGTATTTGCCAAGCTAGTACACCAAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1	+	chr3R	4133603	5'	-	Quasimodo	250	2	76.55
AGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACA:1	-	chr4	829449	5'	+	INE-1	565	1	47.50
TTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGAC:1	-	chr2R	4601642	5'	+	HMS-Beagle2	61	2	62.94
ATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	-	chr2L	17471682	5'	-	roo	349	2	62.22
GTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	+	chr2R	14387950	5'	-	roo	329	2	75.94
TATTGATGTTAAACTTAAAAGACTTCCTCATAACTTTAATAGTCAAAAAATGGGAAAAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2L	12153281	5'	+	roo	50	2	56.72
ATTTTCGGCCTATTTGCCTTACCTTTTCTTGGTCTTGTTTGCGGCCACATAATTTACTATCTCCGCTAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTC:1	-	chr3L	7943082	5'	-	Burdock	6161	2	51.80
CCATGACGGTAATAGGGTTCAAAGTCTAAACATCTTATATTTGTTCTGTGAAAAAAATGAATTAAGTGCTGAAAATGTTCTTTATTGTTGAATTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1	-	chrX	7887215	5'	-	297	376	2	73.97
CCGAGGNATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1	-	chr3R	25454143	5'	+	Quasimodo	18	2	58.90
TGTGGCATCTGGTTGGTATGATTCAAACTCAAATTGAGTTTATATATTACCTTACCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1	-	chr3R	5061985	5'	-	mdg3	5486	2	74.66
CGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:1	-	chr3R	10274049	5'	+	HMS-Beagle	6821	2	60.68
TCTTTCGACTTTATAGAACCACTCCAAACGAATATCTCTAACGAATGCATTTTATTCATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGATTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATT:1	+	chr3R	13846113	5'	-	I-element	5309	1	56.59
TAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1	+	chr3R	28758286	5'	-	mdg1	7409	2	52.05
ACTTTATCGGCAACTGTATATCCTCTTACTCGGCATTCGTAAAAAGGGAACGAGATGTGCACGGTTTTCCATCGTACTTCTGGGGATTCCCCAAGGAAAAGGATCGTAAGTGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCT:1	+	chr2R	14162590	5'	-	roo	111	2	77.70
GGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAA:1	+	chr2L	12328663	5'	-	hopper	1336	1	75.94
ATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1	+	chr2L	11732235	5'	+	Doc	18	1	62.14
AAGTAGCTTAATGACTTATTAGCCAAATTATGTAGAGCAGAATGGTTCGTAAGGAACACAAACTAGCAAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCAGATACCA:1	-	chrX	17262569	5'	+	X-element	4399	1	55.45
AGCGAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	+	chr4	419964	5'	+	roo	8726	2	67.14
CTTTCTTCCCTTCCTTTCCTTCCATTGCAGATTGAACGAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAT:1	-	chr3R	31001801	5'	-	blood	7178	2	66.13
GCTCCAATACGACGACGAAGAGCTGAAATGAATTTTTCTTTGGTACTGGACGCTTCCAGGCAGTCAGTCAGTCAGATTCAAAGGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAATATACACCTAGCTCACTCTC:1	-	chr3R	7172152	5'	+	invader3	138	2	62.33
ATTTAAAGCTGATTTTTATAAATAGGTACCATTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAACTGCCGATTCGAACTAGACGTGTCTGCCTATCCGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAAAAGCTA:1	-	chr2L	14885055	5'	+	INE-1	151	1	58.22
ATTGATCGAATTTCTTTGATATTCACAGTATTCACACAGTAATTAATTGGGTATGGGAACATACATATACGCACGGTATGTAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAAAG:1	+	chrX	20384934	5'	+	S-element	37	2	48.97
TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATAAACAGCGTGGACAGCAGCACACTAACGGGTTCAACCAGTTTCGCCGGCGTTGGCTC:1	+	chr2L	19479165	5'	-	R1A1-element	484	1	63.16
ATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr3L	11393455	5'	+	roo	8703	2	58.22
ATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1	+	chr2L	17295829	5'	+	Doc	54	1	51.75
CTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1	+	chr3R	21705975	5'	+	297	54	2	57.34
AAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCACATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1	+	chr2R	15005052	5'	+	jockey	63	1	52.05
ACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGTCTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATAGCGGTAAACTTCTGTCGAGCGC:1	+	chr2R	23332556	5'	+	invader4	2831	2	79.84
ATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	+	chr3R	7835128	5'	-	roo	9036	1	58.88
AAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATA:1	-	chr3L	12879828	5'	-	roo	346	2	56.94
AATGAGTAATCTATATAATTTCGAAACAATTTGCTTTTTGGCTCTGCACTATGAGATTTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGG:1	+	chr2R	8651909	5'	-	R1A1-element	4925	1	64.44
CGATGAGGCAAGGTTTGTAGGAGGTGGAAGCAGACACAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGCTCACATTGTCGCTGAGAACGTA:1	-	chrX	18348085	5'	-	Doc	229	1	63.89
ACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTAGGAGAACATACATACA:1	+	chr4	1301730	5'	+	1731	67	2	59.31
GCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACC:1	-	chr3R	25454120	5'	+	Quasimodo	41	2	50.00
AAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1	-	chr2L	6863367	5'	+	pogo	75	1	74.10
CTTATGCAAAAGTAGCAGTCATATATATTATTTTATTTCAAAATATATAATTAAAGTAGTAACCTTTTTTAATTAATGTTAATGCTTTATACTTATTTTGAAATATACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGC:1	+	chr2R	13507369	5'	+	1360	180	1	54.48
TGCCTTTAATATTTTCTGAATATTACAAAAAAACGTTGTTGTTAAACAACGCACCCAACCATAAGACGTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAGGTCGCGGACAGACCAAATAT:1	-	chr2L	22368902	5'	+	Rt1b	199	1	53.98
AAAACATGTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGA:1	+	chr3R	23495658	5'	+	copia	80	2	70.55
TGTATTATTTTTTAGAAATATATTTCATATATTAAATAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1	+	chr2L	4953890	5'	+	Quasimodo	12	2	76.71
TTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGAGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGACTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGA:1	+	chrX	17054186	5'	+	jockey	11	1	69.39
CTAAATGGCCGCCCCAAGAAATGTGTTCGAGTGTGCTTATATTAATGCCCAGATATGTAAAGCAAAGCATGCATACAATGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTCAGATAACAA:1	+	chr2R	17930302	5'	-	roo	101	2	50.68
AAATCCATCTAAAGCTTTTGCAACAAAGTAGTTTCAATGTACTGCTTAACTTTTATCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTG:1	+	chr3R	12854496	5'	-	Quasimodo	217	2	51.59
CAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTGTACATAACTTCGTATAC:1	+	chr2L	22315584	5'	+	frogger	2361	2	80.56
AGTATAAGCTCCTTTTGCTCTTCTTCAACTTAACGCACTAATCATGAAATATCTTTATTAATAATAATTTCTTGCGTACGGTATAATAATGTTTCATATAAGTATTCTTCACATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAA:1	-	chr2R	18526434	5'	+	jockey	4890	1	76.71
GATCTTTGCAACTTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	-	chr2R	16785458	5'	+	412	7069	2	72.93
GGGTGGGTTGAAGTAACCAAACTCTATAAGATAGCCGTTGCAGCTCGTAGCAAGCAGACGTAGGAAAACAGTTCGTTACATCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTCTTTTGTTTATTGTTT:1	-	chr3L	25493191	5'	-	Porto1	189	1	59.85
TTCAGAGGTTTTTTTTTTTAAATTTATATGAACATAGTTAATGAGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1	-	chr2R	13817769	5'	+	412	14	2	74.13
TGTTACAGGTTGCCCCAGCTAACTCATCCATTTATCCATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTCTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1	-	chr3R	21706092	5'	-	297	6942	2	57.36
TTTATTTTTTGCCCAAAACCGACAAAAAAAATAAAAAAATAATTGA:1	-	chr2L	3823927	5'	-	Tc1	1394	1	58.70
TTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTA:1	+	chr2R	9258416	5'	+	3S18	5834	2	64.14
CTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCACAAGAAG:1	+	chr3L	4840758	5'	+	jockey	4728	1	70.75
AACAATTTCATAAATAAGGTAGCTTTGATAGTCCTGTTTAAGGAGCGATTGTGGAGATGAATTTTGTTCTTAGTGTGTTGTTAATTTTTTTCATAATTTTATTATTATATCAAACAATTCAACATATGTTTCACTTTTATTTTTTC:1	-	chr4	1023506	5'	-	HB	1496	1	58.22
GTTTTTAATCAATATGAAAAAAAGAAGAAAACTATTAACAATGAACACTGTCAAGAAATTCTGTCCACACTTTTCTTTTGTTCTCTATTTTGCTCCTATTTTGCTTTATGCGTTGTGTAAGTGGCCGATTTTTATGCATTTGGTTG:1	+	chrX	312137	5'	+	S2	330	1	65.75
GGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCCTATCGCAGCTTTCCGAAAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTCTAAGTAC:1	-	chr3R	27424938	5'	+	blood	23	2	58.70
AGTCAGAGTTGATGAGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGC:1	-	chr2L	23352609	5'	+	accord	23	2	58.88
GATATTTGCATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1	+	chr2L	13585798	5'	+	Tabor	6864	2	68.09
GTTTTTTAAGTCTGTGCTTGGTGACCTTTACAGAGAACCAAACTTAAGGTTCGCTGTCAATGATGCATTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGGCTGC:1	+	chr2R	14991788	5'	+	accord2	7412	1	49.22
GTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAGCGCATCT:1	-	chr2R	18336223	5'	-	roo	8989	2	74.48
CTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTA:1	-	chr2L	13914153	5'	+	jockey	4760	1	78.62
ACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1	+	chr4	311187	5'	-	1360	3334	1	56.85
CTTTATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chrX	9539998	5'	+	roo	15	2	65.79
CGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCCCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGG:1	-	chrX	21667900	5'	+	gypsy2	60	2	80.00
CAATGGAATGAAGCTTTTTACGTCAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCG:1	-	chr3L	21818096	5'	+	roo	8694	2	63.04
AAAACGGGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTCGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1	-	chr3L	17560418	5'	+	pogo	24	1	67.12
ATTTCTTGTAATGATGTATTAGAGCTATACTAAACAATTTTAAGACCCTTACATTTACCTTTACTTAATTTACTTAATAGTTTCCAATCCATTTAACCAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAAT:1	+	chr3L	8539041	5'	+	pogo	1901	1	54.48
AGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1	+	chr2L	18419140	5'	-	412	7513	2	51.33
AGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr3L	233316	5'	-	roo	329	2	73.97
CATCATTATCAAAATCATAATTACAATCCCAGTGACAATTTAGGCAGTGATGTTGGAGTTCATAGACTATCTTCAAACATTTAAGAAATATCACAATTAAAAGATTACTGATAAATAAAAGG:1	-	chrX	7579337	5'	+	BS4	495	1	73.77
GGAAATGTTCTATATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chr2L	16092029	5'	+	roo	27	2	67.81
TTTATTAGTCTTGTAATTTTTTATCAATTTGCAAAAAGAAAATTTCTTACTACCACTCTAACTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCT:1	-	chr2L	9547539	5'	-	Stalker2	7456	2	57.93
TAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGG:1	+	chr2L	4953926	5'	+	Quasimodo	48	2	57.53
TTTATAATTATAACATAATAACTATAAACTCACTCACTCAGCGTGTATAAATATAAATTTTTACTAGTCCAAACTGAGATATGAAAGCCAAGACTGAGAAAAGCTTCGCGTCAATTTAGCCTTAACAAACAGGTGATCAAACATAT:1	+	chr2L	22685968	5'	-	transib3	166	1	68.49
GTTGTAAGAGATAATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1	+	chr3R	5061796	5'	+	mdg3	22	2	71.23
CATAGATTATACGGAATTATGACAAGCGCGTGTCTATCCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1	-	chr2L	21891833	5'	-	mdg1	388	2	59.26
GCTCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGGGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTATGCACAAT:1	-	chr3R	15072649	5'	-	pogo	2082	1	51.11
AAGGGTATACTAGATTCGTTAAAAATTATGTAACAGGCAAAAGGTAGCGTGTCCGGTCATATAAAGTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTGGCC:1	+	chr3R	14437794	5'	+	INE-1	101	1	80.91
ATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chr3R	22844216	5'	+	roo	28	2	68.75
GATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGC:1	+	chr2R	20194205	5'	-	Max-element	8513	2	55.45
TAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTTCTTCTTTCTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGCTAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTTG:1	-	chr2R	14871483	5'	-	INE-1	548	1	74.62
GCCTTAGCAAATTGTTGTTGCTCTTCGAATGACACATAATGACGCATTACTTGGACTATAGAGTAAATGGCCTCCACTNTCTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1	+	chr3R	22123261	5'	-	roo	9060	1	67.86
ATTGCACCGGAAAAAATGGATTTGCATTCGAAATTCATAAGTTTATTTAAAATAAATATTTTATTCATACATCTTTATTTCCAACAATAATTAATGACAAAAATAAAATATAGTTGGTAAGATACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCT:1	+	chr2L	16548457	5'	+	gypsy10	298	2	75.34
GCGTATTCGGATGGGAATTTATTTTATGTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1	-	chr3R	23495768	5'	-	copia	241	1	71.88
TTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATAT:1	+	chr2L	14588754	5'	+	1360	377	1	55.48
CACAGAGTTCCAGCAGCAAGATGTTCTGGTGCCGTGGAAGACCAAGGATGAGCAGAAGACCACGTATCTGCGATACTACCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCGTTTATTTTAATTTATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCA:1	-	chr2R	22634263	5'	+	Cr1a	4158	1	54.11
CTTGCATGAATTGATTTTCGACGGACGTGTTTTTCGATACACTCGTGTACAGACTGCGACGTTTTTCTTGCTCGGCGGTAGTGATGTGCGACGACC:1	-	chr3L	25005653	5'	+	R1-2	9	1	91.67
TGATATTTACGGATTATTAGAGTGAAAATCATTTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTAT:1	-	chr3L	19521835	5'	-	I-element	5267	1	78.08
AGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	-	chr2L	16091985	5'	+	roo	8735	2	69.86
ATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1	-	chr3L	17560386	5'	+	pogo	56	1	56.85
TCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCA:1	+	chr3R	18582164	5'	-	roo	328	2	71.23
GTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATGTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chr2R	9632168	5'	-	roo	320	2	75.86
GGAAGAACCCTTTTGATGTCACTCCTCTTCTGCCTCAGCTGCAGACAGTTTTGTCTAGTAATGCATGGCGCATCAATTATGGAAGACTAAAGTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAA:1	-	chr2R	19969240	5'	+	Idefix	7263	2	58.90
TTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr2R	7898080	5'	+	roo	8736	2	73.29
AGGACCTCGTTTCCCCAGCTCCTTGCTGCGGCGTTTAAGTCGTTAGCAAGCTTTTCTCGCTCGTTCTTCTGCGCCCTTTTCAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACG:1	+	chr3R	7939064	5'	-	Circe	98	1	65.55
AAGTTGAAATTTCCATTCAACGTCTGCCTTGTAAGCGCTTCGACTCTGTATATAAAGTTGTCCACTGACATTATCGGGTGCAGCTAATAAGGGTTGCATCCAGTCTGGTATATTCTAGATACTTCTTGCT:1	-	chr3R	6935080	5'	-	gypsy12	97	2	53.85
TTTGTAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1	+	chr3L	10848623	5'	+	blood	7054	2	56.16
AATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chr2R	8585532	5'	+	roo	55	2	60.90
AGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3L	11393470	5'	+	roo	54	2	58.90
GCTGCTGGCCTAGGAAACACAGCTGGTACGCGCACTACCCACTACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	-	chr3L	22349330	5'	+	jockey	27	1	71.92
ATTTGTTTGATCAAAACGTACAGCCATTACCTGAAAGCATCCGCTATAAAAGCGTCCGGTTCCTAGATTTCCAAAATGAGTTTGTAGTCGAAAAGCTAGCGTGGGTCTAGTTATGGTGTTGGTAACATTGGTGTTACTACTAGTTG:1	-	chrX	7407510	5'	-	jockey2	252	1	49.32
GGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chrX	14336483	5'	+	roo	8752	2	83.56
AATAAGGGCTCTGAGCTAGATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAA:2	-	chrX	22643365	5'	+	Tc1	1582	1	62.76
AATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTCGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTAT:1	-	chr3L	14944624	5'	-	G5	4832	1	55.71
ATTATTTGTTTAATTTATTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATC:1	-	chr2L	4034963	5'	-	TAHRE	10399	1	52.59
GAGGACTAGCCAAAGCCGAAAATAAAATCCTGTGCAGCTGTCGGAGGTCCTTCCAACTCCCAGACCCACTGCCAGTTAGATTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1	+	chr3L	17286534	5'	-	1731	308	2	66.36
TGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTC:1	-	chr2L	17079813	5'	+	jockey	4732	1	76.32
GCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1	-	chrX	17833049	5'	+	Tirant	27	2	68.75
CATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1	+	chr2R	7898078	5'	+	roo	70	2	70.55
TCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr3R	31817520	5'	-	roo	8989	2	76.71
AAGTTTTGTAAAATGTTAATTTCTTTGAAGTAATTTGTAATAAGTAATTTTAAACTGTTTAGTTTTTAAAGAATAGAAGAGCTTCTGCTGTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAACGCCCAAAGTGCGCTGAAGTTGGGTTCAGCTATC:1	-	chr3R	14843601	5'	-	Stalker	7154	4	70.55
GAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTGCCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1	-	chr2L	15833065	5'	+	hobo	58	1	69.49
ATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTT:1	+	chr3R	4160066	5'	-	invader2	5045	2	58.90
CTTCATTGGAGGAGGCTCCTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGGCCAATTCGCATGGGAGATGAGCCATCGA:1	+	chrX	18193618	5'	+	jockey	11	1	75.78
ATCCACAATGCGAGCAAACAGAAAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1	-	chrX	18030341	5'	+	opus	28	4	59.80
ACCACGGCCCCATCTTCATTTCTCCCATTTCCCTGTGATACATTCAGCGAGGCTGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACA:1	+	chrX	2301369	5'	-	Tirant	8292	2	51.72
ACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCCAGGCTCTCT:1	-	chr2R	5531193	5'	+	1360	72	1	57.14
GACTCATCGAGAGCCTTTCAAAAATCTGCCTCGTATATTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACAAGAGTCACTTATTTTTGCTACCTTTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGG:1	+	chr2R	7895632	5'	-	roo	468	1	73.97
CTTAGCATATAAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTGTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1	-	chr3L	16015385	5'	-	1360	3388	2	77.24
TTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAA:1	-	chr3L	1251818	5'	+	Stalker4	69	4	65.52
CGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGTCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1	+	chr3R	17531374	5'	+	1360	82	1	74.83
GAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1	-	chr3L	21855529	5'	+	blood	7072	2	63.31
TTGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAACAGAAACGAGGGAATGAATATAATG:1	-	chr3R	4583048	5'	-	Cr1a	4331	1	64.66
AGGGGAAATGTAAACAAGCTCAAAACTTTTAGCTGCGATGTTGATTTGAATGCTCCACACCAATATTATATGTATTGTTACATCGTCTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATG:1	+	chr2L	19949801	5'	-	R2-element	64	1	67.44
CGTTTTATTTCAAAATAAATAAATTATTGATTAATGTAGGTAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1	+	chr2R	15064311	5'	-	412	470	2	66.91
GTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGA:1	+	chrX	6499889	5'	-	Quasimodo	203	2	71.05
TACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGCTGCTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1	-	chr2L	16067154	5'	+	297	6618	2	69.39
AAATCCAGGCTCTCCATTCTTTGCATACGCACACAGGCACATTCGTACGTACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAA:1	+	chr3R	28946318	5'	-	hopper2	1539	1	62.33
TTTTAGTAGTTTATCACTAAACTAGCTCGTGTTGAATTTTAAAAGAATTTATTTGTCCCGTTTTCGGGAAATTCCTGCTTCTTCAAAAAGTGGCTGCATAGTGCTAAACCAATGTATGGCCGTTACGCAT:1	-	chr3L	26370562	5'	+	1360	3367	1	72.31
CTTCGAGTGCCTAAAGATGTTTATTGTTCTAGTAGCCACTTCTGGATAGATGTTCGAATTCTACTGGCATGAAATCGAAATTGTAGTAAACTGGTTTCAATTGAACCAAATCGGTTTTGTAACTAATAATTAATTATTTTGTTGT:1	-	chr2L	892332	5'	-	gypsy11	3943	1	80.00
TCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	22844158	5'	+	roo	20	2	65.38
GCCGCAAGACCACACAGAGAGAAAATATTACAAGCCGATTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTCG:1	+	chr3R	21436947	5'	-	412	412	2	61.90
CATAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1	+	chr3R	19589881	5'	+	BS	5021	1	63.64
GCAGGGATGCGTGTCCTTCGGATGATGGCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	+	chr2R	19050153	5'	+	roo	27	2	64.38
ACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGC:1	-	chr2R	5173511	5'	+	gypsy	7051	2	64.18
CCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTACGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGAT:1	-	chr3R	9714468	5'	-	Stalker4	335	4	67.81
ATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCAACCATGAACACGAATATAT:1	-	chr3L	9998216	5'	+	roo	8668	2	77.36
AGTTGACCAAAGAAAAACAAACAATAAATAAAGACGTAGGCTGCAGTGTCGACATGTTCCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCGTACATTGGTTTTGCACTATGCAGCTACTTTTTTAGAGACGGCCAAAAT:1	-	chr3R	801962	5'	-	1360	3327	1	69.18
ATTTTGAGTTATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1	-	chr3L	20033827	5'	+	blood	7025	2	65.75
GTCGAAGAAGCGCAAGAGGCGCACATCCTTCACGCCGCAGGCTCTGGAGCTCCTGAATGCCCACTTCGAGCGGAACACAGAGGGTGTGTGTACGCTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	8395271	5'	-	accord	7105	2	69.03
ACAGTCGTTTCTCATATCCGGTTAGACAGAAAATCGCAGACCTACGCCTCCTCTATTATATACTGATCCCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCA:1	+	chr2L	18526254	5'	-	R1A1-element	5057	1	50.88
ATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr2R	8585506	5'	+	roo	8744	2	73.10
AACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	-	chr3R	10266134	5'	+	1360	63	1	78.90
GAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1	+	chr3R	30344634	5'	-	pogo	2033	1	75.76
ATTTGGAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1	+	chr3R	9921945	5'	+	blood	30	2	64.83
TAATTAATATAAAATGCCGGGTCTAAGCCAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAA:1	-	chr3R	29397536	5'	+	jockey	4576	1	63.72
CATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACTCTCTTCGGTTTAA:1	-	chr2L	12892708	5'	-	roo	9013	2	59.85
GGAGAGCTCTATAGAAATAGGTGTAAAATCGCGGCGGTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTT:1	+	chrX	17832996	5'	-	Tirant	320	2	71.92
CCTTGATAAATATTTGCCTTGCCCAAAAAAGTATGCTACACATTTTGCTCACCACCGAGTATGAAATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCGA:1	+	chr2L	1839220	5'	-	hobo	2923	1	65.09
TTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCAAGGTCCACTTGCATCAGGGGTCTCGGCACTCGCTGCCG:1	+	chr3R	17316240	5'	-	opus	7474	2	53.70
TCTTTCGTTATCTAAGCTTGCCTCTCTCCCGAGCTCTCCCTCACTCTTTTAAATGCTTAAGAGTCCAGTCTGGCAGCGGTCTCACTCGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCAC:1	+	chr2R	1459990	5'	-	Stalker	299	4	63.31
GAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1	-	chr3L	18369009	5'	+	opus	7040	4	62.83
GCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCAC:1	-	chrX	12074616	5'	+	412	7168	2	52.94
CAAATATTTGCCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1	-	chr3L	10013681	5'	-	hopper	1399	1	66.06
CTCCTTGAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	+	chr2L	14081287	5'	+	1360	17	1	67.50
GGTGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1	-	chr3L	25401039	5'	+	Doc	30	1	56.16
ATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTG:1	-	chr3R	11547794	5'	+	G2	284	1	70.37
GGGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTC:1	+	chr3R	18272136	5'	+	1360	71	1	78.74
GAAAACTGCCCTCCAGCTGGCGAATGGGGTAGCTTTTGTGGTCTCGGTCCTGTTTTCTCGGAGGTCGACCTCATTTAAGGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	-	chr3R	27994301	5'	-	roo	9038	1	60.43
TACAGAAATGTCAACAGTGTACTTTAAAAATGCATTTGGTTTGTAATGCATGTTTTTTTTATAATGTTAGACATATACATAAACATATAAACAATATACCGTTAGCTTATTTATATATGTACACACAACACACACACACACACAGA:1	-	chrX	11799217	5'	+	gypsy3	423	1	50.68
ACGGGACCAAAATAAAAAGAAGTGAGTCGTGAAAGCGAAAATACAAAGCCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAACTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAAGGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1	+	chr3R	20499693	5'	+	mdg3	5258	1	80.14
ATTTACTTCAAAGTAAGCCATCGAAATTAGATTTATGGTTGAAAAAACACTGAATACATTAGAAAATGTATTTAATATATTCCACACTTAAATAAATAAAATTACTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1	-	chr3L	13845280	5'	-	opus	7495	2	75.69
CAATACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCC:1	-	chr2R	5198490	5'	+	INE-1	87	1	60.96
CAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1	+	chr3R	19446105	5'	+	297	29	2	65.07
CATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCA:1	-	chr3R	11496597	5'	-	1360	3306	1	71.92
GGGCGAGAGCGTTTAAGATGGCTAAGGCAATTGAAACATTAAATTCGGTGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAA:1	+	chr3L	2325693	5'	+	I-element	5110	1	55.97
GGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGCTAGGAATAA:1	+	chr2L	21008537	5'	+	invader3	5251	2	59.59
AATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCGGA:1	-	chr2R	4886038	5'	-	INE-1	569	1	50.00
TAGCGGGCGATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTT:1	-	chrX	11471679	5'	-	hopper	1394	1	63.79
CCCGAGGATGCTGCTACTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1	+	chr3R	11083840	5'	-	412	472	2	70.55
GTTTCGCCTCGCAGGATGTAGCTCCATATCCCTCATATTCTAGTTGCGGATGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGTGCAGCGTGTCTGGCAGTACTTGAGCTGCTATATGGAACACACACAGACATGAACACACACACGCACA:1	+	chr2R	17968404	5'	+	accord	7024	2	52.14
TCCAGAGACCAATCTCGATCCGGAAACTAAAACAGACAACAATGCCACGCCAAATAGTTAGTTTCTACATCGCCTTTCTTTAGTTTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGAGTCTTGGTTACT:1	-	chr2R	17430676	5'	-	jockey	4911	1	62.22
ATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGACGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAG:1	+	chr3R	19450158	5'	-	roo	8601	1	58.72
ATATTACCGGTAAAGATGCTAATATCCCAACACAATTTCTTTAAGTATCTTAATTACGGGCGTTTGCATTTCATTTGTTTTCATCGATGCG:1	-	chr3R	15652775	5'	-	Chouto	5935	1	54.95
GTGTTGTTACTGCTGGTACTGGTACCACACGGCGTATGGGTGATGGCGAGCGGGCCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTAGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1	-	chr2L	9564541	5'	-	transib2	2768	1	58.39
ATAAAACATTATTTGAAAATGAATATTATTGATGCTTAAGATTGGAAAAATCAGTTAAAAAGAAGTGGCAATTATTATGGCAATTCTCTTGCCACATGTTGTGTATATGCTTGCTAAATTGTATTGAAATATATATATATATTTTT:1	+	chrX	14325035	5'	+	copia	4659	1	78.77
ACTCAACATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1	-	chrX	3308368	5'	-	hobo	2895	1	65.38
ACTATTAAATATATGAAAAAATATCACATAATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGC:1	-	chr2L	21377761	5'	-	HMS-Beagle2	7037	2	61.00
ATACAGAGGCGGATACACGGATGCGGAGATACACAGATACGGCGACGAGACCTGGCGATACGGATACATGCAGTCCTGCGAGTCCTGCGAGTCCTATGAGTCCTGCCATACAATAGTTATATGTCTTCAGTATA:1	-	chr3L	13645445	5'	-	Bica	94	1	79.10
CGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAAC:1	-	chr3R	11547791	5'	+	G2	322	1	51.05
CGGGATGGTATCAAGTTTAGGGGACTAGGAAAAGAATTTTGGGCGCTTGACAGTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAA:1	+	chr3R	29360963	5'	+	mdg1	70	2	63.70
CCTAACTTCTAGCTCAATTGTCGAACTGCTAGCGATAGACAGAGCTCTGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1	+	chr2L	21153492	5'	+	1360	73	1	68.06
AGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTTGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chr2R	19050275	5'	-	roo	351	2	60.47
CCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATA:1	+	chrX	10644460	5'	+	jockey	4836	1	76.15
ACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1	-	chr2R	2427623	5'	+	Doc	8	1	69.47
CACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGTAGTGAACGCCAAAT:1	-	chr2L	11660995	5'	+	F-element	71	1	63.93
ACCGAAACAAAGATCGAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATTGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1	-	chr3L	3863557	5'	+	blood	7036	2	66.18
CGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chr3L	16343201	5'	+	roo	42	2	54.07
CTTGGTCCTTGACAAGTGCGATAGATGGTAGGATGACAGGATGATGGGATGGGTCTCGAGTGATGCGACATATGATGCGATATATGACAAGTTTTTGCTCTGGGAGAGCCTCGCTCTCGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTT:1	+	chr3R	30173467	5'	+	blood	166	2	60.71
GAGGCGAAAATGTTATCGAGCACGCATTAAGTAGATACATGGGTTCTTCACAGGGAAAACATTTCTGCTCAGTGCAAATCAAGCTATTTTTGCCACGTGTTCAGAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAA:1	+	chr3R	31000055	5'	-	micropia	131	4	51.37
ACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAANTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr2R	8585427	5'	-	roo	346	2	60.00
CTCCACAGATCTTTGAAAACGCGGTATTTCAGGGAATTGGTGTGCACAATGGGACCGGTAACTATTTGCGCATTAAAGTCTAAGGACTTCTGAGGTGAAGGTCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCA:1	+	chr3L	14760832	5'	-	1360	183	1	50.35
CTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:2	+	chrX	5643450	5'	-	roo	9036	1	60.00
TGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGC:1	+	chr2L	12290643	5'	+	1731	4333	2	66.93
TCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1	+	chr2L	21367232	5'	+	Doc	84	1	69.86
AATAATAAAATATAAAAAAATTTATTGACTTTTATTTCATAATAATGGTTTTTGCATCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCAACGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTGGGATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1	+	chr4	905123	5'	-	transib2	2780	1	57.53
CATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr2L	3886243	5'	-	roo	345	2	59.59
TTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1	+	chr2L	14772008	5'	-	roo	408	1	78.90
CATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGAC:1	-	chr3L	23702237	5'	+	G4	67	1	66.67
AATAAGGGTTGGCTTGGCTGGTGGGTGGGTGTTTCATACATTCATATATATGCATATACATATACATATGCCTATATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1	-	chrX	4215057	5'	+	flea	4774	2	62.18
CTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAAAAAATAAACTTTAAAAATATATTATTAAAAAA:1	+	chr3R	19450194	5'	-	hopper	165	1	77.40
AAAGAAAAACGTAAAAAAGTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	-	chr3L	11441876	5'	-	roo	393	1	73.97
TTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTG:1	-	chrX	21016831	5'	-	Transpac	5154	2	75.71
AGAAAACATCAACTCCCACAACCGACACGAACAAACTACAGAAATGAACTAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGGCAAGAGACACCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGAGCGAGTGAAAGGA:1	-	chr3L	6550752	5'	-	P-element	2827	1	38.52
AAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAA:1	+	chr3L	17558015	5'	-	jockey	4926	1	66.44
TAACATGGAACTTCATATCCTAAGAATTATATTTATAGACTTAGATATCTAAGATAAAAGTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1	+	chr3R	9293177	5'	-	297	366	2	60.98
TGTGAAATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTCAC:1	+	chr3L	25406603	5'	-	1360	3380	2	64.83
CAATGGCACTGCCATGGCTCCCATACACGGTTTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGTCTCTTTTACGACTCCTTTACGACTGCCTCGTACTTGGT:1	-	chr2L	13580398	5'	-	Tabor	342	2	62.38
GATCCCCCTCTCCCATTATCTTATATAGGTGCTATAGAGGTATTTTCTCGATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1	-	chr2R	16945355	5'	-	jockey	4954	1	54.13
ATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1	+	chr2R	20496939	5'	+	blood	60	2	74.56
CCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr2L	14772058	5'	-	roo	320	2	76.71
GAAAAAGGGAACGAACAAATTTTTTAATGCATATCAGTGTGGCTAAACACAGAAAAAATATATTATTTCAGCCCATTATGTTGTTTTAATCTATAATTTCGAAACTATTGAAGAAATAAAAGTGAATCATTTGTTGAATTGTTTGA:1	+	chr2L	21151664	5'	+	HB	1511	1	60.27
TACAATTGTGCGGTAGCAACTTGTACAATAACTAAAAAAAATGTAATACAAAAATTATGTAAGCGTACCTTGGAAAACAAAACAAATACGTTAAGTGTAAGTATGTAAACGTAA:1	-	chr3L	9025939	5'	-	rover	6975	2	76.32
AGCAATAAAGAAATAAATATTTTATATTGCTTCATTAGCATTTTCAAACGATACTTAAGAAATTTTTCAGCAATGCAAAAGTTTAAGAGGTGAAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAAT:1	+	chr2R	5693612	5'	+	I-element	164	1	65.07
GTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTG:1	-	chr3R	13349121	5'	+	BS	5049	1	60.00
TAACAAGTTCATTATTATGTTAAAAATGTATTTAATAATGTCATTTGCATTTATCGCGCATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTC:1	-	chr2R	11629323	5'	-	Tirant	319	2	67.83
ACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTG:1	-	chr2R	20194280	5'	+	Max-element	8306	2	68.38
AATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTTGCGGGAATAAACTTATGG:1	+	chr3R	13457904	5'	+	X-element	65	1	54.20
ATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chr3R	22844293	5'	-	roo	9037	1	56.59
TAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	+	chr2L	17420146	5'	-	roo	9020	2	57.86
GATGCACATTAGTAAATGATTTTTTTGGAACCTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1	-	chr3L	6978245	5'	-	pogo	2043	1	58.90
AGCACCTTTCGCGAAATGCGAGTGACGCCCTACGGCTGCATCTGCAAGGATACTTCCCGCTTTAGCTTCAAGCTAAATTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAAC:1	+	chr3R	5353132	5'	+	Tc1-2	172	1	58.33
CTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAA:1	-	chr2L	6623034	5'	+	Burdock	6201	2	63.70
GGAATAAAGTAATACATATAATATACCTTACTTACTGGTGCGTTTTCTCAGACATGTTGAGATCATATGAAAATTGGAAGGCTAATTAAGAATAAGTAACCTACTTAGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGA:1	-	chr2R	5149340	5'	-	INE-1	152	1	73.79
ACCAAAGAAACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr2R	8585544	5'	+	roo	56	2	56.16
ATTTAAATATTAAAATATTTAAAATAAAAAAAAAAA:1	-	chr2L	16537623	5'	+	TART-B	10631	1	75.00
CAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATTAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1	+	chrX	10521640	5'	+	Tabor	6911	2	63.01
ACATTTGGAACGGTAGCCGCACTTCATACAGAATCATGAATGTTCGCATAATTGGCAGAGTTTTATGAATCTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTA:1	-	chr2R	9258556	5'	-	3S18	297	2	47.86
ATATTGGAACAATTCTTTCCTTAATAGCACGTGCAAGTTAACAACTAAAAATGTATTACTTCAGAGCAACTAAGTAAGTAGCTTTTTATAAACAAAGCTGATGCGTCAGAACTTTTGGCAGCGGGAAGCTGACACT:1	-	chrX	3428862	5'	+	gypsy	102	2	58.82
GTAATTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTTCTTCTTTCTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGCTAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTTG:1	-	chr2R	14871499	5'	-	INE-1	548	1	77.40
AGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1	+	chr2R	2016810	5'	+	1360	30	1	58.87
ATAAGAAAAAAAAAATTTTTTAATTAATTTAA:1	-	chr3L	7392150	5'	+	Stalker2	7189	1	87.50
ACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1	+	chr3L	21855432	5'	-	blood	7372	2	64.76
TATCTAAATAATCCTATTAAAGTATCTTTTAGTTATCTTAATCCACTTAGTTTGTGGTTTATGATTAAAAGCTTGAATTTACATATGTACATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTT:1	-	chr2R	13830357	5'	+	Quasimodo	6915	2	60.69
TGCACTGAGGGAGAAAACCACCAGAAGATACACAACATTAAATGATATCCCGGATGGCCAAAGAGTCCAAGACACACAGACCAAAGACACTAGACTAACAAGATGCGTAACGGC:1	-	chr3R	17531466	5'	-	1360	3377	1	71.93
ACCACGAATCGTCTCCCTACGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGACTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr3L	16343182	5'	+	roo	15	2	70.87
AGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGGAGCAACTAAG:1	+	chr2R	5209594	5'	+	gypsy	18	2	62.14
CCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACA:1	-	chr2R	9463486	5'	+	rover	32	2	62.26
AAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTACGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1	-	chr2L	11518499	5'	+	412	35	2	54.55
TACAATATACGTAATACAATAATAAAATAATAATTAATTAGTTGCATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTAC:1	-	chr2L	22575679	5'	-	Quasimodo	7296	2	75.34
ATCAAATCATTGATGCAGCTGTTACGCCATATATATATATAGTAGATAGATAGATGAGCACGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAT:1	+	chr3R	22217835	5'	-	hopper	1359	1	56.34
AGCGAGGGACGTAAAGCCGCAAAAAGTGGAGCGAAGCATTAAGAATGTTATGCTCATCTACAGCCGAACGAAGCCTTTGGGCATATAACGCATAACCATATAGTACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1	+	chr2R	15289072	5'	+	hobo	15	1	73.97
TATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1	+	chr3L	17558025	5'	-	jockey	4925	1	71.53
CGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:2	-	chr3L	20831381	5'	+	roo	8722	2	59.59
ATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1	-	chr3R	11878244	5'	+	Doc	58	1	64.29
CAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAAATAATTATTAAATGTTATGAGCAATACATTTTTACACTCTCAATTTAACGGTTCTTTTTGTTTTTAGGCAC:1	-	chrX	16361574	5'	+	Tc1	159	1	47.26
TGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	-	chr3L	4536777	5'	+	roo	8740	2	70.55
CTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3R	22122764	5'	+	roo	8738	2	76.87
ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAATAAGAAGAAGCAAGATTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCTATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTC:1	-	chr2L	22211545	5'	+	INE-1	134	1	69.86
CCTTTGCTCAACACTGATTAAACCGAAACTACTAGGTAGCNAATAAAATAGAACTTTAAAATATTGCTCTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTT:1	-	chr2L	2573482	5'	+	Cr1a	4363	1	53.42
ACACGGCCAGAAAAGGATATTCATTAGTCAGATTCTGTGTGTGATAAAGTGAAGTTTTGGTGCTAAAATCTAGTATTCAATGCAAGCAGCCCTGCACTTTATTTACAGCTTGGACTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTA:1	-	chr3R	13258493	5'	-	roo	65	2	75.34
AAGCTCTAGTTCTTCCTTTATTGGAATTAATAAAAACGTTTAATAATACATAAAAAAGCTACTTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTT:1	-	chr2R	4103361	5'	-	invader1	3998	2	63.01
GACACCGCGTTTAGACAGGATGTCGATGCGGCAGATCTCGTAAAAGAAACCAGAACTGCCGACACAGCACTTTCGGAGATACATGTCGCCTCTTGTAAACATATAACGTTTTACATAAACGTAGCGATCCATACCAGTCTGCATGA:1	-	chr3R	3187511	5'	-	Doc4-element	464	1	73.29
GTTCGGGTATTGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1	-	chr2R	24218632	5'	-	412	7509	2	54.62
TCTATCATATTTAAATTTTACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGC:1	+	chr2L	20117875	5'	-	invader4	3040	2	52.74
GATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1	-	chr3L	27415340	5'	+	transib2	36	1	60.96
ACCGGCGATAAGGGGGATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAA:1	-	chr2L	19965086	5'	+	Doc	48	1	57.53
AGTGAGGTCGAGCTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1	+	chr2L	14081315	5'	+	1360	67	1	66.20
GACTCCTGCTGCGGCGGCACTTAATTCTAGAATGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1	+	chrX	5662847	5'	-	P-element	2876	1	72.64
CGAAGGAGGACAAGATTTCGAGAAAAGGAGTCCTTCGCAAAGCAAAAAGGTCCAAAGGGATACCGAATGTGAAAGAAAAGGAATATTAAGGAGGATAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACTA:1	+	chr2L	17892242	5'	-	Cr1a	71	1	65.07
TTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1	+	chr2L	15832997	5'	-	hobo	2902	1	53.85
ATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1	+	chr2R	20596445	5'	-	roo	358	2	52.05
TGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1	-	chr3R	25454104	5'	+	Quasimodo	51	2	59.29
TGCGGCCTTAAATGTTGACGGCAAAACTGGGAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1	+	chrX	2518011	5'	-	P-element	2857	1	60.77
TACGGAAAGTCGGCGTGCAGACAGTGTAAACATGTGCACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1	+	chr2L	12328617	5'	-	hopper	1370	1	46.90
ATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:1	+	chr2L	4412573	5'	+	Quasimodo	72	2	73.53
TTGGCACAAATGGGAAAACCAAAACGAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1	-	chr2L	11661066	5'	+	F-element	23	1	62.07
GTGGCAATATCAATTTGTATAATAAATGTTACAGGTTGCCCCAGCTAACTCATCCATTTATCCATGCATCATAATGACTTACCTAAGCATCCAGCATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1	-	chr3R	21706118	5'	-	297	6951	2	68.49
TAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1	+	chr2L	544774	5'	+	412	7117	2	58.90
GGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAAGACTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	-	chr2L	6059291	5'	-	roo	397	1	53.42
ATGCTACACATTTTGCTCACCACCGAGTATGAAATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1	+	chr2L	1839252	5'	-	hobo	2897	1	68.00
GTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr3L	22437934	5'	+	roo	8752	2	78.77
ATTTAACTGAAGGAATTTCAATTATTTGAAACTGTAGCTCTCTACCGCACTTTGTTCTTTATTTCTTTTTAAAAATGGTTTTCCAAACCAAATTAAAAGTGTAAACATGGAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:1	+	chr3L	20168302	5'	-	mdg3	236	2	77.93
GAAAAATCATGGCCATCTGGTCATCTGTTTGCCTCGAAAGGGAATTCAAATTATATCTTTTATATTATAGATAAGATAAGAAAGGCAGCTTTCATATTTAAGTTCATCAAAAAATATATATCAGTAGTGAGTAAAATGAAGAAAAG:1	+	chr3R	13945864	5'	+	Tc1	1571	1	78.08
AACTGGTATATATATTCCATAGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1	+	chr2L	15247898	5'	+	Transpac	52	2	57.53
TCCACCAACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTGACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGGTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCA:1	+	chr3L	23933523	5'	-	Cr1a	232	1	51.37
CTGACAGATACGTCACGGCCGCTCCTCGTATCTTTTCCGCTCAGGTAAACGAATATCTCACAGCCTGACCCGAAAGACTGTAGTACAAAGACCTCTTATATAACTCAGTTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCT:1	+	chr3R	16803038	5'	+	Doc3-element	4312	1	42.96
ACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1	-	chr4	311564	5'	+	1360	63	1	80.00
ATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr2R	13084682	5'	-	roo	9019	2	60.74
GTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGTGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1	-	chr2L	15875839	5'	-	hobo	2924	1	65.71
GTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCTAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACAACTGATTTTATT:1	+	chr2R	20596434	5'	-	roo	369	1	56.85
GTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAA:1	+	chr3R	9714388	5'	+	Stalker4	7025	4	63.70
CAAGCGCGTGTCTATCCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1	-	chr2L	21891811	5'	-	mdg1	355	2	64.38
GTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTCA:1	+	chr2R	15064355	5'	-	412	416	2	66.44
CCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1	-	chr3R	20499875	5'	-	mdg3	228	2	68.99
AGTTTGCTTTTTATGCTTTATTGCACCGAGCCAAGCGGAGCTGTAGAGTCGGAGACAAAATCAGAACTGA:1	+	chr3R	10589365	5'	-	gypsy2	6687	2	85.71
AGACGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1	-	chr2R	13585526	5'	-	412	462	2	61.48
ACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1	-	chr3L	20888788	5'	+	1360	54	1	65.38
TATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr2R	9632094	5'	+	roo	8686	2	60.19
TATGCTTACACAATAAGTCTTACCACTAACAATGTACAAATATTAAATGTGTATTTTTATCACACTTGAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCT:1	-	chrX	20780075	5'	-	Burdock	6294	2	53.42
CAAGTCGAAATCCTTGCTGGGAATCGCGTGCATGGTTCTTATTATCTCCATGAGGTTACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGGTC:1	-	chr2R	23329861	5'	-	invader4	381	1	74.49
AGGGCATAATTTTGTTATCTATCATCGTAATTTAGTTTCGGTCCTCCATTTGCTACCTGGCCAAAATTGCGATAGTGTTAATACGAAACTGTAAACATTGCAGTGGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1	+	chr2R	20899819	5'	+	hobo	12	1	79.02
ATATAATAAGCCGCATCAATAGTCGAACACGATTTGTGAGCCGAGATTTCTATGCACTTGGAAAAATGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGAC:1	+	chr3L	20655306	5'	-	roo	169	2	62.86
TAGACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTTGTTTAATT:1	-	chr3R	15364046	5'	-	flea	223	2	64.38
TATATAAGTATGTATATATATAACGTATTTAGATGTAAATCATATACTTATTTAAGTATGTGTTTGTATATAGTGTAGTTAAATGTAATTTGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATTATCAGAAGTGGGC:1	+	chrX	10824479	5'	+	invader2	260	1	71.03
GTGAGTTTGATTTACAATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:2	+	chr3L	11530884	5'	+	roo	67	2	68.49
CAATAATTCAACAGCTGCACAGACAAAGGGAGAGATAGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1	-	chr3L	21855583	5'	+	blood	14	2	76.03
ATCCCGGCTCAAGGGGGTCAGAACGGCGTCTTCCGCATTTGTAGAGTCGTCATAAAATGATAAAAATATTAATTTCGTGCTTTAAAAAAATTGATTTAAATATTTATTTGGCTTACAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAG:1	-	chr3R	28044751	5'	-	Burdock	6256	2	49.65
ATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1	+	chr4	311176	5'	-	1360	3345	1	55.48
GCAAGTCAAGCGATTGCAAGGTACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTGTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chr3L	20654599	5'	-	roo	9037	1	61.64
AAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGCTTTGAGTGAA:1	+	chr2R	977516	5'	+	F-element	58	1	50.35
TGATTTCCGTACTTTGTTATGCAATAAGTGCGTTCCCATCGATTGGGAAAGGCAAAGGTGTGCAGACAAAGGTTGAATAAAGTTGCTCGACTTTAAGATACCCATTACTCAGCCAGTG:1	-	chr3L	21427072	5'	-	INE-1	541	1	66.10
GATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1	-	chr2L	19965071	5'	+	Doc	41	1	55.65
AGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTGT:1	-	chr2R	13817726	5'	+	412	7113	2	56.85
AAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGAGTC:1	+	chr3L	19013938	5'	-	invader3	196	2	74.82
AATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1	+	chr3L	16015216	5'	+	1360	41	1	49.64
GTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	-	chr2L	12892694	5'	-	roo	326	2	74.66
GATGCAGCAGCACGTGCCAGAGGTGTTCCAGCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAA:1	+	chr2L	10023017	5'	+	Doc	40	1	62.50
TTTTCCCTTCTTATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATT:1	+	chr3L	17557994	5'	-	jockey	4955	1	50.00
TCCCTACTGAGACCCATTAACACAGCAGCTTCACACACACACACGACGAACAGAAAGTTATCCAACGCCAGTAAACTGAACGCATCTGGATGCTCCACGTTTCATAG:1	-	chr3R	9319311	5'	-	1731	472	1	67.29
ACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTCCACAAAGACCTCAAGCTAGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCGTTA:1	-	chrX	23108321	5'	+	BS3	1467	1	62.22
AAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGA:1	-	chr3L	23702260	5'	+	G4	58	1	54.11
GGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	+	chr3R	18272137	5'	+	1360	59	1	77.19
ACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	+	chr3L	22437884	5'	-	roo	329	2	75.00
TACAAGGTAAGCCAAAGCCCCAAAGTTTATGCAATGCAAAAAAACATAAAGTCTCCCATCCGACCTCACACACACACATGCGTATGCAGCCCCATGAACACACACACACACAC:1	+	chr2R	13829860	5'	+	accord	7025	2	52.21
GTAGTTCGTTTCGAGTAACGAAACATGAAATAATGGGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTG:1	+	chr3R	6611162	5'	-	HMS-Beagle	7037	2	77.97
AAATAGACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGTGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1	+	chr3L	16015200	5'	+	1360	16	1	63.85
GGATATCATTCACATATCAACTAAGTTGCATCATTTGCATTGGAAGAACGGGTACAATTTGATTAGAATTGAAAAAAAAAAACATTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACT:1	-	chrX	22897719	5'	-	Bari1	1682	1	62.96
GACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATACATGCCAGAATTTTATTG:1	-	chr2R	4774734	5'	-	baggins	5334	1	71.11
GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGATCAA:1	+	chr3L	25232768	5'	-	accord2	7589	2	54.95
ACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGTCATACATTGGTT:1	-	chrX	22511453	5'	-	1360	3365	1	54.11
ATTCAGTGGCATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1	+	chr3R	7482708	5'	+	412	7070	2	68.99
TTTATATAATGTGAATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAATAATGTTAGTGTAACATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTAGAGTTTTT:1	-	chr2L	12892742	5'	-	roo	9052	2	68.94
CCTTGGTAGGACTTGGGCAATCAAAGTTTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGTAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTA:1	+	chr2R	13817654	5'	-	412	7466	2	74.81
GAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1	-	chr3R	25454090	5'	+	Quasimodo	70	2	70.34
CTGCAGACTAAAGTAAAATTGAAACAACCTTGAGGAATGCCGGAGCAAATACACACACACACACAGGCTCCGGCAAACACCCACAAGCACCAACACACATTCATTTTTTATATAAAGCAATAAAC:1	+	chr3L	1138143	5'	+	Ivk	5279	1	77.60
GTCGTCGTCTCCATTGTCGTTTTACTTTATTGTTTATGCCCGAATTGTGTTTGAGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTT:1	-	chr2L	2687430	5'	-	copia	5057	2	64.38
CCGCGAGTCCTTTAGCGTGGATCCAAAAGCCACGGTTCGTGTCTTTTATAATATACTAAAAATTGGTTTATAATTTTATGAAATATTTCACAAAAGCTGCATAAATTTTAGACTACTTTTAATTAATTTACTGTCCCTAGCTAACC:1	+	chr3R	26386123	5'	+	Cr1a	3998	1	73.29
ACACACTCATCGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAA:1	-	chr2R	10582508	5'	+	Juan	3827	1	63.01
CATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3R	7835099	5'	-	roo	9026	1	52.74
TGTTCATCTAAATTGAGTTACTTTATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	-	chr2L	9668307	5'	-	1360	3357	1	62.07
GTTAACTGGACATGATAGTAAAGTTAATTTACTTAAACAAGAGGGAAAGCTTTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCATAACTCAGCTA:1	+	chr3R	14576797	5'	-	INE-1	544	1	74.19
ATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr2L	7898357	5'	-	roo	8997	2	77.95
CACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	+	chr3R	18339111	5'	-	roo	322	2	75.86
ACATTTTTATTAGTCTTGTAAATAGTCATCGATTTGCAAAAAAACAATTCTTGCCACGTCCACTGTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAAC:1	+	chr2L	22063444	5'	+	INE-1	345	1	74.16
GATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1	-	chrX	6522075	5'	+	F-element	47	1	53.08
AAAATATTTAAGCACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3R	14364712	5'	+	roo	8706	2	53.90
ATGAATGATTTCATTTTTGGCTGACTGACGGTGAAGTCAAATCGAGGTGGCCCAAAATCTGACAAAGGCATTCTTGTATAAGCTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAA:1	-	chr2L	4412679	5'	-	Quasimodo	7356	2	74.38
CGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGACACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1	+	chr3R	21705961	5'	+	297	43	2	52.74
AATATTTTCGAATAAAATTTTTAAAAATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1	+	chr3L	1534607	5'	-	pogo	2085	1	69.72
TTGCGCAAATTGGTCGTTCTGAAATCGGAGAAAATATCGAAATTTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGATAAACCACTAGGTAAAATCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chrX	5643432	5'	-	roo	390	2	64.38
GTGCACAGAAATAACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGTGTCAGCGCAGCAA:1	+	chr2L	21325078	5'	-	invader4	3038	2	74.66
AGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1	+	chr3R	26431991	5'	+	opus	66	4	77.87
AATAGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAG:1	+	chr3R	18339040	5'	-	roo	9057	1	73.79
AACAAACGAGAGTTGAAACTAATTCGAAAATTTAAAAAAAAAAAT:1	+	chr3L	15732909	5'	+	TART-C	11093	1	86.67
CGGTGGAGTTATCCATAAGTTTGTAGAATAAAACGACTATAATAAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTC:1	+	chr2R	5209550	5'	+	gypsy	6993	2	78.52
GAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chr3L	11393461	5'	+	roo	45	2	54.11
TAGGACGTACGACTTGAACAGGTACTCATAGTAACTGTCGATGCCAGCTCCGACTCCAGAATCGCGACGCACCCAATCGCCCGAATGGACATTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCG:1	-	chr2L	13194255	5'	-	HMS-Beagle	218	2	68.84
ATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCTGAACGTA:1	+	chrX	21668136	5'	-	F-element	4370	1	69.16
TAGTGCTCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1	+	chrX	21014763	5'	+	copia	43	2	47.95
AAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2R	21907925	5'	-	roo	355	2	58.46
ACTCCAACATGCAGCAAAAAATATCGAAAACCACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCGGCGC:1	-	chr2R	23332643	5'	-	invader4	3043	2	62.07
GTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:1	+	chr3R	10182123	5'	-	blood	7335	1	60.00
AAGATTTGGCTCCTGTGTCGCTAATATTTTTAGTTGTTATTTTTTTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1	-	chr4	1152125	5'	-	transib2	2785	1	57.53
GGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGGTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGAC:1	+	chr2R	5209614	5'	+	gypsy	7029	2	61.68
TCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAACATATTTAAAGACT:1	-	chr2L	5254376	5'	+	roo	13	2	60.19
ATATATATATATACCCATATATATGGGCGTGGCAACATGGGCAAACAAACTTGCGCTGCGTCTATTACTCTTTTGAGTCTTAACAATCTAGATATTATAGTTCCTAAGATCTTGACGTTTATACGTTCATACGGACAGATGGACA:1	+	chrX	4486496	5'	-	INE-1	124	1	77.93
AGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTCCGTACATATCTTATGTAAA:1	-	chrX	10640107	5'	+	roo	8711	2	56.00
CATGTTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1	+	chr2L	14892199	5'	-	transib2	2771	1	54.79
TGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAACATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr2L	14772144	5'	+	roo	8683	2	64.66
CTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr2R	20596426	5'	-	roo	9053	2	68.42
TTAAATAAACCTTTTACATTTACAATCAATACCTACCATGTAAGACCAGAGTATATAGGTATACTAGAAATATTGAGTAATACTGTGTTTAGACTGCTGTGAAAATTAATCTGATCCCCAAGAGGGTCAACTTTCAGATCTCTTTC:1	+	chr3L	26013673	5'	-	G5	4510	1	67.81
GCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1	-	chr2L	15991406	5'	-	mdg1	7400	2	58.90
AGTAGGGAACAAAAGCTCCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1	-	chr2R	9662837	5'	+	412	26	2	67.81
GCAATCCTTTCACAGTCACTGCCCGCACACAGACAGATGTTGACACAGTTTCCTTGAGCTCCGTCTGAGCTCAGCACAAAATGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1	+	chr2R	9662678	5'	-	412	7511	2	58.74
ACTTATATACATTATTATCTTACAAGTTGATAATATTTATTTTTTACACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTT:1	-	chr2R	19502883	5'	-	P-element	2641	1	19.86
ATATAAAGTGGTTAGTGGTTATGTAAATTAACAGACAAGGCTTTTGGGTATTGAGATTTATTATGCGACTATGCGCGTTCTGATGAGTTTTTAATGTTGATGATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCAG:1	-	chr3L	27874121	5'	-	gypsy4	6356	1	64.38
ATTTTTGATATAACCATAATTTCCTTGATTGCCAAAATGGACACACAAATATTTATATGTAGTATATACGAACATGATAACAATAATAATAACAGTAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGT:1	-	chr3R	14981247	5'	+	mdg1	67	2	63.45
AAATGCAATTACAGGCATATCGCAAGTGCCAGTAGGCAACGGACTCCGACTCCTCATGGCAATAAGGTCGTACATCGTACATCGTCCGACATTTCGTTTGCCCATCCTTCAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAA:1	+	chr3L	17081494	5'	+	FB	835	2	61.64
TGAGTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATTTTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTC:1	+	chr2R	5039338	5'	-	gypsy11	314	2	62.86
AGAAGCCGCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1	-	chr3L	16750763	5'	+	Tirant	5	2	74.00
CGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1	-	chr2R	9791663	5'	-	412	422	2	70.00
TGATAATAAATTTTTGTTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACCGCCATGCCTCCCGCCCAACCGACTGAGAGGCTCTGCCGTGTATCGTACG:1	-	chr3R	4583047	5'	-	Cr1a	4399	1	73.63
GTGTTGATAAATGTTTTTAGTTCGTCCCCTAGCCCAGGCACTTGTCCAAGAGTACACTTAAAAAAAAAGTGTCAAAAACAGGAAAGAAATATTTATTACTCTGATACTTCAAGCAATTAGTTCAAAAAATATATTAATATGTATAT:1	+	chr2L	11749531	5'	+	G3	4503	1	52.05
ATAATCTTTTATTCGACTGTATTGATGGTGCAAGTACGCGTATATCGTAGTAACTTGTTTCGTATATGATGTCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTACTGGGAATGCG:1	+	chr3R	4504047	5'	-	INE-1	533	1	56.69
GATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1	+	chr3R	14651218	5'	+	P-element	47	1	39.82
ATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1	+	chr2R	15064344	5'	-	412	442	2	56.49
AAGGGGATAGTCCGCAAGTCTTATTTATTTAAATGAGATTGAGTAGTTTGCCAAGAAAACTACTACACAAGGAACTACGGCAAACGTGTAGAAGCATATTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCGTGTG:1	-	chrX	2657907	5'	+	1360	453	1	60.27
AGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1	-	chr3R	16076867	5'	-	roo	9034	1	57.27
AATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTCACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1	-	chr2L	17079850	5'	+	jockey	4686	1	67.62
CCAGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCGTCACTCTATATTTTGGCAAGTTACCCATTATTTGCTGAGCTGTATTTTGTTTATACCTTGCACACGTTACACATTCTCTTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATG:1	-	chr3R	19447202	5'	-	roo	138	2	75.34
GCCTTTGTTGTTTACGGCCAACTGTCAACGGTGTCAACAGCACGCTACAGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCACATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1	+	chr2L	2909656	5'	-	hopper	1352	1	62.14
GGAGGACATGGAACCATCATCATTAGTCGCTGCCGGAGACATTGAGACACGTTTGATAGCAGCCCATAGGATGCAGCACGCTATTGCAGCGGAGAACTGACAATGCTGCTACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1	-	chr2R	16299329	5'	-	blood	341	2	50.00
ACCAAGAATGTAAGCCCCGACTCGTAAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAA:1	+	chr3R	13457878	5'	+	X-element	38	1	56.15
TTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAGTAGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATC:1	+	chr3L	14944550	5'	+	G5	4806	1	56.16
CATTAAAAATGATTTGCGTAAAACGCAATTTTATTTTTTCATCGCCGCAAAATGAGGGGGAAAAAAATAAAACGCCAAGAAAGCTACCCAAAAAAAAAAGAACAAAAAGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAA:1	-	chrX	6443211	5'	+	G3	4583	1	55.97
ATAAATGTTCGCTGCCCTCGACGGCGCCAATGTCTTGCTTGCTCTTCCTTGTTAAGTTTTTTAGTACATAATTAAATCCTACTAACACTAATAATTATTAGAGTTATTTTACTTTATAAACATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTT:1	+	chr2R	1983896	5'	+	Cr1a	4341	1	64.34
CTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	-	chr2R	7898162	5'	-	roo	9003	2	68.49
ATTCGCCTGGTTAAGCTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1	-	chrX	2842608	5'	+	Tabor	6863	2	68.99
ATTGTATCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3L	11441709	5'	+	roo	13	2	69.23
AAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	-	chr2R	15064431	5'	+	412	7098	2	59.50
CTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1	-	chrX	13504239	5'	-	412	7474	2	67.81
AATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGT:1	+	chr3L	17558018	5'	-	jockey	4923	1	68.49
GACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTGTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	+	chr3R	19968103	5'	-	roo	341	2	63.70
TACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTCCC:1	-	chr3L	17205281	5'	+	hobo	10	1	65.48
TATCTTTCATCATAATAAACGGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1	-	chr3L	10848741	5'	-	blood	339	2	53.28
TCTTGCCGAAATACGAAAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	-	chr2L	16016438	5'	+	412	40	2	58.22
GATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1	+	chr2L	17295819	5'	+	Doc	47	1	50.00
TATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTG:1	-	chr2R	20194298	5'	+	Max-element	35	2	50.85
AATTATTGATAACGGACACTGTGAATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1	-	chr2R	18609443	5'	+	opus	7143	4	58.00
ACAACATAATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1	+	chr2L	8986093	5'	+	412	7082	2	62.86
GTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	+	chr3R	18339060	5'	-	roo	9036	1	59.59
ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGCCAAACTGTATGTATGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr3L	23730764	5'	-	roo	333	2	73.19
GGTCACACACATTTCGGGCGAACCCCGGGCAATGTTAAGTTATGTAAAGGCAAATTTAACAATGTGCCAAGGGATGGAGCTGAGGGTAATCAATGTGAAGCAGTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCA:1	+	chr3R	21717612	5'	-	297	6873	2	73.79
TATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr3L	11530976	5'	-	roo	9010	2	64.34
AAAAAAAAGCACAACTGGAAAAAAGCAGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCA:1	+	chr2L	5929563	5'	-	I-element	5010	1	67.86
GAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1	-	chr2R	4601680	5'	+	HMS-Beagle2	6909	2	70.55
CTGAATATTTTTGATATAACCATAATTTCCTTGATTGCCAAAATGGACACACAAATATTTATACGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAA:1	-	chr3R	14981253	5'	+	mdg1	7100	2	58.22
AAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chrX	9540093	5'	-	roo	9015	2	71.31
CAAATCTTGTTAACAAACTATACAGGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chr2R	7898036	5'	+	roo	28	2	65.07
CAGAGTGACGTGCCCCCAGGGTACGACAGCCCAGCAAAGGTTCAAGTTGAGGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTA:1	-	chr3R	26465962	5'	-	HMS-Beagle2	119	2	57.58
AGGGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAACTATTTTATTTTACAATGCGTCTTGGTTACT:1	+	chr2L	6569976	5'	-	jockey	4911	1	80.92
CTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTAT:1	+	chr3L	19013914	5'	-	invader3	237	2	54.92
GTTTGCGAATTTACATATATATAAAACCACTTCATACCCCAGAACTCCCAGGGTATTTTCCAACTGGTTGAACAGCTCCACGCTTTCTTTTCATTTTTTGCATTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACT:1	+	chr2L	11493924	5'	-	R2-element	3552	1	73.97
GTAGCCTACATAAGTAGGGTTTTTTGAGCGAAATGAGGTGGAGCATTCACGATATTATGGGAGCTTTTTTGGACCGAGTTTAAATGACGATTTTCTTAGAAATTCTTAGGCTTTAAAACTATATTATTTTTGATCAATTGGCAC:1	-	chr2L	19903511	5'	+	1360	260	1	61.11
CACTGAGCGAAAAAAGGGCTCCATTCAAAGGGTATTTATTTACGATTGCTTACGTATATGTATTGTATATTGCATCGTAACTCAAATAATGCATCATAAGATGACTCTAGTTCCTTTCTGAATATAAATTATGCATTGTTTTAAGA:2	-	chr3R	22656616	5'	+	Transib5	437	1	58.22
GCCAGCCCAGCAGAAACAATACCGTTCGAAATTGCTTAATAAACCTCGTCCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTC:1	+	chr3L	25514123	5'	+	Rt1b	4802	1	53.70
AGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr2R	11164491	5'	+	roo	75	2	73.29
CGTTTCCGGAAGAGTTACAGCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAG:1	-	chr2L	2122499	5'	+	Stalker	37	4	55.22
GGAGCATTGCTAACCAAACCACCATCTGGTCCGAAAAGGGCACAGGAGAAGTCCAGACGCTCCTTGATGTTGGTGGAAATCGAAGTGCGTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAAT:1	-	chr2R	22481336	5'	+	gypsy	7447	2	70.77
ATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	+	chr3L	14603268	5'	+	jockey	74	1	61.64
AAACTAAATAAATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATA:1	-	chrX	10201228	5'	+	transib2	64	1	61.64
TGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCCCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	-	chr3R	22276758	5'	+	jockey	75	1	57.50
ATACTTAAACGTCTAAAAACTAAATTTGTCTCTCTAACCACAACTTTCTAACTTTTATAGTTCCTGAGGTCTGGACGTCCATACGGACGGACAGGGCAAAATCGACTCGTCTATTGATCC:1	-	chr3R	4841292	5'	-	INE-1	97	1	66.67
GAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1	+	chr2L	14081307	5'	+	1360	34	1	53.85
GAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chrX	5274289	5'	+	roo	50	2	54.07
GCAAAAGTTGGTTGGTTCTTAGCCCGGCTTATTTGCGCGTCGCCTTCGTCCTGCGATTCTTTCGCCCTCACTTCGTCCTTTTTTATGCATTCGCCTTGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAG:1	+	chr2R	23334966	5'	+	invader4	179	2	70.37
ACAACTTCTTCACACGCAACTTTCGCCCCTCGCCGACCACGCCCCTAATCAATCAGTCAATTCAGCCAGTCAGTCACTCATCCCCGCTTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	-	chrX	3274501	5'	+	roo	8668	2	70.16
AGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1	+	chr3L	10647910	5'	-	412	7483	2	60.69
AGGCGAAATACGCTGAACTTTTCTCGAACTGAAGACCCATTTTCATAAAACAATTTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTC:1	-	chr2R	5209738	5'	-	gypsy	7430	2	72.60
ATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGAC:1	+	chr3R	22388997	5'	+	G2	2644	1	69.00
ATTAGACTTACCCGCATCGCAGCAGCTGTGCGCCTTTGAGCAGCATTCTGTCACCTGTTCGTGTTGGCTTTCACTTTCTAATTTCGCCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1	-	chr2R	18527790	5'	+	jockey	4757	1	67.42
CAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1	+	chr3L	21855430	5'	-	blood	7347	2	53.03
AGAGTATGCGCTATTCGCATATCACTCGCATTCGCTTTCGCACTCGTCTCTCTAGATTTATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCA:1	-	chrX	18386468	5'	+	invader4	2760	2	66.28
GAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1	-	chr2L	15833065	5'	+	hobo	61	1	71.90
TGGGGTGCTAATCACCCAGCGACTGGCCATTAACCCATGGAGGCCCAACAAGTGAGAGTCGTACGTTTTTTTTTTACGGTGATGTTTTTATTATTTGGTCAACGCACTGTTAC:1	+	chrX	13126440	5'	-	jockey	4973	1	53.98
CCTCAGAGCGCCAATAAATAACAACAAAGAGCAGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1	+	chr3R	12717688	5'	+	297	17	2	74.66
AAAATCAATAGACACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1	+	chrX	17756557	5'	+	297	6623	2	53.42
TATTTGCATAATTATGGTCCTTGGATTATCAATACATTAAAATCAACTATTGGCTTGTTCTTTTATATAAATAAGCTTCCGGTTGGATTATGTTGATTTTTATTCAGGATATTGAAACCTATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATG:1	-	chr3R	27067964	5'	+	F-element	4266	1	71.23
ATGGTCACGCAGAAAAGGAACGAGGCGGAGTAGTTCATTTCGGCAGGCAGGCAGAGACTTAAATACCCTGTAAGCGTACAAGCGTATCTATCGGAGTGAAGATATACAAAGTTACTTCATACAATAAATATAATAATATTAATTAC:1	+	chrX	19409304	5'	-	Tc3	276	1	71.23
CCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGAATAGATGTAATAGATTTGG:1	-	chr2R	5173209	5'	-	Stalker	385	3	53.06
ATTCAGCAAGAGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1	-	chr2R	18609419	5'	+	opus	35	4	78.57
ACACCGAGCATAGCGTGCTGTCTTCCCATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr2L	3114588	5'	+	roo	13	2	70.64
GCTTACAACATGTTGCAAGTTGCAAGCTCGTCGGCTCATCAGTTGGCTCAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1	+	chrX	7195044	5'	-	P-element	2853	1	47.22
GCGAGGCAGCAAAAAATTAGCATACGTACATATGTATGTGCGTGTGTGTGTACTTGTGAGCCAGGCAGCGGAAACTGAAGTGCGTAGCACTCTCTCTCACTCACTCACTCACACACACACACACGTAC:1	-	chr3L	12312572	5'	+	Quasimodo	35	2	48.44
ACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1	+	chr3R	21705980	5'	+	297	6642	2	61.38
GCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGC:1	-	chr3R	11547829	5'	+	G2	285	1	77.08
TTTAGATTTCTTCTGTGGCATCCTATCCAAACTTTAAAGAAAACAGCCCTTATGTGCAGCGAAAAGTTATTACACAATTGAATAAGAATAAGAGAGAATACTACAGTCGAGTTTACCGACTATCAGATAC:1	+	chrX	19330521	5'	-	INE-1	558	1	56.15
CTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCATCTTAATTTGATCTGCTTAAATTATT:1	-	chr3R	28075410	5'	-	jockey	4937	1	53.42
TGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGGCAGCA:1	+	chrX	13704776	5'	-	invader4	3019	2	69.57
ACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1	-	chr3R	20427446	5'	+	jockey	79	1	75.97
AACGAGATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1	+	chr3R	28758277	5'	-	mdg1	393	2	41.35
AGACCATTTCCCATTACCGCGCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1	-	chr2L	21400394	5'	-	mdg1	7430	2	54.87
CAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGA:1	+	chr3L	25804310	5'	+	gypsy	7129	2	83.33
TTCGGGCTGCTTGACGTTTTACGCCATCCCGTGAATTTAAATACGTTAACATCGCGCGACCAAATATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1	+	chr3R	14979776	5'	-	pogo	2076	1	59.32
TTGTCTTTCTCTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1	-	chr3R	18585678	5'	+	P-element	55	1	47.95
TTATCAGCATTAATTTCATTAATTTCCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	-	chr3R	30344729	5'	+	pogo	49	1	52.74
AGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1	-	chr2R	5531207	5'	+	1360	70	1	63.25
CGAACCTTCGGCAGCATGTTGCTTTCACCTGGTTGGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCATTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTC:1	-	chrX	2518157	5'	+	P-element	9	2	73.23
AAAAGCAAAAAAAAAGTATAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGATATAAGTTGGAAATTTCGTCAAGATCTGGCGATCTTAACTGTCAGGATGGTCGAATTGATGTAGGCTAGTGGTACATATACATAAGTTCA:1	+	chr2R	19689070	5'	+	invader2	4871	2	87.14
TGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTGTTGTGGAGATATGATGAGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1	+	chr3L	19036022	5'	-	Tirant	343	2	78.79
AACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1	+	chr2R	5485125	5'	-	blood	304	2	71.53
CAAGAACCGCTTTACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCG:1	+	chr2L	10037302	5'	-	Quasimodo	7316	2	64.79
AATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	-	chr3R	25448424	5'	+	roo	8726	2	67.91
ATAAGTCCTAATGACTGAACGGCTGCACGGAGGATGTGGCTGGGGGGGGAGGAGGTCCTTTTTGGAGGGCAGCAGGACAGAAGGAGAGAAGGACGTGAGAACATCAAGACCTTAATGACACACGGGAAAAACACCGTGCA:1	+	chr3L	6084188	5'	+	baggins	5102	1	64.29
ACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACG:1	+	chr2L	21008572	5'	+	invader3	19	2	66.15
ATGCTCCTGATCCTCTGGCTTTCGGCCCTGCTCTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGT:1	+	chr3L	2362294	5'	+	Stalker2	7275	2	63.50
CTAAACGGCAAATAAAGTACACGTTATTCCATGGGCAAATAATTGTCTTGAACTATTGATTTCACTTTGTTCAACTGAGAGAACAAACACATAGTCTTAAGCACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAGAACAGCAATATGAATT:1	-	chr2L	14452523	5'	+	Stalker3T	266	1	54.11
TAGCGGGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1	+	chrX	18386409	5'	-	invader4	3039	2	80.00
ACAGTCCGTTCCAGAATGCTAAGAGAGATTTTAGAAAGCTGATCTGGGCAGCGGATCAAGGCGCTCAGGCGCTTGGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAG:1	-	chr2L	17387721	5'	-	Doc	298	1	64.35
AATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1	+	chr3R	17478365	5'	-	copia	5065	2	60.27
ACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1	-	chr3L	16343279	5'	-	roo	8981	2	75.86
TTTGGCTGCGTGTGTACGTTTGTATCTCTTCAGCTTGTGCGGGTTTTTTGTTGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTT:1	-	chr2R	11365233	5'	+	Bari1	1612	1	61.19
TAATGGTTCTGAGCTCTTACTAAGGATTAAAACAATTTAAATTTATGTATATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATT:1	+	chrX	7195182	5'	-	P-element	166	1	61.45
GAACTACTAACTTAAAAAAAAATACTGAGAATGAATGCTAGAGTCGACTTCCCCTACTATCTGATACCCGTTACT:1	+	chr4	385799	5'	-	INE-1	550	1	62.67
ATATTTTGACTAGTTCATTTGGAAAGCCCCTTTTTTGCGATGTCCCTGCCATGTGAAGATGCCGTTGACAGCGAATGGGGAGCTCATATACATATCTATGTATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATC:1	+	chrX	20282324	5'	+	Chouto	148	1	67.59
CGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGACGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1	+	chr3R	14981150	5'	-	mdg1	7401	2	56.16
AATTCAGTCTGCTTACATTTTAGCTTATATTTGAAGCACATGCAATATTCATATTTTTGGATATCATACATATACATCTATGTGTGTCTGTATTTCGAAATTAATTTTTGTAATTGTTTAATTTTTTTTCCTTTTCCTTTTGTTT:1	-	chrX	5053710	5'	-	Doc2-element	235	1	73.79
GACATGACCAAGATTATCTGAGAATATTCTACCTGTTACAAACTTTACAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGTGTATATATATATATACAGAGGTGGTCAAAAGGATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAAC:1	+	chrX	22715006	5'	-	Bari1	1683	1	66.44
AAATTTCTGTAATATAAAATTCTATTTGCAAATCCGTCTGATCATTCCAATCTAAAGTCCGCAATAAACATTTCAGCACTTTAAAGCGGACTCGCACACACTTAAACATCTCACACAACACACACACACACACACACATGTGC:1	+	chrX	19836889	5'	+	accord	185	2	54.55
CCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr3R	19968090	5'	-	roo	355	2	55.86
ATTAGTTTCTATCTACCTTACATGTCTAAAGTTACTAGTCCTATTCATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAATTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAATT:1	+	chr2R	326476	5'	-	S-element	1512	1	70.55
ATTTTGTTTGCCAAACTAATGAGTGAAAATTTGTCAGTGCAAGCCACTTCGAGGAAAATCAATTTCTGACTAATAACTGAATGTATCGCATTCGATTGTTTTTTCTATGGAAAACTTTGATTAGACGAAGATATTTGGGAGATACA:1	-	chr2R	13047799	5'	-	accord2	7543	2	52.05
AAACACGATTGATTGATTACTGATTTTTTAACCATATTTATCTGCTTTTCATCATATATTAAAGAAATATACAATTTTTTTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1	+	chr3R	11105905	5'	+	Doc	9	1	37.24
CGTTGTAGACGAAATTATTTTTTGAAGTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATACGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1	+	chr3R	17316213	5'	-	opus	482	2	68.55
AACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr2L	16091911	5'	-	roo	9010	2	67.69
TTTCATAAATAAACACACAAAAACCGCACCTGTGCTCTCACTTTTCTCGTGGGATTTTTGGGCTTCGCTCAGTTGGCGGCAATGACATTCAAAATGTGTAATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTT:1	+	chr3R	13118761	5'	-	17.6	219	2	68.06
GGTACCATTTGAGCATCGTCCGAATTTGCTGCCGAAGACTGTCAGGAGTTAGAGCAAGAACTTTGAGGAAATTAATATAATGTAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTATGTACCAAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGA:1	-	chr3L	23750293	5'	-	Cr1a	4254	1	55.86
CGGGTTTATTAAACAAAATTATTGACTAGTTAAACATAATAAAACGATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr3L	233376	5'	-	roo	390	2	72.60
AAAAAAAATGATGCTTCAAAATGATACAAAAAAGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATA:1	+	chrX	17526776	5'	+	roo	8665	2	72.41
ATTTATCTGATTTAAAGTTATTCGAAATTTTTTCTTAATATTTCATATTTCATTAGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTTTACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGG:1	+	chr2R	9258415	5'	+	3S18	63	2	60.71
AAAAAACCGCTTTTCGACTTCGGGCTGCTTGACGTTTTACGCCATCCCGTGAATTTAAATACGTTAACATCGCGCGACCAAATATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1	+	chr3R	14979758	5'	-	pogo	2077	1	65.19
CTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTT:1	-	chr2R	11329666	5'	-	P-element	270	1	15.97
GCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	-	chr2R	9328699	5'	-	roo	9044	1	56.14
ATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr3L	9998015	5'	-	roo	399	1	47.48
GCAATAATGTTGGGCTATAAAATGTTCATTTCGATAGTGAAGGAAAATGTTAGCTCATCCAAAAGTGTTCGTTCTCTATACACATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAA:1	-	chr3L	4385507	5'	-	Quasimodo	207	2	43.84
TAAAACTTATTTGAGACACGAGGAACATGAATTTATATGCTGTGTATGCTTAAAATTCACCATTTGATGCGTGAAAATAATTCTAATTCTAAGCTTCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1	+	chr2L	17607563	5'	+	hobo	24	1	59.59
TGACCATGTGGAGCACGAAATCTTTTGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGTTTTCATATTCTGATGAAATT:1	+	chr2R	23332511	5'	+	invader4	42	2	53.96
CTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCGCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr3R	20469583	5'	+	roo	8703	2	47.14
GGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGA:1	+	chrX	2518063	5'	-	P-element	2791	1	20.14
ATAAATGATTACCCACTAAGCAATGTAAAAAGATAACAAAGGGTATCATAATGTGACTTCCTGTGCCTTATTCGAGATGGCTGCTAATTAATAAACGCAGTACCCCCAAGAAGATAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAG:1	+	chr3R	19367635	5'	+	GATE	445	1	43.15
ACCTAATGTGGACACCGAACCGGTGGGAATTTAAATGGTTTAATCAGGAAAGGATAAATTGATATATTTTAAAGATTAAAATTAACTCTCAGATTTCTATAACGATGTATATTAACTAATAGTTAATATT:1	+	chr3L	4532304	5'	-	Tc3	265	1	41.54
CCAAGGTTTCATTCATTCGCACTTACATTCAAAAGCTTATTTTGATTGGAAAAACTATGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATA:1	-	chr3R	14971969	5'	+	pogo	1700	1	60.27
CGTTGAGCCACGTTTATTTGATAGGCCAAGCAATGTCAAACTGCCTGATGTTTGATGCATGCATATATCTAGGCAGCTATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1	+	chr2L	16067054	5'	-	297	383	2	71.19
AAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1	+	chrX	3309636	5'	+	jockey	81	1	72.14
ATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1	+	chrX	21014793	5'	+	copia	4925	2	64.34
ACCCAAGTCGTTGGTTTAAGATACGAGTCTTGAAGCAATAATCACTGGGCCGACAGGTGGCACTAAATAATGATTAGAAATCGTAATGGTAATCAAATTTTTGTTTCTTAACAATATTTATTATTTATT:1	+	chr2R	15052025	5'	-	Juan	4060	1	54.26
AGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1	-	chr3L	10574412	5'	+	Tabor	6865	2	57.93
ATTAACAATGAGCAGATAATTTTAGCGCAGTGTGTGTACGCCAGCTGAGGCCAGTCGGCGGCTAAAGTGAGCTTGTAAATTATGCAAACAATTAAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGG:1	-	chr2L	4829209	5'	-	blood	7045	2	76.92
GTTTATTTTGTTCTTTAATTTTTGGGGAAATAAACACCATTTATTTAGGAAGTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1	+	chr2L	16016291	5'	-	412	7542	2	73.91
AGTAATTGAGTGCACAACATTGAATGCTGTGGCAATGGATGAAAAAACAAGAGTCCAAACGAATCAAACAAGTGAAAATCGGAAAAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTTTTTGTCGGCCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGC:1	+	chr2R	17948557	5'	+	diver2	278	2	51.37
CTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1	-	chr3R	22276764	5'	+	jockey	79	1	57.69
AATTACTTTTAGGGTACGTTATTATTATAAGAGGAAAATATGTAAACGGAAATTCTATTGCATTTCACAAATTGAGGTAATGTAATTTAATGCGTCAAAGCGAAACTTATCCATACCATATCAATTATTAAATATATATATTTTTT:1	+	chr3L	15375551	5'	+	Tc1	62	2	46.58
ATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr2R	20596465	5'	-	roo	338	2	64.38
ATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1	+	chr3R	24455367	5'	+	Quasimodo	70	2	73.97
GCAATATTAAGATGTTCTGGCGCCCACTGAAAAAAGTTTTCCATCAATTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAA:1	-	chr3L	2622736	5'	-	BS	5026	1	65.00
TGTGGGCCAAACACTTTCCGCACTGAGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1	-	chr2R	13006534	5'	+	3S18	46	2	55.17
CATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:2	-	chrX	23439048	5'	-	P-element	2495	1	65.19
CGAGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACTCAGCAACACT:1	-	chr2R	5485227	5'	+	blood	34	2	57.04
TACTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1	+	chr3R	11083854	5'	-	412	458	2	60.96
CTTATATATGTTGTACTTACCTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCC:1	+	chr2L	22315513	5'	+	frogger	2280	1	70.15
AATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1	+	chr2L	11518390	5'	-	412	7481	2	60.96
AACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTACCGCCATACGATTCTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1	+	chr3L	11257355	5'	+	1360	3380	2	45.00
CCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTGT:1	-	chr3R	14940157	5'	+	jockey	95	1	73.97
ACTTGCTTTCCTATGAGTTATGTATTTATCTCGGGTGAATCATTAACAATCCTTTACGACGCGCAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGACTAATTAACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACA:1	+	chr2L	2800973	5'	+	Burdock	387	1	54.48
ACTACAGTCTCAGTATTATACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1	-	chr2R	6173098	5'	-	pogo	2066	1	56.92
GGAGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1	-	chr3L	20831402	5'	+	roo	8700	2	60.69
AATTATTACAAAAAAAAAAATAATTATCATTTAAGAATTTTTTGTTGCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAA:1	+	chrX	11432908	5'	-	roo	9045	1	52.05
CAACGTGCTCAAACACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	-	chrX	9540148	5'	-	roo	385	2	68.75
AGTTGGTTTGACTTAAACGTACATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chrX	2444311	5'	+	roo	8683	2	69.23
AATACAACGTTTTCATTTTTGTTTTTTTCAAAGCGAACGGTCGTTTTTTTTTTCGCCCCGAATTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGGTTTTAGTAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAAGA:1	-	chr2R	5555270	5'	+	Cr1a	104	1	80.69
CAGTGAGGTATAGTGCAGGTCCGTTAATTTATTTTCAACAGTGAGCAGGCATAAATGGGACTAGATTATCCGCATTCAGTCTG:1	+	chr3R	4553014	5'	-	Rt1c	5175	1	48.19
CAGACATTGTTTTGCGGGCAAATATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	-	chrX	5274390	5'	-	roo	347	2	60.96
ATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chrX	2444333	5'	+	roo	21	2	62.60
GTAGTTTAAGTTAAAAGAATCTTTAAGCAAGGCTTTTTTTCCAATATTCTAGCCTCTTTCGATTCTTGCAATCGACTTAAAACTTAACTTAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTAC:1	-	chrX	12073061	5'	+	412	7261	2	50.71
GTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	+	chr3R	22844157	5'	+	roo	19	2	66.15
ATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	-	chr2R	9632199	5'	-	roo	9020	2	54.29
AAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCG:1	-	chr3R	5061916	5'	-	mdg3	165	2	74.66
TGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTACATTTAGG:1	-	chr3L	4536777	5'	+	roo	76	2	69.18
AATCGAAATTTACAAAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1	-	chrX	14749698	5'	-	copia	233	1	56.83
ATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATG:1	-	chr3R	30872894	5'	+	micropia	4990	2	60.00
CTATAGAATATCTTGGTGCTATATCTTTAGGTAATGCGCTAGAAACTTGACAACTTAACACAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATA:1	-	chr3R	19448239	5'	-	roo	21	2	54.81
GTATGCGATGCTGTCCCGCGTCAGTGGCCACCAGTCCAAGGGTATTGTCTGAAATTTGCATTTCACGAGGATTAGGAAATAGCTTAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAC:1	-	chrX	23030693	5'	-	BS	4991	1	67.74
CTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1	-	chr3R	18585654	5'	+	P-element	79	1	31.51
CCGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1	+	chrX	8543466	5'	+	roo	87	2	78.62
GTACTCAGTCAAACGTTAAGAAGGATATAAAAGTTTTAAGTAGGATAACGAATTTTAAAATAAATAAAAAAAATTCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGAGCTGG:1	+	chr4	599562	5'	+	R1A1-element	5051	1	50.68
CAGTGCATGTCTTAGCTCTTTGGTATGCATGAAATGTACGCGACGCCAAATTTGTTGTGCGGCGAGGCGAATGCTCAAAATGTTTCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGTATC:1	-	chr3R	10458336	5'	+	opus	351	2	64.23
GCTGGCAGCGCTGCTCCTCGACCTAGGCTAAGAAACTTGATATAAAGGCAAGGTGGAGTGAGGAAGAGAAGTGGATGAGGGCGAGAAAGG:1	+	chrX	23202018	5'	+	R2-element	496	1	55.56
GGTCCCGTTGTTGGCAGATAAGTTTCCCAACTTGGATCACCTTACTCTCGAAAACTTTGATATGAGCTTCCCGGAGTTGGGTGAGTATGTATATAGTAAGGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATG:1	-	chr3L	19800348	5'	-	mdg3	5313	2	58.74
AACTTATATTCAAAACAGCAGTTGATTTCGTTTAAACATATGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTA:1	-	chrX	22838797	5'	-	INE-1	544	1	53.42
TTCTTTTTCAGCAGAGCAGTAGCAAGTCCCCATAGCAGATTTTATAGTTCATCTTTGACTCTAGGCTTCAAGTCATCGACTTGGGGCGTATAGTCAATCTAGTAGAATATACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTC:1	+	chr3R	1203129	5'	-	Cr1a	4082	1	57.53
TAAAATGTGATGATGTATATATTTTGACAATGCTTGTAATCCATTGTAAAACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATA:1	-	chr2L	17420302	5'	+	roo	8665	2	78.08
AGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chr3L	11393473	5'	+	roo	8717	2	59.86
ACCAAAACGGTTGAGATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	+	chr2L	544747	5'	+	412	37	2	58.90
TCCAGAGATTATTTTAATATAATATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:1	-	chr2R	9221110	5'	-	opus	432	2	64.38
AATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTTAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1	-	chrX	21564729	5'	+	diver	87	2	74.66
CCTGATACTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCAC:1	-	chrX	21994021	5'	+	McClintock	5985	2	62.33
AGGGGTCGGAGTTCGTTTCAAGGTGTGTTGCGGTGGCGATGATTACGTCTTTGGCATTACTTTTATTTTATTGCTGCCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	-	chr3R	22124860	5'	-	roo	9028	1	48.25
CAAAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1	-	chr2R	19540464	5'	-	jockey	4988	1	64.89
ATTTCAAGCCAGTTTTTTCAATATGTTTTCAAGCTATATAATCCAATTGAACTGTTCAAATGGCTTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTCTATCTTTATTAGGTTTTTATTAAGC:1	+	chr3R	14988623	5'	-	mdg1	7389	2	50.38
CCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTA:1	-	chrX	23182917	5'	+	Idefix	67	2	66.44
AAGCCAATTTCGGCTGCACTGAGGGAGAAAACCACCAGAAGATACACAACATTAAATGATATCCCGGATGGCCAAAGAGTCCAAGACACACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1	-	chr3R	17531480	5'	+	1360	8	2	77.42
AAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr3L	21817984	5'	-	roo	335	2	69.86
GGGCCATGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGC:1	-	chrX	22715157	5'	+	Bari1	50	1	52.78
TAAAAAACGCTCAATAAAACCACACATAAAAATTGACTAAATACAAAACATGACAGACGGCGTGCGAGTAAGTCAAGGTATGTAAACTTAATAAAGCCATTTATGGTCTATGGGCACATAAATTCGATCGCCGACGTGTGCAGACG:1	-	chr3R	8224405	5'	+	F-element	17	1	50.68
AGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2	+	chr3L	9998013	5'	-	roo	394	1	45.21
TTTTACTTTTGTTACAAGTCTACTGACTGAAATTATTTACACAGCGAAATTTAATTTAAATTTTTATTTTTTATTTTTTTTATTTTTATTTTAATTTTTTCCAAA:1	-	chr2L	355778	5'	+	Tc1	314	1	64.76
CTGCCCGGAAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr2R	21228992	5'	+	jockey	35	1	56.73
GACGGCAACACCCTGCTCCACAATGTGCTCCTCAAGCAGTATCGCGAAAAGGTGCAACGGCTTCTTGCTCAGCAGTAAAAAGGGTGAGAATCTAACATTGTATTAAATCAGAATGCTTAGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAA:1	-	chr3R	18272264	5'	-	Tc3	312	1	70.55
GTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGCAGAATACACT:1	-	chrX	1899680	5'	+	P-element	38	1	33.71
TGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTAC:1	-	chr3R	14979875	5'	+	pogo	73	1	68.28
CGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chr2R	16945275	5'	+	jockey	17	1	60.19
TAACGAAAACTTCCGGTTATTTTTTAACCAGTAGATTGAGCATTACGGCCATAAATTAAAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAAC:1	+	chr3L	21319576	5'	+	Transpac	231	2	55.97
GTTTGTTGTGGTCAGCCTTTGTAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1	+	chr3R	22821945	5'	-	mdg1	414	2	63.70
ATGCAATGCTTAAAATACAACCAATATATAGACTATCAAGTTTCATGGAGTCTGAGTAATTCGTAGAACTCATGCAAATCGAATGAATCATATTTGCAAATATCTTCGGTTTAAA:1	-	chr3R	28862202	5'	-	roo	348	2	78.26
ATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr2R	18336228	5'	-	roo	8994	2	72.41
AAAATAACTGGTATATATATTCCATAGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:1	+	chr2L	15247893	5'	+	Transpac	4966	2	54.11
AGCAGCGATGATGATCCACATGACATGAGTAATCTTTTCAGCAGCTCGCTGTTCTCCATGCGATGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	-	chr3R	12404747	5'	+	roo	8710	2	56.85
GCAGTGGGGTAAAGGGGACTACGGGTGGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1	+	chr3L	11957113	5'	+	blood	7033	2	60.18
AAACCTTATGTCTAAGATCCATTAACTCAGCAATTGTTTTTCGACTACCTCTAATGAAGATCTGTATTAGCTAAATACCCGAGAAGGATGTAAAGTAAACGATGGAACCATACCAAGCATATATATTCTTGACCAGGATCAATATC:1	-	chr3R	14555749	5'	+	INE-1	86	1	63.70
AATACATTCTGCACAACTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCA:1	-	chr2R	5198489	5'	+	INE-1	88	1	60.27
GCTAACAAACGCGGCAAGTGCATGTAGAAGAAGTTGTGCCAAAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1	-	chr2R	16373594	5'	+	Max-element	14	2	73.44
AGTGATTTTTATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1	-	chr2L	12483838	5'	+	P-element	49	1	52.05
ATTTGTGTCAATGAAAAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	-	chrX	8543574	5'	-	roo	399	1	74.42
ACGATAGCATATATTTTGCGAAAACCAGAGCACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1	-	chr3L	22968472	5'	-	mdg1	401	2	69.86
GCCAGCTGCTGTTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chr2R	14388048	5'	+	roo	31	2	62.50
TAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGCAAAATCCCAAATAAGAAGACTCTACTCGCT:1	+	chr3L	21817966	5'	-	roo	397	1	66.02
CAACTATTTTTTGAAACAAGAATCACTCATGAAATATGTTCTATGAGGCTTGTTAGGGAAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1	+	chr2L	6622900	5'	-	Burdock	230	2	68.49
AGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAATTACAATTT:1	-	chr2R	14542248	5'	+	roo	21	2	58.68
AGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1	+	chr3L	18368906	5'	-	opus	7473	2	58.20
TATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1	+	chr3L	7292447	5'	+	HMS-Beagle2	6928	2	56.94
CATTCGGCCATGCTGTCAATAGTCGAATAACCAAAATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1	-	chr3R	19529231	5'	+	jockey	4675	1	56.94
TGGGGGAAAGTCCCCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1	+	chr3R	14049308	5'	+	transib2	38	1	59.59
TTCCATTCGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCACCA:1	+	chr3L	7292426	5'	+	HMS-Beagle2	6907	2	71.53
TGCAAGTGTGTTGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chrX	3309568	5'	+	jockey	20	1	73.97
GTATTTGACGCAATTATGTCATGATACGTCATTAAAACTTTTAAAGTAATAGTGCCATTCGAACAACTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGT:1	-	chr2L	22159390	5'	-	Stalker4	7202	4	54.79
ATACGCCTTTTGGACCGGAGAAATGTGCTGTTTTTTTCAGGAATTTCTTTGATTTATTTATCTTTTTTTTTTTCTTTTCAACCATTCAGCAACAACGAAGGTTGAAAAGAAAAAAAAAAA:1	-	chr3L	10654040	5'	-	Tc3	92	2	80.00
GATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr2R	13084683	5'	-	roo	355	2	60.29
ACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1	+	chr3R	19446104	5'	+	297	28	2	65.75
GGACGGATGATAATCATGGATGATATTTACGGATTATTAGAGTGAAAATCATTTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATA:1	-	chr3L	19521855	5'	-	I-element	5287	1	64.38
AAGTCGTAATATTTTAATAGGAAGCAGTAAAGAACAGTCAAAAGAGCTAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTCAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTG:1	-	chr2R	10112440	5'	+	P-element	2554	1	28.08
TTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAAATACTTTAAACTGTTAT:1	-	chrX	17431779	5'	-	hopper2	1522	2	75.00
CAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1	+	chr2R	13585427	5'	+	412	71	2	71.85
GTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3L	22437973	5'	+	roo	42	2	56.83
AACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	-	chr2R	25118777	5'	-	roo	9010	2	62.33
AAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGATGTGTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1	+	chr3L	18555909	5'	-	jockey	4943	1	79.00
CCTTGGTAGGACTTGGGCAATCAAAGTTTGTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGG:1	+	chr2R	13817654	5'	-	412	7455	2	78.08
GTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTC:1	-	chr2R	4601636	5'	+	HMS-Beagle2	6914	2	56.07
TAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAACAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	+	chr3L	1534663	5'	-	pogo	2039	1	66.67
GCCCATTCAAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAA:1	-	chr2R	9328699	5'	-	roo	410	1	75.29
GACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1	+	chrX	13504127	5'	+	412	7076	2	66.15
TTGTACACCATAAGGAATTCTTTTGAAGTCATTCATTTTAAATTAGGTTCTCTATTTGCCTGCCTTGCTTACTATGGAGTTCAAAAATATAGGGTCAGGAAACATAAGCACAGACTAGAATCTTATCCGAATAGTCTAGCTAGACG:1	+	chr4	629271	5'	+	jockey2	3106	1	63.70
AAATAAATAGAAAAGCTTTTACATTTCCAAATGTCAACACATATGGAATTACCTTTGAAACAGATGAGAAATTTTGTGCAAAATATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTAAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAA:1	+	chr3L	17652885	5'	+	S-element	36	2	57.53
GCCTGGCTGGATGACCTCAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1	+	chr3R	11496507	5'	+	1360	11	1	72.48
CAGTCGAAGTTTATCGGACGTTAAAAAGCGATAATCCCAGACTGAAAATAAAGTCTGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCATACATCTTCGGGGTACTGCCAGCAACTCATATATTGAGATTCTACAAC:1	+	chr2R	3914698	5'	+	G4	3468	1	70.55
GAATAAGTCACTTTAGTTACAGTGTTACAGTGTTACAGTGTTACAGTTTAAGTGAGACTTCCATCCACAAATTGTTGTTAACTTTTAAATGTATAGTTTTCCCTTTCTCACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTC:1	-	chr3L	760380	5'	-	micropia	5196	1	56.85
ATGTGCGGCAACAACAGCATATGAAACAAAACAACGCAACGTTCAGTGGCGGATTAACCGAAGCCTGTATACCCTGACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTT:1	+	chr2R	23333914	5'	+	invader4	2660	1	67.89
GAGTGGGTGCTGGAGGGTGGAAAGGGAAGCCGACTTATAACCAGGAGGTATTGTACCATTTTACGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATCACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTC:1	+	chr3L	10843199	5'	-	mdg1	7324	2	51.94
ATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr2R	8585531	5'	+	roo	8733	2	65.07
GGCTTAACCAGCCGCCTCCGAGTGCGGTAATCGAAGCGTGCCACGAAAAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGAT:1	+	chr2L	9668148	5'	-	1360	3387	2	78.15
GTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGC:1	+	chr3R	19589896	5'	+	BS	5030	1	55.47
CCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGGGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAA:1	-	chr2L	21008612	5'	-	invader3	5391	2	70.37
ATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCG:1	+	chr3L	25482888	5'	+	accord	46	2	55.81
TAATAGGCATTTACATGTGGAAATTTTGGGAGCACTTGCACGCATATTAGGCTAAGCCATTCTAATTATCCTGCAGGATATTGGATAAAGGGAGGGAAATAAAAATTCTGAGCGTGCAGACTGCTTTCTTGCGGTTCTT:1	+	chr3R	31867767	5'	+	Cr1a	348	1	71.22
GATATTATATTATTCAAACGAGTCACTGATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	-	chr3R	3179557	5'	-	roo	331	2	80.47
TGTATTTATAAAATATACGGATATTTTTGGATATTTTTCATTTTCATATAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGG:1	-	chr3L	7943127	5'	-	Burdock	23	2	60.16
CGGATCTTGATTGTCGGCACACACAAACGCAGCTACTTTACCGGCATTTACAAAATTCTTCGAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCT:1	-	chr3R	21020847	5'	+	1360	3385	2	57.66
ATAAAAACAAAGTTCTGAAGCACATAACTTTTGATATCTTTCGAAAAAAGTACCATGCACATTTATTATACTAATAATAATATTATTAATAATATTTCTCTTCACACCTGGCGACATTTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGAT:1	-	chr2R	14445555	5'	-	accord	7099	2	49.32
ATGTATGCAACACACCGCACCACATTTAATGGCCTCCGAGGAGCGCAATTCGGTTTCCAGGACCTTTGTTCTCGCATGAGGCAAAAGAAGACTCACGCGACACCACC:1	-	chr2L	20137705	5'	+	jockey	4745	1	70.09
AATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTG:1	-	chr2R	6085997	5'	+	1360	408	1	58.22
TCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGATCAAGAATATA:1	+	chr3R	18346661	5'	-	INE-1	83	1	57.53
TAATGGGTTAAAGGCAGCTGGCTATGTGACTCATTAAGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGACATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATG:1	-	chr3R	13501164	5'	+	hopper	75	1	72.86
TAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTT:1	+	chrX	4205746	5'	+	FB	799	3	68.28
AATGCTAGAAAATACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATA:1	+	chr3R	27994156	5'	+	roo	8665	2	78.18
GTGATTTCCCAAATCCCATTTAAGAATTCCCTTTGTGGGAGCCAGGGATACCCAGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1	+	chr2L	15875743	5'	+	hobo	52	1	62.31
AAATTGGTTTCCGCTTGCCCATTTCTCTTTAGTTTCTATTTCGTCAGTGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCA:1	+	chr2L	16794157	5'	-	HMS-Beagle2	125	2	53.75
TAGCAGNGCACCGCGGAAATTCACTGTAAGATGTCTTAAAGCTCTCCACCAAATCTCCTCCAATAAGTTTACGTCTTTATTCTTTTGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCATATTGGATTGAGG:1	-	chr3R	846068	5'	-	297	6836	2	53.08
ATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	-	chr3R	31817533	5'	-	roo	338	2	67.81
CACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTG:1	+	chr2R	5617463	5'	-	invader1	375	2	59.59
CCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGGAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCG:1	-	chr3L	5102508	5'	+	BS	4730	1	60.27
TCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1	+	chr3R	15072532	5'	+	pogo	31	1	61.54
AGTCTGTTTGGCCAACTTTTCTGCTGACTTTTTAGACTAAAAGTCAAATATTTCATTTGGAAATTCCTAGCGACGAGGCGAGAATGAAATGTGAAATTTTCCACCAACATTTTTAATAAAATATATAATATTATTTATTTAT:1	+	chrX	4836663	5'	+	Tc3	259	1	71.13
ATGCTGCTACTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCACTTAAGAACACAAGTCCGATT:1	+	chr3R	11083847	5'	-	412	477	2	71.64
CGCTACTACAACTTCCCGTTTCACAACACCCATACTCACACTCACTACCTGAGAGAAGGAGACAGACAGCGGACAGAGAACAATTTTTGCCGTCACCAAA:1	-	chrX	22736284	5'	+	1360	3323	1	71.00
CCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAG:1	+	chr2R	3065945	5'	+	P-element	73	1	26.56
GTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1	+	chr3L	14603281	5'	+	jockey	87	1	70.55
TAACAATTTCAGTTTCTGATTGCGTGCGTAAATAATTGCCAAAACAATTAAATCATCAAGCTCTGATTAATTTACTTTAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGT:1	-	chrX	20865922	5'	+	gypsy	6985	1	56.16
ATATGGCCATAATTAATCAAATTAACACATTTTTTATACATAATTTGCTTGTACATAAATTGAAGTCGTGGTAAAATTTTCAGATCCTTTGGGAATTTAATGGCGCTAAGAATCTCAGCGTGAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTT:1	+	chrX	20108720	5'	+	1360	3309	1	73.10
GTAAACACGAGTCGCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1	-	chr2L	3886259	5'	-	roo	9025	2	52.74
AAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCT:1	+	chr3R	13237284	5'	+	3S18	5807	2	52.27
AAAATGCAGCAGCAGCATCGCATTCTTGCTGGTATAGACGGCAACGCCGACCTCCGCTCCCCATGCACCAACAACGGACATGAGGTGTTCGCCTTTCGACTCC:1	+	chr3R	30976841	5'	-	R1-2	2743	1	77.67
CTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chrX	13066604	5'	+	jockey	20	1	64.55
AGTATATACGTGTTATTATTCGACTTACTGTAGGAAAACTTCCACAGAGACCACCAATTTAAGAATTGTTCAAATGTGTGGGCGTGACAGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTC:1	+	chr3L	25498411	5'	-	Porto1	223	1	69.84
GAGAAAGGTTCTTTAGAAGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2	-	chr3L	15600379	5'	-	roo	401	1	66.44
CTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	+	chrX	5643450	5'	-	roo	9039	1	61.27
AGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1	+	chr2L	9399465	5'	+	Transpac	4945	2	61.36
AAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGAGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1	+	chr2R	11629729	5'	+	Tirant	12	2	70.27
TTCGGTAGGCAAAACATCTCGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1	-	chr3R	22276809	5'	+	jockey	28	1	76.61
CGCTAATATGTCATCATTTTTTCAGTTGACAGTTTTGGGTGGTTTGTGTGGGCGTTATGGTGGGCGTGTAGAGTTAAGAACTATGCATAATTCCGATTTTGTGAAGAGATGCAGAACAGACATGCCTCGCTTACGCGCCAGAAAA:1	+	chr2L	22173363	5'	+	invader1	3948	2	57.24
CAAAGACCCTAGAATAACAAGATGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACTGCTCTTTT:1	+	chrX	14317414	5'	+	1360	127	1	77.97
GATATTAATCTAAAATTGGGTATTCAAAGGATTTGGCGATAGATATCTACGGTGCACTGATTTAGATGTACATATATATATATACATATATATAGTTTAT:1	+	chr3L	18737803	5'	-	1731	4406	1	69.00
GTTGCCTTATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1	-	chr3L	4605744	5'	+	pogo	23	1	66.92
CGAGTACTCTTAGGAAACACTTACCTTAAAAACCTGTCAGCTACGCCTAGGCCATTAACACAGCCGCACACATCGAGAAAAAACACGCAAACAACCGCACAAAACTGCCTCGCCCACATTTTTGAAAAAT:1	-	chr2L	21691480	5'	+	INE-1	253	1	73.08
GCATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTTGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCACAATCAGTAT:1	-	chr2R	11629266	5'	-	Tirant	8382	2	69.86
AGGGGGTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGGGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTTACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr2R	11164525	5'	+	roo	8684	2	62.40
ACATTCCATATGCAGACAATTATTTTTTATGTTGTGGCAAAATAAATGATTTTTTGATGACCGAAATTTGGAAAAACAGACTCTGCAAAAATGTTGATATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1	-	chrX	13057302	5'	-	Tabor	461	2	52.74
TGCTATTAAAATATTGCTGGTTTTCTGCTGTTATAGAATCATTTTTAAAAGTGTAACGTAAAAAATAAAATAAAACTAGTATTACTATGATGGCGGACAAAATCGTTTGGGATGGGGCTCACGTGATCATCGTCACCATG:1	+	chr3R	6863396	5'	+	Rt1a	4715	1	57.86
CACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACANATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1	+	chr3R	22822000	5'	-	mdg1	7397	2	60.96
ACTGTGGACACTGTCACTGTCGCCATGTAAAATGTTAATTTTTATAAGACTAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTATTAATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAGGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCT:1	+	chr3R	3177914	5'	-	Stalker	282	4	82.88
GAAAATACAAAGCCGTGAAAAGCCTCGGCCAAAGAAAATGCAAATTGCAAATTCGAGATTTAATTTCGTTAGCAAACAAAGAATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1	+	chr3R	20499729	5'	+	mdg3	42	2	56.85
AGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCC:1	+	chrX	21772499	5'	-	gypsy3	6567	1	67.57
ACTTAGAAATATTTTAAAAGTTTCATATAAGTGATTGAATTTTTTATAAATTCGAAGTCAATAGGTTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTACATGAATTAATTTTACTCCA:1	+	chr2R	24561416	5'	-	P-element	188	1	51.37
GGGGGGGGTGGTTGTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGCGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chrX	10640123	5'	+	roo	8685	2	56.52
ATATTACTTTATTTGCGCAGTCAAATTTTGTAAAGATTTTCCTTGGCTCTTTCTATTCCTATTGAATTTCATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACA:1	+	chr3L	2325159	5'	-	I-element	5212	1	54.79
AAATATATACATACATACATATTGTATGTAGTTGTTTTTAAAAGAATCGCAAGCAATAGACATGAGACCAAGAGTCAAGACTCTTGCGTTGCGTCTATGTTTCTAGGATCTGTAGGCCTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1	+	chr3L	101059	5'	-	INE-1	159	1	51.37
CGGTGAATTCAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3R	7835229	5'	+	roo	8686	2	65.29
TGTGGAGCAGGCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1	-	chr3L	25401037	5'	+	Doc	32	1	54.79
GAAAACTCGTAAAATCTCGGAAAACCCGCAAATGCTCGTCGACTTCTGACTCGAGGGGTTCTTGAATTGCGCTCGAAGTATCGAACAACATTGAGCGGGAAAAGAAGCATACGACCATATCCCCGTTAGGAATA:1	+	chr2R	14481303	5'	+	invader3	64	2	71.64
GAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1	+	chr2L	14081293	5'	+	1360	32	1	58.14
GTAAGTGCCGCTGACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTA:1	-	chr3L	20168450	5'	+	mdg3	5316	2	58.90
TAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	+	chr3R	18339057	5'	-	roo	9039	1	61.64
CAGTAATTCTTCTCATGTTAATAGTTTTTATACGCCTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCATTGCAAAGTATGTAATATATATATTAGTAATCTATAAGTAATCAGGAGCAATAGCCGAGTCG:1	-	chrX	14815836	5'	+	INE-1	93	1	74.05
AAATTAAGCTATGAATACTTAAAGTAACTGAAAGTCCTTGCTCGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTC:1	+	chr2L	22393170	5'	-	Rt1b	4929	1	74.40
ATCATGCCGTGTTGTGGATTTTTGTTCAAGTTGCTTAATTTCATGGCAATTTATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1	-	chr3L	16769321	5'	+	FB	71	1	69.18
CAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1	+	chr3L	14603290	5'	+	jockey	95	1	76.55
GTAATAGGTGAAAAATTCAATGAATTCATGGTAAGCTGAGGTAATTGTGAGGGAAGGTGGATCGGTGGAGTCAACCAAAATAGCTGCCAAAAGGCGAGACAAAATTGTTATATTGTTAATTGTTATATTTGTATTATTGTTTTGTT:1	+	chr3R	9475847	5'	+	BS3	1656	1	69.18
GTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	-	chr2R	21920570	5'	+	jockey	74	1	73.68
CAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1	+	chr3R	12618592	5'	+	F-element	42	1	50.39
AAACTGATTATTTGGATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTG:1	+	chrX	20870084	5'	+	gypsy	40	2	55.48
CAAGCGCAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCGACAGACAACCGTTA:1	-	chr3R	12477411	5'	+	invader1	3690	2	90.58
AACTTGGTTTTTATTAACTTTGCAAAGTATTTTCTGCCAAACCAGAATTTCTACGGAATTTACACTCTTCGAGGGCTTTTCTTTTTCTTTTCTTTGCTTTGCCCTTCCCTTCCCTTTTATTTTTGTGTTATTTTTGTCTT:1	+	chr3L	2688651	5'	+	S-element	282	1	57.14
ATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	-	chr3R	31817564	5'	-	roo	9042	1	64.96
CAAACTTTTCGCTGCATTTCCTTCCACTAACACACTCACAGCCGTGCTGTGCAACGCTTGTGTATAATTTCGGTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1	-	chr3L	22346627	5'	+	jockey	4757	1	64.66
CGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1	+	chr3L	22400295	5'	+	1360	51	1	74.26
TACCTAGCTGCTCTTTTACGTATTTGCCAAGACTTAATTGAAAAATGTTTCCCCGTATTTTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTAT:1	-	chr3L	10056207	5'	+	transib2	55	1	55.48
TTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1	+	chrX	3308327	5'	+	hobo	64	1	73.50
ACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	-	chr2R	16785409	5'	+	412	47	2	63.48
AAGCAAATGCGAATATTCAATGAATGTATTGTTTACCTTAATAAGCTCAACAGGTAATAATTTATTTATTATGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAAT:1	+	chr3L	18732137	5'	-	X-element	4664	1	55.74
ATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1	-	chr3R	11496614	5'	-	1360	3340	1	58.14
GTATATATATTCTTGATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAACA:1	+	chr2L	21930797	5'	+	INE-1	147	1	68.22
AACCACTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGGCTCTTCCATTCATTTATTCACTGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGC:1	+	chr2L	21325090	5'	-	invader4	3043	2	63.57
AATTATAGCCTGGTACAAACAGATAGTGTTAGGTCTATACATGGGTGAAAGGGGGCGTGACCAGTGTTTCTGATTTACAGATCAAAATTGGCAAGATTAACAATAAAACGAAGAAAAATCCAAGCATTTTTTAAAAGTGTGGGCG:1	+	chr2R	5436938	5'	-	INE-1	255	1	68.97
CCTGCTCATTGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr2L	3114454	5'	-	roo	9033	1	58.90
AACATAGCCTTAATCTTAGTTGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTT:1	-	chr2L	5845082	5'	+	transib2	58	1	58.22
CGGATTTAAAACCGGACGATGAAAACAAATGTTTCATTTGTAAGGTAATTTCTCAGTTTGCTTCCGATCACTTTACGCTGAGATAATTTCGACATTCCACACTCGGTAGCTGTGTAAGGGGTATCTGATAGTCG:1	-	chr3L	19651436	5'	+	INE-1	550	1	52.99
GGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	+	chr3R	17817907	5'	-	roo	8992	2	74.65
ACAGGGAACGAAGTTGCTCACTGCTAAAGTGAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3L	10292941	5'	+	roo	8686	2	70.55
GATCAGCACCGATGGTAATGACATTGAACCCGTGCTGGCAGATGGTTTCTTCTTGACCTCCGCGGAGCGATTTGATTTCGTTTTGGAAGCTAATCAGTACAAGAAAAACTATTTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGATTCAAGA:1	+	chr3R	25898533	5'	+	baggins	5071	1	77.40
TATGTTATATTAAAGTTGAGATCTTTAGCTAATAATCAGATCATTTACCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGT:2	+	chr2L	524196	5'	-	mdg1	7385	2	67.81
TTTACACTCTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	-	chr3L	19334358	5'	+	roo	8710	2	55.48
AGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	+	chr2R	9632098	5'	+	roo	64	2	62.33
ATACAAACAATAAAACAAATATTACAATTAACAATATATCCATTTGAAATCATCTTCAACGCCTGGCTCTCGTCAAGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCTGCCTCCTGTGCAGCCTTCTTGGTGGGCGAGCTCTGGATA:1	+	chr3R	28792778	5'	-	BS3	1533	1	79.29
GTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	+	chrX	5643447	5'	-	roo	9038	1	61.64
GGTAATGGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATCTTAACTTATGGC:1	-	chr3L	10773164	5'	+	412	7093	2	53.49
ATATATATAATGGAATATATTCCATTTATAGAAGATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTAAAATCTTTTGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	-	chr3L	7476279	5'	+	roo	8707	2	48.97
ACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTGC:1	-	chr3L	19339424	5'	+	Tc1	75	1	63.45
GGCAATGCGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTCCTAAAAACTACAACAGCAAAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1	-	chr2R	5031021	5'	+	Doc	88	1	68.28
ATATAAAAGGAATTTAAAATCGTATTCGGTAAATAAATTTATTATTTCTACAAATTCTAAATTAATATGTATATAATATGTATATGTTATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAG:1	+	chr3L	19339306	5'	-	Tc1	1614	1	56.16
CGTTTTCGCGCAATATTATCGCTTCTCAAGTCGATAGAAATTTACAAGACCAATAAAAAATTGCGAAAAAATATCAACTCATTTTTCAAAAGTG:1	-	chr3R	3752606	5'	-	INE-1	261	1	72.34
GTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	-	chr3R	14364696	5'	+	roo	8727	2	62.33
CGATGGGTGAGCTGCGCGTTCGGGTATTGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGCGTAATGATGAACTCCAATTAAGA:1	-	chr2R	24218649	5'	-	412	491	2	78.57
ATAGAGAGACGAGCTCTTAAACGCCCGCAATCCAACTACCAAATGGAACAAGGACCAGAGCGTAGGGATCGAACAGAGATGAGAGCCTATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTG:1	-	chr3R	17289065	5'	+	roo	8900	2	69.67
ATTTTCTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1	-	chr2L	14081440	5'	-	1360	3364	1	67.81
GTTTGAATTTGGATAAGTGATGCGATACTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTCGATTCGTTGTAAAGTATGTAAGAGACAGAAAGAAGCGTTTTCTACTATATAAAGTATATACTCTTGATCAGGATCAATA:1	+	chr2L	21710801	5'	+	INE-1	84	1	65.75
ATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr3R	25448333	5'	-	roo	350	2	56.85
TGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGGAGTCGCGG:1	+	chr3L	14603262	5'	+	jockey	36	1	53.04
CATTTTCATTTTCAACACAAAGTTTTGTTTTATTACCCCGAGGACACGAACAAGACTTTGTAACTTACAAGCCAAATAACAAGTTGGCCCGGCCGCCCGGAGGAAAGAAAAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGAA:1	-	chr2L	4783996	5'	-	diver2	231	2	78.08
CTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chr2R	19050206	5'	+	roo	80	2	71.23
ATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr3R	17817964	5'	+	roo	8745	2	75.17
AACACGATGAACAGCCCAAACAATCGGTTATTATCATCCTAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAAT:1	-	chrX	21349269	5'	+	pogo	1771	1	70.68
AAACAAAGGAGCACGCACAGCATGTGGTACCCACATATGCATTCAATGTCCTTCGGTCGCTGTACACAAAAACCGAAACCTATAAATGCACTCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1	+	chrX	9764377	5'	+	1360	74	1	72.00
TTCGACTATTTCTCTCAGCTATATCTACATATATGATTCCATTCCGACTTATATTCTAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTCATTTCCTAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGCT:1	-	chrX	23015584	5'	+	Tc1	72	1	59.59
AAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr3R	16076786	5'	+	roo	8733	2	66.44
CGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1	-	chr3L	17205264	5'	+	hobo	30	1	67.82
ATGGGTAATCTAAATAGGAATTGTGTACATTTCTGTGAACGTTTTGTATTGCTCGAAATTTTTAAAAGAGAATATGGAAGATTTAAGGCAAATGCATTTCACTGCACAATGAATTTTTTTTATTTTATTT:1	+	chr3R	19224719	5'	+	transib1	1897	1	72.31
CGGATGCTGGCTGCTTGGGTGAAAGCACACGAAAATGATCCATTTGTGTCCTTTGAAGGGGATAAAAACTCAATTACACTAATCGGTCATCTATTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTC:1	+	chr3L	17353894	5'	-	HMS-Beagle	161	2	76.67
TAGGTTTAGTAAAATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTT:1	-	chr3R	20469683	5'	-	roo	351	2	57.97
GAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	+	chr2L	544786	5'	+	412	7093	2	56.36
AAATGTTATTCTGCCAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTAATTCGTTTATTAGATATT:1	-	chr2L	22224623	5'	-	Rt1c	5416	1	65.75
AGCGGCGGATAACAACAGAGGCGAAAGGTGCAAATAATGCCAGGCACCAAAAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1	-	chr3L	917230	5'	+	hobo	11	1	74.81
GTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGGTT:1	-	chr2L	16016394	5'	+	412	7125	2	71.64
CGCCAGTTTCTTGTTCCTCCACTGCAAGGATCCACTGCTCGTCCTTCCTTAAGTCAAATGACTTAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGTTGACAATTGATCAAAAATAATATAGATTGAAAGTCTAAGAA:1	+	chr3L	27130677	5'	-	1360	240	1	56.16
AATTAATAGCAATATTTATAAGAACTTAATAAATTGAAAAAAATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATT:2	-	chr2R	4774808	5'	-	baggins	5404	1	69.86
TTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGCTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGCGCACATCGGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	-	chrX	14336527	5'	+	roo	4	2	73.58
ACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1	-	chr3L	20888815	5'	+	1360	27	1	60.00
CCGAGGGTTGTGCATTTAGCACTGTCAAGGTGCTCCTGCCCGTCTGGTGGGTGCTGTTCCTGGTCTTGGGATCGGTTCTTCATTGGGAGGCAAATATGCGATTCTGCGGTAAATCATATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAC:1	+	chr2L	8226291	5'	+	1360	3120	1	77.93
CAACTTTGTCGCGACGGCACCCGGCGTAGCAGCTTTGTCAGCAAACTCAAGCTTGCGCGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTT:1	-	chr3R	3194279	5'	-	1360	3218	1	59.62
CTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTGTT:1	+	chrX	21669996	5'	-	Stalker2	348	2	56.30
GGGCTGAGACTTGGGGCAAGAAGGGCGGAACTACGGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1	+	chr2R	5248203	5'	+	1360	34	1	59.59
AAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1	-	chr2L	17079838	5'	+	jockey	4693	1	60.00
AACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1	-	chr3R	17605729	5'	+	Tabor	65	2	59.59
CAAGGACACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1	+	chr2R	9791538	5'	+	412	20	2	72.41
AAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1	+	chr3R	12618593	5'	+	F-element	44	1	49.22
TCAGCAACGAAAATCCGACCCGTTCGCAGAGGACAGTCTGAAGTTATAGCCGAGACCAAAGACACTAAAAAAACTCGTAACTCCATTCGATTCTTTTGCACACGAAATTTTTGTGCTGGCTCTCTCGAATTTTTG:1	+	chr2L	20117381	5'	+	1360	82	1	48.15
CATCCCGCACTCCTTTCTAATTATAATAATTAATTTGTTTTCTGTGTCTTCGTTTTTGCTGTTGTTTTCGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCG:1	+	chr2R	24440408	5'	+	F-element	248	1	74.49
CAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATCGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATC:1	-	chr3L	17115510	5'	+	blood	82	2	75.56
ACTGGTATACTGAAAAAGAAGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCT:1	+	chr3R	13237270	5'	+	3S18	5807	2	56.85
GCTTCATTATGCATTTCGCTTAAACGTTCTCTTAATTCTGTTAAAAATTCTTTCTCAGTATTTGGTTCTTCTAGTTCTGGCCGTTTTTGTTTAGAGGCGTGGGGGATTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCG:1	-	chr3R	4068948	5'	-	Tirant	8108	2	69.77
AAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr3L	233317	5'	-	roo	330	2	73.29
GCATGTCCATTAATCATGCAAGTCAAACATGAACGAGTCAAATTGATTGGGGTTTTCAGGATCGGGTATCGCTGTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAG:1	-	chr3R	9351352	5'	+	17.6	238	2	58.14
GTTCGGCACTTTTGCATGCTCGATGCCCATTACTCATGGCCCCTCTGAACATTGTCCTGGCCAGTTAGTCCTGCTGTAGTTGCTATTGCTTGGCCGACATCTTGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCCAT:1	-	chr3L	7289634	5'	-	HMS-Beagle2	5	2	67.83
ATAGCATACTTTTGGGCACAAGTGGTTTTAGTATCGAATTCATATATGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATTATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATT:1	-	chr2L	6579161	5'	-	jockey	4825	1	67.12
ATAGAATACAAAAGAATTTAACTCTTTACAACCACGAGGTCAAACCAAGTCAAAAGTGTAGCACATATTCAGTTGAGCCAAAAAATAAAGCTTTTTTTTTGTTTAAAAAAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCT:1	-	chr3L	27357524	5'	+	Tc3	1617	1	66.44
AACTTGAGGGGGGAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTCGCTTTGTA:1	-	chr3L	25810383	5'	+	gypsy	28	2	52.99
ATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1	-	chrX	23280948	5'	+	roo	4	2	47.83
AGAAAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGC:1	+	chr3R	13237289	5'	+	3S18	61	2	56.85
AGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTATTGTGTTTAACGGCAGTGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGTCACAAGATTT:1	-	chr4	158193	5'	-	gypsy	7230	2	67.86
TATGCTGAGCGATACCTTTGTACATCGCTTGAAACAATCACAATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCTAATTCC:1	-	chrY	3605095	5'	+	I-element	4972	1	68.12
TTTCAAAGGTAAACACGAGTCGCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	-	chr2L	3886267	5'	-	roo	9033	1	58.22
TAAATAGGAAAAAGATTTTACCTCTTGAGCAATAAATAGGTTTAGTAAAATAAATGCCTAGATTATGTGTTTATCAGTCATTAATCCTAATTAATTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGATAC:1	-	chr3R	20469719	5'	-	roo	9043	1	59.59
TTTCAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr2L	18294312	5'	+	roo	35	2	58.57
TAAGAACTAAAGACGTAATCTGTATTATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGCCAATGCTGACCCTCG:1	-	chr3L	17555637	5'	+	jockey	4710	1	39.44
ACATACGACACAGAATTGGGTTTGGAGTGGGAGTTGAGTTTATATAAGATAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	-	chr3R	17316320	5'	+	opus	32	4	61.62
CTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGTGATAAATTAT:1	+	chr3L	23635041	5'	+	roo	69	2	69.57
AAATGTATACTTTTTCCGGATAGAGCTGTCTAGAAACCTGTTAATTTTTTTCTTTCCAAATCTGTATTCGGTTAATTTTAATAACTTGTCCAGTTAAATTTAAAACCAGAGAGAATGATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1	-	chr3R	7040270	5'	-	INE-1	560	1	31.72
AACCAAATATGTAATAACAACATAATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:2	+	chr2L	8986077	5'	+	412	19	2	71.23
TAAGGCAAAATACTAAGTTTAAATTTGATGTGCTGCAGAAGGTAGCGTTTGAACAGTTAAAAGTAGCATTAACTTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1	-	chr3L	23866748	5'	+	copia	48	2	56.16
TCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTG:1	+	chr3R	14049342	5'	+	transib2	72	1	65.75
AACTAGTTTGACTGACAGTATAAACCACGACGTGACCCAACTAAAGAAGTGGTTGGAAGCTCTTGGATGCCAGACTTCCGCCACAAAAGCGGAACTAATAGTGCGTCTGCAGGCCATTTCCCCAG:1	+	chr3L	28092614	5'	+	invader3	426	1	73.60
AGTTTCCTTTCCTTTTCATTTTTCTCTTTTACCTTCAGGACCAGGTGTTCTTCTAACCACTTTGAATAAACTTGTGAGGAGTTTTAAAACTCCCCATAAATCTCGTGT:1	+	chrX	2550488	5'	+	gypsy8	4664	2	60.19
GACCCTTGAATTTCATCAAACGATATTATATTAAATAAACTGAATAAAAAAAAA:1	+	chr3L	10043799	5'	+	X-element	4719	1	94.44
AAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATAACCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGT:1	+	chr2L	15247922	5'	+	Transpac	4995	2	72.60
TATAAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAATGACACTAGAATAACAAGATG:1	-	chr3L	16015378	5'	+	1360	3	2	76.43
CGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCACCAACCAC:1	+	chr3L	25482866	5'	+	accord	17	2	68.85
CCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chr3L	9998182	5'	+	roo	53	2	66.12
CGATAGTGTTAATACGAAACTGTAAACATTGCAGTGGCAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1	+	chr2R	20899888	5'	+	hobo	65	1	74.80
AAAAACAACATATAAGGCCCTGTGGAGACTATGCTCTAACATTTTAATCGAATTTTAAGTGATACCATGGTTTGTTTAAAAGTATGCAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGTCTATATATAGTGTATATATTCTTGATCAGGATCA:1	+	chr4	1123362	5'	+	INE-1	81	1	53.42
CGTGTTAGCTGTCAATCAAAGTGGGAGCACTCATTGTTTTTTGAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTAT:1	+	chr3R	25423142	5'	+	3S18	4	2	80.00
ACTCATAATAGGCACTTTCTGCGTAAATATATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1	+	chr3L	11321384	5'	-	mdg3	226	2	61.29
GAAGACAAAAACGTGAAAACATAATAAACTCTATCGAAATAAAACTAAAAGAAAATACAAAATGGATCATCATCATCCGAATCCGAGTCGTTATCATCGCTTCGTAAAAAATGTTCATTATTAATATGTTTTACATTTGGTGCATC:1	+	chr3R	1966481	5'	-	transib3	2494	1	60.27
TAACGAAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGC:1	-	chr2L	6623070	5'	+	Burdock	29	2	65.75
GATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:3	+	chr3L	16245410	5'	-	roo	8992	2	72.60
ATCAGGCACCTTTGCATTTCTCCAGACCGCAACCGCAACCCCCTGACACCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr2L	7945466	5'	+	roo	8675	2	76.71
ATCTATATAGAATTCTATTATGATTGAATATGTTGAAATGATATAGAAATCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1	+	chrX	8347579	5'	+	412	71	2	67.12
CTTACACTTAACGAATTCGGGCTGAAACTGATACATAATATATATATATTCAAATAGATAAAAGTAGGGTACTTTTTATTCTCAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACCGCGCTAATC:1	+	chr3R	18418304	5'	-	rooA	165	2	62.39
CCGGAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATA:1	+	chrX	21016729	5'	+	Transpac	4919	1	78.10
CGCTTGCAGAGCTTTGAATTGCATTACTTTTTCGTATCCCCACATTTGCAGCAAGTATAGATTCATCAATCTTCTCTAATCATCCAATTTTTCCAATCTATTATGTGGAGTATTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATT:1	-	chr2L	7029932	5'	+	accord2	7275	1	77.40
AAAAGCGAACGAATTCTGCACCCCAAATGTAATGACCTATAAAAGGCACAACATGACAGTTACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1	+	chr3R	21434871	5'	+	412	7112	2	58.22
GTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	+	chr2R	15004758	5'	+	jockey	36	1	47.10
AAATTCAGTTTTTCATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGCGCTGCCATATATTTATGCAATTTCTCCTTT:1	+	chr2R	16785332	5'	-	412	426	2	57.53
TCTATAAAATTCTGGACGACCGACGCGTCCACGTTTACGATCTTTTTCTTTGTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGC:1	+	chr2L	23067827	5'	+	1360	3313	1	62.33
AGTGCATTTCAGCGAGGGCGAAAAAAAAACGAGAGAGGTAAAGGAAAAAGGGTAAGGAAAAAGGGATATAAACTATATGGCTCTGCCTTAGAGACCTTCTTTCTTTTTTTTCCATTTTTTTTTTT:1	+	chr2L	10046886	5'	-	Doc2-element	231	4	85.60
ATTAGCGCAGGGAAAAAGCGCAGCAACAACATCATCAAATATCACACAATGCACATTACTCGGGGAAAAAGCAAAGAAAGCATGACGAGGCAATGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCAAGGCGAAAAA:1	+	chr3L	21715892	5'	-	1360	56	1	74.81
ATTATTTGGATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGC:1	+	chrX	20870090	5'	+	gypsy	46	2	52.74
TTTTAAACAACTATGTATGTTTGCCAGATTCGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGA:1	+	chr3L	16750677	5'	-	Tirant	8417	2	81.51
CGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1	-	chr3R	10182194	5'	+	blood	7081	2	70.15
AATCTAATAGGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCGACCATATAATCAAATATATAAATATATATTTTTGATCAGGATTAATAGCCAAGTCG:1	+	chr2R	5705574	5'	+	INE-1	93	1	69.18
AAGTAAATTACTCCATTGATAGCCATCGGCACTAATCCGCTTGGTCAAAGTATCTTTCTCGCTCGTTCTGTGCCCAAGATTGGATACAATTGCAGCCCTGAACCCCAATTAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTTGAC:1	-	chr3L	2430412	5'	+	baggins	5347	1	60.00
TCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr3R	17420510	5'	-	roo	355	2	59.85
GTATGAATTCAAGAAAAATACCGTAGTCAAAAGCGTAAAGCAAAATACAGAATACATATGTGGACACTATAATTTAGGAACAGAATCCATAATATCTGTTAAGCTACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGA:1	-	chr2R	4336351	5'	+	G5A	2796	1	57.78
ACAAACTAAGGAGTTATTCAAGACGCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1	-	chr3R	15364043	5'	-	flea	220	2	62.33
CCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1	-	chr2L	1665030	5'	-	hobo	2902	1	70.33
CTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACAACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCT:1	-	chr2L	6623059	5'	+	Burdock	6176	2	58.22
CAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1	+	chr2R	2016846	5'	+	1360	12	1	58.57
CCATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGAA:1	-	chr2L	18339056	5'	-	pogo	2027	1	69.86
GAGGATCATTTTGTTTGAACAACCAATAATGCGACTGATTTCACAGTAGGTTATACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAATGGTTCGACGGTACAATGCTTTCCGCGACCCATGACTAGAGAATATTTGGTCTTCGTTTGGAAC:1	+	chr3R	22731888	5'	-	Tc1	328	1	82.88
AAGAAAAGGTTTTAAGGTGATGTCTACAGAATGCTGTAACAACAGCATTTTTTAATAATACAAATTTTAAACTCTAAACTATTTCTCACTTTAATGGAGTGATATTATAATTTAATAACATTTTAAATAAAATTTTTATAAGTTTT:1	+	chr2R	17995218	5'	-	HB	327	1	76.71
CCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCA:1	+	chr3R	13237302	5'	+	3S18	5837	2	65.28
TTAAACAAAATTATTGACTAGTTAAACATAATAAAACGATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr3L	233368	5'	-	roo	9045	1	67.12
ATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCA:1	-	chrX	21014833	5'	-	copia	170	2	77.40
ATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAACAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAA:1	-	chr3R	11547787	5'	+	G2	319	1	50.74
AAAAATTAGCAACAGAAGAACCAACTCTTCAAACCCTTGGTTAACACCATCTGCACTGGCCCTTTAAATGTGTTCTCATCATCTACTTCTGGCATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATAT:1	-	chr3R	834386	5'	-	Bica	4883	1	67.65
TTTTAAATTTTTTCTCATTTTTTTCCCAATTTCTATCCAGAAAATATCAAAAAAATGATTAATTTTCGCGCTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTG:1	+	chr2R	12202638	5'	+	INE-1	558	1	69.75
AATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCT:1	-	chr3L	8249097	5'	+	jockey	4584	1	73.45
GAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	-	chr3R	22844273	5'	-	roo	391	2	57.61
ACGTAATACAATAATAAAATAATAATTAATTAGTTGCATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAATTGA:1	-	chr2L	22575671	5'	-	Quasimodo	7288	2	80.82
CCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chr3R	18582269	5'	+	roo	33	2	60.00
GAAGTCAAATTGGAAACCTATCTGTCCGCGGATAACGACGTTCAGCAGATGGTTACCACTCTAAACAGTAAGTTAAAAACCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATG:1	+	chr2L	11519202	5'	-	412	192	2	51.37
ACATGGCCAGCGCGAGGCGGTCAATTTAAATAATACTGAAAAATAGTTCTATGATAATAATGCAATGGAATATGTATACGTACCATTGGCGGGGGAAACAACAGAATCACTCTTATAACC:1	-	chrX	9469537	5'	-	rooA	478	1	66.67
TATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:2	-	chrX	22511439	5'	-	1360	3351	1	54.79
TTATTATTTATTTAAATCCGGAGCTTCTAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCCGTGGAGTCCGGGGTGCAGAAGAGTATTTTTTACGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTG:1	+	chr2L	22744985	5'	-	Gypsy6A_LTR	262	1	77.24
ATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGG:1	-	chr3R	11547785	5'	+	G2	280	1	70.53
ATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCT:1	+	chr2R	5485120	5'	-	blood	7318	2	68.49
GGCAACTGGGCTCAAATGTTGCCGCAGCAGCAGAACTTTAATAACAGCGACGCAGATTGAGTTACAAACAAAATAGAATATGATAAATTCTACACAATTTTGTTTGCTAAAATCGCCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATT:1	-	chr2R	11835236	5'	-	1360	2966	1	66.44
CGGCAGTGGGATCGCTTCCGGCATTAATTTCTTTAAATATGACAAGCTAGTAAGCTAATAAATGAAGTGAGGACAGTCCTAGACGAACTAGAAGCTGTCAGCAAACTAGACCTTAATGACACACGGGAAAAAC:1	-	chrX	22371804	5'	+	baggins	5094	1	38.35
AGTGGAATATAATAAATGGGTACCGGAATACAAAATATAAATTTAAAGAGTGGGTGTTGCAACATGGGTCAACAAACTTTACTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCCAC:1	-	chrX	22906119	5'	-	INE-1	145	1	58.22
AGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGGACACAGCAACACTTAG:1	-	chr3L	20033782	5'	+	blood	37	2	47.58
GATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr3R	25448440	5'	+	roo	8722	2	59.59
TGCCCCACCTTCCTATCCTGAATTCTGCTGCTCCTTGGTCAATAAATTTGCTCTGCGTCTATGTCTCTGAATCTGTATGCCGAATCTCAACCTTCTAGCTTTAATAGTTCCTGAGATCTCGAAGTTCATACGGACAGATGG:1	+	chr3L	3888338	5'	-	INE-1	127	1	75.89
CGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1	+	chr2R	23266043	5'	-	mdg1	336	2	75.34
GGTAATTAAAAATTTATGTTCTCAATTTGATTCGGACTTGTTCATGATCTCTTTAAGTCTTATCACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAAT:1	-	chr2R	916576	5'	-	micropia	82	2	56.55
ACCGGCGATAAGGGGGATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1	-	chr2L	19965086	5'	+	Doc	48	1	57.53
CGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:1	+	chr3L	24213783	5'	-	invader2	180	2	69.92
ATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACG:1	-	chr3L	23702252	5'	+	G4	56	1	56.62
CTATACCATCCTTAAACACAACATGCTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1	-	chr2R	16785439	5'	+	412	6	2	73.08
CCATGCATCCTGCTCGCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGGGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAAC:1	-	chr2L	21008637	5'	-	invader3	253	2	63.39
CAAAAATTTTAAAATTTTTAAAATTTCCATTTTTATACACAGTTCGATTAGGAATTTGAATACGAGCTCAACTAGATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chrX	14401620	5'	-	roo	9047	1	58.06
CTTTCAGGCGTTTCTGCCAATCAATAGGTTACGGGCTCAGGCATTGCAATGCATTGGAGAAATTACAGTGGGATGTGTGACTCTCGACTAAAAACAATAGAATAGGCAATAGGCAATGCCCACATGTATGTTGAATATAGGCAATT:1	+	chr2R	2962611	5'	+	1731	25	2	67.12
AGCCCACAAGAGCAAGAGTGTGTTCACGGACAGTACATATGCATATGTATATGTATGCAT:1	-	chr3L	3142834	5'	+	Stalker4	244	4	81.67
GATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	-	chr3L	233331	5'	-	roo	9023	2	59.54
TTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1	-	chrX	23155232	5'	+	blood	87	2	77.54
AGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTATGCACTATGCAGCCCCACTTTTTTGGTGACAATCAAAATTGCCCTATGTCCGGCTCGCTTACGCTAAGAGCGGAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAA:1	-	chr3R	1202714	5'	-	1360	3257	1	80.82
TAAAAAAACCATATCTAAAAATAACTCCACTTTTTTTAAACGCCTTCGCAATTAACAAGCAAATAGACGCATAAATTAAAGGTAAAATTTACTTACATATATGAAATTAAAGTTATCAAATAGAAATTAATAATAAACAATAA:1	+	chr3R	17129162	5'	+	flea	237	2	56.64
AAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	+	chr3R	22844205	5'	+	roo	83	2	75.34
CGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1	+	chr3L	21855440	5'	-	blood	7350	2	52.94
TGGCTTNTTGAAGTTTCCAAGTTGGTGGAAGAGAAGCCCAGAGCGAGAGAGAGGGAGTTTTACTAAGCTGTTGTTTTTGCACAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1	+	chr2L	12483706	5'	-	P-element	2875	1	71.43
CAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1	+	chr3R	25448340	5'	-	roo	343	2	61.64
AACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	-	chr2R	13817722	5'	+	412	47	2	55.81
CGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1	-	chr3L	22400365	5'	-	1360	3334	1	54.79
CAAGAAACAGTTGGGAAAATTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:2	+	chr3R	10462561	5'	-	opus	7487	2	72.60
TATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTT:1	+	chr2R	20596435	5'	-	roo	372	1	57.75
ATCAACAACTGCAGAAACAACTAGATCAACTATAGGTGGTACTATATGCGGTAGGTGCCCGGAATCGAGTCGTTCAGGTGGAGATTTTTCGGGGGAAAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGCTTGCTAAGC:1	+	chr3R	13527877	5'	+	Quasimodo	7228	2	72.93
AGAATACACACACACATACTCATCATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTAGCACTCTACGTCCACCCGAT:1	-	chrX	3308385	5'	-	hobo	2917	1	56.57
TAAGAAAAATGCTCAACTGATAAAGGGTGAAGCACCAACACACTCGCATACTCTCACACACACACACACACACACACACATACATACGGCG:1	+	chrX	6601607	5'	+	accord	258	2	75.82
TTGCACATCAAAATGTACAATTTGATTCCCAGAAAGGGCATTTCAATCAGGTGTTGATCAGCGAACATTTCAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGCGGGT:1	+	chr3R	12852708	5'	-	Quasimodo	6956	2	57.36
GACTGTTCCTTTCCAGGTCAGAGAAAGCCTCAGTCACTGCTAAGTTTGGAATAATTCTCTCGTACCAATTTTACAAACAAAATTTAGTAGCCTGTATATTCTTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGT:1	+	chr3L	27863357	5'	+	INE-1	113	1	54.79
ATACCCTTAGCCTGTTTCGAATATTGGGTGCCATTGATTAGGGCTAGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAA:1	+	chr3L	23603120	5'	+	F-element	40	1	59.59
TAGATACTTAAAATTGTTAGTTTTCATGAGAGCACATATTATTTCTCTCAGTGCCTGGCTGTAGCCACAGTTAAGCTCGGTCCGGGCATAAATTGTAAAAGACTCATAAAAAATATGAAAAAATATTAACACATTTTTCAAAAGTG:1	+	chr3L	17123553	5'	-	INE-1	261	1	60.27
GAAAGAGGTTGGAAGAAATTGAATTTCTTTTGCACTTCCAGACGCCCACAAGTCGCAACAAAAAGAGGTTGACTACATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1	-	chr2L	1665075	5'	-	hobo	2918	1	65.00
TATATACCACTTTACATGTTTTGGTTGTGGAAACGAACCCCTGGTGATTCACCAGGAGTTCGTTTCCCTATAAAGCGTATATATGCTTGATCCGGATCAATAG:1	+	chr4	634288	5'	+	INE-1	85	1	43.69
ACCTAGACCTTTGGCTTAACGTTTTGCTGTTCACTCTGTCATTAAGTCGCGCATTAACATTCGTCTCTACGGAAACGCTTAGTCCCCCCCAAGGACAGAGAGCGTGCTCTTGCTCTCC:1	+	chr3R	2404383	5'	+	Doc4-element	119	1	54.24
AATGCATATTCATAAAAAAAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1	-	chr3R	28075444	5'	-	jockey	4971	1	67.12
GTATAAATATTTCTGATGACTTAAATGCCTGTAGATGTTGCACTGATTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTC:1	-	chr3L	12159802	5'	-	G2	2924	1	68.49
TTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1	-	chr2L	15833075	5'	+	hobo	49	1	63.03
AGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr3R	11496560	5'	+	1360	53	1	79.59
AAACAGAGAGATAAAATAAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr2R	18336100	5'	+	roo	14	2	72.92
GGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTATTTTGTTGACGGCCAAA:1	-	chr3R	11496620	5'	-	1360	3329	1	56.16
ATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCTGTCGGGCTGACATATATTTAT:1	-	chr2L	544863	5'	-	412	440	2	61.72
GTTTAAAATTGAATATTTAAGCATTTTTCATGAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCT:1	+	chrX	21100569	5'	+	BS3	1419	1	68.49
GAACAAGCACCAATAGAGGGTTGCATCCTTTGGTGGGTACTACTAAACTGTTCTCTTTCTGAGGTATTTATTTTCTTACAACTTTATTTCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCAGAACGTAGTCTGGTCGCG:1	+	chr3R	12071875	5'	+	invader1	3719	2	64.93
AACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1	-	chrX	8543546	5'	-	roo	353	2	54.11
CATGGATCATATAATTAATCAAAGCGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1	-	chr3R	10274073	5'	+	HMS-Beagle	26	2	66.90
AAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chr2R	21229000	5'	+	jockey	86	1	67.12
CACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1	+	chr3L	27415237	5'	-	transib2	2770	1	69.83
AAATATATAAATTAAGTTTAAATTCTGAAATACTAAGATACTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1	+	chr3R	14337416	5'	+	copia	76	2	73.57
TCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTATCTGTAAGGGTATTGTTCACAGATTAACATGAATATATCTAAAGACT:1	-	chr3R	25448415	5'	+	roo	8677	2	51.32
GTAGTGTGTCTGTGTGTGTAAGCTTCAAGCTTGATAAATCCCAGTTCCTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCAC:1	+	chrX	8138139	5'	-	gypsy4	455	1	64.44
TAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	-	chr3R	19449427	5'	+	roo	8	2	67.12
GTGTCCTCATTTTCACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAATTTACTCGTTGAG:1	-	chr3R	7100948	5'	-	roo	394	1	71.92
TTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTCTTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATG:1	+	chr3R	3617314	5'	-	micropia	172	2	72.03
GCGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTGGCTA:1	-	chr3L	11257399	5'	-	1360	15	1	41.03
GCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATTATGGTGAAACTCTGCACCGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:1	+	chr3L	2362330	5'	+	Stalker2	7279	2	49.52
CGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1	+	chr3R	21276549	5'	+	BS	5073	1	68.49
GTTTTTTATATTATCGATTTAACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1	+	chr3L	1534500	5'	-	pogo	2095	1	70.00
GATAGGAAACTTCCTATCAAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACCATGCCTCG:1	+	chr2L	6863265	5'	-	pogo	2076	1	63.11
GAATGACCCACCTAAGATATTGTCTCGCATTCTCTCAGGTTCGATCAAAGAACATGATTTCCTGTCATTCTCTGAGGATGATCTCTGGGGCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAAC:1	-	chr3R	5024760	5'	-	R1A1-element	5072	1	67.54
AGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTGACATG:1	-	chr2R	19050267	5'	-	roo	9001	2	68.66
ACTCATTGTTTTTTGAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1	+	chr3R	25423170	5'	+	3S18	6	2	73.95
CCCACACCCGTAATGAAGTTTAGACAATCAAATCGCGATCGCTTGCTTAATGCTTTATTTATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGGTAACTAATTGCAGGCTTGTTATGTT:1	+	chr2L	8922482	5'	-	I-element	5214	1	58.41
AATCGAAAAAAAGGGACAAATATTTGCCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1	-	chr3L	10013697	5'	-	hopper	1378	1	60.27
AAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACGACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAACTCATCGGACAC:1	+	chr2R	11629717	5'	+	Tirant	8141	2	63.45
GTCCGTCTGTCCGCATGAACGTCGCTATCTCAGAAACTATAAAAGATTCTAGAGACAAAGACACGGCTCAAGTTTGATGACCCATGCTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAA:1	-	chr2L	20840209	5'	+	INE-1	216	1	74.34
CCTCAATGGGTTAATTTGGTGGGGAGCAAGGGGCTAACGTAAACACAGTTAGGTGCCAAAAAAAGAGAAAAAAAAATGAAA:1	+	chr3R	19300956	5'	+	Doc2-element	245	1	55.56
ATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1	-	chr3R	10266156	5'	+	1360	62	1	65.38
GCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATC:1	+	chr2L	4412569	5'	+	Quasimodo	67	2	70.37
TGGTTATCCACATTCAGTTAAACTGTTGCCTTACTCCCACAGAGAGATATCCTGAAAAATGATATCATACAAATTTTTTAGTCGATTTTGGAAAAAATTAATGCCTGCATATTGGATACATGATTTTATGACTTATAT:1	+	chr2R	6728270	5'	-	Quasimodo	104	2	78.99
CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGG:1	+	chr2R	2007458	5'	+	1360	59	1	50.68
CGAAATACGAAAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1	-	chr2L	16016432	5'	+	412	7099	2	54.11
AGCATAAATGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chr3R	22955957	5'	-	roo	339	2	63.70
CAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr2L	8986132	5'	+	412	68	2	67.86
AAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAG:1	+	chr3R	13237293	5'	+	3S18	5830	2	59.59
GTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACCCCATACGATTTT:1	+	chr2R	2016811	5'	+	1360	22	1	62.61
TATCTTGGTATAAAGGAGCTCGCGAAATTAGTAATGGCGCCCGGTATCACATGTACTCAGAAGGTGACAATCACTTCCTAAATATTAATGACGTATTCGTTCTAGTAAGGAAACTTGATCTTTTAGG:1	+	chr4	767511	5'	+	Q-element	359	2	77.95
ATGGCTAAGGCAATTGAAACATTAAATTCGGGGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAATCAAGAAATATTTAACAAC:1	+	chr3L	2325710	5'	+	I-element	5078	1	75.29
CGGAGAAACATTTTTCACTTGAATTTCTGTCGGCGGCCATCTAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1	-	chr3L	19036074	5'	+	Tirant	40	2	55.65
GTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	15064439	5'	+	412	41	2	54.40
TAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1	-	chr3L	17115533	5'	+	blood	41	2	52.14
ACAGAGATGCACTGGGCTCAGCACAGGTTTATATATGTATATATACATATATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1	-	chrX	8814831	5'	-	pogo	2037	1	69.86
CAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATNTCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTA:1	-	chr3L	21855516	5'	+	blood	22	2	52.87
AATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAA:1	-	chr3R	25448413	5'	+	roo	8673	2	55.71
TAGCCCACTTGAAACCATCTATAGCTTATCAGCTTAAAAAAATATGTGCTTAAGTAATCGATATAGTTCGAACTTTTTAAATTATCAAGACAAAGAGTGAAGTATGTTTAAACTTTAAAATATCTTTAATTTAATTTTATTTGTAA:1	+	chr2L	16374061	5'	-	NOF	3957	1	42.47
AGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGC:1	-	chr3R	6611291	5'	+	HMS-Beagle	62	2	60.27
GGTGTTGTATCCGAACCTACTAACTACTAGCTCACTACTTGTGGTCTACGAACACGGTCTGGGAACATGGAGGTGGACAAGACGCAATCCAGCAAGGTGACGCTACCGAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1	+	chrX	1300132	5'	-	1360	3388	2	55.40
AGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1	-	chr2L	11661003	5'	+	F-element	51	1	54.55
CGGATAAAACAGCTGATAGCGCTGCCAACTTGGCGCAGCGGGCGATCTGGAGAGGGAGGCGTTGCCAGATCAAACGTGTGATCAGTGTTGTGTTAAACCTAAAATTAAACCGTTGAAATTTAATTTAATTTTAAT:1	-	chr2L	22373917	5'	+	Rt1b	122	1	97.04
CATGCAGGGTGTAAAGGAAAGTAGACGATACCATAGCACTGACTTTCCGCAAGGCTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATT:1	-	chr2R	3463238	5'	-	Ivk	210	1	56.52
TGATTATTTGGCCTCTATTCTTTCGACTTTATAGAACCACTCCAAACGAATATCTCTAACGAATGCATTTTATTCATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1	+	chr3R	13846095	5'	-	I-element	5310	1	54.11
AAATATGTATATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1	+	chr2L	11732225	5'	+	Doc	14	1	66.44
TGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1	-	chr3R	17831898	5'	+	F-element	34	1	54.10
GTGCAAATTAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1	+	chrX	10639997	5'	-	roo	9027	1	52.05
TTAACCCATATTTGGCAGCTTGTCGCGTAAAACAATTTCGATTTTGACATCGACTTTCGAAACGATTAACAATAATTATCCACAAACATTACAATTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGT:1	-	chrX	11432089	5'	-	Stalker4	7009	4	64.38
TATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAAT:1	+	chrX	10644466	5'	+	jockey	4814	1	75.49
ATTCATAAAAAAAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1	-	chr3R	28075437	5'	-	jockey	4972	1	67.39
TTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1	+	chr2R	14542125	5'	-	roo	354	2	54.11
ATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:3	+	chr3L	4536664	5'	-	roo	9038	1	58.22
CAAGTTGTTTCTGGAGTCAGAGTTGATGAGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCT:1	-	chr2L	23352623	5'	+	accord	25	2	62.60
ATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAGGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACT:1	-	chr3L	10574389	5'	+	Tabor	50	2	49.32
AATATCTTACTCCACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGG:1	+	chr2R	3065931	5'	+	P-element	74	1	33.57
AGCTTACCCTTTATATATACTTTCTACACGGTATACCTTATAAGAACTCTCATTATAGTTATTGAAAGCTACCAAGTGCTCTCCGATAACAATGGCATATATAGATTTAAAGTCAAATAACTTCTAAGGTGAAGGGTATAT:1	-	chr3R	7420369	5'	-	1360	219	1	70.21
AATTCTTATATTATTCTTTTATAACAGTCTATTCTAATGACCAAGAAAAATTCGTATATATACTTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1	+	chr3L	20324659	5'	+	297	6636	2	63.70
AGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1	-	chr2L	16067179	5'	+	297	49	2	62.22
AGAAGAGGTGTAGGCAGCCTATCCTCACAAAACAAACAAAAAAAACTAATGTAGAACGCATGGATGGTTAGGAATAGGAAATAGCGGCGCGCGTGTGTGCGGATTGTGATAAATTATTTGTAATTTATTAATTTATTTATTAATTT:1	-	chr2L	19688257	5'	-	flea	4986	3	52.05
TTATGGAGTTTTAGAAACTTGAGGAGACTTTGCTTACGATCTAATTTCACATGCTCAGAGTATGTAAGTATAGTTGGGGGGGGTGTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1	+	chr2L	1517585	5'	+	jockey	4709	1	59.29
CCGGCAAATGAATGTCACCAGGCGGCCGAAGGATGAGCTAAACTACATGCGAATTAATGAGCTGGTCGTGTGGGTGCACTGAGAGAAATCAAGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1	+	chr3R	10641290	5'	+	1360	81	1	81.03
AGAACGACAATAAGCAGTAGACTGTATTAAATAATCTTCAATTCAAATGTCTGCGCTCATTTCATTTCAAAGTTCCTTCCAATGATTTTCAAAATACAAGCAGAACGGGTCTTACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	-	chrX	13402190	5'	+	roo	8691	2	76.71
GGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1	+	chr2R	9220996	5'	+	opus	7149	4	60.00
AAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCACCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGC:1	-	chr2L	23084409	5'	-	accord	7338	2	54.69
CGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACG:1	-	chr2R	6271500	5'	+	blood	206	2	81.16
TTGCTACAATATTTGCACTTGCGTTAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTTCTGTGAGTGTGTTTGCACACAGATACAGGCTTATGTGCTCGTGTTTTTTCCCCATTTTTTTTTCTTTTTT:1	+	chrX	3761399	5'	+	hopper	138	1	55.73
CCTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1	+	chr3R	15072530	5'	+	pogo	26	1	64.29
ATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAAT:1	-	chr2L	13585902	5'	-	Tabor	396	2	76.03
GGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	-	chr3R	20427515	5'	+	jockey	14	1	78.36
TGCAAACCAACAAAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGATTCTGTATTTTTACGATTACGATGAGGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1	-	chr2R	19540474	5'	-	jockey	4973	1	57.98
CTTTACATCTTTCTTGATGTGTGAACATGTTATAAGAACTATTGAACTCGGTAGGAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTTTTAGACTTTAAATCTA:1	+	chr4	307996	5'	+	1360	237	1	66.44
TATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGT:1	+	chr3L	14603272	5'	+	jockey	21	1	56.67
AGCTTGACTACAGTTACTCGGTGTTCAGCTAGTGGAAGGGCGAATTGGCAAGTATTGGGATCGCAACAAACAAGAGAGAATGTGTAGGTCGAGTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAGAATGCGAAC:1	+	chr2R	1728344	5'	-	INE-1	530	1	70.71
GTAAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTATTTGTAAGAAACTGATTTTATTCGGAAACATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr2L	18294192	5'	-	roo	346	2	58.22
TAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGT:1	+	chrX	10521631	5'	+	Tabor	6902	2	58.22
TAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1	+	chr3L	10848627	5'	+	blood	47	2	53.42
AGAGTAACGGGTATAAAAATAGAGGACCATAAAGTATATATTATATTCTTGATCAGGATTAATATCCGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTCTGTCCATCTGTCCGTATCAACTTCGAGATCTCAGGAACTAT:1	-	chr2L	11924454	5'	+	INE-1	143	1	74.10
CTACAGGTATCGGCAAAAAAAAAAGATCCATCAAAATGGAAATCCGCAATGGAATGGCATAAATATAGAAAATATGATAATAATCTACTGGCATTTATGCCAGTATTATCTAGCTTTTAATTAATTCAAAAAAAAAAA:1	-	chr3R	13707211	5'	+	jockey2	3407	1	50.72
CGCTGGCAGCTACGCTTGCGCTGTGATAATACGGGATCACTAAGTCAGGCTTAGTGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGGTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1	+	chr3L	23797899	5'	+	Doc	66	1	58.27
GAAATGGCGGCAAAGTGGAAAAGTGAAATAAGCGCAGCTTTATATGCACAAATACACATACATATGTACACACAAATATATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGCATTTTTATTGATCAAAAA:1	+	chrX	6498919	5'	-	Quasimodo	7331	2	57.53
GTCTATGCTTATGCCACTTATATACATTATCCCCACAAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTGAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATA:1	+	chr3L	23496289	5'	-	1360	259	1	73.10
AGTGATTAGAGATTCAAGCCTTACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCC:1	+	chr3R	19445217	5'	+	roo	165	2	69.44
AGCCTTGCTAAGACGCAGTGTGCGCCTCTCCACAATTACCGCATGTGGCAGGAGCGTCTTTGGTCTTAGCAAAGACATTAGAATAACAAGAT:1	+	chr3L	26645878	5'	+	1360	2	2	68.48
AACTGTCTGTCAATTGAAATTTGACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1	-	chr3R	25423323	5'	-	3S18	305	2	59.03
CTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGTGAATAGCATCTTAAAGTA:1	-	chr2R	9632161	5'	-	roo	318	2	78.57
ATGTATGGAAAAGTAAGCTTTTTGTCTGAGGAATTTTATTACTGCTTTTAAAAAATGCCTATTTCTTACCAATGCACTCTCAAGCAAACGCATTTTCGGTTTTTTCAAATAATAAAAATAATGGATACCCTTACATACCCTCTTAT:1	-	chr2L	15250052	5'	+	Transpac	4928	2	44.52
AGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCACGACTCACCAGCGCTCGGCTATCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1	+	chr3R	26431991	5'	+	opus	172	4	73.04
CATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTACCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	+	chr3R	7482717	5'	+	412	7093	2	55.94
ATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAG:1	-	chr2L	9778710	5'	+	INE-1	566	1	78.65
GCGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1	-	chr2R	13585524	5'	-	412	449	2	54.79
ACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGTTC:1	-	chr3R	20427496	5'	+	jockey	23	1	69.35
CTGCGTAAATATATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1	+	chr3L	11321402	5'	-	mdg3	223	2	53.21
GGAAGGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCA:1	-	chrX	2295989	5'	+	Tirant	37	2	55.26
AGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	-	chr2L	18294277	5'	+	roo	8740	2	72.60
TATATTCCTGTAATGGACCAAAATTTGTATAGGTCAGTTACATATTTTTGATAGGTGTTCAAAAAGCTTGATAATACTGCCACGCCCACACATTTGACATTTTATAGTTTTTCATATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGAT:1	-	chr2R	14438150	5'	+	INE-1	300	1	49.32
ATTATAGTGGGAAGGGGCCAGGGGAGGGTTGGCCAAGCTGAAGTGGTCGCCATATAATCAAAAATAAATACGCAGCCAAGTACAAATGAACACACACCCGAAAACAACAAAAACGACGAGTGGAAGTCTTAAATAAACAATGTTG:1	+	chr2L	7638163	5'	-	Tabor	6915	2	66.21
GGTCATTAAATGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTT:1	-	chr3R	13349172	5'	+	BS	5014	1	69.18
TGCTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr2R	13710593	5'	+	roo	60	2	66.92
AGTAACGAAACATGAAATAATGGGCTAATTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:1	+	chr3R	6611175	5'	-	HMS-Beagle	6996	2	54.11
ATCGTGTATGGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAATCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1	+	chr2R	9220987	5'	+	opus	7031	4	64.75
TCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTT:1	+	chr3R	18339073	5'	-	roo	9061	1	70.37
GTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1	-	chr3R	10274014	5'	+	HMS-Beagle	22	2	62.03
GAAATCCATAATACCTATTGGTAAATTGGGCTCGAAAGTTGTTAGACTCTAGTTCTTGAGACTTTAGGAGACGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACT:1	+	chr3L	25840005	5'	-	roo	8790	2	54.07
AGCTAAAATTGTTAATACCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1	+	chrX	21016742	5'	+	Transpac	4956	2	51.94
GACCGCCAATAGTTTACAAAAATTCAAAATTAATGACTAACATCTATTTTGGCTGACAGGCCCTTGTATTTATGTTGTATGGTTTACGTTCAGTTGAATTAATCATTTCATTACATTTTCTCGTTTTTTTTTTATTTTGTTTTTCT:1	-	chrX	13318028	5'	-	Doc2-element	221	1	80.82
CATTCAACGTGCTCAAACACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1	-	chrX	9540152	5'	-	roo	387	2	70.55
AAGGGGTGAGATGGCCGTGGAAGGAAACGCGGTCGGCATTCGCTTTTGAACTGCACTGTATGTGTTTGTGTCGTTATGGCCGCATCTTTTTGTTTTGTTTATTGTTTTCACTTGTTTTTTTTTGTTTATCTTGTTTACA:1	+	chr2L	3577200	5'	-	Porto1	153	1	66.91
GCTGCGGCTGCACTTCACTTTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1	+	chr3L	22437838	5'	-	roo	9040	1	61.87
ATATAAATGTATTTATGGAAAAGTTTTCACACAGTCAGATATATTAGATAAAAGAGCTTGAATTGTATACGCCTACATTTTATTTTGTGCAAAATTCTTTAATTTAAAGTCCTTAATTTGAGGCATAAAATTATATCGTTAAAAGA:1	-	chr2R	21077932	5'	+	micropia	5375	2	45.21
ATTTGCTTTCTTTTTTATACGCAAAATCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	-	chr3R	17420536	5'	-	roo	9036	1	56.85
CTTCCGAATGTTCATATTAAAAATATTTAAGCACTGTTATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTC:1	-	chr3R	14364731	5'	+	roo	28	2	63.70
ATACTAGCCTATTTCCCAGTGCATCTCCCAGAAGTAAAGATGACAAAACGTTGTAGTAGCTGTCGTTGGTTTACTCTGGGTCTCAGCACCCGCGTTTTG:1	-	chr3R	18778564	5'	-	R1A1-element	5078	1	65.66
AGCCCTCAGATATGGAAGAGAAATGGCTGGCAGGTGTTGAGCGGGCGCAGGACTCCCATGGTGGATATTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAT:1	-	chr3R	6472279	5'	+	1360	3326	1	50.00
ACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1	-	chr2R	5311501	5'	-	1360	3345	1	59.50
ACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATG:1	-	chr3R	1047987	5'	-	Quasimodo	189	2	74.80
GAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTTCGCACAAA:1	-	chr3R	17831889	5'	+	F-element	39	1	48.31
GGGATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr2R	13084591	5'	+	roo	52	2	60.77
TTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1	+	chr2L	9399467	5'	+	Transpac	4998	2	76.98
TTAAAAAAAAAAATTATTACCACCTTTTTATTTCTTTCACACTTTTAGAACAAAGACAAGAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCC:1	-	chr3L	25481073	5'	+	accord	7306	2	58.33
GACAACGAAATCGAAACTTTGCAACAAAATTGCATTTGAATGAGCAGCGGGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1	+	chrX	2295900	5'	-	Tirant	8450	2	63.43
AAATTGAGAGCGTGAAAATCTACAGGGTGCGGCAGAATAACTTCCTTTTTTTAAATTGAGCGCCATTCCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCCTGTT:1	-	chr3L	27364874	5'	+	mariner2	63	1	75.00
CGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr2R	20596472	5'	-	roo	8995	2	70.55
CAGAAATTAGTTATTTCCTTCGTAATACGTTTATCATAATACCTACTTTAACTAATATACTTAAATCTAAAACGGACTTGATTAGTAATACGATTTTAAAACTTCAAACTAAAATTAATTCAGATAAAATTGAAATTAAAATTTT:1	-	chr3L	16942353	5'	+	1360	3045	1	34.48
ATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr2R	20596538	5'	+	roo	8743	2	76.03
TATAATTTGTATTTATACGTGTTTGTGCTTAACTAAATTCTTCATAATACTACGTCTGCTTATAACTAAATTCGTCAGTAATTTTTGGTTTCTAGGCCGCAGGAATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGTCCCGCCCG:1	+	chr2L	22407693	5'	-	gypsy8	298	1	67.86
TACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:1	+	chr2L	20117893	5'	-	invader4	275	2	61.94
TAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACANACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTT:1	-	chr3R	17243225	5'	-	hopper	1365	1	51.37
TGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	18339109	5'	-	roo	323	2	74.66
CACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1	+	chr3R	25448316	5'	-	roo	9031	1	57.53
AGGGAGATCTCCGATCAAAATTTCTCCGAAACGTATTCGCAAGAAAGCAGCGCTGCTACGGACAGTATTCAAGAGACAAGCGTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCAAAGCCACCAC:1	-	chr3R	11622433	5'	-	R1A1-element	5003	1	57.55
TGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTAC:1	-	chr3R	25423287	5'	-	3S18	6033	2	67.12
GATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	-	chr3L	22968421	5'	-	mdg1	358	2	62.77
GAAATATGACTTTTGAACCTATTTCATGGAATTTCACAAATTTTAAAAGCGGCAAAAGTATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1	-	chr3L	10648020	5'	+	412	7089	2	48.28
GCGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1	-	chrX	21014842	5'	-	copia	179	2	71.23
AAACGGTTGAGATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2L	544751	5'	+	412	7094	2	56.16
ATTAAACGCAAATTGCAGTCCAAAATTCAGGCACATAAAGTTTGCCAATTTCGCGCTTAACATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAGTCTAACTTAATTAACTTT:1	-	chr3R	21717586	5'	-	Doc	4620	1	58.33
AGAACAAAAGAAGTCTCTCTGTCTCAATTTTATGTATTTANTCATTTCTATTAATAATCATGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGATCGCTGTTCGCTGTGTTCCGTTATGCGAGTTTAACAGATTTTGCTCTGTTCTACATAGCCT:1	-	chr3R	17908486	5'	+	invader6	153	2	58.90
AGTATCGGCTTAAAAATATCAATTTTGTTTATTAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1	-	chr2R	6885418	5'	-	flea	4983	2	54.79
TGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGCGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1	-	chr3L	22349273	5'	+	jockey	57	1	57.63
CGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr2R	20596548	5'	+	roo	8733	2	69.18
AAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCC:1	-	chr2L	12290747	5'	-	1731	4550	1	68.97
AATGAAGAGCATATAGCCATTTCTATATGTATAAGATGATTTCTATATAATACTAATTACCGATGCAGATTGCGATAAAACCCGCGCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCA:1	+	chr2R	14388106	5'	-	roo	119	2	57.53
ATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1	-	chr3R	11496614	5'	-	1360	3332	1	60.58
GTGTGTAGAGAAACTAACTAACTAACAAGATGCAGCTAGTTATTAGATCTAACAACGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1	-	chr3R	21435005	5'	-	412	7517	2	65.07
GACAAGATATGACCAGACATTTCACTTCGTGTGTCTTCCAAACACATTTTTGCGCATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAA:1	-	chr2R	3291249	5'	-	1731	4276	1	62.76
CTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCCTATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1	-	chr2R	23332610	5'	-	invader4	3043	2	64.29
CCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1	+	chr3L	4755230	5'	+	jockey	4687	1	53.01
AAGACATTGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGATCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1	-	chr3R	29361078	5'	-	mdg1	382	2	52.94
GCTCTCTTAAATTGTCTTTCTCTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1	-	chr3R	18585689	5'	+	P-element	42	1	56.25
GGGCTTACGTGACTTGCCGATGACCTATAAAAAGAATTTGGACTGTCATCGTTCCAAGAAGTATTTATTTGCAAGTATTACAGGCAAATAGTTCCAAAGTTACCATATAAATTTAAGGGTTACAAATTATTAAGTATAAAAGTAAA:2	-	chr3L	19014157	5'	-	G5	4724	1	67.12
AAAAGCTCTACGCAACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr2L	6059192	5'	+	roo	8703	2	57.53
TTTAAGTGCATTGGAGCTCAAGCTTAGTTCGTTAAATACATATTTCTGTTCCTCGGGGCACTTTTTACTGCCTACTTTCAGGCGACAGGTGATTGACCAAAGCCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1	+	chr2R	18528642	5'	-	jockey	4986	1	72.93
TTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAATACTATTTACAAGGCGTTAGATTGGGCGTAACAAACAAATTTGGTAAATTGATACAAATTTACAAGACTAATTAAAATATACAAAAATATCAACCGATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGG:1	+	chr2R	5667269	5'	-	INE-1	252	1	40.69
AGGCACTTTTGTTTGATTTTAACAGGAAAAAAAAAACACTGTAAAGGGACTGTTTATACTGATTGTTAAGTGGCTAAAACAACCAACTTCTTTGAAAGAACACCCGAATTGAACTCATTAAATGTACGCACAAGTTTATAGTGTGA:1	-	chrX	8838411	5'	+	rooA	362	2	63.01
ATTTATCTATCTCTCCCACGCGGCAAGTCAAAGAGCACGAGGAGCAGGAATTTCTCAATGGAGCCAAAGATGCTCAAAACCGAAGATCTCGAAATGGTAAATGATGACAGCGCAACTGATTCTGCTAAGACCCCACCTATCATTCT:1	-	chr2L	8470684	5'	+	G4	159	1	52.74
TCCACTTCAACGAGGACGTCGGATAGAATGCATCGAAACAGGCCACAAAGCTCAGATGACACTCGTCGAGAATCTCCAGCGATAGTTCATAGCCTACAAAGTACGAAAAAACCCTATAAGGACATTCAAAAAACCTTTG:1	+	chrX	15054883	5'	+	HB	426	1	74.10
GACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1	-	chr2R	2016932	5'	-	1360	3373	1	68.70
GATCCGAAAAAGGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGA:1	+	chr2L	21008526	5'	+	invader3	44	2	52.21
ATATATCTGCAGGCAACCAGTACCAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	+	chr3R	7641027	5'	-	hobo	2921	1	59.82
AATGAAAAGGGGGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGTTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1	-	chr2L	16067196	5'	+	297	6609	2	63.36
AAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr3R	18582153	5'	-	roo	355	2	60.77
CAAAACTGGCAACCCGTTCAGCCAGCAAAATGGGTATTAAGGATTCTGTCGCAGGACACGCGTTGCATGTGTATGCACATACATATGTACATACATACATACATATTTC:1	-	chrX	10830281	5'	+	412	227	2	57.80
AGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTCATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCT:1	+	chr3R	13237296	5'	+	3S18	56	2	56.72
CCACTTCTGGGGTCTGCTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGAAAATGAATCGAGAGCGAT:1	+	chr2R	13710579	5'	+	roo	62	2	59.59
TATAAACTTTTGCTGATGACACCCCAATTCTCAGCCGATCGAAATGCCATCTGCAAGCATCAGCGCACCTGGCTGCTCAGCTAACTATTGTTTATCAAGTGCAAGGTGCGGTTATAAAACACAGTTCTAAAACCA:1	+	chrX	10065385	5'	+	Doc4-element	2574	1	48.15
AAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1	-	chr2L	6623050	5'	+	Burdock	24	2	62.81
CATTTCCTGCGTGCCCGAAAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	+	chr3R	13360277	5'	+	jockey	10	1	77.78
TTTAAAGTTGACATAAAATTCCACTTAAACACCTGACCATTTAGATGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1	-	chr3L	3501068	5'	-	opus	474	2	69.18
AGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAA:1	+	chr2R	5209594	5'	+	gypsy	61	2	57.53
CATCATATATCATATTTTTAATGATATATCTATCATATCTACCTATATCTATCTATCTATCTATCATTTAATATATTTTCTATAAAGAAACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCC:1	+	chr3L	11257271	5'	+	1360	12	1	72.60
GATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGATGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1	-	chr3R	30872895	5'	+	micropia	4976	2	64.34
GGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	+	chr3R	17817878	5'	-	roo	400	1	72.00
GGTGACCAGCGACATGGCCATTATAGAACTCGATTCCTGGCCAAGGTTTCTCCTTATGCTATTGTTGATGTTGCTGCCGTTGCGTTCCTGCCAGGGCATTAATTAACATTTCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTAT:1	-	chr2R	19040242	5'	+	roo	327	2	77.40
ATATACTTTTGCATAAGAATGCTTTAAAAAAAGGAACAGATATATATTTGACTGACTTCGTAACATTGTCTTTTTATACACAAAAATATACAAAAGCTAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGA:1	+	chrX	18019232	5'	-	Circe	7239	2	63.70
ATTTGCATGCCTTGTAGCATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	+	chr2R	13585367	5'	+	412	18	2	71.13
AAGGGTTTAACCTACAGAGCGAATCTGAAAAAAGTGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr3L	4536812	5'	+	roo	8704	2	54.17
GTTTAAATTTGAAATTTTTTTTTATTTTAAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chr2L	3886119	5'	+	roo	35	2	57.53
TTTGGGCCTTTTTCGCTCTTCCGGTTGGCTCCTCCTGAAAGTCCTTCGTGCGCTTAGATGTGCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCC:1	-	chr2R	9781642	5'	+	roo	170	2	57.53
AATTTCTTGTTCTTAAGCTATATACATAAATGTCCAACCAATAGTTATTATACCCGTTACTCGTTGCGCAAAGGAGATTCGTAGAGTGAATCTGTCCGTCTATCCGTATGAACGTCTTGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGG:1	-	chr2L	21290424	5'	+	INE-1	156	1	56.85
CTGCTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr2R	13710592	5'	+	roo	8678	2	65.88
ATGGGGGGAAAACTTCAATTAGACAAAGTGCAGTCCCAAGAGACACGAGAGCATAGTTTGACCCAGTTTTTGGGGAAATCAACATGAATGTTGCTCTTGGTCAGG:1	+	chr3L	11702602	5'	-	Fw2	301	1	77.14
ATTCCACCTATGTATTATTTATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTAACATAACAGC:1	+	chrX	20266145	5'	-	BS	5050	1	61.64
GACATACACGTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATA:1	+	chr2L	12290633	5'	+	1731	4330	2	70.90
GGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGAAAACACA:1	+	chr3L	7292483	5'	+	HMS-Beagle2	6926	2	66.98
ATGCTAGAAAATACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	+	chr3R	27994157	5'	+	roo	8701	2	58.62
CTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	+	chr3R	18582158	5'	-	roo	334	2	68.49
GAGGGCAGTCGCACGGATATGATCACCAAGGATCAGATCCTCCTCGCCGCCCAAACGATGAGCCAAATCACGCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACCGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGT:1	-	chr3R	30448449	5'	-	Quasimodo	6964	2	60.16
ACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTTTTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr3L	23635040	5'	+	roo	22	2	56.52
GACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAA:1	-	chr3L	8249101	5'	+	jockey	4608	1	75.89
AGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1	+	chr2R	2016810	5'	+	1360	32	1	57.94
AGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3L	19334267	5'	-	roo	8987	2	78.08
GCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTAGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACT:1	-	chr2L	12892714	5'	-	roo	9026	1	53.08
ATCGCTTTTCAATGTAATTCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1	-	chr3R	10462713	5'	+	opus	7024	2	61.11
AGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr2R	20596488	5'	-	roo	8988	2	80.29
AAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1	+	chr3R	19446149	5'	+	297	6642	2	69.40
GTTTATATTTGCATATTTCTCATATACTTCGATTGGAAACGATTTCAGATCTAGCATCACTGTGCTGCTTCCGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1	+	chr2L	20840357	5'	-	Transpac	5222	2	79.45
AAATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2	+	chr3L	4536662	5'	-	roo	9040	1	59.59
ATGAACATTCACTTTTACAAATCATGCAATCATAAAATGATTGAATTTAAAGTTTTGATATGTAAATTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTC:1	+	chr2L	20122590	5'	+	invader4	2647	1	66.21
CGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chrX	6486816	5'	-	roo	9022	2	53.42
AAACAATATAAGATGGAAAAATTTAAGTACAAAGAAAAAGTAGTAAGAGAAAACCATTATTTTAAAGTTCCAAATTCACAAGGGTGTAAAAAATTAAAGGGTTAATATAGGTATAGTTAATTTGCTCGACTATCAGATACCCGATA:1	-	chr2R	8201677	5'	-	INE-1	552	1	60.27
ATATTATATATAAGGTTATATATTTATAACCTTTGGGTTGAGTCGTTTCCATTAACATATAACTATCTTGTCTTAGATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATA:1	+	chr3R	23236952	5'	-	jockey	4866	1	51.45
ATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1	-	chr2L	17420228	5'	+	roo	85	2	77.40
AAACGTCGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chrX	5274282	5'	+	roo	54	2	54.11
CGACGATAAAATGAAAGAGAGATTTTCATTTCCGCAGGCACGTCCTTATTGCTCACTTGTGGATTTTTTAAGCTACTTGAAATCTGAGTAATACAGGCTGTTATATGTATATATCAAAATATATTTTAAATCAATAATATAAAATA:1	-	chr2R	13104972	5'	+	G7	1146	1	77.40
AATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTCCCATTATT:1	+	chr3R	19446097	5'	+	297	6602	2	70.55
CAAGCGGGTGCCCACTGTAACGTAGTGCGTTCCCAGGTGGATCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1	-	chr3L	3799855	5'	-	copia	5079	2	69.86
ATAGCAGAACAAGGAAACTCATAGAAAAGTGTTAATTAAAACCACATGTGCGACTTTGTAAGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAA:1	-	chr2L	10685197	5'	-	I-element	5017	1	55.26
TTTCCCCAAGGGCCAAACTCAAGTGTCACAACACGTAAGTCAACACGTGAAAATTGGATTATTATTATTATTATTATTATATTATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1	+	chr3L	18596587	5'	+	Doc	34	1	42.22
AACTGTCGCTTTTGCAAATTGGGCTCTGAGAGTGTGGAGTGTCGGGGTGTCGGACTATCTGTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCATACAATTTTGCGTGCGGGAGCTACTCGCCACGCAC:1	-	chr2R	20913981	5'	+	hobo	60	1	55.86
ATTCAGGATTGTGTCAGACCGTGGTGCATCTTTCACATTACATTTGTCCAAGGAATATTGCAAAAAACAGCAGATTCAGTATTTAGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTACTACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTGCGCTGTA:1	+	chr2R	4613924	5'	-	1360	130	1	57.93
AAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTCTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAACATTCATAAGTTTGC:1	-	chr2L	6863358	5'	+	pogo	91	1	77.40
ATATTCTTCTATATTCAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	-	chr3R	14364693	5'	+	roo	8730	2	64.38
ACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2R	16785424	5'	+	412	42	2	54.40
GTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAA:1	+	chr3L	10056111	5'	-	transib2	2753	1	67.59
TCACTTTGTTTATTTGCATCATCAATCACCAATCATCATAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1	+	chr3L	17560234	5'	-	pogo	2083	1	73.97
TGTTGCAATTTCTCATTGTCAGCGAACGCGTTCGCCGGTAAATTTTGATTAAACGCTCCGCGGGAATTCACTTTGGCTTGCACTTTTTGCTTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTG:1	-	chr2R	23248663	5'	-	Idefix	77	2	66.67
CAAGATATGGGGATTTACTTAGTAGCAATAATCGTATAATATCAATTGCAATTCAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAAAGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTT:1	+	chr2R	2509773	5'	-	1360	445	1	64.38
TATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGAAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chrX	18193682	5'	+	jockey	86	1	70.29
AACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGACCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr2R	9632118	5'	+	roo	8739	2	72.99
ATGTTTTGCCTCCGAAAGCTAACCAAATGTTGACGTCTCATCGTTTTTGGGTTCCTCTAGAAATGTATCTGACTAACGTAGAGCTTTCCAATAAAAATTAAACTTTTGTCTACAAACCACTCCCT:1	-	chr2L	18073357	5'	-	Penelope	727	1	63.20
ATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1	-	chr2R	19798103	5'	+	Transpac	79	2	73.97
TTTTTTGTCTTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1	-	chrX	3158124	5'	+	micropia	4962	2	79.45
ATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTT:1	-	chr2L	19310375	5'	-	Juan	4134	1	71.92
GCATCAGTAAGCAAATTTGAATTTCACAATTCTGTGAAATAATTTCAGAGTAAAGCTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAT:1	-	chr3R	1207563	5'	+	copia	66	2	61.64
GGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTC:1	+	chr3L	24213773	5'	-	invader2	5044	2	63.50
TCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chr3R	25448459	5'	+	roo	28	2	62.96
CTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATT:1	-	chr3L	14944610	5'	-	G5	4742	1	78.08
CAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTT:1	+	chr2R	5173436	5'	-	gypsy	7376	2	66.44
TTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGC:1	+	chr3L	19013917	5'	-	invader3	212	2	62.50
GATTGGTCATGGGTGTCAAGGGAATACTCTCGTATTTCGCTTAATCATTTTGGCCGGGATCACTAGCCGAGTCGATCTAGCGATGTCCGTCCGTTCGTCTGTCGGTATGAACGTCGAGATATCA:1	+	chr3L	20503130	5'	+	INE-1	135	1	78.23
AAAACCTCATAGGGAAATACAAACTATTTCTTATACATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr2R	9868567	5'	-	roo	8987	2	78.77
AAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATAT:1	-	chrY	3648941	5'	-	Stalker	7097	4	73.75
ATGAATTACTCTTTATATTTTTTCAGTGCACTTAGAAGCGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCTCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	+	chr2R	9328540	5'	+	roo	8670	2	78.77
CATTTTGTTGCCCCGACACTCGAGTTGCGTGCGAGCGATGGGAAAATTCAAATATAAAGCAGATTCAGCACCTCCACGACCCCACCAAACCAAAAACCAAGCCCGACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACG:1	-	chr3R	22843790	5'	-	roo	8714	2	73.29
GAAGGCTTCCGCAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGATCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1	+	chrX	10521593	5'	+	Tabor	9	2	73.85
TGCCAGTACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTAGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAACTATCTTCGGTTTAAA:1	+	chr3R	18582144	5'	-	roo	348	2	56.16
GCCTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1	-	chrX	21667961	5'	+	gypsy2	29	2	66.92
GTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr2R	20596468	5'	-	roo	335	2	67.81
AGTGGTTCTTTTCTCGTAGTGCGTGGTGACGAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCCGCAAATCCACACTGGGGTTTGTGCCGCGTTTC:1	+	chr2L	23038615	5'	+	Rt1a	107	1	74.07
TAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCA:1	-	chr3R	934276	5'	-	Rt1b	4746	1	59.20
AACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr2R	19050282	5'	-	roo	9053	2	55.21
GGTTGGCGGGAAAACTGAAGTCAATATATTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAG:1	+	chr2R	3031236	5'	+	F-element	4438	1	74.78
GTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTTTTGGCTTGGCGAGCAGAGCATAAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1	+	chr3L	17136020	5'	+	hopper	4	2	76.92
ACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATA:1	-	chr2R	21298811	5'	+	jockey	302	1	72.60
TTATCATGCCGTGTTGTGGATTTTTGTTCAATAAATTGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1	-	chr3L	16769323	5'	+	FB	64	1	74.19
AAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:2	-	chr3R	14049413	5'	-	transib2	2743	1	70.55
GTACTAATATTTCAAACACAATAATTGCAAAACCCCAAATAAGAAGACCTTACTCGTTGAGCTTTTGTACGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr2L	16091933	5'	-	roo	352	2	69.61
TGTTTTCCCGAGCTCACAAAGTCGATAAATATGTATACACATGTACACACACCCACCCACATGCAGGCGACTTTATGTACATATACACATACACCCATATATGTACATACGTATATATAT:1	-	chrX	7144859	5'	+	G3	4507	1	54.17
AGGCTTTAAAATGGCAGGCCCATTTTGGGGCGTTTTCATTTGTATTTTTTTTTTT:1	-	chrX	6482816	5'	-	Porto1	169	1	63.64
ATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1	-	chr3R	17831887	5'	+	F-element	42	1	47.90
AACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATT:1	-	chr3L	14944641	5'	-	G5	4801	1	49.15
TGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1	-	chr2R	13710645	5'	-	roo	8979	2	81.25
ACGCCGAACGAGATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1	+	chr3R	28758271	5'	-	mdg1	386	2	41.78
AAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATCAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	-	chrY	311341	5'	+	1360	59	1	59.59
ACTGATGAGGGGATTGTGCTCGGCGAGAAATGCAAGGTAATTTCATACCGTTTTGTGATATAATATGCCATTTCTATTGTTGCGGTTGCTACTTCAATAATTATATGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCAC:1	-	chrX	19078856	5'	+	1731	4342	2	76.03
CACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATCCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1	-	chr3L	26011945	5'	+	F-element	16	1	44.29
ATTATGTATGATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTT:1	-	chr3R	9714515	5'	-	Stalker4	382	2	66.44
GGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTCTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr2R	14387957	5'	-	roo	8995	2	78.23
TATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGATAGGTTGAGAAGCCCACAAACCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1	-	chr3L	20533802	5'	+	INE-1	246	1	53.57
ATATAACGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3R	12887013	5'	+	roo	22	2	66.67
GGCTACACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAA:1	-	chr2R	9500085	5'	+	G5	4729	1	45.89
GGTGGTCAGGTCAGTAATATTGGGACTTAAAGTGATCGCTCCCAAAAACCACGATAGAAATAATCAATTTGTATAGAGTGACGTATTTGGGTGGGCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1	+	chr3L	15995913	5'	+	297	6623	2	51.08
TGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAA:1	-	chr2R	20194332	5'	+	Max-element	29	2	64.38
TATTGAGAAATTAATGTAATGTTTGATATTTAGGAGATGTTAGTATTTTGCTAAAGTACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGTGTTCTCTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATACATATACATATGT:1	+	chr2R	1881356	5'	-	Stalker4	246	4	56.85
ACTGCGGCTGCAGTAGTCGAGATGTTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTCGAAAAACTTTGAAA:1	-	chr2R	13696072	5'	+	Tc1	273	1	80.30
AACATTATCTCTTTTTTCTATCTTCGTCCCCTTGTTATTATTGTCTGAATTTTTAAGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTG:1	-	chrX	8523714	5'	+	invader4	64	2	65.75
TGAGGAGTCTAGATTTTGCGGAAGGGGCCAGACAAACGACAATTTGCCGAAACAACCAAGTGTGTGGAAAAACACAACGAATTCAACGAAGATCTCCAATACGAACTCGGACGA:1	-	chr3R	8437524	5'	-	accord2	7561	2	62.28
GCAGAAAAAATGGCTTAAATGTCGCATTGGCCATTATTTCTAGTTATACAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAAC:1	+	chr2L	6202854	5'	+	G2	145	1	68.49
AGAGTATGCGCTATTCGCATATCACTCGCATTCGCTTTCGCACTCGTCTCTCTAGTTTTATATATGTCGGAGCGTGACTCTTCGCATTCC:1	-	chrX	18386468	5'	+	invader4	2764	2	65.56
ACTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACAT:1	+	chr4	1301730	5'	+	1731	4380	2	60.96
ACACGCATATGCAAGTCGATAAATGTCTCTGTGTGCTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGATATACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGC:1	-	chrX	6417850	5'	-	accord	7025	2	73.91
CCCGCATAAAAATACTCGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGTCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr3R	17531358	5'	+	1360	53	1	60.00
CAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCT:1	-	chr3L	23728710	5'	-	HMS-Beagle	6962	2	78.10
ATATTATATTATATTATATTATCGGCATTCCACAGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGCATAGTGAAAGTTAAACACA:1	-	chr2L	15950935	5'	+	Doc	79	1	82.84
TAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTT:1	-	chr3R	17243225	5'	-	hopper	1365	1	51.37
TTTTGGTGTATATAAAATTGTACTTTGAATTGTTATTTATTTATATGTATTGTGTAGATTTAAAAATATTGTGTCTCCAATTTTTGTCACATTCAGATCGCTTTCGATATCTCTGGTCCTCATATACCAAGGAG:1	-	chrX	22137131	5'	-	jockey2	2998	1	57.46
AGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	+	chr3R	18339094	5'	-	roo	9002	2	64.38
GCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGGTGCATTGCATAAATAAATG:1	-	chr3L	17115512	5'	+	blood	7068	2	68.75
TTATGATATACAGTTTGGTCCCGACTGCAACTCCTCGACTGGCTCTTCCACTCCAGTAAACTACAAATAAGCTCTAAGGCCCTTTAAATCAAAGCCATACTTGCTCCAACG:1	-	chr3R	896648	5'	+	G5	4362	1	70.27
TTAAATTATTTTTAAGTTCGTTAAAAGCTTTAACAGCTAGGTCATCTAACCAAAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGACACTTTTTTAGTGACGTCCAAAATTTCTCTCTTTCCGCTAGCTCCCGCTGAG:1	+	chr3R	2649389	5'	-	1360	3299	1	59.70
CTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTCAATAGGTGACACGAGAATCG:1	+	chr3R	7835131	5'	-	roo	330	2	69.18
AAATTCCCTTTGGGGATTCTTCCTCGTTTGAAAAAATTCTGGTACTATTCCAATTTTTATAAATATCCGCTCATGGCGACTGCAAATCTTGATGAAAAGTATGAGTTCTTGTATGTTATCTGG:1	-	chr2L	1842964	5'	-	I-element	5133	1	72.36
AAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1	+	chrX	10521627	5'	+	Tabor	59	2	55.48
TTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCA:1	-	chr3R	14337477	5'	-	copia	176	2	73.29
CACCAAAGAAACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chr2R	8585545	5'	+	roo	55	2	55.48
GTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1	+	chr2R	20496932	5'	+	blood	75	2	74.26
ACCAAAAACCCCAAAACCAATAAAAATTCGTTGGAGTAAACTGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1	+	chr3L	21855385	5'	-	blood	366	2	78.77
ACAGGTGAAAGGAGGGCCCAATTTTAATTGGATTTAAAATGCTACGAGTAGAACGTAGCAGTCAGTGAGACAATCCTCTTAGTTAATTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACT:1	-	chr3R	9955665	5'	-	invader2	5047	2	54.48
AAGTGGGAGCACTCATTGTTTTTTGAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATAC:1	+	chr3R	25423160	5'	+	3S18	6	2	75.97
ACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1	+	chr3L	9998031	5'	-	roo	9039	1	45.21
TATATACCCTCAAACTCTCGCAGACATTGTTTTGCGGGCAAATATGTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1	-	chrX	5274410	5'	-	roo	9031	1	57.53
CCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACANCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGACATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGATCATACATACATAAA:1	+	chr2L	12290682	5'	+	1731	71	2	63.04
AAAATCTGCTAAAGAATGTATGGAAAATTATATAAAAAAAAAGAAGAGAGTATGCTACAGTCGAGTTCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGCCTTCTAGCATTTATCTCAAATAGCTTTTATAGTTCCTGCGATCTCT:1	+	chr2L	15004806	5'	-	INE-1	147	1	81.43
TATTAGCAATTTTATATATTTTTCTCATAATATATGTATTTAAATAACATCATTATGCTGAAATAAAGAAAATGTTATTGGCTTGTCTTAATGGCAAGTGAAAATAGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1	-	chrX	21973970	5'	-	pogo	2100	1	73.88
ATGCTCCAATGCCCCACCAAGGAAAATATTTTGCATTTGGGCTCGGGATTGTATGTTATGCATGCCTACCCCGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1	-	chr2L	17081877	5'	+	jockey	4669	1	73.12
CACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCGCATAGCCTCGTCCCTCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACAAACACACA:1	-	chr2L	23352593	5'	+	accord	178	2	52.59
ACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGT:1	+	chr2L	21884520	5'	+	pogo	71	1	68.75
ATAAGGGAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1	+	chr3R	6290944	5'	+	Doc	11	1	71.43
TTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGTTTCTGTTCCTAAAT:1	-	chr2R	4339488	5'	-	G5A	2754	1	80.00
AATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr3L	11393458	5'	+	roo	14	2	69.49
TACGTCAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTCAATGAATCGAG:1	-	chr3L	21818078	5'	+	roo	8720	2	58.22
CCCCATGTTCTTGGAAAATGATACCGTGTTATAACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1	-	chr3R	17478480	5'	+	copia	4918	2	52.74
TATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTG:1	-	chr2L	9399537	5'	-	Transpac	242	2	65.75
GGTTTTCGATATGTCCGAGTATATCTGCTGGCCGCTCAGCTCGTTGATCCACTTGCTAAGGAAGATTTCAGCATCCTGAAAGAAAGTTGGATGACGAAGTAGAAAATATAAATTTATAAAATAAAAAAAAA:1	-	chr3L	14792714	5'	+	TART-C	11097	1	66.41
CCCGCGTTTCACTGTTGCTTTTTTTTTCGGCACAAAAGGCAACAAATGAAAGACAAAAATGCTTGTGTAATGAAAGACTTGAGCAACAACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGG:1	+	chr3L	3481957	5'	-	Idefix	278	2	60.27
ATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCAT:1	-	chr2R	21298801	5'	+	jockey	301	1	77.78
ACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTT:1	-	chr2L	23034042	5'	-	FB	347	1	63.45
TAATTAAATAAATTGTATATATTATATTCAAAATTGCTTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1	+	chrX	22617209	5'	-	roo	9033	1	57.53
CAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCG:1	+	chr3R	18346662	5'	-	INE-1	533	1	57.45
TCTGAAAATGTTTTGAGCCCGCTTTGGAGCTTGGCCCCATCTTCGTTGGCTTAATTACAGACCCTCGATAAGGCGTCGATGGCTCGGAACAAACCTGAGTTCTTGACATTCATACGGACAGACGAACATG:1	+	chr3L	6807302	5'	-	INE-1	122	1	71.54
TCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1	+	chrX	21014769	5'	+	copia	4918	2	52.05
TCTTGATCTAATTTTCTTGCAGCTCCTACAAAATTTGTTCCGTTGTCTGAATAGATATTGGAACATTTTATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGG:1	-	chr3R	19447451	5'	-	roo	49	2	50.71
GAATACACACACACATACTCATCATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1	-	chrX	3308384	5'	-	hobo	2907	1	51.85
ATATTACTGGCATCACTACGGCTTTCAATTGTGATAGTACATCAAATTATATAGTATAGAAGAGCTTAAGGATTACAGTAGTATAAAATAAACTATACATATCCCAAAAGTAGCTAAGTACCTACATTTAAATCTTATAAATTGAA:1	-	chr3L	9955320	5'	-	Tc1-2	1410	1	48.63
TTTTCAGCTGCAAGAAATGCCAAAGGAAAGTTGAAAAACATAACAAACTGCAAAAAAACATCAGCAGCAGAAAGCTGGCAAATAAATTGCACAAAAAAAAAACACACACACACACAAAAACAGAATTTAGGATTCTGATCGTGAA:1	-	chrX	5936429	5'	-	Idefix	386	2	82.07
GAAAAATACCCAGAACTATTTTTAAAAATTTTATTCGAAAATATTGCGTTATTTCGGTGCAACCTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1	-	chr3L	1534630	5'	+	pogo	5	1	73.20
GACTATCGCACCTGATCCTCCAGGCTGGCTTCTAATGATCTTGTACTCGGTGCTTTCGTAGGCTCCAGGTTATGAGAGCCAGTCTCGGTTGTTTTAAACAGTTCATGTACCTGAGCGGGTTTTCCCGAG:1	+	chr2L	15424436	5'	+	R2-element	3322	1	51.16
AACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1	+	chr3L	16015234	5'	+	1360	54	1	60.45
AGCCAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAA:1	-	chr3R	29397511	5'	+	jockey	4628	1	67.86
AATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr2R	19050329	5'	-	roo	390	2	64.34
TTTTAGTATCAAAATTTGAAAGCCCGTTAAAGAAATAATCGAAAACTCGATAGTTTTGGTGCGGCATTGCCAGCATTCGAAAGGCAAAGAAAAAGCCGTATGAAAATTTCTCTAGAAAAATCGAAATTCTTTAAATTAGAAACAGC:1	-	chr2L	5532311	5'	+	TLD2_LTR	160	1	58.90
GTTGTGGTCAGCCTTTGTAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1	+	chr3R	22821949	5'	-	mdg1	410	2	71.23
AAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACAC:1	+	chr3R	24455357	5'	+	Quasimodo	35	2	60.33
AAAAAAGAAAGGAGTATGTTGTTTCATTAGAGACTCGAATAAATAAACTTGAAAAAGAATGCGATTCCCTAAAAGCTGTAAGTACTCTCTTTCAGTTTAAATAATAAACTTACTCGAGTGCTGCTTTATCTCGTCAAATACCGTTG:1	+	chr2R	5149080	5'	-	X-element	4378	1	77.40
CTTTAAAATCACCGTCAGTTGGCACTGACCATCAATTATCACCGTCAACCTTTGGCCTTTCGGCACGAGGGTTTTGATTTATGCAGTTTTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1	+	chrX	18030213	5'	-	opus	488	2	71.97
TTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAGTTTTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATGTTTAAAGACTTACAGTTTTGGGCTCCGT:1	-	chr2R	20596544	5'	+	roo	31	2	51.92
GGTACGCCCACACAAATTGCCACGCCCCTAAAAGGGAGAGTGCCCAACTTCTTGTTATTTACGACCCACATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1	-	chr3L	20886406	5'	+	1360	48	1	56.80
GTGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGGGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAG:1	-	chr2R	5924406	5'	-	jockey	4722	1	44.23
ATTAAGCACATAAAACAATCAGTCATATGGTAAAAATATGGAAAAGAGGGCGGTCGAAATATAAGAAACTTTACCTGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACATCTTTTGGTTCAAGCTGCACGGTAGCG:1	+	chr2L	15819433	5'	-	hopper	475	1	54.81
TGGGTTCATGGGGTGAGCTGATGTGCTTGTTGGCGGAGTCGGTCTAAGTCATTCCTAGACTATTTTAAAAAAGCCTTATCTGAGAAAACAGATACGAAGAAATGAATATAGTTTAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAG:1	-	chr3R	1424256	5'	-	Cr1a	4298	1	60.96
AATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1	-	chr3R	29361035	5'	-	mdg1	341	2	75.52
ACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	+	chr3R	17817874	5'	-	roo	9045	1	62.30
TAGCAGAACAAGGAAACTCATAGAAAAGTGTTAATTAAAACCACATGTGCGACTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTAT:1	-	chr2L	10685196	5'	-	I-element	5001	1	58.91
GGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTNNNTCTGTAGTAGGCTGCTCNTNNNNCCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:1	-	chr3L	20168426	5'	+	mdg3	5284	2	54.44
CCACTCGTCCTTGGCTCCATTTCCTGTGTCTCTCTGCACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1	-	chr3R	7482864	5'	-	412	7513	2	62.33
GGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGCTCATATCTTATG:1	-	chr2R	11164523	5'	+	roo	43	2	56.16
GGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGTTATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	-	chr3R	20427516	5'	+	jockey	14	1	77.04
ACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTATATGAAT:1	-	chr2L	14772141	5'	+	roo	52	2	51.37
ACTATGCCTAACCTACTGATCCACTGAATTTTCCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTG:1	-	chr2R	5285513	5'	-	Doc4-element	2625	1	40.30
CATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACATTG:1	-	chr2R	5532318	5'	+	G4	3825	1	69.78
ATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTC:1	-	chr3R	25423275	5'	-	3S18	6048	2	69.75
CCGCAAATTGAAATGAATTTTGCGGTTAAACACAGTCAAAAGGAAATAAAACGGGGGGGTGTAGATACATACGTACATACAAAAAACGACGAGAATTGATCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCT:1	-	chrX	17548172	5'	-	roo	30	2	69.18
GATATTAATCAAAATTATTTCGGATTAGTGGTACATATTTAACTTAATTCGAATATGCATATCTATGTCTTAAGAATCTGTATGATAAATCTCAACCTTTTAGCTTTTATAGTTTCTAAGATCTCAACGTTCATACGGACAGACG:1	-	chrX	22595424	5'	-	INE-1	128	1	57.93
CGCATAAACAAAAACTACCTGGGCACAGTGTGACCAAATGGGGCTTAGTAAAGAATCTAAAAGTGGCTTTTTCTGATAACAAGAAATCCACCTTAACTTATTTGTTACTGGTCAAGGTAATAACCGAGTCGATCTTGCCATTTCCA:1	-	chr2R	22888959	5'	+	INE-1	108	1	59.59
AAAGCGTGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1	-	chr2R	5485231	5'	+	blood	7052	2	56.85
TACCGACTTTTAGGTACCTCTACAAATAATTTAATGGTAATATTATAGAAAATGAATATGTTCATTATATATTTATTTTTAGTGTACGAAAACCGATTTAAAATGCTTGTATAATCCACACAAGCTGAATAAATATAAATAAAT:1	-	chr2R	16726843	5'	+	Burdock	306	1	69.44
AAAATCTGAATTTTTGTCTGAAAATGTTCTTAAAGAAGGGCGAAATCAATTAACCTTTCAAAACCAGTTATTATGATTTGATGTCCTTTTGGGAACAGCTACCAGGACTTAGGTAGTCTAAGATTCTCCTCCGAGAATG:1	+	chr2R	8987690	5'	+	baggins	5051	1	47.48
ACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTAATTT:1	-	chr3R	22844291	5'	-	roo	9037	1	55.91
TTCGCTCCGTCTCCCCACACAAAGTGTGTGTTGGTATACATATACACTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAG:1	+	chr3L	13581270	5'	+	hobo	448	1	65.15
ATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCGGCT:1	-	chr3L	16015312	5'	-	1360	3312	1	70.55
AGATGTAGCATTTTTCCCCATCCGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGGGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1	-	chr2L	18419290	5'	+	412	13	2	69.86
CTCTGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1	+	chr3R	15072531	5'	+	pogo	33	1	60.96
TCTGGAGTCAGAGTTGATGAGCACATATGAGCAACTTAAAAATGCCCTAATTGGCGAATTAAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGCCATCAGCAAA:1	-	chr2L	23352614	5'	+	accord	57	2	55.48
GTATACAAAAAAACGCAGCGAAAAAGTAAAAACCAATTTGTTTCGAAAAAACAAACGCAGAAGAGGAAAAACCACAAATCGATATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACAC:1	-	chr2R	13005236	5'	-	3S18	6065	2	43.84
TTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCT:1	+	chr3L	7292436	5'	+	HMS-Beagle2	6915	2	65.49
AGAATAATAATGCTAATTCCAATGTTATAATGCCAGGATCGTCGCGGATCGTCTTGCCGGGCTTATGGGAAAATCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACAC:1	-	chrX	2516404	5'	+	1360	168	1	60.83
TACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTT:1	-	chr2R	5924451	5'	-	jockey	4737	1	52.99
AAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1	+	chr3R	19446102	5'	+	297	25	2	67.59
AGCTATAAGTAATTATATAGTAATTTACAAATAACATACAATTATTTGACAAATTTGGTAATTAATTGAAATTATTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACA:1	+	chr2R	17213436	5'	+	Transpac	458	1	50.68
GAGCAGCTGCCGCCGAGATCCGAAAAAGGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATAC:1	+	chr2L	21008510	5'	+	invader3	5204	2	69.05
GATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1	+	chr2R	5248245	5'	+	1360	69	1	68.35
AAAAAATTAGTTTTGTTAAGTCCTGCGACTCCGCACCGTCAAATTCACACTTTACATTTTCATTTCAAATAGCCATCACTGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1	+	chr3L	15490296	5'	-	copia	235	1	64.80
AATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	-	chr3R	16076865	5'	-	roo	8996	2	70.55
AATGTAAAATAAAGGCAATTTTTATTGCAATTTGCATGAATAAACTATAAAATAAGCATATAAATATAAATAATGTGTGTTGCCACAGTTACAACAACAAAAACGAGAATAACGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1	-	chr3L	2841052	5'	-	copia	247	1	78.08
GTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1	-	chr2R	3065995	5'	-	P-element	2810	1	34.72
AATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1	+	chr3R	18582154	5'	-	roo	339	2	65.52
TGTCAATGAAAAGTGAATTTGTGAACCCCCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1	-	chrX	8543569	5'	-	roo	407	1	76.72
GAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAGG:1	-	chr2R	21298806	5'	+	jockey	219	1	60.34
ATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTCTA:1	-	chrX	6522072	5'	+	F-element	23	1	64.08
ATTTAGTATATTTATTAAATCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAAAAGTGTTTCAAAAAAAAATATATATTTACAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAA:1	+	chr3R	25504189	5'	+	1360	2995	1	96.55
TAAAAAAACCATATCTAAAAATAACTCCACTTTTTTTAAACGCCTTCGCAATTAACAAGCAAATAGACGCATAAATTAAAGGTAAAATTTACTTACATATATGAAATTAAAGTTATGAAATAGAAATTAATAATAAACAATAAAAT:1	+	chr3R	17129162	5'	+	flea	240	2	58.90
GGTCCCAGTTACCGCCCATAGGAAATATAACTCCACAACTTTTGTCAGCCATACTGAGGGAAAATGAAGAGCAAAGTTGCTGAGGAAAAAAGTAAGGGATACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr3L	4843161	5'	-	roo	9021	2	64.38
AACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGTGGCGAGTACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAA:1	+	chrX	23439053	5'	-	R1A1-element	4934	1	64.42
TAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGA:1	-	chr3R	11547784	5'	+	G2	325	1	53.24
GTAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCC:1	+	chr2R	2016808	5'	+	1360	43	1	52.52
AAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1	-	chr3L	7943735	5'	-	Burdock	6355	2	56.85
CGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGT:1	-	chr3R	1844833	5'	+	Cr1a	130	1	53.41
CGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCT:1	-	chr2R	19540451	5'	-	jockey	4946	1	61.79
TTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	18582251	5'	+	roo	48	2	56.93
CTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chrX	3309624	5'	+	jockey	35	1	52.34
TATATACACTTTATATGGTCGGGAACGCCTATTACACACTTTTCAACAAATCTAGTACCCTTTTAATTGTCGAAGAAAATAGCGGTACCACAGTACATTCCGACATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATAT:1	+	chr3R	4112113	5'	+	Quasimodo	13	2	76.03
GTGCACAGCGAAAAAATTGTGAGCATTTTATGCATATATTCGTAAGTTAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1	+	chr3R	12598424	5'	+	hobo	6	1	79.20
GTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1	-	chr2L	15875804	5'	-	hobo	2925	1	65.22
GAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCA:1	-	chrX	5629196	5'	+	jockey	127	1	59.59
AAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTT:1	+	chr2R	4260432	5'	+	micropia	5212	1	49.25
GACACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1	-	chr2L	2703590	5'	+	hobo	26	1	59.48
TATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGCAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	+	chr2R	9632094	5'	+	roo	8697	2	52.94
AGCCGGCGAGGCCTAGAAAACTTTGAAGCTCTCGAATGTTTTGTGGAATCGGATACTTCATAATTACATTGTGAGAAACAATATAACCAATATACAAAACAATGATGTCGAACTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTC:1	-	chr2R	2879977	5'	-	INE-1	549	1	50.00
AAGGGAGAGATAGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1	-	chr3L	21855558	5'	+	blood	7028	2	69.35
TTGTGCATTTCCTACCATCTCCTCCAGCTCGATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGCGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1	-	chrX	10521737	5'	-	Tabor	7285	2	51.15
AATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAAT:1	-	chr3R	21276636	5'	-	BS	5045	1	50.00
AAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAA:1	-	chr3R	11547753	5'	+	G2	318	1	66.34
ATTTAATTTCGCATGAAGCATTCTCTGCAAATAATTATAGACTTCTCTGAATATATACAGATTATTAGGTCACCTAAATAAGAAAATGACTACAATACCGAAATATAGTACATTGATCGGCGTGGGAATGCTGACCATGCACTTA:1	-	chr3L	18953024	5'	-	gypsy11	4147	2	70.34
TATTATTATTATTCTAGTGTCTTTGTAAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1	+	chr3L	21253103	5'	+	pogo	36	1	60.69
TACAACATACGTACTCCATACCCAAGTGTTAACCTTTAATATTCTATCAAAAGCATTTACTCTGTACAACTTATAAATGCTTCAAATCGCAGTATTTGCGCTAATCCAATACTCTCTTCGCCGCTCAAGATAGGCAGACGTGCCCG:1	-	chr2R	7382518	5'	+	roo	240	2	78.08
ACTGTAAGTATGCAACAAGTCTCCAGGGTTCTAGCCAAGACTTGAAACCTGGGATAGAAAAGCTTTGAGCTCACAAACAGTTGCTTGTGCGATCGCGCGGCAACTGCGCAGCGGAGCCCC:1	+	chr3L	2008265	5'	-	X-element	204	1	80.00
GTTGACCATTGAGTTCCTGCTGCTCTGGTGCTCTGCTGCGGACGAATAGCAGGAGGCCTATGCTGTGCTGAGCTATTTTCCCATTTTTTTTTTT:1	+	chr2R	16048141	5'	-	Bica	340	1	56.38
GAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr3L	22400296	5'	+	1360	50	1	74.75
GCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTGGG:1	+	chr2R	19050212	5'	+	roo	8689	2	55.29
GCAACAACCCGTGCTAAACGATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATA:1	-	chr3L	7943765	5'	-	Burdock	249	2	60.27
GCAAGCAGCTAAAGAAGCTAACCAAGAATGTAAGCCCCGACTCGTAAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACG:1	+	chr3R	13457858	5'	+	X-element	12	1	75.00
GCATTATTATTGCTGCGAAATGTAGCACCATTCATGCATATAACACGCTGATTAATGGAAATTCTTTCTTTTTTTTCCTTATCTACACATTCCATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAA:1	+	chrX	20487738	5'	-	HB	61	1	54.79
TATGCAGAATTACTAGAATCTTTTTCTATCATATTTAAATNTTACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATAT:1	+	chr2L	20117851	5'	-	invader4	318	2	51.13
AATAAAAATATAACAAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTATAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3R	22261179	5'	+	roo	8718	2	55.86
AATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTCTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCAT:1	+	chr2L	13763170	5'	+	pogo	83	1	75.34
GTTCGTATTCCAAATTGTTTGAGGTTTTCAAGACAAAAGACATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1	+	chr3L	23818313	5'	-	copia	248	1	58.90
GATCGCTCGAAAGAACAACAAAAGCAAACAATAACAAATTCCCAGCATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1	-	chr3R	14651333	5'	-	P-element	2862	1	69.18
ATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1	-	chr3R	17243212	5'	-	hopper	1352	1	60.27
ATTGGCTTATAATCTGCAATTAGACTTAAAGCTATTTCTTTTTGAACACTACTCAAACGCGATAAATCAACCTCATCAAATATGTCAGCCTGCTCCACACCCAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAG:1	-	chr3R	1327277	5'	-	Quasimodo	242	2	70.55
AAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCG:1	-	chr2L	13151043	5'	+	G6	55	1	75.76
CTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCATAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAA:1	-	chr2R	23332610	5'	-	invader4	3038	2	62.39
CAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr3R	19968096	5'	-	roo	351	2	59.44
GGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chr3L	11393495	5'	+	roo	42	2	67.89
TGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1	-	chr3R	17243238	5'	-	hopper	1378	1	58.22
ATTCAGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr3L	9998009	5'	-	roo	398	1	45.21
AAGAACGCTTCTAGGAGCACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCA:1	-	chr2R	4677385	5'	+	invader3	5185	1	81.58
AAACAAATCGAACAACACAATACCGTAAACAACTTGTTTAAATCGTTCCACAAACATCAAAGATCCGATGCATATTTCTAAAAAATATTTTTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTT:1	-	chr2L	2359319	5'	+	1360	58	1	68.70
TAAATATAGGCCAGGTTTCCGCAAATCGTGATAATAATATTGAAATCAATCAAGGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1	+	chr2R	6487858	5'	+	copia	38	2	55.65
TATACGTTATAAGAAAACGTTACATCAATTTTGTAGCATACATTTTGGGGCATGTACTACTGAATGTACTGCATGTACCGTAGAAAACTACTTCTATTGCCCGAGGTTGGGTTTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATGAT:1	-	chrX	20266420	5'	+	BS	5039	1	76.71
TTTTTATTTCAACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTA:1	-	chrX	23182967	5'	+	Idefix	1	2	71.92
GTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACA:1	+	chr4	1301736	5'	+	1731	4385	2	64.83
ATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr3L	22437864	5'	-	roo	349	2	60.71
AAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chr3R	19968100	5'	-	roo	344	2	63.01
AACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGATGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATGTATTTATTCAATT:1	-	chrX	7256184	5'	-	412	7487	2	67.23
CCCCGAAGGCGTCGGATCTCCTTGTTTGGCGATCAGCAGCGGTATAATTGAAGCAAAAGAGAATCACGTAGCAGTCGTAATTGCATACTGTCATCGTGCGTCCAGGGAGTTGCCTTAAACTGCTACCCCACAC:1	-	chr3L	24054615	5'	-	aurora-element	68	1	60.90
TATATATTTCTGTTCTTATTTTCATAAAGTAATCCTTTTAAATATTTTACTTGCATTATATACGAAAATATTAAAAAAATTGTAAATTGTAAATTGTTTCATATACGTTTTGGTAAAAAATGTAAAATATTTATCTTTATAATAAC:1	-	chr3L	10167928	5'	-	looper1	1660	1	75.34
AAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCCACTCACACCC:1	-	chr2L	15833097	5'	+	hobo	25	1	60.68
TTTCAGTAAAAAGATTATGCGGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACA:1	-	chr2L	22121672	5'	+	gtwin	24	2	52.74
GTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCA:1	+	chr2L	21325101	5'	-	invader4	256	2	65.07
AAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACAT:1	-	chrX	21667925	5'	+	gypsy2	6518	2	54.74
CTGCCTTTTCGCCACACTTTCCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1	+	chr2R	10582383	5'	-	Juan	4153	1	59.31
AGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1	-	chr2R	2427619	5'	+	Doc	25	1	57.41
TTGCTACCTTGGTCCTGCGTTTAAGTTACTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	-	chrX	14559892	5'	+	pogo	65	1	75.41
CAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAATACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTA:1	+	chr3R	25423218	5'	+	3S18	69	2	67.91
AAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1	+	chr3L	23146473	5'	+	1360	41	1	52.42
AATTTTCTAAATATTTTAGAATATACTTATTTAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATA:1	-	chr2R	14542284	5'	+	roo	8665	2	76.64
CAATTAAAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1	-	chr2R	15064472	5'	+	412	29	2	63.70
CGATTGGACTGGGTGCACAGCGAAAAAATTGTGAGCATTTTATGCATATATTCGTAAGTTAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1	+	chr3R	12598412	5'	+	hobo	15	1	76.03
CAGTTAACAAAGTAATTGTAAAAGACCATTTCCCATTACCGCGCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1	-	chr2L	21400416	5'	-	mdg1	7419	2	57.53
GGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1	-	chr3R	17831881	5'	+	F-element	44	1	51.30
CTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCT:1	+	chr3R	22388949	5'	+	G2	2629	1	63.16
TTCTCTCATTATGACAATTACGCGTGGGGGGGTAAATATGTACATATGTATATATATGTACATTCATGTGTAACTTGTAATTTAATGCTATTATCAGTCAATTTATAGTTACACATGTATGTACATATATATACATATGTACATAT:1	-	chrX	19455162	5'	-	G3	4507	1	50.00
AACGAAGGAGAAACGCAGCGGGCTTTCACAGATTTACACAAAATAATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2L	3165037	5'	+	412	7094	2	56.64
GACATACACGTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCAACATGTGTGTTGAATATAG:1	+	chr2L	12290633	5'	+	1731	4331	2	70.37
CTCAGAGTATCCTGAACCACAGTCACCAGTTGATTCAGCCACCGCTGCAAATAATAAATTTAAGTACATGTACTTTAGATATATTATTGATCAGGATCAATTGCCGAGTTATCTGACCATGTCCGTCTGTCCGCATTAACGTCGAG:1	+	chr2L	17977203	5'	+	INE-1	129	1	52.05
ATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:1	+	chr3R	9921981	5'	+	blood	7055	2	60.16
TGATGGCGTTAGCCGACGAAAAGCGCGACACCCAAAGGTTCGAAGGTACTGTTCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGAA:1	-	chr3L	23666115	5'	+	Osvaldo	23	1	53.10
ATAAAAATACTCAAAATTTCCTAAGCAATGACGTTAGAGTGGCAAAAGGTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTTATAAAATATCAACACATTTATCAAAAGTGTGGGCGTGTTAGTTTTGG:1	-	chrX	12698550	5'	-	INE-1	243	1	80.71
TTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTG:1	-	chr2R	4601635	5'	+	HMS-Beagle2	6954	2	68.49
AAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAAGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1	-	chr2L	14081422	5'	-	1360	3354	1	57.25
AGTTGAAACTGAACTTGATTCCGCATAGCGCACAATTGACGATCGATAATAATCGCGCTGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1	+	chr2L	14110727	5'	+	Quasimodo	44	2	58.57
TCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr2R	21907931	5'	-	roo	333	2	68.49
ATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACACTCAC:1	+	chr2L	13585807	5'	+	Tabor	6878	2	59.59
TATGTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTCGGTGACGGCCAAAATT:1	-	chr2R	5311506	5'	-	1360	3326	1	61.38
CAACTGTATGAGGGATGAAATCAAAAATTAAATGAGATTCCTCAAAAGCCAGTGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	+	chr2R	11164415	5'	-	roo	9000	2	67.81
AAATAAACATAAAATTATTTGGTAAATCACAGTAATCATATTAATTACAAAATGAATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1	-	chr3R	16404597	5'	+	pogo	30	1	65.52
GAAAATTTATCTGCAAGTTATAACAACTCGATTGTGTTGGCATAAAAAAGTGATAAAATTTATCTTATGAATTGGCCCATTGCGGACGCTGTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTC:1	-	chr3L	12221578	5'	+	F-element	4646	1	61.43
TTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	+	chr3R	16076776	5'	+	roo	8713	2	58.09
AACAATTAATGCAATTTTAAATAAATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1	+	chr3R	17478334	5'	-	copia	229	1	66.67
CCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTAT:1	-	chr3R	20499875	5'	-	mdg3	5463	2	60.96
CCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	26222878	5'	-	roo	8987	2	78.08
ATTTGACGATGGAACACCTAAGCCCTTTCATCTGAAAAATATATTCAAATATGACGCAATATGAAACATAAATCGAACATCTATTAATCTATCTTGAGGATTACGACTATATTTCGTCTGTTTGGTGATTGTGTTAACTCCTCCCC:1	+	chrX	15848317	5'	-	Burdock	6130	1	54.11
CTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1	+	chr3R	9921970	5'	+	blood	7061	2	57.14
CTAACTTGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCACAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAGTATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr2R	13710651	5'	-	roo	334	2	70.23
CGTGCTAAAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTT:1	-	chr2L	15833533	5'	-	jockey	4990	1	61.96
GTATATAGAGTAAAGTATATAAAGTATATAGATATAGTCAATAGATTCGATCTGGATATGTCCGTCTGTCCATATGAACGACGAGATCTTAGGA:1	+	chr3L	15981847	5'	+	INE-1	138	1	60.64
CGCTTACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGCGAGCGAGAGAGCGGAG:1	-	chr3L	24789700	5'	+	1360	103	1	56.48
TTGAAAATGAAAATTTTTTTAAGTCGCAATTAGAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTACCCATC:1	+	chrX	22777117	5'	+	FB	58	1	70.80
CCCGTTCTAGTTGCTATTGCTGATTGCCATTGTCTGCCGAAAAAGCAGTAAGCTCCAGCAGGAAAAAAAAAGAAGGCAAAATAAATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTA:1	+	chr3L	10385803	5'	-	Burdock	6379	2	73.39
AGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTT:1	-	chr3R	3286186	5'	-	Gypsy12A_LTR	1949	1	66.67
GCAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGTTTTTTTGGCACACG:1	+	chr2R	18448155	5'	+	1360	32	1	51.33
GCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGT:1	-	chrX	6486803	5'	-	roo	9017	2	58.70
TCCCGTTCCCCTCTCGTTTACCATGTTTCATTACCCTATTTCAAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr3R	22122820	5'	+	roo	8678	2	73.08
ATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACT:1	+	chr2L	22315576	5'	+	frogger	56	1	71.65
AATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1	+	chr2L	11518396	5'	-	412	7493	2	60.16
GTTGTGAAATACATACACATGGCCCTTCACCACCCAGACCGGCCACCCCTTTCAGCAAGCCCTGCACCATCAAGCTGCCAAGTATCTCCAATATGAGCTACAGAGATGCGCTCATGTCTA:1	-	chr3R	20106324	5'	+	G2	67	1	72.50
TTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr3L	20654453	5'	+	roo	22	2	65.87
TGCAATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCTGAGTCCAGGTCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1	+	chr2L	11518387	5'	-	412	7520	2	56.36
TGTTATGGCCTTTTGCTCAATAATTTAAGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1	+	chr2L	18419113	5'	-	412	454	2	58.22
GGTTCGCCACGAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGTACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCACGTCAGCAG:1	-	chr3L	18369019	5'	+	opus	57	4	60.84
TTATCAAATGTCCAATTTGGAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATAGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1	+	chr3R	9921931	5'	+	blood	7028	2	74.66
CACGCAAACCCACCTCAACATCGACCTCTTTCCCGGCCGATCCCCCTCTCCCATTATCTTATATAGGTGCTATAGAGGTATTTTCTCGATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1	-	chr2R	16945393	5'	-	jockey	4973	1	58.59
TGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGGGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACCCCAACGC:1	+	chr2R	11629726	5'	+	Tirant	8119	2	71.05
CTTAAAACTAGCATATCATTCTTTCAAATCGTATACTTCGTTTTCATATGCTATTTGCACTGTTTTTAAATTAAAACACGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGT:1	-	chr3L	22848702	5'	-	INE-1	542	1	79.10
GCTGTTATCTCGCAAGTCTTCGAAACCCATGCTTATCAGCGGGGAGGTGGTCGGGCGTGCCACCCAAGACTGCATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAACGGACTCCTGGGCA:1	-	chr2R	17681304	5'	+	baggins	5272	1	59.09
TTCCAGTTGAAGAGCATCTCTGACTGGGGGCGTTTTTGGCCACGCTGTGTGACTAAGCAGGCGAGAGCGTTTACAAAAACCGAAAGCAAACGGAGTTGCCCTGCTCTTCCCACCAGCGAATTGAACTAAAATAAAAATAAAAAAAA:1	-	chr3L	6359289	5'	+	F-element	4683	1	60.96
GCGCAAGAAGGCGGCCATTTTGAATTGATTTGCATAAATATTCGAGAGAGTGAAAATGCAACCCCCAAAATGTACACTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTT:1	+	chr3L	809500	5'	-	gypsy4	450	1	52.41
GTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	-	chr3R	25448452	5'	+	roo	8710	2	53.42
ACAGAAATTAGTTATTTCCTTCGTAATACGTTTATCATAATACCTACTTTAACTAATATACTTAAATCTAAAACGGACTTGATTAGTAATACGATTTTAAAACTTCAAACTAAAATTAATTCAGATAAAATTGAAATTAAAATTTT:1	-	chr3L	16942354	5'	+	1360	3045	1	34.25
TTTATTGTCTGCAAAAGTGTAGATTATACAATCAGGCTAGTGCTAGAAACCGGCAAAGGAATAAATTGTTAAGGCCTGCTGCATCGCATTGATAATCTTTATTTAGAAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAA:1	+	chr2L	15834389	5'	-	jockey	137	1	77.70
TTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAGGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:1	+	chr3R	15363897	5'	+	flea	42	2	55.48
GTCAATTACAGCAACAAAAACAGCGCGAAAAATATGACAAATGACAGAGGGAGATGGAGACACCGCTTTACACATCTCGTCTACCTTTCATCGAGGGTATAAGAGGAAGAGGGAGCGAGAGACACACACACACACACACGCATTC:1	+	chrX	18051885	5'	+	accord	185	2	77.24
GTTTAATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1	-	chr2L	17079867	5'	+	jockey	4677	1	78.76
ATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1	+	chrX	13504160	5'	+	412	7125	2	65.75
TAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1	+	chr3L	17560272	5'	-	pogo	2080	1	63.06
AATTGCGGAAACTTTGCAACAATTTATAGCTGCATTGCAGTGGCTGGTTTCCCAGACTTTCCTTCCTTGTCTTCCCCCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1	+	chr3R	20177072	5'	-	transib2	2796	1	63.36
GCTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGTAAGGGGGTTTCGGGTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCGATGGGTCGGTAACTCC:1	+	chr3R	2833315	5'	-	ZAM	7961	1	70.68
TTATTATTATTATTTAAAAAAATCCAGGATAATATAGTGCTCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAA:1	-	chrX	18409141	5'	+	copia	9	2	58.22
GACTCGTAAATGACTCGTGAAGGCGCTCAGTCCCAAACTCATTAATTAAACACAAGTAACAACCAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACACAGTGGATTAAGTGAAATTA:1	+	chr3R	13457896	5'	+	X-element	41	1	47.83
CGCGCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAATACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1	-	chr2L	21400377	5'	-	mdg1	7380	2	68.49
TTAGCATTTTCAAACGATACTTAAGAAATTTTTCAGCAATGCAAAAGTTTAAGAGGTGAAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACT:1	+	chr3L	19521639	5'	+	I-element	198	1	59.59
AGATATAAACACACCTATAGATCTTATATTCGTATTCGCCGCCGTTTTGTGTGCGTGCGAAAAGTAAAATTAGAATTTATGTGCGTACGCCGCGAATGGCTAATCATAACACTCCCACCAGAGCATACACACACACACACATATA:1	+	chr2L	1631924	5'	+	Quasimodo	36	2	75.17
TCTATGCAGAATTACTAGAATCTTTTTCTATCATATTTAAATTTTACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATC:1	+	chr2L	20117849	5'	-	invader4	3082	2	54.62
CTACAACATATAGAATTTTATTCGAACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTAACACTTTATGGCTCCGTTCATCTCTTATGTA:1	+	chr3L	20654467	5'	+	roo	8709	2	48.15
GGCGAATTATTAAAACAAATAGAGCCATTAAATGAAAATCTAGCTGAAGCCAATAAAACTATTTCAGATGCAGAAAAGCTGCTCAATTTGGAAAAGGAAAATCTGCATCAGTATTGTCCAGTAGGGAGATGGTCGTTATGTTGGG:1	+	chr3L	14981240	5'	-	G7	990	1	73.79
GTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1	+	chr3L	4755243	5'	+	jockey	4737	1	75.83
TGCGGAAATTGAATTCTAAAATATTTATAGCTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1	+	chr3L	4948027	5'	-	hobo	2921	1	63.06
ACAAGTCCAGGAGTGGTCATCTCTAAATGCTTAGACCTGATGGGATAGGAACTTTTATGTGCCCCATACTTGACTAGGGAATTCTGAGTTCCGACCGACGGGTGCACACGCCGAATTCTCGCAGATAACACGATTTATCAAGCGGC:1	+	chr2R	6759466	5'	+	Chouto	6228	1	63.01
TAGCCGACGACTCGGCTCCTTGAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1	+	chr2L	14081272	5'	+	1360	16	1	71.64
GAATAATTTTGCAAAGATAATGAGTTCGTTGTATAAATTATGGCGAAAAGACGTACCATTTCAATGGCCCGATAGTTGTGGTGCATGGTGCCGGACTGATCTAGAGCAAGCCGACGTGTTTGCTG:1	+	chr3L	23817613	5'	+	BS3	71	1	58.40
GCACCCACACAGCACTAATTTTCTGATTGGGAGGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAA:1	-	chr3R	10264946	5'	-	1360	3112	1	77.40
CAAAAATACTTGCGCAAACTTTTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1	-	chr3L	17205322	5'	+	hobo	31	1	65.75
AGTAAATTATGCAACACGATTCGCTAACTTGCTTCAATTTCGAAGCAAACATTTGGTTGCGAAGGAATAATTTCCAATGCCGAACATTTACTATAAGATTAACGTTTAATATTGTGGACGCCGAAAAATGAAT:1	+	chr3L	17766669	5'	-	invader3	278	1	57.89
GTGCATTGGAAACGCCGTCTGGTGACAGAAGCGGCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	+	chr3L	10773052	5'	-	412	480	2	66.67
GACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGTATGCAGAAGGCATGCATATGCTATGTATAGCTTGACCACTTGAGCCGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCGACGCTCCGC:1	-	chr2R	1355079	5'	-	Stalker4	186	4	78.38
CATCCCGTGAATTTAAATACGTTAACATCGCGCGACCAAATATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	+	chr3R	14979800	5'	-	pogo	2039	1	69.47
TACACACATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACAAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCA:1	+	chrX	9571544	5'	+	Quasimodo	42	2	67.62
AACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCA:1	+	chr3R	25423196	5'	+	3S18	5824	2	55.48
CTCATAATAGGCACTTTCTGCGTAAATATATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATAC:1	+	chr3L	11321385	5'	-	mdg3	5484	2	64.10
CTTCGCCGTTAATGAACTAAACCTGTCCTTTGGAGTCCTTCGACTACATCAAAAATTAAACGTGTGCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGATTTATTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1	+	chr2L	5844971	5'	-	transib2	2781	1	52.59
CAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr2R	14388006	5'	+	roo	8739	2	69.86
CATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	+	chrX	5643485	5'	-	roo	336	2	68.49
TTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	-	chr2R	20596533	5'	+	roo	84	2	79.45
CCTTACCAAAGGTATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTA:1	-	chr3R	25448483	5'	+	roo	15	2	74.66
AGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCACTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGGACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1	+	chr3R	9921990	5'	+	blood	7063	2	65.57
AAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTATCTTTATT:1	-	chr3L	22968437	5'	-	mdg1	366	2	53.42
GATATCATCTTTTTCTTCTTCTTCCACTTCCCAGTAGCGATCTAAATCTTTTATTTCTATTGTTGCTAAGTAAAAAATATATAAAGTGGCTGGTATATGTTGTTGATGTATGTTATGTGGTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAA:1	-	chr3R	19444929	5'	-	Tc3	312	1	62.33
AACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAG:1	-	chrX	23280927	5'	-	R1A1-element	480	1	67.26
AGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	+	chr2R	19050219	5'	+	roo	37	2	67.78
CAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1	+	chr2R	12835049	5'	+	jockey	72	1	68.46
GCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATA:1	+	chr3R	9714350	5'	+	Stalker4	31	4	64.38
GTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGA:1	-	chr3R	19450173	5'	-	roo	273	2	52.74
ATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1	+	chr3R	19446118	5'	+	297	6608	2	62.60
AATATGTGAATTACTCAGCTTAATTATGTCAACACACAAACTAACACGATAATTACCTATGCAACAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAACAAATTTTAATGGGCGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTG:1	+	chr2L	586212	5'	-	FB	844	2	52.14
ACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1	+	chrX	10521639	5'	+	Tabor	6909	2	63.45
TTCATGATGCTGCCAAAAATGAATGGTTTATTTTGTTCTTTAATTTTTGGGGAAATAAACACCATTTATTTAGGAAGTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTCATGATGAACTCCACTTAAGAACACAAG:1	+	chr2L	16016266	5'	-	412	484	2	74.48
CCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr3L	4536765	5'	+	roo	8752	2	78.77
CGACGTTCATACTCTACAAGTAACGGGTATAACAAATAATAACTTCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCAGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCG:1	-	chr2R	1439249	5'	-	1360	94	1	69.18
ATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTGAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCCTGGTATATGAGAACA:1	-	chr3L	8249103	5'	+	jockey	4564	1	59.60
TCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAA:1	-	chr2L	12290752	5'	-	1731	4554	1	65.75
TGACTGTGTCTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:1	+	chr3L	10574273	5'	-	Tabor	434	2	50.00
AGCCGTACTCTGATTTTGATTTTGATTTTCTGCAAGTGGGTTGGTATATGTGTGTATTGAGTTCCCTGTAAGTCCAGGATCACAAGACGAGTCGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATG:1	-	chrX	21631311	5'	+	Stalker2	405	1	66.67
TCTCATGTCATAGGGGCATATTAGCATACAAAATATTCTATAAAATCTATATACCATGGAATAAATATGTGATATTATGATTTCTCTTCTCATACGACTGAATATGAACTCTTTCATAAACAACAATTAAAATTACAAAAAAAAAA:1	+	chrX	11945229	5'	+	Doc	4694	1	80.14
TAATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCG:1	+	chr3R	4357524	5'	-	Tc3	1661	1	53.68
AGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTCACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1	-	chrX	17833050	5'	+	Tirant	8138	2	67.06
CACTTGCATTTACGGAGCTGCATACGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1	+	chr2L	18404550	5'	-	hobo	2894	1	75.79
ATGGTCTATCTATCTACAAATGTACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTAAAACGTTGTAAAAAGATATATACAATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAA:1	-	chr2L	22750385	5'	-	Tc3	1621	1	76.03
AGTGGACGCATCCCATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	-	chr3R	22844307	5'	-	roo	9034	1	58.22
ATTTAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr2R	14542256	5'	+	roo	15	2	64.23
GAGAAATCTGCTTTATTTGATAATAAAGATGTGCCGATATAAGGGATGCCATAAACATATACTACAATGCCAACATATACATATGGTTGGTTTATTAGTTCAAAAATTTAACATTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	+	chr2R	9632681	5'	+	roo	71	2	65.07
GAGGACACGATGGTGACACCCCTATAAGGAGAGGCTGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTTCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGG:1	+	chr2R	5173389	5'	-	gypsy	436	2	70.55
ATATACTTCTTTTGGTCGCAAATGTGTCTGCCAAACTTCTGGATATAATCGAGATGCCCTCTGAAAGCGTATAAAAAGTCTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTC:1	+	chr2L	10685840	5'	-	jockey	332	1	55.71
CATTAGGCGCAGTTCCAATGGACGCCCACATGGTAGTCACTTCACCAGCCCAGCTCCGATCATCCGTCCATGTCCTCCGGCCACACCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1	-	chr2L	19308403	5'	-	Juan	4165	1	74.77
GTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAACAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	-	chr3R	10266144	5'	+	1360	53	1	67.89
CGGGAAACAATATTTAGTAGGAGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chr2R	18336160	5'	+	roo	53	2	68.29
AGCGCCNCTCGCATTCTCAATAGCATTTGCTGCCACCGCATAAAGTCAACTGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	28624692	5'	+	roo	8680	2	70.15
CATAATATGAAATTGCCTTATGATAAAAACCAGGCGTCAATTTATGCCACACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACGTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1	-	chr3L	7188653	5'	+	hobo	28	1	66.67
CGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1	-	chr3R	20427455	5'	+	jockey	76	1	70.37
TTTAAGATTCGCTTTCGCTTCCCCTTTTATTTTAGCGCACTCAGTAAAATTTCCATATTTGCATCCCGCTCGCTCTGCCTGTTGCCATCGTCGCCTTCGCCTTGTGTATTTTTTTATTTATTTCCTTTTTTTTAATTTTTCTTATT:1	+	chr3L	3240780	5'	-	Doc	4691	1	61.64
CTGCAAGTGTGTTGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chrX	3309567	5'	+	jockey	12	1	78.42
GTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr3R	13360325	5'	+	jockey	35	1	60.00
AACCTATTAAATCATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1	+	chrX	13704723	5'	-	invader4	305	2	69.18
CTTTAACATTGTTTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCT:1	+	chr3R	22388930	5'	+	G2	2611	1	76.87
TCACGCTGTAAGACAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAAT:1	+	chr3L	15600144	5'	+	roo	8664	1	61.02
CACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCAT:1	+	chr2L	4953935	5'	+	Quasimodo	57	2	63.70
AAACAGAGAGATAAAATAAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr2R	18336100	5'	+	roo	16	2	71.92
AACTGACGGTTTCTGTGGATTTGCTTTCTTTTTTATACGCAAAATCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	-	chr3R	17420554	5'	-	roo	9054	2	67.81
TTGTATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTT:1	-	chr3L	14638687	5'	+	1360	3386	2	51.37
ACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCC:1	+	chr3R	9922000	5'	+	blood	86	2	79.45
GCATTTGAATTTCAATTAGAATTTTAATAATCGAAGCAATGAGTGTGTATGTGTGTGTGTGTAAGAATGAGTGTGTGTGTATGTGCGTAAGTGAGTGCGGGTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAA:1	+	chr2R	13335113	5'	-	roo	41	2	67.81
ATGGCTATTATAGCAATAAGAAATTATTATTTCAATTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACGCCCAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACA:1	+	chr3L	16787108	5'	+	Chimpo	174	1	63.45
AGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1	+	chr3R	17420444	5'	+	roo	91	2	82.88
AACCCACTCACCTGTCAAATGCGTGTTCATATCAAATTGATTGCAAAGTGCTGGCGACCCAAAAAAAAAAGTATGCAACTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAG:1	+	chr2L	2940614	5'	-	roo	232	2	51.37
AATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	+	chr2R	18336168	5'	+	roo	8748	2	78.77
AAACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATAAATTTCAACAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTAT:1	+	chr3R	4604450	5'	+	1360	400	1	62.76
ATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	-	chr3L	11441808	5'	-	roo	324	2	76.71
TGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	-	chr2L	7898378	5'	-	roo	8999	2	66.44
TGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCACAAACATTTGCGC:1	-	chr3R	22276774	5'	+	jockey	80	1	52.48
AAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chrX	10640039	5'	-	roo	8987	2	75.00
TGCAAAATGAAAAAAAAAAACAACAACAACCAAGGAATGTCGATGGTTGTCAAAAGGATCCTGAACTCAACAGTCGTAATTGAAAACTGTACCTTCTCTCTCACGCTTGCTTGGATATGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chrX	7154723	5'	-	accord	7032	2	76.69
AAAATATAATCTTAATTTAAATAAAATTACACAGTTTTGGGCGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGTGTTGCAACATGGGTCAACAAACTTTACTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCCTGA:1	+	chrX	22905338	5'	-	INE-1	154	1	62.33
TTCCATATTCCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1	-	chr3R	1433204	5'	-	mdg1	343	2	69.66
TGTTTTAATTTTTTCTTTTGGAGAATTTCTCCATAAAATATATTGATATTTTTGATCATTATTATCTATTTTAATTTGTCGGTACATCTTTTCAATGTCTGCCGAAACCACAAATTCAAGTTAATCAGACTCAGCCGCATTAACAG:1	-	chr3R	19445466	5'	+	gypsy2	493	1	80.14
AAATAAATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1	+	chr2L	23068815	5'	-	1360	3367	1	66.17
ATATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTATATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTAGAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCG:1	+	chr3L	25255410	5'	+	INE-1	298	1	65.75
TAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chrX	13039537	5'	+	roo	80	2	78.57
AGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTG:1	-	chr2R	20497004	5'	+	blood	7331	1	63.33
AATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	-	chr3R	31817534	5'	-	roo	9004	2	66.90
GTGTGAGTACTTAATATTAAAGCATTCTGTGAAACGGACGCTGTGACGCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAG:1	-	chrX	18378018	5'	+	invader4	80	2	63.36
ATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1	-	chr2L	16067167	5'	+	297	6642	2	71.11
GAACAACATTTTGGTAATATTTCTAAGGATTTAATAACTACAAATGAATGCACTTTAAGTAAATATTTTAAAATATTTACTTAAAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACAT:1	-	chr3L	20445596	5'	-	Cr1a	4198	1	59.06
GAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTCACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chr2R	15004753	5'	+	jockey	14	1	52.07
AATTCAAATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chrX	13066621	5'	+	jockey	20	1	69.29
TGGGGGTGTAATATATATTATTGGTATAAAAACATGATATTATGTTGATTTTATAACTTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGTATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGG:1	+	chr2L	15227277	5'	-	gypsy12	10165	2	47.79
ACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGGCACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTG:1	+	chr2L	12290676	5'	+	1731	4319	2	62.50
AAAATGAGAGTTTCTCTATTTTCCAGAGACACACTCGTGTCTCTATATATTTTATTCACAAATTTTATTGTGTCGGCTGACAACTGCGCTTCAGCTTTTTTGCAATCTCTTCGCCTTACTTCTGTTGTTTTTTTCTTTATTTTT:1	+	chr2R	19466617	5'	-	gypsy7	5011	2	46.53
CATGACAAGAGAACAGAACGCAGATGTCCTTTTGGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1	+	chr3R	27424810	5'	-	blood	358	2	67.67
GCAGAGAAAGAGAGTGGGTTAATTCAGTTTAGGCCAGGCCAAAAATACAGTGGTCGTCGAGTAAATAAGCCACCGATTCAGAATTTCCATTTTATAATACTAAACGAAAAAAAACACTATAATAAACTTTAAAAATATATTAGGAA:1	-	chr3L	13924076	5'	-	hopper	169	1	63.01
GGCGTTTTTAGGCCTGCTTTTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1	+	chr2R	16891795	5'	-	hopper	1387	1	65.07
AAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAAC:1	-	chr2R	4032631	5'	-	micropia	5118	2	66.67
ACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGACTTTCGGGGGC:1	-	chr3L	2485987	5'	+	jockey	4545	1	39.13
ACAAAAAAATCGCAGAAAATTAAACAATTTACAAAAGACAAGCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1	+	chr2R	18349322	5'	+	roo	47	2	66.96
CTTGCAGAGTATTCTCTAGTTTTTCATACATCTCATCAAAAGTTTGGCTATCGGCATCGTCGATGTAATGCATCATGTCACCTGATGCTTTGCAAATATACCGCTGCTTCGAGCACTGGGCTTTTTGCTC:1	-	chr2L	22200779	5'	-	G6	197	1	63.85
CGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr3R	28624630	5'	+	roo	72	2	80.47
CATAAAGCATACCACGGTTTAATAATTTCATGTGTTGAGTGATAATGATGGCCTTTAGTTTAATTATAATTTTTACATTACTGTTTGGTTTAAAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGCGACACAGTG:1	-	chr2R	2959112	5'	-	Dm88	4419	2	64.14
ACGGAAGGTGTCGCTGGAGCGACTTGGCCGAACCGAAGCGCTTGCCGCACAGCGTGCATTTGCACTCGGACTGTATGTGTGCACACGGATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAA:1	-	chr2R	21004029	5'	+	1360	197	1	58.26
CAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGCCGCGGGTAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCACAAACAT:1	+	chr3R	13360302	5'	+	jockey	74	1	56.85
GTCAAGTGTTCCCACCTAAGAGTCATATTTCGTCTATTATTATATGTATATGTATAAGTTAACTTAAGTTAACGCCGCTACGTATGTGAAAAACGGCAACAACAACATTCTGCAATGTAAGCATTATGCCGGATGACGT:1	+	chr2R	4815883	5'	+	gypsy2	6555	2	82.01
TAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAATAAT:1	-	chr2L	23034062	5'	-	FB	366	1	50.00
CCAGAGCTTGATGTTAGATAATCGAGTTTTTCAAATATAATTATCAAACGTGTGTACAGTTGGCACAAATTTAAATATAACGTATGCCGATAGCTTTTACTTATTAACTTGGGCTTGTATATACATATGTACATA:1	+	chr2R	8338475	5'	-	invader3	5089	1	78.52
ATTCTTTAATTCAATATTATTTACCCAAGCACATATGTAGCCCACTCAGTTGGCCAATTTACTGGATTTATCTTGTATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGC:1	+	chr2R	23335262	5'	+	invader4	3020	2	49.32
CAGGTGAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAC:1	+	chr3R	26659714	5'	+	HMS-Beagle2	6906	2	64.38
TAGAGAAAAAGTTTGTCACGCTGTAAGACAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3L	15600129	5'	+	roo	8677	2	59.59
TATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGATTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAAC:1	+	chr2R	5284572	5'	-	Doc4-element	2571	1	73.97
GGTACATTATATACATAAATATATTTTATTCTGTGTGAAAGCTCCTTCTAAAATATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGC:1	-	chr3L	231535	5'	-	roo	8921	2	63.01
CAAAAACACAAATATAGTTCATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1	-	chr2L	15991438	5'	-	mdg1	7432	2	65.75
CAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAG:1	+	chr2L	21008549	5'	+	invader3	5245	2	64.84
ATTATACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATCGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCC:1	-	chr2R	5206903	5'	+	G4	3764	1	60.27
AAAGCGGCGGACCTTCCTCCTGATGCACATGAAGGTCAAACACGGGATTGCTTTCCCGGGCAGAGTAAATGCTGATCCCGAATATCCAAAATCTGTAGATTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGA:1	+	chr2R	9872844	5'	-	roo	73	2	68.75
TCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	-	chr3L	9998177	5'	+	roo	56	2	69.75
GTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1	+	chr3L	22863402	5'	+	412	7135	2	76.22
GGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1	-	chr2R	13817713	5'	+	412	49	2	60.66
CCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGAGTAATGATGAAATCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATACATTTATTCAATTTCTTCT:1	-	chr2R	24218589	5'	-	412	428	2	69.57
ATATTCGTATGTCCTAAAAGTATCTTATTGTCACTATGATACGGTTGAAAAAAATGTCAATTTGATAACCGCACCCACTGCAAACACTAGCCAATTTGGGATATAAGTCATGCCACGTGCCACAAAGCGTTTCGTTAAGGAAA:1	-	chr3L	2517438	5'	+	invader5	284	2	65.73
GAAACATATTCTGTTGCAAGAAAAATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1	-	chr3R	16076906	5'	-	roo	9037	1	58.90
AATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACAT:1	-	chr2L	21750457	5'	+	Stalker	7004	6	80.17
GATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGT:1	-	chr2L	20117930	5'	+	invader4	2824	2	75.19
ACTTAACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCT:1	-	chr2L	12290781	5'	-	1731	4583	2	54.79
CGATGTTGCCAATAAGGTTCCTGAGATATGAGGCCATAAANCACGACCTCGTCATAAAAAAAAGAAAAAAAAAAC:1	+	chr3R	14071635	5'	+	BS	5103	11	90.67
AAGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1	-	chr2L	13914181	5'	+	jockey	4703	1	50.00
CAATTGTAAATTTCGATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAGGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1	+	chrX	13504108	5'	+	412	9	2	76.30
AATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTACAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1	+	chr3L	12861733	5'	-	pogo	2033	1	77.95
TGTTTGCTTTATGAATGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1	+	chr3R	15072534	5'	+	pogo	36	1	58.90
GTTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1	-	chr2L	15833111	5'	+	hobo	28	1	61.94
GAAAATGTTTTTCAATTGAATTGATTTTGAATGCGCTCTGTCTGACTTCTGTCTGTGTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1	+	chr2L	1377609	5'	-	hobo	2924	1	68.38
CCTTAAATACCCGCCGAATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chrX	13039527	5'	+	roo	55	2	80.95
AAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCA:1	-	chr3R	19448074	5'	-	roo	162	2	55.47
CCTTGACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAACGCACAAGAG:1	+	chr3L	23933551	5'	-	Cr1a	226	1	66.94
ATTATTGGCATTCATTTGTCTTAACTGATGAAAAACGTTTTAATTTAGATGGCCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCATGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTA:1	-	chr2R	6487943	5'	-	copia	187	2	62.33
GCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1	-	chr2R	5485224	5'	+	blood	7056	2	53.15
GAGCTAGATGATGTTTTCCTTTCCATTTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGATCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGAGTCAGAAAATGAAGAAACGCTG:1	-	chrX	22643353	5'	+	Tc1	1595	1	54.11
GACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGAT:1	+	chrX	13704758	5'	-	invader4	3030	2	60.00
CAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1	-	chr4	829120	5'	-	INE-1	156	1	69.47
TGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1	-	chr3R	29361071	5'	-	mdg1	7403	2	57.53
CTTCCAGCCGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	-	chr3R	14940160	5'	+	jockey	10	1	55.38
GTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chrX	9540032	5'	+	roo	80	2	76.55
GTTTTCTCTTGTTTTCAGACATTTTAACAACAGCAAAAACCCATTTTCGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chrX	6486652	5'	+	roo	8684	2	41.78
CAAATGATTGTTGTCAACCCAATCAAGTTCATTCACCCAAATCATAATAATCGATTCACGGGTCGCGATGCGCTCTTTATTGAATATAAAATCAAACTGAACTTAGGGCTAACAAAATATGAAACTCATACCGGCCACTC:1	+	chr2L	1647437	5'	-	gypsy6	7539	2	60.71
GTCACTTCGATGCCTACCGCAGAAGGATACACTCTCGCCATTTACCATTCTGCTGCCTCACTCCTGCTCCATTATCCTTTCTCCGTTCTTCATTCTCCAATCTCCTTACCATCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCC:1	+	chr3R	12853533	5'	-	Quasimodo	253	2	77.40
TCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1	+	chr2L	20840426	5'	-	Transpac	5200	2	57.58
AATATCTCTCGCATCGATGATAAATCATAATTAGACTAGATCGAAGGAAAATAAAACACAGACTGTCAAACTTTAAGCTCTTCAGCTGAGGATAATTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTAC:1	-	chrX	14736174	5'	-	roo	308	2	70.92
AATACGCCGTACAGAATATAAGAACGGGGAAGTTATATCTAATTATATAGTTAATATTAGTCCACTTAATTATTGTTTTAAAAAACAGCATCTTAAACATTTTTGTAGCTTGGGACAGCTGGTCGTGATTCGCGTCAACATCCTGG:1	-	chr2L	22190061	5'	-	BS3	136	1	73.97
AATCGAGAACAAGTGAAGTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCGGCTCTGTTTGAATCTG:1	+	chr2L	2122386	5'	-	Stalker4	7305	4	51.37
AAGAAACTTATGAAGAAACTACAATATGTTTTTATGAAAGCTTTGGGAAACGCATTCTGTTAACACTCTTTGATAATGGCGACTTCGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1	-	chr2L	14109443	5'	-	Quasimodo	250	2	62.96
AGAAGCACCTGAAGCAGGGCAAATTCTTCACCTGCCAATGCGAACGCTGTCTGGATCCCACCGAATTGGGAACACACTTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAAGACTCCAAACTTTTTGTGCAAACTACTTGTGATTTAACAACAA:1	+	chr2L	10853642	5'	+	transib2	2749	1	52.78
TGTTATATATGTATGTTTACAGAAACGAAAACTGGTCAATTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATAAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGAC:1	-	chr3L	10580507	5'	-	Tabor	371	2	71.72
ATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1	+	chr3R	25826650	5'	-	mdg1	391	2	58.46
ATCTGCAACTACGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1	+	chr2R	5530007	5'	-	1360	3368	1	58.00
CTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	-	chr2L	7898400	5'	-	roo	357	2	51.37
TTGTATATTCATTGAATAGTAGAAGACAGTGTTTCCAACTCTACTCTTCATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGGGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTCTGTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAG:1	-	chr3L	100564	5'	+	INE-1	167	1	77.40
CGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1	+	chr2L	11732247	5'	+	Doc	35	1	53.10
GCAAAACATAGCCTTAATCTTAGTTGTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1	-	chr2L	5845086	5'	+	transib2	47	1	53.24
TATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGGTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCG:1	-	chr2R	21298824	5'	+	jockey	268	1	56.00
CACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGCCGCCAGGCC:1	-	chr2R	20496989	5'	-	blood	7340	1	64.91
ATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1	-	chr2R	5485193	5'	+	blood	79	2	71.23
CATTTGCCGCAAAAGTTTTTCATTTAATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	+	chr3R	28624524	5'	-	roo	9045	1	67.12
CTGCGCGACATGCCCCCAAAACTGGCGACCATGGCAATCTAAAAAAAAAATAATATAAAATAAAATAAAATAAGACACACATTGGTGAGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr2L	7898265	5'	+	roo	8677	2	67.48
ATGAAGATGGAAAAATTATAAAAATTTGTTTAAAGCCGCTTAAATGGTCGTCACATCACTCAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTT:1	-	chr3L	7942709	5'	-	Burdock	6153	2	57.45
GGCCATATTGAATAGCAGAATTATGCAAAGTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTACAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTC:1	-	chr3R	23235560	5'	+	jockey	4852	1	76.71
TGAAAAAAAATATTTTTTAATGTAAAAGCAATATAAAAAAGCAATATTAAAAGTGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAAGGACAGACGGACATGGCCATCTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATA:1	-	chr3R	12863662	5'	-	INE-1	83	1	50.38
AACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1	+	chr3L	1534520	5'	-	pogo	2097	1	65.91
CGACACGCTGCGTCGTCTCCTCCGAGCCTCCGGATACTGAAAGAAATGCAATCTGAAGTTGTAGTTCTGGAAAATTATGGGATATGCCATCAAAGGGTTTGTTCATAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAG:1	+	chr3R	18064376	5'	+	Q-element	94	2	69.72
AACATGGTTATATCATAAACATCAACATTTAGAAATTATAAAATTGAAAATCATAGCCTTATATACATACATTTTTATTCTAGATTAATATTAAATTAAATTGTATATATGTATATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1	-	chr3L	11393634	5'	-	roo	403	1	74.66
GAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chrX	13066610	5'	+	jockey	36	1	58.33
AATTGCGAACTTTAAAGGGAGTAGTGTTTTTTTTTACTATATTTACTAAATATTTATTTGAAGCCTTTTCGGGACAAATAATTTACAAAATAGTGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGA:1	+	chr3R	27966973	5'	-	roo	8795	2	75.81
AGAGTTTTTCTGTTTTTCTTTTATTTAGTATTATCCTGTATATTTCTGTTAGGGAAGAATGGAGTCTTTCTACCGGGGAATTACTCGTCGACTGCGAAAGGTTCGCAACTCTATCAGCTGTATTGTCTG:1	-	chr2L	15814551	5'	-	Rt1a	199	1	67.44
GGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTATT:1	-	chr3R	17615162	5'	-	mdg1	7078	10	51.19
CTAAACGACTAACGATTTAATCTTAATAAATATTTCCGTTCATTGGTGACCTCTTATTTTTGAATTAAAATTTTCTTATTACTGTAAAAGTGTTAAATAATGTAATATTATTCCAGCACACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCT:1	-	chr2R	25218796	5'	+	Cr1a	3990	1	73.97
CGTGCTGCATCCTATGGGCTGCTATCAAACGTGTCTCAATGTCTCCGGCAGCGACTAATGATGATGGTTCCATGTCCTCCGACCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1	-	chr3L	2701341	5'	-	blood	7319	2	64.76
AAAAGTAAAAAAAATTATTATTAGTTCGCTTAGAAAAGCAATACATTTTTAGGATTCACACTGTTCAGCTATTGAGCTTTTTTAATAGCTGTTGCGTAAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTT:1	-	chrX	13287874	5'	-	diver2	305	2	53.19
CCTCGTTCGTTGTGTGCTTTGCATGCGCATTTTTTCAGTTTAGTTTACTGAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	-	chrX	5629253	5'	+	jockey	70	1	69.18
TATCCAATATGACAGCCCCTGGCGAAGTGAAACCGAAAGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTT:1	+	chr3R	26615114	5'	-	gypsy12	10170	2	54.55
AATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr3L	23146465	5'	+	1360	55	1	54.11
TGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	-	chr3R	28624642	5'	+	roo	78	2	74.66
ATAGCGCACAATTGACGATCGATAATAATCGCGCTGTATGTATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGC:1	+	chr2L	14110751	5'	+	Quasimodo	76	2	74.66
TTCTTATTGAGTTATACAAAAAACCGAATTTTTGTCCAGGTTTTGATTAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr2R	20596604	5'	+	roo	13	2	75.34
CTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr3R	22844211	5'	+	roo	78	2	77.78
AACAACAGCAACAACACCATAAATCACACACATTCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCG:1	-	chrX	7206297	5'	-	F-element	243	1	73.44
GTAAGGGGTATAATATAATGAAAATACATACATACACATTNTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTT:1	-	chr2L	23034077	5'	-	FB	403	1	46.77
TATGATTTATCGGAGCTGCCTGGTTAACTTTTTGCCCTCGAAAATAAAAACAAAAACCAAAAGAAAAGTACGTGATATTGATCAGGTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGAGTTCCGG:1	-	chrX	9985141	5'	-	Transpac	426	1	59.03
CATATTTAAAAAAAAAAAGGGAAAAAA:1	+	chrX	5760219	5'	+	Bica	339	1	85.19
ATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAAGTGTAACTTCTGTTAAGAC:1	+	chr3L	10574296	5'	-	Tabor	7250	2	64.38
AAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTATCTT:1	+	chrX	17526862	5'	+	roo	72	2	77.42
GTTTTCTTTGCTTTCAAAATAAATACCTTGAAAGAAGGTATTTAATTACCTATGCACGATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	+	chr2L	23068799	5'	-	1360	3370	1	69.86
TAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAACTTTGTACGAAAATTCATACGT:1	+	chr2L	18338991	5'	+	pogo	87	1	76.03
GGAATGGATGTGCTGCAGCAGTTGAATGCGGTTATTGATAAACAGAAGGCATGGTTTGAGTTAGCAAACATGAAACAGAAGATTCAGTTTGAGGCCTACAGACCATTAGAATTGAATACAATATGTAGTAGGCTAGAGGGACACAT:1	+	chr2R	1323981	5'	+	invader2	4860	2	77.40
AATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	+	chr2R	13710613	5'	+	roo	8673	2	62.71
CCTGCCACGCCCACTCCACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1	-	chr3R	14940188	5'	+	jockey	23	1	62.26
AGAGGGGTATGAGCATTGAAAACTTAATAAATCTTAAATCTTGCTTAAAAGCAACTTTTATTGATTTAAATGTAAATTTTTTAATTTAAAGATAAAGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGTATACAA:1	+	chr3L	12327915	5'	-	gypsy12	10036	2	50.68
CTTGTCACGAGATTGAAACTTTTTTCGGCACAAGCAACATTTTCTCTCAAATTACGAACACTTTGGGTCAGGATATTCTGCACCATGGGCAATCATCCGCCTCCTCATGTCCAAAGCGCTTCACA:1	+	chr3R	18492522	5'	-	Rt1c	5037	1	61.60
ACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:2	+	chr2R	9791545	5'	+	412	7081	2	67.12
TGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAA:1	-	chr2L	21153556	5'	-	1360	325	1	60.27
CGTACAGTAGGGAACAAAAGCTCCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1	-	chr2R	9662842	5'	+	412	7074	2	71.23
GATCATGTGTACACCGGTTATACCCTCCACCCAGAAATATTCCGTCTTTCGCAGCTCTATCAGATCCTCTTCCAGCCAAAAGCAGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAG:1	+	chr3L	8965337	5'	+	Doc	4505	1	61.54
CAGCAGCCCTTCGCCCCAAGGCCAGAAACCAAATCCTAGCGAACCGAGCTGACCGGAAATCCCCAACAGCAGCAGCCGCCCCCTTGCACATTCCATGGGCTGACAGCAACGCTTCTACTTCGGCCTTGCATTCAT:1	-	chr3L	13281866	5'	-	Chouto	5952	1	63.70
ATATATTTAAAGTAAGAATTTAAATTCACTTACGGCCAGTCGAAATTTTTGCCATTAATCATATGTTTAATATTTATTTATAACTATTTCTCCCACACTCAGAGCGATTTATTTATATGTTTTTTAAT:1	-	chr3L	2153352	5'	-	S2	1603	1	76.56
GAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1	+	chrX	5643501	5'	-	roo	9025	2	71.43
TTTCTAAATTTGTCGAAAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAATTTTATCATTTCGCTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTTAGAGAGACAACATATGGTACTTATT:1	-	chr3R	21619592	5'	-	Tc1	103	1	58.22
GGCAGCTACGCTTGCGCTGTGATAATACGGGATCACTAAGTCAGGCTTAGTGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGGTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1	+	chr3L	23797903	5'	+	Doc	58	1	57.48
CCACGAAATCAATGTTCGATGCTTTTCCTTGCCCCAGAAAAAACTTTTCTTTTGCTCAGCTCTTCTTCCCACGTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGC:1	+	chrX	2525286	5'	-	P-element	415	1	59.35
AAAATTTAATTGCAATTTGTTATGGCCTTTTGCTCAATAATTTAAGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1	+	chr2L	18419096	5'	-	412	7524	2	69.86
CACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	+	chr3R	22844193	5'	+	roo	18	2	53.76
CCTTTTCACACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGATAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	+	chr3R	25448308	5'	-	roo	9056	1	71.32
AATATCTATAAACAACAAACAACAAGTTATAGAATTTTTTAACTTTTAAGGAAAAATAAATAATAATAATAATAAAATAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAACACGACATACGTTCTCAG:1	-	chr3L	26375416	5'	+	Doc	218	1	41.54
GAAGATAAATCAATTTTTGAATGGACTTAACAGGTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTT:1	-	chr3L	6603100	5'	+	Circe	64	2	81.40
GGCTCTTAAATTGTTTGTAAAATGTTCAACAACCGCGCGCGCTGCTCAGCGGCAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACACTCATGACCTCCCTAACCTGGCTTTGAC:1	-	chr3R	20423573	5'	+	jockey	4773	1	49.11
GTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1	-	chr3R	17831901	5'	+	F-element	14	1	65.71
GCGAATTTATGTATCTGGAACGAAGCGGAGCCGCAACCCCAATGAGGCCAGGAACCGAAAACCATGGACCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAACGCTAAGAA:1	-	chr3R	16972673	5'	+	Ivk	241	1	54.14
AATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1	+	chr2R	16945269	5'	+	jockey	21	1	60.18
GTATGTATGTGTATGTAAAATTTTGCTGAATATATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCC:1	-	chr4	166519	5'	+	Quasimodo	77	2	80.00
AACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCACACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1	-	chr2L	11661034	5'	+	F-element	54	1	42.36
TGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGCACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1	-	chr3L	21855508	5'	+	blood	72	2	75.19
GCCGGTATGAGCACTTGCTAAATAATAGGAAACAAAAAAATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1	+	chr3L	23325940	5'	+	pogo	17	1	73.24
GTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	-	chr2L	18419260	5'	+	412	37	2	52.86
GTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1	-	chr3R	10266131	5'	+	1360	43	1	76.74
ATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1	+	chrX	18193681	5'	+	jockey	77	1	69.23
CTGCTTCCCACTTTTTAAGTTTACTTCGCACATCTACATTCCATTCCGTTTGACGGTACTCTGATCACCGTAATGAAGAGGCCGACGATTCCCTAATTGCTGTTGCCAGGAGTCCCGCTACCAAAGACACTAGAATAACA:1	-	chr2R	3175022	5'	+	Tc3	240	1	56.43
AATATAATGAAAATACATACATACACATTTTTACTGTGATCAAACATGTTTTTTATTGGAAAATCTTATTTTAAAGAGGTGGGCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTTAAGGTTTTTTTAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAAAAA:1	-	chr2L	23034066	5'	-	FB	370	1	47.26
AGAGATTACTCTTCACAAGCTTAAGAGAAGGTGAGTTAGAGAGACACTCTCGTTGGAATCTAACTGACTCGCTGCTGAGAGGGCTTCGCGTTTTATTCATTCTTACATGGGTTCTTATCATCCAATTATATAATGCAG:1	-	chr2R	3705437	5'	-	rooA	252	2	61.59
GCGGAAAGGTGATGAACACACGACCCAGCCGTTTGTACTGATCCAGATTTCTGGTGTCCTCTGCACTATAAAGCAAGACAGAATGTTGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCA:1	-	chrX	13810265	5'	-	INE-1	548	1	59.66
ATGACAAGAGAACAGAACGCAGATGTCCTTTTGGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1	+	chr3R	27424811	5'	-	blood	7356	2	60.96
ACGCGACAAAGGTAAACGGCGCTCACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACAT:1	-	chrX	22386796	5'	+	hobo	62	1	57.14
AAATATGTTACACGTCTGGTGGGAGTAAGATAGAAAAATTTCAATAGAATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAG:1	-	chr3L	21346	5'	+	Quasimodo	71	2	66.20
CGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGT:1	+	chr3L	9998013	5'	-	roo	397	1	46.15
GTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	-	chr3R	7100914	5'	-	roo	9034	1	54.07
TATATTCACTTCTCTATCTGTAGAAGAAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	25448471	5'	+	roo	8680	2	71.85
GAAGAAGTCCAAGAAGAAAATAAAAAAAATAGGTGGCCTGACTTAATGCCGCGAAACGCAGTTCAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAG:1	+	chrX	10253180	5'	-	hopper	1362	1	53.42
CCCTTGATAAATATTTGCCTTGCCCAAAAAAGTATGCTACACATTTTGCTCACCACCGAGTATGAAATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1	+	chr2L	1839219	5'	-	hobo	2906	1	56.45
AGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTC:1	+	chr3L	24213771	5'	-	invader2	5037	2	64.38
ATTATTTCAATATGCAAAACAAGTCCAAAGAATTTCCTTCAGCTATGAAAATAATTTTGAGTTGCCTTGCAAATGATAATATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAAT:1	-	chr3R	11832112	5'	+	jockey	325	1	56.16
ACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	+	chr3L	16015206	5'	+	1360	17	1	63.20
CGATAGACTCCATTCCTATCATCCGTTAATTGCTTTTAAGATGAACCAGTTTGATAAACAAAAAAAAACTAAAAAATATATCATAATCTTGTTTTTTTTTTTCTTTT:1	+	chr2L	14632123	5'	-	gypsy7	5012	2	69.16
CTGTGCACTGACACCGAAACAAAGATCGAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1	-	chr3L	3863569	5'	+	blood	7034	2	69.86
TGCCAGCCGAAGCAGGAGTACGAAGCATGCCATCCTGTCGTGTGTCAGCGAAAGAGAGGCAGGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1	-	chr2R	21101832	5'	+	P-element	17	1	58.25
GAACGCTGCCGAGAAATATTTTTGATATAGCCTAAAGGATGAGCAATAATGCTAGTAACCCCAAAAATCCGGAAGGAATACATACATACATTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATA:1	-	chr3R	2461696	5'	+	mdg1	7069	2	64.38
AAGGATATCCCCTATGCCAAAGATATTTCGGAAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	+	chr3L	14638567	5'	+	1360	17	1	72.93
ATCACACCAAAAGTTCACTTCATCGCTTTTCAATGTAATTCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1	-	chr3R	10462734	5'	+	opus	7154	4	59.59
CTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGAAATTTTTTTTTCGAGAGCGAGAGAGCG:1	-	chr2R	5531205	5'	+	1360	100	1	49.32
TTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr2R	7898064	5'	+	roo	56	2	62.33
AAATGAAAGTAATAAACAAATTTATTTAATTTACATAAGCGCGACTTTATTGCATTCCTTTTAAAACTGTATTCTTTAAAGGAGGTTGGTAATAGAGGGTCAATCCTGATTACTGATTTCCTGATTTATAATTAATTTAATTATAA:1	-	chr2L	16793904	5'	-	flea	231	2	54.79
CGCTTACACAATCTTGTTTACACTCTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chr3L	19334374	5'	+	roo	8694	2	65.07
ATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr2L	17471707	5'	-	roo	396	1	68.42
GGGCTATTTGGTTCATGTTTATAGAATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTACATCTAGCGTAC:1	+	chr3R	6611196	5'	-	HMS-Beagle	179	2	63.01
ATCCTTAATCATACTTTACTAGCTGTTTATCAAGAGTATAGCACATACTCAGTTAGAAAAGTCATGTGAAAGGATATTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1	+	chr3R	22825657	5'	-	mdg1	348	2	46.90
TTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1	-	chr3L	16015365	5'	-	1360	3382	2	73.28
TCAGCTTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGGATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1	-	chr3L	5876356	5'	+	Tirant	8114	2	65.98
GAATGTATCAACTAAGCCATTTCTACAGAACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1	-	chr3L	23818401	5'	+	copia	4899	2	68.67
CAGTTTGTTAATTACTTGAAATTTTGCTATCCCTAAACACTTTATGACAGACTTTGATGGAAATGTCCAGAAGGAAATTTGATATTTTATGCTTTACACGATGACGAGTTAATGTCTCGCGAGTCAAAAGAGGACTCAAGCGACAC:1	-	chr3R	13361342	5'	+	jockey	4741	1	80.14
ATATGCGTGTTAAGACCTCGGCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1	+	chr2L	17081760	5'	-	jockey	4969	1	60.00
TGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACATAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGA:1	+	chr2R	20496933	5'	+	blood	7084	2	72.18
TTTTAAAACTCTATAGTATTCCCTGTATCTTGCTATTATTTTATTAATTCTTTTAAAGACTTAATATTATTTTCTGCTCACGATATTTTCCTTCCGTTTAGTTGTCCTTTAATTTTATTAAAGAAATTATTTTATTTAATTGACTA:1	-	chr2R	5342212	5'	-	jockey2	3377	1	48.63
CGCTGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1	-	chr3L	20033793	5'	+	blood	7057	2	48.61
TAACTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1	-	chrX	13504242	5'	-	412	7493	2	61.54
AAAAAGTCATGCGATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTTGT:1	-	chr3L	17558132	5'	+	jockey	4695	1	68.97
GTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1	+	chr3R	12618586	5'	+	F-element	28	1	58.82
TTGAGGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	+	chr2L	16091857	5'	-	roo	9049	2	65.52
AAGCACAATAAAAGGCAGCAAAATAAAGCTGGCCATACATTTATGACCGGTTTCTCTCGAATGTGTGGCAATTATTTTGCAACTAATTGCTAGCTCTGCTATTATTCTGACCGCAGC:1	-	chr2L	4136163	5'	+	HB	1625	1	71.79
CTGTATTTTTATATATGTTTTTTTAAGCCGCTGCCTTTTCTTGTCAGACTCACGCACACTGCGTCACTCACACAATCGCACACACACTTACACACACACACACACACACTTACACACACACACACACACACAGATGC:1	+	chrX	18185135	5'	+	accord	7031	2	74.45
AGCAAAGCTTAAACTAAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	-	chr3L	20831400	5'	+	roo	8703	2	58.90
AACCAAAATACGTAGTGAAAGACGTAAGGCGATGGCTTGGCCATGGCATTTAAAGCTAGAGCATAAAGTAAACCGGTTTTAAATGGAAAATTATTTATTTTATACAAAGGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1	-	chr2L	20344425	5'	+	1360	27	1	76.71
GCTGCACTTCACTTTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	+	chr3L	22437844	5'	-	roo	9039	1	59.70
TGGCTGCATTTTGCCTCAATTTGTCAAAGACGACTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTAATTT:1	+	chrX	14336382	5'	-	roo	9037	1	62.33
AAATGGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTATATAACAGCACCTTGTAGTCCA:1	+	chr2R	5284578	5'	-	Doc4-element	2555	1	64.38
ATTGTGTATATTGATGTAAATTTGTAGTTTCCGTTTCATTCATTAAAATTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAAACGCTATAATCGAGTTCACCGACTATCACATACCCATTACTCAGCTAG:2	+	chr3R	17733214	5'	-	INE-1	543	1	67.81
CCAGAGTCCAAGAGTTAATGAATCGTTGTGTAAAAGTCACAAGCAAAGTTATCCGGACACGGGCACACATTATCCTGTAGCTCAGATGACCTGAAAATATGTAAAAAACAAAAACTGCAGAGACGATTAAAGGCTCGATTGACCAA:1	+	chr3R	26576691	5'	-	roo	431	1	78.08
GTGTATCCGTCGGCCTATATGTCCAAGTGTCTAATACAAGAGAGAACGCTGATTCGTGATACCTGTTAGTAACAGGCTGTTACTCAGCTAGCCGACATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAA:1	+	chr3R	5167474	5'	-	Tc1	1636	1	84.62
CTGGAAGAAGTCCAAGAAGAAAATAAAAAAAATAGGTGGCCTGACTTAATGCCGCGAAACGCAGTTCAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTT:1	+	chrX	10253177	5'	-	hopper	1365	1	51.37
GGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTCCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr3L	11393495	5'	+	roo	8736	2	73.38
CAGCTGTGCGGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTCATGTTTAT:1	+	chr2R	13585419	5'	+	412	74	2	67.12
GTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr3R	20427506	5'	+	jockey	18	1	74.42
ACATATTTTAATTTTCCACTCGTCCTTGGCTCCATTTCCTGTGTCTCTCTGCACATATTTTTTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1	-	chr3R	7482879	5'	-	412	475	2	72.60
GAAAAGAAGAAACGTGAACAATAAATATTTTTATGTACATACATAACCCACCCAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTT:1	-	chr2R	9874890	5'	-	S-element	370	1	65.75
GTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1	+	chr2R	20496932	5'	+	blood	7088	2	75.36
ACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGTGTAGCACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCAATCCCACGCTAACCAAATTCCGCTATGTA:1	+	chr3L	24272124	5'	+	gypsy11	195	2	81.51
GTCTAAAACTGTCACTGCAGGTTTATTTATTTTTTCTACCGACGGGTCGGTATTTATCATATTAGTTTCTGGTTTAAATTTAATGGTTTTTTTCGGGTCCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTAT:1	-	chr3L	13968201	5'	-	blood	7083	2	78.12
AGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1	-	chrX	6486773	5'	-	roo	8981	2	82.64
GATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr3R	18582248	5'	+	roo	8723	2	61.38
ATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	-	chr3R	12886974	5'	+	roo	78	2	76.71
CGTGTATGGGTAAATTTGGTGTTCATTTCAGAAAGCAGCTAAAATTCATGCCAAATAACAAGCATATTATGTACTGTGATAATATAAAAGTTAAGAACCCTCATCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1	+	chr2R	9220989	5'	+	opus	139	4	65.19
ACATGAAGAGGGAAATGGTAGAGAGTGTCGGGGAAATGTGAAATGTGTTTACCCATGCCACATTAGCAGAAATCAAAGAAACTCCCTTGCCAGAATTTTATTATTATTATTATTAATTGGGTTTGTATGT:1	+	chr3R	15884672	5'	-	baggins	5429	1	53.85
TCAGACGGAGACCAAAAATCAACTTCAAAAAAAGCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1	+	chr3R	24455328	5'	+	Quasimodo	28	2	63.64
ATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1	-	chr2L	5069689	5'	-	flea	4980	2	65.07
AAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1	-	chr3R	28075426	5'	-	jockey	4954	1	56.55
GAATATACAACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr2L	12892622	5'	+	roo	69	2	66.44
AAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAG:1	+	chrX	3309636	5'	+	jockey	4	1	67.19
TCCCATTATCTTATATAGGTGCTATAGAGGTATTTTCTCGATACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAA:1	-	chr2R	16945345	5'	-	jockey	4908	1	72.41
CACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	+	chr3L	233252	5'	+	roo	8725	2	70.08
TTACAATTATCGATCCGCGACATTAGTTAAAAACAAGAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTGCTCA:1	-	chr3L	24402217	5'	-	INE-1	548	1	60.71
CATTCCTCCCTCGGAAATCCACGTCGCAATATGATCTACGTCCAGGATTTGCTTTTCGTTTTTAGCCATTTCTTCACCAGCCATAATTAAATATTTTATTGATATTATATACAGAAAATCAAATAAAATAAAATCATATTAAGATG:1	-	chr3R	22443672	5'	-	transib1	1888	1	59.59
GTTTCCTTAGTCACCAATTCTTCTTATTCTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGA:1	+	chrX	21010040	5'	-	pogo	50	1	77.24
CCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1	-	chr3L	16343278	5'	-	roo	8980	2	78.08
AAATGTTTCAAATATGTGGGAGTCACAGTGGGCGTATCAACCTTCCTGTTAATTTTGTTCGTCAAAACTGCAAGATCTTTAAGATATTTTAGAGAATTAAAAAAGCCTCCGCTCTCTCTCCTCTCCTTGTCAAAC:1	-	chr2R	5490073	5'	-	Rt1a	4937	1	62.22
CAAATACGAGCACGGAATGTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1	+	chr3R	14981122	5'	-	mdg1	391	2	63.01
GCTCATTTTTATCACACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	-	chr3R	18339203	5'	+	roo	32	2	59.70
ATGGACTCCCCATTTCATTTTTTTAAAGGAACACACCAGAAACAACAAGAAAAAAAGCACGGCCAGAACGAACGTGTTGCAACTTTACATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACA:1	+	chr2R	13092158	5'	-	invader1	3769	2	66.67
GGGGGGAAGGAGGGACAGAGGATAATGGAAGGGGAGGAGAATGGGGAATTTAAATATGTTATTGATAATTGAAATTACCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1	-	chrX	2296015	5'	+	Tirant	3	2	77.36
GGGGACTCGGGAACTTTTGTCATCGCCTTCGCCCAGCCATTTGAACCCATCAATCTGCGCGGCTCCTTTGTGATTTCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1	+	chr3R	28075295	5'	+	jockey	4675	1	74.29
ATCCAAATTTGGGAAAATTATGGTAGAATCGAAGCTCATCTCTGCTAGTGACATTGATGGGAACTCTAGCGTGCCTTTTAGCGAGTTAAAATATAGCTAAAAAATACTTATTTTTTAAAA:1	-	chr2L	17195175	5'	+	gypsy11	3946	1	80.00
AATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1	-	chr3L	1534727	5'	+	pogo	51	1	70.27
TAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	-	chr3R	17817974	5'	+	roo	8696	2	56.60
CTAAACTTTTTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1	-	chrX	21014897	5'	-	copia	237	1	72.03
GGCAAGACAAATAAAATAAAATGAAAATTTCAAGTGTGTGTCCGTCGTTTCGAAAATATATATTAAAACAACATAACAGGCAGAAATTCTGGTGTTCACTAAAATACCAGTGCTTTGAAAAAAATTGTAACAAAATTCAACTTGA:1	+	chr3L	23127764	5'	-	HB	1395	1	66.90
TACAGAATCATGAATGTTCGCATAATTGGCAGAGTTTTATGAATCTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTT:1	-	chr2R	9258530	5'	-	3S18	6030	2	67.81
TATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCAC:1	-	chr3R	11496625	5'	-	1360	3348	1	54.55
AAAAAAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1	-	chr3R	28075430	5'	-	jockey	4974	1	66.67
TTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:1	+	chr3R	19446108	5'	+	297	26	2	65.71
GGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCG:1	+	chr2R	20194207	5'	-	Max-element	8512	2	53.00
GTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1	-	chr2R	13585515	5'	-	412	7510	2	55.81
ACTGCACCTTAAGAACATAAATATTGCAGTATTTAAGTGTAGTAAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGTTACATTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGAGCC:1	-	chr3R	5165087	5'	-	Tc1	120	1	49.17
GCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAT:1	+	chr2L	17081780	5'	-	jockey	4941	1	57.25
GTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	-	chr2R	18336249	5'	-	roo	9014	2	58.22
GCCCTTCCTTTCACCTACAAAACGGCCACGTCCACAATTTGACTCAATTTTTAAATTTTTTCTCATTTTATTTCTTAATATCTACCGATATTCCAGAAAAAGTTTTGCGTTCGCATTCACACCAGCTGAGCAAC:1	+	chr2L	21580876	5'	+	INE-1	534	1	50.00
TTGGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1	+	chr3R	27424841	5'	-	blood	7326	1	60.27
CCTTTGAATCGCTTTCGAATGCGAATTCTTTCTACATTTCTTATTATTATTTTTTTTTTGTCCATGTTTCCTTTTCTCTTTTTTTGTGTGTGTGTGTTTTTTT:1	+	chrX	5927123	5'	-	Tc1-2	494	1	75.73
TTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACT:1	+	chr2R	16891849	5'	-	hopper	1334	1	70.34
CTGCTGTCAAAGGCGCTAGCCCTGGCCCATATTTCCGAGTCGTTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	+	chr3R	12886886	5'	-	roo	9036	1	56.00
TATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTC:1	+	chrX	12657099	5'	+	Rt1b	4942	1	62.92
CTACACTCCCAACCGAAACCTCCTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACA:1	-	chrX	21667959	5'	+	gypsy2	6517	2	66.41
ATTTATTTATGCGGCTACTGGTCAACGAAGGAGAAACGCAGCGGGCTTTCACAGATTTACACAAAATAATGCAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGT:1	-	chr2L	3165060	5'	+	412	7104	2	49.32
GGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	+	chr4	419982	5'	+	roo	86	2	80.82
ATTCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1	+	chr3L	1534654	5'	-	pogo	2049	1	61.07
GAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGAAATTTTTTTTTCGAGAGCGAGAGAG:1	-	chr2R	5531184	5'	+	1360	98	1	54.47
CAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGC:1	-	chr2R	4774732	5'	-	baggins	5323	1	75.69
TTTCTCCCTGTGTGGGATTGAAATTCGTTGTAAAAACGTTTTTTATAACCGGAAAACAACTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCGACTATT:1	+	chr3R	6791909	5'	-	Circe	7398	2	55.17
AGTGCAAAAATTTTAACTATCCATTTCGAAAATACCAATGCGAAGTTCTGTGTACAGGTTTAGGTACACAAGGAGCCAAAAATGTTAGGTTCCTTTAAGTTTCAGTTTTAAGTTAGTATAATGAAAGCACGTTCTTTTCTCGTGCG:1	+	chr3R	19738459	5'	+	Rt1c	5107	1	76.71
GACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1	+	chr2L	21884519	5'	+	pogo	72	1	68.49
TGAATTTTCCATGTGGCGAAATTGTCTTCGCCCAAGGGCTCTACTAGCACCATACATTATACAACGTTCGTTAAAAAGTATGTAACAGACAGAAGGGACATATATTCGTCTGTCCGTATGAATATGCATGCTGAATCTCAACCTTC:1	-	chr2L	21580592	5'	-	INE-1	173	1	57.53
AATAGAGCATCCTTAGCTGTTTAAGACCTTCATGACTCATCCTGCTATTTTGAGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAG:1	+	chr3L	22968337	5'	+	mdg1	7104	2	65.52
CTTACATAATTTACATAATTTTCAAAAAATGTAGTATACCTCTTAAATAAATCAAAAGACCACAAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAATACGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCAGCTCAAGTGG:1	+	chr2R	1006777	5'	+	Stalker2	7445	2	69.66
AAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr2L	15833442	5'	+	jockey	35	1	57.76
ATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATNAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439058	5'	-	P-element	2495	1	60.69
TTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAGCGGAGCTATGCTTCAGAAAGAAACATTCAAAGGATTTTCAATATAGCATGGCGACCGTGACAGGAT:1	+	chr3R	19045995	5'	+	gypsy11	449	1	59.31
CCAGCCTTCAATCGCCACTTATTTCACCATTTTTAATAATCCTCTGTACACTTTGTCATTCGGTATTCGGCCTTACAGTAATGGGCCGTAGTGTAGGCAGGATGCAGGCTATTCAAATTA:1	-	chrX	544281	5'	+	X-element	4284	1	77.50
CGTGAGACATCGCCCCGATTGGGAGAGCTATATGAATTCCCCAATCCATTGCGGAGCTTGATGTGACATTAAAGAGATTCTCTTAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGAC:1	-	chr2R	9789287	5'	+	412	7516	2	68.46
GCTCACTGCTAAAGTGAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1	-	chr3L	10292926	5'	+	roo	36	2	60.69
CACCCTTTGACCCCTTGGGGCAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGGTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1	+	chr2L	17081811	5'	-	jockey	4951	1	69.07
GTGAAAATTTATAAATAGAATTCAATGAACAAACAAAACGGTCGAAGGACGGGATGGGAACTAGAAAATTGAATAGAAATCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTACATAGTATGGGCAGTCTG:1	+	chrX	9830399	5'	-	BS	4760	1	54.79
CTTCATCTTTTTTCCATAATACGGAAAGTTTGCTTTACGGAGTTTGCAATCTTCAAAGTGTCAAGCCCACATTTTTGAAAAATTGTTGGATATTTTTTTCGTAATTTTATTAGTCTTGTAACTTTATATCGATTTGCC:1	-	chr3L	23635726	5'	+	INE-1	440	1	72.46
ATTTAATTATTTTGAAAATAGTTATAAGGCACGATCAAATAAACTAATGATTAAGTTTGAGCTGATTAAAACAACCAGTAGCTATGCTCATTATTTTAACAAGAATTAGTAACTATTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGG:1	-	chr2R	10553706	5'	-	F-element	325	1	74.48
TTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chr3R	26222869	5'	-	roo	332	2	71.92
CAACGTAAAATATTTGCCCCAAGTATATTTCGATAGTTGAATTCCTCTAGGTAGAGGACAGCACAGCTCCCAGGAGAAGAGAATGTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGGAAGAAAAAAACATATAAGGAAATTCAAAAAACCCTTGAA:1	-	chr4	512022	5'	+	HB	428	1	67.81
AAGTAAGGACAAGTCCTTGCTTAAGTGCGTGGAGTTTTTCTTCACTTTTTTTTTGTTGGTTTTATTTTTATATTCCTTTTTTTTT:1	-	chr2L	6199651	5'	-	Doc2-element	253	2	81.18
GCTTAGCATACATATTTGGCATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTGGCTTCG:1	-	chrX	10537398	5'	+	I-element	39	1	70.24
CGAAAATTTGCGCAACAGACTCGCTAAGTGGGAGCCAAACTGTAGCATACTTTCCAGCCAAGTTTATGCAGTGCCATTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1	+	chr3R	13501062	5'	-	hopper	1375	1	58.22
TTTTAAAACTTTGTTTTTGAATTCATCCAAATCGTCCATAACTAGTCGTCGGTGAACACTTATAAAAGCAAGGAATCACCTAAATAAGGTCGGGGTTCTACAAGCCAAGTCCCTAAGAAAAATTTCCTTGGTACATGAGAACCAG:1	-	chrX	21157396	5'	+	jockey2	2998	1	47.59
CGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	-	chr3R	31817517	5'	-	roo	8986	2	78.77
ATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATATGTTCATGTATTCGTAGGCAAGGACACACATATGGACTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTT:1	-	chr3R	1047993	5'	+	Stalker3T	48	1	74.66
GTACAATATTACAATAATAATTATTATGATTAATGTTGTAAGTATTATTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGACGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACAACTTATCTTA:1	-	chr2R	883098	5'	+	Cr1a	4129	1	66.20
ATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTT:1	+	chr3L	17558019	5'	-	jockey	4930	1	67.39
ACGAGCGCTTGATTGTGCGGCTTGTGTGACTGTTGCTGGCTATAAAAAGTGTGCACCACTCATCCAACCGCTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGTATAAAGTCTAAATTTTT:1	+	chr2L	9564435	5'	+	transib2	26	1	60.83
CCGAAATTCTGTTTGGAGACATACGGATCCGGATTTGGAATTCGGTAAACATTCTGACCCAAAAAATGCCTCCAATCCCACAAAATAAGTGGAATAAAAGGTCGATTCCGAAAAGGAGCATGGAAAAATACCTTTGTATTACTTAG:1	+	chrX	21269864	5'	-	HB	41	1	54.79
TGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	+	chr2R	20496911	5'	+	blood	7075	2	61.64
AATACTTTTGGTCTGTGAAATCAATAGGTATTTGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTG:1	-	chr2L	7807226	5'	-	P-element	356	1	22.76
TATAGAACTGGTACAGACAGCGTTGTACGCATGATTTATGCGCCTAATAAATTGCAGCGGCGAAAATAAAACTACTTGCTTATACTATTTCAAACACAGAATATGTATTCGAGCGATGGTGCATCGCACAGAGAG:1	-	chr2R	13281182	5'	-	Doc2-element	122	1	50.37
CGGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAGTT:1	-	chr2L	22121653	5'	+	gtwin	6948	2	42.96
GCCTCTGTTTGCCTTTTCCTTTCAACTCCCCTCGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATAT:1	-	chrX	9539026	5'	-	roo	89	2	76.26
AAAATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTACAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	-	chr2R	19050339	5'	-	roo	397	1	69.86
AATTCTGATCAACAAGTACGTAAAGAAATTAATGATTGAAATAATAAGAGTATGCCAATTACTTTCTGATTTTATTTGAAAATATTTTTTTAAGTCGAAAGCTTTCTGCACTAAATCATCCTTTGTAATAAGTCAGTCTTAAGCTA:1	-	chrX	13206090	5'	+	gypsy5	268	2	75.34
AAAGTGTCAAGTTTCAGTTGTCGTTGTAGACGAAATTATTTTTTGAAGTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1	+	chr3R	17316192	5'	-	opus	7484	2	72.60
GCCAAGCCAAAGGGAACCCGTCTTTGTGCCAGTGATTGACTCAACCACCACGCAGCGGACTTCAGTTCCCCGGCCCACGAGTGGATCACTCATGGGCACTGATCAGCAGAGAAC:1	-	chr2L	14108463	5'	-	Quasimodo	247	2	63.16
ATGAAATCAAATAGCATTATTTATGAAATTATATGGTCATTTTAGTTCTTTAATTGGAATTTAATTGAAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1	+	chr2L	12498315	5'	+	pogo	33	1	54.48
TATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1	+	chrX	22511334	5'	+	1360	45	1	54.11
CCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAA:1	+	chrX	6499877	5'	-	Quasimodo	6962	2	53.19
CGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGAC:1	-	chr3L	8249099	5'	+	jockey	4606	1	76.64
GTTTAGTGATTTTTATTACAAGCTTCACTTTACCTGCCAAGCTTTGCTTTGTTGTGCTCTCAGTGGCTTTGCATTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1	-	chr2L	12483842	5'	+	P-element	27	1	62.50
ATTGTTGTGAGATATTCCAGTACGCACGCGCGAAAGTTCAGCTGCTCCTTGTCGGTTATGTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCG:1	-	chr3R	3784954	5'	-	F-element	266	1	67.02
AGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGC:1	+	chrX	6499826	5'	-	Quasimodo	254	2	74.60
ATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGGGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTATATTTAT:1	+	chr3L	17307313	5'	-	Stalker	6936	4	57.04
CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTACAATAGTATACAATAGTATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAA:1	-	chrX	124083	5'	+	1360	3345	1	62.14
AATATAGTAATTGTGAATTAGCGTAGAAACAATTAGTTAGAAGTAGAAACAAATAACAAAAATAAAAAATGCCAATCGGTCAAATGAACGGACAGATAAACGGAGAGACACACAAGGTCATATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATC:2	-	chr3R	7178042	5'	-	INE-1	92	1	70.55
ATTTGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1	-	chr2L	14772147	5'	+	roo	24	2	62.90
TTCTAAATTGAAATTGCAATGCAAACAATTTAAATGGGATTTGCATAAATTTAGGACGATTTTGCAATTGGTCGACTAAGTAATTCAAAACCGCAAAAGGGAGCAGAAAGAAATGCACACACACACACACACA:1	+	chr3L	18414505	5'	+	accord	180	2	54.89
AGGAATATACACACATATATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATATACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACACA:1	-	chr2L	17289522	5'	+	Quasimodo	64	2	55.15
AAATCAACTAAGCTAAACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGCCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1	+	chr2R	19499304	5'	-	P-element	2843	1	48.46
TAATGTTAAACATCCAATCATTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCAAAGATTCTTTTGTATCTTTTTGCTTTTTATATTTATACTCTGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAA:1	+	chr3R	19446954	5'	-	roo	463	2	50.76
ATCGCCGGTATGAGCACTTGCTAAATAATAGGAAACAAAAAAATATGCTAGTGAATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1	+	chr3L	23325937	5'	+	pogo	18	1	73.29
ATTGAAATCTATGACAAAATTATTGGTATTCTAGATAAAGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1	-	chr3R	17831940	5'	+	F-element	16	1	73.97
AAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	+	chrX	10640033	5'	-	roo	8991	2	71.23
CATACGCTTATATATGTTGTACTTACCTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCGCGGTA:1	+	chr2L	22315507	5'	+	frogger	2286	2	68.49
CGATGGGAGCCCACACCACTCGCTCAGCTGAGGAAAGTTTTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1	-	chr2L	16275444	5'	-	accord	183	4	81.54
ACAACACCGGACTGGTCTATGCCGAGTATCGCCTGAATAACGGATGCACTGCACCAGTTCTCTCCTAGAACTTGAAGATCCGATTGTTCCACATTTTGTTTTCCAACATTGTTTCTGAGTAAACACAAGTGCCCAA:1	-	chr3R	14725205	5'	+	HMS-Beagle2	6935	2	61.03
GAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1	+	chr3L	3500957	5'	+	opus	7037	4	69.23
CCTGTGAACAGCACAATATTTCAGTTCCGCCGCGTCTTATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1	+	chr3R	10266023	5'	+	1360	10	2	79.45
AACACTCGCGATACGAACCAGGAGATGTTTTGCGTGCAAACTGCAGTACTTTGCCATCTCGGCCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAAAAGGAATAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAG:1	-	chr3R	17238992	5'	-	copia	76	2	56.16
TCCAATTGCCTTTGTTCGCAAAAGTTTCCAGTTTCGAGTGCGCATCCAATCCCGGAATAACGGAATAACAGCATAGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTT:1	+	chrX	5663084	5'	-	P-element	146	1	76.42
AACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1	-	chr3R	20427475	5'	+	jockey	67	1	58.90
TCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1	+	chr3R	9921954	5'	+	blood	40	2	58.22
AAATTATGTATGATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGT:1	-	chr3R	9714517	5'	-	Stalker4	384	1	67.81
AAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGC:1	-	chrX	22715124	5'	+	Bari1	85	1	76.03
CTGGCAGCGCATATATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGA:1	+	chr3R	10182138	5'	-	blood	293	2	74.66
GGCTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACT:1	+	chr2R	20596424	5'	-	roo	401	1	75.00
AGATTTCTGGGTTAAGTGGAAAAGTGAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr3R	19447854	5'	-	roo	337	2	67.59
TTTTTGATCTCAAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1	+	chr3R	14651180	5'	+	P-element	41	1	57.24
TCTCCTCCCTTGAGAGCTCGAATAAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTT:1	-	chr2R	4339533	5'	-	G5A	2800	1	79.82
CAAGTGACCCTCCATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAAT:1	+	chrX	10644442	5'	+	jockey	4814	1	61.11
AAATCCGTTCAAAGGTAGCATGAGGACTATATCACATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATCCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAG:1	-	chr3L	2483000	5'	+	jockey	4926	1	74.66
CTGTGAAAAAAATGAATTAAGTGCTGAAAATGTTCTTTATTGTTGAATTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1	-	chrX	7887170	5'	-	297	331	2	69.86
AAGTCAACACGTGAAAATTGGATTATTATTATTATTATTATTATATTATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAA:1	+	chr3L	18596623	5'	+	Doc	81	1	69.86
GCAAATAATGAGTCCACTTGGCGCAGAGTTATTTTCCGGTGGTTCCCGTCTTGGTCTGATTGTTAGAATAATCTAATATTCTGACGGATAAACTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTAGACACTCT:1	-	chr3L	1353940	5'	+	blood	245	2	62.33
GTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCT:1	+	chr3L	28063322	5'	-	Stalker4	7071	4	73.97
AAAAAGAAATCAATAAATCAAATTCAACTAAAGAATGAAAGCTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1	+	chr2L	12250008	5'	+	1360	26	1	52.05
CTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1	+	chr2L	17081794	5'	-	jockey	4951	1	60.53
ACCCTATTTCAAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	22122788	5'	+	roo	48	2	59.85
GCTGCTACTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCACTTAAGAACACAAG:1	+	chr3R	11083849	5'	-	412	484	2	75.20
AACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1	+	chr3R	21706009	5'	+	297	54	2	75.23
CTTAGCCTAATAAAAGTTATTGGGGTGAAGCTCTTTTAACAGCAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGACTCGATGCAGGTAAC:1	-	chr2L	22775603	5'	-	pogo	2065	1	59.59
CAATTAGGAACATGTTAATAGCTTTTGTGATCAAGGGTTTAACCTACAGAGCGAATCTGAAAAAAGTGTTCTTTGTGCCCAAGTAACTAAGCTGTCGAATTCAAGTGTCGCATGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr3L	4536844	5'	+	roo	8674	2	75.34
GAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGTTCACAG:1	-	chrX	13066610	5'	+	jockey	27	1	62.60
CAATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1	-	chr2R	19798130	5'	+	Transpac	52	2	55.48
GGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1	+	chr2L	9668204	5'	+	1360	54	1	74.78
AGTGGAATAATAAGAAAACCAATATATCTGCAGGCAACCAGTACCAGGATCAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1	+	chr3R	7641006	5'	-	hobo	2922	1	66.67
AATAAAGAGGCTTTCTCAGCTGGCACCGCAGTAATTTAAATGTTATTTAGCTGCACAATTAAAATGGCATTAAGACGCCACCGAAATGCGAGTTGCAGGTAGAAGGGAGTTAGAAGTTTGGAAAAGTACTGGGCAAG:1	+	chr3R	13248007	5'	-	3S18	5902	2	72.99
AATATCTGCTATTCTGTATTCCTCTTTCAAACACGCGATTTCCGAACCAATTTAGACACTTTATGTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAA:1	-	chr2R	8624864	5'	+	Juan	4083	1	54.11
AAAATATAGAGTGACGATGACATTCCCGTTTCTTAATACTGGAATAGATTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAG:1	+	chr3R	19447182	5'	-	roo	272	2	64.77
CGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1	+	chr3R	17817882	5'	-	roo	9020	2	56.12
AATTTCCTGTATTTCATGTGATCGTACTGATTATGTAGAAACACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr2R	23802960	5'	-	roo	331	2	71.92
CAGCATAAAAAAATTTGTTGTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTT:1	+	chr3L	27356031	5'	-	Tc3	1686	1	73.97
ACATTAGTAAATGATTTTTTTGGAACCTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1	-	chr3L	6978240	5'	-	pogo	2038	1	62.33
TCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTAGGCACTATGCAGCCACT:1	-	chr3L	16015311	5'	-	1360	3347	1	61.82
ATAGTGATTTATTCAGTTTCCTTGATTGCTGTATATTGGGCATTTTATTTGGCAAAATTAACAAAATCACTCTGGCCTTTAAAAAAATAGAAGAAAAACAAGAGAGAATACTTTAGTCGAGTTCCCCGACTAT:1	+	chr3R	20125972	5'	-	INE-1	565	1	34.59
AAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr2R	20596485	5'	-	roo	388	2	63.16
ATCAGGTGGCAGCTCTGGGTTTGAATATATATTTATCCACATTCAGCTTGAGCAGCATAAACCAATATTTTGTGATCCTACAACATTGGCATGAATTAAAGTTTACAAAATAGCACTATAAATAATACCCTAATATGTACAATGTA:1	-	chr2R	11219451	5'	+	1360	3143	1	76.03
TGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGG:1	-	chr3R	11547819	5'	+	G2	290	1	72.66
CTTATGGATATGTCACTATATAGACTATAGCGTTATCGGATTTTATGAGTTCTCTTAAAGTACCATTATAGATCTTGTGAACTGCGCTGGTGATATGCCCAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1	+	chr3L	24486371	5'	+	1360	21	1	31.51
AAAGTTCCTCATATCACTGGACTCTTGGGGGGGCTATAAATATCACAGTTACTTATTTGTTTAGCTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTT:1	-	chr2R	10398530	5'	-	gypsy4	445	1	60.69
ATAGACATAAGTAGGAATACTATCAACTGTGGTCTATACTAGTCAATAATCAGATAATGAAATAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTT:1	-	chr2L	4954047	5'	-	Quasimodo	7328	2	54.62
GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1	+	chr2R	981624	5'	+	1360	30	1	58.91
TAATGTATCAACTAAGCCATTTCTACAGAACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAT:1	-	chr3L	23818401	5'	+	copia	61	2	77.19
AAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	-	chr3L	11531010	5'	-	roo	9042	1	64.38
GTTGCAGATCTAGAGTGGTCGGCAATTTGGGCGGGTGGGGTATCCAAACAGAGATATTTCTGCCTAGATTGGGTTGTCACCACGTGTTGTCTGTCATTGCCAACAAAGGTCACGCAACCAACTATTAAGATTCTG:1	-	chr2L	16398856	5'	+	Tc1	1340	1	65.93
GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGC:1	+	chr3L	25232774	5'	-	accord2	7579	2	63.48
ATATGGACAGAAATGCATATATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1	+	chrX	22511315	5'	+	1360	14	1	52.24
TGGGGCACTGATAAACTTAAAATGGGGGTGTAATATATATTATTGGTATAAAAACATGATATTATGTTGATTTTATAACTTTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTG:1	+	chr2L	15227255	5'	-	gypsy12	10175	2	59.20
CAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTACTATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCA:1	+	chr2R	23332541	5'	+	invader4	79	2	73.97
ATAGCCTAAATCATATCATAGACTAGGCTTCTTTGATTTGCTAGAAAGCATCGCTTCAAAGGCTAAAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1	-	chrX	7256250	5'	-	412	473	2	69.86
AATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr3L	15600176	5'	+	roo	8724	2	59.59
ATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTT:1	+	chr2L	14892205	5'	-	transib2	2765	1	58.90
CTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTGGGCATATCACCAGCGCAGTTCACAAGATCTATAATGGTACTTTAAGAGAACTCATAAAATCCGATAACGCTATAGTCTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATG:1	-	chrY	917823	5'	+	Idefix	16	2	30.14
AAATTCTTCTGCAAACGTGCTAAATTGTAATTAAGGCAAGTCTTATCATATATATTTTAAAAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCATTTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1	-	chr2L	6863428	5'	+	pogo	6	1	74.81
AAAAATTATATTACAACATTGTGTATAAATTGTGATTTCCAGGCAACAGCAGCTAAGGCAGTATTCAAGAACACATTGCACTTGGATGCACTGAAAGAAAACTACTAAATATTGTTGATTTTCTAGTTCCTGAAATCTCGGCGTTC:1	-	chr2L	13614120	5'	-	INE-1	141	1	69.18
AAAGTTCTGCTCACAGTACCCTGTTAAGTTTTGCAACGAAATTGGCCAAAAATCCAAATATGTAAATTGACCTCTCCCCGCTCGTGTGAAATTGAGAAAAATCTAAAAATTGAATTTGCGTGCTAGAAGACAATTTTCGGGCCGAA:1	-	chr4	431416	5'	-	1360	3191	1	57.53
AAGGCAAAAATTATTTATGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATACGTCCTCAAATTTGGACGAAAATACGGATAGACGCACAGACGGAGATGGCTAGATCGACTCGACTATTGATCCTCATC:1	+	chrX	22806282	5'	-	INE-1	92	1	58.65
AGTCATTGACCATAATCTCAACATTATCATGTAAACATCATATAAATTTCCTGAAGCTTGTTTACTTACAACATTAAAATTATTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTA:1	+	chr3L	15411235	5'	-	I-element	267	1	55.48
GTTTACATACGCTTATATATGTTGTACTTACCTAACTTCAACAATTTGTTTAATATGTAATTAGAACTAATTAAATCTAACTCAAATATTCTTAAAGGGAACTTGGGTCCTCTCGCTGAGGACCTGGTTGCATAAGAGTGCCGCCG:1	+	chr2L	22315502	5'	+	frogger	1	1	71.92
ACAAGCTAGAAATTTAGCTGCTTGCTGTACTTTTGCACAATGTGTTGCCTACTTGAGTAGGCATGTGAGTATAATACACCTGCCTAATTTAAATTAAGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCA:1	+	chr3L	14944519	5'	+	G5	4775	1	55.48
CTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTA:1	+	chr3L	2362326	5'	+	Stalker2	33	2	49.55
TTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3L	21817997	5'	-	roo	8988	2	78.47
ACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTTAGTGAATC:1	-	chr2L	16092003	5'	+	roo	8717	2	54.79
TCATTTTCATGTTTTTAATAGTTACTTTATAGGTTAATAAGCCTTGAAAGGGCATTAAAAAACTTCGGTTTTAAGATGCTTCTGACTTATCTTCACTGCATCTCAACAAATTTGTTGGTAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATA:1	-	chr2R	11628697	5'	-	Tirant	8421	2	78.47
AAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTG:1	+	chr2R	5209593	5'	+	gypsy	7041	2	55.71
ATTAAATGGTGTACTTCTTTCTCGTAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTT:1	-	chr3R	13349168	5'	+	BS	5014	1	68.31
GATCGCCACACACCTTGCAGGGAATGTCCAACAGGCGATCGCCCGCTAAAAAATGATAATAAGGTGAATATTTATTTATTTATTATGATCGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGG:1	-	chr2L	5928092	5'	-	I-element	5299	1	52.05
GACAATTTTCCAAAGCTGCTGATCGTCCCACTTGGTAACTTGTGCACTGGGAAAAACTGTGTGTGAGTGCAGCTAGCTTGATGGTGTCCTCCGAGCCGGATATATGTGTAACTCATAAATATACAAATATACAAA:1	+	chr3R	29534543	5'	+	Stalker4	7048	4	51.85
TACCGCAAATGGATTTCAAGTTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:2	-	chr3R	22956074	5'	+	roo	8701	2	54.79
ATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	-	chr3L	15177316	5'	-	roo	9038	1	50.81
ATAAGTGCAAAATTAAACTTATACTACACATTGCTTACATATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCGCACTCCGCGAT:1	+	chr3R	435126	5'	-	Stalker4	183	4	76.55
ATAATAATAAATTAAAACCAAAAGGTGTGTTTTGAGTTAATGTCACCACTGGTTTTGTGTTTCCAACGCAGCCATATACTGATC:1	-	chr3L	26834261	5'	-	invader4	386	1	60.71
CTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCAGTTTGGTGCTAGGATCTGTTTGTAAATTATCAATAGCCGAGTCAGTCTAGCTATGTCCCTCTGTCTGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTGACGAACTATAAAAGCT:1	+	chr2R	4479789	5'	+	INE-1	150	1	49.29
ATGTGATCGTACTGATTATGTAGAAACACAAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr2R	23802975	5'	-	roo	352	2	74.55
AGTGGGCTGAATGAACGCGATAAGGATCTAGTCAATAGTGCAATTTAAATAAATTTTCACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1	-	chr3L	17685248	5'	-	mdg3	5476	2	46.04
ACTTTTGACTACTGGGCAGAGTCAGAGCAAATAAATCTTCAGAACTAGCTATTTTCAGAAACTGTCACTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCCAACCTGGTTTTGACCTAG:1	-	chr3L	22346391	5'	+	jockey	4777	1	54.55
GTGTATCTGCGGGGACTTCGAACTGCCTGTGTGTACGTTTAATTATTGTAATGCTCACTCTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTC:1	+	chr3R	7835359	5'	-	roo	491	1	68.54
CAAAAAGAGCTGAGAAACAAATTTGAACGGATAATAATAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1	+	chrX	23457617	5'	+	Doc	59	1	62.96
AATATTGCACCATACTTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1	-	chr3R	14049456	5'	-	transib2	2787	1	58.90
ATAATAGCTTCGACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr2R	9868628	5'	+	roo	74	2	73.43
TTTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1	+	chr3R	12618578	5'	+	F-element	14	1	69.03
ATATTCGAATAGGAAAAATACCCAGAACTATTTTTAAAAATTTTATTCGAAAATATTGCGTTATTTCGGTGCAACCTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1	-	chr3L	1534642	5'	+	pogo	42	1	56.85
ATGCACTACGACTTATGCCCTTAAACTTGAACGAAATTGAGCAACATTAAAATTGAGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTTGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTC:1	-	chr2R	3592316	5'	-	FB	302	1	61.38
AGGTTAAGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGAT:1	+	chr3R	9714343	5'	+	Stalker4	23	4	69.66
AACTTAAATTGGCTAGCTGCTAAATTTGCTTTTATCTAAGATAGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGA:1	+	chr2L	9399409	5'	+	Transpac	4947	2	65.07
CTGCACAATATGACCTAGGAAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1	+	chr2L	13763177	5'	+	pogo	62	1	77.97
AGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGAAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAAT:1	+	chr2R	5209637	5'	+	gypsy	7039	2	78.72
AATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	12835054	5'	+	jockey	73	1	71.43
TTTTCAGAAATTTGGATGTAGGGGTTTTTAGGTTGTCTTTAAGTTTTGAATTTGTATTGGATCTATGTGATTGGAGAGCGATGAAATCGTCTAGAATGTAAGGTATTAGGAAATGTTGAAAAGTACTAGATTCGTTGAAAAGTATG:1	-	chr3L	18848155	5'	+	INE-1	11	1	34.25
AAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1	+	chr3R	21705957	5'	+	297	6594	2	67.50
AATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	-	chr3L	11531001	5'	-	roo	9033	1	58.22
AAGTGTTGGCGAAAAAAACGAGTGTAAGGGCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGATCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTAATGAATTGTCCAGG:1	-	chr3R	4063792	5'	-	G4	25	1	76.47
ACAGAACCCAAATTCAGTTTTTCATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1	+	chr2R	16785323	5'	-	412	7511	2	51.22
GAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	-	chrX	16717917	5'	+	roo	83	2	77.40
AACCAGCCATCCTTCCTGTCGTCCTGCATGAGAAATAGCTATGCTCACTAACAGGATATGCTGCCAAAAACATTTTTAATAATTTAGCACACATATTTTCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCC:1	-	chr2R	10968430	5'	-	roo	8949	2	71.92
TGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr3L	10773153	5'	+	412	42	2	57.50
ACTTAAAAAGTTAATAGGCGAATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTCGAAAGCTGGAATCGT:1	-	chrX	6191199	5'	+	FB	38	1	71.76
GAGGCTTTCATATGGACAGAAATGCATATATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1	+	chrX	22511306	5'	+	1360	17	1	58.90
AAATAGAATATTATAATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACTAGCCACTTTCATTATT:1	-	chr2R	23878198	5'	+	297	21	2	72.31
ATTGGCCTTCATGTGTTAAATACTCTTGTCAATGCGAAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCCATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1	-	chrX	6279440	5'	-	P-element	2823	1	41.78
TAAATAGAATAATTATTAAAAAAAAAGAAATAAATAAGGTTTTAGTCATGTAAGGATCATCAAATTCCTTAGACCGCCTTTTTTATAAAACCAAACACACCACAATAGGATACAGTCTATTATA:1	-	chr3R	8970228	5'	-	Cr1a	4208	1	79.03
AATAGCCACCACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTATATACACGCGTCTCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAA:1	-	chr3L	6388971	5'	+	17.6	6957	1	59.09
AGAAAGTTAAACATAAATCCAAAAACATCGTAATTCAACATACATTTTTTGTATAATTCTGTCATTATACAAAATGCTTTGAGACAAAACATTGCTAATTGTCCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1	-	chr2R	1193104	5'	+	GATE	8270	2	65.75
AAAAATAAAAGTGGAAACATTTTTAAACAGGTACGTATTAAGAATGCCATTCGGAATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCGTTCAGCATTTTATACTGAATTTTAAGAAAATGCAAATGAAAATTAAAATTAAATGAAAATC:1	-	chr3R	12136377	5'	-	Rt1b	124	1	69.18
GGTTGAGATTTAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTG:1	+	chr3L	14665461	5'	+	INE-1	578	1	77.40
GGATGCCGGGGAGTACACATGTCGGGCGATGCGCATAACGCCGACTTTCTCGGACTCCGATCAGATAACAATTTTGCTAAGGATACATTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATTTATTAT:1	-	chr2L	2001001	5'	-	accord2	108	1	58.22
AGAACATTCATGAATACGGGAGTTATATTAAAGACATCAGCGATGTCTGTCAAAGCAATAACAAGAGATACTCTCTTGAGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	+	chrX	16725946	5'	-	roo	9037	1	50.68
CTGCCAAGCCGAGAACGTAAGCCTCGTAAACCTATTAACCCAATGACGACAACTGCGATGATTGAAATGGATAAGAGGACTCATATGAAGCTTAAAGCAGCCAATCTTCACTGGCTTATTAATTACAACTCTCCCCTTAGTCTGGA:1	-	chr3L	9801613	5'	+	Doc2-element	4301	1	51.37
GGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCA:1	-	chr3L	8249121	5'	+	jockey	4586	1	61.15
GTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	-	chrX	10640110	5'	+	roo	8717	2	59.70
GTGAGCTTCAGCGATGTATGTGCTCCATGCATCCTGCTCGCTTTCGTATCCCATTGGCCGAGGCTTAGAAGCAGAGATTGAGTTACATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCT:1	-	chr2L	21008661	5'	-	invader3	243	2	61.64
CACTAACTATTATTACTTTTTGATTTCATTTGCCATTTTGTTCATCCAATGCTAATGATTTGCTTTTATTTTACCATTCATTAATTATTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGAGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGG:1	-	chr2R	19568099	5'	-	Q-element	490	2	56.30
ACTGCAGCAGATGTTTGTTGAGAAAAATGCAATAAATCGATATCGGTCAATAAATAAAGTCTTTATTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCT:1	-	chr2L	16704344	5'	-	1360	235	1	57.64
AAGTCACGGCAATTGATAAGTCTTTGTCGCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:1	+	chr2R	1569126	5'	+	jockey	4830	1	78.77
AAGTGATGTATGTATATGCACAGCTCGGTGCCCCTTACTTCACACCCGATTCGAAACTAAATAAATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1	-	chrX	10201281	5'	+	transib2	7	1	78.87
CATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	-	chr3L	22968410	5'	-	mdg1	7388	2	71.11
AAGCTCTACGCAACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	+	chr2L	6059194	5'	+	roo	41	2	56.16
GTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATCTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2L	18419247	5'	+	412	7095	2	49.24
TTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCA:1	-	chr2L	22685187	5'	+	Ivk	59	1	62.12
GGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	-	chr2L	11518463	5'	+	412	7097	2	64.76
AGAAATGCATATATGTACATACTTTCTATGGTCGGAAAAGCTTCCTTCTCAACTTGTCAACGTATGTATCTATTGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1	+	chrX	22511323	5'	+	1360	34	1	47.26
ATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAGTTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2R	9791561	5'	+	412	7094	2	55.94
ATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCA:1	+	chr3R	1875807	5'	-	Rt1b	4709	1	50.00
CAGCACGCTATTGCAGCGGAGAACTGACAATGCTGCTACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTA:1	+	chr3L	2701356	5'	-	blood	268	2	72.59
GTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chr3L	14603236	5'	+	jockey	15	1	72.50
TAAAGGAGTTAAATAAACAAAAGAACTTTTGTTTACGGATCCGATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAACTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	-	chr2R	13077193	5'	-	roo	391	2	49.65
TGCCGAAATACGAAAAACAAAAAGCCGAAGGGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	-	chr2L	16016435	5'	+	412	7090	2	57.14
ATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGAT:1	-	chr2R	20497022	5'	-	blood	342	2	48.12
GGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATACGTTCGCTTCGCGAGTGATT:1	-	chr3R	1844854	5'	+	Cr1a	126	1	60.95
CATGGATGTCGTGACTTTTCCCAGTAATATTTTCGACAGTAACCGTTATTTTGCTGCCTGTGTGTGTGTGCTACCACTACACTTTTGTGAGTCTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chrX	8640649	5'	-	accord	188	2	54.21
GAGTAGCAACGGAAAAAAAAATTTTTTTTAGCTATTAATTACGTAATGTGTAATATTTTATACTAT:1	-	chrX	6667453	5'	-	G5	4678	1	75.76
AAGTGCTTGCTACAACTCGTTGATTACCGTCCTTAAAATCGAAAAACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCAC:1	-	chrX	16361640	5'	+	Tc1	5	1	74.77
GCAGGATCCGGTCTGCAGCCGGGTCCTGCCCAGCCTCCATCCCCATTTTTAGTTGTTTTTATAACCGATACTTGTATGGTAAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1	+	chrX	21175625	5'	-	1360	3367	1	39.84
GATCTCGTCCCAATTCAGACTGATCTTCTAAATCTTAATCCTAATCCACTCAACCTCGGCCAGAAGCTTTTCTTTAGGATTTTCTTGAGCCTTCAAATATGTTAGGATAAAAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1	+	chr3R	1207417	5'	-	copia	245	1	78.77
ATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr2L	16091968	5'	+	roo	8752	2	81.51
ATGGTGACCTGCAATGGAGAGAAATGTGCACGAGGGGTTAGGAAAATGGTTATGGATTGCCGCCTAATGGTAATGGAAGTGGAGCACCGAGCGGTAGTTGCCAAAAAGGTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTT:1	-	chr2L	1856416	5'	+	roo	302	2	78.83
AAAATCAGATCTAACTGCCAATTAGTTCTCGTTACTTTTGGATATGGACACACACAGTGATGCCAATTTCATTTCTCAACTCGCCAGCCACAGCAACCACAACTTGTTATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGCCATTATCATGGTTGT:1	+	chr3L	27361158	5'	-	G3	4395	1	70.55
ATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCATATAAATTTATACACACAATAGG:1	-	chr2R	9500048	5'	+	G5	4766	1	60.96
TTTCGCGTCGTCTTGCGGCGCATCGTGTCGGTTCCCAAAAAGCGCCAGCAAAACTACCAACTCAGCTCAACTCAGGGCAAAGTAAAGTAAATTAAAATAATG:1	+	chrX	11003897	5'	+	TART-A	13139	1	87.25
CTTGGGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chr2R	15004734	5'	+	jockey	14	1	46.43
TGATGTTGATATTCTTCTCATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGTACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr3R	17818020	5'	+	roo	8679	2	73.33
GAATCAATTCAAGAGAGATGTTAAGTAAATTCTGCAATCCTATATTAAAGTATTGGTGCGGTGCTAACGAAGAACGAATTGTTCCACTGTACCATTTCTCAAGGAAGCTGGGGTCGGATTTTTTAAATTTGACTGCTGGAATCGTT:1	+	chr3L	1403252	5'	+	FB	39	1	66.44
CTCGTTGGCGCCTCTCAAATTTTTTTTCTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr3R	17817841	5'	-	roo	391	2	74.66
ACAATAAAAATTCGTTGGAGTAAACTGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1	+	chr3L	21855401	5'	-	blood	350	2	67.12
GTATAAACTTTTTTTATTATTATTTTTTCCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATGACAATAAGTAAATTTTATATATTAATCTTAAATTAACAGAGGCAGTTGTTATCCATTAATCACTACTACATGCTCTAT:1	+	chr2L	19817854	5'	-	G4	3748	1	77.40
AGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	+	chr3L	11393486	5'	+	roo	64	2	68.57
ATTGACTTTATGTCACTACCTCGATCTGTGATCAACGCCTACAATAATTTTGCGTTAGTTATGAGAATGGCAAAGACAACAATCGCCGCGACGATAAGCGGTGGGCATGAAAAAAAAGTAAAACGAAAAAAA:1	-	chr3R	8785319	5'	+	Doc2-element	236	1	65.91
ACACACGATCCTCCTTACTAGTTACTCACATTTCAAAAGAATAAAAATTTGATTCAATTACACATGCCGGTATAATTATATTTATTTATTAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCATGCAAATGAACACTATCACGTC:1	-	chr2L	5483001	5'	-	diver2	397	1	52.52
TATATTAGGAAAGTTGTAAGAGATAATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1	+	chr3R	5061784	5'	+	mdg3	5262	1	76.03
ATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1	+	chr3L	11393455	5'	+	roo	8698	2	60.28
TATTTTAAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr2L	3886140	5'	+	roo	52	2	56.74
GTCATCGCTAAGGGGGATCAGCTGTTTGCCAACATGTGAGTGTGTGGGTGGTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCT:1	+	chr3R	9038888	5'	+	Juan	4028	1	69.23
ACGAAAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2L	16016426	5'	+	412	7094	2	54.07
AAAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3R	25448445	5'	+	roo	8686	2	61.74
GAATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1	-	chr2R	20497046	5'	-	blood	7365	2	60.27
TTCTTATTATTTATTTAAAACTAAATTTTTCATTTGTTAAGACTGTTCAACGAGCTCTCTTTCTTCTGTTGCACAGTACAACATAATTTAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCT:1	+	chr3L	3863598	5'	-	blood	7131	2	56.16
ATTAAATCATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTAT:1	+	chrX	13704728	5'	-	invader4	3074	2	73.28
GCAACTGCATTAATGGAGCCCGTCTTACAATAGTTGTCCGTTCCCGCTCCCTGTTGCCCGGAATCCTGCCATCATCCAGTGATATATATAGGTATCTGCGTATGTATGTACATATGTATATATATTGAT:1	+	chr2L	1018102	5'	+	G3	4511	1	55.81
TCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	+	chr3L	14603243	5'	+	jockey	18	1	68.97
TCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACCGTGAGAAAAAGTTGCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTCGTGATTGTAAAATCGCAAATAAGAAGACTTTAGTCG:1	-	chr3L	15600353	5'	-	roo	399	1	51.64
ATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1	+	chr3L	16343231	5'	+	roo	8701	2	63.00
AACTTCTTCACAACAATAATTCTCTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGC:1	-	chr3L	19014045	5'	+	invader3	26	2	64.58
CCTGGAACAATTAATGAAGTATACATTTATTCAAACCCACTCCAATTTGTCGTGCAACAATATGCCTACTCCTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAAT:1	-	chr3R	2404803	5'	+	G6	34	1	61.82
ACAGCAAAAGCAGCAGAAACAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr2R	9632054	5'	+	roo	8684	2	70.55
ATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1	+	chr3R	10462587	5'	-	opus	7476	2	62.60
GTCAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr3L	21818075	5'	+	roo	8723	2	61.64
GGTGCTTTGTTTTCATTTTTCGCCTCCTCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGCGGGAATAACTGATTCGGCAGCAGAC:1	+	chr2L	10037544	5'	-	Quasimodo	190	2	72.13
CTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTAACACATGAACACGAATATATATAACGAC:1	+	chr3R	16076813	5'	+	roo	12	2	51.61
ACAGCGTTGTGAAGGTAAGTAATATATGTGCGTAACATAGTTTAATAATAGTTGTTATAGTTGATTTACAAATGTTAAAAACGCCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACCGTAAAGTAATATCTTTCGCCCATTTTTGCTC:1	+	chr3R	1961502	5'	+	transib2	495	1	55.48
ATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3L	10292888	5'	+	roo	75	2	68.49
ATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATC:1	+	chr3R	19589923	5'	+	BS	5066	1	64.38
CTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACCAA:1	-	chr2R	5031005	5'	+	Doc	79	1	78.33
GATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAA:1	+	chr3L	27415240	5'	-	transib2	2737	1	78.08
CTGGAATCGAAGCAGGGATGCGTGTCCTTCGGATGATGGCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr2R	19050142	5'	+	roo	8674	2	75.00
TGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGTGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAAC:1	+	chr2L	22975406	5'	+	1360	153	1	71.67
GGGCTAGACGTTCAAACGCAATCAGATGGGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCG:1	+	chr3L	23603160	5'	+	F-element	33	1	46.46
ATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr2R	20596536	5'	+	roo	81	2	77.40
ATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAGG:1	-	chr3L	233330	5'	-	roo	9008	2	62.76
GTTGCCCACTGGAGCGGCAAATTCTTTTGCGGCTGCCGCTGGAAAATGTGGCTCCAAATGCTTACACACATGGAAATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCT:1	+	chr3L	19435869	5'	+	Tabor	7057	2	76.77
CAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAA:1	+	chr3R	24455362	5'	+	Quasimodo	64	2	70.34
GTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTCTTGCAACAATGTTT:1	+	chrX	10521633	5'	+	Tabor	65	2	58.22
CAAGAACCGAAAAAGAAGTCAAGTGGGCGTGACTTTTAGCAAGAGTTCAATGTCAAATGGCTGTGTTTATGATACAGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1	-	chr3R	20005136	5'	+	297	6618	2	58.87
CTGACAATGCTATAAATACAAAATGTAGAGAATTATAAAAATTCAAATATTTCATCTTTTACTGCACAGACTTACTTACATTTATACATATACATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGT:1	-	chr3L	1840303	5'	+	Stalker	285	4	44.52
ACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	+	chr3L	15600167	5'	+	roo	18	2	43.36
TGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGT:1	+	chrX	5662879	5'	-	P-element	2822	1	35.16
TTTATGTCATAGATTATCTGTGAGCTGCACGCTCCTCCAGCCAAGCATTCAATTTTAAGTGCAATTGCTTGCTTAACTGACCACAAAACAGATCAAATACGGATCAGTTTTGCTGATAAG:1	+	chr2R	16257017	5'	-	BS	253	1	55.00
GAAGTTGCTCACTGCTAAAGTGAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTCGGGCTCCGT:1	-	chr3L	10292932	5'	+	roo	8695	2	64.38
TCTCTCACATTCCAAACTTTTTCAGTTTCAATGTTTGAATCTTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1	-	chrX	17054268	5'	-	jockey	4927	1	67.12
CACGAAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATAT:1	-	chr3R	2520355	5'	-	Tc1-2	1611	1	64.38
AGCATCTATAGGCCATTATTAGATACATATTCGTTATATTCGGCTTGCCATACACAGTTAGCAAAATGGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACCAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACG:1	-	chrX	1761934	5'	-	Bari1	1699	1	53.42
CAATGTGACTCCAAAGGCCGTTTGAGAAGCGCAGAGAACCCTCTAATTGGGCCCGAACCCTTCTGGTGTGTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTAAAGTCAATTGCAGCCCTGAACCCTAA:1	+	chrX	21976897	5'	+	baggins	5315	1	68.80
GTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAA:1	+	chr3L	25804307	5'	+	gypsy	7123	2	82.72
ATAAAACATTATTTGAAAATGAATATTATTGATGCTTAAGTTTGGAAAAATCAGTTAAAAAGAAGTGGCAATTATTATGGCAATTCTCTTGCCACATGTTGTGTATATGCTTGCTAAATTGTATTGAAATATATATATATATTTTT:1	+	chrX	14325035	5'	+	copia	4659	1	78.77
TTAATGCTAGATAGTTGGTTTGACTTAAACGTACATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	+	chrX	2444299	5'	+	roo	7	2	76.22
TTTGGTATCCCCCTCTCCAACCCATTGAATACTTTCTTCAGCCACGTACCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1	-	chr2L	7810121	5'	-	P-element	2839	1	43.44
GGCCTGGATTCCCCAAAGTCCGAGTTTAGGTGTGGGTCATCCTGCCGCTGGACAGGGACATCTCGCCTTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGGTT:1	-	chr2R	20845613	5'	-	F-element	299	1	60.91
TAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1	-	chr3L	10574405	5'	+	Tabor	6873	2	53.42
CATCAATCCGGTAGTTTGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	-	chr4	311608	5'	+	1360	55	1	54.79
GACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGACTTTGTTG:1	+	chrX	13504151	5'	+	412	52	2	54.81
CCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1	-	chr2R	2529354	5'	-	1360	3328	1	58.22
ATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr3R	28624555	5'	-	roo	350	2	57.53
GGAAAGTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	+	chr3R	7835087	5'	-	roo	393	1	69.53
ATGGGGGATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1	-	chr2L	19965077	5'	+	Doc	57	1	50.00
ATTACATCATCATTCACAATATCTGCATTACGATAATAGTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAGTAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1	+	chr3L	23818354	5'	-	copia	208	2	70.34
ACACTTTCCGCACTGAGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAG:1	-	chr2R	13006524	5'	+	3S18	5819	2	52.45
TTATTTTTAATGTGTAATGCATTTCTAACTTATTCTTAAGGCAAAAATAATTAAAAACTCATTTTCGCTGTTTAAAAACGGAATACTAAGATAGCAACTTCAAAGAGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1	+	chrX	14749562	5'	+	copia	4883	2	65.97
AAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATC:1	-	chr3L	23702259	5'	+	G4	18	1	59.05
ATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1	-	chr3R	20499835	5'	-	mdg3	5474	2	53.68
CAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	-	chr3L	21818073	5'	+	roo	8679	2	64.00
CCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAA:1	+	chr3R	9921992	5'	+	blood	7089	2	73.97
GAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAG:1	-	chr3L	23702242	5'	+	G4	74	1	65.97
AATATTTTCTTAACCGATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1	+	chr3L	3863440	5'	-	blood	7340	1	58.87
GGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1	-	chr2L	19965056	5'	+	Doc	77	1	62.76
CAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAGATTAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATA:1	+	chr2R	545171	5'	+	Bari1	1462	1	52.05
TGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1	+	chr2L	21884510	5'	+	pogo	63	1	63.70
CATCATAATAAACGGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTCACTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1	-	chr3L	10848734	5'	-	blood	7332	1	59.70
AGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAG:1	+	chr3R	23020784	5'	-	INE-1	562	1	65.75
CATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGCTTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439048	5'	-	P-element	2495	1	63.70
ATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:1	-	chr3L	10518317	5'	-	Burdock	6323	2	73.88
AAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr2R	21907925	5'	-	roo	346	2	62.59
ACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr2L	3886227	5'	-	roo	8993	2	70.55
ATATCTATAAAAGCAAAAAGGCCAGAAGTGAAAGAAAATAGACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGA:1	-	chrX	21575455	5'	+	INE-1	94	1	63.01
TAATCATACAATAGAGTTTAGGAGCGCATTTCGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTATCAAGAGAGTACGCTATAGTCGACTTCCTCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTG:1	+	chr2L	18176999	5'	-	INE-1	541	1	73.97
GCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr2R	9328684	5'	-	roo	8997	2	66.44
AAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTC:1	-	chr2L	6863368	5'	+	pogo	81	1	74.66
AGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1	+	chr2R	2016804	5'	+	1360	3	2	74.76
CTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	-	chr3L	15600300	5'	-	roo	323	2	77.08
ATATGTATGTATATGTATGATGATCACGTGAGGCCCATCCCAAACGGCTGAGAGGTGGCCCAGCGAGCGCCACGAGCTGCGCCCTCTCCTCGACGAACCC:1	-	chr2R	21699524	5'	-	Rt1a	4610	1	80.00
ACCTCTCTCAAAAAATATTAATAATGATAACACGAGAAGATCTAAATGTATTTTAGTAGGTATAAACATATAGACAAGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTC:1	+	chr3R	28238267	5'	+	roo	388	2	52.74
GTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1	+	chr2L	14081326	5'	+	1360	64	1	71.09
ATCTTTTTCCGCCAACATCAGCTCATTTTTATCACACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1	-	chr3R	18339223	5'	+	roo	8688	2	68.49
CCCTTTAGTCGCTCCCAGACGCTAAGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1	+	chrX	13039446	5'	-	roo	9032	1	59.29
GCATATAGACATTCAGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1	+	chr3L	9997999	5'	-	roo	410	1	45.83
CACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAATCACAAATA:1	+	chr3L	2362339	5'	+	Stalker2	7315	2	65.15
ACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3R	18582260	5'	+	roo	48	2	53.42
GAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1	-	chr3L	3863534	5'	+	blood	7069	2	55.48
GGCCAGACAAATCGAAGCGAATCGAAATGGTTGGGAGTGCGACTGGGATTTGAACCGCAATTTGCAAATTGAAATCAATGAAAGCGAAGAATTCAAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1	+	chrX	21069571	5'	+	R2-element	3584	1	54.39
AAGGGGGATAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1	-	chr2L	19965077	5'	+	Doc	55	1	52.08
ATTACTCAAAATGCTTGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1	-	chr2R	20194347	5'	+	Max-element	8249	2	74.66
CATATTTTCACGCCACGCGTACCGAATCCGAAAACCGAAAGTCAAAAACTTAAAACCGCGTATGGTGAGCGCTGCATTTCGGGCGATATCGTCTTATTTACACAGCGATTTCATTGTTTTTTTTTTT:1	+	chr2L	6757305	5'	-	transib2	2645	1	46.46
TGTCTAGTAATTAAAAATAATACTATTGAATGCTGATGCTAATGAGTGCCTAGTAACTATCCTAGTTTGACGGGCATTTTATCATCAACTGTGGGCAACTCTTTGTTTTTTTTTAAATGTTTT:1	-	chr3R	31746272	5'	-	TART-B	10507	2	78.05
AGTGCGGTAATCGAAGCGTGCCACGAAAAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1	+	chr2L	9668168	5'	+	1360	48	1	55.17
ACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGGGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1	+	chr3L	10848675	5'	+	blood	57	2	76.85
ACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	+	chr2R	20496919	5'	+	blood	7075	2	65.22
GCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	-	chr3R	31817527	5'	-	roo	9015	2	67.72
ACCCTTTTCGGCTATGGTGGCGACTTAAATATAGGCCAGGTTTCCGCAAATCGTGATAATAATATTGAAATCAATCAAGGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1	+	chr2R	6487833	5'	+	copia	4913	2	55.48
CTGTAAAACCGGAAAGTCATGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1	+	chr2R	8146077	5'	-	P-element	2844	1	23.60
ACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1	+	chr2R	6173004	5'	+	pogo	39	1	64.42
ATTACTTTCAGTCCTGCCAACGGGCGAGAGCGTTTAAGATGGCTAAGGCAATTGAAACATTAAATTCGGTGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAG:1	+	chr3L	2325672	5'	+	I-element	5101	1	65.75
ATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAACCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCAC:1	-	chr3R	22276759	5'	+	jockey	100	1	64.38
ACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1	-	chr3L	16750719	5'	+	Tirant	38	2	68.54
TATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAG:1	-	chr2R	19727745	5'	-	R1A1-element	5127	1	57.46
GAATTATTATAACTACTATAATTTAAAACACAAGTTTTACAAATATGCAAAAGTCATATCTTGAGGCACGAAATGCGGACACTAGCCCTCAATAATGCCTTTTAAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGA:1	+	chr3R	6861434	5'	-	1360	422	1	64.84
CTAATCTGTACATTTGGAACGGTAGCCGCACTTCATACAGAATCATGAATGTTCGCATAATTGGCAGAGTTTTATGAATCTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGCGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAG:1	-	chr2R	9258565	5'	-	3S18	309	2	53.28
GGAGTACGAAGCATGCCATCCTGTCGTGTGTCAGCGAAAGAGAGGCAGGGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1	-	chr2R	21101818	5'	+	P-element	63	1	34.07
GATATACTAGATTTGTTGAAAAGAATGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTCCAACTATATACATACTTATATATTCTTGATCAGG:1	+	chr3R	28636009	5'	+	INE-1	77	1	88.10
TATGCGGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAGTTAATATAA:1	-	chr2L	22121657	5'	+	gtwin	6955	2	42.47
TTTGCTTTAATTACTTTGTTTAAAATGTCATAAAACACTTTGCAGGTAGAACTATCGAAGTCTGGAACGGAGAGGCGAGAACCTTTTTACGATGTCACACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCC:1	+	chr3R	16829338	5'	-	R1A1-element	201	1	71.32
ATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1	-	chr2R	3065987	5'	-	P-element	2816	1	32.31
TAAAACTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTAGTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTGCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCGGTTCCT:1	-	chr2R	4339511	5'	-	G5A	2758	1	79.84
CAAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGC:1	+	chr2R	2007458	5'	+	1360	48	1	48.89
GTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGATACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTA:1	+	chr2L	21936074	5'	+	INE-1	13	1	42.98
ACAGAAAAGTCGTAAGTGTTTTATGCATCTCTTGACCAAACACTTTTCGTATTCGTTTTTATTTTTCATAATAAAAAATTTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTTTCTTGCTTGTGTGAGTAAAAGCAAGAGGCG:1	+	chr3R	11752475	5'	-	1360	3242	1	56.74
ATGCTAATTCCCCTTAGGAATACCTCAGAGGGGTATATAAACAAATTTTATAGATATATTTATTCATAGAGCTGAATCGCCTAGCAGTTTTACAACATTTATTTCGGGTTTCAACTTTTCAAATTGATTGACCAATGTTTAGTTTT:1	-	chrX	20891066	5'	-	Transib-N1_DM	406	1	50.68
CATCGTGGAACAGGTTCTGTGCCCGGCCTGAATAAACAAATGCCCTGATAGCGGGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTTCGA:1	+	chrX	18386361	5'	-	invader4	3031	2	53.42
GATTAAACTTAAAAGGAGAATAGGAAACTGTACGACTGTGTGCTAGTGTGAGTGAGTGAGTGAGTAAGTGAGTGTGTGCTGGTGTCCTAGTGTGTGTGCCCTTGCCAGCTTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTTACCT:1	-	chrX	20345306	5'	+	1360	212	1	77.86
ATTATTATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTT:1	+	chr2L	12569980	5'	+	micropia	36	2	60.96
AAGAGCGAGAATAGAGATGAAAAACATGACCATGTAACACATGAACCACACTTTTTCTCGTCACAGCAGTTTTTGTTATTAAACGGAACCCTGGGGCCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAAA:1	-	chr3R	1443516	5'	+	INE-1	84	1	73.68
GTGGGAAGGTCACAAACCTATTGGAATGCCCATAGTTTCTTAATTCATATTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1	+	chr3R	9038938	5'	+	Juan	4075	1	64.29
TTTAATGTTACAGGTTATAGGATTGCAATGTCGCTCTTCATGCTGTCTGTTAAGATGGCCACTAGGGAAATGCCTATCCTGAGAACATAGTCCAGAGCCAAAGACACTAGAATAACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAA:1	-	chr2L	21153611	5'	-	1360	379	1	67.12
CTTTATCTGAATATTTATGATTCTTTGATTTAAATTGAAAATATTGCTCAATAACTAATATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1	-	chr2R	20944446	5'	+	pogo	56	1	60.27
ATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1	-	chr3L	25401023	5'	+	Doc	46	1	45.21
AATTAGACCTAAACTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCA:1	-	chr2R	16248042	5'	+	BS	20	1	64.38
ATTTAAAACTTTATAGAGATCATCTTATTATTATATTAAATTATAAATAAGGTAATAATATAACTTATCCTTAGCCTGTACCCTCTTTTCGCTTTTAATAATTAGTCGGTAAACTTCGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGT:1	+	chr3L	20055852	5'	-	F-element	4537	1	78.08
AACTACGCTTAATGTGTCATTGCCAACGGTTTTCAGACTGTTTTCACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1	+	chrX	8543416	5'	+	roo	38	2	60.96
AAGTAACATGATATTAGAAAGAAAAGCGCTAATTTTCTCTTGCATAAATGCTTTTAATAAGCCTTATATTATACCTTATAATAATAAATATTATTAACAAAAACATAGCATTAACAATTTGTCCTAATTTTTTTGATTGGTAGCGT:1	-	chr3L	6853673	5'	-	G4	3488	1	67.81
GTTGTTATTTTTTTTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTTGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1	+	chrX	5419509	5'	-	transib2	2770	1	58.46
GGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1	+	chr2L	13585846	5'	+	Tabor	32	2	56.00
AGAGGTATACTTTTTCAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	-	chr2L	18294324	5'	+	roo	28	2	64.83
AGTTTGGAAAATAAAAGACATTGACAATTTTTTTTCCGAATAGAACTCGAGTTATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATATT:1	-	chr3L	46999	5'	+	FB	60	1	59.42
ATAAAGTTGTCGAAATTTGGGATAATATTATTTTTATTTCTCTCACTTTCTGTTTGCCTCTGTTCAGTGAATTGGAAGAGAGAATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1	+	chr3R	12954041	5'	-	jockey	4954	1	66.19
AAAGAACCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chrX	9540120	5'	-	roo	9059	1	65.71
AAGCGACCCAGTTTGACATCGCCTTCAGTGCAAGAATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	+	chr2R	14542079	5'	-	roo	401	1	76.03
ATCAAGAAGTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTAT:1	-	chr2R	4601691	5'	+	HMS-Beagle2	15	2	76.71
AGTGACACACAATGACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCCATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1	+	chr3L	3799787	5'	+	copia	59	2	63.85
ACGAGTGTTGCAACGTGCAACCAAATATTTGCGTAGGTGTTCGACCGACTGTCGCTGCGGGCTTCGTGTCAATTAAAATTAAGTTTACCCCGATCGAATCAGAGGGTAATCCTTTGCCCACCTCTTAAAACCAAATATTATCAACA:1	+	chr2R	14085587	5'	+	FB	326	1	56.16
ACATATATGAACGGTTCGGTTTATCTGGCCCCCACTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTTACATTAAACTTTATACCGATTTTGAACTTCATGAAAGTCAG:1	-	chr3L	19034524	5'	+	Tirant	8389	2	62.20
AAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCTGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1	-	chrX	22511418	5'	-	1360	3330	1	67.81
CTCACTTAAGACGGCCTCAGTTTTCGTAGGAGGTACTTGCGAGTCCACTGCCACTGCACAGTGGTTCCGTCAGAGGCCAAAAATAAAAAATTGGTGCCAGGTTATAAAACCTGGTCAGCCAAAAATGACTTGTT:1	-	chr3L	23784090	5'	+	Cr1a	492	1	67.16
TTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAA:1	-	chrX	23182953	5'	+	Idefix	9	2	65.00
GCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:2	+	chr3L	10292821	5'	-	roo	8991	2	77.40
CTCGGGATTGTATGTTATGCATGCCTACCCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1	-	chr2L	17081836	5'	+	jockey	4742	1	76.00
TTTTAAAAATGTTTCGATCTTTTTATTTTATTATTTTCTTGCCAATAAAAATCCTTGGTAACTTACTTTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCAT:1	+	chr3L	20895928	5'	+	invader3	5234	2	51.11
GCCAATTCCAACATCGACGACAACCACAACAGCGTCATCGACAACATCCACAGCGATTCCGCCCTCTACAACAATCCCACCCAAATTCGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTTGACTAGGACACACAAACATAGCC:1	+	chr3R	6308520	5'	+	I-element	4952	1	52.74
AAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr2R	7898083	5'	+	roo	75	2	75.34
ATGAGCGCGCTGCCTTAATGCGACTTGACAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCACTGGTGTGCCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1	-	chr3L	13574527	5'	+	hobo	35	1	51.67
ACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	+	chr2R	18336131	5'	+	roo	8710	2	53.10
GCCAATGCCCAATGCTCAACAGCTCCTGCAGCTCATTCCCGGCCATGAGAATGCCCAATCTGTCCCAACTCATCACCACCGTCACCCGAAAAGTCAAAAATTTGATATTCATCGAACAAC:1	-	chr4	803076	5'	-	Tc1-2	251	1	73.33
ATTAGCATGAAATCCCAACGGTGCCTCAAAGCACTCATCACAATTTTACTTATACATCGCACTATTTGAGTCGAAGTTGGACCGGGAGAAGAAGTGGGTTTCTGACAACAGGAGGATGTCTATGTCGTGAAGCTCAATAAAAGCGA:1	-	chr2R	4330506	5'	-	G5A	80	1	54.11
ATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1	+	chrX	5643474	5'	-	roo	9023	2	57.46
AAAGGAAACTGTTAACTGGGTCCATAAATTCAACTTTGTTGTATATACATACATACATACTGTATGTTCATATAAGTACGTCACTTTAAACATCTGCCTTCGTTTCCTTTAACCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTT:1	+	chr3L	21821365	5'	+	Tc3	313	1	76.03
GTGATGATTATGTGAATATGCCATTTATTGCCCATTTGTTTATATTTTTTGGGGCGCGAAATCGTCATATTATTTAAAAAATTTGAGTGGCCGAAGACAGCAAGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACGTCTTT:1	+	chr3L	27334821	5'	-	hopper	497	1	61.64
GGAGAAATATGAAAATTATGAAAATACATGAGCTGCACGAGAGGGCAGCAAAGAGTGCCCCTATTCTAGATTTACGGCCTTGACAGCCCATCGGGGTATCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTT:1	-	chr2L	21853493	5'	-	P-element	2638	1	70.00
GTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGACTCGAGAGCGATAAATTA:1	+	chr3L	20654479	5'	+	roo	8732	2	64.38
CACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGAC:1	+	chr3L	17205234	5'	-	hobo	2904	1	76.25
AGAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGATCATATCTTATGTGAA:1	-	chr2L	14203567	5'	+	roo	8711	2	58.54
ATGGGGGAACACTTTAAGACTTAAGCCAAATCCAGCGGGAAATGAAATGCAATTTCCAAGGACTCTCAGACACGAAGGAAAATCGGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCA:1	+	chr3L	16222655	5'	+	blood	168	2	76.64
AAACGACCTTTTCTTTCTGCATAATTTCGGGAAATATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTT:1	+	chr3R	6524834	5'	-	I-element	5262	1	76.71
CATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	-	chr3L	11530955	5'	-	roo	8987	2	76.03
TAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAAC:1	+	chr3R	17478384	5'	-	copia	5049	2	72.22
ATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1	-	chr2R	3065974	5'	-	P-element	2848	1	34.12
CGTAGCTTATGGGAATTTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3R	19968217	5'	+	roo	42	2	57.53
CAATGAAAAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chrX	8543566	5'	-	roo	9037	1	60.27
TAAGAACAAGCGTTTGTATGGCAAGTGTCGCTCTTAAAATGTGTCTTTCAAAAAATTGTGTACAGGTGTACTACTTAAGCATCAAGCAACGAGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGTG:1	-	chr2R	10113896	5'	+	R1A1-element	5074	1	67.15
TCCAGATGCAGAGAGCTTGTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAG:1	-	chr2R	5173565	5'	+	gypsy	21	2	66.90
GAATTGATATGCAGATGCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAACATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chrX	6486846	5'	-	roo	9052	2	64.38
AGTTTCAGACATAGGGGTAAAGATTTTTTATTTTCTATTGCCAACATTACCAAAATATGAATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAATGGAA:1	-	chr3L	14944682	5'	-	G5	4815	1	67.12
GAGCTCCTACCGAACACTATACTATACTTTACTATATGAGAGGACGTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAACAATTGA:1	+	chr3L	10056066	5'	-	transib2	2797	1	65.75
TATTGATTTTGGCTCAGCAATATTACATGGAAAAGTATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1	-	chr3L	3477530	5'	-	mdg1	7412	2	54.11
ACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAACTGTGATC:1	-	chr3R	20427474	5'	+	jockey	62	1	56.43
GCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1	+	chr2R	20496890	5'	+	blood	7054	2	54.79
CGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr2R	21907939	5'	-	roo	9001	2	71.64
AAAAAATTTAAGTAATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1	-	chr2L	21884609	5'	-	pogo	2038	1	63.70
CCTGATCCCCTCAAGAAAGATCATATCTGGCCACGAAATCAATGTTCGATGCTTTTCCTTGCCCCAGAAAAAACTTTTCTTTTGCTCAGCTCTTCTTCCCCCGTTTTTTTACTATTCCAACTTACTCTGCTTGTGTACTCCCACTG:1	+	chrX	2525256	5'	-	P-element	422	1	69.18
GACATTTACAGAGAGAGCAAAGTTATTGTTTTCCCTGAAAGGCAATCACGCCTTCACATTATTAACGTTTTGCATCTATCGCATCTCTGTTTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCA:1	-	chr3R	22115924	5'	+	Circe	7347	2	56.12
AAATTGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1	-	chr3L	10574419	5'	+	Tabor	7	2	69.17
AATAAAATTAGTTTTAAAAAATAAATAAACGAATGTAGATGTGTTTTCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAA:1	+	chr2R	4906397	5'	+	INE-1	146	1	73.29
AAAATGATACCGTGTTATAACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGTAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTACGC:1	-	chr3R	17478466	5'	+	copia	63	2	59.59
CAATGAAAAGGGGGTCAAAGTTACCAGCAAATTAAACGCAAATTACCTGCCAGAAACACAATATCCAACTACCACATATATATAGTGACGAATTTGGGTGGTCCAA:1	-	chr2L	16067197	5'	+	297	2	2	79.25
GTTTTATTACTGTATATGACAACGCTGAATGGCTTACGTGTCTTTCCTCTCTTTTTTGTTCCTGTGCAGGGCAAGGAGCCCCAGTTCGAGAAACTTAACTTTGTATTTTTGAATGAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTG:1	+	chr3R	13458777	5'	-	X-element	140	1	54.11
TCCGCAAAAATGTATTGACATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr3R	19968049	5'	-	roo	396	1	76.03
ATCGATGAGACTTAAAAACATTTCTAATCACAGCAGTTGCATAACAACGGCGAATATCAAACTCAATAGGAATTAAGCCAAGTGAAGCAAAGTGTTTCGCAAAATAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAA:1	+	chrX	15412438	5'	+	1360	3116	1	68.49
ACTAGGATACGCACGTCAAATTCCGTAAATGTTTTACCCAAATTAAGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1	-	chr2L	13914225	5'	+	jockey	4677	1	70.15
TAACTCCCATTAACAAATCCATCCAAAAACGACACTGAAAAGGGAGCACACTTGCATGCATTTATTTATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1	-	chr2L	8986231	5'	-	412	7514	2	56.00
CAAAGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTATATGAATCG:1	+	chr3R	31817447	5'	+	roo	54	2	59.40
ACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTT:1	-	chr2R	8146128	5'	+	P-element	63	1	38.57
CTGCTTCCCGACCTAGGCGAAGAAATCTTTTTATTGTGGTAGGATGAACACTAATAAGGCC:1	-	chr2L	20166103	5'	+	invader3	6	2	86.89
CCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGTAGTGAACGCCAAATAA:1	-	chr2L	11661017	5'	+	F-element	73	1	54.79
AATTGTTTTTTCAAAAACAAGACATTTAAAAACATTCCCTGACTCACCCAAAGTAAACTCCTTACCCTTTCTGTGAATGTCGATCTGAGCCATGTCCGTCTGTTCGTATTAAGGTCGATATCTCAGGAACTATAAAAGCTA:1	-	chr2L	22984268	5'	+	INE-1	151	1	54.61
TTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1	+	chr2L	17295870	5'	+	Doc	93	1	80.14
ATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAATATTTATAGCGGCACTTCTGTCAACGTTGCGCCTCGTGACTTCTCAC:1	-	chr3R	1960321	5'	-	gypsy9	158	2	87.67
ACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTNCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1	+	chr2R	977529	5'	+	F-element	48	1	53.33
AAAGTTTTTCATTTAATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGAGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGT:1	+	chr3R	28624535	5'	-	roo	398	1	71.43
GAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATAT:1	+	chr4	419967	5'	+	roo	71	2	69.18
AATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:2	+	chr3R	19968071	5'	-	roo	9037	1	60.96
TATTACTATTTTGAAAACTTGCCAAGTTAGTTTTCAACAGACACACACGAGTGGATAACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTG:1	-	chr3R	24452805	5'	-	Quasimodo	6945	2	56.14
GGGGGTGGTTGTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chrX	10640120	5'	+	roo	8718	2	55.86
CCCTCAAACCCCACCCACCATCACCCCTGTGAAATGAGAGTTAAGCCCAACAATGGACGTATAACGAGCCTCTGAAGTATTTTCACAACGCGCAATATTTGCAAA:1	-	chr2L	18328676	5'	-	Bari1	1684	1	66.67
TTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTG:1	+	chr3L	6620587	5'	-	accord	7034	2	51.43
TGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCATTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1	-	chrX	2518120	5'	+	P-element	39	1	46.67
GGCAATGCGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1	-	chr2R	5031021	5'	+	Doc	63	1	67.50
GCAATTACCAATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	-	chrX	6486830	5'	-	roo	9036	1	54.79
GCTATAGCTTGGTTGTGTGTAGACGTGCTTGAAGTATTTTAGATTAAAGCACGGCCGTTTTGGTGTCGTATAGAGAGTTTTCGGATAAGATATGAAAAAATGTTTATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCA:1	-	chr3L	13602147	5'	-	roo	8646	1	70.34
ACTATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTG:1	-	chr2L	22575945	5'	-	INE-1	539	1	68.27
CATAACAAAAATACTTGCGCAAACTTTTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1	-	chr3L	17205327	5'	+	hobo	26	1	69.18
ACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGA:1	-	chr2R	4206658	5'	+	1360	320	1	72.60
AGGATCCACTGCTCGTCCTTCCTTCTGTGTCCTGCGCCTTTCTAAGTTCCCGACACTTTCACAGTTCGCTCTTCACTGACTTACCCGCGCGTTCTCACTCACTAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGC:1	+	chr3L	27130703	5'	-	1360	302	1	69.86
TATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTCGGCTCCGTTCATATCTT:1	+	chrX	23362233	5'	+	roo	40	2	58.62
ATTATTACATAGCTATTCATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAAAAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1	+	chr2R	13121939	5'	+	pogo	7	1	68.49
CACAAGCGACTTTCATCTATATTACTATATTAACTTCTTACTTATATAGAAAATTCACAAAGTTGTTATTCAATTTAATGTTTCGGGATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1	-	chr2R	6085249	5'	-	pogo	2071	1	47.95
ATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:2	-	chr3R	22844257	5'	-	roo	8984	2	78.77
CCTGTATTGTTGATTTTGGTTGGTTCGGTTCATTACAAAAGTTTCGCCGCAACAATATTTCATGTTTATTAATGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGGCAAACGAAAAAAATAAATTTTAAAGGGTGGGCAAACGAAA:1	-	chr2R	18349421	5'	-	FB	864	2	52.05
ATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1	-	chr3L	20888812	5'	+	1360	38	1	54.35
TGGCGGGTTCCCATCAATTCAACAGCTCGCAACATACACTCGACTATTGATCCAGTTCAAGAATATAAATACTTTATATAGTCGGATACGCTTCCTTCTACCTGTTACATAC:1	-	chr2L	22995786	5'	-	INE-1	28	1	67.86
CCTTCTATAAATGTATCTTTATATACCAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAGAA:1	+	chr2L	3855759	5'	+	Bica	342	1	66.00
CTAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1	+	chr2L	13585861	5'	+	Tabor	55	2	73.15
AAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGC:1	-	chr2L	12290742	5'	-	1731	4551	1	71.22
CGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACT:1	+	chr3L	25232773	5'	-	accord2	141	2	66.14
GGGCTCTTAACTTTTACTGCATCCCAATTTGGAAATGGTGTACGTCAAAAAAATTGTATGTGAACTACCCTATTTGACATTCTTTGACTATATTTGTATCTTACATACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCA:1	+	chrX	17463274	5'	+	Stalker	6835	2	69.86
TGAGGGTCCGAGCATGGGATTACATTTATTATTTATTTACGGGCACTTGGCCAACAGATCTGGAGAATATCTTGTTTGGAAAGCTCCACGTAGCCGTTCAACTTCCCCCCATTTTTTTTT:1	+	chrX	5811462	5'	+	hopper	131	1	50.83
TTTAATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3R	28624546	5'	-	roo	9026	1	53.15
AAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr3L	10292891	5'	+	roo	8736	2	67.81
CAGACTGTTTTCACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCTACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGCCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chrX	8543449	5'	+	roo	52	2	60.63
AAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTT:1	-	chr2L	4039201	5'	-	roo	372	1	52.41
GGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAAGTTGAAGGCAGTCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTC:1	+	chr2R	16785363	5'	-	412	7485	2	77.06
CCAACGAATTAACCTTAAACACTTTGGGGCTTTCAGGTGTGCCAGTGCCAGAAGCACTAGCTCAGAGGACATCTGTTAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAG:1	+	chr2R	23157455	5'	-	hopper	1056	2	50.00
TGGTATTTTCTTATATAGAACATTTTGTTCCTTTCCATTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAA:1	+	chr2R	5173091	5'	+	Stalker	6881	4	62.07
TACGATTTACTTTTAATCTGACTAAATTCGAGTGAGTTTTTATTCGTTGCAAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1	+	chr3L	22863331	5'	+	412	14	2	74.66
AACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1	-	chr2L	10037424	5'	+	Quasimodo	43	2	52.86
AGAGGAAAAATAGGTGATTCATCAAATCGACGCACATGGCATTCAAACCATTAAGGCGGTGCCCAAACCTCCACGAATCACCCCACCACCGATGCG:1	+	chr2R	23566187	5'	+	HMS-Beagle	6713	1	68.75
AGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1	-	chr3R	10274037	5'	+	HMS-Beagle	49	2	58.91
ACTGTGGATCTGATTTTAACACACACGACGCTGGCTGGGCTTGACCTGAAATTCCCATCGATAAGGTAAGGTGATATGGGGGATATAGCTCGATACGTATTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAA:1	-	chr3R	18374464	5'	-	roo	3	2	76.92
CGTTTATATGTTTAGATTTTTTCTAATTAAATGATATTGTATAATTTATTGCAAAAATTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1	-	chr3L	15519853	5'	-	pogo	2041	1	61.64
ACAGATCTTCAAATCGAAATGCCATCTGTTTAGAAAAAATATGCACAGAACCCAAATTCAGTTTTTCATTTTGTATACAAATTCGGAAGAACCGGAAACGGATGACTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1	+	chr2R	16785279	5'	-	412	486	2	77.54
GAGGTGGTTTTCGCGGAACATCTTATGTGAAAAGTGTAAAAGAGGCAAAAACGCTGCAACCAACAAACAGTCAAGGACCTTCCAAGAGTCATTGCAACTACATCACGCTGAGAGCGTAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCT:1	+	chr3R	9507646	5'	-	1360	3265	1	69.86
AGTGCCTATAATCTCGATCTGCTTTAACAACATAGTTGAACTATGTGGTTGAGACTTTCTCAAAAGTTTTCCTAAATAGAATTGAAACACGATAGAATAAATAAAAATAGATAATAGATAGATAGATAAATATACAAATATACA:1	+	chrX	22775891	5'	+	Stalker4	7046	4	79.86
CCCATTTGGCCAGCTTGCACTTGTTTATCATTTATTACTGCAGTCGGAAAATCTGTTTCAGCTCCTTCTACATTTCACATTGTTTGTCTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACT:1	-	chrX	20864927	5'	+	gypsy	7002	2	67.36
CGTGAACCGTGTTGCATTTATTTTTGTACTGTGCCGTCGCAAAGCACAAAACACGAATTGCCATTTAACTGGTATTTTTTATTTACGACAACGAGCAACTATCTATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1	-	chr2L	18339116	5'	-	pogo	2088	1	75.17
GGGTTGACACAAAAAAAGTAATCGAAAAATTAGAATTTAATATTAATATTTCGAAGGAGCTGAAAGAAATATGTATGTAAGTGTTCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCAT:1	+	chr2L	17062638	5'	-	412	7110	2	56.85
CACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTG:1	+	chr2L	12328653	5'	-	hopper	1333	1	71.23
AGACTTACATATATAGACGGCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1	-	chrX	12074635	5'	+	412	7134	2	71.15
TAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chr3R	22844167	5'	+	roo	8709	2	52.05
GATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATG:1	+	chr3R	4357544	5'	-	Tc3	1638	1	68.35
GCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr3L	9998201	5'	+	roo	8699	2	54.92
ATAAAGCGGCATTTATTTTAATTTGCCGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1	-	chr3R	14979914	5'	+	pogo	8	1	75.63
AAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr3R	22122778	5'	+	roo	8705	2	60.87
GAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:2	-	chr3R	7100895	5'	-	roo	9004	2	63.01
GTCATGATTTTGATGTTGGCTTTGATTCGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAG:1	+	chr4	863765	5'	-	Cr1a	4301	1	75.22
TTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACAC:1	-	chr3L	24208202	5'	+	Quasimodo	61	2	67.14
CTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1	+	chr3R	12618589	5'	+	F-element	37	1	53.60
AGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1	-	chr2L	10037406	5'	+	Quasimodo	31	2	54.55
CTTAGCATATAAGCCTATTATTACATAACTTATCCATGAAGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1	-	chr3L	16015385	5'	-	1360	3387	2	78.08
TGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAACGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1	-	chr2L	19965031	5'	+	Doc	94	1	77.37
GTCTAATGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCC:1	+	chr3L	25782375	5'	-	Stalker4	57	4	55.86
AAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1	-	chr2L	9399524	5'	-	Transpac	252	2	69.92
ATTATTGATAACGGACACTGTGAATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:2	-	chr2R	18609442	5'	+	opus	7148	4	60.58
ATTTTAAAATATTTTTTTTATTTCCATTCTTTTGAGTGCCTCGCGTCAGTCTATTCACCAAATGGCAGCCGTGCACTTTCTGGTCGACCGCCTTTGTCAAGGTTCGCAAGGTCAATGATGGGGAGGGAAGTAACATAATAT:1	+	chr2R	10485118	5'	+	rover	6943	1	66.67
TCACTGATTTGCATGTGCACGGCTTAAATCCCAGATTAAATTGCTGATAGTAGCGAGTTGCGAATTACGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATC:1	-	chr3R	25826772	5'	+	mdg1	55	2	54.79
ACGGATGTAGGGGTGTGAAGTTTTTGGCATATTCAAAGTTGGAAAAGTTGCACTTTGAGGCTGCTAACCAAAAAATATAACTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	-	chr3R	11084004	5'	+	412	37	2	54.79
CAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGTACGTGTTCACATAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1	+	chr3L	14603290	5'	+	jockey	60	1	65.45
CGAATCTCCTTTGTGGTCCTGTGACTGCCGAGGCGTGTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCC:1	+	chrX	6499785	5'	-	Quasimodo	253	2	73.85
GAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGA:1	-	chr2R	6085998	5'	+	1360	479	1	61.64
ATTTTAGAGCCCAATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1	+	chr3R	25826637	5'	-	mdg1	7426	2	60.96
GGCTAAATTAAATCGAGTTTATTACTTGAGTACATTGCTAAACGATCATTTTCATCATTTCCATCGATTTCGGTTTTGATTTTTCTCCATTAACGTTTTCATACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATC:1	+	chr3R	8950600	5'	-	flea	4732	1	73.57
ACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1	+	chr2R	9791604	5'	+	412	7140	2	79.45
GTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1	-	chr3R	16404535	5'	+	pogo	32	1	71.76
GCAGGGAACTCGTAAATTTCCTGCTCAAACACGCGACCAGGATTTGGTCAAAAGTCGAATGGAGTCAAGTGGGGGATAAGCTAGATTCAGTCATCAAGATAGGCAGATGTGCCCG:1	-	chr3L	9985931	5'	+	roo	8904	2	78.26
AATTATGTTTTAGTAAGAATGGGGTTGAATCTGATTTTACAGCCTTAATGCAGCTTTTAGAATCTATATTTAGAGTGTGGTATATATATATTTATATAAGTTAACACGCGCATGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATCAGACCGGA:1	-	chr3R	1146296	5'	+	gypsy4	6597	2	78.08
CAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1	+	chr3R	25826664	5'	-	mdg1	394	2	54.87
TTGTTAGCTCAAATCAACTAAGCTAAACTGGTAACTATACTCAAAGCAGACTCTCGAACAAAGATTAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1	+	chr2R	19499294	5'	-	P-element	2837	1	50.00
CACTTCTGGGGTCTGCTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr2R	13710580	5'	+	roo	60	2	60.84
TTGTTGCCTCGGCTTTCGCTGATGATCTCAAGCACAATCGTGCCTTGACACAGATATATATATTAATGTAATATAAGTAAGATAATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1	-	chr2L	22209349	5'	-	flea	4991	2	69.78
ACTCGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGTCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGCATTTTTG:1	+	chr3R	17531371	5'	+	1360	82	1	71.92
CCGGCGGGGAGGGTGTTGTGTGCCTGGCAAGTGCAGATGAGCTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGC:1	-	chr3L	18044586	5'	-	Porto1	351	1	73.45
TGGAAAGTCAGGCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCT:1	+	chr2R	5173424	5'	-	gypsy	412	2	54.81
TAATGAATTCGATGCAGTATGCGATTTGAAAGTTTAACACCACTCGGAATACATTTTGTGTGATTTTGCATATGCCTTAGTATACTGCCCTCCGACTCTTGGATG:1	-	chr3R	19857859	5'	+	G5A	338	1	69.52
CTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1	-	chr3R	27424907	5'	+	blood	79	2	72.65
GGCTGCTGCTGTCAAAGGCGCTAGCCCTGGCCCATATTTCCGAGTCGGTGGGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	+	chr3R	12886881	5'	-	roo	400	1	70.87
AACTTAATTGGGTAGAAACAAGTCCACTAAATTGCTTAATTTCCTTTTTCCCTGGTTTTTAGTTTGAAAGTAATCGCTTTTCTTGATTAGGATCAATAGCCTAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTTCGTATGAATGTCGAGATC:1	-	chr3R	9242773	5'	+	INE-1	132	1	52.74
ATTCGCTTAAGGAATGCAATCAGTACAAATAATATTTCGATAGTTAAAACAAATTATTATAATTGAACAAAGAAAACAAATAATAGATGTATGTAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAA:1	+	chrX	22897536	5'	+	Bari1	8	1	76.71
ACGTGTTGCCGGGCTGACACTTTTTCCGCTTAATACACTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGAC:1	+	chr2L	12290640	5'	+	1731	22	2	67.18
CGATTTAAGGAATACAAATTTTGCTTATTTTCTTGTGTGCGAGTGGGTGTGCTTGTGTGCCGCCCACAGAAAACGTTTTGCGCCTCCCAACCACACAGACACACACACACACACACAGCG:1	-	chr3L	17448446	5'	+	accord	7104	2	78.33
CTTTGGAGCCAAGACTTTTTACAATTGGTAAGCTAAATAAATTTCTTAAAAAGGATTTCGTTTATAACATTTAAGCGTATCCGACTACATAAAGTACTGCATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCCA:1	-	chr2R	5198473	5'	+	INE-1	102	1	50.69
ATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1	-	chr3R	20427453	5'	+	jockey	68	1	69.60
AATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCA:1	-	chr3R	17316307	5'	+	opus	7172	4	77.27
AATTATATGATTTAAATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1	-	chr2R	20497045	5'	-	blood	352	2	59.59
TTTGATTTATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr3L	22437856	5'	-	roo	9015	2	56.85
ACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1	-	chr2L	6623060	5'	+	Burdock	39	2	58.90
AAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1	-	chr2L	14081393	5'	-	1360	3365	1	56.12
GTTGAATTTTTAAGTTTTCATTAATTTTTTGTTTTTATTTTGTTTTAAGTTTTTATTCAAAAAGCTTCAGTTCCAAATAATATGAAATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1	+	chr2L	21559111	5'	+	FB	36	1	60.96
AATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1	-	chr2R	20194301	5'	+	Max-element	51	2	53.28
AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCTATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439059	5'	-	P-element	2495	1	58.90
CGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr3L	11393494	5'	+	roo	78	2	75.34
TTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1	+	chr3R	9921963	5'	+	blood	7060	2	54.11
CTGCTGAGTCAACCCGGTACCCATTTGAAAGAGACGTAATACGGCCCCAAGAGAGAGAGAGAGACAGAGCGCACGAGCGGGAGAGAGCTACTCAGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAG:1	+	chr2L	12365982	5'	-	1360	3240	1	74.58
AGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	-	chr2L	23068911	5'	+	1360	50	1	70.75
TATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	-	chr3L	10292905	5'	+	roo	58	2	58.22
ATATATGATATCTGTGATTTCAAAAATATTTCCTATTAGGTTCCTTGAAAATATTTTAAAAACTCGTGTGATTTTGAAGCTTTTCCATTCACATTCTATCCATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAAT:1	-	chr3R	9038756	5'	-	Juan	4124	1	68.49
TATGTCAATATCTTGACCAGGAGGTGCTCTAATGGGAGCGTCAACTTGTACCTATTAGTAATGAATGAGAATTAATAGAAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGAAAAAGGAGTTGCATTAAAGGTTTTTATTGAATTTTT:1	-	chr2L	7707320	5'	+	Tc1	308	1	55.94
ATCATAATTAAATTAAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGCTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1	+	chr3R	19589879	5'	+	BS	5021	1	64.14
TCAACAGTAATCATAAGCTAATTAACAACTACAGCTGAACTACGGACTCGGAACTCTCATTTAACGTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1	+	chr3R	13349035	5'	-	BS	5042	1	54.79
TTCTTGTTTGCATTATGATATTGGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1	+	chr2L	17295803	5'	+	Doc	30	1	61.38
AGGTAAATCCCTCAGATTTAGACGACTAATCTGAGTGACTCAGAGGATCTCGGTGTGTGCGAGTTTGACCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGGTCCGAATGCACACA:1	+	chr2R	10291136	5'	-	opus	7230	2	52.05
ATTTAAGCCCCGCCCACACTCTCATGAATAGAAGTAGTAACATTTTCCTTGTTTCGTAGCGTTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1	-	chr2L	23068943	5'	+	1360	58	1	56.85
ATAGCTTGTATAGATTGTTATTAAAGTTAATTACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:1	-	chr3R	16404542	5'	+	pogo	57	1	73.50
GCAATTTTAAACAAATTTGGGATTTAGGTTTTATTGCACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1	-	chr3L	15996008	5'	-	297	6928	2	70.80
TCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTAC:1	+	chrX	13066523	5'	-	jockey	4912	1	73.97
ATGTGCATTGGCATTCCATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCACCTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	-	chr2L	11674472	5'	+	jockey	15	1	78.46
CATAAATAAAACTAGAAAACTAGGAAACGAATGCGAAAACATTTTACCAACTTTTTTTTGTCAAGCAAAGCGAAGAATGGCTAAGTGGCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATG:1	-	chrX	1140969	5'	-	17.6	161	2	62.39
CAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATA:1	+	chr2L	21008564	5'	+	invader3	5235	2	70.87
AGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1	+	chr2R	13585391	5'	+	412	46	2	52.74
AACGAACTCTCCGCCCTTCGGAAAGCTGAAGCTGGGCCAAAACTTTTTGGCCAAGACTTGAACTCGTTGGGATGTTTTTAAAAGCACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1	-	chr3L	14606827	5'	+	jockey	8	1	75.63
ATTGCAGCTAGAGATTAATGCAAAGGGATGGTATATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1	-	chr3R	14337513	5'	-	copia	228	1	63.08
ATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1	-	chr3R	17831874	5'	+	F-element	69	1	63.16
AAAAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCA:1	+	chr2L	4177208	5'	+	GATE	59	2	54.69
CTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1	+	chr4	1294987	5'	-	TAHRE	10434	1	88.30
CTGTGAGAAGAGGGTATAATTTGGCTGTAGGTACAAGTTGACGAAGGGTAGTTGGCCGACCCTTGATATGCGTGCTAGGTCGATGAGATGAGCCGACT:1	-	chr2R	4471112	5'	-	Chouto	6027	1	75.51
AAATTTAAAACTTTTTGCCAGTGCATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	+	chr2L	7945288	5'	-	roo	9038	1	63.01
GTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTCATTGTGA:1	+	chr2R	21229012	5'	+	jockey	60	1	64.81
ATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAACAAATTTACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAA:1	+	chr2L	12534746	5'	+	Cr1a	258	1	75.34
CTCTTATTTACACACTTCCCAGACAAATTAGCGCACAATCAACACTCCGACACAAAGGACCCTCCATTGTGGCCAAATCAAGTCCAATTGAGACTGGTATCACGTACAGTGAAATTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCA:1	+	chr2L	19397544	5'	-	F-element	72	1	78.87
GACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	+	chr2R	9791587	5'	+	412	7097	2	60.83
AGCAAGATTCTCGCTGAACTTGGGCGCCCGCCTCATAACCTTGGGCGTATGCAACTGCGACTCGAAGAGTGTTCGCAGATTGTCTCCACAGTTGTGAGGCTTGGGAGATCC:1	-	chrX	13810195	5'	-	invader5	362	1	59.46
AAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAA:1	+	chr3L	21484243	5'	+	1360	422	1	69.18
AAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGAATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAA:1	-	chr3L	14638666	5'	-	1360	56	1	37.50
GTTTGAATTTATTTATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAA:1	+	chr2R	23352141	5'	-	Stalker	215	4	62.33
TGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGA:1	-	chr2R	9632185	5'	-	roo	336	2	64.38
TGGATATTCCACCTAAGCCTATTACAAAGCATATTTGCCTATTTGCAAACTGACCTTTCTCTTCTAAAGTGTAATGAATTCCCACATAATTCATCAAAAAATATCATACTCACACCAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATT:1	+	chr2R	4518762	5'	+	1360	3268	1	55.32
AATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1	-	chr3L	21855528	5'	+	blood	7078	2	65.28
GCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	+	chr2R	12835047	5'	+	jockey	86	1	70.55
AGTTTGAAGTTATTGCTTTCATTTCCCTTTAGTCGCTCCCAGACGCTAAGAATTTAATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGAGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGT:1	+	chrX	13039422	5'	-	roo	387	2	70.55
GTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	+	chr3R	17420421	5'	+	roo	63	2	66.91
CAGCATATCCCCATGCACCGATGATGTTTAGCACTAAGCAAATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATC:1	-	chr3R	24383356	5'	+	rover	39	2	56.16
ACACACACACATACTCATCATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1	-	chrX	3308380	5'	-	hobo	2893	1	59.32
GAAATAAGTACAGCATTACTCACCGAAAGTCACTGCGATGTGTGCACATATGTATGTAAGATAAGAACCTCTTCTTTCGCTCTTCGTCATGACTCACCAG:1	+	chr2R	9544026	5'	+	opus	7025	2	63.00
AAAATTCTCTACATCTATTCAACAGAGCCTGGGACACGTCTACACTTTCAGCGGTTTCAGTCTTTGCTTAAGTCGGAGACTTTTTATGGAGACCATTTAGGGAGAATTTCAAAATTCTAGTTCATTTTTTTTTAATATATCATTTG:1	-	chr3R	21386305	5'	-	BS4	728	1	88.36
GTATTATAAACGCTTCGCTGGACATTTCTCGTTGGGCTGAATATACAGGGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAAT:1	+	chr3L	13189810	5'	-	I-element	5048	1	55.05
AATTCGATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTA:1	-	chr3L	16343304	5'	-	roo	371	1	51.28
CTTAGAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTACAATCCCATATAAGAAGCCTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr3L	21817929	5'	-	roo	391	2	71.92
GGCGGTCCTAATCCCGCTTAACGTTCTGTTGACATCGCCGTGCCAACCGAATGCCATCAGGCATTTCGTCACATAAAAATACATGGCCAATATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTT:1	-	chr3L	7292595	5'	-	HMS-Beagle2	301	2	75.00
GCTGGGTTACCCGTCTCTTTGAGTTCTTACCACTGGTTCAGCTAGTTACACCGTTGCCGGTCGCCGGCTAGACTGAAGTGGCTTTCGGAGGTCTGTGGTAGTGTTCATGTGAACCGTCCAAGAACCCTACAAGA:1	+	chr2R	2110258	5'	+	mariner2	636	1	74.63
AGACACAAAAGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTT:1	+	chrX	5629128	5'	-	jockey	4914	1	69.86
AAATGCAGCGTAAACTCCGATTGCCAGCCACATGGCTACACCGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGA:1	-	chr2R	9500118	5'	+	G5	4696	1	69.50
CCGCATGATGGCGTCCCCCTGCTGACATAAAGCTGAAATGTACAACATTCTTCTTTGCGATATAAAAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGCACTTTGCACAATGCCTCGATG:1	+	chr3L	12861697	5'	-	pogo	2073	1	58.54
CGTGTACTCAAAACCAAGCCGAGACCGCCTGTCAGCATGTTTGTCCGTTGTTCGCTGTCCCTTTGTCCATGAGTGGATCACTCATGGGTCCTG:1	-	chr2L	4412371	5'	-	Quasimodo	6988	2	73.12
ACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chrX	17054182	5'	+	jockey	20	1	66.67
TAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGATACGGCAGCGGCGGAGCGGCTTTCTTATGTATATCTTCT:1	+	chrX	21949009	5'	-	412	7325	2	80.77
ATGTTTACAGTACAATTATAATAAATGAATTACGCTTGATTAAAGGTATCATTGCATGAGCAAGTTGCTTGAATTCTCTAATTTATAATTAATTTATAAACTTAAAGTAACATCGCATAAAAGAAAACGAACAAAAAAAA:1	+	chr2R	23627148	5'	+	Doc2-element	218	1	75.00
AAGCCTACCAAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chr2L	15833433	5'	+	jockey	15	1	72.38
ACAGTAGGGAACAAAAGCTCCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1	-	chr2R	9662839	5'	+	412	23	2	69.66
TTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTG:1	+	chr3R	21276525	5'	+	BS	5049	1	52.05
AGCAACTGTCTGTCAATTGAAATTTGACTAGTGAAAATTGTACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTC:1	-	chr3R	25423326	5'	-	3S18	6071	2	58.90
GTTGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	-	chrX	7987671	5'	-	roo	9006	2	68.15
TGGATCGAAATCGAATGAATCCGTCGGGCCATCCATTTATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1	-	chr3L	17115584	5'	+	blood	19	2	71.23
CTGGTTTCTATGTATGTATATAAATTGTTGTAAGGGGTAGGGATTTTGTAAAATAATGTTAACGGGAAATTTTGGTTCTATTATGGCAAGATTTAAAATGAATGTAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAAT:1	+	chr3L	3477386	5'	+	mdg1	7056	2	60.96
ATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCATGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	+	chr2R	25118678	5'	+	roo	8727	2	63.70
GTACTGTGAGCAGAACTTTTAACAGCATTAATATTAAGTTCATCAATATTAATGCTGTTAAAAGTTCTGCTCACAGTACCCTGTTAAGTTTTGCAACGAAATTGGCCAAAAATCCTAATATGTAAATTGATTTCGGCCCGAAAATT:1	+	chr4	431419	5'	+	1360	3184	1	68.49
GATGTTGAGCTGTCCAAATGCACCATAACCAGATGAGGCCTTCATTCCCGTTTACTGCTCCTCGTCACCCAACTCGTGCTTGATCTTGGATTTATTATTATTATTTATTATTTATT:1	+	chr2L	9492033	5'	-	flea	4999	2	77.59
CGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGGTTAAATAGGTG:1	-	chrX	8543535	5'	-	roo	9006	2	60.27
CGAGGCGTGTCTCAGTTGGCTTATTTTTCATTTCTCCATTGCCCCGCCGACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCAAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAG:1	+	chrX	6499813	5'	-	Quasimodo	6983	2	76.81
TAGGTTAATTTTAAATCGAAATATTAACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1	+	chr3R	6290908	5'	+	Doc	16	1	77.40
GGTGCCCACTGTAACGTAGTGCGTTCCCAGGTGGATCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1	-	chr3L	3799849	5'	-	copia	5073	2	73.97
ATCGACAACAACAACAACCGAAACAGTCTCTTCAACTCAACCGATTCAGTGAACGACCTTACCGGCTTTTGCATTGCAGGCAAAACAATTAACAGCTACAATTACCAATTTACGTCAGTCAAAGAGCAATCCAA:1	-	chrX	7740689	5'	+	Doc4-element	424	1	72.39
GCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACA:1	-	chr2R	9463514	5'	+	rover	36	2	57.97
GTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGCCGCTCCCACGGGCGCATGAA:1	-	chrX	21667923	5'	+	gypsy2	18	2	60.49
CTTTGGCGGAAATCGAGACGGCGCAAAAGTCAATTGGAATGGAAATTGTGGCGAAGGGTCAATGAGTGGCACGTGAGGCGATGGAAAAGCACCAAAATGAGGGAGGAAAGCTTACAAAAAAACGACTGAG:1	-	chr3L	17220227	5'	+	accord2	7465	2	74.62
GAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACT:7	-	chr2R	6085998	5'	+	1360	371	1	59.59
ATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCAT:1	+	chr3R	9714383	5'	+	Stalker	6913	4	60.27
GTTTCTTGACAAACTGTATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCC:1	-	chr3L	23233851	5'	-	accord	64	2	69.81
AGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1	+	chr3R	22844213	5'	+	roo	8755	2	80.82
ACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTAC:1	+	chr3R	23020795	5'	-	INE-1	551	1	60.96
GTTCGTCTTACTTTTCCCAGGTAAAGTAGCCTGCACACGCAAAGCATATGGCTCGAAGCTACACTTGCGAAAAAGTCTCACAGTTCCATTGAAAGAAAATGTATTTATTATTATAATGTTTTATTGGAATTATTTAGTTT:1	+	chrX	12887560	5'	-	FB	475	1	72.86
ATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	9791576	5'	+	412	42	2	55.04
CTGATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1	+	chr3R	10182110	5'	-	blood	7369	2	61.47
ATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1	-	chr3L	21484243	5'	+	Tabor	49	2	50.68
AATCGAGAACAAGTGAAGTTGAATTGTGGTTGCGCAGCGGAGCACACTGCGTATTACGTATACTGAAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAG:1	+	chr2L	2122386	5'	-	Stalker4	7328	2	51.22
TAGCAAATTTGCATGCCTTGTAGCATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	+	chr2R	13585361	5'	+	412	16	2	73.29
TAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1	-	chr2R	9791692	5'	-	412	7510	2	56.72
CACTTGTTATCTGGAAAACATGATTAAACACTATATATGTAGCCATGATAGACATAAGTAGGAATACTATCAACTGTGGTCTATACTAGTCAATAATCAGATAATGAAGTAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTAT:1	-	chr2L	4954094	5'	-	Quasimodo	7359	2	78.08
CTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGCATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGATATATC:1	-	chrX	9540113	5'	-	roo	359	2	54.48
TCCCTTCGAGCCCTGGCCACAAAGTGTTGCGTTGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGT:1	+	chr3L	19035990	5'	-	Tirant	349	2	60.80
CACCGTCGCTTAAAACCGGTGGCCAAATAGCCACCACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTATATACACGCGTCTCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1	-	chr3L	6388996	5'	+	17.6	6951	1	65.12
AATTGATTCTGATTGCAGCTAGAGATTAATGCAAAGGGATGGTATATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1	-	chr3R	14337524	5'	-	copia	223	1	63.70
ATTAATTCATATCGCTTCTGGGAGCACAACCTCCTCGCTCGGCTGTCGAAAAGCGTCTGATGGAGGCCGTTAGCAGCTTCGCACTTATCGCTTGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1	-	chrX	7195164	5'	+	P-element	28	1	67.81
AGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTAATTCGTTTATTAGACATTT:1	-	chr2L	22224608	5'	-	Rt1c	5415	1	61.36
TGCAACTAAAAATTAATCAATATTAGCTTAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1	-	chr2L	15833136	5'	+	hobo	15	1	75.34
ATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1	-	chrY	2720371	5'	+	297	6640	2	67.12
GTTAGTTGATTTCTGGATAATAAACGCGTTGGTCATCGCCACGTAAATCGAAAATCAAATACTCATTTAGCGCAGACAGCGCTTGTCAACGAAATTGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCCGACGACC:1	-	chr2R	4601458	5'	+	HMS-Beagle2	145	2	67.81
ACATACCATACATACACTTAGTCGTAACTCTTAAGTCGGAGATGATGTTGGAGATGTCTTTGTTAAAGAAAAATCAGCCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTG:1	+	chr3L	5744903	5'	+	invader4	2645	1	60.48
TCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1	-	chr2R	2016911	5'	-	1360	3333	1	59.70
ACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCT:1	-	chr2R	5206898	5'	+	G4	3765	1	59.86
AGCCACTTTAACTAGATGGAGCCAACAAACCTGTGCTCCCCATCCACCTCCCCCCCAAACCAGTTAATATAGTTGATAGAAAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTTAAAAAAAGGGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCG:1	+	chr2L	12790010	5'	+	blood	7010	1	56.25
CAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1	-	chr2L	15991389	5'	-	mdg1	7388	2	68.09
GTAATTATGATACAAGTTGAGCTAAAATCATATAAAAATTTATAACTCAAATGCTGATTATGGCGACAACAACATTGGGGGCATTATGCATGGTTTATTCTTCTTGAGTGGATAACTCATGGGTGCTGATCAGCCGAG:1	+	chr3R	24450300	5'	-	Quasimodo	250	2	71.74
AATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGTTTC:1	-	chr3R	17316307	5'	+	opus	7045	4	71.88
AATATCACAATGTCAACATTTTTTCCCTTCTTATTCAATTAAAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGC:1	+	chr3L	17557974	5'	-	jockey	4967	1	61.38
GATGCTGCTACTCTGCCACCGAAAACATTTTAGTTTGGTGAGAAAATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1	+	chr3R	11083846	5'	-	412	7540	2	77.60
CTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATAGATCA:1	+	chr3L	27356084	5'	-	Tc3	1633	1	69.18
ACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	+	chr3R	18339112	5'	-	roo	320	2	75.34
CAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACACTTAAATAAA:1	+	chr2R	13585419	5'	+	412	7073	2	53.26
GTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:2	+	chrX	2842468	5'	-	Tabor	7282	2	56.85
AGCGGGCATTTAATAAATTGAGAACGAGGGTCGGCAAGAGCAAAGCATACAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCG:1	-	chr2R	8529707	5'	-	INE-1	555	1	56.96
CGATGGCTCGGCTGCATTTTGCCTCAATTTGTCAAAGACGACTGCGATTATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	+	chrX	14336374	5'	-	roo	9045	1	68.49
CAAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1	+	chr3R	14651190	5'	+	P-element	47	1	51.77
AGATTCCACTTATGTATTATTTATATAAATGACAACGTGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTATTTCTTTATTTATTTAGAAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTATCATAACAGCGCAATTAA:1	+	chrX	20266143	5'	-	BS	5042	1	66.44
TTTCCCTCGACACTTTTGACTGGGATTGCTATAGAGGTCTTCGAGAGAGCCTGAAACCAGCTTTTTAGCCAGCACGAAGAAATCGTGTGCAAAATATCGAAGGGCGTTACCCATCTTGTTATTCG:1	+	chr3L	23250427	5'	-	1360	11	1	72.80
GGATTTGCTTTCTTTTTTATACGCAAAATCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1	-	chr3R	17420538	5'	-	roo	9038	1	58.22
CGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1	+	chr3R	15363923	5'	+	flea	34	2	55.36
AAACAGCACTACAAAAAAATTTAAGTAATATCTATCAAATCTGTTAGTGAATTACTTGTGAAGCAAAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1	-	chr2L	21884622	5'	-	pogo	2052	1	56.55
TTTCATAAAAATATGATAACTAGAATTATTCCAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1	+	chr2L	6007626	5'	+	P-element	45	1	45.83
TTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTCCACAGAAGTCGC:1	-	chr3R	20427486	5'	+	jockey	34	1	60.80
CATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1	+	chr2L	15832992	5'	-	hobo	2897	1	53.54
GAGGAGCATATTCTAGCTTTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCATACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr2R	21920637	5'	+	jockey	18	1	73.10
ATATTATTTTAACTTTCTGCATGCAAACTTTAGACGAGTATCTCGTTAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATG:1	-	chr2L	14663786	5'	-	Transpac	4937	2	55.66
GGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1	+	chr2L	13585846	5'	+	Tabor	78	2	69.86
ATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCT:1	-	chr3R	9714483	5'	-	Stalker4	7306	4	57.53
ATTTAATTTAATTGCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTATAAGGGGTATACAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCGGAATAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAA:1	-	chrX	9151941	5'	-	Cr1a	4059	1	60.84
GCACACTTGTCACACTCCCAGGCATGCAAAACAGGTCGAAACCCTCGGCCATGGCTAACACTCTATAAAATAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA:1	-	chr2R	20710127	5'	+	mdg1	7075	10	54.39
AGTGTGCAATCTCAAAAGCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:1	-	chr2R	9463531	5'	+	rover	6978	2	66.44
CCATTGAGATTTAAGTGGGAATTATAAATTATAAATAATTTTGCATAATAGATATGCTTATATAGTTGTATATACTGTTTTGTTAGTCATTTGGTTAGTACTCAAATAAAAACAATAAAAATACACAATAATAATAATAATAATAA:1	+	chr3R	9486358	5'	+	mdg1	35	4	75.34
ATTGATTCATTACAAATTACAAACATTAAAGACTAGTATAATTGGATATAATATAAATATATTAAGAAACTATGCACATTTAGATTATATTTGAGCTTGTAAGTTTATTGAATAATAATCAATGTCTGCGTGGCGACGACCGTCGC:1	-	chr2L	22759727	5'	-	gypsy7	5369	2	50.00
ACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr3L	4536710	5'	-	roo	335	2	69.06
TCTATAGACAAAATAAATAAAACCTCAGCACTAGATATATCAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACC:1	+	chr3R	19448254	5'	+	Transpac	2	2	71.92
TTTCGGTTTTTCGGGTTTTCTGTTCAGTTTTTTTGTTTATGCCCGTTTTATGTTTTGTTAGTTTGACATATCAGTGACAGCTTGTATTTAATATTAAATCAATTAGCCATTGTCGCGTATTAATAATTAAATTCAATTTGCTTTTT:1	-	chr3R	27458017	5'	-	TAHRE	41	1	58.22
TGATCGCATACCAAACGTTGATAGGAAAAAGAGAGGTGAAGTCGTTGAAAAGTATGCAACAGGCAGACGGAAGCGTTTCCGACCATATAATCAAATATACAAATATATATTTTTGATCAGGATTAATAGCCAAGTCG:1	+	chr2R	5705583	5'	+	INE-1	93	1	72.26
CGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1	-	chr2L	11674441	5'	+	jockey	29	1	64.60
GAAAAGGAATTTAATTAATTCATTTAGGAAAACTTGGCAGTGCTCACCATTCCATTTATTCAAAACTAGCCTTGCAACTAAAAAGTCTTTGGTATCATTATTGATAGCATATTTTTTTATGAAAAATTAAAAAAGTTTTGAGTTTT:1	-	chrX	6208016	5'	+	transib1	245	1	56.85
CGCGCATCGAGGATCAGTCGGATCGTCTGCAAGATGCAAAGACATTGTAGTTAATTTGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACA:1	-	chr2L	21400377	5'	-	mdg1	342	2	68.49
TGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr3R	12886980	5'	+	roo	8736	2	72.60
GTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAG:1	+	chr3R	25339981	5'	-	mdg1	7386	2	67.12
GTTCTGTTCAATTCAGTTGAATTCTTTTTGCACTCCACGCACTACAAAAAAAAAACAACTCAATTAATTCAAGAAAAATATTGCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1	+	chrY	1076850	5'	-	opus	486	2	67.21
GTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chrX	5643477	5'	-	roo	344	2	63.01
AGATATTTCTGTACAGCTGAAGTTCTGTAAAGTTTAACTGTGAATATGAAATTATTATACCCCTCGTTGAAAAGTATATAACAGCCAAAAGGAAGCGTGTCCGACCATATAGGGTATACATATTCTTGATCAGAATCAATAGCAG:1	-	chr3L	23428086	5'	+	INE-1	88	1	73.10
ATGGTCTCTTATGTTTGCAAAGCGAATTAGTTGGGATTGCATTCTAATTGAATGAGTGTACACTGGTTTTAAGTAAGCCATTTTAAGTGTAATTATGAAATATCCCGTTCGCACTATCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATTGT:1	-	chr2L	19381349	5'	+	INE-1	548	1	60.27
TATGGGCATTGTTTTTATACCGTAATTGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAGCACGAATATATTTAAAGAGTTACAAT:1	-	chr3L	20831354	5'	+	roo	19	2	56.25
ATGAAATTCTGAAAAATGTCAAATGTCTTTGTAGTTTTTACCATAAAATATTCATGTAAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1	+	chr2L	18294124	5'	-	roo	403	1	56.55
GAAAAACAATGAACTACACGAAAATCTCTCTCAACGTTTTTTTCGTTACGTTTCACTTTTCACCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACATA:1	+	chr3L	16378301	5'	+	ZAM	8150	2	55.40
ATTTGATCGAGCGTTGCGCTTGGGGCGGGGCTCTTGGGCGTTTTTTGGAAAGGCACTGATCGATAAGATCGGCCTAATCCCGTGGCCAAATAATGAGTGCTTGCACCCTGGCTAACTTTGATGATTTGCATT:1	+	chr3R	20668909	5'	-	pogo	178	1	76.52
TATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1	+	chr2L	4412556	5'	+	Quasimodo	44	2	57.60
ACTTGAGAAATGCAATATTTTAATTGCATTAGCTGCTCACATAACATAAATTCTTCGAGTGTACTTCTTGAATCCATAATCCTTACCTTGCTTTCCTGCATCAAGTAAAATAAGATTCTGAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACA:1	-	chr2L	17807360	5'	-	Cr1a	51	1	66.44
TGTGTGGACTCAACTCCCCTTTCCCGCAGGATAATTATGAGCTATGCATGGGGAATGGCGGGGCCACAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	+	chr3L	20888689	5'	-	1360	3357	1	55.47
AACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1	-	chr2L	9399561	5'	-	Transpac	5185	2	54.79
AAATGATCAATTACCGTTTGATAAGATAAAGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATAT:1	-	chr2R	24217221	5'	+	412	205	2	79.45
TACTTATATAGAAAATTCACAAAGTTGTTATTCAATTTAATGTTTCGGGATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1	-	chr2R	6086409	5'	-	pogo	2033	1	65.07
GATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAA:1	-	chrX	11471671	5'	-	hopper	1356	1	58.22
CTTTTAAAGTGGTACAACTTATATAATTTTACGAATAACCCTTTTTTGTAGCATCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAA:1	+	chr3R	25453989	5'	-	Quasimodo	7332	2	61.64
CAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTC:1	-	chr3R	19449483	5'	-	roo	8676	2	51.72
GAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:1	-	chr3L	11957203	5'	-	blood	7311	2	71.92
TCATGAGCGATGCAGAGGAAACAAAAGCAGAAGCCACCACCAAAGTGTTGTTCAAAAAAGCCGGTCGAAAAAACCTAAGGCAACGCAAGTAAAGTAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGC:1	+	chr3L	1665249	5'	+	F-element	111	1	68.46
AGTTCCCAAGCGGCATTAGAATTTTTGACAGGACCTGTCAAACCTGGGCTGGCTTAAATTATATGTTTTACTTAAATTACTTAAATATAACAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTT:1	+	chr2R	1638649	5'	-	I-element	297	1	64.38
TATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCACATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCATCACAAACATCT:1	+	chr2R	16945290	5'	+	jockey	76	1	58.90
TATAAAGTTAGTACTGGTGCACGATACAAAGATTTCAGTTTTATTTAATGGTGAAAGCGTATAGTTTATGCGTATAGCTTAACTAACTACTAAAAATGAATAGAGCTATATTAGCTGCGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTGATCC:1	+	chr3R	23465252	5'	-	copia	4767	1	68.49
CACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1	-	chr2L	2703588	5'	+	hobo	34	1	54.92
ATGGTGGGGAGTGCAGATGGTGGGGATGGCAGAAAGATCATCATCAAGATTGCAAAGTGAAAGACACTCGGTCTCGACTTGTTGATGATGCGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATC:1	+	chr2L	6169395	5'	-	hobo	2471	1	66.21
TGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	+	chr3L	3500930	5'	+	opus	32	4	54.31
TATTAAAGAGCCAAGTTTGTTTTTGGCACAGCTATTAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chr3L	19334238	5'	-	roo	9016	2	60.96
GTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACA:1	+	chr3R	22388990	5'	+	G2	2683	1	73.97
ACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1	+	chr2L	18419151	5'	-	412	457	2	54.29
TTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATA:1	+	chr2L	4412561	5'	+	Quasimodo	70	2	67.12
AAGAATTATGTTGTGCGAAGTGTAAATTGGGTTTAAATTAACTACTTTCGATTAGATGAAGAAAATAGATGTTGCGGTTTGCTCTATATATAGTTGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTG:1	+	chr3R	8958644	5'	-	Doc3-element	4523	1	60.27
GTGGAACAGGTTCTGTGCCCGGCCTGAATAAACAAATGCCCTGATAGCGGGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1	+	chrX	18386365	5'	-	invader4	3054	2	57.14
CTAGTTAAACAGCCACAAGAAATTCAACAATTCAAAATCACAAACACCAGCCCCTTTCGATCCCATTATCACTTGTTTAATAACAACTTTTCCTTGTTTCTTTTTTATTGATTTAAGTAAGCTTATTAAATTATAAAACAAAACAA:1	+	chr2L	21702527	5'	+	gypsy9	443	1	79.45
ATATCGAAATACAGGTTGAATAAATAAAAAACTTTAGGCTAACTAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCC:1	-	chr3R	19528667	5'	-	jockey	4700	1	63.85
GGTTTTATTTAAAGGTACATTTGTGCGTGAATGTTCTCTAATTGTTTCTCAAATATTAAAGAATCTTATTCTTGGACTTAAAAAGTTAATAGGCGAATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1	-	chrX	6191274	5'	+	FB	16	1	73.91
GTTGTTTACTGCGTGTGTTCTACTCTTTGTTTATTCCTAATTTTTCAAATTGCTTCCTCGCTTTGAATGAGCTGCCAGTAGATGGTTTTTTATTCTATGTGTGTGTGTGTGTGTT:1	+	chr2L	12389910	5'	-	accord	184	2	66.09
ATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAATGACTCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	+	chr3L	11393506	5'	+	roo	77	2	78.95
CAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chr3R	25448340	5'	-	roo	344	2	61.38
AGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1	+	chrX	18193686	5'	+	jockey	90	1	74.64
AGTTACTTGGAGTTAGCGTTTTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTCTCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1	-	chr3R	6611313	5'	+	HMS-Beagle	6836	2	56.85
GCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chrX	6486725	5'	+	roo	8739	2	72.86
CATTTACGGAGCTGCATACGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGTACTCTACGTCCACCTGATAAACACTC:1	+	chr2L	18404556	5'	-	hobo	2909	1	71.62
AGAGGAATTTTATAAATATTTTAGAATATACTTATTTAGCAAGGACTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1	-	chr2R	14542289	5'	+	roo	5	2	76.71
GCGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1	-	chr2R	5031015	5'	+	Doc	82	1	75.19
CATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1	+	chr3R	19968067	5'	-	roo	9041	1	63.70
ATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTG:1	+	chr2R	6086334	5'	+	pogo	70	1	75.19
CACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	-	chr3L	15600349	5'	-	roo	9034	1	45.89
GTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGTATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTT:1	+	chr3R	26659769	5'	+	HMS-Beagle2	6961	2	71.92
CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGGTTAGA:1	+	chr2R	4260424	5'	+	micropia	5215	1	47.59
AAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACG:1	-	chr2R	4939194	5'	-	1360	3384	2	25.81
GGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGGCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGTAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr3R	17817907	5'	-	roo	349	2	66.94
AAAGGAAAGCATCTAGAGCGCCTTAGCCTATCGTCAGTAAGAACGTCCGACTGTGGAAAGCTGACACTTCTTATTTGGAGTGTTACGCTGCGCCGCAAGAAATGCTGAGCCGGCTTGC:1	-	chr3L	23594495	5'	+	gypsy	152	2	68.64
GTACTGAACCGTGCCAAGTGCCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr3R	18582289	5'	+	roo	19	2	69.86
AACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1	+	chr3R	14981176	5'	-	mdg1	7392	2	72.09
AGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:1	-	chr2L	14588754	5'	+	Tabor	28	2	65.07
AATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	+	chr2R	9791560	5'	+	412	18	2	68.60
GCACATAAGTGCTTGTCAAACTGTAGTTTTGAGTGTTTGTTGCTCCTCTCGAAATTGAAGTACCCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr2L	3886246	5'	-	roo	9019	2	55.40
GACCTGATATTCTATGTGGCCTGGCCATATTGAATAGCAGAATTATGCAAAGTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTAT:1	-	chr3R	23235582	5'	+	jockey	4830	1	63.01
AAGGTTTTCTTTAGTTGAGGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	+	chr2L	16091843	5'	-	roo	400	1	75.17
AAAGAAGCGATAATCAATATCTGTACATACACATAAAACTTGTTAGTAAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATCTGATAATTGCGCTGTTATGTTACTATTACTGCATTGTATGGATTTATCGCATCTAAATAAATAAATATAAAAAA:1	-	chr3R	16040698	5'	+	Tc1-2	478	1	63.01
AGATGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr3L	9998013	5'	-	roo	394	1	45.21
GATTAAATAATATTTAAGATAGCTAAAAACAATAATGCTTTGTAAGTAAAATCTTTCTTTTAGGAAGATGAATATTAAAACTATAAAGAAAGTTTAAGAAACGCACACAAAATGTTTATATTAATTAATAATAATAATAATATGTA:1	-	chr3L	12854413	5'	+	mdg1	7091	2	52.74
CTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	-	chr3L	11531005	5'	-	roo	9038	1	61.38
AATTATACAACGAATGTTTAGGGAGAATATGCACAGCACGTGTGTTTCTTAAATGGATAATCAGCTAGGAAACATATCCATCGAATATCAGATACCCGTTACCTTCTAGCTTTTAAAGTTTTTAAGATCTCGACATTTATACGGAC:1	-	chr3L	15514312	5'	-	INE-1	133	1	52.05
AAGATATAAGTTTTACATATTTTTTCAGTGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1	-	chr2R	15064466	5'	+	412	34	2	60.00
CAGGCTAATGACAACCACCCAAAAGATGGTTCAAGCCAATTTGGGTGAAATAGGCAGCATCAAGGATGCCTCGAATATTTCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1	+	chr2L	1843265	5'	+	hobo	43	1	47.26
AACAAAACTCTGGCCACACCCACTCCACAACAACCACACGAGCAACACTAAAACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAACCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTACTAATTATG:1	-	chrX	16474030	5'	-	Cr1a	111	1	67.81
CAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr3R	12886956	5'	+	roo	10	2	73.33
GTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAA:1	-	chrX	10201206	5'	+	transib2	86	1	76.71
AATTAAACGCGCACACATTCACACAAGGATGCTCGCACCCGCTTTCAGACTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1	+	chr3R	11083890	5'	-	412	463	2	51.43
CATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGAT:1	-	chr2R	5485190	5'	+	blood	81	2	73.10
TGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1	-	chr3R	9922059	5'	-	blood	308	2	69.57
ATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:1	-	chr2R	20194297	5'	+	Max-element	45	2	52.76
AAAGCGAACGAATTCTGCACCCCAAATGTAATGACCTATAAAAGGCACAACATGACAGTTACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1	+	chr3R	21434872	5'	+	412	7113	2	58.90
ATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTATATTGTTATCTA:1	-	chr2R	20596527	5'	+	roo	8753	2	80.69
GCGTGTGTATTTATATTAGTGGACAACGAAGGTTGTCTAATTGCAAACCAACAAAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1	-	chr2R	19540515	5'	-	jockey	4987	1	75.34
ATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1	-	chr3R	7100924	5'	-	roo	9039	1	59.29
CGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAGTCCAAACTTAGTGGAGAGAGTAAGTTGATAAGCCAGTGAAACCTACTGGCTTTCA:1	-	chr2L	16856993	5'	-	Doc4-element	2504	1	69.18
AGTGTATAGAATGTGATGTATCAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAGATGACAACCAACAT:1	+	chr3R	10462621	5'	-	opus	441	2	68.46
AATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACAGATATAGTCATGTATACCCTTACATA:1	+	chrX	21016755	5'	+	Transpac	4919	1	63.29
AACATTTAATAAACACCACACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGGTAATGTTTA:1	+	chrX	6503425	5'	-	Quasimodo	6907	2	81.10
CGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTAAAAGACATACAATTTTGGGCTC:1	+	chr3R	27994179	5'	+	roo	28	2	55.26
TTGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCGCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr2R	13710646	5'	-	roo	8994	2	76.92
TTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTACATTATTTTATTTTAC:1	+	chr2L	17081796	5'	-	jockey	4928	1	66.67
TGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1	+	chr3L	10647936	5'	-	412	419	2	76.15
TTTTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1	+	chr3R	11105977	5'	+	Doc	73	1	71.97
CAAAGATATTTCGGAAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr3L	14638584	5'	+	1360	37	1	58.82
TCACTACTTACTAAAACTATTTTCAACAAACAACAAAACTCAATCGTGCTGACTGTAAAGGGTAGAATAAAGCACTTTCGACCATATCAAGTAATCATGATCACGATCGAGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAA:1	-	chr2R	20538531	5'	+	INE-1	154	1	40.58
GGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTT:1	-	chr2R	2879464	5'	-	Stalker	89	4	57.89
TATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTGTATTTATTAAGTCATTTGACTTAACCGTAAATGTTGTCTGCTGTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACTTGAGCAGCCAAAAATGACTTGT:1	-	chr3R	22232288	5'	+	Cr1a	491	1	51.08
ATTAGATATATGTAAAGATAAACATCTAAAAAAAAACTAGAGTTTATTGGTTGGATCGTATAAAAGGTCTGGGAATCCAGGGCATTTCAAAGTCCAAGCCCCTATGCAATATCGTTTCATTCTAATGATTATTTCTTTCTATTAGT:3	+	chr2L	7807290	5'	-	transib3	2683	1	76.03
AAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATACT:1	-	chr3R	19448074	5'	-	roo	95	2	60.77
AATAACAACAAAGAGCAGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGTGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1	+	chr3R	12717704	5'	+	297	6596	2	72.66
AAACTTTAGTACTTTTAAAGTTCTTGTTAATACTTTCTTAAATTTGGTTTTTTTTTTGTGTGTAAGTTTTAAGCACTTTACTTTGTCGACCAACCTTTTGTCCATATGTGTGCGTGTGTGTGTGC:1	+	chrX	12147153	5'	-	accord	7029	2	62.40
CATAGTACAGAAGACTATATTTCTCGTTAGTCTGAAAACTTTCTGTATTCATAAAGCGAGGCAGAAATAGTTTCTGTCAACGCAGTCTGGCAT:1	-	chrX	22689576	5'	+	invader5	118	2	56.99
GGACAAGGAAATGGAAAATGCTGCTTTGAATGTAAAAAAAAAATACATGCACATATTTCATAAGTACAGATACAAGACGATAACACTGCATTAACGAGTGCAGTGACCTC:1	+	chr3R	20404725	5'	+	Doc	499	1	62.73
TAATATAAAGCTAAGCCAAGAGAGGAAAGTATGCAATATAGAAGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCATCAGGACTCACCAGCGCTC:1	+	chr3L	13845092	5'	+	opus	7030	4	53.42
AATGGGCGTTTGCCATTTCAGATTAATGCCCGGCGGCGTCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAG:1	+	chr2R	19798039	5'	-	Transpac	310	1	67.69
TGTATTCTCCGAGTCACATCCGGTGTCCACAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGA:1	+	chr3L	25058775	5'	+	G2	188	1	76.80
GGGGGGGAAACTATAGTAAAATTCATAAATGAAACCGCTTCCGGAGCTGCTAAAAAAAATAGTTAATCTTAAATTAATTTCTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1	-	chr3L	6450992	5'	-	hopper2	1551	1	53.42
GCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGAGCTTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGGACCTTGGAGCCCAAACTTAGTGGAGAGAGTACGTGGATAAGCCAGTGAAACCTAC:1	-	chr2L	16856994	5'	-	Doc4-element	2513	1	59.42
AGAAAAAAAAAAACACAAGTTTGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGGGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAG:1	-	chrX	16369923	5'	-	accord	147	2	77.78
ACATATATGATACCTGTACATAATTCATAATCTTAAAATGACTCGTATTGCTTAACTGTTTTTAATATAGTAAGGCACCATGTATTCTCCTCAAACTAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGAC:1	-	chr2L	211488	5'	+	gypsy6	12	2	67.81
GTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCGTGCGGCAACTTAATTTGATC:1	+	chr2L	17081799	5'	-	jockey	4950	1	61.82
AGTGCTCTTTAGCTGTCTGTTAGAGCCGTGCAGCAGAACCAATTAAGAAATTAAAAGACAAATACTTCTGCATTCTCGCACTTACATACATGCACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1	+	chr2L	14078833	5'	-	1360	3385	2	69.57
AAGAGGAAACACGATATGAACGTTTCCTGCCCGTAATTAGTGTGAAAATGTGTGTTATCCAAGCCGTAGGTAAACTCAATTTTTTAAGAGTAAAAATCAAATGCAAATTGAATTGAGAGAACCCTCATTATTTGAACAATAT:1	+	chr2L	7506756	5'	-	297	230	2	57.04
ATAGGATTGTGAATACTAAATGGGGTCAAAGGATTGGAGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCCCGCCCTGCGCGCTGCGCAAG:1	-	chr2R	21298873	5'	+	jockey	219	1	78.40
AAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1	+	chrX	10521621	5'	+	Tabor	6886	2	51.43
TAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTAGACTCACACCCTACAAT:1	-	chr2L	15833108	5'	+	hobo	31	1	61.19
GTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	-	chr3R	7100919	5'	-	roo	9055	2	65.55
ATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1	-	chr2L	1377704	5'	+	hobo	81	1	73.97
GCATTCCTCACTACTTTTTTCTCTACCAGTATTTTTTTGTTTCTTTTTTTGGTTGTGTTTTTTTTTTT:1	+	chr2L	14398730	5'	-	Tc1-2	494	4	50.00
GGATGTGACATTTCTTTTGTTTGCACACTGAGAAATAGTGATGTCGTGTTTTGTTTGTTATTTCTTTAGTCAAAAGTAATTGAAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACCATATAGGGGGAAACTGCAGAGTCGA:1	-	chr3L	18329380	5'	-	roo	451	1	62.22
GCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	-	chr3L	21855511	5'	+	blood	7075	2	73.39
GTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTA:1	-	chr3R	11547799	5'	+	G2	317	1	55.48
CCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATACACACATCA:1	-	chr2R	9463497	5'	+	rover	7012	2	62.33
TTTTGCGAAAAGTTTTCTACTCTGCAAGTGACCCTCCATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTC:1	+	chrX	10644418	5'	+	jockey	4756	1	80.43
CCAAATAACAAACTGAATAAACGAAATGGATGACACACTAATTTATTAATAATATATTAATTAACAATATTAATAAAATTTTCGTATATTAAATTAAGCGACGATTAATACTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATA:1	+	chr3R	10948801	5'	-	TAHRE	10415	1	74.66
CGTAATAGATCAGCGGAATTATCTTGTAACAATGTGCTCAACCGAGTTGAATAGCCAGCTAATGGGTTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTG:1	+	chr2R	23207215	5'	-	Doc	15	1	51.09
TAAAACTTGTTATCGCAGAGGGAGAATGAGAAAAATCATTTTTTTTTCTCTTCCATTCTCGATTGAACACTAGAGAAAATATTTAAATATTTAAAAAAAAAAA:1	-	chr3L	13215256	5'	+	TART-B	10505	2	83.50
ACTCTGATCATTATAAAATTACTAATAGAAATAGAATTACTCACTACTACAAAACACAATTCAAAAAACGAAAGAAAAATAATCAGCTCTCAATTCAACAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAT:1	+	chrX	7874008	5'	+	Stalker2	23	2	65.07
GGGCTATGCCGGAAGAATGAGAGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTGAAGTAAATGG:1	+	chrX	16717871	5'	-	roo	8977	2	80.14
ACAGACTTTATTCCTTCCAAGGGACAAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCATCATTCCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTC:1	-	chr3R	19448099	5'	-	roo	8739	2	69.18
TGCTCCTGACAAGTGAATGAAAGGCCGAATGATGATGTCAATCTATCAAATACACACACACCCCTTTATTTTTTCTGACCACACGTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1	+	chr3R	10546059	5'	-	hopper	1379	1	56.16
TGTAATTGTAGTAAAGAAAACATCAATACGTTCATGTCTTATAACACAGGCTATTTTATATAGCAAGAATAAATTGAAAGTACCCAAAAATCGCTAGTTACAATTAACAATTCGGTAAGGAAAGGTACATTTATTAAAAGTAGTC:1	-	chr2L	21272376	5'	-	Cr1a	3984	1	76.55
ACTCTGGGCTTAGCCCTTGACCTCAACTGCAAGAATATATATACATACATATATAGTATGTATGTGTGTATGAATACATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTTTATTTTGTTTTTT:1	-	chrX	11533585	5'	+	hopper	149	106	53.90
TAAATAATGGCAATTCAAATTCGATTTGCGCCCGCACAACGCACCATTTTCAGTATAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGTCAATTTT:1	-	chr3R	16162254	5'	-	1360	3344	1	55.12
TAGTAATTGTGAATTAGCGTAGAAACAATTAGTTAGAAGTAGAAACAAATAACAAAAATAAAAAATGCCAATCGGTCAAATGAACGGACAGATAAACGGAGAGACACACAAGGTCATATCGACTCGGCTAGTGATCCTGATCAAAA:1	-	chr3R	7178038	5'	-	INE-1	88	1	73.29
CATTTACATTTAACATTTCTAGCAATTGCGTGGTTCTACTTCCCCCGCTCCTACCCGCGAACAGACTACGTTCGGCAGAAACTCT:1	+	chr3R	11290616	5'	-	invader1	3711	2	60.00
TATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	-	chr2L	16092017	5'	+	roo	39	2	59.59
ATTTTACTTATGGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGCTTAAAGCG:1	+	chr3R	4357517	5'	-	Tc3	1661	1	46.15
ATGGAATGGGTATCCCTATCGTAACCCCAACAGGTTTCGATCGTCCGATCGGTCCTTAACATCCTGTAGTATGTGCCTGTGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1	-	chr3L	10773160	5'	+	412	50	2	55.56
GCTGGTGAGTTCCACACGCTAAACTGGAAATCGATGAAGGCAGCATTAATGGGATGTCCCTTTGCATCGTACTCGAACATAATATTGGTGGTCCACAGATCTCCGTGATTGAGAATCACAAAATCGCCAGGATTATTAG:1	-	chr3R	25268086	5'	+	BS3	1374	1	71.22
GACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGC:1	-	chr3L	27391433	5'	-	1360	3377	1	77.24
TAATGCGACTTGACAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCACTGGTGTGCCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1	-	chr3L	13574512	5'	+	hobo	67	1	67.15
CAGTGGCATTTGTCGCAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	+	chr3R	22844130	5'	+	roo	8	2	76.03
ATAATCAATAAAATCAGAAGAGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1	+	chr3L	15519718	5'	-	pogo	2070	1	67.81
AACAGATGCAAGTCAAGCGATTGCAAGGTACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1	-	chr3L	20654606	5'	-	roo	397	1	74.62
GCATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr2L	7945310	5'	-	roo	9054	2	64.81
TGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTG:1	+	chr3L	27415225	5'	+	transib2	72	1	66.90
CCTAGAACAATCGTTAACGAAACTAATGAAACCTATTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGTTGATGTTGTTGCTAAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGTTTGCTGTA:1	+	chr3R	2208317	5'	-	Doc3-element	493	1	58.33
CCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTC:1	+	chrX	6499878	5'	-	Quasimodo	6928	2	66.14
ATGGACACGTATAGCTTAAGCTAATATAAAGCTAAGCCAAGAGAGGAAAGTATGCAATATAGAAGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:1	+	chr3L	13845071	5'	+	opus	6	2	67.81
AATTACGATAAATTTATAACCGCCAGGACCACAAAATGTAATTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGG:1	-	chr2L	13757699	5'	-	pogo	1773	1	74.66
TATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	+	chr3L	22437863	5'	-	roo	344	2	61.64
ATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1	-	chr3R	17831884	5'	+	F-element	72	1	59.59
TTTTTTTTCTGCTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1	+	chrX	7256098	5'	+	412	7088	2	50.77
CATAAAAAAAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1	-	chr3R	28075434	5'	-	jockey	4961	1	61.64
TTAATAAACGTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATATCCTACTCGTAGCCGAAACCCACTTCTCCCCCAGA:1	+	chr2L	11985779	5'	+	G6	1715	1	68.57
ATTTGAGGTGCGCCACAGCGAGCTCCTACCGAACACTATACTATACTTTACTATATGAGAGGACGTGCATCCGTACACGGCACTTTTACGCTGCGTTGGCAGTGAAGGACTGCACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1	+	chr3L	10056047	5'	-	transib2	2816	1	77.40
GATCTAACTCTTTTATTTCTATACTTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTA:1	-	chr3R	19444891	5'	+	GATE	8272	2	75.68
ATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAA:1	+	chr2R	5173446	5'	+	Stalker4	7040	4	47.59
TTTTTGGAGCATAAGAAATTTTGTGACAGGTTTCTAATCTGAGATCTGAATGTTGTGAAAACGTTGGTATTTGAAATAAAAAATTTTGGTAACATCTAAATAATAAATTCGCAGATAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTGG:1	-	chr4	257535	5'	-	INE-1	574	1	42.47
GTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1	-	chr3R	10266171	5'	+	1360	58	1	57.45
GCGTGGGTGCCATCATAAAAAGCATAATTACGGGCATTTGTGCTAATGTGACTCTCTGGCCGCAGGCGTTGGCAGAACACTTCTTATCACGGCGGTAGGTTGTGATGTGAGGAAGGACTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATT:1	+	chr2L	21780873	5'	+	1360	344	1	80.82
GCCTGGTATTAGACCTCAAGCGGAATTTCCTTTCGTTTGATTGTAAGTTGTGGGAACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1	+	chr3R	17605586	5'	-	Tabor	7309	2	74.66
AACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	+	chr2L	8986124	5'	+	412	66	2	63.70
ATATCAAGTAGTTATCAATTAAAAGCGACAAAACTCCACTAATGCTAAATTTTTGCTTAAGCCTATATATGTTAACAAAAAGCTGAATTTTATCATCGTCATTTCAGCGATAACGAAGAAAGCCATACTGATGAAGA:1	+	chr2R	6087165	5'	+	pogo	1689	1	75.91
AGTAACTGTTCACTTGTTGATTTGGTTATTCACTTTATTGAACAGTACCGCTACTCTTTGCGTTAGGTCGAAGAGTTTATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAG:1	-	chr3L	24870904	5'	-	Stalker	6874	4	52.74
ATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATC:1	-	chrX	10201217	5'	+	transib2	75	1	69.18
CAGAGCTGTCAGCTTGCCCATTTACCAGATAGATTCCACTTATGTATTATTTATATAAATGACAACGTGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTTTTTTTATTTCTTTATTTATTTAGAAGCGATAAATCCATACAAT:1	+	chrX	20266113	5'	-	BS	5072	1	48.63
ATTTTTGTAGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr2R	19004121	5'	-	roo	357	2	52.05
ATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1	-	chrX	13066614	5'	+	jockey	26	1	64.29
AAGTAATAGCATCGACTCTTTTGGTTGTCTATTATTTAGCGTTCTTTTTTTTGGGGTTGAAAATCGCCCAGGGAGACTAAATCCAATAAAACGGGAAATTAATTATAAATTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1	+	chr2R	12836409	5'	-	jockey	4977	1	76.03
TGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1	-	chr3L	11257396	5'	+	1360	1	2	67.16
ACGAGATTGAGAATTGAATTTGGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGCTATTTTTATGGGTTGGATAACTTGCATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1	-	chr2R	611236	5'	-	297	6928	2	54.11
TATACCCTTAGCCTGTTTCGAATATTGGGTGCCATTGATTAGGGCTAGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCG:1	+	chr3L	23603119	5'	+	F-element	33	1	62.86
AATCAGTGCAAAGGGCGCGGAACTCTCCCCTGTCTGCCCTTTGCCAAAATGTTTTTATTGGAATTTTATTTTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATAT:1	+	chr2R	25122253	5'	-	roo	8684	2	52.86
TAAGATTGTAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAA:1	-	chr3L	27415343	5'	+	transib2	33	1	63.01
AGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTGTTGCTT:1	-	chrX	22715122	5'	+	Bari1	87	1	76.03
CGGAAGCGGATGGAGATTGAGGAGTGGGTGAGAAAAGCGGATGTGGAAAGGGAAACGCCACTTTGCGGTCAACAGCATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACACTATTGTAAAAAAAACA:1	+	chrX	5259448	5'	+	hopper	1395	1	54.23
TATTTCTCCTATTGTTAATGAAACTGCCGTCACTCACGTGGCGAACATCTGCTTGATCTCCTCCCACGAGTGGATCACTCATCGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGT:1	+	chr3R	12856206	5'	-	Quasimodo	236	2	56.14
AAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAA:1	-	chr2R	9328691	5'	-	roo	410	1	73.08
AATACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	27994166	5'	+	roo	20	2	63.87
CTTTGGCATTATGTAATTTTCAACAATTATAATTATGCGGATTATATTATTCTATATAAAGATATTATCTATCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGACTCCAG:1	-	chr2L	15248023	5'	-	Transpac	5182	2	56.16
AAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1	-	chr3L	16750751	5'	+	Tirant	21	2	59.62
GTGATACCAAATTAATTTCGCTATCTTTACGGTTTATAGCTCGCTGTCATTGATCAAATTACTGTGGACAGTAAATGGCATTTAAACGTTTTACGAATGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCC:1	+	chrX	1832325	5'	-	R1A1-element	460	1	70.45
GCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1	+	chr2R	11629719	5'	+	Tirant	3	2	80.36
GTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1	+	chr3R	22821986	5'	-	mdg1	373	2	52.05
GCAAGAAAAATAAGTATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAACAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr3R	16076891	5'	-	roo	9022	2	51.37
AAAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTGTATTACATACATAGTGTATAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1	+	chr2L	17420123	5'	-	roo	9037	1	58.22
CATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGTTAACAACTAACAATGAATTGCTTCGTAGCAACTAA:1	+	chr3L	9218281	5'	+	gypsy	7004	2	73.33
CGCACTTTTCACGCCCACTGCGGTGGCGTATTTTCCACCCCCGCATTCCCCTCTATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTG:1	+	chrX	6499676	5'	-	Quasimodo	225	2	56.14
GGTAATTTTTCGGCGAAGAAAACACAGGTTCTGGTGGAAAAAGACACAGCTGAAAGATACGGGCTAAAAGTTGTGTGGAGTGCAGGTAGCAGGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTACATTCGATTTTTAGTCTTAAGCTAAGATCA:1	-	chr3R	1445318	5'	+	297	6859	2	72.60
TAATGGAACCACTGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1	-	chr2L	19965069	5'	+	Doc	52	1	50.38
CTCACAAACAAATATAGTGCAAGGTGCAGTGGGTTCTGATAAGCTCGATAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1	+	chr3L	6978146	5'	+	pogo	68	1	66.90
CCTCTATTGTGTATGCTCCTCTCACGTTTTGGAGGTAGAAGTCTTATTGGACGCAACGCCAAAGCGGCTTTCCTTGTTTTTTTCTTTGTTTCTTGTTGAGTCTGATTGGTATTATTCAAAGTGTCTTGTAATATGACCCTAAATTA:1	-	chr2L	21595429	5'	-	Gypsy12A_LTR	81	1	56.16
AGGCACTTTCTGCGTAAATATATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1	+	chr3L	11321393	5'	-	mdg3	226	2	58.26
ACACTCATGAAGTGCACGTGGCCATTGCCAAAAAGACACAGGCGCGCAACTATATATGTATGTGTGTGTATGAGCATGTCTATGTGTGTTTGTAGTACAGTATAATTTGCTTAGCTGCCT:1	+	chrX	21009359	5'	-	pogo	2099	1	80.00
CATATATTAAATAAATATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACAT:1	+	chr2L	4953915	5'	+	Quasimodo	37	2	59.59
TTTGCAATTTATAAAATAATAACCTCAACTGGACGTTTAAGAAGCATCTTCTTAACATAAATAAGGGAATTAAAAAAAAACCCCATAGAAGAAAATCACAAGGAAACAGATCGGGAGAGCGTACCG:1	-	chrX	21582503	5'	-	mariner2	564	1	50.79
CAGGACACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1	-	chr2L	2703593	5'	+	hobo	53	1	58.22
TGAGTACTGAACCGTGCCAAGTGCCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr3R	18582292	5'	+	roo	8680	2	71.92
TAACTATTTAGGCCAATAGCTTGTCATGCAACTCCGAATAAACCACTTTGTTTTTTTTTGGGCACTAATAAATATTAACTTACTAGATCAAATACTTCAATATAATTGAACAAAATTTTCAAGATTTCACTTGTTTTTTTTTT:1	-	chr3L	11356369	5'	-	Porto1	172	1	65.73
TAGTCGGGACGGTTACACTCACCACTCCACTCCATTCTCCGCCCTCAGCACGCGTACTTATGCGATAATTGCAGGAAATGCAGCGCACACCACACACCAAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAA:1	+	chrX	22517733	5'	+	1360	3164	1	75.56
TTGATGGCATATATAAATTAAATCAACCGGTTTTAATATAAATACCTCGATTGATATAATGCAGTCCCAGTGATGCTCGTATTTGTTTACTTCCGAGGGTTGCGCCAGAACATCAGATACTTCAGTCATTATATCAGCATCCAAAG:1	-	chr2L	6530673	5'	-	Chimpo	463	1	50.00
AGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	+	chr3R	22844160	5'	+	roo	26	2	61.94
CAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	12835049	5'	+	jockey	73	1	68.70
GCCTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTG:1	+	chr2R	981624	5'	+	1360	46	1	60.69
ACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACCGCATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGC:1	-	chr2R	4774733	5'	-	baggins	5323	1	72.41
TAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1	+	chr3L	10574300	5'	-	Tabor	407	2	68.49
GAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAACCATA:1	+	chr3R	14049363	5'	+	transib2	93	1	78.77
TGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGACTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr2R	2016832	5'	+	1360	50	1	59.84
AGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2L	14081325	5'	+	1360	53	1	67.80
CTGGATTTCCTTTACTTCTCTCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1	+	chr2L	11391875	5'	+	accord2	223	1	72.09
ATATAAAATGCCGGGTCTAAGCCAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACCAGAGACATCGAACGCGACCTCA:1	-	chr3R	29397530	5'	+	jockey	4586	1	56.41
CATTTACTTAGCCGACTGGCCCTGCGACTCCTGCTGCGGCGGCACTTAATTCTAGAATGAAGAAGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1	+	chrX	5662822	5'	+	P-element	7	2	78.74
AGACCGAGTTTCAACTCGCAATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1	+	chrX	5662885	5'	-	P-element	2816	1	30.47
GCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	-	chrX	13066592	5'	+	jockey	14	1	64.13
GGTATGATTCAAACTCAAATTGAGTTTATATATTACCTTAGCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1	-	chr3R	5061971	5'	-	mdg3	5481	2	69.34
TAATACCATATTATGTATATTTAAATAGGAGTAAGTATTGGTCGCATAATGGTAACAACATATTTTAAGAAAGAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1	-	chr3R	31720608	5'	-	pogo	2059	1	60.14
TAACATTATCGATTTCCATTCGCAGCCTCTCAAGCTCCGAATGCCAACGAACTAGGCCACACTCGACTGCTCCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1	-	chr3R	17478702	5'	+	copia	4902	2	44.96
GTTCCACATTCTCGATAATCAGCGTTCCGTTGGGGAAGACCTTCTGTTTGCGGTTGATGGGCAGGGCACGGTTATCTAACGAAAGAATTAAGTTTTTATTGAATCTAATCAATCAACCTTTCACCAAAGGCACTAGAATAACAAGA:1	+	chr2R	7347936	5'	+	1360	1	2	67.81
GAGAGCAGCACGAAACACGTCTGCACTCGCCGAATGCCTAATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACT:1	-	chr2R	5532367	5'	+	G4	3761	1	58.59
TGAAACTGTATTTTAAGAAATTTAAAACTTTTTGCCAGTGCATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr2L	7945271	5'	-	roo	9055	2	74.66
GAAGAAACTCCCGTGAGTTAATAAAAAATTCGCGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCG:1	+	chr2L	22468208	5'	+	HMS-Beagle2	125	2	64.52
AATTTTCTCTTATTTTGCTCCTTTGGCTAATTTTCTGTGCTTTTTTCGCCGCCTTTGGGCCACAATTTGCTGTGGTGTAGACAGAAATGATTCTGACAAAGCATACGTGTGCACACATATAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGT:1	+	chr3R	25388135	5'	-	1360	151	1	66.90
TGTATTGACATCAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	+	chr3R	19968059	5'	-	roo	9049	2	69.18
AGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1	+	chrX	2518056	5'	-	P-element	2823	1	30.25
TGTGAATTAGAAGCAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1	-	chr3R	9922098	5'	-	blood	365	2	71.43
TTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3L	21817996	5'	-	roo	8988	2	77.93
AGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCGCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGGGGGCGTTACAATTTACCTTACA:1	-	chr2R	21298836	5'	+	jockey	246	1	54.78
TTCCTGACCAAACACAATTCACTTGAAAAACATTTGCGGAACAAAGCGAATAATTTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1	-	chr3L	20888828	5'	+	1360	23	1	65.47
CAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1	-	chr3L	17560410	5'	+	pogo	19	1	69.17
ACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGT:1	+	chrX	13504171	5'	+	412	83	2	73.29
ACAGCAACTGTCTGTCAATTGAAATTTGACTAGTGAAAATTGCACTCAACGCATACAAATTAAGTGACATGCCATGTTTTTGTAATTGGTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGT:1	-	chr3R	25423328	5'	-	3S18	308	2	61.64
CGTGGTCATTAATATACATATAATACATATATCTACTAAAAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAG:1	-	chr3L	19339471	5'	+	Tc1	13	1	76.92
AAGCTCCTCGGGACCAGTCCAGCAGAATATGATGCCCGGCATGCCAGCCCAGCAGAAACAATACCGTTCGAAATTGCTTAATAAACCTCGTCCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAG:1	+	chr3L	25514081	5'	+	Rt1b	4776	1	78.23
TAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	-	chr2R	11164481	5'	+	roo	49	2	73.64
TGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGGATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGATCTTACAGTCGAAGACCTTAAG:1	-	chr3L	2485975	5'	+	jockey	4530	1	34.09
TTGTAGACGAAATTATTTTTTGAAGTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCGCTGCCG:1	+	chr3R	17316215	5'	-	opus	7474	2	62.41
TTACGTATGCACCGCACAAATCCCAAGACCCCACCTATATATATATATAGTATACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGTGAATG:1	+	chr2L	10037313	5'	-	Quasimodo	7319	2	67.97
AGGAGTTGGGGGCCAAGTGCATTGGAAACGCCGTCTGGTGACAGAAGCGGCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGGTT:1	+	chr3L	10773036	5'	-	412	477	2	69.35
CGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1	+	chrX	2842504	5'	-	Tabor	407	2	69.18
ACTCACGCATCCTTCGGGACACAAGCAATTAGAAATTTGAATATTAAAAGAAATATTCCAATGCCTTGGATGATTTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1	+	chr2R	20944310	5'	-	pogo	2081	1	60.00
TGCTCGTCTTTTTTATGTTTTTTTGAATTGATGGGATCTTTATTTCGCGTTTCCGCGCATTCGTACACACACAACACCACACACACAC:1	-	chrX	15483072	5'	+	gypsy3	416	1	87.50
GATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1	-	chr3L	17558120	5'	+	jockey	4700	1	63.77
ATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGNGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1	-	chr2L	9668281	5'	-	1360	3357	1	52.94
ATAACCATAATTTCCTTGATTGCCAAAATGGACACACAAATATTTATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAA:2	-	chr3R	14981238	5'	+	mdg1	77	2	72.60
GGATGGTGCCACAAATCATTCAGTGGCATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1	+	chr3R	7482691	5'	+	412	17	2	72.60
TGCATATTTCATTCTAAAATATCATTTTATTTCCAACATAGTAGGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGGAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCACGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTT:1	+	chrX	23457216	5'	-	G2	2912	1	64.18
AGTATGGCAGCAAAAGATGAACGATTCGCATTGTATGCGAAGTATTGTCTATAACTATGAAATTAAAGAAAAGCAAGGGAAAAACTTAAGATCAACCATATTTTCTTGGGTTATTTAAATATTTTTTTAAAACAGTTTTTAATC:1	-	chr2L	15351060	5'	+	Juan	3783	1	66.67
TCTACAATTGAATATTTAGTAACATATCATAGTAAAATATTTTTTCAACGTATTTATTTTTATTTCATATCCCTTTGTGCATTATTGCACTCGATACCCATTAACACCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAA:1	+	chr3R	4134924	5'	-	Quasimodo	248	2	75.34
CTGTATATTTTTATACCCATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCACATTCGCACTAGCTAAGTAACG:1	+	chrX	15408723	5'	+	INE-1	535	1	84.38
GAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1	-	chr2L	15833098	5'	+	hobo	29	1	59.02
AAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCCAGCCACGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAG:1	+	chr3R	16970177	5'	+	INE-1	152	1	54.35
CATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTCCGCA:1	-	chr2L	20117972	5'	+	invader4	1	2	71.82
AGCTAAAACAATATCTTATAGATAACTATGTATCTGTGTTTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGAC:1	+	chrX	5629137	5'	-	jockey	4905	1	76.03
AAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAA:1	-	chr3L	10574378	5'	+	Tabor	60	2	56.55
GCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAAA:1	+	chr3R	17817895	5'	-	roo	9012	2	62.69
GTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1	+	chr2L	1377665	5'	-	hobo	2930	1	67.27
GGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	+	chrX	13504132	5'	+	412	44	2	55.48
TCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	+	chr3R	9921978	5'	+	blood	64	2	64.38
AGTCCAGGGCAATGTTGAACTCTTGATCGACATCTTCCTTGGTCTTGGTACTTCTCGCACGGAATGTGACGTTCTCAACATCAGCATACAGAAGATTATTAAAAACTACGGCTGGTGT:1	+	chr3L	2047257	5'	-	Cr1a	61	1	72.88
AACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCACCGCTC:1	-	chr2R	5173521	5'	+	gypsy	7053	2	60.27
TATTCACCGCTGCCGGATTCGGAAACTTGTGTTCGTACAGTGGGTGCAGTACTGCTCAATAAGTAGTTCAAAATAAGGACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1	-	chr2L	12250152	5'	-	1360	3348	1	56.85
ACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTG:1	-	chr3R	20499869	5'	-	mdg3	5459	2	57.64
ATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGACTTGCGGTGTGGGAC:1	-	chr2R	4802892	5'	-	mariner2	254	1	34.88
AATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chr3L	233269	5'	+	roo	8685	2	70.00
CCGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTNTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCG:1	+	chr2R	1320649	5'	-	diver2	336	2	59.03
TGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGACTTTAAACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTC:1	+	chrY	652805	5'	-	Stalker4	366	2	51.72
ATGGAATCCAGCAACTAATATTTGGCGGCGTATCCACATGGATACGGAATGGCCAGCGGAAGTGATCAATGGGCTATTTTTATTAGATTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCTTCATCGTTCACGAAGCG:1	+	chrX	18331402	5'	-	Bica	68	1	65.65
AAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1	+	chr2R	15004755	5'	+	jockey	28	1	48.87
TAGACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCCAGCCACGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAAC:1	-	chrX	21575417	5'	+	INE-1	140	1	45.21
TGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	+	chrX	9540003	5'	+	roo	49	2	58.74
TGTGTCAATGGAATGAAGCTTTTTACGTCAGGCTCCAGAGGAAGAAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	-	chr3L	21818101	5'	+	roo	33	2	63.01
GGGGACGGGGAGGCAAACAAATGGCCTAATAGAGCCATAAACTACACCGAGATGAACACGAACGGATAACTGCTTATCAGTTAGACAAAGTATTTACGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCAT:1	-	chr3R	28370043	5'	+	R1A1-element	5025	1	72.59
CGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAGCGA:1	+	chr3L	15600174	5'	+	roo	8719	2	55.94
AGGATTGGAACAGATAAACTAAATTTATGCTTAGATATCCGAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1	-	chr3L	16015346	5'	-	1360	3348	1	54.11
ACTTTGTCATACGAGGCGCTTGACAAAAATGTTATTTATACGGGGCAAGAACACACACAGGCCGGAGGCAAGAACAGCAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATAC:1	+	chrX	18001058	5'	+	412	7273	2	57.53
ATTTCGACTGCAAGTGTGTTGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAGATCATCTCATGTGAAAAGCGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1	+	chrX	3309560	5'	+	jockey	12	1	76.03
ATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGGTAGGAATAAGTATATCA:1	+	chr2L	21008567	5'	+	invader3	73	2	76.61
TGTAGCGCTGAATTTACATAAATCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1	-	chr2R	17259379	5'	+	jockey	4695	1	65.89
CATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAAAAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1	+	chr2R	13121956	5'	+	pogo	12	1	61.94
CCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	-	chr3R	18582268	5'	+	roo	8690	2	62.88
TAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1	-	chr3R	17831886	5'	+	F-element	33	1	51.38
CACTTTAATAGTTTGCTTGTCTTTTGTCAACAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	-	chr2R	23803067	5'	+	roo	23	2	69.23
TATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTAC:1	+	chr3L	20654451	5'	+	roo	16	2	69.67
GGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCATACGACTTT:1	+	chr2R	2016822	5'	+	1360	22	1	58.65
GAGGGCAAACATTTTGCGCTCGTAAAAGCCAAAGTTACAAACTCGCTAGTTGGCTTAGGGGGTTGAAGGGCCCGCTTGCTTTTAATGTTCTCCTCGAGTTAAAAGAAGACTCAAGCGACA:1	+	chr3R	31927840	5'	+	jockey	4740	1	77.50
TGTAATAAGGACCTGGCTGAAAAAACATATACGTGCGCCATAAAGTCCTTAGCGATTGAAATGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr2L	12153181	5'	-	roo	355	2	57.55
TATCGGGTTAGCATTGTTAGCCAAAAGATCGACCAACAGTCGCATCCACAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1	+	chr3R	25380258	5'	+	jockey	4683	1	55.14
AATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1	-	chr2L	17079863	5'	+	jockey	4696	1	66.41
AAAACACTCTCACAAGGGAATTAGTGGGATCTTGCAACCATACTTAAAACTCTTTTGTTAAACCCAGCCAAGGCAGAAACCATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCGCATCATATCATCAAT:1	+	chrX	3467545	5'	-	hopper	346	1	80.14
GCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1	+	chr3R	19446142	5'	+	297	45	2	61.60
CAGACGCGTTCAACTAAGTAGCAGTTGATTTAATTAATTAGGAATCATGTTTTGCGTCAGGCTTAAAAGTAATCATAAAATAACATTTAGAATGTCTTTATATATGTACCTTACTTGTGTGCCAATTTTTTTTTAGAAAATAAT:1	-	chr2L	2617164	5'	-	transib2	72	1	59.03
ATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3L	15600164	5'	+	roo	20	2	44.07
AGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3L	15177301	5'	-	roo	9001	2	67.12
AATGTCATCGGCTGAGCTGAAAGCGCCTGCGCAAATTGCTTACCCCGAGTTAACTCCTTTATGATTCAGTCTCGTCCTCCTCCTTATTTTTTATTAAATAAATTTAAATG:1	-	chr3L	10379079	5'	-	TAHRE	70	1	70.91
GGCAGGGGCGTGGCCAAAGTGTTTTAGGTATACAGATAGAAATTGGCAATAAACATAGAAAAATCAAGACATTTTTCAGAAGTATTTTTTTCTATTTATTTACAAATTGAAGAAACTTATAGGAAAATAATTTATTAAAGAAAAAA:1	-	chr3L	23978913	5'	+	BS4	729	1	63.70
AATTAACACTAAAACTATATTCAAATCGTTTGGAATATTTGACAGAAAGCATATTTAACTTCATGAGAGATGCATCTGCAAAATTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATTG:1	+	chr2L	5266650	5'	+	Juan	410	1	56.85
TACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3L	22437883	5'	-	roo	324	2	75.34
ACTCACATGGCCAGAAAAACCAGCCTCTGCATTTGTATCTTTTAGTCTCCAGAGGACCGCAGGCATGGATACGCTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1	+	chr2L	18338949	5'	+	pogo	24	1	62.40
TTTTTTTTTTGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGG:1	+	chr3L	6342457	5'	-	Porto1	330	1	59.66
AATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1	+	chr3R	5061856	5'	+	mdg3	65	2	66.67
TAGGTGCAGCCGAGAGAATTTTAGATGCGGAGAGCTCTATAGAAATAGGTGTAAAATCGCGGCGGTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGGGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1	+	chrX	17832968	5'	-	Tirant	354	2	52.52
AATGCCAGTATTCGTGATTCGCCAAGGAGCCGAATTGAGAAGAGCTCGGATATGTCAATTAATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGAAAACTGACCACACACAGTGTTGGCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACC:1	+	chrX	8387220	5'	+	R2-element	3555	1	58.22
GGCAACCGCGGAGAAAAGCCAGCTTGATCGACAGGTCCACCCCAATCCCCAATGGAATTGCATCAATCAGTCAATTGTGGGTGTATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1	+	chr2R	21299582	5'	-	jockey	4971	1	57.58
CCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACACGCATAAACACATCAAACCA:1	-	chr2R	9463492	5'	+	rover	66	2	65.75
AAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1	+	chr2R	977516	5'	+	F-element	41	1	57.14
CAAAATAGAGAGGCAGAGGCAGGAAGAACTGCAGATGGCGGAAGCGAAGAACCGCGCGTCCTGGAGAATGGTGGCCTGGCAGTGGAACGTGTAACGAAATAAATTGATAGAAGGCAAGGGAACCTGTACTAGTG:1	-	chrX	21175427	5'	-	Gypsy12A_LTR	2229	1	85.82
GCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	-	chr2L	16091970	5'	+	roo	8750	2	78.77
GTAGTTGACGTAGTAGTCATTTGCACGTTGGAAGACCCCTATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr2R	25118638	5'	+	roo	22	2	66.44
CGCTTAAACCGAATTTTCCGAGTTGGGCCTCTGGTCTTGAAGAAATGAATTTACATAGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGATTATTATAATTT:1	-	chr2L	9720591	5'	-	1360	3068	1	73.97
TGGGGCAAAGTAATTTTTTCGGATTACTGTATGTAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAG:1	+	chr2R	2564941	5'	-	gypsy	7385	2	58.22
CAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGAC:1	+	chr3R	22844145	5'	+	roo	8676	2	71.11
GGAATGGAAACGGAACATGCACACGAATGCCAGCCGAAGCAGGAGTACGAAGCATGCCATCCTGTCGTGTGTCAGCGAAAGAGAGGCAGGGACATGATGAAATAACATAAGGCGG:1	-	chr2R	21101859	5'	+	P-element	2	2	75.65
GATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGATCATATCTTATG:1	-	chr3L	9998217	5'	+	roo	43	2	56.85
CGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACGATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1	-	chr2R	13817706	5'	+	412	80	2	70.55
GAGCGCCAATAAATAACAACAAAGAGCAGGGGAATATAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1	+	chr3R	12717693	5'	+	297	10	2	77.61
TTCTCAATAAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGACA:1	-	chr2L	11518507	5'	+	412	41	2	54.79
GGTCCAGTGTTCTCCACTCGCCAACTTGGGCTATCCACACAGGGCTTGGAGCCATAAGTCCAGATAGGGTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAG:1	+	chr2L	10023387	5'	-	Doc	4227	1	60.48
AGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2L	14081315	5'	+	1360	53	1	62.50
TAAAAAATTATAAAAAAAAATAATAAAAATGGATCATTAACATACATAAATCATATTAAGTCAAATGACTTAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAGATT:1	-	chrX	8668940	5'	-	1360	253	1	51.03
GCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	+	chrX	13504156	5'	+	412	45	2	56.10
ATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAGATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr2R	18336226	5'	-	roo	334	2	71.22
TTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTG:1	-	chr2L	12636389	5'	-	Porto1	4547	1	78.01
ATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1	+	chr2L	8986129	5'	+	412	7104	2	61.90
GGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1	+	chrX	21016762	5'	+	Transpac	73	2	71.03
AAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAA:1	+	chr2L	4412571	5'	+	Quasimodo	73	2	72.66
GTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGA:1	-	chr2R	6885358	5'	-	flea	162	1	80.14
GACTGACGTCTGGACTGCGGCAGCGCCGACCAAACACAAGTTTTGCAGTCTGACGGCTGTTAAACAAAATCCCAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATGGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAAT:1	+	chr2R	1070822	5'	-	1360	324	1	50.69
GTAACGTAATTTTAAGAGGCAATTTCACAAACTTTTACTGCACTTCCACCAGGAGTTTTATATTCCTCGATGCTCAAGGTCAGAAGTGTAAGGGAATCGCCCCGAATTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGG:1	-	chr2R	14522194	5'	+	Cr1a	52	1	70.07
AAGTTAACCAAGCTAAACAAACAACATCTTGAGCTGTCCGACCGACCGTCAGTTGGATTTCATCCGCCGAGGTTGTTTGTGAGGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCC:1	-	chr3L	3445891	5'	+	1360	3342	1	61.19
AATTCTAGGTTAAGCTAAGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAG:1	+	chr3R	9714337	5'	+	Stalker	6867	4	73.29
AGAAGTATATTAGATATATTGCTTATTGAAAAATAATGACCTGTTTGATCCAAAGCATTTCATAAAAATAAGATTAATGTCTTCTTTACACTCAATAAGGATAACTGTCAAGAGTATTGTAACTGTGACACTCTCGTTCATCTCA:1	-	chr3R	18348728	5'	+	Circe	7335	2	66.21
AGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	-	chr3L	17560377	5'	+	pogo	65	1	63.01
CGACCACGCCAAGTCCTTTTTGTCTTCTCCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1	-	chr2R	2016933	5'	-	1360	3343	1	54.79
CCGAAAGGAGTGGGATTACCTCGATTCTTGAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1	+	chr2R	6919656	5'	+	hobo	30	1	54.31
AGGTCCTGCCAGCGAGTGTGCTAGTGTGCGTGCGATGTTTTCGTCCTCGGCGATGTTCTCTGCCTTCCAGCGTATCCTGTTGCTTGCGAAACGCAACCAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1	-	chr3L	2712879	5'	+	P-element	12	1	74.82
GTTTGCAGTTGAGCCAAGGCAACTGGATGTCTGAAGACGCCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTG:1	-	chr3L	5102548	5'	+	BS	4670	1	68.00
GTTACCAGAATTTTCAGAAGGCATTGGCAACAGGAACAATAACAAAACAGCAGGAACAGCGACTCTAAATTCGGTGCAAGCGGGAAGATGAGCGCAAAGAAGACGTCTTTGTGTTTTGTTTAGGCGGGATGCAACCCTTATTAGCT:1	-	chr3L	24211087	5'	+	gypsy12	124	2	70.55
CATTAATGAACCAACCCAGGTGAGTAAGTGCCGCTGACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1	-	chr3L	20168473	5'	+	mdg3	5257	1	76.36
CCGCACATTTTGTGGTACATTTTACGTTGACAACAGCCATGCAATAACAATACCAAATACTTAGGTGGTAACTTTATTTCAGCGCGTTTTCGATTCACGTGCTATGTGCAGCACCTGCAACACACACACACACACACAGTCACACA:1	+	chr2R	21455845	5'	+	accord	190	2	54.79
ACCTTAAATTGGCATCAGGACTTTGGGGAAGGTGATAGTAGGCTTTGAGTGTGTGACCTTTATTCGCAACGGCCACTGAGGAGCAAAAATTAAGGCTTTAAAGT:1	-	chr3L	8423128	5'	+	pogo	1751	1	75.96
GCTTGCCTCTCGCTTCTCGTTTGGCCGCAGTTCGTCATTTTCTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGCGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAAT:1	-	chr3R	27785717	5'	+	micropia	160	2	68.57
GGTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1	+	chr2L	17295825	5'	+	Doc	32	1	53.60
AATCCTGTCATGCTGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCTCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1	-	chr3L	11531025	5'	-	roo	395	1	75.17
GAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chr2L	17471664	5'	-	roo	8984	2	77.40
ACCACAATGTGACCGAGCTGTTCCAGGAGCTGCTCAACATGGAGAAGACGCGCACCGTCTCCCTGCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGG:1	+	chr3R	9786658	5'	+	opus	7291	2	67.00
GACATACTTACACACCCTATAGCAAAGAAAACGAAATTCATGATCGTTGTTGTGGCAGATGAGCCAAATGGCCTGTTCATTTTTCTTTAGCTCGACGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTTTTATTTAAGATAACA:1	-	chr2L	22366975	5'	-	F-element	170	1	69.63
GTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGAAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chrX	14336428	5'	-	roo	9046	1	56.04
ACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCATGGCTATCAAATAACCGTTACTCAGCT:1	-	chr2L	22130779	5'	-	INE-1	545	1	61.64
AGTACAACCAACGTGTTACATAAAACATTTTCGTTGCAGTATTTTCTTTTTCCTTACGTTCTAAGTTGAATCAAGAGGTTATTTAAAAACATCGTAAAAATAAATAACAATAAAAAAAAA:1	-	chr2L	16868602	5'	+	BS	5095	2	74.17
AAAGCCGTTGAATAGCGACGAAAACTACGAAGGATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1	+	chr3L	18368863	5'	-	opus	492	2	78.32
GACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTT:1	-	chr2L	22685172	5'	+	Ivk	99	1	75.86
GTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAATTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr3R	20469577	5'	+	roo	39	2	45.21
GTAAATAATATTTATTCCTTTTGTACCAAATGTTCATTGATTGGAGAGTCCTTCATACTCCAGCAGGATAATAGAAAACCTCTGGTCATATATAAAACAAAAAAAGGCGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAG:1	+	chr2R	5505330	5'	+	Tc1-2	1229	1	74.07
ATTTCAAAAATATTTTATGCCGGCCAAAAAGGCCAATACAAATACACACGCAAAATACAGCAGAAAAACGACTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1	+	chr3R	10266061	5'	-	1360	3364	1	63.41
AACGTTTTATTTCAAAATAAATAAATTATTGATTAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1	+	chr2R	15064309	5'	-	412	7521	2	67.86
TATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTAT:1	+	chr3R	3922959	5'	+	Cr1a	76	1	72.87
GGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATGAATA:1	+	chr3L	27356093	5'	-	Tc3	1638	1	72.73
CACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAACCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAA:1	-	chr2R	5173226	5'	-	Stalker4	370	2	50.00
GGGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGGGGTTCCACATAGGCTCCGCTGCCATC:1	-	chr3R	10274050	5'	+	HMS-Beagle	6837	2	52.24
GCCTTTCTCACTGTCTAGTTTTAGTAAATTGAATGCAGTGTGTAAGCTGCATGATGCATCAACTTGTTCTGCAACGCATAGCAAGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTT:1	+	chr2R	20684331	5'	-	roo	8774	2	42.47
TCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:2	-	chr3L	20654549	5'	-	roo	8987	2	76.03
ATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCCAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1	-	chr3R	11496624	5'	+	1360	5	2	73.68
AACAATTGCATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr2L	6059205	5'	+	roo	52	2	54.11
AGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGATTT:1	+	chr3R	18339043	5'	-	roo	390	2	71.23
ATACTTTAACATTGTTTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTCAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAA:1	+	chr3R	22388927	5'	+	G2	2620	1	71.23
CAGATTATAGCAAATAATTGTGTACGCATTATGCAAATTCCAGCAATAGTTTTGTGTCTTTTCAAGTGTTTAATTTATGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1	-	chr3R	9210742	5'	+	mdg1	11	2	71.05
AAAAAAGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chrX	17526803	5'	+	roo	13	2	60.00
ACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTAATTTT:1	+	chr2R	21907913	5'	-	roo	9036	1	55.20
ATTACACATACTTAGACCTTTCTATGTATCTTGTACGTTCTGGAATAACGTGTCTTGTACCAGCGCCTTTGCGGTTGACTAGTTGGTACCTTCCCTTAGAGCCTTTCAAAGAAACTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGGCG:1	+	chr2R	5020435	5'	-	Doc	371	1	79.45
ATTGCTATGGCTTCTAATAAATGTGAAATGTCAGTACCACCTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTCGATAAACAAATAACAACCACAA:1	+	chr3R	31109680	5'	+	I-element	93	1	77.24
ATAGGATTATCGATATGTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCTAATTG:1	-	chr2L	22685230	5'	+	Ivk	30	1	65.07
GTCACTTAGCAAATTTGCATGCCTTGTAGCATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1	+	chr2R	13585355	5'	+	412	10	2	76.71
GTTCAAGTGGCCAAACCTATTTTGGTGACCCAAAGACAATAGAATAACAAGATGCGTAACGGACATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCCTTCTTTCC:1	+	chr4	1170208	5'	-	1360	3315	1	76.00
CACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCTTACATACCTAATTATACATAGCCAATCTCGTCATAAGCTTATAC:1	-	chr3L	20168416	5'	+	mdg3	67	2	73.91
CACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGG:2	+	chr3R	4604451	5'	+	1360	431	1	62.76
ATTTGTATTTATAAAATATACGGATATTTTTGGATATTTTTCATTTTCATTTTCGGCCTATAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTG:1	-	chr3L	7943130	5'	-	Burdock	6156	2	55.80
GTTTATTTACAAGTCTCGAAACTGTCACACTAATGGAAATCCCATTAGTTTTTGTTCCAATTCAGGTATACATCAGGAGCCCTAATAGAACAAAGTTTTAAGCCGA:1	+	chr3L	7727861	5'	+	Fw2	494	1	68.87
TGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3L	22437948	5'	+	roo	74	2	69.18
GTCCTACCTTTCAAATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTCAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGAT:1	+	chr3L	27356050	5'	-	Tc3	1668	1	61.38
GAGAGATAAAATAAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chr2R	18336105	5'	+	roo	8685	2	68.49
TCCAGAGTTCTCCGTTGCCCAATAGATTTGTGTGTGTGTGCGGAGGAGGTCCTCAGTTTACTCGGCGATTTACGAGGCCAGCGTAGCTCTCCTTACACATGTATGTATATATATTCATTTTGGTGACTAAAAATTATTAACAATAT:1	+	chr3R	6817203	5'	-	Gypsy12A_LTR	1818	1	76.03
GTATTTCATTCCATTCGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACTTTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1	+	chr3L	7292418	5'	+	HMS-Beagle2	6901	2	74.66
ATACTTGATATGCTTTAAGAATGGCTTTAGCTTTGACTTTTGTAGAGGCGACTGAAGCAGTTGGTGAGGAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGGGGTCAGCTGTGACACACTAAAGTGAGGTCTTAC:1	-	chr3R	26615167	5'	+	gypsy12	68	2	71.32
GAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr2L	16091986	5'	+	roo	8718	2	65.38
GACTAACCAAGTGCCTGGCCTGGCCCTTTTCCTACCCGTTTTCCTTCTCGTTGGCTTTTCATTCTTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGCGGTCAATGCTGA:1	+	chr3L	4755206	5'	+	jockey	4704	1	54.84
AATAATTAGTTATTTTACTTTCCGCACGCTTTATTTATCAGACTAAATAACAATTGTATTGAATAGAAAGTCAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGCT:1	+	chr2L	19965400	5'	-	Doc	277	1	50.71
CATATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1	-	chrX	3308362	5'	-	hobo	2887	1	71.70
CTGCGGCGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAG:1	-	chr2L	6623008	5'	+	Burdock	6155	2	63.51
CAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAATACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1	-	chr3R	10266166	5'	+	1360	42	1	57.50
CCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAG:1	-	chr3R	11547769	5'	+	G2	295	1	54.26
CAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1	+	chr2R	19050224	5'	+	roo	57	2	77.14
AATTCCGAGTTAGAAGCCATCGGGTGTGTGCAAATAAAAGTTCATATATATATTTGTTACGAATATTTATGCACTGTGNACGAATAGGCAACAACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAG:1	-	chr3R	4414937	5'	+	rooA	7350	2	71.32
TAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCG:1	+	chr3R	16076777	5'	+	roo	8724	2	60.27
ATGTAATTCAAATAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACNNNNNNCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1	-	chr3R	10462702	5'	+	opus	7155	4	56.52
AAAACATTTCCAAACTCGCGCCTGGTCTTTAAAATAGTTTCCAAAGCCACAATAAAGTTTCTAAGATAAAAATCCACTGGCTGTTGCTTAAATTAACACGTGCACGACCTTTTCCTTGGGTGTTCCCTTTGACCCTTCATTTCT:1	-	chr3L	1412114	5'	+	hobo	2639	1	63.19
ATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1	+	chrX	10521623	5'	+	Tabor	6882	2	52.24
TATGTACCTATATTTATATGTACCTCTCAGTCTTGATCAGTCCCCGTTGGCAGGCATGTTGTGTTTCTTTCAACCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1	-	chrX	1804489	5'	+	Doc	79	1	49.21
TTTCCACTCCCACCAAGCTGCTCCATAATGTTCCATTGCTCCATTAGTTTGGGAAAAATGTGAGGATGACTGTGGATATGGACGTGGATATGGGTATGGAAAATCTGGCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGGTGTTG:1	+	chr2L	11663068	5'	-	F-element	260	1	69.06
AATAGACACACCTAAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1	+	chrX	17756563	5'	+	297	6622	2	51.80
GAGATGAAAACTCATTGCGCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1	-	chrX	5662915	5'	+	P-element	57	1	23.53
ATATTATGCTGCGACTGCCGCTGCTCTAAGAAAGGAAATTCAATTGGCCAAAAGGATGGAGAGGAAGTGGAGCTGGAAAGGTTCTTCCTGCATTAAATTAGCTGCTTAAAGGTGGGAGGAAAATATATATTTATACATATACATAT:1	-	chr3L	12683952	5'	-	Stalker	248	4	80.82
AGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATACA:1	+	chr3L	23603183	5'	+	F-element	74	1	70.94
ATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGCATGCGTGAAGTCGCTGTTTACTTCT:1	+	chr3R	9485829	5'	+	micropia	26	2	61.72
AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAGAGGTGGC:1	+	chr2R	2007459	5'	+	1360	60	1	51.37
GGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1	+	chr2R	5485099	5'	-	blood	7341	2	53.47
AACTGATAAAGGGTGAAGCACCAACACACTCGCATACTCTCACACACACACACACACACACACATATACA:1	+	chrX	6601621	5'	+	accord	186	2	57.14
ACGAAGGATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1	+	chr3L	18368889	5'	-	opus	7474	2	63.77
GAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGGGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1	+	chr2R	977554	5'	+	F-element	58	1	70.48
ATTGCTGTGGCCTCAGAGTAGAATGATAAGCGATATATCTTTACACGGTTAAAACAGCTAAAGCATGTCATTTTATTTATTTATTAAGAA:1	+	chr2R	22809186	5'	+	copia	228	1	50.00
GAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTC:1	-	chr3L	8249098	5'	+	jockey	4585	1	73.04
AAGAAGGGCGGAACTACGGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1	+	chr2R	5248220	5'	+	1360	34	1	54.26
AAAAGCATTCGCTTTTCATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCT:1	-	chr2R	9463518	5'	+	rover	6991	2	57.53
GTTCGATAAGTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3L	9998221	5'	+	roo	22	2	67.44
AATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr2R	18336229	5'	-	roo	330	2	71.92
CTAACATAAACAATGGCAGGAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGCAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	-	chr2R	18336219	5'	-	roo	8996	2	75.37
CGCTATATTTAGCAATGATCTTCCATTCAGAATAGAAGTGGAGTAGTGTGTGTGAGTTGGAGAAGAGATCGGTGGAGACTGAAAGATTAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATA:1	-	chr2L	7809143	5'	-	P-element	159	1	66.17
GTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1	+	chr2R	13585424	5'	+	412	79	2	71.92
GAGGTATACTTTTTCAACTGTTCATTGGATTTTGCTTTGGGAAATAAGGTGTACCCTATGAGTAAAGGAAAATATAGTTTATTTATTACTGTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCG:1	-	chr2L	18294323	5'	+	roo	8694	2	63.70
ACTTCGCCGTTAATGAACTAAACCTGTCCTTTGGAGTCCTTCGACTACATCAAAAATTAAACGTGTGCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1	+	chr2L	5844970	5'	-	transib2	2771	1	54.79
CTTTTTGCCGGTCCTCTCAGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1	+	chr2R	16891811	5'	-	hopper	1371	1	54.11
AGAGCAAAATATTTATCTCGCTTCTAATGCGACTGAGTCCTTTTTTGAGGATGCTATCGTCTACAGGTTCATACACACACACACAGACATACACTGGCGCACACAGATGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTC:1	+	chr2R	19073665	5'	-	flea	4672	1	73.29
GATTGCCTTTTTGCATATCGCATAGCATAAATGCAATGCCATAAAGCGTTAAATGGGCAAGTGTCGTGTTAGAAGAGGTCGCTGCCGTTAAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGG:1	-	chr3R	26347001	5'	+	Cr1a	4045	1	73.68
AACCAGAGCACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAA:1	-	chr3L	22968450	5'	-	mdg1	404	2	67.50
GGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGGAATGCACTCTAGTA:1	+	chr3R	19446138	5'	+	297	49	2	59.40
ATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAA:1	+	chr2R	4601574	5'	-	HMS-Beagle2	239	2	77.17
AAATGATTATTTTTTATTTATTATGCGTTTTCTAAACATTTTGTTTACATTTAAAATATTCTAATCAGTATATGTGAACAAAAAAGAACGAAAAAAGAACGGTATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGT:1	+	chr2L	17392096	5'	-	rover	104	2	54.81
TTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	-	chr3R	17817990	5'	+	roo	43	2	53.38
AATGGAGTTGGGATTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1	-	chrX	1899716	5'	+	P-element	59	1	45.21
TGGGTTGGCCATAAAGCAAGTAAGACTACGGATACGTTATAATGCAAACTGAAAAGGGACCCTTTAACTTCGTTTCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1	-	chr3L	24293158	5'	-	1360	3366	1	36.99
AACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1	+	chr2L	9399456	5'	+	Transpac	4988	2	69.29
CTTAAAGCAATTGTTTGTCATCTGACACAAGTCTAAAGGCAAATCGAAGAGAAACTTAAGGACCGTAACCATATTTATAATGATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACC:1	+	chr3L	3923613	5'	-	R1A1-element	5289	1	54.11
ACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAG:1	+	chr3R	3617316	5'	-	micropia	5122	2	70.55
CTGTGCATTTCGAATTATGATTGTTGCAAGCCTTAGTGTAGTGATTAATTGCATATAGTTTCTACCATCGATTTAACTCATAATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTT:1	-	chrX	21104641	5'	-	F-element	89	1	55.24
GATTAATTATTGGAGCCAATTTCAAATTCGAGAATTTTATCGAGTTTTAGTAGACGTTTTATATTTTGTACAGTTTTAAATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1	+	chr3R	15363895	5'	+	flea	4797	2	56.85
CAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr3R	19968096	5'	-	roo	349	2	60.00
ATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1	-	chrX	6486820	5'	-	roo	9036	1	51.47
GACGTGATTCTGTAATGTCCGAAACAATTGCGAGAACTCGTGCAATGGCTAAGCCCGTGGGCCGCGCTGAGACACTTAAGACATGTCTTAAATGTGTAAACGGCAGCTAATT:1	+	chr3L	23244265	5'	+	1360	2972	1	79.46
ATTTCTACGTAATTGAATTATTAAGAATATACAACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chr2L	12892598	5'	+	roo	8706	2	53.15
CATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1	-	chr3L	22349271	5'	+	jockey	86	1	65.52
AATAACCCTTTTTTGTAGCATCTTTTATATAGTTTTGCTGAGTTGAAGTTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCT:1	+	chr3R	25454022	5'	-	Quasimodo	7299	2	69.86
TTTGTACAAATTGATATACATATAGTAGTACGCCTGTCATATACAAATTTATATATATCTATGGATAGACGTTAACTGAGCACACAACCACACACACACACACA:1	-	chr3R	16566511	5'	+	gypsy3	419	1	78.85
AACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAT:1	+	chr3L	17560274	5'	-	pogo	2043	1	59.59
CTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	-	chrX	22511458	5'	-	1360	3370	1	57.53
CAAATATTAGAAAGCATAAATATTCAGAAGGGATTGTTAACATTACTATATACCATAAAGGAGTAACAACAATTAGTTAAGTATATTAAGTGTAGGAAGTCTTGGTTATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGACAGAG:1	+	chrX	17809619	5'	-	Cr1a	4245	1	65.75
TAAAAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACGATGCTTGTGTAACTTGCGCTACGTCTAGAATCTAGAATAGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTAAAGTACCTGAGATCTCGACGT:1	-	chr2R	6803001	5'	-	INE-1	143	1	55.48
GAAAAATGGGGCTTGCAAAGCTAACAAATGAGGGAAGAGGCCTGTTCATTTGCTTTAGGTATATATATATAGAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTCTTTATGAGTCGAACTAATGCCCCGTCAGTT:1	-	chrX	17756693	5'	-	297	6948	2	56.69
ATATTAATAATTAAATAAAATATTATTGCCAAATATCTATTGATATCCCAGGATAATGATTAAATAAAATTTAAATTAAAACTAGATTAAATTTCGCGTTCGCATTCACTCCAGTTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCAG:1	+	chr3R	21419001	5'	+	INE-1	551	1	50.00
ATCGACAACCACCAACCTTACCTGCAAAACCTAATTTTGGTAAACGACTCCTAAGGGAGTTAAACTGCTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAAT:1	-	chr2R	3382454	5'	-	GATE	364	1	51.77
ATAAATTTGTTAGGTAAGTTTTCCTTAACAACCTGTTTTTTGTATCTAGTTTTTAGCTTATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCTAGCGGAAAGAGAGAAATTTTGGACGTCACTAAAAAAGTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATGT:1	-	chr3R	3483655	5'	+	1360	3352	1	65.75
TGTATAAATGACCTGTGATTTATGGTAATTAGGTCTACCTTATTTACGGCTGGAACACTTGGAATGTGGAACACGGTGAAATAAAATGTTTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAA:1	+	chr3R	12086628	5'	+	Bica	145	1	64.54
GACAACCTGCTCATTGGCAGTGCCACACTTTTTCTTCCATACTGCAATAGTTTATGTCATATATGGGCAGTGGGATATGGCTTACAATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1	+	chr2L	3114449	5'	-	roo	9038	1	62.33
CATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1	-	chr2R	16785408	5'	+	412	7103	2	64.96
ACATTTGTCACAGCCCGCCAAAGTATGCAATAGATTCAAGAGTTCGCCGAGTGGCTTGGAAAATCACTAAGGGTAAATCGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTT:1	-	chrX	11296493	5'	+	BS	5001	1	73.15
GAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:2	+	chr3R	26659719	5'	+	HMS-Beagle2	28	2	60.96
AAGCGAATGACTCACGATAAAAAATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr3L	4536641	5'	-	roo	9061	1	72.60
GTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	-	chr3L	9998198	5'	+	roo	8715	2	57.78
TAATAAGCTCTTTGAAGTGTTTAATTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	+	chr3L	10848627	5'	+	blood	33	2	59.09
GTAAATAATAATAATATTTGAATATTCTAATTCAAAGTATACATGTTCTTATTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTT:1	+	chr3L	17945163	5'	-	Juan	4155	1	63.04
GCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGACGAGCAATCGAGTGGAC:1	-	chrX	13066592	5'	+	jockey	17	1	62.11
AGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr2R	19050209	5'	+	roo	72	2	71.11
TTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACC:1	+	chr2L	14892212	5'	-	transib2	2758	1	63.70
TATGCCTTAATAAATAAATTAATTTAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAATTTACTATCCCTAGCTAACCGTAGAAATATGCTTGGAGCAGTCCTTATTTATAAGCTTATTCGTGGTGATATTGAGAGTCCCGACTTGATT:1	-	chr3L	26246022	5'	+	Cr1a	4069	1	65.52
CTTTAATGGGGCTTTATTTACATTTTTTTTAGAACTCCAATTCAAATTGATTCGGGTAATCCCCAACCACACACACACACACACACACACACACACACATATG:1	-	chrX	14209611	5'	+	accord	7030	2	74.76
GTCAACTCCACAGTTGCTGTCTTTTTTTGTAGACTGGCACAGTGGAATTGGCAGAACTTTATCGGGAGGAGAAATTAGGATAGTTCGAGACTCGAAGCACATTTGACATGAGTAATTATTTTTCCTAATATATTTTTAAAGTTTAT:1	-	chr3L	13922609	5'	+	hopper	172	1	65.75
CAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1	+	chr3R	26431989	5'	+	opus	7153	4	69.47
CCCGCCCATCGGCAGCCCGCATAAAAATACTCGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGTCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1	+	chr3R	17531343	5'	+	1360	50	1	52.82
GCAGGTCCTGGCCAGTTGTTTGTGCTACGTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1	+	chr2L	15832951	5'	-	hobo	2932	1	76.69
TTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1	-	chr2L	18419257	5'	+	412	46	2	48.63
ATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACCGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTCTTTGTGTGAATAGAAA:1	+	chr2R	6172988	5'	+	pogo	65	1	62.33
TGTTTATGGCGGTCGTTTTTTGTTTACAAAATGAAATCAAATGAAAGCAACAAAAATGGGCAAAAGATAATAGTTAAAGGTACAAACTGACATTTTTAATTTTAGTCAGAAATTGTCAGAAAATGAGTTATACTCCGCGAAACACA:1	+	chr2R	5493024	5'	-	transib2	398	1	67.12
GTTAAATCTCAATTGCCTGCTGACCTAAAACTATGTGACTGTACTCGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1	+	chr3R	9210603	5'	-	mdg1	7432	2	61.36
CCTTCAGCTATGAAAATAATTTTGAGTTGCCTTGCAAATGATAATATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATG:1	-	chr3R	11832077	5'	+	jockey	360	1	69.18
ACATTTAACTCTGCAGATTGGATGCTGGGTGATAGTCTTAACTTGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATAT:1	+	chr2R	4601558	5'	-	HMS-Beagle2	7119	2	69.18
ATGGGAATTTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	-	chr3R	19968209	5'	+	roo	8706	2	55.07
TGGGCGGTAAGTACAACACCAAACAGTAGAAAAAAAACAACAAAATGAATCCTCTCCCACACACACACACACACACACATACATTATAGCAACACATAGCAACAGCCATACACCAAATCATAGAATGC:1	-	chr3R	12556961	5'	+	Quasimodo	76	2	57.81
GTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1	+	chr3R	29487012	5'	-	flea	4972	2	59.59
TTTTCANATTGTTAGAAGTGTCTTTATAAACTATAATCATTTGTTCTAAAGTTTTCAAGGGCTATTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1	+	chr3L	234228	5'	+	roo	86	2	56.16
AATAATATAAAATAAAATAAAATAAGACACACATTGGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1	+	chrX	14635204	5'	+	roo	8747	2	79.31
GCGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGGGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGACTCCGTTCATATCT:1	+	chr3R	22844161	5'	+	roo	39	2	53.42
TGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	+	chr3R	17420420	5'	+	roo	58	2	65.19
ATGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	-	chr3R	3320506	5'	+	1360	59	1	74.56
AATTGCCTTTCTATTATGACTTCATCAATTGTTAAAAACCTTGTTAAAAACTTTATTAATATTTGCCATTTAAAAACCCCGAATATTGACGCAAAAATTCTCCAGCCCAGCAAAGAAATCCTAGGTCCGTCTCTAACTAATACAAT:1	-	chr3L	25237439	5'	+	Doc2-element	4659	1	59.59
AAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chr3R	12886977	5'	+	roo	40	2	66.67
ACAATTTGTAATTCTGATGAACAGTTGAGCAAAACTTAAGCATCGTCTGTCCCGCCTGCTGCTGTTATGTTGCTGTTGCTATTGCTATTGCTGTTGCCATTGTATTGTTACTATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAG:1	+	chr3R	11497337	5'	+	1360	3299	1	76.71
TAGTAAATGATTTTTTTGGAACCTAGAACATAGTGTAGTTTTCATTTACACTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1	-	chr3L	6978236	5'	-	pogo	2034	1	65.07
TGCTGAAATACTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	-	chr3L	11531015	5'	-	roo	9047	1	67.81
AAACAAAGTAGTTGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTTCATATCTTATGT:1	-	chr2R	19004248	5'	+	roo	44	2	57.24
ACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGACTACCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1	-	chr3L	22968441	5'	-	mdg1	388	2	55.47
ACTTGCAGTGGGTGCGCAAATTGTCGCTGCGCGTATAGGTGGCCCGGCACAGCGGACACTCGAAGCGGCCCGGAAAATGGAAGCTACTACAACTACTACTAATAGTAATAATAATAATAACAATA:1	+	chr3R	18422988	5'	+	mdg1	7057	3	64.80
TCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr2R	14542128	5'	-	roo	9015	2	57.53
TAGCAATCTTATATCTACTAGTATTTAAACATACCTTTTTAGATAGTGTATAAGCCAAAGACTGCAAACTACTTCAAATCCATACTTGCCTGAGAGATGGAAATAAGTCTCTCCCATAGTTTAGAAAGGGAGGGTAAGAGGCT:1	-	chr3R	26850041	5'	-	Helena	196	1	62.94
CAAATGTGTGGACTCAACTCCCCTTTCCCGCAGGATAATTATGAGCTATGCATGGGGAATGGCGGGGCCACAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTT:1	+	chr3L	20888685	5'	-	1360	3365	1	60.48
AAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCATAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr2L	3886146	5'	+	roo	8703	2	54.10
GGTACGCGCACTACCCACTACCCTATACCCCCTTGCATGCCATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCG:1	-	chr3L	22349306	5'	+	jockey	35	1	62.31
AGACCCCAAGGAAAAGCGAAAGATCCGGCGATCCGGGAATGCGTATACATTTTATACGCATTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAA:1	+	chrX	20645829	5'	+	1360	379	1	58.90
GTTTTATCAGGTCCCTGTAGCTTATTTTCCATCTCCACCGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATTGAAAGAGTAAAAATTTCGTGCTCAGAGAGACAACATATGGTTCTTATTATTTATGCAATC:1	+	chrX	19694091	5'	-	Tc1	91	1	66.18
AAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr3R	25448444	5'	+	roo	54	2	56.85
TCCAAATGCCAGGGAAAAGGCAAGACCCTAGAACAAACTTGCGCTGCATCTTTGTCTCTAAAAGCTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTACCTTTAATAGTTCC:1	+	chr3L	22725267	5'	-	INE-1	157	1	67.96
GTGTGAGTGTGTGTCTGGCATATTTGTATATGCGTGTTAAGACCTCGGCTGATAAAAATGCCTTTGGTTAAGCATTTTCACCCTTTGACCCCTTGGGGTAGGCATTTTTCTTGTTACGATGATGTTTTTATTATTTTATCAACGCA:1	+	chr2L	17081733	5'	-	jockey	4980	1	71.92
AAAAAGAAGTCACAGATTCCCCAGCACAATAGACCCCATAAGTATCTTAAAATACCTCCCTTCTATATCTCTGGAAACTATATGTCTTATCTCAACCTTCTAGCTTCTATAGTTACTGAGATCTCGAC:1	+	chr2R	5866165	5'	-	INE-1	145	1	53.91
ATCTCTTACTTTCTCTGTTTGGCTACCACCGTATTTCGCGAATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTCACTCG:1	+	chr2R	20596404	5'	-	roo	399	1	77.40
CGAAAGTTAAACAAAGTAGTTGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	-	chr2R	19004256	5'	+	roo	8689	2	67.16
ATTTAAGACACTTCGTTTAAATGTGCTACTTTCATTTTAATTCTAAAGTTCCATTTGCAGTTTTTTATTCAAGAGTTGTTTCTCAAATTTGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGT:1	+	chr3R	22127559	5'	-	roo	8780	2	64.44
GGTTGAGATTTAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCT:1	+	chr3L	14665461	5'	+	INE-1	574	1	78.17
TTCACTAATACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1	-	chrX	22511462	5'	-	1360	3374	1	60.27
AGCACCACCCAACTATTCCTATCCCCACTCATTTCAGCACTGAGAGCTTCGCCACTTTTATGCAAATAATGTCTTCCAGGATAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCC:1	-	chr2L	8565166	5'	+	roo	166	2	63.78
GATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGTA:1	-	chr3R	20427454	5'	+	jockey	81	1	67.63
GGGCTTGCAAAGCTAACAAATGAGGGAAGAGGACTGTTCATTTGCTTTAGGTATATATATATAGAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1	-	chrX	17756685	5'	-	297	6921	2	64.38
AAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1	+	chrX	21016767	5'	+	Transpac	4980	2	71.09
ATGTTTGTATTCAACTTCATTTACATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTA:1	+	chr2L	10685344	5'	-	I-element	5261	1	82.88
AAATATTCCCCTTTCCGTGGCTCTTTTAATTAAGTGCAAATGCGAAAGTTATGAACTCGAGTTTCGGTTTTCGGCCAAACTTTTCTATCTCTCCTTCCGCTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTGAAATCGATTGCTT:1	-	chr3R	20346058	5'	-	Cr1a	4259	1	68.49
AAAATAAGATTAACTTAATAGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATA:1	-	chr3R	23020990	5'	+	INE-1	565	1	37.93
GCCCCTGACACATTTCCGAGGACATTGTCTTCGGCCAGGGAGTGCTTCCCTGCATGTGGAGTGATATAAACCCTGTTTTTCCGAGACAAAAAAAAAGAGCTTTGTTGCTCGCGAGGCATTCATTGTTTTCCTTTTTTTTT:1	-	chr2R	18511223	5'	-	transib2	2641	1	52.14
TTTAATAATGTCATTTGCATTTATCGCGCATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGT:1	-	chr2R	11629293	5'	-	Tirant	8395	2	54.11
CAGTTGACCAACTCAATTTTTCGTTGGCAAAAGGAAAATCGCAAAAGGAGTTTTGCGGCTGTGTCCATGTGGACGACTAATACAGCGATAGGATGCCTCTAACCC:1	+	chr3L	16438220	5'	+	R1A1-element	4874	1	60.95
AATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr3L	23635037	5'	+	roo	8737	2	69.86
GGCGTGGATTAAACATAAGCTGTCCCTCACAATTATTATAATAAACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1	-	chr2L	13763240	5'	-	pogo	2075	1	59.60
CAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAG:1	+	chr2L	15833447	5'	+	jockey	27	1	60.19
AAAAATTTGCTCATCTTATACTTAAAGAACAATTAAATTTATGTCTAATAAATTTCAACGAAAATTTGCCATTTATTTAAAGTTTGTATTATTCTTTGAATTTTATATTTATTTGGGTTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAA:1	-	chr3R	28771404	5'	+	mdg1	7043	2	54.79
AACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1	+	chr3R	25826687	5'	-	mdg1	338	2	73.29
TAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr3R	20427512	5'	+	jockey	18	1	75.56
TGTTGCTTCTAACAATAATCAAATCTTAAGTAAAAGTGTAAAAATGGAGCTTCCAAAAAGGTCCCTTTTGCCAAAGTAGGTAGTAACACGTCATCAAGAACAAATGTTCGATTGATCTAAAAAAGTAAAAAGTTTGATATTCTTCG:1	-	chr2R	1650402	5'	-	Tc1-2	257	1	50.68
AATATTACATTTTTATTTCAAACCATAGACTCAATTATTTGTTGTATCTATAAAAGAGTGATTATTGTATATTTCGTCCGAAATAAAGTTATTATTTGTTATACCCGTTACTTGTAGAGTATGAACGTCGATATCTCAGGAACTAT:1	+	chr3L	455850	5'	+	INE-1	143	1	21.92
GTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGC:2	+	chrX	13704747	5'	-	invader4	3040	2	52.74
TGAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTCTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chrX	16717918	5'	+	roo	80	2	73.61
ATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTA:1	+	chrX	21087561	5'	+	mdg3	37	2	50.00
CAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGA:1	-	chrX	22913196	5'	+	gypsy7	5278	2	72.95
AATAGAAGAAATTAAAAATAAGAGAGAATAGAAATATGTAAAATCAAGAAAAAAATTAAAACATGGATAGGAAAATAATTTAATAAAAAAATAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1	+	chr3R	2527710	5'	-	INE-1	546	1	47.59
ATATTCCTATAAACTAAATAAAAAACTGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATT:1	-	chr3R	14049403	5'	-	transib2	2735	1	77.08
TAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCAACTCATAAGCTTA:1	+	chr3R	5061838	5'	+	mdg3	64	2	55.48
TCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3L	12879732	5'	+	roo	8720	2	60.00
ACCTATTCTGTTCAGTTCAGTTTTCGTCAGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1	+	chr3R	25339931	5'	-	mdg1	407	2	73.72
TATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chrX	9540023	5'	+	roo	72	2	73.29
TGAAATAATAATGATTTATTTGCCAAATTGCTCAAGTGTACAAATGTGTATAAATATGCACATATAGATTCGCATGAAATCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTACACTATTGGAGA:1	-	chr3R	28946432	5'	+	hopper	40	1	58.22
CTCAATAGCATTTGCTGCCACCGCATAAAGTCAACTGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	-	chr3R	28624677	5'	+	roo	8676	2	69.57
AAGGCATTCAGATACTCTGAGTGCAGCTATCGCGTATATATTTTATTTATAATATATAATGAGTGCAAAGAATGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1	-	chr3R	30344070	5'	-	pogo	2100	1	55.07
AAGTATGGCCAAAATGTAGCATACTTTTCAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1	+	chrX	17054160	5'	+	jockey	33	1	64.38
GAATAAAGCGGCATTTATTTTAATTTGCCGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1	-	chr3R	14979916	5'	+	pogo	30	1	64.34
AGTACGTATAATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGCTGTGTCCA:1	-	chr2L	9399576	5'	-	Transpac	5200	2	63.70
TGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:1	-	chr2L	19310428	5'	-	Juan	4187	1	64.38
AGCGTCACAAAATTTTGCATAGACAAATGCTAGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACTGGTCACACATGAACACGAATA:1	+	chr3R	27994131	5'	+	roo	8665	2	45.45
AGAGTGGAAAAAATGGACCAGCGTTTAAGTTTCCGCAGTGATTAAGAACAAGTTTTTAAGTGCTGCAAAAAAGAAATCAAATAATTCATAAATAAATAAATAAAGAATAAAGTGGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCT:1	+	chr3L	17685066	5'	+	mdg3	5258	1	56.55
AGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTAT:1	+	chr3R	19589904	5'	+	BS	5047	1	51.37
AACTAAATATTACATTTTTATTTCAAACCATAGACTCAATTATTTGTTGTATCTATAAAAGAGTGATTATTGTATATTTCGTCCGAAATAAAGTTATTATTTGTTATACCCGTTACTTGTAGAGTATGAACGTCGATATCTCAGGA:1	+	chr3L	18072335	5'	+	INE-1	138	1	21.92
GAGATAAAGTGAAAATGAAAGACTGTTGGAGTTAATCAATAACTATAGTAACGTGTAATATCAAATGTATACAGTCACCGACTATCTCTCTTCAAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1	+	chr3L	27261773	5'	+	Ivk	54	1	60.27
TAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGCATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1	-	chr3L	10574394	5'	+	Tabor	43	2	46.53
GTTGTATTAATTAAATCTTTATGGTCAGTTTTGTACGGAATTTATTAGAAGCGAGCAAGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1	+	chr3L	3500899	5'	+	opus	15	2	70.77
CGGGGATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1	+	chr2R	13084589	5'	+	roo	42	2	56.56
TAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGNAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGA:1	-	chr2L	13585918	5'	-	Tabor	412	2	65.07
CGGGGATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chr2R	13084589	5'	+	roo	8714	2	59.23
CAATCACATTTGCGCCACATTTCCAGTTCATCATTAGCGTCGGACATTGACAATGATGAGGACGACAGGTTTCGTTTCGTTTCGTTCCGTTTACTTTAATTTAATTATTTAACAAACGAAAAGCGGCA:1	+	chrX	4056018	5'	+	invader2	412	1	57.81
AAAGTACTCTACCCCCTTCGAAACCATTTCATTCATTTTTGATGGCACCGAAATGAATTTGGTTATCATAAATAATCTTTTCTAATACACTGATTTAATTCAAATAATTAATATTTTACAAAAAGCACACATGAAAATTTCTCTAG:1	+	chr3R	20883799	5'	+	TLD2_LTR	129	1	49.32
ACTCGCACATGGGGCTGTTCGCCGTTATCCGTGTTTTAAGGTTTTAGGTTTTAGGTTAGGTTAGGTTTTCGATTCGTTTTTGGTGGGTTCATAGGTGTTTGGTTGATGCTACGAAATTGGCAAAAAAACTACCCTAATATGTACA:1	-	chr2R	14279131	5'	+	1360	3138	1	73.10
AATTAGCCAAAATGAAAAAAAATAATTATAAGGGCTAGTCCGAAAGAAAAAAGGGAAACTACAAAAGATTTTTTGAAAAATATGTAACAGGCAGAAGAAAACGTTTTCGACTGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAG:1	+	chr2L	16614225	5'	+	INE-1	85	1	75.18
GCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	+	chr3L	15600194	5'	+	roo	8715	2	65.55
TGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAAACAAATTTTTATGTATG:1	+	chr3L	27356107	5'	-	Tc3	1642	1	80.70
ATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTTGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1	+	chr3L	7292448	5'	+	HMS-Beagle2	47	2	54.48
AAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATCGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCT:1	-	chr2R	5173234	5'	-	Stalker	7224	4	56.39
GTAATATTAGCGCATTAATATGTGCCACATAGCCATGTGTGTGCATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTGTGTGCGATTGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTG:1	-	chrX	18185264	5'	+	jockey	125	1	48.63
AGAGTAGTTGAAGAAAAGAGCTTACTGGACAAACGGGTATTGAGACCCGATAGCCGCGAAAGAGTCGGCAAAACAAAGAGGCTATTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAGAGT:1	+	chr3R	5281217	5'	-	roo	8983	2	62.22
GGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1	-	chr2R	9791650	5'	-	412	7456	2	80.14
TTCATATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGCTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGC:1	-	chr3R	19448609	5'	-	roo	8643	1	73.97
GGTGATGACTGTAAAATCCCCAGGTTGGGTGGGTGCGCATGGATGCTGGGATAAGCCAAGGATTTGAGCTTCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTG:1	-	chrX	21032651	5'	-	Quasimodo	6945	2	61.29
TATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1	-	chr2L	544853	5'	-	412	7517	2	60.64
ATTGAGAATGTTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chr3L	20654452	5'	+	roo	8692	2	63.16
ACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1	-	chr3L	3863524	5'	+	blood	7060	2	56.69
AAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTACAATT:1	-	chrX	10640098	5'	+	roo	8684	2	50.56
AGTGACCCAAAAGTTGAATCAGACACCCGCGTCGTACAAGATATACATGTACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGATCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1	-	chr2R	17626923	5'	-	opus	461	2	55.65
AAGTGTGTCGTGCTGGTAAATTGTGGGATTAGCCTGGGACTTGTTAACAATGTTTCGTCGCTGAAGCCTTGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1	+	chrX	2842446	5'	-	Tabor	476	2	77.78
GGGAACAAAAGCTCCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1	-	chr2R	9662833	5'	+	412	7082	2	65.52
ATTGCACCTTCAAACTTGCCACCAGATGCCAGCGAGGTATGCACCTCGACAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTG:1	-	chr3R	6286913	5'	-	Doc	374	1	62.34
TATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1	+	chr2R	5485062	5'	-	blood	7376	2	73.29
ATTGGAAAATGGAATTGAAGTCGACGCCAAACGACCGTCCCGGGAAACTGTAACACTGCAATAA:1	+	chr2R	23466041	5'	+	Doc	483	1	60.94
TATAATTCTGCATAGCTTAGCAGGGCTTTAATTGTGACCTGAGCTTAGCGTTTTTCCTCTTCCTGGCTCCTGATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTA:1	-	chr3R	9973484	5'	+	jockey	4889	1	52.74
GGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAATATTTAGAAT:1	-	chr2R	11164487	5'	+	roo	78	2	73.10
CTATACCGAGGTTTTGGTGTTTCTTGAGACTGAAGGACAATCTTCAAAATGGTCTTAATTCTTGAGATAGAATAGCTGCAGTTCTCATGCTGAATAGTGATCAGTACGATTTTATTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCT:1	+	chr3R	13032199	5'	-	1360	140	1	77.40
CAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACTCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1	+	chr2R	2016809	5'	+	1360	13	1	66.67
CTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCT:1	-	chr3L	17115527	5'	+	blood	7071	2	63.08
GCAAAAATTATTTATGTATTTATGTGCAAAAGAAACAAGAGAGTAGGCTATACGTCCTCAAATTTGGACGAAAATACGGATAGACGCACAGACGGAGATGGCTAGATCGACTCG:1	+	chrX	22806285	5'	-	INE-1	108	1	54.39
GTTCTTCATCATTCCGGCATTAACAGGTTAACTCATTTTAAATGAAATCTGCGCTGAGCGAAATATAAATATATGAATCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGAGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCG:1	-	chr2R	23135855	5'	+	Bica	36	1	58.33
GACGGAGAATTGGTACTTACTCGTCGACAATCAGATATTAGTTTTGTAAATTTCCATCAATCTGTCAAAAATCGTTTTGCCGCACCCACTCTAAAGCCCACAAACTGCCGAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAATGTTT:1	+	chr3R	21337657	5'	+	INE-1	257	1	75.69
CAGACGTTACAGAACACTCAAGAGTATTTTAAAATACCAAACATCTTGAAAAAAGAGACTACATTTGATTATTATTGCTTTACTCACTCGCATAAGTCTGCGGTGCGGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAG:1	+	chr2R	1523112	5'	+	1360	90	1	70.34
AATAGGGATCGATTTTTACTTAAAAGACGACACCTGAGCATTGACACTGAGCTCTTCGACCACAACGTCTCAAATTTTATTGGTGATAAATTTTTTCCCTTATACTATTACAAGACCCTCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAG:1	-	chr2L	21367193	5'	-	Doc	391	1	50.71
AATGGCAGAGCCTAAAAATGCTTCCTTATCATGAACAGTGCACTCATGCCAATGCACTATGCTAATGCAGATTTATATCGTTTTAACACCCACCAATTAGCTCGGGCTCTAGTTAGTATTTTTTCATTGTCGTGTAAGAGGTGGAG:1	+	chr3R	15459105	5'	+	aurora-element	4185	1	70.55
CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAAC:1	+	chr3L	25232764	5'	-	accord2	142	2	61.48
TACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chr3L	11393492	5'	+	roo	76	2	73.97
GATATATATCGATTTTTAAGAATTTAACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCG:1	-	chr2L	22130805	5'	-	INE-1	579	1	43.48
CTTGTTGTTGCCTTTATCCATACGATGCATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAG:1	+	chr2L	21325095	5'	-	invader4	262	2	64.38
ATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:1	-	chr2R	16373549	5'	+	Max-element	8261	2	53.68
CACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1	-	chr3L	25232916	5'	+	GATE	8269	2	54.63
TGGGTAACTTGTGCATTGTCAGGCGCTTTGTTAGAAATACCCCCTTTACCCATCAGTCCGCACTTAGCCAGTCACAATTAAAAAAAAAAATATAAACACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTGATCT:1	-	chrX	12953059	5'	+	Tc3	1617	1	55.17
AGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGC:1	-	chr3R	11547752	5'	+	G2	281	1	57.14
TACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2L	18419243	5'	+	412	42	2	52.34
AACCTGTCTTAAAGGTGCAGACCCTGTCATTCAGTCCCATAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAG:1	-	chr2L	4411695	5'	-	Quasimodo	195	2	68.22
AATATTCTGATCTAACGATTTATCATGCCGTGTTGTGGATTTTTGTTCAAGTTGCTTAATTTCATGGCAATTTATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1	-	chr3L	16769342	5'	+	FB	39	1	55.56
AATTGCATTTGAATGAGCAGCGGGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGCG:1	+	chrX	2295927	5'	-	Tirant	8504	2	54.72
CCGGTGNACAAAATTGCTCAAGGAACTAAGGCACTTACACGTGGTATCATCGGCATGGCCTCGATCAAGGTGGTGTCCTTTTGGAAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAA:1	-	chr3L	9952318	5'	+	baggins	5060	1	52.14
AATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCACATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTCTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCT:1	-	chr2R	6085997	5'	+	1360	449	1	60.96
GACCAAGACGAAGCAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGAT:1	-	chr2R	5173244	5'	-	Stalker4	389	1	64.34
AACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr2L	17420147	5'	-	roo	349	2	60.27
TACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTT:1	+	chr3R	11496542	5'	+	1360	38	1	62.38
TTATGTGGCGAACATGCATGCATAAGTAGTAATTCATTCCGTTTCGATTCGTTTCATTGCGTTTCATTTGCAATTTGCTGCTGAGCACTGCATAAATCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1	-	chr3L	4948169	5'	+	hobo	20	1	70.92
GAAAGTATGCAACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1	+	chr3R	13360293	5'	+	jockey	27	1	62.39
CGATATTGGCCAAAGAAACCATCATATAAACTTATATCATTCAGAATAAATTGTATCATCAAAAAGTCAAGAAAGATCTTAGAAAATCTATAACGCTGTATCAAGTCGCTTATTCAAGTGTGTTAGAATATAAAATAAAATAATAT:1	-	chr3L	10295217	5'	-	transib1	1900	1	74.66
TTAAGAGCGTTGTCCCTTTTTTAGAAATGTTCTTGTAAGACTTCATTCTGCAACTTTCTCTTTTAAACACGGTGGCGATCGGAGAACATTTCTCAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTC:1	-	chr4	698293	5'	+	invader1	212	2	58.22
CGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCCTGATATGACAACCA:1	+	chrX	12214070	5'	-	opus	445	2	70.54
AAATGGAGGTGCGTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAA:1	+	chr3L	19013887	5'	-	invader3	5432	2	64.29
GGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1	+	chr3R	10182140	5'	-	blood	7316	2	73.48
CAGATATTTTGCTCACAGAGCTTAAACAGCATCACTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATT:1	-	chr3R	31816078	5'	-	roo	67	2	76.71
TAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1	-	chr2R	4601675	5'	+	HMS-Beagle2	6913	2	67.59
GGAGAAAAGCCAGCTTGATCGACAGGTCCACCCCAATCCCCAATGGAATTGCATCAATCAGTCAATTGTGGGTGTATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1	+	chr2R	21299591	5'	-	jockey	4961	1	50.38
AGAGATGAAAGAGGGCAGGCAATGGGGACCCGGTTCACTTTTTCCCGGCCTAGCAAAATTCCCGGCCCCAAAGGACCCTCGCACACACACATATATCACCACCCTCATGACCTCCCTCAC:1	-	chrX	17963988	5'	+	jockey	4762	1	80.00
GTCCCCAATGGATCCATAGGCCTCGACCTGATATTCTATGTGGCCTGGCCATATTGAATAGCAGAATTATGCAAAGTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAA:1	-	chr3R	23235606	5'	+	jockey	4805	1	55.17
GAACACGTAAATGATTAAATGCGTAATTGGCACACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1	+	chrX	17229049	5'	+	1360	82	1	76.62
TGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGCAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAATTCTCAAAACGC:1	+	chr3R	25826683	5'	-	mdg1	388	2	55.00
GTAATTTAAATTAATTTTTGTTTTTTAAGCTTTTCTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	-	chrX	5274365	5'	-	roo	8986	2	78.08
TCAGCAATAAATTTAACTCTGTTTCGAACCGCAGAAATAAACAACCGAATGACGATAATCACCACAAAAACACTTGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1	-	chr3R	12717869	5'	-	297	6949	2	68.49
CACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1	-	chr3R	10182191	5'	+	blood	7070	2	69.17
AAGTGGAAAAAAATCTTGCACATCCAGAGGCATTTATTATCGTTTTTAGTATGCAGTACCAAATTCGGTCATCGTTATTAAGGGATTGCTAGCACACGATGATGTGTGATAGGTCAGGAAGGCCGCGTCGCAGG:1	+	chr2L	12187191	5'	+	invader1	3597	1	48.51
CATAACTAAGCTGATCTTAAAATCGCTAACTTACGCTTAATTGCAACCTTAGCTTAGGCTAAAGTCAAAGAAAAGCTCAGTTCACTCTATTTGCATACAAAAACTTCAGTGATTTATTTCTCGTGTTTTTTAATTTTAAAGCTTTT:1	-	chr3R	12296922	5'	-	1360	3022	1	80.14
CCGGAAGGGGCGTGGCAAGCGGAAGGGGGCGTGTACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGA:1	-	chr3L	12308392	5'	-	hopper	1347	1	69.23
AATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1	+	chrX	10521628	5'	+	Tabor	6898	2	55.86
AGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATAT:1	+	chr2L	21008550	5'	+	invader3	5257	2	68.35
ACCTAGTTGAAACTGAACTTGATTCCGCATAGCGCACAATTGACGATCGATAATAATCGCGCTGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTCCACACACACACACATA:1	+	chr2L	14110723	5'	+	Quasimodo	34	2	64.18
ATGATCAACTTATTGCGCTGTGAAAAAATTTAAGCGCAAAGCTTATATCCTAAACATATTTAAAAGCTCAAGAAAATCCTAAAGAAAAGCTTCTGGCCGAGGTCGAGTGGATTATAAAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTCTT:1	+	chr2R	5302175	5'	+	FB	156	1	77.40
ACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCTGATCGACGTCAGCAGT:1	-	chr2R	23332611	5'	-	invader4	258	2	70.50
TAGGGCTAGTCGTTCAAACGCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1	+	chr3L	23603158	5'	+	F-element	21	1	55.06
CATGTTTTGGTGCAGCCGATTACATATTTGCGCATCTGAGGAAACCAGAACAAATTGTAAGTATTCTTAGCTACTTCTTAGTAAGAGTTTATTTTATAGAGTAAAACAAGAGAATTTGCTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1	+	chr2R	5253466	5'	-	INE-1	560	1	65.75
GACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACA:1	-	chr2L	22063437	5'	-	INE-1	124	1	60.96
TGATTGAGTAACTGTCACCCTCAGAACGAACAGATTCCATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGTCA:1	+	chr2R	4788768	5'	-	297	370	2	46.88
AATGTGTAAATACAAAAAGTTTTTTTTTGAAAA:1	+	chr3R	14624209	5'	-	INE-1	321	1	81.82
TTCCACTTCGCTTCGTGAAGTTCTCCCCCTTGCACCGCACCGATAAAACATTATCTTTCATCATAATAAACGGAGATAGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGCAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1	-	chr3L	10848792	5'	-	blood	366	2	77.40
CATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1	+	chrX	13704735	5'	-	invader4	305	2	66.42
TTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAACACGCAGCTGGTCATTTTATC:1	+	chr3R	28758285	5'	-	mdg1	7410	2	48.63
TGGGGCTAACTCTTCATTGGGGTGATTGGATTTTTTGTTAGAAAATCCACAAGGAACTAAGTATTTTTTTGGCAATTCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTATTTTTGGTTTGATC:1	-	chr3L	19282995	5'	+	pogo	275	1	54.11
CTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGG:1	+	chr4	311162	5'	-	1360	3378	1	74.02
ATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr2R	19050322	5'	-	roo	9045	1	59.03
AGTAGAAACAGAAAATTTTGTTTAATTGTGGGCGTGTCAGACTTGGTTGGTTTGTGGACGTGGCAGAATGTTTTTATTGAAATCGACCGAAATGACAAATATACATGTATTTAGTTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTGTGT:1	-	chr2R	2118697	5'	+	transib2	324	1	71.23
CACACCGAAAAAACTGTAATATCTTGATCTTAATTGCAGTGCCAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGTAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACA:1	-	chr3R	22822179	5'	+	mdg1	7042	2	63.70
CTTGTGTGAGTGCCAAAGAATTTATTGTTGAAAATTATCAAGAGGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr2R	13710595	5'	+	roo	8742	2	71.92
AGAATAGAGATGAAAAACATGACCATGTAACACATGAACCACACTTTTTCTCGTCACAGCAGTTTTTGTTATTAAACGGAACCCTGGGGCCACATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAAAAGA:1	-	chr3R	1443509	5'	+	INE-1	86	1	78.12
CCGGATACTTCATAATTGTGGAAATTTTTTCTGGATCTGTTTTAATTACATTTTGAGAAACAATATAACAAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGCTTCGTTCGCTGACGCGTGAAGACGTG:1	-	chr3L	25207992	5'	+	Doc2-element	9	1	74.59
AAAAAGTTTACCTCAATATATCCCTCTCTAATTTGGAATAATTTAAATTAATGATCAGTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCCTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGA:1	+	chr3R	13237292	5'	+	3S18	64	2	58.90
AGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATGTTTAAAGACTTACACTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr2L	3114548	5'	+	roo	8745	2	75.18
TCCATTTGCATAATTATTCATTGCGCAGCATTATGAGCATAAATAAAACGATGCTCCACTGCACAGACACACAAACACACAAACACCACACACACACACACAAACACACACACACCACACACACACACACACACATACTC:1	-	chr2R	12839568	5'	+	accord	7031	2	71.43
GGTGCGTCAATTATTGATAACGGACACTGTGAATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGTTTC:1	-	chr2R	18609451	5'	+	opus	42	4	57.72
GTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1	-	chr3L	19036046	5'	+	Tirant	8146	2	70.93
AACCGCACACATCAAGGACAAAGTATCCCTGGAGGAGATGGAGATGGAATCAAGCCGAAACAGGAAACATCAACATGACAGAGAGGAGACCATGTAAGCGTTATTTCGCTTTTATATGATGGTTGCACTTGGGCTTGAATTTTGCT:1	-	chr3L	21849206	5'	-	Porto1	65	1	63.01
GTCTCCCCAGAACCACTTTTGCAAGCACCTAGAAGCGCACGTCTATTAGGACCGTTCCTGTCACAAGACACCAGCTAATGACTCCTTCTGAGCACTCAAGAAATATTATAGGCTAATAGGAAGAAGATCGAAG:1	-	chr3L	25847440	5'	+	G7	785	1	75.94
AGAAAAAAATATGCAAAAATAATCCTTAACACTTGAATCCCCTGGCGATTCTCTGGAATCGGAAGATGTTTAATGTGTGTTCGCAATTCAGACTTATTCCTTTTCAAATAAGTGTGTGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGC:1	+	chr3R	9359387	5'	+	diver2	9	2	24.66
GGTCAGGAAGGCCGCGTCGCAGGTCATTTACATTTAACATTTCTAGCAATTGCGTGGTTCTACTTCCCCCGCTCCTACCCGCGAACAGAC:1	-	chrY	996325	5'	-	invader1	121	2	67.78
TATATAATTATTACAAAAAAAAAAATAATTATCATTTAAGAATTTTTTGTTGCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr3L	10292765	5'	-	roo	388	2	37.93
GTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTAT:1	+	chr2L	12290689	5'	+	1731	4364	2	66.07
AGTTGACTAACATCACAATCCTTAAGCCTTCTCCTAATACAGCTACTTTAAACAGGAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1	-	chr2L	13914180	5'	+	jockey	4733	1	60.00
AAAGGGGCGGGTATTTGGGGCGGTCATAGAGGGGTTGGGTTCCTTCGTCGGGATTGCTGCGCAGATTAATGCTGCATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGCTTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1	+	chr3R	10273924	5'	-	HMS-Beagle	223	2	64.52
TATTTTATTAGTGTGAAGGTTTCTGCATTATTTAAATGACACTGACACCACTGACATTTGAAAATTACATTCTTCTAATGCAAATGTGTGAATCAATAAAAATTGTCTCGTCGCTTAGGAATCCCAAGACACAATCCTTAGCGGT:1	-	chr3L	12047304	5'	-	R1A1-element	246	1	76.55
ATTTCGCTTCGTTTCAATGTGCAGGTAGGAATAACAAAAAGCGGAGGATGGGAGTGACAACGAAATCGAAACTTTGCAACAAAATTGCATTTGAATGAGCAGCGGGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCTAGGGTGGAGCCTT:1	+	chrX	2295845	5'	-	Tirant	8497	2	76.06
AGTAGCTGCATATATGAATTAATTTAAAAAAAAAA:1	-	chrX	18474108	5'	+	jockey2	3406	1	71.43
GCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1	-	chrX	13066561	5'	+	jockey	82	1	77.34
ATACGAGCACGGAATGTGGCTGTTCCGTGTATTTTATGCTAATCGAGACCCAACAGCAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1	+	chr3R	14981125	5'	-	mdg1	415	2	74.79
AGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr2R	14542213	5'	+	roo	81	2	75.34
ATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2	-	chr2R	19050336	5'	-	roo	394	1	67.81
CATAGTGCCAACAAACATATCGTCGTCGTACGATAAGACTTCAAGCGATGCTGGAGCTTCCAATGACTCAATTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATTAGCCGAG:1	+	chr2R	5295333	5'	-	Quasimodo	6978	2	68.47
ATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGCCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1	+	chr2L	14892222	5'	-	transib2	2780	1	60.53
TAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACCACCAACA:1	+	chr3R	10462605	5'	-	opus	7445	2	60.69
TCCGGCCTTCAACGGACAAAATAAGATCAATTCAACAAGCTCCAACTAAGAACGTCCGACTGTGGAAAGCTGACACTTCTTATTTGGAGTGTTACGCTGCGCCGCAAGAAATGCTGAGCCGGCTT:1	-	chr3L	23592493	5'	+	gypsy	150	2	63.20
TCTAATTATTGAAGGCAATATTAATAATATGACTTCAATGACTTCAACCGACAGCCAAGTGAACTGAAATATCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1	+	chr2R	5251994	5'	+	1360	80	1	68.93
ATTCCTCTTTCAAACACGCGATTTCCGAACCAATTTAGACACTTTATGTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTCGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAAC:1	-	chr2R	8624847	5'	+	Juan	4084	1	60.00
GACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTCCTATCTACTCTACTACGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGC:1	+	chr3L	23112571	5'	+	R1A1-element	5191	1	44.25
GATGCCAGCGACTTTTCACCACGACATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr3R	18582227	5'	+	roo	81	2	74.66
CCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	-	chr3L	11441825	5'	-	roo	9005	2	65.07
TTTCAGAAAAATTCACCTCCCCTGCCAACAAGTTGTAGATTTTCATTTCGATTCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTAATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAA:1	+	chrX	21560567	5'	+	17.6	7388	2	66.67
GAACTATTTCGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1	-	chrX	2444437	5'	-	roo	401	1	63.29
CAAATGTTCACCAAGTGATCAATATCAATTTGTCAATCAAGACCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr3R	14364678	5'	+	roo	50	2	67.83
TATATGAACATAGTTAATGAGCTAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	13817745	5'	+	412	7094	2	57.53
ATGGTTTGTAATGTAATTTTTTTCTTGCCTGGCAAGAAGAAGATAGCGATGTCGAAGGTATGGTCACACATAAGCGAATTAAAATTGGGCAATCGAAATTATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTT:1	+	chr2R	1069305	5'	-	FB	480	1	71.03
ATAGTTGAAATGCTAAAAAAAAAACGTTTTAGAATTATTTTTCGTTTCCTTTATGTGGGTTAATTTTCGCTGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGGT:1	-	chr3L	2076829	5'	+	roo	8647	1	54.84
GATCGGTTCTGTCTAGTTTTTTTACTCAACTCTTTTTTACTTCTTATTTAAATATTTTAAGGTGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATAAAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTTCACT:1	+	chr2L	21795708	5'	+	HB	78	1	63.01
AGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACATCTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAGTTAATATAAACAATGCTGACGCGCCCAA:1	-	chr2L	22121623	5'	+	gtwin	58	2	59.54
ACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	+	chr3R	18582176	5'	-	roo	9001	2	77.60
GGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTT:1	+	chr3R	25423205	5'	+	3S18	68	2	61.64
AACCCCCTGACACCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	-	chr2L	7945430	5'	+	roo	8680	2	66.09
TATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1	-	chr2R	13585476	5'	-	412	408	2	78.42
AAATGGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAGTCCA:1	+	chr2R	5284578	5'	-	Doc4-element	2555	1	64.38
AGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1	-	chr2R	19499388	5'	+	P-element	30	1	45.00
AGCACCGATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	+	chr3L	12879722	5'	+	roo	8693	2	60.98
ACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCACCTTCATGCGTCTGCTTATTTGCTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCC:1	+	chr3R	20627938	5'	+	gypsy6	7453	2	60.96
ATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATCGTGATCCATCAC:1	-	chr2R	21920589	5'	+	jockey	68	1	61.64
TTATATGTTTTTAAAATAAAATATAAAACCAATAAATATTTATCACCCGACTTGCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATC:1	-	chr2L	5962576	5'	+	gypsy3	329	2	60.64
TTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1	-	chr3R	20499873	5'	-	mdg3	216	2	62.59
ATGTACATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1	-	chr2L	20117977	5'	+	invader4	31	2	57.93
AAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1	-	chr2L	14772102	5'	+	roo	8755	2	79.45
ACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1	+	chr3L	9998029	5'	-	roo	404	1	55.00
ATTGGCATACACACTTTTGAAATTTTTAATTTAAATTTTTATGATTATTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTA:1	+	chr3L	23325991	5'	+	pogo	72	1	70.55
ATAGCATTACCTATTGATTTTGCATCCAACGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTTTTGGACTTCGTTTTTGCCTTCATGGAAATACCTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	+	chr3R	4569152	5'	-	1360	3370	1	69.06
AATCGCATTACAAGAAAAGTAAGGCAGAATGGAAAAAGGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1	+	chrX	12214006	5'	-	opus	7495	2	79.45
ATCTTTGCAACTTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1	-	chr2R	16785457	5'	+	412	30	2	65.75
TACCCTGTCTAAATCCCTCAAGTTAAACAGAAATTTCCCTTGGCGAGGAAAAAATCGGACTGACACCTTCAATTTCACGTTTAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTC:1	+	chr4	556527	5'	-	Circe	7409	2	77.78
ATACATACAAATGCAGATTTGCATGGCAACAAGGGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1	-	chr2R	8146114	5'	-	P-element	2884	2	46.97
AAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1	+	chr3L	10574288	5'	-	Tabor	430	2	57.04
AAATATAACGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGCTCATAT:1	-	chr3R	12887015	5'	+	roo	8701	2	60.27
AGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1	-	chr3R	17478445	5'	+	copia	84	2	75.34
AAGCACAACTAATTTAATAATTCCCCGATCTCGCCTCAAATCTCCCGCATCTAATCGGCTTAGTCCACGCAGGCGCGTCGCACTAAGGTAAGGAATAAGCCTTCAAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCAT:1	+	chrX	13715691	5'	-	invader4	2622	1	73.97
CTTTTGTCTCCGGGCGACAAGCAAACGAGCAACAAAAGGACATACGGAAGGACAATGGCAACCGAAACATTCCGAGTCAAAGGCACAAACACACACACACACACATATAA:1	+	chr2L	14952545	5'	+	accord	185	4	66.36
TGTTAAATATTCAGGCTTCCCTAAAAATGAAAATCACACGTTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTCGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAAC:1	+	chr2R	9499958	5'	-	G5	4787	1	51.37
GGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1	-	chr2R	13817705	5'	+	412	7134	2	72.60
CTCAAGATTAAAACCCTCCACTTTCACACCTGTTTCTAATTTGGGATTAAAGTTTTCGCAGCTAATAGTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTGAACTTAAGGCTAACAAAATATGAAACTCATAG:1	-	chr3L	17906474	5'	-	gypsy6	7548	2	51.91
GAGTGTAGTCAATTGTTCACTACTTACTAAAACTATTTTCTACAAACAACAAAACTCAATCGTGCTGACTGTAAAGGGTAGAATAAAGCACTTTCGACCATATCAAGTAATCATGATCACGATCGAGAGATCTCAGGAACTATAAA:1	-	chr2R	20538547	5'	+	INE-1	146	1	47.95
AATTGTTATTTATGGCAGGCCAGGGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGACTTT:1	-	chr2R	16785393	5'	+	412	7101	2	72.00
TCGTGCATGCTTTCGTCGCTCTTCTTCTTCCTGTGCGTCAACTTTGCATGTACATCGGCACTTTTCGACGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCC:1	+	chr2L	23352524	5'	-	accord	7342	2	54.01
TGGAGGAGGCTCCTCCATTGGCCCATTGCGCTTCGATTGCAGTTTAAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chrX	18193624	5'	+	jockey	35	1	63.70
GGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCAACTCACACCCTACAATTTAGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1	-	chr2L	1377700	5'	+	hobo	68	1	70.54
CTTTGGGCGTCTGGAGTAGGACTCCTGGAGGAGGACTCCTTGGGCCTGTAGCCCGCTGCCTTAATTGCGGAAGTTATGAGCATGGAATTTTAATTATTTCACTCGAGAACTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTA:1	-	chr3R	14469661	5'	+	I-element	5031	1	75.34
GAAGATGACCCAGAATGCAACTTGTGCGGGTTAGTTGCCTGGTTTTCCCATCTGCACTCGTGTGCGTGTGTCATGTGACTCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAAT:1	+	chr3L	10056485	5'	+	transib2	400	1	56.16
TATTTATAGAAGAATGGGTTTATAGCATCAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1	-	chr3R	16076877	5'	-	roo	9034	1	54.17
AAGTCGCCGAGAACTTTTCCAAACACCCATCCACCCATCGACTTCTACCATCTTCCGAAATAAGGTAAACAGGGAAAACACTCAACACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCG:1	-	chr2L	17226450	5'	-	F-element	4485	1	73.04
AATGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3R	22955963	5'	-	roo	333	2	67.81
CTGAGTACGTATAATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1	-	chr2L	9399579	5'	-	Transpac	298	2	72.73
ATACCGGGCATTACCTGCTTCGTCTTTGCTTGTTGTGGGGATTATTTCGCAGGGAAGGGCCTTGAATGCATTGCCAGTGAACTGGCGCGATATCATTAACTGCCATGCACACACACACACACAGA:1	-	chrX	3519244	5'	+	accord	7026	2	70.40
CTTTTAAAAACTGCTAATATAAAAGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGATCC:1	-	chr2R	5531230	5'	+	1360	63	1	72.93
AGTCCTCGGTGAATTCAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chr3R	7835235	5'	+	roo	8678	2	70.59
TATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1	-	chr3R	14337480	5'	-	copia	5048	2	71.23
CATAAGAAAAACTTTCAACATAACAATAAAAATTTCATGCCTGTAAGGCCCTTGACTCTCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCC:1	+	chr3R	25454672	5'	-	Quasimodo	6949	2	50.00
CAAGTTTGCCTAAAAGTATTCTTCGTTTCGGGCAAACTTCTAGAATATTTAAAATCGATTGTAGTCCATTTGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTT:1	+	chr3R	21276521	5'	+	BS	5045	1	50.68
GCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	+	chr2R	18336152	5'	+	roo	59	2	65.69
AATTAAGTACCCTAGCTGTACCAAATGAACATGGATGGGTATGCTTAATCTGAACCTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCG:1	-	chr4	48652	5'	+	1360	41	1	75.81
ATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTT:1	+	chrX	21016749	5'	+	Transpac	61	2	62.33
AAGCCTTTCAAGTTATACAAGTCTTCTTATAATCCTTTTGCTAATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1	+	chrX	13066449	5'	-	jockey	4986	1	76.03
GATATATAATATATATAATATTCATATCAGAAATACTTTTTATATTATCAAGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCT:1	-	chr2L	5020552	5'	-	HMS-Beagle2	250	2	61.43
TTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:1	-	chr3R	25454127	5'	+	Quasimodo	26	2	51.45
CGCTTAACGTTCTGTTGACATCGCCGTGCCAACCGAATGCCATCAGGCATTTCGTCACATAAAAATACATGGCCAATATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAT:1	-	chr3L	7292581	5'	-	HMS-Beagle2	7154	2	56.94
ACTTTCTGGTTAGAATGCTGCGAAGGGATGATGGGCAAAGGTTCTTGGCAAAAGGGAAAAGAGGTAGCGGTTAGCATTCAAGCACTAAAGCTTCGGAATAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATT:1	-	chr2L	17021635	5'	+	FB	937	3	67.36
AAGACCCCTATCTAGATCTATTGTAGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	+	chr2R	25118669	5'	+	roo	8686	2	59.65
AGAAGGCGTGGAGGCGTGACAGGGGCTGGGGACTGGGCGCGTGCTAAAATTATGCAATACAATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1	-	chr2L	15833572	5'	-	jockey	4987	1	69.40
TTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGCCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1	+	chrX	21087551	5'	+	mdg3	5258	1	73.87
CTTGACTAAGCAAATTCGTATACACACATATGTATGTGGCATGTGTTTATAGCCCAGTTAGTTGTTGGTTAACGGTCCAGTCGAACCAACAAACGAAGCGTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAT:1	+	chr3R	23452431	5'	-	Stalker4	7011	4	56.30
AACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1	+	chr3L	10773087	5'	-	412	7478	2	76.80
TTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1	-	chr3L	23456283	5'	-	1360	3341	1	54.11
ATTGGGCACTCCCTTGCAGATGATCTATCTTCTCTAAATATATGCTCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGA:1	-	chr3L	2486778	5'	+	jockey	4738	1	64.29
GTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chr3R	18582205	5'	+	roo	8694	2	82.19
AGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACA:1	-	chr2R	9463474	5'	+	rover	73	2	76.30
TGCAGGACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1	+	chr2R	12835013	5'	+	jockey	15	1	74.55
TGGAAAAGTGAAATAAGCGCAGCTTTATATGCACAAATACACATACATATGTACACACAAATATATGTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCG:1	+	chrX	6498934	5'	-	Quasimodo	7316	2	60.96
CTGGTATTAGACCTCAAGCGGAATTTCCTTTCGTTTGATTGTAAGTTGTGGGAACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTAC:1	+	chr3R	17605588	5'	-	Tabor	7307	2	73.29
GGGAAACACTTCCTCCGGCTTCTCATCGCGTTCAATGTCCTCGAAATTTCGCGTATCATCGTCGGAGGATGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTC:1	+	chrX	16629849	5'	-	R1A1-element	268	1	62.62
GACATTTATATGGTCCTTCAAATAAAAAATGTCTTTATTGCCGAGATGGTAAGCAAAAGGGCTGGCTGGTAAATAAAGCGGCCAAACATAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCTGCACAAA:1	+	chr3R	12618574	5'	+	F-element	39	1	57.75
ATTGCTGCGTTTAACACACAAAGGGAATTTTACAATTTGCGACAACATTTCGAAAATACCAATAATCAACGAGTTTTGACTTGTTGCATTACCGTGCCAGTTCCCACTTTGCTTGATTTTTTGTTGTTGTTTGTTTTCTT:1	+	chr3R	32029537	5'	-	mdg3	5089	1	55.00
ATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1	-	chr2L	11674455	5'	+	jockey	16	1	76.32
AATTTGTTACATTTTACCTTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTC:1	-	chr2R	5924458	5'	-	jockey	4732	1	53.42
GAATTATTATTGGTTTTTATTATTGGTTAGTGGGTTTGTAGACGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGATG:1	-	chr3L	16015308	5'	-	1360	3335	1	68.91
ATGGAAAAATTAAACCTTAAACAACTCAATAAAAAATTTCATATTACACATATTTCTGCGGAAATATTGTAGATCCATCCACTTCATTGCCTTGCATGGCTAATAGAAATGTACTAAAAATGTCCCAAAAAATTTTACCAATAATA:1	-	chrX	23184331	5'	+	Helitron	494	1	64.38
TTTTACTCAACTCTTTTTTACTTCTTATTTAAATATTTTAAGGCGTAGAATATGTTTCGCAGTTGTGTCTCATACACAGGTCATAAAAAGGTATTTTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTTCACTTATTTTTGTAAAATGGAA:1	+	chr2L	21795727	5'	+	HB	96	1	48.97
ATCCATTCATGCGCGTCACTAATTAGATGAAGAGGCATTTGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCA:1	-	chr3L	23112566	5'	-	R2-element	3205	1	51.85
GATGGTGTGAGACAAGACATAGGATTATCGATATGTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1	-	chr2L	22685248	5'	+	Ivk	12	1	77.40
ACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGCATGATCA:1	-	chr3R	9714461	5'	-	Stalker	333	4	70.21
GGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTAATTTGATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr2R	25118752	5'	-	roo	8997	2	74.63
GGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr3L	9998016	5'	-	roo	391	2	45.21
ATTGTGGAAATTTTTTCTGGATCTGTTTTAATTACATTTTGAGAAACAATATAACAAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGCTTCGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATC:1	+	chr3L	25324241	5'	+	Doc3-element	28	2	57.89
AATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCTAGTGTGGAACACTGACAACCATA:1	-	chr2L	12290771	5'	-	1731	4601	1	59.32
ATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:2	-	chr3L	20831353	5'	+	roo	86	2	78.77
GCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3L	9998027	5'	-	roo	9053	2	46.32
TATTATATTATATGTATACATATTATGTATGCCAAAAACACTGTGGCCACGCCACCAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCTTTGTATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAA:1	+	chrX	22641242	5'	-	Tc1	1636	1	27.59
AAAATCTTTATTAATAAATATATGGACAGCCATAAATCTAAAATTAATTTTTAACCCTAATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	-	chr3R	17420514	5'	-	roo	9014	2	59.59
GCTGCTTATTAGGCACTGACAAGTGTCAACAGAGCAGCAACACATAACATTACGTATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATA:1	-	chr2L	2122480	5'	+	Stalker4	7024	4	63.70
TTAAAAACTAGTTTTATTTGCATCCGTTCAAGAAAGAGATTTTTTTAGATTTGTTTGATAAATTCATTGCTATGGCTTCTAATAAATGTGAAATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1	+	chr3R	31109614	5'	+	I-element	29	1	63.70
AATGGAGGTGCGTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTT:1	+	chr3L	19013888	5'	-	invader3	5425	2	60.96
CACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGCAGACTTTACTCGTT:1	-	chrX	9540135	5'	-	roo	9060	1	72.27
AGTGTAGCGCTGAATTTACATAAATCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1	-	chr2R	17259381	5'	+	jockey	4710	1	58.90
GCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGT:1	-	chr2L	19965051	5'	+	Doc	83	1	66.44
AACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1	-	chr3R	22276770	5'	+	jockey	81	1	55.80
CGATTTCACTTATTTATGCGACTGCGACGGGACATCCCTCCCAAAGTACAAAACTTTCTACACAGCGCAAAATTGGGCAATAATAATACATATTTAAACAAAAGAGAGCGCTATAGTCAGTTTCCTCGACTATCAGATACCCATTA:1	-	chr3R	21254735	5'	-	INE-1	552	1	67.12
AATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	+	chr3R	16076765	5'	+	roo	32	2	61.54
GGGGGGGAAAATGTTTTTCAATTGAATTGATTTTGAATGCGCTCTGTCTGACTTCTGTCTGTGTTTGGACCATTGAAGAGTGCGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1	+	chr2L	1377603	5'	-	hobo	2917	1	65.38
AGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCACCGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTGCCCGACAAAACAGGA:1	-	chr3L	23702239	5'	+	G4	76	1	67.83
ATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1	-	chr3R	11496614	5'	-	1360	3333	1	60.29
ACTATTTTTTGAAACAAGAATCACTCATGAAATATGTTCTATGAGGCTTGTTAGGGAAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:2	+	chr2L	6622902	5'	-	Burdock	6364	2	67.12
ATTGAGTTTATATATTACCTTACCCAAATTCATTCGTAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCT:1	-	chr3R	5061953	5'	-	mdg3	202	2	54.11
TTTCGTTTGATTGTAAGTTGTGGGAACGTGCAACAGCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1	+	chr3R	17605616	5'	-	Tabor	7279	2	54.11
AAAATATTCGGAAAAGTCTGGGACATGATAAGGATATTTGGAGTGAATGCAGAAGTATTTACATTTACATTCAATAAGCTAAAGATCGCTCTACATTTCTCTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTG:1	-	chr3L	20653569	5'	-	roo	132	2	66.44
AAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1	+	chr2R	16945298	5'	+	jockey	79	1	68.09
TGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1	-	chr3L	27415292	5'	+	transib2	84	1	74.66
TTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1	+	chr3L	14603297	5'	+	jockey	70	1	76.11
AGTTGCCCGCCATTGTCATCCGACGACCCCTTGACCCTCGTTGCCCAAATGGTCGTATGTTATCGGTGTTCTTCTTTGACGTCTTGTTTTTGAGTTGGCAGAGATTCCGGCAAATCTAA:1	+	chrX	21567279	5'	-	diver	463	1	59.66
AAACTGCTGTAATTTTGTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCC:1	-	chr3R	11547834	5'	+	G2	282	1	79.45
ATTCGGTTTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:2	+	chr3L	7292430	5'	+	HMS-Beagle2	6913	2	67.81
ATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTACTGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTC:1	+	chr2L	16016343	5'	-	412	458	2	59.14
GTGCCAATTTGGCCGTAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr3L	9998212	5'	+	roo	8712	2	53.42
AAAATATTTTTTTATCTTCATGTTTTTCACCTAGGCTAGATTCTTGCGCTTTTTTTTTGTTTTTGTTGTCAAGCTTTTTAATTTCGTTTG:1	-	chrX	12869768	5'	-	1360	3010	1	31.11
GTTACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCT:1	-	chr3L	23702275	5'	+	G4	43	1	53.42
CTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1	+	chrX	7256109	5'	+	412	62	2	60.27
TGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1	+	chr3R	28624582	5'	-	roo	323	2	77.40
GCCAGGGGCAGGATTGGGGTCGCAGAGGGGGCGAGCACTTGCAATTCCACGTAAATCCACTCGATGAGAGCACTTACATGAGCTTGCGTTTGTCACAAACACACTCAACAAACGCAAAGGATTTTGAAATTTAATTTAATTTTAC:1	+	chr2R	12905285	5'	+	Rt1b	121	1	72.41
GCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	-	chr3R	18582224	5'	+	roo	84	2	78.08
ACCCTTTTCACACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	+	chr3R	25448306	5'	-	roo	9041	1	64.38
CACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACA:1	-	chr2L	12290760	5'	-	1731	301	1	62.11
AATTGTCCTTTTAAATTGATTTTATCATTTGCCTCGGACATTGAACCCATGCAGTGCAGCACAAAGAAACAGATTTATTTTTATATTTAATTACGTTGATTGTCATTCTTC:1	+	chr2L	13570483	5'	-	transib4	2260	1	70.27
AAGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1	-	chr3R	17831903	5'	+	F-element	52	1	48.97
GAACCCCCTTTATCTTAAACCATAGACACCCATGCATGTTACGCCGCAGTTGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1	+	chrX	12074524	5'	-	412	424	2	63.70
GAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	+	chr2R	9791569	5'	+	412	45	2	53.24
TATACTTTTTAATAAATAATCCGATTGAAATGGATGGATATTTATAATCAAAAGTCAAAATCTCAATTAAGCTTTGGGAAAATCTAGCAAAACATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1	+	chr2L	20139824	5'	-	jockey	4974	1	62.32
AGTTAGACTTGAACACTATTTTTCAATTCAAAAGTGTTTCTTGCAGTGCAGATCAGACACAATTAAGTGCGAAGAAAACGGAAGCAGACGATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTCTC:1	-	chr3R	30540353	5'	-	Doc	87	1	62.33
GGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGGGATATAA:1	-	chr3L	21855507	5'	+	blood	78	2	76.87
CCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1	-	chr3L	16750753	5'	+	Tirant	6	2	70.33
ACAGGTTCTGTGCCCGGCCTGAATAAACAAATGCCCTGATAGCGTGGCGAAATTGAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGGCTCATCCGTATTATGTATTCACTTCGCGATTTTGTACGACAGCG:1	+	chrX	18386370	5'	-	invader4	3044	2	49.19
AAATAAATGACTATAATAAGAACCCATTACTTTTCCTTGGTTGGTCATAAATATTGTGGGACGAACGCACAAACTCTCTGAGCTAGCCGATGCAATCCATAGCGAGGGTACAAGGTCCACATATTGTGCCGTTAATTCACGGTGCG:1	-	chr2R	677249	5'	-	gypsy8	258	2	71.23
CAGAAGAGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1	+	chr3L	15519732	5'	+	pogo	38	1	61.15
TCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1	+	chrX	21014788	5'	+	copia	45	2	58.54
CTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCATAGAAGTCGCG:1	+	chr2R	15004749	5'	+	jockey	35	1	44.52
GTAGAGGGGTCCCAGGTTCAACTGTTTGCCACGACGACCGGAATTCGATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	-	chr3L	16343345	5'	-	roo	396	1	75.94
ACTAAAATGTGATGATGTATATATTTTGACAATGCTTGTAATCCATTGTAAAACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAA:1	-	chr2L	17420304	5'	+	roo	8663	1	78.77
CACTTTTCAATTGGTAATTTAATACGTTGGGAGCAGATAAATATTTGATTTATGTCAAAATTTTGTTGACACAGTTTGGTTTAACAAATTTACGGACAAGTTCACAACTGTGGCACGAAGTGTAGTGATCGAGAACATAATCAAAT:1	+	chrX	6499265	5'	+	G5	104	1	53.42
TTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr3R	19449987	5'	-	roo	330	2	68.28
CCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGGATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGC:1	-	chr3L	5102486	5'	+	BS	4733	1	71.65
TAGAAAAAAATACAAACAAGCTATAATTAATGACGAATATATATATATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1	-	chr3R	19139470	5'	-	opus	7452	2	74.02
ACATAGGATTCCTCTCTTTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTT:1	-	chr2L	9608201	5'	-	blood	164	2	86.96
TATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr2R	19004207	5'	+	roo	8739	2	77.04
CTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1	-	chr2R	9632215	5'	-	roo	9030	1	56.85
TTTTCTGAGTGTTTTAAACGATACGGAAAGTCGGCGTGCAGACAGTGTAAACATGTGCACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1	+	chr2L	12328596	5'	-	hopper	1390	1	60.96
CATTATTCTTACCCAACCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTTTGTCTACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTAAACCGCTGCTTTACATACCCTTT:1	-	chr2R	6486740	5'	-	Circe	7145	1	66.67
TATAAAGCTAAGCCAAGAGAGGAAAGTATGCAATATAGAAGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGTAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1	+	chr3L	13845095	5'	+	opus	7022	2	55.56
AATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1	+	chr3R	18339066	5'	-	roo	9030	1	56.85
AAAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2L	9668194	5'	+	1360	53	1	68.55
TTTTTTTTTAATGTTTTAATGTGTCTAGTAATTAAAAATAATACTATTGAATGCTGATGCTAATGAGTGCCTAGTAACTATCCTAGTTTGACGGGCATTTTATTATCAACTGTGGGCAACTCTTTGTTTTTTTTTAAATGTTTT:1	-	chr3R	31746293	5'	-	TART-B	10507	2	65.28
GAGCATATTCGTACACTAAAAAATACTTATATTATTAAAAAAAAAAACTCATTAATCTCATTACATTTACCTTACCAACGGAAAGTCTTTCACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAG:1	+	chr3R	25464656	5'	-	Quasimodo	233	2	63.45
GCGCTATATACGTATGAATGTGTGTGTGCATAGATGTAAATTGTGCGGCTGGCCCCTCGACGTATGCAACACTTTTGGCTTGGCGAGCAGAGCATAAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1	+	chr3L	17135999	5'	-	hopper	1408	2	78.91
AAGACGCGAGCGCATTTAGTTTATATAATGTGAATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAACATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1	-	chr2L	12892761	5'	-	roo	400	1	78.57
AAAGCAACCAAGAAGTGACCAAATATAACGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr3R	12887035	5'	+	roo	17	2	73.97
CATGACCATGTTGAAGCAGCAGGAGCCCGAACGATACATCNATTTGGGTAAAATATAAGCCATTCTAAGGTTTCACTAGAGTTCGTGATTCCTAATTGGTATATTTGTCTGTAAATAATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAG:1	-	chr3R	18980395	5'	+	Tc1	1225	1	76.71
CGAGATCCGAAAAAGGGGGAAAATCTCAGGAGAAGAAATGACAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGA:1	+	chr2L	21008523	5'	+	invader3	23	2	61.02
AAAATTTAGATGTTGATGGGTTTGCATTGTTTGCTGCGTCTGCTGGATGCGATACCTTTGTTAGGGCGTGGCTAGATTAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCACGCCATACGATTTGTTGGCACACGATTTTT:1	+	chr2R	1880982	5'	+	1360	38	1	53.68
CCGAGGAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1	-	chr3R	25454143	5'	+	Quasimodo	6	2	64.93
AAAATGTTTATAGATTGACGAGGCTGAGTTATATTTTGTAAAATATATGGAAAATTAAGGCCTTTTTGTTTACCTCTATGTATTTTTTTAATTACATCTATTTGTTTATATGTTTTTATCAATGTGTAAAAAAATAATAACAAAAC:1	-	chr3L	23228001	5'	+	S2	137	2	68.49
TTTGAATTAATACAATTCGTAAATACTAGATTCGTTCTAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCCGTCCGACCATATAAAGTATTCTTGTATTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCCCTTTCCGTATGAACGTCGAGATCT:1	-	chrX	22519212	5'	+	INE-1	133	1	60.69
AGGGGAAGGGGAAAACTTAGTGACAGCAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGGCACTGGGAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGGAGAAATACC:1	+	chr2R	16373498	5'	-	Max-element	162	2	40.32
TAATTCTATTCGCCAACTGCATGTGGTGTGAGCAAACCACACAGATAAATATTTAATGTGTGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1	+	chr3R	12717729	5'	+	297	45	2	60.90
CCAAATGATAAAAAAGGTGTTCAAAGATTCTTAGGATTGGCTATTTCTAATCTGTTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGATGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGA:1	-	chr3L	23866821	5'	-	1360	241	1	75.34
GAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr3R	12886964	5'	+	roo	88	2	83.56
GGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGCCATGCGTGCA:1	-	chr3L	5102504	5'	+	BS	4734	1	64.38
CCGACGAACTATTGAAGAGATCCTGTATTCCCATCTGCAAATTTAGAAACATGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1	+	chr2L	7888117	5'	-	pogo	2092	1	61.36
ACAAATTCAAAGTGGATGCCATTTAGCCGGTGAAAGAGATGGCTATACGTTTGTACATATGTAGAGCGGGACACTGTTCCGTTTGAATCGATTTATTTGAATGAATGCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTA:1	-	chr3L	10366204	5'	-	Stalker2	302	2	50.71
CGGGGCGTAAATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCGCTGCTTGG:1	+	chr2R	4260424	5'	+	micropia	5210	1	45.71
GATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1	-	chr2L	15833069	5'	+	hobo	33	1	60.82
ACTACGGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2R	5248232	5'	+	1360	55	1	58.70
TTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACAC:1	-	chr4	1152082	5'	-	transib2	2741	1	73.29
CTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAACGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr3R	25448420	5'	+	roo	8739	2	70.63
CCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3L	22437928	5'	+	roo	74	2	80.16
GGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1	-	chr2R	13817705	5'	+	412	7106	2	66.10
ATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1	+	chr2R	15005055	5'	+	jockey	22	1	59.22
TCTCACAAATTGTCGAAACCTTTCACGTTTGCGCCTATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGGAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1	-	chr3R	20499893	5'	-	mdg3	229	2	71.92
CAGACGGCCAGCTAAATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTATCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1	+	chr3L	10647872	5'	-	412	7529	2	55.47
AGGTAAGTTAAAAATTCAATTGAATCCTTTAGCTTGTAGTAAAGGTCACTAATTTTAAATTATTTCTGGTTGTTAGTAGCCAATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTATTCACAGCAAAAAACGCACAAGA:1	+	chr2R	7105610	5'	-	copia	134	2	56.16
TGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1	+	chr2R	9091843	5'	-	1360	3320	1	68.57
CAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1	+	chr3R	7835095	5'	-	roo	9032	1	56.25
AGGCAGACTTACATATATAGACGGCAAACGAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCA:1	-	chrX	12074639	5'	+	412	7148	2	63.93
GAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCAT:1	+	chr3L	16343202	5'	+	roo	35	2	56.69
GGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTATACTCGTTG:1	+	chr2R	8585420	5'	-	roo	396	1	68.93
AGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGG:1	-	chr2R	4939192	5'	-	1360	3367	1	33.09
GCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCAAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr3L	22400259	5'	+	1360	53	1	53.96
ATGTAACAACAACAAAAAAATAGCCAAAGAAAGCAAAAACCTATTTAAAACAAAAAAAAAACCAACAAAATGTTAAGTTATTGCATAAAAAAAATCCTAAATAAAAAACAAAAGCAAAA:1	-	chrX	12470375	5'	+	transib2	100	1	76.47
ATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	+	chr3L	22437868	5'	-	roo	9004	2	64.83
CGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1	-	chr2L	16016410	5'	+	412	7117	2	63.38
GTGTTTGAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACTATACGCCCTGCCCAAAGAGACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1	+	chr2R	2016795	5'	+	1360	15	1	69.35
TACCTGTGTACAGGTGAGGGGGAAGTGGGCATGGGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAATGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1	+	chr2L	6569960	5'	-	jockey	4955	1	62.14
TTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	+	chr2R	5248259	5'	+	1360	53	1	72.48
TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTG:1	+	chr2R	1982172	5'	+	gypsy	7128	2	63.16
GTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCG:1	-	chr2L	9668262	5'	-	1360	3314	1	72.03
ATAAATTTAACTCTGTTTCGAACCGCAGAAATAAACAACCGAATGACGATAATCACCACAAAAACACTTGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGCTGACTA:1	-	chr3R	12717863	5'	-	297	6943	2	64.38
TAATTGATTAAACAATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1	+	chr3R	16076752	5'	+	roo	8687	2	69.40
AGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCG:1	-	chr2L	12290740	5'	-	1731	4567	2	68.60
GCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACCGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1	+	chr2R	20496907	5'	+	blood	7068	2	57.34
GCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	+	chr3L	10292813	5'	-	roo	335	2	71.92
ATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTCCAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGT:1	-	chr2R	5531188	5'	+	1360	57	1	64.71
GCAACGGCAGCAACAACGCCGCACGTTTGGAGGTTCCAATAAAAATGGGGTCACTTGTCGTTGGCCAGTCGGGTGAAGTAGGTTTTGTTTTCAGTAGTAAGTAGAAACGAACACACACACACACACAC:1	+	chr3R	8946615	5'	+	accord	7027	2	61.72
CTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGGACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3R	27994201	5'	+	roo	20	2	54.76
CAAACATACCCATCACCCAACCTCACCCTGAGTGGATCACACATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGG:1	+	chr3R	12854922	5'	-	Quasimodo	6920	2	73.33
GGTATCGTATCGAAAAAGGAGCTGGGGGCCTGTCATCGACAACAGCTGCTGCTGCTTTCATGTCTGTTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAA:1	-	chr2L	9412109	5'	+	jockey	4521	1	51.45
TCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTC:1	-	chr2R	16373526	5'	+	Max-element	47	2	77.42
AGTTATGGTGCTCTTCTTCCTACACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1	+	chr2R	11629744	5'	+	Tirant	8146	2	59.35
TTTTAAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1	+	chr2R	977512	5'	+	F-element	57	1	52.05
GAGGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr2L	16091859	5'	-	roo	9046	1	63.70
ATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	-	chr2R	19004209	5'	+	roo	82	2	77.08
CATTATGTAATTTTCAACAATTATAATTATGCGGATTATATTATTCTATATAAAGATATTATCTATCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1	-	chr2L	15248017	5'	-	Transpac	5177	2	53.79
GTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	+	chr3L	20654490	5'	+	roo	79	2	73.29
ATTGATGATATTTCTATCCACAAATTAAAATTCTATTAAAATACCTACATTAAATACTCATCCAATATAGCTGATAGATCTAAAACAAAGAAAAGAACAGAACGTTATTACTTCAAAGCACCACGATACTCCCACCA:1	+	chr3L	15672171	5'	-	R1A1-element	4990	1	45.26
GCAGCCATTGTTTAAAAACGATTTGTCAATTCGCTGAACTCGAACTTCAATAGCTGGTTCTGCGTTTTTTTAATTTTTTTTTTATT:1	+	chr3R	21165408	5'	-	BS	5102	4	39.53
TAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1	+	chr3R	11496554	5'	+	1360	58	1	76.15
GTACGCTTTTCTCTGCTATTTTTGTGTTGTCAACGTAAGCCAAGCTTACTTCTCTCCCGCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTT:1	-	chr3R	31058927	5'	+	Cr1a	289	1	70.41
AAGCTGTCAAGTGGAATGGCGAAAACTTACTCAATTCTCATGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	+	chr2R	14387940	5'	-	roo	326	2	71.23
GGAGGGTAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATTCAAAATACTTTGAATATTTCTTTAAACTATTGCACAAATCACAAGAATCACTCGCGAAACGAACGTATTTTTAATAATTATATTTACAATTTATGATAATTAAAGAAGATTAT:1	+	chr3L	4777116	5'	-	Cr1a	80	1	81.38
CGATTTCCGCATGGAGCTCGTCGAAACTCTTAAAAGCGTTGGTAGATTCTGCTCACCTTATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1	-	chr2L	7888220	5'	+	pogo	55	1	62.07
CGTTCGATACCTAGAATAATATCGAAATAAATGCAAGCCGACTTTTGTTCGATATTTACCATCCGAATCGTTTAGAAAAAACGTTGATATTTTCCAATAAAAAATGAATATATAGACGGTTTTTTTGTGTTCGTGGGTAATGACTA:1	+	chr3L	19446759	5'	-	gypsy2	385	1	80.14
ATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1	-	chr2R	15064422	5'	+	412	49	2	65.52
ATCAATAAAAGCCAAAGTGTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr3L	22437864	5'	-	roo	9010	2	61.54
TTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	-	chr3R	12886973	5'	+	roo	72	2	76.26
GACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACCCCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1	+	chr3L	3799800	5'	+	copia	78	2	72.79
AAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1	+	chr3L	21855462	5'	-	blood	299	2	75.18
GATTATAGTTTATATAGCACTCTCAAATTTGACAGACACACCCACACTCACACACACACACACACACACACACACAAATGCCATGGAGTCGATGCATAAACAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTG:1	+	chr3L	9817323	5'	+	1360	440	1	60.96
GACGAAATAGAAACTAAAGAGAAATGGGCAAGCGGAAACCAATTTATGGGTGAAAAAACTGGTGCTGCCGGAGAGGAAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGC:1	-	chr2L	16794180	5'	+	HMS-Beagle2	6744	1	55.45
AATTTAAAATGTGCATTGGCATTCCATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTAATTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1	-	chr2L	11674480	5'	+	jockey	23	1	76.71
AGATACTAATGACTACCAATCGTTTTTTTTTAAAGAAGGTCAAGCCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr2R	25118693	5'	+	roo	8742	2	72.60
GGTATTACATTACTAAACTTTAACTTGCAAAACAGAAATGCTTTTTTTAATCAACACATTTTTTTTGTAATGTTATCGTTGCTGAAAATATGATAAAGTTGTTCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTG:1	+	chr2R	5416701	5'	+	baggins	5161	1	75.18
TACGATCTTATGCAAATCGCCGCTTTCGTTGCACTAGCCCCCAAACTTGCTACCGTGACTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1	+	chr3L	7588352	5'	+	hopper	7	2	79.45
TACCGAGGGTTTTATATTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACAGAAGATATATACATATAGTCTAGATCTGGATCAATAGCCGA:1	-	chrX	19192409	5'	+	INE-1	89	1	70.16
GAGCAGATGAATGATCTCGAACGAGTGCTTGACGATGCGGCAGGCCATCAGCTTCTTGCCGTTGTTGCGACCCTTCATCATCAGGGATCAAGCCAGTTCAGATGGGCACGTAGCTTGTTGCGATATTTTTCCCTTTGTTTTGCTAT:1	+	chrX	17146819	5'	-	Fw2	3710	1	59.59
AAAGGAATTCGGGCAATTGTCCCCCAAGGCAGTGTCCTTGGCGCTCTGCTATACAATGCATACGCTGTCGACCAAACCAAGCCAACCAGCGCCTC:1	+	chr3L	25847778	5'	+	G7	749	1	75.79
AAATCCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGCAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1	+	chr2R	8585413	5'	-	roo	406	1	76.00
ATGGGGTCTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1	+	chrX	14336423	5'	-	roo	332	2	71.23
AAGAGACAGACTTAAATGAAATTCATTGCAGAAATTCTGATAAACTAACCATCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCACTAAATATATTCGTGTTCATG:1	-	chrX	17523747	5'	-	roo	9	2	56.72
TGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr3R	7100910	5'	-	roo	355	2	52.74
TTGGAGAACGATTCCCGGTTGGCTCTTCAGCTCGACGCCATAAGCGATTAGGTTTTGTTGATCCCCTGGGATTTATTTTATTTATTTATTATGATTGTCGTCGTGCATCCAGGGAGTTGCCTTAAACGGCTACCCCACACATTGGT:1	-	chr3R	7008466	5'	-	aurora-element	62	1	50.68
GCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACTCTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1	+	chr3L	10848656	5'	+	blood	7063	2	59.84
GCAAATATTTGCGAAACAACAAGACGATGGCGCTGCCTGTATAGTATACATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAA:1	+	chr3R	24455361	5'	+	Quasimodo	63	2	69.66
AAATATTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1	-	chr3R	11496631	5'	-	1360	3370	1	67.24
TGGGACCGAAAGTCAACCAGCCCAGAAAGGTATGAGAATAAAAAACATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1	+	chr4	1151982	5'	+	transib2	39	1	58.62
ATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1	-	chr3L	4605722	5'	+	pogo	1	1	75.28
AATCTCTGTTTCTCTTTATTTATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1	+	chr2R	20596444	5'	-	roo	9025	2	52.08
GGATGAGTTGCAAGGACGAAATAACAGGATTTCGTTGGGATTTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAA:1	-	chrX	17431820	5'	+	hopper	14	1	67.89
CAAGACTTAATTGAAAAATGTTTCCCCGTATTTTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAA:1	-	chr3L	10056180	5'	+	transib2	81	1	73.79
AACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGTAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	-	chr3R	20427469	5'	+	jockey	73	1	58.90
TAGAAATTGGATCATGTATACATATAAAAAATGACTATTACATAAAATGGTATGTACAGCCGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACCTGAGAGTTTAAGATCAAAAATTCCTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTT:1	+	chr2R	6989077	5'	-	HB	1559	1	61.64
AAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACGTTGTTGCTCTGT:1	+	chrX	13504147	5'	+	412	58	2	53.79
ACTCAACTTCGCTGCCAGCTGCTGTTTCAATTCGATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr2R	14388061	5'	+	roo	8684	2	70.55
AGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1	+	chr2R	2016804	5'	+	1360	46	1	54.11
CACCGAAAGAAAATTGCATGCAGTTTGAATATTTTGTACACACATTTTACACATGTGAATTTGGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGCGCATGCTGACCATGCACTTATACT:1	-	chr2R	16784719	5'	-	412	182	2	54.11
GATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTAAGTTTGCATGAATA:1	-	chr3L	19339418	5'	+	Tc1	82	1	67.81
AAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	+	chr2R	20596487	5'	-	roo	329	2	78.95
ATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGGTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chrX	13039572	5'	+	roo	8714	2	53.10
TTTAATAATTAAGAAACTGAGGGCACATGCATACGAGTAATATCGAATTTTCTTTAATTTTTTTACCTCAAACAAACTACATTTACATTTATTTATTACTCTATAACCTTTTACAGCACAGTCGAGTGTCCCGACTATCATATACC:1	+	chr2L	20139656	5'	-	INE-1	557	1	57.53
GAAACCCAGTAAAACCCAACCAGATCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAAC:1	+	chr2R	4272107	5'	+	Quasimodo	7351	2	77.98
TTAGTTGCAAAATACATAAATAAACATATATCAAATAAATTCAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTATTATACTAATGTACATATCAGCTTTGCTGGCCCGTTGGCAGAATGTTCACACATGA:1	+	chr2L	1172968	5'	+	roo	8656	1	88.00
CTGCGAATACTTAGAGTTGTATTTCATTCAGCATAGGCTTTCGATACTGTGCACCTTGTATCATCTTGCTAGGATAACTATACACATTGCCACGATATAAGCCTCTAAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTG:1	-	chr3R	17238060	5'	-	17.6	7191	2	69.86
GATATAACCAGCGGAATTGGAAGCTTTTTCACCCAGGTGCTATCCGAATACCTAAATGGAGTCGAGTACCAGAGGAGGAGAAGGCGCAGGAGCATAGACTCGGATGAATTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTA:1	-	chr3L	18156467	5'	-	Burdock	6332	2	69.86
GATAAGATACTACTATCATCGAATATATAGGAAACAAACCCCTTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1	+	chr2L	23068856	5'	-	1360	3326	1	72.18
TATTGATGATAAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1	+	chr2L	13763122	5'	+	pogo	35	1	61.64
AGTGCAAGTTCATGTGATATGCCAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGTTTATGTT:1	-	chr2L	16016407	5'	+	412	71	2	65.07
GAAAAATCAGTTAAAATTCTACCAAATCGTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1	-	chrX	10694578	5'	-	I-element	5322	1	48.63
AGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	+	chr2R	21907936	5'	-	roo	328	2	71.92
CTGAAAATGTTCTTTATTGTTGAATTTATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCTCGTCAGTTGACTAAGCACAACGCCAAGAGAT:1	-	chrX	7887147	5'	-	297	6925	2	75.45
GGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1	+	chr2L	15247918	5'	+	Transpac	4991	2	71.23
TTTGCACCATTCTATTATAAGCTATAGCTTATAATCTTCTTCGTTTGGTCCTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGGGCTGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCTT:1	-	chr2R	2745870	5'	-	invader2	4940	2	58.59
GACCTAATAATTTGACATCGATGTGCGCATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAA:1	+	chr3L	23728667	5'	+	HMS-Beagle	60	2	78.07
AATTGAACAAAGAAAACAAATAATAGATGTATATAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGGGAA:1	+	chrX	22897596	5'	+	Bari1	67	1	61.38
CGGTAGGCAAAACATCTCGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	-	chr3R	22276807	5'	+	jockey	35	1	72.09
ATATAGCAAGATTTGGCTCCTGTGTCGCTAATATTTTTAGTTGTTATTTTTTTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:1	-	chr4	1152132	5'	-	transib2	2792	1	62.33
AAAGACAACCCCCGCATAGCGTCTCTTTTGGGTGTGTTGTTGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTAT:1	-	chr2R	17683270	5'	-	Doc	4451	1	71.92
GTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	+	chr2L	14081326	5'	+	1360	59	1	69.92
AAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTTCTATGCACAATGCCT:1	-	chr3R	15072675	5'	-	pogo	2078	1	63.33
ATAGGAGATGCAATCCCAGTGGACCTAGGAGCCAGTCTTTTCTTTGAGCTTCTGTTTATAACTGTAACCAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCGCACCACTATTTTGACCGGCATGCTCAGGGAAAATGTGCG:1	-	chr3R	2913314	5'	-	Circe	7369	1	80.00
GAAATATTTATGTCAGGGTCAGTCTTTGGAGAAGAACATGTGTGATAGGCCATGACAACCTCGAAGGCAGTTTTGGCATGAAGCCAACCTTTTTGCCTCCTGTAAGCGATCTTGAGGCGACAGTTTTC:1	-	chr3L	15847016	5'	-	G3	109	1	58.59
ACTATTGAAGAGATCCTGTATTCCCATCTGCAAATTTAGAAACATGTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1	+	chr2L	7888124	5'	-	pogo	2070	1	66.02
GATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGGCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAA:1	+	chr3L	27415240	5'	-	transib2	2737	1	76.71
ATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1	+	chrX	18193681	5'	+	jockey	92	1	72.41
AAAAAAAGGGACAAATATTTGCCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1	-	chr3L	10013692	5'	-	hopper	1402	1	70.94
AATGGAACCCACAGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGAT:1	+	chrX	5662904	5'	-	P-element	2779	1	13.70
TTGTGAATTAGAAGCAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1	-	chr3R	9922099	5'	-	blood	7365	2	65.15
GAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr3R	19968196	5'	+	roo	8725	2	63.89
ACGCACTTGATTGTATCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1	+	chr3L	11441700	5'	+	roo	8697	2	61.64
ATCCAATTGGCTAAAAGATTGCCATTCCAATAGCAATTTCTAGTCCAGCAATAACTTATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAAATCTA:1	-	chr3L	2354669	5'	-	Stalker2	7580	2	59.59
GCTTGGGTAGGAAGAGAACACTGTGACGAGTTGTACGATCCATTTCTGTACGGATTCCGGAGGCCATAAATGGGAGCCACTAAAGCAACGTATAAGATTGGTTGATTACTTATGGATCGCTCTACATT:1	+	chrX	21393365	5'	-	G3	4367	1	69.53
GATGGGCATGCAGTTGATGTTCAATTCAAGTTTCTTAAATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGCTCCACTTGCATC:1	+	chr3L	18368895	5'	-	opus	494	2	75.23
TTTGCATTTCTCCAGACCGCAACCGCAACCCCCTGACACCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	-	chr2L	7945456	5'	+	roo	6	2	76.34
TGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1	-	chr3R	28556521	5'	+	micropia	127	4	56.12
GGGAAAATTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1	+	chr3R	10462573	5'	-	opus	493	2	75.20
GTCTTGGATTTGCGTTTGGAGGCATTTTGGGCCTCGTTAAGGGTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTG:1	+	chr3R	21546637	5'	-	Transpac	145	2	68.15
ATTGTTTTCTTTATCCAAGCAAACTTATTTGAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chrX	16717947	5'	+	roo	8714	2	55.94
AGAACAAGTCAAATATAGACTGTAGTCTATTTTCGTTTAGATGCCACAGGTACAGTTATGGGTACAGTTGTGTTCAAAAGGTCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGT:1	+	chrX	3899141	5'	-	jockey	4923	1	54.79
ACTTAAAACTCCATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGAACTGGTAACAATTAGCTCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1	-	chr2L	544901	5'	-	412	476	2	67.69
GAATAAATCTTCTTTACTTGATTCTAAAAATATCATAAATACATATACATATGTGTGTAGCCCGGTGCAAAAGTTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAT:1	-	chrX	17962967	5'	-	jockey	4938	1	50.00
GTTATTTTGATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCNAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1	-	chr3L	20033820	5'	+	blood	17	2	61.97
GATGGAACCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	-	chr3L	233331	5'	-	roo	9014	2	62.14
GTATTGTGCGAAGTCCTAAAACGCCCAAAAAATGTGGTATGAGTACAAAAAGAAGCGGTGTGATGCAACGCCTTCAAAATAGAAAGGCAACGTCGGTAAATTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTATTAGATTTCTTACGCT:1	-	chr3L	24766388	5'	+	1360	3277	1	72.60
TAAAAAATAAATAAACGAATGTAGATGTGTTTTCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAG:1	+	chr2R	4906411	5'	+	INE-1	148	1	70.90
TATATAACCATTTAACCTTCAGGTGTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTGGCTTGTGCAG:1	+	chrX	22897625	5'	+	Bari1	49	1	72.45
AATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chrX	14336498	5'	+	roo	73	2	73.29
TGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCAC:1	-	chrX	21014829	5'	-	copia	166	2	80.14
TACACTGCACTACAAAAACAAAATATGCGGGGACTGGAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGGGAGCCGTTACAATTACACAGTTTTTGTTGGTACCACGATGAAATAACATACGGTGGTCCCGTCGAAAG:1	+	chr2L	7810006	5'	+	P-element	14	1	70.87
AGTTGAGTTTAGGCATTTCATAAGCAGCTAAGTTTAACTTTTTTTATTGTTATTATTTTGACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTC:1	-	chr2R	4601684	5'	+	HMS-Beagle2	6903	2	74.31
CTTGTCAATTTGTTAGCTTATCAAATGCTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACC:1	+	chr2L	5307110	5'	+	jockey	4742	1	76.98
ATTTGAAAAGTAATTGAATTTGAAACTATAAAAGTGTTAACTAGAATATCTAATTGGTGTACGCGGCACCAATTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCT:1	+	chr2L	14758302	5'	-	roo	8943	2	50.68
AGCGGAGCAGTGAGGCAGTAAGAAGATAGCACTGTGGACACCCCAACCTGAACCCATAAAACATTGCACTATGGTCCAGAATTCGCTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTC:1	-	chr2L	14892310	5'	+	transib2	59	1	58.90
CAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGCTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3R	27994195	5'	+	roo	8720	2	66.67
CAGTTTCCAATTGGAGGGCCAACGATTGTTGACACTGGTTGATGTGCGTCCGTTTGTGTTGCCAATTACTTGTTGCTAATACATAGCTATAGCTTCTAG:1	+	chr3R	13981106	5'	+	R1A1-element	5197	1	77.78
CAGCCCGCATAAAAATACTCGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGTCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1	+	chr3R	17531355	5'	+	1360	57	1	59.85
CACTTAGTGCAATTGGATACTTACGCAGCTTTGCAATAATTAAAGGACACTGCAACAATAGCCACACCAGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGCCT:1	+	chr2R	25249960	5'	-	HeT-A	6013	1	52.11
CAAGACTCACTTTGTTTATTTGCATCATCAATCACCAATCATCATAAACAAAATGATATATTGTAGATTTCATCTTCACGTACACATAATAATAATAATAATAGATAAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1	+	chr3L	17560228	5'	-	pogo	2089	1	78.08
CAAAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1	-	chr2R	16373555	5'	+	Max-element	8287	2	60.63
ACATTTCCCTGAACGAGAATTTCTTGCTAAATTTTTTATGAATATTTCCTGACGCAGCTCCTCTGCTTTTAGGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTT:1	+	chr3L	3887107	5'	+	invader2	384	1	62.50
ACTACGAAAAATATATACAATAAAAATTTAATAAAAAAAATTGGTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1	+	chr3L	18555888	5'	-	jockey	4920	1	72.22
ACAAAGGGAGAGATAGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1	-	chr3L	21855561	5'	+	blood	24	2	66.42
TTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1	+	chr3L	4303849	5'	+	Tirant	40	2	62.96
GGTAATGGAGGCTCAATGGTCTACATGGAGTGTATGAAACGGGATACAACGTAAGGTTTTGTTATGAATAGATCTCAGGAACTATACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAAC:1	-	chr3L	26011212	5'	-	F-element	4566	1	56.52
TATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAAT:1	+	chr3L	10574311	5'	-	Tabor	7235	2	76.03
AGACTTGCATTCCCCTTAGGGAAAAGTGGACACAACTCGCCAGCGAACTAGCAATATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	-	chr2R	7452939	5'	-	pogo	2039	1	62.33
CTCCGAAGTCTTTGAATTTTTTCGTAGAAACTTAGCATAATGTACACAAACTAACATTACATTTTGTTACCCCAATGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCA:1	+	chr3R	22824278	5'	-	mdg1	7330	2	56.39
AAAACCGAATTTTTGTCCAGGTTTTGATTAAATAAAGCGCCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1	-	chr2R	20596585	5'	+	roo	8696	2	62.33
GCTCTTTGAAGTGTTTACTTGAAGCTTTTGTTAAGCAATTAGACGGCAAAGTGAAGTTGCGCCGAGGTGTTGTGTAATATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCACAAATA:1	+	chr3L	10848633	5'	+	blood	7064	2	49.32
CGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr3R	17817882	5'	-	roo	394	1	66.67
ATGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATAATAATGAATTCT:1	-	chr3L	25232857	5'	+	accord2	71	2	60.96
TGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAA:1	-	chr3L	26011939	5'	+	F-element	89	1	76.64
ATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTAT:1	-	chr2R	4774747	5'	-	baggins	5336	1	65.75
AGGGAAAAGCGGTTGCCTTATTTAACTACTGGGATTGGTATCCTTTAATCCATAATGGTTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1	-	chr3L	4605755	5'	+	pogo	14	1	74.07
CCAAAGATATTTCGGAAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr3L	14638583	5'	+	1360	37	1	59.12
CCCATGCAAACACAGTGGTGGGCATACTAATAGAAGCACAGGACGTGTGGTTAGCCATCCTGCTGACGCATTAAACGTAAGTTAGTTAACTTCTAGCTGTGATAATTTATGAGCTTTTAACGGTGAAGTGTTAAACTGCTGAT:1	+	chrX	3486068	5'	+	transib2	163	1	65.03
AAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGAAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr2R	7898152	5'	-	roo	329	2	75.34
TTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGTGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1	-	chr3L	20033795	5'	+	blood	7040	2	48.06
GTGCAATCCTTTCACAGTCACTGCCCGCACACAGACAGATGTTGACACAGTTTCCTTGAGCTCCGTCTGAGCTCAGCACAAAATGTCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1	+	chr2R	9662676	5'	-	412	464	2	61.87
CCTTATAGTTTCTAAATCACAATGCTTATAATACGTTTTATGCAACTGCTAACCTGTTCCATTAACGATCAAGTCCCCCAACCAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGC:1	+	chr2R	2843250	5'	-	1360	487	1	62.88
CACAGAGAGAAAAGTTTGCTTGCTTAGTAAACAGTATACAAAATAATATTGATTCAAAATGAATGACGAAGTTGATGTTGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGG:1	-	chr2R	23461919	5'	-	Doc	480	1	53.33
CAACAACCCGTGCTAAACGATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATAT:1	-	chr3L	7943764	5'	-	Burdock	6384	2	76.71
CACAGGGCAAAAATCGATTAAAATTTAGGTCTTAGTTTACTTAAGAACATAACTATACTTATTCTGTGCCTTTGAGCTTTCTTATATTAATGGATGACGTTTTGCAAAAACGTAGCGATCCAGTCTGCATGACCGAATTCGGGC:1	+	chr2R	7371606	5'	-	Doc4-element	452	1	47.92
ATTCTGTATTCCTCTTTCAAACACGCGATTTCCGAACCAATTTAGACACTTTATGTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAA:1	-	chr2R	8624854	5'	+	Juan	4093	1	60.96
GAAAAATGTCAAATGTCTTTGTAGTTTTTACCATAAAATATTCATGTAAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr2L	18294134	5'	-	roo	392	2	56.16
CAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chr2L	11674423	5'	+	jockey	36	1	53.92
CAGGCGTCTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTCCTACATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTA:1	+	chrX	4214935	5'	-	flea	198	2	58.90
CGAAGGTCATGCGCTTGATTAGTCAGCGATTGGACAGAGCCAACTATTCAGAAAATTGGCAACGTTAATAGGAAACGCTAATAAGGAAACAAACTTTAAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATCGTTACTAA:1	-	chr2R	7703369	5'	+	copia	4798	1	66.44
AGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAATTAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1	-	chr2R	9662801	5'	+	412	44	2	57.03
ATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTA:1	+	chrX	18193683	5'	+	jockey	94	1	73.79
CCAATATCTATCGATATACCAACAAAACATTGTCCACGCCCGAACTCTTGAATATTTAAGATCTATCGATATCTCAGAAAAATTACGAAATTTCGCGTTCGTGTTTCCACTAGGTGAGTAACGGGTATCTGAAAG:1	+	chrX	23078698	5'	+	INE-1	547	1	62.22
ACTCATTTGGCCTGAGAGTGGCGAATATAATATGCATTTTGTTTGGTGTGTGGGTCAGAAGATCGGTCTGACACGATTTCCTCACAATTTCTCCACCCAACAGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGC:1	-	chr3L	2486520	5'	-	jockey	4612	1	75.74
ATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1	-	chr3L	18368995	5'	+	opus	7055	4	75.44
TGCTACAGAATGTGCACACAATGGCCAACACTATATATGCTATATGTACTATATCGATGAACGACAAACTAAAATTATAACAAAAATCAAATAAATTAAATAAAGTCTCCTCACCTAAAGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGC:1	+	chr3L	4593208	5'	-	diver2	358	2	76.03
ATTGGTTGATAACTGCTTGATTGCAGAGATATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chrX	13039602	5'	+	roo	8685	2	73.29
AACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:1	-	chr2L	15991388	5'	-	mdg1	7382	2	69.86
CACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAA:1	-	chr3L	5102498	5'	+	BS	4716	1	62.30
GGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATTTTATGTAAATGAATCGAGA:1	-	chr2R	19004224	5'	+	roo	57	2	62.69
GAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATTACAACCAACA:1	+	chr3R	17316250	5'	-	opus	442	2	68.50
AACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGATCTAAAAACTA:1	+	chr2L	17295857	5'	+	Doc	53	1	62.28
AAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1	+	chr3L	14603252	5'	+	jockey	56	1	50.00
CGCATAGCGCACAATTGACGATCGATAATAATCGCGCTGTATGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1	+	chr2L	14110748	5'	+	Quasimodo	60	2	72.59
ACAGGATTTCGTTGGGATTTCGTCATGTGGTGTCCGATCATTTGGCCGCTGCACTATGGGGCATTTGACCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTCGAAATACT:1	-	chrX	17431797	5'	-	hopper2	1534	1	63.70
CCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCC:1	-	chrX	21667927	5'	+	gypsy2	6546	2	66.40
GGGGAACAAAGCCTTATCCTTCTCCCATAAAGAATGTCAAAAAACCTAGCGACTCCTAAATGAGTGTAAGGAAAACACTCGCCGATCTACACATGAAGATGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCC:1	+	chr2R	18279946	5'	-	Tabor	310	2	47.95
TTTCTACCATATTCCCCTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCGAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAGCTAGTG:1	+	chrX	22596351	5'	-	INE-1	541	1	68.49
GACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTA:1	+	chr3R	23020794	5'	-	INE-1	552	1	61.64
TAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1	-	chrX	13504228	5'	-	412	418	2	73.91
CTAAACTTTTTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1	-	chrX	21014897	5'	-	copia	234	1	70.55
CCGGGCCACAATATTGTGAAAGGTTACATTACTCATAATAGGCACTTTCTGCGTAAATATATCTAACTCTACGTTCCACTTCAGCTTCTTCAGGTAATCCACTATGTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1	+	chr3L	11321354	5'	-	mdg3	5486	2	72.60
TTCTATATGCCAAAAGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1	-	chr2L	16092022	5'	+	roo	8698	2	63.01
CAGTAACAACAACGTGGCACTTCGGCAACAACAAATCGGTGCTACAAAGCAAAGCCAATGAATATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1	-	chr3R	14980785	5'	-	mdg1	376	2	53.38
AACAATATTTTTCGTATAAAAATAAATTCTTAAAAAAGAAAAAAAATTGAGTATTTTCTATAAACGGAGGTTTCGGAATTCTTTATTGTGTTTTGTTTCCTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTT:1	-	chr3L	11578229	5'	+	Cr1a	245	1	47.26
CTGCAATTTCCACAGTGGAACCAGTGGTACCAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1	+	chr3L	17205224	5'	-	hobo	2907	1	68.97
AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGA:1	+	chr2R	2007459	5'	+	1360	18	1	62.50
GAGTAAATGAATTATTCATCTTCCTTCAAGGTGTCAGCACTCCATTCTTCCCAGCTCATCGTTAATCCAAATGAATTAAGATAAATTTGGCTGATAAATGTATTTTATATATTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATTCTG:1	+	chr3L	9288632	5'	-	INE-1	26	1	63.45
ACTGAGAATATTTGTATTTAGCCTACCGTGATTAATATCAGTAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAG:1	-	chr3R	19448922	5'	-	roo	8654	1	71.23
AACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAA:1	-	chr3L	22968424	5'	-	mdg1	7391	2	63.70
AACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:2	-	chrX	23439050	5'	-	P-element	2495	1	64.23
ACCAGTTGGGTAAGATAAATTTCTTGCCCGCAAAAATCGATATTGAAAATAAAAGTAAATAAATACAAGACACTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGAACAACGCATACAATTCCATATACATACTTATAAACATACTCATA:1	+	chrX	20812536	5'	+	ZAM	8164	2	50.68
TAAACGCGTTCCAGCCGACAGGAGGTCCGTTGTCAGGGAAGAACAGGACAACGAAGACAAGGCGTTTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGCTTGTTGAGCCACACCCACAGTTTTGAAAAATGTGTTG:1	+	chr3L	24566609	5'	+	INE-1	259	1	50.39
ATAGATATATAATATATATAATATTCATATCAGAAATACTTTTTATATTATCAAGATGCAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAG:1	-	chr2L	5020555	5'	-	HMS-Beagle2	7130	2	60.96
GCCTTATGATAAAAACCAGGCGTCAATTTATGCCACACAAAACGACTATCCCATCTACTCGTTATATGTGTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1	-	chr3L	7188639	5'	+	hobo	25	1	66.12
ATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	-	chr2R	14387998	5'	+	roo	67	2	72.31
AGTTCGGGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1	+	chr3R	18272131	5'	+	1360	39	1	68.00
AACAACAGGCATATCAGTTTGCCACTTGCCGAACTCTTTCCGTTTTCCCAACTCTTTCCAGTTGTTGTTGCTAAGTGACAAATACAACAACAACAGCATCCAGATCTATATCGACATACACACACACACACATCCATAT:1	-	chr2R	14659441	5'	+	Quasimodo	39	2	69.06
ATTTAAAATCCCAATTTTTCGTTGATAGACACTTTGGCTTTCCGACTCATTTAGTTTTAAGAAAGAATTACTAATGTTATATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1	+	chrX	21509873	5'	-	pogo	2067	1	62.33
ATACGATAGGCAAATAAAAAGTAGCAGAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACCCTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTT:1	-	chrX	3308359	5'	-	hobo	2885	1	66.67
TAATGAGATAACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1	-	chr2R	7898183	5'	-	roo	9024	2	54.11
AAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTT:1	+	chr3R	14651242	5'	+	P-element	93	1	15.56
TTTTGCACGAGGCACAGAAGCGTTCTGGCCAAAATATTCGTGTCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1	-	chr2R	16641247	5'	+	hobo	66	1	66.42
GATGATGGCCTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1	+	chr2R	19050173	5'	+	roo	2	2	73.27
ACCCGAAAGGAAAAAACACAAAGTCCCAACTCTTAACAAAGGGAAAAGTCTAATTAACCACATAAATAGGCAGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAA:1	+	chr3R	803627	5'	+	G5	4622	1	54.11
ACAGGCCTTCGGCTTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chr2R	7898057	5'	+	roo	17	2	63.16
TGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3R	25448350	5'	-	roo	333	2	68.49
CATACTTTTTGGATCGAAAAACTTAACGAAGAACCGGAATCTTTCACATAAAGAGCTATTACAACCATTGTTGCATAGTAAAGCTTGTTATATATACTAATAAAAATCATTTTAGTTATGCATAATGTTATTGGAATTTAAAAAAA:2	+	chr2L	1627523	5'	-	FB	190	1	75.34
GAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1	+	chr2R	23266044	5'	-	mdg1	7374	2	75.86
CTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTG:1	+	chr3R	28758311	5'	-	mdg1	7384	2	69.18
TATTGAAAACCAATCAGTTTGTCATGGCGAAAATCTCCAGAAGTACTGTGAGTAAATATGCTGGCATGTTCTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTACACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAG:1	-	chr3R	20499858	5'	-	mdg3	5445	2	50.00
GGGTATAAAAATATCTTACTCCACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1	+	chr2R	3065922	5'	+	P-element	52	1	43.85
TTTCGGTTCCGCATTCCATATGGAACGCACTTGATTGTATCGTTTGTACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1	+	chr3L	11441676	5'	+	roo	8672	2	78.62
CTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGCG:1	-	chrX	21585427	5'	-	mariner2	263	1	40.77
ACCATTTTCTACATTCCCTCGCTCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATC:1	+	chrX	6499862	5'	-	Quasimodo	257	2	67.44
ATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGGATAAGACCACATATACTTACACAC:1	-	chr3R	25454128	5'	+	Quasimodo	23	2	52.94
AATGTTCTAGCCTGCATGTGTATATACATATCTTAAATAGACATTCTTGCGCTGAACCTTTCACTTTGTGTGTGCCTTATTTAAGTCACCTTTTCCTGTCTGCAATAACCTCCTCTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAA:1	+	chr2L	13887910	5'	+	jockey	4820	1	77.40
ACTTAAAATCAAACTAAAGTTGTGTTCTTCAATATATATAATATTATAAAAGTGTAAAATTTCTTTCAGTGTCATAACTAATTTCGCTGAATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCTATTATGAAAAGTCTA:1	+	chr2R	22520744	5'	+	GATE	178	2	52.99
AGGACGNCAACACCCTGCTCCACAATGTGCTCCTCAAGCAGTATCGCGAAAAGGTGCAACGGCTTCTTGCTCAGCAGGAAAAAGGGTGAGAATCTATCATTGTATTAAATCAGAATGCTTAGTTATACCAAAGACACTAGAATAA:1	-	chr3R	18272266	5'	+	Tc3	238	1	74.48
TATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCACGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGCGTGAATAGAAAATATGTACGAAA:1	+	chr2L	13763164	5'	+	pogo	77	1	68.49
ACAAACAATAAGTACCCGGATTTCGTGCAAATTAACCAGTATGCCAGTCCGAGAAGAAACAAGAAAAAAATTCGATATAGTTTTTGAAATTTGAGCGAGGTCGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1	+	chrX	10639973	5'	-	roo	403	1	76.34
GACATGCTCATGTTCCTAAGGGCATATTAATAACACTTTTCCTTGTGATAGATGCACTTTCAATGCGGTTAAACACCTACATCTCCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGG:1	-	chr3R	26298100	5'	-	412	7364	2	51.72
GATCCCCAGCGTAAGCCTACCAAAAACAAGTCACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCATACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1	+	chr2L	15833421	5'	+	jockey	9	1	77.48
CTAAATTGCATGGGACATTCGTTGGTTGTATTGTCGTGACAAATGCTGTCTGGAACAATACGATGTGTATATATATATATTATGCATATATAACCATAATGTAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1	+	chr2L	1664913	5'	+	hobo	19	1	41.10
GGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1	+	chr2R	2016813	5'	+	1360	55	1	54.79
GCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTCTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1	-	chr3R	31817511	5'	-	roo	8980	2	81.51
GATCGATTAATTGGCTGATAAAATCAGGGGGATATTACGGTTACTAAATCGTAATAAAATAGAATTAGAATATAATGATTAATTTAAACATATAACATACAACTAAGCATAACCAAGGGGTTTCTTTAGAAGATTGATTT:1	+	chr3R	30205858	5'	+	Rt1a	5040	1	72.14
AATGACAAATGACGCGGCTGGTGGACTTGATGGGTGACACACATTTCAACATCATTTCGTGCATAATCATTTAATTTGGTCTTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1	+	chr2R	12812358	5'	-	roo	385	2	56.30
AAGAACCCTTTGCTTTTCCTGGGTCGGGCAGTCACACAAATCATAGGTTTGGTGAGACGAACGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGC:1	+	chr2R	5209593	5'	+	gypsy	46	2	53.03
TTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGTTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGAGCGA:1	+	chr2R	5617518	5'	-	invader1	3951	2	73.33
ATAGATTATACGGAATTATGACAAGCGCGTGTCTATCCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1	-	chr2L	21891832	5'	-	mdg1	415	2	73.83
GTTGTACTAAATAATTGTAGTTTAATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1	-	chr2L	17079886	5'	+	jockey	4691	1	73.97
GTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTA:1	-	chr3L	27391422	5'	+	1360	7	2	78.29
ACAACACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1	-	chr3L	26011949	5'	+	F-element	72	1	67.69
GGGAAAAGAGAAAGGTTCTTTAGAAGAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1	-	chr3L	15600386	5'	-	roo	408	1	71.23
AAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATGAAATAGCATATTAACTTATGGC:1	-	chr2R	16785401	5'	+	412	7093	2	64.00
AAAGCAGAAGAATCACACGACAACTACTTTCACAATTCACCCAACACACTTGCAGTCGAAATATTTCGAAAAAAGCTCAAATAAAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCTGC:1	-	chrX	3309602	5'	-	jockey	4964	1	64.62
GGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1	-	chr2R	9791682	5'	-	412	489	2	71.74
TAATTACTCTCTAATGTGACAACACCCATAACCATATTAATCACGTGTGACACCATAATAGAATAGGTAAGCAATAGAGGATAAAACACCCAGCGCTTTTGAAGGATGGGACATGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCT:1	+	chr2R	7453182	5'	+	pogo	1711	1	78.08
AGGACACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGAGATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1	+	chr2R	9791540	5'	+	412	7076	2	69.18
AAACGATTGTGCACGACCTGTACCAACTCGCAGTCTTTATATTTTTCGATGTGATGACGCAGGTAGGATTCATAGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCT:1	+	chr2R	16950945	5'	-	jockey	4695	1	50.68
CATCAGGAATATTTCAATGGAAGTAGGGGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGT:1	-	chr2L	7808867	5'	+	P-element	288	1	12.33
ACTTATGGGCAAATTGTTCCTCGGCACTTCCAATCTCAATTCCTGGCCAGCCATTGTTGCATAGTTCGTGCAGCAAGTGCTTGTTGCAAATAAATTGCACCACGGAGGGTCGGGCCGTCATCAGAT:1	-	chr3R	11130772	5'	-	R2-element	281	1	78.57
AAAAATTGTGGACATTGTCAATATTTGCATTGTGTCCCATATGTCGATTTGCTGGTCTCTAAGTTTTCGGGGCTCTGTAATTAGCATTTATGTGTGTTTGTCTTAGCCCAAAACGACGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAA:1	-	chr2R	14787923	5'	+	F-element	4533	1	77.24
GGTGAGGCTAGTTCCACAATGCAAACTTTGCCAAAGCAACGCTATAAAGCAATTTCCTTCAAGTGGCAACAACAGGAAGGAAAATAACCCGGCCAACTATAGCAGCTTTTCACAGAACAACTTGCAGCTATTTGTTACATTTTTTT:1	+	chr3L	26743629	5'	-	invader2	4762	1	71.92
CAGCTCGTATGGCCGTATGTTGAGCAACGCCCGTCCGCCGATCTCCTGCTTGGAGAACTCGTACAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCAC:1	+	chr2R	17419156	5'	+	gypsy	7249	2	64.76
AAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1	+	chr2R	9791570	5'	+	412	7106	2	56.16
TTTTCATTTAATTTAATTGAAACACACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTG:1	+	chr3R	28624540	5'	-	roo	9031	1	56.94
GGCATTTGTCGCAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	+	chr3R	22844134	5'	+	roo	6	2	76.43
AGGCAACTAATTTAAAGCTAATTGTTTCAGTAAAAAGATTATGCGGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACAC:1	-	chr2L	22121696	5'	+	gtwin	6916	1	69.18
ACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGAGTTTTCCTTG:1	+	chr3L	21855429	5'	-	blood	7363	2	60.68
TGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAATTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTT:1	+	chr2L	14892213	5'	-	transib2	2764	1	62.59
TTAATAAACGTATTTGCATTAAAACTGTAATTCATTTTGCGATTAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATTGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCAGATCGATCTCATACTCG:1	+	chr2L	11985779	5'	+	G6	1689	1	50.88
ATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr3L	21818055	5'	+	roo	8743	2	75.34
AATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:2	-	chr2R	9632187	5'	-	roo	339	2	64.14
ATTTCGGTGCGTCAAATGCAGGGGCATGGCGATTTATTTGTGCCGCATTCCTTGATTGTTTCGTTTTTACTTCGACACCACACATGCAAACAAACAATGACACAGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGG:1	-	chr3R	29656344	5'	+	Bari1	27	1	75.69
GCTTGGCACAAATGTGAAAACCAAAACGAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1	-	chr2L	11661068	5'	+	F-element	22	1	64.38
GGACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chr2R	12835017	5'	+	jockey	14	1	74.29
AATAGTCGAATAACCAAAATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1	-	chr3R	19529214	5'	+	jockey	4678	1	50.00
TGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATG:1	+	chr2R	9791592	5'	+	412	75	2	71.23
AAACAGTGACTGAAACAACGGCGGATGCCTCGAAGCGAGCTAACTTTTTCTCATTACACGTTGCTCACACATGAACACGAACATCTTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr2R	21908015	5'	+	roo	8683	2	56.44
AAAGTGAATTTGTGAACCCTCGTCGCGTGGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1	-	chrX	8543560	5'	-	roo	9031	1	56.16
ATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATAC:1	-	chrX	5437560	5'	+	Quasimodo	59	2	59.59
AGGCATGGGTATCAAAAATTCGAATTACATCTCAACCAGTAGATCATAAATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCA:1	+	chr2R	16945221	5'	+	jockey	6	1	78.08
AGAGAATTTAAAACAATATTTACGCATTGCAAGTGGCAACGGCAATGGCAACAGCAACAAAAGCCCTGCAAAATGCCAAAAATGTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTCTGCATGCACAGA:1	-	chrX	8347919	5'	+	Cr1a	256	1	56.16
AATGAAATTCTGAAAAATGTCAAATGTCTTTGTAGTTTTTACCATAAAATATTCATGTAAGAGTCATGTCAAATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1	+	chr2L	18294123	5'	-	roo	403	1	56.16
ATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1	-	chr2L	6623031	5'	+	Burdock	62	2	64.29
GCATACACGGGATCCTATATTTATACAATGTATTCGCATTTTGCTTGTTATATGATTCAATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATT:1	-	chr3R	15364019	5'	-	flea	4955	2	59.59
GTAAATATCTAAATATGTATATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCG:2	+	chr2L	11732215	5'	+	Doc	4	1	72.60
TTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACT:1	+	chr2L	14588754	5'	+	1360	371	1	57.86
TATTAACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1	+	chr3R	6290929	5'	+	Doc	20	1	71.32
TCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCCTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr3R	18339183	5'	+	roo	8728	2	65.07
ACTGCTGTTCATTGCCTTCAAAACTTCCAAAAAATATACCACAATACAATACTCAAATTATATTATAAAAAAAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGATTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAATTA:1	-	chr3R	1221652	5'	-	Cr1a	3987	1	52.05
AACACGGAACTAATCGGCGACTACATCGCCAAAAGAGAGTACTCGGTTTGGGGTTTCCTTTTTGGTATTTTTAGCTATGCTATCAACTATCACATACCCGTTACTCAGCT:1	+	chrX	4125754	5'	-	INE-1	545	1	74.55
ATAACTCACATAAACTCAAGACATGGCCTGCATTCGCCACACTACACAAATATCATCGCAAACGAAGCCATAACTGTGGTAAAGTGATCGATACGCCCTCTCAGAGTCCTGATCTGAACCCCATTGAAAATTCGTGGGCTTACTTA:1	+	chr3R	23311043	5'	+	S-element	1249	1	52.74
AAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr2R	9328626	5'	+	roo	8737	2	78.74
CTATGTTTAAAATTAGTGTGAACTGTCGATTTTAATTTACATGTTTGTACACACGATACATACAAATATAAATCTTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGT:1	-	chr3R	12439396	5'	-	Doc	74	1	53.10
CTTTACTCACTCGCATAAGTCTGCGGTGCGGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAACGCTCTCTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACG:1	+	chr2R	1523189	5'	+	1360	169	1	76.92
GACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCC:1	-	chr2R	4601625	5'	+	HMS-Beagle2	6964	2	75.34
ACCTTAAATGCAGTAATCACGAGGCATTCACATATGGATAAAAACAGTCAATCAAATAAATAAGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTATGCACACATACAGTTGTCTGCTATCATTGTATGTGTAG:1	+	chr2L	18326540	5'	-	1360	149	1	58.90
ATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1	+	chr2L	17295842	5'	+	Doc	64	1	58.57
ATCATCAATTTTGCTGCGTCGTCAATAAACAGAAAAGCGAGAAAGTTGCCAGCAAAAGCAGTGGAATGTGGAGGGGGGAGGAGGGGTTGGTAGTGAAGAGGAGGACCCTGGTGGGGGCTCGTCCAGGCCTAAATC:1	+	chrX	8938297	5'	+	flea	278	1	78.52
ATTTTTTAATTTTAATTACTGCCAGGTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTTATCATCTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCC:1	+	chr3R	6611221	5'	-	HMS-Beagle	168	2	76.52
CTGTGGATAACATTTTAATGGAATTTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTCAGCATACAGA:1	+	chr2L	18159014	5'	+	INE-1	175	1	49.65
GGGGAGCATCACATACGACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	-	chr3R	17316330	5'	+	opus	55	4	63.64
TTTGATGGAGTAAATAACATCTGTTAGAATGAATATGACCAGATGCAGTGTGAGTTCGAGCACCATTTCAAAGTTCTAAGCTAGCTTCACATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGT:1	+	chr2L	21963766	5'	-	Quasimodo	6957	2	61.64
ATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACC:1	-	chr2R	21298801	5'	+	jockey	241	1	60.00
AATTCCTTTGTTGGAAATTTAATTAATCGAGTTACGTTAGTGATTTTTTTGCTTAATTTTTTTATTTAAATTGTTTAT:1	-	chr2L	7395046	5'	-	X-element	4717	1	32.05
GCATTGTTGACTATGCGGGGAAAATGCACATGCACCCATACATACTTACATACATGCACACACAGACACACACACACATACACAACCA:1	+	chr2L	15157299	5'	+	Quasimodo	42	2	62.50
ATACAGAGCCGTCGAGTTTGTTTCGCTCGGATTGCAGCTGCATATTTGACGGTTGTGTATTTTTTGTAGTTATTTTTTTTCATTTTTTTTTTTAT:1	-	chr3R	26828409	5'	-	gypsy7	5002	8	66.32
GTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1	+	chr3R	17817897	5'	-	roo	9037	1	57.01
GTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1	+	chr2R	6086319	5'	+	pogo	31	1	58.72
GAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1	-	chr3L	17560388	5'	+	pogo	54	1	55.48
GGCGAGTGAATCGAAATAGTAAAAATTTAGGAAGAACATAGTTCTCATTGCTTAGTAAAAAATAATTAAAGACGTTTTTTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1	-	chr3R	6289991	5'	+	Doc	87	1	57.53
GAAATCGAATGAATCCGTCGGGCCATCCATTTATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1	-	chr3L	17115578	5'	+	blood	7	2	76.56
ATTTAATGAGTAACTTGGACAGTACACACATATTCGAATTTATTACCCTAATGCCGTACAAGAACCGGGACGCTTGTCAGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCT:1	-	chr3L	14612469	5'	+	R1A1-element	5280	1	54.79
ATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1	+	chr3R	19968079	5'	-	roo	9041	1	60.45
CCCCAAACTTGCTACCGTGACTCGACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1	+	chr3L	7588390	5'	-	hopper	1370	1	53.42
AAATTCCTGGATTTCAAAGTCTGGACAAGCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGCGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCAC:1	+	chr3R	11514971	5'	+	I-element	91	1	76.15
CAGTGTGAACCCACAATTTAGGTGAGTTTTCGTCTTAGTTTTTGGTATCCCCCTCTCCAACCCATTGAATACTTTCTTCAGCCACGTACCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1	-	chr2L	7810161	5'	-	P-element	2856	1	64.14
GGCACGGTTCAGTACTCATAGCCGCGCACTCATCTACTCAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAA:1	+	chr3R	18582296	5'	-	roo	424	1	70.90
GAAGAATGTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATNNCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr3L	15600361	5'	-	roo	394	1	57.04
ATGCGCCGTGATTGTTAACATTTTAACAAGGGACAGTGATAAGTCGTTACATCGAGAAATCAACAAAGCTAAATAAGAAAGTGTTTTCTAACTAAGAAAAAGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCAT:1	-	chr2L	12436351	5'	+	F-element	4391	1	62.76
CTGGCGTTGCTATTTTAATTTTAGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	+	chr2L	14771990	5'	-	roo	394	1	73.76
TTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3L	4536676	5'	-	roo	9026	1	50.00
CAATGTGAAGCCCTGCCCGCCGGAAGATCCCAAGCCAGTCATCCAGATCAACAAAGTATGTAACATGCAAAGGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCTGGATCAATAGC:1	+	chr2L	21717108	5'	+	INE-1	86	1	58.40
CCTAGGGCTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGCGAAGCCGTTTTTATCGTGCCCCGCACAAAATCGGTTGTCTTGAGTGTAGTGA:1	-	chr2L	11661027	5'	+	F-element	62	1	42.07
AAAGAGCATCGAGTCCTCAGCCGATTAAGGGTTGCTGCCCTGTCGATCACCGGCTTCAGGACCACGTCCAGTATCTCGCTGAAATATTAGTTAAATATGAGTCAAAACGCAATCGGTCATATTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	-	chrX	23317674	5'	-	mdg1	7396	2	72.34
ACAGGTCGAGGCCAACTGTCACACAGGTTTGACACGGTTCGATTATTATGCTCCAATCAACGAGCTTCAACCACACACTTGGCCGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCA:1	-	chr3L	26570204	5'	+	invader6	4531	2	55.86
GAGCAAGAAGAATGTGTACGTGAATGCAGCAGACAGTTGGCATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGTTTCTGCCCATGTTAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATATGGCC:1	-	chr3R	4508621	5'	+	INE-1	101	1	65.38
TTTTTATGCCAATAACATAACTATATGCATAATATGAAATGCAAAATAAGGTTTAATTCACAGTGGAAATTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAACATATAAAGCTTATTTAAATTATAACGTAAT:1	-	chr2L	8343250	5'	-	Copia1_DM	8	1	54.79
TATCGTTTCGTTACTGAAAGCAAAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	+	chr2R	20596464	5'	-	roo	9004	2	64.83
AATGGAGGTAATAAAATGTAGGCGAAACGTTCCACTTTTAACCTACATATTTTACTGCCACAACAAATAAGGTACTTGATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTC:1	-	chrX	10638726	5'	+	roo	164	2	50.00
AGCACGGAGTAAATGACAATTTTGTCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGCATTTTAGTATTAATAC:1	+	chr2R	16891829	5'	-	hopper	1353	1	56.85
ACTCAAAGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGCATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACCGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGAC:1	+	chr3R	23020778	5'	-	INE-1	568	1	66.44
ATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1	-	chr2L	7898410	5'	-	roo	9035	1	59.15
ATTTTCTATGTCTGCTCGCTAGCTCAGAGAGTTTGTGCGAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGA:1	-	chr2R	5209671	5'	-	gypsy	410	2	66.96
TTTTACGCATTTAGCCGCCGATTTCTTGACCTTAAACTTTAGTTAACACTTTTATCATAAGTTTACATAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1	-	chr2L	588452	5'	+	FB	40	1	51.54
CGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1	+	chr3L	17558023	5'	-	jockey	4931	1	69.17
TGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGG:1	-	chr2L	7945385	5'	+	roo	92	2	80.14
CATTAAAATTTCACACATTCGGCGGTAAAGAAAACTGTGCTCCATTTACCTTATTATGTATGCGCGATGTCTGATGTTGTTGGCTTAATTACAAATATTTTCAGAACCTCCCTGCATCAAATTCCGAAGTGAATAAATAA:1	+	chrX	12563582	5'	+	invader4	3056	2	62.86
CACACTTCGTGGCAGTTTTTCCTCAGGGTGTGGGCCAAACACTTTCCGCACTGAGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1	-	chr2R	13006562	5'	+	3S18	5772	2	80.60
GAGAAGTCATTTTTATTGCCAAAACAACGTTAAAAGGACTTAAAAAATTATTAACGTAAAATTATTAGTAGTCAAACGCGCACTGGCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATA:1	-	chr3R	3750446	5'	-	invader2	4677	1	73.60
AAATGAACACCAGAGCTACGATTGAACAGTGGATGCAACATTGTGTTATTTCCTTATTATTTTATTATATATATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCACGATATCTGCATTATTT:1	-	chr2L	13584761	5'	+	pogo	40	1	56.12
TATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGT:1	+	chr3R	25339982	5'	-	mdg1	7385	2	67.81
TAGCGGGTTGTTCGCTCTACAGCCAAGTCGCTTATTCACTGCTTTTCGTAACATATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTCTGAAGATCGCAAGCGATCGTTTATTGCAAATTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTA:1	-	chr3L	23728733	5'	-	HMS-Beagle	6976	2	59.59
CGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGACATATCTTCG:1	-	chrX	6486813	5'	-	roo	355	2	54.11
ATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCAAAA:1	+	chr2L	21367206	5'	+	Doc	48	1	49.63
ATGCAAGCCCATAAAATTTGTGTTGGCTGTATGGCTTCAACAAATTTGTTGTACATCAGAATTGAGAAAAGCGCGTAAAATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCT:1	-	chrX	13704891	5'	+	invader4	2792	2	59.42
AAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGG:1	-	chr3L	23702261	5'	+	G4	57	1	53.42
ATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1	+	chr3L	22863405	5'	+	412	7141	2	77.40
CCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	+	chr2R	13084614	5'	+	roo	75	2	78.46
AAGGAATTCGGGCAATTGTCCCCCAAGGCAGTGTCCTTGGCGCTCTGCTATACAATGCATACGCTGTCGACCAAACCAAGCCAACCAGCGCCTCAAGAAATATTATAGG:1	+	chr3L	25847779	5'	+	G7	764	1	65.14
GTTTAGATAAGCGAATGACTCACGATAAAAAATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1	+	chr3L	4536633	5'	-	roo	9069	1	78.08
AAGCTTAATTTAAAATGCGACGAAGCGTGGCACACACACACACAAACACAGAAAAAATCCGGAAAATGCCTCGAATATTTCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1	-	chr2L	1839341	5'	+	hobo	31	1	61.19
AGGAGTTCCTAGAACAATCGTTAACGAAACTAATGAAACCTATTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATT:1	+	chr3R	2208310	5'	-	Doc3-element	4507	1	76.00
AGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	+	chr2L	12892641	5'	+	roo	82	2	78.57
CTCGTGGCTTCAGACCAGCGAACCCGCAAAGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	+	chr3R	31817421	5'	+	roo	8699	2	58.57
TCACAAAAAACTGCTCGATAAAGTGTGACCCTGGCTGCGGAATGAGCAACAAGCTACAGCAACAATTGGTGCGACAAGTTGGCAGCACGCACACACACAACACTCTCTCGCTCTCTCTCTCTC:1	-	chrX	18370888	5'	+	Cr1a	297	1	55.28
GTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	-	chr2R	11164484	5'	+	roo	66	2	75.38
GACATAATGCTCGTTGGCCAGAAATTAAACGCACACATCGATTATTCACGCCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAATAATGTGTTTTTTACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAAT:1	+	chr3L	7588413	5'	-	hopper	1355	1	61.59
AGCAGTTGATTTCGTTTAAACATATGTATCACCCAGCAGCCGCAAAAACCTGAATGGCAAAACATAAAATGTAACAAGAGAGAATGCTATAACCTTGTTCCCCAACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCAAAC:1	-	chrX	22838781	5'	-	INE-1	530	1	61.11
GGTTTGAAATACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAATAATCATTGCCTTATTAATTGTT:1	+	chr3L	24996078	5'	-	1360	439	1	59.59
ATTATGCGAACAGGCCTGCAACTCGGCGCTTGCATTTTTTTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1	-	chr2L	15833511	5'	-	jockey	4956	1	61.54
ACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1	-	chrX	22511442	5'	-	1360	3354	1	52.74
GTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	-	chr2L	18419260	5'	+	412	7095	2	51.03
ACACTTTTGAACAATTTTTAAATGTTTTCTCATATATTCCCCAAATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGT:1	-	chr2L	22211210	5'	-	Burdock	6318	2	72.60
GCAGATGATATGTGAAATTAAAATTGAATTAGAAATTTAAAGCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1	+	chr3L	715490	5'	+	412	7069	2	43.70
GAGACACGTATCCTTCGCTGTGAGCAAAACCTCCAGTGGAGTTCAGTATACCAGAGATGCGTTGTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1	-	chr3L	11957224	5'	-	blood	7332	1	57.53
AGGAAATAATCATAATAATTAATAATCAAATTTTATGTGTAACTGTATTATTTACAGTTCTACAACAGAAATATAATTTTGATCTTTAATTACTGGTTTTAAGGTTTTTACTTTTGGCGTATACAAAATGTTTATTTATTTTTATT:1	-	chr2L	12389157	5'	-	mariner2	830	1	78.77
AAATGTACCGACTTTTCATTGCAATTTTGTAGGTTAAAACAACACAGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3L	21818057	5'	+	roo	60	2	70.54
AATATTTCATGTTTATTAATGGGGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAGACTAATTTTATTTGGAAACATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1	-	chr2R	18349368	5'	-	roo	8991	2	79.23
TATGCAGTTTTCAAATAAAGTTTGGTTGCGTGACCTTTGTGGGCAATGACAGCTGCGCATCGTCCACCAAGTCCTGGCACCGCTTTTGAGGAATTTTACT:1	-	chr3L	16087636	5'	-	Tc1	1256	1	78.00
AGGGGATGAATGTGGACAACTGAGTGTATTTTGTATTGTATTAGAAAATGTGACAGAGGAGAGCGGCATTCTTGGCGTTCGACATTAGCAATTATTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTAATATGTTTTGCTATTTCT:1	+	chr3R	28750346	5'	-	G4	3587	1	54.79
GATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTTAAGAAACTGATTT:1	+	chr3R	19968076	5'	-	roo	9037	1	59.57
ATTATAGGCAGAATACTAAAAACCTTTTGTATTGTCTTTGTCCTTTGAATATTTAAGTATATATTTGGTGCGAATTTTTTAGTTGTGTTGTCTATTGTTGTGGAAGATCGAGAGGGTGTCTCCTCATGAGACGTCTGCTTGTT:1	-	chr2L	23005785	5'	-	G6	1863	1	62.24
GTGTGGACTCAACTCCCCTTTCCCGCAGGATAATTATGAGCTATGCATGGGGAATGGCGGGGCCACAGTCTTACCAAAGACACTAGAATAACAA:1	+	chr3L	20888690	5'	-	Tc3	312	1	74.47
CACCGGACAGTGACACACCCCAGGAAAAAATACAAGTATTTTTGGGGGGGTGGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCG:1	-	chr3L	24039777	5'	-	gypsy5	6983	2	62.07
ATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAA:1	+	chr3R	6290980	5'	+	Doc	68	1	73.81
CGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAA:1	+	chr3L	1534536	5'	-	pogo	2044	1	68.80
ATTGGTTGGGTTTGTTTCTGTTTTTTATTATACCCATTACTCGTAGAGTAAAAGGGTAGACTAGATTCGTTGAAAGGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAAAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAAT:1	+	chrX	16541456	5'	+	INE-1	91	1	75.34
AAATCCCCGCCCATCGGCAGCCCGCATAAAAATACTCGATGACAGGACCAGAAATGTCTCGGTTATGGGGTCTGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1	+	chr3R	17531338	5'	-	1360	3384	2	74.51
CGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1	-	chr2L	15833094	5'	+	hobo	53	1	55.63
ATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGCCGTCATGCCACCTTTTTATTTCTTCTTA:1	-	chr2R	20496999	5'	-	blood	7321	1	65.03
CGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACCCGCGGCCT:1	+	chr3L	25340833	5'	+	gypsy8	323	1	76.61
AGAATCTTTTTCTATCATATTTAAATTTTACGACGTTCTCATTTTATAATTGTAAATGTATATAATGTAATGTATATGTATATATATATATGTCGGCGAAACAGCAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACG:1	+	chr2L	20117865	5'	-	invader4	3050	2	44.52
AAGGAAGGAAATGCCATGTCGACGCTAAAACTGGGTTAGCTTACATAACGACAACATTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCC:1	-	chr3L	2620039	5'	-	BS	4691	1	69.05
TGATACCACCCCACCATTAGTGTTACGCATTGAAGTCATCTCCTAATAAAAATATGAAAGCTTTTATAGTACTAAGATCTCGACGTTTATAAGGACATACGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACTC:1	+	chr2R	5477007	5'	-	INE-1	109	1	65.62
AAAGCAGAAACAAAACACTCAGAAAAATAACTGGTATATATATTCCATAGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGATATGT:1	+	chr2L	15247869	5'	+	Transpac	4943	2	67.12
TCGTTTTGTCGATCAGTCGATTTTGTCGATGCCGGCACCGCAGAATGCTGGCTAAGCCAAAGCCAGTCAAAAAATATTCAATGATGAATCGTTGGATACTGCGTTTCTCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCG:1	-	chr3L	20616591	5'	+	X-element	381	1	59.40
GGGCGATCGCATTTTGGAGATCAACGGACGACTGGTAACCGGAAAATCCAAGGAAGAGCTGCAGAACCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACTGATTTTAA:1	-	chr2R	11386299	5'	+	G2	3037	2	51.97
ATAAAGGCAATTTTTATTGCAATTTGCATGAATAAACTATTAAATAAGCATATAAATATAAATAATGTGTGTTGCCACAGTTACAACAACAAAAACGAGAATAACGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGT:1	-	chr3L	2841044	5'	-	copia	240	1	71.72
AATGTTAAATATTCAGGCTTCCCTAAAAATGAAAATCACACGTTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTCGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCT:1	+	chr2R	9499956	5'	-	G5	4798	1	56.20
TTTTTACATACGAAACATAGAAGCAAAAAATTATTTAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1	-	chr3L	4605697	5'	+	pogo	46	1	71.56
TATTATTTCCGGATATTAACTCACTTTATATTTTTTCAACAATCAACAAGACACACTAACACCACACGTTACAACACAAGACCGCACCGACAAGTGTTTCTTATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCG:1	+	chr2L	15247595	5'	+	invader1	196	2	66.90
AGGGAATCCTTTTTCGAGAGCTCCTGCCCGGAAATCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1	+	chr2R	21228969	5'	+	jockey	22	1	71.93
AAGAAATGTATACTTTTTCCGGATAGAGCTGTCTAGAAACCTGTTAATTTTTTTCTTTCCAAATCTGTATTCGGTTAATTTTAATAACTTGTCCAGTTAAATTTAAAACCAGAGAGAATGATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAG:1	-	chr3R	7040273	5'	-	INE-1	562	1	30.14
CTTAAATAGTACTTGTTTACGAATTGTGCCGTTGTATTTTTATCTTGGTATACTCGGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1	-	chr2R	3066009	5'	-	P-element	2839	1	49.61
GGGTTATTGAGATTTAGGGAATTGATTTTGAATTATCGTTTAAATTACTAAATGAAGCAGCATTAAAAGCGATGCAAAACTCAGTTAAAGACAAAAACCAAAAAAATGTACTGGCTCTTAGGACCCCGCTCTCAATAAAGCCTAGA:1	+	chrX	14325348	5'	+	G3	4134	1	62.33
AAAAGGTTCTTAACAAAAAATGTACATTTTTTTCTCTAAAAATAGAACAATTGGTATTTGAGTAATTACTCCCCGTAACTGTGTTTGTGATTAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1	+	chr3R	30248075	5'	-	Juan	4197	1	67.83
ATTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTT:1	-	chr3R	11496627	5'	-	1360	3345	1	54.01
TTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	+	chrX	9540009	5'	+	roo	8715	2	61.87
ATGTGGATGTGTCCTCCTTTGGTGGTTCTGTGGAGAGTGTGTCGTCTACTTAACACAATAAACACTCAATTTTCGAGAATGTTTTGTTTTGGATTTTGCCCTAACTATATCAATTGTTACATGGGTTACTACATTCTGGCAAACTG:1	+	chr2L	19686061	5'	+	mariner2	284	1	73.29
AGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCCCACGTGTGCGCACATAGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCTACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCG:1	-	chr3R	4571527	5'	-	1360	30	1	55.26
ACAGAACCAAAAATTGCAAAGCGTGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATTGAGGGCACACTGTACCTATAAGTACA:1	-	chr2R	5485248	5'	+	blood	7035	2	68.49
ATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	-	chr2L	17471705	5'	-	roo	9041	1	58.46
AGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1	-	chr3R	20427457	5'	+	jockey	68	1	67.44
GCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1	-	chr3R	7835218	5'	+	roo	8711	2	54.81
TAGAGGCTCTTGCTTCTGCTGCGTTACTGCAAGCTGCAACATCAGACACCACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTTGGTTTGGCACATTGGTTTGGCACTATGCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTC:1	+	chr4	369825	5'	-	1360	3320	1	62.77
GTCGAGAGATAGCTTTGTGTTCACCAGCCCCTGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAT:1	-	chr3L	27292930	5'	+	roo	410	1	74.80
CAGTGTGTGCTGAACGCAGGATACACGGGTCTTCAACTTGTCCGTGAATGGAGTGTACTCGCCGCGGCACATGTCCTGGCACAAGTCCGGAATCTGTGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATA:1	-	chr3L	14866126	5'	-	blood	7168	2	72.73
AACATTGGATCTTGGAATAATCGAAATTTACAAAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1	-	chrX	14749716	5'	-	copia	244	1	54.79
AATTAATAAGAATCAAAGAAATATGGCTCAGTTCTCAAGCTGGCAAAATTGCATCCGAAACAAATGATGCCATAAAGCATTTTGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAA:1	+	chrX	19415095	5'	+	Tabor	249	2	63.24
AAATTATTAATAGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1	+	chr3R	18339032	5'	-	roo	9064	1	78.77
TACCTAGAACCGTTTGAGGAACTCCTCGGCGCAGGTGCGTGCCCTGGCATTGACCGCCAGTTTCATTTCGCTGATCTCCTTGTCGATCTCCTCCATGTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTT:1	-	chr2L	6125737	5'	+	FB	784	3	78.23
GCAAATTGAATAAATTAGATGATATTACTTTAATATATGACATTAGGTTTCCATTACCCATGTGCAGTGAGTTTGCATTATTTTGTTAATTGAGTTGATTGGTAATTGCATAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCAC:1	-	chr2L	2099543	5'	-	Stalker	7148	4	77.40
CACGGATGTAGGGGTGTGAAGTTTTTGGCATATTCAAAGTTGGAAAAGTTGCACTTTGAGGCTGCTAACCAAAAAATATAACTGTCTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1	-	chr3R	11084005	5'	+	412	7073	2	62.31
GATGGGATTAGGTGTGCAGGATTACATAGAATGTCGTGAGAATTTCCGCCAGCACAACCTTGTATCAAAGACACTAGANTAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTGTA:1	+	chr2R	8638682	5'	+	Tc3	316	1	60.00
ATATCTTACTCCACCACTGAGACTTTCTCATTCATGATCTTGCCGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACCCTTAAATTCAGTGCACGCTTGCTTGTT:1	+	chr2R	3065932	5'	+	P-element	63	1	35.88
TTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1	+	chr2R	24218522	5'	+	412	7090	2	52.03
TGGAAAGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGC:1	-	chrX	22715151	5'	+	Bari1	41	1	52.71
CAACATCAGCTCATTTTTATCACACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chr3R	18339211	5'	+	roo	8684	2	67.69
GGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1	+	chr3L	21817962	5'	-	roo	9024	2	53.85
CCATTGAATACTTTCTTCAGCCACGTACCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1	-	chr2L	7810100	5'	-	P-element	2802	1	23.19
CTGTCGTCAGATTCGGATTCTGGTGCTTAAATAGCCGGAGGCTTTCCACTTTGAGCACTGTCTGCATTTGCACATGGTAGTTGATGGTTTAAGGAAAGTCCAGACATTGGAGATGAAGTACATTTGACTCTGTTAATCATTACCTT:1	+	chr3L	15285454	5'	+	Q-element	333	2	48.63
GTCGGGAACTGTTCCGCTGAGAATATGTAGATGGTTCCATACGACGAGGTAATGGCCAGCTTTCCTATCATGGCGCAGGCAACGATCAGCCACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTACACTAGCTCAGTAACGGGTATCTGATAG:1	-	chr3R	24278272	5'	+	INE-1	547	1	61.64
TTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	-	chr3R	25448427	5'	+	roo	8735	2	68.49
CGAACTTAAAAAGTGGCAAGTGTTCATCGAATCTCTGGTAGCTCCAGCCTTAATGAGTTCTGTTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATAT:1	-	chrX	14336549	5'	+	roo	8685	2	71.03
GGAGACCAACTAGTCATCGACAACAAATGAACAAATCGCGTGCCATCGCATTGCATATAGTAAGCATTGCAATGCATTAACCCTCCATTGGGGGTTTCTCGTCTGATTAGATCGTTGTCATGCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAG:1	-	chr2R	22066434	5'	+	gypsy	133	2	79.45
CTTAAACACTTAGTTAACTGGAAATTTATGTATACCATATAATAACCTTTCAATGCATATTACGTATACGACACGTGAACAAGAATTTGAAGCAACGAAGCATTAAAGGAAATTTGTTTATTGATTTTGGTAAATAGGTAGACTAT:1	-	chr2L	18173675	5'	-	Tc1-2	1534	1	69.86
CTGGGCAAAATGCAGCAGCAGCATCGCATTCTTGCTGGTATAGACGGCAACGCCGACCTCCGCTCCCCATGCACCAACAACGGACATGAGGCGTTCGCCTTTCGACT:1	-	chr2R	7157049	5'	-	R1-2	2745	1	76.64
CTTGTGACACTTTTTTCACTCACACTTAACTGGCCACTGGAACTTTTATGTATAAGAATTGATCTGCCACTTTTCCAAGAGTATTAAAATTTTGTCGCAACTTAAAACCAAACCTTTGAATGTTCTGTCAAAATGGTATCCAATGC:1	+	chrX	15047568	5'	+	HB	454	1	76.03
GTGTGAGAGAGAGAGAGCGCCGAATGAGAGAGCGAAAGCTTTGCAGCAAACCTGTAAAACCGGAAAGTCATGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1	+	chr2L	12529802	5'	-	P-element	2845	1	51.08
AAAAGGTTCCATCAATATTAGTTTTAGAAATGAACATTTTTCTGTAGTTTTTTGAAAGATACTTTATAATTTGATCTACATCAACTTTTAATGAGTATACCAAATCTGCCAGCGGGCCACTCAATTTGGGGAATAATCGCTTTGCC:1	-	chr3R	26263090	5'	+	Ivk	212	1	69.86
TTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chrX	9540028	5'	+	roo	76	2	73.79
CACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1	+	chr2L	16091900	5'	-	roo	341	2	63.70
ATACTTTTCCGCACTTACTCTGCTGTTTCCGAATTTCTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCC:1	+	chr2R	22145508	5'	+	FB	85	1	74.66
GAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGAGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1	-	chr3R	25454103	5'	+	Quasimodo	42	2	55.38
AGCTAGCCTTGTTGTTGGTGCTGCAATCTGCATAAAGTTTCCATTGCCCGTGCAAACTTGTCTGCACCGACAAAAAACGGCTATATTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGTCTCTTTAAATTTATTGATGACATTA:1	-	chr3R	8113361	5'	+	hopper	337	1	57.64
AAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	+	chr2L	544766	5'	+	412	39	2	49.61
TTTTGATAATTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTACATTTCTATCGATTGACAAAAAAACCTTTTGCCACACACACTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAA:1	+	chr2L	23334736	5'	+	1360	196	1	52.05
GAGCTTTTTTCCGCTTACACAATCTTGTTTACACTCTTAGGATTTTTAACAGTGAATTAAGCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:2	-	chr3L	19334385	5'	+	roo	8683	2	72.60
ACAGTTCCCGAAATAACTCTATAATGCCAATATTTAGGAGTTATAGATTATACGGAATTATGACAAGCGCGTGTCTATCCATCGAGCAGGACAATGGACGAATGTCGCCAACAGACTGGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1	-	chr2L	21889767	5'	-	mdg1	418	2	54.11
GAATTATAGCATGAAATTTCTCTATAATTGATATTCTTTTGTTAACTTTATGTAGGATCTGATACTATTTTAATGAAAATAATTGTTGAAATTGCAATACTCAATTATTTATATTGAATGATCGAAATGGGAAATGAAGACAAC:1	+	chr2L	6151564	5'	+	G4	124	1	54.17
GAAACGAAATTACCTAAGGTAAAAGCTGGTGCATCTAATTTAATTAAAAAAATTTACAAATGGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	-	chr2R	25118779	5'	-	roo	9028	1	56.15
GTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCATTAGGAAGAAGCTATAATACTTGTGCCAGTAACCAGAATCAAAATTAAATTAAATTAAATTTAAACGGTTTAATTTTAAATTTAATTTTGAATTTAGCGCCCTAC:1	+	chr3L	25232921	5'	-	Rt1b	81	1	66.92
AGAAAATACGGAGAGAACGGGGCGGGAATAGGACAAGCACTTGGCCATTGCAGCCTGGCTAAAAGGTTTTAAGTTCTTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1	+	chr3R	27994162	5'	+	roo	8707	2	54.79
TCAAAAAACCTAAAAAAAAATATACGATATAAAAACTGATAATTTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACATCGGAGGGAAATAGGGCCGACAAGATCATTCGCTA:1	+	chr2R	23910694	5'	-	G5A	2645	1	61.67
CGTTGTGCAATTAGATGGTGAGCTGATGAATGCAAATTAGAATGAAAAGCGCACAGTGGAGCCAAAAATAAAATATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCG:1	+	chr3R	30344595	5'	-	pogo	2076	1	62.50
GGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTT:1	+	chr3R	19446130	5'	+	297	6635	2	58.90
CTCGACTTTCACTTGGCTGAGGCGAACTGATATTCACTTGATTGCTTGTTGCTTGGCTATTCAACTGATGACCCAGTCCGGCAACTCCCCCACTTTTATACCCACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTT:1	+	chr3R	20503548	5'	-	Doc	4408	1	75.86
GGCTTGGGGGCAGTCCTCTTCTTGGCCTCGATGTAGACCCGGCAGCCCTGGTAAGACGCAGGGTGCTATTATTTTAACCGCAGC:1	+	chr3L	26645835	5'	-	Tc1	5	1	73.81
TGAAGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTAT:1	+	chr3L	25782381	5'	-	Stalker4	50	4	51.37
ATGCTCCAATGCCCCACCAAGGAAAATATTTTGCATTTGGGCTCGGGATTGTATGTTATGCATGCCTACCCCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAA:1	-	chr2L	17081877	5'	+	jockey	4722	1	51.37
TTATAAAAGTGAAATATACACTTGATCAATGCAACACTTGGATCTACATATATAAATAGCTTAAGTCATTGTTAGCTTGTCAAGAGTAATTTGAAGCTCAGAATTACCAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGAT:1	+	chr2R	17629099	5'	-	opus	370	2	75.34
ACATTCCCACAAGACGCTTTTTCTCAATGAAGTATTTTTTATTGGGTAAATTTACGTATTTTTCACATTAATTTTACATTAAAAGGTTCTGGATTACATACGCTTTTTTTCAAGGGCTTTTCTACTTTTTAAATTTTAAC:1	-	chr3L	16496935	5'	+	hopper	1185	1	41.43
ATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTA:1	-	chr2R	19727744	5'	-	invader1	384	2	73.29
GCAGTTGCTGCTACCTTACAAAATAATTTGTATGCTTATGACTTTCTTGCGAACCGATAAGAGGACAGTCAAAGCTACAAATAAAAAATAGAATATTAACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACGAAA:1	-	chrX	334220	5'	+	diver	5742	1	74.44
TATGTTTTTGCGTAAATTTATCTAAATAGATATTTATGTATGTGTGAATCAGCGTTTTATGGCTGCGAAGCATTGCTGCCCGAGGACGATCA:1	+	chr3R	2950425	5'	-	Rt1c	5316	1	84.78
AATAAAAAAACCTGGAGTTGGCAGCAATCTAAGATTTAAAATAACTGAACAACAATAAAGTCGCGACGGTATGTATGTTTATTTTGTCTTTTACGTTACGTTTTCTTAGATATTTATGTATTTATTCGGTGAAATAAATGTAACAG:1	-	chr2R	12989064	5'	+	INE-1	17	1	43.84
ACAAGCAAAAAATACTTGTCCACATTAGTTTTTTTTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTAT:1	+	chr3R	26686032	5'	-	Juan	4118	1	78.77
GAAAACCTACTTTTTTTTATTAAGCTCTCGGTCTGAATTCGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTGTAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAAACACATAGTAACAGCCATACACA:1	-	chr2R	4103309	5'	+	Quasimodo	62	2	63.70
TCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACGACAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTCTAAGGAGATTAAGAAGAAAGGGATTCGCACAAACACCTGGACAACCCTAAAAACCCCCTCGAAATA:1	-	chrX	3731456	5'	+	BS	4960	1	51.37
CATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTACACACAAGTGCC:1	+	chr3R	26659759	5'	+	HMS-Beagle2	49	2	58.27
CGTAGAGGTGCGACACCGACGTATTCCTAATGTGCGATGTCCGTAAAGTTAATGGGGTTGTTTACCTTTTATTTATTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1	-	chr2R	4009148	5'	-	Juan	4166	1	52.05
CGCCGGGACGAACTCGCCGACAATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGCAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAA:1	-	chrX	21947740	5'	+	mdg1	53	2	52.74
GAATGTTTTATGAAAAAAAAAGAAAAGAGACAAAAAACAAAAGAAAAAATATGAAAAAAGGAGTAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCG:1	-	chr3R	27203087	5'	+	Idefix	259	2	53.08
AGGGGGGGTGAAATCAGAGGCGGCAGCAGGTGCAGGGAAACGTCGAGGGATGCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	+	chrX	5274245	5'	+	roo	8681	2	72.60
ATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1	-	chr3L	17558053	5'	+	jockey	4685	1	58.93
ATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGT:1	+	chr2L	544782	5'	+	412	51	2	56.80
AAGGCGAGCGCCAAAACGCGCAGGAAGGGGTGGGGGGTGTGGAGAGGGAAGGCGCTGAGTTGGATGGTGGAATTACCAACAACAGCGAAACAAAGGAACCAACAGTTTATTTGAATAAAGATTATATTTTTTTATCTTATAAAT:1	+	chr2L	845858	5'	+	Idefix	7373	2	72.22
CGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3R	22956039	5'	+	roo	8724	2	63.43
CGGTAAAGACGGGGTCGTTCGACTCTCTTGCCTTTGTTGTTTACGGCCAACTGTCAACGGTGTCAACAGCACGCTACAGACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAATAATGTGTTT:1	+	chr2L	2909627	5'	-	hopper	1393	1	64.84
GTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1	+	chr2R	9791600	5'	+	412	7119	2	73.64
TGTATCTCACTTCCACTTTGCGTGGGTCTTTCAAATTTCCAAATAAAAGTAACTAATGTGTTGCTATAGAGCACAAAATCTAATTTGCAAAGCAAACGCTTAGCTAATCTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATCG:1	-	chr2L	8776672	5'	-	Quasimodo	7207	2	49.64
AATTACGTCGCTTGATTTGCCTGATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1	-	chrX	6486821	5'	-	roo	9028	1	49.66
CACTATATATGTAGCCATGATAGACATAAGTAGGAATACTATCAACTGTGGTCTATACTAGTCAATAATCAGATAATGAAATAATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAATAAAGCATTTTTATTGATCAAA:1	-	chr2L	4954066	5'	-	Quasimodo	7333	2	61.11
ACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1	-	chr3L	17205280	5'	+	hobo	29	1	56.86
ATATATAACTTAAATATTATTTGCAAGAAATATATTCAATTAAAATCTGCTCCTTTATATTAAAAATATAGTTAAATTAACACCGTTCACTAAAGTCTAACCATCTAATTAACAGCATTATTAATTTGTTTCTTTTTTTTTAAATA:1	-	chr2L	3508433	5'	-	TART-B	10632	1	67.12
ACTTAACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATT:1	-	chr2L	12290781	5'	-	1731	4599	1	61.54
ACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTC:1	+	chr3R	22388978	5'	+	G2	2655	1	61.54
TAACCAAAATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1	-	chr3R	19529204	5'	+	jockey	4696	1	58.70
TTTAGAGCCCAATAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1	+	chr3R	25826639	5'	-	mdg1	386	2	59.59
AGAACTCCAGAAGAAGAAGTATAGAAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGCGGATGGCGGGATTTTCGTGGGAGGGATGGG:1	+	chr3R	22960221	5'	-	G2	2758	1	67.02
AGTGTAGGCAAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGG:1	-	chrX	22715146	5'	+	Bari1	63	1	60.96
CTCATCATATATTATTTATACATTCATCTAAATGCTAAGTGTTGCGCTATCGCCTACTGGTATATGTATAAAGTTAAAAATGAATAAAGTTAACCAAAATATCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACT:1	-	chr3R	25865734	5'	+	G2	2967	1	67.61
CATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGAGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGCATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1	+	chr2L	13585815	5'	+	Tabor	6874	2	54.48
GACAACTATTAAATTTTTAATAATTATTTAACAAATTTTAATTATGTAAACATAGTGTACTTTCTGTACCACCGCAAGATGCGTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1	+	chr3L	16015205	5'	+	1360	37	1	54.79
AAACTATATTTTTTCATTTCCTAACGAAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAA:2	-	chr2L	6623091	5'	+	Burdock	6143	2	80.69
CACGTCATGTGTTCTCAGGCAAATCGCAGTCTGAAGAGAAGAGATCAGAAACTTTGATATTTAACAAATGACTGATCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTA:1	-	chr3R	4357633	5'	+	Tc3	1665	1	65.60
ATCCATTTGGGTTGTACTATGAAATGATAAGGCATATATTTCCTTGAAAAACTTAGGACATTCAAATTGTGTTCTTTAGCATTTTTTGTATTACACTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCAGCTCT:1	+	chr3L	20255226	5'	-	1360	116	1	63.01
CCGTATAAGTATTTTTTGTTGTTGTTTTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCC:1	+	chr3L	23797644	5'	+	Helena	1149	1	61.64
CACCATCAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1	+	chrX	8543460	5'	+	roo	8740	2	73.57
ATCTATAAAAGCAAAAAGGCCAGAAGTGAAAGAAAATAGACTAGATAATTTCATTTAAAGAAAAGGTATAAAAATGTAAAGGTTCATGATAATCAAATCAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGTCGATC:1	-	chrX	21575453	5'	+	INE-1	96	1	61.64
GAATTGACAGCGTGTTACTTTCTCGCCAAATTACATGTGTTTTGCTGAATAAAATTAATAGAAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTTTCCACAAATTTTATAAAAAGGAGTTGAATTGAAGGTTTTAATTGAATTTTTTCCAAACAAA:1	-	chr3L	21434154	5'	+	Tc1	318	1	67.12
TGTAAGACAATTAAATTACAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTGAAAGACTTA:1	+	chr3L	15600150	5'	+	roo	15	2	51.97
AATTGGTCGTTCTGAAATCAGAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chrX	5643439	5'	-	roo	9046	1	67.12
TTTTTTTTTTGTATAATTTATTTTGCATTTGTTGCATAGCTTTGAATGTTCCAAATGATTTAACTTCATAGAGTTTCTATATATATATATATATATATATATATTTAGTATATACATACATGTA:1	+	chrX	2279407	5'	+	INE-1	63	1	66.94
CTTTTAATCAGCGCTTCGTGGCAATGAAAACTGATAGGTTGCGGGATGTCCTTTGGGAATGGGCTTCTGCTCTTGCTGTTTTTTTTGGTTGCAAAAATATTTAAATATGTAAATA:1	+	chr2L	5750589	5'	+	G3	4504	1	60.87
TTTACCATAAATGTTCAAAGACTCTACTTTAGCGATATAGAACAATATATCCCTTATAAAGAATATATATACTTTATATGCTATGCTCTATGTGGTAGAAATCGCTTCCTTCTGCAAGTTACAT:1	+	chr2R	5507040	5'	-	INE-1	30	1	43.55
GTGGCTCTGCAAATTGTAGATTTTCTGCTGTTCCTTTTTCTTTTTTTTTTTCCATTTCCTGAATCATAATTCTGCATCCTATAATTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTA:1	+	chr2R	4899057	5'	-	Burdock	63	2	79.63
AGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACATTGA:1	-	chr2R	8146100	5'	+	P-element	40	1	29.21
AAATTTTGTGTTGGATGTCAAGAGAGTGGGTGCCCAGTGCAGTTTATGTGCATAAAAAAACAACAGAAAACAGCATTAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTT:1	+	chr3L	21362684	5'	+	G6	38	1	55.56
ATCGTTGAACATATCAGCGCCGCACCTTGCCGGTTTCTAATTGTGAGCAATTAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGC:1	+	chr3L	26014288	5'	-	F-element	432	1	55.32
AGCACTTAGGTTGGGCAATTACCAATAGGCGGCAACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGCAAC:1	-	chr3L	10848715	5'	-	blood	7301	2	77.40
TAATATTTATTAAAAACATGACAATCAATCGTTAATTTTGTTGCTTTGTTTCCAGAAAAACTTAGTTTTTTTGTATTTTTGTTTGATTTTTTTTTTCTGTTTAT:1	+	chr3L	7438446	5'	-	Porto1	163	1	71.15
GTGGAGCATAGGAGACACGTAGGATAGTCTATCTTAATTGNACCCAGTGAATAGCGCACGTTCAATGTTTTAGGTTTCATTCTAGCCAAACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTC:1	-	chr3L	17366459	5'	+	Stalker2	111	2	60.71
GGGTGACAGAAGCGGCAACGGGAGCAGAATCAACCATTCGAGAAGGAGGATTGTAATGATGAACTCCAATTA:1	+	chr3L	10773071	5'	-	412	494	1	69.44
AGTGATGTATGTATATGCACAGCTCGGTGCCCCTTACTTCACACCCGATTCGAAACTAAATAAATATTTTTATTGTGTTTGTTTGAATTTTATTTGCCTGACTGCTGCCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:1	-	chrX	10201280	5'	+	transib2	12	1	78.77
CATGTTAAATTACACAAAACAGAGTCACTCCGCATTCACTCACACACACTCGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1	-	chr3R	22276760	5'	+	jockey	93	1	63.57
CTTGAAAAAACCAATGCAGTACTTTTGTCAAGTCATCGAGGGACCAGGACTATAATTTAAATATACGAATTTAAATATACGAATTGACTAAACCAAACACAAATATTGATAATTTCGGGATTTTACGTTGGTCAAAACCAGACACT:1	-	chr3L	14710413	5'	-	HB	225	1	64.38
ATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTCATTCACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATTCGGTCCGAATCTATTATGATAA:1	+	chr2R	3275418	5'	+	gypsy9	5065	2	45.89
AAAAATACATTTTCCCTCTGTTGTTTTTCTTATTTTTGGGGACTTTTCCTGCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGATC:1	-	chr2R	16373553	5'	+	Max-element	47	2	58.33
GACATCTTAGATCGCAACGAGACCAACGTTAGGTATCGCAAGCACAGATACCGCGTAGTGGAATTCCTCCCGGAGGAAAGCGTAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTA:1	-	chr2R	24974946	5'	-	invader4	2991	2	64.44
CCCCGCCTCCAAATCCTGGCAATGACTCTCGAAAATTGTTTAAAATGAAATTGTAACAGCAAAACTTACTCACGTTGCTAGAAAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr2R	8585403	5'	-	roo	9046	1	64.66
ATTCTAATCAAGCCAGAGTCCTGGGCAAATCTCCGCTGAAAATTAACCGCAGCAAACTGCCAGCCAGGGATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1	-	chr2L	11683882	5'	+	roo	8705	2	63.64
ACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:1	-	chr3R	25454118	5'	+	Quasimodo	26	2	48.06
TACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1	+	chr3R	5061815	5'	+	mdg3	5293	2	58.22
ATCCTCGAGTCAGCCTGCGCATCCCAACTGGTGCCCTCCGTTTGCAGTCCGATGATGAGGATTAGATGCCAAGGCAGGGGCCAACCGAAATGCCAAGGCGATCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1	+	chr2L	11048678	5'	+	297	6600	2	78.86
GAAAGTTAAGAATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr3L	21817933	5'	-	roo	396	1	73.72
AAACAAGCGAAAGAAAGCTAAAGAAAATGTTAATGGCCCTCGCTTTGCTATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTG:1	-	chrX	22715137	5'	+	Bari1	55	1	62.79
GCATAAATAAAACGATGCTCCACTGCACAGACACACAAACACACAAACACCACACACACACACACAAACACACAAACACCACACACACACACACACACACATACTC:1	-	chr2R	12839532	5'	+	accord	185	2	60.38
CTTTCGGTAAAGTATTTGTGCAAATTTCTATTAATTTCGAAGTAACTTCATTAAATTAACTTAAATACCTGTATTGCGGTTGTAATTAAGAGACTCATATCTTGTTACCTAGGAATCAAAAAATGAAAGGAGCATTAAAATATCAA:1	-	chr2L	14042311	5'	-	transib4	53	1	65.07
GTATACATAAAAGAGAATATTGGTAATAAAATAACCATTTTAATCTTTTTTGGCTAGGCATTTAATAGATTCTCGGCAATCTAAGAACGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCG:1	-	chr2L	13669874	5'	-	Doc	279	1	60.42
AACCAAAAACCCCAAAACCAATAAAAATTCGTTGGAGTAAACTGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1	+	chr3L	21855384	5'	-	blood	367	2	79.45
GGGGCAAGAAGGGCGGAACTACGGAACTCAGATGTTGTATTACATTCTACCTATGGCGCATAGCTTGCCAATGCGAAACCAAAGACACTAGAATAAGCAGATGCGTAACGCCA:1	+	chr2R	5248215	5'	+	1360	13	1	66.37
AAGTCTCGGCAATTTAAGTTTTAAAAACTTCGTCATATTAAGTAAAACTGTTTATTGTTGCATTTGGTAATTCGACACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGC:1	+	chr3R	31410255	5'	-	invader4	2854	2	58.40
ACCCATACTCGTCCTGATCCTTGCCCGACCCACAGCTACTAACTTGAAATTGCTTTCGGCAAATATATTAGCCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGAC:1	-	chr2R	13710689	5'	-	roo	9070	1	76.29
CTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGA:1	-	chr3L	8249118	5'	+	jockey	4575	1	59.20
ATTGTATTTGTCCCTAAGTTATTCAATTTATTTATGTAACCCAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCC:1	+	chrX	21091271	5'	-	mdg3	5260	1	60.96
ATGAATCCCGAATATGTTTTTAGCCCATAGATCCGATCTGATCCGATCTAATTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCT:1	+	chr2R	16942797	5'	-	jockey	4621	1	59.06
ATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACA:1	-	chr2L	15833068	5'	+	hobo	82	1	74.48
ACACCCCACAGGAAAATGCAAAATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1	+	chr3R	17831668	5'	+	F-element	38	1	42.74
CATCTGCAGTTGCAATTCAAAAGTTCTGATATACCGCAAATGGATTTCAAGTTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1	-	chr3R	22956105	5'	+	roo	8670	2	76.03
GATTGAATATTCTGTGTTAGGGAGAAGGAACAACATATGGGAAATCGAAGGGGGTGGTAGGAAACTAACAACTAATCTCTCATCAATTCGTTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAC:1	-	chr3R	3736442	5'	+	1360	3199	1	60.00
TATCATTAGGTATTTTATTTTAAACAATTCAACAAATGTTTCACATTCATTTTTTTCAATAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAAGCAGAAATAGCAGTGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATTTCCCATTAAAACTTTAAATCT:1	+	chr3L	5962656	5'	+	HB	1566	1	73.97
ATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGAGGAACACCTCC:1	-	chr3R	11547778	5'	+	G2	315	1	50.41
GCATTACACAAACTATGTACAATGATATACTAAAATTATTAAAGTATTAGCAGAATCGTTCGTATGTGCATATATGTACAATATACATGCTTGAGATGTTAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCT:1	-	chr2L	21313789	5'	-	1360	123	1	74.81
AACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGA:1	+	chr3R	4604451	5'	+	1360	396	1	64.29
TGCCCGAAGTGAGAGGGAGAGCAACGAAACTCACCACGGCGGAAAGGCCTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1	+	chr3R	18121653	5'	-	P-element	2852	1	48.62
TCCAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1	+	chr2R	21229003	5'	+	jockey	72	1	65.12
AGTAAGTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATT:2	+	chr3R	3922950	5'	+	Cr1a	84	1	69.18
ATTGCAGTTTAAGTTTATCTCAGTAATCACGCAATCTTAAAGCAACATGAACGCGATATCTTTATCTGTATCTGTATCTGCATCTATATCTTGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:1	-	chr3L	7943745	5'	-	Burdock	6365	2	63.70
CTGTTCTTAATAATTCTATTGACTTACAATACTATTCTGAGTGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCCTCGTATAAAATCGGTTGTTTTTTTTACTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAAAT:1	-	chr2R	5348423	5'	+	Doc2-element	81	1	72.86
ATAATCACCACAAAAACACTTGGTATCAGCCCTATATATGTATATAGTAAGAATGTTGTTTTATTACTGAGTCGAGCTAATGTCCCGTCAGTAGTCTAAGGTCAACGCTAAGAAATAAATAATAG:1	-	chr3R	12717815	5'	-	297	335	2	58.40
AAATATAAATTAATTTAAGCACACAGCAAAAAATAGGACTATGAGTAATTTAAATATTTTTGCTTCACTGATTTTTTGTCTTTCCTTCAAAAGCTTACATTTCACATTTTCCTTTTGTTTTTCCTTTTT:1	-	chr3L	7876954	5'	-	Doc2-element	245	1	75.97
AATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1	+	chr3R	5061808	5'	+	mdg3	24	2	67.65
GTTTGTTTTTGAAATTTTATTGAAATGCTTATACAGTACTTAATAAATTTATGAACCCAAATTGCAAAAAAATAATCTATAGATTCCTACATCGTGTAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACCACCATGCGGAGTGTGATTCAACAGCG:1	-	chr3R	25418547	5'	+	3S18	498	1	53.42
TAAAGTAAAAAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAATGTTAATGTCAATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGCGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTCTGTCCGTAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAG:1	+	chr2R	7744173	5'	+	INE-1	155	1	86.13
CATTTTCATCCCATTTCCCGTTGCCGTCAACTGTTGCACTCTGTTGCACATGCGAGTGACACACAATGACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAAACTACAA:1	+	chr3L	3799743	5'	+	copia	4875	2	70.99
AAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1	-	chr3L	16750751	5'	+	Tirant	8119	2	65.26
AATGGGGGCATTTATCGGGGGACGGGCCGACTTTCGTCGCCACCTGCAGCTGCATTATGCAAATGTCGCGGGACCGGAATAAATTATTGAAAAAAAAAAA:1	+	chr3L	17665687	5'	+	jockey2	3406	2	70.00
CGAAGGCTTCCGAAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGGACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1	+	chrX	10521592	5'	+	Tabor	6863	2	65.07
CGTTTTTCCACTTTTCCACTTTCTCTGCCTTTTCGGCCACCGGAAACGACCTTTTCTTTCTGCATAATTTCGGGAAATATTATTATTATTATGATAGATAGACTAGGTTATAAAACTAGACTAACTT:1	+	chr3R	6524791	5'	-	I-element	5324	1	62.99
TATAAGAATGTGAAAGGTGCTCATATGTAATCATTCACATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1	-	chr2L	19310445	5'	-	Juan	4204	1	76.03
GAAATACGATTAAGATTAGGATAAGGATATTTTAAAATGGATCCTTTGAAAGCTCTACATACGAAACTTGTTAATTTCTTAGAACTAAAGGATAGTAAGGTAATAAAACAAATAATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGTAC:1	+	chr2L	5563434	5'	+	Rt1b	4774	1	76.03
GAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	+	chr2R	13084611	5'	+	roo	8752	2	78.77
ACGTGTAACAACCAACGTTGTGAAGTGGAGTTCTTATGTTTGTTAAGATTGATTCTCACGTAATCTGTGAAGTAAGAAGTGATTCCATGTCTTAAGTAGATATAAAAAGTATGAGCTCTACATAATTTGAATGTTTTTTTTTTTAT:1	-	chr2R	8796815	5'	+	Tc1	1467	1	70.55
CAGTAGATCATAAATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1	+	chr2R	16945257	5'	+	jockey	10	1	70.18
GACGACGAAAGTGAAAGAATCGAAAGTAATTGGGATAAGGGGAAATGAATCCCTACAAAAAGTGTGGGTGACAAAAGCAACAAATAATATATATTTTTTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTC:1	-	chr3L	3140288	5'	-	blood	224	2	64.38
GATGCAAGTCAAGCGATTGCAAGGTACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	-	chr3L	20654602	5'	-	roo	393	1	71.54
ATCCAAGGGGATTGGAAACGAGTGTTGACAATATCCTGCTTAGTTTGAAATTAACTGGCAACGAACAGAGTTGAGCAGCTAGTAAGTAATTTAATTTCAGGAAATTAATGTAAGTATAAATTTAAAGATAATAAAAGATAAGATAA:1	+	chr3L	19937906	5'	+	Stalker3T	203	1	72.60
TTGTTGCATTAATTAACTAATTTAATTTTTGTTTGGCTTTTTTTTGGGCATTCAAATCGAGTTCTCATTTCAGAGTGGGAATAGTTCTTGAGATCGCGACGAGATCGAGATCGGACAAACTGACATGGCTAGATCGACTCGACTAT:1	+	chr3L	13171614	5'	-	INE-1	103	1	55.48
CAAGGCGTTGCAGGAAAAGCAGCGAGATCGCCGAAGGAGTTATAAAACATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTCAACGGATTCCCAAGC:1	-	chr2R	4294612	5'	+	McClintock	69	2	67.81
TTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1	+	chr3L	4840735	5'	+	jockey	4679	1	62.50
AGGAAGTGGGCTGAATGAACGCGATAAGGATCTAGTCAATAGTGCAATTTAAATAAATTTTCACATTCCTTAAATATTAAATAGTTAGGTAGGTACATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTG:2	-	chr3L	17685252	5'	-	mdg3	221	2	46.58
GGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr3L	16343247	5'	+	roo	8716	2	78.79
ATTACANAAAAAAATCGCAGAAAATTAAACAATTTACAAAAGACAAGCCCCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1	+	chr2R	18349317	5'	+	roo	16	2	56.18
ATACGCAACATATGACTTTGATGGATTCGCACCTTTTGCTGGGCATGATTGAAATTGAAGTACACATATGCGCACAGTGGTTCAAAAGTGTGGTATTTGAGCCGCTTAATTCCCCGCCTCCTAAACTAGTCCCTTAGTGGGAGA:1	+	chrX	10805072	5'	+	roo	196	2	75.69
CCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	+	chr2R	13084597	5'	+	roo	8737	2	68.97
TTTTTTTCTGGCACAGAGATGGAAAACGGTTCGCCACGAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	-	chr3L	18369046	5'	+	opus	7148	4	58.62
ACCAAGACGAAGTAGGGCACGATTGGGATGAAAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAA:1	-	chr2R	5173243	5'	-	Stalker4	409	1	77.78
ATATTTTAATTGCAGTTGCCATTTAGTTTAGTTGACCGTGAAAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATAAACCCATTATGCTTTCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAA:1	-	chr2L	22635547	5'	-	1731	4217	1	70.42
CTCTTGAAAGTGGCCACAATGTCATGCAGTTCGGCACGTAATTTCTTCCATCTTTTCCCCTCTTTGTATACCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2R	14542244	5'	+	roo	50	2	54.11
GCAGAGTTCCCCGAACACCCGTCTTGGCGATTCAAAACCGATTTCTGGCGTTTGCCGTGACTTTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGCAATTTCATCTTGGATGTTGGCTTTCAAATCTTCT:1	-	chr2L	21992120	5'	-	mariner2	652	1	72.80
GAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1	-	chr2L	16091976	5'	+	roo	68	2	73.88
CTTGAATGATTTTTCGCATGCGATTCTATATGTTTTTATATCCACAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTG:1	-	chr2R	3129077	5'	+	Tc1	1643	1	62.50
CATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	-	chr2R	14388022	5'	+	roo	30	2	54.70
ATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2L	544777	5'	+	412	41	2	52.50
TAAGTTTAATGAAACGAAAAAAAAGGTTTTTCCTTTATAGATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACCGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1	-	chr2L	15833108	5'	+	hobo	43	1	53.42
AATTTAATAACTAACTCTAGCAAATTTTTTTATCCCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAA:1	+	chr2R	1569307	5'	+	jockey	4823	1	73.97
AAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCAGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1	+	chr2L	13763133	5'	+	pogo	46	1	54.11
TAGTTGTCAGGACGCAGGACTGCCGACTGCCAATCCGTCCCTTGTGCCTCTGCTCCCAAATGTGTACTTAAAATTGCTCGTTCAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTC:1	-	chr3L	22431849	5'	+	roo	8828	2	68.60
GACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAG:1	-	chr3L	23678162	5'	+	Osvaldo	20	1	66.36
TTTAAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr2L	3886143	5'	+	roo	8724	2	58.90
TAATGGGCATTAAAGCCTCATCCGTTCGCAGAAATGCGGCTTTAAGGCCAACGAAAGACACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	-	chr3L	9998197	5'	+	roo	51	2	58.21
CTGAGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATA:1	+	chr4	1301731	5'	+	1731	4381	2	61.64
ATTGAGAATTGAATTTGGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGCTATTTTTATGGGTTGGATAACTTGCATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAA:1	-	chr2R	611231	5'	-	297	342	2	56.16
TAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATCAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	-	chrX	9540121	5'	-	roo	9036	1	55.81
ATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGATATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTT:1	+	chr2R	20194206	5'	-	Max-element	283	2	57.89
GTAAGGCCCTTGACTCTCACCCCATTCGACACTCCTCGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAG:1	+	chr3R	25454714	5'	-	Quasimodo	6961	2	57.47
ATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGT:1	+	chr2L	8986111	5'	+	412	53	2	54.11
AAAATTTCAATATTTTTCTATTTCGATAGAAATAGTAAGGAGTTTATGGGGATGTTTTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGCCG:1	-	chr3R	4338778	5'	-	G5A	2661	1	61.36
ACTTAAAATTTTAATATTTTTTTTTAATCAACAGTGCTGCGCAAAATTAATGAATAAAACAAATGGGGTTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTT:1	+	chrY	1447543	5'	-	G2	3068	1	57.78
CGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCTAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTAGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1	-	chr2R	13084667	5'	-	roo	336	2	71.22
CATATAAAGAAAGAAATCCTATAGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	+	chr2R	13585384	5'	+	412	39	2	57.53
GCCTTGTCAATTTGTTAGCTTATCAAATGCTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGACAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCG:1	+	chr2L	5307108	5'	+	jockey	4737	1	73.17
CTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCACC:1	+	chr3L	20831306	5'	-	roo	8990	2	80.43
AAAATGGAGAAGGAAAATGTAACAAAAAAAAAAA:1	+	chr2L	4064013	5'	+	TART-C	11095	1	61.76
TTTTTGGCACAGCTAATAATTTTGAAAATAATTTTTTATATATGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATACGTGACATGAGAA:1	+	chr3L	19334257	5'	-	roo	333	2	69.86
AACCCATCTACATGCCATTCCCTTGCTATCCATTCTCACCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAAT:1	+	chr2L	10040495	5'	-	Quasimodo	209	2	68.97
ATGGTAGAACATTTTCCACAGACTTACATGTATGGATGGGCAGATGCACAAAAAACAGATTTGCTTCAACAAAATACATGAAAATTGAGTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTG:1	-	chr2L	3948272	5'	-	R1A1-element	5106	1	59.59
GTGGCATTTGTCGCAGTGTACCATTGTCAGTGAACTAAAAGCGTTTAGCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr3R	22844132	5'	+	roo	10	2	74.66
TGTTCATATGTAACAGAAATATATAGAGCTGAAGTGACCAAGTGGTTGCTGAATGTGTGTTGCGGCACTTTGCTGCTCACAACACAGTCACCTCGTTGTCGCCTGTGCAGCGGCGGTGTGGTGCAGAGTGC:1	-	chr2R	4577048	5'	-	Chouto	287	1	77.86
CCCCATACACCGATGATGTTTAGCACTAAGCAAATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACA:1	-	chr3R	24383348	5'	+	rover	46	2	52.41
TACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTA:1	+	chr2L	3813588	5'	-	Ivk	5220	1	69.18
AATTTCACACACTTAACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAG:1	-	chr2L	12290791	5'	-	1731	4593	1	61.64
ATATTCAAGTTTCAAGTTATTTTACCCTCAAGTTCGTCGTCGTCTCCATTGTCGTTTTACTTTATTGTTTATGCCCGAATTGTGTTTGAGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGAATAAATAAATAGTCAAG:1	-	chr2L	2687465	5'	-	copia	223	1	63.01
TACAGTGACTAAGACTAACGCAGACCACACGAACGAAGACACATAAATTACACCACGTCACCCAGAAGGAAAAGCAGCAGAGGAAGTTTGTACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGTGTAGAAAAGA:1	-	chr3R	11772819	5'	-	1360	143	1	65.00
CGAATGGGGTAGCTTTTGTGGTCTCGGTCCTGTTTTCTCGGAGGTCGACCTCATTTAAGGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	-	chr3R	27994281	5'	-	roo	9011	2	59.59
AAGGGGGTCGGGAAGGGGTGGGGGGGCAAAGATTTCTAAAAAACGGATTCGCGCATAATAAATTTCCGCATTAGACTCTTGATTATTTGTCCTTTCTT:1	-	chr3R	6099576	5'	+	Circe	6962	1	73.47
GCCTAACACGAATTTGCAATTACTTGTAATCTGGATTAGAAGGCCATATGCTCCTTATGTGCTTAGTATTAGAATTAGAAGTTATACTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCG:1	+	chr2R	9325373	5'	+	BS	5029	1	50.68
ATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	+	chr3R	11496549	5'	+	1360	59	1	73.04
ACGAGATCGATTGTGCCAACCGTGACTTTGTACCACATCCCAATTGCCGAAAGGTTAGTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAATATAACAGCGCAATTAACATATAA:1	+	chr3R	13770041	5'	-	BS	5035	1	57.45
CCCCATCTGGTGGGTTTTTGGGGGGCCAAAATCGATGGAATATAATTAAATATTTTCCGTTTTCTTGTCCATAAACAAACTTGCGCTGCGTCGTTGTCTCTAGAACTGTCTAGATTTTATAGTTCCTCAGATCTCAACGTTCATAC:1	+	chrX	706012	5'	-	INE-1	137	1	54.79
TATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1	+	chr3L	14603260	5'	+	jockey	66	1	56.16
TTGCATCCTATTCCAGCGTAGTATGTGTCTGCTTCTTTTTTGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1	-	chr3R	7482818	5'	-	412	7470	2	76.22
AATAGTTTCATGTATGGCTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCC:1	+	chr4	311145	5'	-	1360	3376	1	76.71
TGGAAAATGATACCGTGTTATAACCGAAGAAGCAGATCACAACATTTTATTAACCTTATAAAGACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1	-	chr3R	17478469	5'	+	copia	4929	2	60.27
ATACTAGAAACTAGATACAGATTGCAACTGCGGCTGCTGTAGTCGAGATGTTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTTT:1	-	chr2R	13696098	5'	-	Doc2-element	227	5	84.93
TTTTGANTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1	-	chrX	21014872	5'	-	copia	209	2	52.74
CCGGAGCCAAAGGCAAAGTCAAAGGCCCTTTATTATGGAATGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGGGCCTCTCAGTCT:1	-	chr3R	19265883	5'	+	I-element	25	1	51.11
AGAGTGCCATTGGCACCGTAGCTGGTGCCCATGCTTGTGGCCCAGATGAGCGGCAGTAGGGGCATCTGGACCTGGTCATATACGACCATGTCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTG:1	-	chr3L	2362451	5'	-	Stalker2	384	2	71.11
CTTTATGCTCTGATGAGGCAGCAGGTGATCAATGACCCTCAAGGATTTTTTATTGACTCTGTGGAAGCAGAATTTTTAACAGATTTTGGCGGTTTTAGGGCGTT:1	-	chr2L	22196480	5'	-	INE-1	344	1	68.27
CTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAA:1	-	chr3L	8249118	5'	+	jockey	4596	1	65.07
GTGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACG:1	-	chr3L	8249108	5'	+	jockey	4578	1	65.25
ATTGGCAATGAAAATAAGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	+	chr2R	21907884	5'	-	roo	9044	1	67.12
ACGAACATGGCGACCATCAGCACAAGCAACTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1	+	chr3L	22911763	5'	+	jockey	4745	1	76.15
GTAATTGAAATATGAAATATTATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1	+	chr2L	17295826	5'	+	Doc	40	1	50.00
GTTTAGAAGAAAACAAAGTGTATATTCGCATCGGAGGAATTTAGACAGAATGGATTGGGGCCAACCGGGTCCGTAATAACACCGTAACTCAAATGACGAGCATGAAGG:1	-	chr2L	18951105	5'	-	R1A1-element	5040	1	70.37
AAAACAATAAACTAGAACACGAGTAACGGGAATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGCCCAA:1	-	chr2L	9399532	5'	-	Transpac	5199	2	54.37
ATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:2	-	chr3R	17605714	5'	+	Tabor	80	2	69.86
ATTTTTAGAAAACGCCTCACCACAGTCACCCTGTGACTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGGTGCTGGCAGTACCCCAGAGCTGTATGCCATAAGTCCACACGGGCCTTA:1	-	chr3R	5442378	5'	-	G4	3418	1	64.66
AATCGGATATTTTAAATTTAAAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACGTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1	+	chr3L	18368932	5'	-	opus	457	2	66.97
AATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTACTAACCAAATTTCAAACCTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCACATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr3L	4536666	5'	-	roo	392	2	62.20
AAAACAATAAGAAAGTGTGCAGTTGACAATAATGAGAAATGCACAATAAGCAACTAAATGCGATTAGATATAAGCCATTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCACGATGGTTCCCTTGTGTGACACCG:1	+	chr2R	7562017	5'	-	Q-element	483	2	53.79
ATTTCTTGAAACAAATAAAACCGGTAAAATATAGTAGCTTAGCAGCCTTCCACTCAAAGAAGGCAACATCTGATCAGCATTCAGGATCCTTAAGTACAATATTCTTTTTAGGCTATTAATTGCGCCTTCGCTGCCTGGTGAAGTCG:1	+	chr2R	2777446	5'	-	gypsy11	297	2	63.01
TACTACATATGTACATATGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTACTTAATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1	-	chrX	22511454	5'	-	1360	3366	1	54.79
GTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1	-	chr3L	18368992	5'	+	opus	145	4	72.53
GCTGACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1	-	chr3L	20168441	5'	+	mdg3	5298	2	57.14
CTTGCAGGGAATGTCCAACAGGCGATCGCCCGCTAAAAAATGATAATAAGGTGAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1	-	chr2L	5928079	5'	-	I-element	5294	1	60.14
AAGGATCGTTATCAACATTTAAGCGCAAAGGTGATGTATCTAATCCTCTTACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGC:2	-	chr2R	11363840	5'	-	Bari1	1637	1	65.75
AATATATTGAAATAAATAAAGACATATAAGTTAATAATTAAAGTTATCGATTTGATTT:1	-	chr2L	20808383	5'	-	HMS-Beagle	237	2	70.69
AAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	-	chr3R	17817983	5'	+	roo	8724	2	61.54
AGTAATCATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCTCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGGTGTTACAATTTACCTGACAAGTAAACC:1	-	chr2R	21298836	5'	+	jockey	254	1	51.22
GATCGGTGTGTATTTACGTACCAAGAGCAAGGCCCACACGAAAATGTGGCCGACGTTGACCATCTTAAATGTAAGTCTTGAGCTTTATTCTGAAAAACAGTCATACTTTTATACACATATATGTATATGTATATGTGTATATATAT:1	-	chr3L	20417273	5'	+	G3	4507	1	70.55
TTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGCTTGAGCGAAGCCGATGGTACTGGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1	-	chr3L	17205301	5'	+	hobo	39	1	56.39
CAGAAATGCGGCATTAAGGCCAACGAAAGACAATAGTTCACACATGAACAAGAATACATTTGAAGACTTACAAT:1	-	chr3L	9998169	5'	+	roo	8683	2	52.70
CAACATTCCTAATTAACAGATCTCCAATTATAAAAAAAAACACTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	-	chr2L	22775561	5'	-	pogo	2039	1	72.31
AATATCAAAACATAAATACATTTAAAACATTTTACAAGTTGAAAGGCCGTTGGATTAGCTGAAAACACTTCGATTACAAAAATTACAATCCATTCCATCGGATATCCATCAATTATTTCTTCGAGTGCAGACCTCTGTG:1	-	chr3R	13320942	5'	+	Ivk	18	1	80.58
GTTTGTTGACTTTGGGTTTTTATGGCGCGCTACTTTATTGCCACCACAAGTCCACGGCGACCCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	24218521	5'	+	412	42	2	51.94
AGATCGTCAGCGTCACAGAACAACAAGCAAAACCAAACTAGTTTCTGTGCAGTCGCCTAAAGAGCAAGATCAGAATACCTATCTCTTAAAATGCATACTGCAAAAATTTCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGA:1	+	chr3L	26466471	5'	-	Quasimodo	6977	2	78.08
TTCTGTTCAGTATCATCACCACCACGAATCGTCTCCCTACGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	+	chr3L	16343162	5'	+	roo	8671	2	80.58
GAGTGCAGGAAAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCATGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTG:1	+	chr3R	25423184	5'	+	3S18	47	2	50.68
TAGATACCCGTAACTCAGCTAGTGTAAATGTGAACGCGTAATTTCAATATTTTGCTGGGATATCGATAGATCAACAAACCTGCGATGCGTCTTTGTCTCTAAAATCTGTACGCTGAATCTCAACCTTCTACCTTTTATGGTTCCTG:1	+	chr2R	5646039	5'	-	INE-1	155	1	55.48
ATAATATTTAATAAGACCGTGTGTTAAAAGCTTTTAAAAGATATACATGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGGCAACATGGCGCTGCGTCTATGTCACTACAATCTGTATGCTTAATCTCAACATTCCTGAGATCTCAACGTTCATACG:1	-	chr2L	22718310	5'	-	INE-1	136	1	67.12
CATAATTACAACTTACAAGAGCTTCGATGCATATTAAGTTCGTACAAGAGGGCGTATGAGAGATGCAGCAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTT:1	+	chr3R	26342015	5'	-	jockey	62	1	55.48
GGAAATCCGCATAAACAACCCAAGCATGCTGACTGAATACGCTCCGCTTTGGCTCTTGCCTTGTGGCTGTTTACTTTAGCGTTTTAGCAAGATAAACACATCGCGCTGGCTGCCAAAAAAAAAGAAGAAAAATAA:1	+	chr3L	16061586	5'	+	gypsy7	5006	1	72.59
CCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGCCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCT:1	-	chr2R	4181305	5'	-	accord	7346	2	56.36
AGACCGGAATTCGATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTT:1	-	chr3L	16343311	5'	-	roo	373	1	54.10
TCACACACTTAACTGAAATTTTACCCACACACACTTCATGAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATC:1	-	chr2L	12290787	5'	-	1731	4590	1	59.31
GGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAG:1	+	chr3L	24213773	5'	-	invader2	177	2	65.75
GGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr2L	5254348	5'	+	roo	8718	2	70.69
AACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1	-	chrX	9540103	5'	-	roo	9002	2	68.97
CCAATGTTTCGAAAACATGTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTCATGCCATAAA:1	+	chr3R	23495647	5'	+	copia	4938	2	63.70
GAATGTTAAATATTCAGGCTTCCCTAAAAATGAAAATCACACGTTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTCGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCT:1	+	chr2R	9499955	5'	-	G5	4796	1	55.71
AGAAATAAAAAATGAAACTGAAAGGTTTTGTCCTCGGGCAAGGCTCGAAGGACCAAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1	+	chr3L	22439873	5'	-	roo	9004	2	69.18
GCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	+	chr2R	20496895	5'	+	blood	7044	2	57.25
GGACATGCTGTTGTTTTTGCTATTATACGCACAATGGGACAAACAGACTTTCGGTTTTAATTTTCTTACCATAATTATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1	+	chr3R	31720469	5'	+	pogo	42	1	56.85
AACATTGAGTTGCATAAAATATTAAGTATCCGCAATGTTATCAGCATTAATTTCATTAATTTCCTTTCCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1	-	chr3R	30344766	5'	+	pogo	12	1	73.29
AAGACCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAA:1	+	chr3R	7835090	5'	-	roo	9044	1	61.31
GCAATTTAACAAATTTTAATTAATCAAATTAAACAACAACAAAAAACAAATGCAAAAATTGCAATTTAATTTTTTTCTCTGTGTAAAAGTTGATTAAAAAATAAATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGC:1	+	chr3L	11498973	5'	+	Cr1a	4352	1	71.92
AAGTTTTTGTTGAGCTTATTGAACCTTTTCAGCGAGGAGAAACTTATATTGGAGAACAGAGCCAGCCTTATTATTAGGTAAACCCATTGTATATACATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCAC:1	-	chr3R	12463580	5'	+	invader1	28	2	65.75
TTCGCAAGAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAA:1	-	chr3L	11321511	5'	+	mdg3	5300	2	49.29
TGCTATGGCCAATGGATGATGGTCCTTTTGACGGGCCCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1	+	chr3L	22400258	5'	+	1360	38	1	52.80
AAATGCTGCCCCTTGTAGTTGGATTGGATTGATATGGGGGGTGTAGTCGACGCATACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1	-	chr2R	9328691	5'	-	roo	9008	2	60.56
ACAAATGTGAAAACCAAAACGAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATATGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTGTATCGTGC:1	-	chr2L	11661061	5'	+	F-element	29	1	58.22
CAAGGAGAGTTTTTGAAACTATTGAAGTTTTTTTGAAATCCAATTGCAGCGTTTGCGGTCTGACAGGGCTATTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTATTC:1	+	chr3R	31764477	5'	+	Burdock	6303	2	63.48
TGTCTTCCCATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1	-	chr2L	3114570	5'	+	roo	7	2	70.59
GCCATGATTACATGAGCGAGGCAACCGTGGAGATTCTATTGGGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTT:1	+	chrX	11479155	5'	-	accord	7207	2	72.86
ATATATATTTAATGGTTTCTAACAATGCTGCGCAATTTGTATGTTTTGTATGTTATATTTAAATGTTTTTATTTATTATTTAAGATACAATTTTGCTGTGTGTCTAATGCACCAGACGAACAATGGAAAATGGACAAGGCTAAGC:1	-	chr2L	16570729	5'	+	copia	426	1	43.45
GCTAGCGAGCCTGTAACCCAAGAGGATACTTCTCAGAAGCCGGAGACTAGACAGGATGCTATCATCTCATTCGTAGAAGTGTACTCTAACACAACGTGACCCTCT:1	-	chr2R	18122255	5'	-	1731	4164	1	53.33
CAATAAATTCACTGCCAAAAACTAAAGCCCCTTTGCTGAGTTGATAATCGGGCGAGCGCAAATATTAATAAATACACTTTTTTAATAATAAGGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1	+	chr3R	23237599	5'	-	jockey	4964	1	65.28
AGCGTAGATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chr2R	21907900	5'	-	roo	9052	2	67.21
GGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr3R	7835184	5'	+	roo	69	2	76.42
ATGTTTGCTTTAAGAATTAAAATACATTCATTTCAAATTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:2	-	chr3L	3477494	5'	-	mdg1	338	2	78.77
GGCGCAGAAGAAAGCTCGGCTCTTAATTAATAATCAACTGAACTGGCTGGCAAATGAGGGTCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chr3R	14364598	5'	-	roo	9010	2	63.01
GAACACGAATACAAAAGCCGAAGGCCGAAGATGACGACACCGGGCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1	+	chrX	2518041	5'	-	P-element	2857	1	51.00
GCTTGTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAAT:1	-	chr2R	5173551	5'	+	gypsy	36	2	56.85
ATTTTTTAATATATGTGTCCTCTCGAATCGTCGTCCTAAAATTGAAATTTTTCTTAGATATTATTACCATATTATGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCT:1	-	chr3L	12966076	5'	+	jockey	4857	1	57.53
AACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1	+	chrX	13504170	5'	+	412	7135	2	72.60
CTGTCTAGAATACTGACTTGAATTGTAATGTCGTTAAAATGGCAAAAACAAAGGAGCTATCAGTTGGGCATCGAGTCGAGATTGTCACTAAACTTAAGACTGGTTCTTCTGCATCCAAATTAGCTGAGTTGTACAAAATATCAC:1	+	chr4	896816	5'	+	Bari2	339	1	76.39
GAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1	-	chr2L	11661041	5'	+	F-element	43	1	47.86
GCTGTTTTCCGATGTTTCATAAATAAAAAAGAGTATTCGCTGGAAACATGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCC:1	-	chr2L	15233341	5'	-	jockey	4731	1	50.00
AATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTC:1	+	chr3L	10574295	5'	-	Tabor	420	2	63.04
ATGTAAGTTTGTAATACACATTTTTTTAATATTTATTATAATATAGTTTTTGTTGATTGGCGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTTAGGAAGGCCGTGTCGGAGCG:1	-	chr4	898373	5'	+	invader4	2748	1	51.79
ATATAATTAATCAAAGCGCTGTGTTGATAGTTGCGGTGTTGCTGGGTTAGCGTTAGCTGCGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGACTCTCTAACAT:1	-	chr3R	10274065	5'	+	HMS-Beagle	10	2	73.73
GAACCGTTTTGCACGAGGCACAGAAGCGTTCTGGCCAAAATATTCGTGTCTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGGGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1	-	chr2R	16641253	5'	+	hobo	56	1	59.23
TAAGCAATTAGTTGCCTTTTCAGCTGAAGTAAAAGCAAATCGGGTGAGCATGGAACGAAGTATATATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGGGTCAGCACTTGGCTGTC:1	+	chr3R	27422413	5'	+	mdg1	260	2	49.21
CAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	+	chr2R	11629720	5'	+	Tirant	8122	2	72.36
AAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	+	chr3R	17817876	5'	-	roo	9019	2	52.74
TGGTGCAACTTCCTCCTTCCCGTTCCCCTCTCGTTTACCATGTTTCATTACCCTATTTCAAGTTCAGGACGCTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr3R	22122837	5'	+	roo	13	2	75.34
GGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1	+	chr3R	27424843	5'	-	blood	7326	1	61.11
GTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1	+	chr3L	21855435	5'	-	blood	7348	2	51.59
GTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1	+	chr2L	13763155	5'	+	pogo	62	1	65.71
CTGTAAGGCCCTTGACTCTCACCCCATTCGACACTCCTCTTCACTTTCTCCCTCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGGT:1	+	chr3R	25454712	5'	-	Quasimodo	228	2	52.73
CAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:2	+	chr3R	21705941	5'	+	297	23	2	65.07
ACTATTTACTACTATTTCCCCGACTTCTACCCAGCTAACAACACATGGAATTAATGGGTCGGACAACGACCCAAAACTGTGGAACATAACCTCAAGCTACTCAGTCGTTTTTTTGTAAGCTTTCCTCCCTCGGCC:1	+	chr2L	16499671	5'	-	accord2	7451	2	65.93
GTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCAC:1	-	chr3L	22349258	5'	+	jockey	100	1	76.03
TGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1	+	chr2R	11629726	5'	+	Tirant	8	2	75.45
GGACAAATGGACAGCGAACAACGGACAAACATGCTGACAGGCGGTCTCGGCTTGGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCG:1	+	chr2L	4412325	5'	-	Quasimodo	7058	2	78.21
AACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr2L	12892697	5'	-	roo	355	2	66.67
CAGAATGGTGCCAAATTGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAC:1	-	chr3L	10574431	5'	+	Tabor	8	2	71.23
TTTGAAATTTTTTTTTATTTTAAAGAAGTGTTTAGGCGTAGGCTCTTTTTCATTTGCTATCACCTCCCAAGGGGCAAAGGGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	-	chrX	9484995	5'	+	roo	8684	2	62.10
AAAGGGGGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGCTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCCC:1	+	chrX	12214040	5'	-	opus	463	2	56.74
ACAAAACAAATTTAGCCATAACTCCTAATGCCCCCCCCGAAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAA:1	+	chr2L	9399774	5'	+	Transpac	268	2	50.00
GTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1	-	chr2L	20840511	5'	+	Transpac	41	2	53.23
AAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGAAGCATGTGCCTATGCAATATTAAGAAAAATTAAATAAAAAAGCATATTAACTTATGGCAGC:1	-	chr2R	16785405	5'	+	412	7096	2	58.88
TTAATGTGTAATGCATTTCTAACTTATTCTTAAGGCAAAAATAATTAAAAACTCATTTTCGCTGTTTAAAAACGGAATACTAAGATAGCAACTTCAAAGAGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1	+	chrX	14749568	5'	+	copia	4891	2	60.96
AAAGTTTCAACTTCGGTCTGGCAGTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCC:1	-	chr3R	12839240	5'	+	gypsy6	38	2	64.21
CCCGTGTTCAAAAAGAGCTGAGAAACAAATTTGAACGGATAATAATAAACTTTATTATATACGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1	+	chrX	23457609	5'	+	Doc	60	1	59.72
TTTTGATCTCAAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGACGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1	+	chr3R	14651181	5'	+	P-element	27	1	63.08
ATTGTTGCAAACAAGAAGCGATAGTGTTGCTGCCTTTTGTTCGCCGAATTCGAGTGGAAACAATGCAACAGTTACTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1	-	chr3L	12879843	5'	-	roo	9045	1	60.98
ACTCCCAAATGTATGCTACGTTTTGCTCCCATTTTATGCTGCGCTGCGTCGCAGCCCGCGTCGACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1	-	chr2L	15181459	5'	+	jockey	4815	1	54.93
TTTAAAATTAGAATATATTTTAAGAATTCATTAAACAATTTTTTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAA:1	+	chr2R	11329665	5'	+	P-element	2727	1	21.92
TATTCTAGCTTTGCTACCAAATCAAAGTTACGTGGGCGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTAAATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	-	chr2R	21920629	5'	+	jockey	18	1	72.99
TGGATGTCGTGACTTTTCCCAGTAATATTTTCGACAGTAACCGTTATTTTGCTGCCTGTGTGTGTGTGCTACCACTACACTTTTGTGAGTCTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chrX	8640651	5'	-	accord	7034	2	53.33
AATTCAGCAAGTGGCCTTTGTTATATCAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1	-	chr2R	18609420	5'	+	opus	18	2	72.06
GTCGGCGGCCATATAATTAAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1	-	chr3L	19036046	5'	+	Tirant	8114	2	57.41
CTTATTACTTATTACTTATTATTATAATTATTATTATGCCTAACTAAACTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGGAACCTGTACTGGCGGGTG:1	+	chr3R	18157447	5'	-	Gypsy12A_LTR	2225	1	62.86
ATATTTTAAAATTGGAAACTCAAATTTAGATTCTGGAATTACTTTTAATTCTCCTTAATTTGGGCCATATTAATTTACGACCGTTACATCCCATCTAATTCTTAAACGAATTATTTTTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAAAA:1	+	chr3L	7435798	5'	+	INE-1	499	1	77.40
AATTAATATTTATTATGTGTATAAGTGAAAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCC:1	+	chr2L	14683584	5'	-	R2-element	3453	1	77.40
TATTTTCTGTGCACTGACACCAAAACAAAGATCGAAGTTCCGAGACTTCGGACCCTTTTCCAGCGCAGTTCTATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1	-	chr3L	3863575	5'	+	blood	7026	2	73.61
CTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATGCCAGATCT:1	-	chr3R	1433194	5'	-	mdg1	332	2	75.34
ACAAACAACACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:1	-	chr3L	26011953	5'	+	F-element	84	1	68.49
GTTGTTGTCGATTCGTTGGTGTTGCTGCTTTCGCTGCACTTGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGTG:1	+	chr3R	7963648	5'	-	Idefix	18	2	37.74
AAATATAATCGTTCGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTGCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1	+	chrX	22601885	5'	+	INE-1	82	1	54.17
CATGGGTTAGTGCGTGTGTAAGAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1	-	chr3R	20427519	5'	+	jockey	22	1	74.66
TATTCTATACTGTTGCCTATATTCTGTATAGTCTTCTAAATCATATCTATATTGTTTTATTTCGTAAGTACAGTTTATATCAAAAGACCACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACGCTTATACATAA:1	+	chrX	21761526	5'	+	Stalker	157	6	53.42
TAGAGTCAAAAGAAAATTTTTGCAATGTAAATTAACAGCCAACGAAACTAGTCAAAAGAGCAAAAAAAAACAAAATCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1	+	chr3R	11937501	5'	-	blood	7358	2	51.43
TTGAATATTTAGTAACATATCATAGTAAAATATTTTTTCAACGTATTTATTTTTATTTCATATCCCTTTGTGCATTATTGCACTCGATACCCATTAACACCCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAG:1	+	chr3R	4134931	5'	-	Quasimodo	6970	2	71.92
GACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGC:1	+	chrX	13704758	5'	-	invader4	3040	2	57.04
GACCGAAAGTCAACCAGCCCAGAAAGGTATGAGAATAAAAAACATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCC:1	+	chr4	1151985	5'	+	transib2	43	1	56.16
GACCAACAAAACAAATGTTATAATGATTTATACGAATTTCGCCTTTAATTTGAGCTGAGCTAGAATGATATTTTAGTTTTTGACCTAATTAGTGGCTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAA:1	-	chr2L	12777281	5'	+	Stalker	242	4	63.01
TTTTAGTTATTCTCTAATTCTCAAGTGACTCACAACGCTTCTCTTGTTTTCTCCGGGAGATTTACTCGCGCGCAGATTATCAAATAATAAAATGATATTTTACGGCTG:1	-	chr3L	21202861	5'	-	gtwin	7214	2	73.15
AGTTGCTCACATTTTGTTGATTTTTGTACAGTATTATTTTCTGAGTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATT:1	-	chr3L	9675690	5'	-	Doc	4363	1	68.97
GAAAGTAAAGTGTAAAATATAAATTTTTACTTTTCCCATATCGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCA:1	-	chr2L	12290748	5'	-	1731	4556	1	67.14
TTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATC:1	+	chr2L	4412558	5'	+	Quasimodo	67	2	65.07
ACGCGTTTCTATTTTCAGCTTTGTGTTTATGTTTCACGTCATGATCGAAGTTCTGGCCACTCTGAGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCA:1	+	chr3R	14928620	5'	+	I-element	4979	1	53.57
GTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1	-	chr3R	20427451	5'	+	jockey	91	1	72.60
TTGCTCGTATTATTTGTGCATAAATTAAACGTAGGTAAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1	-	chr3L	20888774	5'	+	1360	65	1	75.59
TGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3R	18582232	5'	+	roo	8738	2	72.22
ACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1	+	chr2L	14081299	5'	+	1360	46	1	53.28
ATTTATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGT:1	-	chrX	6522081	5'	+	F-element	45	1	55.97
ACAGAAAAGTCGTAAGTGTTTTATGCATCTCTTGACCAAACACTTTTCGTATTCGTTTTTATTTTTCATAATAAAAAATTTGAGAGCGTAAGAAACCTAAAAATATAATTTTCTTGCTTGTGTGAGTAAAAGCAAGAGGCGAGAAC:1	+	chr3R	11752475	5'	-	1360	3237	1	54.79
CATTTTGTCATAACGCTACCGCGCAGTGACAATCTGATTCGACTCCCGATCACTGAAGTTTCCCGTCCGATGGCTCGTTCCACTGCACTATGGGAAATTTACCCCCTTTTTT:1	-	chr3L	21864249	5'	-	Transib-N1_DM	488	1	74.11
AATTGATTAAACAATTGTCTTACTTAGAAAGTAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1	+	chr3R	16076753	5'	+	roo	8700	2	63.01
TGAATGTTAAATATTCAGGCTTCCCTAAAAATGAAAATCACACGTTTAGTTGCTAAATTTCTAAGCTAAACCCTTTAGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTCGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACT:1	+	chr2R	9499954	5'	-	G5	4791	1	54.11
CAAGAAAAGTAAGGCAGAATGGAAAAAGGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1	+	chrX	12214016	5'	-	opus	7485	2	72.60
ATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1	+	chr3L	1534544	5'	-	pogo	2073	1	64.77
GTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	-	chr2R	9632182	5'	-	roo	333	2	67.81
GCTCTGCTTTTTGCGGTACTTGCCACGCACCACCGATCAAACGGAATCTGGGCCTCCGATTAAATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1	-	chr3L	20548180	5'	+	297	33	2	60.74
TGAAACTCAATAATTTTCATCTGACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAA:1	+	chr2L	21884485	5'	+	pogo	38	1	60.96
GTTCTCTAAATTAAAAACACAATAAGGGGGCACGTAAAAAGTTTGATTTAGTTTTTAGCTTGTGCTACTGAGCATTTACAACACGATTGTGGAGGGGGGTTAACAAACACAGGCACGGAGTCGATGTGCAGGCAAAAAAAAACAC:1	+	chr3R	21336322	5'	-	Cr1a	255	1	78.62
AATGCTCGGTTACCAGTTGATAATTTTATAGAATAATGTATATAATGTTTTATAATGTAATGTATTATAATGTATCGAAAGTTTGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTATGAACCGAGAAGTTAAGCCGA:1	+	chr2L	21827529	5'	-	Cr1a	4093	1	55.48
GTCACTTTGACCTCTACAGGCGGTCTCCTTCCATATTCCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1	-	chr3R	1433232	5'	-	mdg1	370	2	51.37
TTTCGTGTTTTATATCTTTTTTAGCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1	+	chr2R	20496857	5'	+	blood	7021	2	76.03
CCCCCATCCCAACCTCTCGACCCGGCTCCCTTTTCCCGAAACTTTCGCTGCCTGTCTGTGGTCAATAAAAATCTCAGCATAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTT:1	+	chr3L	16486138	5'	-	297	6803	2	53.42
TATAATTATTTAAAATAATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1	-	chr2R	19050350	5'	-	roo	408	1	77.40
TCCTTATGTTTTTAACTGCCAGAACTCTGAACGCAGAAGCACCTGAATAGTGTAAAATAATAATGATTTTTCTTACGTAAATGCAATTTGTTTCCTTCCGTTTTTATCAACAATCCCATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1	-	chr2R	7328818	5'	+	roo	8753	2	50.00
TTTTAGACATATATGATTTGTGATTTAATTGCAATTTAATCTTCGGTGCGTTCGAAACTCGCTGCGCGAAATGGAAAATAATAATTGTGCTCCGACATATACATATACAAATGTATGCAGAAGGCATGCATATGTTATGTATAGCT:1	-	chr3L	23529716	5'	-	Stalker2	7470	2	72.60
ATTTGACTTATCAGCGTTCCATAAACGAGACATTAAAACTGGCCAAGGAAATCAGAATAAGAAAACCACTGGATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGAGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1	+	chr3R	26431946	5'	+	opus	7048	4	54.79
ACCTGCGGTCGATTAAATGTCATATGACATTGAGGAGACTTTGCTTACGATCTAATTTCACATGCTCAGAGTATGTAAGTATAGTTGGGGGGGTGTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1	+	chr2L	1520425	5'	+	jockey	4705	1	44.52
TGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1	-	chr3L	10574412	5'	+	Tabor	6863	2	59.44
TTTGTTGGCTTTGTTTCTACCGACGGTTATCTGCCGGATTGCATTGATAGTTATTACGAATTGATTAAGATGATTGGATTGCAGTGATTGTAGGGGGAAAGTGATTAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1	-	chrX	9537374	5'	+	roo	8754	2	80.60
ACAAGCGCTCCTTTAAAGTTGTGCAGGACGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1	-	chr3L	23906506	5'	+	1360	31	1	61.64
ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACG:1	-	chr2R	1982173	5'	+	1360	169	1	65.89
GCCATTTACAGGCCAAACAAGCTAGAGAAAACTCTTAAACTATCTATGCATTTGTTACATTTGTTTCTGGTTAGAAAAAGGATAAAATAAGCTTATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGGAGCAGGAGTTGAGCCA:1	-	chr3L	17469661	5'	+	jockey	407	1	65.28
TTAAATTTTTAATTTTTGTACCAAATATCTAGCTGCCAGACATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCC:1	-	chr2L	11740141	5'	-	roo	8931	2	71.92
GTCAATGGACTATGTTATAGTATAATTTTTGGTTAAGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr3L	20831229	5'	-	roo	396	1	77.40
TATTTCGAAATTTCGCATGCAAGCCGTGGGCGCAGCTTGGACACGAAATGGGCGCGGCCAAGTAGCCGCCGGTTGCTTGGCCAAAAATCCCCCTCCAGCTCAGGGTGGCAGAA:1	+	chr3L	21452905	5'	-	R2-element	3177	1	76.99
AACAGGATTTTAATCAAAATGACTACACTTGGTTAATGGACCTTGTCCATTCGCCTGAAAATTCGGAATCATGATGGGGAAAAACACCCGGGACGGTCGTTTGGAGCGGCGAGAGGAGCG:1	-	chr3R	11471009	5'	-	Doc	451	1	66.67
CTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCACTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGC:1	+	chr3L	19013928	5'	-	invader3	5385	2	70.55
ATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1	+	chr2L	11732238	5'	+	Doc	14	1	63.16
ACATATACATATATCCATGTATACATGTACATGTATATCTACATATATCCATTTAACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGACATGGAAAAATGCATTTGTATTACTAAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTC:1	+	chr3L	14935084	5'	-	HB	18	1	71.23
AATGGGTGAAGGAAGTTTATATAGCTTGGGATCAAAAAATACTGGGCCCGCCGACGTTGAATTATCCGTAAGGATTTGTAAGCCCATATGGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTGCCGGGAAAATTTAGCTTTTCAT:1	-	chr3L	26763447	5'	+	aurora-element	4166	1	52.74
AAAAATGAAGCTTAATTTAAAATGCGACGAAGCGTGGCACACACACACACAAACACAGAAAAAATCCGGAAAATGCCTCGAATATTTCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1	-	chr2L	1839348	5'	+	hobo	17	1	70.08
GCAAAGTAATAATGGGTTATTCGATGGGCATTATAAAACACACATAAACGTTAAATAAAAATACATACAATCCACTTACTTTCGCTGCGTCTAATGTCTCTAGAATCTAGCTTTTATATTTTCTGATATCTCGACGTTCATACGGA:1	+	chrX	22853728	5'	-	INE-1	134	1	52.74
ATATTATTCTATATAAAGATATTATCTATCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCACAAGATCGTTGCCT:1	-	chr2L	15247980	5'	-	Transpac	5186	2	67.68
AAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAG:1	-	chr3R	11547783	5'	+	G2	302	1	56.52
CTTGCAAAGCTGTTTAAAAATAATTAATTAATTCGCTGTTGTCTCTGAGTGCGTACCTTTTAAATTATGGAAGGTAATCAAAACTGTATAGAGTGTTCACGTGACCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTT:1	+	chr3L	24210632	5'	-	Quasimodo	6973	2	73.97
GCGCAAATACATTTCGCATGCAAATATCAAATGTGATTGCGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACATCG:1	-	chr2L	18404593	5'	+	hobo	64	1	66.67
GGTATGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGCTAGCATAAACAATAATGTTCAAGTGGAAGTGTAGCACACTGCATAAGTGCATGGTCAGCAATCCCA:1	+	chrY	1732327	5'	+	gypsy11	4148	2	74.24
CCGTGCCAAGTGCCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr3R	18582281	5'	+	roo	13	2	69.70
ACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACAC:1	-	chr2R	9463498	5'	+	rover	7008	2	63.64
TACTTTGCAAACAGAACCAAAAATTGCAAAGCGTGCCCTCAAAGTAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1	-	chr2R	5485258	5'	+	blood	7023	2	76.39
AAACCGAATGCTTTAAACTACACGGAAGTTCTATGAGCATTGTTTTTATACCGTAATAGTTTAATAAAGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr3L	20831385	5'	+	roo	54	2	56.85
TTATCATATATATTTTAAAAAATTCAACAAAGTATTTTCGACTATTGGGCGCCAATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGA:1	-	chr2L	6863386	5'	+	pogo	63	1	63.01
ATCAAAAATTCGAATTACATCTCAACCAGTAGATCATAAATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGC:1	+	chr2R	16945231	5'	+	jockey	5	1	78.52
CGCAACACTATACATTCAATATCTGCTATTCTGTATTCCTCTTTCAAACACGCGATTTCCGAACCAATTTAGACACTTTATGTATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAA:1	-	chr2R	8624881	5'	+	Juan	4064	1	57.64
ACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCT:1	-	chr2L	20117969	5'	+	invader4	33	2	54.68
TAGGTCAACTGTAATTATAAATAAGTTAGCATAAGAAGATGACCGAAATAATATAGCGGGTTACAAATGTGTTCACGCCAGACGGGCGCAAACA:1	-	chr3L	25337409	5'	+	Max-element	8239	2	62.77
CCTTTCAAGATTTAAATTGGAGGGCATTGTTTCACGAAAAAATAATTGTTTACATTAAGGAGATTTACATAAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGG:1	-	chr3R	17419883	5'	-	roo	444	1	51.37
TATGCAAGTTTCTCTGTACATATATTTTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chrX	9540001	5'	+	roo	50	2	58.22
CTTGCCAACAGAACACAAAATACTTTAAATATGTACGTTTTCTTAATATAGATACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1	+	chr2L	20808321	5'	+	HMS-Beagle	50	2	59.54
TGGATGGCATAGGTACCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1	-	chr2L	19965057	5'	+	Doc	56	1	56.00
CACACACACACACACACACACCACATATCACCAGCCATACACAAAATCATA:1	+	chrX	17971843	5'	+	Quasimodo	70	2	92.16
GATACTAATTAGTACTATCTGTTTACTATACCAGCCTATCCAGTATTTATGTATGAGTATTATTTACTTAAACATACATCTAATAGAAGTACTTAAATTAAAAATAATATATGAATACACTAGGTTCCTACATGATAAAAATAAAT:2	-	chr3L	4168320	5'	+	mariner2	821	1	67.12
GAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGC:1	+	chr2L	11732248	5'	+	Doc	28	1	55.47
ATTAGCAGCTTGATAAATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1	-	chr3L	17115546	5'	+	blood	7068	2	54.11
GACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTTTTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chr2R	14542155	5'	-	roo	9006	2	67.97
TTTGTTGTGGTCAGCCTTTGTAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1	+	chr3R	22821946	5'	-	mdg1	414	2	63.45
GAGCAGCCGGAGAACATGACCATGTGGAGCACGAAATCTTATGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAG:1	+	chr2R	23332495	5'	+	invader4	7	2	74.17
AAAAGATTTACAATTAAAGTTGGCGATTAAATTGTTGCGATAGCCTTGCCTCGATTACCAATAACCATATGCTCACTTGTGGGTATAT:1	+	chr3L	14285163	5'	+	R1A1-element	5257	1	71.59
CTTCACTTCACTTTCTCCTTCAATTACTTAAACGTCTAGATCGCCGGCTTAATAACACTAGACGTCTTATAAATGCCCTTTCTTATATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTT:1	+	chr3R	5873773	5'	-	roo	8617	1	60.00
ATTAAGTCGGTCTAGTAAAATGACTTGCTTGACTTACTCCCCTCAGCGTAGTAAATAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCTATGTATTTTTTTTTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATT:1	+	chr3L	22532216	5'	-	Cr1a	4211	1	79.45
GGTTACACTCAGTTTCTGGTGCGCGACGTCACCGACACCTATCCGCAGCTGCTGGAGAACTGCACGCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACG:1	-	chr3L	9668941	5'	-	Doc	476	1	70.10
AGAAACAGACTTGCAAAGCAAATCTTGTTAACAAACTATACAGGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr2R	7898018	5'	+	roo	8674	2	77.40
TCACACTTTAATGTTATATGATGTTAACTTTTATTTATGTAGTCAGTCGGCTAAACTTCTCTGTTCCGAGTAGATTCACTAGAAACAATAAACCCCTTACCTTAAAGCATTGTAG:1	-	chr2R	4886832	5'	+	Cr1a	4140	1	61.74
ATTATATTTGCTAAGAAAGAGAATAACAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGGACA:1	-	chrX	10939936	5'	-	INE-1	132	1	79.17
GTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATG:1	-	chr3L	16047625	5'	+	Cr1a	499	1	57.14
ATATCTTTTTTATCACCGAAATAAATTATCAATTAAACTAAATTTCGTGTATCAGAGTTTACATTACACATTATTCGCAGTTTGGCACTTAAAACAAGAAGTTTGTTGCCACTAGATCTTTATAAAATATAAACTTTAGAAATATA:1	-	chrX	16990200	5'	-	hopper	176	1	75.34
ACTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACG:1	-	chr2R	5173517	5'	+	gypsy	70	2	63.01
AGAAGACGACGTTGCTTGTCTCCACAATGGCGGTCAATTCCGGCGGCTGATTATGGGACTCGATGCCCATGGGCATAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAA:1	+	chrX	6123800	5'	+	transib2	176	1	68.00
TTCATGTATGGCTATGGTCCCCTCTATAATGTTGCTACAATTATAAATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACAT:1	+	chr4	311151	5'	-	1360	3370	1	71.92
TGTGATAAATGCCAACCAGTCAGCGCACACTCTCACAAACATACCCATCACCCAACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGCGGACTTGAGCTGCGCAAGCGGTTTTGACCC:1	+	chr3R	12854887	5'	-	Quasimodo	6949	2	47.46
GCCAACCGGAAGGGGCGTGGCAAGCGGAAGGGGGCGTGTACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1	-	chr3L	12308397	5'	-	hopper	1337	1	68.97
AGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1	+	chr3R	28758316	5'	-	mdg1	7379	2	72.60
CTCAGGACTAGAATCTGTTGACGAAAGCGATTGGAGATTGCAGGGAATGCAATTCAAATCGAGTCATGTGGCCACTTTTAAGGACATTACATCGGAGTCCAGGCCCTCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1	+	chr2L	11518340	5'	-	412	7539	2	76.09
TGGCATTCGCAATTCGATTCGATTGACTATCTGTGACGAGCACCGATGTCTGCAATAAAGTTGTGAAAACACTCGATAATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr3L	12879684	5'	+	roo	10	2	79.58
AGGCTGACTGACGGTGAAGTCAAATCGAGGTGGCCCAAAATCTGACAAAGGCATTCTTGTATAAGCTTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGA:1	-	chr2L	4412662	5'	-	Quasimodo	7322	2	53.96
CAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1	-	chr2R	16785402	5'	+	412	32	2	62.37
ACTTTCAAGACATTGATTTGTAGCTATTATTTCTTATAGAGCAAATATCCCTTTCTAGACTTTAGTTACGAACCCCCTTTATCTTAAACCATAGACACCCATGCATGTTACGCCGCAGTTGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAA:1	+	chrX	12074454	5'	-	412	7546	2	74.66
GCTCTATAGAAATAGGTGTAAAATCGCGGCGGTGTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGGGAAGATTTCCAAT:1	+	chrX	17833001	5'	-	Tirant	315	2	73.97
GTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTT:1	-	chr2R	9463480	5'	+	rover	78	2	73.97
CCTGCTAAAGTGATTGGAAAGCTGTAAGAGTTCAGCACATCTTATTAAAATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3L	233324	5'	-	roo	9001	2	68.49
GCCAAAATGCAGCGGGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTCA:1	+	chr2R	9792086	5'	-	412	469	2	44.55
ATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATATTATATTT:1	+	chrX	2444362	5'	+	roo	8737	2	69.86
CAAAAAATATAACAGGCGGTGCCACGCTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTATCCATATGTAAGCTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGATGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCAC:1	-	chrX	22913226	5'	+	gypsy7	36	2	53.79
TGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTTGATATG:2	-	chrX	2950649	5'	-	Porto1	294	1	71.92
ATTGTAGTTGCAAATTGTTTATTTTTCTTTCGGTTTTTCGTGCGTGCGGAAAAACAAAATCAACGTTCGTTTCAAAATAAACTCATAACATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chrX	5643606	5'	+	roo	8695	2	63.01
AAAATAATTGGTAAAACAAAAAAAAAACCTTCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTTTTTTTT:1	+	chr2R	8577633	5'	+	Tc1	1463	1	64.77
GGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chr2R	18336162	5'	+	roo	8742	2	74.66
CCAGCGTGCAAAGGCATCTGATGGAAACGTGCAAGCGATTTTTACACCCTTGCCGGTGGCAAATCGAAGGAGAGGCACAGAACTACCAACTTCTAAGGCTAATCAAATAAATACACTGAAAATCTTTTCAAGTAAAAATAAAGAAT:1	+	chr2L	18748272	5'	-	pogo	2016	1	86.30
TATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1	+	chrX	9540033	5'	+	roo	82	2	77.40
GCTTGTTTGAATATTTACACAAGTGACACTGAATATATAGTGTGTGTGTGTGTTTGAGTCTGTTTATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATGCACTATATATTCATTCTCGCACGCATTTATCTGT:1	-	chr3L	17215514	5'	+	diver2	4645	2	35.16
GTGCAGCATACAAATGCAGTGCTGCGCAGAGTTGCCACACATCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1	+	chrX	1899632	5'	-	P-element	2847	1	44.04
CGAATAAACTGATGGTAGACTTGGAGTCGCAGTGAAATTATGAATAGGAAATAACTTCACCGCTTGCGCACGTTTTGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1	+	chr2R	9328578	5'	+	roo	27	2	61.24
AATATTAATTAATATAAAATGCCGGGTCTAAGCCAAAAATGGTTGCAGCCATTTTCATTACGGCCATAACAATGAAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATT:1	-	chr3R	29397541	5'	+	jockey	4599	1	54.61
TCCCCATCCATTCGCATGCCGGCTACTTAAGTTACACAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr2R	9632237	5'	-	roo	9052	2	71.92
GTCAGGACACGAAAATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1	-	chr2L	2703595	5'	+	hobo	33	1	57.81
TATGATCAACTGCATCAGTAAGCAAATTTGAATTTCACAAATCTGTGAAATAATTTCAGAGTAAAGCTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1	-	chr3R	1207574	5'	+	copia	4907	2	53.49
GGGTTTGCAGTTGAGCCAAGGCAACTGGATGTCTGAAGACGCCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTG:1	-	chr3L	5102550	5'	+	BS	4670	1	68.50
GTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1	-	chr3R	23495741	5'	-	copia	196	2	62.33
AGATAATTATCTCTTAAACTGCGTGAGGCGATTGCTATATTAGCTCGGTAATGGGTAGTTTCTTATAATCACTCAATCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGTTGATGTTG:1	-	chr3L	21853751	5'	+	Cr1a	4052	1	51.37
ACACATGGAAAACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1	+	chr2R	9791543	5'	+	412	25	2	68.97
ATAATTACTTGCTTCCTTTATTATATACTTATTTTTATCTATAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATCAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1	-	chrX	17316467	5'	+	412	7127	2	69.78
CGAAATTATTTTTTGAAGTTTATTACACGAAGGCGTGCGCGTGTCCAAGTATCTCCCGCCCAGATATATGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1	+	chr3R	17316222	5'	-	opus	468	2	58.91
AATATTAAAATGTAAATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACCTTACTC:1	+	chr3L	21817943	5'	-	roo	400	1	73.98
GTTGTCTAATCGAACATGGCTATCGCAAAATGGGTTATTTTTCAGGTTTTGTCCAAGATAAGATATCGAGAAACCCATTGCAATTTCGCGGCCGCAACTCCAACACTTCGGTATAATATGAACCATAATAATAAGTAAACTAATA:1	+	chr2L	7990349	5'	+	mdg1	76	2	76.55
ATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1	-	chr2R	5485198	5'	+	blood	74	2	67.81
GGGCGATAATTCATTTCCGCCGCGAGCGCCCCGAAAAGTGGGCTACGGTCAGTAAACAATCCGTAGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTGCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1	-	chrX	11471675	5'	-	hopper	1362	1	53.47
TATAGTTCATATATATCATTAAAACTTGTCCGACGATTAATATGTATATATATACCTAGTAGTAAAATTAATAGAATGTCTAAAGTTGAATTAGATGTTTATAATACTGCTATTGAAACAAGGGTATCTGATAGTCGGGGAACT:1	-	chrX	19184191	5'	+	INE-1	557	1	77.08
CAGTTCTATCCAATGTTTCGAAAACATGTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTA:1	+	chr3R	23495638	5'	+	copia	4929	2	57.53
GGCTTACCTATAAGAAAAGGAAAAGGACACCCAATCATCCCAAAGGGATAATCGTGTAATGGTGGTGGTTTGTGTAAAGAATGAAAGATAAATAATTTAGTGTTCCGTG:1	+	chr3L	5655533	5'	+	R1A1-element	72	1	74.31
AAATTGCATGTACCATCACGTTGATTTGATAATTTGATTGATAATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAA:1	-	chr3L	24916726	5'	+	Porto1	145	1	38.89
TAGCTGCTAAATTTGCTTTTATCTAAGATAGTATAACACAACCAGTTTTATGTCTAGCTATAAAAATCAACCAATAAGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1	+	chr2L	9399422	5'	+	Transpac	41	2	56.16
CACCGTTTGTTGGCCTGCTTTTTTTTTAGTTTTACCACCCACACAAGTCAAGAAGAACAAGCCACAACAAACACACTCACAGAAACACACACACACACATACTC:1	-	chr2L	1705145	5'	+	accord	7031	2	78.85
ACACACAGCTCAGCAATGAATCCAAAATCTAAAGGGATTCTTTAAAAAACGCCACAAAAAATGTTTTTTTTTCGTTTTCACTCGCCGCAAGATGAATACTCTACTGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTTAAATTTATTTT:1	+	chr2L	17751689	5'	-	1360	371	1	50.68
CTTTAGTGGAAATTTACACCATGAAATACATGTGTACTGTCTTTCTTAGGGCGGCGTAATCCTGGTTTCCCACGACGAACGCCTCATTAAGGTCGTCTGCAAGGATAATAATAATAAGCTTACAAATAAAGACTG:1	+	chr3L	19588782	5'	-	Cr1a	4038	1	77.78
GATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTG:1	-	chr3R	27424930	5'	+	blood	72	2	58.65
CTTAATTTAAAATGCGACGAAGCGTGGCACACACACACACAAACACAGAAAAAATCCGGAAAATGCCTCGAATATTTCACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1	-	chr2L	1839338	5'	+	hobo	15	1	68.70
AAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAACATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1	+	chr3L	20831302	5'	-	roo	333	2	77.04
ATAAACTAGAAATCTAAAAACTAAAATTATTTAAATTAGGCATTTTTTTTAAATAATCATTCTATTTATTTTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAG:1	-	chr3L	14944623	5'	-	G5	4755	1	69.18
GAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTCTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1	-	chrX	9540094	5'	-	roo	8992	2	70.55
GCCACCAAATGCCACGTACAAATGTACCTTTATCCCAGCCCATCCGTCGCACTTCCATACGCAGAACCAACTGCGCATGGAAGTGCGTTACAGATGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAGGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTT:1	-	chr2R	7252880	5'	+	HB	40	1	42.47
CTATCTCAATCATTGAATCACCGAGCATAGCGTGCTGTCTTCCCATCCAACATTTCCGGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	-	chr2L	3114605	5'	+	roo	13	2	73.81
TCCCTTCAAGCAAACAATGCTGACATAGTTTTGTTTTTGCAAAGAAATGCTTGGATTAAGTAATTTAGTTCCTTAGAAAGTATTGACTTATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1	-	chr3L	24291271	5'	-	1360	205	1	60.96
TAAAAAACAGAGAGATAAAATAAATGCTTAAAGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	+	chr2R	18336096	5'	+	roo	12	2	74.66
CGTCTAGCCGAAGTCTACGCTTCTAAGGGGCTTATAAAAAAAAGTATATATAAAAAAGAACGAGACAGAAAAAAGCCTTGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGCGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCA:1	-	chr3L	17483164	5'	-	roo	128	2	50.00
TATTGGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTCCCAAAATTAATTTTGCCACAAGACCAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTGTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGTTAGG:1	+	chr2R	4565594	5'	-	G5	4666	1	67.12
GATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCC:1	-	chr3R	6611290	5'	+	HMS-Beagle	47	2	56.15
TGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCTTATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr3R	20469580	5'	+	roo	39	2	47.55
AATTAGTTATGGCCGATGGTTGGGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAATTCAGGTATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	-	chr3R	27424961	5'	+	blood	33	2	63.20
TCGAATATAATAATAATGTGTAGAATGCATATATTTTTTGCAGCTTTATGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTCAATTTT:1	+	chr3L	1534656	5'	-	pogo	2040	1	63.04
TTTTTGTTGTCGTTTTTTTTGTGTGATATTATCAAGTGAAGTGCTTTTGCGGTTCTCGCGGCTGCCTTTGTCCATTGCATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAACAAAGGGATTTTTCCATGTCCCTTTTCG:1	-	chr3R	31883625	5'	+	HB	57	1	54.11
GGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATG:1	-	chr3L	11530969	5'	-	roo	337	2	65.07
TTGTGTTGAATTTTTTGCATGAATTATGCAAAGGAGGGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGATAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1	-	chr2L	15875843	5'	-	hobo	2933	1	71.00
CGTTCGGGTATTGCCGTTTGCCATTTGGCATTTTATTTACCGAACCGGAGCTGAGAAGCCAACTGGGAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1	-	chr2R	24218633	5'	-	412	7534	2	67.92
CAGCAAAGGTGTGATCGATTACGTCAAAAATGCACGCTGTGTTTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAATGTAGGACTCAACGGCAAAGGCACTATTCCTCACTATTCCAACGCATGATGGCGACTGAACCGTGTCGGGACAAAACT:1	-	chr2L	22015878	5'	-	mariner2	103	1	69.86
TCGCTGCATACTTTTGGGGATTACGAAACGACACCATGTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTAT:1	+	chr2R	16891853	5'	-	hopper	1329	1	73.29
AGGGAACTGCACTCTCTTTCTCACCCTCGCTGCCTTATTCACTCTGTTGCTGGTGGCGTATTAAATTTCAAGAACTGGTGATGGAACACCGTAAGCCGGTGAGCCAGGCAGCACG:1	+	chr2R	18223039	5'	-	G6	249	1	67.83
AATAGAAAAGCAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1	-	chrX	22511403	5'	-	1360	3342	1	74.79
AAAAAGGGAATGGTCGAGCCGAACGGCTCTATTGTCGATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTG:1	+	chr2R	1320631	5'	-	diver2	353	2	71.72
AATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1	+	chr3L	23146502	5'	+	1360	67	1	73.55
AAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1	-	chr3R	17605762	5'	+	Tabor	6871	2	62.33
TGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACCCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1	+	chr2R	6919689	5'	+	hobo	41	1	64.89
TACGCATTTTGTTTTCAATGCCCAATTTTGCGTATTGCAGCTAGCCAATTGATTGGCCTTCATGTGTTAAATACTCTTGTCAATGCGAAATCTCATTTCCAATAGACTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1	-	chrX	6279491	5'	-	P-element	2874	1	76.71
AACAGTTTATATAAAACACGAAAAGAGACAGAAAAGAATCTCTTGGCGTTTTTGTTTCGCATGCTATATTAAGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAAAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAG:1	-	chr2R	5125312	5'	-	Doc3-element	4516	1	50.68
AAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1	+	chr2R	6086314	5'	+	pogo	45	1	60.94
GTTCAAAAATCCCACTTACTGGTATCGGAACTTTTAAGTCTGTGTTTTCTTCAGATTTGTTTAAATTTATCAACTTAATAATAACTTCTTAAGTTTTTTCTCATTTTGGTGCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAA:1	+	chr2R	3190878	5'	+	INE-1	507	1	61.64
TAGAGGGAATTCAGATAAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1	-	chr3L	21855548	5'	+	blood	35	2	57.58
GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATAC:1	+	chr3L	25232771	5'	-	accord2	146	2	63.71
ACCCGGCCGGCCAAATGCTGAAGCGGCACAAAATATGTCTCTGTTTACATTAAAAACCTATGTACTCTTAAGACCTACACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGTACATATATATATAAGGGATA:1	-	chr3L	25824668	5'	+	Juan	4189	1	61.03
CAATGCAATGTAGACCACATAATTTTTGATTGCCCACAATCCAGAAAAACGACAGCGATCGACATTGCAATGTC:1	+	chr3L	24038313	5'	-	G3	192	1	63.51
ACCGTTTTCACCTTCCAGCTGCCCAGACACCAAAGTCACTAGCCAAATAGACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1	-	chr3R	14940171	5'	+	jockey	80	1	65.52
TCATAAAGGCTTTAATTGTCCTGCTTGCGAATGCCATCATAATATCACAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTTTATTCGAATTTTTGTCAATAGAGTGTTCAGCATGCGACAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGC:1	+	chr2R	18436866	5'	+	1360	467	1	76.03
AAAAAGGGACAAATATTTGCCAATGTCAGAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGCTTTTTTTTCAATAATGTGTT:1	-	chr3L	10013690	5'	-	hopper	1394	1	65.85
CTCGGCTATTGATCCTGATCAACAATATACATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTTATCGAATCTAGTATACCCTTTTACTTTTACCCTGTAACGGGTATAAAAAGTTAGAATTGATTGCTTT:1	+	chr2L	21737998	5'	-	Cr1a	4258	1	73.29
TATTAAGTGTCGTTAATTGCTATCCTTGTGCAATGCAATAAATGTGTGACGCTCAGCTGGAGGTTACCACCTACCGCCTCCCACCGCTAAATACATACGTATGTGTGTGTGTGTGTAGAT:1	-	chrX	4611142	5'	-	Quasimodo	35	2	66.67
TAAAATGGAATCCTAAAGTTATAGTAAAGTGTATTACAGTTATAAGCCCCGCTTGAATATGAATTAATTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTA:1	-	chr3R	9039022	5'	-	Juan	4158	1	58.90
CTTCACCAAGCCGTCCGTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACAT:1	+	chr2L	12290677	5'	+	1731	74	2	65.75
ACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	+	chr2L	14772020	5'	-	roo	9022	2	50.68
TAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1	-	chr3R	17243225	5'	-	hopper	1367	1	50.69
CTGATGGCCAATGCGCAGCATGCCCAGATTCTCCAGCTCGTATGGCCGTATGTTGAGCAACGCCCGTCCGCCGATCTCCTGCTTGGAGAACTCGTACAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTTGCTCCGGCTCAC:1	+	chr2R	17419123	5'	+	gypsy	7249	2	73.19
TTACAAACAACACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1	-	chr3L	26011955	5'	+	F-element	65	1	62.79
AATGCCGGATAAAAATGGCTCGTAACGACGACAACAACCAGTTTGTACCCACACACACACACACGCACATATACAC:1	-	chr3R	15067750	5'	+	accord	7033	2	88.16
GGACATAAGAGACGTGACTTCGCCGTTAATGAACTAAACCTGTCCTTTGGAGTCCTTCGACTACATCAAAAATTAAACGTGTGCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1	+	chr2L	5844954	5'	-	transib2	2787	1	60.27
AATACGCCATCATTGTGATTGGAGTGAACAAAGGAGATAGGATTTAAGTATTAAAACATGTTATGAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCCTCTGTTAATTTACGATTAATTATAAATTTACTTATCATACTTTTTTAAGACACA:1	-	chr2R	5532328	5'	+	G4	3822	1	64.38
CCAAAAAAGGTGTCACTTAAAGAAACTTCACACCACAAAAAGGTCAACCCGTTACTCGTAAAGTGAAAGTGCTAGTTTCGTTGAAAAGTAGCGTTTCCGACCATATAATATATGTATGTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCC:2	-	chr2R	5509956	5'	+	INE-1	87	1	64.38
AGTGTGTGTTGTTGTAATCAAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCA:1	-	chr2R	13006509	5'	+	3S18	5837	2	63.70
GGTTTGACTTAAACGTACATTAGGTTGCTTGTTAATTGAACTAATCAATTTGAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chrX	2444315	5'	+	roo	15	2	70.37
CCAGCATAAGCCATCGATAGGGTGGCAGATCCTTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCC:1	+	chr3L	12971574	5'	-	jockey	4561	1	75.37
ATGTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGC:1	-	chr2R	20497030	5'	-	blood	337	2	49.32
ATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	+	chr3L	23635038	5'	+	roo	8738	2	70.55
AATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:2	+	chrX	13066491	5'	-	jockey	4944	1	52.05
CATAACCCCACCATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATG:1	-	chr2R	9463502	5'	+	rover	48	2	59.42
AGGACGAGAGCTTTCATTACACATTTTATCCCGAAAAGTATGCACCATTTCCACACAGCCCGCCTTTTTAAAATATTGTTGAATACTTTTTCATAATTTTATTATTCCCTTAAATATCTATCGATTTTCAAAACAAAACTTTTTG:1	+	chrX	22745106	5'	+	INE-1	320	1	59.31
AATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAAT:1	+	chr2L	19310292	5'	+	Juan	4102	1	54.79
ACGGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTGTGGGCATGTGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGAATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGCTAGCTGCATCGGCA:1	+	chr2L	21884508	5'	+	pogo	23	1	51.85
GGAAATATGACTTTTGAACCTATTTCATGGAATTTCACAAATTTTAAAAGCGGCAAAAGTATATCAGACTAATAATCATGAAAATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:3	-	chr3L	10648021	5'	+	412	7089	2	48.63
GACAAACCATTTATCCTGCAGTGTGATGCTTCACTACATGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTCAGTTGCATCGCATA:1	-	chr3R	524105	5'	+	blood	49	2	67.57
TATTGCTCAATAACTAATATTTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGATTCTTTATTTTTCCAAAAAAATTAAGTTAGCTGC:1	-	chr2R	20944405	5'	+	pogo	2035	1	77.40
AGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGCGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTAGGGTGG:1	+	chr2R	5173452	5'	-	gypsy	373	2	77.40
GCACTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1	+	chr3L	233251	5'	+	roo	8730	2	70.68
AAAACGGATTACAACGAAGGCATATTTCATATTTCATATTCCTTTCATAAATATTTGACCTTAAATAATTTTAATAAGCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATG:1	+	chr2R	5217454	5'	-	copia	92	2	56.85
AATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATAT:1	-	chr3L	8249133	5'	+	jockey	4557	1	53.28
ATCGGAAACTGGCTTGGCCATATGGTCACGTGCTGTTGTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chr2L	17471726	5'	-	roo	9046	1	66.44
AAATGGAGGTGCGTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACTTGCTCCTTCCT:1	+	chr3L	19013887	5'	-	invader3	5448	2	72.58
AGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCG:1	-	chr2R	2308823	5'	+	McClintock	27	2	68.00
TTTTATTAAATAAAATTAATTGTTCTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTTTTTTTTAATTTTTATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATT:1	-	chrX	8976036	5'	-	TAHRE	10411	1	47.26
GAAACACTAAAAGCAACGCAGACAAAATACTCGGCCCCACACAACAAGCAACACACACGCATAGCGAGAAGTAAACATTTAAATTTAAATTAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTT:1	-	chr2L	14546929	5'	-	invader2	28	2	62.33
CTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAACTATC:1	-	chr3R	31817526	5'	-	roo	359	2	61.86
CCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1	-	chr2R	2016894	5'	-	1360	3309	1	73.76
AAAATCATCATATTTAAGGTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGAACTCGCTGCCGCATCCCTCACCTTGATA:1	+	chr3L	18368952	5'	-	opus	7457	2	80.43
GGTTGTTGTGTGGGTCACTTCGCTCCTTCTGATAAACACTCGCTGATAAGCCCAGCGCAGACACACACGCACACAGACACACATTGCTGAACGTGGCCACTTGCGC:1	+	chr2R	16731477	5'	+	micropia	5203	1	52.83
AGCTCCTTGAGGTAGAGCTAGCAAGTATTGTAAACTAAGCTCGTGCATAAATAAAATCCTCAATTTGGGTTCATATTAAAATAGACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1	-	chr2R	9662824	5'	+	412	39	2	58.90
AATAAAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1	-	chr2R	19050334	5'	-	roo	393	1	65.75
GTTGGCGCCTCTCAAATTTTTTTTCTCCCCACAAGGATCGCATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTGGAGTTTTTG:1	+	chr3R	17817844	5'	-	roo	9051	2	71.23
CCTGAGCAGCCGGAGAACATGACCATGTGGAGCACGAAATCTTTTGCACCAGAGATTGTTGAGTACATATTCTCAGTAAGTAAATAATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGA:1	+	chr2R	23332492	5'	+	invader4	2767	2	75.81
AACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1	-	chr2L	17079836	5'	+	jockey	4725	1	61.54
AATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGTCAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	-	chr3R	28624624	5'	+	roo	84	2	81.34
GACGACGTCTGCTTTTTTATATCGCAGTCCGGAGAGACTGCCGACACCCTAAGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTG:1	+	chr3R	4136829	5'	-	Quasimodo	214	2	57.02
GTATAGCGAGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr4	419960	5'	+	roo	56	2	63.77
AAGCAAGTGAGCTGCACACAGCTCGAGTTTGGGAATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTACAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1	-	chr3R	19446261	5'	-	297	6936	2	58.90
TAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTCTTCCA:1	-	chr2R	9791641	5'	-	412	7489	2	75.00
GTATAAAAAGTAAACCAACCGCATTCCAATCCGAGTGACGCACATTGGACCCCTCATGACGACAAAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCC:1	+	chr3L	134282	5'	+	McClintock	447	2	61.61
TGCGTCTTTCCGAAATTAGCAATGGAGTGAAGTCAGAAGAAAAGAAGAAAATGCTGTGACAATCTCAGAAAGACAAGCCAAGGGTCCTGCTAACAAAAGTCACGGCAAACGCCAGAAATCGGTTTACGCCATGTAGGG:1	+	chr2L	22002312	5'	+	mariner2	734	1	68.12
GAGATAATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1	+	chr3R	5061803	5'	+	mdg3	5280	2	66.90
CTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1	+	chr2L	21884509	5'	+	pogo	62	1	63.01
CATTTCCATAAACAAGTCGAGACTGTTGTCGAATTTGGGTAGAGATTGCATTCGGGGGCAACGCAAAGATGTGCTAGTCCGATATCTATATGTATATATATATAT:1	+	chr3L	7093829	5'	+	1731	4409	1	72.38
ATTAAAATTACTTTCAGTCCTGCCAACGGGCGAGAGCGTTTAAGATGGCTAAGGCAATTGAAACATTAAATTCGGTGCATGTTACCATTACATTTTTCCTAGCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGAC:2	+	chr3L	2325666	5'	+	I-element	5093	1	70.83
AAAAAAAAAAAGAAAAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGAAAAATTCAAATGGCCTTTTTATTGTTTTTTTTTTGCGTATTTTCATGTTTCCTTAAACTTTTAGT:1	-	chrX	9702322	5'	+	Transib5	399	1	73.33
GTGAGACAAGACATAGGATTATCGATATGTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1	-	chr2L	22685242	5'	+	Ivk	18	1	73.29
CAGTCGCGGTAGGAATATTAGTCGCGGATAAATAAATTTCTATCCGATATTGAGCATAAAAAAAATCAAACAAAAATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCCTACCTCACCTTGAT:1	+	chr2L	10849663	5'	-	opus	7458	2	53.42
AAATCGCTATATATGTAAAATGATTAAAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTTCCAGTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr2R	19050330	5'	-	roo	9051	2	63.70
ATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACACGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1	+	chr2L	13585827	5'	+	Tabor	7	2	69.15
TATGACAAAATTATTGGTATTCTAGATAAAGTTTGGGTTTGCGAATAATTGGTTATGATTTACCTTTTTGTCTATTGATTCAAAGATTTAAAATTTTGGCGAATTGGTTTCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1	-	chr3R	17831931	5'	+	F-element	14	1	73.33
GATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCTTTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1	+	chr3R	21706001	5'	+	297	56	2	68.91
TAATGTAGGGAACGTCTTAGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1	+	chr2R	15064342	5'	-	412	431	2	59.03
AACATGTTATTCTATTTGATTGCACATATTTTAATTTGCATAAACATGGGCAACTGGCGCGGCACCATCCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGTC:1	+	chr2L	14892197	5'	-	transib2	2815	1	69.23
GTAAAACTTATTTGAGACACGAGGAACATGAATTTATATGCTGTGTATGCTTAAAATTCACCATTTGATGCGTGAAAATAATTCTAATTCTAAGCTTCCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1	+	chr2L	17607562	5'	+	hobo	1	1	70.97
GTTTTAGTCCGCATTAATGGTTCGTAAGCCATTTTTAAAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGA:1	-	chr2L	5845061	5'	+	transib2	73	1	71.43
GTAGTTTAATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1	-	chr2L	17079870	5'	+	jockey	4686	1	73.60
ATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1	-	chr3L	21855513	5'	+	blood	35	2	63.92
CTTGCTCCTTTCTAAAATTGTTAATAATATCTGCTATTCATATTGTTCACACATGAACATGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAACTATATTTAGGATTTT:1	+	chr3L	233254	5'	+	roo	81	2	72.41
AAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2L	16016422	5'	+	412	7094	2	52.67
TTTGAGATAGATTCCTATCACATAATGACGGAAGCCACATTAAATCAATGTCAGAAATGGCAACTAAATAAGAGAATATGCAAAGGAAGTTGGCCCGAAGCCCGTGCATAGCTGGCAAACACTACCC:1	+	chr3R	19449217	5'	+	gypsy6	94	2	75.59
AACCAAAATGCTTGTGGTTCCTGTGGACGTCGCGTTGATTTTGCACTTCATTTGTTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1	-	chr3R	19529203	5'	+	jockey	4691	1	57.58
GTAACATCAATTCTAATTGTAAAGCCTTCAAAACTAATCACTTAACCATTAGTTCTCATATGATGATGCACAGTTCCATGTTTCTCCAATAATTTTTGATTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGGA:1	-	chrX	20954062	5'	+	297	352	2	60.80
TATACGTTATAAGAAAACGTTACATCAATTTTGTAGCATACATTTTGGGGCATGTACTACTGAATGTACTGCATGTACCGTAGAAAACTACTTCTATTGCCCGAGGTTGGGTTTTATTATTTACTTGTTAATTGCGCTGTTATG:1	-	chrX	20266420	5'	+	BS	5037	1	77.78
ATACTCAAGACTTTTGGTTGCGCAAATTGGTCGTTCTGAAATCATCGCATATGTATATGTAAAATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chrX	5643415	5'	-	roo	351	2	70.37
GTACGCCAGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAG:1	-	chr3R	11547818	5'	+	G2	289	1	72.99
GTGTCGTCTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1	+	chr2L	21367182	5'	+	Doc	35	1	59.59
ACTTACAGGGGAAGGGGAAAACTTAGTGACAGCAGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGGCGCTGGTAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGG:1	+	chr2R	16373492	5'	-	Max-element	8393	2	37.31
TTGGATGCCTGTTCTATTTATTTTTGTTTCAAATTGTACAATTTTTTATGAATTCCTTTAATTTTATATAATAATAATAAAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACATTTGTCTGCTAT:1	-	chr4	299582	5'	-	1360	163	1	54.79
CACGTTCTACAAAGATTTGCGAGTGCACTTTGCATAACATTCCATAACATTGGTAATATAGGAGAAACTAAACTAGCTATTGGCGGTCCGTCTGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTG:1	-	chrX	15302460	5'	+	INE-1	159	1	60.28
TTTCATTCTGCTCGTCGTCTGCCTGCCCCAGAGCTCCGACTACAGCTGGTTCTGGCCGTAAGTCTGATCAAAACTACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAACTTTATCGCACCCAT:1	-	chr3R	6929521	5'	-	jockey	379	1	61.86
GACATCGCCTTCAGTGCAAGAATCTCGAAACTTTTTCATCCTTCGATTTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1	+	chr2R	14542093	5'	-	roo	398	1	71.85
AAGCAGCGAGATCGCCGAAGGAGTTATAAAACATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCA:1	-	chr2R	4294596	5'	+	McClintock	32	2	68.82
TAGCCCCACTCCAACATGCAGCAAAAAATATCGAAAACCACTAGCGCAAACATTGAAACCAAACATTTCATATGATGATCTTAAATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTT:1	-	chr2R	23332650	5'	-	invader4	3064	2	74.05
CAAAACATTCCCAATAGTTTTTTAAGCGAAATACGTTCATATATGTATTTTTATGGTATCAGCAATCTCAGACATCTGTGTCCCATGCTGACTACATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAAC:1	-	chr2L	15732606	5'	+	F-element	274	1	68.35
CCAAATATGGCTAAAACCACTGTTGTTGGGCCCAGATTTCACAAATAAATATTTGGCATTTTTTGTACAGAGGAAACTTTGGTAGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATG:1	+	chr2L	15282219	5'	-	Quasimodo	189	2	66.06
CCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGTCCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:1	-	chrX	6499041	5'	+	Quasimodo	72	2	71.23
CCAGAGCACCTAAGGACGAAATCGAACGATTCTGCCCACATCGAAATTGAAAAAAAAAAATTACGATTAACGGAGCATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1	-	chr3L	22968448	5'	-	mdg1	7431	2	60.00
AATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	+	chr3R	18339055	5'	-	roo	9041	1	63.01
AAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1	-	chr2L	14081381	5'	-	1360	3322	1	75.19
ATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAG:1	-	chr3R	9714505	5'	-	Stalker4	7328	2	59.59
ATTAGAAAATATTGGTTACCTTTTTTTCTGGCACAGAGATGGAAAACGGTTCGCCACGAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:2	-	chr3L	18369066	5'	+	opus	13	2	68.49
AGAAAATCTTGACAATAACTCATTATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAGATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1	-	chr3R	31817588	5'	-	roo	395	1	77.93
TCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1	+	chr3L	4948058	5'	-	hobo	2924	1	50.65
CGAACTAATCTATTAGCTCTAAGAGATTATGTTTATTACCCAAAAAGACCATAAAGAACTACGTAAGCACTCTAGCGCCCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTAATACATATGCCGATCGCGGAGAGTGGGCATGCTGAGCATG:1	-	chr3R	25592497	5'	+	Stalker4	189	4	68.97
TAATGGGGGCTTCCAATAGTTACGGGTGTTGCTGTCAACAAAACACATTGATTAGACCCATTAACAAATTGGAACGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1	+	chr3R	25826651	5'	-	mdg1	415	2	71.43
ATTACGACTGCAGAAGGCAAGGAGTCCGGAGTCGAGTTCCTGGCCATTGCCATCAAGCGAAACCCATCAACGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1	+	chr2R	21907907	5'	-	roo	9021	2	52.05
GTGGCAGAAGGACACAACAATAAAGGACATCTCTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGT:1	+	chr2L	12290693	5'	+	1731	89	1	76.55
TAAAGTAGGATCATGTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATT:1	+	chr3R	16076784	5'	+	roo	67	2	65.07
TTTTATATCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	+	chr2R	6172976	5'	+	pogo	49	1	54.23
GTTCAGTTTCATTTATGCTGCCCCATAGCTGGTGTATTTGNAGCATGCATAAATATGGCCGCAGGCCTTCTTTTTATGCGGCGGCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCACAAACTTAAGCGA:1	-	chr2R	10215807	5'	-	Quasimodo	7322	2	61.87
TCTTGGTTGAGCTTCAAGCTCCCGAATTTAGCTCCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGATTT:1	+	chrX	6499884	5'	-	Quasimodo	6954	2	58.95
AATCGTTTTAATACATCCAAACCGATTTAATGGAATCCAAAATTTTTCTTTTTTTTTTT:1	+	chrX	7325473	5'	-	HMS-Beagle2	493	1	86.44
GTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1	-	chr3R	17605743	5'	+	Tabor	6890	2	50.00
ATGTGAATATCTCGAATAGTCTTGCAATTAAGAATCGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAT:1	+	chr3R	23495663	5'	+	copia	61	2	69.67
CATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1	-	chr3R	10462686	5'	+	opus	7041	4	71.43
GATGTGTCAGTTGCCAAGTGAGGAGGACGACGAAACCCAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATAT:2	-	chrX	10521707	5'	-	Tabor	401	2	73.97
ACCATCGCCTTGAAGTATGCACTACTTTTTTCAAACTATTAGCTCCGAAGAACTTCTTATCCTAAATACTAACCTTTCGGTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATATTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAA:2	-	chr3R	13770145	5'	+	BS	5075	1	53.42
GTTATTATCTTTACTAAACGTAGGAGAGTATAACCAATGCACTATAACTAACAAGTCGAACCGTTTTTGTAGCATAATATGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGATGCAGCCG:1	-	chr2R	20497028	5'	-	blood	7347	2	47.95
CAATTTCTGCGTAGATGATGGGACAGTTTTAGGTGTAAGCATATGAGTCATTTTGTTTTTATTAAAAAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1	+	chr2R	21145856	5'	-	pogo	2091	1	67.29
GAGCTGGGGGCCTGTCATCGACAACAGCTGCTGCTGCTTTCATGTCTGTTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTT:1	-	chr2L	9412091	5'	+	jockey	4527	1	61.11
GTGCCGCTGACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1	-	chr3L	20168446	5'	+	mdg3	68	2	61.64
TAAATGTTTATTTTTTTTAAGTCAGATTTCATCAATAATAAGTTCCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAAACTTAAATA:1	-	chrX	9699859	5'	-	Tc1	1561	1	70.55
AATCTCAGGAGAAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCCCCGTTAGGAATAAGTATAT:1	+	chr2L	21008544	5'	+	invader3	71	2	65.52
AGTAAGCAAATTTGAATTTCACAATTCTGTGAAATAATTTCAGAGTAAAGCTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAA:1	-	chr3R	1207558	5'	+	copia	4939	2	64.83
AATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1	-	chr3L	17560375	5'	+	pogo	67	1	64.38
ATGGAGACACATGTGACACATGTGCGCCATCTAGCGACAGTTTCAATAATAGCTTCGACGCTCTGATGTTTGACTGAATAAATGCAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr2R	9868673	5'	+	roo	8685	2	66.67
AATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chr2R	7898073	5'	+	roo	8703	2	61.67
GATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAAC:1	-	chr3R	11547788	5'	+	G2	322	1	50.71
TCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAA:1	+	chr3R	26659733	5'	+	HMS-Beagle2	6922	2	52.45
ATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1	+	chrX	18193683	5'	+	jockey	75	1	69.84
CTGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGGCTGGATGGCG:1	+	chr2R	4330779	5'	+	baggins	5241	1	65.18
AAAGTACGGAATATATGTATATGAACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1	-	chrX	18030319	5'	+	opus	7149	4	77.65
ATTTTCTTTAGACGGCCAGCTAAATTGTCAGCGAAATTAATGTTGAAGATATAATTTATGGAATGAAAATAATGAGTGCAACCGTTTTCGAGTCTCTTATTAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1	+	chr3L	10647864	5'	-	412	487	2	64.93
AAGAAGCCGCCCCAAGATGTGAGAAGAGTGAGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1	-	chr3L	16750764	5'	+	Tirant	28	2	60.48
TTAGATTGCAGGATACAGCTTTTAAAACAGACAAGAAAGCTGGCTTTAACGTATCTACGCATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCC:1	-	chr3R	6611293	5'	+	HMS-Beagle	6843	2	54.89
AATAAATACTTTTTATTGCCTAACTCATAAAATAATACTGCATACCTTGACGAAATAAATTTGCGATGCATACCCAACATAACTTATTATATTGCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1	+	chr2R	919648	5'	-	copia	230	1	67.81
AATAACTCATTATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1	-	chr3R	31817575	5'	-	roo	9044	1	68.49
GGCCTTGGAGCCCTCCATATAGTAGAACACAAAAAAAAGGGTCTCCGTTGAGAGTCGTTGATAAAACTCAACTGTATCATATATTGGCATCTGTGCCTTAAAATACATAATTAGATCCAACTAGCACTAATATTTAATATAGTTAT:1	+	chr2R	5657486	5'	+	Cr1a	4305	1	73.29
ATGGAAATTTCCCGGAACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1	+	chr2R	9091807	5'	-	1360	3351	1	59.31
GTTTGAATTCCAACGGATATAATAGATAATGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTTCTTGAAACGGTTTATTCGGATAATCAAAGAGTGCTGAAGCTGGGGTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATG:1	-	chr3L	21543378	5'	-	Stalker4	279	4	76.81
CGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATAATTCTTACGAGATTCGTTTTGCGCGTATGTTGCCGCTATGCCCGAATGCAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGCGCTCCTTGGTATATG:1	-	chr3L	2485994	5'	+	jockey	4558	1	42.96
GCTTTCACCTGGTTGGTTGGCTGCTTTGCAAATGCTCGGGTTCCATTCTGTTCGGGTTTTATACGTTTGGTGCGCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1	-	chrX	2518137	5'	+	P-element	42	1	52.14
CTCTGTGATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAA:1	-	chrX	21994014	5'	+	McClintock	5973	2	66.14
GCAGAGCCAAGATAATCAGCATTAGGATCTGCAAGTTATATTTTTTGTGTGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTT:1	+	chr2R	5173435	5'	-	gypsy	7377	2	65.75
GTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chrX	6486794	5'	-	roo	9009	2	66.42
TCATCAGACGTGAATTGTTTTCCGTTATCGGAAACTAATGTATCAACTAAGCCATTTCTACAGAACTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTT:1	-	chr3L	23818436	5'	+	copia	58	2	58.22
TTGCATCATCATTTTCTATGTTCATTTCTAATGCTGCCTAAATATTCGTTTAATGGTCACTTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATG:1	-	chr3L	10578791	5'	-	Tabor	316	2	58.90
CAGGAAAAAAAAAGAAGGCAAAATAAATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCCTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1	+	chr3L	10385861	5'	-	Burdock	194	2	78.45
GTACTTATGAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1	+	chr3L	22437882	5'	-	roo	8989	2	74.66
ATTTATAAATACAAATTATTCGAATTACTTATTGTTTACTGACAACATTTTTAAACTTTTAATGTCCAAAATAATACCAAAAGTATAACTCCGTTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCTCCGAGCTATGGGGCATCGCATCGAGA:1	-	chr3L	17877556	5'	+	Doc3-element	4338	1	56.85
GGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTATCCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1	+	chr3R	6290948	5'	+	Doc	14	1	70.19
TTACAATGTTTTCTTAACATTGATCATATTTGGAACTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACAC:1	+	chr3R	11105979	5'	+	Doc	78	1	75.56
AGATAATAAAGGAACTCAAGGATTCTTTATGGTAGCAAAAGACAAAGCCGAAAGTGGAGTTAAATACCATCGTAAAACATTTCTATAAAAACATATTTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGG:1	+	chr3R	14951134	5'	+	jockey	4952	1	71.83
TTTAGATTTCCCCATCTGGTTATTTGTACCCATGCAATTATTTTCATTAGGGTTAGGTTACAGTTCTAGTTTCTTTTCATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTC:1	-	chr2R	17623375	5'	-	opus	329	2	58.91
GCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGACCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	-	chr3R	18582224	5'	+	roo	8745	2	76.22
CCATACACCGATGATGTTTAGCACTAAGCAAATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACAT:1	-	chr3R	24383346	5'	+	rover	6998	2	53.47
TATCGAATGTAATGTAATGTAATATGTGGGTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCCTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1	-	chr2R	9221088	5'	-	opus	424	2	75.76
ATACTTTCAATTTCCCCTGCCAAATAAATGATAACGTAATGCGCCAGCATTATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1	-	chr3L	17115530	5'	+	blood	64	2	62.77
AGTAGCCACTCACTTTGTGCTCTGGCAAGTTATATGCCCACTGATTGTGTTCCAGGCGCAGGTCATATCCGGCTATTGGGAGAATTTACCGCCAATTCTGGTACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCG:1	-	chr2L	13306231	5'	+	gypsy2	59	2	68.79
AATATCCTTCTTAAATCTACACTTCAGGCTATTGGCCTAAACTTTAACTTATATCATGACAATGCACTCTGTTACAGTCATTCTAAGGAATTCAAAGTTTTGAAATATGCATCTATGTAGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTG:1	-	chr3R	6146160	5'	+	blood	7286	2	78.77
CCAAACTTGACTTTATCCTGAGCTTCGGAGCTTTCCATTTCAAGCTTAAAGCTGCACAAAGCTCCGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTT:1	-	chr3R	11510597	5'	-	I-element	114	1	59.81
GACAGACCAGTCAGTCCACACACCTGGCTAGCTATCAGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTGTGT:1	+	chr3R	30357844	5'	-	gypsy3	418	1	73.85
TATAATAATGCAAATTCTTTAAACATATTTAAGCATATAAATATTTTTAGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGT:1	-	chr3R	11207292	5'	+	FB	59	1	64.89
TAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTTACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCA:1	+	chr2R	13136865	5'	+	Doc4-element	338	1	50.00
TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCACCGTCGATGCATTGCT:1	-	chr3R	27036955	5'	-	invader2	318	1	61.64
CGAAATGGCAATGGAGCTCCGACTCGCAACTCGCTAGACCAAAAGAAGATTACCCAACAAATGTCCAGGAGGTCGCTATGTGAGAACTCGAACTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGA:1	-	chr3L	10059003	5'	-	transib2	497	1	60.69
AAGCAGTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chr2L	17420124	5'	-	roo	9047	1	63.70
GTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1	-	chrX	2842593	5'	+	Tabor	6895	2	55.48
AATTTCGATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1	+	chrX	13504116	5'	+	412	28	2	66.44
CAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1	-	chr3R	17243242	5'	-	hopper	1382	1	60.96
AGGATTCCGAGAAATATGACCTCAAAGATGAAGGTGAAGCTGTTGATTAATATAAAAAAATGCTTTATTTCCAGCGATATGACAATTAAATGTTTGAATTTTTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1	+	chrX	20453688	5'	+	INE-1	550	1	79.45
CACGATAAAAAATAATGCAAAGATTGTGAATTACCAAACTTCTAACCAAATTTCAAAACTAATAATCATGGACTTTATATTTTGAAAATACCATTACTCATGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1	+	chr3L	4536653	5'	-	roo	9049	2	64.38
AGATTCCAGCACGCCGAACGAGATTTAGTTAGCTAACTTAATTAGTTTCACTTTGAGTGAAAGAAAATTAAGTCACTCAGAAAAAAACTTTAATTAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTCATAAAGCCT:1	+	chr3R	28758261	5'	-	mdg1	396	2	48.63
ATATCACTTCGCTTTTGTGATTTGTCAGTATAATAATCCTTTGGAATATATAATCTTTTGGTAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1	+	chr2L	4953931	5'	+	Quasimodo	42	2	57.78
AGGTGAGGGGGAAGTGGGCATGCGAGTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCT:1	+	chr2L	6569971	5'	-	jockey	4919	1	79.69
AGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTTCAGTAGGCAG:1	+	chr2R	15064365	5'	-	412	408	2	72.92
GCCGTTAATGAACTAAACCTGTCCTTTGGAGTCCTTCGACTACATCAAAAATTAAACGTGTGCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAACATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTG:1	+	chr2L	5844975	5'	-	transib2	2768	1	56.25
AGCCCCAAAGGAAATCACCGGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATACCTTATGTAAATGAATCGAG:1	+	chr3R	22844178	5'	+	roo	8720	2	55.48
AGTGTATTGGATAGTGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1	+	chr4	419968	5'	+	roo	8736	2	71.23
AATTTTGGTTAAGGTTTTAGACAATAGACAATTTTAGTATAAAAATTATAATATAATTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1	+	chrX	22576308	5'	-	Bari1	1643	1	63.01
ACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chr3R	20427494	5'	+	jockey	20	1	70.59
CATAATTAATTAGTTATGGCCGATGGTTGGGGCAGTGTGATGTGTGCTTTTTGCCGTCCACCTTATCGCAGCTTTCCGATAAGAGAAGTCAGGTATCGAGGGAACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1	-	chr3R	27424968	5'	+	blood	7039	2	66.93
GGTTGTGAGTAGCGGGAAAAGCAACTGTTTGCACTTTGCGCATTTGATGTGCCAGTATACCGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chrX	10640114	5'	+	roo	8725	2	60.27
CACCACCACGAATCGTCTCCCTACGAGAGCTCTTTCAACTCTATATATCCCGGATCCAGTCCCGATTTCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCG:1	+	chr3L	16343178	5'	+	roo	30	2	65.75
GGAGTGGGATTACCTCGATTCTTGAGATGAACTTTGACTGTGCAACCGACTGTAAAAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1	+	chr2R	6919662	5'	+	hobo	52	1	56.06
ATCGTCATTATTTGCAATTATCGACAGTTTGCTTTTCTGCGGTTTCCTCCATCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1	-	chr3R	14651287	5'	-	P-element	2816	1	37.67
ATGGTGCCAAATTGCTGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTA:1	-	chr3L	10574427	5'	+	Tabor	12	2	68.49
GCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGAGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1	+	chr3R	14651229	5'	+	P-element	87	1	23.94
GGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	+	chr2R	7898060	5'	+	roo	8715	2	59.31
AAGGTGCAAATATTTCAGAGCATAGTTGTGGTTTTATTTCACCTATCCGCATTATCTGCAGTCAGTTCAACTCACTTTTTGTAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1	-	chr2R	21145998	5'	+	pogo	35	1	60.27
CCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	-	chr2R	14388007	5'	+	roo	51	2	66.67
ACACAAATATAGTTCATACTTCTGAGCGCCTACGAACAAAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1	-	chr2L	15991433	5'	-	mdg1	389	2	62.33
CGAAAAATAAAGGTAGACTCTAATATTTTCCTAAATAATGAAGGTGTTGGCACCTCTAATTTTGCATTGTACCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCC:1	+	chr3R	17891894	5'	-	R1A1-element	5145	1	59.29
ACAGGCCTTCGGATTCAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1	+	chr2R	7898057	5'	+	roo	8713	2	57.53
TTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACA:1	+	chr3L	27415235	5'	-	transib2	2742	1	74.66
AAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGCGACGGATTG:1	-	chr3L	23702254	5'	+	G4	61	1	57.34
AATGGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAGTCCAA:1	+	chr2R	5284579	5'	-	Doc4-element	2554	1	63.70
TAACAATATTTTAATTATTTGATTCATATGATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACT:1	-	chr2R	5485214	5'	+	blood	7045	2	54.10
CCGGCGCCTGGCTGGATGACCTCAGTTTCAGAAAAGACGATACGGATATGGTTAAAACAGCCATTTTTATATATGGCCTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGTACACAATTTT:1	+	chr3R	11496502	5'	+	1360	37	1	58.57
CATATTGAAATTAAGCATTCAATTTCTGAAGAATGCGCCCCTTTTGACGAACATTAATCTTAACAATTAAGTTTTCAAAAGACATATTAAGCGCTCGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTG:1	+	chr3L	15230626	5'	-	Stalker3T	98	1	65.15
TGTCTTATATACAAGACAAAACAAAAGCCGATAATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1	-	chr3R	18717919	5'	+	blood	35	2	66.67
AAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1	+	chr2R	9632122	5'	+	roo	8731	2	75.20
GATGTGTAGGTGTAAATTTCGATGAGTGAAAGTATAACTGATGGTTTTGTAGTGGCGACTGAAGAGCCGAGAAATAAATTTTTGCGCTTGAAGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1	-	chr3L	20033812	5'	+	blood	29	2	55.48
ACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1	-	chr2R	19798105	5'	+	Transpac	36	2	61.90
ATTAATAATAAAAGGAAGTATAAGTGAAAACTTATATTGATTGTAAGATCGCACTTGTTATACATCCCATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1	-	chr3L	15177323	5'	-	roo	9034	1	54.81
TGTTAGCAGAAATAATAAATAAAAATTCAAACTAAACTAAAGTTGTAATATCTTAATTCGGGCTTAATTACGTTCTGCAAATGGACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATCACAGTAA:1	-	chr3R	21276649	5'	-	BS	5059	1	51.72
GCTTTTCTTCCTCTTCTTCAGCTTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGATTGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCCGCCTCTAAAC:1	-	chrX	17833101	5'	+	Tirant	8127	2	65.35
CTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGCGTGTAG:1	-	chr2L	11661031	5'	+	F-element	59	1	41.78
TAGTTGTGTTTCGTAATACACGACGAAAGGGGGCGTTTAGCTCAACATCTTTGCCGTGTGGTTAGCGGGCGAGAATACTACCACAGTCCAGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGA:1	+	chr3R	7102247	5'	+	R1A1-element	4907	1	52.17
TTATTTTATTTCTACGTAATTGAATTATTAAGAATATACAACTTGTTAAGAGTATTGGGTAGTCTGAAAAGGAAAAACGTCACTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr2L	12892591	5'	+	roo	14	2	68.03
CATGCGCAGAGATAAATTTTCTCCCTTCAATATTGACCATCATTTGCCTCTTCCTTGCGTATAGGAACAGTTATT:1	+	chrX	20740822	5'	-	Bari1	156	1	58.67
AAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	-	chr2L	16091975	5'	+	roo	8723	2	72.58
TAAAAACTGGAGAGACCGCCATAGTCGAGTAGCTCGAATATCACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1	-	chr2R	6885386	5'	-	flea	4953	1	60.42
CAGTGTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1	-	chr2L	1377710	5'	+	hobo	34	1	58.10
ATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAG:1	+	chr2L	11732238	5'	+	Doc	11	1	64.62
AAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCG:1	-	chrY	311341	5'	+	1360	44	1	54.96
TATTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGTA:1	-	chr3R	11496628	5'	-	1360	3360	1	60.98
AGCCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTCGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATACATGTCTC:1	-	chr3R	10182203	5'	+	blood	61	2	60.45
AAAAATAACGTATATTCCGGGGGAATCGAATTTGTACTTAATATGTTTTTTTTTTGCGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1	+	chr3L	17558015	5'	-	jockey	4927	1	66.21
AATTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTC:1	+	chrX	21564655	5'	-	diver	6052	2	60.69
CCAATGATTTGGTAGTTCTGCGTGGCAAATTAGGTGCTCGTTATATAATTAGTTCAAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGAT:1	-	chr3L	9997419	5'	+	roo	8868	2	58.21
AAAAATACAAGAAAAAATAGATTTTTATTTTTCATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCA:1	-	chr2L	4221388	5'	+	opus	7169	4	73.50
TCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGACTTTTTG:1	+	chr3L	23906353	5'	+	1360	25	1	63.43
TACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2	+	chr3L	20654491	5'	+	roo	80	2	73.97
TTTGATGCATGCATATATCTAGGCAGCTATGTCTATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1	+	chr2L	16067104	5'	-	297	363	2	70.45
AAATCCACAAGGAACTAAGTATTTTTTTGGCAATTCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTATTTTTGGTTTGATCG:1	-	chr3L	19282953	5'	+	pogo	276	1	63.81
TGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1	+	chr2R	9091828	5'	-	1360	3329	1	59.59
ACCCTTTTCGGCTATGGTGGCGACTTAAATATAGGCCAGGTTTCCGCAAATCGTGATAATAATATTGAAATCAATCAAGGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACCACACTACTTTATATT:1	+	chr2R	6487833	5'	+	copia	36	2	58.70
CTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTACCATTTCAATGATGTAGGGGGATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGGT:1	+	chr3L	24213787	5'	-	invader2	5038	2	69.53
AATTCTTAAAATATTCGCCTGGTTAAGGTGCGCATCTTAAATAAGGCTACTTTGTAATAAATACACTCTAAAGCTTAAATCCCTTTTGAAAATTGTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1	-	chrX	2842620	5'	+	Tabor	29	2	70.55
CACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATCTGCCATAGTATAAGACCACAT:1	-	chr3R	25454119	5'	+	Quasimodo	11	2	54.78
CAAAAACCCATTTTCGCCGCCAATAAATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chrX	6486697	5'	+	roo	53	2	54.79
GTTTTCTTTAGTTGAGGTTAAACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1	+	chr2L	16091846	5'	-	roo	396	1	72.60
TAACATAGTTGGTTGTCCGGGTTAAAGGTTACAGCTAATTATATAGTACCTTCTCCTGCCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAGAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	-	chr2R	13817723	5'	+	412	7094	2	51.61
CTCTGTCCGTATGGCCTGTCCGTATGGCCGGTGGGATCTCGGGAACTACGAAAAGCCAATTCAAATGCCCTTAATTTTGGTTTTATTATTTTTCTCTCCCGCATTCTGGCAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGAG:1	+	chr3R	20343251	5'	+	INE-1	552	1	89.29
GAGAAAATATCCAAAATTGTTATGTACATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGCCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	+	chrX	5643459	5'	-	roo	9042	1	58.46
CAGAAGCATTACTACATCCTTTATCCTCCCATCCAGACATTAAAACGAGAGAGAAAGCTTAAGTTGACTTCCCCGACTTTCAGATACCCGTTACAGTGTTGGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCACACATTG:1	+	chr3L	23906337	5'	-	1360	3368	1	69.86
ACGTATGACAATGTCCATTTCTCCGGCTGAGAGTGAATCTGGAATGAAGAAGTAATGTGAATGAATGTAGTCACTGCTTACTCCATAAAAAAATATTTAGGAGATCATAATAAAGTAGGATTTATGTCAAGTTCCGGTCAGGCAGG:1	-	chr2L	17600957	5'	-	jockey2	3197	1	55.48
AAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1	-	chr3R	10182186	5'	+	blood	79	2	76.30
TGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1	-	chr2R	13084656	5'	-	roo	318	2	81.51
ACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1	-	chr2R	18336220	5'	-	roo	321	2	78.08
GAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:1	+	chr3R	26659719	5'	+	HMS-Beagle2	6902	2	64.96
CCGCATCGCATACAGATGGAGAGGAAAATACTTGAAAAAGGAAAAAAAAAAATGAAAACCGAAATTGCGTCGCATTAAGTAAAGCCTTCCTGGCCTGGTTAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCA:1	+	chr3L	10520201	5'	+	297	6518	1	71.85
CCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr3R	22844262	5'	-	roo	9009	2	71.43
TATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATAAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATG:1	-	chr2L	15622432	5'	+	micropia	138	4	52.41
AACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	+	chr2R	18336165	5'	+	roo	8744	2	76.55
GGCACACAGATCGCATGGCATTCGGAAAATATTCCACAGTCCCCAAATGTGACGAATTGTTTGGCTGCTTTTCTCTTTGCGATTTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGGTAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCA:1	-	chr2R	8146751	5'	-	P-element	171	1	60.96
CTTGGAATAATCGAAATTTACAAAGTACATTTAAAAAAAAGAGCATTATTCGTAAAACAAATTGATCTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1	-	chrX	14749706	5'	-	copia	234	1	53.42
GTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	-	chr3L	16343287	5'	-	roo	8993	2	72.34
AGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGC:1	+	chr2R	5284534	5'	-	Doc4-element	2624	1	59.66
ATCTGCTAATGAGAATACACGCACATACCACACATATGTATGTATAGGCGCGCGCACGCACACACCTGCAAAAGCTTTAACTAATCTATCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	+	chr3R	12443901	5'	+	roo	61	2	74.58
AGATGGCAAAGAGTCCAGCGAATGCTTGCTGATTGCAAATTGTCACGGTATTTTCGCTGGCAGCGCATAAATTGCCGTTTAACTCGCATTACAGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGGGTTTTCCTTGC:1	+	chr3R	10182082	5'	-	blood	350	2	65.97
TTTTAATCACAAAGTTTCAATCAATCAATAGCATTCAAATTTATGCGATATGAAAAAAAATAAAATACCATAAGCTATACAACTTAGCTGGGGGAGTCATGTATACCCCTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1	+	chrX	21016915	5'	+	Transpac	4949	2	56.55
AAATACTAAATTATATTAAGCTAAATATACAAACAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTACGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTACT:1	+	chr2L	6622958	5'	-	Burdock	194	2	72.00
ATGTGACTGTACTCGAATAAAAAATATAGAATTATTTATATATCGAAATGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTA:1	+	chr3R	9210635	5'	-	mdg1	7395	2	64.96
TCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTG:2	+	chr3R	15072555	5'	+	pogo	57	1	59.59
TTCCAAATTGCCTTGTACTTCAACTTTATCAATTATTCACAAAAACCTTTACCCTGAACTCAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGTGACGTG:1	-	chr3L	9673139	5'	+	Doc	16	1	58.42
GAAAATTAGTTTGTTTTATTTGAAAAACGTGGCTGCAATTTTAAACAAATTTGGGATTTAGGTTTTATTGCACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1	-	chr3L	15996042	5'	-	297	348	2	60.27
TCGAGATATTAAAATGTCACAGTTTTATTATTCTAAAAAAAGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGA:1	+	chrX	18478593	5'	+	I-element	73	1	74.81
ATGTATCGCTTCGGAAAGATTTTATATATGTATATGTCGGCGAGACAGGAGTCTCATCCATTCATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCACAC:1	+	chr2L	21325123	5'	-	invader4	3012	2	75.59
TCGTCTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTAAAATGTAATCATTTTCCAATTGTTTTTTATTTATAATAATTAAATTCGTTGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1	+	chr2L	21367185	5'	+	Doc	32	1	60.00
AAACTCAAGTGTCACAACACGTAAGTCAACACGTGAAAATTGGATTATTATTATTATTATTATTATATTATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1	+	chr3L	18596601	5'	+	Doc	59	1	54.79
TTTTTGGTTAAGACACCAAGTCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATGTTAT:1	+	chr3L	20831254	5'	-	roo	9034	1	60.27
GAAAAAAAAACATTTTCCATTTTTCGGAACTTTGTTTTAATCGTTACTGTGTTATCTTCAAAGTCATCTTCGGTCCTAAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTT:1	+	chr3L	9468340	5'	+	1360	3386	2	46.58
ATTATATCAAAGCGAATGTATTTTATATATTGTTGTATGCTCTTGGTTGCTCCAAATAATTTGCCTAAGACGCCCACAGTAACACTTTTCTCCTACACCGTCAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1	+	chr2L	11732235	5'	+	Doc	24	1	59.59
GGGAATACACGCTCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAATCCAGAGAAACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chr2R	15004738	5'	+	jockey	17	1	46.76
GCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1	-	chr2L	14081416	5'	-	1360	3375	1	67.57
GAGAACAGAACGCAGATGTCCTTTTGGTCTTGTTTTTGTTAGCTTGTCTCAGCCTTGACTGACTTTGTTTATCTTTCATTATTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1	+	chr3R	27424818	5'	-	blood	349	2	61.19
GTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCCAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCT:1	+	chr3L	19013899	5'	-	invader3	228	2	53.42
ATTAATGTGTATGTGTGATTGTTTACTTATTCCTAATTTTTCATTTTCAATTCCTCTGAACTTAACCTAATGTGTGTATAAAGGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTCATTATTAAGTACAGAAGGAAAATTTATCTAGTTATTAA:1	-	chr3L	26007749	5'	-	G5	4706	1	67.12
TATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1	+	chr3L	22863398	5'	+	412	43	2	62.96
CCCTGCAATTAAGTTGCTCGTTGTGCAACAAGTTTGTTTAGTAGAATTAAATAATACGTTCGCTTAGCATTCCAAAGTCATCGCTCTGTAATAAAGTCATTCATTAACTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTT:1	-	chr3R	28994499	5'	-	Idefix	281	2	73.79
ATCCAACATTTCCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr2L	3114561	5'	+	roo	8712	2	63.25
GACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGG:1	-	chr3R	11547810	5'	+	G2	306	1	63.01
AATGTGTTCAAGACTGGTACGACGAAATCGCGGACTACGACTTTGAAAAGCCACAGTTTGCAATGTCAACGGGTCGCTCCAGTGATAATTATCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGT:1	+	chr3R	6601687	5'	-	Doc	4317	1	51.03
AGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr3R	7482753	5'	+	412	7095	2	59.63
CTCCTCGACGGACGCAATCTTTGGCTGCGGCTGGGTCGATTCAACTGGCGCCACTGGCACAACCTTCTCAAGCGCCAGAAAACGCCGC:1	+	chr2L	5008203	5'	+	invader1	345	2	76.14
GAGGGATCGACCTCCATAGGCTCTGGTGTGCGTTGTTTTTGTAATTTTTGACATTTTGCGGATCGGCGTGAGCCCTGTGCTGCCTATAGAAATACGGATTTGTCTGAAAAAAGAGCGGCAGCTTATCAACTCCGACT:1	+	chr2R	4183267	5'	+	Gypsy6A_LTR	197	1	73.72
TTTTGATTAATAAAATTTTTCAATTACAACATATAGGTTGATCATTACAGTTCATATTTAAGTTCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATGAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGG:1	-	chrX	22643327	5'	+	Tc1	1620	1	52.41
ATGATTAAAAATAAAATTTTAAAAATAATTTCGTGTAATTNATATTATGAGATAATTCTAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAACCAACAATCATATCGCTGTCACACTCAGACTCAA:1	-	chr2L	16005050	5'	+	P-element	2785	1	21.01
TGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACTGACAGCTGCAGAAAGAAAGATGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTCTGGGCTCCGTTCATCTCTTAT:1	+	chr2R	9632076	5'	+	roo	8706	2	53.42
ACCGCTTTTTCAGCTCGTCCACGGCCGCCTCCAGTTTCTCCACCACCGGCTTGGAACGCATGTACGAAATTTTGATTCGTTTTATTT:1	+	chrX	2079205	5'	+	17.6	394	2	74.71
TATGCAAAGGAGTGTGTTCAACTGTTGTGGGTGAGCCTGTGTTCTGGGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAAC:1	-	chr2L	15875819	5'	-	hobo	2863	1	69.86
GAACGCCGTCGCCAGCTCAAAGAGAAGTATTCAGCCTTTATTTACGGGTACTTCTCTCACTCTACTCACTTAAGTACAATTGTGATGAAAAGGAGCTGCATC:1	+	chr3R	3593000	5'	-	gypsy5	453	1	51.96
TAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTACTGATTC:1	+	chr2L	13053751	5'	+	BS	5063	1	66.21
GTAGAAGGGTAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCG:1	+	chr3R	26659777	5'	+	HMS-Beagle2	82	2	76.76
GAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr3R	25448330	5'	-	roo	9033	1	53.85
ATTAATTGGGACCGACTATGTTTCTTGGCGCCCTGTTTTCGAGCCCCTCAGTTCTCCGTAGACTCAAAGTAATACAATATCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTC:1	-	chr3R	5040398	5'	-	mdg3	5412	2	51.37
AATTTGTGTGTATGCGAGGGCACCTGGAGCTCACTGGGCACTCCTCCAATAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTATGTTTGAATCTGTTTATT:1	+	chr2L	2126841	5'	-	Stalker	7192	4	56.06
TGTATTTTTATGGAATATATTTAAATTTGTCGCTGACTATACATATTAAAGTCAAGAAATTTCTAGCATCCTACTATTCCATAAGCTAAGGCCAGGCTTTACTGCAAAAATTAACGTTTGGATAATAAAAAAAAATAACTTTAAAA:1	+	chrX	16295493	5'	-	1360	3094	1	56.16
CGGATCTTAATCTGTCCGAACGAACCCGGCGGCAGGATATGCCGGAGCAGATGGTCTCTCGTAGCTGGTGGGAAAGACCCATTCATTTTCGGCAACAACAGCGCCATTACTTTATTATTCCACACACAGA:1	+	chr2L	22344289	5'	-	Doc3-element	154	1	54.62
AGCTATTACTCAAAATGCTTGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1	-	chr2R	20194351	5'	+	Max-element	10	2	77.40
ATGCGTGTAGTTATTTCAACGGGCCAGACACTGAGGGAAAATTGTGTTATTACAGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTA:1	-	chrX	6486798	5'	-	roo	350	2	61.76
AATAATTACCAACAATCATGTGAAAACGCGAATTACCCACGTCGAAGCAATTAATTGAAATGAAAAAGGCCGCTGGGCTTTATTGTTGAGATGGAGGAATTGGGGAAAAATACCTTGGCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTG:1	+	chr3R	26431588	5'	-	opus	76	4	81.56
ATTATTATTATTTAAAAAAATCCAGGATAATATAGTGCTCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1	+	chrX	21014731	5'	+	copia	4880	2	56.85
ACTTAAAAAGTTAATAGGCGAATGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1	-	chrX	6191199	5'	+	FB	39	1	74.42
AGTTTCTACCCTATCATCCTCATTACCTAGTGATCAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAAC:1	-	chr2R	1708009	5'	+	17.6	440	2	75.18
TACAACAATCGTCTCAGAATTCAGGATACTCCTATTTTTCGGGAGCTCCATGGTATTTTCGGAACTAGAATATACACAGAGACTTAAAAATAAAACTTGTCATTGAGGCAATAGCAGAGAAAAAATTAAAGTACAATGAAAAACTA:1	+	chr3R	2999816	5'	+	Doc3-element	4497	1	67.81
CCATGCAGATTTTAGCAGTAGTCAGTCCTTTGAGGGAATGCAATTTTTTTTAATTGCTGCCGGACAATGCTGGAAACATTCACTTTTTCTTTTTCCTTCACGTTCTGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAG:1	-	chr2L	1518665	5'	+	jockey	4868	1	71.53
AAATGGAGTTGGGATTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1	-	chrX	1899717	5'	+	P-element	17	1	63.81
GAGGGAGCTGCCTATGCGAGGAGACACAGGAGCGGAGGACCGCC:1	+	chr3L	25973129	5'	+	gypsy8	4587	1	84.09
TATAAGTATTTTTTGTTGTTGTTTTGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGG:1	+	chr3L	23797647	5'	+	Helena	1152	1	59.59
CTTCCTTTCTACCATTTTATTTGAACAACTTTGGCGCAGCAAAGTTCTTAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1	-	chr2L	14772165	5'	+	roo	25	2	67.13
GAATGCGTGCTGTATATCTCAGATGCCTGTTGTCAAAAATCGAATTGGCCATATTTCATTTATATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCGT:1	+	chr2L	13038617	5'	+	1360	14	1	60.69
CCACGGATCCGATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1	-	chr2R	13084693	5'	-	roo	9019	2	56.16
AGCGCATTTGCGATTCTAAGCAGTACACTTAAATAACTCCCCCAATACATTAATTATGTCCAATTTGTATTGTTCTTTATGTGTCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACAT:1	+	chrX	21408975	5'	-	pogo	270	1	53.62
TTACATTATTTTCCTGCGGCGATACAACCAATGCCCATCGATTAAGGTCGACTTACATATATTAAATAACATTGTTATTCTAGGGTCTTTGTTATATGCAATCCGACTTAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTTATTTGT:1	+	chr3R	3584425	5'	-	Tc3	1624	1	51.37
CACTCAACAAATTGCAAATGCACTACGGAAAATGAAAGAAAATTGCGGTGGTCCGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3R	28624564	5'	-	roo	9026	1	59.20
TTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCG:1	-	chr3R	1844836	5'	+	Cr1a	119	1	57.50
ACTAAGATATACCTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1	+	chr2R	15005065	5'	+	jockey	76	1	60.27
ACACTTTTCGCATTATCGAAAGTTAAACAAAGTAGTTGGGAAAAGTTCGGTTAAGTACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr2R	19004272	5'	+	roo	8682	2	72.73
ATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTC:1	-	chr3R	9714483	5'	-	Stalker4	361	4	54.07
CTCCCCTTTTTGGCATACTTTCGGGGGCCGAGGAGTGATTTACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1	+	chr3L	4948057	5'	-	hobo	2893	1	62.39
GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAG:1	+	chr3L	25232774	5'	-	accord2	7548	2	71.23
AGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1	+	chr2L	8986108	5'	+	412	50	2	52.74
AGAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTTCAGCATTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTGTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCAC:1	+	chrX	21668136	5'	-	F-element	4366	1	70.27
CTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1	-	chr3R	20427459	5'	+	jockey	77	1	68.57
TAATTGTAGTTTAATAGCTGATTAGAATGTAAATGCAAAAACCATTGCCTACATTTCGGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1	-	chr2L	17079875	5'	+	jockey	4689	1	72.93
ATTGACAAATATTCGTTCAGGTATAGATGACTCTACTCATCTGCTGTCTTCCAACAGTATTTTTTCCTATCTACACATGTGGAATACAGCGTCGATTTCGAAAAGGGACTTGGAAAAATACTTTTGTATTTCTTAGTTTCCATCGC:1	-	chr2L	21703164	5'	-	HB	31	1	35.62
ATGAACAATTAATGCAATTTTAAATAAATTATCCAATTCTTTTGGATTTTGCTAAAAAAATGTTAGCTATGTCCGTCGACTTTATAAGAATATTGTCTTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1	+	chr3R	17478331	5'	-	copia	230	1	67.81
ATGGTATATTTGGCCAATCGAACGGGTTAATAGCACCAAAAGTGTATAGTAGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1	-	chr3R	14337486	5'	-	copia	185	2	67.12
GTGCGAGTGTGTGTGTGCTTACGCCCACGCCTTAAATTTTTAAATCAAAAACCAAAATAGTATAAAAAAAAGATGGTAATGCTAAGCAGCATTTAAATTACAGTCATCTTATTTTTGGATATTTACATATACATACATATAGTTAA:1	-	chr3R	24234637	5'	-	1731	4407	1	69.18
ATAAGCTTAATATAAGCAATCACATTTCTTCGTAGAGATCGACTAGCTGATTTTGCCAGAAAATAGAACATAATACATTGAAGACTCGGAAAAACTTCGTTCGTATGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGC:1	-	chr2R	16815890	5'	-	micropia	5296	1	71.03
GCACAAATGTGAAAACCAAAACGAATACGAACCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1	-	chr2L	11661063	5'	+	F-element	21	1	63.57
GGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	+	chrX	5274316	5'	+	roo	88	2	77.40
TGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chrX	17054216	5'	+	jockey	73	1	67.44
AATTAGTGAAAATATTAGAGTGCAATATGGGTAGATATGAGTTGATGAAAAACAAGAGGGGGAAGGTGAGGTAGATGTTGGCCATATATGTATATACATACATATATATTA:1	+	chr3L	10405395	5'	+	INE-1	68	1	79.28
AATGACATCTATTTTACTTTTCAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCAGTTTTAAGTTG:1	-	chr2R	9791717	5'	-	412	470	2	69.18
TGGTATTCACTGCACACTTACAATATTTTCTGTGTCGCAAGTGTCGGGATGAGAACGATGATGATGATGGTGATGATGGTGATGAGGATAGATGGAGGTTTAAGTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1	+	chr3L	9998016	5'	-	roo	391	2	45.21
TTGCACTGAAAAAAAGAAATGAATGAATAAAAGAGAAGTTCCTTTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chr3L	11393437	5'	+	roo	21	2	70.55
GTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1	-	chr3L	17560413	5'	+	pogo	29	1	65.07
TAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	-	chr3L	18368994	5'	+	opus	7058	4	81.03
ATTAGTTGAGAATTATGAGCGCCAGTTTAAGCCCGAATTCATTCGATGTGAATTGAGTATTTCGGTCACTTATGCATGTACTTCTGCGTTTCTCAATGGTTTTGTACACAATCCTCGCCTTATTAATTTTTCACA:1	-	chr2L	14460537	5'	-	1360	435	1	78.52
CAATGATGTCCCAAGGACTGTTGGCCTGCGGCTGCCTTTTATTATTATTATTTTTATGTGCTGCTCTTCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGCGG:1	+	chr3R	12853685	5'	-	Quasimodo	230	2	57.60
GTCTTTGTAAAAAGTAACCCAGTGCACTATTTGTGTTAAATAGTATAGGAACCTAGGTAAAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1	+	chr2R	6086306	5'	+	pogo	55	1	60.27
GGGGGCTATGCCGGAAGAATGAGAGGGGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1	+	chrX	16717869	5'	-	roo	9010	2	74.78
AATGTACCAAAAAATGGCAAGAGGGTTGTCCCAATACAAGAAATTTGTTGTGTGTGGAACAATAAAGTAAAACTAAAAAACAAATAGACAACGAGCGCCAACTCTCTTTGCAGCGGAACA:1	-	chr3L	23937207	5'	+	Doc3-element	272	1	66.67
GTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACA:1	+	chr3R	9714401	5'	+	Stalker	6931	4	72.60
TTAGTCGCTCCCAGACGCTAAGAATTTTATTAATTCCCGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	+	chrX	13039450	5'	-	roo	389	2	66.38
ATGCTCATCTACAGCCGAACGAAGCCTTTGGGCATATAACGCATAACCATATAGTACGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1	+	chr2R	15289121	5'	+	hobo	64	1	64.38
ATATGTTTAATATCGCATCAACTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCACTTACGTAGTTACTATTTCGAGTCGAATAAATGATCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1	+	chrX	23362232	5'	+	roo	8703	2	59.31
GTGTGAATTATAGCATACTTTCAAGCGCGTGCAGGAAATTATTTTTGAATGGAGAGACAAAACTTCAATGTCTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1	+	chr2L	15832979	5'	-	hobo	2928	1	67.89
CAGTGGCAACAGCTTCTACGGTATCAGCAGCCATGAAGCGAAGGCAACAAAAGCAGCCAACGGACAGCTTCAGAAATAAATACGTCTGATCCCACACGAACACGCATATATTTA:1	+	chr2R	9632073	5'	+	roo	7	2	61.40
TTCTTGTTTTTGGACAGATTTTGACTGAGATTAATCAGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTAAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCT:1	-	chr3R	29732059	5'	-	invader4	206	2	75.19
AACAAAAATCGTATGTGCCACTGTCATTAACAGAGACCGGTTCGTAAAGGGGCGTGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTC:1	+	chr3R	13360303	5'	+	jockey	32	1	55.77
CACGTTTTCCAGAAAGTCGAGTATCTCCTTGTGCGTTGCGGACCAGGGCAGGCCGCGCAACCGAACGAATTTGGGGCTCTCGCCGACGTTTTTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACA:1	+	chr3R	11818727	5'	+	1360	3200	1	63.01
CTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1	+	chr3R	22821996	5'	-	mdg1	7414	2	54.89
ATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:5	-	chrX	23439058	5'	-	P-element	2495	1	60.69
TTTAAATTAGGAAAGTCCAGGCATTTTAACAAACTCATTGAAAATGTAGAATTCTGTAGAGAATGTGAGGCTCGAGCACAAATTAAAGTTAAAAACGTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1	+	chr3R	7835078	5'	-	roo	405	1	77.60
CTCATAAAAAAACTTTCGATTCGAGCGACATTGGGGACCACACCTGGTAGAGCCACAGCTTCGGCAATTATACCAGCAACCATCACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTTTTTTGGTCATATCTT:1	-	chr2R	4829632	5'	-	1360	492	1	64.89
GAGTAATTGAAACACATGTTTTACACGGCATTTTAATTGGGTTTTGATTCGTGTAGGACGCTACCACCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGT:1	-	chr2R	9981508	5'	+	blood	7178	2	78.89
TCTTATACCTTTCTATTGCATGCATGCTTGCCGCAATCACGCATTTGCTTGCATTTAGTCTCGCATGCAAACTCTTTGGAGCAGGGCAACTCGTAGAAAGCCACCACAATTGCACCCACAACTGTTAGAATGGATACTGCACAGAT:1	+	chr3L	4257576	5'	-	17.6	147	2	63.01
TCCAGAGTCTCAGGCCGTCAATTGTCGAACTGATAAGAAAAATGCTCAACTGATAAAGGGTGAAGCACCAACACACTCGCATACTCTCACACACACACACACACACACACACATACATAC:1	+	chrX	6601573	5'	+	Quasimodo	39	2	82.50
GTTTATGGCCTTGTATGTTGCCAATGTTATGGTATTGGGGCTGGAATATCTGTTCGTTCGTTTGTTTGTTTGCTTGTCGCTCGGTTGGCGTTTGTGTGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAG:1	+	chrX	7255681	5'	-	412	7222	2	72.86
GCATAATAGACCAGTGATTCATGCCGCCCAGTGACCCAAAAGTTGAATCAGACACCCGCGTCGTACAAGATATACATGTACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1	-	chr2R	17626952	5'	-	opus	7495	2	76.11
AGCAGAGGGTAGTACGTTTTGTAAATTCTATTGGTAAACTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCTGGCTGACATATATTTATTCCATTTCTTCTTTTGAT:1	+	chr2R	15064360	5'	-	412	7475	2	66.67
AATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGCGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATC:1	-	chr3R	11547772	5'	+	G2	332	1	58.96
GGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTGT:1	+	chr4	419983	5'	+	roo	8745	2	79.29
ATTTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGGATTAAAATGAGACAAAATTTAAAGTGTTCAAGTGTGGGCGTGACCGGTTCTTCTAGCTTTTAGCTGAATATATGTATATACTTTATAAAGTTGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTA:1	+	chr4	652178	5'	-	INE-1	33	1	49.32
GCAATCAGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1	+	chr3L	23603177	5'	+	F-element	97	1	73.97
GGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1	-	chr3R	17605757	5'	+	Tabor	6876	2	58.90
GTTATATTCTGTCATTAAAAAAAAATTTTTGCAGCTGAATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTGTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAA:1	+	chr3L	25782395	5'	-	17.6	7340	2	72.60
CAATTTGATATTAAACAAATCCAAGCCAATAAGGACGAAGTGAAAATGCTCGACTTGCAATCGTAAATGCACATGATAGACTCGTATTTTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	+	chr3R	19968070	5'	-	roo	9046	1	65.22
ACTCTTGGCACAGGCATAAGTACGAGTAAGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTG:1	-	chr2R	22976292	5'	-	Idefix	339	2	79.14
AGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1	-	chrX	13039559	5'	+	roo	40	2	57.38
ACCCATGCAAACTCAACAACGACGAATATTCAAATATTCAACAGACCACCAATAAGCTTACAAATAAAGACTTATCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAA:1	-	chr3R	1102244	5'	-	Cr1a	3991	1	66.67
ATTTATTTTATTTTAACTTTGCTTTAACTTTGCTGGTGGATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAGTGAATTCTGTTCCGCATCCACCATTTATTTTGCCTTTGATTACAATTT:1	-	chr2L	11779461	5'	-	HeT-A	6000	1	65.75
CCACTGTCTACCATCTTTTTCCGCCAACATCAGCTCATTTTTATCACACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	-	chr3R	18339235	5'	+	roo	8676	2	75.34
TTAGCTAACTTATTCTGAAGAAGACCGCTGCTGTTGCCCAAAAATGCTGAGTTTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCATTTGAAGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAAATCACCAG:1	-	chr3L	23290486	5'	-	X-element	297	1	64.38
ATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTCTGTAAATGAATC:1	-	chr2R	20596534	5'	+	roo	8717	2	71.55
ATTGCAGAGATATCAGGGATAGTAAGTAAGTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTCCATATCTT:1	-	chrX	13039583	5'	+	roo	8704	2	60.27
TTATTAGGTTAGAGCTATCGTTGCGACCACAGCTGTTTGTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATACCATAAGGTGGTCCCGGCGAAAGCCGAAGCTTAC:1	-	chr2R	8146156	5'	+	P-element	25	1	63.08
TAAACATAAGATATCAAGCAACATTTTAATTTCTCTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1	-	chr3R	10462690	5'	+	opus	177	4	75.00
CTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGAAAACTTTATGTGTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1	+	chrX	3464214	5'	+	1360	316	1	66.39
ACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1	+	chr2R	12835039	5'	+	jockey	78	1	65.07
AGCTCTTATCTCCCAGCTGTGCAGATCTAAAGATATGTACTTATGTCTTTCTCCTAGAGACTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr2R	13585406	5'	+	412	42	2	53.54
TAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTT:1	+	chr2L	15247926	5'	+	Transpac	4990	2	74.45
GATACTAATTAGTACTATCTGTTTACTATACCAGCCTATCCAGTATTTATGTATGAGTATTATTTACTTAAACATACATCTAATAGAAGTACTTAAATTAAAAATAATATATGAATACACTAGGTTCCTACATGATAAAAATAAA:1	-	chr3L	4168320	5'	+	mariner2	820	1	66.90
AGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTCAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	+	chr2R	7898085	5'	+	roo	74	2	74.83
TTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3R	25448422	5'	+	roo	8738	2	71.53
ACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAATAGGTGTC:1	+	chr2R	14542151	5'	-	roo	340	2	67.91
CTATACGATAGTTTAGGTTTACCTTCATTTCTTTTACTGCGTCTGATTTCTTGCTCACTGTTATCGTTTATTTCATCGCCAGTTTCAGTTCGCGTATTGCCCTACCCTACCTAAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTAGTGG:1	-	chr3R	3286200	5'	-	gypsy12	9879	3	58.90
AGCAAAAATGTACAAACATCAAGTATGAAGAGGTGCTTCAATTAAGGTAGACCAGGAGCACTTTTAAAACTAAAAGTATTAAATAAATAGTTTCCATTAGGGAAATACTTAAATTCATTTTCACTTTTAGTTACATTTTT:1	+	chr3L	19847749	5'	-	gypsy2	442	1	51.43
AATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCAC:1	+	chr2R	5070921	5'	+	gypsy5	6962	4	24.82
AAAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTCTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTAGTGTTAGATTTAAATGGCTCCAAGTGTAAAGTTATGACCTCTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1	-	chr2L	2436616	5'	-	1360	3376	1	54.11
AGCCCCAAGTGTCAAATTAGACAAACAGCCAATGCAAACCCAATGCAAACTCGGAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGATAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGG:1	-	chr3R	13844447	5'	-	I-element	5069	1	61.64
TTGCACCATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGACTAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTGTGTAAACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGAATTATAAGTAAAAT:1	+	chr3L	16973354	5'	-	S-element	126	2	52.74
GAACACACACAATTAGATGCGGCAACAACAACCATACCCCTAGCGATGTGTAACAACTATTGTGGATATAAAATGCATAATTTATAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1	-	chr3R	20427498	5'	+	jockey	11	1	77.19
AGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1	-	chrX	9540095	5'	-	roo	9039	1	60.00
ACATTTATATTCGTAAAAGGGTCGTCAGTTTAACATCAAGTGCAACATACTTATTTTTTAAATTATCTCTATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCAACGCCTTTAAAGAAGT:1	+	chr3R	24383222	5'	-	rover	296	2	52.74
AAGCCAAAATGTTAGCCTAAGCAAGTAATCAGTAAGTGTTGGTCGATCAATATACGGTTTCTACTTCGAATATTACTATTACCATCAATCACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAA:1	+	chr2R	10126915	5'	-	P-element	2617	1	68.28
CGACATTGCGTATACTTGATCTTGTTACACGCCCAGCTACATGTCAATTTATTTGCCACACTCCAAAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1	-	chr2R	21920593	5'	+	jockey	16	1	66.67
GTAAGGAAATGTACATACATATATTGTTTTGATTTTTTTTTCACATATTTGTACGATGTATGTGAGTAAAAAATGTATTTTCATATATACATTTATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCT:1	-	chr2L	20117985	5'	+	invader4	2777	2	65.71
ACCCCCAGAAAGATACTTGGTTTGGTTCTTGGTCAACACTCCAGTTTATTTGCGCCCTCGTCGGCTTACAATATCGTATTACAAATATGTATAATAAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGT:1	-	chr2R	14367880	5'	+	accord2	126	2	58.46
ATGGCTGTGCAATATCTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTCCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1	+	chr2R	17626868	5'	+	opus	7067	4	83.49
AACACATCGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCTAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1	-	chr2R	19499397	5'	+	P-element	50	1	41.86
GGCTTATTACCGGTAAGCCTAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr3R	12886931	5'	-	roo	399	1	64.81
AGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAATTTTACATTATTTACAATTTATAATGAGTTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCG:1	+	chr3R	31817503	5'	+	roo	94	2	62.33
CTGGTATATATATTCCATAGCAAAGGTAAACATTATTCGTCCCAATAATAATATATATAATGATAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTC:1	+	chr2L	15247900	5'	+	Transpac	54	2	58.90
AGCTGTTGAGTAATATAAAAAAATGCTTTATTTCCAGCGANATGACAATTAAATGTTTGAATTTTTCGTACGCGCTTTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1	+	chrX	20453725	5'	+	INE-1	549	1	70.37
GCTATTACTCAAAATGCTTGATATTGCTTGTTTAGTGGATAAACTATTTAATTATAAGTAGGAATTTTATACACTATATACTACAGCTATCTTTTGAGTATTAGGAAATAGTAGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTG:1	-	chr2R	20194350	5'	+	Max-element	8243	2	78.32
TCATATTTTCTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTG:1	+	chrX	13704734	5'	-	invader4	295	2	62.07
TTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1	+	chr3L	22863400	5'	+	412	7115	2	69.60
AAATGTCAACAGCGATAGCTGCAAAAACCAATGACAAGTCTCGGTTGTTAGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	-	chr2L	15991395	5'	-	mdg1	358	2	64.75
ATACACTGCCAGAAAACGGTAGGAAAGATGTATTTTGAAATATTAAATTGATGCTTAAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATA:1	-	chr3R	1193634	5'	-	Cr1a	4169	1	65.75
AGTATTTTATTCGTAAGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGGAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr3L	20654478	5'	+	roo	15	2	57.45
CTGCAGTTGCAATTCAAAAGTTCTGATATACCGCAAATGGATTTCAAGTTACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1	-	chr3R	22956102	5'	+	roo	9	2	73.97
TTTATATCAATGATTGCTTTATTTCGATGAATCTTCTCTGTGTGCCTGTATATCCTGGTTTTTGTTTAGTCGAGTCCTAGTCCGAGAAGACAAAAACAAGAGGGGGTATATTATTAAAAAAGATATAATCATGCCAAATTTACTC:1	-	chr2L	9104363	5'	+	transib3	2696	1	68.97
GAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATCTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACT:1	-	chr2R	6085998	5'	+	1360	371	1	58.22
TCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1	-	chr2L	14081413	5'	-	1360	3375	1	66.67
GAGCGGCGGATAACAACAGAGGCGAAAGGTGCAAATAATGCCAGGCACCAAAAAGTGTGCTACACATGTTGACATTGCCCGTGCGTGCATGTGTAAGTGTGCGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1	-	chr3L	917231	5'	+	hobo	21	1	69.86
ATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTT:1	+	chr3R	25554217	5'	+	micropia	4997	4	56.16
GGCCCTGCCTAATTCAAATTTGAATAACTCGCAGCGCGCGCCGCTAAGTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGGGATGAGCAATCGAG:1	-	chrX	13066631	5'	+	jockey	12	1	75.97
GGTCACTTTGACCTCTACAGGCGGTCTCCTTCCATATTCCTTTTTTAGACAACGTCTTCCGCATTTCCTCGACCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGGAGTTAATAAAGTCTCAAA:1	-	chr3R	1433233	5'	-	mdg1	392	2	59.20
GCGAGCGCATTTAGTTTATATAATGTGAATAAGCTGCCGACTGCAAAACATGCAAACAAAACGTTGGCAATGCGCAGCAACGAAAAATCGGAATAAAAATGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr2L	12892756	5'	-	roo	9052	2	73.29
TAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1	+	chr3L	1534545	5'	-	pogo	2060	1	70.00
AGGGGCAAGGTGTTTTATGAATGAATTCAAGCATTGCCGCCAGCGGGGCAAAATGCCGAATTGTAAATGGTACAGGGGTCTGGCCAAAACAGGTAACAAATGCGGCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAAC:1	-	chr3L	21481144	5'	+	Cr1a	43	1	77.44
CACAACTGGTAGAGATACAAACCGCCGAAATTGGGGCTTCGACGAGCTGGGGAAATGTGCAAGATCGTTAAACGGTTAGTTAAATTGGGGCTATCGTCATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1	+	chr3R	21705939	5'	+	297	10	2	71.85
GCATAGCTTCAGGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAACACTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1	-	chr2L	6059302	5'	-	roo	334	2	66.44
TTAGCTGTTTAAGACCTTCATGACTCATCCTGCTATTTTGNGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAAC:1	+	chr3L	22968349	5'	+	mdg1	7109	2	71.01
CTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCG:1	+	chr3R	25423199	5'	+	3S18	62	2	57.53
AATCTTCGCAAGAATGTTCAAAGGATTGCGATTAAGAGGGCTGTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1	-	chr3L	11321515	5'	+	mdg3	50	2	48.63
TTAACATTGTTTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTA:1	+	chr3R	22388932	5'	+	G2	2625	1	69.18
TTCTACATAATTTAATTGCAATCTCTTCTGCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1	+	chrX	3308327	5'	+	hobo	40	1	66.67
CGTATTTATGCATAATTTGGGTTTATGGGAAACGTTTACAAATTTCGTCGACAATAATCGATCAGATTGTTTTTGAAAAGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAA:1	-	chr2L	719377	5'	-	R1A1-element	48	1	52.05
GAATTTCCGATTTCAATACTTTTACTACACCACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1	+	chr3L	22437890	5'	-	roo	8988	2	79.14
AAATATGAGAAAAAATCAAGTTGTTTATCCCTAAAACTTATACAAGTATTAACAATGATTTACAAAACTTAATTGCAAATTTTTCTATATACACTTTTATTGAAAAAAAA:1	+	chr3L	12457371	5'	+	transib2	2627	1	80.00
GTATAATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1	-	chrX	13039554	5'	+	roo	12	2	66.29
AAATGAACAAAATTAACAAAAATATAAATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTG:1	+	chr3R	17243096	5'	+	hopper	46	1	54.11
TAAGTAATATATACAGTTTTTGTTAGTAAAGGAGCGAAGTATTTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTCAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGGTTTCTTTTCTTCT:1	-	chr3L	11320629	5'	-	mdg3	5102	1	66.42
AAGTATTCTTTCAGTGCACCACAAATTCATATAAGCCCGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1	+	chr2L	16016339	5'	-	412	7480	2	68.75
GTATAGCAGTGGCGCCAAAAAACGTCCAATAAGGTTCACTGTACACTTCACTCCTTTCCCTTTTCTGTATGTTTTTTTTTTATTATTATTATT:1	+	chrX	23448972	5'	-	Rt1a	5072	7	74.19
CAAATGTCCAATTTGGAAATCATTAACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1	+	chr3R	9921935	5'	+	blood	15	2	74.29
ACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGACAATGCTGACCC:1	-	chr2R	17259346	5'	+	jockey	4707	1	52.78
GAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2	+	chr3L	11393496	5'	+	roo	80	2	76.71
GTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGACAAATTATATTT:1	-	chr2L	14772093	5'	+	roo	8737	2	80.67
CAACAGCGTTTCCTATAAAAATAATGTTTCGAACATGAAAATCGAAGAAACTTTGATTTTATATTTAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTGAATCGACTCCAGCTCTTGC:1	+	chrX	23439099	5'	+	gypsy6	7618	2	52.78
CTATTTAGCCACAAAAATTGGCACGCTTTTTCCGTAATCCCCCCCTATGCGATTCCTGCATTATTTTCCAATTTTTT:1	-	chr3R	9997448	5'	+	pogo	51	1	24.68
TTTTTTTTGGCTGCAGGACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	+	chr2R	12835002	5'	+	jockey	20	1	73.81
CCAAATTCATTCGGAAATATTTACAATATTATTTTCACAAACTTATTTACTTATATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1	-	chr3R	5061930	5'	-	mdg3	5496	2	69.14
ATTTGCATAAAGAATGTTACCCAGTTGCGATGACAGCCAGTGGAAATTGTTTTGAAGCCATCATCAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr2R	14388027	5'	+	roo	10	2	67.65
ATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTC:1	-	chr2L	14081388	5'	-	1360	3320	1	71.74
AGGTGGCACTACACTGCACTACAAAAACAAAATATGTGGGGACTGGAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGGGAGCCGTTACAATTACACAGTTTTTGTTGGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1	+	chr2L	7809997	5'	+	P-element	6	2	76.56
AAGCGACTAAAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTA:1	+	chr3R	821127	5'	-	accord	7352	2	57.60
AGGCACTACAAGTTAGTGACGAAAAGCGCTGTTCGGGAAACAATATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTTAAAACCCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1	+	chr2R	18336127	5'	+	roo	15	2	66.10
AATGGAGGTGCGTCTTGTCTTGTTTACTTTTCACGTTGGACTGTCGTCAAAAATGTTACTGTTCAACAATTTTACTGCAAAGCATTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTACTTCCTTTAAATAACTT:1	+	chr3L	19013888	5'	-	invader3	251	2	64.93
CAAAAAGTCAGCATTCTGCAAGAGTGAGCGAAGTGCTCACTGAGAGCAGCCGTCAAAATTATTTCAGGAAATGCATTAAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1	+	chr2L	13584592	5'	-	pogo	2091	1	73.29
GTTTGGTTTTATATATGTATGTAGCTCTTCGAACCCCGAGCGCTTGGAAACAGAACAATGCAAATTTTTAATTTATGTATTTTATGCTTCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCG:1	-	chr3R	8159574	5'	-	R1A1-element	380	1	63.57
TAATAAAACTGGTAATTAACAAAAGTAAAAAGTTATTTAACTTATACAAAAATATTTAGTTATTGTATTCAATAATAAGATGGTAATAATAGATGGTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1	-	chr3R	17605767	5'	+	Tabor	27	2	65.75
TTTACAATAATTCGAATTTTTTAAAAAATTGATAGTGGTGCTATTTTTTCCCCTAGTAAATAAGATCTGATTTGATATAAAACATGAGAGAATGATGTAGTCGAGTTCCCCGATTATCAGATACCCGTT:1	-	chrX	21100321	5'	-	INE-1	553	1	51.94
CATCACCATCAGTAAAGAGTATCTTTACGCTTCAACTTTAGTACCTATATATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAG:1	-	chr2R	9463491	5'	+	rover	7018	2	67.81
CATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:2	+	chr3R	17420369	5'	+	roo	8681	2	70.34
TTGTTGCTGCTGCTGCTGGGTTGCCCGCTTTGTGCCCTTCTGTAATGGGAAAAATGGGAAACATCGAGTTATTAAGTGCAATATGACATTATGATGATAAGATATATCATACATAATTTACCTAATACTATATGTACAATATGTAG:1	+	chr3L	239982	5'	+	Stalker2	270	2	52.05
AACGCCTACAAACCTCCCAAAAGTCAATTTATTCTTTTTCCGTTTTAATATTTATCTTGCCAATTTCTGACGACCACAATCCAAACAAAAATGTCACCCCACCACTTAAAAAGTTATTGGTCTTAGTTATTATTATTGTTATTAAA:1	-	chr2L	22805230	5'	-	mdg1	16	2	52.74
TGGGAAAATTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATCATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1	+	chr3R	10462572	5'	-	opus	473	2	63.70
TTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:1	-	chrX	6522069	5'	+	F-element	36	1	55.75
CTTCTCATTCTGTTTACTTTTTTTAAGCGCACTTAGCTTTTTAATTAATTAATTTTTCTGAGTGCAATGCGCTTAGTTTCAGCCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTT:1	-	chr3R	17818007	5'	+	roo	8686	2	66.67
AAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1	-	chrX	7256185	5'	-	412	7474	2	72.93
AAAAGATAACATCTACTTTCAATTCTGATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTACATATCTTATG:1	-	chr3R	25448444	5'	+	roo	8707	2	51.85
TCTTCCATAAGAGCTGATTATGTGAATGTGTCACTTATTGCCCTTTTGTTTACATTATTTGTGGAGCGAGATTGCCCGCTTGGGATACTGACTGTATACAGCTAGTGGAGAGTGCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTG:1	-	chr3L	25674418	5'	+	Cr1a	4086	1	76.76
CGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTT:1	+	chrX	21016761	5'	+	Transpac	4986	2	69.29
CGACACCTGAAGCCGGGGAAAATATTAAAGAATGTGGATGATGTGGGAAATGAACCAGATCAAGTAAACGACCCAGTACATCTAAGATTTTCTCACACCAATTGTTTCAGTCTTAAGCTGATATTCAATC:1	+	chr2R	3600881	5'	+	Tom1	284	1	56.15
GAGGAAGTGGAGAAGTTCCCAGTGATCATTGAATAATCGCATTGCCTGTTTATTATTTATATTTTTTTGGTAGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCA:1	+	chr3R	9714092	5'	-	Stalker	45	4	55.48
TACGGAGTTAAAGATGAAGATTTTTTCGATTTCTCTGATGATTTCTAGCCGGCCAAAGTCTTTGACTTTGGAAAGTCTAAGGACTTGTAAAGTCTAAGAACTTAAAAGTCCGATGGCGTTACGCATCTTGTTATTC:1	+	chr3L	27368866	5'	-	1360	12	1	50.00
TAGGGATCAATGCCAAAGTGTAGATAGACTAATTAAATTAGTTGTAATACATTTGATTAGCCTTAAACTATACTTTATAGGCTGTTCGTTTGAAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCT:1	+	chrX	9931599	5'	-	Quasimodo	7193	2	63.01
CTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	+	chr2L	16091868	5'	-	roo	388	2	63.64
ACGATGTCGAATGAAAACATTCTTAACTCGCAGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1	+	chr2L	2916606	5'	+	hopper	144	103	80.00
GCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCG:1	+	chrX	13704797	5'	-	invader4	3044	2	79.35
TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTTGACCCATTTGTTTATTCGTTTCCCGGTTCGTTGTACCGGAGTGCCCATGGGCGTCGATGTGTTCAGTGGTGTAGGCGTGGGGGTTTAGGGG:1	+	chrX	14768481	5'	-	Tirant	8124	2	75.20
AGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAACAGCGCTCGGC:1	+	chr3L	3500956	5'	+	opus	143	4	64.77
CACTTCGCTCATTGAATTGGGTTGCGGAGCGGCAGACTGTTTTTTTCCGTTTTGAAGTTATTAATTTTGGCCGCAAAAAG:1	+	chrX	22732586	5'	-	Transib-N1_DM	21	1	60.00
TATTAACGAATATGTCCACAACTTTCTCAATAAGCCCATCCAGATAGCTTTGGACCAGTTGACCGATGGAAAGAGTCGTAGGGATGGAATTGAGGCTAGATGTGGAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1	-	chr2L	11518530	5'	+	412	7071	2	70.55
AAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCGATTAAAGCGAAATAAATTTGTAT:1	+	chr3R	4357536	5'	-	Tc3	1647	1	63.04
ATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1	-	chr2R	9791673	5'	-	412	7510	2	54.78
GGAATATATTCCATTTATAGAAGATTTTCATATAAAAAATATATTTGAAGATTTTTTTATCTTTTGCATCTGTTCACACACGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	+	chr3L	15177205	5'	+	roo	8716	2	53.15
AATGCATGCAAATTTCGTTTGCCAATTTTCGTTAATTTGAGCAACTGTGTTCACACATGAACACGAACATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1	+	chrX	6486722	5'	+	roo	78	2	70.55
ATTGAAAAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1	+	chr2L	17295847	5'	+	Doc	75	1	65.07
CACGCTGGATGGCTTCCATTGCACGAGGCATGTAACCATTTCCACCTGAGGAAATTGCACACCACATTGGTGAAAGTCTTTTCATGCAATTCTCGAGGGTTGGTGTCAGAATGTAGTGACCCATGTAACAATTGATTT:1	-	chr3L	7724512	5'	-	mariner2	266	1	71.74
ATTATTGTGTATGGCGGAATGACTTTTGATTTTTCGGGAATTAAATTTCCAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATCAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACT:1	+	chr2R	3090696	5'	+	Doc	4250	1	64.38
AGCATGTATTTTTATTATCAAAAGCTTGGATTATGTACAGCTTTGATGTTTCGGTATTATAGCCTATCATTATGACTAAACTAAATAAATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACA:1	+	chr3R	9714354	5'	+	Stalker	34	4	62.07
GAAAATCTAGAAACTAGATATCAAGACCTCGAGAACTCGATTTTTAACCATAACTTTTTTGACATAGCCATCTAACTCGGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATT:1	-	chr3R	20495651	5'	-	mdg3	68	2	62.40
GGCTGCAGGACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chr2R	12835010	5'	+	jockey	17	1	73.91
ACCCTATTATTATTATTATTTAAAAAAATCCAGGATAATATAGTGCTCTTGATTTGAAGACTGAATCTAAATCTGCAAAGAAATGTTAAATATGAAATTTATGGCGATCAACCGTTCTCGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1	+	chrX	21014723	5'	+	copia	4872	2	60.96
GGTTCATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTAATTTT:1	-	chr2L	7898415	5'	-	roo	9036	1	60.96
TGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCT:1	+	chr2L	1432058	5'	-	Stalker	4	4	78.77
GCCAGAATCTATGTGACAACATTGTAGTGTGATATATTTGAGTACACTTCTCGACTTCTATTCCATGTTCACTGAAAAAAATTTGAGGCTATACTTTAAAATGTAACATTATATTTATTTCATTCTTTTTTATTTTTTT:1	+	chr3L	4561194	5'	-	transib2	2642	1	65.47
CGGAATTCGATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr3L	16343307	5'	-	roo	345	2	58.22
GATTAATTTTGTATAATTTTATTGTAGATTGTCGCTCAAGGGGGTATGTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1	+	chr2R	20384595	5'	-	412	7507	2	57.27
TTTAATGGAAACCTGAGTACGTATAATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1	-	chr2L	9399591	5'	-	Transpac	296	2	73.97
AAACGAGTGTAACGATTTTCTGTATAGTTTTTTGCCGCTAAGTTGTTTTAATAATAGGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGGTCAACGCT:1	-	chr2R	5173522	5'	+	gypsy	7052	2	58.22
TAGGTTTTAATGGAAATTTCCCGGAACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATTTTCCCTCTAAAACTTTTAATGAAACAATGTTATCAAAGACACTAGAATAACCAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1	+	chr2R	9091798	5'	-	1360	3361	1	65.97
ACAGTAACAGCGACTTTCAAATGAGAAGAAGACCCAAGAAACCCCAAGATTCTTTGCGGTTTTACTTTACATACCCCTCAGACAGGATGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATTTTAAATATTACTGTTA:1	-	chrX	156714	5'	-	Cr1a	4302	1	73.33
AAGAATATACCTAAGAAAATTATAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTTAATAATTAAATATGATTACTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCT:1	+	chr3L	23697996	5'	-	1360	493	1	77.27
CAAGAAATAACAAATATATATTTCAACAGGATAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGA:1	-	chr3R	12598530	5'	-	hobo	2905	1	60.22
AATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1	-	chr3L	10574407	5'	+	Tabor	6871	2	54.79
GTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1	-	chr2L	20840511	5'	+	Transpac	4975	2	58.27
GACGCATCCCATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1	-	chr3R	22844303	5'	-	roo	9046	1	62.31
GTACTTCAATGTGAAATGTGTAAATAATAATAATATTTGAATATTCTAATTCAAAGTATACATGTTCTTATTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1	+	chr3L	17945144	5'	-	Juan	4166	1	52.05
TGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTG:1	+	chr3L	14603262	5'	+	jockey	57	1	52.59
ATAAACTTTATTCGAGTAATTGTATGGAAAATATCTATGAATTAACCTTACCTTCGTCGCTATCGAAGCTATAGAAGTTTGAAATTTTTCCCGAAATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTC:1	+	chrX	8525798	5'	-	Max-element	8444	2	53.24
AGTCAGATGATTAAAGCTGGTGATATTCCAGCGCTTTAGAAAATCGATATAAATGTTCTGTCATAACCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	-	chr2R	13696498	5'	+	roo	10	2	69.61
TTTTAGTATTTTATTTATTTAAATGTTTTGCCATATATTTCTTTATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	+	chrX	9540027	5'	+	roo	74	2	75.69
AGTGCACATGAAAATGAGCTAAGAGTTAACTTGAAAATGCATTGTCGACATTCCAAACGCAAACAATCATTTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTCGGCTCCGTTCATA:1	-	chr2L	16092008	5'	+	roo	8700	2	58.21
GCCCAGAAATTGCGGACGGAATCGGGATGCAGCAGCACGTGCCAGAGGTGTTCCAGCTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGCTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1	+	chr2L	10022992	5'	+	Doc	64	1	56.20
AGTGGCAGTGGCAACAGAATACTAAATACTGCACAATGGTGAATGGAATGAAACCGAAAGGAGCTGAATGGAACAGAACAGTCAATTAAGTTCTCACATGATTAGTGAGAGGTTCGGTTTTATCTTTTAT:1	+	chr3R	18194739	5'	+	BS	5017	1	36.15
AAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGCCCTCCTTTC:1	-	chr2L	23084411	5'	-	accord	7366	2	61.76
TGGCCTTTTGTTATTGTTTTCTTTATCCAAGCAAACATATTTGAAGTGTGCGAGAACCGCTGCCCTTGGCCCCCTAAAAAGTGCTGTTCACACATGAACACGATTATAT:1	-	chrX	16717959	5'	+	roo	4	2	75.23
CTAGTATCATTGAATCTAATATCATTGAAATGTATTTAGCAGACATAAGGAACCGTTCCCGTATGTCTGTTGGATTGGGTGGCTTCTT:1	+	chr3L	26417951	5'	-	Quasimodo	7011	2	69.32
GCGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1	-	chr3L	19334325	5'	+	roo	8743	2	78.08
GTGGAAAATTTTTAGAACACATCGAGAAATGGGCCTGTACCTGCCTATCGACTGTGCAGTGCTAAGTCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1	-	chr2R	19499412	5'	+	P-element	40	1	50.00
ATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAA:1	-	chrX	17501198	5'	+	Doc3-element	169	1	78.40
GAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1	+	chr2L	16091874	5'	-	roo	9041	1	57.35
AGGAAGAAGCGGCATTCGAAAGAGAACAGAATAAACGGAGGAAGAAACAGATGTAATAACTAAAGCAGAAGAAGAAATAAAAGACTTTATCCTATCCTTTATCTGTAATCTTGACTTTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAA:1	-	chrX	5081751	5'	+	Cr1a	4253	1	52.05
TTTCAGTTTTAACAGGACTACGTTGCAAATGGGGCGGGAAAAAGAGCAAAGGTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	+	chr2R	14542140	5'	-	roo	9009	2	64.29
AGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGCTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1	+	chr3R	22844197	5'	+	roo	59	2	66.15
GGGGGAAATTAACATAAATCGGTTAAAATATATAGATGTATAATTTTTCATTAAGCCTAATACAATGTTTTACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATT:1	+	chr3L	15993470	5'	-	297	240	2	53.42
CTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGCCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAACGTAACTCCACACTTCATAAATACCTCAATAT:1	+	chr3L	23797686	5'	+	Helena	1190	1	54.48
TGTGATAATACGGGATCACTAAGTCAGGCTTAGTGATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAG:1	+	chr3L	23797920	5'	+	Doc	82	1	73.88
CCAGCTTGTTTTGGCAGACATACAGCCAACAATCATCATCATAATTATACAGCGATACTGCAAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGCTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGC:1	-	chrX	11465600	5'	+	hopper	447	1	56.91
CTCATTATAAATTGTAAATAATGTAAAATTTTAGAAAATATATGCTTAGTTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1	-	chr3R	31817570	5'	-	roo	9039	1	65.07
TGCACAACAGTGGATGCGATGTGTGGGAAAAGTTGAAAAGTTGTTGCAATAATTGATTTGTTGCAGATGTTTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1	+	chr3L	21855426	5'	-	blood	7348	2	54.81
CGGAATAGTAATAACATGTCTCTGTACCGAAAACTAGAAATATATGTATGTAAATGGCACTACTACAAATAATAATATTTAAACGAATTTAGTGCATTTCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATC:1	-	chr3L	21321277	5'	+	1360	332	1	63.45
CACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACCTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1	-	chrX	9540129	5'	-	roo	9036	1	58.39
AAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1	-	chr3L	10574393	5'	+	Tabor	46	2	46.58
CGGGTCCTGGCCCGCAACAAAAACGCGGAGGGAGGGGCGTGGTGAAGTGTGGGGGAAAAAGAAAATGCCAAAAACTATATAAAATAAAATAAAATA:1	-	chr3R	21329140	5'	-	transib1	1904	1	66.67
TAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1	+	chr2R	9791594	5'	+	412	7130	2	72.60
ATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1	+	chr3R	7482718	5'	+	412	28	2	60.77
CCAGCTATTTGCAATGGTTTCCTAACCCCAATGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr2L	3114550	5'	+	roo	88	2	78.08
TGCTTGTCTTTTGTCAACAGATCATTAGAGTTTATTATTCCATCTCCTTCCTGATAAGCAAAGCTAACGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAATACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1	-	chr2R	23803054	5'	+	roo	8716	2	52.74
ATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1	-	chr3L	11441847	5'	-	roo	9027	1	55.48
TGAATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1	-	chr3L	3501023	5'	-	opus	7438	2	66.43
TAATCAACTGAACTGGCTGGCAAATGAGGGTCTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGGAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1	+	chr3R	14364628	5'	-	roo	322	2	80.00
ATCATTTCTACTATATTATTTTGTACAATTACCGCCTGGTTGGATTAATTTATTTATGCACATTGCCCATGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAGGTGG:1	-	chr2R	21725086	5'	+	R1A1-element	276	1	52.08
AATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1	-	chr3R	25448408	5'	+	roo	8744	2	77.21
GTAAAGTTTAGAATTAGACCTAAACTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1	-	chr2R	16248053	5'	+	BS	9	1	71.92
CCTTTAGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAT:1	-	chr2R	20596546	5'	+	roo	71	2	70.55
GCACCAAGTAAAAGTGCTTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1	+	chr2L	2794144	5'	-	Burdock	223	2	60.27
CCCCTTCAACATTTAATGAGATAACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1	-	chr2R	7898196	5'	-	roo	9037	1	58.90
CCTGGCCTAGGGTTGCCACAAAAGTTTCCAGAATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1	-	chr2L	11661032	5'	+	F-element	23	1	52.25
CAGTTAAAATTCTACCAAATCGTTTGGCTGCCTCTTACGGTAGCTTAAATGTGCTAAAGGTATTTATATATTCCCAACTGGTTTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1	-	chrX	10694571	5'	-	I-element	5315	1	45.89
TACATAAAAGCCATAAACATAAGTGCCGAGTTATCATGCGAGTGGGCGTGGCAGCGTCATTAAGTCCACCATGTCGACTTGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACT:1	-	chr3L	17681465	5'	-	mdg3	5292	2	55.56
AGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1	+	chrX	17054189	5'	+	jockey	57	1	50.71
ATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATTTTGAGGCACGAGGTGCGGACACAAGCACTCAACAATAATTGCCTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCACATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1	-	chr3L	21484243	5'	+	Tabor	6882	2	52.86
AGTGGCACCAAACGCACCAAGTAAAAGTGCTTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCCCAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCG:1	+	chr2L	2794131	5'	-	Burdock	6373	2	69.66
AAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACA:1	+	chr2L	4412571	5'	+	Quasimodo	62	2	70.31
ACCAAGACATTGAATGAAATATATAGATCGCTGTCCAAATGAGTTCATCGTGTGTCATTTGTTTCGGTGTAGCAAACTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1	-	chr3R	29361081	5'	-	mdg1	7450	2	70.64
TAAGTCCTCTCCGCTCGGATTGTTGGGAGGGCTTAGAATGGGGTAATCTGTAAAGGAACCGGTTTTTTTCCTATTTATTGTTCGTACTTCTCGCCATCAAACGGCTTAATCTTACGTT:1	+	chrX	21014013	5'	-	copia	445	1	71.19
GCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGCGAGCGAGTGTGGGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCAACCCCCTAAACCCC:1	+	chr2R	11629737	5'	+	Tirant	8114	2	69.39
AAGTATTCACTCTAGATTAATGCAAATTGATGAAATTATTTATTTATCGTACGCACTTACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTCCATTTCCTAAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTA:1	-	chr3L	19339432	5'	+	Tc1	68	1	58.22
CATAAAAAAAAGCACGCAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1	-	chr3R	28075434	5'	-	jockey	4968	1	64.75
AAAAAAAAAAGGTTGAAAAATTATATTGTATGTCTGAGCTGCTTTCCATTTTTTGTTGTTATTTTTATCTGATTAACCTTGATTAAAACCTTTGGCTGAGTGGACGCACAAGCAACGATCGGTCGCAGGCCATTTTT:1	-	chr2L	12262690	5'	-	hobo	2735	1	54.74
ATTTTACTATGACACAGTCTAAAATGTATGACAAATAAATCAAAGAGCTGATTTAAAATATTTCTATTGAGAATATTAAAATAAGGAAGAGAGATAAATTAGATAAACAAGTTATTGTCTCAGTCAAAATTAAATTAATTATTTTC:1	+	chr2L	9504929	5'	+	NOF	3964	1	93.15
GGACGTGATCCATTTTATTGTGGTATTTTCTTATATAGAACATTTTGTTCCTTTCCATTAATATTATATTATATTATAATTATATATTATCGATATAGCTAATATAGGGAGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATAC:1	+	chr2R	5173071	5'	+	Stalker	13	4	75.34
ATTGGCCCTGCGGAATGCCGGCTCTCCACTCAACTTTAATGGCACTTAATTACCTTTCGCACGGCCCAGCTTATCGGATATCGCGTAATTACCATCGCC:1	-	chr2L	2448488	5'	+	Ivk	64	1	78.79
ATATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1	+	chr3R	17420361	5'	+	roo	8674	2	75.34
TAAAGATTGGTGGTCTGTTTGTATTTCTATACCAACAACACCATTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGTGG:1	-	chr3L	25208156	5'	-	Max-element	8502	2	55.56
ATGGAAGGCAATATGTTCATTTCCTTTATATACTTAAAAATTAAATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGATTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCCCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1	-	chr3L	3501020	5'	-	opus	435	2	64.96
TCCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTTTGTTTATGCACGCAGTT:1	+	chr2R	9791609	5'	+	412	84	2	80.43
CCTTCTGTCTGTTATATAGTATACCCTTTTACTCTACGACTAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGGATGTAACAGGTAAAATGAAGCGTGTAATGTATACATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTC:1	-	chrX	22651487	5'	+	INE-1	92	1	67.41
TTTTTGGGATGCAGATGCGTTTTGATTGGTCTTCACAGATTTTACCATCACGGCAGCTATATTGCTAACAAAGTCCAAATAGTCTAGGAATGCTCGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1	-	chrX	21014891	5'	-	copia	229	1	66.90
CGCATTNTCGACGGACCCTTTTCACACGTTCTGAATTGGAAATTTGACCAGTGCACAGTGGATTAACGAAACGGAGTTGGACGCAAAGTGAATACATTTGTGAATACCTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1	+	chr3R	25448292	5'	-	roo	9055	2	73.29
AGACGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	-	chr2R	13585526	5'	-	412	7533	2	70.94
GCTGATATATTTGATGAGGTTGATTTATCGCATTTGAGTAGTGTGCAAAAAGAAAAAGCTTTAAGTCTAAGCTTAAGTCTAATCATATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1	-	chr3L	25401027	5'	+	Doc	36	1	50.00
ATATTTAGTATCCATTAATCAATTTGCACTCGCCGCTGATCTTGCGTTGCGATGCGGTCAGTATTTTGCCTGGCTCAGATTTCAGTACAGTAGGTACTTCAGGCTCTATACCCTTTAGAACGACTTGAAGGCCCTTCCTACTTTTC:1	+	chr3R	30303411	5'	-	Fw3	178	1	63.01
ATTTAAATTAAATTAGGATAAGCTGTGGGCTTAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTACGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGA:1	-	chr3R	17472928	5'	-	copia	4886	2	76.39
AGACAAACACCAGTCGTATACGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTG:1	-	chr3R	11547811	5'	+	G2	305	1	63.70
GGGGCACGGAGGATTTATTTAAGTGGATTTAAATGCGCTTTGAGACTCGGAGAAGATTCAAAAGATTCACATTTCATTTGTTCGCTTGCATACTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGTTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAA:1	+	chr2L	17762201	5'	+	F-element	4241	1	61.64
TAATCAGTGTTACTCTTCGTTGATTAACCACTTGAATGAATTCTCCTTATTGACTCGCCAACTTTTTAATGGCCTACAACTTCTTTAAATGAGTTTATTAGCCTGCCTCCTATTTTTGCCATAAAATAAATTAAAACATTTAAAAA:1	-	chr2L	1917456	5'	+	HB	317	1	58.22
GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTGATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCCCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGGTGCGCAACACTCGGGTGCTGT:1	+	chr3L	23112569	5'	+	R1A1-element	5073	1	63.12
ATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1	-	chr3L	10574391	5'	+	Tabor	6887	2	47.95
GTAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCC:1	-	chr3L	11321473	5'	+	mdg3	46	2	67.00
GCATGTGTGATGAAATTCAATTATTAAAATATTACTATCTTACCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTA:1	+	chr3R	17605651	5'	-	Tabor	405	2	69.86
TAGCACGTAGATAAGAGAATATTATTCGTTTTTTTTTTTCTGGACCGAAGTCTGACGGGGGTCTGCTAAATGCGTCATCAAGTGCGTTAGGGTTCACTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTTAGCAAGATCGCGAACGTTTGCAT:1	+	chr3L	9097478	5'	-	Doc3-element	370	1	54.17
AAATATTCCTGATGCGATTTCCGTTTTCGTATCGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGTAAGCAT:1	-	chr2R	13006490	5'	+	3S18	5856	2	76.71
TAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGC:1	-	chr3R	10266135	5'	+	1360	60	1	77.57
AGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGTGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1	+	chr2L	14081304	5'	+	1360	44	1	54.62
ACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTG:1	-	chr2R	5173199	5'	-	Stalker4	328	4	73.10
CGGCAATGCGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTCTAGTGAAAGTCAAACACA:1	-	chr2R	5031022	5'	+	Doc	79	1	67.88
TACGTGTTGTGACACTTGAGTTTGGCCCTTGGGGAAATGTACTCAGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGT:1	-	chr3L	18596602	5'	-	Doc	4404	1	66.67
TTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCT:1	-	chr2R	16248024	5'	+	BS	38	1	52.05
TAAGCGTGCAAGTAAAAATGCAACGTCAACGCCTCGAACGTAGACCCAGTGGTCACACATGACCACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGG:1	-	chr2L	14772117	5'	+	roo	8740	2	65.07
TTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTAGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1	-	chr3R	18582252	5'	+	roo	8710	2	54.41
ATTCTAGCATAAATGAGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTCAAAAAAAAATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr3R	22955952	5'	-	roo	9011	2	65.73
TGGGCGTGGCAGTTATGGGCGGTTTGAGGTCGTTGGAGTGAGTGTGGCAAAACTTTTTTTGCAAATTAATAGAAATTTACAAGACTAATAAGAATGAGAAAAAATATCAACACATTTTCCAAAAGTGTGG:1	+	chr3L	9208275	5'	-	INE-1	258	1	68.46
GTTTAAGTAAATAGAAACTGACTGTGTCTCTTTAAATAAAAATGTTAACCTCTTTCTATCGCGCTCATAAAATTCAAATTATACACAGTACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:2	-	chrX	14549773	5'	-	Tabor	7291	2	56.85
GTGGCGTTTTGTATTCTTTTGTTTTAATGAATGAAAAATAAAGAGGGGGTGGATATTTTCTAGAGGACCAGGCACGATCGATTTGCATACAAAAAAAAGAAAAAGAAGCAAAAAAAAA:1	-	chrX	4470132	5'	+	Doc2-element	220	1	64.41
CACTACAATAAAGTGGATGTCGAATGTCAGTTCACATGCGCTTTGTATACTTTTGTCTCGATTGCGGCTACAAAAAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTA:1	+	chr2R	23356345	5'	+	1360	186	1	52.05
TTTGTAAAATGTTACGAATTCCTATTTTTTGGAAAAAATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATATAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAAC:1	-	chr3L	25703044	5'	+	F-element	245	1	74.13
CAGCTCATTTTTATCACACGCTTCATGCAGAGCGACAAAAACTTGCTGCAGATAAAGATGACATTTCCTATAAATACAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chr3R	18339205	5'	+	roo	8695	2	60.74
CGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTACACTTTTAAGTCAGTAGATACATTTCAACTAATTATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGCGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chr3R	17420407	5'	+	roo	50	2	55.71
GTTTCATTTGTACGGCCTTTGAACGGAAATTCTAAAATATTCGAAACATTCAAGATTAAATTATTTAACAAGTCTGAAAGAAATTGAAAAATTCTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCAGTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCC:1	+	chr4	915130	5'	-	invader4	103	2	63.70
CAAATCCAAATCCAACCCCCAAATATTTCCCATAAAAAAAAGAAATGTTCGCATTTTAACTTTTATATATTTCTTTTTATTATTGTTTTACAGGCTTAAGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATT:1	+	chr3L	10577331	5'	-	Tabor	497	1	65.38
CTGGAAGAAATGAACTAAAACAAAATCGATTTATTCGCATACAATTGCACATCCTTGAATATTCATATCTTGTAAGCATACGAATTTCATATGGAAGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGG:1	-	chr2R	4729378	5'	+	accord2	193	1	75.81
TTTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAACAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTGTGACTTTAGTCCGAGGGGCAGCATTGAC:1	-	chr2R	5924440	5'	-	jockey	4715	1	40.00
AAAAATTTAATAAATAAAAAGAAATATAAGACATTAGACAAAAAATGTATAAAAGTTATATATAATTAAGTGGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCCTTTAAAGATCCCATTGAAGTCCAATGCA:1	-	chr2R	4774770	5'	-	baggins	5359	1	50.00
AGTAGTTGTTGCTTTTTGTGTTTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr2R	19004129	5'	-	roo	9013	2	56.85
TCCAGACCGCAACCGCAACCCCCTGACACCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAAGCCGAATA:1	-	chr2L	7945446	5'	+	roo	1	2	79.31
TTCTGGCCAGAAAAACACCAAATTGTCGCTTTGTGCACATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1	-	chrX	14336487	5'	+	roo	84	2	80.82
TTTGCCGGGAATTAAGCGTGGAAAGTCTAGGAGAGCGTGTGCCTTAATGCGGCCACAGGACAACAAGTACAGTATAAGTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1	-	chr3R	14979893	5'	+	pogo	8	1	70.41
GTTCGTTGTGTGCTTTGCATGCGCATTTTTTCAGTTTAGTTTACTGAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1	-	chrX	5629249	5'	+	jockey	74	1	66.44
CGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACAT:1	-	chr3R	25454116	5'	+	Quasimodo	45	2	52.74
TCTGGAATCAAACGCAGGAGTTTCGTTCTGGGCTCCGCAAATGAAATAAAATTAATTTATGGAAACTATATCAGCAGGACGAGAAAGTCTGCTTGGGTCCACCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:1	+	chr2L	21891676	5'	+	mdg1	22	2	67.81
AGCCACTTGGAAAATGAATAATATTTAACTATATTGACATTTAATTGGAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGATTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCT:1	-	chrX	17855761	5'	+	BS	5072	1	74.66
GATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAT:1	-	chr3R	13349106	5'	+	BS	5076	1	73.94
AGAGCTAAAAAACCCTATTTGAAATAATTATAATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1	+	chr3L	3500956	5'	+	opus	7063	4	75.42
AAAAAAGGCATTTAAGGTGTTTGATTGGTTGGTAGTAATACCAGAATACCTCATACTTTGAGCAGTAATGGTTCTAAAAGGAAATGGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTAGCAACAAGTGCC:1	-	chrX	23016020	5'	-	Tc1	176	1	65.93
GTTGGGTGAATTGTGAAAGTAGTTGTCGTGTGATTCTTCTGCTTTCTTTGCGGAGAAAAATGCTTTGTATGCCTGGGAAATCATCTCATGTGAAAAGTGCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1	+	chrX	3309577	5'	+	jockey	18	1	73.33
AGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	+	chr2R	11629718	5'	+	Tirant	15	2	72.80
TTAATAACTTAATATTGCGTATATAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATT:1	+	chr3R	22388942	5'	+	G2	2627	1	65.94
ATAACGTATATGCACTGATGTCACTGTCAATTATTTTGGCTATTATTATTCTTATTATTAT:1	+	chr2R	18059865	5'	-	mdg1	7064	2	80.33
GTAGGACAATTAAACGCTAATGTGATTGGCACTCGCACTTCGGAATCGCTAACGGGTAATACATATAGCCACACACATATATATATAGAATATATATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1	+	chr3R	22821965	5'	-	mdg1	394	2	50.00
GTCAATGCTTTAAGTCATCTTAAATTTAATTTGCCAACTTTTTAAGTAGCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1	+	chr3R	12598469	5'	+	hobo	35	1	60.55
TTATGCAACCATTCTTTCCCCTATTTTTTCCATCGTAATAGTATGCAACACTTGAGTTCCCAATGCAGCCACGAAGTATCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1	+	chr3L	4840708	5'	+	jockey	4704	1	58.33
GTTAATATTGACTATTCAGGCTTTAAATCCTCCCATACACTACTGCTCACGTAATTATACCCGTAGAGTTAAAGAGTATACTAGATTCGTTAAAAAGTATGTACTTGCAAAAAATAAACGGAATAGTCGGGGAACTCGACTAAAG:1	-	chr3R	20126132	5'	+	INE-1	566	1	60.69
TGTCGAGTGGCGCCCAGGAATATCCAATATGACAGCCCCTGGCGAAGTGAAACCGAAAGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGT:1	+	chr3R	26615094	5'	-	gypsy12	10174	2	57.69
CTTGATAAGCTCATTGCGTGAATTGTCTTTAAAGCTGCGGTCAGGCGTCTCCATTCGTCCAGCCATCCATCTGTACATATCTTTATATCAATCCATTCCTACATATCTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1	+	chrX	4214894	5'	-	flea	4998	2	71.23
AGTATAGCTGTCAAAATATCGATGGTACTATCGATAGTCTGACGTCGATGGTTTTCTGACTATCGCCACAATACATCAATTTCGTACCCTAAGAATATAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATT:1	-	chr3R	17043563	5'	+	Stalker4	7005	4	62.69
GCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTAGGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATACATGTCTCAA:1	-	chr3L	21855511	5'	+	blood	7074	2	69.92
CATGTGGGTGTGAGGGCGGGTTATTGTTGTTGTCGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGG:1	+	chr3L	11531467	5'	+	roo	228	2	74.63
AATCATTTTTAGTAGGAGCAGTTTTAAATTTTAAATAAATAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1	+	chr3L	11530899	5'	+	roo	8745	2	78.62
AATCACGTCAGGGTCACCAAATGTTGACCTAATAATTTGACATCGATGTGCGCATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1	+	chr3L	23728642	5'	+	HMS-Beagle	6827	2	54.55
GATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:2	-	chr3R	25448418	5'	+	roo	8744	2	71.92
GTGTCCTCATTTTCACTCTGTGATATTTTGTTACGTTCTGTTCCTATGAAATCGAAAAGAATAGATTTTTAGGGATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1	-	chr3R	7100948	5'	-	roo	394	1	71.92
AAATAGTTCTTGATTGTACTTTGCTTGGAACTTTAGCTAAACCACAAAATTGAAATACTTTAACTATTAGTTGGCCATCATTCATGGGCCGTTTCGTCTTGGTTTTTTTACTTGTTTTTTTTTTT:1	+	chr3L	16184114	5'	-	Porto1	171	2	64.00
AAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1	-	chr3L	23906460	5'	+	1360	53	1	64.75
GTGGCANTACACTGCACTACAAAAACAAAATATGTGGGGACTGGAAGAGAGAGGGAGAGAGAGTGGGAGCCGTTACAATTACACAGTTTTTGTTGGTACCATGATGAAATAAAATAAGGTGGTCCCGTCGAAA:1	+	chr2L	7809999	5'	+	P-element	13	1	72.18
AGAAGTGACCAAATATAACGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTAGCAGTGTGCGGTTAGAGTTCACATATGAACATGAATATATTTAAA:1	-	chr3R	12887025	5'	+	roo	9	2	73.44
AAGAAATGGCAGATAATACAGTTGATAATAATCCCCAGCAATTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCA:1	+	chr2L	21008555	5'	+	invader3	5233	2	64.55
TTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1	-	chr2L	7898364	5'	-	roo	330	2	74.45
ACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1	-	chr3L	17560393	5'	+	pogo	27	1	60.48
TTAAGANGCTGAATGACTCAACTAGTAATTAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTTTTTTAATATGTTAATTAGGGCCTAA:1	-	chrX	22837226	5'	-	HB	1347	1	74.44
AAAGTATACAATTGAAGTATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1	+	chrX	17756602	5'	+	297	6642	2	76.67
AAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTAGACGGTCTAAGGGCGTTAGAGTGGGGGGTGGACAAAATGCTTTTATTTATAACTTATATAACTACAAAAAACAACTTTCGATCGCCGACGGGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1	+	chr3R	4322609	5'	+	F-element	39	1	32.88
AATGTGAACTTCTTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGTCTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chr3L	14603233	5'	+	jockey	35	1	62.94
CAATTTAAAACTATTCATTAATGAGGAAAATTCCCTTATTAACAATTCGTATTTTCTTGAATGCTATGAAATAGGTATTTGTCTTTTTACCTGAGATATGAAAAAAATAAATTATATAGTAACCCGAATAATATGATAATAATTAT:1	-	chr2L	3608262	5'	-	Transib5	2567	1	72.60
GTGATTAAAATCTAAAGCTACCAATCTCTAATAAAAAGTGAAATTAGAACTAACACTTTGCGGAATTCAGATTCAAAAGCCGATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1	-	chrX	21016903	5'	-	Transpac	301	2	73.10
AAATAATAAAACAGTCTCCAAAGGTGATACCACTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCT:1	-	chr2R	3170098	5'	-	1360	493	1	77.40
CACATATTTAATGTGGAACGTGGTGGGTGGTTAACGCAAAACGGACTGACTACAAAAAAACAAAAAAGACAAAAAAAAAACGCCAAAAAC:1	-	chrX	2284990	5'	+	Bari2	908	1	64.44
GAAAAACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAA:1	-	chrX	16361600	5'	+	Tc1	35	1	88.12
TGTAAATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGC:1	-	chr3R	19449749	5'	-	Quasimodo	6969	2	71.03
ACCGAAAACACAAATCAACAATTTTGCAGCAAGAGTTAATACGTTGGTGTAAGTTTACAAATCAGTATTCATTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTT:1	+	chr3L	22100	5'	-	Quasimodo	218	2	51.45
AATTTGGAAATGTATATTTCTTGCAAATATAATGTATTGTTATATAACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1	+	chr2L	18294207	5'	-	roo	8995	2	72.60
CATCTTTATTATATTGTCTACTTTGAGGAATCGAATTTGCTCGCTTCGAAAGCCCCTTTCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTT:1	-	chr2R	21298830	5'	+	jockey	273	1	56.62
CACTCCCAGGATCTCTCCTCGCTGTAGTGATCCTCACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAG:1	-	chr2L	23197598	5'	+	Transpac	63	2	72.80
AAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAA:1	-	chr2R	11329664	5'	-	P-element	280	1	16.67
CAAGTTCCCCGACTATCAGATACTCGTTACTCAGCTATTGGGAAAGCCAATGCGATATTTCATAATTTTTCTTCGATANACAAATATACAAATTGTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGCG:1	-	chr3L	23747151	5'	+	Cr1a	212	1	52.86
AAACGATAACTGTGGTTACTCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATATTCTTAATAGTGATTAATACCCAAGTCGATCTGGCTCTGTTCGTCCGAATGAACGTTGAGATCT:1	+	chr2L	22724096	5'	+	INE-1	133	1	73.95
CTACTACTACTATACATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTATTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1	+	chr2R	15005077	5'	+	jockey	71	1	62.79
ATAAGAAATTTTCTTAAATCCACTTGAACTAGCGCTAGTGCAAGAAACTCTCAACGTGAGAACTTTAATAAAAGTCCTTTGTCGAGAAGTTTGAAGGATGCTCTACTCCCTATTTTAAAAGGATAAAATTTAAAAAAAGAACAAAA:1	-	chr2L	10037805	5'	+	TART-C	11096	1	75.34
TAGCAGTTCTTGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1	-	chr2R	13585493	5'	-	412	7472	2	67.59
TAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCCACATGCTG:1	+	chr3R	10462627	5'	-	opus	7440	2	72.66
CATTTTTAATTAAAAAGGTCTTATCTGAAAGAAATCGATTGCGCTTCTGTGACGCAGACTGACTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1	-	chr3L	1534759	5'	+	pogo	32	1	57.26
ATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCAT:1	+	chrX	10521660	5'	+	Tabor	92	2	78.08
ACCGGGGGACTCTGGAAATCATTGTTATTAATACGATTATTGTGTGCACAGGTGCGTGTTAATTTCACTGTGATTTAACCTGGGAGAATCTTTGTTGTCTCGCTCTATGTTTGGCTTATTTATTGAATCTACCCTTTTACTTAAGA:1	+	chrX	16921255	5'	-	Doc3-element	4693	1	76.71
TTCTTAACCCGCCCAACCACCACCCAGCAACATAAAAACACACACTGTAGAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	+	chr2R	19004150	5'	-	roo	9037	1	53.47
CGAAACAAAAATATATAAAACCTATATTAAATGGAATACAATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	-	chr3L	19334324	5'	+	roo	74	2	77.86
TTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCAGC:1	-	chr2R	6271493	5'	+	blood	211	2	77.21
ATTTGTGTAATTTTTTATTAAAGACATTAGTCAAATAAGTGCATGCACACGGGGCCGATCGCTTCTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1	-	chr2R	19798128	5'	+	Transpac	4960	2	53.38
TGAGTCAACGTCAGTAGATAAAACAAGTTGGGACTAACTGGATGAGACAAAGTTGTACGGACTTGGAAATACCCATTAGGATATACACATTCCCTACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTG:1	+	chr2R	20194165	5'	-	Max-element	8514	2	67.14
CCCTGCTCTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGGGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1	+	chr3L	2362319	5'	+	Stalker2	7301	2	53.62
GCCCCAAAGGAAATCACCAGAGGGGCAAGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1	+	chr3R	22844179	5'	+	roo	8717	2	56.34
GTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCTAGTGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATACGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTCACGAT:1	+	chr2R	4193297	5'	+	1360	34	1	78.08
GTCGTTCAAACGCAATCAGATTTGCGCCATGTATTTTTCTTCATCGAACCGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGGGTTTATCGT:1	+	chr3L	23603166	5'	+	F-element	27	1	43.68
GATGTCGGGAATTATAAGCAAGTTGGGGCAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1	-	chrX	21016821	5'	-	Transpac	251	2	78.95
GCAACGATGTCGAATGAAAACATTCTTAACTCGCAGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1	+	chr2L	2916603	5'	+	hopper	144	103	70.69
TTTTTTCTCCTTAGTTTTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAAAACAACAATAACAATAGGGCAACAACTGAAAACTAAGGAGAAAAAATAAAACATCAAAAATAA:1	+	chr2L	13033281	5'	+	P-element	2694	1	67.81
GGGATTGTATGTTATGCATGCCTACCCCGTCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1	-	chr2L	17081833	5'	+	jockey	4711	1	65.93
ATTAATAGATTAAGCCATAATAAGTAGCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTG:1	+	chr3R	18339037	5'	-	roo	9059	1	75.34
CCAAAATAAAAATATAACAAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTCAATGAAT:1	-	chrX	23280918	5'	+	roo	8716	2	54.11
AAAGTTGAGAAAGGCGCCTGAAAGTAGGCAATAAAATGCGTTTGTGGTGTGGTGGAAACAATAAATGCATTTTCCTGACCAGTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1	+	chr3R	19589893	5'	+	BS	5028	1	57.25
GACAAGAAACAGTTGGGAAAATTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1	+	chr3R	10462559	5'	-	opus	486	2	73.97
GTGCCAAGTGCCCAAAGTGACTGTTTGTTTAGATTAGATTTTTAATTTGGCCGATGCCAGCGACTTTTCAGCACGTCATGTGGAAGAAGAATAATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1	-	chr3R	18582279	5'	+	roo	8683	2	69.12
AAAAGACACAATTACGCGGCAGGAAATTGTGAATTAGAAGCAGCGGCGATGCTTTCGGGATCCAGTTGCATTATCCTGCGGCAACGATTAGCAAACTGAATGCCATATATTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1	-	chr3R	9922125	5'	-	blood	366	2	77.24
CTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGCACGCAACCCTGCACAAAGACCTCA:1	-	chrX	23108320	5'	+	BS3	1421	1	51.06
AACTGCTTAGTGATAAGGTATTAAAAATAGCACAAAATCAGTTAAACTCTTTACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1	-	chrX	13504241	5'	-	412	426	2	65.73
AAAAGGTGCAACGGCTTCTTGCTCAGCAGGAAAAAGGGTGAGAATCTATCATTGTATTAAATCAGAATGCTTAGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1	-	chr3R	18272218	5'	-	1360	3344	1	51.37
GTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chr3R	17817889	5'	-	roo	9047	1	58.10
CTGCGCTCTCTTAAATTGTCTTTCTCTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1	-	chr3R	18585693	5'	+	P-element	17	1	69.11
TCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCCCGCAGGTAGGCCAGGGCGG:1	+	chrX	13504184	5'	+	412	96	2	79.45
AGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1	+	chr3R	7482735	5'	+	412	45	2	52.31
AAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1	+	chr2L	13763132	5'	+	pogo	39	1	57.14
CGACACAGAATTGGATTTGGAGTGGGAGTTGCGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1	-	chr3R	17316315	5'	+	opus	7153	4	66.67
ATGTGATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCG:1	-	chr3R	11547792	5'	+	G2	300	1	59.02
ATGGGAATTCTTGCGTCTAAATTACAACAATTCCAATTTAACCCTCACCGCATTTATTGGTTGACAGACTTTCTCCGAAAATGAGTTTCAATTAAGCGAAACACTTGGTTGGATTGCTTTTGTTAGCCGGCATAGCCTTACAC:1	+	chr2L	21152542	5'	-	HB	1305	1	69.93
CGCGACCCTATCTAAATTATTTCGTTATTTAAATACACAACACAATAAAAACGCAGCACGAAAATTATGAGCAGTTTTCGAAAAATTCCGAGAAGGAAATAATG:1	+	chr3R	14064509	5'	-	copia	401	1	79.81
CCAAGGCAACTGGATGTCTGAAGACGCCAAGGATGCCACAGCTAAGAACCAGTTAGAAAGTACTGATTATATACAATATAATCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAG:1	-	chr3L	5102535	5'	+	BS	4681	1	58.54
AGCAAAAATTCTATACAATTCAACATTCTCAAGCTGTCACTCAATTACACTCGATTGGTTTGTTTGTGTTGCTATAATGTATGTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTATATGTAGTCAAGTGTTATACTATGGCACATATGCTAC:1	-	chr3R	22010028	5'	-	Quasimodo	2	2	54.79
ACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1	+	chr3L	1534523	5'	-	pogo	2078	1	52.88
ACTTTTAGCAACTTTTACTTTAAGCAATTAGTTAATATAATCATTAATAATTTGTTGAACCATCATCGATGACACACTTTGTTGCACCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCATTATGCAG:1	+	chr4	1185862	5'	-	1360	3352	1	60.27
AGTCCAAGAAGAAAATAAAAAAAATAGGTGGCCTGACTTAATGCCGCGAAACGCAGTTCAAACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATT:1	+	chrX	10253185	5'	-	hopper	1366	1	54.01
ATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGTTCTCA:1	-	chr2R	9500071	5'	+	G5	4743	1	48.63
ATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAAT:1	+	chr2L	4412557	5'	+	Quasimodo	66	2	64.38
AAATCATTCAAACACTTGTTAAATATTTTCTTAACCGATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1	+	chr3L	3863419	5'	-	blood	7350	2	54.81
ATTTTCATCTTTCGCTCTCGGGTTTTTCCTTTTGCCATTGGCAGCACCGTAGACTTTTGGCGCCAACGGGATTGACTTGTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCC:1	+	chr3R	14046613	5'	-	transib2	2700	1	54.79
AGGTGAAAAAAATATCGTTCACAATTTGATGTTAACTACGATTTCATCGTTTCCGTCATAGGGTAGAAGGGCAATTGAAAATGCCTTATAAAGAGCATGCAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCC:1	+	chr3R	26659715	5'	+	HMS-Beagle2	6	2	71.09
TAAGTTAATATTTAATATAATCGTGAACATTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATGAGA:1	-	chr3R	16076849	5'	-	roo	334	2	77.34
AAAATGTTTTGATCATCGGTAATATTAAAGTATACAATTGAAGCATTATAGAGAATAGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1	+	chrX	17756576	5'	+	297	6604	2	52.78
CCTTTATAAATATAAGTAAGTTTCTTAAAAAATACCTCCCCTACCCCATTTTTGAATGAATGAAACCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCC:1	-	chr2L	5517398	5'	-	jockey	4564	1	50.78
AGTGTATCTGTGAAAATTAGCTTAACTTAGCTTTCTCTTCGACGCTCATGCTCTCTTCCACGCAACATAAAAAAAGTTCAATCGCATGGAATGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCT:1	+	chr3R	18585032	5'	+	P-element	22	1	47.48
AATCACAAGGCTTTCTAACGTTTTCAACACAAGTTGTACTCGTATGTATACACATACCGAACAAGATTATAAATAATTGAAACGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTG:1	-	chr3R	9124370	5'	-	Doc	4355	1	55.48
GAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATANTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1	+	chr3L	11393487	5'	+	roo	30	2	58.10
ATATTTTCTGATATTATCGCTATATTGTAAATTGTTCATCAAAATTGAGTTACTTTATATACAGCTAACAATAGTTAGTCAGATAATCAATATGAATGCGTACCGTCTGAATATGGGCCATGATCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1	+	chr3R	14063207	5'	+	1360	1	2	78.77
TTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1	-	chr3R	12886991	5'	+	roo	8725	2	65.07
AGTTGTAAGAGATAATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1	+	chr3R	5061795	5'	+	mdg3	5272	2	72.41
AAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTCTGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGACTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTCGTAATTT:1	-	chrX	21564721	5'	+	diver	5983	2	79.45
ATTCGACCATTAATCCTACTAACAATGAATCAACAAACAAGACAAGTCCACAGCTGACATGGAGTGACAAAATAGGGTCGGCCGAGGACGGCCTCAATCTTGAGGGGGGAGTAGTTAACTAAGTTAACCG:1	-	chr2L	15728206	5'	+	gypsy3	6572	1	55.38
GGGGCTGCCCTCTAATAAATGTGTTCATGAGTGTGTTTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTC:1	-	chr2L	17079818	5'	+	jockey	4748	1	76.30
AATGAGATAACTAATATACTCTTTATATAGAAAAATAAAACAAATTAGAACAAAGTAATTAAAACAATAAGCTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1	-	chr2R	7898182	5'	-	roo	9023	2	54.79
AAACTTTTGTAATTCTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGT:1	+	chrX	21669982	5'	-	Stalker2	7599	2	51.37
CCACCACTCGGATCCAGCTTCCAATCCTCTATATACACGCGTCTCTATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCG:1	-	chr3L	6388966	5'	+	17.6	35	2	63.64
CGAAGGCTTCCGCAGTTGAGAGGGCGGGGAAATGCAAATTAGTTGTGACAGCTTTCAAAAAGTTCAACATAGTTGTCGATGGTTGGTACCCCGAGTACTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCGCTGTA:1	+	chrX	10521592	5'	+	Tabor	12	2	73.88
GGATAGCCTAAATCATATCATAGACTAGGCTTCTTTGATTTGCTAGAAAGCATCGCTTCAAAGGCTAAAACATACTAAGCATCTTTAGTCGTTCAGGAAAAACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1	-	chrX	7256252	5'	-	412	7528	2	71.23
GAGTTGCTGACGCCTGACGCTTAAACTGCAATAAATAAATAACGCTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1	+	chrX	2444366	5'	+	roo	8741	2	73.97
AAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1	+	chr2R	16945298	5'	+	jockey	73	1	66.67
GGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1	-	chr2L	18419267	5'	+	412	36	2	55.48
TGTGTGAGAGGCAAGTTGCTAAATGGCACTGACACTTGACCTCCCTCACCACGCACACACTTATAAATATTTATATGCTCCGTGCTTGTTTTTCCACAGCCACACACACAGTGTGTGTGTGTGTGTG:1	-	chrX	2899106	5'	-	accord	259	2	73.23
CACCTGACAGGAAGGTGGCTGTGGCAAGCCGAATCTTATTTACCCTTGCAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACG:1	-	chr2L	10986867	5'	-	1360	3335	1	61.90
TACGATACCAAAAATTGTGGGCGTGGCCTATAGTGCAATGCAATGACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGATGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1	-	chr2L	15332573	5'	+	jockey	4568	1	53.10
GATATAAGCAATTTGCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGATTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAG:1	-	chr3R	11547788	5'	+	G2	302	1	56.67
TTGAGTACACAAAAGTGAATGGCTAGTGAGGTCGAGTTGAAAAGCGCATGATACTAAAAGCTTTTGGGTAGGTTGCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1	+	chr2L	14081291	5'	+	1360	31	1	57.69
TACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCC:1	-	chr3R	934266	5'	-	Rt1b	4721	1	45.71
ATCCTCTGGCTTTCGGCCCTGCTCTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGTAGTGGATCTACCCTCACTATAACTCCACTCTACATATATATAAGTA:1	+	chr3L	2362303	5'	+	Stalker2	28	2	60.47
CATCGGAATGAGTTCGGGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1	+	chr3R	18272121	5'	+	1360	59	1	67.69
CTCCAATTTATGACTTTCCACCACGCAAGCGACCAAACTGAATGCAATAAATTCAAGTACAATATAAAGGACAAGCAGGGTAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAAATTAGGACCACCCTAATTCCTT:1	-	chrX	2640366	5'	+	mdg1	104	2	62.50
ATGTAATAACAACATAATGTATAAGAATTAACCTAACTAAACCAATTCAATGTTAAGGAACCAAATGATTAAAACTTAAAATATGAAATACTAGATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1	+	chr2L	8986085	5'	+	412	7080	2	65.75
TTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGGGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGGCTCCGTTCATATCT:1	-	chr2R	11164514	5'	+	roo	39	2	53.38
CACGTTTCGAGGCGCAGAGCACACACACATACAGGCAGCTGCACACATGCAAGCGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1	+	chr2L	15833452	5'	+	jockey	34	1	54.29
ACGGATAATCGCATCGAAATTCATCCATAAACAGACATTGTAAGCCGTCGACGTTACCGCATGTGCGTGCATTAAAAATTAATTACATTGTAGTATGTGCCTATGCACTATTA:1	+	chr2R	9791554	5'	+	412	4	2	78.76
AATATCAAAACATTTTGCAAAAGTGTGAGCTTGGCAGTTTCGTGGGCGTGGCCACATTTGGATACAAACTTGCGCTGCGTCTATGCGGAAGCTGCATACTTAATCTCAACCTTCTATCTTTTATAGTT:1	+	chrX	22902352	5'	-	INE-1	159	1	53.12
ATCTGCATCTTTTTTTTTGGCTAGAAAGTAGTTTACTTAACAGCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGT:1	+	chr2R	23873557	5'	+	297	334	2	70.55
GGCACGGTCACAGGAGAGCTCTGACAATCGCCATACTGTGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGAT:1	+	chr3L	11957139	5'	+	blood	74	2	74.10
AAAATGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGTTTGTAAGCGTTAGAACAGTCAGCATGGGTCAACAAACTTGCGCTGCGACTTTGTCTCTAGGATCTGTAAGTTGAATCTGAACCTTCTAGCTTTTATAG:1	+	chr3L	21609977	5'	-	INE-1	161	1	69.29
AAAAAGTATATAACTAATTTAAATAGAGCATCCTTAGCTGTTTAAGACCTTCATGACTCATCCTGCTATTTTGAGGCATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:2	+	chr3L	22968316	5'	+	mdg1	7084	2	54.11
AGTCAATACAATTATTCACTAGGCTCAAGCTGAAATCTCAATTCCGAAAGCCTTCAATTCTCAATTTGTGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAG:1	-	chr3L	1254175	5'	-	F-element	4240	1	53.10
ATGGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCAGGTGAATCGTTACGTTGGAGGCGCGTGTTGTTATTCACTTCTATAAGTGATTTGGTCAATCGATTTGGTTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCTTGTAG:1	+	chr2R	5284580	5'	-	Doc4-element	2559	1	65.71
ACAGGGGGTTAAGTTTCTATACTTTGATCCACGTGGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATAGTT:1	+	chrX	8543465	5'	+	roo	73	2	74.24
AGTCAACCAGCCCAGAAAGGTATGAGAATAAAAAACATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTA:1	+	chr4	1151992	5'	+	transib2	47	1	52.45
CTACAAAATCTGAACAAAAACAAAGAAAAACGGTGAAGATGAGTCGGTACCAGTTGGTGTGGAACGTATGTGGACTCAAGCCCTTAATCAACAATCATGACAGACCCACAAAGCATTTACAAAATTACTTCAACAACATACCAATC:1	-	chr3L	7533072	5'	+	I-element	215	1	50.68
GAAAGCAGCCTCCATGGACCATTCCGCACCTCTAGCATTTTGGGGCCCCGACCGACTAACACATTAATGCCTTTTGATCTTCTTTTAAAGATCGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1	-	chr2L	15989193	5'	-	mdg1	383	2	67.20
GCTGCAAAAAAGAAATCAAATAATTCATAAATAAATAAATAAAGAATAAAGTGGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACA:1	+	chr3L	17685127	5'	+	mdg3	5320	2	62.33
GGGAAACACTTCCTCCGGCTTCTCATCGCGTTCAATGTCCTCGAAATTTCGCGTATCATCGTCGGAGGATGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGC:1	+	chrX	16629849	5'	-	R1A1-element	229	1	52.74
TATGGTCATTACTTATGGCTAACCAATATGGTAACTAACATAAACAATGGCAGTAAATGTAAGTTTAGGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1	-	chr2R	18336253	5'	-	roo	9030	1	54.48
CAATGACATTTTTCAATGTGTCAGAATTTTATTGTTGCAACTTGGGGCATTGTTGTTGACAACTGACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	-	chr2R	9632201	5'	-	roo	9016	2	54.79
ATTTTATGTCTTTATTGGCATTAACATAAGATATTCTCTTTTATTGTTCGTTGAATATATTTTATTGCTCCGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1	-	chr3R	23495748	5'	-	copia	5073	2	57.24
CGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAG:1	+	chr3L	25232767	5'	-	accord2	157	2	58.12
CAAATACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAA:1	+	chr2R	7586168	5'	+	I-element	5126	1	78.77
AAAGAAACATTTGAAATTTGCTACAATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAGGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1	+	chr2R	20596486	5'	-	roo	317	2	80.14
CCGAACGCCAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAATTAGTGTTCACACATGAACCCGAATATATTTAAAGACGTACAATTTTGG:1	-	chr2L	7945418	5'	+	roo	8688	2	57.66
GAATCAACAAACGTTGAAGCTATTATCGTTGTCGCAACATCGCACAACTACTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTA:1	-	chrX	12074610	5'	+	412	132	2	61.54
CGGCTTGGCATGATAAGCCAGCCAGCCAGTACACATCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1	+	chrX	13039487	5'	-	roo	9047	1	60.71
CTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1	-	chr3L	20654550	5'	-	roo	8990	2	75.00
GATCCTTCACCTCAATTCTCACCCGTCAAGGCCACACGGCGGCTGTGGCATACAGCCAACTCACACAAAAAATGTTATTCATCTTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1	-	chr3R	15076767	5'	+	pogo	49	1	42.76
GAAAGGAGTGAAGTGTACAGTGAACCTTATTGGACGTGGTAAAGTCGCACTCCCTCTTCTTATTCGTCTTCCTCATTCTTCAGTCGCCTTTTACGACAAG:1	+	chrX	23447807	5'	-	Rt1b	4884	1	57.00
AGTCACAGGACTTGCGTAGCTCATCGGTCAATCTGACAGGCTTAAGACTTTTTTTTTTTATTTCATTTTTATTT:1	-	chrX	21220598	5'	-	Tc3	1572	1	66.22
AACTGGAAGAAACATATTGAATTGCATGAGCACTCACGTTTTAAAAACTTCGACAAAATGTCTCAACGTACTAATATTTCAAACACAATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1	+	chr2L	16091866	5'	-	roo	402	1	71.67
AATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGCGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGGGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAACCCCC:1	+	chr2R	11629724	5'	+	Tirant	8114	2	72.97
ATTGAATCCTTCTATCGCTATCTCTTCTTTCATTATCGTACGCACTATCCACATGATCAGACAATTGTACATATCGCATGCCCAGGTCCATGTAGATTTGTTTAATTTCTTGTATATTTGATATTTTGAATTTGTTTTTTAATTTA:1	+	chr2R	6754461	5'	+	S-element	1580	2	66.44
AGAATATTAGTTTACTTAGAGCAAAGGGTATAAATGCATCTACTTGCAGTAATTCCTAAAACTTTAAGGCAAACCACATGGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1	-	chr3L	22437982	5'	+	roo	8682	2	70.97
GCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCGAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1	-	chr2R	11164490	5'	+	roo	75	2	74.48
GTTGACACATGATTGTCGCAAAGCAATTGCAGCGCGACACGCTAATTTGTGTTTAGAAAAAGTTCACGTGCTTCATATTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCTCTA:1	+	chr2R	5326680	5'	+	jockey	4858	1	51.37
CTAAATAATTGGATAAAACTTTCAATTGTTTTGTTGAAGT:1	-	chr3R	14104478	5'	-	P-element	2630	1	90.00
AGTATATATTACATATTGCATCCAATCATCATGGATTAAATTCCCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	-	chr2R	20596541	5'	+	roo	8693	2	61.62
GTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1	-	chr3L	10013650	5'	+	hopper	7	2	59.42
ACATAATAATAAAAACAAGCGCTCACGGGCTTTTTCACAGGCAAGAGTAAGTGAAATATATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTCATTAATTTTTC:1	+	chr3R	30389397	5'	-	1360	438	1	59.59
AACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1	-	chr3L	16750726	5'	+	Tirant	51	2	67.89
AGGGGTAGGTAATAGCAAAGACACTAGAATAACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGCCTCTTGTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGT:1	-	chr2R	3120311	5'	+	1360	3276	1	87.61
TGGCTCGCATCGGAATGAGTTCGGGAACTTCCTCTCTAGAAAACAGGTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1	+	chr3R	18272114	5'	+	1360	48	1	61.11
ATTCAATGTAATTGACATATTGGGAATTTTCTCTGTAAGGGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	-	chr3R	25448417	5'	+	roo	8718	2	69.75
GATGCCTAGCCAATAAATACAATTTGAATGCTTTACAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTCTAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1	-	chr2R	5485185	5'	+	blood	7090	2	73.91
ATGCTTAGGTCCCGAGTAGCCAACGCAAATATTCCTAACTGTATCGCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGCACCTGATTTTATTTGGCAATATCTTCGGT:1	-	chr3R	31817529	5'	-	roo	9017	2	61.42
ACTGCAGCCATATCATGTGGAAAAACTTGAAGACCACGATCATCATGTCAAACAGGTGGTGGAGAAGCACATACCCATACCATATGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGACGCATTGTC:1	+	chr2R	13757870	5'	+	Tc1	433	1	58.57
CCTGGAGAAGGTGTATTAGTTTTTTAGTTAGGAAAACGATCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAACCTACAACA:1	-	chr2L	19965042	5'	+	Doc	58	1	60.71
AGGGGTTGTTATTAAACTTTAAGTTTTGACTTTGTGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1	-	chr2R	11164525	5'	+	roo	35	2	60.00
ACTGGGCCAACATTTTTCTGCGTGCAATGTGAAACGAAAAAGGGGAAGAAAGATGCCCATTCTTATCAGGAGGTATGATATGTCAAGTGTGAATATAGCACACGGACCGTTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTA:1	+	chr2L	15248205	5'	-	Transpac	101	2	80.00
TTTTTTTTCTGCTGATATTTTTAAAATAATATTTGGTAGTTAATGCTAATTGAAATTCATTGCCAATATGCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1	+	chrX	7256098	5'	+	412	7091	2	49.62
AATGGGTTTCATATTCAAAAACCACGGTATTTTATGATCGGCGGCTGTTGGGAGGAGGTTATAAAAAGATGGATTACATAATTATTAAAGTAAAAAAGTAAAAAAAAAACGAAAA:1	+	chrX	21583494	5'	+	Doc2-element	246	1	73.91
TAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1	+	chr3R	20469589	5'	+	roo	8715	2	54.79
AATAATAATATTTGAATATTCTAATTCAAAGTATACATGTTCTTATTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTA:1	+	chr3L	17945169	5'	-	Juan	4141	1	69.18
GCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	-	chr3R	19968183	5'	+	roo	69	2	71.94
GTCTTGCCAATTTCTATCGGTAGTCCACAGACACGCCCAGACTTTTGAACAATTTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTAATGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTTGCGATCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAG:1	+	chr2R	6165460	5'	+	INE-1	535	1	57.53
CAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1	-	chr2R	9791696	5'	-	412	7502	2	54.79
GATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGCATTGCGCCATATTGTACGGCAAGAACCTGCACTTAGACTGTATTTCCAAAAAAACTTATTACTGCCTTCGGAACTGTTTTTTTTTTTCATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTAAAACAAAT:1	+	chr3R	19449508	5'	-	transib2	2418	1	64.83
CGGCTCAGTCTGACCTAGCAAGCCCCAAAGCATTTTTCATAGTCAAAAGCAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGA:1	-	chr2L	13585957	5'	-	Tabor	451	2	61.64
AGATGTGTGCCATGTATTTTTCTTCATCGAATCCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:1	+	chr3L	23603183	5'	+	F-element	78	1	73.55
GTTCCTGATGGAATAAGGGTTGGCTTGGCTGGTGGGTGGGTGTTTCATACATTCATATATATGCATATACATATACATATGCCTATATAGATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1	-	chrX	4215068	5'	+	flea	12	2	67.20
CTTAGAATAACGGTTCCCTTTTTTGTAAAAGGTATCAACTAATGCACCTAAAAGCGCTATATACAAACTCAATTACAGGGACAACTACAAGACAGTAGAATAACAAGATGTCTCCAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAG:1	+	chr2R	1986396	5'	-	INE-1	170	1	63.01
TTGACAAAAAAAAGTCATGCGATTAAATGAAGGTGCTCAAAGTACATATATAATATGTACATATACATATAATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1	-	chr3L	17558140	5'	+	jockey	4685	1	74.13
GGTTAATTTTAAATCGAAATATTAACATTAATTAATAAGGTAAACGATGTGTTTTTAAGTTTAGATAAATATAGAATTCCAAAAATAACTTTTAATTTCACATCTTCGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1	+	chr3R	6290910	5'	+	Doc	14	1	75.71
AACGTGGCAGTATGATCACACTTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTG:1	+	chr3R	18346550	5'	-	INE-1	541	1	35.62
AAATCATTCAGTGGCATGAATTATAGCTGGGAAGCTCAGAACGTGCTTCCAGCGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1	+	chr3R	7482703	5'	+	412	7082	2	64.38
ACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCAAGCACGCTCAATTTCTTGATCTTATTAATTGTTGTCTGTAACGAAAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCGGCCTCTAAAG:1	+	chr2L	12892676	5'	+	gypsy12	10137	2	70.00
TGTTTCAGTAAAAAGATTATGCGGATTCTTTATTCTTGTATAATTAATTTTCGCTGCAACGGAAGAGGATAAAAAGGCATATAAGTTAACAACTAAGAGCACAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAG:1	-	chr2L	22121674	5'	+	gtwin	11	2	58.52
AAGATACTACATTTTAAATTGATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1	-	chr2L	6623065	5'	+	Burdock	34	2	62.33
AGTGTGCTCAAGAGAGGTGGGTATGTGTGCCTGAAGGTAATGTGCTCCGTACTCAACCCTGCTCCACAGTGCTAATAGAAAATTGATCATAGAAATAAAAACCAAAAACAAAATTGACCGAAAGCTTCACTAAAT:1	-	chr3L	9701387	5'	+	transib2	122	1	49.63
GGCCAAGCACGCTCGCTCATTGACCGATGGAGGTGTGCGATACTTTGTTTCAAAGCATTGATGGAAGCATCCAAGGCTATAGCTTTGTATAGATTCAAAAAAAACGATAACCAAAC:1	+	chr2R	20276025	5'	-	Circe	69	2	81.90
ACTTTTATGACTACATATTCCATTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGGACACTGTAC:1	+	chr3R	9921960	5'	+	blood	7024	2	69.91
CAAGCGACGCAGTCGCCTCTCCCCATTCCCCCGACAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGATACCACTT:1	-	chr2R	16890096	5'	+	hopper	1053	1	55.13
AGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	+	chr3L	21817961	5'	-	roo	9022	2	54.11
CAAAAAGCGCAGCCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGAAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:2	-	chr2L	10037445	5'	+	Quasimodo	28	2	65.07
ATCGCCGCATTATCATTCTAATGGCACCAAATGGGACAGGGGAAAAGCAGAGGGAGGGGTTGGGGGTAAGAAAAAAGAGAAAGTGACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAA:1	-	chr2L	2686469	5'	-	copia	147	2	68.33
TTTTGTTTCCCCCCTCCTTTTTTTCCATTTTTTTTTTGTAAATTGAAAAAAAAAA:1	-	chr3R	9323193	5'	-	Tc1-2	1402	1	50.91
ATAGTGTATTTTCAAAAGAAAACGTCTAGGATTTTTAAATTTAAGGAAAGAAATAAATCAATAGAGAACGCTATTTCGCAATGTCCCTCGACTATCAGATACCCGTCAC:1	-	chr2L	21940649	5'	-	INE-1	551	1	68.81
GTAGGCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chrX	13066584	5'	+	jockey	36	1	50.00
CAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1	-	chr2R	15064433	5'	+	412	68	2	65.07
TCTTATATATATTTTTGAAGCTAAAAATGTTGCTGCACTTAAATTATGAATATTAGAATGCAAAAACATTTATTTAGCAATGTATGTATGTATATATGTAATGCTAGCTCGCTTAAACACAGACACTATCACAGAAATCACCACTC:1	-	chr3R	1283447	5'	-	diver2	491	1	50.68
GGCGAATAAAGACTTTGATAAAAGGAAATTGATTTTTTTAACAGATACAGTGCCGCTCAACTGAATACGTTTTGTTTAGGTTGATTCGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCCG:1	+	chr3R	4357528	5'	-	Tc3	1670	1	53.66
GTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1	+	chr3R	18339119	5'	-	roo	351	2	75.00
ATAAAATACAAAGTCTTATTAGTTTCTTGTAAGTAGATATGCGATCTAATGGTATTGTACTATCATGTACGGCTTTAGTAAATATAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAAT:1	+	chr3R	5061809	5'	+	mdg3	35	2	62.33
AATAGAGAGGACATTTGAAGAGATCGTAGAGGAGTCGGGAACTAGAAACTTCTGGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTGTATAAACATTAAGTAATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTT:1	-	chr2R	3461830	5'	+	invader2	4940	2	64.83
ATTGCACAAGAACAAAGAGGACTCTGAATGAAAAGGTTTATTTATGGAATATAAAGCCAATCTTTGGACGTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACA:1	+	chr3R	6564784	5'	-	1360	435	1	52.05
TTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTAAA:1	+	chr2L	17550614	5'	-	Transib-N1_DM	440	1	79.45
GGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGA:1	-	chrX	21564744	5'	+	diver	65	2	67.63
CATTTGCATGGGTCGTAGCTTATGGGAATTTAGAGAATGTAGAAATAGCTAACTTACATCCTCGGCTAGTGAATAAAACAGTTGAAGGACATAAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1	-	chr3R	19968230	5'	+	roo	8686	2	68.35
TGTTGAAGTTTTGAGGATTTGGTAGTACGATGTGCCCGGTTTATGTACCCATGGTTGGCTCCTGTCGTATTTCCGATTCAAGCTTGATATACCGAAAAATGATGAAATTTTGCGGTCGCATTCACACTTGCTGAGTAA:1	+	chr4	871453	5'	+	INE-1	533	1	60.14
TGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTACACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATA:1	-	chr3R	25454095	5'	+	Quasimodo	38	2	58.47
CAACATATTGTTGTACGTATTAGTTGTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACGTGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	+	chr3R	20469552	5'	+	roo	8678	2	52.74
ATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTTTATTCCCTAATATATATGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGTTACGGGTATCTGAAAGTCGGGGAACTCG:1	+	chr3L	22848494	5'	+	INE-1	559	1	60.00
TCAACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTA:1	-	chrX	23182959	5'	+	Idefix	1	2	70.29
GTTTTGTATACCTTCAAATACAGTGGAACCGCTTGGGTCGATTGAAGATACTATTCAGTCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1	-	chr2L	17471689	5'	-	roo	9032	1	52.85
CTGCAAGTGACCCTCCATCTGCCTATATATCCCTTTCGCTTGTGGTGGGGCCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTGTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAATACTATG:1	+	chrX	10644439	5'	+	jockey	4831	1	61.64
AGTTCAACAAAATAAATTGACGCCGATTTGAACAACCATGAAATTTAAAAGATCACTTTAAAATACTAACTCAAAATTAAAGTACGCTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1	+	chrX	17526808	5'	+	roo	28	2	52.14
TTTAGCAAAAACTTTTATGTGCAATCATATTATTTCGTATCATCTCAAAGACTTCTACTTACTTCCTCACACTTTTCGCCACATACGCATGGGTGATGAGCAATCGAGTGGAC:1	+	chr3L	14603245	5'	+	jockey	17	1	67.26
GAAAGGCAGGCTACGATATTTTGGAAACGGAAAATTATGGTAAACTTTGTGAGACCATTGAAAAATTTTTTACATGGTTCCAACTAATCAAAAAAAATATACATTTTAAGTCTAAGAAATTCTAAGGTGAAGGGCTTATTTTGTCA:1	-	chr2L	12813165	5'	-	1360	212	1	56.85
GTAAACATAAGCAAAAAATTAAACAGCCGCTCCTACTTGCATATCTACACATTTGCCTGCGGACGCTCTTAAGCAGAGTAATGGGTATCTGATAGTCG:1	+	chrX	20122019	5'	+	INE-1	550	1	88.78
AGGGTGTGAAGATGGAGAACAAATGGTCAGCACGTGCATTCGCTTTAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACAACGC:1	-	chr2L	23076812	5'	+	gypsy4	480	1	66.21
GTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1	-	chrX	14824761	5'	+	jockey	4749	1	72.00
TGGATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGAGCCGCCAGAAT:1	+	chrX	20870096	5'	+	gypsy	7039	2	51.37
AGTGTAAAGCTTCATTAGGTTAGGCATTGCGAGACACACTGTCAGACACACCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:1	+	chr3R	31817450	5'	+	roo	8734	2	66.44
TCATCAATGCCAGTACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAATCAAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1	+	chr3R	18582137	5'	-	roo	399	1	67.96
ATTGGCATTCCATCGACTAAATGCCCGAAACGAATAATTATTTCAACTTTTCTTTGAGCATTAACCGCTGAATATTTAAAGGACCACCCACCCAGAGGCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1	-	chr2L	11674466	5'	+	jockey	20	1	74.42
AAATAATAAAAAAATGTAAAGTTAAGGCAAGGTCAACGAAGCAGGCAACTTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGC:1	-	chr3R	17412682	5'	-	roo	263	2	65.75
CGGATCTTTCTTTTCGAGTTAGGAAGCCTCGCATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTCTCTTTCAAACTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCA:1	-	chr2R	5031014	5'	+	Doc	93	1	76.22
CCACAACCGCCACATAAATACGCTCCCATCTGGAGTTTTTCGCGGTACTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1	-	chr3R	10182201	5'	+	blood	7080	2	66.43
GAAGGTGTCCGAATGTCAATGGAAACCTCGATGGCTGGCAGTTGCCATGTCAACACCCTGGGTGCCAAAACATATCACCAGCTGACGTCGCTCCAACTTGTCCAAATATCTTCGTCAGAGGTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACT:1	+	chr3R	10803963	5'	+	accord2	147	2	69.18
GCAGAAGGACACAGAGCCGGAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGATTAAAGTCTGACCCAATCCGCATTCCCCAATCCACAAACCACACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1	+	chrX	21016713	5'	+	Transpac	4925	2	77.17
CCCATCGCAATAAGCTCTTAATTTCTTCGCCCAATCGAGTGAAAGTTAAAATATTTTGTGCATAAATTAAGTGTTTTGCATTGTTTAAATCTTCCTGATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTC:1	+	chr3L	18149266	5'	-	1360	401	1	62.76
AACAGTATTGATATTTGCATATGTGCCATATGTGAAAAATTGCACATGTGCCGGGGCGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1	+	chr2L	13585789	5'	+	Tabor	6860	2	71.92
TTGTAATTTTATTTTTTCTAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGA:1	-	chr2R	5924439	5'	-	jockey	4729	1	45.38
AAGCGCTTGGCTATATGAGCTTTAAGAGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCCAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1	+	chrX	18193669	5'	+	jockey	80	1	64.14
CATTTATAAATCTATAGAAAAAGATGCTAATAAATGGAGTCGAAAAACCACTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1	+	chrX	5643485	5'	-	roo	9016	2	64.62
GAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAAC:1	-	chr3L	10574379	5'	+	Tabor	6897	2	55.56
ACGTTAGGTGTTTTATCTAATCGACAACTGAAATGGAGTTGGGATTCTTTCTGAGCTGCCTACGCGAGTATGTGTGTGTAGGCACAATCGTTTGGATCATGATGAAATAACATAAGGAG:1	-	chrX	1899747	5'	+	P-element	1	2	80.67
CACCAAGTAAAAGTGCTTATCCTTAGCCACCAAGGGCACGCACTCTCTCACAAAGCCACCCAACCAGCCACCCATCCACATATACATATATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAT:1	+	chr2L	2794145	5'	-	Burdock	228	2	60.71
GGCAAAAAAGAACACAGTTTAAAAAAGGATATAGACATTTTCGTATAGTTTCTTTCAATATGCAAAACGATTGTACCCACTTTTGAAGAATTTTTAAATTATTTCTCATTTTGTTCCCTAATATCTATCGATATCCCAAAAA:1	-	chr2R	6033657	5'	+	INE-1	498	1	53.52
ACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1	+	chr2R	19050185	5'	+	roo	8690	2	54.87
GCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1	+	chr2R	7898077	5'	+	roo	69	2	71.23
AAACTACCTTTAAATTCGCCTAAATGTATGCAACGAAATATTTCCCAATTGTATTACTCCCTTCCAGACATTTTAATTAGTAATTAATTAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAG:1	-	chr2R	16248032	5'	+	BS	24	1	60.00
CAAATATTTTTGGGCTAATGTGATTTTATTAGAAGTTATGGATTTATAGGGAACAAAGCGTTAAAAGCTGTATAAAAACTATAAGAAGAGAAATATCATTATAAAACCGTATCGATTGTAAAAATATTGATATTATATTAAGAAAA:1	+	chr2L	12525734	5'	-	transib1	1916	1	60.27
CAGCTTGATGTTGGGGAGTAATCTGGCTGAATCTGGAAAGAAAGATGTTTAGTCAGCAAGCTGAAGGAAATGGAAAATTAGTAAATTCTGTGGAAAGAGATTTGTAAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTAT:1	-	chr2L	7268611	5'	+	Doc	114	1	71.83
AAAGCGATTTGGCCAAATTGACTGCGCAAAGTGAATTATTAATGTCATGTAGGGGCTCAGACAGGCTGGGAAAATCGGAAAAACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1	-	chr3R	29357900	5'	-	mdg1	7396	2	58.62
ATAAAAGAATACAATAACATATGTAGAATAGTCACAACTATAGAAGATAGATTAACAGAAACACATATGTTCATGTATTCGTAGGCAAGGACACACATATGGACTGTAGTGTATCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATG:1	-	chr3R	1048020	5'	+	Stalker3T	54	1	56.16
ACTTTCCATTAAGCTACTATTTTGCTCACTCTTCAAAAATACAAGGAGCCTATATTTACATTCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGACAGCTGGAATCGTTTGCCCAT:1	+	chrX	6191139	5'	+	FB	46	1	53.03
ACGTGAAATTATGGCGCCAAAAGGCGTCCTTGCCTGTGTGTCAGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	-	chr2R	19004216	5'	+	roo	50	2	66.39
TTAACTATTTTAAATTGTAATGACACCAAAGAAACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1	-	chr2R	8585568	5'	+	roo	31	2	43.45
TGGGGAATAGAAAAATAATAAATATTAATTTTTGAAATGCTTTCAAAGGGATAGTTTGTAAGAAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1	-	chr3L	10574412	5'	+	Tabor	26	2	58.62
TCATCAATGCTATCGCCATTTTGCAATGACATTCCAATAGTTTTCTTTGATTGCTTAACTGACGCGAACGTCTAAATTTGCATAATGCACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGAT:1	+	chr3R	18340170	5'	-	roo	57	2	73.77
TTTGCTAATTAGTCATTATAGCATAAATATTGCAATATTCATGTAACCCCTACAATGTAGGGTATCAAAGCCTAGGCAATTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1	+	chrX	13066485	5'	-	jockey	4961	1	57.04
AGATTACACTTTTCGTCCATAGGATTATAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCATCCTAGTAGATCTTTAGATTCACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTA:1	-	chr2L	15991176	5'	+	mdg1	165	2	75.19
AGTTTTAAGAAAGAATTACTAATGTTATATATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAGTTTGCACAA:1	+	chrX	21509925	5'	-	pogo	2083	1	60.26
ATTATTTGGCGCGATGGGGAGCGATGCTCCCATAACTCATGATAGCAGCTCCCGACTCTTCGATGGTTAGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTTGTTTGGTACTATGCAGCCACTTTTT:1	-	chr3R	11496627	5'	-	1360	3343	1	53.24
TGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1	+	chr3R	7482763	5'	+	412	7121	2	72.80
GGTGGGGGACGGATATAACAAGTGGGTGAAATGGAAGGATGTGAGGGTATTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1	+	chr2L	13585843	5'	+	Tabor	6886	2	60.17
TATGCCATGTTAATTTTCAAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1	-	chr3L	14638684	5'	+	1360	3379	2	50.74
ATACAGTATACCCAGTCCGTGCTCCAACGGAGTGCTGTTTACCGTCATGAGCAGACCCACCGGATCAACACAGAGGCAGACTCGAGACCAAGTCACGGTCGCCATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGA:1	-	chr3L	2361165	5'	-	Stalker2	7631	2	55.48
GTTGTAATAATATTTCGTAACATTAATCATACTCCTAAGAGGGCTAGAAAATAATAATAATAATGTAACATTTTCAATTATACAATACTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTGATT:1	-	chr3L	11441858	5'	-	roo	9038	1	61.64
AAAAAACAAACTGATTATTTCCTATCTCATGTAACATACGTTACATGACTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAA:1	+	chr2L	17295853	5'	+	Doc	56	1	61.16
AAGAATTTTGTAATATTTATTGTAATGTATCGTTGTTTCGTTATCTTTGGACAACGTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1	+	chr3L	22863381	5'	+	412	64	2	60.96
TATATACTTAAAATATATACTTACTCAATCAAACGTTCTAAAACAGTGAAAGTGATTAAGTCGACGACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAATAATTCATCAAACGGATTATATCT:1	+	chr4	772523	5'	-	Tc1	1377	1	54.79
GGTACGACATAAAACTACCCCATATCTAGTTCTCTTTCATAGCGAAGGTCGCCATTTTTAACTTACAAAAAGTAAAACTATGATAAAATATCCAAAAGTTTTTCAAAAATGTGGGCGTGG:1	+	chr4	409977	5'	-	INE-1	252	1	58.33
CAATAAAGTGTTTTGCAATGAAGCAATTCCTGGCACGATTCCCTTCGCACGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	+	chr2R	21229005	5'	+	jockey	69	1	64.52
AGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGGTAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1	+	chr3L	15519747	5'	+	pogo	59	1	58.62
ATCCGAGGCAGGTGTAAGTTTGTCGCCTTGCTCTGCTTTCCACTGCCTAATGCAAAACTGCGCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr2L	7945312	5'	-	roo	9014	2	58.90
TATGGCCTTTTGCTCAATAATTTAAGCAATATATCACATTCAATTGGAATTATTTGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1	+	chr2L	18419116	5'	-	412	451	2	56.16
AAGTTTGTCAGAAGTGTCTAACGCAGATCTTCGTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAG:1	-	chr3L	10574356	5'	+	Tabor	6927	2	75.86
TAAGATCACAAAACCTAATCTCCTCACTTAATTATAAAGTTATACTAAATTGCCTAGGTCTTGGCATCTGGGCCAAGATTTGATTGTTGTATTATTTCAATGTTGCAGTTGCATGCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCC:1	+	chr2R	5284532	5'	-	Doc4-element	2600	1	50.34
CGCAACTCAAAAGTGTTTCAGTTCACTTCCTTACTCAGCAATCCAGAAACTGTTTTTTTTTCAACAATCGGTTTCAGTTTAGATCTCAATCAACTGGTTTTTTAAATTGTTTTAAGCATTTTCTTTTTTAAAATTATTATTATTAT:1	+	chr3L	11910246	5'	-	mdg1	38	2	65.75
ACTAGATTCGTTAAAAATTATGTAACAGGCAAAAGGTAGCGTGTCCGGTCATATAAAGTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGGACGTCGAGATCTAAGGAA:1	-	chr2L	17178549	5'	+	INE-1	139	1	72.86
TATTGATAAACACAAATAATTTTGTAGCAGGATGATGTGTCGTATGTGCATATATCGAGGGCACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGAATTGCATAAAT:1	-	chr3L	3863504	5'	+	blood	7063	2	62.73
GGGTGTGTCACATCACAAAATGCATTGTAAGTAGCTGTCCGGTTCTTTACCGTTTGGTTAACGTTTTGCATCTATCGCATCTCTGTTTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTC:1	-	chr3L	26022637	5'	+	Circe	147	2	72.60
GCAGGCAAGGAAAAGCGGATGGGTGGCAACATTTTATTAACAGACATCGTCTATGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1	+	chrX	5274296	5'	+	roo	45	2	56.91
ATAATACGAAAGATACATGCTACATATACACATATATAGAGTACATACTACCTTACATAGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1	+	chr2L	6059214	5'	+	roo	60	2	60.00
CAGATCCCTAATTCCTGCATCTACCTGCTCTCTTGCCGAAATACGAAAAACAAAAAGCCGAAGTGCAAGTTCATGTGATATGCAAAGTGGAGTGCATGATGGAGTTTCAGTGCGGTGTAGTATGTGCCTATGCACTATTAAGAACA:1	-	chr2L	16016468	5'	+	412	10	2	77.40
AGCCTGCCACGCGTTTGCTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1	+	chr2L	14772012	5'	-	roo	409	1	78.85
ATTCCAGTTATAATCAATAAAATCAGAAGAGAGGTGTTAGAAAATAAAGCTTACCACATTTTTCGGAGTGGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:2	+	chr3L	15519709	5'	+	pogo	22	1	73.97
CTTCTATTCGTATTCAAATTTCTGGCGAAAATTATCTGAAATATGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATTATTCTGTGT:1	-	chr3L	4048560	5'	-	Rt1b	4757	1	55.00
CCTTAAAATTTCCCGTATCGAAGCGGCAAAGTGCGAAAAGCAAAGGGAAATGTGTATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1	-	chrX	6499053	5'	+	Quasimodo	60	2	64.38
GTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGAGTACGGGACCGAGTACGGGACTAGTACGGGACCTGTATGGGCTCCGTGGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGGTTATAAAACCTGAGCAG:1	-	chr3L	16047625	5'	+	Cr1a	476	1	49.17
ACAAAGGGAGAGATAGAGGGAATTCAGATCAAGAATTCCATTTTCCAAATGCCTGGCAAATGCAGACAAAGCCGGCAAAGCACCAAAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	-	chr3L	21855561	5'	+	blood	7044	2	60.84
GGTGCTTATAAACTTATTAAGCGGCTCAATCGGGCCATGAGAAAATTGAATATATTAAACTAAACTAAAACTAAAATGAAAGCCGAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAAAAAACTTA:1	+	chr3L	9551629	5'	+	Doc3-element	4531	1	64.00
GCCCGATAAGATAACAGAATATAGCAAAACCATGTAAACTCTGGTTCGGTTCTTCAATCTTAGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAG:1	+	chr3L	9674552	5'	-	Doc	293	1	54.81
AAACCATCGGCTGACCGTATTAAATATACACAAAAGATAAAAATAATCAATACTCTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTT:1	-	chr2R	5173212	5'	-	Stalker4	356	4	60.00
AACGATTTCAGATCTAGCATCACTGTGCTGCTTCTGAAACTGCAAGTGTTTGCGGGCACCATTAAGAAAGTGCAGCTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1	+	chr2L	20840394	5'	-	Transpac	5185	2	55.48
AATGAAATGGAATTAGTAATCGACCTTAAATACCCGCCGTATTTAAACGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1	-	chrX	13039550	5'	+	roo	62	2	68.15
GTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTC:1	+	chr2R	5617489	5'	-	invader1	379	2	52.59
ATGGCAACAACTTTTTAACTAATGGAAAATAGATTTACCAACAGTTCAGCTACAGCTGAAACACGATAGTAAAATAGCACATAAATTCAAAGATATCCAAAAAAGATTAATATTTTGGGCTCCGTTCATCTCTTATGTAAATGA:1	+	chr2L	18299731	5'	+	roo	50	2	77.78
CTTTAATGTTTACATTTGATTTACTAGTTTATCAAAGGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1	-	chr3L	11531005	5'	-	roo	9037	1	60.96
AAAGTTGAGTGGCGCAAATGACATTTAATTGAATTAAAAATAGCAACAGCAACGTATATGGAGAAGGGAAGAGGCCTGAACATTTATTATTATAATAATAAATTGCTGCAAATGATGATTGACATTGAATACGTGTGTGTGTGTGT:1	-	chr2R	11078051	5'	-	accord	187	2	55.48
GCCATGTTATGGTAGTCCATGTGGTCAACAATTTTTCGGTACTTCGAGCTGTCTTTCGGCATTATTCTTACCCAACCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCTCAACACACTTTGTCTACTATTTTGACCGGCATG:1	-	chr2R	1282403	5'	-	Circe	7386	1	77.24
CAGGGTGACCGACGAGAAAATAAATTTGTGCTGAAATTTTTGAGAAAAAGTCCATTCCTAAGATTCAAACGATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1	+	chrX	17054188	5'	+	jockey	35	1	56.67
ACCGCCGAATCGAATCTACCAATAATCACCATAACTTATGGGCAGTTCTGCTCTTGATCAATGTCGGCTGGCGACTATCTACGTCACTAAACAGGAAAATGAGCTATTTGATGTTGTTTTTTGCATGCACATAAA:1	+	chr2R	6628842	5'	+	Cr1a	258	1	75.56
ATTTTATTAAAGTATTTAGGGTAAAGTCTATTTGAAACTTAGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTATATGTATGCAGGTTTTTACGTTTCAGCAGCTAG:1	-	chr2R	11629264	5'	-	Tirant	8444	2	54.63
TCAAAATAATTGAGCTCATTGACTTTACAATCTTCTTCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATC:1	+	chr2R	10596081	5'	-	Juan	3838	1	74.48
GCAATCCTTTGGCTTTAAAGCAAGTTTAATATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCT:1	-	chr3R	11547774	5'	+	G2	316	1	54.17
CGGAGAAACATTTTTCACTTGAATTTCTGTCGGCGGCCATATAATTAAGGTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1	-	chr3L	19036074	5'	+	Tirant	8122	2	61.11
TACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	+	chr3L	11441722	5'	+	roo	55	2	60.27
CAACTGTCCCGCTCCCCAAAACCGCTGGCCTGTGGGAGCAAATGTTGTCCATAAATAGCGTTCACACATGAACACGAATAAATTT:1	-	chr2L	7945410	5'	+	roo	6	2	68.24
CCAACGCCCTCTGCCCGAAAAGTGGGCGTCTGTGGAAATTTCAATTAAATGCGCACATGCCAAAAAAGGCGAAACTGAGCCAAGTCCACAACAAATTGAAAGGTCGTTTTTAGATATTCTAAAATACCAAATATTGTTATACAAAA:1	+	chr2L	19310256	5'	+	Juan	4066	1	79.45
CATATTCATAAAAAAAAGCACGCAAAAAACTCTAAGAAGCAGAACTTTCTCATATATAATTTTATGCTGCATAAGCAGAGATAAGTTAATTGAAATCACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1	-	chr3R	28075440	5'	-	jockey	4969	1	65.52
GGTCATTCTTTGTGGTTGGTTTCCTAATCATGCTAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACG:1	+	chr3L	2362541	5'	+	Stalker2	135	2	77.40
TGGGCAAAAACCAGAAGTCTAAATATGAGCACCTAGGCCCACTGGATTAACTTTACGCGTCATTTCTACACTTCCAGATGTTATACTGATTTCAGTAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAGGGTGAAGGGCATATTTTGTC:1	+	chr4	408874	5'	-	1360	213	1	65.07
AAAATTTTGGCGCTCATCCAAATAAAAATAAGACAAACAAGCTAAGTATATGCGATCCGAATAACCAACCATTCTAAAGATTTTTTTCAGCATTCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTC:1	+	chr3R	25245799	5'	+	blood	7169	2	61.87
GAATACTTCATGTAATTACGCGTGCCCGAAAATGAACAAAATTAACAAAAATATAAATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATT:1	+	chr3R	17243067	5'	+	hopper	17	1	73.97
CAAAATTGCTTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTAGGAAACACAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1	+	chr3R	26222860	5'	-	roo	9011	2	64.29
TTTTGCAGAAGCTACGGAATCTTGAAATATTTGCTACTTCTATGAGATATGGTAATTATAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	+	chr3L	11393480	5'	+	roo	64	2	65.75
GTATGCACTGGCAAAAAATGTTACCCCTACCATCTGCAATCTTGTGTAAAAAAACAAAGATATAGCTCGTGTCGTAAAAACATACATAATATTTCTTAGTGCTAAAGTATTTAAGAACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCAT:1	+	chrX	18744325	5'	-	R1A1-element	379	1	79.45
TATCATGAACAAGGACTTGAAGACGAAAGGAGCCTGTGGTATATTAGTAAATCATTAACACAATTAGTTGGCTTCAATTACCAAACGGCTTCATCTCCTTCGGAATCATTAAATAATACAATGCAAACCGCACTAATGTGGAA:1	+	chr2R	7418151	5'	-	frogger	2056	1	72.73
GTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTCCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1	-	chr2L	5254344	5'	+	roo	48	2	69.81
CACTTGTAGAACTTACATGTTCTGAAACTCTGTTAACTCTCTGTTATATTAGACTGTTTCACTATTTACTGTATGTGCCGGTATTCTTTTCAAGTTGTTCAGCTGAAATTATTTAATTTAATTGACTAGCGTACTATTACCCTTCT:1	-	chrX	21171428	5'	-	jockey2	3359	1	39.73
AGCTAAGGCACGGGAAAATTACAAAACTTGCACAGATTTAGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCAC:1	+	chr2R	2843172	5'	+	1360	3319	1	73.97
GAATATTTAAGCATTTTTCATGAAGGGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATCATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGTC:1	-	chrX	23108364	5'	+	BS3	1429	1	58.90
GAAGTGCAACTATGTATTTCTGTGGTACCCTGGCAAAATCGGATAACAAAGGCTGGTAATTACAAAAGATGTAAATTAAACCTCGGAAAATGAAATGGATAAAACTATAGTAAAAATGAAAAAAAAAAA:1	+	chr3R	6533876	5'	+	Doc	4693	1	73.64
CCAAGCTATGATCAACTGCATCAGTAAGCAAATTTGAATTTCACAATTCTGTGAAATAATTTCAGAGTAAAGCTTTAGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1	-	chr3R	1207580	5'	+	copia	4912	2	54.29
TATTGATTTAAGTTTTTGTGCTTGCACTAAAAATAGTTATTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCGATGTACT:1	-	chr3R	11547745	5'	+	G2	340	1	77.39
CCAGTACAAATACTATATTCCCAAATCAGAACAGCAACTAAATGCAAAAACCAGGAAGCTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1	+	chr3R	18582146	5'	-	roo	342	2	64.38
AATAATAAATATTTAAATATGTTGAATATATAATGAACATATATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCAT:1	+	chr2R	6359423	5'	+	copia	4935	2	70.45
AGCGGGTGTTTAATTAATATGACAAATTTTCAAATTTGCTCACATTCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1	-	chr2R	11164491	5'	+	roo	8719	2	69.05
ATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1	-	chr3R	17243232	5'	+	hopper	7	2	71.82
AAGCACTTAATCGCGACACACGTGTCGTATACGTAATCCACATGGCAACGTTTCTGTATTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1	-	chr2R	19540462	5'	-	jockey	4955	1	53.60
CTGCGGCCTTGGGGCAAATAATAAAATCAAGCAAATAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATA:1	+	chr2R	15004371	5'	-	jockey	313	1	75.34
GAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1	+	chr2L	9668199	5'	+	1360	52	1	71.19
TTAATATTCCAACAAGTGGTCCATCATTTGAACATAGTATCGTGGTACACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGAT:1	-	chr3L	22016893	5'	-	INE-1	151	1	70.55
CGCTCCCGCTTCGCATTCCGAAATCCCAAGTGTCTTTTGCCTACATAGAAAACATTTGTAATTGTTGCTGCTCCATGTTATCAGACTGCACTATGGAAAATTTGAACACTTTTTCTGGCCAAAATTAAAAACTCCAGAAC:1	+	chr2L	21108630	5'	+	Transib-N1_DM	31	1	52.14
AATTGCGTCACGATGGCGTACCGGCAACATGCAACGAATGTTGCTGGTGGCACGTACGCGAAACCCGCTGACTTTTGCCACTTTCATGCGTCTTGGTCCTTGGCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATC:1	-	chr3R	28562072	5'	-	pogo	1640	1	79.39
TTTTTTTCTTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATTCTGTTGG:1	-	chr2L	12636389	5'	-	Porto1	4543	1	78.62
AACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	-	chr2R	8585536	5'	+	roo	64	2	61.64
GTGCTTTTCTTCCTCTTCTTCAGCTTTGTTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTGTTTAGCTAACTTGTTTTGGTATGAATGGTATGCGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1	-	chrX	17833103	5'	+	Tirant	7	2	71.55
CGTGCCACGAAAAGAGAGACGGAAACACAAGCGCTTTAAGTCGTATTCACTACATCATGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1	+	chr2L	9668184	5'	+	1360	48	1	62.02
GCTTGGTAAGCTTCAATGACTGATTTATATCGTATGGGGTGCTTAATTGATAAAGTGAACTTTTAATTATTTTTAAAAATATATCAAATAGAATATTATAATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1	-	chr2R	23878283	5'	+	297	17	2	74.66
TGAGGCGCTGAAGTGATAGGAAACTTCCTATCAAATTTGGGGAAAATACATATCATGTACTCTACGTGTGTTAAAATAAGTGCTATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1	+	chr2L	6863251	5'	-	pogo	2067	1	62.76
CGTTAAAGTGTCATTACTGGGCTTAATGAGTCGGCGAACTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1	+	chr3R	7482755	5'	+	412	42	2	60.75
AGTATCTAGGATGAGGTTCTCTAAGATTCCAGGACGACAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1	+	chr3R	22844206	5'	+	roo	58	2	70.83
ACTCGGATTGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGGTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1	-	chr2L	20840522	5'	+	Transpac	20	2	64.04
CCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCTACTTTGCATATATTCATATATATATATATATATATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1	-	chr3L	23839703	5'	+	17.6	33	2	65.42
CCTGAAAAAAAAAACCCTTCCTCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTT:1	-	chrX	13707244	5'	-	invader4	297	2	74.70
CGAAATAAATTAAAAAACCAACTTTTCAATCTTCTGGGAATATTGAATACTGAGGAAAACTTTTATAGATGCTGAGATCTCGAAGTTTATACGGACAGGCGGATCAGATGGCTAGATCGACTCAGCTATTGATCTTG:1	-	chrX	19124346	5'	-	INE-1	95	1	56.20
GTCACTATGCTATTATTGTTATTTATTTTCGTGACGATGGCCGACGAAACAATATAATGTTACCGATTTCATTGACAAGCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1	-	chr2L	22685214	5'	+	Ivk	46	1	54.11
AAAACGTGCAATCTCTTGAAAGGATACCTTGAATAGGAAAGAGAATAAAACCAACTCCTAGTTCTTAAATCTAATTCTTTAATAGTTGCGTTCTCTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1	-	chr3L	17560418	5'	+	pogo	18	1	71.43
GTCGGCACATTTATCTTAGAGATACCAGAAAGTGCGCACTGTGAGAAAAAGTTTCTTATATTTCTGTGCTTCTTTTCTAAGAATTTTGTGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1	-	chr3L	15600354	5'	-	roo	9042	1	50.35
AGGGATGTGTTCTGCATTGGCGAACTCACACCTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAA:1	+	chr2R	142813	5'	+	HMS-Beagle2	281	2	77.05
CGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1	-	chr3R	2689433	5'	-	diver2	4474	1	65.71
AGTTGCTTATCCTTGAAAGTGAAAAGTAGTTTCTCCTGACCGCAACAAATCCGGACAAGATTCCAAATCAGCACATGTAAAAGAATTTTATTTTTTCGTTTATTAGTAATTTTCATACTTTTATCCATTTTTTTATTTCTTTTTTT:1	-	chr2R	12062934	5'	+	hopper	141	1	76.03
GATATAATGTAAGATCTATTGAAAAGGTTTACACTTGATTTCTAAGGACTATTTTTAAAAATACTTAATCTGAGGCTTATCACCACTGTGTAATTTTAAGAAGTGCATTTTTATCAAACATACTTATTTAATATTAATTATAAAAT:1	+	chrX	20704209	5'	+	G4	3792	1	56.85
AGTGGGCTAAAACTTGGAGCTTGTAGCTTGTAGCTTGGCCCTTTTCCCACCCTCTCCCTCTCTCTCCGCTCGATTTTCCGCTTTTCTTATCGCTCACTTGGCAGCAGTGACAGGGAACATGACAGAGAAAAATAAAATGAATATAG:1	-	chrX	5454674	5'	+	invader2	297	1	58.22
AAAAAAAAATAACTTTCTTAAAGAGAATTTTCTTTCTAAAAATACAAGAAAAAATAGATTTTTATTTTTCATATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1	+	chr3L	4523620	5'	+	opus	7160	4	55.17
ATAAAAAATTTTGGAGTCGTCAAAATTGGTATACAGATAGAAATGGGTCAGACAGATGATAATACGAAATAAAAGGCAAAACATTTAAACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCCTTGTGTTATGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTG:1	-	chr2R	5743861	5'	+	Cr1a	217	1	58.22
TTTTATGATTTATTTTCGTTAAGGACCCTTTATTTTTGTTGTGTTCGGCCCTCATATACATTTTTCATTATTCTGCTTTTCACATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTA:1	+	chr3L	7292437	5'	+	HMS-Beagle2	37	2	63.01
CTAATTGTTTTCCAAATCATTTGGAAAGACATGACCCATTATTAACACTGCTTGAGTAGGTGCAACCAAAGACCCTNGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1	-	chr2L	14081406	5'	-	1360	3346	1	56.92
ACTAGTTTGATTAGAAATGTTCAGCGTATTTTCTTTTCAAAAATGTCCATTTTAATCCCAATGCTTGCAAGTCTTATAAAATACATTATCAAAACAACAAACTTACAGGATGGGTTTGCAGCAATTACGGCTTTAAAGTCCATTTT:1	+	chr2R	7453372	5'	+	pogo	1758	1	71.92
TTTAGCACTAAGCAAATGGAAAAGAGAACAGATTGGCCAAATAAATATGAATAGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAA:1	-	chr3R	24383330	5'	+	rover	63	2	63.19
ATGCTGTAACTCACCACTGTCGTGTGCAGTAACAATATGTTTTTGAATTAAATTAAAATAAAACATTAGCTTTGTTTATGCCATCACTGTTTCATTATTGAACCAAAGACACTAGAATAATATTCTAGTGTCTTTGATTG:1	+	chrX	19787192	5'	+	Tc3	314	1	72.86
CAAGTAATGTGGCAGAATCTGAAGTCGCTATCCCCACACGNCGCAGCGTTCATATTATAATTAATCATTTGTTGAATAATAATAATGGAGGCGTCTGATGGTTTCACTGTTGTCCAGGAGGTTTATAGCCAGATGGTT:1	-	chrX	11689101	5'	-	G-element	4120	1	61.59
CAATTTAAAACTATTCATTAATGAGGAAAATTCCCTTATTAACAATTCGTATTTTCTTGAATGCTATGAAATAGGTCTTTGTCTTTTTACCTGAGATATGAAAAAAATAAATTATATAGTAACCCGAATAATATGATAATAATTAT:1	-	chr2L	3608262	5'	-	Transib5	2567	1	72.60
CACACACACAGACGTAAAGAAGCTGAGAGCCAAACAATCCAGAAATTGGTATACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAACATCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGT:1	-	chrX	9540135	5'	-	roo	9061	1	72.88
CAAATAAGGCAAGATCATAAGCGCCAAATATAACAACGATCTTCAAGATACATTTAGCTGTTATCAGATGCAAATGTTTAACAATTTGTATTTGAGATAGTCTGTGCAAAGACCCTAGAATATTCTAGTTATTCTAGGGTCTTTG:1	+	chr2L	11292457	5'	-	1360	1	2	35.86
CTCTAGCTGCACTTGCCCCGTCCCTTAATAGGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTG:1	-	chr3R	2532012	5'	-	gypsy8	4898	2	84.55
TAATTATTCAAATCTTATTATATTTTCATTAGGATTTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCT:1	-	chr3R	23358443	5'	-	Doc2-element	4483	1	76.00
GCTTGTTTGAACCACGAAACGGAGGACTCAGTCAGACTCAGTCTATCAGCAAATCTGCTCTGCTCATACAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAA:1	+	chr3R	28076351	5'	+	jockey	4894	1	52.74
CATTACCTAGCTGCTCTTTTACGTATTTGCCAAGACTTAATTGAAAAATGTTTCCCCGTATTTTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTCTTTTTTGGCA:1	-	chr3L	10056210	5'	+	transib2	10	1	68.27
TTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1	-	chr2R	16785428	5'	+	412	7073	2	62.62
TGAATTAACAGTATATGTGTGAACAAATAATACAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAAT:1	+	chrX	2842515	5'	-	Tabor	7235	2	76.71
CGGACTCCTAGTCATTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCT:1	+	chr2R	1571526	5'	-	1731	271	2	55.17
ATACTTAAATTTCGAGCCAGATTCGAGTTCGTATCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1	-	chr3R	7100874	5'	-	roo	9009	2	72.50
CTACCAGCAGGAAATAACAAATATATATTTCAACAGGATAGCTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1	-	chr3R	12598537	5'	-	hobo	2895	1	61.82
TAATTAAATAAATTGTATATATTATATTCAAAATTGCTTTTGTATTCCCAACCTAGGCTACAACATTTTATTTGTGGGAAACACAATGTAAAATACCAAATAAGAAGACTT:1	+	chrX	22617209	5'	-	roo	405	1	72.07
AATGAGGAATAAAATAAAAATGTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1	+	chr3L	21817957	5'	-	roo	9026	1	52.74
ACTGCTTTATTCACGCAATGATTAATGACCGACTTTGCGGCACAGATACTTAGTAATTGCAGATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTACATGAATCGAG:1	-	chr3R	22956052	5'	+	roo	8720	2	55.24
GGTGTCACCCGGGAAGAGCAATACATCTCAATCTGGATTAAAACTCAAGCTGATAAATAAAGGAGGGATGTGGGAACGTGACGATGAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGG:1	+	chr2R	3292651	5'	-	Idefix	178	2	52.74
GGGTGAAAAATGCAATTTCCGCACAGACGCACACATTTTCCGGCCAACACAGTACATATACATATATTGAAATATATATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1	+	chrX	12214043	5'	-	opus	455	2	56.85
CATTAAAAGTCAACTGTTTGTTTGCCAGCGAGTTAGTGTGCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAATCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1	-	chr3L	22349266	5'	+	jockey	69	1	65.04
ATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGAAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:1	-	chrX	23439047	5'	-	P-element	2495	1	64.18
CGTCGAAACTCTTAAAAGCGTTGGTAGATTCTGCTCACCTTATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1	-	chr2L	7888202	5'	+	pogo	67	1	73.38
TTTGTTGCTGCCTGTTTGTAGTCGTTGCCCAAAGGCAGACTCACTTTTCACTACCTGCAACATGTTACCGCTGCTAGCCAAGAATTCTGATTAGGTTTGATTTTATTAACGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAA:1	-	chr2L	16807022	5'	-	1360	3283	1	78.26
CCAAGAAGTAACGAGCAAATAAGTGCGAGCACGGAGCGCGTTTATGGCCCGATTCTTGGCCCAGAAGATGGAGGAGCATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAC:1	-	chr2L	10037433	5'	+	Quasimodo	40	2	55.48
GATATAAAATTGACTTCTATTTCATTTGGAAAAATTTTCCCTTGGACTAACAAATAGTTCAATTCACAAAGATTAAGATTTTTCATTTTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGCATAGATGTAA:1	-	chr3R	9714506	5'	-	Stalker4	394	1	70.40
CAATGAATAACCTAGAAAAGGGGTTTGTGGTAAATGAATACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATA:1	-	chr2L	13585908	5'	-	Tabor	7241	2	71.92
CGGGCTGTCCTCCCAAATAAAGAGAGTCAGAGCAGGTTTACCCCAGGAAAGTGTGTTAGGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1	-	chr3L	23906478	5'	+	1360	47	1	58.21
ATATTCACCTCAAATTTGAATTGGGTATAATAAGAAAGCGTTTAGAAATTATGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1	-	chr2L	11661000	5'	+	F-element	33	1	47.19
GGTTTCAAAAGTCAAGCAATGAGACAGCGAAATGCCAGGATATCGCCATCAGGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATGT:1	-	chrX	8543532	5'	-	roo	9032	1	52.99
GAAGTAAATGCTTGTTACAAATGGATAAGGAATCTAAAACGCTCTTACTCCAATTTAAGTTTGTCCACAGCTATTATATTCACCTTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCC:1	+	chr2L	5927991	5'	+	I-element	31	1	42.86
AGACTCAACAAATTGCATTAGTTTTATGCAATTTGGTGTTTCTACATTTATTAACACACACACACACACA:1	+	chrX	16673271	5'	+	accord	180	2	74.29
AAAACAAAGCAAAAATGTAAACAAACGCAGTCCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1	+	chr2R	11629711	5'	+	Tirant	29	2	67.12
CAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1	-	chr3R	17243242	5'	-	hopper	1383	1	61.38
GCTAATAATATCTTTTGCATATCTAGAATTTAGTCAATGTTAAAAGTGCACTTATTGTACAATACAAATATTACCAAATATGTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1	+	chr3R	18339063	5'	-	roo	9033	1	57.53
AACAATTTATCATTAGGGTCATCGAAGGTACATTTTCCCATTTATTTTTCGATTATTCCAATGGCCACCTATATAATATAGTGGTCCGGACTCGACTTAAAGATAGCAAAATGAAAACGTTTTAAATGTGTGGGCGTGACAGTTTT:1	+	chrX	22663754	5'	-	INE-1	245	1	73.29
ATTATTTATGTTTAGATTTGAATGTCAATGTCGAATAGGAATCTGACTGTGCGAGTTGTGGGCGTGGCATCATGGGGAACAAACTTTCGCTGCGTCTAATGTCTCTCGAATCTAGCTTTTATATTTTCTGATATCTCGACGTTCAT:1	-	chrX	22857996	5'	-	INE-1	139	1	60.96
TAAACAACTATGTATGTTTGCCAGATTCGCTCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTGTAAGTTCCAG:1	+	chr3L	16750680	5'	-	Tirant	344	2	74.31
ATTTAAACTATTAGTATATGATAGAAGAAGAAATGGTATTTAATTTAATCAAACCACTTTCCAAGCAGATATTCATTATTCATCATTTCATTCGATTTCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATAT:1	+	chr2L	13053706	5'	+	BS	5019	1	65.75
AAGGTTTGTATTCAACGCAATGCTCCTCATTTTTAGCATTATTTGGTTCATTATTACACCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCG:1	-	chr2L	4411638	5'	-	Quasimodo	6927	2	57.53
CATGTTATTGCAATTTGGAGTAATCAGATGCGTATATATAGATTACAAGAACAATACAATGATTTGGTATTTTATTTATTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1	-	chr2L	19310408	5'	-	Juan	4167	1	50.68
TTAGGAAAAATGTATTTGTATGATAGCATGTCATTCAAAAACAAATTATTTATAACATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1	-	chr2R	13122093	5'	-	pogo	2039	1	63.70
AACCAGTAGATCATAAATTCACGGAGCCCAGCTAAGTATGCAACAAAAAAATAAAAAAACGTCAGGATATCGGGCCATATATACCTCTATATGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1	+	chr2R	16945254	5'	+	jockey	24	1	63.36
ACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATAAACAGTTATCAATTTAATTATTTACTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATG:1	+	chr3R	4604452	5'	+	1360	478	1	63.89
CTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTT:1	+	chr3L	24213793	5'	-	invader2	5032	2	76.74
GACGAATGTAATGAGGATTTCAAGGATTGGGCACATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAG:1	-	chr3L	8249101	5'	+	jockey	4609	1	76.06
ATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1	-	chr3L	10292875	5'	+	roo	8752	2	78.77
ACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAATT:1	-	chr2R	16785415	5'	+	412	35	2	54.13
AAATTCAACTAAAGAATGAAAACTCTTCATTAAATTCTATAATTATTTGTGCTTTTAAAAATATGCTATGATGGTATGTCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1	+	chr2L	12250027	5'	+	1360	36	1	45.99
AACTGTTTGCCACGACGACCGGAATTCGATGGCCTGTCTGTATCACCACCGCTCACATTGGCACTTCGCTCCACATGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr3L	16343326	5'	-	roo	9053	2	68.33
AGCTTTGAAGAGCAATGTAGTCTAGTCTTAGATAATATGCAAAGTCAGTTATCGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTGTTTATGATACAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATA:1	+	chr3R	19448431	5'	-	roo	8608	1	76.22
TGTTTCAAAGCTATGCATATTTTTTGGTGCTATATAAAATTGTATATACATTAATTAACCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1	-	chr2R	15064438	5'	+	412	7107	2	59.12
ATACGGAAAGTCGGCGTGCAGACAGTGTAAACATGTGCACAGTGGGTGGAATAAATGCACGCCCATCCAAGTCTCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1	+	chr2L	12328616	5'	-	hopper	1396	1	57.50
CTTAGTTGTCAATGACTCTAAAATTAATCTCTGTAAGTTAATTAATTGTTTTAAACATTTTTTTAGGGTGAAGATATAAATGCCTATTTATTCAGTACTAACTTTTAGCTCATTGGCTTAATTTTTTTTTTCTATTTTTTTTTGT:1	-	chr3R	18009717	5'	-	G2	3076	7	65.52
TTCTAGGAGCACAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCC:1	-	chr2R	4677377	5'	+	invader3	7	2	74.56
CACGAAGAATTGATTAAATAGTGTTTAAAGAAAAATGTTGCACTTTTTTATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCACCG:1	-	chr3L	18369012	5'	+	opus	7053	4	63.57
CGATGTTTTGATATATTATCACCCCATACATAAGGACACTTGCAAAATGTGGTCTCAAAAAAAAGTATTAAATATGCTCAAATTTATACAATTTCATCACTTAAACAGCGATAAGAAATACATTTTGTCAAGAAAGTGTTTACACA:1	-	chr3R	25495892	5'	+	S-element	5	2	72.60
AGTAAACTTTTTAGCCAGGAAAGTATCTTTTTTGGGTATATGTATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1	+	chr3R	22955967	5'	-	roo	329	2	70.55
ACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAACCTGCATTAGTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1	-	chrX	23280950	5'	+	roo	8678	2	43.90
CTCAAATTTTTTTTCTCCCCACAAGGATCGGATGTGTAACTGCGTGTGTTTTCGGGGCAGCTGCATTGTCGAGCAATTAAGCGCTGTCCCCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTG:1	+	chr3R	17817854	5'	-	roo	9041	1	65.75
TGGGGGCCTGTCATCGACAACAGCTGCTGCTGCTTTCATGTCTGTTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGGCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACC:1	-	chr2L	9412087	5'	+	jockey	4525	1	60.83
ATATAGAATTCTATTATGATTGAATATGTTGAAATGATATAGAAATCTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1	+	chrX	8347583	5'	+	412	7100	2	62.71
CTTATTTTTGGGACTCTCGTATTTTTTATTTTTACTTTGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACAT:1	+	chr2L	4412537	5'	+	Quasimodo	33	2	55.00
CCCTTCGAGCCCTGGCCACAAAGTGTTGCGTTGCACTCATATTTTGCCGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGGGTAAATGTATGAAGG:1	+	chr3L	19035991	5'	-	Tirant	358	2	56.52
ATGTAAAAAAAACTTCCCCTAAAATTAAATCAACAACTTAAAAAAGAAAGCAGTTGCAATAACATTTTGAATCGCGAAAACACCAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGT:1	+	chrX	22826671	5'	-	R1A1-element	27	1	53.96
GTAAATATTGTATTACTGCACTCAACATCATTTTTGTAAATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1	+	chr3R	16076798	5'	+	roo	74	2	73.38
GAGGAATTTAGGCATTTTAAGGCACCGGATACGGAAATGAGAGTATTGAATGAAGAAATTTGGTAATCAAGGTACTTATACTTATAAGTGCTTAAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACA:1	-	chr3R	25454141	5'	+	Quasimodo	20	2	58.22
GACTGAACGATAGAGCGACAGAGATGGCACTCTCACGACAAAAAAGACAAATCAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAAGCTGAGATCTCGCCGTTCATAC:1	+	chrX	5256496	5'	-	INE-1	137	1	48.25
ATATAACGAATATTATTTGTCATTTTAACCTAATGCAAAATTTTTATGTAAAGCCTACAACCGTTTTTCTTGCAGTGTGCAGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	-	chr3R	12887013	5'	+	roo	21	2	67.19
GCATGATATGCAAAAACTGGTGCTCCTGGAATACCGTATCTTGTCAACCAAATGGTACATGTCCCTGACATGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTG:1	-	chr2R	5283326	5'	-	Cr1a	4123	1	53.73
GCCATACATTGCAATGCAAATATATATGCGTTGGATAATACTGTGTTATTAAGTGCGATATTCACTTCGTTAAATGAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1	+	chr2R	20496880	5'	+	blood	7044	2	58.90
AACAATAATTCTCTATTATGCCAATCTATTACCAAATCTTACACCATTTTTTGAATATTGTTTGTGCAAAGCTGTAGTTACAAATGTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATACGAAGAAGCA:1	-	chr3L	19014034	5'	+	invader3	39	2	56.16
CTCACTGCTTATCCCCAGCACGTGCTCAGTGCACTCCAGGAACAATCGCACAACGGGTGTGAAGGCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1	+	chr2R	19050182	5'	+	roo	8688	2	57.02
TCTTAAAGATCCTAATTAGATCCTACTAACAGTAAAGACAATAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCT:1	-	chr2R	19528307	5'	-	1360	424	1	76.03
CAGGGGCTGGCATGCAAAGCGGGTTGCAGCAGATTCTATACACTGCGAGAAATCTACAACAAGGAAGTGGAGCAGAAAAGCACTATGAGAGTAGTAAACCCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1	-	chr2L	5254410	5'	+	roo	8669	2	72.87
GTGTGATAGATTGTCATTAACTTTTGCATTAAGCTGTTGTATGTACATACATATAAATAATGATAGATTATATTACATACATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:2	+	chr2L	17420129	5'	-	roo	9031	1	55.48
CATAATAATAAAAGCAATGCGGCGAAATTGAGTGAAAAATAAATTTCGTTTACGAAAAATAATCAAAAAATATCGCAGCGAATGAGAGGAAAAAATTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1	-	chr2R	23797882	5'	-	roo	320	2	73.13
ACTAAATTTAGCTTTTTGGAATTTTAGATTGATTTTATATTTATTTTCTATAACACAGAGGAGGTAGTATATATCCTTTAAGGATAATAATTGAGTTCGTATCACCAAAGACCCTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTATCA:1	+	chr2R	16745319	5'	+	Tc3	316	1	70.34
GATCTCAAGACCGCAGACGAATACGAAGTCCAAGATTTTAGCGTGCAAACAAAAAGAAAGAGAGAGGAAGTGATGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1	+	chr3R	14651185	5'	+	P-element	4	2	73.79
GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTC:1	+	chr2L	20360644	5'	-	R1A1-element	137	1	66.36
TGCATAACTATATATCCGTGAAATATATTGTAATGATGAACTGCCCTTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1	+	chr2L	18419170	5'	-	412	7488	2	73.15
ATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTTGCTTTTCGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATGTGGTTCAATTGTATTAGAAAAGATTATTATAACAT:1	+	chr3R	28666930	5'	-	TLD2_LTR	50	1	54.11
CAGTATGAGCAAATGCTGGATGTTGCTTAACTCACAATACNCCACGAACGCCAACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCAC:1	-	chr3L	25846903	5'	+	Idefix	160	2	61.83
TATAGCGAGTGTATTGGATAGGGGGGAAATTGGATTTTGAAAAATTTTGTACATACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr4	419961	5'	+	roo	8718	2	63.70
CTTTGTTTCGAATCCGACTGCTTGACAATTCGTTGTAATATTGTATTTTCCTTTGCTGCATTTCTTTTGTGAATAATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACG:1	+	chrX	13704743	5'	-	invader4	291	2	57.86
ATTGTTATCTCGCACATTGCAGACGATTTCCGGCAGGCATTTGCCCACGTATGTATGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1	-	chr2L	2703581	5'	+	hobo	6	1	68.97
TTTGGCTGCAGGACGCAGCTGGAAAGTATGCAACGCCTGTGCCAGTTAATTACGAGGCTGCCACAGAATAAAGTCGACAAACACACAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1	+	chr2R	12835007	5'	+	jockey	14	1	76.52
TGGGTTGAGTGGATTCGAGTGGAGCGACGCTGGGTCGGGTTTACGAGTTTACTGCTCCGCGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1	-	chr2L	20840514	5'	+	Transpac	4979	2	58.22
GAGGAAATTCGACATGCGGCCGCGCGTATTTGCCGAGACTATCTAACTGGGCCCTGGACAGTTTGTCGACGTTAGAGTGGGCGTG:1	-	chr2L	21618080	5'	-	INE-1	215	1	68.24
TAGGATCAAGTTCCAAAAATCATAATCAATAATCGTAATATGGGGAATGTAGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGG:1	-	chr3R	20497862	5'	-	mdg3	23	2	56.41
CCGGGGTTAGTTTTCGAGATCTGTAGTACAGATTCTGTACATGCGGATAGAGAGCCTGTTATGGTTGAGTCGATGTTGATCACGAAAAGGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1	-	chr2L	18419269	5'	+	412	34	2	56.85
AATGATTATTACATAGCTATTCATTAAACACCTTTTTTGAAGTAATAATTAATCAAAAACAGTAAAAAAAAATCTAATTTGTACGAACCCTCATACATTAATACTATGAGCTAAATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1	+	chr2R	13121935	5'	+	pogo	2	1	71.72
GGGAAATACTCATGCATACATGTATTTGCTTTTGAAATAATCTTTTCATCTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1	-	chr3L	11530969	5'	-	roo	9001	2	66.44
GGGGAAATATGAGGAAAAACAAGTTTCAGGCCAAAAATATTTCAGCATGAATTTCGTTGTCACAATATGACTGAAACATGGGCAAGGCATGCCGCATTCGAGGGGTATGGGGTTCCCCGACTATCAGATACCCA:1	+	chr3R	14706841	5'	-	INE-1	555	1	79.85
TAACCGATTGATGATGATTGTGACTCGCCGAGGTAGAATCATCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGGGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCG:1	+	chr3L	3863450	5'	-	blood	7347	2	57.94
AAAACCTCTGTGGTCATTAAAATGCAGGCAATGGCAAAATAATGCATTTCAATGACAATGACAACACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1	+	chr3R	25423194	5'	+	3S18	5787	2	57.66
GCTATGAAATCGCTTGCTCGCACTGTTTTTCTGCGGTCTTGCCTAGGCTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGGTCACAGAAGTCGCGG:1	-	chrX	13066580	5'	+	jockey	36	1	50.98
CCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAA:1	+	chr2L	22975388	5'	+	1360	130	1	56.52
ACTGTAGGCTAGACAGCATCAGTATCAATGTTTGGGCTTGGGTTTTACCTGATATCTTTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1	+	chr2L	21884508	5'	+	pogo	60	1	62.07
TTCATAATAAAACTGATTATTTGGATAGCTTTTGTTAATTTATTCAATGTAATATGTATTAGATATTTAAAAACTTCTGTATAGCAAGTGTATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTA:1	+	chrX	20870075	5'	+	gypsy	7003	2	68.70
GAATAAGAGATTTATTTATACTCTATAATTATAATTTAATGGCTAATAAAACCTCTGGCTTTGTCTTAAATAATCGGGTTCATAATCACACCATATATTAGTGGTGTATGAAAGAGAATAAGAAAGGGAAACGCTTG:1	+	chr2R	19976023	5'	+	invader5	210	2	65.69
GAGTGCTTGGTACCACGGCGGGGATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAACACT:1	+	chr2R	13084571	5'	+	roo	13	2	69.37
TACTACCTATTCTGTTCAGTTCAGTTTTCGTCAGCGGTAAAATAAGACAGCACGGTATTAATATATACATTTTACTTTTCATTGGATTTTTACCCCATATTATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1	+	chr3R	25339927	5'	-	mdg1	7440	2	71.92
CCGAAGGACTACCTGCGGGCTGGACCGGGCTTAGGATGTTATGGGGCAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1	-	chr2R	2016905	5'	-	1360	3348	1	56.64
GATAGAGTCTTAACAATTTATGGTTTTTGTGTGTAGCCTAGTCTAAATTGAATGACATCGTTTAGTTGCTAATCATATTTCCATTATTTATTTTTGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGT:1	-	chr2L	14091679	5'	-	R1A1-element	5248	1	66.44
GGAAAAAAGGGATTTAAGTTGTGCAAACAAATGCAGCATTGCACAGGCAAGCAGGCTTGTCCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATGCATTGGTTTGGCA:1	-	chr2R	2980294	5'	-	1360	3360	1	90.99
ATTTTTTCTCATTTTTTTTTGGTCTTGTAAATTAGTATCGATTTGCAAACAAACTTTTTGCCGCGCCCCGATCACAATAACGTCCTAAAGCCACCCAAAATTGGATATCTTTTCATAATTAAATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGA:1	-	chrX	7945446	5'	+	INE-1	299	1	34.25
AGCTCATTAATTTATAATTAAATTTTTATAATCTATTCCATGTCAGTAAATGAGTATACTAGAATCGTTGAATAGTATGTAACAAGCAGAAGAAAGCGTTTCCAACTATATAACGTATATTTATTTTTGATCAGGATCAATAGACG:1	+	chr3L	3001950	5'	+	INE-1	88	1	54.79
AAGGACGGCAACACCCTGCTCCACAATGTGCTCCTCAAGCAGTATCGCGAAAAGGTGCAACGGCTTCTTGCTCAGCAGGAAAAAGGGTGAGAATCTATCATTGTATTAAATCAGAATGCTTAGTTATACCAAAGACACTAGAATAA:1	-	chr3R	18272267	5'	+	Tc3	238	1	75.34
GGCCTGCAGGACAGAGAAGGACGAGCAGTGAAAGTGGAGANTGGTTTTTGGAGTGGAGGAGCAAGGACCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1	+	chr2R	2016722	5'	+	1360	29	1	52.74
ATGACAATGCCTCCGAGACGGGATCCTACACATCCGTTTCCACCGCACTGCTCTCAACGGAATCCACCGAACTGGGAATGGGGTGTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGC:1	-	chr3R	10802906	5'	-	G5	4603	1	60.90
ACATCCATATGCATATGGTGGAGGCGACAAAAGTGTTTCCAGCTGATGGCCAGCTGAAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCATCT:1	-	chr2R	14540654	5'	-	roo	325	2	59.59
TAAGCACACCGGGACATTCGGAAGTGAGAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTTGTTCAGGATGATTTTATCG:1	-	chr3L	11321472	5'	-	mdg3	301	1	49.32
ATGTCGGCAAACATTATGAAATCAACAAAGCTCAGCCACAGCGGGCTCCCCAAGATGAAGAACATGTGCTAATGCACTGCTCCAGGTTCACGGCGGAGAGAGAGCAGCTAAAGACGCTGTCAGGTTCCCC:1	-	chr3R	17835658	5'	+	Rt1b	4675	1	55.38
AATCGATGTGCAAAACAATTAACTCGTTAAATGACTAAACGCTCGCAGCTCATCAAAATATAAACGCCATTCGCCGAAGGCGCTAAAAAATAGTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1	-	chr3L	2804561	5'	-	jockey	4973	1	79.13
AGGTTCTTTATTCAACTGTTTACAATGTGTTCTGTTGGGTGCTTATATTTATGTATTCTTTATTACATACATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1	-	chrY	3648909	5'	-	297	347	2	56.85
TAGAAAATGTATTTAATATATTCCACACTTAAATAAATAAAATTACTATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACCACC:1	-	chr3L	13845222	5'	-	opus	446	2	70.23
AGATATACCTACTACTACTATACATATCTTTAACTTTCAGGCAGTTTCATCATTTTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1	+	chr2R	15005069	5'	+	jockey	8	1	62.67
ATTAACTTTTATCACTTCCTTGTTAAACATTTCTTCTCGCTGACTGGAAAATTTTCATTCGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1	+	chr2L	3164945	5'	-	412	7513	2	50.00
TCTTAAAAAAAAAAAGAAAAGCGCAAAAAATTGTAACGATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCGTCG:1	+	chrX	14336431	5'	-	roo	355	2	68.70
TGGCAAATGAAATTGACGGCAAATCAATTGAAATTGTGTACAAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTCACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACA:1	+	chr2L	4412567	5'	+	Quasimodo	62	2	66.67
TTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1	-	chr2R	17259327	5'	+	jockey	4706	1	65.91
ACGTATAAGTGTTACTGTTTCATAAAGACAGTGTACATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCACAATGCTGACCAAAG:1	-	chr2R	4601624	5'	+	HMS-Beagle2	6949	2	71.54
AATTTACGTAAATTACACAAAAAAATCGCAGAAAATTAAACAATTTACAAAAGACAAGCCCCCTGTTCACACATGAACACGACTATATTTAAA:1	+	chr2R	18349306	5'	+	roo	9	2	66.67
GTAAAACAAAAAATTTAATTTCCATTTTTGAACACAGTTTGATTGGAAATTTTATTACGAGCTCTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAACCTTCAC:1	-	chrX	18376571	5'	-	1731	4579	2	52.24
ACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1	+	chrX	13504176	5'	+	412	85	2	76.22
GAATCATACCAGACCATGGTCGGTATGCTCCTGATCCTCTGGCTTTCGGCCCTGCTCTCCGCCTTTATTCACAATGCGGCGGTGGCTCCCATCATGGTGAAACTCTGCACTGATGGAGGGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTC:1	+	chr3L	2362270	5'	+	Stalker2	7260	2	76.03
CTATGGTATTTTAAGTAAAGAAAAAACTTGTTTTACCCGCGTACTAAATGGAGAGAAATCAATTTGCACATAAATACGAGGCAAGTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1	+	chr2R	977504	5'	+	F-element	32	1	65.12
AATAAAAGGCAGCAAAATAAAGCTGGCCATACATTTATGACCGGTTTCTCTCGAATGTGTGGCAATTATTTTGCAACTAATTGCTAGCTCTGCTATTATTCTGACCGCAGCT:1	-	chr2L	4136157	5'	+	HB	1626	2	75.89
GATGGAATATGAATTTGCATGATTCCATTAATTGTGTACAGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACAC:1	-	chr2L	15833069	5'	+	hobo	81	1	73.79
GCATTCTCAATAGCATTTGCTGCCACCGCATAAAGTCAACTGCTCTTAATTGCGTAATAATTGACTTTATTTTTAGTTTATTACCCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr3R	28624682	5'	+	roo	8681	2	68.00
TATATGTGGAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1	+	chr2L	22121324	5'	-	opus	494	2	39.84
GTACCGCACTGGACCTTGGACTCCAGCGGGCCACGGTGCGCGCACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAAC:1	+	chr3L	25607819	5'	+	gypsy8	164	2	94.20
CAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCACAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	-	chr2R	13084678	5'	-	roo	9053	2	59.79
GGGTGGATTTGTTTCAGATTATTTGAAGTGAGTACAGAATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTACATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATT:1	+	chr3L	15519778	5'	+	pogo	68	1	74.80
CCGAAGTCCTTTCATTAGGCTCGCTTCGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1	+	chr3L	22400294	5'	+	1360	47	1	72.45
AAGACACCAATCCACGGATCCGATTGCAACGATTGGACGAATGTTTTGTGGGAGAGCGAACGGTAAAGATGCACTTCGAACGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1	-	chr2R	13084704	5'	-	roo	388	2	65.60
CTGAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACAGATACAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTT:1	-	chrX	5629206	5'	+	jockey	115	1	52.08
ATATATATAATTATTACAAAAAAAAAAATAATTATCATTTTAGAATTTTTTGTTGCTTTATGGCTTTTGGCATTTAAAGTATTTTTAAATATTTTCGGTTCATTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1	+	chr3L	10292762	5'	-	roo	9053	2	61.64
CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATGCGTGTGCACACATACAGATGTCTACTATCACTTTGTGCGTTGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCACAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAA:1	-	chr3R	4571525	5'	+	1360	3349	1	60.47
GTGGTACACTAATTTTAAAACGAGATAGAACTCTTGTTCTGGAATCGACGCATCCGGAATATGCATGCTTAATCTAAAATTTAAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCTCAGTTCATATGGAAGGTCAGACCAAAGACACTAGAAT:1	-	chr3L	22016852	5'	-	Tc3	317	2	72.60
TACACTCTCGCCATTTACCATTCTGCTGCCTCACTCCTGCTCCATTATCCTTTCTCCGTTCTTCATTCTCCAATCTACTTACCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGC:1	+	chr3R	12853560	5'	-	Quasimodo	6982	2	71.05
AACACATATACAGTTGCGTAAAAAATAGCACCACCATAGCGCGTTTTATTCTAGATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1	+	chr3L	1534520	5'	-	pogo	2063	1	54.92
CTGAACTAATCAAAAATCAAAGTTTCCTCGAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCG:1	+	chrX	16718226	5'	-	roo	440	1	72.48
TTTTGATCTTTGCAACTTTTGTCCTATACCATCCTTAAACACAACATACTCCCACATAAACAAGACGTAAATTGTTATTTATGGCAGGCCAGTGATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1	-	chr2R	16785462	5'	+	412	7072	2	72.14
TTAAAATTCCGTTTACTTAGAAACTTTCGAACTACGTACACTACAGCAATCAGGTGGAAAGTAACAGAACATCTGATTTGCGTAGCCATTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGC:1	-	chr3L	23457467	5'	-	rooA	7489	2	74.40
GTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAAC:1	-	chrX	21667930	5'	+	gypsy2	6516	2	57.14
TAGGTAAGTTTGGACATATTTGAAAGTTTAAAATACCCTGCATCTTTTTTGGTTACAATATTTTAAAAAGTCCAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGC:1	+	chr3R	22388965	5'	+	G2	2658	1	56.85
AGCCCCTGGCGAAGTGAAACCGAAAGTGTAACGTGTAACGAATTAAACGGATGGTCGACTGGAGTACCTGTACTTGCGGGTGC:1	+	chr3R	26615127	5'	-	gypsy12	10162	2	67.47
GAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTA:1	-	chr3R	14049335	5'	+	transib2	2742	1	54.47
TGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACACATTGCTTACATATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCGCACTCC:1	-	chr2R	1234691	5'	-	Stalker	7037	4	76.81
TGCGCGGTCCCTTGTTCGTTCTGTTTTTTGAGGCATTTCTGTGCGTATCGTATGACCTGTGCCCACCCTCGAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1	-	chr3L	22400369	5'	-	1360	3338	1	53.42
CGTATTAGTTGTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1	+	chr3R	20469567	5'	+	roo	29	2	42.47
ATTTCTTATTGATGATAAAACCCACATATATTCTAGTATGTATTTAAATATACAAATAGAGCTGCACAATATGACCTAGGTAAACTTTTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1	+	chr2L	13763116	5'	+	pogo	29	1	65.75
GAAAGAGGCAGTGGAGTCTGTGGTCGCCAAAGGTGGTCGCCAGGCCAAGCGTTGCCTCAACCCGTGGACGATACGCCCTGCCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1	+	chr2R	2016801	5'	-	1360	3384	2	75.93
TACCCATTATTTTAGTTGCCTAAGCTTTTAGCTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1	-	chrX	9540084	5'	-	roo	318	2	78.77
GTGCGATATTCACTTCGTTAAATAAATAAAAATATTACATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTAGCATTGCATAATT:1	+	chr2R	20496932	5'	+	blood	7063	2	64.60
ACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACG:2	-	chr2L	22063441	5'	-	INE-1	128	1	63.70
CCGTTACTTTAATATGTCAAGTACTATAGTACTTAGCAATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1	-	chr3R	30344699	5'	+	pogo	65	1	70.45
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTACTCGCATA:1	-	chrX	12649914	5'	-	blood	157	2	90.24
GCTGCCGTCTACAAAACGTACATAATTGTTGTTGTAGTTCATTAACGTCAACACCGACACGCTCAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGCCACACGATT:1	-	chr3R	10266177	5'	+	1360	20	1	63.30
GGCCACAAAACGAGGATGAAGCTAAAATAAAAGAAGCCACGCGACGAGTCTTGTGGGCGATCGGGTGGGAAATGGTTAGGATTATAAAAATCATAAATATAATTTATCGCTCTCG:1	-	chr3L	18092526	5'	-	roo	74	2	70.43
CATATGAAACGACATGTGTTGGGGGAGGTGGGTACATTATATAAATTGATTTTAGTTTTCCAAGCCCTAAAATGACTTTCGAAAGAACATATTAATGTTCGATGTTCATATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATC:1	+	chr3L	23269579	5'	-	invader2	4715	1	76.71
ACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGGGGCTGCTTATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1	+	chr3R	20627938	5'	-	flea	4976	2	60.96
GCGGGGAAAAGCACTTTGGAAAATGGGCAGACATTAGCACCACCAGCTGGTTTCCTTTTATGCACTGTTATAATAACAACTGTTAAAGTCGGCTGTTGCGGGCATATAC:1	-	chr2L	17869686	5'	-	hopper	1251	1	54.13
AGATAAGAATTGTTATATTCTGTCATTAAAAAAAATTTTTGCAGCTGAATATATATATACTCAGTAGCCATTCTAACTGCCAACTGGGCTCAGACGTCGCGATCCGGAAAATTTTGGGATTTTCCAGGAGTGCCAACTC:1	+	chr3L	25782384	5'	-	Rt1c	30	1	50.36
ACCGAATCCATAGTCCTCGGTGAATTCAGCCTGCGAAGGGTGAGCTGAAATCGGTGGAAAGCAGAGAGAGCTTCAAGTGCTTTTCCCAGCCAACGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1	-	chr3R	7835246	5'	+	roo	8681	2	72.18
TCCTACATATAATGAGTTTAGAAAAGAGAAAGCTATTAATAGAAATAGTAATAATTATGAGTATCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1	+	chr3L	20831274	5'	-	roo	350	2	60.96
AAAAAAGTAAAAGAAGAAGAAGAAGCAGCAGCAGCAGTCAACTTGCAACACAATCGTTGTTGCTTTTTGGGTAAGTGTTTTCCTTTGACGAAATTCAGTTTGAGATACTATCAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1	-	chrX	14824834	5'	+	jockey	4680	1	77.27
ACAAGATCATTGTTCGTACCCCATTCAGGAATATTCATTAAAAAAACACTAGAAATCGATTCACACGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1	+	chr3L	11441723	5'	+	roo	50	2	59.29
TTTTCAATTAAGAGCCATGGGAGTGCGATGGGATAGGCGTTCTGTCCGCCGGCGAAAATTAAATCTTTTTGCCATTTAAAATGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1	-	chr2R	9791700	5'	-	412	454	2	57.93
CCATGTGGATGTAATATTTAGAAAACAACAAAAATTATAACGGCTTAAGTCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAA:1	+	chr3L	26851904	5'	-	Cr1a	4194	1	62.90
CCATTCGCGCTCTCGCTTCTTCTATCTGATTCTATATAAATATACTATATATATTTATATATAAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGCTTTCGGGCCCCGTCAGC:1	-	chrX	12214168	5'	+	opus	7171	4	68.09
ATATAAAATAAAATAAAATAAGACACACATTGGTGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1	-	chr3L	18790329	5'	+	roo	8711	2	75.24
AGCATTCTGCAAGAGTGAGCGAAGTGCTCACTGAGAGCAGCCGTCAAAATTATTTCAGGAAATGCATTAAACATTTGTAATCATAGAATGATTACACACAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1	+	chr2L	13584601	5'	-	pogo	2083	1	67.59
CATCCCATACCGTTGCGAAAAAATCCGAAGCTCTTATCCAAGATGTGTATTGTGTGCAAGTGCACCTGGAAAATGCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1	-	chr3R	22844299	5'	-	roo	9030	1	55.63
CTCTCTTCCATTCCGCACATAAACGAACCAATTATAGGCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1	-	chr3R	22122766	5'	+	roo	8737	2	77.04
CGATCTCAAGTTAACAAGTAATAAATGTGAAGAGCAAAGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACATGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTAATTCAATTTCT:1	-	chr3R	21434950	5'	-	412	431	2	69.35
TCGTGACATTGTCTGCTATTTTTAACTATTTTAAATTGTAATGACACCAAAGAAACCAATAAATTTCTGTATTCTATTATTAACTAACTCATTTTAAAGGGCATTTAAAGTTTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1	-	chr2R	8585589	5'	+	roo	8675	2	56.85
TCGATAATTGTTTTCTTGAGCTTTTTTTATTGAGAGAAATGAGGTGAGAAATTCGGAACCATCAAGAATTTATTTCTTTCTAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGTCATATA:1	-	chr2L	18337297	5'	-	pogo	1940	1	53.79
AACTATTTCGGGGGCCAAATTTTATCTCGAATAAGCCCTGTAGCATAGCTGTAGAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1	-	chrX	2444436	5'	-	roo	335	2	68.53
GTATGGCTACTTTAAATATATTTTGCGTTTCAAGTAAACAATCATATATATGTTATTGCTTAGTATATGCCACTTTTTAATATTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1	+	chr3R	20469577	5'	+	roo	8685	2	40.62
CAAGGTACACATGGGTACCATTTACTCCATTTACTCTACCTAAGAAACTATAATAAATGTTATTAAACTATAATTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1	-	chr3L	20654583	5'	-	roo	9022	2	52.41
CAATGGCATTTAAAGCATTCAAAAAACATTTGAACATTTGTCTGGTTTTTAAGATCGTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1	+	chr2R	7898072	5'	+	roo	8728	2	67.81
CCTTATTGCATAGCTTCAGGCGCACAACATCGTGTAAATAAGCGTCGACTAACACTGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1	-	chr2L	6059309	5'	-	roo	9017	2	59.70
AGTTTTCATATTTTTATTTATTTTACAAAGACAAATTAGAGAGACAGTTTAGAATTAAAATGCTGAGGAAAGAAAACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAAT:1	+	chr2L	17663020	5'	-	1360	397	1	55.48
TCATGTGTTGAGTGATAATGATGGCCTTTAGTTTAATTATAATTTTTACATTACTGTTTGGTTTAAAATAAGAGAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGCGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTAT:1	-	chr2R	2959085	5'	-	Dm88	4394	2	52.45
AATCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGTTCACTTTAATAATGCGCGTGCACAGCTCTGTGATCCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGC:1	-	chr2R	17259359	5'	+	jockey	4719	1	52.63
GTATCACTTGATACTGATGGGCAAACCGCGGATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCG:1	+	chr2L	10039007	5'	-	Quasimodo	193	2	73.98
TATATATTTCATATTGGAACAATTCTTTCCTTAATAGCACGTGCAAGTTAACAACTAAAAATGTATTACTTCAGAGCAACTAAGTAAGTAGCTTTTTATAAACAAAGCTGATGCGTCAGAACTTTTGGCAGCGGGAAGCTGACACT:1	-	chrX	3428872	5'	+	gypsy	102	2	61.64
GATTTATATCGCTTATTCGTCAGGCCTATTTTAAATGCTGCGGTGATTGATACACTTAAGTTACACATATAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1	-	chr2L	6623045	5'	+	Burdock	6190	2	56.16
AGTGCCGCTGACAATAATCGAGGAGTGGGTGCACCGAGAGAAAAAATGGCAGTGCTTCTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1	-	chr3L	20168447	5'	+	mdg3	67	2	60.96
AAATGAAGAGACCTGAGACCAAAAAAACGGGGCCAATTATAAGCTTCGTCATTAATTTGAATAAAATTAATTCTCCCAAACACACACACACAAAGCGAATGAAAATGCCCCAATTATGTGCGCTTTGCTTATCGCGGAATTACCA:1	+	chr3R	21344504	5'	+	Ivk	59	1	73.79
GTAGAGGTGCGACACCGACGTATTCCTAATGTGCGATGTCCGTAAAGTTAATGGGGTTGTTTACCTTTTATTTATTTTATTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATCTATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1	-	chr2R	4009147	5'	-	Juan	4165	1	51.37
ATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1	+	chr3L	15600170	5'	+	roo	54	2	55.48
AAAATGTGATGATGTATATATTTTGACAATGCTTGTAATCCATTGTAAAACATAGACGATGATTGAATATGTCAAATTGAAAAATCCATCAGAATATATTGTACAGGCAAAGCAAATGCTATGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1	-	chr2L	17420301	5'	+	roo	2	2	77.40
TGACACACAATGACAGCGGCTAATTAAGCTATCAAAATGTACGTCGATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1	+	chr3L	3799789	5'	+	copia	69	2	66.67
TGGGAATAAAATGATTTTAGCTGAACTCCTGTAGTTGGTCAACTGTTGCTATGAAACGTAGGTATGTGCAATTGATATTAGAATTGACCCCTGAAAGATAAGACATAGTTTCTCAGTTATGCATTAAATGAAATAATTCGCTTTAA:1	-	chr2L	13605894	5'	-	S-element	377	1	69.86
CTAAAGTGAAGAATATTTGAATTGAATAAAATAATGACAAATAATTAATAAACCAAATCGATAGAATATGTGAATGCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2	-	chr3L	10292918	5'	+	roo	45	2	54.79
AGTTGACAAACGTTGACACGCGAGAAAAGGGAAAAAAAGCACGCGAGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGCCGGCAACTGGAACACCGCATCC:1	-	chr3L	16750734	5'	+	Tirant	8176	2	66.67
CGTGGCCTGGGGCCTCTGGCTTCACTTCACTTTGTCCACACAGAGCACACCCGTAGCGGACCACATGATAAATAATCGATAAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:1	-	chr3R	11010415	5'	-	transib2	2752	1	61.48
TATATGACCTATTTCTGTCGTTCAAAGTAATACGGTTATTCTGTGAAATTAGATTACTAATTTTTTTTGCCGAAGTATTTTGACGTTGCTTTACGATCGTCCGAGCACTAGCACGGGTAAAAATGCTGACACAGCGTTTGGACGGA:1	-	chr3R	31865597	5'	+	gypsy6	65	2	62.33
ACGCCAGCAATCTTAAACAATCATTGACAGCCTCCTCGTGCGCAACTATTTTCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAA:1	-	chr2R	19050010	5'	-	roo	8664	1	62.24
TAATTGCAGTGCCAAATGCGGCAGGAAGTGTAAACTCACATTATGAGCGACACATACGGGGCGTAGGAGTATGTATACGTATGTATGCGTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAAT:1	-	chr3R	22822149	5'	+	mdg1	18	2	48.46
AAATGTTGACTCTTCTGTTTGTGTGTCATTCAGTTTCGGTGTGAGTTTCTGTATGTACTTATATGTAAATAACTGTACTGTGGCTTTGAGTAGTAAGCCCCATTATTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCAC:1	-	chr2L	9405251	5'	-	P-element	236	1	74.82
CATTTCACTTATTTTTGTTTCGCAAAAATGCCAAACATATGATTAATAAATTGAGGAGTACTGGTAACAATTAGCTCGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1	-	chr2L	544890	5'	-	412	480	2	65.22
TCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:1	+	chr3L	27415236	5'	-	transib2	2752	1	73.33
GTGGAATGAGTTGTGGGTGTGCCAGACATTTGTTGCTGTTTGTCTGGCTGTAAAGCTGGCCGTGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1	-	chr2R	19726940	5'	+	1360	8	2	50.38
GTGTAGAAAAAAACAAAATTTTATTGCTTCTTCTTAGCTTCAGTAGTCGGTCTTCTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr3L	21817978	5'	-	roo	9013	2	63.77
CAATGCCGAATGAGAATAAATGTCAGGCTCAGATGTTCAAGCAATCAACAAGCGAAGGATGATTGTTCATCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1	+	chr3L	15600168	5'	+	roo	8677	2	44.86
CGTATAGCTTAAGCTAATATAAAGCTAAGCCAAGAGAGGAAAGTATGCAATATAGAAGTGTTATCTATCTATATCACAACAATATGTATTCGCTCAGCAATATAGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1	+	chr3L	13845078	5'	+	opus	13	2	56.85
ATCCGAGAACGGATGCCAGCACACGAAATTAAGCGGAAACTCTGAAATTTATTTTACCATGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1	+	chr2R	13696391	5'	-	roo	9025	2	54.55
ATTTATCTTCCTAATTGCTACGGACTTGCCGTAAACCAAAGCGTCCCCTGTAGAGTTTAGGGTCCTAGATATAACGTTACCTTTTGTTTTGGTCTTAAAATATGTAAAAAAAGTATTAGGCCCGAATTAACATATTAAAAAGAAAA:1	+	chr3R	4194092	5'	+	HB	1356	1	73.97
GATGGGACGAGGAGGGCTGCACGGTAAGTGACACGCCTATACAGAGAAAACCAAACTGACAATCAGTTGTGTGCCATGAAAATCGATGTAATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1	+	chrX	13504122	5'	+	412	34	2	62.33
GATCCCCAGTTCATTTGCGAGCCCAAGCCAATGACAAATTGAAATCGAAAGCGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1	+	chr2R	13084593	5'	+	roo	63	2	64.75
TTCTACTACAACATATAGTATTTTATTCGTACGTTCAACATAACAAGGCTCGAGGTAATTCTACATTGGATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1	+	chr3L	20654462	5'	+	roo	20	2	64.35
CGCAAGTTTCCATTTCTTGGACTTTCATCATAATTTTTGGGCGTTAGAGTGGGCCAGTGACACTGGGTCAATGCGTCTATGACTCTAGAATCTGTACGCCTAATATCAACCGTCTAGCATTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGTC:1	+	chr2R	25240231	5'	-	INE-1	142	1	65.52
CACAAAAACCTTTACCCTGAACTGAAATGCAGTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1	-	chr3L	9673102	5'	+	Doc	77	1	75.20
CCAGTTATGGTGCTCTTCTTCCTCCACGTGTGTGTGAGTGGGTGAGCGAGTGTGTGTAATGCGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1	+	chr2R	11629742	5'	+	Tirant	16	2	65.69
TGGGAAAATTGGAAGATTGGATGCTCTTAAGGTAAAAAATAAAAATAAAGTGTATAGAATGTGATGTATAAGTCATAATTCATATGTATTTACACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1	+	chr3R	10462572	5'	-	opus	473	2	65.07
AATAAGATATATTTAAGATGGGACTGTTCAAACATATTAAACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1	-	chr3R	18722949	5'	+	jockey	4716	1	61.54
GAATGCGTTTTGGAAGCGCATCCGGTTCCGGATATAGTCTGGTATTGCTCAGAAAAGGAAATCTGTAACAATCAAAGAACGAAAATGACTCGCAAAGCAATAAAAAGAAAGAAAAAAGAAACATTTTTCAAATGTGTGGGCGTG:1	+	chr4	729347	5'	-	INE-1	253	1	72.92
GTGCATACATACAAATGCAGATATGCATGGCAACAAGAGTTACATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1	-	chr2R	8146118	5'	+	P-element	69	1	32.35
AGTGGCGGACGCCTTGTCAATTTTTTAGCTTATCAAATGCTCTAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1	+	chr2L	5307098	5'	+	jockey	4680	1	52.63
ATTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1	+	chr3R	19446094	5'	+	297	6599	2	72.60
TTCATTTCGATTCCGCGTCACACTATCTGTAACTCGCACTNTTTGTTTTGTTGGCGGAATTCTCTTTCACCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGTAAGCGG:1	+	chr3L	22820479	5'	-	Quasimodo	230	2	57.48
ATTCAAAAGTGATAAATCTGATTTGAAATTAGTGAATCCCGAACTTAGTTTGTGAAAACCTGCTAGCTTATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1	+	chr2L	544762	5'	+	412	41	2	52.59
TTGAAAGCAGCCCGGCAAACAAATAGTCGCGTGCAAATAAAGTAGAATAGGGGCAATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1	+	chr3R	9921982	5'	+	blood	68	2	67.12
ACATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGG:1	-	chrX	23280950	5'	-	R1A1-element	470	1	66.44
CAAACAACACTTCTGCCCCTCCTTTAAATTAATTAATTCAATTCGATGATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1	-	chr3L	26011952	5'	+	F-element	51	1	59.82
GAACAAAAATATAAATAAAGTTTAAATCGTAACAAATTTTCTTTTAATGACTTTATATTAGAATAATTGTTATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTC:1	-	chr2L	10264011	5'	+	1360	463	1	70.14
GTTTAATGGTTCATTTGTGGGCCTTCACTACGAGCACGAGTATGTGTCTGGCTTCCAGTTTTCTTATCGCCGCGTCTATATCTCTCTTAGCCTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1	-	chr2L	7898422	5'	-	roo	9052	2	70.07
GTATTAGGTGTGGGCTGGGCGTTTTTGGTTGTTGGTAAGTACGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1	-	chr2L	1377706	5'	+	hobo	17	1	54.76
GTGTGCCCCACTTATAAAGTCAGATGATTAAAGCTGGTGATATTCCAGCGCTTTAGAAAATCGATATAAATGTTCTGTCATAACCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATAT:1	-	chr2R	13696515	5'	+	roo	8701	2	60.27
TATGATATATTCAAAGATTTCCGATACCGATTCCAAGCCAAGGTCTGCTAATTTAAAGCAAGAGATGCGTGAATATTTACAATATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTT:1	-	chrX	6522078	5'	+	F-element	46	1	54.55
CTGAAATTAGCGTGATGCACTCCCCATTACCAACCTGCCTGCTACTCAGATACATTTAACTCTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1	+	chr2L	14772029	5'	-	roo	9013	2	56.85
TATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACCAGCATTGTTGTCGCCGCGACAGCAGCAGCATGGCCAAAAACACCAGCAACACCTTCAAATTTGAGC:1	+	chr3R	19122724	3'	-	Stalker	6894	4	51.11
ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAATAAATAAATAAAATGCTGAACAAAATTACTTGACTATCTAG:1	+	chr3R	11515014	3'	+	I-element	5286	1	70.45
GTATATGTATATGTAATATGTATATGTTCTATAAATATGTATAAGTTTCATCGTTTCATTTGATTGTGAAATATAAAAAAGTAAAAAAACTTTTAACAAATCTAGACTTATTCCCAACTAACAGTCTCCAAAATTGATCTGAATAA:1	-	chr2L	7870789	3'	+	Stalker2	7508	2	69.86
TTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGTAAAATTTCAGTTAAGTG:1	+	chr2L	12290782	3'	+	1731	4586	1	56.25
ATTTTAAAATTTTTTCTCATTTTATTCCCCAATATTTTTTGATAGTTTTTTGTGCTTTAAGGCATTTTTCTTTACACTCGTCATAAATGAATAATTAAATTTTGTATATTTTTTTTCAGGTACAATCTGCAATGCGCCCACTGCTA:1	-	chr2R	5196811	3'	+	INE-1	470	1	69.86
AAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTAGCTGATGTACAATGAAGGGGGGGCGTGGCAATAGGCCTGGCATTTGGCGTCCATCGACCA:1	+	chr3R	22217942	3'	-	hopper	45	1	50.75
TTAAAATATATATTATTAAAAATTGTAATGTATTAGATTATATATATTCAGCCTAATAGTTTTGGAAAAACTTTTTAACTTCTTTTTCAATCTACCATTTATTATACAGTAAATTCCAAATGACAAATAAACATGGTTTAATAAGG:1	+	chr2R	22040023	3'	-	hopper	166	1	65.75
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAG:1	-	chr3L	233265	3'	-	roo	8730	2	79.83
AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCC:1	+	chr2R	9791670	3'	+	412	7495	2	61.42
ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTGGTAGGCTT:1	-	chr2L	15833433	3'	-	jockey	19	1	69.72
GACGCTACAGCTTCGCTTGGCTCGGTGTAATAAAGCATGTCACTGATGCGTTATTACTGGAGGGTTTTAAGAATGATTCCAAAAGAATTGTTCTTCTCTACTGGTACCTCCATTTTTTATTAAACAGCCC:1	-	chr2R	4132899	3'	+	gypsy2	219	2	72.31
TGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCCCCTTGCACATCCAAAAACTCCATTACAAGAG:1	+	chr2R	18309852	3'	+	mdg1	264	2	75.94
TAAAACTGAAACATTTGTTGAATTGTTTGAAATTAAATACCAAAGGATATTATAAAAAAAAAAATTGTCCACTTGGAAAAGGCCACCCTCCTAAGGCTGCACCTCTGATGGCCCACAAAGTCAGTAAGCCTGTCTACTAG:1	+	chrX	22679049	3'	+	HB	1503	1	49.29
ACATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTTTTTACCATGCCCCGTTGACAATTGGTTTAACCC:1	+	chr3L	11955050	3'	+	Stalker	252	4	71.54
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAAT:1	-	chr3R	25448326	3'	+	roo	357	2	52.05
AGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACAAGGATTGTATTAATCGAGATATGTATGGTCGATGTGGAT:1	+	chrX	18939383	3'	+	Doc	4325	1	71.22
GAACTATAGAAGCTAAAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGGCATTCTAGAAGTCAGGGTCCAGTTTGTTGCCGCATGTTGCCACGTCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACAAATTTCTTTTCATTTTATAACTTTTTA:1	+	chrX	6648389	3'	+	INE-1	158	1	50.68
GCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACTAGCGGGGTGGGCATGGTGATCTTCTGGCGGGAGCATTCGATCCAGTAGCCGGGAGTGGGCATCAGATTGTGCGGATACTCCTCG:1	-	chrX	13068057	3'	-	jockey	91	1	67.50
GTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAACAAAGGCAAGAG:1	-	chr2L	2909651	3'	+	hopper	1378	1	53.78
TTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTCGAGATCAACTTTGCCTGGATGTATCC:1	-	chr3L	8911126	3'	+	roo	8690	2	73.79
ATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCCTGCGTGAATACCCGCGAGAAACTGGCCGCCCGGACGGCACTGAGCGAGGCCAGGG:1	-	chr3L	12423455	3'	+	G2	2735	1	55.05
TGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTCCATGTTTACACTTTTAATTTGGTTTGGAAAACCATTTTTAAAAAGAAATAAAGAACAAAGTGCGGGAGAGAGCTACAGTTTC:1	-	chr3L	20168329	3'	+	mdg3	225	2	65.12
ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATG:1	-	chrX	10644454	3'	-	jockey	4830	1	71.54
TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACC:1	-	chr2R	2016822	3'	+	1360	3382	2	68.54
AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCAA:1	-	chr3R	9714380	3'	-	Stalker	59	4	57.64
TAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACAAACAGCTGTGGTCGCAACGATAGCTCTAACCTAATAACTTGTT:1	+	chr2R	8146162	3'	-	P-element	24	1	65.19
TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAAA:1	-	chr2L	12892599	3'	-	roo	8710	2	51.37
TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCTCTGGGTGGGTGGTCCTTTAAATATTCAGCGGTTAATGCTCAAAGAAAAGTTGAATTAATTATTCGT:1	+	chr2L	11674437	3'	-	jockey	67	1	52.74
ATATATTCTTGATCACGATCAATAGCCAAGTCGAACTGGCCACGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTCTGTTTTTGTTTCATTTTTTCCCCTCGTTTTCTTTTTTTTGCGTTTGACTTTTGTTTTTCCT:1	-	chr2L	14941220	3'	+	INE-1	82	1	56.64
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGCTGGAAATGGGGCGTACATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAG:1	-	chr2L	14772015	3'	+	roo	396	1	62.28
GTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGAGGTAGAGAGCGCCAGTGAGAGCGGGTTAAGAGCCGCACAGTGGGCGTCATAGATGACAACTATCTGTTATTAGCGATAAAAAATTGTTTCGATAAAAA:1	-	chr3R	18583966	3'	+	roo	479	1	70.00
GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATG:1	-	chrX	10644454	3'	-	jockey	4810	1	66.36
GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTG:1	+	chr2L	14081361	3'	-	1360	67	1	65.81
TTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTAAAAA:1	-	chrX	16758625	3'	-	1360	309	1	50.68
TATTGATCCAGATCAAGAATAAATATACTTTATATGTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATA:1	+	chr3L	22721133	3'	-	INE-1	84	1	73.29
GTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATTTTGGTGATACTGCTAAATGCATTCTAAGCTTCCATTAATTTGAACAAAGCATACA:1	+	chr2L	1199794	3'	+	roo	8715	2	61.64
CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGTTTTTGCATTTACATTCTAATCAGCTATTAAACTACAAT:1	+	chr2L	17079873	3'	-	jockey	4703	1	65.52
GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAGCTTGGCAGGTAAAGTGAAGCTTGTAATAAAAATCA:1	+	chr2L	12483836	3'	-	P-element	35	1	56.92
ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGCTTAGTTGAT:1	-	chr2R	19499306	3'	+	P-element	2825	1	41.78
TGCATATATCATAAGTATACAAGATTGTAATTTGGTAATTTTTACACAGTGTAGATATATTTAGCTGAACTCAAGTGTAAGCACGGGATATATATGCGTGTCGATTT:1	+	chr2L	7630795	3'	+	accord	7287	2	77.57
CGGGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCAATCAGAGTTCCTGTTCCTCTACCAATAGAAGGGTATAAAACTCGCTTTTCGACCAGGTTAATACGAGCTCCGCA:1	+	chrX	15287403	3'	-	INE-1	576	1	65.71
CCATAGGTCCATATGGGTTTCAAAACGGAGTTATATAAGAGGACTTTTTACTCCAGTCTTAGGTGAGAGCGGCTTCTACACCTTTTGTTGGGGGCGACAAAAGCACCAGCTCGTCGG:1	+	chrX	22807642	3'	-	Doc3-element	4310	1	60.68
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACAAA:1	-	chr3L	4605623	3'	+	pogo	2046	1	62.88
CAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTTGAGTTTCCCCAAATGCCAATTCAGTCAATGACAGAGCA:1	+	chrX	10186006	3'	-	opus	7399	2	73.29
GATGTCTGAAGAGAATCCATCCCCATGAACTCCTTACACGTAATATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATAGATTGTGTGAATGAGCATGCACGCCAGAGAGCCACACAGGGGCGGAACGGTC:1	+	chrX	19665986	3'	+	G5A	2678	1	56.25
TACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAGAGCTCTCCGCATCTAAAATTCTCTCGGCTGCACCTAC:1	-	chrX	17832967	3'	+	Tirant	8477	2	59.68
TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTATGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATT:1	-	chr2R	12835054	3'	-	jockey	81	1	71.64
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATCGGTCAACTGGTCCA:1	+	chr2L	11518480	3'	-	412	7121	2	63.01
TTTGCATTTCTTTTTTTTTTCTCTTTCCTTCGGAACCATTCCCTTTGCCTCAACTGGCAACCATTTCGCGGCGATTTTTTTTTGACACTCGCGCAAGTTTGTCAAGTGT:1	-	chr2L	10114365	3'	-	gypsy2	405	1	68.81
CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATACTTATCCTGCGGGAAGGGGGAGTTGAG:1	-	chr3L	20888697	3'	+	1360	3352	1	53.60
AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGAGTCATACGCATAAGACAAGCTCACACTTG:1	+	chr3L	7588521	3'	-	hopper	27	1	60.80
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGG:1	+	chr3L	9998209	3'	-	roo	35	2	57.69
GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCTTCTTTGTGGCGAC:1	-	chr2R	7586128	3'	-	I-element	5052	1	65.18
ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGAT:1	+	chr2L	18419251	3'	-	412	50	2	52.08
TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACGAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAA:1	+	chr3R	20868173	3'	-	BS	5077	1	79.70
AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGCACGCTTC:1	+	chr2L	12328736	3'	-	hopper	56	1	53.42
CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAA:1	-	chr3R	14651222	3'	-	P-element	53	1	35.65
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGAT:1	-	chr3L	16343224	3'	-	roo	8712	2	62.71
CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACA:2	-	chr3L	10848625	3'	-	blood	45	2	54.79
TTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGT:1	-	chr3L	10574275	3'	+	Tabor	7271	2	51.37
AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGGTGTGG:1	+	chr3R	10182201	3'	-	blood	7055	2	59.13
AAAGAGGACAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTAAGTCAAATGACTTATGAGAGCTTTTTGAAATAGTGCGGAGAAACCTTGGCCAAGTTTCCCTTGACCAGG:1	-	chr3L	23941433	3'	-	Cr1a	4342	1	46.90
GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATAGAGTGTGTGTAGACAACA:1	-	chr2L	20117833	3'	+	invader4	323	2	59.59
ACGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATT:1	-	chr3R	19589889	3'	-	BS	5032	1	56.85
GCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAATGTAACTCTTTAAATATAGTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAAT:1	-	chr3L	16343242	3'	-	roo	93	2	77.93
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTT:1	+	chr2L	12892726	3'	+	roo	9034	1	57.46
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCAGCCAGCCAGCCAGTCTATATGCCCATCTATG:1	-	chr2L	3114413	3'	+	roo	407	1	83.56
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACA:1	+	chr2R	9328714	3'	+	roo	9034	1	56.83
AAAATACCTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGGTAAACTGA:1	-	chr3R	24383246	3'	+	rover	7223	2	69.18
GTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAACCAACTTCTTCCAGCACAGGGTGCGTATAGT:1	-	chr3L	5603061	3'	+	mdg1	218	2	78.47
CAAGCAAATTAAATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCTAGCGGAAAGAGAGAAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGCAATACACATTAATAGTTGAAACAGCTGCAGAAATTTCTTTAATAAAATAAATTTCATTCAGAA:1	-	chr3L	24375370	3'	+	1360	3267	1	56.16
TGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGTCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTC:1	+	chr3R	20499830	3'	+	mdg3	184	2	64.57
TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGC:1	+	chr2L	6570033	3'	-	jockey	4834	1	51.11
TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAAAAAAGATACTTATCAGCTACGTGACAAGATACATATGTGATAGCAAAAATAAGAGCGATAAGATTTGTAATATGTTCT:1	+	chr3R	26223007	3'	-	roo	9	2	76.03
ATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGA:1	+	chrX	21667932	3'	-	gypsy2	6540	2	66.13
GTACATATACATTTATAGTACATGTATACATAGAGTACAATGTTTTTAGAATAATTACATAAATCACTAACATATGATGAATGGGTGCCATAATAGTCACAAGATTGGATTCAATTGATGGCGTTCCTGTAGAAAAACGCATGCAA:2	-	chr3L	14249400	3'	+	gypsy11	11	2	49.32
AAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGA:1	+	chr3L	19339440	3'	-	Tc1	60	1	53.42
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGGAGTGTGGCAAATAAATTGACATTTAGCTGGGCGTGTAACAAGATCAAGTATACGCAATGTCGCCCACGTAACTTTGATTTG:1	+	chr2R	21920612	3'	-	jockey	27	1	65.89
AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTACCAGCACGACACA:1	-	chrX	2842449	3'	+	Tabor	464	2	70.83
AAATTAAAACAAAAAAAAAAACATATTTAAGCCGACAGAACTCATCAAACTGTGGCCACAGAACGTTAAAGATAT:1	-	chr3R	15358983	3'	+	Doc	4699	2	58.67
ACTAGAAACTAAATACCCGTTATCATATATTATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGAGCCTTACAGAGTATTATGTTCTAACTATAGTAGATACAATATTTTGTTTAATGCTAAAATCAGCATATTTATGCTTTTCA:1	+	chrX	5652963	3'	+	Cr1a	4124	1	66.91
ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGTTCGTAGGCGCTCAGAAGTATG:1	+	chr2L	15991419	3'	+	mdg1	385	2	56.62
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTA:1	+	chr2R	16891947	3'	+	hopper	1409	2	63.28
TATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTT:1	-	chr2R	20596490	3'	+	roo	331	2	79.69
GATATTGGTCCTGATCAAGAATATATATACCTTAAATGGTCGGAAACGGTTCCTTCTGCCTGTATCATACTTTTCAACAAGTCTAGTATACCCTTATACTCTACGACTAACGGGTATAATAAATTCATCACCA:1	-	chr2L	22130394	3'	-	INE-1	86	1	70.68
TTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCGGCAACACGTGTATGTCACGGAGAAATTATTGT:1	-	chr2L	12290617	3'	-	1731	4326	2	76.03
ATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATTGCAATAAACCACACTAAGGAGCTCTATTAGCTTCTGATAGGTTTTAATGATTATAGATTAATTTTATTAAGTTAGT:1	+	chr2L	1632326	3'	-	roo	395	1	51.37
AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTAT:1	-	chr2R	15005088	3'	-	jockey	93	1	75.00
TTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATCCTGATCAAGAATATATATACTTTCTATAGTCGGAAACGCTTCCTTATGCCTGTTACATACTTTTCAAGGAATCTTGTATACCCTCTTACTCTACGAG:1	+	chr3L	25245594	3'	-	INE-1	146	1	81.82
ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATCTGAATTATGACTTATACATCACATTC:1	-	chr3R	10462629	3'	+	opus	436	2	74.02
GCTGCCCTGCGGAACTCCAGCTCTCATAACGCGGGGAATCGAGTAGGAGTATATAATCGTCACTGCATTGAAAACTTCTAACTTAAATCGATTTACCCCCTGCAAGAATAGC:1	+	chr4	409405	3'	-	BS4	69	2	53.57
TTTGAATATGTATGTGTGTGTGTGATTGTGTAAAAAGCTGACACTTTCCTTCGCCACCCTGCACCTTGTGGTATTTTGAAATCTAAAATTGCCAAACACCCAGCGCGTTTC:1	-	chr2R	8064973	3'	-	accord	188	2	58.56
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTT:1	+	chr3L	11530971	3'	+	roo	9014	2	62.22
CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGACAAGGCGTCCGCCACTCAACGC:1	-	chr2L	5307092	3'	-	jockey	4735	1	65.69
TTTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCAAACCCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGCCGTTTTCTATGCACACTCCATAGATTTTAATGCAATTTTCTCAATGGCGG:1	-	chr2L	14719664	3'	+	hopper	181	1	54.17
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCA:1	+	chr3L	11530957	3'	+	roo	8991	2	74.31
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCT:1	+	chr2R	11164525	3'	-	roo	39	2	58.33
ACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGTG:1	+	chr3R	1446148	3'	-	1360	6	2	23.61
TTATTTTACAATGTGTCTTGGTCTAAAAATAACCGCCTTTGCACAGACACACAGACAGGCCGCTCCACGTGCCACGCCCCACGCC:1	+	chr2L	6569721	3'	-	jockey	4915	1	72.94
CTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTT:1	-	chr3L	27356080	3'	+	Tc3	1637	1	66.44
TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAATTACCTATTTACCCGAAACAGGCGCACAATAAA:1	+	chr2R	1567952	3'	+	jockey	4926	1	61.64
CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGAAGCGATCGGCCCCGTGTGCATGCACTTATTTGACTAATGTCTTTCATAA:1	+	chr2R	19798114	3'	-	Transpac	4982	2	65.25
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTNCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACT:1	+	chr3R	18582264	3'	-	roo	42	2	54.17
CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATCATTATATATATTATTATTGGGACGAATAATGTTTACCTTTGCTATGGAATAT:1	-	chr2L	15247909	3'	-	Transpac	63	2	65.07
ACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATA:1	-	chr2R	5284515	3'	+	Doc4-element	2616	1	61.64
TGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAATTTCCAGAGCATCAGATACTAACAGGAAATACGAACGATTATATTTTTT:1	-	chrX	22601882	3'	-	INE-1	81	1	54.11
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAATAAAGCAATAAATATTATTCAAGTGATTAACCGCCTT:1	-	chr2R	23802921	3'	+	roo	392	2	66.40
GATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCCAGTAGTTA:1	+	chr3L	4605733	3'	-	pogo	47	1	53.42
TACATAATTAGATCCTACTAACAGTGATATTTAATTTTATTCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGTCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTT:1	+	chrX	15690634	3'	+	Cr1a	4284	1	73.29
TTTTATTTATTTTTTTTTTAAGGATGATGGTTCTTTATTTTTTGAAGGATGTGGAGAGGAATGTTGATTTCCAAATTATTATTTCTTTAAACCTTTTGTTCCCTTATAATTTTATCTGTTTCCCT:1	+	chr3L	7034584	3'	-	mariner2	787	2	86.40
AATATTAACTATTAGTTAATATACATCGTTATAGAAATCTGAGAGTTAATTTTAATCTTTAAAATTTATCAATTTATCCTTTCCTCATTAAACCATTTAAATTCCCAACGGTTCGGTGTCCACATTAGGATCCCCAAAACTC:1	-	chr3L	4532292	3'	+	Tc3	265	1	66.20
ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGGGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACA:1	+	chr3L	22400357	3'	+	1360	3339	1	57.14
CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGTATACATATATAGGGCTGATACCACGTGTTTTTGTGGTGATTATCTTCATTCGGT:1	+	chr3R	12717826	3'	+	297	325	2	69.18
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCAT:1	+	chr2L	14772100	3'	-	roo	66	2	76.47
TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCC:1	-	chr3R	21705971	3'	-	297	6600	2	61.61
AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCC:1	+	chr3L	12308379	3'	+	hopper	1410	2	59.26
TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACAAACTTTGATTGCCCAAGTCCTACCAAGGACTACCCTGAACACCAAGAGCCCC:1	-	chr2R	13817630	3'	+	412	449	2	54.47
AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGCGAAACAAAAATAAGTGAAATGGAGT:1	+	chr2L	544894	3'	+	412	453	2	55.48
GCTGGTTTATTTCGTCAAATACCGTTTGCTAGTTTGTGTTCCTTACGAACCATTCTGCTCTACATAATTTGGCTAATAAGTCATTAAGCTAATTTCTTACAAAT:1	+	chrX	17262579	3'	-	X-element	4383	1	66.35
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGACAAACTTTTTCTCTACATGTGTGG:1	-	chr3L	15600120	3'	-	roo	4	2	65.75
CAACTACAAAATTATGACAAATTAATAAAAAATTTACCCTCCCTTTTTTGACTTGTTTGTTACCGCGTTGCGAATTATCGTTGCCAGGGTCAAGGGTAGCTCGTCGAGAGAACTCGAGAGCCGACTTTTT:1	-	chr4	806066	3'	-	Tc1-2	1378	1	65.38
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGCAGATGTTATCTTTTTCT:1	+	chr3R	25448447	3'	-	roo	8707	2	52.17
GATCAGGATCAATAGCCATGTCGATCCAGCCACGCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAACATACATGATATAAAAACATTGGTTAAATACTAAGTGTAGTATTTATAAGAAGTATTAAA:1	+	chrX	21576910	3'	+	INE-1	92	1	49.61
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCTACCTGAAAATCGAAAAATACAAAAAA:1	-	chrX	8814708	3'	-	pogo	29	1	54.41
CAACAAAAAAAAAGAAAAAATAAAACAAAACAAAGCTGCAAAAAATCGACAGAACAAACAAAACAAAAAAGCGAATGGCAAATGGCAAATACCGAGCTCTCTTGGCTTATTTTCCTGCTGACCCCGTTTTTGCC:1	+	chr2L	2096300	3'	+	gypsy7	5003	2	74.63
CAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAGTCGTATACGCAATTCTTTTAGCTTTTCTTTTGTCTGATTGCCAGGCGAGAAGAAACTCATGTCTATGGCTTTAGACTTAGCTTAGCACG:1	-	chr3R	25946100	3'	-	roo	8819	2	75.00
CGAGGGTCTCAAGTTTGCGGTGAAACCATAAACGGATTCGGACAGGTGTCCCCCAAGCCAATGCCCTTTTCCTTTTAATATACAACGCATTCACAGCATCCATAATGGCAGCCACATAC:1	+	chrX	17245549	3'	+	G7	442	1	19.33
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACA:1	+	chr3R	27994265	3'	+	roo	337	2	69.29
TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCTTCTATCATATACTAATAGTTTAAATTAA:1	-	chr2L	13053703	3'	-	BS	5016	1	67.81
TAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTAAAAAAAAACTAAAAAGACATTCACA:1	+	chr2R	6885449	3'	+	flea	256	1	81.06
GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGCAACAATGTTTTTTTTTGGTCATTAGTTTTAAGTGAGTTGATGTTAAAGTTTTAGTTTATTTAGACCAGTTATCGTTTGCTTATTAGACAATAAATAAATCAAAACTCAAGCTTTGTT:1	+	chrX	17760787	3'	-	297	32	2	76.71
GAAAAAAAGAAAGGAAAAAAAAATGATGACAGAATTCAAATTAATGCTGAAATCTCGGCTTAAGCAATTTCAAGTTATAAAATAAAATTTCTACTCCTAAATTTATTAATGTAAAGGCGGAACCGTGGAGGCCTGATTCGCCAAAT:1	+	chr2L	992674	3'	+	Doc2-element	250	1	75.34
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAG:1	+	chr3L	17560364	3'	-	pogo	29	1	57.73
AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTGGGTATCCCTGGCTCCCACAAAGGGAATTCTTAAATGGGATTTGGGAAA:1	-	chr2L	15875747	3'	-	hobo	72	1	69.18
TGACCCTTACAGAATATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTAGCCTATTATCCGTAATCTTGTACTGCCTGTCCGTTTATATTCCATATGCCTAAATCTACATTTTGTTTAACATTTATATT:1	+	chr3R	3399907	3'	+	Cr1a	4180	1	54.92
CCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAAATTGCCAAAATTCAGCAGAGTCTTTCGGAGAACCTAGCAATTCCA:1	+	chr3R	19448988	3'	+	roo	271	2	53.42
GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTT:1	+	chr2R	5485231	3'	-	blood	41	2	56.85
TATATTCGTGTTTTTGTGTGAATATAGGGTTTACGACTCTCTTAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTGTTGTAGATTTCTCGCAGCGTATAGAATCTGCTGCAACCCGCTTTGC:1	+	chr2L	5254397	3'	-	roo	8667	2	59.65
AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGATGGCATTAACTAATAGGTATGGG:2	-	chr3R	9210577	3'	+	mdg1	7444	2	73.29
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACTTATATCTTTAATTGTATTTTTCTAA:1	+	chr2R	15064483	3'	-	412	17	2	71.72
AAGAAGACTGCTATGACTCGGTAATCTGTCACTGTATCGACTTGTTTGTCTCCCAATTAAACTTCTTCTAGCCGAATTGAGGAGTGTCCGGGATGAGCATTTTTAAAATAAGAGTGTTTAAGATCGAAGTGAGAAGAGCAGCAATA:1	+	chrX	15712737	3'	-	Helena	1266	1	72.60
ATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAA:1	+	chr2L	6623053	3'	-	Burdock	46	2	54.11
TTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1	+	chr4	1294988	3'	-	TAHRE	46	1	51.75
CTATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAAAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGCGCTTTATTTAATTTCTTTGAAAGCTCGGAAACAAAATGCTTGGCATGCCAAAGAGACAGGACG:1	-	chr3R	8162510	3'	+	1360	32	1	54.93
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATC:1	+	chr3L	20654602	3'	+	roo	9051	2	68.89
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAAAGTTTCGAGATTCTTGCACTGAAGGCGAT:1	-	chr2R	14542096	3'	+	roo	390	2	67.14
AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAAAGCTGA:1	+	chr3L	5876356	3'	-	Tirant	55	2	55.86
GTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTAATAGATTGGCATAATAGAG:1	+	chr3L	19014024	3'	-	invader3	5204	2	62.61
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTG:1	-	chrX	6486730	3'	-	roo	8750	2	77.40
AGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTCAGTGGGAGACCACAGATAACTTGCACTCGCTTTCGCAACGCGCTTTGATTTATTTGCCACTCCCCCGAAATTTGGCAGTCGCCTCTGC:1	+	chr3R	15050329	3'	+	roo	8832	2	53.49
GTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTGCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAGAGAAGTGAATATACCTTTGGTAAG:1	+	chr3R	25448482	3'	-	roo	16	2	72.60
AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCT:1	+	chr3L	17115543	3'	-	blood	7071	2	56.16
ACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTCCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGGGGGATGGGTATGTTTGTGAGAGTGTGCGCTGACTG:1	-	chr3R	12854903	3'	+	Quasimodo	215	2	62.04
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATCTGTTCCGCTT:1	+	chr3L	20654612	3'	+	roo	9051	2	71.03
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTAGAGTTCCACCGCGGTGGTGGGTGTACGTGCGCGAGTATTGGTGATGTGTCCATGTCCGTGTTATCGCCACCAGTATTAAAGTGCTCCAA:1	+	chr3R	31812927	3'	+	roo	9034	1	59.59
TAGGTGGTTGGAGGAGATGCGAAGAAAAAAACTCTCTGTGCTAGCCGCTGAAACTCCTAGCAAGGAGAACCAAGAAAACAGTTCTGTCGTTTATTTACTTAAATTTAATAATTATCTATTATCCTCAAATTATTTGTAGATA:1	-	chr3L	25798921	3'	+	Osvaldo	327	1	59.15
TTATTGTACTTTACGGTCTAATTTTGAATTTAAGACTGATTACATATGTGAGTGAGAATTGA:1	-	chrX	10694218	3'	-	McClintock	291	2	83.87
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTT:1	-	chr3R	19968092	3'	+	roo	352	2	57.53
CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTGTGTGCGGGCAGTG:1	-	chr2R	9662694	3'	+	412	7510	2	54.69
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATTTGTGGCACCATCA:1	-	chr3R	7482691	3'	-	412	17	2	71.92
AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATA:1	+	chr3R	28075387	3'	+	jockey	4914	1	70.55
ATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCCGTTCGGCTC:1	-	chr2R	1320646	3'	+	diver2	4880	2	65.93
TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCCACTGCCTAC:1	-	chr3L	11957109	3'	-	blood	7037	2	59.50
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTG:1	+	chr2L	6059293	3'	+	roo	337	2	71.64
AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTAATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCA:1	-	chr2R	981616	3'	-	1360	39	1	62.33
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAGTACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCAT:1	+	chr3L	11531016	3'	+	roo	385	2	67.12
GCCAGGACTTGGCGGACTCCATGCCAAGACGATGTCCAGCTGTGAAACGGGGCAGGACAAA:1	-	chrX	19695006	3'	+	Tc1	1278	1	63.93
TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGGCCAGCTTTTTATTAAATTTAGAAAAGCTTTTTTAGCCTCT:1	-	chr3R	2461520	3'	+	mdg1	405	2	76.71
CAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGATCAATATTAGTTGTATATTGTGTGCTCATGCAGTCCTTGAAGTGCCTTCCGACTGTTTGATTAGGCATTCCGGCTGCCGAATA:1	-	chr3L	19246823	3'	-	blood	122	2	54.11
GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTG:1	+	chr2R	2016924	3'	+	1360	3350	1	48.46
AGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCGTTAATGAAGTCAAAGGGAAATGCCT:1	-	chr2R	10582332	3'	+	Juan	4204	1	77.24
CGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTCTTATTTGCATACTTCTAAAATTGGAGTTAACATCTTCTGTTGTTCTCTTTAATAGATTAGAAGTTGAATCAACCACA:1	-	chr3R	19448685	3'	+	roo	282	2	55.48
CTTAGGATATAAGTCATAAATTCAAGTATTCCATAAGAACCCCAATTTTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTGCCCAAGTCCAGACTTTATACAAAATTTAAAAATGCCCACAAAGTTGGGGTTAAAATGGTGCAGGGGCAGGTTG:1	-	chr3R	3458478	3'	+	Quasimodo	98	2	52.05
AAATTATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAATACT:1	-	chr3R	3922954	3'	-	Cr1a	86	1	69.44
GTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTTCACCTCTTAAACTTTTGCATTGCTGAAAAATTTCTTAAGTATCGTTTGAAA:1	-	chr3L	19521646	3'	-	I-element	161	1	52.94
CTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCTTGTGTGC:1	+	chrX	21994038	3'	-	McClintock	5964	2	76.06
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATT:1	-	chr3L	23635037	3'	-	roo	71	2	69.44
CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAGC:1	+	chr2L	12483802	3'	-	P-element	73	1	29.85
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATCCTATTATAGAGATATAA:1	-	chr2R	6172978	3'	-	pogo	40	1	53.44
CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGG:1	+	chr3R	10182195	3'	-	blood	70	2	69.63
TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACTTTCTATGTACAGGG:2	-	chr2L	15991272	3'	-	mdg1	31	2	54.79
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCCTCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCG:1	+	chr2R	13084667	3'	+	roo	9028	1	65.77
ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCCCCCA:1	+	chr2L	6570064	3'	-	jockey	4806	1	71.01
GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTC:1	+	chr3L	17205269	3'	-	hobo	28	1	63.33
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTT:1	+	chr3R	25448437	3'	-	roo	8722	2	60.84
GATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCACTATCTCCGTCTCTGTCTTTATTTTTCTTTTCCCCCTATTCCGTCTTGGCTATAAATTTT:1	+	chrX	5186601	3'	+	blood	165	2	67.05
ATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTACCCTAATTAGCCACTGCACGTCTCTTTGACGCCGTG:1	-	chr3R	28457717	3'	-	F-element	4273	1	75.34
ATGAACGACGAGATATCAGGAACAAAAGCTAGAAAATTGAGACTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAATTTGTTAATCCATATTTGACATATTTAGGGCTATATGAATAAAAGTAACTAACACCGAAAAA:1	-	chr2R	4880025	3'	+	INE-1	139	1	67.83
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGT:1	+	chrX	9540124	3'	+	roo	9022	2	52.05
GACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGACTTTAACTTAACTTTAACTTTTCTATTACATAATTAGATCCCAATAACACTTATACAGACAAACGAAGCCAAGCAAAAATGTTGTATTTATGCAAAAAGCGGAATGAAAAATATTTTT:1	+	chr2L	14921473	3'	+	Cr1a	4241	1	56.85
AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATGTAAATGAAGTTGAATACAAACATACATATATTCATCGCTGAAAAATA:1	-	chr2L	10685320	3'	+	I-element	5285	1	70.55
AGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGGGGTAGGGTTAGTTAGCATAAAGAAAATCTAGCAGTAAATCGGTTTAATAATTGGATTCGGTTCAAGTCATTAGCACATCTAGTGGGGTGAACGGAACTCAAAT:1	+	chr3R	23234438	3'	-	jockey	4857	1	71.92
GGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATATGTAAGCAATGTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACA:1	+	chr2R	1234691	3'	+	Stalker	7045	4	76.92
TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAAT:1	-	chr3L	17558028	3'	+	jockey	4944	1	68.70
ATATTCTTGATCAGGAACAATAGTCGAGACGATCTGGCCAGGTATTCGAGAGTAGCTCTGTTGAGGTCCTGCTTAGACTGGGCGATATTGGCCAG:1	+	chr3R	4505423	3'	+	INE-1	84	1	61.05
TGGTTCNGAGGAATCAATCGCTCTGTTGAAATTCACATGATCAATTTTCTGTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAGA:1	+	chr3L	14951344	3'	-	transib2	2384	1	78.08
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCA:1	+	chrX	6486804	3'	+	roo	346	2	61.64
CCTTGTTCATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGGCAAATATTCTAATCTAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTTCATTTTCTTATGTAGTTTCTATCGATACGTCAAATAAGTATCTTTTAAAAAACACTTGCTC:1	+	chr3L	26373878	3'	-	1360	431	1	57.53
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTT:1	+	chr3R	14979871	3'	-	pogo	40	1	62.96
CGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGG:1	-	chr3L	23728658	3'	-	HMS-Beagle	6878	2	76.55
AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAA:1	+	chr2R	15064435	3'	-	412	66	2	63.70
CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGCTGTTTGCAAT:1	+	chr2L	21884627	3'	+	pogo	2056	1	54.79
GTACTTATTATTCATGCAAACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTG:1	+	chr3L	19339410	3'	-	Tc1	90	1	73.29
TTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGC:1	+	chr2L	22224607	3'	+	Rt1c	5401	1	54.79
TTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCGATTTGACTTCACCGTCAGTCAGCCAAAAATGAAATCATTCATGTGCATTGAGGCGTATGCCGTAA:1	+	chr2L	4412702	3'	+	Quasimodo	7354	2	77.40
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAGTTTTCACGCACGGTTTCCCTC:1	+	chr3R	27994317	3'	+	roo	9050	2	69.93
ATATTTATCTGAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACGAGATCAAAACTTTAAAGCGAGCTGTTAAAATAACCGCAGTCTGCACGCTCAGAAATTTAGATGATGTGTGGGAGAGCGAAAGACCGAGATAGTGAGAGCGAGAGA:1	+	chrX	7938685	3'	-	Cr1a	415	1	86.11
CGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTG:1	+	chr3L	8249110	3'	-	jockey	4580	1	64.75
ACTTACGCGGCATGAAGTCCACTATGTCCTGGCAACGCTTAGACGTCGGGGAGGTCTTCGACACATATTGCAGTGCAACAAAGAAATTCTTTCATCACAGAATGCAGCGACCGCATAAACAAATTTATTTTCATTCTCCGTGCACC:1	+	chr2R	16092489	3'	-	HB	1285	1	51.37
ACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTATAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGG:1	+	chr2R	5173198	3'	+	Stalker	7176	4	72.41
TTTTTTTTTTTGTTTTTTAAAGTTTGCTATGTTTAAATTAATATATGTATAAATTTATATGATAGACAGCAATTATATTTAGCAACAATTTATATTTATTGTTTCTTATTTTCTTATAGATATAAGCGTATTAGGGACACAGAAAG:1	+	chrX	1763239	3'	-	TART-C	11099	4	57.53
CTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGTAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTATTGTCTTTGTAGAATAAATGAATGAAATGAAGGCACAGCGGG:1	+	chr2R	3877152	3'	+	1360	426	1	77.24
CGTAAAGTCAAATAATAAAGCTAGAGAGCTGAATTTTTTAGAATTGGTGCATTTGACATTTAAAATACGTACTTAAAATTTTAAGTAAATCGGAGCGAATATAATGCGATAAGAACTCATAGAACTTAGCGAATGCTGCAAAGTTA:1	-	chr2R	2520283	3'	-	transib3	2833	1	64.38
CGTTACTCAGTTAGTGGGAATGCAAGGAAAAAAGTTTTGAAGCAATTGTGAGAGTTAGAGTGGGTGTGGCTATCTTATGAAAACAAGCGTCTCATAGTCCTTGCTTCATGCCCATCTCATTCCTATCCTCATCCTAGTCT:1	+	chr2R	6914211	3'	-	INE-1	535	1	62.14
CCACTAGCTGAGTAATGGGTATGTGATAGTCGGTGAACTCGATTATAGCGTTTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAATTTTAATGAATGAAACGGAAACTACAAATTTACATCAATATACAC:1	-	chr3R	17733217	3'	+	INE-1	540	1	78.77
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCACTGTC:1	+	chr3R	22844310	3'	+	roo	9037	1	60.27
ATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATAGCACACTTTTGCCGAGAACACTTAATAAGATGCGACAG:1	+	chrX	10253305	3'	-	hopper	16	1	66.09
TATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1	-	chr3L	25232769	3'	+	accord2	129	2	67.13
AGCTTGNAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACGTATATAATAAAGTTTATTATTATCCGTTCAAATTTGTTTCTCAGCTCTTTTTGAACAC:1	-	chrX	23457612	3'	-	Doc	29	1	56.36
GACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTA:1	+	chr2R	6271497	3'	-	blood	7228	2	74.66
AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTACGAGAAAGAAGTACACCATT:1	+	chr3R	13349164	3'	-	BS	5022	1	63.70
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAG:1	-	chr3R	12886901	3'	+	roo	9037	1	55.05
GGTTTTGTATTTGGTTTATTGAGAGCTGTACACTTTTTGATAGGATTAACAAAAAAATTTTTGGGAGATTATTATTGCTTTCAAATAATTTACACATTCCATCAGCAATGTATTCACAATAAACGCAGCAATTATTTTTCAGTGCA:1	+	chr2L	15509380	3'	-	Dm88	326	1	75.34
GCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAACACAAACAACAATCGCTTCGTCT:1	+	chr3L	10385935	3'	-	Burdock	6156	2	60.55
GTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAATGGAAACGGGATTCGGGCATTCCGATGGCATGGCAACGGGAAGTCAGAAATTATGGAAGTGGCATTCATTACACTAGAGATGTAT:1	+	chr2R	13089443	3'	-	roo	9036	1	74.78
TAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTCCAATTAAATGTCAATATAGTTAAATATTATTCATTTTCCAAGTGGCTCGCATAAAATGGCACTTTAGTTAACCGATTTGCTTAA:1	+	chrX	17855798	3'	-	BS	5035	1	52.74
CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAA:1	+	chr3R	1433204	3'	+	mdg1	7421	2	59.05
TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCCGTATAAAAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCAAAGCTGAGGC:1	-	chr3L	13574445	3'	+	hobo	2914	1	55.32
GAAGAGNGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAACTTAAACGCTGGTCCATTTTTTCCACTC:1	-	chr3L	17685067	3'	-	mdg3	5260	1	56.16
AATCTCAACCTTCTAGCTTATATAGTTCCTGATCGGTTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACATATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATCGAGTATACCCT:1	-	chr2L	13064623	3'	-	INE-1	164	1	86.99
GTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAAACGCCAACGTCAAGTCTCATAAAGACAAGAATATCTCCACCGCCCAAAAGCGG:1	-	chrX	10591717	3'	+	pogo	441	1	58.46
CTCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATTAGAGGGCTGCATAACACCATTCAAACCATTCAATATAACAGTCGTGAACTAAGTGAATTCGGCTCGTTTCGCAAGTGATCGTGCATTTAAACGC:1	+	chr2R	4616645	3'	-	1360	34	1	84.50
CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTACATGA:1	-	chr2L	18294188	3'	+	roo	9031	1	55.81
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGACCTGAACTTGAAATAGGGTAATGAAACACG:1	+	chr3R	22122799	3'	-	roo	8694	2	56.00
CTATTCACACAAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATAC:1	+	chr3L	4605718	3'	-	pogo	62	1	63.01
CATAAACTTGACTATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTTTTG:1	-	chr3L	23818346	3'	+	copia	5086	2	64.58
CGTTGAAGGTTTTTTTTTTTGTCTTTGTTGGGG:1	+	chr2L	7535695	3'	+	Tc1	1467	1	90.91
CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGG:1	+	chr3L	22349276	3'	-	jockey	82	1	63.70
TGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTATGT:1	-	chr3L	18596619	3'	-	Doc	77	1	67.12
CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTA:1	-	chr2R	9791559	3'	-	412	42	2	57.53
CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGT:1	-	chr2R	9662722	3'	+	412	7470	2	71.43
CTTGACTCACTGCCGCTCTTAAAAAACTCAATTTTAATTTGTTTAACTCATAATTAGATCTTACTGACATTTATATCTATTATATTTATTTTGTATAGGGGTTTGTATCCTTTAGATATCGGGATCGAAAGAAAGGCGCAGCTTG:1	+	chrX	18429305	3'	+	Cr1a	4238	1	64.83
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCAT:1	-	chr3L	233247	3'	-	roo	8721	2	66.41
ATTTGTTTATACTACTGCACAAATCGCAAAGAATCACTCGCGAAGCGAATATAATTATCCCTCCTCCTTTTGCCATTTGCCCGAAAAAAAGCGCTCCCAATTTTATTGTTTTTACCATTCCTCTTCGTC:1	-	chr3L	13733714	3'	-	Cr1a	157	1	54.26
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGACGTTTCCCTGCACCTGCTGCCGCCTCTGATTTCACCCCC:1	-	chrX	5274248	3'	-	roo	10	2	77.21
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGC:1	-	chr2R	9632099	3'	-	roo	53	2	59.70
ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTA:1	-	chr3L	10848672	3'	-	blood	7059	2	69.61
CTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATAC:1	+	chr3L	19339430	3'	-	Tc1	70	1	59.59
GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCG:1	-	chr2L	15833464	3'	-	jockey	80	1	68.12
GAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGAGAACAGAAAAGCGTTTGAGTAATTTGGAAAGCGTAAGCACCAAGAGGAACCAGGAAATGCTTTTTCTTTGAAATTATAAACGATAAGGGACCTACATGGTCTATATG:1	-	chr3L	23146180	3'	+	1360	113	1	78.46
GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCC:1	+	chr2R	2427616	3'	-	Doc	57	1	61.31
AGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGTAAAATAATTTTTACTTAAGATAATG:1	+	chr3R	2425644	3'	+	1360	3319	1	76.03
TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCT:1	-	chr3R	7482727	3'	-	412	7072	2	62.50
GGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATTACAAGTTTTGCGGAAAGAGAAATAGAAGGCGAGGAAGCAAAGTTGTACAACGGGTCGTATGAGTATTGGGTATTATCACTCACACACGGGCACTA:1	-	chr3L	7772561	3'	-	Doc	317	1	72.41
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCGCAA:2	-	chrX	5643432	3'	+	roo	9053	2	71.92
ACACAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCGGTACCACGACAGGATAGAGCGCCACAGAAATCGCTCCACAGGAGACATTTATTTAGTTCTCGTCACGTCTACTGTC:1	+	chr3R	15823040	3'	+	BS3	1419	1	79.72
AACTATAAAAGATAGAAGGTTGAGATTAAGTATGCAGCTTCTGCATAGACGCAGCGCAAGTTTGTATCCAAATGTGGCCACGCCCACGAAAC:1	-	chr2L	3995870	3'	+	INE-1	159	1	61.96
TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCCAAGGGTGAAAATGCTTAA:1	-	chr2L	17081800	3'	+	jockey	4944	1	66.09
ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTATATTATCCTG:1	-	chrX	21014753	3'	-	copia	4902	2	43.15
TTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTA:1	+	chr3R	17605711	3'	-	Tabor	6896	2	65.83
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTG:1	+	chr2R	9632188	3'	+	roo	339	2	63.70
TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATA:1	+	chr3R	22822108	3'	-	mdg1	56	2	61.42
GAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAAT:1	-	chr3L	2325722	3'	-	I-element	5144	1	69.78
GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATTTCATACTCGGTGGTGAGCAAAATGTGTAGCATACTTTTTTGGGCAAGGCATCAATGGAACCAAATTTTAGATAAGTATACGTAAAATAAACAACATTCTTTGCAAAACAAGAAC:1	+	chrX	15937402	3'	+	hobo	2933	1	42.47
CTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAAGTATTGTGAGACCGTGTGAGTGTGCGTGTGTAGGAACCTGTCTTTCGATTGCTGATCGATCACAAATCG:1	-	chr3R	28086560	3'	-	jockey	4899	1	54.79
TCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAA:1	+	chr3R	20868194	3'	-	BS	5060	1	67.15
TTTGGTGTATGGCTGTTGCTATGTGGTAATGTATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTAGTAAAGTGTTATACTATGGCAGAAAAAAGTTTGATAGAGGTAATGCTGAAGCATATCACAAGTTGCTTTTAGGAGAGATAATAAAAGTG:1	-	chr3R	3457162	3'	-	Quasimodo	65	2	53.42
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTAT:1	+	chr3L	11530964	3'	+	roo	346	2	66.67
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGCTAACTCTTAGCTCATTTTCATGTGCACTTTTGGCATATA:1	+	chr2L	16092019	3'	-	roo	8699	2	60.42
CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCGCGTT:1	-	chr3R	11083895	3'	+	412	7470	2	68.49
CAGCTTTCATATTTTAAAAATTTCAAACATTCTAATCAGCTTAAAAACCTAAAGCCTCTTACAAAATTATTGAAAATTGATGCAAAGCAAGGTTTCAGGCTGTACGATGTCTTCCCATTTAGCGTACGCATCAGTCAATAACAATA:1	-	chr3L	18924999	3'	-	FB	31	1	52.74
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGG:2	-	chr3R	25448307	3'	+	roo	9040	1	63.70
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATTGTGTAACTTAAGTAGCCGGCATGCGAATGGATGGGG:1	+	chr2R	9632236	3'	+	roo	9054	2	72.73
ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGTCAAGGGCATTTAAGCTTCAGTTTGCTATCTTCAGCTTCCT:1	-	chr2L	14960327	3'	-	jockey	4695	1	64.04
TTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTT:1	+	chr3L	9764440	3'	-	P-element	2674	1	17.81
GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTCTATTTA:1	-	chr3L	16015199	3'	-	1360	29	1	59.72
TCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGTGGTAGCCAAACAG:1	-	chr2R	20596418	3'	+	roo	395	1	72.79
TCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTCCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAA:1	-	chr2R	14542125	3'	+	roo	408	1	65.59
ATATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTTGCTGGTGTTATCTAGTAGGCATAGAAATGAAAAACAAATCGATTGTATTTTGTCGGTATCGATGTATTAGATCCCATACAAA:1	-	chr2R	3600335	3'	+	accord2	117	2	67.69
TTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTAAGCCGGCAACTGGCCGCATACGTAACGCACTCAAATGAAGTTGCTGATGTTGAAAGTG:1	+	chr3R	18778971	3'	+	gypsy	3	2	56.30
CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTTTTTATTTGAAGGACCATATAAATGTCCG:1	-	chr3R	12618572	3'	-	F-element	17	1	68.85
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTCTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGAT:1	-	chr3R	18582170	3'	+	roo	335	2	74.44
ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGATGGCATTAACTAATAGGTATGGGA:1	-	chr3R	9210576	3'	+	mdg1	7445	2	73.97
ACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACCCCAAAATCCCAATCCAAAATAAAGGCCAAAGCTCTTAACAAAAACAAGCACACTCACACAGCGAAATCGAATCCATATAGAACCTTAAACTTAAACATAAACCTAAAC:1	-	chrX	13564693	3'	+	I-element	190	1	56.52
CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTG:1	+	chr3R	20868189	3'	-	BS	5067	1	71.22
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGG:1	-	chr3L	22437896	3'	+	roo	347	2	79.09
CAAGCAACAACTCAACTCTCTCGTCACTTATTGTCTGTTACGGGATCTTGATCTGCTAGAAAAGGAAAACACAAATATTTTTTTATGGCTCCTGC:1	-	chr2R	4237162	3'	+	Fw3	2992	1	69.47
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTNTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGCTCTCGCACACTTCAA:1	+	chrX	16717919	3'	-	roo	59	2	70.97
AAAAGATTATTGTATCATCCATATAACCATGGAAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATATATCGTCCTTTGCACAAAGATGTGGTTTAACTCTACATTTCGCAGACCCCAGTCACCTCGAACGG:1	-	chr3L	25323251	3'	-	TLD2_LTR	46	1	52.00
CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGGGAGAACCACAACTCGCTCTCAATGGGAATGGGTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCACAACGCCTCCTGTGGCTG:1	-	chr2R	21101705	3'	+	P-element	2876	1	71.31
CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTGTGTGCGGGCAGTGACTGTGAAAGGATTGCACTC:1	-	chr2R	9662674	3'	+	412	467	2	63.77
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGGGTGTGTGTTTGAGCACGGTGAATGGTTGA:1	+	chrX	9540157	3'	+	roo	392	2	71.23
GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGGGGGCACAGGGCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAA:1	+	chr3L	22400355	3'	+	1360	3332	1	58.70
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACATTGGCTTTTATTGATAAATCA:1	-	chr3L	22437858	3'	+	roo	9013	2	58.22
ACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTATAGCATTGGCTACAGGACCTACAGCTATATTGGTTTACAATGCAATTATATCTTAATCTAGTTAATGTCCACGTCTTTGGAGCCTGCTGCAGTCCTGCAGCACAGGAC:1	+	chrX	18428115	3'	-	I-element	5320	1	68.66
TATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCTTCAGCATTTGGCCG:1	+	chr3L	25824661	3'	-	Juan	4189	1	58.91
CAAAAAGACTAGGCAATCGCGAACGTCCGTATGCAACGAAGGCTAGGCAGAGACTACTTGATGGGATGCCGTGGAAACAACTTGTTTTGGTCTTCTCCTCGGCATCCATATCAATGAACAACTTCACT:1	+	chr2L	11116611	3'	-	jockey2	21	1	66.41
AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTCTGGCTGGAAGTCAGGAGGCAGCTCGGGATTATCCAGTGCACTGTCCAGTCTCTCCAGTTGGAAATCCCAAGCTT:1	-	chrX	17223345	3'	-	roo	27	2	54.11
TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGTCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGC:1	+	chr2L	10037409	3'	-	Quasimodo	64	2	63.70
ATAACAACAACAATAATAATAATAACACAAGTCAAAAGCAAGGAGAGTGCGAGCGAGATGGCCGGCGAGGCCTGAAAGAGACAGAGCTAGCGAGG:1	+	chrX	4435238	3'	+	mdg1	26	5	56.84
GGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGCGATAAAAATGAGCTGAT:1	+	chr3R	18339207	3'	-	roo	8703	2	56.55
ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACACTTCATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAATCATAATATGAATAAATGTGCTATAGTTTTTGAACAGTACACTTAAAT:1	+	chrX	15077395	3'	-	S-element	74	1	95.89
GGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGTGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGGCATTTTTTATTTTTGTTATTTGTTTCTACTTCTAACTAATTGTTTCTACGCTAATTCACAATTACTATATTTTC:1	+	chr3R	7178045	3'	+	INE-1	97	1	68.06
AAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTCCAACTCGCTTAGGTATGCAAAAGCGGCCTGTGTGGGTGGCAGTGGACCAAAGGCAGACAAACAATAAATAAAGACAAAGGATGCAGC:1	-	chr3L	24041239	3'	+	Bica	217	1	68.80
TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATC:1	+	chr2L	19965055	3'	-	Doc	61	1	58.59
GCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCTGCCATTGAGACCACTGTGCAAGTGTGTGGGAACTTGACACTTGGCTAAGAGAAATCCGTGAGATATG:1	-	chr3R	14210127	3'	+	412	60	2	52.11
GAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTTTTCAATAGGCGCAAACGTGAAAG:1	+	chr3R	20499874	3'	+	mdg3	5478	2	67.69
AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCCGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGT:1	-	chr3L	10056109	3'	+	transib2	2770	1	60.77
AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTCAACACCATCTTTAAATTCTTTGATT:1	-	chr2L	21884461	3'	-	pogo	14	1	76.03
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGA:1	-	chr2L	14772049	3'	+	roo	8998	2	69.50
AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCTCTTGTCATGA:1	-	chr3R	27424809	3'	+	blood	7358	2	62.33
GTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGGGTTTTTGTTGATGAAACTAGTAGTTTTGCACATAAGCTGTGTCTAATTTACTTAACTTTTTATAATTAAAAAAAGTGTTTGTTTATTTTTATATGAAAAAACAACTAGATATGCGTG:1	+	chr2R	4744599	3'	-	roo	9065	1	78.08
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATT:1	+	chr2L	18294281	3'	-	roo	8736	2	69.86
TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGC:1	-	chr2R	9791612	3'	-	412	73	2	82.26
AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAAGTCACGCCCACTTGACTTCTTTTTCGGTTCTTGGAGCATC:1	+	chr3R	20005143	3'	-	297	22	2	67.67
CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCCGCAAATACAAATACCAATACCAAAGCCCC:1	-	chr2R	10124150	3'	-	P-element	84	1	24.46
GTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTTTCGGTGTG:1	+	chr3R	22822179	3'	-	mdg1	3	2	64.14
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCT:1	+	chr3R	7835204	3'	-	roo	8680	2	60.00
GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAAGAACTGTTAGAAAATGGTGAGAA:1	+	chr2L	14081448	3'	+	1360	3372	1	73.29
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAGCTACCAGA:1	+	chrX	14336516	3'	-	roo	53	2	60.42
TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGATTATATAATTGCCAAAATCATATGAACACATACGTTTTGAACAATATGAGAGGTCGGCAACCACTGCCTACCTATTATAGTAGTTAATGACGAGGTGGTTGGCTAC:1	-	chrX	23431004	3'	-	Transpac	4940	2	67.12
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTAGTAGTGAAGG:1	+	chr2L	7898401	3'	+	roo	9044	1	58.87
TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGGAGAGGTCAAAGTGACC:1	+	chr3R	1433233	3'	+	mdg1	374	2	50.35
TACCGACCCATCGGTACCACGCCTACACTCCCAACCGAAACCCCCTTACTTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATCGAACCGGGAAGATAAGATATATATATAAGACAAAGACATTTTTCAGC:1	-	chr3R	2833315	3'	+	ZAM	7966	2	72.66
ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAAGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCAT:1	+	chr3L	27415293	3'	-	transib2	83	1	72.60
AATTAATGGGTTTACTAAATAATATAAGAAATATACAACAGTTAGAATTTGTCCAATTAATACATAAGGTTCTTCAACTGGTCGAGCTCCAATTCAAGTTAATAACGCCTATGCTGCCTGGTGCTCAGT:1	-	chrX	750575	3'	-	HeT-A	364	1	19.38
ATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTTG:1	-	chr3R	26686028	3'	+	Juan	4122	1	76.03
AATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCTCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTCATCGACACTTTGCTTTTTAATCAATTTAACAATTTTTTGTTCGGC:1	+	chrX	13898592	3'	-	R1A1-element	138	1	63.64
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGCGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAA:1	-	chr3R	18339076	3'	+	roo	360	2	50.70
ACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACGGAGCAATAAAATATAGTCAACGAACAATAAAAGAGAATATC:1	+	chr3R	23495719	3'	+	copia	5058	2	74.81
TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGAT:1	+	chr3R	17243220	3'	+	hopper	1360	1	54.79
AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGCAATATTTTTCTTGAATTAATTGAGTTGTTTTTTTTT:1	-	chr2L	3922901	3'	+	opus	432	2	73.85
TAGTCCTCAGATCACAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATGTAATTTAATATTAAAGCTGTCTAAGCTAAAAAGCTTCTGGTTTTCTGGCTTTCTTAG:1	+	chr3L	12348268	3'	-	blood	415	1	51.22
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCG:1	-	chr2R	19050228	3'	-	roo	35	2	74.68
TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTTCTATTCATGAGAGTGTGGGCGGGGCTTAAATCGAATAACTTTGTATAAAGATTTCCC:1	+	chr2L	23068969	3'	-	1360	32	1	63.70
GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATG:1	-	chr2R	20496886	3'	-	blood	28	2	62.22
GAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTATAGTGTGTACCAAAACGTCTTCAAATGGTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAAT:1	+	chr3L	9955182	3'	+	Tc1-2	1262	1	77.08
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTATTTATTGCTCAAGA:1	+	chr3R	20469697	3'	+	roo	9021	2	52.05
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTCTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAAAAG:1	+	chr3R	19449413	3'	-	roo	8685	2	76.55
AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTG:1	+	chr3L	3477513	3'	+	mdg1	358	2	65.52
CCTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATATAATATTAACAATCTTTAGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTGCGCTTTTGGTCATAAATATTGCCGCTTTGTGTT:1	+	chrX	11306273	3'	+	Juan	3909	1	73.79
CTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGCAGAGGTTTTAAATATTTTCCGTAAATTTTTCATACTCGCCTCAAGTTGATTG:1	+	chr3L	3577822	3'	-	Stalker	6944	4	63.70
ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGA:1	-	chr3R	22821997	3'	+	mdg1	7400	2	58.90
TGTGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCACTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGTTTTGTTTGTCAATACTTTTTAATCATTTATAAATATTTGAAATGTAGGTTACAAACGATGTAAATGATC:1	-	chr2R	3919099	3'	-	G4	3537	1	50.68
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTC:1	+	chr2L	16091993	3'	-	roo	8727	2	64.38
ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAATCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACAAAAACAAACA:1	-	chr2R	21572090	3'	-	hopper	41	1	52.31
CCGAAAGAGTATTTTTAAGTAGAGCATTGCCAGTTATGGACGAAGCTGGCCTGATTCCCGATCACCAGTTTGGCTTCAGGCGGCGTCATCAGAAGAAATCTGCCCTAGCCTTGCTGATATGAACCTTACATGGTCTGTTAAGTAGA:1	-	chr2R	4955121	3'	+	G7	304	1	77.40
GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTTACCAAGATTGTAGCCAAAAGGGCCAAATCTTGGTCCCACTTCAACTTGAGCATACGAGCTGCAATAGGTAGCCTGTGCATTTGACCC:1	-	chr3L	17875738	3'	-	1360	16	1	71.32
CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTC:1	+	chr3R	29361070	3'	+	mdg1	7437	2	59.46
GCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTAGGGAACTTTCAAATATACGCGAGGACGAAACGAAACGGATCGCGTCGTTTATTTTTATAACATCAAA:1	-	chr2L	4966332	3'	+	Quasimodo	7048	2	62.07
CAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTTAAAGGTGTCAAGACGAGGCATTAATGTCTATTAAAATCTGTTAACTTTGGTTTACTACTTAAACTTA:1	+	chrX	123714	3'	+	R1A1-element	353	1	66.44
ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATACTACAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTA:1	+	chr2R	9091975	3'	-	1360	14	1	71.92
AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCTTATGAAATGCCTAAACTCAAC:1	+	chr2R	4601683	3'	-	HMS-Beagle2	12	2	78.52
AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATG:1	-	chr3L	7292429	3'	-	HMS-Beagle2	29	2	68.49
ACGTGTTCATAAATACGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAAAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATAATTGAATATGACACGCCAGAAAACTTAATAGAAATATTAAGGAAGTA:1	-	chr3L	24355931	3'	-	micropia	5030	2	65.07
TATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTG:1	+	chr3L	27415331	3'	-	transib2	37	1	57.97
GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTGGTACCACTGGGTCCACTGTGGAAATTGCAGGATATGCAAAAGGGGCGTCAGGTCAGAGCAGGGG:1	-	chr3L	17205190	3'	+	hobo	2928	1	66.00
GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAA:1	-	chr2L	17295809	3'	-	Doc	24	1	62.41
TTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAACGGGAGGTATACAATACATGAGTCATTGTGAGTTTTTGATAAAACACGACATATAATCGAATATGACACACCAAAAAATTTAGTAGGAATATATTATC:1	+	chr3L	25208470	3'	-	Cr1a	101	1	71.03
AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCA:1	-	chr3L	11957138	3'	-	blood	34	2	63.00
GACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACAT:1	+	chr2R	6271491	3'	-	blood	217	2	73.57
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAG:1	+	chr3R	22122764	3'	-	roo	86	2	80.14
TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTT:1	+	chr3L	10648019	3'	-	412	7089	2	47.92
AGATATNTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTAGCTGTGCCAAAAACAAACTTGGCTCTTTAATATGATAT:1	-	chr3L	19334232	3'	+	roo	358	2	53.42
ACACACACACACACACAGCGTACACACATCTTGGCCGTAATCCTCTGGGCGATGCATCCGAGATAATTGACGGTGAGAAATTTACATGC:1	-	chrX	7155519	3'	+	accord	260	2	79.78
AAAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTATAAAAAAAAGCAAGAAAAACACAACAACGACAATTGGGTTTCCATGTTGATAA:1	-	chr2R	16251586	3'	-	FB	861	2	65.75
TATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGGAAAAACAAGAGACGAGAACGAGTATATGTATTGTGTGGCCATCTTCGATCTGCCCGCCTTCGCCGACTGTTCGTGATCCGTAGGTACACAC:1	-	chr4	56478	3'	-	1360	3258	1	61.74
AACAAGAGAGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGTAGCGA:1	+	chrX	15946776	3'	-	INE-1	580	1	53.42
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCATGAGAATTGAGTAAGTTTTCGCCATTCCACTTGACAGCTTAAAGTTC:1	-	chr2R	14387933	3'	+	roo	9028	1	57.39
GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTCCCGAAGGCTGCGTGAGTTAATCACAACTCGAAAATA:1	-	chr2R	20944291	3'	+	pogo	2085	1	64.83
TTTTATAACATTTAAATAATTGTCAAAATACTTATGCCATTGCTAATTTGTAAAAGAGTAATTTTTGTTGGTATGGGTATCGGCTAGTAA:1	+	chr4	220251	3'	+	Tc1-2	1414	1	76.67
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGG:1	+	chrX	9540082	3'	+	roo	347	2	75.65
ACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCTGCAACGCCTTGC:1	+	chr2R	4294613	3'	-	McClintock	6005	2	64.89
GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGAATTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCA:1	-	chr2R	16785320	3'	+	412	438	2	53.42
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGCCT:1	+	chr3R	14979911	3'	-	pogo	38	1	58.22
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGT:1	+	chrX	9540130	3'	+	roo	386	2	64.80
GAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATTAAATCAATAAACAACACACACGCACACGCAGGCGGC:1	-	chrX	18214939	3'	+	1360	124	1	72.79
CATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGG:1	-	chr2L	12290687	3'	-	1731	84	1	72.60
AAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACTACAATTCAACTTCACTTGTTCTCG:1	-	chr2L	2122389	3'	+	Stalker	7195	4	54.79
TGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTGGCGCCCAATAGTCGAAAATACTTTGTTGAATTT:1	+	chr2L	6863367	3'	-	pogo	82	1	75.34
CACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTTCTACATAAGTACATCTAGTAAATACTCTTTTTTAATGT:1	+	chr3R	21169314	3'	-	Bari1	1677	1	73.29
ATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTTATTATTATTTGAAAATAGATTAAAAATAGTCAAATCTTGGAGACCAAGAACCGCATGGAGGGACGCAACGTCCTGAACCCCGTCACCTTCTACCT:1	-	chr3R	27006762	3'	+	1360	263	1	60.27
AGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTAATTTTGGCGCGACATTTAAGCCCTTTT:1	-	chr3R	5063000	3'	+	R1A1-element	5102	1	71.58
GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTATCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCAGTTTTGTCAAGTAGCATTAAGGCAGCGC:1	+	chr3L	13574521	3'	-	hobo	51	1	56.92
GGAGCAGCCAGCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTG:1	+	chr2R	3104460	3'	+	Gypsy6A_LTR	332	1	69.66
ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTCAACACCATCTTT:1	-	chr2L	21884474	3'	-	pogo	27	1	68.49
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTGGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGG:1	+	chr3L	11531022	3'	+	roo	9054	2	71.23
TGATGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATATTCTATGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGGCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACG:1	-	chr3L	23871826	3'	+	INE-1	94	1	53.92
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCGGACCACCGCAATTTTCTTTCATTTTCCGTAGCGCATTTGCAATTTG:1	-	chr3R	28624571	3'	+	roo	355	2	64.80
CGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAACATTTAACTGTCGGCGGAATGTGGCAGGTTTCCTTTGG:1	+	chr2L	3295298	3'	-	412	228	2	67.23
TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAACTAGGAAGACAATT:1	+	chr3R	19446228	3'	+	297	322	2	69.18
CAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTAGAAGGCATTTACAATTTTGAAAGACATTTGATGTCATGGTTCTATTAGTCTGACGCCTATTATCTCGTTTCCCATCCA:1	-	chr3R	14651672	3'	+	P-element	243	1	57.53
TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCCCCCAAAGTTGGAGGAA:1	+	chr2L	6570076	3'	-	jockey	4792	1	79.41
GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTTACAGTCGGTTGCACAGTCAAAGTTCATCTCAAGAATCGAGGTAATCCCACTCCTTTCGGATC:1	-	chr2R	6919653	3'	-	hobo	23	1	58.93
GGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCATGTTTCCGAGCCAGAGGACTGTGAGGCAGATGATACACAGGCAGAAGGGTG:1	-	chrX	21527826	3'	+	297	428	1	61.94
AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGGGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAA:1	+	chr2L	14081398	3'	+	1360	3343	1	60.80
AATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCTTGCCCCTTATCAGGCGCTTTTCTGAGTGATTCTTGGGAAT:1	-	chr3R	10824532	3'	-	roo	396	1	68.22
AAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAAAGGGTTCTTATTATAGTCGTTTTATTCTACAAACTT:1	-	chr2R	5209566	3'	-	gypsy	6992	2	77.97
GACTTTGAAAGCGCGCTAAAAATAAATGATAACTCGTAAAAATGTTGTAAAATTATTGTTATTCTATCTTGCACAATAACTTCCCAAACCCAGTAGATAATAGCACTGCAAGCGAATTGCAAAATGTG:1	+	chr3L	12818162	3'	-	transib4	144	1	43.75
CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTACTAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTC:1	+	chr2L	20840508	3'	-	Transpac	4982	2	60.14
ATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTAATATAATACAAACAACATATTCCTGGTTTTTTCTTTTTTTTTATTTGCCTTATTGGTTCTTGAACCACTGTACCATGTTGTACAGTGTGACGTAGCTGGTAATAATACATGTT:1	-	chr2L	23049025	3'	+	Doc2-element	53	1	65.75
CGCCTAACCGACCGAGGGGCGGTGCCGTGCATCGTACGGCGAGAAGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAATCTGCTTATGTCCTTTTGAAATCATTTTAGAATCATGTGTAACGTTGCTAAAGAAGGGGATAATAATAC:1	-	chrX	9893844	3'	-	Cr1a	4415	1	52.74
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGAATATCACCAGCTTTAATCATCTGACTTTATAAGTGTGGCACACG:1	+	chr2R	13696516	3'	-	roo	36	2	59.59
ATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAAGAGGTTTTTAAAAGTATTTGCGCTCCACTGGCGGGGATTAAGGAAAGT:1	+	chr3L	20654371	3'	+	roo	86	2	64.29
GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTA:1	+	chr3L	20033800	3'	-	blood	7052	2	47.26
AATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGTGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTAGAGGTCCAGTTGATGGTTGAATTTGATCGATTGATTGATAGGGTTCCAATGTTTA:1	-	chr3L	986944	3'	-	TAHRE	10397	1	62.33
GAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAGTAATCAGAATTGTTTCCCCTTCAGGTAATACGTTTCGGTCACGATTGGGACCCCGCCTGCATGAAAATGGATGAGGTCATGTACAGCATCGCCGAG:1	+	chr2L	4403564	3'	+	Quasimodo	270	2	78.26
AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGCCCGATGCTGCGTGACACGCAAATCCGACACG:1	+	chr2L	14892343	3'	-	transib2	5	1	79.20
ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATGTGTGGCAACTCTGCGCAGCACTGCATTTGTAT:1	-	chrX	1899639	3'	+	P-element	2806	1	28.67
AAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGCGGAAAATGGTGGCTCTAGCTGGCGACCGACCAAGCCAACAACAAGAACAAT:1	+	chr2L	4412241	3'	+	Quasimodo	6954	2	50.89
AGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCACTAGTAAAGGCCTTATCTGATACGCAGCGTTAATAATACAGCGCTCCAAAAGAGGTTCATTGCGGGCGCATGTTGTTATTGTGAACGCTAACAGAAAAATATTTA:1	+	chr2R	25249861	3'	+	HeT-A	5841	1	75.71
TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGCGCAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCACCGAGGAC:1	+	chr3R	7835234	3'	-	roo	8698	2	57.97
GGCCGTCACGCATCTTTTTATTCTAATGTATTTGGTCCTACGTCATTAGGAATAGCTTAATTAAAAAATTGATCAATTATGCACTATAATTAGGCTATACCTAAGATATTTCAATTTACCATAAGGGCCTTGCACAAATTTAC:1	-	chr3L	22722108	3'	+	1360	3376	1	59.44
ATACACACTGGAGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCACAGAACATTAATGTTATAACTCAGGCCATAGTACCCGCAAACAAAGTACAAT:1	+	chr2L	21318219	3'	-	invader4	2936	2	59.40
TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGT:1	+	chr3R	22822167	3'	-	mdg1	7054	2	55.48
GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACCAATAAACCGCACCACTC:1	-	chr3L	10848604	3'	-	blood	7034	2	69.66
TAAAAAAAAAAGAATTTTAAAACAAATTTCTAAAACAATTTGTAACTCTTGTTTATATATTTCTAAATCCATTAGAGCTTGAGATAATAAGTTTGTCTCCTTATTTCGCTG:1	-	chr3L	13184799	3'	-	FB	176	1	55.86
ACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCCGCCTGCTTCGGCTCACAAGTTTCAGCTTTGCACTGGACAC:1	+	chr2L	11729953	3'	+	Doc	346	1	76.84
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGC:1	-	chr2R	8585407	3'	+	roo	400	1	75.00
GATGGCAGCGGAGACTAGGTGGAACCACAAGAGGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAAGAACTTGCATAAGCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGC:1	+	chr3R	10274010	3'	-	HMS-Beagle	6837	2	65.96
ATCTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAAGTCCCTTAGTGGTCAGTGCTTTCAAAAACAATCATAATTACAAACAGATGTCACTTTAAGTGCGCGTTTCGAGTTAGCGAGCACTATTG:1	-	chr2R	14486103	3'	+	roo	144	2	51.37
GGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTGTTAGTCCAAGGGAAAATTTTTCCAAATGAAATAGAAGTCAATTTTATATCATACATA:1	+	chr3R	9714513	3'	+	Stalker4	7336	2	65.07
AGAAAAAGAAAAAAAAAAGGAATATGAATGGAATGGAATGGATGACTTCATGCGCTTCTGTACTTCAGTTTGCTGAGAAAAGGAGAACACATTATACACTATGGAAATCCACCTAACAAACTCCTATATCAACATGAGCGAATCAA:1	+	chr2L	14267612	3'	+	Doc2-element	221	1	69.86
AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGA:1	-	chr3R	19446145	3'	-	297	6634	2	65.38
ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCG:1	-	chr2R	9791568	3'	-	412	7103	2	54.48
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCA:1	+	chr3R	26222924	3'	-	roo	8738	2	79.69
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGGTGTTCGAGGTAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCAACGATACACAACAA:1	-	chr3L	23773150	3'	+	roo	390	2	50.00
ACAACTCTTCCAATCGTACTGTGCACGCGCACAATTTCTATTTCTATCCAATGCACAGCAGTGGTGACAGACAATTTCGGGTAAAGGCGATTATATCAGTGTAAGCAAGCATGCACAGCA:1	+	chr4	1179653	3'	+	jockey2	56	1	63.33
GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCAAAGCGACCAGTGAAACACACAGAAATAGCACAGT:1	+	chr3R	15157730	3'	+	invader3	5449	2	72.60
GTCGACGAGGTGTCTCACGGCGGACTTATTAAGCCGTCCGAAAAATTTCAAGAGAAGTTAAAAGAGCTAGAATGTATTTTTTTGCAGCCTTGATACCTGAAAGATAATTAAAACATGTTTAGTAAGCGCAAAAGAATTCTGGGGG:1	+	chr3L	18503347	3'	+	P-element	2410	1	40.69
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATT:1	+	chr3R	7835198	3'	-	roo	67	2	69.63
ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACTAACTGATTGGTTTTCAATA:1	+	chr3R	20499858	3'	+	mdg3	5474	2	61.02
GGCTTGCCTACAATGGTTAACGGAGTATGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGTGGATTTTGGCAGTAGCGCCATTCGCGGATTATGGATCACAGATCACAGCCTTCGCCGGCAAATGGGAACGTGCAGA:1	-	chr2R	16779157	3'	-	Doc4-element	227	1	52.59
GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCG:1	-	chr2R	5248236	3'	-	1360	60	1	61.87
TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGC:1	+	chr3R	27424937	3'	-	blood	47	2	49.57
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACAAACATATACAAACTATAACTGTGTTACTCCGCG:1	-	chr2R	7452815	3'	+	pogo	2060	1	56.85
GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTCTCCGTATTTTCTAGCATTTGTCTATGCAA:1	-	chr3R	27994145	3'	-	roo	8690	2	66.44
ACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGGATATACCAAGA:1	-	chr2R	5284509	3'	+	Quasimodo	6916	2	65.52
CGCTCGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTTAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGATAACGCGTATATGTGTGCGATCTGGACAAATTCTTTGATTAATATTCTGGAAATTACGTAGGTCCTATTTA:1	-	chr3L	25625204	3'	-	1360	3294	1	64.38
AGATATAGACCCGATATAAAAAAGGGAACAGAAACGAAGAAATAAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAAGATGGAATAATTTTGGATTTATAGCAGAACAAGGAAACTCATAGAAAAGTGTTAATTAAA:1	-	chr2L	10685179	3'	-	Cr1a	4362	1	59.59
ATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGGCTCCACCCTTTTAACAACCGCTGCTTTACTTACCCTTTGGTGCCCAACGAGTATTTCGTTTAAAGAGTATCCAGAAGAAGTTTT:1	-	chr3L	24892114	3'	-	Circe	7205	1	72.09
ACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAATTTGCAGA:1	-	chr3R	14860110	3'	+	BS	5061	1	58.90
GCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGATACTCTAGGGTCTTTGGTCTTAGAGTCGGTCCATAGTGCCCCGCCAGAACTCACTCTCGCTTTCAGGGCTGGCTTAATTAATTTAAATTCTTAATTTAA:1	+	chrX	11142335	3'	-	1360	42	1	58.22
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCC:1	-	chrX	5274320	3'	-	roo	80	2	78.36
TTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGTAGCAGTGCGATTGCATTCGTAGTCACGCCTTTAGTTACGTATAGCTTTCCATTCATCGCTTTCTGTGAGTCATTAAAGTATTGTTG:1	-	chrX	13125755	3'	-	jockey	4935	1	63.50
AAAATAAATGTAAAAACATTGTGTTTAATGCTGGGTCTTAGTGAAGGAAATGCTGGAGGTGCTGGCGAGATGAATCGTAGTTGACCAAGCGGATTGTGCTCCATTTCAGCGGGCTAATGTTTAAGAATCGGTTAAAGATCGTAACT:1	-	chr3L	3390396	3'	+	looper1	1812	1	41.78
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAA:1	+	chr3L	20831357	3'	-	roo	71	2	74.07
GACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCAGCAGCAGCAGCTGCGGCAATTGTTGCTGTTGTCGTTT:1	+	chrX	18000847	3'	+	412	413	2	56.18
GTGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTAT:1	+	chr3L	24208224	3'	-	accord	189	4	52.74
AGCTTTTATAGTTCTCGAGATCTCTAAAATAATAAAGACATGTACATGTAACTATCTATCCTGATCAAGACTATATATATATAAAATCATTTTAACCCCTACCATATACACAAATTCAAAAATTGTACGAACTTGAAAATAATGCA:1	-	chr3L	18917790	3'	-	INE-1	150	1	54.79
GCTACTGATCCTGATTAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTACCTTCTGGCTGTTACATACTTTTCAACGAGTCTAGTATACCCTAGTATACCCAATTTCTTCGACAATACTCTGATTATCATCCTGGGCCTTCA:1	-	chr2R	2969001	3'	-	INE-1	86	1	77.08
GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGG:1	-	chr3R	19968090	3'	+	roo	402	1	70.71
AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTG:1	+	chr3R	13349113	3'	-	BS	5072	1	69.66
AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTAAACTTTTTTCTTCTTTT:1	-	chr3R	13237283	3'	-	3S18	5804	2	53.85
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCATGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCACATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAA:1	-	chr3L	11393482	3'	-	roo	61	2	64.54
TTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATGTTCGCCTCACCACCAAAAGCTGACCCCTAATTTCACGATCCCCAGTCTAGGCCAAAAGCAAACACCCCCACTTGGATTTC:1	+	chr2L	21089393	3'	-	HMS-Beagle2	7164	2	54.79
AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGCATACATTTGGGAGTCGTTGCCTCGCAGT:1	+	chr2L	15181473	3'	-	jockey	4789	1	60.77
GTCCTGGAATTTATGATATCTGGAGAGTTCCGGAGCCATACCGGAAGAAATCGTTATAACACACTTATCTTGAGTACGCTATGACTTAAGAAGGAGCAAACTGATATTAAGTGTTCGATCTACTTTCTACATTTTTAATTATAAAT:1	-	chrX	11006484	3'	+	Circe	367	1	68.49
TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAG:1	+	chr3L	20831393	3'	-	roo	34	2	58.96
TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATTTTCTGCTACCAACGTCACTCATCCATCTTCGCCTCAAATCGTTCGTTATCAATTGTTAGTGAACTTATCAGCACG:1	+	chrX	12469338	3'	+	S-element	1674	1	56.85
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTT:1	+	chr3R	7835211	3'	-	roo	39	2	55.00
AACAAAATCTATTTTTAGTCACTACATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTTTTTAGCCTAAATTAAGCAATATGGGCAAGCTTTAATTATATAACCCATTTTAA:1	+	chr4	1146836	3'	+	jockey	123	1	61.64
AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTCCATCATTACAGCGGGCTTATATGAATTTGTGGTGCACTGATAGAATACT:1	-	chr2L	16016340	3'	+	412	7484	2	66.67
TGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCAAAAATAGCTTGAGGTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAATTATGTATAATAAATGTATC:1	-	chr2L	17007691	3'	+	micropia	24	2	54.79
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAA:1	-	chr3R	7482723	3'	-	412	46	2	51.75
AATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGG:1	+	chr2R	5173209	3'	+	Stalker4	343	4	65.00
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAA:2	+	chr3R	7100923	3'	+	roo	9032	1	56.16
CTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGT:1	-	chrX	13066536	3'	+	jockey	4899	1	82.88
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATCCCGAAACATTAAATTGAATAACAACTTTGTGAATTTTCTATATAAGTAAGAAGTTAAAGTAAAATTGTCAGAACATTAAATAGACACATTG:1	+	chr2R	6086452	3'	+	pogo	2076	1	68.49
AGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAATGCTTCAGAGATTGGAATTTGAAATCTGTTTATAAATTTTATAAAATGACGCACCCGCTTCATTATGTATTTCGCTTAAAAGC:1	-	chr2R	978021	3'	+	F-element	4396	1	59.59
TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCCCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGCCTGTG:1	-	chr2R	9662705	3'	+	412	7538	2	61.80
CGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCATTCATCTAAATGGTCAGGGGTTTAAGTGGAATTT:1	+	chr3L	3501053	3'	+	opus	7462	2	57.53
CACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGAAACTTATAATTATAATGATCCAGCCAGCCATTTGGCTCATATTGTGGCTTATC:1	-	chr2L	6625312	3'	+	Burdock	20	2	60.00
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATT:1	+	chr2L	17471673	3'	+	roo	350	2	66.40
ACATCAGGAAAAGCTGCGTGTGACGACGAACGACACACGAAGCTATACTTCGGATGCTGGTCGGCGGCCGTGATCTGTGGTTAATTTATATGTTTTAATTTTTTCTTTTGGAGAATTTCTCCATAAAATATATTGATATTTTTGAT:1	-	chr3R	19445432	3'	+	Chouto	13	1	54.11
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGAC:1	-	chr3R	18339095	3'	+	roo	337	2	65.07
AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGC:1	+	chr2R	5485228	3'	-	blood	44	2	54.79
CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCACGTGAGTGCGTCTCGCTCGCACCCATGGGGAGTTGGGGCCAGCAGCTGGAGTGGGCG:1	+	chr2R	11629846	3'	+	Tirant	382	2	58.42
CTACATNTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACATAGAAAACAACAATTACAATGGGCCCACATCTGCCGCTCTCGATCGCGCTCATCATTG:1	+	chrX	4940379	3'	+	hopper	1056	1	58.22
GGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATTAAGCTTCATTTTTATTTCTATTT:1	+	chr2L	1839358	3'	-	hobo	15	1	73.33
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTT:1	+	chr2L	7945393	3'	-	roo	8744	2	75.35
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGATCATTTATTCGACTCGAAATAGTAACTACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAGTTGATGCGATATTAAACATATTCAATT:1	-	chrX	23362226	3'	-	roo	8685	2	69.17
GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACA:1	+	chr2R	2016913	3'	+	1360	3351	1	52.54
GTTAGTGTTAAGGTAGTTGTAATTTACCAGTGCCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTC:1	+	chr2R	4999691	3'	+	Max-element	8409	1	63.74
CTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGC:1	-	chr3R	25423227	3'	-	3S18	73	2	73.64
AATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAACTGTTGCATACGTCGAGGGGCCAGCCGCACA:1	-	chr3L	17136040	3'	+	hopper2	1559	1	57.36
GTACATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGGCGGGAAAGAGTTTTAAATGGAGATATAAGTCAGTGCTTTTGTCACTTTTCGAATCGCAAATCTGATTATGAAAAGCGATTAATTTCAGTGAATAATTGCAC:1	+	chr3L	20900992	3'	-	invader3	5309	2	74.83
GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGGGGGTGGGCCGCCAGCAGCAGGCGGTCATTAAGCAAATGGCT:1	-	chr2L	15238106	3'	-	jockey	4783	1	62.83
TCAACTTAAAACGGACTTATGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGA:1	-	chr2L	11518403	3'	+	412	469	2	50.00
CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGGTGGTACCAA:1	-	chr3L	22400238	3'	-	1360	5	2	75.00
TCAGGAACTATAAAAGCTAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGAGTAAAGTTTGTTGACCCATGTTGCAACACCCACTCTAACGCCCTAAAACGCCCAAAACTGTGTAATTTTATTTAAATTAAGATTATATTTT:2	-	chrX	22905338	3'	+	INE-1	154	1	62.33
TAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCTCGATCGTGATCATGATTACTTGATATGGTCGAAAGTGCTTTATTCTACCCTTTACAGTCAGCACGATTGAGTTTTGTTGTTTGTTGAAAATAGTTTTAGTAAGTAGTGAACAAT:1	+	chr2R	20538536	3'	-	INE-1	151	1	43.57
CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATG:1	-	chrX	10644454	3'	-	jockey	4787	1	57.47
TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGAATACAAAAAAAAATAACAACTAAAAATATTAGCGACACAGGAGCCAAATCTTGCTATATCAAATATTA:1	+	chr4	1152141	3'	+	transib2	2812	1	74.07
AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAA:1	-	chr3R	27424841	3'	+	blood	7326	1	60.27
TAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACGCAGAATAGGAGCTAGATGGATATTTATGGGCCGCAGACATGTCCTGGCCTAAGTGGAGCCTTTTAGTGCGGTTTA:1	-	chr3L	13113647	3'	-	1360	224	1	54.11
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTCGCAGTCGGCA:1	+	chr2L	12892722	3'	+	roo	391	2	64.55
ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTATGTATATATATACGAGCAACCAACATTTGCTCGCCTTAAA:1	-	chr2L	19634979	3'	-	flea	46	2	71.19
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGTCAATTCCATTCAAGGAGGATGTCACCTTAG:1	+	chr3R	19445029	3'	-	roo	16	2	43.48
TTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTCATGCAAAAG:1	-	chr2L	17420149	3'	+	roo	9045	1	52.68
GGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAAC:2	+	chr3R	17605709	3'	-	Tabor	85	2	73.29
GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGC:1	-	chr3R	20499775	3'	-	mdg3	75	2	72.18
TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGCCGGCGTGTGTCTCTGATTATATCACCCG:1	+	chr2R	21908045	3'	-	roo	34	2	60.96
TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTCGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCAT:1	-	chr3R	15072544	3'	-	pogo	34	1	55.22
CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGCTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCACT:1	-	chr2L	14081308	3'	-	1360	32	1	52.63
AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAACAAAGAAAATATGATTTAATAGGTT:1	-	chrX	13704723	3'	+	invader4	3064	2	69.18
AATAAAAATAAATAAACATTTTGTATACGCCAAAACTAAAAACCTTAAAACCAGTAATTAAAGATCAAAATTATATTTCTGTTGTAGAACTGTAAATAATACAGTTACACATAAAATTTGATTATTAATTATTATGATTATTTC:1	+	chr2L	12389155	3'	+	mariner2	830	1	79.86
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCTCTTTCCAAC:1	-	chr2R	2016797	3'	+	1360	3380	2	72.41
AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAG:1	-	chr3R	9714378	3'	-	Stalker4	59	4	56.85
CTCTTTCTTGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTGGGGTTATAGGTTATTGGCCACTCGTTGTCTGCGTTTTCCCCTGTTCCTCGGATGGGTTGTGATCATTAAGCTCAAAAATTTTAATATCTGGAGGCAATAAGTAGAAGAAGG:1	-	chr2R	5396267	3'	-	F-element	348	1	52.74
CAGCTAATTCAGCGAACGCAATCGAAAATGCTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATGCGCAATGATTTAAACATAGAAACAGTCAACTATTAAAAAGAACTGCCGTCGATCCTCGTAACTCTCGC:1	-	chr2L	9621190	3'	+	Porto1	4317	1	77.40
GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGATTTTTATGGATCTTGTGTATTAAACAAGACTGTGTGTT:1	-	chrX	17756523	3'	-	297	8	2	76.71
AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACAAAAACAAACAGGCTTTGATA:1	-	chr2R	21572080	3'	-	hopper	24	1	63.41
AAATACGCGTTTTTTTTTATTGAAGAGAGCTTACGCTCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAACACGTCTGC:1	-	chr2R	5532365	3'	-	Doc4-element	56	1	58.22
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGCTTGTCTTTTGTAAATTGTTTAATTTTCTGCGATTTTTTTG:1	-	chr2R	18349323	3'	-	roo	76	2	74.13
ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAA:1	-	chr3L	10574286	3'	+	Tabor	7301	2	50.48
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAAATCAAACTCACGCTTTTGCTAAGCTAACTAAAAATGTATGCTTAGCT:1	-	chr3L	11530848	3'	-	roo	31	2	64.38
ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGATGGCATTAACTAATAGGTATGGGATAG:1	-	chr3R	9210573	3'	+	mdg1	410	2	76.03
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTC:1	-	chrX	10640028	3'	+	roo	332	2	67.81
GCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTG:1	-	chr3L	19013935	3'	+	invader3	5385	2	74.10
AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTAC:2	+	chr3R	16404576	3'	-	pogo	52	1	55.48
AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAA:1	+	chr2R	15064436	3'	-	412	65	2	63.01
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCTATTATACGTATAAGTTTTTCTTTACTGGAATACCTTTCT:1	-	chr3R	19446657	3'	+	roo	9032	1	46.48
GAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTTGCCATTTTTACAGTTTGTACTTCTTTAAGATACACATACTTACGTGGGTGGCATCATGG:1	-	chr2L	8501809	3'	-	G2	2977	1	58.33
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGAC:1	-	chr3L	15600189	3'	-	roo	8737	2	68.49
GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAGTTTTAAATGGAGTTATTTGTAAATTTAAGCATAT:1	-	chr2L	23313623	3'	+	S-element	1686	1	66.44
GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCGAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCG:1	+	chr2L	12328709	3'	-	hopper	31	1	56.04
TATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCT:1	+	chr2L	21153548	3'	+	1360	317	1	65.07
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGC:1	-	chrX	21087603	3'	-	mdg3	5261	1	58.06
ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGATGTTT:1	-	chrX	5629094	3'	+	jockey	4976	1	66.10
TCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATGGCGTATACGTATTATTTTTTGTGCAT:1	+	chr2R	9328742	3'	+	roo	408	1	80.77
GAGACAAAATCAGAACTGAATATAAAATACAAGAATTCAAACTTAGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATATAATGGGTTTTACTCCCTCACTGGCCACTTTATACGGAAAATTCGAAGTGGCCGTGCTGCTGTTATTT:1	+	chr2L	7207299	3'	-	gypsy2	196	2	50.71
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTC:1	-	chrX	5274289	3'	-	roo	8702	2	52.03
AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTAGCTGATGTACAATGAAGGGGGGGCGTGGCAATAGTCCTGGCATTTGGCGTCCA:1	+	chr3R	22217935	3'	-	hopper	17	1	60.61
GCTTTTATAGTTCCTGAGATCTACGGACAGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCGACGCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATATATTGACATTAACATTCAGCCTTTTACATTCTTTTTTTTT:1	-	chr3R	17437878	3'	-	INE-1	149	1	83.87
TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTCC:1	+	chr3L	21855555	3'	-	blood	12	2	71.55
GTTGTCCAGGTGTTTTGGCGAATCCCTTTCTTCTTAATCTCCTTAGAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGTCGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAA:1	+	chrX	3731457	3'	-	BS	4939	1	60.32
CTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGACGACGA:1	+	chr2L	2687432	3'	+	copia	5059	2	63.01
GAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATATATACACGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGAATATTCTCAGATAATCTTGGTCATGTCAGTCTGCTCG:1	-	chrX	22714996	3'	+	Bari1	1705	1	79.85
ATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGTAGCGAAGGAGATGAG:1	+	chrX	15946786	3'	-	INE-1	570	1	46.58
ATAATTAGGGAAACTATAAAAACTTTCGCTGCCATTAATGGTTTCTTCTTTTTAATTCACTTTTCATGTATACGTATAGCATCCTGTATCGATTATGAAAATTAAATAAATGTTTTGCTTTAATTGTTTTTCAATTTGCGGCAATT:2	-	chr3R	19441522	3'	+	rooA	25	2	76.03
GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAATTTGGAAGGC:1	+	chr3L	9673142	3'	-	Doc	57	1	51.03
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTC:1	-	chr2R	9328601	3'	-	roo	8697	2	53.57
CTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTATACTATACAGGCAGCGCCATCGT:1	-	chr3R	24455384	3'	-	Quasimodo	47	2	80.19
TAAAAATTAAAAAAAGAAAACATTTAATTAGATATACATATATGTATTTTTATCGATTTGAAGATTTGTTAGACTAGAGATACAAAATATTTTCCCCACACTTTCTACCCAATTGCAATTTACT:1	+	chr3L	13910356	3'	+	Doc	4696	1	67.74
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATTCAATTCAAATATTCTTCACTT:1	+	chr3L	10292915	3'	-	roo	48	2	52.74
CTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTGCCCATTTCGGGCTCTTATTTTGAGGAGCTTTTATGTATCCGCTGGCAGG:1	-	chr2R	3090488	3'	-	Doc	4400	1	54.95
CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGCAGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTG:1	+	chr3L	7188604	3'	-	hobo	66	1	72.44
ACTCTGTGGTGACCAACACCACTGAATGTTTCTGGCCCAATTAGAGGGTTCTCTGCCCCATTCCTTTTAGGTCCAGGGGCCCTACCCTGGCGACG:1	-	chr3L	24157427	3'	-	baggins	4955	1	66.32
GGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATTTTGCACAAAATTTCTCATCTGTTTCAAAGGTAATTCCATGTGTGTTGACATTTGGAAATGTAAAAGCTTTTCTATTTATTTTAAAGATTCAAAAATTATTTTTAGGCGAA:1	-	chr3L	17652856	3'	+	S-element	1709	2	74.66
TCATATCAAGGTGCGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGG:1	+	chr2R	17626898	3'	+	opus	7454	2	74.00
GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGTGTGCCAATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCAAATATCTTAAGATATTTTAAGATTGG:1	-	chr3R	3282481	3'	-	1360	63	1	77.93
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCT:1	+	chr3L	15600337	3'	+	roo	9030	1	47.83
TAATTTTTTTTTTCATTTTATTTTTGCAATTTTGACTTAAGCTGGCTAGTCGCAGAATCTTTAAAGCGCTTAGCCACATAATATTTAACTGGAAAGTTGACTTTCTTACGATAATATCGATAACTTATCGAAAC:1	+	chrX	3292017	3'	+	INE-1	474	1	76.12
TAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGCAAAATAGGACCCGCCAGACCGGGGTGCTGCCAAAGGGTGGGCGTGTTTTCCGAGTTTCCCAGAGCTTTTC:1	+	chr2R	18527147	3'	+	jockey	4886	1	65.79
GAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCAAGTCTACCCGCAATACAAACACACTTTGGAG:1	-	chr3R	4565289	3'	+	1360	3311	1	75.71
TAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGACACTGGAAACTTTTGCG:1	-	chrX	5663100	3'	-	P-element	201	1	39.06
GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTCCTTATTTTGAACTACTTATTGAGCAGTACTGCACCCACTGTACGAACAC:1	+	chr2L	12250124	3'	+	1360	3333	1	63.91
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAATAAAATG:1	+	chr2L	14772153	3'	-	roo	19	2	67.20
CCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACACCTGAAGGTTAAATGGTTATATACATCTATTATTTGTTTTCTTTGTTCAATTATAA:1	-	chrX	22897592	3'	-	Bari1	63	1	60.00
GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAAGGTAAGTCGAAGGCCCCTCAAATTCAAAACCCCATAGTTCAAAACATTTTGTGGGCAAATGCAAATTTATTGCAACTAGTTGAGGAT:1	-	chr2R	21911996	3'	-	jockey	4741	1	65.07
AGAGAGTCAAGATAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTATAATGATTTAAGATAAGGGGTAAAGTTAGATGGTTTTATAGGAGTAATTGAGCAGG:1	-	chr3R	1850538	3'	-	Cr1a	4227	1	76.71
GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAATTGTTCATTTTATACGATATAGTAC:1	-	chr3R	17478314	3'	+	copia	247	1	79.45
TAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATGAATATTATGTGTGGAACACTATCTGAGATTCCGACTGTTCGGCTAT:1	-	chr3R	18585757	3'	+	P-element	2763	1	33.08
AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAA:1	+	chrX	7195095	3'	-	P-element	56	1	28.57
AAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGACTTCTTTACCTGGCTTATGCGATGATTATAGCACTATAACAACTTGCATTTTTTC:1	+	chr3R	21744866	3'	+	Ivk	420	1	78.08
AGCTGTGAGAAACTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGCTTGTGCCTTGGGACAGCTTAGTGCACTTTACCAATAGGTGGTATTAAGCTTAGGTAATCAAGCATTGTTCGAAAATTCAATACTGCTTAAATTAATATATATGAAT:1	+	chr3L	2718173	3'	+	R1A1-element	218	1	49.66
TATTGGTCATTTATATCCGGAGGCAACGCATAAATGAGAGACGACTACTGGCCGTACACTATCCCCAACTGCGACAGAAAATTCGGAACCTCGAAAACAGGCCGAAGAACTTGGGAATATTTAAGACATCGA:1	-	chr2R	4032658	3'	+	rooA	7169	1	50.76
ATATTTTTGAAGTTTACTTTTAAGATTAAACTAATTAAGAGTATTACAAAATTTTACATCAAAAAGGGTGCTCTTGGCAAAATAATTTTATATTTAGTCTCCCAATGCACAGAGTTCTCTTTCTTCTTAGCCAAAATTAAGTGGCT:1	+	chr3L	4676188	3'	+	hopper	177	1	65.75
ATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTATTGCATAATTTTAGCACGCGCCCAGTCCCCAGCCCCTGTCACGCCTC:1	+	chr2L	15833562	3'	+	jockey	4987	1	67.74
TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAATTGTTTAAT:1	-	chr3R	16076758	3'	-	roo	8705	2	59.59
AAACAAAAAACAAAAAAAAAAATTGCAAGTGCAATTGTTTTGCACAGGCAAACAACAAAAGTGATCAGCTCGATGCAAAAATGTCATTTCGAGAATCAAACTAAATTACGAGTACCCGATGTGAATTCTGTGGAGGATTGGG:1	+	chr3R	22636089	3'	-	hopper	145	110	61.27
ATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTG:2	-	chr3R	4604451	3'	-	1360	346	1	73.60
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAAATAATTTTATGTTTAT:2	+	chr3R	16404595	3'	-	pogo	33	1	63.70
ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGACGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAAT:1	+	chr3L	9673133	3'	-	Doc	65	1	55.56
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCT:1	-	chr2R	9632083	3'	-	roo	7	2	73.08
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGA:1	+	chrX	7256195	3'	+	412	7477	2	67.14
GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAGGTCTTAACACGCATATACAAATATGCCAGACACACACTCAC:1	-	chr2L	17081735	3'	+	jockey	4979	1	71.03
AGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACCATAGTAGCTCCGTTTTATTCTATGATCGTTCTTTAAGATTATTCAGTACAAATTATTTAATCTTAAACAAGTTAGTAATTAGTAATACACGAGTGGC:1	-	chr2L	22579760	3'	+	Chimpo	157	1	77.93
ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATT:1	+	chr3L	17560375	3'	-	pogo	67	1	64.38
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAACTTGAAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGCTCGTTTATGTGCGGAATGG:1	+	chr3R	22122759	3'	-	roo	56	2	73.87
AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGCGAAACAAAAA:1	+	chr2L	544879	3'	+	412	7492	2	56.55
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGCATTTATTCAGTCAAACATCAGAGCGTCGAAGCTATTATTGAAA:1	+	chr2R	9868633	3'	-	roo	8736	2	70.55
TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGCCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGC:1	+	chr3L	27391411	3'	+	1360	3360	1	59.29
GGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTTTCTTTAATATGACTTTTGTACTTTCATATTATGTCTAGAGACAATAAGGCACACTAGTATTAATA:1	+	chr3L	13054710	3'	+	1360	451	1	67.81
GGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGG:1	+	chrX	21667938	3'	-	gypsy2	58	2	69.12
TCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGTGAGACGGTTGTACATCGGTCGGTGGAG:1	-	chr3R	13822508	3'	-	hopper	83	1	78.10
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGGAATTTAATCCATGATGATTGGATGCAATATGTAATATATACTAAAGGCGCTTTATTTAATC:1	+	chr2R	20596560	3'	-	roo	8721	2	60.96
GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCTT:1	+	chr3R	29361078	3'	+	mdg1	380	2	53.62
CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCACAAATTTATTTTCTCGTCGGTCACCCTGAAAAGTATGCTACATTTT:1	-	chrX	17054170	3'	-	jockey	35	1	61.59
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCGCTAAACAAAACAATAAATAAACTTAAAAATGAAAAACACAACTTAACAGCTGAAAGAAAGCCTTTACGACCGCAAAA:1	-	chr2L	17471572	3'	-	roo	8696	2	60.74
ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTGTGTGTATGGGTGGTGAAAACAAGGCCAAGACAAAG:1	+	chr3L	7292849	3'	-	HMS-Beagle2	6908	2	73.53
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGG:1	+	chr2R	13710687	3'	+	roo	9019	2	52.74
TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTAACTTTGACCCCCTTTTCATT:1	+	chr2L	16067196	3'	-	297	6597	2	69.75
GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAACCTTTT:1	+	chr2L	15833088	3'	-	hobo	63	1	60.96
CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGCTATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATGGCCCGACGGAT:1	+	chr3L	17115566	3'	-	blood	37	2	58.90
AAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTA:1	-	chrX	13704778	3'	+	invader4	251	2	73.79
AAGTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACA:1	-	chr3L	27415229	3'	+	transib2	2748	1	69.18
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACCATCTAATTGC:1	-	chr3R	30344601	3'	+	pogo	2052	1	55.48
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGTCAGTCTGCGTCACAGAAGCG:1	+	chr3L	1534718	3'	-	pogo	29	1	70.00
AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGATACAATCAAGTGCGTTCCATA:1	-	chr3L	11441694	3'	-	roo	8691	2	65.75
TAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTGGAGACAGCGCTAGTTTGTTGACCCAAACCACCCAAAACTGCCACGCCCACTTGAAAAATGTGTCAACTGGAGAAAACCAAAAGTGAAACTTATTTAATTTACGAAAAC:1	+	chrX	21309490	3'	+	INE-1	164	1	65.75
ATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATGAATAGAAATCGAGATACGATTCTCCAAGTAG:1	+	chrX	2436926	3'	+	roo	8782	2	72.17
AAAGCTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTGATGTTAGACAAACATCATGCACTAACTTCTGGTGATCTGTGCTAAGGTACAGTAAATTTGTTTAGGCTTCCGCCTATAAAGCGCTTGA:1	+	chr2R	1513426	3'	+	1360	3139	1	58.74
CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCA:1	+	chr3L	17560389	3'	-	pogo	53	1	54.79
AACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGCTACTACGCCTCCAAGCGACTAAAC:1	+	chr2L	4795882	3'	-	Max-element	8396	2	73.40
ACTGCCAATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAAATAACGTAACATAGTGTAGTTATTTTATTTTATTATTAAAAAAAATTTTTTTTGTCTTTTTG:1	+	chrX	13139125	3'	-	gypsy11	4059	2	73.97
TTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTG:1	+	chrX	21947695	3'	-	mdg1	26	2	67.74
TCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAGAAGTACAGGATATAACATATAAGTAAATACAATATAAGTAACATTGACTAAGATAAGACTAAGTTTAGTGATTCGATAATAATGATTAGATGTACATGAAAG:1	-	chr3L	4539064	3'	+	roo	48	2	68.28
ACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGCTCAAGTGCTGCTCGGCGATTTTGAAGGTCTGGACAGATTTTTGGGTTCAAAAGGATATTAAGT:1	-	chr2R	20991440	3'	+	R1A1-element	5063	1	55.56
AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCG:1	+	chr2L	21400375	3'	+	mdg1	7415	2	63.30
CTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGTAGCGAAGGAGATGAGAA:1	+	chrX	15946788	3'	-	INE-1	566	1	45.83
CAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGTTCGCGGGTAGGAGCGGGGGAAGTAGAACCACGCAATTGCTAGAAATGTTAAATGTAAATGACCTGCGACGCGGCCTTCCTGACC:1	+	chrY	996325	3'	+	invader1	3699	2	52.07
TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGTGGGGCATTGGAGCATTAAA:1	+	chr2L	17081881	3'	-	jockey	4717	1	49.66
ATTTAAGTGTATAATTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATTTCGCATTGACAAGAGGATTT:1	+	chrX	6279423	3'	-	P-element	43	1	36.11
TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGG:1	-	chr3R	13360282	3'	-	jockey	24	1	67.52
GGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTAAATCCGAAACAAATAGAATGAAGCGAATAGGAAAACTAAAGGGTTTAGCTTAGAAATTTAGCAACTAAACGTGTGATTTTCATTTTTAGGGAAGCCTGAATATTTAA:1	-	chr2R	9499960	3'	+	G5	4785	1	50.00
ATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTACGTAGTGTTGGTGTCTTATATATTGTATGTGCTTCTTAGTAAATGCTGTCAGTGGAAATTTTCAAGTACTATAATTTTAAGAA:1	-	chr3R	13855478	3'	-	I-element	5026	1	50.69
AAGAAGGGGACCAAGATGGCTTGGTTGTGGACACCGGATGTGACTCGGAGAATACAAGATAAACAATTTTTAAAGAGGATTTGTTGGGTCCTGCTCAAACAGCTTAACAGCTGTTTGCTCATTACAAAA:1	+	chr2R	4517007	3'	-	Q-element	498	2	65.89
TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAAT:1	+	chr3R	20427487	3'	-	jockey	29	1	63.64
CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACATGATCTCTTCAATAGT:1	-	chr2L	7888124	3'	+	pogo	2053	1	70.83
AATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTAATCAGAAAGGAAAAGTTGGGGAAAAGTGTGAGGTGAAATTATTATTAAGTGCTCGCCACGA:1	+	chrX	21019978	3'	-	Transpac	4807	1	57.78
GCAATGTATGGAGAATGGGAGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTTATAAAATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTAACATTATAAAAATAAATAATCCAAGTTCCGAGTTCCTCGGCTACTCGAT:1	-	chrX	19243701	3'	+	mariner2	745	1	76.92
CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAAATCGATTACG:1	-	chr2R	24218488	3'	-	412	6	2	76.19
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCTATTTTCACTTGCCATTAAGACAAGCCAATAACATTTTCTTTATTTCAGCATAATGATGTTATTTAAATATATATATTATGA:1	+	chrX	21973946	3'	+	pogo	2064	1	59.59
TTGTTTAAACTACTGCACAAATCACCAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTAAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGTCTGGTTTAAATGTATTTTTTGGCAGGCCAAAGTTGC:1	-	chr2L	11569644	3'	-	Cr1a	155	1	76.03
GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGTCGTCGT:1	+	chr3L	16343315	3'	+	roo	379	1	59.17
GCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGAGCAGTCGAGTGTGGCCTAGTTTTTGGGTTCAAGGGACAATGAA:1	-	chr2L	2687352	3'	-	copia	4932	2	65.91
ATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATA:1	+	chr2L	20117926	3'	-	invader4	41	2	72.38
AAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAAAAAATTGTATATTTCTTTAATATATGATGAAAAGCAGATAAATATGGTTAAAAAATCAGTAATCAATCAATAGTGTTTGCGGTGTG:1	-	chr3R	11105897	3'	-	Doc	2	1	41.10
GTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATC:1	+	chrX	21564747	3'	-	diver	62	2	65.47
TAATTATATTATTTAAAAAAAATGTGGCATTTAGTAATCATATAAAGAAAACGAGGCATATTTTTTGGACAGTAGCTCGAGCAGCTTCACCCGGATGGAGGTGTC:1	+	chrX	8558239	3'	+	HB	1544	1	63.81
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGACAACAG:1	+	chr3R	27994252	3'	+	roo	327	2	78.10
GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGG:1	+	chr3R	7482806	3'	+	412	410	2	84.06
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGG:1	+	chr3R	7100906	3'	+	roo	351	2	55.48
CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACC:1	-	chr2R	2016835	3'	+	1360	3379	2	60.76
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTT:1	-	chr3R	7835089	3'	+	roo	9036	1	59.59
CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTC:1	+	chr2L	11518462	3'	-	412	7139	2	75.34
AGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCTTTTTATGTTTAACATTGTTATATCAAGACTATTGTCTATGAGACGGGTCCTGTGG:1	-	chr3L	2129080	3'	+	pogo	1894	1	76.03
AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACAACATGCCTGCCAACGGGGACTGATCAAGACTGAGAGGTACATATAAATATAGGTACATATAAATTAAGAAGAGTAAGC:1	+	chr2L	21577789	3'	-	Doc	45	1	28.83
CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACCAAATTTACCCATA:1	-	chr2R	9220993	3'	-	opus	7031	4	63.16
TAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAATCGAGCACAGCAAAATCCACGCCGGCTACTTTCATACTGATAGGCTAATTGAAAATCTATG:1	+	chr3R	5139176	3'	+	G4	3802	1	52.34
TAGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTATCTTTCTCTCATCCGCCAGGCCATCGCCATCGCCTGCATTGTGCTATACGAGACGGTTGGAAAC:1	-	chrX	9071945	3'	-	Ivk	420	1	50.00
TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGA:1	-	chr2R	19050227	3'	-	roo	3	2	56.25
GGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATCTTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTAAAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAACACAAAGAATTAAATTAACTCACACATCTTGCTTGATATGTCATCAATCGCG:1	+	chrX	20645661	3'	+	1360	3083	1	71.92
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATA:1	+	chr2R	8585499	3'	-	roo	88	2	78.08
TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATTGGGACTTTAGTAAGCAAGCTAGCTTGTTTCAACAAAATATCAAATA:1	-	chr2L	15237064	3'	-	jockey	4812	1	66.44
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCACTGTCGCCTCATATCTGTGAATTCCTT:1	+	chr3R	22844332	3'	+	roo	396	1	75.34
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCAT:1	+	chr3L	11530958	3'	+	roo	8990	2	73.97
CACTAGCTGAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTAGTTCAAAATAGATAGATATTCTTTCTAGTTCAAAATAGATAGATACTCGAAAGAAAACAGCGTACCATAAAGGGGAATATGGTAGAAA:1	-	chrX	22596351	3'	+	INE-1	541	1	68.49
AAAAATAAAAATGAAATAAAATGGCATAAAAAATGCAACAGTTCAGTGAGATAAGCACGAAAAAGCCAAGATAGCCCGAAGGCTAAGGAAGATGGCTAAGAATGAAGAGGATAGATCTCGTTTTGCCGCCTCTTG:1	-	chr3L	20920836	3'	+	Tc3	1570	1	54.07
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGCAGCCCTCCTCGTCC:1	-	chrX	13504126	3'	-	412	7084	2	62.59
GCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTAGATTCATAAAACTCTGCCAATTATGCGAACATTCATGAT:1	+	chr2R	9258524	3'	+	3S18	6037	2	69.17
ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTTGAGCACGTTGAATG:1	+	chrX	9540152	3'	+	roo	9061	1	76.30
GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGTTTTTGCATTTACATTCTAATCAGCTATTAAACTACAATTATTTAGT:1	+	chr2L	17079881	3'	-	jockey	4696	1	70.55
CAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTC:1	-	chr3R	25423184	3'	-	3S18	47	2	50.68
ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTCGATAGGCAGGTACAGGCCCATTTCTCGATGTGTTCTAAAAATTTTCC:1	+	chr2R	19499410	3'	-	P-element	43	1	49.63
ATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAACGAGCCAACAGAGATGGGTGCTAATGAAAGAAAATAGGGGCAGCATATATATACGAAGTTTCAAATACC:1	+	chr3L	12160818	3'	+	G2	2960	1	49.62
TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATC:1	+	chrX	21014868	3'	+	copia	229	1	60.66
TATTTTCACTCAACTTAATTTAGTAAATTTCAGCTTAACATCTAATTTCAACATAAGAATTTCTTAATCTTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTG:1	-	chr2R	545171	3'	-	Bari1	1462	1	52.05
CATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATATTTAAATTGATTCCGATTG:1	+	chrX	20870166	3'	+	gypsy	386	2	69.18
TATTATTAATAATATTATTATTAGTATAATAAATGTGCATGGTACTTTTTTCGAAAGATATCAAAAGTTATGTGCTCAGAACTTTGTTTTTATAATCAATCAATTCATAACCCATCTGTGCTCAGTACACACACATGCTAAGACT:1	+	chr2R	14445607	3'	-	mdg1	7078	2	60.00
ATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATCATTATATATATTATTATTGGGACGAATAATG:1	-	chr2L	15247930	3'	-	Transpac	84	2	78.77
AAGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAAAAACTAGAGAAGACAAAAACGTGAAAACATAATAAACTCTA:1	+	chr3R	1966492	3'	-	1360	3179	1	68.89
AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACATTT:1	+	chrY	3648887	3'	-	Transpac	67	2	63.70
TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCGTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCC:1	-	chrX	2518063	3'	+	P-element	2789	1	19.86
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGTTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCG:1	+	chr3R	27994281	3'	+	roo	9052	2	59.05
AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAGAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGGGACGGTGAGATT:1	-	chr2R	4830338	3'	-	1360	78	1	91.94
GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGTTCGTATTCGTTTTGGTTTTCACATTTGTGCCA:1	+	chr2L	11661065	3'	-	F-element	25	1	62.33
ATTGGGGCGGAGTTGGGGCACACCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTTGCTCTTTATTATTATATCCGGCTTACGTGGCGTATGATGAACACGTCTATCGG:1	+	chr3R	20150577	3'	-	hopper	124	1	56.25
CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTT:1	-	chr3R	6290952	3'	-	Doc	59	1	57.93
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGGAATTTAATCCATGATGATTGGATGCAATATG:1	+	chr2R	20596530	3'	-	roo	86	2	81.38
CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAG:1	+	chr3R	27994296	3'	+	roo	9031	1	56.03
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGGTCCTACT:1	-	chr3L	11530909	3'	-	roo	8712	2	79.41
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGGTAATAAACTAAAAATAAAGTCAATTATTACGCTATTAAGAGCAGTTGACTTTATGCGGTGGCAGCAAATGCTAT:1	+	chr3R	28624673	3'	-	roo	8711	2	53.42
CAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTATCTCTGGGTATTGATGGGCGGGCTCACTAGGGTTGTACTCTTCCGGCAGGACTGTGTCGGTCCTGGGCCTGTGTGCCTTGCTAATCCACTTCCTCA:1	+	chr2R	2903611	3'	+	1360	491	1	33.56
AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCTTCACCTTGTTCCACTTGTAATGTTGCTGTCTTCTTTATGACTTTGTTTCTGGCTCTTAATTAACAAACAAAGCTACTGGCTTC:1	-	chr2L	11674631	3'	-	jockey	97	1	58.22
CAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTTGATTCGTTTG:1	+	chrX	12074615	3'	-	412	143	2	62.33
GAGAATGATATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATGCTCCTTTTGAATTTCGCTCCTGGTTTCACTCG:1	+	chr3R	7037652	3'	-	INE-1	573	1	51.47
CCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTAGCACTCACCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTTGAATATAGCATTCTTTCTTGTTAGAATTTAAGGACTAACCAATTAAATTTATTACACTCCACAACTTAAGTA:1	+	chr2R	5780607	3'	+	INE-1	513	1	77.08
CTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTATTATTAGATAATTATTTTGACATATATTTTACT:1	+	chr3R	13356667	3'	+	jockey	4899	1	80.69
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTT:1	-	chrX	14336437	3'	+	roo	9026	1	72.55
ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGTATAACATAGAAAGATACCACATTGATGGCTCGTTACCAACAAATTGCATTGAAGTCCCA:1	-	chr3R	13358536	3'	-	jockey	4767	1	55.37
GTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCA:1	+	chr3L	20168422	3'	-	mdg3	92	2	78.08
TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAA:1	+	chrX	17963947	3'	-	jockey	4807	1	58.87
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTTGAGTTAGTATTTTAAAGTGATCTTTTAAATTTCATGGTTGTTCAAATCGGCGTCAATTTATTTTGTTGAACTTTTTTGTATCATTTTG:1	-	chrX	17526792	3'	-	roo	8682	2	60.96
ATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTGGCGAGTCTGCCTTACTCACATTGCCATTGCCCC:1	+	chr2L	9562512	3'	+	transib2	2658	1	68.81
CCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCTAGTTTAAGGCAAACTTCTAGCGACCGGTAAGCACCAGAAATATCAACTATTTGTAAATTAAGTACAGTACATTTTTTAAGTA:1	+	chr2L	6633071	3'	+	Burdock	280	1	60.27
CAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGA:1	-	chr2R	1320658	3'	+	diver2	325	2	52.74
TAGAAAACATTTATATTTAAAAAGTGAAATCAGTCAGTTGATTATATGTACTCTGATTAGGGTATCCTGAATGCGAGTTCACTTTAAAGTTCCGACTCTTTGCTTTCCCT:1	-	chr2R	15987919	3'	-	TAHRE	10154	1	76.36
GTATTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTCCTGCCCAGGTATTGGCGATAAGAAATTCCA:1	+	chr2R	10938472	3'	-	accord	7031	2	76.92
ACAACCACTGCCGTCACATGTTCACTAACCTCTAAAATACACCCTATTGAACACATACATATTTAATTCATGCAATAACACTTATATCGATAGAATGAATTGTCTTGTCTT:1	-	chr2R	1264057	3'	+	accord2	7356	1	55.86
GAAATCAATTCTGATCGAAGATCCGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAAAATTTTTTTCCTCCATTAGGGAGCTAAGCTAAGAGCAAGCGTAAGACAATGCAGT:1	-	chrX	897052	3'	-	1360	3172	1	66.43
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGT:1	-	chr2L	17420148	3'	+	roo	349	2	60.69
GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATCTTTATCATAAAGTACCCTTGTGCCATTTACTTGAATATAT:1	-	chr3R	9456643	3'	-	jockey	4744	1	70.00
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCG:1	+	chr3L	16343307	3'	+	roo	387	2	60.58
TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGACATTTGGTTCACTGTCATATTTGCCAAGCGCTTCACATCAAATCGCAATCAGGCTGGATTGATGGAAC:1	+	chr3L	15490425	3'	-	copia	4875	2	73.00
CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTT:1	-	chr3R	21705991	3'	-	297	27	2	55.00
TAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAACAAAGAAAATATGATTTAATAGGTTGCAAATT:1	-	chrX	13704716	3'	+	invader4	3071	2	73.97
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACCGAACTTTTCCCAACTACTTTGTTTAACTTTCGATAA:1	+	chr2R	19004260	3'	-	roo	33	2	64.38
TAGGTANAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATTTTTGGTTCTGTTTGCAAAG:1	+	chr2R	5485256	3'	-	blood	7027	2	73.97
ATGTAACTTGCAGAAGGAAGCGATTTCTACCACATAGAGCATAGCGTATAAAGTATATATATTCTTTATAAGGGATATATTGTTCTATATCGCTAAAGTAGAGTCTTTGAACATTTATGGTAAATCAGTTGCATACGGACAGA:1	-	chr2R	5507021	3'	+	INE-1	30	1	51.05
AAATAATACCGAGCTTCCACTGTAGAGGAAAGTATTGCAGCCTCACCATGGCGTTGAATAAAAACGTAATGTAGAGGATCGCATACCTCGGTAGTGCCTTTATGGTGCAGATGCAGTTCCGTAAGTGACTGTGGTTAATTTATATG:1	-	chr3R	19445486	3'	-	BS3	368	1	73.29
GGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATA:1	+	chr2L	19965029	3'	-	Doc	105	1	80.82
ATATATTTTATTAGTTCAAGTATTTTTATAATTTAAGTATATACATGGGCAACCTTGAAACGATTGTTCTCTCAAGATCAAGAGTGAACTACCCTGCCTTGTTGTGGCAAGGGGCACGCACATGCATCATGCAACATGCAACAGCG:1	+	chr3R	30255765	3'	-	G7	1166	1	77.40
ATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATGGGATCTTTAAAGGGGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATAT:1	+	chr2R	4774747	3'	+	baggins	5336	1	65.75
AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCAACTTTGTGC:1	+	chr3L	9907401	3'	-	BS	5014	1	66.44
CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGC:1	+	chrX	7195089	3'	-	P-element	87	1	18.46
AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTTGTGCTCCTTAATGCT:1	+	chr3R	20868248	3'	-	BS	5015	1	70.55
GAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTGCATTCGGGCATAGCGGCAACATACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGATTTTCAAACGAAA:1	+	chr3L	2486024	3'	-	jockey	4539	1	49.32
AATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGTTAAAAATTATTTGCTTATTCTGTGCCTTGATCCCACTGTTCTTCAAGTGAATTGCCACCTGAGACAATGTAATTTTTGAATACTTCATCGGTT:1	-	chr2L	17084271	3'	-	jockey	4906	1	67.81
CGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGAATAACTCAATCTCAATCTAAGCAGCGAGTACGACTACAGCGGAAGTGATAAGCAGC:1	+	chr2R	14286327	3'	+	R1A1-element	5333	1	60.00
AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACAC:1	+	chr2R	13006504	3'	-	3S18	41	2	56.36
TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAATCATAACTCCAAGTAACTATTTTACGAAACAACA:1	+	chr3R	6611329	3'	-	HMS-Beagle	6803	2	73.64
GGGGGGATCATGGGGTATTTGAGGGGATCATGGAGTATTTGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATGTGTGACTGCAATTAAACTGTGTGACTGTATTTAACTTAA:1	+	chrX	22491154	3'	+	R2-element	1	1	56.16
AAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCT:1	-	chr3L	15519756	3'	-	pogo	69	1	66.44
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGAACTATTTACTTCCGAAAACTTAATAGTTCACTATGATTGCAAGTTGCAGTTAATACTAGCATGTGACGTCCTGTATTAAGTGTCACAATGTTCGAATTAGTGTAGC:1	+	chr2R	4549686	3'	-	roo	8680	2	73.29
AGCTTTTAAAGTTCGTGAGATCTCGACCTTCATGCAAACAGATCTACTCGGCTATTGATCCTGACAGAGTTGACGAAGGACCAAAATGTAGAGACGGGCAATGAAAACACATCTACATTCGTTTATTTATTTTTTAAAACTAATTT:1	-	chr2R	4906401	3'	-	INE-1	150	1	71.92
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAA:1	+	chr3R	17817988	3'	-	roo	58	2	58.90
GGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTCACATTTATTAGAAGCCATAGCAATGAATTTATCAAACAAATCTAAAAAAATCTCTTTCTTGAACGGATGCAAATAAAACTAGTTTTTAAAGTTTTTAAAATT:1	-	chr3R	31109601	3'	-	I-element	16	1	71.23
AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACG:1	-	chr2R	9662739	3'	+	412	7486	2	78.50
GGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAAC:1	+	chr2L	10037394	3'	-	Quasimodo	77	2	73.61
AATTAAAATTAAATTAATATTAATGCAATTAAATTTAATTGCAATATTGAAACAAGATATTAAAGCAAGCAAACTAAACTAACAAAACAGTAGTTCCCAGTAGGAAATGAAACACCTGCTTTTATCCCTTGTAGGCAAATAGTTCT:2	-	chr3L	9546658	3'	-	Rt1b	123	1	76.03
GTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAAT:1	+	chr2R	20194305	3'	-	Max-element	8273	2	52.34
ATATATACATATATACATATGTATATATATTTCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCC:1	+	chr2R	10594194	3'	-	G3	4505	1	55.40
GTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAATCAGAACGGGGTAAAGTTAGGGACCTTGCCTTGGTTTATCGTTAAACAAAAGTCAACTGATCTACGTGGAAG:1	-	chr3R	18586188	3'	+	P-element	2572	1	51.43
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTCTAAAGAACCTTTCT:1	+	chr3L	15600378	3'	+	roo	400	1	65.75
TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTT:1	+	chr3R	28075416	3'	+	jockey	4943	1	50.68
TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATCAAAACGCATCTGCATCCCAA:1	+	chrX	21014888	3'	+	copia	225	1	64.38
TACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTAATACAACCGTTTGAGTTTAAAAAAAAGTGCTGTGTCAG:1	+	chrX	21429563	3'	-	hobo	280	1	72.14
TCTATTNTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTATT:1	+	chr2R	4206663	3'	-	1360	315	1	76.03
ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1	+	chr2L	5069689	3'	+	flea	5000	2	78.77
GATGTATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACA:1	+	chrX	13874136	3'	-	blood	173	2	75.56
GTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAAGCACGAAGTACGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTGCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATA:1	-	chr3R	25504188	3'	-	1360	492	1	78.08
TTTTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAAATAGCAAAGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTTTACGCAGCTTCGAGTTGGAATGCTCCGAGCAACATGTTGAAGAAA:1	-	chr3R	5283875	3'	-	Tc3	1631	1	63.93
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAG:1	-	chr3R	7482748	3'	-	412	46	2	58.47
CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTACATATATATCTGCATTTTATTACAACTTGTTAATCACTACAATAAGCATCTCAAGCGCACATGCTTCTCAAGAAAAGCTGAGAAAATAACCAAATAATGTTCG:1	-	chr3R	6664897	3'	-	I-element	14	1	76.03
GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTACATATATATCTGCATTTTATTACAACTTGTTAATCACTACAATAAGCATCTCAAGCGCACATGCTTCTCAAGAAAAGCT:1	-	chr3R	6664921	3'	-	I-element	38	1	59.59
AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATT:1	-	chr3R	19589889	3'	-	BS	5031	1	57.24
ATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAATATATTTATGTAATTGTAGCTCTAAACTTGAAAATACAAGTAAGCTACTCAACATTCCCACAACGTTACT:1	+	chr3R	7355624	3'	+	accord	354	2	54.48
ATACACGTTACTCAGCTATTGTGAATGCGAACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATTGGGTGAGTGTTACTTATGCAAAAGTAAATTATCGACTAAATAAGAGAAATGGAAGAAATG:1	+	chr3L	25971493	3'	-	INE-1	540	1	63.50
AGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCCCACAATTTTTGGTATCGT:1	+	chr2L	15332572	3'	-	jockey	4549	1	60.80
ACTATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTTTTGTCTTGAAAACCT:1	-	chr3L	23818334	3'	+	copia	227	1	56.85
AAAATGAAAAAGTAAAAAAAAAAGAAGAATACCTAATGCAAACCGAATAAAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGTTCCGAAATTGATGTCGAAATATATAA:1	+	chrX	18828851	3'	+	Doc2-element	239	1	75.73
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGGAGTCCTTCGGA:1	+	chr2R	2016906	3'	+	1360	3363	1	49.49
AGTGGCCGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTTGAAGTTGAAGTAGTAGCGAACTAATTACCTTTTACATACTAA:1	-	chrX	22738539	3'	-	297	12	2	74.17
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAAT:1	-	chr2L	16091881	3'	+	roo	360	2	50.68
AGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCG:1	-	chr2R	8585406	3'	+	roo	401	1	75.89
ATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCATCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTCCAGGG:1	-	chrX	20453678	3'	-	INE-1	540	1	78.08
CGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATGGAGGAACGTGCGCGTTTCACTGCCTACAAGCTGCGAGTCGAGAATC:1	-	chr2R	17725983	3'	+	jockey	230	1	55.24
AGTTTGAGATTTTCCCTAAGTTTGGATCTCTCCGTACGAAGAGAGGATCGAGACCATCTAGTTGTCTTTGGACTATTGCTGATGCTTTCTAGGATCTTAGTTTTGCAAGACGTTTCTCAGTGAGCGGGAGGATCTGACTCCTC:1	+	chr2R	24039617	3'	-	G-element	3858	1	67.13
CCAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATAAATCGTAAGGACGCTGTTTTCTGAGTTCGATTTCAGTTCGGATAGTACTAGTTAATCTGTCATCCTTAAATTGCCCACTTAAGGCTGATCATAAATACTTT:1	-	chr2R	5269020	3'	-	Cr1a	4328	1	72.14
GATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATGGAATGAAATAC:1	-	chr3L	7292418	3'	-	HMS-Beagle2	6894	2	79.86
GAAATATAAAAAAATTTATTTATAAAGAATTTTTCTCACTCTAATATTTAAGGCAACATCTTTACGAATAAAAATATTTCATTTGCAATTAATAATTTATTAAAAGTATTTTATAACCATGTTAATATTTAAAAAAAATCTCAGC:1	+	chrX	7824392	3'	+	transib4	2282	1	51.03
TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGGTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGTC:1	-	chr3L	10574274	3'	+	Tabor	433	2	50.68
TAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGGTGGGGTTATGAAAAGCGAATGCTTTTGAGATTGCAC:1	+	chr2R	9463528	3'	-	rover	19	2	69.63
ACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGCACAAGAAGGAAAGAAGGGAATTTCTGCTGGAAAACGAACCGAAGAGAAAATAAAATAAATTGCATCATAAAAACGGGCCG:1	-	chr3L	2840648	3'	-	copia	152	2	65.79
AAAAAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTAAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCTC:1	-	chr3L	24565352	3'	+	hopper	1409	2	44.95
AATAAGAGGGTATGTAAGGGGATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACCCAATC:1	+	chr2L	20840517	3'	-	Transpac	10	2	70.71
GAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGCAGGCGGTATGGCATAGTACGATACTAGGTAACCTCGACATGTTTATGAGCGTCTAAACCATGGA:1	+	chr3R	22843021	3'	+	roo	75	2	50.76
CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTACAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGA:1	-	chrX	18193656	3'	-	jockey	30	1	54.13
GTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAACATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCC:1	+	chr2L	22224604	3'	+	Rt1c	5419	1	60.48
AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTT:1	+	chr2L	14081363	3'	+	1360	3358	1	82.67
ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACC:1	+	chr3L	11257395	3'	+	1360	3374	1	57.50
CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCACAAAA:1	+	chr3R	7482822	3'	+	412	7508	2	65.14
TGTTTTCGTGCACAGTAGTTTGATTTTGGACAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTATATATTGTATCTGTTGGCTGCAGGCAACCCTTGGATA:1	+	chr2L	17662681	3'	+	Cr1a	400	1	66.67
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTT:1	-	chr3L	21817992	3'	+	roo	8991	2	75.34
AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATT:1	-	chr3R	22821983	3'	+	mdg1	7414	2	50.00
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAATACATACTAGAATATATGTGGGTT:1	-	chr2L	13763134	3'	-	pogo	47	1	53.42
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATG:1	+	chr2L	3114562	3'	-	roo	8740	2	69.86
TCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACGCAGAGATGGGCTGCTGCG:1	-	chr2L	2122348	3'	+	Stalker4	399	1	73.88
CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAGATCGGCGACGGGATCTGCGTATTTGGCTAGTGATGCTGTGAACAGAACGCACTCGTATAG:1	+	chr3L	15995407	3'	+	297	6906	2	56.43
ATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTT:1	+	chr2L	6570013	3'	-	jockey	4859	1	65.00
GACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCATACGCATGTATATCTATATTAATTTACTCACCCTGATGCTCCTTGGTTGG:1	-	chr2L	17411600	3'	-	roo	8847	2	60.63
AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAAATACTAAAAAGCCCC:1	+	chr3R	17243263	3'	+	hopper	1412	2	78.83
CATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACGTTAGGGAAAACTGCGAAGCTGAAACAGGAGCGGAG:1	-	chr3R	12889812	3'	+	roo	54	2	74.29
AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCG:1	-	chr3R	11083899	3'	+	412	425	2	68.66
AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAACTTTTTT:1	+	chr2L	21884609	3'	+	pogo	2038	1	63.70
CAAAGATAACAATTTTAAACTGAAATGTATTGCCAAAGAAATAGTTGCAACAAAGTACTAACTGTGGATCATTATTATTTCTTTAATATTTTCCCCCGTTGAGTTGAAAATCCTTACTAAATATTGAAAAAATATAGCAAACGACC:1	-	chrX	20919807	3'	+	looper1	1404	1	73.29
ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAA:1	-	chr2R	5248254	3'	-	1360	2	2	60.32
GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAAAGCTGAAGAAGAGGAAGAAAAACACTCA:1	+	chrX	17833106	3'	-	Tirant	10	2	70.49
ACAAAAAATTATAAAAATTAAAAACCGAGTAATTTAGCTTGGGATGTTTTTTGTTAGTACATTTTTATTAAATTTCATTTAGAGCTCAATCTTAATAAGGAAATTTGGTAATAATAAATTGATTTTTAAA:1	+	chr2R	11242496	3'	+	HB	315	1	69.23
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTATTTA:1	+	chr3R	20469687	3'	+	roo	9024	2	54.89
AGTGAAGAGGCAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATA:1	+	chr2R	19727745	3'	+	invader1	3994	2	73.97
GGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCATGTGCAACAGAGTGCAACAGTTGACGGCAACGGGAAATGGGATGAAAATGAGATG:1	-	chr3L	3799738	3'	-	copia	1	2	74.81
ATATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTAGACAGAGCTTAAAAGGGATCAGTCGTATTCTGATGCAGCTAATAAACTGCGAATTACTTGATGTCTGGCTAAAACACACAGAAAATTTATGACATTC:1	-	chr3L	15063118	3'	+	gypsy9	214	2	60.47
ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACC:1	-	chr2L	13053740	3'	-	BS	5052	1	60.00
AAAGTAGTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCATAAAGCTGCAAAAAATATATGCATTCTACACATTATTATTATATTCGAATAGGAAAAATACCCAGAACTATTTTTAAAAATTTTAT:1	-	chr3L	1534618	3'	+	pogo	2089	1	69.29
ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTACTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATATTATTACTTTCATTACAGAAGTTTAAGACTTTAGATCCCTTAAAAAAACGATACCATAAAGA:1	-	chr3R	21340664	3'	+	1360	374	1	56.85
CTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCTGTCCGTCCGTTTGAACGTTGAGAAGCCAGGAACTTCAATTACATTTCATAATTCATGATCCACGCCCGGTTAGCCAATGAATATGCATAAAGGATATA:1	+	chr3L	5383066	3'	+	INE-1	89	1	56.85
ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGCATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTT:1	+	chr3R	17243236	3'	+	hopper	1376	1	55.48
CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACA:1	-	chr2R	21572100	3'	-	hopper	47	1	56.35
GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACA:1	-	chr2R	8585439	3'	+	roo	9017	2	62.70
ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATCACTT:2	-	chr2L	544768	3'	-	412	58	2	54.79
CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAA:1	+	chr2L	9668286	3'	+	1360	3352	1	53.49
CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGGTGGATATTGTGTTTCT:1	+	chr2L	16067146	3'	-	297	47	2	82.00
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACCGAACGTAACAAAATATCA:1	+	chr3R	7100928	3'	+	roo	9042	1	60.28
AAAAACAGGCCAAATGCCCAATAGCGAATTTATGCTCTGCTCTCCAAGCCAAAAATGGTGCATAAGTCGAGGGGCCAGCCGC:1	-	chr3L	17136043	3'	+	hopper	1410	2	57.32
TGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCAATTCGAATAATAATGGATGAGGGAATG:1	+	chrX	17431848	3'	+	hopper	1404	2	76.12
GACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATACACACGGCGAAACCAAAAGCAAAACCAAAGTCGTCGATGGCGACGGTCGCATCATAAAAATGTCTAAGATAAGCAATGTAA:1	-	chr3R	22571016	3'	+	jockey	4772	1	55.48
AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTGAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTCGACAAACTGTAAATAGCAGCTCTAGAACTATTGACAGATATATAGATAGATATA:1	-	chr2L	14546114	3'	+	S-element	1636	2	71.23
ATGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAG:1	+	chr3L	11957207	3'	+	blood	304	2	67.81
AAGGCAATGATTGTTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGGTTCTTTAATATGACTTTTGCAATAAACAGT:1	-	chr3R	22232288	3'	+	1360	449	1	72.54
GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTGGACTCTTTGCCAT:1	-	chr3R	10182084	3'	+	blood	363	2	72.09
GACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCCCTGTTTTCCGAATGTGGCTCTCTG:1	+	chrX	22715180	3'	-	Bari1	29	1	65.07
GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGT:1	+	chr3L	16015358	3'	-	1360	29	1	60.96
TGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACGTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCA:1	+	chr3L	10574380	3'	-	Tabor	59	2	55.48
GAACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATATATCTCTCTATTTAAGCTGAGCAATTTATGTTTTATATCAGCTTAGATCGATAATTTTGGTTACGTATTGGTAACGATAAAAAGTATGCATA:1	+	chr3L	19631626	3'	+	INE-1	141	1	69.18
TATAATTTGACATCGCCTGCGTAACGTAAGTACACCCTCAAACATGAGCGGGGTGATAACAATTATAACACAAAGAATGTACCTAAAGGACGACAAACCAATAAAGCAACGGTGAAATCCGAAGCAGCAGGCAGACAGGACGGG:1	-	chr3L	23467487	3'	-	Q-element	578	1	25.69
TGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGAGGAAGAAGATTTCTACGGAAGCAGCAATAATAATAATAATAACTCTGTAGAAATGATTTATGCCTATTATCATTTAGTTTTCTT:1	+	chr3R	12938054	3'	+	invader2	400	1	65.52
GCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTC:1	+	chr2L	12290748	3'	+	1731	4551	1	68.28
CTGCGCNAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATACAAAGCATTTTTCTC:1	-	chrX	3309631	3'	-	jockey	82	1	69.18
CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGA:2	+	chr3L	21855518	3'	-	blood	7090	2	72.60
GAAAAATTTTTCAAACAACTACATGTTAACACCACTTGCTAAATGTACAAATTAGTAGTTTTAAAGAACAGGTCTAGATACATAAACTTCAAGCGAAGTATCTAAACTATTCTAAGATACGTAAAATATATTATTTTATTTTTATT:1	-	chr3L	12320454	3'	+	hopper	1038	1	60.96
TCTGCCCGGGTAGACCGTTTATTTCTCTGCAACTCGTGGGAACCATTAACCATAAACTGAAAGCCACTGATCTAAAAATACTTGGCATTGCCGGCGGTAATGCCGTCGAATCTGGCCTAAACCATAAGCTATATTTGCACCATG:1	-	chr3R	8601189	3'	+	baggins	354	1	63.19
ACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGTTAAAACCAAGTTCAAAAACGTTAACAAATCACAGAATAACAAAACTTCTATGTAAAGAATGTCTT:1	-	chr2R	11363737	3'	-	Bari1	54	1	57.53
CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGA:1	+	chr3L	21855525	3'	-	blood	72	2	67.81
GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCAT:1	+	chr3L	3501020	3'	+	opus	7450	2	64.80
GAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATT:1	+	chr3R	20499827	3'	+	mdg3	5414	2	72.60
ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAAATTCAAAAGTGCAGTCTGTTATACATTAATTAATTAACCAAAATGTCGAGTCAGGATATAAATCAAATTCGTATAAACTCAACGATTCTGT:1	+	chr2R	13062786	3'	-	blood	7179	2	79.03
ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTTTATTATAATAATTGTGAGGGACAGCTTATGTTTAATCCACGCCAATATCAATACCTCGACTAACAGATACCCTTGACTCCG:1	+	chr2L	13763278	3'	+	pogo	2082	1	69.23
CAAAGACACTAGAATAAAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGCCACTATATCATGGAACCTTTCTCGGATCAATGATATCGTAAACTTCACTTCTTTCTGCCGAAGCGACAAGAGAGCAGGGTTAGCGTGATCTTCTATT:1	+	chr2R	4242187	3'	+	1360	1	2	64.14
GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATCTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTACATAAGCTTCTGCTGTTTTAATAGACAGAAACACCTTTCACATACATACATATGTA:1	-	chr3L	10325040	3'	-	FB	64	1	59.59
ATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACCATATTTTCACTCCGGGAATTCCGTCGAGAAGTTTTCCCAGAAGTATTCCCAAATTAGATTGCTCACCACTAAATTCAGGCATTTG:1	-	chr3R	29023281	3'	+	S-element	389	1	58.90
AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCT:1	+	chr2L	9668259	3'	+	1360	3342	1	68.75
TTCGCTNTCACTCTCTCGCTCTCACTCTCGCTCTCTCGCTCATTATAATATTATAATAATTATTTAGGACCATATTTAGTTTCAGAAATAGGAGATAATGACAACATTACAATTATAGGAAATAAAAATAAAAAACAGA:1	+	chr2L	17817658	3'	+	Cr1a	288	1	70.50
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCC:1	+	chr2R	25118797	3'	+	roo	9030	1	58.22
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGTAGTAAATG:1	+	chr3L	20654565	3'	+	roo	9014	2	62.22
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTT:1	-	chr2R	9328575	3'	-	roo	28	2	61.65
GAAAAATTAATTTTTTTTTTTAGCACATTATAATTGACTTGCGTTAAGATGAATCTATGCACTCCATAAATAGTGCGCTCATGCTGGCGAATGTTTAGAATTTAATTAGCCACGCTCCCTGATTATGCGCGCATGAAATTAGAGC:1	+	chr3R	22340065	3'	+	NOF	3865	1	51.72
GGGAAATTCGACTATAGCATTCTCTCCATATTTATGTATTTATTAGTTTATAGTCGAACTAAGTTCAGTCGACTGTAATTATTGGCACAACCCTTTGAACTTTGTGGACATTGTCACGG:1	-	chr2R	4345188	3'	+	INE-1	571	1	78.15
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGAC:1	+	chrX	6486815	3'	+	roo	357	2	54.11
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTT:1	+	chrX	9540119	3'	+	roo	9021	2	54.23
AAAATTGTCCAAAAAGCTTAGTTTATTATATGAAGTAATTAACCCCTAAGCTTCGAGTGAGCATCTCATCTATCATATGATGATCCTTCGTCGAACAGTGCGTATGAGCGAAGTCTGCACGCTTGAACTTGTAGACATTTGAAGAA:1	+	chr2L	21612113	3'	+	Ivk	5258	1	66.44
CTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATA:1	-	chr3R	556456	3'	+	Tc1-2	1543	1	72.41
GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAACAAATT:1	-	chr2L	18419109	3'	+	412	458	2	60.96
ATCTAATTTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGGATAATTGTTTTCCAAAACCATTGCCCTTTTCCAATTTTAAAAC:1	-	chr2L	5928726	3'	-	I-element	5228	1	68.47
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATATAAATAAATAAAA:1	+	chrX	16689670	3'	-	roo	84	2	81.51
CTAGAAGGTTGAGATTCAGCATAGAGACGCAGCTTAAGTTTGTTGATCCATGTTGCCACACCCACAACAAATATTTCTGTAATTTCTTGTCAACAAAAAAACCCATAATGTTAGG:1	+	chrX	20672625	3'	+	INE-1	170	1	54.78
AAATATTTATTTTTTTTTTTAATTATTTAAAAATCTTTTTTTTTCGGCTTAAAACTACTTTACCTGAACTTCGTGCAACTATCCGTCTGGCTCACACGATTTTGTGTGCAGTTTGCATTCTTTTTTCC:1	+	chr3R	17973087	3'	-	mariner2	829	1	75.00
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGT:1	-	chr2L	3114473	3'	+	roo	350	2	56.85
GTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGCGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTAGGTACTCG:1	-	chr2L	14110718	3'	-	Quasimodo	19	2	71.77
AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACC:1	+	chr2L	9564527	3'	+	transib2	2778	1	61.95
AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAGACAATTCACGCAATGAGCTTATCAAGC:1	-	chrX	4214893	3'	+	flea	4999	2	73.29
GAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCTTC:1	-	chr3R	13457871	3'	-	X-element	47	1	54.79
AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGCAGAAAACTTTTCGCA:1	-	chrX	10644421	3'	-	jockey	4784	1	58.97
ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAAATG:1	+	chr2L	6623056	3'	-	Burdock	42	2	56.55
AGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCATCGACG:1	-	chr2L	21400696	3'	-	Doc3-element	31	1	45.97
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTGGGCACTCACACAAGCAGACCCCAG:1	-	chr2R	13710585	3'	-	roo	49	2	59.84
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTAT:1	+	chr2L	12892728	3'	+	roo	394	1	69.91
ATAAGCAGCATCCAATTTATGTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGATATATTTTATTATTTTATCTTTTATTTTATTTTATTTGATTTGGTTATCACTTGTAGCAAACGGTGGCCGAGTTGCTTATATATTTCAAC:1	+	chrX	16394695	3'	-	Bica	4713	1	61.64
ATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCA:1	+	chr2L	11661019	3'	-	F-element	71	1	53.42
AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGGGGTAGGTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGGTTAATT:1	+	chr2L	16067168	3'	-	297	6635	2	65.12
ATATGAACAAAGCAAAGACACTGGAATAATTCTAGTTATCATATTTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTATAATGATGGTAAAAGGTAGCCTATTTTCAGATACTAAAATGGGGAACGACTGGGGATGCTTTTTCCAGTG:1	+	chr3R	10268755	3'	+	1360	495	1	54.48
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTA:1	+	chr3L	11530953	3'	+	roo	9018	2	70.80
TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAAAGATATAA:1	-	chr2R	20496866	3'	-	blood	18	2	70.34
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATC:1	-	chr3R	25448352	3'	+	roo	331	2	69.86
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAA:1	+	chr2L	7888191	3'	-	pogo	57	1	77.97
GATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTG:1	+	chr3R	13349110	3'	-	BS	5053	1	65.85
GATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACGAATGTTTCTTTGTTTGTTTATGCTTTCTTTACGTTTTCCGAGTAGAAGGAAATGACTTTGAAAGCATTTGCCAGCAGTTCCCTTCACTTTACTTCGCCCGACTCCACAG:1	+	chr3R	14650710	3'	+	P-element	404	1	75.34
AAAAAAAGGAAAACATGAAAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCCCTATATACACTGGTACGAATAACCCGAAAAAAGGAACATATTTTGGATTATGATTTCATCTAATTATATGAAATTATACAAAAACTGTAATCGATACGGTA:1	+	chr2R	5519668	3'	-	HB	152	1	65.75
TAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATGAGAGAGGGGTAGCAAGAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAG:1	-	chrX	12649915	3'	+	1360	344	1	46.15
GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTC:1	-	chr2R	20944327	3'	+	pogo	2048	1	58.90
GAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGTAAGAGCTAGGGCGTCCACGAAACAGGCGCGAAAGTCAATTATGGTCGGTGGGGCAGAGCGTCATCGA:1	+	chr2R	14453931	3'	-	Cr1a	297	1	78.65
TTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATATCTGGGCGGGAGATACTTGGACACGCGCACGCCTTCGTGT:1	-	chr3R	17316246	3'	+	opus	7447	2	67.44
GACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTTTAGGTCTAATTCTAAACT:1	+	chr2R	16248049	3'	-	BS	9	1	71.13
GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGC:1	-	chr3L	2325713	3'	-	I-element	5136	1	63.57
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGA:1	-	chr3R	17817905	3'	+	roo	327	2	73.79
AAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACCGATAAAGAATGCAAAGAATCTGAATTCTACGATTACAAATGTAGCTGCGTTTGACACCAAATTGAATCACCTATTAGTGGACACCATTACTGGACGAG:1	-	chr4	1023213	3'	+	Tc1	189	1	73.33
CTCTGTTAATCATTACCTTCTAGTAAGGAATCTTGATCTTTTAGGTTGGTCTGTTGGTCTTCTAAATTGGATTTCACTAGAATTGGAATTGGATTTCACTAGAAACTATATGACTTTATAATTTTCTTTCGTCGCTACT:1	+	chrX	4231037	3'	+	Q-element	336	2	79.86
AAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAATGTCTGATGA:1	+	chr3R	3286223	3'	+	Gypsy12A_LTR	1949	1	75.17
GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCA:1	+	chr3L	21855512	3'	-	blood	7096	2	76.71
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGCTCCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGCGT:1	-	chr2R	19050214	3'	-	roo	8750	2	76.39
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCGTTATATTTGGTCACT:2	+	chr3R	12887022	3'	-	roo	30	2	65.07
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCACTTCTCGGATTCAATTTTGTGGGGAAGTTGCAACAGCTG:1	-	chr2R	13696362	3'	+	roo	397	1	70.40
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAAT:1	+	chr2R	9328695	3'	+	roo	9044	1	54.55
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACC:1	-	chr2R	9632092	3'	-	roo	49	2	55.47
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGCGGATTCCGTATACGACACGTGTGTCG:1	+	chr2R	19540449	3'	+	jockey	4937	1	65.38
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTTCCTAATT:1	-	chr3R	7835082	3'	+	roo	9043	1	64.38
ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCAAAATCAATATTTTCATAACCTGGTTCGAATTCGGCATTTTCGTGTGC:1	+	chr3L	3477568	3'	+	mdg1	412	2	76.03
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTG:1	-	chrX	10640000	3'	+	roo	396	1	65.77
TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTA:1	-	chr3R	13237300	3'	-	3S18	5776	2	62.35
CATGGCGCTTTCCATCAGGAGGAAGAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAGATATTGTCCCAACATGAAGTTGAACCCACGTGATAAATCTATGTTGATTGCCGATCTTACTTCAA:1	+	chr2L	22299220	3'	+	baggins	5256	1	55.12
TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAACCCGCATTTCTGCGAACGGATGAG:1	+	chr3L	9998181	3'	-	roo	77	2	72.22
GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACGGCAGCAAACAGCCAACAAAACAACAACTATAT:1	+	chr3R	10266204	3'	+	1360	3385	2	80.00
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTGTGTTGTTTTAACCTACAAAATTGCAATGAAAAGTCGGTACATTTCTTCCTCTGGAGCCTGACGTAAAAAGC:1	+	chr3L	21818084	3'	-	roo	8712	2	54.86
CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGTTTAGC:1	+	chr3L	7943753	3'	+	Burdock	237	2	69.18
TTAAAATTAAAATTAAATTAATATTAATGCAATTAAATTTNATTGCAATATTGAAACAAGATATTAAAGCAAGCAAACTAAACTAACAAAACAGTAGTTCCCAGTAGGAAATGAAACACCTGCTTTTATCCCTTGTAGGCAAAT:1	-	chr3L	9546664	3'	+	NOF	3957	1	72.22
AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCAAGAACTGCT:1	+	chr2R	13585492	3'	+	412	7486	2	64.62
GTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGA:2	+	chr2L	23034081	3'	+	FB	385	1	43.15
GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACAAACTTTGATTGCCCACGTCCTACCAA:1	-	chr2R	13817656	3'	+	412	7482	2	74.36
GAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAAAGGGTTCTTATTATAGTCGTTTTATTCTACAAACTTATGGATAACTC:1	-	chr2R	5209555	3'	-	gypsy	6993	2	79.23
GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGG:1	+	chr2R	17626917	3'	+	opus	460	2	60.91
GATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGCAGAACGTTTCCACGTCCACAGGAAACTTATCAATTTTTTTTTGCCAATTTCTATCGATAAGTTTTCTTGCTTTGGTTGCGGTATCCTTTTTTTTATCCCATGACATTTGTTTACTC:1	+	chr2R	15692265	3'	+	INE-1	150	1	57.93
AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTCCATGTTTACACTTTTAATTTGGTTTGGAAAACCATTTTTAAAAAGAAATAAAGAACAAAGTGCGGTAGAGAGCTACAGTTTCAAATAATTGAAATTCCTTC:1	-	chr3L	20168310	3'	+	mdg3	227	2	71.92
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCCTATAACGAGGATAGCACTGGTA:1	+	chr2L	6059359	3'	+	roo	392	2	74.66
AGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAGATGATAAGGTCCGAGTGGCTAAAGTAAAGATGCAGGAAGGATATATCACTAGACCCATTACTAAAATTTGT:1	+	chr3R	19448076	3'	+	roo	8813	2	72.00
AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGT:1	-	chr3R	9210625	3'	+	mdg1	358	2	60.27
CGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGGCATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTG:1	+	chr2R	23332604	3'	+	invader4	266	2	72.58
AGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATT:1	-	chr3R	556396	3'	+	Juan	4142	1	71.53
TTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTATTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTTGTAATGGATGTGGTATTAAACCAGATCCGTTTGTTGC:1	-	chr3L	16515981	3'	+	Cr1a	205	1	71.85
AAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAATAATGAAACAGTGATGGCATAAACAAAGCTAATGTTTTATTTTAATTTAATTCAAAAACATATTGTTACTGCACACGACAGTGGTGAGTTACAGCATTGAAATCCTGC:2	-	chrX	19787181	3'	-	Tc3	309	1	77.40
TTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTTAGTATTTCATTCTGGCATTAAGTAAGAGCATTAAACACATACATATATTGTTTGTCCAACTCTTACCTTATTTT:1	-	chr2L	5256987	3'	+	roo	463	2	50.00
GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTG:1	+	chr3L	8249110	3'	-	jockey	4577	1	63.87
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGG:1	+	chr3R	7482842	3'	+	412	7497	2	58.57
CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGGCTTAAGGATTGTGATGTTAGTCAACTTAATTTGGGTAAAACATTTACGGAATTTGACGTGCGTATCCTAGTTTTTCTCAATATCT:1	+	chr2L	13914239	3'	-	jockey	4675	1	73.97
GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGCATCCACTGTTGTGC:1	-	chr3L	21855427	3'	+	blood	336	2	54.48
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCATGTGTCC:1	-	chr2R	9791541	3'	-	412	17	2	73.38
TGACGGCTGCATCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAGATAAT:1	+	chr2R	20497025	3'	+	blood	7344	2	49.32
ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAAT:1	-	chr2L	4412557	3'	-	Quasimodo	66	2	64.38
TAAGTAAGTAATATTTTAAGTAAGTAAGTAATATTTTATTTAAGTAAGTTGAAAATTATCGGTTTTCAAACTACCACCAGACATTTGTCCCAATCCTTCCGCCGCCCAAAAGTATACTACATTTTGCCACCGTAATGAATAAATAC:2	-	chrX	2679566	3'	+	Stalker3T	43	1	59.59
CTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGACGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACATCGAAAACAGTTTAAGCTCATGCGTCGCGTTGTGATTAATCGGTTACGAGCCTTAATGAATC:1	+	chr2R	5607399	3'	+	gypsy4	434	2	55.86
GAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACCGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTA:1	+	chr2R	20194269	3'	-	Max-element	8321	2	75.71
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTCGGCCTTTCATTCACTTGTCAGGAGCACAG:1	-	chr3R	10546056	3'	+	hopper	1382	1	58.22
TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGAAATATA:1	-	chrX	10644462	3'	-	jockey	4772	1	54.69
TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGATTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAAATAT:1	+	chr3R	15072690	3'	+	pogo	2071	1	61.27
TTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGACTCCGCCGGGCATTAATCTGAAATGGCAAACGCCCATTCGCCAGGGAAACCG:1	-	chr2R	19798025	3'	+	Transpac	261	2	58.59
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGCAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGC:1	+	chr2R	21908017	3'	-	roo	43	2	56.69
CAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACGC:1	-	chr2L	2122365	3'	+	Stalker4	386	1	63.08
ACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATATATATATTGTTCGCTCTCCGCTCTCCGCTCCC:1	+	chr3R	29682367	3'	+	gtwin	386	2	77.40
TTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAATAAGCAGCTGTAACTCTTCCGGAAACGAAGGGTAGCCCAGGAATCAGGGGTCAAG:1	+	chr2L	2122527	3'	-	Stalker4	6971	4	70.00
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATCTGAATGTCTATAT:1	-	chr3L	9998001	3'	+	roo	406	1	45.21
AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTG:1	+	chr2R	19540464	3'	+	jockey	4936	1	58.90
AAAAACCAAAAATGTTTTACAACTTTTGGTTTGAGTGCGTAAAATGTATTTTTATGCTTTGAAAAACATTTGCCAAGCTAAAAATTATAAAGAAAATAATAAAGGAGG:1	-	chr3R	31922950	3'	+	I-element	390	1	60.19
AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTTGGCACGGTTC:1	+	chr3R	18582284	3'	-	roo	8669	2	76.38
AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTGTTTGGGGCAGC:1	+	chr3L	9907365	3'	-	BS	5039	1	51.85
AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTG:1	+	chr2R	19540472	3'	+	jockey	4954	1	50.74
AGAGTCAAATGCTTTACTAAAATTAGTGTAGATGACATCTGTTTGAAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTTGCTCCAAGAGGTTATTTTTATTTTGTTTGTCGAAGCTTGTATATATATTTAGCGTAAACTTTC:1	+	chr2L	58914	3'	-	Q-element	318	2	66.44
ATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGGGTACATCCGAAGTGGTGTATATGTATTGGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTGAGGTCGTGCTAACTCGGGTCGAATAAATGAAAA:1	+	chr3L	27412821	3'	-	Idefix	127	2	74.29
AAATATGTACATATGTATATATATGTACATACATGTGTAACTATAAATTGACTGATAATAGCATTAAATTACAAGTGGCTTGCGTCAGGGGCTTAGAGCTTAGCTTCACAGTTCTGGCTCGCCTAAC:1	+	chrX	19453178	3'	+	G3	4505	1	58.27
TTTTTTTTTATTAATTAATTTAAAATTCTTGATTAAAACCATTGTCTAGTGTGTTATGCTTCATTTAAGCGTGGAAAGTGCCTATCACTTAAGCCCCTATCTTCTTCGTCCAGGATTCACATTTTTCATACCG:1	+	chrX	12404691	3'	-	jockey2	3407	1	60.15
TGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGTGTGT:1	+	chr2R	10582508	3'	-	Juan	3826	1	63.45
AACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAATCAGTTGTAATGTGGCACGCCCCTTCAATCTGCCTGGGCATTAGGCCTGTACAATCTTCCTGC:1	-	chr2L	15191745	3'	+	Stalker4	383	1	50.00
CGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGTTCGCGAGCT:1	+	chrX	21994031	3'	-	McClintock	5959	2	77.69
AAGGTATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGTAAGCACGCTCAATTTCTTGGTCTTATTCATAATTTCTAGCAAACAAATATTACCTTCCAATTCTCCTTGACCTGAATGCGCCAGA:1	-	chrX	13500792	3'	+	Gypsy12A_LTR	2056	3	62.07
TCAGATACCCGTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAAAAATTGGCAAGGCAAATAATA:1	-	chr3L	22848493	3'	-	INE-1	544	1	61.11
AGATCATTTGAACATTTGTTCTTGATAACGTGTTGCTGTATGAGAGGATTTCGTAAGGTGGATTCTCGTACGTTGGGGACTCTGGCCTTGATCTGCAGGACCCCCCATTGCCGCCCCTTC:1	+	chr4	802756	3'	+	Tc1-2	285	1	75.00
CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGGCCTTCGGAGAAGAC:1	+	chr2R	2016912	3'	+	1360	3355	1	50.44
AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATCACT:1	-	chr2L	544769	3'	-	412	7112	2	55.48
GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAAGTAAGATACACAAAAACTCTTTAACCCAGATGCGAGAGGGAGGCGCAAACTACTTGATCTTGTCGAGCAACCAACC:1	+	chr2L	9906566	3'	+	invader3	232	2	52.74
AAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAAC:1	-	chr3L	17685094	3'	-	mdg3	5270	2	42.64
AAATATTTATTTATTTTTATGCTTTATGTATTTATGCTTTAAAGACACTACGTTAGCTTTGAAAGTCGGCTGAACAAAAACCAAAAACCGAAGCCGAAACGATGTATTTTTCCCTTTGAATTCCCACATATACTTCTTA:1	-	chr2R	12786064	3'	-	mariner2	829	1	64.03
TTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTTTTATTGGATACATGATTTTATGATGAATAAACTATTGTATCTGCTGTCCTTGGG:1	-	chrX	15922418	3'	-	Quasimodo	6926	2	76.43
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTTAAAAAAGAAATTGCCAAAATTCAGCAGAG:1	+	chr3R	19448963	3'	+	roo	9024	2	52.59
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTC:1	-	chr3R	25448324	3'	+	roo	9040	1	58.91
CTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCC:1	-	chr3L	24213773	3'	+	invader2	5035	2	65.75
GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTTATAA:1	-	chr4	311191	3'	+	1360	3336	1	57.86
TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAA:1	+	chrX	10201211	3'	-	transib2	81	1	73.29
TTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCGTACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTTTAGGTCTA:1	+	chr2R	16248039	3'	-	BS	23	1	60.96
GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATGTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAAC:1	-	chr2R	20596451	3'	+	roo	353	2	55.17
ATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTCTTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGACGACGAACTTGAGG:1	+	chr2L	2687440	3'	+	copia	198	2	56.16
CACCTATCTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATA:1	+	chr2R	18336240	3'	+	roo	342	2	62.76
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTC:1	-	chr2R	9791569	3'	-	412	39	2	55.64
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCT:1	-	chr3R	19968093	3'	+	roo	356	2	56.74
TTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTTCCCCGTATTTTCCATCTGCCCCAAGCCCTAT:1	+	chrX	22674314	3'	-	invader2	4866	2	76.12
CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGC:1	-	chr3R	13360285	3'	-	jockey	57	1	52.05
AAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCCGG:1	+	chr2R	9500078	3'	-	G5	4736	1	45.21
GTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGTCTATATCGACTCGGCTATTATTGAGCAGCTTCTTTAGAGCAAAAGTACAGACAATATTCCTTGCTTAGTCTACCCTACGCG:1	+	chr3R	3186385	3'	-	INE-1	154	1	48.53
AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATGTGAAGTGAATTTCTGCTGAAGGGGTAGCTG:1	-	chr3R	22271500	3'	-	jockey	4801	1	72.27
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTGCCGAAC:1	+	chr2R	14542216	3'	-	roo	72	2	72.14
TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATA:1	+	chr2L	19965029	3'	-	Doc	81	1	77.87
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATAT:1	-	chr3L	11393506	3'	-	roo	84	2	81.43
GAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGATGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTT:1	+	chrX	12074605	3'	-	412	7170	2	59.09
CCGTACAGCCAGATCGGGATTATATTGTATATAATCAGTACTTTCTAACTGGTTCTTAGCTGTGGCATCCTTGGCGTCTTCAGACATCCAGTTGCCTTGGCTCAACTGCAA:1	+	chr3L	5102546	3'	-	BS	4658	1	74.77
TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGACTGTCTAACAAAA:1	+	chr3R	14981295	3'	-	mdg1	17	2	71.33
CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCATACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGAT:1	-	chr2L	21884503	3'	-	pogo	55	1	58.62
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCA:1	-	chr2L	7945340	3'	+	roo	322	2	78.08
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTG:1	+	chrX	9540096	3'	+	roo	9006	2	68.66
TGGGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGTGTTGTGTGCGTGCGTGCTGCCAACTTGTCGCACCAATTGTTGCTGTCGCTTGTTGCTCATTC:1	+	chrX	18370849	3'	-	Cr1a	300	1	66.67
TAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCTCCGTTTTTCTCCTCATATTATGTTTCTCACTTTACGCGTTTCATAAAAGACGAATATTTTAATAAAAGTGCGAAATATTTTGTCATTGAACTTGAATC:1	-	chr2L	3894694	3'	+	roo	309	2	67.12
GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAG:1	-	chr3L	27415224	3'	+	transib2	2756	1	66.43
AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGTCGCCGCAATGGACGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTATAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTTTATTTATT:1	+	chr3R	14860273	3'	-	BS	5006	1	72.92
TTAACAAACAAATTTAAAAAACTTTCAAGTTATAATAGTCAGAGCGCGAATTTTCAAAATTTTTTTTATTTTATCATATTTTTATGAAAATCCCTCCCGGCAGCTGCGTTCCTGCCTTTCGGCGATGGC:1	-	chr2R	6972494	3'	+	1360	3006	1	57.36
ACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTAAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGACTGCTGTCCAAGTAAACTAGCTTTTTTCACTCGATTGGCAAGAGAGTGG:1	-	chr2R	17629568	3'	+	1360	3221	1	65.75
TAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTATATATAGGCACTATAATATTAGAACACCGTTAACATAATTCTATTATTAAGCTTAAAAAGGGATATTCATATTTTTAAATCGAACATTATAATAATACCATATC:1	-	chr3L	7938374	3'	+	Burdock	63	2	76.26
AAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATGATGCCAAGGGCACGAAATTGCCATCATTTACCTATATAGATATCCGCCTTTTATACAATTCCAACCATCCATCGATCGATTGAAATT:1	-	chr3R	19342554	3'	-	1360	372	1	62.86
AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGCTGATTCTGCTCCCGTTGCCGCTTCTGTCAGCAGACGG:1	-	chr3L	10773066	3'	+	412	476	2	54.74
AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGCTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAA:1	-	chr2L	15832998	3'	+	hobo	2932	1	63.95
GTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTTTCCGCCTTTTTTCTGGCTCTAACTACTTGCAGTTTATAACGCCTCACAA:1	+	chrX	3306601	3'	-	hobo	492	1	52.38
CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGAGTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAATTAAGACTA:1	-	chrX	3308312	3'	-	hobo	66	1	65.67
GTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTATTATCTCTTACAACTTTCCTAA:1	-	chr3R	5061788	3'	-	mdg3	5266	1	76.03
GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATTTTTGTCAAGTCGCATTAAGGCAGCGCGCTCATTCGACTTGTTCGTTCTGCCCGTCGACTGCTGA:1	+	chr3L	13574559	3'	-	hobo	12	1	72.87
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATT:1	-	chr2R	9328620	3'	-	roo	86	2	77.40
ACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGTGAA:1	+	chr3R	1446150	3'	+	1360	3383	2	23.29
AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACCAGCAGTAACAACACGGCAAACGGCAAATACAGT:1	+	chr2L	9564560	3'	+	transib2	2778	1	52.74
AAAAAAATCGTGTGCCGAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1	-	chr2R	981617	3'	-	1360	40	1	60.96
TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGGCCATCTAAATTAAAACGTTTTTCATCAGTTAAGACAAATGAATGCCAATAATTTAGACGAGTGTCAGATTGGACATTCCACGTCATGTATTCCTTCGCGAATAGAA:1	+	chr2R	6487997	3'	+	copia	241	1	73.97
ACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACCTGTTCTCGTATGGCTGATCCTGCGGTAGCCAAG:1	+	chr3R	11237901	3'	+	R1A1-element	5314	1	75.65
CTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGGGCTCTCAGGTGGTGTCTGTGATCCTCCGAGTGGACGAATCATACCAGACCATGGGCGGTATGCTCC:1	+	chr3L	2362279	3'	+	Stalker2	403	2	53.91
TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGA:1	-	chr2L	10023013	3'	-	Doc	73	1	70.40
ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGT:1	-	chr3L	17685113	3'	-	mdg3	54	2	52.74
CTATAGTCGAGTTCCCTGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGTATGCGAACAAGCAAGTTTCATCATTTTTCTGGGATATGGACATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTGTTGAACAGTGTGGGCGTTAGAGTGGGCG:1	-	chr3L	22511717	3'	-	INE-1	566	1	69.18
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTT:1	+	chr3L	20831360	3'	-	roo	79	2	73.97
TATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAGTTGAAACTTAAAAAAATAATGGCAT:1	+	chrX	5637420	3'	-	roo	410	1	75.00
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTG:1	-	chr2R	9632120	3'	-	roo	8745	2	76.60
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCACCG:1	+	chr3R	7835229	3'	-	roo	8704	2	56.83
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAGTCGTCTTTGACA:1	-	chrX	14336403	3'	+	roo	352	2	56.85
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATGAACCGAAAATATTTAAAAATACTTTAAATGCCAA:1	-	chr3L	10292825	3'	+	roo	8999	2	78.36
ACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTGAGCAAATGATTTTATTTATGCAGACAAATTTCACAATTAATCACTACCAAGAG:1	-	chr3R	18584788	3'	+	roo	36	2	48.62
GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAAGAAGACTTGTATAACTTGAAAGGCTT:2	-	chrX	13066449	3'	+	jockey	4986	1	76.03
ATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTAAGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAAC:1	-	chrX	10521633	3'	-	Tabor	2	2	69.88
GAAAGGCAGTACAGAGATTTTGCTCTGTGCCACCAGCTGTGGCATCGAGGCGAGGGCGTCGTTCAGGAGCT:1	-	chr2R	23805276	3'	-	3S18	5715	1	85.92
ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCTCTTG:1	-	chr3R	27424815	3'	+	blood	347	2	61.15
AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTCTCAAAATATATTTTCTGTGGC:1	+	chr3R	17243210	3'	+	hopper	1350	1	61.64
AACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAGTTGCAGGACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGCGC:1	+	chrY	3609355	3'	+	F-element	188	1	55.45
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGCATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTAT:1	-	chr2L	17420121	3'	+	roo	9045	1	62.14
CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCGGGCTTATATGAATTTGTGGTGCACTGAAAGA:1	-	chr2L	16016345	3'	+	412	403	2	76.71
CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTAT:1	-	chr3L	17558019	3'	+	jockey	4922	1	69.18
CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGGTGGGGTTATGAAAAGCGA:1	+	chr2R	9463510	3'	-	rover	48	2	56.16
CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCCGTCCGCAATTTCTGG:1	-	chr2L	10022994	3'	-	Doc	64	1	58.52
ACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGGAAAAATTTAT:1	+	chr2L	12290730	3'	+	1731	4621	2	52.63
CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCAC:1	-	chr3R	19589936	3'	-	BS	5067	1	70.90
ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAGGCTTTTAATTAG:1	-	chr2R	9325363	3'	-	BS	5019	1	56.16
GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGTTGTTTTAACCATATCCGTATCG:1	-	chr3R	11496539	3'	-	1360	67	1	69.92
ATGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGACTCACTTCTTTTT:1	-	chr3R	20499706	3'	-	mdg3	5259	1	79.10
AAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGAC:2	+	chr2R	21298849	3'	-	jockey	264	1	52.05
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCCATTAATAAACATGAAATATTGTTGCGGCGAAACTATTGTAATGAACCGAACCAACCAAAATCAACAATACAGGGAAAAAATTAAAATATA:1	+	chr2R	18349438	3'	+	roo	9055	2	70.15
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATGCTACAGGGCTTATTCGAGATAAAATTTGGCCCCCGAAATAGTTCTATCAATAATAAAAAAAAAAACTTAACATTAGTAATTCTA:1	+	chrX	2444477	3'	+	roo	9037	1	61.64
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGAC:1	-	chr2L	17420141	3'	+	roo	355	2	56.16
AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAAT:1	+	chr2L	19965028	3'	-	Doc	45	1	69.41
AGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCACGTATATGTGTAGATATATAAAAGACATATCGCCTTAAATAGTTTCCACGCCTTGAAACAAAAACTTTAGCAGAAAACACGTTAGCAGTATGCAAGTGCAATC:1	-	chr2L	22181049	3'	-	R1A1-element	5107	1	75.00
TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAGAGCTCTCCGCATCTAAAATTCT:1	-	chrX	17832982	3'	+	Tirant	368	2	53.15
GTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGT:1	-	chr3L	2325691	3'	-	I-element	5120	1	52.74
TCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCG:1	+	chr3R	1844855	3'	-	Cr1a	163	1	54.86
ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCG:1	+	chr3R	10182181	3'	-	blood	7059	2	72.73
AAATAGCCAAATCTATGTACATATTAATATTAACAATTAATAAGGCAATGATTATTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTCACA:1	-	chr3L	19029876	3'	+	1360	341	1	60.27
CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAACTGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAAGTGTTGCATACGTCGAGGGGCCAGCCGCACAATTTACATCTATGCACACACAC:1	-	chr3L	17136018	3'	+	hopper	1385	1	62.12
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGG:1	+	chr3L	20654566	3'	+	roo	9026	1	58.06
AGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTAAATGTTGACATTTGAATATAGTATGAATATTAAGAAGCATGTACTTGGTCTAACATTTACTGGTGATATTGATATTATTTTGACCGCAATACAAAAAGTGCTGTATCAGTAGTGAGTGTCA:1	-	chr3L	12956074	3'	+	INE-1	156	1	70.55
CATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTCACATGCTAGCGATGGACTTAAAATCTCTTGGGAAACAGAAATTAATTTCCCCACAATGTGCCGTTGTAGGGCCAGAAAG:1	+	chr2R	6885525	3'	+	flea	274	1	60.96
CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTAGGGTCTTTGCTCTTGGATTCCACAATACGCAGTCCACTCGGACCGCATTGCATCGGTCCAAAAAAACTTCTTACTTTTT:1	-	chr2R	2007459	3'	-	1360	26	1	56.25
ACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTCGAAGGGGACAGATGAATAAGTGGTCGGCAAAGGCGGTCCCATGCCGAGCGTT:1	-	chr3L	27130620	3'	-	1360	3230	1	56.32
TTTTTTTCCTTTTCCTATTTTTTGGCCTGGCTATTTGGGGTTTTGTTTTCTCTCTTCTTTCTTTGTGCCGTTCCGGGCTGGTAAATATAATTTCTTTTG:1	+	chr3R	27806098	3'	-	Doc2-element	236	1	83.84
TTTTAAATGAAAGGAAATTTCGATATTTAAATCGAAATGTATTGTAGGTGTCTAAAAGTTTTCAGTTTATTGAAGGCAATTTTTACTGCATACTTTATGAGAAAATTTTTAATAGCGAGTAACTTATTTTGCTGAATTTTCAATAT:1	+	chrX	9844988	3'	+	invader1	12	2	52.05
GTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTCCCAGCTTGATCCC:1	+	chr3R	1451961	3'	-	mdg1	7041	2	56.25
GTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTCAAGGGCTGTCAGGTCGAACAGGAGTTGGTGGACCTTGGATCCCAGCAAA:1	-	chr3L	23933506	3'	+	Cr1a	250	1	57.24
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAA:1	-	chr3L	16343244	3'	-	roo	19	2	65.22
CTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGGGCGTGCACAAAGGAGATGCAAAAAGGAAGAGGACTACACACTCGTAAAAAAAGGAAATGAAAACGCCAAAGCAATTTAAATTAAACGCGCACTG:1	+	chrX	6133213	3'	+	gypsy8	4753	2	55.48
AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGA:1	-	chr2R	13585416	3'	-	412	7124	2	66.44
AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCATGTGTG:1	+	chr3L	22917692	3'	-	jockey	4791	1	52.73
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACACCATTCGCCAGCTG:1	+	chr3R	27994288	3'	+	roo	354	2	54.79
GAAGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACCATTCTCGTTGTCTGCATAACGTTTTCTGGCGCGTGATTTCCACTGTTGTGCTCTCCCAAATCCTGATGATCCTTATCCCGATACCAATGCTGCT:1	-	chrX	7729113	3'	-	invader1	398	2	55.04
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGGATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTAC:1	+	chr2R	9328677	3'	+	roo	394	1	50.63
ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGTGGTGCACACTTTTTATAGCCAGCAACAGTCACACAAGC:1	-	chr2L	9564454	3'	-	transib2	30	1	52.38
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAG:1	+	chr2R	13710682	3'	+	roo	9041	1	56.30
ACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACTGGCAGTCAATTTCACCACCATGGGGGTGGTTTTCATAGAGGAC:1	+	chr2R	17137693	3'	+	R1A1-element	5248	1	60.00
TACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTG:1	-	chr3L	10385848	3'	+	Burdock	6313	2	75.34
ATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATTTTCTTTT:2	+	chrX	21564771	3'	-	diver	45	2	55.48
TCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACACCTGAAGGGTAAATGGTTATATACATCTATTATTTGTTTTC:1	-	chrX	22897607	3'	-	Bari1	66	1	67.67
GACTGCACACGTATGCTCATGCATCGTAAATTTGACAAATAATGTCCTTCACTTTACAAGTTCTTAGTCTTTTCGGAATAGGTGCCAAAAATGGTATCGGACTGTTTGTCGATAGGCTAGAGGCTATTTCTACTGCCTCCTCC:1	+	chr3R	3671861	3'	+	1360	180	1	50.35
TTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTAGTGCATGCGCACCGTTCTCCCTGCCCGGTTATTGTGCAGGTT:1	-	chr2R	9502227	3'	+	G5	4724	1	50.65
CTGTGAAAATATCTCCAAAATATATGGAAGCGAATGATTCATTCCTTTTCCTAGGAATTTTTAAATAATAATTGCAGAATTTTCACTTAAGTTGACATCGATATAATTACAAGCTAA:1	+	chr3R	30314187	3'	+	Ivk	5233	1	90.60
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGATGCTGCGCATTG:1	+	chr2L	12892689	3'	+	roo	337	2	76.92
ACTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAAAAAAAAATTGTGGAATGCACCATCTAATATTATTATATTATATATACATTGCGAATTAAGATCAGTATTCAAATTGAATTAAAAGAGACATACACACCAGTT:1	-	chrX	20461866	3'	+	BS	5081	1	56.92
CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGCTGGGTG:1	-	chrX	13126452	3'	+	jockey	4966	1	50.93
GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTAC:1	-	chr2R	10582365	3'	+	Juan	4189	1	62.20
GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTAATTTAGTT:1	+	chr3L	17205289	3'	-	hobo	56	1	61.59
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTTGTGGGGAAGTTGCAACAGCGGCTTGCAGTTGAAG:1	-	chr2R	13696349	3'	+	roo	400	1	76.30
ATGAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTCTGTGCGTCTATCCGTATTTTCGTCCAAATTTGAGGACGTATAGCCTACTCTCTTGTTTCTTTTGCACATAAATACATAAATAATTTTTGCCTT:1	-	chrX	22806282	3'	+	INE-1	93	1	58.33
CTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACATCTCTGAGAGAGATATCACGATATAT:1	+	chr2R	3693199	3'	+	F-element	4460	1	75.45
AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACAT:1	-	chr3R	14981138	3'	+	mdg1	7444	2	66.09
GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAATACGTCCACTCGATTGCTCGTCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTA:1	-	chr2R	12835057	3'	-	jockey	96	1	74.66
TTAAAAATAAAATTAGATTCATTAAACTACTAAATATTATTTGGAAACAATGTCGCGGCAAGATAAAATATTACGAAATAAGAATAAAATATAAAATCAACGTTGAGGAGAGTAAAGCTTGTAGTACGATAGTCAGCCATTCAGTT:1	-	chr3L	1789223	3'	+	NOF	3957	1	75.34
AATATATTCAATATATTTCTTTGTAACTCATTGTTAACTTAAAGCAAAATTGTTCAATAATTTTAGTAAATAGGCTATCGTTGTTAAATTAGGTAACATAAACATCACGCTGCCCGAGCTCTGGGGAAACAATTGACGACAGTTT:1	-	chrX	876238	3'	-	Tc1-2	1594	1	72.41
CAAAAAATATTTAAAAAAAAAACCCAAGCAGCGGGCTAGGCAGTCAAGCAGGACGACGTGACCGATTGCC:1	+	chr2R	15186591	3'	+	TART-B	10625	2	82.86
GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGACGCCGCCGGGCATTAATCTGAAATGGCAAACGCCCATTCGCCAGGGAAACCG:1	-	chr2R	19798025	3'	+	Transpac	5221	2	66.67
GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTG:1	+	chr3L	20168457	3'	-	mdg3	50	2	51.80
GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTCCTGCTTCGGCTGGCATTCGTGTGCATGTTCCGTTTC:1	+	chr2R	21101853	3'	+	P-element	2882	2	72.32
GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGTGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTAGGTACTCGAAGCGGTCGC:1	-	chr2L	14110708	3'	-	Quasimodo	15	2	74.62
TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGTTGTGTCCACTTCT:1	+	chr2R	7452918	3'	+	pogo	2050	1	70.18
GGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTTGTTGTTCTCGATTGGTGGAAAAGTCAGATCAGATCGAATTTCGTTTCCGTTTCCGGGCTGTGTTACCGTTTCGTTTCATTTCCGTTT:1	-	chrX	21237218	3'	-	jockey	4856	1	71.88
TTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCAGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAGAATGTAT:1	+	chr2R	5198488	3'	-	INE-1	89	1	59.59
TATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTTCGCCAAGCTCGCTGTTCAAGTTCCTTACCGCGCTGGTAACGAACGTTTGGCTTTGCATCCTGGCTGCCTACTTCTTTACCAGCTTTCTC:1	-	chr2L	4832201	3'	-	baggins	5427	1	75.20
ATTCTTGATCAGGATCAATACCCGAGTCGACCTGACCCTCGGGAAAAGTTAGTTGAATCTCAAAGTCTGTGGGGACAACACCTAAAGAAACTAAAAAGTGTCAATTTTCTCTGTTTGCAAAAATTGTAATTAAAGTTACT:1	-	chr2R	12510525	3'	+	INE-1	86	1	75.71
CATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAAGTGTGCTGTATATGCTGTATAATTATGTTATGTGTTTACTATACT:1	+	chr3R	9804213	3'	+	roo	428	1	68.49
ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAAGTCATCCCTCTT:1	-	chr3R	1433125	3'	-	mdg1	9	2	64.44
AATTAAGGTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCATTTCATTCTAATTTGCATTC:1	-	chr3R	30344622	3'	+	pogo	2042	1	63.70
ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTC:1	+	chrX	1899695	3'	-	P-element	80	1	30.82
CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTT:1	-	chr3L	16015215	3'	-	1360	47	1	50.68
CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGTGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGCCCGATGCTG:1	+	chr2L	14892321	3'	-	transib2	48	1	52.74
TTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAGCTCACTTGCTTAGTGAATTAATCCAAAGACTA:1	+	chr3R	19446282	3'	+	297	384	2	77.54
CAGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGC:1	+	chr3R	20427480	3'	-	jockey	36	1	57.85
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGG:1	-	chr3R	31817435	3'	-	roo	8693	2	56.67
ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTG:1	+	chr3L	21855505	3'	-	blood	7092	2	80.00
TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTAGGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGT:1	-	chr3L	20654472	3'	-	roo	9	2	65.96
TTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATT:1	-	chrX	8814745	3'	-	pogo	76	1	71.23
AGTTCAACTGATTTTTTATAATCACCATTTGGGAAAATCTGTTAAGGAATTGTCAGAAATAATTTCTGCTTCGCGGAGCGGGGGGTGGACTGAGCGGGATGCCTGAGAATGCTGTTTGTTTTAACTTTGTTATTGGCCGTTTGTCG:1	+	chr2R	20967855	3'	+	S2	432	1	53.42
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTAC:1	+	chr3R	25448410	3'	-	roo	88	2	77.40
GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATTTGGAGCAACCAAGAGCATACAACAATATATAAAATACAT:1	-	chr2L	11732250	3'	-	Doc	38	1	51.03
GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCT:1	-	chr3R	27424819	3'	+	blood	7348	2	55.48
GACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAATG:1	+	chr2L	18689253	3'	+	Gypsy6A_LTR	257	1	73.61
TTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGA:1	+	chr3L	24208219	3'	-	Quasimodo	50	2	56.85
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGC:1	-	chr2R	13585383	3'	-	412	37	2	58.62
TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGCTTACACTTCCTGCCGCATTCGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTT:1	+	chr3R	22822170	3'	-	mdg1	7	2	57.14
AAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAGTTTAGTTGGCTGTTTCCTTTTGGTTGTGTTATTCGTTATTTGTTGCGCTTTGAT:1	+	chr3L	22833155	3'	+	invader2	5046	2	64.93
GTAATACAAAGGAATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATTGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGGAATGTGTAGGTGAAACACAAAGAATATAACTTAAACTTAACTTAAGGTCTTAAGTAACGTCTTCTCTA:1	+	chr3R	4187254	3'	+	HB	45	1	56.12
TGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAAAAGTGCAACATTTTTCTTTAAACACTATTTAATCAATTCTTCGTGGCGAACCGTTTTCCATCTCTGTGCCAGAAAAAAAGGTAACCAATATTTTCTAATT:1	+	chr3L	18369067	3'	-	opus	11	2	71.72
GAAATTAAATAAGCAAAATGTAATGTACATCAAGTTTTGATGACTTACATTAATTTAGATTAATATAATATTGAAAATTTTTTTATAGTGCTGAATCACACTAATCAAAAGTGGGAGCTTATCGAGTCTGCGATTCGCGGTTG:1	-	chr2R	12850302	3'	-	accord2	430	1	59.44
CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCT:1	-	chr2R	9791596	3'	-	412	79	2	73.97
AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCC:1	-	chr2L	13585846	3'	-	Tabor	6916	2	69.66
ACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGTAGCGTGAGTGCCTTGATTTAGTGCTTTCAAATCTGTGGCAACTGCCCG:1	-	chr2R	9049070	3'	+	R1A1-element	336	1	69.64
CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTACC:1	-	chr3R	31817468	3'	-	roo	60	2	72.03
AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATTTAAAACTGTACAAAATATAAAACGTCTACTAAAACTCGATAAAATTCTCGAATTTGAA:1	-	chr3R	15363915	3'	-	flea	47	2	56.39
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAG:1	+	chr3R	18339164	3'	-	roo	83	2	78.08
CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATTTAAAACTGTACAAAATATAAAACGTCTACTAAAACTCGATAAAATTCTCGCATTTGAAATTGGCTCCAATAATTAATCGATAAGC:1	-	chr3R	15363888	3'	-	flea	20	2	66.17
TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGCACGCTTCAGG:1	+	chr2L	12328739	3'	-	hopper	52	1	51.03
AATATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAAAGGCCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAACACCGCTTTAATTCGATGCCCATTCAGATGACGCTTAGATCA:1	-	chr2R	15748020	3'	+	mdg1	7204	2	70.55
TAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTATATTATCCTGGATTTTTTTAAATAATAATAATAATAGGG:1	-	chrX	21014724	3'	-	copia	3	2	60.69
AATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGG:1	+	chr3R	14860228	3'	-	BS	5053	1	56.85
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTCGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGAT:1	-	chrX	5643455	3'	+	roo	9030	1	56.16
CTATCGATATCCCAGAGAAATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGGGGAACCTGACTACAGCATTCTTTCTTGTTGGCTATGTCTGATGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAG:1	+	chr2L	22092992	3'	+	INE-1	502	1	70.55
CTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATGCTGCGCAAT:1	+	chr2R	12839549	3'	-	accord	187	2	64.80
ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCT:1	+	chr2L	18419253	3'	-	412	27	2	54.47
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGTAAATGAAC:1	-	chr2R	13084601	3'	-	roo	8704	2	62.04
CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCGCTTTGATTAATTATATGATCCATGT:1	+	chr3R	10274074	3'	-	HMS-Beagle	6813	2	71.64
AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAAT:1	-	chr3R	17605593	3'	+	Tabor	464	2	70.34
TCGAGAGGCAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTACATTATGGTTATATATGCATAATATATATATATACATATCGTATTGTTCCAGACAGCATTTGTCACGACTATACAACCAACG:1	-	chr2L	1664932	3'	-	hobo	16	1	63.71
GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATG:1	+	chr3R	22276760	3'	-	jockey	62	1	53.21
CTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTCTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTT:1	+	chr3L	7007618	3'	-	Rt1b	226	1	32.73
GTCATACCAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTCATACTCAATGCTTGGAACCCACATATCTCTTAGCTGTCGTATACGTAATATATATATACTTCACGTTTTAAAGCTTTACAATACAGAGCGCTTTTGGTCACAT:1	-	chr2R	18400520	3'	-	Tc3	317	2	66.44
AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTG:1	-	chr3L	1534530	3'	+	pogo	2037	1	67.39
AAGGATCAATAGCCGAGTCAATCTAGTCATGTCCGCCTGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCCGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTGCATAAACGAAAATTTATTTGATTGAAGACCCTCGATGG:1	-	chr2L	22080695	3'	+	INE-1	95	1	73.28
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCCTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAG:1	+	chr3R	19968170	3'	-	roo	78	2	80.74
GCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGATTACAAGAAGTA:1	+	chr3R	934302	3'	+	Rt1b	4751	1	68.49
CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCATGCCCATCCTTCGTAG:1	-	chr3L	18368887	3'	+	opus	471	2	64.29
CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGTT:1	-	chr3R	22821977	3'	+	mdg1	7421	2	45.52
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTACAATACTTGCTAGCTCTACCT:1	+	chr2R	9662815	3'	-	412	39	2	56.20
CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGACATAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAATCAATAGCCGAGTCGATCTAGTCATGTCAGTCCGCCTGTATGAACGTCACATTTTTGAACAATTTTTGGATATTTTTTCATAA:1	-	chrY	1803451	3'	+	INE-1	12	1	55.71
TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAA:1	-	chr3R	1433137	3'	-	mdg1	7	2	60.53
ATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTAGATAAGCGGAGATAGTAAATTATGTGGCCGCAAACAAGACCAAGAAAAGGTAAGGCAAA:1	+	chr3L	7943070	3'	+	Burdock	6194	2	59.60
GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAAAGCTGAAGAAGAGGAAGAAAAGCACTCAAAGTGTGCTGAAAATATTTG:1	+	chrX	17833126	3'	-	Tirant	7	2	77.70
GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACTTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACCAATAAACCGCACCACTCACCAAAGAGA:1	-	chr3L	10848594	3'	-	blood	7024	2	75.17
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGAGTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGCATACCAATTTCT:1	+	chrX	9540095	3'	+	roo	9002	2	69.34
ATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACTGTTAGCTAGGGACATCGTTTGCGTACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAAAAGATTTTCCGAGTTGGGGAGTGGGTTTAATA:1	+	chr2L	4105646	3'	-	Cr1a	4026	1	70.09
AAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTTATCGTGAGTCATTCGCTTATCTAA:2	-	chr3L	4536635	3'	+	roo	9067	1	76.71
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTAAAGACTGCCGCTCCCATAGAAGGCTACTGTATTAAGTGCAGCTCTAAGAGGTATCTCTGCCTTTTGGCCAACCACTTTGTG:1	-	chr2R	13088117	3'	+	roo	9026	1	56.16
AGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTACCCATATATTTATCGATTTACCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCCCACT:1	+	chr3R	4185855	3'	-	Burdock	6194	2	62.33
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTG:1	-	chr2R	9791585	3'	-	412	68	2	66.44
AAATAATTTTAAAATTTAGGATTAAACTTCGATTTAGTGTTTTGGCAAAAAAGAAGAAAATGGGGAACGGAAACTTGGTCGAAGGAGTCATCTATGTATGAGTAATCGCTTTCATGCTTGATGACCGAAATGATTAATGGATTTTG:1	-	chr3R	12786929	3'	+	S-element	1461	1	71.92
TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAG:1	-	chr2L	18419122	3'	+	412	7498	2	52.05
GTGTATATGCGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGTGTCCTTGCTGCTGCAAATGGCAGCACTCAGAGAGAAACTTACTCAAATGTTACTCAAATCGGC:1	-	chr3L	2675014	3'	-	accord	187	2	54.26
CCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACCGATGAATAAATATCATGCCAATTTAACATAATGATTTATTAGGTTATTTATCTTCC:1	+	chr2L	21887665	3'	-	G2	2663	1	65.07
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGGGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAATATACCAGTTAAATGGCAATTC:1	+	chr2L	18339062	3'	+	pogo	2064	1	55.65
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTGGGTGGATTCGGTCTGGTTTTATGGCAAATATTTTCGGTTTGTCCCTTTGCGAACTGGCCAAGCGGCAAAAGTTAAGTTTCAAAA:1	+	chr2R	9631288	3'	+	roo	9029	1	58.90
TATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCT:1	-	chr3L	25782384	3'	+	Stalker	6898	4	50.00
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAGTTTGTTAACAATTTTATCAGGCCCGAGATGTTT:1	+	chr3R	22276798	3'	-	jockey	56	1	60.00
AGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTAGCTGAAGAAACGATTGTTGGGTAAAAATATTGGGATCGCCTGTGACCACCGGATTTCTTCTAGAATGAGAATAT:1	+	chr4	954102	3'	+	1360	465	1	48.63
ACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAGTAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTACTCACTAACATTGCCAAGA:1	-	chr3R	4504007	3'	+	INE-1	554	1	75.34
ATGTGATTTATAAAAATAAAACATATAAAAATGTATGTTTATACATCTGAAATAGTAAAAGAGTTTAGTTTGATTTAAATTGGTACGAATATTTATCATTTTAATATTGGACAAAGGATTGCCTTGCATCATATTATATTCAAAG:1	-	chr3L	10003051	3'	+	looper1	1688	1	59.31
GTGGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTATATACAATATTATTCTGTTATTATATTAGTATTATTATTGTTTAATTGTGTCTTCGTTTTAGTGGATTAGTGGCATGATAGTTT:1	-	chr2R	8198640	3'	-	invader3	5111	1	75.00
AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTTGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAA:1	+	chr3R	27424919	3'	-	blood	7100	2	66.91
CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTATCAAATAAACG:1	-	chr2L	16067064	3'	+	297	348	2	55.24
ACTAAGAATTAATAACAATATTAAAACTCAAACATTTTGTATTTAAATCTAGCACGCCAATCTGTGTCCTTTTTTCTTTTTATTTTTATTTTTTTGCGAATCATTTTGGGTCTCATCAATCAAATGACGAACAAAAGCCGCTGGAC:1	-	chrX	3575086	3'	-	Gypsy12A_LTR	1817	1	87.67
TATGAGTGTCCAAAACGAACTGCTTAAAGCTAACAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTCAGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACTGTTAGGTTTTCCTCTTTTTCTTCTAAAT:1	+	chr2R	2565121	3'	-	gypsy3	127	2	72.39
CTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATGCCATTGCATCTGATAATGCTTCGTAACTG:1	+	chr3L	12879775	3'	+	roo	8619	1	48.11
GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCCTTTGAATCTTAGGGATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCACAAATTTATTT:1	-	chrX	17054205	3'	-	jockey	23	1	54.95
GTGCTGCCCCGCGGCGCTCTCAAACTGCTTCTCCGGAGACTGAGAGGAAAAAATTTTTTTTTTCAACTTAACAGATCATTTGTTATTATTCATTAGTCAGTAGGAATCGTT:1	+	chr2L	21825339	3'	+	X-element	392	1	77.48
GTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAG:1	+	chr3L	7588474	3'	-	hopper	78	1	79.07
TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTTAAGGTCGATTACTAATTCCCTTTCATT:1	+	chrX	13039550	3'	-	roo	8681	2	56.67
CTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGCCCTCGATATCACACATTGTAAGTTTGCTTTTGGCCAATGTTTACAGAAACTTTCCAAG:1	+	chr2R	24444708	3'	+	roo	194	2	61.48
TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACC:1	+	chrX	6522037	3'	-	F-element	82	1	71.65
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACATTCCGTGCTC:1	-	chr3R	14981129	3'	+	mdg1	384	2	58.22
AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTT:1	-	chrX	19983073	3'	-	blood	90	2	76.71
TGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATGTGCGACTCTGCCGCTGGTGTCTGTGTGTTTTTG:1	-	chr3R	178128	3'	-	BS	49	1	73.53
GAAGCGATGAATCAGTACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGT:1	-	chr2L	13053758	3'	-	BS	5071	1	71.23
TCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCACCTTAATTATATGGCCGCCGACAGAAA:1	+	chr3L	19036051	3'	-	Tirant	58	2	74.55
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTT:1	-	chr2R	16785315	3'	+	412	443	2	51.37
GGACTAATCTACCCTACCAATATATTAAATAAGTGGGTATATAAGTTATGAGTTTCTCTCCTGTGTCCAGAATTATGCAAATTAGGTATTTCTCTCCTG:1	-	chr3R	3948065	3'	+	Stalker4	6968	4	62.63
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATC:1	+	chr2L	17420251	3'	-	roo	8726	2	61.64
TAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGGGCAACCCCAGCTATAGTATAGTTTCGGACTTGGACCGATGCAATCTACGCTGGCCAGTTATCGACTT:1	-	chrX	5019781	3'	-	Doc	4588	1	59.17
AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGG:1	+	chr2R	16945343	3'	+	jockey	4930	1	68.60
GCTACATCTAGTAAGACCTCACTTTAGTGTGTCACAGCTGACCCCCCTATCGATTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAAAGTCAAAGCTAAAGCCATTCTTAAAGCAT:1	+	chr3R	26615158	3'	-	gypsy12	78	2	78.46
GAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACG:1	-	chr3R	19589931	3'	-	BS	5063	1	67.41
AGAAGGGTAATAGTACGCTAGTCAATTAAATTAAATAATTTCAGCTGAACAACTTGAAAAGAATACCGGCACATACAGTAAATAGTGAAACAGTCTAATATAACAGAGAGTTAACAGAGTTTCAGAACATGTAAGTTCTA:1	+	chrX	21171422	3'	+	jockey2	3359	1	37.14
TTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTGAATCACACAT:1	-	chrX	21564626	3'	+	diver	193	2	60.00
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGGAAATGGGTTTTTGCTG:1	-	chr2R	8760026	3'	-	roo	39	2	48.89
AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTACCAGCACGACACACTTG:1	-	chrX	2842445	3'	+	Tabor	7305	2	72.60
GCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAACAACGGCAATTGGAATCCGGTCAAGTGCGT:1	-	chrX	5663068	3'	-	P-element	160	1	68.91
TTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGCGTAAGTATATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGAATGACGTTTAGTTCTCAGCAT:1	-	chr3R	2468848	3'	-	Quasimodo	73	2	52.00
CTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGACATCTTGACGTTCATACGGACAGACAGGGTCCAATCGACTCGTCTATTGATCTAATAATTTCTCCCTTACACTTTGTGTAAGGGGTATCTGTTAGTACAGATAGTATCGTTTACAG:1	-	chr2R	4699239	3'	-	INE-1	155	1	53.96
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTC:1	+	chrX	8543512	3'	+	roo	8983	2	77.40
CTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAAATATTTAAAAGGGAAAGTAGGTTTAAATTTAAGTATATACATAGTTATCTTATAATGACTTTTTCGTCACAAAAACAACATATCTTTGAAGGATACGT:1	-	chrX	14749991	3'	+	copia	169	2	65.75
TCAACACACACACACACACACACACGTACGCAGCTCATTCTCCTGATGT:1	+	chr3R	28126698	3'	+	accord	182	3	73.47
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACAGAGTGAAAATGAGGAC:1	+	chr3R	7100946	3'	+	roo	393	1	71.72
GGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAACAGGATAAGCAGATTGCACTTAAACTCAGTTTCATTTAGACGGCAATTGTGACAAGAGGCCCATTAGTCGAGGACACTA:1	-	chrX	5457180	3'	-	HMS-Beagle	38	2	53.42
AATTCTTTTTAAAATAACCATTTTATATGATTAAACATACGTTTTATGATTGTTAACATAAACGAGTTTCTAGGGAATTGACCCTGATTATGTTCTGTTAAATCGTTATGTTTATATTTATACATTAGATTGTATATATATTTAC:1	+	chr3R	13353461	3'	+	Tc1	1495	1	68.97
TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGAT:1	-	chr2R	9791576	3'	-	412	7085	2	56.30
TATTAGCGTATCTATGCACTGGGAAGGGCGCTACTTTTCTTTTTCACATCTAGTTAACCAATTATTTTGTTGTTATTTTGTTGTTGTTATTTTTTAAAAAAAAGGTTGTAGTTTAAAGAAAAAAATTTAA:1	+	chr3L	7558821	3'	+	Porto1	4574	1	77.69
TAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTG:1	+	chr2R	2879460	3'	+	Stalker	6937	4	60.00
ATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTAAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATAGGGGATTATTAATTGATTTCATGTTTTTCGTTTAGAAATGAATACAGGTTATTTACTTAGGAAAACAAAAATGTATTTA:1	+	chr3L	7581889	3'	-	hopper	244	1	56.12
AGATCGCGTTCGATATCTCTGGCATAATATGATGTTTTTATGCTATGCTATGATGCTTAGGTCCAGTTCTTTTTGAATGTTTTAAATCATTGTTTTTAAACTTACTTTAATAACCAAAATAGTCAAATTTAAACAATTTTTGACAC:1	-	chr2R	4887628	3'	-	jockey2	3016	1	62.33
CGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAACATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATA:1	+	chr2L	20117926	3'	-	invader4	2830	2	77.04
TTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAG:1	+	chrX	16717900	3'	-	roo	8663	1	62.22
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTTCTAAGTGCACTGA:1	-	chr2R	9328562	3'	-	roo	8692	2	65.07
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATATG:1	+	chr3R	16076902	3'	+	roo	9033	1	56.16
GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAATTGTTCATTTTATACGATATAGCAC:1	-	chr3R	17478314	3'	+	copia	247	1	78.08
ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGA:1	+	chr3R	1433196	3'	+	mdg1	334	2	75.34
TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGC:1	+	chr2L	7888185	3'	-	pogo	64	1	83.19
GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTC:1	-	chrX	13704758	3'	+	invader4	3029	2	60.27
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGAAAATG:1	-	chrX	6486705	3'	-	roo	8713	2	56.72
CGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTTACTACCTTCG:1	+	chr2L	22150641	3'	-	S-element	70	1	82.07
TTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAACACTGAATTTGGGATCTGTGCATATTTTTTCTAAACAGATGGCATTTCGATTTGAAG:1	-	chr2R	16785285	3'	+	412	485	2	72.93
TTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGATAAGCCCAGTCTCCTCCTGTGCCAGGCACAAAAAAAAACGATTGTAAATGGGAAAAAATAAAAAATAACGATCGTTACGACAAACATTACGAGAAAACGATTTTCGCC:1	+	chr2L	7364117	3'	+	mdg3	5189	1	78.08
ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGAC:1	+	chr3R	14981276	3'	-	mdg1	7077	2	58.22
AACAAAGGGATCATATCTTAAGAACTATGTTTAAATAATCCTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTAAGTCAGTTATCTTGGAGCGGTATTATTTGGACTCTGTATTAACG:1	+	chr2R	5410318	3'	-	Tc1	1373	1	56.88
ATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAACTTGAAAGTTTTTTAAATTTGACGATCTGCTGGCCGATGCTGTGATGCACTCACCAAACACGTCCGG:1	-	chr3R	14645032	3'	-	1360	3165	1	58.57
AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAATGGAACCCGAGCATGTGCAAAGCAGCCAACCAACCAGGTGAAAGCAACATGCT:1	+	chrX	2518145	3'	-	P-element	22	1	61.72
CTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCT:2	-	chr3L	24292000	3'	-	1360	90	1	80.82
TTTTTAAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTTACCTAACCAAAAACACACTTTTTAGAAAATATTGATAATTTTCTTTTTTTTCCTATCTACACTTATTTATTCTGTTAAGACAGGTGTGCTTTTTTTAAATTT:1	+	chrX	15046398	3'	-	HB	309	1	59.42
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGAAAATGGGTTTTTGCTGTTGTTAAAATGTCTGAAAACAAGAGAAAAC:1	-	chrX	6486652	3'	-	roo	14	2	43.57
AGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGTAGAGAGATATTGTTCGAGTAAGAGTTAGGGTTAGCTAGAGGAGTGTTCATCGTGAGTTAGTTG:1	-	chr3L	3988851	3'	+	Doc	4418	1	51.88
ACTTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAATAAATTATTTCATAAGTCATGTATTACGGAGTTAAAAAAGTATTTATCAACAAAACATCGTACTTGCAACAACAGAAC:1	-	chr2L	15741551	3'	+	1360	247	1	49.32
GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAAATCACTCCTCGGCCCCCGAAAGTATGCCAAAAAGGGGAGCTATAAATATTTTAGAATTCAATTTCCGCACTTCCTTGGCGAC:1	-	chr3L	4948014	3'	+	hobo	2921	1	66.94
TTATGCGATATCAAATTCATATGTTTGATCAGCTGTTACGCTAAACTTTTACTCAACTTTGTGATTCTGTTAAAAATACAGAATGGAATATATATGCATTCAAAACTGAATCTTTCGGTTTTTTCCACTTACATTTAAC:1	+	chr3L	10778691	3'	+	transib3	148	1	67.63
AACAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGCGGGAGAGAAGTAAGCTTGGCTTACGTTGACAACACAAAAATAGCAGAGAAAAGC:1	+	chr3R	31058923	3'	-	blood	7180	2	73.68
AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACC:1	-	chr3L	10848621	3'	-	blood	7020	2	73.68
CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGCTGGGTGATTAGTACCCCAAGTAGTTAACCGCAAC:1	-	chrX	13126424	3'	+	jockey	4982	1	62.50
ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCCAACTCCATTTCAGTTGTCG:1	+	chrX	1899726	3'	-	P-element	43	1	54.29
GATAGCAGACAACTGTATGTGCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCCTCACCTGAGAAGTTCTTGGACTTTAAATATATATTATTTTTTCGCCCGCTGAGCACACATAATTGGGAGCAGCGGGAAGGTCCTGAAGAAAG:1	-	chr2R	25065621	3'	+	1360	162	1	65.28
ATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTTTTTTGTAGATTTTGTTCTATAGAAACTACATCAAATTCTAATTCATAAACAATTTTTGACAGTAATTGA:1	+	chrX	13335387	3'	-	hopper2	1177	2	56.16
AGTTCCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTC:1	-	chrX	22601934	3'	-	INE-1	141	1	76.71
AATTTTTAAAATATTTTAATTTTTTTTTAATTCCTTTAATATGAACATGAAAAACAAATAGACGCAATATAGAGTATCTTCTGTCATAAAAATGTCAATTGAAAC:1	+	chr2L	15564200	3'	-	1360	3032	1	75.24
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCCCAA:1	+	chrX	8543551	3'	+	roo	9022	2	50.68
GTTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTATCGTTAAGAGATAAGAATGTACACCTAAGACACTAGAATATTCTAGGGTCTTTGGTAG:1	-	chr2R	5876921	3'	+	invader3	97	2	59.52
CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAATAGAATAACATGTTAACCGAATTATT:1	-	chr2L	14892185	3'	+	transib2	2785	1	58.90
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTCTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTCAACACCATCTTTAAATTTTT:1	-	chr2L	21884466	3'	-	pogo	19	1	73.97
CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGCTAAGAAAATATTTAACAAGTGTTTGAATGATTTTGAAA:1	-	chr3L	3863414	3'	+	blood	343	2	57.04
TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATAT:1	+	chr2L	17420245	3'	-	roo	8732	2	65.75
AATATAATAAATTAAATAATTATTGATTGAAAATTTTTTTAAGCGATCATAATAGTGCTAGAGACATTGTTAATAACACCCATGATTGCACTTGCAATGGCTTAACCCATCTTTTTTTTTTACTGTACGCACTTT:1	+	chr3L	12834048	3'	+	HeT-A	7	1	28.15
GCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGCGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATTTCTGGTCCTGTCATCGAGTATTTTTATGCGGGCTGCCGATGGGCG:1	-	chr3R	17531345	3'	-	1360	48	1	51.45
TATTAAATTTCAAACAATTTAAAAAAAAATATTTCACTTTTATTTCTTCAATAAAGTCAAAATGAGACAACCACCGAACAACCCCACAATCCAACTAGAGCGCTATTTGTTAG:1	+	chr3R	31886253	3'	-	HB	1520	1	53.98
GCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAATTTCCAGAGTATCAGATACTAACAGGA:1	-	chrX	22601904	3'	-	INE-1	86	1	53.49
TCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGTCCTTTTTGCGGTTCCGAGATAGCGA:1	+	chr2R	9806049	3'	-	1360	116	1	77.00
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGTTCCAAAAAAATCATTTACTAATGTG:1	+	chr3L	6978241	3'	+	pogo	2042	1	60.84
AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTAAGCTGCTTTTGTTGTCTTCGCTTCATGGCTGCT:1	-	chr2R	9632098	3'	-	roo	27	2	50.46
GAAAAAAAAATGAAATATTGGACTTAAGGAGGGATTTATTTATGGTTGTTTGTGGGTCCTTGACATTTTGGTGGCACTTAATTTAAACCGCCACCAGCTTAATGGCTTTT:1	+	chr2L	16918077	3'	+	P-element	144	1	56.36
GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAG:1	-	chr3R	9210641	3'	+	mdg1	7381	2	71.03
AACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATACTATATATATATATAGGAGGGGGCTTGGGATTTGTGCGGTGCATACGTAAAGCGGTTCTTGCAAATTAAGGACTTATACTCACG:1	-	chr2L	10037279	3'	+	Quasimodo	7362	2	69.75
CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAGCTTTGGTAAATATAC:1	+	chr2R	13585515	3'	+	412	456	2	55.38
CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGTGTTCTTACACACGCAC:1	+	chr3R	20427510	3'	-	jockey	15	1	76.92
AAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGC:1	-	chr2R	7586157	3'	-	I-element	5099	1	67.69
TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACG:1	-	chr2R	19050162	3'	-	roo	8672	2	72.03
ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGT:1	-	chr3R	9921972	3'	-	blood	7063	2	58.57
CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCCCGTTGCCGCTTCTGTCACCAG:1	-	chr3L	10773070	3'	+	412	452	2	60.00
ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTTCTGTAGAAATGGCTTAGTTGATACATTAGTTTCCGATAACGGAAAACA:1	+	chr3L	23818421	3'	-	copia	73	2	68.49
TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCGCAGCTAAGATCAATAAACCGGGTCGCATTGATTTAATCATTGGAGCAGACGTATATACTCACATTCTGCAAAATGGAGTTATAAAAAT:1	+	chr3R	19444778	3'	-	mdg1	34	2	52.74
GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGC:1	+	chr3L	20168441	3'	-	mdg3	5319	2	63.57
ACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGCTGGTGTGGCTATTGTTGCAGTGTCCTTTAATTATTGCAAAGCTGCGTAAGTATCCAATTGCACTAAGTGCAAGGGATTATTTTGTAAC:1	-	chr2R	25249941	3'	+	TAHRE	10429	2	77.19
AATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCA:1	-	chr3R	17605661	3'	+	Tabor	7234	2	76.71
TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCAC:1	-	chr3R	19589936	3'	-	BS	5079	1	73.29
TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTGATTGCG:1	-	chr3L	23603176	3'	-	F-element	82	1	70.45
ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGATTTCATGCGAATCTATATGTGCATATTTATACACATTTGTACACTTGAGCAATTTGGCAAATAAATCATTATTATTTCATCAAATTTGTCATTGATAAT:1	+	chr3R	28946452	3'	-	hopper	20	1	71.92
GTAAGCCTTTATATATATTCGTTTTCTTGGGTTAACAATACCCTTACAGAGAAAAATCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGA:1	+	chr3R	25448426	3'	-	roo	8680	2	55.56
AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACAATTTCTTCTTCTATCATATACTAATAGTTTA:1	-	chr2L	13053709	3'	-	BS	5014	1	68.84
TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATTTCCCCGCCGCAGAGAG:1	+	chr3R	18121880	3'	-	P-element	71	1	21.37
GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGTTAAATAACTTTTTACTTTTGTTAATTACCAGTTTTATTATTATTATT:1	+	chr3R	17605775	3'	-	Tabor	19	2	71.23
ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATCAAAA:1	+	chrX	21014872	3'	+	copia	210	2	53.79
ACATAAACCAAAACAACAACAAAAGACGTATCATCAGTATATTCAATTGAAATCAATTCTAAATAATTGTAATGTTTTTTTTTCTTTTGTATTTTCAAAATTGTAGTTTCGGTAACC:1	-	chrX	8525561	3'	+	gypsy9	449	1	64.10
ATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACACCTGAAGGTTAAATGCTAATATACATCTATTATTTGTTTTCTTTGTTCAAT:1	-	chrX	22897597	3'	-	Bari1	69	1	63.70
CGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTC:1	-	chr3R	19450005	3'	-	roo	8832	2	70.55
GGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATATTCAATATATTTGTTTGTAACATAGTGGCAAAAGCTCCTCCGGATCATTGAAGCCACTTTTGCAAGCCTTGCTATTTAGAAAATTTAGCTGAAAAGG:1	+	chr3L	8408000	3'	-	Tc1-2	1616	1	66.40
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCACGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAGCAGC:1	-	chr3R	14979781	3'	+	pogo	2043	1	59.59
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTT:1	-	chr3R	16404486	3'	+	pogo	2059	1	68.27
ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTAACTTTGACCCCCTTTT:1	+	chr2L	16067192	3'	-	297	6612	2	60.77
ATCTAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTACACTTTTCCAACGAATCATATGCGCAATGAACAAAACGCGAGCTGAATC:1	+	chr2R	17122145	3'	-	Quasimodo	7254	2	65.00
ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCTC:1	-	chr2R	2016805	3'	+	1360	3383	2	74.29
GATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTTTCTTTGGATATAGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCAATGTTTCCTTATG:1	-	chr3R	19447018	3'	+	roo	8939	2	69.18
TTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCCCACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGA:1	+	chr3L	26011941	3'	-	F-element	73	1	70.73
ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGAT:1	+	chr3R	22822153	3'	-	mdg1	7068	2	45.89
TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGC:1	+	chr3R	17243217	3'	+	hopper	1357	1	56.85
AAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAATCTAGAGGCCTCCTTGCCTCCTACCAGTTGGCACTTCCCCAAGCTGTCACTTGTGCTGAAACACTCTGGGTGATTCT:1	-	chr2L	301051	3'	-	roo	9028	1	53.42
TTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGG:1	-	chrX	10445567	3'	+	INE-1	537	1	70.65
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAG:1	+	chr2L	6059318	3'	+	roo	9016	2	56.25
AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACA:1	+	chrX	11296488	3'	-	BS	5007	1	66.97
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAACTGGGTAACATTCTTT:1	+	chr2R	14388019	3'	-	roo	8719	2	61.87
AGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATTCGGCT:1	+	chr3R	9039056	3'	+	Juan	4204	1	75.37
ATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:3	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	377	1	55.48
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTGATCCCCTTATCATGTCCATTATATTTGAAAACTGATTTTCACT:1	+	chrX	8347640	3'	+	412	7497	2	60.50
TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCACTGGAAAGCCACACCAATGTTTGTCAACAGAGACCACGCGCAGACCGACCAAGAC:1	-	chr2R	15011399	3'	-	jockey	4802	1	60.84
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAAATAGCAGACAATGTC:1	+	chr2R	8585585	3'	-	roo	15	2	54.79
CAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTAGTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTAAATCTCAACC:1	-	chr3L	14665461	3'	-	INE-1	578	1	77.40
GAGAGAAAGAGAGAGAGAGCTTACAAATGCCGGCTAGTTTTCGGTGAGCATTCCCCAGCTGTTGCGCCAAAACATTATAAACAATCCATTTACAATGGAAAAGGAAAGGGAAGGGAAGAGAGTATACGCTGCTGGAGGTGGCTCCA:1	+	chr2R	13897947	3'	-	blood	166	2	64.38
CACGTTCAAAGCTCGCAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATGTGCAATGTATTCTGATGAACAAGAATGTTGGAAAGAAAGGTCAACTGTTTTGTATTTACAAGGGAGATAAGCCTCTGCA:1	+	chr2R	3287738	3'	+	Idefix	252	2	61.11
CACGTAATATAGCATAATCTCTCCACGGTACATTTGTATAGATTGTGTGAATGAGCATGCACGCCAGAGAGCCACACAGGGGCGGAACGGTCTGGGCCCTCGCGGGCAGGGGCCG:1	+	chrX	19666009	3'	+	G5A	2714	1	65.22
ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCA:1	-	chrX	2842480	3'	+	Tabor	7277	2	51.08
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGCCGGCGTGTGTCTCTGATTA:1	+	chr2R	21908036	3'	-	roo	28	2	61.07
AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAATTACCTATTTACCCGAAACAGGCGCACAATAAACTCGC:1	+	chr2R	1567957	3'	+	jockey	4955	1	50.00
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTAGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAACAACAAGAATACCAGTTTAGGCAAGAGATAAAGTGCCTTAAAATCAAAAAGGAAATCAAG:1	+	chr3R	19446840	3'	+	roo	9029	1	58.90
AAATATATATATAATATGTATGTCCCATTTAGCACCATTTCTTGCAATTTATATTTACTTCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTAAACTAACCTGCTTGGTCACCGAATCGATGAGACGCACGAAAATGTCCTG:1	+	chr2R	14793522	3'	+	Dm88	4367	2	66.91
TTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGTTCTCGTT:1	-	chr3R	18582087	3'	+	roo	410	1	81.29
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGA:1	-	chr3L	22437865	3'	+	roo	9006	2	63.01
AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTTTGTAATAAACCAGAATTTGTGTAATTAAAGCAGGAAAATGTAAAAAAGTATCTTGCAGATA:1	+	chr2R	9544144	3'	+	opus	7491	2	73.50
ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAACATACCTCTATAGCACCTATATAAGATACTGG:1	+	chr2R	16945343	3'	+	jockey	4941	1	65.45
AAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAGAGCTCTCCGCATCTAAAATTCTCTCGGCTG:1	-	chrX	17832974	3'	+	Tirant	8459	2	54.07
CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCGG:1	-	chr2R	8585405	3'	+	roo	9031	1	58.22
AATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCTAAGGATAAGCACTTTTACTTGGTGCGTTTGGTGCCACTGCCACCAC:1	-	chr2L	2794123	3'	+	Burdock	245	2	75.17
GACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTGCTAGTATTGATATATTTGTTAATGGATTTGTATGACGGCATTGATACGAGGGCTCGATCTAGCCAGATTGATGGATGGTCTTCGGGAATAAAAATGTTACAGAC:1	-	chr2L	23068234	3'	+	1360	499	1	73.29
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACG:1	-	chr3R	17817896	3'	+	roo	9012	2	64.66
CAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGC:1	-	chr2R	20596441	3'	+	roo	396	1	67.86
ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTAAAAAAAAACTAAAAAGACATTCACATGCTAG:1	+	chr2R	6885455	3'	+	flea	248	2	77.40
CTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTAATATGTTTGAACAGTCCCATCTTAAATATATCTTATTAT:1	+	chr3R	18722951	3'	-	jockey	4735	1	66.40
TGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAAT:1	+	chr3R	20427440	3'	-	jockey	73	1	78.63
CCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCACTCGACGAGCGTTGGAAGTGGACGAGGACGAAAAGG:1	-	chr3L	12871825	3'	+	roo	259	2	61.29
TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCT:1	+	chr2L	19965047	3'	-	Doc	80	1	67.63
TGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGGGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTC:1	-	chr2R	5284523	3'	+	Doc4-element	2620	1	59.70
AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTCATAAACACAATTGATATTTTTAAGCCGATACT:1	+	chr2R	6885418	3'	+	flea	4999	2	58.46
CGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCACTT:1	-	chr3L	25008285	3'	-	297	6934	2	79.29
AATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACATATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTACCAGCACGACAC:1	-	chrX	2842450	3'	+	Tabor	7300	2	67.81
AGAGATGCTTGTTGATGTTCTAAAAAGGAAAGGAAAACATAGAGAAAAAAAATGTATTTTGAGTTATCTACAAATTGTAAACTCTAAATACCACGTAATAGATCCCTTTGATGGCCGCAC:1	-	chrX	22707535	3'	+	invader5	3573	1	70.00
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAAACAGCTGGCAGTCACCTC:1	-	chr3L	22437808	3'	+	roo	400	1	78.08
AATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCAAGACTGTCAAAAATGTTCGTATATTTATGTTTACGGACAGACTTA:1	-	chr2R	6887998	3'	-	flea	378	1	65.67
TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATACATATATAGTAGCATACATATGTATCATACATGCATACATACTTACGCACACAAACAATACAAAACCTGGGGCTTCAGTTACTCTTTAATAGTCTTGTCCT:1	-	chr3L	20325467	3'	+	297	381	2	50.68
TAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCACCCTTTGTCGCCCCCCTTTTACTGAGCTTTATTTATGGTTGGAGCGTTGCGTGTTGCTTTATCTCTCTGAGAG:1	+	chr3R	9212073	3'	-	micropia	5107	4	50.71
ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGC:1	-	chrX	5662902	3'	+	P-element	2801	1	17.46
TTGTCACGGCTCCGCCCGACACTTGGTTAGTAAAAGCCGCGCGCGGTAATCGCCGGCCAACCCCTTTTCTAATTTACATATAAAAAGAATAAAGTT:1	+	chr3L	23365935	3'	+	gypsy2	280	2	91.67
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTA:1	-	chr2R	23802959	3'	+	roo	332	2	71.23
GCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATTCATTTGATATTTATAGAGATATATATGCGTACGAATAATTAACTACAGCTAGTGCATTACAATATGTACACTTAGTGGATAAA:1	+	chr2L	1380681	3'	+	hobo	403	1	60.27
TGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGCGAGCGCGAGAGAGAGTAAGAGAGTTGGCCGTCAATCTTCGCTCAG:1	-	chr3R	1301403	3'	+	F-element	193	1	62.16
AATGAAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCTACGGAACACTAAATTAATTATTTTATTGTTCCGTCAGTTGCTTAGTGTTCATGAGCTTTCTGAAT:1	-	chrX	2447754	3'	-	R1A1-element	152	1	71.23
TCCTCAAAAACAGTGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAAGACGATGTCCAGCTGTCATTACCAGCATAGGTCACGCAGATGAAGAGCTGGGGCGGCAAC:1	-	chrX	19677142	3'	+	Tc1	1264	1	76.24
GATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTGTTGTTGTTGCCTTTGCGGCTTTACGTCGCTCCTAG:1	-	chr3R	18122488	3'	+	P-element	4	2	34.86
AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCATTAAGTCAGGCCACCTATTTTTTTTATTTTCTTCTTGGACTTCTTCCAGAAGCTTTTACCTCGTCCAAGTGAAATG:1	-	chrX	10253150	3'	+	hopper	1392	1	67.81
ATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGG:1	-	chr2R	982342	3'	+	rooA	7491	2	50.00
GTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCA:1	+	chr3R	19450163	3'	+	roo	265	2	58.90
GAGAATGATATAGTCGAGTTCCCCTAATATCAGATATCCTTTACTCAGCTGGTGTGAGTGCGAACACAAAATTTGATTATTTTTCGGTGATATCGATAGATATTAAGGAAAGAGCCTAGTCCACCATTTCTGTCCACTGGGATAAT:1	+	chrX	1876563	3'	-	INE-1	573	1	75.34
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAGGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGTC:1	+	chr3L	9998201	3'	-	roo	49	2	54.41
GCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCCGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAACCAGGTGGAGAGGATGGGGATGGAGCTGGGGATG:1	-	chr3R	24994775	3'	+	412	320	2	75.34
CTTCTTTCTCCAAAAACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGTCTGAAATTTGTAGTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAATGATACCACTGAGCTTTCTCTTTCTGC:1	-	chr3L	25911975	3'	-	looper1	1525	1	82.88
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCA:1	+	chr2R	21907990	3'	-	roo	8712	2	75.24
ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTGAATCACACAT:2	-	chrX	21564626	3'	+	diver	192	2	59.59
GTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTCAACAAATTTTAGGTTATTTTAATAAAACGTTAATCACGATCTGTGTATCGCTTCTTCGCCT:1	+	chr3R	31976599	3'	-	TART-B	10183	1	76.03
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTG:1	-	chr2R	9662723	3'	+	412	7496	2	65.49
ATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGAATAGGGTAGTGGGT:1	+	chr3L	22349294	3'	-	jockey	31	1	58.77
GTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGCGATTTGTCGCTGCCCCACTTAACCAGTATCGAGTGCTTAGGTGTAGCATGGAAATTAGGCATAAGAAGTATGGTATA:1	-	chrX	10540311	3'	-	I-element	264	1	55.48
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGC:1	-	chr3R	18582126	3'	+	roo	9031	1	55.86
ACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTGATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTT:1	-	chrX	20453686	3'	-	INE-1	548	1	79.45
TTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCCGGCCGCAATTTCT:1	-	chr2L	10022996	3'	-	Doc	40	1	50.46
TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTGGG:1	+	chr2R	16785467	3'	-	412	20	2	72.60
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTT:1	+	chr3R	18582274	3'	-	roo	8684	2	67.42
CATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTACTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTATTGTTGAAGCTGTCAAGTATGGTGATGTCAACTTTCAAATTCGCATGATCGG:1	-	chrX	20362737	3'	+	1360	365	1	69.18
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTGCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACA:1	-	chr3L	22437881	3'	+	roo	8990	2	72.60
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGC:1	-	chr3L	9998027	3'	+	roo	9043	1	45.21
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCAC:1	+	chr3L	4536769	3'	-	roo	8748	2	76.03
ATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTCTCTCACAAATACACTCGGGGGTCCAGGTCCACAGGTACAGGTATGTGGGAGTTACGGAGGGAAAAAATTGCCAAGAGTTTGAAAACAAGGCGGTGG:1	+	chr2L	15826403	3'	+	hobo	433	1	65.07
ACCAAANAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTGTCTTATT:1	-	chr3R	25339967	3'	+	mdg1	7400	2	56.85
ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTTTCAATTAAATTCCAATTAAAGAACTAAAATGACCATATAATTTCAT:1	-	chr2L	12498337	3'	-	pogo	67	1	71.23
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAAT:1	-	chr2L	18294208	3'	+	roo	340	2	69.85
TAAATAAAAACCAATTACAAAAGGAAAAAAAGCGAAATAAGAAAGCCACGACGAGGAAACCCCTGTACATAGCTGCAACCAGAACAACAACAGGCTCACATAGAGAGCATAAACAACTAGCTGATAATCAATAAAGCAAAAGCAGG:1	+	chr3R	16399551	3'	+	transib2	100	1	58.90
TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTAGGATAACGATGTGTTCCAGTTCGGAATGGGCTGAAAATAAATTATACATTCAAATGCGTTTAAAGCACGAAATTGTCATCAAAACGGGATA:1	+	chr2L	12264200	3'	-	jockey	4778	1	65.28
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATT:1	+	chr3R	16076883	3'	+	roo	9046	1	57.02
ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATT:1	-	chr3R	22217839	3'	+	hopper	1351	1	60.27
AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAAAAATATTTATTTAGTTTCGAAT:1	+	chrX	10201233	3'	-	transib2	53	1	56.43
CTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATACTTGCTGCACATTGCGGCGGCCAATGATTACACCGACATGTGTAAGCTGCTGCTGGA:1	+	chr3R	27361890	3'	-	jockey	4929	1	60.96
ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAA:1	-	chrX	13066485	3'	+	jockey	4951	1	53.10
TGAGATCTCGACGTGCATACGGACGGATAGGCAGACACGTCTAGTTCGAATCGGCAGTTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAATGGTACCTATTTATAAAAATCAGCTTTAAATTTAAA:1	+	chr2L	14885060	3'	-	INE-1	135	1	64.44
AAATCGCGCACCGCAGCAAAAAGACGAGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTCCTCGTTGATTACCGAACCATTTAAGTGTATTAACAGAGCTGATCCCTTGAGATACAAATACCCTAACCCCTTCG:1	+	chr3L	10393310	3'	-	Rt1a	31	1	58.14
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATCTGAATG:1	-	chr3L	9998008	3'	+	roo	399	1	45.21
TTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGACTTACTTTATTCGGATTAATTTGATTTATTTCAGGGCCACTGTGCCGCTTCTTCTGGCCGGACTCATATCG:1	+	chr2L	19004288	3'	+	I-element	331	1	53.10
ATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTCTGCGTGAC:1	-	chrX	19409307	3'	-	mdg1	36	2	70.00
ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTT:1	+	chr2R	16248031	3'	-	BS	17	1	62.88
TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTTTTAATTTATGTTGAGGAAGTTTGAGGGAGAAAGACAT:1	-	chr3R	21434835	3'	-	412	7076	2	64.38
AAACCTCGCACTAAGCATGTGAGGACTTAATTCCTCTTAATTACTTTACGGGCATGGTAAGCACGGTGGCGAACAGACGAGGCTGAAAGAGTCGTAGATCCTGCAGCTTCTCGGGATCTTGAGACAATG:1	+	chr3L	16729515	3'	-	BS	5002	1	62.02
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAA:1	-	chr3R	25448320	3'	+	roo	9028	1	55.17
ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACACTGCTACTGTAACTCTGATCCAGATTCGGATTCAGATTCAGATTCGCAGCAGTCGCAAATGACAATGCATT:1	-	chr2L	2703440	3'	+	hobo	2926	1	50.00
CTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAGAGCTCTC:1	-	chrX	17832997	3'	+	Tirant	8431	2	71.63
AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTC:1	+	chr3R	29361066	3'	+	mdg1	7404	2	59.29
GAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCTTCTTTGTGGCGACACGCGTCGCC:1	-	chr2R	7586118	3'	-	I-element	5035	1	79.05
TGAACTAAAATTTTAAATATAATCCAAGAACTGCAATTCTGTTTCCCACGGAGCGCTGGGGACCAACAAGCCATAGTCCCCCAATTATATTGTGAAACCCATTTCAGAACCTATGCTCTCACATAAA:1	+	chr3L	14779817	3'	+	Rt1a	345	1	70.87
GATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTGGAGTGGGGCTAGCTGGCTAGCTGGTGGATGCCATACGAGCGTG:1	+	chr2R	23332674	3'	+	invader4	323	2	76.55
GCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATAGTTGTTTAAAAATAGTTTTAAATGCAAAATGACGTTTGAAAAGGGAAAAATGGGGGGAAACTATCGAGTGTCATGCACTTGACGTCAT:1	-	chr3L	16750600	3'	+	Tirant	393	2	77.86
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAATAAAATGGTAGAAAGGAAGTGTGGCACGG:1	+	chr2L	14772175	3'	-	roo	8682	2	71.23
GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTAC:1	+	chr2L	10037426	3'	-	Quasimodo	27	2	60.32
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGG:1	-	chr2R	14542132	3'	+	roo	9047	1	56.36
AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTACCAGCACGACACAC:1	-	chrX	2842448	3'	+	Tabor	466	2	72.03
CTTTGTAGGTCAATTATATCACCATGTCAGCAAGGTTTTATGAAACTTAGTGCGGAAAAAAGCCCACATAGCAAAGTCTTCCGCAAAAAATAAAAGCAAGCTCAGCGATATTCAAGCAAGCTTAGGCACAAACAAGCAAGTACCAG:1	+	chr2L	22760427	3'	+	Q-element	181	2	67.81
GAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTT:1	+	chrX	21564738	3'	-	diver	5966	2	73.29
AAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGTAAAATACATGATGCTTTTAATTCAATTTAAAAGGATATCTGTCAAATTAACTAAAGTGCCTAAGA:1	+	chr3R	17500769	3'	-	roo	272	2	47.27
ACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCAT:1	+	chrX	13704861	3'	-	invader4	2824	2	66.43
AACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAATCTAACTCAGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATATTTAAATTGATTCCGATTGTA:1	+	chrX	20870168	3'	+	gypsy	7377	2	67.36
AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCGTGACCGTGGCAACGAATATCGACA:1	-	chr2R	19726876	3'	-	1360	39	1	75.86
CCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGAAAATATGTATTATTTTAATGCATATGAAATCAGAGCTCTTATGTACATATATAAGGCCAAACTAAACGATGCAGTGACCAAA:1	-	chr2L	22093191	3'	+	roo	8977	2	57.53
AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAACCTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATATGTATGTATAATGAACAACGATTTATGTAT:1	+	chr2R	6361977	3'	+	copia	5048	2	76.34
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGA:1	-	chr2R	20596448	3'	+	roo	9019	2	54.11
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAATTATACTATAAC:1	-	chr3L	20831242	3'	+	roo	9046	1	68.49
AAATAAGTAAAGTATTAATGATCCAATTTAATTAATGGCAAGAAAGTGCCTTCAATGAAAACGAAATCGACAAAATTTGGGATTAATAAACTGAACTTTTAATTCAGAAATTTCTAGAACTTAAAAACTTAATTTAATAAAAATG:1	-	chr3L	11423049	3'	+	Tc1-2	75	1	83.45
ATTTCGCATTAACACTAACTGAGTAAGGGGTATCTGCTAATCGGTGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGATCGACATTTTTTTACACTTAAAAAAATGTAGCTGTTAGGATGATTTTGGTT:1	-	chrX	22518963	3'	+	INE-1	529	1	66.44
TGTGTGCGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATGCCTA:1	+	chr3R	25454133	3'	-	Quasimodo	28	2	52.74
TTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTATTAGATAAGTCCATGAAAATTGCTTTTCTATTACCCCTGGTTGAGCCTGACTTTTTAATGTGCAAATAAAACGCTGCTTAGCCATTA:1	+	chr3R	20493405	3'	-	mdg3	5497	2	66.44
TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCATGTTAAATTAACACAAAGGGGAATGACATTTTTT:1	+	chr3L	18357208	3'	+	opus	7499	2	57.14
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCGCA:3	-	chrX	5643433	3'	+	roo	9052	2	71.23
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATTCAATTCAAATATTCTTCACTTTAGCAGTGAGCAACTTCGTTCCCTGT:1	+	chr3L	10292941	3'	-	roo	22	2	70.55
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAG:1	-	chr2L	7945342	3'	+	roo	8994	2	77.94
GCGCGCTCTCTCTTGATTTTTTCCAAGGCGACCAGCAGGCGCCACTCTGCTCCTGCTCCTACTCCTGCCGCTGCCGCTGCTTCTTCTTCGGGCTGTTATTATGGCTGT:1	+	chr2L	1618193	3'	-	F-element	353	1	77.78
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGA:1	+	chr2R	13710696	3'	+	roo	9028	1	55.48
GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAACCTTTTTTTTCGTTTCAT:1	+	chr2L	15833100	3'	-	hobo	51	1	52.74
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGG:1	+	chr3R	7835217	3'	-	roo	42	2	53.49
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTC:1	-	chr3R	25448324	3'	+	roo	389	2	64.96
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTT:1	+	chr2R	18336221	3'	+	roo	8991	2	76.60
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAG:1	+	chr2R	13710676	3'	+	roo	9021	2	56.39
GAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTTGTTGTGGACTTGGCTCAGTTTCGCCTTTTTTGGCATGTGCGCATTTAATTG:1	-	chr2L	19310297	3'	-	Juan	4107	1	51.37
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGCCGTTTAAAATATGTCAAAAGTTGAATTGAAATTGTATAAGTGTTGTTTTGGAATTCCATAAAAACTAGTTTAATAGCTTTAGGAAAGGGTTGTGTGTTTCTGA:1	+	chr3R	25442232	3'	+	roo	400	1	73.97
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAGTTTTCACGCACGGTTT:1	+	chr3R	27994312	3'	+	roo	391	2	70.90
AACATANACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTT:1	+	chr2R	16785404	3'	-	412	65	2	70.31
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACTGAGGAATTTGAACGATTGAATAATGAAATTAAATTTATGAAAGAGAACCATCAAAAATTGAAAGATTTACATTTCCATCATATTTCCGGACATG:1	+	chr3R	19449772	3'	+	roo	9043	1	68.06
AAACAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTAAAAAAAAA:1	+	chr2R	6885432	3'	+	flea	250	2	68.66
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGTTCTCGTTG:1	-	chr3R	18582086	3'	+	roo	406	1	79.17
ATAATAATAATAATAATAATTAGGCTCAATATTATGGTTTCCAAATGAATCTTAAAAACATATAAATATGTATCTAATACCTATTTCTATATTTATTAAGATGAACTAGTTTCTAAGCTAACCAAAGTTTTTGAGAACCAAGAAAT:1	-	chrX	14157567	3'	+	mdg1	7082	2	51.37
TTTTTTTTTTAATTTTCATGATAAAATCCTAAATATGAGTAGCACTTTTAATTGGATCCTAAGCTTAAACAATTATAGTCGAAATGGTTCTCTGTGGAATCAGCAGAC:1	-	chr3L	8684192	3'	-	Doc	4692	1	81.48
TTACGCGGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGTAGGGGAGCTAAATTCGGGAGCTTGAAGCTCAACCAAGAGCGAGGGAATGTAGAAAATGGTCGGCGGGG:1	-	chrX	6499854	3'	+	Quasimodo	6962	2	57.85
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCATGAGAATTGAGTAAGTTTTCGCCATTCCACTTGACAGCTTAAAGTTCCTCTGCCACTCGCGACTCCAA:1	-	chr2R	14387912	3'	+	roo	9053	2	63.96
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAA:1	+	chr3R	18582241	3'	-	roo	8731	2	66.44
CCATTTCTGCCTACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTA:1	-	chr2R	15064369	3'	+	412	402	2	76.03
GTAGTGTATCTATCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACCAAGCCATGGGTTGGCACACCAGGAGATTTACCTGCGACTCACAGGCTCGCAC:1	+	chr3R	15101748	3'	+	Stalker3T	2	1	65.75
ATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGATCCTTGTATCATATTTTATTTGGTAT:1	+	chr3R	19448567	3'	+	Quasimodo	190	2	75.81
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTC:1	-	chr2R	20596479	3'	+	roo	8989	2	75.17
AAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTGAATGAATGAATAAATATAAAATCTTTGGTGTAATGTATGGCATTTTTATTAATTACAAATTTCGTAGCAAATAATTTAATTTATTACTTATAACGAGCAAGTATACTGCATCTG:1	+	chrX	22837198	3'	-	INE-1	34	1	75.34
CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAACAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTTCATATACATATATTCCGTACTTTTCTGTTTGCTCGCATTGTGGACTTTTT:1	+	chrX	18030346	3'	-	opus	58	4	64.96
ACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACA:1	+	chrX	11296488	3'	-	BS	5044	1	53.42
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACGATTCGTGGTGGTGATGAT:1	-	chr3L	16343173	3'	-	roo	8678	2	74.81
ATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTGGAGCTGTCAATGGCAATGCGCGCTTTATCGCTGATTAACCCAAATTTAAATGGAGCCTACCCCAGTCACCCGTTCCATC:1	-	chr2R	23803311	3'	+	roo	8721	2	64.04
TATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAACTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGGGTTTGTGCTGTTGG:1	-	chr2L	22975388	3'	-	1360	136	1	57.02
CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGTATACGGGTATAAAAATATTATATTGCTTTTCTATTAAGTAAGCATTATT:1	+	chrX	22511417	3'	+	1360	3335	1	68.57
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGAGAAG:1	-	chr3L	22437850	3'	+	roo	9022	2	52.41
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTTTTATTATTA:1	+	chr3L	15177321	3'	+	roo	9021	2	53.42
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTTGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATT:1	+	chr2L	18294281	3'	-	roo	8718	2	64.06
AATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTGACTGCGAATACACACTCGGTCGACGCCGACGCCAACGCCTC:1	+	chr3R	12595914	3'	+	hobo	315	1	64.10
AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAATGCTTGCCTCTGCTTAAGCAGATGTGTGAGTGAGAGTGTGCCTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGAGCGGGGTTAAAAAGTGCCA:1	+	chr3L	17136167	3'	-	hopper	32	1	61.64
AGAATGCCTTAGGATTTAAGTCATAAATTCAAGTATCCCATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTTAAAAAATGTTCGATAAATACGAGTAAAATATATTCAGTAATGCAGTCGA:1	+	chrX	10366419	3'	+	Quasimodo	91	2	65.75
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATC:1	+	chr2L	11485272	3'	+	roo	8991	2	74.31
CGGGAGAGCAGGAGCGCGGTTTTTTTTTGTTTTGTTGTAG:1	-	chrX	13696145	3'	-	F-element	366	1	65.00
GCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCACAGATAGACCGACACACCGACAC:1	+	chr2R	20913950	3'	-	hobo	67	1	81.58
GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTAGTCAACCTCTTTTTGTTGCGACTTGGGGGCGTCTGG:1	+	chr2L	1665038	3'	+	hobo	2897	1	66.35
CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGTTTGCTTTTGTTGTTCTTTCGAGCGATCTGCTAGCA:1	+	chr3R	14651341	3'	+	P-element	2870	1	74.66
GTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTT:1	+	chr3R	1446145	3'	+	1360	3380	2	29.86
TGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGCTACGCCGGCAGCGCTGCTCCTCGACTTTGGCTAAGAAACCCTGGTATGTAGATCATAAGAGCATTGACAAA:1	+	chr2R	3194087	3'	-	McClintock	5957	2	67.13
TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGAATGTAAATATAGGCTCCTTGTATTTTTGAAGAGTGAG:1	-	chrX	6191163	3'	-	FB	69	1	72.52
GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAACCATATCTGTATCGTCTTTTCTGAAACTGAGGTCATCCAGCCCGGCGCCGGAACTCATTTCCCCGGC:1	-	chr3R	11496486	3'	-	1360	16	1	71.11
GGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCAC:1	+	chr3L	23702266	3'	-	G4	25	1	57.98
CGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATTCCTTATAAACTGATATTTTTCCTTATAATAAGACATTTCGTCTTCGTGAATCGC:1	+	chrX	22118634	3'	-	gypsy	63	2	62.33
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAAGAATGGGTATA:1	+	chrX	9540086	3'	+	roo	9001	2	75.19
GTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTAGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATGCGTGTATGCGAGTGCATTGTACGGCTCAATAATTACATTGTATTTATTTGAAACAGT:1	+	chr2L	15842570	3'	-	Stalker4	153	4	58.90
ATTAATTATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAAAGAAAAAAATATAATAAATAAAAAGATAAGAATCAAAGTCTTACATGGTGACCAATTACCTTAGACATTAAGAATAACTCTTA:1	+	chr3R	5453627	3'	+	G4	3800	1	62.33
TGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAA:1	-	chr2L	4412559	3'	-	Quasimodo	68	2	65.75
TTATGTTCGTATATACTACATTACATTCATTTTAAATCTTGCCATAATAGAACCAAAATTTCCCGTTAACATTATTTTACAAAATCCCTACCCCTTACAACAATTTATATACATACATAGAAACCAGGCAAATTGAATTGATTTGA:1	-	chr3L	3477367	3'	-	mdg1	7037	1	72.60
GGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACACTTGCTATACAGAAGTTTTTAAATATCTAATACATATTACATTGAATAAAT:1	-	chrX	20870112	3'	-	gypsy	7054	2	63.45
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAAT:1	-	chr3L	6978115	3'	-	pogo	38	1	57.53
CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCATAACTAATTAATTATGCCTTCTT:1	+	chr3R	27424975	3'	-	blood	40	2	63.70
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGA:1	-	chrX	6486710	3'	-	roo	8730	2	63.70
AATGCCGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACCCGCCTCCTTCAAGCCGCC:1	+	chrX	21009463	3'	-	pogo	36	1	71.43
GTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAG:1	+	chr2R	8624843	3'	-	Juan	4089	1	64.89
ATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAG:1	-	chr3L	18368928	3'	+	opus	7427	2	73.97
TTGTCATTAGAGTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTCGTGCCTCAAGATATGAACATCCATTGGTCTCGCATATCCTGCGATAAGAGTATATATAACATCTGCTGA:1	+	chr3L	3476121	3'	+	1360	407	1	61.48
TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTTCGAAACAGAGTTAAATTTAT:1	+	chr3R	12717863	3'	+	297	6943	2	64.38
GCCAAAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGGGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTATTTCTACGTTAGTCTGCGATCGTCACCTACAACAACCTACACCGTTGCGGC:1	-	chr2R	4909227	3'	-	G4	3419	1	79.58
TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAG:1	-	chr2R	5248233	3'	-	1360	64	1	61.64
TATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTGCGGCGAAAGCCTATAAATAACAATATGCATTGCTATTTCGGATTTGGGCGTCGCTACCTTCGTCCATT:1	+	chr2R	16783961	3'	-	412	7292	2	51.75
AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCC:1	+	chr3R	15364011	3'	+	flea	228	2	55.66
TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAATACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGAC:1	+	chrX	6522036	3'	-	F-element	89	1	72.18
TGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATGTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAAT:1	-	chr2L	14588753	3'	-	1360	328	1	56.55
GTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTGCCGA:1	+	chrX	10253282	3'	-	hopper	70	1	65.07
TATCACATACACGTTACTCAGCTATTGTGAATGCGGACGCGATATTTCATCATTTCATTTTCGGGGTTATATTGGGTGATATTGGGTGAGTGTTACTTATGCAAAAGTAAATTATCGACTAAATAAGAGAAATGGAAGAAATGAAA:1	+	chr3L	25971496	3'	-	INE-1	546	1	62.33
GAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCAAATCAAAACAGGACGAAATGTGCAAGTTTGTAAATACA:1	-	chr2L	12699093	3'	-	412	276	2	69.29
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAACTGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTA:1	+	chr2R	8585558	3'	-	roo	42	2	45.89
ACTACATCAGAAGGATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCGCGGTAATGGGAAATGGTCTTTTACAATTACTTTGTTAACTGTAACTTGTAAACTTGTAACTT:1	+	chr2L	21400437	3'	+	mdg1	407	2	74.47
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCTCTGGGTGGGTGGTCCTTTAAATATTCAGCGGTTAATTTTCTACAAGAACAATTGAAAATCTTTTTAAGTAATTTCCACACGTAATCCA:1	-	chr3L	22531218	3'	-	jockey	27	1	41.09
AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGAATTTGACGGTGCGGAGTCGCAGGACTTAAC:1	-	chr3L	15490310	3'	+	copia	5069	2	54.79
TGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTGCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTACTTCT:1	+	chr2L	10037430	3'	-	Quasimodo	42	2	53.79
TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACCAATAAACCGCAC:1	-	chr3L	10848609	3'	-	blood	7037	2	67.13
CGAATAACAAGATGGGTAACGCCCTTCGATATTTTGCACACGATTTCTTCGTGCTGGCTAAAAGGCTGGTTTCAGGCTCTCTCGAAGACCTCTATAGCAATCCCAGTCAAAAGTGTCGAGGGAAAGAATTATTATAATG:1	-	chr3L	23250413	3'	+	1360	11	1	75.54
CTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAACACAAACAACAATCGCTTCGTCTACGTCGCTTTTTG:1	+	chr3L	10385948	3'	-	Burdock	44	2	54.11
GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAA:1	+	chr3L	7943737	3'	+	Burdock	221	2	43.84
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAG:2	+	chrX	9540113	3'	+	roo	9011	2	59.59
CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCAATGGGCCAATGGAG:1	-	chrX	18193636	3'	-	jockey	35	1	60.45
CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCAAGGCTAATCCCACAATTTACCA:1	-	chrX	2842459	3'	+	Tabor	7291	2	61.64
ATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGCTTTACTCTGAAATTATTTCACAGAATTGTGAAATTCAAATTTGCTTACTGAT:1	+	chr3R	1207561	3'	-	copia	4930	2	61.15
ATTTGGTCCTTTGAGCCGGATCGAGCTTGATTATTCATCCTACCTTAATGGTCAACATTACCACCCAACATTCTTTACTATCCCAAAATCCATAGATTTTCGAGCCCCAATGTACCCAATACATAGTATTCCCC:1	+	chr3R	30780045	3'	+	GATE	273	1	67.91
AGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTT:1	+	chr2L	23372630	3'	+	Gypsy6A_LTR	281	1	51.37
GATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAAACCGTCACTGAAAGCCGGCCAGAGATTGTGACTTGGGGCCNAGTTGGTTGTGGGAGCAACTGGAGCAGTAGGACCAGCAGGA:1	-	chr3R	12599864	3'	+	hobo	2506	1	73.28
TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGACATTTGGTTCACTGTCATATTTGCCAAGCGCTTCACATCAAATCGCAATCAGGTTGGATTGATGGAA:1	+	chr3L	15490424	3'	-	copia	19	2	66.07
AACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGTAGCAAATGCCAATGTTTAATTAGAAAACACATATGCAAA:1	+	chr3R	9037066	3'	-	S-element	1702	1	54.12
ATGCACTGTATCTCCCTCTTATTGTCACGGTAACCAGAAGCTTCTTTCTCTTATTGTGAGACTCTCTGTAACTCGTAAGTTGGCTGCCTGCGTGCAAACAATATAGAGATCGAAGTGGCGTATATATGAGCAGGCGAATTAAATTA:1	-	chr2R	5541273	3'	+	Dm88	56	2	64.38
TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGACGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTCAACACCATCTTTAAATTTTTT:1	-	chr2L	21884465	3'	-	pogo	11	1	76.98
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGA:1	-	chr3R	18582137	3'	+	roo	9020	2	53.79
TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTGGCAGAGAGCGAAAACAAAGAAACCTACCGCCCGAGAG:1	-	chrX	6279341	3'	+	P-element	2830	1	45.21
TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAAGAAGACT:1	-	chrX	13066468	3'	+	jockey	4980	1	70.68
AGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTTTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATTAAGCTTCATTTTTATTTCTATTTACATTTTGCTC:1	+	chr2L	1839369	3'	-	hobo	15	1	73.97
AGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTTATCACTTGGCGGCAGCTCCG:1	-	chr2R	19501383	3'	-	P-element	484	1	17.27
AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGCGTAGACAACTATATTCAGGGACAACTGCAGTGCATTCAATGTTATGCAGATCACCTCCAGTTGCTCAATGAAGGAGTCATCCA:1	-	chr2R	16946650	3'	-	jockey	4747	1	68.64
ACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTAATAGATTGGCAT:1	+	chr3L	19014017	3'	-	invader3	5242	2	55.48
TTTTAAGCTACACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGAACAGGAA:1	-	chrX	6952084	3'	+	G5A	2779	1	63.19
GCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTA:1	-	chr3R	16076777	3'	-	roo	8723	2	60.00
AGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAAT:1	-	chr2L	17420144	3'	+	roo	9019	2	56.64
TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACATGTTATGGTAAGCGAAATCAACTGTTGGGCAAAAACCAGAAG:1	+	chr4	408869	3'	-	BS	5073	1	65.60
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCT:1	-	chrX	10640024	3'	+	roo	355	2	59.84
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTG:1	-	chr3R	25448340	3'	+	roo	358	2	57.25
CTCAAATAATAAAAAAAAAGAATAAAATTCCTAATAATGAAATAGTTGATCCAATAGTTGATACAATATTTCATGTTGTGTAAGCATCTGGGTAATCTGAATAACGTCGAGGTATTCCATAGTGAGGTGCTCATTTTCTCTGTTAA:1	-	chr3L	14381953	3'	+	Rt1b	5145	1	18.49
ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATTTGATTTGATTTCCTTAGATAATTGCCAAACTGAAACATGTGCGAGA:1	-	chr3R	22217793	3'	+	hopper	1397	1	71.92
GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGGCTTTGGTCAATCACCTGTCGCCTGAAAGTAGGCAGTAAAAAGTGCCCCGAGGAACAGAAATATGTATTTAACGAACTA:1	-	chr2R	18528666	3'	+	jockey	4950	1	53.10
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGATAGAAATTTACAAAACTAATAA:1	+	chrY	9415	3'	-	roo	8740	2	71.23
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGG:1	-	chr2R	20596432	3'	+	roo	9045	1	62.96
CTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAA:1	-	chr3L	17685119	3'	-	mdg3	5312	2	56.85
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATAAAGAACATAAATA:1	-	chr2R	19004083	3'	+	roo	396	1	77.40
AAATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAAATATAAATTAAAACTTTGGAACTACATTGTAATTTATTGAAAACCATGCACGCGTTTATGTTATGGAAACAACCTTTTTTCT:1	-	chr3L	27859087	3'	+	mariner2	733	1	61.64
AAATAATTTAAACTGTATTTTATTGTTTTTTATTTCTTAAATACCAAGGGATTGACGTATATTCGTGTGGTTTTCCATCATCACAAATTGAGTATCCATTTCAGAGCCAACTTTTCGGTCAGCTGGGCAGACTAACAA:1	-	chr2L	13927068	3'	+	Transib5	261	1	39.13
ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCCCGCTGCTCATTCAAATGCAATTTTGTTGCAAAGTTTCGATTTCGTTGTCACTCCCATCCTCCGCTTTTTGTTATT:1	-	chrX	2295874	3'	+	Tirant	386	2	67.52
GTCTATCCGTATGAACGTCAAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTGGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTTGAGACAAAGAAGCATTTGTTGCTGCAATGCCCACTCTAAGGTCAAATCAAATCGGCATGCAAATCAATTGATT:1	-	chrX	3107552	3'	+	INE-1	129	1	81.51
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACTTTTATTCTCATTCGGCATTGTACTT:1	-	chr3L	15600163	3'	-	roo	8675	2	44.55
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAA:1	-	chr2L	18419124	3'	+	412	443	2	50.68
CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTATGGAATGCGTCATGCTATCGGTGCTTTAAGCGATCATATTAATAGAACAGTCGGAT:1	-	chr3R	19265814	3'	+	I-element	5300	1	58.39
GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTT:1	-	chr3R	17605647	3'	+	Tabor	409	2	67.12
AAAATAAAACAAAACAAAATTTGGCATATATGCAAAATTGAACACACTCCACCGAATTGGCTTTGAGCGTAGGGGATAGATTATAGTCTGCATGCACATTTCCAATTCTCTTTTATTTTTGTATACAGTTACCGATATTCAAATTT:1	+	chr2L	22757131	3'	-	17.6	7322	2	56.85
ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAG:1	+	chr2L	12483801	3'	-	P-element	80	1	27.86
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCACACAAGCAGACCCCAGAAGTGGGAGGCAGAGGTCCTGCATCCTCGCATCCCG:1	-	chr2R	13710549	3'	-	roo	8696	2	65.07
GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCCCAATGGGCCA:1	-	chrX	18193642	3'	-	jockey	25	1	61.86
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATGAACTACAGTAATTGGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAATGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCA:1	+	chr3L	3477521	3'	+	mdg1	365	2	53.42
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTTCTTTTTTTCAGTGCAAGT:1	-	chr3L	11393435	3'	-	roo	19	2	71.92
AGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCAGATATCTTACCCTTTCCTATGTTTATACTATTTTGAATTTATGAGTTCAATAATT:1	+	chr2L	12840637	3'	-	roo	8838	2	58.33
GGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCGCG:1	-	chr3L	26852642	3'	-	1360	12	1	47.95
ATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGGCATTCGGTTGGCACGGCGATGCCAACAGAACGTCAAGCGGGATTAGG:1	+	chr3L	7292589	3'	+	HMS-Beagle2	309	2	75.44
ACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACAACTCATGACAACAGGTAAGCTGCGAAATGCCGGCTAAATGTAAATGGTAATGGTATTGGCCACGCTTAATGGC:1	+	chr2R	20915487	3'	+	hobo	189	1	72.73
ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACAC:1	+	chr2R	19540441	3'	+	jockey	4951	1	65.74
TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTTATCAGTTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGCGATGTTTCTATAACTTTTTTTCCCTGTGT:1	-	chr3L	10841412	3'	-	mdg1	7054	2	61.64
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTG:1	-	chr2R	7898058	3'	-	roo	8706	2	55.80
ACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTC:1	-	chr3R	19589912	3'	-	BS	5055	1	56.85
AAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAAT:1	+	chr3L	4605722	3'	-	pogo	52	1	55.71
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGCACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTG:1	+	chr3R	25448414	3'	-	roo	8740	2	73.19
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGCTTGGA:1	-	chr3L	233209	3'	-	roo	8699	2	61.81
ATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTGACGGCTGGCACCTTTTGTGTGCTCTGGTGTTGCCTGTGTGTTAGTCGAGCTCCAGCAGAGTGTACATCGTGATATCCCGCTACGTATCGCTCTGTT:1	+	chr3L	9178230	3'	-	accord	191	2	51.26
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTTGCCACTGTTTCTGCTGCTTTT:1	-	chr2R	9632059	3'	-	roo	15	2	72.06
GTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATT:1	+	chrX	6499047	3'	-	Quasimodo	51	2	64.89
AATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGCGTAGTTCGATTCTTACCTGCTCAGAATCTCC:1	-	chrX	11696526	3'	-	TLD2_LTR	98	1	44.27
TGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATTATAATTATTTCAAATAGGGTTTTTTAGCTCTTGCTCGCTTCTAATAAATTCCGTACAAAACTGACCATAAAGATTTAATTAATACAACATGTGCTTCAGTACATGGAA:1	-	chr3L	3500879	3'	-	opus	11	2	76.71
GTCAAATTGCTGACCAAGCATTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCTGTCGTTAAAAACATTTTCGAGCTGATGGCGGATGGTGGTGAATTTAC:1	+	chr3R	16778480	3'	+	springer	7182	2	58.90
CTACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTA:1	-	chr2R	15064359	3'	+	412	7465	2	69.18
ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAA:1	-	chr3R	26659739	3'	-	HMS-Beagle2	10	2	65.74
TTTTTTTTGCCAAAACCCATTTTATGAAAGTCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATGCATTTAATGGGAGACTGCTTTCCCGTATTACCAGATTAAAAGTTGGCAAATTTTAATTTG:1	+	chrX	2081745	3'	-	Transib-N1_DM	472	1	51.67
TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAG:1	-	chrX	5643450	3'	+	roo	9035	1	59.59
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATG:1	-	chrX	5643485	3'	+	roo	9001	2	68.28
CTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGCT:1	-	chr2R	23466016	3'	-	Doc	487	1	55.91
ATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGACTATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCC:1	-	chr2R	23332520	3'	-	invader4	2808	2	59.85
ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTTTAGGTCTAATTCTA:1	+	chr2R	16248045	3'	-	BS	17	1	66.44
AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGC:1	-	chr3R	19589930	3'	-	BS	5062	1	66.67
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTCCTTGGCGAGACTGCAGAACATGAGACTTCGAATTAGCTTATACAAAGATTA:1	-	chr3R	31828327	3'	+	roo	9024	2	52.74
AAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCA:1	-	chr2L	2122405	3'	+	Stalker4	387	1	49.44
GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTATTTCATTATCTGATTATTGACTAGTATAGACCACAGTTGATAGTATTCCTACTTATGTCTATCATGGCTACATA:1	+	chr2L	4954059	3'	+	Quasimodo	7324	2	55.48
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTTCTTTTTTTCAGTGCAAG:1	-	chr3L	11393436	3'	-	roo	20	2	68.49
TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGC:1	+	chrX	14336482	3'	-	roo	89	2	84.25
ATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTTCATATATACTGTACATATATACTGTACATATATACTGTACATATGTATGTATGTACATCGATTTCCTAGCTTTATTTTATCTGTTTTGCTTTTCACAATACTAG:1	-	chrX	16274974	3'	+	S-element	1702	1	60.69
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTTTATTAACGGTAA:1	+	chrX	23280963	3'	-	roo	8670	2	44.52
GTATACAGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGGTGTTCCGTGCCCTGCCTAACACATGAG:1	-	chr2R	1320696	3'	+	diver2	303	2	60.77
ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGCGGAAAGCGTTTGGCCCACACCCTGAGG:1	+	chr2R	13006542	3'	-	3S18	5767	2	78.90
ACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCA:1	+	chr3R	11547742	3'	-	G2	337	1	78.90
AAATTTGGCTGTCGCAAGCCAAGCCCCAAATCTGACAACCATACCTCCATATGGAGCTATAAATTGCTTGAAAATTGTCACCTTGTTGGAGAGTGACAATTTACTTCATTCTGCATTCGAGTATCCTGTGCACGCAGAAATCGGAC:1	+	chr2R	5610860	3'	-	BS3	1331	1	75.34
AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCAAGGGTAAATAAGATTCGGCTTGCCACAGCCACCTTCCT:1	+	chr2L	10986859	3'	+	1360	3345	1	64.81
TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATA:1	-	chr3L	9998019	3'	+	roo	395	1	47.48
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCA:1	-	chrX	13039492	3'	+	roo	9019	2	73.83
AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATACAACTGCGGCGTAACATGCATGGGTGTCTATGGTTTAAGATAAAGGGGGTTCGTA:1	-	chrX	12074521	3'	+	412	7506	2	53.33
TTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAA:2	-	chr3R	9714403	3'	-	Stalker	84	4	73.97
CTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTCTTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTT:1	-	chr3R	4604451	3'	-	1360	380	1	73.39
ATATTTGAATAGATTTAAACATAACCCACCTTGCAGGACGTCGTCGAACCAATATAATAAGTAGCAAGAAAAGCAAAACGATGAAAATCCATCTTCCATTCAGATCTTTGCAGGCCTCTT:1	-	chr3L	1398965	3'	+	Dm88	4231	1	70.00
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACG:1	+	chrX	6486816	3'	+	roo	9033	1	49.63
CTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATACACCCAGTAGTTTTCTATTTTGGTACAAGTAAATATCAATTACCTGTTGATATTT:1	+	chr2R	10293084	3'	+	mdg3	5287	2	55.56
AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATATTAGCTT:1	-	chr3L	13845088	3'	-	opus	5	2	64.06
AACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCGGCAACACGTGTATGTCACGGA:1	-	chr2L	12290628	3'	-	1731	11	2	75.76
TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAAC:1	-	chr3L	17685117	3'	-	mdg3	58	2	55.48
CGGTTATCCGGCTCGAAGGACCAATTTTTATGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCGTTAATTAGTTTATCAACGAACTTTAACTTTAACCTTTACAAGCATTA:1	+	chr3R	13236334	3'	-	3S18	370	1	58.97
TGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAAATCCCACTAACACTAATATTTATTAGAGTTATTTTACATTATATTCATTCATCTCAAGCATAACAGATATCAAGGCAGCAAGCAAAGCAAC:1	+	chr3R	26502432	3'	+	Cr1a	4240	1	74.66
ATTAGCGCGAAATCCATATCAAGATGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGTCCCTCTTTTTCTGATTTTTAAGCCGACTGTTCTCTTCGGTTCTTTGTTTTGCTTGGTGTATTCTTCAGCTGCTGATGTGTTGTTG:1	+	chr3L	21240209	3'	+	invader2	4661	1	57.93
GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAG:1	+	chr2L	12483801	3'	-	P-element	45	1	37.14
CTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATTAAAGTTGATCGCAGTAAAAAAATTGAAGAACACATTTTGATTGGCACCCCAGGAAAACTTTTGGATTG:1	+	chr3L	27332211	3'	+	Quasimodo	36	2	54.61
GGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTC:1	-	chr3L	26852647	3'	-	1360	12	1	51.47
GTGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGGAGTGGTACTGTCATAATATTTATAATGATCTTAATGATGACACAAACTAAAGCAGGACCA:1	-	chr2R	2009402	3'	-	I-element	18	1	79.78
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAGTTTTCACGCA:1	+	chr3R	27994306	3'	+	roo	9036	1	60.96
AGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCC:1	-	chr3L	26852645	3'	-	1360	49	1	64.49
AATGAATGCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATAGGTGCATTGAACCTATCAATGGCTTCCTGACGCAATGATCCTGTGATTCCACC:1	+	chr3L	19885144	3'	-	Stalker2	321	2	59.26
ATGACTTTATTTTAGAATATTTGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAATTTAATAAGGCAATGATTGTTGACTGCTCGTGTCCGCTTGCTTAGTTCGTTGTTGCTAATTTTTCTGTGGGCCAGTTTTGCCAGATCTCTCAGGC:1	+	chr4	832159	3'	+	1360	387	1	56.34
CTACCGTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGTAACCGGCAACCGCAAATCAAACGAATTGCTTTTAAAAATAGAGTCTAGTCTGTCTGTCCTC:1	+	chrX	463549	3'	-	1360	2966	1	57.53
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATTCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCAGCCAGCCAGC:1	-	chr2L	3114438	3'	+	roo	401	1	76.34
AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTTAATCTA:1	-	chr3R	18339042	3'	+	roo	9054	2	71.92
ACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTACTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACATGGAACGCATTTGAATCGGATTAAGGATGATTGATGTCGCCTGTGCT:1	-	chr2R	8293349	3'	-	F-element	144	1	66.44
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTT:1	-	chr3R	31817449	3'	-	roo	67	2	65.28
AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCTTCCGGTCGGCGGGTCCTGGGATCCG:1	+	chr3L	12308412	3'	+	hopper	1407	2	65.56
GTTCCTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTAT:1	-	chr3R	31045721	3'	-	INE-1	140	1	69.63
GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATGGAGCCAAGGACGAGTG:1	+	chr3R	7482863	3'	+	412	7515	2	62.94
CAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGAAGAGTAAGAGCTTTGCGAAACACGATTTATATTGCTATCTTTTAGTTATTAATGGGAACGTGTGGAG:1	-	chr3L	23690750	3'	+	Quasimodo	6972	2	61.82
TTTTATTTCTTAGCGTTGTCTTTACATTAGTTCGACTCAAAAATATCACAAGTAATTTTACTATATACATATGTATGTATTTACAAAATATGAAAAGATATACATATGTAAAATGACCGCATCTGCTTGTATAATATTTTTTATTT:1	-	chrX	3662915	3'	+	297	340	2	76.03
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTTTAAGTAAACTAATATTCTAATATTCATCTTCTATGAGCTGTA:1	+	chr3L	22438006	3'	-	roo	8680	2	73.97
AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTACTATATGGTTATGCGTTATATGCCCAAAGGCTTCGTTCGGC:1	-	chr2R	15289134	3'	-	hobo	50	1	67.23
TCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGCTTGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTTTGATTTGTCTTTTTTTTCGTGAGAGAGCCATCTCTGTCGC:1	-	chrX	5256510	3'	+	INE-1	134	1	58.25
GTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAACGAGATTTTTATTAGAGCAGTGCAAATATTTCTCTACTATTGTACCGTATGGAAAATGTTGTAGCAAAGTC:1	+	chr3L	7226085	3'	-	Doc	326	1	53.42
GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAA:1	+	chr3L	9673114	3'	-	Doc	38	1	56.12
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGCCCACAG:1	-	chr2R	2016818	3'	-	1360	9	2	66.32
CCATATATATATATATATACATATACTGTTCGAAAAGCGCATATACACTATTAAAATAAAAGTTATAGTCGCAAATTTGTTAACTTATATTTATCAAAAATAATCATA:1	+	chr2L	15126761	3'	-	G3	4509	1	75.93
ATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTGAACGGACTTAGCAGTTCTAATAATTGCAGAATAAAAAAGGTTCTATAGATTCCCTCAAACTCTCTCACTTTATGGAACTTAGGTGGTGC:1	-	chr3L	20832580	3'	+	roo	8755	2	60.27
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATAAAGA:1	-	chr2R	19004092	3'	+	roo	9052	2	72.92
TTTCTTACAAATTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTCCCATTAACTAATATTTACTAAATTAATTAATTAACCAAAATAAACATTTTTAAATTATGTACATAGGAACCTTTTTTAAATACGTAACATCACTTCCACT:1	+	chr4	348583	3'	-	Tc1-2	1450	1	76.06
TGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTAGATTCATAAAACTCTGCCAATTATGCGAACATTCATGATTCTGTAT:1	+	chr2R	9258531	3'	+	3S18	6044	2	63.91
AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAATTTGGAAGGCTCATGGGGGGACAAGCAAAGGTTGATCCCAAACTTTG:1	+	chr3L	9673180	3'	-	Doc	21	1	65.07
ATTTGACCACTTTTTCTGGCCAAATTTAATAGCTCGAGAACGGAGAACGATATTAAGATACATACATATCTTTTATGATTCCGAAAATTGTGGGCGTAGCACATATATGGCGAGGAATGAGTTAGATTGGGCTG:1	+	chr3L	21775831	3'	+	Transib-N1_DM	12	1	75.37
CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGCGGACTCACCTCG:1	+	chr3L	3799868	3'	+	copia	223	1	60.96
GTGTTGTTGGTGTATGCCACGAACTCCGACGATATTTTGAATTTAACAATCTTAATGTTAAACATGGGTGTTGTGTATATAAACGATATATCTAATGCTAAAGCATCCTATTAGTTGTTTTTTTTTAACTCCTAATAGGTG:1	-	chrX	6631600	3'	+	accord2	305	1	73.76
ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTTTCAATTAAATTCCAATTAAAGAACTAAAATGACCATATAATTTCATAAATAATGCTATT:1	-	chr2L	12498324	3'	-	pogo	54	1	62.33
AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGAATTTGAATTCTAATGAACTACAAGTTTGCTACACGGAAACAAATGACACACGATGA:1	+	chr3R	29361028	3'	+	mdg1	7370	2	76.55
AAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCA:1	+	chr2L	23034090	3'	+	FB	410	1	55.38
GTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATT:1	+	chr3R	2689442	3'	+	diver2	4466	1	63.93
ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGACTTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTTTGCCTTTGGCTCCGGGTCGCTCCTTACGTAAGCCATG:1	+	chr3R	19265905	3'	-	I-element	59	1	56.85
AGATTATTATTTTTGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCTAGCCTTGTGGTCCGGCAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTACCACGCTTTACTACCAACAAGTGAGTTAACGAACAATTACTCTT:1	+	chr2L	9650754	3'	-	Gypsy6A_LTR	291	1	76.92
AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTGGGTATCCCTGGCTCCCACAAAGGGAATTCTTAAATGGGATTTGGGAAATCACAAGCCGAGCCAAGAGATGGAGATGTGAAATTA:1	-	chr2L	15875711	3'	-	hobo	26	1	62.50
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACAC:1	+	chrX	16717914	3'	-	roo	8748	2	79.17
TTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGTCTCAAGATATGAACCATGATGAAATAACATGAATAGGCTCTTGAATTAGGGAGTGCAATTTGTATAGAAATTTAATGC:1	-	chr3R	10267457	3'	+	1360	421	1	56.16
GAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATATATGGCATTCAGTTTGCTAATCGTTGCCGCAGG:1	+	chr3R	9922051	3'	+	blood	7317	2	74.24
CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGAACAGCAGGATGGGGGGC:1	+	chr2R	13710713	3'	+	roo	9062	1	75.97
GCAACAATGCCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAACTGTAATAGGAAAATGATTAAATCCCCAGGTGGATCTCCACATGCGCTACATCCAACTGCAGAGCATGTTG:1	+	chr3L	6079362	3'	-	Bari1	407	1	63.16
AGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTGTAGGAAAATAAGGCAGCACACTTTGACTATAAACAAGAATTTAAAAATACACATCCCAT:1	+	chr3R	18580346	3'	-	roo	8838	2	58.90
AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAACACAAACAACAATCGCTTCGTCTACGTCGCT:1	+	chr3L	10385943	3'	-	Burdock	6168	2	57.36
AAAATAAATCAAAAATAAATTGGATAGATAAATATGACATGAATATTGTTTCCTCATAAGCAAAGTCGGTCAGATAACTAATGAAGTCCGATTCACTTTTGGGAATTGGGGATTGAATAAATACTAGATATAGGC:1	+	chr3L	14444468	3'	+	Fw2	75	1	72.59
AAACATATGTATATATGTATATTAAACATCAGTTTTCACTAATAATGCCATTCAAGTCTTAGGCATAAAAATATAATCATTCAAATTGCGACTATTGGTTTATGTACATATCCGTGAGATATGTACATACATATACATATGTGGAA:1	-	chrX	19785779	3'	+	G3	4503	1	65.75
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTG:1	-	chr3L	20831267	3'	+	roo	357	2	56.16
TAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCG:1	-	chr3L	17558032	3'	+	jockey	4909	1	78.08
TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGAATAAACTGCTCAACATGC:1	+	chr3R	25826805	3'	-	mdg1	22	2	69.86
AAAAAAGTGGCTGCATAGCGCCAAACCAATGCATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACA:1	+	chr2R	2016913	3'	+	1360	3342	1	52.76
CCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAANAACCCCGATCGTTTGTAATAAACCAGAATTTGTGTAATTAAAGCAGGAAAATGTAAAAAAGTATCTTGCAGATACGAAGTACATAGGAGCTTTTGCCGCGAGCAA:1	+	chr2R	9544175	3'	+	opus	490	2	73.29
GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCATAAAAGTTAA:1	-	chr3R	9921957	3'	-	blood	7034	2	65.08
AACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGCCCACCCACTGACCTCTTTTTTCCCCAGCACGGCAGCCAATACAGCGACAATTTTGTGTAGTTTGCATTTCAATT:1	-	chr3R	24078696	3'	-	roo	8647	1	55.40
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCG:1	-	chr2L	14772021	3'	+	roo	9029	1	52.90
TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCC:1	+	chr3R	14979886	3'	-	pogo	63	1	62.33
ATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGATGATTCGTTTGCCGTCTATATATGTAAGTCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGGCCA:1	-	chr3R	21955089	3'	-	412	7151	2	57.53
TGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAGGTAAACAACCCCATTAACTTTACGGACATCGCACATTAGTAATACGTCG:1	+	chr2R	4009132	3'	+	Juan	4152	1	62.50
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATAA:1	-	chr2R	19004095	3'	+	roo	385	2	70.34
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCGTTATATTTGGTCACTTCTTGGTTGCTTTTGCAAAA:1	+	chr3R	12887042	3'	-	roo	8674	2	78.77
AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGG:1	-	chr2R	9325414	3'	-	BS	5072	1	69.86
TAAAATAAATAAAAAATAAAAAAGAATTAAAAGGTGATATGCATATGGTAATTATGATTAAGGACGCAAGGTTTCTTATTTTATTTCTTTCAATGTTTTTTGACAAGAACAAATTAGGCAATCGA:1	+	chr3L	1275570	3'	+	F-element	4685	1	68.00
AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGTGCAAAAACAACAGCTTAGTA:1	-	chr2L	12483766	3'	+	P-element	2805	1	20.16
TTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACAC:1	-	chr3R	9038929	3'	-	Juan	4072	1	59.59
GTTTAAACAAATATACAAATTGTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGCGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGCACCCGAGCGCGGCTCTTAAGAATTTGTGGCACGTTTCCATTGAT:1	-	chr3L	11189033	3'	+	Cr1a	167	1	66.17
CTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGTATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAAACTTACCTATATACGCAATATTAAGTTATTAAAC:1	-	chr3R	22388940	3'	-	G2	2633	1	63.70
GGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAACCATCTTTGCCTCCTTTCGCTTTGTCTTGCGATTT:1	-	chr3L	5707995	3'	+	R1A1-element	5272	1	68.18
CCTACATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATATAGTTGCGCGCCTGTGTCTTTTTGGCAATGGCCACGTGCACTTCATG:1	-	chrX	21009364	3'	+	pogo	2069	1	62.76
TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGCAAA:1	-	chr3L	10056131	3'	+	transib2	2791	1	68.97
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGAT:1	-	chr2L	11518397	3'	+	412	7497	2	59.35
CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATG:2	+	chr3R	16076852	3'	+	roo	8984	2	79.31
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGATAAAGTGT:1	-	chr2L	3114473	3'	+	roo	407	1	72.22
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTAACCTCAACTAA:1	-	chr2L	16091853	3'	+	roo	9054	2	68.75
CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTAT:1	-	chr2L	5069689	3'	-	flea	4786	2	65.75
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAA:1	+	chr3R	20427486	3'	-	jockey	56	1	52.05
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGT:1	-	chr2R	15005065	3'	-	jockey	56	1	53.97
CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTT:1	+	chrX	11471642	3'	+	hopper	1370	1	66.99
AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGAATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCGCACTCCGTTTCGGTAATCCACTGTGCACTG:1	-	chr3R	25448340	3'	+	roo	9060	1	54.84
CTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCAACTAGATACCTTTGGCCACAAGATACCTTAC:1	+	chr2R	4977099	3'	-	1360	53	1	71.05
ACTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACTTCATGAAAAATGCTTAAATATTCA:1	+	chrX	23108365	3'	-	BS3	1428	1	62.33
ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTTGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGG:1	-	chr3R	14981173	3'	+	mdg1	7385	2	70.50
TTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACT:1	+	chr2R	4601654	3'	-	HMS-Beagle2	52	2	55.48
CTACACATTATGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAGTGAATAATAATTATTTTACAAAAAAAAAAAGACAGAGATTTCAACGCCACGACTACACTATTAAAAAATGCTCCTCGTTTTATTGTTTGTCTAATATTC:1	-	chr3L	23040539	3'	+	G5A	2786	1	64.79
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTT:1	-	chr2L	21884488	3'	-	pogo	38	1	61.54
GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATAACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCCGTAGCGCTGTAGCGAAACTCGGTACCACGAGTATT:1	+	chr2R	631905	3'	-	1360	210	1	95.52
TTTGAAATCCCGTGTTTATATGAATCGTCCAAGAACCCTACAAGATTTGAAAACAAACATTCGCTCTCAATTACCACAGAGACTGGAAAATAATCTAGAGTGTTAGAACTGTTCAGATTCGA:1	-	chr2R	24437016	3'	+	mariner2	613	1	49.18
AGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACTCTACTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTGAAATTAAAAAAAGTTTTTCGCTTACAAAAGTTAAGTCAACTTAGTTTT:1	+	chr2R	9321604	3'	-	hopper	279	1	72.60
TGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACCAGCAGTAACA:1	+	chr2L	9564537	3'	+	transib2	2755	1	63.70
AAATATATTTTTATGTTTTTTTTTGTGTTTCCGTAAAACTCAATTGTTACATGTTATTCTTGTTAAGTCGTAATGAAAATAAAAGTCTAGTAATAATATTATTATAAACCAACAATTTCTTTCTCTAAGCCAGACATTTAAATATT:1	+	chr3R	5846588	3'	-	Transib5	31	1	74.66
ATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCG:1	+	chrX	21947726	3'	-	mdg1	3	2	67.09
CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTT:1	+	chr3R	17478448	3'	-	copia	4950	2	73.29
ACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATTGAAATGGTAGAATTGTATGGTTCCCGTTTTTGGGTCAAAAAACTCGGTTACC:1	+	chr2L	9412882	3'	+	jockey	4847	1	58.49
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCG:1	-	chrX	6486714	3'	-	roo	53	2	62.02
AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAAC:1	-	chr3R	28758288	3'	+	mdg1	369	2	53.42
GAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTGATTGGATTAAAGAAATTGAAAAATTTCAAATTGAAAATATACACGATTCTAAGAGTCTAAATGG:1	+	chr3L	18627344	3'	+	FB	38	1	49.22
TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTTTTTATTTGAAGGACCATAT:1	-	chr3R	12618581	3'	-	F-element	23	1	63.03
ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAA:1	-	chr2R	13121967	3'	-	pogo	35	1	50.68
CTTTATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTAAGAACTCATCTGAACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATGTTGACTTACTTAGGTACAATG:1	+	chr2R	3549906	3'	+	gypsy4	184	2	63.97
ATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATAAAACTAAAGATTGAAACTTAGTTAAATGCCCAGAGACTAAATGGAAATGTGCATACCTGCCGATTTTAATTAGACCTAC:1	+	chr3L	22919745	3'	+	jockey	4834	1	58.90
GTATTATTAAGCGGTTTGATGGACGACCAATTCGAATTTCTTGGCTTAATTAATCTCTGTAGTTCGTACTTCTTTTCAAAATATTACCATCATAGATATTTCTTAAGAATATTTCAATGCTACAAATTAACTAGG:1	-	chr3L	16486650	3'	+	copia	448	1	64.44
CTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTGACGCCGTGCTCGCTTGTATACTGTTAAGTTCTGTTCAATTCAGTTGAATTCT:1	+	chrY	1076853	3'	+	INE-1	89	1	70.53
GCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTTGCCCCCAGTGACCCAT:1	-	chr3R	26686013	3'	+	Juan	4137	1	65.75
ATTTTTCAATTTTATTTTTAATTACTTCCGCACTTCCCCATCGGTAATTGGTCCTTAGTACACTACATAGAAAGCATTTAAATGTTTTTCCCTTCCGTTTTTCCCTTTGTCTTCGAGCCTGTCTGTGTGTCTGTGCAAAGGCGCTT:1	-	chr2L	6569688	3'	+	hopper	179	2	79.45
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGATGATTTGTAATCTTTAACTTTTTCAAGAACTTCACTTTCGGACTGAATGTTATGG:1	-	chr3R	19449585	3'	-	roo	66	2	62.33
AATATTATTAATAATATTATTATTAGTATAATAAATGTGCCTGGTACTTTTTTCGAAAGATATCAAAAGTTATGTGCTTCAGAACTTTGTTTTTATAATCAATCAATTCATAACCCATCTGTGCTCAGTACACACACATGCTAAG:1	+	chr2R	14445604	3'	-	mdg1	7080	2	62.07
TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGACACTTACTCACCT:1	+	chr3L	20168456	3'	-	mdg3	47	2	51.11
ACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAGAAATTGAAAACATTATCAAGGCGATTAATTATTGATACTTTGATGTT:1	-	chr3L	2710688	3'	-	P-element	245	1	36.55
ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTT:1	+	chr3L	24208234	3'	-	Quasimodo	33	2	60.42
CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGA:1	-	chr3L	25406614	3'	-	1360	5	2	70.77
ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGTAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCCTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTCGCCAGG:1	-	chr2L	15832957	3'	+	hobo	2926	1	67.67
CAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGTGAGCATTTT:1	-	chr2R	5070919	3'	-	Tirant	8108	2	26.12
TTTAACAATTTAAAGTATTTTTAGCATTGGTGTGTATCCTACATTTTTGGTTGTCTAAAAATATATTTTAATATATTTTATTGCCTTAGAGACTTATGTACCTCTTAAGTTTTAACATAAGTTATCTCAACATATCTTTTATGTTT:1	+	chr3L	9873180	3'	-	HeT-A	5811	1	70.55
TACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAG:1	-	chr2L	12290653	3'	-	1731	4355	2	53.96
AAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATC:1	-	chr3L	24213776	3'	+	invader2	5032	2	67.81
TGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATCAATTGTGGGAGCTGCAAGAAAATTAGATCAAGAGTTATTTAATGCAATACAAGAAAATATAA:1	+	chr3R	19447480	3'	+	roo	8665	2	58.90
TGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTTTAATTGTACTAAATGTGCACATAAATTCACAATAACCGCACGCCAATAACGTTCACAATCCGCAATTCACAATTCACCATACTTCAATTTCAACACCCACCCATAATTTGTCT:1	+	chr3L	16873785	3'	-	accord	7026	2	63.50
TAAATAAATAAATATAAATAAACCTCAGTTCTTAGAAAGCTTTCATTTCAAAGACTTTTATTACCACAAACAATATGCTTATCTTTAGGAACCGGATATAACAAAGTTAGAATTCTGGTTACATCAATTTCGTTTTT:1	+	chr2L	9506535	3'	+	diver2	444	2	76.64
GCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGGGCCGTGTAGGATTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATGTTTTTTATTCTCATACCTTTCTGGGCTGGTTGACTTTCGGTCCCAGTTGCTTCGCTT:1	-	chr4	1151970	3'	-	transib2	9	1	76.38
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCGCTCAGCTTCTTTACG:1	+	chrX	9540123	3'	+	roo	9033	1	53.73
TATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAGTTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCGACTACTGTT:1	-	chr3R	19449387	3'	-	Ivk	5284	1	62.33
AAAAAAAAAAGAAAAAAAACTCGTTAGAAATTTTATACGTTTTATATGAGATTAAGAATCGAGAGATGAAGCACGAGCATATTCAGATTTATTCAATCGTTTTTAAATCCGATATTTCCGCT:1	-	chrX	6497272	3'	+	HMS-Beagle2	490	2	77.05
AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATATAGTTGCGCGCCTGTGTCT:1	-	chrX	21009392	3'	+	pogo	2040	1	60.27
TCCTAGTAGCCAGTTAAGTTGCTGTTTTCATGTTAGTTTTGAGCCAATAGTTAGTCCACGGTACTTGGCATATGGGTGTAATAGTAGTCAGTAGTCGATGAAGCGCAACTGGAGGATGGCGAGTACTATATGTA:1	+	chr3L	23715311	3'	-	Porto1	4184	1	62.69
AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTGATTT:1	-	chr3L	15519728	3'	-	pogo	36	1	63.12
AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTCGGAATGTACTGTGGTACCGCTATTTTCTTCGACAAT:1	-	chr2L	22575605	3'	-	Quasimodo	78	2	75.34
CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGC:1	-	chr3R	26431987	3'	-	opus	178	4	73.60
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTGTTTCCTACAACTAAAATGTTGTAGCCTAGGTTGGGAATA:1	-	chr3R	26222874	3'	+	roo	337	2	70.59
CCTGAAGCCAAACTGGTGATCGGGGATCAAACCAGCCTCATCCAGTACTGGCAATACTCTGCGCAAAAATACTCTTTCGAGTATTTTGGAGAGGCAAAGTAACGCATATTTGATTATGCATTAGAAGCCACTTGCCAGACTAAATA:1	-	chr2L	18040508	3'	-	G7	362	2	64.38
AACAAAAAAAATGAAAAAAAACTAACGACGTAACGTGCGCAGCAGCG:1	-	chrX	13332805	3'	+	gypsy7	5004	1	82.98
TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAA:1	-	chr3L	22437826	3'	+	roo	403	1	76.80
AGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGAAAAAACATCCTGGTCTCATTCTACGTTTGGAAATTAAAAGGAAAAATAAAGGCACCATAAACTATGGTAGAAATTGTAAAAATTAAAATTTTCCTAAAAAAAGGAA:1	-	chr3R	3821572	3'	+	Idefix	149	2	70.55
AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGAGTGCTGGCA:1	-	chr2R	13696404	3'	+	roo	368	1	58.04
TACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGGGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCA:1	+	chr2L	6623007	3'	-	Burdock	6207	2	77.60
ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGTGCC:1	-	chr3L	11321394	3'	+	mdg3	222	2	55.93
CTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAGAGTATTTTTACAGGAGTCTTATGCGCTTGCTGTTTGCAC:1	-	chr2R	652323	3'	-	copia	4952	2	75.34
ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAG:1	+	chr2R	20944446	3'	-	pogo	56	1	60.27
TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTATTTTGCCTTAACAGGTCCGACACAGGCTTAGCAGTCA:1	+	chr3L	23866775	3'	-	copia	21	2	69.86
ATATACATACATATATACATATACATATATATATATTATAATATACAAAAACTAAATTACCTTCAATCTTGATTATCAAAACATTGGGTTAATCGATTATTCATCACCCCCTTCGAATTGTCGCAAAATTATTTCAATTATTGCCC:1	+	chr2L	9447274	3'	-	G3	4507	1	68.49
CTCCCCACAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCGCGGCAAAACTGCAGCGCAATATACCACGGAGATAGAAAGTACGAGGCTGCTGGACGGTGTGTCTCCTTGGGTT:1	+	chr2R	18649513	3'	+	gypsy8	16	2	40.00
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACCATCTA:1	-	chr3R	30344606	3'	+	pogo	2047	1	58.90
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAATAGGG:1	+	chr3R	22122787	3'	-	roo	8717	2	61.76
AAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1	-	chr3L	25232769	3'	+	accord2	7553	2	67.81
GATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTTTGATTTTGGAATTAAGATAGAAATATTATCCGTAAGGGTCGACATATTGCACCTAAGGAATCTGAGGTCTTGAAAGGCTCTTACCTGTCCGATGGATTGTGCAATCGAAACTGTAG:1	+	chr3L	11357464	3'	+	Dm88	4270	1	55.17
CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCT:1	+	chrX	7195101	3'	-	P-element	30	1	42.35
AACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTT:1	+	chr2R	5173211	3'	+	Stalker4	347	4	63.04
GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAAGAAAGATCCGCATTGCCG:1	+	chr2R	5031022	3'	-	Doc	76	1	70.15
AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGTTTAATTGTCCTACAAAGGCTGACCA:1	-	chr3R	22821953	3'	+	mdg1	406	2	58.22
TAATTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTCCACAGGGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGGGTCCTAAAAGAGAGCTGAAGAGAAAGAAAGAAATTTGGGAAAAGAAGAGAGACAGTGCCTACGTTTGTTCG:1	+	chrX	15077754	3'	-	TART-B	10199	1	55.48
ATAGATATTAATAAAAAAAATTCATGAATTCATGAATAAGAGGTCTTTATATTTTTGCATTGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACATTTTCTTGGCAAAATGTATGTATCTAATTATTTAATAGAAATGATAT:1	+	chr3R	18917838	3'	+	S2	1623	1	80.82
GCTGTTATACAACACAGTTGTATAAAAAACCATAAAACCAAATCGATTGACCAAATCACTTATAGAAGTGAATAACAACACGCGCCTCCAACGTAACGATTCACCTGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCCATTTAGTATAACTTTAT:1	-	chr2R	5284565	3'	+	Doc4-element	2568	1	73.29
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAA:1	+	chr3L	20831408	3'	-	roo	8695	2	64.38
ACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGTTACGAGTAAAAAAACCACCCGAGGCCTGCTGCGCAAGAGCCGTATGGGTGATAGATTCTCAAGTGTTTTCGCTTTT:1	-	chr3R	31011950	3'	-	hobo	2834	1	76.85
ATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTG:1	+	chr3R	1844841	3'	-	Cr1a	168	1	62.22
AAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1	-	chr2R	4826124	3'	+	1360	3099	1	55.48
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCT:1	-	chr3L	11441726	3'	-	roo	8720	2	62.24
GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGGAAAGAGGTCGATGTTGAGGTG:1	+	chr2R	16945383	3'	+	jockey	4979	1	59.82
AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTT:1	-	chr3R	19589925	3'	-	BS	5045	1	59.35
GTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGAGATTCCAGAAGCAAAGCACAATAGAGTATGATTCTAGATATATGTACGTATAGGTAAACACTTTTCAGGTACTCACGTAAGCCCCA:1	-	chr3L	15601286	3'	-	roo	407	1	63.31
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTATTCCTCATTTACATTTTAATATTCTTAACTTTCTAAGAA:1	-	chr3L	21817927	3'	+	roo	396	1	74.83
GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCG:1	-	chr3R	14651196	3'	-	P-element	45	1	50.38
AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTGGAAGCCCCC:1	-	chr3R	25826655	3'	+	mdg1	370	2	51.37
ATCGTGCTGACACGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAGAAGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTCCGTCGTGGACGAGGTTAGGCTGGCCAAATCGATGTCATTCAGTTGCTTGCTATCCAATCCGCAGGCG:1	+	chr3L	9738210	3'	-	Q-element	195	2	52.45
AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTAT:1	+	chr2R	6173081	3'	+	pogo	2036	1	71.33
CACCGCAGTTGATACACAAATAATTGTCCTCGTGCATAGCGTAGAGCCAGTTGCGTGGGGCCCAGCTCACTTGCCACAAAGACACTAGAATATAGTTGCTGTGGTGCGGTCCACTCGTCGGGTCGCTGCTGCCG:1	-	chr2R	16645797	3'	-	jockey2	442	1	56.72
ACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACATTTTGAACAGCTGAATAAAGAACCTCATAAAGAGCAGA:1	+	chrY	3648922	3'	-	Transpac	24	2	69.57
TAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCT:1	+	chr3R	28075407	3'	+	jockey	4934	1	56.85
AATTCCATAGCAAGCTTTACACGCACCCAAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCGAAGCGCCATACACAAGTTACCACAGATTTTCATAACTAGCTAATGACCGAAATTGACACGTTCTGACGGCCGCAGCCGATG:1	+	chr3L	180544	3'	+	F-element	4446	1	65.93
GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGAAGTGGTGGCGCCTCCACTCCATTGTCTTCGATGGATTTCACCACTTTCGCTGCTT:1	+	chr3L	7254878	3'	-	hopper	23	1	55.24
TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAAAGCTTCCA:1	+	chr2R	24561538	3'	+	P-element	2832	1	47.95
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTGGCAANCTGTTGATTGGCTGGAGTGCGCGTGCGCGATGAAAATGGCTG:1	+	chr3R	18121729	3'	+	P-element	2878	2	62.65
AATATTTGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGCTTCCTGCTTGAGATTAGAACGG:1	+	chr2R	4932065	3'	+	G7	1164	1	57.48
GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATATCTGGGCGGGAGATACTTGGACACGCGCACGCCTTCGTGTAATAAACTTCAAAAAATAATTTCGTCTACAACGACAACTGAAACTTGACACTTTG:1	-	chr3R	17316191	3'	+	opus	7485	2	73.29
CGGCTATAGCATTCTCTCTTTATAGCTTAGGAACTAGTTACATACACGATGGTGCCAAATGCATCTTAGAGGACGGTTAAAAATGATGTCAGCTGTGGAGTACCCTCGACTTAATCCAGCTTGGAATACACTCAGAACATTATTTT:1	+	chr3L	27875018	3'	+	INE-1	579	1	76.03
TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTGTCAAGCGCCCAAAATTCTTTTCCTAGTCCCCTAAACTTGATACCATCCCGACATTTGCCTCAAATTAACACCTCTGGGAGACGGCTGACTTTTATGGTCTACTATT:1	-	chr3R	29360907	3'	-	mdg1	7052	2	75.34
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATACTGAGACTGTAGTAATCTTCAC:1	+	chr2R	6173107	3'	+	pogo	2059	1	56.85
AGGTTGAGATTTAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTT:1	-	chr3R	4562142	3'	+	INE-1	175	1	78.08
AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATG:1	+	chrY	2720331	3'	-	297	6602	2	77.94
TTCTGGGATATCGATAGATATTGGGCGGTTTGTAGGCGTACGAGTGGGCGTAAAAATGGTTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAGAAAGTCGTGACTTTCTAGTTCCAAGTCCAT:1	+	chr4	601172	3'	-	INE-1	497	1	76.47
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCAGCAG:1	-	chr3R	12886883	3'	+	roo	9042	1	59.84
CAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGTGTGTGCATGTGTGCGCATTT:1	+	chr2R	10582524	3'	-	Juan	3811	1	73.97
TTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCAAACAGATTCAGTC:1	-	chr2L	17550603	3'	+	Transib-N1_DM	452	1	80.00
AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGCGTATCCATGCCTGCGGTCCTCTGGAGACTAAAAGATACAAATGCAGAGGC:1	-	chr2L	18338971	3'	-	pogo	48	1	58.27
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTG:1	+	chr2R	25118801	3'	+	roo	9034	1	60.96
CAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTTAATCTATTAAT:1	-	chr3R	18339037	3'	+	roo	9059	1	75.34
GAATGCTCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGCATGCATGATGCGTCGACGTGAAATCTCTTAGTCCTTCTCCCCTT:1	+	chr2L	701218	3'	-	Stalker	320	4	70.71
AATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCACATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACG:1	-	chr2R	20596433	3'	+	roo	374	1	57.75
CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAAGAAAGATCCGCATTGCCG:1	+	chr2R	5031022	3'	-	Doc	84	1	71.83
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAAGACTAGAATCAAAACACAGCACTGTTGATGTGGTT:1	+	chr3L	21955085	3'	-	roo	31	2	68.18
GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATATTAGCTTAAGCTATACGTGTCCA:1	-	chr3L	13845072	3'	-	opus	7	2	67.12
TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATG:1	-	chrX	10644454	3'	-	jockey	4799	1	62.63
AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAAAA:1	+	chr3L	16015301	3'	+	1360	3347	1	72.00
AGCGACAACCAGAGTTCCCAGTGCTTTGTGAAAAATGACACTTTCCATGCACGTAGTAAGCATAAAGATATAAACTGGCAGTGTCCAACTTTTAGCGGAATTGCTACCGGGCTAAAAAGGAAAAAAGAGTGGAAAACCCGGAGCCG:1	+	chr2L	5458427	3'	+	Dm88	4067	1	50.68
CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGG:1	-	chr2L	13053766	3'	-	BS	5027	1	65.96
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACA:1	+	chr3R	22844256	3'	+	roo	8983	2	79.45
TAATTAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACCAGTTGGGAATATATAAATACCTTTAGCACATTTAAGCTACCG:1	+	chrX	10694534	3'	+	I-element	5279	1	69.66
AGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACC:1	+	chr2L	23034071	3'	+	FB	375	1	45.21
CCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACATATGGCACATATGCAAATAT:1	-	chr2L	13585799	3'	-	Tabor	30	2	65.52
GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGTGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAATATTTTTGAAATAAGACGCGGCGGAACTG:1	-	chr3R	10266044	3'	+	1360	3372	1	71.97
AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTT:1	+	chr3L	16973484	3'	+	S-element	1677	1	56.25
TATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCATAAATTAAACACTTGAAAAGACACAAAACTATTGCTGGAATTTG:1	+	chr3R	9210709	3'	-	mdg1	76	2	74.66
AGAAAGGGAAAACTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACTCTGAATATTTGTGAAGTGGGCCCTGGGGCACTGAATGGAAACTGGAGGAGGTTCTCCTGGGTTTTCCCGAGTCACTGAACG:1	-	chr3L	1726111	3'	+	micropia	249	2	61.94
AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTGGATAGAACTGCGC:1	-	chr3R	23495635	3'	-	copia	57	2	56.85
ATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGTGTGTAATCATTCTATGATTACAAATGTTTAATGCATTT:1	-	chr2L	13584660	3'	+	pogo	2023	1	70.55
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCGTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTT:1	+	chr3R	7835188	3'	-	roo	88	2	77.40
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAG:1	-	chr3L	22437855	3'	+	roo	9018	2	55.56
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACG:1	-	chr2R	19050202	3'	-	roo	76	2	68.49
CCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGATTCGCTGGGAGCCTCTGGCGACTTGCAGGTAAGTAGTTGTGTACTTGGGCTGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1	+	chr4	1294987	3'	-	HeT-A	5734	1	77.78
ATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAAAAATATTTATT:1	+	chrX	10201222	3'	-	transib2	70	1	65.75
TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGC:1	+	chr3L	22917685	3'	-	jockey	4822	1	66.42
ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAA:1	-	chr3R	17605616	3'	+	Tabor	7279	2	54.11
GTGATTTGTGCATTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTAAGTTCTTAAACATGAAATTGACCTTGCTGCCTGCTTCCTCTTGTGAGTTTATGCTCTCTCTTAGCCTTTTCTCTTTCTCTATAAAAACCTTA:1	+	chr3R	1849017	3'	+	Cr1a	152	1	68.49
ATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATC:1	+	chr2L	22684595	3'	-	transib3	53	1	52.85
ATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTGATGGAGATTAGTTGAGGCATTTATTTAGTTAGGTGCTTCGACCGTCAACTACCACAGAATCAATCAATTTTTTATTTAGAAATTTCGATTTTT:1	-	chr2R	13127721	3'	-	pogo	2093	1	58.22
CATACTTTTCAACGAATCTAGTGTACATGGATGGTTTGTGGGCGTGAAAGTGGAAGTAGAAAAGTTTTTTTTATCAAATCGATAGAAATTTACACGACTAATAAATTGGGTATTCATATCTGTTAACTGATAGCGATCTAGAATAG:1	+	chr3R	10642345	3'	-	INE-1	11	1	70.55
ATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTTGGTAGAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1	+	chrX	14317416	3'	+	1360	274	1	72.27
TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGGTTTGTATCTCTACCAGTTGTGGGCTACAC:1	-	chr3R	21705931	3'	-	297	1	2	78.36
CAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAA:1	-	chr3L	17557994	3'	+	jockey	4953	1	50.00
GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTCGATAGGCAGGTACAGGCCCATTTCTCGATGTGGTCTAAAAATTTTCCACTGACAACGTAAGCAAACAAAGAG:1	+	chr2R	19499435	3'	-	P-element	15	1	68.18
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGTCGTCGTGGCAAACAGTTG:1	+	chr3L	16343327	3'	+	roo	396	1	72.17
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGC:1	+	chr3R	27994286	3'	+	roo	9032	1	53.08
AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCCCGTTG:1	-	chr3L	10773086	3'	+	412	421	2	76.92
TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTGGACTCTTTGCCATCTGAAAACCCGGCTTAGTCTTAG:1	-	chr3R	10182061	3'	+	blood	369	2	79.45
CTTGCTTGTACAGATAGCTTTTCGTTACATACATTATTGAATAAGGTCAAGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAAAATAAAGGAGCTAGTATAGGCCTTCGGTCGTTGGCCCTGGCAG:1	+	chr3R	16143691	3'	-	Gypsy12A_LTR	2156	1	78.99
GGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGGCAATGGAGAAATGAAAAATAAGCCAACTGAGACACGCCTCGGC:1	-	chrX	6499811	3'	+	Quasimodo	6950	2	59.09
CTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTACATACAGTAATCCGAAAAAATTACTTTGCCCCACACTTAAGGTTTTTCTTAGCAATGGAAAACTCGTATTTCTTGCAGTTGGCAAATTATAGTTGAAGTTT:1	-	chr2R	2564873	3'	+	gypsy	7427	2	70.55
GCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGTTATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTA:1	+	chr3L	9218281	3'	-	blood	7080	2	62.33
GCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTGCTGGATACATTGAAATATGTAGTAACATCCACTCCCATGTAACACTTAAATGCTTTGGGG:1	-	chr3L	20546795	3'	-	297	6810	2	72.22
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGT:1	-	chr2R	9791554	3'	-	412	7090	2	60.96
GGTTGCAGGTATCCGGGAGGCAGGGCGGTTGCCGCAGACCTCTTCTCCTCAGAATTAGAAGATATGGTTAGTTATGTAGGTAGCAAAACCTGCACTTTGCTAGACGG:1	-	chr3L	27381252	3'	-	gypsy6	336	2	63.55
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTTC:1	-	chr3R	7835088	3'	+	roo	9037	1	60.27
TGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATC:1	-	chr3R	26659754	3'	-	HMS-Beagle2	51	2	58.21
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATA:1	-	chr2R	11164421	3'	+	roo	357	2	65.55
CATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATT:1	+	chrX	21564764	3'	-	diver	5940	2	55.48
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATA:1	-	chr2R	20596464	3'	+	roo	9003	2	65.07
ACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGTTAAAACCAAGTTCAAAAACGTTAACAAATCACAGAATAACAAAACTTCTATGTAAAGAATGTCTTGAATATTGGCCTTTTAGTAAAATTAAGCTAACTG:1	-	chr2R	11363703	3'	-	Bari1	20	1	71.23
CTAGTACTCATTAAATTTAATTAGATTTAGTATTGTATACTATATCTAATTTGGTTAATTAAAAAGACCCCAATCATCCAATTATATTGTACTTCACATCAATGTAAGGAAGAGTAGATCATTTTGTTACAAAATTGATTATTGAG:1	+	chr3R	31140678	3'	+	Ivk	5331	1	55.48
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCTATGTAAGGTAGTATGTACTCTATATATGTGTATATGGAGCATGTATCTTTCGTATTATGCAATTGTTGCGTAGAGCTTTTTATATACATCTAGATAGTTTCGTTCGGTTGTG:1	-	chr2L	6059160	3'	-	roo	8671	2	72.60
AATATAGCTGTAGGCCCTGTAGCCAGTGCTATACTTTTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATTAACATTTCCTAAATAGAGATGAACCGAAATGCAAGCCTGGTGCTTTTAGAAGACTTATT:1	-	chr2R	3170759	3'	+	I-element	5285	1	61.64
TAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAAGCGCCCAAAGC:1	-	chr2R	4601545	3'	+	HMS-Beagle2	249	2	60.27
GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCACTAAGCCTGACTTAGTGATCCCGTATTATCACAGCG:1	-	chr3L	23797917	3'	-	Doc	76	1	70.99
ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGTTCGTATTCGTTTTGGTTTTCACATTTGTGTCAA:1	+	chr2L	11661066	3'	-	F-element	24	1	61.64
CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATATTCGCGTA:1	+	chrX	1899687	3'	-	P-element	77	1	25.93
TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACGCACACTTACACATGCACGCACGGGCAATGTCAACATGTGTAGCACACTTTTTGGTGCCTGGCATTATTTGCACCTTTCGCC:1	+	chr3L	917211	3'	-	hobo	16	1	67.77
TGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGGACTTGAGCTGCGTAAGAGGCGGCTAAACAACATTACTCAAGGCACCGAGGACACGAGGACATGCAACATCCAACACACA:1	+	chr3R	20519600	3'	-	Quasimodo	282	2	51.49
GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAAAACAATGAGTGCTCCCACTTTGATTGACAG:1	-	chr3R	25423150	3'	-	3S18	12	2	74.48
CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATC:1	+	chr2L	11518466	3'	-	412	82	2	72.60
TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCATTATGTCGAGTCACGGTAGCAAGTTTGGGGGCTAGTG:1	-	chr3L	7588383	3'	+	hopper	1401	1	69.67
ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAGGCCTAAAAA:1	-	chr2R	16891799	3'	+	hopper	1402	1	68.80
TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTAGTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGCATGCCGAATGAACGTATATAATAAAGTTTATTATTATCCGTTCAAATTTGTTTCTCAGCTCTTT:1	-	chrX	23457620	3'	-	Doc	73	1	66.44
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGG:2	-	chr3R	19968090	3'	+	roo	9034	1	53.85
GTAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGATCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGCGTCACAATCATC:1	-	chr3L	3863462	3'	+	blood	7320	1	73.77
ATCAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAATAATGAAACAGTGATGGCATAAACAAAGCTAATGTTTTATTTTAATTTAATTCAAAAACATATTGTTACTGCACACGACAGTGGTGAGTTACAGCATTGAAATCC:1	-	chrX	19787184	3'	-	Tc3	312	1	75.34
TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGTCGAGGCCTATGG:1	+	chr3R	23235593	3'	-	jockey	4819	1	55.48
AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTATGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCAC:1	+	chr3R	17243245	3'	+	hopper	1392	1	64.75
CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGTGTGCT:1	-	chr2L	6569935	3'	+	jockey	4953	1	52.31
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATC:1	+	chr3R	22956033	3'	-	roo	30	2	56.12
CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTCAAGGAGCCGCGTCGTCG:1	-	chr2L	14081276	3'	-	1360	32	1	61.64
AAATTGTTGAGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGTGACAGAGGGAACACCTACGCCGACTCAGGACACAGGAGTTGGGTCAACGTATTTGATTTCAATAACAGTAAGTTGCAATTTCTATTCGCCCCTT:1	-	chrX	22765798	3'	-	hobo	33	1	32.56
AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTCCTTATTTTGAACTACTTATTGAGCAGTACTGCACCCGCTGTACGAACAC:1	+	chr2L	12250124	3'	+	1360	3347	1	59.66
GCACACAAAATTGTAGGGTGAGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGGAAGCTTAGAATTAGAATTATTTTCACGCATCAAATGGTGAATTTTAAGCATACACAGCATATAACTTCAT:1	-	chr2L	17607589	3'	-	hobo	40	1	45.59
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGA:1	-	chr3L	11441715	3'	-	roo	8712	2	55.48
GAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATTCTGCGCAATGAATAATTATGCAAATGGAGCGG:1	+	chr2R	12839572	3'	-	accord	7031	2	69.86
GAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAAACGCTAGACGGCCATTGCTGCTCTCTGTGAATTTTCTGCTTGGGTCTCTGATTCCGTTTGCCAACAATTCGCTTAAAACTATTCCGTATTTT:1	+	chr3L	17552482	3'	-	pogo	2076	1	69.86
AACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAGAGAATAGATTAAGTAAGGATCAGAAATCAAACTTTGCAAGGC:1	-	chr2L	416736	3'	-	pogo	1982	1	70.55
CAGCATAAACATCAACAACGGGTCAGACGCCGACATCCGCCCAAAATGCTGACACCACATCCTTTTCGCTTACTAAAAAATATCCTGTAAATATAGTTGTGCAAACTTATTACACTTTGAATAATGCAAATATAAAA:1	+	chr3R	13503267	3'	+	ZAM	8064	2	53.28
TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACACCCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTG:1	-	chrX	6279378	3'	+	P-element	2824	1	26.96
AATTATAATAAGAAGGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTAAAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAACACAAAGAATTAAATTAACTCACACATCTTGCTTGATA:1	+	chrX	20645647	3'	+	1360	3069	1	62.33
TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAACAAATTGCAATTAAATT:1	-	chr2L	18419098	3'	+	412	7522	2	68.49
TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGTTGGTTG:1	+	chr3L	26011952	3'	-	F-element	57	1	61.86
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTCAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACGGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGGA:1	+	chr3R	19968176	3'	-	roo	8747	2	73.29
CGTAGCTAGTACTCATTAAATTTATAAGGTTAAGTATTATATACTTTGGGTATGCAAATTCCGGCTGCTGGTAAAAAAAAACGGTATAGACAGATTTCGGCATGTACCTCACAATAGGGATTTATAGAATTTTAAAAGGGTTTCGG:1	+	chr2R	25237168	3'	+	Ivk	5326	1	68.49
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAANTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTGCATCTGCATATCAATTCTCT:1	+	chrX	6486849	3'	+	roo	9055	2	67.81
AATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATGTATATGTATGAACCCCAAAAAATTGAATCCATAAACATGCAATTAC:1	+	chr2L	5765082	3'	-	Stalker4	7275	4	70.15
CTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAATCTTTTACCCAACACACGTACATACGTAACCAGCTATCTGCCTCTCGTTCTGCCTCAGTTGCCATCTCCCTCCCGCAT:1	+	chr2L	12886432	3'	+	roo	130	2	55.48
ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAAATACTAAA:1	+	chr3R	17243256	3'	+	hopper	1399	1	70.63
CAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAG:1	+	chrX	21667959	3'	-	gypsy2	6528	2	61.15
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTG:2	-	chr3L	9998028	3'	+	roo	9042	1	45.21
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCT:2	+	chr3R	18339175	3'	-	roo	8736	2	70.55
AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATTTCCCCGCCGCAG:1	+	chr3R	18121876	3'	-	P-element	63	1	20.00
ATTTATTTATATTTATTCAGCTTGTGTGGATTATACAAGCATTTTAAATCGGTTTTCGTACACTAAAAATAAATATATAATGAACATATTCATTTTCTATAATATTACCATTAAATTATTTGTAGAGGTACCTAA:1	+	chr2R	16726834	3'	-	Burdock	306	1	67.41
GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGT:1	+	chr3R	23235581	3'	-	jockey	4810	1	57.60
CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAAGGTGAGCCTTTTTAATTTTATTGAGCCAATTATCCAATAATTTCATTAACTAGT:1	-	chr3R	15076077	3'	+	pogo	2088	1	42.47
ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAA:1	-	chr3L	7292439	3'	-	HMS-Beagle2	6911	2	66.67
TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGG:1	+	chr3L	12861806	3'	-	pogo	34	1	56.14
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATAAATTATAACGCCCCAAATAGCCGTGCAATTATC:1	-	chr2R	16262265	3'	-	roo	8744	2	79.71
TATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTC:1	-	chr3L	25782382	3'	+	Stalker	6898	4	50.68
TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGT:1	+	chr3R	20427446	3'	-	jockey	94	1	78.47
AGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAA:1	+	chrX	17431790	3'	+	hopper2	1527	1	68.49
AATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAGAGAAGTGAATATACCTTTGG:1	+	chr3R	25448478	3'	-	roo	8684	2	71.23
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAAACAGCTGGCAGTCACCTCTGCC:1	-	chr3L	22437804	3'	+	roo	404	1	78.77
TCTTCCGCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATTTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTCCTCTCGTGCGGTTTAAAAGAACTAATCACAAATTAAAATAGATAATAATGATCAAAAATATCAATATATTTTATGGAGAAATTCTCCAAAA:1	+	chr3R	19445451	3'	+	Cr1a	299	1	56.85
GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAATGCTTGCCTCTGCTTAAGCAGATGTGTGAGTGAGAGTGTGCCTGCTGTGTGTGTGTG:1	-	chr3R	14711713	3'	-	hopper	22	1	58.25
CAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATAGAACAATATTCTCAGACATGGGTGCTGGGAACAGCAAGCCGCAAACGGTGCAGATTGAAAATCCAACGGCATTTGAGATTACT:1	-	chr3R	4578528	3'	+	BS	368	1	71.17
TAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAATGTTCATTAGAAACTAATTTTTAGCGACCGCTGAATAAATGTGCTTGGCTTTTGTCAAGGATTTAGGCGAAGGCTTTGTTCCGTG:1	+	chr2L	12281932	3'	-	HMS-Beagle2	7188	2	50.35
ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTT:1	-	chrX	21564646	3'	+	diver	172	2	54.79
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAA:1	+	chr3R	7100918	3'	+	roo	9043	1	59.23
AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGCTACAAGGCATGCAACTTTGCTAAGT:1	-	chr2R	13585358	3'	-	412	13	2	73.97
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTAAATGGGTGGATTCGGTCTGGTTTTATGGCAAATATTTTCGGTTTGTCCCTTTGCGAACTGGCCAAGCGGCAAAAGTTA:1	+	chr2R	9631278	3'	+	roo	9038	1	61.54
ATAATCTTCTTTAATTATCATATATCTGAAACATAATTATTTAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGATTTGTGAAGTAGTTTAAAAAGACAGCCAACCGCATGTGGGAA:1	-	chr2R	22209987	3'	+	Cr1a	80	1	77.19
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTC:1	+	chr2L	7898385	3'	+	roo	9037	1	51.30
TAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCG:1	-	chr3R	10273972	3'	+	HMS-Beagle	185	2	79.82
GAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAANNATTGTAACCAAAAAAGATGNAGGGTATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAAACTTACC:1	-	chr3R	22388967	3'	-	G2	2612	1	64.29
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGAAAATGGGGTTTTG:1	-	chrX	6486697	3'	-	roo	8717	2	54.79
ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAG:1	+	chr3R	18585668	3'	-	P-element	48	1	46.51
TATTTGTTTTATTAATTAAATTGTTAATTGCCAAGAAAACAGAAACGCTGCTAAGAGTATATATAGATTTTTTTCTATCAAATTCATAAAATTATATGGATACAAAGACTTAAATCAATATATGAAACGTAATGAAAGATGAAGAT:1	+	chr3L	11151731	3'	-	TAHRE	54	1	70.55
ATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGACGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	10582476	3'	-	Juan	3850	1	50.36
CTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATA:1	+	chr3L	9673106	3'	-	Doc	94	1	76.03
GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAA:1	-	chr3R	28758306	3'	+	mdg1	351	2	65.75
CAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTTGGGGTTTTCCGGTGGTAAGCTCTTTAATATCTATATATTTTTGAACTTTTAATTGCACATCCTGGATACGAAATCGAT:1	-	chrX	6500306	3'	+	Quasimodo	6945	2	53.42
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACAC:1	-	chr2L	17420129	3'	+	roo	9033	1	56.25
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGTCGC:1	+	chr2L	6059327	3'	+	roo	9046	1	60.98
ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTC:1	-	chrX	10644414	3'	-	jockey	4788	1	60.94
AGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGACACTTTGAGCTGCGTTTTTGGATCGCTGCCAAGC:1	-	chrX	20567931	3'	+	412	7375	2	76.71
AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAACTCCCAACGAAATCCTGTTAT:1	+	chrX	17431800	3'	+	hopper2	1543	1	61.43
AAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCGAAACAAGTGCGGTTCGCTTGAAAAAAACGAAACTTAGTTTAAAGTTCAGGGGCAGG:1	+	chr2L	9462338	3'	-	blood	166	2	60.76
GGTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGCATTGGATACCATTTTGGAGGACGAATACGGCAACTCTGTGACTAGAAACTTTTTTTACCCTGTACCCTTTTAAAAAATTATGGGCATTAAAGATTCAGAACTAA:1	+	chr3R	4195785	3'	-	HB	482	1	67.91
AAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAGAGACACTGATAGGAAAAGCGTTACATTTCCACCCTCATAATGTCGTCTAATACCCTTTTAATTGGCATCAAATTTCTCAGGATCTTAACAAAATGAAAA:1	+	chr3R	9122767	3'	+	Doc	4630	1	67.12
TTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGG:1	-	chr3R	17605599	3'	+	Tabor	7296	2	65.75
AACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTT:1	+	chr3R	20499851	3'	+	mdg3	5438	2	56.16
CATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATTCGCCTATTAGCTTTTTAAGTCCAAGAATAAGATTCTTTAATATTTGAGAAACAATTAGAGA:1	+	chrX	6191240	3'	-	FB	58	1	56.85
ATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGTTAAACTGACGACCCTTTTACGAATATAAATGTATTTTTCGAAACAGAAAA:1	-	chr3R	24383204	3'	+	rover	314	2	62.33
ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAAC:1	-	chrX	10521633	3'	-	Tabor	44	2	52.80
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTATTTGAGAGAAAAGCACAGAAGGTTGCATTATGCGAGCATCGGATACCCTACCACTAAATAATTTCGCCTTAA:1	-	chr3R	18584304	3'	+	roo	8995	2	53.33
CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCT:1	-	chr3R	10182143	3'	+	blood	331	2	68.63
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGT:1	+	chr2R	9632196	3'	+	roo	9013	2	57.64
CAAAAAAAAAATAAAAAAAAAATAGGGGAAAAAAAACACGCATGTGTACCTAAAAAATAGAAACAACAAGAAACAGATTAATTCATGGCCCCGTTTTGGCGCGCATT:1	-	chrX	12723442	3'	+	G2	3077	4	71.96
CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAGGTGAAAACGGTGGAGTGGGCGTGGCAGGTCGGGGGCACTTTCACAACTTGCTACGG:1	+	chr3R	14940216	3'	-	jockey	18	1	71.32
ATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATAGAGTGTGTGTAGACAACAC:1	-	chr2L	20117832	3'	+	invader4	3083	2	60.27
AGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGGCAAATTGTTAAATTATTTGTTGATTATGAATATGTAAGCAGGT:1	-	chr2L	12187141	3'	-	Quasimodo	7149	2	68.35
AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCG:1	+	chr2R	2016890	3'	+	1360	3364	1	58.54
GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATT:1	-	chr3R	10462630	3'	+	opus	7453	2	73.21
AGAGCCAAGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAGTTGGGGTTTTTTGGTTAAAGCTTGCTTTTGTCATCCAATTAAGTTTT:1	-	chr2L	16976421	3'	-	1360	51	1	73.97
CATCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAGATTCCTTGAAAAGTTCATCAATAAGTTATCGATAACTTAAGTCGCA:1	+	chr3R	8932228	3'	+	1360	3335	1	68.12
GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAATAA:1	-	chr2L	4412538	3'	-	Quasimodo	40	2	52.05
AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCGATGTGGGCAGAATCGTTCGATT:1	+	chr3L	22968429	3'	+	mdg1	7396	2	60.27
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTAACCTCAACTAAAGAAAAC:1	-	chr2L	16091846	3'	+	roo	396	1	72.60
GAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCCACGTATCCAAGGCAGTATTTACATTAATATCGCACTTTAGCTCATTCAATTTCTTTGGTTTTCTTGTG:1	-	chr2L	17652425	3'	+	roo	8662	1	52.74
AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACG:1	-	chr3L	17558023	3'	+	jockey	4918	1	71.92
TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTC:1	-	chr3L	23146501	3'	-	1360	64	1	73.95
ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATA:1	-	chr3L	17558027	3'	+	jockey	4925	1	72.59
ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAAG:1	+	chr2R	5031005	3'	-	Doc	42	1	72.29
ACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAAGAATTCATTTCCGGTTTTATAAAGAAACGATCTGCTCGAACCAAATCCATTTATTAGATT:1	+	chr4	726140	3'	+	Doc	329	1	62.75
AGTTCCATCGGCCTGCTACCGTCTCCATGGTCTTAGGAGCAGATGTTTATCCAAAGGTTATCCAATCCTCTGTGATTTCTGGCATGATAAAGTCTGTCGAATATCT:1	+	chr2R	3464640	3'	+	GATE	8041	1	64.15
AATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCCCAACGTGGGGCATTT:1	-	chr3L	17439100	3'	+	gypsy5	352	2	62.22
TTTTGGTTCAAGCTGCACGGAAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTGAGCCCAGCCACAAAGTGAGTCGCCTGCCGC:1	+	chr3R	17233452	3'	-	hopper	478	1	76.84
TCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTAACCAGGGGTTTATTCATCGACGATAAATTGATCATTAGTGCAAAAGTGCCTCTGTTTAGCAGGCATCCATCCAAATTGTTCGGCTTATTCCGGGGCCAATTCGA:1	+	chr3R	19449141	3'	+	roo	8717	2	69.18
TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACTTATATCTTTAAT:1	+	chr2R	15064470	3'	-	412	7079	2	64.54
TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACC:1	-	chr2R	5674618	3'	+	S-element	1674	1	56.85
CTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGAAAGGAAGAAAATGGAAATGGAAACCCTGTTACACTGCACTGCGAAAAAAGCGAACATAGTCGACTATTGTATACCCTCCTAATCAATACAA:1	+	chr2R	23299468	3'	+	invader4	2812	2	68.94
ACGATGAGCGATATTTTCCACAGAGCTATTGATTCCTCGGACCCACTATTATCAACAAGTTTATCCTGTCAATGTGCACACCATTGAAACCTGAAACGGTGACAATTTTGGGGCCAAGAACTTTTTCGTTCACCGTAACAATATGT:1	-	chr3L	10056856	3'	+	transib2	2361	1	61.64
AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACG:1	-	chr2L	5844977	3'	+	transib2	2765	1	59.31
CAGCGATCGGCATTACAATGTCGTAGGTCCACCTTTAAGGCAGTTTTGTCATAAAGCAAACGTTTGCATACCTTCTTATCTTTACGCTTATATTTGTGCACAGCGTTCGGAGAGACAAACTTTCTCAGTTTTGAGCTCAG:1	+	chr3L	26015283	3'	-	G3	192	1	63.57
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAA:1	-	chr3R	16076767	3'	-	roo	30	2	63.49
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGG:1	+	chr2L	3886271	3'	+	roo	9037	1	60.96
GTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGACTTTAAACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATATCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGATAGTTTCAGCGGATCCCAAATAATCTTCGGCGCTTCACTA:1	-	chr3R	19449642	3'	+	Stalker	441	1	47.26
CGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTNGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGGT:1	-	chr3R	26431969	3'	-	opus	60	4	63.77
CAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACT:1	+	chr3R	11547752	3'	-	G2	364	1	77.40
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTGGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTGCAGATCCCGCTGAGTACCATCGCAAGCA:1	-	chr3R	7098340	3'	+	roo	9032	1	71.03
GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACTAAAATAAATCATA:1	-	chr3L	7292440	3'	-	HMS-Beagle2	6923	2	59.59
AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACT:1	+	chr3L	10013651	3'	+	hopper	1375	1	65.05
TAAAATAAATTAACAAATAAAAGTCTGGCCTGAAGTTCGGCTTGGTGGCCTGCCCTCAACCTGTTTACCAATTGAAGGCCTTTATTATGTTTAACAGACCCCC:1	+	chr3R	16525142	3'	+	HeT-A	308	1	77.67
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCTGATTTTTCTTTGCTGCTCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTT:1	+	chr2L	12892710	3'	+	roo	386	2	53.40
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCGTAGTGAAGGCCCACAAATGAACCATTAAA:1	+	chr2L	7898421	3'	+	roo	9052	2	69.85
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTG:1	+	chr2L	5254351	3'	-	roo	8686	2	55.17
AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAA:1	-	chr2L	17295815	3'	-	Doc	43	1	52.74
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATCGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTG:1	+	chrX	23439053	3'	+	P-element	2495	1	61.43
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTTAAGGTCGATTACTAATTCCATTTCATTATACTTACTTAATATCCCTGATATCTCTGCAATCAAGCAGTTATCAACCA:1	+	chrX	13039600	3'	-	roo	8668	2	79.53
GATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAAAATACAAAGTATTTTGCGTTTTTCGTCTTTGTGTTTGGGAGAGAGTAGCTTTCCAGCCCCTCTCGCAACGGTTCCCACATCTATAAACTCA:1	-	chr2R	3288560	3'	+	Cr1a	154	1	52.17
TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAG:1	+	chr2R	25118754	3'	+	roo	323	2	78.08
TCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGATGTTTAACACCCAGGTGGCCCGATATT:1	-	chrX	5629072	3'	+	jockey	4988	1	78.12
CAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGAGGCTTAACATTTAATCATAAATAATAATA:1	+	chr2L	4952069	3'	+	Quasimodo	6945	2	68.69
TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAATAAATAAATAAAATGCTGAACAAAATTACTTGACTATCTAGCACCTGAAAGATGTTTAAAGCATTTTTGCGTTACAAGCTGAACACCTGAAATAAAAACC:1	+	chr3R	11515072	3'	+	I-element	5331	1	60.27
ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACA:1	-	chr3R	13360324	3'	-	jockey	89	1	74.82
TGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGC:1	-	chr3L	2362348	3'	-	Stalker2	7338	2	76.03
AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGAT:3	-	chr3R	19589879	3'	-	BS	5022	1	63.70
ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGATGCTTTGCCGGCTTTGTCAGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGA:1	+	chr3L	21855538	3'	-	blood	48	2	53.33
AATAAAACCCAGCCAGACATAAGGTTTCCTTACCAATAATATCGTTTGATGGCACAACAAGCCGTTGCC:1	-	chr2L	7763149	3'	+	Penelope	427	1	88.41
ATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAACCATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCACCGGAATATACGTTATTTT:1	-	chr3L	17558016	3'	+	jockey	4925	1	65.75
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAATAGGGTAATGAAACATGGTAAACGAGAGGGGAACGGGAAG:1	+	chr3R	22122822	3'	-	roo	14	2	73.48
AGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTTTACATTTACATTAAGTCAAATGACTTAATGGAATAAATGTAGCGTTAAACGTAGGGTTCCGTCCATAACTCACCCACATCGGCAGACTTGTG:1	+	chr2R	15370893	3'	-	1360	3332	1	51.54
TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGCGAAAATGCTTAACCA:1	-	chr2L	17081797	3'	+	jockey	4943	1	64.71
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGA:1	-	chr3L	4840740	3'	-	jockey	4709	1	58.10
TAAATAATAACAAAAAATAAAAATGCACTTGTGTATTTCTACTCGCTTTGAATTAAATTTGAGATGCCATCTCTCTTTCCATGGTTTGGCTGCTTGACATTCGGTCTGTCAGCGGAA:1	+	chr2R	9491455	3'	+	BS	5097	1	52.14
CTGTAGCGAAAAGGTATCTGTACAAGAGAGACCACCACCACACGCAACGCCATGAGCTAGAGCCGGACCAAAGACACTAGTTATTTTAACGTCTTTTTATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATC:1	+	chrX	22824228	3'	+	Gypsy12A_LTR	2148	1	60.27
GCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGAGGTGATGGAGTAAAAGACGCCGTAGCCATCGAAGACCATGGGCGCC:1	+	chr3R	27703945	3'	-	F-element	191	1	68.49
CTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTTATATTTTTTAATGAAATTTATGAACTTACAGTAGTTATAATAGTTTCTATTATTAATACGTGCATAAAAGAGTGAGCAATAAAAGTAGTGGAAGGAACAGGAG:1	+	chrX	12766689	3'	+	1360	489	1	62.33
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACT:1	-	chr3R	25448366	3'	+	roo	9016	2	72.97
CATAGATTTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACTGCCGCTCATCT:1	+	chr3L	2362408	3'	+	Stalker2	330	2	65.75
GCTGAGCGATACATAAGTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATAGATACAAATATGTAAAT:1	+	chr3L	9353439	3'	+	G3	4370	1	82.88
CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTNGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCCGCAAATACAAATACCAATACCAAAGCCCCCTGTAAGGGTCATTCTGTGCACGTGTGTGTGTG:1	-	chr2R	10124116	3'	-	P-element	57	1	45.52
GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTTAATTTGCTGGGAA:1	+	chr2L	16067177	3'	-	297	42	2	61.11
TAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACAT:1	-	chr3L	17557983	3'	+	jockey	4958	1	54.79
TCTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCCTGGCGA:1	+	chr2R	5439247	3'	+	INE-1	501	1	65.75
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCAAAGCAAAATCCAAT:1	+	chr2L	18294300	3'	-	roo	53	2	56.85
TAGCTCAATTTTTAGAATTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGCAAGCCAATATAAATATATACATATATACACGTATATAGTCGCACAGACATGTGTTTTTTTTT:1	-	chrX	10201126	3'	+	transib2	2793	1	52.50
TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATACACCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGTGTGCTGGTGTTGGAAAATTGCAAGCCAACATAAATTTATGTCT:1	-	chr2L	6569897	3'	+	jockey	4980	1	68.57
AGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGA:1	-	chr3R	21276543	3'	-	BS	5067	1	63.70
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTT:1	+	chr2R	25118778	3'	+	roo	9011	2	61.64
AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAACAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAACAAAGAAAATATGATTTAA:1	-	chrX	13704729	3'	+	invader4	305	2	66.43
CTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACACCATAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGCAGTTAGCC:1	-	chrX	23201992	3'	-	R2-element	102	1	49.59
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAGTCGTCTTTGACAAATTGAGGCAAAATGCAGCCGAGCC:1	-	chrX	14336378	3'	+	roo	394	1	73.85
CTCCCTTTTTAGAGAACTGAAGAAGCTTTCCACAACAGAATTGTCGTAACAACAACCTTTATAACTCATCTATGTTTTTTATGGATAAGAGATATTGATAAGGCGGCTAGCTCTTTCGTTAGTTTATTTTTTTAT:1	+	chrX	5981587	3'	-	Stalker2	7226	1	23.70
GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGTCTTACCTACGTTTAATTTATGCACAAATAATACGAGCAAATTATTCGCTTTGTTCCGCAAATGTTTTTCAAGTGAATTGTG:1	+	chr3L	20888816	3'	-	1360	11	1	68.70
AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGNAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAAATGTAGTATCTT:1	+	chr2L	6623065	3'	-	Burdock	22	2	67.16
GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCTCGTTAGTCGATGCTCA:1	-	chr2R	981616	3'	-	1360	16	1	53.66
ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTGCCGAGAACACTTAATAAGATG:1	+	chrX	10253299	3'	-	hopper	53	1	53.42
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATGGC:1	+	chr2R	9328718	3'	+	roo	9037	1	59.29
GGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCTAAACACGAATCGCACCTTTTGGTCCTCTCTTAACAGGTA:1	-	chr3R	14640603	3'	-	opus	414	2	69.70
AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCG:1	-	chr3L	3799805	3'	-	copia	76	2	76.74
GTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCATGGCAAGCCTCATCTGCATCAACATTGAGAGACCGGCACAACAAAAACGGGAGGGAAGAGGAAGAGCCAGGCGATA:1	+	chr2R	6125153	3'	-	pogo	1666	1	65.00
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATGTGTTAAATCG:1	-	chr3L	1534514	3'	+	pogo	2046	1	57.93
CTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTACAAGGACTTTTCCCAAGCAAAGTAAGCTGCCACTGCTTGAGTGCAATTCTTGGGCATCAAT:1	+	chr2L	18211513	3'	+	Doc	4259	1	54.48
TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCT:1	+	chr2L	17420221	3'	-	roo	77	2	80.15
AATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGAACCTAAA:1	-	chr3R	3922965	3'	-	Cr1a	99	1	78.08
TCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCAC:1	+	chr3L	8249123	3'	-	jockey	4569	1	54.84
GTGCTTGTGTCCGCACTTTGTGCCTCCAGATATGAACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCGTTGGTGTTGGTTTCTTTAGGGTGTTGGTGATGGTGGTGGTG:1	-	chr3L	7582567	3'	+	1360	466	1	60.00
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATTGCAGACATCGGTGCTCGTCACAGATAGTCAATCGAATCGAATT:1	-	chr3L	12879694	3'	-	roo	8688	2	70.55
TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCC:1	-	chr3L	15519778	3'	-	pogo	58	1	76.11
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTGCATCTGCATATCAATTCTC:1	+	chrX	6486848	3'	+	roo	9054	2	67.12
AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTTGGTGCGACTGCCTCTGTGTGCGTGAGCGGGTGTGCGAGTGTGCG:1	+	chr2R	21572184	3'	+	hopper	1350	1	66.91
CATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTAT:1	+	chr3R	21276658	3'	+	BS	5071	1	59.15
TATAGTCGAATTACCCGACTATCAGATACCCCTTACACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAACATCATCGATTATAACTTATGATGGTAGGGTGGTTTTTGTTCTTCATGCGTGGTTGCAATGTATCAAATA:1	+	chr2R	5151120	3'	-	INE-1	565	1	53.33
AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTT:2	-	chr2R	13585393	3'	-	412	48	2	51.37
GTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTACTCCCCCCCAATATTAACTCTACTCTACATATTTAGGGTAGATAAATTATGAAGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTG:1	-	chr2R	1243232	3'	-	gtwin	6939	2	60.00
AAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1	-	chr3R	29487012	3'	+	flea	4952	1	62.33
TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGCAGAATCGC:1	+	chr3L	11957234	3'	+	blood	349	2	59.06
TGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAAT:1	+	chr3R	25454097	3'	-	Quasimodo	62	2	65.28
CTTGAACACACACACACACACCGATGCACAGATACACCAACACACTGACAGCGGAACAATTTGCTGTTGACAACACTTTGCAACA:1	+	chr3L	1991485	3'	+	accord	180	2	61.18
ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATAC:1	+	chr3L	23456268	3'	+	1360	3356	1	56.16
CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCAAACA:1	-	chr3L	7943614	3'	-	Burdock	48	2	62.99
CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTT:1	-	chr2R	5485125	3'	+	blood	302	2	71.92
AAAACGTTAATTATTGGAAATATCGCTGAGAGAAAAAAAGGCCAGCTAACTTTTTTTTTCTTGAACAAATTGCCAAATTTGCCGAGTGCA:1	+	chr3L	2609879	3'	-	FB	483	1	41.11
AGTTCACGGTCTTTCCGCTTTACACGGACACAGTGGACAACTCAGGCACGATGCCAATTCCTCAGAGGAGCGGAGGCCTGGAAACGGGCGGAGTCGGAGGATCCTCGGCC:1	-	chr3L	6246695	3'	-	gypsy8	4720	2	76.36
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGACTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTTGAG:1	+	chrX	9540141	3'	+	roo	9039	1	61.64
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCA:1	-	chr3L	9998016	3'	+	roo	9054	2	45.21
GGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACC:1	+	chr3R	8049019	3'	-	Q-element	119	2	61.90
GTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTTCACTTAAAGAGATTCAATCCCTTCAAAAGCTTAC:1	+	chr2L	2246173	3'	+	Ivk	51	1	75.00
ACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAATTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTAACTATATATATATATATATGTATTGTTGCCGAGCGAT:1	-	chrX	23201819	3'	+	McClintock	6378	2	79.82
AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTTACCTACGTTTAATTTATGCACAAATAATACGAGCAAATTATTCGCTTTGTTCCGCAAATGTTTTTCAAGTGAATTGTGTTT:1	+	chr3L	20888819	3'	-	1360	37	1	56.94
GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTG:1	+	chr3R	10182191	3'	-	blood	25	2	56.98
GTAGGGTGGGTATAGAATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTCTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGAAGACGGATCCATAGAGCAATAC:1	+	chr3L	17437777	3'	+	Circe	7200	1	78.70
GCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGTTTCAGTTTCATTTAATCAATCCAAATAAACGGTGGACGATGTCGATAAGTGAACTAAATAACCAGATTAAAGC:1	+	chr3R	12316767	3'	+	HMS-Beagle2	196	2	70.77
CCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATTGAAAAAGCGTTANATCGTATTACTGGGGCGCTGGTTTTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTA:1	-	chr2L	23069854	3'	-	Stalker	7025	4	57.29
ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATCCTATTATAGAGA:1	-	chr2R	6172983	3'	-	pogo	60	1	60.27
AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGCTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGGTGCACTCATTATTTTCATTCCATAAATTATATCTTCAAC:1	-	chr3L	10647905	3'	+	412	434	2	56.16
GAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATCATTTTCAGGCTGGGTGAACACGGTTCTCTGCTTAATCAACTCGTCATTATCGTTCTGGATAATTGGCTGAATGTC:1	-	chr2L	1843611	3'	+	hobo	216	1	66.06
ACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGGAAAGTTAAAGCACACTATTGTATTTATATTGGCCGCATTTTAGCCACGCTTTTTATGCC:1	+	chr2L	4947897	3'	+	Quasimodo	215	2	52.63
TATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCTTACATTAAAACA:1	+	chr3L	24208199	3'	-	Quasimodo	70	2	70.55
CTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAGTATTATAAGTAGGATGTTAAAAACGCCCTTGGTAAACATAAACTTCCCGATGTGTCTCTACCAACAAGGAAT:1	-	chrX	10643933	3'	+	jockey	4795	1	70.00
CCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTANTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTGTTTTCCTCGAATTCGATTGCTTCAATCTGTAG:1	+	chrX	11438988	3'	+	jockey	4774	1	76.71
AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCTTGATTGATTTCAATATTATTATCACGATTTGCGGAAACCTGGCCTATATTTAAGTCGCCACCATAGCCGAAAAGTGTGAATAATG:1	-	chr2R	6487825	3'	-	copia	36	2	59.59
ATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCTTGATAATATAAAAAGTATTTCTGATATGAATATTATATATATTATATATCT:1	+	chr2L	5020553	3'	+	HMS-Beagle2	245	2	62.33
GCATTAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAATAACATAGAATAGCATAGAATAACATAGAATAAAGTAGAATAACATAGAATAACATTGAATAACATAGAATAACATCGAATAACATAAAACAACTTAGCAAATGAGCACACACACAC:1	-	chr3R	28851264	3'	+	invader1	197	2	26.71
AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAAA:1	+	chrX	13504246	3'	+	412	7492	2	60.00
TATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGG:1	-	chr3R	17243092	3'	-	hopper	42	1	56.85
TTTAAAATATATTATTTTATTATTATATAGGTAGAGCACTGGATTTGTAATTTTATATTAAATAGAGGATAATGCAAAGTTGTCATTTTCACTAAGGGCAGAAACATAGGTCACACATCTGGGCGCTTAGTGGGTGTGTGG:1	+	chr3L	19611290	3'	-	BS4	724	1	71.63
TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTAC:1	-	chr2L	7888102	3'	+	pogo	2050	1	60.69
CCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAA:1	-	chr2R	20596458	3'	+	roo	366	1	54.40
GCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACT:1	-	chr3L	21855456	3'	+	blood	7307	2	72.60
AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACGCGGGTAAAACAAGTTTTTTCTTTACTTAAAAT:1	-	chr2R	977511	3'	-	F-element	50	1	55.00
TAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGG:1	+	chrX	21667952	3'	-	gypsy2	54	2	71.23
AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACAAACTTTGATTGCCCAAGTCCTACCAAGGACTACCCTGAACACCA:1	-	chr2R	13817638	3'	+	412	7487	2	63.08
CACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCTGCAAATGCAAAGTAAAATTAAGAACACAAATTACACAAAATTTAAAGAGAAAATATATGTTTATAAGAAATGAAAGTGAAGTTATCAACCAAAGTGAATAACATACCG:1	-	chrX	21961048	3'	+	hobo	79	1	70.34
CTAATCTCATACTTTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGCCCACAATGATTTGGATGAAAGTATCTTACGTTGGATAATCTTTCTAGGATTCAATATTGGCAGAAATATGAAAAAGTAACATAAACA:1	-	chr3R	25427928	3'	+	diver2	4569	2	56.85
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTTTCACGTTTCCTT:1	-	chr3R	17420400	3'	-	roo	49	2	54.11
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGG:1	-	chr2R	19050217	3'	-	roo	8752	2	78.32
TAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATACAGTGAGTTGCACTAAAGTCTTGAAAACACCCTTATCGTATGGCATACCTCCACTGGAATGGTCGTCGGAC:1	-	chr3R	19258079	3'	+	Stalker	7136	4	68.00
ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATATATGTGTGTTTGTATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTACCTGATGTCGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCTAATGCTGTTGCTGCTTCTGCTGTTGTTGC:1	-	chr3R	19169483	3'	-	opus	9	2	78.57
TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCC:1	+	chr2L	7888208	3'	-	pogo	68	1	70.55
TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAACGGCAGCAACAC:1	+	chr3L	12879820	3'	+	roo	336	2	64.38
CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCAAAGGAAAACACTTACCCAAAAAGCAACAACGATTGTGTTGCAAGTTGACTGCTGCTGCTGCTTCTTCTTCTTCTTTTACTTTTTTGGCTCCTTGTTCT:1	+	chrX	14824847	3'	-	jockey	4680	1	77.93
GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTACAC:1	+	chr3L	20033803	3'	-	blood	7039	2	52.94
GGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATCTCTTAGTTCAATAGATGTATATATTTTCC:1	+	chr2R	9500076	3'	-	G5	4732	1	44.29
ATGGTTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCA:1	-	chr2L	15991298	3'	-	mdg1	57	2	56.85
GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAAT:1	-	chr2R	12835055	3'	-	jockey	85	1	74.45
AATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAGTACGTAG:1	+	chr3R	17615230	3'	+	Tc3	305	1	76.22
TCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCATACAGCCAACACAAAT:1	+	chrX	13704876	3'	-	invader4	2794	2	53.60
GTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCGCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTTTAAACCAAACAGTAATGTAAAAATTATAATTAAACTAAAGGCCATCATTATCACTCAA:1	+	chr2R	2959078	3'	+	Dm88	24	2	58.22
AGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTTGGTGGCAGAGATTCGCAGCTGATACCACTTGGCAGGCAGAAAGTCGCAGAAGATTAAATTTTCACGGTT:1	+	chr3R	17477789	3'	+	copia	4970	2	55.22
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTACATGAATATTTTATGGTAAAAACTACAAAGACATTTG:1	-	chr2L	18294143	3'	+	roo	9046	1	56.16
TTAAAGGTAAAAATTAAGGGTTCTTTTCTTAATTAAACGCAATTTTTTTGTTCAATATAAATAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAACACTCGCCTTAATACTTTCTACACTATGCTTTCGTTTTACCTATCGTAACTCATC:1	+	chr3R	6427196	3'	-	S-element	1663	1	62.33
GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATTTTCAGGATCGTAGAGTCCGGCGATCATTCG:1	+	chr3L	11321545	3'	-	mdg3	5254	1	76.56
TACATAAATACATATACATATGAGTATTTTAGGCGAAAAACTTCCAATGGAAGCCTCGGCCATGGCAATCGCTTGTGTTCTAATTGCCGGCAAGGACCTGCCTGCCTGGATCCGACTGCCTGGCATCC:1	+	chr3R	20768077	3'	-	Stalker4	247	4	63.28
ACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGATTTAGATTCAGCATACAGATTATAGAGACATTGAACCTAGCATTATAAAACAGGAAGGTGCTACAACTGTATTTATTGATGATGACCCCTTCACTAGTTTTGATGACCTTA:1	-	chr4	172459	3'	+	INE-1	143	1	53.42
GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGATGGAAAAAATAGGGGAAAGAATGGTTGCATAATAACATTGCCTGCTAC:1	-	chr3L	4840692	3'	-	jockey	4689	1	69.92
ATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTACGGTCAACGTTTTTGTAGACAAATTGGCGCTGTCACAGTTTTGAAAAGTTTCTGACATATTTCGCTCGACCCACTGTCCGAAAAAGAGCGAAAGAGAGG:1	+	chr3R	17243581	3'	-	hopper	963	2	69.86
ACAAATGTATATGTATAAATGTATAAATGTATGTATAAATGTATAACTCACAAATATTTTAAACAGAATAGGCCTTATATCAATCTTTTTTTTTGTCATATTTTATAAATACAAGTGATTACACCCGTTACTCGTAGAGTAAAGTG:1	-	chr3L	21858920	3'	+	Stalker	246	4	68.49
AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTC:1	-	chr2L	20840429	3'	+	Transpac	267	2	64.55
CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCACAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCAT:1	-	chr2L	17081790	3'	+	jockey	4953	1	57.76
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCG:1	-	chr2R	21907911	3'	+	roo	357	2	53.52
TATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATCA:1	-	chr3R	556455	3'	+	Tc1-2	1544	1	71.72
TAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTATTATGTGGCCGCAAACAAGACCAAGAAAAGGTAAGG:1	+	chr3L	7943066	3'	+	Burdock	6135	1	72.59
CAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAGTAATTGTTGAATGTGTAACGTGTGCAAGGTATAAACAAAATACAGCTCAGCAAATAATGGGTAACTTGCCAAAATATAGAGTGACGATGACATTC:1	+	chr3R	19447185	3'	-	Doc	164	1	59.59
CGTGGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCGAGAAGGTTCAGATTCAGCTTACCTTTTCTACATTCAGAACATTCGTATTTTACTAACTCCTGCTAATAGCTACTGGGTCCTTTAGTATTCTTATATACTGTGGTGCCCTAACTCGGGA:1	-	chr2L	22689424	3'	+	INE-1	144	1	65.75
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCTAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAA:1	+	chrX	6486784	3'	+	roo	8991	2	73.79
CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTT:1	+	chr2R	5485231	3'	-	blood	7031	2	66.40
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCG:1	+	chr2L	7898392	3'	+	roo	387	2	60.55
AGATACCTTTTCGCTACAGACAGTAATGAATAAGATTGAACGTTCTTGCGACAAAAGAATATAGGATTTATAATAAAAAATCGGAGAAAGCAAATTAATATATTCGGAAGAAAAGGAAGAAAAGCTTTTTAACGCGTTCTACGAAT:1	+	chr3R	27191169	3'	-	Gypsy12A_LTR	2145	1	78.77
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACG:1	-	chr3L	11441716	3'	-	roo	36	2	55.64
GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAATACAAA:1	-	chr2L	22121340	3'	+	opus	460	2	50.00
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCA:2	+	chr2R	9328685	3'	+	roo	335	2	65.52
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGGAGCGGGACAGTTGGCGTTCGGTGTCAGGGG:1	+	chr2L	7945427	3'	-	roo	8693	2	58.40
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGTCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAATTTTACATTATTTACAATTTATAAT:1	+	chr3R	31817567	3'	+	roo	9037	1	62.07
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACT:1	+	chr3L	15177301	3'	+	roo	9002	2	66.90
GAAATTGAATAAACATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGC:1	-	chr2R	15064361	3'	+	412	7485	2	66.13
AATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGCAGTTGTTAATTAGCTTATGATTACT:1	-	chr3R	13349040	3'	+	BS	5044	1	56.12
ACGGGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGC:1	-	chr3R	10182137	3'	+	blood	361	2	51.28
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAG:1	+	chr3R	25448429	3'	-	roo	8733	2	67.12
TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATTTTGTGTTCTGTTGGCAAGGTTTTTCACCGTTTTAAAGCATTTAGAAACAACTTTTTT:1	-	chr2L	20808282	3'	-	HMS-Beagle	6822	2	67.81
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCA:1	+	chr3L	15600313	3'	+	roo	334	2	68.49
AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCG:1	+	chr3L	20168429	3'	-	mdg3	85	2	73.29
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGT:1	-	chr3L	6978145	3'	-	pogo	57	1	64.44
AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGAGCGAGCATCCTT:1	-	chr3R	11083914	3'	+	412	7492	2	74.29
GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGCAACACACGCGCAGATACAGATACAAAAACACTCGGACGCAGATACATTTACATCTGGCCGGAAGCGA:1	+	chr2R	20899956	3'	+	hobo	2902	1	50.77
ATACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTAAGACGTTCCCTACATTAATCAATAATTTATTTATTTTGAAATAAAACGTTTAATCCGGCTTTTAT:1	-	chr2R	15064294	3'	+	412	477	2	75.34
AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAAT:1	+	chrX	21014831	3'	+	copia	5054	2	75.97
ATATCTATTGATATCCCAGAAAAATGAAGAAATTTTGAGTTCGCATTTGTACGGGTATCTAATAGCGGGGAACTCGACTGTAGCATTCTCTATTGTTAATTAAGTAAAACAACCCCATACACCAACTTATGCC:1	+	chr3L	27974564	3'	+	INE-1	498	1	84.96
TTTTGTTTTTTTTTTATAAATTTTACCCCTGCTAACGCTGCTGCTACTGTTTTGACATTTAAAT:1	-	chr2R	18075259	3'	-	HMS-Beagle2	478	2	85.94
GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAGGCCTAAAAACGCCGCGCAG:1	-	chr2R	16891789	3'	+	hopper	1405	2	75.37
TTTCCCCATGTTTAACAAATTTAGGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAACACGTATGGGCATGTCCGAATGTATGTCCCTAAACATCTCCGCTTCTGGGGAGAATCCTCTGTTACATCCAATACCTCGTGTTTTCG:1	-	chr2R	5505421	3'	-	Tc1-2	343	1	60.00
GTCCGGTGCCTGCAGCCTGCCGTAGGATGGCTGTGTTGCAACCCCAGTGATTGTTATTAACTTTTGAACTTGCCACAATGATACAAGCCAACCACACGGCACTTGGCCAAAATGCCAATCAAACT:1	-	chr2L	11288081	3'	+	GATE	8171	1	56.00
ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAAGAACTGTTAGAAAATGGTGAG:1	+	chr2L	14081446	3'	+	1360	3370	1	71.92
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATCGGATCCGTGG:1	+	chr2R	13084693	3'	+	roo	9031	1	54.48
TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGCGAAACAAAAATAAGTGAAATGGAGTTTT:1	+	chr2L	544897	3'	+	412	468	2	62.69
GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGATAGATAATATCTTTATATAGAATAATATAATCCGCATAATTATAATTGTTGAAAATTACATAATGCC:1	+	chr2L	15248019	3'	+	Transpac	5178	2	53.42
AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATTATTTTGTGTAAATCTGTGAAAGCCCGCTGCGTTTCTCCTTCGTTGACCAGTAGCCGCATAAAT:1	+	chr2L	3165056	3'	-	412	7104	2	52.11
CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAAC:1	+	chr3L	23866732	3'	-	copia	4917	2	63.08
CGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAAATCAATTTACTACAAGGCTTAAAGTCTTAACAAAAGGTTGGATTTCTCTGCATACTTTCAGGCGTCAGAATCAGAGCAATTGCTTTAGTAAAATACT:2	-	chr2R	18687716	3'	-	jockey	4988	1	42.47
AGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGTTTTTTTAATTTTGGTGTTACACTTAATGTTGCACCGCGCCG:1	-	chr3L	25878232	3'	-	1360	3359	1	70.55
CTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAGGTATACTGAGAGATTTCCAGTAACACCTTTTGTTGATTATCACCAAGCCGCCAC:1	-	chr2L	17420652	3'	+	roo	47	2	62.33
TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAAC:1	-	chr2R	14542161	3'	+	roo	318	2	80.14
TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTGTTGTTTTTAGCCAGTCC:1	-	chr2R	22308025	3'	-	Tirant	8118	2	63.71
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACA:1	-	chr3R	17817898	3'	+	roo	350	2	65.12
CATGCGGAGTGTGATTCAACACGATGTAGGAATCTATAGATTATCGTTTGCCAAAAGGCCAATAATCAAAATCAAATTTCCCGATCGTCTACTGCAATGAGTCCTTCTGCAAGATCAGCGGCTATAACCGTGCC:1	+	chrX	14986349	3'	+	3S18	496	1	49.25
CAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTACAA:1	+	chr2R	5924439	3'	+	jockey	4713	1	40.41
AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAAC:1	+	chr2L	5845064	3'	-	transib2	53	1	65.04
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAATTTTACATT:1	+	chr3R	31817551	3'	+	roo	9020	2	55.48
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGACAAACTTTTTCT:1	-	chr3L	15600132	3'	-	roo	16	2	57.53
GTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGTATCTTAGTATTTCAGAATTTAAACTTAATTTATATATTTTATAAGCATTTATTTACATGATTTGATTAAACTGCAAGTCCAAAACTCCTTTGCATTTCGATACTCTGT:1	-	chr3R	14337347	3'	-	copia	4882	2	76.71
CTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCAC:1	-	chr3R	17605643	3'	+	Tabor	413	2	64.38
GTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGAACGTTGACCAAAAGTGTCGGGAATTTCAATGAGCTAATAAATTGAGTTGCGAAAGTGAGTTTAGTAGAAAGTGTGGGAATATGTGGATACTTGCGGTTT:1	+	chr2L	13909637	3'	+	jockey	4905	1	69.86
GTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTCGGCCGTCACCAAAAAAGTGTTGTTCCCAAAACGACTCCATCAATAAATAAATCGATCTATTGA:1	+	chr3R	9822399	3'	+	1360	3250	1	69.66
TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGT:1	-	chr2R	20944330	3'	+	pogo	2045	1	60.96
AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGTTTTTGGG:1	-	chr3L	15995953	3'	-	297	43	2	74.00
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCGTATAAAAAAGAAAGCAAATCCACAGAAACCGTC:1	+	chr3R	17420550	3'	+	roo	397	1	69.85
AAAAAATTGGCTGCGTAGTGCCAAACCATTTATGGCCGTTACGCATCTTGTTTTGCTAGTGGCTTTGATTGAACTATAAAAACAGACCTAGTTCGTTCGGTCAGTTTGGTTAA:1	-	chr2R	4591915	3'	+	1360	3342	1	90.27
AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGC:1	-	chr3R	10182146	3'	+	blood	7333	1	73.39
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGCATTCACCGAGGACTATGGATTCGGT:1	+	chr3R	7835246	3'	-	roo	8677	2	72.87
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTC:1	-	chr2R	8585449	3'	+	roo	335	2	73.88
ACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTA:1	-	chr3R	9714347	3'	-	Stalker	6877	4	66.44
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTC:1	-	chrX	5643452	3'	+	roo	9034	1	58.62
AGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAGACTATAGCGTTATCGGATTTTATGAGTTCTCTTAAAGTACCATTATAGATCTTGTGAACTGCGCTGGTGATATGCCCAAGGCAAAGACACTAGAATAAC:1	-	chr2R	2053923	3'	-	Idefix	19	2	32.88
ATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTTCAGGGCGCTGGGCGGAATGGGTTTGGTGCAGGGGGTCAGATGCTCACACATGAGAGGGAACTGGCAA:1	+	chrX	1897292	3'	+	P-element	15	1	56.10
AAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACACTTCATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCTAGTTTGGCGCCGTCAAAACAAGTTTGAACCACTTTTGCACCCCAGTGTACGATGACACCCATTTATCTACAAGCA:1	-	chrX	15080315	3'	-	S-element	77	1	57.64
AGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTGTTGTCCCTGAATTGGATTAGGTTTTACCGACTAGCATAATGGCTTTCCAGTTTGTTAATTACTTGAAATTTTGCTATCCCTAAACACTTCATGACAGACTTTG:1	-	chr3R	13361308	3'	-	jockey	4857	1	72.41
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:35	+	chrX	23439059	3'	+	P-element	2495	1	60.27
AGTTGATATAACATAGTAATTATTATGATGGCTATGACTTCCTTCGTCCTGCTCGGAATCCTTCATTGTGAATGTACCCACTGCCGTCTTGCAATGGGCATTGATCTTGCAGCTGGAGTCACTGGCCCAACTCTCGCACCCGCAGG:1	-	chr2R	16946935	3'	-	jockey	4842	1	75.34
CATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGTGGTACCAAACGTAAAACCACAGAGATAGAGGATCGACGCATGGTTCGTTAGAGCAATACTCCTTCTCCCTTCCATCATTCATTTCAACTGTCATTGTTCTGGCATATTTGTTGG:1	-	chr3L	1440066	3'	+	HB	476	1	60.00
GCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGAAAGAACGCG:1	-	chr3R	4357499	3'	+	Tc3	1676	1	50.00
ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGCCGCCTATTGGTAATTGCCCAACCT:1	+	chr3L	10848708	3'	+	blood	7330	1	78.18
ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGGCAAATATTTGTCCCTTTTTTTCG:1	+	chr3L	10013694	3'	+	hopper	1399	1	69.67
GAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAACTATCACCAGATAGACCACCAGAG:1	-	chr3L	23849679	3'	-	R1A1-element	5115	1	79.83
TACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTCCAGGGA:1	-	chrX	20453677	3'	-	INE-1	539	1	79.45
AAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCAACTGCTCTTTCTCATTGTTGGCACTTGCTTTTGCTTGTTGCCTTTGGGCCATATTTTGTACCTTTTACGTTTATTGTGACATTATGCTTTGAATAA:1	+	chr3R	17816240	3'	+	roo	134	2	72.59
TTTCTATTCACACAAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGA:1	+	chr3L	4605715	3'	-	pogo	65	1	65.07
CAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATATTATAATATTTAAGTTATCTTATCGTAGGCAGTTTTGTTGATTTTATAAAACGTTTCCGTTTTATTAGTGCTTAAGAAC:1	+	chr2R	18352434	3'	-	FB	41	1	54.11
CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCG:1	+	chr3L	17205264	3'	-	hobo	52	1	74.31
GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCAAATGGCAAACGGCAATACCCGAACGCGCAGCTCACCCATCGAGGGCTAG:1	+	chr2R	24218657	3'	+	412	481	2	72.31
GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAG:1	-	chrX	10644457	3'	-	jockey	4838	1	74.81
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTGTCTTATTTTA:1	-	chr3R	25339964	3'	+	mdg1	365	2	55.48
ATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTATATGTTTAAATTCCGAACAGGTAACAAATGAATATGACTTCTTATTTTATCTGAAAATTACATTTAAGGTGTAGAGTTAGTGTGTCACTTCG:1	+	chr3L	27391104	3'	-	1360	2997	1	67.14
AGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTATATCCTAATGGGTATTTCCAAGTCCGTACAACTTTGTCTCATCCAGTTAGTCCCAACTTGTTTTATCTAC:1	-	chr2R	20194178	3'	+	Max-element	8506	2	60.00
CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAACAAGACATACAATTAAAGATAATATAA:1	-	chrX	17833735	3'	-	Tirant	8153	2	64.35
AGTAGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCCGAAAAACTGGTACAGTCCCAATACATTTCAAGAGAGAATATGGATCACTTTTCATTAAAATATAAACTAATTTCCGCTTTAAGAGCGACTTA:1	-	chr3R	17245083	3'	+	hopper	1034	1	66.18
CACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCCCGACCGCTGCCCTACGACTTCGAAAAGGAGCTGATCCATAGATCTAACCGGCACATCCGACTTTAC:1	-	chrX	1902647	3'	+	P-element	2886	2	48.97
GGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTTCAATCGCTAAGGACTTTATGGCGCACGTATATGTTTTT:1	-	chr2L	12153200	3'	+	roo	8992	2	72.60
CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTG:1	+	chr2L	15991397	3'	+	mdg1	7402	2	62.22
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAG:1	-	chr2R	9328586	3'	-	roo	52	2	54.11
CAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTTTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAGTTGAGTAAAAAAACTAGACAG:1	-	chr2L	21795716	3'	-	HB	86	1	57.53
AATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCG:1	+	chr2L	4412637	3'	+	Quasimodo	7290	2	73.29
GAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACTGGCTCAGGCTCATTGTCTTTTGTCGAAACCTTTCTTCGATTACCCACAGGTCGGACCTTCTTTGCTGTTCTTTTG:1	-	chr3R	9712033	3'	+	Stalker4	7330	2	57.53
GTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1	-	chr3L	25232768	3'	+	accord2	7573	2	62.20
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCA:1	+	chr3L	9998203	3'	-	roo	8721	2	57.53
GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCG:1	-	chr2L	2909670	3'	+	hopper	1342	1	71.32
TATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATATAAGCTGATGGACGGACGGCGACAAAGTGCGTT:1	+	chr2L	20633436	3'	+	Stalker	7019	6	80.14
CAGATTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGA:1	+	chr2L	17079808	3'	-	jockey	4765	1	80.28
TTCTGATTTTAAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTTGTTTATTGTTTTCACTCGCTTTTTTTTTATGTTTTCTTTGGGTCTTGTGTTTTTCTTATTTCAGGCATTTTTACTGTTATTACACA:1	-	chr2L	14674414	3'	-	Porto1	218	1	57.14
ATCAGGATCAATAGCCGAGTTGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATTTCCTTGGACTTGAAGTTGAGAAAAAAATCCAAAATTCTCCACAAA:1	+	chrX	17136363	3'	+	INE-1	93	1	66.90
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGATCATTTATTCGACTCGAAATAGTAACTACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAGTTGATG:1	-	chrX	23362247	3'	-	roo	8718	2	56.55
CTATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTAAGGTAGGGTAGGGCAATGCGCGAACACGATTCCACCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTCCGCCGTCGAGAAGAGTTGAGAACGCGAAAATGGCCGC:1	+	chr2R	24866154	3'	+	gypsy12	9888	2	69.92
CGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGC:1	-	chrX	13704762	3'	+	invader4	3025	2	63.01
ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATT:1	-	chrX	2518048	3'	+	P-element	2834	1	37.93
CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTGGGTATCCCTGGCTCCCACAAAGGGAATTCTTAAATGGGATTTGGGAAATCACA:1	-	chr2L	15875742	3'	-	hobo	67	1	65.75
ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGACGACGAACTTGAGGGTAAAATAACT:1	+	chr2L	2687451	3'	+	copia	5079	2	53.79
AATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGAATAATTTCAGGTTTGCTCCCATACAAGTAAAGACCTTTGTCTACCCGAACTTTTAAATGGAAAGCAATCAAGGTGTGAGTTCGCCAATGCAGAACACATC:1	-	chr2R	142816	3'	+	HMS-Beagle2	7185	2	55.07
CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTTCATATACATATATTCCGTACTTTTCTGTTTGCTCGCATTGTGGATTTTTTGTAGTTTTTG:1	+	chrX	18030356	3'	-	opus	7060	4	61.64
TATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTAATAGATTGGCATAATAGAGAATTATTGTTGTGAAGAAGT:1	+	chr3L	19014044	3'	-	invader3	29	2	63.01
CAGACACTGCAGACTTGCGTGGCCGCTACGAATATGAGATCGCAACAATGTGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAACTGATTGGCTGCTACTTTTGCGTTGTCTATATGGCGTTCTAATG:1	+	chr3L	6269478	3'	+	gypsy2	100	2	65.35
ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAAT:1	-	chr3L	12308327	3'	-	hopper	74	1	65.75
ACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACTGTTTCAATTATTTATAATCTTGTTCAGTATGTGTATACATACGAGTACAACTTGTGTTGAAAACGTTAGAAAGCCTT:1	+	chr3R	9124364	3'	+	Doc	4410	1	52.74
CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAGGAAAACTGTTTGCCTCCA:1	-	chr3L	6978094	3'	-	pogo	4	1	77.44
AATTAGATTTAATTATTTTGCTCTACAAATAAGACGTGAATTTTCTTCGCTTCCACTAATAACGGAAGTTGCCGCTAATTCTTCTTTGCGCTCATCTTCCCGCTTGCACCGAATTTAGAGTCGCTGTTCCTGCTGTTTTG:1	+	chr3L	24211045	3'	+	Bari1	338	1	59.29
AGAAAAATAAAAATAATATTTAAAATGGTCAATATAATGTATATGTCGTAGTGTTTATATTAGATCATTATGATCTTTAAACCTTTCATGGGGAATTTATATAGAGAAAGCTCTATTATCTTGACCGCCATTGTAGCCATTGCTAT:1	+	chrX	6664901	3'	+	invader6	4386	1	50.68
ATCCACTTCTCTTCCTCACTCCACCTTGCCTTTATATCAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGCAGTTAGCCTTAA:1	-	chr3L	21978037	3'	-	R2-element	482	1	61.32
GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCGATTTGACTTCACCGTCAGTCAGCCAAAAATGAAA:1	+	chr2L	4412671	3'	+	Quasimodo	7324	2	56.16
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCTACCTGAAAATCGAAAAATACAAAAAAAAAATGCCATCAAAGA:1	-	chrX	8814692	3'	-	pogo	20	1	61.54
GGCTTTTGGGATTATTCTGAGCATTTCCGATTGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGCGAACTCCACTATAGTATTCCCTCTTGTAATGTAACTAAAGTTGAACCAATGTAATAAAAATAAAAGAA:1	-	chr2R	1996393	3'	-	Porto1	4346	1	78.08
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGTTCTCGTTGT:1	-	chr3R	18582085	3'	+	roo	406	1	79.31
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTG:1	-	chr3L	16343213	3'	-	roo	8729	2	62.33
ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAACAAAGGCAAGAGAGTCGAACGACCCCGTCTTTCCCGCTCTCTCTCTCTCACCACCGCACA:1	-	chr2L	2909601	3'	+	hopper	1399	1	69.86
AGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATGTTTGGATGCTGCTATTGTATTTGCATACAATAAATCATACAACATAAATCCCATTGTGTATTTCTTGATTAGGAACATGACCACATGGACAACTCTAACATGGCCTTG:1	+	chrX	23452754	3'	-	gypsy3	1	4	60.14
TCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCC:1	+	chr2L	15833499	3'	+	jockey	4906	1	80.28
GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTA:1	-	chr3R	14981164	3'	+	mdg1	351	2	65.28
AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTTTGTAATAAACCAGAATTTGTGTAAT:1	+	chr2R	9544108	3'	+	opus	7441	2	67.18
AGCGAAGGCGCACTTCATAGCCTAAAAGGAAAATTGTATTAGCTTTAAGAATCAGAAACAAATAAAACATTCATTCAGAATTTCAAACTCAACTCCAACGGACGTTTCTCTTGGGATCAATACCACCAAATCTTCACCACTCAAAC:1	-	chr2R	5039335	3'	+	gypsy11	311	2	62.33
GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGC:1	-	chr2L	20840420	3'	+	Transpac	298	2	62.50
CACTCAACAATAATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATATCCCCGACCGCCCTCACTCCACCAAAAACGGAGCTTCCTGATTGCGTGTTGTCAGCACATTACCGCCAGCA:1	-	chr3R	17974446	3'	-	1360	447	1	51.37
AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCTTGGTTTTTTCTAGT:1	+	chr3R	29361091	3'	+	mdg1	7434	2	64.44
AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTATATTATCCTGGATTTTTTTAAATAATA:1	-	chrX	21014736	3'	-	copia	4885	2	53.42
TAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTTCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTA:1	+	chrX	22643320	3'	-	Tc1	1628	1	57.53
GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGCATCCAC:1	-	chr3L	21855435	3'	+	blood	337	2	52.00
ATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTT:1	-	chr3R	16076785	3'	-	roo	66	2	65.28
TAATAAATTTAAATATACTAATATACAAAAATACCACTTAAAACT:1	+	chr3R	19727944	3'	+	Stalker4	85	4	82.22
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTCGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAA:1	-	chr2L	3114483	3'	+	roo	353	2	58.65
CACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGTATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAAACTTA:1	-	chr3R	22388969	3'	-	G2	2662	1	59.59
TATTGATCCTGAGCAAGAATATGTATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTAGTATTCTCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGTATAACATGAGAGAAAGCTATAGTCCTGTTCCTCGACAAGTTTAACCGTTTTGTCAATGCCA:1	-	chr2R	5081142	3'	-	INE-1	84	1	64.38
GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCC:1	-	chr3L	17558035	3'	+	jockey	4912	1	79.29
GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGG:1	+	chr3L	23906466	3'	-	1360	31	1	58.49
CATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGATCGAATGTGTTTTTGTTGCTGTTGGAAAAGAGGACGAGGAAATCCTTTTCAATGCAATGTGAAAAGC:1	-	chr2R	14390277	3'	+	roo	117	2	51.56
AAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTAATTTCAATTTACAGTACGTGATCATGAGGCGCTCGCATTTTGTGTCGCTCACGTAGCCGCAGTCTTAACCACTAAAAATGCACTTATTAATAGGGAAGTAGATA:1	+	chr3R	12586124	3'	+	hobo	217	1	72.92
ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATGTGTGGCAACTCTGCGCAGCACTGCATTTGTATGCTGC:1	-	chrX	1899634	3'	+	P-element	2808	1	31.51
ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAGAAAAGCTGAA:2	+	chr2R	20944456	3'	-	pogo	46	1	53.42
AGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTATAAGAGTATTTACAGTTTCTTTTTCCTTTGTACAGTATACTGACATCTGGTTAGATTGGTTAATGTTTTGTCCATCCTGAATTTGAATGC:1	-	chr2L	18421590	3'	+	412	7079	2	54.11
GTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGGCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACGCCTGGTTTTT:1	+	chr3L	7188629	3'	-	hobo	60	1	60.27
AAAATAAAGAAATTCTTATGTTGAAATTAGATGTTAAGCTGAAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAATACTTTTGAAGCGCAATAAACATGTGAAAATACTATTGACAACTTGTAAGTTTGAAAAGCTATAAGCTGTATAACAG:1	+	chr2R	9504540	3'	+	Bari1	1413	1	78.77
ATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTAC:1	-	chr3R	4504025	3'	+	INE-1	536	1	64.38
ATTTTTTCGCCGTGGCTCTATAGATGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCTGAGAGCGCTACAGCGAATCACACATTTCAACGAAATGCCATCTCTCTGCGGCTTATTGCAG:1	+	chr2L	22246356	3'	+	1360	54	1	72.09
TTTCGGATCCCTCCGATCTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTAAATTTACCTTTATCTGATGTCGGCAAATATTGGAAAAGTTTTC:1	-	chr2L	19918550	3'	-	R1A1-element	5326	1	69.18
AAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTCGCAGTCGAGCACGAACCGCATTCCTTGT:1	-	chr3R	10425209	3'	-	opus	7409	2	73.64
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGGATTTGTTTAATATCAA:1	-	chr3R	19968074	3'	+	roo	407	1	78.18
TTGTTGTTTTTTTTTTTATTCTTTGTTTTTGCTCTAAGCAATTACACAAGGCGTGCGCGCCGTGGAATGGGGAAAAAGTTGTATAAATTTATTTATATTTTCAACAAATATAGGATGATACATAAGCGGTCGTCGTTGTTCAATTT:1	-	chrX	7698587	3'	-	gypsy7	5012	1	61.64
TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACCTCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGG:1	+	chr3R	1433202	3'	+	mdg1	7391	2	67.67
GTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCCG:1	-	chr3L	2362316	3'	-	Stalker2	46	2	50.00
ACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGCTATAGCATTCTCCCTTGTTTTTTTCTTTGCCACTGTGCGTG:1	+	chrX	17622342	3'	+	INE-1	542	1	93.33
AACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCCTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCGAAAAACAATGTGCATTTTGAATTATCTCAGTTCGAACAACAACCAGTTCGCGAAT:1	-	chr3L	24881068	3'	-	aurora-element	4220	1	69.86
TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATCACTTTTG:1	-	chr2L	544765	3'	-	412	55	2	52.74
AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGCAGCATACATT:1	+	chr2L	15181452	3'	-	jockey	4785	1	53.33
GGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGAGATAATTAGAAGTCATGCCTAAACTGACGTAATTGT:1	-	chr2L	19996250	3'	+	Quasimodo	221	2	63.46
CATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCC:1	-	chrX	2842470	3'	+	Tabor	442	2	55.86
ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTTCGGGGCGCTCGCGGCGGAAATGAATTATCGCCCGCTAAATGGGCGCGCA:1	+	chrX	11471691	3'	+	hopper	1402	1	71.67
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTTGTGTG:1	-	chr2R	13696378	3'	+	roo	397	1	67.89
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TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTAAGGCTGTGCTAGCTAACAAAGGCTATCCAACCAAGTATTATGCCGTAATTAACATATTAAAAAGAAAAAGAATTTCTGCCTATTATGTT:1	+	chr2L	12075104	3'	-	1360	30	1	64.14
AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTT:1	+	chr2L	11518461	3'	-	412	51	2	68.18
TTAGGAGCGGCAGATAGTCAAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTTAGAACATAGTACTCTGTTAGTATATGCAGGAACGTGTTTATGTCTTAATTTGATCAGCATTGAAAAGATTAGCCCGCTTGCAGATATATTTCGATTG:1	-	chrX	16742286	3'	-	Cr1a	4238	1	53.79
AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATT:1	-	chrX	11471588	3'	-	hopper	8	2	60.27
GATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCTAGCGGAAAGAGAGAAATTTTGGACGTCACTAAAAAAGTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATGTCTGGCTTTGGTTAGATGACCTAGCTGTTAAAGCTTTTAACGAACTTAAAA:1	+	chrY	382986	3'	+	1360	3286	1	65.94
CGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCTTATGAAATGCCTAAACTCAACTTCTTGATAAATAA:1	+	chr2R	4601697	3'	-	HMS-Beagle2	9	2	80.82
ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACNGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATT:1	+	chr3R	17243235	3'	+	hopper	1376	1	56.55
CAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAGTAGTTATTGCTATACACGTTACTCG:1	+	chr2L	9399513	3'	+	Transpac	5168	2	77.39
ACGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAAC:1	-	chr3R	27424849	3'	+	blood	7360	2	50.00
CAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGGCTATGGCGAGTACTCACAGCATG:1	+	chr3L	16343253	3'	+	roo	221	2	76.67
AAATAGATTAGAAATAGCGAAATCTATGTACATATCATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGCACTCAGCTTGCGGCGTGTGAAATATGGAGGATGATGTTAGCAAAGCCTCGACGCATTC:1	+	chr3R	4934441	3'	+	1360	330	1	73.29
ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTATTGTGAAGTGCTGGTTGCTCCGAAGAGGCTTCCAGATTGTTAAATCTGCTAGTATTAGTCTGACGTGAACTAAAGAATATTCCACCTCTATATTGGCGTGAGTGGCAAT:1	+	chr3L	27386608	3'	+	1360	3356	1	75.34
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAACACAATGTCTGCGAG:1	+	chrX	5274394	3'	+	roo	357	2	56.43
CATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAACAAAAAAAAGGGAAAACGAACACACAATTAAACACTGAAAATAAAAATCAAACAAATAGATATATGTATGTATACCA:1	+	chr2R	3166645	3'	-	F-element	4266	1	61.54
ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTT:1	+	chr3L	17560381	3'	-	pogo	35	1	52.50
AAAAATAAAATTAGATTCATTAAACTACTAAATATTATTTGGAAACAATGTCGCGGCAAGATAAAATATTACGAAATAAGAATAAAATATAAAATCAACGTTGAGGAGAGTAAAGCTTGTAGTACGATAGTCAG:1	-	chr3L	1789233	3'	+	NOF	3959	1	73.13
AGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTCACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGGCTTCAAATCTATTTTATTTTGGATCAATTGGCATGTTGCTCAGATCTCCGATATCAGCCTGCTTGT:1	-	chr3R	26634290	3'	+	1360	168	1	77.40
CGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATAGAGAATATCTGACAATGACTTTAGATGCCACTGTACACTGGCAATGAATATAAATAACAG:1	-	chr3L	2187742	3'	+	I-element	19	1	58.90
ATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTAGCACAAAGCAGACCTGGATGCACAAATAAAGGAGATGAAGCGTATCCAGGAAGAGGAAGAGAAACGATTTGATAGTCGCCTTAT:1	-	chr3R	4505014	3'	+	INE-1	560	1	77.98
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGAACAGCAGGATGGGGGG:1	+	chr2R	13710712	3'	+	roo	9044	1	66.44
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTT:1	+	chr3L	20831390	3'	-	roo	8713	2	53.42
TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAG:1	-	chr3R	21276557	3'	-	BS	5081	1	73.97
AAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTGGGAACACGAACCAAATAAAGACAAATTGCGGCATTGAAAGGTTTATAAAGTTTGAACCAGTCCGAGTTTCAACTC:1	+	chrX	21426168	3'	+	hobo	2518	1	71.30
TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATATCTGGGCGGGAGATACTTGGACACGC:1	-	chr3R	17316260	3'	+	opus	7451	2	74.77
TGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGC:1	-	chr2L	13585830	3'	-	Tabor	25	2	58.72
GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGTTAAGAAAATATTTAACAAGTGTTTGAATGATGTTGAAAA:1	-	chr3L	3863413	3'	+	blood	333	2	53.42
ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGCGCGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGC:1	-	chr2R	12835066	3'	-	jockey	61	1	72.55
GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAAATCACTCCTCGGCCCCCGAAAGTATGCCAAAAAGGG:1	-	chr3L	4948060	3'	+	hobo	2904	1	60.00
AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGC:1	-	chr3R	25423188	3'	-	3S18	41	2	51.47
GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTTT:1	-	chr2R	16945300	3'	-	jockey	34	1	54.74
AACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACATTTTTTAACATATGTAACCAGTCCTAAAAAACTACGGGTTTCCTCTTTGTTTTTGGAATGTCTAAATAAA:1	+	chr2L	22738907	3'	+	diver2	23	2	77.32
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAA:1	-	chr2L	7945331	3'	+	roo	8996	2	71.72
AACTTTATTATTATTATTATTTGTGCTCCCTTTGACGAACGCCTACTCTCTTAGAAGCACTTTTCCCACTGACCTACAACGGCTGTTCTGGTAACAGGCCAAAGACCGATTCTCGATTCCCAATTCCCGATTCCACGTCGCGTCTG:1	+	chr2L	15807652	3'	-	invader6	4390	1	79.45
GTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAATCAAAAGCGAAAAAAAGAAACGAGAATTCTTCAAA:1	+	chr3R	14041614	3'	-	1360	131	1	76.71
AACCAAAAATGCTCAGAATAATCGCAAAAGCCGAATGGTACATTAGAAATTAATATATACATAATGATTTAAACATAACAGCTTCAGTCGCCAATAAAATCTTTAAAGAAGTAAATGTTGTCTCCTGGCCGAAATGGTAGTGAAAG:1	-	chr2L	5449465	3'	+	Porto1	4336	1	52.74
AGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCT:1	+	chr3R	11547756	3'	-	G2	360	1	74.66
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCC:1	+	chr3R	19968167	3'	-	roo	8736	2	81.75
TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCT:1	+	chr3L	16973490	3'	+	S-element	1681	2	59.59
TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATAATTTCCAGC:1	-	chr2R	12835024	3'	-	jockey	37	1	57.02
AAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATAGCCTGTGGCAGATTCACATCTACATTCTGTATATCGCTGGAGAATCGATTGAGCACTCTCCCAGATGAATTAGCATTGAAGAAGTACATCCAG:1	+	chr2R	21287382	3'	+	jockey	4832	1	65.07
GCCGTGCGCAAAAAGGGATAAAGGGACGGCGCAAGGGCACCTCGGGCGGTCACTGACAACAAGGGAGAAGCCATGCGTAAACACGGAGTCAGTTTTACAGGGATACTACGATCGTTTATAGATTATATGTACATA:1	+	chr3L	24167908	3'	+	gypsy8	305	1	59.26
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTATACGATGTTGAGCGCCTGAAGCTATGCATTAAGGACACCGGAGGCCTGCCGCAACTCTTGC:1	+	chr2L	6059336	3'	+	roo	9032	1	53.42
ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTGAATGATTACATATGAGCACCTTTCACATTCTT:1	+	chr2L	19310442	3'	+	Juan	4201	1	73.97
CAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATAT:1	-	chr3R	4504028	3'	+	INE-1	541	1	65.94
TCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCATTCGAGGCTCGATAATAATCATCAACAATTCATTTTCAGTTTCATT:1	+	chr2L	1779368	3'	-	HMS-Beagle2	7033	2	61.02
AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGGGCTCGTAGTGAAGGCC:1	+	chr2L	7898403	3'	+	roo	405	1	73.53
TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGG:2	+	chr3L	12861806	3'	-	pogo	66	1	65.75
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCGC:1	+	chr2R	25118805	3'	+	roo	397	1	75.00
GGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTATCAAGGAAGTGATAAAAGTTAATGAATATTTGTGCCATTAAACTTGATTTCTCTATCGGTTCGCTGCTG:1	-	chr2L	3164899	3'	+	412	481	2	75.54
AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCT:1	+	chr2R	7586188	3'	+	I-element	5285	1	71.85
ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTTATCAGTTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGAGATGTTTCTATAACTTTTTTTCCCTGTGTACAA:1	-	chr3L	10841408	3'	-	mdg1	7050	2	65.75
AAGCCATCTCTCTCTCTCTCTTTGGCCGTTTATACAGATTCTTGTCCCCAGTCGCTTAGAAACGCTGACAGGCGGCAAGAATCTGTATA:1	-	chrX	22732967	3'	+	blood	166	2	51.69
GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCA:1	-	chr2R	5485098	3'	+	blood	7341	2	53.10
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTAC:1	-	chr2R	21907903	3'	+	roo	9041	1	60.77
ACTCGACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATTCACATTATATAAACTAAATGCGCTCGCGTCT:1	+	chr2L	12892760	3'	+	roo	393	1	76.03
CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACA:1	-	chr3L	7943623	3'	-	Burdock	6199	2	71.43
CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACCAAATTTACCCATACACGATTAAATT:1	-	chr2R	9220981	3'	-	opus	7032	4	65.75
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATCAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATT:1	+	chr3R	27994279	3'	+	roo	9032	1	53.66
CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGCATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACCCTTATTCCATCAGGAACAGTGATGTCAACGAAA:1	+	chrX	4215084	3'	-	flea	16	2	60.69
ATGAACGTCGATATCTCAGGAACTATAGAGGCAAGAAGGTTGAGATTAAGCTTTATGATTCTAGAGACATACATAGATGCAACTTTGTTGACCAATGCTGCTTTTACCTGTCGCCACTCTAAAGCAAAATAAATAAATA:1	-	chr2R	25097529	3'	+	INE-1	139	1	72.66
GAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCT:1	-	chr3L	24213771	3'	+	invader2	5037	2	64.38
ATTTCTTACGTTCTAAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTAGGCCGTTACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCATCATCCTTTGCGATCATTCCCTTCGGCTTCAGAAACA:1	-	chr2R	13074964	3'	+	1360	3287	1	66.09
GTATATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCATATATTTATTTCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCCAAGTGATATCCCAAGAAAACAAGGCACAACCGTTTGAAAAGAGAAAGTTTGTCATAATTTCCTAT:1	+	chr2L	17152092	3'	-	Stalker4	248	4	78.08
AAGGAAAAAGAAAAACAAAATGCCCGCTGGTCATTTTGTAACTCTTTTGTAGACTGACTTTTCCGCCCATTTCCCGCCCAGTTTGTTTATTTAATAAACCAAAATACATTGTTGAAGGCTGTTCAAAATAATCCCCAGAGTAAATA:1	-	chr3R	20251684	3'	+	Doc2-element	241	1	60.27
AGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTAACAATTGCGGAAAATATAAAATGTATTTCAAACCTTCGCGGAAATTGTAAACCGAACTAG:1	-	chr3L	24996052	3'	+	1360	465	1	77.40
GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTTTTTATTTGAAGGACCATATAAATGTCCGAGTTAGTCA:1	-	chr3R	12618563	3'	-	F-element	32	1	63.70
ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGGA:1	+	chr2L	15181443	3'	-	jockey	4788	1	49.49
CGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCATTAGATAGGGACAGGAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1	-	chr3L	23112568	3'	-	R1A1-element	32	1	66.40
TCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCNTACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCG:1	-	chr3L	19035996	3'	+	Tirant	323	2	69.66
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAG:1	+	chr3R	27994291	3'	+	roo	392	2	66.07
GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACAAA:1	+	chr2R	8146121	3'	-	P-element	50	1	39.17
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCT:1	-	chr3R	22844213	3'	-	roo	72	2	77.95
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATG:1	+	chr3L	11531017	3'	+	roo	9049	2	69.18
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGACACTTA:1	-	chrX	13504146	3'	-	412	7090	2	52.00
AATAAAATAAAAAATAAAATAAAAATAAAATAAAATGCAAAAATTTAATAAAATTCAGGTCCTCCTTTTGCGATGCGTAAAGTGCAGTCAAATGGTTTAATTGGCTCGTTGATTTATTGAAATGCTCATTTTAGTATGTGATGTCA:1	-	chr2L	13334752	3'	+	HeT-A	311	2	70.55
AATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATA:1	-	chr3R	17478360	3'	+	copia	201	2	56.85
AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCATCGGTAATTGGTCCTTAGTACACTACATAGAAAGCATTTAAATGT:1	+	chr2L	6569433	3'	+	jockey	4940	1	55.48
TTTTAATTTTATTATTTATTTATGTAAAAAGTTGGATTACAATTTGTTTTTCACAATTTTTGAGAAGACAATTTTTCTTATATACATGTATGTATCGTCGCTGTTGTCTAGCACAGTTTAGAACACGACGGATGTAAAAAAACGAC:1	-	chr2L	21653181	3'	-	BS	5093	1	56.16
TTTTTTTTTAATAATATTTTTCGATGGCAGTTGATCCGCTTTATTAGTATTCCCACAAACAGAACACCAACCACCTCTATTCA:1	+	chr3R	26043482	3'	+	hopper	162	1	75.90
ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATACGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATAATAACATTATATATAATACTTCAAAAAAAAA:1	-	chr3R	25567732	3'	+	opus	7436	2	78.40
GACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGTAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAG:1	+	chrX	124083	3'	+	Cr1a	4241	1	76.15
GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAAT:1	+	chr2L	13585926	3'	+	Tabor	420	2	59.59
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGCATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAG:1	-	chr2L	14772048	3'	+	roo	9020	2	63.33
TGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGA:1	+	chr3R	22822158	3'	-	mdg1	4	2	57.60
TTTCAAATCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAA:1	+	chr3L	20095766	3'	-	G4	3672	1	69.77
AAAAAAATATTTTTTAAATTTTATTCTAAATTAAGATGAAAAGCTGCGAGTTTTTAAATAGTTTAAACTGTTAAAAACTGTTTAAAATGCTACTATACATTTCATTATTTATATG:1	+	chr2R	18695073	3'	-	Transib5	2726	2	40.87
AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGA:1	-	chrX	10521646	3'	-	Tabor	6917	2	68.49
TTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATCTGAATGTCTATATGCGA:2	-	chr3L	9997997	3'	+	roo	410	1	45.21
AAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCAGCAACACGTGTATGTCACGG:1	-	chr2L	12290629	3'	-	1731	26	2	66.44
ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATTTTAAGGCGATGAAGTCGACTTTTCGCCCGGGAAAGTGCG:1	+	chrX	6499086	3'	-	Quasimodo	11	2	68.46
AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTAAAATAGATCAAAGCCGAAAAATAATCAACGACCTTTTTTGAGAG:1	-	chr3L	17115456	3'	+	blood	7336	1	60.98
AAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAA:1	+	chrX	12657098	3'	-	gypsy	7012	2	69.86
AATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAGGAAATTGTTGAAGTAATTCCATTACTTTATTCTCGATGTTTAGTTTATTTGGAATTTCTTTTACAACTAGAATTGTTGAATTTTGGACATTTTCGAATTTTGGCCAATAATGTCCTC:1	-	chr3R	1705985	3'	+	invader2	5097	2	80.82
CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGATGTTTAACACCCAGGTGGCCC:1	-	chrX	5629078	3'	+	jockey	4966	1	65.28
TACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGCGAGTAGTTGCTGGGAGGGGGGTTTCTCGAGGAGGAGGGGAAGAGCAACTTGGGGGGTTCGTCCAAGTTTCCCCCTGCTCC:1	+	chr2R	8585383	3'	-	roo	8786	2	74.07
AAAAGAAAAACTAAGTTAGTTCTAGGTCAAGTTGAATTTTGCTACTGACCAGACTTTGACATTTGCCTCACTGGAGTGCGAGCAGGACAACTAGTGTGCCGGTTGGGATCGCTGTTTCGGCACCTTACAACACTG:1	-	chr2R	6992857	3'	+	HB	1369	1	73.33
CATAAATTTTTTAATTATTTTGTTAATATTTGAAAATTTTTAGTATTTAGTATGACCCCCATAAGTTCCTCATCAACAACGTCTAGTTTCCCGGTTTCTATGGCGGTAAGCCACCGATCCTCTTCACTGGACGTATCACTGTTGCG:1	-	chr2R	5351083	3'	-	S-element	1459	1	58.22
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAATTGTTTAATCAATTA:1	-	chr3R	16076752	3'	-	roo	28	2	66.91
AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACAC:1	-	chr3L	19036013	3'	+	Tirant	354	2	73.20
TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTTGCCGCCATTTCACACATATAATACGCAGAGTTTGC:1	-	chrX	6498895	3'	+	Quasimodo	7355	2	73.97
AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGTGAGACGGTTGTACATCGGTCGGTGGAGGGAGGCGGGGAGTTTTGGCCGC:1	-	chr3R	13822486	3'	-	hopper	7	2	63.86
TATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCAACAAGCTGGAAACTATCAAGCTACGTTACAAGTGCAC:1	+	chr2L	17470433	3'	-	roo	180	2	72.41
GCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGACAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATATGTGCTTGCTTCCACATGTGCACTCGCTCGCAGCCTCAATGGC:1	-	chr3R	26679344	3'	+	1360	307	1	68.61
TCATATATTTTATTATATTTATCTGTACCCTTTTAATGTTTTTGGATTTTCCATCACAACTGAAGTCCAATCAATGGACACGCCCAATCAGCTTCTCGGGTAGAGATCGAATTTTGAGTCCAACAATTTCATTTTAAT:1	+	chr3L	18320752	3'	-	G7	1151	1	61.59
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCAG:1	+	chr2L	3886276	3'	+	roo	9046	1	66.20
AAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAG:1	+	chr3R	1844829	3'	-	Cr1a	170	1	68.80
ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATTCTATTGAAATTTTTCTATCTTACTCCCACCAGACGTGCAACATATTTTAATTGCTTGAAGATTGACTTTCGCTCGCATC:1	+	chr3L	21378	3'	-	Quasimodo	37	2	57.14
CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCG:1	-	chr3R	21434876	3'	-	412	63	2	61.38
AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGAC:1	+	chrX	21014863	3'	+	copia	200	2	56.85
TAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTACATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGA:1	-	chr3R	10273968	3'	+	HMS-Beagle	6953	2	80.14
AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCACTGTGCACATGTTTACACTGTCTGCACGCCGACTTTC:1	-	chr2L	12328621	3'	+	hopper	1366	1	48.97
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTT:1	-	chr2L	16091866	3'	+	roo	9040	1	59.31
ATATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGGACACTTTTGTGTCCGCTTCTTAACAGTTTGGTTATCGTATTTTTTGAATCTACC:1	+	chr2R	6433217	3'	+	Circe	7228	2	85.00
ATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGAACTTTTTATAATTTTTTCATGTTTCATGATAGTTTACGCGCTGACTGAAACAACATTGCT:1	-	chr2L	17746300	3'	+	R1A1-element	29	1	58.22
TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTC:1	-	chr2L	21884486	3'	-	pogo	23	1	67.69
ACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCAATCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTATCGTTG:1	+	chr2R	4659362	3'	-	S-element	1493	1	48.63
CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTCTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCGGGCTTATATGAATTTGTGGTGCACTGAAAGAATACTTCCTAAATA:1	-	chr2L	16016331	3'	+	412	7470	2	65.75
CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACC:1	+	chr2R	2427612	3'	-	Doc	70	1	66.44
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAG:1	+	chr2L	16091990	3'	-	roo	66	2	66.44
CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACTTACCAACAACCAAAAACGCCCAGCCCACACA:1	+	chr2L	1377700	3'	-	hobo	39	1	66.00
ATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCTTCAGCATTT:1	+	chr3L	25824656	3'	-	Juan	4199	1	52.99
AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAA:1	+	chr3R	20005103	3'	-	297	22	2	53.76
GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAA:1	-	chr2L	14892211	3'	+	transib2	2759	1	63.01
CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCTCTGGGTGGGTGGTCCTTTAAATATTCAGCGGTTAATGCTCAAAGAAAAGTTGAATTAATTATTCGTTTCGGGCATTTAGTCGATGGAATGCCAATGC:1	+	chr2L	11674468	3'	-	jockey	35	1	68.49
AATTTGTCAAAATGCTTATGCCAACTAGTGTATATGACAGATAATTGTCGTGACCAATTGTGACAAGCAGGTGGTTGAAGACGAAGTGGATCACGGTTTCTTTCGAGCTTATTTGGTCTCGCACAACAAC:1	+	chr2R	4916298	3'	+	Tc1-2	1431	1	73.85
AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGAGGATCACTACAGCGAGGAGAGATCC:1	+	chr2L	23197590	3'	-	Transpac	6	2	56.67
CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTCCTGCTTCGGCTGGCATT:1	+	chr2R	21101834	3'	-	P-element	7	2	65.26
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCCCTCTCATTCTTCCGGCATAGCC:1	-	chrX	16717872	3'	+	roo	397	1	64.52
GGGCAATAGAAACTAATTGGTGATTCGCACCTTCACTTACAGGTATTACCGGATTCGT:1	-	chr3R	11242998	3'	-	FB	86	1	89.66
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAATTATACTATAACATAGTCCATT:1	-	chr3L	20831232	3'	+	roo	393	1	75.34
TCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTAGTTTGATGGTCTTTAGGCATTCT:1	-	chr2R	961095	3'	-	transib2	2500	1	52.74
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATACTGAGACTGTAGTAATCTTCAC:1	+	chr2R	6173107	3'	+	pogo	2060	1	57.24
TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATCGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGG:1	+	chr2R	2016894	3'	+	1360	3328	1	67.21
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATTGCAGACATCGGTGCTCGTCACAGATAGTCAATCGAATCGA:1	-	chr3L	12879697	3'	-	roo	8682	2	72.99
AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAAAGATATAAAACACGAAAT:1	-	chr2R	20496856	3'	-	blood	7020	2	76.71
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACATTTATCTGCAATATCTACCAGAACCCTGGTAGCCAAATATGGTGCAGATGCAGTTCCG:1	-	chr3R	19445511	3'	+	roo	9016	2	57.78
GAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTCCAAAACCAATGTATGGCCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGTGGGTTTGTTGATATAAAGCCATAATAATGATATAAAA:1	-	chr3L	21605416	3'	+	1360	3311	1	70.54
GTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTATTTTATTATTATTATTATTTATTTTTCCTTAAAAGTTAAAAAATTCTATAACT:1	+	chr3L	26375392	3'	-	Doc	258	1	63.70
AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAG:1	-	chr2R	5485080	3'	+	blood	346	2	60.96
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGG:1	-	chr3L	16343227	3'	-	roo	66	2	69.17
GAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAG:1	-	chr3L	19013928	3'	+	invader3	5413	2	65.25
CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGACAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAA:1	-	chr2L	17081795	3'	+	jockey	4966	1	55.10
GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAACCTTTGCTTGG:1	-	chr3R	14651169	3'	-	P-element	25	1	67.14
TATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGA:1	+	chrY	418186	3'	+	Stalker4	392	1	55.06
AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGCTCTCG:1	+	chr2L	18419255	3'	-	412	7101	2	50.00
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAACTGGGTAACATTCTTTATGCAAATCGAATTGAAACAGC:1	+	chr2R	14388041	3'	-	roo	14	2	69.17
AGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATTGAGGAGTGACACGAACAACATATTAAATG:1	-	chr2R	16887662	3'	-	hopper	457	1	60.34
GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGAAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTT:1	+	chr3L	9673118	3'	-	Doc	20	1	44.05
TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGCCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTAT:1	-	chr3L	12879738	3'	-	roo	68	2	65.75
AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTAACAATTTTAGCT:1	-	chrX	21016742	3'	-	Transpac	49	2	56.03
ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAACGATATTTTTTTCACCTGCACAACTG:1	-	chr3R	26659706	3'	-	HMS-Beagle2	6898	2	69.86
TGTTAATCACTATTATTATATTGTAAGTATAACGCTTATTGAACGAATTAAAAATATTATTATTATTATTATATTATAACCTATGCAAAGAGTATTGATAATATAGGGGGGGATCCCAGCCGTTCAAAGCGTTTTGCGTGGGTGCC:1	-	chr2L	2794259	3'	+	Burdock	454	1	70.55
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAAT:1	-	chr3L	11441731	3'	-	roo	62	2	65.97
ACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGAACA:1	-	chrX	6952088	3'	+	G5A	2795	1	60.47
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGTTATATTATATNTATCTATGATTTTTATTTTAGCTAGTAAGCATACTGATAGTTTATAGATATTTTAGTAATTAAACTTTTTAATAAATAACGCTTTTTTGGGAAGTGA:1	-	chr2L	5254223	3'	+	roo	406	1	27.54
CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCT:1	-	chr2R	9791586	3'	-	412	69	2	67.12
TTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGCAATTAAATTAAAT:1	+	chrX	9151941	3'	-	1360	484	1	53.91
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTTCCTACTTTA:1	-	chr3R	7835080	3'	+	roo	9045	1	62.33
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCC:1	+	chr3R	27994283	3'	+	roo	9036	1	53.66
AATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGT:1	+	chr3L	16343309	3'	+	roo	369	1	52.42
GCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGTGTGTGAGTAGAGGAAAATAAAGTTGCAGTACCTGAAAGAAAAACAGAAAGAGAGAATGTGAAATTAGTTGCCTACTTCTGAGAGCACTTAAGCTTAAAATTAAGAAAGAGAGCA:1	-	chr2L	2944947	3'	-	Tirant	403	1	75.52
CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGG:1	+	chr2R	16785434	3'	-	412	7105	2	53.79
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCCAAAGCAACGAAATCGGCGGAATAAAACTAAAAATATCTATTCGAAA:1	-	chr3R	22122668	3'	+	roo	9031	1	57.53
ATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCTTTCAACATCAACAATCAACATCAATACACTAAACTTACAAGAGTTTCGGTTTAAAAGCGCTTCAACAATGTGGCAAATGAAATGCACA:1	-	chr3R	29444948	3'	+	gypsy7	272	1	60.71
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGG:1	-	chr3R	18582127	3'	+	roo	9029	1	54.79
GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGTGTCGTTTTTGGATGGATTTGTTAATGGGAGTTACATAATGCTGGCAATGCATATAAGAACATGATATACGTGCGG:1	+	chr2L	8986273	3'	+	412	7535	2	75.34
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGAACATTCTCAATACAAAG:1	-	chr3L	20654446	3'	-	roo	24	2	66.67
TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATGTAAATGAAGTTGAATACAAACATACATATATTCATCGCTGAAAAATATGTAAATTTTATAGGGGCT:1	-	chr2L	10685301	3'	+	I-element	5304	1	57.53
CTGCTATTTTTATGAACACAGTTGTATAATCGCCACACATGAACTAATAACTATTAAATAAGAAACTGGGCAAATAAACAAATGATGCACAAGCGCAAATTTGAGGGGAAGAAGCTGAAAAACTATGCCAAAACCAACGAATAAG:1	-	chr3L	17247034	3'	-	HB	8	1	56.55
AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTCGATAGGCAGGTACAGGCCCATTTCTCGATGTGTTTTAAAAATTTTCCACTGACA:1	+	chr2R	19499417	3'	-	P-element	39	1	52.17
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATT:2	+	chr3L	9998207	3'	-	roo	48	2	53.19
AGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGAAGTTGCCACAGAGTTGGTTGGTCGGAACAGGGGGGGAATCTGCCGGAGGCACCACACCGACTGTCAGTCG:1	+	chr2L	19201805	3'	-	F-element	4440	1	53.42
GCCATCATCCACTTCTCTTCCTCACTCCACCTTGCCTAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTAC:1	-	chrX	23202003	3'	-	R2-element	488	1	54.44
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCCTTTGTTGCCTTCGCTTC:1	-	chr2R	9632107	3'	-	roo	73	2	68.49
CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTT:1	+	chr3R	13349102	3'	-	BS	5067	1	74.42
ACGGTGAACGCAGCGGAGAGGAACTTTTCTGCAACGTAAAAGCAATAGGGCCAGTTGAACATCGTTGATGTTAAGGAGTATTATACTATTATGGGATACTTATTAAGTATCCCATAGCTAAGTTAGTATGTCAAAAAATAAATATA:1	+	chr3L	23323039	3'	+	Osvaldo	22	1	58.22
AATTAAATAAATTAAATAAATTAATTATTATAATTTTCTGACCATCGAAAATGATAAGCTATTGCTTTCGAGAAAATGCATTTAACTGGTTATCCTTACATTGAATCCTTATAGGTCATATTCCAGCCGAGATATTCAAAGCTTGA:1	+	chr2L	8525449	3'	+	HB	321	1	72.60
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGGATTAATTAAATTCTTAGCGTCTGGG:1	-	chrX	13039459	3'	+	roo	406	1	75.56
TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGTT:1	+	chr3R	10182197	3'	-	blood	77	2	70.14
AGCTGAGTAACGGCTATCTGATAGTCTCTTGTCCGAAAAATATAAAATAGATTTCCAAACAGATTCGTATTTTCTTAAAAATAAATGTAGATATTAGAATGTTTTTTTTCTCTTCTTAAAGTAAACATT:1	-	chr2L	12156871	3'	+	INE-1	545	1	79.84
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCA:1	-	chr3L	24039753	3'	-	roo	67	2	65.75
ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCC:1	+	chr3L	20168421	3'	-	mdg3	5325	2	75.40
AAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTTAATCT:1	-	chr3R	18339043	3'	+	roo	390	2	71.23
ATCAGGATCTATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAAAAAGCTACAGATTCTAGAGACAAAGACCCAGCGCAAGTTTTTTGACCCATGTTTCCACGTCCACTCTAAC:1	+	chr4	71479	3'	+	INE-1	93	1	45.21
GCTCGCTGTATGATTTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAAAGCTTTCTGCATCGCCAAAATCCCATAAAAATCAACAACTTCGAGAGGAGGGCCAT:1	-	chr2L	19367975	3'	-	Doc2-element	4406	1	59.59
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTGGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTATCAAGGAAGTGATAAAAGTTAATGAATATTTATGCCATTAA:1	-	chr2L	3164927	3'	+	412	7499	2	51.37
TTTTCTTTTTATTCTTATATACACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTGCAAAAAGGGAAAATACCTTTTTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAA:1	-	chr2L	21795751	3'	-	Rt1a	5069	1	54.79
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAATT:1	+	chrX	8543554	3'	+	roo	9053	2	64.41
GATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTG:1	-	chr3L	19013886	3'	+	invader3	244	2	63.64
AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGT:1	-	chr2R	15005065	3'	-	jockey	76	1	60.27
AGAAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTAATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAG:1	-	chr2L	9399531	3'	-	Transpac	4825	1	60.96
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGTGATAAAAATGAGCTGATGTTGGCGGA:1	+	chr3R	18339216	3'	-	roo	8678	2	72.09
ATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTAACCTAGA:1	-	chr3R	9714340	3'	-	Stalker4	20	4	71.72
CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCCTATGAATCAAATAATTAAAA:1	+	chr2R	5485206	3'	-	blood	7075	2	61.81
AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGACTCACTTCTTT:1	-	chr3R	20499708	3'	-	mdg3	5264	1	75.91
ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTT:1	-	chrX	10521648	3'	-	Tabor	6883	2	60.00
GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAA:1	-	chr3R	21706014	3'	-	297	6621	2	75.56
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAATACATACTAGAATATATGTGGGTTTTATCATCAATA:1	-	chr2L	13763122	3'	-	pogo	29	1	64.29
AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAG:1	-	chr3L	7292487	3'	-	HMS-Beagle2	84	2	79.72
TTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAGTCCACAACTGACCAGCGACAACAACTGGCCATCCACTTGGCCCCAGATTGCG:1	-	chr2L	16402639	3'	-	pogo	1986	1	63.70
CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAAGAAAGATCCGCATTGCCG:1	+	chr2R	5031022	3'	-	Doc	70	1	68.75
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCT:1	+	chrX	9540118	3'	+	roo	9019	2	55.24
CTGGCAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGATCTTCAGGTATTGACCACATTTTATATATATAATTTGGATATTTGACAATCAACGAGTTATGAACAAACG:1	-	chr2L	22326911	3'	-	Gypsy6A_LTR	236	1	50.00
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTGGCAAAAAGTTTTAAATTTCTTAAAAT:1	-	chr2L	7945280	3'	+	roo	399	1	76.92
GTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAATGCTTTGGGGCTTGCTAGGTCAGACTG:1	+	chr2L	13585952	3'	+	Tabor	7307	2	68.55
TTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGAGACGCGTGTATATAGAGGATTGGATGCTGGATCCGAGTGGTG:1	+	chr3L	6388965	3'	-	17.6	6946	1	58.06
ACGCACCGTGAATTAACGGTACAACTGTTGAACCTTGTACCCGAGCTGGCCGTGCGAAAAGTGGAAATAACGGGATCCCCGCCTATAAAGCTCAAGGCAGTCAGTCTCAACACGCGAGGAGCCGTTCGGACGCGAG:1	+	chr2R	5208837	3'	+	gypsy8	4908	2	72.79
GACAGCATAAGCGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGGTTCATCGCGGTTGTGTTCATTCAGGCGTTTCTGAAATTTGATATTAAGCTCCGTTTTTCATTTTTCTGTTCTTATT:1	-	chrX	14878728	3'	+	rooA	7317	2	56.85
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACATATACCCAAAAAAGATACTTTCCTGGCTAAAA:1	-	chr3R	22955975	3'	+	roo	360	2	67.29
ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTCACAATCAAAC:1	-	chr3R	17605620	3'	+	Tabor	7277	2	50.69
GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAAATTTTCGTAATCTATGAAAAGTGAACTTATTTTATTT:1	-	chr2R	9258358	3'	-	3S18	12	2	74.66
GAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCACGCAAAACAATTAAAACAACATACACACACACAAATATTTCAAATGCAAAAAAAAAAA:1	+	chrX	18697341	3'	-	ZAM	18	2	56.57
TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCATTTTCATGTG:1	+	chr2L	16092004	3'	-	roo	51	2	56.55
TAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGTATCTGCGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGCACTTGCATTAATCATCATTGATTGATCACTGAACCCGGCTAAATA:1	-	chr2L	21884052	3'	+	pogo	196	1	68.28
TTTTTTATTTACTTTATTTATACAAGTCACTGCCAGAGAGTTTGGGCCACCAATCAGGGCGGATAACATGTGAAGTGGCTGGGTCTTCTTCTTCTCCC:1	-	chr3L	17278793	3'	-	X-element	4716	1	77.55
ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGTCGAG:1	+	chr3R	23235585	3'	-	jockey	4809	1	55.47
TTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCA:1	-	chr3R	9038939	3'	-	Juan	4073	1	64.23
GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATT:1	+	chrX	14749698	3'	+	copia	226	1	58.90
ATTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTATACACTGCAGAAAACTGTCGAA:1	-	chrX	21669997	3'	+	Stalker2	336	2	60.96
TTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGTAAAATTTCAGTTAAGTGTGTG:1	+	chr2L	12290786	3'	+	1731	4594	1	60.71
AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAAAACAATGAG:1	-	chr3R	25423171	3'	-	3S18	5798	2	60.00
TGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTACTATACACTTTTGGTGCTATTAACCCGTTCGATTGGCCAAATATAC:1	+	chr3R	14337483	3'	+	copia	182	2	69.18
AACGGAGCCCAAAATTGAAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATG:1	+	chr3R	25448435	3'	-	roo	32	2	53.04
TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAAATTGTGGGTTCACACTGCTGT:1	+	chr2L	7810165	3'	+	P-element	2859	1	66.44
ATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGTCATTAGTTCGACTCAAAAGAAATAATCATTCTAGGCAAAGACGGCGAACCGGAACCTATACAAAAGCTACAGGACTTGGTCAATAAGTATGATATGAAACAAACC:1	-	chr3L	20322685	3'	+	297	337	2	66.44
TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTGGATGCT:1	+	chrX	14749726	3'	+	copia	244	1	73.77
CATACACATATATATATATATATATTCTTTTTTTTTTCGCTGTGTTCCTTTGTCAGCGGCCAACTATTTGGGGGCAA:1	-	chr2L	9854095	3'	+	Stalker2	7499	2	80.52
CACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGCCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCNCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATCATT:1	-	chrX	10445541	3'	+	INE-1	539	1	75.86
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAG:1	-	chr3L	16343218	3'	-	roo	8721	2	62.41
AATTAAACAATATATATTTTACTTATAATTCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAA:1	-	chr3L	16973369	3'	+	S-element	111	2	61.64
TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATGTGTGTGAGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAAT:1	+	chrX	17963931	3'	-	jockey	4813	1	67.54
TAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATGTAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATATTAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTGAAAGTGTTTAAAAAAAA:1	+	chrX	4275230	3'	+	1360	338	1	63.01
CAAAAATTTCACTTTTTTCAATTAACTAACTGCTTAACTATCAGACAGTATAGCAATGTGACTCCTTTGACCCGATACAGTGGCGACCACGTCCAACTTGCCCCCTCTGCCGG:1	+	chrX	20088894	3'	+	FB	162	1	57.52
ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTCACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACA:1	+	chr2L	2687416	3'	+	copia	186	2	70.15
AGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCT:1	+	chr3R	14860233	3'	-	BS	5048	1	53.42
TATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGG:1	+	chr2L	12290763	3'	+	1731	4601	1	56.36
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTGGCAAAAAGTTTTACATTTCTTA:1	-	chr2L	7945284	3'	+	roo	9042	1	64.38
TGTACTGTTTTTGTGTTGTGTAACACCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAATTTCTAACATGTCCCCCTGTGTTTCGGGGATTATAACTCAGTGTGGGTTTGGGATGTTATGGGGTA:1	-	chrX	23470652	3'	+	transib2	330	1	77.97
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGACGAGCATTTTCACTTCGTCC:1	-	chr3R	19968102	3'	+	roo	394	1	58.95
CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCAACTAGATACCTTTGGCCACAAGATACCTTACCTAGATATTTTT:1	+	chr2R	4977111	3'	-	1360	47	1	62.50
AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAA:1	+	chr2L	16016436	3'	-	412	7083	2	61.94
CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAA:1	+	chrX	10521755	3'	+	Tabor	460	2	62.96
AAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATGTACAATGATTTAAAATAAGGGCTGGCAATGTTTGACTCTTGCGCAAATTTCGAGGCGATGCAAATAAAGCCG:1	+	chr4	860715	3'	-	Cr1a	4176	1	53.21
GTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGCGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACAGATGGAGGCAGAAATGCATTAAG:1	-	chr3R	28286835	3'	-	micropia	109	1	79.00
ATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCCAGCTGGGGAATTCCCTTTTAAGTCATCTACAAACGTAATT:1	+	chr3L	19035236	3'	-	Tirant	210	2	70.27
TAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGT:1	-	chr2R	20596431	3'	+	roo	403	1	74.78
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAGAGAAGTGA:1	+	chr3R	25448466	3'	-	roo	8696	2	63.01
TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGCCACTGCAATGTTTACAGTTTCGTATTAACACTATCGCAATTTTGGCCAGGTAGCAAATGGAGGACCGAAACTAAATTACGATGATAGATA:1	-	chr2R	20899834	3'	-	hobo	30	1	67.12
GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATT:1	+	chr2R	5485237	3'	-	blood	28	2	64.03
CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACT:1	+	chr2R	17626940	3'	+	opus	457	2	54.41
GCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACAACATTGGGTAACACAACTGCGGCCAAATGCACTCAACTTAACGCAAAGTGACAAAACAATTTCGCAAAACAAAGTCA:1	-	chr3L	8168473	3'	+	Stalker2	243	2	56.43
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTCTTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACTACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTG:1	+	chr3R	27994288	3'	+	roo	9018	2	53.42
GGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAG:1	-	chr3R	21705975	3'	-	297	6581	1	73.03
GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCATTCATCTAAATGGTCAGGTGTTTAAGTGGAATTTT:1	+	chr3L	3501054	3'	+	opus	460	2	59.59
AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAAATAC:1	+	chr3R	17243252	3'	+	hopper	1392	1	66.44
TTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTTGG:1	+	chr3L	20168463	3'	-	mdg3	5286	2	57.36
GCGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTCTTCGTCATTACCAACGAG:1	-	chr2L	8710838	3'	+	Bica	4916	1	75.31
CAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAA:1	+	chr2R	21298809	3'	-	jockey	288	1	70.77
TATTTTGATTTTGGAATTAAGAGCCTGAGTCGATGAGAACTTCGGACTTCTAAAAGTTTTGGGTTTGGTGAGATCTTCGCAGGCGTTGTCTTTGCTTTAATCGGCCAACGCAGAAGTCAACAGCAGGCG:1	-	chr2L	21333761	3'	+	Dm88	4294	1	68.22
TCTTTTGTTTTGGGCATTTTATTTAATAAATCATTTTGAGGTTCCCATTTTAGTCCTAAGGTTTTAACACATTCATTTTCGATAATATTGAGAACCTTATTGTCCCCTGTGTCCTCCAC:1	-	chr3R	19445749	3'	-	Bari1	374	1	80.67
CGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCTACTTTAGCATTCTTTCTTGTTTTTTCTAAACTTTGGCAGTTTAGCTACGGATATAAAAGCAAGCTCCAAAAGCTCTCATGGATGCG:1	-	chr2R	3144733	3'	+	INE-1	555	1	50.00
AATATTNATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACA:1	-	chr3R	17605656	3'	+	Tabor	400	2	72.60
TCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATGCGTATAAAATGTATACGCATTCCCGGATCGCCGGATCTTTCGCTTTTCCTTGGGGTCTCGAAACAATTGATTCGGC:1	-	chrX	20645811	3'	-	1360	320	1	68.27
AAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATT:1	+	chr2L	22775551	3'	+	pogo	2014	1	76.55
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAA:1	+	chrX	13504235	3'	+	412	424	2	69.06
GCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAGAACTATTCAAAATAGGGCAATAGTTAATTTAAATGCAAATGCAACCAGATTTACTGGGCCCTTAAAAGTAGGCAAGCG:1	-	chrX	11982139	3'	+	hopper	1240	1	54.48
TTTTTTTTTGTTTTTTATTTTGTACTTTCCTCCTCCTGTCTCATGGTGTGTTTGACAAATCCTATAAACACAAAAGAGCGACAGGGTTGATTGCCTTTTACAGTTTGCAATCGCACCCACATGCCCACCAACCATTCCAGCAGTAC:1	+	chr3L	13137554	3'	+	S2	235	10	56.85
GTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATC:1	-	chr2R	5173445	3'	+	gypsy	7381	2	69.70
CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGTGTGCTGGCGGTGGAAAATTGCAAGCCAACATAAATTTATGGCTGC:1	-	chr2L	6569895	3'	+	jockey	4977	1	63.01
ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGA:1	-	chr3R	23020780	3'	+	INE-1	581	1	69.47
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAA:1	-	chr3R	25448310	3'	+	roo	9052	2	68.70
GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTA:1	+	chrX	7256187	3'	+	412	7463	2	73.97
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCA:1	-	chr2L	14772027	3'	+	roo	9019	2	54.23
GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGT:1	-	chrX	5629122	3'	+	jockey	4920	1	65.75
TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATAAGTAAATAAGTTTGTGAAAATAATATTGTAAATATTTACGAATGAATTTGGGTAAGGTAATATATAAACTCAATTTGAGTTTGAATCATACCAACCAGATGCCACA:1	+	chr3R	5061985	3'	+	mdg3	236	2	75.69
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTC:1	-	chr2R	21907928	3'	+	roo	342	2	65.00
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGG:1	-	chr3R	25448307	3'	+	roo	9055	2	70.99
AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGAAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAA:1	+	chr3L	7188613	3'	-	hobo	2	1	72.22
TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCATATTATAATATTTAAGTTATCTTATCGTAGGCAGTTTTGTTGATTTTAGAAAACGTTTCCGTTTTATTAGTGCTTAA:1	+	chr2R	18352430	3'	-	FB	27	1	60.16
AACTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCAATGCTGAAATCGGTGGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCGCAACGCACTGCTGTTACTCGAAAAAAACGAAACACGGCGATGGCCAATGTGGAGATCAAGCGC:1	-	chr2R	15677896	3'	+	Tc1	395	1	67.81
GCTACCAATCAAAAATATGAAGACAAATTTTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTTGTAAAGACGTGCAAAGGTCTTTACAAGCATGTGACGCAAC:1	-	chr2R	5548275	3'	+	G4	3490	1	63.37
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGAGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCT:1	-	chr2R	9328594	3'	-	roo	8707	2	54.26
AGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGT:1	-	chr3L	14944519	3'	-	G5	4741	1	72.32
CAATAATAATAATAATACTAGTAACAGTAATAATAATAATAACAACGTTCTCGCCACTCCCATCGCTGTCCGCATCCGCATCCGCATCCAGATCCGCTTCGCCATCGATTTGGGGCTCGGCTCCTTGCTCCACATCCTC:1	-	chrX	2660922	3'	+	mdg1	7074	2	66.19
GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGATGAAGTA:1	+	chr3L	9673124	3'	-	Doc	76	1	63.70
AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATAAATTCAACAATAAAGAACATTTTCAGCACTTAATTCATTTTTTTCACAG:1	+	chrX	7887170	3'	+	297	332	2	69.66
TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCATAACTAATTAATTATGCCTTCTTAAAGCGGC:1	+	chr3R	27424983	3'	-	blood	7043	2	69.18
TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAA:1	+	chrX	14749705	3'	+	copia	233	1	54.11
ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCT:1	-	chr2L	11518420	3'	+	412	7488	2	75.23
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAG:1	-	chr2L	3114458	3'	+	roo	9029	1	56.16
CAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTG:1	+	chrX	11296483	3'	-	BS	5043	1	55.00
AGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCTAAGTCAATTGCCTATTTACCCTGGTTATGGCTAAT:1	+	chr3R	18086957	3'	+	F-element	4304	1	75.34
GACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACTCCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAAT:1	+	chr2R	4181292	3'	+	accord	7374	2	63.77
TAAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTCCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAACCAAGTTGAAACGATTTAATTATAAAGCAATGTCTGACTGGCGGATTGGTCACTTCTTG:1	-	chr3L	25414123	3'	-	accord2	7320	1	59.31
TTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACT:1	-	chrY	680447	3'	-	invader2	40	2	70.55
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTNGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGA:1	+	chr2R	9328693	3'	+	roo	9041	1	52.25
CAAATCAGAATAATTATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGCAAAAGGGCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCATTTAGTGATCTAAATGTACCCTAATAGATATTCATG:1	-	chr3R	5440498	3'	+	Idefix	7272	2	73.11
AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGCTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTT:1	-	chr3R	21434872	3'	-	412	7113	2	58.90
GTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGTACAGTCAGCCAGTGTAAACACTTTCGGTACAAAATAACCA:1	+	chr3L	4130057	3'	-	roo	9030	1	66.39
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAA:1	+	chrX	23291025	3'	+	P-element	2495	1	80.73
ATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACACCAATTACAAAAACATGGCATGTCACTTTATTTGTATGCGTTGAGTGCAATTTTCACTAGTCAA:1	+	chr3R	25423302	3'	+	3S18	317	2	57.14
ATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACT:1	-	chr3L	17685116	3'	-	mdg3	57	2	54.79
CAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTATAACATTCGGAAGGAAGGGAATGAAAAACTCTGTATTTATTTATTCTGGCA:1	+	chrX	8794298	3'	+	F-element	4539	1	60.00
GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACCTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACCCAACCAATCTTAAAGTGTTTTATTACCG:1	-	chrX	16541436	3'	-	INE-1	34	1	90.32
AGCGCTCTTCGCTCTCTCGCCCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTGACTCACTGAAATGAAGTTTTCTTTCATTT:1	-	chr2R	4262572	3'	-	1360	109	1	73.97
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAGGCTATCATTTTCAATTTTATAATTTCTAAATGTTGATGTTTATGATATAACCATGTTTTT:1	+	chr3L	11393637	3'	+	roo	406	1	78.08
GATTGGGTATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCT:1	-	chr3L	25782389	3'	+	Stalker4	6998	4	51.37
ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCTCAAAATAGCAGGATGAGTCATGAAGGTCTTAAACAGCTAAGGATGCTCTATTTAAATTAGTTATATACTTTTTTATTATACTTAGCT:1	-	chr3L	22968302	3'	-	mdg1	32	2	63.70
AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGAATCGTGGAATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1	+	chr3R	26435576	3'	-	1360	36	1	75.54
ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGTAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAA:1	-	chr2R	9325385	3'	-	BS	5025	1	46.15
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTA:1	+	chr2R	19004221	3'	-	roo	72	2	69.18
ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGAATAAACTG:1	+	chr3R	25826795	3'	-	mdg1	32	2	63.01
ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACATATGGCACA:1	-	chr2L	13585810	3'	-	Tabor	41	2	57.93
AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAGCTC:1	+	chr3R	19446253	3'	+	297	6944	2	60.00
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCCCTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCC:1	-	chr2R	19050157	3'	-	roo	8680	2	67.18
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTG:3	-	chr3R	18582147	3'	+	roo	345	2	60.96
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTGTTGTAGATTTCTCGCAGTGTATAGAATCTGCTGCAACCCGCTTTGCATGCCAG:1	+	chr2L	5254404	3'	-	roo	16	2	65.67
AAAACGCTTCCTTCTCCCTGTTATATACATTAAAACGAATCTAGTATACCCTGTTACTCTACGAGTAACGGGTATAATACGAGATAAATTACCGTTATTACGGTACGAGATACAATTTCAAAATGATTTGACCATATCG:1	+	chrX	151641	3'	-	INE-1	34	1	64.03
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGTGATAGCAAATGAAAAAGAGCCTACGCCTAAACACTTCTTTAAAATAAAAAAAAATTTCAAATTTAAACAAA:1	-	chr2L	3886116	3'	-	roo	4	2	73.73
AAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGG:1	+	chrX	21907819	3'	-	springer	474	1	79.82
ATGAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGCTAACTTCTTTCTTAATACAGGGTTTCAAAAATAATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGACTTCTGGAAACCGAACCAATATCAACCCACAAATTTTATAAACAAACA:1	+	chr3R	5124695	3'	+	Q-element	220	2	69.18
AGTCGGGGAACTCGACTATAGCCTTCTCTCTTGTATTGAATTAAATTGATATCTGCTTATTCCATTGAAAAGATCAATTCGTAAATCAATAATGTTGTTGATGCGTATACTGTTTACAGTCTCAATTTCATGTTTTGTATTATAAA:1	-	chr2L	21799962	3'	+	INE-1	567	1	59.59
TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAA:1	-	chr3L	10848647	3'	-	blood	7066	2	58.21
TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTAT:1	+	chr2L	15833516	3'	+	jockey	4942	1	63.41
GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCCGTATAAAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCAAAGCTGAG:1	-	chr3L	13574447	3'	+	hobo	2920	1	55.29
CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGA:1	+	chrX	21014862	3'	+	copia	5073	2	56.03
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCACAGCAAAATCCAA:1	+	chr2L	18294299	3'	-	roo	8701	2	51.94
GAAATAACGTTCCATTTGACGCAGCTGATCAGTGGGCACGGTTGCTTTCGCAGCTATCTGAATCGCTTTGGACACGAGGAATTTTTCCGCGGTGTGCTACGCATTTAAGGGCTTTCGTTTTTACCCACAATTCT:1	-	chr3R	7587902	3'	+	Rt1c	4981	1	59.70
AAGGGGCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTTAGTGGAGATAGTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACACTTGTTTAGTTACATAAATCACTTTGGTTCTGTTAACACAA:1	+	chr3L	17680849	3'	-	mdg3	5163	1	69.18
CATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACACCTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGT:1	-	chrX	10521639	3'	-	Tabor	6901	2	61.31
TGCCTGTTACATACTTTTCAACCAATATTGTATACCCATTTACTCTACGAGTAATGGGTAAAATAGAAGTGAACCATTGTTGAATGGTTTTAAATTAAAAACCTAATGATGTGGTTGTTTTATTGTAAAGCCTCGACGTTAATCT:1	-	chr2L	21358078	3'	-	INE-1	20	1	75.86
TTTAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATGGCCTACACCTCGCCTAATGTTTCTCCGGACGTATGGTATTGAAGGGGTCTACCCTGGCTCTAATGACAAACATGTGCAGAG:1	-	chr2R	914937	3'	+	Gypsy12A_LTR	202	1	68.52
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAAAGTTTCGAGATTCTTGCAC:1	-	chr2R	14542106	3'	+	roo	9045	1	60.87
AAACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTACATTACGTCCTTAAAGTTTTAAAATAAATCATA:1	+	chr3R	13237363	3'	+	3S18	264	2	77.04
ATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATATAAACTTAGAAAAATCATCATACATTCAGTTCCATTTCTGGTTTATCCTGA:1	-	chr3L	4540344	3'	-	1360	3183	1	65.75
AATTTCATCGGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAAAAAAATCAAAACAATATAT:1	+	chr2L	20117967	3'	-	invader4	2801	2	51.37
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGT:1	-	chr3R	25448338	3'	+	roo	345	2	60.27
TGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACATTGTGA:1	-	chr3L	17557978	3'	+	jockey	4963	1	58.22
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTGGTATTGTACAATAAGTGCACTTT:1	-	chr3R	18339105	3'	+	roo	8991	2	71.92
GATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTATGAAAAGTACACGTTGGTGTTTCGTGTCTAATTATACTTGATAAGCCATAGTTTTTGATGATATTCCTTCTTTGTG:1	+	chr3L	24213465	3'	+	invader2	248	1	63.85
AAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAATTATATTATAATTTTTATACTAAAATTGTCTATTGCCTAAAACCTTAACCAA:1	-	chrX	22576312	3'	+	Bari1	1639	1	65.75
AGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCACATTTGCCGCTCACCTACAAAATGTGTTCACGCCAAACCAGGCTACTAGCACATTCGCGCTACCG:1	+	chr3L	23681449	3'	+	Stalker4	7013	4	56.06
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATG:1	-	chr2R	11164400	3'	+	roo	9015	2	57.53
ACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACNATATCGCTCTTAATGTCTATAAGGTAGTTTGGCAAATCGATGAATT:1	-	chr3R	19137079	3'	-	Bari1	28	1	85.06
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAA:1	+	chr3L	15600303	3'	+	roo	9030	1	63.46
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTACGCTTATTTTCATTGCCAATTTT:1	-	chr2R	21907881	3'	+	roo	9052	2	71.63
CTATATGAAAGTTGACCAAATCACTTGAAACTTTGTGAATCATCTTGGGGGAAGTAAAGAGCAACAAAAACCCAAATTTGGTGTTATTTTAAGGATTTTCCCTTATTGTGTGATTTTTATCTGGATCATTTTCCC:1	+	chr2R	13642914	3'	+	transib1	2029	1	61.48
CTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGGGTCGCAATGTCTTCATCACGGGAGCCACTGGCTTCGTGGGCGTCACCATTGTGG:1	-	chr2R	16591331	3'	+	BS	5001	1	54.29
GGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATAGACGGAGGACAAAAAGTTGAGAAGTTCAAGTGTATAATTTCGTAACAATTGGGACAGTTTTAGTGCTTCGCCGGA:1	+	chrX	20749077	3'	+	Stalker	7037	4	52.05
CATCCACTTCTCTTCCTCACTCCACCTTGCCTTTAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGCAG:1	-	chrX	23201998	3'	-	R2-element	483	1	58.70
ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAG:1	-	chrX	18193688	3'	-	jockey	61	1	68.22
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACACCTGATTGCGTT:1	-	chr3L	23603174	3'	-	F-element	71	1	66.67
TTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATTCCTTATAAACTGATATTTTTCCTTATAATAAGACATTTCGTCTTCGTGAATCGCTAAATAATTTGGTGTTATTAC:1	+	chrX	22118655	3'	-	gypsy	35	2	59.71
GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATTATATACACATTAACGAGTAGGGCGAATGAATCATGTATGTGTGATAGGGGGGGTATTGCGGCATTTAAGGGTTTGTTCTGCTGCTCCCACCAGCTTAGA:1	-	chr2R	18609313	3'	+	opus	7481	2	59.59
AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGCCAATTTAT:1	-	chr3R	10182148	3'	+	blood	357	2	61.97
TGCAGCTAACTTAATTTTTTTGGAAAAATAAAGAATCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAA:1	+	chr2R	20944403	3'	-	pogo	2036	1	78.62
TACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACA:1	+	chr2L	12290738	3'	+	1731	4541	1	75.17
TTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTTGATTCGTTTGCCGT:1	+	chrX	12074619	3'	-	412	7188	2	58.45
ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTA:1	+	chr3L	17115544	3'	-	blood	58	2	55.17
TTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATGTTTACTATAGTTATTGAATTTTTATAGAATGAATGCTCTGATTGAATTCTTTTGCGGCTCTAATAATTATTTTTGAATAGTCAATAATATTAAATTCTTTCT:1	+	chr2R	4521200	3'	+	Cr1a	4269	1	64.38
AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGTAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTT:1	+	chr3L	17560372	3'	-	pogo	36	1	54.46
AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATAT:1	+	chr3R	7482825	3'	+	412	7474	2	71.92
ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGG:1	+	chr3R	9039011	3'	+	Juan	4150	1	65.73
AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGAGTATCCGT:1	-	chr2R	9791554	3'	-	412	7088	2	60.42
TAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTGCCGCTTGCCACGCCCCTTCC:1	+	chr3L	12308390	3'	+	hopper	1357	1	67.80
GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCG:1	-	chr2R	5248228	3'	-	1360	42	1	52.71
AATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGACTAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTGCAATAAACAGTTTTCGAAAATATGCGATATTTGTTGGGCTTGGTCAGCAG:1	-	chr2L	7881576	3'	+	1360	454	1	76.03
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACA:1	+	chr3L	15600315	3'	+	roo	351	2	63.36
AAAAAAAAAATTAGAGAAAACATAGAAATCTTTGGTAGGGAGATTTGCAGGGATTTCGGAAAGTTTTTGTATGGACGGGAAGTGAGAAGGGATTGCCTGCCACAATTTTTGGTGCGCATAAATTTTAACACCAATTAAATCGATAA:1	-	chr3R	20178997	3'	-	Tc3	78	1	80.14
AGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTAAGGAAAAAAGCACCCCATCCCTGCGAATGATCATGTGCCCTGATGAACCCG:1	+	chr2R	4929854	3'	-	Burdock	109	2	64.83
GTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGTCTATTATATTTTTAAGCTTTTTAATCTGCATTAAAACTTCATTCTATGGACGGCAGACGGCATGTTTGT:1	-	chrX	21235676	3'	-	1360	3137	1	67.81
TGGACAAAAAGGAAATTTGTGCCAAGTTCAAATGCGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTACAAAAGACGCCCGCTGATAAGAACAAATGGCGCGAGAAATTCG:1	-	chrX	1833894	3'	+	pogo	416	1	75.24
TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGACATTTGGTTCACTGTCATATTTGCCAAGCGCTTCACATCAAATCGCAATCAGGTTGGATTGATGGAACAGGACTATATATATCTATATGTGTATCGAGTGG:1	+	chr3L	15490458	3'	-	copia	4888	2	73.97
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGG:1	-	chr2R	19050195	3'	-	roo	69	2	63.70
GGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGAT:1	+	chr3R	934291	3'	+	Rt1b	4740	1	60.96
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAAATATTGTTTCCCGAACAGCGCTTTTCGTCACTAACTTGTAGTGCCTTTAAGCATTTATTTTATCTCTCTGTTT:1	-	chr2R	18336100	3'	-	roo	16	2	71.92
ATTTTTAAAAAAAATAACATTCAATAACTGTATACGTATAAAAATGAAATCGAATTCATTATCATTTACCTTATTTAAATAACTCCCTGAATGTTTATATGGTAGTTTGATTACATTCAGACTTTTCCTAGCCTAAATATAATAGG:1	+	chr3L	12473146	3'	+	Circe	471	1	45.89
AAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGCGGCTTGTGGGCGTTACAGTAGGCGTGGCAACATGGGTCAACTTGCGCTGCGTCTTTGTCTCTTACTGTAAAAGTGTTAAATAATGTAATATGTAGTTTTAAATTTTTAATAATCAAGCTTA:1	-	chr2R	25218680	3'	-	INE-1	244	1	56.85
TTTCTCATTCTAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTT:1	-	chr2R	4260432	3'	-	micropia	238	2	53.10
GTTTATCTCGTCAAATACCGTTTGCTAGTTTGTGTTCCTTACGAACCATTCTGCTCTACATAATTTGGCTAATAA:1	+	chrX	17262554	3'	-	X-element	4379	1	61.33
ATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTNAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATGAATAAAATGCATTCGTTAGAGATATTCGTTTGGAGTGGTTCTATAAAGTC:1	-	chr3R	13846119	3'	+	I-element	5288	1	65.97
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTCTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATA:1	-	chr2R	19004096	3'	+	roo	9048	2	68.75
AGAGTAAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTACAAAGAAAAAGCGAAATGTTTAAACTAAGTTAATTGAGTACAAATTATTGAATTAAAAATAATAAAAACCATAATTGTAATCCAATAAAAT:1	+	chr3R	19450070	3'	-	Cr1a	202	1	61.38
AAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTCGTCAAAACAAAAAAAGGTCGATTAAC:1	-	chrX	6279733	3'	+	P-element	177	1	18.49
CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGG:1	-	chr3R	13360282	3'	-	jockey	12	1	75.24
CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACC:1	+	chr3R	27424944	3'	-	blood	7051	2	55.65
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAAATAA:1	-	chr2L	12892596	3'	-	roo	8707	2	53.42
GCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGGCG:1	+	chrX	5629174	3'	-	jockey	126	1	74.78
AAATGAAAGCAGCTTTAAAATATCAATCACAAAAAAAAATTATCTTAATACCAAAATGTCCTGCTTTTTACCCATAGGGTACATAGAACACAATGTATTGTCCTCATGGAGACGTAAAATAATTTATA:1	+	chrX	22510791	3'	-	transib4	57	1	76.56
GTGTGTGTGTGTGTGTTTATGGTTATTTTATGTTTGACATCGGGGAGTCAGAAATTGATGCCTTTTACGGGCGAGAAACTGTGGAGTTTTCAGCCAGAGATGAA:1	+	chr3L	9284494	3'	-	accord	179	2	69.23
GAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACTTAAGCTTTCTCAGTTGCTTTATTTCTGACCAGTAGCAATCTTTAATAGAAAACTATCAATCGCC:1	-	chr3L	14465793	3'	+	R1A1-element	4977	1	54.23
TAAGCGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTATATAGCTGCATCTCATTCATTTTACGATGTCGTTATAGGGGTGAGGGCAATTTCTGGAATATGTTATTCAGAGCTTACACTCTGGAGTAAAAAATACTGAACTAAATTATGAT:1	+	chrX	22259397	3'	-	rover	6962	2	54.79
CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGTTCGTAT:1	+	chr2L	11661039	3'	-	F-element	33	1	50.78
ACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGACACAAGAGATCTGCCAAGATCAGAAAACGGAAATGAGTATGCTGTTACTATCATTTGCGATTT:1	-	chrX	1875883	3'	+	mdg1	7246	2	63.24
AACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAATGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGTGGTAGCCAAACAGAGAAAGTAAGAG:1	-	chr2R	20596406	3'	+	roo	397	1	74.66
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGGTGTTCGAGGAAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCA:1	-	chr3L	23773164	3'	+	roo	9039	1	42.47
TCGAAATTTCCTTTCATTTAAAAACTTTTCTAAATAACATGCATAACATAATCATTGCACTTTAAAATTTATTACGCAATCTTCCGCAATCTTTCGCAATAAAAATTCCTTTGAGTTTACTTTTC:1	-	chrX	9844794	3'	-	invader1	3622	2	74.40
CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATGATATCGGGTAAATAGCAGTGAGAATCCAAAAAAAAGTAAGAATCCAAAAAC:1	-	chr2L	21882938	3'	+	pogo	2070	1	41.78
GCCCACACTTTTGAAAAATGAGTTGATATTTTTTCGCAATTTTTTATTGGTCTTGTAAATTTCTATCGACTTGGGATACGATTATTTTAAGAAGCTCTCGGAGAGCTCTAGAGAAAGCAGCTCTTTTGTACGCTAAGGC:1	+	chr3R	3752561	3'	+	INE-1	256	1	52.52
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCA:1	-	chrX	3309648	3'	-	jockey	36	1	67.86
ATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCGGCAAC:1	-	chr2L	12290644	3'	-	1731	4352	2	57.93
TCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCTCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTACATAAAGTCATTTTTGATATACATATATACACAGCATTTAGTATATTGAGTAACGCACTTAAATTAGCAGCGAGTCTAGTGGCCA:1	-	chrX	6127691	3'	-	1360	437	1	53.42
GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCG:1	+	chr3R	10182194	3'	-	blood	7080	2	69.92
ATAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTTCTTTTTTT:1	-	chr3L	11393445	3'	-	roo	8693	2	65.07
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTG:1	-	chr2R	19050208	3'	-	roo	8723	2	67.48
CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTT:1	+	chr3R	28075416	3'	+	jockey	4948	1	51.06
GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGGTAGTTTCGCATACGTACAATCAGTTCAATGTCCTCCTTCTTGACTTGGACCTTCTGGAGCTCCTTCTCTTTGGCTACTCGCAGT:1	+	chr3R	14035489	3'	-	1360	4	2	75.22
AGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGNTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGA:1	-	chr3R	10182124	3'	+	blood	349	2	51.46
TAAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTATTTTTTACCTTCAGATCGTGTTTTTAATAAAATTTCTTTTTTCGACGGTAAAAATCGCTGGCAATTTCTGCGCCCGCGATG:1	-	chrX	19057078	3'	-	Tc1	442	1	72.81
AAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCCGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACAAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATT:1	-	chr2R	4260433	3'	-	micropia	5208	1	44.96
TGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGTTTTATGTTTTATGCGGTTTGTGGCAACATGGGTATGCCTAATCTCAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAACTGGCAGCATATGTACTCAGGATTTTCAATTGGATTTTTTGCGGTC:1	+	chrX	22904324	3'	-	INE-1	251	1	52.05
GCCCTGAACCTCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGAGCATTGGACTTCAGGGGGATGCTAAACTATGTTGCCCGGCTTTTGAGTGCCACGATGGCACCTTTTAACCTTTTTTACCCCACCACTCCCACTCCTGGACTTA:1	+	chr3R	6138786	3'	+	baggins	5323	1	60.00
TAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTGTACTATTTTCCATTTTTCTTGCCTGAACTTGTCAAGCTTTCATGGTGGCAACACTTGTTCATTAAGTGATGCAGCATTTGCCATTGCTTAT:1	-	chr3R	18591323	3'	+	P-element	2508	1	70.23
ATATAATAATAAAAATAACACATAGCCCAGCGCAGGGCTCAAAGCGATTTCAATTGGGAACTTAAGCTACTTAATTTCAGTTCAATACTTTTCTTAAAGTGCTTCTAAG:1	-	chr3R	28955706	3'	+	invader3	5058	1	69.72
CAAAGTAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGTC:1	+	chr2R	16248015	3'	-	BS	36	1	48.89
ACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAAAATAAATAAAAGGTAAACAACCCCATTAACTTTACGGACATCGCACATTAGGAATACGTCGGTGTCGCAC:1	+	chr2R	4009141	3'	+	Juan	4159	1	56.85
GAACTAAGGTCCCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCGGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATT:1	-	chr3L	25008302	3'	-	297	6946	2	72.59
GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTCACCTTATTATCATTTTTTAGCGGGCGATCGCCTGTTGGACATTCCCTG:1	+	chr2L	5928075	3'	+	I-element	5303	1	59.20
GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTATTATGCG:1	+	chr2R	17626953	3'	+	opus	487	2	73.11
AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGCGTGTTTGAGCACGTTGA:1	+	chrX	9540149	3'	+	roo	9064	1	75.97
AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCCAGTAG:1	+	chr3L	4605730	3'	-	pogo	39	1	55.56
CCTGATGCAAGTGGAACTTGTGTTAACTTAAATATATATTTCAATATATGTATATGTACTGTGTTGGCCGGAAAATGTATGCGTCTGTGCGGAAATTGCATTTTTCACCCTTTTTCCAT:1	-	chrX	12214034	3'	+	opus	491	2	72.27
ATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATAACAATGACAATAACAATAATTACAATAAAAAATTTA:1	-	chr2R	5308162	3'	-	Bica	304	1	70.40
TACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGG:1	+	chr2L	11661032	3'	-	F-element	58	1	44.52
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGA:1	+	chr3R	22844263	3'	+	roo	8990	2	74.66
CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATTTGGAGCAACCAAGAGCATACAACAATATATAAAATACATTC:1	-	chr2L	11732248	3'	-	Doc	37	1	52.05
ACTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGTCTGCATTTTTGGACTAAAGCGAAATGAAATTTGTGG:1	+	chr3L	9921692	3'	+	1360	3246	1	73.97
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATACAG:1	-	chr3L	3256469	3'	+	pogo	2064	1	60.38
TTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTT:1	+	chr2L	2122460	3'	-	Stalker4	7026	4	74.22
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGAACATTCTCAATACAAAGAAT:1	-	chr3L	20654443	3'	-	roo	8679	2	72.09
CTTTAATTTAAAAAAAAAAGAAAACAAAAACTGAAATAGACAATATATTGTGAAGTGCTTTGCAAAAAAGGGGAATTTCTTGTTAACTGGAAAGGAAGTTTTTCGGTTTCTTTTGCAAT:1	-	chr3R	19880569	3'	+	transib2	2632	1	77.31
TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGG:1	+	chr2R	16945362	3'	+	jockey	4957	1	49.56
CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCTGTGCACGCGCCTTATTAAAGTGAACTCACCT:1	+	chr2R	17259334	3'	-	jockey	4751	1	70.71
ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAAAACAATGAGTGCTCCCA:1	-	chr3R	25423163	3'	-	3S18	26	2	65.07
AACATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCATATTTAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAAAGTTGACAGGCTATTCAAAATTTCATAATAATAAATTTCAACAAAACAGTGGTGCTCGAGTGTCCTGGCGTGGGATCCC:1	-	chrX	2451322	3'	+	F-element	4626	1	78.08
AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGCAATCACATTTGATATTTGCATGCGAAATGTATTTGCGCTCCAC:1	+	chr2L	18404598	3'	-	hobo	34	1	55.77
TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGCTCGGTAAATAAAATGCCAAATGG:1	+	chr2R	24218613	3'	+	412	7500	2	57.50
CGCCAAAGCGAAAAAAAAAATGGAAAGTACTAAGGCTGCATTTGAACAAAATGCTGAGCATGGGAAACATGTAAAAGAAATACACAAGATAATAGAAATGCAATGCTCCGAAAAACAATAATTGAAATACCATAGCATTTATTTAC:1	-	chr3R	9335253	3'	+	invader2	290	1	74.66
AAACTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCATTCCACTTCACATATTCCACCCCTGTTGTTCAGTCCAGTCCAGTCCAGTCC:1	+	chr2L	19830920	3'	+	G2	2607	1	58.20
AAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAATTCAGGATTTTGCTCTAATCGGCTACAGACAAAATACCAGCGATACATCCTAATAATGATG:1	+	chr3R	27545823	3'	-	1360	207	1	57.53
GTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCAACGGACGGCTTGGTGAAGTG:1	-	chr2L	12290675	3'	-	1731	72	2	64.38
GTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCACTGTGCACATGTTTACACTGTCTGCACGCCGACTTTCCG:1	-	chr2L	12328619	3'	+	hopper	1385	1	51.56
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAATTTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAA:1	-	chr3L	16343211	3'	-	roo	59	2	58.45
TGCTTCTCATATTATGCTTACATTGCATTAGTCGCTAAGTATACTATCTTGCATGCACAGAAAATAAGTCAATGGGATCTCGAACGTCTAACTTATCAGCCGATATCACTGCCTTTATCTAGGACTTCATATCTGCTTGGCCACC:1	-	chr2R	4329320	3'	+	rover	6964	2	62.76
GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATAAGTAAATAAGTTTGTGAAAATAATATTGTAAATATTTACGAATGA:1	+	chr3R	5061924	3'	+	mdg3	179	2	67.86
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCCTATAACGAGGATAG:1	+	chr2L	6059351	3'	+	roo	9047	1	69.18
AATATGTATGTATATATACTTAATATGGTCAGAATCTAGTATTCTCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGTATAACATGAGAGAAAGCTATAGTCCTGTTCCTCGACAAGTTTAACCGTTTTGTCAATGCCATATTTGAAAACTTGAA:1	-	chr2R	5081126	3'	+	Dm88	19	2	74.48
ATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCAT:1	-	chr3R	25423224	3'	-	3S18	83	2	73.94
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGGCGTAATCTACGCTTAT:1	-	chr2R	21907897	3'	+	roo	9031	1	56.85
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATA:1	+	chr2R	8585502	3'	-	roo	81	2	75.35
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCTT:1	-	chrX	13039469	3'	+	roo	9054	2	63.16
AAGGTGGCCTGACGGCTGCATCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCC:1	+	chr2R	20497006	3'	+	blood	7335	1	59.56
AAGAACCGCACAAGAGCGGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGTGAGAGCGAAACGTGGAGTTTATGTGCATGGAAAAAACAATCTCTTCGTGTGCAGCTCATCCGCATACATG:1	+	chr3R	16324771	3'	-	Cr1a	348	1	77.04
CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGTTTGCTTTTGTTGTTCTTTCGAGCGATCTGCTAGCAAG:1	+	chr3R	14651343	3'	+	P-element	2872	1	76.03
ATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATATGCGGGTTAGCTGAACCCAATTTCACACTTTGATTATTCGAATATGCCGCATATGCTGTACTTCCCGTGGGCGTCGATACGATCAGGCCATCGC:1	+	chr2R	13538340	3'	+	Stalker4	7206	4	63.89
CGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGCTGTTGTAAA:1	+	chr2R	2906084	3'	-	1360	92	1	70.55
CTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATTTGGAGCAACCAAGAGCATACAACAATATATAAAATACATTCGCTTTGATATAATATACATATTTAGA:1	-	chr2L	11732222	3'	-	Doc	11	1	68.49
ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATCGGTCAACTGGTCCAAAGCTATCTGGATGGGCTTATTGAGAAAGTTGTGG:1	+	chr2L	11518515	3'	-	412	7080	2	62.86
CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGC:1	+	chr3L	25401027	3'	-	Doc	16	1	58.33
TGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTAT:1	+	chr3L	20168434	3'	-	mdg3	80	2	69.86
CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCATGCCCATCCTTCGTAGTTTTCGTCGCTATTC:1	-	chr3L	18368872	3'	+	opus	491	2	77.78
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCA:1	+	chr2R	18336259	3'	+	roo	360	2	54.11
ATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACA:1	-	chr2R	1320688	3'	+	diver2	320	2	54.55
GACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAG:1	+	chr3R	28075393	3'	+	jockey	4920	1	66.44
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTT:1	-	chr2L	16091865	3'	+	roo	9046	1	62.14
GACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAAAGTTATAAAATCAACATAATATCATGTTTTTATACCAATAATATATATTACACCCCCATTTTAAGTTTATCAGTGCCACAAGGGGTTGTAAAAATGTAAGGCGATGCGGAGATTA:1	-	chr2L	15227220	3'	+	gypsy12	10189	2	76.03
ATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCCATAAACCGTTCTTATCCTCCCGAATCAGACTG:1	+	chr3R	389627	3'	+	blood	63	2	77.40
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGG:3	-	chr3R	25448308	3'	+	roo	9039	1	63.01
ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTG:1	-	chr2R	13585419	3'	-	412	74	2	68.49
GATCTAGATGTCTCAGAACGTTTACTTGGGCCATGGCTGAAACTGCAGTTTTCTTCTTTGATTTTCCGATATTGTTGAAGTAAAGGGTGCCGTTTATTTTAATTTTTTCGGTATATAAATTAAAACATAAGCACTATTAAACAAT:1	-	chr2R	3928233	3'	-	gypsy10	5510	1	78.62
GCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTTACTACCTTCG:1	+	chr2L	22150641	3'	-	S-element	71	1	82.19
CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTT:1	+	chrX	14749685	3'	+	copia	213	2	67.81
CTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAA:1	+	chrX	12657098	3'	-	gypsy	7008	2	71.83
AATTCCAAATCGCCTCAAATTGAGTTAAGGCGCTCTGAAAAATGTGTCCCTTTAAAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGAT:1	-	chr2R	4802880	3'	-	mariner2	540	1	71.43
AAGCAATTTAAACTTGATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTACAACGTTGCTAAAGTCGCTGGCCTGAAAGAGATTCATTCGCTGTTTAG:1	+	chr3R	28324654	3'	+	accord2	7238	1	58.40
ATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCTATTAAGACAGGTTCTTCTACAGACTGCTGCCGAGGCCAAAGTTCTTTTGTGTCTGCTAGCC:1	-	chr3R	19446548	3'	+	1731	60	2	44.44
TTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTTGTTGTGGACTTGGCTCAGTTTCGCCTTTTTTGGCATGTGCGCATTTAATTGAAATTTCCACAGACGCCCACTTTTCG:1	-	chr2L	19310271	3'	-	Juan	4064	1	78.29
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTGGGCTA:1	+	chr2R	16785470	3'	-	412	7070	2	74.66
GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAA:1	-	chr2L	17081795	3'	+	jockey	4928	1	67.65
ACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATACAGTAATAAAATTAATTTTAAAAAACTCGCAGACAGACTCTACATGCAATTAGCTAGATTTGACATAACAACAGTTAGTAAATTAAAGCAAATT:1	-	chr3R	2081335	3'	-	1360	3150	1	67.81
CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCC:1	-	chr3L	11957118	3'	-	blood	7048	2	53.66
AATTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTTCTAACTCGAAAAGAAAGATCC:1	+	chr2R	5031013	3'	-	Doc	71	1	72.50
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCAC:1	-	chr3R	31817424	3'	-	roo	21	2	64.23
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCC:1	-	chrX	13039488	3'	+	roo	9034	1	66.67
TTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGAAACCAATTCGCCAAAATTTTAAATCTTTGAATCAATAGACAAA:1	+	chr3R	17831865	3'	-	F-element	73	1	67.19
CAGACTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGAACCATGAACCCCGAATGCTTTGCTATAATATAATATTTGCTATAATCTTTCAGTTACTCCCATTTTCGCCCAAATTAAATATTGAATATATTAATGGCCAGATT:1	-	chr3R	17981571	3'	+	baggins	5280	1	69.18
CTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTCGCACAAACTCTCTGAGCTAGCGAGCAGAC:1	+	chr2R	5209662	3'	+	gypsy	378	2	77.78
AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAA:1	+	chr2L	13585922	3'	+	Tabor	7255	2	62.33
ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCGTTAATGAAGTCAAAGGGAAATGC:1	-	chr2R	10582334	3'	+	Juan	4201	1	75.34
CATATTTATCTGTGTTAAAAACCATATATATCTCTGTAAACAAGATAAACAAAAAAAAACAAGTGAAAACAATAAACAAAACAAAAAGATGCGGCCATAACGACACAAACACATACAGTGCAGTTCAAAAGCGAA:1	-	chr2L	3577238	3'	+	Porto1	119	1	63.70
TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATACATATATATGTGTTTCTACAATGGCACCCACGCAAAACGCTTT:1	+	chr2L	2794258	3'	-	Burdock	6191	2	71.32
CTACCCGCGAAATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTATATATTTCTAGAATGATATAAACATTACAGATGGTAGGATACACGAAAA:1	-	chr2L	15819711	3'	-	R1A1-element	5016	1	65.07
GGCGTTNCGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTCCTGCACAACTTTAAAGGAGCGCTTGTGGAGGAAGCTTTTTATTAT:1	+	chr3L	23906525	3'	-	1360	12	1	74.66
AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATT:1	-	chr3L	17558010	3'	+	jockey	4932	1	62.76
TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATT:1	+	chrX	14749701	3'	+	copia	229	1	56.85
GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTTCGCTCACGTAGCGCTTCGTAAGGTAAAA:1	+	chr3R	6198754	3'	-	roo	213	2	74.11
CGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTATTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGGCCCACACTCAACAAGGTGACAATTTTAGAACTGGTTG:1	+	chr3L	24862152	3'	-	diver2	4621	2	92.86
TAATCTGATACTCTTTAATATTGTAAGCTGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGTTGCACATAGTGCAAACCGCTGTTTTCGCTTGCATTTCTTATAATTTATAGTGTAAGAAAAAATACACTTCTATACTTTTATATACTATATT:1	-	chr2L	22217497	3'	+	diver2	38	2	59.59
ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAA:1	-	chr3L	17136072	3'	+	hopper	1384	1	70.89
GAGAACNTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCCGTATCTGTGGGAACCAACGCCCTCAGCGAGCGTGTCTTCATCTGTCGTGTCCGCTGTGATGAATCCATCTTTATCGGC:1	-	chr3L	17886207	3'	-	1360	3280	1	58.90
GGAAATTCAAACCTTATGGAAGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTATAGTGTGTACCAAAACGTCTTCAATTGGTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTTCTTTTCAATTTATAATATTTAAATA:1	-	chr2L	6949	3'	+	Tc1-2	1261	1	75.34
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACACACGTTGATGTGTTTCGCTTGATGGCACTGGCCAGG:1	-	chr2R	21907945	3'	+	roo	9026	1	66.99
GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCAATGGGCCAATGGAGGAGCCTCCTCCAATGAAGAAACCTCCATTG:1	-	chrX	18193606	3'	-	jockey	17	1	76.03
AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATTACACCATCTTCTTAGGACCA:1	-	chr3L	14638637	3'	-	1360	51	1	79.38
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAATGAGAAGAATATCAAC:1	+	chr3R	17818016	3'	-	roo	8694	2	65.07
GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATACTTATCTAA:1	-	chr3R	6290970	3'	-	Doc	78	1	70.55
TATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTTTTGTCTTGAAAACCTCA:1	-	chr3L	23818332	3'	+	copia	229	1	55.48
TAAGAAACCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACGAAACGAAACCATACACTATGAATAATATCTGAACTTTGAAATATGCGTTACCCCAAAACGAACTAACACAACAACAACTTCCAATCCAACATAATAATAA:1	+	chr2L	14083301	3'	-	1360	3273	1	71.92
AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACTCACCTGTTTTCTAGAGAGGAAGTTCCCGAACTCATTCCGATGCGAGCCAAGCTCTACAAGATGTTGGAGGAGTCCA:1	-	chr3R	18272087	3'	-	1360	24	1	64.34
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATT:1	+	chr3R	14979895	3'	-	pogo	19	1	63.96
TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACACTTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTA:1	-	chr3R	15072559	3'	+	pogo	2075	1	53.15
ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATT:1	+	chr3R	22822162	3'	-	mdg1	21	2	52.05
TCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTTAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCCTGACCTAGCAGTTTCGTCTGCTCTCTCTGATTTCTGAATATTTCGAGTAAGGTGTATGGAGTAGT:1	+	chr2R	21844669	3'	+	McClintock	5963	2	76.03
ACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTGCTGTTCTTGCCGCCGGCCTGTGTGTGTTCTTGCCCCGTATAAATAACATTTTTGTCAAGCGCCTCGTATGAC:1	-	chrX	18001063	3'	-	412	7267	2	57.04
TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTA:1	+	chr2R	5485203	3'	-	blood	63	2	62.86
TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTG:1	-	chr3L	23603182	3'	-	F-element	89	1	75.19
GCTATTGTAACGTGATGCCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCTCGCATATATGGTATTATGGCGTAGGTTCAGCGTGTCTGAAAGGGTCAGCGGTCAG:1	+	chr3R	845357	3'	+	Bica	4820	1	59.54
GTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATATTTAAACTATACTATATAGGAAACATCATGC:1	-	chr3L	9105878	3'	-	accord	7114	2	77.24
ATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCGGCAACACGTGTATGTCACGGAGAA:1	-	chr2L	12290625	3'	-	1731	4327	2	74.10
ATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTTTTTGAAAATATTATCACTCCTCATTTGCACCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCACGGTTTTGACAACATTAACCTGTTAACCCAAACTGACGGCAAACGGC:1	-	chr3R	8142695	3'	+	Q-element	98	2	71.22
CACTACTGGAAGTGCAACTACACTCTCCACGCGAGGGCGGCTGGAAACAGGTGAACTCCCAGGTAACAGTGGGAGTTGACGTTGCCTATCATCCCACCACTGTA:1	+	chr2L	23169158	3'	+	baggins	73	1	54.81
ATGTCANCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCC:1	-	chr2R	21907927	3'	+	roo	9002	2	64.83
TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAAATAAATAACAATAATAGCA:1	+	chr2L	22685207	3'	-	Ivk	45	1	52.17
GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGAGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCGTACTTACCAACAACCAAAACCGCCCAGCCC:1	+	chr2L	1377695	3'	-	hobo	63	1	73.95
ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATT:1	-	chr2L	14892229	3'	+	transib2	2752	1	73.33
AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACGTATAACAATAATAAGCCACAGCAACAAAAACAATTCAGGAAACTTGGCAACAAAATAAACAAAAATGAAAATAATCG:1	-	chr3L	2840892	3'	-	copia	4906	2	50.00
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAAATAGCAGACAA:1	+	chr2R	8585581	3'	-	roo	8683	2	52.05
GTTTCCCGACTATAAGATACCCGTTAGTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTAAATCTCAACCTTCTAACTTTTATAGTTCCTAA:1	+	chr4	829451	3'	-	INE-1	556	1	78.77
GATTCTTGGCCTTTTGGCACACCCTCTACTCAGTGTCGCAGATCCTTTTCTTTTTATTTTTGAAAGGAAACAAGGCTGCGGTGTGAAACTAGTAAAAGTACAAGTGGAAATTAAGCATTCAGCACGCCAAAGCTTGGGGCAATACG:1	-	chrX	12834942	3'	+	3S18	422	1	75.34
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTT:1	+	chr3L	11530972	3'	+	roo	343	2	63.64
TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCG:1	-	chr2R	16891819	3'	+	hopper	1403	2	68.87
TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTAGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTT:1	+	chr3L	3477498	3'	+	mdg1	7380	2	74.66
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCT:1	+	chr3L	11530970	3'	+	roo	338	2	65.75
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAG:1	+	chr2R	9328686	3'	+	roo	9042	1	52.43
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCG:1	-	chrX	6486711	3'	-	roo	8692	2	51.40
CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGCAGTTTGGAATTTCT:1	+	chr3R	15072636	3'	+	pogo	2053	1	72.64
AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGTGCCTATTATGAGT:1	-	chr3L	11321384	3'	+	mdg3	214	2	55.88
GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCATTAAGTCAGGCCACCTATTTTTTTTATTTTCTTCTTGGACTTCTTCCAGCAGCTTTTACCTCGTCCAAGTGAAATGAGTGATCTTCGTG:1	-	chrX	10253137	3'	-	hopper	10	2	73.97
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAGGAAAACTGTTTGCCT:1	-	chr3L	6978097	3'	-	pogo	20	1	69.86
CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGC:1	-	chrX	6279348	3'	+	P-element	2823	1	41.78
ATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGCAATTGGAAATCGAGAGCGAAAGCTAAGAAATGCAAAC:1	+	chr3L	19521489	3'	-	I-element	479	1	73.61
TCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTATACTCGTGCATCAATGACAACAAGAGCTATTTTGATTATTGCTTTATTTCGAATTTT:1	+	chr2L	575534	3'	-	FB	408	1	58.57
ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCAGGAAAAGTCCCCAAAAATAAGAAAAACAACAGAGGGAAAATG:1	+	chr2R	16373546	3'	-	Max-element	17	2	55.42
TACTCAGCTAGTGTGAATGCTAACGCGAAATTTGATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATCGCCAGAGTCAACATTTGCAGAAACACACGCGCAGGGTATCTCCTTCTCGTTTCCAAGGGAGCCGTCAT:1	-	chr2R	1891947	3'	-	INE-1	532	1	53.49
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTT:1	+	chr3R	7100892	3'	+	roo	339	2	64.58
GTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGAT:1	+	chr2R	7586217	3'	+	I-element	5303	1	54.11
CTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAGTAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCTCCGTAGAAATTCATTTGGATGGGGGGAGTAGAGTAAGTGAAGCGAAACCGCAGAGGT:1	-	chr3R	8212855	3'	+	Ivk	5233	1	60.96
TCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCATTTTCATAAGGTGCATACCTAAACGACTTTTTATTCAAATTTGTTCCAGAAATTTAAAAC:1	+	chrY	1434552	3'	+	gypsy	7415	2	35.86
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTA:1	-	chr3R	16076777	3'	-	roo	8713	2	58.52
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGCTTGTCTTTTGTAAATTGTTTAATTTTCTGCGATTTTTTTGTGTAATTTACGTAAAT:1	-	chr2R	18349307	3'	-	roo	8727	2	63.70
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTTTATTATAATAATTGTGAGGGACAGCTTATGTTTAATCCACGCCAATATCAATACCTC:1	+	chr2L	13763254	3'	+	pogo	2042	1	63.01
CCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGATTATATTGTATATAATCAGTACTTTCTAACTGGTTCTTTTCTCATCCTCGGGCTGTGATGCTTACAT:1	-	chr3L	5103379	3'	-	BS	4673	1	37.62
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAAAGGCAGCAACACTC:1	+	chr3L	12879822	3'	+	roo	350	2	59.70
ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCGAATTAACTACAGCATTTCTATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAG:1	-	chr3R	9210627	3'	+	mdg1	7394	2	62.33
ACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGT:1	+	chr2R	5173199	3'	+	Stalker4	7283	4	73.29
GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCA:1	-	chrX	13504150	3'	-	412	33	2	53.85
TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGC:1	+	chr3L	26011938	3'	-	F-element	72	1	73.95
ATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAATTCTTCTGTTGCCATGTGTATGTTTGCTGGCAGGTAGCCC:1	+	chr3L	13675086	3'	-	Stalker	64	4	71.01
ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTC:1	-	chr2R	9791587	3'	-	412	7111	2	64.93
TCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATA:1	-	chr3L	27356087	3'	+	Tc3	1641	1	68.89
CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCG:1	-	chr2L	21153483	3'	-	1360	66	1	62.33
AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTAT:1	-	chr3R	6290944	3'	-	Doc	52	1	52.74
AAACTTAACTTTGTATTTTTGAATGAAAATGTTTTCGTTTCACTATTATTTCACTGTTAGTGACTTGGGGGGTCACCAAGTGGGAAATAAGAGCGCTTATTGAAATATTTAACGGCCATCAAAAGGATCGAACGACATGACAATGC:1	-	chr3R	13459768	3'	-	X-element	174	1	52.05
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAG:1	-	chr2R	19004152	3'	+	roo	9031	1	61.90
TTTCCTTTTTTAATTTTTTCTTATGCGCCAGTACGGAGACAATTGCACTTGATTAAGT:1	+	chr3L	16152187	3'	-	Doc2-element	226	1	89.66
CATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAA:1	-	chr3L	17557995	3'	+	jockey	4968	1	54.84
CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGAATTGGAATTCTAATTAACTACACACCAGACTGTTGGCGACATTCGTCCATTGT:1	+	chr2L	21891784	3'	+	mdg1	7427	2	69.41
CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTAAATTTGGTCAATCGACCCGTGGCGCAGGTGCCTTCTTGCTCTTCTTCG:1	+	chr2R	6094987	3'	+	roo	9030	1	67.89
CCGGCATGCTCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGAACAAGAGTGTCACAGCTACAATATTTACTATATTAACTGATGAGGTATTTCAAGGTGGAATATTGACAAACTTAAATGTGATAGCCTACCGTT:1	+	chr2R	23600029	3'	-	Circe	7372	1	49.28
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTT:1	+	chr3R	17243236	3'	+	hopper	1382	1	59.29
GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTG:1	+	chr3L	27415331	3'	-	transib2	45	1	54.79
CATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGG:1	-	chr3R	13457894	3'	-	X-element	64	1	52.86
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTT:1	-	chr2R	13696416	3'	+	roo	8986	2	76.03
ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGC:1	-	chr3L	10013588	3'	-	hopper	43	1	60.71
CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATNTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGG:1	+	chr2L	7810101	3'	+	P-element	2816	1	26.40
AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGCGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTAGATATTGCACAGCCATGGCC:1	-	chr2R	17626864	3'	-	opus	7179	4	80.36
AGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATGCTGCGCAATGAATAATTATGCAAATGGAGCGG:1	+	chr2R	12839572	3'	-	accord	184	2	71.72
AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTATATAGCACCTATATAAG:1	+	chr2R	16945336	3'	+	jockey	4918	1	75.40
AAGTATTTTAATAACTTTTAAAAATGTGCAAATATTATTTTAATTCAGTGCATTAAGATTGAGTACAAGCAGCGACTAAGAACCGATTATTTCTTTATACTAATTGAAACGAATTGGACTTGCATTTAAAGCTTAAAAATACTTTC:1	+	chr2R	20435110	3'	-	Transib-N1_DM	288	1	62.33
AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTTCCTAGCAAAATAAATATTCAGAAATTTCCCTCCAGGCACATTTTTATTTAATCTTTATTATTTATTCTCACTTCCAAAACAGAAGATACAGTACAACTTTTTCTG:1	+	chr3L	2325860	3'	+	I-element	5343	1	38.36
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCA:1	+	chr2R	18336225	3'	+	roo	332	2	73.57
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCCAAAGCAACGAAATCGGCGGAATAACACTAAAAATAT:1	-	chr3R	22122678	3'	+	roo	357	2	52.05
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACACATCCGATCCTTGTGGG:1	-	chr3R	17817871	3'	+	roo	9041	1	61.24
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTACATGAATATTT:1	-	chr2L	18294182	3'	+	roo	9021	2	55.17
TTGTAAATTTGACAAAACATGCCCTTCAAGTTCTTGGACTTGTTGGTGTTACGTGCTGCCTGGCTTCTAAATATATCCTATTTCCTATATCCTATATCCCTATATTTGTAGCTTCTAGATATATCCTTG:1	+	chr3R	3745498	3'	+	1360	203	1	68.99
GTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCAACAATGACATAAAAACATATTATTTTGAC:1	+	chr2L	8665385	3'	-	Doc	4496	1	79.45
ATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATGTATGTAGGTGAATTTTATGGTTAGAGGCAAGCGCAAGTGAACGGATTAGATTAATTTTCATAAGAATGCAT:1	-	chr3L	17558851	3'	+	jockey	4956	1	46.58
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCT:1	+	chr3R	18582249	3'	-	roo	59	2	60.96
ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCACTAAGCCTGACTTAGTGATCCCGTATTATCACAGCGCAAGCGTAG:1	-	chr3L	23797908	3'	-	Doc	65	1	63.57
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGGGATATATTGCTTA:1	-	chr2L	18419138	3'	+	412	446	2	52.71
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCC:1	-	chrX	5274312	3'	-	roo	84	2	74.66
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCC:1	-	chr3R	22844200	3'	-	roo	8742	2	71.92
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCC:1	+	chr2L	6059337	3'	+	roo	387	2	67.44
GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAACAGTGCCGTGTA:1	-	chr3L	10056120	3'	+	transib2	2759	1	70.77
AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCG:1	+	chr2R	7586215	3'	+	I-element	5309	1	52.90
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAA:1	+	chr3R	18582241	3'	-	roo	8730	2	64.83
TGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGGGTATTA:1	-	chr2L	12290670	3'	-	1731	67	2	60.96
ACACTTTGAGCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGCAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAAT:1	-	chr2L	2122408	3'	+	Stalker4	327	4	66.44
AAAGTCGATTCCAAAAAGGGACATGGAAAAATACCGTTGTATTACCTAGTTTCCCACGTTTCATAATCTTTATAGTTATGCACGTAGTTAAAACATATTTTTTACTTTCTTAAAGCAATAATTATTTATTATTCCAGCCAAGAACT:1	+	chr3R	18638179	3'	-	HB	68	1	56.85
AGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGG:1	+	chr2R	9463492	3'	-	rover	6991	2	61.67
AGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCG:1	+	chr3L	20168429	3'	-	mdg3	84	2	73.10
GTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTATTGTTGTACGTCTCTAATAAAATCGTTTACTATTCCTCTTTTTGAAAGTTGTTACAAATCATTAGGTTTAAACATAGGTTAATGAATGGAAAGGGTTATTATTGGTGAAATATACTT:1	-	chr3R	8941319	3'	-	Bica	404	1	52.05
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGC:1	+	chr3R	17817972	3'	-	roo	73	2	69.66
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATA:1	+	chr3R	16076873	3'	+	roo	340	2	65.07
GCATGCTAGGAAGACTGACCACACACAGTTTTGGCAGACCTAGCATCTTTAGTAGATTTCCATACTTTCGCGATCTACAAAATAAATAAATAAATA:1	+	chr3L	4501766	3'	+	R2-element	3511	1	89.58
AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAG:1	+	chr2L	12483784	3'	-	P-element	97	1	15.71
ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTACGAGAAAGAAGTACACCATTTAATGACCTCG:1	+	chr3R	13349175	3'	-	BS	5005	1	74.29
GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGGATGCTATAATTCACACGTATCACAAACAA:1	-	chr2L	15832966	3'	+	hobo	2931	1	69.75
AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAAATTTTCGTAATCTATGAAAA:1	-	chr2R	9258375	3'	-	3S18	29	2	63.01
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTCTCCGTATTTTCTAGCATTTGTCTAT:1	-	chr3R	27994149	3'	-	roo	6	2	76.23
GGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGAAGCGATTCTCATGTCACCTAAGTGTATTGTTTTAATATACCCTGTAAAATAAGCAGGCTGATGCGCGTGTACTCCTGA:1	+	chr3R	14098942	3'	+	roo	8924	2	60.27
TACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCTGATGACTGCCTTCTGTCAGCTATACTTAAAGAA:1	+	chr2R	15084979	3'	-	hobo	87	1	76.71
CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATGGATCGCGGCCAAATCGGCGGCGAGACGCAAAAAGCAGCACAGAG:1	-	chr3R	30667440	3'	-	copia	4931	2	67.44
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAA:1	+	chr3R	16076858	3'	+	roo	8989	2	75.34
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGTTCCAAAAAAATCATTTACTAATGTGCATCATTTTTTTTT:1	+	chr3L	6978255	3'	+	pogo	2060	1	53.96
TTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTATTGGCGATGAGTGCCACCTCTGCAAGTGGAGAAAAAAATCAGAACGGGGTAAAGTTAGGGACCTTGCCTTGGTTTATCGTTAAACAAA:1	-	chr3R	18586210	3'	+	P-element	2490	1	58.90
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTCT:1	-	chr3R	27994173	3'	-	roo	8677	2	65.71
GCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCA:1	+	chr2L	21008607	3'	+	invader3	202	2	73.68
TTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTAGGAGCGTGGTGTGGGTGTTATTAGCTGGTGCTGCTGTTGCTGACTCTCCTCTGCCTTCCCAAATTCGACGTCTTCCCTTCTTCACGAATATT:1	-	chr2L	7810225	3'	-	P-element	2688	1	66.67
GTAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAGAAAAGCTGAAATATTATATTTTG:1	+	chr2R	20944469	3'	-	pogo	33	1	57.53
CAATCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTACGGATACGGACAGATACGTACAGACGGACATGGCTAG:1	-	chr3R	8005046	3'	-	INE-1	159	1	94.29
AGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCT:1	-	chr3R	9714376	3'	-	Stalker	57	4	55.48
AAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATG:1	-	chrX	4214945	3'	+	flea	4947	1	65.75
ACATAAGGTGGTCCCGTCGACCGAACCGCACGCT:1	-	chr2R	21101945	3'	+	P-element	13	2	64.71
CAATATTATTTTATTTAATTGAAGGAATGTTTAACACAGGGTATCAAAGTATAAGCAAATATTTAAACAAAGATCAAAAGATCTTTTTTGAAAAAAACCCTGCGATTGTTGTTTTTTTGTCTGGTTAGGTTCTTATCGTTATGTTA:1	-	chr2R	13048999	3'	-	jockey2	3380	1	85.62
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCAGGCAATCAACTGTGTAAT:1	-	chr2L	17420097	3'	+	roo	400	1	77.40
ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGCACGCTTCAGGTG:1	+	chr2L	12328741	3'	-	hopper	41	1	49.26
TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCAC:1	-	chr2L	13585820	3'	-	Tabor	6874	2	57.36
GTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAACGATCTGCGACATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAAATTATTGCCCCGTTAAATGCTTGAATATATAATGACTG:1	+	chrX	22383359	3'	-	invader1	3650	2	51.56
ATTAGTTTCTTACAAAAATTCAACGAGGAAAGACTTCTTATTTGGGTTTTTACAAGCCATTTGTAATTTTTTTTAATTAAATTAG:1	+	chr2R	25118745	3'	+	roo	9039	1	64.71
CACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCTTCTTTAG:1	-	chr3R	13457866	3'	-	X-element	35	1	61.15
CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGT:1	-	chrX	13504180	3'	-	412	7144	2	79.31
GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTT:1	+	chr3R	15072675	3'	+	pogo	2065	1	57.14
GGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACGGGGTACGGGGATGGGGCCATGGCGACACACTTACAGATGAGCTCACATGAGGATTCCATCTTTCCC:1	-	chr3R	29341399	3'	+	mdg1	7365	2	52.14
TGGCCTGACGGCTGCATCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAG:1	+	chr2R	20497020	3'	+	blood	7339	1	52.74
GCTAAGTTATTTTCATATGTTCTTAGTCTGTCAATATATTTTTTACTATGCATAATCACACCTAATATGTGCGGTTCTTGTGGTCTTTACCGGTATATCTCTGGCCACATTTAGCAACGTTTTAAAACACGTCTGTGCAACATAGC:1	-	chr2L	21935333	3'	-	G4	3628	1	70.55
ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTA:1	+	chr3R	20427458	3'	-	jockey	84	1	70.55
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGACTTCTTATCTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTA:1	-	chr3L	20831313	3'	+	roo	9036	1	71.76
AATAAAAGCAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTNTTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGATCCCACAACTTACAATCAAA:1	-	chr3R	17605621	3'	+	Tabor	7300	2	60.00
GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGTTGGTACCAATACAATGG:1	-	chr3L	22400230	3'	-	1360	4	2	78.99
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTTCTTT:1	-	chr3L	11393449	3'	-	roo	33	2	62.33
GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTTTT:1	-	chr2R	16945299	3'	-	jockey	85	1	69.86
GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAAAGCTGAAGAAGAGGAAGAAAAGCACTCAAAGTGTGCTGAAAATATTTG:1	+	chrX	17833126	3'	-	Tirant	8117	2	76.06
TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGAACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTGGCCCCCAGTGACC:1	-	chr3R	26686016	3'	+	Juan	4174	1	53.77
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGA:1	-	chr2R	20596471	3'	+	roo	8996	2	69.86
ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATAAGTAAATAAGTTTGTGAAAATAATATTGTAAATATTTACGAATGAATTTGGGTAAGGTAATATATAAACTCA:1	+	chr3R	5061951	3'	+	mdg3	5452	2	52.74
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTAGCTGTGCCAAAAACAAACTT:1	-	chr3L	19334250	3'	+	roo	340	2	66.44
TCTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCTTCTTTGTTGTGGTTCCATGGCGAAGGTAGTGAGGTTCAGGTTAGGAGGCCGATCCCTAACGCTGATCCTT:1	+	chr3R	6663328	3'	-	I-element	498	1	51.75
CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTG:1	-	chr2R	9662707	3'	+	412	7526	2	57.58
CCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTGCATTCGGGCATAGCGGCAACATACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCAAACTTTGCATTGA:1	+	chr3L	2486011	3'	-	jockey	4552	1	40.41
CTTGCAGAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:1	+	chr3L	23678155	3'	-	Osvaldo	35	1	74.58
AGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTC:1	+	chr3L	23678151	3'	-	Osvaldo	25	1	75.00
GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTCGATAGGCAGGTACAGGCCC:1	+	chr2R	19499382	3'	-	P-element	52	1	33.62
GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGC:1	-	chr3R	13360285	3'	-	jockey	9	1	76.77
TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTT:1	+	chrX	14749716	3'	+	copia	244	1	54.79
AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACACCAA:1	-	chr3L	7292472	3'	-	HMS-Beagle2	6901	2	59.78
AAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACT:1	+	chr2L	23372627	3'	+	Gypsy6A_LTR	278	1	53.42
CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAA:1	+	chr3R	27424942	3'	-	blood	27	2	62.00
CCGTCAGTTGACTAATGACAACGCTAAAATTATCAGAGAAATAGTTATCACGTCATTATTCTATTCATCTTAGCTTAAGACATTGTGTGGGATTCGCCACTCTGTATTTCTTGCTGTGCTTATTATGTGAATATGTCACTTATTCC:1	-	chr2R	5226150	3'	-	297	6935	2	77.40
AAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTT:1	-	chr2R	5173443	3'	+	gypsy	424	2	59.62
TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAA:1	+	chr3R	27424942	3'	-	blood	7073	2	50.37
ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTAAAACTGGATTTTTAGTCGATCGGCAGAGAGCGTGATGCATTCATAAACTAAT:1	+	chr3L	16868314	3'	-	FB	57	1	61.19
CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGT:1	+	chr2R	2427623	3'	-	Doc	59	1	58.90
AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTGCGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTGGATGC:1	+	chrX	14749725	3'	+	copia	253	1	59.59
TGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGTGTTTACGGCTCATTTAAATTGACAAATGCTGTGTGGGCTGCT:1	-	chr3R	9123343	3'	+	Doc	4381	1	70.55
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACC:1	+	chr3L	20654580	3'	+	roo	9018	2	54.79
GTATAACGAAAAGCTGACCACCCATTTTTGACAAAAACTACTTACAATCTACGTCCATAGCCTTACATGAATCACCACGTATGTGCTTGTGTTTGTCAAAGGAAACCCCTC:1	+	chr2L	14137190	3'	+	Doc	4471	1	39.64
TTTTATAGTTCCTGAGATCTAGACGTTCATAGGGACAGATGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGA:1	+	chr2R	5198430	3'	-	INE-1	147	1	77.40
ATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	375	1	56.25
GATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGATTATATTGTAGATAATCAGTACTTTCTAACTGGTTCTTAGCTGTGGCATCCTTGGCGTCTT:1	+	chr3L	5102514	3'	-	BS	4668	1	54.44
TAACAGCTGTTATTATAACAGTGCATTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACATTTCATTTTTGCCCGACGAAGCCAAGTGTCATTAGCGT:1	-	chr3R	10557130	3'	+	hopper	1275	1	66.98
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACT:1	-	chr3R	25448341	3'	+	roo	9037	1	52.17
TCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGTTCGTATTCGTTTTGGTTTTCACATTTGTGCCAAGCAAGCTCA:1	+	chr2L	11661075	3'	-	F-element	15	1	69.18
ATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAANGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATC:1	-	chrX	21087585	3'	-	mdg3	35	2	58.33
AACGGGTATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTTTGATTTGTCTTTTTTTTCGTGAGAGTGCCATCTCTGTCGCTCTATCGTTCAGTCTCGATCTGAGTCCCCAAA:1	-	chrX	5256478	3'	+	INE-1	553	1	67.31
ATTTATAACGTTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTGTAAAAACGTAATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGTTTGGGGAGTTGGAGTTTTGTTAATTGTTAACGATTTTATTTGTTTTTCTG:1	+	chr3R	13222966	3'	+	Tc1-2	1414	1	67.12
TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCA:1	-	chr3R	17605623	3'	+	Tabor	7272	2	50.68
GGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCTTCTCAAACGGCCTTTGGAGTCACATTGCT:1	-	chrX	21976895	3'	+	springer	7155	2	74.58
CTATGAATAAATAGATATTAATAAAAAAAATTCATGAATTCATGAATAAGAGGTCTTTATATTTTTGCATTGAAAGTCAAAAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACATTTTCTTGGCAAAATGTATGTATCTAATTATTTAATA:1	+	chr3R	18917828	3'	+	S2	1613	1	80.82
GCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAACCAATTGAGAAGATCAACATAGATTCAATATGTTGGATTCAACAAAAAAAAATCTCTAGTATACTCAGTATGCGCAGCTACAAAATCGACCACATCTGAATGCGAAAT:1	-	chr3L	23979644	3'	+	F-element	474	1	64.38
GCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCTTTATTTTAGTATTTTTATCCTTGCGCACAATT:1	-	chr3R	12153378	3'	+	R2-element	3421	1	72.73
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGCTTTAT:1	+	chr3R	14979914	3'	-	pogo	20	1	68.70
GCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCAC:1	+	chr2R	11164492	3'	+	roo	300	2	50.00
GCTGACACAGCGTTTGGACGGAAGCTCTAACGTAGAACTCTGTGCTGATGGCCTAACTGCAGTCCGTTCACACANACGCACTAATAATATGTGTTGGCCGGCCAACTGAAACTGGCTCACACTCACACAC:1	-	chr3R	11055710	3'	+	gypsy6	7484	2	66.92
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGGAATTTAATCCATGATGATTGGATGCAATATGTAA:1	+	chr2R	20596533	3'	-	roo	8748	2	79.45
GACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAG:1	-	chr3L	7292487	3'	-	HMS-Beagle2	6970	2	80.14
TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTT:1	-	chrX	4214924	3'	+	flea	4985	2	60.47
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCTTAGCGT:1	-	chrX	13039464	3'	+	roo	9021	2	57.89
ACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAAA:2	-	chr2R	9258394	3'	-	3S18	5813	2	51.37
CGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1	-	chr2R	981624	3'	-	1360	44	1	61.54
CGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTATTGTGTCATCTATTTTTCTTGTGGCTGCCAACATTCCAACGTAGATTTAATAGCATATTTTCTACCGTCTCTTCCCTATCCTTT:1	+	chr3R	17194818	3'	+	roo	50	2	55.17
CATTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTTTTAAACCTGAGTTCAGATTCGGAAATTTTTTATGTAGATTTACAATTGAAAAATTGTATTTTGAACTTACAGATTCCGTTTTGATAGAAAAGCCTTATTTTTATAAAGATAGG:1	+	chr2R	14738122	3'	+	transib2	2470	1	50.68
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCT:1	+	chr2L	17420258	3'	-	roo	8707	2	52.99
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATG:1	-	chr2R	7898098	3'	-	roo	75	2	79.39
CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGGCCATCTAAATTAAAACGTTTTTCATCAGTTAAGACAAATGAATGCCAATAATTTAGACGAGTGTCAGAT:1	+	chr2R	6487960	3'	+	copia	5073	2	52.05
GACTGCTCGATCTTTATGTCCACATGACTCTCTTAGACAGCGGCGCTCTCGCTGCCAAAGTTAAGTACATAAGAGCAAAGCAACGTCTCTGCCGACGGCCTCTCTTTCGTTATTCTTTGTAAGCTTAATATATT:1	+	chrX	6698927	3'	+	Tabor	193	2	78.36
CAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTT:1	-	chr3R	17243096	3'	-	hopper	46	1	54.11
TTTTATTATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAAAGTAATTACTTTTAATTGTTACAACGAGTTGCATTTACGTTGAAGTGATTGCGGTGTTTGTGGAAAAATATCGGCCAACGCAGAATT:1	+	chr3L	26002563	3'	+	Tc3	284	1	67.41
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTAGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGATTTCATAGCCTACTTAGCGGCGCGCGCTGCG:1	+	chrX	13066602	3'	-	jockey	27	1	60.00
TAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTG:1	-	chr3L	19013951	3'	+	invader3	5424	2	78.57
CACACATCATTGCTATTGTGTGTAAACAGTTTGGTTACCGGTGCAAATACAGTGCTTGTAAAACTGTTTACCGGATCCTTCGTTTGACTTGGCTCACGATTCCCTGGAGGAACTGGATCTCAGTCAAATTGGA:1	-	chr3L	25412355	3'	+	G3	55	1	43.61
AACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACACTCGCTGGTTTCGC:1	-	chr3R	9038873	3'	-	Juan	4016	1	78.08
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAGGTGAAAACGGTGGAGTGGGCGTGGCAGGTCGGTGGCACTTTCACA:1	+	chr3R	14940205	3'	-	jockey	27	1	65.35
ATATATCTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGCAGTAGTCTATGCTAAAGTAGGACGTCATGTTAATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAG:1	+	chr3R	19446218	3'	+	roo	20	2	52.05
AGGGGGTGGGGGGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAAAGCTGAAGAAGAGGAAGAAAAGCACTCAACGGGTGCTGAAAATATTTGCACG:1	+	chrX	17833130	3'	-	Tirant	8107	1	79.41
GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTATAGTATAGGGTTCGG:1	-	chr3L	10056075	3'	+	transib2	2788	1	58.22
GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATAATTATGGTAAGAAAATTAAAACCGAAAGTCTGTTTGTCCCATTG:1	-	chr3R	31720500	3'	-	pogo	73	1	73.29
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTCGGCCTT:1	-	chr3R	10546079	3'	+	hopper	1382	1	52.03
ATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTTCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTAT:1	+	chrX	22643318	3'	-	Tc1	1629	1	58.62
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGCTGTTCAAATA:1	+	chr2L	14772148	3'	-	roo	43	2	53.47
AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCG:1	+	chr3R	14979908	3'	-	pogo	10	1	73.04
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGTTTA:3	-	chr3R	22821975	3'	+	mdg1	7422	2	44.52
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATGTTTTACAATGGATTACAAGCATTGTCAAAATATATACATCATCAC:1	+	chr2L	17420296	3'	-	roo	6	2	74.48
AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAG:1	+	chr3L	20654550	3'	+	roo	8988	2	75.34
TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGCTAAC:1	+	chr2R	2427611	3'	-	Doc	36	1	56.76
TCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGT:1	-	chr3R	11083910	3'	+	412	407	2	78.01
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGA:1	-	chr3L	20654463	3'	-	roo	8706	2	53.68
CTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTAAACAAGTTAAGAATAAATTCTATACAAAACAAAACTTCCTAACAAAAACCATACAACAACAAATCT:1	+	chr2L	22975181	3'	-	Stalker	7153	4	56.49
AGGTGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCAAAGAAACGTTTAGGAAATTCAAACCTTATGGAAATAGAAATGAATGGCACACGCATCTCAAAACGAAACAAACGACGACTGCTTAACTTTGTAGGTTTCACATTAAAATCGAAGAC:1	+	chr2L	22673987	3'	+	Tc1-2	1220	1	62.50
TACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATTCCCCAGCAATTTGGCAC:1	+	chr3L	10574424	3'	-	Tabor	6851	2	67.83
AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATGTCGAATAGGTCGTTTAACCAGAAATTAATCAA:1	+	chrX	11296524	3'	-	BS	5008	1	74.66
TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAA:1	+	chr2R	5485206	3'	-	blood	7074	2	61.54
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGT:1	+	chr2R	13084676	3'	+	roo	339	2	67.59
CAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGCAGCTTTTAAAAGACG:1	+	chr2R	5531233	3'	-	1360	73	1	67.12
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGA:2	+	chr3L	11531023	3'	+	roo	9055	2	73.29
TAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCT:1	-	chr2L	6569971	3'	+	jockey	4944	1	74.76
CTATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCAAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAG:1	+	chr3L	17560364	3'	-	pogo	69	1	68.61
CCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGAGCAAGCACTACCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCTCTACTGCCACCTCCCATTTATTTGGTCACGTATC:1	-	chr3R	5805738	3'	-	R1A1-element	5164	1	75.00
AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCATAAAAGTTAATGAT:1	-	chr3R	9921953	3'	-	blood	39	2	58.90
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCACGTGGATCAAAGTATAGAAACTTAACCCCCTGATGGTGAAAACAGTC:2	-	chrX	8543451	3'	-	roo	8737	2	68.49
AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:2	-	chr3R	29487012	3'	+	flea	4982	2	66.44
ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCACAAATTTATTTTCTC:1	-	chrX	17054201	3'	-	jockey	74	1	60.69
CATATTACTTACTTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGATAGATACACTACAATATTGTAGTACTTCTGTCTTCTTTAACTATTTCCTTCCTAAATCTACTTGAGTCGGCCTTTGAAGCTTTATCAGATTTTTCCGCTTTA:1	+	chr3L	6735650	3'	-	Stalker3T	36	1	74.66
CACAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGGTG:1	-	chr2L	2909674	3'	+	hopper	1328	1	74.66
AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGACGTTTCCCTGCACCTGCTGCCGCCT:1	-	chrX	5274262	3'	-	roo	8669	2	77.78
AAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTGAGGGACAGCGAGTAGAGGAAGTGTTTCCTGGACCATTGCTCTTA:1	-	chr3R	31924936	3'	-	jockey	4769	1	55.00
GACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAAC:2	+	chrY	3648876	3'	-	Transpac	4996	2	71.03
AAATATTTTATTCATATTACATTTTATTTATGATATTAAAATAATGTTACATGCAGTTTGAAGTACGTTGTAATAAACGGTTAATGTTTAGTTAACCTATAATTCTCAAAATTAACTTTCATGCGTCCGTTTATAATATTACTATA:2	-	chr2L	8888017	3'	-	transib1	1924	1	78.77
GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAACGATATTT:1	-	chr3R	26659724	3'	-	HMS-Beagle2	6906	2	61.76
CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAGTAATTTTATTTATTTAAGTGTGGAATATATTAAATA:1	+	chr3L	13845213	3'	+	opus	457	2	74.77
GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGATTTTT:1	-	chrX	17756556	3'	-	297	40	2	54.48
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCG:1	-	chrX	10640022	3'	+	roo	9002	2	63.70
CAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAATAGGAGAGGCGAGAATTATTGCCACTCTAATCGTTCTCTCCCGC:1	+	chr2L	22761585	3'	-	mdg1	7310	2	69.86
TAATTCACGGTCTCTCCGCTTTGCCCTGCACCGCGGCTGTTGCCACGCCACTCCCCTACGAATATCGTATCGTAAATATACATAACCACAAATACTGCAGGTAATTTGTTGTTCTCAGCTGAGCCACAGCGCTGCTCCAGCTATAT:1	+	chr2L	22645527	3'	-	gypsy8	4721	2	56.16
GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACCATCTAATTGCACAACGCGCGAGTGCGAGC:1	-	chr3R	30344582	3'	+	pogo	2077	1	66.43
ACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACACACA:1	-	chr3L	28063321	3'	+	Stalker4	7073	4	75.17
AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGAGAAAAGCAGAATAATGACAAATGTATAT:1	-	chr3L	7292490	3'	-	HMS-Beagle2	58	2	75.44
GAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATG:1	+	chr3R	934284	3'	+	Rt1b	4733	1	56.16
AACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAAC:1	-	chr2R	20596451	3'	+	roo	392	2	64.15
CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCAA:1	+	chr3L	25401042	3'	-	Doc	27	1	58.22
AGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTATCAAAAAGGAAATCAAGACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATC:1	+	chr3R	19446868	3'	+	roo	8943	2	68.97
TTTGGTTTGTGTTTATTTTTTGGTATGTTCATATTTAAAATGAAATGACTTATGTAATAGCAAATTCGTTTATTTAATTAACTTTAAACCAGTGTGTTTAACTATTTTTCCGAGTGTAACGAGTGGTCTTCCTGCCTGGGACACTT:1	+	chr2L	6832813	3'	-	transib4	2538	1	62.33
TGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTT:1	-	chr3R	10462619	3'	+	opus	427	2	71.92
GTCTCTCCTTCTTGGAACACCTACCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAGTAAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATTGAGGAGGAGCGCTTTCCATCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCATATGCACATCGATATAAGGAAAAGCC:1	+	chr4	1085944	3'	+	baggins	5012	1	41.78
AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATC:1	-	chr2R	5248245	3'	-	1360	39	1	55.96
TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTAAAA:1	-	chrX	10644406	3'	-	jockey	4794	1	60.56
GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAAC:1	-	chr3L	10574298	3'	+	Tabor	409	2	67.12
GAGATATCGACGTTCATACGGAAAGACAGCCAGATTTGGATTTGGCTAGATCGATGCGGCTTTTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATTCCTACCATGTCTTAAGCTTAACCTCCTCCACATAAATTC:1	+	chr2L	15896984	3'	-	INE-1	134	1	64.44
GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTTTATTATAATAATTGTGAGGGACAGCTTATGTTTAATCCACGCCAATATCAATACCTCGACTAACAGATACCCTTGACTC:1	+	chr2L	13763276	3'	+	pogo	2077	1	66.17
TGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTGTCTTGCAGCAACTGCATGTTTTTGGCGGGGAGAGAAAGAGAGAAGATTTCGATTCACCAGGTTAGTAACCGTAATATGAATGATAATCATGAGAGGCAAATTCATGCTACACCTCGTGCTCA:1	+	chr2L	13921864	3'	-	Quasimodo	36	2	64.38
CCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTT:1	-	chr3R	14049315	3'	-	transib2	8	1	73.39
GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTCACATTTATTAGAAGCCATAGCAATGAATTTATCAAACAAATCTAAAAAAATCTCTTTCTTGAACGGATGCAAATAAAACTAGTTT:1	-	chr3R	31109618	3'	-	I-element	33	1	60.96
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATCTTGTAATTAATATGATTAC:1	+	chr3R	16404566	3'	-	pogo	62	1	62.33
CAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGGGGAATGATGATAAGGTCCGAGTGGCTAAAGTAAAGATGCAGGAAGGATATATCACTAGACACATTACTAAAATTTGTCCCTTG:1	+	chr3R	19448082	3'	+	Quasimodo	6953	2	58.62
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAAAT:1	+	chr3R	16404581	3'	-	pogo	47	1	54.11
AATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATT:2	+	chr3L	23702258	3'	-	G4	60	1	55.48
GGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTACATAAGCTTCTGACGTTTTAATAGACAGAAACACC:1	-	chr2L	588374	3'	-	FB	85	1	75.34
AATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCTAAGCTTTTGGGCTGACATTTAATTAGTTCGC:1	+	chr3R	6142407	3'	+	F-element	4446	1	71.68
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCA:1	+	chr3R	29361071	3'	+	mdg1	7403	2	57.53
CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAAATTGTGGGTTCACACT:1	+	chr2L	7810160	3'	+	P-element	2870	1	70.77
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACAAAACAAGTAATT:1	-	chr3L	4605613	3'	+	pogo	2042	1	59.59
CTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACACTTGCTATACAGAAGTTTTTAAATATCTAATACATATTACATTGAATAAATTAACAAAAGCTATCCAAATAATCAGTTTTATTATGAAATTGGTT:1	-	chrX	20870068	3'	-	gypsy	7008	2	67.83
TGTGCACACATATGTTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTGTACTTTAAATCTATATTATTTTTGAGAAATAACGATAGGTAACTTGTAATTAATTTTTACTGGTCGAAATGTTCTGTTTTA:1	+	chr3L	23343234	3'	+	1360	181	1	63.70
AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTCGGCCT:1	-	chr3R	10546080	3'	+	hopper	1358	1	58.22
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTATGCTCGGTGATTCA:1	+	chr2L	3114592	3'	-	roo	44	2	56.94
TTTAAAGTAATATCTGAAAGAAGTAGAAGAATTGCGCTTGTAATGGTATGAAATGGAAAGGAATTTCCTGTAATAAATACCAAGAAGAATTGAGAAACATCATGACCCAAAGTATTTATAAGTTCTTCTTCTGGAATTTGGAATTT:1	+	chr3R	12819642	3'	+	Helena	483	1	72.60
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTAT:1	+	chr3R	25448439	3'	-	roo	47	2	56.72
ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAACGTATTCTCAATGGGATGTATCTCAATTGGTTCCGCAACGCACTTTGCTTTAAGGGCGGATTCTTATAAAT:1	-	chr2L	10197481	3'	-	FB	35	1	43.94
AATAATAAAAAATAATAAAAAATAAATTTAATGTTTGATATGCCTACCAATATTCACCTAAACTTCATTAAATAAATCTCCCCTAAACCGCAACTGTGAATTGCAGATAATCAATCAAAAATGTGGTTCCTTCAAATAAATATCCT:1	-	chr3L	15759213	3'	+	Rt1b	5149	6	41.10
AAGACAGCAACATAGATTTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGCGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACT:1	+	chr3L	2362397	3'	+	Stalker2	320	2	74.48
CTTAGCAGTGAATACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTTGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATCTATAAAGCGAAGCATTTGTTTTTAGCCGCTCG:1	+	chr3L	15643749	3'	-	R1A1-element	233	1	72.18
TATTCCACTTATTTTTGTTAAATTGAATGTGTAGATAGGAAAAAAAAAATCCCGTTAGTTTTTCATGCTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAGTAAAATCACATGCCTAACAGATTGGCACACAGAAGAACGCCTTCGACCCGG:1	+	chr2L	10436516	3'	+	HB	91	1	69.86
AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGTGTG:1	+	chr3R	15364058	3'	+	flea	235	2	72.60
ATATATNCTTGATCAGGATCAAAACGAGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGGTCGTAAGAACATCTCAGGAACTGTAAAATCTAGAAGGTTGATATTAAGCAAATACCCCGTTTAAGTATAAATACACTATCTTTTATTTTTGCC:1	-	chr2R	17797631	3'	+	INE-1	82	1	71.23
GAGTCAGCATTTAGGTTTTTAGAAATTCATATTTTCAAAATCAATCAATGCTTAATAATTAATAACAATATTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTACACCGAGTCATTGGCAACCCCTTTCTGCGGTCTTCC:1	+	chr3L	21715631	3'	-	gypsy12	9821	2	75.34
TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATGCAAACAAGAA:1	-	chr2L	17295803	3'	-	Doc	25	1	63.57
TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCAAAACATATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATTAATATTTAT:1	-	chrX	15947448	3'	-	Doc	50	1	49.66
TTCTTGATCAGGATCAATATCCCAGGAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCAAGCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTA:1	+	chrX	14979249	3'	+	INE-1	87	1	62.02
AGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTAT:1	-	chr3L	23456271	3'	+	Gypsy6A_LTR	272	1	65.12
TATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGAGGAATAAAAAAAGAGGAAGCATTCGAGTTGGCT:1	-	chr2L	12486504	3'	+	P-element	52	1	14.88
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTG:1	+	chrX	16717928	3'	-	roo	8720	2	66.15
GGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATG:1	+	chr3R	3320507	3'	-	1360	43	1	77.78
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAAC:1	-	chr3R	31817468	3'	-	roo	8752	2	78.77
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACG:1	+	chr3R	22844289	3'	+	roo	352	2	56.85
ACTCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGTCAAGGGCTG:1	-	chr3L	23933547	3'	+	Cr1a	219	1	66.67
AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTTACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATA:1	-	chr3L	16750688	3'	+	Tirant	391	2	66.67
TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAA:1	-	chrX	10644430	3'	-	jockey	4822	1	58.22
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATAT:1	-	chrX	5643465	3'	+	roo	389	2	63.16
GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATA:1	-	chr2L	20117882	3'	+	invader4	274	2	57.53
TGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTCAGTTTATTTT:1	-	chr3R	556378	3'	+	Juan	4152	1	60.69
CAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAATCTCCAAATCCCCAAGTACAGTCACTTGGCGTGTCCTTTTG:1	+	chrX	1022933	3'	-	1360	282	1	59.38
ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAAATCGATTACGGA:1	-	chr2R	24218486	3'	-	412	22	2	68.06
TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGC:1	+	chr3L	20168444	3'	-	mdg3	39	2	53.04
TACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAAAGGGTTCTTATTATAGTCGTTTTATTCTACAAACTTATGGATA:1	-	chr2R	5209559	3'	-	gypsy	9	2	76.74
TGTCTAAATACTTATGTCCACTAGTGTATGTATGCAGTAAAATAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAAATATCGGAGAAATAGTTTAGTCTTTATTCTTTTAATCTCAGCTTAAGACTAAAATCTTTCTTATACTGCCCTTATGTTT:1	+	chrX	22926192	3'	-	Tc1-2	5	1	70.55
TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATAT:1	+	chr3L	10574391	3'	-	Tabor	6877	2	47.06
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCACGTGGATCAAAGTATAGAAACTTAACCCCCTGATGGTGAAAACAGTCTGAAAACCG:1	-	chrX	8543442	3'	-	roo	8726	2	61.81
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGCTACAGAAACACATTCATAAAGCAAA:1	-	chr3R	15072536	3'	-	pogo	38	1	56.16
AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACCCATTCCATT:1	+	chr3L	10773161	3'	-	412	59	2	59.31
GAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGGAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATT:1	-	chrX	4792083	3'	-	gypsy6	7452	2	62.37
AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAAGTATGTGGTTGAAATTATTTCATTAAGTAATACATATGTAAATAATACTACCACATTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAG:1	-	chr2L	9399539	3'	-	Transpac	6	2	66.91
GACCAAAGCAAAGACACTTGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATCTTGAAATAAACAGTTATCATAATTTTATGAAATTTATGAAATTACAGTAGTTCGTTTTTGTTTGAGAACATCTTTTGTCACTAGTTCAATTTGTATACATAT:1	+	chrX	2781064	3'	+	1360	499	1	64.38
ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAACACAAACAACAATCGCTTCG:1	+	chr3L	10385932	3'	-	Burdock	60	2	60.27
GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTTGGTTCATTAATGGGACCTC:1	+	chr3L	20168480	3'	-	mdg3	5255	1	79.13
ATTTTGTGTATGGCTGCTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCA:1	+	chr3R	25454095	3'	-	Quasimodo	66	2	65.75
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTAT:1	-	chr2R	25118695	3'	-	roo	8744	2	73.97
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATTG:1	-	chr3L	12879736	3'	-	roo	66	2	64.38
ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACCCATTCCATTACCT:1	+	chr3L	10773165	3'	-	412	56	2	56.85
ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCCTTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTT:1	+	chr2R	5485218	3'	-	blood	38	2	52.31
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATC:1	+	chr2L	11485272	3'	+	roo	325	2	74.66
GTCCAAGAAGTCCCCGACGTCTAAGGGTCAGATTTGGCATTGTTGTTACTCTTATTGTTACTATTTGGTTCGACTGGGTCCCGCCCACCCCCGGATTCGACTCCCCTTGTCGGGGGTTGAGGAACTGGAAT:1	-	chr3R	7139212	3'	+	HB	1194	1	75.57
CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTCTATATATATATACCTAAAGCAAATGAACAGTCCTCTTCCCTCATTTGTTAGCTTTGCAAGCCCC:1	+	chrX	17756686	3'	+	297	6940	2	58.59
GTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGGATAAGGAGTCCTCCAGCACTTCATTGGCAGAAGGAGCCCCAGCAG:1	+	chr3L	13930326	3'	-	I-element	5084	1	68.06
GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCG:1	+	chr3L	16750757	3'	-	Tirant	8114	2	70.83
TTAATTTATATTTATTTATTTAATTTAATTGTTGCAGGTGTTAAAACCAAACTCTGACCTATAGATATCCTCGTAGGTATTCTGAACTTCTCGCATGTGAGAAGCATTATTGGCGG:1	-	chr3L	10273481	3'	+	S2	98	1	70.69
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGGAGCGGGACAGTTGGCGTTC:1	+	chr2L	7945416	3'	-	roo	8696	2	52.99
AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGA:1	-	chr3L	2362338	3'	-	Stalker2	51	2	61.54
GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAA:1	-	chrX	401307	3'	-	Tirant	8175	2	65.75
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTGTTGTAGATTTCTCGCAGTGTATAGAATC:1	+	chr2L	5254379	3'	-	roo	35	2	50.78
AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCG:1	-	chr3L	10056124	3'	+	transib2	2770	1	70.43
GTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGGG:1	-	chr2L	22975401	3'	-	1360	118	1	58.89
ACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCAAAAATAAATAATGGAAATATGATTAGCAACTAAACGATGTCATTCA:1	+	chr2L	14091631	3'	+	R1A1-element	5200	1	67.81
AGAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGA:1	-	chrX	21087588	3'	-	mdg3	5264	1	58.75
GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACTTACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTT:1	-	chr2R	13585390	3'	-	412	7098	2	53.42
ATTTGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTTTTCTCTTAATAAATCCTCCATAATCATCAGAATGAAATTAGGCTGAGATTCCAGGACAAGACCATCACCCCACCTAACCGACATGGAGCAGC:1	+	chr2L	23017209	3'	-	TLD2_LTR	51	1	52.05
AAATAAAAAAATAAAAAAAATAAACTTCTTTCAGGACTATTAGAAGACGGTATAATTAGACCATCCCGGTCTCCATATAACTCACTTATGTGGGTCGTACCAAAAAAAACTTACTCGCCATAGAGCAAAACGAATTTCTAAGTGAA:1	+	chr2L	22968372	3'	+	F-element	4687	7	74.66
AAATATTTGAAAATACTATTGAAGGTGCATAAACTACGATTATACGTTATAGCCATTTAAAAATGGCAGAAATCTTCGTTTTTCCAATTTATCTGAATTTATCTGAATCAACCAAAGTTCTTTTGATCCCATTAAAATAGATTAAT:1	+	chr2R	18831639	3'	+	Bari1	1499	1	75.34
ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATT:1	+	chr3R	9039051	3'	+	Juan	4187	1	65.75
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGATTTGGTGTCT:1	-	chr3L	20831264	3'	+	roo	360	2	54.11
TTGTTTTTTTTTTATTTCTTTTGGCTTTATATCTGCTAATTTATTTATTTTTGGGTACTACATGTGATTTCTCTGGTATTTTAGTGTTCGGCTTGAATTATATATTTTCTTTCGATGCGTTACGCAGGAATGGCGAACTTGTTGCT:1	-	chr2R	15399074	3'	-	gypsy7	5012	2	76.71
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATTCAATTCAAATATTCT:1	+	chr3L	10292909	3'	-	roo	54	2	55.48
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGTTCCAAAAAAATCATTTACTAATGTGCAT:1	+	chr3L	6978244	3'	+	pogo	2043	1	59.31
CCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGTCAACTTGCTCCCAACTAATTGCAGTTGCGTGTGCCTTTATAAGACAATAAAGATCTGAAAAACAAATA:1	-	chr2L	7450226	3'	+	Stalker4	405	1	44.52
AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATATGTATATATACATATATAAA:1	-	chrX	12388368	3'	+	pogo	2037	1	85.71
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCATTTTCATGTGCACTTT:1	+	chr2L	16092010	3'	-	roo	45	2	55.17
ATGGTCGAAAACGCTTCCTTCTCCCTGTTATATACATTAAAACGAATCTAGTATACCCTGTTACTCTACGAGTAACGGGTATAATACGAGATAAATTACCGTTATTACGGTACGAGATACAATTTCAAAATGATTTGA:1	+	chrX	151633	3'	-	INE-1	41	1	69.57
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGAGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCAT:1	+	chrX	14336497	3'	-	roo	43	2	61.74
TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAGAGAGCAGGTG:1	+	chr2L	16016447	3'	-	412	10	2	75.20
GATTGTAAATAAGAACAATTGTGTTTAACGGCTGTGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGACACAAGATTTGTACGAGTTCTCCAAGCAGGAGATCGGCGGACGGGC:1	-	chr2R	17419184	3'	-	gypsy	7282	2	64.55
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCTTAGCGTCTGGGAG:1	-	chrX	13039457	3'	+	roo	404	1	76.60
ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCGGAGCCCAGAACGAAACTCCTGCGTTTGATTCCAGACAGTTACAT:1	-	chr2L	21891667	3'	-	mdg1	12	2	74.48
TTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTGCATTCGGGCATAGCGGCAACATACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTTCATACTTTCAGGGTGACCACGATC:1	+	chr3L	2485997	3'	-	jockey	4535	1	37.39
AATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAATTAAATTTTAATTTGTATTAACCAACATATTG:1	-	chrX	1020606	3'	+	roo	8749	2	79.31
CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAAGATCATGAATGAGAAAGTCTCAGTGGTGGAGTAAGATATTTTTA:1	-	chr2R	3065927	3'	-	P-element	73	1	35.62
ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGCATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTA:1	+	chr2L	7810143	3'	+	P-element	2853	1	56.15
TGGTTTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAATAACGAATTCTGGACCATAGCGCACTGTAAGAGTATCTTTAATACCAGTAGTTCT:1	-	chr3R	14049362	3'	-	transib2	91	1	76.55
AGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGATATACAAACTATAAAAATAAAACAAATGGTCTAAACTTTTTCAATTTA:1	-	chr3R	22821170	3'	-	mdg1	7313	2	67.12
AATGTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAAGACATTTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCAAGACTAAAAACATTTCAAAAAGCAGTGTTGAAATGTTTTTTTTAAGATTCGCCAGGAATAATTAATAATTACCTAGTTTTGTA:1	-	chr3R	18707026	3'	+	Tc1-2	1413	1	51.37
AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCA:1	-	chr3L	22400274	3'	-	1360	49	1	60.83
GTAACAGGCAGAAGGAACCGTTTCCGACCTTATAATTCTTTTAATTCTTTAATTCTTTTAATTCTTTCGGAATAGTTAGAGCACCATCTTTATTCTGATTCGCAGCTTTCGGAGTTGACCTCCTTCAGACCTAATTATATTCGTTT:1	+	chr3R	3854500	3'	+	INE-1	32	1	61.64
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTCGCCTATAACGA:1	+	chr2L	6059345	3'	+	roo	9043	1	64.58
GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAACAAATTGCAATTA:1	-	chr2L	18419102	3'	+	412	7518	2	65.75
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCG:1	-	chr3L	16343228	3'	-	roo	8737	2	71.22
TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCATG:1	+	chr2R	9791685	3'	+	412	7502	2	52.59
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTTATCG:1	-	chr3L	4536655	3'	+	roo	9047	1	63.70
ATTCTTAGGGTAGATTAGTGCAATATGCTACACCGGAAATGATCATCCAGCTGCCACATTCTGCAGTTCGCTCAATACAATTTGCTCTGCTATACATACAAACAACAAACAACACATACCCGCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTA:1	-	chrY	2720393	3'	-	Stalker4	6967	4	56.16
TGGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCT:1	-	chrX	10644410	3'	-	jockey	4760	1	78.85
GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGC:1	+	chr2R	5485233	3'	-	blood	25	2	64.39
GATTTATAGTGTGTGTTTGTAAGTACTCGCGATGTGCGTGGCAGGTAGCACCCGCACATAAAATTTTTGGGTGTGAGTCGAGTGGAAAGCTCTCCCCAGAAAACAGCATTCGATGAAAATCGCATAACA:1	-	chrX	1119545	3'	-	hobo	93	1	65.89
TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATAACTTTTATCTTAGATATCTAAGTATATAAATATAATTCTTAGGATATGAAGTTCCATGTTAAAATCTCTTCAAAGTCTA:1	-	chr3R	9293159	3'	+	297	361	2	62.33
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCGTTAGGCAGTGGAAAGCAGTGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTGGC:1	-	chr2L	7945304	3'	+	roo	9034	1	53.73
TTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACCACCAAAGTCCAGGAGCAGATGGATGAGACCTCGAATGGCTATCAGCAATCGGAGACCACTTCTGGCTATGTTTCGC:1	-	chr2R	8973273	3'	+	F-element	4437	1	75.93
ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGACGGTTGGCTGTCCCGCAGTAATGTGCTTCTGAAGATCTCCTCC:1	-	chr2L	11518892	3'	+	412	7536	2	60.19
TTTTTATATATACATATATATTATATGATATACTAGCCTTTAGTTGTATTAACTATCTTTAGCTTTTAGTGGGTTCCGCCGCTCATCACTGTTGCAACATCGAACAAGCTCGTTC:1	+	chr2R	16732099	3'	-	Dm88	19	2	73.04
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTGGAAATAACTACACGCATCAG:1	+	chrX	6486801	3'	+	roo	9039	1	53.51
AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCA:1	-	chr3L	7588420	3'	+	hopper	1375	1	60.36
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTG:1	-	chr2R	19050200	3'	-	roo	8727	2	62.96
GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCG:1	-	chr3R	20499754	3'	-	mdg3	67	2	60.27
AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTGTCTTAGTTTACCGCTGACG:1	-	chr3R	25339955	3'	+	mdg1	406	2	65.79
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGGATT:1	-	chr3R	19968087	3'	+	roo	358	2	53.79
TTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAAAGGGGGGGAAAGATATAAAAAGTATATAAAAA:1	-	chrX	13042692	3'	+	roo	425	1	74.22
TTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATCTCCTTGGGCTCGTATTTGGC:1	-	chrX	11696509	3'	-	TLD2_LTR	96	1	54.11
CCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACGTACGAATGTGCCTGTGTGCGTATGCAAAGAATGGAGAGCCTGGATTTAT:1	-	chr3R	28946316	3'	+	hopper2	1541	1	60.96
ATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCACAAAGAACACTTTTGTCAGATTCGCTCTGTAGGATAAACCCTTGATCACAAAAGCTATTAACATGTTCCTAATTGAAATGCTATT:1	+	chr3L	4536854	3'	-	roo	8664	1	78.08
TCTGGAATGTACACTCGCTCAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCAGTCTGTTGGCGACATTCGTCCATTGTCCTGCTC:1	+	chr2L	21891791	3'	+	mdg1	7373	2	76.71
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTG:1	-	chr3L	22437848	3'	+	roo	9030	1	54.68
CCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTAAAAAAAAAAA:1	+	chrX	17787070	3'	+	transib2	2463	1	69.18
ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACTTTCTATGTACAGGGCTATTTT:1	-	chr2L	15991265	3'	-	mdg1	24	2	58.90
TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGACAGTTATATTTTTTGGTTAGCAGCCTCAAAGTGCAACTTTTCCAACTTTGAATATGCCAAAAACTTCACACCCCTACATCCGTGCGTGAAAAGGACGGCT:1	+	chr3R	11084021	3'	-	412	20	2	66.44
ATGTAACACGCAAAAGGAAGCGTTTCCGACTCCATAAAGTTGATATATTGTAGATCAGGATCATCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGTACCTCAATTTTTATTGGTCTTGTGACTTGATTTCGTTTTGTCACGCCCATGATTACTT:1	-	chr3R	18377290	3'	+	INE-1	30	1	73.29
TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAG:1	-	chr2R	24218530	3'	-	412	67	2	63.45
AATTTTAAAATATAAATTAAAATTCCAATTGCAAACCCTAATAATAAAACAGGCTCAGGCTTCTTCGCGTTTTTTGAAGTAAGATAAACGTGGATTTCAAGACATAGAAAATATTTTTGTATGTTAACTTTTAAAAAAATATATTT:2	+	chrX	16295411	3'	+	1360	3041	1	16.44
GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACA:1	-	chr2R	7452848	3'	-	pogo	73	1	69.86
GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATT:1	-	chr3L	27415221	3'	+	transib2	2795	1	53.27
TGACAAAGGGGTTTTCAGCTACTCCGTATGCCTTAAAAAAATACACTCTATTGCAATATTAACGCTGAAGTGACTTTAGTAACTCAGCTGTGTTGCAGGAGGAGGAAGAACACCATGGTTGGAT:1	-	chr4	354930	3'	+	BS3	1735	1	67.74
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGTTTTAATGCCCATTACGGCCAAAATGGCACTTATCGA:1	+	chr3L	9998219	3'	-	roo	10	2	66.96
ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAA:1	+	chr3R	28075396	3'	+	jockey	4923	1	64.38
GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGNTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACA:1	-	chr3R	2461586	3'	+	mdg1	351	2	70.90
GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATGGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAGAGAAAGACAATTTAAGAGAGCGCAGAT:1	+	chr3R	18585695	3'	-	P-element	37	1	58.62
TATGAAGAGGAATCACAAAGACTCCTTCCATATATGAGGGAACTGTGAAGATTCAAGAGATAAGGTAAGCAGTTTCAGTAGAGGCTTTCCTTCAAAATCCTTCAAAGATTTCCCGTTAAAATGCAAAAGAAGC:1	+	chrX	20265673	3'	-	Q-element	58	2	65.41
ACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGGATGGATTGAGATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGTA:1	-	chrX	4214943	3'	+	flea	4949	1	64.38
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCATGAGAATTGAGTAAGTTTTCGCCATTCCACTTGACAGCTTA:1	-	chr2R	14387939	3'	+	roo	9024	2	61.95
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAGTCGTCTTTGACAAATTGAGGCAAAATGCAG:1	-	chrX	14336385	3'	+	roo	393	1	71.77
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTACAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGTGCTAGCGCCTT:1	-	chr3R	12886895	3'	+	roo	357	2	54.96
AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAAAAAAAAA:1	+	chrX	13504252	3'	+	412	7495	2	56.52
TAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATATTAGCTTAAGCTATA:1	-	chr3L	13845080	3'	+	opus	293	2	61.64
CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGACATGTTTATCAAGGAAGTGATAAAAGTTAATGAATATTTGTGCCATTAAACTTGATTTCT:1	-	chr2L	3164916	3'	+	412	457	2	58.90
TTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATAACTTTTATCTTAGATATCTAAGTCTATAAATATAATTCTT:1	-	chr3R	9293198	3'	+	297	6904	2	73.10
CATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCCCCTCTGCCCTTTCAGATGAACGAGCTGCTGGTTAGCAAGGCGCATGCCGAGAAAGTGCTCCGCGAGCAGAGCGGCG:1	-	chr3R	14035218	3'	+	1360	197	1	74.55
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CGGAGGAAGCAAATTAATATATTCGGAGGGAGACAGTTCTAGAATTCACATTTATCTAGATGCATTTGAACAAGTGGGTATGGTTTTGAATAAATTGGGCAGTTATGTGTTGTACCTAATAAGTGTTTAATGATATTTGTAAATGT:1	-	chr2R	16613433	3'	-	Gypsy12A_LTR	2057	1	71.23
AAAATGTGGGCGTGGTAGTTTTGGGAGGCTTTAGGGCATTAGAGTGGGCGTGGCAAACATTTCTATACAACAAATCTATACAAATTTAAATTATATTCGAATCGAATTATTACATAAAATCCACGAGCCAAAGTGGCGTAACCCGA:1	+	chrX	3301948	3'	-	INE-1	245	1	60.27
GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGAAGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGAACGGCCAAA:1	-	chrX	18030263	3'	+	opus	7463	2	63.64
ATAGTTAAATTCAAAATACAATTTACAACATTTTTTGACTTTATACCTAAAAAATGGGTATCTGGCCCAGTGGATAAATCCATAATAGGAAGCTTAAGAAAAATACAGGAAGAAGAAAGGTGGTTGAGAGAAACCAA:1	+	chr2L	22689766	3'	-	transib3	53	1	51.09
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTAGGGAGAGCTTAGGAAAAAAGACGAAATGGTTCAGAAG:1	+	chr3R	7834184	3'	-	roo	10	2	74.48
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCA:1	+	chr3R	25448419	3'	-	roo	79	2	71.23
ACGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCGGCTTCTTTT:1	+	chr3L	16750766	3'	-	Tirant	12	2	70.00
ATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTCAAATGTTAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGAAAAACCTATATATAATGCCAAACAACGAAACCACACAGCAAAA:1	+	chr3R	10512274	3'	-	hopper	330	1	70.34
GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATG:1	+	chr3R	11496590	3'	+	1360	3336	1	72.48
CGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAACCTTTTGGAGCGCCACGAATGCTGTTGAGGTCGTCTATCGCCCTCCCTACGATCACCTCCCGATAGAACATGGCTCTGGAGATCCCTTTGAACGCCCTTCGACCGTGGTAACATCAGCTG:1	+	chr2R	564778	3'	-	1360	92	1	53.42
GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCGCGGTAATGGGA:1	+	chr2L	21400386	3'	+	mdg1	7389	2	63.01
ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGTCGAGGCCTATGGATCCATT:1	+	chr3R	23235600	3'	-	jockey	4800	1	55.22
CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACG:1	-	chr3R	20499742	3'	-	mdg3	44	2	51.85
CAAGAAAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGCGAAATTAGTTTAACAAATGTAAATGAGAGAAAGAAATG:1	-	chr2R	18937269	3'	+	Doc2-element	219	1	76.43
AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTCGGCCTTTCATTCACTTGTCAG:1	-	chr3R	10546064	3'	+	hopper	1374	2	54.11
GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGG:1	-	chr2L	14772062	3'	+	roo	8993	2	77.44
CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATATGTATATATACATATATAAACCTGTGCTGAGCCCAGTGCATCTCTGTACACACGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTGACAAAGCCGCAGATAACCG:1	+	chrX	8814881	3'	+	pogo	2097	1	80.60
TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAGCAG:1	-	chrX	5662852	3'	+	P-element	2854	1	58.54
ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATC:1	+	chrX	10521707	3'	+	Tabor	401	2	73.97
TTTACTTAAGAGACTAACAATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATATAGAAGTATGAACAAAATTGTAAAGCAAATAAATGCCTAGCCATAGA:1	+	chrX	9622146	3'	-	Doc3-element	4682	1	52.10
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATT:1	+	chr2R	11164480	3'	-	roo	8739	2	79.26
ATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTAAAAAAAAACTAAAAAGA:1	+	chr2R	6885441	3'	+	flea	255	1	79.20
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTAAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTC:1	+	chr2R	25118774	3'	+	roo	9023	2	60.00
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAA:1	-	chr2R	19004143	3'	+	roo	9031	1	57.02
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATATGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCCCTGCTTCGATTCCAGCT:1	-	chr2R	19050140	3'	-	roo	13	2	73.79
GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGGACAATGGGGGCGTAACCCCGCCCCAGGGGAGCGGTTGCGTTTCAGTTGCGTGCGAGGGCACCAAG:1	+	chrX	18196925	3'	-	jockey	4773	1	65.66
GTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGCTGCTCCTGGATCTTGCGAGTCTCG:1	-	chr2R	23465993	3'	-	Doc	475	1	70.19
AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATTTTTGGTTCTGTTTGCAAAGTAACATA:1	+	chr2R	5485263	3'	-	blood	9	2	78.77
ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATTTCTGGTCCTGTCATCGAGCATTTTTATGCGGGCTGCCGATGGG:1	-	chr3R	17531347	3'	+	1360	3387	2	72.22
TCTTCGACACATATTGTTTAATGTCCCCCTACAGGTTTTCAATCGGGTTTAAATCGGAAGATGGTGCTTGCCACGGCATTGCATCTATTCTATTTTGGGTGAACCTATGAAAAAAGAGTTAATAGAAGTTAAAAAAGTTAATAGAA:1	+	chr3R	4191689	3'	-	HB	1180	1	73.97
CTCTGGTTCATCTTAACACAAAACCCACTTCCATTTTCCCTGAACATGCTGGTCAAAAAAGTAGACAGAGTCTTTTTAGTTTATCTGATTTGTGCGGATTGATTGATTTAGACATCACATGCC:1	-	chr3L	6569172	3'	+	Circe	131	2	60.16
TAGAATTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCAGCATGCAAAAAATTTTGGAACGTACGATTAAGATAAACGCTAATATAGATGTGACTATGTTACGCGTAAATACAATTGCAGAAACCTTAGTAGTGC:1	-	chr3L	27383465	3'	+	1360	244	1	64.66
AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAATGCCATTCAAAACTGAAATTTTGCTT:1	-	chr2R	2832923	3'	+	1360	3319	1	76.38
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGAC:1	-	chr2L	18294198	3'	+	roo	9004	2	66.44
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAAGTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTGCAAAGTCAGTTATCGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTGTTTATGATACAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCG:1	+	chr3R	19448519	3'	+	roo	353	2	51.72
GCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGCTAAAGGATACGTTGGTAAAAATGTAATCTTAAATATTAGTTCTTAATACTTAAGC:1	+	chr3R	27396654	3'	+	blood	66	2	58.21
ATAATAATAAAAAAAAAAACAAGATACACGTGATTTAAAAAATGATTTTTGATTAATTTTCGGGGAACTATTGTGATTTTTATTTATGTCCGCTGACTAGAACAAATACAAATAATCGGGCAGCTGA:1	+	chr3R	14584215	3'	+	Rt1a	5073	1	58.27
GTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTG:1	-	chr3R	3177922	3'	+	Stalker4	295	4	83.20
GGTGGCNTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGT:1	-	chr3R	10182126	3'	+	blood	7337	1	60.00
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTTTTATTATTAATAAATAATATTACTTCAGCTTATCATCG:1	+	chr3L	15177350	3'	+	roo	9051	2	69.66
GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGTAATTTGTTATTGTTTGCTTTTGTTGTTCTTTCGAG:1	+	chr3R	14651328	3'	+	P-element	2864	1	67.63
AGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATACATATATATGTGTTTCTACAATGGCACCCACG:1	+	chr2L	2794247	3'	-	Burdock	83	2	82.19
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCATCTGTGACATGCG:1	-	chr3R	16404451	3'	+	pogo	2064	1	56.72
AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTCTTTCTTAAAATATGTTGTTACCATTATGCGACCAATACTTACTCCTATTTAAATATACATAATATGGTATTATCCCATATTAAAAGCTATATAACATGTTAAAG:1	+	chr3R	31720640	3'	+	pogo	2089	1	81.38
GTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGCACGCTTCAGGTGTTAATGATATAATTTTATTTCGTG:1	+	chr2L	12328765	3'	-	hopper	9	2	70.54
ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAAC:1	+	chrX	7195096	3'	-	P-element	48	1	31.63
TATTGTTATTATTATTATTATTATTTCAAGGCTTAAGTTTTGGTAGATGGAAAAAGGACTAAGAAGTATATCCGTGCCGAAAAAGAAAACATCTTAAAAATCGTAACTATTTTGTTAATCTTTTTCAATAAATAGAAGAGTTGAC:1	+	chr3L	15081589	3'	-	mdg1	19	2	74.48
GAAATATTGTTCAAATACTGAGACTTCTCCTCAATCCGATTTACATTTGATCTTTAGTCTTAAGCTTCTTCTTCACAAATTGACAGTAACTCGTTTTCTCTCTTTTTTATTTCTATATCTAGCCGATAAAAGAGTATATCT:1	-	chr2R	1368154	3'	+	297	6808	2	56.03
ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACATTCCGTGCTCGT:1	-	chr3R	14981127	3'	+	mdg1	7441	2	67.44
TTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACA:1	-	chr3R	19589935	3'	-	BS	5078	1	72.60
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATATATGAGTGAATATAATTAATTAGTTACATGTGTAATTGATTAAATTGTTGCTGATGCTGGCGTGAAGTCCAAGGAAATCGCTGTGATTTGCAA:1	-	chrX	4918337	3'	-	roo	19	2	37.67
GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATTATATACACATTAACGAGTAGGGCGAATGAATCATGTATGTGTGATAGGGGGGGTATTGCGGCATTTAAGGGTTTGTTCTGCTGATCCCAC:1	-	chr2R	18609322	3'	+	opus	7490	2	62.50
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTAAGACGTTCCCTACATTAATCAATAATTTATTTAT:1	-	chr2R	15064325	3'	+	412	446	2	54.11
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGTTATATTATATATATCTATGATTTTTATTTTAGCTAGTAAGCATCCTGATAGTTTATAGATATTTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTA:1	+	chr3R	19450072	3'	+	roo	401	1	33.56
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATA:1	-	chr3L	9998019	3'	+	roo	388	2	45.21
AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACCCAATCC:1	+	chr2L	20840518	3'	-	Transpac	4934	2	67.62
AGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAATAAGAACATGTATACTTTGAATTAGAATATTCAAATATTATTATTATTTACACATTTCACATTGAAGTACTTATTCGACTATAACAATTGGTCTTACTAATTGTTAAA:1	-	chr3L	17945123	3'	+	Juan	4204	1	63.01
CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTGGTTGCGTTTCGCAAGCAACAGGATACGCTGGAAGGCAGAGAACATCGCCGAGGACGAAAACATCGCACGCACACTAGC:1	+	chr3L	2712860	3'	-	P-element	17	1	68.00
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGAT:1	-	chr2R	9791561	3'	-	412	38	2	58.57
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATTTTCAGGATCGTAGAGTCCGGCGATCATTCGCATCTGACCA:1	+	chr3L	11321555	3'	-	mdg3	5261	1	74.48
ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACCAATTTTTTTTATTAAATTTTTATTGTATATATTTTTCGCAGTGTTGGGCATGCATTTCCCTTTTT:1	-	chr3L	18555865	3'	+	jockey	4941	1	56.85
ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGAATGTAAATATAGGCTCCTTGTATTTTTGAAGAGTGAGCAAAATAGTAGCTTAATGGAAAGTTAATAGAGCCTCAAGGAA:1	-	chrX	6191121	3'	-	FB	35	1	59.71
GCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCGCAAACACGATACGAAAACTGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGCGG:1	+	chr2R	13006517	3'	-	3S18	61	2	55.94
GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCAT:1	-	chr3R	5061857	3'	-	mdg3	5334	2	71.03
GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATA:1	+	chr3L	15177291	3'	+	roo	8993	2	73.61
AACCGAAGACTTGGCGGCCTTAATAAATTCGATTTGTAGTTAGTTCGTGTCATTTCAAATTGCATCTCTCGGGTGAGTCAGAATATATGTATATTCTTCTACTTAGCTGTCTTACAAATTAAAATGTCTATCAGGAAGACCGCTAC:1	-	chr3L	20826404	3'	+	gypsy10	244	2	71.23
ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGG:1	-	chr3L	7292485	3'	-	HMS-Beagle2	6957	2	77.04
GAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAAGTTTTGTTATCCATGCTATATAGAATTTATAGAATGTAATCATGTCGTTTGTCTGGGCGATTTTTGTAAAGCTTAAAAGCCCATTAATCTTTGATTAATATTTA:1	-	chr2L	4020766	3'	+	jockey	4824	1	67.81
GGACAAAAACGAAATCTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATGCAGTATATTGGTCCCGCTCTGGC:1	+	chrX	19696947	3'	+	Tc1	1617	1	80.00
AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAGCTTTGGTAAATATACTTTTCACGTCTGC:1	+	chr2R	13585528	3'	+	412	7506	2	58.22
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATAGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTTTTATTATT:1	+	chr3L	15177320	3'	+	roo	9027	1	51.08
TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCAGC:1	+	chr2L	7810141	3'	+	P-element	2846	1	52.59
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACATTCCGTGCT:1	-	chr3R	14981130	3'	+	mdg1	7422	2	57.93
TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGAGGGAGACCGTCCCTCTGGAGGGGGCGTGGCACATGCAAAAGAGCGAGTCA:1	+	chr3R	10469001	3'	+	opus	7452	2	68.24
TATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTCCGGGCGCCAGTTCATATTTCACATACTAAGATTTG:1	+	chr2R	4206656	3'	-	1360	313	1	68.61
ATGTTTAGTCTACCATTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCGTATAACAATCTTTTTCTTAAGCATTGTGAAATTTAAATTTGCTGACTTTGTGTTTACTTTAAGTTCGGTTATTTATC:1	+	chr3R	4139565	3'	-	Idefix	175	2	58.27
AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAAATGTAGTATCTTCGTTAG:1	+	chr2L	6623071	3'	-	Burdock	6158	2	69.29
GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTATTGCAT:1	+	chr2L	15833521	3'	+	jockey	4950	1	58.33
AAAATAATCTTCAAATAGATGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTCTTAATCATTACCTTCTAATAAGAAAACTTGATCTTTTTCGGATCTGTGGATATTCCACCTAAGCCTATTA:1	+	chr2R	4518764	3'	+	Q-element	284	2	74.02
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CTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTTTTAGGCATTGCATTATCTGGGCACGGGAAAACAATATAATATAATCATAAAAATGATAC:1	-	chr3R	5067405	3'	+	mdg3	35	2	58.90
GAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTTC:1	-	chr2R	5173426	3'	+	gypsy	7392	2	57.86
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CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAAT:1	-	chr2L	12892609	3'	-	roo	56	2	57.53
ATTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGTGTAGTTCGATTCTTACTTGCCCAGAATCTCCTTGGGCTCGTATTTG:1	-	chrX	11696511	3'	-	TLD2_LTR	97	1	51.72
CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAATAAAAACAAAATGACTCATATGCTTACACCTAAAACTGTCCCATCATCTACGCAGAAATTGCGTCATAAAAAAGTG:1	-	chr2R	21145841	3'	+	pogo	2069	1	60.42
AAAATACTGCACTTTGCACATTTCTATGAATTATATATCCCTTTTTTTAGCCTATAAAACTAATTAAAAACTAGTATAATACTAATTTCTTATGAAACTTTTGAAAATTCGACAATTCTTTACATTTCTCCAAGTGTAGCGATTGC:1	+	chr2R	8722674	3'	-	gypsy4	452	1	73.29
TTCCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATCAGTGACTCGGTTGAATAATATAATATCAGT:1	+	chr3R	3179560	3'	+	roo	8997	2	75.97
TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGATACAAT:1	-	chr3L	11441709	3'	-	roo	41	2	55.86
ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTCTGTATTTTTCGAGAAAGGGCAAATCAGGTGAATGCCACAAATTTTACCGAGAAAATCTCCGTGCGTGTGCGCATGTGTGTGTATGTGTAAGGGAATACATTTAAATAA:1	-	chr2R	10966365	3'	-	accord	7027	6	66.67
TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTTGTCGAGTGGGCCACGCACTTGAATGGAGTACTGTGGTGGGATGGAGGGCGCGGGCGGAG:1	+	chrX	1897760	3'	+	P-element	2821	1	43.51
AAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGTGGTAGCCAAACAGAG:1	-	chr2R	20596416	3'	+	roo	390	2	70.63
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCA:1	+	chr3R	7835201	3'	-	roo	8731	2	68.12
GCACAAAAAAAAAAAGGAAAAAGGATCGGAAAAGTTTCCTGAA:1	-	chr2L	13601967	3'	+	Doc2-element	228	1	93.02
TGGGCATTGCTTATATTCAAGAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATAAACCCATTATGCTTTCCCTTTGACACAGACAGACAGAAGTTGAACAAACTGTAGAATCTTGAAAATAT:1	-	chrX	12609107	3'	-	1731	1	2	69.18
GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTC:1	-	chr2L	14081307	3'	-	1360	63	1	61.64
AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGAGCAGTCGAGTGTGGCCTAGTTTTTGGGTTCAAGGGACAATGAATGTGCGAAAAATATTTTATGAGCTATATTATGTAAACCGA:1	-	chr2L	2687312	3'	-	copia	4906	2	57.53
CGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAATGCTGAATTAATTGGAATTGTTTTGAGTTACATGGGATTTT:1	+	chr3L	5077141	3'	-	jockey	201	1	68.22
ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACCTTTATTTTGTTAATGTAAAGATAAAAATAAAATTACAAGGGTTACAAATAAACGATAATTGATGAAATGATCAAAAATTAATGATACCTCTACTCACCCCGGTCATTT:1	+	chr3R	25340119	3'	-	mdg1	12	2	76.03
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAATGATAAATTGTAATACAGCGC:1	-	chr2R	15176563	3'	+	roo	359	2	54.62
AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGTTAAATGGCAATTCGTGTTTTGTGCTTTGTGACGGCACAG:1	+	chr2L	18339088	3'	+	pogo	2078	1	62.20
GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCTTG:1	+	chrX	6522045	3'	-	F-element	93	1	69.86
GCATGCATATTTTCTTTTGCTTTAAGCTTTGTACTATGAACCGTTATCTTTCGTATTTCTTTTCGACTACCTTCTGCAAAGATTTTTCAGCACTTGCCCAACGGAATTTCGACTCAATATCAGTTGGGTTCGACTTGTCTGCACTC:1	-	chrX	15789016	3'	+	Bari1	1527	1	55.48
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCC:1	+	chr2R	9791682	3'	+	412	446	2	54.81
ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGGGCACCCACTCC:1	+	chr3L	20168426	3'	-	mdg3	5333	2	74.10
TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAAATTGTGGGTTCACACTGCTGTGTTGT:1	+	chr2L	7810170	3'	+	P-element	2871	1	73.38
ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATTTTGTGTTCTGTTGGCAAGGTTTTTCACCGTTTTAAAGCATTT:1	-	chr2L	20808297	3'	-	HMS-Beagle	28	2	63.16
TCGTGGAGTTAGCGATTGTGGCCCTGCGCATGTTAACTTTTATGTAGTCCCACGATAAACAATTGCAGCCCTGCCCCAAATCATCTAATTCAGAGGAAACCCTTCTCCATTTACAGAAAAAGCAGA:1	+	chr3R	3005840	3'	-	gypsy4	17	2	61.90
ATAATTAATTTTATTTTATTTTTTATAATTTTTTTTTTTAAAGCTTTAAGTTTAAGTAAATCTAGCAAGTTCCCAAACTTGCGGTCCACAATGGTAGCC:1	+	chr3R	27005843	3'	-	NOF	3960	1	73.74
ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAATACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGATTTCCGGGCAGGAGCTCTCG:1	-	chr2R	21228983	3'	-	jockey	61	1	51.45
ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAG:1	-	chrX	13126462	3'	+	jockey	4969	1	54.74
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTA:1	-	chr2L	16091864	3'	+	roo	9041	1	60.27
CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTG:1	-	chr3R	10546105	3'	+	hopper	1385	1	61.70
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTGA:1	+	chr3L	20831391	3'	-	roo	8709	2	52.45
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCC:1	+	chr3R	27994276	3'	+	roo	9042	1	53.64
ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTC:2	+	chrX	14749702	3'	+	copia	230	1	56.16
ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATACATATATATGTGTTTCTACAATGGCACCCACGCAAAACGCTTTGAACGGCTGGG:1	+	chr2L	2794269	3'	-	Burdock	60	2	66.90
TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAAGGTGTTTAATGAATAGCTATGTAA:1	-	chr2R	13121943	3'	-	pogo	11	1	65.75
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGCATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAA:1	+	chr2R	18336260	3'	+	roo	9026	1	55.17
CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGA:1	-	chr3R	7482750	3'	-	412	75	2	67.59
TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTCGGCTCTCAGCTTCTTTA:1	+	chrX	9540121	3'	+	roo	9029	1	51.47
ATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATAAAAAAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGATGAAGGCAAATATTTTTTACCGCACCAGGCAGTGATTAGAGATTCAAGCCTTACGACCACATTGAGAGTAGTTTTTGATGCTTCAGCAAAAA:1	+	chr3R	19445257	3'	+	1360	420	1	69.86
GCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAGATTACAGATATAGACATAAATTGAAGCCGCAACTTGCTTATCT:1	-	chr3R	31102842	3'	+	I-element	60	1	69.01
ACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTCACTTAAGCCTGTAAAACAATAATAAAAAGAAATATATAAAAGTTATGTTAAGCGTCGCTCCTCCCAGCTCTTCACGTA:1	-	chr3L	8339573	3'	+	Tabor	480	2	73.39
CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTT:1	+	chr2L	15991371	3'	+	mdg1	336	2	79.71
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTT:1	+	chr2R	25118734	3'	+	roo	9039	1	83.78
TGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCACA:1	-	chr3R	12717750	3'	-	297	57	2	75.00
TCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGTTTAATGAACGCTTTTGCCGCTCACAATTCTATTTGGCAGCAGATT:1	-	chr2R	18607561	3'	-	opus	397	2	68.49
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCAC:1	+	chr2R	13084657	3'	+	roo	9011	2	76.27
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGGGATAGCAAATGAAAAAG:1	-	chr2L	3886169	3'	-	roo	62	2	72.13
GGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAATGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGCAATTTCATAAATTTCATAAAAATATGATAACTAG:1	+	chr2L	6007627	3'	-	1360	456	1	69.23
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACA:1	+	chr3L	16343288	3'	+	roo	9002	2	68.66
AAAAATTAAAGAAATATTATTTTATTTTATATTCTAACACACTTGAATAAGCGACTTGATACAGCGTTATAGATTTTCTAAGATCTTTCTTGACTTTTTGATGATACAATTTATTCTGAATGATATAAGTTTATATGATGGTTTCT:1	+	chr3L	10295204	3'	+	HB	327	1	69.18
CTTGAAATTTTTCGGACGGCTTAATAAGTCCGCCGTGAGACACCTCGTCGACGTATGTAAATGTCAAATTTTCTTTTAGGGTATATGTATCTAATGGGCGATGAATAAATCGCTGCG:1	+	chr3R	29303817	3'	-	P-element	2440	1	35.90
CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTCACATTTATTAGAAGCCATAGCAATGAATTTATCAAACAAATCTAAAAAAATCTCTTTCTTGAACGGATGCAAATAAAACTAGTTTTTAAAGTTTTTAAAATTTTTTTAA:1	-	chr3R	31109594	3'	-	I-element	9	1	76.03
AGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCATCATACGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGCTTAGAAAAATATTACCTCAGTTAATCTTTATAAATTCGTGGGAATG:1	+	chr4	1264021	3'	+	1360	238	1	73.29
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAG:1	+	chr3L	11441827	3'	+	roo	343	2	63.70
ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATAC:1	-	chrX	3309645	3'	-	jockey	87	1	78.10
AATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAGATGATAGATTCCCGCTGCCACTGCCAGCCCCCTTTTT:1	+	chr2R	21292337	3'	-	jockey	4922	1	73.61
ATATATTTATATTATATTCATTTTTACTTGTGTGCAATATCGTTTTTAGTGTTCCCCCGAAATGGGCCTGTCCCACTGTAATTAAGGCAAATCACATGTCAAGGTCCTTGTCAGGACTATAAGAACACGTCAAT:1	-	chr3R	13439551	3'	+	gypsy7	5067	1	52.99
ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAAATAATTTTATGATT:1	+	chr3R	16404593	3'	-	pogo	35	1	60.96
GTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAG:1	-	chr3R	23020779	3'	+	INE-1	568	1	66.21
ATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTTGCCCCCAGTGACCCATTGTCACGCACAGGCAAATAATAACA:1	-	chr3R	26685988	3'	+	Juan	4172	1	53.68
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAG:1	-	chrX	14336415	3'	+	roo	358	2	60.16
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCAC:1	-	chr3R	25448342	3'	+	roo	9017	2	59.70
AAAATAAAAAATAAAAAAAACTACATATTTGAAATTATCTCAAATATTTTTTAAAAGTTTAAATCATTGACTAATTTCCAAATTATTTTCTCTCTCTACTAATATTTACCAAATACCAAAGGGTCACCAAGTGCACTTTGTTCAGC:1	+	chr3L	8671701	3'	+	HMS-Beagle2	489	2	63.70
ATTTCTTTGTTTTTTTTTTTATTACTATTTCCAATGGGATGACAACGAGCACAACTGAACTGGTG:1	-	chrX	14362556	3'	-	transib2	2643	2	76.92
GAGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAAAACAGATACATAGTTATCTATAAGATATT:1	-	chrX	5629146	3'	+	jockey	4979	1	53.97
AAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGTG:1	-	chr2R	20596430	3'	+	roo	404	1	75.65
ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCCGTCCGCAATTTCTGGGCGAATCCGGCAAAGGAACCC:1	-	chr2L	10022973	3'	-	Doc	42	1	59.70
ATATATACATATATACATATGTATATATATTTCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCCACAGATG:1	+	chr2R	10594201	3'	-	G3	4505	1	57.53
AATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTAAGTGAATTATCGATTACTTATTCCATATGTAGGCAAACAAAATATACATAAGTATTAAATAACTTAGGAAGGTTTGCAATGGCTGTCTCGTTGATGTGGTTGTACATACGT:1	-	chr2L	23173890	3'	-	1360	3090	1	76.71
TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCTTGGAATC:1	+	chrX	6522050	3'	-	F-element	68	1	61.11
AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGATCACATAGGTACACCGGCACGATCTTTTCATACCTCCGCAATACAAATCTAGTTA:1	+	chr2R	8022663	3'	-	accord	7030	2	91.46
AATAAAAATAATAATAATAATACTAATAATAATAATAGCTGAATATTATTCCTGAAATTTGTAAATTCTGCGCTGCAGAAATCTAAGCAACGCACAGACAACAAGAACAACAACCCGTTATGACTATGACTTTCAGGGGTGCTTC:1	-	chrX	6860444	3'	+	mdg1	7069	2	62.07
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCACGAGCCTGACATGTG:1	-	chr3R	31817410	3'	-	roo	30	2	63.70
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAA:1	-	chrX	13039474	3'	+	roo	400	1	67.90
CCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAAAAAATTGTATATTTCTTTAATATATGATGAAAAGCAGATAAATATGGTTAAAAAATCAGTAATCAATCAATCGTGTTTGCGGT:1	-	chr3R	11105900	3'	-	Doc	5	1	40.41
ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGCGAAGTCACG:1	-	chr2L	5844966	3'	+	transib2	2776	1	52.41
ACTGATTTCTTTGAAATAACGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAAATAACCGTTTAA:1	-	chr3R	21706006	3'	-	297	6616	2	69.89
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCG:1	+	chr2R	13084675	3'	+	roo	9007	2	67.14
AGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTG:1	+	chr3R	8049030	3'	-	Q-element	114	2	67.42
AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTTTTTATTTGAAGGACCATATAAATGTCCGAGTTAGTCAAACATCCTGGGA:1	-	chr3R	12618551	3'	-	F-element	20	1	71.92
AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAG:1	-	chrX	13066483	3'	+	jockey	4960	1	57.25
GATCGTATTACTCGGACGCTGGAATGCTTATGTAGTCATTGGTGGTCTTTTGGGTATTTGTATATTTACGTGCGATAATAGATGTCGATAATAGATGGCCGGCCAACTTGAAAAAAGTTACGATGACATCATCGC:1	+	chr3R	31913922	3'	-	Stalker	6990	4	52.59
ATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAAGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGTTTTTTTGGCTTCAATGTTGTGTGGATTGTGCCGCCAAATGTTCCGATTG:1	+	chr2R	3037126	3'	-	F-element	4225	1	76.98
ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACAGGCAAATCAGTGA:1	+	chr3R	25826772	3'	-	mdg1	6	2	71.13
GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAG:1	+	chr2R	16785447	3'	-	412	40	2	58.90
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTCTTAAGAAC:1	+	chr3L	15600372	3'	+	roo	394	1	60.27
ATACTAATAATAATATTATTAATAATATTTCTCTTCACACCTGGCGACATTTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGATTTAGG:1	-	chr2R	14445418	3'	+	mdg1	38	3	84.52
GTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGTATTTAGCCACTTGCCGCTGTTTTTTCATTTTCATCGATTTACGGTTCTGTCAGC:1	-	chr2L	2075898	3'	-	invader4	153	2	59.85
AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGC:1	-	chrX	2842505	3'	+	Tabor	7245	2	69.86
TGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCAGTTGCTGTTCGAGGCTCGAAGGATACGCACGGCTCAGGTGGACGACGGAAGTTGGATTGAAAATGCATCGGGA:1	-	chr3L	7189856	3'	+	hobo	115	1	68.52
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGT:2	+	chr3R	22844291	3'	+	roo	354	2	55.48
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGC:1	+	chrX	5274391	3'	+	roo	348	2	60.27
AATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAGCATAGAAAAAAGATGAGAGTTTACATGAATTCTTGTACGCACTGATAGAAATAGCTAAGCCAGCAAAGCTTGAAGATGAGAGCAATATAGATTATTTCATTAGTGG:1	+	chr2R	2002303	3'	+	Porto1	4369	1	70.55
AAGCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTTATGTAAATCTCCTTAATGTAAACAATTATTTTTTCGTGAAACA:1	+	chr3R	17419856	3'	+	roo	437	1	63.49
GTGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1	-	chr3L	25232769	3'	+	accord2	206	1	66.67
ACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGT:1	-	chr3R	21907534	3'	-	Tabor	6908	2	65.47
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGAC:1	-	chrX	5643444	3'	+	roo	9047	1	66.43
ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACATTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAAAGAG:1	+	chrY	3648918	3'	-	Transpac	4955	2	64.38
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCAGGCAATC:1	-	chr2L	17420108	3'	+	roo	400	1	75.56
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACG:1	+	chr2R	13710680	3'	+	roo	359	2	54.07
CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCTTGGAAT:1	+	chrX	6522049	3'	-	F-element	56	1	57.52
ATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTTTCGGTGTGGCAA:2	+	chr3R	22822183	3'	-	mdg1	7038	1	66.44
TTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCATTAAGTCAGGCCACC:1	-	chrX	10253213	3'	+	hopper	1346	1	71.76
CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAACAAATGAAGTGCAAAATCAACGCGACGTCCACAGGAACCACAAGCATTTTG:1	+	chr3R	19529200	3'	-	jockey	4700	1	61.59
GCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCTGTGCACGCGCATTATTAAAGTGAACTCACCTTGAAATAAAAGATG:1	+	chr2R	17259348	3'	-	jockey	4736	1	60.43
TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCTTCTATCATATACTAATAGTT:2	-	chr2L	13053711	3'	-	BS	5024	1	62.33
CCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTGGAAATAGCAAAAAAATAGAAAATCAAAGAAACCAATTTGTAGCAATC:1	+	chr3L	7866941	3'	+	pogo	64	1	67.12
AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGG:1	-	chr3L	2362328	3'	-	Stalker2	54	2	57.69
ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAAT:1	-	chrX	18193659	3'	-	jockey	19	1	61.05
TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTAGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGATTTCATAGCCTACTTAGCGGCGCGCGCTGCG:1	+	chrX	13066602	3'	-	jockey	26	1	60.53
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGC:1	-	chr2R	15064361	3'	+	412	422	2	70.15
ACACCGGAGCGGAGGACCGTCGGGATCATTAAGTTTTTAAAATCTTCTGAAGTATCATAACATCGCACAATTGCTGATAAAACTTACCGCCGAGGAGACGGC:1	-	chr2R	4879844	3'	+	gypsy8	4588	1	55.88
ATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATAAATAAGTAAACTATTGATTCAGATCAAGAATATATACATACATATATTTGAAATGTAATCTTTCTTCTACCTGTTACATACT:1	+	chr4	913528	3'	+	Tc1-2	12	1	56.16
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATCATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACT:1	-	chr2L	17420128	3'	+	roo	9032	1	54.11
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGCT:1	+	chr3R	14979910	3'	-	pogo	38	1	59.31
ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTT:1	+	chr2R	5485218	3'	-	blood	52	2	53.47
CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACAT:1	-	chr2L	13585818	3'	-	Tabor	46	2	53.52
TTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTATAACACGGTA:1	+	chr3R	17478459	3'	-	copia	70	2	67.12
TATTAATAATAATAATATTAATTGGTATTTGAATTACTCTCAGTGCATTGTGAGAAAGGGGCTGGAGAACTTAGTAGAGAAACGTTGGTAAGGGACGGAACGGAGTGCTGAG:1	+	chr2L	17243707	3'	+	mdg1	7074	2	89.29
TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGATGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACGGGTCG:1	-	chrX	11471548	3'	-	hopper	14	1	68.91
GCTACGAAATTGGCAAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCCTCGTGTAAATTCGTCTTCTAGCACAACACACACACAAATGCAGACCGGCAGGATTCGGTGGCTTGCTTTCCGAGAGTG:1	+	chr2R	22408426	3'	+	1360	3122	1	65.91
ATTATTAATAATATTATTATTAGTATAATAAATGTGCATGGTACTTTTTTCGAAAGATATCAAAAGTTATGTGCTTCAGAACTTTGTTTTTATAATCAATCAATTCATAACCCATCTGTGCTCAGTACACACACATGCTAAGACTT:1	+	chr2R	14445608	3'	-	mdg1	7080	4	64.38
GCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCACCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTTCTTCAAAGAAAAGTAAATGGGCGAAAGTGGTTAAAGCTGGATCAAGACTCTTT:1	-	chrX	159422	3'	-	R1A1-element	402	1	54.84
CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGGAGTGTGGCAAATAAATTGACATTTAGCTGGGCGTGTAACAAGATCAAGTATACGCAATGTCGCCCACGTAACTTTGATTTGGTAGCAAAGCTAGAATATGCTC:1	+	chr2R	21920634	3'	-	jockey	20	1	72.92
AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACCATG:1	-	chr2R	9791589	3'	-	412	7124	2	68.97
AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCGGTGCACGCGCATTATTAAAGTGAACTCACCTTGAAATAAAAGGTGCTAAAATGATTTATGTAAATTCAGC:1	+	chr2R	17259373	3'	-	jockey	4714	1	52.82
AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTA:1	-	chr3R	19589924	3'	-	BS	5002	1	61.73
ATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACATAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATGGAATGAAATACAGATTACT:1	-	chr3L	7292410	3'	-	HMS-Beagle2	6893	2	80.14
TCATATTTTAGTTTTATTTATTATTTTATTTATAGAGATAAAGAAATTCTTTTCGTAATGACTTTTTTATTCTGAATAAGTTATTTTGCTTTAACTTAATGCAAATATGCGAAGTTATAATGTTAGAGTAAAGTTATAAGTTAAGA:1	-	chr3R	8306061	3'	-	Porto1	193	1	56.16
AGTCTTCTTTTGACTCTGGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGGCT:1	+	chr2L	13914156	3'	-	jockey	4731	1	69.75
ATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAATCAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCTTCGACACAAGTAAAGAGAGCTTCACCCGACCACAAGCGGTCA:1	+	chr3R	2210718	3'	+	1360	3017	1	65.87
ACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTGGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAATTCAGACCTAATTATATTCGTTTTTGATTAAGCGCG:1	+	chr3R	3854513	3'	+	Idefix	352	2	79.58
AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACATTGTGATATTTCTAC:1	-	chr3L	17557969	3'	+	jockey	4978	1	67.14
AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTATTATGCGGGGTCAGCGTGGCATTTGATTGGTTA:1	+	chr2R	17626979	3'	+	opus	486	2	76.03
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATT:1	-	chr2L	11518396	3'	+	412	7475	2	65.07
GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGACGCTTTT:1	+	chrX	7195116	3'	-	P-element	35	1	48.57
CCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAATTGATGTTCGCTACAGTCCACAATGGAGTAGCCACTTTTTTTGTGCCACCCACTTAATGGCCAAAGA:1	-	chrX	11207674	3'	+	Doc	4283	1	54.11
ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTT:1	+	chr3R	20427447	3'	-	jockey	95	1	78.08
CGCACTTTGTGCCTCCAGATATGAACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTAGCATAGGTAATAGAAGAAAGGCACTCTTGAAACTAGATGAAAATAGCTCCAACTTCAACATA:1	+	chr3L	5742520	3'	+	1360	477	1	54.07
AACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGATTCCCAGTTTATGCTTCCCCACTCGGCCCAGCCCAGACCCATCAATTCTGCCTGCGGAGTGTAGTAACCACGATACCAG:1	+	chr2R	19191943	3'	+	HMS-Beagle	396	1	62.30
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCTTAGCGTCTGGGAGCG:1	-	chrX	13039455	3'	+	roo	396	1	71.15
GAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTTCATTGTTATGGCCGTAATGAAAATGGCTGCAACCATTTTTGGCTTAGACCCGGCATTTTATATTAATTAATATTA:1	+	chr3R	29397542	3'	-	jockey	4585	1	60.94
TCTGCTTATTTAAAAGCTGGGTGTCATCAGAATTGTTCTCATCCATTATATTGAGCTCAAGCTACTTAATTTTTTTTTTATATTTACTATATTTTGAATTCGAACTTTCTCAATTACACACGACTACGAGAAGTAAGCAAGCATGG:1	+	chr2R	16248166	3'	-	BS	365	1	54.79
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGC:1	+	chr3R	18582224	3'	-	roo	8727	2	74.40
ACACACACACACAAATTCACCCGTGCAAATCGGGTATCTATGTCGTCGTATCTGTGTTTTTATATCACAACTTCTCCGATACTTCTTATGAGCATACGATATCGTATATTT:1	+	chr3L	3877078	3'	+	accord	7035	2	76.58
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTA:1	-	chr3R	18339086	3'	+	roo	9010	2	58.90
AGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGG:1	+	chr3R	11547802	3'	-	G2	313	1	57.93
ACACACACACACACACATACTCAAATGCAGAGACACACACAGTCACACAGACACACACAAGCGCATACATGCATCTATCTATTTAATTACTATACTCTATATAGTAAGCACAGCAATCGAAAGCAAGTTAAGGAA:1	+	chrX	18172839	3'	+	accord	7031	2	73.33
ATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCAC:1	-	chr3R	13457912	3'	-	X-element	78	1	64.71
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGTCTCTCAGCTTCTTTACGTCTG:1	+	chrX	9540127	3'	+	roo	9057	1	66.67
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTAT:1	+	chr3R	16076882	3'	+	roo	9018	2	57.45
ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTA:1	-	chr2L	15832994	3'	+	hobo	2917	1	56.19
GTGTAAGTATTAAAATGTTAAATGTAAGCTTGAACTATTCAACTTGTTGTCTGCGTTTTCTAGATGCTTTGTTTTGAAATGGGAATGGAAGTGGGTGGATGTTCCCCGCACCCCGCTTC:1	+	chr3L	9957195	3'	-	ZAM	8221	2	42.86
CTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTTTTTCAATAAACAGTTATAATGTGTGATTAGCGTGTACACACTGATGTTTTTTGGTGCAAGTGTGTCTTCAACTCA:1	-	chrX	560484	3'	+	1360	482	1	58.57
CATAACATTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCATGAACAATACATGTGCTGTCACTGTATGCG:1	-	chrX	3464224	3'	+	hopper	1328	1	95.21
CTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTAT:2	+	chr3L	23702297	3'	-	G4	21	1	67.12
AGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGTTATCTTAATAATTATAATAATGACTCAATAAATTTTGTAAGCAGTTGCCCCAAGATCATTTTAAACA:1	-	chr3R	15803889	3'	-	1360	3225	1	56.16
ATTTAAATAATTGTTTAATTTACATAGTAATAAACTAGCGCATGTATTATAACTATTATACACTAAAAAATAATCATGTAAATGTTATATATTAAATTATGTCTTTAACGTTATAATTTCCATTTAGAACTATGGCTGCTTCTAT:1	+	chr2L	11907040	3'	-	HeT-A	14	1	59.31
ACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAGAGAAGATTCAATAAA:1	-	chr2R	5284495	3'	+	Doc4-element	2636	1	75.34
AGGGATCTTTAAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTAAA:1	+	chr3L	25350826	3'	+	baggins	5374	1	56.16
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATC:1	+	chr2R	13084683	3'	+	roo	9047	1	58.33
AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAG:1	-	chr2R	5248241	3'	-	1360	49	1	60.98
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTTGGCA:1	+	chr3R	18582278	3'	-	roo	8694	2	63.70
GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTC:1	-	chr3L	3799786	3'	-	copia	71	2	65.73
AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCCCATCGCGCCAAATAATATTTAAATATTACTTATC:1	+	chr3R	11496645	3'	+	1360	3365	1	66.67
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTATA:1	-	chr2L	8986104	3'	-	412	46	2	52.74
GATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCC:1	+	chr3L	20033759	3'	-	blood	7093	2	71.23
ACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTT:1	-	chr2L	12290684	3'	-	1731	81	1	70.55
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAATAAAGCAATAAATGTTATTCAAGTGATTAACCGCCTTATTGCTTCTAGAAGCTGTTT:1	-	chr2R	23802901	3'	+	roo	9055	2	71.03
TCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTAAACTTTTTTCTTCTTTTTCAGTA:1	-	chr3R	13237277	3'	-	3S18	5775	2	71.03
GCTCCAGGCTCTCTCGAATAATTCTAGTGTCTTTGTGTTATGTTGATCGTGAGACAATGGGTCATTGTTCCAGATTTAAATGATTGTTTTCGATTGTTTTCGATATGGCTTATTTCGATTGTTACTGCTGTAGTTTGTG:1	-	chr2R	2953596	3'	+	1360	80	1	74.82
GTTTGTCCCAGCGTTTCTTCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTAATCAAAAATGGAAAGGAAAACATCA:1	+	chrX	22643345	3'	-	Tc1	1603	1	48.63
GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATACAGCCAGCAATGA:1	+	chr3L	22721146	3'	-	INE-1	29	1	57.89
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCA:1	-	chr3R	25448336	3'	+	roo	356	2	56.20
AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACG:1	+	chr3L	27391399	3'	+	1360	3342	1	52.05
GTATGGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACTTTCAAATTCCTTTTAAATGATAACTTTTAATTGATATCTTAATCCGGAGCGGGATACTAGCTCATTCGCCATGGACTGGGTGTGACTCTCAAATAAAATCC:1	-	chr3R	13716543	3'	+	BS	5075	1	59.59
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTTATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCA:1	-	chr2R	9328590	3'	-	roo	8695	2	57.02
CTTATCTGGTATCTGTTGGGTATATCCGGAGTAGTGTAGGGTGTATTTGGTTGTACATTTTGTGTGTGTATTAGTGTGTAGGCATGTTCTTAAGTCATAGGGACTTACGCATGTAAGCTATGGGCGCCAATAGGTGCACGGAACG:1	-	chr2L	22183215	3'	-	Idefix	6914	2	72.41
TATAAAAAATAAAAAAATTCTTTAACACCACTTTAATGTTATGGAACTTTAGAAGAATATTTTCGCTTTTCGTTTAAATGCAAAGTGATACTAGTTTTCCTCAGTGCCTACCGAAAATCAAGACCCAGATGCGATCGACTCAATTT:1	-	chrX	12960737	3'	+	Bari1	1408	1	47.26
ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCAATGGGCCAATG:1	-	chrX	18193639	3'	-	jockey	21	1	66.67
TATTTTTTTTAATTTAAATTTAACTATACTCTAAAGAGTAACACCTTCCTATAAAATATGTGCGTTAGAAAACTTCTTGAGACTACAAGATACTGAATGTATCTGAAGATACATTCTAATGCCCTATTTATTAAGAAGTAATGTTT:1	+	chr2R	10655386	3'	+	S2	90	1	73.97
TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGCTACAAGGCAT:1	-	chr2R	13585373	3'	-	412	28	2	65.07
TGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATTTTTTTTTAATAATTCCATCTGGATTTGTAATTCCAAAAGTGTTTTTGTATCTAACAATATACAGTATTAAAAAAAC:1	+	chr3L	17653034	3'	+	S-element	1675	1	57.53
ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAAGTCATCCCTCTTCAAGCTGTACACGACTTCCCCATCTTGCTCTATTTTCCTTTTGCCCGGACAATCAG:1	-	chr3R	1433069	3'	-	mdg1	7047	2	78.08
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAAT:1	+	chr2R	14387982	3'	-	roo	8712	2	76.84
AATGTGAAAAAAAAAGCTATTTCACAAGAATGTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAAACACACCCACACACATGTGTCTATGCTGGTTTTCCATTAATTTTATTTCCGTATTTATCTGCCTTTGTGTTT:1	+	chr2R	22700308	3'	-	copia	372	1	50.34
AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTT:1	-	chrX	7195060	3'	+	P-element	2860	1	41.18
TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCGCGTTTAATTTTCTCA:1	-	chr3R	11083884	3'	+	412	445	2	55.81
ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCA:1	+	chrX	17431770	3'	+	hopper2	1548	1	77.14
GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGGGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCTAA:1	-	chr2L	2794167	3'	+	Burdock	6357	2	50.40
TTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCAAATACCCGC:1	-	chr3R	10273930	3'	+	HMS-Beagle	6991	2	55.48
AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCTTATTGGTTGATTTTTATAGCTAGACATAAAACTGGTTGTGTTATACTATCTTAGATAAAAGCAAATTTAGCAGCTAGCCAATTTAAGTTCGACTTTAAAGAGTGCCA:1	-	chr2L	9399391	3'	-	Transpac	10	2	77.40
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCG:1	+	chr3R	22122768	3'	-	roo	8746	2	77.40
CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTTATGTAATAATAGGCTTAT:1	+	chr3L	16015377	3'	-	1360	10	2	72.60
CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAA:1	+	chr3L	9659854	3'	-	Tirant	8118	2	61.05
AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTAAAAC:1	-	chrX	10644405	3'	-	jockey	4791	1	62.14
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTATTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATT:1	+	chr2L	12892729	3'	+	roo	9032	1	57.55
ATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCT:1	-	chr3R	9714349	3'	-	Stalker4	6986	4	65.07
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGTATGTATATATGAGTGAATATAATTAATTAGTGAGCTTGTAGCTTGTTTAATTGTGAACTGAAAGGATATGAAGATTTACAACCTGAGATTCAGGCCAATGGCCT:1	+	chr3L	17783189	3'	-	roo	8678	2	49.66
ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTNCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTC:1	-	chrX	10521638	3'	-	Tabor	6902	2	60.43
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTC:1	-	chr2L	12892640	3'	-	roo	80	2	77.70
ACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTGTAGGAGTCTGAAGGCCCACGGGCCCCAAGCAATTAAGACGACCACCTGCCGGTGTCCTAATTAGGCCAAGTGCTCGAAAAA:1	-	chr3R	27996688	3'	-	roo	121	2	71.30
CTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCACAAATTTATTTTCTCGTCGGTCACCCTGAAAAGTATGCTACATTTTGGCCATACTTAAAGACATAAATACAGTTT:1	-	chrX	17054141	3'	-	jockey	12	1	77.08
CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCC:1	+	chr2L	19965056	3'	-	Doc	70	1	60.87
CAAGGACGTTAGATGGGATCTTTAGAAGATTTAATTTTCCTGCCGTATATAATAAAACCTCCTCATACCCGTTATTTGACTTACTTCAGAGGTTGGATTTCGTTCTTCATCAGCG:1	-	chr2L	6653506	3'	+	Rt1a	5026	1	62.61
CTAATAAAATTATGAAAACAATCATGAAAACAATTGTTTTTATGTTGCTACCAGTCCGATTTTGGAATCTTTTCCCTAATAAAATTATGAAAACAATCAATATTATTGTCCATAATTATCTCATTTCGACTGATCGATGCGCATC:1	+	chr3L	20707629	3'	-	INE-1	400	1	76.55
GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATCTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAGGGGAAAACGGTGGAGTGGGCGTGG:1	+	chr3R	14940184	3'	-	jockey	32	1	50.45
GCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTATATCCTAATGGGTATTTCCAAGTCCGTACAACTTTGTCTCATCC:1	-	chr2R	20194204	3'	+	Max-element	8507	2	52.78
TGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGGAGGAGGTGGAGGAGCAGCAGCTCCTCCCAGGAGACGGACTAACATTTTGACTCGAAACTTTGCGATTAAACAGAAG:1	-	chr3R	28076204	3'	-	jockey	4740	1	74.29
AAGAGACGAGAATGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGCCGGTAGAGTATGGGGAAGCGGTGTTGTTGGCGTATTACGTTGTTGTTTAATTGCATTTTCAATTTTAAGTCGTCAAAATCGTCAGTCTTTTCATTT:1	+	chr3R	2444965	3'	-	1360	3228	1	74.10
GTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGG:1	+	chr3L	7588491	3'	-	hopper	78	1	69.86
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATG:1	-	chr3R	7835099	3'	+	roo	9032	1	55.00
AAACTAACTCGAACAAAGATCAAAATAAATTCTTAATTTCAGTCTATTCCAAACTGTGAAATAACCATTCTAAAGGTATATATTGTTATTATGATTAGATGCTTCAATATATTAAAAATTTATACATTTAAAACGCGCTGCTATTA:1	-	chr3L	10282253	3'	-	S2	367	1	74.66
ATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGTTGATGTAGTACCAACTGGAATTGCTTGTTAAGGAAGTTTAAACTTTCTCCTGGACTGCC:1	-	chr2R	20492764	3'	-	G2	331	1	54.79
CAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGCCGTTTCCCTGCACCT:1	-	chrX	5274272	3'	-	roo	23	2	63.20
TAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTG:1	-	chrX	5629133	3'	+	jockey	4909	1	73.29
CTGGCCGAAATTAATAACTCAAGAACGGGGAGAGATATTAAGATAATTTTCGCAATGGGGTTTATTTTTTGTGGCTTATAACTCCAGAACGGAAAAATATATTTAATTAACTAATTTTGTATAGGGATTTCCCTAATTCC:1	+	chr2L	22107777	3'	+	Transib-N1_DM	27	1	65.71
AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCACGGGAGAATATACGGAAACTATTCAAGAGTTTACA:1	-	chr2R	16950003	3'	-	jockey	4825	1	75.34
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGCTGCCTTTAACCCATTATATACCGTTCGGCAAAAACAATGGACCACAATCAGAGACACTCTTTCCAATTTCCTTTGTATAGC:1	+	chr3R	13501229	3'	-	hopper	4	2	78.36
CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTCGCTAAGTGCAGGCTGCAATCAATGCCGTAATAGCAACAAAAACAACAGCAATAACAGCAATAACAACTTCCGTATTTCATGCGCTGTAATTTAGCTCAAG:1	+	chr3R	13822621	3'	+	hopper	1398	2	73.79
CGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTATTTCCCTCATCAGGCAGCGATCACCATTGATCTTCGATCGTCCAATGAACGTGGCCCTCC:1	+	chr2R	4736780	3'	-	Doc2-element	4595	1	62.73
CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGCTTAGTTGATTTGAGCTAACAAAGGGTTATAATATAACCCACTATCTTAACCAG:1	-	chr2R	19499262	3'	+	P-element	2877	2	76.09
ATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTATAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACAAATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTCTTCATTGTTAAACTAAAGTTGAACGAGAATTATTTG:1	-	chrX	19221724	3'	-	1360	3014	1	74.66
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATGGCACTGCATAAACTTGGCTGGAAAGTATGCTACAGTTTGGCTCCCACTTAGCGAGTCTG:1	-	chr3R	13501077	3'	+	hopper	1382	1	56.45
GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGAC:1	-	chr3R	20499718	3'	-	mdg3	31	2	64.38
AAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGACTTCTCTTATCGGAAAGCTGCG:1	+	chr3R	27424902	3'	-	blood	7107	2	79.07
CGACTATCAGATACCCATTACTCACCTAGTGCGAACGAGAGAGTTCAAAAATATTTTTGGCATAAATTCAACACATTAATTTCCTAGAATAATACAAAACACTTTCTAAAAGTCCAAAGTCAATCTTAAAGTTTCAGAGAGAAAA:1	+	chr2R	13232892	3'	-	INE-1	550	1	77.24
CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAACAAATTGCAAT:1	-	chr2L	18419104	3'	+	412	467	2	66.20
TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGCTACAAGGCATGCAAATTTGCTAA:1	-	chr2R	13585360	3'	-	412	15	2	73.97
TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAATTT:1	+	chr3L	9673135	3'	-	Doc	47	1	50.00
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTGACCATATGGCC:1	+	chr2L	17471711	3'	+	roo	9053	2	66.13
TATTTTAAATTTATTTGTTTATTTTTTAACTGCATTTTATATACTTCCTTATTCGAGCCGCGGGCAGTGTGTTGATTGCCGATGTTGTTCCATCCTCCTGCCAATTTTTTTGCGTTTTGAACAGCAGATCAGTTAGCTGTGG:1	+	chr3L	22520747	3'	+	S2	99	1	67.61
TTATCAAGAATATATATGTATGTATACTTCAAAGGGTCCGAAACGCGTTAAAGTTGTATCACCCCTGCGGTTTTATAACCTGATGCTTTTGCTAAAGTAATTTATCGGAAAAGTTGAAGTGCCGTTATTTTGTTG:1	-	chr2L	6090358	3'	-	INE-1	75	1	77.04
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTAT:3	+	chr2L	17420260	3'	-	roo	53	2	55.48
AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAAT:1	-	chr3R	17478366	3'	+	copia	5064	2	60.96
GGTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTA:1	-	chr3R	17478395	3'	+	copia	5037	2	78.62
GTAAACACTTTCTTGACAAAATGTATTTCTTATCGCTGTTTAAGTGATGAAATTGTATAAATTTGAGCATATTTAATACTTTTTTTTGAGACCACATTTTGCAAGTGTCCTTATGTATGGGGTGATAATATATCAAAACATCGATA:1	+	chr3R	25495895	3'	-	S-element	2	2	72.60
GTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTG:1	+	chrX	21014843	3'	+	copia	180	2	70.55
AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTTATAAATAATTTGTTTTTGAATGACATGCTATCATACAAATACATTTTTCCTAATTTATTAGTTTGTAAAAAGTGTACATTTATTAGGTTTTTATGAGCAAGCT:1	+	chr2R	13122143	3'	+	pogo	2089	1	74.66
AGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACTAAAAGACTAATCCACTTATTGGCGGTTTGGACCGAAGGAAGTAAAAAATACACAGCACTAGAGTT:1	+	chr2L	20135615	3'	-	jockey	4755	1	63.30
ACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAA:1	+	chr3R	17605712	3'	-	Tabor	82	2	71.23
AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGC:1	-	chr3L	2362345	3'	-	Stalker2	54	2	66.37
GACGTTCATACGGACAGACGGCTATTGATGCTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGCCGGAAACGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTACGATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGTCAAGTTA:1	+	chrX	19810264	3'	-	INE-1	126	1	68.49
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATG:1	+	chr3R	25448435	3'	-	roo	63	2	63.01
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCCTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCGTTATATTTGGT:1	+	chr3R	12887018	3'	-	roo	32	2	63.19
TATAGGAACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCA:1	-	chr3R	9922013	3'	-	blood	7029	2	70.77
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACG:1	-	chr3R	25448318	3'	+	roo	9029	1	56.16
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAGTTGTGCTCAGTCTGAGTATGAGTATGAGTATGAGTATTTGGCTGCCTGGCAGGGATTAAGTGGGTAATGAAGTATCTATT:1	-	chrX	14341365	3'	+	roo	9013	2	76.19
GGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTT:1	-	chr2R	5209630	3'	-	gypsy	47	2	73.96
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTAT:1	-	chr3L	12879738	3'	-	roo	63	2	64.54
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCT:1	-	chr2R	21907926	3'	+	roo	9042	1	53.77
ACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACACGAAATTTCATAATTTTTCTGGAATATCGATAGATATTGGGGAGTAAAATGAAAAAAAAACTTAATAATTGGCAAGAAAAACAATACAACGAAGAACGTTCCGTG:1	+	chrX	22959250	3'	-	INE-1	548	1	65.75
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGA:1	-	chr2R	19050193	3'	-	roo	8719	2	58.96
AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACGCCTGGTTTTTATCATAAGGCAATTTCATATTATGCTTGGGCATTTCGGCTTTAGT:1	+	chr3L	7188674	3'	-	hobo	5	1	83.09
GACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGCGAAGTCACGTCTCTTATGTCCTACGGCAA:1	-	chr2L	5844946	3'	+	transib2	2807	1	71.64
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGCCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGT:1	-	chr2R	16785355	3'	+	412	7475	2	74.02
ACACTTTTGAAAAATGTATTGACATTTTTTGATTTGGAAAACAAATTTTTGCCATACAAGTAATGTTAAAAGTTGGCGAATTACTTATATTCAGCAATGTGAAAGCGTTCATCAGGGAAAGGAATTTTTCTCAGAACCAATCAAAG:1	+	chrX	21450907	3'	+	INE-1	260	1	59.59
ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCT:1	-	chr3L	10848666	3'	-	blood	7054	2	64.08
GCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGATTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTA:1	+	chr3R	9039001	3'	+	Juan	4137	1	71.92
CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGAGCAGTCGAGTGTGGCCTAGTTTTTGGGTTCAAGGGACAATGAATGTGCGAAAAATATTTTATGAGCTATATTATGTA:1	-	chr2L	2687318	3'	-	copia	4912	2	53.42
ATAAATGCAATTAAAAAATATTAAAATTATATTACAGTCAGACAGATATGGAGCTTCATCTATCAGGCAAAACATGGGGTTGGAAAATCTATGCTCTGATTGCACCCAAATATGTTCAATATAATTGTGGAATAATTTCAATTA:1	+	chr3L	14386803	3'	+	Tc3	1358	1	56.25
GCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCACAGTAAGCTGTTCTTATGTAATTTAAGTCCGGAAATCTTCAATACGTTAACCAATGCACGTGGCCGAGTATAAAGAGGGCCGGAGAAAGGTGAGCTAAAATTGTTAATAGCCGGAT:1	+	chrX	21016744	3'	+	Transpac	368	1	73.97
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATACTAAAGTACTTACTCATGAAACTTATGGATAGACATCTATTAAAA:1	+	chr2R	7896356	3'	-	roo	8740	2	62.50
CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCTGCTACTTTTTATTTGCCTATCGTATATGATGAGTATGTGTGTGTGTATTCTCCTTAAAGTGCAAAATACATTTTT:1	+	chrX	3308409	3'	+	hobo	2908	1	60.61
AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAACAAAGAAA:1	-	chrX	13704740	3'	+	invader4	305	2	65.12
GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCA:1	+	chr2L	3886275	3'	+	roo	9063	1	75.00
GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATC:1	+	chr3R	11496605	3'	-	1360	67	1	59.71
TGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAA:1	-	chr3L	7292451	3'	-	HMS-Beagle2	6934	2	55.48
AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAATGCTTTG:1	+	chr2L	13585932	3'	+	Tabor	7267	2	54.86
TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTC:1	-	chr2R	16891843	3'	+	hopper	1360	1	62.40
GGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTTTCATTGGATTTGGAAGTCGTAGTATTTCTCCACCCTAAATAAGGGGACACTGAGGCCAGAGCCTCATACGTGGGGTTCGAAATAC:1	-	chr3L	19473947	3'	-	Cr1a	4230	1	73.77
TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACAAAAACAAACAGGCTTTGATATTTACAATTATA:1	-	chr2R	21572068	3'	-	hopper	33	1	62.50
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACGCGGGTAAAACAAGTTTT:1	-	chr2R	977526	3'	-	F-element	71	1	59.59
CGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACATGGGATATAAGAAACTAGTAACGAAAATTCAATAAAAAGGCACATGCAACTCTACGCACAATGCGG:1	+	chrX	15955776	3'	-	hopper	66	1	51.11
TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATGTAAATGAAGTTGAATACAAACATACATATATTCATCGCTGA:1	-	chr2L	10685326	3'	+	I-element	5279	1	74.66
TTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACAAAAACAAACAGGCTTTGATATTTACAATTATAGAAAATCGACCATATAGAGAT:1	-	chr2R	21572047	3'	-	hopper	14	1	76.03
AACTTTCAGATCTCTTTCGATTACCTGGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCTCAGATGCGTGACGTGCAGCTCTCGACTGGTTTTTATCTATCGTAGTGCAAACATTCTGGTAGGCGGTCATGCTTTGGTATTTGGCAACAC:1	+	chr3R	26717875	3'	-	G5	4506	1	57.14
GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGATATGAACACCAAATTTACCCATACACGATT:1	-	chr2R	9220986	3'	-	opus	7143	4	64.03
CTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGGAGTGGAAATGGGGTGGGAAACACCTGTTAGGTTGCATTCACAACTGGATCTGAATGCACACTCGACGAGCTGAACATTTTGTGATATAAATGGATCAC:1	+	chr3L	20651838	3'	+	roo	8794	2	69.18
CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTATTATGCGGG:1	+	chr2R	17626955	3'	+	opus	7495	2	76.72
AAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAATGTACTAAGTTATCATAAGTTATGGCACATAAGTTGTTGCCAAATCTTTTGCACTGGCTG:1	-	chr2R	12120101	3'	-	Stalker	6816	2	52.80
ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCG:1	+	chrX	17963958	3'	-	jockey	4818	1	57.53
GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGTATACGGGTATAAAAATATTATATTGCTTTTCTATTAAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATATACATATGTACATATGTAGTATTAGTGAAAAATACAAAAT:1	+	chrX	22511473	3'	-	1360	4	2	67.81
GCTATTGATCCTGATCAAGAACATATGTTTATACATAGCGTTACAAAAAGGTGCGCTTCCCGGGGAGTCTCGGAAATCGGTAACTGTGCTCCTAAAGGCTACCAGTTCACTCGAATCGCCCCACTAGCTTAAG:1	-	chrX	648028	3'	-	INE-1	86	1	72.18
GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGACGCTTTTCGACAGCCGAGCGAGGAGGTTGTGCTCCCAGAAGCGATATGAATT:1	+	chrX	7195161	3'	-	P-element	15	1	73.85
CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTC:1	-	chr3L	10013579	3'	-	hopper	37	1	53.91
ATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATC:1	-	chr3R	9714398	3'	-	Stalker	79	4	70.55
CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGGTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCGGCATCCCTCG:1	-	chrX	5274288	3'	-	roo	8724	2	58.22
TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGACGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAAC:1	-	chr3L	6978142	3'	-	pogo	65	1	63.70
AACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTG:1	+	chr2R	16248002	3'	-	BS	4	1	60.00
TAATAAAAATAAAATAAAAAAACTTTGGGGAAATGCTGCAACTAATAAAAGTTTTTGCTCTTCGACGGCGCGTTCGGTGGTGTGCCACGCCCACCAACACACTCTCGCTTCCTGGCCACCGGTTGA:1	-	chr3R	17450158	3'	+	Doc	4693	5	77.78
TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGAATGAATAATGGAAAATGAAGTGTTC:1	-	chrX	23283830	3'	-	blood	49	2	59.09
GATAAGCTGGGCGATGGTAATTCCGCGATAAGTAAAAAAATTCATTCAGTTGTCCAACTTCAACTCCAACCGATGTTTTCTCTGGGAACCAGCATCAAATCACTTCTAACTCCCGCACCTACCAAGGAGTTAACTGGCGCAGACGG:1	-	chr2R	3463861	3'	-	Ivk	73	1	78.77
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAA:1	+	chr3L	15600344	3'	+	roo	9032	1	44.76
TTCACATATTTTAGGATCGGCGGACACAAGCACTCACTTACAAAAGCACATTCTTTAAAAAGTAGACACGCGAAATTACAATTGTCTTAAATTGTTTTGAATTTAATATAGATCGAATTTTATTGCATGTGGTA:1	-	chr3R	26671832	3'	+	FB	1036	1	71.64
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTTTCACGTTTCCTTATACATTAAATTCCCCGAACATAACATAAT:1	-	chr3R	17420370	3'	-	roo	19	2	69.18
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTA:1	-	chr2L	3164968	3'	+	412	432	2	70.59
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCAGGCAATCAACTGTGTAAT:1	-	chr2L	17420097	3'	+	roo	404	1	79.58
TGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAGAATGTATTGCCATTC:1	+	chr2R	5198496	3'	-	INE-1	81	1	63.70
TTTTTCTTTTTAATGTGTTAATTAGGGTCTAATACTTGGTTGGATAGACTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCTATTTTTGAACATTTAACATAATAAGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCG:1	-	chr3R	19447196	3'	-	HB	1357	1	52.74
TGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGACGCTTGCTACTTCTGAGAAATGTTTCGACTTCAAAATTGACTTCGGTGTGAGGGAGGAATTTGAGGAAATACTGTTG:1	-	chr2L	11653194	3'	-	F-element	4487	1	50.00
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCC:1	+	chr3L	16343296	3'	+	roo	357	2	59.35
CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATT:1	-	chr3R	7482704	3'	-	412	24	2	66.43
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGTGATAGCAAATGAAAAAGAGCCTACGCCTAAACACTTCTTTAAAATAAAAAAAAATTTCAAATTTAAACAAAGTGTTTGAATT:1	-	chr2L	3886105	3'	-	roo	8685	2	65.75
TGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTCAGGGATCGTTTTAAAGTTTCGTAGTTGCAATAGAAACGCGCGATGAGTTGCCCACATTGAAAATGTTAAAAATATATTTACAA:1	+	chr3R	25172249	3'	+	Dm88	413	1	50.69
CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTACTATATGGTTATGCGTTATATGCCCAAAGGCTTCGTTCGGCTGTAGATGAGCATAACATTCTTAATGCTTCGC:1	-	chr2R	15289102	3'	-	hobo	35	1	58.82
CAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACTGCCGCTCATCTGGGCCACAAGCATGGGCACCA:1	+	chr3L	2362429	3'	+	Stalker2	384	2	65.49
CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGT:2	-	chr2L	14892220	3'	+	transib2	2750	1	69.18
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAGGCTATCATTTTCAATTTTATAATTTCTAAATGTTGATGTTTATGATATAACCA:1	+	chr3L	11393630	3'	+	roo	399	1	73.29
GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAG:1	+	chr3L	26011934	3'	-	F-element	93	1	78.68
AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCCGTATAAAAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCAAAGCTGAGGCTGCTGGTTTCTAT:1	-	chr3L	13574432	3'	+	hobo	2930	1	68.13
GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTTGGTTCATTA:1	+	chr3L	20168470	3'	-	mdg3	5283	2	60.90
AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCCACCGCCTACCTATCCACCCGTTC:1	-	chr3L	11957095	3'	-	blood	7045	2	58.74
AGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAAATTTAACTAAATTATACACATACCATATAAATATATTCGATTTTCTGAATAAGTGCTATTCTTATCTGAGTGAAAATCCTGTGGAGAATATCTTAAACTACCGCGTCT:1	-	chr3R	20427740	3'	+	jockey	464	1	51.72
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCCAACTTTCTCCACTGCATTTCTCTGTCGATTT:1	-	chr3R	14958047	3'	+	roo	9034	1	75.00
ACTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCC:1	-	chr3R	12618633	3'	-	F-element	70	1	71.05
AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAAC:1	+	chr3L	7943739	3'	+	Burdock	6359	2	59.59
TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGC:2	-	chr3R	17605651	3'	+	Tabor	7244	2	69.86
AAAAAACTAATTGGTGGGCAAATATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGCTGACACCCCATCTTTTTTTAAATATTAAATATTAAAGCTCATTTTTTT:1	-	chr3L	49549	3'	-	FB	80	1	67.81
TATCTGCTGGGTACATCCAGAGTATTGTAGGGTGTGTTTGGGTGTATTATTGTGTAGGCATGTGGTTATTTTTTTTTTCACTATTTTCGTAACATTTCCGCCTTTTTGCATTCAATTTAATTTAACATAAACATTTATATGCTTAT:1	+	chr2L	14869892	3'	-	Idefix	89	2	52.74
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGA:1	+	chr3R	22844268	3'	+	roo	331	2	72.60
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACA:1	+	chr2R	9328712	3'	+	roo	396	1	68.75
GAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATACAGATTCTAGAAACATAAACTACGAAAAAATTAGTAAAAATACATAGTGCGCAGTTTTACACAAGTGCCTATTTTGCAATTAACTGTGCTGTTACGAAGGC:1	-	chr4	1189709	3'	+	INE-1	148	1	60.96
AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATANGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACAT:1	-	chr3R	26659743	3'	-	HMS-Beagle2	30	2	54.03
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGT:1	-	chr3R	25448357	3'	+	roo	8990	2	73.29
GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTA:1	-	chr3R	19589887	3'	-	BS	5030	1	58.22
CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTAAATCTCGTTCGGCGTGCTGGAATCTGATTAAAGTGCCAGTTCC:1	-	chr3R	28758243	3'	+	mdg1	414	2	60.96
AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATA:1	-	chrX	17833005	3'	+	Tirant	354	2	70.59
TGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATT:1	-	chr3R	13349054	3'	+	BS	5047	1	61.48
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAA:1	+	chr2L	14772146	3'	-	roo	40	2	55.40
TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGT:1	-	chr3L	11393493	3'	-	roo	8741	2	74.66
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCCTATAACGAGGAT:1	+	chr2L	6059349	3'	+	roo	9046	1	68.28
GTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAA:2	+	chr4	829116	3'	+	INE-1	137	1	33.56
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATC:1	-	chr3L	9998014	3'	+	roo	393	1	45.21
TTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGCTTTTGTGGTGAT:1	+	chr3R	12717812	3'	+	297	6904	2	78.36
GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGCGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCCTGCGAATGGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGC:1	-	chrX	18193678	3'	-	jockey	72	1	67.19
ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCACGTGAGTGCGTCTCGCTCGCACCCATGGGGAGTTGGG:1	+	chr2R	11629826	3'	+	Tirant	8474	2	60.42
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAAATCAAACTCACGCTTTTGCTAAGCTAACTAAAAATGTATGCTTAGCTAAGTAAAGGCAGAGATA:1	-	chr3L	11530831	3'	-	roo	14	2	74.66
AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCA:1	-	chr3R	19589929	3'	-	BS	5072	1	68.49
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTTAAGGTCGATTACT:1	+	chrX	13039536	3'	-	roo	8703	2	68.37
TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCG:1	-	chr2R	23266043	3'	+	mdg1	353	2	72.09
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTAACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATT:1	-	chr2R	8585451	3'	+	roo	345	2	70.49
TAAAAGGCGACGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTGGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTATAATGTGAACATTTTTCGTCATTTGCTTTTCCTAAGTACCGTTTCTTAAAATTCTGC:1	-	chr4	290944	3'	+	rooA	7530	2	71.74
TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGACTTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGATTTCCGTGCAGGAGCT:1	-	chr2R	21228987	3'	-	jockey	67	1	56.43
TGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATGCCTAAATT:1	+	chr3R	25454137	3'	-	Quasimodo	24	2	55.48
ATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAATTTGTTGAAAATTCCGTTAGGCTTTCCTTTC:1	+	chr3R	17264911	3'	+	roo	8755	2	77.54
TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAANAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACATTGTGATATTTCTACATGTGTTAG:1	-	chr3L	17557960	3'	+	jockey	4984	1	71.33
AATAAAAAAAAATAAAAAAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATACCCCTCCCTATTCCCACCCTATTCCG:1	+	chrX	19769944	3'	+	BS	5102	4	64.71
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGG:1	-	chr2L	3114471	3'	+	roo	9017	2	55.17
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTCTTGATTGACAAATTGATATTGATCACTTGGTGAAC:1	+	chr3R	14364673	3'	-	roo	86	2	78.08
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAAATAAAATAA:1	-	chr2L	12892591	3'	-	roo	8702	2	56.85
AAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTATCTCCATTCTGCAGCACCCCC:1	+	chr3L	12932178	3'	+	F-element	365	1	76.71
CGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATGTACGCGTTCTCGTCGCTTGTTTTTACTCTCACAAGCAAGCAAATTTCCATTCGTTTATATGTATATTCATACTCTATATATTGTCGTTAAT:1	+	chr3L	9594554	3'	+	1360	3198	1	61.60
ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGC:2	-	chr3R	20499768	3'	-	mdg3	5333	2	69.86
AGTTAACCAGCAGGAGAAGGTTACCATCGCGAAGATTAGAGATGGATGTGATGTCTTTGCTTATATACTTAAAGGCTCTGTGGACGGCAAAGCAGCAACAACAATTAAAAAGCGCGGACACCGAGAGAACTTTTTTTTAAAGATAT:1	+	chr3L	16178049	3'	-	Ivk	456	1	65.07
AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTG:1	-	chrX	13066517	3'	+	jockey	4918	1	69.86
ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGGCATTCGGTTGGCACGGCGATGTCAACAGAACGTTAAGCGGGATTAGGACCGCCGCTTTGCGCTT:1	+	chr3L	7292606	3'	+	HMS-Beagle2	294	2	73.29
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATTCAATTCAAATATTCTTCACTTTAGC:1	+	chr3L	10292919	3'	-	roo	44	2	55.48
CATACTTTTCAACGAATCTAGTACTTTTCAACATTTCCTAATACCCTACATTCTAGACGATTTCATCGCTCTCCAATCACATAGATCCAATACAAATTCAAAACTTAAAGACAACCTAAAAACCCCTACATCCAAATTTCTGAAAA:1	+	chr3L	18848155	3'	-	INE-1	11	1	34.25
GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTGGATAGAACTGCGCTTGAAT:1	-	chr3R	23495629	3'	-	copia	4894	2	66.67
AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGGCAAATATTTGTCCCTTTTTTTCGATTCGTGTTCTCTGCTGGGG:1	+	chr3L	10013714	3'	+	hopper	1407	2	78.36
ATTTTTCTAGAATATCGATAGATTTTGGGTAATAAGATGGGAGAACGGGTAATAAGATAGGACGTTAGAGTGGGCGTGGCAAATCGATAGAAATTTAAAAGACTAATA:1	+	chrY	1654283	3'	-	INE-1	501	1	37.96
GGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGGGGGCTTAACTTCTCGATGCCTAGTTGATTCACTAGAAACTATATACCCCCGGGTTAAAAGAAAGAATTAAGTTTCAGCT:1	+	chr3L	18592286	3'	+	Cr1a	4066	1	60.75
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTACTGCTCGTAGTGAAGGCCCACAAATGAACCATTAAACA:1	+	chr2L	7898423	3'	+	roo	9055	2	68.89
GTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATTCATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACAGTGTATAAAATTGGATGTGAACGATATCGTTGGC:1	-	chr3R	26409862	3'	+	Quasimodo	6975	2	65.71
GTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGAGGAGAGAGCCTCAATAATCCGACATGGTAGCAAAAAGAGCATTGGCCCATGATAATGGCAAGAAAT:1	+	chr2L	9409537	3'	-	jockey	4895	1	53.42
TATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTC:1	+	chr2R	5532336	3'	-	G4	3788	1	56.45
AAATATTTATTTTTTTTTTTAATTATTTAAAAATCTTTTTTTTTCGGCTTAAAACTACTTTACCTGAACTTCGTGCAACTATCCGTCTGGCTCACACGATTTTGTGTGCAGTTTGCATTTTTTTTTCCA:1	+	chr3R	17973088	3'	-	mariner2	829	1	73.64
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGAGTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGGTGCGAGAACAG:1	+	chr2R	13710700	3'	+	roo	386	2	64.34
AGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATT:1	-	chr3R	4160065	3'	+	invader2	189	2	57.93
ATATATATGTGCATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATT:1	+	chr3R	556445	3'	-	Juan	4179	1	79.41
AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGA:1	-	chr3L	4605633	3'	+	pogo	2034	1	70.90
CTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGGCG:1	-	chr3L	27415189	3'	+	transib2	2796	1	64.49
GTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGCAAACAAGACAA:1	-	chr3L	19013902	3'	+	invader3	225	2	52.74
AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGT:1	+	chr3L	11957226	3'	+	blood	7335	1	55.86
TTTTTGTAAAAAACACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACATTTTATTGGCCGCACA:1	-	chr3L	10013537	3'	-	hopper	15	1	72.59
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATGTTT:1	+	chr2L	17420264	3'	-	roo	49	2	52.74
TATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGTTTAATTGTCCTACAAAGGCTGACCACAACAAACCGGAGG:1	-	chr3R	22821939	3'	+	mdg1	420	2	78.08
GTTTGGACTACAAGGTGCTGTTATACAACACAGTTGTATAAAAAACCATAAAACCAAATCGATTGACCAAATCACTTATAGAAGTGAATAACAACACGCGCCTCCAACGTAACGATTCACCTGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCCA:1	-	chr2R	5284581	3'	+	Doc4-element	2552	1	62.33
TTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCAAAGGATAACAAGTTGAAGTTGGCCTTAATACATGTCCAGTTGGCATGCAAGTGGCATCAGACCCTCCTG:1	+	chr3L	10055968	3'	-	transib2	2745	1	50.36
CGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGATACTTCCTCTGCTAATTTATATGCTAGCTGCAAGTTTTAAACTTACCCCTCGTGAGTCTCTGAAGAGGATGGC:1	-	chr3R	21202559	3'	+	HMS-Beagle	385	1	58.91
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCA:1	-	chr2L	3114448	3'	+	roo	9040	1	63.45
AGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAAAACTAGAGAGACGAGTGCGAAAGCGAATGCGAGTGATATGCGAAT:1	+	chrX	18386456	3'	-	invader4	73	2	70.55
TCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGTAAAATTTCAGTTAAGTGTGTGAAAT:1	+	chr2L	12290790	3'	+	1731	4592	1	60.96
TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATCCTATTATAGAGATATAAAACTTATTGAGCCCTAAACACAGAGGA:1	-	chr2R	6172951	3'	-	pogo	28	1	66.44
GTTTGGTATAATTCGGTTATCGGAGAAAAGTGTTGTTCAGCTGATCGTGGTTTCCGCCGTTGGCCCACGCCTCGCGACCACATGTACGGCCCACAGTTTCCACCAGTTT:1	-	chr2L	13701372	3'	+	gypsy12	157	2	67.89
TAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCG:1	-	chr3L	17685099	3'	-	mdg3	5285	2	40.29
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGA:1	+	chrX	6486814	3'	+	roo	356	2	54.79
GATTTTTATTTTTTGTTTGTCAAACCAGCCGTGATTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATAGTCTCCTTGCTGGAATACATTCCCAGGCCAACGGACTTTAAACCCCTGCAAAAAATGGAAAGA:1	+	chr3L	20192296	3'	+	Cr1a	40	1	55.56
GCTCTTGGATACAAGTGCTTTATGGCTTATAATTTGATACTTTTGTTTTTCGGGACTTTGAATCCGAAGTTTGAACGTGGGAACGTGTTGTTTAGTCTACTAAACAAACATCAAACTCCAATCTAAGCA:1	+	chrX	21790407	3'	-	Idefix	7141	2	77.52
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCAAATGGC:1	+	chr2R	24218614	3'	+	412	7496	2	58.40
GGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGCGGACTCACCTC:1	+	chr3L	3799867	3'	+	copia	251	1	68.67
AAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAACCTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	373	1	58.22
AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGGAGTGTGGCAAATAAATTGACATTTAGCTGGGCGTGTAACAAGATCAAGTATACGCAATGTCGC:1	+	chr2R	21920594	3'	-	jockey	22	1	65.09
TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGTAGAATCGCCTGCAATCTCCG:1	+	chr3L	11957246	3'	+	blood	7361	2	64.03
AGCTACGGATAGCAAGTTCTAAAACTACAACGGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGCAAAGTGAAGTTCTTACAATTATTGACTATATTAACTATTTTCACTTTAAAGTTAACCAAAGATAGCAGCAGCACTTAGTCGAGATAG:1	+	chr3R	29914114	3'	+	Doc	47	1	60.96
TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTA:1	-	chr3L	6978135	3'	-	pogo	58	1	60.27
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAACGGGTATACCAATTTCTGG:1	+	chrX	9540097	3'	+	roo	8996	2	70.34
GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACA:1	+	chr2L	2687416	3'	+	copia	174	2	73.97
CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATAGTAAGTCTCTAAATATATTCGAGTTCATGTGTGAACATTAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTA:1	+	chr2L	18294261	3'	-	roo	92	2	78.77
TTCTTCTTTTTTAAAAAAATATTAATAATGATTCGCATACATACACCAATTAGCAATTGGTATATGAAAATCTGTCAGAAGGTATATTTGTTTCTAAAACCATTGTTACATTTTCCAGGGCATCTGCAATTCGTTGGC:1	-	chr3L	18423636	3'	-	TART-C	11035	1	75.36
ACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAG:1	+	chrX	10521716	3'	+	Tabor	417	2	66.19
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAG:1	+	chr2L	3114567	3'	-	roo	65	2	65.00
TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTA:1	-	chrX	10644409	3'	-	jockey	4778	1	67.48
AAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACA:1	-	chr3L	28063325	3'	+	Stalker	6961	4	71.92
AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTAT:1	-	chr3R	19589876	3'	-	BS	5006	1	72.18
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTTGTGGGGAAGTTGCAAC:1	-	chr2R	13696367	3'	+	roo	9052	2	67.97
AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTANTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATTT:1	+	chr2R	5485238	3'	-	blood	7045	2	60.96
AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTTCCCTTTACTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCGGCTTCTTTTTC:1	+	chr3L	16750768	3'	-	Tirant	8142	2	57.04
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGTGATAAAAATGAGCTGATGT:1	+	chr3R	18339209	3'	-	roo	8675	2	72.27
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAATA:1	+	chr2L	14772148	3'	-	roo	45	2	54.11
GTATCACCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTATCACCGTATTTATGATTAGCATTTTGACAGAGTTCTTTGAGAACTCTTTTCAAAATTTCTAACCCAAAGCACTGCAACTGTTTTCTACAGATG:1	+	chr2R	16745477	3'	-	Tc3	317	1	56.93
GGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAACCCTCAAGCCTTGGGGCACACTTAATGTTCATTAA:1	-	chr3L	5191452	3'	+	Bica	28	1	76.03
GGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGGC:1	+	chr3L	7292543	3'	+	HMS-Beagle2	231	2	73.29
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTTATAAATAATTTGTTTTTGAATGACATGCTATCATACAAATACATTTTTCCTA:1	+	chr2R	13122092	3'	-	pogo	62	1	63.45
TGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTAATATGTTTGAACAGTCCCATCTTAAATATATCTTATTATATGT:1	+	chr2L	11878947	3'	-	jockey	4747	1	66.67
GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTG:1	+	chr2R	16785402	3'	-	412	25	2	59.30
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAA:1	-	chr3L	11530895	3'	-	roo	78	2	76.03
TTCTTCTTTTTTAAAAAAATATTAATAATGATTCGCATACATACACCAATTAGCAATTGGTATATGAAAATCTGTCAGAAGGTATATTTGTTTCTAAAACCATTGTTACATTTTCCAGGGCATCTGCAATTCGTTGGCAAGCACCC:1	-	chr3L	18423628	3'	-	TART-C	11035	1	76.71
TATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTTTGTCGTGACTCTTGTTTGTTAGCATAGCAGGTGTTAAGTTGTCAATTTCTTCTTGGATGTTGGTTTTTAAACGCCCTTACGGGTGGCATCCTGCTGTTCTGTTTAT:1	+	chr3L	14323696	3'	-	mariner2	729	1	73.68
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTT:1	+	chr2L	16016408	3'	-	412	7091	2	56.14
AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCTCTTGTCATGATGCTG:1	-	chr3R	27424804	3'	+	blood	357	2	67.14
ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATCTTTAAAGTATTTTGTGTTCTGTTGGCAAGGTTATTCACCGTTTTAAAGCATTTAGAAACAACTTT:1	-	chr2L	20808285	3'	-	HMS-Beagle	15	2	69.70
GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAAT:1	+	chr3L	10574385	3'	-	Tabor	49	2	50.35
TTCTAACCAAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTA:1	-	chr2R	4260435	3'	-	micropia	5216	1	51.85
ATACACATATATATGTATATATATATATAGATGGATTTGGGTAATACGTATTCACTTGCAGCGAGAAAAACAAGGCGAAAGACGCCAAAGAGGAAGCGAACGACGATACCGATGAGGGAGCTGCGAAAG:1	+	chr3L	9870204	3'	+	Stalker2	252	2	65.89
TATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAATATGTAATAATGCA:1	+	chr3L	23529730	3'	+	Stalker2	236	2	64.38
TCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATC:1	-	chr2L	13585854	3'	-	Tabor	73	2	72.93
ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACAAAAAGTGAGTTGAACTGACTGCAGATAATGCGGATAGGTGAAATAAAACCACAACTATGCTCTGAA:1	+	chr2R	21145985	3'	-	pogo	46	1	54.86
AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTAAAATAGATCAAAGCCGAAAAATAATCAACGACCTTTTTTGAGAGTGTGGGGCA:1	-	chr3L	17115447	3'	+	blood	7322	1	60.96
GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACCAGAGTTCGGAAAGTTATTATGTTATATTTGTTTAAAGAAAGAATATATATATATGTATTTAAGCGAATATAAAAATATTCACTATTTAAACCTTC:1	-	chr2L	15235768	3'	-	jockey	4762	1	63.70
TCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAAGAAGAGGGTATGTAAGGGTGTACATGACTATATGTGAGGATCACTACAGCGAGGAGAGATCCTGGGAGTG:1	+	chr2L	23197598	3'	-	Transpac	83	2	73.79
AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAGAGCCACTTGAGACATTCGACGCAATCGTGGCAAGAAATCCATACGATCCTCCAAGTCCTCCCAGCCAGC:1	+	chr4	748719	3'	+	1360	3342	1	54.23
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGGAGCGG:1	+	chr2L	7945402	3'	-	roo	42	2	61.06
GTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACA:1	+	chr3L	24208199	3'	-	Quasimodo	35	2	61.26
CCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAGGCAACAGGCTACAGTGTCCTTCTGAATTATTGAGCGTGCAACTTGTTGAAAATCCAAGGATACCGTCGAAAGGGGAAGCTGCGGGC:1	-	chr2L	4410189	3'	+	Quasimodo	27	2	64.38
GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTT:1	+	chr3R	17605719	3'	-	Tabor	6913	2	66.21
ATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGAGACGCGTGTATATAGAGGATTGGAAGCTGGATCCGAGTGGTGGCTATTTGGCCCCCGGTTTTAAGCGACGG:1	+	chr3L	6388994	3'	-	17.6	7	2	71.82
ATCGACTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTATAGAC:1	-	chr2R	5296809	3'	-	INE-1	95	1	70.34
CTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTCTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCT:1	+	chr3L	10013661	3'	+	hopper	1362	1	64.29
GTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGACAAGGCGTCCGCC:1	-	chr2L	5307101	3'	-	jockey	4741	1	71.64
TAGCTGAACCCAACATCAGCGCACACATTGGGCATTCAAATAAAGAACTTCAATCAGAGCAGAACCTATTCTCTCCTTTTAAATTAACAACTAATCAACTAATATTACAGATAGGTAGATCGCTAGACTTATTAAAACGATATTGA:1	+	chr3R	21177426	3'	+	Stalker4	307	4	67.12
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAGTTTGTTAACAATTTTATCAGGCCCGAGATGTTTTGCCCACCGAATGAGGA:1	+	chr3R	22276815	3'	-	jockey	36	1	71.74
TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCAAATACCCGCCCCTTTTTCTGTTTTACCTTCGCTAATTGA:1	-	chr3R	10273900	3'	+	HMS-Beagle	225	2	71.23
AAGGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTACAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAACACAAAGAATTAAATTAACTCACACATCTTGCTTGATATGTCATCAATCG:1	+	chrX	20645659	3'	+	1360	3081	1	69.18
CTTAATCTCAACCTTCTAGCTTATATAGTTCCTGATCGGTTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATGTACATATGTATATACTGTATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCAGCCTTTTATATACCTTTCAACGAATCGAGTATAC:1	-	chr2L	13064626	3'	-	INE-1	167	1	86.99
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAAAGGCAGCAACACTATCGCTCCTTGTTTGC:1	+	chr3L	12879837	3'	+	roo	9017	2	52.74
CTGCCTACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCT:1	-	chr2R	15064363	3'	+	412	408	2	71.92
ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTT:1	-	chr3L	21855453	3'	+	blood	299	2	70.55
AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAG:1	-	chrX	13126462	3'	+	jockey	4918	1	70.55
GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTTGCCC:1	-	chr3R	26686025	3'	+	Juan	4153	1	70.59
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCCCATCGCGCCAAATAATATTTAAATATTACTTTTCACC:1	+	chr3R	11496648	3'	+	1360	3363	1	67.86
GATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCATATCAGATACTTTTCGATCCAAATTAACGATTTGTTCCTTTAGGAGCGTTGAAGAATTTTGTGTAATTTTTG:1	-	chr2R	1726892	3'	+	Stalker	334	4	50.00
ATGTACTATATATATGTATATACATATACATAATACATAATTAATAAATTTCCAAAAAAGAATACAAATATTATGGAGAGCGAGAGCATATATTCTTTTAGCGAGATTCCTCTGTTTGTTTTTGATCAGGAAGGGCATTGGTGTGT:1	-	chrX	7256780	3'	+	1731	4406	1	60.96
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGTAATATAAGAAACTTTTTCTCACAG:1	+	chr3L	15600316	3'	+	roo	9048	2	48.48
ATCGCCACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACCTAATCTCCATAATTTGTATACTCGTGGAGCGATAAAAATTGAGATATTTGGTAAATTGGTAAAAGTAGACATATTTATGTAAACGG:1	-	chr2R	5214281	3'	+	gypsy	7312	2	54.29
ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACAAAAAGTGAGTTGAACTGACTGCAGATAATGCGGATAGGTGAAATA:1	+	chr2R	21145964	3'	-	pogo	54	1	66.41
ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTAC:1	+	chr3L	20033764	3'	-	blood	7067	2	64.00
AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGCAATTACTACACTAAAAACTATAGCTATCGACTGTGGAAATAGGAGAAGTC:1	+	chr3L	2482608	3'	-	jockey	4790	1	57.69
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCACACAAGCAGACCCCAGAAGTGGGAGGCAGA:1	-	chr2R	13710571	3'	-	roo	8693	2	61.98
TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGC:1	+	chrX	6522042	3'	-	F-element	69	1	65.55
ATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGGGGCTAAATTACCTTCGCCAACATTGTGAAGCATAAAATCAGAACCACGGACATATTCTAAACAATTCCGATACAGTTCTTTGAAAACAGGTAATATTGTTTTTTGAAAAGCCTA:1	-	chr3L	23632751	3'	+	mdg3	5481	2	77.40
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTAT:1	+	chr3L	10292888	3'	-	roo	8739	2	69.86
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTG:1	+	chr3L	15600349	3'	+	roo	9034	1	45.89
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATATGTATATATACATATATAAACCTGTGCTGAGCCCAGTGCATCT:1	+	chrX	8814827	3'	+	pogo	2052	1	68.50
GTCTGTATGTATGTATATATATTTGACAGCTGACATTTAGAAGAGGAGTACGAACTGAAGACAGGCATTTTCGAGTGAAACTACAATTCAGCAAAATTATAATGTACTCTCTAACTCACAAATCTCTCTCTACT:1	-	chr2R	14519644	3'	+	1731	97	1	61.19
ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACGTACGAATGTGCCTGTGTGCGTATGCAAAGAATGGAGAGCCTGGATTTATCGC:1	-	chr3R	28946313	3'	+	hopper2	1544	1	58.90
GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGAACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAA:1	-	chr3L	16015231	3'	-	1360	60	1	60.84
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTT:1	-	chrX	13504169	3'	-	412	7131	2	71.33
CAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTGAAATAGTCGACTTCATAGCCAAAACCTATTTCAATTTACCCAATTCAATTTGTAGTTGATGCGGCTTTTCATTTCGTTCGC:1	-	chr2L	3883792	3'	+	roo	8796	2	48.63
CAAGTGCCTAAAAACAAAAAGAACCGTTAAATTGAGAGTGTAAAAATGTATTGCTCATAACATTTAATAATTATTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCATCTGTACGTATAATACGTTTAT:1	+	chrX	16361571	3'	-	Tc1	162	1	47.26
TATTAGTGAGTGGTGAAATTGGATAAAGCGTATTGAAAAATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAACCTAAATAATTGGCTAAATATTTTACACATTTTTCCATGTGTCACCGCTTCGCAGGCGAAAG:1	-	chr3R	21162085	3'	-	accord2	7326	1	48.41
TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAACTGGGTAACATTCTTTATGCAAAT:1	+	chr2R	14388027	3'	-	roo	17	2	63.30
GCGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGG:1	-	chr2R	21572112	3'	-	hopper	67	1	67.16
GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCCTATA:1	+	chr2L	6059341	3'	+	roo	400	1	75.83
TGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAAGTAGGAAAATAAGGCAGCACACTTTGACTATAAACAAGAATTTAAAAATACACATCCCATAAGCCGTATGCAAATTGCTAAAATAATAATAACATCAAA:1	+	chr3R	18580385	3'	-	roo	133	2	69.18
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATATGTTTCTCGATGAGGAACCCCC:1	+	chr3R	16076922	3'	+	roo	9053	2	68.49
GGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAATGTGCACGCTTAGGAGGCTGCCAACCA:1	+	chr3L	15599704	3'	+	roo	433	1	75.65
ATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTGCATTTGGGCTGGGAATTTTCGCAACAGCTCTCAACATCATTTCCCAGCTGGGTTATGGATGCGAGTGTGGATCGGCAAAAA:1	+	chr2R	9327920	3'	+	roo	8721	2	70.69
GGTTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCC:1	+	chr3L	18592072	3'	-	Cr1a	469	1	41.18
CTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTTTGAAT:1	+	chr3R	17922340	3'	-	Rt1b	226	1	35.65
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTGGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGAT:1	+	chrX	13066572	3'	-	jockey	27	1	52.94
CGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCAAATGGCAAACGGCAA:1	+	chr2R	24218623	3'	+	412	460	2	52.99
GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGT:1	-	chr2R	11629735	3'	-	Tirant	10	2	71.84
CCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATTCCTTATAAACTGATATTTTTCCTTATAATAAGACATTTCGTCTTCGTGAATCGCT:1	+	chrX	22118635	3'	-	gypsy	55	2	59.71
ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGGGTA:1	-	chrX	10639985	3'	+	roo	398	1	70.97
ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTT:1	-	chr3L	10848680	3'	-	blood	38	2	72.62
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCG:1	+	chr3L	233332	3'	+	roo	345	2	63.01
TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCCAATTGATTTCTCT:1	-	chr2R	977555	3'	-	F-element	97	1	77.62
CCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCAACTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTAACC:1	+	chr3R	23893873	3'	-	1360	93	1	84.25
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCATGCAATCAACT:1	-	chr2L	17420104	3'	+	roo	393	1	71.23
TATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAATTTCCAGAGTATCAGATACTAACAGGAAA:1	-	chrX	22601902	3'	-	INE-1	84	1	51.16
GTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACATCCAGCAAGCACACAATGTAACTGAGTGCGACTGAGAGGGAAAAAAGCCGTGCCC:1	-	chr2L	14544105	3'	-	roo	8658	1	57.36
AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGA:1	-	chr2L	16067089	3'	+	297	333	2	70.68
TTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGCCATTGGAGAGTTGATAATACAACAAACTGTGGCATGCCAC:1	-	chr3R	14937076	3'	-	I-element	5020	1	61.68
CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAGCAGGAGTCGCAGGGCCAGTCGG:1	-	chrX	5662833	3'	-	P-element	10	2	74.79
GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGATGTTTAACACCCAGGTGGCCCGAT:1	-	chrX	5629075	3'	+	jockey	4967	1	66.44
AATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGGTAGGGAAATTGTAATCAAGTCGAAGCTAACCAAGAAGTTATGAAATTTTCTAAATACCACAAAAATATCCTGAGCAACATA:1	+	chrX	10644251	3'	-	jockey	4922	1	59.59
TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTAT:1	-	chr3L	10056089	3'	+	transib2	2783	1	53.28
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATGTGTTAAATCGATAATATAAAAAACATATATTTTAATTAGTA:1	-	chr3L	1534482	3'	+	pogo	2076	1	63.01
AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGTCCACCTTTGG:1	-	chr2R	2016827	3'	-	1360	23	1	54.00
AGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAATTGCAATGGCTTTCTGATGGAGAATGGAAAACGGAACTTAAACAAATATTAGGTGGAACCCTCCATTATTACGT:1	+	chr2R	21907327	3'	+	roo	8962	2	52.74
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGC:1	+	chr2L	7898372	3'	+	roo	390	2	53.49
AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACATTTTACTGGCCGCACACA:1	-	chr3L	10013535	3'	-	hopper	24	1	69.86
CGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAACATTCCTACTTATAATTA:1	+	chr2R	20194302	3'	-	Max-element	59	2	55.48
CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTATTGCATAATTTTAGCACGCGCCCAG:1	+	chr2L	15833540	3'	+	jockey	4966	1	50.41
TAGACTTTAAATCTACATTATTTTTGATCAATTGGCACCACGTACAAATTTTTTTGTTTTGAATTGCCTTAACGTTGTTTTTATTTAAATATAGCTTAGAAATAATAATATTTTAGTTTTCAATAAAATGTAATACCAAAGTTCTG:1	-	chr4	1196691	3'	+	1360	244	1	72.60
TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAGTTTCAGCGGATCCCAAATAATCTTCG:1	-	chr3R	19449653	3'	+	roo	9035	1	43.15
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACATATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAA:1	+	chr3R	22844287	3'	+	roo	9020	2	56.43
GGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTG:1	+	chr3R	16933805	3'	-	17.6	6967	2	58.39
GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGCCGCATTTTAAAT:1	+	chr2L	1839334	3'	-	hobo	23	1	61.34
GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCGCAACTCCCACTCCAAATCCAATTCTGTGTCGTATGTGATGCT:1	+	chr3R	17316326	3'	-	opus	165	4	64.80
CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAAGAACTGTTAGAAAATGGTGAGAAATGGTT:1	+	chr2L	14081454	3'	-	1360	10	2	77.93
ACAAATAAATAAACAAATATAAGAGAAATATATACAATCTTCAAATATACTGTCTGGAATCTAACTTGTCTCTACCTACATCGATTTATTTTAATTATGATTTACATCCTCTTTAAAATTAAACATTGCCTTTAACCTTTTAGGTC:1	+	chr2L	19864796	3'	+	Juan	4215	1	70.55
CTGACGGCTGCATCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAGATA:1	+	chr2R	20497023	3'	+	blood	7343	2	50.34
CAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCA:1	-	chr2R	9325387	3'	-	BS	5032	1	45.93
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATC:3	+	chr2L	2007439	3'	+	roo	8995	2	70.55
TGCTAGAAGACAATTTTCGGGCCGAAATCAATTTACATATTTGGATTTTTGGCCAATTTCGTTGCAAAACTTAACAGGGTACTGTGAGCAGAACTTTTAACAGCATTAATATTGATGAACTTAATATTAATGCTGTTAAAAGTTCT:1	-	chr4	431430	3'	-	1360	3195	1	77.40
TAACGATCGTACTACGTGCAAAAGCAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCGAATCAGAGTTAGGCGTCCTTCTAATAATAATTATTATAAAAATAACAGACAGAATTATAATCATTTTTCAAAAAAAAATTATTTTA:1	+	chr4	1151907	3'	-	transib2	222	1	63.64
CGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATGTGGAGAAGGGCGAAACGATCGAGATGCCGAGTCGAGACGGCAAACGACAGGGTCTACTAGACTGAGACTGTGTTAGGCTGAG:1	+	chr2R	979577	3'	-	F-element	4411	1	75.45
GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATTCGTAAAATTATATAAGTTGTAC:1	-	chr3R	25454000	3'	+	Quasimodo	7324	2	55.24
AATAACTAGATAAATTTTTCCTTTTGTACTTAATAATTAAGAAACCACTTGGTCTCATATACATTCATACACACTCTTTCACGTTCCCCGCATCGTTGCTCGCCA:1	+	chr2R	7342996	3'	+	G5	4708	1	70.48
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAGAGAAGTG:1	+	chr3R	25448465	3'	-	roo	8697	2	62.33
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTATAAATGGAAATATTAAAGTTTTAACTACAAGTAATGGAGTGTTCAAATTTAATGTTGGCAATGTTTTTTTT:1	-	chr2R	19050255	3'	-	roo	74	2	46.92
TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATATAATAAAATAATAAGGAAATAACACAATGTTGCATCCACTGTTC:1	+	chr2L	13584738	3'	-	pogo	34	1	60.91
TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGATGGAAAAAATAGGGGAAAGAATGGTTGCATAATAACATTGCCTGCTACTAGGATGGCTCATAA:1	-	chr3L	4840677	3'	-	jockey	4687	1	73.97
AACTGGATGCAAGCAATTACTGAGGAATCTCTAAATTGTTGGATATCCCAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTAAGTAAACTACTTACATTTGTCGTGTAATAGAAGGTAGGCTGCTGCTCCGTTTT:1	+	chr2L	22168397	3'	+	Q-element	92	2	57.35
TAAATTTGAAAAAAATATATTAAAAAAGCTAACTCTAACCGCAGTCAAGACGAAGCCAAAAGCTGCCATGCAATCGATGACTTGGACAAAAATAACTTGTTGCCTGCGATTGTTGTTGGTGGTGCAGGTTAAATGCAACTGCCGC:1	+	chr3L	3259693	3'	-	copia	4667	1	71.72
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAA:1	+	chr2R	11164517	3'	-	roo	8713	2	55.48
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAA:1	+	chr2R	7898192	3'	+	roo	9033	1	56.16
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTCCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCAC:1	+	chr2L	14772112	3'	-	roo	8723	2	66.13
GTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGGTGCGGTTATG:1	+	chr2R	9463502	3'	-	rover	45	2	58.52
TTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATTATATGTATATTAATGAC:1	+	chr3L	19339467	3'	-	Tc1	33	1	65.75
TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAAAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTAT:1	-	chr2L	11732290	3'	-	Doc	69	1	63.97
GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAGGTCTTAACACGCATATACAAATATGCCAGACACACA:1	-	chr2L	17081740	3'	+	jockey	4973	1	67.12
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTACCATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1	+	chrX	23439059	3'	+	P-element	2495	1	60.27
GACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGAAGATATTGCACAGCCATGGCCACTTGACTGGGACAACCCGCT:1	-	chr2R	17626843	3'	-	opus	123	2	56.25
ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTCATTTTAAATCTTGCCATAATAGAACCAAAATTTCCCGTTAACATTATTTTACAAAATCCCTACCCCTTACAACAATTTATATACATACATAGAAACCAGGCAAATTGAAT:1	-	chr3L	3477375	3'	-	mdg1	6	2	68.97
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATCGGATCCGTGGATTGGTGTCTTGTTGCACTG:1	+	chr2R	13084713	3'	+	roo	392	2	70.00
AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATAGTTGTTTAAAAATAGTTTTAAATGCAAAATGACGTTTGAAAAGGGAAAAATGGGGGGAAACTATCGAGTGTCATGCACTTGACG:1	-	chr3L	16750604	3'	+	Tirant	391	2	76.09
TACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAATGGAAAGAGAACCTGCAATTTGCTT:1	-	chr3L	19035953	3'	+	Tirant	383	2	66.41
AAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCGTTGACTTTAAATCTATAATATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAAAAATATGTTGTATTGTATGGATATAGCGT:1	-	chr4	617259	3'	+	1360	216	1	78.08
TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCATAAAGCTGCAAAAAATATATGCATTCTACACATTATTATTATATTCGA:1	-	chr3L	1534656	3'	+	pogo	2050	1	61.72
TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGCAGCCCTCCTC:1	-	chrX	13504130	3'	-	412	41	2	57.24
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTAC:1	+	chr2R	25118761	3'	+	roo	331	2	73.10
CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATT:1	+	chr2R	6487186	3'	+	1360	3338	1	69.44
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATAGATCTAGATAGGGGTCT:1	-	chr2R	25118670	3'	-	roo	28	2	56.30
CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATACTTTCCAGCTGCGTCCTGCAGCCAA:1	-	chr2R	12835008	3'	-	jockey	15	1	75.65
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAAC:1	-	chr3R	17817901	3'	+	roo	9036	1	59.62
GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAAGGGGCGTAATA:1	-	chr3L	23728617	3'	-	HMS-Beagle	6817	2	66.40
GGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGG:1	+	chr2L	13914154	3'	-	jockey	4757	1	77.62
AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTG:1	+	chr2L	544859	3'	+	412	439	2	65.60
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATT:1	+	chr3L	15600357	3'	+	roo	9042	1	51.37
CGACAATGCCACCGATTTCAGCATTGGTTTTACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAATTTGTCGGAAACCGATTTATATG:1	+	chr3L	24916746	3'	-	Tc1	434	1	48.44
TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGC:1	+	chrX	14336503	3'	-	roo	8732	2	69.86
AAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGG:1	-	chr3R	18339051	3'	+	roo	390	2	69.57
TCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAACGAGGTTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGTCAGTTTCTAT:1	-	chr3L	10574265	3'	+	Tabor	453	2	55.56
AAAGAAAAAAAATGTATTTAGAAAGACACAAATGTTTGCTTCAAAACATTTTCTTAAATCTCAAATTGTTCACACCGTTTTCTTTTGAGTGTCTTTCGAACTGGTTGTTTGTTTAGTTAGAGCTCCCCTGGAAAC:1	+	chr2L	16500165	3'	+	invader5	3613	1	57.78
AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCTTATGAAATGCCTAAACTCAACTTCTT:1	+	chr2R	4601688	3'	-	HMS-Beagle2	6901	2	76.03
AATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATAAAAACCAAATAAAGATAAATATGACCGATTGCGTTTTGACACCTATTTAACTACACTAGCACTTCAAAAAATTACATAGCACCA:1	-	chrX	21946082	3'	-	mdg1	7233	2	76.38
AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATAC:1	-	chr2R	5485068	3'	+	blood	358	2	69.18
TTTCGTTGTTTTTTTTTTTGTTTGTTTGCAGATGGGCGAGCACCTGGTGCCACCGCGTTTCGACGTTG:1	+	chrX	12769706	3'	-	transib2	2642	1	67.65
GTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAATTCGTACGTTCACATATATACAATACATATATCTACATATGTTG:1	+	chr3R	4711234	3'	+	S-element	352	1	69.86
AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAAGGGCATTTCCAGTTCGCCTAATGAATTACTAATCGCTTCGCTTGTTTTGATTTCGCC:1	-	chr2L	15235662	3'	-	jockey	4789	1	55.22
AAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGCTGCCTTTAACCCATTATATA:1	+	chr3R	13501168	3'	-	hopper	60	1	67.44
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAAATATTGTTTCCCGAACAGCGCTTTTCGTCACTAACTTG:1	-	chr2R	18336135	3'	-	roo	8706	2	53.28
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCG:1	+	chr2L	3886252	3'	+	roo	9018	2	53.42
CGTTTTATGATTTATATTTTATTTATTTTTTATACTACCTTATTATTCTATCACCTGATTATCATTCAATCTCATTAGATAATAGAAATCCGCAAGGAGTTTGAAAAAAACATATGGATGATATTGTTTTAAAAATAAGCATTTG:1	-	chr3R	21596950	3'	-	copia	5060	2	66.21
ATAAAANTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTCTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATA:1	+	chr3R	7100925	3'	+	roo	9034	1	56.16
CCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCTTCTTTAGCTGC:1	-	chr3R	13457862	3'	-	X-element	27	1	65.93
CAGGAAGAGAGCCCGGGTGAACCATTTGCCCTCCGGTCCT:1	-	chr2L	5426748	3'	+	aurora-element	484	1	90.00
ATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATTTACTTAATAAGCGGTATTCTAATAAAAGTTTATGTTCCAGTCTCAC:1	-	chr3R	4090787	3'	-	copia	75	2	72.60
GCAAGCTAAATACTCTAATGAGAATTATTCTAATATAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTAATATTATGATTTGGCTATTACTATTTCTAAGCTTTATTTAAATAATAATCTAGTTATTTTAAGAGGAATTGGTGACAATATAGTT:1	-	chr3L	25556491	3'	-	1360	409	1	75.34
TAAAAATAATATTTAAATAAATAAAATAAATGGTTTTTATATGTGTAGAATGCTCATCCCAACATCCATTGACGCCTCAACGTCTGGGTTTAGATACCCAGTGACTCAGAGCCCTAAAATCCGTGGCCGTGAATTGTT:1	-	chr2R	20068222	3'	+	blood	6916	1	76.81
AGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTGGTGAGCTAAGCAATTTGCAGCCGATCATGGATTGTAGGTGACGATAACGAACTACTCAATGAATTCCCCTCCGAATCGAATGTCGCCTCCATAAAATGGCAAATTTCT:1	-	chr3L	20831539	3'	+	roo	310	2	73.97
ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAA:1	-	chrX	18193675	3'	-	jockey	84	1	67.83
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAA:1	-	chr3R	20469597	3'	-	roo	59	2	60.27
GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTGTCTATCATAATAAATTAATAAAATTGCAACTGTATTTTTTTCTTTGTTTTACACGTAAAACTTTTGTTTAATGTCATCGATTTTGTTCACATTTCCTAAATCCCTTTACTCTG:1	+	chr3L	27670248	3'	+	I-element	5326	1	65.71
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTACATGAATATTTTATGGTAAAAACTACAAAGACATTTGACATTTTTCAGAATTTCA:1	-	chr2L	18294125	3'	+	roo	401	1	56.16
TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAAGTATATATACGAATTTTTCTTGGTCATTAGAATAGACTGTTATAAAAGAATAATATAAGAATTGCGTCC:1	-	chr3L	20324653	3'	-	297	6630	2	58.22
CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTG:1	+	chr2R	16248002	3'	-	BS	44	1	57.69
AAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTGATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAAGCCGAGTTAGACAGTGTAGACAGACGACGGATTGGGGTGTCGGGCATTTAA:1	+	chr3L	20063733	3'	+	mdg1	284	2	63.70
ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGAAGCGATGCTTTCTAGCAAATCAAAGAAGCCTAGTCTATGATATGATTTAGGCTA:1	+	chrX	7256249	3'	+	412	472	2	69.18
AGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACAAGTTTGTCAAAATTGTACAGTGTTATGCGGAGCGTGGTGTGGGTGTTATTAGCT:1	-	chr2L	7810291	3'	-	P-element	153	1	42.31
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAACTGGGTAACATTCTTTATGCAAATGGAATTGAAAC:1	+	chr2R	14388038	3'	-	roo	8666	2	74.29
CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCATCTGTGACATGCGGTCAAAGACGGACGCAGCATA:1	-	chr3R	16404430	3'	+	pogo	2073	1	66.44
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAA:1	+	chr3L	15600302	3'	+	roo	9020	2	67.26
TTATTGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGAAAATTTTTAATATTCAATTAATTTAAAGATTCTTAATTAAAGTCAGACATGAATATGCACTGCTGTTCATCGAC:1	+	chr2R	12623724	3'	-	Ivk	5285	1	48.80
AAAAATCGTGTGGCGTTACACATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTAATACCCTTGCAACTAGTCAGCCAGTAACATAGCTATGCATGAAACTTTTCCCTACAGTTGCGGGCAAGAATATGCGGCGTTTTGCGAACTGGTTAATTG:1	+	chr2L	21723071	3'	-	1360	23	1	67.81
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTCCATCTGCATATCAATT:1	+	chrX	6486845	3'	+	roo	399	1	68.89
CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCAC:1	-	chr3R	28758317	3'	+	mdg1	352	2	70.90
GTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGCGCTTGTGAGCTGATAACAATGAGTAATTGCGAGGCGGGAA:1	+	chr3L	674037	3'	-	Quasimodo	6944	2	70.71
GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGCGACACTCGACTAAAGCGTTTTCTCTTGTTTAAAGAACAGAATAGAATAAAACATTGGCAGGACTATTTCTTGCAGTGTCTG:1	+	chrX	17816739	3'	+	INE-1	549	1	44.76
CTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGT:1	+	chr3R	11547803	3'	-	G2	302	1	62.96
ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCC:1	-	chr2R	24218515	3'	-	412	7075	2	60.00
TAAAAATAAAATTAGATTCATTAAACTACTAAATATTATTTGGAAACAATGTCGCGGCAAGATAAAATATTACGAAATAAGAATAAAATATAAAATCAACGTTGAGGAGAGTAAAGCTTGTAGTACGATAGTCAGCCATTCAG:1	-	chr3L	1789225	3'	+	NOF	3958	1	74.83
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCATAAAGAAAATGCTGTAT:1	-	chrX	9539986	3'	-	roo	8699	2	58.22
GAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCATTGGTGTATCCATCAAAAATCAGTTGCTTGGAGAAGGAGAACGACTGGCAGAGGATTATGCACTTTGAGTGCGTGTCCAATTGATCT:1	+	chrX	11079533	3'	-	blood	168	3	60.00
GAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACA:1	-	chr3L	19013908	3'	+	invader3	227	2	55.80
AAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAATTCCCTTGGCCCTATAATTATGCTAGACTGTGGAACGGAACG:1	-	chr3R	21243931	3'	+	1360	384	1	57.58
CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGATGAACAATTTACAATAT:1	+	chr2L	9668318	3'	+	1360	3378	1	74.81
TAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATTTTCAGGAT:1	+	chr3L	11321523	3'	-	mdg3	5259	1	70.27
AGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTGTCAGGGGGTTTGGGTGTTGCTTCGATGATGGGCACCTTAAAAACACATTAGTCGAAGC:1	+	chrX	10692864	3'	-	I-element	4873	1	53.91
CACTTTCGTTTTTAACCACACGTCCACACAGTGGAACTGAGGAAAACGCAGTGAAAAGTCGGAGAAAGTGGGAAAAACAATTGAGCGCAATGGGCGAATCTGTCAATTGAT:1	+	chrX	22670946	3'	-	Dm88	431	1	78.38
GTTACGTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTT:1	-	chr2R	4193271	3'	-	1360	9	2	72.60
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAAATATTGTTTCCCGAACA:1	-	chr2R	18336156	3'	-	roo	8709	2	63.87
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCNAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTAT:1	+	chr3L	10292888	3'	-	roo	8726	2	66.17
AATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTC:1	+	chr3L	23702242	3'	-	G4	60	1	62.31
AAAAATAATTTAATAACATTTTTTAAAAATTTCTCGAATTTTTAAAAGTTGGCTACAGGAGAGGATTAAAACGAATTTTCTTACCCCGTATCTGAAACTATAACTAGGCTGAACTAGGCTAACACATTTGGTAATGGCAAGCAAAA:1	-	chr3R	11175995	3'	+	transib4	106	1	26.71
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAAGCTGGCTCGAAATTTAAGTGTCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACA:1	+	chr3R	7100920	3'	+	roo	9033	1	52.82
TATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTATTATCTCTT:1	-	chr3R	5061801	3'	-	mdg3	5277	2	68.75
CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGCAATAAAACCTAAATCCCAAATTTGTTTAAAATTGCAGCCACGTTTTTCA:1	+	chr3L	15996022	3'	+	297	6909	2	67.81
AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATA:1	-	chrX	5643497	3'	+	roo	324	2	76.71
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTTTAAGCGTCAGGCGTCAGCAACTCAAATTGATTAGTTCAATTAACAAGCAACCTAATGTACGTTTAAGTCAAA:1	-	chrX	2444317	3'	-	roo	28	2	63.70
ACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGTATATTTATTTTTATTTTTTTGCAGAGATCGTTTCCGGAGCCGGAGACGCGCATCGATTGCTCCTCT:1	-	chrX	5711762	3'	+	BS	5004	1	51.49
GCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGGTAGTTGTAATTTACCAGTGCCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTC:1	+	chr2R	4999691	3'	+	Max-element	8395	2	55.24
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAA:1	+	chrX	9540078	3'	+	roo	9038	1	72.62
GTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGGCTGGCATGATGAGGCCTAACAAACAACACAGGCTTCTTAAGACT:1	+	chrX	21087680	3'	+	mdg3	5484	2	55.14
GAGGAAAAGCATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGGTGGGGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTACGAAAAAGGTAATGGTAACATGCA:1	-	chr3L	2325741	3'	-	I-element	5144	1	72.50
TAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATAGAGTAACCGCTGCGTTTGGTTCATAAGTTTCTTAGCTTAGGTCGAGGAGCAGCGCAGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGCAGTTAGCCT:1	-	chrX	23201991	3'	-	R2-element	370	1	48.44
TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACCCAATCC:1	+	chr2L	20840518	3'	-	Transpac	21	2	63.96
CTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAAGCGCCCA:1	-	chr2R	4601549	3'	+	HMS-Beagle2	252	2	61.87
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAA:1	+	chr2R	19050284	3'	+	roo	354	2	57.46
AGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCATACTAGTGAGATAAAGATAGTAAGCACATGATGCTGCCAT:1	+	chrX	17873813	3'	-	G2	3023	1	72.60
AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATTTCTGGTCCTGTCATCGAGTATTTTTATGCGGGCTGCCGATGGGCGGGGATTTCGAAATCGC:1	-	chr3R	17531329	3'	-	1360	20	1	65.87
GTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTTTTACAGTAAATTAGAACGATTAGCATTTGTAA:1	+	chr3R	11522508	3'	-	I-element	4942	1	77.24
AATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTTCCCGAAATTATGCAGAAAGAAAAGGTCGTTTCCGGTGG:1	-	chr3R	6524827	3'	+	I-element	5269	1	71.92
CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGGGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTAT:1	-	chr2L	11732290	3'	-	Doc	66	1	64.66
CAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCA:1	-	chr3R	19589911	3'	-	BS	5032	1	49.19
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTCTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAAAAAA:1	+	chrX	13504249	3'	+	412	443	2	57.46
GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCT:1	+	chr3L	17560398	3'	-	pogo	44	1	54.79
TGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCG:1	-	chrX	5663124	3'	-	P-element	237	1	20.00
ACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAGGAATACAGAATAGCAGATATTGAA:1	+	chr2R	8624867	3'	-	Juan	4080	1	52.05
TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATT:1	+	chr3L	22437932	3'	-	roo	8754	2	80.14
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACGATTCGTGGTGGTGATGATACTGAACAG:1	-	chr3L	16343164	3'	-	roo	7	2	80.29
CTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTGATAACAATCACTTACTCACCAAGTGTTCATTTTTATATTTGATTTTT:1	+	chr3R	11115593	3'	-	Doc	4549	1	67.36
AATTATTTATTTATTTTTAGAAACAATTGTTATCAACGCTCCCAAAATGTTTAGACTATATAGTTACTATGATTGTTTATTTTATGAATTTTTATGGGTGTATTTTATGAATTTTTATGTGATGGTAAGTGTCAAGCTGGTAATTC:1	-	chr3L	8809276	3'	-	mariner2	829	1	71.92
TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTG:1	+	chrX	9540131	3'	+	roo	9029	1	56.16
TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGCTGCCTTTAACCCATTATATACCGTTCGGCAAAAACAATGGACCACAATCAGAGACACTCTTTCCAATTTCTTTTGTATAGCTGTG:1	+	chr3R	13501233	3'	+	hopper	1406	2	76.22
TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAGACAATTCAC:1	-	chrX	4214911	3'	+	flea	243	2	71.20
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCGCGTTTAATTTTCTCACC:1	-	chr3R	11083882	3'	+	412	444	2	55.30
GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAACACAAAATTTTTGATCGTCTTAGAATT:1	+	chr3L	24208222	3'	-	Quasimodo	31	2	54.62
GGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCTGCAAC:1	+	chr2R	4294606	3'	-	McClintock	70	2	72.34
GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAAGAAG:1	-	chrX	13066471	3'	+	jockey	4964	1	62.33
TCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGAGCTACAGCGAAAACTCTGCAGTAGCCTCAAAACATATTTAAGAAGCTTTAGCCCGTA:1	+	chr3R	21255311	3'	+	1360	70	1	59.13
GGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGGCTTAAGGATTGTGATGTTAGTCAACTTAATTTGGGTAAAACATTTACGGAATTTGACGTGCGTATCCTAG:1	+	chr2L	13914224	3'	-	jockey	4690	1	63.70
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACG:1	-	chr2R	19050202	3'	-	roo	8719	2	63.20
GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTACATAAGCTTCTGCTGTTTTAATAGACAGAAACACCTTTCACATACATACATATGTATGTAAGTAAAATTTTCACAAGGACTCCATTTGCCG:1	-	chr2L	588314	3'	-	FB	29	1	56.16
AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAG:1	-	chr3R	7482771	3'	-	412	7112	2	75.93
CTGCCGACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTTGCTCTTCACATTTATTACTTGTTAACTTGAGATC:1	+	chr3R	21434949	3'	+	412	7461	2	76.03
CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATACGTGGGCAAATGCCTGCCGGAAATCGTCTGCAATGTGCGAGATAACAATTTTCGTG:1	+	chr2L	2703588	3'	-	hobo	42	1	56.92
TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCC:1	-	chr3R	22122714	3'	+	roo	321	2	76.71
AAGACACAGACGGCCGCACTCGAAGCGAGATAGCCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGA:1	+	chr2L	22685186	3'	-	Ivk	22	1	54.26
TATTTGGGAGATACATACATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATGTGTTGGCTTGCCAAATAACGGAATCATTTTCAGCCTTTTGCTCTTCTAGTTGTACGGATCTAACTGTTATTGAAAGGTTTCTGTTGTTTTT:1	-	chr2R	1265919	3'	-	accord2	109	1	63.45
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAAT:1	-	chrX	5643486	3'	+	roo	335	2	69.18
GAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGGCTGTAGTCCTTACTGCTGGCAGACGGACTTCTTCATCGTGGACCTGGTTCTTTTATTCGTTTAACTAGCTGAACATCGTGTTAATATTTCTATG:1	-	chr3R	23387091	3'	-	accord	185	2	60.00
TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGGCGTGGTCGAAAGG:1	+	chr2R	2016938	3'	+	1360	3382	2	75.89
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCCAAACTTAAAG:1	+	chr2R	11164509	3'	-	roo	57	2	60.96
AAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTGTTTGTATATTTAGCTTAATATAATTTAGTATTTCCCTAACAAGCCTCATAGAACATA:1	-	chr2L	6622934	3'	+	Burdock	6333	2	62.33
AAAAAAAAACAAAAAAAAATGGGATAACAAATTTGTTTCCAAAATAGTAATTTCCTTTGCACAAAACCATCCGTTTATAAAATAATAAAATAGATTTCCAAAAATTTTAGTTTTT:1	+	chr3R	4996523	3'	-	hopper	141	1	88.70
ATTGCTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGATAGAAATGTGATTTCCTTTTTACATTTTTAAGGTACTTGATGTACATAC:1	+	chrX	11284561	3'	+	invader2	4929	2	65.07
ATCTTTGACATCTATACCCGTTGATGGTTCAGTAAAATCATGTAGTGCTTCCAAATAGTCGTTTCTCGTATATTAAGAGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTGAAAGGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTG:1	-	chr2L	15956055	3'	+	Stalker4	389	1	81.16
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGGGCCGTCG:1	-	chr3R	25448300	3'	+	roo	9047	1	67.12
TACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTT:1	-	chr3R	4357535	3'	+	Tc3	1644	1	63.38
AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGTCGAACGCCACGCTCTTT:1	+	chr2R	10124178	3'	+	P-element	2817	1	20.87
GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGTTAAGAAAATATTTAACAAGTGTTTGAATGATTTTGAAAAATGATGTGCAGCATGCGCAGCAACAGGA:1	-	chr3L	3863385	3'	+	blood	7375	2	73.61
TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGTTCGTAGGCGCTCAGAAGTATGAACTATATTTGTGTTT:1	+	chr2L	15991435	3'	+	mdg1	394	2	65.03
CTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTG:1	+	chr3R	16933805	3'	-	17.6	6959	1	62.02
GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTAGCAGCATTGGCAGTTCTCCGCTGCAATAGCGTGCTGCATCCTATGGGCTGCTATCAAACGTGTCTCAATGTCTCCG:1	+	chr2R	16299296	3'	+	blood	337	2	57.14
AAGAAAATAAAATGAAATAAAAAATAAAGGTAAACCAACAATGCGTCGACGAATACATAGTAACATGTACATGATTTAAAATATTATTCTTTGCTATTCAAAAAATGTTACTAGGATTGCATATCCCTAGGATAATATATTATTAA:1	-	chr2L	21794441	3'	-	transib1	1901	1	54.79
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATTGCAGACATCGGTGCTCGTCACAG:1	-	chr3L	12879714	3'	-	roo	8701	2	59.71
ATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATAGTTGTTTAAAAATAGTTTTAAATGCACAA:1	-	chr3L	16750659	3'	+	Tirant	8446	2	66.67
TACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAA:1	-	chr2L	13053749	3'	-	BS	5056	1	65.00
CAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAA:1	-	chr2R	23466019	3'	-	Doc	477	1	61.25
ACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATCTGTATCTATATTAAGAGAACGTACATATTTAAAGTATTTTGTGTTCTGTTGGCACGGTTTTT:1	-	chr2L	20808315	3'	-	HMS-Beagle	6824	2	50.43
GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCA:1	-	chrX	18193650	3'	-	jockey	62	1	51.37
ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCATGTGCAACAGAGTGCAACAGTTGACGGCAACGGGC:1	-	chr3L	3799758	3'	-	copia	15	2	61.60
CCAACAATTTTTCAAAAATGTGGGCTTGACACTTTGAAGATTGCAAACTCCGTAAAGCAAACTTTCCGTATTATGGAAAAAAGATGAAGATTCGGACTATTGAGTAAACAATCGAAATGAGTATTCAGTAACA:1	+	chr3L	23635770	3'	-	INE-1	376	1	58.65
ACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATATACCCTGCACCAGGTGGGCACAACGTTGATTCGGCCATTGG:1	-	chr3R	31346929	3'	-	1360	3217	1	63.48
ACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGCTGTTCGATGCTTCTGGGTCTTATCTGTCTGGTGAGTCGGTGAGTCGGCAGTGGATTAGATAAGGAACTTATTGA:1	-	chr2L	19967530	3'	+	Doc	226	1	70.37
CTGGATACCGTACTTGGCAGCAGACTGAATGCGGATAATCTAGTCCCATTTATGCCTGCTCACTGTTGAAAATAAATTAACGGAACTGCACTATACCTCACTGCCGGTGGCATGTGTATAGTATGTAAGTTATGC:1	-	chr3R	4552982	3'	+	Rt1c	5155	1	54.81
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTG:1	+	chrX	9540096	3'	+	roo	330	2	70.55
AAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCCTGCCACGCCCAACTTTAATTACTGGCGCCCAACCAGTACAGCCAGCTAGTAGTAGGCATGACTCTGGGTTTATGGTCTACTTAGCACTTGT:1	-	chr2L	12721314	3'	+	Gypsy6A_LTR	277	1	60.27
TTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCTTGATAGTTTTATCTAGCGCCTGGTATAAACTATTCTACTTGAT:1	-	chr2L	22685628	3'	-	Ivk	5047	1	70.54
CAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGACGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCAC:1	-	chr2L	12328657	3'	+	hopper	1373	2	62.75
GAAAATGCTACAGTCGAGTTTCCCGACTACCAGATATCCGTTACTCAAGTAGTGGGATTTTTCTGGGATATCTATAGATTGGGAAATATCATTTTTGGTTTTACTTGGAGAGTGTCGCT:1	-	chr3R	12362981	3'	-	INE-1	573	1	73.95
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGA:1	-	chr3L	9998022	3'	+	roo	9048	2	45.21
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAA:1	-	chr2L	12892633	3'	-	roo	8733	2	71.85
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCTTATATAGTATGTCTCTGTAAAAAAACTGAACAGTCGATCAATAAGGCAATTGGCATTTCCCCTATGA:1	-	chr2L	5260867	3'	-	roo	8680	2	48.97
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGATTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTACGCTTA:1	-	chr2R	21907898	3'	+	roo	393	1	68.33
AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTG:1	-	chr3L	27415220	3'	+	transib2	2778	1	58.40
AGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAA:1	+	chrX	17431780	3'	+	hopper2	1527	1	73.53
TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATGTGTTAAATCGATAATAT:1	-	chr3L	1534507	3'	-	pogo	37	1	52.99
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATATAGTTGCGCGCCTGTGTCTTTTT:1	-	chrX	21009388	3'	+	pogo	2076	1	58.77
ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTG:1	-	chr3L	10056127	3'	+	transib2	2767	1	73.04
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCACGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTTTTATATATTTTTGTTTCGCTTAATTCACTGTTAAAAATCCTAAGAGTGTAAACAAGATTGT:1	+	chr3L	19334367	3'	-	roo	31	2	62.86
ATGAACGGAGCCCAAAATTCTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACCAATGTGTGTCTGCTTCTTGCTAGCCTTGGTGGCCATCGGAGGA:1	+	chr2L	7894187	3'	-	roo	8699	2	58.10
GAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAAGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAATCAAATGACAAATCTACCAGGAGAGACCC:1	+	chr3R	7207608	3'	+	invader2	459	1	75.83
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTT:1	+	chrX	9540138	3'	+	roo	9036	1	60.96
ATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCG:1	+	chr2R	5173224	3'	+	Stalker	352	4	56.16
AACCAAAGACACTAGAATAATGTTCTAGTGTCTTTGGACTTAACGGTCTATCACCATAATAAAAAATTCAAAATTAAAAAAACAAATACCAAAAAAAGAAACCATAAAAAAGATTTCTATAACATCCAAAAGATTTTGATTCAAAA:1	-	chr2R	18042808	3'	-	Tc3	313	2	34.93
TCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAACGGCTTAATATTACGTTTAGCCTTGTCCATTTTTCACTCAATATAATATATGGTAATAATAATTTTATTAGATAAATTACCTGCAGGCGCAACGC:1	-	chr2R	21901032	3'	-	copia	476	1	58.78
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTC:1	-	chr2R	9662733	3'	+	412	432	2	74.56
GGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACT:1	+	chr3L	8249114	3'	-	jockey	4594	1	66.43
TGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGGGCGAGAGTATTTGCATC:1	-	chr2R	7586164	3'	-	I-element	5082	1	66.98
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGA:1	+	chr3L	20831356	3'	-	roo	72	2	74.81
TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGGCTGGCGGTCAATTTATCAACCCCAACCTTAGTGGGTAGTGACCGAGAGATGGTCACGTGTCTCAAGTCGGCCCCAAAATAGCCG:1	+	chrX	23155291	3'	-	blood	26	2	65.44
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTACGCTTAT:1	-	chr2R	21907897	3'	+	roo	396	1	72.03
AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTAACA:1	-	chrX	10644406	3'	-	jockey	4797	1	57.93
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAA:1	+	chr3R	17817988	3'	-	roo	54	2	57.75
AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATGCATGTTTAATTTAAATGTATCATAGTTATATATAACTTTTAACTAAGCGCAAAAATGCAATTTTCTAGAGAAAC:1	+	chr2L	12498460	3'	+	pogo	2063	1	56.85
TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTC:1	+	chr3R	2457004	3'	-	copia	67	2	78.91
AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGGTTTTT:1	-	chrX	17756556	3'	-	297	6594	2	65.25
AAATTATAAAAATTATAAAAAAAGATAATTTAATTAGATTTATTTCAATATTCCACTAGATAGAATAACTATCAGAAAATGTCCAATTTTGTTGTAAATCTCTTCTAGATTTACTGATTCCTTATTGGACTTGGTTGTTCTTTGTC:1	+	chr3R	19584529	3'	+	Doc	4690	1	63.70
TTACCAAAGACACTAGAATAATATAGAATAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACAAGTATAAAGGTATAAGGTATAAGGTTCAGGTATAAATATTAGATAGTAAAATATATGAAACCACTTTTGACTTGCTTTTG:1	-	chr3L	16740676	3'	+	Tc3	239	1	63.70
GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGAAGCATACTTC:1	+	chr3R	14860224	3'	-	BS	5011	1	60.00
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAGAG:1	+	chr2L	16016439	3'	-	412	7092	2	58.90
ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCT:1	+	chr3R	29361077	3'	+	mdg1	378	2	52.52
TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGGTGCCAGGAAAA:1	-	chr3L	46914	3'	-	FB	66	1	62.33
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTC:1	-	chr2L	16091871	3'	+	roo	9034	1	55.48
CACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTAATAGAGGAACTACATGAGGTTCCTTTTAGAAGGCTGCCAATAACAAAACTGTATGATACCATTTTGGATCTAAAACATGTATTGACA:1	-	chr3L	27386997	3'	-	invader4	21	2	65.75
TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATTATTTTGTGTAAATCTGTGAAAGCCCGCTGCGTTTCTCCTTCGTTGACCAGTAGCCGCATAAATA:1	+	chr2L	3165057	3'	-	412	44	2	49.26
AATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGAGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCT:1	-	chr2R	9258398	3'	-	3S18	45	2	52.52
CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAA:1	+	chr2R	24218603	3'	+	412	7464	2	71.23
GTATTAATACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAACAAAGGCAAGAGAG:1	-	chr2L	2909649	3'	+	hopper	1353	1	58.90
AAGAAAAAAAAAACAAAAAATGAAATGAAATCTATGTAAACCAAATTGTAGAGAAATTATTGTTTTCATTTTAAATTCATTTGCTCATTTGTTCATTTTCATTCTTCACATCGAGATTCTTGTTTCATATTTTTTCCCCTGC:1	-	chr3L	16146887	3'	-	hopper	142	3	52.11
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATC:1	-	chrX	5274313	3'	-	roo	8713	2	67.27
TCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTGTATTCTAGCTTTGCTTTCTTAAAAGAGAAAC:1	+	chr3L	17005814	3'	-	Doc2-element	4368	1	75.79
CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATAT:1	-	chr3L	13845094	3'	-	opus	7031	4	52.41
TGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCAGAGAAAATTCACAATGCGAAAGACAAACGTCCTGCCGAC:1	-	chr2L	11639444	3'	+	jockey	4571	1	53.01
GTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTTGAGTTAGTTGAAGTGGTAGTTAAGGCGTTGGATTCCACCGACGACCATAACGTTAAATTTGTC:1	+	chr2L	14913482	3'	-	Doc	350	1	63.53
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAG:1	+	chr2L	7898371	3'	+	roo	9025	2	62.83
TCAGGATAAATAGCCGAGTGGATCTGACCCTGTTTGTCTGTCCGCCCGTCTACATACAGAGACATAGATGAAGCTTTTTAATAATGCATATCGTAGTTCCCTGGTTAATAGTTGACTGAAATACTTTTTATTCGTCCTTTGGAAAA:1	+	chr4	411449	3'	+	INE-1	94	1	51.37
GTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAAGTCATTTGACTTAATGGAAGTTTCAAATAGTTTCATGCCCAAGACGTCGGCAAATTTATGGTCAGTCAATACTTCCT:1	+	chr2R	3171020	3'	+	1360	176	1	49.28
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AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCACGAGCCTGACATGTGTCATATGCATTTGCCT:1	-	chr3R	31817394	3'	-	roo	14	2	74.66
GATCATTCGAATAAACGGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGATTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATA:1	+	chr2R	5173195	3'	+	Stalker	7183	4	72.59
GCATGCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTGTAGCATTCTCCCGTGTTTAAATTCGAGTCTCATTCTGTCCATTGGAATGTTTAGTTTCGATGTTACCAC:1	+	chr4	331596	3'	+	INE-1	534	1	64.17
GTAACGGGTATCTGGTAGTCGAGGCAAGGTGCGACTCTGGCCGAGATCAGCCGGCTGTGGCAGGGACATTCGCATGCCCGGATAGCCAC:1	-	chrX	21110588	3'	+	INE-1	551	1	75.28
GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAATAGAATAACATGTTAACCGAATTATTTGCATATTAC:1	-	chr2L	14892175	3'	+	transib2	2795	1	65.75
CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATC:1	+	chr3R	20427454	3'	-	jockey	88	1	73.29
GGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGAGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATAT:1	+	chr3R	11547787	3'	-	G2	329	1	53.42
TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTG:1	+	chr2R	16785410	3'	-	412	7130	2	70.55
AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATATATATTTCAATATATGTATATGTACTGTGTCGGCCGGAAAATGTGTGCGTCTGTG:1	-	chrX	12214064	3'	+	opus	475	2	60.00
AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGCGGACCCACCTCGATACAGTGGAAACTCGCC:1	+	chr3L	3799886	3'	+	copia	249	1	69.23
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAAA:1	+	chr2R	19050285	3'	+	roo	343	2	60.27
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GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGTGGTGCACACTTTTTATAGCCAGCAACAGTCACACAAGCCGCACAATCAAGCGC:1	-	chr2L	9564439	3'	-	transib2	45	1	51.85
TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACCCATTCCATTACCTGCTAACGCGACCGTTTTTAT:1	+	chr3L	10773185	3'	-	412	19	2	68.22
AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATTTCGCATTGACAAGAGTATTTAACACATGAAGGCCAATCA:1	+	chrX	6279442	3'	-	P-element	56	1	45.00
TATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCCCCACTTTGTTTTACTTTTATTTTCGACAGCCTGCTGACCAGCTGAA:1	-	chr3L	15491431	3'	-	copia	245	1	69.86
AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAAAAATCCCATTTCGAGCGGGAACTGTGCAATGTGCAACTCGCTTCCCGGCTCTTTGTGTGCGTCGT:1	+	chr2R	6919761	3'	+	hobo	2932	1	67.35
GGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAACAAAAAAAACACACACAGAACATGCAACAGCAGCCAATTGAAAAACCACAACATATAAGAAAGAACGAGGACTTAAAAAGCTAACGTGTAAATATCC:1	-	chr3L	15117370	3'	+	Rt1b	5110	1	60.69
ATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGGTTTCAAATTGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGAAA:1	-	chr2L	17550615	3'	+	Transib-N1_DM	444	1	77.30
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ACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTG:1	-	chr3L	19013886	3'	+	invader3	5458	2	79.13
AGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATA:1	-	chrX	13704781	3'	+	invader4	3006	2	76.03
AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGAAGCGATCGGCCCCGTGTGCATGCACTTATTTGACTAATGTCTTTAATAAAA:1	+	chr2R	19798116	3'	-	Transpac	4985	2	65.07
CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAAGTGTTGCATACGTCGAGGGGCCAGCCGCACAATTTACATCTAT:1	-	chr3L	17136028	3'	+	hopper2	1555	1	53.79
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATACAACTGCGGCGTAACATGCATGGGTGTCTATGGTTTAAGATAAAGGGGGTTCGTAACTAAAGTCTAGAAAGG:1	-	chrX	12074504	3'	+	412	7497	2	50.00
GACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATATTTTCCAATCATTTTCATGGGCTCTCCACTACCTGGGCATTTGTCAGGGCATTATGCGGCTTCACGGACATTAATAAAGCAAATAACTGTG:1	-	chr2R	13716329	3'	-	roo	146	2	70.15
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGAC:1	+	chr2L	6059311	3'	+	roo	354	2	58.52
CTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCAAAGTCGAACGGAATGACCATCAGTGGAGC:1	+	chr2R	9325001	3'	+	BS	5001	1	74.79
TTTTTAAAATTTTATTTTTTATGCTCGACATTCTTAAAACTACCGAAATGACTTTCTTAGACAACCAATGAGTTGTTAATGCCTATGGTTGCCGAGTAACTGGAGTAGTGGAGACTGCGCATCCTGCTGCATGCGCACATCG:1	-	chr3L	13859865	3'	-	P-element	2691	2	87.32
TAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAATTATATTATAATTTTTATACTAAAATTGTCTATTGTCTAAAACCTTAACCA:1	-	chrX	22576313	3'	+	Bari1	1639	1	65.52
TATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCCGAAAGCCAGAGGATCAGGAGCATACCGACCATG:1	-	chr3L	2362284	3'	-	Stalker2	24	2	67.36
AATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGTTGGTACCAATACA:1	-	chr3L	22400234	3'	-	1360	35	1	61.64
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAATGAAGAGGTTTAGTCATAACCAATCATGACTAAACCTCTTCATTTATTTTCCACTCAAAAGAAAAACTTTAGGATACCAATTCTCTAATAT:1	-	chr3L	16340387	3'	+	roo	347	2	42.86
GTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTGATTGCGTTTTCAATGCCAGCTCGGTTCTGCAGGGAAATCGATTGATCCA:1	-	chr2R	14370671	3'	-	1360	3274	1	58.54
TGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATGGTGAAAATATATAAAGTGATTTTA:1	+	chr3R	20868212	3'	-	BS	5051	1	56.85
CACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTCGCCTGACTTTGGTGAAATTCAACGCGTCAACAGCGCATCTTAAAGATTTTTATCGGTTTCCAC:1	-	chr3L	22372534	3'	+	Chimpo	239	1	68.75
TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTATGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTT:1	-	chr3L	23728633	3'	-	HMS-Beagle	6822	2	57.02
AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTG:1	-	chr2R	20496891	3'	-	blood	44	2	54.11
TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTG:1	+	chr3L	7943741	3'	+	Burdock	6362	2	61.38
GTTAATTTATTTTAACTATGCTGGTGGATTTAGCTTTTGTACTTTATTCCTCGTGCGCTCTTCTACCTCTCTTTCTCTTTTATTTTTTACTTTACTTTTTTTCCGTAACGAACAGTTCTGGGTGATGACTGTTGGTTGCTTCTT:1	-	chr3L	15536045	3'	-	HeT-A	300	1	70.14
GCGCTGTTATATTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAACTAACCTTTCGGCAATTGGGATGTGGTACAAAGTCACGGTTGGTACAATCGATCTCGTTGGGATCGAACTGCGGTC:1	-	chr3R	13770023	3'	+	BS	5048	1	52.74
AAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAAACACAATCACACATGC:1	+	chr2L	23390236	3'	+	rooA	7540	2	47.86
AAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAAGCGCCCAAAGCTTTCAAGATAAGAGTGAAGCCTTGACTCAAGATTAGGGATAGCTTAAGAGA:1	-	chr2R	4601494	3'	+	HMS-Beagle2	300	2	77.40
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCC:1	+	chr2R	25118797	3'	+	roo	9034	1	59.86
ACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCATTGCATATTTAATTTGTTGTACAAAAATCCCCGCGCCCA:1	-	chr2R	15917240	3'	+	roo	156	2	71.11
GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAG:1	+	chr3L	22349284	3'	-	jockey	63	1	54.81
CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCC:1	+	chr2L	18419267	3'	-	412	24	2	60.45
TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTACACCTACACA:1	+	chr3L	20033810	3'	-	blood	30	2	54.48
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATTTATTCATTGTACGGCTTGGCTTAATCCATTAACGACCCCTTTTAGCCGTCACTTTCTTTGGCAAAGTTTACGGACATTTTTGGCAAATTACAAA:1	+	chr2R	9631577	3'	-	roo	42	2	71.85
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTTAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATG:1	-	chrX	5643485	3'	+	roo	337	2	66.90
GGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCATCTTTGAGCTTACATTCGCCTATTAACTTTTTAAGTCCAAGAATAAGATTCTTTAATATTTGAGAAA:1	+	chrX	6191230	3'	-	FB	68	1	62.33
TATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTATGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCT:1	+	chr2L	2122470	3'	-	Stalker	6927	4	69.18
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTATGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGC:1	-	chr3R	19968094	3'	+	roo	404	1	68.82
ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCTAAGGATAAGCACTTT:1	-	chr2L	2794154	3'	+	Burdock	6364	2	59.54
TCTGCCTGTTACATACATTTCAACGAATCTAGTAAAACCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATACAAACAGGAAAAAAAAAACGCAAAGTTGAAATAAACAAGAAACCATTCCAATGTGAACAAATGAGCATAAATAAAAGGTTT:1	+	chrX	11906370	3'	-	INE-1	22	1	48.97
CCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAGAAAAAAAAAAACGAACACGAAAGTGCGATGCATTGCTAATAAGCCAAATATATAACGAATTTATACTCTTGATACT:1	-	chr3L	12164693	3'	+	G2	3016	1	57.53
AAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTCAATATAGCGTCATAGCGGGTCATATAGGGTCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACA:1	-	chr2L	21750457	3'	+	Stalker4	6949	2	77.40
CAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTTAAT:1	-	chr3R	18339045	3'	+	roo	388	2	69.86
ACCGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTA:1	-	chr3L	12308340	3'	+	hopper	1414	2	60.00
GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATAC:1	-	chr3R	13360313	3'	-	jockey	85	1	68.49
TCAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAA:1	+	chr3R	8049021	3'	-	Q-element	131	2	59.29
TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCACATGCAGTTGGCGAATAGAATTATATTCCCCTGCTCTTTGTTGTTATTTATTGGCGC:1	-	chr3R	12717695	3'	-	297	10	2	77.27
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTAGGGAGAGCACAGTTGCGTCAACTCAGCGATTTATCCATCAAATGTTCAGTTTTAACATGCAATGCATTAACTTTTGATAGGCGAGGGATTCGTTATATTCTAGCTA:1	+	chrX	1235208	3'	-	blood	166	2	78.29
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCGACTTAAAAAGGAACTGCGATCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAA:1	+	chrX	13504235	3'	+	412	7485	2	58.02
ATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACAGACTTTCATGGCAAATAAATGAAGGAAGCGAAAACACTTTTCAAGTCTGTTCAAATATTGAAAATATTACAATT:1	+	chr2R	16944488	3'	+	jockey	4855	1	50.68
AAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCATGGCGTACTGCCATTTTATTTATGACATTATTTGCA:1	+	chr2L	17077237	3'	+	jockey	4800	1	74.66
CACTTTTGAAAAATGTTTTGATTTTGCCTCGTTTTATTGTTTGTCTTGCCAATTTCTACGTTGAAAATTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAG:1	-	chr2R	1461346	3'	+	INE-1	261	1	46.30
AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAAATCACTCCTCGGCCCCCGAAAGTATGCCAAAAAGGGGAGCTATAAATATTTTAGAATTCAATTTCCGCACTTCCTTGGCGACGAGG:1	-	chr3L	4948010	3'	+	hobo	2903	1	59.59
ATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGATGGGCACACACTGGCAGTCGACGATCTGCTGGCGCGAGGTGTCATATCCACTCTGGTACTGAC:1	-	chr3L	16341909	3'	+	roo	450	1	51.49
GAATAAGCTTACAAATAAAGACTGATCCAAACTTAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGACTGTGAATTAAGAACAAGACGTGCGTACTTGCTGCCCAACGAGTCATTCCATCCACCAATG:1	+	chr2L	23000561	3'	-	Cr1a	4040	1	58.22
GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAG:1	-	chr3R	21276557	3'	-	BS	5066	1	70.99
CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTT:1	+	chr3L	10574356	3'	-	Tabor	89	2	76.03
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTATCGAGTGTGAAGGTTCAGATGTTTACTATTGAATAAACAGCATAGATGATGTAAAGACTTCATT:1	+	chr3L	22437272	3'	-	roo	8693	2	72.73
AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATAACTTTTATCTTAGATATCTAAGTCTATAAATATAATTCTTAGGATATG:1	-	chr3R	9293190	3'	+	297	330	2	67.81
GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAACCCACATATAAGTTAATATATCTAATCGAATTGTAGCTATATGTTTAACCAATTCTC:1	+	chr2R	9220467	3'	+	opus	443	2	60.00
GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAAAGCTTCCAACAGGGAACTATCGGTGCTATCG:1	+	chr2R	24561561	3'	+	P-element	2882	2	76.47
ACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACT:1	+	chr2R	21101816	3'	-	P-element	62	1	33.33
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCGGACCACCGCAATTTTCTTTCATTTTCCGTAGTGCATTTGCAATTTGTTGAGTGTGTTTCAATTAAATTAAATGAAAAACTTTTGCGGCA:1	-	chr3R	28624528	3'	+	roo	9041	1	64.38
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTACAGCCGCATTTCTGCGAA:1	+	chr3L	9998173	3'	-	roo	8750	2	77.93
GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGG:1	+	chr2R	16785411	3'	-	412	76	2	69.86
AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGA:1	+	chr3R	7482832	3'	+	412	428	2	67.12
GATCAATAGCCGAGTTGATCTGGCCCTGTCCGCCTGTCTGTCAGTCCGTATGAACGTCAAGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATATAGATTCCAGAGACTTAGACTTCGATAGCAAGGACTATATAGACAATTACG:1	-	chr3R	24684066	3'	+	INE-1	98	1	77.40
AACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGACGACGAACTTGAGGGTAAAATAACTTGAAACTTGAAT:1	+	chr2L	2687463	3'	+	copia	221	1	61.64
CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCA:1	-	chrX	13066487	3'	+	jockey	4965	1	58.14
ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTGTGTGCGGGCAG:1	-	chr2R	9662696	3'	+	412	440	2	53.85
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACA:2	+	chr3L	11530999	3'	+	roo	9031	1	56.85
TCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTAT:1	-	chrX	15408735	3'	-	INE-1	553	1	82.84
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTTGAGCACGTTGAA:1	+	chrX	9540150	3'	+	roo	386	2	69.66
TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAA:1	+	chr3L	11531003	3'	+	roo	9035	1	59.59
AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAAATAAATAACAATAATAGCATAGTGACATATCGATAATCCTATG:1	+	chr2L	22685231	3'	-	Ivk	29	1	65.75
ATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTACTGTCGTCCTAGATATTGACATTCCTCGACTTTCTGTGG:1	+	chrX	1898188	3'	+	P-element	2734	1	32.17
AACCTAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGCTGAAATAAACGATAACAGTGAG:1	+	chr3R	3286147	3'	+	gypsy12	9826	2	76.71
GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATAAAGAACATACATTAAA:1	-	chr2R	19004080	3'	+	roo	400	1	75.86
GTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTAAAAATATTTATATGCTTAAATATGTTTAAAGAATTTGCATTATTATACCT:1	+	chr3R	11207295	3'	-	FB	70	1	65.52
GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAAAG:1	-	chr2R	20496872	3'	-	blood	7036	2	65.75
TATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACGCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAA:1	-	chr3L	19035989	3'	+	Tirant	8486	2	56.25
TGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCATTCATCTAAATGGTCAGGTGTTT:1	+	chr3L	3501042	3'	+	opus	7462	2	55.56
ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTG:1	-	chr2R	1857480	3'	+	1360	3374	1	58.22
AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAG:1	-	chr2L	17081794	3'	+	jockey	4919	1	69.18
AATGGTTTTTGCACCTTGTGTCCTCACTTCGCTCCCACGCCACTCCCTTTGATGAAGTAAGAATCATACTAGATTTGCTTTACCGATGATCTCGTTTCATTACTTCCATCTGAATTTTTAACTGCCTCATAGTCTTG:1	-	chr2R	4545881	3'	+	transib4	2319	1	66.42
ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAAGGTGTTTAATGAATAGCTATGTAATA:1	-	chr2R	13121941	3'	-	pogo	9	1	67.12
ACGCAACCAAATATTAAGATTCTTGGTGAGCGTTTGATTAGCGCTGGGACCTCACTACCTTGGTCAAGGTG:1	+	chrX	19694902	3'	+	Tc1	1338	1	64.79
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTTTTATATATTTTTGTTTCGCTTAATTCACTGTTAAAAATCCTAAGA:1	+	chr3L	19334351	3'	-	roo	8717	2	60.27
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTG:1	-	chr3R	25448340	3'	+	roo	9027	1	55.56
ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCCCTTGCTATGGCGGCAA:1	-	chr3R	1433138	3'	-	mdg1	7070	2	56.00
GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCATTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTTTGCCTTTGGCTCCGGGTCGCTCAT:1	+	chr3R	19265892	3'	-	I-element	38	1	54.46
AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACCATACAAGTATCGGTTATAAAAACAACTAAAAATGGGGATGGAGGCTGGG:1	-	chrX	21175653	3'	+	1360	3345	1	59.02
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAATTCACTTTTCATTGACACAAAT:1	+	chrX	8543574	3'	+	roo	399	1	74.42
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTTGAGTTAGTATT:1	-	chrX	17526863	3'	-	roo	8723	2	80.91
ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCACCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTAT:1	-	chr3R	10462617	3'	+	opus	436	2	67.63
AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGCGGAAAGTGTTTGGCCCACACCCTGAG:1	+	chr2R	13006541	3'	-	3S18	5788	2	67.44
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTG:1	+	chr3R	27994288	3'	+	roo	9033	1	54.20
CGATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACCAACTTAATTTTTTCCCATTTTTCCTCCACCA:1	-	chr3R	9922900	3'	-	blood	7010	1	69.23
CCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGGTGGATGAGTGGTGCACACTTTGTATAGCTAGCAACAGTCACACAAGCCGCACAATCAAGCGCTCGTCTCGGGGTTTATGTC:1	-	chr2L	9564420	3'	-	transib2	8	1	68.38
AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCG:1	+	chr2L	18419255	3'	-	412	48	2	50.00
CCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTTCCAGCCTCCCCTTATAGGGGTGTCACCATCGTGTCCTC:1	-	chr2R	5173389	3'	+	gypsy	436	2	69.18
CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTAC:1	-	chrX	13504145	3'	-	412	57	2	55.48
GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATATATATTTCAATATATGTATATGTACTGTGTTGGCCGGAAAATGTGTGCGTCTGTGCG:1	-	chrX	12214062	3'	+	opus	443	2	68.35
ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGATTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAATTAAGACTAAAAGAGTTGGCAAATCGGGTTAGCACTG:1	-	chrX	3308284	3'	-	hobo	36	1	55.30
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTAGCTGTGCCAAAAACAAACTTGGCTCTTTAATATGATATGTTAACCCATCCAATTACATATATTTTCAAAGTTTACA:1	-	chr3L	19334194	3'	+	roo	396	1	76.71
CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATCATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTA:1	-	chr2L	17420135	3'	+	roo	9030	1	51.77
TCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTA:1	+	chr2L	13585918	3'	+	Tabor	412	2	65.07
AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGG:1	-	chr2L	21153479	3'	-	1360	51	1	56.30
GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTCAATTAGCAGACCTTGGCTTG:1	+	chrX	6522045	3'	-	F-element	64	1	62.39
TCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAAAATACGGGGAAACATTTTTCAATTAAGCCTTGGCAAATACGTAAAAGA:1	+	chr3L	10056196	3'	-	transib2	66	1	63.01
GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGTTG:1	-	chrX	7195049	3'	+	P-element	2851	1	43.81
GTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGC:1	+	chr2L	6623022	3'	-	Burdock	56	2	67.20
GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAGAGAAAGACAATTTAAGAGAGCGCAGATCGCACTTATGAATACAGTCGTG:1	+	chr3R	18585717	3'	+	P-element	2881	2	80.15
TATTTTATTTTATTTTATTTTTTTTACTCAGCTCGTATGGGCAAACGCGTACATTTCTTTGGCTTTTTTTTTGTTTTCTCGCAGATAAAAAGATGTCCAAAGCGGCTCAGCGTGAGTCGGTGGCAACTGCAATGCCTC:1	+	chr3R	19359936	3'	+	transib1	1899	1	51.45
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTA:1	+	chr3R	18582250	3'	-	roo	8722	2	60.27
ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCT:1	-	chr2R	13585428	3'	-	412	83	2	74.66
GATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGTGCCACCT:1	+	chr2L	4412635	3'	+	Quasimodo	7336	2	62.24
ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTA:1	-	chr3L	11321407	3'	+	mdg3	5439	2	57.55
AATATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTATGG:1	-	chrX	2082620	3'	+	Transib-N1_DM	443	1	91.35
ACAAGANAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAATGCCAATTAGTTCGGATAGTTAGTGACTTTAATTCACTCCAAT:1	-	chr3L	16973311	3'	+	S-element	169	2	70.55
AGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTGCTTCGATTGGTAGATGTG:1	+	chr3R	23818234	3'	+	P-element	2583	1	22.22
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGGAGCGGGACAGTTGGCGTTCGGTGTCAGGGGGTTGCGGGTG:1	+	chr2L	7945437	3'	-	roo	8670	2	72.32
CGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCATGACCTAGGCCAGAATCAGACTTGGCCTTCTCCTC:1	+	chr3R	11098270	3'	+	Quasimodo	6959	2	76.03
TGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAA:1	-	chr3L	7292455	3'	-	HMS-Beagle2	51	2	57.04
ATTTTCAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATG:1	+	chr3R	8049023	3'	-	Q-element	135	2	59.59
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTC:1	+	chr3R	7835212	3'	-	roo	8725	2	61.54
CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATTATATACACATTAACGAGTAGGGCGAATGAATCATGTATGTGTGATAGGGGGGGTATTGCGGCATTTAAGGGTTTGTTCTGCTGATCCCACCAGCTTAGACATAGACGATTGG:1	-	chr2R	18609300	3'	+	opus	491	2	69.18
GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGAT:1	+	chr3L	7943729	3'	+	Burdock	6349	2	52.74
TGAGTTTTTCTTTGGTGCAATTTCCAGGCCATCACTCTCTCTCTCTCTTTCTCGCTCTCCTATATTGCTGTCTCTCTCTCTTGGGGCTTGGCCTTCCCGGCACTG:1	-	chrX	20686664	3'	+	Tc3	52	1	56.19
GCAAACATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCACCGATCTCCCTAACCGGAGGATAGTATAAAATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1	+	chrX	10664376	3'	+	G5	4603	1	64.58
CCACACACACACACACATAGTCGTAGGGAAAAGAGAAAGCAGCACACACATACAGAGTAACAAACAAAAGCCGCAAAAAAAAAAACCAAAAAGAAAAGA:1	-	chr3L	8583620	3'	+	accord	185	2	75.76
TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTG:1	-	chrX	13504153	3'	-	412	7072	2	60.00
TACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCAGTTTGAACCATGGACATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTATGCCATCCCTTTTCCCTCTTCTAATTCCGTCTTCTTTTTTGTTAAACTCTCTCGAATTGCATA:1	-	chrX	9421784	3'	-	diver2	114	2	56.85
AAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGCAAAATCTCCCTTTTAATA:1	-	chr3R	4160067	3'	+	invader2	5046	2	59.03
CGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTATACACTGCAGAAAACTGTCGAAGAATTACA:1	-	chrX	21669989	3'	+	Stalker2	361	2	50.39
AAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTCTGCCACACGAACGTC:1	+	chr3L	23678151	3'	-	Osvaldo	30	1	73.85
AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATCAAA:1	+	chrX	21014871	3'	+	copia	209	2	53.10
TAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTTATTTACTTACAGGAAAATCCATCAACAGGAACCAAATCTCCCAAGCCAGTGAAGGCTACGCATCCCCAAACGTTTGCCAGCGCAAACATTGATGCAATTGTCCCTGTTCA:1	-	chr3R	15140485	3'	-	Tc1-2	1595	1	70.00
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTT:1	+	chr2L	3886228	3'	+	roo	330	2	69.86
TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCT:1	+	chr2L	6059333	3'	+	roo	9029	1	56.85
TTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATAATCACAAAACCCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATAGATAATGACTTAAACATATGTGTGCTGATGACTTGCTGAGCCTCGAAGATGGAGATG:1	-	chr3L	12301821	3'	+	Porto1	4324	1	64.84
AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACA:1	-	chrX	21087596	3'	-	mdg3	15	2	56.00
GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAGGTTGCACCGAAATAACGCAATATTTTCGAATAAAATTTTTAAAAATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATA:1	+	chr3L	1534649	3'	-	pogo	30	1	63.83
GCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGG:1	+	chr2L	12290764	3'	+	1731	4568	2	56.94
TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTC:1	+	chr2R	16785399	3'	-	412	77	2	76.30
TCAAACAAAAAAAAAAACAAAAAGAAAAAAGTAAAAAATTACCTGGCACACCGTCTTTGAGAGAGCCCATTTATACAGGGATTGTAACACTTTGAGGCAAGGCGGCATCTGG:1	+	chrX	13096162	3'	+	R2-element	3584	3	61.61
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAG:1	-	chr2R	20596449	3'	+	roo	9020	2	54.17
CCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACAAACATATACAA:1	-	chr2R	7452837	3'	-	pogo	21	1	60.00
CTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATCGGGTAATAACAATATAACAAAGTAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAAAAGTAACAAGAAAGAATGCTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1	-	chrX	15903342	3'	-	INE-1	566	1	66.44
TTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGTGTCATACGCATAAGACAAGCTCACACT:1	+	chr3L	7588519	3'	-	hopper	15	1	68.47
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCA:1	+	chr2R	13084671	3'	+	roo	360	2	64.71
TATTTCTTTTTATAAATTGATATGATTGATAAATTGATAAATTTAAGCTGAATTTTTATTATGTATCTATTTAATATACATATAATTACTGAGTTATTGCCAGTCGGCTGAGTTTCGGTTTCGGCTTTGGCCAGTCCAAAAGGCCC:1	+	chr2L	1565575	3'	-	transib3	2678	1	58.90
GGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGCTAAATTTTATTATATGTATTGTACTTCTTCAGCATCTTACGTGTCCAACGTGAGGTGG:1	+	chr2R	10385923	3'	-	Quasimodo	6906	2	59.09
AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGTCGAGGCCTATGGATCC:1	+	chr3R	23235597	3'	-	jockey	4789	1	59.17
CCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGC:1	+	chr3R	3286162	3'	+	Gypsy12A_LTR	1887	3	65.75
GCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTATTGATGAGCGAACCCGACCCGGCAGCTGTTCTTGTTCCTGTTCCTGGCTGCCTTC:1	-	chr3R	28772211	3'	+	mdg1	477	1	56.25
ATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATTCCCCAGCAATTTGGCACCATTCTGGACGTG:1	+	chr3L	10574437	3'	-	Tabor	2	2	75.34
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATT:1	+	chr2L	17471673	3'	+	roo	9031	1	61.11
GAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACGTCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTACTCACTAACATTGC:1	-	chr3R	4504012	3'	+	INE-1	549	1	71.92
ATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTCGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	377	1	55.48
GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTG:1	+	chr2R	19540444	3'	+	jockey	4950	1	64.29
ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTGGATAGAACTGCGCTTGAATAGTACGATAGCACTGATA:1	-	chr3R	23495611	3'	-	copia	33	2	63.01
AGGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAATATATAAATTAATTTAAAAAAAAACTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAGATTGAGTAGTAGAATGTAACCGACATTTTGTTAT:1	-	chr3R	4714600	3'	+	X-element	4687	1	61.11
CCAAATCGCCTCAAATTGAGTTAAGGCGCTCTGAAAAATGTGTCCCTTTAAAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGA:1	-	chr2R	4802881	3'	-	mariner2	536	1	71.11
GACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAGTTTGAGGGTATATAAGGGAATAGGGGGGGAGTCTCAAGAATTT:1	+	chrX	5274439	3'	+	roo	397	1	77.40
ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCAC:1	+	chrX	10521735	3'	+	Tabor	429	2	54.79
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGGGGTAGCCAAACAG:1	-	chr2R	20596418	3'	+	roo	386	2	66.90
CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGCGCAATGAGTTTTCATCTC:1	+	chrX	5662915	3'	-	P-element	87	1	18.18
GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCAAATGGCAAACGGCAATACCCGA:1	+	chr2R	24218630	3'	+	412	7540	2	71.13
AGATAAGAAAATAAAATAAAATGGCTTGCTTATCTGTTATTACCAGGGATTCATACTTTTCATATACTTTTTGGGAAATAAAGCG:1	-	chr3R	18659535	3'	-	transib1	1900	1	54.12
TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATGTATGTATGTATTCCTTCCGGATTTTTGGGGTTACTAGCATTATTGCTCATCCTTTAGGCTATATCAAAAATATTTCTCGGCAGCGTTCCGGAG:1	+	chr3R	2461701	3'	-	mdg1	7064	2	67.81
AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTTGCTCTTCACATTTATTACTTGTTAACTTGAGATCGTTGTTAGATCTAATAACTAGCTGCATCTTG:1	+	chr3R	21434980	3'	+	412	7492	2	56.16
TATCTACCGTTTGAAAGCCAAACGTCAACAACCATCTAAGACTATTAAATCCGGGGACGAATTCATCTTAAGACAAGGAGGAGTTAACACGAGCAAGTTAGAGGGGTGCACATATTTTTTATTCACATATGTATGAATCCCCAC:1	-	chr3L	23515300	3'	+	gypsy10	5571	1	70.14
CATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCATATCCCAGAAAAATTATGATATTTCCCCTCGCATTCACACTACTATAACATTCTCTCTTCTTTATAATTAATAGCAGA:1	+	chr3R	4161047	3'	+	Idefix	5	2	57.53
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCACAACAATTTCCACTGGCT:1	+	chr2R	14387993	3'	-	roo	8726	2	74.17
TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTAT:1	-	chr3L	12879738	3'	-	roo	68	2	65.75
GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAG:1	+	chr2L	7810107	3'	+	P-element	2838	1	35.78
AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAACCATATCCGTATCGTCTTTTCTGAAACTGAGGTCATCCAGCCAGGCGCCGGAACTCATTTCCCC:1	-	chr3R	11496489	3'	-	1360	24	1	67.86
GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTTCAATGACGACGGTGCTGCCACCCTCG:1	-	chr3L	12861665	3'	+	pogo	2098	1	80.00
GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACA:1	+	chr3R	27424933	3'	-	blood	31	2	55.79
CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAAGA:1	+	chr2L	14081427	3'	+	1360	3355	1	60.56
ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAAT:1	+	chr3L	16973456	3'	+	S-element	1671	1	62.30
AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTAAAAC:2	-	chrX	10644405	3'	-	jockey	4797	1	59.59
ATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGT:1	+	chrX	21667976	3'	-	gypsy2	30	2	69.86
GGAGAAAAGCTCCAGAACATTGCTAAAAAAATATATGGTACGACTCAATACCTACCCAAACAGTCTGCAGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAGAAGAGAGAGGGCCGAAAAGCCGGGCCAAAAGACAGGCTGTGAAACT:1	+	chr3L	18634084	3'	+	jockey	4622	1	35.17
AAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTACATAAGCTTCTGCTGTTTTAATAGACAGAAACACCTTT:1	-	chr2L	588371	3'	-	FB	82	1	73.29
GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGA:1	-	chr2R	9791562	3'	-	412	43	2	56.25
TTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCA:1	-	chrX	2842507	3'	+	Tabor	430	2	65.00
CTTATAGGTAAAGATCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGC:1	+	chr3L	10385907	3'	-	Burdock	63	2	71.77
GACTTTATCGTATTATCTGTAATCTTGAATATCTGCCGCTCGTAAAGCACTCAATTGTAACTTTTTTAACACATAATTAGATCTCACTGACATTTATATTAATTATACTTATGGATAAGATACAATTTGAAAGTCTTAACAAATAT:1	-	chr3L	28064792	3'	+	Cr1a	4215	1	75.34
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTTGTGGGGAAGTTGCAACAGCTGCTTGCAGTTGAA:1	-	chr2R	13696350	3'	+	roo	389	2	71.72
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTCTTGATTGACAAATTGATATTGATCACTTGGTGAACATTTGAATATAGAAGAATATAACAGTGCTTAAATATTTTTAATATGAACATTCGGAAGCAGGCCTTCAAAAT:1	+	chr3R	14364745	3'	-	roo	8675	2	74.83
ACCTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTTTGTAAAATGCGGTTGACTGTGGATCTGTCGCATTTGAACTTGGCACAAATTTCCTTTTTGTCCACCCACTGTTAATCCATGCTAAGGTAATCGTGGAATCACTCCA:1	-	chr3R	19446340	3'	-	pogo	498	1	71.92
GGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	10582472	3'	-	Juan	3855	1	53.62
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATT:1	+	chr3R	17420502	3'	+	roo	338	2	67.81
AGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCGGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGAAAATATGTGTGCTAAATTATTAAAAATGTTTGTGGCAGCA:1	+	chr2R	10968372	3'	+	roo	8891	2	71.23
GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCTTTCAAGAGATTGCACGTTTTGG:1	+	chr3L	17560420	3'	-	pogo	22	1	69.86
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATAAAGAACATAAATTA:1	-	chr2R	19004082	3'	+	roo	397	1	78.77
GAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTATCATATCTTATTTCAATTGATGTATATATTTTCCGGTGTAGCC:1	+	chr2R	9500085	3'	-	G5	4703	1	54.78
GCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCATTACATATGCCAATTTATTCATTATATTCATATTGTGCTG:1	+	chrX	979963	3'	+	Idefix	269	2	72.41
TATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCATAAATTAAACACTTGAAAAGACACAAAACTATTGCTGGAATTTGCATAATGCGTACACAATT:1	+	chr3R	9210727	3'	-	mdg1	7096	2	62.33
ATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGCTTTAGTTATAAACATATCGGTTTGTGGTTTTTCCTCCTCTGCGTTTGGTTTTTCTAAACAAATTGGTTTTTACT:1	-	chr2R	13006423	3'	+	3S18	286	2	54.41
TTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGTGAAGTCACGTCTCTTATGTCCTAC:1	-	chr2L	5844951	3'	+	transib2	2802	1	66.42
AACCGAAGATATTTCCTAATAAAATTAGTTTCTTACAAATACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCTTTTGTAAATTTTGTTAATTAAATTATATGCACCAGTTTTTACCTTAGGTAATTTCGT:1	+	chr2R	25118776	3'	+	roo	9016	2	56.12
CGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTCAAATATATATTGTAATACCAATCGTCGACGCGATCGGTTGTAATCCGAAATCGATTTTG:1	-	chr3R	451597	3'	+	Doc2-element	107	2	54.55
TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTAGCTTGTCTC:1	+	chr2R	16891956	3'	+	hopper	1404	2	63.38
GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTG:1	+	chr3R	20427470	3'	-	jockey	32	1	56.07
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGC:1	+	chr2L	12892721	3'	+	roo	9017	2	56.16
TTTTTCCTTGGTTTTTTTTTTCAAGGAAAGGAGAGTCGTGTAATTATGTGCCACTAAAGATGGCAACGAAGCAAATGGGGCCAGGCACAAAAAGAATGAGTCGAATCAAATCGGAAAGGGGCAAACAAAACAAATCAAC:1	+	chr3R	25557288	3'	-	Doc2-element	228	1	70.50
AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCATTATGTCGAGTCACGGTAGCAAGTTTGGGGGCTAGTGCAACGAAAGCGGCG:1	-	chr3L	7588369	3'	+	hopper	1392	1	68.28
GATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCCACTTAATCTCTTAATCACTGTGGTGCAGGCACTATCCAAATCGGTTTGATCTCCCGCAA:1	-	chr3R	8083787	3'	-	Quasimodo	239	2	52.76
TTCTTAATAATAAATAAATAAAAATAAAATTACTTAAATACCTTCAAAGTTGAATTTCCTTTTAGAAAGTTTATTCTAAATTGAAGCAGAAACTTGAAATTAAATTCACCATTTCGAAAGGGAAGGCAACTTTTTCAGTAAAAGTG:1	-	chrX	9542056	3'	-	copia	5096	1	34.25
GTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTGCTGTTCTTGCCTCCGGCCTGTGTGTGTTCTTGCCCCGTATAAATAACATTTTTGTCAAGCGCCTCGTATGACAAAGTGTCA:1	-	chrX	18001054	3'	-	412	216	2	60.27
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTG:1	-	chr3L	20654470	3'	-	roo	8723	2	59.59
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCAGCCAGCCAGCCA:1	-	chr2L	3114436	3'	+	roo	404	1	80.00
TATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTGATGGGTAACAGGCGGCCAGCAAAAGTGGAGGAGCTCACCTGAGACTGAGTCATTGCACTTCTGTA:1	+	chr3L	15599968	3'	+	roo	8754	2	54.03
AGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCA:1	-	chr3R	25423204	3'	-	3S18	56	2	57.78
CCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTTGCATTGCGAGGATTCGACTTTGTTAATGGATAAGGTGGGGGAGGGG:1	-	chr2R	18526082	3'	-	jockey	4637	1	57.27
GCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAACCATATCCGTATCGTCTTTTCTGAAACTGAGGTCATCCAGCCAGGCGCCGGAAC:1	-	chr3R	11496499	3'	+	1360	3354	1	60.28
GCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCAGGAAAAGTCCCCAAAAATAAGAAAAACAACAGA:1	+	chr2R	16373537	3'	-	Max-element	8291	2	71.68
GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGACAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAA:1	-	chr2L	17081796	3'	+	jockey	4986	1	51.95
GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGGAAATGAGTGCTCGCCCA:1	-	chr3R	13360265	3'	-	jockey	23	1	72.18
AAAATATTTTAATTTTAAAGCGGCATCATCATAATTTTTTATAACTTCGGATATCTTACAAAAGCTAACATCTATAAGATATAAATTCAGATTTCAATATGCATTTAAATTAAAACCATTTGTTTAGTGTCGTCAAAATAAATATT:1	-	chr3R	16714743	3'	-	1360	3025	1	54.79
AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAATCGCATTTTATTGCCTACTATCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGAT:1	-	chr3R	19589879	3'	-	BS	5006	1	68.46
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTTGGCACGGTTCAGTAC:1	+	chr3R	18582289	3'	-	roo	19	2	69.86
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTG:1	-	chr2R	19004170	3'	+	roo	8995	2	82.11
TATATTTCTAAAGTTTATTTTCAATTTCAATATTATATAAAAATTCATAACCGTCGCCCTCTTAAAGGAAGGAATTAATGCCAATTACAGTAGGGGAATACTTGGATATATCCTCTCCATCCTCCTCCATCATTGAGCTAAAAG:1	+	chr3L	26834356	3'	+	hopper	176	1	55.56
ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACACGTTAAATGCTGGTATCGATTTCACATAATGAGTTAAATATGTATGGGTCATG:1	+	chr3R	8874204	3'	+	hopper	1384	1	36.99
AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAGCTTTGGTAAATATACTTTTCACGTCTGCATGCGAGAGAGCGAGCAAATAAA:1	+	chr2R	13585551	3'	+	412	476	2	73.97
GAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGAATTGAATCCGCCACACGACTTGCCACACGCGGCTC:1	-	chrX	20646411	3'	+	1360	340	1	72.09
TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGTATTTAAGGTCGATTACTAATTCCATTT:1	+	chrX	13039546	3'	-	roo	8714	2	67.23
TATATATTTCTAAAAAAGGAAAAAATGTTCACTATAAAATAAATTAAATAAGCCACCTGTGCGGCACTTGAAAAAAATCAACGTAAAAAGGAAATTTGCA:1	+	chr3L	428378	3'	+	TART-C	11034	1	63.00
GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTAAAGTAACGGAAAGGAAATTAATGAAATTAATG:1	+	chr3R	30344722	3'	-	pogo	43	1	53.38
ATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTATATATGGAAAAAGGGATAAAAAGGTAAAAGGATAAAGGACGTGGCACATGAGGACAGATACTCCGCTTGTGGGGTGCCTCGTCATATATCAATTTCAATTATCTGGCATTTCCG:1	+	chr3L	9557031	3'	-	INE-1	300	1	55.48
AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCAC:1	-	chr2L	13585836	3'	-	Tabor	6903	2	61.97
AAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCTGCATTTTTCAAGCTGAAGTCTGTGATATTGGACGCTGTGCGGAGTTTAGTCTGCAAAGGAACTATCGTGGCAAGGACATTGCTAAACTGTCTGATAGTCAAGCAGCCATAA:1	+	chr2R	4330778	3'	+	baggins	5338	1	72.60
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAACAGTGTG:1	-	chr2L	3114472	3'	+	roo	9015	2	56.16
GTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTATGGTTTATTTAACGAAAGAACAATCATGACCATGAAACTTAATTAACTA:1	-	chr3R	20136427	3'	+	transib2	2717	1	64.75
GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCA:1	-	chr3R	28758318	3'	+	mdg1	7377	2	73.97
TATTATTTTATTTTATATTCTAACACACTTGAATAAGCGACTTGATACAGCGTTATAGATTTTCTAAGATCTTTCTTGACTTTTTGATGATACAATTTATTCTGAATGATATAAGTTTATATGATGGTTTCTTTGGCCAATATCG:1	+	chr3L	10295217	3'	+	transib1	1901	1	74.48
AAAACCTTTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCAAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCTATTATTCAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGTCTATAGATGACCTAGGACACT:1	-	chr2R	11191524	3'	-	Tc1	296	1	80.82
CGCATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACA:1	-	chr3R	4504064	3'	+	INE-1	533	1	50.00
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAGCTACCAGAGATTCGATGAACACTTGCCACTTTTTAAGTTC:1	+	chrX	14336548	3'	-	roo	23	2	69.86
CGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGGTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGA:1	+	chrX	21667928	3'	-	gypsy2	6511	2	57.14
AGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTAAATCACTCCTCGGCCCCCGAAAGTATGC:1	-	chr3L	4948069	3'	+	hobo	2872	1	75.42
CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAAAGTCTCCTCAAGTTTCTAAAACTCCATAAGCCATACTAACCATA:1	-	chr2L	1517570	3'	-	jockey	4700	1	67.59
ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTTTATTATAATAATTGTGAGGGACAGCTTATGTTTAATCCACGCCAATATCAATACCTCGACTAACAGATACCC:2	+	chr2L	13763269	3'	+	pogo	2057	1	55.48
CGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCAT:1	+	chr3L	8249091	3'	-	jockey	4580	1	76.70
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGCTTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAAGAATTTCCACTGGC:1	+	chr2R	14387992	3'	-	roo	83	2	77.14
GAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGAAAGAGACGCAGCGAAAGTTAGTTGACCCATGTGCTTATTTCTTTTATTTATTTTTTTTTTT:1	-	chr3L	20601506	3'	+	INE-1	148	1	67.23
CGTATCCAGGTGATACAAAATCGCACACTACGACAAATAACCAACTGTTCCTGGTATGTACGTAACTCCACACTCTATCAAGACCTCAATATTCACACAGTTGAGGGAATTCGCCATGGCGCTTATTAATAAAACAGCAAATAGCT:1	+	chr2L	17116965	3'	+	Helena	1120	1	70.55
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGACTTCTACATTT:1	-	chr3R	7835119	3'	+	roo	343	2	63.45
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGAC:1	+	chr3L	15600354	3'	+	roo	9039	1	49.32
GGGAGAATGGTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCATCTAGTGGAAATGCGAACGCGAACTTTTATAATTTTTCTGGGATACCGATAGATTTTGGGAAATAAAAAAAAATATTAGCCAACACTAACATTAAATTGATTTGACA:1	-	chr2R	21605892	3'	-	INE-1	575	1	70.92
CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGGAAAGAGGTCGATGTTGAGGTGGGTTTGCGTGGCGGC:1	+	chr2R	16945398	3'	+	jockey	4982	1	64.52
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAATAAAAAACGTTAGCCAGCGACGCTGGGATGGGCAAACGACCATCCTTAAAAA:1	-	chr2R	6034684	3'	+	pogo	2039	1	65.28
ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTG:1	+	chr2L	16016418	3'	-	412	27	2	57.52
TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATCGTTTCCACCACACCACAAACG:1	-	chr3R	19589931	3'	-	BS	5074	1	69.86
ACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAA:1	+	chr2R	21298808	3'	-	jockey	305	1	74.66
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGAC:1	+	chr2R	18336249	3'	+	roo	9015	2	57.93
CTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTATTCTTAGGAAAAGAACGCCTTAATCGAATATCGCCAGATGGGCATTACAATTAAAAACCATGTGTTACATGAAGATACGTTAAGCAGATACCGTTCCGGCCTTCACCAAGATGACCCC:1	-	chr3R	2512767	3'	+	INE-1	577	1	63.70
TATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAACGTGTTGCATAC:1	-	chr3L	17136060	3'	+	hopper2	1536	1	70.15
CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCACGCTG:1	-	chr2R	5485139	3'	+	blood	7311	2	79.85
CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGA:1	-	chrX	5662895	3'	+	P-element	2809	1	23.20
ACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACT:1	+	chr2L	12290740	3'	+	1731	4542	1	73.97
GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAG:1	-	chrX	5662855	3'	+	P-element	2857	1	58.97
GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTTCGAAACAGAG:1	+	chr3R	12717853	3'	+	297	352	2	57.53
TAAATATAATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCC:1	-	chr3R	16076791	3'	-	roo	8738	2	69.86
TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTA:1	+	chrX	5274364	3'	+	roo	321	2	78.77
GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAGGTCTTAACACGCATAT:1	-	chr2L	17081760	3'	+	jockey	4983	1	67.24
TATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTTGCT:1	+	chr2R	5198467	3'	-	INE-1	84	1	53.33
AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGGTGTTCGAGGCAAATCCAAAAGTGAATACAGAAACTCAACGATACC:1	-	chr3L	23773156	3'	+	roo	9064	1	53.49
AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAAGTTTTCACATATGGCAC:1	-	chr2L	13585811	3'	-	Tabor	6881	2	55.86
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCT:1	+	chr3R	19968190	3'	-	roo	8733	2	68.49
TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTGTTTGCGTTTCGCAAGCAACAGGATACGCTGGAAGGCAG:1	+	chr3L	2712820	3'	-	P-element	46	1	39.47
GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGCCCGAGA:1	-	chrX	6279342	3'	+	P-element	2865	1	60.91
CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGACAAGGCGTCCGCCACTCAACGCAAAA:1	-	chr2L	5307088	3'	-	jockey	4718	1	58.87
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTC:1	+	chrX	9540109	3'	+	roo	9019	2	58.96
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATA:1	-	chrX	9540023	3'	-	roo	72	2	73.29
GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCCCACAATTT:1	+	chr3L	8249134	3'	-	jockey	4573	1	51.80
AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTAATTTAGTTAAAATATTCAAAAAGTTTGCGCAAGTATTT:1	+	chr3L	17205319	3'	-	hobo	7	1	78.15
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGAATATCACCAGCTTTAATCATC:2	+	chr2R	13696493	3'	-	roo	59	2	61.64
AAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTTTT:1	-	chr2R	16785313	3'	+	412	475	2	63.48
GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGTTAAATGGCAATTCGTGTTTTGTGCTTTGCGACGGCACAGTACA:1	+	chr2L	18339092	3'	+	pogo	2098	1	76.58
AAGAAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATCCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATTCTATAATGCTAACCACAGATTTCAATAATC:1	+	chr3L	23099428	3'	-	S-element	61	1	94.17
ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATT:1	+	chr3L	21855541	3'	-	blood	56	2	56.85
ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGCGAAACAAAAATAAGTGAAATGGAGTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATAT:1	+	chr2L	544920	3'	+	412	479	2	73.29
TTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCT:1	-	chr3L	7292458	3'	-	HMS-Beagle2	6927	2	56.06
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACTTATATCTTTAATT:1	+	chr2R	15064471	3'	-	412	7082	2	63.45
AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTCCATGTTTACACTTTTAATTTGGTTTGGAAAACCATTTTTAAAAAGAAATAAAGAACAAAGTGCGGTAGAGAGCTACAGTTTCAAATAATTGAAATTCCTTCA:1	-	chr3L	20168309	3'	+	mdg3	5480	2	72.60
AGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAATTCTATTGTTCTAGTATTCTAGTGTCTTTGATCTGACCACGTCTGTCTGTCCATCTATCCGTATAAAAGCCACTATCCTTACGCAAAACATTTGTAATGCTAAAATCAGTATGATAGTCGAC:1	-	chr4	750734	3'	-	1360	3332	1	62.33
ATTTTTAAAAATTATTTTTAATTATGCGTTAAAGTATTCTAAAGGACGTATCCAGTAAAGGGAGTTTATTAGTTCATATTTACTGCAAAATACCACACAGCACCCTGTATGAGCCCTTCAATGCGATTAACCTTATC:1	-	chr2R	14443027	3'	+	hopper	179	1	33.58
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTG:1	+	chr3L	15600318	3'	+	roo	347	2	63.04
ATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGCGGAAAGTGTTTGGCCCACACCCTGAG:1	+	chr2R	13006541	3'	-	3S18	4	2	79.09
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCG:1	+	chr2L	7898386	3'	+	roo	356	2	57.14
TTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGCTTATGATTACTGTTGAGTAAAATGGAAACCTTTTTTAAACGCTTAAGGGTTCAAGC:1	-	chr3R	13348995	3'	+	BS	5082	1	74.66
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCTAGACACA:1	+	chr2L	7898380	3'	+	roo	355	2	59.38
AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACAC:1	-	chr3R	15072550	3'	-	pogo	39	1	52.63
ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGA:1	+	chr3L	3863528	3'	-	blood	58	2	57.86
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTGTCCATGACA:1	+	chr2R	25118786	3'	+	roo	9019	2	56.16
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGT:1	-	chr3R	18582157	3'	+	roo	8999	2	67.81
AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACG:1	-	chr3L	17558023	3'	+	jockey	4919	1	71.72
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGTAT:1	-	chr3R	18582162	3'	+	roo	8994	2	71.23
AATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTAAAATAGATCAAAGCCGAAAAATAATCAACGACCTTTTTTGAGAGTGTGGGGCAAAAACTATCCTCTATACATCTCGATTGTTTGGCCACCAAGTGCGGCCCGCATAGAAATCCA:1	-	chr3L	17115386	3'	+	blood	7383	2	80.82
TCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAATAAATATATAAATTCTTCAAGATTATAAATTTTATGCAGTTGTAAACAATTTCAGACATGCGACCACAG:1	+	chr3R	6613712	3'	+	HMS-Beagle	382	1	64.96
GTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACGGAATTTAATGTTTCAA:1	-	chr3L	2325723	3'	-	I-element	5147	1	70.21
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGAC:1	+	chr3L	15600354	3'	+	roo	9040	1	49.66
ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTGGCGCCCAATAGTCGAAAATACTTTGTTGAATTTTTTAAAATATATATGATAAGACTTGCCTTAATTACAATTTAGCACGT:1	+	chr2L	6863414	3'	-	pogo	35	1	57.53
AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGATTTCATGCGAATCTATATGTGCATATTTATACACATTTGTACACTTGAGCAATTTGGCAAATAAATCATTATTATTTCATCACATTTGTCAT:1	+	chr3R	28946445	3'	-	hopper	27	1	65.75
TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGATTATC:1	-	chr2R	20496936	3'	-	blood	77	2	77.61
CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAA:1	+	chr3R	28075380	3'	+	jockey	4907	1	75.34
ACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAACAAAGGCAAGAGAGTCGAAC:1	-	chr2L	2909643	3'	+	hopper	1361	1	54.17
AAGAAAATATAAATAAAAAGTTTTTATTTTACATGTGGATATTGATCCTTACATAACTCCTTCGATAAGTTTTAAAATTTATAAATTGTATATATCTTGAATATTTGTATTGTGTGTAAACGAACGTTCACACTTTGAACAGA:1	-	chr3L	19059815	3'	+	mariner2	791	1	56.64
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGA:1	+	chrX	6486814	3'	+	roo	394	1	60.55
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAATTATACTA:1	-	chr3L	20831246	3'	+	roo	9042	1	65.75
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGGGGTGGTTGGGCGGGGTAAGAAACACAAAAAGCAACA:1	-	chr2R	19004135	3'	+	roo	9014	2	58.99
ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATGGGGGGAGGTATATTATTCTGTTCACGCTGCGTATACGTAATGTGAAGCGAACTAACCCATGGCATTTGCAACT:1	-	chr3R	26166546	3'	-	BS	5033	1	45.65
GGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCAGCAGAGGCTGACGCTTATCAAAAAACCTATTTGATTTCACTTTGCTTGCTGTTGACACAAAGCAGTATTAGAAGGTATATAGTACAAATATCGTTATTATACTTAATATG:1	+	chr3R	7466478	3'	+	X-element	4507	1	55.48
GTCACGAGGCGCAACGTTGACAGAAGTGCCGCTATAAATATTTGAATATGAAATTGTACTTTAGTTTTGGACAGAGCTCAAAAGTGATCAGTCGTATTCCGATGCAAAAAATAATTATTATTTGAAATAACTTAATAATTGTTTAA:1	+	chr3R	1960328	3'	+	gypsy9	165	2	88.36
AAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTGGTTAAGCCACAAAAGCATTTCTGCAGCTTTTGCTGAGCTGGGTGCTCCC:1	-	chr2L	9668107	3'	+	1360	19	1	56.14
AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCC:2	-	chr2L	13585843	3'	-	Tabor	75	2	67.81
GAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTTCCTTCAACATCAACAATCAACATCAATACACAGAATAATATTCACATGGAAAAAGGACGAGTCGAGGCAAGACTTCGCCTTCCG:1	-	chr2L	11244267	3'	+	gypsy7	279	1	70.87
AATTGCTTGCATTCAGTTTGCTACCTTTTTTCTGAAAAGGCATCACAAAGGACTCCTATGTTTTTAAAAAACATTTAAAGCCAAATTATAAGCAGTCGCGGGATGACTCTATAAAATTAACATTTATCAATGTGAAACACTCAATG:1	+	chrX	22938801	3'	-	Q-element	88	2	59.59
GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGTTTTTGGGAGCGATCACTTTAAGTCCCAATATTACTGACCTGACCACCGATCC:1	-	chr3L	15995908	3'	-	297	6596	2	66.67
GACGTCCATACGGACAGACGGAAATGATTCTAATCAAGAATGTTTATACTTCGAAATCGAAAACGCTTCCTTTTGTTTGTTACATACATAGATACTCAACGAATCTAGTGTGTCACGAGTAACCTGAATTATTAAGGAATTTATGA:1	-	chrX	22784269	3'	-	INE-1	126	1	77.40
TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTACACCTACACAT:1	+	chr3L	20033811	3'	-	blood	7041	2	54.79
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTTGAGTTAGTATTTTAAAGTGATCTTTTAAATTTCATGGTTGTTCAAATCGGCGTCAATTTATTTTGTTGAACTTTTTTGTATCATTTT:2	-	chrX	17526793	3'	-	roo	13	2	62.86
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAAAGGCAGCA:1	+	chr3L	12879816	3'	+	roo	9008	2	64.18
CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACA:1	-	chr2R	2016819	3'	+	1360	3386	2	72.73
CCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATT:1	-	chr3R	17243097	3'	-	hopper	47	1	53.42
GGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTGGGGTGGAACGATGTCTATGGGAT:1	+	chr2L	4412190	3'	+	Quasimodo	6950	2	70.93
GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGACGCTTTTC:1	+	chrX	7195117	3'	-	P-element	52	1	42.28
GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCATGCGGCAATCGA:1	+	chr2L	7888221	3'	-	pogo	44	1	58.52
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCACCGAGGAC:1	+	chr3R	7835234	3'	-	roo	8684	2	67.74
AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGTGTGTA:1	+	chr3R	15364060	3'	+	flea	4998	2	75.00
CATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTA:2	-	chr3R	4504026	3'	+	INE-1	535	1	63.70
CTATCGATGCAGCTAATCGAATTATACTGTACATATAATTATGGTAAGAAAATTAAAACCGAAAGTCTGTTTGTCCCATCGTGCGTATAATAGCAAAAACAACAGCATG:1	-	chr3R	31720472	3'	-	pogo	8	1	71.56
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCGAACTGGCGAGA:1	+	chr3L	9998229	3'	-	roo	18	2	71.43
GATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTTTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTGGTTGAGGAATAGAAGAAAAGCATCGAGAGGGCGACGCTTGAGTAAATTAGTCTGGTGAGAACGATA:1	-	chr2R	2498423	3'	+	1360	457	1	50.00
ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAATAAAAAAAAACTGAGACTAATCACAAACACAATTACGGGGAGTAATTACTCAAATACCAATTGTTCTATTTTTAGAGAAAAAAATGTACATTTTTTGTTAAGAACCTTT:1	-	chr3R	30248076	3'	+	Juan	4197	1	69.01
AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAG:1	-	chr2R	16891808	3'	+	hopper	1410	2	74.55
GGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAATTGCATTGCGCATTCGGACGGTTTGTGCTCTTATTCGCATCTCTGGTTGCC:1	-	chr3R	16738513	3'	-	HMS-Beagle2	7028	2	57.14
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATCTGCTCCGCTTAC:1	+	chr3L	20654614	3'	+	roo	389	2	70.55
ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCC:1	+	chr3R	22822130	3'	-	mdg1	36	2	44.96
ATTCCTTGCAGCGTGCAGCAACACTCGGAATAAGAAGCGTCAGCTTTTCACTGCCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAA:1	-	chr3L	25804308	3'	-	gypsy	7124	2	82.72
GTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1	+	chr2L	17599966	3'	-	1360	492	1	52.74
CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGACACCCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAAAGTCTCCTCAAGTTTCTAAAACTCCATA:1	-	chr2L	1517586	3'	-	jockey	4675	1	78.10
GTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCCTGCACTCACACGAAGATCTTCCACTTGATCATGCTGGAACGGTTTGAG:1	+	chr2L	1359778	3'	-	hobo	2659	1	64.49
GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGATTTCCGGGCAGGAGCTCTCGAAA:1	-	chr2R	21228980	3'	-	jockey	66	1	53.42
AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTTTTTCTAAACAGATGGCATTTCGATTTG:1	-	chr2R	16785288	3'	+	412	7529	2	70.50
AGAAGGGCAGAGCGAATTGGATCATCAAACGCGTCGGTCGTCGCCACGCAGACATTGATTATTATTCAATAAACTTACAAGTTTAGAAATGGTGTTATACGAGTCAGAAGTTTTTATGTTTATTCAATTTTT:1	-	chr3L	26695615	3'	+	gypsy7	5339	2	64.39
AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTAT:1	+	chr3L	17560386	3'	-	pogo	52	1	55.63
GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGGCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGCTCGTAACTTAGCCCAGAGATTCCTTAATTGTGAGTTTAAAC:1	-	chr3L	9406659	3'	-	opus	7165	4	66.02
GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAAGAAGACTTGTAT:1	-	chrX	13066463	3'	+	jockey	4972	1	67.81
TCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGTTGATTCAAGTTCTGGCTATTATTTTAGATTTTTATTGGGCGCCAAGTTCGAATCGTATT:1	-	chr3R	6319835	3'	-	F-element	347	1	55.71
GAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATCTTGTAAGGGAAAGCGAAAGAGTGAGAGAGTGATAGCGAAAAGTGTGTATACCACAGATATCGCTAGAAAGC:1	-	chrX	13780864	3'	-	Cr1a	337	1	73.79
GATTTAGCAAAAATTACTTTTTGCTGGCCGAAGAGAAGTCATCGGACCTCTACTGCTGGCCGCGCGTTCTTTTCACAGCATTTCAAGTTGCCAATAATAAATTAATTGCCCTAGCCAACAA:1	-	chr2L	7286251	3'	-	Tc1-2	1467	1	81.82
ATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAATGAGATGAGGATTAAAGCACGGTATTTACCAATTCGTTATATCTGAGCTTG:1	+	chr3R	16406403	3'	+	Quasimodo	7274	2	64.83
CGATTCCAAAAAGGGACATGGAAAAATACCGTTGTATTACCTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTATGTTCTTGATATTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCTATGTCCGTATGAACGTCGAGATCT:1	-	chr3R	4487816	3'	-	HB	63	1	67.81
ACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTC:1	+	chr3R	14979861	3'	-	pogo	87	1	77.93
AGTCGGGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCTTTTGTTTTTATATTTGATTTGGTTTATTTTGTGAGAAATCAAAAAGGAAAGCACAACATCTGGAATATGATGACAGGCGCTGAAGTGTGGTAGTACTCCTCATCCTGATCGGGC:1	-	chr2R	18626643	3'	+	INE-1	567	1	58.62
TGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAA:1	-	chrX	13704748	3'	+	invader4	280	2	53.42
AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTGTTTGTATATTTAGCTTAATATAATTTAGTATTTCCCTAACAAGCCTCATAGAACATATTTCATGAGTGATTCTTGTTTCAAAAAATAGTTG:1	-	chr2L	6622900	3'	+	Burdock	230	2	68.49
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCT:1	+	chr3R	7835210	3'	-	roo	53	2	60.15
CATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGGAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTC:1	-	chr3L	3799800	3'	-	copia	62	2	69.17
ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTCCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCGCTTTGATTAATTAT:1	+	chr3R	10274063	3'	-	HMS-Beagle	6836	2	58.22
TACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTC:1	+	chr3L	12861800	3'	-	pogo	72	1	68.49
ATATGTACATAGATTTGGCTATTGTACATATACATATATAATATCAATTTTCAAATAATAATAACGTTCAGGTAATGCAAAACAAGAATTTTTTTCATGTGAATTTGTTTATTGTGATAGGAACAATTTTTCCAGTGCATCTGACT:1	+	chr3L	20600924	3'	-	1360	343	1	68.49
AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGTTCGT:1	+	chr2L	15991402	3'	+	mdg1	7396	2	61.64
GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGGCTTAAGGATTGCGATGTTAGTCAACTTAATTTGGGTAAAACATTTACGGAATTTGACGTGCGTATCCTAGT:1	+	chr2L	13914225	3'	-	jockey	4689	1	63.01
GAAACTATATACCCTTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGATTATTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTATCACCTAAATATGCGCCAATAAGTATGCAAAATTAAAA:1	-	chr2L	15874343	3'	+	Cr1a	4128	1	73.97
ACGAGATCAAAACTTTAAAGCGAGCTGTTAAAATAACCGCAGTCTGCACGCTCAGAAATTTAGATGATGTGTGGGAGAGCGAAAGACCGAGATAGTGAGAGCGAGAGA:1	+	chrX	7938685	3'	-	Cr1a	379	1	83.33
CGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGCACTGGGCGGAGCAGAAGGCGATTCCCGAGCAGTGGAGACAG:1	+	chr3L	12400749	3'	-	G2	2848	1	59.43
GAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATATTGTGAAATTTACAATGCATGAGCACACGTGTGCACACACACAGATGTCTGGTATCACTGTATGCGTAGAAAAGATGATTAGGTTTAGACATCCATCGGTTTATTGGGCCTTGTTGGCAAT:1	-	chr3L	3542339	3'	-	1360	221	1	67.12
AGAAGGTTAAGATTCAGGATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAAGTTTGTTGACCCATGTGGCCACACCCTCAATAACGCCTACAAACCGCAGAAAACTGCCCCGCCCACACTTTTG:1	-	chr3L	23331450	3'	+	INE-1	172	1	75.42
GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCCATTGAAAAAATAGTTGGTAAAAACCAATGTAAGAAT:1	+	chr2L	5845123	3'	-	transib2	17	1	73.29
TCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTG:1	-	chr3L	23603182	3'	-	F-element	102	1	77.40
GTGCATGCCATCCAAGGACTTTAGATGGTATCTTTAGAGGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAAAAATAAAAAAAACACACACACACAGAACATGC:1	-	chr2L	4352075	3'	+	Rt1a	5014	1	74.75
TAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATCTTTTAAATCGCTTTCCAACCCAATAATTCCACACTCCAAAAAGGTTTCCGGAAATTGCCGAACAAATTCAATTTGCAACAAATTCG:1	+	chr3L	22530497	3'	+	Q-element	356	2	66.40
GGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGATGCTCTTTATTATG:1	-	chrX	21772491	3'	+	gypsy3	6569	1	60.00
TATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCCACTTGTGCCTATTTATGTTTGCCAGACTCG:1	+	chr2R	11195300	3'	-	Stalker	278	4	76.15
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGAATTAACAAATGTATTCACTTAGCGTCCAA:1	-	chr3R	25448368	3'	+	roo	9045	1	66.25
GATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCAACGAAGGGACCCAACCCCTCTATGACCG:1	-	chr3R	10273944	3'	+	HMS-Beagle	247	1	70.00
TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATAAGTAAATAAGTTTGTGAAAATAATATTGTAAATATTTACGAATGAATTTGGGTAAGGTAATATATAAACTCAATTTGAGTTTGAATCATACCAACCAGATGC:1	+	chr3R	5061981	3'	+	mdg3	233	2	73.43
CATACACACACACACACATGCAGGCAGGCGGCACAACCACATTCACATTTGATTTGCATTTCATTCT:1	+	chr3L	4663746	3'	+	Quasimodo	36	2	82.09
AGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCATATTCATACGGACAGACGAATATATGTCCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTTAACGAACGTTGTATAATGTATGGTGCTAGTAGAGCCCTTGGGCGAAGACAATTTCGCCACATGGAAA:1	+	chr2L	21580587	3'	+	INE-1	168	1	60.96
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATGCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAATAGGGTAATGAAACATGGTAAACGAGAG:1	+	chr3R	22122810	3'	-	roo	38	2	59.03
GTAACAAGAATACCACTGTTTCTCTACTAACCAAAAAAATAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAGTAAAGGTATAAATATATTGAAATCTAGTATTAATTCTCGTAAATTAAAAATTCTT:1	-	chr3L	19338411	3'	-	Tc1	1438	1	44.52
GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTT:1	-	chr3L	23728660	3'	-	HMS-Beagle	54	2	72.17
TGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTACTTCTTGGCTGC:1	+	chr2L	10037437	3'	-	Quasimodo	8	2	73.73
ATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTGCTGTTCTTGCCTCCGGCCTGTGTGTGTTCTTGCCCCGTATAAATA:1	-	chrX	18001090	3'	-	412	7271	2	58.93
GCAGACAAATAGGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTAAACTTTTTTCTTCTTTTTC:1	-	chr3R	13237281	3'	-	3S18	5817	2	51.03
TGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTACAAGTGCCAGTCGGTGCGGTGGCATCAAATTATTCAGGTATATAGTATATGGCT:1	+	chrX	18387130	3'	-	Quasimodo	282	2	56.10
ATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCGAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAAAT:1	+	chr2L	5711	3'	-	G6	23	1	58.96
AAAAAATAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAACATCCGAATAANCGAGGTTCGTACTATTTCGGTTCGCAATTCTTTTTTTTTATTGTGTTATTCCATTTTGTTGTTGTTTTCG:1	+	chrX	2667497	3'	-	Tc1	1393	4	81.08
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCACGCACGAAAAACCGAAAGAAAAATAAG:1	+	chrX	5643589	3'	-	roo	47	2	54.48
AAATAGAGTTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATAAACGAAAACGTTTATATGTGTGCGTACTTGTGCTAGAATGATCAGAAACCTTCTGAAAGGAGCGACTGAAATGCATGTGAGCTAATACTTTATTTGGATTAAGTTCAGT:1	-	chr2L	16422464	3'	-	1360	3261	1	52.05
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTTGGT:1	+	chr3L	20168464	3'	-	mdg3	5261	1	71.43
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCGTGAACATCTGAGCCTGACA:1	-	chr3L	15600188	3'	-	roo	8736	2	67.81
ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATT:1	+	chr3L	21855514	3'	-	blood	7067	2	69.75
CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAA:1	-	chr2R	20496888	3'	-	blood	7051	2	56.55
GTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGTCGAATCCAGCACTCCCTTCACAAATCAAGCGCAACATCACGCAACTTTCCAATAAACGACTCATTTGTTCTCCCCGACCAATTATAA:1	+	chrX	20118545	3'	-	R1A1-element	375	1	56.06
CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATTTGATTTGATTTCCTTAGATAATTGCCAAACTGAAACATGTGCGAG:1	-	chr3R	22217794	3'	+	hopper	1396	1	71.23
TTATTATTATTTTTTTGATTATATTTTATTATTTTTTTTTTTATGTACGGGCATAACGCCTATTCACTGCTGGTATTGAAGTACTCATTATTGCTCAATAAACGATTGTTACATTGCACTTACTGGACTTGACCCACAACATAAT:1	+	chrX	19845002	3'	-	jockey	4826	1	78.62
TTATAAATACATATTTACATATGAAGCTATGGTAATCTCTATAGAATTACATCCTCAATTGTCAAAAGCAGTGATCTGCGCAGATATTTAACTTGACTGAGAAACTGAGGCAATAACTACGTGTAATA:1	+	chr3L	20487217	3'	-	G3	4507	1	71.88
AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAATTACCAAATCATTTTTTGCCATTTCTCTACCCATTTACCACTAATTCCAGCAACTTATTAAATGTTATTAATATTATGCGTGCTG:1	-	chr3L	12978315	3'	+	jockey	4949	1	62.33
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGGTGTGTCCACTTTTCCCTAAGGGGTATGCAAGTCTGTGC:1	+	chr2R	7452943	3'	+	pogo	2043	1	59.59
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTGTGTTGTTTTAACCTACAAAATTGCAATGAAAAGTCGGTACATTTCTTCCTCT:1	+	chr3L	21818065	3'	-	roo	8726	2	66.91
CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTATGATGGAAAAAATAGGGGAAAGAATG:1	-	chr3L	4840717	3'	-	jockey	4718	1	51.09
AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAGAAAAGCTGAAATATTATATTTTGCACAGAATCAAAACCAATT:1	+	chr2R	20944488	3'	-	pogo	14	1	69.18
GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATT:1	-	chr3L	6978156	3'	-	pogo	73	1	71.43
ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACA:1	+	chr3R	20427452	3'	-	jockey	84	1	73.57
CTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCTTCACTTCCCACTGTGCCCTTTTAATGTCGCATTCATTT:1	-	chrX	10189576	3'	-	roo	129	2	73.10
CAAGCACTCAACAATCATTCCAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGTCCAAGGATTGGAAAAAGAAAATTTCCCTTCCCCGCTCTTTCTAGCTCCAAACAGCCTGCCGTGGC:1	+	chr2R	14958956	3'	-	1360	451	1	50.00
GGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAAAGTTGGGAATTATATGCGCACACGCAGGCGAAAGCAACGAATTTGCACACTGCC:1	+	chr2L	21215261	3'	+	opus	344	2	55.00
GTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAGAGTTGAAGGCAGCCACAAAGTGATGCTCACACACACACACACAAGCACTAACACTCACATGACGCACACAA:1	+	chrX	20384614	3'	-	S-element	1521	1	64.60
TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATTTTAAGGCGATGAAGTC:1	+	chrX	6499063	3'	-	Quasimodo	22	2	57.63
AAAAATATATATATTTAATAATTGATATGGTATGGATAAGTTTCGCTTTGACGCATTAAATTACATTACCTCAATTTGTGAAATGCAATAGAATTTCCGTTTACATATTTTCCTCTTATAATAATAACGTACCCTAAAAGTAATTA:1	-	chr3L	15375550	3'	-	Tc1	61	1	47.26
ATATGTACATATATATATATATTTTTTACAACCAGGAGTAGCAGCAGACACTGCAGCCACTGCAGCATCAGCAGCAGCAACTGCAACTAGCTATCATTCTGGGCATTTATTTTACAATGCATTGCCGTAATATAATTGATATGCTC:1	+	chr2R	18965993	3'	+	G3	4507	1	76.03
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ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATT:1	-	chr3L	12879737	3'	-	roo	8730	2	64.83
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATGGCGTATACGTATT:1	+	chr2R	9328729	3'	+	roo	9052	2	69.12
GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTA:1	+	chr3L	22437933	3'	-	roo	8751	2	79.17
ATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTTACATTTTTATACCTTTTCTTTAAATGAAATTATCTAGTCTATTTTCTTTCACTTCTGGCCTTTTTGCTTTTATAGATATAAAAAAGATTT:1	+	chrX	21575466	3'	-	INE-1	83	1	70.55
ATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATAATGAACAAGAAACTACGGAAGGCAATTACAAGCAATACTAGAAATAGTTTTAAATACATAACGAAAAAATCATAGTCACCAAAGCGCACCTCAGTAAAAA:1	+	chrX	21096977	3'	+	S-element	1702	1	53.42
GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCAGGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCAT:1	-	chr2R	19050174	3'	-	roo	26	2	57.26
GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGGAAAGAGGTCGATGTTGAGGTGG:1	+	chr2R	16945384	3'	+	jockey	4979	1	60.18
AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTG:1	+	chr3L	26011945	3'	-	F-element	51	1	63.81
AGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCATAAGTTTAGTTCTAAACTTATATCCTGCTGCTCTAACGAGTCGACAAATAAAACCAAAAATAATGCTATAGTCGACTTG:1	+	chr3R	1431583	3'	+	mdg1	287	2	52.05
AGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGCAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGTGAGGG:1	+	chr2R	16945350	3'	+	jockey	4966	1	50.00
AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATATAGTTGCGCGCCTGTGTCTTTTTGGCAATGGCCACGTG:1	-	chrX	21009373	3'	+	pogo	2091	1	71.93
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACA:1	+	chr3R	7100930	3'	+	roo	9039	1	60.96
ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTGCCGAGAACACTTAATAAGATGCGACAGCGGATAC:1	+	chrX	10253312	3'	-	hopper	34	1	60.71
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAAAG:1	-	chr2R	14542123	3'	+	roo	391	2	61.61
TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAAGAACTGTTAGA:1	+	chr2L	14081436	3'	+	1360	3360	1	65.07
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGATCTGTTGACAACAGAC:1	+	chr2R	23803049	3'	-	roo	45	2	53.73
TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATC:1	+	chr3L	17115535	3'	-	blood	7078	2	61.38
AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGT:1	-	chr2R	9791588	3'	-	412	71	2	68.49
CTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAAGCATGTGTACCAGACCATCAGGTAAGGTTTGCTCTGC:1	-	chr2L	10805603	3'	-	R1A1-element	5018	1	73.97
TACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTT:1	-	chr3R	19589914	3'	-	BS	5056	1	57.93
AGCGCCAATTAAACTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCACCGGCGTAGGTTGCAGGTATCCGGGAGGCACAGACCTCTTCTCCTCAGAATTAGAAGATTATTTTAAAACTGAATATATATATTTTT:1	-	chr2L	13046502	3'	-	gypsy6	392	1	77.78
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTG:1	-	chr2L	17420127	3'	+	roo	9033	1	56.85
CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGC:1	+	chr3R	20427480	3'	-	jockey	20	1	66.67
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATG:1	+	chr2L	16091969	3'	-	roo	81	2	80.00
TCTTCAATAGTTTCAAAAATATAGATTAAAACAACATAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCGCTCAAAGGACCTCTAGACCTTCATATAATGCCCATCGAGTC:1	+	chr3R	4222718	3'	-	HB	1479	1	58.82
ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTGCCATCAACAAGCCACAACTAGCCCCTTAAAT:1	+	chrX	2512507	3'	+	P-element	2853	1	47.92
ACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATC:1	-	chr2R	5617510	3'	+	invader1	377	2	58.76
GCGTTAGCCTTCTGGACGGGGCCAGCGGAGGCGAAGTGCAGGGCGGGTGCAACA:1	+	chr3R	26622658	3'	-	gypsy8	4511	1	92.59
AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGA:1	-	chr3R	17478368	3'	+	copia	193	2	62.33
AGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTGCAGTGAAAGCTTTAGACAATTTG:1	-	chr3L	19013863	3'	+	invader3	5452	2	79.17
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGAT:1	+	chr3R	16404572	3'	-	pogo	40	1	53.85
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTT:1	+	chr2L	12892711	3'	+	roo	9007	2	63.01
CTATGTTTGAAGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGGGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGTCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTTTTATGTTTAAACAAAAAAAAA:1	-	chr3R	23181431	3'	+	Tc3	1398	1	75.34
AAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTAAAGGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTGGCATTGTGGGTTGTTCAAGCTAAATGATCCGCAAAGCATAAAAGCAATTCAACATTTTTAATTGAATATCAGACAGTAAAAAATATAG:1	+	chr2L	17337931	3'	+	Tc1	389	1	65.75
TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCATAAATTAAACACTTGAAAAGACACAAAACTATTGCTGGAATTTGCATAATGCGTACACAATTATTTGCTATAATCTGATTTATTTGTTTCGTTTTGCATTTCGATT:2	+	chr3R	9210771	3'	-	mdg1	14	2	75.34
AGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTATTTTATCGATGACACAAATGATGCACTAATGAATGATGATCAGTACGAGG:1	-	chr2L	12716608	3'	-	mdg1	7456	2	65.75
AATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCA:1	+	chr3L	21855508	3'	-	blood	7100	2	79.45
TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAAT:1	-	chrX	13066499	3'	+	jockey	4942	1	55.71
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCG:1	-	chr3L	11393494	3'	-	roo	8742	2	75.34
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACG:1	-	chr3R	13360312	3'	-	jockey	27	1	54.44
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCA:1	+	chr3R	19968226	3'	-	roo	33	2	63.70
TGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATATGTAACATAACTTTCAATTTTGGAAACATTTAGAATGACGTAGAATTTTGTTTACATATGTGCGGCACTTTCCTT:1	+	chr2L	13898921	3'	-	rooA	7461	2	50.68
CAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATAATTAAATTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	443	1	54.79
GAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCGGCAATTATGAAGAAAAAAGCGCGTTAAAAAAAAGGGAAACAAA:1	+	chr3R	28775354	3'	+	mdg1	480	1	78.85
CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTT:1	-	chr3L	17685112	3'	-	mdg3	53	2	52.05
TGAATAAAAGGCGAAGCCCTCACAGTAGCGAGGGAGTTAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTATACGCACAGTGGTAAGAAATTTATGAGCGTGGAGTATCAGCAGGAAATGCGCGAAAGGATGCAGGAC:1	-	chrX	3466447	3'	+	rooA	7526	2	63.77
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCCCTGCTTCGATTCCAGC:1	-	chr2R	19050141	3'	-	roo	15	2	72.60
CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCA:1	+	chr3R	27424945	3'	-	blood	7075	2	50.00
CTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCTTCTTTAG:1	-	chr3R	13457866	3'	-	X-element	33	1	62.04
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAAC:1	+	chr3R	22844288	3'	+	roo	388	2	61.82
TATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCAATTATCCAAGGCGCCGAGACACTCGGGAGATCCGCC:1	-	chr2R	20337399	3'	+	Doc	194	1	74.66
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTGGCAAAAAG:1	-	chr2L	7945298	3'	+	roo	407	1	78.85
ATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGTTATATTCTTTATTTCGGCATTGCTGTAACCTATTTAAGTTGTGGTGCCAG:1	-	chr3L	46919	3'	-	FB	71	1	65.75
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAATAAAGCAATAAATGTTATTCAAGTGATTAACCGC:1	-	chr2R	23802924	3'	+	roo	9031	1	56.16
GACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTGCATGTGTAGCTGT:1	-	chrX	21585244	3'	-	mariner2	265	1	65.71
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAAATGCCTAATTAAATTT:1	+	chr2R	18336276	3'	+	roo	9041	1	65.75
CATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTA:1	-	chr3L	7292456	3'	-	HMS-Beagle2	6939	2	58.90
ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGGTAACATTCTTTTCAGACCGCCCGCCATAAAGAAATGGACTGCGATTTGTTTGCCATATCATTGATGCCTAGAAAATCAGAATGGTAATGG:1	+	chr2L	22025833	3'	-	mdg1	32	2	63.70
CTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATTGGAAATGTCGTCGCAGATTACATAGTTCACGG:1	-	chr2L	5915008	3'	-	blood	79	2	72.73
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAA:1	+	chr2L	14772145	3'	-	roo	48	2	52.05
AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAG:1	-	chr2R	13585408	3'	-	412	60	2	60.14
TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTACAAACACATCGTTTACCTTATTAATTAATGTTAATATTTCGATTTAAA:1	-	chr3R	6290917	3'	-	Doc	25	1	69.86
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAACAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATA:1	-	chr2R	19004096	3'	+	roo	9048	2	68.75
CATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTGTGTAATATTTCCCAATCGCCTTCTTAGACCCTGAGCCAGAACAAGATCATGGAGGGCTGCACATCGCCGC:1	+	chr2L	12298835	3'	-	1731	33	2	55.97
TTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCTGTGCACGCGCATTATTAAAGTGAACTCACCTTGAAATAAAAGTTGCTAAAATGATTTATGTAAA:1	+	chr2R	17259367	3'	-	jockey	4724	1	50.00
GAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCAAATCAAAACAGGACGAAATGTGCAAGTTTGTAAATACAGGACTTCTTATTTACTATC:1	-	chr2L	12699074	3'	-	412	276	2	60.27
AAATACAATGAAAAACTAGCCTTACATCCAATTCCTCTTACAAGAAAACTTATTATTATGCAGCCAAAGGAGAGAAGTAATTGCGGAGATTTTTTCTCCTAGATCTTGCGGGCTATCCATTGTACAGTTACATACCT:1	-	chrX	22765625	3'	+	Doc3-element	4501	1	50.36
CCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAAATGCCATTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTCGATATAGCTTTTTTTAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGT:1	+	chr3L	25245595	3'	+	diver2	4700	2	74.64
CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCG:1	-	chr3R	25339979	3'	+	mdg1	350	2	65.75
ATATATACATATGTATATATATTTCCCCGGGTGTGTGCTATATGTTTAGCCCCGCACGCACTTGTGATGTGTTCACATTCTATTTCTCAATGGGGTCTGCAACAGCAATTGCTGTTGCTGCCACTTCTGCCACAGATGCTGCTCT:1	+	chr2R	10594208	3'	+	G3	4507	1	62.76
CAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTG:1	-	chrX	2842493	3'	+	Tabor	418	2	61.64
ATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTTATATTTATACATGCAAAGTTCTATTAGTATGCCAAAAACATTTTGGGTCTAGGAACTCGAGTGTACCTTTTTCTCTGTTATAGCT:1	+	chr2R	4907027	3'	-	Burdock	369	1	60.27
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTGAGAGTGTGTTGCAGGAAGGGAGTCATTACAGAATGTCAGCACATCGTCACCT:1	+	chr2R	13709796	3'	+	roo	8991	2	63.01
CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGCTTAATTGTCCTA:1	-	chr3R	22821966	3'	+	mdg1	414	2	56.00
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGTGGGGCATTGGAGCATTAAAGATTTTCAA:1	+	chr2L	17081890	3'	-	jockey	4709	1	55.48
GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGTTTTTGGGAGCGATCACTTTAAGTCCCAATATTACTGACCTGACCACCGATCCATTAAATATTTTCTAAGCCAATATTTTCGATATAT:1	-	chr3L	15995873	3'	-	297	6590	2	77.40
CTTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAACAAATAAAAACTAAACTAAGATCAGTCGATTATCTTGAACATATACTGCAGCTCCAGGTTG:1	-	chr3R	9681377	3'	+	hopper	336	1	56.52
AAATATTTTCAAATAAAATAAATTAAATGGAACCTCAGAAAATTGAGTAATTGTAACCGACATTACAATAAAAAAAATTTAACTAACAT:1	-	chr3L	19873280	3'	+	transib3	254	1	91.01
AATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAGAGAAG:1	-	chr2R	5284505	3'	+	Doc4-element	2626	1	68.49
TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGACTTTTCGTTGCTGC:1	+	chr2L	12892683	3'	+	roo	8987	2	79.71
AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCT:1	+	chr3L	21855551	3'	-	blood	44	2	54.86
AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTAGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGATTTCATAGCCTACT:1	+	chrX	13066585	3'	-	jockey	76	1	63.70
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTGACCATATGGCCAAGCCAG:1	+	chr2L	17471718	3'	+	roo	400	1	73.55
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAG:1	+	chr2R	13710682	3'	+	roo	353	2	55.24
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGC:1	-	chr2R	13084609	3'	-	roo	61	2	72.73
CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCAGGCCTAGCTCATAATTATCCTGCGGG:1	-	chr3L	20888711	3'	+	1360	3338	1	62.40
AATAATTTTAAAAAAGTCGCGCCCTTGTTACTATAATTTTAAAATTTTAATTTAAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTATAAATAATTTTTTTTTTTCAAAATTGGGTAAATATAACATTGCCATTGCAAACAATTATCA:1	+	chrX	4340060	3'	-	1360	3085	1	57.53
TATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACCCAGTGCGGAAAGTGTTTGGCGCACACCCTGAGGAAAAACTGCCACG:1	+	chr2R	13006555	3'	-	3S18	5770	2	77.60
TATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCTTCATAACTTGAATATATAAAATAAATG:1	+	chr3L	17683793	3'	-	mdg3	39	2	42.76
GTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTGGGGGAGAATTTTTCTGGGATTGCAGAATAAAATGAGAATTTTTCTTAATTGTGAGTGTGACCGTTTTGGAGGGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGTATACCGATAAAAATTGG:1	-	chr2R	79007	3'	-	INE-1	556	1	59.59
GCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACAAAACAAGTAATTGCCATCATAAAGCTACTTATGCCACTG:1	-	chr3L	4605586	3'	+	pogo	2072	1	69.93
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTC:1	+	chrX	9540117	3'	+	roo	351	2	56.85
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATTGTGTAACTTAAGTAGCCG:1	+	chr2R	9632218	3'	+	roo	9033	1	58.90
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGTGATAAAAATGAGCTGAT:1	+	chr3R	18339207	3'	-	roo	8668	2	76.36
CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTG:1	+	chr3R	17243208	3'	+	hopper	1349	1	62.76
ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1	-	chr2L	20360644	3'	-	micropia	4989	2	54.63
GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGATTTATGCAGTGCTCAGCAGCAAATTGCAAATGAAACGCAATGAAACGAATCGAAACGGAATGAATTACTACTTATGCATGCATGTTCGCCACATAAACACACAC:1	+	chr3L	4948177	3'	-	hobo	17	1	73.97
GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGCATCCACTGTTGTGCAGTTTACTCCAACGAATTTTTATTGG:1	-	chr3L	21855401	3'	+	blood	7362	2	67.81
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGAAAATGGGTTTTTGCTGTTGTTAAAATGTCTGAAAACAAGAGAAAACTATTTATTAGACAA:1	-	chrX	6486638	3'	-	roo	6	2	41.78
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTAGCTTGTCTCAGCTG:1	+	chr2R	16891961	3'	+	hopper	1411	2	67.86
AAAAAAATGTTTTAATTAATCTACCCATAAGATAAGATATTTCTCTAAAAAGAAAATACTTTACTTTCAGATTTTCAATATGATTATCATATGCTACAGATTTAGGGATGCTACAATTAAAGATATATAAGTATATTAG:1	-	chr3R	26101038	3'	+	Stalker2	7187	1	80.58
ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCACTGTCGCCTCAT:1	+	chr3R	22844317	3'	+	roo	398	1	73.64
GAATCAGTACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAA:1	-	chr2L	13053750	3'	-	BS	5063	1	65.75
ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGTGTGTATAT:1	+	chr3R	15364063	3'	+	flea	5000	2	75.17
ATAATTTTTTTTTTCATTTTATTTTTGCAATTTTGACTTAAGCTGGCTAGTCGCAGAATCTTTAAAGCGCTTAGCCACATAATATTTAACTGGAAAGTTGACTTTCTTACGATAATATCGATAACTTATCGAAACGTG:1	+	chrX	3292020	3'	+	INE-1	473	1	76.81
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTA:1	+	chrX	23280943	3'	-	roo	8694	2	44.03
GGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAAGCCAAAGCTGTGCAGAAAAAAAAACAGAGGCTCAA:1	+	chr3R	10541103	3'	+	hopper	1319	1	76.87
TTTTTTTTTTTAATATTATGTTTTTCTATTTTCTAGCGATGACGTTGTCAAACTTGTTTCATTCTCCTGCTCTTTTTTCATTGTGTTTCATTTTATTTTTAAATGTATAGTGCTATCTTTGAAACAGCCGGCACATTTTT:1	+	chr2R	13936787	3'	+	hopper	160	1	70.00
ACTTGAGACCTTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAG:1	+	chr3R	27424907	3'	-	blood	7076	2	66.99
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACACATCCGATC:1	-	chr3R	17817879	3'	+	roo	9020	2	53.52
TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACACAAACTTTGATTGCCCAAGTCCTACCAAGGACTACCCTGAACACCAAGAGCCCCAAGGACCCCGAAGGACTTACGTTCGCGTGCCGACTGAT:1	-	chr2R	13817592	3'	+	412	475	2	69.63
TTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCCTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAA:1	+	chr3L	11321499	3'	-	mdg3	5300	2	53.91
TAAATTGTTTGAAATTGAATACCTAATGATATTATAAAAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTAAGGAATCAATAAAATTCTTTATGAT:1	+	chr3R	19448813	3'	+	HB	1521	1	77.24
AATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGC:1	-	chr3L	14944553	3'	-	G5	4800	1	56.20
CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGTAGAGGTCAAAGTGACCGGCGTAGAAGGCCTGGTGAGGAGCATCGACTTTGCGAGCATGG:1	+	chr3R	1433276	3'	+	mdg1	414	2	78.77
GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTCCCATTTCACCCACTTGTTCTATCCGTCCCCCGCCCCGGCAC:1	-	chr2L	13585836	3'	-	Tabor	6878	2	53.85
GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCAAATACCCG:1	-	chr3R	10273931	3'	+	HMS-Beagle	7015	2	60.33
AAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGTTGGCAGGACTGAAAGTAATTT:1	-	chr3L	2325670	3'	-	I-element	5099	1	67.12
CTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATATTTAGATTTCTGACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAATTATTACATATACAAATCTAATAAAGAGTAACAAATTAAGATAAAATGACAAGATATTTCCTTGAGA:1	-	chr3L	20690657	3'	+	1360	3240	1	54.11
TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTTATATTTATTATTTTTCTATTC:1	+	chr3L	10574408	3'	-	Tabor	31	2	54.11
AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGC:1	-	chr3R	16404466	3'	+	pogo	2037	1	63.70
ATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAATGCATGTGCATTTGAAACGTTTCGTCGTTTAGCTGTAAGGTGTTCTGGATCTCCCGACAACTCAGACTAT:1	-	chr2L	21662241	3'	+	roo	161	2	49.64
AGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCA:1	-	chr3L	2325724	3'	-	I-element	5153	1	72.60
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGGAATTTAATCCATGATGATTGGATGCAATATGTAATATATACTAAAGGCGCTTTATTTAATCAAAAC:1	+	chr2R	20596565	3'	-	roo	52	2	57.53
CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTTATAAATAATTTGTTTTTGAAT:1	+	chr2R	13122061	3'	+	pogo	2053	1	79.00
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTT:1	+	chr2R	25118758	3'	+	roo	327	2	75.34
TAATAAATAATAAATATTCGTAAAATGCTATTCATACAATTGGGAAAAGGGAATGGGGAATGTTTAAATGGACTTAAAGGCGTCTGCGTGTGTGTCTTCAATTTTATTTTAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGT:1	-	chrX	22824238	3'	+	Juan	4059	1	68.28
GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGCGCACCCACTCCTCGATTATTGT:1	+	chr3L	20168437	3'	-	mdg3	75	2	67.36
GGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGAAGTGTGATGAGCGCGGAGGGGTGGGCAACAAACGCATTGCAGTTACTGGCCATGTCCATGGGCG:1	+	chr3R	28236487	3'	-	Doc	4538	1	52.21
CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATAGTAATTTTATTTATTTAAGTGTGGAATATATTAAATACATTTTCTAATGTATTCAGTGTTTTTTCAACCATAAATCTAATTTCGATGGCTTACTTTGAAGTAAATC:1	+	chr3L	13845281	3'	+	opus	7494	2	75.34
ATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATA:1	-	chr3R	21276537	3'	-	BS	5061	1	60.27
AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGAGTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTC:1	-	chr3R	7482733	3'	-	412	7112	2	56.16
TAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTACTATACACTTTTGGTGCTATTAACCCGTTCGATTGGCCAAATAT:1	+	chr3R	14337481	3'	+	copia	5061	2	67.91
TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTCATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCT:1	-	chrX	20453684	3'	-	INE-1	546	1	78.08
ACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTC:1	+	chrX	9540111	3'	+	roo	9061	1	65.96
AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGCATACATT:1	+	chr2L	15181452	3'	-	jockey	4825	1	60.69
TTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTATCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAAC:1	-	chr3R	26659745	3'	-	HMS-Beagle2	54	2	55.48
TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAA:1	-	chr2R	16785342	3'	+	412	7469	2	69.86
TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACA:1	+	chr3L	3477493	3'	+	mdg1	7375	2	79.45
TTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAAAAACGGTACAACTCTCGCCGCGAGCTGAG:1	+	chr3R	16951499	3'	+	gypsy5	282	2	73.64
ATAGTTAGATCTACAATTATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTCAATCTACTATGGACATTGAAGGGAAGGGAATTGCCTTCAGGAGTGTTCGCTCATTCCACGGTCACTTTCGGAGAGGAATTC:1	+	chr2R	2744286	3'	-	Cr1a	4150	1	59.23
GGGAGTGAGAACGCGCGGGCAAGTCGGAAAGAACAAACGGCGGAAGCGTCGGGC:1	+	chr3R	1363050	3'	+	gypsy8	444	1	92.59
GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATT:1	-	chr3L	23728636	3'	-	HMS-Beagle	44	2	56.59
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTTTCACGTTTCCTTATACATTAAATTCCCCGAAC:1	-	chr3R	17420380	3'	-	roo	29	2	62.33
ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCAT:1	-	chr3L	3799798	3'	-	copia	4955	2	74.66
ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTT:1	-	chrX	2518053	3'	+	P-element	2825	1	32.50
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGAAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAGATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTG:1	-	chr2R	9632120	3'	-	roo	78	2	73.19
GCGTCGATTTGAAGGACCACCTTTTTTCCTCTCCGGCAGCACCAGTTTTTTCACCCATAAATTGGTTTCCGCTTGCCCATTTCTCTTTAGTTTCTATTTCGTCAGTGG:1	+	chr2L	16794185	3'	-	HMS-Beagle2	6737	1	61.11
AATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAA:1	-	chr3R	21276526	3'	-	BS	5048	1	52.08
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTT:1	-	chr3L	12879750	3'	-	roo	78	2	73.61
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCAGGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGGCTCGCA:1	-	chr3R	31817477	3'	-	roo	48	2	75.26
GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACA:1	-	chr2L	13585819	3'	-	Tabor	6878	2	55.97
ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTAAAGTAACGGAAAGGAAATTA:1	+	chr3R	30344710	3'	-	pogo	60	1	63.77
ACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTG:1	-	chr3R	460083	3'	-	F-element	144	1	52.05
TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCT:1	-	chrX	20453684	3'	-	INE-1	546	1	79.45
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTATTTA:1	+	chr3R	20469687	3'	+	roo	9011	2	58.90
GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCCGTATAAAAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCAAAGCTGAGGCTGCTGTTTTCTATATGTAGG:1	-	chr3L	13574425	3'	+	hobo	2922	1	65.09
AAAGCAAAACAAAAAAAATTATTAGGTCATTTGGCTGGCATCATATCGCCGCGTACATCGGCTGTAGCAGATAGAAGAACATTTGATGCTGACAGCTATG:1	-	chr3L	18022297	3'	-	Tc3	86	1	70.00
GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTA:1	-	chr3L	23728632	3'	-	HMS-Beagle	41	2	53.85
ACGAGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGTTTTTAGTGAAGTGAATGGTTATTATCTGGGACTAAACGATGTCGAATGATGCAGCCGGCCAGCTGTTATATCTACGTTTTCTTTCCGTTTTCTTCTACTG:1	-	chr3R	19114504	3'	+	Doc2-element	16	1	52.05
CATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGACATCATCTCGCTCGCTCTCGACCGACGTGTGAAGTCCATCAA:1	+	chr3L	8712896	3'	+	412	192	2	69.78
TATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTCATAAAATTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCT:1	+	chr2L	5460060	3'	-	Tc3	284	3	62.12
TTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTCCTGCTTCGGCTGGCATT:1	+	chr2R	21101834	3'	-	P-element	13	1	61.39
GTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCC:1	+	chr3L	8249126	3'	-	jockey	4582	1	57.86
ATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCTCCCACTATTTCTTTTCCTTTGTTTCCATGCGCTCCACAATTCATCACCAC:1	+	chr3L	21483945	3'	+	Cr1a	269	1	54.55
GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGC:1	+	chr3L	9907362	3'	-	BS	5041	1	53.73
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCACACAAGCAGA:1	-	chr2R	13710591	3'	-	roo	71	2	68.53
ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATG:1	-	chrX	13066498	3'	+	jockey	4938	1	56.55
AAGTAATATATTCAATATATTTGTTTTTAACTTGTGCCATATTGGAATACCTCATTTGGATATCGAGACGAACGATGCCATTATCCTTGGCTTTATGATTGCCGAGTTCCTGGAGGAGTTCCGCAACTTTGCCGTG:1	-	chr3R	15144721	3'	-	Tc1-2	1598	1	75.74
GACGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAATGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAG:1	+	chrX	6486811	3'	+	roo	353	2	55.48
TTGTTGTTTTTTTTTTAATAATCTCACTTTGTAGATTTATTAAATTGATTTTAATTTATTTAATTATTGATTTAAACTTCGAGAATTATTATTCATGTGGTTTTAATCCATTTTTAATGCATTAAATTTCATTATTGTTTGTTAAT:1	-	chrX	18357365	3'	+	hopper	155	1	54.11
TGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATGTCGGCTAGCTGAGTAACAGCCTGTTACTAACAGGTATCACGAATCAGCGGTCTCTCTTGT:1	-	chr3R	5167509	3'	+	Tc1	1615	1	64.66
ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTC:1	+	chr3L	21855554	3'	-	blood	7054	2	56.16
ATAGATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATCGGAAGCAAACGCAGAGGCATTTCTAATTTGTGCGTTGCGCGACTTTCAGAGATCGTAGACTCG:1	+	chrX	308179	3'	+	G3	4497	1	55.56
TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATACGTTTTCCATGTGTCCTTGTG:1	-	chr2R	9791536	3'	-	412	18	2	72.41
GATGCGATTCTCATGTCACCTGGTGAGCTAAGCAATTTGCAGCCGATCATGGATTGTAGGTGACGATAACGAACTACTCAATGAAT:1	-	chr3L	20831583	3'	+	roo	8990	2	76.74
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGG:1	+	chr2L	12892720	3'	+	roo	9032	1	54.62
CAATAGTCGAGTCGATCTGGCCCTGCCCGTATGAATGTCTCGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATATAAATTCCGTGCGAAATCCCTGCAGTCCATTCGCATCTTGGACTTTGACGCCAAGC:1	-	chr2L	3468036	3'	+	INE-1	101	1	63.57
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCGCTAATTT:1	+	chr2R	25118811	3'	+	roo	9044	1	67.81
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGAATATCACCAGCTTTAATCATCTGACTTTATAAGTGGGGCACACGTGTATGCATTCT:1	+	chr2R	13696528	3'	-	roo	8688	2	69.18
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGT:1	-	chr3R	18582094	3'	+	roo	396	1	73.97
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAATAAAGCAATAAATGTTATTCAAGTGATTAACCGCCTTATTGCTTCTAGAAG:1	-	chr2R	23802907	3'	+	roo	9048	2	67.81
GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAA:1	+	chr2L	7810144	3'	+	P-element	2862	1	62.30
CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTTGAACATTTCCAGCAGGACTCTCT:1	-	chr3L	2712776	3'	+	P-element	2823	1	24.11
AGGCAGCATAATTTCCTTTTTTTTCAGAACTCAATGAAAATCTATTGTAGGCATTTAGGGTATTATCGATCTGGGGTGTTTATTGGGTGATTATAACAAATAAAAGGAG:1	+	chr2R	7392322	3'	-	mariner2	884	1	61.47
TTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGTAAAATTTCAGTTAAGTGTG:1	+	chr2L	12290784	3'	+	1731	4586	1	56.85
CAGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATAAATGTTTATTCTATATATTTTCGTGCTTTTCGCTTTTTGCTTTCGGCGGGGCTGTCTGCAGTGAG:1	-	chr3R	20005003	3'	+	297	6953	2	61.34
ATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGACTCCTGTGCTTTCTGATCTGAATTGGTTTCTGCCAAGGCCACCAAGTTATTTTCCCTGCAAGCTATTTCAAAGGCTTTCGCTATGT:1	+	chr3L	27413623	3'	+	invader4	2638	1	61.64
TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGTTGTT:1	+	chr3L	26011950	3'	-	F-element	87	1	70.55
GTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCTTCTT:1	-	chr3R	13457869	3'	-	X-element	20	1	67.77
TTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCC:1	+	chr3L	3501014	3'	+	opus	426	2	72.86
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATA:1	-	chr3L	11393507	3'	-	roo	8752	2	83.92
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTTCACGATGTTGTGCGCCTG:1	+	chr2L	6059293	3'	+	roo	342	2	70.54
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAACAATATGTG:1	+	chr3R	7482828	3'	+	412	424	2	69.86
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCAC:1	+	chr3R	22844306	3'	+	roo	387	2	65.12
GTTTACTTAAGCTTTTAGTTATGTTCCTTAAAAATGCAGAGCTAGACTCCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATATAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAAAATATGATAACTAG:1	+	chr2L	6007627	3'	+	Transib5	402	1	65.75
GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTCCTTATTTTGAACTACTTATTGAGCAGTACTGCAC:1	+	chr2L	12250109	3'	+	1360	3336	1	71.30
CCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGCTTAAGTGC:1	+	chr2R	19540460	3'	+	jockey	4967	1	49.55
GATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGATTATATTGTATATAATCAGTACTTTCTAACTGGTTCTTAGCTGTGGCATCCTTGGCGTCT:1	+	chr3L	5102513	3'	-	BS	4677	1	53.06
GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGTTCATTCAGCCCACTTCCTACC:1	+	chr3L	17685255	3'	+	mdg3	224	2	47.26
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCC:1	+	chrX	6486777	3'	+	roo	332	2	78.20
CTTCGGAAGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGGTTTCTGTCTTTAGTTTAAAAACTCATCTGAACGCGCATAGTCGCAGAATAAACCACACTAATTAAAATTGTTGTCTCTTAATTTATATTATTTTGGGGATTTTGTGCTT:1	+	chrX	10155809	3'	+	gypsy4	6737	2	79.31
AAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAG:1	+	chr3L	23866736	3'	-	copia	59	2	64.14
AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCCCGTTGCCGCTTCTGTCACC:1	-	chr3L	10773072	3'	+	412	7506	2	60.71
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAATAAACACTCAAAACTACAGTTTGACCAGCACTTATGTG:1	+	chr2L	3886245	3'	+	roo	9022	2	54.81
AGATATACATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAATATTAAAGA:1	-	chrX	21949005	3'	+	412	275	2	79.39
ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCCCATCGCGCCAAATAATATTTAAATATTACTTTTCACCAAAGCGCGCCAAATC:1	+	chr3R	11496663	3'	+	1360	3374	1	76.39
AATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAACAAAATTAGTAACAGATTAAATGGATACTTGCTAAGAAAAATTCAAATTCGACGGTCCTGCGCACTACGCACCTACTTAACTGTTCCCGGTTATCAACAGG:1	-	chr3R	5172159	3'	-	Tc1	1543	1	54.62
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATT:1	+	chrX	13039522	3'	-	roo	8699	2	78.75
ATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGTCAGTTTCTATT:1	-	chr3L	10574264	3'	+	Tabor	7282	2	53.42
ACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTGTTAGTCCAAGGGAAAATTTTTCCAAATGAAATAGA:1	+	chr3R	9714491	3'	+	Stalker	7207	4	52.05
TATTTAAAATTAAAATTAAATTAATATTAATGCAATTAAATTTAATTGCAATATTGAAACAAGATATTAAAGCAAGCAAACTAAACTAACAACACAGTAGTTCCCAGTAG:1	-	chr3L	9546701	3'	+	NOF	3954	1	61.82
TAAAAAAAAAAGAATTTTAAAACAAATTTCTAAAACAATTTGTAACTCTTGTTTATATATTTCTAAATCCATTAGAGCTTGAGATAATAAGTTTGTCTCCTTATTTCGCAGTGTTATTTTTTCCC:1	-	chr3L	13184785	3'	-	FB	176	1	49.60
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCAC:1	+	chr3R	7835227	3'	-	roo	8692	2	61.60
ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCGATTTGGTAGAAGGGAATGTATCAAGATGGGGGCAAATCACGGTTCGGATGGCAGAAATTCTTCAAAAACTTTAT:1	+	chr3R	28077725	3'	-	jockey	4750	1	54.79
AAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGG:1	-	chr3R	14049320	3'	-	transib2	24	1	62.50
TGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCGTGTCCGATCTCGGTTGATAGCCCTGTCTCCGGGCGGTTCGGTAGGTGGGGGGTGGTTTTACGGAGCAGAGGGCTGCGGTGGGCCAATG:1	-	chr2R	5742056	3'	+	INE-1	91	1	74.38
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGCAACACATGGCG:1	+	chr2R	9328719	3'	+	roo	9037	1	58.16
ATTGTTGTTATTATTATTGTTAAGCTTGGAGTGCAGTTGCTCCTTCTCCTGCAGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCATGGATCGCAGCTGGGACTTGAGCGCATTTTTCTCCACACGC:1	-	chr3R	11374706	3'	-	mdg1	21	2	71.30
GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGCAAA:1	+	chr2L	2687410	3'	+	copia	5037	2	80.14
AAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTACATTACGTCCTTAAAGTTTTAAAATAAATCATAAGAC:1	+	chr3R	13237367	3'	+	3S18	6049	2	70.59
TTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGAGCTATATTTTTCAACCGGAAACGGAAGTGTTACGCTTTCGACCCCGTTATCTTTATCGCCGCCATGGTC:1	+	chr3R	18436033	3'	+	1360	337	1	55.65
TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACCCATTCCATTACCTGC:1	+	chr3L	10773167	3'	-	412	7085	2	58.06
CAAAATAGTAGACAAAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAAGGTTGGGTAAGAATAATGCCGAAAGACAGCTCGAAGTACCGAAAAATTGTTGACCACATGG:1	+	chr2R	6486783	3'	+	Circe	7395	2	81.67
ATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTCGCTAAGTGCAGGCTGCAATCAATGCCGTAATAGCAACAAAAACAACAGCAATAA:1	+	chrX	12737357	3'	+	hopper2	1544	1	58.90
ATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATGCCTAACCATTTCTTTGGCCTTTGTATTGCGCCAAGCCATCAGATTATT:1	-	chr2R	5718580	3'	-	Porto1	4237	1	66.44
ACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGTCATTTTCACGTCGCGCAATCGCAGAATCCCATTTCCAGCTAAC:1	-	chr3R	12316565	3'	+	roo	427	1	60.36
AAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAA:1	+	chr2L	12483794	3'	-	P-element	92	1	22.07
GTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCATCAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTATTTCATTATCTGATTATTGACTAGTATAGACCACAGTTGATAGTATTCCTACTTATGTCT:1	+	chr2L	4954045	3'	+	Quasimodo	7311	2	59.31
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAAT:1	+	chr3R	22122783	3'	-	roo	66	2	66.90
GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCC:1	-	chrX	2518063	3'	+	P-element	2851	1	34.52
TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCCACTGCCTACCTATCCACCCGTTCCAACC:1	-	chr3L	11957090	3'	-	blood	7029	2	68.94
ACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAAAAATTAATAATAAAATATGAAAAGTTTAACATTTTTTCTACCTACATACATATCTTCGTAGTTCGATCAAAAAGCA:1	-	chr3L	2192936	3'	-	I-element	42	1	52.05
AACTATAATAATAATAATGTTAAGTACTCTTAAGTTTTGTAAATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCT:1	+	chr3L	13285664	3'	+	mdg1	7072	2	72.41
CTTATTGTCATACTTTTTTAGAACAGATTGTAAATAAAACGAGAGAAAAAAAATAGATTCTAGCGTTATCTAGGCTTTCCATTTACATTTGTATATATATATTTAAGACGTAATGTAGTACTG:1	+	chr2L	8777128	3'	+	G4	3817	1	82.93
ACAAAAGGAAAAGGAAAAAAAATTAAACAATTACAAAAATTAATTTCGAAATACAGACACACATAGATGTATATGTATGATATCCAAAAATATGAATATTGCATGTGCTTCAAATATAAGCTAAAATGTAAGCAGACTGAATTTGA:1	+	chrX	5053713	3'	+	Doc2-element	237	1	73.97
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCG:1	+	chr2R	13084675	3'	+	roo	9003	2	68.06
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTG:1	+	chr3L	15600318	3'	+	roo	9003	2	65.07
GTCATATTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTGCGTGTGTGTGAGTGCCCATGCGATGCTTGCTCCTCTTGTTGGGAGTCTAAATTTAAATGTGTGTACAACTTAATGATTCT:1	-	chrX	13275643	3'	-	S-element	1342	1	60.42
AGGCCTTGACTGCGGGAAATGTCGCAAAACAGTTCAAGGACCGTCTCCTTGATGAGATTGCATTGAATATGTTTATTTTTAGTTTGAGTTTGTAATATTAGACATACAGCTTTGAGA:1	+	chr3L	24000382	3'	+	baggins	432	1	58.12
CAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGCTTTAAAATAATGTCGTAAAGGATCAGGAAACGATGTTAAAG:1	-	chr2L	9185386	3'	+	1360	167	1	71.54
GTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACA:1	-	chr3L	7292473	3'	-	HMS-Beagle2	61	2	67.91
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAAT:1	-	chr2R	23802957	3'	+	roo	9006	2	66.67
ACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAAT:1	+	chr2L	18689246	3'	+	Gypsy6A_LTR	248	1	72.60
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACA:1	-	chr3R	17817888	3'	+	roo	400	1	68.89
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCGAACTGGCGAGAGACCCATGGGACTG:1	+	chr3L	9998243	3'	-	roo	15	2	74.31
GTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCCCTGCTCCTATTTGGTGGTGTGCCTGGCCCAGGTGGTCCTCTGCACCTGGCTCATCATCTGGCTGCGATTGGGCACCTTCTCGCTG:1	-	chr3L	9593701	3'	-	Max-element	366	1	77.39
GTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAAT:1	-	chr2L	20117889	3'	+	invader4	267	2	62.33
GAGAGAATGCTATAATCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTGGGGGAGAATTTTTCTGGGATTGCAGAATAAAATGAGAATTTTTCTTAATTGTGAGTGTGACCGTTTTGGAGGGGCGTGGCCACAGTG:1	+	chr2R	4886138	3'	-	INE-1	575	1	45.00
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTGCCGAACTGCATGACATTGTGGCCACTTTCAAGAGTCC:1	+	chr2R	14542247	3'	-	roo	47	2	52.05
AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGC:1	-	chr3R	22821999	3'	+	mdg1	7398	2	60.27
TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCC:1	-	chr2L	10023009	3'	-	Doc	75	1	68.70
GGTGGGTTTAGATTGTTGGTTGGGCGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGATGCAGAGAGCTTGTCATTTAATTTGTTCGATTTTTGAAAACGAGTGTAACGATTTTCTGTAT:1	-	chr2R	5173519	3'	-	gypsy	489	1	51.49
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTTGGGATCCCCG:1	-	chr2R	13084589	3'	-	roo	8716	2	59.85
CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGAAGTCATAAAAGTTAATGATTTCCAAAT:1	-	chr3R	9921945	3'	-	blood	7021	2	73.60
ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGA:1	-	chrX	10644456	3'	-	jockey	4847	1	75.86
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGGTGTTGTT:1	+	chr3R	20427475	3'	-	jockey	56	1	55.56
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATGAACCGAAAATATTTAAAAATACTTTAAATGCCAAAAGCCATA:1	-	chr3L	10292817	3'	+	roo	331	2	74.66
GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAAATAAATAACAATAATAGCATAGTGACATATCGATAATCCTATGTCTT:1	+	chr2L	22685235	3'	-	Ivk	11	1	75.76
CTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGCTTACAC:1	+	chr2L	21400820	3'	+	Doc3-element	4694	1	32.82
TATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAAATCGATTAC:1	-	chr2R	24218489	3'	-	412	1	2	79.17
GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACCCATTCCATTACCTGCTAAC:1	+	chr3L	10773171	3'	-	412	43	2	54.68
ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGT:1	-	chr2R	9791584	3'	-	412	7111	2	63.50
ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATA:1	-	chr2L	544772	3'	-	412	7115	2	57.53
GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAGAAAATTGTATATTTCTTTAATATA:1	-	chr3L	16470829	3'	-	Doc	54	1	57.35
GCGCCATTTTTTTTTTTATTTTTGCCTTGAAATTAAAAGCAAAAAAAGCAGCAAATAGTAGCCGAA:1	-	chr2L	8629588	3'	+	hopper	138	1	81.82
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAC:1	+	chr2L	6059295	3'	+	roo	8991	2	72.60
GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTT:1	-	chr2R	5485093	3'	+	blood	333	2	52.05
TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAAT:1	+	chr3R	14979900	3'	-	pogo	17	1	66.67
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGGTACACATCCGATCCTT:1	-	chr3R	17817876	3'	+	roo	388	2	63.16
AACTTTCAAAGTGTTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGAATAATCAATCTTTTCGTACGTTTTCATCGGTGTAGTTCAAAATGCAACGACCTAAGCGACGGAGATATAACTTCTGGTCGAGATACAT:1	+	chrX	3462937	3'	-	hopper	1197	2	54.11
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGA:1	+	chr2R	23803033	3'	-	roo	71	2	68.06
GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATC:1	-	chr2L	17420137	3'	+	roo	359	2	53.42
ATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGGTAGTCGATTCTGTTTTCGAATGCGTCCCTTTAAATTTATTGATGATATCAAGATATCCAAGATATCTTTGGAGTGAACCAATATTTTGTGGACTGTCGCTGTCATGGGAAGC:1	-	chr3L	17863022	3'	+	hopper	289	1	53.62
CTACGCGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGATTACCATAAGTCAAAAAATGTTAAGCCCCAAAGAAAAATGGAAAAAGTGTTATCGGGTGCTTTAAATACTTGGATA:1	+	chr3L	7483322	3'	-	micropia	5054	1	50.68
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAAAACTTTAATATTTCCATTTTTAATCATTTTACATATATATCGATTTT:1	+	chr2R	19050331	3'	+	roo	393	1	64.79
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAAATAATT:1	+	chr3R	16404585	3'	-	pogo	38	1	58.87
GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGG:1	+	chr2R	17626897	3'	+	opus	7463	2	74.44
GTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAACTAAAATCCGCATT:1	-	chr3R	907924	3'	-	gypsy11	364	2	25.41
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTA:1	+	chr3L	15600338	3'	+	roo	9037	1	44.70
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAATACATACTAGAATATATGTGGGTTTTATCATCA:1	-	chr2L	13763125	3'	-	pogo	38	1	59.59
ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCG:1	+	chr3R	10182181	3'	-	blood	7085	2	78.40
AACAATTTGATAAAATAAAATAACATAATAATAATTATAATTAGATCAACTCATAATACTTCTAAAACTAATTAAATATCCTTCACAAATTAGCCATTTGTAATC:1	-	chr2R	10552236	3'	-	1360	3103	1	85.71
ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGC:1	-	chrX	13126465	3'	+	jockey	4956	1	61.90
GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAA:1	-	chr3R	25448354	3'	+	roo	329	2	71.23
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGACAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAACTGGCTTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTGATTGCGTTTGACCGACTA:1	-	chr3L	23603164	3'	-	F-element	71	1	57.89
GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTACTGAAC:1	-	chr2L	7888097	3'	+	pogo	2055	1	57.24
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTTTTTGGGATTTTACAGTTTTCAAGCACCGTGAGAAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAA:1	-	chr2R	8585442	3'	+	roo	394	1	51.81
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGGGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAATAACAACAAAATGACTCATATGCTTACACCTAAAACTGTCCCATCATCTACGCAGAAATTGCGTCATA:1	-	chr2R	21145849	3'	+	pogo	2059	1	52.74
GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCG:1	-	chr3L	17685099	3'	-	mdg3	40	2	43.15
TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAA:1	-	chr3R	1433137	3'	-	mdg1	10	2	58.23
GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCA:1	-	chr3L	18368903	3'	+	opus	472	2	58.54
AGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGACTCACTTCTTTTTATTT:1	-	chr3R	20499702	3'	-	mdg3	5267	2	75.34
ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACG:1	+	chr2L	11518454	3'	-	412	50	2	72.55
CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACCAACAAAAACTGTGTAATTGTA:1	-	chr2L	7810072	3'	-	P-element	84	1	19.85
ACTAGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGAATTATAAGTAAAATATATATTGGATATAAAAACCAATATTTATTTTGCTGTCCATCCATCGTTTGTTTAGCCCACAGTGGAGC:1	+	chr3L	16971294	3'	-	S-element	175	2	52.14
ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACATGACTTTCCGGTTTTACAGGTTTGCTGCAAAGCTTTCGCTCTCTCATTCGGCGCTCTCTCTCTCTCACACACACTCTGGCACCTGCCTAATTCGATTAGCCG:1	-	chr2R	8145994	3'	+	P-element	2884	2	75.76
ACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATTTTCAGGAT:1	+	chr3L	11321523	3'	-	mdg3	5273	2	62.40
GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGCCCGATGCTGCGTGACAC:1	+	chr2L	14892329	3'	-	transib2	39	1	58.62
AACAAAAAAAGGGAAAAAGAAATTGTTGGCTTTTTTTTTTGGCGCTGCTGTTTACAGCATTTTTTTCAGGTGGTTTTTTTTTACTTTGTTATTATGTTT:1	-	chr2L	8245474	3'	+	Doc2-element	232	1	40.40
TTAATATTATTATTATTATACTTTATTTATTCCCTAATAAGTGTACCTAAAACTTAAGGACTATATTTATTGAATTTTGGTACATTTAAGTTAATATAAATGAAAGTACTGAAGTACACCTTTTTATCTTAGATACTCATCAAT:1	-	chr2L	10983529	3'	-	mdg1	7073	2	44.44
AAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTGAATCACACATTATTGGGTATGGGTATACTAGATTGGA:1	-	chrX	21564599	3'	+	diver	219	1	78.08
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGTGTCGTTTTTGGATGG:1	+	chr2L	8986213	3'	+	412	7475	2	69.86
GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAA:1	-	chr3R	25423180	3'	-	3S18	40	2	54.55
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAG:1	-	chr2L	3164977	3'	+	412	7499	2	72.92
ACACACACACACACACACATATACATAGCCGAGCAAACCTACTAACCGAACTAAC:1	+	chr3L	9183638	3'	+	accord	183	4	83.64
TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACAAAAACAAAC:1	-	chr2R	21572091	3'	-	hopper	52	1	54.29
ATATTTTTTTATTTTAAATATTTCTTTAAGTGTGTCTTGATTAATCTGTGCACTTTGGAGCAACATCACCTTTCTGAACCGCAAGAATGTCAGAAAAGTGGCGCGCGCATTTAGGGGCATCCC:1	-	chr3R	30246161	3'	-	G7	1164	1	77.24
TTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCCGGTGTAGCCATGTGGCTGGCAA:1	+	chr2R	9500098	3'	-	G5	4698	1	65.04
CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATTTTTGGTTCTGTTTGCAAAGTAACAT:1	+	chr2R	5485262	3'	-	blood	10	2	78.08
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCT:1	-	chr3R	18582173	3'	+	roo	8983	2	78.77
AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAACGATATTTTTTTCACCTGCACAA:1	-	chr3R	26659709	3'	-	HMS-Beagle2	6901	2	67.81
AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTCCT:1	+	chr3L	23906482	3'	-	1360	23	1	47.37
GAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACACCAATTACAAAAACATGGCATGTCACTTAATTTGTATGCGTTGAGTGCAATTTTCACTAGTCAA:1	+	chr3R	25423302	3'	+	3S18	283	2	56.85
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTT:1	+	chr2L	16016430	3'	-	412	7091	2	56.62
ACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTTAACGTTCTCTCTTTTCAAATTTGAAACTAGAAGCAAGAAAAAAATTAATAAACTAGCACTACTTAAAAAAAACTTTAATTATTGATAATTTTGAATTAGCATG:1	+	chr2R	4900849	3'	+	INE-1	542	1	61.64
GAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGC:1	+	chr2R	2308822	3'	-	McClintock	5953	2	54.41
GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCGGACCTACCCAAGTGATCATTTCAAAAGAAAAAGAAAAATCGGCATCAAT:1	+	chr3R	1916489	3'	-	1360	71	1	67.59
CGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATT:1	-	chr3R	20499778	3'	-	mdg3	89	2	75.69
ATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTAAACGCTATCAAATTTA:1	+	chr3L	13746956	3'	+	P-element	2611	1	20.55
GATCTTGAGGCGACAGTTTTCTGAATTGTGGGCAATCAAAAATTATGTAGCCTACAGCATTGCTTATGTAGACAGGTCGTCGTTGCAGCCG:1	+	chr3L	25405991	3'	-	G3	108	1	69.23
GAATAGTGTGTTAGAGGGAGATGAAAATGTAGTGAACGCCAGTGTGTATAGATATTAGTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATATTTTTTTTTATCTTTGCTGGTGGAG:1	+	chr4	1294990	3'	+	invader4	2909	2	47.54
GATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAA:1	-	chr3L	14944550	3'	-	G5	4806	1	56.16
TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACGTTGTCCAAAGATAACGAAACAACGATACATTACAATAAATATTACAAAATTCTTGCAACGAATAAAAACTCACTCGA:1	-	chr3L	22863358	3'	-	412	14	2	68.91
AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCCGTTGAG:2	+	chr3L	10648027	3'	-	412	7083	2	52.74
ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCACAGGT:1	-	chr3L	25406600	3'	-	1360	6	2	64.14
TTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTT:1	+	chr2R	21298846	3'	-	jockey	260	1	52.52
ATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTT:2	+	chr3R	25454086	3'	-	Quasimodo	74	2	73.10
CAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTTAGAAGAACTGTGTAATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAA:1	-	chr2L	9778711	3'	+	F-element	4580	1	66.44
AACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTAGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGGCATTCGGTTGGCACGGCGAGGTCAACAGAACGTTAA:1	+	chr3L	7292578	3'	+	HMS-Beagle2	7150	2	51.72
GTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCATAACTAATTAATTATGCCTTCTTAAAGCGGCGTTAAACGTTG:1	+	chr3R	27424994	3'	-	blood	13	2	81.16
GAGGAATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGACGA:1	-	chr3L	10013572	3'	-	hopper	25	1	57.27
TATTAATATTAATATTAATATTATATATAATATATTAATATACTCTGAAACTAACTTATTTATTTTTAGTATACTTCCAATTAGCTCCTCCCCTAAGCCCGCTTTCTGAGTACGCCACTGCTCGCAGAATTCCATGTGTCCACATT:1	+	chr3R	14053680	3'	-	mdg1	7075	2	67.12
CATATACACACACACACACACACACACACACACATGTGGCGGCCACAACAATTTCA:1	+	chr2L	20255219	3'	+	accord	180	4	87.50
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTG:1	+	chrX	9540133	3'	+	roo	9042	1	62.22
AACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAAAGTTTATTGATATTTGGAAGGGATACGGTGCTCTCAAGGGTTC:1	+	chr3R	12618225	3'	+	F-element	4475	1	69.86
TAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTAT:1	+	chr2R	5532327	3'	-	G4	3776	1	58.25
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAG:1	+	chr3R	18582259	3'	-	roo	8713	2	54.11
ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACCAATAAACCGCACCACTCACC:1	-	chr3L	10848601	3'	-	blood	7032	2	71.23
ACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGGTAAGTCCAATGTTGTGAA:1	+	chr3R	1446150	3'	+	1360	3383	2	26.71
CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTAT:1	+	chr2L	19965070	3'	-	Doc	64	1	53.42
AATATTTTATATTATTGATTTAAAATATATTTTGATATATACATATAACAGCCTGTATTACTCAGATTTCAAGTAGCTTAAAAAATCCACAAGTGAGCAATAAGGACGTGCCTGCGGAAATGAAAATCTCTCTTTCATTTTATCGT:1	+	chr2R	13104970	3'	-	G7	1148	1	76.03
CTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCATACATGTAGAAAAAGCAGAAACCCAATAATGATTATATATTAGATAGATATATAGCCA:1	+	chrX	7055593	3'	+	F-element	4220	1	60.27
AAAATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCCGTCGTCTTTGACAAATTGAGGC:1	-	chrX	14336394	3'	+	roo	9036	1	57.78
CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTATAGTATAGTG:1	-	chr3L	10056080	3'	+	transib2	2785	1	56.94
TTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGT:1	+	chr2L	10037423	3'	-	Quasimodo	3	2	73.74
ATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATAT:2	+	chr3L	19339445	3'	-	Tc1	55	1	50.68
AATGTATGTACGTTACTTATATATACGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCCG:1	-	chr3L	2362316	3'	-	Stalker2	41	2	50.39
GGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTGCTGTTCTTGCCTCCGGCCTGTGTGTGTTCTTGCCCCGTATAGATAACAT:1	-	chrX	18001086	3'	-	412	7296	2	64.54
CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAAGTGTTGCATACGTCG:1	-	chr3L	17136056	3'	+	hopper2	1549	1	68.29
GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGCTTAGTTGATTTGAGCTAACAAAGGGTTATAATATAACCCACTATCTTAACCAG:1	-	chr2R	19499262	3'	+	P-element	2875	1	75.00
GCAATAAAGTATCTGCCACAGCGTCTGCATATATCATCAGCTGTACCTATATTCCTGCAGCTTAGNGTTTTCGTGCATTTTGCATTCAACTTTTNGCTGATATAGCTGAT:1	-	chr3R	15519493	3'	-	ZAM	8192	2	61.82
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCTATGTAAGGTAGTATGTACTCTATATATGTGTATATGTAGCATGTATCTTTCGTATTATGCAATTGTTG:1	-	chr2L	6059204	3'	-	roo	23	2	61.02
AATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTAGATCCCAATCCAAATCCGAATATCCCCCTTTTCCGCACCCACTATCTCATCCTATCCGACTCCTTTGC:1	+	chr3R	14650792	3'	+	P-element	2728	1	48.28
GACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACACGAAATTTCATAATTTTTCTGGAATATCGATAGATATTGGGGAGTAAAATGAAAAAAAAACTTAATAATTGGCAAGAAAAACAATACAACGAAGAACGTTCCG:1	+	chrX	22959248	3'	-	INE-1	549	1	66.90
AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCA:1	-	chr2L	17081782	3'	+	jockey	4932	1	60.69
TATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTATTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATGCAGGAAAACCAATGGCCAC:1	-	chrX	19817459	3'	-	invader3	5087	1	74.48
TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCC:1	-	chr3R	7835097	3'	+	roo	9028	1	54.11
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTT:2	-	chr3L	4536659	3'	+	roo	9043	1	61.64
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAAT:1	-	chrX	10640003	3'	+	roo	357	2	50.68
GGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATCAAGTACCTTATTTGTTGTGGCAGTAAAATATGTAGGTTAAAAGTGGAACGTTTCGCCTACATTTTATTACC:1	+	chrX	10638720	3'	-	roo	8834	2	50.68
CTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAG:1	+	chr2L	22224613	3'	+	Rt1c	5406	1	58.90
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATACGTACAACAATA:1	-	chr3R	20469557	3'	-	roo	8683	2	49.32
AAAATAATAATAATAATAATAATAATAATGAATGAATTTGAAGATTACGTTTGTCCTTGCTATTGCGGTACTGTGGACAAGCGTATCCTTGGCGGCACAGGC:1	+	chr3R	23156134	3'	+	mdg1	26	20	52.94
ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCTAA:1	-	chr3R	17605594	3'	+	Tabor	7301	2	69.18
TAAATACCTAAATATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAA:1	+	chr2L	19310394	3'	+	Juan	4154	1	57.24
CTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAAGCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATTTATTTTTTACGACACTGGCTTCCATCGAAC:1	-	chr2L	15516954	3'	-	hopper	449	1	77.70
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGAGTCTGGGC:1	+	chr3R	14940151	3'	-	jockey	36	1	63.41
ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACAC:1	-	chr3R	14981151	3'	+	mdg1	362	2	58.22
AGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTAGCGTAATATAATGTTGAGTTCTAGCTAAATCACTTAATTGCAAGTAACAGATGAAAAAAAATGTATATGAAAAAGGGGCGTTATTGAG:1	+	chr2L	5844105	3'	-	transib2	2612	1	41.78
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTT:1	+	chrX	23439050	3'	+	P-element	2495	1	64.23
CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGTTCTTAACTTACATACATATGTGCACACATCGCAGTGACTTTCGGTGAGTAATGCTGTACTTATTTCGTTTATCTTATCTAGGCTTTTGTGCTTTTACAGGCGCCT:1	-	chr2R	9543987	3'	-	opus	29	4	67.12
TTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCNAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGG:1	+	chr2L	5845053	3'	-	transib2	87	1	76.03
ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCGGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAAGTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTTTAT:1	-	chr3R	26431966	3'	-	opus	7167	4	56.06
GCGTGATGCATTGGAGCCACAGTAGATTGTATAATTACATATGTATATGTACATATGTACATACATACATATGTATTACGTATTCCGTAAACAAATATGCACATTACAATATAAGGCGTTGATAGGCGAGGCAGATACATATAT:1	-	chr2L	22125217	3'	+	gtwin	197	2	80.56
TGAGATCTCAACGGTCATACGGACGAACAGAGCCAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATCGTTTAAC:1	-	chr2L	22724093	3'	-	INE-1	135	1	75.00
GTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAACGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGACATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGCCAGTATGCCCAAAACAGGACACTATAAAAC:1	+	chr2L	22217646	3'	+	invader4	2901	2	77.86
GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAGATCAACCTCATCAAATATA:1	+	chr3L	25401022	3'	-	Doc	20	1	52.94
TTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTT:1	-	chr2R	2016847	3'	-	1360	33	1	66.67
GGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTTGTTTGCTCAGGAGTGTTTTTTGTGTAGCGCTGAATTTACATAAATCATTTTAGCAACTTTTATTTCAAGGTGAGT:1	-	chr2R	17259348	3'	-	jockey	4988	1	52.05
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTACAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCT:1	+	chr3L	20831395	3'	-	roo	8695	2	59.40
AACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCC:1	+	chr2R	21298851	3'	-	jockey	231	1	67.83
GTTTATATGTATATATATGGATATATATATTGCGTATCGTAGCTTCGCCGATCAGCATTAATGCATATAGCTACATCAGTACCAATTAGCATATGTTAGTATCCACCAGTAGGTAACATATACATGTACGTATGTCACATAGCG:1	+	chrX	15101417	3'	+	G3	4511	1	79.17
ATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGAAAGAGAACCTGCAATTTG:1	-	chr3L	19035956	3'	+	Tirant	378	2	64.62
AAATATTACATTTTTTTTTATTTAAATCTTTAGAATATATATTACGTCTTTTTCATTACGCCCTCGATTAAGTTAACTTTCTAGTGTTAAACACTAAGAAGTCCTTAAACAAGTTAATATTTATTAATCAACTGGAACACTCAATG:1	-	chr3L	3593877	3'	-	P-element	142	1	58.90
TGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTTAATTTGTTTATTTTTATTAACTTTATTAACTTTGCTGGTGGAGTTTTTTCTCTTTGCTTTTTTTTTATCTTTGCTGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGT:1	+	chr4	1294992	3'	-	HeT-A	3	1	68.49
AAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGTGAAAGTAATTCATTGTGCATCCAGTTGTCTTAAGTGGAACTAGAGTGTAGA:1	-	chr3R	29714067	3'	-	Stalker	454	1	64.14
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACA:1	-	chr2R	20596450	3'	+	roo	9017	2	55.48
GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAGGTTGCACCGAAATA:1	+	chr3L	1534581	3'	-	pogo	30	1	79.45
AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGTGAGACGGTTGTACATCGGTCGGTGGAGGGAGAAAAGGTACGTTTAAATGATATGCCATAGGAATTTTTTACACATTTTCATTTTTGTAAATTTTCACTTATTTTCACTCA:1	+	chr3R	13827556	3'	+	hopper	1407	2	58.62
TGGTCTTATACTATGGCACAGATGCTACTATATATATATACACATTTCCTTTTGCTTTTCGC:1	+	chrX	6499013	3'	-	Quasimodo	8	2	64.52
CGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCAAATGGCAAACGGCAATACCCGAA:1	+	chr2R	24218631	3'	+	412	7510	2	54.69
AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATGTCGAATAG:1	+	chrX	11296500	3'	-	BS	5031	1	58.62
AAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTGTCCACAGTGTTTAA:1	+	chr2R	1531560	3'	+	Stalker	7137	4	84.25
TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGGTAGTTTCGCATCCGTACAATCAGTTCAATGTCCTCCTTCTTGACTTGGACCTTCTGGAGCTCCTTCTCTTTGGCTACTCGCAGTTCGTTCTCC:1	+	chr3R	14035498	3'	+	1360	3373	1	68.66
TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGCAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAA:1	+	chr3L	17115549	3'	-	blood	7065	2	52.05
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCT:1	-	chr2R	13084612	3'	-	roo	53	2	72.73
ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTA:1	-	chr3R	14860135	3'	+	BS	5037	1	58.22
AAATAACAAAAAATAAAAAAAAATAAAATAAAAAATGGGGTATTCGCATTAGTAAGCCCACAAAGAGGAAGACAGACTGGTAGACAGAGGAATTTTTATGGCATTTCTCATGGTTCAAGCTCACACTTACACTTC:1	+	chr3L	12054486	3'	+	Rt1b	5148	7	58.52
TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACATATGGCACATATG:1	-	chr2L	13585806	3'	-	Tabor	6877	2	60.27
GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAA:1	-	chrX	401307	3'	-	Tirant	8139	2	54.55
CGTGGTTTAAAAATAAAATTTATTTGTTAAATTTTAAATTATTTATTATACTGGTTGTCCTGGTTCGTAAATAATATTTATTTTTAAAATTTTTAATTATATTTTATCATGTTAAACTATTTGGTTTTAAACTGTTGATCATGATG:1	-	chr2R	12628927	3'	+	NOF	3951	1	78.08
ACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCTCTATCTTAATGAAGGTAAAGATAGCGAAGAAGCTCAAAAATTCCCCAA:1	-	chr2L	15987800	3'	+	mdg1	203	2	65.25
CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCTCTT:1	-	chr2R	2016803	3'	+	1360	3386	2	76.92
TATTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATAAAAAAGACATTTTTAGTCTCTCATTGTCAAATGTTTTGTTTTATATGTAGACTCCAAAATTTCCTAGTACTCTTCTATGTCCAGTAAACGGTAACTTGTT:1	-	chr2R	5078725	3'	+	Tc1	76	1	57.04
TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGACTATAGTCTTCTTATTCGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGTGGTCGACCTCCGAGCAAACAGGACCGAG:1	+	chr3R	27994259	3'	+	roo	336	2	68.15
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTCGAGTTAGTATTTTAAAGTGATCTTTTAAATTTCATGGTTGTTCAAATCGGCGTCAATTTAT:1	-	chrX	17526819	3'	-	roo	8703	2	49.29
AGGTGATTAGGCGGCGTGTTCTTTGTTTCCCGGTGCTTAGTATATGTCGTTCTTGTAGTGCTGCTGTGCTTCTATTCACCTTTGTATTTTTTTTTTCGTGTTTTCGACTTTAGTTGTAATACATGATTTAAAT:1	+	chr2L	8273533	3'	+	accord2	290	1	79.70
GAGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATTAAGCTTCATTTTTATTTCTATTTACATTTTGCT:1	+	chr2L	1839368	3'	-	hobo	16	1	74.66
GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATCGCCAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGACTTCACAGTC:1	-	chrX	21087533	3'	-	mdg3	5257	1	76.56
GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAAT:1	+	chr3L	11257418	3'	+	1360	3372	1	63.81
ACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCAGAAAGCTCAGAAAAAACCGTTTACGGCCGCTGGAGCGATGGGCATAATTAAATCTATGTTGGGCATCAATAAAAGTTGCAAATGGATTTTTAA:1	-	chr2R	19543913	3'	+	jockey	4750	1	70.00
GGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGTGTGCGAAAATGCGTGCGAGTGTGTATGTTTGAATGCATGTTGATGTGTGCTTATGTGTATGTGAGGCCAAAGCGGCAATATGTATGCTACATACATATATG:1	+	chrX	7194309	3'	-	P-element	2868	1	75.71
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTACAAAATTTTTCAAAATCCAATTTCCCCACTATC:1	-	chr4	419977	3'	-	roo	81	2	77.40
GCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGT:1	-	chr3L	19013927	3'	+	invader3	202	2	69.44
TTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCCCGTTGCCGCTTCTGTCACCAGA:1	-	chr3L	10773069	3'	+	412	7546	2	70.67
TGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAAATCAATTTACTACAAGGCTTAAAGTCTTAACAGAAGGTTGGATTTCTCTGCGTACTTTCAGGCGTCAGAATCAGAGCAATTGCTTTAGTAAAATACTAACCAA:1	-	chr2R	18687710	3'	-	jockey	4982	1	39.73
CGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCA:1	+	chr3R	6611287	3'	-	HMS-Beagle	65	2	62.76
CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACCTTAAGAGCATCCAATCTTCCAATTTTCCCAACTGTTTCTTGTCC:1	-	chr3R	10462558	3'	+	opus	498	1	80.74
GTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAACTTC:1	-	chr3L	24152588	3'	-	1360	4	2	70.31
GGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGG:1	-	chr2L	12290682	3'	-	1731	4334	2	51.69
GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAAACATATTT:1	+	chrX	10201219	3'	-	transib2	45	1	60.17
GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCC:1	-	chr3R	12618633	3'	-	F-element	64	1	72.22
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCAGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTAC:1	-	chr2R	21907903	3'	+	roo	9028	1	53.85
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAA:1	+	chr2R	9328679	3'	+	roo	352	2	63.93
ACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAAAAAAATCAAAACAATAT:1	+	chr2L	20117965	3'	-	invader4	2803	2	54.11
AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCG:1	-	chr3R	17243085	3'	-	hopper	27	1	65.22
GGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCC:1	+	chr3R	20499833	3'	+	mdg3	168	2	68.49
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCTTTCA:1	+	chr3L	17560402	3'	-	pogo	40	1	57.53
TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGGCGTGGTCG:1	+	chr2R	2016933	3'	+	1360	3382	2	74.77
GCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCATAATCTTTTTACTGAAACAATTAGCTTTA:1	+	chr2L	22121684	3'	-	gtwin	6928	2	60.96
TGTCCACCAGCGAACAAATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATACCTAGGCTTTCGGTTGCACCTGAAAGCCTTGATGCAACTCAAATAAAAATAAAAAAA:1	-	chrX	23338895	3'	+	GATE	312	1	60.27
AACTCACTCTAATAATATCCATCAGCATTAAAAAAATTTCCACGCCCGCAGATTATAATTTTACAACGACACGAACTTTTCACAATTGTCAACATAGAAAAAAAAAAATATTTTAAAAATATAGCAAAG:1	-	chr2R	4410850	3'	-	Gypsy12A_LTR	356	1	64.34
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAAC:2	+	chr2L	16016400	3'	-	412	7131	2	71.23
AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCTTCTATCATATACTAATAGTTTAAATTAATACTTATG:2	-	chr2L	13053695	3'	-	BS	5008	1	73.29
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGAATGATTCAACACACCA:1	-	chrX	11471578	3'	+	hopper	1411	2	65.82
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATGCATGTTTAATTTAAATGTATCCTAGTTATATATAACTTTTAACTAAGCGCAAAAATGCAATTTTCTAGAGAAACT:1	+	chr2L	12498461	3'	+	pogo	2064	1	56.16
AGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTAGATTCATAAAACTCTGCCAATTATGCGAACATTCATGATTCTGTATGAAGTGCGGCTACCGCTCCAAATGTACAGATTAGAGAGATACTTAA:1	+	chr2R	9258577	3'	+	3S18	6098	2	66.40
AGATTCGTTAAAATGTATGTAAGAGGAAGAAGAAAGCGATTACGACCATACAAAGTATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATGTTGGTTTTTTTATTTAAGTTGCGCGGAATGATTTGTTCCATGTACGACTAAAACTGGAGC:1	+	chr2R	16344152	3'	+	INE-1	14	1	58.90
AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAGTAGTTATTGCTATACACGTTACTCGTGTACTAGTTTATTGTTTTAAATAATACAGCACAGAATATAAGCTGTTAGTATTATACGTACTCAGGTTTCC:1	+	chr2L	9399585	3'	+	Transpac	5224	2	77.86
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCTCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGG:1	-	chr2L	3114454	3'	+	roo	9033	1	57.53
AGACTACTATTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAGCAAGTTGTCTGAATTGAATATTGGTTCTGTAATAGTGTGTCTGTGATATGTTGGAAAAACAATTTCAAATTTGTA:1	+	chr3R	3875536	3'	+	Cr1a	3983	1	60.96
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATT:1	+	chr3L	22437932	3'	-	roo	54	2	73.64
GGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTG:1	+	chr3R	11547801	3'	-	G2	315	1	56.85
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGC:1	+	chr2L	12892683	3'	+	roo	8996	2	79.84
CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGTTCGTAGGCGCTCAGAAGTATGAACTATATTTGTGT:1	+	chr2L	15991433	3'	+	mdg1	7427	2	62.33
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGACAATATTGTAAGTGTG:1	-	chr3L	9998028	3'	+	roo	391	2	49.25
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAATTCACTTTTCATTGAC:1	+	chrX	8543568	3'	+	roo	9039	1	61.64
AAAGAGCAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATCGGGCAATCACACAAATCATAAATTTGGTGGGACGAACACATAAATTTTCTGAGCCAGCCGTTGCAACTCGTAGCGAGCAGAAATAGGAAGAACAGTTCGTCACAGGAGCTTTTGCG:1	+	chr2L	22698856	3'	+	HMS-Beagle	441	1	78.08
TAAAACGCCACCACCCTCAAGACCTGACTGACCAAGGAAAAAGCCAACAGAGGTAGACTCGTATAGACCAATCAGCCTCCTCCCTTCCCTTAGTAAAATT:1	-	chr3R	2471281	3'	+	jockey2	3175	1	68.00
AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTTTTAATTTATGTTG:1	-	chr3R	21434859	3'	-	412	7100	2	50.00
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATCATTGCGTGAATAAAGCAGTAACTTGAAATCCATTTGCGGTATATCAGAACTTTT:1	+	chr3R	22956087	3'	-	roo	22	2	64.58
GTTTTGGCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTA:1	-	chrX	2082623	3'	+	Transib-N1_DM	478	1	81.82
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATACTAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAG:1	+	chr2R	16945348	3'	+	jockey	4937	1	62.18
GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTATTATC:1	-	chr3R	5061805	3'	-	mdg3	31	2	65.07
AGTTTCNTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGAAAGGTAATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTTTATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCA:1	-	chr3L	6630130	3'	+	roo	9042	1	65.07
GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGTTTGCTT:1	+	chr3R	14651312	3'	+	P-element	2868	1	67.23
GTTCATGTGTATGTATGTATATTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAAGCTCAACGAGGTACGTCATTCCATATTCAGACAATTATTTTTAA:1	-	chrX	13057295	3'	-	1731	4390	2	68.06
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCAGAGCCG:1	+	chr2L	3886281	3'	+	roo	9047	1	67.81
AAAATAAAAATAAAAAAAAACTGAAAATGAAAATGGAAAAAATCTAAGCCGAAAGAGATGATTGCGTCCTTTTTTGTTTTTGGGGTGCAAAGTTTGGCGCGAAAATTTTTGAACGTTTCTGCATAATAAATTTTGAAAAGTGGATT:1	+	chr2L	9471639	3'	+	HMS-Beagle2	489	2	77.40
GTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTAAAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAACACAAAGAATTAAATTAACTCACACATCTTGCTTGATATGTCATCAATCGCG:1	+	chrX	20645661	3'	+	1360	3084	1	72.41
ACACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTTTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAG:1	-	chr2L	21795737	3'	-	HB	101	1	45.71
AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGCGTATCCATGCCTGCGGTCCTCTGGAGACTAAAAGATACAAATGCAGAGGC:1	-	chr2L	18338971	3'	-	pogo	50	1	58.91
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATTCAC:1	+	chr2L	12892732	3'	+	roo	9052	2	68.03
CGGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTTAACAATCATATTTTTCAAATTAGGTTGTTTCCTGTTT:1	-	chrX	10291148	3'	-	roo	8836	2	60.61
TTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCTAGCGGAAAGAGAGAAATTTTGGACGTCACTAAAAAAGTGTCTGCATAATGCCAAACCAATGTATGGCTTTGGTTAGATGACCTAGCTGTTAAAGCTTTTAACGAACTTAAAAATA:1	+	chrY	382989	3'	+	1360	3281	1	65.75
CTGGTGAACAAATATTCTGAGTTCTATAATTAGCTTTGCACTTATAATTTGTTTGTCACAGTTCAAACAAATGTTTTCCATGGAAAAAAAATGCAAAAAACGTGCTTCGACTAAAGTTTTTCAAAATTCTTGAACAGAAATG:1	+	chr3L	11668904	3'	-	gypsy4	406	1	53.52
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCACGCACGAAAAACCGAAAGAACAATAAAC:1	+	chrX	5643590	3'	-	roo	8695	2	56.92
TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTAGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACCAGCAGTAACAACACGGCAAATGGCA:1	+	chr2L	9564552	3'	+	transib2	2783	1	51.88
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGGGAATAATCGATGCGAGCGTTTAATTTCTGACCAACGAG:1	-	chr3L	7588422	3'	+	hopper	1382	1	62.75
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTTTTATATATTTTTGTTTCGCTTAATTCACTGTTAAAAATCCTAAGAGTGTAAACAAGATTGTGTAAGCGGAAAAAAGCTCG:1	+	chr3L	19334386	3'	-	roo	8682	2	73.29
TCTATAATTTTTTTTTTTGTTTTGAACCTTCAAGTTCGATTAACAAATCAGCTGAAAGCCTAAATGAGCAGAGGG:1	+	chr3R	4935844	3'	+	Tc3	83	1	56.00
AGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTATATCCTAATGGGTATTTCCAAGTCCGTACAACTTTGTCTCATCCAGTTAGTCCCAACTTGTTTTATCTACT:1	-	chr2R	20194177	3'	+	Max-element	271	2	60.29
GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGTGCAGCCCCGAA:1	+	chr2L	17079821	3'	-	jockey	4756	1	73.29
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGC:1	-	chrX	13126458	3'	+	jockey	4937	1	64.12
TAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGAGTTATGCAGTGCTCAGCAGCAA:1	+	chr3L	4948095	3'	-	hobo	8	1	54.55
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTC:1	-	chr2L	7888122	3'	+	pogo	2060	1	67.83
ACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTTCCAGCCTCTCCTTATAGGGGTGTCACCATCGTGT:1	-	chr2R	5173393	3'	+	gypsy	435	2	69.23
CACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTCACATAATCAGTACTTTC:1	+	chr3L	25482995	3'	+	accord	485	2	55.17
ATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAACATCGTTTACGTTTATTAACATTTGACTTACAAAACCTTATTGATACTATCACACTAGCCAAAATTGATTTATTCAACACACACATTT:1	-	chr2R	2893684	3'	+	1360	3153	1	69.78
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCGG:1	-	chr2R	8585405	3'	+	roo	9043	1	63.43
CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTCCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCC:1	+	chr3R	20499819	3'	+	mdg3	174	2	73.02
AATAAAATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCT:1	+	chr2L	7898390	3'	+	roo	9033	1	51.61
GATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAACATTAAGAACAAATTTCGAATAACTTTAA:1	-	chr2R	9258426	3'	-	3S18	5845	2	71.23
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTCCCTTTTATTATTAATAAATAATATTACTTCAGCTTATCATCGATATTTAGA:1	+	chr3L	15177359	3'	+	roo	396	1	73.97
TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACA:1	+	chr4	1152071	3'	+	transib2	2812	1	56.25
TGTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGATTTTATAGTTCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTG:1	+	chr3R	3586564	3'	-	INE-1	173	1	52.46
GCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTCTTTATTTATTTCAATATATTCCATGTATAATTTATGAATTTCATATTTTTTTATTATTAAATTTTAGTGCAGTAAAGACTT:1	+	chr2L	20808444	3'	+	HMS-Beagle	210	2	60.96
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACGTATTTATTG:1	+	chr3R	20469690	3'	+	roo	9032	1	50.78
ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGGGAGAACCACAACTCGCTCTCAATGGGAATGGGTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1	+	chrX	12649914	3'	+	P-element	2834	1	45.77
GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGC:1	+	chrX	7195092	3'	-	P-element	52	1	27.55
ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCG:1	+	chr3R	20427455	3'	-	jockey	84	1	72.03
ATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGAAATATGAGTTTGTATCTGTGTGTGAGTGCGAGTGCAGTGTGCATTGCATTGCCAGACCGTCCGGCGCGCATAACGTCATCGCCACTCGGA:1	-	chrX	7293395	3'	-	1360	3165	1	55.48
AGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTCTGCAGCGCTGTGGTGGATTGGGTAT:1	+	chr3L	10572674	3'	+	Tabor	7249	2	66.44
CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCTTCCATCATATACTAATAGTTTAAATTAATACTTATGTA:1	-	chr2L	13053693	3'	-	BS	5003	1	74.83
CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCGCAACTCCCACTCCAAATCCAATTCTGTGTCGTATGTGATGCTCCCCGGTGCTTAGAGATCGTTG:1	+	chr3R	17316348	3'	-	opus	7115	2	76.60
TATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTATTCTTGACTCTTTGCCGCTCTTAAAGCAACTATATCGACGCATATGGAGAGTGTGGGCACCTTGGAATCCAATAGAACCAATC:1	-	chr2R	6131029	3'	+	Cr1a	4197	1	54.10
GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTG:1	+	chrX	11296466	3'	-	BS	5066	1	67.12
CGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGAGCCGACATATACATATGTAATCGTTAACTTCATGCACACGGGAACACTGTCACGGACGCCATGTAATGTTTGAAATCTAGGAGAT:1	+	chr3R	1330071	3'	-	invader4	119	2	68.33
AAACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTAAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCCCT:1	-	chr3L	24565353	3'	+	hopper	1412	2	45.71
AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCATTAAGTCAGGCCACCTATTTTTTTTATTTTCTTCTTGGACTTCTTCCAGAAGCTTT:1	-	chrX	10253170	3'	+	hopper	1391	1	62.20
TTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAA:1	-	chr3L	7292480	3'	-	HMS-Beagle2	64	2	72.31
AATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAGGATTTGTTTTGTTCAGGAATATTTTCAGAAAAGTGAGCACCACGCTGGATTGTGAGTTTTGTT:1	+	chr3L	2719670	3'	+	P-element	452	1	37.41
ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTCCACCGTCTCTCAATTGCCGCTAACCGAGTGATGCTATCTTGACGCACAG:1	-	chr2L	23313657	3'	-	S-element	64	1	61.64
CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAGATAATAACATTTAAATCATATAATTCCATGAAA:2	+	chr2R	20497053	3'	+	blood	7372	2	63.70
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATCCCGAAACATTAAATTGAATAACAACTTTGTGAATTTTCTATATAAGAAAGAAGT:1	+	chr2R	6086415	3'	+	pogo	2039	1	60.96
TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAGCAGCCCGAAGTCGAAAAGCGGTTTTTTCCTAC:1	-	chr3R	14979753	3'	+	pogo	2071	1	62.33
AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCAGTCC:1	+	chr3L	22400373	3'	+	1360	3342	1	52.74
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGCACTTCTCTTTTAT:1	-	chr3L	11393463	3'	-	roo	47	2	54.11
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAG:1	-	chr2R	24218506	3'	-	412	7091	2	55.71
AGTCGGGGAACTCGACTATAGAATTCTCTCTTTTGTTTTTATATTTGATTTGGTTTATTTTGTGAGAAATCAAAAAGGAAAGCACAACATCTGGAATATGATGACAGGCGCTGAAGTGTGGTAGTACTCCTCATCCTGATCGGGCA:1	-	chr2R	18626642	3'	+	INE-1	567	1	58.22
TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGCACTCTTCAATGGTCCAAACACAGACAGAAGTCAGACAGAGCGCATTCAAAATCAATTCAATTGAAAAACATTTTCCCCCCC:1	-	chr2L	1377603	3'	+	hobo	2923	1	68.55
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAG:1	+	chrX	23291029	3'	+	P-element	2495	1	77.88
CTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGAAGAACGGAGGACATTCGGAAATTAAAAAATACTGAATGGAATCATGTTAAGTCAGAGGATATTCCAGCAGATTTAGCATCCAGGGGA:1	+	chr3R	19446474	3'	-	297	6562	1	82.73
GACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGCGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGCGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGTC:1	-	chr2L	12290695	3'	-	1731	90	1	74.31
CAGTGCTTTGCGGATCATTTAGCTTGAACAAAAAATCATGATTTAATATAAGTTCAAAGTAAAGAAAGAAATCCCAAAATCCATGTGTTTTATTTTTGACTAGACAGTGCTTTTAACGTTTCCCGATAATTCCGG:1	+	chr2L	18115257	3'	-	Tc1	466	1	78.52
GTTTACATATTTATATTTATGTTGATAATTATTTATGTGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGAACACCACGGGGAGGCCATTACGACAGTTTAGGCAAATAGAGCCATAGTCATCAGAGCACCTTCATAGCCATACAATTA:1	+	chr3R	18624344	3'	-	1360	2961	1	60.96
GATTCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAAGATAATAGATTTTTTCTGTTTAATATTTCAGGTCAATACAAGAAGAACTAAGTGTGCTGGCTCATATTTCAGATAACATTCGCGCCTCAGCTAAGCCACTTTCCGA:1	+	chr3R	1588348	3'	+	Doc3-element	4630	1	74.66
CAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGATCATAAGATGACAGTCCATGTCCCTGTCTGTCTTCCTGTTCCTCCACATCTAGTTGTTCGC:1	+	chr3R	16519897	3'	-	1360	3333	1	53.39
CTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTATCTTTGTGAAAATTAAATTTTTTTCAATATCCATCGTTAACATTCAATCAAGTTTTTTGAACTCTTCTACTCAGTGTAGGGTAGTTCAGCGTCACACAAGCAAAAAACTGTGT:1	+	chrX	716458	3'	+	INE-1	562	1	54.11
ATTTGACAAGTTGTGCAGGATGCATGGTCGAAATTCCCCCCAAGCGTTGCCAGGACCTAGTGGACACCATGCCGCATGGGTGTAAGCAAAAACACTAGAATAACAAGATG:1	-	chr2R	1982176	3'	+	HB	1225	1	78.18
AGATTTGAAAACCAACATCCAAGAAGAAATTTCCAACATACACACTTGCTATGCTAACAAGAGTCACTCAAGGCTCAAAAATCTCAAAATTCAGGACGTTCTTTATTCCCAGTTTAAAGTTGAATAAAATTAG:1	-	chr2R	2118759	3'	+	mariner2	655	1	52.63
ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCACTTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCT:1	+	chr2R	2427617	3'	-	Doc	65	1	63.01
TATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGCGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTAGGTAC:1	-	chr2L	14110721	3'	-	Quasimodo	34	2	63.24
ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGTTCGTAGGCGCTCAGAAGTATGAACTATATTTGTGTTTTTGCGGTTTCGCTTTG:1	+	chr2L	15991451	3'	+	mdg1	407	2	74.66
TTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTCGGCTCGGTGTAATAAAGCATTAAAGATGAAGATGTATCTCTTTTCTGGTTCAAATATATCTGTGACCATGCCTGTATTCTGCA:1	+	chrX	21668287	3'	+	gypsy2	191	2	54.26
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCG:1	-	chr3R	14364600	3'	+	roo	358	2	60.61
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAA:1	-	chr2R	23802958	3'	+	roo	8998	2	70.34
GGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCTTCTTTGTGGCGACACGC:1	-	chr2R	7586124	3'	-	I-element	5045	1	70.64
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTAACAACACTTAAACCTCTATCTATTCTCATCACAATCATCACTATCAT:1	-	chr3L	2301816	3'	+	roo	356	2	63.25
AAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGATAGCAGTTTGCACGTAGTGTAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAGAGAGTT:1	+	chr3R	26776851	3'	-	Cr1a	362	1	85.00
CCCAAGGCGGATGTAACATGATCGTACACTTGAAGGCTACTAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCCCACGCCGACCAAATGCACAATACATAAGACCATAGTTTTAGTTTGTGAATTTTCGACATTCGG:1	+	chr3L	3826324	3'	+	412	7161	2	70.00
CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATT:1	+	chr3L	10574396	3'	-	Tabor	6882	2	47.26
ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATC:1	-	chr3L	27415240	3'	+	transib2	2767	1	72.41
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAAACAGCTGGCAGT:1	-	chr3L	22437814	3'	+	roo	394	1	73.97
GAGAAGTTAAAAGAGCTAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAACTTGTATGTTATTGCTTGTATTTATCAACCAAAAATCGAGTGGACAATCGATATCTTAAGTA:1	-	chr3R	21831949	3'	+	P-element	2461	1	43.45
TAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGCAAAGTGAAGTTCTTACAATTATTGACTATAGTAATTAAATAATATTAAAATGAAGACGATGGTCTGACGCCTTTGCACATGGCCATTCGACAGAACAAGTA:1	-	chr3R	9044969	3'	+	Doc	83	1	62.40
AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATTTGTGGC:1	-	chr3R	7482698	3'	-	412	13	2	73.33
ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAG:1	+	chrX	17963939	3'	-	jockey	4837	1	70.55
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCAC:1	-	chr3L	6978139	3'	-	pogo	62	1	63.01
GTAAAGGGTATCTGATAGTCGAGTAACTCGAGTATAGCGTTCTTTCTTTGTGCAGGAAACCCAGCCAAGTGATCGCCAGCGAGCAGCTGCTGACC:1	-	chr3R	5850719	3'	+	INE-1	551	1	61.05
ACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGC:1	+	chr3L	17205275	3'	-	hobo	44	1	63.39
ATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCAATAAATTGACTAAATTATGTCATTTTAAGCGGTCAAAATGGGTGATTTTCCGCTTTCAAGTACCAGGCGAACAGAAGATACCTTCTAGAGATTCTGTTCAACTGGTACGCAA:1	+	chr2R	4341	3'	+	Copia1_DM	25	1	78.08
GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGC:1	+	chr2L	6570037	3'	-	jockey	4841	1	50.00
TTCGATTTCAATTTATTTGTTTATACAATATTTTATTGCCACTGCTGCTGGCGTTGTGGGAGTCTAAACCTATTGAGGGTGGATCTCTGGCAGCTTGTTCTGCTCTGGGCC:1	-	chr3L	5635598	3'	-	Doc2-element	95	1	51.35
TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCG:1	-	chrX	13504155	3'	-	412	67	2	62.33
ATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCTTGACGAACGCCGGCAGGCACGTTTCCACGCAAAACCGATTGAAACTGAAGACGC:1	-	chr3L	6334835	3'	+	F-element	157	1	64.62
ACCTATGACTACTTTCCTTAAGATCATGGGTCTTGGGGAAGTTTTTTTTACATTACAATAGTTTTATATGTGAGCGCTGCTGTCGCTGTTGCGAGCCTTAGCAATATTTCATTGTGATTACTTAGGCATATGAAT:1	-	chrX	22826589	3'	-	Gypsy12A_LTR	1941	1	74.81
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATG:1	+	chr3L	12861805	3'	-	pogo	57	1	63.97
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAAAT:1	-	chr2L	12892598	3'	-	roo	8701	2	55.07
TGAAAGAAAGGGCAGACTAATCCGTGGTAGTAGAACACGTTTTATTCTGGAAGAATTCAATGTTTCACAATTGCAACTAACTTAACTTATTATCCGCCAGGTTTTGGAGGGACT:1	+	chr3L	22279383	3'	-	aurora-element	37	1	79.82
GCGTCACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAACATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACATCGATTTGTCAGGTCAAAAAAGTAGATATGTATAAGCTGATTAGGAGAAGGAAAAGTGCTCGAGAGCC:1	+	chr2L	5497365	3'	+	gypsy4	6423	1	52.74
ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATC:1	+	chr3L	17560396	3'	-	pogo	46	1	53.42
GAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTACATTACGTCCTTAAAGTTTTAAAATAAATCATAAGACCCGCCAGTTACTGTAAT:1	+	chr3R	13237384	3'	+	3S18	306	2	54.39
ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCAGCAGCCACAAA:1	-	chr3R	12886876	3'	+	roo	9026	1	55.17
GAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTTGATTCGTTTGCCGTCTATATATGTAAGTCTGCCTGC:2	+	chrX	12074641	3'	-	412	7170	2	54.79
GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATGCCTAAATTCCTCGGAATAACTTT:2	+	chr3R	25454152	3'	-	Quasimodo	9	2	65.75
CTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACATAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAG:1	-	chrX	12649915	3'	-	jockey	162	1	80.77
CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTAGCCAGCCAGTTCAGTTGATTCTTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCGCCAATCGAAA:1	-	chr3R	14364590	3'	+	roo	9031	1	51.88
GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACGTGTTGTGA:1	-	chr3L	18596612	3'	-	Doc	54	1	57.69
ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGACTGAGCTCAGTTCTCCGGAGAGCACTCGTAGCACACAGTGAGTT:1	-	chr3L	13614137	3'	-	blood	7179	2	91.43
ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCAAGGGTAAATAAGATTCGGCTTGCCACAGCCACCTTCCTGTCAGGTGATGGTTATTTTAGCAGTATATTAAAAAAAAATAAATGAAACGAAACAGATAATGCTTTACATTTAC:1	+	chr2L	10986935	3'	+	1360	3387	2	80.00
TATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATA:1	+	chrX	5437561	3'	-	Quasimodo	58	2	58.90
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCATA:1	-	chrX	9540001	3'	-	roo	19	2	62.61
TACATTTAAGAACCTATGTACTCTTAAGAACAAAACACTTATGTACAAAACAGAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCAAAAGAATAATCGAGCTGAGATGTGTGCGCCAATGGTGTAAGTACGCGTGCCAGCCAGAGT:1	-	chr2R	6858716	3'	+	Tirant	8305	2	62.22
ATTCTTTATTTTTCCAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCT:1	-	chr2R	20944360	3'	+	pogo	2016	1	78.72
CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCATGGCTCTTAATTG:1	+	chr2R	9791696	3'	+	412	470	2	64.00
GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTGGACTCTTTGCCATCTGAAAAC:1	-	chr3R	10182076	3'	+	blood	365	2	74.81
GGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGC:1	-	chr3L	2325713	3'	-	I-element	5142	1	65.07
AAAAATTTACAAAATTGTCCAAAAAGCTTAGTTTATTATATGAAGTAATTAACCCCTAAGCTTCGAGTGAGCATCTCATCTATCATATGATGATCCTTCGTCGAACAGTGCGTATGAGCGAAGTCTGCACGCTTGCACTTGTAGAC:1	+	chr2L	21612103	3'	+	Ivk	5248	1	58.22
ACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGAGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATC:1	+	chrX	7195106	3'	-	P-element	80	1	27.86
GACAAAAGTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTATCTTTGACGGTAAAGTAATATATTTTTCTCATTTATTATCATTGTACGAAAAAAAAAAACACATTTCTCTCACTTGTTTTCGAAGATAATATTTTTGCATAT:1	+	chrX	23004495	3'	+	transib2	437	1	49.30
TGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGTGAGCATTTCCAAAAATTAGTTTATATTTATGATTTTAA:1	-	chr3R	22276068	3'	-	jockey	4957	1	73.29
TGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTTGATTTTAACTATGGTTTTAATGTTAGAATTTAATGTTAATAACCAGCATAAATCTATTTTTAAGTATTATTGTGGAGGGTTACAGCTACTCATC:1	+	chr2R	15288229	3'	-	hobo	481	1	75.78
CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAA:1	-	chr3L	27415200	3'	+	transib2	2777	1	53.42
ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGCGTATCCATGCCTGCGGTCCTCTGGAGACTAAAAGATACAAATGCAG:1	-	chr2L	18338975	3'	-	pogo	71	1	66.44
ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAA:1	-	chr3L	23146467	3'	-	1360	57	1	55.48
CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAA:1	-	chr2R	16891812	3'	+	hopper	1398	1	66.10
AAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACCAGCAGTAACAACAC:1	+	chr2L	9564541	3'	+	transib2	2820	1	70.59
TATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATC:1	+	chr3R	25448418	3'	-	roo	1	2	65.67
AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAA:1	-	chr3R	27424852	3'	+	blood	7334	1	62.99
CAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTATAG:1	-	chr3L	10056087	3'	+	transib2	2777	1	51.72
AAAATTAAAAAAGAAAAATAAAAATAAAAGAAGACAACATTTTTTAGTAGCCGCCGGCGGAGAAAACAGCAATTAAATGCACATTTAAATAAACAAATGGCATGCTGTAAAATAATTTACCTTTAATCCTAACTTTTATTGTAAAA:1	-	chr2L	12456715	3'	+	Doc	4698	1	73.29
ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATCTGTTTGTGAGTAACCACTGTAT:1	-	chr3L	6978134	3'	-	pogo	56	1	59.31
AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTG:1	-	chr3R	21276521	3'	-	BS	5045	1	50.68
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACTCCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAA:1	-	chr2R	20596452	3'	+	roo	351	2	56.16
ATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATAGATCTAGATAGGGGTCTTCCAACGTGCAAATGACTACTACGTCAACTACCAATAGGTTGAAGTAATTCTGTT:1	-	chr2R	25118615	3'	-	roo	8664	1	80.82
ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAAGTCACGCCCACTTGACTTCTT:1	+	chr3R	20005124	3'	-	297	6619	2	54.62
GAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCGCAACATTTTTAGTTTATTTTTTTTTATTTCGCCTATCTGGACTTTTGAAGGCCAAAAACCAGAAGGTGGACGGGAGTAAATA:1	-	chr3L	12977150	3'	+	jockey	4824	1	64.96
GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCCGACGCTTTTCGACAGCCGAGCG:1	+	chrX	7195129	3'	-	P-element	37	1	51.67
TTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTA:1	+	chr2L	14892284	3'	-	transib2	85	1	76.71
CGTTAATTATTAGTTTTTGTATACAAAGTACCTTCTACTTTAAAATCCATTTTATAGGAGGACGGACGGAAGAATATGCGCACCTATCAAAAGGTCAATCTGTGAACGCTGAAAAAATAGTGGATCCGCCAAGGGAATATTTGAA:1	+	chr3R	3853327	3'	-	Transib5	305	1	63.45
AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACATTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTA:1	-	chr3R	14651223	3'	-	P-element	76	1	29.20
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGA:1	-	chr2R	8585429	3'	+	roo	343	2	61.64
GGAGTCGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAATATAAAATCAAACTGAACTTAACGTTTCTTCGATTTCCATGTTCGAAACATTATTTTTATAGGAAACGCTGTTGTTGTAAGTACTCGACACAAATACG:1	-	chrX	23439075	3'	-	gypsy6	190	2	54.48
GCTGTGGACCGTTATCCATTTTCAAAAAAAAACGTACGCTGGCTAGCAAAAATGAGATCCACTGTTGTCCCTCAGGATAAAATTTTGGCAGAGTTATATGTTTTCCCCATTCATCAGTTGCCGATGCCTTTGGGT:1	+	chr3R	1167807	3'	-	G5	408	1	65.93
ATAGTCGGGGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCA:1	-	chr3R	23020798	3'	+	INE-1	565	1	59.69
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCT:1	+	chr3L	17560384	3'	-	pogo	47	1	54.81
TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTAAGACGTTCCCTACATTAATCAATAATTTATTTATTTTGAAATAAAACGTTTAATCCGGCTTT:1	-	chr2R	15064297	3'	+	412	474	2	73.29
AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCAAAATCAATATTT:1	+	chr3L	3477533	3'	+	mdg1	377	2	54.79
ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATTCTATTGAAATTTTTCTATCTTACTCCCACCAGACGTGTAACATATTTTAATTGCTTGAAGATTGACTTTCGCTCGCATCCACAGG:1	+	chr3L	21384	3'	-	Quasimodo	37	2	60.27
TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCC:1	+	chr3L	10648021	3'	-	412	36	2	48.63
AAGCGAACGGTCGTGTTTTTTCCGCGCTTCGTGGCAAAAATTTATTTTTTCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGAGAAAAATTGAAAGTGAAGTGA:1	+	chr2L	4981859	3'	+	Cr1a	11	1	42.47
GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTGCAATTAGACAACCTTCGTTGTCCACTAAT:1	+	chr2R	19540501	3'	+	jockey	4979	1	70.00
CCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGCGTACAAAATTACAGCAGTTTTA:1	+	chr3R	11547836	3'	-	G2	280	1	80.82
TAGGTACGTTGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACGCGACGCGAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGGGTGTTTGAATATATTTCGAACTAGTAACGACACACCCTA:1	+	chr2L	7198733	3'	-	G6	126	1	66.37
ATTGTANGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAATAGGGTAATGAAACATGGTAAACGAGAGGGGAACGGGAAGGAGGAAG:1	+	chr3R	22122829	3'	-	roo	19	2	70.83
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAG:2	+	chrX	5274396	3'	+	roo	9017	2	56.85
ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGG:1	+	chr3R	29361038	3'	+	mdg1	7379	2	73.97
TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCC:1	+	chr3L	21855544	3'	-	blood	7064	2	54.79
TGTTACAATTTATTTATGATTTAATTAAAAAGCGGCGGCTNACGCACACACACACAAACACAGACGCGCATAGGCAGCGTCGCCCGG:1	+	chr3L	7911728	3'	-	Fw2	80	1	86.21
CCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTGCATTCGGGCATAGCGGCAACATACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACG:1	+	chr3L	2485994	3'	-	jockey	4543	1	37.50
CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTACCAGGAAGTATTCCCTTTCATTGTGGAGATACAAATATAGTTCCTTGCATAAGCACCATTTCCCTTAGAATTCCTCCTTTAGTTTCCCATAGATAACTTTCTTCC:1	-	chr3R	14035322	3'	-	1360	17	1	63.01
CGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCTGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGGTCGGTA:1	+	chrX	21667981	3'	-	gypsy2	23	2	72.92
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGNCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACAATAACAGTATCTCTATCCGCATGTACAGCATCTGTACTACAGATC:1	+	chr2L	18419252	3'	-	412	7084	2	49.21
GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGATTTCATGCGAATCTATATGTGCATATTTATACACATTTGTACACTTGAGCAATTTGGCAAACAAATCATTATTATTTCATCAAATTTGTCATTGATA:1	+	chr3R	28946450	3'	-	hopper	22	1	69.18
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGCG:1	-	chr3R	22821994	3'	+	mdg1	365	2	57.53
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTAACC:1	-	chr2L	16091861	3'	+	roo	9044	1	62.33
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATC:1	-	chr2R	14542137	3'	+	roo	394	1	60.00
AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCATGCCCATCCTTCGTAGTTTTCGTCGCTATTCAACGGC:1	-	chr3L	18368866	3'	+	opus	488	2	76.39
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAAGGTGTTTAATGAATA:1	-	chr2R	13121952	3'	-	pogo	20	1	59.59
TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCAT:1	-	chr3L	10056101	3'	+	transib2	2773	1	57.78
CGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATACATATTAATTTAGAATTTGTAGAAATAATAAATTTATTTACCGAACACGATTTTAAAT:1	-	chr3L	19339317	3'	+	Tc1	1612	1	51.82
ACACACACACACACACATATGCGCATATGTACGTGAAATAATTTTCCCCGCTTTTCCAATTTACTTTCTTGCCTATTCACCTCACTTTGTTGCACATGCTGGAGCAGAAAAAAGCGCAGATAAGTCTCAAATTGCCTACTCTC:1	+	chr3L	3263686	3'	+	accord	185	2	81.12
CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGGCGTGGTCG:1	+	chr2R	2016933	3'	+	1360	3378	1	72.07
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTC:1	-	chr3R	7835136	3'	+	roo	325	2	75.34
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTC:1	-	chrX	5643452	3'	+	roo	9033	1	58.22
TGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAG:1	+	chrX	21667940	3'	-	gypsy2	35	2	57.39
ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGAATTTGACGGTGCGGAG:1	-	chr3L	15490324	3'	+	copia	186	2	64.38
GGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGCTGCTGTTGCTACTGCTGTTGCTGCTTCTGCTGCTGCTGTTGTTGCTGCCTC:1	-	chr3L	11224185	3'	+	gypsy12	10021	2	60.82
ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCTCTGGGTGGGTGGTCCTTTAAATATTCAGCGGTTAATGCTCAAAGAAAAGTTGAATTAATTATTCGTTTCGGGCAT:1	+	chr2L	11674446	3'	-	jockey	31	1	65.00
ACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCCCTGTTTTCCGAATGTGGCTCTCTGCCCTTCCCC:1	+	chrX	22715189	3'	-	Bari1	20	1	71.23
AACATATTTAACAATTATTTCTTCAATGTCAACTTGATTGAAATTATTATTCTCTGTGTATTTGGGTTAAAAGCACCAACTCTTTAACTATTTTTTGCTTTCATTTTGCTCTACCTCACCCTATCTCCCTTTCACTCTATCTCTTT:1	-	chr2L	3105887	3'	+	frogger	327	1	76.03
GAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCATTTAGTAGGTGCTTGATCAATATTTATTT:1	+	chr2R	18336179	3'	+	roo	70	2	79.45
TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATCTATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGGAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTAACTTTGACCCCCTTTTCATTGCGGCACTG:1	+	chr2L	16067205	3'	-	297	6607	2	62.32
AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTG:1	-	chrX	10521647	3'	-	Tabor	6903	2	65.65
AATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAAAGTCCACCACATTTACCCTTTAAAATTGCCAATCTACACGTTTTGTTG:1	-	chr2L	3886435	3'	-	roo	9066	1	66.21
ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAATAAAAAAAATAAATAATCTCAATACCAAAAAGTTCTAGTGAAATTCACAATTCTGACTTGGAAAGTGAAAGTTTGGCCATTAAACGTACGATTAAAATCCACAACAGCAC:1	+	chr3L	3249751	3'	+	Juan	4195	1	72.41
GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTG:2	-	chr2L	6569944	3'	+	jockey	4928	1	63.70
TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTA:1	-	chr3R	14364621	3'	+	roo	323	2	78.77
AATTGAAGAGAGCCGACGCTCGTCTTGTTCACGCTGACGTTGCTCACGAATTTCACTGATTTTGTGATTTATTTATTATTGTAGTTCATTATACACATTGGAGAGCAACACGAACCCTAACGAAAGCTTTTAAGAATGAGAAGG:1	+	chr3R	3190475	3'	-	Doc4-element	39	1	79.17
ATTGTGAAAATTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACC:1	+	chr2R	2879456	3'	+	Stalker	6917	4	64.38
GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGT:1	-	chrX	5629130	3'	+	jockey	4912	1	71.23
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATCGCTGGAAATGTTGGATGGG:1	+	chr2L	3114564	3'	-	roo	8738	2	68.49
GGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAATGGAATTGGAAACGAAATTGAATTTGCCAACCATTAGGCGAGTATTTCATTTCAAGTTCCTTA:1	-	chr2R	16912671	3'	-	jockey	4945	1	56.85
CAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGGAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCG:1	-	chrX	4214931	3'	+	flea	5012	2	72.63
AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGG:1	+	chr3R	14940157	3'	-	jockey	75	1	71.43
ATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTGTGGACACCCTTGTAATGATAAAAAACACTGTTAACAGAAAACGTAAAAATAAAACGTTCTAATAAAATAATAAATGTGCAGATAACGGCCTTATACAA:1	+	chr2L	6564767	3'	-	jockey	4862	1	68.49
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATG:1	+	chr3L	9998179	3'	-	roo	74	2	72.66
TCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1	-	chr3L	23112567	3'	-	R1A1-element	49	1	71.23
AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCA:1	-	chr3R	30344613	3'	+	pogo	2078	1	57.41
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAATT:1	+	chrX	8543554	3'	+	roo	9028	1	53.15
CAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATT:1	+	chrX	6279403	3'	-	P-element	64	1	22.02
ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTT:1	-	chr2R	10582368	3'	+	Juan	4167	1	52.05
AACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTGTCCACAG:1	-	chr3R	3177915	3'	+	Stalker	313	4	82.46
GAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTG:1	-	chr3R	9038917	3'	-	Juan	4023	1	64.22
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTTTGTGTGTTCTTACACA:1	+	chr3R	20427505	3'	-	jockey	36	1	63.70
AACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATT:1	+	chr2L	21153543	3'	+	1360	312	1	67.81
CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTG:1	-	chr3R	25339977	3'	+	mdg1	7390	2	64.38
CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAGCTTGGCAGGTAAAGTGAAGCTTGTAATAAAAATCAC:1	+	chr2L	12483837	3'	-	P-element	49	1	51.72
TATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCCCCCACCAGGGTCCTCCTCTTCACTACCAACCCCTCCTCCCCCCTCCACATTCCACTGCTTTTGCTGGCAACTTTCTCGCTTTTCTGTTTAT:1	-	chrX	8938321	3'	-	flea	285	1	69.49
GAAAAAAATATTTTGGTAAAGGACTACAAATTCCGAATACGATAATGTAAGGATGTACTTTACTGTATTTGTGTCACATCACAAAACATCCATAAATATTTTTGTCATTTAGCCCCCGGCAGCGGC:1	+	chr3R	6972905	3'	-	FB	406	1	58.73
GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGAGAACGCATTGAATAGTCTGACAAACCCTAGGAAAGCCTTATACGCCAAGTTGTAGTTTTGGAAACC:1	-	chr2R	9253582	3'	-	3S18	5805	2	58.46
TCTACTTGGAATAGAGAAGTTATGCCGATTAACCAAGTCGGGCTCTCAACTTAACCACGAATAAGCTTACAAACAAAGACTGTTCCAAGCATCGTTCTATCGATAGCTAGGGTAACAAAACAAGAAACATATAACAACTAAATTT:1	-	chrX	8775617	3'	-	Cr1a	4099	1	77.24
AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCATTATGTC:1	-	chr3L	7588413	3'	+	hopper	1391	1	55.88
CAAAACAAAAAAAAAGGAAAAAAGTGAAAGGAAAGCAAAAGGATGAAAGGGCAGCACATATCCAAAGGATATGCCTCCTCGCATCACGTCCTCCGTCGTCTCACACATGTGC:1	-	chrX	6494791	3'	+	Doc2-element	228	1	91.07
CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGTTTTTGCATTTACATTCTAATCAGCTATTCAACTACAATTAT:1	+	chr2L	17079876	3'	-	jockey	4688	1	72.18
TTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGG:1	-	chr3R	13457927	3'	-	X-element	77	1	72.50
CACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTTCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTAATCAAAAATGGAAAG:1	+	chrX	22643335	3'	-	Tc1	1613	1	47.26
GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTTTTATTATTAATAACTAATATTACTTCAGCTTATCATCGATATTTAG:1	+	chr3L	15177358	3'	+	roo	402	1	76.98
ATCGTATGGCGTTACGCATCTTTCTAGGGTCTTTGCTCTTGGATTCCACAATACGCAGTCCACTCGGACCGCATTGAATCGGTCCAAAAAAACTTCTTACTTTTT:2	-	chr2R	2007459	3'	-	1360	19	1	61.90
ACCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTA:1	-	chr3R	14651223	3'	-	P-element	85	1	27.40
GGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAG:1	+	chr3L	14944610	3'	+	G5	4758	1	75.38
AAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACAATTGAAGAGAACACGTATTCAGTTTGCCAATTAAAAG:1	+	chr3L	10583172	3'	+	Tabor	374	2	74.66
TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCAATGGGCCAATGGAGGAGCCTCCTCC:1	-	chrX	18193625	3'	-	jockey	26	1	67.65
ATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTG:1	-	chr3L	23603182	3'	-	F-element	85	1	74.42
TGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATC:1	-	chr3R	26659754	3'	-	HMS-Beagle2	6946	2	61.64
GAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTAATTGACCGCAAATTTGCAATTAATTATTTGATTGAAAACGAAAAGAGATTGATTCGATGATGATGTCGGCAATGTAACCCCAAAAAGCGTTTCAGCAAACTCGGAATA:1	+	chr3R	27731982	3'	-	Doc2-element	423	1	69.86
ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGA:1	+	chr3R	22822114	3'	-	mdg1	7080	2	53.78
CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAA:1	-	chr2L	4412555	3'	-	Quasimodo	48	2	58.46
CAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATATATACACGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGAATATTCTCAGATAATCTTGGTCATGTCAGTC:1	-	chrX	22715002	3'	+	Bari1	1688	1	69.66
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACCAATGTGTGTCTTATTTTATTTTATTTTATATTATTTTTTTTTTAGATTGCCATGGTCGCCAGTTTTGGGGG:1	-	chr2L	7898277	3'	-	roo	48	2	54.79
CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAA:1	+	chr2R	5485192	3'	-	blood	7075	2	68.46
TGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAA:1	-	chr3R	26659740	3'	-	HMS-Beagle2	27	2	56.45
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAA:1	+	chrX	5274380	3'	+	roo	357	2	62.70
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAAC:1	-	chr3L	11441734	3'	-	roo	8720	2	65.93
AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACGTTATTCTCGTTTTTGTTGTTGTAACTGTGGCAACACACATTATTTATATTTATATGCTTATTTTATAGTTTATTCATGCAAATTGCAATAAAAATTGCCTTTATTTTAC:1	+	chr3L	2841049	3'	+	copia	245	1	76.55
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTA:2	-	chr3R	18582150	3'	+	roo	9006	2	63.01
TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCACATGCAGTTGGCGAATAGAATTATATTCCCCTGCTCTTTGTTGTTATT:1	-	chr3R	12717704	3'	-	297	6597	2	72.09
GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACTGGGACACCATTTAAAACAAAGACAAATTCGCACTTTCCCCAATGCATTCCCAAAATCTCCCCCCATTTACATTCACATTTCACTTTTGTGACATCTCTGGCGAAAAATG:1	+	chr3L	18555463	3'	-	jockey	4746	1	76.39
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTAAAGGCAAGGTTCCTAAATTGCTGGAGGGAATAAACTATTCTATTTTCTAAAAATACTTCT:1	+	chrX	2934852	3'	+	pogo	2046	1	59.44
GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGGAAGCTTAGAATTAGAATTATTTTCACGCATCAAATGGTGAATTTTAAGCATACACAGCATATAA:1	-	chr2L	17607595	3'	-	hobo	56	1	54.79
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCA:1	-	chr2L	7945309	3'	+	roo	353	2	56.85
AATTATAAAAATTATAAAAAAAGATAATTTAATTAGATTTATTTCAATATTCCACTAGATAGAATAATTATCAGAAAATGTCCAATTTTGTTGTAAATCTCTTCTAGATTTACTGATTCCTTATTGGACTTGGTTGTTCTTTGTCT:1	+	chr3R	19584530	3'	+	Doc	4691	1	63.01
GCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAATTT:1	+	chr3L	24916726	3'	-	Porto1	147	1	38.36
AACAACACACACACACACACATATAAAGCAGCGCGTGTAGCCCTTTTCGTGTTGGAG:1	-	chr3L	5750327	3'	+	accord	7027	6	87.72
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTCCGCAGGC:1	+	chr3R	7835218	3'	-	roo	58	2	58.22
AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGGGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1	-	chr3L	25232774	3'	+	accord2	127	2	70.71
GTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAGACATTCAGCCGGTTTCATCGAAAATCACTTTGGTATTTTTGGGGAAATCATTATATTTAAGAGGCACATTCCGGCAAACTATCGCTTTCATTCT:1	+	chr2L	2702945	3'	-	hobo	2592	1	65.75
TGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTCCAATTAAATGTCAATATAGTTAAATATTATTCATTTTCCAAGTGGCTCGCATAAA:1	+	chrX	17855769	3'	-	BS	5064	1	70.55
CACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATGGCGACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGGTGTGCCTATTATATTCAACTGATGACCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAGACACAAG:1	+	chr3R	178126	3'	+	Stalker2	396	2	44.52
GTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGATGGAACAAATAGGGGAAAGA:1	-	chr3L	4840720	3'	-	jockey	4730	1	54.79
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACT:1	-	chrX	9540007	3'	-	roo	8718	2	59.03
AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTG:1	+	chrX	14749720	3'	+	copia	245	1	73.04
AACTAGAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCACGTGAGTGCGTCTCGCTCGCACCCATGGGGAGTTG:1	+	chr2R	11629824	3'	+	Tirant	8455	2	62.83
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCGATAATATTGAGAACCTTATTGTCC:1	-	chr3R	19445763	3'	+	roo	319	2	79.45
ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTTCTG:1	+	chr3R	16933805	3'	-	17.6	6965	2	59.26
CAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAAAATTGATTTCGGGCCGGGAAAGGCAGTGGTATCAACATACTTTGCATACTCCGGGTCGCGAAATGGGGAGCACACTTCAATGGTCATGTTAC:1	-	chr2R	6065019	3'	+	1360	3137	1	57.55
GTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1	-	chr3L	23112568	3'	-	R1A1-element	7	1	60.19
TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGAT:1	+	chr3R	22822153	3'	-	mdg1	14	2	51.54
CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTTCGAAACAGAGTTAAATT:1	+	chr3R	12717860	3'	+	297	6940	2	62.33
TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCGAGAAAGGCTTTTCACTTGTTTTTTATCTGTGGTATTTAGACATAATACGTTTAGGAACCGTG:1	-	chr2R	6885262	3'	-	flea	23	2	69.86
AGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATAAATCACAGAGCTACTAGTGATATCTACGTGACAATCGTCAATGAGGCAGTTACTCGATCTTTGGCACAGTGAGCTCCCTAAACGGCGACCCCTTCGCCGGCGTTAAT:1	-	chr2R	10072018	3'	-	Circe	8	2	56.20
GCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGAGAAATTAAAATGTTGCTTGATATCTTATGTTTATTTGAATTACATTGAAAAGCGA:1	+	chr3R	10462712	3'	-	opus	7058	4	61.70
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATATGTTTCTCGATG:1	+	chr3R	16076912	3'	+	roo	9043	1	63.01
TCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTCACACGCAGCTTTTCCTGATGTTACCGTGTATATAACACTCAGTACCGAAAA:1	-	chr2R	4478730	3'	-	Chouto	45	1	73.81
GTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGTGACAGAGGGAACACCTACGCCGACTCAGGACACAGGAGTTGGGTCAACGTTTTTGATTTCAATAACAGTAAGTTGCAATTTCTATTCGCCCCTTTGGCGCATTTAACA:1	-	chrX	22765784	3'	-	hobo	23	1	39.85
CCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGTTAAACATCCAATCATTTTAGAAAAATGC:1	+	chr3R	19446966	3'	+	roo	218	2	50.69
ATCGACTCGTCTATTAATCCTGATCAAGAATATCTATGTATACTTTATTTGGTCGGAATCCCCTCCTTCTACCTTTTACATACTTTTCAACGATATAATATTCACAGAAATTATTATATGGGACCACAGTGAATATGTTG:1	-	chrX	22633246	3'	-	INE-1	95	1	62.14
TGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGTAAGAGATTTTAACTTTTTTTAATCCATAATTAGATTCTACTAACAATAATATTTATTAGAGTTTTTGCATTATATTCATTTCCTCACTTTTGGGCAACACTTTTAAATGTTCACA:1	+	chr3L	22933967	3'	+	Cr1a	4232	1	75.34
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGGGCACTTGC:1	+	chr3R	22844244	3'	+	roo	9009	2	83.33
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTT:2	-	chr3R	18339106	3'	+	roo	326	2	72.60
TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAC:1	-	chr3L	17558004	3'	+	jockey	4943	1	57.14
GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCAT:1	-	chr2R	24218542	3'	-	412	80	2	71.92
TCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGGGCGGAGTGCTGCATTTATTGGCACCTGCCAAATGTACTTGTGGCTGGTGAGGCGACCCTTTTC:1	-	chr3L	22827545	3'	+	Quasimodo	6952	2	50.81
GGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCATTTCT:1	-	chr2L	21008556	3'	-	invader3	5239	2	66.96
AATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAATATATATGAAATTCAGATTTTATTTTGAGTCGAGCCAGTTAAATAAATATTTCATTTGTTGATGCGTCGATTTTGTATGGTTTTTTTTT:1	+	chr3L	14003592	3'	+	G2	3009	1	61.64
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTA:1	+	chr2L	3114578	3'	-	roo	8696	2	57.63
CATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACGATTTCTGGTTAAGTCTTTAAAATTAATCGGAATAGGAAGCACCTGAAAGTGCCATTA:1	+	chr3L	9588809	3'	+	rover	20	2	61.64
ATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGC:1	+	chr3R	3286148	3'	+	gypsy12	9833	2	75.00
TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTCCTTATTTTGAACTACTTATTGAGCAGTACTGCACCCACTGTACGAACACAAGTTTCCGATTCCGGCAGCGGTG:1	+	chr2L	12250148	3'	+	1360	3382	2	71.30
CTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGATTCAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTTACTATATACATTTATGTACATTGGGTTGCGTTTTAAATTTGAATGGAAATGAACTTGCGACGAGTTCGCAATC:1	+	chrX	3663235	3'	-	297	6772	2	80.71
ATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGACAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAATTCCCTTTAGTGCAGGCACCGTTGTTTAAAAGTTTTAAACGCTTCGTTAATTAGAAAACTTACACG:1	-	chr2R	17902853	3'	+	1360	304	1	53.19
ATATGAAACCGCAACAATGTGTTTCGTTTTAATTTTAGCTCTTAATTTTAATTCTTGTATTCGTATATTTAATTCTTTTCTACCCTCATAAATTTAAAATAAGTTAAGCACACAGATTCTAGTGA:1	+	chr2R	4754753	3'	+	gypsy2	6619	2	72.80
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCA:1	-	chr2R	13585425	3'	-	412	68	2	70.15
TTGTTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATATACAATGTAAATTCGTTTCTTCGACCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATTGGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1	-	chrX	20783463	3'	+	1360	3107	1	64.75
AGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTGGGAAGATGGATGGACTTAGCCATTTTTTCGAAAAGCTATATATTACTTTTCTTTCTGTGTATC:1	-	chr3R	17523989	3'	+	1360	334	1	54.93
CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATA:1	+	chr3L	25401022	3'	-	Doc	41	1	46.43
ATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGTTTCTGTCAGGCCAGCCCGCAGAAAAGTTGACTGTCCTTCTTATGACTATATAAGAAGTTGGACGATAA:1	+	chr3R	10282538	3'	+	HMS-Beagle	430	1	74.66
GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACCCAAGTCTACCCGCAATACAAACACACTTTGGAGACTT:1	-	chr3R	4565285	3'	+	1360	3315	1	72.86
AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGTTGTGGCTTTTTGGCCAGAGCTTCAG:1	+	chr3R	10182221	3'	-	blood	9	2	71.00
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTT:1	+	chr3R	22122778	3'	-	roo	8708	2	63.56
AGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGAGCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGC:1	-	chr2L	2122427	3'	+	Stalker4	7264	4	79.45
TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCAA:1	+	chr3L	25401042	3'	-	Doc	26	1	58.62
GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGCGTCATACGCATAAGACAAGCTCACACTTG:1	+	chr3L	7588521	3'	-	hopper	26	1	61.29
ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTTATCAGTTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGAGATGTTTCTATAACTTTTTTTCCCTGTGTACAATCA:2	-	chr3L	10841405	3'	-	mdg1	9	2	67.81
AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTT:1	+	chr3L	20168461	3'	-	mdg3	5264	1	68.57
AATAAGCGTCGTAAAACATATTCTTATTACTTACTGTGCCAGACCACAAGGCTGTAAGTTAAAAGATTATTCAAAAGATTAATTATTTTTTATAACAGC:1	+	chr3R	3463727	3'	+	Gypsy6A_LTR	216	1	58.59
AAATAACGGGATTCCTGCGTCCTATACAGGGTAGGCGCGAGCACGGATGCGAGGCAGTTAATGAGACAGCAAGATCGCGCACGGAAGACGACAGAGCGTTAATCAGAAAGTGTAGAGTCAGTTTAGAAGCAACGGGAAAGTTAACG:1	-	chr3R	16583552	3'	+	gypsy8	322	1	66.44
ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCACTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAA:1	+	chr2R	5485204	3'	-	blood	7076	2	62.94
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTTATAAATAATTTGTTTTTGAATGA:1	+	chr2R	13122063	3'	+	pogo	2046	1	78.90
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAANTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTG:1	-	chr3L	23603182	3'	-	F-element	71	1	70.43
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTTCTGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCC:1	+	chr2R	11164488	3'	-	roo	8729	2	69.92
CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGG:1	+	chr3R	17243209	3'	+	hopper	1349	1	62.33
TAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTG:1	+	chrX	22386759	3'	-	hobo	74	1	59.77
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGG:1	-	chrX	6486713	3'	-	roo	8733	2	65.75
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTCTTGATTGACAAATTGATATTGATCACTTGGTGAACATTTGAATATAGAAGAATATAACAGTGCTTAAATATTTTTAATATGAACATTCGGAAG:1	+	chr3R	14364731	3'	-	roo	8684	2	67.39
TAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTGGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTT:1	-	chr3R	30486951	3'	+	Cr1a	113	1	75.34
TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCAAACA:1	-	chr3L	7943614	3'	-	Burdock	6197	2	66.43
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAAT:1	+	chr3R	17818001	3'	-	roo	45	2	54.79
TTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTTAACTTTTATACGAGTTTTCATGTTGCCAGTGAAAGCGAAAGAGGTGGCCAATGAAGGGTGGGGGAAGTGGAAATGAAAATGG:1	+	chr2L	2019063	3'	-	Porto1	231	1	52.05
GAAGAACTGGAGTCCCTCGACCCGTAAGCTTTTAGAAAAAGGATCATGCCATCCCTCCCTCAATTAACCCATAGCGCCATTTCAGCCAGCTCAGATGAGATTGTTGTGATGTGCAGTTTTTTT:1	-	chrX	22819330	3'	+	mariner2	321	1	50.41
AGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCTGTAATTTTTATCTTCTAGGGATAATTCCTG:1	-	chr3R	19446007	3'	-	Doc	383	1	75.20
CAGAATGATAGGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTGAGCATCTTTGGCTCCATTGAGAAATTCCTGCTCCTCGTGCTCTTTGACTTGCCGCGTGGGAGAGATAGATAAA:1	+	chr2L	8470683	3'	-	G4	160	1	52.05
TTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTATTTACTACGCTGAGGGGAGTAAGTCAAGCAAGTCATTTTACTAGACCGACTTAATTTTAGCAA:1	-	chr3L	22532208	3'	+	Cr1a	4219	1	78.08
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAAT:1	-	chr3R	25448333	3'	+	roo	9014	2	56.85
AGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAAAAATATTTATTTAGTTTCGAATCGGGTGTGAAGTAAGGGGCACCGAGCTG:1	+	chrX	10201261	3'	-	transib2	18	1	72.18
ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAA:1	+	chr3R	22822156	3'	-	mdg1	27	2	47.95
TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGC:1	+	chr2L	5845076	3'	-	transib2	64	1	62.33
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGCGCATCTCCATC:1	-	chr3R	16404468	3'	+	pogo	2059	1	58.20
TTTGGGCACCTTGAGGTCACGTTCTAAACCGCAATTAGTCGGCGACCCATTGTGAAACTCTGGTGGAGATGTTGGGTCGGGCTCACACACGCACATACAGACAATCAGGACGTGTCTAATGCA:1	-	chr3R	12952290	3'	-	jockey	4597	1	50.41
GAAAAATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTTCTCGTCTCACCTGATCTCAGCCTCATCGTCT:1	-	chr2R	4430668	3'	-	pogo	2008	1	78.08
AGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTATGTGGGTTGACTCAAAGAGTCTGCTGACTTTTGAGAGTCTGCTGGTCATTGAACGAAATTTACCGTGACTAGTCCAAACTGCTTCGAGAGTGTAATAAAAAGAATTTAAT:1	-	chr2L	22716350	3'	-	1360	3332	1	74.66
AACGCATTAAAACCGCCCAAAACAGCCACACCCACATTTTTGGACCATTTTTTCATATTTATTTTCATTATTGTATTAGCCTTGTAAATTTCATTTTATTCCCCAACATTTATCAATATCCCAGAAAAATGATTAAATTTCGCGTT:2	+	chrY	2458276	3'	+	INE-1	344	1	65.07
ATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATGTAAATGAAGTTGAATACAAACATACATATATTCATCGCTGAAAA:1	-	chr2L	10685323	3'	+	I-element	5282	1	72.60
GAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAA:1	+	chrX	14749712	3'	+	copia	252	1	76.00
ATCGGTTGAGTTGAAGAGACTGTTTCGGTTGTTGTTGTTGTCGATGAGATTGCAGTTGTGAGAGAGGCAACCCTGCTGGTAGTTACTGCAGCTAGGCTTAAGAATGTTGTGTGTAATTTGTTGT:1	-	chr2R	18885050	3'	-	Doc4-element	335	1	67.74
ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAAATATAGGTAAA:1	+	chr3R	15072697	3'	+	pogo	2074	1	65.75
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTC:1	+	chr3R	7835225	3'	-	roo	8679	2	68.18
AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAC:1	+	chrY	3648883	3'	-	Transpac	4989	2	68.28
AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTACAAAGGGTGTAGTATTAAAATGCTCTCAGTTAGTTAAGGGGTATATCCAGGCC:1	+	chr2R	7551776	3'	-	1360	70	1	65.07
GCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCTGGCGACGGAGATGGAGATGGAGACCGAGACGG:1	-	chr2R	21360986	3'	+	roo	152	2	72.27
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTCTACCCCCTCAGATATCCGCAATTCAGCGTGCGAGAACGAGACTGCAAAACAAACAAGA:1	+	chr3L	11366785	3'	+	roo	351	2	57.34
ATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACGTACGAATGTGCCTGTGTGCGTATGCAAAGA:1	-	chr3R	28946335	3'	+	hopper2	1522	2	73.97
TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAATCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAG:1	-	chr3L	6978112	3'	-	pogo	34	1	60.00
TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTATTCCCCTTTCGACACGCGCAAATCCACAATGCGCGGAGCTTTGCTTC:1	+	chrX	1026654	3'	-	pogo	28	1	43.65
CCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGGTGTGGCTTTTTGGGCAGAGCTT:1	+	chr3R	10182218	3'	-	blood	7013	2	71.11
CCGGTCAAAATAGTAGACAAAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAAGGTTGGGTAAGAATAATGCCGAAAGACAGCTCGAAGTACCGAAAAATTGTTGACCACATGGACTACCATAACAT:1	+	chr2R	1282400	3'	+	Circe	179	2	78.99
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATTCAATTCAAATATTCTTCACT:1	+	chr3L	10292914	3'	-	roo	49	2	52.05
AGCGAAGGCGCACTTCATAGCCTAAAAGGAAAATTGTATTAGCTTTAAGAATCAGAAACAAATAAAACATTCATTCAGAATTTCAAACTCAACTCCAACGGACGTTTCTCTTGGGATCAATACCACCAAATCTTCACCAC:1	-	chr2R	5039341	3'	+	gypsy11	311	2	60.71
GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGGCCAGCTTTTTATTAAATTTAGAAAA:1	-	chr3R	2461535	3'	+	mdg1	390	2	66.44
GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1	-	chr2R	981623	3'	-	1360	60	1	68.69
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATG:1	-	chr2L	7945311	3'	+	roo	9017	2	57.64
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGA:1	-	chr2R	7898071	3'	-	roo	63	2	67.12
TTAGAGAAATTTAATCTTTTATGTTCACTTGCTGTAACACCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTAGTTTCTGTGTGAGCTCGCTTGCTAACTTTGGATTTGGTTCACAGGGTCTTGTAGCAG:1	+	chr2R	891271	3'	-	I-element	470	1	62.33
TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCG:1	+	chr2R	9791675	3'	+	412	451	2	56.10
ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACT:1	-	chr3R	5061829	3'	-	mdg3	5273	2	63.39
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGACTTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATAT:1	-	chr2L	7888113	3'	+	pogo	2047	1	64.96
TTTCCCGTATGTCATTATGGTCTTGTATGCTACCTGAACGTTGATCGTATTATTCGTCGTGTATCGATGTATGCATGGTTCCTTATCAACGCAAAGACGAATTC:1	+	chr2R	4519601	3'	-	baggins	5091	1	75.96
ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCA:1	+	chr2L	19965040	3'	-	Doc	62	1	66.67
AATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATACTTCGTACAATCTAAACAAGTAATGCCACTGCTAATTTAACAATACTTCAACCAATTCCATAAAATAA:1	-	chrX	17245365	3'	+	1360	3075	1	58.90
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAGTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTA:1	+	chr3L	11441807	3'	+	roo	9024	2	67.89
GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGGGTAGGGCAATCTGCGAACACAATTACACCCGTATTTCGCTAGCAACAAATATCTCATTTGATTCTGAATGCGTGTAAAGTAAACAAGAGATTCGGATTG:1	+	chr2L	22557915	3'	+	1360	3376	1	72.46
AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTGGAAGCCCC:1	-	chr3R	25826656	3'	+	mdg1	369	2	52.05
TATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACACACTATTTGAACGACGCTTTGCATTAAGTGCCTTGAAATACGCAATAGCACTTTCGT:1	+	chr2R	17069932	3'	-	Stalker	65	4	60.96
TGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAAGTAAGCAGATCGGTTAACTTTCTAATGCTAATGGGAAATTTGAAAACTTTTCAATGGAACTACGTATA:1	+	chr3L	13381934	3'	+	I-element	339	1	56.16
ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAAT:1	-	chr2L	18419153	3'	+	412	7467	2	68.49
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCAC:1	+	chr3R	22844306	3'	+	roo	9033	1	57.53
GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCC:1	-	chr2R	2016813	3'	-	1360	16	1	65.42
ATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAG:1	-	chr3L	17558003	3'	+	jockey	4969	1	52.17
AAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAGACATTCAGCCGGTTTCATCGAAAATCACTTTGGTA:1	+	chr2L	2702886	3'	-	hobo	2637	1	72.52
TATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCT:1	-	chr2R	1320671	3'	+	diver2	344	2	56.14
TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGTTGTTTGTA:1	+	chr3L	26011954	3'	-	F-element	82	1	67.59
AGATTGGGACACTAAAAAACGTAAACGTAAATAAGTACATACAAAATTGCATATTTCGCTGGGTATGAATAATATCACGATCTAGAAGCCATCCAACCTCTTAAAAGAATGAATAAAATGTAACGCTTTAATTC:1	-	chr3L	21291718	3'	+	hobo	2505	1	74.63
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTTCTAAGGGCACTGAAAAAATATAAAG:1	-	chr2R	9328550	3'	-	roo	8680	2	71.92
GAGTCGAAAGGCGAACACCTCATGTCCGTTGGTGGTGCATGGGGAGCGGAGGTCGGCGTTGCCGTCTATACCAGCAAGAATGCGATGCTGCTGCTGCATTTTG:1	-	chr3L	3400735	3'	+	R1-2	2744	1	75.73
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACGTTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATACG:1	-	chr3R	20469567	3'	-	roo	8693	2	42.47
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGT:2	+	chrX	9540136	3'	+	roo	9034	1	59.59
TTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGTTAAATAACTTTTTACTTTTGTTAATTACCAGTTTTATTATTATTATTTA:1	+	chr3R	17605777	3'	-	Tabor	6856	2	72.60
GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGTATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACCCTTATTCCATCAGGAACAGTGATGT:1	+	chrX	4215076	3'	-	flea	4782	2	63.01
TAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAATTCACTTTTCAT:1	+	chrX	8543564	3'	+	roo	405	1	76.11
GAAGTAAATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTGCAAATTAAGGACTTATACTCACGTAGCTTGCTCCGTTTCATGCAGTCAATG:1	-	chr2L	10037251	3'	+	Quasimodo	7216	2	54.39
GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTGTTTGTATATTTAGCTTAATATAATTTAGTATTTCCC:1	-	chr2L	6622955	3'	+	Burdock	6312	2	76.71
TCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTATACGTAACCAGGAAATCCCGACAAAATTGTAAGATTCTTTTGGGTTTCCTTGCGCACATTAGGGGTCATTCGATCACTTACCAGCG:1	-	chr3R	17833204	3'	-	F-element	127	1	70.45
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGACACAATCAAGTGCGTTCCATATGGAATGCGG:1	-	chr3L	11441684	3'	-	roo	15	2	72.22
ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTATACATTATGTTGTTCTTACAT:1	-	chr2L	8986085	3'	-	412	27	2	64.38
TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGTGTGCTGGTGTTGGAAAATTGCAAGCCAACATAAATTTATGTCTGC:1	-	chr2L	6569895	3'	+	jockey	4985	1	73.19
AAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACGATAAAACCCA:1	-	chrX	3276772	3'	-	hopper	147	105	82.35
AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCCATTGAAAAA:1	+	chr2L	5845096	3'	-	transib2	44	1	54.79
AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCA:1	+	chr3R	29361067	3'	+	mdg1	361	2	60.27
CCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAACGATATT:1	-	chr3R	26659725	3'	-	HMS-Beagle2	34	2	56.85
CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTA:1	-	chr2R	5485081	3'	+	blood	351	2	62.86
GGGGAGAGCGAACGTTTATAAGCCATTGTAGATCCCTTCCTTTTAGTCTGAGCTATTGGTCGCTGTGCGGAGTTTAATCTGCAAAGGAACTATCGTGGAAAGGACATTTCTATACTGTCTGATAGTCAAGCAGCCATAAA:1	+	chr2R	4330779	3'	-	Doc3-element	4249	1	65.71
TTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGCAATTGGAAATCGAGAGCGAAAGCTAAGAAATGCAAACTTTCACTTTGAGAGAAAGTCTCGAAAAATAAATACGAATGCAAATCCACCTCCTGTGCATTGAACA:1	+	chr3L	19521555	3'	-	I-element	415	1	76.71
ATAATAACAATAATACTAATAATCTTAATGTTTCAATTAGAAAAAAAAAAGTGTGTAAATTGAAGGCGAAGTGGCTTTAAAGAAGAGAAATACGTTACTTATAGTTTGATTCTTTTCATTACAAATTTCAATATTTTGTTCGCTTT:2	-	chr3R	20305828	3'	+	mdg1	7067	2	69.86
AATTTAAGGGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAAGTGAAGTGTTTAAAACTAGTTGAACCAGTTTCTTTGTTCTCAAAGAATACTGTCAACTATTAAAAAATATTTTACGGCTCA:1	-	chr2L	14772799	3'	+	roo	8807	2	66.38
TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCATGCGGAAATCGATTTTAAATTTAGGAAGCTGCACATGTACATC:1	+	chr2L	7888252	3'	-	pogo	23	1	66.21
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAAGAATGAAAAGCCAACGAGAAGGAAAACGGGTAGGAAAAGGGCCAGGCCAGGCACTTGGTTAGTCGCAACATCCGGAGACGC:1	-	chr3L	4755189	3'	-	jockey	4709	1	56.85
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCT:1	+	chr2L	16091987	3'	-	roo	69	2	68.49
TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAA:1	+	chr3R	20868185	3'	-	BS	5077	1	74.48
GATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATGTTTGCAGAATCCCATTCGGCATCGTCGCGCAGCAGTGGTGCACAATCTCAGCATCAGCAGCAGCTAAGCAATG:1	-	chr3R	7101432	3'	-	roo	8617	1	55.86
CATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGAAAGAGAACCTGC:1	-	chr3L	19035962	3'	+	Tirant	8469	2	55.71
GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCTTGTCCAGACTTTGAAATCCAGGAATTTATTCAGCTGTTATCCAGGAATATTTATTCCATATTCTTCATTGGC:1	-	chr3R	11514926	3'	-	I-element	33	1	64.10
ACAAATAGGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTAAACTTTTTTCTTCTTTTTCAGTAT:1	-	chr3R	13237276	3'	-	3S18	5813	2	52.74
TTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATCTCTCGATGCGACATATTTATTTGTTGATTCATATATTTGCTCTTATTTATATGCATAATTTGCATTTGACACATTTTTATGGTGCCTGTTTGCGCGC:1	+	chr3R	12776345	3'	+	S-element	1704	1	76.09
GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACAC:1	-	chr2L	6569965	3'	+	jockey	4928	1	74.40
TGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGG:1	+	chr2L	9564517	3'	+	transib2	2740	1	76.60
AAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAA:1	+	chr2L	21737998	3'	-	INE-1	245	1	73.33
AACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATGTCGAATAGGTCGTTTAACCAGAA:1	+	chrX	11296515	3'	-	BS	5001	1	76.92
GGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAATTTATTGAAGTTGGTCAAGTGGGAGAA:1	-	chr3L	16769267	3'	-	FB	65	1	79.49
ACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACGGCTTAATCGCGACATAATGAATGTGAGTATTATCAGCGAATGA:1	+	chr2R	13573237	3'	+	hobo	91	1	69.86
ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGCAGGACTTGGTGTCTTA:1	-	chr3L	20831262	3'	+	roo	9026	1	53.42
GTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	370	1	58.27
GCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCCAGCGGGGCAGGCCGTACGCTTTACTCCGCCCCGTAGATCACGCCCTAGTGGGCGACATGCGCAATGGCATCGAGTGGCATTGGGTTGCCCACTG:1	+	chr3R	17604827	3'	-	Tabor	169	2	73.39
GTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTACGTGCCTGTTAATGCAATATTCAAGTGATTGCAGACGTTTCTTTGGCCCCACTCGGCTCCATC:1	+	chr2L	509324	3'	+	Cr1a	260	1	73.12
CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGGAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGG:1	+	chr3L	17115552	3'	-	blood	7056	2	50.00
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTGCCGAACTGCATGACATTGTGGCCACTTTCAAGAGTC:1	+	chr2R	14542246	3'	-	roo	48	2	52.74
AACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGTGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAATATTTTTGAAATAAGACGCGGCGGA:1	-	chr3R	10266048	3'	+	1360	3365	1	67.41
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATG:1	-	chr3R	11083905	3'	+	412	7477	2	72.09
GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAACTTTAAACTTAGTATTTTGCCTTAACAGGTCCGACACAGGC:1	+	chr3L	23866765	3'	-	copia	4	2	75.63
ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATC:1	-	chr3L	21855443	3'	+	blood	7320	1	63.70
TATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAAAGACCGGAAAAAATCAAAAAAAAAGAGAATACGG:1	+	chr3R	12954968	3'	+	jockey	4574	1	56.96
ATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAA:1	+	chr2L	21008620	3'	+	invader3	204	2	66.67
ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTATCCCCCTTATCGCCGGTGGTTCC:1	+	chr2L	19965092	3'	-	Doc	42	1	61.64
TTGCAGTTTTTTAAAGAAAAAAATAAGAAGTATATATTTTTATCTACGATTATATGGTATTAGCTTAAAACAAAGTGTACTAGTTCAACTAATGGCAAAACGCATGGAGTTAATTCTATATCTAATTATAAGTTACACTTAAATCA:1	-	chr3L	9761422	3'	+	flea	312	1	63.01
GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATGGAGCCAAGGACGAGTGG:1	+	chr3R	7482864	3'	+	412	461	2	62.76
AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTTGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTAT:1	+	chr3L	10574395	3'	-	Tabor	6881	2	47.22
TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGGCTGGCGGTCAATTTATCAACCCCAACCTTAGTGGGTAGTGACCGAGAGATGGTCACGTGTCTCAAGTCGGCCCCAAAATAGCCGCAACT:1	+	chrX	23155296	3'	-	blood	18	2	69.17
GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTCGCTAAGTGCAGGCTGCAATCAATGCCGTAATAGCAACAAAAACAACAGCAATAACAGCAATAACA:1	+	chr3L	22466702	3'	-	hopper	10	2	69.90
CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCCCATCGCGCCAAATAATATTTAAATATT:1	+	chr3R	11496638	3'	+	1360	3378	1	73.91
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAATG:1	+	chr3R	17818002	3'	-	roo	4	2	76.42
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGATCCAAAAAAATCATTTACT:1	+	chr3L	6978235	3'	+	pogo	2059	1	58.33
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTT:1	+	chr3L	20654582	3'	+	roo	358	2	52.78
AATTGAAATTTTAAAATTAAAATGAAAAATAGCTCTAGGCTATAGCTATTTGATTTTAATTAGCACACATTTGATAACTTCAAATTATATCTTTTGTATAATACACCAATAACTTTAGACGGTGCACAATCAATTTTATTCAATG:1	-	chrX	19828734	3'	+	1360	3055	1	78.62
AGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAT:1	+	chr2R	5206900	3'	-	G4	3767	1	59.59
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTTCTAAGTGCACTGAAAAAAT:1	-	chr2R	9328556	3'	-	roo	20	2	70.14
AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCAAATACC:1	-	chr3R	10273933	3'	+	HMS-Beagle	205	2	53.38
GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCG:1	-	chr3R	9210648	3'	+	mdg1	7377	2	75.35
ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATTTCCCCGCCGCAGAGAGCGAGT:1	+	chr3R	18121885	3'	-	P-element	78	1	23.26
AAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTG:1	+	chr3R	24383325	3'	-	rover	70	2	65.75
ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCCGCAAATACAAATACCAATACCAAAGCCCC:1	-	chr2R	10124150	3'	-	P-element	75	1	26.15
GGTTTATGAATCGTGCATGCCACCCACGGTAGTTGGTACGGTAGTTAGAATTTATACTACTGCACAAACATACAGCATTAAATATATGTATGTATAAGATGCGTGCATTGCAGCTCATACCAGAGTCGTAATATATCGATATA:1	-	chr2R	2856903	3'	+	Rt1a	5002	2	63.64
GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAGGTGAAAACGGTGGAGTGGGCGTGGCAG:2	+	chr3R	14940187	3'	-	jockey	23	1	61.90
TTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCCCTCTCATTCTTCCGGCATAGCCCCCCTCCCCCGCCCCCCTCTCCTTACCGTGCGTGTTTGTTTAATTCGAATTCTAACTC:1	-	chrX	16717815	3'	+	roo	410	1	76.64
GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTAAATCTCGTTCGGCGTGCTGGAATCTGAT:1	-	chr3R	28758258	3'	+	mdg1	7454	2	57.36
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTGTTTCCTACAAATAAAATGTTGTAGCCTAGGTTGGGAATAC:1	-	chr3R	26222873	3'	+	roo	9007	2	71.76
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAA:1	+	chr3L	233347	3'	+	roo	361	2	53.10
GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACCAATAAACCGCACCAC:1	-	chr3L	10848606	3'	-	blood	14	2	73.88
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACTTATAT:2	+	chr2R	15064463	3'	-	412	38	2	57.53
AGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGTGGTAACTAAAGGTGTTAAGCCTTGACTTTGCTAAATTTCTTTTAATAAAAATTTTAATTATCCAAAAGAGACTTAGACCTTGAGGGATAATTTGTTCT:1	+	chr2L	4411838	3'	+	Quasimodo	6968	2	65.97
GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAACCGGTTGCGTTTCGCAAGCTACAG:1	+	chr3L	2712803	3'	-	P-element	50	1	23.76
AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAATTTGCGCATTTACAAAGCGGCCTTAAAATA:1	-	chr3L	12308298	3'	-	hopper	45	1	53.42
GGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATTAAAAGGGCTCTGTAGATAGTCGGTGCTGTCATTCGCAGAAG:1	+	chr2R	22598391	3'	+	blood	7005	1	71.23
AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGAGCGCTATGCGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTAGGT:1	-	chr2L	14110723	3'	-	Quasimodo	16	2	68.97
AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGGCCAGCTTTTTATTAAATTTAGAAAAGCTT:1	-	chr3R	2461531	3'	+	mdg1	7444	2	75.37
TATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGATTATATTGCATATAATCAGTACTTTCTAACTGGT:1	+	chr3L	5102487	3'	-	BS	4751	1	76.03
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAA:1	+	chr3R	26222929	3'	-	roo	8746	2	78.01
AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTACTATATGGTTATGCGTTATATGCCCAAAGGCTTCGTTCGGCTGTATATGAGCATAACATTCTTAATGCTTCGCT:1	-	chr2R	15289101	3'	-	hobo	3	1	75.24
ATAAAAAACGTTTGCCCAACCAATATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTACAAAAAAAACCTTTAAAGAGCATTTTTTTCGATTGCATAAACTTAAAATATAAATCCTTTGGGTAGTTTCTAATTGATTTTTAGAT:1	+	chrX	19500471	3'	+	FB	345	1	68.09
TTTCTCTTTCATTTTTTTTTTTGTTTTTCCTTCTCCTGCTTTTTCCACCGTTTTACCTTGTGTGCATGGAAAA:1	+	chr3L	11308829	3'	-	Doc2-element	232	2	80.82
GGAGCTTGGTGGTGCAGGGCTTGCTGATAGGGGTGGCCGGTCTGGGTTTGGTGGGTTGGTGTGGTCTTGCCTAACGATTGATTTCCGTTTATACATTATGGGTAATTAAAAATTACATCTTTTTTAAACAACTAA:1	-	chr3L	16120768	3'	-	G2	25	1	62.22
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGG:1	+	chr3L	20168458	3'	-	mdg3	5261	1	69.70
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCGTCAGTTTATTCGCTTCTAAGTGCACTG:1	-	chr2R	9328563	3'	-	roo	16	2	69.17
ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAGAAGCCCGA:1	-	chr3R	14979777	3'	+	pogo	2074	1	56.30
CACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAA:1	+	chr2R	21298825	3'	-	jockey	270	1	57.81
AGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATGGCAAATAAACAAAGTTAACAATAAATGAAAATGATTCATCTGAATAAAATGACGAGTTTGTCGGATTGTCAATGAACAATACGCA:1	+	chr3L	15597757	3'	+	roo	8974	2	61.43
TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAG:1	-	chr2R	16891863	3'	+	hopper	1357	1	75.00
GGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAATCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAA:1	+	chr3R	11547760	3'	-	G2	356	1	71.92
GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATCTCTCGATGCGACATATTTATTTGTTGATTCATATATTTGCTCTTATTTATATGCATAATTTGCATTTGACACATTTTTATGGTG:1	+	chr3R	12776332	3'	+	S-element	1686	1	64.34
CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACGTTATTCTCGTTTTTGTTGTTGTAACTGTGGCAACACACATTATTTATATTTATATGCTTATTTTATAGTTTATTCATGCAAATTGCAATAAAAATTGCCTTTATTT:1	+	chr3L	2841046	3'	+	copia	241	1	73.97
TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATT:1	-	chrX	2518048	3'	+	P-element	2830	1	36.67
CATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTTATTAATGGAACAGTTTCATTACAAATC:1	+	chr3R	16799844	3'	-	X-element	4636	1	61.97
AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATTACTATTGGGCCAACATGGTTACGGAGTATATAAAAAGAAATGAAAAATTTCTTTGGTCTGCAACTAGACTTAAAACTAAAGGGATACAAAACCAAGAT:1	-	chr3R	4305356	3'	-	1360	22	1	51.37
GCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAAATGTAGTATCTTCGTTAGGAAATGAA:1	+	chr2L	6623079	3'	-	Burdock	6156	2	71.92
GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATT:2	+	chr3L	10574392	3'	-	Tabor	47	2	47.26
CATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTATTACGATGCACATACGAAGATTGCCCAAAGATTATTGTAACGTATTGA:1	+	chrX	21008461	3'	+	pogo	37	1	66.44
ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGC:1	-	chr2R	16891817	3'	+	hopper	1367	1	52.08
TTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCATTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTTTGCCTTTGGCTCCGGGTCG:1	+	chr3R	19265887	3'	-	I-element	77	1	68.49
AGCGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTC:1	-	chr2R	5070918	3'	-	gypsy5	24	2	26.21
TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGGTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTGATTTCAAAT:1	-	chr2L	544782	3'	-	412	7081	2	49.02
CACACGCCGCAAGCTGAGTGCTCTAATGACAAATATTCTAATATAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGATATGTACATAGTAATCATTTTATAATCAAATTAATTCCACAGTTCCAAATTAACTTTCACTGCCTTGTTCAAC:1	+	chr2L	11926355	3'	-	1360	417	1	57.53
TCTCCGGCATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCGATTTGACTTCA:1	+	chr2L	4412648	3'	+	Quasimodo	7312	2	61.48
GTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACATAAGCCGATCGCGGCGTTAACAGTTTACGCTTGCCTGCTGGCTAAAAA:1	-	chr3L	17129826	3'	-	gypsy	7056	2	68.06
ACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGATAAAACATAAATTGCTTTGTACAATCCGAAGAGGCCTCTCTGCCTGCCAGAGAAAT:1	+	chr3R	23082695	3'	+	copia	4889	2	60.00
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATGAAAGGTAATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATGATTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTTTATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCA:1	-	chr3L	6630130	3'	+	roo	9042	1	65.07
GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTTGCAGGGAATTTGCGGTTAATTTGCTGGTAACTTTGACCCCCTTTTCATTG:1	+	chr2L	16067197	3'	-	297	6623	2	53.42
ACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATACACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTTCAAAGTGCATAAAACCTAAAGGTAATTAGAACTAGTTAGAACTATCCATTTCAAAAACTTTTAATAA:1	-	chr4	1157623	3'	-	Stalker	7124	4	60.96
ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGCATCCGGCTGCACGGTCTTGTCCCTGTCGCTCAGCATGCATCTGC:1	+	chr3R	23064733	3'	-	1360	3254	1	63.71
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCTACTGGCTGTCAT:1	+	chr2R	14387998	3'	-	roo	69	2	72.73
GGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACGACTTGGCTGACTGGGCTGACTGGGCTGACTTGGCCCT:1	-	chr3R	12619544	3'	-	F-element	4389	1	52.50
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAACTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAATGAGAAG:1	+	chr3R	17818007	3'	-	roo	8703	2	57.53
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATCTGTTCCGCTTACCG:1	+	chr3L	20654616	3'	+	roo	9054	2	73.29
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCATAAAGCTGCAAAAAATATATGCATTCTACACATTATTATTATATTCGAATAGGA:1	-	chr3L	1534650	3'	+	pogo	2060	1	55.65
TTTAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGATTGCGGATACCCACAAAGGCA:1	+	chr3L	20907288	3'	+	hopper	444	1	73.42
CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCATAAAGCTGCAAAAAATATATGCATTCTACACATTATTATTATATTCGAATAGGAAAAAT:1	-	chr3L	1534645	3'	+	pogo	2088	1	60.40
ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTA:1	+	chr3L	22349263	3'	-	jockey	95	1	72.60
ATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAANTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAA:1	+	chr2R	7586199	3'	+	I-element	5286	1	65.52
ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTT:1	+	chr3R	20427447	3'	-	jockey	87	1	76.81
TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCCCCCAAAGTTGGAGGAAAACTCTA:1	+	chr2L	6570083	3'	-	jockey	4795	1	78.77
GATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAGAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGA:1	-	chrX	18193656	3'	-	jockey	9	1	67.05
AAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTGCCAACTGCACATGAATCCTA:1	+	chr3L	5190973	3'	+	roo	8692	2	78.57
TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAATTGTTCATTTTATACGATA:1	-	chr3R	17478320	3'	+	copia	241	1	75.34
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCG:1	-	chrX	5643435	3'	+	roo	9053	2	71.33
GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAA:1	-	chrX	5662867	3'	+	P-element	2875	1	65.52
AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAATACATACTAGAATATATGAGGGTTTTATCA:1	-	chr2L	13763128	3'	-	pogo	41	1	56.16
TATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACG:1	-	chr2R	977543	3'	-	F-element	77	1	68.89
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGGATTAATTAAATT:1	-	chrX	13039472	3'	+	roo	9043	1	53.40
AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAA:1	+	chr3R	7482820	3'	+	412	7480	2	73.33
ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATTATTTTGTGTAAATCTGTGAAAGCCCGCT:1	+	chr2L	3165021	3'	-	412	7127	2	74.62
AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTCATAATTCGCTAACTAAGCCAAAAGCCGCAAAAACTGCATGC:1	-	chr3R	14937481	3'	+	I-element	5285	1	68.75
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGG:1	+	chr2L	18294269	3'	-	roo	67	2	75.19
AATTATGCAAAGTTTTAACATCATCCTGGTAATTTTTCAATTTCTTTCATTTCTGCTCATGCTGACCATAAGCCGGCAGTGTGGCAAAAACTCAATGCACAAAAGGCTCCGACGACACAAAAACGTGCCAAAAATATCCTGCTCAG:1	+	chr3L	15729280	3'	-	transib1	1864	1	69.18
ATTTGTGTGTTTGTGTGTGTTTCTGTGTTATTGCCTAGGCCATTAAAATAATTGCACAAATATATCCGGTTATGCTGCCCCTGCAAAAAGCAACAGGGAAACAGGATTTGAAGAATCTAAAGTTGAAGGACCAAAAGCAGAAGGTG:1	+	chr2L	16677973	3'	-	gypsy3	424	1	67.12
CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGACAAGGCGTCCGCCACTCAACGCAAAACTCGTTGGGTCCCCAAAATGTCT:1	-	chr2L	5307065	3'	-	jockey	4700	1	58.14
AGATATCTTGCCGATCCAGCTAACAATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGCAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATAC:1	-	chr2R	6172994	3'	-	pogo	31	1	50.00
AAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGCGTGACTGCCCGACCCATGAAAAGCAAAGGGATCTTATCA:1	-	chr3L	23602450	3'	-	gypsy	7011	2	53.51
AATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTG:1	+	chr2L	12290760	3'	+	1731	4563	1	60.00
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGGGTACTTATTGTTTGTTTTCAAGCGTG:1	-	chrX	10639962	3'	+	roo	399	1	76.03
TCTTGTTCTCACATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACACTCGTCATTGCATTG:1	+	chr3L	8249110	3'	-	jockey	4567	1	58.72
AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTATAGTATAGTGTTCG:1	-	chr3L	10056076	3'	+	transib2	2787	1	58.90
GTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCAT:1	+	chr3R	19449316	3'	+	roo	8929	2	74.66
TATTCATGCAAACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATC:1	+	chr3L	19339418	3'	-	Tc1	82	1	67.81
AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTACTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAG:1	+	chrX	10521719	3'	+	Tabor	419	2	64.29
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTGACCAT:1	+	chr2L	17471705	3'	+	roo	361	2	52.05
GTGTATTGATGTTGATTGTTGATGTTGAAAGAAAATCCGCAGTTGAAGACGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTATCCGCGAGTACAAAGGAGTTCGCAGGGATAATACGT:1	-	chr2R	5804985	3'	-	gypsy7	331	1	68.33
TTTATTTATTTATTTATGTTTGCCCACATCTGGTTTTGTGGCCCTCTACTCATATTTGTATGACATTCTTATTAATAACTAAATAAAAATTGAAGTAGATTCGAGAGCTTTAACTAATGTATTCCTTTAACGCTGCT:1	+	chr2R	19178508	3'	-	Juan	4214	1	55.47
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCATTCCGCAGTATAGTATGTGCATGTG:1	-	chr2R	14524937	3'	+	roo	9032	1	43.84
TAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCGGTTCTCTCTTGTTTTTGAATCAAAA:1	-	chr2R	5883563	3'	+	NOF	3958	1	47.76
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAG:1	-	chr2L	3114455	3'	+	roo	400	1	73.91
AATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAAAGAATGCAAAATATTTATTTTGGCAAGAGTGAGGGCAATTAAATTACTTTCAATATAGGTATTTTTTTAATTTAAATAAATTTGAATTTAATTTAAT:1	+	chr3L	9197139	3'	+	Stalker4	292	4	74.05
ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACTCACCTGTTTTCTAGAGAGGAAGTTCCCGAACTCATTCCGATGCGAGCCAAGCTCTACAAGATGTTGGAGGAGTCCAACGACTATTCGCCGGATCGCCTCCTAGAAGAATT:1	-	chr3R	18272053	3'	+	1360	3383	2	79.31
AGTACGGTTTTATGAAACGCAGATCAACAACCACCAACCTTTGGAGCTAACTTAAGTCGTAATACAGGCCTTCATAGGTAATCTGCACTACAGTAATAAAAAAAAATCAC:1	+	chr2R	5520780	3'	+	Q-element	209	2	65.45
ACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAAACTTGACGATCGCCGTATCGCCTACTCACTTGCACTCATTTCAGCCA:1	-	chr3R	16948714	3'	+	jockey	4764	1	63.28
ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATTGTCTAGACTAATCTTTGTTCG:1	-	chr2R	19499348	3'	+	P-element	2795	1	15.67
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATA:1	-	chr2R	25118687	3'	-	roo	8736	2	68.49
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACAC:1	+	chr2R	11164486	3'	-	roo	73	2	75.54
TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCGACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTATTTTGCCTTAACAGGTCC:1	+	chr3L	23866756	3'	-	copia	4901	2	61.59
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTTCAATCGCTAAGGACTTTATGGCGCACGTATATGTTTTTTCAGCCAGGTCCTTATTACACACTTT:1	-	chr2L	12153175	3'	+	roo	9019	2	55.17
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAAAAGAACTCATTA:1	+	chrX	14336499	3'	-	roo	4	2	65.38
TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATTTGATTTGATTTCCTTAGATAATTGCCAAACTGAAACA:1	-	chr3R	22217802	3'	+	hopper	1403	2	73.28
CGCAATATTGGCGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGGGTCGAGGGACTCCAGTTCTTCGTTTTGTATGCTTTTTATGGCTAACATTGACTGTGTACCGTAGTACGGAAACGTTTTCTAAATATGA:1	+	chr3L	27858583	3'	-	mariner2	369	1	56.20
ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAG:1	-	chrX	10644451	3'	-	jockey	4830	1	69.92
GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACAAACAGCTGTGGTCGCAACGATAGCTCTA:1	+	chr2R	8146147	3'	-	P-element	50	1	50.00
ATTCTTGATCAGGATCAATAGCCCAGTTGATCTAGGTCTGTCTATCCGAATTAACTTCGAGAAAATTATAAATGTTCGCGTCCGCAAAAGTGCCACACCGATCAAAGGCGAACTCACAAGTTGCATCATTAACATATTCACAGTC:1	+	chr3R	5981451	3'	+	INE-1	86	1	56.55
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTACTTTG:1	-	chrX	10640000	3'	+	roo	360	2	48.63
AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATG:1	-	chrX	7978949	3'	-	hopper	7	2	54.67
TATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTGACGCCGTGCTCGCTTGTATACTGTTAAGTTCTGTTCAATTCAGTTGAATTCTTTTTGCACACCACGCACTACAA:1	-	chr2R	5599049	3'	+	INE-1	81	1	71.20
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCA:1	-	chr3L	233256	3'	-	roo	8742	2	75.71
TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGCGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAA:1	+	chr3R	10266152	3'	-	1360	15	1	55.70
CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATTTAAAACTGTACAAAATATAAAACGTCTACTAAAACTCGATAAAATTCTCGAATTTGAAATTGGCTCCAATAATTAATCGATAAGCTAATGAAACTATCTTAA:1	-	chr3R	15363871	3'	-	flea	16	2	71.92
ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTAGCTGATGTACAATGAAGGGGGGGCGTGGCAATAGTCCTGG:1	+	chr3R	22217922	3'	-	hopper	63	1	65.15
GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTAT:1	-	chr3R	5061814	3'	-	mdg3	40	2	58.90
TGGACGTAGAGTGCGAGGGGCGGGCCGGAGTTTTCTGGTAGAGACATTGAAAGTTTGTCTCGCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGGATGCTATAA:1	-	chr2L	15832986	3'	+	hobo	2923	1	54.21
TAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTATCAGGGCATTTGTTTATTCAGGCCGGGCACAGAACCTGTTCCACGATGGGATCAGATCACCTAGCTAGTCACCCGCACCGGCTC:1	-	chrX	18386325	3'	+	invader4	3075	2	78.26
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACCCCAATAACTTTTATTAG:1	+	chr2L	22775597	3'	+	pogo	2059	1	55.48
AAAGTCGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAGATACATTTGTATTACTAAGTTTCCCTCGCACTTTAGTACTTGATTATCCTTCATACTTACCCACTTTGGTTGGTTATGTACTCCAGATGAAGTTGCACATCCAGTGCGCGAACATA:1	-	chr3L	1734632	3'	-	HB	68	1	54.79
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATGTTTTACAATGGATTACAAGCATTGTCAAAATATATACAT:1	+	chr2L	17420290	3'	-	roo	8677	2	69.86
TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCCGTTGAGTGATTAATTTTT:1	+	chr3L	10648039	3'	-	412	18	2	59.59
GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTT:1	+	chr3R	7835188	3'	-	roo	8751	2	78.62
TGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATAGAG:1	-	chr2L	20117848	3'	+	invader4	3067	2	49.32
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATTTCCTTTGG:1	-	chr3R	22844182	3'	-	roo	44	2	54.62
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTT:1	+	chr3R	17817983	3'	-	roo	63	2	62.33
AATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAGTGTTTGAGATACAACTTTAATGTAATGTTTAAGGTAATGTTTTAATTATATTACCACTTGAGCCGCCCATTCTAATGAACATGTTTTTGTCTAATATCTTCATAATA:1	+	chr3L	22820790	3'	+	Quasimodo	7171	2	75.34
ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTA:1	+	chr3L	17560385	3'	-	pogo	46	1	54.07
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTAGGGAAAGTGTTTTCTACCGACTCGCCCTTAATTTTTTCATTTTTATTTTTAATTT:1	-	chr3L	6796120	3'	+	roo	342	2	68.49
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCG:1	-	chr2R	21907911	3'	+	roo	9034	1	55.04
ACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGCGTACGCAGAGGCGCAGGACTCATGCGGG:1	-	chr3L	13827681	3'	+	opus	122	2	75.63
GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAA:1	-	chr3R	5061824	3'	-	mdg3	50	2	52.05
GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATTTAATCGGAGGCCCAGATTCCGTTTGATCGGTGGTGCGGGGCAAGAACCGCAAAAAGCAGAGCTCCTAAA:1	+	chr3L	20548187	3'	-	297	11	2	70.83
ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTT:1	+	chr3L	10773132	3'	-	412	83	2	78.57
AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCAT:1	-	chr3L	10056101	3'	+	transib2	2822	1	70.93
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTGTTGTAGATTTCTCGCAGTGTAT:1	+	chr2L	5254373	3'	-	roo	8707	2	54.62
TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAACATATGCATAGCTTTCAACCACTGAAAAAATATGTACAACTTATATCTTTAATTGTATTTTTCTAACA:1	+	chr2R	15064485	3'	-	412	7069	2	67.12
AAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGCTTTACTCTGAAATTATTTCACAGAATTGTGAAATTCAAATTTGCTTACTGATGCAGTTG:1	+	chr3R	1207568	3'	-	copia	4927	2	57.34
CCCCGACTATCAGATACTCGTTACTCATAAAAATTTGCAAGACAAACAATGAGACGACAAAAAATCTAAACATTTTTAAAAAATGTGGTTTGAAAATGGTGGAGTTTTGCGTATTTTAAAATATCAAATGGCTGGCA:1	-	chr3L	23262244	3'	-	INE-1	553	1	71.53
CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAAC:1	-	chr2R	9221009	3'	-	opus	7060	4	61.64
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTTTAAGCGTCAGGCGTCAGCAACTCAAAT:1	-	chrX	2444362	3'	-	roo	8737	2	71.23
TTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTG:1	-	chr3L	2362339	3'	-	Stalker2	74	2	68.35
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCA:1	-	chrX	10639998	3'	+	roo	9026	1	52.74
CAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGATTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTATAAATCGCCGCTCGAATAAGCTATCTGTAGGATATAAAACAAAATCAGATATAATTCCAAAGGGCTT:1	-	chrX	11029131	3'	-	1360	3101	1	69.86
AAACAAAACACAAAGACGAAAAATGCTTAATTTCCTGTCGAGTGGTGTACACAGCTAAAAATCTTAAAAATTTTCAATTTTTTGTAAAAATATGTATATTTGGGAAATTGCTGTAAAACTCAGAAATGCCGTCTAGCCG:1	-	chrX	7041844	3'	-	Cr1a	197	1	57.55
CGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACG:1	+	chr2R	6271495	3'	-	blood	7229	2	73.79
TTGTATTACCAAATATTTTTAAACAATTGTATGTGACATTTATATATCTCCAACCCATTGAAATTATTTTAAAGGCACATTAAACATTATATTTTAAAGATCTTTCAGAATTATACAACTATATTGTT:1	-	chr2R	18513830	3'	+	Tc1	1485	1	43.75
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAA:1	+	chr3L	9998188	3'	-	roo	8722	2	64.39
TTTTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGTGTAGTTCGATTCTTACCTGCCCAGAATCTC:1	-	chrX	11696527	3'	-	TLD2_LTR	96	1	47.66
AAAAACGTACGCATCGGTGGCGTCATAATCATTTGAAGCGTCTGAACTGAAACAACAAAATCAACTAAAAGCATATGAATTCAAACACGACTAGGAAAATATAATCCAATAATTCTAAAGGACG:1	+	chr3L	26695570	3'	+	3S18	262	2	54.03
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAAGGGGAAGTGTAAAAGAAAACCCTTTT:1	+	chr2R	7898218	3'	+	roo	396	1	73.97
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTGCTTGGAT:1	+	chrX	16717935	3'	-	roo	49	2	60.77
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAGTCGTCTTTGACAAATTGAGGCAAAATGCAGCCGAGCCATCGCAG:1	-	chrX	14336371	3'	+	roo	386	2	71.03
TACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATATGCAATTATTGAGCACATCACATTTTGAAGATAAAAAAATATCACTGGAATTGCCCCCATTGGGTCTTTTTCGAGTTAAACTAAATG:1	+	chr2R	4619585	3'	+	Stalker2	227	2	63.91
ACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGGATAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1	-	chr3L	23112569	3'	-	R1A1-element	485	1	56.78
ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAA:1	-	chr3R	26659732	3'	-	HMS-Beagle2	25	2	55.38
GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAATATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGACCGAAAGGTTAGTATTTAGGATAAGAAGTTCTTCGGAGCTAATAGTTTGAAAAAAGTAGTGCATACTTCAAGGCGATGGTATGTATTTT:1	+	chr3R	13770154	3'	-	BS	5066	1	59.59
ACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAATGCGAGGAGAGAAAAACAGTCACGGGGGCACAATAATCATAATAAATAAGCTGGGGGAAACACTGAAAACAGAAA:1	-	chrX	7980871	3'	+	Doc2-element	311	1	64.17
AATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCA:1	-	chr3R	7482714	3'	-	412	3	2	76.15
TAATCTTTAAACAGATGTCATCTACACTGATTTTAGTAAAGCATTTGACTCTTTTAATCATTATCTTTTAATAAGAAAACCTGATCTTATAGGTTTCCCCGTTGATCTTCAAGAATGAGTTAAGAGTAATGAAATTCATGGAAAT:1	+	chr2L	22171088	3'	+	Q-element	288	2	74.48
CTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTAAAATTAAACCCAAGCAAGAAGATGGCTCGTTCTCGCTGAGTGCGCTTGTTGTGTT:1	-	chr2L	14809982	3'	-	Doc	218	1	57.89
GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGCTTGTCTTTTGTAAATTGTTTAATTTTCTGCGA:1	-	chr2R	18349331	3'	-	roo	87	2	80.14
AATGCCTCGATGCAGGTAACTTGAAGGTTGGTTGACGGAGAAAT:1	-	chr2R	6085923	3'	-	pogo	2063	1	50.00
GCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGT:1	+	chr3R	11496593	3'	+	1360	3303	1	74.48
AGCAACATAGATTTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACTGCCGC:1	+	chr3L	2362402	3'	+	Stalker2	7573	2	72.41
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGATTTTT:1	+	chr3L	11531028	3'	+	roo	397	1	76.71
CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCC:1	+	chrX	1899707	3'	-	P-element	68	1	39.04
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAAACAGCTGG:1	-	chr3L	22437818	3'	+	roo	406	1	80.00
ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTT:1	+	chr3L	17560371	3'	-	pogo	35	1	56.36
GGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGT:1	-	chr3L	3799801	3'	-	copia	4958	2	76.71
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCAT:1	-	chr2R	19050177	3'	-	roo	45	2	50.00
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTT:1	-	chr2R	9791595	3'	-	412	7131	2	73.29
AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGA:1	-	chrX	4214941	3'	+	flea	4994	2	59.22
CAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGTACCAAATCACTCTGGATGGACACTTGACCAGCACCT:1	-	chr3R	8577443	3'	+	1360	158	1	70.63
ATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTTTTTATAAACAAAGATAAAACATTTAATTAAATTCGTTATAACATTTTTTTTAATTCTTGTATGCAAAGTTTTTATTTAT:1	+	chrX	23280088	3'	+	3S18	321	2	59.09
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGCTTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGA:1	-	chr3R	15072555	3'	-	pogo	57	1	59.59
CACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTAT:1	+	chr3R	17478450	3'	-	copia	4948	2	72.60
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAAATGCCTAATTAA:1	+	chr2R	18336272	3'	+	roo	9037	1	63.01
TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAGGCTAAAATTAAAATAGCAACGCCAG:1	-	chr2L	14771990	3'	+	roo	395	1	74.29
ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAA:1	+	chr2R	5031004	3'	-	Doc	62	1	78.43
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGA:1	-	chr2R	19004113	3'	+	roo	9029	1	57.53
TAAAAAAAAATAAAAACAAAGAAGGTTATGACACGTTATGTCTATAAGAACATACATACAAATGTTACACATAAATAGTTTTCTGAACTAGTTTGAATCGTTGTTAACAATAATTGTGGAAATCAATCCTCTTAATCGCCATGAA:1	-	chr3L	18232963	3'	+	transib2	2640	1	84.14
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGG:1	+	chr2L	18294270	3'	-	roo	83	2	77.40
ACATATAAAAAAAAGAACCAAACTAGAATATGGCTACCCTAACAAAAGTCGAAATGCCTAACTCACACAAATCTAATCAATT:1	-	chr3R	7941915	3'	-	BS	5021	1	85.37
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAACACTAGTCGCTCGATGATGAGGCCAGCT:1	-	chr3R	2461554	3'	+	mdg1	384	2	54.14
TTATTAATTTTATTATTTTTATATCCAAATAGCTTATACTAGAGTTTGACATTGAAGATGTTATGGAGATTATTAAATCTTTGGATATAGTGACTTAATTTTAGTAATTTATAAACATATAAGATTTTATTATTACAATGAAAATG:1	+	chr3L	17988452	3'	-	mdg1	7076	2	16.44
GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACATGACTTTCCGGTTTTACAG:1	-	chr2R	8146077	3'	+	P-element	2787	1	14.38
CTTTAAGGAAAGAGGAGTGACGTATTTGGTAGGTCGAAACCGGCACCTTCAATTATTTCTAAGAAAACAGTAATGCACTTTAGTGATGGAAGCGCAGGCAGATGAGGGTTATAAATCGGATTTTTAATCGAAATTTGTGGTTCTAA:1	+	chr2L	9728592	3'	+	297	6567	1	58.22
CCTGAGATCTCGACGTTCATCGGGACATGTCCGTCCGTCCGGCCACGACTTGCACACACACACACTCACACTCTAGAGAGGAGAGTCTGACCACGAACTTTGTTCTAACACTT:1	+	chr2R	6035613	3'	-	INE-1	137	1	61.95
CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTGTTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGG:1	-	chr2R	2016855	3'	-	1360	56	1	75.24
GAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAG:1	-	chr3R	16076775	3'	-	roo	53	2	57.45
AACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGGCATTCGGTTGGCACGGCGATGTCAACAGAACGTTAAGCGGGATTAGGACC:1	+	chr3L	7292592	3'	+	HMS-Beagle2	280	2	63.70
AAAATTCATATCTCAAAAACTGGAAGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAAGGAAATGCTGCTGAGATTGGAGTTTAAACAAGCAAAACCTCGGATTTATAAGCTTACTAGTAAATATGTA:1	+	chr3R	26247094	3'	-	FB	113	1	50.68
CCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTTCATT:1	+	chr3L	8249109	3'	-	jockey	4552	1	54.84
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCA:1	-	chr2R	19050211	3'	-	roo	53	2	67.54
CAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTGGCGCAGTCGGAGCTCTTGATGCTGCCTTTGCTACGGTTGCTGCAGCAGTTGCTTTTGCTGCAGCAGTTGCTGCTTCT:1	-	chr2R	14057457	3'	+	gypsy5	385	2	51.61
AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATACTACAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATC:1	+	chr2R	9091969	3'	-	1360	20	1	67.81
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTTTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTG:1	+	chr2R	7898190	3'	+	roo	9033	1	54.17
GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTT:1	+	chr3L	27415333	3'	-	transib2	43	1	56.16
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTG:1	-	chr2L	3114472	3'	+	roo	9015	2	56.16
AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTTTGTAATAAACCAGAATATGTGTAATTAAAGCAGGAAAATGTAAAAAAGTATCTTGCAGATACGAAGTACATAGGAG:1	+	chr2R	9544159	3'	+	opus	486	2	72.39
AAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAATGTGTGATCATAGGCCCATTAACCCAATCATGATTACATGCAAATCAAGAAGTAG:1	-	chr3R	5519115	3'	-	copia	4837	1	60.71
AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGTGGGGCATTGGAGCATTAAAGATTTTCACA:1	+	chr2L	17081891	3'	-	jockey	4708	1	54.79
TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGCACGCTTC:1	+	chr2L	12328736	3'	-	hopper	48	1	50.72
GAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACACACGCAT:1	-	chr3R	19589928	3'	-	BS	5071	1	67.81
TAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTCCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGC:1	-	chr3R	1433143	3'	-	mdg1	73	2	71.32
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTT:1	+	chr2L	17420231	3'	-	roo	8745	2	75.17
TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCT:1	-	chrX	11471572	3'	-	hopper	38	1	50.42
GCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCATTTCGCTTTAACAATTTGCCAAAAAATGTCG:1	+	chr3L	4773188	3'	+	accord	7025	2	77.14
TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTG:1	-	chr3R	22844196	3'	-	roo	8673	2	58.02
GGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCACCTGGGTACAGTGCTGCTAAAAACCCGGGTAAACATGGTTGAAAGACGTCTAT:1	+	chr3R	18580471	3'	-	roo	185	2	63.01
GTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGAC:1	+	chr2R	21298815	3'	-	jockey	296	1	69.44
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGC:1	+	chr3L	20831394	3'	-	roo	8707	2	55.56
CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATAAATTAATATATGCAACCCATCTAAAATTGGTTTCATTTCTTTCTTAGTTCTTGCGAGGATTTTCGAACA:1	+	chr3R	9293304	3'	-	297	6608	2	56.62
AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATTCGCCTATTAACTTTTTAAGTCCAAGAATAAGATTCTTTAATATTTGAGAAACAATTAGAGAACATTCACGCACAAATGTACCTTTAAAT:1	+	chrX	6191268	3'	-	FB	15	1	73.28
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTG:1	-	chr2R	8585412	3'	+	roo	9024	2	54.11
GTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTC:1	-	chr3R	13237327	3'	-	3S18	5801	2	74.70
CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCTGTGCACGCGCATTATTAAAGTGA:1	+	chr2R	17259326	3'	-	jockey	4765	1	77.40
GAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTAAAGGCATGCTTGTTT:1	+	chr3L	23702315	3'	-	G4	3	1	79.45
GGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAATTACGGCCACAACACAGGGCGCCAGCTCATT:1	+	chr2R	21222414	3'	-	jockey	4856	1	70.19
GAACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATAGGGCTACGGCTAGAACTCCACTAGTTATC:1	+	chr2R	3170846	3'	+	1360	499	1	79.14
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTANTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAA:1	+	chr3R	27994248	3'	+	roo	9039	1	68.24
AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAG:1	+	chrX	13504239	3'	+	412	421	2	67.81
GTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGTACATGGTTCAACAAATATATAAATAATAGAGCGCCAAGTGATTTCGTCGCACAACGCTATAATTGAAAACAAAGGACAATGCTTACGTTGTAAAATCCATGCCGGGGAACTCATGGAAA:1	+	chr2R	22652208	3'	-	INE-1	218	1	75.34
AGATCTGAGGAACTATAAAATCTAGACAGTTCTAGAGACAACGACGCAGCGCAAGTTTGTTTACCCATGTTGCCACGCCCGATTGTCACCGACACTTGCCTAAAATGGAAAAAGTCAATGGCGCAGCAACAAAAGAAGCGAAGTAA:1	+	chrX	710168	3'	+	INE-1	149	1	66.44
CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAG:1	-	chr3R	13360283	3'	-	jockey	35	1	61.42
TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCAATATAATAAGTTATGTTGGGTATGCATCGCAAATTTATTTCGTCAAGGTATGCAGTATTATTTTATGAGTTAGGCAATAAAAAGTATTTATTTTATAAG:1	-	chr2R	919641	3'	+	copia	237	1	72.60
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGATCTGTTGACAAAAGACAAGCAAACTATTAAAGTGTTCTATCTTTTTTTAATAAACGAG:1	+	chr2R	23803091	3'	-	roo	14	2	78.62
TAGAGACAACATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTAAAACAGATCCTGAGAAAATTTCCACAATTATGAAGTATCCGATTCCACAAAACATTAGAGAGCTTCGAAAAGGAGCATTCTAAAATAAATATGTAAATTC:1	+	chrY	1068031	3'	+	TLD2_LTR	172	1	77.24
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGG:1	-	chr2R	8585408	3'	+	roo	9037	1	60.58
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGACAAACTTTTTCTCTACAT:1	-	chr3L	15600126	3'	-	roo	10	2	61.64
TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAAC:1	-	chr3L	27415233	3'	+	transib2	2754	1	71.32
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACT:1	+	chrX	8543523	3'	+	roo	393	1	53.57
TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGGACTTTTCAA:1	-	chr2L	14081327	3'	-	1360	54	1	69.23
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGC:1	-	chr3R	17817913	3'	+	roo	347	2	74.36
AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTAAAGTAACGGAAAGGAAATTAATGAAATT:1	+	chr3R	30344718	3'	-	pogo	52	1	57.97
GCGATTTGATTGTAAATAAGAACAATTGTGCTTAACGGCTGTGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGACACAAGATTTGTACGAGTTCTCCAAGCAGGAGATCGGCGGACGG:1	-	chr2R	17419186	3'	-	gypsy	7289	2	66.09
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAAT:1	-	chr2L	17420144	3'	+	roo	352	2	58.22
TAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAATAAGAACATGTATACTTTGAATTAGAATATTCAAATATTATTATTATTTACACATTTCACATTGAA:1	-	chr3L	17945148	3'	+	Juan	4162	1	54.79
GGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATG:1	+	chr3R	1446143	3'	+	1360	3376	1	27.40
TTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGG:1	-	chr3L	27415191	3'	+	transib2	2811	1	71.90
GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGTTGCTTGTGCTGATGGTCGCCATGTTC:1	-	chr3L	22911765	3'	-	jockey	4705	1	67.05
AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAA:1	+	chr3R	14860209	3'	-	BS	5072	1	69.86
GCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTATGTGTTCCAAAGTGAACTGAACTTACTTTACTTATCGAACAAAAGCTTAAGCTACACATATTTAAAACAATGCTTATGTTCTATTGAGAGTCGTTAAG:1	+	chr3L	23437349	3'	+	HMS-Beagle2	7102	2	72.59
GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAAAAAATTGTATATTTCTTTAATATATGATGAAAAGCAGATAAATATGGTTAAAAAATCAGTAATCAATCAATCGTG:1	-	chr3R	11105908	3'	-	Doc	13	1	34.93
AATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACCCAAGCATCAATAACCGTCAATCGTCTTTACACACAGTAAACACACATAATA:1	-	chrX	1260156	3'	+	1360	3184	1	66.15
AAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTG:1	+	chr2R	9463482	3'	-	rover	7027	2	72.60
TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGTGTTCTTACACACG:1	+	chr3R	20427507	3'	-	jockey	26	1	70.29
AATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTAGTTTATGTTACATATTTATGCATCACTTTTTTTTT:1	-	chr3R	19841928	3'	-	mdg1	414	2	78.08
GTTTATTATTATTTTTTATTATTATTTTCCATTTAACCCTAATTTGACACACACGCAACCTTGACGAACGGCAAAGGAGGCGGAAAGGGGTGTGGATGCTACGGGGGGTGCGGCGTCAGGCGGCAAGTCACAAA:1	-	chr2R	22230590	3'	-	flea	5004	2	78.36
GTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTTATCGTGAGTCATTCGCTTATCTAAACA:2	-	chr3L	4536632	3'	+	roo	9070	1	78.77
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTA:1	+	chr2R	9328709	3'	+	roo	9055	2	65.49
GCAAAACAATTAACAGCTACAATTACCGATTTATGTGAATCTAAGAGCAATCCAAGTGGACGCCCAAATTCGGTCATGCAGACTGGTATGGATCTCTACGTTTTTGTAAAACGGTGGAGAGATGCCTGTTCTTAGAGAAAAAGTTG:1	-	chr3R	1614088	3'	+	Doc4-element	391	1	77.40
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAG:1	+	chr2L	16091990	3'	-	roo	65	2	66.21
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATAT:1	-	chr2L	7888113	3'	+	pogo	2052	1	65.15
ACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAAATGTAGTATCTTCGTTAGGAAATGAAAAAATA:1	+	chr2L	6623085	3'	-	Burdock	13	2	76.55
TAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCA:1	+	chrX	17431821	3'	+	hopper	1406	2	71.43
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGC:1	-	chr3L	22437838	3'	+	roo	9033	1	58.90
AGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATAT:1	+	chr3R	11547787	3'	-	G2	313	1	53.08
GACGCTGAGGGAGTGTATATTTTTTATTAATTTGTCATAATTTATTATTAAAAAAATTATTAACCAATTTTGCTTTAAGTAAAAAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTCT:1	+	chr3R	3736167	3'	+	Tc1-2	1349	1	63.01
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCCATTTGCG:1	-	chrX	5643435	3'	+	roo	9050	2	68.49
AGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1	+	chrX	6485952	3'	-	accord	6969	2	63.64
TAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCATGTTGTACAAACACATATCCCGATACGAATTATTAGCTACGCGTA:1	-	chr2L	9539784	3'	+	Transpac	188	2	65.12
ATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGCGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATGGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGTTTACAGAGAATA:1	+	chr3R	13349129	3'	-	BS	5057	1	57.53
TGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATTTATTGTGGTTCTGCCGTTGAATGTTATTAAATATGATCCGTCTTA:1	+	chr2R	4270292	3'	-	gypsy9	25	2	54.93
AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGCCACTGCAATGTTTACAGTTTCGTATTAACACTATCGCAAT:1	-	chr2R	20899884	3'	-	hobo	72	1	73.91
TATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTAATAGATTGGCATAATAGAGCATTATTGTTGTGAAGAAGT:1	+	chr3L	19014044	3'	-	invader3	29	2	61.64
ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCGATGTGGGCAGAATCGTTCGATTTCG:1	+	chr3L	22968432	3'	+	mdg1	385	2	50.82
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATC:1	+	chr3L	20654588	3'	+	roo	9026	1	54.11
GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTAC:1	-	chr2R	9791593	3'	-	412	76	2	71.92
GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTATTATGCGG:1	+	chr2R	17626954	3'	+	opus	472	2	65.19
ATTCCTGAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACAGAGCCAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGA:1	-	chr2L	22724076	3'	-	INE-1	140	1	80.14
ATTGTGGGACACCGGATGTGACTCGAAGAATACAAGATAAAGTATTTTTAAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGG:1	+	chr2R	5265151	3'	-	Q-element	475	2	58.54
GCGAGCACAGTCTAGGATTCTAAGAATCATTACTGGAGCTCCATGGTATATTCGGAACGAGAATATACACAAAGACTTACAAATAAAACTTGTAGGAATCTGTTTTGCCAATATAAGTTT:1	-	chr2R	5114887	3'	+	Doc3-element	4380	1	75.83
ATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACG:1	-	chr3R	17605619	3'	+	Tabor	7295	2	59.84
TATTTTATTTTATTTTATTTTTTTTTATTTCTTTTAATTTAGTTTTATTTTGCTGCTAGCGTTGTGCAATTCTTGGAGCTTTTGTCTATCTCTTTGGGGCTCGATTCTCGTTCTTTATAAATCACATCTT:1	+	chr2R	10852607	3'	+	transib1	1899	1	80.77
ATGTCGAAGAGTCATCAGGGTGCCCTTCTTCCCACACTGCCAGGCAAATAAACAATCAAAGGAAAAAAGATATAAAAAGGCGTGTAAAAAAAGACAAAAGCATAAACAACAA:1	+	chr2R	6613839	3'	-	invader1	403	1	70.54
CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTC:1	+	chr2L	16016409	3'	-	412	7105	2	60.47
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCGTAGTGAAGGCC:1	+	chr2L	7898403	3'	+	roo	394	1	68.14
TTTATAAAAAAGAAAAAAAAAAGTACAGGAACAACCTGGGTACGCGTCACTTTGAGAGGCG:1	+	chr3L	10372661	3'	+	HMS-Beagle2	480	1	93.44
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTC:1	-	chr3R	7835117	3'	+	roo	351	2	60.43
ATTTTTTTAGTTTTCTTTTCCTGGGCATTTGGACAGCTTNAAAACTTAAATAAATATCCCACAACCATCACACTTGTCTTTCCTTCTATGTACTTTTTCCACCTGCTTC:1	+	chr3L	15325501	3'	-	mdg3	5104	1	46.79
ATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGGATCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTGGAAAGGTCTTCAATAGTACTTTCGTTTCGTTTGCGATAGTCG:1	-	chrY	680453	3'	-	invader2	4893	2	67.41
AAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCC:1	+	chr2L	21153555	3'	+	1360	329	1	59.57
TTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTAATTAGT:1	-	chr3R	13349051	3'	+	BS	5026	1	65.75
TAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTTCATATCAGCTAGCAACTAACCAACTGCATGACCTCGATT:1	-	chr3R	6769667	3'	-	mdg1	7082	2	68.49
CGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCTAAC:1	+	chr3R	6611302	3'	-	HMS-Beagle	51	2	52.74
GCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTTTCATTGAGAGCCAGGGCTGCAAGACTTTAAGGTGAGCAG:1	+	chr3R	22362676	3'	-	F-element	100	1	75.34
CTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGAGGGAACCCAGATGAGTGGACCACCATTATAAGCGTCTTTGAGAATAGTACATTCGCCGCTGCTTCTCCAATGTATAAAATATGTCTATATATGCGACT:1	-	chr2R	4576898	3'	-	Rt1b	4776	1	74.81
ATTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGGGGTCT:1	-	chr3L	10581693	3'	+	hopper	143	8	83.78
CATACATATGTATATGTCTATATATATATTCATATATATATCGCATGTACCCGCTATGGGTACACATGTCTCATCGACTTCGTCATGGCCTTTATTTTTAGGTTGCTGCCTGCCGCCGT:1	-	chr2L	7087540	3'	+	Stalker2	251	2	84.03
GAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTGTCTTATCATGACCCAATTCTTTTCGAAGGCGAGGTCGCCATTGAGAATGCGGCCTACGTTGTT:1	-	chr3R	26223656	3'	+	roo	8741	2	52.59
AAATATAAAAATATATAAAAAGGGGAACTAAAATATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAAATTCAAATGGGTAACTTTGAAATAAAATTATGTATTGTACATCTAGGGAAATAAATCGGAGATTAACCTTTTAATAAT:1	+	chrX	17058264	3'	+	Stalker4	7051	4	73.29
CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCAAGGGTAAATAAGATTCGGCTTGCCACAGCCACCTTCCTGTCAGGTGATGGTTATTTTAGCAGTATATTAAAAAAAAATAAATGAAACGAAACAGATAATGCTTTACAT:1	+	chr2L	10986931	3'	+	1360	3379	2	76.39
CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTTATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTT:1	+	chrX	13504217	3'	+	412	7464	2	79.85
GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGA:1	-	chr2L	21884491	3'	-	pogo	43	1	58.62
CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGC:1	+	chrX	10253269	3'	-	hopper	83	1	73.97
AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTC:1	+	chr3R	20868220	3'	-	BS	5034	1	56.20
TAAACAGATTCAAACAGACCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATC:1	+	chr2R	5173217	3'	+	Stalker4	345	4	59.59
ATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTATGGCAGCGTAATGCACTATGGTCCCTATGCATTTTCCAAGAATGGCG:1	-	chr2L	15615641	3'	-	micropia	50	4	59.55
TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGC:1	+	chr3R	10182180	3'	-	blood	53	2	74.76
AGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTT:1	-	chrX	20453686	3'	-	INE-1	542	1	78.57
ACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTTCCA:1	-	chr2R	5173424	3'	+	gypsy	7394	2	56.43
CTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTATCCCCCTTATCGCCGGTGGTTCCA:1	+	chr2L	19965093	3'	-	Doc	41	1	62.33
GGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATTTGTCATTTGTGTAAAGTTTTTTGTTGGAGAAAAATGAGAAGACTTAACGGTTTAAT:1	+	chr2R	6234688	3'	+	roo	8708	2	57.14
TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGACTGTCTAACAA:1	+	chr3R	14981293	3'	-	mdg1	22	2	68.49
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCC:1	+	chr3L	22437957	3'	-	roo	8717	2	59.70
AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTTGAG:1	+	chrX	9540141	3'	+	roo	9060	1	73.60
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAATTTTGTTT:1	+	chr3L	233366	3'	+	roo	9043	1	65.75
CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAG:1	+	chrX	1899688	3'	-	P-element	87	1	26.03
TGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTTCAACGAGCTGTCCTCCAGGATCAACAAGCTTACTCCGCCCAAGAAGCACGC:1	-	chr3L	1611698	3'	+	roo	63	2	62.04
ATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATAGAGAGTTTGTGCGTTCGTCCAAATTAATGTTTGTGTGATTGCCCGACCGAGGAAAAGCAATG:1	+	chr2L	23189119	3'	+	1360	321	1	53.78
CACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATCACTATACTAAATAATTAAATATG:1	+	chr3R	11282904	3'	-	1360	417	1	71.92
TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGT:1	+	chrX	22386752	3'	-	hobo	78	1	66.67
ACAAACAAAAAAAAAAATAAGAGAAATATGAGAAAATTATTGTTTTGTTTGCCGTGGGGGGCAGTGGGAAAGGGTTAGCAGGCGACATAACAATTGCAGATTTGCTGAAA:1	-	chr3L	10007795	3'	+	gypsy2	397	1	62.73
GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGATTTATGCAGTGCTCAGCAGCAAATTGCAAATGAAACGCAATGAAACGAATCGAAACGGAATGAATTACTACTTATGCATGCATGTTCGCCACA:1	+	chr3L	4948166	3'	-	hobo	25	1	67.83
TTCTACTTAATAATTAAGAAACCACTTATTGAGGTTTTTAAATATTTTTATATTTATTTGCTATACCCCAAGTTCATTTCTTCCTGTGCATTTGTGGCAG:1	-	chr2R	9500681	3'	+	G5	4731	1	74.00
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAACTGGGTAACATTCTTTATGCAAATCGAATTGAAACAGC:1	+	chr2R	14388041	3'	-	roo	8688	2	63.85
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGGGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCT:1	-	chr3R	31817432	3'	-	roo	8668	2	70.41
TGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAACTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTC:1	+	chr3L	16973436	3'	-	S-element	72	1	78.29
TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTC:1	+	chr2L	19965064	3'	-	Doc	68	1	56.94
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTTTCACGTTTCCTTATACATTAAATTCCCCGAACATAACATAATGTTAAATATCATT:1	-	chr3R	17420357	3'	-	roo	4	2	79.17
ATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCCTAACGTGGGGCATTTGTTCGTAAGGTGTACAATTTTATAGTCGTTGTAT:1	+	chrX	21668436	3'	+	gypsy2	305	2	66.35
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTT:1	-	chr2R	7898083	3'	-	roo	75	2	75.34
ACATATGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAAGAGAACACAGAAGCTCTTCTCTTGTTATTTAAAGTGTACTTTAGCAAAATACTAACATCTCCTAAATATCAAACATTACATTAATTTCTCAATA:1	-	chr2R	1881356	3'	+	Stalker4	7202	4	56.85
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTA:1	+	chr3R	27994272	3'	+	roo	9055	2	59.14
ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTATTATCTCT:2	-	chr3R	5061802	3'	-	mdg3	5280	2	67.12
GAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTT:1	-	chr2L	2122393	3'	+	Stalker	342	4	57.53
CTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATTACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCC:1	-	chr3L	19036004	3'	+	Tirant	337	2	69.92
GGATAGCCTAACTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAAACTAAACACAGCGAATAAACATACGCCCGGTTTAATGACACGACATTTTCTTCCACAAGAGGTAGAGATATGGGAATGGACGAAGGACGAAAGACGAGGGG:1	+	chr3R	12793107	3'	+	GATE	8342	2	51.08
TGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGGCGAAACAAGCTGAGACACTTTACGCT:1	-	chr2L	21936064	3'	-	INE-1	16	1	41.04
CTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATGTATCTATATTTATTGAATTGTTAAGTTTTTAGTTAATT:1	+	chr2R	16942972	3'	+	Doc	4259	1	73.29
TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGAC:1	+	chrX	7195110	3'	-	P-element	71	1	33.33
GTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGTGACAGAGGGAACACCTACGCCGACTCAGGACACAGGAGTTGGGTCAACGTATTTGATTTCAATAACAGTAAGTTGCAATTTCTATTCGCCCCTTTGGCGCATTTAACAAAAGC:1	-	chrX	22765779	3'	-	hobo	23	1	42.75
AGCGAGTCAGTTGGATTCAAACACCCTAAGTACCGTTTCTTAAAATTCTGCTTGCTCTTCTTACTCAAAATATAGCGTCTGGGACTTAGTAATACTTCCTTCCCTCGACACCC:1	-	chr4	290882	3'	+	rooA	7552	2	76.99
TTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTCACATTCTTGTGAAATAACCTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACATGCTTTTGGTTTTTTAGTTCTTGTTTCG:1	+	chrX	13859061	3'	+	copia	321	1	79.45
AATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAATGGACCGAAAATATATGTCCGGCATTACGTAGTCGAAAATTTTGTG:1	+	chrX	7536478	3'	-	roo	125	2	67.81
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCAC:1	+	chr3R	7100929	3'	+	roo	9047	1	64.23
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAG:1	-	chr2L	3114455	3'	+	roo	9032	1	58.22
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTACGCTTATTTTCATTGC:1	-	chr2R	21907888	3'	+	roo	388	2	69.63
TCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGGGAAGTCGG:1	+	chr3L	23678164	3'	-	Osvaldo	17	2	65.14
GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGCATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGTCTTAGCTTTATATTAGCTT:1	-	chr3L	13845088	3'	-	opus	7026	2	53.42
ACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGTATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAA:1	-	chr3R	22388974	3'	-	G2	2661	1	61.43
ACATTCAAGAGTTTTTTGAATGTCCTTATATGCTTTTCCTTCCTTTATAAGCTTAATGTTAATAATGAAAATAATTGGTAATACAATTTTAACAATTTTCTATTTTCAGACTGAATTACTTTATAATGAATTAGAATCAACATTTT:1	+	chr2R	4757251	3'	-	HB	431	1	63.70
AAGAAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAA:1	-	chr3R	17605622	3'	+	Tabor	7305	2	64.04
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGA:1	+	chr2R	25118784	3'	+	roo	9017	2	57.53
TAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGCGTGTG:1	+	chrX	9540133	3'	+	roo	9066	1	73.87
TATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACGTTATTCTCGTTTTTGTTGTTGTAACTGTGGCAACACACATTATTTATATTTATATGCTTAT:1	-	chrX	22678634	3'	+	copia	233	1	58.04
ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCAATGTGCACATGTTTACACTGTCTGCACGCCGACTTTC:1	-	chr2L	12328621	3'	+	hopper	1376	1	45.93
TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCACACAAGCAGACCCCAGAAGTGGGAGGCAGAGGTCCTGCATCCTCGTATCC:1	-	chr2R	13710551	3'	-	roo	8	2	79.17
GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCATGTGCAACAGAGTGCAACAGTTGACGGCAACGGGAAATGGGATGAAAATG:1	-	chr3L	3799743	3'	-	copia	4889	2	64.14
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTT:1	-	chr2L	16091865	3'	+	roo	9040	1	59.59
AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGTGTTCAGCATTACACTATTCCCAGTAGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCA:1	+	chr2R	24218608	3'	+	412	477	2	52.94
TATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGGGCGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAATTGAAATAATAATTTCTTATTGCTATAATAGCCA:1	-	chr3L	16787109	3'	-	Chimpo	176	1	62.33
TCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTAGCCCATTATTTCATGCTTCGTTACTCGAA:1	-	chr3R	6611171	3'	+	HMS-Beagle	234	2	69.83
TTCAGCACACTTTGAGCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAAC:1	-	chr2L	2122414	3'	+	Stalker	321	4	70.55
TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTTAATTTGTTGGTAACTTTGACCCCCTTTT:1	+	chr2L	16067192	3'	-	297	6617	2	57.04
CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATT:1	-	chr2R	16785316	3'	+	412	452	2	51.47
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTATACTGGCACATCAAATGCGCAAAGTGCAAACAGTTGCTTTTCCCGCTACTCACAACCACC:1	+	chrX	10640117	3'	-	roo	8717	2	56.74
GTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGG:1	-	chr2R	5485137	3'	+	blood	290	2	80.14
GTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATA:1	-	chr3L	7292440	3'	-	HMS-Beagle2	6923	2	60.96
GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAANCCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATTCGTAAAATTATATAAGTTGTACCAC:1	-	chr3R	25453997	3'	+	Quasimodo	7324	2	56.16
TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCTTGGTTTTT:1	+	chr3R	29361085	3'	+	mdg1	379	2	55.48
TAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATGTATATTGCTTGATAGGCTGCTGTTTCATTNGGCAATTGGTAAATGTTTTGAATTTTGGTAGAATACTTATTGGCTTCTTTATTTCGCA:1	-	chr2R	6624477	3'	+	invader1	379	2	53.28
AGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAACCAAACTGAACGAAACTAAACGAAACAATGAGCTCATTCTTTCGGCATGAAAAGAGGAGAGACAAACGCCCAGGAAC:1	-	chr3L	23652212	3'	+	1360	116	1	61.67
AGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGAAACTATAAATGCAAAATTACTCTTCTTTCTCGCCAGAAATGGAAATATCAACCATATTCCGCCAATTACAATCGCCTGTT:1	+	chr3R	30037924	3'	-	Doc	379	1	53.42
TATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTCTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAG:1	+	chr2R	6173062	3'	-	pogo	2097	1	53.85
CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTACTGAACCAGTCTGGCACTAGA:1	-	chr2L	7888082	3'	+	pogo	2069	1	59.59
ACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCGCCTCCATAAAATGGCAAATTTCTTGGGTGGCTGCCAGTCAGCTGAAGGAACCTGAAGTCAGGTGTCAAAACAGAAGATAATCGAGTGCTGCCGCCC:1	-	chr3L	20831466	3'	+	roo	294	2	68.49
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATG:1	+	chr3L	11530993	3'	+	roo	9026	1	50.34
CTTCCTTCTGCCTGTTACATACCTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACCCAACCAATCT:1	-	chrX	16541454	3'	-	INE-1	28	1	90.00
ATGTATTTATATTTATATATGACCCATGTGTAAGTGCTGTATTTTTGGGCTTCATACCTTACTCGCTATCACTGTTGACATACACCTGCCACCTCATAGTGCAATGTTTTTAATTTTACTTATATGTTTTAAAT:1	+	chrX	21009964	3'	-	diver2	445	1	50.00
AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTAAAGTAACGGAAAGGAAATTAATGAAATTAATGCTGATAACATTGCGGATACTTAATATTTTATGCAACTCAATG:1	+	chr3R	30344764	3'	-	pogo	14	1	71.92
TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGG:1	+	chr3R	10182195	3'	-	blood	7073	2	67.72
AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATTATATACACATTAACGAGTAGGGCGAATGAATCATGTATGTGTGATAGGGGGGGTATTGCGGCATTTAAGGGTTTGTTCTGCTGATCCCACCAGCTTAGACATAG:1	-	chr2R	18609308	3'	+	opus	7489	2	65.73
ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGTTTAGCACGGGTTGTTG:1	+	chr3L	7943764	3'	+	Burdock	248	2	76.71
CGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTAATCTGAGAATGTTGCCAGTTCTGCGCATCCTATTACCTCAGGAATATCC:1	+	chr2R	18339924	3'	+	roo	8744	2	65.75
GGTAACAAAAATAGCACTGACCACGTATTTGCTGAATAAAATTAATAGGGGTGATTACTTTGGTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAACGGAGTTGCACTAAACGTTTTATTGGAGCAGCAATCAAGCAATAGCTAACCAAAACCA:1	+	chr2L	4419603	3'	+	Tc1	208	1	73.97
AAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGCGATCTGCTTGGTTTTTGCTTTTCGAACTTAGAGCGGCG:1	+	chr3L	4692719	3'	-	blood	166	2	90.00
CGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTAACATTCAATTCATTTATAAACTAACCATTCAGTTATACCACCAATTCATATTAAAGAGAACTGCAAATGAATCCTCCTCAATCATCAGTAAATCATTTATTAATTGGGTAAT:1	-	chr2L	12777495	3'	+	INE-1	570	1	54.79
GAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTT:1	-	chr3R	26686041	3'	+	Juan	4184	1	69.01
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAG:1	+	chr3R	22122766	3'	-	roo	8716	2	72.81
ATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGATAAGAAAAAGATTGTTAGTATTTAGGGTGATGAATTTCGTCTGCAATTATCTATTAGGCTCGGCGCTTAATAA:1	-	chr3R	3859937	3'	+	Idefix	43	2	63.01
CTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATTTTATTAATATATGAATATTAGCTGTTTACATTTTTTAGTATCTCATGAAAACAATATTTTCTAAGGTTAC:1	-	chr2R	13013854	3'	+	roo	8697	2	51.37
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTAAAGTAACGGAAAGGAAATTAATGAAATTAATGCTGA:1	+	chr3R	30344726	3'	-	pogo	47	1	53.19
CAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCAGTTGTTGGTTGCGAAATGGAAAAGAATACTAAATTGCTTTACTTTTTTGTTTGTTTTATTGAAGTTTATTACTAAAAATTTAAATTAAAATGTT:1	+	chr3R	9293619	3'	+	297	6880	2	67.59
ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTC:1	+	chr3L	27415302	3'	-	transib2	52	1	62.10
AACGATTTGGGCGGTGACAAAAGTATTTAGACATCACATTTAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTTGCGGGTGACTGTGGTGATGAGTTGGTACAGATTGGGCATTCT:1	+	chr4	803029	3'	+	Tc1-2	191	1	68.42
GTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTGCGGGCGCCGGTGGTGTAATGGTGCCTCCTTGGAGGCTGGATTCGAGG:1	-	chr3R	24052219	3'	+	Tabor	360	2	57.89
ATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATTTGCGGCACCATCCAAAA:1	-	chr3R	7482687	3'	-	412	2	2	80.00
GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATACAACTGCGGCGTAACATGCATGGGTG:1	-	chrX	12074550	3'	+	412	7511	2	68.60
CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCCCTTCTTGCCCCAAGTCTCA:1	-	chr2R	5248207	3'	-	1360	3	2	76.58
GCAAAAACAAATAAACAAAATTAGAGTTATGTGATTAATGTGCCTAATCTGATGATTTCAAAACTATTTTGTTCTTAGCATTGAGTGACACCTTTTTCGCTGAACTTATCAGTTCTAAGAAATATTTGATTAATGCCTACTTTATC:1	-	chr2R	11670471	3'	+	Stalker2	7324	2	47.26
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCACCG:1	+	chr3R	7835229	3'	-	roo	31	2	60.77
ATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTA:1	-	chr3R	16076784	3'	-	roo	66	2	64.83
CGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATTTTTTTTTAATAATTCCATCTGGATTTGTAATTCCAAAAGTGTTTTTGTATCTAACAATATACAGTATTAAAAAAACAGTATTTGG:1	+	chr3L	17653043	3'	-	S-element	8	2	76.23
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTT:1	-	chr2R	13696383	3'	+	roo	9019	2	53.42
CTTGGATTCAAGTGCATTCGCTCTTGGATACAAGTGCTTTATGGGCTGGCTTATAAAAGTATTTTATTATATTAAATTCAATAAAAACCAACGCGTCATTTGACAGACTCTTAAATACGACAGTGTAATATTGTAGCAATCTACCC:1	-	chrX	21790161	3'	-	Idefix	343	2	72.60
AGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAATCCGCATGGTAAGACGCCTTTGGGGCCTCAGACGCTCC:1	+	chr3L	15516709	3'	-	pogo	1711	1	66.67
GCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGC:1	-	chr3L	7292484	3'	-	HMS-Beagle2	6966	2	77.93
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAG:1	-	chr3R	14979785	3'	+	pogo	2039	1	62.33
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAGGCTATCATTTTCAATTTTATAATTTCTAAATGTTGATGTTTATGATATAACCAT:2	+	chr3L	11393631	3'	+	roo	400	1	73.97
TAATGATATTATAAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGAATTTTTGATCTTAAACTCTCAGGTCCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAACACGGCTGTACATACCATTTTATGTAATAGTCATTTTTTATATGTATAC:1	-	chr2R	6989092	3'	+	HB	1544	1	70.55
CCGTCCCAGACCGCAAGTCAATTGTTACATGGAAGTTAAACCACCTTCTATAGTATCAATTTTGGCGCAGAGAATAGGCAAATAATCAATACTCCGTAGCATTATTTATATTATTTATGATCACATCGATAGACAGTAG:1	-	chr2R	5183767	3'	+	mariner2	252	1	77.70
TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAG:1	-	chrX	2842506	3'	+	Tabor	405	2	70.55
CGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAACAATTTTCGTAAGAGAAATGAGAAATATTTGCATTTACTTGAGTAG:1	+	chr2L	2597352	3'	-	Burdock	155	2	60.83
GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAACTTGCATTCATCAGCT:1	-	chr3R	30344615	3'	+	pogo	2072	1	54.46
CATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATAGAACTTGTCGTTGTGCAATTTGTTTAATGCAATCATCAAATTAAAT:1	-	chr3R	13356379	3'	+	jockey	4769	1	56.88
AAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGACAATGTTAAATTGCTATACTAAAAAATTTTCTGTGTTTGGAATATCATTAAGAATATATTTATTTATGTTTCAATTTTTGGGT:1	-	chr3L	18951843	3'	+	Doc3-element	89	1	67.23
CTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTCTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGATTAATCGTTGTTAATCCCTTGCAGAGGAGAGCAAACAGGCCAGTCGCATCTTCACCGAGGACTGCCTTGCCATCAAGAGCAA:1	-	chr2R	13902260	3'	-	hopper	1219	1	52.74
GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATTTCGCATTGACAAGAGTATTTAACACATGAAGGCCAATCAATTG:1	+	chrX	6279446	3'	-	P-element	58	1	45.89
AAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGGCAATGAATTATATGCTTGTAATATTGAATCTACTAGACGCCCATATTTGTTATTTTTGGGTTAAGTTTGCCCAGTGAAGTCCCTTTGTAACTTTGTTTTTGTCTTTCGTGTTTGTG:1	+	chr2L	9035542	3'	-	Cr1a	12	1	64.38
CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTAACAATTTTAGCTCACCTTTCTCCGGC:1	-	chrX	21016728	3'	-	Transpac	40	2	56.85
CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCA:1	-	chr2R	21572109	3'	-	hopper	75	1	68.28
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTT:1	+	chr2L	17420232	3'	-	roo	8745	2	74.66
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATCTGTTCCGCT:1	+	chr3L	20654611	3'	+	roo	9050	2	70.34
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTCCGGATTTTGTCGCAACGGTATGGGATGC:1	+	chr3R	22844300	3'	+	roo	9027	1	52.05
AATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACCAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTATCCGCATCTTTTATGAATAAAACGCC:1	+	chrX	6274944	3'	+	Doc	54	1	80.14
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTT:1	+	chr3R	16076884	3'	+	roo	351	2	57.53
TATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAGTATCAAATATGCTTACATTCTGATGGGGTGGCTGAGCTTCCCTGTC:1	+	chr3R	25337382	3'	-	mdg1	7260	2	66.14
ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGT:1	+	chr3L	7943748	3'	+	Burdock	6368	2	65.75
GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGAAACCAATTCGCCAAAATTTTAAATCTTTGAATCAATAGACAAAAAGGTAAATCATAACCAATTATTCGCA:1	+	chr3R	17831892	3'	-	F-element	64	1	52.74
ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATATGTGCATATGTGCACATACGCAGACAAG:1	+	chrX	21177029	3'	-	1360	77	1	79.84
AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTGTGTAATAAACCAGA:1	+	chr2R	9544097	3'	+	opus	438	2	73.33
AGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTCGATTAATTGTAGTTCGTAAGATAT:1	-	chr2L	23020629	3'	+	Transib5	2941	1	50.68
CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCCCTGCT:1	-	chr2R	19050152	3'	-	roo	25	2	65.52
TACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGCAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCATACAGCCAACACAACT:1	+	chrX	13704876	3'	-	invader4	56	2	56.16
AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCCCTTCTTGCCCCAAGTCT:1	-	chr2R	5248209	3'	-	1360	21	1	63.78
AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTT:1	-	chr3L	21855462	3'	+	blood	7335	1	69.64
GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGGGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTT:1	-	chr2L	15833445	3'	-	jockey	62	1	54.68
TAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTAC:1	+	chr2R	5198446	3'	-	INE-1	98	1	58.41
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGCCTATGTTT:1	+	chr2L	17420264	3'	-	roo	8712	2	52.41
AAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTAGCCCATTATTTCATGTTTCGTTACTCGCAACGAACTACGAACT:1	-	chr3R	6611157	3'	+	HMS-Beagle	237	2	74.80
TTTAAAAAAAAAAGTATTTTAAAGTGATTGAATTGAATTTAAATGAATTAAATAGTTAACAAATTGAAGTATGTATAGCGCATAGTTTTGGCCCAAAATAAATAATTTAAAATTTGTTCTCTT:1	+	chr2R	10243130	3'	-	Quasimodo	7342	2	48.78
AACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCTATGATATTACTCACT:1	-	chr3R	4504020	3'	+	INE-1	553	1	72.39
GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTCCTGCTTCGGCTG:1	+	chr2R	21101829	3'	-	P-element	25	1	52.78
TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGCATGCTGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTT:1	-	chr2L	9668212	3'	-	1360	54	1	71.96
TCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCCGGTGTAGCCATGTGGCTGGC:1	+	chr2R	9500096	3'	-	G5	4696	1	65.55
TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTACTTTGAGGGCACGCTTTGCAATTTTTGGTTCTGTTTGCAA:1	+	chr2R	5485254	3'	-	blood	7029	2	72.60
AATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCTAAGGATAAGCACTTTTAC:1	-	chr2L	2794151	3'	+	Burdock	6381	2	69.23
AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTT:1	-	chr3R	11083914	3'	+	412	434	2	75.45
TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTC:1	+	chrX	7195102	3'	-	P-element	89	1	25.52
ACCCCCTTTTTTTTGCCAAAACCCATTTTATGAAAGTCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATGCATTTAATGGGAGACTGCTTTCCCGTATTACCAGATTAAAAGTTGGCAAATTTTAATTTGAA:1	+	chrX	2081747	3'	-	Transib-N1_DM	478	1	52.34
CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGTTGGTACCAATACAATGGCACAACCAGCATGC:1	-	chr3L	22400216	3'	-	1360	17	1	72.60
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTT:1	-	chr3L	11393504	3'	-	roo	76	2	80.60
AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTGTCTTAT:1	-	chr3R	25339968	3'	+	mdg1	7399	2	58.22
AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCA:1	+	chr3L	22917686	3'	-	jockey	4833	1	68.49
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGAATATCACCAGCTTTAATCATCTGACTTTATAAGTGGGTCACACGTGTATGCATTCTTCC:1	+	chr2R	13696531	3'	-	roo	8685	2	69.86
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGCATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGT:1	+	chr2R	13084676	3'	+	roo	9020	2	61.72
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCA:1	+	chr2L	16091977	3'	-	roo	79	2	75.34
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCTTAGCGTC:1	-	chrX	13039463	3'	+	roo	358	2	57.14
ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTGGTACCACTGGTTCCACTGTGGAAATTGCAGGATATGCAAAAGGGGCGTCAGGTCA:1	-	chr3L	17205199	3'	+	hobo	2926	1	63.44
TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACCAATTTTTTTTATTAAATTTTTATTGTATATATTTTTCGC:1	-	chr3L	18555891	3'	+	jockey	4927	1	72.39
AGGCACTCACACTGCTGTCGCTCTCCATCGGCGTTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTAACGAGTCCAGCAATCGTATGCTACGTGACATAAGAATTGTTTAGGCAGAGAGCC:1	+	chrX	11798593	3'	-	R1A1-element	391	1	70.18
GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCTTGTCCAGACTTTGAAATCCAGGAATTTATTCAGCTGTTATCCAGGAATATATATTCCATATTCTTCATTGGCATGCACACATACTCCCCTGCATTCCAC:1	-	chr3R	11514899	3'	-	I-element	35	1	71.23
GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAA:2	+	chr3R	17243248	3'	+	hopper	1388	1	63.70
CGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATTTTTTAAAATTTACCTATAAATAACGAAATAAATCTTCCGCACCCATTCCCATCCAATTACG:1	+	chr3R	6210266	3'	-	1360	3214	1	57.24
ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCAT:1	-	chr2R	9791547	3'	-	412	22	2	69.57
AGGGTGACCCTAAGGAATTAGCGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATATTATTTATATTAAGCGAAACATGTTAGTGTGATTAT:1	+	chr3L	22972460	3'	-	mdg1	7153	2	73.10
ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTAT:1	+	chr2R	16785407	3'	-	412	74	2	71.43
TAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTAGCCCATTATTTCATGTTTCGTTACTCGAA:1	-	chr3R	6611171	3'	+	HMS-Beagle	204	2	56.85
AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCTTATGAAATGCCTAAACTCAACTTCT:2	+	chr2R	4601687	3'	-	HMS-Beagle2	19	2	75.34
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTACTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGATACAATCAA:1	-	chr3L	11441706	3'	-	roo	8703	2	56.16
AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGTTTAATTGTCCTACAAAGGCTGACCACAACA:1	-	chr3R	22821948	3'	+	mdg1	7456	2	75.54
TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCTACCT:2	-	chrX	8814730	3'	-	pogo	61	1	64.38
TATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAGTCAAG:1	+	chrX	21907834	3'	-	mdg1	358	2	72.38
AAAATATTTTTTTATTTTAATATTTTAGGAAGCTTGCGTGACATTTAATATAATTTTGGTATACATATACTGTTAGGCAACGTTTAATTCGATTTACCATTAAAATATGTTCTTAATATTTTATAATGTCAGTGCCGCGGAATTC:1	-	chr3L	15885674	3'	-	mariner2	830	1	80.00
GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAGGTCTTAACACGCATATACAAATA:1	-	chr2L	17081753	3'	+	jockey	4967	1	61.15
CGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAGATTCACCATACAGATTATAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCATAAACCGCACAGAACTGCCACGCCC:1	+	chr3L	19271023	3'	+	INE-1	147	1	82.73
TTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGCGAAGTCACGTCTCTTATGTCCTACGGCAATTAAACGTGGCCCCT:1	-	chr2L	5844931	3'	+	transib2	2810	1	76.03
GGGTATCTGATAGTCGAGAAATTCAAAATTAGCGTTATCGGAAAACTATATAATAAGTCTGCTATTGGATCAGATAAAGAAAGAAGAAAAAAAAATAACAGATAAGAAATGCAAAATTCTTATCATACTTTTAATTACGTTCATA:1	+	chr2R	14871506	3'	+	INE-1	556	1	75.86
TAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACTGTAGTTGTAGTTGCAAGCGAAATGCCGTTCGACAACCAC:1	-	chrX	5663028	3'	+	P-element	341	1	28.78
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTT:1	+	chr2L	16091981	3'	-	roo	58	2	68.99
TATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAAT:1	+	chr2L	2687418	3'	+	copia	237	1	52.94
TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTGGATAGAACTGCGCTTGAATAGTACGATAGCA:1	-	chr3R	23495617	3'	-	copia	18	2	73.60
CACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCGTTAACGTTATTATTATTTGAAAGTAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATAT:1	+	chr3R	11449567	3'	+	1360	279	1	64.93
TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTC:1	+	chr3L	15600358	3'	+	roo	403	1	61.79
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGGAGCGGGACAGTTGGCGTTCGGTGTCAG:1	+	chr2L	7945424	3'	-	roo	37	2	53.85
AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAA:1	-	chr3L	7292439	3'	-	HMS-Beagle2	29	2	66.18
GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTCTTTATTTATTTCAATATATTCCATGTATAATTTATGAATTTCATATTTTTTTATTATTAAATTTTAGTGCAGTA:1	+	chr2L	20808437	3'	+	HMS-Beagle	7015	2	63.08
TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTC:1	+	chr3L	3863525	3'	-	blood	7062	2	56.92
GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCT:1	+	chrX	7195093	3'	-	P-element	86	1	21.05
CGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAGAGAAAGACAATTTAAGAGAGCGCAGATCGCACTTA:1	+	chr3R	18585703	3'	-	P-element	27	1	66.43
AGATATNTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGGCTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATT:1	-	chr3R	25448325	3'	+	roo	9022	2	51.37
TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACATGGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTGGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCA:1	-	chr3R	31817425	3'	-	roo	3	2	69.23
CCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTGTATGGGTGGTGAAAACAAGGCCAAGACA:1	+	chr3L	7292846	3'	-	HMS-Beagle2	67	2	56.90
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGAC:1	+	chrX	8543539	3'	+	roo	356	2	55.88
CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAAGGGGCGTAATAGTCTTT:1	-	chr3L	23728611	3'	-	HMS-Beagle	6832	2	60.96
CCTCAAGATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATGACTCTTGCAATTAACAGTTTCATTAAATAATTCTGATGAATGTGAACTGGACATTCGCGCAGAAGACATAGTGGATTCTT:1	+	chr2L	22043024	3'	+	1360	488	1	60.96
GGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGTAACAACATGTTGTTACTGGAAGCTGTGCTGTAAATAACCCAACTATATAGCATCAACTTCGCATAACTTTCTTTGGC:1	+	chr2R	20808416	3'	-	gypsy5	7025	2	56.43
AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCCGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGGCCAGCTTTTTAT:1	-	chr3R	2461548	3'	+	mdg1	377	2	57.53
AAAAATGAAATAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTACCTGAGTCACGACTCACTCGCGTTGCCCGTGATCCTCCAGAACATGCAACA:1	+	chr4	802069	3'	+	Tc1-2	389	1	65.00
ACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCAA:1	-	chr3L	7943617	3'	-	Burdock	6206	2	69.86
AATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATGGTCATGTT:1	-	chr2R	23332507	3'	-	invader4	24	2	63.20
AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCT:1	-	chr3R	14651239	3'	-	P-element	95	1	17.14
ATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCGGCAACACGTGTATG:1	-	chr2L	12290635	3'	-	1731	4344	2	63.70
CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCAATGGGCCAATGGAGGAGCCTCCTCCA:1	-	chrX	18193624	3'	-	jockey	18	1	72.09
ATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAATAAGCAGCTGTAACTCTTCCGGAAACGAAGGTTAGCCCAGG:1	+	chr2L	2122513	3'	-	Stalker	6872	4	65.67
CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACGCCTGGTTTTTATCATAAGGCAATTTCATATTATGCTTGGGCATTTCGGCTTTAGT:1	+	chr3L	7188674	3'	-	hobo	15	1	77.40
AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCAC:1	+	chr2R	17626939	3'	+	opus	479	2	64.60
GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAATAGT:1	+	chr2R	20194308	3'	-	Max-element	8288	2	51.37
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTGATCCCCTTATCATGTCCATTATATTTGAAAACTGATTTTCACTGAGTGTATTTATTTCGGAACCACCG:1	+	chrX	8347665	3'	+	412	7496	2	50.34
ATGTATGGCCGTTACTCATCTTGTTATTCTACTGTCTTTGGTATCTCGGTATCAAAAGCGTGTAAATGTTAGAATGGCCGTGTCGGGGAGAAAATAATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCG:1	+	chrX	21907808	3'	+	1360	3370	1	40.41
AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTG:1	+	chr2R	19540459	3'	+	jockey	4931	1	62.33
AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCATTAAAGCAC:1	+	chr3R	28075451	3'	+	jockey	4978	1	71.92
GAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGTGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGATTATTGGTGGAAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGCTTTTCATATTCCGGAACTGTAATGTGGTAAAATTATGAG:1	-	chr3R	12919485	3'	+	R1A1-element	161	1	69.86
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAAGTGTTGCATACGTCGAGGGGCCAGCCGCACAATTTACATCTATGCACACACACA:1	-	chr3L	17136017	3'	+	hopper	1409	2	76.15
ATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTG:1	+	chr2R	21298847	3'	-	jockey	266	1	50.68
AGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTGCATTCGGGCATAGCGGCAACATACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGG:1	+	chr3L	2485986	3'	-	jockey	4549	1	43.22
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCCCAAGTAATTCACTAACAGATTTG:1	+	chr2L	21884587	3'	+	pogo	2047	1	73.04
AGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTTGATTCGTTTGCCGTCTATATAT:1	+	chrX	12074627	3'	-	412	7169	2	51.91
AAAAAGAACGAAAAAGAAAAAAGAGAAAAACCATGCAAGAGTTAGTCGTAAAATAACGATTGTTTTCCTTTCGATTTCCCGTTTGGGTTTTTGGGTTCCCGGGAGGTACAGCTAGCTTCTCGTGTAGTGGTTGGTTCAT:1	-	chr3L	16407986	3'	+	Doc2-element	235	1	64.03
AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTTTTTATTTGAAGGACCA:1	-	chr3R	12618584	3'	-	F-element	22	1	62.61
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACAG:1	+	chr3R	7100931	3'	+	roo	386	2	65.69
TGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAACATACAATATTACAACGAATTGTCAAGC:1	-	chrX	13704762	3'	+	invader4	3047	2	53.23
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGC:1	+	chr2L	12892721	3'	+	roo	393	1	67.29
AAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCTTTATTGTCATATGTATTTTAGTCAGTGTGAAAGGGTCTTATTTTGGCCATAATTAACTAATTATATTTTACGTTCAAGAAACCCTAAT:1	-	chr4	931069	3'	-	1360	3153	1	65.93
ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGGCCAGCTTTTTATTAA:1	-	chr3R	2461545	3'	+	mdg1	381	2	60.00
AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCC:1	+	chr2R	24218587	3'	+	412	421	2	78.33
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGTACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGGTAATAAACTAAAAATAAAGTCAATTATTACGCAATTAAGAGCAGTTGACTTTAT:1	+	chr3R	28624653	3'	-	roo	67	2	65.75
GTTCCTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGT:1	-	chr3R	31045710	3'	-	INE-1	140	1	71.92
GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTATTATGCG:1	+	chr2R	17626953	3'	+	opus	460	2	59.59
CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGATCTTAATTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTG:1	-	chr3R	26431989	3'	-	opus	7153	4	65.26
GACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTTTATTCCCTAATATCTATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACAAAAGTCATTGCTAAAACCTGACCACAGAGTACATTAATAATTAAAT:1	+	chr2R	4886049	3'	+	INE-1	580	1	56.16
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACAT:1	-	chr3L	23603185	3'	-	F-element	71	1	73.21
GAACATATTTAACAATTATTTCTTCAATGTCAACTTGATTGAAATTATTATTCTCTGTGTATTTGGGTTAAAAGCACCAACTCTTTAACTATTTTTTGCTTTCATTTTGCTCTACCTCACCCTATCTCCCTTTCA:1	-	chr2L	3105899	3'	+	frogger	326	1	74.07
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGC:1	-	chr2R	21907916	3'	+	roo	9018	2	56.43
AAAAGAAAGAATGCTATAGTCCAGTAACCCGACTATCAGATACCCGTAAGTTTTGGTACAGAAAAATTGGAGACCACAGTTGGATTTTACGTGGATGTGAAAAAGGAGCGAATGTACTACGAAAGCAG:1	+	chr3L	18744909	3'	-	INE-1	579	1	64.06
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAAT:1	-	chr3L	15600159	3'	-	roo	43	2	47.95
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCTAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAAGAACTGT:1	+	chr2L	14081432	3'	+	1360	3363	1	64.03
CACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTGTTTGGTTCCTACGTTTTTAAATTATTACATCTTATTTACAATGTGCAAGTTGTCCCGGCAGCCGACT:1	+	chr3L	10055037	3'	+	transib2	2536	1	53.42
GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAAGGTGAGGGGTGAAGAGAACTTTGTGCTTGGTCACCGTGGCTTACTGGTTCGGTTCCTGTTTCAACCGCACACGTC:1	+	chrX	2293362	3'	-	Tirant	69	2	55.48
GTACTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGAATGTACACACAATATAAGGCCTATAACACCGAAAACAATCAAAATCCCGATCTAACGGTTTTTGTTATTGTGAGGTCATACAAAAACAGCAATGTGATTGCATATTTTTGTCAT:1	+	chr2R	25049973	3'	-	G5A	2707	1	75.17
TGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAA:1	+	chr3R	14981245	3'	-	mdg1	69	2	67.59
GTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGC:1	+	chr3R	11547774	3'	-	G2	342	1	62.33
TTACAAATCCTCCCACATTCGGACTTCTCAAAATACTAACTATAGCCTAGCAAGGACAATGAGTATATGGCGATGGACACTGCGCGTTCGCCACCCGATTGAATAA:1	-	chr3L	21573052	3'	-	aurora-element	4100	1	51.89
TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGCTGTTTG:1	+	chr3L	26011952	3'	-	F-element	82	1	68.53
CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCCCTGGTCTATTATGCGGG:1	+	chr2R	17626955	3'	+	opus	7480	2	66.41
GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCAC:1	-	chr3R	30344650	3'	+	pogo	2055	1	82.98
CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCG:1	+	chr3R	28075420	3'	+	jockey	4948	1	52.41
GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGT:1	-	chr3R	14981177	3'	+	mdg1	338	2	75.69
ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCA:1	+	chr3L	20168445	3'	-	mdg3	5287	2	50.89
GGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTAGTTCTAATTACATATTAAACAAATTGTTGAAGTTAGGCAAATGCAAATATTATTTTCGTAA:1	+	chr2L	22314098	3'	-	frogger	2280	1	55.40
AACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTACAGCGTTCCCTCTTGTTGCAATCTTTGGTGTTTAAACAAAATTCGTTAAATTGA:1	+	chr4	829121	3'	+	INE-1	142	1	63.01
GCTGTGTCAGATACTTTAATTCTAAGAACTTTAACATTGTAACACACACGTACATATTCACTGTTAGCTTATTTATTTCATAATCCATTGAATTTAAGCTTCTTCCCTGCGTTCTGGACATATTATAGTCTTTATAAACTATATTT:1	+	chrX	17303517	3'	+	ZAM	8192	2	51.37
GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGG:1	-	chr3R	14049322	3'	-	transib2	45	1	52.52
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGTCAGTCTGCGTCACAGAAGCGCAATCGATTTCTTTCAGATAAGACCTTTTTAATTAAAAATGTAATTTCA:1	+	chr3L	1534767	3'	-	pogo	20	1	65.83
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGACCATATATTTATTAA:1	+	chr3R	17420504	3'	+	roo	340	2	65.07
CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATATATATTTCAATATATGTATATGTACTGTGTTGGCCGGAAAATGTGTGCGTCTGTGCGGAAATTGCATTTTTCACCCTTTTTCCATTCTGCCTTACTTTTCTTGTAATGCGATT:1	-	chrX	12214006	3'	+	opus	492	2	79.45
AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCC:1	+	chr2L	21400367	3'	+	mdg1	7370	2	75.34
TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACA:1	+	chr3L	27415315	3'	-	transib2	33	1	54.24
CTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGCATATATTTAGAGAAGATAGATCATCTGCAAGGGAGTGCCCATTTCGCTTGTTCCCCACCCAAAGTTCTACCCTC:1	+	chr3L	2486810	3'	-	jockey	4735	1	78.57
GCTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGGTTCTCACTTCCGAATGTCCC:1	+	chr3L	11321462	3'	-	mdg3	76	2	79.83
TGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTCACTCA:1	+	chr3L	20168453	3'	-	mdg3	5275	2	57.41
ATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGAAAGCAGTGCCTCCAGGAAAGACGAGGCAGGCCATCTGGTGTTTTCTCCAAATGAAAGGGTTATAGTGAAAAAG:1	-	chr3R	13059170	3'	+	R1A1-element	385	1	65.74
TCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATT:1	-	chr3R	17243106	3'	-	hopper	51	1	51.77
TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTCATAATTCGCTAACTAAGCCACAAGCCGCAAAAACTGCAT:1	-	chr3R	14937483	3'	+	I-element	5304	1	65.04
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATCTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTGATTGCGTTTGAACGACTAGCCC:1	-	chr3L	23603160	3'	-	F-element	71	1	58.39
GAAATAGGGTCGACAAGATCATTCGCCAACGTGTTCGGGTGGGCGCTAAGTACATTCGTCATCGGTTGATGAAGATGTGCTCTCCCGTGCTGATGGGCATACATCAACCCCCTGATCTGCCGGAAGAGTTTATGGAG:1	-	chr3R	5548906	3'	-	G5A	2651	1	66.42
TTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTTTCGGTG:1	+	chr3R	22822177	3'	-	mdg1	5	2	62.76
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTCACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAAATGCCTAAT:1	+	chr2R	18336269	3'	+	roo	9034	1	59.59
TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTCCCTTTGTCTGTGCAGCTGTTGAATT:1	+	chr3L	21855579	3'	-	blood	18	2	73.29
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTAGCATGAGAAGTGTAAACAAATATGGAAAATAAAAGCAGGGAACCGCAATTAATTGGTGAGCTAAGCAATTTGCAGCCGATCATGGATTGTAG:1	-	chr3L	20831610	3'	+	roo	9036	1	66.19
ATCGACGCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATATATTGACATTAACATTCAGCCTTTTACATACTTTTTTTTTTACTTTACTCTCCGGGTAACGGGGAATGTTTCACAGATAGGACTTTCCGAGTAA:1	+	chrX	20806509	3'	-	INE-1	95	1	82.54
TTTTAAAGTTATTTTTTTTTATTATCCAAACGTTAATTTTTGCAGCAAATCTGGGCAGATGGGCCTACAATCTCTCCGGATTCAACCAATACGGTAGGACTACTATATAACCTAGTGATTCCTAACAGCT:1	+	chrX	16286628	3'	+	1360	3094	1	71.54
CTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATAGTTGTTTAAAAATAGTTTTAAATGCAAAATGACGTTTG:1	-	chr3L	16750650	3'	+	Tirant	8444	2	63.01
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATCAGCAGTGAG:1	-	chr2R	19050182	3'	-	roo	29	2	52.94
CAAATAACCAACTGTCCCTGATATGTACGTAACTCCACACTCCATAAAGACCTCAATATACACACAGTTGAGACCCAAATTGAGTCAAGCCACAGAATTCACTTTGCATTCGCCGGGGGCGTTTCAGACTTTCGAGGATTCG:1	+	chr2L	4711336	3'	+	Helena	1153	1	56.34
GTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATAAAAACCAAATAAAGATAAATATGACCGATTGCGTTTTGACTCCTATTTAACTACAGGGCGACCGTGACAG:1	-	chrX	21555678	3'	-	mdg1	212	2	62.31
ATAAAGTAAAACTATAAAAAAAAAGAAACATAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTTTAAAATGAGCCAACGCGAATTGCGCGGTCATCGGGAAGTTAGCCCCTTGACGACCATCCCCTCTCATCAGCGCCTCTTCAGCGGC:1	+	chr2L	15018088	3'	+	Doc3-element	169	1	66.67
AAAATTTAAGAAAAAAATAAAAAAAAAATAAAAAACTGTGAGCAAAAACTCCCATGGAGGAGTGGCGACCAAAT:1	+	chrX	8854776	3'	+	TART-C	11096	1	77.03
ATACTTTTTCTGGGATATCGATAGATATATGTGGTCAAAAAAACCCATTAATATTGAAATAATTAAAACGAAACATTGTTAGCTAACTAACAAAATTAAACTGTTCGATTCAAATCTTTTAGCTTGTGAAGTACCCGATGTCCCGA:1	+	chr2L	21938842	3'	-	INE-1	504	1	71.23
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAAATAATTTTATGTTTATTTTT:1	+	chr3R	16404599	3'	-	pogo	29	1	66.44
CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGTTAAATAACTTTTTACTTTTGTTAATTACCAGTTTTATTATTATTATTTATAACTAG:1	+	chr3R	17605784	3'	-	Tabor	6849	2	77.40
AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAA:1	-	chr2L	18419125	3'	+	412	7495	2	50.00
AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTTACCTACGTTTAATTTATGCACAAATAATACGAGCAAATTATTCGCTTTGTTCCGCAACTGTTTTTCAAGTGAATTGTGTTTGGTCAG:1	+	chr3L	20888825	3'	-	1360	22	1	63.70
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAGCTACCAGAGATTCGATGAACACTTGCCA:1	+	chrX	14336536	3'	-	roo	35	2	61.64
AAAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCAC:1	+	chr2R	5532314	3'	+	Cr1a	4212	1	49.32
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACA:1	+	chrX	6486793	3'	+	roo	9032	1	60.18
GTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAGGCAAGGGCTGTCAGGTCGAACAGGAGTTG:1	-	chr3L	23933528	3'	+	Cr1a	245	1	50.00
AGTGTGGTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCGAT:1	+	chr2L	17551102	3'	-	Transib-N1_DM	226	1	51.37
TAACATAACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATATTTAAATTGATTCCGATTGTAATTTATGCCAATAATTTGTTTATTTAAGCTAATGAGGACATGCATCTTGCATCTTGCATGAAGAGATAAAAACATAAATGAAGA:1	+	chrX	20870224	3'	+	gypsy	447	2	51.72
AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCC:1	+	chr3R	14860238	3'	-	BS	5008	1	68.47
TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTTCCCGAAATTATGCAGAAAGAAAAGGTCGTTTCCGGTGGCCGAAAAGGCAGAGAAAGTGGAAAAGTGGAAAAACGGAAGCATGCAGGACATGAGTAAACA:1	-	chr3R	6524766	3'	+	I-element	5337	1	75.54
AAAATAAACTAAAATAAAATAAATCTAAGCACACAGACACACATGTTGGGCGTTTTGGCCAAAAAAATATGTATATGTTGGTGTCCCTAAAAATAATTTTAATGAAGCTTACCTAAAATAATGCACGAAAATATTC:1	+	chr3R	9222140	3'	-	transib1	1898	1	60.29
TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGAGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCG:1	+	chr3L	22917684	3'	-	jockey	4802	1	61.06
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAACTATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTTATC:1	-	chr3L	4536656	3'	+	roo	9046	1	62.33
TTTCTTTTTCTTTTTTTTTTATCAAGGTTTGAATGCTTAAGAGTTTTAAATCAACAGCTCTATAGGGGGAGTATAACTCCAGGGGAATAATCTCTGTCAAGGTTTATCCAAAAGTAGTTTATAAGTCGGACCCCACTTTGAAGCAG:1	+	chrX	19332855	3'	-	BS	5103	9	39.73
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGG:1	-	chr2R	8585417	3'	+	roo	355	2	53.42
CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGTTTAAT:2	-	chr3R	22821973	3'	+	mdg1	386	2	44.52
ATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCATACAGCCAACACAAATTTTATGGGCTTGCATTT:1	+	chrX	13704893	3'	-	invader4	2789	2	60.58
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTT:1	-	chr3R	17420412	3'	-	roo	8717	2	60.14
TTTTTTGTTTTTTTTTGTTGTTTCTAATCTCAGCCAAATCGAACCACTGTGCACTGAACCTGCGCACAGTGGTGCTCGCGCTCTTGTCCAGTTCG:1	+	chr3L	737783	3'	-	gypsy7	5001	2	74.74
GGGTATCTGATAGTCGAGAAACTCGACTTGAGCTCTAGCCCCTGTATGGTCTAGTTTCAAATGACCATATTGGGGGAAACGCGCGCCAAAATTTGAGATATGCTCTTCTGCGCAAACTCTCTC:1	+	chr3R	7037253	3'	+	INE-1	556	1	56.10
GCTTCCTTCTGCCTGTTACACACTTTTCAACGAATCCTATACCCTTATATCCAAATACCCTAACGGGTATAAAAATGCACTAAAAGTATATTTTGTTTTATGTAGAAAGATAATTTGCAATCGGCTAATTGATTTCGATTTGTTTG:1	-	chr2L	22002454	3'	-	INE-1	29	1	75.34
CTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCC:1	-	chr2R	5209613	3'	-	gypsy	75	2	68.79
CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGGAGTGTGGCAAATAAATTGACATTTAGCTGGGCGTGTAACAAGATCAAGTATACGCAATGTCGCCCACGTAACTTTGATTTGGTA:1	+	chr2R	21920615	3'	-	jockey	30	1	65.19
ATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACTTGTTGGCATCTGGGCTGCCAACTCACGCTTATAA:1	-	chr2R	23877708	3'	+	297	6925	2	57.53
GCATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACACATGGCCTGAATGACGACGAGTGTCACTTGCATCCTGTATAATT:1	+	chrX	21247594	3'	-	blood	170	2	75.00
AAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCACCAATAATTTTTCAACACAACATAATATTCCGCTTAAATTACAAGCCGCGG:1	-	chr3R	14419970	3'	+	Stalker4	262	4	65.07
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGA:1	+	chr3R	7100912	3'	+	roo	9021	2	51.37
CTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACGCTTCACGTTGAACTGAACTG:1	+	chrX	2517632	3'	+	P-element	322	1	18.71
GACTTCCCCAGGCTCTGTCTCCGAGGGGCTGCTATCGCTTGAGCTGCTGCTCTTCACCTCCTCCTTCTCTTTCT:1	+	chrX	4899084	3'	-	G-element	438	1	82.43
CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGC:1	-	chr2L	14081336	3'	-	1360	65	1	77.31
AGGCATGTTCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1	+	chrX	6485952	3'	-	Idefix	19	2	65.83
TATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAG:1	-	chr2R	20596455	3'	+	roo	361	2	54.89
TATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGG:1	+	chrX	21947738	3'	-	mdg1	7078	2	50.38
GATCAGGATCAATAGCCGAGTCGTCAGTCCGTCTGTCCGTATGAACATTCAGCATACAGATTCAAGTTTGTTGATCCATTTTTCCACGCCCACTGGAACAGCTTTTGTCCACCTGTATCCATCTTAGGAACCATA:1	-	chr3L	22639669	3'	+	INE-1	92	1	69.63
GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGC:1	+	chr3R	28075423	3'	+	jockey	4950	1	54.11
AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATC:1	-	chr2R	10582361	3'	+	Juan	4175	1	57.24
TGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTCAGGATCGCTTATTGTCCCTTGGCTCATCGCTCACTT:1	+	chrX	4213470	3'	+	flea	134	2	64.76
TGTTGGCCAAACGTTTTTTGTTCCCATGTTCCTGTTTAGACCATTCCTTTTCGCGTCATCCTTTTTTGTCGGCATTTCGGGCATTTGATATCTTTTGTTGCTGGACTCAATGAATTCGTTCTTCAATCGGCACTCTTACTGTCACT:1	+	chr3R	21898762	3'	-	FB	344	1	82.88
ATAACAGTAATATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGACCGAAAGGTTAGTATTTAGGATAAGAAGTTCTTCGGAGCTAATAGTTTGAAAAAAGTAGTGCATACTTCAAGGCGATGGTATGTATTTTGTATTTGGATGACTTATTT:1	+	chr3R	13770173	3'	-	BS	5047	1	72.60
TGCAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAACCCAAAGCAATCACTCCTATTAAATTTATCCATCTCAAACGACATAAAGCATTGAAATGTCAATATATGCACATGAAAACATATTAAATACCTTAAAAATATATTAACTTT:1	+	chrX	19693673	3'	-	Tc1	285	1	61.64
CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGGACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTAAAATAGATCAAAGCCGAAAAATAATCAACGACCTTTTTTGAGAG:1	-	chr3L	17115456	3'	+	blood	302	2	65.75
ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATT:1	-	chrX	17054222	3'	-	jockey	95	1	75.17
CGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTCAGCTACGTGGAAAGAAATTGTATCCGCATCTATATCCTTACACCCTTAAGCGAATATGCGAAC:1	+	chr2R	4782419	3'	-	Quasimodo	7183	2	65.07
GTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACACTTTCCATGGCC:1	+	chrX	22715156	3'	-	Bari1	31	1	58.87
GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCATAACT:1	+	chr3R	27424957	3'	-	blood	23	2	67.57
GGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCTCTTGTCATGATGC:1	-	chr3R	27424806	3'	+	blood	375	2	76.67
GGAGTGTATCCGTCCCATTCATGCCCGTTGATAGAAATTATTTCTGCCTCGCTTTATGAATACCCAAACATACGCTAATAGAGTTTTCAGAAGACAACGAACTTAAAGTAAACTCATTTGCTAGTCGAA:1	+	chr2R	3291540	3'	-	invader5	3830	2	59.69
AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAAT:1	+	chr3R	15364001	3'	+	flea	228	2	57.29
ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGT:1	+	chr2R	6885423	3'	+	flea	229	2	56.85
TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGTTCATTCAGCCCACTTCCTACCTTTTTGTATGTGCAACTT:1	+	chr3L	17685273	3'	+	mdg3	244	2	60.42
CGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAAACTAAATTTGCCATTTCATGGCGAAATAATGCA:1	-	chrX	6278915	3'	-	P-element	339	1	30.83
CATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAACGGGAAAACAACAAAGCGAAAAAAAGAGACGAAAACTAGTGCATGCAAAATGAGTTTGCCTGTTGA:1	-	chrX	3646566	3'	+	Quasimodo	455	2	54.79
ACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1	-	chr3L	23112571	3'	-	R1A1-element	43	1	72.09
CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTA:1	+	chr3R	6611292	3'	-	HMS-Beagle	61	2	59.59
GCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGCCTCAAGACTTCCCCCAAGGTTATTCAGAGATCCCTCGACGAGCACCTTACGGTCCTTGTAGAAGTTGAGCAGATGGTTCCACAGCTGCTGC:1	+	chrX	11902246	3'	+	X-element	4659	1	60.80
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCAC:1	+	chr3R	27994264	3'	+	roo	9015	2	66.40
ATATATGTATGTATATATATTTATATACGTTAAGATAATAAAGCAATGCCAGAGTAACATCAATCTATATAAACTATGCGTAGAACAATAGAAAACTTGCCATGAAAATAATCGAAAAATTCTGATTTAAAAA:1	+	chrX	16117736	3'	+	1731	4411	1	77.44
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGC:1	-	chrX	6486715	3'	-	roo	61	2	64.71
TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCGGAGCCCAGAACGAAACTCCTGCGTTTGATTCCAGACAGTTACATATT:1	-	chr2L	21891664	3'	-	mdg1	10	2	76.03
TGCCCTTTTAAATATACTAATTAACTTAACCAAACTCACTTTTTAGAAAATATTGACAATTTCGGTCAGCTTGGCAAAAAGGAAATCGTCGCACAGTCCGCACCCAAACAGCGGCAGAGGGCATTAGCCAGACTTTCTGAACCGTG:1	-	chr3R	31884110	3'	-	HB	296	1	69.18
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTCATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAAC:1	-	chrX	5643447	3'	+	roo	9038	1	60.27
GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAG:1	-	chr3L	11321398	3'	+	mdg3	5476	2	55.36
TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTG:1	-	chr2L	17295859	3'	-	Doc	25	1	53.57
AGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGAGGGGTCACATAGGTAAGCCATGGGGATAATACCCACGGTCTTGACTTAAATCGATGCTACTTTTCGGTTTAA:1	+	chr2R	15007653	3'	-	jockey	4887	1	50.68
TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCA:1	+	chrX	13504231	3'	+	412	7466	2	73.29
GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTG:1	-	chr2R	9662707	3'	+	412	429	2	61.54
TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATCTTGGATTTAATCCCTATATCATTTCACTCGCTTATTTCCATAAAATATGCGATACCCCTTTTCCCCTCTTTAAGATCCGGCCAAAGAGCAAACTATACAATAAAGAG:1	+	chr2L	15180963	3'	-	jockey	4846	1	71.01
TTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCATAATCTTTTTACTGAA:1	+	chr2L	22121671	3'	-	gtwin	25	2	52.05
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATCTTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAG:1	+	chr2L	7945386	3'	-	roo	8733	2	75.81
TCTGCCTGTAGACCACACCAAGTTCAGTTATGAATCAGGAATAGATCAGGAATGTACACATGCTGAATAAAAACCAAATAACGGACCATATTTTCAAAAACATTTGTTTATTGGGCAATTATTTTACTGGG:1	+	chr3R	7773561	3'	+	mdg1	7328	2	61.83
TTTTCTCTTTTTTTTTGTTTTTGGGGTGCCCCCTTGCCAGCCGTTTTCCTTTTTTTTTTT:1	-	chrX	3088807	3'	-	gypsy7	5001	4	41.67
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGCAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTGATTT:1	-	chr3L	15519728	3'	-	pogo	40	1	60.00
CGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGTGAAA:1	+	chr3R	1446151	3'	+	1360	3384	2	28.77
AGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATAGCATTGCACTATAGGCCACGCCC:1	+	chr3L	8249127	3'	-	jockey	4549	1	52.78
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACGATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCG:1	+	chr2L	16091963	3'	-	roo	8750	2	83.45
CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCAAAATCAATATTTTCATA:1	+	chr3L	3477538	3'	+	mdg1	7420	2	58.22
ATTAAGATGATTTTCTTTGCATAGGGTTATACTAGCACATATCTTTTATGACTTTATGACTTTGACTTATGACTTTCACACAAGTCAAGGGGAATCGGAAGTGACTATATGAGTTCTGAGCGCGGAAGGGAAGCACAGCACTGATG:1	-	chrX	2089984	3'	+	Transib-N1_DM	63	1	55.48
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAATGAGAAGAATAT:1	+	chr3R	17818012	3'	-	roo	8696	2	63.19
GATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATGTATACTATACAGGCAGCGCCATCGTCTTGTTGTTTCGCAAATATTTG:1	-	chr3R	24455362	3'	-	Quasimodo	67	2	71.23
AGAGAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTG:2	+	chrX	21564730	3'	-	diver	5973	2	77.24
ACGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAAATAGGAGTCAAAACGCAATCGGTCATATTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGC:1	+	chrX	21907809	3'	-	gypsy11	452	2	67.41
ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTCTCCAAGCCACTCGGC:1	+	chrX	11296448	3'	-	BS	5084	1	79.45
AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGA:1	+	chr3L	7588481	3'	-	hopper	45	1	68.93
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACG:1	+	chr2L	14772113	3'	-	roo	8744	2	71.92
ATAATAATAATAATAATAATATAATAACCAACTCAAAAACATTCAGCAAATAAACTGACGACTGTAGCTTTTTTTTCAAGTGGACGTGAATATTTCTGGGTGTTCCGATGTGTA:1	-	chr3R	26197639	3'	+	mdg1	7070	3	77.19
TACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCTTCCGGTTGGCCGGGCCTGGGATCCGCGTTTTATGCAACAC:1	+	chr3L	12308427	3'	+	hopper	1368	1	50.00
TCTATTCACACAAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGAT:1	+	chr3L	4605716	3'	-	pogo	63	1	64.14
TAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCAGATGCACCTGACCCTGCAGAGGAGTCACTTGCTGGAACGC:1	-	chr2R	9545596	3'	+	opus	7355	2	68.00
AAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGA:1	+	chr3R	3286152	3'	+	gypsy12	9831	2	73.29
TAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAGAGAAGTGAATATACCTTTGGTAAGG:1	+	chr3R	25448483	3'	-	roo	8679	2	74.66
TAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGGATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATTATGTGTTCTGTTGGCAAGGTTTTT:1	-	chr2L	20808315	3'	-	HMS-Beagle	6855	2	58.22
TTTGGANATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATATTCGAAATGTATGTAGAACGACGGCGACGCCGACACTTAA:1	+	chr2R	13335065	3'	-	roo	349	2	66.39
CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGAAATCACAAAGGAGCCGCGCAGATTGATGGGTTCAAATGGCTGGGCGAAGGCGATGACAAAAGTT:1	-	chr3R	28075306	3'	-	jockey	4693	1	59.82
TTTTTANTTTCCTTTTTCTTTTGCTTCTTACGGCCATTGGTTGCGTTATCAGAAGATTTATCATCGGCGATTTT:1	+	chr3L	5498419	3'	-	Doc2-element	252	1	56.76
AAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTGCTAAACATCATCGGTGTATGGGGATATGCTGTCGA:1	+	chr3R	24383360	3'	-	rover	10	2	72.73
GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAACACAAACAACAATCGCTTCGTCTACGTCGTTTT:1	+	chr3L	10385945	3'	-	Burdock	6138	2	73.27
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAATTATTAGTACGTTGAG:1	-	chr2L	16091927	3'	+	roo	357	2	79.61
TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAATTAAAAGGCATTTG:1	+	chr3L	20831422	3'	-	roo	17	2	73.97
TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTG:1	+	chr3R	14981274	3'	-	mdg1	29	2	61.94
ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGAAGTCTCGGAACTTCGATCTTTGTTTCGGTGTCAGTGCACAGAAAATAATTCTT:1	+	chr3L	3863581	3'	-	blood	7022	2	78.08
TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATNGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTAACCTCAACTAAAGA:1	-	chr2L	16091850	3'	+	roo	395	1	67.83
CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACAGGGGTTCTCAATTGTGAGCATATATTGGTTTATTATAACTGTAATGCGAGTTATACGTCAAGTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCA:1	-	chr3R	10182111	3'	+	blood	7342	2	44.44
TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCATTGAGTTTGTTAAA:1	-	chr3R	7835102	3'	+	roo	361	2	51.39
GGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTA:1	+	chr3R	11547759	3'	-	G2	357	1	72.60
GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTGCTAAACATCATCGGTGTATG:1	+	chr3R	24383345	3'	-	rover	6971	2	62.93
TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATAATTATCCTGCGGGAAAGGGGAGTTGAGTCCACACATTTGGGTGGTCAGTGACCGACCAGAGTGAGCAAGATTTTCCC:1	-	chr3L	20888647	3'	+	1360	3381	2	77.40
TGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGG:1	-	chr2L	12290687	3'	-	1731	4385	2	70.37
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTCGCTTGTC:1	+	chr2R	16891954	3'	+	hopper	1411	2	64.66
CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGCGTTCTTACACACGCACTAACCCATGTTTA:1	+	chr3R	20427523	3'	-	jockey	18	1	76.03
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGATT:1	+	chr3L	11531025	3'	+	roo	394	1	74.66
GAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGTGACATTCTTGTTTCTGCTTTAAAGCCCTGGAAGAAGTGGTCAAGGGTCACCGAGTGGAAACTAAACTCAGTCAGAATTTAAGCATTCCCTCGTGCTGCG:1	+	chr3R	31024656	3'	-	G2	2977	1	52.80
TAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGTTTAGCACG:1	+	chr3L	7943756	3'	+	Burdock	6376	2	71.23
ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCCGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGC:1	-	chr2R	19499315	3'	+	P-element	2822	1	35.71
AAATGAAATGAAAATGAAAATGATAACGGAAAGTAAAATTTAATTACAAATAGCTCATACTTTGGTACAATTTTTTATTTGTACATTTCATAAATGCATATTAAACAATTATCTTCTTTCGTGATCTTAAGAGTTGAAGCTTTAAG:1	-	chr3L	16406651	3'	-	17.6	326	2	77.40
CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCG:1	+	chr3R	19968168	3'	-	roo	91	2	83.56
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTGTGTTGTTTTAACCTACAAAATTGCAATGAAAAG:2	+	chr3L	21818046	3'	-	roo	8750	2	81.25
CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAG:1	-	chr3L	7588422	3'	+	hopper	1349	1	68.89
GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTT:1	-	chr3R	13360307	3'	-	jockey	78	1	64.14
TGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGCGAGAAAGTGAGATCGAAAAGTGCAGTTTATGTGAATGCAAAAAAACAACACCAAACATCTTTTTTTGTGGAATTTCTTTTAATTTCTTATTAACAGCTCTTT:1	-	chrX	8215712	3'	-	Cr1a	327	1	69.18
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTT:1	-	chr2R	9328583	3'	-	roo	8687	2	63.33
ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTG:1	+	chr3R	28075418	3'	+	jockey	4951	1	52.86
ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGC:1	+	chr3L	20168441	3'	-	mdg3	73	2	65.07
CATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1	-	chr3R	17660024	3'	+	micropia	389	2	62.33
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTG:1	+	chr2L	3886254	3'	+	roo	9034	1	54.55
GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCATTAAAGCACAACG:1	+	chr3R	28075455	3'	+	jockey	4983	1	75.17
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACG:1	+	chrX	9540123	3'	+	roo	9038	1	57.36
AATAATTAAATTAATTATAAATACATATAGTCTGTAAACGTGGAAGTTAAAAAATGCTTTGCTAATTTGCTACCTGACGCATTCTCTCCTGGCCATAAAAAGCTTATTTGTAAAAACTTATAGATTAACCAACCCGTTATTACGCA:2	+	chrX	21049404	3'	+	flea	4991	2	56.85
GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCC:1	+	chrX	17963963	3'	-	jockey	4810	1	53.15
AGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTAAGCATAACAGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAAGTATAACTATCTAATTCATATTTTAAAATACAAAGTTTTTTAAGGAGCTGATTGAGGAGAGA:1	+	chr3L	17463170	3'	+	invader1	302	2	54.86
ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCCAGTAGTTAAATAAGGCAACCGCTTTTCC:1	+	chr3L	4605753	3'	-	pogo	27	1	67.12
ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAG:1	+	chr2R	16945348	3'	+	jockey	4923	1	67.67
TGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCATGGCAAGCCTCATCTGCATCAACATTGGCATATTCATTCCAAGTTAAAGAATTCGCTGTTCATTAACTTACTCATTTATTCGGAATGCTG:1	+	chr2L	6860932	3'	-	pogo	1658	1	69.18
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCG:1	+	chr2R	25118775	3'	+	roo	344	2	63.70
ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCG:1	-	chr3L	17558032	3'	+	jockey	4938	1	72.65
TGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTAAAGATAAAAATTACAAAAAAAGTGAAAAAAAAAATCTTCAATAAAAACTTATGATATAATCAACAAAAAAAAAAGCATGGGTTAGAAATCTTTAATGTTTGCTGGGC:1	-	chrX	17864789	3'	+	BS	5023	1	70.55
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTTTTATATATTTTTGTTTCGCTTAATT:1	+	chr3L	19334331	3'	-	roo	73	2	73.97
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATTCACATTATA:1	+	chr2L	12892738	3'	+	roo	9034	1	60.96
TATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATACAGTGAGTTGCACTAAAGTCTTGAAAACACCCTTATCGTATGGCATACCTCCAC:1	-	chr3R	19258096	3'	+	Stalker	255	4	60.71
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTT:1	-	chr2R	16945301	3'	-	jockey	56	1	63.48
CGGGCCGAAATCAATTCTGGTCGAAGAAATGAATTTACATAGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAGCTTTCTGGTAATGGTAATGGTAATGGTGAACGGCGATGCCGACATCTTGAAGTTCATTCCGTTTAGTC:1	-	chr3R	9225820	3'	-	1360	3178	1	51.37
CCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTGGAATTGTTATAACGATGACCACCTATGTAATAAGTGCGGCCCCTTGTATTAT:1	-	chr2R	3293908	3'	+	1360	225	1	57.45
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGG:1	+	chr2R	24218589	3'	+	412	7485	2	75.68
AACGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAACGAAGTGCCAATGTGAG:1	+	chr3L	16343275	3'	+	roo	404	1	52.73
GCACACTTTGAGCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCA:1	-	chr2L	2122416	3'	+	Stalker4	7281	4	70.71
GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGTAATTTCAATTATCAATAACATATTTAAATTCCCCATTCTCCTCCCCTTCCATTATCCTCTGTCCCTCCTTCCCCCCTCCAC:1	+	chrX	2296020	3'	-	Tirant	28	2	63.97
ATGCTTCCTTCCGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTACTCTACGAGGAACGTGTATAAATACATACATTTTTGTTATTATTCGTGTAAGGAAGGAAGTTCGGGGAACTTAGCTAGCTTTCTGCTACATTC:1	+	chr4	869902	3'	-	INE-1	31	1	63.91
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATTTCCTTTGGGGCTAAACGCTTTTAGTTCACTGACAATGGTACACTGCGACAAATGCCACTGTGT:1	-	chr3R	22844127	3'	-	roo	4	2	78.62
CTGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCC:1	+	chr3L	18592072	3'	-	Cr1a	458	1	47.30
GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTT:1	+	chr2R	4939193	3'	+	1360	3361	1	35.62
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTGGTAGGCTTTACATAAA:1	+	chr3R	12886971	3'	-	roo	8745	2	78.77
TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTATTAATTAATGTTAATAT:1	-	chr3R	6290928	3'	-	Doc	34	1	64.58
AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAATTTGGAAGGCTCATGGGGGGACAAGCAAAGGTTGATCCCAAACTT:1	+	chr3L	9673178	3'	-	Doc	22	1	64.14
ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTTGCCGCCATTTCACACATATAATACGCA:1	-	chrX	6498903	3'	+	Quasimodo	7347	2	68.49
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAAAGTTTCGAGATTCTTGCACTGAAG:1	-	chr2R	14542101	3'	+	roo	9042	1	60.96
CTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCATTTAGTATTCAC:1	+	chr2R	21298865	3'	-	jockey	248	1	61.64
CGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAGTAGTTATTGCTATACACGTTACTCGTGTACTAGTTTATTGTTTTAAATAATACAGCACAGAATA:1	+	chr2L	9399552	3'	+	Transpac	258	2	55.17
GAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATNCTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATA:1	+	chr3L	20033780	3'	-	blood	61	2	56.16
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACCGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAGTTTTCACGCACGG:1	+	chr3R	27994309	3'	+	roo	9041	1	62.50
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGCTACAAGGCA:1	-	chr2R	13585374	3'	-	412	29	2	64.38
GATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATT:1	-	chr3L	23635037	3'	-	gypsy6	184	2	54.11
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTG:1	+	chrX	9540133	3'	+	roo	9038	1	60.43
ATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTAGGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAACACGTAACGTAGGGTCTTTTCTTTAAGCATTTCCG:1	-	chr2R	5505551	3'	-	Tc1-2	362	1	70.59
CAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTGCTAAACATCATCGGTG:1	+	chr3R	24383341	3'	-	rover	6993	2	53.73
AAAAATTAAAAAATTAAAAAAATATTTTGCTCATTTTAAATATATATCAAAAAAGATATTAAAGTGAATTTAGTATTTAGTACTTCCATTTTTTGGTTCCCCCTTCTAAGAAAATAGTAAGCTCTTTAAGAGGCAACAATAAGTTT:1	+	chr2L	16707975	3'	+	Doc	4697	1	35.62
GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTG:1	+	chrX	11296466	3'	-	BS	5041	1	61.98
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCGGACCACCGCAATTTTCTTTCATTTTCCGTAGTGCATTTGCAATTTGTTGAGTGTGTTTCAATTAAATTAA:1	-	chr3R	28624547	3'	+	roo	9022	2	53.42
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTTAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACT:1	+	chr3L	15177301	3'	+	roo	9027	1	58.33
ATATGGAGGTATCCTGTTTGATTTAGTGTACCCTATATCTGTACCATGTCTCAAAATCCATAGTATCTTAGAGAAGGCAGTTCGGAACGGATCGGTGAAGGCAGGAAGGCAGAGAAGA:1	-	chrX	22575176	3'	-	Bari2	843	1	54.24
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACG:1	-	chrX	10639996	3'	+	roo	9028	1	52.74
ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCC:1	-	chr2R	16891834	3'	+	hopper	1351	1	60.84
AAAGTGGCTGCATAGTTCCAACCCAATTCAGCTACACACGGAAAGTTTTGGGATAATTCGGTTATCGCAAATAGAGTGGGTGCTCTTTCCAGCGAGTGGCAGAAGAGAAGAAGCAGCAGCAGCGGGACC:1	-	chr2L	5538774	3'	+	1360	3345	1	62.79
ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCA:1	-	chr2R	5485144	3'	+	blood	342	2	74.42
CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGTGTGCTGGTGTTGGAAAATTGCAAGCCAACATAAATT:1	-	chr2L	6569904	3'	+	jockey	4968	1	63.01
AAAGCGAAATGAATTGAAACTAATGCCGAAATAGCAATCAATGCAACATGAGCAACATGAGCGACTTGCACTTGCAACAGCTGTTGTTCGCTTGCTTTCCCGGCGACCAACTCGAAAATCCTGTT:1	+	chrX	6906214	3'	+	invader2	425	1	49.60
ATTTATTTTGGGTCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTAATAGTATCAATTATGTTTTTCAGGTCGAGTGTTAACAATCGTAAACGATGTTTTCATAACGGCAATTCTTTATCAATAAAA:1	-	chr3R	906045	3'	-	G5	4816	1	62.50
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTGCATCT:1	+	chrX	6486834	3'	+	roo	9040	1	57.53
CAAATATTTGTACCTATATATTGCACTTACTGTAATCAAAGTCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACATTAGCCCCGATATGACGGACGGACCACGATGTTTG:1	-	chr3R	30294595	3'	+	HeT-A	5974	1	59.80
CGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGCCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCC:1	-	chr3L	26852646	3'	+	1360	3386	2	51.67
AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATC:1	-	chr3R	30344619	3'	+	pogo	2041	1	66.19
AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCT:1	-	chr3R	30344615	3'	+	pogo	2038	1	65.07
TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTG:1	-	chr3R	20499776	3'	-	mdg3	5341	2	75.34
AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTCTATTGCAGACATCGGTGCTCGTCACAGATAGCCAATCGAATCGA:1	-	chr3L	12879697	3'	-	roo	27	2	65.75
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCC:1	-	chr3R	27994192	3'	-	roo	8737	2	69.18
ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATACTATATATATATATAGGTGGGGTCTTGGGATTTGTGCGGTGCATACGTAAAGCGGTTCTTGCAAATTAAGGACTTATAC:1	-	chr2L	10037284	3'	+	Quasimodo	7359	2	70.09
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCA:1	-	chrX	9540003	3'	-	roo	52	2	59.59
ATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGCTGTGGCCGGACATTAAGCCTTTTGGCCATTTGCATTGGCACTTGCCAATTTTCCCATCGACCCACCACTCACACTGGATCAAGTTTTGCAGC:1	-	chr3R	14338661	3'	+	copia	4658	1	74.24
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGATTTCTATATCATTTCAACATATTCAATCATAATAGAATTCTATATAGATATAGCACTATATCTTATTATGCTACATCATAAGATTGAA:1	-	chrX	8347540	3'	-	412	31	2	49.66
TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCC:1	+	chr3L	17560397	3'	-	pogo	45	1	54.11
GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTCAAGGAGCCGAGTCGTCGGCTAGG:1	-	chr2L	14081270	3'	+	1360	3385	2	79.03
AACCAAAGACCCTAGAATATTCTAGTTATTCTAGTTATTCCATTATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACTGGATACCTTTCTGCCCGTTCGAAAGTGGAAATCGGGAAAGCAGCATCCATAAAAAGCAATTCGACTTTG:1	+	chr2L	14798909	3'	-	Tc3	313	1	48.28
GCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCA:1	-	chr2L	2122399	3'	+	Stalker	336	4	60.96
CATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGG:1	-	chr2L	12290687	3'	-	1731	4387	2	70.80
GATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTGGC:1	-	chr2L	21580871	3'	-	INE-1	541	1	50.68
TTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTGTTTGAGGCAAATCTGCTCTATCTCGGTTTTAGATTCTTCAAATGAGCATTTACACA:1	+	chr3L	25730798	3'	-	Quasimodo	199	2	61.64
GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGTACACTGCTACTGTAACTCTGATCCAGATTCGGATTCAGATT:1	-	chr2R	11513478	3'	+	hobo	2920	1	54.02
TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTTATCAGTTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGAGATGTTTCTATAACTTTTTTTCCCTGTGTAC:1	-	chr3L	10841410	3'	-	mdg1	7052	2	64.38
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGATGTGTACTGGCTGGCTGG:1	-	chrX	13039504	3'	+	roo	9039	1	77.33
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAAATATTGTTTCCCGAACAGCGCTTTTCGTCACTAACTTGTAGTGCCTTTAAGCATTTATTTTATCTCTCTGT:1	-	chr2R	18336102	3'	-	roo	8682	2	70.55
GAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATGGTCATGTTCTCCGGCTGC:1	-	chr2R	23332497	3'	-	invader4	13	2	71.77
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACA:1	-	chr3R	17817900	3'	+	roo	8996	2	70.34
AATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATAAATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTATAGGACGCAGTATCCCGGTTTGCTTGCGCCGTGTCTCCGTTGACGCCTGCTTTGGCCTGACGCTGAAAAGGTAGACTTCCTGTACTGC:1	-	chr3L	25478698	3'	+	Cr1a	4309	1	61.64
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTTTCAC:1	-	chr3R	17420408	3'	-	roo	49	2	57.25
CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTTGTG:1	+	chr3R	20868236	3'	-	BS	5027	1	62.33
ACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTAACTGGCAGTCTCGGTGAGCGAGCAAGGACTTTAGTACGTAGGCATAGTTACAGCAACAAGGAAAACTCTATGAAATCTCTTCACTTGTTCAACAGTTCATTTAATTCGTCTGGCGAGC:1	+	chr2L	22367910	3'	+	Rt1b	4964	1	51.37
AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGCATCAAATAA:1	+	chr2R	5485200	3'	-	blood	35	2	55.05
AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCACATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCAATTCGAATAATAATGGATGAGGGAATG:1	+	chrX	17431848	3'	+	hopper	1392	1	68.49
AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGCACGCTTCAGGTGTTAATGATATAATTTTATTTCGTGTACAAGTAAATTTCATTACCCTTG:1	+	chr2L	12328789	3'	+	hopper	1413	2	78.77
AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTGGACTCTTTGCCAT:1	-	chr3R	10182084	3'	+	blood	346	2	63.70
ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTT:1	+	chr3L	10574378	3'	-	Tabor	6900	2	56.85
ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCT:1	+	chr2R	19540461	3'	+	jockey	4933	1	60.96
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGC:1	-	chr3R	20469582	3'	-	roo	44	2	50.00
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATT:1	+	chr3R	17817965	3'	-	roo	39	2	64.42
GGATATTGATCCTGATCAAGAGGATGTATACTTGTAAACGCTTCTTACCTGTTACATACATTTTAAGAAATTTAGTAAGCCGTTTTACTCTATGAGTAACGAGCATAAAAGATAAAGATAGATATTATGCACAGGAATGTTAAAAA:1	-	chr2L	22196887	3'	-	INE-1	87	1	35.62
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAAC:1	+	chr2L	12892694	3'	+	roo	353	2	68.91
CCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGTTGTAAGCACTC:1	-	chrX	7195040	3'	-	P-element	2	2	68.75
CTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCAAAGAAACGCTAGGTAGTCCTGCTAAATCGGCGGAAAAACAAGCGGCAGGAAGCGAACAGCATGCAAATCAGTTCGGAATGCGGCA:1	-	chr3R	19962167	3'	-	roo	8871	2	68.25
TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCA:1	+	chr2L	6059328	3'	+	roo	9035	1	57.78
GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTCTAAGTAAACTAATATTCTCATATTCATCT:1	+	chr3L	22437993	3'	-	roo	8676	2	75.19
ATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGAGGGAAATACGTGAGCTTGGGCTGCGTGG:1	-	chr3R	7835316	3'	+	roo	429	1	75.00
GCCCTAAAACCGCCCAAAGCTGCCACGCCAACATTTATGTAAAGCTTGTCGGTATTATTTATAATATTATTATTTTGCCTAGCCCTCAACAGAATGTGTTAACAACGCAAAACATTTTGTTGAGCACAGTCCATC:1	-	chr3R	3461165	3'	+	INE-1	347	1	62.96
AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATAAATTCAACAATAAAGAACATTTTCAGCACTTAATTCATTTTTTTCACAGAA:1	+	chrX	7887172	3'	+	297	6914	2	68.49
GACTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTAGCTATTCACGTTTATTACTCGATAACTTGAGATCGTTGTTAGATCTACTAACTAGCTGCA:1	+	chr3R	21434975	3'	+	412	7514	2	49.58
AAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACCGCCTCTTTCAAACA:1	-	chr2R	2016796	3'	-	1360	38	1	58.22
AACAATTAATAAGGCAATGATTATTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTAACAATTGCGGAAAATATAAAATGTATTTCAAACC:1	-	chr3L	24996078	3'	+	1360	439	1	59.59
AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAA:1	-	chr3R	21276525	3'	-	BS	5042	1	50.36
ATTAAGCAAAAACCCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATGTAGTTAATCTATAATTTGGTACAAACATTTGGAGATTTATAAGTACCGAATTA:1	-	chrX	13275925	3'	-	S-element	64	1	62.33
TGCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAAT:1	-	chr3R	25448333	3'	+	roo	352	2	54.86
AAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCATGATTATTACTTGAAACGAATTTATAGGCGTTGTGCCAGC:1	+	chrX	1250872	3'	-	micropia	5199	1	66.94
CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAG:1	-	chrX	10644439	3'	-	jockey	4777	1	57.61
CGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATGCTTTTTATGTTAATTCCCCT:1	-	chr2R	21831602	3'	+	P-element	2568	1	21.23
GTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATGTTTGGATGCTGCTATTGTATTTGCATACAATAAATCATACAACATAAATCCCATTGTGTATTTCTTTGCATAACTTGCTTCTGCCGCTAATAAACCCATAGTT:1	+	chr2L	17741428	3'	-	springer	7150	2	51.03
ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGG:1	-	chrX	13126473	3'	+	jockey	4921	1	75.76
TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACCGGACTGCGTTTGTTTACATTTTTGCTTTG:1	-	chr2R	11629715	3'	-	Tirant	8116	2	75.41
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTT:1	+	chrX	23280927	3'	-	roo	10	2	41.78
ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCCCTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTC:1	+	chr3L	20168425	3'	-	mdg3	5333	2	74.64
AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGC:1	+	chr3L	3799856	3'	+	copia	248	1	61.33
CTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGA:1	+	chr3L	19339422	3'	-	Tc1	2	1	72.86
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATA:1	+	chr3R	19968210	3'	-	roo	48	2	54.48
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTT:1	-	chrX	5274306	3'	-	roo	78	2	70.55
CATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAAT:1	-	chr2L	18419164	3'	+	412	403	2	76.03
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTC:1	+	chrX	9540111	3'	+	roo	354	2	58.39
CCTTATCTTAAATCATTATAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATAGGGGAAAAGAGAGCGTACAGGAAGCAAAGATCAGATTTAAATTAACATTTCTTAA:1	-	chr3R	1853604	3'	+	Cr1a	4141	1	61.64
AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACTACCAATTT:1	-	chrX	5643438	3'	+	roo	405	1	77.60
GCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGTTTATGGCCAGAAACTTGGCGTTGGTCCGACTAAATCTTTGCCGCTGAACTTGCCACACATCCCATTGTTG:1	-	chr3L	20893360	3'	+	invader3	5385	2	68.70
AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGGAAGCTTAGAATTAGAATTATTTTCACGCATCAAATGGTGAATTTTAAGCATACACAGCATATAAATTCATGTTCCTCGTGTCTCAAATA:1	-	chr2L	17607570	3'	-	hobo	18	1	60.15
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTT:1	-	chr2R	13084617	3'	-	roo	43	2	73.68
ATGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGAAGTCCAATGTACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCTATTTTGATTAATGTATATTTTTGTTATATTTTGTATTTATGTGTG:1	-	chr2L	22299076	3'	-	baggins	5423	1	60.27
AAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTATAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAGTGCGGCGAACAAAAGTCAGCAACACTATCGCTTCTTGTTTGCAA:1	+	chr3L	12879839	3'	+	roo	372	1	50.39
GATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGGTACCAATGGG:1	+	chrX	21667975	3'	-	gypsy2	6519	2	69.18
TAAAAAAAAATACAAAAAAATATTATCTGTTTAATTTAATGGAAAAACAAACCAGTATGCATGCATGCATAAATTGACATAAATATATTTGAATTTGATCTGTTCTCCTGGAGTATATTAGCATGGATGCGTTGCGCTAGGAATCT:1	+	chr2L	8401752	3'	+	gypsy11	3932	1	75.34
TGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGTAAAATTTCAGTTAAGTG:1	+	chr2L	12290782	3'	+	1731	295	1	65.85
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGGTCCGTC:1	-	chr3R	25448301	3'	+	roo	9057	1	73.33
TTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTATTTTTTGCATGGTGTCAATTGATCAATAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTTTAAGGTGAAGAGCATATTTTGTCAAATTTAC:1	-	chr3R	4571528	3'	-	1360	270	1	57.53
AAATAAAATATTGCAAAAAAATTGTAAATAAAGATAAAAATGAACTTGAGCTAGCTAAGTAACTCATGTAACATAATTTCATTTATGCTAAATACTGAATAATATTGAACATATATACCATTTAAAACCTACTGCTAAGTCAATTT:1	+	chr2L	6844509	3'	+	HMS-Beagle2	395	1	43.15
TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAAAAAAAA:1	+	chrX	13504251	3'	+	412	7498	2	55.97
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTAC:1	-	chr3R	7835123	3'	+	roo	9002	2	66.44
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCCCTTCTTGCCCCAAGTCTCAGCCCTTCAACATGTGCCTTCTGTAATGCT:1	-	chr2R	5248178	3'	+	1360	3380	2	78.08
CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACAT:1	+	chr3R	22844257	3'	+	roo	320	2	78.77
ACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAAGTAAGATACACAAAAACTCTTTAACCCAGATGCGAGAGGGAGGCGCAAACTACTTGATCTTGTCGAGCAACCAACCGGCTTTATGGCC:1	+	chr2L	9906578	3'	+	invader3	272	2	75.42
GGGACCGCGGTTTTCGGGCTTCCATTCATATTTAATGGAATTATGGTTGAAGGCAGCGTCATCTAAGGGGCTTAGAGCCGCTATGTCTG:1	+	chr3R	4514940	3'	-	HB	491	1	53.93
CAAAGTTTTGTCCCGACACGGTTCAGTCGTTGAAATAGTGAACAGCACAAACTTCAAGAGCATCGATGGCTGTTTTAATGTATTTTCTATGTGTACCTTGCGATTTGCTGGTCTGTGC:1	+	chrX	22785381	3'	+	mariner2	100	1	64.41
AAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGTTGTGAGTGTTAATATGGTGATAAGTAGTGTTGTGTAGGCTAAATATGTCAGTTCAG:1	-	chr3L	5059967	3'	+	P-element	213	1	33.10
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAATTTTACATTATTTACAATTTATAATGAGTT:1	+	chr3R	31817572	3'	+	roo	9041	1	66.44
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTTTTCCCATTTTTTGACTATTAAAGTTATGAGGAAGTCTTTTAAGTTTAACATCAATATGTTTCATATGGTTGCCAATGAAATGTTGTAAGC:1	+	chr2L	12153305	3'	-	roo	8692	2	56.85
AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTTTTTCTAAACAGAT:1	-	chr2R	16785302	3'	+	412	7530	2	67.74
GGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTTTTAAATCTAGCCAGCCTTGGATACAATGTCAATTGTCAAATTCTTTAAGGCAGAAGGTCGCCTATGAAAAATCAGTATA:1	-	chrX	7854226	3'	-	accord	7171	2	56.83
AAATAAGGAAAACATCAAAAAATATCAATTATATTTTTATAAATGATAGAAGAAAGTCTACTCGACTGTGCTTATGAACGAATAATATTTCGTTCAAGATGTTGTTTATATTTGATTTACTTGATTCTTTGGCACAATATAGACTT:1	-	chr2R	16639466	3'	+	Doc3-element	4718	1	78.08
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAATGGAACCCGAGCATTTGCAAAGCAGCCAACCAACCAGGTGAAAGCAACATGCTGCCG:1	+	chrX	2518149	3'	-	P-element	9	2	71.43
GGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATGGGGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATAC:1	-	chr3L	25482922	3'	-	accord	7357	2	55.04
AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGCTGGGTGATTAGCACCCCAAG:1	-	chrX	13126438	3'	+	jockey	4949	1	51.80
ATTATTGTTATTAATATTGTTATTGTTGCGGCTGAGGCCAAGGCGGTGATTATCTGCCGATCGGTTTTGGGGCTTTCACTAGAGATCATATATAGCGGTGGTAATTAAAAAATATATTCAGAAATTACTTGTCATCCCCT:1	-	chr3R	17785061	3'	-	mdg1	21	2	80.00
AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCTACCTGAAAATCGAAAA:1	-	chrX	8814718	3'	-	pogo	36	1	51.88
ACTGAATTTAAGTGTAAACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTG:1	+	chr2R	8146101	3'	-	P-element	48	1	27.55
CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGACAAGGCGTCCGCCACTCAACGCAAAACTCGTTGGGTCCCCAAAATGTCTAATGCGATCTTGTCTGGCCCAACACAC:1	-	chr2L	5307038	3'	-	jockey	4671	1	78.74
ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAACTTAAA:1	-	chr3L	17685089	3'	-	mdg3	28	2	41.67
GTTTATATTAACTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCA:1	+	chr2L	22121655	3'	-	gtwin	6957	2	41.78
ATAAATTTTGTTATATATTATTCTTGGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAACAACAAGAATACCAGTTTAGGCAAGAGATAAAGTGCCTTAAAATCAAAAAGGAAATCATG:1	+	chr3R	19446840	3'	-	transib4	2279	1	74.55
CATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATAACCTGTCCCTAGCGTAAGAGAAGTTAAATTTTTCCACTTTTATATTATCGGCTTTTGTTTTGTCTTGTATATAAGACAATACATCAGACGATATTT:1	+	chrX	22641592	3'	-	Cr1a	499	1	67.41
CAGAGCTGGGTCCATCATACCAGACCAATTCACCAAACAAGGCACATGGCACCATGAGTCCGGCATATATAGTCCAAGTAGGTTACTTATTCTTAATTAGCCTTCCAATTTTCATATGATCTCAACATGTCTGAGAA:1	+	chr2R	5149296	3'	-	R1-2	3095	1	54.74
ACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGTGATAAAAATGAGC:1	+	chr3R	18339203	3'	-	roo	44	2	54.79
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCA:1	-	chr3R	12886887	3'	+	roo	9037	1	56.10
AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTTCAATGACGACGGCGCTGCCACCCTCGT:1	-	chr3L	12861664	3'	+	pogo	2089	1	73.57
CACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGAGTCACT:1	-	chr3L	23112568	3'	-	R1A1-element	4	1	59.00
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCG:1	-	chr2R	8585406	3'	+	roo	396	1	72.65
ATTCTGAAATGGAATCGTCTGATAGTGCCTGTATTAGACGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAATCGAAGAATTGAAACCAGTCTGTATGGTATTTCAGCGGATTTGTATGACATATAGTATAAATCTAT:1	-	chr3L	14554499	3'	-	Bica	4534	1	56.85
AGATAANATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGTTCGTAGGCGCTCAGAAG:1	+	chr2L	15991415	3'	+	mdg1	371	2	52.05
GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTA:1	-	chr2L	20117886	3'	+	invader4	270	2	60.27
AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATCTACACCTAC:1	+	chr3L	20033807	3'	-	blood	34	2	50.68
TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATGAAAGTAATGAGGGG:1	-	chr3R	14049292	3'	-	transib2	20	1	71.53
AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGGGTACTTATTG:1	-	chrX	10639978	3'	+	roo	405	1	76.61
AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATAT:1	-	chr3L	11321412	3'	+	mdg3	5427	2	63.01
AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTACCAGCACGACACACTTGCCT:1	-	chrX	2842442	3'	+	Tabor	7309	2	75.17
AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCTCAGGCTAATCCCACAATTTACCAGCACGACACAC:1	-	chrX	2842448	3'	+	Tabor	7309	2	72.66
GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTC:1	-	chr3R	14049350	3'	-	transib2	49	1	65.22
GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTG:1	-	chrX	9205541	3'	+	hopper	1335	1	76.09
TAAATAAAAATATAAAAATATATAAAAAGGGGAACTAAAATATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAAATTCAAATGGGTAACTTTGAAATAAAATTATGTATTGTACATCTAGGGAAATAAATCGGAGATTAACCTTT:1	+	chrX	17058257	3'	+	Stalker4	88	4	68.49
CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTCCAAATTGCAATAACATGTGAATGATTA:1	+	chr2L	19310418	3'	+	Juan	4177	1	57.53
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCGTATAAAAAAGAAAGCA:2	+	chr3R	17420533	3'	+	roo	9033	1	54.79
GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTT:1	+	chr2L	11518461	3'	-	412	80	2	74.82
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAG:1	+	chr2L	14772119	3'	-	roo	35	2	56.07
CCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAG:1	-	chrX	4214920	3'	+	flea	4972	2	54.79
GTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACT:1	+	chrX	21907824	3'	-	springer	448	1	69.32
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTT:1	+	chr3L	9998214	3'	-	roo	8679	2	69.57
AAAAAGAAGAAAACAAACAACAGAAAACCAACAAAAACCACACAGAATCATAGCAAAGAGCTGAAAAATCGCTGAAAAGCGGTGTAATGATTTCTTTTCTGGGAACTTCTAGTACTTACTCAGAATTCTGTAAGATAAAACTAAAA:1	+	chr3L	6264390	3'	+	gypsy7	5011	1	48.63
ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCA:1	-	chr2L	13585837	3'	-	Tabor	6875	2	53.10
CAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCACTAAAGTTGGCGCATTCGAAGCAGATCGAGGAATTCAGTACCGA:1	+	chrX	4360674	3'	-	Stalker4	7269	4	69.66
AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCC:1	+	chr2L	5845087	3'	-	transib2	53	1	54.79
CGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTG:1	+	chr3R	1446146	3'	+	1360	3379	2	29.45
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTTCGGGGCGCTCGCGGCGGAAATGAATTATCGCCCGCT:1	+	chrX	11471678	3'	-	hopper	4	2	74.49
ATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTT:1	+	chrX	21087674	3'	+	mdg3	5486	2	59.60
ATAAGCAAAGCGAACACAATTGGAAAGACACAGACGTCGTAATCGAAGAGATATACCACAGATTTGCCGATGAGTAACGGGTATCTGGCTCTCGAATATAGCATTCTCTCTTGTTTATTACTAATCGTCCTATTTTTAACCGACCT:1	+	chr2R	556237	3'	-	Ivk	46	1	73.97
AGTAATCACGGTGGCTGGGCGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAATGAATTTTGGTTGTTTGTTTCGACTGGT:1	-	chr3L	3196656	3'	-	Max-element	495	1	77.42
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCAAATGCACTATAATC:1	+	chr3R	19968240	3'	-	roo	8683	2	71.92
ATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1	-	chr3L	23112569	3'	-	R1A1-element	45	1	71.43
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTTAAGGTCGATTACTAATTCCATTTCATTATACTTACTTACTATCCCTGATATCTCTGCAATCAAGCAGTTATCAACCAATTAT:1	+	chrX	13039605	3'	-	roo	11	2	77.70
AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAACCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTAA:1	+	chr2L	15833109	3'	-	hobo	7	1	74.77
AGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTCTTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	413	1	54.79
CGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTGACGTGTTGTGTGGCGCGATAAGTCGACTTCTTTCGGTTTCTTGCAATTT:1	+	chr3L	11529846	3'	+	roo	260	2	62.12
CTTGTATCAGTTGTAAAACTCGAGTGATTCTTAACAGTTACTTTAAACTACAATACAACAAACAGAGACATAGAGGATTTGGTACTTGAAAAATAACGCCTGCAAAAAAAAAATTAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAAGA:1	-	chr3R	907910	3'	-	gypsy11	367	2	22.86
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTATAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTTTAAGCGTCAGGCGTCAGCAACTCAAATTGATTAGTTCAATTAACACGCAACC:1	-	chrX	2444337	3'	-	roo	8712	2	52.74
GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCGAAGATCAATGTAACGACGATAAGCTGGGCGTGGAGGTTTTTCCCTAACGTGTTAGCCCTGAAC:1	-	chr2R	3339027	3'	-	Doc	57	1	54.29
ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATTTCCTTTGGGGCTAAACGCTTTTAGTTCACTGACAATGGTACACTGCGACAAA:1	-	chr3R	22844138	3'	-	roo	8664	1	79.23
GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATT:1	-	chr3R	19968097	3'	+	roo	359	2	57.46
ACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGA:1	+	chr3L	21855538	3'	-	blood	7069	2	58.62
GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATATAGTTGCGCGCCTGTGTCTTTTTGGCAATGGC:1	-	chrX	21009379	3'	+	pogo	2092	1	71.03
AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTACAGAGTTTACCTGATTTTGTGCTATTTTTAATA:1	+	chrX	13504223	3'	+	412	7487	2	73.50
AAAAAGCTTTTTGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATAAGGGTGAGGAGCATATACTGG:1	-	chr3R	1521173	3'	-	Dm88	80	2	79.41
AAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATCAAGTACCTTATTTGTTGTGGCAGTAAAATATGTAGGTTAAAAGTGGAACGTTTCGCCTACATTTTATTACCTCCATTCATTG:1	+	chrX	10638731	3'	-	roo	154	2	55.32
TATTGCATAGGCACATACTACAGTGGCAGGAGAAGGTACTATATAATTAGCTGTAACCTTTAACCCGGACAAC:1	+	chr2R	13817712	3'	-	412	1	2	69.86
GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAAAGTC:1	-	chr2L	1517610	3'	-	jockey	4730	1	55.56
CCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACAACCAATTACACCTTAATGACATGAACTTGACACCATTTCATTGCCGATGCCTCTATTTCCATAAAGTAGGCAGCCAAATAGACAACGTGATGCGGTTTAA:1	+	chrX	6193999	3'	+	FB	406	1	64.58
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAA:1	-	chr3R	18339102	3'	+	roo	8994	2	69.86
AAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGATAAGATTGGAGGGCACTACGCGACCCAATAACAGCCAACAGCATTTAACCGCAATTTAGTTATAATTCACATTTTTAGTGTACTTTTATTAATGGAATTTATTGTTCCTATTA:1	-	chr3L	23446499	3'	+	HMS-Beagle2	7003	2	73.97
CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATACAAAGCATTTTTCTCCGCAAAGAAAGCAGAAGAATCACA:1	-	chrX	3309607	3'	-	jockey	57	1	53.10
CAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1	-	chr3R	29487012	3'	+	flea	253	2	86.99
AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGAAGTCTCGGAACTTCGATCTTTGTTTCGGTG:1	+	chr3L	3863558	3'	-	blood	34	2	62.33
GCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGCGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGAACTTAAAAAAATTATCTTATTTGA:1	-	chr3L	26719153	3'	-	Tc1-2	28	1	64.00
ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTACTTCTTGGCTGCG:1	+	chr2L	10037438	3'	-	Quasimodo	13	2	70.97
AAGGGAAACGAAAAAAAAAAAGAAAACAAAAGCAGAAGGCAAAATGAACACAAAGAAAAAAAAAA:1	+	chr3L	12646038	3'	+	Doc2-element	241	1	53.85
TGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGTCC:1	+	chr2L	17081839	3'	-	jockey	4747	1	74.44
TCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCACCTTAATTATATGGCCGCCGACAGAA:1	+	chr3L	19036050	3'	-	Tirant	58	2	75.23
AAAACGTTTGCCCAACCATTATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAA:1	+	chr2L	23034039	3'	+	FB	349	1	64.29
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGG:1	-	chr2R	21907932	3'	+	roo	9022	2	62.50
GATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTACTGAATTTTTTCCGATATAAGGCTAAGCTAGTTAACATAGATTAAAACATCAAAGCTAACACATCAAGTTCAGTCTGGGCAGAAATAAAACTTAAACGTA:1	+	chr2L	17087629	3'	-	jockey	4860	1	69.86
ACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTGTTAGTCCAAGGGAAAATTTTTCCAA:1	+	chr3R	9714481	3'	+	Stalker4	348	4	58.90
ATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTTGAACTTTTAAAAAACTTTGCTTTTAATTTTATCTTTTTTAACTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTAACTTTTTTTTAACTTTGCTG:1	+	chr4	1294984	3'	-	TAHRE	56	1	50.68
ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCG:1	+	chr3R	15364020	3'	+	flea	224	2	57.14
GACAAGATTTATGTAGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGGACCATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCGAATCGTGGCGACCCTTTCGCATCGA:1	+	chr2R	4730494	3'	-	Doc2-element	4494	1	79.80
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTTTTTGTTGCATACTTAGCTG:1	-	chr2R	16945282	3'	-	jockey	56	1	54.48
GCCAGGACGATTACCGGCTGCGAATGGTACGTAAGGAACACAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCACTAAAAAATTCTTTTGTTTAACTTACAATATTTTAACATTGTATTATGACA:1	+	chr3L	23953364	3'	+	BS3	1382	1	66.44
GGGGAACTCGACTATAGCATTTCTCTTGTTTTACGTTCTGATCAAGTCCCAGCAGTCTAAAGTAATGACATACATCTCGAGTGACTGGGGTTTAGAAGAATACACCATGCACAAGGCAAGTCCCA:1	-	chr2L	22318167	3'	+	INE-1	571	1	68.00
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAACAGTTAATGACAATCT:1	-	chr2L	17420136	3'	+	roo	360	2	52.74
CCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTCACTCCACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTAAAATTAAAAATCAAAAACAA:1	-	chr3R	8924376	3'	+	P-element	260	1	17.12
TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTG:1	-	chr3L	22437876	3'	+	roo	8997	2	70.14
TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCGGAGC:1	-	chr2L	21891707	3'	-	mdg1	53	2	51.37
GTGGTGAGGCTGCAATACTTCCCTCCACAGTGGAAGCTCGGTATTATTTCCATGATTCACAAACCTATTTCAGATCAGAGTGACATTTGATAATGCTCTTGTACCTCACTGTTTTATACAATTT:1	+	chr3L	23954029	3'	+	BS3	341	1	52.42
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTCTAAAGAACCTTTCTCTTT:1	+	chr3L	15600382	3'	+	roo	404	1	68.49
GCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTTTTTGGAGCTTTGGCTCCCTGAAATGGCCGCTACAAAATTGGTTCGTTTGGCCGCCGAAGGCACTT:1	-	chr2L	1230279	3'	+	blood	329	2	50.38
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCACGTGGATCAAAGTATAGAAACTTAACCC:1	-	chrX	8543470	3'	-	roo	86	2	80.71
AGGGAGGGTAAACAAAACACTAAGAATCGTTGTTAGTTTTTTAAAAAGGAAGAAGATGAAGAGGCGGATG:1	+	chrX	13710585	3'	-	Cr1a	206	1	68.57
TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCATGTGTGTGTG:1	+	chr3L	22917696	3'	-	jockey	4778	1	59.41
AATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTT:1	+	chrX	12074605	3'	-	412	7195	2	66.67
CAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGAACGTGATGCGGCGGAAGGGGGCGTGTAAAAAACGATATATAGAGGGACATGGGATAAA:1	+	chr2L	14151410	3'	-	Idefix	335	2	59.59
TATTCTAGTGTCTTTGGTCTGACCTTCCATATGAACTGAGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTGTACCA:1	+	chr3L	22016851	3'	+	Tc3	316	1	72.60
GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTGGCAGAGAGCGAAAAC:1	-	chrX	6279363	3'	+	P-element	2818	1	33.82
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTG:1	-	chr2R	19004104	3'	+	roo	396	1	74.40
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGG:1	-	chr3R	2461560	3'	+	mdg1	365	2	56.16
TTTTACCAAAGACACTAGAATAATATAGAATAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACAAGTATAAAGGTATAAGGTATAAGGTTCAGGTATAAATATTAGATAGTAAAATATATGAAACCACTTTTGACTTGCT:1	-	chr3L	16740680	3'	+	Tc3	237	1	61.81
TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACANTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATGTATTTAAGCATGAATATATACACGGAAATTCCTTGTGGCGTTATT:1	-	chr3L	20548067	3'	+	297	6921	2	70.50
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAA:1	+	chr2R	11164478	3'	-	roo	67	2	79.20
TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCA:1	+	chr3R	22822145	3'	-	mdg1	7076	2	41.10
GTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACGTGTTGTGACACTTGAGTTTG:1	-	chr3L	18596600	3'	-	Doc	57	1	53.79
CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTAAATCTCGTTCGG:1	-	chr3R	28758274	3'	+	mdg1	7421	2	43.84
ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCTTCTATCATATACTAATAGTTTAAAT:1	-	chr2L	13053706	3'	-	BS	5019	1	65.75
GTTCTCAATTGGCGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGCTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGATTAGTACAGATAATAACATTTAAATCA:1	+	chr2R	20497038	3'	+	blood	365	2	58.73
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACG:1	-	chr2R	19004100	3'	+	roo	9042	1	66.44
GTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGCTGGGGGGTACAATCTTTATCATAAAGTACCCTTGTGCCATCTACT:1	-	chr3R	9456652	3'	-	jockey	4744	1	71.76
AAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATCGAAATGGTAAATTCCCACTCACAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAAT:1	-	chr3R	4160068	3'	+	invader2	5045	2	59.72
GTCCGTATGAACGTCGATATATCTGGAAAGAGAAGGTTAATATTCAGAATACAGATTCTAGACACAAAGACCCACTATAAAGCCCACATGTGTTAAAATGTAAA:1	+	chr3L	27908648	3'	+	INE-1	133	1	64.42
AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTC:1	-	chr3R	17605640	3'	+	Tabor	7255	2	62.33
AGAAAAAAAACATTTGAAAAAAAGCCTGGAGAAGAGCAGACAGACAAGATGAAAGGCAAACATGAAGAGCCAGCGACGACGATCACTTATATAGATATAGAGAC:1	+	chr3L	10785539	3'	-	FB	174	1	88.46
CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTC:1	+	chr2L	21400369	3'	+	mdg1	336	2	73.61
ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGAC:1	+	chr3R	14981283	3'	-	mdg1	7070	2	63.01
GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGCCGTCATCTTCGGCCTTCGGCT:1	-	chrX	2518056	3'	+	P-element	2818	1	27.42
GCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGCGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCAATGCCAGTGGAGAGAGCAGCAACAAACAGAAAAGATTTT:1	+	chr3R	20790464	3'	+	1360	3303	1	66.94
ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAG:1	-	chr2R	14542133	3'	+	roo	398	1	64.21
TGTGTGNATAAATTTATATGAGAACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTAT:1	+	chr2R	9500053	3'	-	G5	4761	1	58.90
AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGC:1	+	chr3L	11530956	3'	+	roo	324	2	75.34
TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGTATG:1	+	chr3R	14049446	3'	+	transib2	2783	1	54.29
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGC:1	+	chr3L	9998191	3'	-	roo	69	2	65.75
TTATAAATTTAAACAAATACAAATAAATTAAGATTTAATGTTACTAGGCGTTTAAAATATTTAGGTTTAATAAACCTGATTCCATATTATGTTTTAACCTACCTCTTTTGAGTTTTCAACAATTATGCACTGACAGTGACTAATTA:1	+	chr2L	5334018	3'	+	frogger	240	1	66.44
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCACTCCAACTACAAGGGGCAGCAT:1	+	chr2R	9328689	3'	+	roo	9002	2	63.01
CCCCTTTTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTGCCACCATTGGGATCCTTGCCGGGGGTACCTGCCACTTGGCAGAAACAATTTATTGACCCGCCGACC:1	+	chrX	8543342	3'	+	hopper	140	2	75.00
CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGT:1	+	chr2R	15064452	3'	-	412	49	2	52.05
GGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTA:1	-	chr3R	26659778	3'	-	HMS-Beagle2	6964	2	77.14
GAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGT:1	-	chr3R	17605648	3'	+	Tabor	7248	2	67.59
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGC:1	+	chr3L	20654590	3'	+	roo	9046	1	63.28
ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTT:1	-	chr3L	13845104	3'	-	opus	7152	4	48.25
ACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATCTGCCCATTAGCCATTTGAGCTCTCTAGGAGTTATTGAGTTACTACTATGCTC:1	+	chr2L	6568810	3'	-	jockey	4908	1	63.70
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTGTTGTAGATTTCTCGCAGTGTATAGAATCTGCTGCAACCC:1	+	chr2L	5254390	3'	-	roo	42	2	52.05
ATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATTGATTCTTTTTGCGTCCTTTCCTTCAACGTTT:1	+	chr2L	83674	3'	-	Stalker	7164	4	72.17
AAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCC:1	+	chr3L	11257379	3'	-	1360	3387	2	43.64
CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAAGGGGCGTAATAGTCTTTTGG:1	-	chr3L	23728608	3'	-	HMS-Beagle	6829	2	63.01
ATAGCATTTTTTCACATTCTTGTGAAATAGCTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGACTATTGCGTTTGTAGTATTGCCGCCGTATGCATTCTTGAGGTTCTCCGCCAATCGATCCATCAGATATC:1	+	chr3R	13968926	3'	+	copia	348	1	52.41
GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACG:1	+	chr3R	10274015	3'	-	HMS-Beagle	32	2	65.56
CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGTGTCGTTTTTGGATGGATTTGTTAATGGGAGTTACATAATGCTGGCAATGCATATAAGAACATGATATAC:1	+	chr2L	8986267	3'	+	412	7537	2	75.36
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGAACAGCA:1	+	chr2R	13710702	3'	+	roo	9034	1	59.59
TGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCTGCAACGCCTTGCCTCCGTGATCCTGATT:1	+	chr2R	4294629	3'	-	McClintock	32	2	58.73
CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAAAAATATTTATTTAGTT:1	+	chrX	10201227	3'	-	transib2	65	1	62.33
ACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGGATGTAGATATTGCACAGCCATGGCCACTTGAATGGGACAAC:1	-	chr2R	17626848	3'	-	opus	122	2	55.41
TAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTT:1	-	chr2R	3919675	3'	-	1360	123	1	64.34
AGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGCAGCGTTAAGTGCATCCTAGCGGCAGCT:1	+	chr2R	25134593	3'	-	accord2	7248	1	74.00
GAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAGATCTCCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAAGGGAACAAATCTTAAATACGCCACAAA:1	-	chr3L	17688426	3'	-	mdg3	5260	1	75.41
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTAC:1	-	chrX	5643482	3'	+	roo	339	2	66.44
GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCATAAAAGTTAATGATTTCCAAATTGGACA:1	-	chr3R	9921939	3'	-	blood	25	2	68.49
AATTATAATAAATAATAAAATACTTGACAATTATATTTAATCAACAACCATCATAGGTGTCAGTCTTTTTTATAAATTTTTTTTATCAATTTTTACTTTAATCTTGAACT:1	+	chr3L	11410025	3'	-	INE-1	419	1	47.27
AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGA:1	+	chr3L	9907336	3'	-	BS	5072	1	74.10
CAGCCCAAACTTCAAGAGCATCGCTGGGCAGACAAAATGACGGACATGGCAATAACGACTCGGCTATTGATAATGATACAGAACTTTTTTTCTCACGTCT:1	-	chr3L	23649801	3'	+	mariner2	477	1	71.00
AAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1	-	chr2R	981617	3'	-	1360	40	1	62.33
TTGCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCCTTGCTGTACGCCTCCCATTCAGCGCAAAGCGCTTGGAG:1	-	chr2R	13504851	3'	-	G2	248	1	62.86
TGTATATATATATGTATAAGTGCTTATTCTTTACACGGAGTTTACAAAAAAAACGCAGGAATTTCATTTTAGCTTTTTACACAATAACTGATTGTTTTTATCTGGAACAAGAGACTAATTCGATCATGTGTAACCTTACTGCTTA:1	+	chrX	18223253	3'	-	blood	7194	2	66.90
CCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTTTTTGTTGCATACTTAGCTGGGCTCCGTGAATTTATGATCTACTGGTTGAGATGTAATTCGAATTTTTGATA:1	-	chr2R	16945230	3'	-	jockey	15	1	73.29
AAAATAGAAAGCGAAAGAGACGCCACACACACACACAAGCAGATGGCAGAGCTCTAAGTTGGCTGAACTGTGGAAGCG:1	-	chrX	9944564	3'	+	Doc2-element	102	2	67.95
ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGT:1	+	chr3L	9673117	3'	-	Doc	83	1	68.49
AATACTAAAACACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCC:1	-	chr2R	16891834	3'	+	hopper	1358	1	57.35
AGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAATAAGCAGCTGTAACTCTTCCGGAAACGAAGGTTAGCCCAGGAATCAGGGG:1	+	chr2L	2122522	3'	-	Stalker4	5	4	76.00
TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACTTTCTATGTACAGGGCTA:2	-	chr2L	15991269	3'	-	mdg1	28	2	56.16
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCAAGTACGAAATGCCGAAATAGCATCGATCGATTTCCGTTTAATATCCCCAGCATGATATGCTACCATTTTCCCAGGGCTCACAAGTAAATATGCCAAAT:1	+	chr2R	19048663	3'	-	roo	8666	2	75.91
TTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATTTTGTGGTC:1	-	chr2L	20808331	3'	-	HMS-Beagle	6839	2	62.28
CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAA:1	-	chr2L	6569953	3'	+	jockey	4982	1	51.81
GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGTTGTGTCCACTTTTCCCTAAGGGGAATGCAAGTCTGTGCCAACAACTTGACGTTTAAGGGCCAAGCCAACCCCC:1	+	chr2R	7452978	3'	+	pogo	2085	1	71.94
CCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTGGGGGAGAATTTTTCTGGGATTGCAGAATAAAATGAGAATTTTTCTTAATTGTGAGTGTGACCGTTTTGGAGGGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGTATACCG:1	+	chr4	976490	3'	-	INE-1	552	1	58.78
GCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTTGTTGTGACTGTATAGATTCAAGACTTATACTTCGG:1	+	chr2L	13098040	3'	-	invader4	378	1	74.29
AGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCATTCATCTAAATGGTCAG:1	+	chr3L	3501036	3'	+	opus	7445	2	58.22
AATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGATTATTTTGTTTTTTAGTTTTAAGTAAATACAAGCAATACAAGATGTGAGGCTTATGATTGATACTTTTACCGATGAACCCTCACCATCTAACCCCCTGGCAT:1	+	chr2L	16831304	3'	-	rover	6871	1	74.48
TTATCTGTAATCTTGACTCTCTTCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAAATTTTTTAATACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTGTCATTGTTCCTGACTTTATATATTTGTCATTGTACTCTGGTTCGTCCGCGGAGTGG:1	-	chr3L	25478973	3'	+	Cr1a	4227	1	60.96
GTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATCATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTTATCGTGAGTCATTCGCTTATCT:1	-	chr3L	4536637	3'	+	roo	9065	1	73.97
AATAAAATAAAAGCAAATGTCAAACGAGGCGAACGCATTCGAATAAAATGAAATGAAATTACAAATTAATGAATGCATTTGAATGGATTCCCCTCGATTTGGTTACAAAATGTGATGGTGTGTATTTGCAAAGTGCCGG:1	+	chrX	6923813	3'	+	HeT-A	323	1	51.08
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTA:1	+	chr3L	9998197	3'	-	roo	38	2	53.72
GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCGCAACTCCCACTCCAAATCCAATTCTGTGTCGTATGTGATGCTCCCCGGTGCTTAGAGAT:1	+	chr3R	17316343	3'	-	opus	7026	2	59.29
TACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTT:1	-	chr3R	15072570	3'	-	pogo	72	1	69.86
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTG:1	+	chr2R	9632180	3'	+	roo	8995	2	69.18
ACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTCGCACAAACTCTCTGAGCTAGCGAGCAGACATA:1	+	chr2R	5209665	3'	+	gypsy	391	2	75.20
AAAAATTGATTTAAAATTTATGCAAATTTACCAAATCTTCAAAAATTCTATATTTTGTGGGAAATATAAAAATTCTAGCAAATGCACTTAAAAAAATCTATTCTATTCTATTTAAATCTATTCAACAATGTAATGATTTTTGCAGC:1	-	chr3L	11014264	3'	-	Juan	3779	1	80.14
TATTTTATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAACACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAATACTTATAACATTTCGGCGATTTGTTGCCAT:1	-	chrX	12469242	3'	-	S-element	88	2	77.40
TGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCAC:1	-	chr3R	12717751	3'	-	297	57	2	75.61
AAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAA:1	-	chr3R	19449898	3'	+	HMS-Beagle2	6883	1	50.68
GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGAAATCACAAAGGAGCCGCGCAGATTGATG:1	-	chr3R	28075342	3'	-	jockey	4742	1	76.00
CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTAAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATAT:1	+	chr2L	9668283	3'	+	1360	3335	1	58.74
TATAACATTAAATATACAAAATATTGCTCAAATAGTGATAACAACTGAACTTGTTTTTTTTATAACAATAACAATATATACACACAAAAGGAAATACAAAAAATTTTTATGGGATAAACAAAACTGCAATTTATGAAAC:1	-	chr3L	8902062	3'	+	Juan	340	1	71.22
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATCTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGCCATATTAATTAAACAC:1	+	chr2R	11164486	3'	-	roo	61	2	71.65
GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCA:1	+	chr2R	9791683	3'	+	412	7511	2	54.03
AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTACAACGAC:1	+	chr2L	2687415	3'	+	copia	5076	2	66.96
GTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGGTGGAAAAGGTGCATAAGGGGAATGATGATAAGGTCCGAGTGGCTAAAGTAAAGATGCAGGAAGGATATATCACTAGACCCATTACTAAAATTTG:1	+	chr3R	19448075	3'	-	roo	9030	1	65.75
AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTT:1	+	chr2L	13585912	3'	+	Tabor	7245	2	69.18
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACA:1	-	chr3L	4605625	3'	+	pogo	2064	1	58.04
CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATATCTGGGCGGGAGATACTTGGACACGCGCACGCCTTCGTGTAATAAACTTCAAAAAATAATTTCGTCTACAACGACAACTGAAA:1	-	chr3R	17316203	3'	+	opus	7486	2	71.43
AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCAT:1	+	chr3R	29361068	3'	+	mdg1	7407	2	57.55
ACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTAATACTTGTATTAACCAAGATAATATTAAATAAACGAAATCAGCGCGGCAAATAAACTTTAATTTAGGCGGGTCATAGATAAGCAATCGAT:1	-	chr3L	3430028	3'	+	Cr1a	4300	1	42.66
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCC:1	-	chr2R	21907934	3'	+	roo	9006	2	67.91
TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATACAACGCATATATA:1	+	chr3L	8142213	3'	-	blood	7064	2	54.11
TTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTAATATGTTTGAACAGTCCCATCTTAAATATATCTT:1	+	chr3R	18722946	3'	-	jockey	4734	1	68.91
GCTCTCCGTTCTCTCGCTCTCTAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGAAACCTCTAGAGCCACGGCGAGAAATTTCAGCTTACTAAGTTTACCACCCACACCGGGTGAAGTTGCAAAATC:1	+	chr2L	10342821	3'	-	1360	106	1	60.83
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTTTTATTATTAATAAATAA:1	+	chr2L	2476274	3'	+	roo	9029	1	54.79
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAATTTTAC:1	+	chr3R	31817548	3'	+	roo	9047	1	62.93
TGATAGTCGGGGAACTCGACTTTGATTTGTCTTTTTTTTCGTGAGAGTGCCATCTCTGTCGCTCTATCGTTC:1	-	chrX	5256500	3'	+	INE-1	563	1	69.44
ATCGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGACAACCCCCATTAATTTGCAACTGCTAGGA:1	-	chr2L	7491310	3'	-	FB	91	1	77.40
AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCGCG:1	-	chr3R	11083897	3'	+	412	7478	2	67.65
ATTAAATACTTTTAAACTTAATGATATTTTAGGTGTAAGGGTTCGGCTGTTACGTTAGAAACAGCTAGAGGCCCTTTCGGTTTACTTGGCTTGCACAGTACTTCCAGCTCAACTTCTACGGTGTCGGAACCTGAGTCGTTTTTGGC:1	-	chr4	755405	3'	+	Tc3	1526	1	81.51
GATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAG:1	+	chr3L	26011943	3'	-	F-element	93	1	73.79
TATAATGTTCTTTATTTTAACATAAGAAAGACTGGTTTGCTTTTCAGGGTCTTCGCTGGAAATACTTCTATTTGAGCATTTTTCCGGCTTCTTATAAAGTCAAACCACACAAGGAAAAGACGGAATGAGAC:1	+	chr3R	9176969	3'	-	Circe	473	1	74.05
CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGT:1	+	chr2L	7810102	3'	+	P-element	2796	1	23.29
CTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATG:1	-	chr3R	9714356	3'	-	Stalker4	37	4	60.27
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTCTTTATTGCTCAAGAGGTAAAATCT:1	+	chr3R	20469707	3'	+	roo	9036	1	51.77
TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATG:1	+	chr3R	14860203	3'	-	BS	5075	1	73.43
GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAAATAGCAGACAATGTCACG:1	+	chr2R	8585588	3'	-	roo	12	2	56.85
AAGAGAGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGTAGCGAAGG:1	+	chrX	15946779	3'	-	INE-1	577	1	51.37
TGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCACGATACA:1	-	chr3L	27356085	3'	+	Tc3	1633	1	69.66
AGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATG:1	+	chr3R	25454129	3'	-	Quasimodo	32	2	50.00
GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTGCATTATTTTGTGTAAATCTGTGAAAGCCCGCTGCGTTTCTCCTTCGTTG:1	+	chr2L	3165038	3'	-	412	53	2	60.32
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACAAACATATACAAACTATAACTGGGTT:1	-	chr2R	7452823	3'	-	pogo	47	1	53.10
CGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGAC:1	+	chr3L	9907337	3'	-	BS	5067	1	72.59
GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTATCAAATAAACGTGGCTCAA:1	-	chr2L	16067056	3'	+	297	375	2	66.13
AAGCGATAAATCCATACAATGCAGTAATAGTATCATAACAGCGCAATTAACAAGTAAATAATAAAACCCAACCTCGGGCAATAGAAGTAGTTTTCTACGGTACATGCAGTACATTCAGTAGTACATGCCCCAAAATGTATGCTACA:1	+	chrX	20266389	3'	-	BS	5070	1	76.71
TATTGATCCTGATCAAGAATGCATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACGTTCTTGTCAACGAATCTAGTGTTGTACTTTCTACAAAATGGTGGGGTTGAAAGTCCCCTGGTGTTGCAAACATTTTTGCTC:1	-	chr2L	21752022	3'	-	INE-1	84	1	71.23
CCTTGTGGGACACCGGATGTGACTCGAAGAATACAAGATAAAGTATTTTTAAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATC:1	+	chr2R	5265158	3'	-	Q-element	476	2	56.49
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCTGGCTGAATTCACCGAGGACTATGGATTCGGTAGG:1	+	chr3R	7835249	3'	-	roo	10	2	75.19
AACTGGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTTGCTTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAG:1	+	chr2R	5071022	3'	+	Tirant	73	2	55.45
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAA:1	-	chr3L	22437862	3'	+	roo	9015	2	59.29
ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTCTCCCATCGCACTCCCATGGCTCT:1	+	chr2R	9791690	3'	+	412	7501	2	51.06
ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCAC:2	-	chr3R	19589941	3'	-	BS	5084	1	76.71
ATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTGCTAGATAATAATGCATCATTTGTATGCAGTGAGTCAATTTTAGATC:1	-	chrX	2514935	3'	-	P-element	2786	1	34.48
CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTCTTCTAGTGTCTTTGTTATAACACAGCTACCAAATGGACGATATGGTCGTCTTGTATATCACCAA:1	+	chr3L	27390350	3'	+	1360	3355	1	94.29
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGAAAACAGAATGAGAAGAATATCAACATCAAATCTTA:1	+	chr3R	17818027	3'	-	roo	19	2	69.86
AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAGGAATACAGAATAGCAGATATTGAATGTATAGTGTTGCGCCTCCTAGAACTTTACTTATAAATAATAAAGCA:1	+	chr2R	8624914	3'	-	Juan	4033	1	79.45
ATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATACCTTACGACTAATGGGCGTTGATTAGCTAATTTGCCGCGCTCGTTTCAATTTCCACTCATGCC:1	-	chr3R	21420338	3'	-	I-element	4912	1	54.93
AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAA:1	-	chrX	10521645	3'	-	Tabor	50	2	60.50
AGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTGTAATTTTTGACATTTTGCGGATCGGCGTGAGCCCTGTGCTGCCTATAGAAATAC:1	+	chr2R	4183340	3'	+	mdg3	40	2	55.56
TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGTATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTACAATATGTGCAATCA:1	-	chr2L	14892213	3'	+	transib2	2773	1	60.00
TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTA:1	-	chr3R	31817470	3'	-	roo	8754	2	80.14
GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATGGCCCGACG:1	+	chr3L	17115563	3'	-	blood	33	2	59.71
AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCCAACTC:1	+	chrX	1899712	3'	-	P-element	63	1	42.47
GTTCGGTCACAAACTAAGAATACTGTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTGCCAAGAATGTTTTGGTCGGACCATGGCTTATTGA:1	+	chr2R	8869515	3'	+	flea	4937	1	71.54
GCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCA:1	-	chr2L	21008561	3'	-	invader3	5224	2	65.26
AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTAAGACGTTCCC:1	-	chr2R	15064349	3'	+	412	426	2	63.38
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAA:1	+	chr3R	31817525	3'	+	roo	331	2	73.10
CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAGTATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTG:1	+	chr2R	13710691	3'	+	roo	9059	1	67.27
AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGACAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTG:1	-	chrX	10644442	3'	-	jockey	4833	1	66.21
TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATG:1	+	chr3L	11530955	3'	+	roo	323	2	76.03
GTACATAAGTACACGCGAATGTAGATGACATCTGCTTGAAGATTATTTTTGAAGCCCTGTATTACGAAAAGCCGGAATGGTCGCCCCGGTGGCG:1	-	chr2L	16194249	3'	-	Q-element	558	2	73.40
GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAAAAGTGCAACATTTTTCTTTAAACACTATTTAATCAATTCTTCGTGGCGAACCGTTTTCCATCTCTGTGCCAGAAAAAAA:1	+	chr3L	18369046	3'	-	opus	7023	2	63.91
GTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATT:1	+	chr3L	25508749	3'	-	1360	339	1	60.96
TTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCGTTAAATCTTCTTGCACTTTAGATTCAGGATTCGGATGCCATCCACTCTCTGGGCAGCTCCAAGCTGCAGATACTTTTGTCCCGAGCTATTTGTTTGCACTTCAAAAG:1	+	chr3L	5095499	3'	+	BS	5021	1	78.42
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAGAG:1	+	chr3R	25448460	3'	-	roo	38	2	58.90
GAATATAAATTATAAATTAAAAAATATGGCTTAAGGGGAGTTATATATGTTAACAGTCAAGTTTGAAGTATTTTTCAATTTTTTTAAAATGAAATCATTAAGTAAAGTCAAAGATTCTATATAATTTAATGGAGGAACTTCTTAGA:1	+	chr3R	19593410	3'	+	copia	5120	2	63.01
GTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACCAAAAGATTATATATTCCNAAGGATTATTATACTGACAAATCACAAAAGCGA:1	-	chr2L	4953939	3'	-	Quasimodo	61	2	66.44
AGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAA:1	+	chr2R	10582445	3'	-	Juan	3890	1	74.66
TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTG:1	-	chr2R	9632126	3'	-	roo	8734	2	78.23
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACT:1	-	chr3L	15519775	3'	-	pogo	62	1	75.00
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGTCAGTCTGCGTCACAGAAGCGCAATCGATTTCTTTCAGATAAGACCTTTTTAATTAAAAATGTAATTTCACCTATACT:1	+	chr3L	1534775	3'	-	pogo	38	1	59.59
ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGTCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAAT:1	+	chr3L	21855540	3'	-	blood	7032	2	60.00
GGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTTGAACTTCTTTCTTGTCCATTTCATTAAGCACATGCGCTAGCCATT:1	-	chr2L	18295123	3'	+	roo	8708	2	52.69
CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCAC:1	-	chr3L	23146505	3'	-	1360	56	1	72.90
AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAAGTAAGATACACAAAAACTCTTTAACCCAGATGCGAGAGGGAGGCGCAAACTACTTGATCTTGTCGAGCAACCAACCGGCTTTATGGC:1	+	chr2L	9906577	3'	+	invader3	243	2	60.27
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCAGGGAGAACCACAACTCGCTCTCAATGGGAATGGGTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1	+	chrX	12649914	3'	+	P-element	2878	2	64.89
ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAAC:1	+	chr3R	15364031	3'	+	flea	4968	2	54.48
AAAACAAAATTATAAAAAAAAAACATGATGAGCAATTTCCTTTTCGCTTATGCTTATAGCAAATTAATAGATAAAAGCGAGTTGAATAATATCGCTAAACAGGCATATCTGGCGCCACCACCTTGAATGT:1	-	chr2R	13096744	3'	-	Tc3	77	3	40.00
CTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCAAGTTTCAAATAGACTTTACCCTAAATACTTTAATAAAATGCGCGATAAATGCAAATGACA:1	+	chr2R	11629285	3'	+	Tirant	278	2	58.90
GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATG:1	+	chr2R	8146111	3'	-	P-element	86	1	25.34
AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGAAAGAGAACCTGCAATTTG:1	-	chr3L	19035956	3'	+	Tirant	8497	2	71.19
CTCGTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGTTAAACTG:1	-	chr3R	24383247	3'	+	rover	279	2	68.12
CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGAT:1	-	chr2R	21229002	3'	-	jockey	88	1	68.49
CGATATGCTTACTACGTGCATGGAAAGTGTAATTTTTCACCAAGCACTGGGCAATTTGCAATGGAACAATAAATATTCCTAAATAATAGTCCTAGGCTGCATTCCGAATCGTGAAAATTTTATGTTCTGTACGCGTCATCCCAACG:1	+	chr2R	5621798	3'	-	Dm88	4112	1	66.44
AAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCG:1	+	chr2R	5532324	3'	-	G4	3793	1	62.39
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAA:1	+	chr2R	18336260	3'	+	roo	9026	1	55.17
CAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCT:1	+	chr3R	14979879	3'	-	pogo	70	1	65.75
AATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGAGCTAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTATGTGTACCTCATAGATATGTAAATTCTAAAGCA:1	-	chr3R	18592596	3'	+	P-element	297	1	24.66
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTT:1	-	chr2R	9328575	3'	-	roo	8699	2	58.57
AGGTATGCGGCAGCAAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGTATATACTTATATATTTTTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGA:1	+	chr3R	26432058	3'	+	opus	464	2	67.54
GTCGAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACGTGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCATCTGCTGCTGCTGCTGCTTTACTTCCTTGAAATTTTGTTTACGTTTTCAGCTGGACGCGACGGAC:1	-	chr2R	8763659	3'	+	Tc1	383	1	55.48
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGATTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTT:1	+	chr2R	9791646	3'	+	412	443	2	73.53
AGCACACACACACACACATATATATGTACATGCACCCACACACTCACATATGCACGTAAAGACACCGAGACACACGTGCAGAGAAAAATGAGACAAACAAACAAGCGCGAGACAGAGAGAGAGAAAGG:1	-	chrX	15374438	3'	+	accord	184	2	69.53
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATC:1	-	chr2R	19050173	3'	-	roo	8711	2	50.68
ATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGA:1	-	chr3R	9714371	3'	-	Stalker4	48	4	51.41
ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGAAT:1	-	chr3L	27415221	3'	+	transib2	2767	1	62.22
GCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAATTGCCAGCAAGTGTGAGTCGAGGGCCTTAACTCTTGGGTGCGTCGGTCGTCTTTCCTCCTCTTT:1	+	chrX	898670	3'	+	412	7376	2	51.49
ATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTTAAGGTCGATTACTAATTCCATTTCATTATACTTACTTACTATCC:1	+	chrX	13039567	3'	-	roo	8664	1	77.78
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGT:1	+	chr2R	16785448	3'	-	412	39	2	59.59
GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGATCTGAAATCGTTTCCAATCGAAGTATATGAGAAATATGCAAATATAAA:1	-	chr2L	20840358	3'	+	Transpac	5221	2	80.14
GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTGGGTATCCCTGGCTCCCACAAAGGGAATTCTTAAATGGGATTTGGGA:1	-	chr2L	15875749	3'	-	hobo	28	1	57.00
CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCT:1	+	chr2R	2427617	3'	-	Doc	64	1	62.76
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGCGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAGGCTAAAATTAAAATAGCAACGCCAGAG:1	-	chr2L	14771988	3'	+	roo	407	1	80.00
TAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGT:2	-	chr3L	10574302	3'	+	Tabor	7244	2	69.86
TTTTTTTTTTTGTTTTAGTCCTGGCTTAGTTAGATGATGTCATCTGCCGGCCCAAATGGCCCCCGAGAGATAAA:1	-	chr3R	18029570	3'	-	Osvaldo	1520	1	89.19
AACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAAC:1	-	chrX	10521633	3'	-	Tabor	6903	2	59.31
CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTATGATTAATGTTACGAAATAT:1	+	chr3L	11441849	3'	+	roo	9030	1	57.24
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGAAGGTGTATAATTTTAAACTGCAGCTATATGAT:2	-	chr2L	16093347	3'	+	roo	355	2	54.11
AAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGCCTTTATCAGCGTTGCGC:1	+	chr3R	18833125	3'	-	1360	3044	1	73.04
AAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAAC:1	-	chrX	10521663	3'	-	Tabor	6916	2	77.34
GCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGAAGAAAAGCACTCAAAGTGTGCTGAAAATATTTGCACGTTTTTCGA:1	+	chrX	17833138	3'	+	Tirant	195	2	53.19
ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGAT:1	-	chr3R	19589879	3'	-	BS	5005	1	72.09
CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACACATCCGATCCT:1	-	chr3R	17817877	3'	+	roo	9030	1	54.48
GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGAATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCATTAA:1	+	chr3R	28075446	3'	+	jockey	4973	1	67.12
GGGAGGATGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCATGTTTAAATGCTGAACAACAAATTCTAGGAA:1	-	chr3R	11306411	3'	+	diver2	4526	1	72.81
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTC:1	+	chr3R	18582261	3'	-	roo	8702	2	55.47
AATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTCTTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTTT:1	-	chr3R	4604450	3'	-	1360	401	1	62.33
CTCGACTATAGTATTCTCTCTTTTATTATTATTATAAACGCGAGTGATGGCACTATAATTTTATTAACTAATGTACAAATTATTTAATTGGTATTATGTTTCTATAATGTGTGTTAAATTCTTAAAAATCGATATATATCATTCAA:1	+	chr2L	22130811	3'	+	INE-1	577	1	42.47
ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATTCGGCTTATTT:1	+	chr3R	9039061	3'	+	Juan	4197	1	72.60
GTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTCCATGTTTACACTTTTAATTTGGTTTGGATAACCATTTTTAAAAAGAA:1	-	chr3L	20168364	3'	+	mdg3	172	2	66.44
AATAGTTTACTTATTTATTTGATTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATACACTATAATATATAATTACAAGACGTTAAAAAAATTATCTTATTTGA:1	-	chr3L	26719153	3'	-	Tc1-2	69	1	75.89
GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATTGCGCATCTCAAATGCTGGAACTCTGCTCGTCTGTTTGCAGCATCACT:1	-	chr3R	13362677	3'	-	jockey	4798	1	62.41
CTCGACTGTAGCATACTCTCTTCTTTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAGCAGATTTTAAGAAAATATTAACTAAACATGGAGAAATAGTAACGTAATGTTTGTTAGCGTACAAATCTTTTGTTATATTCAGA:1	-	chr2L	15004733	3'	+	INE-1	577	1	76.43
GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACCAAATTTACCCATACACGATTAAATTTTAACT:1	-	chr2R	9220975	3'	-	opus	7026	2	69.86
AATTATAAAAATTATAAAAAAAGATAATTTAATTAGATTTATTTCAATATTCCACTAGATAGAATAACTATCAGAAAATGTCCAATTTTGTTGTAAATCTCTTCTAGATTTACTGATTCCTTATTGGACTTGGTTGTTCTTTGTCT:1	+	chr3R	19584530	3'	+	Doc	4691	1	64.38
GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAACAAGTTAGCTAAACAAAAAAAAAACAATAAAAAAAAACAAAGCTGAAGAAGAGGAAGAAAAGCACTCAAAGTGTGCTGAAAATATTTGCACGTT:1	+	chrX	17833132	3'	-	Tirant	8	2	78.08
GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATT:2	-	chr3R	9210650	3'	+	mdg1	7371	2	77.40
CTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAAC:1	-	chr3R	10273962	3'	+	HMS-Beagle	163	2	77.40
GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATACACCCACAAAAAAAAAAAGAATATAAGGCTAAATAAAACAAAGGAGAGCCAGGAGAGCGATTGACGATTCTCTTT:1	+	chr2R	21297960	3'	+	jockey	4967	1	52.34
CTTTTGCTCCGACAAGCATGGTTAGAGGAACCAATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTATAGTTATACTGATAGAATAACAAACCTAGATATGTACATATGTATATGCAAATGATAAACTATAGAAATGAAATTATTAAACTAAAAAT:1	+	chr2R	20586502	3'	-	R1A1-element	4892	1	61.38
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATCT:1	-	chr3L	9998013	3'	+	roo	394	1	45.21
GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGATTTCTATATCATTTCAACATATTCAATCATAATAGAATTCTATATAGATATAGCACTATATCTTATTATGCTACATCATA:1	-	chrX	8347548	3'	-	412	7093	2	45.89
TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGTTTCTC:1	-	chr2R	15005060	3'	-	jockey	70	1	56.55
TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCAACTTGCTTATAATTCCCGACATCGGCTTTTGAATCTGAATTCCGCAAAGTGTTAGTTCTAATTTCACTTTTTATTAGAGATTG:1	+	chrX	21016882	3'	+	Transpac	5198	2	58.22
CATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATATTAAGAATCGCTTAAATCGATACCGATTAAATTAAGTTGCCCAAGAAGGGTAATGGTACGCTAGTCAATAAAATATAATATTAATATGAAATATGAAAATAGGTTTCCTTGAATGTTA:1	-	chr3R	19719144	3'	+	jockey2	3288	1	69.18
CTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGTTTTAGAGTATCTGAATGGCAATACGTACATTAGATTG:1	+	chr2L	6622521	3'	+	Burdock	6319	2	60.00
CGTCCACTCGATTGCTCATATCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTA:1	+	chr3R	20427448	3'	-	jockey	18	1	53.52
TAATTTAATTAATGGTTTAATTATTTAGTTAAATAAAGTTTCAATCTTAAGTCCAAGCACTCGAAACTCGCTTAACAGCGATCAATAAGAAGTTAGAAGCTATGCAAGAGTATCCCCTATTCGTTGTTATGTGGAGTGAATATAT:1	+	chrX	21476182	3'	-	flea	4982	2	74.48
TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCGGAGCCCAGAACGAAACTCCTGCGTTTGATTCCAGACAGTTACATATTTC:1	-	chr2L	21891662	3'	-	mdg1	8	2	77.40
AATTTTGCACCTAAACTTCGATATTAACTGGAGCTTTGTTAAAAACACGTCCGTCTCGGTTTCAGTTCAGGGATCTGCGGATCGTGGTGCAGATCAACAGGATGTGATATGTTAATGACACAAGCGTTGCCTGTAGGTTTCCAGCT:1	+	chr3R	19365233	3'	-	Porto1	52	1	63.01
ATAAGAACTAACAAAAAGTTCAAAAATCTGAACTATTAAAAATTTTTTATGTACAGTTGTTTTTTTCCAACTGTTCTGAGATTAAACGTCGTTCATACCTGTATATGGATATAGTGTTAGTGCGT:1	-	chrX	16503169	3'	-	F-element	4634	1	72.80
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACCAATGTGTGTCTTATTTTATTTTATTTTATATTATTTTTTTTTTAGAT:1	-	chr3R	10733532	3'	-	roo	8730	2	70.00
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGCTGTATATTCTTAATAATT:1	-	chr2L	12892613	3'	-	roo	59	2	60.00
ATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTAACTTGGGGTACAGTCTTATATTTATTGATAAAGTACAATATTACAATAATAACTACTATGATTAATGTTGTAAATGTTATTAT:1	+	chrX	22218714	3'	+	1360	263	1	49.32
TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTC:1	-	chrX	5662880	3'	+	P-element	2827	1	36.07
TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAATAAGGCAGATACACTTTTATATACGAGTAT:1	-	chr2L	4412511	3'	-	Quasimodo	12	2	71.03
TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAAG:1	-	chrX	13066474	3'	+	jockey	4963	1	61.11
GTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAA:1	-	chr3L	17685095	3'	-	mdg3	30	2	38.57
GATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGCATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATT:1	-	chr3L	2362342	3'	-	Stalker2	7330	2	70.14
ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTAT:1	-	chrX	21014762	3'	-	copia	42	2	47.26
TTGTTTTTAACGTATGTAGTTAATATATGTGTAGTTGCAAATACCTGTGAAGCTGAATGGAAATTTGTACATACCTGCCATAAAGGGATTATCCGAACTAGGTTCCGGTTCAGATTGCATGAGAA:1	+	chrX	22992592	3'	+	transib2	295	1	69.60
AGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAATTTTTTCCTCCAGCTGCCAAATTTGGTCCGACC:1	-	chrX	14133681	3'	+	Stalker	178	4	73.60
AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTTTGTTTTTTCTTCATGCTCCACCTTTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCA:1	-	chr3R	14651228	3'	-	P-element	44	1	26.00
GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACT:1	+	chr2R	20194294	3'	-	Max-element	67	2	60.96
CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGT:1	-	chr3R	17243138	3'	-	hopper	83	1	73.57
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGAC:1	+	chrX	8543539	3'	+	roo	357	2	55.56
GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGTTTTTGCATTTACATTCTAATCAGCTATTAAACTACAATT:1	+	chr2L	17079874	3'	-	jockey	4696	1	69.06
TAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAAGCCTGCTTGCATGTGCAAAGCTGCATTTGTTTGCACAACTTAGATCCCTTTTTTCCAATAGTATTATT:1	+	chr2R	2980306	3'	-	1360	52	1	78.08
TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTTTATGGAACGCTGATAAGTCAAATGTTGCTGGGCATTCTAGCCCGGCG:1	-	chr3R	26431922	3'	-	opus	21	2	69.86
AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGTAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGGATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTATTAATTAATGTTAATATTTCGATTTAAAATT:1	-	chr3R	6290914	3'	-	Doc	22	1	71.92
GACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGTGGTGCACACTTGTTATAGCCAGCAA:1	-	chr2L	9564467	3'	-	transib2	17	1	53.16
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCGGG:1	-	chr2R	8585404	3'	+	roo	9032	1	58.22
CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGGATACGGGTATAAAAATATTATATTGCTTTTCTATTAAGTAAGCATTATT:1	+	chrX	22511417	3'	+	1360	3335	1	68.57
GGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAACCCATGATATTA:1	-	chr3R	4504026	3'	+	INE-1	556	1	74.40
CGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACA:1	+	chr2R	21298816	3'	-	jockey	297	1	69.18
CCTAATGTAAACATAAACATCCGCTGCCGAATCCGTTATTCCCACCGAAGGGTCAAAACCGCTTAAAGTCCAGACTTTATACAAAATTTAAAAATGCCCACACAGTTGGGGTTAAAATGGTGCAGGGGCAGGTTG:1	-	chr3R	3458478	3'	+	Quasimodo	6900	2	50.37
TATTTTTTTATTTTTTAATAATTGAGTATTTTTTCATACGTTTAGTTGGATTTATTTATATGTTTAACTATGTCCACAAATTAACTCTGCCAAAGAGTGGTTTACGTTACGGTAGTATCAGACAGTC:1	+	chr2L	182776	3'	+	hopper	155	1	70.87
GAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCAAATTACTTAAATTTTATTACATTTAATTCTAATAAATAATCCGTTTGTAAAATGTATTATAGGTTTAATTTGTGTAACGAACTGTTTTCTTGGTTCTCCTTGCTAGG:1	-	chr3L	25798389	3'	-	Circe	7075	1	73.97
GAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAA:1	+	chr2R	9328679	3'	+	roo	400	1	58.67
CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGACGCTT:1	+	chrX	7195114	3'	-	P-element	61	1	37.98
ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATCATGGCCCATATTCAGACGGTACGCATTCATATTGATTATCTGACTAACTATTGTTAGCTGTATATAAAGTAACTCAATTTAGATGAACA:1	+	chr2L	9668307	3'	+	1360	3356	1	61.64
AAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCAT:1	-	chr3L	7292441	3'	-	HMS-Beagle2	13	2	74.58
AAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCGTTAATGAAGTCAAAGGGAAATGCCT:1	-	chr2R	10582332	3'	+	Juan	4203	1	76.71
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAGTTTGAGGGTATATAAGGGAATAGGGGGGGAG:1	+	chrX	5274427	3'	+	roo	387	2	70.14
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTCTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTA:1	+	chrX	6486791	3'	+	roo	344	2	68.15
AAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGAGATTGGTATGTTTTTGAACCTATTACAATTGTAATGGCCTCACCGTGGTAAGGGCAACTATTATGTTTTATTTTATTTCGCAGCATGGTG:1	-	chr2L	19958497	3'	-	I-element	269	1	71.53
AACACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAATCTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAATTGGATGAAAAGAGACGAGAAGTTCCGCAGAGAATAAGATGCATCAGAATACAATAG:1	+	chr2L	9293556	3'	+	Porto1	4451	1	56.30
GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATGGCCCGACGGATTCATTCGATTTCGATCCAATAGC:1	+	chr3L	17115589	3'	-	blood	7025	2	74.66
ATAAATTATTTAAAAAATAAAATCTTATACGAATTTTCTGTTTATTTGTTTAATTGTTTATTGTTTCATGCAATACACCCTGCTTATAAAGTTTATTTATAAAATTT:1	+	chr3R	28046128	3'	+	jockey2	3406	1	60.75
GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGGCTTTGGTAGACGCATCGTGCGGTGCTACAGAAAGAACACTATGTTTACATAATTAA:1	-	chr3L	16015242	3'	-	1360	63	1	65.19
GAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGTGGAAAAGTGAATATTTGCATACGCTCCAGCAAAGGAATAAATGGAAAAAGGAAATTCCTAATATAGAAGAAGGGCAAATAGTTTTATTAAAGGA:1	+	chr3R	19447943	3'	+	roo	8734	2	65.75
GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGCGGACTCACCTCGATACAG:1	+	chr3L	3799874	3'	+	copia	247	1	50.78
CTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAAGGTATTGTATTTATCACTCCCGAAGAAACCAAAAAGTCTAAGCACAA:1	+	chrX	18475198	3'	+	Ivk	5209	1	63.36
GGCCATTCATATCAAATATAAAGGAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTATAACACGGTATCATTTT:1	+	chr3R	17478466	3'	-	copia	4919	2	57.14
TAATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTATATGTAGTCAAGTGTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAA:1	+	chr2R	21757921	3'	-	Quasimodo	39	2	60.15
GTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATATGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACAGAAACAAATTTTCGTTTCTCGACTTTCCCCTGATTAAACATCATCTGATATATTGTCTTATATACAAGACAAAAC:1	-	chr3R	18717919	3'	+	diver2	315	2	49.32
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTG:1	+	chrX	14336505	3'	-	roo	66	2	68.49
AAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGGGAGCTAAATAATCAAGTAAAAAATAGAGCCTTGAAGATGTATTGCTCTTGAAATTCTATTAAAT:1	+	chr2L	4409744	3'	+	Quasimodo	219	2	53.79
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCCCGTTGCC:1	-	chr3L	10773084	3'	+	412	446	2	70.09
GATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGAGCGCCGATCACACTCGGCACTCATAACG:1	+	chr3R	1465945	3'	-	gypsy5	53	2	72.38
TGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAAT:1	-	chr2L	13585827	3'	-	Tabor	6898	2	56.85
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTC:1	-	chr2R	21907912	3'	+	roo	358	2	53.57
TGTGTGCGTCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGCTGTATGAAAAAAATTTCAACTATGCTGATGGAAGAAGGGTAAGCAGAATTTAAAGAAACTGTACTTACGAAACCCAAACGACCAAAAGGA:1	-	chr2R	5244413	3'	-	hopper	1089	1	52.74
ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTTTAG:1	+	chr2R	16248034	3'	-	BS	28	1	58.90
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTATAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACTATTTCATTTTAAA:1	-	chr2R	8585441	3'	+	roo	9032	1	57.80
GTGGGTAAAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTGGTTGCAGGTTTTCATGTTTTCATAGGAAAACGCATTAGAACCAACTTC:1	+	chr2R	6988475	3'	+	HB	351	1	53.33
CGAGATCTCAGGTACTTTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACTATTCTAGATTCTAGACGTAGCGCAAGTTACACAAGCATCGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTTTTACACT:1	-	chrX	4967093	3'	+	INE-1	147	1	52.74
GGAGGTATTATCACTCAGAAGATAGAGGAGTTATGCGGTCCAGAACCAGAGTGGAGGACCGCCGGGATCATCAGTCTTTTTCAAAATTCCGAAGGAAGGGGGAGATGTAAGGAGTCTTA:1	+	chr2R	3107245	3'	-	ZAM	8392	2	62.18
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGAC:1	-	chr2L	18294203	3'	+	roo	8999	2	69.86
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAA:1	-	chr2R	19004144	3'	+	roo	334	2	67.12
TCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATT:1	-	chr3L	10574295	3'	+	Tabor	412	2	65.07
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGG:1	-	chr2R	20596432	3'	+	roo	9050	2	65.38
CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTANTTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATT:1	-	chr2R	16785316	3'	+	412	7510	2	53.44
CACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAGTAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGG:1	+	chr3R	15364006	3'	+	flea	4948	1	65.00
ATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTAACCTA:1	-	chr3R	9714342	3'	-	Stalker4	6979	4	69.86
GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGTTGTAAGCACTCGGAGATCCT:1	-	chrX	7195031	3'	+	P-element	2847	1	50.39
CGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACATTTTCCATTATTAATATATATTATATGATTAT:1	+	chrX	23283850	3'	-	GATE	8289	3	76.07
AAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAAACTGGACACACTGAAACTTCCGTCGTGGTGATGGATTAATATTCCTCGTGTAGAACTGTAATTATAGATGCATTAATATATGTCT:1	-	chrY	511680	3'	+	Chimpo	41	1	54.23
TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACCATACAAGTATCGGTTATAAAAACAACTAAAAATGGGGATGGAGGCTGGG:1	-	chrX	21175653	3'	+	1360	3388	2	43.04
GATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTAATCGCAAAATGAATTACAGTTTTAATGCAAATACGTTTATTAAATTCCAGATTTAAAAAG:1	-	chr2L	11985762	3'	-	G6	1676	1	51.69
CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGTATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACCCTTATTCCATCAGGAACAGTGATGTCAAC:1	+	chrX	4215080	3'	-	flea	4762	1	72.31
ACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGCTGTTTG:1	+	chr2L	21884623	3'	+	pogo	2052	1	53.42
GTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCGGCAATTATGAAGAACGGATGACATTCGGAAATTAAAAAATACTGAATG:1	+	chr3R	19446425	3'	+	mdg1	471	1	71.19
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATCAT:1	+	chr3R	22956035	3'	-	roo	76	2	69.18
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTAGGTTGAGGATGGATGCTACATATGGGTTTTAATTTGCCTGGCATAGCCAA:1	+	chr2R	25118571	3'	+	roo	352	2	65.07
TTCCTATTAGCCTATAATATTTCTTGAGGCGCTGGTTGGCTTGGTTTGGTCGACAGCGTATGCATTGTATAGCAGAGCGCCAAGGACACTGCCTTGGGGGACAAT:1	-	chr3L	25847793	3'	-	G7	774	1	54.29
AAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACACCAAAGGACTTTTTTGCCACCCATATAGCTGAGCAAACAACTTTGACTTAGAATTT:1	-	chr2R	22956876	3'	+	hobo	12	1	60.56
CTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGGGAAACACTTTCA:1	-	chr3R	31045727	3'	-	INE-1	136	1	67.20
CTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAATGCCATTCAAAACTGAAATTTTGCT:1	-	chr2R	2832924	3'	+	1360	3299	1	78.08
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTTTTGCAATAAATTATACAATATCATTTAATTAGAAAAAATCTAAACATATAAACGA:1	+	chr3L	15519854	3'	+	pogo	2042	1	60.96
TATTGATCCAGATCAAGAATAAATATACTTTATATGTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTTTCACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATA:1	+	chr3L	22721133	3'	-	INE-1	84	1	71.92
GATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGTTTCTCTGGATTTTCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGTTCGCCATTTG:1	-	chr2R	15004723	3'	-	jockey	9	1	44.52
AATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAAGGTAAGTGCTCAACTGTGTGGCATAGAAATTTGGCCAAACATAATTGGCTTTTTCAATTCATAACTTTTTAGACTGTGGGGGGCTACAATAGGTATAAGCAA:1	+	chr3R	18591309	3'	+	P-element	2778	1	77.24
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAAGGTGTTTAATGAA:1	-	chr2R	13121954	3'	-	pogo	20	1	59.03
AGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAA:1	+	chr2L	21008608	3'	+	invader3	224	2	67.86
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATAATTATGGTAAGAAAATTAAAACCGAAAGTCTGTTTGTCCCATTGTGCGTATAATAGCAAAA:1	-	chr3R	31720483	3'	-	pogo	47	1	59.12
ATATATATATATATCTACATATATCTGCACTCTGGATGAACGGGTATTCGTAGAG:1	+	chr3L	703526	3'	-	G3	4507	1	94.55
GATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAAAATACGGGGAAACATTTTTCAATTAAGTCTTGGCAAATA:1	+	chr3L	10056187	3'	-	transib2	75	1	69.18
CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAAAGT:1	-	chr2L	1517611	3'	-	jockey	4680	1	67.86
CAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGAGGCGCACTCGAAATTGGAAACTTTTGCG:1	-	chrX	5663100	3'	-	P-element	168	1	50.53
GCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATATTCGCCA:1	+	chr3R	20499834	3'	+	mdg3	169	2	67.81
AGATATGAACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAATAAACAGTTATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATGGGAGCTTCAAAAAGGGTGTATTCTTTTTCT:1	-	chr2R	2833318	3'	+	1360	493	1	78.77
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTATTCCTCATTTACATTTTAATATTCTTAACTTTCTAAG:1	-	chr3L	21817929	3'	+	roo	9054	2	71.92
GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGTTAAATGGCAATTCGTGTTTTGTGCTTTGCGACGGCACAGTACAAAAATAAATGCAA:1	+	chr2L	18339105	3'	+	pogo	2087	1	72.59
TGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCACGTTACTGTCTAAAAGCTAAGACTAGAATATTATTCTTTCATGACTTTTTATTTTTTTGATGCTGGATCTTAATCAGGATTAGAGTGTGGCTGGGAGAG:1	+	chr2R	9704871	3'	+	HeT-A	5846	1	54.40
CCAAACTAATGTATGGCCGTTACGCATTTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTGATAGTTAAACTCTGCGACACCTCAGCTGTGCAGCAATATCTTTCCTTATCTAAGCTCCCATCTCTTGCTCTCTTTATAGTACTCTCGCACCTAC:1	+	chr2R	4606488	3'	+	1360	3362	1	68.28
AATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGA:1	-	chr3L	17557986	3'	+	jockey	4955	1	52.74
GGTGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCTTCTTTGTGGCGACACGCGGCGCCCAC:1	-	chr2R	7586115	3'	-	I-element	5052	1	67.20
CGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTA:1	-	chr2R	5485054	3'	+	blood	374	2	79.86
GTTCTTCGCGTGGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1	+	chr3R	4571526	3'	-	gypsy	7065	2	73.76
CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGA:1	+	chrX	7195109	3'	-	P-element	83	1	30.14
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTC:1	-	chr3R	25448365	3'	+	roo	325	2	77.70
TTTTGGACAAATTTGAAAATTTTTAAGATATTTCCACAGGATGGGTTACTTAAACAATTCGAAAGATATACTAAATAATTGATAGCTTTGCAAAGAACTAGTTTGAAATGGCTAACAAACGCAATAGCTAGAAGATAAATCCATGT:1	-	chr2L	9509468	3'	-	Ivk	5250	1	56.16
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCCCTCTCATTCTTCCGGC:1	-	chrX	16717878	3'	+	roo	404	1	67.35
TGGGTATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTAT:1	-	chr3L	25782386	3'	+	Stalker4	45	4	50.68
ATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGA:1	+	chr2R	5532341	3'	-	G4	3773	1	50.00
CTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTAAATCGGATTGTATATATCTTTTTACAACGTTTTAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTACATTTGTAGATAGATAGA:1	+	chr2L	22750381	3'	+	Tc3	1617	1	78.77
ATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATA:1	+	chr2L	22224617	3'	+	Rt1c	5410	1	61.64
TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGG:1	-	chr2L	14772062	3'	+	roo	8980	2	79.45
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTAT:1	+	chr2L	3114579	3'	-	roo	8723	2	58.22
GTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTCTGTGCGTATGGGTATCTGTATCTGTGTGAGTGTGTTTGCCGAACACACACTCAAATAACTTCATTTTGGACAATCTGAC:1	-	chr3R	31120907	3'	-	I-element	462	1	64.29
TTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATATGCATTTAATTTAATTCCCGCCAATGTCCGTCCA:1	+	chr3L	1356992	3'	+	F-element	70	1	73.64
TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAAGAAAGA:1	+	chr2R	5031010	3'	-	Doc	69	1	75.65
GAGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATCTAATGATGTTATTGTTGCTACTGCACCTGCATCATTTGTGGCCGCTCAAATTGCATAATGTATGCAAAAAGCTTAACTAA:1	-	chr3R	12852986	3'	-	Quasimodo	303	2	78.18
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTG:1	+	chr2L	3886254	3'	+	roo	9037	1	55.81
TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGACCTTCCGTGTAGT:1	+	chr3L	20831369	3'	-	roo	8734	2	67.81
AAGTATTTTAATAACTTTTAAAAATGTGCAAATATTATTTTAATTCAGTGCATTAAGATTGAGTACAAGCAGCGACTAAGAACCTATTATTTCTTTATACTAATTGAAAAGAATTGTACTTGCATTTAAAGCTTAAAAATACTTTC:1	+	chr2R	20435110	3'	-	Transib-N1_DM	288	1	63.70
TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAG:1	+	chr2R	15064428	3'	-	412	7126	2	68.49
ACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	416	1	55.48
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTG:1	+	chr3R	22844261	3'	+	roo	8995	2	74.82
ATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCATTGCCTAATAAGCAGCTGTAACTCTTCCG:1	+	chr2L	2122493	3'	-	Stalker	44	4	51.11
GCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCGATTCAGCTAAGGGTTGATGCACTAGTGAAGGCGGCGCAGGCTTTGCCAACACCTTATTCTTTTCCAACTCTTCATTCTCGCAGATGGAACGCATCACGGAGGGC:1	+	chr2L	21146379	3'	+	1360	31	1	70.55
TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTTCTGTAGAAATGGCTTAGTTGATACATTAGTTTCCGATAACGGAAAACAATTCACGTCTGATGAATTTAAAATATTTAAGACCATTAATAGTTTAAATCACATATTGACA:1	+	chr3L	23818482	3'	-	copia	4881	2	76.03
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCGGACCACCGCAATTTTCTTTCATTTTCCGTAGTGCATTGGCATTTTGTTGAGTGTGTTTCAATTAAATT:1	-	chr3R	28624549	3'	+	roo	9052	2	60.53
AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAAGAATGAAAAGCCAACGAGAAGGAAAACGGGTAGGAAAAGGGCCAGGCCAGGCACTTGGTTAGTCGCAAAATCCGGAGACG:1	-	chr3L	4755190	3'	-	jockey	4690	1	66.67
AATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTCTTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAAAAGTTCGAACCTTTTTGCTAATTTTAATTGATCAGACGGGGTCAGGTTTTTAGGGCGCTCCCAGGAGCAT:1	+	chr2R	5248161	3'	+	1360	3075	1	50.68
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCAGAGCCGGAATAAGC:1	+	chr2L	3886289	3'	+	roo	9055	2	73.29
AATAACATTTCTTTAATTTTTTTGATTTTTTCCCAAAACTAAAGACACCAAATCTAATGTATTTCCTTGCGAGACCTTTGATTGCCAACT:1	-	chr3L	10295014	3'	-	HB	326	1	75.56
ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAA:1	-	chr3R	17478339	3'	+	copia	222	1	62.33
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAGAAAAAGTAAACAGAATGAGAAGAATATCAACATCAAATCTTATC:1	+	chr3R	17818029	3'	-	roo	6	2	77.04
TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAACCCACATATTACATTACATTACATTCGCTATTATATTAAA:1	+	chr2R	9221098	3'	+	opus	420	2	72.60
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCAGTTTAAC:1	-	chr2L	16091862	3'	+	roo	9043	1	61.64
CGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAATTCTTTTTAGTTTTTTCTCCAGATTCATGTAACGAGCTATCGCTTGTTTCTTTGAAT:1	-	chr3R	19445054	3'	+	G2	2935	1	60.96
AATAAAAAAAAAAAGGGAAAAAAACAGCAACGAGCAACGGCG:1	+	chrX	9736153	3'	+	Bica	337	1	78.57
AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATC:1	-	chr2L	17081783	3'	+	jockey	4930	1	61.64
CTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTAGATATTGCACAGCCATGGCCACTTGAATGGGACAACCCGCTGGGCTGTTGGTTTGGCTGAAGTTT:1	-	chr2R	17626819	3'	-	opus	135	2	59.48
AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAAT:1	-	chrX	13066521	3'	+	jockey	4914	1	72.60
GGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGGCAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAA:1	+	chr3R	11547761	3'	-	G2	329	1	61.67
CACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCACAAATTTATTTTCTCGTCGGTCACCCTGAAAAGTATGCTACATTTTGGACATACTTAAAGACATAAATACAGTTT:1	-	chrX	17054141	3'	-	jockey	14	1	74.66
TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTGAACAGCTTTTCTGACTTT:1	+	chrX	21430254	3'	+	hobo	2905	1	73.08
TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGATGAGGC:1	-	chr3R	2461559	3'	+	mdg1	368	2	54.86
CGATTGCTTTAAGAGCGCTAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGGTAAAGTCATGCAACTCATAATTAGATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTATAGCCACCCTACAATGCCCCATCATGAAAGTGGAAGAAAAATAGC:1	+	chr3R	20443264	3'	-	Cr1a	4246	1	67.81
TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACAGGACGAAATCCCA:1	+	chrX	17431785	3'	+	hopper	1386	1	56.18
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATT:1	-	chr2R	9328613	3'	-	roo	8720	2	65.85
ATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGTTAAATAGTTCACTTCGATGTAATGCATTCCCGT:1	-	chrX	2297100	3'	+	Tirant	281	2	76.71
TATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATAGAGTGTGTGTAGACAACACAGGGTTCGGCTT:1	-	chr2L	20117820	3'	-	Dm88	15	2	76.34
ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATT:1	-	chr3R	17531390	3'	-	1360	34	1	74.68
AATATATATATAATATGTATGTCCCATTTAGCACCATTTCTTGCAATTTATATTTACTTCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTAAACTAACCTGCTTGGTCACCGAATCGAT:1	+	chr2R	14793501	3'	+	Dm88	4368	2	61.40
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGNACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGAC:1	+	chr2L	17420241	3'	-	roo	72	2	67.81
TTTTATAGTTCCTGAGATCTAGACGTTCATAGGGACAGATGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAAAGAAATCCTTTTTAAGA:1	+	chr2R	5198430	3'	-	INE-1	147	1	77.40
AAATTGGATTTTCGAACCTTTTCCTGCAGCGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAG:1	-	chr3L	25373416	3'	-	GATE	380	1	60.00
TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAATGCTTTGGGGCTTGCTAGGTCAGACTGAGCCGTTTGTTA:1	+	chr2L	13585964	3'	+	Tabor	7297	2	66.44
GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAACAAACAGAACGAACAA:1	+	chr3L	22400358	3'	+	1360	3350	1	55.28
ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACACATCCGATCCCTG:1	-	chr3R	17817875	3'	+	roo	9026	1	52.14
AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAATTGTTCATTTTATACGATATAGT:1	-	chr3R	17478316	3'	+	copia	245	1	78.08
GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGTTAAGAAAATATTTAACAAGTGTTTGAATGATTTT:1	-	chr3L	3863418	3'	+	blood	7340	1	51.37
TTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCGATTTGACTTCACCGTCAGTCAGCCAAAAATGAAATCATTCATGT:2	+	chr2L	4412681	3'	+	Quasimodo	7334	2	63.01
AAAAATTGCGTTTAATGATGCGATTCTGAAATGCATGGGAAAAGACGGGGGCAAGTGTGGGGCAAGAGTGGGGTTAAGGAGGCGGAGAAGCAGGCAGCCAAAATCCGACTTTGGCTGATGATGAGTGTCG:1	-	chrX	7397319	3'	+	S-element	1638	1	86.15
GACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGATCACCTTTAAGGCGCAGACATGACTACTGAGACCCACTCGAGCTGCAG:1	+	chr3R	19242910	3'	-	Burdock	6255	2	67.12
CCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGAGCAGTCGAGTGTGGACTAGTTTTTGGGTTCAAGGGACAATGAATGTGCGAAAAACATTTTATGAGCTATATTATG:1	-	chr2L	2687320	3'	+	copia	109	2	49.32
CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACTACTAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTC:1	+	chr3L	16015339	3'	+	1360	3378	1	62.39
AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCTTTCA:1	+	chr3L	17560402	3'	-	pogo	39	1	57.93
ACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGATTCCATGCCACTTATAAGATGTTCGACGAACCCGAACATATATCTCTGCCA:1	+	chr3L	9673525	3'	+	Doc	474	1	62.35
GGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTCGTTTTGTTTTATATTTGGCCTGGGCTGTGCAGAAAA:1	+	chrX	10692547	3'	-	I-element	4908	1	79.45
GCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGAAGACTGTGGCCCCGCCAGTCCCCATGCATAGCTCCTAATTATCCTGCG:1	-	chr3L	20888713	3'	+	1360	3351	1	60.00
CTACACATCTTTCAAAAGTGTGAGCGTGGCAGTAGTGGGCGGTAAAACACAGGTCACAACTTTAGATATTAATGTAGCTATTTAAAACTTATTTATTCCAATTTGTACGCAAATGCCTTAGAAGTTACGCATACGACATGGCCACA:1	-	chrX	17060343	3'	-	INE-1	259	1	70.55
ACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTTTTTCTAAACAGATGGC:1	-	chr2R	16785299	3'	+	412	459	2	59.59
GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAATCATCATCTTTCATATTTTAATAGATGAAATATAATAGATATAGACATATACATTTTTCAGCTTAAAAAGCTTTCCAGCTATTATATTGGGG:1	+	chr2L	5300912	3'	+	jockey	4947	1	54.79
ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTTGATATAACAAAGGCCACTTGCTGAATCCACAGTGTCCGTTATCAATAATTGACG:1	+	chr2R	18609447	3'	-	opus	38	4	58.26
ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATACAAAGCATTTTTCTTCGC:1	-	chrX	3309628	3'	-	jockey	58	1	62.40
CATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCGATTTGACTTCACCGTCAGTCAGCCAAAAA:1	+	chr2L	4412666	3'	+	Quasimodo	7319	2	53.42
CAAAAGGTAAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTAGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAGGAGGGCACCATCTCTTGACATTTTATAACCCCATTCTGGTCGAACCATTTAGGCATTTAATT:1	+	chr3L	3641017	3'	+	Quasimodo	217	2	57.69
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTGGGACCAAGCACTCCATTCCACTCTGCCAACC:1	-	chr2R	13084553	3'	-	roo	8678	2	71.54
GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCCGGTAGCTATCCTGTTGAAATATATATTTGTTATTTCTTGCTGGTAGAAAATTTAAAAGCTTGCAGC:1	+	chr3R	12598557	3'	+	hobo	2921	1	60.58
TGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTTCCTAGCAAAATAAATATTCAGAAATTTCCCTCCAGGCAC:1	+	chr3L	2325780	3'	+	I-element	5277	1	73.29
TGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTGCTAAACATCATCGGTGTATGGG:1	+	chr3R	24383347	3'	-	rover	32	2	57.69
ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTACGAGAAAGAAGTACAC:1	+	chr3R	13349160	3'	-	BS	5025	1	61.38
TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTA:1	+	chr3L	12861808	3'	-	pogo	64	1	64.38
AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTG:1	+	chr3R	28075418	3'	+	jockey	4945	1	50.68
TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTTATCAGTTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGAGATGTTTCTATA:1	-	chr3L	10841434	3'	-	mdg1	17	2	58.46
TGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGTGGGTTATGTATGTACATAAAAATATTTATTGTTCACGTTTCTT:1	+	chr2R	9874884	3'	+	S-element	364	1	69.86
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAAT:1	+	chr2R	7898186	3'	+	roo	9033	1	54.29
TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCGTGTGGTACCAGTACCAGCAGTAACAACACGGCAAATGGC:1	+	chr2L	9564551	3'	-	transib2	21	2	62.50
CGTGCGCATTTTCACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGTCGACTTCACAGCCATTTGAACAAGATTGGCATTGCAGACAGTGAACAAAACAAAACAAAAATACGTGCGCTTTTTTAAATAAAGCACAGAATACAA:1	-	chr2L	23077989	3'	+	baggins	5118	1	57.89
AGGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTAAACTTTTTTCTTCTTTTTCAGTATACCAGT:1	-	chr3R	13237270	3'	-	3S18	42	2	56.85
GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCAACTTGCTTATAATTCCCGACATCGGCTTTTGAATCTGAATTCCGCAAAGTGTTAGTTCTAATTTCACTTTTTATTAGAGATTGGTAGCTTTAGATTTTAATCACAA:1	+	chrX	21016905	3'	+	Transpac	5221	2	73.97
GCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTTAAGTAAAAATTCAAAACAGATGCTCATTATAAATATCCATTAAAATTACAT:1	+	chr3L	14299810	3'	-	roo	8956	2	58.06
TCTCTGTTTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAAGAGTATTGAGTCGTGTGCCTCCATCCTCGAGGAGCAC:1	+	chr2L	810830	3'	+	Circe	102	1	70.97
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGGATTT:1	-	chr3R	19968086	3'	+	roo	404	1	73.27
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGCCGGCGTGTGTCTCTGATTAT:1	+	chr2R	21908037	3'	-	roo	42	2	55.48
CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTG:1	-	chr3R	25339974	3'	+	mdg1	364	2	59.85
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTG:1	-	chr3R	18582152	3'	+	roo	9008	2	63.38
TTAAAGAAATTATTTTATTTAATTGACTAGCGTACTATTAGCCTTCTCCGTCGGAGGGGGCACGGGTATTCCCTGCAGCTCCCTTGTTTTTTGTCGTTTTGCTGTGCTATTTTGC:1	-	chr2R	4141841	3'	-	jockey2	3384	1	53.04
GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCCGTTGAGTGATT:1	+	chr3L	10648032	3'	-	412	7078	2	54.79
CACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGCACCATCGGCTTCGCTCAA:1	+	chr3L	17205254	3'	-	hobo	45	1	75.00
AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATATGTATATATACATATATAAACCTGTGCTGCGCCCAGTGCATCTCTG:1	+	chrX	8814830	3'	+	pogo	2036	1	70.55
CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTATGCTAAGAGCCAACCGTCTGGTGG:1	-	chr3R	7641072	3'	+	hobo	2908	1	68.75
GCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGAGCTGGAGGTGGGGCGTTCCTAAGGGCGCAG:1	-	chr2R	23427967	3'	+	Quasimodo	7243	2	66.29
AAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACA:1	-	chr2R	19004135	3'	+	roo	405	1	72.94
ACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCCTTCAACAATGTATTTTTGTTAAATAAACGTATTAT:1	-	chr2L	16019335	3'	+	412	53	2	69.49
TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACGTATAACAATAATAAGCCACAGCAACAAAAACAATTCAGGAAACTTGGCAACAAAATACACAAAAATGAAAATAATCGAA:1	-	chr3L	2840890	3'	-	copia	4896	2	53.08
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATG:1	+	chr2R	18336247	3'	+	roo	348	2	59.59
CTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTGCCAATTTCAATGAATATCATCTAAGTTACCTGCATCGAAGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATCCCGAAACATTA:1	+	chr2R	6086372	3'	+	pogo	131	1	47.48
AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAG:1	-	chr3R	28758297	3'	+	mdg1	360	2	59.59
CTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCCGCACCGCAGACTTATGCGAGTGAGTAAAGCAATAATAATCAAATGTAGTCTCTTTTTTCAAGATG:1	-	chr2R	1523153	3'	-	1360	96	1	55.45
GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTT:1	+	chr2R	4939193	3'	+	1360	3361	1	34.25
GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTG:1	+	chr3L	11321497	3'	-	mdg3	5255	1	66.67
AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACACTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGT:1	-	chr3L	17558022	3'	+	jockey	4919	1	69.86
AAAGAAGAAATCACAAAATATTAGAAGGAGTCCTTCCTCAATTGAATTATGGATTCAAGTTTCAAATGTGAAAAAAATCAACTAAAAAATACCGATATTTTTTTGTATACCTAGCTTATACTGTTAATTATATTTATTTAACGCTC:1	-	chr2L	14945294	3'	-	Juan	77	1	67.12
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAAT:1	-	chr2L	17420138	3'	+	roo	358	2	54.11
ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATTATATACACATTAACGAGTAGGGCGAATGAATCATG:1	-	chr2R	18609376	3'	+	opus	468	2	64.13
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGTCTCTTAATGTTTTTGAAACTAACTAGAGATTAAAATGATATTAACTGATTAGGCACTAAAATTTTC:1	+	chr3L	2029852	3'	-	roo	8718	2	65.75
ATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTA:1	-	chr2R	1320670	3'	+	diver2	320	2	47.48
GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTAGTCAACCTCTTTTTGTT:1	+	chr2L	1665019	3'	+	hobo	2937	1	64.44
TCTAAAATCAAAAGAAGAAATCGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGTTGCACTCATTATTTTCATT:1	-	chr3L	10647925	3'	+	412	7469	2	69.44
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATCAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1	+	chrX	23439059	3'	+	P-element	2495	1	58.90
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGC:1	-	chr2R	19050212	3'	-	roo	63	2	70.73
GTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGACGAGCTCATGCCGCCGGACGGCATGTGCATCATCATG:1	-	chr2L	7052406	3'	-	roo	9030	1	69.67
AATCTATATTATTTTTGATCAATTGTCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTAAGTGAACGTAAGTAGTGAAAAATAAAAGCGAAGTTCATGTATATATAGGACTCATTACATGGAAATAATGGAAAA:1	-	chr2L	12553049	3'	+	1360	253	1	48.28
AGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGTGGGCGTAGCGAAATGTGTCAACAAACATGCTTTTGCGTGAATTTTAGAACAGAATTTAAAGGAATTAAAGGACTTTAAATTTTGTATTTACAAAAATAAA:1	+	chr4	916840	3'	+	invader4	2925	2	75.17
TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATC:1	-	chr3R	9038903	3'	-	Juan	4040	1	60.00
GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAAC:1	+	chr3R	29361030	3'	+	mdg1	7376	2	78.72
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCATAAAGAA:1	-	chrX	9539996	3'	-	roo	8709	2	52.74
AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACTAAGCATTCTGATTTAATACAATGATAGATTCTCACCCTTTTTCCTGCTGAGCAAGAAGCCGTTGCAC:1	+	chr3R	18272213	3'	+	1360	3364	1	48.76
ATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAC:1	+	chr3L	16973453	3'	-	S-element	64	1	68.84
GTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATG:1	+	chr2R	10582447	3'	-	Juan	3888	1	73.29
TTTTATTTTATGTATTAAAAAACAAAACAAAATCCAAGTTTTTTATCGCCGTGCTTGG:1	-	chr3L	12660120	3'	-	G7	1144	1	79.31
GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTA:1	-	chr3L	7292456	3'	-	HMS-Beagle2	50	2	57.14
CTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACCTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACCCAACCAATCTTAA:1	-	chrX	16541451	3'	-	INE-1	85	1	73.10
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCT:1	-	chr3L	11393486	3'	-	roo	63	2	68.35
GCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACAAAACAAGTAATTGCCATCATAAAGCTACTTATGCCACTGA:1	-	chr3L	4605585	3'	+	pogo	2072	1	70.14
TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTTCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTT:1	-	chr3R	25423194	3'	-	3S18	5796	2	51.67
TATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATT:1	-	chr3R	9038962	3'	-	Juan	4046	1	70.11
TCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGAGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGATGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATCGGGTTAATAAAATGGTGTGATCTGCTTCTTCG:1	+	chr3R	17478445	3'	-	copia	4953	2	71.92
CTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACC:1	+	chr2R	18336250	3'	+	roo	394	1	67.31
CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAAATAAATAACAATAATAGCATAGTGACATA:1	+	chr2L	22685217	3'	-	Ivk	41	1	56.94
ATTTAAAAAAATATAAAAAAATAAAAAAAAAACTAAAATAAACAATTTATGTAGTTCCAAAAATATCCGTTTCCTTTAACCTTTCTAGGCGAAAGGTGTTTTAACAGGTCCACTATTTTCAAACTCAAGTTAATTACAAGGTCAA:1	+	chr3L	15903595	3'	+	transib4	2275	2	62.76
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACCCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATTTGTGGCACCATCC:1	-	chr3R	7482691	3'	-	412	17	2	71.23
AAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTTACTA:1	+	chr2L	22150635	3'	-	S-element	77	1	82.19
GCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAACCCACATATTACATTACATTACATTCGATATTATATTAAAATAATCTCTGGAGATTAAA:1	+	chr2R	9221117	3'	+	opus	439	2	59.59
TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGCATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGC:1	+	chr3R	17243240	3'	+	hopper	1401	1	68.00
ATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATTTGGGGAATATATGAGAAAACATTTAAAAATTGTTCAAAAGTGTAGG:1	-	chrX	416231	3'	+	Burdock	185	2	70.55
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTTGCTCTTCACATTTATTACTTGTTAACTTGAG:1	+	chr3R	21434946	3'	+	412	443	2	72.22
ATTTATAAGAAAGAAAAAAAAATAACAATTGGCCGGAA:1	-	chr3R	25822020	3'	+	HMS-Beagle2	479	1	68.42
AAATTAAATTTGTATTATTAAATTATTCTTATGTATGCCATATTCATTTAAAAATATAATTATTTGCTTACCGAAAGAATACCAAATCGATTAATGTTTGGCGATTTAAATAAGTTGCCATACTGATGAAGCCAAACCACCCAGAA:1	+	chr3R	23591741	3'	+	invader2	4727	1	36.99
CAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTAAGGAGACGCCTCATAATTCACAAAAGTGTTGACAATGAAAACGAAATTCCCATTAAAATGCAATATGTTGCAG:1	+	chr2R	14521407	3'	+	BS	4845	1	54.11
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATAATGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCC:1	+	chr3L	17560383	3'	-	pogo	57	1	56.94
ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTT:1	-	chrX	6498930	3'	+	Quasimodo	7320	2	58.22
CATAACTCCACGTTGGAGCAAGTATGGCATTGATTAAAAGAGCCTTATGGTTACCAAAGAGCATATCGAAGAGGTGGCGCCCCTTATAGGCG:1	-	chr3R	5819145	3'	-	G5	4372	1	54.35
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTTCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTC:1	+	chrX	8543512	3'	+	roo	326	2	74.82
ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGAATAAACTGCT:1	+	chr3R	25826797	3'	-	mdg1	30	2	64.38
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCTCTCCTCTGTGAGTAATCAAAGCCACGCCCCAGAAAG:1	-	chrX	17431729	3'	+	hopper	1411	2	63.77
GGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAAGTCACGCCC:1	+	chr3R	20005112	3'	-	297	6626	2	56.80
ATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGCTTAATGCTGAAGAACTTTGCTCTAATTTGAACGCATAACTATTAAACTTAATTGCATAATAAAAAT:1	-	chr3L	14597426	3'	+	jockey	345	1	54.11
TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACT:1	-	chrX	10644444	3'	-	jockey	4836	1	67.81
TTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGACATCCAGCTCCATCTTGGTGGGGCAAATCAGACCCACCCACAGCCGACGGTTCGTGGAGTCCAAGAGTACAAAGTAAATGA:1	+	chr3R	31106738	3'	-	I-element	93	1	66.67
AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACT:1	+	chr3L	11957190	3'	+	blood	7323	1	74.38
ATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCATTTATTTATATAATGCTAATGCAAGTGACTTCTAGCTTATACTTGGATTCGCATTAGTATTTTATTTAAATCAACATTTCTG:1	-	chrX	5665516	3'	-	P-element	490	1	61.11
AAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAATGCCAATTAGTTCGGATAGTTAGTGACTTTAATTCACTCCAATACA:1	-	chr3L	16973308	3'	+	S-element	175	2	74.13
GCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATAAGTACAAAACTAATGGGTATAGCTGACCTAAACTTTACGTTTAAGTGTACTTATTTTCTATTTCTTTGCCATTTCAGACACGCTCAACTCTG:1	-	chr3R	20508237	3'	-	BS	5068	1	66.67
CAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTTGTGGGGAAGTTG:1	-	chr2R	13696371	3'	+	roo	367	1	56.85
GAACACACACACACACATATAGCTCTTTCTATATATACACTTGTGGAGAGTGAACCACATCATACACAGCTGCATATGTGTGCGTGTAATTAGATTTCCGCATAAAAAGAGAAGAAGGGAGTTGAAAATTCACCCACACACTTGG:1	+	chr3L	4958557	3'	+	accord	183	2	49.66
ATTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGGTATCCCGCTGAGATACTGCTGATCCACCCTCATAAAACGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTCAATCAATTGTATGGCACAAGTACAATTATAGCAAA:1	+	chr3L	1320942	3'	-	gypsy7	5092	1	78.52
TTTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGAGAATATTCTGGAAACTTTT:1	+	chr2L	11661013	3'	-	F-element	75	1	56.94
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTA:1	-	chrX	9540030	3'	-	roo	8743	2	75.34
GTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTAC:1	+	chr2L	21400811	3'	+	Doc3-element	4686	1	39.23
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATT:2	+	chr2R	18336255	3'	+	roo	9020	2	54.11
GATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAAATCAATTTACTACAAGGCTTAAAGTCTTAACAAAAGGTTGGATTTCTCTGCATACTTTCAGGCGTCAGAATCAGAGCAATTGCTTTAGTAAAATACTA:1	-	chr2R	18687715	3'	-	jockey	4987	1	42.47
AGCAATAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTATGTTTTTGGGCAATTGCTGCAAAAGTATAGCAATTCATACAAAGTTGTTTAATTTGTTTTAACAGACAAATAGCATTTATATTACCAAAATCTAATATGGAAAAATA:1	+	chr2R	18988909	3'	+	Tc1	129	1	62.33
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGCCGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCG:1	+	chr3R	18582228	3'	-	roo	8696	2	63.27
CGAAAATAAACTAAAATAAAATAAATCTAAGCACACAGACACACATGTTGGGCGTTTTGGCCAAAAAAATATGTATATGTTGGTGTCCCTAAAAATAATTTTAATGAAGCTTACCTAAAATAATGCACGAAAATATTCCAAATGGT:1	+	chr3R	9222148	3'	-	transib1	1900	1	61.64
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCCACTTC:1	-	chr3L	12308355	3'	+	hopper	1411	2	58.33
AAGTATAAATATAAAATAAATCTCTGGAAAACGTATAGAGCACAT:1	-	chr2L	16974005	3'	+	transib4	2576	1	91.11
TTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCTT:1	+	chr3L	25824648	3'	-	Juan	4197	1	52.42
GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCATAAAAGTTAATGATGTCCAAAT:1	-	chr3R	9921945	3'	-	blood	31	2	63.01
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAA:1	+	chr2R	9632173	3'	+	roo	332	2	72.46
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAAATAGCAGACAATGTCAC:1	+	chr2R	8585587	3'	-	roo	8677	2	56.16
ACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGATTCCATGCCACTTATAAGATGTTCGACGAACCCGAACATATATCTCTGCCAG:1	+	chr3L	9673526	3'	+	Doc	474	1	62.79
GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATTATAATTATTTCAAATAGGGTTTTTTAGCTCTTGCTCGCTTCTAATAAATTCCGTACAAAACTGACCATAAAGATTTAATTAATACAA:1	-	chr3L	3500900	3'	-	opus	20	2	67.91
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGG:1	-	chr2R	19004166	3'	+	roo	8989	2	80.45
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGATAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTCT:1	+	chr3L	15600365	3'	+	roo	394	1	58.27
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAAC:1	-	chr2L	3114498	3'	+	roo	8990	2	73.79
ATAAATAAATCAAATAAAAAAATTATTGAATCAACAACGTAAAATAATTAAATCAACATGAATGATTTAACGCTCCAAATGTGTTTGTTCTGGCAAAATGTACAATTGTTGCAATTCTAATTTAACACTTAATTTCACGAGAAACT:1	-	chr3L	5063808	3'	+	X-element	4717	1	58.22
GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACATATGGCACATATG:1	-	chr2L	13585806	3'	-	Tabor	37	2	60.69
CAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTNACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATA:1	-	chr3R	4357525	3'	+	Tc3	1650	1	56.85
TAAGAANCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCATTGGTGTTCTCATTCGTCAGCCATAGTTTTTAGCCATTTATTTGTAAATTGCAAACGACAGAAAT:1	-	chr3R	8736169	3'	+	Idefix	315	2	54.79
AGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAGGTAAATAAAAAAAATATATATATTTCTACTCTTCGAAAAAGATTTGTTTAATGAAATAATTTCTCCATAATGACACTGATTAATTACAAAAATAAATCATTTTATGATATTGCCTAGGGG:1	-	chr3R	17814361	3'	-	roo	8989	2	75.34
GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAA:1	-	chr2R	3919679	3'	-	1360	40	1	67.02
CGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCTATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGTTTTCCTATACATTTCATATGTAAATGAAAGGGAAACGAATTGTTATTGGACCACCTTCACGCTGCTATTCCATCTGGATGTAGGTCC:1	+	chr3R	14944489	3'	+	jockey	164	1	68.57
TGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGATAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGACAGCATTTCAAAAATTAATATTTATAATTTTCCTATTCCCCAGCAATTTGGCA:1	+	chr3L	10574423	3'	-	Tabor	7	2	64.23
GCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACATTGTGATATT:1	-	chr3L	17557974	3'	+	jockey	4967	1	60.96
AATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTG:1	+	chrX	21014858	3'	+	copia	5064	2	60.27
AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAA:1	-	chr2L	11518415	3'	+	412	419	2	75.38
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTGTATAGTTTGT:1	-	chr2R	7898048	3'	-	roo	2	2	76.85
AAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATCCTGCGAGCTTCTGTTGCTCAACTTCTTAAAAACTTTGCGATC:1	+	chrX	8602286	3'	+	I-element	139	1	70.55
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACGTTGTCCAAAGATAACGAAACAACGATACATTACAATAAA:1	-	chr3L	22863396	3'	-	412	78	2	71.03
GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGGCGAGGCAGAGATCGGGGGTTGGTCCACTGCCAAATGAACTTGCCGGCACAAAATGGAAATTGTTGATGGGGGAATTCGAAATGCAAAAAGCGCACAAAGCCG:1	+	chr2L	11671896	3'	-	jockey	4748	1	72.66
ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTACAATACTTGCTAG:1	+	chr2R	9662807	3'	-	412	7109	2	59.59
GTACAAACTGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAATTAGGGGGAATGATGGCGCTGTGCTGGCCAAATGATTGGTCACTCAAATCCATCATA:1	-	chr2L	14891727	3'	-	transib2	443	1	65.56
TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTTGGCACGGTTCAGTACTCATAGCCG:1	+	chr3R	18582298	3'	-	roo	8673	2	76.55
CTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATACCCAACT:1	+	chr2R	7586231	3'	+	I-element	5318	1	55.17
TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATTTCGCATTGACAAGAGTATTTAACACATGAAGGCCAATCAATTGGCTAGCTGCA:1	+	chrX	6279456	3'	-	P-element	46	1	53.47
GGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCTCGCGGGCTTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGTGCGGCTTCTT:1	+	chr3L	16750764	3'	-	Tirant	8	2	68.27
ACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAA:1	-	chr2L	13763158	3'	-	pogo	71	1	68.49
TTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGACAGCTGGCAGA:1	+	chr2L	22224614	3'	+	Rt1c	5407	1	58.22
ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACT:1	-	chr3R	19589895	3'	-	BS	5036	1	53.47
ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAGACAATTCAGGCAATGAGCTTATC:1	-	chrX	4214897	3'	+	flea	5004	2	71.53
GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAGCAGGAGTCGCAGGGCC:1	-	chrX	5662839	3'	+	P-element	2882	2	76.85
AACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGAGAGTATAATTTGCCGGCTATGGTGGAAAAATGAAAATTGTCAACCGAAGCTTCCTCGACTTTTCCCCCTTATGATTCCATTTAGCGCCTGGCACGCCAATTACAATG:1	-	chr3R	22218735	3'	-	hopper	1197	1	69.18
CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTTTATGGAACGCTG:1	-	chr3R	26431957	3'	-	opus	7025	2	61.61
GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGA:1	-	chr3R	7482710	3'	-	412	7078	2	64.44
AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATC:1	-	chr2L	13585854	3'	-	Tabor	75	2	73.33
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAAC:1	+	chr3R	22844288	3'	+	roo	9038	1	55.28
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAGCAAA:1	-	chr3R	15072536	3'	-	pogo	38	1	57.53
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTTCAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAG:1	+	chr3R	25448432	3'	-	roo	66	2	69.18
ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATAAGTACAAAACTAATGGGTATAGCTGACCTAAACTTTACGTTTAAGTGTACTTATTTTCTATTTCTTTGCCATTTCAGACACGCTCAACTTTGACCTTGGCAAAACAGGCAT:1	-	chr3R	20508218	3'	-	BS	5084	1	77.40
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCT:1	-	chr2L	17420136	3'	+	roo	360	2	52.74
ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTGTTTGTATATTTAGCTTAATATAATTTAGTATTTCCCTAACAAGCCTCGTAGAACATATTTCATGAGTGATTCTTGTTTCAAAAAATAGTTG:1	-	chr2L	6622900	3'	+	Burdock	6372	2	70.00
CTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTCAAGTACAAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1	-	chr3L	23112568	3'	-	R1A1-element	42	1	65.07
TGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAGACTTTTCATAGTTGCGCGGGCGCTTCCGGGCGTATGTTTATTCAGCGAAATTAGTTTTGTTGCCAACCAACCCAAATGTCA:1	+	chrX	17028260	3'	-	GATE	209	2	75.65
ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAA:1	-	chr3R	26659739	3'	-	HMS-Beagle2	6929	2	50.69
GACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGG:1	+	chrX	21667941	3'	-	gypsy2	65	2	69.86
TTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTTCGAAATATTTTTTACAAATTTTGGTCTTACGACTGTGTGCGCATAGCTTACGTAAATTTGAATTAAATTTGACTATACGTAAAA:1	+	chr2L	8981415	3'	+	1360	413	1	54.11
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTA:1	-	chr3L	20831292	3'	+	roo	8996	2	73.29
TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCG:1	+	chr3L	3863512	3'	-	blood	80	2	70.55
AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTAATT:1	+	chr3L	17205284	3'	-	hobo	50	1	62.20
AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACCTTAAGAGCATCCAATCTTCCAATTTTCCCAACTGTTTCTTGTC:3	-	chr3R	10462559	3'	+	opus	486	2	73.97
GGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTGTGTAGCTATAGGATTCGCTCCGGTA:1	-	chr2L	19965171	3'	+	Doc	265	1	78.15
GATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAGACATAAAAATCCGCAGAAAGTCCAGACTTTATACAAAATTTAAAAATGCCCACAAAGTTGGGGTTAAAATGGTGCAGGGGCAGGGTGGGGACTTCG:1	-	chr3R	3458469	3'	+	Quasimodo	274	2	62.90
GGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGTTGGTTATGATTTATGTGACATAGTTCACTAGTGGATGCAGGCATGAT:1	+	chr3R	18087341	3'	-	F-element	4452	1	53.76
GTTTGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCGATTTTGG:1	+	chr2L	17551107	3'	-	Transib-N1_DM	220	1	47.59
ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCGGAGCCCAGAACGAAACTCCTGCGTTTGATTCCAGACAGTTACATATTT:1	-	chr2L	21891663	3'	-	mdg1	9	2	76.71
CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGCAGGAGAAGGTACTATATAATTAGCTGTAACCTTTAA:1	+	chr2R	13817702	3'	-	412	42	2	64.42
CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTTAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAAATTTTCGTAATCTATGAAAAGTGAACTTATTTTATTTCAA:1	-	chr2R	9258355	3'	-	3S18	9	2	75.34
CGTGAGGAGTCACGAGACGCAACGTCGACAGAAATAACGGCAGGGGTGCCGCTATAAATATCTGAATGTGAAATTGTACTTTAGTTCTTAACAGAAGTTTAGATGAGAAAAACACCGAAACTGATTGGTGCTG:1	-	chr3L	4971284	3'	+	gypsy9	157	2	70.68
GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCACATGCGGTAATTGTGGAGAGGCGCACACTGCGTCTTAGCAAGG:1	-	chr3L	26645880	3'	+	1360	3336	1	54.61
GACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAAC:1	-	chr3R	5061830	3'	-	mdg3	55	2	52.41
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAA:1	-	chrX	21087551	3'	-	mdg3	5261	1	71.93
TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATAT:1	-	chr2L	17295820	3'	-	Doc	48	1	49.32
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCA:1	+	chrX	5643562	3'	-	roo	8739	2	73.29
CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAA:1	-	chr2R	20496874	3'	-	blood	7031	2	67.63
AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTGATCCCCTTATCATGTCCATTATATTTGAAAACTGATTTTCACTGAGTGTATTTATTTCGGAACCACCG:1	+	chrX	8347665	3'	+	412	7495	2	50.68
AATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAAC:1	+	chr2R	5532371	3'	-	G4	3774	1	54.48
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAACTAATTCAAAAACAAACATCTGTGGTTGATTCAACTTCTAATCTATTAAAGAGAACAACAGAAGATGTTAACTCCAATTTTAGAAGTATGCAAATAAGAATTG:1	+	chr3R	19448746	3'	+	roo	9024	2	73.10
ACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCT:1	-	chr2L	13053731	3'	-	BS	5044	1	54.11
AGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTG:1	+	chr2R	10582470	3'	-	Juan	3865	1	57.53
ATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTA:1	+	chr2L	2122471	3'	-	Stalker4	64	4	66.92
AAAAATAAAAAAAATGGGGGGGTTTAATTAAAAAAAAGGAGAAAAAAA:1	+	chr3L	17610905	3'	-	hopper	136	1	60.42
GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTA:1	+	chr3L	10647989	3'	-	412	7133	2	75.34
CTGACGGCTGCATCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAGATAA:1	+	chr2R	20497024	3'	+	blood	331	2	50.00
GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGNTCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGC:1	+	chr3R	28075419	3'	+	jockey	4947	1	51.72
TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTTTAAGCGTCAGGCGTCAGCAACTCAAATTGATTAGTTCAATTAACAAGCA:1	-	chrX	2444340	3'	-	roo	8715	2	56.16
AGTCAATGCTGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATACTACTATAATTAGAAAAAATAAAATTAC:1	+	chr2R	5924437	3'	+	jockey	4714	1	39.86
ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAG:1	+	chr3R	22276764	3'	-	jockey	87	1	60.14
AGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTAAAATTATTATTATTCTCCCAATGACAGTCAACCTCCAAGGAACTCCTGCTATTTTGACCGTCCCCGTACTCTCGCCCTG:1	+	chr3L	594946	3'	+	invader2	389	1	51.15
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCATTTTCATGTGCACTTT:1	+	chr2L	16092010	3'	-	roo	40	2	57.14
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATTGTGTAAC:1	+	chr2R	9632207	3'	+	roo	9022	2	51.37
TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTATCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGAGGCAGATGGTGGCCCGCAGTAAACGTTGACC:1	+	chr3R	29395192	3'	-	jockey	4804	1	71.31
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACCAATGTGTGTCTTATTTTATTTTATTTTATATTATTTTTTTTTTAGATTGCCATGGTCGCCAGTTTTGGGGGCATGTCGCG:1	-	chr2L	7898268	3'	-	roo	39	2	54.79
AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCATTTCGAATAATAATGGATGAG:1	+	chrX	17431842	3'	+	hopper	1394	1	68.12
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGT:1	-	chr3L	233225	3'	-	roo	53	2	55.48
TAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATCATAACAGTTGTGACACCAATATTGACTATCCCAT:1	-	chr4	546153	3'	-	R2-element	3531	1	75.86
TAAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGTAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATC:1	-	chr3L	24757197	3'	+	Cr1a	4257	1	54.11
CGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCTAGGGGGTATAG:1	+	chr3L	22349284	3'	-	jockey	33	1	53.77
GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACT:1	-	chr3R	9038926	3'	-	Juan	4069	1	57.53
AGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATTCCAAGTCGCAGGCACAAAGAGTGAACGGCAACAACTTGCCTTGTTATCTAGAAA:1	-	chr3R	4611543	3'	+	G2	2829	1	58.96
ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTAAAAAAAAACTAAAAAGACATTCACA:1	+	chr2R	6885449	3'	+	flea	5007	2	76.43
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAG:1	+	chr3R	28075410	3'	+	jockey	4937	1	54.79
TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGATTTTTATGGATCTTGTGTATTAAACAAGA:1	-	chrX	17756532	3'	-	297	6587	2	76.30
AAGAAATATTTATATATATTTTTGTTAGAAACAAAGTTCAAAATATCTTAAAAAAAAAAAGTTTTTATGTCCTAAATAAAATCAGATTTTGGCTTTTCGGCGAAATTTGATTCAGAAATACGGCCACACAATGTGCAGCTGTCAA:1	-	chr3L	10267151	3'	+	copia	4658	1	37.24
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCCAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTGGTACCAAGCACTCCATTCCACTCTGCCAAC:1	-	chr2R	13084554	3'	-	roo	8668	2	77.31
GTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATACCCCATGGCTATAGTGGATTTCGTGAACAAAGTTGTTATAAGACGGCATTATCCGACCCTCACGGTCACCTGATAATAATTCAGTGTGGATGAGTAATCGTTATAGGAGATAGGTTGTC:1	+	chr3L	27143566	3'	-	1360	370	1	80.82
ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAG:1	-	chr3L	17558000	3'	+	jockey	4976	1	56.76
CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTT:1	-	chrX	13504170	3'	-	412	7135	2	72.60
TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAAAATACGGGGAAACATTTTTCAATTAAGTCTTG:1	+	chr3L	10056180	3'	-	transib2	35	1	61.62
GTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTT:1	+	chr2R	9463478	3'	-	rover	80	2	75.34
CCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTTTTATACATATAACATAACATACATATAATATAAAATAACTTAATAATTACGCATAAATTTTAATTTTCACGTA:1	+	chrX	13132422	3'	+	jockey	4783	1	60.27
AAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTACAAAGGCGCCGCCATATTACCCACCGTTCTCCTTTCACACTCATTCGTGAAAATTTCTATGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATATTAATCCAG:1	-	chr3R	20005368	3'	+	GATE	430	1	70.77
GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGCACCTATGCCATCCA:1	+	chr2L	19965057	3'	-	Doc	44	1	51.33
GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGC:1	+	chr2L	11661018	3'	-	F-element	31	1	41.90
GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAATTGATATTGC:1	+	chr3R	21706115	3'	+	297	6964	2	74.62
CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACA:1	-	chr2R	16785350	3'	+	412	415	2	74.10
TTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACC:1	+	chr2R	10582441	3'	-	Juan	3862	1	71.05
AATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGCT:1	+	chrX	12074605	3'	-	412	142	2	66.67
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATCTCAGCTCAC:1	+	chr3R	7835207	3'	-	roo	48	2	60.00
ACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCATAACAGCAGCTTTAACCATTTTTTCTCCTTTTTTTTAATATTTCGTCAATACCAAAAGTTTACACTTGTCTACACAATACAA:1	+	chr3L	22803401	3'	+	Quasimodo	7080	2	66.67
CAGTAGGGATTAATGGATAACTACTGCTATCCATTAATCCGTACTACATACTCTAGGCATAACATGTTTTAATAATTAATACCTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATT:1	-	chr2L	8776853	3'	+	G4	3758	1	86.99
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTT:1	-	chr2L	16091876	3'	+	roo	9029	1	52.05
TAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAGAAAAACA:1	+	chr2R	4673658	3'	+	Quasimodo	7297	2	69.66
AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATCACTTTTGAATC:1	-	chr2L	544761	3'	-	412	7104	2	50.00
CGGTGTAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAAGTTACAGGTATCCGGGAGGCAGGACGGTTGCCGCAGACCTCTTTTCCGCGGTGAACAGGTTAACTGACACGA:1	+	chrX	22093351	3'	-	gypsy6	7788	2	68.87
GGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATTTACAAGAAAATGATGATGTTTCC:1	+	chrX	2439993	3'	+	roo	8912	2	77.14
CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTGTGTGTAATTTAACATGGCAGTT:1	+	chr3R	22276766	3'	-	jockey	82	1	57.78
CAGGGCGGATGTAACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATCTATCAAAGCGAAAAACCTATTTATTACAAAAAGAGAGAGAGAGAGAACGAAATAAACAAGCAAAATACGAAAAAAATACATGTATTAATTTTTTATTATTA:1	+	chr3L	11255943	3'	+	412	7163	2	76.03
GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAA:1	-	chr2L	17295848	3'	-	Doc	76	1	65.75
TGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGAGCAAATATTTTTTTAAGCCCGGCCATCAAATGGCGCCGAAATACAGGCGCAGACAAAGGCACCGTGCAGGTAAGAAATTCGCAACACTTTAT:1	+	chr3L	7295103	3'	-	HMS-Beagle2	6926	2	69.92
GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGCACTGTCATGCCAAATATGTATGATAAGCACGCACATCTTTCAAATTAGTTCTCCAA:1	+	chrX	10537426	3'	-	I-element	46	1	55.46
TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAAC:1	+	chr2R	14388004	3'	-	roo	46	2	66.96
AAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAATAAGAACATGTATACTTTGAATTAGAATATTCAAATATTATTATTATTTACACATTTCACATTGAAGTACTTATTCGACTATAACAATTGGTCTTACTAATTGTTAAATGGATTT:1	-	chr3L	17945116	3'	+	Juan	4211	1	67.81
CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTA:1	-	chr3L	19334270	3'	+	roo	320	2	80.14
AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAG:1	-	chrX	13066489	3'	+	jockey	4946	1	50.68
TGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAATT:1	+	chr3L	24916725	3'	-	Porto1	148	1	38.36
CGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTTACTACCTTCGT:1	+	chr2L	22150642	3'	-	S-element	70	1	82.19
CTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACCTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACACAACCAATCT:1	-	chrX	16541454	3'	-	INE-1	85	1	74.65
GTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACAACATAATTGTTGTTGTTATTAAATTAAATATTCCTACGATTTTCTAAGAACGCTACTAAACAAACATGATGAGTCCCTTATATGGCATTAGCGAATGCGCGTCAG:1	+	chr3L	26415394	3'	+	HMS-Beagle2	243	2	72.60
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTG:1	-	chr2R	9632100	3'	-	roo	8693	2	54.13
TAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCT:1	-	chr2R	7586141	3'	-	I-element	5090	1	57.66
GATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCA:1	+	chr2L	22685183	3'	-	Ivk	61	1	64.62
TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAATTGT:1	-	chr3R	16076763	3'	-	roo	8710	2	56.16
CGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGA:1	-	chr2R	9258408	3'	-	3S18	62	2	58.90
CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTTCAATGACGACGGTG:1	-	chr3L	12861677	3'	+	pogo	2097	1	77.31
GGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTACCTCGTTCCACGTCAGCCTTCTTTGGTGCGTTGGCGACCAGGAG:1	-	chr3R	9569377	3'	-	Stalker4	101	4	69.86
GTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTGCAGCAGCATCCTTGGTGGAAATCTCGGACTGGAGGAGGGCGATTCGAGCTCTCAAGTGCAGCACTTCCTCCTG:1	+	chr3R	15366092	3'	-	flea	4938	1	51.37
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGC:1	+	chr2L	12892721	3'	+	roo	9044	1	60.50
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ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGG:1	-	chr2R	13084614	3'	-	roo	8699	2	68.89
AGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTGAGTCAATACTCATTATGTCGAATGTGTGTCTCCTATGTATATATTGCAAATTTTGTTAATCGTCTACCGCG:1	+	chr2L	6569311	3'	-	jockey	4887	1	51.37
ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACGTACGTATACATACTACTAGGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTT:1	+	chr3R	22822136	3'	-	mdg1	7083	2	46.53
TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTCCCAATATCATAATGCAAAC:1	-	chr2L	17295808	3'	-	Doc	36	1	56.16
ACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGCTGCTCCTGGATCT:1	-	chr2R	23466004	3'	-	Doc	493	1	55.86
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTA:1	-	chr2L	17420122	3'	+	roo	9038	1	60.27
ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTATTTCATTATCTGATTATTGACTAGTATAGACCACAGTTGATAGTATTCCTACTTATGTCTATCATGGCTACATATATAGTGTTT:1	+	chr2L	4954069	3'	+	Quasimodo	7341	2	65.47
GTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAACGAGAGTAATTTTGGCCGTAAAACAAAAAACGGAAATTGAAATGTGGTAAA:1	-	chr2L	9672859	3'	+	1360	3243	1	77.17
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AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGTGCTAATTGAACTAAAAAACGAAAAATACGTTATAAAAAACTACATGAAAAATAAGCAAAAGGGGG:1	-	chr2L	15237544	3'	-	jockey	4775	1	55.48
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGA:1	+	chr3R	31817520	3'	+	roo	8989	2	76.71
GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTG:1	-	chr2L	15833010	3'	+	hobo	2921	1	51.76
TGTTAAAATAAAGAACATTATACATTTGTCATCCAGCCAAATGCCAAAATCCAGCTTTCATCATTCATAAAAAGTAAATCCTTTAAGTTTGCGAAATAATGCAATTTCTTAAAGGTTGTTCTTACACTGTCCCGAGATAGTTATTC:1	-	chr3R	9176787	3'	+	Circe	473	1	71.92
TATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCA:1	-	chr2L	12290654	3'	-	1731	4351	2	55.22
AATAAAAATATGTTTTAGAACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTTCTTAATATGGTTAATGCAAATTCAAACTTAAAGCAGAATGCAACGACACTAATTGTTTTAGATACGGAAAACAAAATAATAGTTTTTCAAAGGCAA:1	-	chr3L	23149440	3'	-	Gypsy6A_LTR	222	1	54.11
TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGACTGTCT:1	+	chr3R	14981288	3'	-	mdg1	7049	2	73.85
CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACC:1	+	chrX	17963957	3'	-	jockey	4787	1	57.02
TATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGA:1	-	chrX	18030272	3'	+	opus	423	2	78.99
ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTG:1	+	chr3R	14860234	3'	-	BS	5010	1	66.06
TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTCACATTTATTAGAAGCCATAGCAATGAATTTATCAAACAAATCTAAAAAAATCTCTTTCTTGAACGGATGCAAATAAAACTAGTTTTT:1	-	chr3R	31109616	3'	-	I-element	28	1	63.64
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTGGCATGCATTTAT:1	-	chrX	6486719	3'	-	roo	8721	2	65.62
TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATACCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAA:1	-	chr2L	17081800	3'	+	jockey	4929	1	69.23
ATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGG:1	+	chrX	21667951	3'	-	gypsy2	55	2	71.23
TCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTTATCGTCGATGAATAAACCCCTGACTGTTAACAGTGTATACACTTCCT:1	-	chr3R	19449035	3'	-	1360	320	1	63.56
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TAGAGCGCCACAGAAATCGCCTAGCCCTATACAAAATTAGTTATGTGCTAGTTAATATCGTTAATATTTACTGTCGTGGATGTGGCTTTTCCTAAATGGACAACAAAGGATCGGTTTTCTAGGTAATTCTGTCAAATTTCCATTCG:1	+	chrX	22927897	3'	+	BS3	1500	1	57.53
GAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAA:1	+	chr2L	16091967	3'	-	roo	89	2	81.51
TTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTT:1	-	chr3L	2325726	3'	-	I-element	5155	1	73.97
GACTAACAATAAGTTTGCAAATCGTATTCTAAACTACCTAAATATCATGTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAATCAGTTATATTGTTGCTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGGCTTCTATG:1	+	chrX	8518369	3'	-	Fw2	3899	2	70.16
AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCG:1	-	chr3R	14979797	3'	+	pogo	2038	1	68.15
TTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGCCGCAGCATAAAAAGAAGGCCTGCGGCCATATTTATGC:1	+	chr2R	10215761	3'	+	Quasimodo	7269	2	73.97
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ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTATAGTATA:1	-	chr3L	10056083	3'	+	transib2	2808	1	66.95
AGGCAAATAATGAAAAAAAAAAACCTCAAGGCCGCAGCTTTAAATGTTG:1	-	chrX	11526780	3'	+	Rt1b	5144	1	89.80
GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAAAGTCTCCTCAAGTTTCTAAAACTCCATA:1	-	chr2L	1517586	3'	-	jockey	4701	1	63.08
GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTAAAACAAACACAATAA:1	+	chrX	10201211	3'	-	transib2	49	1	65.79
AAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGCTTCTTGATCCGCACGTTTTAAAACCGAATCGTCAGTGACGTTACCTCGATGCATAGAGTACGCAATTGCTTCATCGTCGCTC:1	+	chr3L	23092146	3'	+	1360	439	1	81.65
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTCTTCTTCGGGCAGTC:1	-	chr3L	27248922	3'	+	roo	9047	1	81.54
TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACCTTAAGAGCATCCAATCTTCCAATTTTCCCAACTGTTTCTTGTCCCTGAAG:1	-	chr3R	10462552	3'	+	opus	493	2	78.08
GAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTC:1	-	chr2R	10582415	3'	+	Juan	4133	1	79.70
AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCTAACTCCAAGTAACTATTTTACGAAACA:1	+	chr3R	6611326	3'	-	HMS-Beagle	6809	2	74.24
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ACCTAAAGATTGATTATCTATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCTATTAATAATCTATAATACGATTTAGTTCAAATGAAACTCATAGG:1	-	chr3L	15283228	3'	+	hopper	1145	1	68.97
ATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATT:1	+	chr3L	27415324	3'	-	transib2	52	1	52.74
ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAGTTTGTTAACAATTTT:1	+	chr3R	22276779	3'	-	jockey	61	1	51.18
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GACTATCAGATACCCGTTACATAGCAAGTTTAAGTGCGATGAAGATACAGATATGCAAAATATAAAGAAATAAATATTCTTACCAAGATTGCTTACTTATACATATAAGATAAAGTCGATATAAAGCTTAAAAGCTGACCGATTTT:1	-	chr3L	11578826	3'	-	INE-1	549	1	31.51
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTA:1	+	chr2L	21884597	3'	+	pogo	2039	1	69.17
AAAAATAAATTATTTCGCTGGCAGCGAGTGTGATTCAATGGCGCACGAAATGTGAAATGAAATGTGGCATTTGAAGCGTTGAGTAGGACGAGTATGTGGGGTTTTCACTACGATGCCCTGGAGAACCAGAAG:1	-	chr3L	3401222	3'	+	FB	699	2	60.61
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATCG:1	+	chr2R	13084684	3'	+	roo	355	2	59.85
CTGGAGTATAAAGAGAAGCCTATCGAGTTCTGGTTTGATGTATGCATATATCGCCTTATCCGTCTCCTTTACACTTTCCCATACGCATACCGTTGGCCAATGGAATATCTGGTTTCCACGCCATTAATATCGATGTGCGGGCTAT:1	+	chr2L	4220061	3'	+	Bari2	613	1	75.17
CCCGTATGCTCATGCATCGTAAATTTGACAAATAATGTCCTTCACTTTACAAGTTCTTAGTCTTTTCGGAATAGGTGCCAAAAATGGTATCGGACTGTTTGTCGATAGGCTAGAGGCTATTTCTACTGCCTCCTCCAA:1	+	chr3R	3671863	3'	+	1360	187	1	50.72
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TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGACATCGGGACT:1	-	chr3L	16343235	3'	-	roo	8734	2	74.42
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TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCA:1	-	chrX	10640014	3'	+	roo	346	2	58.22
TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCCAAAGCAA:1	-	chr3R	22122707	3'	+	roo	8992	2	71.92
GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGTAATTTCAATTATCAATAACATATTTAAATTCCCCATTCTCCTCCCCTTCCATTATCC:1	+	chrX	2295996	3'	-	Tirant	20	2	60.58
CACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGCCGGGGCTT:1	-	chr3R	13457889	3'	-	X-element	35	1	51.72
TAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCT:2	+	chr2L	21400808	3'	+	Doc3-element	4667	1	47.95
CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTTCATATACATATATTCCGTACTTTTCTGTTTGCTCGCATTGTGGATTTTTTGTAGTTTTTGGCCAAATGCCAGCGGAATCGTTTGACTGGGCTAATCCCCCGTTTTATAG:1	+	chrX	18030405	3'	-	opus	8	2	78.77
AACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGA:1	+	chrY	3631954	3'	+	Stalker	357	4	62.22
ATTTGGNGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACG:1	-	chr2R	977543	3'	-	F-element	71	1	66.67
AACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGAATTTGACGGTGCGGAGTC:1	-	chr3L	15490322	3'	+	copia	188	2	63.01
TTTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCTTTGCCTTATCTGACAATTTTTTAAAATCGAAATATTTTTTTTTTT:1	-	chr3L	10051490	3'	-	1360	489	1	65.00
AGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTA:1	-	chr3R	26659751	3'	-	HMS-Beagle2	6915	2	50.00
TGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAAAAGATAAATATGTCGTAAAAGTTTTTTATTTGCGTTCTATTTTTTTTGATACAGAAA:1	+	chr2L	15180451	3'	-	jockey	4904	1	60.27
GCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTCTTAGAAAAAGGCGCACACAATAAACAATATATTCGTTGGGGGTTACTTTCTCGCCAACGAAAATTTG:1	-	chr3L	7590673	3'	+	hopper	1023	1	73.53
AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACGTGT:1	-	chr3L	18596617	3'	-	Doc	72	1	65.03
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACACTAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCT:1	-	chr3R	18339062	3'	+	roo	9034	1	56.85
CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCTTTCAAGAGATTG:1	+	chr3L	17560410	3'	-	pogo	32	1	63.01
GGGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGCATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTTGTTTTTTGCTCTGCACTCTCTCTCTCTTTCGCTC:1	-	chr2R	17345242	3'	+	Cr1a	159	1	80.74
GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATTTTCAGGATCGTAGAG:1	+	chr3L	11321530	3'	-	mdg3	5260	1	69.75
TAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCA:1	+	chr2R	21298853	3'	-	jockey	244	1	61.54
CACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGAT:1	+	chr3L	10518315	3'	+	Burdock	173	2	77.40
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTATACTGGCACATCAAATGCGCAAAGTGCAAACAGTTGCTTTTCCCGCTACTCA:1	+	chrX	10640109	3'	-	roo	8717	2	60.15
AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTACAATACTTGCTAGCTCTACCTC:1	+	chr2R	9662816	3'	-	412	30	2	60.47
CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAGTTGGTTTAG:1	-	chr2L	8986121	3'	-	412	7116	2	61.64
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGACGCTGTAACACATGGCGTATACG:1	+	chr2R	9328725	3'	+	roo	9042	1	61.97
AGACTAGTATAATTTGATATAATGTAAATATATTAATGAACTATGCACAACGCTAATTGGTTGTTTGTTCTACGATTTATAGCGATCCTTAGGCATTTTCGCTATTTCACAACAATACGTTTGAATAATAAATCGTTTGTATTATT:1	-	chr3L	8077491	3'	-	gypsy7	5078	1	52.74
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGGACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTT:1	+	chr2L	3886240	3'	+	roo	9022	2	56.92
CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATAT:1	+	chr2L	5069689	3'	+	flea	4950	1	63.70
CTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTCGGTGTATTTTGTAGTTCTAAGACACCATTTCACGAGGTC:1	-	chr3L	17559847	3'	+	jockey	4710	1	71.43
CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCAGAGCCGGAATAAGCA:1	+	chr2L	3886290	3'	+	roo	9062	1	77.14
AAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAAAGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAATGAAGAGTTGGACTGACTTGCAATATTTTGGTCCTTCAGGTGTTGAGAACG:1	+	chr2L	10155148	3'	-	1360	207	1	60.74
TACATACTTTTCAACGAATCTAGTAAGTCTACGAGTAACGGGTTAACGGTAACGGGTAAGTAACGGGTAAAGACTATGATGTCGTCAATATAGCTAAACTGCATGAGTACTGCAAGATCTGAGCGGACGATGCTTTGTCACTAA:1	+	chrX	4602959	3'	-	INE-1	13	1	64.58
GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACG:1	-	chr2L	20117898	3'	+	invader4	274	2	64.62
TTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAATTATATTATAATTTTTATACTAAAATTGTCTATTGTCTAAAACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGATGGCTGATGATAT:1	-	chrX	22576277	3'	+	Bari1	1685	1	42.22
ACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTTTATTTGATATTTGACGTGTTCAGCTTTAGCATACGACTGACACCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCGATTGCTGCCAATGGGCTAGCATGCCGGGCATC:1	-	chr2R	1246730	3'	-	invader2	5066	2	76.60
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAAGGGGAAGTGTAAAAGAAAACC:1	+	chr2R	7898213	3'	+	roo	391	2	70.55
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTAT:1	-	chr2L	8986105	3'	-	412	7099	2	52.41
AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCACGGCCAGCTTTACAGCCAGACAAACAGCAC:1	+	chr2R	19726908	3'	-	1360	37	1	66.15
CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTGGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGATTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAATTAAGACTAAAAGTGTTGGCAAATCGGGTTAGC:1	-	chrX	3308288	3'	-	hobo	43	1	52.59
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTTGAGCACGTTGAATGG:1	+	chrX	9540153	3'	+	roo	388	2	71.23
CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGAAATCACAAAGGAGCCGCGCAGATTGATGGGTTCAAATGGCTGGGCGAAGGCGATGACAAAAGTTCCCGAGTCCCCGGCCA:1	-	chr3R	28075290	3'	-	jockey	4700	1	61.48
CGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTAGATTCATAAAACTCTGCCAATTATGCGAACATTCATGATTCTGTATG:1	+	chr2R	9258532	3'	+	3S18	6032	2	66.44
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTGGTACCAAGCACTCCATTCCACTCTGCCAACCC:1	-	chr2R	13084552	3'	-	roo	15	2	72.73
TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGAGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTGTTCCTAACTAAAATACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCTATTATCC:1	+	chr2L	19965072	3'	-	Doc	61	1	50.34
TTAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACG:1	+	chr3R	14049431	3'	+	transib2	2762	1	57.53
GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGATTTTTATGGATCTTGTGTATTAAACAAGACTGTGT:1	-	chrX	17756526	3'	-	297	6586	2	77.86
CATTATTATTATTATTTTTATTATTATTGTTCCGTCATATTTCACTGGCAATTCGAGGGGTGCCTGCAATCAATTAGGCTTTGATGATGTTTGCCGAGTCGAAATTGAGTCCATTGCACGATCATTATACAAGATGATCGCATTAT:1	-	chrX	6620096	3'	+	invader6	9	7	67.12
GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCTTGTCCAGACTTTGAAATCCAGGAATTTATTCAGCTGTTATCCAGGAATATATATTCCATATTCTTCATTGGCATGCACACATACTCCCCTGC:1	-	chr3R	11514906	3'	-	I-element	20	1	78.23
TTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATT:1	+	chr2R	6085997	3'	-	1360	484	1	61.64
CCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGCTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTT:1	-	chr3R	13457930	3'	-	X-element	65	1	69.52
GTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAATAATAGAGGCACACCCGACTTTCTAAG:1	-	chr2R	5674606	3'	+	S-element	1686	1	65.07
GAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACAGAGCCAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGAAGCGAT:1	-	chr2L	22724070	3'	-	INE-1	134	1	67.81
GAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACGCAGAGATGGGC:1	-	chr2L	2122355	3'	+	Stalker4	7337	2	63.45
ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTG:1	-	chr3L	7588431	3'	+	hopper	1329	1	77.40
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAA:1	-	chr3L	233216	3'	-	roo	8708	2	56.16
CTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACGCAG:1	-	chr2L	2122363	3'	+	Stalker4	372	2	57.53
GCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAAAAGTTATAAATGACACAAAATTTTGAGGGCCAAGTCGAATAGCTTTGTCTT:1	+	chr3L	2992552	3'	-	Doc	339	1	64.14
TGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGAGCCCACACAATGTTTATCGAATTTGACTATTTGGCATTAGCCTGGGATTTCGGCTGCAATATTCATTCGAATGCTGC:1	+	chr2R	9638003	3'	-	roo	8865	2	61.19
GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATTAAGCTTCATTTTTATTTCTATTTACATTTTGCTCT:1	+	chr2L	1839370	3'	-	hobo	14	1	76.03
GTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAACACA:1	+	chr3L	10385916	3'	-	Burdock	73	2	70.63
AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTATTAATTAATGTTAATATTTCGATTTAACATTA:1	-	chr3R	6290913	3'	-	Doc	21	1	70.55
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGA:1	+	chr2L	3886265	3'	+	roo	9031	1	56.85
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCTATGTAAGGGAGTATGTACTCTATATATGTGTATATGTAGCATGTATCTTTCGTATTATGCAATTG:1	-	chr2L	6059207	3'	-	roo	8696	2	54.03
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGG:1	-	chr3L	16343196	3'	-	roo	8700	2	58.21
TGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACACCACACACGTGTGGTGTGCACACCATCGACTCAAACACACACACACACACCCACACAC:1	-	chrX	12258321	3'	-	hopper	1065	2	53.49
CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAATAAAAAACGTTAGCCAGCGACGCAGGGATGGGCAAACGACCATCCTTAAAAACGAT:1	-	chr2R	6034680	3'	+	pogo	2053	1	59.70
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATGTTTTACAATGGATTACAAGCATTGTCAAAATATATACAT:1	+	chr2L	17420290	3'	-	roo	11	2	70.83
AGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATT:1	+	chr2R	9138272	3'	-	mdg3	5303	2	68.52
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTAC:1	+	chrX	6486792	3'	+	roo	334	2	69.86
TTAAATATTTTAAAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTA:1	+	chrX	21907828	3'	-	springer	486	1	75.38
CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGC:1	-	chr3R	19968094	3'	+	roo	9031	1	53.49
ATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGG:1	+	chr3R	9039046	3'	+	Juan	4182	1	62.33
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCGCTAAACAAAACAATAAATAAACTTAAAAATGAAAAACACAACTTAACAGCTGAAAGAAAGCCTTTACGACCGCAAAAAGTATTTATGTATGTTTATCATAGATCA:1	-	chr2L	17471544	3'	-	roo	10	2	78.01
AGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCAGGACTCTCAACATCCAAACGAATAAAAACGCACGCAGTGCTCGTGTCTTGGAGAGCAGGAGAGAGAGAGAGA:1	+	chr2R	20943532	3'	-	Cr1a	4127	1	66.43
TGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATGGTCATGTTC:1	-	chr2R	23332506	3'	-	invader4	27	2	62.02
TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGGAAATGAGTG:1	-	chr3R	13360273	3'	-	jockey	24	1	69.84
ACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTTGAGACTTGCTGATGTTGCTCTCATTAACAAATTGTCAGGTGTGCTGGCCGCGTCAGTTAT:1	+	chr3R	21827351	3'	+	Tirant	277	2	58.22
CTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAGCGGCAGGGCAATGACTCCTTTCCCAAGG:1	+	chr3L	3241695	3'	+	roo	47	2	76.98
AGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCGTGGGGATCTGGAGGATTGCCATTCTCTGCGTAAGCGACGTTTTACGTGGACGAGTTGCTCGATTTGTACGTTGGTCTTTTTTGAATTAATTGTATTATTTGT:1	+	chr2L	15940321	3'	-	micropia	40	4	69.86
ATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTT:1	-	chr2R	5284533	3'	+	Doc4-element	2598	1	49.32
ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTANATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTG:1	+	chr3R	22822143	3'	-	mdg1	21	2	44.88
ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTGTCAAGCGCCCAAAATTCTTTTCCTAGTCCCCTAAACTTGATACCATCCCGACATTTGCCTCAAATTAACACCTCTGGGAGACG:1	-	chr3R	29360930	3'	-	mdg1	7074	2	60.00
CCGATTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTAGAAACCACAAACACGTCAAACAATTAATCTGATCTACTTAATTCCTC:1	+	chr2R	16564402	3'	-	412	350	2	67.81
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCC:2	+	chr2L	6059325	3'	+	roo	357	2	52.05
TTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCCGGACACACGGACTCACTTAATGCTCCAGATTAAGACTATACTTTGTGTACTTAAGTTTTGAGGGCTTCACATAATTAGACCAAAATACAAAGTAGGAGATTA:1	+	chr2L	20840299	3'	-	Transpac	4936	2	70.55
ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACATTCC:1	-	chr3R	14981135	3'	+	mdg1	7416	2	54.11
TGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGAGCACTGAAATTAGCTTAATACACATCTCTCCCGTAAACAAAATGCAGCTGCGGCTGTCACTCG:1	+	chr2R	24550491	3'	-	P-element	105	1	54.24
AAAATAAAAAACGAAAATAAAACGAAACTTGAAAAACTTATATTCTCACTGTTGCTTTTCCGTTCATAAGGACGGCTATGCTGTATTCCTTCTCTTTTTCGAGATACTCATTGGTTTGCCACGCTTCCGTTCTCGTCCAGCTATCC:1	+	chr3R	24096386	3'	+	Doc2-element	251	1	67.12
GCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTAAGTCATTTGACTTAATCGAGGTCTAATATAAAAGAGCAAGATTTCAAAATAACTTTCAGTTTCAAAATGCAGCTCGTCGTGAAATTACTGGTGAGTAAGGTAG:1	-	chr2R	15373714	3'	+	1360	194	1	65.47
TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTGGGCTA:1	+	chr2R	16785470	3'	-	412	10	2	78.42
TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGGACAGAAAGCACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTCTAT:1	-	chr3L	16015202	3'	-	1360	18	1	62.31
CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTA:1	+	chr2L	22685160	3'	-	Ivk	48	1	75.53
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCATTTTC:1	+	chr2L	16091999	3'	-	roo	8721	2	60.27
ATAAGATAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1	-	chrX	12649915	3'	-	blood	7179	2	82.22
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACATATACCCAAAAAAGATACTTTCCTGGCTAAA:1	-	chr3R	22955976	3'	+	roo	9001	2	73.64
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACA:1	+	chr2R	11164485	3'	-	roo	8680	2	59.26
GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCCTATGCAATAAACTCAGCCTTCTTATAGCACAAGGCTATTTATATTTCCGCTA:1	+	chr2L	17607691	3'	+	hobo	2902	1	53.91
GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTGACCATATGGCCAAG:1	+	chr2L	17471714	3'	+	roo	402	1	73.91
GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTCCCGAAGGATGCGTGAGTTAATCACAACTCGAAAATAGTTCACTTTGCGAT:1	-	chr2R	20944277	3'	+	pogo	2098	1	74.66
TCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTGGCGTACAA:1	+	chr3R	11547820	3'	-	G2	296	1	69.86
CTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAA:1	-	chr2L	20117874	3'	+	invader4	3041	2	52.05
TGTAAAAGTAGTTAGTATTTTGTAGACTTAGGCTTTTGACAGTAATTAGGACAGGTAACATTATGGAATATATGGTTTGACTCGCAAAAACTTATTTGGTACGCAAAATTATTGCATCTCCTTGGGGA:1	-	chr2R	15593537	3'	-	TAHRE	10262	1	50.78
TTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAA:1	-	chr3L	7292449	3'	-	HMS-Beagle2	39	2	58.82
ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACCAAATTTACCCATACAC:1	-	chr2R	9220990	3'	-	opus	151	4	59.59
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGT:1	+	chr2R	25118788	3'	+	roo	9026	1	53.90
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAA:2	+	chr3R	17420507	3'	+	roo	343	2	64.38
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTGATTTT:2	-	chr3L	15519727	3'	-	pogo	40	1	61.64
GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATTTCATACTCGGTGGTGAGCAAAATGTGTAGCATACTTTTTTGGGCAAGGCAAATATTTATCAAGGGAAAATTAAA:1	-	chr2L	1839210	3'	+	hobo	2893	1	54.11
TTTTTTTTGTTTCTTTTTGTTAGTCTAGTAATGTTAGTCATTTTTAAGCTTACCTAATACTTAATACATTTTTCAGCATTTAAACACTAAAGTGCCAAGCTAATAAACGATATTAGTGCCAAAGCTCATTTCAACAAATATTGTTA:1	-	chr2L	6305533	3'	-	gypsy7	5003	1	54.11
GTATCTGTACAAGAGAGACCACCACCACACGCAACGCCATGAGCTAGAGCCGGACCAAAGACACTAGTTATTTTAACGTCTTTTTATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGTTACTATGATTATCG:1	+	chrX	22824229	3'	+	Gypsy12A_LTR	2161	1	55.97
GTCACGTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGACGTGTGGCTCTCGACTAGACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGTTAGTTATCGATAAGAATTTCGCATAAAACAATTAGAAGCAT:1	+	chr3R	5334818	3'	-	G5	4475	1	66.13
ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATG:1	+	chr3R	16404561	3'	-	pogo	67	1	65.75
CCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCTTTTGCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGGGCCGATGTTGTGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAAAGAAATACTTCCTGCTAGTTGCCATCGC:1	+	chr2R	21783764	3'	-	invader2	5023	2	78.47
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATAACATTAGTAATTCTTTCTTAAAACTAAATGAGTCGGAAAGCCAAAGAGTCTATCAACGAAAAA:1	-	chrX	21509887	3'	+	pogo	2059	1	53.57
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACT:1	+	chr3R	31817515	3'	+	roo	8999	2	77.86
CTTTTATTTTCTTTTATTTTCTTTCTTTCAATTTTTTTGCAACGCACCCTGCCAAGAATAGGAGTGTAGTCTTCTTGGAAATTTGTTAATAAGACTTCGAATGAAAATGTATAGGCGCGTCACAAA:1	-	chr3R	24970844	3'	+	transib1	1900	1	51.59
AATCGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAATTAAAAGGCAT:1	+	chr3L	20831419	3'	-	roo	8684	2	71.92
GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTCTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCATT:1	-	chr3L	7588418	3'	+	hopper	1342	1	67.12
TAAAGTTACATTTTGTTTTCTTTTTGTTGCCCCCATGTTCAGCAAAACATAAAACATTAAGTAAAACCTTAAGATCAGCGCAAAGACCATACTTGAATGGAATTGTACAATATATCTTAAAAGCATTGAAAAAT:1	+	chr2R	6618480	3'	+	accord2	424	1	75.37
GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTGCCATCA:1	-	chrX	2518026	3'	+	P-element	2857	1	57.39
AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGTATAGTATAGTGTT:1	-	chr3L	10056078	3'	+	transib2	2822	1	77.06
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAA:1	-	chr2L	12892600	3'	-	roo	36	2	54.81
TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACGG:1	-	chrX	11471552	3'	-	hopper	14	1	69.57
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGC:1	+	chrX	6486796	3'	+	roo	9011	2	64.96
GTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAAT:1	-	chr2L	4412540	3'	-	Quasimodo	15	2	62.18
AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACCCATTCCATTACCTGCTAACTCGACCGTTTTTATAC:1	+	chr3L	10773187	3'	-	412	7087	2	63.01
TTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACAACATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAG:1	-	chrX	17833004	3'	+	Tirant	8420	2	75.86
ATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACATATCGGTTTGTGGTTTTTCCTCTTCTGCGTTTGTTTTTTCGAAACAAATTGGTTTTTACTATCGCGCATTTGGTATTAATTTTGCTATTTATTAGTAGAGATTTT:1	-	chr2R	13006378	3'	+	3S18	6086	2	67.81
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCACAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAATAAAATATC:1	+	chr3R	7100927	3'	+	roo	9053	2	62.02
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGCAGCCCTCCTCGTCC:1	-	chrX	13504126	3'	-	412	7091	2	59.59
TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAATAAAAAACGTTAGCCAGCGACGCTGGGATGGGCAAACGACCATCCTTAAAAACGATACGA:1	-	chr2R	6034676	3'	+	pogo	2045	1	60.27
GACTATCAGACACCCATTACTCAGCTAGTGTGAATGCGATCGCGAAATTTGATCACTTTTCTGGGATATCGAAAGAGACGCATGGAGTCTCACAGAGTTCGACAGGTGAACATCGCACATTGCTCAGTTAACAAGATAGAGTCAAC:1	-	chrX	9898726	3'	-	INE-1	549	1	56.16
AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTG:1	-	chr3R	25826664	3'	+	mdg1	7415	2	52.31
GAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAGGACGGTGAGCCACCGCCTCGTTACGAGCCACCCGTGGAGCCAGTCAATGGCATTGTACAGCCACCGGTGATTCCACCAGC:1	-	chrX	8055342	3'	-	accord	7031	2	69.72
AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTGGCCAGGA:1	-	chr2L	15832956	3'	+	hobo	2930	1	74.62
CAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCAC:1	-	chr2R	3338790	3'	-	Juan	66	1	61.64
TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAA:1	+	chr2R	5485205	3'	-	blood	7061	2	58.14
AACCGCATACAATTATCGGAAATGGATTTTGCAGTCAAGGCAGAAACTATCACCGATCGACAATACATCGATATC:1	+	chrX	12651991	3'	-	transib4	316	1	70.67
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATATGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGG:1	+	chrX	9540097	3'	+	roo	338	2	67.63
ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAGGTGAAACCCAGCTATTATGGGAGGATGCTGCTTCCACTGAAAGACTTTTGGATACAAGATGCCAGAAATTTGAAAACATCGAACGTACCAATGTTGCACTTGGAATCATTTCACAGGTTGTAA:1	-	chr3L	25406595	3'	-	1360	2	2	60.96
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGGATTCACTTTGCG:1	-	chr3R	25448373	3'	+	roo	9023	2	76.29
GAACATAAATATAAATAAATAAGTAATTATTTTAAGAATCTTTGGTCTTGGCACCAGTAATCTGATGTAAAAACATCATCATCATCATCATCATCCTGCCGGGCGGAGTAGCAACCCCTGCAAGCTGGCTGTCTGTTTATAGAAAT:1	+	chr3R	21565431	3'	+	1360	2959	1	51.37
ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTGCCGAGAACACTTAATAAGATGCGACAGCGGATA:1	+	chrX	10253311	3'	-	hopper	41	1	57.53
ACATAATTATTATTATTATTTATAAATCCAAAATTACTTGTTGTAAAGTCATGCTCGATTATTCATAGATTGCGACCTATTGTTTCGACCCCTGCTGTGGGCCACAAAATGGCACAGGAACAGGGGCAGAAAGTCATTTATGA:1	-	chr2R	9738285	3'	-	invader6	4389	1	57.34
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAAC:1	-	chr2R	19004133	3'	+	roo	9009	2	59.59
AGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTTTAAAATTATTTAAAGGAGGGATGTGTCCAGA:1	-	chr3L	22848535	3'	-	INE-1	572	1	78.46
ATCCTCTACATTACGTTGTTATTCAACCCTATGGTGAGGCTGCAATACTTCCCTCCACAGTGGAAGCTCGGTATTATTTCCAACGCCTGGACACTGGAGCAGCAG:1	-	chrX	16754080	3'	+	BS3	311	1	78.10
CGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACGTTTGTTGATTCGTTTGCCGTCTATATATGTAAGTCTGCCT:1	+	chrX	12074639	3'	-	412	7169	2	54.55
CAAAGACACTAGAATATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAATAATGAAACAGTGATGGCATAAACAAAGCTAATGTTTTATTTTAATTTAATTCAAAAACATATTGTTACTGCACACGACAGTGGTGAGTTACAGCATTGAAATCCTG:1	-	chrX	19787182	3'	-	Tc3	310	1	76.71
CGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACAAACCAATAAACCGCG:1	-	chr3L	10848610	3'	-	blood	7010	1	81.74
TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTACAAACACATCGT:1	-	chr3R	6290953	3'	-	Doc	56	1	57.45
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCGCTAAACAAAACAATAAATAAACTTAAAAATGAAAAACACAACTTAACAGCTGAAAGAAAGCCTTTACGACCGCAAA:1	-	chr2L	17471573	3'	-	roo	42	2	56.25
GGTCTCCCACTAAGGGACCTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCATGTCTTATGGCTTTTGTTCTGGAATTTATAGCAGGTTTAACCCACTTCGCCGTAATGCTCTCGATTTCAGAGCCCAAG:1	+	chr2R	14543727	3'	-	roo	198	2	52.05
ATAAATAACTAATCAGATAACTAAGTTAAGTAGAATTATTATCTTCAAATGGCGTTTATATTGACTTTCTTCTCGTCGATCTCGATGCCATCGATGTACCACTTGGCATGGGGCCGCGGATAGGCATCCACACC:1	+	chr2R	24005611	3'	+	Transib5	317	1	50.75
GCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGGT:1	+	chr2R	24218585	3'	+	412	7507	2	72.94
AAGGCGNGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTGGTGAGCTAAGCAATTTGCAGCCGATCATGG:1	-	chr3L	20831617	3'	+	roo	278	2	68.00
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATCATTGCGTGAATAA:1	+	chr3R	22956046	3'	-	roo	8726	2	60.84
ACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATAT:1	+	chr3L	3501010	3'	+	opus	7439	2	73.02
GGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCAT:1	-	chr3R	23020791	3'	+	INE-1	571	1	64.62
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGCTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATA:1	-	chr2R	19050191	3'	-	roo	8697	2	49.12
CCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACA:1	-	chr2L	3672973	3'	+	roo	301	2	66.13
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTCTC:1	-	chr3R	27994172	3'	-	roo	8716	2	55.17
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGCCG:1	+	chr2R	21908019	3'	-	roo	8708	2	57.69
CACGACTATCAGATACCCATTACTCAGTCAAAGAGTTAGATATACATAGATGTGCAAAGCGAGTGCCATGCGGAGAGAAATTTGCATT:1	-	chr3L	22519317	3'	-	INE-1	552	1	75.00
ACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCTTCCGGTTGGCGGGTCCTGGGATC:1	+	chr3L	12308410	3'	+	hopper	1361	1	56.72
TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCATGG:1	+	chr2R	9791686	3'	+	412	445	2	53.57
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGT:1	-	chr2R	19050214	3'	-	roo	8736	2	73.85
TTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCA:1	-	chr2L	17081797	3'	+	jockey	4926	1	69.12
TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTTTTCGGCAGACAATGGCAATCAGCAATAGCAACTA:1	-	chr3L	10385810	3'	+	Burdock	6356	2	60.00
TTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAANTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAACCTACA:1	-	chr3L	27415229	3'	+	transib2	2761	1	66.92
CGGCAGCGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAATCTGGAAAATAGAAAAGTTGAATGTAAAACACATAGA:1	-	chr2L	3888745	3'	-	HMS-Beagle2	160	2	69.42
GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGT:1	+	chr2L	12892701	3'	+	roo	353	2	64.29
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTCAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTAC:1	+	chr2R	8585552	3'	-	roo	8712	2	49.32
GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATT:1	+	chr3L	20168432	3'	-	mdg3	16	2	53.75
ACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGTAATAT:1	-	chr3R	12886914	3'	+	roo	9039	1	59.57
GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAAGCGCCCAAAGCTTTCAAGATAAGAGTGAAGCCTTGACTCAAGCT:1	-	chr2R	4601512	3'	+	HMS-Beagle2	7176	2	68.89
GAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGAGTTTGTTTTACTCTCTTAAAATGCGGAATAAA:1	-	chr2L	9233031	3'	+	I-element	416	1	77.78
GACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATCATTATATCTATTATTATTGGGACGAATAATGTTTACCT:1	-	chr2L	15247923	3'	-	Transpac	4996	2	72.60
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTA:1	-	chr3L	9998034	3'	+	roo	9036	1	45.21
TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGCATGTAAGGGGATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACC:1	+	chr2L	20840482	3'	-	Transpac	4945	2	58.75
TATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACTCCCTATATTAGCTATATCGATAATATATAATTATAATATAATATAATATTAATGGAAAGGAACAAAATGTTCTATATAAGAAAATACCACA:1	-	chr2R	5173089	3'	-	Stalker4	31	4	63.01
GATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTTATTTATTAAATTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAATATTGCTATTAATTATTA:1	+	chr2R	4774812	3'	+	baggins	5408	1	72.60
AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACAACACCGGCAGCAGCGGCATTAGCACCTTTGTGTGTGCGCCC:1	+	chr2R	15066623	3'	+	412	7472	2	58.76
TTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGA:1	+	chr3L	16973473	3'	+	S-element	1672	1	54.35
ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGAGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGTATATACTTATATATTTTTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCG:1	+	chr3R	26432066	3'	+	opus	7471	2	61.86
AAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAATATGATCGTTAAGGTACCTTTTCCGAGTGGTTTGTACAAA:1	+	chr3R	10067462	3'	-	roo	9028	1	70.15
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAGTCGTCTTTGACAAACTGAGGCAAAATGCAGCCGAG:1	-	chrX	14336380	3'	+	roo	9045	1	65.71
GTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAGGAATACAGAATAGCAGATAT:1	+	chr2R	8624863	3'	-	Juan	4084	1	54.79
AAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCGAATTTGACCACTCAAGGCTTTCAACACTCCACATCCGCACAGCATCCTCCTTCCCACTC:1	+	chr3R	13840772	3'	+	I-element	5023	1	64.42
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TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCGGTTGTTCAAAAAAAAGCATCGCCAGTAGGCAATTAGCATACACATGCGAAATATAAATAACAAATGTTCTCACTAAAATAGTTCGACGAACATCAGGTGCCAGC:1	-	chrX	13125470	3'	-	jockey	4805	1	67.81
ATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCAC:1	+	chr2R	5674730	3'	-	S-element	64	1	64.18
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CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCACGAGCCTGACATGTGTCATAT:1	-	chr3R	31817404	3'	-	roo	8688	2	67.81
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGACTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATCCTTTTCGATTTCAT:1	+	chr3R	7100903	3'	+	roo	9012	2	57.53
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TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAA:1	+	chr3R	14981270	3'	-	mdg1	7075	2	57.25
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AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCG:3	-	chr2R	9791563	3'	-	412	46	2	54.79
AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAGAATAGTATAGTGTTCGGTA:1	-	chr3L	10056073	3'	+	transib2	2819	1	74.36
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AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAACTTAAACGCTGGTCCATTT:1	-	chr3L	17685076	3'	-	mdg3	17	2	50.00
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AATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATCTTCATCGCTTTGTTTGTTGACCAAGTACTTAGATTGATGTGTGCTTGTGTAGGAG:1	-	chr2L	14894286	3'	-	transib2	350	1	61.64
AGGCAAAAGGCGCTACTAACATCAATTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGTTATTAGTTTTTGAGTGACGGAATAAAATAAATTGGATTGTAGGTATGAAATCGAAGGTAGTTGCC:1	-	chr2R	5472983	3'	-	transib3	486	1	56.20
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTG:1	-	chrX	5643437	3'	+	roo	385	2	68.49
AATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTTGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCACTGCA:1	+	chr3L	8249112	3'	-	jockey	4599	1	67.13
GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTT:1	+	chr2R	23332627	3'	+	invader4	274	2	60.43
AATAAAATAAAAAATAAAATAAAAATAAAATAAAATGCAAAAATTTAATAAAATTCAGGTCCTCCTTTTGCGATGCGTAAAGTGCAGTCAAATGGTTTAATTGGCTCGTTGATTTATTGAAATGCTCATTTTAGTATGTGATGTC:1	-	chr2L	13334753	3'	+	HeT-A	311	2	70.34
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AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCGGGCTTATATGAATTTGTGGTGCACTGAAAGAATACTTCCTAAATAAATGGTGTTT:1	-	chr2L	16016321	3'	+	412	7480	2	60.27
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CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACATTCGCCTATTAACTTTTTAAGTCCAAGAATAAGATTCTTTAATATTTGAGAAACAATTAGAGAACATTCACGCACAAATG:1	+	chrX	6191257	3'	-	FB	9	1	74.56
CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAA:1	+	chr2R	5485204	3'	-	blood	7068	2	60.74
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CATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTAAAC:1	-	chr3R	4504037	3'	+	INE-1	535	1	60.74
ACAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCGCAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGG:1	+	chr3R	14940157	3'	-	jockey	95	1	72.60
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGTGTTCT:1	+	chr3R	20427499	3'	-	jockey	36	1	63.57
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAG:1	-	chr3L	16343198	3'	-	roo	8688	2	63.33
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TGATAGTCGGGAACCTCTACTATAGAGTTCTTTCTTGTTTATATTACAATACTTGTTGCAGAAGTATGTAAACCAAATGCACACCGCTTAGAGCATGTTCCACCTCCTCCCACGAAAACACACAGATATTCGGC:1	+	chr3L	17898089	3'	+	INE-1	563	1	58.96
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AAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGCTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGG:1	-	chr2L	5844976	3'	+	transib2	2765	1	58.90
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GCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTCCATGTTTACACTTTTAATTTGGTTTGGAAAACCATTTTTAAAAAGAAATAAAGA:1	-	chr3L	20168357	3'	+	mdg3	5431	2	61.64
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TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATG:1	+	chr3L	22917666	3'	-	jockey	4848	1	79.43
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GTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAAGTAAGATACACAAAAACTCTTTAACCCAGATGCGAGAGGGAGGCGCAAACTACTTGATCTTGTCGAGCAACCAACCGGCTTTATGGC:1	+	chr2L	9906577	3'	+	invader3	5439	2	64.71
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTGACCATATGGCCAAGCCAGTTTCCGATTTCATG:1	+	chr2L	17471732	3'	+	roo	389	2	70.55
ATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGCTGGTGTGGCTATTGTTGCAGCGTCCTTTAAT:1	-	chr2R	25249998	3'	+	HeT-A	5989	1	76.56
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ATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAAT:1	-	chr3R	14860117	3'	+	BS	5056	1	54.48
AATATANATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTGGATGCT:1	+	chrX	14749726	3'	+	copia	254	1	61.64
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CAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGG:1	+	chr3R	11496598	3'	+	1360	3325	1	69.53
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TACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGC:1	+	chr3R	17243217	3'	+	hopper	1360	1	55.94
GACGTTGCTCACGAATTTCGTTTTGCATTTTAATTTTGCTAGCTTGATTGTGAAGTTGGAGTCAGTCAGAAACTGAAATTTAAAGAAGGTAGTTCAAAATCCAGGAAACACAAGGCCACAAGGCTTGAAACA:1	-	chr3L	25976324	3'	-	Doc4-element	4	1	75.76
ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTGTTGCTCTTTCAGCTTCTTCTCCATCTTCGTCTCGGGAAAACTGCAGGCTGGGCAATTTTCTTGCTTTTATGCATACAC:1	+	chr3R	25422579	3'	-	3S18	32	2	60.74
ATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAGGAATACAGAATAGCAGATATTGAATGTATAGTGTTGCTCCTCCTAGAACT:1	+	chr2R	8624893	3'	-	Juan	4054	1	63.70
AAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAGAAATAAAAAACTCAGCAAAAAAATACGTTTTTATCACGAATTTTTTTTAATGCTGTAGAGCCCTTGTAATTCCCTAACATCGCAGGTTTAAAAGTTT:1	+	chr4	976321	3'	+	S-element	1612	2	69.18
ACAGGAACCAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAAGATCTAATTATGCAATAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTAAGAGCGGCAGATTTATTTCTTACTCGGCCGAAGAGATATTTTTTTGGA:1	+	chr2L	7360616	3'	-	Cr1a	4335	1	74.66
TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAACATGAAGTTATTTTTGGGTTTTTCGATTGTGCTGCGGCTTATAGGTGTCCAGCATATATCGATGGAGATGAGTGTT:1	+	chr3R	28756889	3'	-	mdg1	7057	2	57.53
AATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTATCAGGGCATTTGTTTATTCAGGCCGGGCACAGAACCTGTTCCACGATGGGATCCGATCACCTAGCTAGTCACCCGCACCGGCTCGT:1	-	chrX	18386323	3'	+	invader4	3069	2	73.97
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATACGTACAACAATATGTTGTACT:1	-	chr3R	20469548	3'	-	roo	10	2	55.48
AATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTT:1	-	chr3R	18339106	3'	+	roo	8990	2	71.92
TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATG:1	-	chrX	10644454	3'	-	jockey	4834	1	72.39
AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGCCCCCTTTACCCCACTGCCTAC:1	-	chr3L	11957109	3'	-	blood	15	2	63.64
ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTCATTTGC:1	+	chr2L	10037419	3'	-	Quasimodo	33	2	53.60
CTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAATATGTACATAACGATGCCTTATTTATTTTACAGGTCAACTTCACCGTCGACGAGATCCGTGGCCTCATGGACAAGAAGCGGAACATCCGCAACATGTCT:1	-	chr2L	21681493	3'	-	HB	1378	1	76.69
AAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTGGAAAAATAAAGAATCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAG:1	+	chr2R	20944400	3'	-	pogo	2040	1	80.82
TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGCAGCCCTCCTCGTCCC:1	-	chrX	13504125	3'	-	412	7079	2	65.19
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTTTCAATTAAATTCCAATTAAAGAACTAAAATGACCATATAATTTCATAAATAATGCTATTTGATTTCATTCATTTCGGATA:1	-	chr2L	12498303	3'	-	pogo	33	1	56.85
AAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATT:1	+	chr3L	9235167	3'	-	mdg3	5337	2	74.48
TAATAAATTGTGGATGCGATAGGACCGTACACCCTCTACATATGCATTACATGTGTAATTTGTAACGAAATTAGAAGTTTGCGTTCTGCGGCAAAAAAAATCCGAGGTGGGTGCAATTTCCTTTAGACTTTT:1	-	chr2L	17509421	3'	+	rover	384	1	75.76
GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTT:1	-	chr3R	26431969	3'	-	opus	147	4	56.25
GCCAAAAAATCGTATGGCGTTAGGCATCTTGATATTCTAGTGTCTTTGGTATTAAACTTTGATGCCACACTTTGACTTTTAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAA:1	-	chr3R	4571526	3'	-	1360	27	1	41.48
CACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTCGATAGGCAGGTACAGGCCCATTTCTCGATGTGTTCTAAAAATTT:1	+	chr2R	19499407	3'	+	P-element	2886	2	71.11
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCA:1	+	chr3R	25448419	3'	-	roo	8717	2	68.33
GTAGGGCTCTTGGACGGTTCACATAAACACGGGACTTCAAAAATCTCGAAAAGAAATAAAATCAATAATCAAATCTATTTATAGTTTCTGAAATCCAGCGCCTATGACCTCTACTGTTTTTTTGCAATACCGAGTTTGACTAGTAT:1	+	chr4	1081489	3'	-	mariner2	632	1	73.97
AATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGT:1	-	chr3R	17243138	3'	-	hopper	89	1	74.66
TTATATATTTTTTTTTTTCAAATACATGTAAAGTGAAACTCATTGTGTGTGTGTCGGCGGTGTCCTAGTCAAATTCATTCATAAATTTTAACACCGCTTTAAGTTGAG:1	+	chr3L	11357153	3'	-	G7	1168	1	60.19
TCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAAAAATAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAA:1	-	chr4	1294987	3'	+	TAHRE	10422	2	81.58
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGCTTTGGGGAGCGGG:1	+	chr2L	7945403	3'	-	roo	2	2	66.22
AATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCCAACCACTTGCCACCTGCAAAAAGACAATCTAACTTTCGCCATGATTGCGTTTCGGATAATAATGGCTGT:1	+	chrX	21008268	3'	+	pogo	1793	1	55.48
AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACCTTAAGAGCATCCAATCTTCCAATTTTCCCAACT:1	-	chr3R	10462569	3'	+	opus	7482	2	68.53
AATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATATATACACGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGCATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGAATATTCTCAGATAATCTTGGTCATGTCAGTCTGC:1	-	chrX	22714999	3'	+	Bari1	1690	1	69.86
CCACGCCCACTCTAACGCCCACTAAGATCCCAAAAGTGATACGACCTCACTTCTGTGGAGCAAAACCCATACAGACTAGTAATTAAGGACTTAAAAATAGCTGATGAAGATATTTATCT:1	+	chr3L	23007609	3'	+	INE-1	214	1	56.30
ATGTGAGGATATGTGTGTGTGTGCGTGTATGAGTGTGCGGGGGGGGGGTGGTATACTTGTTGCTTTAGC:1	+	chrX	20105851	3'	-	accord	191	2	85.51
ATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTTCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTCGGAACCAGG:1	+	chr2R	5531165	3'	-	1360	135	1	71.64
GTGGACATATTGCAAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGAGGCACGCACGAAGCACGAGCAGATCGAGACTAGCATTCGCGAGAGCTGCGCCCAAGATCGTGAGGCCATTA:1	-	chr2R	9824117	3'	+	R1A1-element	23	1	53.42
GGCCGATCGTTGACTGTGCGTCCACTCACCCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTGGAGGAGGAAGAGAAGCGCAAACAGGCCGCGGCCG:1	-	chrX	9673518	3'	+	hobo	2748	1	64.29
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATCAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTA:1	+	chr3R	19968164	3'	-	roo	8730	2	81.20
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCACCA:1	+	chr2R	19004205	3'	-	roo	8752	2	80.14
AGTGATAGCAGACAACTGTACGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTATAAGAATTGGCCTCTAATTTGTTATTAATAAAATAAGACATCGCTAAAGTCGA:1	+	chr2R	3901384	3'	+	1360	159	1	63.01
GAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTGTTAAGAATAATAAAAATCAAATTACACAGAGAATTAACCAACAAAA:1	-	chr2R	5401665	3'	+	1360	3320	1	66.44
TGTATATTTATATTTATTATATAAATATTCATTTTTAACTATGTATGTATGTTTGTATAGTTTTTATGAAATACATTTTTTAAAATGTGTTCGTCCCATCAAATTTTTGATTTGTGTGAGTACCTGACCAAGGAGAAGACAGAGTT:1	-	chr2L	23070726	3'	-	Stalker	6931	5	60.27
AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTATATTAT:1	-	chrX	21014757	3'	-	copia	4900	2	42.14
GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATG:1	-	chrX	13126467	3'	+	jockey	4964	1	60.00
CATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCATAATAAT:1	-	chr2L	12569980	3'	-	micropia	34	2	61.81
TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAATATCAAA:1	+	chr2R	16785461	3'	-	412	26	2	67.12
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATAGATCTAGATAGGGGTCTTCCAACGTGCAAATGACTACTACGTCAACGACCAATAGG:1	-	chr2R	25118631	3'	-	roo	8680	2	68.49
AATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGAACTCTAAATATATATGTACGCATACCACATCTCCCTCCTTTTAAAAATAACGTAACATAGTGTAGTTATTTTATTTTATTATTAAAAAAAATTTTTTTTGTCTTTT:1	+	chrX	13139123	3'	-	gypsy11	77	2	75.36
ACCTTTAAAAAAGTTTTTTTTTATAATATTCA:1	+	chr3R	6290060	3'	+	FB	405	1	75.00
ACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGATAGATAATATCTTTATATAGAATAATATAATCCGCATAATTATAATTGTTGAAAAT:1	+	chr2L	15248008	3'	+	Transpac	248	2	60.27
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCAC:1	+	chr2L	17471697	3'	+	roo	356	2	53.85
TGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTAACAATTGCGGAAAATATAAAATGTATTTCAAACCTTC:1	-	chr3L	24996075	3'	+	1360	463	1	72.00
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACTGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAG:1	-	chr3L	22437833	3'	+	roo	9038	1	61.64
AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATTATAATATTCTATTTGATATATTTTTAAAAATAATTAAAATCTTTTCACCTCTCTTCCATGGCACCTGGGGCTGG:1	+	chr3L	2082914	3'	-	297	6603	2	43.65
TTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTAC:1	+	chr2R	21298835	3'	-	jockey	278	1	56.16
ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGCGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTATTAATTAATGTTAATATTTCGATTTAAAA:1	-	chr3R	6290916	3'	-	Doc	17	1	74.10
TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCAGCCAGCCAGCCAGTCTATATGCCCATCTATGA:1	-	chr2L	3114412	3'	+	roo	408	1	84.25
ATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGACGGCGTATT:1	+	chr2R	5532328	3'	-	G4	3773	1	56.44
AAATAANATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGC:1	-	chr2L	14772017	3'	+	roo	9032	1	55.40
CTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACTAGTTTAGTAATATAATTTGTGTATTGTGTATTGAGAATATATATTTTTGTGGAAATTTTAAACATCAGTAGAGTTGAGATCAGAACGATAT:1	-	chr2R	1486924	3'	-	Idefix	7298	2	74.79
ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGAAGGCTATAATAATGGCCCCATTGCCGATGACCAGAAATATGGCTGGGG:1	-	chr2R	16946304	3'	-	jockey	4809	1	64.38
AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAGGTAAACTTTTTTCTTCTTTTTCAGTATACCAGTTGGGAAGGCAATCCTGG:1	-	chr3R	13237253	3'	-	3S18	22	2	69.93
TGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACACTTGCTATACAGAAGTTTTTAAATATCTAATACATATTACATTGAATAAATTAACAAAAGCTATCCAAATA:1	-	chrX	20870092	3'	-	gypsy	48	2	51.37
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATG:1	-	chr2R	14542129	3'	+	roo	9021	2	56.12
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGCATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAA:1	+	chr2L	7810133	3'	+	P-element	2878	2	66.32
AATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAATCAACAAAG:1	-	chr2L	2909658	3'	+	hopper	1350	1	63.57
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTT:1	-	chr3R	22844205	3'	-	roo	37	2	64.00
CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCCCCC:1	+	chr2L	6570063	3'	-	jockey	4803	1	72.39
CGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAACGGGATCTTATTATAGTC:1	-	chr3L	23602445	3'	-	gypsy	7032	2	50.00
CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCCCTGCAATCTCCAATCGC:1	-	chr2L	11518366	3'	+	412	7526	2	66.40
CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATA:1	+	chr3R	14651279	3'	+	P-element	2809	1	32.41
AATTTACCCCCTTTTTTTTGCCAAAACCCATTTTATGAAAGTCGGTCGATTAAGATAATATTAAATGCATGCATTTAAGGGAGTGTTTGTCTCGCTTGTCTATCAATCACTAGCGCTTGCGATCCCTGGAGCGATC:1	+	chrX	2078494	3'	-	Transib-N1_DM	483	1	51.47
ATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTG:1	-	chr3R	10546105	3'	+	hopper	1344	1	73.33
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATG:1	-	chr2R	7898098	3'	-	roo	69	2	78.40
TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCG:1	+	chr3R	27424902	3'	-	blood	87	2	77.50
CTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATTCTCTACATTTGCAGAAGTGCACGTTTTTTCTTTCTATCTTCGAGATATGCCCAAAGAAAGAGTATAATTGC:1	-	chrX	18700369	3'	+	roo	108	2	50.34
ATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCA:1	+	chr3L	20033760	3'	-	blood	7092	2	70.55
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATTGTGTAACT:1	+	chr2R	9632208	3'	+	roo	9023	2	52.05
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTATTCCTCATTTACATTTTAATATTCTTA:1	-	chr3L	21817939	3'	+	roo	9044	1	65.07
TATATTTTATACAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACACTTCATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAATCATAATATGAATAAATGTGCTATAGTTTTTG:1	+	chrX	15077379	3'	+	S-element	1626	2	94.52
CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGTCATTTCGCGATAATTAACGCA:1	+	chr3R	17243230	3'	+	hopper	1370	1	51.37
GAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAG:1	+	chr2R	3104455	3'	+	Gypsy6A_LTR	344	1	65.62
ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACA:1	+	chr2R	8146119	3'	-	P-element	78	1	30.82
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGC:1	-	chr3R	22844203	3'	-	roo	8745	2	73.97
AGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAA:1	+	chr2R	4601629	3'	-	HMS-Beagle2	6960	2	72.60
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGT:1	+	chr2L	17420256	3'	-	roo	57	2	58.22
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAAGTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAA:1	-	chr2R	20596438	3'	+	roo	388	2	62.60
ATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGATTATTTTTTTGGAACATAAATTGGAATAGTACCT:1	-	chr2L	14954678	3'	-	Quasimodo	6917	2	76.87
ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATTACCGCAC:1	-	chr2L	9668169	3'	-	1360	14	1	65.45
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAACCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCAT:1	+	chr2R	9328689	3'	+	roo	9020	2	57.81
CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGCAATAAAACCTAAATCCCAAATTTGTTTAAAATTGCAGCCACGTTTTTCAAATAAAACAAACTA:1	+	chr3L	15996036	3'	+	297	6929	2	58.57
ATACATATACATACATATAGTATATATATAGTAAGTCAGCGTGGGCGAAAAAAAAAACAAAAATGAAAAAAAATCACCCATATTAACCGAAGCGTATAAGTTTAAAATTCAGCTAAATAAAAGCCGAAGATGAGAAACACACGCAA:1	+	chrX	12948358	3'	-	1731	4409	1	66.44
TTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAACGATATTTTTTTCACCTGCACAACTGGGCTTAA:1	-	chr3R	26659699	3'	-	HMS-Beagle2	8	2	74.66
AGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCTACATCTACAGGCCATCGGCCCAGCTTACATAAATATCATAAATATCCAACATAA:1	-	chr3L	19038090	3'	+	Tirant	294	2	60.43
GAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTGGATG:1	+	chrX	14749724	3'	+	copia	252	1	60.27
AAATTTGACCACTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACTCAATAACTCCAACTTTTTTTGCATTGCCTTACACCAGCCCATATCTTTAATGATATATAATATACATTTTGAAGTTTGCAGATAGTCATTCAATTAACTTTTTTGCATTT:1	+	chr2R	16581825	3'	+	Transib-N1_DM	10	1	81.51
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCA:1	+	chr3R	17243238	3'	+	hopper	1382	1	59.86
GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGT:1	-	chr3R	9922000	3'	-	blood	7096	2	79.31
AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTC:1	+	chr3R	29361076	3'	+	mdg1	7408	2	54.11
AGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCG:1	+	chr3R	10274049	3'	-	HMS-Beagle	6799	2	74.74
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACAC:1	-	chr2L	7945323	3'	+	roo	339	2	66.44
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAG:1	+	chr2R	13710647	3'	+	roo	334	2	77.17
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTGCCGAACTGCATGACATTGTG:1	+	chr2R	14542230	3'	-	roo	48	2	59.23
TGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTTTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACATATAAAAATATATTTTCATTCGAAACTGCGATTTAC:1	+	chrX	8349437	3'	+	BS	5018	1	71.97
AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCAGGCGACCACCTTT:1	-	chr2R	2016829	3'	-	1360	23	1	53.06
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAGGTTGCACCGAAATAACGCAATATTTTCGAATAAAATTTTTAAAAATAGTTCTGGGTATTTTTCCTATTCGAATATAATAAT:1	+	chr3L	1534648	3'	-	pogo	19	1	68.99
TTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTA:2	-	chr3R	9714389	3'	-	Stalker	70	4	64.38
TTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGG:1	+	chr2L	10037386	3'	-	Quasimodo	65	2	75.81
GCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTCAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGCAGTTTTTAAAAGACGAGGTTTATTTG:1	+	chr2R	5531244	3'	-	1360	60	1	75.69
CTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTCTTTGCGAAATTAAAGTAATTCTTTTATTGTTTGTGTTGTT:1	-	chr2L	4875197	3'	-	opus	7421	2	71.53
ATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTTCACAATAAGAACATTGTTCTTCAAAATATGTGGGGGTGAAAATCTGGTTCAAGTGCTTGGAGAATAATTA:1	+	chr2R	21873739	3'	-	Quasimodo	1	2	48.63
GTTACTCATCTTGTTATTCTACTGTCTTTGGTATCTCGGTATCAAAAGCGTGTAAATGTTAGAATGGCCGTGTCGGGGAGAAAATAATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGG:1	+	chrX	21907818	3'	-	1360	9	2	39.73
GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGCTTTGCTCAC:1	+	chr3L	11957205	3'	+	blood	7345	2	62.28
GCAACAAAGTGCTGCCATAAGCTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTCTCAGTTTGGTTTTCTCTGT:1	-	chrX	13504162	3'	-	412	53	2	60.00
ATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGGGCGTAGAATGAGGTAAATTAATTGAAAAATTAAAGATGAGATAT:1	+	chr2R	6225376	3'	-	I-element	214	1	69.18
ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTA:1	+	chr2R	24561526	3'	+	P-element	2820	1	39.73
CAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGAGAGAGGACAACCAGACA:1	+	chr3R	20008057	3'	+	297	402	1	80.22
GCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAATCTATGATTTGT:1	-	chr2R	5209628	3'	-	gypsy	7051	2	74.78
GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATACAAACATTTTTCCATATATGTATTTTTATAGTTTTATTTGTTCTGAACATATCAGCACTTTG:1	-	chrX	1020404	3'	-	jockey	34	1	43.84
GTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTCCAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAATCCCACCATGTTTAATTACCTTAAGGAGGGCAA:1	+	chr2R	13715195	3'	-	1360	492	1	46.15
ACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAAAGGGTTCTTATTATAGTCGTTTTATTCTACAAACTTATGGATAACTCCTC:1	-	chr2R	5209552	3'	-	gypsy	19	2	72.60
GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACTAAGCATTCTGATTTAATACAATGATAGATTCTCACCCTTTTTCCTGCTGAGCAAGAAGCCGTTGCACCTTTTCGCGATACTGCT:1	+	chr3R	18272230	3'	+	1360	3372	1	56.15
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATAGATCTAGATAGGGGTCTTCCAACGTGCAAATGACTACTACGTCAACTACCA:1	-	chr2R	25118636	3'	-	roo	8685	2	66.44
ATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAACAAAATCAAAACAATATATGTATGTACATTTCC:1	+	chr2L	20117981	3'	-	invader4	2787	2	58.90
TAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTC:1	+	chrX	21947722	3'	-	mdg1	44	2	58.82
AATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAAAACTAGAGAGACGAGTGCGAAAGCGAATGCGAGTGATATGCGAATAGCGCATACTCTCACTTTTTGCAGAAGCTTAAATGAGCTCCAAGTTTATCCACTCG:1	+	chrX	18386512	3'	-	invader4	2762	2	78.03
GTAAGGGACATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACAAGTGTTCCCAGTGCTCGAAGTCCTTTCAAGTCGAACATGAACTTTGGATGCACAT:1	-	chr3L	21489253	3'	-	Cr1a	4168	1	55.38
TTTTCTTTGTTTTTTAATTTTTCTCTTGCCTCCACTGATCACGCCCAATTTGGCATAAACTAAGCATTGGTTTGGCCCATAAAAATTATCTCAGCTTT:1	-	chr2L	17471234	3'	-	Doc	4697	1	75.51
TACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTC:1	+	chrX	17431816	3'	+	hopper2	1553	1	52.05
CGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCAGGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAG:1	-	chr2L	14081313	3'	-	1360	32	1	54.13
AGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGGATGGATGGGAATGGAGCCCACCAAGGCCGTTGCAGTCAAG:1	+	chr2R	23131289	3'	-	G2	117	1	65.67
TAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTCGTATCCATATAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCAAAACATAAGGGATGACCGAAACGGAGGAAGGTGTTTTATGGCT:1	+	chr2R	4902180	3'	+	G4	3521	1	68.33
CAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTA:1	-	chr3L	27415231	3'	+	transib2	2746	1	71.92
TTGATTTTATTTATTAATTTATTTTATTTATTAATTTTGAACGAATTCAGTTGGAAGGTATCAATAATAATTTTCGCAATTTTTATCTTGTTACAGTCCATACATCTAATAGGGTGTTAATGCTGATTATCTTTTTATATATATAT:1	+	chr3R	6170662	3'	-	HeT-A	312	1	63.70
AAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTAACAATTTTAGCTCACCTTTCTCCGGCTCTGTGTCCTTCTGCTCGACTTTCTCTGACACT:1	-	chrX	21016695	3'	-	Transpac	7	2	78.08
GACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGGAGTCGGTGATTTACAAACGAAAATAACCGCAGGAACTATACAGTAACATAAA:1	+	chr2R	17530516	3'	+	F-element	446	1	53.91
TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGTTGCACTCATTATTTTCATTCCATAAATTATATCTTCAACATTAATTTCGCTGACAATTTAGCTGGCCGTCTAAAGAAAATAAAATATTTACAG:1	-	chr3L	10647851	3'	+	412	488	2	68.49
GTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCACAGGA:1	+	chrX	14824757	3'	-	jockey	4750	1	73.77
ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCGCCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACGCCTGGTTTTTATCATAAGGCAATTTCATAT:1	+	chr3L	7188649	3'	-	hobo	36	1	59.86
ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGT:1	+	chr3R	20427468	3'	-	jockey	74	1	63.70
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACATATACCCAAAAAAGATACTTTCCTGGCTAAAAA:1	-	chr3R	22955974	3'	+	roo	322	2	75.34
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTGCTTGGATAAAGAAAACAATAACAA:1	+	chrX	16717952	3'	-	roo	8685	2	64.71
CTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTTTTGAGCTTTTCTAACATGGACTTTAGATTTTAGGGTTCTGATCAAATGAAGAGAGAGCTTTTGACCTGGCGTCGGTTCGATCGCTTGTAATTATGCTAATTATGAGTTTGATTT:1	+	chr3R	8271428	3'	-	Idefix	7260	2	65.52
TTATAGTTTCTGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCATACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGG:1	+	chrX	21587751	3'	-	INE-1	145	1	63.24
CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGGGAGCTTCGCATACGTACAATCAGTTCAATGTCCTCCTTCTTGACTTGG:1	+	chr3R	14035453	3'	+	1360	3334	1	63.28
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGCGAACAGCAGGATGGGG:1	+	chr2R	13710710	3'	+	roo	392	2	69.92
TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAGACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATGCGAGGCTTCCTAACTCGAAAAGAAAGATCCG:1	+	chr2R	5031014	3'	-	Doc	49	1	67.68
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGTG:1	-	chr2R	13084614	3'	-	roo	8752	2	80.42
GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACCCGCTCTCC:1	+	chr3R	14979864	3'	-	pogo	85	1	76.03
GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTAACAATTTTAGCTCACCTTTCTCCG:1	-	chrX	21016730	3'	-	Transpac	5	2	74.31
CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGTAAAA:1	+	chr3L	3863520	3'	-	blood	7048	2	54.05
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGG:1	+	chrX	13039517	3'	-	roo	8684	2	80.00
GAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTT:1	+	chr3L	11321506	3'	-	mdg3	16	2	59.22
AGCCAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAATTCAAAATTAGCGTTATCGGAAAACTATATAATAAGTCTGCTATTGGATCAGATAAAGAAAGAAGAAAAAAAAATAACAGATAAGAAATGCAAAATTCTTATCATACTTTTAAT:2	+	chr2R	14871496	3'	+	INE-1	545	1	77.40
AACGGGTATCTTATAGTCGAGACACGATTAGTTGTGTCACGCTCTTTCGTATTTTGCCAATAACAGAGGTGTCATCCATAGTTTACTTTTACTGACTGTTTTAACAAAGAAATCAATACATTTTTTGAACTGTCTAATCTCAA:1	+	chr2R	15252094	3'	+	INE-1	553	1	67.13
CCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGGAATCACGAATTTCTGAATATTCTGCTTCTGAAGCATTAACATATATATGAAGAATCCATGCAGTTCTAAAAGCCATTTGTCCCTCATGCTCAATTTTG:1	+	chr4	634909	3'	+	412	7345	2	78.57
CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGAAGCGATGCTTTCTAGCAAATCAAAGAAGCCTAGTCTATGATATGATTTAG:1	+	chrX	7256245	3'	+	412	470	2	67.36
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAA:1	-	chrX	5643478	3'	+	roo	343	2	63.70
ATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAATCATTCCAGGTTAATTAAGAAAACAATCCAGGTTAATTTTTAATGGAAATTCTACAGTAACTTGATTTAAACGCCGCGGTTTCTATTCTAACGTAATTACTATGCG:1	-	chrX	10252656	3'	-	hopper2	1411	2	76.71
AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTC:1	+	chr2R	19540448	3'	+	jockey	4931	1	67.41
GTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCACTAAGCCTGACTTAGTGATCCCGTAT:1	-	chr3L	23797927	3'	-	Doc	101	1	80.82
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCGCTAAACAAAACAATAAATAAACTTAAAAATGAAAAACACAACTTAACAGCTGAAAGAAAGCCTTTACGACCGCAAAAAGTATTTATGTATG:1	-	chr2L	17471558	3'	-	roo	8693	2	65.75
AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGG:1	+	chr2R	16945362	3'	+	jockey	4946	1	54.03
GGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGAGGTTTTCCGCTTGTTTTCAAATCTATTACTAACTGTTGCCAAGTTAGGCTGAAGGATTCTCGACTATTATTAATTTAATA:1	+	chr2L	4951337	3'	+	Quasimodo	222	2	56.85
CTCTGACGAAGATATTTGGGAGATACATACATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATTATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGCATGAAGTGCTGACTTGTTTACCGCTTCCTGCAGGATAACAA:1	-	chr3R	22828655	3'	-	accord2	121	2	71.23
GCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGTGAAATTATCGGCAGC:1	-	chr3L	24351815	3'	+	micropia	25	2	55.00
ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAGTTTGTTAACAATTTTATCAGGCCCGAGATGTTTTGCCTACCGAATGAGGAAAATGAGGGAAAT:1	+	chr3R	22276828	3'	-	jockey	31	1	78.08
TCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTGAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTCTAAAGCCAAAGGATTGCCAATTGCTTCTATCACGTATACGACTGGTGTTTGTC:1	+	chr3R	11547810	3'	-	G2	301	1	60.99
GAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAATGCCAATTAGTTCGGATAGTTAGTGACTTTAATTCACTCCAATA:1	-	chr3L	16973310	3'	-	S-element	1543	2	72.73
TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTA:1	-	chr3R	25448355	3'	+	roo	8992	2	71.92
CATCGGCTGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCCCAATCAAGTCGCATTGCTGTGCTGAGAACACCAACGGCGTCTGCTTCCCCTTAGCAACGGGGGGAGTA:1	+	chr2R	4329516	3'	-	G5A	2591	1	63.00
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTGATTCGGTCTGGTTTTATGGCAAATATTTTCGGTTTGTCCCTTTGCGAACTGGCCAAGCGGCAAAAGTTAA:1	+	chr2R	9631279	3'	+	roo	361	2	52.59
GATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCGAG:1	-	chr2R	6885322	3'	-	flea	4814	2	70.83
CATATATAACAGCCGCTTCTCTGCCGACTTCACCAGGCAGCGAAGGCGCAATTAATAGCCTAAAAAGAATATTGTACTTAAGGATCCTGAATGCTGATCAGATGTTGCCTT:1	-	chr2R	2777505	3'	+	gypsy11	4249	2	71.17
AGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAGAAATCAGACGCAGTAAAAGAAATGAAGGTAAACCTAAACTATCGTATAGATTTTTAGAAAAATGTCT:1	+	chr3R	3286218	3'	+	Gypsy12A_LTR	1945	3	72.22
AACACACACACACACACACACTCACACATACATATACACATACATATGCT:1	-	chrX	9436902	3'	+	accord	7030	2	92.00
AATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATATGGTTGGCTGTAGTGCTATTAATGAGTTTTCTTC:1	+	chr3L	19333132	3'	-	Tc1	1627	1	76.71
CAACTCAACACTTTTATTATCTTAAAACTATGCTTAATTTAATATATAAGGAGTCTAGCTCTGCATAAACATGAAAAAAATTAAGTAAAAAAAGTCAATATAAACGCCATTTGAAGATAAGGGGTGGTGAGATCTTGATC:1	-	chr3L	23963708	3'	-	Transib5	456	1	48.57
TATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACA:1	-	chr3R	9714400	3'	-	Stalker	80	4	71.72
TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTAT:1	-	chr2L	3164967	3'	+	412	413	2	74.10
TTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGGCATTCGGTTGGCACGGCGATGTCAACAGA:1	+	chr3L	7292571	3'	+	HMS-Beagle2	259	2	54.11
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAG:1	+	chr2R	25118787	3'	+	roo	361	2	53.90
GTGTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTATTTTACAGATTGTGGG:1	-	chr3R	22066741	3'	+	Stalker2	248	2	72.62
TTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACCAGTTGGGAATATATAAATACCTTTAGCACATTTAAGCTACCGTAAGAGGCAGCCAAACGATTTGGTAGAATTTTAACTGATTTTTCTCTGCTTAAAAAAT:1	+	chrX	10694592	3'	+	I-element	5336	1	58.22
ATGATGAACGATGGATTCGTGTTGAATCTGTAATTACAGATGCATTAGTATGTGTTTATAATTTCATATTTATATCAATCTTTATTGCAGGTGTCTGTTAACAATGGACTTACACTTCTACGATTAGAATTGTTCTCAATAACTGA:1	-	chr3R	14406267	3'	-	gypsy5	483	1	59.59
AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGC:1	-	chrX	10644441	3'	-	jockey	4801	1	56.14
CACACACACACACCTATACACACATGCATGTATAGCTTCATGGCACAGTGCTGACCTCGACACGTCCTTGACCTCGGCACATCAAAAACACGCCCAATTCCCCGGCGATGGTCTTCTTTAAACTAATCGAAAATATCCTTTTAATT:1	+	chr2L	11249022	3'	+	accord	188	2	76.03
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTG:1	-	chr2L	7945306	3'	+	roo	356	2	54.79
GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCGAAGCGATACATGCAT:1	-	chr2L	21325119	3'	+	invader4	3029	2	71.05
AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCATGGCTCTTAATTGAAAAGTAAAATAGATGTCATTG:1	+	chr2R	9791718	3'	+	412	7524	2	69.86
AAAAAACAAAAAAAAAAGGAAAAAATTGACACAGAAATTGATTTTTGTGCCTTTATCATGTTGCTCAGCATCCCTTTTTTCCCTCCTTATGTATGTATGTGTTCTTGCAGCTGCCGACTCATAATTATAAAA:1	-	chrX	11291797	3'	+	Doc2-element	245	5	80.30
AATATTTATTTATTTTTCTAATGCCAACATTTCTATTAGTCCACCTGCCCGACGGGATCCATCAATCCAGAAACTGACGATGACGACCAAGACAAGACCCAGTCCTCCAG:1	+	chr3L	6398206	3'	-	mariner2	828	1	34.55
TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCCGTCCG:1	-	chr2L	10023004	3'	-	Doc	75	1	66.18
CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACT:1	+	chrX	14749683	3'	+	copia	5080	2	69.18
GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATCTT:1	-	chr2L	20808348	3'	-	HMS-Beagle	6846	2	75.00
TAAAAGCTAAAAGGTTGAGATTCAGCATACAAAGTATTTCGATTGATTCAAGTTTCCTTGGGAATCATGCAGAAAAAGCTGTTGGACTTAAGCAAGCAGAAATTGTATCGCATGAAGAATGTTGCGCTTGTTACAATC:1	+	chrX	22783635	3'	+	INE-1	164	1	76.81
CGAGGAAAAAAAAACAAAAAAAGAAAGCACGAAAATATGTGTGGCTCACTGGCGAGAATTATGGGGACTAGGCTGAGAGTTCAGC:1	+	chr3L	13543708	3'	+	Osvaldo	1518	1	84.71
GTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATCTCCTAGGCAAATTTGGGGTATAGCTTCTACGATTTCTGGCTGCAAGCGTTTCCAAGCTTCC:1	-	chr2L	2707919	3'	+	hobo	291	1	55.45
GACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACATTTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTTTAGGTCTAATTCTAAACTTTAC:1	+	chr2R	16248053	3'	-	BS	9	1	70.55
TAGGCGCTGAAAATTAAAAAAATTGTAAAATCGCTTTATTATTATTATTATTATTATTATGCCAATTTTTGTAGATAAGCTAAAGGGATTTGAATTACTAGCCAAGTAACTGGTTGCTAATAGTCGAGGAACTAGCTCATGTTTTT:1	-	chr4	1271832	3'	+	TART-C	11087	1	57.53
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATA:1	-	chr3L	22437887	3'	+	roo	9037	1	60.22
AATAATAATAATAATAATAATAATAATATTTCTTAATGAGGAAGCTATAAAACAAATCAAGGACAAGTTTTTGTAAAATAGGAAGGCATGTGTAATTTATTCCTAAGGCAAAAATTAACAACTAACATAATAAACTAGTCGAAGCT:1	+	chr3L	2376534	3'	+	mdg1	31	10	78.08
ACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAGCAAAGCGAGGGCCATTAACATTTTCTTTAGCTTTCTTTCGCTTGTTTGCCTACA:1	+	chrX	22715144	3'	-	Bari1	54	1	59.26
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGATAGAAATTTACAAAACTAA:1	+	chrY	9412	3'	-	roo	8743	2	73.29
AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCATGGCTCTTAATTGAAAAGTAAAATAGAT:1	+	chr2R	9791711	3'	+	412	7530	2	71.43
AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGA:1	+	chr2L	18419256	3'	-	412	47	2	49.32
GCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCGTAGATAGATAGGGTCTACGGACGTGTTCGTCTGG:1	+	chr3L	11393116	3'	+	roo	238	2	74.07
CAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGA:1	-	chr3L	10056116	3'	+	transib2	2768	1	66.40
AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATTTTCTGCTACCAACGTCACTCATCCATCTTCGCCTCAAATCGTTCGTTATCAATTGTTAGTGAACTTAT:1	+	chrX	12469331	3'	+	S-element	1684	2	58.91
CCCAACNGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATT:1	-	chr2R	5485083	3'	+	blood	7355	2	58.90
AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAATTGATATTGCCACTAGGCCAATT:1	+	chr3R	21706128	3'	+	297	6963	2	76.39
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTC:1	+	chrX	9540125	3'	+	roo	9055	2	66.67
CCAAAACAACAACAAGGAAAAACAAAAAATAAAAAACCCTAGTGCAACTGCACTAGGCGAGTGAAAAACAAAAACCACGGCCGGTTTATATGTAACATATAAAACGAAAACGCACAGCAACAGCAACAACAACAATACA:1	+	chr2R	13630172	3'	+	gypsy9	456	1	46.04
AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAAATACTA:1	+	chr3R	17243254	3'	+	hopper	1407	2	74.44
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCACCCTTTGCCG:1	+	chr2R	25118804	3'	+	roo	9037	1	61.64
ATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTGCAGT:1	-	chr3L	19013882	3'	+	invader3	5431	2	65.07
AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCATAAAGAAAATGTTGTATTTTAACATGAT:1	-	chrX	9539975	3'	-	roo	5	2	75.59
CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTATATTA:1	-	chrX	21014758	3'	-	copia	38	2	44.52
AACTTCACAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTCAAAAGAGAGAGTGTAGAACCTAATGGCCTTTAGTGTATTTTAAG:1	+	chr3L	8426843	3'	-	invader3	234	2	76.87
ACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCTTTTGTTTTGATATAGAGATATAGAGAGAGGAATGCCTGATGAAATTCTGTGCTGTATACACTTTTGATTGAATTTTCAGTT:1	-	chr3L	2017627	3'	-	accord2	7279	1	56.16
GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCCCTTCTTGCCCCACGTCTCAGCCCTTC:1	-	chr2R	5248200	3'	-	1360	31	1	60.27
GGTCTTGGTGGATGTTCGCGTTCCGGATGTACCAAGGTGCACCAGTTATTGTTCTTGGTTCTCCTTGCTAGGAG:1	-	chr3L	25798387	3'	-	Doc4-element	2713	1	72.97
ATTGCCTTATTAAATTTTCACACGCCGCAAGATGAATACAAATATTCTAAAATAAAGTCATTTTTTAAATTTGTTATGTTTAATTCTAATTTGTGTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGATATATTTTTTTTGAAACACTTTTA:1	+	chr3R	29011379	3'	-	1360	435	1	53.42
TGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGG:1	+	chr3L	10013671	3'	+	hopper	1352	1	60.27
AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCG:1	-	chr3R	14981168	3'	+	mdg1	7398	2	66.41
CTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGACG:1	+	chrX	7195111	3'	-	P-element	68	1	34.59
AATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCAAACAG:1	-	chr2L	17550611	3'	+	Transib-N1_DM	443	1	79.45
TAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAACCTTTTCGTGAATATAGTGAATATTCAAGCT:1	+	chr2R	18861446	3'	+	Stalker4	7263	4	78.62
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCT:1	+	chr3L	11441819	3'	+	roo	335	2	69.18
ACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTGAGTGAAATATGTATGTGAATATGTGTATTGTTTATTATATTGATAAAAATCAATTTTTCCTCTGCATGTGAAACACTTGAAAGTATCGCACAGGCAACG:1	+	chr3L	7591652	3'	+	hopper	405	1	69.18
CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACCCCAATAACTTTTATTAGGCTAAGTACAGAGACTTTTCACT:1	+	chr2L	22775620	3'	+	pogo	2088	1	75.54
AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGAGTGAGACGGTTGTACATCGGTCGGTGGAGGGAGGCGGGGAGTTTTGGCCGCGGCCA:1	-	chr3R	13822481	3'	+	hopper	1410	2	67.44
AATCGATTTTAACTTTTTTATTGCATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATACGCCGATGCTCCAGGCACAAGCAACCACTT:1	+	chr2L	6703162	3'	+	Cr1a	4263	1	69.52
TTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAAGGTGCCCATACTGGTTTTCGGTACAAATGTATATAAAGTGTTTGTGACAAC:1	+	chr2R	19504514	3'	+	P-element	2488	1	37.50
CTGTATGGCGCGTGCCCAGCAGAAACGCGCAATTGCTAGAAATGTCGTTAAATTTAAATGATCTGCGACATTCTCTCAGTGACTGCCTACCTGAAG:1	+	chr2R	3384134	3'	-	invader1	3648	2	73.96
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTCACACACAGGCAAGGACGCC:1	+	chr2R	19004194	3'	-	roo	8726	2	82.57
TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCAT:1	+	chr2R	5485187	3'	-	blood	7058	2	66.67
AAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATGCGTATAAAATGTATACGCATTCCCGGATCGCCGGATCTTTCGCTTTTCCT:1	-	chrX	20645837	3'	-	1360	387	1	64.38
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTAGACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGAC:1	-	chrX	14336428	3'	+	roo	9014	2	67.48
CGGTTATTGATCCTGATCAAGAATATATACTCTTTATATGTACGGTGTTCACCAATATCATATTGCCAAGTTGTGCTATGTCCGGATGTGTCCCCAGAATTGATCCAACCAGGTGTCATGCCAAGCCAAA:1	-	chr3L	23343814	3'	-	INE-1	88	1	70.00
AACGATTCCAGCTCTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACTTTCTTGCGTTTATTAAAGTTATTAAGTTACTCTAAGAAGCTCTTTAACTTACAATTGTCGTTTATTTTTTTTATAC:1	+	chr3R	27115099	3'	-	FB	39	1	57.45
GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAA:1	-	chr3R	9921977	3'	-	blood	23	2	58.49
GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAACGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTT:1	-	chr3R	13360306	3'	-	jockey	78	1	61.64
ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGGCTTTGGTCAATCACCTGTCGCCTGAAAGTAGGCAGTAAA:1	-	chr2R	18528712	3'	+	jockey	4941	1	65.22
AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCC:1	-	chr2R	2016813	3'	-	1360	37	1	54.69
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAATTAAA:1	+	chr3L	20831413	3'	-	roo	10	2	76.15
GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTAAATCTCGTTCGGCGTGCTG:1	-	chr3R	28758267	3'	+	mdg1	390	2	44.52
TCCTTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAGCCAAACTAGACATATTTAACAACACTAACCCTCTAGAGCCTTCACAAATCCCACATAGTGCCTCCTTCTTCTCGTGCTTCT:1	+	chr2R	3641099	3'	+	I-element	5012	1	72.60
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATTTCCTTTGGGGCTAAACGCTTTTAGTTCACTGACAATGGTACACTGCAACAAATGCCAC:1	-	chr3R	22844132	3'	-	roo	7	2	74.83
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCA:1	-	chr3R	19968110	3'	+	roo	335	2	69.66
TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGAATTTGACGGTGCGGAGTCGCAGGACTTAACAAAACTAATTTTTTGGCATATTTTTTTAAAGTTTAAAAAAG:1	+	chr2R	23812084	3'	+	copia	241	1	69.18
TGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGGCTCCCAGCCGCCAGCAGCACCCAAATTGCACAATTA:1	+	chr3R	2689431	3'	+	diver2	4476	1	60.40
TCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATACATATATATGTGTTTCTACAATGGCACCCACGCAAAACGCTTTGAACGGCTGGGATCCC:1	+	chr2L	2794274	3'	-	Burdock	6181	2	60.74
TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATAT:1	-	chr3R	25339987	3'	+	mdg1	7380	2	71.23
CAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAGCATATATTTTCGGTACAATTTGTTTGATGTACATACA:1	-	chr2R	8146991	3'	+	P-element	2637	1	27.69
GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGATTTCATGCGAATCTATATGTGCATATTTATACACATTTGTAC:1	+	chr3R	28946395	3'	-	hopper	77	1	68.49
ATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATGAGG:1	-	chr2R	5284545	3'	+	Doc4-element	2598	1	51.49
ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTG:1	-	chr2R	2016828	3'	-	1360	14	1	61.11
GCTATTTAACAAATGACTGATCTATTCATACATAAAAATTTGTTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAAT:1	-	chr3L	27356101	3'	+	Tc3	1616	1	79.45
CTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGGTTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCATTTAGTATTCAC:1	+	chr2R	21298865	3'	-	jockey	248	1	60.27
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATT:1	+	chr3R	7100899	3'	+	roo	9009	2	60.00
AAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGTTTTGCTAGATTTTCCCAAAGCTTAATTGAGATTTTGACTTTTG:1	-	chr2L	20139879	3'	+	jockey	4918	1	67.81
AAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCGCTTACGATGTGCATGAGTATGTTGGGTTTTTACCTTGTTTTCCCACCTCCATCTTCTCGTTTTC:1	-	chr2R	10549810	3'	-	1360	3370	1	58.90
CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCTTGGAATCGGTATCGGAAATCT:1	+	chrX	6522064	3'	-	F-element	65	1	54.01
GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACAGAGTGAAAATGAGGACACTCACAGCA:1	+	chr3R	7100956	3'	+	roo	402	1	77.40
AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATATATATTTCAATATATGTATATGTACTGTGTTGGCCGGAAAATGTGTGCGTCTGTGCGGAAATTGCATTTTTCACCCTTTTTCCATTCTGCCTTACT:1	-	chrX	12214023	3'	+	opus	475	2	67.81
AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTATCAAATAAACGCGGCTCAACGTGGTG:1	-	chr2L	16067049	3'	+	297	382	2	66.13
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCCGTTGAG:1	+	chr3L	10648027	3'	-	412	7082	2	53.10
CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATCAAAACGCATCTGCATCCC:1	+	chrX	21014886	3'	+	copia	223	1	63.01
TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGTAGAGGTCAAAGTGACAGGCGTAGAAG:1	+	chr3R	1433243	3'	+	mdg1	7440	2	65.60
AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACAT:1	-	chr3R	9714386	3'	-	Stalker	6908	4	60.14
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCT:1	-	chr2R	9791596	3'	-	412	78	2	73.79
CTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAACATGCAAATACTTTTTCGTGTATTTTCCTTGTATTAATCCAAGTAACCACTGTTTTGCATACAAATT:1	+	chr2L	1665390	3'	-	hobo	2491	1	65.29
ACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACAAAACAACAACAAAAAATACTTAT:1	-	chr3L	23797648	3'	-	Helena	1153	1	58.90
TGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCA:1	+	chrX	21014829	3'	+	copia	167	2	80.00
GAACTTCTCGGATCATCCAGAGGTCTGCGGAAGGCGGATCCACCTTGGGCCAGCAGCTGG:1	-	chr3L	7950355	3'	+	Burdock	5961	1	73.33
CTTACACACACACACACCCACATGCAGACACTGCACAGTGTGTTCTGGTGGGAAGGGGGCACTGGCACAGGGACAGAAGGAGCA:1	-	chr3R	27422331	3'	+	Quasimodo	36	2	86.90
TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTT:1	+	chr3L	10773138	3'	-	412	7074	2	57.14
TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTT:1	-	chr3R	31817448	3'	-	roo	68	2	65.07
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACG:1	-	chr2R	20596472	3'	+	roo	9019	2	64.75
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTC:1	-	chr3R	27994174	3'	-	roo	8702	2	52.71
ATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCC:1	+	chr3R	11496611	3'	+	1360	3356	1	56.36
TATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGCAA:1	+	chr3L	21855520	3'	-	blood	7088	2	71.23
AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCAAATCAAGAGCACTATATTATCCTGGATT:1	-	chrX	21014749	3'	-	copia	29	2	45.89
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATG:1	-	chr2L	3114486	3'	+	roo	9020	2	60.63
AAATTTATCAAAGTGACCTCTTTACCCGGGTTATGCGATATCGAGTGCAAGCTTCAAAACATGAAACTTGAAACCTGGGCTTACCTTGACGCACTCCTGATAGA:1	-	chr2R	17670309	3'	+	Ivk	495	1	58.65
AAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAATGGCATCACTTTCCATCGGAACACGCACCGTAAACGCCGTATACTG:1	-	chr3L	25232691	3'	+	HMS-Beagle	6604	1	41.98
ACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCC:1	-	chr2L	10023009	3'	-	Doc	90	1	71.92
AGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTAAAATAAAAAGTTTTGTAATCATTTAGTGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTC:1	-	chrX	23182855	3'	+	Idefix	480	2	82.19
CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAATTTTAAGTTTGATGATTTGTCTATGCAAGCGGTGCCAATTGGAGCCGCAGAGCAATTCATTTACTGCATGC:1	-	chr2R	1657646	3'	+	copia	5086	2	54.07
GGACTGGGGACTCAGTCCACGCGCCAGGCGGCCTATATATGCCGGACTCATGGTGCCATTTTAGTTTTCCTTCTCTTTTCATGGGAAGTCATTTTTGAACTT:1	+	chr2R	5151191	3'	+	R1-2	3013	1	55.88
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGC:1	-	chr3R	12886898	3'	+	roo	9008	2	63.12
ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTCATTTTAAATCTTGCCATAATAGAACCAAAATTTCCCGTTAACATTATTTTACAAAATCCCTACCCCTTACAACAATTTATATACATACATAGAAACCAGGCAAATTGAATT:1	-	chr3L	3477374	3'	-	mdg1	7044	2	69.18
AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGC:1	+	chr3R	28075403	3'	+	jockey	4930	1	59.59
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGAAGCGA:1	+	chrX	7256200	3'	+	412	424	2	64.83
AGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGTACAACAACAATTCCCATTCGCTTTTTATTGTTCTT:1	+	chr3L	5639100	3'	+	opus	7100	2	74.10
AAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCCAAAGCAACGAAATCGGCGGAATAAAACTAAAAATATCTATTCGAAAAATT:1	-	chr3R	22122664	3'	+	roo	9067	1	78.07
CAACAGNGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGTATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACCCTTATTCCATCAGGAA:1	+	chrX	4215067	3'	-	flea	32	2	57.64
GTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTGATTGGATTAAAGCAATTGAAAAATTTCAAATTGAAAATATACACGATTCTAAGAGTCTAAA:1	+	chr3L	18627341	3'	+	FB	18	1	57.24
ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCATGTG:1	-	chr2R	9791544	3'	-	412	27	2	67.81
CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTATTTCATTATCTGATTATTGACTAGTATAGACCACAGTTGATAGTATTCCTACTTATGTCTATCATGGCTACATATATAGTGTTTAATCA:1	+	chr2L	4954074	3'	+	Quasimodo	7339	2	65.75
CATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCT:1	-	chr2R	5173439	3'	-	Stalker4	6977	4	46.09
TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACATGACTTTCCGGTTTTACAGGTTTGCTGCAAAGCTTTCGCTCTCTCATTCGGCGCTCTCTCTCTCTCACACACACTC:1	+	chr3R	29572294	3'	+	P-element	2863	1	59.84
TACCACGGATTAGTCTGCCCTTTCTTTCGGGAACCAATGTGTGGGGTAGCCGTTTAAGGCAACTCCCTGGATGCACGACGACAATCAGTTATCATAAAACCCACTTTGTGTTTCTAAATTTGCAGTTCCGTCATTCCTGAG:1	-	chr3R	15152170	3'	+	aurora-element	30	1	60.28
AAACTATAACCACCAGTTGGGTGGGTTATGTATGTACATAAAAATATTTATTGTTCACGTTTCTTCTTTTCAGACTTGTAAGCGGTTTAAATATGATCGCACATT:1	+	chr2R	9874924	3'	+	S-element	445	1	71.43
AGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGCGAGCGAGCAAGGACTTTCAGTTACTTTAAGTATTCATAGCTTAATTTTAATT:1	-	chr2L	22393165	3'	+	Rt1b	4944	1	66.09
CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGCGAAAAGTGTGAGGAAGTAAGTAGAAGACTTTGAGATGATACGAAATAATATGATTGCACATAAAAGTTTTTGCTAAAGAAGTTCACATTGTACTTAATAAGGTTAGG:1	-	chr3L	14603215	3'	-	jockey	20	1	73.97
GTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGTATATGAAGAAAGTACGCATGTGTGTGCGGGGGCGTGTGCATATCTTAGCCATTGCCAGTGT:1	+	chr2L	15174598	3'	-	17.6	56	1	63.01
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTTGAGCACGTTGAATGGTTGATA:1	+	chrX	9540159	3'	+	roo	9057	1	73.97
CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCAAACAAATTTC:1	-	chr3L	7943608	3'	-	Burdock	28	2	56.64
ATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGTTTAGCACGGGTTGTT:1	+	chr3L	7943763	3'	+	Burdock	248	2	76.55
AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCNTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTAAGACGTTCCCTAC:1	-	chr2R	15064346	3'	+	412	428	2	60.84
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTG:1	+	chr2L	3886254	3'	+	roo	9031	1	53.33
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGAACAGCAGGATGGGGGGCCAGATAGCGC:1	+	chr2R	13710723	3'	+	roo	9055	2	73.97
TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGAC:1	-	chr3R	14049325	3'	-	transib2	47	1	52.90
GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGGTTGCTTTTGTTGTTCT:1	+	chr3R	14651322	3'	+	P-element	2851	1	60.27
ATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGC:1	-	chr2L	14110749	3'	-	Quasimodo	66	2	74.29
TATTGCTAGGAAATTGGCAAAAGCTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTGATGTTAGACAAACATCATGCACTAACTTCTGGTGATCTGTGCTAAGGTACAGTAAATTTGTTTAGGCTTCCG:1	+	chr2R	1513410	3'	+	1360	3118	1	48.63
TTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAA:1	+	chr3L	17115525	3'	-	blood	78	2	68.49
AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCCCATTTCCCC:1	-	chr3R	21705987	3'	-	297	18	2	55.79
ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTNGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGA:1	-	chr3L	15600144	3'	-	roo	8664	1	61.02
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTATGATTAATGTTACGAAATATTATTACAACT:1	+	chr3L	11441859	3'	+	roo	9039	1	60.27
TGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGT:1	+	chr2R	16248030	3'	-	BS	20	1	61.19
AATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGAGTTAATTAGTTCTAATTACATATTAAACAA:1	-	chr2L	22315547	3'	-	frogger	2294	2	52.63
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAACTAAAGAGAAACAGAGA:1	-	chr2R	20596446	3'	+	roo	9021	2	52.74
GCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGTTGGGGCGTGGTCTAGGGATGATGTATTATGATGAAGTGGGGATATTGAACTTTGAATGATATATTAAGAGGGTGCCATCTCTTTAGCAGTCGATTTTGATTTATTGAAATCCAT:1	-	chr3L	23451873	3'	-	rooA	7428	2	77.40
AGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACC:1	+	chr3L	20168455	3'	-	mdg3	5261	1	68.75
AAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTAT:1	-	chr2L	4025374	3'	-	copia	5085	2	58.45
GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGTTCTTAACTTACATACATATGTGCACACATCGCAGTGACTTTCGGTGAGTAATGCTGTACTTATTTCGTTTATCTTATCTAGGTTTTTGTGCTTTTACAGCCGCCT:1	-	chr2R	9543987	3'	-	opus	7026	2	72.86
CCGATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAA:1	+	chr2L	23373496	3'	+	Tc1-2	1531	1	78.08
TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTTGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCAAAGGAAAACACTTACCCAAAAAGCAACAACGATTGTGTTGCAAG:1	+	chrX	14824796	3'	-	jockey	4724	1	51.11
AAAGACCCTTTCAGAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTTGAATGGTGAAAAAGTTTTCTCTAAACAAAGTATTATCTATTTCGATCAATT:1	-	chr2L	9292406	3'	+	Ivk	265	1	59.38
TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTTCCCGAAATTATGCAGAAAGAAAAGGTCGTTTCCGGTGGCCGAAAAGGCAGAGAAAGTGGAAAAGTGGAAAAACGGAAG:1	-	chr3R	6524787	3'	+	I-element	5327	1	65.62
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCTGATACAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCGTGCTCCTTTCGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATATTTT:1	+	chr3R	19448558	3'	+	roo	396	1	45.89
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATAC:1	-	chrX	10640011	3'	+	roo	9013	2	56.16
CACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACC:1	+	chrY	3631958	3'	-	Stalker	443	1	60.61
GTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACA:1	-	chr3L	23797671	3'	-	Helena	1159	1	48.84
GAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTAACAGATACTCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCAAAATTGTATAATTTTTCTGGGATATCGCACTGGCTAAAACAGAACAATGCTATTTAAAACACTACGGCTTTAAAATCAAC:1	-	chr2R	5186097	3'	-	INE-1	571	1	63.70
TTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTTTACATTTACATTAAGTCAAATGACTTGGTGTGATTGCTGCAAAGGATGCGGACACCTTTGGTAACTAGACAATAGGCCTGCAAAATCTGGCACATCTTGGTGAACTCC:1	+	chr2R	15370665	3'	-	1360	3326	1	57.86
GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCA:1	-	chr2R	2016812	3'	+	1360	3385	2	73.96
ACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGATTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAAT:1	-	chrX	3308320	3'	-	hobo	86	1	73.97
GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATC:1	+	chr3L	17205263	3'	-	hobo	51	1	74.77
TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGC:1	-	chr3R	17243090	3'	-	hopper	29	1	62.96
AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAATTTGGAAGGCTCATGGGGGGACAAGCAAAGGTTGATCCCAAACTT:1	+	chr3L	9673178	3'	-	Doc	23	1	63.70
ATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATTATTTCATTATCTGATTATTGACTAGTATAGACCACAGTTGATAGTATTCCTACTTATGTCTATCATGGCT:1	+	chr2L	4954054	3'	+	Quasimodo	7320	2	54.48
ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAAATCACAAAAAGTATCCGAATAAAGAACCTTCGAGTAGTGTATATAGATATGTGTTGGTGTTGCACATATATATATTGGTGCTATATAACGCACAATTCATACGATGGTGCGGCA:1	-	chr3L	7192981	3'	+	297	6949	2	53.85
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACCGAACTTTTCCCAACTACT:1	+	chr2R	19004242	3'	-	roo	35	2	60.00
AATTTTGAAATTTTTTAATTTTCTGTATTTCACTAATTTGCTTCCATTGATATTTCTAATGAATTTCTGCCAAGTCGACAAACTCGACTATAGCGTTCTCTTTTAGTGCCCGTTATTTTTTCATTTATTAACAAAATTCAACAG:1	+	chr4	966737	3'	-	1360	3031	1	68.75
GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGCAGGAAAAGTCCCCAAAAATAAGAACAACAACAG:1	+	chr3L	11124036	3'	-	Max-element	8283	2	70.19
CTCATAATTGTTATAATGTTAATTGTTATATTTGTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTCTGATCACGGGGAATTTACTGGCACGTAGTGCAATAATAACACGAAGTCAGTGCTTATCCTCTACAGAA:1	+	chr3L	24148701	3'	+	BS3	1629	1	76.55
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCT:1	+	chr3L	20831395	3'	-	roo	8708	2	55.48
CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGGGTCACTGGGCGGCATGAATCACTGGTCTATTATGCGGGGTCAGAGTG:1	+	chr2R	17626964	3'	+	opus	484	2	73.68
ATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATAAAACACTTTCTCAACTTAAACCACATAAATAAACGGTGTGATGGATGAGCCCGTGCCATCT:1	-	chrX	6962010	3'	+	G5A	2767	1	51.67
AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTTTTGCAATAAATTATACAATATCATTTAATTAGAAAAAATCTAAACATA:1	+	chr3L	15519847	3'	+	pogo	2035	1	65.75
AAGAAGATTATGAAAAACCACGGCTGGATTGACAAACACAAAATAAAAAGTCGGGGCGCAAAAAACCCGGTCCTAAAAGGATTAAATGTAAAAATAGAACTTAAGCATTAAAAAATATATAGGGCAACAGAAAATTACTAAAA:1	+	chr2R	19081662	3'	-	Cr1a	69	1	45.45
TCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATATGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACGCA:1	-	chr2L	2122364	3'	+	Stalker4	371	2	55.48
TGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGTTATTTATATAACATACCCACATAAGAACACACTGTGG:1	-	chrX	515262	3'	-	Stalker4	7215	4	51.37
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAG:1	-	chr2L	17081776	3'	+	jockey	4937	1	56.85
AAGAAAAAAAAAATCAAAAAACAAAACAAACAAAAAACCAAAAACGCTCCGAAAAAAACGCGAAAAGCCAGCGTAAAGGTTCAACTGAGTGTATAA:1	+	chr3L	10994783	3'	+	gypsy7	5014	1	88.54
AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCA:1	+	chr3L	16015341	3'	+	1360	3343	1	52.05
AAAAAATATTTGTTTTTTAAAATCATACTACTTACTAGCTTTGCATTGAGATATTCAATAAAAGTATTACATAATATAGTATGAAATGGTCATTATTTATATTATTTATATTATCTTTGTGCGCAACAAGCAATTCGATTT:1	-	chr3R	18940765	3'	+	NOF	3905	1	60.99
CTAATCCTAAATATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTTGGCATTGCGCCGCCACTGTAAGATCGGTGACTCATGTGTCATCCGTCACCATTA:1	+	chr3L	9784599	3'	+	mdg1	7195	2	58.65
CAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACCGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTTTTCAATAGGCGCA:1	+	chr3R	20499864	3'	+	mdg3	207	2	56.12
GATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCTTATTGGTTGATTTTTATAGCTAGACATAAAACTGGATGTGTTATACTATCTTAGATAAAAGCAAATTTAGCAGCTAGCCAATTTAAGTTCGACTTTAAAGAGTGCCA:1	-	chr2L	9399391	3'	-	Transpac	4929	2	76.03
AATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAA:1	+	chr3R	17615202	3'	+	Tc3	305	1	72.17
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGTGTCGTTTTT:1	+	chr2L	8986207	3'	+	412	422	2	72.86
GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAG:1	+	chr2L	16016437	3'	-	412	9	2	73.68
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAA:1	+	chr2R	8585570	3'	-	roo	30	2	44.52
GTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAA:1	-	chr3R	9714362	3'	-	Stalker	2	4	78.10
GACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATTTAAATAGCAGAGTATTTAATGAAATTTACCAACTATACTGACGCATTACAACCTTTAACCCTCGAAATCGGCCACAATAATACCGCTGTTTGATTTGGACATAAATTTCTGAGG:1	-	chr3L	7587129	3'	-	hopper	298	1	78.77
CGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACCTTCTGTCGCTGACAATGATGATGTTGCTGCTGTCGCTTCTGATGTTG:1	+	chr3R	4798044	3'	-	Transpac	5200	2	54.74
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTTAAGGTCGATTACTAATT:1	+	chrX	13039540	3'	-	roo	19	2	57.32
AGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGATAGATAT:1	-	chrX	15408713	3'	-	INE-1	542	1	86.21
TGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTGTGAGTGCAAATCAGATAAATTTTCTTGATCTTAGAACCGATAGCGGTGATATTTATCAGAAGGCTGGGCATTTGACAGGAGAGCAGGTGCAC:1	+	chr2R	1717260	3'	-	Stalker	6789	2	66.42
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAATAAAATGGTAGAAAGG:1	+	chr2L	14772162	3'	-	roo	29	2	64.58
GGTATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGG:1	+	chrX	13039517	3'	-	roo	38	2	82.05
GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTTTTCGGCAGACAATGGCAATCAGCAATAGCAACT:1	-	chr3L	10385811	3'	+	Burdock	6349	2	56.85
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAATTGTTTAATCAATTAAAGATGGATTC:1	-	chr3R	16076741	3'	-	roo	24	2	71.23
TAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCTTCTT:1	-	chr3R	13457869	3'	-	X-element	41	1	57.75
GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGC:1	-	chr2L	15833009	3'	+	hobo	2894	1	62.83
GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTA:1	-	chr2L	7888103	3'	+	pogo	2055	1	59.71
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATAT:1	+	chr3R	16076901	3'	+	roo	9032	1	55.48
AGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTCATAATTCGCTAACTAAGCCAAAAGCCGCAAA:1	-	chr3R	14937491	3'	+	I-element	5290	1	72.87
ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCAT:1	+	chr2L	19965054	3'	-	Doc	42	1	51.85
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTCGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCC:1	-	chr3R	22844201	3'	-	roo	8720	2	67.48
CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTTGTAGGCTTACGCTGGGGATCCCC:1	-	chr2L	15833418	3'	-	jockey	20	1	71.20
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCTGCTAAGACGTTCCCTA:1	-	chr2R	15064347	3'	+	412	7477	2	63.01
AACGTTTTTATTACATAACTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAAAATAGTTATTTTATTGGAGTACTTCTGATTTGACTTCATATATTGTGTTGTAGAAGTATGCGAAATTTTTTTTATTACTGTAACCAAAGAAAACAATACTG:1	-	chrX	170683	3'	+	Cr1a	4273	1	60.96
AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGAC:1	-	chr2R	2016816	3'	-	1360	22	1	60.91
AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTG:1	-	chr3R	25448345	3'	+	roo	9060	1	62.50
AGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAAT:1	-	chr2R	20596461	3'	+	roo	378	1	52.73
CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATCGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTGGTAGGCTT:1	-	chr2L	15833433	3'	-	jockey	57	1	52.05
AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATCAAAA:1	+	chrX	21014872	3'	+	copia	209	2	53.42
GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCATTAA:1	+	chr3R	28075446	3'	+	jockey	4973	1	68.49
ATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCGACAGCCTTAATATAGAAGAATCAGATAAATTTCAAAAATACACGTGAGTGTATTTATAAAACGTCTCGATGGAAATGAATTTAA:1	-	chr3R	18582505	3'	-	P-element	202	1	60.96
ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTAGTTATTCTAGTGACTTTGATTGAGGCTTATTTTTACGTTTCGTCAGAATCCCGCGTAGGCCCCTCTATGC:1	+	chr3L	23219306	3'	+	1360	3339	1	60.98
GTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAAGCCAAAATTTAATCATTTTTCTGGGATATCGATAATATTCCGGATTCATATAGACGTGAAGTATAATGATTATGACGTGCTAGAAGCA:1	-	chr2R	5182965	3'	-	INE-1	561	1	63.43
TTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGATTGCCCGACCAAGGAGAAGACAGAGTTTCAGATGAAACTCCTTCGGCGATCGTGCTGCTCCTACGGCACTGATCCTGCGCCGCCTT:1	+	chr3L	27130500	3'	-	1360	3274	1	75.81
TTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAACCAGCTGGCAGTCACC:1	-	chr3L	22437810	3'	+	roo	410	1	82.09
AGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCATGGTGATCTCCTTGATCCGACTCTCTGCCATGTTGTTGGTGAACATCGCATAGAAATACGGGATGGTGGCCGCCAGCACAACGCGGTGCGCTG:1	+	chr3R	12010103	3'	-	R1A1-element	409	1	73.05
GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCGGCTTCTT:1	+	chr3L	16750764	3'	-	Tirant	8117	2	71.43
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGC:1	-	chr2R	7898061	3'	-	roo	8717	2	60.27
AATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCATACAGCCAACA:1	+	chrX	13704871	3'	-	invader4	2809	2	57.78
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTTTTCAATTAAATTCCAATTAAAGAACTAAAATGACCATATAATTTCATAAATAATGCTATTTGCTT:1	-	chr2L	12498319	3'	-	pogo	38	1	55.56
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGCTTGTCTTTTGTAAATTGTTTAATTTTCTGCGATTTTTTTGTGTAATTTACGTA:2	-	chr2R	18349310	3'	-	roo	66	2	65.75
AAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAAAACTGGCACGCCCAGACTT:1	+	chr2L	23034110	3'	+	FB	415	1	63.45
TATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCAT:1	+	chr2L	23034060	3'	+	FB	368	1	50.00
AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGG:1	-	chr2R	2016855	3'	-	1360	20	1	71.01
TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTCATTTTAAATCTTGCCATAATAGAACCAAAATTTCCCGTTAACATTATTTTACAAAATCCCTACCCCTTACAACAATTTATATACATACATAGAAACCA:1	-	chr3L	3477387	3'	-	mdg1	19	2	60.27
ATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTACATCTTAAATTATTATAAGAATATTTTTGGATGTCGGCACTAACAAAGAATATTTCAACTTGACTTTCTACTGA:1	+	chr3R	9918795	3'	-	blood	7008	1	53.42
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGTTGTGTCCACTTTTCCCTAAGGGGAATGCAAGTCTGTGCCAA:1	+	chr2R	7452946	3'	+	pogo	2047	1	57.24
ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACGCGGGTAAAACAAGTTTTTTCTTTACTT:1	-	chr2R	977516	3'	-	F-element	60	1	52.41
TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTG:1	-	chr2R	20496896	3'	-	blood	49	2	50.68
AAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAG:1	-	chr3R	9038895	3'	-	Juan	4022	1	70.77
ATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGGGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCG:1	+	chr2R	21298799	3'	-	jockey	291	1	74.80
GCAGCTCAAGTCCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGATGGTAAGGAGATTGGAGAATGAAGAACGGAGAAAGGATAATGGAGCAGGAGTGAGGCAGCAGAATGGTAAATGGCGAGAGTGTATC:1	-	chr3R	12853558	3'	+	Quasimodo	6966	2	64.71
GATCTAGGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAATTTGAATATCTTTCTCACACTTCTACTATATAAGTAGGAAGTACTTGATAGTC:1	-	chrX	19228602	3'	+	INE-1	150	1	82.56
AGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTTTGTACATGCGTTGAGTTTCTTGGTTAGCCAGCGATAAGCGTAGGTTACACACA:1	-	chr3L	17561561	3'	+	jockey	4755	1	63.01
TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGTACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTACATCTACACATCAAA:1	+	chr3L	20033815	3'	-	blood	26	2	56.16
TGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACGTTTGTTAATTATTGTAAGGGTATTGAGTACTCATGCATAAATGACCCATTGATTCGAATT:1	+	chrX	11908439	3'	-	X-element	4270	1	60.55
TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATC:1	+	chr2L	19965055	3'	-	Doc	63	1	59.23
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGTAT:1	+	chrX	13039521	3'	-	roo	36	2	80.00
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCGGACCACCGCAATTTTCTTTCATTTTCCGTAGTGCATTTGCAATTTGTTGAGTGTGTTTCAATTAAATTATGTAATTAATGCAGAATGAATGCCATGAATTGACT:1	-	chr2R	12461540	3'	+	roo	393	1	50.68
TTTCGGCCCGAAAATTGTCTTCTAGCACGCAAATTCAATTTTTAGATTTTTCTCAATTTCACACGAGCGGGGAGAGGTCAATTTACATATTTGGATTTTTGGCCAATTTCGTTGCAAAACTTAACAGGGTACTGTGAGCAGAACTT:1	+	chr4	431415	3'	+	1360	3190	1	58.22
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTTGAGTTAGTATTTTAAAGTGATCTTTTAAATTTCATGGTTGTTCAAATCGGCGTCAATTTATTTTGTTGAACTTTTTTGTATCATTTT:1	-	chrX	17526793	3'	-	roo	19	2	60.27
TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGAAGTCGAAGGACTCC:1	-	chr2L	5845002	3'	+	transib2	2775	1	69.09
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTACT:1	-	chr2L	7888101	3'	+	pogo	2076	1	56.67
AAATTAAAGAAATATTATTTTATTTTATATTCTAACACACTTGAATAAGCGACTTGATACAGCGTTATAGATTTTCTAAGATCTTTCTTGACTTTTTGATGATACAATTTATTCTGAATGATATAAGTTTATATGATGGTTTCTT:1	+	chr3L	10295205	3'	+	HB	329	1	70.34
ACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGGTTCTTATGTTATACTTGAATTTATGACTTATATCCCAAGGCATTCTATGATTATGTGTATGGCACATATGCTACTATATGTATATAATTAAATGCTTTTGTT:1	+	chrX	1422034	3'	-	Quasimodo	158	2	68.97
GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGTTGTGTCCACTTTTCCCTAAGGGGAATGCAAGTCTGTGCCAACAACT:1	+	chr2R	7452951	3'	+	pogo	2077	1	62.50
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAAATACTAAAAAGCCCCAGCAAT:2	+	chr3R	17243269	3'	+	hopper	1409	2	78.08
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATTGTGTAACTTAAGTAGCCGGCATGCG:1	+	chr2R	9632225	3'	+	roo	9040	1	63.70
GCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCATTCCCCAGATTGGCGATAAGTTCGCTTCTCGTCACGGACAAAAGGGA:1	+	chr3R	14128962	3'	+	1360	153	1	63.85
TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTTATATAGCACACACAACAAATGAAATATACTTGTTGGCATCTGGGCTGCCAACTCACGCTTATA:1	-	chr2R	23877709	3'	+	297	343	2	58.22
TGGTTAGGGAGGCCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCCTTTGACTCAAAGGGTGGGCGCGTTTTCCGAGTTTCCC:1	+	chr2R	18527137	3'	-	jockey	4764	1	56.41
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTC:1	+	chr3R	18339176	3'	-	roo	8735	2	69.86
CTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTT:1	+	chr3L	19339434	3'	-	Tc1	66	1	57.53
TTTAAATAAATAAAATAAAATATTTGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACC:1	+	chr2R	4932040	3'	+	G7	1146	1	75.83
TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGA:1	+	chr3R	15364026	3'	+	flea	4962	2	54.79
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAAAACTTTAATATTTCCATTTTTAATCATTTTACATATATAGCGATTTTA:1	+	chr2R	19050332	3'	+	roo	390	2	65.07
GCATTCGCGACTCCCACCAGATGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGTGGACTTACCCTATTTTAATGGGATCCTCTCCGCTGTG:1	+	chr3L	9642415	3'	+	Quasimodo	323	2	64.41
CATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTA:1	+	chr3L	20168433	3'	-	mdg3	5326	2	68.35
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATCTTGGTTAG:1	+	chr2R	18336235	3'	+	roo	352	2	63.85
TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCG:1	-	chrX	5643435	3'	+	roo	395	1	73.91
AGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTNGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCA:1	-	chr3R	10273939	3'	+	HMS-Beagle	6982	2	60.96
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATCCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCATTTTCATGTGCACTTTTGTCATATAGAACATTTCCCGAGCGCAT:1	+	chr2L	16092038	3'	-	roo	18	2	71.23
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCACTGTCGTCTCATATCTGTGAATTCCTCTCGCT:1	+	chr3R	22844337	3'	+	roo	407	1	79.29
AAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGGCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTAAAGGTGGTACATACTCCAAAGCT:1	-	chr2R	5020671	3'	-	Doc	387	1	68.29
ATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTAATCAAAAATGGAAAGGAAAACATCATCTAGCTCAGAGCCCTTATT:1	+	chrX	22643365	3'	-	Tc1	1583	1	62.33
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGC:1	-	chr3R	12886910	3'	+	roo	9032	1	61.90
CGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAAT:1	+	chr3L	12879796	3'	+	roo	8992	2	77.69
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCCTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGAC:1	-	chr3L	16343236	3'	-	roo	8752	2	76.71
AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCCGAGTATACCAAGATAAAAATACAACGGCACAATTCGTA:1	+	chr2R	3065992	3'	+	P-element	2805	1	32.19
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATCTAAAGTAGCCATACAACTAATACGTACAACAATATGTTGTACTAAAACCAA:1	-	chr3R	20469540	3'	-	roo	8666	2	59.59
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGATAAG:1	-	chr3R	25448309	3'	+	roo	9043	1	63.12
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTTCCTAATTTAATCAAGAC:1	-	chr3R	7835072	3'	+	roo	391	2	71.72
CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAAC:1	+	chr2L	18419260	3'	-	412	7095	2	51.03
CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTGATTTTATTGATTATAACTGG:1	-	chr3L	15519712	3'	-	pogo	25	1	71.92
TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCT:1	+	chr2R	14387993	3'	-	roo	77	2	77.04
AGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGT:1	+	chr2R	19540447	3'	+	jockey	4919	1	70.55
ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTATTAATTGAATTT:1	-	chr3R	17605663	3'	+	Tabor	407	2	75.76
CATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGTAGGCGTGG:1	+	chrX	21667965	3'	-	gypsy2	16	2	75.21
GGATCGGAGCAAGGTGATTAGGTGGCGTGTTGTTGGTATATGCCACGAACTCTGGGTTGTATCGATGTGCAGGGGATGTCCTTTGATCGCGTGTTCCTATATAGAACTTAAACTTACAGAAATCACACACTTTTAGTACCAC:1	-	chr3R	28927066	3'	+	accord2	279	1	59.15
CCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGCCCGGCAACACGTGTATGTCACG:1	-	chr2L	12290630	3'	-	1731	20	2	70.50
AGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATAAAAATATGATAACTA:1	+	chr2L	6007626	3'	-	1360	461	1	72.60
AAACTTTAAATTAACATTTTAAAATAAAGTCTAAATATTTTGGATAAAATTTGGCGTGCAACAAACTTAAGATTGTCGACGTCCAGAGTTTCCGAGATCTTGACAACTGTATCTGCAGATCGTCCTCCACGCAC:1	+	chr3L	14565189	3'	+	1360	3047	1	74.63
CTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGAGAGGTCCTTGAGGGATAACATCGAACAACAGCAACAGCCAACGTATCCCAATGGCAACAATGGGTATTTGCAGCGTCACAATTCCCTGCGCTC:1	+	chrX	6580737	3'	-	R1A1-element	5309	1	77.60
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAAGGG:1	+	chr2R	7898195	3'	+	roo	9037	1	58.62
GGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCA:1	-	chr3L	19013896	3'	+	invader3	267	2	73.64
TGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCACAC:1	-	chr3L	7943615	3'	-	Burdock	57	2	65.19
GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTCTATGTATCTATATTAAGAAAACGCACATATT:1	-	chr2L	20808348	3'	-	HMS-Beagle	6842	2	74.00
CAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTGGAGTGGGGCTAGCTGGCTAGCTGGTGGATGCCATACGAGCGTGACCCACTGGACCAAATACCA:1	+	chr2R	23332694	3'	-	invader4	2810	2	79.45
GGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTAAAGGCATGCT:1	+	chr3L	23702310	3'	-	G4	4	1	78.17
TTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCTCTT:1	-	chr2R	2016803	3'	-	1360	33	1	59.70
CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAA:1	-	chr3R	20469598	3'	-	roo	8724	2	60.96
AGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAAATTTGATTTGAATGCGTAATCGAAACGTATTGTGGGGACTCACAGATGACATGCAAAACCAGCAACCAGAAATCGGGAATTGCTGACAACGCACGGCTG:1	-	chr3L	10016820	3'	-	hopper	360	1	73.13
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGA:1	-	chr2L	7945334	3'	+	roo	335	2	72.66
GCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTAAAAAATTCTGGATGCGTCCTGAGCCGGAGTAATTTAGATGGTTTAACACTAGAAAAGTGGAAGGCGATTATAAATGCTCATAGCTTGTCTA:1	-	chr3L	26000285	3'	-	1360	146	1	60.96
TATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAA:1	-	chr3R	9714364	3'	-	Stalker4	45	4	54.79
TATTTTAGTAATTAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTGTTGTTTTTTTTGGAGTTCCTGGAGTTCCCTGAATTTTGGTTAGAATTCTCCGAACC:1	+	chr3R	21177708	3'	-	Doc	141	1	63.70
AAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTA:1	-	chr3R	17243109	3'	-	hopper	59	1	55.48
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAG:1	+	chrX	7256188	3'	+	412	422	2	71.11
TTATAGTAAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTTATGATAGTTGTTGCTTTTATGTGCACGAGCTCCTAGAATCTAAAGCCTATTTAATTC:1	+	chr4	1148647	3'	+	transib2	259	1	60.27
AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGTTTTGCTAGATTTTCCCAAAGCTTAATTGAGATTTTGACTTTTGATTATAAATATCCATCCATTTCAATCGGATTATTTATTAAAAAGTATAAGCAATTTG:1	-	chr2L	20139815	3'	+	jockey	4975	1	65.07
CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACCAATTTTTTTTATTAAATTTTTATTGTATATATTTTTCGCAGTGTTGGGCATGCATTTCCCTTTTTTAACAAGGGTTCAACGTCCCCAAGAGCACTTTCCTTACATT:1	-	chr3L	18555824	3'	+	jockey	4982	1	73.97
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGT:1	-	chr3L	20654472	3'	-	roo	8725	2	60.96
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGC:1	+	chr3R	19968213	3'	-	roo	8706	2	56.34
ATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGCTTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGGGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACATTCATCTAGCCCGAATTATTCCGGCAGTAGCC:1	+	chr2L	11618987	3'	+	1360	412	1	74.07
TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAAAGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAA:1	+	chr3R	17243231	3'	+	hopper	1371	1	52.05
GAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGAAACACTTTTATTATTTTATTAACTGCATATATATAAATGTGGCCTGCATTTTGTGTTTAGGGCTTACTTTGCTTGCTCTCGAATTTGT:1	+	chr2R	3900796	3'	-	1360	3172	1	56.85
TAACGGGTATCAGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTGAATGAATCATTATACCCCCAGTAAGAGCAGGC:1	-	chrX	20381392	3'	+	INE-1	552	1	78.07
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGC:1	+	chr3R	27994282	3'	+	roo	360	2	55.22
GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTTTACCAAGATTGTAGCCAAAAGGGCCAAATCTTGGTCCCACTTCAACTTGAGCATACGAGCTGCAATAGGTAGCCTGTGCATTTGACC:1	-	chr3L	17875739	3'	-	1360	31	1	63.64
AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAGAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACGGG:1	-	chrX	11471551	3'	-	hopper	44	1	55.48
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCT:1	-	chr2L	12892639	3'	-	roo	8750	2	78.08
GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAATAAAATGCCAAATGGCAAACGGCAATA:1	+	chr2R	24218625	3'	+	412	481	2	65.31
TGAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACAGAGCCAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGATTGAGTAACCACAGTTATCGTTTAACGTCCCAATGAAAGACGAAG:1	-	chr2L	22724074	3'	-	INE-1	135	1	79.72
GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACCAGTTGGGAATATATAAATACCTTTAGCACATTTAAGCTACCGTAAGAGGCAGCCAAACGATTTGGTAGAATTTTAA:1	+	chrX	10694568	3'	+	I-element	5312	1	47.95
AAGAAGGATAATAGTACGCTGGTCAATTAAATAAAATAATTTCGATAATAAAAAAAAAGTTTTTCTCTTGATATGCCACATTTTTTCTTTTAAAGTTAATTTGTGAATGCCATCGATGCGGGCAGTGCCATCCAGGGATCGGGAAT:1	-	chrX	16728139	3'	+	jockey2	3358	1	67.12
GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGCAGCACAAACA:1	-	chr2L	15832967	3'	+	hobo	2913	1	61.76
CACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAAGTCAAATGACTTAATATGACTAGTATTTACTCTTTTAGGAAATGCGAGTGCTAATGAGTTTTAT:1	-	chr3L	12769349	3'	-	1360	417	1	51.11
CATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAA:1	-	chr2L	4412566	3'	-	Quasimodo	75	2	70.55
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTA:1	-	chr2L	18294193	3'	+	roo	345	2	63.01
ACATATTATCACAAAATAAATTTCAATAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCCAATGCACTGCTGCTGTTAAGGCTGGAGTCCATTGG:1	-	chr2R	20579360	3'	+	1360	359	1	66.67
ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGCAAAGCAAACTGTCGAT:1	+	chr3R	14651268	3'	+	P-element	2813	1	26.15
ATTCTTATCTCTTAATGCTAGCTTATAAGTAAGAGCGAGATAGGGGAAGTATCAGTGCGTTATGTCTTTTCATGTATAAATTGCGAAGTAAATTCAAGTTAAATCATTTTCACTATGCTGAAACTTGAGCCAAAATCCAGGACATG:1	-	chr3L	20039793	3'	-	invader3	119	2	66.44
CATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTT:1	+	chrX	21667925	3'	-	gypsy2	56	2	65.29
CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTGGTAGGCTTACGC:1	-	chr2L	15833429	3'	-	jockey	10	1	76.92
GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAATGGAACCCGAGCATTTGCAAAGCAGCCAACCAACCAGGTG:1	+	chrX	2518132	3'	-	P-element	45	1	49.28
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTTCCTA:1	-	chr3R	7835085	3'	+	roo	9046	1	65.00
GGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTATAACACGGTATCATTTTCCAAGAACATGGG:1	+	chr3R	17478479	3'	-	copia	4919	2	53.42
TATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTGCATGTGTAGCTGTCATGTGCTTTTA:1	-	chrX	21585232	3'	-	mariner2	259	1	71.23
TCTCAACCTTCTAGATTTTATAGTTCCTGATATCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGTTTCT:1	+	chr3R	3586575	3'	-	INE-1	162	1	56.56
GAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTG:1	+	chr2R	23332639	3'	+	invader4	304	2	71.07
CAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAGAGCTCTCCGCATCTAAAATTCTCTCGGCTGCACCTAC:1	-	chrX	17832967	3'	+	Tirant	387	2	69.16
GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATACGTGGGCAAATGCCTGCCGGAAATCGTCTGCAATGTGCGAGATAACAATTTTCGTGTCCTGACCAAG:1	+	chr2L	2703599	3'	-	hobo	10	1	71.56
CGGGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGATTTATGCAGTGCTCAGCAGCAAATTGCAAATGAAACGCAATGAAACGAATCGAAACGGAATGAATTACTACTTATGCATGCATGTTCGCCACATAAACAC:1	+	chr3L	4948173	3'	-	hobo	15	1	74.29
ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGAGGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCT:1	-	chr3L	23728651	3'	-	HMS-Beagle	40	2	62.73
AAATATATTATTAAAAACTAAATATCAACAAAAAAAAATTTGAACAAAATGAAAGTCAAAATTTTTACGGGGAACACATAACAAGTAGATGCTGCTCTAAATAAGAAGCACTGTGATAAAAAACAATCAGATGCCACTCCAAATAA:1	-	chr3L	27390908	3'	-	hopper	161	1	40.41
TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATGTAAATGAAGTTGAATACAAACATACATATATTCATCGCTGAAAAATATGTAAATTTTATAGGGGCTTGAACGGTTGCCGGTAA:1	-	chr2L	10685284	3'	+	I-element	5321	1	56.16
TGCTGGTGCCTAAGCAGAGGCTCTGGTGACCGAGAACAAACCTCCGGAACAACCCTCAATGTCAGAAGCTGGTTCCAATTTCGACAAGGATTATGCAAATACGGAGCTTCACGATAGAATGGCACACACCTTAAAGTACCATACGC:1	-	chr3L	27382987	3'	+	Rt1b	234	1	57.53
AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACA:1	+	chr3R	29361022	3'	+	mdg1	7399	2	80.00
AAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTGAACGAATCTAGTATATATATCCCTATACTCTACGAGTAACGGGTATAACAACATAGGAGACATTGCTTCTTCCATCTATATAAACA:1	-	chrX	5853588	3'	-	INE-1	578	1	78.57
CCGCTTCCGATCTGCCTCTATGCTTGTTGCTACAGAGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCTACCCGAAAGCGAACAATGACTTAAAAAAATCGATTTGTGTGCCACAATTA:1	-	chr3R	29018959	3'	-	invader2	4988	2	73.68
ACTAATACAATTACTTCATATTGTAATTAATATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAATGCGAAAAAAAACAAAAATTTATTATCAATTCCAAATGG:1	+	chr2R	3550648	3'	+	Doc2-element	4670	1	80.82
AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAAC:1	-	chr2R	16785339	3'	+	412	7478	2	66.43
AAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTATAAACATAGATAAAGCTGATTAAAATAAAAGTGCAAGAAGTAGATCGGGCTTATCAATTAATAAC:1	+	chr2L	13582082	3'	+	pogo	1935	1	54.81
ATATGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAATTAAATTTAAAAATATGACATAGTTTTGATTATTTAAAAGGATATCATTTAAAATTACTGTATTATTTAACTATAAAGATGGTAACTGAGTTAAGTGCAAACTACTTACAAT:1	+	chr3R	6411407	3'	+	Juan	4201	1	74.66
ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCGTCGATACGGG:1	+	chrX	6499042	3'	-	Quasimodo	69	2	71.53
GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTC:1	+	chrX	9540125	3'	+	roo	9023	2	52.05
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTCGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTCTTTCGCAACG:1	+	chr3R	22844289	3'	+	roo	9033	1	51.16
AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCATGAAGTGAAGCATCACACTGCAGGATAAATGGTTTGTCATA:1	+	chr3R	524108	3'	-	blood	39	2	66.35
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGAATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAAC:1	+	chr3R	7100919	3'	+	roo	9037	1	55.47
TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGAATACAAAAAAAAATAACAACTAAAAATATTAGCGACACA:1	+	chr4	1152112	3'	+	transib2	2783	1	52.59
ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTCTTTCTTAAAATATGTTGTTACCATTATGCGACCAATACTTACTCCTATTTAAATATACATAATATGGTATTATCCCATATTAAA:1	+	chr3R	31720620	3'	+	pogo	2068	1	67.12
AGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGT:1	-	chr3R	3177923	3'	+	Stalker	273	4	84.25
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCA:1	-	chr2R	21907947	3'	+	roo	352	2	72.97
CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTGCCGAGAACACTTAATAAGATGCGA:1	+	chrX	10253302	3'	-	hopper	50	1	51.37
AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATAATTAGTTGAAATGTATCTACTGACTTAAAAGTGTAACAAATCTTACACGGGAGTTTCACGTTTCCTTATACATTAAATTCCCCGAAC:1	-	chr3R	17420380	3'	-	roo	8691	2	63.19
AATATCACTCATCGTATTGATCCGACTATTTTTCCTTGCANAAGATAGTCGGTCTCTTTTGTAGAGTTTATTCCGGGCTTCATTCGCATTTTCGCCTATTATTTAGTGAAATAGTATCATTTGCTACGCCTTGGCATAA:1	-	chr3R	28358244	3'	-	transib2	2354	1	61.15
GTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGAC:1	+	chr2L	13585916	3'	+	Tabor	411	2	66.21
ATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTATTTTATAGAGTGTTAGCCATGGCCGAGGGTTTCGACCTGTTTTGCATGTCTGGGAGTGTGACAA:1	+	chr2R	20710121	3'	-	mdg1	7065	8	49.09
TCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAAAGGCAGCAACACTATCGCTTCTT:1	+	chr3L	12879831	3'	+	roo	365	1	50.78
GCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATCACTACCAACAAACGAATAATGTATCCAAAATCTACTAAATAATAATCACAGTAATTGTGACATGCAGAATACAGGCATGGTCACAGATATATTTGAACCAGAAAAGAGATACA:1	-	chrX	21668258	3'	+	gypsy2	6806	2	73.97
CAAGAGCATACGTGTGCACACATATAGTTGTCTCCTATCAACTAAACCCACCAAACCCACCTTATGTCCTTCAAAATGGTTAACACAGCACTCCTATCTTCCTGGACTTGAAAGAAGCCTTTCATATTTTTTTATTGTATAAATTT:1	-	chr2R	11789793	3'	-	1360	179	1	24.66
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGGGTACTTATTGTTTGTTTTCAAGC:1	-	chrX	10639965	3'	+	roo	396	1	73.97
CGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATATATTTCATGTTCACAACACTGAGGAATGTCAGGATGATAAGTCAATAGGACGTACGATAGGCTTGTGTTGGAAGAGTACATCGAGTATCAGCAATGTATGCATGTTCAGCAATCCTA:1	-	chr2L	23011034	3'	-	transib2	369	1	67.12
ATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTGAATTGGAAACATAAAACAAAATTAATACCAATGCGAACACGATTAAAATAGCAAATTGAGTAACTTAAAAAGAGAAAACTG:1	-	chr2R	7595041	3'	-	I-element	5339	1	70.59
CTACGGACCGACGGCAAGTTATTATATTATATTATTTTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGCTCCCTCCACATGGTTATCCCGTTCGGGTAAATCATCCAGCACGGCCACT:1	+	chrX	21501675	3'	+	G-element	38	1	36.30
GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACTATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATA:1	-	chr2R	24218556	3'	-	412	7096	2	70.53
TGATATTTAACAAATGACTGATCATTCATACATACAAATTTATTTCGCTTTAATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAAT:1	-	chr3R	4357559	3'	+	Tc3	1615	1	74.66
AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGTGTGTCTTGGACTCTTTGGCCATCCGGGATATCATTTAATGTTGTGTATCTTCTGGTGGGTTTCTCCCTCAGTGCAGCCGAAATTGGCTT:1	+	chr3R	17531480	3'	+	1360	3369	1	69.12
TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAA:1	+	chrX	21087659	3'	+	mdg3	5496	2	59.46
CCTATGGGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGC:1	+	chrX	6499013	3'	-	Quasimodo	48	2	78.43
AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCTACCTGAAAATCGAAAAATACAAAAAA:1	-	chrX	8814708	3'	-	pogo	39	1	50.68
GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATATCTGGGCGGGAGATACTTGGACACGCGCACGCCTTCG:1	-	chr3R	17316249	3'	+	opus	7431	2	71.83
AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAA:1	+	chr3R	14940159	3'	-	jockey	75	1	70.31
ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTG:1	+	chr2L	11661014	3'	-	F-element	55	1	51.20
CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCC:1	-	chr2L	13585847	3'	-	Tabor	6885	2	61.95
TACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGCAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTTA:1	-	chr3R	18339047	3'	+	roo	386	2	67.12
CTTTTCGGATCCCTCCAAACATGTTTTACGTGGCGGGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTAGACACCCACATACAACATGCAACTATAAAGCTC:1	+	chrX	12646075	3'	-	R1A1-element	5328	1	70.48
TTTATTTATTTATTTATTTGTTGCAGCTATAACCTTCACTGAGTGATATAAAGACCATTCTGAATATTGGTTTTAATCAGCAAGTTTTAATTTAAAACTTTTAAAACAACTACAACTCAACTTACTCTACAAAGAGTCCACAAAGT:1	-	chrX	19762573	3'	-	Juan	4214	1	54.79
GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGTGTGTAATCATTCTATGATTACAAATGTTTAATGCATTTCCTGAAATAATTTTGACGGCTGCTCTCAGTGAGCACTTCGCTCACTC:1	-	chr2L	13584613	3'	+	pogo	2100	1	74.14
ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTC:1	-	chr3L	10848674	3'	-	blood	76	2	77.34
TCCTGACCTATCCCACTTCCTCCCTCCCCCCCCTTTCAATCCCTTCTTTTCGGCC:1	+	chrX	19128898	3'	-	invader1	3582	1	87.27
ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCT:1	+	chr2R	2427617	3'	-	Doc	65	1	63.01
AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCCA:1	+	chr3L	4605726	3'	-	pogo	41	1	54.89
ACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACGTAGCTGCTTATG:1	+	chr2R	4601666	3'	-	HMS-Beagle2	3	2	79.82
AATCGAACTGGAGTCGAAAGGCGAACACCTCATGTCCGTTGTTGGTGCATGGGGAGCGGAGGTCGGCGTTGCCGTCTATACCAGCAAGAATGCGATGCTGCTGCTGCATTTTG:1	-	chr3L	3400735	3'	+	R1-2	2734	1	79.65
CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGATGGCATTAACTAATAGGTATGGGATAGC:1	-	chr3R	9210572	3'	+	mdg1	411	2	76.71
GACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATG:1	-	chr3R	9921973	3'	-	blood	59	2	60.96
AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTT:1	-	chr3R	19589888	3'	-	BS	5031	1	57.53
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTCTTCATTCATTTCTTTTTTTCAGTGC:1	-	chr3L	11393439	3'	-	roo	23	2	67.81
AATAGATCCGACTGAGTCGCAGTACACATACATTTCCTGAAATGGATGGATAAATGGATAGGTGACCTCATCGCCCTATTTCCATTTTTAAAATGTTCTTGATCATATTTGCTTGCGGC:1	-	chr3L	24158120	3'	+	baggins	5404	1	71.43
TGATATAACATAGTAATTATTATGTGGCTAAAATTATGCAACAATTTAGTTTAGAACGTTGACATGTGTGTTAATTGTAATACTAGTGATTTGTGATTTTAGAACTATACTGATATTTTCCATGTTCCTTGTTTCCATTTTAATGT:1	-	chrX	18196473	3'	-	jockey	4839	1	76.71
AAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTCTTCGTGCCTCTACTTCTAAAATGTAACTGTGTCTTCCTGATGCACTTGGACTCCTCTTTTTGCTCCAATAAAATATGGGGTGCAATTGATTTTC:1	+	chr3L	24206522	3'	+	1360	441	1	64.44
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTG:1	-	chr3R	25448316	3'	+	roo	9037	1	60.00
ATTACATAAAATATAATATTAATTACTAAGACCATCTACCTTAAAATTGTTTGTTAATCACTATTATTATATTGTAAGTATAACGCTTATTGAACGAATTAAAGGCGGCTCTCAAATGCTTATGAAGATATTATGAAAA:1	-	chr2R	18236588	3'	+	Burdock	403	1	74.10
AGTAATGGGTATCTGTTAGTCGGATAACTCCAAATATTTAATTATTTAAATTCGAAAAATAAAATCTATTATTTGAGAAATAGTTATTGCAAATATTTTATTGCTTAAAAATTTATAAAATTAACTCACAAATAGTTGTCATGGGA:1	-	chr2R	9423710	3'	+	INE-1	550	1	78.08
AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGTAGAGGTCAAAGTGACCGGCGTAGAAGG:1	+	chr3R	1433244	3'	+	mdg1	396	2	64.39
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAG:1	+	chr3L	15600340	3'	+	roo	9046	1	48.00
CAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGT:1	+	chr2L	11660994	3'	-	F-element	95	1	70.34
GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTT:1	-	chr3R	25423194	3'	-	3S18	21	2	58.18
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGG:1	+	chr2L	7945397	3'	-	roo	8729	2	70.23
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGGTAATAAACTAAAAATAAAGTCAATTATTACGCAATTAAGAGCAGTTGACTTTATGCGGTGG:1	+	chr3R	28624660	3'	-	roo	58	2	61.81
AGAGAGAACGCTATAGTTGAGTTGCTCGACTTTCAGATATCCGTTACTCAGATAGTGGAAGTACGAGGCAGACATTTCAAAATTCATTGACATATCGATGGAAATGGGCAAA:1	+	chr4	1248961	3'	-	INE-1	576	1	84.82
GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGACCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGGCGTGGTCGAAAGG:1	+	chr2R	2016938	3'	-	1360	4	2	76.15
TTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAAC:1	-	chrX	2842497	3'	+	Tabor	7253	2	64.38
GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCATCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTTTTTCTAAACAGATGGCATTTCGATTTGAAGATCTGTTT:1	-	chr2R	16785277	3'	+	412	487	2	76.98
GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGACAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATG:1	+	chr3L	17115555	3'	-	blood	25	2	59.35
GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGCGAAACAAAAATAAGTGAAATG:1	+	chr2L	544890	3'	+	412	7514	2	58.96
AACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGCTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACA:1	-	chr3R	14981152	3'	+	mdg1	7399	2	57.53
GTGTCGCGACTATCAGATACCCGTTACTCGATTAGCAGAAGTGCTTACCCAATTCTAAACACCCTTACTGGCCATCTAAATATTTAAATTTTTGTATAATAACAAAAACTGGGCTTTTTAATACATTACTTTAAAATTTCAGATAC:1	-	chrX	17816558	3'	-	INE-1	556	1	42.47
TAATAATAATAATAATAAAAATTGCGTATAATTTGGCCCCTTATGATTTGTTAAGTTTCTGTTTTGGAAAATGGGATGCTGAGATAGCCCTGAACAGGTGTAAGTCGTCCTACTACACTATGACACAT:1	+	chr2R	10813744	3'	+	mdg1	39	11	80.47
CGAAGGACCAATTTTTATGTTTATAAATAAAACCGCAAGTTTTACCTCACCTTAACTTTCTGGCATACTTCTGGCACACGCACATTGCTAGGAAAATTGTTTTCTAAATACCCAAGCAAACTCCG:1	+	chr3R	25422174	3'	-	3S18	357	1	40.00
TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTACATGAAGTATT:1	-	chr3R	17243068	3'	-	hopper	18	1	73.29
GGACTTATGGCATACAGCTCTGGGGTACTGCCAGCACCTCAAATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAATATTAAGACAAATTGTTAATGCACCATTTTAAGCACTGCGAAATCAATTACGTCCAGTTTAATGGCTG:1	+	chr3R	5440071	3'	+	G4	3430	1	71.33
ACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAATAAT:1	-	chr2L	12569980	3'	-	micropia	35	2	60.27
GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGCGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGA:1	+	chr3L	7588481	3'	-	hopper	76	1	73.88
AATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTAGCTGATGTACAATGAAGGGGGGGCGTGGCAATAGTCCTGGCATTTGGCGTCC:1	+	chr3R	22217934	3'	-	hopper	44	1	53.60
GCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCCC:1	+	chr3L	8249127	3'	-	jockey	4545	1	56.73
TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGGCTGGCGGTCAATTTATCAACCCCAACCTTAGTGGGTAGTGACCGAGAGATGGTCACGTGTCTCAAGTCGGCACCAAAATAGCCGCAATTCATACCAGAACA:1	+	chrX	23155308	3'	-	blood	18	2	70.34
AGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTTGTTCCTGTGCTAGCCTTCTTTATTAACTGGGTTAT:1	-	chr2R	17305857	3'	-	Max-element	370	1	74.10
TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAGACAATTCACGCAATGAGCTTATCAAGCGAC:1	-	chrX	4214890	3'	+	flea	5002	2	75.34
TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATGTGTGGCAACTCTGCGCAGCACTGCATTTGTCTGCTGCACTGCCGC:1	-	chrX	1899626	3'	+	P-element	2824	1	37.68
GGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTAAATTTTGTGTAGCAT:1	+	chr2L	6570023	3'	-	jockey	4855	1	59.59
GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACG:1	-	chr3L	18596620	3'	-	Doc	78	1	67.81
AAAGTTTTTACTTAAATTTTTTATATTATTTTTGCTTGGTTTTCCCAACTCACTCCCTTTCTGTCTTTGCAGCTTCCTGCAACACTGCACTCATAACTATATTTATTACACATTCATACTCACATCCTTTCATCGCTTTCAGATAC:1	+	chr2L	17052470	3'	-	mariner2	792	1	58.90
CTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAAATTTGTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTTTA:1	+	chr3R	29011379	3'	-	1360	430	1	60.74
CAAGAAAATAAATATAAAAAAAGTAAAGCTTACAACAAAACAAGAGAGCAAGTCAATAAGCCCCCACTAACTGAAATGTATATGGAAAGCAGGAAAAAAACA:1	+	chrX	6792230	3'	+	Tc1-2	479	1	76.47
TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAA:1	+	chr3R	16404557	3'	-	pogo	65	1	67.14
AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTGCAATTAGACAA:1	+	chr2R	19540483	3'	+	jockey	4955	1	54.79
AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGCCC:1	+	chr2L	14892314	3'	-	transib2	53	1	56.94
CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTATCCCCC:1	+	chr2L	19965075	3'	-	Doc	59	1	50.00
AAGCACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGGAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATT:1	+	chr3L	7188615	3'	-	hobo	73	1	69.66
AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACGTTGTCCAAAGATAACGAAACAACGATACATTACAATAAATATTACAAAATTCTTGCAACGAATAAAAACTCACTCGAATTTAG:1	-	chr3L	22863352	3'	-	412	34	2	60.69
CAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGGGGTGGGTTTTCCACAGG:1	-	chr3R	4133714	3'	+	Quasimodo	6932	2	79.00
GAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGACAGCTGAAGGATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAA:1	+	chr2R	20194304	3'	-	Max-element	47	2	50.74
GGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTTTGGGGTTTCGGTTTTGCTTCCCTGCTATTTTTTCGGT:1	-	chr3R	23661036	3'	-	I-element	4965	1	73.97
TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGCCCGATGCTGCGTGACACGCAAATCCGACACGTAAAAT:1	+	chr2L	14892349	3'	-	transib2	13	1	75.54
GGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACGAGACTTTCGCTTTATTTTTTGAAAGCGGTAAAGCGGTAAATTAAAAACTATATGTCTATGAAAATCTGTCTATAAAAATATGTATAATTTGATTAAATTAATTT:1	+	chr3L	23287154	3'	-	X-element	453	1	57.53
AATAAGGCCAATAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGGTACACTTTTTTGTCCGCTTCTTAACCGTTTGGTTAACCAAATGTGGCATGAGGAATGCCCTCAAGTGGCCAA:1	-	chr2L	18930534	3'	+	Circe	7215	2	66.36
AATATTAAAATTATTTAATTTTAAAATGCGTAAATTTTGCGTAATTTTAAAATAGTAAAAAGATATTTTGATTCGAAATTTACATAAATAATATTTTAGTCGTCTGATAATGTTTCTTTTTGGGAAAAATCAAAATGCCAAAAA:1	+	chrX	21044129	3'	-	1360	3031	1	77.08
ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTA:1	-	chr3R	28758286	3'	+	mdg1	378	2	49.64
AATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAACTTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATA:1	+	chr3R	20868201	3'	-	BS	5062	1	64.38
ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATAATTATCCTGCGGGAAAGGGGAGTTGAGTCCACACATTTGGGTGGTCAGTGACCGACCAGAGTGA:1	-	chr3L	20888660	3'	+	1360	3374	1	71.43
CACAGCATTTCTTGCAGCGTTAAGCAACACTACGAATAAGAAGTGTCAGCTTCCCGCTGCCAAAAGTTCTGACGCATCAGCTTTGTTTAGGCCTGCGGAATTTTAGCTACAAATTCACTCGAAGAGGGTATTT:1	+	chr3L	19316642	3'	-	gypsy	7130	2	51.13
AAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGG:1	+	chr3L	16343294	3'	+	roo	368	1	56.36
AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCTTCC:1	+	chr3L	12308390	3'	+	hopper	1393	1	56.10
GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTT:1	+	chr3L	10574402	3'	-	Tabor	37	2	51.37
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTA:1	-	chr2L	18294193	3'	+	roo	9016	2	61.15
AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTTGTTGGTGCTTAATATCCAATTAAATACGCATACATATATGGAAAACAGAA:1	+	chr2R	652393	3'	+	copia	254	1	47.26
GAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAAAATACTCGCTCACTAGAGCAATGAAGCG:1	-	chr3L	27349077	3'	+	roo	261	2	76.86
ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCGCGTTTAATTTTCTCACCAAACTAAAATGTTTTCGGTGGCAGAGTAG:1	-	chr3R	11083853	3'	+	412	483	2	73.77
AATTTGTATGTATGCATAGAACACACTACGAAAAAACATATTTCTACTTTAAAATGTACTTTAAATCTATATTTGTGGCGAATCGGTTGAACTAAAAATATGAATACTTTTTTGGTGAATGGTTCGGTGTAGGCAGCATAGGCTGT:1	+	chr2L	21028869	3'	-	Tc3	1634	1	71.92
TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCGCCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATC:1	-	chr3R	6290973	3'	-	Doc	81	1	71.23
AACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAGAGAAGATTCAATAA:2	-	chr2R	5284496	3'	+	Doc4-element	2635	1	74.66
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAACATGATTGTAAATCAAACTCACGC:1	-	chr3L	11530882	3'	-	roo	54	2	64.44
TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCCCTGCTTCGATTCCAGCTTTGGC:1	-	chr2R	19050135	3'	-	roo	8	2	77.24
CGATTATTTGAAGCTTTTCCTTTAGTGTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTCACCCATTTTAATAACTTTATGTGTGGAAATATTTATCGATAATTTTACAAATTAGAGGGATATAAAACAATTTGGTATATTTTCATTTCATACC:1	-	chr2R	6085637	3'	-	pogo	376	1	50.68
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCCTTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAATTATACT:1	-	chr3L	20831247	3'	+	roo	9041	1	63.70
AGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCAGTCGACCATCCGTTTAATTCGTTACACGTTACAAAGTTATAAAATCAACATAATATCATGTTTTTATACCAATAATATATATTACACC:1	-	chr2L	15227281	3'	+	gypsy12	10144	2	58.46
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCAG:1	-	chr2L	17420114	3'	+	roo	9046	1	65.75
AAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAGGCATATGCCTGGCGCACAAACAACGCGAATGAAAGAAGTCAGGGGCGGAAAAGTCGACGAACAGCAAAGGAAATGATTTCACTTGATTTTCATATTTTTATTATGTTCCCGCCGGGC:1	-	chrX	6215015	3'	+	Doc2-element	239	4	80.71
CTGCATATTGCAAAACCAATGTTTCTAAAGTTAAGAAAACACTCAAGTTGTATGAAAACAAGCGAAAATTATAAACCGGATTATCCTGCGATTCATCACTACGGGGGCGTGTCTCTCAGAAAAAGAATCGTCTGCAAAT:1	+	chr4	872712	3'	+	1360	3352	1	73.38
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCACGAGCCTGACATGTGTCATATGC:1	-	chr3R	31817402	3'	-	roo	8686	2	69.18
GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATT:1	-	chr3R	20499732	3'	-	mdg3	31	2	60.61
AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGAATAC:1	+	chr4	1152078	3'	+	transib2	2747	1	74.26
CGTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTACATCTCG:1	-	chr3R	28758279	3'	+	mdg1	399	2	40.80
CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCAGAGCCGG:1	+	chr2L	3886282	3'	+	roo	9059	1	74.07
TTATATTTTTGAACTTTTAAAAAACTTTGCTTTTAATTTTATCTTTTTTAACTTTAACTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTAACTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1	+	chr4	1294995	3'	-	TAHRE	15	1	45.69
AAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATA:1	+	chr2R	20194276	3'	-	Max-element	85	2	73.29
AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAA:1	+	chr3R	10266146	3'	-	1360	70	1	72.66
TGTTTAAAAAAAAAAACAAAAATTGTG:1	+	chrX	10315377	3'	+	TART-B	10632	1	77.78
AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATG:1	-	chr2L	14892221	3'	+	transib2	2764	1	66.41
ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGTTCTGTGCATATTTTTTCTAAACAGATGGCATTTCGATTTGAAGATCTGTT:1	-	chr2R	16785278	3'	+	412	483	2	76.06
AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGTTCGTATTCGTT:1	+	chr2L	11661044	3'	-	F-element	20	1	58.33
TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGTTTTTGGGAGCGATCACTTTAAGTCCCAATATTACTGACCTGACCACCGATCCATTAAACATTT:1	-	chr3L	15995897	3'	-	297	24	2	61.31
CATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTTATTTATTAAGTCATTTGACTTAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1	+	chr3R	1202714	3'	+	1360	282	1	56.16
GAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATATATAAAACGTATTTAATCGATGAGAAGCCAACGAAGAACGAGCTGGAAAGAGCTTAGATAATATTTCCTCTTT:1	+	chrX	17501324	3'	+	baggins	5002	1	61.64
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCT:1	-	chr3L	21817982	3'	+	roo	356	2	63.78
AAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCTCTTTCAAACA:1	-	chr2R	2016796	3'	-	1360	38	1	59.59
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTT:1	+	chr2R	16785405	3'	-	412	7121	2	71.21
GGGCCGTGCGCAAAAGGGGAAATAACGGTATCCCCGCGGCCTATAAAGGGACGGCGCAAGCGCAGCTCGAGACAGTCAGCTCCAACATGCGATGAGCCCTACGTACGCGA:1	+	chr3R	1362858	3'	+	gypsy8	303	1	94.55
TGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACG:1	-	chr3L	4840741	3'	-	jockey	4733	1	64.84
ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGC:1	-	chr3R	14651197	3'	-	P-element	33	1	55.00
CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCGG:1	+	chr3L	16750758	3'	-	Tirant	42	2	52.27
GTGTGACGCATAAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGTGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1	-	chrX	7978952	3'	-	hopper	72	1	68.84
CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGCTGGGTGATTAGCACCCC:1	-	chrX	13126441	3'	+	jockey	4948	1	53.28
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGC:1	-	chrX	5274296	3'	-	roo	8706	2	55.83
GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGAAGTCTCGGAACTTCGATC:1	+	chr3L	3863546	3'	-	blood	7057	2	54.11
GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCC:1	-	chr3L	2325712	3'	-	I-element	5141	1	64.38
ACAAGAGAGATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGAGACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGT:1	+	chrX	15946771	3'	-	INE-1	579	1	53.57
AACGGGTATCTGATAGTCGTGAAACTCGACTATAGCCTTATCTCTTGATTTTTCTACATTATCAAAAAAGAGCAAGTGAACCGAAGCGCACCGAGAAAATGCCTTCCAACGATAATGAAGAGTTTTTACTTGTTGATGGTCGGAAC:1	+	chr3R	6291267	3'	+	INE-1	553	1	56.16
CCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGCCAAAGAATAATTTCTTGCAGGTTGAAATAACAGCAGCAGAAC:1	-	chr3R	1022791	3'	+	Doc	4492	1	54.12
TATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTT:1	+	chr3L	24208205	3'	-	Quasimodo	58	2	65.00
ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCTGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAAAGCTTCCAACAGGGAACTA:1	+	chr2R	24561549	3'	+	P-element	2853	1	56.62
AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGCGCAATGAGTTTTCATCT:1	+	chrX	5662914	3'	-	P-element	91	1	17.04
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTT:1	-	chrX	9540006	3'	-	roo	8719	2	58.90
GACCAAGAACACAACAAACAAAGCGAAAACAAGAAGATCCGTACTCGTGTTATCAAGAAGGTCAAGGGTGACAAGCAAGAGGTCACGAAAATTGAAACCGTCGAGGAGGACGACAAGCAAGCGGAAACAACGGTAACAGTCGAAGA:1	-	chr3L	2063479	3'	+	gypsy4	478	1	76.71
TATTTTTTATATTATTATTATTATTTCAAACAAACTAGGATTTACAAGATGTTTAAATATTAAAATAACAAAATTATTATATTTATTAAGTGTGTTACACATTGATAATTTAATTTTGTATGTTATATATCTACTACTGCATTCAT:1	-	chrX	11627137	3'	-	mdg1	7078	2	78.77
GTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAAGCGTTTTTTCCACCATATCTTCTGACCCTCCTTTCCCGCT:1	+	chr3R	22157770	3'	-	blood	341	2	69.23
GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCC:1	+	chrY	311346	3'	-	1360	73	1	77.88
GGACCGTTTCTGGAACGTGCGCGAAATGAAGAGGACGATCCTGATGTCTAGCCGGCCAGGGATACCTTTGCCTACGCAAGGGGGGGGAGAATGTTCACGCCAGAAGTTTTCGACCTGTTCATCTGGTGCCTCAAC:1	+	chr2L	7545287	3'	+	Max-element	8145	1	78.52
ATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTAC:1	-	chrY	680448	3'	-	invader2	41	2	71.23
AAAATAAAATATTGCAAAAAAATTGTAAATAAAGATAAAAATGAACTTGAGCTAGCTAAGTAACTCATGTAACATAATTTCATTTATGCTAAATACTGAATAATATTGAACATATATACCATTTAAAACCTACTGCTAAGTCAATT:2	+	chr2L	6844508	3'	+	HMS-Beagle2	394	1	42.47
TAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAAT:1	-	chr3R	7482708	3'	-	412	4	2	76.72
TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAAGAATGAAAAGCCAACGAGAAGGAAAACGGGTAGGAAAAGGGCCAGGCCAGGCACTTGGTTAGTCGCAAAATCCGGAGACGCTTGCAGC:1	-	chr3L	4755182	3'	-	jockey	4697	1	65.25
AGCTTATACATTCATACACCCATCCTTACTATATACCCTTTTAGTTTACGAGTAACTGGTATAATAATCAAGGGCCACAATAAAAAATAGAACCAAGCATAGGCTACCTCCCCTTAGAAGGAGG:1	-	chrX	21088198	3'	+	mdg3	5332	2	69.35
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATACTGAGACTGTAGTAA:1	+	chr2R	6173100	3'	+	pogo	2052	1	58.90
ATAATTTAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGACAAACATAAAATAAAAATCGGAGAGCATCTCACCCAACTAGAGTGTCCCAGGAACTCCGCCAGGGGTGTAGGTACAAGGCAACCCGAGGTGCAAACACCCA:1	-	chr2L	18091749	3'	-	Cr1a	76	1	51.43
AAGAATTCAGAAAATTAGTCAAAACACTTAGTAATGATTGTGTGAAGTACCACACCGAGGAGCGGAGCGCATGCTGTATTCGCGTTTGCGTGACAAAGGGAGTGGGTCAACAATCCCAGAAAGTTG:1	-	chr3L	26344956	3'	+	G4	300	1	58.73
CAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATATAATTGTTTATTTTTTTTTATTTGTTGTTTAAATGGATTCCGGATCGCTCAATGATTACTCTTA:1	-	chr3L	25106524	3'	-	F-element	47	1	65.81
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTACTGA:1	-	chr2L	7888099	3'	+	pogo	2052	1	58.90
CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGGTTCTCCGTTAGTTTATGTGTACATAAGAGCTCAACATCAAAATCAAAAATTTGACCTTTTCAATTTTTTCTAATTAAA:1	+	chr2R	5311576	3'	+	1360	3378	1	39.04
TTATATAAAATAAAATAAAATACTAAAATAAGATAAATTTTTGCATACCAAACCCTTTTAAAATACATGTGTATGCTCGTTCCAGTGAAGCCATCTCGAATCATTGCTATCTCCATCGTCTTTTCCTTTCACAGTTGACA:1	+	chr3L	16759877	3'	-	transib1	1904	1	85.71
TGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTTCATTGTTATGGCCGTAATGAAAATGGCTGCA:1	+	chr3R	29397498	3'	-	jockey	4614	1	71.68
AAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATAT:1	+	chr3R	17605716	3'	-	Tabor	6917	2	68.49
ATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACCAGTTGGGAATATATAAATACCTTTAGCACATATAAGCTA:1	+	chrX	10694531	3'	+	I-element	5275	1	73.29
TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTC:1	+	chr3L	233308	3'	+	roo	321	2	79.45
GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACCCCAATAACTTTTATTAGGCTAAGTACAGAGACTTTTC:1	+	chr2L	22775617	3'	+	pogo	2079	1	69.18
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACG:1	+	chr3R	22844289	3'	+	roo	399	1	69.00
ATAAAATTGAAATTAAAATTTTTCAATTTTCAACTCATTAGTCATCACAATAACAAAACTTAACCAAAAAACATAATGTACATTAAATAGAATAGAACTTACATTGTCGTCCAATTGCCTTTAAAAAAAGGATTAAAAGT:1	-	chr3L	16942130	3'	+	1360	3045	1	88.57
AGAAAAAGAAAAAAAATAAATAATACAACAATGCACGAAAAATGGCAAGAAAATTTTAGATGGCAACAACATAAGGTCAGCACGCTGAACCAGTGGACGCGAAATTAGTTTAACAAATGTAAATGAGAGAAAGAAATGGGTGGGG:1	-	chr2R	18937262	3'	+	Doc2-element	221	1	78.62
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCGTTAAGGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCG:1	+	chr3L	9998218	3'	-	roo	8706	2	54.79
TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAATTGTGAACGATATTTTTTTCACCTGCACAAC:1	-	chr3R	26659708	3'	-	HMS-Beagle2	6899	2	68.97
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTT:1	+	chr2L	14772104	3'	-	roo	8716	2	70.64
AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTC:1	-	chr3R	10462629	3'	+	opus	459	2	70.19
AAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACAGCTGACCGCAAGCCAAAGCCAGAGCTCCTGGAAATAGGGAAAACC:1	-	chr3L	3501431	3'	-	opus	498	1	65.85
ATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAA:1	+	chrX	21667922	3'	-	gypsy2	6556	2	69.23
GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAACCTTTGCTTG:1	-	chr3R	14651170	3'	-	P-element	16	1	71.54
TAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACC:1	+	chr2L	20840512	3'	-	Transpac	62	2	59.59
ATACCCGTTACTCAACTAGTGCAATAATAATAATTTTTCTGGGATATCGATAGACATTGGTGAAGAAAATGAGAAAAATATTTCATGTTAGATATCGTATGTGTTTTATTGTTGTGAGTCGTCAATAGGTACCGATGTGTATGTTG:1	+	chr2L	22995757	3'	-	INE-1	540	1	45.89
AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGAAAGGCCAAAG:1	-	chrX	18030262	3'	+	opus	7478	2	59.38
CTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGGCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCACCCGTGTCATGCACACCTGGAGCACAATTCGCCC:1	+	chr2R	23593528	3'	+	Doc	347	1	65.35
AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTACAGACATTGAAGGTTTGTCTCTCCA:1	-	chr2L	15833028	3'	+	hobo	2885	1	75.73
AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTATCAACTTTTCCCACACATCGCATCCACT:1	-	chr3L	21855434	3'	+	blood	7335	1	55.71
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGC:1	+	chr3R	7835203	3'	-	roo	73	2	68.49
TATGCTCGCAACACCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGAACTGTTAAATTAACTTATGCGGGCTAAAACATTGGACAATGCTCGACATGGGTCCTGTTCC:1	+	chr3L	17290906	3'	+	hopper	1254	1	72.64
AAGAGGCGAAAACATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTCAACGAAAGTGTTTGACTTTGCTAGCGCCGGGCATATTGTCTTACCTTTGTTCATATTTTATATTATTGCTTTAAACTTGCT:1	+	chr3L	10015396	3'	-	hopper	317	1	60.71
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTC:1	-	chr2R	9632112	3'	-	roo	71	2	70.50
GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGTCAGTT:1	-	chr3L	10574270	3'	+	Tabor	7276	2	49.32
ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATACACCCACAATTGACTGATTGATGCAATTCCATTGGGGATTGGGGTGGACCTGTCGATCAAGCTGGCTTTTCTCCGC:1	-	chr2R	21299589	3'	+	jockey	4969	1	54.33
CAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCATCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:1	-	chr3L	23112567	3'	-	R1A1-element	25	1	63.93
AAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAACACCGTGGATGTGAAGGCGGGTCAGTGTGGCGATGCCTACGCCTATATTCCGGATCTGGTGTACCGGCGCCTG:1	-	chr3R	12994126	3'	-	Transpac	4986	2	54.07
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTTGGCAC:1	+	chr3R	18582279	3'	-	roo	23	2	67.14
GCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTTTAAATAAATATTTGCCGTCCAGGCACTGACCTTTTGGCCTCATTGCGTCCCCTGCAT:1	+	chr3R	27422944	3'	-	blood	7219	2	61.00
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGG:1	-	chr2R	8585408	3'	+	roo	9039	1	61.48
GTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATCTTCTTGATCTTCTTATCAACGCGTACGTGCAAATCAAAAACATTTCACTTAAAGAGATTCAATCCCTTCAAAAGCTTACCTACTA:1	+	chr2L	2246179	3'	+	Ivk	51	1	71.92
AATCGGATTGCATATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCGAATCAACCTAAACAAAACGTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATCTGTTAAAAAAATCAATTTCCTTTTATCAAAGTCTTTATTCGCCATAAGTAAAATATGATCAGA:1	-	chr3R	4357508	3'	+	Tc3	1667	1	47.26
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTACATGAATATTTTATGGTAAAAACTACAAAGACATTTGACATT:1	-	chr2L	18294138	3'	+	roo	388	2	56.16
GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGCTTAG:1	-	chr2R	19499311	3'	+	P-element	2847	1	47.06
AAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTGGGGGAGAATTTTTCTGGGATTGCAGAATAAAATGAGAATTTTTCTTAATTGTGAGTGTGACCGTTTTGGAGGGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGTATAC:1	+	chr4	976488	3'	-	INE-1	558	1	55.56
AACACACACACACATTTTCACACACGAAGCTCGTATGCAATAATGTACAAATATTTACGCACACACAGAGGGAACACTTTGGTTTTCTGTGTGTGCGCTGTTGCTGTTGTTGTCACTTTCACATCTCGCCCTTCT:1	-	chr3R	25709706	3'	+	accord	188	2	80.00
GGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATG:1	+	chr2R	15064423	3'	-	412	77	2	71.03
TCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAG:1	-	chr2L	12290677	3'	-	1731	56	2	60.94
AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTT:1	+	chr3R	28075427	3'	+	jockey	4954	1	56.85
TTTTATGATTTATATTTTATTTATTTTTTATACTACCTTATTATTTTATCACCTGATTATCATTCAATCTCATTAGATAATAGAAATCCGCAAGGAGTTTGAAAAAAACATATGGATGATATTGTTTTAAAAATAAGCATTTGGCC:1	-	chr3R	21596947	3'	-	copia	5058	2	69.18
AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACAT:1	-	chr3R	15072548	3'	-	pogo	49	1	54.48
ACCTGACTGACCGGAAATTGACATAAATCAAATCTTATTAATTAAAATCTTCCAAATAAGATTATGAAAACGTACAATCAGTAAATCGGTAAAGTGGTTGTAATTTTCTTTTT:1	+	chr3R	25081641	3'	+	jockey2	3196	1	49.56
ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATACAAAGCATTTTTCTCCGCAAAGA:1	-	chrX	3309623	3'	-	jockey	58	1	60.00
ACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACAC:1	+	chrY	418176	3'	+	Stalker	7176	4	79.17
TGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCAT:1	+	chr3R	28075443	3'	+	jockey	4970	1	66.44
TCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATAGAACCATCGAAAGCAGCTGTGACTGCGAATCTAGAAAACGCATGTAGAGAAAGTCAACTTACTGTCTCAGCGCCCTCGGC:1	-	chrX	823580	3'	-	1360	315	1	53.10
ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGCAGCCCTCCTCGTCCCAT:1	-	chrX	13504123	3'	-	412	12	2	73.17
TAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAAG:1	+	chr3R	3286151	3'	+	gypsy12	9830	2	73.97
ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATA:1	+	chr3L	17115547	3'	-	blood	56	2	53.42
TCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAAATCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACG:1	+	chrX	6486795	3'	+	roo	353	2	61.54
AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGTATACGGGTATAAAAATATTATATTGCTTTTCTATTTAGTAAGCATTATTTCAAGCCTCATAGATA:1	+	chrX	22511433	3'	+	1360	3345	1	58.90
TGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAATGCTTTGGGGCTTGCTA:1	+	chr2L	13585942	3'	+	Tabor	436	2	51.37
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGGTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATG:1	+	chr2L	3114555	3'	-	roo	8696	2	62.11
GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTAC:1	-	chr3L	16015250	3'	-	1360	50	1	67.54
TTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGATTCTTTAATATGACTTGTTGTTGCGATAAACCTCTGAAATATTGAATATTTTT:1	-	chrX	20945728	3'	+	1360	444	1	72.14
CATAAATGCATTACACTTATTAGCTTTATAGTACTCTCTCAAGTGTACTTACCAAAAATCAAGCTGGTATAATGAAATCTTAGTGAAAATCAAACAATAAACAAATATAGATTAGATGAATTTATATGCCAACCGAATAATGTCAA:1	-	chr2L	551946	3'	+	Tabor	7322	2	69.86
ATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGC:1	+	chr2R	24561488	3'	+	P-element	2782	1	15.07
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGTTCTCG:1	-	chr3R	18582089	3'	+	roo	401	1	77.40
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGTTGTT:1	+	chr2L	21884621	3'	+	pogo	2052	1	56.94
AACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATG:1	+	chr2R	5206897	3'	-	G4	3770	1	57.53
TTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCGGTCGGAGATTGAGGGCCCGGAATGAATGGAGCATTTATCCGAACGACTACGACAAATGGCCACGTT:1	+	chr2R	20194687	3'	+	Max-element	302	1	75.00
CTATAGTTAGCTTTTTCTAGTTTACAATAATAATACAGTACATAACAAACACATATAATAAATAGATTTTTTGAGCCTTGTGTTACAGTTTTCTTAATGGTGTGTCTGGCTTATGCCGCGACTGCGGCTTTGTGGCTGTG:1	+	chr2L	58466	3'	-	X-element	4616	1	55.71
GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGATGGCAT:1	-	chr3R	9210594	3'	+	mdg1	7428	2	62.07
TCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTTGGCTGTGTGCATTCTGGCTATTAACTTATCGTACGACTCGGCTATATCTCCGCCACACTGTGGTTGTTGTTATGGCAATTTCAACACCTTTGGACAC:1	-	chr3L	11531526	3'	+	roo	58	2	71.92
GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAAC:1	-	chr2R	21229014	3'	-	jockey	85	1	74.05
TAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTA:1	-	chrX	21087601	3'	-	mdg3	5271	2	62.16
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATG:1	-	chr3R	12886913	3'	+	roo	9002	2	71.97
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGG:1	+	chrX	6486823	3'	+	roo	9029	1	50.00
GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGG:1	-	chr3L	17685098	3'	-	mdg3	26	2	39.85
CTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAA:1	-	chrX	21087598	3'	-	mdg3	5296	2	60.77
AAATAAATGTTATAACATTAATAACTATGAATATAGATCAATTTTAGTTCAAATATTTTCAGCATGATTTAAAAAATAACTACACCTATTCACATTTGTTTCTGGCGCTGGCCCGTTGAGTTCTTTGAGTTATTGTGAGTGATTC:1	+	chr2L	20301457	3'	+	looper1	1813	1	53.79
GAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGAATTGGGGTCACCGCCTCGCCAGTCAAAGTACAGTGGAGATTGTGTGGAG:1	-	chrX	6498362	3'	-	Quasimodo	7035	2	64.37
GCGGCAGTTCCCCTCACCTGGATGGCATAATTCCACGTTGGAGAAAGTATGGCTTTGATTAAAAGAGCCTTGGAGCTCATTTGTAGTTTGCTAGATTGTGTAAATAGTCTGTAAATTAGAAACATTTACACGTA:1	+	chr2R	12404960	3'	-	G5	4397	1	68.66
CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAG:1	-	chr2R	19499333	3'	+	P-element	2809	1	26.67
CGGGAGAAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTAATCGCAAAATGAATTACAGTTTTAATGCAAATACGGTTATTAAATTCCAGATT:1	-	chr2L	11985769	3'	-	G6	1711	1	62.33
CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAAAAAAGATACTT:1	+	chr3R	26222940	3'	-	roo	8724	2	67.69
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAAC:1	-	chrX	5643447	3'	+	roo	9038	1	61.64
GGAGGTNTTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAATTTGCGCATTTACAAAGCGGCCTTAA:1	-	chr3L	12308302	3'	-	hopper	26	1	60.16
CCATACTGTGTCCCCCACCCTGGGTTTCCGCGGCCGTCTGCGGAGACACTAGAGTATAGATTATAGTGTCTCAGCGTGAGAAGTTAAGATTAAATTGACA:1	-	chr3L	23156965	3'	-	Osvaldo	1296	1	71.00
TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCT:1	+	chr3R	19446242	3'	+	297	6943	2	55.83
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCTATGTAAGGTAGTATGTACTCTATATATGTGTATATGTAGCATGTATCTTTCGTATTATGCAATTGTTGCG:1	-	chr2L	6059202	3'	-	roo	8674	2	69.16
AGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCAT:1	-	chr3R	13457905	3'	-	X-element	81	1	62.33
AACTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCATACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGAT:1	+	chrX	21587769	3'	-	INE-1	131	1	51.43
GTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGTATACATTGGGATGAAATACTTTCGATACAAATCGAACCGTTGGCGGTTTGTTTGGATACTCTTCCGTAAATTCTATGGTTAACTTAAATGTTC:1	+	chr3R	4950624	3'	+	INE-1	137	1	63.70
AATAGTCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTCTGTGCGTCTATCCGTATTTTCGTCCAAATTTGAGGACGTATAGCCTACTCTCTTGTTTCTTTTGCACATAAATACATAAATAATTTTTGCCTTCATTT:1	-	chrX	22806277	3'	+	INE-1	102	1	53.12
TATTCTAATGTAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGGTATGTACATAAATTTGGCAATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTACATCAGCCAAAGGGACCGGTGCGCAAGGTAGCGCTGTACAAGAAGCTATGGG:1	+	chr3L	26380650	3'	-	1360	384	1	62.33
TTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAAAATACGGGGAAACATTTTTCAATTAAGTC:1	+	chr3L	10056177	3'	-	transib2	68	1	72.87
CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTTTAA:1	+	chr2L	14081425	3'	+	1360	3352	1	58.74
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCGGATGGGGAAAAATGCTAC:1	+	chr2L	18419286	3'	-	412	17	2	68.49
TTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCA:1	-	chr3L	2362344	3'	-	Stalker2	7312	2	68.55
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCG:1	+	chr2R	25118804	3'	+	roo	9037	1	63.01
CAAATTAAGTTGCCGTATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTATTGCATAATTTTAGCACGCGCCCAGTCCCCAGCCC:1	+	chr2L	15833550	3'	+	jockey	4953	1	49.32
TTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCA:1	-	chr3R	19589937	3'	-	BS	5078	1	73.61
AGGATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTATAGTGTGTACCAAAACGTCTTCAATTGGTTATTAATTTGTTATAATTTTTTAGTTGACTTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGC:1	-	chrX	22943377	3'	+	Tc1-2	1281	1	79.45
TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGGCACTTAAGCTAATACTAACTTTTTGTCATAGAAAAGTCATTATTTTTCGCATAACATTCCAAAAAATGATCGGAGAAAAAAGTGATATGCCTTG:1	+	chr2R	16836464	3'	-	I-element	28	1	65.75
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCAT:1	+	chr3R	16076864	3'	+	roo	331	2	71.23
TTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCCCGTTGC:1	-	chr3L	10773085	3'	+	412	7459	2	78.77
TACAGCTCCGCTTGGCTCGGTGCAATAAAGCATAAAAAGCAAACTCCTAATCTTTCATTGTCACGGCTCCGCCTGACACCTGATTAGTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCCCAAC:1	+	chr3L	24080178	3'	+	gypsy2	224	2	65.60
GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTT:1	-	chr2R	5485102	3'	+	blood	7340	1	54.93
GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTT:1	-	chrX	10521621	3'	-	Tabor	37	2	55.38
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTT:1	-	chr2R	9632108	3'	-	roo	58	2	65.38
TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCG:1	-	chr3R	22821979	3'	+	mdg1	7439	2	47.20
ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGCTACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCC:1	-	chr2L	13585846	3'	-	Tabor	41	2	57.80
TATAATACAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACGAACAGAAATGTAATCGAATTGCAAATTATACC:1	+	chrX	5627919	3'	-	jockey	295	1	76.03
GACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGTCGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAG:1	-	chr3L	7292487	3'	-	HMS-Beagle2	87	2	78.77
AATATATATGAATATAATAACACTCCTGTATTATTAGGCCATACATTTTAATTACTCCTATTATGAATTACGTTTAACTTGCAACCAATATACTATAATAAAATGGTATCACTTTTAACTACAAATTCATAATAGGAGTAATTAAA:1	+	chrX	7746837	3'	+	mdg1	4	2	81.51
AGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAATATGTACTCGAAAACAAAGTCCAAACAATAAACCAAATGGCGGAAAAGCAGAGAGAAAACGTTCGCAAAAAAAAAGCTTTATA:1	+	chr2L	8649745	3'	+	Doc	4241	1	70.40
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTAT:1	-	chr3L	21817965	3'	+	roo	354	2	56.85
ATGTCGAGATCTCAGGAACAATAAAAGCTAAAATGTTGATATTAAGCATCTTTGAAGTTTTTAAAAGAAGGAAAGAAGGATGAGGAATGACAAATTCATTAGAATACTTATTGATGCCGGCAAAAAACGAAACTATACCCAACCAA:1	-	chr3L	25346410	3'	+	INE-1	143	1	69.18
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAATAGGGTAATGA:1	+	chr3R	22122793	3'	-	roo	8721	2	60.27
AGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTT:1	+	chr2L	21400809	3'	+	Doc3-element	4669	1	46.90
GTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGCCTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGTATTTTAAACTTTCAA:1	-	chr3R	22388984	3'	-	G2	2677	1	68.49
TATTAATTTGTAATAATTTTATGAAATTTATCCATCCATCTACACACTTTTTATTAAAATTATCCATCCATGTAGCACACCCTATGATTGGGATATTCATCGGTGCACTGTCGCAATAGCTCAT:1	+	chr3L	11887928	3'	+	Tc1-2	1373	1	57.26
AATAAGAAAAAAAAACACAAAAAGGGGGGAAAGGGAGAAGGGCGGGGGAATTTCTCAGCGCGGCTGTCCACACCAATCTGAAGTG:1	+	chr3R	23038154	3'	-	pogo	302	1	75.29
AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTATCAAGGAAGTGATAAA:1	-	chr2L	3164952	3'	+	412	421	2	65.07
ATATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATGACATTTCGCGTTCGCAATCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATTCGATAGTCTGATAATTAATGTGATTAATTACAGCAAATGTAGTCCAACTGTGGGAAGTTCGAAACAATG:1	+	chr2L	22697566	3'	+	INE-1	498	1	59.29
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAAAGGCAGCA:1	+	chr3L	12879816	3'	+	roo	9019	2	60.98
TCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATACACTTGCTATACAGAAGTTTTTAAATATCTAATACATATTACATTGAACAAATTAACAAAAGCTATCCAAATAATCAGTTTTATTATGA:1	-	chrX	20870076	3'	-	gypsy	31	2	60.00
AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGTTCCAAAAAAATCATTT:1	+	chr3L	6978232	3'	+	pogo	2038	1	65.94
CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAACAAATTGCAATTAA:1	-	chr2L	18419101	3'	+	412	466	2	66.44
GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCT:1	-	chr3R	14651224	3'	-	P-element	86	1	26.71
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATTG:1	+	chr2R	9632201	3'	+	roo	9034	1	53.91
ATTGCTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGTAGCGAAGGAGATGA:1	+	chrX	15946785	3'	-	INE-1	570	1	46.90
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCAT:1	+	chrX	14336497	3'	-	roo	73	2	73.79
ATCATTTCATTTTATTTTATTTAAAGAATGTTATACATAAACCTGGTTTTATAAATTGTTTTTCTAACATTCCAATAACGTTCAAACGATTAAAGAAACTAAATTTCTTG:1	-	chr3L	9311204	3'	+	transib1	1897	1	88.18
GAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAAAGGGTTCTT:1	-	chr2R	5209593	3'	-	gypsy	7046	2	57.24
TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAACCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTAAGCTAATATTGATTAATTTTTAG:1	+	chr2L	15833131	3'	-	hobo	20	1	71.92
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTTGCCACTGTTTCTGCTGCTT:1	-	chr2R	9632061	3'	-	roo	10	2	74.42
GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAACTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAAGGTCAAGCAGC:1	-	chr3R	14979781	3'	+	pogo	2052	1	55.47
TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTTTTGTCTTGAAAACCTCAAACAATTTGGAATAC:1	-	chr3L	23818317	3'	+	copia	244	1	56.16
ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGG:1	-	chrX	21087604	3'	-	mdg3	54	2	66.42
TGTATGTACATATGTATACATGTACATATATGTATGTACATATACATACATATATGTATGTGGTCCACTCAGTTACTTAAACATACAAATCTTCAAATCAAAAATTCTCATTAAAATGAATTAAAATTTCAATTGTTGTACATTTT:1	-	chr2L	6644053	3'	+	invader3	5087	1	64.38
AGCCATCCGGAAAAATGAAGTGCATCCAATATACAAGCTACAGTTTCTTTTGCACCGTAGAATTACCGTATAAGAACCACACAAAGGCCCAGTCCAAAGTATTTTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTTTATT:1	+	chrX	23280955	3'	+	Fw3	354	1	66.44
ATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATACATATATGTATTCTTTTTTGTCATCTGTGTGCCTGAGTGGG:1	-	chrX	19317021	3'	-	G3	4505	1	76.39
CACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACCGATGTATCTCGCATGCCGTCTTCTGCTTG:1	-	chr3R	12959325	3'	+	Juan	3823	1	40.19
CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAACCCACATATTACATTACATTACATTCGATATTATATTAAAATAATCTCTGGAGAT:1	+	chr2R	9221113	3'	+	opus	435	2	62.33
CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATT:2	-	chr3R	19589884	3'	-	BS	5027	1	60.27
TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAAAGATATAA:1	-	chr2R	20496866	3'	-	blood	7030	2	69.86
ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGAACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGGTAGAACGCTTTAATTTGAATTCATAACAGAG:1	+	chr2L	5307392	3'	-	jockey	4699	1	43.64
TGCGAGAACATCTTCTCCATCATTCCTTGCATGATGGCAAACATCGGTTCAAGCTGGTTGTTTAGATAAATGGCAAAATAAAAGCGCAAGAAGAAAACAATGATTGATTTACGTTAATCTTACCCGACACCTACTATAAATACCAA:1	+	chr2R	1440930	3'	-	G2	203	1	62.33
TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTGACCTTATTATCATTTTTTAGCGGGCGATCGCCTGTTGGACATTCCCTGCAAGGTGTGTGGCGATCGCAG:1	+	chr2L	5928096	3'	+	I-element	5304	1	50.34
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCC:1	+	chr2R	18336237	3'	+	roo	338	2	66.44
AATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGAC:1	-	chr3R	16076769	3'	-	roo	52	2	54.79
ATAAATAATAATAATAAATAATACCATGCAATTATTATTACTTTATCACACCTTCTTCCAGCCTTGACGAAGAGTCCTCTGTGAAGATTTGCGATAGCGCCCTCTCTCGCGATCTCTTCACAGACGACTACGACTGTCTGGGCGAC:1	-	chr2R	13058529	3'	+	flea	5007	2	70.55
CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGANCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGAC:1	+	chr2R	19540439	3'	+	jockey	4948	1	66.97
GACGGTTTTTACTTTAAAATCCTTATCATTAAATGCCTGCGTTATCTCAGAAGGTGTTGCTTCAGGTCTATATTCTTTAGAACGAGAGGGCAGCCCGGGGTTCCCTGTTTTTATAAGGCTTGACATCCTT:1	+	chr3L	18673631	3'	-	Fw3	264	1	63.85
ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCA:1	+	chrX	17431821	3'	+	hopper	1395	1	64.66
TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGAC:1	-	chrX	13066496	3'	+	jockey	4939	1	55.48
ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTGGCAGAGAGCGAAAACAAAGTAACCTACCGCCCGAGAGTGAGCGAGAG:1	-	chrX	6279331	3'	+	P-element	2879	2	72.90
GGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGAAAGGCCAAAGGTTGACGGTG:1	-	chrX	18030252	3'	+	opus	459	2	59.02
CGTATGAACCTCGAGATCCCAGGAACTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTCACCATACAAATTCTCGAAACATAGACGCAGCGCAAGTTTGATGACCTATGTTGCCACGCCCTAAAACTGCAACACCCACATATTTAAAACTTTTT:1	-	chr2L	22211493	3'	+	INE-1	136	1	73.97
CACTTATACTTTTTGCCTTCGAGGGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCTATAAGATATAATGCTACAAATGCTAGCGCGCAAAAATAGCCTCTGCATTTACATAC:1	-	chr3R	7484113	3'	-	412	170	2	49.14
AATATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGAT:1	-	chrY	680451	3'	-	invader2	4902	2	73.29
TAAAAAAAAAAATAGTCCTTGACGCAATGACATTAAGAAATCTATGTTTTTTGGAATACCAAATAATTAAGTTCCTTCCATCAAGGGATTGCTTTATATACATAAAGTAGGCAATTAAGGCCAAATATACATTTTCCTT:1	-	chr2L	21925217	3'	+	rover	6835	1	71.94
GAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATGGAATGAAAT:1	-	chr3L	7292420	3'	-	HMS-Beagle2	6903	2	74.66
TTTCCTTCAGAGCATGGCTCCAGTGGTCCCTTAGGTGCCCTACGTCCGGAGAGACATCAGCCGAGTTCAGTATTCATATATTTAACGCTGGCCCAATTGCTCCTACTCCCACTGCTGCG:1	+	chrX	16242439	3'	-	Gypsy12A_LTR	1929	1	68.07
AGATAGAGTGAGAGCGAAAAGTTTATGTGCATGCACCCAACACACACACACACCAGCACAACCATCAGCATCCAAACGAACGCATAACAATGCAAACTTTATG:1	-	chr2L	19702698	3'	-	Cr1a	284	1	73.79
CACGTGAATTAATTTTACTCCATGAGTAATGTGCTGGACAGTCAATAACATGGAGTTCGTGTGTGCTTCGGATGGAGACCACGGAACTCCAC:1	+	chrX	1899113	3'	-	P-element	188	1	77.17
GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATT:1	+	chr2R	9138272	3'	-	mdg3	82	2	75.54
AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGC:2	-	chr3R	9210617	3'	+	mdg1	7404	2	54.79
CCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCATCAACACTCCCCAAAACCTCAGTTCACAGCGCTTGTCC:1	+	chr3R	12730172	3'	-	roo	192	2	70.54
ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGTAGAGGTCAAAGTGACCGG:1	+	chr3R	1433235	3'	+	mdg1	7411	2	52.05
AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAAATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTG:1	-	chr4	158193	3'	-	Tabor	6881	2	55.48
TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAATAACTCCTTAGTTTGTCTATTCGTATGTGTGTA:1	+	chr3R	15364060	3'	+	flea	237	2	73.97
GTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTATCTGAAAGGAAAAAGGATGCGAGGTCGCGTGTTTGATAAAAATATTATTTTTGTGTAAACATAATTTAGTAATAATTGTGTTTTTCTTGTTTATATCCCGTGAAT:1	-	chr2R	9866710	3'	+	roo	9070	1	65.65
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGGGC:1	-	chr3L	233251	3'	-	roo	8736	2	71.94
GAGTAGCCCGACTATCAGATACCCGTTACTGAGCTAGTGTAACTCGAATATAGCATTCTCTCTTGCTGATAAGAGAACGCTATAATCTCATTGAGTGCAATCTCCTAATGCACTTGCCCGCCATAGGAACATTCAAATTTTTTA:1	+	chr3R	24278976	3'	-	INE-1	558	1	54.17
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGACAAACTTTT:1	-	chr3L	15600135	3'	-	roo	19	2	55.48
ATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGGGAGCCCATGTGCCTCTGGATGCTGCACAGACGAAAATGGAG:1	+	chrX	14817402	3'	-	jockey	4918	1	70.55
CGACGCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATATATTGACATTAACATTCAGCCTTTTACATACTTTTTTTTTTACTTTACTCTCCGGGTAACGGGGAATGTTTCACAGATAGGACTTTCCGAGTAATTCCCTTTA:1	+	chrX	20806518	3'	-	INE-1	93	1	83.46
GAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATACTTAAAATATTTGTTAGGCAGGGGGAAAAGAAAGAAGGGCTAATAGAAAATAGAATGCTATTAAAAAAAGTCAAAGTTCATGGG:1	-	chr3R	10178482	3'	+	Stalker	7046	4	60.96
ATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTGGAGTGGGGCTAGCTGGCTAGCTGGTGGATGCCATACGAGCG:1	+	chr2R	23332672	3'	+	invader4	3079	2	74.66
ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTGGATAGAACTGCGCTTGAATAGTACGATAGC:1	-	chr3R	23495618	3'	-	copia	40	2	62.33
CTACAGAGTGTCTAGTCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGTTATTTAAGGAACACGCCAAGTCGATTAAGATACGATAGCCGCGATAGTGGGCGTCCTCTACTAATTTATATGCTAACTA:1	-	chr2R	24144363	3'	-	blood	249	2	59.26
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAATTA:1	+	chr3L	20831411	3'	-	roo	22	2	69.29
AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAAATCGCTTACGGACGCC:1	-	chr2R	24218482	3'	-	412	13	2	71.94
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCAGCAGCCACAAAGACTGACC:1	-	chr3R	12886868	3'	+	roo	9033	1	60.27
AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATA:1	-	chr2L	20117851	3'	+	invader4	3064	2	47.26
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAAAAAAGATACTTATCAGCTAC:1	+	chr3R	26222949	3'	-	roo	8726	2	63.83
AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGAATTGAAAGAAAAATGATTCAGCATTTTTTGAACCGACAAAGAATTGGAAGAAAGTTCGACGAATTTTTTCAATTCTTCATGTTACAT:1	+	chr2R	13585127	3'	+	412	430	2	61.64
TATTATTATTATTGTTATTATGATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGT:1	+	chrX	21947729	3'	-	mdg1	28	2	57.14
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTG:1	-	chr2R	8585412	3'	+	roo	9055	2	68.70
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACCGTGCCCCCTCTCATTCTTCCGGCATA:1	-	chrX	16717875	3'	+	roo	9024	2	75.79
TCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTATAATTCCCTGTTCATATTTTCAGTAAGTTGAAAAAGTGCAGTAA:1	+	chr3R	14858847	3'	-	BS	4997	1	68.49
CGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCCACTGCCTACCTATCCACC:1	-	chr3L	11957100	3'	-	blood	7010	1	78.64
ACTAAAATCAAGTAATTTTATACGGAGCTTAATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATGCCAACAGGCGTGCGTAGAATCTGGAAAATCCGTTTTGGATATCAAAATCAAATTCAAATCGAATTCCCCATTTTAACTGCCGTGATA:1	+	chr3R	11870895	3'	-	Doc3-element	41	1	54.11
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTCTATGTA:1	-	chr3L	20831277	3'	+	roo	347	2	63.01
GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAA:1	-	chr2L	14892227	3'	+	transib2	2743	1	73.97
AAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAACTGAAAATGAAAATGGAAAAAATCTAAGCCGAAAGAGATGATTGCGTCCTTTTTTGTTTTTGGGGTGCAAAGTTTGGCGCGAAAATTTTTGAACGTTTCTGCATAATAAAT:1	+	chr2L	9471624	3'	-	hopper	148	111	75.56
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCAT:1	-	chr2R	7898074	3'	-	roo	54	2	66.42
TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTGGGTATCCCTGGCACCCACAAA:1	-	chr2L	15875774	3'	-	hobo	55	1	75.49
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATC:1	+	chr2R	13710674	3'	+	roo	9022	2	56.92
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCGCAAC:1	-	chrX	5643431	3'	+	roo	391	2	72.60
GGAGCTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTATCAGAAACAAAGCTTTTGCACTTCCAAAGGTTGTGTGATTCGTTAATTCCATTTTAGCATTGATCAATGAAAATACAAATGATGTAACACAAGGAATCAGCGA:1	-	chr2R	5492076	3'	+	INE-1	573	1	79.26
CTCGAGGCAGCTAAGTGAATTATACTGTATAATAGCACTTATTTTAACACACGTAGAGTACATGATATGTATTTTCCCCAAATTTGATAGGAAGTTTCCTATCACTTCAGCGCCTCATTTTCACGGTCCCATTGAAATTTCAACCT:1	-	chr2L	6863222	3'	+	pogo	2095	1	82.19
AGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCACAGCAAATGGATGTAAACACATAAACATGTTCCAAAATCCAAGGGAGTTACCCCTTAGCATGCCCG:1	+	chr3L	19982416	3'	+	R2-element	478	1	66.95
GAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATGACATACTGCAGAGTCATCACAGATGTGCAAAGCTCTCTTAAGTGAAAAGCACCACCTGGTGG:1	+	chr2R	18400664	3'	+	Tc3	310	1	73.03
ATTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCG:1	+	chr2R	2879465	3'	+	Stalker4	77	4	60.27
GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACA:1	+	chr3R	20427452	3'	-	jockey	78	1	72.39
TATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTG:1	-	chr3R	31817436	3'	-	roo	8665	2	73.63
ATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGAGGGAAATACGTGAGCTTGGGCTGCGTGGAAAGCACAAGAG:1	-	chr3R	7835304	3'	+	roo	422	1	69.78
TTTCGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAATTATCTTT:1	-	chr3L	27356070	3'	+	Tc3	1658	1	59.26
ATACTAAAGCCCGTGTGAACTTATGGCATACAGCTCTGTGGTACTGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTAATAGATTAATTTTATATTTCAAATGAAAGTATCCATAAGACTTAGGAATCCCTTATATCTTAAATGGTCAGTTTCA:1	+	chr2L	21924778	3'	+	G4	3414	1	48.63
TTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTT:1	-	chr3R	16076781	3'	-	roo	64	2	63.01
TTTTTTATTTTGTTTAGTTTATTAAATACTTTACTTTACATCGTTTGTATCAGCTTATAATCCAGGGGGAACTATCCGTCGCTTCTGTAGCCAGCTAATGTTTAAAAATTAAAAC:1	+	chr3R	6032365	3'	-	F-element	91	1	56.52
GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGAGTCACTAATTTCAAATCAGATTTA:1	-	chr2L	544774	3'	-	412	53	2	55.56
AGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATCTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGTG:1	-	chr3L	11321396	3'	+	mdg3	5443	2	52.05
TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCT:1	-	chr3R	12618631	3'	-	F-element	89	1	75.56
TGGGACATACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATATCTGGTCCTCCGTTCCTTGCTGATATACGTTTTCTACGGCTGCGGTTGCACTATGTCAGATCGGATGCAAG:1	-	chr2R	5080558	3'	+	Tc1	1615	1	56.80
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAGGCTAAA:1	-	chr2L	14772009	3'	+	roo	9033	1	58.22
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTCCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAG:1	-	chr3R	19968118	3'	+	roo	327	2	73.79
GAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAA:1	-	chr3L	19013916	3'	+	invader3	5408	2	59.26
ATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTAGCATTCCGCCTCTTATA:1	+	chr3L	27415313	3'	-	transib2	63	1	60.27
GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCA:1	-	chrX	2842480	3'	+	Tabor	7276	2	50.71
TGTTGTCTGTTAATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAAGAACCAAGCAAGCGAAAGGAGATCTCTGGAAGCCCTACTTCCCCTCCAATTGTTATTCTGTTTACTATT:1	+	chr2R	1245267	3'	+	gypsy4	268	1	66.09
ATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCATACAGCCA:1	+	chrX	13704868	3'	-	invader4	2795	2	54.24
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCA:1	-	chr3R	15072545	3'	-	pogo	47	1	52.74
TTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGG:1	+	chr2L	11661005	3'	-	F-element	74	1	60.00
AATAAAACAAAATAAACTCATATCAAGCATATGCTCATCATTGTGTCGAGCCTATGGTCATTAGTATCTTTGATCCCCCGCACCGTTTCAATCAGTTTTGTGGGACTCCACCCTATAAAGTGTGCCTATATATCATCAAATCTG:1	+	chr2L	2435577	3'	-	transib1	1896	1	33.33
CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTCTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTT:1	-	chr3R	9210631	3'	+	mdg1	352	2	63.01
GCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGGATTAAGCTGTACATGTTTTTTATGGTGTAGTTG:1	+	chr2R	7895243	3'	+	roo	8710	2	73.85
TTAACTAATTTGTTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCATAATCTT:2	+	chr2L	22121662	3'	-	gtwin	34	2	45.89
AGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGAC:1	+	chrY	418189	3'	+	Stalker	350	4	67.91
TGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCAT:1	-	chr3R	5061857	3'	-	mdg3	76	2	69.78
AATAATAATATAATAATATGAAATGTAAGGCAAATGAAAGTACAAGAATATATGTATTGATTATTTATATCCTATAGAACAAAGCCGTCGTTCCAATTTTATTTAAATATTTAACAGCTTTGGTCGCTTCACACTTTCCCTCG:1	-	chr2L	3906721	3'	+	invader3	5051	5	76.92
ACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGA:1	+	chr2R	16248017	3'	-	BS	45	1	51.37
TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATCGGTCAACTGGTCCAAAGCTATCTGGATGGGCTTATTGAGAAAGCTGTGGACATATTCGTTAATACAGACTATTTG:1	+	chr2L	11518541	3'	-	412	7	2	76.71
ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAAC:1	+	chr3R	17243227	3'	+	hopper	1367	1	50.68
GAGAAACAATATAACCAAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATATGTCATCCATTGCTCTTTGAAATATT:1	-	chr3L	22231511	3'	-	TLD2_LTR	183	1	58.90
TCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCAGGCAATCAACTGTGTAATCCAATGTT:1	-	chr2L	17420089	3'	+	roo	408	1	82.88
GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATGTGTTAAATCGATAATATAAAAAA:1	-	chr3L	1534501	3'	-	pogo	43	1	52.74
TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCG:1	-	chr2L	15833464	3'	-	jockey	67	1	64.80
AAATAAAAAAACAAAATAATTATTAAAAATCCAATTATTTTCTTACGAGTGCGCACAATTAATATCCGGTTTTGAAAAGCACACGCCGCGAGGCATTGCGGAATTCGATTTTGCACGCCATTTCACTTAC:1	+	chrX	4302243	3'	+	gypsy11	3936	1	74.62
GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTTTGTAGACGGCAGCAAACAGCCAACAAAACAACAACTA:1	+	chr3R	10266201	3'	+	1360	3385	2	79.49
AATTAAACTTAATTATTATTTCATTTTTTATAAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATCGCATGTTGCAGACCCCTTTTTCACGATACACTTGCGGAGGGCTTTATAATGTAGATCACAAGCTTGCAACCAT:1	-	chr3L	15251096	3'	-	Tc1-2	395	1	50.00
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAAT:1	+	chr2L	15833511	3'	+	jockey	4937	1	67.48
TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTCCTGCT:1	+	chr2R	21101822	3'	-	P-element	42	1	42.37
ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTTGCCCCCAGTGACCCATTGTCACGCACAGGCAAATAATAACAGGCTGTATAATAAAGC:1	-	chr3R	26685972	3'	+	Juan	4197	1	70.08
AAATGGGTATCTTAATGTTAAACATGAGTGTTGTGTATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTGGCTAATGGCTATCGACTACTTTATTTATTACTATTTACGAGTGATTGTTTATTAAAGGATATGGAGATATCCTTTACA:1	-	chr2L	5369452	3'	+	accord2	366	1	40.41
CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACA:1	+	chr3R	10274044	3'	-	HMS-Beagle	45	2	54.55
CGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTAGAATGGAGATAAACTCACTAATTTACTTACCCGTACTTAGCTATCGTGATCGTGCCAAG:1	+	chr2L	1181852	3'	+	mdg3	5219	1	61.11
TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACAC:1	-	chr2R	20496922	3'	-	blood	75	2	69.18
TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCACAAGTCATATTTCCGTTGAGTGATTA:1	+	chr3L	10648033	3'	-	412	23	2	54.48
AGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAACATTAAGAATATTTACTTTGAAGAATAGGTTTGCATGCGATTCCCTCAGGAAATCAAATTAACA:1	-	chr2R	5555294	3'	-	1360	3173	1	57.93
GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGACTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACATTCCGTGCTCGTATT:1	-	chr3R	14981124	3'	+	mdg1	7428	2	60.69
TATCGATTTGCCAAAAAAAACTTTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGCGGTCCTAGTATACCCGGATACCAAAGACCCTAGAATAACTTTGCGGATACCCTAGCATACCGGATTTTACTGTATA:1	-	chr2R	5738134	3'	+	INE-1	315	1	70.31
GATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACGTTATTCTCGCTTTTGTTGTTGTAACTGTGGCAACACACATTATTTATATTTATATGCTTATTTTATAGTTTATTCATGCAAATTGCAATAA:1	-	chr2R	20592939	3'	+	copia	241	1	69.47
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAGTCATGCGGACTTATTTTCAGTGCTGGAAATTTTGTGCCAGCCAGGCAAACTTGATGAGAGGCTCCTTC:1	-	chr2L	14772211	3'	+	roo	8998	2	47.20
AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTT:1	-	chr3R	21434872	3'	-	412	60	2	58.90
CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGTTCGGTAAAT:1	+	chr2R	24218599	3'	+	412	7468	2	72.46
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATTGGAGTTAACATCTTCTGTTGTTCTCTTTAATAGATTAGAAGTTGAATCAACCAC:1	-	chr3R	19448686	3'	+	roo	345	2	60.96
AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGGTGGGGTTATGAAAAGCGAATGCTTTTGAGATTGCACACT:1	+	chr2R	9463531	3'	-	rover	27	2	66.44
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAGCA:1	-	chr3R	15072538	3'	-	pogo	40	1	56.16
GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGCAGGAGAAGGTACTATATAATTAGCTGTAACCTTTAACCCGGACAACCAACTATGTTAGCTCATTAACTATGTTCATATAA:1	+	chr2R	13817746	3'	-	412	7093	2	58.22
GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTT:1	-	chr3R	9921999	3'	-	blood	85	2	78.77
AGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGCTATATAGTTATGCAA:1	-	chr2L	18419169	3'	+	412	398	2	81.51
GTGTATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGACTCGAAACAAAAACTTTTTTACTATACAGACGCTGGACTTTAATCCAAGTGTCAGCATTCTTAAGCTGCATTCTTGGCTACAGCCAAATACCTGAATACA:1	-	chr2R	3592420	3'	-	1360	3213	1	73.19
GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATCCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCG:1	+	chr3R	17243218	3'	+	hopper	1388	1	56.03
AAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGAGCTAATTCCCAACACGTGCTGTCACTTACAATTGTCCGC:1	-	chr3R	29652335	3'	+	HMS-Beagle2	73	2	64.91
TGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACCCACACACAC:1	+	chrX	2457418	3'	-	Tirant	61	2	79.17
CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACC:1	-	chr3R	25826675	3'	+	mdg1	7388	2	65.07
TGTGAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAACCTGGACAAATCGTAATACTGCTGGCGATACTTTACTATGAACT:1	+	chr2R	7449701	3'	-	pogo	1827	1	60.00
AAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAATTTCACTTTTTTGTTTGCCTCTTTGTCTGTGGTTCACCGCATTCAGTTAATATCGCAGTTTT:1	-	chrX	6664272	3'	-	roo	427	1	54.81
GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAA:1	+	chr2R	5485197	3'	-	blood	7080	2	67.14
CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAGAAGCGATCGGCCCCGTGTGCATGCACTTATTGGACTAATGTCTTTAATAAAAAATTACACAAATTGCATAG:1	+	chr2R	19798135	3'	-	Transpac	27	2	60.32
GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGC:1	-	chr3R	20499740	3'	-	mdg3	50	2	50.35
TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACA:1	+	chr2R	9328714	3'	+	roo	395	1	68.70
GTAAACAAGACACAAAGACAAAAAATGCACAAGACTTAGTAAAAACTGTATTATGTACTCAAGTATTTCGTTTTCTAAATTGGTGTATGAAATATTATTTATTGTTGATGGGGCGTTGATTGTAATAAATATATTAAATA:1	-	chr2R	3522975	3'	-	Cr1a	199	1	72.86
TTACAAATTATATGCTTAGTTTTATCTATTAACTTACCTGTTAACAGTTAGTTTAAGTTCCAATTAAGCGATCAACATTTTTTCAATTATGCTTGTATGTACTGTAAAGGGGATCCTAAAATGGATGCGTTTATTAATTATTTGG:1	+	chr4	893269	3'	-	Bari2	232	1	53.79
TGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAG:1	-	chrX	2842513	3'	+	Tabor	398	2	75.34
CAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAA:1	-	chr3L	28063327	3'	+	Stalker4	110	4	70.55
GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGATGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTACCTCTTATATTATCACAGTACATATTATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACAA:1	-	chr2R	9221005	3'	-	opus	7052	4	50.00
TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATC:1	-	chrX	5274313	3'	-	roo	68	2	70.54
ATATTTATACATATACATATACATACATACATATATATATATATGTGTATATAAAGGCAGGACATCTTTGTGAGAATTTACGATTCGTCAGGTGCTGCAAAGGTG:1	-	chr3L	12683782	3'	-	Stalker4	246	4	59.05
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGCT:1	-	chr3L	233213	3'	-	roo	16	2	70.25
ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCA:2	-	chr3R	19589937	3'	-	BS	5080	1	73.97
CCTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTT:1	-	chr2L	8776807	3'	-	G4	3701	1	45.21
TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTAGGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAG:1	+	chr3R	27424907	3'	-	blood	7098	2	72.80
ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTTTTTGTTGCATAC:1	-	chr2R	16945289	3'	-	jockey	65	1	60.29
TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCTCAAAATAGCAGGATGAGTCATGAAGGTCTTAAACAGCTAAGGATGCTCTATTTAAATTAGTTATATACTTTTTTATTATACTTAGCTATTTTGTAT:1	-	chr3L	22968293	3'	-	mdg1	23	2	69.86
GAAAATATAATAAAATAAAATAAAAAATGGGGAAAATAGTGCAACGAATGTCATTCGCATTGCACGCCGATCTTGAAGTTTATGGCGCCCGCAACTTGCTGAAAATTATGAATTATGATGCTGCGGAGTCTTTAATATCAT:1	-	chrX	14127912	3'	-	transib1	1899	1	73.76
CAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTA:1	-	chr3L	14944546	3'	-	G5	4802	1	54.11
CAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCTGCAACGCCTTGCCTCCGTGATCCTGATTGATC:1	+	chr2R	4294633	3'	-	McClintock	5993	2	56.12
TATATCTACATATGTACATACATATATCATGTCATGGTCAAAAAGCATAAATATTTACTTGTCACCCGGGACAAGAAAAATGCAAGAAAAGGACTCG:1	+	chrX	905683	3'	-	invader3	5087	1	61.86
TGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTGGGTGGTATTTTTGATTCGTTCGAATTTTGGGAAAAGCGCGACGCGCTCGATTCGT:1	+	chr3R	7639372	3'	-	hobo	2692	1	61.64
TCTAATTCAAATAATTAATATTTTACAACAAGCCAATATGAAAATCTCTCTTGAAAAATCTAAATTCTGTAAATTGGAAACAGCATTTCTTGCAATGTATATGATTACATATTTTTCCCTGACTGTCGATAATTGGC:1	+	chr3R	25572479	3'	+	TLD2_LTR	98	1	64.23
AAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGTGCTGAAGGGGGCAGACTGGATCGTTAACGAGATC:1	-	chr2L	6062197	3'	-	roo	405	1	70.16
AAGAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAAATACTCTTCTGCACCCCGGACTCCACGGAGCAGCGGCAAGGTAAGGGGTGTGCGGGAGCTGAGCTTCCGCCACTATAAACAAAGAAGCGAAGAATAAATAATTGAAATACAAAT:1	+	chr3R	27020161	3'	+	Gypsy6A_LTR	278	1	62.68
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTG:1	-	chrX	5274301	3'	-	roo	8731	2	65.71
AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCG:1	-	chr3R	25826673	3'	+	mdg1	375	2	56.91
AATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGCGAAGTCACGTC:1	-	chr2L	5844964	3'	+	transib2	2823	1	78.00
AATGAAAATAAAAAAGGAAAATAAATGGAATGGCCGGGAGTATACGACTGGGTGTGGCTTTTGAGACAGAGAATAAGCTACGCCTTCTTTCTTTCTTCTTATTTTCAAATTAAATGAAAATATTTCACATTCAACACT:1	+	chr3L	6703139	3'	+	Doc2-element	247	1	60.87
TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTA:1	+	chr2L	14772117	3'	-	roo	8728	2	66.42
GTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAATAAGGCAGATACAC:1	-	chr2L	4412527	3'	-	Quasimodo	29	2	59.59
CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTT:1	-	chr3L	12879740	3'	-	roo	60	2	64.71
AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAA:2	-	chr3L	17685121	3'	-	mdg3	62	2	58.22
AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCAATAAT:1	-	chr3R	7482722	3'	-	412	48	2	48.63
CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGCGTCTATTGATTTTTAT:1	-	chrX	17756554	3'	-	297	6620	2	54.11
GGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACTTCGCTAGCTTCTATTCCACTTCTAATTATACTTTTGCCACACATTCACTGCTCGTGGCGCAAGCGAAAGGAATGCAAAGGTAATCCCGAAAA:1	+	chr3R	25449307	3'	+	Quasimodo	147	2	72.06
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAG:1	-	chr3L	22437836	3'	+	roo	9036	1	60.69
ATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTA:1	-	chr3R	16076799	3'	-	roo	8715	2	67.83
CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTAT:1	-	chr2R	13585387	3'	-	412	42	2	55.48
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATGGGTTTCT:1	+	chr3L	12861825	3'	-	pogo	40	1	56.12
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAGTAAACAGCTGGCAGTCA:1	-	chr3L	22437812	3'	+	roo	396	1	75.34
AATTATAATAGTTGATATAACATAAAATAAGCTGATAAATTCGTTTGTATTCAAAGGTATTTTAAGTGTTAAGAGCGCTTAATATGGGGACATGAACTTTTAGAATGGAAAATTTTCGTAGCTAATAAGAAGATTAGGTATAAGCA:1	+	chr3R	20424960	3'	-	jockey	4851	1	76.03
ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGGAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTAACTTTGACCCCCTTTTTATTGCGGC:1	+	chr2L	16067201	3'	-	297	6619	2	57.53
CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACGTATAACAATAATAAGCCACAGCAACAAAAACAATTCAGGAAACTTGGCAACAAAATAAACAAAAATGAAAATAATCGAAGCAGAGCT:1	-	chr3L	2840882	3'	-	copia	4883	2	63.20
ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATCGGTCAACTGGTCCAAAGCTATCTGGATGGGCTTATTGAGAAAGTTGTGGACATATTCGTT:1	+	chr2L	11518526	3'	-	412	22	2	67.81
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGCTTGGAGC:1	-	chr3L	233207	3'	-	roo	35	2	62.33
GAAATATTGTAGATCCATCCACTTCATTGCCTTGCATGGCTAATAGAAATGTACTAAAAATGTCCCAAAAAATTTTACCAATAATACGGTCAGAAATGTCGACGTAAACGGTGTGGTGGTTAAATACTCTGAGCCCCCGGAGGCAC:1	+	chrX	23083968	3'	+	Helitron	430	1	69.86
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATCGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAAAACTTTAATATTTCCATTTTTACTCATTTTACATATATAGCGATTT:1	+	chr2R	19050330	3'	+	roo	392	2	62.68
CTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGTGACATTTTAAAGGAAGATGAAACTGTGAACGTGCTTTGTGGCCATTTTGGGGCTTAG:1	-	chr2R	15288558	3'	+	hobo	476	1	78.77
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCT:1	+	chr2R	25118756	3'	+	roo	8989	2	76.71
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAAGGGGAAGTGTAAAAGAA:1	+	chr2R	7898209	3'	+	roo	387	2	67.81
ACTTTTCTTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGANTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTCCTGCAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACCG:1	-	chr3L	25373416	3'	-	GATE	451	1	65.75
TAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCGCACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGGCTAATACCAGG:1	-	chr3R	17605587	3'	+	Tabor	469	2	71.23
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCA:1	-	chr2R	13121972	3'	-	pogo	40	1	47.26
ATTGTTTTTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAATAGAGACATATTTTGTGCC:1	+	chr3L	25824644	3'	-	flea	4994	2	62.07
GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGTGTGCCGTATAAAAAAAATGGCGCCCAACG:1	-	chr3L	13574462	3'	+	hobo	2921	1	61.43
CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCGGGTCGAACGCCACGC:1	+	chr2R	10124173	3'	+	P-element	2781	1	13.01
ATTATTATTATTATTATCATTATTATTATAATAAAGACATTTCTGGTCACCCGAATTCATAATCTAAGGATCTGTTTACAACACAGGATCACAGGA:1	+	chr2L	11016829	3'	-	mdg1	7068	8	85.42
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAG:1	-	chr2R	8585428	3'	+	roo	9008	2	60.96
AAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTT:1	-	chr2R	5173427	3'	+	gypsy	7387	2	59.72
TTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTAAGAGGATTAGATACATCACCTTTGCGCTTAAATGTTGATAACG:1	+	chr2R	11363834	3'	+	Bari1	1631	1	69.86
TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCATGTGTCCTTGTG:1	-	chr2R	9791536	3'	-	412	7072	2	73.29
GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGTGTTCTTACACACGCACTAACCC:1	+	chr3R	20427516	3'	-	jockey	23	1	73.61
ACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTCGGCCTTTCACTCACTT:1	-	chr3R	10546069	3'	+	hopper	1369	1	50.68
TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACTAAGCATTCTGATTTAATACAATGATAGATTCTCACCCTTTTTCCTGCTGAGCAAGA:1	+	chr3R	18272202	3'	+	1360	3328	1	60.96
GACTATCAAATACCCGTTACTCGGTTAGGACTAACTTGCCAAGATTGTTGTCCTTCTAAAGCAAGTTGCAAGCAAAAGT:1	+	chr3R	14927988	3'	-	INE-1	549	1	54.43
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATACGTACAACAATATGTT:1	-	chr3R	20469553	3'	-	roo	8675	2	53.52
GAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATAAAGGTGTTAGTAGGATCTAATTATTCTATGACGATATATACATACATGTATGTATGTACATAAATTTAATCATTCGTAAAATCAGATTTTATTGTGTACATATTGTTT:1	+	chr3L	24724595	3'	-	Cr1a	4327	1	63.01
CGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTAT:1	-	chr2R	20496917	3'	-	blood	70	2	65.75
TACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGAGACGCGTGTATATAGAGGATTGGAAGCTGGATCCGAGTGGTGGCTATTTGGCCACCGGGTTTAA:1	+	chr3L	6388987	3'	-	17.6	6940	1	66.97
TACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCCGAAAGCCAGAGGATCAGGAGCATACCGACCA:1	-	chr3L	2362286	3'	-	Stalker2	28	2	65.07
TGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCCTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATA:1	-	chr3R	9714366	3'	-	Stalker	6896	4	53.42
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCAGCAGCCACAAAGACTGACCAGAG:1	-	chr3R	12886864	3'	+	roo	9037	1	63.01
ACAAAGAAAAAAAAAATGGAAAAACCTCCGCAAAATGGATGTTCGTATGGGATGAATGGGGATCTGCAAGTTTTATAGA:1	-	chr3R	25859675	3'	+	Doc2-element	245	1	88.61
ATATGTAAATTGATTTTCATTAATTTATCGTAGTATTTGCTTATCAACAATGCCAACAACTCAGTTTTTTTCAAGGAATTCAACGTCATACCTCTTCTTCTTCCTATGTTTCTCTACTTCTATTTGTTTGGGTATACCAATACAAA:1	+	chr2R	6133454	3'	-	TART-C	10720	1	71.92
AACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTTACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAAC:1	-	chr3L	19036015	3'	+	Tirant	335	2	78.07
ATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACT:1	-	chr2L	15991286	3'	-	mdg1	7083	2	50.00
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCT:1	+	chr3R	17420487	3'	+	roo	330	2	76.98
GTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTTTGCAGCGCAGCTTGAAAAGGACAGGATTGATTGGCATTTTATTCCCCCGGCAGGACCTCACTTCG:1	+	chr3R	19447549	3'	+	roo	462	2	51.52
GAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGGATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAAACTTACCTATATACGCAATATTAAGTTATTAAACAATGTTAAAGTATGAAGTACT:1	-	chr3R	22388919	3'	-	G2	2612	1	76.71
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCACACAAGCAGACCCCAGAAG:1	-	chr2R	13710582	3'	-	roo	42	2	56.10
GTTGATGTAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAAATACCGTTTAAAGTCACTCGCACCTACATGGACACACACAACACAGAGACAGAC:1	+	chrY	3631950	3'	-	Stalker3T	317	1	43.70
ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCAAAGGAAAACACTTACCCAAAAA:1	+	chrX	14824774	3'	-	jockey	4750	1	65.47
GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTTGCCGCCATTT:1	-	chrX	6498920	3'	+	Quasimodo	7336	2	59.29
AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATCGGTCAACTGGTCCAAAGCTATCTGGATG:1	+	chr2L	11518494	3'	-	412	54	2	53.42
AAAGGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAAAAAATTAAAAAAATAAAATAAAATAAAATAATAAATTCTATTAAAATTGCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATTAACTACCTTGTTTAAATATTTTTT:1	-	chr3R	16799766	3'	+	X-element	4685	1	51.37
TAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTATACACTGCAGAAAACTGTCGAAGAATTACAAAA:1	-	chrX	21669986	3'	+	Stalker2	7595	2	54.11
ATTCAAGAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCC:1	-	chr3L	26852645	3'	-	1360	77	1	67.41
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCG:2	+	chr2L	17420255	3'	-	roo	8722	2	58.90
GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATG:1	-	chr2R	5485104	3'	+	blood	340	2	51.56
AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGTACATACATATCTATACATACATATATGTTATATGTATGCTCGCATTTTATATGTATGTGAATGCATGTGGGCATCTCTT:1	+	chr2R	15289236	3'	+	hobo	2930	1	70.43
ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTCCTGCACAACTTTAAAGGAGCGCTTGTGGAGGAAGCTTTT:1	+	chr3L	23906519	3'	+	1360	3387	2	79.23
GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTTCCACTTCTTTTAAAAATAGTGCTCCAACTGGTTCTTGGGTTTCCAAGTATTTGCAGGCACGGTCACACCGACA:1	+	chr3R	12408284	3'	-	Stalker4	38	4	51.37
TTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGTATCTTAGTATTTCAGAATTTAAACTTAATTTATATA:1	-	chr3R	14337419	3'	-	copia	4954	2	75.34
ATAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAAAGTATTATCAATGGGATGTATCTCAATTGGTTCTGCAACGCACT:1	-	chr2L	10197508	3'	-	FB	49	1	60.50
AAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTAGTTCGAAGCGCCGCACTGGCACTCCGTGCAGATAGTGGTGCTCGGAGG:1	+	chr3R	8387568	3'	-	mdg1	7142	2	55.56
GCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGGAGATTGAATTTTTCTGTTAC:1	-	chr2L	18158985	3'	-	INE-1	149	1	67.12
ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACACTGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCTTCGATGCGCGG:1	+	chr2L	21400378	3'	+	mdg1	7405	2	62.30
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGCTAAATGGCAATTCG:1	+	chr2L	18339063	3'	+	pogo	2076	1	51.92
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAACAGTTAATGA:1	-	chr2L	17420142	3'	+	roo	9018	2	56.85
ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACACACTGATTGGTTT:1	+	chr3R	20499852	3'	+	mdg3	5439	2	55.48
AATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGTTTGACGATGGACGTGTTTTCG:1	-	chr2R	5277124	3'	+	Quasimodo	7340	2	54.72
GAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATGGTCATGTTCTCCGGCTGCTCAGGTGGCGACCCACTG:1	-	chr2R	23332479	3'	-	invader4	17	2	71.92
AGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGC:1	-	chr2R	23466017	3'	-	Doc	468	1	69.86
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATT:1	+	chr3L	12879797	3'	+	roo	362	1	70.10
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTT:1	+	chr3L	9998186	3'	-	roo	66	2	67.39
TTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAGATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAAGTAGGAACAAATGAAGGCGCCACATCTCGATGGTTGTTGCCGCTA:1	-	chrX	4218206	3'	+	flea	202	2	61.54
AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTGGAAAACAATTAGTCAGAGAAGCAGACTT:1	+	chr2L	14081422	3'	+	1360	3364	1	63.28
GCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCGAGGCATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGATCTCTTCTTTGAAGACATTTGTTATTTCATAACTCAAAAATCAGCATCCAATCTACATTGGCTAAACAATGAAACGTA:1	-	chr2R	6636371	3'	-	invader1	3954	2	52.41
ATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGTAAAATTGTTGTAGTATGCACACATATCGGTTTATCACTGTACCTATATATATATATTTC:1	+	chr3R	3181075	3'	+	Cr1a	4162	1	57.14
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAAC:1	+	chr2L	7898365	3'	+	roo	322	2	75.34
TCAACCTTCTAGCATTTATAGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACAGAAGAACAAGAATCTATGTATATACTTTATACATATGGTCGGAAACCCTTCCTTCTACCTGTCTCATACTTTTCAACTAATCTAGTATACCCTTTTACTC:1	-	chr3L	23746964	3'	-	INE-1	160	1	63.01
GTTTTTTGATTTTTTTTTTCTTTTTTGGATTTTTGCGTCTCGTCGGTGGCGGCGCTTTATTCATAAAATCCGTCAGTTGCATGAAATACAGCTTAATTAACA:1	-	chr3L	10994635	3'	-	gypsy7	5014	1	87.25
GCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCTGCAACGCCTTGCCTCCGTGATCCTGATTGATCCTGATTAGGATGTTATGG:1	+	chr2R	4294651	3'	-	McClintock	5980	2	66.67
ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAAATAAATAACAATAATAGCATAGTGACATATCGATAATACTATG:1	+	chr2L	22685231	3'	-	Ivk	28	1	62.07
TTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAG:1	-	chr3L	23933562	3'	+	Cr1a	205	1	77.61
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCAGCCAG:1	-	chr2L	3114443	3'	+	roo	9054	2	71.32
AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTATAACACGGTATCATTTTCCAAGAACATGGGGCACCCAATTC:1	+	chr3R	17478490	3'	-	copia	4906	2	59.72
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCACTTCCTTGTTGTAGATTTCTCGCAGTGTATAGAATCTGCTGC:1	+	chr2L	5254385	3'	-	roo	8694	2	55.04
GTTTAAGATAAAAAATTCCTATGATTTAATGTTCCATTAGCACTGTAAATCATAGGAATTTTTTATCTTAAACTCTCAGGTCCGAAGCACTGCTATTTTTAAGAACACAGCTGTACTTCGAGTATACCACCTTTTATTCTTTATCC:1	+	chr3R	7141071	3'	-	HB	1587	1	80.14
AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTAT:1	-	chr3R	19589876	3'	-	BS	5002	1	74.42
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGCTTGACAAGC:1	+	chr2L	3886236	3'	+	roo	338	2	64.38
TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTG:1	-	chr3R	25448347	3'	+	roo	336	2	66.44
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATG:1	+	chr2R	9328696	3'	+	roo	361	2	53.08
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTACTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGA:1	-	chr2L	3114484	3'	+	roo	9003	2	63.01
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAG:2	+	chr3R	25448420	3'	-	roo	78	2	70.55
CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTATTTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCTCAGGCTAATC:1	-	chrX	2842472	3'	+	Tabor	7293	2	57.25
GGGGATGAGACGTCTTGCAAGAAGACTGCTATGGCTCAATAATCTGTCACCAAAGACACTAGAATATTCTAGGGTCTTTGCTGTCACTATATCGACTTGTAAAAGTTAAGGCGTCCTTCGATCGAGCGAA:1	-	chr3R	7480012	3'	-	Helena	1284	1	77.69
ATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTACTAGAT:1	+	chr3L	19014011	3'	-	invader3	40	2	52.42
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATTTCCT:1	-	chr3R	22844186	3'	-	roo	61	2	61.54
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGATCTGTTGACAAAAGACAAGCAAACTATTAAAGTGTTCTATCT:1	+	chr2R	23803075	3'	-	roo	31	2	67.12
CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGTTTCTCTGGATTTTCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAG:1	-	chr2R	15004751	3'	-	jockey	14	1	52.85
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAAAAAAGATACTTATCAGCTACGTGACAAGATACATATGTGATAGCAAAAATAAGAGCGATAAGATTTGTAATATGTTCTT:1	+	chr3R	26223008	3'	-	roo	7	2	77.24
CAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTGGGCTCTCTGTGGGATGCTTCTTGGATGGATGGGAATGGATTGCGCCTGTGTGATTGCACCTGC:1	-	chr2L	10671289	3'	-	Transpac	199	2	50.77
GGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATATGTGGAGGTGCTGAATCTGCTTTATATTTGAATTTTCCC:1	+	chr3R	22843751	3'	+	roo	8948	2	69.53
GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTTTATGGAAAGCTGATAAGTCAAATGTTGCTGGGCATTCTAGC:1	-	chr3R	26431928	3'	-	opus	140	4	65.75
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTTTCATGCCAAGCCGGGGATTAATTA:1	-	chrX	13039476	3'	+	roo	400	1	62.03
TGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCTTGCTCGCGCTGACCCTGAGCGCGAGTGTTGTTCGTGATCATATTTTTATTATTTAAGTATATATATTATTTTAAGATAATGAATTACAATATATATTTGAGCGATAT:1	+	chr3R	778384	3'	-	F-element	235	1	54.20
GCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1	-	chr3L	11115124	3'	-	micropia	4971	2	65.48
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGNTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAA:1	-	chr3R	7835103	3'	+	roo	9022	2	52.74
GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGTTGTAAGC:1	-	chrX	7195044	3'	+	P-element	2857	1	49.04
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAGGCTAAAATTAAAATAGCAACGCCAG:1	-	chr2L	14771990	3'	+	roo	393	1	73.24
ATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAAT:1	-	chr3R	21276538	3'	-	BS	5025	1	52.29
GAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGT:1	+	chr2R	10582504	3'	-	Juan	3831	1	61.64
GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACCAAATTTACCCATACACGATTAAATTTTAACTTTAATT:1	-	chr2R	9220969	3'	-	opus	10	2	77.70
ATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTCAGGCAAAGAGCAAAACAAAACATTATGTGCACAAAACAACAAGGCCATTATAAGCAC:1	+	chr3L	22393707	3'	-	1360	377	1	68.49
ACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACATTTCACTTTTTCTTTTCAGCCGCTGCCAAGCGAATGCGAACCAAAAACAAAAAAAAATAATAGATAAGTAAA:1	-	chr3L	2489076	3'	+	jockey	4733	1	54.03
CTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATGTCGGAATGTACTGTGGTACCGCTATTTTCTTCGACAATTAAAAGGGTACTAGATTTGTTGAAA:1	+	chr4	897200	3'	-	Quasimodo	53	2	58.22
GTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAA:1	-	chr2R	9258395	3'	-	3S18	5801	2	55.64
ACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAAAGTGCAGTCACACTCCCCAATCGACTCGACTTGACGTCACGAATGCACAGTGAG:1	+	chr3L	3473565	3'	+	mdg1	162	2	62.50
ACTGGCGGTTTTTTTTTTAAACAAGAAAATTACGTCCTTAAAGTTTTAAAATA:1	+	chr3R	13237356	3'	+	3S18	339	2	39.62
ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGGACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATC:1	+	chr3L	20033792	3'	-	blood	7049	2	45.19
GATTTATCTGGATGAAGCCGACAACGAAGATAAAATTACCAATCATTTTAGAAAAATGCCACCTAACAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAGGGATAAACCTTATGCGAAACTATATCCAAAGAAAG:1	+	chr3R	19447053	3'	-	diver	328	1	73.97
ATACGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCGGCCTTCCTTGTAAAATGTGTAGAAAATCTATTTA:1	-	chr2L	6002344	3'	+	opus	7471	2	71.05
CCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTGGCACTCACCCCGATCATGACCAGCTTAGGCTATAGGGGGAACAATAA:1	+	chr3R	12077485	3'	+	opus	67	4	66.13
CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGGAGCAGTCGAGAGTGGCCTAGTTTTTGGGTTCAAGGGACAATGAATGTGCGAAAAATATTTTATGAGCTATAT:1	-	chr2L	2687324	3'	-	copia	43	2	50.00
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTG:1	-	chr3L	15600197	3'	-	roo	8737	2	72.46
CACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACACGTTCTCGTTTATTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTAATTTGTCAGTCGAATAAATGATCCGTCAATAACAAAG:1	+	chr2R	3146366	3'	+	gypsy	7425	2	38.81
TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAAC:1	-	chr2R	20496909	3'	-	blood	7073	2	59.59
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAAATCAAACTCACGCTTTTGCTAAGCTAACTAAAAATGTATGCTT:1	-	chr3L	11530852	3'	-	roo	35	2	61.64
TCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTAGGTGAATATGAAGGCGATTTGGCTCACCGGCGGATCGCCCA:1	-	chr3R	20749488	3'	+	Tabor	7230	2	71.92
GTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCAT:1	-	chr3L	2362343	3'	-	Stalker2	70	2	69.47
GTTTATTTTTTTGGTTGGTTTTGAAAGGG:1	-	chr2L	17493588	3'	+	Tc1	1404	1	75.86
GAATATTTAAGTCTATTTGGATGTTTTCGTTCCTGATACTGTTGGAGATGGTGCTCCAGTTGCTGTTGCTGGTGCTGCTACTGATGGTGGTGGGGGCGGTGAAGGGCCTAGCACCTCAGCTGC:1	-	chrX	5615001	3'	-	F-element	4388	1	73.17
AAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATATTCTCCGTTCGGAAAGACAGCCAGCTCATTAAGCCCTCCATTGACTGGCTAAAGATGGAACA:1	+	chr3L	16168481	3'	+	Stalker4	7228	4	54.74
TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTACATATATATCTGCATTTTATTACAACTTGTTAATCACTACAATAAGCATCTCAAGCGCACATGCT:1	-	chr3R	6664935	3'	-	I-element	51	1	55.17
AAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTGATATTGGAAGTCTAGCAGTCATTGCAGCACTGACAAAATGGCGTGTGTATGTTCAGGGAAAATAGTTTTAAATCGTCATGCGTTAAATTGTAATGCGTTTGCAATG:1	-	chr3R	1445604	3'	+	1360	372	1	71.23
GTAATTTCTGCATTCCAAAAGCAAACTTCAAAGGCATCATACGTTTTGGCAACGCAGCTTGCGGCTGTGTGACCCGACGGCTGTTACCCCGGTTATCTATTTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCCAT:1	-	chr2R	5019412	3'	+	Transib5	197	1	70.83
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAAAG:1	-	chr2R	14542123	3'	+	roo	9020	2	54.11
CTATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAAT:1	+	chr3R	934274	3'	+	Rt1b	4723	1	49.32
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACA:1	-	chr2R	13585423	3'	-	412	78	2	71.23
TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCC:1	-	chr3R	22844214	3'	-	roo	8749	2	80.58
GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGTGGCA:1	+	chr3L	26011939	3'	-	F-element	67	1	72.17
ATATTCTTCGAACAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTTAATACTTTGGCACCGCCCAAATCGTTATCTATGTAGCTTTCTAATCATTGTCATTTCCACACGCAAAAGTCATTTGGCACATGTGACACCCTTTTCT:1	-	chr2L	5396028	3'	-	Tc1-2	245	1	63.01
CTAATTATAAATAAAATAAAAATATATATGGATTTACATTTTCCCTGCATTTTTTACTTTATTTTTTTTTACTCGTAAAGTTGCAAGTGGCGGCCATTTTGCAA:1	-	chr3R	13889015	3'	+	transib4	2574	1	51.92
CGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGGAATGGAAAACCTAAAAATCTGGGGAGATGTG:1	-	chr3L	20662429	3'	-	roo	8881	2	78.08
GTTCCTATTGAATCTACTTGGAACAAATAAGTTAAGCGACTCTCAACTTCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACGGTTCCAAGCATCGTTCTACGGTAAGCTAGGGCCTCGTATCTGGCATATTTTTGAGC:1	+	chrX	17520551	3'	-	Cr1a	4111	1	55.97
GGTGATAGACGCTAAGGGAGGGTAAATTTTTTATTAATTTGTCATAATTTTGTAGTTGACTTTTTTTAGTAAATGCCGATACATTGTATTTTTGTTATTTGCGCGCGGGTGGGTACCGATAAAAACAATAACAACAAATTCAGAGA:1	-	chrX	7705831	3'	+	Tc1-2	1342	1	54.79
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTGCATCTGCATATCAATT:1	+	chrX	6486845	3'	+	roo	9051	2	65.07
CTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTGTATTTTAGTGTTGAATGCTTTTGTCAAAGTAAAGTTAGTTCTGGAATTGCATATTGGCGTCGCATCGATCGCTTACCGAAAAGCGAAACTCAATTATATAATG:1	+	chr2R	5421894	3'	+	S-element	1517	1	66.67
GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCG:1	-	chr2L	10023014	3'	-	Doc	78	1	72.09
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAA:1	+	chr2R	14542202	3'	-	roo	76	2	80.77
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAAT:1	+	chr3L	233359	3'	+	roo	9036	1	60.96
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGTGCTCGCAAA:1	-	chr2R	13084606	3'	-	roo	66	2	72.09
TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCCCGCTGCTCATTCAAATGCAATTTTGTTGCAAAGTTTCGATTTCGTTGTCACTCCCATCCTC:1	-	chrX	2295888	3'	+	Tirant	364	2	52.00
AAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGACA:1	-	chr2R	4260421	3'	-	micropia	5199	1	34.09
AAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTATTATGTGGCCGCAAACAAGACCAAGAAAAGGTAAGGCAAATAGGCCGAAAATGAAAATGAAA:1	+	chr3L	7943092	3'	+	Burdock	17	2	55.94
AATATATTCAATATTTTTTTTTAAAAGTTATTCTACAATAAATGAACACATTGGCAACGCAAAAAATTAAGATGGAGGATGTTACCATAAGATATTGCATAAATTTAAAATATGCGCTATCTATTCGGGGTATGCCTATGTAAATC:1	+	chr3R	7495638	3'	-	Tc1-2	1594	1	79.45
AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACAAACAGCTGTGGTCGCAACG:1	+	chr2R	8146138	3'	-	P-element	59	1	43.84
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCACTGTCGCCTCATATCTGTGAATT:1	+	chr3R	22844328	3'	+	roo	392	2	72.60
TTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGCCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCT:1	-	chr3L	19013893	3'	+	invader3	5432	2	61.19
ACGTTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATAC:1	-	chr3L	17558024	3'	+	jockey	4923	1	70.00
GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACAC:1	+	chr3R	10274045	3'	-	HMS-Beagle	44	2	53.79
AATAAAAAAAAAGCAAAATTAATTCAAGCGCCAAAAGTGGCGCGTTGATAACTTTACACTCAAATGCACAAATTGATATCCTTCTTCAGTGTTTAGTGTTTGACAAATGTCGGGGCCAAGCGGCCACATCCTTGTAATCCT:1	-	chr2L	17961374	3'	+	HeT-A	323	2	63.83
TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACA:1	-	chr2L	18294217	3'	+	roo	321	2	79.45
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGCGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTAT:1	+	chr3L	22437953	3'	-	roo	8717	2	61.54
CATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTCTGATTAAACCGTGTGGACAAGTTCATTAAACTCGCTGGCTGAAACCATTTGCAGGCT:1	+	chr2L	6727844	3'	-	Stalker4	411	1	57.04
ACAAGAATGGCTAAGTGGCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAATAGGCAAAAGTACGTACGCTCAGAGAAGCTCCACCTGGC:1	-	chrX	20760680	3'	-	17.6	186	2	69.92
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTC:1	-	chr3L	11393487	3'	-	roo	71	2	70.55
TTATATAAAATAAAATAAAATACTAAAATAAGATAAATTTTTGCATACCAAACCCTTTTAAAATACATGTGTATGCTCGTTCCAGTGAAGCCATCTCGAATCATTGCTATCTCCATCGTCTTTTCCTTTCACAGTTGACAGCTTTG:1	+	chr3L	16759883	3'	-	transib1	1904	1	86.30
ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACCCCAATAACTTTTATTAGGCTAAGTA:1	+	chr2L	22775605	3'	+	pogo	2068	1	61.38
TATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGTAGGATTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATGTTTTT:1	-	chr4	1152022	3'	-	transib2	78	1	69.44
GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGC:1	-	chr2R	7586142	3'	-	I-element	5052	1	60.20
AATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATAGGGTAATATTATTGTTTACCTTTTGAAATCGCACCAATTTGTTGGTAACTTTAGCTTTTAGCCATGAAGCATCAT:1	-	chrX	14750662	3'	-	copia	4836	1	67.89
AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAG:1	-	chr2L	17081781	3'	+	jockey	4949	1	53.91
AAAAAAAAAAATAATAGAATAAGGGCCCACTCCCAGTGTGTGGGTAGGTGTATGCTTTTATTTGTCAAGCGAATTGAATCCGTAACATCCAGCCG:1	+	chrX	8978833	3'	-	Tc3	79	1	64.21
GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGC:1	-	chr3R	9921996	3'	-	blood	82	2	76.71
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTT:1	-	chr2R	21907925	3'	+	roo	361	2	58.06
AAAAAATCTGAAAACGAAACAGGCAATTGTACATAACAAGCCAGAAATTAGTTAGGAAATTATATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTACCCTTCCTCGCTAGTAGTGGCTTTACATAGTCATTCTCTACATGAAAAACTT:1	+	chr3L	25340179	3'	+	F-element	107	1	63.70
ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAG:1	-	chr2R	19499346	3'	+	P-element	2801	1	17.69
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACT:1	+	chr2L	21884599	3'	+	pogo	2042	1	67.42
ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGAAGTCTC:1	+	chr3L	3863534	3'	-	blood	48	2	52.21
TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTACCATACAGAGGTATGGTATGAAAGATCACATGTAGATTTTAGATCTGGG:1	+	chr3R	10181391	3'	-	blood	12	2	68.09
CATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGG:1	-	chr2L	12290691	3'	-	1731	88	1	75.34
ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCTTATTGGTTGATTTTTATAGCTAGACATAAAACTGGTTGTGTTATACTATCTTAGCTAAAAGCAAATTTAGCAGCTAGCCAATTTAAGTTCGACTTTAAAGAGTG:1	-	chr2L	9399394	3'	-	Transpac	4928	2	76.06
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGATACAATCAAGT:1	-	chr3L	11441704	3'	-	roo	8700	2	59.31
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTGTGTTGTTTTAACCTACAAAATTGCAATGAAAAGTCGGTACATTTCTTCCTCTGGAGCCTGACGTAAAAAGCTT:1	+	chr3L	21818086	3'	-	roo	48	2	54.11
CCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTGATCTTCTGTGGCCTTGTCTAGGGCTCAGAGCACA:1	+	chr3L	16835403	3'	+	R1A1-element	5298	1	70.37
AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAACAATTAATATTTATTATTTTTCT:1	+	chr3L	10574404	3'	-	Tabor	27	2	54.35
ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTT:1	+	chr3R	22822170	3'	-	mdg1	7044	2	60.43
GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAGCTAGAAGTTAGGAAGGCTGCGTTGGATTGATGTTCGGACACTGAGTCA:1	-	chr2L	21153456	3'	-	1360	11	1	71.19
AATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTAGATTCATAAAACTCTGCCAATTATGCGAACATTCATGATTCTGTATGAAGTGCGGCTACCGTTC:1	+	chr2R	9258549	3'	+	3S18	320	2	51.82
AGCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGACAAGGAATCCAAGATCCTGATTTATTTTGAATATT:1	+	chr2R	3760469	3'	-	accord	68	2	72.09
GATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGGGCATTCGGGAAATACGTGAGCTTGGGCTGCGTGGAAAGCACAAGA:1	-	chr3R	7835305	3'	+	roo	8745	2	68.06
AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTTTTAATT:1	-	chr3R	21434866	3'	-	412	7107	2	54.79
TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGTGTGACATTCACCCAGATTGGCCAGGTATAAAAGAAGGTAATTGCGGCGAGGCCCG:1	-	chr2R	1462848	3'	+	hopper	1354	1	74.66
TTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATTATGCAAACTAATTAAAATACTCATACGACGCGTTCAACTTGCGCTTCTGTTACTGCCAACCCCGCCCCCATCCTTTCT:1	-	chr2L	15991701	3'	+	mdg1	7003	1	61.76
GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCGCAACTCCCACTCCAAATCCAATTCTGTGTCGTATGTGATGCTCCC:1	+	chr3R	17316329	3'	-	opus	64	4	66.43
ATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTACCAGGGCATTTGTTTATTCAGGCCGGGCACAGAACCTGTTCCACGATGGGATCA:1	-	chrX	18386355	3'	+	invader4	3077	2	71.70
GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGT:1	+	chr3R	14651264	3'	+	P-element	2838	1	31.68
TTAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCATTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTGTGCCTT:1	+	chr3R	19265874	3'	-	I-element	59	1	70.43
GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGC:1	-	chr2L	23372626	3'	+	1360	3333	1	70.83
GATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCG:1	+	chr2L	6570031	3'	-	jockey	4838	1	51.09
GAATATAAATTATAAATTAAAAAATATGGCTTAAGGGGAGTTATATATGTTAACAGTCAAGTTTGAAGTATTTTTTCAATTTTTTTAAAATGAAATCATTAAGTAAAGTCAAAGATTCTATATAATTTAATGGAGGAACTTCTTAG:1	+	chr3R	19593409	3'	+	copia	5120	2	62.33
GTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTC:1	+	chr2R	6085998	3'	-	1360	339	1	76.99
ACCAAACTTACGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTACTCTGTCTATATATTTTTTACTATGTTTTGCTATTTGTGGCGTGGCAAAACTACACCCTAATTGTCTTAGTCCTCATGGAACCGACCAAAAAGAAAGTCACAAGTATAA:1	-	chr3R	5444134	3'	-	G4	3640	1	56.85
AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCAC:1	+	chr3R	17243245	3'	+	hopper	1392	1	66.19
CGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGATAGGGACAGTAGGAATCAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCAC:1	-	chr3L	23112569	3'	-	R1A1-element	32	1	59.59
CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGCGAAGTCACGTCTCT:1	-	chr2L	5844961	3'	+	transib2	2798	1	63.28
TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTATACATTATGTTGTTATTACATATTT:1	-	chr2L	8986081	3'	-	412	23	2	68.49
AAATATAATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACAT:1	-	chr3R	16076796	3'	-	roo	73	2	72.14
AAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTTGCCGCCAT:1	-	chrX	6498922	3'	+	Quasimodo	7328	2	55.48
TATTTATACATATACATATACATACATACATATATATATATATGTGTATATAAAGGCAGGACATCTTTGTGAGAATTTACGATTCGTCAGGTGCTGCAAAGGTGCTAGAAATCCCGCGGACAAGTGAAAAGGACGAGCTGCATTC:1	-	chr3L	12683741	3'	-	Stalker4	245	4	74.48
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACACA:1	+	chr3L	12879808	3'	+	roo	396	1	51.35
GTGTGAATGTGCGTGTGTGTGTTTTTCCGACTCTCAACTATTTAAGGTCGAATCATAAGACATTGATACAAACGAATTGCAGAACACAGA:1	-	chr3L	9961242	3'	-	accord	189	2	52.22
GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGG:1	-	chrX	10644453	3'	-	jockey	4759	1	65.00
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCCTCCTTCTCGAATGGTTGATTCTGCTCTCGT:1	-	chr3L	10773088	3'	+	412	7499	2	72.82
CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAG:1	-	chrX	18193674	3'	-	jockey	86	1	67.81
ATATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTATTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCTTAAGTCGAGTGTGGCACATTTGGCTATATTTTTGTTATGTTTATGCAGGAAAACCAATGGCCAC:1	-	chrX	19817459	3'	-	invader3	5088	1	74.66
ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTCGATAGGCAGGTACAGGCCCATTTCTCGATGTGTTCTAAAAATTTTCCACTGACAACGTAAGCAAAC:1	+	chr2R	19499429	3'	+	P-element	2884	2	75.44
AAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGATAGAAAACGAGCCCTGAAATGCGG:1	+	chr3R	27888073	3'	+	gypsy7	5008	2	58.70
TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCATGCCCATCCTTCGTAGTTTTCGTCGCTATTCC:1	-	chr3L	18368871	3'	+	opus	481	2	71.92
AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACAAACTTTGATTGCCCAAGTCCTACCAAGGACTACCCTGAACACCAAGAGCCCCAAGGACCCCGAAGGACTTACGTTCGCGTGCCGACTGATGCAGCTG:1	-	chr2R	13817585	3'	+	412	471	2	69.86
AATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCCGGACTCAGATGNAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCCCTGC:1	-	chr2L	11518379	3'	+	412	495	1	74.44
GGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGA:2	-	chr3L	7292481	3'	-	HMS-Beagle2	6964	2	76.03
ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGC:1	+	chr2L	14892312	3'	-	transib2	55	1	58.33
GTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGATAATTTAAAGTGGCGCCAAGGCAAATGGAAGTGGAAATGGATGGCCTTATGAGCTAG:1	+	chr2R	16793209	3'	-	I-element	5136	1	60.55
CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCAGATT:1	+	chr3L	16973500	3'	-	S-element	8	2	75.19
TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGCCAAATATGTATGCTAAGCACGCACATCTTTCAAATTAGTTCTCCAAAAGACGAGAAATCATGCTC:1	+	chrX	10537445	3'	-	I-element	52	1	51.39
TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTCTCTTTGTCTGT:1	+	chr3L	21855565	3'	-	blood	7043	2	62.33
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCC:1	+	chr2R	11164488	3'	-	roo	8742	2	75.34
AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATTTGATTTGATTTCCTTAGATAATTG:1	-	chr3R	22217815	3'	+	hopper	1375	1	56.85
ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGACTGTCT:1	+	chr3R	14981288	3'	-	mdg1	7065	2	65.75
TTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGG:1	+	chr2L	5845053	3'	-	transib2	87	1	76.71
GTTTCTCATTTTATTCTCCTTAGTAGCCCAAAGTATCTGAGACACATGCATTTTTGATAATTGTTATTTATTAATAAACAGAAAGATATAATTAAAAGGGTAAGTAGAAAAAGTGCACCTCTACAAGCTTGTCAA:1	-	chr4	827823	3'	-	mdg3	5154	1	70.37
AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAA:1	+	chr2R	9632173	3'	+	roo	324	2	73.97
TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACAGTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGCTACCAAGCGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTC:1	+	chr3R	12717823	3'	+	297	340	2	67.19
ATACAAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGAACTTTTTTATGTGACATTATGTCACATATGTGTTATGTACATAGATTCGGCTATTACTTTATCTAGTCTGCGACCAGACAATTCGCACAAGTCAAGTCAGCAGAGGAGAAGAGA:1	-	chr3R	26091739	3'	-	1360	391	1	61.64
GTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGTAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCT:1	-	chrX	21087612	3'	-	mdg3	40	2	68.75
AGGGGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGC:1	+	chr3L	7588485	3'	-	hopper	81	1	72.03
ATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATAAAACACTTTCTCAACTTAAACCACATAAATAAACGGTGTGATGGATGAGCCCGTGCCATCTGATTGATGGAATCAATAAATCTTTGG:1	-	chrX	6961984	3'	+	G5A	2767	1	58.90
ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACATCGAGCTGGAGGAGATGGTAGGAAATGCACAAGAGTTCACAACGTTCAAAGTTCATATGTGC:1	+	chrX	10521767	3'	+	Tabor	473	2	72.39
GCTAGATTTAGCTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAA:1	-	chr3R	6611203	3'	+	HMS-Beagle	183	2	65.19
AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATA:1	-	chrX	13066520	3'	+	jockey	4931	1	68.46
GTATGTGTTTATATCCATGTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCTTCCGGTGGGCGGGTCCTGGGATCCGCGTTTT:1	+	chr3L	12308418	3'	-	hopper	975	2	54.62
TAGCTAAATATCATTTTATGAATTGATTAGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGGGCAACCAGCCAGACCAGTTGGTCGTTGATTAAGCGAGTGCATATGGCAAGGGCTTCTGGCATTAGCG:1	-	chr2R	13324861	3'	-	Doc3-element	4637	1	66.14
TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCACTTAAGATCAAGATATTACAGTTTT:1	+	chr3R	22822170	3'	-	mdg1	7051	2	56.16
GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCATTCATCTAAATGGTCAGGTGTTTAAGTGGAATTTTATGTCAACTTTA:1	+	chr3L	3501066	3'	+	opus	7475	2	67.81
CAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTCGGTTGGAAATTGATAAAAGGTTTTATTGCTTTACCGGAAGTGGGCGGCAAGTTGGATTGACTTAACTGACCTGCAGCTGTAGTATTTACTTTTGCATCTGCA:1	+	chr2L	15763135	3'	+	mdg1	48	9	72.39
AAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAATATACAATACAAAAGTCTACGGCTTCAATTTTATTCGTGTATTCGTTGACAAAGAGAGAAGATACATAAGGTTTCTTTTTTTTATTATAAT:1	-	chr2R	13811969	3'	+	FB	495	1	58.22
ACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTA:1	-	chrX	13126470	3'	+	jockey	4921	1	74.07
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCC:1	+	chr3R	27994276	3'	+	roo	9032	1	55.00
GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTT:1	-	chr3R	19449987	3'	+	roo	8972	2	80.14
AAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGTGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACATGTAAGAAAGTATTTTTCACGTAAGAGAAGCAAATCAAGCAGGTCCAGTAGTAAAAGCAGAAAGACAA:1	-	chr3L	23646574	3'	-	1360	245	1	52.74
AGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACAATAAATGATTGGGTATTCCTATTTGCAACCCTAAACGAGAGCTGAATGTGTTTTAGTGGATTTTTTTTTTATGAGGAGAGGTCAAATCGTATGAT:1	+	chr3L	23665485	3'	+	Stalker4	6960	4	64.57
AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGTTGTGTCCACTTTTCCCTAAGGGGAATGCAAGTCTGTGCCAACAACTTGACGTTTAAGGGCCAAGCCAATCCCC:1	+	chr2R	7452978	3'	+	pogo	2078	1	69.86
AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTCTTTGTACACCGTCTCTCACTTGCCGCTA:1	-	chr2L	23313684	3'	+	S-element	1636	2	79.26
TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTC:1	+	chr2L	7810138	3'	+	P-element	2832	1	47.95
AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAG:1	-	chr2L	3164977	3'	+	412	439	2	74.76
CCAAAAAGAAATTGCCAACATAACACCTGCTATGCTAACCAGAGTCGAAATCGACCATAGCGGGACTCTAGTTAGAAACCCATTTTGTTGAAAACAAGCTGTGACTTGGCTTGGGAATTTCT:1	-	chr4	641234	3'	+	mariner2	673	1	65.57
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTTGCCACT:1	-	chr2R	9632074	3'	-	roo	7	2	69.03
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTATGCTCGGTGATTCAATGATTGAGATAGATACTTC:1	+	chr2L	3114612	3'	-	roo	8682	2	73.91
TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCAAACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAG:1	+	chr3R	22822115	3'	-	mdg1	7051	2	42.86
ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCAGTCTGTTGGCGACATTCGTCCATTGTCCTGCTCGATGGATAGACACGCGCTT:1	+	chr2L	21891810	3'	+	mdg1	356	2	64.58
ATTAAAAAAAAAAAGGGAAAAGTTAGTTTTTCAAGCTCTATGATGAAAACTATA:1	-	chr2R	21797944	3'	+	Bica	338	1	77.78
ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAAT:1	+	chr3R	22822147	3'	-	mdg1	36	2	41.78
TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTGATTTTATTGATTATAAC:1	-	chr3L	15519715	3'	-	pogo	28	1	69.86
CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAG:1	+	chr3L	9673116	3'	-	Doc	84	1	69.18
ATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATTCTGAAAAGAACAATATATAAACATATAAACAAACATATAAAAATATAAATAATTAAAATCATCGGTTCAACTCTGAACCCACTAGTTCCATAAAATTAGAGATTACATTGA:1	+	chr3R	17239136	3'	-	hopper	1356	1	80.82
TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCGGGCTTATATGAATTTGAGGTGCACTGAAAGAATACTTCCTAAATAAATGGTGTTTATTTCCCCA:1	-	chr2L	16016312	3'	+	412	447	2	51.85
AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGTTCATTCAGCCCACTTCCTACCTTTTTGTATG:1	+	chr3L	17685265	3'	+	mdg3	237	2	55.24
AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGGAAACTTTTCGCAAAAATT:1	-	chrX	10644415	3'	-	jockey	4790	1	58.14
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGGATTT:1	+	chrX	13039523	3'	-	roo	24	2	74.29
TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCAC:1	-	chr3R	12717751	3'	-	297	36	2	68.63
AAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGATCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGGCACTG:1	+	chrX	21907825	3'	-	springer	474	1	73.91
AGGACCTGGTTGACTCCATGCCAAAGCGTTGCGCACCTATTATTGCTAATAAGGGTTTTAATTTAACTTAATATGCGTTTTTTTTTGAGGTAGTTATATTATATTTCTTGCCTAACTTCGTCGTTATTAAAAAAGGTAACTAGGAT:1	-	chr2R	8106929	3'	+	Tc1	1281	1	56.16
ACTGCACTCGTTATTGCAGCGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGCTG:1	-	chr2R	23466015	3'	-	Doc	493	1	53.00
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCA:1	+	chr2L	7945385	3'	-	roo	8704	2	71.28
TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTCCTCGTCGCTGGTGAAGTAGTTCCAGTGCTCGGTGCCGTAGAAGTACTTCTCGTACGTCTCCTGTTCCACAGAGATCAGTTCGAATG:1	-	chrX	13068379	3'	-	jockey	4819	1	56.85
AGTGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACAA:1	-	chr3L	23797670	3'	-	Helena	1172	1	44.76
AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAA:1	+	chr3R	29361029	3'	+	mdg1	332	2	80.14
GTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGGAATCCCTTGCAGCGGAAAAAACAACCAATGGGCCCGCCAATTTTCTTATTAACCCAT:1	-	chrX	6929643	3'	-	gypsy7	5007	3	83.33
ACAATAATACTAATAATCTTAATGTTTCAATTAGAAAAAAAAAAAGTGTGTAAATTGAAGGCGAAGTGGCTTTAAAGAAGAGAAATACGTTACTTATAGTTTGATTCTTTTCATTACAAATTTCAATATTTTGTTCGCTTTCACCT:1	-	chr3R	20305823	3'	+	mdg1	7073	2	64.38
GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCTCGACG:1	-	chr3R	10273969	3'	+	HMS-Beagle	6989	2	76.15
AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGCGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCG:1	+	chr3R	27424902	3'	-	blood	90	2	76.42
ATAATATATTTAATTACATACAATTTTCGAGGAATCAAACTAGTAAGCTCGTAAATTAACAAGAAGAGGGTTATGCTCGGGATTGCTGATGGATTACAAATTAAGTTGAAACTTAACTTGATGTGGGCTGCATTATCGAAAAGAGA:1	+	chr2L	13999661	3'	+	transib1	1935	1	71.92
CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTGGGTGTCCCTGGCTCCCACAAAGGGAATTCTTAAATGGG:1	-	chr2L	15875757	3'	-	hobo	43	1	67.29
TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGTT:1	+	chr2L	11661034	3'	-	F-element	39	1	46.51
ATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCG:1	-	chrX	21564649	3'	+	diver	6060	2	55.94
GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAA:1	-	chr2L	5845000	3'	+	transib2	2741	1	75.34
GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATTATAATTATTTCAAATAGGGTTTTTTAGCTCTTGCTCGCTTCTAATAAATTCCGTACAAAACTGACCATAAAGATTTAATTAATACAACATGTGCTTCAGTACATGGAAACAA:1	-	chr3L	3500875	3'	-	opus	7	2	79.45
TTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGATTTTCAAAATGTTGCATGCCGCGTAATGTAATATACG:1	+	chr3R	5810373	3'	-	Cr1a	4016	1	68.37
AAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATGTTTTATCGAAGAGGTGCAAATAACAATAATAGAGGATTCCGAGGTTATAATCGTGGTAGAAATAGCAACCACAACAATTACAACCGAGGCAGCAATTACAACAATAACAA:1	+	chr3R	23184751	3'	-	TLD2_LTR	100	1	74.48
CAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATAAGTTTAGTTCTAAACTTATATCCTGCTGCTCTAACGAGTCGAAAAATAAAACCAAA:1	+	chr3R	1431562	3'	+	mdg1	7127	2	56.92
GGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTG:1	-	chr2R	11629732	3'	-	Tirant	8118	2	71.96
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTATGCTCGGTGATTCAATGATTGAGATAGATAC:1	+	chr2L	3114609	3'	-	roo	29	2	67.81
TTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCAT:1	-	chr3L	2362343	3'	-	Stalker2	74	2	70.37
AAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCAT:1	+	chr2L	21153572	3'	+	1360	341	1	49.32
AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTT:1	-	chrX	17756577	3'	-	297	6603	2	54.72
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGGTCCGTCGAGAATGCGG:1	-	chr3R	25448291	3'	+	roo	9057	1	75.17
ATAAACACACACACACACACACACACATACACACACCAGTGAGCATCCAAGGTCGTTCTTCGGCGCGTAAAT:1	+	chr3R	29326864	3'	+	accord	7027	2	69.44
TCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAA:1	-	chr2R	20496928	3'	-	blood	7091	2	73.79
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAAGGGGAAGTGTAAAAGAAAACCCTTTTATTT:1	+	chr2R	7898222	3'	+	roo	400	1	76.71
CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAA:1	+	chr3L	20033796	3'	-	blood	7056	2	47.26
GGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCGCATTGCAATTAGCCGTCGTTTTCATATAGTTCAGTTACCCGACAGCCAAACGATTTGCACTGAAGCGGTGAGCGG:1	-	chr2L	5003365	3'	+	P-element	264	1	52.74
ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGTGCCTATTATGAGTAATGTAA:1	-	chr3L	11321377	3'	+	mdg3	222	2	61.48
CCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTG:1	+	chr3L	7588476	3'	-	hopper	93	1	80.14
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCG:1	+	chr3L	16343307	3'	+	roo	9055	2	63.64
AAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGAGCCGAAATCAAATCTAAACTGTGCCTTTGCCAGTTAAAGGTCTAGCTATGCGTAGTT:1	+	chr2R	1338218	3'	-	1360	3263	1	70.34
TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACCATCTAATTGCACAACGCGCGAGTGCGAG:1	-	chr3R	30344583	3'	+	pogo	2084	1	66.67
AAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAAAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAAGGTTGGGTAAGAATAATGCCGAAAGACAGCTCGAAGTACCGA:1	+	chr2R	6486764	3'	+	Circe	7362	2	73.13
AATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATCACCTCCGTTTGCCAGCGAGCAAATTCATTGTGCTCTGCCCGACTGAACTC:1	-	chrX	17463158	3'	-	Stalker	7182	4	65.07
ATTAAGCAAAAACCCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCGTGACAAACTGTATATATGTAGTTAATCTATAATTTGGTACAAACATTTGGAGAGTTATAAGTACCGAATTA:1	-	chrX	13275925	3'	-	S-element	64	1	60.96
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTATGCTCGGTGATTCAATGATTGAGATAGA:1	+	chr2L	3114606	3'	-	roo	33	2	64.38
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCAT:1	+	chr3R	27994278	3'	+	roo	391	2	61.00
ATTAATAATAATAATAATATAATAATGCACTGTCGTGTTGCAGCTTTTAGTTTGTCCTTTTGCGGTTGTTGCATTTACATCGGGCTCTTTCTTTTTGTTGTGTCAACACTTTTTGGGCAACAGTGCGGGAATCAT:1	-	chr3L	3138013	3'	+	mdg1	52	4	70.37
GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATTTTTGTCAAGTCGCATTAAGGCAGCGCGCTCATTCGACTTGTTCGTTCTGCCCGTCGACTGCTGACGAAA:1	+	chr3L	13574564	3'	-	hobo	24	1	67.81
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGAC:1	-	chr3L	16343236	3'	-	roo	8739	2	75.94
AAAAAAAGAAAATCCGGTTAGTTTTTTCCTTTCCTATCCTTTTTTTATTTACATTCTTGAGCAATTTTTAGTCTGTTCATAAGAATAGCAGTGTCTGGTTTTGACCAACGTAAAGTCCTCTTGTGCCTTAAATTCTTTAAATTTCT:1	-	chr2L	18854821	3'	+	HB	131	1	71.23
CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGTTTTTGCATTTACATTCTAATCAGC:1	+	chr2L	17079859	3'	-	jockey	4718	1	55.48
ATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTGAATTTCCATTCTCTTTCATTTCAATTATTTCGTTTTTAAAGTGGGTTAAAAATAGCATTTTGGGCATTGAACACCAAACTGACTCTGACTCTCAGAGTC:1	-	chr3R	16076598	3'	+	roo	126	2	71.72
CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGTATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACCCTTATTCCATCAGGAACAGTGATGTCA:1	+	chrX	4215078	3'	-	flea	4762	1	73.44
TCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAG:1	-	chr3L	23933559	3'	+	Cr1a	221	1	72.73
TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAA:1	-	chr2R	18336173	3'	-	roo	89	2	82.19
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGGTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAA:1	+	chr2R	13696463	3'	-	roo	8739	2	80.30
AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTT:1	-	chr2L	8986124	3'	-	412	7119	2	63.70
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCCTGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGAT:1	-	chr2R	19050192	3'	-	roo	66	2	60.27
AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGCTGCCTTTAACCCATTATCTAC:1	+	chr3R	13501169	3'	+	hopper	1410	2	62.67
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGCTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTAC:1	-	chr3R	7835133	3'	+	roo	348	2	69.05
AAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTAT:1	-	chr3R	9201036	3'	+	R2-element	3225	1	64.38
GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACTGCCGCTCATCTGGGCCACAAGCA:1	+	chr3L	2362420	3'	+	Stalker2	353	2	59.26
AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGCTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGACCACATCAA:1	+	chr3L	9907413	3'	-	BS	5002	1	71.92
CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACAT:1	-	chr3R	22821984	3'	+	mdg1	414	2	50.47
GTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCACATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCCGAAAGCCAGAGGATCAGGAGCA:1	-	chr3L	2362295	3'	-	Stalker2	30	2	60.43
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAAATATTGTTTCCCGAACAGCGCTTTTCGTCACTAACTTGTAGTGCCTTTAAGCACACATTTTATCTCTCTGTTTTTTACAATCACCC:1	-	chr2R	18336087	3'	-	roo	8666	2	77.24
GTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAA:1	+	chr3R	19450137	3'	+	roo	202	2	56.43
CCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTAT:1	+	chrX	13504229	3'	+	412	7464	2	74.66
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTATGATTAATGTTACGAAATATTATTACAACTTTTT:1	+	chr3L	11441863	3'	+	roo	9043	1	65.07
AGATTGGGACACTAAAAAACGTAAACGTAAATAAGTACATACAAAATTGCATATTTCGCTGGGTATGAATAATATCACGATCTAGAAGCCATCCAACCTCTTAAAAGAATGAATAAAATGTAACGCTTTAATTCAATGTAATTGTA:1	-	chr3L	21291706	3'	+	hobo	2505	1	68.49
AAATTGCATTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATCTCTCGATGCGACATATTTATTTGTTGATTCATATATTTGCT:1	+	chr3R	12776289	3'	-	S-element	76	1	66.44
TTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTC:1	-	chr3L	10056103	3'	+	transib2	2760	1	62.33
TAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAGGGGGGGTATGTTATGATATTGCCAACTGCACTCGCGTAATTAGCAACAA:1	+	chr2L	5844643	3'	-	transib2	2731	1	62.41
GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAGCTTGGC:1	+	chr2L	12483807	3'	-	P-element	26	1	48.91
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGCAGGAGAAGGTACTATATAATTAGCTGTAACCTTTAACCCGGACAACCAAC:1	+	chr2R	13817716	3'	-	412	37	2	54.87
CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAATAAAAAACGTTAGCCAGCGACGCTGGGATGGGCAAACGACCATCCTTAAAAACGATAC:1	-	chr2R	6034678	3'	+	pogo	2081	1	62.04
AAAGGCAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTTAAGGGGGGTAATTTGTGGGGGGAAGCCCGCACATTCATCATGGAAAATTCATAAA:1	-	chr3R	18583429	3'	+	roo	475	1	51.00
TCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATA:1	-	chr2L	17295816	3'	-	Doc	12	1	66.67
CGAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGACTATTCCGCACTCCATGTGCGAGAGCGCCTCCAATAATGATTGGGAAGTTTCGCT:1	-	chr2L	20606631	3'	-	accord	258	2	88.24
CTTTTCTTTTTTTTTTAATTTTTTGATTTTTTTTCCTTTAGCTGCAGCCGCATTTAACTCGTGTGTTGTTGTTATGTGAATTGGCAACCGCAAAA:1	+	chr2L	5486824	3'	-	Doc	4698	1	73.68
CCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAAAACAGACCCGCC:1	-	chr3R	22122722	3'	+	roo	8977	2	82.19
AATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCGGCTTGCGAAGTGTGAAAAATTCAGATGGCAATGATTGTTGAGTGCTCGTGTCTAATGTCTTCGTTGCGAGAGTTCATCTCACGAAGCATTTTTGTGTATC:1	+	chr2L	22105140	3'	+	1360	394	1	68.70
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGC:1	-	chr2R	9632116	3'	-	roo	76	2	73.57
CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGC:1	+	chr2L	16016412	3'	-	412	7105	2	59.09
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTG:2	+	chrX	23439053	3'	+	P-element	2495	1	62.86
ACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCG:1	-	chrX	13704757	3'	+	invader4	3036	2	57.86
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGAC:1	-	chrX	5274286	3'	-	roo	58	2	56.85
CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGAAATCACAAAGGAGCCGCGCAGATTGATGGGTTCAAATGGCTGGGCGAAGGCGATGACAAAAGTTCCCGAGTCCCCGGCCACTCACACTGTA:1	-	chr3R	28075279	3'	-	jockey	4688	1	70.15
GTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCT:1	+	chr3L	12308387	3'	+	hopper	1342	1	73.08
CTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGAC:1	+	chrY	3631950	3'	+	Stalker4	400	1	59.09
AATCAAGTCGGCACTCTCCACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGGCTTTCATGTTTCTCAGCATG:1	-	chr2R	11333535	3'	-	Cr1a	4069	1	80.56
TAAAAAAAAGAAAAATAAAAAAATCCACTAAAAATGCGCGCCAAAACGGGGCCATGAATTAATCTGTTTCTTGTTGTTTCTATTTTTTAGGTACACATGCGTGTTTTTTTTCCCCTATTTTTTTTTTATTTTTTTT:1	+	chr3L	11096191	3'	+	Rt1a	5080	12	77.94
GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCGTTATATTTGGTCACTTCT:1	+	chr3R	12887025	3'	-	roo	26	2	67.59
GCTGAATCTAAGCATTCTAGCTTTCATGGTTTCTGAGCTCTCGACTTTCATACCTTCAGCCAACGCTCAACTTTCTAGCTTCTATACTCGGCTATTGTGATTCTTCCTCATAAGGTTGGAAATGCGTTTTTTACTCAGTTGCGAAG:1	+	chr4	811414	3'	-	INE-1	168	1	62.33
GGTGAGTTTGGGAGTTGGACATAGTTAATGTTAATGTTAATGTTAAAGTAGTTAGTATTTTTGTCCCTTTTTTTCCACAGCGATCCATCTATCTCTATCCCTGTCTGGTGCCGCATGTGTGCTGGCATGATTAATGCCTTTGT:1	+	chrX	18222452	3'	-	TAHRE	10296	1	53.85
CAATTTCGTTCAATTTGCTGTCAGATTTATTGTCAGATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAAGGAAATTAGTTACATTTTTACATATTTGTATTCGGCAATCGACTTATTTGTGCTGCAATGTACGAGTAATTCACAC:1	+	chr2R	12507086	3'	+	GATE	396	1	53.42
CTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCACGCCTCAACGGCAAA:1	+	chr2L	21888287	3'	-	mdg1	66	2	60.27
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATT:1	+	chrX	5274370	3'	+	roo	332	2	73.76
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTACAAAATTTTTCAAAATCCAATTTCCCCACTATCCA:1	-	chr4	419975	3'	-	roo	79	2	76.03
CTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAA:1	+	chr2L	22224618	3'	+	Rt1c	5412	1	62.76
TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCAT:1	+	chr3L	20033791	3'	-	blood	50	2	50.68
GGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAAAAGAAACAATAATATTGCCAAAATAATTACAGATTTTAAAAACACACTAGA:1	+	chr3R	2631118	3'	-	1360	3176	1	71.43
ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGGGGGCAATTATGTATTTAAAATATCATGTGGGAGCAGAGGAAAACGAGTCCTGGCATAAATGTGCCAATAAT:1	+	chr2L	3885788	3'	+	roo	8680	2	50.00
ATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCCAAGGATAAGCACTTTTACTTGGTGCGTTTGGTGCCACTGCCAC:1	-	chr2L	2794126	3'	+	Burdock	6384	2	74.82
CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTC:1	+	chr2R	13696460	3'	-	roo	91	2	84.14
CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGCAAACAATATCCCTATGCTACGTCAGTCTCAGATTTCGTAAAAAAAATAAATAATCTATAGAATGCTAAAAGAGCTAATTATAAGTTATAATGATTATTCCTTTCGACACAAC:1	+	chr2L	14336557	3'	-	1360	10	2	78.08
ACAGAGGTGGTCAAAAATACTTCAATACTGTAAATAGAATATGTTGAAAATGAGAAATATTCATTGATTTGTCTAAAATGTACGAAAGTGGCAAAAATCACATACATAAGTACTTGTTACTTTGAAAACAATATTTCTCCTATAGT:1	-	chrX	8412145	3'	-	Bari1	1707	1	75.34
ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTT:1	-	chr3R	13457881	3'	-	X-element	52	1	49.65
CAAGGTGCTGTTATACAACACAGTTGTATAAAAAACCATAAAACCAAATCGATTGACCAAATCACTTATAGAAGTGAATAACAACACGCGCCTCCAACGTAACGATTCACCTGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCCATTTAGTATA:1	-	chr2R	5284572	3'	+	Doc4-element	2562	1	68.97
TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATC:1	-	chr3R	6290955	3'	-	Doc	63	1	60.27
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATTCACATTATATAAACTAAATGCGCTCGCGTCTT:1	+	chr2L	12892761	3'	+	roo	396	1	77.78
CCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCATGACTCAAGGATTACTCGGGGGTGCTCGAAAAGGAATCCTTGAAGCTGCTGATACGGCT:1	+	chr3L	7657733	3'	-	baggins	5397	1	53.41
TAAACACAAGATAAAAACTTTCAAGCGCGCTGTTAAAAGAACCGCATGAGAACGTCTGCACCCTGAGAAATTTAGATTTTATGTGGGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAATAGGTGCATAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAA:1	-	chr4	1265528	3'	-	Cr1a	384	1	86.43
TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTC:1	-	chr2R	977556	3'	-	F-element	75	1	75.83
ACCGTTGGTGGGGCGTTGATGCCCTTGTGATACCTACTGGTATGCCAACATACAAGAGAGTATTTACAGTTCTTGGATACTCAATTATAAAATATTACCATATAAGGTACAAACCGCGCCAGAACCATGC:1	+	chr2L	22297645	3'	-	baggins	29	1	78.46
AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTT:1	+	chr3R	17605719	3'	-	Tabor	75	2	66.44
GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGGAAATGAGTGCTCGCCCAAATA:1	-	chr3R	13360261	3'	-	jockey	32	1	68.49
TTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCAT:1	-	chr3L	3799782	3'	-	copia	68	2	63.19
AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGTGGGGCATTGGAG:1	+	chr2L	17081874	3'	-	jockey	4702	1	52.85
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGCTTGGAGCGAAATTTCG:1	-	chr3L	233198	3'	-	roo	24	2	69.44
ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTGGAAGCCCCCAT:1	-	chr3R	25826653	3'	+	mdg1	7416	2	52.14
CAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAACAAAGGCAATTGGAATCCGGTCAAGTGCGTTGTAGTTGTAGTTGCAAGC:1	-	chrX	5663049	3'	-	P-element	168	1	70.55
TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACT:1	+	chr3L	20654596	3'	+	roo	9035	1	60.00
CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATTACCGCACTC:1	-	chr2L	9668167	3'	-	1360	26	1	59.68
ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAACATGAAGTTATTTTCAAGTTTATAATAATGCAAAGGAAAATCTCTTCTCGCATTCGTTCTCTTCGGCGTAATTCTCA:1	-	chr3R	25825860	3'	-	mdg1	7044	2	62.69
CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTAAGAACTAATTTGGAAAAGTTTCTCTAGGTGACCAAAAATATTGAACTGCGCTCAAGCGTTAGAGTAAAAAATTTTCCCACCTCCT:1	-	chr2R	13818047	3'	+	412	452	2	63.31
GAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTCCCG:1	-	chr3L	26852644	3'	-	1360	71	1	66.92
ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGCTGTTTGCAATTGCCACGCACATCAATCA:1	+	chr2L	21884645	3'	+	pogo	2074	1	65.75
ACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTC:1	+	chr3R	15364022	3'	+	flea	199	2	57.53
CTCGGCTATTGACCCTGATCAAGTATATATATATACCTTATATGGTCAGAAACTCTTCCCTCTATCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAATATACTGACAGAATTTATAGACTGGTAG:1	-	chr2R	5296803	3'	-	INE-1	90	1	65.75
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTCA:1	-	chr2L	21884485	3'	-	pogo	38	1	60.96
CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTGGCCATGCCCGTCCGTATGAAAATATAGA:1	-	chr4	33791	3'	-	1360	65	1	96.64
TATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCG:1	+	chr2R	10582494	3'	-	Juan	3834	1	57.55
AGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATAC:1	+	chr2R	16248007	3'	-	BS	55	1	58.22
GAGTGGGAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCATTTTCCTCGTTTGATGCAAAATGCTTTCGATTTATGTCCGTCTCTTTTCTACACGGCTTTTAATATGCTTCTCTAAGTAGATT:1	-	chr2L	16067618	3'	+	297	461	1	62.41
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGT:1	+	chr2R	11164510	3'	-	roo	16	2	65.09
TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTTAGGTCTTAACC:1	+	chr3L	24208257	3'	-	Quasimodo	12	2	73.97
TTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTTCATTGTTATGGCCGTAATGAAAATGG:1	+	chr3R	29397493	3'	-	jockey	4630	1	78.23
CTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGACACAGGTCCATCAAGTTTTAGTTTTTAGATTT:1	+	chr3L	27205039	3'	-	F-element	179	1	77.40
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTCTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGTTGCACTCATTATTTTCATTCCATAAATTATATCTTCA:1	-	chr3L	10647907	3'	+	412	432	2	57.53
CGCCCACACTTTTAAAAAATTTTTCTCATTACATTTCCCAAAATCTATCGATATCCCAAAAAATGGTGCAATGCTTTTGCGGTCCCACAAAAAGTTCCTTTTTTAGCTCAGTGTGGATGGTTCCAGC:1	-	chr4	819311	3'	+	INE-1	255	1	69.29
TGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCG:1	-	chr3L	2362329	3'	-	Stalker2	71	2	63.01
AACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCTTTGTTTGGATTTCCAGACAACCCATTGCTAGTTCCTAATACGCGTTTTGTG:1	+	chr4	833767	3'	-	micropia	352	2	59.84
TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCTCAAAATAGCAGGATGAGTCATGAAGGTCTTAAACAGCTAAGGATGCTCTATTTAAATTAGTTATATACTTTTTTATTATACTTAGCTATTTTG:1	-	chr3L	22968296	3'	-	mdg1	7063	2	68.28
TGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCTTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCCATT:1	+	chr2L	5845090	3'	-	transib2	50	1	51.37
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGAACATTCTCAATA:1	-	chr3L	20654451	3'	-	roo	40	2	58.22
CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATG:1	-	chr2L	21884502	3'	-	pogo	55	1	58.22
AAAATTCGAGATAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTTTGCCAAAAAATCGCATCGCGTTACGATCATAAATTAGAGTTTTTCCTCTCTCTCAATAGAGGCGAGCACGGCTTTTTTAGTCTTTATTCTGTAA:1	+	chr3L	25271149	3'	-	1360	80	1	50.00
TGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCATTAAACTGCAAATGGAGGAAGGAGTTTTGGTTCTATGAATTAATTTTGCTATACTTGAAGGTAGCTG:1	+	chr3L	14601865	3'	-	jockey	105	1	53.42
CTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACA:1	-	chr3R	25454035	3'	+	Quasimodo	7286	2	78.77
AGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCCTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATCCTGATCAAGAATATATATACTTTCTAT:1	-	chr2R	8443974	3'	-	INE-1	574	1	41.10
TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGT:1	+	chr3R	12717842	3'	+	297	341	2	59.59
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTG:1	+	chrX	9540129	3'	+	roo	9037	1	58.82
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATG:1	+	chr2L	3114555	3'	-	roo	8747	2	74.66
TATAAAGTCATTTTTAAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGTTTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAATTGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATTACTGTTTATTGCAAAGGTCATATCAAAGACACTAGAAT:1	-	chr2L	14588753	3'	-	1360	376	1	50.68
ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTACACCTACA:1	+	chr3L	20033808	3'	-	blood	11	2	62.10
CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATACGTGGGCAAATGCCTGCCGGAAATCGTCTG:1	+	chr2L	2703562	3'	-	hobo	52	1	73.68
TTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAATCGTTTGGAGAAAATTTAGTGGTGGCATTTATTGACTTTGTAAACAAAGGTGGCGACGAAACGGGAAAAAACAATGGTATATGGAATATTCGTGTAAGCTCACTTCACTT:1	+	chr2R	13929190	3'	-	Bica	4490	1	53.42
TAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCA:1	+	chr3R	14049421	3'	+	transib2	2763	1	62.22
AATTTATCGCTCTCGCTTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATATCTGCGAACGGA:1	+	chr3L	9998177	3'	-	roo	67	2	70.77
GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATCGGAGTTCATCATTACATGGCGACCGTGACAGTCGTCCAACGCTGGACGAATTGACCAAAGCTGGTGAAAACAAAGGTGCATTCATAATCCTAATGGAATTGATTTCTC:1	+	chr3L	13155967	3'	+	412	7514	2	76.71
CTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGCTTGACTACATTTCAATTTAGTTTCAAACAAAGAAAGGGGGAA:1	+	chr2R	16891346	3'	+	hopper	1056	2	77.14
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTC:1	-	chr3R	19968111	3'	+	roo	334	2	70.34
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTAC:1	+	chr2R	9662795	3'	-	412	68	2	67.81
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTC:1	+	chr2L	7898391	3'	+	roo	9033	1	52.00
ATATATATAAAATAGAATAAAATGATATCTCAAGAATTATAGTTACCTTGATTTAGCGTCAGAGCCGGTACATATATGCAAATGGGTGTTGTGTGGACGGATGTCATTCAGGGCACCGTAATGATCGGATCCATGCTCATAGTCA:1	+	chr3R	25917515	3'	-	transib1	1906	1	58.62
CGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAGGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTACTGATCATTAATTTAAATTATTCCAAATTAGAGAGGGATATATTGAG:1	-	chr3R	13237303	3'	-	3S18	5840	2	66.44
AAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGGGAAAAGTAAACAAGAC:1	-	chr3L	19013904	3'	+	invader3	5409	2	54.11
CTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCCCGCTGCTCATTCAAATGCAATTTTGTTGCAAAGTTTCGATTTCGTTGTCACTCCCATCCTCCGC:1	-	chrX	2295885	3'	+	Tirant	359	2	51.88
AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGTCGAGGCCTATGGATCC:1	+	chr3R	23235597	3'	-	jockey	4768	1	71.72
AATGGAAACATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTACGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTAT:1	+	chr3L	17560386	3'	-	pogo	47	1	52.55
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACG:1	+	chr2R	19004215	3'	-	roo	11	2	64.56
TTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATG:1	-	chr3R	18339052	3'	+	roo	9044	1	65.07
TTATTCATCGAGATTTTCCTCACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAAAAGTCAAAGCTAAAGCCATTCTTAAAGCATATCAAGTATA:1	+	chr3R	26615168	3'	-	gypsy12	25	2	56.32
ATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTCGAACGAG:1	-	chr3R	21678304	3'	+	Idefix	293	2	79.44
GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGTAGAATCGCCCGCAA:1	+	chr3L	11957240	3'	+	blood	7349	2	55.86
ATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCTTATTGGTTGATTTTTATAGCTAGACATA:1	-	chr2L	9399470	3'	-	Transpac	69	2	76.98
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTTTATTATAATAATTGTGAGGGACAGCTTATGTTTAATCCAC:1	+	chr2L	13763237	3'	+	pogo	2076	1	61.05
AAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGTGCCTATTATGAGTAATG:1	-	chr3L	11321380	3'	+	mdg3	208	2	54.79
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTG:1	+	chr3L	15600329	3'	+	roo	352	2	56.94
AACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGTCTGAAATAAATAATAAAACCACGCATGCTGAGCCCG:1	-	chr3R	24298752	3'	+	1360	28	1	70.40
GTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTTCATTGTTATGGCCGTAATGAAAATGGCTGCAACCATTTTTGGCTTAGACCCGGCATTTTATATTAATTAATATTA:1	+	chr3R	29397542	3'	-	jockey	4577	1	65.00
ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACT:1	-	chr3R	19589895	3'	-	BS	5038	1	52.74
GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGATCTGAAATCGTTTCCAATCGAAG:1	-	chr2L	20840383	3'	+	Transpac	298	2	73.60
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGAGAGTCGTACAGCAGCGTTAACCGCAATAGGTATCTTTTCCAGTTTTTTTTAAGATAACTTGGCCAAAAATTGTGCAATTTGTACAAATTA:1	-	chr3L	20533434	3'	-	jockey	4709	1	58.90
GGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATACCAAG:1	-	chr2R	5284510	3'	+	Doc4-element	2621	1	65.07
TTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTGTTAGTCCAAGGGAAAATTTTTCCAAATGAAATAGAAGTCAATTTTAT:1	+	chr3R	9714503	3'	+	Stalker4	7326	2	58.22
TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAAATAGCAGACAATGTCACGTCGAAAGCA:1	+	chr2R	8585597	3'	-	roo	8667	2	63.01
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTTCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACA:1	-	chrX	5643476	3'	+	roo	9010	2	60.69
TTACATATTTCAATATTTATTAGATATTCGTTACGACAGGATTCTAAATAATATTTCTTGTGGATGGTTTCCGCTGAATGCGAACAAAGAAAATTCAAATACTGACCAAAATTATGCTAGACCGATTAA:1	-	chr2R	14434466	3'	-	Penelope	156	1	80.62
AACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGAAAGTCCAATTTCCAGAGTATCAGATACTAACAGGAAATACGAACGATTATATTTTTTTTCCTGTATATGAATTCTGCAAGTACCCCGTTCAGCACT:1	-	chrX	22601842	3'	-	INE-1	32	1	76.71
AGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATGGCGTATA:1	+	chr2R	9328723	3'	+	roo	401	1	74.58
GTATGAACGTCGAGATTTAAGGACCTACAAAAACTAGAGAATTGAGATTAGGCTAGCACATAATAATTGGCTAACAAAACCTTATAAAAACCAGCCCCCTAACTTAAATCGAGTCCAG:1	+	chrX	16262484	3'	+	INE-1	137	1	73.73
CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACACCATCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCGTGAGAATGAGTAACCACATTTC:1	-	chr3L	14638597	3'	-	1360	53	1	56.83
GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTT:1	-	chr3L	20654498	3'	-	roo	87	2	78.77
ATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGCTTCAACG:1	+	chrX	12074599	3'	-	412	7194	2	69.53
TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGC:1	+	chr2L	544869	3'	+	412	437	2	61.31
TCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTCTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTA:1	-	chr3R	19589917	3'	-	BS	5060	1	60.27
GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGTTTTGCTAGATTTTCCCAAAGCTTAATTGAGATTTTGACTTTTGATTATAAATATCCATCCATTTCAATCGGATTATTTATTAAAAAGTATAA:1	-	chr2L	20139823	3'	+	jockey	4967	1	59.59
AAAAAAAAACAAAAAAAAATGTAGGAAGAAAACCTACATAAACTGGGGGGGGACAAGAAAGAAAACACACCAGAGATGTAGAAGCCTCTCGGATAGCCCTCAACTCCCC:1	-	chr3L	19026795	3'	-	hopper	141	6	52.29
TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATTAAGTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATATCTTCGATTCTATCCAAAGAATTTGTTTAAGCCATTCCCATCTTAACTTGGGTTTATATCTCTCA:1	-	chr3L	14624757	3'	+	copia	181	2	52.08
ATTTACTTTGTATACCAAAATTGATGACAAAGATTTCTCATACAAGGCCAGCAAAGACAACCAAGTAAGGGTAATGATATCTGATAAGTCGAGCTATAAGGCGCTGAAAGATCGACTGGACACAGCTGGCAAAAG:1	+	chr3L	23961672	3'	+	Transib5	294	1	79.26
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGAAGAGAAGGAAGTCAAATTCAAAGGAGCCTCTACCAGCAGCAGAAGCAGCAACAACAGCAGCAGCAG:1	-	chr2R	13181439	3'	-	roo	8678	2	60.32
ACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGAGTCAAGCAAACCAACCGTTTCACCC:1	-	chr2R	9221313	3'	-	opus	73	4	66.23
ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGTTTTGCTAGATTTTCCCAAAGCTTAATTGAGATTTTGACTTTTGATTATAAATATCCATCCATTTCAATCGGATTATTTATTAAAAAGTATAAGCAATTTGT:1	-	chr2L	20139814	3'	+	jockey	4976	1	65.75
TGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTA:1	-	chr3R	13349057	3'	+	BS	5023	1	69.23
AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGCTAC:1	-	chr2R	13585380	3'	-	412	35	2	60.27
AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAAAAGTGCAACATTTTTCTTTAAACACTATTTAATCAATTCTTCGTGGCGAACCGTTTTCCATCTCTGTGCCAGAAAAAAAGGTAACCAATATTTTCTAATTGAAAAA:1	+	chr3L	18369073	3'	-	opus	6	2	75.34
ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTCGGAGTGCGTTGTGTTTTGTGCACATCCGTTAACTTTGTCGGTGGTTGGATAAGTAAGTGGGGTGGTGGGGTGCGTTGTATCGCTATAACATTTATGCGCTTTTCCC:1	+	chr3R	27870432	3'	-	Quasimodo	37	2	49.62
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCCAAA:1	-	chr3L	20831255	3'	+	roo	9033	1	58.22
GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTTCTGTAGAAATGGCTTAGTTGATACATTAGTTTCCGATAACGGAAAACAATTCACGTCTGATGAATTTAAAATATTTAAGACCATTAATAGTTT:1	+	chr3L	23818466	3'	-	copia	4897	2	65.07
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGTGTGTAATCATTCTATGATTACAAATGTTTAATGCATTTCCTGAAATAATTTTGACGGCTGCTCTCAGTGAGCACTT:1	-	chr2L	13584622	3'	+	pogo	2076	1	58.78
TCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATGGTCATGTTCTCCGGC:1	-	chr2R	23332500	3'	-	invader4	38	2	58.90
TGAATCAGTACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTA:1	-	chr2L	13053751	3'	-	BS	5064	1	66.44
ATCCTGACGACGACAGTATCGCAAGACGCTGCGATCAATCGTTAAATAATTTACACACAAAAGTGCACCGAAATTAGTTAAACTGTTTTTTGAGTTCACGATAAAGAAATGTTACCGAACGTCAGGGTCACCAAATGTT:1	+	chr3L	23728645	3'	+	Gypsy6A_LTR	370	1	79.86
TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATT:1	-	chr3R	7482704	3'	-	412	7081	2	64.58
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACTTATATCTTTAAT:1	+	chr2R	15064470	3'	-	412	7084	2	62.33
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGACTG:1	+	chrX	9540101	3'	+	roo	9009	2	65.44
GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTCGTTTTTGCCAACTTGGTTCTTTTACTAATATGCCGGGCCATACCATTTCCATTTCCCCTACCATTCTCGACTTTGAAAGCA:1	+	chr2L	14830592	3'	-	opus	7163	4	56.16
TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCGGTTGTTCAAAAAAAAGCATCGCCAGTAGGCAATTAGCATACACATGCGAAATATAAATAACAAATGTTCTCACTAAAATAGTTCGACGAACATCAGGTGCCA:1	-	chrX	13125472	3'	-	jockey	4805	1	67.36
CCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAAC:1	-	chr2R	20596468	3'	+	roo	354	2	61.42
CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCTTGTCCAGACTTTGAAATCCAGGAATTTATTCAGCTGTTATCCAGGAATATATATTCCATATTCTTCATTGGC:1	-	chr3R	11514926	3'	-	I-element	62	1	52.74
GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAACCTTTGCTTGGTTATTGAGGTACATTTATCGAAAGGA:1	-	chr3R	14651140	3'	+	P-element	2882	2	81.51
GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACTCCTGGATATTATCATAAGGCAATTTCATATTATGCTTGGGCATTTCGGCTTTAGTTTTTC:1	+	chr3L	7188679	3'	-	hobo	9	1	77.24
GCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGGGTTGTGCAGCGAAGCGATAAGTG:1	-	chrX	6499604	3'	+	Quasimodo	194	2	78.07
ATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATAAGTTCGCTAACCAGAAAAAAAAATCAACGTAACCCCACACCTTTGAACTTCCGACCACAAACCGCAACCACCTGTGCATGTAC:1	-	chr3L	20892100	3'	+	1360	3091	1	58.33
CTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAA:1	+	chr3R	934278	3'	+	Rt1b	4728	1	52.41
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAATGCCTGGACTTTCCTAATTTAATCAAGACCAAAAAGTG:1	-	chr3R	7835063	3'	+	roo	399	1	77.40
GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGATTTACTTAATAAGCGGTATTCTCATAAAAGTTTATGTTCCAGTCTCACATAAAGAAAGTAAATTCGTCT:1	-	chr3R	4090766	3'	-	copia	54	2	58.22
CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGATTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAATTAAGA:1	-	chrX	3308315	3'	-	hobo	64	1	66.67
AAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGG:1	+	chr3L	7588477	3'	-	hopper	57	1	74.77
AACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTAAGTAAGTGATTTATGACTAACGCCCAAACAGAATCCCCAGTTCCGCGTCGGTTACACAATCGGTTTAATTAGGTGGATGG:1	+	chr3R	31757612	3'	+	Doc	4576	1	62.32
AGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAA:1	+	chr2L	15833079	3'	-	hobo	72	1	67.12
GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTATTGCATAATTTTAGCACGCGCCCAGTCCCCAGCCCCTGTCACGCCTCCACGCCTTCTGCTCTCC:1	+	chr2L	15833579	3'	+	jockey	4981	1	67.81
GTGGGCATTGCCAATATTCAGCCGGGCATCGACCTGTACGCGGAGGTCAGCGGCAACAAGCAAGTGCTGCCTTATCCAGGAGCATGCGAGGAGGCATGAGAATCCCGAGTACATCAAG:1	-	chr2R	21010878	3'	-	1731	2	2	61.86
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGT:1	-	chr3R	22821995	3'	+	mdg1	7403	2	57.93
ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCACCTTAATTATATGGCCGACGATAGAAATTCAAGTGAAAAATGCTTCTCCGATGATGAAAAC:1	+	chr3L	19036085	3'	-	Tirant	8131	2	54.55
GCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCTTTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTAAGAGTTTCGTGGAAGCGAAGTAAGGGTGAAATAATTGAGTGCAGTTGAGG:1	-	chr2R	2498482	3'	+	1360	452	1	57.55
ATTTTTTTCTCTTTTTTTTTGTTTTTGGGGTGCCCCCTTGCCAGCCGTTTTCCTTTTTTTTTTTGTTGTTGTTCTCTGCTGGTGAACAACACAAAAATTATGTCATAAAA:1	-	chrX	3088763	3'	-	gypsy7	5005	1	63.64
TTTTCTTTAACTTTTTTTTTTTCGCTTGGCCGGGGTGTAGAATTCACGTTGAACT:1	+	chrX	4138650	3'	+	Tc3	80	1	85.45
TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGTTAAATGGCAAT:1	+	chr2L	18339060	3'	+	pogo	2054	1	61.79
ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCATTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAG:1	+	chrY	311460	3'	-	1360	2	2	52.78
TTTTTATTATAAACTTAGCTTTAAAATACAATAAGATTAAAGAAAGATAATTGAAACTTATTTCATAATATTTTGTGCTATCAAAAATTCTCACTATTAACATTGGCAATGAATCCTTCTCCGCTTGGCATTCCATTTGGCCTTAT:1	+	chr2L	16007382	3'	-	Ivk	5270	1	54.11
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTG:1	-	chr3R	25448316	3'	+	roo	9038	1	60.43
TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAAC:1	-	chr3R	19589932	3'	-	BS	5075	1	70.55
ATTGTAAATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTAACTTCGGACAAAAAAGTTTGCTTCCGAATAATTAGAAATTGATTTTGTGTAAAGCTGAGATGTAGTTTTCAATAATATGCCTATTGCTGATGTGCCTACCCTTTCATCGGCTT:1	-	chr3L	27291564	3'	+	1360	202	1	77.40
TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAACTCAAATTAACTACAATGAATTTGCATCTTGCAGACGAT:1	+	chr2L	21400356	3'	+	mdg1	353	2	77.19
GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTTCAGGGCAATAACTTATATGCGTCGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTG:1	+	chr3R	6611266	3'	-	HMS-Beagle	6837	2	65.00
ATTCGGTTATCGCAAATAGAGTGGGTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATGGCCTATACCTCATTTATTTCGATTTTAAACGTTTAATTAATTTTTATTGTTTTTACAGCCTGCTTCTAACAACAGTGCGCATTTCGTTGTGTC:1	+	chr2L	9519407	3'	+	Gypsy12A_LTR	176	1	51.37
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTTTTATATATTTTT:1	+	chr3L	19334318	3'	-	roo	86	2	82.88
GCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGAGATCATTGGTCAAGAGGGAGGCAAACAACACGAGTGCTTCACTACTAGCCATATTTTTAGCTAATCTGTATTATTTTC:1	-	chr2R	5636345	3'	+	1360	62	1	71.43
GATGATGTGTGATAGGTCAGGAAGGCCGCGTCGCAGGTCATTTACATTTAACATTTCTAGCAATTGCGTGGTTCTACTTCCCCCGCTCCTACCCGCGAACAGAGTAAACAAAGACAGAGACAAAGCCAAAGCCAG:1	-	chr3R	16520840	3'	+	invader1	3582	1	55.56
GCATATGTGTGTGAGTGTGTGTGTGAGTGTGTTGGTGTGGCAGGCAACCGAGCGGATAAGCCAGGCGAGGAACAGG:1	+	chrX	13000360	3'	-	accord	185	2	85.53
ATGGATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAATGTAAATTGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGAAAGATTGTATGTACAATGCTTGTGTAAGCGTAATATGTTTGCTGTCTCAGCGCAGCTGCTAATTTAACAACAG:1	+	chr2L	14223824	3'	-	rover	7065	2	76.03
CCTCGGCCGTCTGTAGTTCAGCGATAATCTGCCTAACTTGGCCTGCGGATTTTCTTGCCTCGGTGAAACGCCTTTGTTGTTATGCAATTGGCACGCGCTAAGGTCCACAA:1	-	chr3R	21705621	3'	-	gypsy6	7375	1	66.36
ATACATATTACATACGTACATATTCCATATTAAACCTTTAGTTTTTTCACATTTTTCTTTCTTGAGCTAAGAAAATCAAATTTTTAAGTGTTTTCTGCTGAGAGCGAGTAGAGAAAAAGGAACCAAGAAAGCCACATGACAGGCAT:1	-	chr2R	18511619	3'	+	412	7272	2	78.08
TTTTTTGTTTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGGGCGGTTACCCCAAAACACTGACACTGACA:1	+	chr3R	23413526	3'	-	G2	3076	3	71.67
TTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGT:1	+	chr3L	26011946	3'	-	F-element	91	1	73.29
TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCACGTGGATCAAAGTATAGAAACTTAACCCCCTGATGGTGAAAACAGTCTGAAAACCGTTGGCAATGACACATTAAGCGTAGTTCAACCCCG:1	-	chrX	8543408	3'	-	roo	9	2	77.60
AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAATTTGCGCATTTACAAAGCGGC:1	-	chr3L	12308307	3'	-	hopper	54	1	52.74
CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATCAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAG:1	-	chr2R	13585432	3'	-	412	87	2	76.03
TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAGTTTGAGGGTATATAAGGGAATAG:1	+	chrX	5274419	3'	+	roo	9040	1	63.70
ACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTAATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATAAATACATATAAAATACATATACACGTACTATATATTAAGAAATTA:1	+	chrX	19409645	3'	+	17.6	423	2	73.97
CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACA:1	+	chr3R	7482840	3'	+	412	7505	2	56.92
GCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGCCTACCTATTTATACTGCAACACATTATTGCCTATTTCTTGCCTTTAATTTTCTTGAAAGTTAAATATTCTATT:1	+	chr3L	22755557	3'	-	gypsy2	148	2	52.08
GTTTTTTTTTGCGCCCCAATTCTTATTCTGCATTGCACACAATGTCCTTTATATGAATTCGTATAAGCATTATATGTATATTTTTTTTTCTGTGTAAAAATAGCTAGATGCAGCGTGAAACAAGCTAAAACTG:1	-	chrX	7319149	3'	+	Cr1a	23	1	82.71
ATACATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAATATG:1	+	chr3L	23529720	3'	+	Stalker2	226	2	71.23
GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACATTGTGATATTTCTACATGTGTTAGCG:1	-	chr3L	17557958	3'	+	jockey	4983	1	71.92
ATAGCCAAATCTATGTACATATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGAAAAATTAATAAGGCAATAACTGTAAGGATATATATATATTATATTAAGTATTGTGTTTTT:1	+	chr4	613481	3'	+	1360	343	1	74.66
ATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGCG:1	+	chrY	3609354	3'	+	F-element	167	1	64.62
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATT:1	+	chr3R	22956029	3'	-	roo	8746	2	73.29
TCTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTTTTGTTTAACTTTTTTTTTTTA:1	+	chr3L	12285428	3'	-	TAHRE	47	1	42.67
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTACTTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACG:1	+	chrX	8543540	3'	+	roo	9032	1	51.20
ATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCAC:1	+	chr3R	11547790	3'	-	G2	326	1	51.37
ACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGAGGAAATAAACGATAACAGTG:1	+	chr3R	3286145	3'	+	gypsy12	9835	2	76.30
AATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTACGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGAAACGATCTACAAATGGAAAATCAAATACCTAGT:1	+	chr2L	16588588	3'	+	Doc	4687	1	77.40
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCCAAAGCAACGAAATCGGCGGAATAAAACTAAA:1	-	chr3R	22122683	3'	+	roo	352	2	55.48
ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCCAGTAGTTAAATAAGGCA:1	+	chr3L	4605742	3'	-	pogo	38	1	59.59
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATAT:1	+	chr2R	7898158	3'	+	roo	354	2	66.93
CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATACATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAATTG:1	+	chr3R	21706108	3'	+	297	6941	2	61.64
CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACCAATTTTTTTTATTAAATTTTTATTGTATATATTTTTCGCAGTGTTGGGCATGCATTTTCCTTTTTTAACAAGGG:1	-	chr3L	18555856	3'	+	jockey	4977	1	58.82
TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATA:1	+	chr3L	7943730	3'	+	Burdock	217	2	54.55
TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACG:1	-	chrX	11471553	3'	-	hopper	15	1	68.70
CAGATCAAATTAAGTTGACGCATGAATACCACGGCGTTGATAAAGTTCGTACACAGTCCAAAGGCCGACAAGGTGGGCACGGCCA:1	-	chr2R	16945729	3'	+	jockey	4948	1	81.18
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCCTTCGAGCCTTGGTGGACTAAATCATTGGCTTAAGGACTTT:1	+	chr3L	11440804	3'	+	roo	9014	2	74.02
TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGCAG:1	+	chr2R	5531220	3'	-	1360	64	1	70.16
GGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCTATTCCAATCGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGCGGTATCTTTATCAGGCTAGACTCACAGTTG:1	-	chrX	819016	3'	+	Rt1b	5036	1	78.43
TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGC:1	+	chr2L	15181445	3'	-	jockey	4815	1	60.94
AATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCA:1	+	chr3R	14860225	3'	-	BS	5053	1	58.04
TTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTG:1	+	chr2L	11660995	3'	-	F-element	70	1	63.64
TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTGGAGTGGGGCTAGC:1	+	chr2R	23332652	3'	+	invader4	3080	2	78.63
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAG:1	+	chrX	8197933	3'	+	roo	9009	2	63.70
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTATTCCTCATTTACATTTTAATATTCTTAACTTTC:1	-	chr3L	21817933	3'	+	roo	391	2	71.13
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATACTGAGACTGT:1	+	chr2R	6173095	3'	+	pogo	2047	1	62.33
AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGTAGAGGTCAAAGTGACCGGCG:1	+	chr3R	1433237	3'	+	mdg1	7413	2	53.42
AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAA:1	-	chr3L	12308328	3'	-	hopper	54	1	61.60
AACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAANGTATTTTGTGTTCTGTTGGCAAGGTTTTTCAC:1	-	chr2L	20808312	3'	-	HMS-Beagle	19	2	62.39
TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTA:1	-	chr3R	17243079	3'	-	hopper	29	1	65.75
ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCATAAATTAAACACTTGAAAAGACACAAAACTATTGCTGGAATTTGCATAATGCGTACACAATTATTTGCTATAATCTGATTTATT:1	+	chr3R	9210749	3'	-	mdg1	36	2	60.27
CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTATTAATTAATGTTAA:1	-	chr3R	6290931	3'	-	Doc	37	1	62.50
CAGCGCAATTAACAGATAAATGATAAAACCAAACCTCGCAATTTAATTGAGTATGTTTTGCAAACCATCCAATAAATGGGTTAA:1	+	chr3L	20712115	3'	-	BS	5032	1	72.62
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCA:1	+	chr2R	13084671	3'	+	roo	9044	1	57.58
AGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTAATCGCAAAATGAATTACAGTTTTAATGCAAATACGTTTATTAAATTCCAGATTTAAAAAG:1	-	chr2L	11985762	3'	-	G6	1704	1	58.22
AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTTACAGTCGGTTGCACAGTCAAAGTTCATCTCAAGAATCGAGGTAATCCCACTCCTTTCGGATCTGTGCGACATGCATGTGCCGC:1	-	chr2R	6919632	3'	-	hobo	13	1	70.73
AAAGTTTAAAAAAGAAAAAAAAAAACACACAAATTTGGAAAAGTCCGAAATTTTCGAAAAAACT:1	-	chr2R	12118401	3'	+	TART-C	11096	2	92.19
ATATATATATATATTTACATATATATAAGTTCTCGTATGTTTGATGTGTATTTACAAAACGACAAGGAAATATATTACAGAGGCCAAAGGCAGAGGCAAACACACACACACACACATAAAAAAATTGAAAATTGGGTGTAAAAATC:1	-	chrX	10411605	3'	-	G3	4507	1	74.66
TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATT:1	-	chr3L	11393458	3'	-	roo	8698	2	59.42
GCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTTAATATAGAATTGTAGATTATTGTAATTAAAGACAAATGCGAAAATGTAACTGGCTGACTTAGTGGGTAC:1	-	chr3R	27737483	3'	-	F-element	4304	1	60.71
ATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAG:1	-	chr2R	1320657	3'	+	diver2	4880	2	62.90
ATGGAAAAAAAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATATAATAAAATAATAAGGAAATAACACAATGATGCATCCACTGTTCAATCGTAGCTCTGGTGTTCATTTC:1	+	chr2L	13584762	3'	-	pogo	46	1	52.74
CAGCAATAAACTTATTAGGTAATGGAAAACAAAGTGTTAATCAAAAGTAAAAAAAAAAACAATACTGTAGTATCCTCGAGTGACAGAAAGATATGGTTCATACTTATGCATATCTTTCCGCATAAAAG:1	+	chrX	5075556	3'	+	Doc	4568	1	65.62
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCTGT:1	-	chr3R	25448362	3'	+	roo	342	2	72.80
ATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATT:1	-	chr3R	17243116	3'	-	hopper	62	1	58.45
ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGCTACTTAAAAAGTTGGCAAATTAAATTTAAGATGACTTAAAGCATTAACTTACGAATATATGCATAAAATGCTCACAATTTTTTCGCTGT:1	-	chr3R	12598428	3'	-	hobo	31	1	65.07
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCCAAGCAAAATC:1	+	chr2L	18294296	3'	-	roo	56	2	59.31
GAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCATCTCCAGCGGATTGATATTGAAAACTTATGCCAATTTTCCGATATTTCAATTT:1	-	chr3R	11520361	3'	-	I-element	5097	1	63.45
CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATCATTATATATATTATTATTGGGACGAATAATGTTTACCTTTGCTATGGAATATATATACCAGTTATTTTTCT:1	-	chr2L	15247890	3'	-	Transpac	4942	2	63.20
AGAAATGCAAAAAAAAATATTTACCTACTTAATTACTAACTGCAATCAAAATTAAGACTTGCCAATTATAGTTTGACTATACAACACCATAAGTGGCCAACAAAAGGCGAGACATCGATTAGATAAGCCGTGACTTTTTCGGGATG:1	-	chrX	15126671	3'	+	transib1	32	1	61.64
TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATG:1	+	chr3R	20427466	3'	-	jockey	60	1	57.69
AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAA:1	+	chr3R	7482821	3'	+	412	430	2	72.18
AGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTTAGCTATAGTCGTCGCTTCTGCATTTTCAAGACC:1	+	chr2R	21884668	3'	-	roo	8623	1	76.71
ACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAATTGTACAAGAAAAGAAATTTTTGTTTCGTTGGGTTTGATCATTAAGTATAATTAGTACACATGCATGTGTACGTGTTTTTTTTTAATAATAAATACTGGTGACCAGCTA:1	-	chr3L	22996891	3'	+	S-element	131	2	64.34
TTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCT:1	+	chr2R	4601662	3'	-	HMS-Beagle2	44	2	58.22
AACCAAAAAAAATAAAAAAAAAAATCTCGCATGAAAATTCAATTCGATTACCCAGTGGGATAGAACTGAAATGCTTCATCCAGTGCTTCTTCC:1	-	chr3L	5209955	3'	+	gypsy7	5004	2	83.87
GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAATGCAAAGCCACTGAGAGCACAACAAAGCAAAGCTTGGCAGGTAAAGTGAAGCTTGTAATAAAAATCAATAAACACCTCATAAATATCAAAAT:1	+	chr2L	12483861	3'	+	P-element	2881	2	76.98
TGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTT:1	-	chr3L	2325716	3'	-	I-element	5145	1	67.12
ATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGTGCCAATCCTGCGGAACAATCGTATAAAGTTTTGTTTAGTAGTGCAGTGCAAA:1	+	chr3R	12733040	3'	+	F-element	148	1	59.23
TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTG:1	-	chr2L	6569970	3'	+	jockey	4942	1	74.53
AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTCTCAACTGCGGAAGCCT:1	-	chrX	10521595	3'	-	Tabor	6866	2	65.75
TTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTGGTATTTTAGAATATCTAAAAACGACCTTTCAATTTGTTGTGGACTTTGCTCAGTTTCGCCTTTTTTGGCATGCGCGCATTTAATTGA:1	-	chr2L	19310296	3'	-	Juan	4097	1	52.55
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAATTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATG:1	-	chr2L	18419152	3'	+	412	7477	2	64.23
AACAAAAAACGTTTGCCCAACAATTATTATTATTTTTTGTCGCTCTATATTTTTCGTTGGAATTTAACCACTCACCTGAACCACATCTGTGCAAAAGTCCATTACTATTGTGGC:1	+	chr2L	7482545	3'	+	FB	344	1	73.68
CTGGGGTACTGCCAGCACCTCAAATATTGAGATTCTACAACGCTCTCAATCGTATCTGATCAAATCAAATCAGCCGGCTCGGCATCCGTGCTCCTGGCATCCTGGCAACCTCCCCACAACAATCCACAAT:1	+	chr3R	5436040	3'	+	G4	3449	1	70.00
GAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCCTCGAACCCCCTCCATGCTACCATCATT:1	-	chr2R	8969818	3'	+	F-element	4378	1	75.44
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTATCGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTAAAA:1	-	chr3R	7835101	3'	+	roo	9024	2	51.37
ATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCATTAGTTTTACAAATGTTTCAAGCT:1	+	chr4	1265179	3'	-	1360	477	1	50.00
CGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAG:1	-	chr3R	27424860	3'	+	blood	7313	2	72.14
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACGATTCGTGGTGGTGATG:1	-	chr3L	16343175	3'	-	roo	8675	2	76.15
GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAAATTGTG:1	+	chr2L	7810150	3'	+	P-element	2882	2	75.93
CAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTG:1	+	chrX	21564757	3'	-	diver	59	2	60.27
TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATGCCAAATATGTATGCTAAGCACGCACATCTTTCA:1	+	chrX	10537412	3'	-	I-element	86	1	74.48
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCT:1	+	chr3L	20654541	3'	+	roo	331	2	79.23
ACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAGTAGTTATTGCTATACACGTTACTCGTGTACTAGTTT:1	+	chr2L	9399524	3'	+	Transpac	5164	2	71.54
GTCGAGATCTCAGGAACTATAAGAGCTAGACGATCGAGATTCAGCATACAAATTCTAGAGAGAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGGCCCACAAACATTTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGTC:1	+	chr2L	22063437	3'	+	INE-1	145	1	60.80
ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCAAAACATATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATTAATATTTAT:1	-	chrX	15947448	3'	-	Doc	42	1	52.55
AATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTAC:1	-	chr3R	17605628	3'	+	Tabor	7267	2	54.11
ACTACCAGCAGGGTTGCCTCTCTCACAACTGCAATCTCATCGACAACAACAACAACCGAA:1	-	chrX	7740689	3'	+	Doc4-element	274	1	78.33
GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGC:1	-	chrX	18193678	3'	-	jockey	68	1	65.32
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGGGTACTTATTGTTTGTTTTCAAG:1	-	chrX	10639966	3'	+	roo	404	1	78.10
CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAAACTAGCAGAAGGCAAGTAGCTTTCCAACAACACAGATTTAAGGGAACTCACATTGCGGACGTACTTACCATAGAAACATGGTATCTCTTGTCTTTAAAAAAGTAAGAATCTTATAA:1	+	chr2R	23602400	3'	+	1360	3386	2	56.16
CTTTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTAAACAAACCATAAAATAATGTTCTGAGTGTATTCCAAGCTGGATTAAGTCGAGGGTACTCCACAGCTGACATCATTTTTAACCGTCCTCTAAGATGCATTTGGC:1	-	chr3L	27874981	3'	+	Cr1a	4358	1	76.03
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCAGAAGCGAG:1	-	chr3L	22437829	3'	+	roo	390	2	68.89
AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGC:1	+	chr2L	20840491	3'	-	Transpac	4934	2	56.41
ATGTATACATATGTACATACATACATATATGCACATGTATTCGTACAATGGGGCATTGCGTAGTTTACAATTGAGAATCT:1	-	chrX	19817523	3'	-	invader3	5086	1	53.75
TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTGATTGCGTTTGAACGACTAGCCC:1	-	chr3L	23603160	3'	-	F-element	58	1	55.65
TGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATCCATACACATGAACTGTATGTATGTATACTGAATGCTCTAATTGCTTGTAATACACATTGTTGCATCCAATTGACGTGAAAAGGAAAACACAGTTTCGACTTGTCACGAGA:1	+	chr3R	18492512	3'	+	1731	53	2	58.33
CCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCATTTAGTATTCACAATCCTAT:1	+	chr2R	21298873	3'	-	jockey	226	1	74.24
GATCACTAGCCGAGTCGATCTATCAATGTCCGTATGTCCGTCGAGGTCTCGGATACTATAAATTTCATAATAAGAAGCAAGCTTGTTTTGCAACTAATCCTAAAACTTACAAATTGTACACTTCCTTTTTATCTTTCAATGGTTAT:1	+	chr3R	4325654	3'	+	INE-1	98	1	66.44
AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCA:1	-	chr2R	5248268	3'	-	1360	51	1	78.57
AGTAATGGGTATCTGACAGTCGAGGACTCGACTACAGCGTTCTCTCTTGTTTTAAATCTATTCTCAAAGACCAAAATATGCGAGCAGCACACAAAACCCGACAAGCGGCATTTTTTATTATTTAATATTTATTTGTGATAGACTTT:1	-	chr2R	1579896	3'	+	INE-1	550	1	68.49
TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTGAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTA:1	+	chrX	13504234	3'	+	412	7469	2	71.23
AAATTGGGGCGGAGTTGGGGCACACCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGATACTTTTTACAAATTCTGAGTAACTCTTTTAGCTCTTCTTTATTCAAATGCTCTGTCCTCATCTTATGCAATGGAATGCTCCCACTGTCGTTTTT:1	+	chr3L	27412256	3'	-	hopper	126	1	73.61
ATTTGAAAATAGAATAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTAATATTAACAATTAATAAGGCAATGATTATTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAAT:1	+	chr2R	9842749	3'	+	1360	324	1	71.92
ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAAACTCTCTGAGCTAGCCGCTGCAATCCGTACTTATTTTTAAAATTAGAGCATTTAGTTGAAGAATTAATAGTTGTTAGTTTTAAGGC:1	+	chrX	16665948	3'	-	1360	34	1	60.96
AATAGTATTCGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTT:1	+	chrX	21087674	3'	+	mdg3	5480	2	56.19
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCG:1	+	chr2L	16016432	3'	-	412	7099	2	54.11
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAACTATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTG:1	-	chr3L	4536699	3'	+	roo	339	2	63.70
ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGC:1	-	chrX	5662902	3'	+	P-element	2795	1	16.67
ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGA:1	-	chr3L	10013560	3'	-	hopper	49	1	52.74
TTTTTCTTTAATATTTTTTTTTTTCGTTTACTTTAAGAAAACTTAATTTTGGTATAACAAACGTCACTTTTGGTATATAATAATGCCATATTTTTCATGTTTAGATTGATTAATCTACGTAATTATCACCATCACTGGCTGTACA:1	+	chr2L	7659060	3'	+	Tc3	79	3	72.41
AAAAAAAAGCAAAAAAAAAACATAGTGGCATTAAACAAGTATTCAAAGAGTTGTTGAGGGCAGCGATTGATAAATAGGAATAAACAAAAGAAAAAACACAACAACCAAATAGTAAATAATGCAAACAACACGCGCAGCTTGTTCAT:1	+	chr3R	9892818	3'	+	gypsy7	5008	1	51.37
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAAT:1	-	chr3R	20469596	3'	-	roo	8722	2	59.59
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGTATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGACA:1	+	chr2R	15064444	3'	-	412	29	2	53.39
AGATTTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCACCTACTGCCGC:1	+	chr3L	2362402	3'	+	Stalker2	333	2	70.07
AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGCCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTCACATTTATTAGAAGCCATAGCAATGAATTTATCAAACAAATCTAAAAA:1	-	chr3R	31109656	3'	-	I-element	70	1	63.70
TTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAAAAGTCCGTCTGCAATGTACTGGCTCTCAAATTGAATTGTTTGATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGAATTG:1	+	chr3R	19449517	3'	-	roo	8601	1	51.37
AGAAGGTTGAGATTTAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTTATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCT:1	+	chr2L	3964500	3'	+	INE-1	172	1	78.77
CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAAAAAAAAACTAATGTGGACAAGTATTTTTTGCTTGTCTTGCCCCCAGTGACC:1	-	chr3R	26686016	3'	+	Juan	4160	1	60.83
CATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGAGCAGGATGCATGGAGCACATACA:1	+	chr2L	21008647	3'	+	invader3	281	1	80.85
AATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCG:1	+	chr2R	4032636	3'	+	micropia	169	2	69.40
ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACG:1	+	chr3L	10773141	3'	-	412	74	2	72.14
ATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGGCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGACAGTAGCAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1	-	chr3L	23112570	3'	-	R1A1-element	51	1	74.07
AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTTTTGCAATAAATTATACAATATCATTTAATTAGAAAAAATCTAAACATATAAACG:1	+	chr3L	15519853	3'	+	pogo	2041	1	61.64
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGATTCTAGCATCGTGAGTAAGTATTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTT:1	-	chr2R	8585435	3'	+	roo	9050	2	48.45
CTTCCGCCCTTCTGACGGGGGTACCTGAAAAGAATAAATCAATAACAATGTTAGTTCTAAATTTCAATGTTTTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGAAGCCAAAGTATTGGACAAGTTTTGTGGGTATATCTCAAGAATTAC:1	+	chrX	17346599	3'	+	HeT-A	5736	2	64.38
GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTTTATG:1	-	chr3R	26431965	3'	-	opus	7180	4	63.70
CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCTCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAA:1	-	chr3L	27415228	3'	+	transib2	2785	1	60.00
CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTGTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCTTGATTGATTTCAATATTATTATCACGATTTGCGGAAACCTGGCCTATATTTAAGTCGCCACCA:1	-	chr2R	6487847	3'	-	copia	47	2	52.59
GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCTGGCAAACTGTTGATTGGCTG:1	+	chr3R	18121701	3'	-	P-element	16	1	40.32
ACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAA:1	-	chrX	13704783	3'	+	invader4	277	2	71.05
GCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAACTTCTATAAACATGAACCAATTAGCCCATTACTTCATGTTTCGTTAC:1	-	chr3R	6611176	3'	+	HMS-Beagle	210	2	54.81
AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1	-	chr3L	25232774	3'	+	accord2	127	2	70.00
CGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCT:1	+	chr2R	4294601	3'	-	McClintock	6029	2	73.43
GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCT:1	+	chr2L	21400368	3'	+	mdg1	7371	2	74.66
AATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGCAAAATTGCAAAATAAAAACGACATAGGGATAACCGACTAACTTATTCAAAACATAAGCAAGCCATGATG:1	-	chr3R	20155033	3'	-	roo	313	2	52.74
AAATTACAAATAAATTAAAATTTGTTTTCTACTCAATTAGCTTATATCCATTAGAGATTACAATGAGTTATCGAAATCGTTTTTCACAAACAAATTAAATCCTTTCAAAATCTTATTCGCATGCATTCAATCACCTTTGATATTTT:1	-	chr2L	8329163	3'	-	Rt1b	124	1	76.71
AATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATAATTTAACTAAATTATACACATACCATATAAATATATTCGATTTTCTGAATAAGTGCTATTCTTATCTGAGTGAAAATCCTGTGGAGAATATCTTAAACTACCG:1	-	chr3R	20427745	3'	+	jockey	4825	1	55.88
AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTTCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTGTTGTTGCATACTTTCGGGCACG:1	-	chr3R	13360286	3'	-	jockey	56	1	50.69
GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGAAGCGATGCTTTCT:1	+	chrX	7256208	3'	+	412	7491	2	57.55
CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGCTGTTTGCAATTGCCACGCACATCAATCATTCATTA:1	+	chr2L	21884652	3'	+	pogo	2081	1	70.55
ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCG:1	-	chr3R	21276512	3'	-	BS	5036	1	55.48
GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTAATTTAGTTAAAAT:1	+	chr3L	17205294	3'	-	hobo	23	1	61.82
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGGTCACAAATTCACTTTTCATTGACACAAAT:1	+	chrX	8543574	3'	+	roo	9048	2	65.73
AGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGC:1	+	chrX	21564753	3'	-	diver	63	2	63.01
CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTT:1	+	chr2R	9662776	3'	-	412	87	2	80.82
TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATC:1	+	chr3R	22844258	3'	+	roo	8985	2	78.08
AAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCC:1	-	chr3L	10056125	3'	+	transib2	2770	1	71.05
ATTTAATTTTCAATATTATTATGAAGAAACATTATTTTATTAATATTCTCTGAATTTAAAGAGATGGCAGAGATCTTATTGAATTTCGAGCGTCTTAAAATGCTATTTCATTTTCCCTGTGGTCGGTATGCGAAAGTAGCCCCAGC:1	-	chr3L	15202727	3'	+	hopper2	22	1	75.34
GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCTGCTACTTTTTATTTGCC:1	+	chrX	3308351	3'	+	hobo	2928	1	64.81
AACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTATATCCTAATGGGTATTTCCAAGTCCGTACAACTTTGTCTCATCCAGTTAGTCCCAACTTGTTTTATCTACTGACGTTGACTCAATGTCGAAGC:1	-	chr2R	20194155	3'	+	Max-element	283	2	71.23
AAACAAACAAAAAAAAAAACAACGAAAAAATCTTAGAAACATTGTAATCAGTGATTTCTTCGATACAGATTAT:1	-	chrX	12769617	3'	+	gypsy7	5009	1	50.68
AATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCCAGTCGAAGTCCAGCTGCAGGTCCTGTTGGCCATACTCAGCCACATCTTGGCCAACAACCACATCCACATCCACATCCAC:1	-	chr2R	13082301	3'	-	I-element	4977	1	64.23
AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTGCCATC:1	-	chrX	2518027	3'	+	P-element	2860	1	58.56
TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTGTATACCTTATGGTATTTTATTTTTTTTCATATCGCATAAATTTGAATGCTATTGATTGATTG:1	-	chrX	21016932	3'	-	Transpac	44	2	55.94
AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATC:1	-	chr2L	544772	3'	-	412	47	2	52.67
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCGTAGTGAAGGCCCACAAATGGATTAAGACTTT:1	-	chr2L	7899334	3'	+	roo	397	1	65.38
CCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAGCAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTCAAAAAAAAGGAGCCTCACTTCACCTACCCACTTTAACTAT:1	-	chr3L	20761419	3'	+	F-element	4522	1	67.74
ACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGCAGGAGAATCACAAAGAAGCGGCTACTAATCCACATGTTTACCGGCTTC:1	+	chr3L	7189307	3'	+	hobo	91	1	63.10
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAAAAAAGATACTTATCAGCTACGTGACAAGATACATATGTGATAGCAAAAATAAGAGCGATAAGAT:1	+	chr3R	26222993	3'	-	roo	8687	2	67.81
TTTTTAAAAATTTATAATAACAATGCAAATCAGTATGGATACCTTTTGCTTTTGATTCTTTAAATTTGTTCTGCTTCATCCCATCAATCTCTTTTGATCATTTACAACAC:1	-	chr3R	24523875	3'	-	TART-C	11028	1	61.82
ATCTACAGACACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGGACTGGACGTGGGTGGTGAACGTGGGTGGTGAGCGGTCTAGTGCGGGAAAAGTGCGAAAATTGTGCGGGAAAGTGTTCGAATTTGAGCGCATATTGTGCAAG:1	+	chr3L	12158759	3'	+	G2	2823	1	78.01
TACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGGCAA:1	+	chr3L	10013674	3'	+	hopper	1368	1	54.14
GAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACAAAACAAGTAATTGCCATCATAAAGCTACTTATGCCACTGATTACCAC:1	-	chr3L	4605578	3'	+	pogo	2077	1	73.97
ATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGTATTATTATTTAATCACAATCTCTATTAACTAGTAGTGTGCTTCAGAAGGCGACCTTTTTCTCTCAGGCTGACTCATGCAAATGG:1	-	chr2L	19275752	3'	-	HMS-Beagle2	109	2	52.74
CTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGGTGTTTGTGTGTTTGTGTGTCTGTGCAGTGGAGCATCGTTTTATTTATGCTCATAATGCTGCGCAATGCATAATTATGCAA:1	+	chr2R	12839563	3'	-	accord	7033	2	66.91
AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGAC:1	-	chrX	13066496	3'	+	jockey	4940	1	55.17
TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTT:1	-	chr3R	19589903	3'	-	BS	5046	1	50.68
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAG:1	-	chr3L	11393491	3'	-	roo	74	2	73.10
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACA:1	-	chr2L	2909664	3'	+	hopper	1409	2	64.00
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAG:1	-	chr3R	28758293	3'	+	mdg1	365	2	56.55
GTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGATTTACCAAATCACAGATGCGAATGTATTTATTTCACATAAATAAATTATTAAGTACTTCAATATTATTAAATCCTCATTAACAATGTGACAATGAATAATAAATATGCTCAGCT:1	-	chrX	3308624	3'	-	hobo	111	1	75.34
TACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACCATCTAATTGCACAACGCGCGAGGGCG:1	-	chr3R	30344585	3'	+	pogo	2093	1	72.73
TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCATGTAGTGAAGCATCACACTGCAGGATAAATGGTTTGTC:1	+	chr3R	524105	3'	-	blood	7094	2	77.93
GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACG:1	-	chr3R	21276544	3'	-	BS	5066	1	64.58
TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTATGATTAATGTTACGAAATATTATTAC:1	+	chr3L	11441855	3'	+	roo	9035	1	60.27
AGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGC:1	-	chr3R	20499775	3'	-	mdg3	70	2	71.09
AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTA:1	-	chr3R	28758303	3'	+	mdg1	7398	2	62.14
TCTAAAAAGAAAAGAAGAAATTAATGCGTAAATAAAATGTATCAGTCTTAATCCTTAAGACCGATCCAATGACAATGAGTATTCCCTCGCGATAGTTTCGTTGGGATCTGTATATAGAGGGTATCAAGGCGCCCACACAGCACA:1	-	chr3R	25966160	3'	+	412	416	2	61.11
CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACGAGTATACGGGTATAAAAATATTATATTGCTTTTCTATTAAGTAAGCATTATTTCAAG:1	+	chrX	22511422	3'	+	1360	3334	1	66.44
AGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGGGATCAGGCCTACTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTTAACCTGCTCCGGTTCCACTCGCTTC:1	-	chr2L	10038819	3'	+	Quasimodo	6989	2	72.41
AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATGTTCGAAAATTATGAAAATAAACATGTGATAAATGTTGATAAGCATATGGAATTTAAATTAATTTTCTGAAAATCCAATATTAAAGGGATTCTCAATTGAAG:1	-	chrX	11294986	3'	-	BS	5031	1	68.49
GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTAT:1	+	chr3R	21276638	3'	+	BS	5075	1	54.24
CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCAT:1	-	chr3L	10056101	3'	+	transib2	2809	1	61.62
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAA:1	-	chr2L	3114478	3'	+	roo	9009	2	60.27
GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGGTGCCACTGCAATGTTTACAGTTTCGTATTAACACTATCGCAAT:1	-	chr2R	20899884	3'	-	hobo	63	1	70.54
AAGAGAGAATGGTATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAGTGGTGGAGCGAAATTTCAAAATTCTTTTGGCATGTCTATAATAAACATTATTTTGCTCAAATATTTATCAAGAGAAACTTTACC:1	-	chr3R	25574233	3'	-	INE-1	577	1	65.75
ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTCTTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAA:1	-	chr3R	25423181	3'	-	3S18	5809	2	51.37
ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGTCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTG:1	-	chr3L	10056122	3'	+	transib2	2772	1	68.70
AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGCAATAAAACCTAAATCCCAAATTTGTTTAAAATTGCAGCCACGTTTTTCAAATA:1	+	chr3L	15996026	3'	+	297	332	2	65.07
CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACCGATTTCCTCACTAAAAAACTAATACACCTT:1	+	chr2L	19965035	3'	-	Doc	82	1	74.42
ACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCATTTCTTCTC:1	-	chr2L	21008552	3'	-	invader3	67	2	68.42
CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATCCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTTATGTAATAATAGGCTTATATGC:1	+	chr3L	16015381	3'	+	1360	3384	2	74.48
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGG:1	+	chr2R	9328698	3'	+	roo	9041	1	54.31
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGGCAAGATGCTTGCACATAAAAAAGATACTTATCAGCTACGTGACAAGATACATATGTGATAGCAAAAATAAGAGC:1	+	chr3R	26222985	3'	-	roo	8678	2	67.44
ATTAATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATTCAGCCTATAGTGCATTAGATTATGCAACGTTTTTGTGAAGCATACTTGTTGTTGTTAACACGGCCATAAAAGTGCTAAACAAGCCAACAATTTGAGCGCTTTTC:1	-	chr3L	17896923	3'	-	Transib-N1_DM	20	1	57.14
GACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTATGGCTG:1	-	chrX	2082617	3'	+	Transib-N1_DM	458	1	90.22
TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCT:1	+	chr3L	25401029	3'	-	Doc	40	1	49.32
AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATGGAATGAAATA:1	-	chr3L	7292419	3'	-	HMS-Beagle2	19	2	75.34
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTC:1	+	chr3R	17420490	3'	+	roo	8990	2	76.03
ATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTGTC:1	-	chr3R	3177920	3'	+	Stalker4	7232	4	85.62
AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTACAATACTTGCTAGCTCTACCT:1	+	chr2R	9662815	3'	-	412	7101	2	54.11
ATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGAGGGGCACATCAATCATCTGTAATTACGGAATGCA:1	+	chr2R	7374984	3'	-	F-element	4265	1	76.03
GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATGTATGTATGTATTCCTTCCGGATTTTTGGGGTTACTAGCATTATTGCTCATCCTTTAGGCTATATCAAAAATATTTCTCGGCAGCGTTCCGGAGCTAT:1	+	chr3R	2461705	3'	-	mdg1	7053	2	74.10
GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATGCC:1	+	chr3R	25454131	3'	-	Quasimodo	9	2	60.00
AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGCTACTTAAAAAGTTGGCAAATTAAATTTAAGATGACTTAAAGCATTAACTTACGAATATATGCATAAAATG:1	-	chr3R	12598447	3'	-	hobo	50	1	55.48
TTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAAAAAAATCAAAACAATATATG:1	+	chr2L	20117968	3'	-	invader4	2799	2	51.72
AACATTTTATACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCC:1	-	chr3R	10273960	3'	+	HMS-Beagle	171	2	73.57
TACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACATATATAATTGGCGCCCAACATTTTAAATCATTACATAACATTTTTAAATGGACAATCAATTCGATATGATTGCACTGGAAATGTCGCCTCAGATGTAAGCTGATATAAGC:1	-	chr3L	23063766	3'	+	gypsy	7425	2	62.33
ATACTAAAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAGTAACAGATTTAATGGATATTTTAAAAATATAAACGCGGCCATTCTCATTGTACAACGGGGCGTATGAGTTACGAGTTATGTGCAA:1	+	chr3L	14735410	3'	-	Tc1	1542	1	54.10
AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAAAAGTGCAACATTTTTCTTTAAACACGATCTCATCTCTAAAAGCAA:1	-	chr3L	18376968	3'	-	opus	7179	4	68.31
TTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGAGAGTCGTACAGCAGCGCTAACCGC:1	+	chrX	13126497	3'	-	jockey	4734	1	80.95
TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATATATATTTCAATATATGTATATGTACTGTGTTGGCCGGAAAATGTGTGCGTCTGTGCGGAAATTGCATTTTTCACCCTTTTTCCATTCTGCCTT:1	-	chrX	12214026	3'	+	opus	7496	2	76.80
TCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAATTTCCAGAGTATCAGATACTAACAGGAAAT:1	-	chrX	22601901	3'	-	INE-1	89	1	53.33
GATCTTTATTTCTTCGTTGTCGGCAATATACAGCCAGCAGCCGACTTATCACCGCGCCGTCGCTGTTG:1	+	chr2R	9444870	3'	-	rover	7193	2	70.59
TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCAATTCGAATAATAATGGATGAGGGA:1	+	chrX	17431845	3'	+	hopper	1389	1	67.81
AAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCAC:1	-	chr2R	2016833	3'	-	1360	38	1	55.96
ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGTTAAATAACTTTTTACTTTTGTTAATTACCAGTTTTATTAT:1	+	chr3R	17605768	3'	-	Tabor	6865	2	66.44
TAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCAAAAACAAACATCTGTGGTTGATTCAACTTCTAATCTAT:1	+	chr3R	19448689	3'	-	Doc	129	1	51.37
CTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTCGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATATTGATAGCTTAATTAGC:1	-	chr3L	3799807	3'	-	copia	81	2	79.55
ATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCCGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTC:1	+	chr2L	14892306	3'	-	transib2	55	1	59.42
CCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTC:1	-	chr3R	12886922	3'	+	roo	353	2	72.22
GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGATACTTTGAGGGCA:1	+	chr2R	5485225	3'	-	blood	7057	2	51.72
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCG:1	+	chr3R	19968168	3'	-	roo	8738	2	81.40
ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAA:1	-	chr2R	9662726	3'	+	412	7501	2	65.71
AATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTTTAATGAGGTTCGAATAATATGAAAAACACATATGGTTATCCGCACAGAGGATAAAAACTTTCACGGGTTTTATGGTACTTACTTTTT:1	+	chr2R	19001939	3'	+	roo	85	2	60.96
GCGTACATAAGTGCACTCGAATGTTTTATTACTAAGGGGAGGTCGTAAGTCGGTCTAGTAAAATGACTTGCTTGACTTACTCCCCTCAGCGTAGTAAATAGTATCTAATAGTCGAGGCATGCAAAAATTGCATTCTCCTCTCCT:1	+	chr3L	22532271	3'	-	Q-element	560	2	48.61
AAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAA:1	-	chr2R	2666336	3'	-	Rt1a	14	1	55.29
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATG:1	+	chr3L	9998190	3'	-	roo	52	2	61.72
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGG:1	-	chr3R	12886911	3'	+	roo	9007	2	69.77
GGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAACAGACATGAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGATGAC:1	+	chr2L	9412078	3'	-	jockey	4548	1	73.13
AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAACACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGG:1	+	chr2R	16945352	3'	+	jockey	4930	1	63.85
GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTGTTTACATTTTTGCTTTGTTTTTGTCTTATTGTT:1	-	chr2R	11629699	3'	-	Tirant	8115	2	78.83
TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGGCTTAAGGATTGTGATGTTAGTCAACTTAATTTGGG:1	+	chr2L	13914189	3'	-	jockey	4704	1	49.60
CGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCAGTTTGGTGCTAGGATCTGTTTGTAAATTGTCAGCTTGTTGGATAGCGACAATTTACGTTGTTTCCTCCAAAATGCAGCCACAAATTGCTCAACATAATTCAGAATGTTT:1	+	chr2L	17850887	3'	-	X-element	4248	1	63.70
GTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCT:1	-	chr2L	13763173	3'	-	pogo	85	1	78.62
CATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCCCATCGCGCCCAATAATATTTAAAAATTACTTTTCA:1	+	chr3R	11496646	3'	+	1360	3355	1	60.96
CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATAATATGCCGCTCCCTAAAATTTTCAACCAATAATATATAAAGTGGCCCCAGAAATAAAGCCAAATTGAGAAGCTGCTTTTGTATATGCTTTCATT:1	-	chr2R	18352284	3'	-	FB	28	1	65.75
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGT:1	+	chrX	8543545	3'	+	roo	353	2	54.48
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTT:1	+	chr3L	9998185	3'	-	roo	63	2	67.16
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTC:1	-	chr3R	27994193	3'	-	roo	58	2	66.15
CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCTAAGTTGTATACCTTATGGTATTTTATTTTTTTTCATATCGCATAAATTTGAATGCTATTGATTGATTGAAA:1	-	chrX	21016929	3'	-	Transpac	4964	2	54.11
GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGGCGTGGTCGAAAGGGACAGTG:1	+	chr2R	2016945	3'	+	1360	3372	1	71.32
TTATTAATTTTATTATTTTTATATCCAAATAGCTTATACTAGAGTTTGACATTGAAGATGTTATGGAGATTATTAAATCTTTGGATATAGTGAATTAATTTTAGTAATTTATAAAAATATAAGATTTTATTATTACAATGAAAATG:2	+	chr3L	17988452	3'	-	mdg1	7076	2	19.18
TGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGTCATGTTCGTCTGTCCGTATGAACAGTATAAAAGGTAGAAGGTTATACGGAATGGAGAGCTGGTCACTTTTTCCTAGCTGCGGGGTGCGATGCACCGATTGCACG:1	+	chr2R	5471868	3'	+	INE-1	91	1	46.67
CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGTAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGG:1	+	chr2R	2016925	3'	-	1360	3	2	75.79
AAATTAGTGAATAAAAATCAGAATAAATATTCAACAACTAAATAACTAACTAACCAAACGAATTCAAATTCAAAACGTTGATGAAAAATGTTGTCCAGTTGATGAAATATCTTAAGTTCAAGCCAGGGTTTTATGTTTTTCCTTTT:1	+	chr2L	3146034	3'	+	Bari1	323	1	50.68
TCTGCATACATATGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAAGAGAACACAGAAGCTCTTCTCTTGTTATTTAAAGTGTACTTTAGCAAAATACTAACATCTCCTAAATATCAAACATTACATTAATTT:2	-	chr2R	1881363	3'	+	Stalker	239	6	52.05
ATAGTCGAGTTCCCCGACTATCACTATTTCGGGGATATCGATATGAATTGATTTAATTAAAACCGCAAGGTCGTCCAAATAAATAAAACAGCAAAAACGAGCGTATGTGTGCACGCTCGCATATATTTGA:1	+	chr3R	22595697	3'	-	INE-1	564	1	50.77
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTACT:1	+	chr3R	16404554	3'	-	pogo	62	1	67.91
TTGGTTTTTATTTCTATGAACAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCT:1	-	chr3R	14049362	3'	-	transib2	92	1	78.08
TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGATGACTTTTAA:1	+	chr3L	22349264	3'	-	jockey	94	1	71.92
GTTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGAGTGGCGGTGATAGCTTTGGTGGGTATATGATTTTTTGGTCTTACAGGCAGGCGTCTTCCCG:1	+	chrX	2496456	3'	-	Quasimodo	40	2	78.41
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGCGATAGCAAATGAAAAAGAGCCTACGCCTAAACACTTCTTTA:1	-	chr2L	3886145	3'	-	roo	62	2	60.27
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCG:1	-	chr3R	17817906	3'	+	roo	332	2	73.38
CTGTATGTAAATAATTTTGACGCGTAAAAATTGTGTGTAAATACTTTTGACAACAGACAAGGATCAGTTCAATGCTTCTATTTTTCGCAAATTTTTATCTCCATTTGCGAGCTGCGCTTTTCCTTTTCACTTTTCTCCTCGCACGG:1	-	chr3L	949340	3'	+	Bari2	941	1	58.22
CTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGATCCCTCGCCGCAGGCACTGGGTCACT:1	+	chrX	21907824	3'	-	springer	469	1	75.23
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCA:1	+	chr2R	9632166	3'	+	roo	9042	1	65.88
CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAACAATGACGATGCTGGGAATTTGT:1	+	chr3R	14651300	3'	+	P-element	2870	1	62.86
GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCAC:1	-	chrX	17054215	3'	-	jockey	80	1	68.61
ATTTTCGAAAATCAAAAATTTCACTTTTTTCAATTTTTTTTTTAAATCGCAATAATTCTCGTTCGCCCAACATTTCGCTCTTTTGTTGTAAATATCATAAATATTTCGATGCTGCCGCTACTGCTGGCCGTCATAAAATGTTTT:1	+	chr3R	14385665	3'	+	FB	150	1	61.81
GGGAACTCGACTATATCATTCTCTCTGGTTTTAAATTTAACTGGACAAGTTATTAAAATTAACCGAATACAGATTTGGAAAGAAAAAAATTAACAGGTTTCTAGACAGCTCTATCCGGAAAAAGTATACATTTCTTTCTATCATTA:1	+	chr3R	7040283	3'	+	INE-1	572	1	26.71
ATTGTTACATGGGTCACTTCATTCAGGCAAACTGCAAGTGCGACAAAACGAAGAACTGGAGTCCCTCGATCCATAAGATCACCTCAGAACATTGAAGCTGTGAAAAAACATCCGATTTGAAAGCGACACATTTGATAGCATTGTC:1	+	chr3L	3898582	3'	+	mariner2	272	1	72.41
TTTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAATACAAGAAAAAAAGGATGGGAGGATTCTTAAAACTCCACAAACCTGGTTGCGGGGAAGCGGCCTAGTAACAGCGAAGACGGCTGGAATG:1	+	chr3R	2446852	3'	-	X-element	4713	1	71.77
GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAAGAAAACA:1	-	chrX	23282934	3'	-	HMS-Beagle	44	2	53.47
TATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAA:1	+	chrX	21014860	3'	+	copia	197	2	58.90
AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGAAGTTGAGATAGCAGGTCCTAAAAGACCTGAAAGTCTTTGTTTTTTTTTTCAGTGCACTTGTGCGAAGTGCAGAACCCTTTAGCCGCGATATCTAG:1	+	chr3R	9977785	3'	+	jockey	4949	1	74.63
GGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAAGTAAGATACACAACAACTCTTTAACCCAGATGCGAGAGGGAGGCGC:1	+	chr2L	9906536	3'	+	invader3	5394	2	65.71
CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAAT:1	-	chr2L	8986111	3'	-	412	7105	2	54.48
GGGGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCG:1	-	chr3R	9038893	3'	-	Juan	4026	1	69.12
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTGAATTATTTTGAAGCAAAGGGAAGGGTTGGCATAGATGTTGTGGTCACGAATCAAGAATCTAATGATTTGCGGTAAAATCGAATGATTATTGCTTTTGGTGTACAGATGAAAAG:1	+	chr3R	25449140	3'	+	roo	9044	1	77.93
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCACTCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAG:1	+	chr3L	233351	3'	+	roo	9028	1	54.11
ATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAACAAAGAAAATATGATTTAATAGGTTGCAAATTCGTGTA:1	-	chrX	13704710	3'	+	invader4	3077	2	78.08
TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGTATCTTAGTATTTCAGAATTTAAACTTAATTTATATATTTTATAAGCATTTATTTACATGATTTGATTAAACTGCAAGTCCAAAACTCCTTTGC:1	-	chr3R	14337362	3'	-	copia	4896	2	66.90
AGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGTCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATT:1	-	chr2R	5173448	3'	+	gypsy	393	2	70.00
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCCCTCTCATTCTTCC:1	-	chrX	16717881	3'	+	roo	9047	1	80.30
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTT:1	-	chr3L	233267	3'	-	roo	8723	2	79.09
GTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTA:1	-	chr2L	12290670	3'	-	1731	30	2	53.21
CTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAATAGGGAAATTAAGTAAATAATTCAAAAAAAGTTT:1	-	chr2R	13700815	3'	+	roo	409	1	76.03
CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATC:1	+	chr3R	27424947	3'	-	blood	64	2	49.30
AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAA:1	+	chr2R	15064454	3'	-	412	47	2	51.37
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAA:1	-	chr2R	19004124	3'	+	roo	9024	2	52.14
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATG:1	-	chr2L	3114460	3'	+	roo	9028	1	55.17
GATAGGCAGATGTGCCCGAGCGGGAATAACAGCTAAAGGAGTTCATCCCATCCAG:1	+	chr2R	13710522	3'	+	roo	244	2	74.55
AAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAATAGTTTCGTTAATAAAAAAAAAGAAAATAAAAAACGTTTCAAACGTCACGACGATGATGATGACGTCCCACCACCTTCACCACCTCCACCACCACCCACACCCAC:1	-	chr2L	16524307	3'	+	jockey2	3349	1	53.79
CATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAA:1	+	chr3R	556471	3'	-	Juan	4163	1	64.38
GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTTTTGTCTTGAAAACCTCAAACAATTTGGAATACGAACAAA:1	-	chr3L	23818310	3'	+	copia	251	1	60.96
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAG:1	-	chr2L	3114482	3'	+	roo	9020	2	58.78
ACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTANCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAAT:1	+	chr4	651046	3'	-	micropia	4968	2	67.31
ATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACCTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGGT:1	+	chr3R	1844857	3'	-	Cr1a	157	1	52.14
CGTTAGAGTGGGCATGGCAACATGGCGCTGCGTCTATGTCACTACAATCTGTATGCTTAATCTCAACATTCCTGAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACAGAGCCAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTA:1	-	chr2L	22724143	3'	-	INE-1	209	1	80.14
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATA:1	-	chr3R	16076803	3'	-	roo	8750	2	78.08
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCT:1	+	chr3L	20831395	3'	-	roo	37	2	58.27
TGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCTCCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAG:1	-	chr3R	19589910	3'	-	BS	5051	1	54.86
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGG:1	+	chrX	13039517	3'	-	roo	8696	2	83.33
TTTGTTACAAATATGTATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCGCGTGCCTTGATTTATGATTCAGTCGCAGATTATCGTAATTAAAACA:1	-	chr2R	22097220	3'	+	accord2	7523	1	61.42
ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTAC:1	-	chr3R	19446166	3'	-	297	17	2	67.12
GCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTG:1	-	chr3R	23495648	3'	-	copia	49	2	58.40
AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTGTGTGCG:1	-	chr2R	9662701	3'	+	412	471	2	58.88
GCAAAAACTATGAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATTGATTTCTAATTAACCATTTTGCATTTGCTGCGTGCCAGTGTCCATGTGTGAATGTTCTCAC:1	-	chrX	14814767	3'	-	hopper	398	1	54.41
CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTA:1	-	chr2R	20496915	3'	-	blood	68	2	65.07
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATGCTACAGGGCTTATTCGAGATAAAATTTGGCCCCCGAAATAGTTCTATCAATAATAAAAAAAAAAACTTAACATTAGTAATTCTACTGACTATCTG:1	+	chrX	2444488	3'	+	roo	9049	2	69.66
AGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTAGAGGGTGAAATATATAATTAATAACATGAAAAATACATAATGAAATCATTATCTTACCGTAATGTGAAATGATTATCGTATGTGTGTGAAGTGCGCAACAATGGCGAAAGAGA:1	-	chr2L	4022287	3'	+	jockey	4823	1	76.03
TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGATGGAAAAAATAGGGGAAAG:1	-	chr3L	4840721	3'	-	jockey	4717	1	52.27
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTGGAAAC:1	+	chrX	8543531	3'	+	roo	9002	2	64.38
TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGCATACATTTGGGAGAC:1	+	chr2L	15181460	3'	-	jockey	4807	1	51.85
TAATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTCTGCGTGACCAT:1	-	chrX	19409304	3'	+	Tc3	277	1	71.72
TAACAATATTTATATCTAAAAATAAGTACATACTAAAGGAACCAAGTAAATATAAAAAAAATACGGACTAGTGTAATTCAAAGGATAAATATATTTATGCTACCTTCATATTTTTTAAGAAAAGCTAGTAAAAAGAGTTTCTGCGC:1	+	chr2L	11523141	3'	-	gypsy12	9759	2	58.22
GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACATATGGCACATATGCAAATATC:1	-	chr2L	13585798	3'	-	Tabor	6853	2	73.85
TCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTATTTATTATTATTTTCATTCAACCATCCGCCCGTCCTAAAAGCTGCATTGTTCGCAGCGAAATGCCTTTGGTTACCCAGCC:1	-	chr3R	12958041	3'	+	jockey	4952	1	53.42
CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACA:1	+	chr2R	13084658	3'	+	roo	320	2	80.14
GCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATGGAAACTCTTCTGCATGTG:1	-	chrX	21585251	3'	-	mariner2	278	1	59.59
ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAG:1	-	chr2R	9325375	3'	-	BS	5010	1	57.60
AATATAACATCTTTATAGTTTGCCTACTTATTATGTCTAATCACATATTTAGACATTCTCCGGG:1	-	chr3R	3618827	3'	-	rooA	7269	2	93.75
AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTCCCAGTTGGCTTCTCAGCTCCGGGTCGGTAAATAAAATGCCAA:1	+	chr2R	24218609	3'	+	412	428	2	64.44
ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACAACAATCGATTTTCAATATTCTAG:1	-	chr3R	21276560	3'	-	BS	5084	1	74.66
TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCA:1	+	chr3L	20654600	3'	+	roo	9044	1	65.00
GTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCTATGCTGTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAACAAAGGCAATTGGAATCCG:1	-	chrX	5663079	3'	+	P-element	138	1	72.27
GAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCACGGGATGAGATAAGCCAAGCTTGTGGAC:1	+	chr3L	22799812	3'	+	Quasimodo	6928	2	75.00
AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTA:1	-	chr2L	544807	3'	-	412	71	2	77.50
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGTTCT:1	-	chr3R	18582091	3'	+	roo	399	1	76.03
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCAAAGCAAAATCCAATGAAC:1	+	chr2L	18294304	3'	-	roo	48	2	53.79
GTCACGGTCGCCATGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTTATTTCCCCAGCAATCCCATGGCCATAAATGGCCAGCTTATATAAATGCGTATGC:1	+	chr2R	19101835	3'	-	Stalker4	422	2	58.96
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATAT:1	-	chr3R	18582129	3'	+	roo	9027	1	54.79
CCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATAATATTATGGGTCACCATTCAAGGAGCGAGGCGTTTAACTCACATAGGACAAACACGATTAC:1	+	chr3R	23514206	3'	-	roo	192	2	53.03
CACTATGGGAAATTTACCCACTTTTTGTGCACAAAATTAACACCTTTATAAAGGAGATATTAAGATATTTTAGTGGACGGCAAGCTCCAGAAATTTATTTCATTATCCCAGCTCTTTTGGCAGGTCCAATTA:1	+	chr3L	22906555	3'	-	Transib-N1_DM	493	1	51.52
GTATATATATATGTATAAGTGCTTATTCTTTACACGGAGTTTACAAAAAAAACGCAGGAATTTCATTTTAGCTTTTTACACAATAACTGATTGTTTTTATCTGGAACAAGAGACTAATTCGATCATGTGTAACCTT:1	+	chrX	18223245	3'	-	blood	7193	2	65.44
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGATAATG:1	-	chr2L	17420143	3'	+	roo	353	2	57.53
GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGACTTTGCAATTTGCATTTT:1	-	chr3R	20499763	3'	-	mdg3	5257	1	62.67
TGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTACTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCG:1	-	chr3R	26659753	3'	-	HMS-Beagle2	6934	2	57.78
AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTG:1	-	chr2L	15833483	3'	-	jockey	76	1	78.26
TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGTGGTCTTAAC:1	-	chr2L	17081768	3'	+	jockey	4963	1	53.12
AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGC:1	+	chr3L	3477514	3'	+	mdg1	358	2	65.07
TGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCT:2	+	chr2L	22684591	3'	-	transib3	69	1	60.00
CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCATTTTTGCGAAACAAAAATAAGTGAAATGGAGTTTTAAGTTTATTTTATGCTG:1	+	chr2L	544914	3'	+	412	473	2	69.18
GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAGATGGAGCCAAGGACGA:1	+	chr3R	7482860	3'	+	412	461	2	60.28
ATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGACAGTTTTAAAATAAAGACGCTCACTGAATTTATTCGTGTTTCAATTTATAGATTGATGCCTCTGGAGCGCAGTGTGCCCCCCCTAT:1	-	chrX	15205961	3'	+	297	271	2	68.18
CCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAGACGCGTTGTGGCAGTCACGTTCCAGTCTTGATTGTTGCAATGACCGA:1	-	chr2L	1058451	3'	+	1360	281	1	67.12
ATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGG:1	+	chr2R	4939196	3'	+	1360	3370	1	30.71
TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGGTTTTAAATAAATATTGATCAAGCACCTACTAAATATTGTTTCCCGAACAGCGCTTTTCGTCACTAACTTGTAGTGCCTTT:1	-	chr2R	18336125	3'	-	roo	8705	2	54.79
TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTACAGTAACGGAAAGGAAATTAATG:1	+	chr3R	30344713	3'	-	pogo	65	1	63.70
ATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAATAATATATTAATAAAAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTAACACTTATATCGATAGAATTAATTGTCTTGTCTTA:1	-	chr2R	1264056	3'	+	hopper	1080	1	75.34
AGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGCTGGTGTGGCTATTGTTGCAGTGTCCTTTAATTATTGCAAAGCTGCGTAAGTATCCAATTGCACTAAGTGCAAG:1	-	chr2R	25249956	3'	+	HeT-A	6013	1	50.68
CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTTCTGTAGAAATGGCTTAGTTGATACATTAGTTTCCGATAACGGAAAACAATTCACGTCTGATGAATTTAAAATATTTAAGACCA:1	+	chr3L	23818456	3'	-	copia	4907	2	58.22
CTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATATTTTTATTTATTAGCGCTAGTCTTAACTTTAAGCTGTAACATATTCAAGTACACAATTTTTTCCAGTGCACGGAGAGAGGGAGAGCGTTCTGGATACGTGGAGAG:1	-	chr3L	16015839	3'	-	1360	473	1	73.29
ACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAAATAATACACCTTCTCC:1	+	chr2L	19965039	3'	-	Doc	95	1	74.66
TGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGC:1	+	chr2L	21400374	3'	+	mdg1	7380	2	69.93
ATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATCATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATAAAGTTTCATATAAGTGATTGAATTTTTTATAAATT:1	+	chr2R	24561446	3'	+	P-element	2698	1	24.66
CAAATAAATAAATACAAATAAAATTCAAGCTTTGGATTATTCAAAATGTTATTGAAGTATTTAGTTTTTGTGCATTAATACCATTGTACTTTAAATGAATTTAATTTTGTTTTTAAAACATTCAGAAACGTAGGAACACT:1	+	chr3L	16302391	3'	+	Tc1-2	479	1	55.00
TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCATAA:1	-	chr3R	9921964	3'	-	blood	7061	2	54.79
AGGTAGTGTTGGTGAGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTAGAAATGATTACTCAAACAGTGAACGAGTAAATAGGTCCTAGCCGCAATCGGAACATTTGGCGGCACAATCCACACAA:1	-	chr2R	3037115	3'	-	I-element	4966	1	58.52
TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAGAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTCTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATACTTCAC:1	-	chr2R	4830327	3'	-	1360	89	1	92.47
ATTTTATTTCATTCATAAATTTGTTAAACATAGGGAAAACAAAGGAACTGAGCGAATTTATAAAAAATTAAATAATAATTAAGTATAACTCTGGTATTTCTGTGTGTGACTTTCGGGGTGGGGAAAGGAAGTAATAAAACGTTTCG:1	-	chr3R	3511051	3'	+	Tc1-2	327	1	70.55
AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATTTTCTTTTTATCT:1	+	chrX	21564776	3'	-	diver	5928	2	58.90
ATGCGATTCTCATGTCACCAATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCC:1	+	chr3R	17420491	3'	+	roo	327	2	73.97
ATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCGCACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAG:1	+	chrX	22386762	3'	-	hobo	92	1	62.96
ACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCCACTGCC:1	-	chr3L	11957112	3'	-	blood	7049	2	53.08
ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTGGAAGCCCCCATT:1	-	chr3R	25826652	3'	+	mdg1	373	2	50.68
ACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCAACTTGCTTATAATTCCCGACATCGGCTTTTGAATC:1	+	chrX	21016833	3'	+	Transpac	5156	2	74.29
TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGG:1	+	chrX	13039517	3'	-	roo	8675	2	76.47
GTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTATCTATTGATTTTGCGCTGGTGCGTGCTCTTTGCATGTTGCGTCATTTTCATTT:1	+	chr3L	22635584	3'	-	R2-element	3164	1	76.92
CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGC:1	-	chrX	5629125	3'	+	jockey	4917	1	67.81
GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATACTTTCC:1	-	chr2R	12835027	3'	-	jockey	66	1	56.85
GAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAGGTTTTCTTACCCTTAAGGTATCGGTGCCGAATCCTCCTTCTCTCTGAGCTCCCC:1	-	chr2R	21861536	3'	+	pogo	1799	1	56.35
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATTATGGACAACATTTGCTCCCACAGGCCAGCGGTTTTGGGGAGCGGGACAGTTGGCGTTCGGTGTCAGGGGGTT:1	+	chr2L	7945430	3'	-	roo	10	2	69.72
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTG:1	-	chr3R	11083909	3'	+	412	7499	2	68.93
GACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGTTCATTCAGCCCACTTC:1	+	chr3L	17685250	3'	+	mdg3	219	2	45.21
GTCCCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCAAGGGTAAATAAGATTCGGCTTGCCACAGCCACCTTCC:1	+	chr2L	10986858	3'	+	1360	3336	1	66.38
AAATTAAAAGAAAAAAAAAAATGAGATAAACTACATAAAAGG:1	+	chr3R	23746996	3'	+	Doc	4699	2	90.48
CAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCCCA:2	-	chr3R	3617305	3'	+	micropia	178	2	78.08
CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATACTTTCCAGCT:1	-	chr2R	12835023	3'	-	jockey	14	1	72.73
AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTC:1	-	chr3L	15519737	3'	-	pogo	50	1	54.79
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAG:1	+	chr3R	25448429	3'	-	roo	57	2	64.18
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATC:1	+	chr3L	20654602	3'	+	roo	9040	1	63.70
ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCTC:1	-	chr3R	27424818	3'	+	blood	7354	2	58.16
GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCACATAGAACACTTTTTTCAGATGCGCTCTGTAGGTTAAACCCTTGATCACAAAAGCTATTAACATGTTCCTAAT:1	+	chr3L	4536842	3'	-	roo	8676	2	71.23
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTAGGATTAATGTTACGAAATATTATTACAACTTTTTTACGTTTTTCTTTTTT:1	+	chr3L	11441879	3'	+	roo	396	1	74.66
GAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATAAGATCATCTAGACATCTAGATTAGATTATTATGTTTTATATATGACCAGCGTAGATAAGTATTTATGTATTGGATATTCTAACATTTT:1	-	chr2L	23181475	3'	-	Tc1-2	1269	1	69.18
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGATT:1	+	chr3L	11531025	3'	+	roo	394	1	73.29
GCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATTTTAAGGCGATGA:1	+	chrX	6499059	3'	-	Quasimodo	54	2	60.27
ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATT:1	-	chr3R	14981165	3'	+	mdg1	398	2	53.12
AAATAAAATTATTATTATTATTATGTATGTACTTGCATTCAAATTATCTGTCAGTATGAGCGAATGAGTCTTAATCTGCCGTCTATTTATTCGATTATGTACCGTCCTTTTTCTACAGGATATATGTACATATGTCAAGGGTTGTG:1	-	chrX	22538995	3'	+	Burdock	499	1	76.71
CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGAAACCAATTCGCCAAAATTTTAAATCTTTGAATCAATAGACAAAAAGGTAAATCATAACCAA:1	+	chr3R	17831883	3'	-	F-element	52	1	52.00
TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGAATATTGGTTATTATAATAATTGT:1	+	chr2L	13763212	3'	+	pogo	2061	1	82.35
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCC:1	+	chr3R	7835191	3'	-	roo	8742	2	75.54
GGGAGCGCCAACTCCATTCACAGAGCTACTCGCGCGAGTCCCCCCTGTGTGACGGTTATATGTACATACAATCCTTTGTGGCACACAGGACTCCC:1	+	chr2R	7859847	3'	-	Rt1c	22	1	72.63
TTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCATGAAGAGCGACATTGCAATCCTATAACCTGTAACATTAAAAAGAAGATAGTTAA:1	+	chr2L	21153625	3'	+	1360	393	1	76.71
ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCCCCTGGGCTGGTTCATTAATGGGACC:1	+	chr3L	20168478	3'	-	mdg3	28	2	61.59
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAAATTGTGGGTTCACACTGCTGTGTTGTT:1	+	chr2L	7810171	3'	+	P-element	2878	2	77.44
CCAATGCTTATGGCTGCACGAAATGAACCCGAAAGCACTGAGAGCGTCTCGCTCAAGCTCTCCCCATTCAAGATATAAAGTACAGATTGTTAAGCTTAATGCCTTTGTTACTACATGCCCACGGATAAATTGCAA:1	+	chr4	973721	3'	+	Doc3-element	395	1	54.07
CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAAACGCTACGAAACAAGGAAAATGTTACTACTTCTATTCATGAGAGTGTGGGCGGGGCTTAAATCGAATAACTT:1	+	chr2L	23068953	3'	-	1360	47	1	49.66
GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAGCAGCGCGAA:1	-	chr3R	14979776	3'	+	pogo	2048	1	56.16
ATAATAATAATAATTTTAAAAAAGAAAATGCTTAAAACAATTTAAAAAACCAGTTGATTGAGATCTAAACTGAAACCAATTGTTGAAAAAAAAACAGTTTCTGGATTGCTGAGTAAGGAAGTGAACTGA:1	-	chr3L	11910263	3'	+	mdg1	38	2	61.24
AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATACATATATATGTGTTTCTACAATGGCACCCACGCAAAACG:1	+	chr2L	2794254	3'	-	Burdock	75	2	77.24
GTTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTGTTTACATTTTTG:1	-	chr2R	11629720	3'	-	Tirant	11	2	74.79
TAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTGTTTTTGTTATTCGAGTTGATTATCTGCCACCAATGGCATCGCCAGTTGTGGTCCTCAATGTCA:1	-	chr2L	17597232	3'	+	hobo	304	1	50.00
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAGAGAGCAGGTG:1	+	chr2L	16016447	3'	-	412	7084	2	64.38
ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTA:1	-	chr3L	6978123	3'	-	pogo	46	1	52.05
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTGTATAGTTTGTTAACAAGATTTGCTTTGCAAG:1	-	chr2R	7898027	3'	-	roo	8683	2	71.23
ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGCTACTTAAAAAGTTGGCAAATTAAATTTAAGATGACTTAAAGCATTAACTTACGAATATATGCATAAAATG:1	-	chr3R	12598447	3'	-	hobo	44	1	54.29
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAATTAAAAGGC:1	+	chr3L	20831417	3'	-	roo	8686	2	70.55
TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCGCCAATCGAA:1	-	chr3R	14364591	3'	+	roo	9040	1	58.54
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGGGTTTACTACTCTCATAGTGCTTTTCTGCTCCA:1	+	chr2L	5254343	3'	-	roo	8731	2	76.61
AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGCGCGAGTGGCGGGCGGCAGTTCTCTGTAAATCACTCCTCGGCCCCCGAAAGTATGCCAAAAAG:1	-	chr3L	4948062	3'	+	hobo	2903	1	57.45
CCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGCTGCTCCTGGAT:1	-	chr2R	23466006	3'	-	Doc	462	1	76.92
TATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCA:1	-	chr2R	23332519	3'	-	invader4	2807	2	59.12
CAGGCGACCGTATATGTGTACATCATTCGCTGATAATGCACAGGTAAAACATATAGGTACAATCACAAAAATCTTTAGCATTGCGCAAAGAATGAAAGAGAAGAAAAGCTCCAAAGAAAGTGAAGAAGACGAGAATAAGGACGAGA:1	+	chr2L	15027902	3'	-	accord2	7214	1	76.71
AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTGGCGCCCAATAGTCGAAAATACTTTGTTGAATTTTTTAAAATATATATGATAAGACTTGCCTTAATTACAATTTAGCACGTTTGCAGAAGAATTTAATACTT:1	+	chr2L	6863435	3'	-	pogo	14	1	71.92
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCA:1	+	chr3R	7835192	3'	-	roo	78	2	75.00
ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATCTGTATAGTA:1	-	chr2R	15005084	3'	-	jockey	95	1	73.29
TAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCGATTTGACTTCACCGTCAGTC:1	+	chr2L	4412657	3'	+	Quasimodo	7360	2	59.65
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATA:1	+	chrX	16717922	3'	-	roo	8723	2	70.08
TAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTATTATCTCTTACAACTTT:1	-	chr3R	5061793	3'	-	mdg3	5265	1	76.43
TTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGAC:1	+	chr2L	2687427	3'	+	copia	235	1	56.25
CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGTTTGCTTTTGTTGTTCTTTCGAGCGAT:1	+	chr3R	14651332	3'	+	P-element	2872	1	74.07
AATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATTATCACAAAAATAAATTTCAATAGATCTTTGGCAAATGCCGAAGTGCCGCGCATACCCTA:1	-	chr3L	1704101	3'	+	1360	273	1	75.17
CTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTG:1	-	chr3L	7319826	3'	-	1360	380	1	62.14
GCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCAGAACACAGGCTCACCCACAACAGTTGA:1	+	chr2L	15875802	3'	+	hobo	2866	1	78.57
AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATTATCCATTGGTTTTCTTATTCTGATTTC:1	-	chr3R	26431993	3'	-	opus	7074	4	78.40
ATATAATTAAATATTTTATTTATTTACTCCTTGGCATCTTAATTTCTTAAATAATATATAGCACAAGTCTGTTGTTAGAGAATATTCGAATCCCAAGGTGGATTAATTCAAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGA:1	+	chr3R	19446111	3'	-	transib1	1932	1	49.29
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGT:1	+	chr2R	8585565	3'	-	roo	8699	2	41.78
GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGAGGATCACTACAGCGAGGAGAGATC:1	+	chr2L	23197589	3'	-	Transpac	54	2	76.64
AATAATTTATGTTTTAAATTTGATAAGTAATGTATTTCATAGTAATTTAACCGAATCCCTCAAAACATTTTTCTAGATCTTAAACTTCCATATACGAGGACATTGCCCCTTGTTCTTATTCTTCGGCCTGCACT:1	+	chr2L	17071577	3'	-	TART-A	13257	1	52.24
TGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCATCGTATTTTTTACCTTCAGAGATCATGTTTTTAATCAAATTTTTTTTTCGGCGGTACAATGCTTTCTCCTTTGATGCGAGAGGATGGTTCAGGGAGAAGAAGGGCTTTTAAG:1	+	chr3L	16901555	3'	-	Tc1	442	1	67.14
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTG:1	-	chr2L	14772059	3'	+	roo	8983	2	77.40
AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACGCCTGGTTTTTATCATAAGGCAATTTCATATTATGCT:1	+	chr3L	7188655	3'	-	hobo	34	1	64.38
TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCC:1	+	chr3L	21855543	3'	-	blood	54	2	55.48
GCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAGCAACGGTAACGGTTAAAAAATAGCGAAGCAGAATGAAGCGCCGAAGGTAATCTTTCGTCCCAGGTAAGCTTTTCTCTCCATATTTGCTGC:1	+	chr3L	24039287	3'	+	Bica	480	1	51.13
AACCTAAAAACCTAACTACAACTATGATTAAAATTCATAATATTAATTCCTTTTTGTTTATTGACAATCCACATGTTGCCCTGTTTTGGCAATTCGATTACAACACTTGCTTCGGCATCGGTTCAAAAACTGCTTTCCTCTCATA:1	-	chrX	5387260	3'	+	gypsy2	467	1	58.62
TTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGACGACGAACTTGAGGGTAAAATAACTTGAAACTTGAATATTTACATATGAAA:1	+	chr2L	2687477	3'	+	copia	236	1	71.72
GCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGAT:1	+	chr3R	14860231	3'	-	BS	5050	1	54.79
ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGC:1	+	chr3L	17115542	3'	-	blood	52	2	54.01
GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTGGGCTAAAAGTTCT:1	+	chr2R	16785478	3'	-	412	9	2	80.14
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCGCTAATT:1	+	chr2R	25118810	3'	+	roo	9043	1	67.12
TATCTCAGAAACTATAAAAGCTTTAAATTTTAGATTAAGCATGCATATTCCGGATGCGTCGATTCCAGAACAAGAGTTCTATCTCGTTTTAAAATTAGTGTACCACGATACTATGTTCAAATGATGGACCACTTGTTGGAATATTA:1	+	chr3L	22016892	3'	+	INE-1	150	1	69.86
ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGAATAATACTGAGACTGTAGTAATCTTCACCAGAGGTG:1	+	chr2R	6173115	3'	+	pogo	2074	1	64.03
GAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCA:1	-	chrX	2842515	3'	+	Tabor	7238	2	76.22
AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAAGGT:1	-	chr2R	13121964	3'	-	pogo	31	1	53.10
AATATATTCGTGGTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTT:1	-	chr3L	15600153	3'	-	roo	5	2	55.26
ACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTGGAATAGGAGTGTGTGCGCCTTGTATTAAACATTTTTTAATGAGTGTATCTTCTTTTCTGACTTTACTGTTGAAGAGTTGGGTTTTTGAGTTGA:1	-	chr2R	4580908	3'	-	Cr1a	182	1	77.95
AAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTGGCGCCCAACCAACAATCAATTTGTCATCGCATTAATTAATAACAATTTAATTTTAGTTCT:1	+	chrX	20867973	3'	+	gypsy	424	2	46.58
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCATGAGAATTGAGTAAGTTTTCGCCATTCCACTTGACAGCTTAAAGTTCCTCTGCCACTCGCGACTCCAAA:1	-	chr2R	14387911	3'	+	roo	9053	2	64.29
AACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATAACTTTATCTCTTGTCCGCGTGAATTTAGCACCTATT:1	-	chr2R	1725638	3'	+	17.6	291	2	74.48
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACG:1	-	chr2R	20596433	3'	+	roo	386	2	64.62
TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACGCGACGAAGAAGCTATTTTCCAAGTCAATCGGAAAGAAAATTCCAAGTTGGGGCCCTCGACTCGACCCGGCGCCG:1	-	chr2L	7811482	3'	+	P-element	2803	1	71.93
GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAACCCACATATTACATTACATTACATTCGATATTATATTAAAATAATCTCTGGAGATTAAAAAATCTAGAAATGTTGCAATTGATTCAATACAAT:1	+	chr2R	9221151	3'	+	opus	7476	2	67.12
GAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAATGTTGAGATTAAGTATGCACAGCTTCCAGAGACATAGGCGGAGCGCCAATTGTGGCAACTTACCAAGGCTTTGTATTTTGGAGAACATCTATGAGGG:1	-	chr3R	1342284	3'	+	INE-1	148	1	69.60
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTGAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCT:1	+	chr3L	20831400	3'	-	roo	32	2	61.87
GAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATGTTTCACTGTGTCATTCATTATGGAATTCCAACTAAAG:1	-	chr2R	11164363	3'	+	roo	9063	1	68.15
TCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATTTAAAACTGTACAAAATATAAAACGTCTACTAAAACACGATAAAATTC:1	-	chr3R	15363926	3'	-	flea	4816	1	64.93
ATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATT:1	-	chr3R	19589922	3'	-	BS	5065	1	63.70
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCC:1	-	chrX	5274304	3'	-	roo	45	2	60.87
CTTTAAGGATTGTTTTTGTGGGCAGTTGTGAAGGCGTGGTCAGATAAAAAAACAAACAAAATCCGATATTCTATTTAAATCCTAATAATTAATATATAAAAATCAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAAATAAAA:1	-	chr3R	27919362	3'	+	transib4	2493	1	68.49
GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATACTGAGACTGTAGTAATCTTCACCA:1	+	chr2R	6173109	3'	+	pogo	2072	1	62.96
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAA:1	+	chr2R	11164531	3'	-	roo	8699	2	61.64
TTCAGCTGTGTGGCACTGCAAGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCAATAGAGATTTCAGAAAAGTAGGCAACTAGTTTTTCCGACTATAAAGAGGAGACC:1	-	chr3L	21360000	3'	+	G-element	3924	1	62.07
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGC:1	-	chr3R	17817916	3'	+	roo	331	2	79.23
ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTTTGGAGATACAGCTGGAACACAGCCATTCTCTCCTGCGGATCACACTGTGGCAGCAGGGGCATGAG:1	-	chr3L	7139952	3'	-	1360	14	1	50.40
ATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTTCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATAGAATTTCA:1	+	chr3R	16799787	3'	-	X-element	4697	1	67.81
AATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGC:1	+	chr3L	26745414	3'	+	Stalker	263	4	88.89
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTACAAAATTTTTCAAAATCCAATTTCCCCACTATCCAATACACTCGCTATACGTTCAAGGAAGAGGAAACCGTGAGTCCAGCCGTAAGAGCTTCTTTGGCTAT:1	-	chr4	419909	3'	-	roo	13	2	76.71
ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTGTCAAGCGCCCAAAATTCTTTTCCTAGTCCCCTAAACTTGATACCATCCCGACATTTGCCTCAAATTAACACCTCTGGGAGACGGCTGACTTTT:1	-	chr3R	29360920	3'	-	mdg1	7065	2	66.44
ATGTGTGTTGAATATTGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGTGACAATGTTGCGTGCTGTCCCCAGTTC:1	+	chr2R	15637548	3'	+	1731	24	2	78.57
AAGAACACAAAAATGCGTTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTATCAGCACGACACAC:1	-	chrX	2842448	3'	+	Tabor	7315	2	75.94
AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTGATATAACAAAGGCCACTTGCTGAATTCACAGTGTCCGTTATCAATAATTGACGCACCATCTTAACCCGTTTTAAACTATTTTCTTCGGGC:1	+	chr2R	18609484	3'	-	opus	6	2	75.83
GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTC:1	+	chr3L	10574379	3'	-	Tabor	37	2	47.97
AGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAGTTGTTTTACGATAACGTCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTCAGAACTAAATAATACAAAGAGAGTAATGAAACTGAGAAAGTCCGTCATGCATATTTCACGTGTATACACGACA:1	-	chr3R	21464000	3'	-	Chouto	190	1	65.75
CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCAAATGCAC:1	+	chr3R	19968233	3'	-	roo	25	2	67.59
TTAGTCTTAAGCTGAGATCAAAAGAATAAAGACGTGAAAACTATTTCGCTGATATTTATTTATTTCTAACCGTTGTCCTTATTAAACTGATTGCATTCCTTAAGCGAATTTCTGCATCCGGTCAC:1	-	chrX	22897520	3'	+	297	280	2	70.40
CATTGTTTTGTTTTTTTTTTAGTTATCTTTAAAAACAATAATTGATTTTCATTCTCATTCTGGGGTATAGATAATATTTTACTGTATGGTATAGCCTGCTAAGGAGTGATCAATATT:1	-	chr3L	4171773	3'	-	transib2	2639	1	41.88
TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTGCCATC:1	-	chrX	2518027	3'	+	P-element	2832	1	46.76
ACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGTATATATATTTATATTCATGGTTA:1	+	chrX	8090551	3'	+	412	7289	2	77.57
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCC:1	-	chr3L	16343247	3'	-	roo	8716	2	78.79
GCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCTTTCAAGAGATTGCACGTTT:1	+	chr3L	17560417	3'	-	pogo	13	1	73.88
TATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTCTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAG:1	-	chr2L	12290659	3'	-	1731	4328	2	63.21
CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGTTTGCTTTTGTTGTTCTTTCGAGCGATCTG:1	+	chr3R	14651335	3'	+	P-element	2877	2	77.44
CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAGCAGGAGTCGCAGGGCCAGTCGGCTAAG:1	-	chrX	5662828	3'	+	P-element	2880	2	77.69
TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAA:1	+	chr3L	22349249	3'	-	jockey	69	1	75.47
AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCAATTCGA:1	+	chrX	17431827	3'	+	hopper	1392	1	64.80
GGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTGTCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGCCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTTGTCCTTTGATTACCGCACCCTTTTCGCTCTTT:1	-	chr2R	19966576	3'	+	jockey	57	1	74.48
AAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAACGCACTCCAGCTGATCCTGACGAAGCGACACACAGAAAGCCAACCAGGACACACA:1	-	chr2L	18421869	3'	+	TAHRE	10391	1	73.33
TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATG:1	+	chr2R	9328696	3'	+	roo	9048	2	57.01
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCT:1	+	chr2L	12892725	3'	+	roo	397	1	71.03
AAAAAAAAAATAAAATAAAAAAAAAGAGCAGAGATCCAGAGCCAACTCCTTTGATGCGTGGCCATGAGGCCAGAAGAACAATTAAATGACAAGCCAATTTAATGACGATGGTCTGGTCTCAGTTCGCGGCTT:1	-	chr3L	5957748	3'	+	Doc2-element	253	108	67.42
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCGAA:1	+	chr3L	9998220	3'	-	roo	29	2	63.70
AAATTAGTTTCTTACAAAAGCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAATT:1	+	chr3L	233360	3'	+	roo	9037	1	61.64
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAATTATACTATAACATAGTC:1	-	chr3L	20831236	3'	+	roo	391	2	73.61
ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCACGCAGTTGGGGGTTAAACGGGGGGCCCAATGTCCACTGG:1	+	chr3R	22273282	3'	-	jockey	4821	1	72.60
GTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTATCAAGGAAGTGATGAAAGTTAATGAATATTTGCGCCATTAAACTTGATTTCTCTATCGGTTCGCTGCTGATAACCTCCGCT:1	-	chr2L	3164887	3'	+	412	489	2	79.02
ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCG:1	+	chr3R	20427455	3'	-	jockey	87	1	72.60
AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCCATTGAAAAAATAGTTGGTAAAAACCAA:1	+	chr2L	5845114	3'	-	transib2	23	1	68.53
AAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCC:1	+	chr3R	1844860	3'	-	Cr1a	149	1	51.85
TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTA:1	-	chr2R	12835057	3'	-	jockey	60	1	70.00
TGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAACAACTAATACACC:1	+	chr2L	19965033	3'	-	Doc	100	1	78.62
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGGACTTGCACTTC:1	+	chr2L	16016409	3'	-	412	39	2	56.03
TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTG:1	-	chr3R	12618627	3'	-	F-element	75	1	71.20
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACA:1	+	chr3R	7100930	3'	+	roo	9046	1	64.03
AGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATGGAATGAGATACAGATT:1	-	chr3L	7292413	3'	-	HMS-Beagle2	6895	2	78.62
GTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGC:1	-	chr2R	6885334	3'	-	flea	4826	1	80.83
GTATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTC:1	-	chr3L	25782382	3'	+	Stalker4	7004	4	50.00
TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCGGATGGGGAAAAATGCTACATCTACCCAA:1	+	chr2L	18419296	3'	-	412	7	2	73.97
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGTGATAAAAATGAGCTGATGTTGGCGGAAAAAGATGGTAGACAGTG:1	+	chr3R	18339234	3'	-	roo	13	2	74.66
AGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAATGGTGGTGCCGCAAAACATCTGCTGGATGTGTCCGGCCTTGCCT:1	+	chr2R	11488091	3'	+	jockey	4736	1	67.63
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGCATTTATTCAGTCAAACATCAGAGCGTCGAAGC:1	+	chr2R	9868622	3'	-	roo	82	2	77.93
CAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAACAAAGGCAATTGGAATCCGGTCAAGTGCGTTGTAGTTGTAGTTGCAAGCG:1	-	chrX	5663048	3'	-	P-element	154	1	78.20
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCAGGTTTTTGCATTTA:1	-	chr3R	18582184	3'	+	roo	8995	2	80.49
TTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATGTTTTATAATCAGCATATAGCAACAAATCAAGGACT:1	+	chr2R	21123589	3'	-	pogo	1975	1	75.34
CCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGACTGCAGCGTGGGACCCCCTGCAGCACCCCCAGCAACATACATATATACATGTGCTGTATTAACGCAGATTGAATGCGATTCACTTTTGTTTGTAATATTT:1	+	chr2R	5581625	3'	+	gypsy3	310	2	50.00
GTAGTATATTTGTATATTTATACAAGGTACCGCGGAAAATGTTCGAGGGGGATTTTGACGCGGTTGTGGCATCAGG:1	+	chr2L	14823082	3'	-	Stalker	6941	4	52.63
CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAG:1	-	chrX	10644451	3'	-	jockey	4831	1	70.15
TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGATCTGAAATCGTTTCC:1	-	chr2L	20840391	3'	+	Transpac	279	2	61.76
GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATA:1	+	chr2R	4601640	3'	-	HMS-Beagle2	49	2	60.47
GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAGGCTTAAGGATTGTGATGTTAGTCAACTTAATTTGGGTAAAACATTTACGGAATTTGACGTGCGT:1	+	chr2L	13914217	3'	-	jockey	4696	1	59.31
TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCCAAACGTAGCATACATT:1	+	chr2L	15181452	3'	-	jockey	4760	1	70.00
ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGTCAGTTTCTATTTA:1	-	chr3L	10574262	3'	+	Tabor	7284	2	54.79
GGTAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAGCACCATCCTACATAATCCCAAAA:1	-	chrX	19772937	3'	+	G-element	4325	2	52.08
CGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGTTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGAAGAGCTCAGTGTCAATGCTCAGGTGTCGTCTTTTAAGTAAAAATCGATCCCTATTAATTTGTTA:1	+	chr2L	21367202	3'	+	Doc	349	1	51.80
CTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCATATAGCAAAAGCTATTTCAACTTTGAAAATTAACATGGCATACAATATTT:1	+	chr3L	14638692	3'	-	1360	3380	2	48.28
ACCTTAAATCTATAATATTTTTGATTAATTGGCACAATGTAAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTAAAGACATAATTTAGAATTTTTCTCATTTCGATTTTATCATGACTAAATGAAGTGCACTATTAATGGCTTTGGCA:1	-	chr2L	2325989	3'	+	1360	247	1	47.95
TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTT:1	-	chr3L	16015253	3'	-	1360	85	1	76.71
TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGT:1	-	chr2L	6569945	3'	+	jockey	4927	1	64.38
GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGG:1	-	chr3L	12861697	3'	+	pogo	2077	1	60.50
TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGCCTCCATCAGACGCTTTTCGACAGCCGAGCGAGG:1	+	chrX	7195132	3'	-	P-element	19	1	63.81
TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTA:1	-	chr3R	20469589	3'	-	roo	8715	2	54.79
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCAGCAGCCACAAAGA:1	-	chr3R	12886874	3'	+	roo	9052	2	67.77
AAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTACTACATTTTAAGAATATGCCACTGAAAAGAAGTCAACTGATTTAAGAAAGAATTTCTAAATTAAACATTAGGTCATTGCT:1	+	chr3R	25233632	3'	+	Quasimodo	486	2	58.22
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACAT:1	+	chr3R	19968194	3'	-	roo	8729	2	65.75
GGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTG:1	-	chr3R	10182097	3'	+	blood	7387	2	76.92
TTTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCT:1	+	chr2L	11661003	3'	-	F-element	75	1	61.19
TACTTTTTTTTTATTATTATATCTTTTTTCATAATCCTTCTGTGCAGTCAATTGCGTATATTGGTTATTGAACCCACCATCACG:1	-	chr4	91355	3'	-	Rt1a	5071	2	58.33
CTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTTCATTGTTATGGCCGTAATGAAAATGGCTGCAACCATTTTTTGCTT:1	+	chr3R	29397512	3'	-	jockey	4615	1	64.06
ATTATTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTAACAATTGCGGAAAATATAAAATGTATTTCAAACCTTCGCGGAAATTGTAAAC:1	-	chr3L	24996060	3'	+	1360	458	1	72.41
ATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTTATTTATTAAGTCATTTGACTTAATTTATTTTTTCTTCATATGTTCATATATATCCTTAATTATTTATTTATTTATTCAT:1	+	chr3R	27748289	3'	+	1360	258	1	47.95
GACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGTATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACC:1	+	chrX	4215051	3'	-	flea	4807	2	57.53
ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATACGTGGGCAAATGCCTGCCGGAAATCGTCTGCAATGTGCGAGATAACAATTTTCGTGTCCTGACCAAGGCATGACTGTTCG:1	+	chr2L	2703612	3'	-	hobo	31	1	62.94
ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCATATAGAGGTATATATGGCCCGATATCCTGACGTTTTTTTATTTTTT:1	-	chr2R	16945299	3'	-	jockey	74	1	67.41
ACTATATAAATGTATATATATTTTTCATCGTGCAAGATTTGCTAGATATATTGGACACCTTTCTTGGTTAAGCTCTTCAAGTAATACATCTGATGTTCGTTTTAAAAGTTGAAACCAATGGAAGCTCACA:1	-	chrX	12673247	3'	+	1731	4410	1	57.69
ATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACTATGTGATCAACTCATCACTGGTTATGGGCTGGTACGTGGGCACTCGGAAGTTGGAGCAGCC:1	-	chr2R	16596175	3'	+	Doc	160	1	60.96
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTA:1	+	chr3L	15600338	3'	+	roo	9038	1	44.27
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAGCCACATTCC:1	-	chr3R	14981135	3'	+	mdg1	384	2	56.43
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATAGATCTAGATAGGG:1	-	chr2R	25118674	3'	-	roo	8686	2	57.80
CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAA:1	+	chrX	2518092	3'	-	P-element	61	1	24.56
TTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTCTGTCGCAGCAATACAATAAAACACAAGGCTGACTTCAAATGATGCTGGCTTTTTTGGCAGTGATTAAATTGTTATGGCTGAGCAG:1	+	chr3R	26676340	3'	+	Juan	3786	1	70.00
ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTTTGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGC:1	-	chr2R	5209604	3'	-	gypsy	7023	2	54.05
CTGTCCGGGAGATCTAGCACGTGAAATCTTTTAAGTCTTCTTCTTTATTTAGAATTTAAATATTTTGGATTTTTAAATACTTTAAGTGTCAGTGCTTTAAAGAATCAAATCTTTTTTACCTTAAAACTAACATTAGTAGAAACTTG:1	-	chr2L	8776806	3'	-	G4	3700	1	45.21
TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGT:1	+	chr2R	18336232	3'	+	roo	333	2	69.86
GATCGACTTGGTTATTGATCCTAATCAAGACTGTATGTACATACTTTATATGGTCAGAAACGCTTCCTTTTACTTTACGAGTAACGGTTATAAAAATTTAGTTACGAATAGTAATAAAAAGGCTTTCTCTCCTCT:1	+	chrX	17283713	3'	-	INE-1	96	1	79.26
CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATATTTTACACATAAAAACATTGTAGTGTTTACGTTCTATGCAAATCAAAGGAAATGTA:1	-	chr3L	11531746	3'	+	roo	8994	2	67.36
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTT:1	-	chr2R	9632080	3'	-	roo	14	2	68.42
GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACTGCCGCTCATCTGGGCCA:1	+	chr3L	2362414	3'	+	Stalker2	7624	2	55.66
GTTAGCCTTAAGTTCAGTTTGAATTTGCATTTATCAGAATGAAGATCGGCAGCTCGTCAAGAACTACCATATAACTGGAGAATGCCAATTACAAAACTTAATATAAGAGTGTCTATAAAAACTGGAGTTAATTTATAAAATTATTA:1	-	chr2L	22745228	3'	+	gypsy6	7566	2	65.07
GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCCCGTTCGTTGATATGCACAGAG:1	+	chrY	311460	3'	+	1360	3385	2	53.42
AAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCCTATA:1	+	chr2L	6059341	3'	+	roo	405	1	79.13
ATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTTGCAGATATCTTTTACAGAGCAATGGATAAAGGACATTACATTTTTTTTATTGCCAATATTGTG:1	-	chr3R	17185448	3'	-	hopper	442	1	69.53
GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAG:1	-	chr3R	5061854	3'	-	mdg3	79	2	68.97
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTCAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTT:1	-	chr2R	9632108	3'	-	roo	73	2	67.59
CTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATATTCTAACTATAAAAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCATGTCAGGGACATGTACCATTTGG:1	+	chr2R	5283279	3'	+	Cr1a	4132	1	81.94
TAATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTCTGCGTGACCATG:1	-	chrX	19409303	3'	+	Tc3	277	1	71.92
CTAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGCACCCTTCCACAGTTTATAAACCAAA:1	+	chr2R	611218	3'	+	297	6910	2	63.70
AACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTAAGTCAAATGACTTAATATTGTATAATAGCCAACATGAATGAATGAATTTTTATATGAAGCTTGAATCTTTTATATATTTATAACAATAGTCAAACCAAATCA:1	-	chr2R	2589425	3'	-	1360	3151	1	58.62
GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTG:1	-	chr3L	18368921	3'	+	opus	447	2	65.38
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTAGAGTTTGTTTTTCTTTTCCTTTTTTTTT:1	-	chr2L	5444339	3'	+	412	7485	2	77.06
GCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACG:1	+	chr2R	5173197	3'	+	Stalker	325	4	74.66
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAAT:1	-	chrX	14336420	3'	+	roo	9030	1	60.87
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGA:1	+	chr2L	7898361	3'	+	roo	334	2	75.38
TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTGGAG:1	+	chr2R	23332642	3'	+	invader4	319	2	75.23
ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTTTATA:1	-	chr3L	22848562	3'	-	INE-1	579	1	74.55
ACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATTTAAACATTTTGTTTGTGCTTTCTGAGGGTCGTCACAAAACTGAATATTCGACAACAACAATAAATTTAGCACAGATTGTTGATTTCATCT:1	+	chr3L	2151407	3'	+	412	208	2	63.64
AAAAAAACAAAAACAAAAAACTAAAAAAGTAAAATGAAAAGTTAAATTTGTTAATTGTACTCTAAATGATTTCAAAAACAAAAAAAAA:1	+	chrX	9768899	3'	+	HMS-Beagle2	489	2	76.14
TTTTTTTTCTTTTTCTTTTTGTTTGGGCTGCTGGCTTCATTTCGATGGCCTTGAACCGAATTTGTTGTATTCGTATTTTTGTATTGGTTTTTGCTTGCTGGGTCACTTTGGCAAATGTTCGACGGTTTATTTGTATGTATTTTTA:1	-	chr2L	833220	3'	-	Doc2-element	221	5	71.72
TAATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACAAGTATGTTACACTTTTTAG:1	+	chr3R	17615223	3'	+	mdg1	7065	8	71.23
AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATG:1	-	chr3L	1534524	3'	+	pogo	2037	1	64.58
ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTACGAGTAACGGGTCTTTCTTTGCTATGTATATTATTCTTTTTTTTTAATTAAATTAGAAACTGTGCTATTTGAGTCTTAAATGAGTTCTACATTATTTTTTCTATATATGTG:1	-	chr3R	4328023	3'	-	INE-1	10	1	71.23
ATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATAGCGCGGATCGGGTTTACTTTGCGGGCGACATAATTCGCGGCGAGATCTGGATGAACGTCAACAAGCGCACCAAAA:1	+	chr3R	10886060	3'	+	G3	4505	1	52.05
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTT:1	-	chr3L	11393453	3'	-	roo	36	2	60.00
TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTG:1	-	chr3R	9921989	3'	-	blood	7086	2	71.92
TGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGTTCCTGCGAATCTTTACAGGGTGCCGGCAAGGAAATCCGAGAAGCCATCGCCGATCCATCGCCGG:1	-	chr3L	10647081	3'	-	412	7262	2	58.40
GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGAAAGGCCAAAGGTTGACGGTGATAATTGATGGTCAGTGCCAACTGACGGTG:1	-	chrX	18030222	3'	+	opus	7497	2	76.92
GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGAGGGAAGACAAGGAAGGAAAGTCTGGGAAACCAGCCACTGCAATGCAGCTATAAATTGTTGCA:1	-	chr3R	20177086	3'	+	transib2	2774	1	55.40
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATCATTGCGTGAATAAAGCAGTAACTTGAAATCCATTTGCGGTATATCAGAACTTTTGAA:1	+	chr3R	22956090	3'	-	roo	4	2	74.42
GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGAACTGCGTTTGTTTACATTTTTGCTTTGTTTTTGTCTTAT:1	-	chr2R	11629703	3'	-	Tirant	10	2	75.56
GGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCG:1	+	chr3L	3799851	3'	+	copia	251	1	61.19
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAAT:1	+	chr2R	25118771	3'	+	roo	346	2	65.00
CGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTAATCGCAAAATGAATTACAGTTTTAATGCAAATACGTTTATTAAATTCCAGATTTAAAAAGCCAAAGAAAAAGGTTAAG:1	-	chr2L	11985744	3'	-	G6	1650	1	71.82
AGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTGAGTTCTTAGTGAACTGGAAGCCAAG:1	-	chr3R	16077496	3'	-	roo	219	2	79.03
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCA:2	-	chr2L	3114456	3'	+	roo	9031	1	57.53
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGCGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAATATTTTTGAAATAAGACGCGGCGGAACTGAAAT:1	-	chr3R	10266040	3'	+	1360	3363	1	66.90
TTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGC:1	+	chr3L	8249106	3'	-	jockey	4562	1	61.00
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGCAGCAATAAAATAAAACACAGACCCGCCAACTTTCCAAAGCAACGAAATCGGCGGAATAAAACTAAAAATATCTATTCGAAAA:1	-	chr3R	22122667	3'	+	roo	9032	1	58.22
GAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATCAATCAACTGAATTTCGGGACCATCTGAGTATAAGCCCAGCTAACCCACATTTATAACCGCTTAGACTGTGGCACGTACCTAAAATT:1	+	chr3R	19427059	3'	-	invader6	4550	2	62.07
AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAG:1	+	chr2R	16785429	3'	-	412	7104	2	55.40
AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACAATTATGTACGTTT:1	+	chr3R	10266164	3'	-	1360	70	1	63.70
CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCAT:1	-	chr3L	22400262	3'	-	1360	47	1	54.62
GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATATATTATTATTACTCTTCCGACCGAATTCTTACAA:1	-	chr3L	24291995	3'	-	1360	69	1	75.38
CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAATGCCATTCAAAACTGAAATTTTGCTT:1	-	chr2R	2832923	3'	+	1360	3335	1	74.77
TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCTCAAAATAGCAGGATGAGTCATGAAGGTCTTAAACAGCTAAGGATGCTCTATTTAAATTAGTTATATACTTTTTTATTATACTTAGCTATTTTG:1	-	chr3L	22968296	3'	-	mdg1	26	2	67.81
CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTTCGGGGCGCTCGCGGCGGAAATGAATTATCGCCCGC:1	+	chrX	11471677	3'	+	hopper	1385	1	58.54
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAACATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAAATATTCTCAGGCCAAATCAGCTT:1	+	chr3R	19448934	3'	+	roo	332	2	71.85
ACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCCCCCATG:1	-	chr3R	14049306	3'	-	transib2	30	1	63.57
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGTTCTCGTT:1	-	chr3R	18582087	3'	+	roo	404	1	77.93
GCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTTATAAATAATTTGTTTTTGAATGACATGCTATCATACAAATACATTTTTCCTAATTTATTAGTTTGTAAAAAGTGTACATTTATTAGGTTTT:1	+	chr2R	13122131	3'	-	pogo	22	1	67.36
AAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAAAGGGGAAAATACGAGAAT:1	-	chr2R	7895694	3'	+	Doc2-element	237	2	65.31
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATCTCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCT:1	-	chr3L	11393489	3'	-	roo	8737	2	70.55
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGC:1	+	chr2L	6059302	3'	+	roo	9019	2	62.40
GTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATTTTTTTGGGCGATGTTAACAAATGAAGTGCAAAATCAACGC:1	+	chr3R	19529172	3'	-	jockey	4660	1	61.43
CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACA:1	-	chr3R	15072551	3'	-	pogo	53	1	56.85
CGTGACGAACGCCGATCTCTTCGGCTGTATATCGCCGGGAAACACAAGCCGGAATTATTTCGCACACAAATAAAGAAAATGCCCCAGCTACCAGGACTG:1	-	chr2R	13677061	3'	-	gypsy12	424	2	63.64
GTAAAATCCCAAATAAGAAGGCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTATTTGCATTATTCTACTAACTGCAATTCCATTGTTACTGACGGCAAGTTTACGTCCTTTTGCTCAGCACT:1	+	chr2L	7939942	3'	-	roo	407	1	50.68
TCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCACTCTATTGCTTCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTATCCATTGCTTGCTATTTCGC:1	-	chrX	5114925	3'	+	blood	7177	3	86.05
CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCACCTTAATTATATGGCCGCCGACAG:1	+	chr3L	19036048	3'	-	Tirant	64	2	76.11
CTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATT:1	+	chr3L	10574407	3'	-	Tabor	21	2	59.26
TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACA:1	-	chr3L	10013553	3'	+	hopper	1404	2	73.04
TGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATG:1	+	chr3R	10182189	3'	-	blood	7073	2	71.07
ATATTAATATTTATTTTTAAGCCTCTCCTGTCCTTGTAATGCAAACTTTTTCAGCAAACTTTTTTTTCTGCATCATTTGGAAGTTCGTTTCATTTTTATTTCCCAGTAATCATTTCCTCAATGTAGCCATTTCAATT:1	-	chr2R	16729047	3'	+	NOF	3868	1	54.74
GCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGAAAATCTAGTAGTAGTTCGGTCTTAAATCAAATTCGAGAGATGGGGGTGCAGAAAAAGAAGAGGGCGGTGTGT:1	-	chr2L	18403650	3'	-	hobo	58	1	63.64
GGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGATTTCCGG:1	-	chr2R	21228996	3'	-	jockey	81	1	63.45
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAG:1	-	chr3L	22437885	3'	+	roo	325	2	76.22
GTCCGTCTGTCCGCATGAACGTCGCTATCTCAGAAACTATAAAAGATTCTAGAGACAAAGACACGGCTCAAGTTTGATGACCCATGCTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAA:1	+	chr3L	22511716	3'	+	INE-1	125	1	74.34
TTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCGTAATTACACATTGCTGAAAAAGCAGATGGAGGGGGATTTTGAGAG:1	-	chr2L	12283776	3'	+	1731	46	2	68.06
AGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTTATACTGTAAAAAATGTTGTATACCCAGGAAAAAAAAGTTGCTTTCCAGTAAAAATGTTAATTATTATTATTTATACCCTTTACTCTACGAGTTTAAATGTATGTAAACGAG:1	+	chr3L	26169817	3'	+	diver2	14	2	78.87
CTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCCAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGCGGCCAGGGCTCGAAGGG:1	-	chr3L	19035991	3'	+	Tirant	359	2	56.14
ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAAGATCATGAATGAGAAAGTCTCAGTGGTGGAGCAAG:1	-	chr2R	3065936	3'	-	P-element	43	1	38.32
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTT:1	-	chr3R	7835108	3'	+	roo	9017	2	56.16
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGT:1	+	chr2R	25118768	3'	+	roo	337	2	68.49
AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTCAAGGA:1	-	chr2L	14081288	3'	+	1360	3358	1	54.14
TTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTGCAATCGGAAAATTAAGAAGATTAAACAAAAAAGAAAGATAGAAGGACAAAGCAACAATTGAAAATTTTCACACAATTTTC:1	+	chr3R	28919866	3'	-	jockey	4640	1	58.90
ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTACTGAACCAG:1	-	chr2L	7888094	3'	+	pogo	2068	1	55.56
AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTCGGCCTTTCATTCACTTGTCAGGAGCACAGTTAGCGAAG:1	-	chr3R	10546047	3'	+	hopper	1412	2	75.20
ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGGGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGA:1	-	chr2R	8585416	3'	+	roo	9026	1	52.14
GCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGNCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGCCCCAGGAAAAGCAAAGGGGTCTTATTATAGTCGTTTTATTCTACAAACTTATGGATAACTC:1	-	chr2R	5209555	3'	-	gypsy	11	2	72.59
ACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAAGACCTCTGGACTGTCTGGAACCTCATAATTTATACACTGCAGAAAACTGTCG:1	-	chrX	21669999	3'	+	Stalker2	365	2	53.04
GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTGTTT:1	-	chr2R	5277127	3'	+	Quasimodo	7324	2	62.18
CATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACGGAAGTTACAATTTTACCGATGTCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATTATTACAATTACAATTACAATTAT:1	-	chr3R	5925676	3'	+	Tabor	387	2	80.14
CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGTA:1	+	chr3L	11957227	3'	+	blood	348	2	57.85
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGATCTGTTGACAAAAGACAAGCAAACTATTAAAGTGTTCTATCTTTTTTTA:1	+	chr2R	23803082	3'	-	roo	24	2	71.92
AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATTTCACATTTATTAGAAGCCATAGCAATGAATTTATCAAACAAATCTAAAAAAATCTCTTTCTTGAACGGATGCAAATA:1	-	chr3R	31109628	3'	-	I-element	37	1	56.43
AATTAATAATAGGTAAAAGCTGTGGCTTTTTTCCTAAATACATCGTTGACGAAACTGGTTTCAACATTTTATATTATAATATGATATTCAAATTACTAAACAAAATACAAAGAATCAAATTTTGTTCATATCTATCTAAATCAAAT:1	+	chr3R	16090101	3'	+	diver	285	1	71.23
TTTGGAATGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAAGTTTTGAACAATATGAAAGATCAGCATCCACTGCCTGCCTATGGTAGTTTATGAACCCTCTGTCATTGTAC:1	-	chr3R	97127	3'	+	G2	286	1	59.20
TATCATTTTATTATTTGAACATTCTCGCTGAGCCAAAAGGCCAGCGATCGACAAAGAGGGCAAAGTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATGTCTAGCTGAAAATAAGAAGAATTATGAAACACTTTTATGTGGCCATTAGGAACG:1	-	chr3L	12670882	3'	+	gtwin	309	2	68.97
CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATG:1	+	chr2R	16785418	3'	-	412	7122	2	65.07
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGCCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCGAAAATGG:1	-	chrX	6486704	3'	-	roo	8703	2	52.80
AAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCACG:1	-	chr3R	9714378	3'	-	Stalker4	59	4	56.85
AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTGGGACCACTGGTTCCACTGTGGAAATTGCAGGATATGCAAAAGGG:1	-	chr3L	17205210	3'	+	hobo	2930	1	58.97
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACACATCCGATCCTTGTGG:1	-	chr3R	17817872	3'	+	roo	389	2	66.67
GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGTTAAGAAAATATTTA:1	-	chr3L	3863438	3'	+	blood	7340	1	57.94
AAAATAGATTAGAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTT:1	+	chr2L	21153560	3'	+	1360	329	1	57.53
AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCACTGTGCACATGTTTACACTGTCTGCACGCCGACTTTCCGTATCGTTTAAAACACTCAGAAAAAAATGGCT:1	-	chr2L	12328588	3'	+	hopper	1410	2	72.39
CATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAG:1	+	chr2R	10582503	3'	-	Juan	3820	1	66.42
CCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGCAATTAAACCATTTTCCAAGCCATTTAAACCTATCCCGAAACGAATTGTAATTGAATGTTGCTCCC:1	-	chr3R	21924812	3'	-	I-element	5005	1	54.79
CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAA:1	+	chr2R	15064444	3'	-	412	7110	2	57.53
TTTTCACATTCTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTAGCAATTTAGAAAAAAAACAACGTTTTTAAACTATACAAACAATACAAGAAAAGTCAAGAATACTAAAATCTGAAATGATAACACAACTTCTAGCACTCTGTAATCT:1	+	chr2R	5438136	3'	+	INE-1	284	1	30.82
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGA:1	+	chrX	5274393	3'	+	roo	350	2	58.90
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATA:1	-	chrX	13504159	3'	-	412	7121	2	64.34
ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTCTAT:1	-	chr3L	16015202	3'	-	1360	34	1	56.85
GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAA:1	+	chr3L	16015289	3'	+	1360	3316	1	84.87
TGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGCTCATAGAAGCGTTCTTGGTCTTTGGTCTTTGTTCCTTGC:1	+	chr2R	4677408	3'	-	invader3	5194	2	78.08
CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGG:1	+	chr3R	18585647	3'	-	P-element	47	1	36.45
GGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACAAAAGAGGAACGTCAGGCAAAAAGCCAAGAAAGCGTCATAAACGAATGTCATGCAAATTGATATGCCAACTAAACTAAGCGCC:1	-	chr2L	14371911	3'	+	INE-1	557	1	73.39
TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTGT:1	+	chr2L	15991398	3'	+	mdg1	354	2	63.01
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAA:1	+	chr2L	16091967	3'	-	roo	62	2	78.15
ACGGAGGCATTCCCCAAATCCGCTGGGTCAGCAGATTCGCGACAACACAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCCTTTGTAATAATTTGGTATGAAGAAGATGAGTTTTAGAAGGCATTTTCTAACTTATAATCCTCTCCAGATCA:1	+	chr2R	10638748	3'	+	gypsy5	190	2	58.22
CAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACT:1	-	chr3R	21276535	3'	-	BS	5059	1	58.90
AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCGCGGTAATGGGAAATGGTCTT:1	+	chr2L	21400395	3'	+	mdg1	7398	2	56.85
GAGGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGGAGACATAGACTCAGCGCAATTTATTGACACATGTTGCCAAGATCTCCCCGAAAACTGTGGATAACATTTTAATGGAATTTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTG:1	+	chr2L	18159054	3'	+	INE-1	173	1	50.00
AAAAAAAAACAAAAAAAAAACTAACCTTCCTTGTTTTTGTGTAAGCTTCAGCTTGACGGATGGTCCTTCCTTTCTTGTTATTGAAATATTGGCATTTATTATTATTGAGAGTTTTCTTTCACCC:1	-	chr3L	17845073	3'	+	HMS-Beagle2	489	1	75.81
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAA:1	+	chr3L	15600303	3'	+	roo	9014	2	70.00
ATCAATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGT:1	-	chr2R	5284539	3'	+	Doc4-element	2592	1	51.37
GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTGTATGTTCATATACATATATTCCGTACTTTTCTGTTTGCTCGCATTGTGGATTTTTTGTAGT:1	+	chrX	18030351	3'	-	opus	7178	4	63.70
ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTC:1	+	chr3R	20868178	3'	-	BS	5076	1	78.10
GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAAC:1	+	chr3L	10773127	3'	-	412	7086	2	70.59
ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAGACAATTCACGCAATGAGCTTAT:1	-	chrX	4214898	3'	+	flea	236	2	70.34
GTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCCCAC:1	+	chr3L	8249129	3'	-	jockey	4570	1	52.67
GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAA:1	+	chr2L	13585923	3'	+	Tabor	420	2	60.84
GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATGAATGGATGAGACTCCTGTCTCGCCGACATATACATATATAAAATCTTTCCG:1	-	chr2L	21325134	3'	+	invader4	3023	2	81.90
TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTTCCCGAAATTATGCAGAAAGATAAGGTCGTTTCCGGTGGCCGAAAAGGCAGAGAAAGTGGAAAAGAGGAAAAACGGAAGCATGCAGCA:1	-	chr3R	6524778	3'	+	I-element	5319	1	60.00
ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATCACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCG:1	-	chrX	21564649	3'	+	diver	181	2	51.49
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATAC:1	-	chr2R	9632093	3'	-	roo	59	2	58.90
TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAGCCGCAAAAACTTTCAAGTCCTTCATTGATTAAAACGGGATAAAGTTACCCAAATTAAAAAGTTTCAACCGCCTTGATTTAGCCGACTGCATAAACGAAA:1	-	chr2L	9412377	3'	+	jockey	4974	1	76.12
TAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGATAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGAT:1	+	chr3R	19448622	3'	+	roo	8691	2	69.63
TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATGGCGTAT:1	+	chr2R	9328722	3'	+	roo	9035	1	59.59
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAG:1	-	chr3R	22844211	3'	-	roo	8708	2	70.30
TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGCTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGCGGACCTGGACTCAGATGCAATG:1	-	chr2L	11518424	3'	+	412	7494	2	75.76
ATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTC:1	+	chr3R	17243215	3'	+	hopper	1355	1	58.22
AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATGTCGAATAGGTCGTTTAACCAGAAATTAA:1	+	chrX	11296520	3'	-	BS	5012	1	71.92
TATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTCTGCTCAAAGCATATGTGAAATATTTCACGGAAA:1	-	chr2L	18341851	3'	+	pogo	1780	1	76.71
AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGCTTAGTTGATTTGAGCTAACA:1	-	chr2R	19499295	3'	+	P-element	2849	1	54.14
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTA:1	-	chr3L	15600166	3'	-	roo	49	2	52.41
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGG:1	+	chr3R	22844275	3'	+	roo	345	2	64.75
TATAGAAAAATATAAATTCTTTGCATTTTATAGCGTCGTCTGCTATTTGCTGTTTGCTCCAAATTGGCTGGCAAATTTGTTCTGGCCAACCGCTAACCGGTGGTAATTGAGCATAAGTTATTGAGCTGTTTCG:1	-	chr2L	13480400	3'	+	TLD2_LTR	146	1	67.67
AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGGTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTC:1	+	chr3L	11957203	3'	+	blood	7318	2	69.06
TCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTG:1	+	chr2L	17471700	3'	+	roo	408	1	74.74
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGC:1	-	chrX	13039507	3'	+	roo	400	1	72.92
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCATGAGAATTGAGTAAGTTTTCGCCATTCCACTTGACAGCTTAAAGTTCCTCTGCCACTCGCGACTCCAAA:1	-	chr2R	14387911	3'	+	roo	393	1	66.06
AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATNCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAG:1	-	chr2R	13585410	3'	-	412	7118	2	61.64
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTGGGACCAAGCACTCCATTCCACTCTG:1	-	chr2R	13084559	3'	-	roo	8679	2	69.60
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCATTTAGTGCAGCAATTAATCGGAACGACTCTTGAATCTG:1	-	chr2L	18301638	3'	-	roo	8721	2	60.00
ATACAGTTCATAGAAAATAACTAAAGTTAATCAAAGTGTAGATTGGGTGATGCTTCAGAAAC:1	+	chr2R	22607195	3'	+	blood	6955	1	62.90
ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATA:1	-	chr3R	25339982	3'	+	mdg1	347	2	67.81
ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTTGCCGCCTATTGGTAATTGCCCAACCTAAGTGCTATCTCCGTTTATTATGATGAAAGATAATGTTTTATCGGTGCGGTGCAAGGGGGAGAACTTCACG:1	+	chr3L	10848779	3'	+	blood	372	2	78.74
TGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAAG:1	-	chr3L	23728627	3'	-	HMS-Beagle	39	2	54.89
GTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTCTTTTTTCTCTCTCT:1	+	chrX	5225087	3'	-	transib2	2597	1	68.06
ATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCA:1	+	chr2L	20840484	3'	-	Transpac	84	2	77.86
TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTC:1	-	chr3R	27994193	3'	-	roo	51	2	64.23
GGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTACATATTATACATTTTCTTAGTAAAAAAAAAAACCAATCAAAAAATGGCAACTCATCCAACATTGGATGTCATTGACAATT:1	-	chr3L	17209907	3'	-	hobo	2464	1	72.17
ATTATTAAATATATATATTTTTTATTACTGTTTCGGACTAAAACTTGCTTGTTTTTCATATATTTTAAGATTGTTAATTGTAATTTTTTATGTCTTTAATATTTGTTTTGTATATTTAAAGTTAATTTATTATTGACTATATGTAG:1	+	chr3R	11555710	3'	+	Tc1	61	1	71.23
TGTACACTCGCTCAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCAGTCTGTTGGCGACATTCGTCCATTGTCCTGCTCGATGGAT:1	+	chr2L	21891798	3'	+	mdg1	342	2	71.92
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTT:1	-	chr3R	19968092	3'	+	roo	387	2	60.71
AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAA:1	-	chr2R	24218498	3'	-	412	35	2	59.31
CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCATGTGTCC:1	-	chr2R	9791541	3'	-	412	7077	2	69.86
GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCCCTGCAATCTCCAATCGCCTTCGTCAACAGATTC:1	-	chr2L	11518350	3'	+	412	489	2	77.60
ACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGGAAAATTCAGTGGATCAGTAGGTTAGGCAGA:1	+	chr2R	5285511	3'	+	Doc4-element	2642	1	46.96
ATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAG:1	+	chr3R	26987341	3'	+	Stalker4	244	4	63.01
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAAC:1	-	chr3R	18339101	3'	+	roo	8995	2	69.18
CGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGA:1	+	chr2L	21008624	3'	+	invader3	5393	2	64.14
CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGT:1	+	chr3R	12717842	3'	+	297	6929	2	57.55
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCACCTGTTTTATTCACTAGCCGAG:1	+	chr3R	19968170	3'	-	roo	8730	2	78.86
CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTGTAAAGCATTCAAATTGTATTTATTGGCTAGGCATCATATGAATCAAATAATTAAAATATTGTTAC:1	+	chr2R	5485215	3'	-	blood	57	2	56.16
TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATGCCATTTTTCTATTATTTCTTACGCGGATTTTTCGCAAAAAATAACTAGTACTTTTGTCATAAGTAAAAATTGAACTTATCATAAAAATCACAATCGAGTAGCATTCA:1	+	chrX	7990442	3'	-	mdg1	13	2	74.66
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCGTATAAAAAAGAAAGCAAATC:1	+	chr3R	17420537	3'	+	roo	9038	1	57.93
ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGTATAAGAT:1	-	chr3L	26377318	3'	+	copia	222	1	61.64
GCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCC:1	+	chrX	21014840	3'	+	copia	5046	2	72.60
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAAAACTTTAATATTTCCATTTTTAATCATTTTACATATATAGCGATTTT:1	+	chr2R	19050331	3'	+	roo	401	1	70.15
GCTTTTATAGTTCCTGAGGTCGAGACGTTCATACAGAGAGACGGACATGACCAAATTGACTCGGCTATTGATCCTGATAAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGTCAAAGCATAATCAATATAAAGAAATATACAGAAATACAA:1	+	chr3R	24686690	3'	-	INE-1	149	1	71.23
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAATTTTACATTATTTAC:1	+	chr3R	31817557	3'	+	roo	386	2	66.67
AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATACGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTTT:1	-	chr3R	21434871	3'	-	412	59	2	58.22
AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATC:1	+	chr3L	25401024	3'	-	Doc	45	1	45.89
CTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGGAATCGAAGCGGTTATGTATCGTTCGCAAAGAGGAAGAAGAGAAGAGTTTCGAGCCGTCAATCGGTGGCGTGCTCTCGAATAGCAGAGTTTAAATAAA:1	-	chr3L	23485993	3'	+	1360	391	1	67.12
TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATACATAGACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATA:1	-	chr2L	20117851	3'	+	invader4	3080	2	53.91
TGATAAAAATTAAAAAAATAAATAAATCTGAAATTAAAGTGCTTCAATCAGTGCCTTGCAAAATAAACCGAAAATAAACTAAGGGAGCAACAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAGAAGGCAGCATTTTCAGAGGGAACGCG:1	+	chr3R	18444189	3'	+	Doc	4693	1	55.71
GCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGGAAGAAAAGTTGTGTAAATAATGTCTACCCCTTAAATAATGTACTTATACCATTA:1	+	chr3R	17528191	3'	+	1360	452	1	59.59
AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAGGCTTTTAATTAGATTCTTGTAAT:1	-	chr2R	9325352	3'	-	BS	5008	1	63.70
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATT:1	+	chrX	6486821	3'	+	roo	9051	2	58.20
CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCAGACTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGGAA:1	-	chr3R	13360280	3'	-	jockey	12	1	71.96
AATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCATGAAGAGCGACATTGCAATCCTATAACCTGTAAC:1	+	chr2L	21153605	3'	+	1360	373	1	63.01
TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAATTTGCGCATTTACAAAGCGGCCTT:1	-	chr3L	12308304	3'	-	hopper	38	1	54.14
GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTCTTCAACTCGACCTC:1	-	chr2L	14081318	3'	-	1360	16	1	56.82
TCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAGGTCTTCACACGC:1	-	chr2L	17081764	3'	+	jockey	4952	1	47.55
AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAA:1	+	chr3L	27391415	3'	+	1360	3358	1	59.59
AATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAACGCAATTGAGGTAATCCCCATTCAAATGGCAATATGTTGAGCAAATATTTGGCCGACTCG:1	-	chr2R	13933344	3'	+	jockey	4869	1	52.42
AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTACATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTC:1	-	chr3L	3799800	3'	-	copia	4945	2	72.39
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTC:1	+	chr3R	7835212	3'	-	roo	63	2	62.07
ATCAGGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGTGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGGCATTTTTTATTTTTGTTATTTGTTTCTACTTCTAACTAATTGTTTCTACGCTAATTCACAATTACTATATTT:1	+	chr3R	7178043	3'	+	INE-1	93	1	69.86
ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTTATTAAGGTTGCACCGAAATAACGCAATATTTGCGAATAAAATATTTAAAAATAGTTTTGGCTATTTTTCCTATTCGAATATAATAATAA:1	+	chr3L	1534650	3'	-	pogo	2	1	71.05
TGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGAATAATATTTTGTGGCTAATCACATATGTTTGTAGTTTTATTCATAATTATAAA:1	+	chr2L	4951081	3'	+	Quasimodo	6924	2	60.69
AATAAAATATTTGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGC:1	+	chr2R	4932043	3'	+	G7	1159	1	70.91
AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTT:1	-	chr3R	19589925	3'	-	BS	5034	1	55.36
AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGG:1	+	chr3L	7588477	3'	-	hopper	68	1	77.05
GTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCNTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTA:1	-	chr3R	6611200	3'	+	HMS-Beagle	6989	2	61.72
ATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAACGTAAGTAAGAATACATAACTATAAGTATCTTTTTCGTAGATGGTAATTTATAGTACATAACTTATTTTTCCCCTGTG:1	-	chr2R	16381798	3'	+	Stalker4	7155	4	59.72
CACGTGCGGAGTGCAAAATTTCCAATAATTTATTACCTATTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAAT:1	+	chr3R	2412143	3'	-	R1A1-element	161	1	72.65
AAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGTATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTTCTCGAAGTGGTGTTTGCGCTGTGCGAAG:1	-	chr3R	19008523	3'	+	hobo	202	1	79.29
CAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTAGGCTTACAATCCGATCTAGATCGATTTCAAATATGGTGCCGTGATAACTTGTTAGACTTAAATTGAGAACGTCCGCTTTCCGCAGGGTTTTCATCGCATACAAATGGT:1	+	chr3R	30792364	3'	+	Q-element	604	1	64.93
AAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGATGTTT:1	-	chrX	5629094	3'	+	jockey	4990	1	75.00
GGATCACTAGCCGAGTCGATATGACCTTGTGTGTCTCTCCGTTTATCTGTCCGTTCATTTGACCGATTGGCATTTTTTATTTTTGTTATTTGTTTCTACTTCTAACTAATTGTTTCTACGCTAATTCACAATTACTATATTTTCGA:1	+	chr3R	7178047	3'	+	INE-1	97	1	67.12
CATAAGCGACTATCTCTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTTGCGAATTAAAGCGCAGGAAAAGTTTGTGTGCTGTCTTGAAAGCATCACGAAATCATGAAATGATTCAAACTTTTAACGAAAATACATTACATACATACA:1	-	chr2L	2908645	3'	-	hopper	305	1	75.17
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGCGC:1	-	chr2R	19050199	3'	-	roo	33	2	53.77
CCACCGTATGTTATTTCATCATGTTCTCGCTGCTCATCGACGTTATATGTCTCGAATGTTTGGTATATATATATAT:1	-	chrX	3232719	3'	+	P-element	2885	2	63.16
TTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGC:1	-	chr3L	2325719	3'	-	I-element	5148	1	69.18
TAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTACTATACACTTTTGGTGCTATTAACCCGTTCGATTGGCCAAATATACCATCC:1	+	chr3R	14337488	3'	+	copia	192	2	64.54
AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAAGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTTCAGCGCTCTGTGCTGAGACCG:1	+	chr2R	1276181	3'	-	1360	70	1	83.48
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAG:1	-	chr3L	10013583	3'	-	hopper	6	2	67.50
AACATTTGCGTGTACTTATGTACGCAGGCGATGTTAAATTATGTCTCCAGCACAAGAACACTTCGTGCCATTTGTACATCTAGATCCCCCCTCCCCCCACCAAACCATGCCGAACCAAACTAAAATCCCA:1	-	chr3R	9835777	3'	+	Q-element	557	2	63.08
TTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATT:1	+	chr3L	10574407	3'	-	Tabor	6871	2	54.79
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATT:1	-	chr3R	22844190	3'	-	roo	53	2	61.07
ATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATGAGGTCACAACGCGAGTTTCAGCAAAGAATTCGCAAAGGGGGGAAATACCGGAATAA:1	+	chr3L	6979456	3'	-	pogo	2003	1	60.69
TGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAACCAGAATAATGAAAA:1	-	chr3L	7292498	3'	-	HMS-Beagle2	9	2	68.42
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGATTTTTGCAAAAT:2	+	chr3L	11531035	3'	+	roo	404	1	81.51
ATCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGCTTTTTTCGCAACG:1	+	chr3R	22844289	3'	+	roo	9016	2	55.48
AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAATGCTTTGGGGCTTGCTAGGTCAGACTGAGC:1	+	chr2L	13585955	3'	+	Tabor	7288	2	60.27
TTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAATACTATTTACAAGGCGTTAGATTGGGCGTAACAAACAAATTTGGTAAATTGATACAAATTTACAAGACTAATTAAAATATACAAAAATATCAACCGATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGG:1	-	chr4	1221160	3'	-	INE-1	308	1	40.69
TATTTCTTCAAAAACACCAAAAATTATCAGTATAACTTCATCACCTACCATGTACATATGTATATTGACGCTTGTGGAATTATACATACAATGTACGTACATATGTACATATATGCATTTGTGCATATGAATGTATGCAATATCCA:1	-	chr4	60623	3'	-	Tc3	1555	1	71.23
AAGATCTCGAAATGGTAATTGAAGACATCGCCACTGAACATGTTCTATTTAGATATTGAGCCTAACAAAAAAAAACCGAGACATACATATAATCTGCGTTTATTTGTTTATAATAAGTATTTCAACTTTTCTTGTTGCGTCGCTGC:1	-	chrX	12334441	3'	+	G4	117	1	63.70
TATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTA:1	+	chr3L	24208223	3'	-	Quasimodo	46	2	54.11
CCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAACAGACATGAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGATGACAGGC:1	+	chr2L	9412082	3'	-	jockey	4543	1	69.92
GAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCCTATTATTAAAACAACTTAGCGGCAAAAAACTATACAGAAAATCGTTACACTCGTTTTCAAAAATCGAACAAATTAAATGACAAGCTCTCTGCATCTGGA:1	+	chr2R	5173565	3'	-	gypsy	6	2	74.62
AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTTGTTTTACCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTA:1	+	chr3R	20427448	3'	-	jockey	93	1	74.66
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATTTTCAGGATCGTAG:1	+	chr3L	11321528	3'	-	mdg3	5261	1	68.64
CTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTTTTTCATGTTGAACTCCTTTGGTTGCTGGACACTTTTGAACTGAGCACAATTTGAGTTTGATATACAATATATACCATTCGATAGGCACCATTTATTTCTATATTAA:1	+	chr2L	8590937	3'	-	invader2	407	1	70.34
TTAATAATTATAAATTTATGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGAATCTGAGCGAGTAACACGGTCTTGGAATTGTGGCAATATTTGAGGTTGTGGAATCATTTTCTGGGG:1	-	chr3L	18729074	3'	-	I-element	248	1	52.14
AAATATTTGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGCTTCCTGCTTGAGATTAGAA:1	+	chr2R	4932062	3'	+	G7	1163	1	59.20
TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTGGGCATATCACCAGCGCAGTTCACAAGATCTATAATGGTACTTTAAGAGAACTCATAAAATCCGATAATAAAGTGCATTATACATACATACATTC:1	+	chr3R	19145179	3'	-	1360	15	1	30.37
AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTTACCTACGTTTAATTTATGCACAAATAATACGAGCAAATTATTCGCTTTGTTCCGCAAATGTTTTTCAAGTGAATTGTG:1	+	chr3L	20888816	3'	-	1360	37	1	56.03
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTT:1	+	chr2R	8585537	3'	-	roo	8727	2	60.96
ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCCAACATACATAGTTGTTTAAAAATAGTTTTAAATGCAAA:1	-	chr3L	16750660	3'	+	Tirant	8474	2	60.38
GCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGCATACTTAGTTTGAGGCGATAGAAGTGACAAATCTTTCATGGACTCGGAATACTTTCGTAAGGGTGAACCCACCAACTTAATGTCCCTCTTCAGGTC:1	-	chr3R	24755357	3'	-	Quasimodo	7025	2	73.38
TATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTATACATTCGAACTCGATATTTCATCATTTTTCTGGGATACCAATAGATATGAGAAATGTCACATAATTAATGCAGGCGATGAGTGAAATGAAGGGGTTAAGCAAATTCAAGGATCAA:1	-	chrX	20679827	3'	-	INE-1	546	1	57.34
GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCTCTCCTCTGTGAGTAATCAAAGCCACGCCCCAGAAAGTAGGCTTTAATTTATGCTGATGCG:1	-	chrX	17431705	3'	-	hopper	23	1	60.18
GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGCTACTTAAAAAGTTGGCAAATTAAATTTAAGATGACTTAAAGCATTAACTTACGAATATATGCAT:1	-	chr3R	12598453	3'	-	hobo	25	1	60.87
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTT:1	-	chr3R	25448361	3'	+	roo	338	2	73.08
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGCTGTGCGATTGTTCCTG:1	-	chr2R	19050218	3'	-	roo	8730	2	75.00
AAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTGGCTTGTAAGTTACAAAGTCTTGTTCGTGTCCTCGGGGTAATAAAACAAAACTTTGTGTTGAAAA:1	+	chr2L	4783988	3'	-	diver2	314	2	71.00
CTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTTTACCCTTTAACCCTTTCCAATGAATTTACATTTACGTTTTAGATCTCAGTTGTAACTAAGCGTCGGGTTTTTGTAAGATTCTGTGAGTGGGAGCATACAAGTAGCATTCATCTATTA:1	-	chrX	20445710	3'	-	INE-1	17	1	88.36
CACCACCTGTCAAAGGCAGCCGGAGGTTTCGCGGCAAAATTGTCCCCGAGATTTGACGGGCCGCGAATCCGGCGGACTCTCCGGC:1	-	chr2R	24168708	3'	+	Osvaldo	1327	2	69.41
AAGTCCACATATAACAATTATTTTATTATTATTATTATTTATTTTTCCTTAAAAGTTAAAAAATTCTATAACTTGTTGTTTGTTGTTTATAGATATTTATTTAAATAAAAAAGAAAAACAGTCCATACAAGGGTAAGGTA:1	+	chr3L	26375459	3'	-	Doc	185	1	69.29
ACTCGACTATAGCACTCTCTATTGCTTTAGTATGTTTCCGAGCCAATGTGACAATGGTAACATTAGACATTTTGAAAAATGTTTAAATAAACCG:1	-	chr3L	27587	3'	+	INE-1	576	1	67.02
AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAAAATCACAGAGTGA:1	+	chr3R	7100936	3'	+	roo	405	1	75.61
TTATTATTCATGCAAACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATT:1	+	chr3L	19339414	3'	-	Tc1	86	1	70.55
ACTATGGGGCAATGCCTGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCTTAATGTTAGTCTGTATATA:1	-	chr2R	5284515	3'	+	Doc4-element	2616	1	61.64
CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGCATCCACTGTTGTGCAGTTTACTCCAACGAATTTTTATT:1	-	chr3L	21855403	3'	+	blood	7360	2	66.44
GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAA:1	-	chr2R	21229016	3'	-	jockey	66	1	70.91
CTATGTAAATTCATTTCTTCGACCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCACCGTTTCGAGATGGTCAAGGCTTTCGTTGTT:1	-	chr2L	13258673	3'	+	1360	3158	1	77.40
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTGTGTTGTTTTAACCTACAAAATTGCAATGAAAAGTCGGTACATTTCTTCCTCTGGAGCCTGACGTAAAAAGCTTCATTCCATTGACACAT:1	+	chr3L	21818102	3'	-	roo	32	2	63.70
AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGTGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTG:1	-	chr2R	8585459	3'	+	roo	8988	2	79.26
GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAAAGCTTCCAACA:1	+	chr2R	24561541	3'	+	P-element	2838	1	50.35
AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTT:1	-	chr3L	21855461	3'	+	blood	7315	2	73.68
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAATAAAGCAATAAATGTTATTCAAGTGATTAACCGCCTTATTGCTTC:1	-	chr2R	23802913	3'	+	roo	9042	1	63.70
TGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCCGCTGTAGTTGTTAATTAGCTTATGATTACTGTTGAGGAAAATGTAAACCTTTTTTAAACGCTTAAGG:1	-	chr3R	13349003	3'	+	BS	5074	1	65.07
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAATTATACTATAACAT:1	-	chr3L	20831240	3'	+	roo	400	1	77.86
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACG:1	+	chrX	8543535	3'	+	roo	361	2	55.91
AGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATCTTTTTACTCAGTGATTAGCATGAATTGGTTGACGATGGACGTG:1	-	chr2R	5277130	3'	+	Quasimodo	7299	2	70.21
GTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTTGCAAGTGTGAAGTTGTTGGTGG:1	-	chr3L	485731	3'	-	opus	7401	2	77.45
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCT:1	+	chr2L	18294277	3'	-	roo	76	2	72.60
AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTT:1	-	chr3R	9210606	3'	+	mdg1	377	2	53.42
AAAAGAACAGCTCGATACGAATTTTATTTAATAGAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGTAAAGGGGCTTTAGGTCCCCACAACGATATCCGCATACATCACAG:1	+	chr3L	19443360	3'	-	invader6	4568	2	65.69
TATAAACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAAGTTTTTTTTTAGTCAGCACATTCAAATACGCCAATTTGTCGCTGCGATTAGCACACTTTACGATTTATGTATTTAATGTTTCTATTATCTTTTCAC:1	-	chr3R	13531293	3'	+	ZAM	8170	2	69.18
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAAC:1	+	chr3R	7100914	3'	+	roo	397	1	66.97
GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAAACTAAGGGAATTTGAAGAATTTATTATACGATTTTTTGTTCCGTTTTCTGAGAATTTTGCGTTTGCGTTTGCGTTTG:1	-	chr2R	24278341	3'	-	jockey	4748	1	61.94
GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCA:1	-	chr2L	11518408	3'	+	412	458	2	60.20
ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACATACTACGTACACTGCGCGTCACCAGGTAGCGCCCCCTGAGAAATAACTTTTAATGTGAGATATTTCGAAAACGGTTTGAGCGAGAGCTTTGGAAATTTTTTTCCCTTAAAAGT:1	-	chr2L	22239111	3'	-	mdg1	7047	2	76.71
GAATAAGATTTGAAAACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTA:1	+	chr2L	21400805	3'	+	Doc3-element	4664	1	50.00
ATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATTTTCTT:1	+	chrX	21564769	3'	-	diver	5935	2	54.11
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAA:1	+	chr2R	11164507	3'	-	roo	8723	2	62.33
AACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCAACTTGCTTATAATTCCCGACATCGGCTTTTGAATCTGAATTCCGCAAAGTGTTAGTTCTAATTTCACTTTTTATTAGAGATTGGTAGCTTT:1	+	chrX	21016890	3'	+	Transpac	5207	2	64.14
GTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAAAGCTGGGTCGACCTGGCAGTTTTCGATAAAAATGTTGAGATTTCCTGGAAATCTGAAA:1	+	chr3R	4602813	3'	+	F-element	487	1	73.29
CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTNCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTGCCACTGCAATGTTTACAGTTTCGTATTAACACTATCGCAATTTTGGCCAGGTAGCAAATGGAGGACCGAA:1	-	chr2R	20899855	3'	-	hobo	39	1	57.46
GGGGGAGAAGTGGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTAATCGCAAAATGAAATACAGTTTTAATGCAAATACG:1	-	chr2L	11985787	3'	-	G6	1712	1	72.09
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCG:1	-	chr3L	16343228	3'	-	roo	59	2	68.00
CGGCTATTGATCCTGATCAACTTTATACTATATACTTTATATAGTCGGTAAATATTCTTGATCGTCCGTCTGCCTTTATGAAGTTTGCGGAAACAAACATCTACTCTTTGGTACGAATATTGTGAGGAGTTATGGAAAGAAACTTT:1	+	chr4	400891	3'	-	INE-1	88	1	70.55
ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATG:1	+	chr3R	20427466	3'	-	jockey	65	1	62.22
CAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCAGTCTGTTGGCGACATTCGTCCATTGTCC:1	+	chr2L	21891786	3'	+	mdg1	354	2	77.05
CACGTATGCTCATGCATCGTAAATTTGACAAATAATGTCCTTCACTTTACAAGTTCTTAGTCTTTTCGGAATAGGTGCCAAAAATGGTATCGGACTGTTTGTCGATAGGCTAGAGGCTATTTCTACTGCCTCCTC:1	+	chr3R	3671860	3'	+	1360	187	1	49.63
CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGGTTATAGCACAAA:1	+	chr2R	6173068	3'	+	pogo	2053	1	75.22
CAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGGTTGTGTGTGTGTGGTGTTTTTTTTATGGAAATATGCTTGAGGATATTTGGGGATAATATGGGATGCCCGGATTTT:1	-	chr2R	21400509	3'	-	GATE	278	1	74.29
TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATAATTATCCTGCGGGAAAGGGGAGTTGAGTCCACACATTCGGGTGGTCAGTGACCGAC:1	-	chr3L	20888668	3'	+	1360	3381	2	72.00
CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTGAATCACACATTATTGGGTA:1	-	chrX	21564617	3'	+	diver	6089	2	65.75
AAAAAAAAAACAAATAAAAACACTTAAAAGGGCAAACAAATTAAAAGCTTCTTT:1	+	chrX	2786319	3'	+	Porto1	172	6	81.48
TTTACTCTAAAATCGACTTATAAAAGAATTTTTATTTATTTTTACACAAATTTTTTCTTAAATATTTTTTTGAAATAATTTTTATAATTTAAAAGAAAACCACGCCACTTATTTCCTTTGATTTTATTTTAAAAAATAAACTAAG:1	+	chr2L	11123491	3'	+	TART-C	10740	1	26.21
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGC:1	+	chr3R	22844300	3'	+	roo	9047	1	63.49
ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAAATTAACTAACCGTTTA:1	-	chr3R	21706007	3'	-	297	6629	2	70.48
GTATAGAAAAAAACGCAATTGGACCAAAGAAAGAGAACAAAATGTGAGAAAGATTTTTTAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATATAGACGACGCTGAGCTCGAATAGCATGAGATGTTTACAGTAGAGTCGTTGATGATTAG:1	+	chr2L	22712413	3'	-	Tc3	68	1	60.27
ATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTATGGCTG:1	-	chrX	2082617	3'	+	Transib-N1_DM	446	1	91.35
TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTTTCGGT:1	+	chr3R	22822176	3'	-	mdg1	7045	2	61.64
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTT:1	-	chr3R	18582153	3'	+	roo	9018	2	61.07
AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGTTGTGGCTTTTTGGCCAGAGCTTCAGCTT:1	+	chr3R	10182224	3'	-	blood	7020	2	71.84
GAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGTTTCGCCTTTTATGGGAATTTATTGTTTTCTTTTGAATTATTAATTTGAATAATAATGATAGAAATTGTCTTTTTGTATAATTCTAATTGATTATAGGATTCTTAGCTATGTGTGAA:1	-	chr3R	3621369	3'	-	rooA	313	2	77.24
AGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCCCACA:1	+	chr3L	8249130	3'	-	jockey	4546	1	57.41
AGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGATTCTAATATTCATTCTTATACTCTCTATTAACCAATGTAATATCAGAAGGAAACACCCTG:1	-	chr2R	23506583	3'	+	Ivk	316	1	58.90
GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATTGCTAGTTCGCTGGCGAGTTGTGTCCACTTTTCCCTAAGGGGCATGC:1	+	chr2R	7452933	3'	+	pogo	2079	1	55.00
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATCAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTA:1	+	chr3R	20469661	3'	+	roo	358	2	70.64
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAG:2	-	chr3L	9998032	3'	+	roo	9038	1	45.21
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATATGTT:1	+	chr3R	16076904	3'	+	roo	9043	1	60.87
TTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTGTGGATGAGGAGGAAAACTAGAGGAAAACTATGGTAAAAAGTAGCAGGAAAACAAGTTGATGAGTCTAAGTGGTTAA:1	+	chr2L	2910311	3'	+	hopper	1045	1	77.27
CCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTAATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAA:1	-	chr3R	26659746	3'	-	HMS-Beagle2	6917	2	51.20
TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTC:1	+	chr2R	2427615	3'	-	Doc	58	1	62.04
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTT:1	+	chr3L	233345	3'	+	roo	360	2	53.47
ACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACAGCCACGCCCACACTTTTGCAATATGTGTTGAGACACTTCACGTTTGTTTTAGTCTTGTAAATTTCTAT:1	+	chr3L	24324476	3'	+	Quasimodo	291	2	56.82
TTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGG:1	-	chr3R	18339051	3'	+	roo	9045	1	65.75
TCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAA:1	-	chr2R	5209608	3'	-	gypsy	7037	2	61.16
TTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGT:1	-	chr3R	9714390	3'	-	Stalker4	70	4	64.83
GATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGCCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAG:1	+	chr2R	5198481	3'	-	INE-1	96	1	54.79
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCAGAAGTGCACTGAGCACGTGCTG:1	-	chr2R	19050197	3'	-	roo	71	2	65.07
AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCATGTGTGTGTGTGTGGAGGGAGGT:1	+	chr3L	22917709	3'	-	jockey	4764	1	73.00
GGTAACAATAATAGCACCATAAGCAGATTTCGTTTTTGTCCCAGTGTTTCTGTATTTTCGGACTCTTTTTCATAATTTTACTCACAAATGTACATATGTACGTTTGCAATTGGTTTATTCCAGCAGCGGC:1	+	chrX	19690603	3'	-	Tc1	1636	1	54.62
GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATT:1	-	chr2L	11732289	3'	-	Doc	78	1	67.12
ACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCATTGCCTGCCCTCTTTCATCTCTTCGCAT:1	+	chrX	17963994	3'	-	jockey	4782	1	69.86
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAACTATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCT:1	-	chr3L	4536673	3'	+	roo	9029	1	50.68
AAAAAAAAACTTTTTTAAAGGTAAACTGTTTGGACTAAACCATTTAAATCAAAGAAAAAATTTGAAATTCGCGGCTTAATGGTTGCAGAGA:1	+	chr3L	19127831	3'	-	FB	405	1	71.43
AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTTACAGTCGGTTGCACAGTCAAAGTTCATCTCAAGAATCGAG:1	-	chr2R	6919675	3'	-	hobo	13	1	55.00
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTTTTCCCATTTTTTGACTATTAAAGTTATGAGGAAGTCTTTTAAGTTTAACATCAATATGTTTCATATGGTTGCCAATGAAATGTTGTAAGCAGTTTG:1	+	chr2L	12153311	3'	-	roo	22	2	60.96
GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGTAATTTCAATTATCAATAACATATTTAAATTCCCCATTCTCCTCCCCTTC:1	+	chrX	2295988	3'	-	Tirant	36	2	55.36
ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACACACGCATTTTATTGCCTACTTTC:1	-	chr3R	19589912	3'	-	BS	5036	1	50.39
GAACAACGTCAACGTGAGCAAGACGAGCGCCGTGGTCAAAACATGTTAATAATGTGTATGAGCGTGGTGGCTTAGGGGAGGGGGGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGGGCG:1	-	chr3R	443014	3'	+	Doc4-element	16	1	77.12
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGA:1	-	chr2R	23802964	3'	+	roo	327	2	74.66
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGTGATAGCAAATGAAAAAGAGCCTACGCCTAAACACTTCTTTAAAATAAAAAAAAATTTCAAATTTAAACAAA:1	-	chr2L	3886116	3'	-	roo	8696	2	59.59
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTA:2	+	chrX	13504242	3'	+	412	7477	2	65.75
AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGT:1	+	chr3L	7943748	3'	+	Burdock	244	2	52.99
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAAATCAAACTCACGCTTTTGC:1	-	chr3L	11530876	3'	-	roo	8723	2	63.01
CTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGCAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACGCGCATGATTTTTATAGAACACATCTGCTGTCATGTCATCTATAGAAATATTCCAAAATT:1	+	chr3R	19939468	3'	+	R1A1-element	5300	1	58.46
ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGTAGTTAAAACTTTAATATTTCCATTTTTAATCATTTTACATATATAGCGATTTTATTATTTTA:1	+	chr2R	19050340	3'	+	roo	398	1	70.55
GAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTCACTCAGCTAGTGCGTATGCGAACGAGAAATTTTTTCATTTTTTTCTTTTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATGTCAGAATATTGGCTTACTTTGTTAAGTGAAATTATCAACATGCA:1	-	chr2L	8718626	3'	-	INE-1	558	1	67.81
GTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGC:1	-	chr3L	14944535	3'	-	G5	4791	1	47.95
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAG:1	+	chr2L	14772119	3'	-	roo	8717	2	62.40
AGTAGTGAAGCATGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATATCATTGTCTCAATCATGTATGTATGTACGTGGATGCACAAGTCCTTGGAGTGCGCCTTGAATATTTCATAAGCAGC:1	+	chr3R	30310553	3'	-	frogger	2374	2	58.90
TTTTGCTTTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAGCGTAGGAAAAAAGGATAACACTTTGTCTAGAATGTGGTTGTTTACAGCACGGGAAGTTAACACATCCGATACTT:1	+	chr4	967773	3'	+	Tc1-2	137	1	54.11
AAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGA:1	-	chrX	21564653	3'	+	diver	6053	2	59.59
CCCACTTTTCCAAAATATTCATGGGGCATGTGTAACCCATTAAAAAAATCATCCAAATATCTCCCGTAGTTTAGGAGCTATTAATTTTTGTAAAAGACGCAGTAAAACTGTGACGTCAGAGGCTGGGAGTCCAAGGGAGAGGCAAG:1	-	chr3L	9503775	3'	-	hopper	102	1	59.59
CTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTTAATCTATTA:1	-	chr3R	18339039	3'	+	roo	9057	1	73.97
GAATCTTTTGCCCACTTTTTGCCCATGTTTACCCACCTGCCTTGGTGTAACGTTAACACGTGCTTAAATAATGGATAAAAGTCGGAAGTAAACGAAATCCCCTTTAACGAAAATGCAAACGAAACTTTTCAACCCGCCTAATTGGT:1	+	chr3R	19984710	3'	+	FB	53	1	77.40
ATATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACACACA:1	+	chrX	13874138	3'	-	blood	7179	4	63.64
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATATAATAAAATAATAAGGAAATAACACAATGTTGCATCCACTGTTCAATCGTAGCTCTGGTGTTCATTTCCTTTGCGTTTTTCTTAGTTCTGCTTTG:1	+	chr2L	13584789	3'	-	pogo	19	1	72.60
AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCATCTGTGACATGCGGTCAAAGACGGACGCAGCATA:1	-	chr3R	16404430	3'	+	pogo	2089	1	74.62
CTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCGCTCCGTAAACGGTGACGATCCAGACGCAACAGACGACTTAGACTCTGAGGATGAGTACATGGAGCTGCCACCAGACTACGGATCTGGTAGTTGCGTATC:1	+	chr3L	1555038	3'	+	hopper	1147	1	69.01
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGA:1	+	chr2R	13696472	3'	-	roo	8712	2	69.30
ATTGATCCAGATCTAGAATATATGTATATATCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAAAATATAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCA:1	+	chrX	19192432	3'	-	INE-1	83	1	78.72
CGACTCTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGCGGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGGTGGTAGGAGCGGGGGGAAGGAGATGTCTGTATTTTTGAGCATCCGTTGAACACAATACAGTTTTCAGGTCTGAGATC:1	-	chr3R	15257027	3'	+	invader1	3671	2	61.64
TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTTTGATTAAATTAAATACCATTTCTTCTTCT:1	-	chr2L	13053728	3'	-	BS	5040	1	51.72
CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATCGCTCCCCATCGCGCCAAATAATATTTAAATATTACTTTTCACCAAAGCG:1	+	chr3R	11496654	3'	+	1360	3379	2	77.69
GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCAGAACACAGGCTCACCCACAACAGTTGAACACACTC:1	+	chr2L	15875810	3'	+	hobo	2876	1	75.81
ATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTTTTCAGTTTAT:1	-	chr3R	556381	3'	+	Juan	4157	1	60.58
GTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAATTTATTGAAGTTGGCCAAGTGGGAGAATGGAAAATGATGAGCCACATATTCGCC:1	-	chr3L	16769240	3'	-	FB	67	1	65.07
CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGACCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCA:1	+	chrX	17431812	3'	+	hopper2	1549	1	54.79
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGTGATAGCAAATGAAAAAGA:1	-	chr2L	3886168	3'	-	roo	84	2	75.86
GACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGTGCAAAAACAACAGCTTAGTAAAACTCCCTCTCTCTCGCTCTGGGCTTCTCTTCCACCAACTTGGAAACTTCAAAAAGCCACCACCGCAAAGCTGTTGTAACCATTGTTGTTGTTG:1	-	chr2L	12483671	3'	+	P-element	2883	2	80.14
ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTACAGCATTCCGACGGGGG:1	-	chr3R	14049320	3'	-	transib2	28	1	58.87
AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGAT:1	+	chr3R	29361026	3'	+	mdg1	7408	2	75.24
AAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTGAACGAATCTAGTATATATATCCCTATACTCTACGAGTAACGGGTATAACAACCTAGGAGACATTGCTTCTTCCATCTATATAAACAGTAG:1	-	chrX	5853584	3'	-	INE-1	577	1	78.26
AAAGAGNTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGATAGACGACGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAATGCAGCGCCCAAGAGCTCGTACACACTAAAACTATTAAACT:1	+	chrX	14827122	3'	-	diver2	249	2	74.17
CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATG:1	+	chr3R	29361074	3'	+	mdg1	382	2	53.03
CTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGTTTTCGCAGCGAAAGCGATTTT:1	-	chr3R	19113900	3'	-	INE-1	547	1	49.32
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTATTC:1	-	chr3L	21817963	3'	+	roo	356	2	55.48
ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTGACCTCCATCACATTAAAAGGCAAATAAAGAAATCAAACAAAACAGGGACAGAAATTTCCAG:1	-	chr3R	17613317	3'	-	Tabor	11	2	60.19
GACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTTTATTCCCTAATATCTATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACAAAAGTCATTGCTAAAACCTGACCACAGAGTACATTAATAA:1	+	chr2R	4886043	3'	+	INE-1	580	1	54.29
GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGG:1	-	chr2R	15005076	3'	-	jockey	78	1	65.69
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATACGTACAACAATATGTTGTACTAAAA:1	-	chr3R	20469544	3'	-	roo	8670	2	58.22
ATTTCTTTGTTATATTGTTTCTCAAAATGTAATTAAAACAGATCCAGAAAAAATTTCCACAATTATGAAGTATCCGGTTTTAGTTTTTAGTTCTTTAGGCCT:1	+	chr3L	25208028	3'	+	TLD2_LTR	182	1	71.57
GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATC:1	+	chr3L	20033792	3'	-	blood	46	2	48.95
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAATTTTGTTTAATAAAC:1	+	chr3L	233373	3'	+	roo	387	2	70.55
AGTTTTTTAAAAATATTTTATTTGCTAATTTAAAATATTTCCAAGGATTTCAAGCGCTCAGAAGCCTTTTTTCTCAAAATCCTCTCATTGTTGAAGCTTTACTGTAGCTTGAGAAGCATT:1	+	chrX	4589768	3'	+	1360	3090	1	60.00
ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGAATAA:1	+	chr3R	25826791	3'	-	mdg1	7074	2	60.27
TTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTAGTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAACAATGCACTGTTATAATAACAGCTGTTAATGGTCACCGGACGCAGGGCCAGCTGAAGCTTCTC:1	-	chr3L	17324206	3'	-	hopper	1364	1	74.66
GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTC:1	+	chr3R	22822105	3'	-	mdg1	15	2	44.58
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATAATTATGGTAAGAAAATTAAAACCGAAAGTCTGTTTGTCCCATTGTGCG:1	-	chr3R	31720496	3'	-	pogo	62	1	69.06
AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACATATATCTGGGCGGGAGATACTTGGACACGCGCACGCCTTCGTGTAATAAACTTCAAAAAATAATTTCGTCTACAACGAC:1	-	chr3R	17316211	3'	+	opus	479	2	67.44
TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGCACCGGTCTCTGTTAAT:1	-	chr3R	13360328	3'	-	jockey	60	1	70.75
AAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAAATGTCCAGGGAATTCTTTTTGTCTTTGAACAGGAAAAATTCGTGATTGCTGTAATCAATTATTTCTAAAGTGGCTATCATTAGGAATGGTGTTAAAAGTAATAAGTAATA:1	-	chr3L	24394672	3'	-	G4	48	1	67.81
TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTG:1	-	chr2R	16891845	3'	+	hopper	1337	1	67.81
GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACT:1	+	chr2R	15064458	3'	-	412	7096	2	54.11
AAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGTGGTGCACACTTTTTATAGCCAGCAACAGTCACACAAGCCGC:1	-	chr2L	9564451	3'	-	transib2	57	1	59.26
GATCTCAAGAACTATAAGAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATAGAGACGCAACTCAAGTTTGTTGATCCATGTTGCCACACCCACTCTAACGCCCTAACAAATATTTCTGTAATTTC:1	+	chrX	20672596	3'	+	INE-1	150	1	80.34
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGTATTTAAGGTCGATTACTAATTCCATTTCATTATAC:1	+	chrX	13039554	3'	-	roo	8733	2	67.81
ATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATGTGACTTTTGCAATAAAAATTGAATCGGACAACTCTCCCAC:1	+	chr3R	4764140	3'	+	1360	458	1	81.10
GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCAT:1	-	chrX	21087561	3'	-	mdg3	5257	1	72.00
AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAGAATTATT:1	+	chr3R	4565341	3'	-	1360	70	1	82.44
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCGTTATATTT:1	+	chr3R	12887015	3'	-	roo	37	2	60.27
TGGCCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACCCTTTGAGGATTTTTCATCTAGAATTCCATCTCACCTATATTGC:1	-	chr2L	7263645	3'	+	Stalker	7076	4	72.60
GTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTAAGTGCTGATAATGGAAACGATTTACTTTATCGTTTCTTTTAAACGATTAAATAATTCACTGCTC:1	+	chr2L	18417297	3'	-	412	194	2	55.48
CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATAATTATCCTGCGGGAAGGGGGAGTTGAGTCCACACATTT:1	-	chr3L	20888686	3'	+	1360	3384	2	69.23
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGC:1	-	chr2L	7945319	3'	+	roo	343	2	63.70
TAATAAACTATAACCACCAGTTGGAAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTTTCCTGTATCCCGCAAGACCTCGCTCTTTGCCACCGGTTCCTTCGACCTGGACTTCCCCATACCAGACCTGATCGGCAAGACAGAAATCCT:1	-	chr3R	5274981	3'	+	S-element	441	1	55.17
TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTG:1	+	chr2L	6570058	3'	-	jockey	4792	1	77.97
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAATGAGAAGAATATCAACATCAAATC:1	+	chr3R	17818024	3'	-	roo	22	2	70.55
GATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAGTGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAGATACTGTGTCCAGGAAATGTGCCGTACTGAACATTTCACTGGAAATCAGTCGAACTGTGCCAAATAC:1	-	chr3R	19779694	3'	-	INE-1	541	1	52.24
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGCGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAG:1	+	chr2L	14772119	3'	-	roo	8738	2	66.44
GTTCAATGCAACTTTTCGGCCAGGTTTCTTTTAATTTTCCAAATTTCCCAGTGTCCTTTTTTTTAACTAAATTGTACACAGTTTTACGTGATATATCCTATATCCTCAACAACGCCCCACAATTTTTTGTTATGGACTGCTACGTC:1	-	chr4	883271	3'	-	Bari2	426	1	64.38
GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGACCCAATTTAACTAACCGCTTAACGATCTTGCACATTTCCCC:1	-	chr3R	21705987	3'	-	297	32	2	55.05
ATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGTCAGCTTTGGGCTATTGACTTCAACTAATTGAAGGCCATTATATACTGAGACTCAGTCTCAGTATCATTGTGTG:1	-	chrX	6492671	3'	-	Quasimodo	390	2	75.49
AAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTTGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCCGGTACCACGACAGGCTAGAGTTTTGCTATTTTTAGCGTATGTACCTCTCACTCTCCGTGTTCCACATCACTCACACGAATTTTATGAAT:1	-	chr2L	17058008	3'	+	BS3	1434	1	50.71
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAA:1	-	chr3R	27994209	3'	-	roo	8723	2	75.65
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAG:1	+	chr3R	25448432	3'	-	roo	66	2	65.07
ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTAC:1	-	chrX	4214966	3'	+	flea	241	2	59.72
AACCCTTATCAGCTGCACCCGGAAAGTTTTGGGATAATTCGGTTATCGCAAAAATAGTGGGTTTTAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATGGCCTACACCTCGCCTAATGTTTCTCCGGTGCTCCTCATATCTCTGTCCTTTTCCCAC:1	+	chr3L	10806189	3'	+	gypsy12	132	2	80.14
ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTG:1	+	chr2L	7810104	3'	+	P-element	2801	1	25.17
GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAA:1	-	chr2L	20117892	3'	+	invader4	3023	2	64.38
ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTG:1	-	chr3R	19446164	3'	-	297	6629	2	75.47
ATTGTACATAAAAAGCCAGCAATTAGTTAGGAAATTAGAAATTGACTTAATTATGATATAATAACATTGTAAATATATATAACTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATTTAAATACCGAAATCCTCAAAACAGGGAAACTAC:1	+	chr2L	16277431	3'	+	I-element	5210	1	78.08
ACCAGGGTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATACGGGGAAAGCTCGGTGATCCGATCATTTTGCGGCCATATC:1	+	chr3R	22275504	3'	-	jockey	4767	1	50.53
ATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACGGACTCGCTGCTGCGAGGGCGTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGATCTTTATTAAATAAGGTAAGTCGTGGAAGAATACCATTTAA:1	-	chr4	278501	3'	-	rooA	334	2	67.23
GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTAATCTTATTTCTTCTGTTTTCTTTTCTAAAGATCCTGTCTCATTCCTCTATTTCTATTTCATTCGTTCTATTCTCATTTAATTTCTTA:1	+	chr2R	6872916	3'	-	412	33	2	52.74
TAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAGGTATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGACAGTATTTTGGTTTTTGACACTTTTATAGCTCACTTA:1	+	chr2L	14299255	3'	-	Chouto	194	1	68.38
AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAACAGTGCCGTGTACGGATGCACGACCTCTCATAT:1	-	chr3L	10056099	3'	+	transib2	2764	1	59.59
AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATCAAGGACTAGGATCTAGAAAAACGTCAAAGAATATTAAACGGAAAATGTCGAA:1	+	chr2L	17363781	3'	+	412	434	2	56.15
TGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAACAGAAATAGAAGTGAGTAAGTAGAGAAATTACCGATTCCAGGGGGTGGGCGAAAATGGAAGGGGGTTGGGTTTTCATTTGTGCGAGCTACAGCTGCTCT:1	+	chr3R	6668213	3'	-	I-element	4899	1	73.29
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTG:1	+	chrX	9540101	3'	+	roo	9012	2	64.66
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCT:1	+	chr3R	17817973	3'	-	roo	67	2	67.86
ATGTTATAAATTGAAAAGAAAAAAAAAGATCAACTAAAAAATTAGGCTTATTTACATAAGTTTCACAAGTCGCGTGAACTAATTAATAATTTTTGATTGACTTACTTGTTAAATGAGTATTGCAGTGATTTTAGATTCATTGGCGT:1	-	chr3L	8399006	3'	-	Tc1-2	1403	1	70.55
AAATAGCTTTTTTTTTCACATTCTTGTGAAATTATTTCCTTCTCAGAATTTGAGTGAAAAATGGTAAAAGAACATTTGATGACAGCGAATCTACATACATTGTGTTGCACTGCTCTTTCGATTTTCCACAGGAC:1	-	chr2L	10804624	3'	+	copia	372	1	52.99
ATATATATACAGATATACATATATGTACATATATAGCGATTTGTCTGCGCCCTGTCTGCGTCGTAATTAATTTGTATCAGCACTGATTGCACTTGTCA:1	+	chrX	15543484	3'	-	G3	4507	1	75.51
AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTC:1	+	chr2L	17420233	3'	-	roo	8744	2	73.97
CAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGCGGAAAGTGTTTGGCCCACACCCTGAGGAAAAACTGCCAC:1	+	chr2R	13006554	3'	-	3S18	1	2	83.33
GGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATGGGTGAGTGCCTCCAAGACGATTGGGGTGCTGTCAGTCTTTGGGATTTCTTTTGTCGAAGTCACCTTCCTCCACAGGAAGTATACGAGCGAGAAGATAAGTAAT:1	-	chr3R	3771692	3'	-	Rt1a	4728	1	78.03
CCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCG:1	+	chr3L	17205270	3'	-	hobo	67	1	73.85
GACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCGGTCTCCTTTATTTTCTATTCTCATGCAAGACCAAAAGGATTGGCGCACAGCTGCTACTGCCATCGACAGTTTTAAATGAAACCATGAATACTCAATCTATTGAATGTCC:1	-	chr4	828222	3'	+	INE-1	553	1	69.18
CAACAAAGAAAACAAACAAGTAACAGAAAAAAGCAAGTGGAAAAGCCACGAAGGAAAATTCCAGCAGCAAGTGCATAAAAATGCTCAGCACACACACACACACACATTTTCGTAATGTGTTTAAAGCGTCATACAAAATCA:1	-	chrX	11290984	3'	+	mdg3	5084	1	70.92
AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACCAATTTTTTTTATTAAATTTTTATTGTATATATTTTTCGCAGTGTTGGGCATGCATTTCCCTTTTTTAACAAGGGTTCAACGTCCCCAAGAGCACTTTCCTT:1	-	chr3L	18555829	3'	+	jockey	4978	1	71.03
CCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAAGCTTATACAAGAATGCCTTTGTCAGATTTTGGGCCACCTCG:1	+	chr2L	4412637	3'	+	Quasimodo	7315	2	67.77
GCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATC:1	+	chr3L	27391417	3'	+	1360	3377	1	68.99
AAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACGAGTTTTTTGTTTTTCAGCTTCTAAGCCAAACTGGCA:1	-	chr3R	10181889	3'	-	blood	7107	2	74.66
GATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGCTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGG:1	+	chr2L	12290764	3'	+	1731	4584	1	50.00
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCACTTT:1	-	chrX	5643438	3'	+	roo	406	1	78.23
ACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTATA:1	+	chr3R	14860242	3'	-	BS	5038	1	53.79
TAATTTTAAATATAAAAAATATCAGCTTTAATTAACACATTAACTTACAATAAAGTGTATGTGAATAGGATAATATACCCAAGGAGCCAGCGAAATGCATTTGAACAAGGAGCAAAACTGAGAACATTACCGGA:1	-	chr2L	17104622	3'	+	transib4	2575	1	20.15
ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTT:1	+	chr2L	16016421	3'	-	412	56	2	56.55
AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGC:1	-	chr2R	5485141	3'	+	blood	7325	1	78.81
GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCTCAAAAATAAGGCAGATACACTTTT:1	-	chr2L	4412523	3'	-	Quasimodo	23	2	63.19
AACACGGTTTTATAAAACGCAGATCAACAACCACTAACCTCTTGGAGATAACTTTTCTCGTAATACATGGCTCCATGATGTGATCGCCTTCCGGAACCTTGAGACCACTCCGCAGGGTCAGTTTGACGAAGCAGCACTCA:1	+	chr2L	3500272	3'	+	Q-element	209	2	50.00
ACGTACACACACACACACACACACACACGGGCGCGCGAGCGCAGCAATGGAAATATGGGAAAATACACACACTCTCACACGGACAACTCAATTTGCACTTCATCTGTTGATGTGAGTGTG:1	-	chrX	20940748	3'	+	Quasimodo	35	4	77.50
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTANTTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGACTGAGAAGAATATCAACATCAAATCTTATCT:1	+	chr3R	17818030	3'	-	roo	16	2	71.23
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTG:1	+	chr3R	22844261	3'	+	roo	8989	2	75.86
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTG:1	-	chr3R	18582152	3'	+	roo	340	2	64.38
GCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTCTCGGGGTTTGTTCGGAATTTCTTATGGGGGTTGCTACCCTTGCGCGATGTGCCC:1	+	chr3R	11378964	3'	-	jockey	126	1	60.71
GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACAGCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTAT:1	+	chr2L	19965070	3'	-	Doc	51	1	49.62
AGTCAAAAAATTTTTTAAATGGAGGAATAAAAATTTTGTACATTTGTGTCAAACCCAAACTAAGGCAGACGAAGCGTGTCAGGTAATTGAGCCAATTGGAATAATTAACCGATTAGTTGCACTTCGA:1	+	chr2L	12085689	3'	+	transib3	35	1	76.38
GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAAA:1	+	chrX	13504246	3'	+	412	7491	2	60.29
GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGATGTTTAA:1	-	chrX	5629092	3'	+	jockey	4950	1	54.79
ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGT:1	-	chrX	13504171	3'	-	412	83	2	73.29
AATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACACCAATTACAAAAACATGGCATGTCACTTAATTTGTATGCGTTGAG:1	+	chr3R	25423283	3'	+	3S18	6050	2	64.80
AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGC:2	+	chr3R	20868229	3'	-	BS	5034	1	58.22
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCT:1	-	chr2R	9328594	3'	-	roo	8718	2	57.86
GCGTAACGCCATATGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCGCCCGTAGTGTATTAACATACCCTAGTTCT:1	+	chr3L	23060975	3'	+	1360	24	1	64.77
ACCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCGCTTGTGTTTCCGTCTCTCTTTTCGTGGCACGCTTCGATGAC:1	-	chr2L	9668174	3'	-	1360	42	1	54.89
CGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTACATTACTTCCTTAAAGTTTTAAAATAAATCATA:1	+	chr3R	13237363	3'	+	3S18	6041	2	74.80
AAGGTCATAAATTTACACTTGGAGCCATTAATGTTTAGTTTATTTGTAGTACCAAATACCATGACTGGCGTTGTGGAAGCCATGGAGAAATAGTATGTTTTTAACTCCCGAATATATATATAGTATATAGTGACGTAATTAAATAA:1	-	chr4	1183653	3'	-	Q-element	669	2	69.86
AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCCCCCAAAGTTGGAGGAA:1	+	chr2L	6570076	3'	-	jockey	4801	1	74.48
TTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAATCGATATCTTATGTCACAAAATATTTTCAGGTTTAATTACGTTCTGAGTAAAAGTCAAAGCGT:1	-	chr3R	22295465	3'	+	roo	8809	2	56.85
AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAGGCTTTTAATTAGATTCTTGTAATA:1	-	chr2R	9325351	3'	-	BS	5006	1	64.83
TTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATTCGTAAAATTATATAAGTTGTACCACTTTAAAAGCGTTTTATTTTCAGTCAAGTTA:1	-	chr3R	25453967	3'	+	Quasimodo	7353	2	76.71
CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGG:1	+	chr3R	10182192	3'	-	blood	57	2	68.07
ATATGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAAGAGAACACAGAAGCTCTTCTCTTGTTATTTAAAGTGTACTTTAGCAAAATACTAACATCTCCTAAATATCAAACATTACATTAATTTCTCAATACA:1	-	chr2R	1881354	3'	+	Stalker	7097	4	58.22
GATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGTCTATTATATGTCTGATGATTGCAAATGTATATCCAAAATGATTTGT:1	+	chr2L	2335888	3'	-	1360	3160	1	73.97
GGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTACATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTGCTA:1	+	chr3R	24383328	3'	-	rover	65	2	63.19
GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGAAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGT:1	+	chrX	17431797	3'	+	hopper	1380	1	50.47
CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGAATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACAC:1	+	chr3R	29361021	3'	+	mdg1	352	2	80.51
TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATATTTCCCGAAATTATGCAGAAAGAAAAGGTCGTTTCCGGTGGCCGAAAAGGC:1	-	chr3R	6524817	3'	+	I-element	5279	1	65.07
CTCTCGATTCATTTACCTAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCG:1	+	chr3L	20831381	3'	-	roo	58	2	58.22
GGCTACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACT:1	+	chrX	21667924	3'	-	gypsy2	6564	2	70.00
ATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTAAAAGCGAGATTAAAAAATTAAATATGCTAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGCTT:1	-	chr4	158192	3'	-	1360	2971	1	97.26
GTAAAGTAATACCTTTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTTTGTAAATTTGATTTTGTATAGGCGTAGCAATCGGCAATTGAAGGGATAGTCCTCTAGTACATAGCGTTCCTTGGGCAGAGGACAGCTGCTGGGATGCGGGGCATTCGAG:1	-	chr3R	13370087	3'	+	transib2	486	1	50.68
GAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTC:1	-	chr3R	21705979	3'	-	297	6636	2	59.29
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAA:1	+	chr3R	18582233	3'	-	roo	8738	2	71.72
TAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGTTAAGAAA:1	-	chr3L	3863445	3'	+	blood	7331	1	64.06
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACCTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCG:1	+	chr3R	7835195	3'	-	roo	81	2	73.97
AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGGTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTT:1	-	chr3R	10182150	3'	+	blood	7364	2	63.51
GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGGTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAGAAAAGCTG:1	+	chr2R	20944454	3'	-	pogo	16	1	59.65
CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCCCACAACTTACAATCAAACGAAAGGAAATTCCGCTTGAGGTCT:1	-	chr3R	17605596	3'	+	Tabor	460	2	67.81
TAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGGCCGCAGCTTTAAAGACAATTCACGC:1	-	chrX	4214909	3'	+	flea	256	1	78.07
TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATAATCATAAAAATTTAAATTAAAAATTTCAAAAGTGTGTATGCCAATTCACTAG:1	-	chr3L	23325984	3'	-	pogo	65	1	69.18
ACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGAGCATGATTTAGTAGTGGATGAGTCGACCAGGATTTGCCGGTCTACCCATGATTTATGTTGCTTATT:1	+	chr3L	13573616	3'	-	micropia	4991	2	77.78
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCG:1	+	chr2L	18419268	3'	-	412	7082	2	58.57
ACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATG:1	+	chr2R	5206897	3'	-	G4	3769	1	57.93
GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACCTTAAGAGCATCCAATCTTCCAATTTTCCCAACTGTTTCT:1	-	chr3R	10462563	3'	+	opus	482	2	71.23
TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATGCCATTTTTCTATTATTTCTTACGCGGATTTTTCGCAAAAAATAACTAGTACTTTTGTCATAAGTAAAACTTGAACTTATCATAAAAATCACAATCGA:1	+	chrX	7990432	3'	-	mdg1	7061	2	66.44
TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATA:1	-	chr2L	18419116	3'	+	412	451	2	56.16
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCGC:3	-	chrX	5643434	3'	+	roo	9051	2	70.55
CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACT:1	+	chr2L	18419245	3'	-	412	7110	2	56.55
TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTCACCTTATTATCATTTTTTAGCGGGCGATCGCCTGTTGGACATTCCCTGCAAGGTGTGTGGCGATCGCAGTTCCGGCAAGC:1	+	chr2L	5928107	3'	+	I-element	5337	1	65.04
TTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCAC:1	+	chr2R	10582440	3'	-	Juan	3870	1	73.55
CCATTTTTCTGGGATATGGATAGATATTGGGGAATAAAAAAACTAAAAAAATTAAAATATGGGTATTTAAGAGTACAGAAGGGAAATTTAGTTACAACAACTATTTGCTTTTAATAGCATCAGGTAGTAAGAGTAGCTATTGCAA:1	-	chrX	23069291	3'	-	INE-1	503	1	60.00
TGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTC:1	+	chr2R	6085998	3'	-	1360	340	1	76.32
ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACGGC:1	+	chr3R	22822144	3'	-	mdg1	7047	2	48.28
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCTTGTACAAACGATACAATCAAGTGCGTTCCATATG:1	-	chr3L	11441692	3'	-	roo	8683	2	70.00
TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGT:1	+	chr2L	6059286	3'	+	roo	318	2	78.77
TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAAT:1	+	chr3R	21706106	3'	+	297	358	2	60.27
TCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATATATGTGTGTTTGTATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTACCTGATGTCGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCTAATGCTGTTGCTGCTTCTGTTGTTGTTGCT:1	-	chr2R	20115786	3'	-	opus	14	2	76.03
GTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTAAGATATTACAAAATCATTCGTTTAAATGTCATTTAAGAGGAATTTCTTTCGTTGACTTGCACCTGTCAGTGGCAAATGTTACACGAG:1	-	chr2L	18418937	3'	-	micropia	5264	2	69.85
CGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTAATAAATAAAAAAAAAAA:1	-	chr2L	10365211	3'	-	micropia	4970	2	73.29
GATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGC:1	+	chrX	11296448	3'	-	BS	5066	1	76.56
GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAG:1	-	chr3R	18582183	3'	+	roo	9004	2	81.74
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGAACATTCTCAATACAAAGAATTA:1	-	chr3L	20654441	3'	-	roo	8694	2	65.07
ATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAAT:1	+	chr3L	12879796	3'	+	roo	370	1	68.18
ACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATTGGAGGCGATGAAGTATTTTCATTGGTTCTGAATAGCTAATTATAATCAGAATACTTTAAACAAATCTACTTAAATGTTATGCACATGGGATTTCGG:1	-	chr3L	22821142	3'	+	Quasimodo	6964	2	64.38
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTGGGTGGATTCGGTCTGGTTTTATGGCAAATATTTTCGGTTTGTCCCTTTGCGAACTG:1	+	chr2R	9631260	3'	+	roo	337	2	59.59
CTGCAGTGGTTGTCTTGAAAGTGCGTCGGCTACGATGTTCAGCTGGCCCTTTCTGTACGAGATTTCGAAATCGTACTGTTGCAGCTCCCCAAGATCTGGATGACATAAACAGC:1	+	chr2R	24168465	3'	-	Osvaldo	247	1	72.57
GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACA:1	-	chr3R	12618603	3'	-	F-element	64	1	56.52
ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACGTTGTCCAAAGATAACGAAACAACGATACATTACAATAAATATTA:1	-	chr3L	22863391	3'	-	412	7127	2	67.81
TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATAATGTATGTATGTATTCCTTCCGGATTTTTGGGGTTACTAGCATTATTGCTCATCCTTTAGGCTATATCAAAAATATTTCTCGGCAGCG:1	+	chr3R	2461693	3'	-	mdg1	7060	2	67.91
GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGGTTCTTCGTTAGTTTATGTGTACATAAGA:1	+	chr2R	5311509	3'	+	1360	3336	1	58.70
TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGACAAACTTTTTCTCTACATGT:1	-	chr3L	15600124	3'	-	roo	8	2	63.01
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATG:1	+	chr2L	3114562	3'	-	roo	65	2	67.41
CTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAAAATGATTTTCACTCTAATAATCCGTAAATATCATCCATGATTATCATCCGTCCATAGAAAGCTTTCTTTAAATTGCAAAATGATTAAGAATAGATTTTATTAACATAACTC:1	+	chr3L	19521913	3'	+	I-element	5345	1	76.71
ATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTGAGGGCTCCAATCACCAATCAGGATTTATCGATTGGCTAATTAACGTC:1	-	chr2L	8983310	3'	-	412	105	2	65.47
GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAATAAGGCAGATAC:1	-	chr2L	4412529	3'	-	Quasimodo	31	2	58.22
ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGACTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTATC:1	-	chr3R	13360293	3'	-	jockey	61	1	53.52
ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAACTTAATATTTATTATTTTTCTATTCCCCAGCA:1	+	chr3L	10574415	3'	-	Tabor	13	2	64.44
AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCG:1	+	chr2R	9791648	3'	+	412	7480	2	79.17
TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACAT:1	-	chr3L	10013552	3'	-	hopper	28	1	63.91
ACATACACATACACACACACACACACACAACAGGAGCCATCGAAACGTTAGCGGGAGGAGGCGC:1	+	chrX	6914098	3'	+	Quasimodo	29	2	71.88
TATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCTTATATACTACATCTCCCGCTTCTTATTGGAGAAGTGGAATGTTCTCGGAATAATTGTGTTGACTGCTTTGAATTTATTTTTTTATTGAAATAATATTTTTCCTGATTTTTATCTCTG:1	-	chr3R	3073797	3'	-	mdg1	28	2	67.12
GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGGGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAGTTTGTTAACAATTT:1	+	chr3R	22276778	3'	-	jockey	78	1	51.75
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAG:1	-	chr2L	17420149	3'	+	roo	347	2	61.64
ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTT:1	+	chrX	9540119	3'	+	roo	9034	1	54.26
GTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCC:1	-	chr2L	10023016	3'	-	Doc	78	1	73.23
TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTG:1	+	chr2R	14542210	3'	-	roo	8741	2	76.26
GTATGAACGTCGAGATCTCAGCTTGAGAAATGGGCATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTTTGATTTGTCTTTTTTTTCGTGAGAGTGCCATCTCTGTC:1	-	chrX	5256512	3'	+	INE-1	137	1	52.04
ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCCA:1	+	chr2L	5845088	3'	-	transib2	41	1	54.81
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTAT:1	-	chrX	13504160	3'	-	412	7121	2	64.79
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGTGTACATATTTATTTGCTTT:1	+	chrX	10628659	3'	+	roo	393	1	60.96
ATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACTGATTCCCACTGCTTTGCCGCCTTTCAGGTCGAAGACGTGTACCTTTTGCTTGCTTATC:1	+	chr3R	2208141	3'	+	1360	3189	1	65.71
AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATC:1	-	chr2R	9662713	3'	+	412	433	2	63.16
AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAAGCG:1	-	chr3L	17136068	3'	+	hopper	1392	1	64.00
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGT:1	+	chr2R	16785419	3'	-	412	68	2	64.38
TTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGATTACAA:1	+	chr3R	934296	3'	+	Rt1b	4745	1	64.38
CCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTAGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGG:1	+	chr3L	22349277	3'	-	jockey	15	1	61.73
TACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTT:1	-	chr2L	20840431	3'	+	Transpac	5159	2	72.59
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAAT:1	+	chr2R	23803031	3'	-	roo	8739	2	69.86
AGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATACCCAACTTATTAGTGTGCAAATAT:1	+	chr2R	7586248	3'	+	I-element	5334	1	66.44
TATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGCGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCC:1	-	chr3R	14049348	3'	-	transib2	78	1	68.49
ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTAGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGCTTTATTCGATCGG:1	+	chr3R	14979922	3'	-	pogo	27	1	65.75
AGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCACTCGTGCCCTACTTCGTCT:1	+	chr2R	5173239	3'	+	Stalker4	367	2	53.42
AAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTCTTTGGGATTTTACAGTTAGTCTTACCGGTAATAAGCCC:1	-	chr3R	12886930	3'	+	roo	389	2	66.15
TATCACATTGTATGTTATGTTTACATTTGATAATTTGAATTATTTAACAAGAAACATTGGAATTTAAGACTATCGAAGTCGTCTGCCCCATCCCAGTACCCCCACCTCCCCACCCACGTCC:1	+	chr3R	11607072	3'	-	TAHRE	10201	1	59.50
CCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAACAGACATGAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGATGACAGG:1	+	chr2L	9412081	3'	-	jockey	4541	1	70.00
TAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTATGGAATGCGTCATGCTATCGGTGCTTCAAGCGATC:1	-	chr3R	19265835	3'	+	I-element	5279	1	73.72
GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCA:1	+	chrX	6522033	3'	-	F-element	64	1	69.52
TTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTGATTATAGTTTCTT:1	+	chr3L	20654542	3'	+	roo	8980	2	78.08
GCTGTTTAATTTACATATAAACTCAGCTGTATTGCAAAAAAAAATTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCACTCATTGAAATTTTAAACATGTGGATTGTCAAGACACTTAGCTCTTGGAGTATCTAAAT:1	-	chr3L	21024163	3'	+	pogo	1834	1	59.59
CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTC:1	+	chr3R	12717823	3'	+	297	6909	2	71.43
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTT:1	-	chr3R	22844205	3'	-	roo	8739	2	73.91
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCCAGTAGTTAAATAAGGCAACCGCTTTT:1	+	chr3L	4605751	3'	-	pogo	19	1	70.59
TTAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATACTACAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAA:1	+	chr2R	9091965	3'	-	1360	24	1	65.07
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAACTTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATAT:1	+	chr3R	12887004	3'	-	roo	8706	2	54.29
CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGT:1	-	chr3L	23818357	3'	+	copia	5073	2	72.60
ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAG:1	-	chr3R	19446161	3'	-	297	51	2	74.11
GAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAATTATTGTAAGTG:1	-	chr3L	9998030	3'	+	roo	400	1	53.66
TAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATGAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACC:1	-	chr3R	10273961	3'	+	HMS-Beagle	6961	2	75.17
ATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGA:1	+	chr2R	10582499	3'	-	Juan	3819	1	65.89
TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTAC:1	+	chr3R	22822164	3'	-	mdg1	8	2	57.78
ACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATAAT:1	+	chr3R	30872894	3'	-	micropia	35	2	59.44
TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTT:1	+	chr3R	18585641	3'	-	P-element	89	1	23.08
TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGA:1	+	chrX	11296458	3'	-	BS	5074	1	72.60
GTGAATGAGCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACA:1	+	chr3R	2689452	3'	+	diver2	4466	1	66.67
AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATG:1	-	chr2R	5248257	3'	-	1360	72	1	75.38
ATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATATTTCTTTTTATTTATTAAATTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAATATTGCTATTAATTA:1	+	chr2R	4774809	3'	+	baggins	5405	1	70.55
GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTA:1	-	chr3L	17558013	3'	+	jockey	4928	1	65.07
TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGCTAACTAAATCTCGTTCGGCGTGCTGGAATCTGATTA:1	-	chr3R	28758256	3'	+	mdg1	401	2	52.05
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTATGATTAATGT:1	+	chr3L	11441839	3'	+	roo	9019	2	55.48
CGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTGCTCCTAGAAGCGTTCTT:1	+	chr2R	4677385	3'	-	invader3	5217	2	63.70
ACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACC:1	+	chr3R	19448626	3'	-	roo	8785	2	71.92
CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATT:1	+	chr2L	22685164	3'	-	Ivk	65	1	76.52
GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTTACAGTCGGTTGCACAGTCAAAGTTCATCTCAAGAATCG:1	-	chr2R	6919677	3'	-	hobo	14	1	53.16
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGGTCTCGCACAC:1	+	chrX	16717914	3'	-	roo	8750	2	79.45
GGAAGAAGGGCATTCTGATGACTCTTCGACATATACTTGAAAATAACTTCATATTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATATTTCGATTTAGCCGACTAAAAGATACCCTAATGCCATTATGGAAAA:1	-	chrX	5932586	3'	+	invader1	393	2	45.71
AACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATATATACACGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTG:1	-	chr2R	11402323	3'	+	Bari1	1651	1	64.12
TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTT:1	-	chr3L	22437871	3'	+	roo	336	2	67.12
TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGGTGTGGCTTT:1	+	chr3R	10182205	3'	-	blood	29	2	50.96
CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCC:1	+	chr2L	11661029	3'	-	F-element	54	1	45.32
ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCA:1	+	chr3L	17560389	3'	-	pogo	46	1	52.52
AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCATCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTAT:1	+	chr2R	20496999	3'	+	blood	307	2	67.12
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGAT:1	-	chr3L	11530900	3'	-	roo	8746	2	79.31
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATATGTTTC:1	+	chr3R	16076906	3'	+	roo	9037	1	58.90
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAGAGAAAGACAATTTA:1	+	chr3R	18585682	3'	-	P-element	9	2	71.15
CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCAC:1	+	chr3R	17243245	3'	+	hopper	1385	1	63.01
AACATTCATGAAACAAAAGTGCAAGTCAAAACTTAAGTAAACTTCAGAGCGCTTACCAATGCTGCTGTTCGCTTATTTATCGAGAGAGCTTAGCTGTTGTCGGGGTTCTGTGTGCATTTTGATTTAATTTGGAATGCGCTACTCAA:1	+	chr2L	13433183	3'	+	Fw2	314	1	59.59
CTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGTTTTCGCAGCGAAAG:1	-	chr3R	19113907	3'	-	INE-1	547	1	51.80
CATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGCCTGCGAAAATGACAAAACAAGTAATTGCCATCATAAAGCTACTTATGCCACTGATTA:1	-	chr3L	4605582	3'	+	pogo	2073	1	71.23
GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGGAAATGCGGATAA:1	+	chr3L	25232913	3'	-	GATE	37	2	50.00
ATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAATTTTTCCGGCAAATGTACGCACTTTAGTGTGCGATGTGCCA:1	-	chr3R	12619980	3'	+	Stalker	286	4	70.71
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATTCAATTCAAATATTCTTCACTTTAGCAGTGAGCAACTTCGTTCCCTGTTT:1	+	chr3L	10292943	3'	-	roo	8684	2	71.92
AATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAATCCCGCTCATAATCGTCTTCTAGCCGCTTAAGGCCAGGTGAG:1	+	chr2L	2381186	3'	+	mdg1	322	2	69.78
AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTACA:1	-	chr3L	10848625	3'	-	blood	44	2	55.17
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCTATGTAAGGTAGTATGTACTCTATATATGTGTATATGTAGCATGTATCTTTCGTATTATG:1	-	chr2L	6059213	3'	-	roo	57	2	58.74
AAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTAAAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAATACAAAGA:1	+	chrX	20645617	3'	+	1360	3040	1	57.93
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTTCAATCGCTAAGGACTTTATGGCGCACGTATATGTTTTTTCAGCCAGGTCCTTATTACACACTTTCTTACA:1	-	chr2L	12153169	3'	+	roo	9024	2	52.05
AAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCCTCTCTGCATCCGAAAGCAAAGTGATATGGGCCGACGTAATGGACATGA:1	+	chr2R	22956823	3'	-	Max-element	8343	2	52.88
TCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGTGTGCTGGTGTTGGAAAATTGCAAGCCAACATAAATTTATGTCTG:1	-	chr2L	6569896	3'	+	jockey	4988	1	74.63
CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCAT:1	+	chr3L	20033791	3'	-	blood	45	2	48.94
ATACCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTGATACGAACTCAATTATTATCCTTAAAGGATATATACTACCTCCTCTGTGTTATAGAAAATAAATATAACATCCATCTAAAATTCCAAAAAGCTAAATA:1	-	chr2R	16745323	3'	-	Tc3	314	3	67.63
AAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATATATACACGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGAATATTCTCAGATAATCTTGGTCATGTCAGTCTG:1	-	chrX	22715000	3'	+	Bari1	1689	1	70.55
TCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGTATATATTTAGATTTATTCTTAGAGTCACGTATACAGCTGTTTACGCAGAGAATGAAGCCA:1	+	chr2L	14110847	3'	+	Quasimodo	7322	2	63.31
AGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGATTTGCCAGATCGCTTGCCTATCGATAGCAACTCGATACATCGATATATATTTTACATTTTCCTATAACCATAA:1	-	chr3L	23537366	3'	+	Q-element	176	2	64.08
TGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTA:1	+	chr3R	11547748	3'	-	G2	350	1	77.34
CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAGGTATCCTTTC:1	+	chr3L	17560401	3'	-	pogo	25	1	63.85
ATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAAAACTAGAGAGACGAGTGCGAAAGCGAATGCGAGTGATATGCGAATAGCGCATACTCT:1	+	chrX	18386468	3'	-	invader4	60	2	62.07
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCAAATGCACTATAATCGCAT:1	+	chr3R	19968244	3'	-	roo	8679	2	74.66
CCATGTCCGTCTGTCCGCATGAACGTCGCTATCTCAGAAACTATAAAAGATTCTAGAGACAAAGACACGGCTCAAGTTTGATGACCCATGCTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACAAATTTTTGGATTTTT:1	-	chrX	5936830	3'	+	INE-1	121	1	67.94
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGAACAGCAG:1	+	chr2R	13710703	3'	+	roo	388	2	67.69
TGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGATTATATTGTATATAATCAGTACTTTCTAA:1	+	chr3L	5102482	3'	-	BS	4749	1	78.42
ACCAAAGACACTAGAATAATATAGAATAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTTTTACTCTACAAGTATAAAGGTATAAGGTATAAGGTTCAGGTATAAATATTAGATAGTAAAATATATGAAACCACTTTTGACTTGCTTTTGT:1	-	chr3L	16740675	3'	+	Tc3	241	1	64.83
AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATACATAAAGAGAAACAG:1	-	chr2R	20596449	3'	+	roo	358	2	53.52
TACTTGAACTAATAAAATATATCAGTTTGCAGCTTGTCAGCTCAAGAGAGTTGTGTCACTTTGAAAAATGTGTCGACGTGAGGTACCCTCGCCAACTTTTAGTCAACTTGCTCCCAGCTATATAT:1	-	chr3R	30255535	3'	+	G7	1166	1	56.80
CGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAACATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAACATATTATGCGTACGTACTGGCAATTAATTTGCGTGCGCAGCCATTTTAG:1	-	chr2L	9277116	3'	-	hopper	400	1	66.90
TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGG:1	+	chr3R	20427461	3'	-	jockey	81	1	65.75
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAAATAAAATA:1	-	chr2L	12892592	3'	-	roo	8702	2	56.55
TAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACAC:1	-	chr3L	10013595	3'	-	hopper	69	1	70.23
GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAAAACAATGAGTGCTCCCACTTTGATTG:1	-	chr3R	25423154	3'	-	3S18	17	2	71.23
GCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGT:1	-	chr3R	26431970	3'	-	opus	69	4	65.75
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACAT:1	+	chr2R	9328715	3'	+	roo	9054	2	66.67
ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAGCACTTATTTTAACACACGTAGAGTACATGATATGTATTTTCCCCAAATTTGATAGGAAGTTTCCTATCACTT:1	-	chr2L	6863261	3'	+	pogo	2057	1	55.86
CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTGATATTCGAGCTACTCGACTATGGCGGTCTCTCCAGTTTTTAATAAACAAAATTGATATTTTTAAGCCGATACTGACGTA:1	+	chr2R	6885424	3'	+	flea	4989	2	57.53
CTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAA:1	+	chr2L	5845060	3'	-	transib2	79	1	72.41
ATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATA:1	+	chrX	11296470	3'	-	BS	5061	1	64.14
TAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTGTTGGAAAATAAGGCAGCACACTTTGACTATAAACAAGAATTTAAAAATACACATCCCA:1	+	chr3R	18580345	3'	-	roo	175	2	59.59
TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCACTGTGCACATGTTTACACTGTCTGCACGCCG:1	-	chr2L	12328627	3'	+	hopper	1401	1	55.77
ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCCTGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCATGTGTGTG:1	+	chr3L	22917694	3'	-	jockey	4788	1	51.38
GATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAGAATGTATTGCCATCCA:1	+	chr2R	5198497	3'	-	INE-1	80	1	65.75
GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTAC:1	-	chr2R	5485100	3'	+	blood	7338	1	54.79
TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAGGCCTAAAAAC:1	-	chr2R	16891798	3'	+	hopper	1401	1	71.32
TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACG:2	+	chr3L	9998175	3'	-	roo	8749	2	76.71
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACA:1	-	chr2L	7945324	3'	+	roo	9011	2	64.96
AGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTGTTTGGCATAAAGTAAAACTTGAAACTAAAACAAA:1	-	chr3R	10187084	3'	+	blood	7110	2	70.59
CAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAG:1	+	chrX	21994012	3'	-	McClintock	5993	2	56.55
GCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATAATTAAATTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGA:1	-	chr3L	10590623	3'	-	1360	409	1	78.77
AGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGGCGTCAAAAAGTATGCTATGGTATTTGGTGTTCTTGTTCTCAG:1	+	chrX	5629206	3'	-	jockey	111	1	50.71
ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTTGTGCTCCTT:1	+	chr3R	20868242	3'	-	BS	5021	1	66.44
CGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGATAGATAATATCTTTATATAGAATAATATAATCCGCATAATTATAATTGTTGAAAATTACA:1	+	chr2L	15248012	3'	+	Transpac	252	2	57.53
TAGGCAGTAATATTTGGAAGATTTTAATTAATAAGATTTGATTTATGTCAATTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGATGTTGGTGAGAAAATCTTAAACTCTGCCAAAACTTCTGTGTTAGTTTTAAAATGTTCTTAAGATGCAGTAACC:1	+	chr3R	25087691	3'	-	jockey2	3238	1	79.45
GAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCATTCTGCCACGGACGGCTTGGGGAAGGGTATTAAGGGGAAAAAGTGTCAGCCC:1	-	chr2L	12290650	3'	-	1731	4359	2	47.95
GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATT:1	-	chr3R	25454022	3'	+	Quasimodo	7300	2	69.66
GTTACGCATCTTGTTATCCCAGTGTCTTTGGCCAGGTCGACTGCTCGTAATTGGAGCGTGGAATATCACTCTTCATGTTATGACATTTTTTCGCGAGCAGTGAAATAATTGTACACCGCGAAAAATTGTTCTCTTGCAGCATAGTT:1	-	chrX	22937076	3'	+	1360	3380	2	74.66
CGGAAGGTGTGCCCGTGGGACCCGTGACACAAAAAAAAAGGAAGACATTAACTCGTGTCTTACAAACGGGTTTAGAAAAAACTGATTGCCCGGCATGACTGAGGACGATCAGCGTGTCAAGATCAGTTCG:1	+	chr2R	21122845	3'	+	Cr1a	4435	1	66.15
GAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTATAAAAAGCATAGAGTATAATAAAATTCTGATTGTCTTAATTCGAATGTAGAGCCTTTTT:1	-	chr2L	22125927	3'	-	mdg1	7447	2	58.33
GCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATAC:1	+	chr2L	20117927	3'	-	invader4	70	2	77.78
ACAATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGATTCAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTTACTATATACATATATGTACATTGGGTTGCGTTTTAAATTTGAATGGAAATGAACT:1	+	chrX	3663217	3'	-	297	6796	2	78.08
CTCAAAAATTTACAAAATTGTCCAAAAAGCTTAGTTTATTATATGAAGTAATTAACCCCTAAGCTTCGAGTGAGCATCTCATCTATCATATGATGATCCTTCGTCGAACAGTGCGTATGAGCGAAGTCTGCACGCTTGAACTTGTA:1	+	chr2L	21612100	3'	+	Ivk	5245	1	57.53
ATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAACAAATGAAGTGCAAAATCAACGCGACGTCCACAGGAACCACAAGCATTTTGGTTATTCGACTATTGACAGCATGGCCGAATGACATTTATTTTAATTAGCTCCGCAAACAA:1	+	chr3R	19529260	3'	-	jockey	4648	1	76.03
CGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAGGCTTGCGAAAGTGGAGGCCACGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCC:1	+	chrX	22638561	3'	-	INE-1	116	1	72.82
AAAAAAGTAAAAAAAAAACAAGAGAAAGGAAAAGTGGGCTACAACCTTATTATTATATCAATGCGTTTGTTGAATTAGCGGAAACGGAAGAAATCAATCGATCAAGCCTGCCAGTTTC:1	+	chrX	5355703	3'	+	gypsy7	5010	1	73.73
GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGTTGTAAGCACTCGGAGATCCTCAAAGGTCACGGTGGGCGGAGGTG:1	-	chrX	7195007	3'	+	P-element	2883	2	76.52
AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGACATTGTGATATTTCTACATG:1	-	chr3L	17557966	3'	+	jockey	4975	1	66.44
ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCGGAGCCCAGAACGAAACTCCTGCGTTTGATTCCAGAC:1	-	chr2L	21891675	3'	-	mdg1	7059	2	68.49
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGCCGGCGTGTG:1	+	chr2R	21908026	3'	-	roo	53	2	57.53
ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAGAAAAGCTGAAATATTATATTTTGCACAGAATCAAAACCAATTTGCATAAGTTTT:1	+	chr2R	20944500	3'	-	pogo	2	1	77.40
AATGAAGTTATTTTCTATCAACTATATTAAAGAAAAAATATGTATGTATTTTGAATTAATAAAAATTCGATTATATCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAG:1	-	chr3L	5651637	3'	-	blood	6960	1	56.20
GACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATACAACCTTACTTTATGATTTTGTTGTTGTGTTGCTGTGAGTGTCCTCATTTTCACTCTGTGATATTTT:1	-	chr3R	7100941	3'	-	roo	8814	2	52.11
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGGTTATCCG:1	-	chr2R	9791555	3'	-	412	17	2	68.80
AAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGGGAGCTAAATAATCAAGTAAAAAATAGAGCCTTGAAGATGTATTGCTCTTGAAATTCTATTAAATTGAGATA:1	+	chr2L	4409751	3'	+	Quasimodo	6947	2	56.12
TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGT:1	-	chrX	4214934	3'	+	flea	4966	2	55.80
AATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCCGGTGTAGCCATGTG:1	+	chr2R	9500090	3'	-	G5	4724	1	49.32
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAA:1	+	chr3R	17817990	3'	-	roo	48	2	55.07
CTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATAGTTGTTTACAAATAGTTTTAAATGCAAAATGACGTTTG:1	-	chr3L	16750650	3'	+	Tirant	337	2	63.01
CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTATGGAATGCGTCATGCTATCGGTGCTTTAAGCGATCATATTAATAGAACAGTCGGTTAGTCGAAGTTG:1	-	chr3R	19265803	3'	+	I-element	5302	1	53.42
TGGCCCCCGAACATGGACCAGCGAATAAACGCGAACGACAGACAAATATTCCAAGTAGCGGAGAAACTCCCGTGAGTTAATAATCCAAAAAGGTTCAGCTGGTAGGTGCATATTTTCTATTTACCGCATAAAAAT:1	-	chr3R	11798957	3'	+	HMS-Beagle	266	2	65.19
AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGCGAGTAGAGGAAGTGTTTCCTGGACCATTGCTCTTAGATAAACATCTTTGCCATCTGTTGTTGCTCCACTTTGCTTTGGCTTTCTGGGGTCTGGCTGCTG:1	-	chr3R	31924872	3'	-	jockey	4759	1	69.18
GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAAACAAAGGCCATTCAAAACTGAAATTTTG:1	-	chr2R	2832926	3'	+	1360	3354	1	68.54
CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGTATTTAAAGGTAGTTTAGGTCTAATTCTAAACTTTACTT:1	+	chr2R	16248055	3'	-	BS	7	1	71.92
AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCA:1	+	chr2L	15181436	3'	-	jockey	4825	1	68.22
GTGTTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGGAAACCCATGAGTGTTTTGCCTATCATCTCTTTTTAGGCACATGCGTTTTTTGATTTTTTGTCTTCTCCATCCAGAAAGGTTAGTAGCGACGCAATAGAGCTTA:1	+	chr2R	2509584	3'	-	hobo	245	1	75.56
TCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTTAGTGTGCTTCTTTTGTGGTCCTCGCTAGCTGGGGTCATATTCCCCCAGACTTATCCGAATGTGACTTGGACCAGCTTGCTTAT:1	+	chr3R	11104538	3'	-	Doc	4466	1	60.27
GTATTCGTGAAGTGATCAAAGTGAAGTAATCAAAGGAACTTAGTTTAGTTTATTGATAGTGCCGTCGTGGACAGTCGCAGTAATCTCCCGAAACGATGCAATTCGCAATTAAATATCAG:1	+	chr2R	23588925	3'	-	frogger	2204	1	68.07
CACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATAT:1	-	chrX	12657098	3'	-	blood	7077	2	64.29
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTT:1	+	chr3L	233344	3'	+	roo	9032	1	54.81
ATATAAAATTTGTTTTAATTTTACAAGATTTTTTAAACTGCATTTATAAATAAATAAAAAATATAAAAAAGTCAAAAATTAGAACACCAAATAGAAGAAAAACAAACGCAATCAGGGAAGCCATTCATCACTTTCTACGGCCACT:1	-	chr2L	13264136	3'	+	1731	4264	1	55.17
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGT:1	-	chr2R	12835069	3'	-	jockey	36	1	72.00
ATAGCCCGGCAGTTGGAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGTCCACTAGTGTATGTATGCAGTAAAATAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAAATATCGGAGAAATAGTTTAGTCTTTATTCTTTTAATCTCAGCTTAAGACTAAA:1	-	chr2L	22076768	3'	-	Tc1-2	31	1	52.74
ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCGATGTGGGCAGAATCGTTCGATTTCGTCCTTAGGTGCTCTGGTTTTCGCAAAATATATGCTATCGTTTTGCCAT:1	+	chr3L	22968480	3'	+	mdg1	7448	2	75.86
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCACAAAG:1	+	chr3L	4536773	3'	-	roo	40	2	63.21
ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTAGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGTTGCATACTTTCC:1	-	chr2R	12835027	3'	-	jockey	31	1	58.93
CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAG:1	-	chr2R	2016818	3'	-	1360	17	1	63.11
GTTAGACAATAGCCAAACAAGCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACTATCTTGACAGCCTATTGCTTCAAGACTGTT:1	+	chr2L	18040000	3'	+	G6	1848	1	70.48
GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTTTTTATTTGAAGGACCATATAAATGTCCGAGTTAGTCAAACATCCTGGGAAACC:1	-	chr3R	12618547	3'	-	F-element	16	1	74.66
ACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCG:1	-	chr2L	12290666	3'	-	1731	4354	2	51.20
CTCAATAAGAGATGTCCTTAACGTAAATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGAAATACTATCTTTATCTTCCACATTCATGACATACTAACAGACTCATATTTACGTCGCAATAAAAATTTCATTG:1	+	chr3R	3920817	3'	+	Circe	7006	1	59.59
ATTAATATTTATTTTTAAGCCTCTCCTGTCCTTGTAATGCAAACTTTTTCAGCAAACTTTTTTTTCTGCATCATTTGGAAGTTCGTTTCATTTTTATTTCCCAGTAATCATTTCCTAAATGTAGCCATTTCAATTAAGCCGAGTCC:1	-	chr2R	16729036	3'	+	NOF	3870	1	60.27
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATG:1	+	chr2R	23803014	3'	-	roo	62	2	76.72
TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATG:1	+	chr3R	7482826	3'	+	412	437	2	67.94
TAATATATTGTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTATTATTTTTCTTTTATTGCGATTTTACTAT:1	+	chr3L	27414131	3'	-	hopper2	1308	2	78.08
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGAATATCAC:1	+	chr2R	13696479	3'	-	roo	8737	2	71.23
TATTTTTTTTTTTAATTAAAAGATTGTCGAATGCACATTTGGAGCACTTGGAAGACCCTTCTTCTCTCGCATTCTTCTCTGCGCCTTCCTCCCTTTCCCG:1	-	chr2L	12423518	3'	-	transib2	2632	1	87.00
ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTATCCCCCTTATCGCCGG:1	+	chr2L	19965085	3'	-	Doc	42	1	59.71
GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTCCC:1	+	chr3L	21855556	3'	-	blood	7034	2	65.62
AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCATTGCCTGC:1	+	chrX	17963974	3'	-	jockey	4770	1	71.93
GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGC:1	+	chr2R	9791653	3'	+	412	429	2	73.98
TAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCATGTTTGCCAATAACTCAAGAAATTACTTGGATTTGTATGGGAATTTCGTGCAGTTTTTCAGCCAAAC:1	-	chr3L	8335145	3'	+	1360	3149	1	50.37
GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGCGGAAAGTGTTTGGCCCAC:1	+	chr2R	13006533	3'	-	3S18	5777	2	71.82
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTG:1	-	chr2R	13084584	3'	-	roo	19	2	61.54
CGTCGCTTAAGAGAGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTT:1	+	chr3L	23702262	3'	-	G4	56	1	52.74
AAACACGTGTTCTTAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGCTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGTAGAATCGCCTGCAATCTCCGGGATATGCACTG:1	+	chr3L	11957258	3'	+	blood	357	2	68.53
TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTT:1	+	chr3L	3799854	3'	+	copia	229	1	65.87
TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATG:1	-	chrX	10644454	3'	-	jockey	4846	1	74.66
AAATTTCGTAGCAATATGATATATTGAATATAACAAAAAAAAACCAACAGTATGGACCCTTCGCGATAAATTAAGCGACGCCTTGACAAATCTAAAATGTTGTTTCTCAAATCTTCTCAAATTTATTTTATAAAATAACTAAGTTA:1	-	chr3L	26011811	3'	-	1360	3112	1	35.62
CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTAAAATAGATCAAAGCCGAAAAATAATCAACGACCTTT:1	-	chr3L	17115464	3'	+	blood	7311	2	71.43
GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGCGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTAGGTACTCGAAGCGG:1	-	chr2L	14110712	3'	-	Quasimodo	9	2	79.17
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTATTTATT:1	+	chr3R	20469689	3'	+	roo	349	2	57.53
AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTTTT:1	-	chr3L	23818347	3'	+	copia	5083	2	65.75
ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTA:1	-	chrX	10521631	3'	-	Tabor	6902	2	58.22
AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTAAAAATATTTATATGCTTAAATATGTTTAAAGAATTTGCATTATTATACATTAACTCTATCCCATTTAACT:1	+	chr3R	11207315	3'	-	FB	51	1	52.74
GTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATT:1	+	chr2L	10037416	3'	-	Quasimodo	43	2	54.55
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGCATACTATTTCGATCTTTTCGTGTTTTGGT:1	-	chr3R	18582094	3'	+	roo	397	1	74.48
TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAAGTCATCCCTCTTCAAG:1	-	chr3R	1433121	3'	-	mdg1	7057	2	59.62
TAAATCATTGTAGATCTAACCATGATTTGCATTACCCCTACTGTGACTATAATATGCTATGACTGTATAGCGGCTTGTTGGCCTGTTCAAGAATATTATATTTTATAGAGTCGGAAATGCTTCTTTTTACCTTT:1	+	chr3R	4480284	3'	+	Cr1a	4149	1	54.48
AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCG:1	-	chr3R	19446141	3'	-	297	54	2	63.70
ATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACAAAGTTAAATAGTTCACTTCGATGTAATGCATTCCCGTCTACTTTTCCAACATT:1	-	chrX	2297084	3'	+	Tirant	8382	2	63.70
AAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGGG:2	+	chr3R	8049032	3'	-	Q-element	126	2	62.33
GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGCGTCATACGCATAAGACAAGCTCAC:1	+	chr3L	7588516	3'	-	hopper	26	1	59.66
TATTATTTTATTTTATATTCTAACACACTTGAATAAGCGACTTGATACAGCGTTATAGATTTTCTAAGATCTTTCTTGACTTTTTGATGATACAATTTATTCTGAATGATATAAGTTTATATGATGGTTTCTTTGGCCAATATCGA:1	+	chr3L	10295218	3'	+	transib1	1901	1	74.66
TGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATGCCTAAATTCCTCGGAATAACTT:1	+	chr3R	25454151	3'	-	Quasimodo	10	2	65.07
CTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTG:1	-	chr3L	23728656	3'	-	HMS-Beagle	61	2	71.43
TATAAGAATAATTTTAAGCTTCAATTTGAATTTGCATTTGTCTGAATAAAGAGCGAAAGCTCATCAACTTACGACTAAGCGTCGTAAAATATATTCTTATCAGAGTCAATAGAGCAGGCAGGTTGGTTATTAAGTTATTAAATAAA:1	-	chr3L	24532462	3'	+	Gypsy6A_LTR	144	1	68.49
GCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCAATGTTTCCT:1	-	chr3R	19447022	3'	+	roo	249	2	72.50
CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTT:1	-	chr3R	10462609	3'	+	opus	7440	2	65.07
GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTA:1	+	chr2R	25118760	3'	+	roo	8993	2	73.97
GTTCGTCATGCTCGCGCTGAGCGCGAGTGTCGCTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTTATGCCTTATCCAATTCCGCAAACCAT:1	+	chr2L	11773487	3'	-	F-element	219	1	80.00
CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCTACCTGAAAATCGAAAAATACAAAAAAAAAATGACATCAAAGATTTCGATG:1	-	chrX	8814684	3'	-	pogo	15	1	64.38
GCATTCCCAGTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACTATAGACATCATATACGAAACAAGTTACTACGATATACGCGTACTTGCACCATCAATACAGTCGAATAAAAGATTATGTATGTA:1	-	chr3R	4504040	3'	+	INE-1	534	1	59.40
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCGCCTTTGACAGCAGC:1	-	chr3R	12886885	3'	+	roo	404	1	74.74
TTGAGTCGACTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACACCATAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGCA:1	-	chrX	23201999	3'	-	R2-element	111	1	54.47
AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGTATATACATATGGGAAAAAGACCATTAAGCAGCATAAGTGCATGATATTATCTGTACTTGAACAGACAAAGGCGGAACATTGTCAACA:1	+	chr3R	12945941	3'	-	jockey	4747	1	71.54
GCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTGAATCACAC:1	-	chrX	21564628	3'	+	diver	6084	2	60.71
GAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGACTCACT:1	-	chr3R	20499713	3'	-	mdg3	5257	1	79.20
GAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGAGCAGGATGCA:1	+	chr2L	21008634	3'	+	invader3	5402	2	57.53
ATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAAGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGC:1	+	chr3L	25824643	3'	-	Juan	4188	1	52.73
GAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGG:1	+	chr3R	11547802	3'	-	G2	314	1	57.53
CTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGAATAAGCATACACATTCTACGCCCCCTCTAATACCCACAAAACGCCCAAAACTGCAACGCCCACATTTAAAAAAAAAAATGATTGGCTTCAGCTGTCGAAGACGCGGTGAA:1	-	chr3R	4129809	3'	+	INE-1	153	1	80.85
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCAT:1	+	chr3L	16343298	3'	+	roo	9017	2	59.69
AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAA:1	+	chr3R	14979899	3'	-	pogo	49	1	53.10
GCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTATCCAACAGATACCAAATAGGAATAAGATTCTTAAAAACCCCCAATTCTATGAGAACTGTTATCTGTTAAGTACAATCTAAAT:1	-	chr3L	19322775	3'	+	Idefix	37	2	75.86
TCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGAGTTCTTAACTTAATTAGCCACTTCATGAAAAATGCTTAAATATTCAATTTTAAACAGC:1	-	chr3R	23575047	3'	-	BS3	1416	1	70.55
ATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCCAA:1	-	chr3R	9714395	3'	-	Stalker4	64	4	65.67
TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCAC:1	+	chr3L	20168423	3'	-	mdg3	5326	2	74.42
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCA:1	-	chrX	13039497	3'	+	roo	352	2	78.10
AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCTTGTGTGAATGTGTGCGCGTTTAATTTTCTCACCCAACTAAAATGT:1	-	chr3R	11083870	3'	+	412	7495	2	51.37
GACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGATATATATACTAGCATCGCGGATTC:1	-	chrX	10903351	3'	+	Stalker4	7072	4	75.76
TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACAAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCAT:1	+	chr2L	7888210	3'	-	pogo	37	1	61.54
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAACCTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAG:1	+	chr2R	8585493	3'	-	roo	8726	2	78.07
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTCCTTATTTGCTCTTTTAGAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATAC:1	+	chr3L	11530948	3'	+	roo	347	2	59.13
GCCCAGCCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAACATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCATTTTTTTTCACCTTCTTGTGTAATTTCTTTTTTTTTTCTATTTTTGTTAAATTATTTCTTTCTCTGAATTT:1	+	chr2L	14004520	3'	+	copia	285	1	80.00
ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGCTTGCTCTGCCGAGATTTCCCCCGAGCCA:1	-	chr3R	26847862	3'	-	jockey	4847	1	78.03
CACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCC:1	+	chr2L	11661023	3'	-	F-element	61	1	47.14
TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTA:1	-	chr3L	20831262	3'	+	roo	9027	1	53.10
GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCTTGCATATCTGCATTTGTATG:1	+	chr2R	8146111	3'	-	P-element	86	1	23.97
ATTCATTTTAAATTATTAAAATTGTTAAATTATGAATTCCTATTCTTTGAATTTAGAAACTGCTTGAAATATGATAACATAGAATGTGTTGCATACTTGGCGGCTGCATGTCGTGAAATTCATGTAGATATCATGTAGAA:1	+	chr3L	3766912	3'	-	Transib5	257	1	67.14
CGGATGTTTATGTCTGGTGGATTGGGTGATGACTGTAAAATCCCCAGGTTGGGTGGGGGCGCATAGATGTTCATTTGCAATTAATGCTTTTGATTACCTTTTTTTTGTTCCTTTGATTATTAGAGATCTTAG:1	-	chrX	21032556	3'	-	Quasimodo	7024	2	75.00
CAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGAGGGGGGGAGTGGCCGGTCCATAGGCATAGCTGCTCCCATCTGCAAATGGGCAAAATAGTGATATTTTTTGTATG:1	+	chr2L	14110588	3'	+	Quasimodo	225	2	51.85
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTT:1	-	chr2R	8585434	3'	+	roo	9036	1	52.68
ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGTCAGTCTGCGTCACAGAAGCGCAATCGATTTCTTTCAGATAAGACCTTT:1	+	chr3L	1534746	3'	-	pogo	67	1	64.38
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGGTCCGTCG:1	-	chr3R	25448300	3'	+	roo	9047	1	68.49
CGTGATCCGAATCCGAGTCGCTATCATCGCTTCCCAAAAATGTTCATTATTAATAGGTTTCTCAACATCCGTGAATGCGTATTTATCTACAAAAACGTATTTTAAATACAACTACATCGTCACAA:1	+	chr4	903770	3'	-	transib3	2548	1	49.60
AATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATCACAGAGTATCAGGCTCGCGAG:1	+	chrX	21994029	3'	-	McClintock	5977	2	66.44
GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTTGCCGCCATTTCACACA:1	-	chrX	6498914	3'	+	Quasimodo	7336	2	60.96
TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAGGTATTTCCATGAAGGCAAAAACGAAGTCCAAAAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAACCGTTGGATGCAAAATCAATAGGTAATGCTCTTGAAGAT:1	-	chr3R	4569145	3'	+	1360	3371	1	68.28
TTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAAC:1	+	chrX	17963956	3'	-	jockey	4820	1	58.90
AACAACAACAACGAAAAAAAAAGAAGGAGCGTGGAAATATTGCAACCTCGTCACGGCGTCGACCTGTCGTCGT:1	-	chr3L	4606094	3'	+	gypsy9	460	1	82.19
ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGATAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTC:1	+	chr3R	28075400	3'	+	jockey	4933	1	58.57
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGC:1	-	chr2L	3114457	3'	+	roo	9043	1	62.41
GTGCAAAGCGAATTATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTAGTATTGAAGTGAAGTATTTTTTCCGACTAAGAACATAATTCGCTGGCCGCCCCTTATCGATATGCACCATTGTGG:1	-	chrX	20481469	3'	+	gypsy4	387	1	72.60
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATC:1	+	chr2L	16016392	3'	-	412	7121	2	73.44
CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACGTTGTCCAAAGATAACGAAACAACGATACATTACAATACATAT:1	-	chr3L	22863393	3'	-	412	7128	2	68.97
GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTC:1	+	chr3L	20168425	3'	-	mdg3	82	2	74.82
GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTC:1	+	chr2L	11518458	3'	-	412	7131	2	76.12
AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTT:1	+	chr2R	16785404	3'	-	412	7124	2	72.39
AAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGTAAGAATTGCAGGTGCGCGTGTGAACTGTTTTGCAACTGCAGTTCAATGCTCTGATATTGTTTATTTTGTTATATTTTGGTTTATATTATGTTG:1	-	chr2R	3545501	3'	-	F-element	133	1	77.34
GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTCCCTT:1	+	chr3L	21855558	3'	-	blood	31	2	62.32
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTT:1	+	chr3R	20469672	3'	+	roo	8996	2	69.18
AGAAACCACTTGGTCTGATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTT:1	+	chr3L	14944608	3'	+	G5	4747	1	78.42
TTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTGCAGCACTTTCTATTTTTTGTTCTCGGTTGCCTTTTGCGGTCATTATAATCTTGCAATAAAAAAGCTTTGCATGTCATCAGGAATTTAATTTAACTTTCCACGTTTAT:1	-	chr3R	25848569	3'	-	R2-element	3585	6	51.94
ACTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGA:1	-	chr2R	7586149	3'	-	I-element	5092	1	61.07
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAG:1	+	chr3L	11531021	3'	+	roo	9053	2	71.92
ACAGTGTCTTAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACCCAAGACACTAGAATTATTCTAGT:1	-	chr3R	4604452	3'	+	gypsy	391	2	73.03
CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCAAGGATCAGGACGAGTATGGGTTGCGAGAACAGCAGGATGGGGGGCCAG:1	+	chr2R	13710716	3'	+	roo	9059	1	74.81
GGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTTGATGTTATGACACAGACACTCTTTTAACTGAAATTGGCTTAAA:1	-	chr3R	27007375	3'	-	roo	334	2	68.12
GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCCGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGGACTTTCC:1	-	chr3R	14049312	3'	-	transib2	42	1	55.48
CACGAAACACAGGGCACACGTTAGTATTCTCTGTTAAAATACACATTTGGGCATCATATCATAAATGATGAAATTAAATGAAAAAAATTTTCTGTGCGGTGTCACACACATTTGCAAG:1	+	chrX	22992393	3'	-	transib2	387	1	65.25
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCGTAGTGAAGGCCCACAAATGAACCATTAAACAGCAACA:1	+	chr2L	7898429	3'	+	roo	388	2	69.66
ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTG:1	-	chr2L	15833471	3'	-	jockey	84	1	72.59
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGCTTAAAGCATTCGGTCTAGTTTA:1	+	chr3L	20831391	3'	-	roo	8709	2	55.94
GTTCGACTGGGGCAGTCAAAGGATAGTGGATAGCGGGGGAAGAGTGATCAGTTAGTTGACGCCAAGGCTCTATGCTCGAACAGGAACGCGGGCAAAAAGCTG:1	+	chr2R	13422476	3'	+	Gypsy12A_LTR	427	1	70.59
AGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAGTAACGGGTTTCGAGTCTGTATAGAATATACAGTATAGCAGATGGTAACTAATTACCAATCAATTGTTCCAGTTAATACACAACATAAAGAAATAGGTTTTT:1	-	chr2R	9501846	3'	+	G5	4701	1	60.96
AAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTA:1	-	chr3R	21706007	3'	-	297	53	2	73.64
CTCGTGTAGGGGAGCGGCCTAGCAACAGCCGCGGTGCATGGTAAATCGAAGTGACAGTAAACCATGGATGTCGATTGCGCTTGCAAAACTTATGGATGTACCCAAACGTAC:1	+	chr2R	4054682	3'	+	gypsy8	4679	2	55.86
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGCA:1	-	chrX	13504139	3'	-	412	38	2	55.64
AAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCGAAGTTTAATCCTAAATTTTTTAATTATTTTCTTTCAGTGTGCTACCCTTTAGCATTTTAGGCACAGCTGGAGC:1	-	chr2R	6669142	3'	-	S-element	1541	1	70.55
CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATCTTTATCATAAAGTACCCTTGTGCCATTTACTTGAATATATTACGAAAATAATTGCCTACTTTTGGGAGCAACCTATAAATGTAGGGAACCTATCGATA:1	-	chr3R	9456585	3'	-	jockey	4691	1	68.28
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCA:1	-	chr2R	13710601	3'	-	roo	8702	2	65.00
TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTACAATTTAAAATAGTTAAAAATAGCAGACAATGTCACGTCGA:1	+	chr2R	8585592	3'	-	roo	8	2	59.59
ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTGGACTCTTTG:1	-	chr3R	10182088	3'	+	blood	7373	2	70.08
AAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAGAGACACTGATAGGAAAAGCGTTACATTTCCACCCTCATAATGTCGTCTAATACCCTTTTAATTGGCATCAAATTTCTCAGGATCT:1	+	chr3R	9122753	3'	+	Doc	4630	1	63.64
GTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCCTCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCC:1	+	chrX	21994003	3'	-	McClintock	5991	2	52.99
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATCTCTGCGAA:1	+	chr3L	9998173	3'	-	roo	8702	2	64.95
GTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTG:2	+	chr3R	1446146	3'	+	1360	3385	2	28.57
ATATTATTATTATTATTATTATTATGTGCGGTTATCGTTCGACGATAAGATTCGGTTCAAAAGCATGGTGGGAAAGGAGAATGTTAATATATGTGTGTGCACCGCTCACATGC:1	+	chrX	18507119	3'	-	mdg1	32	3	53.98
AGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTTGGTTCATTAATGGGACCTCTTCGATTCTGATTTTGATTCTGAT:1	+	chr3L	4754409	3'	-	mdg3	5262	1	78.77
CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGCCGTATAAAAAAAATGGCGCCCAACGTGGGGCAAAGCTGAGGCTGCTGTTTTCTATATGAAGGTATGGG:1	-	chr3L	13574419	3'	+	hobo	2927	1	71.96
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGTTGCACGGATAAAGA:1	-	chr2R	19004092	3'	+	roo	9050	2	71.92
GCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGTGAAGACATGCGGCTAATGAGATTTCCTTGCGTCATTGCCCCATTCATGCGTTTCGATTG:1	-	chr3R	29689445	3'	-	micropia	429	2	50.82
GGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCAACTCCAGCGTTCTCTCTTAGAAAATGGGCCTTTTGCTAAGATATTAAGCATACG:1	-	chrX	848812	3'	+	INE-1	555	1	88.75
AGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTTTTAGGCAAACTTGATTTAATCGCAAATCGGAATAACGATGGAG:1	-	chr3R	21276491	3'	-	BS	5012	1	69.93
ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATATATGGCATTCAGTTTGCTAATCGTTGCCGCAGGATAATGCAACTGGATCCCGAAAGCATCGCCG:1	+	chr3R	9922082	3'	+	blood	347	2	57.02
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCGTGTGAATCGATTTCTAGTGTTTTTTTAATGAATATTCCTGAATGGGGTACGAACAATGATCT:1	-	chr3L	11441726	3'	-	roo	53	2	61.43
AATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCGTTGGCCTGACTCACTGAAATGTAGTTTT:1	-	chr2R	4262581	3'	-	1360	78	1	72.64
AACATTGTAAATAAACATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAGCAGTCGTACCACAAGCATTTGCTCTAC:1	-	chr3R	4778631	3'	+	I-element	5272	1	76.30
TATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGTTG:1	-	chr3L	2325689	3'	-	I-element	5118	1	54.11
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCTACTGC:1	-	chr2L	3114515	3'	+	roo	359	2	77.89
GGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGTAACACAGCTACCAAATGGCCGATATGGTCGTCTTGTATATCACCAATTTAAGTTTATTTCTTTTTTGATCATATCTA:1	+	chr3L	27390381	3'	-	1360	43	1	81.51
AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTACTTTAGTTAAAAT:1	+	chr3L	17205294	3'	-	hobo	18	1	62.86
AAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTTGGCTTGCATTTTTTTTTGTTTTGGGTTTCGGTTGCATTTACAAGCCGAGAGTTTTCAGTATCCCGTGGCTA:1	+	chr3L	6984813	3'	-	pogo	1784	1	61.60
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAATCCGGGTACTTATT:1	-	chrX	10639979	3'	+	roo	399	1	72.87
CTGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTCCAA:1	-	chrX	22601931	3'	-	INE-1	136	1	74.31
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTT:1	-	chr3R	31817449	3'	-	roo	8711	2	58.06
AATTGTTATTTCTTTGATTATTACCATTACCATTTTAATATTGTAGATTTTGTTTGCAAAATACAAATATATGCAGAAGGGAATTATAAATATATTCATTTGCTATTATCTATGAAATAAATAGTATTTAATA:1	+	chr3R	14526550	3'	-	jockey	4825	1	50.38
AAAGATTTAAAAATGAAAAGTGCTTTTACCTATTTACAAAGATTTTAAATAGATTACTGAGAAGGTAAGAACCGTTCACAATTACCTACGGCTTACAATTTTAAACACATTCACTAAAAATTTAATACTTCACAATTGATAATAAT:1	-	chr2L	9982575	3'	+	Dm88	4239	1	59.59
AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACACTTTTCAT:1	+	chr3L	27415323	3'	-	transib2	53	1	53.42
TTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAATAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCTTGGCATCGGTA:1	+	chrX	6522054	3'	-	F-element	84	1	62.33
TGACGGTTTAATTGAAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTGTAATTGATAAATTCCCTTTGAAAGAGTCGCTTGGATTCTTACTAAAGTATTATCCTTATGCTAGGCAAATATAAATATATATTTTTAATCAT:1	-	chr3L	527651	3'	-	Copia1_DM	95	1	56.85
GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTCTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAACACTTTAT:1	-	chr2R	21229007	3'	-	jockey	66	1	63.87
TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCCGTTG:1	+	chr3L	10648025	3'	-	412	32	2	51.37
GCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATACACCTGAAGGTTAAATGGTTATATACATCTATTATTTGTTTTCTT:1	-	chrX	22897605	3'	-	Bari1	71	1	67.86
TTTAAAAATAAAATTAGATTCATTAAACTACTAAATATTTGTGTCTGCTGGAAATGGAATGGAAACGGGGTCCACGCTATGTACCCGATAAGATA:1	-	chr3L	1789574	3'	+	NOF	3956	1	58.95
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACCGAACT:1	+	chr2R	19004229	3'	-	roo	8716	2	60.45
TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGATGGGTATGTTTGTGAGAGTGTGCGCTGACTGGTTGGCATTTATCACACAGCCAGGACCGGCAG:1	-	chr3R	12854871	3'	+	Quasimodo	6984	2	70.65
AGCAGCAGCCGCAGCAACCACATCAGCAACAACAGCAGCAACCACATCAGCAACAACAACAGCAACAACAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAACAGATGCAGCAGCAAC:1	+	chr3R	17985600	3'	+	Max-element	8503	2	73.64
TTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCA:1	+	chr2L	2122464	3'	-	Stalker	84	4	74.66
AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAA:1	-	chrX	21564644	3'	+	diver	174	2	53.42
GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGG:1	-	chr3L	12861712	3'	+	pogo	2048	1	64.66
GTGATTATGATAAGACAAGATAATAAATGAGAGTGGGTTTTCCAAAGAGGATATAGCGCATTCAGAGCTTCGGCCTATAAGAACCCTTGCAATTTCCTTCTTGTTTTGTAATGTAGAGTAGCAAGTGCTGCACAAACAC:1	-	chrX	20539296	3'	+	Stalker3T	197	1	66.19
TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATGGGTTTCTTCCCGTCTTTCCTGATTCGATTGCAGTTTCATTATGGTAG:1	+	chr3L	12861865	3'	-	pogo	7	1	73.97
GCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCGCTGGGCACCCGCATCTTTGTGTAAAAGTCAATTTGCTGTCGCCGCC:1	-	chr3R	12776210	3'	-	S-element	71	1	66.44
CGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATTATTTTTCGTAATATTGTTTATTTTATCCAAAGTCTACACATCTC:1	-	chr2L	20840108	3'	+	INE-1	128	1	78.47
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGG:1	+	chr3R	22844275	3'	+	roo	9020	2	61.72
AAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTATATCCTAATGGGTATTTCCAAGTCCGTACAACTTTGTCTCATCCAGTTAGTCCCAACTTG:1	-	chr2R	20194188	3'	+	Max-element	8496	2	54.07
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAATAAAAAACGTTAGCCAGCGACGCTGGGATGGGCAAACGACCATCCTTAAA:1	-	chr2R	6034686	3'	+	pogo	2046	1	64.44
CTTCGTGCCTCTAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCGTTGTTTTACTTCATTTTTGGAACTTCCAGGGTTACTGGTGGAGAACTCTTTGATCGCATTGTCGAAAAGGGGTCCTACACAGAAAAGGAC:1	+	chr4	450410	3'	+	1360	481	1	63.19
AAGGTCATAAATTTACACTTGGAGCCATTAATGTTTAGTTTATTTGTAGTACCAAATACCATGACTGGCGTTGTGGAAGCCATGGAGAAATAGTATGTTTTTAACTCCCGAATATATATATAGTATATAGTGACGTAATTAAATA:1	-	chr4	1183654	3'	-	Q-element	669	2	69.66
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGCTTTATTC:1	+	chr3R	14979916	3'	-	pogo	19	1	69.70
GTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGACATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGT:1	+	chr2L	12290765	3'	+	1731	4579	2	52.99
ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAA:1	-	chr3L	7292455	3'	-	HMS-Beagle2	55	2	58.22
AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCC:1	+	chr2L	20840494	3'	-	Transpac	51	2	64.96
AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAG:1	-	chr3L	7943622	3'	-	Burdock	75	2	73.29
CTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCAAATACCCGCCCCTTTTTCTGTTTTACCTT:1	-	chr3R	10273910	3'	+	HMS-Beagle	224	2	68.61
AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCACGTGAGTGCGTCTCGCTCGCACCCATGGGGAGTTGGGGCCAGCAGCTGG:1	+	chr2R	11629838	3'	+	Tirant	390	2	60.00
AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAAGTCACGCCC:1	+	chr3R	20005112	3'	-	297	6626	2	57.60
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCC:1	+	chr2R	2016889	3'	+	1360	3363	1	57.32
CAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTAATAAGAATTGAGAACATGACAGAAGTTCTTAAAGAAAATTATAATGTTTATAAGGAATCAATAAAATT:1	+	chr3R	19448804	3'	+	roo	8701	2	49.63
TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCATGCGGA:1	+	chr2L	7888215	3'	-	pogo	24	1	54.13
AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCCCTTCTTGCCCCAAGTCTCAGCCCTTCAACATGT:1	-	chr2R	5248193	3'	-	1360	24	1	66.44
ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAACACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATT:1	-	chr3L	17558010	3'	+	jockey	4941	1	58.82
TGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATGTTTTGCCATTGAAAAAATAGTTGGTAAAAACCAATGTAAGAATTATCATA:1	+	chr2L	5845130	3'	-	transib2	10	1	78.08
GCCAAATCATTTTCATGTTTTTTGACAGCTTTAAAGAATAATTTCTCTATAGGAGAGAAGTCTGCAACATTAGTGCTGGCCTCTGCCGGATCTTCTCTGTTTGTGTTTGTCCAGTTATCCTC:1	-	chr3L	8231574	3'	+	Transib5	2702	1	56.56
AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTT:1	-	chr2L	13585824	3'	-	Tabor	53	2	53.85
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTAGCTGTGCCAAAAACAAACTTGGCTCTTTAATATGATATGTTAACCCATCCAATTACATATAT:1	-	chr3L	19334208	3'	+	roo	9045	1	67.12
CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACC:1	-	chr3R	30344611	3'	+	pogo	2088	1	64.00
TAGGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTAAATTCCAATATCTTTCTCACACTTCCACTATATAAGTAGGAAGTACTTGATAGTCGAGTTATATTTTTGGAAGGCTTAACTTTGCTTTGGACAGCAGCGATTTCATGTTCTTCACAAAC:1	-	chrX	19228538	3'	+	INE-1	154	1	70.55
CGCTGTATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGATCCAGATAGGTTTCAATATAGAATTGTAAAACCAAAACCAAAACAAAACACAAACGAGCTGCAGATGGAAAGCAACGCA:1	-	chr3L	19663381	3'	-	F-element	4305	1	62.77
AAGCGATGAATCAGTACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGAAATCGAATGAAATGATGAATAATGAATATCTGCTTGGAAAGTGGTT:1	-	chr2L	13053757	3'	-	BS	5070	1	70.55
TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTCAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCGTATAAAAAAGAA:1	+	chr3R	17420529	3'	+	roo	9029	1	50.68
GACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAAGAAATTTATTTAGCTTACCAATTGTAAAAAGTCTTGGCTCCAAAGTTGTGCAGAATG:2	+	chr2R	5198485	3'	-	INE-1	92	1	57.53
TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGACTGTCTAACAAAAT:1	+	chr3R	14981296	3'	-	mdg1	7057	2	70.55
GCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGATAGATTAACAACGGATGTTATCTTAGTTTTATTTGATTATAAAACGTTTTCAGTATGTAACGGT:1	-	chr2R	4134981	3'	-	F-element	4217	1	55.48
AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTTAACCAAAAAT:1	-	chr3L	20831253	3'	+	roo	9036	1	61.38
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTCCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTTCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTTGCCACTGTTTCTGCTGCTTTTGCTGTTTTGTCT:1	-	chr2R	9632047	3'	-	roo	13	2	72.60
GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGC:1	-	chr2R	9791597	3'	-	412	7133	2	74.66
ACTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGGAACTCGACTAGAACTTTCTCTCTTGTTTATTAGTTATAGCCGTTATTTTAGTTTTGTATTCTTGTGCTAAATCTGACTGAAATC:1	-	chrX	21481848	3'	+	INE-1	542	1	91.45
GAGGGGAGGAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACGTCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTTGAACGCGTATGCACGTAGTGTTCACGC:1	-	chr3R	9812350	3'	+	HMS-Beagle2	6875	1	76.56
GATTTGATTTTGTGTTTGAATAGCTGCACAATCACCGCCAGGGCCCCAAGGCAGTGTCCGTTGCCAGGCAAGTGATTTATGCAAGTAGTTTAATGCTCGCTTACATAATAAGTGGAGCTGAAACTG:1	-	chr3R	26519630	3'	+	invader2	390	1	76.98
TTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTATATCACGTATACGACTGGTGTTTGTCTG:1	+	chr3R	11547812	3'	-	G2	277	1	78.99
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTCATTAAAAGGCATTTGT:1	+	chr3L	20831423	3'	-	roo	15	2	73.79
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATCTGAATGT:1	-	chr3L	9998007	3'	+	roo	400	1	45.21
TCATTAAGTAATACATATGTAAATAATACTAACAGCTTATATTCTGTGCTGTATTATTTAAAACAATAAACTAGTACACGAGTAACGTGTATAGCAATAACTACTCCATA:1	-	chr2L	9399503	3'	-	Transpac	4860	1	78.18
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCATGCGGAAATCGATTTTAAATTTA:1	+	chr2L	7888232	3'	-	pogo	33	1	56.30
ACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGCGGTGCACACTTTTTATAGCCAGCAACAGTCACACAA:1	-	chr2L	9564456	3'	-	transib2	16	1	56.18
TCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAAC:1	+	chr3R	20499842	3'	+	mdg3	177	2	62.33
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCAC:1	+	chrX	8543549	3'	+	roo	9047	1	59.66
GTACATAGATTTGGCTCTTTCTAATCTATTTTCATATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCACATGGTGCCAATTGATCAAAAATGAGGGTGAAAGTCATGTGGCTGTCCAGTAACATTTATATTG:1	+	chr4	52108	3'	-	1360	339	1	70.71
TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGGTAATAAACTAAAAATAAAGTCAATTATTACGCAATTAAGAGCAGTTGACTTTATGCGGTGGCA:1	+	chr3R	28624662	3'	-	roo	51	2	58.99
GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAGGTGAAAACG:1	+	chr3R	14940169	3'	-	jockey	66	1	62.79
CCTAATGATATTATAAAAGAAATTTGACCAATAAAACTGTAAATCACAGGAATCTCTTATCTTAAACTCGCAGGACAAACCACTGCTTCAAAGCACTTATGTATGTCTTTGATCTTTGATGTAACGAG:1	+	chrX	1854656	3'	+	HB	1542	1	67.97
ATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCAC:1	+	chr2R	10582440	3'	-	Juan	3877	1	75.00
AATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATTATTTGAATACGCGACGAGGTCTTGAGGATCGCA:1	-	chrX	13138788	3'	+	jockey	4843	1	76.55
AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCTCTCCTCTGTGAGTAATCAAAGCCACGCCCCAGAAAGTAGGCTTTAATTTATGCTGATGCGGCATCGGAGGAAATCAGAGAACTCATTAGTGTGTGTGCGCGTGTGTGTGAGTG:1	+	chrX	12640063	3'	+	hopper	1413	2	55.56
GTCTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCCAGTGTTTGAGTGTGATGTGCATGTGTGCACTGGCTGTGTAAAATGCTCATAAAT:1	-	chr2R	20439565	3'	-	Quasimodo	35	3	62.65
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCG:1	+	chr3L	16343300	3'	+	roo	406	1	71.79
GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTTATCTATTATTATTATTATTATGTGTACGTGAAGATGAAATCTACAATATATCATTTTGTTTATGATGATTGGTGATTGATGATGCAAATAAACA:1	-	chr3L	17560240	3'	+	pogo	2077	1	69.86
AAATAAAAGAAAAATAAAAACATTAAATGGGTTCACACGATGCTGAAAAAAATAGCGCCAAATTAATGAAAAGCACAAAATGACAAAACGATTAATCACTTCCCTTTACTAGAATTTGCATGCAGACTTCAGACT:1	-	chrX	16867225	3'	+	gypsy7	5008	1	67.41
ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACGTACGAATGTGCCTGTGTGCGTATGCAAAGAATGGAGAGCCTGGATTTATCGCTA:1	-	chr3R	28946311	3'	+	hopper2	1562	1	52.31
CTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTAAAAAAAACAACATGAAAAGCTTTCCAAGCATCTTATTTCAAAGATAAGATACGACTCTTACACACATGCCAAGAAAATCAGGA:1	+	chr2L	17765195	3'	+	Juan	18	1	61.60
AGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGTTGGTTGGTAGTGGGGTTGGAAGTCACATCTTGATCTCTGGTGTCGGGGGAAATGGAGGGAGAG:1	-	chr2L	539351	3'	-	412	192	2	64.86
TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGATCTGAAATCGTTTC:1	-	chr2L	20840392	3'	+	Transpac	279	2	61.48
ATGAAAGCGGCTTTAAAGGGAGATGGATGGTGGGCGAAGGGGGGAGATTCTACAAGACAAACCTGGGAAAACAACTCG:1	+	chr2R	10332563	3'	-	transib4	2443	1	51.28
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATACATATACCCAAAAAAGATACTTTCCTGGCTAAAAAGTTTACTCA:1	-	chr3R	22955965	3'	+	roo	8995	2	69.18
GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGATTTTTATGGATCTTGTGTATTAAACAAGACTGTGTGT:1	-	chrX	17756524	3'	-	297	6590	2	76.03
AGCTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGAGCACATACCACGTGGCTGCATTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAGAACTTAAAAAAAAGATCGCAAAAGAAGTCTCCTTTTCGTTTTCGAACCAGCGATCAAAAAC:1	-	chrX	4349471	3'	-	hopper	1261	1	72.54
AAAAAAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGT:1	+	chr2R	9091902	3'	-	1360	3087	1	47.26
TGTATTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAGCGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCGATTTTGGGAGA:1	+	chr2L	17551111	3'	-	Transib-N1_DM	217	1	45.21
CAGACAAGAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGGCCCCCACTCTCGTTATGAAATCCCAACCCAATACCA:1	+	chr2R	17472318	3'	-	Circe	7247	2	71.54
AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAAGATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGG:1	-	chr3L	19036001	3'	+	Tirant	355	2	62.96
TTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATGTTTTATAACTCCTTCGGCGATCTCGCTGCTTTTCCTGCAACGCCTTGCCTCCGTGATCCTGATTGATCCTGATTAGGATGT:1	+	chr2R	4294646	3'	-	McClintock	5973	2	68.94
GAGAGAATGCTATAGTGGAGTTCCCCGACTATTGGATACCCGTTACTTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTGTAGGTGAAAGATGGGCGTGGCCACAGTGTTT:1	+	chr4	976479	3'	-	INE-1	575	1	69.90
AAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCACTGCATTGCA:1	+	chr3L	8249112	3'	-	jockey	4550	1	52.13
GAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTGCGGATAAAATGGGTTCCCGTTTCACAGATTTCTCGGTATTCGCTCTTGCCAAAGTTTTTG:1	-	chr2R	13586697	3'	-	412	227	2	53.85
CGGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTTCGTCTGTCCGTATGAATGTCAAGATGTTTGGTAAATAGTTAGCTTTTATTTTTCTTTGCAGCTGTAGTGGACCTTAATGGACGTTTTTTTGGAGGACGTC:1	-	chr2L	23067045	3'	+	INE-1	95	1	57.14
ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACA:1	+	chr3R	22822165	3'	-	mdg1	18	2	54.11
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCC:1	+	chr3L	15600351	3'	+	roo	390	2	53.49
ATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGTTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTCCTCATGAAAATATATTTTTATATGTATATATATAGTTTTTGATTTGTGTGTAGAGCACACAGACTGGCATCCAGATATATAGATACAGATACACGCG:1	+	chrX	8348233	3'	-	BS	4959	1	43.84
AAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTG:1	+	chr3R	11547754	3'	-	G2	362	1	76.03
GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAGGAAAA:1	-	chr3L	6978107	3'	-	pogo	30	1	63.01
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAA:1	+	chr3R	7100913	3'	+	roo	9022	2	50.68
CTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTTTCAGTTACTTTAAGTATTCATAGCTTAATTTTAATTTCTAGGAGAGCTTTTTACAAGTAGGCTGCGAAATTATTTTCGAATCAG:1	-	chr2L	22393117	3'	+	Rt1b	4961	1	58.22
GGCATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCAGAAGTTATTGTCCTGGGGAGGACGCCAACTC:1	-	chr3R	12632394	3'	-	F-element	4430	1	60.00
GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTTGCTCTTCACATTTATTACTTGTTAACTTGAGATCGTTGTTAGATCTAATAACTAGCTGCATCTTGTTAGTTAGTTAGATTCTCTACA:1	+	chr3R	21435002	3'	+	412	7514	2	61.64
AAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAA:1	+	chr3L	18329912	3'	+	Porto1	4554	1	78.83
TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCTACACAAAGTGCGATGCAAATTTGAATCCACGAGATACTTTTGTAGCTTTTCGCTGCAGCAGCAGATCAATTTCCAGCGACAGCTGTCGAATCAA:1	+	chr3L	16761027	3'	+	Tirant	8468	2	71.01
AATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCATTTAGTATTCACAATCCTATA:1	+	chr2R	21298874	3'	-	jockey	237	1	68.75
ATACATAATGATATTATAAAAAATTTGCCCATTAAAACTGTAATAATTAAAAATATCGAATTTTATTAGTACAAAGATATTTTAGTGATTTTTGAAATATTCTTAAAATGTACAAATATTTCATTAACGTAATTTAGGCACTTCCT:1	+	chr4	1077612	3'	+	HB	1539	1	76.03
CTGTATGTGTGCACACGTATGGTCATGCTTTGTAAATTTGACAAAATATCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGTGCCCGTTCCCGTCATCCAGAGACAGCGGAACAATGTTCGAGAATCGGGCGAGGCGAATGCGAGAAGCTGGGA:1	-	chr3L	10841962	3'	+	1360	174	1	48.97
AATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAACCTAAAGTGTCGTAGTTAAGTGGAAAAGAAAACGCGTTTAAATGTTACCTCGTTAGTGGAAAATGATGGCAAGGGAAAG:1	-	chrX	21424276	3'	+	hobo	154	1	63.70
TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACT:1	-	chr2L	5845004	3'	+	transib2	2737	1	78.08
AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATATTAGCTTAAGCTATACGTGTCCATTTGTGAGC:1	-	chr3L	13845063	3'	-	opus	111	3	73.29
TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTAGAGCATTTGATAAGCTAACAAATTGACAAGGCGTCCGCCACTCAACGCAAAACTC:1	-	chr2L	5307085	3'	-	jockey	4715	1	56.45
CGATGCGTAGACGGATGAAGGTCGCGCATTTCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTAATAGACTAGTACCTTCAACCCGCCTGAACCCGACTCACTGTAGAAGCGATGC:1	+	chr3R	17788400	3'	-	Ivk	5036	1	71.21
TATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCACAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGAT:1	+	chr2R	21298832	3'	-	jockey	281	1	56.85
ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAACGTAAAATCTACTAAAATAATTAAATCAATTTCGTTCGTTTTATGTTTCATATGTATTTAGTATTTTCTCTCTCAGTTCACAAGATTTTGTTTCACATTCTTC:1	+	chrX	3309503	3'	+	jockey	4969	1	71.23
ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCAACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAG:1	-	chr3L	15519758	3'	-	pogo	60	1	65.19
GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCATCTGTGACATGCGGTCAAAGACGGACGCAGCATATGGGCCATGGG:1	-	chr3R	16404419	3'	+	pogo	2085	1	74.48
AGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATAGTTTTCCATGTA:1	+	chr3L	3477507	3'	+	mdg1	7417	2	61.86
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAG:1	+	chr3L	20831355	3'	-	roo	84	2	77.40
AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCACAAACTTTGATTGCCCAAGTCCTACCAAGGACTACCCTGAACACCAAGAGCCCCAAGGACCCCGAAGGACTTACGTTCGCGTGCCGACTGATGCAGCTGTGTG:1	-	chr2R	13817581	3'	+	412	476	2	73.10
AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATCGGAGTTCATCATTACACTATACTAGTCACGATTCAAGACAACGTTGATTTTTACCTACTTGGCATAATCATGACAACT:1	+	chr2L	16196560	3'	+	412	7487	2	58.74
GACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGATGCTCTTTATTATGTATG:1	-	chrX	21772487	3'	+	springer	19	2	57.63
TTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTCGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAATGATCGAAGGGCAGTGAGTCGCCACTGCTTCGGTG:1	-	chr2L	3801787	3'	-	HMS-Beagle	6664	1	65.09
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTAT:1	+	chr3L	9998216	3'	-	roo	8704	2	57.75
ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATATGTATATACTTATATATTTTTTTCTTCCCCGTGCTGTTTTCACTTGAGCGCAGCGAGGCATTTATCATTTTTAATCGAATGCGGAAACAATGGAGCGCGTCT:1	+	chr3R	26432113	3'	+	opus	489	2	76.39
TATTATTAATTTGTAATAATTTTATGAAATTTATCCATCCATCTACACACTTTTTATTAAAATTATCCATCCATGTAGCACACCCTATGATTGGGATATTCATCGGTGCACTGTCGCAATAGCTCATTGAAATATGG:1	+	chr3L	11887938	3'	+	Tc1-2	1370	1	62.04
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACAAAAAGTGAGTTGAACTGACTGCAGATAATGCGGATAGGTGAAATAAAACCACAACTATGCTCTGAAATATTTGCACCTTATTTATTATTATATT:1	+	chr2R	21146013	3'	-	pogo	20	1	69.18
AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATTCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTT:1	-	chr2L	21884488	3'	-	pogo	40	1	60.69
TTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATTCGTAAAATTATATAAGTTGTACCACTTTAAAAGCGTTTTATTTTCAGTCAAGTTAGC:1	-	chr3R	25453965	3'	+	Quasimodo	7355	2	78.08
AAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGTGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTT:1	+	chr2L	6570014	3'	-	jockey	4864	1	65.75
GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACA:1	-	chr2R	9662715	3'	+	412	7511	2	55.66
AAAATAAAAGCAAATAAAAATATTTGGCATTTAATGTATTATGTTTTTTAAATATATACCTTTAGTTTTATGTTATGAGCTGAAATACCGATATTAAATTAAAAAAGTCGTTAATACATTTATACTACAAATTGTTTTTTAAGTA:1	-	chrX	20991099	3'	+	HeT-A	326	1	71.03
AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCG:1	-	chrX	13704751	3'	+	invader4	3064	2	61.86
AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGGTTGCTCACACCACATGCAGTTGGCGAATAGAAATATATTCCCCTGCTCTTTGTTGTTATTTAT:1	-	chr3R	12717701	3'	-	297	21	2	67.15
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGA:1	-	chr3L	20654488	3'	-	roo	8730	2	69.63
TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTTATGCTCTGCTCGCCAAGCCAAAAGTGTTGCATACGTCGAGGGGCCAGCCGCAC:1	-	chr3L	17136041	3'	+	hopper	1386	1	54.63
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGTTCCAAA:1	+	chr3L	6978222	3'	+	pogo	2047	1	67.23
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAACCTTTGCTTGGTTATTGAGGTACATTTATCGAA:1	-	chr3R	14651144	3'	-	P-element	9	2	78.77
CGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTTAAGTCACCTTTAAGTCTGACTGTCTTAACGTTATTGTAAGAAAATTCGACTGGTTACT:1	-	chr3L	23064263	3'	-	gypsy	6994	2	45.21
ACACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACAAAATCGATCCCGAAGTTGTATAGTTTCACTAATATTCTTAATGAACTAAGTTA:1	+	chr2L	19211670	3'	+	17.6	286	2	72.60
AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACCGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGAT:1	+	chr3L	9673112	3'	-	Doc	72	1	67.69
AGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTTACTACCTTCGTGAATAAAATCAACAAAACTGAAAG:1	+	chr2L	22150666	3'	+	S-element	1677	1	82.73
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAAACGCTCAGCAGCATA:1	+	chr3L	20834251	3'	-	roo	8726	2	70.00
CAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGCCTCAAGACTTCCCCGTGAGGCCGACGTCCCAGCGTACTTCGATGTTCTCCTGCGTGGCAGACGCCTTCAG:1	+	chrX	11903940	3'	+	X-element	4652	1	49.55
ACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAAC:1	-	chr2L	2909662	3'	+	hopper	1369	1	54.70
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCACCTTTGCTCTTTTTCCCGCCCCATTTGCAACGTAGTCCTGTTAAAACTGAAAATCGAAGGATGAAAAAGTTTCGAGATTCTTGCACTGAAGGCGATGTCAAACTGG:1	-	chr2R	14542086	3'	+	roo	394	1	71.23
ACATACACACACACGTACACACCTGTAATTTGGCCGAAAAAGCAATTCACAAAACTTAAAATTTCCCACACCAATATTGCCAGCAGGCGAATTATGTTGTAATAAGTCAATTTATCAGCTTATTTTTAGCTTACACATGTAGGCCG:1	-	chr3R	18956387	3'	+	accord	7100	2	69.86
TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTTGAACATTTCCAGCAGGACTCTCTGGGCCTCGGCTCC:1	-	chr3L	2712763	3'	+	P-element	2843	1	38.10
AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTCAAGGAGCCGAGTCGTCGG:1	-	chr2L	14081275	3'	+	1360	3358	1	58.22
GGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCATTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTTTGCCTTT:1	+	chr3R	19265875	3'	-	I-element	89	1	76.71
TGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCATTTCTTCTCCTGAGATTTTCCCCCTTTTTCGGATCTCGGCGG:1	-	chr2L	21008519	3'	-	invader3	8	2	72.90
TAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTTACATAATCAGTACTTTCCGAAGAAATAAGAATTTGCAGAGTGG:1	+	chr3L	25483021	3'	+	accord	7367	2	70.37
ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTC:1	-	chr2R	12835060	3'	-	jockey	74	1	75.21
TAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCG:1	-	chr2L	10023014	3'	-	Doc	73	1	70.97
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAAGAATGAAAAGCCAACGAGAAGGAAAACGGGTAGG:1	-	chr3L	4755236	3'	-	jockey	4709	1	63.64
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCC:1	-	chr3R	17817907	3'	+	roo	335	2	73.33
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCGGATG:1	+	chr2L	18419272	3'	-	412	7082	2	59.72
AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGG:1	-	chr3L	10574303	3'	+	Tabor	7245	2	70.14
ACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTTTAGATAAGTTTGCACGCCTTTTTTCCGCTGTGCCATCCAATGTTTTAATGTCATTACAGTT:1	+	chr2L	23382076	3'	-	Tc1-2	1302	1	74.66
GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTGTATAGTTTGTTAACAAGATTTGCT:1	-	chr2R	7898034	3'	-	roo	26	2	66.44
AGCCATATTAGGTCCAACACTGACCTACGCCCTCCGTGATGAGTGCTTTGAGGCACCGTTGGGATTTCATGCTAATCTTTACTAGATGCGCTTTTTCACAACTGCAAGCAAATGGAAAGGTAAGCGCAATGGTAACGTATGAGAGG:1	+	chr2R	4330576	3'	+	G5A	2409	1	76.03
TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTTTC:1	+	chr3R	22822173	3'	-	mdg1	10	2	59.59
ATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGGGAGAAGCGAAAGCGTCCTGAGTTTTTTGGTTAATTCAAATGACAAATGTGCCTGGGAATCGGGCAAAGAACCAAGACATCTTTGGCAAA:1	+	chr3R	14935409	3'	-	I-element	5117	1	72.50
AAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAAC:1	+	chr2R	5532371	3'	-	G4	3775	1	54.11
GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATT:1	+	chr3L	20033798	3'	-	blood	7052	2	46.53
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCACGAGCCTGA:1	-	chr3R	31817416	3'	-	roo	8687	2	65.41
AAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCGTTCGTCTCACCAAACCTATGATTTGTGTGACTGCCCGACCCAGGAAAAGCAAAGG:1	-	chr2R	5209599	3'	-	gypsy	6992	2	69.41
ATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATC:1	+	chrX	21014868	3'	+	copia	5074	2	53.42
AGTTATTATTATTAATATTTATCATATTATTTCATTATGAATTCTTTGAGTCCCCTGGTGGCCGTGCAGTTCAACTCCCCGCCCAAGGGTCAAATGCTGGACGTGGAGTGCCGTG:1	-	chr2L	6779453	3'	-	gypsy9	299	2	58.26
ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCAC:1	-	chr3R	13360287	3'	-	jockey	31	1	62.18
ATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCT:1	+	chr3R	11547756	3'	-	G2	348	1	72.39
AAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAAAAGAAAAAAAAAATGAATATAAACAATGCATCGACGGCGCAATTAAAAGGATGGTGAAGGTCAAATTTGGGGGCAACAATCTCAGTCTTACGGCTA:1	+	chr3R	14163055	3'	+	invader2	274	1	65.83
TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGCGTTAGAAAATTCTCATAACAGAATCACAGTACTGTAATTTTAACAGAATGTTTTACAAAATTCTTTACACATTCTGCTAATAGCATAATGTTT:1	+	chr2R	13585265	3'	+	412	7489	2	65.75
GTATAATAAATTATTTAAAAAATAAAATCTTATACGAATTTTCTGTTTATTTGTTTAATTGTTTATTGTTTCATGCAATACACCCTGCTTATAAAGTTTATTTATAAAATTTAAGTTATGCGTGCGACAAGTTTCTTACTTTTTGT:1	+	chr3R	28046162	3'	+	jockey2	3401	1	67.81
ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGTTCTGTAGAAATGGCTTAGTTGATACATTAGTTTCCGATAACGGAAAACAATTCACG:1	+	chr3L	23818428	3'	-	copia	4935	2	62.33
TTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACGCAGAGATGGGCTGCTGCGACGTTT:1	-	chr2L	2122342	3'	+	Stalker4	394	1	72.41
CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAGTCATGTAACGTATGTTACATGAGATAGGAAATAATCAGTTTGTTTTTTTTCAATAATATTTCATATTTCAATTACCAATATCATAATG:1	-	chr2L	17295813	3'	-	Doc	41	1	54.11
TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTTTTTGGCAGACAATGGCAATCAGCAATAGCAACTAGAACGGGCAAAGCCAGCAAACGGCAATTGCAAA:1	-	chr3L	10385777	3'	+	Burdock	6383	2	77.40
AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTGATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTAACATTTATTATACAAATTGA:1	+	chr3R	21706109	3'	+	297	367	2	63.57
CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTGCACTCTTTGGCTTGCAGCTCAATAGCATTCCTGCTTT:1	-	chr3R	31856065	3'	-	P-element	30	1	38.62
CAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACAT:1	+	chr2L	20117925	3'	-	invader4	2823	2	77.95
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTTTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCACATTCTCTACAGAATTCTACATTTTCAATGAGTTTGTTACAATGCCTGGACT:1	-	chr3R	7835091	3'	+	roo	9042	1	60.14
ATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCAAATAAATGTAAGCTCTAGGTCATAGAATGATTATGATAATTTTTTTCTACCTTTGGTCGCCTTGCAAATAAAATTACTCCTGACTTTTTTTTGTTGGGCGGCCCCT:1	-	chr2L	22216704	3'	+	INE-1	82	1	35.34
AACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGCTAATAAAGTTTAGCATACATATATATTAATACAACCTATTTGTGC:1	-	chr2R	5617462	3'	+	invader1	376	2	60.27
ATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGTGTTGACAGTCCCAAAGCTGCCTGAACGAAAATCCTTCCAGCAAC:1	-	chr2R	16695962	3'	+	Stalker4	389	1	69.18
CCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTGTTAGCAAGAAATTGGAATTACAAAAGTTATAAAACTTTTAAAAAGATAGAATGGCGACTTTTTCTTCACTTTAT:1	+	chrX	5648804	3'	+	roo	271	2	50.68
GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGCTGTAAGCACTCGGAGAT:1	-	chrX	7195034	3'	+	P-element	2857	1	51.75
GCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGA:1	+	chr3R	7482813	3'	+	412	410	2	80.00
CGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGCGTGAGTAAAAACAAGAGACAACGCAGGCAGAACGAACCGATAAAAAATGAGTACGACAGCAGTTGCAGTAAATTACAGTTTGTTCCATTGGTTTTCATTGAA:1	+	chrX	4140166	3'	-	1360	3284	1	59.59
AAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATAGTGTGTAGGGTACTCGTATTCGGATATATGTAAGGCTTTAGCTTTAGATAGGTATGCATATACTATATACTATATAGGTAAATACATATATCC:1	-	chr2R	24557262	3'	+	P-element	2648	1	74.59
AATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTGCTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTG:1	+	chr2R	9463482	3'	-	rover	75	2	71.03
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTGTATAGTTTGTTAACAAGATTTG:1	-	chr2R	7898036	3'	-	roo	28	2	65.07
GTTCAGTATAGCAACATAGTATATAAACATAATGTCATTGTTCGCTTTCAGGTGCTAAAACACATGGAGTATCGACGCGATAACTGTCGATCGGCATAATCACTATTCTCACGTATTCTCGTTTTGGTTTTGAATTGTCATC:1	-	chr2L	21394006	3'	+	invader2	4893	2	62.68
CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCGAACTGGCGAGAGAC:1	+	chr3L	9998232	3'	-	roo	25	2	67.13
TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCGCTTT:1	+	chr3R	10274053	3'	-	HMS-Beagle	6818	2	63.56
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTAAAGCGCTGGAATATCACCAGCTTTAATCATCTGACTTTATAAGTGGGGCACACGTGTATGCATTCTTC:1	+	chr2R	13696530	3'	-	roo	8680	2	73.57
GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTGCAATTAGACAACCTTCGTTGTCCACTAATATAAATACACAC:1	+	chr2R	19540513	3'	+	jockey	4986	1	74.48
CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACATTTTGAACAGTTGA:1	+	chrY	3648898	3'	-	Transpac	56	2	56.16
CACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATAT:1	-	chrX	12657098	3'	-	blood	72	2	65.75
ATTGGGCAGCGTCGGCCCCCTTCCCGGTGATCATCCCTTTGGGCACTCCGTATC:1	-	chr3R	3906806	3'	-	Osvaldo	1110	1	88.89
TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGATTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAGTGG:1	+	chr3L	22349292	3'	-	jockey	60	1	50.71
CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGC:1	-	chr3R	26431987	3'	-	opus	178	4	75.20
TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCAAAACATATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATTTATATTTATTATATGTATAA:1	-	chr3R	17573762	3'	-	Doc	36	1	57.04
GGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCTAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGAAAGGCCAAAGGTTGACGGTGATAATTGATGGTCAGTGCCAACTG:1	-	chrX	18030228	3'	+	opus	7462	2	57.53
GTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAGGAATATGGAAGGAGACCGCCTGTAGAGGTCAAAGTGA:1	+	chr3R	1433231	3'	+	mdg1	419	2	75.00
GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCAAACAAATTTCCAA:1	-	chr3L	7943605	3'	-	Burdock	57	2	61.38
CGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGAGCAGGATGCATGGAGCACATACATCGCTGAAGCTCACCAGAAGAAATAAATATGG:1	+	chr2L	21008679	3'	+	invader3	5459	2	80.60
AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAA:1	-	chr3R	28758302	3'	+	mdg1	7393	2	63.01
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAA:1	+	chr3R	22122781	3'	-	roo	43	2	61.67
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATT:1	+	chr3L	10648018	3'	-	412	7092	2	47.26
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAAACCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGA:1	-	chr2L	21884491	3'	-	pogo	33	1	61.48
AAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGTCAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATAACCGCAGGCGCTGGCAAAATGGGAATGAAAACGGGAGTGGAAATGGG:1	+	chr2L	8871943	3'	+	invader2	4775	1	63.64
ATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTGCTGTTCTTGCCTCCGGCCTGTGTGTGTTCTTGCCCCGTATAAATAACATTTTTGTCAAGCGCCTCGTATGACAAAG:1	-	chrX	18001059	3'	-	412	7263	2	61.48
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTAGGCTTACCGGTAATAAGCCCAACGACTCGGAAATATGGGCCAGGGCTAGCG:1	-	chr3R	12886899	3'	+	roo	9033	1	55.65
AAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGTAGTCAGCTAGAATA:1	+	chr3R	2533968	3'	+	gypsy8	4902	4	60.00
CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGCATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGATGC:1	-	chr3R	9210597	3'	+	mdg1	386	2	58.90
ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCC:1	-	chr3R	9921995	3'	-	blood	7076	2	73.08
AGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACTGAGATGGAAAAAACAGGACGGAAAATGAAAACCACTTCTGGTGA:1	+	chr2R	15065272	3'	+	412	102	2	64.71
CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAGTGTGCGAGAGGGACCAATGACCGCATTGAGCTATTTATAGCAACAAATAACGACAACAAAAATAACAGAGC:1	-	chr3R	18585532	3'	+	P-element	2877	2	79.26
TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACC:1	+	chr2L	22775580	3'	+	pogo	2059	1	57.36
GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAA:1	-	chr3L	11530904	3'	-	roo	87	2	82.19
TGAACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACACAACTGCGATGACCAAATGCCTTAAATGCTAAATCTATCTGTGCTGCAATATGCTTTTCACACTTAAATACCCTCTAAGTGCATACTTTTTTAACGCACTGTTTGAGTGTGTTCA:1	-	chr3L	10176075	3'	+	looper1	1544	1	56.16
ACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGTGACGATAA:1	-	chr3R	23020770	3'	+	INE-1	576	1	71.23
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTTGAGTTAGTATTTTAAAGTGATCTTTTAAATTTCATGGTTGTTCAAATCGGCGTCAATTTATTTTGTTGAACTTT:1	-	chrX	17526806	3'	-	roo	8696	2	51.37
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCTCTGGTGATTTCCTTTGGGGCTAAACGCTTTTA:1	-	chr3R	22844167	3'	-	roo	39	2	54.29
ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAAC:1	+	chr2R	2427611	3'	-	Doc	71	1	67.12
TAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTCAAAGAAATAGGCAACGAAATGCGTCGGGTGCCGTTAAATTTTAAT:1	-	chr3L	7293228	3'	-	HMS-Beagle2	6875	1	63.77
TTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAATAAGCAGCTGTAACTCTTCCGGAAACGAAGGTTAGCCCAGGAATCAGGGGTCAAGGGAAG:1	+	chr2L	2122532	3'	-	Stalker4	15	4	72.41
GCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACAAACAGCTGTGGTCGCAACGATAGCTCTAACCT:1	+	chr2R	8146151	3'	-	P-element	15	1	66.96
CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTG:1	+	chr2L	7810104	3'	+	P-element	2835	1	33.03
GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAAGAAGACTTGTATAACTTG:1	-	chrX	13066457	3'	+	jockey	4981	1	73.43
ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCACATG:1	-	chr3R	12717748	3'	-	297	51	2	72.50
CAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTTCTACCTTTATCTATATTTCTTTCCCTCTCTCATTTTTAAATATACACCAGAATATAAATATATAGGAAATCATGGCGTAGTCAGAGCGCAGTT:1	+	chrX	18170641	3'	+	blood	7176	2	49.60
TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATAAATTAATATATGCAACCCATTTAAAATTTGTTTCATTTCTTTCTTAGTTTTTGCGAGG:1	+	chr3R	9293293	3'	-	297	6609	2	55.56
TTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTAC:1	-	chr2R	977544	3'	-	F-element	89	1	71.92
CTGCTGACGGGGCGCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACGTGTATGTAGATATAGCACAGCCATGGCCACT:1	-	chr2R	17626861	3'	-	opus	7173	4	74.31
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATA:1	-	chrX	9540023	3'	-	roo	8730	2	69.29
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGA:1	+	chrX	14336486	3'	-	roo	72	2	79.70
TTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATT:1	+	chr3L	24208222	3'	-	Quasimodo	47	2	54.11
GACGTCCATACGGACAGACGGAAATGATTCTAATCAAGAATGTTTATACTTCGAAATCGAAAACGCTTCCTTTTGTTTGTTACATACATAGATATTCAACGAATCTAGTGTGTCACGAGTAACCTGAATTATTAAGGAATTTATGA:1	-	chrX	22784269	3'	-	INE-1	126	1	76.03
AGCTCTGGGGTACTGCCAGCACCTCAAATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAATGTGTGTTCCATAAATATTTTATGATAGTTAAACGTGGCAGACCGATGAACAAAAACTGGTGGTACGAGGACGTCCTG:1	-	chr3R	5444268	3'	+	G4	3445	1	55.80
GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCATGTGTC:1	-	chr2R	9791542	3'	-	412	7078	2	69.18
ACAAGCACTCAACAATCATTTCCTTATTAATTTTTCACACTATGACTTTTTCACTTTCTCAACAGATATTTCCACTTTTAAAGGGTATCTGTGTGACTGAGTTAAAACCACAAAAATTCCCACATTTCACATTTCTTATTCATTTT:1	-	chr3R	14037040	3'	-	1360	452	1	71.92
ACAGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACG:1	+	chrX	17431788	3'	+	hopper2	1525	1	69.86
ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTCTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATC:1	-	chr2L	544772	3'	-	412	7115	2	57.53
GTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTTGCATCGCTTTCACACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACCGCTCTCGTGCGGTAATCTTGTTAGTTAACCTTTGGTCTGTAGCCATATCTATTCCTACATTT:1	+	chrX	7179490	3'	+	Cr1a	231	1	65.97
CTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTTGATAGTTTGTGTTCCTTACGAACCATTCTGCTCTACCTAATTTGGCCAATAAGTCATTAAGCTACTGTCTTACAAATTGTTAATTATTATATTCCTT:1	+	chrX	17262599	3'	-	X-element	4405	1	56.85
AACTGACGGGACATTAGTTCCACTCAATAAACACAAGCATTTCACTATATATATATCTTTATAATTCTCTAAAACTCGTCTATCGTTCATTACGGAATCTGTTCGTTCTGAGGGTGACAGTTACTCAATCAAACTAAGGTC:1	-	chr2R	4788758	3'	+	297	367	2	47.52
TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCTTACAGCGTGACAAACTTTTTCTCTACATG:1	-	chr3L	15600125	3'	-	roo	9	2	62.33
ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCCGGCGCATTACGTTATCATTTATTT:1	+	chr3L	17115509	3'	-	blood	7092	2	77.44
TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTTTTCCCATTTTTTGACTATTAAAGTTATGAGGAAGTCTTTTAAGTTTAACATCAA:1	+	chr2L	12153279	3'	-	roo	8728	2	61.64
TATTCCATTTAAAACAATTTAAACACTTCAATGATTCGAAGCGTGTTTTAAATGCATTGATTGCAATGAAATTCTCACATTATTCTTGTCAAAATGAAAGTAGTACAAACTTAAGAAGATGGTATGACTATTTCTGCAATTGAAGT:1	+	chr3L	17109151	3'	-	HB	1520	1	69.18
AATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTGGCCATGTATTTTTATGTGACGAAATGCCTGATGCTCTACACGAAATTCAGTTATGGCCAACTT:1	-	chr2R	13347962	3'	+	HMS-Beagle	7008	4	48.06
ATTTATACAGTACATTGGACTTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGACGCAGTACACATACAAACCAACTTAATAGTATTGAAAATTGGCAATCCATTTTTATTTTCATAA:1	-	chr2L	22298476	3'	+	baggins	5349	1	75.63
ACTATCAGCTACCCGTTACTGAGCTAAAACAAGCTAGTAGATGGTTCAAACATCCGACTGCAGTTGCAGTAGCAGAATTTGCATACCCGTCGGGCCACTATACC:1	+	chr3L	15173298	3'	-	INE-1	548	1	62.50
TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGA:1	+	chr3R	15364026	3'	+	flea	4978	2	56.92
TTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAATGATGATAAGGTCCGAGTGGCTAAAGTAAAGATGCAGGAAGGATATATCACTAGACCCAT:1	+	chr3R	19448063	3'	+	roo	93	2	58.22
CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCATTTGTATGTATGCACAA:1	+	chr2R	8146120	3'	-	P-element	77	1	31.51
GTTCTTATTTACAATCAAATCGCTATCGCCACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTTTCTTAAGTTCTCCACCGCCTCCAGCACGATCTCCT:1	+	chr2R	17419103	3'	+	gypsy	301	2	64.00
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAA:1	-	chr2R	19004125	3'	+	roo	353	2	54.11
GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACACAGAAAAAATAAGGAAACCAGCCATACGTCAAGAAATTCATTCGGAACCATTGATTGCAGCTAAATCGAATTTAATTTAATTTT:1	-	chr3R	13744461	3'	+	Transpac	292	2	75.71
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCACAAAGAACACTTTTTTCAGATTCGCTCTGTAGGTTAAACCCTTGATCACAAAAGCTATTAACATGTTCCTAA:1	+	chr3L	4536841	3'	-	roo	7	2	76.43
AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGGGCGAGGCTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCA:1	+	chrX	17963966	3'	-	jockey	4784	1	58.33
GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGAAGCGCAATGGGCCAATGGAGGAGCC:1	-	chrX	18193631	3'	-	jockey	17	1	71.07
TTAAAAAAAAAGAACATTCTAATTTGAGTAATTGGTTCTTAGGAATTATAGTTCTGATTTAAAGTCGGTTCTATACCAGGATTTCACTATTCAAAAATGTCAACAAAGTGTATCTGCATAGGATCTAAGTATCTTCT:1	+	chr2L	16664798	3'	+	Circe	474	1	70.07
GTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCATAATCTTTTTACTGAAACAATTAGCTTTAAATTAGTTGCCTTG:1	+	chr2L	22121698	3'	-	gtwin	6914	1	70.55
AAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGTCAGAACTTAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACGTATAGTTAGATCTACAATTAAATGGCATTAAATGCACACCAGGGTCAGGGGATTTTTCATCCG:1	+	chr3L	10143848	3'	-	Cr1a	4251	1	69.18
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTC:1	+	chr3R	18339172	3'	-	roo	8738	2	72.41
CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGAAAACAATTCGCCAAAATTTTAAATCTTTGAATCAATAGACAAAAAAGTAAATCATA:1	+	chr3R	17831878	3'	-	F-element	52	1	55.00
CAAATGATATATTAAAAAAAAATGAACTAGAATTTTGAAATTCTCCCTAAATGGTCTCCATAAAAAGTCTCCGACTTAAGCAAAGACTGAAACCGCT:1	+	chr3R	21386256	3'	+	BS4	728	1	88.66
CAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATTTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTTTTCCACTTTGCCGCCATTTCACACATAT:1	-	chrX	6498911	3'	+	Quasimodo	7339	2	63.01
TAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGGTGATCCCAACCAGTATGTTACACTTTTTAGTAC:1	+	chr3R	17615226	3'	+	mdg1	33	2	70.55
CCCGAACTGCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTGGCGAAAAAAGGGGCGAGAACCCAAGCCAAGGAAATCAGTCATTAATTTGCAATGCAAATGCACCGTGGCGATGTCTCTGTTTCTTTCTTGTCATACCCTTGCAGAGAGTAATGC:1	+	chr2L	1502287	3'	-	mdg3	410	1	77.40
ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTCACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCT:1	+	chr3L	3501015	3'	+	opus	7424	2	71.92
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGCAATCGGGACTGG:1	-	chr3L	16343233	3'	-	roo	8737	2	73.88
TTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTCTCTTTTCTCGTATCTGGTCGTGGCCGCCAGGAAAGAGGAGGAGAACGGGCATCTATCCGATCTTGATTTGGTCTTTCATT:1	+	chrX	5700906	3'	+	hopper	149	111	88.07
GTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAACGTAAGCAGTCGCAATGCGCCCGCGCCATT:1	-	chrX	13923175	3'	+	Stalker2	52	2	79.45
CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGA:1	-	chr2R	13585414	3'	-	412	69	2	65.07
AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTTTAAATGCGAACGAAACAACATAATTGTGCATTTTTTCGAAAGCTAAAATTATTAAAATCCAAAATCAGATGTAACTGAAGATCCCC:1	+	chrX	22701838	3'	-	INE-1	557	1	57.26
AATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAAACTGCCAATTAAAATGTTCAATAGCCGCCGCAATGGATGGCCAAAAACGTAGCATACTTCAGGGGATCTGCCCCTATAATTCCCTGTTCATATTTT:1	+	chr3R	14860260	3'	-	BS	5014	1	69.06
CAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAAACGGGTTAAGATGGTGCGTCAATTATTGAT:1	-	chr2R	18609455	3'	+	opus	7325	2	74.58
TACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTC:1	+	chrX	17431806	3'	+	hopper2	1553	1	55.88
ATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTG:1	-	chr2R	5284538	3'	+	Doc4-element	2596	1	49.65
GGTCGGTCTTTTGTATAAGTGAATTATGAGGAAGGCATAATTACGTTACTATATAAGTTGCAGTACTAAAAGATTAAAACATGGGTTGTTGCATTAAGTAAAACTTACAATTAGTTTTACCTTAGAAAATTTTAATAAAATGCAAA:1	-	chr2R	21870228	3'	-	Tom1	29	1	52.05
TATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGTTAGGTCTTAA:1	+	chr3L	24208255	3'	-	Quasimodo	14	2	72.60
TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAAAAAAAATTAATAATAAAATATGAAAAGTTTAACATTTTTTCTACCTACATACATATCTTCGTAGTTCGATCAAAAAGCAATA:1	-	chr3L	2192933	3'	-	I-element	26	1	59.40
GCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCAACTTGCTTATAATTCCCGACATCGGCTTTTGAATCTGAATTCCGCAAAGTGTTAGTTCTAATTTCACTTTTTATTAGAGATTGGTAGCTTTAGATTTTAATCACAAAG:1	+	chrX	21016907	3'	+	Transpac	5226	2	76.92
CTGTATGCTGAATCTCAACCTAGCTTTTATAGTTCGACGTTCATACGGACAGCCGGACATGTCCAGATCGACTCGGCTATTGATCATGATCAAGCCGGAAACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCAAATCTAGTATGC:1	-	chr3L	21223736	3'	-	INE-1	174	1	80.82
GCACACGCACACACACACATATATACTCACACATGTATGTATGTAGTTGTATTGTACATATTGTAGGCCCTCAATTTAGCAATTCATTATAATGTATCCCTAACACCATTCCCACATTTTTTCTCTGTGGTTCTGTGATGCG:1	-	chr2R	10960363	3'	+	accord	183	2	68.31
TCTAGCTTATGTAGTTCCTGAGATCTCGAAGTTTATACGGGCAGAAAGACAAACGGACATAACCAGATTGACTTGTTTATTTATATCAACATTTTTATTTACATATAAAATACAATATAAACCTTGTTTTTCAAGGCACCAATGAC:1	-	chr3R	24826494	3'	-	INE-1	153	1	55.48
TTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACGATTGTAGTGCTCAGCTAAGAATTTATTACGCTTCAGTTGAGGATTACGATTATTATTATCATTGTAAATAAATAGTC:1	+	chrX	11470148	3'	+	hopper	26	1	50.68
AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCAAAAGGATTATAA:1	-	chrX	13066475	3'	+	jockey	4960	1	59.59
AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGC:1	-	chrX	13504140	3'	-	412	7104	2	51.72
GCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGACCGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGCGTTCATGTGTGAACAGTATGTATGTACAAAATTTTTCAAAATCCAATTTCCCGACTATCCAATAC:1	-	chr4	419971	3'	-	roo	61	2	66.67
TGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCAT:1	+	chr3L	8249091	3'	-	jockey	4586	1	77.98
GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGGACTGAAATCACAAAGGAGCCGCGCAGATTG:1	-	chr3R	28075345	3'	-	jockey	4748	1	74.22
ATATGAACCGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTATACTGGCACATCAAATGCGCAAAGTGCAAACAGTTGCTTTTCC:1	+	chrX	10640100	3'	-	roo	8701	2	57.41
GAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGAACGGCAATTAAAAGGAATGGATGCTGGGCTATGAATTTAATCTATTGTATGGCT:1	-	chr2R	13727850	3'	-	GATE	424	1	71.20
GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAAAGCTTCCAACAGGGAACTATCGGTGCTATCGGGGATC:1	+	chr2R	24561567	3'	+	P-element	2864	1	67.83
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGCTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTGTATAGTTTGTTA:1	-	chr2R	7898046	3'	-	roo	38	2	56.85
GTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAACCATATCCGTATCGTCTTTTCTGAAACTGAGGTCATCCAGCCAGGC:1	-	chr3R	11496507	3'	-	1360	31	1	61.24
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACACAAATA:1	-	chr2R	19004120	3'	+	roo	358	2	51.37
GCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCTTCGTCTCTTCTCATTACACAACTATTATGTTTTCCCCTCATTAAATCTGCAAACCGCAGAA:1	+	chr3L	16222382	3'	-	micropia	5343	2	62.32
AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACCTGAGTTCGAGTCCGTTATTATGGAGACGAGAAGCAGCAGTCCGCCACCTCCATTCCCGAAATCCC:1	+	chr3R	233607	3'	-	F-element	51	1	48.46
TTTTAACTTCAATTTTATTGTTTTTATAATACTAAAACAAGCTTTCGACCATCGCTGCTGTATGCTGGCTACTTTTGCCATTGTGGCTGCCGCCAATGTGGATTGTAATTC:1	-	chr2R	19462427	3'	-	P-element	2635	1	74.77
ACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACACCGTTTCCTGGGCATCTCCAGTCACCATTTTAACACG:1	-	chr3L	22778776	3'	-	mdg1	399	2	68.10
AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATGTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAATACACTAGAATTATTCTAGTGTC:1	+	chr4	158192	3'	-	1360	306	1	68.15
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATACGGACA:1	+	chr2L	6059312	3'	+	roo	9037	1	51.28
CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGAACACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAAAACAATGAGTGCTCCCACTTTGATTGACAGCTAA:1	-	chr3R	25423146	3'	-	3S18	9	2	75.34
TGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTT:1	-	chr3R	9921998	3'	-	blood	83	2	77.93
CTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGAAAATCCAATACCTAGGCTTTCGGTTGCACCTGAAAGCCTTGATGCAACTCAAATAAAAATAAAAAAATACCGAGTTGTGTTTTATTTAAATCGTTTAGTGGTAATATAATTGA:1	-	chrX	23338847	3'	+	GATE	358	1	37.67
ATTTGTTTTATTAATTAAATTGTTAATTGCCAAGAAAACAGAAACGCTGCTAAGAGTATATATAGATTTTTTTCTATCAAATTCATAAAATTATATGGATACAAAGACTTAAATCAATATATGAAACGTAATGAAAGATGAAGATT:1	+	chr3L	11151732	3'	-	TAHRE	53	1	69.86
TGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAGATGGGTTCCAACTAATTGGCAGTTTTATTTGTCTTATCATGACCCAATTCTTTTCGAAGGCGAGGTCGCC:1	-	chr3R	26223680	3'	+	roo	8766	2	54.79
AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTAGAGCGTTATATTTTTTGGTTAGCAGCCTCAAAGTGCAACTTTTCCAACTTTGAATATGCCAAAAACTTCACA:1	+	chr3R	11083991	3'	-	412	30	2	50.00
AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTAATTTAGTTAAAATATTCAAAAAGTTTGCGCAAG:1	+	chr3L	17205314	3'	-	hobo	18	1	70.40
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAG:1	+	chrX	14336508	3'	-	roo	63	2	66.44
GCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGAACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAAAAATGTTGAC:1	-	chr3L	17557985	3'	+	jockey	4967	1	56.30
GCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCAAAGGATTGCAAATTGCTTAT:1	+	chr3R	11547785	3'	-	G2	293	1	62.04
GTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGTTATTTCATAACTTGCACATATTCTTCATAAAATAAGTAGAATTTGTAATGT:1	+	chr3L	9306457	3'	-	Doc	255	1	64.38
ACTCGACTATAGCATTCTCTTTTGTTTTATTTATAACCGGATATTTAGCACTAGTAAAGGCCCTTGAACTGTTATATTTCTTTTCTGGAAATGTTAATAAATTGTCCATCATTAAAAGTTTTAGGCACTTTAAA:1	-	chr3R	9124579	3'	+	INE-1	576	1	72.39
TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGC:1	-	chr2R	9791597	3'	-	412	77	2	74.13
AATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAACTTCTAGCGCAAGACAGAGGGACCAATAAGCTCTGCCGATTG:1	-	chr3R	11821186	3'	+	Doc	4626	1	61.47
ACGTCCAGACCTCAGGAACTATAAAAGTTAGAAAGTTGTCGCATTATGGCAACTCAATTAGTCGGAATGTTTTTTTAATCAGCTAAAGG:1	+	chr3R	4844035	3'	+	INE-1	143	1	57.30
CTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGT:1	-	chrX	10521658	3'	-	Tabor	6927	2	76.39
AAAAGAAAAAAATATTTCAACAATTTTATCTGATCTCGAAGAAATAAGTAAAGATAGTTGCATTGGAGTCTGCTTTTTCGAATAGTGGCTTTTCCTGGCACAACCGCCCACGCTGCCTTTTCCAGTGCGGTGCATTATTAAGCGCC:1	-	chr2L	4439781	3'	-	Tc1	1391	1	45.89
CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGA:1	+	chr2R	7586216	3'	+	I-element	5302	1	54.79
AAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTCGCTAAGTGCAGGCTGCAATCAATGCCGTA:1	+	chr3R	13822550	3'	+	hopper2	1533	1	73.48
ATGATAAGTCAGCGTAATTTGAGTCTGTATATGCCTTACTAGAGGAGGGATAATACTTGTTATCATTGTTTATTATCAACTTAAATAAATAACAATTAATGCAATGCATCGAAATAAATTAACATAAATCACACTGAAAGTTTAAT:1	-	chr2L	16195144	3'	+	Transib5	2515	1	65.07
AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCATTAAGTCAGGCCACCTATTTTTTTTATTTTCTTCTTGGACTTCTTCCAGAAGCTTTTACCTCGTCCAAGTGAAATGAGTGAT:1	-	chrX	10253144	3'	+	hopper	1410	2	78.36
ATTTGGGAGATACATTTATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTATTTTTGCCACGTGTTCAGAAATAGGAACACGCATAATAGCAAATAAACTTAACTTGGCCAGATGACTGACT:1	+	chr2R	23131715	3'	-	accord2	108	1	45.52
ATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAATTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGA:1	-	chr3L	19035974	3'	+	Tirant	378	2	58.93
GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGACGATCGAATTGGAAACCAATTCGCCAAAATTTTAAATCTTTGAATCA:1	+	chr3R	17831856	3'	-	F-element	80	1	73.81
CAACTTAAAACGGACTTGTGCTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATG:1	-	chr2L	11518404	3'	+	412	470	2	50.00
TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGATTGTGGAATGCCGAATGAAGTACCAAATATGATCAATGGTAAGAAAACATTGTAAAAAATTTGTATATTTCTTTAATATATGATGAAAA:1	-	chr3R	11105939	3'	-	Doc	55	1	52.74
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGAGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGC:1	-	chr3L	22437847	3'	+	roo	400	1	70.09
CGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGA:1	-	chr3R	21276543	3'	-	BS	5067	1	64.38
ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATTATCTTACTTATATTACATTAATATATATATCTGTGTCAAGGCACGATTGTGCTTGAGATCATCAGCG:1	+	chr2L	22209333	3'	+	flea	209	2	58.22
TAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTG:1	+	chr3L	12308377	3'	+	hopper	1363	1	74.75
TATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTACGCTCGTTTGTGTTTTGTGGGTTGGACATGCATTTCCGGTTTTAATGATTATAACACAATCAAGTGCAT:1	+	chr2L	5656694	3'	-	Doc	4669	1	52.74
GTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGAATTTCTGAGTATGTGAATTTAAAATTAAACGATTCAGATTGCAAAGCGTTGAAATTTTTGTTTACGTTATGTA:1	-	chr2L	22778407	3'	-	pogo	1713	1	56.06
TTATGTAAAAGAAAAAAAAAACCAAAGACATCGTTATATATTTCAAGCGCATATTCAAGTCTTAACCAAACAAAGATGTTTTTAATTGTTAAGCAATAATGCTCGAAAATTAAGGCAAGTACCTTGGAACATTCTTTTCA:1	+	chr3L	13192167	3'	+	transib2	2635	1	57.86
CCAGGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGTGTCGTTGCGGTCAAAATAATAATTTCGTAATATTTTCATGATGCTTTCAGATATTCATTTAATTTTTTTCACTTAAGTAACTTAATATGACCTCTTATAGTATGTAAAGGCATGCT:1	+	chr3L	23702310	3'	-	G4	8	1	76.03
CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCACAGATTTCCTTGTATACTGATTC:1	+	chr3L	16973517	3'	+	S-element	1708	2	75.34
GACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTT:1	+	chr2R	23332595	3'	+	invader4	264	2	80.34
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCGAACTGGCGAGAGACCC:1	+	chr3L	9998234	3'	-	roo	16	2	72.06
GATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAACATACCCCCTTGAGCGACAATCTACAATAAAATTATACAAAATTAATCTCAATTTAAGCATTTT:1	+	chr2R	4896818	3'	+	412	7487	2	56.16
CAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTAACACTGGATTTTTAGTCGATCGGCAGAGAGCGTGATGC:1	+	chr3L	16868300	3'	-	FB	83	1	73.97
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATCCTATTATAGAGATATAAAACTTATTGAGCCCTAAACACAGAGGAAACACAGAT:1	-	chr2R	6172942	3'	-	pogo	19	1	72.60
ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACA:1	+	chr3R	7482838	3'	+	412	448	2	59.09
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTGCTTGGATAAAGAAAACAATAACAAAAGGCCACACAATCCG:1	+	chrX	16717968	3'	-	roo	8694	2	64.58
TTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAA:1	-	chrX	13704749	3'	+	invader4	279	2	54.11
GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATAT:1	+	chr3L	23456278	3'	+	1360	3336	1	56.16
GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTCGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACT:1	-	chr2L	14081315	3'	-	1360	48	1	59.35
GTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATTTAATATATATATATAACTATATTAAATATATATATATATAACTATACATATATAACTGACTTAAATAGCAAGTGCTCTTGTTGGTCA:1	+	chr2L	21963573	3'	-	Quasimodo	27	2	56.16
CTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATTTTCTCGAATGAA:1	+	chr2R	5173263	3'	+	Stalker4	391	1	71.23
AAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGTAGAT:1	+	chr2R	9091906	3'	-	1360	3083	1	45.21
GCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAG:1	+	chrX	21667940	3'	-	gypsy2	50	2	67.69
CAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGAGTGGGAAATGAATCTTGCTGAAAACTTAAACAACGGATGTCAAGGAATTGTTAAAACTCGGTGTGTAAAAGAACCAAAAATCCTGGTCAAATCTTAAGCCCCCCTCAGG:1	+	chr2L	23033508	3'	-	G6	1753	1	72.34
GAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATT:1	-	chrX	13704753	3'	+	invader4	3034	2	56.85
ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTCTNTATTTATTTCAATATATTCCATGTATAATTTATGAATTTCATATTTTTTTATTATTAAATTTTAGTGC:1	+	chr2L	20808433	3'	+	HMS-Beagle	200	2	53.10
TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACG:1	+	chr2L	15181441	3'	-	jockey	4826	1	65.93
CTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTGTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATAATTGTCACTTTGCGAACATGTTTTCAACATTTGGGCCAGGCCGTTTCAGCACTGCATTCCAGGG:1	-	chr2L	4096308	3'	+	Cr1a	4253	1	54.11
AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATGTCGAATAGGTCGTTTAACCAGAAATTA:1	+	chrX	11296519	3'	-	BS	5013	1	71.23
GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGC:1	-	chr3R	19589930	3'	-	BS	5066	1	67.63
TATGTATGTATGTATGTGTGTACTTGCGCATTCACATATGTACGGCCATAGAGCTCAATTCATCAGCGGAATCTTTTCAGAAAATGTGGGCACGGTAATCTAACTTTTTAATGGTTAAAGAAAAAAGATTTAAACGGTTGTAATC:1	+	chr4	1062949	3'	-	Quasimodo	38	2	77.93
TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTATCAAATAAACGTGGCTCAACG:1	-	chr2L	16067054	3'	+	297	6942	2	56.43
AATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTACATTACGTCCTTAAAGGTTTAAAATAAATCATAAGACCCGCCAGTTACTGTAATATGATATAAGA:1	+	chr3R	13237395	3'	+	3S18	6050	2	56.85
TACAACCAAAGACACTAGAATAATTCTATTCTATTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACTTACCAACTTACAAGTTACGGTTGGTGCCACCGCAGCTCTGCCGAAAAAAAGTTTCCCATGGTTGCTCGGCTGGATCATCACAGCTCTA:1	+	chr3R	23893718	3'	-	Tc3	316	1	56.16
AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAGCACTTATTTTAACACACGTAGAGTACATGATATGTATTTTCCCCAAATTTG:1	-	chr2L	6863282	3'	+	pogo	2036	1	68.97
CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAG:1	-	chr3R	7482737	3'	-	412	63	2	58.90
AGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTGATATAACAAAGGCCACTTGCTGAATTCA:1	+	chr2R	18609422	3'	-	opus	176	4	81.74
GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGAGACCACCTTTGGCGACCACA:1	-	chr2R	2016819	3'	-	1360	43	1	53.12
GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGGATGGCGTTACGCATCTTGGTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTTTCGTCCACGG:1	-	chr2R	2016862	3'	-	1360	43	1	75.29
GATTAGAAATAGCCAAAACTATGTACATATTATCACAAAATTAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTGAAAATGTACATTTGCTTAACCCGCCCAACGACCTCCG:1	+	chrX	6452045	3'	+	1360	335	1	67.74
CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTTTATCA:1	-	chr2L	3164965	3'	+	412	7461	2	73.97
AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTTTAGTGAAATCTTAGTATTGTAAGATACACATTTTTCTACAAGTTTTGAAATATGAGTGGGTTTACATATCTATACGTGTGCATATAGATTTAATTAATTTTAAAGAT:1	+	chr2R	6902415	3'	+	mdg1	7066	10	74.66
AAACGAAATTTTTTTTTTTAATAAATTACTAAAAATTAACTATACAAAAAATTAACTTTCAATATCAACATTTAACATGTTTATGAACCTTTTTGTGCCTACGTTTTTTTCTTTGCAATCATCTAATGTGCCAGGTGTCGCTTAAA:1	+	chrX	15921768	3'	-	jockey2	3383	1	84.93
TTTTAATTAAAGATGTTGAAGGTTTTCAATTCGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAA:1	+	chr2L	17599965	3'	+	invader2	4633	1	74.66
TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATTTACAC:1	+	chr3L	20033803	3'	-	blood	7037	2	53.73
ATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAATAGTTTATCCACTAAA:1	+	chr2R	20194320	3'	-	Max-element	8265	2	60.74
TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGGTTTTGCATTTACATTCTAAT:1	+	chr2L	17079855	3'	-	jockey	4722	1	53.42
ATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAATATATTTATGTAATTGTAGCTCTAAACTTGAAAATACAAGTAAGCTACTCAACATTCCCACAACGTTACTA:1	+	chr3R	7355625	3'	+	accord	7200	2	54.11
ATTATGTTCGTATATACTACAAAACCCAAATAAATATAAAATTCAAAGAATAATACAAACTTTAAATAAATGGCAAATTTTCGTTGAAATTTATTAGACATAAATTTAATTGTTCTTTAAGTATAAGATGAGCAAATTTTTTCTCA:1	+	chr3R	28771409	3'	-	mdg1	7038	1	58.22
ATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATAATTATCCTGCGGGAAAGGGGAGTTGAGTCCACACATTTG:1	-	chr3L	20888685	3'	-	Tc3	236	1	79.79
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAAATGCCTAATTAAATTTGTAAGATTTTAC:1	+	chr2R	18336288	3'	+	roo	391	2	74.48
GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGAAGTCCTTCGGAGAAGACA:1	+	chr2R	2016913	3'	+	1360	3354	1	51.30
GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAAAACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAAATTTTCGTAATCTATGAAAAGTGAACTTATTTTATT:1	-	chr2R	9258359	3'	-	3S18	5777	2	74.48
TTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTCGTAAGGTATGCCTTTTGACTCCTTATTGTCGCCTTTCTGCAACAAATCGGATTAAATTTATTGCGACAGGTGGAGGCAAATC:1	+	chr2R	16934052	3'	-	jockey	309	1	49.32
ATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTAACCATTTTAGCTCACCTTT:1	-	chrX	21016735	3'	-	Transpac	4918	1	75.51
CTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGACGCCGCCGGGCATTAATCTGAAATGGCAAACGCCCATTCGCCAGGGAAACCGGAGCAGGAGCAGGAGC:1	-	chr2R	19798009	3'	+	Transpac	5196	2	57.81
GTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTT:1	+	chr2L	22150631	3'	-	S-element	69	1	80.60
CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGTGTGGTCAGAAAAAATAAAGGGGTGTGTGTGTATTTGATAGATTGACATCATCATTTGGCCTTTCATTCACTTG:1	-	chr3R	10546068	3'	+	hopper	1370	1	50.00
TGTGTAACCCATTAAAAAAAATCATCCAAATATCTCCCGTAAATAAGGAGTTATTCATTTAAAAAAAAACAAATCAGGTCAATTGCCCCCATTGCTAGCAACGTTTGTTATTTGCAACTGCTTCCTCC:1	+	chr2R	5240168	3'	-	hopper	73	1	67.97
GCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTCAAGATTGAGACGAACTCTACAGACAATTCCATTCCAGACATTGAGAATCATCCACTAGCTACAACAGTGAGATATGTACAAGCGGGTCAA:1	+	chr2R	4599533	3'	-	HMS-Beagle2	6955	2	75.00
CATATAATATAAACTAAATAAACTATAAGGAGAGTAATAAATCTATTAATTGAAAGGCTAATGCTAACCTTTTATATGTAAAATTATAAGCAGTAACTGTTGGGCAAAGTTAACCGTTTACTTTGTCGCACTGCATTACAGCA:1	-	chrX	18153134	3'	+	F-element	88	1	37.76
AATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGATCACAGTTGATCAACTGGTTAGAGTCCACTCCCCTGAATGCTAAATCT:1	-	chr3R	19446477	3'	-	1360	305	1	64.44
TCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTAACCTAGAAT:1	-	chr3R	9714338	3'	-	Stalker4	6975	4	72.60
TAATATCTTTTAAGCTACACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTAATGAATAATAAAAAATGATTTAAACCCTAAAAAAAGGTGTTTTATTGTTTTTAAGGCACATTGTGTGAGTATTCGGTTTTAATTACCAGGCGAAC:1	-	chrX	6952089	3'	+	G5A	2772	1	67.12
TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGTTTTTGGGAGCGATCACTTT:1	-	chr3L	15995941	3'	-	297	6617	2	63.81
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTA:1	+	chr3L	20654578	3'	+	roo	9016	2	56.16
GGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTAACTTTGACCCCCTTTT:1	+	chr2L	16067192	3'	-	297	6596	2	69.30
CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGATTGTTGCAGCGGATAAAACAGCTGATAGCGC:1	-	chr2L	22373917	3'	-	jockey	79	1	74.02
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGC:1	-	chr3L	11393490	3'	-	roo	42	2	64.91
ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACCCAATCCGAGTGC:1	+	chr2L	20840524	3'	-	Transpac	4933	2	70.00
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGAT:2	+	chr3L	11531024	3'	+	roo	393	1	73.97
AATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTG:1	+	chr3R	13349110	3'	-	BS	5053	1	66.67
TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATTGCTAAGTACTATAGTACTTGACATATTAAAGTAACG:1	+	chr3R	30344698	3'	-	pogo	66	1	71.21
ATATATATTCTTGATCAGGATCACTAGCATATCCGGACATGTCCGTATGACCGAACTATAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTATCATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTC:1	+	chr2R	13259717	3'	+	INE-1	80	1	64.38
TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGCGTCTTGAAT:1	+	chr3R	15364028	3'	+	flea	4964	2	53.42
ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGACATACCATCATAGCATATTTTTAAAAGCACAAATAATTATAGAATTTAATGAAGAGTTTTCATTCTTTAGTTGAATTTGATTTA:1	-	chr2L	12250021	3'	+	1360	3387	2	59.63
ATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTGGGTTTCGTCGTCCTCCTCACTTGGCAACTGACACAT:1	+	chrX	10521706	3'	+	Tabor	401	2	74.48
AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTATCATTATATATATTATTATTGGGACGAATAATGTTTACCTCTGCTATGGAATATATATACCAGTTATTT:1	-	chr2L	15247894	3'	-	Transpac	48	2	54.11
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCAC:1	+	chr2R	13084657	3'	+	roo	9034	1	70.53
CCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAGAAATGAAACTAGCTTTGGCCAGTCGAAGTTTATATACCCTTTCA:1	+	chr3L	13843134	3'	+	mdg3	15	2	66.44
ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGGTATATCTTAGTTTCTCTGGATTTTCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTG:1	-	chr2R	15004745	3'	-	jockey	31	1	44.52
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGA:1	-	chr2R	9662737	3'	+	412	7496	2	74.75
GGCCAATCGAAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGAGCAAACGATAAAAACTAAGGGGGTAAGTCTAAGATTAAGTCGAAGCCTAAAGCTATGGAAATTTGTACATTATTTACAGTTACATTTGGAA:1	+	chr3L	1140865	3'	-	FB	414	1	53.68
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTCTCCGTATTTTCTAGCATTTGTCTATGCAAAAT:1	-	chr3R	27994142	3'	-	roo	8684	2	69.93
GACAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCCCCTTGACGAGAACCAGGAGACGGTGATTGAATTGAATTGTTAAAATGTTAATCGTTTTATTTGTATTACAGTTTGATTTGGTACATTTGTGCTTATTCTAATATGCTGATCGACAGA:1	+	chr2R	3461221	3'	+	BS3	1569	1	70.55
GAAACATCAGACGAGTTCAATATTTAAGTTTTTAGAAATTCGTTTTTTTTAATTCATGGTGCTGACTCGTAATTAATAATAATATTTATAACTGATAACAATAAGTACATAATAAATTAAATAAGTACATAAATAAATACAAACTA:1	+	chr3L	26265112	3'	-	Gypsy12A_LTR	1879	1	76.03
GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGTGTCATACGCATA:1	+	chr3L	7588504	3'	-	hopper	65	1	62.33
CAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAACCATCAATTTATCACTCGAACAGCGTCAAGGAAGCAGGCTTCGACATGCACAAACGCCAAAAAGGAAAAATAATAATTTGCTCTCCATCATTATTTTTAATGAGGCGTATTATAATCAAAAT:1	-	chr3R	6500865	3'	-	accord	7102	2	76.71
TTGGATTCAAATGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGC:1	-	chr3L	14944553	3'	-	G5	4809	1	58.22
TTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGC:1	-	chr3L	2362348	3'	-	Stalker2	85	2	75.18
TCTCGACGTTTATACGGACAGGTTCTGATCTTGAGCTAGAAAGTACATATTTCCTTTTTTCGGGTCGAAACTTTTTTTATAAACTACTACCTACTATCTACTACTACTTAAGTATTTTCAATCGATTAGGGTTGTACAACATCT:1	+	chr3L	10097494	3'	-	INE-1	130	1	52.08
CGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAAAGTGTGTTGAGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAAGGTTGGGTAAGAATAATGCCGAAAGACAGCTCGAAGTACCGAAAAATTG:1	+	chr2R	6486771	3'	+	Circe	7369	1	73.13
AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTGTCTTATTTTAC:1	-	chr3R	25339963	3'	+	mdg1	366	2	54.79
AAAATAAAAAAAAATAAAATAAAAAATGGGGTATTCGCATTAGTAAGCCCACAAAGAGGAAGACAGACTGGTAGACAGAGGAATTTTTATGGCATTTCTCATGGTTCAAGCTCACACTTACACTTCCTCCCCCAAAGCACACACAA:1	+	chr3L	12054506	3'	-	transib1	1898	6	67.81
GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATG:1	+	chr3R	11496597	3'	+	1360	3315	1	70.80
CTCAACNAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTGGCAAAAAGTTTTAAATTTCTTAAAATACAGTTTCAGA:1	-	chr2L	7945269	3'	+	roo	394	1	76.03
GAGACGACTACTGGCCGTACACTATCCCCAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAATGTACGCAGTTGTAGCTTGCAATATCGATACACAGCATAGCACAGTAGCTATGCTTCCAGTGCCATTCCTTTTGTCTTT:1	+	chr2L	23488925	3'	+	rooA	7206	1	53.96
ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGAGTCAGTCTGCGTCACAGAAGCGCAATCGATTTCTTTCAGATAAGACCTTTTTAATTAAAAATGTAATTCCACCTATACTTCTG:1	+	chr3L	1534779	3'	-	pogo	27	1	62.59
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGCAACCTTTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGG:1	+	chr2L	3114563	3'	-	roo	8699	2	56.60
TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATTTTCTGCTACCAACGTCACTCATCCATCTTCGCCTCAAATCGTTCGTTATCAATTGTTAGTGAACTTATCAGCAC:1	+	chrX	12469337	3'	+	S-element	1673	1	56.16
ATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATGGTCATGTTCTC:1	-	chr2R	23332504	3'	-	invader4	2787	2	62.12
ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGNAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAAC:1	+	chr2L	6059330	3'	+	roo	9026	1	54.79
GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCAGTTTGTTAACAATTT:1	+	chr3R	22276778	3'	-	jockey	68	1	48.12
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACA:1	+	chr3L	16343288	3'	+	roo	9046	1	57.30
GATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGTGTTCCATCAGCCTTTCTTCCCGGGATTCTCGAGTCCTTTCCGCTC:1	-	chr3R	14915809	3'	+	R1A1-element	5103	1	62.30
ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCCAATCACATTAGCGT:1	-	chr3R	22821978	3'	+	mdg1	381	2	46.58
CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCTTATTGGTTGATTTTTATAGCTAGACATAAAACTGGTTGTGTTATACTATCT:1	-	chr2L	9399447	3'	-	Transpac	4982	2	63.64
GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGACAGGATTTTTGCAAA:1	+	chr3L	11531033	3'	+	roo	402	1	80.14
AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCCGTCCGCAATTTCTGGGCGAATCCGGCAAAGGAACCCAATCCCAA:1	-	chr2L	10022965	3'	-	Doc	45	1	60.69
GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGC:1	-	chr3R	20499756	3'	-	mdg3	5298	2	54.47
GTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTTCAAAGATATTTCA:1	+	chr3L	11257439	3'	+	1360	26	1	60.27
AAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTCTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGCCGGTCATTTTTAGTCCTTGTTGCTGCTGTTGTTGCTTGGCCCGGGTTTTGTTACCAAACTCTCTGT:1	+	chr2L	14891228	3'	-	transib2	2783	1	52.74
TATTAGAATATTTGTCATCAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAGCAAATTCTTCTTGTCTTGGGATCGAATGTCCATTTAATTGGATTGCAATGATTGCTCGA:1	-	chr2R	13829135	3'	+	1360	396	1	62.33
CCGTGTGATCAGTGTTGTGTTAAACTTAAAATTAAACCGTTGAAATTTAATTTAATTTTAATTTTGATTCTGGTTACTGGGACCTTTAGGCGAGGTCAGCCTTTGACGTGGCCAGGTGTCTAATTTGAATCACTTAGTGTGGG:1	+	chr3R	28799977	3'	+	Rt1b	54	1	57.34
CAAAAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTCCGATCGGAGCGAACGTAAGCAAACTGAACTGACCGATATGGAACCCTACCCTATCCCCATGATTAC:1	-	chr3R	5063500	3'	+	mdg3	5139	1	58.22
AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTAATATGTTTGAACAGTCCCATCTTAAATATATCTTATTATATGTATATGTACATATTATATATGTACTTTGAGCACCTTCATTTAATCGCATGACTTTTTTTTGTC:1	+	chr3L	17558138	3'	-	jockey	4690	1	71.23
GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAACACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGCGTCGTTTTTGGATGGATTTGTTAATGGGAGT:1	+	chr2L	8986229	3'	+	412	7491	2	57.53
CATCAGGGATTCCTAAGTCTTTGTGGATACTTGCATTTGAAGTATAAAATGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCGTCACTCTATATTTTGGCAAGTTACCCATTATTTGCTGAGCTGTATTTTGT:1	-	chr3R	19447146	3'	-	G4	3558	1	65.75
ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGTAGGATTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATGTTTTTTAT:1	-	chr4	1152019	3'	-	transib2	77	1	67.81
GATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATCCCAGTTTTAATGGCCTGTTAATTGAGCCAGACCACTGAAAAGCCAACACTCG:1	+	chr3L	10252523	3'	-	jockey	346	1	62.14
CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTTACCATACAAGTATCGGTTATAAAAACACATAAAAATGGGGATGGAGGCTGGG:1	-	chrX	21175653	3'	+	1360	3368	1	50.51
CATTACTGTTACATTGTTATTTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAA:1	+	chr2L	22224559	3'	+	Rt1c	5376	1	68.80
CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCTCGGATTCAATTTTGT:1	-	chr2R	13696381	3'	+	roo	9051	2	63.48
ATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTG:1	+	chr2L	21884587	3'	+	pogo	2016	1	78.08
TAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAACTAATGTAACACTTGAAAATCGCCTTTTCAGGAACGAACTGGAGCGACCGGGCCTTGATATATATGCTAACTATCTCACCTCC:1	-	chrX	13741926	3'	+	Juan	75	1	58.22
TGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCAAAATTTATAGTCTGCGCCGAGAGGTAGCCCCAATAATAAAAAAAAAAAGGGAAATAAAGAAAA:1	+	chr3R	26435975	3'	-	opus	302	2	66.67
GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGTGTGTCTATTGATTTTTATGGATCTTGTGTATTAAACAAGACTGTGTGT:1	-	chrX	17756524	3'	-	297	8	2	76.55
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCG:1	+	chr3L	9998171	3'	-	roo	81	2	78.26
CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATTTCTGGTCCTGTCA:1	-	chr3R	17531377	3'	-	1360	88	1	77.40
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTCTAAGTAAACTAATATTCTAATATTCATCTTCTATGAGCT:1	+	chr3L	22438003	3'	-	roo	19	2	73.29
AATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATAGATCCAATCGATAATAGCGATATAAATAACTTATTGTCGATTCCTGGTGATAAGCTATAGCAACGATTCG:1	+	chr2L	12489455	3'	+	P-element	2643	1	52.41
CCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACATT:1	-	chr3R	19449851	3'	+	roo	8935	2	58.22
AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTATGAGCT:1	-	chr3R	19589871	3'	-	BS	5014	1	68.49
TTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTTAGCACTGCACAGTC:1	+	chr2R	19499363	3'	-	P-element	101	1	11.64
ATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCA:1	+	chr3L	16973451	3'	-	S-element	74	1	70.55
ATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCG:1	-	chr3R	9210648	3'	+	mdg1	341	2	75.00
AATATTTTGAAATAAATTGGAATTAAAATGCGACGTGTTTTTAATACGAAATGTATTTTGAACTAGTATCGAAGCATTTCGCAGACTCAGATAATTTTCCCTCTGTTCGCGCATTTTAATGGTGGCCCTCAGTTGCTGTTGCAGGC:1	-	chr3R	24757932	3'	+	transib3	255	1	55.48
CATTTAAATAATAATAATAATAATGGCGAATGCGAGTGGGGCGCGTCAATCACTTCATTATGGCCCATGGCAGCT:1	-	chr3R	20336578	3'	+	invader3	5039	1	65.33
ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCAT:1	-	chrX	5662878	3'	+	P-element	2806	1	31.72
CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAAT:1	-	chr2R	20496887	3'	-	blood	40	2	56.85
GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCG:1	-	chr2R	11629736	3'	-	Tirant	32	2	58.87
TTTTGTCCCATTCAGATCGCGTTCGATATCTCTGGCATAATATGATGTTTTTATGCTATGCTATGATGCTTAGGTCCAGTTCTTTTTGAATGTTTTAAATCATTGTTTTTAAACTTACTTTAATAACCAAAATAGTCAAATTTAA:1	-	chr2R	4887642	3'	-	jockey2	3029	1	71.72
ACAATTACTGACTATAGTAATTATTTACTAAAACTTTGTCAAGCACCTTTATATGCTTTATTGTGCGAGCAAAGAAAAGTAATGTTAAATCTACAAAAAATACTTCTTAATTTTAAATCTCTTAAAATCAAATCTAACGTAGACTT:1	-	chr2R	10403231	3'	+	Doc	128	1	25.34
CCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCT:1	+	chr2R	4939192	3'	+	1360	3367	1	33.09
CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTCACATAT:1	-	chr2L	13585816	3'	-	Tabor	6867	2	61.90
GCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCAGATGTAACAGGGGTGGCTGGCACGTGGGACAACC:1	-	chr2R	9664565	3'	+	412	7116	2	71.59
GAAAGAAGGAAGATCTCTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTTCCAGCCTCTCCTTATAG:1	-	chr2R	5173410	3'	+	gypsy	415	2	56.16
GGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTCTAAAATTTTCGTAATCTATGAAAAGTGAACT:1	-	chr2R	9258368	3'	-	3S18	5785	2	68.75
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGTGATAGCAAATGAAAAAGAGCCTACGCCTAAACACTTCTTTAAAATAAAAAAAAATTTCAAATTTAAACAAAGTG:1	-	chr2L	3886113	3'	-	roo	29	2	61.64
GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATCTATATAGGCATATGTATATGTATATGCATATATATGAATGTATGAAACACCCACCCACCAGCCAAGCCAACCCTTATTC:1	+	chrX	4215058	3'	-	flea	4772	2	62.71
CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCATATCAGTAAGTTATAGGGCAAATTTAAGAATTATAAAAAAGTTATAATAACAGAACGTGACGGAAAAAGAAAAAGTGAATGTTTCCAGCATTGTCCG:1	+	chr2L	1518605	3'	-	jockey	4716	1	45.19
ATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCA:1	+	chr2L	6570035	3'	-	jockey	4837	1	50.71
CACAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTT:1	-	chr3R	22844205	3'	-	roo	8734	2	70.68
AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTGCAAGCGCTCTTGGTTTCGGTGCGGTGTTATGTCAAAAAAAAGAGGATCTAAAATTACAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTTTGTTATATTTTT:1	-	chr2L	19209785	3'	-	1360	21	1	69.86
GCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATT:1	+	chr3R	21276639	3'	+	BS	5048	1	47.95
GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTTCTAGCCCTCTTAGGAGTATGATTAATGTTAC:1	+	chr3L	11441842	3'	+	roo	9023	2	53.10
GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTGCAATTAG:1	+	chr2R	19540479	3'	+	jockey	4967	1	58.46
GCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGATGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCCAATGATTAAATCAATGCGACCCGGTTTATTAA:1	-	chr3R	19444721	3'	+	Doc	280	1	77.24
ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAG:1	-	chr2R	10582399	3'	+	Juan	4169	1	61.95
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGCGCAG:1	+	chr2L	3886276	3'	+	roo	9056	1	71.21
AGCTGAGTAACGGGTATCAGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGTTCACTTCTTCGCGTTGGAAACTTTTGACTGAATCATTATACCCCC:1	-	chrX	20381405	3'	+	INE-1	545	1	78.70
GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACAATCTTATC:1	+	chr3L	27415345	3'	-	transib2	31	1	64.38
TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGTGCAATTTTTC:1	-	chr2L	13585822	3'	-	Tabor	6877	2	55.38
TTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAGGGAGCGATGCTTGTTTTTGACAAATTTGCCAAATTTGACATAAAGTATTT:1	-	chrX	1898595	3'	-	P-element	137	1	35.86
AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCACCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCTATGACAAACTGA:1	+	chr3R	20499845	3'	+	mdg3	227	2	57.00
GCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTAATCGCAAAATGAATTACAGGTTTAATGCAAATACGTTTATTAAAT:1	-	chr2L	11985777	3'	-	G6	1693	1	61.67
AGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGTGTAGCCAAGCCAAACGAGATGCAGTCTCAGCGCGTAATGGGAGCAAAACTGGGCGGGCGATTGCG:1	-	chr3L	22821726	3'	+	Quasimodo	6989	2	75.82
ATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATT:1	-	chr2L	13763170	3'	-	pogo	83	1	76.71
AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCC:1	-	chr3R	10182140	3'	+	blood	7336	1	68.75
CCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTCTGGATGTGTATGTGTACGTGTGTAGCGATCGGGCGTAGAAAATATT:1	+	chr3L	26646416	3'	-	F-element	4511	1	63.70
ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAA:1	+	chr3R	19446212	3'	+	297	334	2	75.42
CACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTG:1	-	chr2L	12290657	3'	-	1731	7	2	71.72
AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTG:1	+	chr3L	11957191	3'	+	blood	7326	1	75.63
ACTGCCTGTCAAGGTATGACTTCGATGAGCAGGATGTGAGGCCATGTCTCTTCTCTTTCCATCGTTTCCTCCGTTCCACCGCGCTCAGCTTCCTATTGGCGAACGATATCACGTGCTCTAATTCCCGTC:1	-	chr2R	5205384	3'	-	Rt1b	4979	1	66.67
AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTCT:1	-	chr2R	15064363	3'	+	412	442	2	66.07
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGTGGTAGCCAAACAGAGAA:2	-	chr2R	20596414	3'	+	roo	389	2	70.55
ACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATGCCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTT:1	-	chr3R	23020783	3'	+	INE-1	581	1	68.75
AGGGGGTGGGGTGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCGGCTTCTTTTTCCAGAAAAA:1	+	chr3L	16750776	3'	-	Tirant	8107	1	80.56
ACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATA:1	+	chr3L	19339429	3'	-	Tc1	71	1	60.27
TTTTATAAAAAAATTGCATTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATCTCTCGATGCGACATATTTATTTGT:1	+	chr3R	12776272	3'	-	S-element	86	2	76.26
GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATT:1	+	chr3R	17243213	3'	+	hopper	1380	1	50.42
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTA:1	-	chr3L	20654491	3'	-	roo	79	2	73.79
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCGCT:1	+	chr2R	25118806	3'	+	roo	9039	1	64.38
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTAGCTGTGCCAAAAACAAACTTGGCTCTTTAATATGATATG:2	-	chr3L	19334231	3'	+	roo	9023	2	53.42
GGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGAATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTTAGGAGTGTCTAGTGATTTTTATGGATCTTGAGTATTAAACAAGACTGAGTGTTCAGCACAT:1	-	chrX	17756515	3'	-	297	6581	1	75.34
CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTGGACCCAAGCAGACTTTCTCGTCCTGCTGATATAGTTTCCATAAATTAATTTTATTTCATTTGCG:1	-	chr2L	21891711	3'	-	mdg1	51	2	52.14
AACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCTCGATCGTGATCATGATTACTTGATATGGTCGAAAGTGCTTTATTCTACCCTTTACAGTCAGCACGATTGAGTTTTGTTGTTTGTTGAAAATAGTTT:1	+	chr2R	20538518	3'	-	INE-1	158	1	45.74
TATTTTATTTTATTATGTATATTATTTAGTTTCTATACTTTGAGCTGATCATTTTGTATCCCCATTTCGTCTCAGTGTATGCAAATCGAGCGAATGTCGCCCCTGGGAACTGCACCTTACGTGGTGGGCGGTG:1	+	chr3L	1986480	3'	+	transib1	1904	1	84.96
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCG:1	-	chr3L	233250	3'	-	roo	56	2	67.74
AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTATG:1	-	chr3R	19589875	3'	-	BS	5012	1	68.57
ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATGTGTTAAATCGATAATATAAAAAACATATATTTTAATTAG:1	-	chr3L	1534484	3'	+	pogo	2074	1	61.64
AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGATCTGAAATCGTTTCCAATCGAAGGATATGAGAAATATGCAAATATAAAC:1	-	chr2L	20840357	3'	+	Transpac	5223	2	80.00
AATTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAATTTTGCTGGTGG:1	+	chr4	1294988	3'	-	TAHRE	72	1	36.69
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTCCGTGTAGTTTAAAGCATTCGGTTTAGTTTAAGCTTTGCTCCATCTAATTAAAAGGCATTTGT:2	+	chr3L	20831423	3'	-	roo	8680	2	74.66
CAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATA:1	+	chr3R	20868201	3'	-	BS	5059	1	63.64
GAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTC:1	+	chr2R	5173235	3'	+	Stalker4	366	2	53.15
ATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGGCCATCTAAATTAAAACGTTTTTCATCAGTTAAGACAAATGAATGCCAATAA:1	+	chr2R	6487942	3'	+	copia	5055	2	64.38
ATAACGTAATTTTTAGTTTAAGGATTAGGTTTAGGAAAATGTATCGGAATATTATCTTTATCTTCAATTATAAAATTACAAACAAACAAAAAGGAGGGAAAACCTAAATCAACTCG:1	+	chrX	7803367	3'	+	Circe	7032	1	62.07
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTACGCTTATTTTCATTGCCAATTTTAGTTGC:1	-	chr2R	21907875	3'	+	roo	9053	2	73.29
AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCCTAATTAACTACACCACTGACCCAGAAAAGGTCAGGGCCATTAAAGAGTTCCCTGAACCAAAAA:1	+	chr2R	23772106	3'	+	mdg1	355	2	64.75
GGTCTTCGCCTGCAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAACAGACATGAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGATGACAGGCCCCC:1	+	chr2L	9412086	3'	-	jockey	4525	1	61.34
TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTG:1	+	chr3R	10182191	3'	-	blood	7061	2	66.67
ACACACACACACACACATACATACGTCGAGAGGTGCGGGTCTTAAGTTCTGAAGTCCCGGGTCTTGAGTTTTAGTTTTGCCATTTGGGTTGGGCCTCCATATG:1	+	chrX	6601735	3'	+	Quasimodo	37	2	83.50
ATATATATTCTTGATCAGGATCAATATCCCAGGAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCAAGCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCCTTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGC:1	-	chr3R	18346664	3'	+	INE-1	80	1	57.53
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAGGAAA:1	-	chr3L	6978108	3'	-	pogo	29	1	63.19
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGA:2	+	chr3R	7100907	3'	+	roo	352	2	54.79
AAGGAAGTCCTTCACCTCTGGAGAGAAACCTGACGGATGACAACATCGCAAGACGGTGCGAAACATTGTGCAAACACTAATAGGGCACTCGAGAGGCTTGTCTTTAACTC:1	+	chr2R	496571	3'	+	Gypsy6A_LTR	345	1	70.00
GTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTCTGCATAGA:1	-	chr2L	20117849	3'	+	invader4	3066	2	48.63
CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAATAGAATAACATGTTAACCGAATTATTTGCATATTACG:1	-	chr2L	14892174	3'	+	transib2	2809	1	72.93
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACG:1	-	chr3L	20654493	3'	-	roo	8736	2	73.53
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATA:1	+	chr3R	19968210	3'	-	roo	37	2	57.46
AAAATGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATGACAGAGGAATCTCTAAGATGTCGGCTATCCCAAAACTTTTTGAAAATATTATCACTCCACATTTTACTCCAAGCATTGAAATCACCGACAAAACAGTTAGCTTGG:1	-	chr2R	1986213	3'	+	Q-element	81	2	67.91
TATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTA:1	+	chr3R	21276646	3'	+	BS	5055	1	49.32
AACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAAAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCAAAAACAAACATCTGTGGTTGATTCAACT:1	+	chr3R	19448679	3'	+	roo	8800	2	50.68
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTTCTAAGTGCACTGAAAAA:1	-	chr2R	9328558	3'	-	roo	6	2	77.34
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGA:1	-	chr2R	7898090	3'	-	roo	8745	2	80.00
CCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGTGCACTTGTGTAGCTCGCCTCGATAAATTATATACTTACTGTAATTTGTTTAATAAGGAAATAAATCCGTTGAATATACATATTCACT:1	+	chrX	13038604	3'	+	roo	8653	1	66.44
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGT:1	+	chrX	23280950	3'	-	roo	8701	2	45.21
AGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGTGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAA:1	-	chrX	15408732	3'	-	INE-1	562	1	86.30
AACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATAT:1	-	chr3L	10056099	3'	+	transib2	2766	1	59.03
CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATAGCTGCCGTGATGGTAAAATCTGTGAAGACCAATCAAAACGCATCTG:1	+	chrX	21014880	3'	+	copia	217	2	58.90
ATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGANGGGAACGGCTGCTGTTGATGTTTGCCCAAGGCTG:1	-	chr2R	8975872	3'	-	F-element	4537	1	72.00
ATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	10582472	3'	-	Juan	3852	1	52.59
AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAG:1	-	chr3R	27424838	3'	+	blood	7329	1	58.22
GACAACCCTAAAAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCT:1	-	chr3R	5061843	3'	+	mdg3	331	1	51.43
ATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTTTATAGCTTCTGTATCTGCATTGGACTGCCTCATTAGCCACAGCGCAAACA:1	-	chr3L	7943614	3'	-	Burdock	60	2	66.19
AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACACACATATACAAAC:1	-	chr2R	7452835	3'	-	pogo	42	1	55.47
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTATGCTCGGTGATTCAATGATTGAGAGAGATACTTCACAGAA:1	+	chr2L	3114618	3'	-	roo	20	2	72.60
GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCCGCAAATACAAATACCAATACCAAAGCCCCCTGTAAGGGTCATTCTGTGCACGTGTGTGTGTGCGTGCGTCTTTGTGGAATGCAAGTGAAACA:1	-	chr2R	10124086	3'	+	P-element	2882	2	78.05
ACAAAAAAAAAAAGAGAAAAAAATAAATACCCTGCCCCACGCCGCTGCCATTC:1	+	chrX	18474498	3'	+	G2	3076	5	94.34
TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCTT:1	-	chr3L	20831263	3'	+	roo	361	2	54.11
CTTACAAATAAAATTAAATTAAAGATATTTTAAAGTTTAAACATACTTCACTCTTTGTCTTGATAATTTAAAAAGTTCGAACTATATCGATTACTTAAGCACATATTTTTTTAAGCTGATAAGCTATAGATGGTTT:1	-	chr2L	16374072	3'	+	NOF	3956	1	46.32
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCATAAAGCTGCAAAAAATATATGCATTCTACACATTATTATTAT:1	-	chr3L	1534662	3'	+	pogo	2042	1	66.92
AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATACTATATATATATATAGGTGGGGTCTTGGGATTTGTGCGGTGCATACGTAAAGCGGTTCTTGCAAATTAAGGACTTATACTCACGTAG:1	-	chr2L	10037276	3'	+	Quasimodo	7343	2	68.09
CAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGTAGAAAATGGTCGGCGGGGCAATGGAGAAATGAAAAATAAGCCAACTGAGACACGCCTCGGCAGTCACAGGACCACAAAG:1	-	chrX	6499793	3'	+	Quasimodo	260	2	76.42
TCATATTTTTTATTTGTTTATTTGCAGCACGATATTATTATAGATAAGCTGCCAATTAATTTCGTCAACAACCAAGTAACCTCCTGGAGACCTTTTGTTTTTATCGCATTGGTA:1	-	chr3L	4553785	3'	-	Porto1	193	1	64.91
CCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTTTTCGGCAGACAATGGCAAT:1	-	chr3L	10385825	3'	+	Burdock	6351	2	54.62
TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTT:1	+	chr3R	12717843	3'	+	297	6924	2	58.62
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCA:1	+	chr2R	11164491	3'	-	roo	75	2	73.29
ATTTTTAAGTTACCTGCATTGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGCATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCTTGTTTTTAAGCCTGCGAATATGACAAAACAAGTAATTGCCATCATA:1	-	chr3L	4605604	3'	+	pogo	2057	1	52.14
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAG:1	+	chr3L	15600316	3'	+	roo	337	2	66.44
AAGAAATGCTGTTTCTAATTTAAAGAATTTAGATTTTTCTAGAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAATCAGTGTAATGTTCTTGGCATACTGCTCGATTTTTCTTGGCCGCCTTTTTGTTAT:1	-	chrX	17622806	3'	-	TLD2_LTR	167	1	71.23
TAATTTTGTTAAATTAAATTAAAATTAAAATTAATTTTTCCATACCTTTCAGTGCACAAAAGTTTTAACTTTTAATGCGCAGCCTAGTTTATAACTTCATAACTACTTTTGTTTGCTTTACATACTTAGTAATGTTCTTTCTGATG:1	-	chr3R	32065986	3'	-	TAHRE	73	2	57.53
GATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATATGAAAAATATCCAACAAATTTTAAAAAATGGGGGCGTCGCAGTTTTGGACGGTTTTAGGACGTATGCATATATCACTAGCATGTAGAATGTATATCGAATGGGCTG:1	+	chr2L	13805037	3'	-	INE-1	297	1	66.67
AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCATTGCCTGCCCTCTTTCATCTCTTC:1	+	chrX	17963990	3'	-	jockey	4785	1	67.59
AAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGCCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGTAGTCAGCTAGAATATGCGGA:1	+	chr3R	2533974	3'	+	gypsy8	4817	2	61.86
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAA:2	-	chr3L	20654483	3'	-	roo	72	2	68.49
TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAAC:1	+	chr2L	19965024	3'	-	Doc	80	1	81.03
AAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAA:1	+	chr2L	22150619	3'	-	S-element	80	2	79.70
GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTAAAACTGCACACACACATACACACACGG:1	-	chrX	568871	3'	-	jockey	4773	1	75.86
GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTCCCGAAGG:1	-	chr2R	20944320	3'	+	pogo	2085	1	58.62
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTTGTGTTTCTACATAATCAGTACGATCACATGAAATACAGGAAATTAATAAAGCAATAAATGTTATTCAAGTGATTAACCGCCTTATTGCTTCTAG:1	-	chr2R	23802910	3'	+	roo	9045	1	65.75
GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCC:1	-	chr3R	12618633	3'	-	F-element	66	1	71.82
TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGCGACGAGGTTAAATGGATCGGCG:1	-	chr3L	27415189	3'	+	transib2	2812	1	69.67
AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACATTTTAC:2	-	chr3L	10013547	3'	-	hopper	24	1	67.16
TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTA:1	+	chr2L	18419262	3'	-	412	7094	2	52.05
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATAC:1	-	chr3R	20469568	3'	-	roo	8693	2	42.07
GCCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCTAACTCCA:1	+	chr3R	6611306	3'	-	HMS-Beagle	35	2	58.21
GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAAACAAACACAATAAAAATATTTATTTAGTTTCGAATCGGGTGTG:1	+	chrX	10201241	3'	-	transib2	45	1	54.29
TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGAACATTCTCAATACAAAGA:1	-	chr3L	20654445	3'	-	roo	8698	2	62.33
TAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTGACTAAATACCTAAATGATGCTGGTAAAAACTACTACACATACCAATTAAAAAACATTGCAAAAACTTGTGCTACAGATTGTCGCAAAAATGGACTGCTTGCAATAGAA:1	+	chr3L	18591646	3'	+	Cr1a	4288	1	49.66
AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAAAGTATATATACGAATTTTTCTTGGTCATTAGAATAGACTGTTATAAAAGAATAATATAAGAATTGCG:1	-	chr3L	20324656	3'	-	297	52	2	61.64
GAGACTTAATTAACTACATAAGAATTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCCCCGTAAATCGAAATTTTTTTTTTTAAATT:1	+	chr3L	10013906	3'	+	mdg1	7433	2	53.57
ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTTTTAATTTATG:1	-	chr3R	21434862	3'	-	412	50	2	52.05
GTATATGTGTGCGTGTTGTGATAGAAAACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATTGAAGAACCCACGCAACACCGAAATTGCAGAGATTGCAATTCGATCCAGCTCAATCAACTTCAAACCACTCCAATGCTC:1	+	chr3L	25765741	3'	-	1360	3213	1	55.56
GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGA:1	+	chrX	7256195	3'	+	412	7482	2	65.93
GCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTTGAAGTGCACAGCATGTTAAATTCGTAAAATTCATTAAGATTCCGTTGCCGATGCCAACC:1	+	chr3R	5060832	3'	+	mdg3	5264	1	81.71
AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATCTTTATCATAAAGTACCCTTGTGCCATTTACTTGAATATATTAC:1	-	chr3R	9456640	3'	-	jockey	4747	1	69.18
TTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAATAAAATGCCCAAAACAAAAGAGTTAACAATTACATTGCTTTTATTTGTTATGCGTTTATTCTTTCTTAACCCTAAAATAAAAAAGGTTACCCTTTAAAAATTGAAATAATT:1	-	chr3R	19148236	3'	+	Bari1	340	1	60.27
CTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1	+	chr4	1294987	3'	-	TAHRE	10434	1	88.30
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCG:1	+	chr3R	22844274	3'	+	roo	337	2	67.12
AAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAACTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATGGATGGGGGTGCAACCAGGAGCGAGGGGAGAACTG:1	-	chr2R	18340100	3'	+	FB	480	1	68.47
AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAAAGATATAAAACACGAA:1	-	chr2R	20496858	3'	-	blood	7020	2	76.39
TAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGAGGATCACTACAGCGAGGAGAGATC:1	+	chr2L	23197589	3'	-	Transpac	4981	2	78.26
AGTGTATACTTCGGAAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAACCTT:1	-	chr3R	14651176	3'	-	P-element	38	1	59.59
GTGGGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTGTTACCCTTGATACTCGTCGACCAAAATACCAATGGAAGCTAGAAAACAAGGGCCTTTCAAACATATATGAAAATTCTGTTTGCGGAAAAATAAGCAAACCATTTTATTCCGGCTATTTAAC:1	+	chr3R	10212622	3'	-	Quasimodo	35	2	54.11
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCACGTGGATCAAAGTATAGAAACTTAACCCCCTGATGGTGAAAACAGTCTGAAAACCGTTGGCAATGACACATTAAGCGTAGTTCAACCCCGACAAACGGCAA:1	-	chrX	8543397	3'	-	roo	8683	2	73.97
GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACAAACATATACAAACTATAACTGGGTTACTCCGCGGTTTTCTAACCCATTGAG:1	-	chr2R	7452797	3'	-	pogo	22	1	70.55
TGCAGCCACATTTCTTCAGATAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATCGAATGATTAGTGTGACCATGCGGCGGTTTATAGCAACTGCATGCGTAGTGCGACAGAGAGTTGCT:1	+	chr3L	16783002	3'	+	Chimpo	414	1	51.94
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATT:1	+	chr3L	9998165	3'	-	roo	62	2	78.76
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGGGAATTTAATCCATGATGATTGGATGCAATATGTAATATATACTAAAGGCGCTTTATTTAATCAAAACCTGGACAAAAATTCGGTTTTTTGTATAACTCAAT:1	+	chr2R	20596599	3'	-	roo	18	2	71.92
GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACC:1	-	chr3R	21706012	3'	-	297	6623	2	74.47
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAACTTCTGACACATTGAAAAATGTCATTGCGTAACTTAA:1	+	chr2R	9632211	3'	+	roo	9042	1	57.69
CCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTTGTACGCGTGAATTAAACCTATGGAATAGTCTATATTCCCGTATTCTAGAGTTTAATTTAACGTTTATGCAACGAATGAAG:1	+	chr3L	20315762	3'	+	297	29	2	59.59
GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATTGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAA:1	-	chr3L	27415228	3'	+	transib2	2781	1	61.40
TAATAAATATTGAAATATGTAAAAGATACATCCTTGTAAATTTGTTAATATATTAAATGTTATATTTAATACAATAATATAACTAATTCATATTCATCACAGTATATAATTGGTTCAGCTGTCTTACTATGTCTGTACTATGTGCA:1	+	chr2R	14434690	3'	+	Penelope	156	1	73.97
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCA:1	-	chr3R	16404464	3'	+	pogo	2039	1	62.33
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAGTTT:1	+	chr3R	27994299	3'	+	roo	9042	1	61.65
ATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGCTGCCT:1	+	chr3R	1844861	3'	-	Cr1a	159	1	51.37
CATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGC:1	-	chr2R	9325388	3'	-	BS	5037	1	48.20
TTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATATTTCC:1	-	chr2L	23020625	3'	+	Transib5	2945	1	52.05
AATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCTTAGCACGTCGATCTAGGGATAGCGACTAATTGTTATCCACCGATATCATTCA:1	-	chr2R	10123603	3'	+	P-element	2714	1	37.36
AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAGC:1	-	chrX	5662854	3'	+	P-element	2860	1	60.87
ATTTTCTTTTTCCATTTTTTTTTTCGTTTTTAGCTGTCTTGCGGACGCGGCCTGAAAGATATGTATAGGTTCGGGCAATGCCGCCAATTGGCT:1	-	chr3L	6990431	3'	-	Doc2-element	234	1	43.01
ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCACTAAGCCTGACTTAGTGATCCCGTATTATCACAGCGCAAGCG:1	-	chr3L	23797911	3'	-	Doc	83	1	69.44
GGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCTGTGCACGCGCATTATTAAAGTGAACTCACCTTGAAAT:1	+	chr2R	17259340	3'	-	jockey	4742	1	65.69
AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGACGAATACTT:1	-	chr3R	21276534	3'	-	BS	5058	1	58.22
TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAATACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGTAGTTCAGCAAAAAATGTGTTCATGTTTTTAAGC:1	-	chr3L	4605639	3'	+	pogo	2061	1	67.33
TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACGAATGAAAATTTTCCAGTCAGCGAGAAGAAATGTGTATCA:1	-	chr2L	3164965	3'	+	412	409	2	73.79
GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGAATTTTATTATCTCT:1	-	chr3R	5061802	3'	-	mdg3	5268	2	71.64
TAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATA:1	-	chr3R	14981159	3'	+	mdg1	7392	2	63.70
ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGATAATAAGGAAA:1	-	chr3L	6978108	3'	-	pogo	27	1	64.08
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTGCAAGGTATAAACAAAATACAGCTCAGCAAATAATGGGTAACT:1	+	chr3R	19447156	3'	+	roo	9015	2	61.86
TATTTTCACTTCAAATAATTAAAATTCTTTGCGTAGTTAATATTGCAAATTTAAGATCATAGAAACATTGATACTTGTATCCTCAGAAATCACTAGAACGTCCAAATATTTATTGTTTCT:1	+	chrX	11696728	3'	+	TLD2_LTR	94	1	75.00
GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATAT:1	+	chrX	5274369	3'	+	roo	8990	2	75.34
TTTTCAACTTGAAAGGCGAATTTAATAAAATTTGCGCGTGAGAGTTATTTGCCGACGAAGCGCGTTTAATTTTATTAAATAAAATTAATTGTTCTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTAACTTTTCTT:1	+	chr3L	2887408	3'	-	TAHRE	139	1	60.96
AAAAAAAAAAGAAAGAAAACTTGGAACAATTTGGGCGACAG:1	-	chr3L	765308	3'	+	HMS-Beagle2	490	1	90.24
GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTACATGTTTCTAAATTTGCAGATGGGAATACAGGATCTCTTCAATAGTTCGTCGGATATCAGCCTCCTACTGAACCAGTCTGGCACTAGAATCAGCCAAG:1	-	chr2L	7888072	3'	+	pogo	2080	1	66.90
CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTGTGTGCGGGCAGTGACTGTG:2	-	chr2R	9662688	3'	+	412	452	2	53.24
CCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAA:1	-	chr3R	9714362	3'	-	Stalker	27	4	63.08
CGGCCCTGTAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGCATGTCCATACCTTGCAATTCCCACGACTCCTCCCCCAAAATTCGAGAAAAAAGTGGTAAAAGCCCGATCAAATCGT:1	+	chr2L	22329072	3'	+	invader2	112	2	78.18
ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCC:1	-	chr3R	9038902	3'	-	Juan	4045	1	58.22
TGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTGCATTCGGGCATAGCGGCAACATACGCGCAAAACGAATCTCGTAAGAATTATTGCATACTTTCAGGGTGACCACGATCA:1	+	chr3L	2485998	3'	-	jockey	4564	1	45.52
CACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTT:1	+	chr3R	18585635	3'	+	P-element	2886	2	55.10
GGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGTGACATTCTTGTTTCTGCTTTAAAGCCCTGGAGAAATTACGAAGTTA:1	-	chr3R	10734439	3'	-	G2	3020	1	59.13
CTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTT:1	-	chr3L	10385844	3'	+	Burdock	191	2	70.07
TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATCTGCCAGCCAGATCAGTTGATTATTAATT:1	-	chr3R	14364622	3'	+	roo	9040	1	64.13
CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCTAGATACTTGCCCCT:1	-	chr3R	22844199	3'	-	roo	8739	2	70.83
AAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGAATGTGAACTTGATGGTTTATTAACTATCCCCCCCTCAGGTTTTTGACCGTCCTC:1	-	chr2R	1276092	3'	+	Quasimodo	226	2	52.14
AAAAAATTGCGTTTAATTAAACAAAAAACCCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGGGGTTAAAGCCACGTGGAAGAAATCGGCTGGGCTGGAG:1	+	chr3R	6252981	3'	+	S-element	1637	2	71.01
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAA:1	+	chr3R	18582251	3'	-	roo	8706	2	54.96
CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGAAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGCACACAATTAATGGAATCATG:1	+	chr2L	15833052	3'	-	hobo	57	1	78.85
ATATAATATATATATACATGTATATATATGTTGTTAAGATTCTAAAATGAAATGTTTTATAAATACCAAATGCCTCACAACTCCAACAGCTAGCAAATAGACCAATTCAAGTGCAATATGCAGCGGCGCC:1	+	chr3R	29114318	3'	+	INE-1	63	1	50.77
TAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCCGCAAGCAAACGCCAGTTATCTATAGCCTACTTTCGGTCGGC:1	-	chr3L	22346657	3'	-	jockey	4666	1	58.00
ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCC:1	-	chr2R	20496912	3'	-	blood	65	2	63.01
AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGAATTCAATGGGTTG:1	+	chr2L	7810104	3'	+	P-element	2861	1	40.96
CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAAGGGGCGTA:1	-	chr3L	23728620	3'	-	HMS-Beagle	45	2	54.79
ATATTANTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTCATTTTAAATCTTGCCATAATAGAACCAAAATTTCCCGTTAACATTATTTTACAAAATCCCTACCCCTTACAACAATTTATATA:1	-	chr3L	3477402	3'	-	mdg1	32	2	50.69
TACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCCACTTTCAAAAACTATTTCGAATTTTTT:1	-	chrX	10640037	3'	+	roo	352	2	70.94
CCACACTTTTGAAAAATGTTTTGATTTTTCTTGGTTTTATTGTTTGTTTTACCAATTTCTGTCGGTATACCAAAAACACTTTTGCCACGCCCCTCCTTACACCTACAAAAATACGCGTATTTTTATTATTCCCTATTATGGATCTT:1	-	chrX	23012243	3'	+	INE-1	258	1	75.34
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGTGGCAGCATTTGAATGGGC:1	+	chr2R	9328699	3'	+	roo	9024	2	52.24
CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATTTCGCATTGACAAGAGTATTTAACACATGAAGGCCAATCAATTGGCTAGCTG:1	+	chrX	6279454	3'	-	P-element	47	1	52.45
TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTGGCGCCCAATAGTCGAAAATACTTTGTTGAATTTTTTAAAATATATATGATAAGACTTGCCTTAATTACAATTTAGCAC:2	+	chr2L	6863412	3'	-	pogo	37	1	56.16
AAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAGCAGTGTGACCAGGCGTCATCGTTCAAATATACCAACCGGCTC:1	-	chr3L	15955092	3'	+	jockey	4895	1	68.55
GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTACTATATGGTTATGCGTTATATGCCCAAAGGCTTCGTTCGGCTGTAGATGAGCATAACATTCTTAATGCTTCGCT:1	-	chr2R	15289101	3'	-	hobo	28	1	62.31
TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTC:1	+	chr3L	15600364	3'	+	roo	9049	2	56.16
GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATA:1	-	chr2L	23068837	3'	+	1360	3332	1	61.64
AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCTAACTCCAAGTAACTATTTTACGA:1	+	chr3R	6611322	3'	-	HMS-Beagle	30	2	64.83
TCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCG:1	-	chr2R	20596442	3'	+	roo	395	1	66.96
ATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGC:1	+	chr3R	19449337	3'	+	roo	91	2	61.27
GAAGTTCATAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATCGGCACCGTGCGAAAAAGACATAATAAGACATAAGACATAGATAAAAAAATCAGAATTATCAATACTGAGAACAATAGAGAAAATAAAGAAACACGAATGGAGAA:1	-	chr3L	25335350	3'	+	1360	236	1	59.31
ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAACCACTGTATTTGCAGGCTTAAAGAT:1	-	chr3L	6978118	3'	-	pogo	18	1	65.85
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTGACTCTCGACATGCCAATTGCAAAATTGTTTTTCGTGCCTCCGCCTCTGCAAAAG:1	-	chr2R	13089210	3'	+	roo	9026	1	53.57
AGAAATATTCTAGTGTCTTTGGGTGTGAATTCTGTCTTCCTCTTCCTCTCTTTCGTCAGAAGTATTTGCGCATCAGACAATCTAGTAGCAGATTTTTCTCTAGAGCT:1	+	chr3L	23213301	3'	+	Tc3	311	2	74.77
TATACATACATACAGTTCATGTATATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCC:1	-	chr2L	12290695	3'	-	1731	92	1	76.71
ATGCGGATAATCTAGTCCCATTTATGCCTGCTCACTGTTGAAAATAAATTAACGGAACTGCACTATACCTCACTGCCGGTGGCATGTGTATAGTATGTAAGTTATGCACAATTGATGAGCGAA:1	-	chr3R	4552966	3'	+	Rt1c	5183	1	73.17
AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAA:1	+	chr3R	16404579	3'	-	pogo	48	1	53.10
TGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTT:1	-	chr2L	20117887	3'	+	invader4	3039	2	57.78
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATCAGTTTATTCGCTTCTAAGTGCACTGAAAAAATA:1	-	chr2R	9328555	3'	-	roo	20	2	70.34
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTACAATACTTGCTAGCTCTACCTCAAGGAGCTTT:1	+	chr2R	9662826	3'	-	412	37	2	60.27
GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTATTACTGCATTGTATGGATTTATCGCTTCTAATTAATAAAGAAATAAAAAAAAACTTCTATTGCCCCACATTTAACAATTTAAGTTCATGTTGTCATTTGTTTTCAGCTTATAAATAATACAT:1	-	chrX	20266154	3'	+	BS	5041	1	66.44
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGGCA:1	+	chr2R	13710668	3'	+	roo	9001	2	65.52
AGGGGGATCTTTGAGTCATAACGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTATACATACAAACCCACTTAATAATAATAGACATTGTGGCAATCAATCATCATTGAGTTGACTGAGAAATTGCTAATAAATTGCAATTAGCG:1	-	chrX	11777051	3'	+	baggins	5372	1	61.64
TCTCTGTTTCGCATCATCGGCTCTGTAGCAACAAGCAGAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTCAAGCTGAACACGTGAAGTACCACTCCTAAACGAACCCTATTTGCTCGGCA:1	-	chr2R	18340337	3'	+	invader2	95	2	76.74
GAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGC:1	+	chrX	21087685	3'	+	mdg3	5490	2	66.04
AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTGTATGATGTATGGTCATGTTGTATTTGATTTAAAAAATAATTGGGGGAATTACATTAAGAACTACGGAGTAGAACGGGTATATAGGATAGGCA:1	-	chr2L	16863527	3'	-	1360	21	1	59.42
GTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTACACTATGGCACATATGCTAATATATATATTTACGAATTCAGACAGAGCGCTTAATACAAAAACGAAGGTTTTCTATGAATTATTCAACGTTT:1	+	chr2R	4103328	3'	-	Quasimodo	33	2	64.00
TGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGG:1	-	chr3R	25454028	3'	+	Quasimodo	7293	2	73.97
TTCCGAATCTGATCTCGAATCAGAATCAGAATGTAAATCCAATATTTTTTCTCTCAGTGCACCTCCTCCGCAGGTTCGCACTTTCGACGGCGCG:1	+	chr2R	13574845	3'	-	transib2	2549	1	57.45
GTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGGTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATA:1	-	chr2R	4673574	3'	+	Quasimodo	7296	2	72.60
GTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTA:1	-	chr3R	4160063	3'	+	invader2	190	2	56.85
ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGACGCCGCCGGGCATTAATCTGAAATGGCAAACGCCCATTCGCCAGG:1	-	chr2R	19798032	3'	+	Transpac	272	2	58.18
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTA:1	+	chrX	9540121	3'	+	roo	355	2	54.11
GACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAATTGTTGTTTGTTGCTCTCTTCGTGTGTTTTTTTACATTAACAACGGTTCAAATCCATTTTTTT:1	+	chr3R	7040928	3'	-	297	402	1	52.27
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCT:1	-	chr3R	18339062	3'	+	roo	9034	1	58.22
AACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTCTGTCGCTAAGTGCAGGCTGCAATCAATGCCG:1	+	chr3R	13822548	3'	+	hopper2	1519	1	77.08
GGCACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCA:1	-	chrX	13066515	3'	+	jockey	4920	1	67.12
CCTACATCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAAGATAATGCTAAAGATGAGTGCGAGCTCAAATGCAAGGGTTATATAAATTGGGGTATCGAAAGCTTCGGG:1	-	chr2L	3668221	3'	+	GATE	259	1	56.16
CATATTACTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAAGTCATTTGACTTAATATGATTTATATATGATAATGATCCATTTTTATTATTTAAAATGCACATTAGATTCAGTTGTTTTTCAGTATGTTATTTAAATAACTGACGACTGAA:1	+	chr2R	4402686	3'	+	1360	3116	1	78.08
ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGATATGTAGGAATGGATTGATATAAAGATATGTACAGATGGATGGCTGGACGAATGGAGACGCCTGTCCGCAGCTTTAAAGACAATTCACGCAATGAGCTTATCAAGCG:1	-	chrX	4214892	3'	+	flea	5000	2	73.97
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACA:1	+	chr3R	7100910	3'	+	roo	359	2	51.41
ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTAT:1	-	chr3L	12308339	3'	-	hopper	67	1	70.08
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGACGTTTCCCTGCACCTGCTGCCGCCTCTGATT:1	-	chrX	5274256	3'	-	roo	14	2	73.48
AGACACNTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTTTTCAATAGGCGCAAAC:1	+	chr3R	20499867	3'	+	mdg3	218	2	62.60
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGGGGCACTGCCAATGAGCAG:1	-	chr2L	3114455	3'	+	roo	9032	1	56.85
AAGAATACTGTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATTATCTTACTTATATTACATTAATATATATATCTGTGTCAAGACACGATTGTG:1	+	chr2L	22209317	3'	+	flea	4952	1	67.81
GTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGGTGGGGTTATGA:1	+	chr2R	9463503	3'	-	rover	7006	2	60.96
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATC:1	+	chr3R	7100927	3'	+	roo	9036	1	58.90
TGTTCACACATGAACACGAATAGATTTAAAGACTTACAATTATGGTTTTATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTTATTTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTCTTAAACAACGATATAGTGGACTGT:1	-	chr3R	19449960	3'	+	roo	8665	2	77.40
GGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCATGTGC:1	-	chr3L	3799778	3'	-	copia	64	2	60.42
CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTG:1	+	chr2R	19540467	3'	+	jockey	4966	1	53.78
GCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTCTAGTTTAAAAACTCATAGGAATGCGCATAGTCGCATAATTACTAACAATATTTATTATTATTTATACCCTTTACTCTACGAGTT:1	+	chr3L	26169799	3'	+	gypsy4	6750	2	67.52
CTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCCCCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGTAGCCGTGGTTGTACGATGATTAGATTATTGTCGCATATATTTTTGATT:1	+	chr2L	1697605	3'	+	R1A1-element	5212	1	65.55
AGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTTTTTCCTGAACGACTAAAGATGCTTAGTATGTTTTAGCCTTTGAAGCGATGTTT:1	+	chrX	7256205	3'	+	412	428	2	61.64
CAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGACGGGAACGGTTCCTTATGTCTGCTAAATACATTTCAATGATATTAGATTCAATGATACTAGATACTCTTTTACTATACGAGTAC:1	-	chr3L	26417928	3'	+	Quasimodo	239	2	66.17
GCCAAGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGAAAATTGATAGAGCATTGGATAATAGTTTTATAGTTTTAG:1	+	chrX	17445292	3'	-	hopper	404	1	71.85
ACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGGCGTCAAAAAGTATGCTATGGTATTTGGTGTTCTTGTTCT:1	+	chrX	5629203	3'	-	jockey	120	1	54.79
CTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTTTAGTCTCGAACTCGAAGTCGAGACCCGACCCCAGATACCCCGGTTTCCCCGCATTCACCCCATCTCCTCAAGAATTTAACACACTTCTCC:1	-	chr2L	2687545	3'	+	copia	4981	2	67.91
CAAAGTGCTGCAATAAGTTAAGATGCGATTTAATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCAC:1	+	chr2L	16016382	3'	-	412	49	2	67.68
ATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATTTCGCGTATATCCTGTTAATCCCGGCAACGATTCCACACCCGCATCCTGGTAATGGTGTTTGCTGCCATGTTCCAGCGACAGGCCGAGCG:1	+	chr3R	22815931	3'	+	mdg1	7079	2	72.39
ATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTTATATTTATACATGCAAAGTTCTATTAGTATGCCAAAAACATTTTGGGTCTAGGAACTCGAGTGTACCTTTTT:1	+	chr2R	4907014	3'	-	Burdock	369	1	57.89
TGGTCATATCTTGAGACGCGAAGTGCGGACACTAGCACTCAACAATCATTGCCCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTTCCAAAA:1	+	chr2L	17599646	3'	-	1360	482	1	63.01
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCACTGGCAAAAAGTTTTAAATTTCTTAAAATA:1	-	chr2L	7945279	3'	+	roo	9047	1	69.18
ATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATATTTACTTAAGGTTTATTAAGAAGTGAGTAATTGAAACTATATTTACCTTTTAAAGCGCCCGCGATTATGACAAATCCCAA:1	-	chr3L	15307380	3'	-	R1A1-element	5320	1	56.16
CTATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGAT:1	-	chr2R	24218518	3'	-	412	29	2	55.46
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAA:1	+	chr2L	7898362	3'	+	roo	325	2	76.43
ATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATAT:1	+	chr2L	23034065	3'	+	FB	369	1	47.95
AGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAAGACGTTGTCTAAAAAAG:1	+	chr3R	1433194	3'	+	mdg1	332	2	76.71
AAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCATTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1	-	chr3L	23112570	3'	-	R1A1-element	24	1	65.22
AAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTAAAATATAAAATCCCATTCGGGAGTAAAGTTTGTCAAAATTGTACAGTGTTATGCGGAGCGTGGTGTGGGTGTTATTAGCTGGTGCTGCTG:1	-	chr2L	7810281	3'	-	P-element	2574	1	65.07
CATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGCGGGCACGTTTCCTTATGTCTGCTAAATACAT:1	-	chr3L	26417980	3'	+	Quasimodo	6917	2	76.38
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGTGACATTTTGTCGAAGTTTGTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATAT:1	-	chr2L	16091879	3'	+	roo	9047	1	55.20
GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCC:1	-	chr2L	11518383	3'	+	412	7514	2	55.00
GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTGCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTATAACACGGTATCATTTTCCAAGAACATGGGGCACCCAATTCAGATGGGGAACGTG:1	+	chr3R	17478504	3'	-	copia	25	2	68.49
TATTTCTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGTTATAACATCCGATTGGTGGGATTGCTGCTTCCTTAGTTT:1	-	chrX	7310643	3'	+	297	343	2	65.08
AAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATT:6	+	chr2R	6085997	3'	-	1360	372	1	58.90
GAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGCGGACTCACCT:1	+	chr3L	3799866	3'	+	copia	252	1	52.17
TTTTTATTTTAATTTTAATTTTCGTATTTCATATAGTTATGGGATTCAGCCTTGCCACTTAAATGTTCTTTCAAAACTAATTCACTAGAGGATATTTCTTCAAGTGCAGCGATGAAAGTATCTGCAAAAGGGCGGCCGTAGGAATA:1	-	chr3R	18871885	3'	+	Rt1b	125	1	59.59
ATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCTTTTGCGCTTACTACCT:1	+	chr2L	22150638	3'	-	S-element	74	1	82.19
ATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCACAAGTATGCAGCGA:1	-	chr2R	16891853	3'	+	hopper	1329	1	73.29
ATATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACTGA:1	+	chr2R	4402685	3'	+	1360	493	1	61.90
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTAT:1	-	chrX	6486719	3'	-	roo	62	2	66.92
GTTCCCAGGCATATCTTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTAACAAGGCTTTATCATTATTTCAATATTGAAATTGAATCATAT:1	+	chr2R	21065190	3'	+	Tabor	6941	2	55.30
GTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACACTCCAGACACATTTAATGCATTCAGCTCATATGTGTTGATCAAACAGAGTTAATTGGAGGGAATGCGTCGTTT:1	-	chr3R	9212412	3'	-	mdg1	7425	2	54.29
AATATGGATGAGACTCCTGTTTCACCGACATATATATATATATTTAACAAATAGCTTCTATTTTTTATTACTTAATATTTATTTCTCTTATACTGCTACAAGACCATTAGTAAAAGTTAATATTAACGTACATCAATCATTCTGTT:1	+	chr3L	26015185	3'	+	invader4	317	2	69.86
CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTTTTGCAATAAATTATACAATATCATTTAATTAGAAAAAATCTAAACATATAAACGAAAATGTAATGGAAACTAATGTAATTATTTTTTTTACAA:1	+	chr3L	15519892	3'	+	pogo	2081	1	69.66
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATG:2	+	chrX	23439048	3'	+	P-element	2495	1	65.19
CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGTCTATTGGAAATGAGATTTCGCATTGACAAGA:1	+	chrX	6279417	3'	-	P-element	79	1	27.54
GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGTAGGATTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATGTTTTTTATTCTCATACCTTTCTGGGCTGGTTGACTTTCGGTCCCAGTTG:1	-	chr4	1151978	3'	+	transib2	2788	1	60.96
TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTG:1	+	chr2L	6570058	3'	-	jockey	4804	1	70.77
CGAGAGCGCCTCTTACTTATGCTTATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTAAATTTTCGATATTGTACCGCAAGCTTAGAACCTTAACCTGAGAAGAAGCACTTGTA:1	+	chr2R	4449866	3'	-	Tom1	199	1	54.87
AAACTTAAATAAAAAAAATATATTTGTAAAAATAAATTTGTATCAAGAATTGAATCACTAAATACATTCCTTAAATCTTATTTGTAAAAATATTTTAAGATTTCTGAACAATATAAATATGGTGCTGCAAGTACTGCCCTGGTTTT:1	-	chr3L	11407337	3'	+	gypsy2	429	1	50.68
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTTG:1	-	chr2R	9632079	3'	-	roo	45	2	53.42
GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATTTTCTTTTTATCTTTAGATGG:1	+	chrX	21564784	3'	-	diver	5908	2	69.40
CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGNCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATAAGTAAATAAGTTTGTGAAAATAATATTGTAAATATTTACGAATGAATTTGGG:1	+	chr3R	5061931	3'	+	mdg3	180	2	63.70
TCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTACTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAACTATTATCGTAATGCAGATATTGTGAATGATGATGTAATGTCTT:1	-	chr3L	23818349	3'	+	copia	212	2	67.12
TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTAGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGATTTCATAGCCTACTTAGCGGCGCGCGCTGCGAGTTATTCAAA:1	+	chrX	13066613	3'	-	jockey	26	1	64.00
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATTGTGTGTAATCATTCTATGATTACAAATGTTTAATGCATTTCCTGAAATAATTTTGACGGCTGCTCTCAGTGAGCACT:1	-	chr2L	13584623	3'	+	pogo	2060	1	52.05
ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCGTATGCAGCTCCGTAAATGCAAGTGTATGTTACATGCATTAAAAATAGTAGTGAAAGTGGTAGTGCAACATGATTTACGTGGTCAGTTTCT:1	-	chr2L	18404484	3'	+	hobo	2926	1	72.09
AATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATAT:1	+	chr2L	9778710	3'	-	INE-1	570	1	79.57
CCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAGCAATAATCCAAACATACAGTCTCGCACTTACATAACATACTTGCATGCACAGAACATAACGTAACGAAACTTGAAACCTGCAACAAAGGAAAACACATGATCAT:1	+	chr2R	6271538	3'	-	X-element	27	1	65.07
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAA:1	+	chr3L	11530990	3'	+	roo	358	2	52.05
GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACTCACACACACACACTTTG:1	-	chr3L	10013589	3'	-	hopper	72	1	67.86
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACG:1	+	chr3R	7100915	3'	+	roo	9024	2	50.68
CAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGACTCACTTCTTTTTCTTTTGGTCCCG:1	-	chr3R	20499694	3'	-	mdg3	5259	1	79.45
TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATACCCAACTTATTAGTGTG:1	+	chr2R	7586241	3'	+	I-element	5327	1	61.64
CGGTGGGACAAACACAAAATGTGCTTATGGTGATATTATTGTTACCGCAACTGTACGTGAGAAAACCTCAAGTGCGCTGGTTAACAAACTAGCTGCAATTATCGGAGAAAACAAGTTCCATTTCATTTGCAAATGTTCCCTGGACA:1	+	chr3R	7613017	3'	+	Tc1	1612	1	78.77
TTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAAGTGGAATTGAGATTAGTTCGGGGCGTTTACCGATTAATCAGGCTGAATGTATTTATTATAATTGCCTGCCAAGCTATTGATCTCGTTAAATGCCAAGCACTATAGCAATATAC:1	+	chrX	17525198	3'	+	roo	8809	2	78.08
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTG:1	+	chr3L	20654576	3'	+	roo	9038	1	54.92
CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCGCAACTCCCACTCCAAATCCAATTCTGTGTCGTATGTGATGCTC:1	+	chr3R	17316327	3'	-	opus	170	4	65.65
TTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATGGTAGGTGGTGGATGGTTGATGGTAGATGGTAGATGGGTGGTATTCCATTGGTGATTCCCAATTCGTGGTACTCACCCCAATCCTGCCGAGC:1	+	chrX	17032419	3'	+	jockey	4884	1	65.93
GACTCAGCATTCCTTGCAGCGTGCAGCAACACTCGGAATAAGAAGCGTCAGCTTTTCACTGCCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1	-	chr2R	1982173	3'	-	gypsy	7132	2	64.96
GTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTTTTACTTGAATTTCCAAATTGAATGTGCTGCAGTCCTCGGGGCCGTACATGAACATCC:1	-	chr3L	22926413	3'	-	mdg1	71	2	56.06
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTATATGTTGTAGTAGAACATTCTCAATACAAAGAATTACGAAGTACAA:1	-	chr3L	20654431	3'	-	roo	20	2	71.92
GGTGGGGTGTACCATCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTGTCTCTGTCCGGTTCGTTAACTCTCAGCTGCCCGCAGCCGCTTTATCCCCACTGCAGCGAAATTGCTGGCCCAAGAAGGTC:1	-	chr3R	902736	3'	-	G5	4638	1	62.96
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGGGGCTTGTCTTTTGTAAATTGTTTAATTTTCTGCGATTTTTTTGTGTAATTT:1	-	chr2R	18349315	3'	-	roo	8735	2	69.18
ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATAGAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTT:1	-	chr3R	17605640	3'	+	Tabor	7273	2	55.47
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGG:1	-	chr2R	13084615	3'	-	roo	76	2	79.23
TCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGGAGCAATAGAAGCTG:1	-	chr2R	23466015	3'	-	Doc	486	1	56.99
TATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTAC:1	+	chr3R	846264	3'	+	Stalker4	98	4	69.39
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GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATT:1	-	chr3R	5061856	3'	-	mdg3	61	2	65.60
TAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAATAGGCAAAGTTTTGACTGTATAATGCGAGATACATTGCAGTTCCATTGTCAGCATGACAATGTGGCGTTCGTTATTAGGCCGG:1	-	chr3R	11567514	3'	+	BS	4908	1	65.32
TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCACAAAGAACACTTTTTTCAGATTCGCTCTGTAGGTTAAACCCTTGATCACAAAAGCTATTAACATGTTC:1	+	chr3L	4536837	3'	-	roo	3	2	78.03
AGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAA:1	+	chr2L	23390220	3'	+	rooA	267	2	45.89
CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCNNTNNTNCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCAC:1	-	chr3L	10013607	3'	-	hopper	37	1	65.52
GCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGCTTCTTACAAAAAACCTGTTAGCCAAAGCCATAATAAGCTTTCATGTTATGATTAGCCTTAAAGGA:1	-	chr2L	5590936	3'	+	roo	300	2	62.33
CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCACACCGCCGCGATTTTACACCTATTTCTATAGAGCTCTCCGCATCTAAAATTCTCTCGGCTGCACCT:1	-	chrX	17832969	3'	+	Tirant	377	2	62.61
GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCATTTTGTTTTATTTGTTACAAAATTTGCGCATTTACAAAGCGGCCTTAAAATATCGTTTGT:1	-	chr3L	12308290	3'	-	hopper	31	1	60.00
GTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGACTGACTCGTGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTAAATATATTATTAATACTATCATTAGTATTAAAGCAATAATTAATCCAGCATGTCCGGAAATATGATGGAAATGTAAATCT:1	-	chr3R	19449762	3'	+	roo	8786	2	75.34
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TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTG:1	-	chr2R	19451031	3'	+	1360	3382	2	64.39
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GGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATAT:1	+	chr2L	6570011	3'	-	jockey	4861	1	65.71
TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTTCGAAACAG:1	+	chr3R	12717851	3'	+	297	6942	2	60.74
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TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCCCCCAAAGT:1	+	chr2L	6570068	3'	-	jockey	4807	1	71.33
AAGCCAAAAATAACGGAAAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGACTTGAAATATAATATTTAGCCCGGCTTTGAGTC:1	+	chr3R	12837584	3'	-	S-element	282	1	77.40
CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCACCTTAATTATATGGCCGCCGACAGAA:1	+	chr3L	19036050	3'	-	Tirant	78	2	77.52
TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGGTGGAAG:1	+	chr3R	14940160	3'	-	jockey	64	1	66.95
GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATACCACTTCCAATTTGCAGGTACGCGAGGGACTCGAGAAAGTCTTTTCACTTGTTTTTTATCTGTGGTATTTAGACATAATACGTTTAGGAACCG:1	-	chr2R	6885264	3'	-	flea	10	2	76.34
CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGACAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCG:1	-	chr2L	17081778	3'	+	jockey	4948	1	54.14
ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAAA:1	+	chr2R	24561531	3'	+	P-element	2825	1	43.15
CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGT:1	-	chr2R	9791604	3'	-	412	87	2	79.45
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTNCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTG:1	-	chr2R	9632100	3'	-	roo	8702	2	55.08
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGCCCCGTTCTCTCCGTATTTT:1	-	chr3R	27994164	3'	-	roo	8703	2	55.71
AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAACAAAGGCAAGAGAGTCGAACGACCCCGTCTTTACC:1	-	chr2L	2909628	3'	+	hopper	1391	1	63.57
TTAGGTCCAACACTGACCTACGCCGTCCAAGTGTGAGAAACTACCTCTAAGACTCAGCTCAATAGTCTTAGAGTAATACAAAACTTTGGGTCTCGCTTCAGATTCTATCTCTGACCATCATTCGCTTACTTCGCTC:1	+	chr3L	26130891	3'	+	G5A	2416	1	59.56
AAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATT:1	-	chr3L	19013888	3'	+	invader3	239	2	60.96
GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTT:1	-	chr3R	17243096	3'	+	hopper	1405	2	71.82
CCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTG:1	+	chr3L	16343283	3'	+	roo	366	1	63.37
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTG:1	-	chr2L	11518412	3'	+	412	7497	2	67.59
CAATAAACACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGAAAGCAAACAGAATTCGAGCAACTGAAGCTGGAGGACTGGAGGAGTGGAGGGCT:1	+	chr3R	23834589	3'	+	Porto1	4446	1	61.29
ATAACAGTTTAAAGTATTTCGAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCA:1	+	chrX	17431785	3'	+	hopper2	1522	2	71.92
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTGTTTCCTACAAATAAAATGTTGTAGCCTAGGTTGGGAATACAAAAGCAATTTTGAATATAATATATACAATTTATTTAATTAACAATGTAAACAATGGAAAAATTC:1	-	chr3R	26222808	3'	+	roo	394	1	73.97
ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTC:1	-	chr3L	10848640	3'	-	blood	43	2	51.16
TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGC:1	-	chr3R	30344616	3'	+	pogo	2049	1	62.69
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACCAAATACT:1	+	chr3R	17243253	3'	-	hopper	6	2	75.38
ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATTTC:1	-	chr3L	12861690	3'	+	pogo	2074	1	61.24
AGTAGTATAAAATTTAACTTATATTTCTTTACTAACTGTTAAATTTTATACTACTACTACAGTAAAAACGAGATGACTTTTTTAAATTTAAGAAATCCGATTAGGAAAGCATTTTCAGCAGCAGAGATGGCTAAG:1	-	chr3R	7718221	3'	-	297	470	1	73.33
AAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATACAATCGAAACTCCAAGGCACCAACAAAATTGGTTACGAAAACTCGTTTGGTCTAC:1	-	chr3L	13500224	3'	+	F-element	110	1	59.09
AGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATATATATATATACACGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTAGTTGTAAAGTTTGTAACAGGTAGAATATTCTCAGATAATCTTGGTCATGTCA:1	-	chrX	22715005	3'	+	Bari1	1697	1	74.07
TAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATNTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCTAATTCTGGACCACAGTGCGCTGGCCCGCTCGCCATCACCCATACGCCG:1	+	chr2L	9564512	3'	+	transib2	2762	1	74.56
GAAAATGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGCACTGTGAGAAAAGCTCGCAGTTGGAAATTGGAAATAATAATTATCTTAAAATTATT:1	-	chr3L	16173106	3'	+	jockey	398	1	60.96
GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGTTGGCGTAAAACGTCAAGCAGCCCGA:1	-	chr3R	14979777	3'	+	pogo	2098	1	70.53
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGGCG:1	-	chrX	6486711	3'	-	roo	8704	2	56.30
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCA:1	-	chr2L	3114448	3'	+	roo	9039	1	63.01
AATAATATTAATATTTTGAATTGCCATTATTTTCCGAACCAATGTGTTATCAGCTTCGTTATGTATGTGTTATCAGCTTCGTATTACGATAGTGTAACCAAATTTCCATGAGATTCAGCATCTCATGACAATCAAGACACGTCAGT:1	+	chr3R	13837047	3'	-	Burdock	499	1	74.66
CAAGAGAGCCTGGAGCCACCCCTAGAGCCACGCCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACC:1	-	chr3L	26852651	3'	-	1360	74	1	69.84
ATAATTNATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATCATTG:1	+	chr3R	22956037	3'	-	roo	69	2	65.96
CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCA:1	+	chr3R	29361033	3'	+	mdg1	7374	2	77.40
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTG:1	-	chr3R	25448314	3'	+	roo	9045	1	64.18
AAAAAAAAGCAATGAAAGTTCGAGCTTAGATATCACGTTAAATATAACCGACTAATTACTCCTATTTTGCAGGTTTAATTTAAAACAATTAAAGTATACCGCAATTAAACTAGCTTAAGCTATACTTATTACAATTTGTATTTCCC:2	+	chr2L	12760364	3'	+	transib2	2647	1	38.36
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGACTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACA:1	-	chr2R	19004126	3'	+	roo	9046	1	61.21
AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCGCCAAT:1	-	chr3R	14364595	3'	+	roo	404	1	73.91
GGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCTATTCTCTATAATACTTCAATTGTATACTTTAATATTACCGATGATCAAAACATTTT:1	-	chrX	17756576	3'	-	297	6637	2	60.28
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAATACG:1	-	chr3R	20469567	3'	-	roo	8693	2	42.47
GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCTCTGGGTGGGTGGTCCTTTAAATATTC:1	+	chr2L	11674397	3'	-	jockey	32	1	59.72
TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGAGTTCATGTGTGAACACACAATGATGATATCATTGG:1	+	chr3R	26222911	3'	-	roo	64	2	83.81
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGACTGAATAGTATCTTCAATCGACCCAAGCGGTTCCACTGTATTTGAAGGTATACAAAACAACAGCACGTGACCATATGGCCAAGCCAGTTTCC:1	+	chr2L	17471723	3'	+	roo	392	2	70.15
GGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAATATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATG:1	-	chr3L	7292429	3'	-	HMS-Beagle2	6907	2	69.50
AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCAT:1	-	chr2R	9791547	3'	-	412	7083	2	65.75
ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCT:1	+	chr3R	14979879	3'	-	pogo	54	1	63.08
TTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATTCCCCAGCACTTTGGC:1	+	chr3L	10574422	3'	-	Tabor	17	2	63.70
TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGTTGCACTCATTATTTTCATTCCATAAATTATATCTTC:1	-	chr3L	10647908	3'	+	412	7500	2	54.62
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTG:1	+	chrX	9540135	3'	+	roo	9033	1	58.90
AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATATATTCAGCAAAATTTTACATACACATACA:1	+	chr4	166516	3'	-	Quasimodo	79	2	82.09
TATAAAAAAATAAATATAAATTAAATTTAAATTATCTCTGGCAAGACGAATATTAACAAAATAATAATATCAGAACGATATATATTAATGGGTCGTATTTAAGTAAAATGAATTTATGTTAATATAGACTATATTTAGGGCATTGA:1	-	chr3L	12731662	3'	-	S2	100	1	73.29
GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATTAAGCTTCATTTTTATTTCTATTTA:1	+	chr2L	1839359	3'	-	hobo	25	1	68.49
TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACGTG:1	-	chr3L	18596618	3'	-	Doc	39	1	55.05
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAA:1	-	chr3R	18582136	3'	+	roo	356	2	53.42
GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTGC:1	+	chr2R	13006515	3'	-	3S18	5817	2	55.30
TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATTTGGAGCAACCAAGAGCATACAACAATATATAAAATACATTCG:1	-	chr2L	11732247	3'	-	Doc	36	1	52.74
ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATAAATTAATATATGCAACCCATTTAAAATTTGTTTCATTTCTTTCTTAGTTTTTGCGAGGATTTT:1	+	chr3R	9293298	3'	-	297	20	2	60.98
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGAC:1	-	chr3R	20499718	3'	-	mdg3	5261	1	75.81
CCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTAAC:2	-	chr3R	9714345	3'	-	Stalker4	6982	4	67.81
TATAAGTATAAATATAAGTAAGTATAAATATATATATTCCTCAACCTTTATAATTTACACCAAATATGAACAAAATTATATTTCCCCATAATAAATAAAATAACCTAATAAAGTAATATGCCTTATAAAGTAATAGGTATACAA:1	+	chr2L	11189412	3'	+	Stalker4	7209	4	46.53
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTC:1	-	chr2R	9662709	3'	+	412	444	2	57.94
AACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTTAAAATTATTTTATGACCCCCATTGGCTTTGGCACTATCAAAATGTAGTGGTCATATATGATGTGAGCACAGTTTCTAATATAAGGCGTATTTTCACACAAATATAAATTTCACGTACAT:1	+	chr2L	13768202	3'	-	S-element	1533	1	60.27
TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTCATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTTCGAAACAGAGTTAAATTTATTGCTGAAT:1	+	chr3R	12717871	3'	+	297	370	2	68.49
AGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTGCCCCAACTTGCTTATAATTCCCGACATCGGCTTTTGAATCTG:1	+	chrX	21016835	3'	+	Transpac	255	2	69.35
CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACGATGCTGGGAATTTGTTATTGAT:1	+	chr3R	14651307	3'	+	P-element	2848	1	54.48
AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATATAAGTAAATAAGTTTGTGAAAATAATATTGTAAATATTTACGAATGAATTTGGGTAAGGTAATATATAAACTCAATTTGAGTTTGAATCATACCAA:1	+	chr3R	5061973	3'	+	mdg3	228	2	69.29
TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTC:1	-	chrX	8814735	3'	-	pogo	66	1	65.75
TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCGCGGTAATGG:1	+	chr2L	21400384	3'	+	mdg1	353	2	63.38
GAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACGATAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAATAAAAAACATGTGTGTATTATTCGGTCTTGGCGTGTGACTGCCCCTTGCCGTTTTAAAAAGACAT:1	+	chr2R	1277273	3'	+	Rt1a	5000	1	74.66
GCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTATGTATGTGAAAAAAGCGCGCTGTCGTCACCGCCATCATCATCGTCATCGTCATCTATAATACTCATATTGAATTAAAACCCACCAATTTCCCAAGAGAAACTC:1	+	chr3R	19739950	3'	-	accord	7033	2	61.94
GTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGG:1	-	chrX	10644449	3'	-	jockey	4841	1	71.23
CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATGTAACTCTTGTTGCCATGCATATCTGCACTTGTAT:1	+	chr2R	8146110	3'	-	P-element	87	1	23.29
GAGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGAC:1	-	chr2R	21907937	3'	+	roo	8991	2	71.23
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATC:1	+	chr3R	25448418	3'	-	roo	79	2	71.72
AGTCGAGATCTCAGGAACTTTAAAAGCTAGATGGTTGAGATTAAACATACGATTCTAGAGACAGGTAACTCAATAACTCGATTTCTTTTTTAATATTTTTTATAGTATGGATTTACATTATTTAAAGACTCC:1	+	chr4	362929	3'	+	INE-1	144	1	57.58
AGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAATCACATGCTGGACTGCGCAAGAAGTGGCTATATACAACGATACTATATAGAGA:1	+	chrX	16833851	3'	-	roo	8835	2	63.70
ACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGTTAAAACCAAGTTCAAAAACGTTAACAAATCACAGAATAACAAAACTTCTATGTAAAG:1	-	chr2R	11363745	3'	-	Bari1	54	1	60.87
GTGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTAATAAAATAATCAAGTTAGCATGATATAAAAACGTG:1	-	chr2R	16893886	3'	-	hopper	1410	2	65.05
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACGATTCGTG:1	-	chr3L	16343184	3'	-	roo	8674	2	75.00
ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTT:1	-	chr3R	6290952	3'	-	Doc	60	1	58.22
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAACTATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTATTTTTTATCG:1	-	chr3L	4536655	3'	+	roo	9047	1	62.33
AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCAA:1	+	chr3L	25401042	3'	-	Doc	23	1	59.86
TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGGAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGA:1	+	chr3R	20868184	3'	-	BS	5079	1	73.97
GCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACTAACATCACCTAATGGCCTCAATAAATTAGGTTCATGACTCTCAAATTAATGAACTTTTGCTGGCAATTAGCTCATATAAATTTA:1	+	chr3R	18334765	3'	+	F-element	4361	1	65.28
TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGTTGTTTGTA:1	+	chr3L	26011954	3'	-	F-element	83	1	67.81
ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAATAGAATAACATGTTA:1	-	chr2L	14892196	3'	+	transib2	2776	1	52.08
AACACAAAAACAGTACAACTATACATATATTAACTACATTCGTTAAAAACAATATACCTTGTCTTTTATTTTCCATATTTTACTATAATTTATTTCCCCCTGTTTTTTCCGCTCGAATTTTCTTGTTTTTGCCATTGTGAGAGTTG:1	+	chr3L	15760123	3'	-	transib2	325	1	59.59
GCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCAAAGCTGCGGTAAGATGATCCAAATCCATCCC:1	-	chr2L	19965247	3'	+	Doc	327	1	68.32
ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGTTGTT:1	+	chr3L	26011950	3'	-	F-element	71	1	66.92
CAATAACCAACATTAAAATCATTTTTATATTTATATCCTTTTCAATAATTTCATAATATTTCAACACAATATTTCGCAACTCTTCCCATTGTGCAACTCACGCTTTTTGAGTGTATGTCTTCGGCTCAATGGAAAAAT:1	-	chr2L	5567167	3'	+	Doc2-element	4397	1	75.36
GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAAT:1	+	chr2R	11164479	3'	-	roo	8751	2	81.51
AAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATTCGTAAAATTATATAAGTTGTACCACTTTA:1	-	chr3R	25453993	3'	+	Quasimodo	7328	2	58.90
AATAATTATTATCATATTATTCGGGTTACTATATAATTTATTTTTTTCATATCTCAGGTAAAAAGACAAATACCTATTTCATAGCATTCAAGAAAATACGAATTGTTAATAAGGGAATTTTCCTCATTAATGAATAGTTTTAAAT:1	+	chr2L	3608260	3'	+	Transib5	2566	1	71.72
CGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTTTCAAACGAACAACAAGAACGATTTTCGATAGCACCGCGATAGCATTTCCGTTTCGACTTCACTGTCGATAGCG:1	+	chrX	19613678	3'	-	Quasimodo	7127	2	49.32
CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGAATTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGATTTCCGGGCAGGAGCTCTCGAAAAAGGATTCCCTTG:1	-	chr2R	21228967	3'	-	jockey	35	1	65.12
AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGA:1	+	chr3R	14981282	3'	-	mdg1	7071	2	62.33
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTC:2	-	chr2L	16091874	3'	+	roo	9031	1	53.42
AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCAC:1	-	chr3L	10013554	3'	+	hopper	1409	2	76.15
TTTATTATATGTTATTAGCTATTCTCCACATCGCCAATGAAAGCAGTTCTAAAATCCTGCAAGCGCTCTGTCCTGCCGACTTGGACAATTGCAAAGTGTGTGCTGATCCCCAGGATCCTGATTTATTTTAAATATTGAT:1	+	chr2R	3760472	3'	-	Doc3-element	70	1	46.76
GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCG:1	-	chr3R	10182100	3'	+	blood	365	2	69.37
ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTTCATAATTCGCTAACTAAGCCAAAAGCCGCAAAAACTGCATTCCG:1	-	chr3R	14937479	3'	+	I-element	5310	1	61.16
AGAAGAGTTGGAGGAATTGGATGGAGCTGCAGCCTGGACATGCTCATAAAAACAAGGACATTCGCGCTGGCCAACAAATCATATTACAAAACTTTACACGCTTAAAAGCGCATGGAATTGGCTTTTGAAATGGACGCG:1	-	chrX	20712509	3'	+	invader3	488	1	71.74
GAAAGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTTTAAACAAAGACTCAGCGCACAAAACTTGTAATGCCGCCGGCGGCTAAGCAGGTTACTTATTCTTAATTAGCCTTCCAATTTTCATATGATCTCAACATGTCTGAGAAAACGCACCAG:1	+	chr2R	5149306	3'	+	INE-1	173	1	48.63
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTCTAAAG:1	+	chr3L	15600369	3'	+	roo	9054	2	59.59
CCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGGTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTT:1	-	chr3R	25423213	3'	-	3S18	76	2	67.12
AATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTTCATGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTCTAAAGTCTATTATATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCCTATTAAGTTAGATTTACTCGTAGACTAAAAAATTTATTGATAAG:1	+	chr2R	1438436	3'	+	Cr1a	4151	1	68.75
GGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCC:1	+	chr2L	11661023	3'	-	F-element	67	1	50.68
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTT:1	-	chrX	5643453	3'	+	roo	9032	1	57.53
AAAAAAATGGGGCGGAGTTGGGGCACACCCACTTTTCCAAAATATTCTGGCGAATTAACCGAATGAAATCAACTAATGAAAGTCATCTGAAAAGCCATATCTCCGTCCCAGTCGCTCTCT:1	-	chr3R	28947751	3'	-	hopper	129	1	65.00
TCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATATTTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAATACGCGAACGAGCACTCACACAGATACTGGCAACAGCGATAAT:1	+	chr3R	18439405	3'	+	jockey	4830	1	69.18
AAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGCGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACTCAAATCTACTACAGAAACCCAAAACCAAAA:1	-	chr2R	7074026	3'	-	F-element	253	1	82.22
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTAT:1	+	chr3R	17420501	3'	+	roo	9001	2	68.49
AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACA:1	-	chr2R	24218524	3'	-	412	7112	2	58.74
CCTGAGATCTCGACGTTCATACGGGCGTGGCTGGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTTACATTTTTATACCTTTTCTTTAAATGAAATTATCTAGTCTATTT:1	+	chrX	21575420	3'	-	INE-1	137	1	43.84
TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAAATGCTTGCCTCTGCTTAAGCAGATGTGTGAGTGAGAGTGTGCCTGCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGGAGCGTGGTTAAAAAGTGCCAACGCAGCATGTTTTCAACAT:1	+	chr3L	17136187	3'	+	hopper	1403	2	76.71
GACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATAGTACAATAGTTTTGGCCAATTTCCTAGCCGTTCTGATCGCTCATAAGAACAA:1	-	chr3R	28263708	3'	-	1360	3224	1	78.08
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAA:1	+	chr3R	25448427	3'	-	roo	69	2	68.06
GGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAAAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTAATTCAGTTGAGAACACAAAATCAAATTAACGACAACAACAAATAAATGCTCCCACACATTACCAACTTATTGTCTTAATTGATTA:1	+	chrX	17227880	3'	+	INE-1	556	1	73.05
AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATG:1	+	chr3L	17115551	3'	-	blood	7045	2	55.47
GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTG:1	-	chr2L	15833473	3'	-	jockey	62	1	68.47
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTCAAGGAGCCGAGTCGTCGGC:1	-	chr2L	14081274	3'	+	1360	3380	2	75.20
TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACA:1	+	chr2R	9632169	3'	+	roo	8987	2	76.22
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGATGGAAAAAATAGGGGAA:1	-	chr3L	4840723	3'	-	jockey	4709	1	50.82
ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACA:1	-	chr3R	6290957	3'	-	Doc	65	1	61.64
TTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTGTCCAAATTTGTTTCCAATATTGCTTAATTTTAATCTTTTAAAATAATTGAAAATTTTAACAAGTTCTTACTTGCTTGACTCCTATGAAATATT:1	-	chr2R	15292023	3'	-	hobo	261	1	62.96
CTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACATGAATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATGTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAA:1	-	chr2L	14588754	3'	-	1360	319	1	60.00
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGT:1	-	chr3L	20831268	3'	+	roo	356	2	56.85
TAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAACAAGGCACTGATTGTTGAGTGCTTGTGAAGTGGAGCGGTGTCTCCCTGGAGGTAAAGATGGGCGACGACTTGCCATCGCCATAGTCCTTTTACCGACAGCGTTTTTCTTTCC:1	+	chr3R	934817	3'	+	1360	414	1	57.53
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCACGAGCTTAGTTTACAATACTTGCTAGCTCTACCTCAAGGAGCTTT:1	+	chr2R	9662826	3'	-	412	31	2	62.86
TAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATCCAGCAGTACCTGGATAAAGGAGCACGGGG:1	+	chr2R	13082252	3'	+	roo	8691	2	79.17
CTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTATCCTAATTGTACAAATACAAAATTAATCTGTGCCGCATATAAACCACATTTGCAAATAAATA:1	-	chr2L	14772311	3'	+	roo	409	1	48.63
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCA:1	-	chrX	14336424	3'	+	roo	348	2	67.44
TGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCACACAAAAAATATAACTTGCAGATCCTAATGCTGATTATCTTGGCTCTGCCTGACTTTCCAGCCTCTCCTTATAGGGGCGTCACCATCGTGTCCTCTCATT:1	-	chr2R	5173384	3'	+	gypsy	7428	2	72.60
GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACAAAAATAAAGAGCTGGCACAGCTTCGTCCAGCAGCAGCAA:1	+	chr3L	10385912	3'	-	Burdock	6150	2	53.75
ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACA:1	-	chr3R	23495664	3'	-	copia	4955	2	75.34
AATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCA:1	-	chrX	21564658	3'	+	diver	161	2	62.76
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATT:1	+	chr2L	12892688	3'	+	roo	331	2	77.04
TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAATTCACACGTAGCACAAACAACTCGCC:1	-	chr2L	15832960	3'	+	hobo	2923	1	68.42
TTTTTTTTTTATTATTTTATTTTGTATTTTATATAT:1	+	chr3L	10356736	3'	-	Rt1b	5143	7	80.56
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTC:1	-	chr2R	13696397	3'	+	roo	407	1	71.25
AATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAGCTATGTGTGTAACCTACGCTTATCGCTGGCTAACCAAGAAACTCAACGCATGCACAAA:1	+	chr3L	17561594	3'	+	jockey	4815	1	59.05
GGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAATAG:1	+	chr2R	20194307	3'	-	Max-element	8262	2	57.98
ATTTGAAAATTTAAAAAAAAAAATGGTTTTGAAAGATAAGGCCTTTCTTTACACAAAAAGTAAAAATTAAATATGTTTACAAATAACGTTTTTGGTCATCATTTGTGTAATA:1	+	chr2R	10160459	3'	+	TART-C	11091	1	78.57
TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGAC:1	-	chr2L	3114504	3'	+	roo	321	2	76.39
CCGCAGGGATCCCGTTATTTTGCGCACGGCCCGCTCGAGTATAAGGTCCAACAGTTGTACCGTTACTTCACGGTGCGGCCTCTTTGTGCATGCACCGTTACGTGCACCTCCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAGTTTACG:1	-	chr4	249255	3'	-	gypsy8	320	1	61.43
ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTT:1	+	chr3R	14979880	3'	-	pogo	27	1	53.85
GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGAT:1	-	chr2R	5485090	3'	+	blood	336	2	54.11
AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAGGCCTTTCCGCCGTGGTGAGTTTCGTTGCTCTCCCTCTCCCTTC:1	-	chr3R	18121658	3'	+	P-element	2817	1	33.09
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTGCCGAACTGCATGACATTGTG:1	+	chr2R	14542230	3'	-	roo	52	2	60.45
GAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCTACCTATTGGTAGACACAGAATCCAGAACGGGACACATTCGACTGCATCCCATTCCACCCATCACGTTC:1	-	chr3R	12913320	3'	-	R1A1-element	329	1	54.40
AATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCAC:1	+	chr2L	22685184	3'	-	Ivk	55	1	62.40
CGGGCGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCTGCTACTTTTTATTTGCCTATCGTATATGATGAGTATGTGTGTGTGTATTCTCCTTAACGTGCAAAATACATTTTT:1	+	chrX	3308409	3'	+	hobo	2919	1	64.46
CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATG:1	+	chr2R	16785408	3'	-	412	79	2	71.92
ATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGCAGTGTATT:1	-	chr2L	12290671	3'	-	1731	68	2	61.64
ATAGTTTAGGAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGGCAAATATTTGTCCCTTTTT:1	+	chr3L	10013690	3'	-	hopper	34	1	59.56
GTCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGGGGAAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1	+	chr2R	18514895	3'	+	Quasimodo	6951	2	51.22
AAACCAAAAAAAAACATCTAAAATATTGAGATTAAAATATAATTACATTATAGTTCCATAAAGTTCTTGAATATACCCTGTAAAGTTCAAGAGTCTA:1	+	chr3L	5878325	3'	+	Transib5	24	1	75.26
ATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGGAGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTTAAAGCTTAGAAACACCCATTTTGATTGGATGTATTGTATTGAATCAAGAGGACT:1	-	chrX	14135759	3'	-	1360	234	1	60.96
ATTCTTGATCAGGATCACTAGCATATCCGGACATGTCCGTATGACCGAACTATAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTATCATCTGTTACTTTCATCTC:1	+	chr2R	13259711	3'	+	INE-1	86	1	65.67
AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTT:1	-	chr2R	9791552	3'	-	412	7088	2	62.33
AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACACTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTGCAATTAGACA:1	+	chr2R	19540482	3'	+	jockey	4954	1	54.11
CTATTATTTTGACCGCATCTGTGCGAAGCCACGTGTGTGCATATCACACTGACTAGAGCGAAAAGTCATTGGAATCACACCCTTGAAGATCATTTGCGGAGACATTTTA:1	-	chrX	18190091	3'	-	Tc1	2	1	72.48
TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGTTGCTGTTAAAAGAGCTTCACCCCAATAACTTTTATTAG:1	+	chr2L	22775597	3'	+	pogo	2060	1	55.86
AAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACG:1	-	chr3R	14049324	3'	-	transib2	54	1	54.11
GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAAAAAATTGTATATTTCTTTAATATATGATGAAA:1	-	chr3R	11105940	3'	-	Doc	54	1	54.17
CCAATCTGGACGTACGGAATTTAGCTGTGGGGTACTGCAAGCACATCACAATTCAGTTACCAATAAACCTCTGCGCTGTAAACACGTTTAATAGTGTCGAAAGAGAGCGAAG:1	-	chr2L	23395745	3'	+	G2	2655	1	56.25
AGGCTTGTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTTAGTTGATAACAGCTGTGACAAAATTAATTTGATTAATTGTAGTTCGTAAGATAT:1	-	chr2L	23020629	3'	+	Transib5	2941	1	49.32
TCACAAGCGTACAAAACACATTGATGTCAGATATCATTTTATAAGGGACAAAATTAACAAAAATTAAATAATTGTTGAATATGTTACTGTCTTGGTTGTCCAGTTTTTTTCCAGTGTGGATTGTTTTTTTAA:1	+	chr2L	3339030	3'	-	frogger	390	1	65.15
AAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAAACATTTAG:1	+	chr2L	22684618	3'	-	transib3	47	1	59.29
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACANGATGTGTACTGGCTGGCTGGGTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCT:1	-	chrX	13039470	3'	+	roo	390	2	58.95
CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAACTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTT:1	+	chrX	9540103	3'	+	roo	355	2	63.28
ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAAATATTAGTTATTGAGCAATATTTTCAATTTAAATCAAAGAATCATAAATATTCAGATAAAGAAAAGCTGAAATATTATATTTTGCACAGAATCAAA:1	+	chr2R	20944481	3'	-	pogo	18	1	67.13
ATTTAAAAATTAAAAAAAAAAACGTGTCTATAAAACGAATATAATTTTTTAGTAATCCAATCTATTTCCTATCTAATTCCAAAGGGAATATTTAAAAAATTCTTTTTTTTTTCAATACTATCTTGGATT:1	+	chr3L	2629773	3'	+	TART-B	10633	2	88.37
AGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCTCTCCTCTGTGAGTAATCAAAGCCACGCCCCAGAAAGTAGGCTTTAATTTATGCTGATGCGGCATCGG:1	-	chrX	17431698	3'	-	hopper	32	1	56.59
GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCA:1	-	chr2R	7586166	3'	-	I-element	5052	1	55.41
GTTCGTCCGTCCGTCCATATCGGCGTCACTCATAATGATTTTCACTACTCAATTTGTACAGCTGCGTGAGTTACCAAATTGCCTTAGATCGACACGGTGGGAGGCTACGATGTGCGTCCATACACTTATCTATGT:1	-	chr2R	981788	3'	-	micropia	426	2	51.11
CACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGTTCGAGTTATTAACCAAGTAGGTACCAGCTACCGTCTGGACGAG:1	-	chr2R	4155696	3'	-	invader4	2882	2	51.11
CCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAAAATACATAGATATATAAAATACGTATATAAGCTTTGCAGTTCTGTTCTTAC:1	-	chr3L	5649560	3'	+	Stalker4	180	4	78.77
TGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGAAGTACTAGACTGCAGCGTAACTTTTTATATAAAATATTTTAAAAAATGTTACACATCATCAGTTTTGCGTATAGTAAGTTTCAAATTGACATAATTAGTTTAAAATAGATTTGCTTTAAA:1	+	chr3R	18326977	3'	+	INE-1	548	1	66.90
CTCCAAGTTTAAAGTTATGACCTTTTGTCGTGCCAACCCAATACGCATGACATGTGTAGTTTCCTGAGAACTATTTCCAGCGGAAGTTTAGCATTTATTGGCGCACTTACTACGTGATTTATTTCCCAGA:1	-	chr2L	839764	3'	+	Q-element	667	2	66.92
TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCAAAATCAATATTTTC:1	+	chr3L	3477535	3'	+	mdg1	7417	2	56.16
ATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAGTAGATATATGTATTA:1	+	chr3L	19339451	3'	-	Tc1	49	1	54.79
GACATTGCAATGTCGATCGCTGTCGTTTTTCTGGATTGTGGGCAATCAAAAATTATGTGGTCTACATTGCATTGCATTGC:1	-	chr3L	24038307	3'	+	G3	192	1	66.25
TTACTAATTTGGTTTTTAGGTCTCTGTGTATGTCTTCGTTCCAAACGTACCACGGCGCTCCGGTGGTTCACACGACTTGACTTTACTTTTTCCCGGTGTGATGAATTCTAACTTTGACTCTAAAAGGAGGGAGAGTGAGA:1	-	chr3R	934662	3'	-	Doc	4421	1	54.29
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTCAGTTGTCAACAACAATGCCCCAAGTTGCAACAATAAAATTCTGACACATTGAAAAATGTCATT:2	+	chr2R	9632200	3'	+	roo	9015	2	55.48
CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCA:1	+	chr3R	27424952	3'	-	blood	7068	2	50.00
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTATACATTATGT:1	-	chr2L	8986096	3'	-	412	37	2	58.62
AACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATG:1	-	chr3R	19589881	3'	-	BS	5001	1	73.98
AGGGGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAAACTCTCGCTTCTGATTTTAAGCGTGAATGCTAAGAAACCAATAATAATAAAAATACACGAGAGCGTGGGCTTCCATCGTCCATCCACCATCCTC:1	+	chr2R	20097011	3'	-	Porto1	311	1	51.72
CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTTC:1	+	chrX	11471643	3'	+	hopper	1362	1	70.54
GAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCATCATACAGATTCTAGAGACAAAGACTCATCCAAATTTTTCCACGTACACTCTTACGCTCACAAACCGCACAGAGTGTTGTGATGAGGGTGAGTGCGATTT:1	+	chr3R	4735084	3'	+	INE-1	148	1	79.29
AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACC:1	+	chr3R	2457001	3'	-	copia	4926	2	79.13
GTCTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATGGAAATGCGGAAATCAGTGCCGTCTTGGACTGGTATGGCGATGGGCAGGAGGAGAGCGAGGCTGAGCTATATTTGCGTAATCTGACGCTAGACCAGATATTCTACG:1	+	chr2R	18423456	3'	-	Quasimodo	35	3	68.46
AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATGACGCAGTACTCTCTTGACGCACTGCACCATGTTGAAAACTGTGACTGCCTGATAATCCGCTCCAGCATCCGCACTTGATTTCAACCACAACCA:1	+	chr2L	15148760	3'	+	1360	3364	1	56.94
GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGTAAGTTCCATTATCAATAACATATTTAAATTCCTCATTCTCC:1	+	chrX	2295980	3'	-	Tirant	65	2	66.92
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTGATTTTATTGATTATAA:1	-	chr3L	15519716	3'	-	pogo	20	1	73.72
GCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATAATTAAATTGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTG:1	-	chr3R	4604451	3'	-	1360	432	1	62.33
TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGAATACAAAAAAAAATAACAACTAAAAATATTAGCGACACAGGAGCCAAATC:2	+	chr4	1152123	3'	+	transib2	2783	1	56.16
GTCATGAAGGGGTAGAGCAATAGCTCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAAACCACATAATAATAATGATCTCCAGGAGTGCCTCTTCA:1	+	chr2R	1247133	3'	+	baggins	5386	1	91.11
ATCAAATTAAATAAAATCATATTTCAATCCATCTTATTCCTCAAATCAGGCGAATTAAAAGCGTATTTAAGCACGATTTAGCACGATTTTTACGAAGGATACTGGATTTGG:1	-	chr3L	20386902	3'	-	transib1	1895	1	80.18
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGGGTAATAAACTAAAAATAAAGTCAATTATTACGCAATTAAGAGCAGTTGACTTTATGCGGTGGC:1	+	chr3R	28624661	3'	-	roo	59	2	61.64
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAATTGTTTAATCAATTA:1	-	chr3R	16076752	3'	-	roo	35	2	63.70
TCTGAAAAAAAAAGCTATTTAATTTCAAAAGAGCTTACATCCACATGATGCGAAGTCATTACAATAGCATGAGCCACCACTTTTAAATCGATCTACATCCTAAAAATTCGTCAAAAAAGTCATCATTTATCAACTTACGTTTTCCT:1	+	chr2L	9093584	3'	-	copia	370	1	78.77
GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTT:1	+	chr3L	20168448	3'	-	mdg3	5292	2	51.67
TAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGGACAAAA:1	+	chr2R	2879482	3'	+	Stalker4	94	4	49.32
AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAACAAAAAAAAAAGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGAAGGCAAT:1	+	chrX	18193722	3'	+	jockey	4930	1	72.59
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCCCCTCTCATTCTTCCGGC:1	-	chrX	16717878	3'	+	roo	9034	1	75.61
TAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTTACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATTTTGCACAAAATTTCTCATCTGTTTCAAAGGTAATTCCATATGTGTTGACATTTGGAAATGTAAAAGCTTTTCTATTTATTTTA:1	-	chr3L	17652883	3'	+	S-element	1682	2	58.90
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAGGCTATCATTTTCAATTTTATAATTTCTAAATGT:1	+	chr3L	11393610	3'	+	roo	9042	1	59.59
GGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTTATTCTTACATAGGTTCTTATCAAGTGTTTCTACCTTTAATAGTGACTCCTTGTAGGCCTTGATAGCATCCATAGTTTTAATAAATATTTTATCAT:1	+	chr3L	18340391	3'	-	rooA	7556	2	52.05
ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGTTGCACTCATTATTTTCATTCCATAAATTATATCTTCAACATTAATTTCGCTGACAATTTAGCTGGCCGTCTAAAGAAAATAAAA:1	-	chr3L	10647860	3'	+	412	7532	2	62.33
AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTCAA:1	-	chr2L	14081291	3'	-	1360	39	1	55.80
CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCT:1	-	chr2L	16067082	3'	+	297	6909	2	68.28
TTACACGTAAGATAGTATAATCTCTCCACTCGAGTTCATGCTCTTCCTGTATCGCCGTTTAGAGCGAAGCATTCTCGCCGGAGCTTTACAATACGCCCAAGAGCATCGCAAGGTCTAGGGATTTAAGCAGACAACCCACA:1	-	chrX	6958427	3'	+	G5A	2711	1	77.86
GCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTAAGAATCAATTTAATATAACTAACAATGCAGCTAACGAGGTTTAACTAACAA:1	+	chr3R	24143868	3'	-	Quasimodo	7354	2	61.07
AAATACCTCGGCATAACCTTAGATAAGCGACTTACTTTTGGGCATGCGTGTGCCAT:1	-	chr3L	2274331	3'	+	BS4	403	1	76.79
TCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCCTCACTCCACCTTGCCTTTATATCAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGC:1	-	chrX	23202000	3'	-	R2-element	492	1	50.96
AAAACAACACAGCTTAGAAATAGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGACAAGCACACGATCGAGCGCTCCGCTTGCGATTTTGTTTCACTC:1	-	chr3R	16203009	3'	-	jockey	192	1	75.89
TGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACCATATAAGTAATTCCTGAGATTTTTAAGAGCCCAGACTATTGCCAACAATTCCTTTTTATTTGTGGCATAAAGTTGTTCGGTTTTATTTAATGTTTTGGATATGAAA:1	-	chrY	3572689	3'	-	Max-element	15	2	75.17
AAATTAAATCCAATTTAACATTAAATTTAAGTCTCAATGCTGTACATAAATATTTAAAGATATTTAAGGATAGTTAAGATGATATTAATATAAATAGTATCTTATTAATTATTTTAAACAACTGAAACTTATTTTTTGAGTGCACT:1	+	chr2L	17855712	3'	-	1731	4263	1	71.92
ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCACATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTACGA:1	+	chr3R	13349147	3'	-	BS	5033	1	52.86
ACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTTGGAATTCTTTTGTAGGGACTACATAACTATTT:1	+	chr2R	9628714	3'	+	roo	14	2	68.18
TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGCGACAGC:1	+	chr3R	14981279	3'	-	mdg1	7060	2	65.15
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGTAGATTTTTCTAATGGTTTGACATACTTCAGTGAGCTTAAAATACCATTATTAAAGATAAGTAAAATCAAGCTATCCAG:1	+	chr2R	9091980	3'	-	1360	9	2	73.97
AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCGATGTGGGCAGAATCGGTCGATT:1	+	chr3L	22968429	3'	+	mdg1	376	2	54.69
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAA:1	+	chr2L	3886266	3'	+	roo	9032	1	57.53
TAAAAGAACCGCACGAGAGCGGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGTGAAAGCGATGCAAAAAAACAACACTTAACAAGATACACTTACAACAGTTCGGATATGAAATTATTTTAAAAAACAATATTTTAAATAGATCT:1	-	chr3L	25107754	3'	-	Cr1a	351	1	53.42
ATATAATATTTAAATAAATACATTAATATTTTACCTACTTTCTGTAAGTATACGTGTAAAAATACATTATTAAATTAGTGAGTATTTTGCGGCACGAATTTCAAGTACCCAGAACCGGTTAAGCTGGAAGTCCATGACAGCAACGC:1	+	chr2L	14238267	3'	+	transib1	1935	1	39.04
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGGTATGGGATGCGTCCACTGTCGCCTC:1	+	chr3R	22844315	3'	+	roo	9042	1	63.70
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCACGCACGCAAAACCGAAAGAAAAATAAACAA:1	+	chrX	5643592	3'	-	roo	8709	2	52.74
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATACCGTAGAAGCTGTTGCCAC:1	-	chr2R	9632075	3'	-	roo	19	2	62.90
ATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTT:1	+	chr3L	25119403	3'	-	1360	477	1	71.23
GAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTTAAATCCTCATTACATTCGTCATT:1	+	chr3L	8249104	3'	-	jockey	4539	1	50.67
CACTAGAATAACAAGATGCGTATCGGCCATACATTGGTTTGGCATGGTCTGATGAAAGATCGTGCAGAGCTCGGATGTTGAATCTGGTAATGGATGCAGATCTACCTACCTG:1	+	chr3L	24973636	3'	+	1360	7	2	63.39
TATTGATTCCTCGCTTCTAAATAAATAACTATATAAAAAAAAGTCCATTTGCAGAACGTAATTAAGCCCGAATTAAGATATTACAACTTTAGTTTAGTTTGAATTTTTATTTATTATTTCTGCTAACATGCATGTATCTTTGGTGT:1	+	chr3R	21276667	3'	+	BS	5076	1	63.70
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCATAATGAAAATGTTGTATTTTAAAATGATGAAAA:1	-	chrX	9539970	3'	-	roo	19	2	69.18
AGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAGACACTAGAATATTCTAGGGTCTTTGG:1	+	chr3R	4215899	3'	+	G2	3050	1	57.63
GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCGCCAATCG:1	-	chr3R	14364593	3'	+	roo	9023	2	57.25
TAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAAAACCGAATGGAATGA:1	-	chr3L	7292423	3'	-	HMS-Beagle2	6897	2	77.37
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACT:1	-	chr2R	9328608	3'	-	roo	73	2	68.97
TATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAACCCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAAGTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATGTAGTTAATCTATAATTTGGTACAAACATTTGGAG:1	-	chrX	13275944	3'	-	S-element	83	2	73.97
AACCTATTGTGTGTATAAATTTATATGAGAACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACC:1	+	chr2R	9500044	3'	-	G5	4768	1	63.19
AGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCTTTTATGGCTGTGTGATTAATGCCAACCAGTCATCGCACACTCTC:1	+	chr3R	12854899	3'	+	Cr1a	3980	1	69.18
ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCACTACCAACTGCATACATATGTGGTTAAAATGCCAACCCAGGACAGCGGGGTAATTATAAAGTTTG:1	+	chr2R	23315378	3'	-	1360	19	1	43.70
TCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAG:1	-	chr3R	16076775	3'	-	roo	8721	2	58.62
TGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGA:1	-	chr3L	15490340	3'	+	copia	5039	2	75.34
CGACATTGCAATGTCGATCGCTGTCGTTTTTCTGGATTGTGGGCAATCAAAAATTATGTGGTCTACATTGCATTGCATT:1	-	chr3L	24038309	3'	+	G3	191	1	64.56
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGTCGTCGTGGCAAACAGTTGAACCTGGGAC:1	+	chr3L	16343337	3'	+	roo	391	2	71.54
TATAAAAAAAAAATTATTTAAATGGGGAAAAGGAAAAGGGGAA:1	-	chr2R	13526717	3'	-	blood	6927	1	53.49
TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACAATCTTA:1	+	chr3L	27415343	3'	-	transib2	33	1	63.01
TGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATAACATATACATATTATATACATATTAATTTAGAATTTGTAGAAATAATAAATTTATTTACCGAATACGATTTTAAATTCCTTTTATATA:1	-	chr3L	19339305	3'	+	Tc1	1615	1	56.85
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTT:1	+	chr2R	18336221	3'	+	roo	322	2	77.40
CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTA:1	+	chr2R	8585530	3'	-	roo	8720	2	62.12
CGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTAACAATATTAGCTCACCTTTCTCC:1	-	chrX	21016731	3'	-	Transpac	4959	2	54.55
AGGAAGATATGCTTCCGCACCCTCTTTTCATACACGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTATGAAACCCGCTGCACTTCCCCATACAATTTCTATACAAACTCTGAGTTCGAACATCCGATGTACGGAATTAAATTATT:1	-	chr3L	18975524	3'	-	mariner2	3	1	52.78
CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTA:1	-	chr3R	10462627	3'	+	opus	7422	2	77.40
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAGCAGCCCGAAGTCG:1	-	chr3R	14979772	3'	+	pogo	2064	1	55.22
AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAA:1	+	chr3L	17560390	3'	-	pogo	50	1	53.47
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAATGAACCGAAAATATTTAAAAATACTTTAAATGCCAAAAGCCATAAAGCAACAAAAAATTCTTAAATGATAATTATTTTTTTTTTTGTAATAATTATATATATTTTTTATATT:1	-	chr3L	10292752	3'	+	roo	400	1	69.86
CAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGGATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1	-	chr3L	25232770	3'	+	accord2	125	2	67.12
AGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACAAAACAACAACAAA:1	-	chr3L	23797658	3'	-	Helena	1150	1	57.14
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAGTATTGTATAATTGAAAATGTTACATTATTATTATTATTTT:1	+	chr3L	11441811	3'	+	roo	8991	2	73.29
AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGCTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTT:1	-	chrX	5662881	3'	+	P-element	2817	1	31.30
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTTTAAGCGTCAGGCGTCAGCAACTCAAATTGATTAGTTCAATTAACAAGCAACCTAATGTACGTTTAAG:1	-	chrX	2444322	3'	-	roo	33	2	60.27
TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAGGCCTAAAAAC:1	-	chr2R	16891798	3'	+	hopper	1406	2	74.19
AAAAATTATAATAAATAATAAAATACTTGACAATTATATTTAATCAACAATCATCATAGGTGTCAATCTTTTTTATAAATTTTTTTTATTAATTTTTACTTTAATCTTGAACTTTTCTACTCACAATAAAGTCAGGCCCACTGCT:1	+	chr3L	11410057	3'	-	INE-1	422	1	60.69
TTCGTATGAACGCCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGACTGTTGCGTGATAAAACAAAGGTAACAGCAATCAACTGGTTGGCAGAGCCGAAGTTTGTAGTATA:1	+	chr2R	7014523	3'	+	INE-1	134	1	54.72
ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTACACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTACGAATTCAGACCGAGAGCTTAATAAAAAAAAGTAGGTTTTCTATGAATTAT:1	+	chr2R	4103319	3'	-	Quasimodo	57	2	60.71
TATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGTGGGGCACACTTTTTATAGCC:1	-	chr2L	9564472	3'	-	transib2	78	1	73.33
AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCC:1	+	chr3R	15364010	3'	+	flea	196	2	63.50
GTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATGACCCATGTTGCCAGGCCCACTCTAACGTCTCAAACCGCACACACCGGACTTAAATCTGATATCATTTCTGCTCAAGCCACACAGA:1	-	chrX	719038	3'	+	INE-1	133	1	68.28
AAAGATTTAAAAATGAAAAGTGCTTTTACCTATTTACAAAGATTTTAAATAGATTACTGAGAAGGTAAGAACCGTTCACAATTACCTACGGCATACAATTTTAAACACATTCACTAAAAATTTAATACTTCACAATTGATAAT:1	-	chr2L	9982578	3'	+	Dm88	4239	1	60.14
GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCA:1	+	chr3R	16076892	3'	+	roo	359	2	52.05
AGGTTCAAGACCTTAATGACACACAGCGTGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCTCCCGTGTGTGTGTGACTCAACCGAGCGTTTGAAGGCACTCAAAATCCAAATAGCCGGGATTCCATAAAACCCT:1	-	chr3L	6483469	3'	+	baggins	5083	1	54.35
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATC:2	-	chr2L	21132332	3'	+	roo	343	2	62.33
TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCC:1	-	chr2R	9791549	3'	-	412	32	2	64.38
TTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGCTGATGGCAGTGTTGGCTAACGAACCCCAGTGTTGAGCTTACCATGGTTGT:1	-	chrX	8152858	3'	+	Circe	137	2	58.26
TAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATAGTATATATTTAGATTTATTCTTAGAGTCACGTATACAGCTGTTTACGCAGAGAATGAAGCCATCTTGAAAGGAACTTTAAGCTTTTTT:1	+	chr2L	14110873	3'	+	Quasimodo	7342	2	68.97
TATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAAAAGAAAAAATTATTCAAGAAAAATAAGCATTTAAGAAAAGAATTTCAAAACAAATGAAATAAATGTAGTGGGGCCTTATACTATGTACCCATA:1	+	chr3R	15987597	3'	+	Doc	176	1	73.33
GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTAACGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAACGTCAAGCAGCCCG:1	-	chr3R	14979778	3'	+	pogo	2048	1	56.94
GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCT:1	-	chrX	13504164	3'	-	412	7129	2	68.49
ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACAATTTTCAAAAGGGATTTAAGCTTTAGAGTGTATTTATTACAAAGTAGCCTTATTTAAGATGCGCACCTTAACCAGGCGAATATTTTAA:1	+	chrX	2842615	3'	-	Tabor	26	2	71.01
AAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTG:1	-	chr3R	28240015	3'	+	Cr1a	121	1	77.27
AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCCGACATTCTTCTTCTAAAGAACCTTTCTCTTTTC:1	+	chr3L	15600384	3'	+	roo	406	1	69.86
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAGCTACCAGAGATTCGATGAACACTTGCCACTTT:1	+	chrX	14336540	3'	-	roo	31	2	64.38
AATAGTCGGATCAATACGATGAGTGATATTTTGCACAGAGAGATTGATTCCTCGGTCCCTCTATTATCAACACCAGAAGATAAAAATTCAATAAAACTCGAAGAAATGTAGATTCTTTCAAAATATTTAAACGCATATTTAACCTC:1	+	chrX	22562578	3'	+	transib2	2346	1	48.63
GTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGCTAAATCTGAAAAAAAAATATAAAAAGCAAGACACAGAAGACAAGCCATAAATGAATCGACCGGGGACCTCGGC:1	+	chr3L	24165893	3'	+	R1A1-element	14	1	56.45
CTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTGTGGGTGAGCGATATTGGTTGAACGGCGACGGAGTC:1	-	chr3R	25346353	3'	+	mdg1	295	2	75.00
ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGAGCGAATCTGGCAAACATACATAGTTGTTTAAAAATAGTTTTAAATGCAAAATGACGTTTGAAAAGGGAAAAATGGGGGGAAACTA:1	-	chr3L	16750625	3'	+	Tirant	8470	2	57.93
AAGCAATGTATATGCGGGTTAGCTGAACCCAATTTCAGCACACTTTGAGCAGTCAAATAATGAACCTGGAACAGAGCAAAAGCGCTTATATTCTTATAAAAATTAAACACAAATTACTTCAAATAAATTAACACA:1	-	chr3L	25931507	3'	+	Stalker	7137	4	79.26
AATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTAGCGTAATATAATGTTGAGTTCTAGCTAAATCACTTAATTGCAAGTAACCGATGAAAAAAAATGTATATGAAAAAG:1	+	chr3L	13070777	3'	-	transib2	2618	1	46.04
AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATTCTTTGTTTGCTAACGAAATTAAATCTCGAATTTGCAATTTGCATTTTCTTTGGCCGAGGCTTTTCACGGCTTTGTATTTTCGCTTTCACGA:1	-	chr3R	20499719	3'	-	mdg3	5284	2	63.70
CCGACCAATCTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCGCCCAAAGTTGTTGATTAATATACGCTAAATACAATGTTTAAGCTGATGCATTATTCAAATGCAGATTTATTAGGGCAATAGAAAAAAAACATAGGTATCC:1	-	chrY	1421024	3'	+	G-element	4224	1	68.53
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGCTTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAG:1	-	chr3R	17817893	3'	+	roo	342	2	63.38
TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTACGCAGAAAGTGCCTATTATGAGTAATGTAACCTTTCACAATATTGTGGCCCGGCAAAATC:1	-	chr3L	11321347	3'	+	mdg3	241	2	77.40
AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTACAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTA:1	-	chrX	21087601	3'	-	mdg3	5315	2	65.75
GCAGAGAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACAATTTCTTGTCAAACTGTAGCGATTTTGATCCTTGTTGACTTTCACGGCCGTCGCTCCATTGCTGCGCGTTTTTCACTCGTATTCTCGTTCTCCTCATCCAACTTTC:1	-	chr2R	4970479	3'	-	S2	29	1	65.00
CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCAAATGCACT:1	+	chr3R	19968234	3'	-	roo	25	2	67.81
ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGTTTTTGGGAGCGATCACTTTTAGTCCCAATATTACTGACCTGACCACC:1	-	chr3L	15995913	3'	-	297	6612	2	56.25
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAA:1	-	chr3L	11393480	3'	-	roo	52	2	62.69
GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCAGAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATAGGTTAAAGCCAG:1	+	chr3R	6611254	3'	-	HMS-Beagle	54	2	77.23
ACTGTTAGTGTTAAGGGAGTTGTAATTTACCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTACTTTTTACTCAATAACCATAAACTTGAGCTCAGTTTCGTTATGATGCAATCT:1	-	chr3R	23736972	3'	+	Max-element	8406	1	59.23
ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAA:1	+	chr3R	7482818	3'	+	412	414	2	76.71
TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGCATACATTTGGGCGTCGTTGCCTCGCAGTTTC:1	+	chr2L	15181476	3'	-	jockey	4786	1	61.54
AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATATATGGCATTCAGTTTGCTAATCGT:1	+	chr3R	9922042	3'	+	blood	7322	1	78.81
ATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTTCATATCAGCTAGCAACTAACCAACT:1	-	chr3R	6769681	3'	-	mdg1	39	2	69.29
ACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTTGAGGATGTGGCATTTGAAGAGTTCGAAGAGGGTAACTAGTTCAGTTGTAATCAAGTTAATTATCAAACTTAATTGAATAGGAATATG:1	-	chr3L	21318572	3'	+	Doc	342	1	67.59
ACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGCCACCCACACTCACACACAGAC:1	-	chr3R	10285618	3'	-	412	7375	2	80.70
TGAGAGAAGAAATAGGAAAAAACTACGTGACAAACTTCAAGCTTCTAGTTCGAGTAGTTCGATTGGTTCCCCCTGTGCAGAGCTGATTCGCTGGCTGTAATCCTAGATACACCCATATGCTCGCTGTTTGTAGG:1	+	chr2R	13391517	3'	+	transib2	2435	1	56.72
AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTT:1	-	chr3R	9210655	3'	+	mdg1	359	2	75.65
AAAGTAAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAACTGTTAAAACGGTTAAAACAACATACATTTGTAACCAAACAAAAACGGCCAGAACTAGAAAAACCAATAATG:1	+	chr3L	27901425	3'	+	gypsy4	497	1	69.18
AATAGCCGAGTTGATCTAGCCATGCTCGAGATTTTAGGAACTATAAATTCTGGAAGGCTGAAATTCATACATACTATATTGGGTGGCTTCTGTTTTGCTCCAGCGTTG:1	+	chrX	22777773	3'	+	INE-1	102	1	66.67
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACGTGTGAAAAGGGTCCGTCGAG:1	-	chr3R	25448298	3'	+	roo	392	2	72.86
CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACTTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAA:1	-	chrX	13126469	3'	+	jockey	4953	1	65.38
TGAACTAAAAAAATATATAATAACTAGGTAACAATTTGTTGTTATATGCGGAAGCAGAGTGGGGCTTCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGCTTCCTGCT:1	+	chr2R	4932051	3'	+	G7	1170	1	62.62
GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATTCTATTGAAATTTTTCTATCTTACTCCCACCAGACGTGTAACATATTTTAATTGCTTGAAGATT:1	+	chr3L	21362	3'	-	Quasimodo	31	2	57.63
ACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAAAGTCCACCACATTTACCCTTTAAAATTGCCAATCTACACGTTTTGTTGGCCCCCTCTTGTAGCCATATG:1	-	chr2L	3886414	3'	-	roo	9045	1	51.72
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACC:1	+	chrX	8543532	3'	+	roo	342	2	62.94
ATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTGACATGGTCGTATATGACCAGGTCCAGATGCCCCTACTGCCGCTCATCTGGGCCACAAGCATGGGCACCAGCTACGGTGCC:1	+	chr3L	2362440	3'	+	Stalker2	386	2	69.67
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTAGGTCAGCAGGCAATTGAGATTTAACAGA:1	-	chr3R	9210600	3'	+	mdg1	384	2	57.93
TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGG:1	+	chr2L	3114564	3'	-	roo	8734	2	67.61
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACGAATTGATTCCTGGTTTTTGCATTTAGTTGCTGTTCTGATTTGGGAATATAGTATTTGTACTGGCATTGATGAATTCATATGGC:1	-	chr3R	18582126	3'	+	roo	9030	1	55.48
AAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTACTGCTACATCCCATAAACACCTAACGTCGATGCTGATGTCGATTGCTGTTGTCTC:1	-	chr2L	9563083	3'	+	412	7240	2	59.26
AAACTAAGAAATACAAAAGTATTTTTCCAAGTCCCTTTTCGAAATCGACGCTTTATTCCACATGTGTAGATAGGAAAAAATACTTTTTCGTCTTATCCTATATTTACAACAATGTGGTTGTAAATATACTGTTGCTCTGTATTTTT:1	+	chr2L	21704845	3'	+	HB	38	1	32.88
CTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCTTCTCAAACGGCCTTTGGAGTCACATTGCT:1	-	chrX	21976895	3'	+	springer	7158	2	73.91
TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAAATCAAACTCACGCTT:1	-	chr3L	11530880	3'	-	roo	63	2	65.75
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACA:1	-	chr2R	9662715	3'	+	412	444	2	60.83
AATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGTTCATTCAGCCCACTTCCTACCTTTTTGTATGTGCAA:1	+	chr3L	17685270	3'	+	mdg3	239	2	57.53
TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACCTTGCAATCGCTTGACTTGCATCTGTTCCGCTTACCGAA:1	+	chr3L	20654618	3'	+	roo	395	1	75.69
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTG:2	-	chr2R	19050184	3'	-	roo	8722	2	56.16
ACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCATTGAGTGTGCGGGGCAGACCCTTAATTTGTCAAAGGTATGAACTCATGCGGAAGGAGCCAACTTTCATTTCCTATTATATCAATTTTTGGGTCGGTACAAATCACTAAA:1	+	chr3L	12161631	3'	+	G2	2986	1	70.55
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTT:1	-	chr3R	19968092	3'	+	roo	9038	1	54.84
TATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGTATTTTTTATTTAGTTTCCTTTATCAAAATAGGCACATACAATCA:1	+	chrX	15448041	3'	-	F-element	142	1	70.21
CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATCCTATTATAGAGATATAAAA:1	-	chr2R	6172976	3'	-	pogo	53	1	55.48
AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAGGCTTTTAATTAGATTC:1	-	chr2R	9325359	3'	-	BS	5015	1	58.90
TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTACATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTA:1	+	chr3R	20427458	3'	-	jockey	37	1	57.00
GCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGT:1	+	chr3R	1446144	3'	+	1360	3377	1	27.40
TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAG:1	+	chr2R	2016893	3'	+	1360	3349	1	63.00
GGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTGACAAACCCCATTAATTTGCAACTGCTAGGACGTG:1	-	chr2L	7491306	3'	-	FB	64	1	73.17
AATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAAAACTAGAGAGACGAGTGCGAAAGCGAATGCGAGTGATATGCGAATAGCGCATACTCT:1	+	chrX	18386468	3'	-	invader4	2820	2	62.33
AAGTCAATGCACTGTGTCGCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTTTAAACCAAACAGTAATGTAAAAATTATAATTAAACTAAAGGCCATCATTATCACTCAACACATGAAATTAT:1	+	chr2R	2959091	3'	+	Dm88	50	2	54.14
ACAAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATCCC:1	+	chr3L	4605725	3'	-	pogo	54	1	57.93
GGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATA:1	+	chr2R	23332622	3'	+	invader4	3033	2	62.69
GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAATTTTTAAGTATATAAAGGAAATGAACATATTGCCTTCCATTCATCTAAATGGTCAGGTGTTTAA:1	+	chr3L	3501044	3'	+	opus	7476	2	62.60
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGCTTGGAGCGAAATTTCG:1	-	chr3L	233198	3'	-	roo	19	2	71.94
AATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGAT:1	+	chrX	13704837	3'	-	invader4	50	2	77.23
TAAACGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGCTTAAGCAAGGATGTATAAATTTCATTATTTTTAAGGTGCGTGTGTTCTTTTTGCTTACGATATCGACAATAATTTTCTTAGGTATATTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTT:1	-	chr3R	19448597	3'	-	Idefix	7055	2	77.08
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGAT:1	+	chr3R	25448456	3'	-	roo	8700	2	58.57
TTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAAGAATGAAAAGCCAACGAGAAGGAAAACGGGTAGGAAAAGGGCCAGGCCAGGCACT:1	-	chr3L	4755215	3'	-	jockey	4723	1	57.46
GAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACA:2	-	chr2R	20596450	3'	+	roo	400	1	69.70
GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGGAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCA:1	+	chr2L	17081840	3'	-	jockey	4748	1	74.81
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAAT:1	-	chr3L	24039755	3'	-	roo	69	2	67.12
GAGTTAATGGGGGACAGCTACGCCTATTAAGCGTAAATGTGACGTACTAATTGGTCGTGAAATAAATTTCAAATTTACACAACCAAAAGTGTTGAGTCGTTAGTATCTACCAATTATGAAGATGTTAAGGAATCAA:1	-	chr3R	1166763	3'	-	Doc4-element	2371	1	73.53
ACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCATCAAACGCACAAAAACACACAAA:1	-	chr3L	28063328	3'	+	Stalker	6958	4	68.49
AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCT:1	-	chr2L	11518420	3'	+	412	7483	2	76.32
TAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGGATACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAATACTTGCGCAAACTTTTTGAATATTTTAACTAAATTACTGTGCCTGCGAAAGCGATGTTAGC:1	-	chr3L	17205276	3'	+	hobo	203	1	57.34
AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGAATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTGGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAACTGTCGG:1	+	chrX	21947724	3'	-	mdg1	31	2	48.96
AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCG:1	+	chr3L	20033793	3'	-	blood	7046	2	46.62
AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCATTGC:1	+	chrX	17963970	3'	-	jockey	4775	1	67.83
CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATC:1	-	chr3R	16404468	3'	+	pogo	2076	1	56.19
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCT:1	-	chr3L	11393470	3'	-	roo	53	2	58.62
CTTGGCGTTGTCCTTCGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAATGTCTTTGAGTCATTTTGGCATGCATTTGGCATCGATTTAGAAACGCTCGCCTGCCCC:1	-	chr3L	10913566	3'	+	297	6929	2	58.90
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTTTTGCAATAAATTATACAATATCATTTAATTAGAAAAAATCTAAACATATAAACG:1	+	chr3L	15519853	3'	+	pogo	2042	1	61.38
ATTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTCTCAACTGCGGAAGC:1	-	chrX	10521597	3'	-	Tabor	6863	2	66.67
GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATCTTTGGCATTTTTGCGAAA:1	+	chr2L	544873	3'	+	412	432	2	60.96
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGT:2	-	chr3L	9998029	3'	+	roo	9041	1	45.21
AATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAATACTT:1	-	chr3R	21276534	3'	-	BS	5058	1	58.22
TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTT:1	+	chr3L	15177312	3'	+	roo	9012	2	59.59
TAGGTCCAGATGGGTTTCAATACAAAATTATAGAGGAAGACCTTGTGGGCTGATGGGAGAGCCAGCGTTGACGAGCCAAAGTTAAAAATAGACTAACCCAGCATAAACCATGACAAACTTCTAAACTGTCACA:1	-	chr3L	24740747	3'	-	F-element	4251	1	57.89
GAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGTACAACGCTAAGAAATAAAAAATTATCTGAGAAGAAATAGTTTTCACGTCTTTATTTATTTGATCTCCGGAATGGAGGCTGAAGTGAAATGCCTGAACGGAAATCCACTT:1	-	chrX	22903437	3'	-	297	370	2	68.31
CACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAACCAGGTCCTCAGCGAGAGGACCCAAGTTCCCTTTAAGAATATTTGAGTTAGATTTAATTAGTTCTAATTACATATT:1	-	chr2L	22315553	3'	-	frogger	39	2	55.64
TTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACTTGCCTCGTATTTATGTGCAAATTGATTTCTCTCCATTTAGTACGCGGGTAAA:1	-	chr2R	977535	3'	-	F-element	79	1	65.52
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAG:1	+	chr3R	18582259	3'	-	roo	8712	2	53.79
ACGCCAGTAACAGCAGCGTAAAAATCATCCAACAAGCCCAATCGAAAATCCTGTCCTTTTCAAGCTGCGCTGCAATCGTTATATTTTCTTGTATTGCATTAAATAACTCTTGATCTAATTTTCTTGCAGCTCCTACAAAATTTGTT:1	-	chr3R	19447434	3'	+	Fw2	3576	1	71.92
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTC:1	-	chr3L	11393471	3'	-	roo	44	2	56.30
TTTTTTTTGTTTTTGTTGTAGCGTGTTCCGATATGTCAGTG:1	+	chr2R	18061942	3'	-	G2	3073	1	87.80
CCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAAT:1	+	chrX	6499046	3'	-	Quasimodo	48	2	64.57
AACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCG:1	+	chr2R	21298799	3'	-	jockey	272	1	73.08
ACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAATAATAAATAAAATACCAAATCATTGTATTGTTCTTGTAATCTATATATACGCATCTGATTACTC:1	+	chr2L	19310391	3'	+	Juan	4150	1	60.96
CACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTAATATAATTTATACCGCAATACTTGTTGGGTGCCAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATC:1	+	chrX	21907800	3'	+	Copia1_DM	164	1	52.38
AGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTGTAGCATACTCTCTTCTTTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAGCAGATTTTAAGAAAATATTAACTAAACATGGAGAAATAGTAACGTAA:1	-	chr2L	15004767	3'	+	INE-1	550	1	78.29
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTA:1	+	chr3L	11531002	3'	+	roo	9034	1	58.90
TGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTTACTCGAGAAAGATGAACTGGTCAAGCAG:1	-	chr3R	25454575	3'	-	Quasimodo	144	2	75.00
AACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCAGCCGCATTAACAGGGCTGTAGCAACAAAACAAGTGCTTATTGGAAGGTTGAAGGTTGGTACTAAAAAAATTAAGTGAGTGTCCAATTCTACACAGCAA:1	+	chr2R	3554545	3'	+	gypsy2	475	1	52.00
ATTTACCTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAAATCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGC:1	-	chr3R	17817916	3'	+	roo	315	2	78.77
CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGCGGGGCATTGGAGC:1	+	chr2L	17081875	3'	-	jockey	4693	1	55.65
AGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCCAATAAGAAGCCTTTCAAATTAAATCGCCTCTGAAACCACAATCATC:1	+	chr3L	20650201	3'	-	roo	483	1	74.44
AGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAG:1	+	chr3L	26011943	3'	-	F-element	94	1	73.29
GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACGTGTCTCGTAGAATCGCCTGCAATCTCCGGGATATGCACTGAATATGAC:1	+	chr3L	11957266	3'	+	blood	363	2	73.79
ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCCACGGCGCCCGTGACCACATTTAATTACTA:1	-	chr3R	17757278	3'	+	roo	8680	2	68.42
AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTC:1	-	chr2R	2016814	3'	-	1360	49	1	53.24
AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTCCTGCTTCGGCT:1	+	chr2R	21101828	3'	-	P-element	44	1	44.44
AAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTTGTCTCATATTTCGAGGGGGTGAAATGGGCAAGAGAAAACTGCATCGGCCAATTAGTTTTTACCTTAAGTAAGCAAGGAAAGTGATACAGTAAAAATGA:1	-	chr2L	17671213	3'	-	BS	5014	1	51.37
CAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACACCCACACATGTAATCGCACACATACCCACACCTATATATTCACATACATACCATACGTGGTAGCTAAGTTTAAGCCACATA:1	+	chr3L	10576573	3'	+	Tabor	79	2	58.90
GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATACTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACTAAGCATTCTGATTTAATACAATGATAGATTCTCACCCTTTTTCCTGC:1	+	chr3R	18272193	3'	-	1360	62	1	52.05
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCACATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAAAT:1	-	chrX	10639992	3'	+	roo	9039	1	56.83
GCTAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACCAAAAAATTTTCTGTGTGTGGAAAAATAAAGTAATGATGCCAACATGACCATCATAGATGATAACGGTCTCGTCCAGACGGTA:1	+	chr2R	4155689	3'	+	Doc3-element	106	1	59.50
ATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGTTAGCGTTGTAGAATCTGCATATAAAATGTTAGGGTAACAACCCCGGACTTATATCGACTTAAGTTTACCCATTG:1	-	chr3L	24892344	3'	-	G4	3532	1	56.72
AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGCCCGA:1	+	chr2L	14892316	3'	-	transib2	53	1	56.16
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGT:1	-	chr3R	17817892	3'	+	roo	9020	2	60.47
TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACA:1	+	chr3R	7100930	3'	+	roo	9045	1	63.57
AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCC:1	-	chr3R	19589919	3'	-	BS	5062	1	61.64
AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTATTTTGCCTTAACAGGTCCGACAAAGGC:1	+	chr3L	23866765	3'	-	copia	4900	2	64.38
TATTTTATTTTATTTTATTTTATTGTATTGTATTGTATTTTTCGTCGGTTTTATACCTAAAAAGTATAAAACCGACGAAAAATACAAAAAAA:1	-	chr2R	7737039	3'	+	transib1	1899	1	43.48
ATAGATCCTGAGATCTCGACGACTTCACCCTGAATTCGTTTTGTCATTTATAGTGTTTTCCCCACACTATGGCCA:1	-	chrX	20895715	3'	-	INE-1	143	1	78.67
AATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGT:1	-	chr2R	5485109	3'	+	blood	7329	1	60.96
TATCCCTTATATATATATGTACATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTGTAGGTCTTAGGAGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCTTCAGCATTTGGCCGG:1	+	chr3L	25824662	3'	-	Juan	4189	1	57.69
AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCAATTCGAATAATA:1	+	chrX	17431833	3'	+	hopper	1394	1	67.44
AAAATACTTATGCCGACTAGTGTACATAGGCATATACATACATAGATGTATCGTCACATTATGACAAAATAGCCTGCTTCTTTTAAAACTTACTTGCGCTTGACATTAACAAACAGAGCGAAACGATGAGCA:1	-	chrX	21399108	3'	+	Tc1-2	1623	2	53.79
ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCC:1	-	chr3R	21705989	3'	-	297	6598	2	57.61
CTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACTCAAGTTAAGGGGTATCGCCTTGCGTCTGCTAATAGCAATGGGCGACTGTTCTGATCCACCACAATTTGGGTATTTTTCCGGCCATCTCTCCGGGGATTTGTAGTCG:1	+	chr3R	22387536	3'	+	G2	2947	1	73.91
GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGAACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCCCTTACCGT:1	-	chrX	13504142	3'	-	412	53	2	53.10
ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAGGT:1	+	chr3R	14940162	3'	-	jockey	13	1	57.14
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATATAATAAAATAATAAGGAAATAACACAATGTTGCATCCACTGTTCAATCGTAGCTCTGGTGTTCATTTCCTTTGCGTTTT:1	+	chr2L	13584773	3'	-	pogo	29	1	64.29
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTAC:1	+	chr3L	9998198	3'	-	roo	55	2	58.99
GACGCACAAAATCGCGAAGTGATTAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTATATATGTAATAAAGAATACATGTGCACGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACGAATCTAGTATACCCTTTTAT:1	-	chr2R	4618504	3'	+	invader4	289	2	62.59
GATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGTAAGCAGTATGGGACTTAAGACTTATGAAGTTCAAGAGGAAAAGCGGTGAATGTAAAAATT:1	-	chrX	17418327	3'	-	Stalker4	7335	4	58.22
GTATATATTGTATATATATATATATATCTGCCACTGCAGTGTGTCTATATCTTTTGTGAGCGTGTGTTGGCCAATATAAATAAACATTTCGCACCCGAC:1	+	chrX	12313863	3'	-	Stalker2	261	2	63.64
CACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCC:1	+	chr2L	11661029	3'	-	F-element	61	1	45.21
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTATT:1	+	chr3L	10292894	3'	-	roo	8733	2	65.75
ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGATTGTGTCTATCTGATATGTTTTGCTTGTCTGCCGCCCAT:1	-	chrX	18237371	3'	-	accord	183	4	67.61
AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTATTCTTTACCTGCATGTCGTTGAT:1	-	chrX	5629098	3'	+	jockey	4954	1	54.41
GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGAACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATG:1	-	chrX	13126475	3'	+	jockey	4979	1	58.33
AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTTTTGACTATGAAAAATGCTTTGGGGCTTGCTAGGTCAGACTGAGCCGTTTGTTACTCTGCTGC:1	+	chr2L	13585973	3'	+	Tabor	7306	2	71.23
TTTGTGTTTTTGTTTCTTATGGCACAAAGTTATTAAAATGGGTAAAACAAAGCGTGTCGTTGGACTAACATAAGATAAGAGGGCGATTTATCAAAATTTGCTCACTGATTCCGTCACTAGTTGCACATGGCCCATTTGTAAGTATT:1	-	chr3L	21409826	3'	+	pogo	303	1	52.74
AAAGCAATCAATTATAACTTTTTTTGTTACAAATTTAAATCTTACTAATTATTCCCGTAACTCGTATGGATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGACCAGGATCA:1	-	chr3L	24757196	3'	+	Cr1a	4258	1	54.79
GGAATGCGCGACCTTCATCCGCCTACACTATACACACATAAACACATACTGACGAAAACGGCGCGACGAACATGCCATCTAAGCGGGGATGAGCTCACCGTTCTCTCCTTGAAACAAACAACTAAACTAAATAATTATTAAAGCGC:1	+	chr3L	2424125	3'	+	Ivk	5026	1	69.86
AATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTACCCGCACATACGTTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACAAATTAATCTAATTATGTTGGTGTAGATCCCTCGCGTTAAAAATCCTCCGAATATATT:1	-	chr4	596479	3'	-	Stalker4	319	4	79.45
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTAT:1	+	chr3L	9998216	3'	-	roo	18	2	68.33
ACATATTAAAAAGAAAGACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCATTGCTTTTCTATTGTTTTAATCGAAATTAAATAGTAAAGTGCGACGCGTGCAAAACACGCCGCACTTTACT:1	+	chr3R	5371831	3'	+	HB	1361	1	55.40
AAACACACAAATCAATTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATCGCGTTGTAGACGTCCGCACGGCCCGCGGTATCCGCAAACGGACGACTTTCCTTCCTGTAGACAAACTTGTTCACAGC:1	-	chr3L	24947525	3'	+	Porto1	4450	1	67.97
GATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCTTATGAAATGCCTAAACTC:2	+	chr2R	4601680	3'	-	HMS-Beagle2	6909	2	70.55
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCAAGAACTTAAAACCTTTTAGCCAGGCTGCAATGGCCAAGTGCTTGTCCTATTCCCGC:1	-	chr3R	27994183	3'	-	roo	8699	2	53.85
AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCAGAACACAGGCTCACCCACAACAGTTGAACACACTCCTTT:1	+	chr2L	15875814	3'	+	hobo	2887	1	70.94
CACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAATGACTTTATTGTGAGTATTTTATTATTAACTAGCAT:1	-	chr2R	8465044	3'	-	Doc	4338	1	75.34
AACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACGTGTTG:1	-	chr3L	18596615	3'	-	Doc	72	1	64.14
GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCGAGTGTGTGTGAGTGAATGCGGAGTGACTCTGTTTTGTGTAATTTAACATGGCA:1	+	chr3R	22276763	3'	-	jockey	85	1	60.00
AGGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCGGTTGAGCAGGCTGCGCATAGCAATTTTGATTGTCGTTAAATCCGACC:1	-	chr4	680882	3'	+	1360	132	1	61.90
CTTCGTTTCTAATTTACCATTCGGCTTTTGTGATTGTTCTGAGCATTTTTTTTTTTGTTT:1	-	chr2R	16601368	3'	-	Porto1	4368	1	75.00
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAG:1	+	chr3R	11496601	3'	+	1360	3363	1	61.29
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCG:2	-	chr2R	19050171	3'	-	roo	8709	2	52.05
CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGC:1	-	chr2L	15833003	3'	+	hobo	2907	1	54.72
CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCCCTATACGAATCTATTAGTCTACTTAAACCCAGTGCTATACTAACAAACATATACAAACTATAACTGGGT:1	-	chr2R	7452824	3'	-	pogo	12	1	69.72
GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTAGTCAACCTCTTTTTGTTGCGACTTGTGGGCGTC:1	+	chr2L	1665035	3'	+	hobo	2933	1	58.46
GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATATATGTGTGTTTGTATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTACCTGATGTCGTCGTTGTTGCTGCTGCT:1	+	chr3R	16714390	3'	-	opus	46	4	89.66
CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTTCTCTGTATAGGCGTGTCACTTACCGTGC:1	-	chrX	13504140	3'	-	412	52	2	52.05
ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAATGTAACCCGAGCATTCGCAAAGCAGCCAACCACCCAGGTGAA:1	+	chrX	2518134	3'	-	P-element	33	1	50.00
AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAAGGGGCGTAATAGACTTTTGGCTCGTCAGAGTAGGCGTGT:1	-	chr3L	23728589	3'	-	HMS-Beagle	6809	2	74.48
CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGA:1	-	chrX	12649914	3'	+	P-element	2809	1	26.15
AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTTGGGCATATCACCAGCGCAGTTCACAAGATCTATAATGGTACTTTAAGAGAACTCATAAAATCCGATAACGCTATAGTCTATATAGTGACATATCCATAAG:2	-	chr3L	24486371	3'	-	1360	21	1	31.51
GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTACAAACACACATAGACATGCTCATACACACACATACATATATAGTTGCGCGCCTGTGTCTTTTTGGCAATGGCCACGTGCACTTCATGAGAG:1	-	chrX	21009360	3'	+	pogo	2072	1	63.70
ATAAATTAAAAAAAAAAACAAATATTCGCAAAA:1	-	chr3R	20742325	3'	+	Doc	4697	1	90.91
AACAACAAAAAAAAACAAAAAATAATAAAAACTATATATAATTTTAAGTCTTCAAATTGAGGGGCTTATTTGCTTGATGTTTAGCAAACTTAAACATGTTTAACAAACT:1	-	chr3L	737624	3'	+	gypsy7	5001	2	74.31
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCGCAACCAAA:1	-	chrX	5643427	3'	+	roo	400	1	78.01
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAGTTTGAGGGTATAT:1	+	chrX	5274409	3'	+	roo	9039	1	60.58
AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTGGCGCCCAATAGTCGAAAATACTTTGTTGAATTTTTTAAAATATATATGATAAGACTTGCCTTAATTACAATTT:1	+	chr2L	6863407	3'	-	pogo	42	1	52.74
AAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGCACCCTTCCACAGTTTATAAACCAAATT:1	+	chr2R	611220	3'	+	297	332	2	63.45
GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCAGAACACAGGCTCACCCACAACAGTTGAACACACTCCTTTGCATAATTCATGCAAAAAATTCAACACAACTCG:1	+	chr2L	15875847	3'	+	hobo	2920	1	65.81
CTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATATGGAGCTCGTGGATCCCCCCAGTGGTTCAGCTGGGCGGGATGGTTTGGTTGGGTG:1	+	chr3L	8248261	3'	-	jockey	4899	1	60.00
TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTCCTTATTTTGAACTACTTATTGAGCAGTACTGCACCCACTGTACGAACACAAGTTTCCGAATCCGGCAGCGGTGAATAGGGAACCCCTTGGGGAATTCTAG:1	+	chr2L	12250175	3'	+	1360	3371	1	72.60
TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAA:1	-	chr3L	11393480	3'	-	roo	8728	2	65.75
AGTTCTAGAACAGGAGGAAAAGCTTGAGAATTTTGCGCCTGCGAAACACAGGTGGAATCGTGTTTGCAGATTGCCCTACCGTACCTATGACCACTTTCCTTAAGAGAAGACGGCACTTTCGATTTCGCT:1	+	chrX	14883009	3'	-	Gypsy12A_LTR	2023	1	78.29
CGCAAGAAAGCAGTCTGCACGCTCAGAATTTTTAGATTTTGTGTGCGAGAGCGAAGAACGCACGAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAGGACCAAAAATACAAATTAGTGTATGAATCCCCCTAATCAGGAACTCCTTTC:1	-	chrX	9580794	3'	-	Cr1a	342	1	77.86
ATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGGTCGAGGAAATGCGGAATACGTTGTCTAAAAAAGGA:1	+	chr3R	1433196	3'	+	mdg1	334	2	75.34
CAAGTTTACACACTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGGGTTTGGCAAAGTTCAAATCAATTAAATAGCGTTTAACCGACAAATGTCGGTACGTTGCAGATGCCGGCAATTCCAACTCAATTAGGCAAGGCACCAA:1	+	chrX	22562954	3'	-	S-element	1524	1	72.60
ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCA:1	-	chr2L	11518387	3'	+	412	448	2	53.49
TGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACACCAATTACAAAAACATGGCATGTCACTTAATTTGTATGCGTTGAGAGCAATTTTCACTAG:1	+	chr3R	25423298	3'	+	3S18	279	2	59.59
GGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTAAAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAACACAAAGAATTAAATTAACTCACACATCTTGCTTGATATGTCATCAATCGCG:1	+	chrX	20645661	3'	+	1360	3083	1	71.92
ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAGAGAGCAGGTGGATGCAGGAATTAGGGATC:1	+	chr2L	16016466	3'	-	412	12	2	77.40
TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGCTCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGCTACAAGGCATGCAAATTTG:1	-	chr2R	13585364	3'	-	412	19	2	69.86
GTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTAAACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATCACTAAGCCTGACTTAGTGATCCCGTAT:1	-	chr3L	23797927	3'	-	Doc	101	1	79.45
AAACAAAATCAGTTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGAGTTTACAGTTTTCTAGCCACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGT:1	-	chr2R	8585427	3'	+	roo	9032	1	50.41
GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAAAAGAT:1	-	chr2R	20496870	3'	-	blood	7034	2	67.12
ATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGCTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAACGTTGTTCAAA:1	+	chr2L	14772146	3'	-	roo	8664	1	73.74
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATG:1	+	chr2R	9328696	3'	+	roo	9009	2	58.22
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACAGTGAGGCTAAGCGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGTAGCC:1	+	chr2L	7898373	3'	+	roo	9055	2	50.59
ATAAAGTCAATGCACTGTGTCGCCCTCTTTTGGTCGCGGTAACCAAAAGCTTTTTTCTCTTATTTTAAACCAAACAGTAATGTAAAAATTATAATTAAACTAAAGGCCATCATTATCACTCAACACATGAAATTATTAAACCGTGG:1	+	chr2R	2959101	3'	+	Dm88	47	2	56.16
GCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAGGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGCTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGG:1	-	chr2R	5070928	3'	-	gypsy5	25	2	27.21
TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTTGTTGGTGCTTAATATCCAATTAAATACGCATA:1	+	chr2R	652375	3'	+	copia	236	1	52.05
AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAATTTTTGCAATAAATTATACAATATCATTTAATTAGAAAAAATCTAAACAT:1	+	chr3L	15519846	3'	+	pogo	2034	1	66.44
TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCACAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCA:1	-	chr3L	11393483	3'	-	roo	61	2	65.71
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGGGCAACGTAATCGAGGCCGCTAAGCGAATTATATCGTATTTCATCCCGAAACATTAA:1	+	chr2R	6086373	3'	+	pogo	2043	1	72.00
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGC:1	-	chr3L	11393490	3'	-	roo	74	2	72.60
CCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTGTAAATAAGAACAATTGTGTTTAACGGCTGTGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTTCGACACAAGATTTGTACGAGTTCTCCAAGCAGGAGATCGGCG:1	-	chr2R	17419191	3'	-	gypsy	7321	2	76.06
CATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATCATGAGTTATGGGAGCATC:1	+	chr3R	11496605	3'	+	1360	3355	1	60.00
CTATCGATATTCCATAAAAATTATGAAATTTCGCTTTCGCATTTCCAGTTTAAAAACTGGATAGGAGTCCGCTAAACGTTCCACTCTACTAAAAATAGCAGAGGAGGAGCCTCAAAAATAGGGTGACATTTTTGTCAGCGGTAAAG:1	+	chr3L	24349312	3'	+	INE-1	502	1	58.90
ATCATCTTTCTTATCTACCGTTTGAAAGCCAAACGTCAACAACCATCTAAGACTATTAAATCCGGGGACGAATTCATCTTAAGACAAGGAGGAGTTAACACGAGCAAGTTAGAGGGGTGCACATATTTTTTATTCACATATGTA:1	-	chr3L	23515311	3'	+	gypsy10	5560	1	77.78
ACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACGTATAAAAGCATCAGTCACGGTAGAATGCAGAATTACCAACACATTGGC:1	+	chr3R	29023451	3'	-	S-element	1535	1	66.44
TCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCAAAGGAAAACACTTACCCAAAA:1	+	chrX	14824773	3'	-	jockey	4752	1	66.43
GTGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTCTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGCAATTCACCGGCGTAGCCTGCAGCGTAGCGATGCTTATCTATGTTATCTTATATA:1	+	chr3L	27654555	3'	+	Gypsy6A_LTR	76	1	63.70
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCC:1	+	chr2R	11164488	3'	-	roo	59	2	71.65
GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCCAACTCCATTTCAGTTGTCGATTAGATAAAACACC:1	+	chrX	1899741	3'	+	P-element	2881	2	77.12
ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGTGTCATACGCATAAGACAAGCTCACAC:1	+	chr3L	7588518	3'	-	hopper	49	1	52.08
TTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGTGTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:1	-	chr3L	25232763	3'	+	accord2	7576	2	58.91
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATCCCGAAACATTAAATTGAATAACAACTTTGTGAATTTTCTATATAAGTAAGAAGTTAAT:1	+	chr2R	6086419	3'	+	pogo	2043	1	58.22
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTCAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTCTTATATATTTTTG:1	+	chr3L	19334319	3'	-	roo	8743	2	80.00
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGT:1	+	chr3R	19968179	3'	-	roo	8743	2	75.86
GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGTAGTAGG:1	-	chr2R	15005076	3'	-	jockey	85	1	67.36
TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAG:1	-	chr3L	23635041	3'	-	roo	77	2	72.60
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATTGTATTCCATTTAATATAGGTTTTATATATTTTTGTTTCGCTTAATTCACTGTTAAAAATCCTAAGAGTGTAAA:1	+	chr3L	19334358	3'	-	roo	8709	2	55.17
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGCGAACAAAAGGCAGCAACACTA:1	+	chr3L	12879822	3'	+	roo	9002	2	63.01
GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGCAATCACATTTGATATTTGCATGCGAAATGTATTTGCGCTCCACGAAGCACAACAATAAACATTGTAAATATA:1	+	chr2L	18404627	3'	-	hobo	40	1	56.12
GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATT:1	-	chr2L	18419163	3'	+	412	7491	2	66.07
AACACAAAGACGAAAAATGCTTAATTTCCTGTCGAGTGGTGTACACAGCTAAAAATCTTAAAAATTTTCAATTTTTTGTAAAAATATGTATATTTGGGAAATTGCTGTAAAACTCAGAAATGCCGTCTAGCCGTGTAGCCAGCCAG:1	-	chrX	7041831	3'	-	Cr1a	191	1	63.70
CCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCCAGCGTGAATGTAATCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGCTAATTGGGGAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAAGTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACCGGTTTGGC:1	-	chrX	9701863	3'	-	INE-1	552	1	79.26
ACCTTACGGTATCGCTACCACTACCAACGCACTCGTGCGTGCGTGTTATCGGTATCAACAGTTACATTCGGCTAAATAGAGCACCTAAAATATTAAAAC:1	+	chr3R	11288365	3'	+	G-element	145	1	76.77
GACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACATGAAAAAAAAATAATAATAATAACAATCATAATAATACTATCAAATAAAAAAAAAGACA:1	-	chr2R	11724275	3'	-	micropia	13	2	72.60
TGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATAGAGACGCGTGTATATAGAGGATTGGAAG:1	+	chr3L	6388949	3'	-	17.6	41	2	76.77
GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCT:1	-	chr3R	10273953	3'	+	HMS-Beagle	229	2	57.30
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCATGAGAATTGAGTAAGTTTTCGCCATTCCACTTGCCAGCTTAAAGTTCCTCTGCCACTCGCGACTCCA:1	-	chr2R	14387913	3'	+	roo	9028	1	50.37
TTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTTAGGGGCGTTAAAAATGTTTGGAATTTCATTAAAAATTCAAACGTCAATGTCAAAATAAATGGAAATTTGTGTGTGTTTGTGTTG:1	+	chr3R	15072353	3'	+	pogo	1889	1	63.36
GTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAA:1	+	chr2L	21008597	3'	+	invader3	5418	2	73.12
ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTCCATGTTTACACTTTTAATTTGGTTTGGAAAACCATTTTTAAAAAGAAATAAAGAACAAAGTGC:1	-	chr3L	20168348	3'	+	mdg3	222	2	59.29
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATG:1	-	chrX	9540019	3'	-	roo	67	2	67.59
TATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATACCCAACTTA:1	+	chr2R	7586233	3'	+	I-element	5319	1	56.16
AATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAG:1	+	chr2R	7586194	3'	+	I-element	5285	1	68.79
ATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGGATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAAACTTACCTATATAC:1	-	chr3R	22388960	3'	-	G2	2653	1	53.42
CACCTTATGTTATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGCGGCAGAGAGCG:1	-	chrX	6283687	3'	+	P-element	2886	2	61.90
ATGATTATTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATACAAGGTATCAGTTGGAAATTAAAGTAAATTTAATTTAATTTAAAATACCTGTAACAATTGCGGAAAATATAAAATGTATTTCAAACCTTCGCGGAAATTGTAA:1	-	chr3L	24996062	3'	+	1360	455	1	70.55
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACCAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAG:1	-	chr2R	20596447	3'	+	roo	9024	2	50.70
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAA:1	+	chr2L	16091967	3'	-	roo	88	2	82.07
GAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGTGACATTCTTGTTTCTGCTTTAAAGCCCTGGAGAAATTACGAAGTTAAAGTTA:1	-	chr3R	10734433	3'	-	G2	2999	1	47.00
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAGTTTGAGGG:1	+	chrX	5274404	3'	+	roo	9041	1	60.00
AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGTGTTCTTACACACGC:1	+	chr3R	20427508	3'	-	jockey	22	1	72.59
GAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTTTTCAATAGGCGCA:1	+	chr3R	20499864	3'	+	mdg3	217	2	62.02
TTGGTGGTCTTTTGCTTACTTACATATTAACTCTACTTTACATATTACTTACTTACATATTAACTCTACTCTGCATATTAAGGGTAGATACACTACATCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAAAGCAGAAGC:1	+	chr3L	23398238	3'	-	Stalker3T	76	1	63.70
ACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGACTAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAANAGCTTAATTAAGTGAAGTTTTATTCGAGCTC:1	+	chr2R	4339520	3'	+	G5A	2788	1	78.70
ATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGGAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTT:1	-	chr3L	4536709	3'	-	roo	9058	1	42.50
TAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTGACATGGTGAAAATATTGTTGAAGGGAAGTGTTGCAAGATACACGCAATCAGGAGGGCCACAGACTTTGGTGGTCTCTCAAAATGTGTAGCA:1	-	chr2L	13582822	3'	+	Tabor	463	2	60.96
AGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGGGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCCGACTTTTTAAACTTAAAGTTTGATTTAAGAGAAATATAATACCAAATCATACTTAGCAGC:1	+	chr3L	20744164	3'	+	R1A1-element	327	1	56.85
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGGTTATGACAGAACATTTATATCGATTTTCTACAGCGCTG:1	+	chr2R	13696470	3'	-	roo	82	2	77.40
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGTTATAAATAATTTGTTTTTGAATGACATGCTATCATACAAATACATTTTTCCTAATTTATTAGTTTGTAAAAAGTGTAC:1	+	chr2R	13122117	3'	+	pogo	2064	1	57.24
TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCG:1	-	chr3L	233229	3'	-	roo	46	2	54.81
AGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTTTGTAATAAACCAGAATTTGTGTAATT:1	+	chr2R	9544109	3'	+	opus	438	2	66.67
TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGT:1	+	chr2L	12892701	3'	+	roo	8997	2	69.86
TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCT:1	-	chr3L	10848655	3'	-	blood	75	2	67.12
ATATATTTATCAAATATAAATTTAATGAATTATGATCATTCGAAACGCGAATTCTCCAGCTGAAGTATTTCCAATAGTTCTTTCGTCATTGTAGACGTTAACTTCTCTTATTGGATGGATGGTATGAGTTAGTGGAATGCAACA:1	+	chr2L	9222787	3'	+	copia	4671	1	56.94
ACTATAAGATACCCGTTAGTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTAAATCTCAAC:1	-	chr4	897300	3'	-	INE-1	548	1	68.70
ACATGGACTGGCAAGCCCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCTGGGACCAAAAAACCACAG:1	+	chr2R	20100476	3'	+	G-element	320	1	68.33
AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTA:1	-	chr2L	8986106	3'	-	412	48	2	51.37
CTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTTGCTTCCTCCAAATGTCTGGCTGGTCTGGCATGATGAGGCTTAACAAACAACAAAGGCTTCTTAAGACTGTTGCGC:1	+	chrX	21087687	3'	+	mdg3	247	1	72.73
GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAGTAGTTATTGCTATACACGTTACTCGTGTACTAGTTTATTGTTTTAAATAATACAGCACAGAATATAAGCTGTTAGTATTATACGTACTCAGGTTTCCATTAAAT:1	+	chr2L	9399592	3'	+	Transpac	5217	2	75.17
TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTACTTCTTGGCTGCGCTTTTT:1	+	chr2L	10037444	3'	-	Quasimodo	18	2	69.63
CAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTCAGTTTTTGAAGGCATACAAAAGAAAACCCAATATTGAGGTAGGTCGTAATTTGGGCATGTTAACCATAAACCAATGCGGAA:1	+	chr2L	18418087	3'	+	HMS-Beagle2	491	1	55.77
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCCTCTTGATAATTTTCAACAATAAATTCTTTGGCACTCACACAAGCAGACCCCAGAAGTGGGAGGCAGAGGACCTGCATCCTCG:1	-	chr2R	13710556	3'	-	roo	33	2	62.86
GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATAT:1	-	chr3R	5061845	3'	-	mdg3	5323	2	63.01
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACG:1	+	chrX	8543540	3'	+	roo	347	2	58.22
CTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTACTCATATACACCTATGATTCACTGTAGTATAAGTTATAAATAGTAACAGTTGTCTAAAAAATAAAAATAAGCACTGTTTAAAGAAAT:1	+	chr3L	25008193	3'	-	X-element	33	1	46.92
ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACGCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGCATACATTT:1	+	chr2L	15181453	3'	-	jockey	4814	1	57.04
CGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACA:1	+	chr3R	10274029	3'	-	HMS-Beagle	71	2	68.53
TTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCCCTAAGTTGGCAACTTTTAATCAGAACTGTGAACTCAAATCTACTGAGGTCGAAGTTTCCACCATACAGCTTTTCATTTGTCACACCCCAGTGAAC:1	+	chr3L	18368379	3'	-	opus	7324	2	72.09
AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTTGCTGACACACGA:1	+	chr2R	21101795	3'	-	P-element	76	1	13.60
CCTTCTCAAGAAGTCTGTGGACAGCCTTCTTCTTAGAAGGGGAGGGTTTACATATTCAACCAGCAGATCAAAGTTCGCCGGGGGCAACTGTAGGCGAAGCAGAG:1	-	chr2R	22750128	3'	+	gypsy7	5191	1	67.31
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTA:1	+	chr2L	14772117	3'	-	roo	15	2	56.47
TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGT:1	-	chr3R	15072561	3'	-	pogo	63	1	63.70
CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGGGCAGCCCCGAAATGTAGGCAACGGCTTTTGCATTTACATTCTAATCAGCTA:1	+	chr2L	17079861	3'	-	jockey	4716	1	54.11
TAATTAATTTAAATTTATTTTAATAGGCTGGTGACCAATGCGAACGGCTGCCTGAGTGATTGGCTTTGGTTGGATTTAGAAGGGCGCGTGGCGGACGAGGGGCGATCGAA:1	+	chr3R	22527385	3'	-	NOF	3959	1	68.18
AGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCCCTTCTACGTAAGAAGGGTAAAGACTCAGGGAACCATATCAT:1	-	chr2R	5021748	3'	+	Doc	254	1	69.57
CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCCAACTCCAT:1	+	chrX	1899715	3'	-	P-element	17	1	60.19
ATTTTAGAGTCGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGATTTTTCAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAAGACTCGATTTGGTCCCACTCAAGCGAACCCAGCGAACTTGGTCAGCAGCCGA:1	-	chr3R	21440377	3'	-	412	7455	2	62.24
TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGTTAACAAGTCCCAGGCTAATCCCACAATTTACC:1	-	chrX	2842460	3'	+	Tabor	7290	2	62.33
ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGTCTGTGTGCGG:1	-	chr2R	9662700	3'	+	412	435	2	56.94
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAG:1	-	chr2L	21884505	3'	-	pogo	57	1	60.00
GGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCATTTAGTATTCACAATCCTA:1	+	chr2R	21298872	3'	-	jockey	241	1	66.44
GTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTCGATGGTACGAAAAATACTGATTTGGTGAGCGAACGTCACAAAGCTAATATTAAAATAAATACAC:1	-	chr2R	10124247	3'	-	P-element	2733	1	48.51
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGACGTTTCCC:1	-	chrX	5274279	3'	-	roo	8680	2	66.67
ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTG:1	+	chr2R	16785465	3'	-	412	22	2	71.23
AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAAGTCACGCCCAC:1	+	chr3R	20005114	3'	-	297	13	2	64.21
CTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAA:1	-	chr3R	31045706	3'	-	INE-1	136	1	71.92
CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAGACTGTGGCCCCGCCATTCCCCATGCATAGCTCATAATTATCCTGCGGGACAGGGG:1	-	chr3L	20888704	3'	+	1360	3362	1	52.78
CCCTAGGTCCGGAGAAACATCAACCGAGTTCAATATTCAGTATCATGGTAGTGACAAATAATTAATAACAATATTTATAACTAATAATAAAATTGAGTGTAACTCATCAGTGTGCACTTTAGCTGCCCATACATATTGGATTACGT:1	+	chr3L	15393444	3'	-	Gypsy12A_LTR	1892	1	61.64
ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTC:1	-	chr3R	15072587	3'	-	pogo	18	1	64.00
GAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGAGCAGGATGCATGGAGCACATACA:1	+	chr2L	21008647	3'	+	invader3	5428	2	57.14
TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGAT:1	-	chr2L	7945312	3'	+	roo	350	2	58.90
TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATTTGGAGCAACCAAGAGCATACAACAATATATAAAATACATTCGCTTTGATATAA:1	-	chr2L	11732236	3'	-	Doc	25	1	58.90
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGC:1	-	chr2L	14772028	3'	+	roo	361	2	52.59
ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCCAAAGTATTCTCAATGGGATGTATCTCAATTGGTTCTGCAACGCACTTTGCTTTAAGGGCGGATTCTTATAAATAAATATGCGGATGAACACGAAATCAATATCATTTA:1	-	chr2L	10197446	3'	-	FB	7	1	61.15
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATT:1	-	chr2L	12892613	3'	-	roo	8723	2	60.00
AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGCAT:1	-	chr3L	21855439	3'	+	blood	7335	1	57.78
AATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAAACACACTTATCGGCGACATGCGTGTTTCCCTACCCCCGTCTCGCTCCGCCATCACCCCGTAGTGAGCGGATGTTCGAGTGTGAGTATTTGTGTTTGTGTGTG:1	-	chr3R	10523797	3'	+	mdg3	54	2	68.97
TATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTG:1	+	chr2L	13585908	3'	+	Tabor	402	2	71.92
TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACCCAGAACACAGGCTCACCCACAACAGTTGAACACACTCC:1	+	chr2L	15875811	3'	+	hobo	2874	1	71.65
AGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTAAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTCCCTTGATACCCTCTATAAATGGACCACAAGAAAACTGA:1	-	chr2R	19460745	3'	-	Quasimodo	6988	2	72.14
GAAGATNTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACT:1	-	chr2L	3114467	3'	+	roo	356	2	52.05
GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGC:1	-	chr3R	14981180	3'	+	mdg1	333	2	78.08
AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATCAATAAAAAACGTTAGCCAGCGACGCTGGGATGGGCAAACGACCATCCTTAAAAACGA:1	-	chr2R	6034681	3'	+	pogo	2040	1	63.70
CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATATTAGCTTAAGCTATACGTGTCCATTTGTGAG:1	-	chr3L	13845064	3'	-	opus	7115	2	72.60
AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCTCGCGTGCTTTTTTTCCCTTTTCTCGCGTGTCAACGTTTGTCAACTCACTCTTCTCACATCTTGGGGCGGCTTCTT:1	+	chr3L	16750764	3'	-	Tirant	16	2	66.96
TCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAATTTAACAAATTTTAATTTATCAACAAATCGGTCGTTTAAAATATTTTGCTAATGCATTTTTAACTCATCACGATATTTGG:2	+	chr3R	4605285	3'	+	G2	3019	1	57.53
ATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATACATAAAGTGTCTAAATTGGTTCGGAAATCGCGTGTTTGAAAGAG:1	+	chr2R	8624843	3'	-	Juan	4104	1	68.49
ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTC:1	+	chrX	9540117	3'	+	roo	9026	1	53.33
GCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAA:1	-	chr2L	20117872	3'	+	invader4	3043	2	50.68
CCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAAAAAATTGTATATTTCTTTAATATATGATGAAAAGCAGATAAATATGGTTAAAAAATCAGTAATCAATCAATCGTGTGTGCGG:1	-	chr3R	11105901	3'	-	Doc	5	1	38.62
ACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCA:1	+	chr3R	21706082	3'	+	297	334	2	64.38
GCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCGTGG:1	-	chr2L	21580872	3'	-	INE-1	531	1	50.37
TTTTCTTTTTAATTTCAATTTTCTACTCGACAAACGGCGGCCAACAATTTGTCGGCGCGGTGTCCTTGTTAGTCCTTGCTGAAGGTTTACGCATTACGTGATTTGATTTTCCATTTGTTAAGTTTCTTGGTAATAAATATCCGCTG:1	-	chr2R	12452481	3'	-	P-element	2641	1	58.22
CCAAAATTATAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGTGCCGAACTGCATGACATTGTGGCTACTTTCAAGAGTCCTTGCTAAATAAGTATAT:1	+	chr2R	14542264	3'	-	roo	8688	2	60.71
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGATGAACAATCATCCTTCGCTTGTTGATTGCTTGAACATCTGAGCCTGACATTTATTCTCATTCGGCATTGTAATTTAATTGTCT:1	-	chr3L	15600154	3'	-	roo	38	2	44.52
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTAT:1	+	chr3R	16076882	3'	+	roo	356	2	56.83
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCC:1	+	chr2L	12892691	3'	+	roo	8995	2	75.36
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAG:1	-	chr3L	9998032	3'	+	roo	396	1	52.80
TAGAGTCAAAAGACGCCTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTCGAGGGTAGAACTTTGGGTGGGGAACAAGCGAAATGGGCACTCCCTTGCTGATGATCTAT:1	-	chr3L	2486772	3'	+	jockey	4735	1	52.83
ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAAAGTGGAAGAGCGCCACAGGTGTCATACGCATAAGACAAGCTCACACTTGTGGGCAATGGATTGATAGCTTTTTGAAT:1	+	chr3L	7588549	3'	-	hopper	20	1	69.86
ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATATAGCCAAGCGCTTAAACTGCAATCGCAGC:1	-	chrX	18193653	3'	-	jockey	61	1	52.11
AAAAATCAAATGTAAATTGGTTTTGAGAAGAAGGCACAATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGATTCAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTTACTATATACATATATGTACA:1	+	chr3R	14473541	3'	-	297	6841	2	75.34
ATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGATGCGGGAACCAATCCAAGCACCGGCGTGTACACATTATACTTCTTATATCCAAGCTCAATTAAACTA:1	+	chr4	419653	3'	+	roo	8750	2	54.11
AGCCTTACTCCATGTTACATGTATTTAAAACTGTACAAAATAAAACGAATCTTACTGGTTGGATTTCTGCAGTTCACGCACGTTCTGATGCAGTTGCTCGTATTTTTCGTCGAATGCCTTCTGCGAAGCTGTTACATTTG:1	+	chr3R	15364698	3'	-	flea	4754	1	73.57
CTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCG:1	-	chrX	13704751	3'	+	invader4	3037	2	55.17
CTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCC:1	-	chr3R	25423191	3'	-	3S18	54	2	52.05
TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAAGTCATCCCTCTTCAAGCT:1	-	chr3R	1433119	3'	-	mdg1	7	2	68.09
CGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATG:1	-	chr2R	23332515	3'	-	invader4	53	2	58.90
TGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGACTGCGATGAGCAACAAGCAAAAGGGTACAAAAAGCTCTCCACGACAAGTGGCAACACGGCGGATGAATTTGGCTTATGCAG:1	+	chr3R	7484993	3'	-	412	202	2	61.87
GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAACTTAA:1	-	chr3L	17685090	3'	-	mdg3	31	2	40.41
GACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGGCGTC:1	+	chrX	5629176	3'	-	jockey	121	1	72.32
AGAACATATTTATAGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACATATTTAGACATTCTCCGGGGGGAAAAGAGTACGGCCAGTCCAGTGCCCATGGCCTTGGGCCAAACTG:1	-	chr3R	19192124	3'	-	rooA	31	2	74.31
GTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGCATGAAAATTCTGCACCTGTGGAAATGTAT:1	+	chr2L	23084407	3'	+	accord	7361	2	55.34
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGCATGTACAAAATTTTTCAAAATCCAATTTCCCCACTATCCAATACACTCGCTATACGTTCAAGGAAGAGGAA:1	-	chr4	419944	3'	-	roo	8699	2	56.39
CAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACAACAATTTCAATGGAACAGTCACTTGGAAAGACACCAA:1	+	chr3L	26378268	3'	+	transib2	2522	1	72.86
AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCTGCTACTTTTTATTTGCCTATCGTATATGATGAGTATGTGTGTGTGTATTCTCCTT:1	+	chrX	3308389	3'	+	hobo	2930	1	66.67
CGTGCATAAACATAAACACAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCT:1	-	chr3R	7482753	3'	-	412	79	2	68.49
GGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCTTCTTTGTGGCGACACGCGTCGC:1	-	chr2R	7586119	3'	-	I-element	5040	1	75.23
AAATGACTTTATATTAGAATATTGGGATAAGGAATTTCCTCCCAAAAGTGAGAACAATACCATGAA:1	+	chr3L	26043506	3'	+	1360	385	1	72.73
ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTTGTGCTCCTTAATGCTTTCAT:1	+	chr3R	20868253	3'	-	BS	5010	1	72.60
AAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTCTTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTC:1	+	chr2R	6085998	3'	-	1360	407	1	58.90
CGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCCTATTATTAAAACAACTTAGCGGCAAAAAACTATACAGAAAATCGTTACACTCGTTTT:1	+	chr2R	5173523	3'	-	gypsy	43	2	53.60
CGATACGGCATTTGGATCTGAAAGGAGCAAACCGATAATTGGAGTCAATCAAGGGAGAAATGCCGCGGGAAGGATTCTCTAAATTGCATTCGAATGTTTAATTGAGCGGAAGGAGGAGGACCAGAAAGGAGAGAGAGAGA:1	-	chr3R	30234866	3'	-	BS4	211	1	62.14
CGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAAT:1	+	chr2L	5710	3'	-	G6	12	1	65.57
ACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTCACGAGTCATTTACGAGTCGGGGCTTACATTCTTGGTTAGCT:1	-	chr3R	13457873	3'	-	X-element	34	1	59.54
CCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTGTTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAATATAATGAACAAGAAACTACGGAAGGCAATTACAAGCAATACTAGAAATAGTTTTAAATACATAACGAAAAAATCATA:1	+	chrX	21096951	3'	+	S-element	1678	2	69.44
TAAAAAAATAAAAAAAAAACTAAAATAAACAATTTATGTAGTTCCAAAAATATCCGTTTCCTTTAACCTTTCTAGGCGAAAGGTGTTTTAACAGGTCCACTATTTTCAAACTCAAGTTAATTACAAGGTCAATGAAATGTGCTTA:1	+	chr3L	15903608	3'	-	S2	1574	2	67.59
AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCGCGGAGCAGTAAACTCGTAAACCCGACCCAGCGTCGCTCCACTCGAATCCACTCAACCCAATCCG:1	+	chr2L	20840519	3'	-	Transpac	55	2	54.79
TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAACCATACTGTCTATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCA:1	-	chr3R	30344613	3'	+	pogo	2083	1	56.31
CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCT:1	+	chr3L	25401032	3'	-	Doc	37	1	51.37
ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTACGAGAAAGAAGTACACCATTTAAT:1	+	chr3R	13349168	3'	-	BS	5005	1	72.93
TAAACCTATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATGTGATCATCCAAAGTAATCGGCTGACTTAGAATTACAAGTGCGAAATCATAAGCTATGCTTCTTCTGTTATAATCTGGGTTAT:1	-	chr2R	3335568	3'	+	Juan	289	1	65.07
CTGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTC:1	-	chr2L	2122376	3'	+	Stalker4	7315	4	50.00
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGG:1	+	chr2R	9328698	3'	+	roo	354	2	54.68
GACCTAATAAAATATATATAAATTTTAGGCCAAATTGATTCAATGTGTGTTTTTCTGTTTTTAACACATAAAAAGTCTTTGTTAGGTAATGTTCGTAAATCTTGCCATTTACTTTTCGTAACACAATGTC:1	+	chr3L	5615512	3'	+	TAHRE	430	1	57.69
AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAATATGTTTCT:1	+	chr3R	16076907	3'	+	roo	9038	1	59.59
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTC:1	+	chrX	9540111	3'	+	roo	9010	2	60.69
ATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAAATCAATTTACTACAAGGCTTAAAGTCTTAACAAAAGGTTGGATTTCTCTGCATACTTTCAGGCGTCAGAATCAGAGCAATTGCTTTAGTAAAATACTAACCA:1	-	chr2R	18687711	3'	-	jockey	4983	1	42.47
AGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAAAACAAATAAAAATATACAGTCCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTA:1	+	chr3R	19449973	3'	+	roo	8943	2	60.00
GATGAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTCTGTGCGTCTATCCGTATTTTCGTCCAAATTTGAGGACGTATAGCCTACTCTCTTGTTTCTTTTGCACATAAATACATAAATAATTTTTGCCTTCATTTAAACAATT:1	-	chrX	22806269	3'	+	INE-1	92	1	53.42
AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTCATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTGGAAG:1	-	chr3R	25826660	3'	+	mdg1	376	2	51.11
TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGTGCAAAAACAACAGCTTAGTAAAACTCCCTCTCTCT:1	-	chr2L	12483751	3'	+	P-element	2807	1	28.87
TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAAGTGTGTGTGTTCTT:1	+	chr3R	20427500	3'	-	jockey	37	1	61.97
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGAAAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTAT:1	-	chrX	6486719	3'	-	roo	8702	2	59.63
AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCGGACTAAAACAACTAAGATTAAGGCTATG:1	+	chr2L	5845080	3'	-	transib2	60	1	59.59
AAATATAAATTATAAATTACAACACTCTTGTTGGTGCTTAATATCCGATTAAATACGCATACATATATGGAAAACAGAAATTATATATATATGTGTTCAAAAAGTGTACAGTAGGGGGAACA:1	+	chr2R	652436	3'	+	copia	253	1	77.87
CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTGTTGGTGCGACTGCCTCTGTGTGCGTGAGCGGGTGTGCGAGTGTGCGTGTTTGTGTTAATGACAAAGCATAGAACGCTGC:1	+	chr2R	21572217	3'	+	hopper	1398	1	66.13
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTG:1	+	chr2L	12892689	3'	+	roo	8991	2	77.14
CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTT:1	-	chr2R	13585394	3'	-	412	49	2	51.37
ACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCATTTAGTAT:1	+	chr2R	21298861	3'	-	jockey	227	1	72.73
GTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCTATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTG:1	+	chr3R	6611278	3'	-	HMS-Beagle	6871	2	67.81
CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACAAACCCACTAACCAATAATAAAAACCAATAATAATTCGGATATCTAAGCATAAATTTAGTTTATCTGTTCCAATCCTTCATGGATAAGTTA:1	+	chr3L	16015360	3'	+	1360	3363	1	62.76
TGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACC:1	+	chr2L	11661022	3'	-	F-element	68	1	51.37
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCGTTATATTTGGTCACTTCTTGGTTGCTTTTGC:1	+	chr3R	12887038	3'	-	roo	8678	2	76.03
AGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTAGTTTTCTTCGTATTTTCATTCTAATAAGGAGGATGGCACGA:1	+	chrX	10533156	3'	-	I-element	5089	1	58.00
CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTAATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCCTTGCAAGTGTACTAAAATCCGGGATCCAAGCACCAACAACAGTCACCTCCAGCGTCCAGCATAAAACCAAAGACCCTAGAATA:1	+	chr2R	5876919	3'	+	transib2	2785	1	47.26
AAAAAATAAATAGTAAAGTTTATGGAAAAAACAAACAAACACAAACAAAATCAAAAATTATATTATAGAATTACGAGAATATTTGCAATACATAAAAGTAAAAGCTTACAAGGAAATAAGTAAGAATCAGAAAAGTCAATATTATT:1	-	chr2L	4025373	3'	-	copia	5088	2	57.53
ATAACCGTCTTCCTCTTCACAATCAGCAGAGTCTGAAGAATTTTTATCAGGTTTAATGGATTATCGCATGGCCATCGTTATTATTGCTGTTGCATTTTCAATTACTGCTTCATTTGGATTTGCTTTCTTTTCTTATCTATACTTTT:1	+	chrX	10255289	3'	+	hopper	219	1	69.86
AGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTGC:1	-	chr3L	19013885	3'	+	invader3	5429	2	63.45
CATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATAGGTACTAAAGTTGAAGCGTAAAGATACTCTTTACTGATGGTGATGGTGG:1	+	chr2R	9463495	3'	-	rover	48	2	62.60
AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAAAAA:1	+	chrX	13504248	3'	+	412	430	2	61.64
TTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACAAAACACTAAATCAAATAATCCTGGAAGACTCAAGCCAGCTTTTGACACCAAAAACCGACCCATTATCCAATTGCAAAATAAAGAC:1	+	chr3R	4717488	3'	-	S-element	1510	1	66.67
AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATATACATATATATGTGTTTCTACAATGGCACCCACGCAAAACGCTTTGAACGGCTGGG:1	+	chr2L	2794269	3'	-	Burdock	54	2	65.47
GGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGTTGGCAGG:1	-	chr3L	2325684	3'	-	I-element	5108	1	59.57
TCAAGTAAAATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGATAATAACAGAAAAGTGCTGCCTCTTAGTTGACTATTTAGCTACTAGCTAGTACCTATACAATATACGCCCCCGGTTCTGAGTACTCGT:1	+	chr3L	19342096	3'	+	Tc1	461	1	68.15
TGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCC:1	-	chr2L	10023009	3'	-	Doc	77	1	69.17
TGATTGAATATCAGCTTAAGACTGAAACAATTGGTGTGAGAAAATCTTAGATGTACTGGGTTAGTGGATGATTTGCTGCCCTTATGTAAGGCTGGCTGCATGATGTTTCACCCACCAAAAGTGCCACCCACGCC:1	-	chr2L	12319859	3'	-	Tom1	285	1	51.49
GATAGCCGACAATTTAGAGATTCCTCTGTCATTGCTTGCATCGAGTTATCTACCTTGTTGAAGATATTCTCATAGCCTTCCAGACTCAAATGGAATATATGTATGTAAATAAGTGAGGAACCTTTCTGGTTTCCAACATTTTCAGA:1	-	chr2R	1892169	3'	-	Q-element	117	2	61.64
GTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGTCGTCGTGGCAAACAGTTGAACCTGGGAC:1	+	chr3L	16343337	3'	+	roo	379	1	65.49
TTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCACACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTT:1	+	chr2R	10582496	3'	-	Juan	3839	1	56.16
TGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGAAGGACGAAAAAGCATTAGCAAGTATAATGCTATGCATTAAGACATCCCAAATTAACCATATAAAAAAACTGTGAGACTGCTGTAGATTAATACTATCATTAGTATTAAAGCA:1	-	chr3R	19449807	3'	+	Dm88	460	1	79.71
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCCCCATTAATAAACATGAAATATTGTTGCGGCGAAACTTTTGTAATGAACCGAACCAACCAAAATCAAC:1	+	chr2R	18349413	3'	+	roo	9020	2	52.05
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCAGAGCCCCCG:1	-	chr3L	16343246	3'	-	roo	8716	2	76.00
AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACA:1	-	chr2R	8585439	3'	+	roo	9032	1	58.56
TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGT:1	-	chr2R	19499332	3'	+	P-element	2845	1	37.00
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCAAAGCAAAATCCAATGAACAGTTGAA:1	+	chr2L	18294311	3'	-	roo	42	2	55.48
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAAT:1	-	chrX	5643486	3'	+	roo	356	2	64.00
GGAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCATTTAGACACCCACTGCAACTGCACTGCATCCGCTGAAAGCTTCCACATTCC:1	+	chr3R	8355414	3'	+	1360	3199	1	54.62
ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAGCTTTACTCTGAAATTATTTCACAGAATTGTGAAATTCACATTTGCTTACTGATGCAGTTGATCATAGCTTGG:1	+	chr3R	1207580	3'	-	copia	4909	2	54.74
GCCACATAGGTAACAGTGCGTTCCTTATATTGTTGATATAAAAAATAACTATAAAATATCATAAATTTAGGATTCCTTCTGCGCTCAAAATAGTTGGTGTTATAATTATTTTATAATATTATTTTAGGATTCCTTCTGCGCTCAGA:1	+	chrX	5672158	3'	+	jockey	4964	1	52.74
GGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTCCATTTTAAATAGAAACTTTACCAACTTATGGCGATTCGGCTTAT:1	+	chr3R	9039059	3'	+	Juan	4206	1	77.04
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTA:2	+	chrX	6486818	3'	+	roo	9024	2	52.05
AAAAATATGTTTAAAAGAAAAACAAAAAAATTATGTTCGATATCAATTTCGCGTGGACACATGCCAAGAGACACGCAACGCCACCAAACACGCGTATCGTTTTTCTCCAGCTGCTTGAGGGCCTTGTTCCAAGAAGACAACAGCTT:1	-	chr2R	24036114	3'	+	transib2	2414	1	64.38
CGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTATCAGAGCATTTGTTTATTCAGGCCGGGCACAG:1	-	chrX	18386377	3'	+	invader4	273	2	61.24
ATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGAAGCAAGTCTGATAATTTAATGTATAAAAGAAAGTAAGCAAGTGAGTTTGTTTAAACGTGGCTATAAGGTTGAGTAAGAATACTCAATGTATGAATATATC:1	+	chr3L	3794028	3'	-	I-element	214	1	71.23
TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGCAATATAATAAGTTATGTTGGGTATGCATCGCAAATTTATTTCGTCAAGGTATGCAGTATTATTTTATGAGTTAGGCAATAAAAAGTATTTAT:1	-	chr2R	919649	3'	+	copia	229	1	67.12
AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGC:1	+	chr3L	3799856	3'	+	copia	249	1	62.16
ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCTGTATCATAAACACAGCCATTTGACATTGAACTCTTGCTAAAAGTCACGCCCACTTGACTTCTTT:1	+	chr3R	20005125	3'	-	297	6598	2	65.45
TTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTG:1	+	chrX	21564750	3'	-	diver	66	2	65.07
GGGAGCAGTGCTGTCCTCTACCCACTAAGATATAATTTTTTTATTTCCTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATGACCTTACTTTTTAGAAAATATTGATTAAAACATAATATTCTTTATGTCATAAAGAAAAATAA:1	-	chr3R	4514620	3'	-	HB	354	1	73.97
TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCA:1	+	chr3R	17243244	3'	+	hopper	1386	1	63.19
TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAGCACTTATTTTAACACACGTAGAGTACATGATATGTATTTTCCCCAAATTTGATAGGAAGTTTCCT:1	-	chr2L	6863268	3'	+	pogo	2049	1	59.59
ACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCATGAAGAGCGACATTGCAATCCTATAACCTGTAACATTAAAAAGAAGATAGT:1	+	chr2L	21153622	3'	+	1360	390	1	74.66
ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTAT:1	-	chr3R	5061809	3'	-	mdg3	5287	2	62.33
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAA:1	-	chr2R	20596452	3'	+	roo	9018	2	55.94
ACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGC:1	-	chr2R	20596441	3'	+	roo	398	1	69.09
TTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAAAGTATGCTAGGATATAAGTTGAAATTAGTAGTTTTTGGC:1	+	chrX	17521424	3'	+	roo	430	1	69.23
GAAAAAAATTAAATAAAAAAAAACATAATTGTGAAATAACCAATTGTCACCAACTAACCCAACCAAACAACAGCCAGCACTTACGTGAAGATGTTAGTTAAGTGTGGCAAAATAACTGAACAAGAATTTATTGCATTT:1	-	chrX	19321579	3'	+	X-element	4718	1	60.14
TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGT:1	-	chr2R	9632119	3'	-	roo	8738	2	74.81
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCCTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAACTTTAAATGCCCTTTAAAATGAGTTAGTTAATAATAGAATACAGAAATTTATTGGTTTCTTTGGTGTCATTA:1	+	chr2R	8585551	3'	-	roo	49	2	50.00
ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATTAGTATCTACAATAGATCTAGATAGGGGTCTTCCAACGTGCAAATGACTACTACGTCAACTACCAATAGG:1	-	chr2R	25118631	3'	-	roo	4	2	76.12
CTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTTTACTATAACTTTAGGATTC:1	+	chr3R	9039015	3'	+	Juan	4151	1	63.70
AGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTATCTGCATATTAATTAGTTTTTTAAGTGTAATTTACATAATGATTTGCCAGCCGGGGGGCGCATAATG:1	+	chr3L	2297822	3'	+	Stalker	7211	4	50.00
AGAAAGAGCCCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGTTGCCAAGTTGTATATATTTTCAT:1	-	chr2L	11744889	3'	+	F-element	362	1	76.15
TGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCT:1	-	chr2R	2016806	3'	-	1360	32	1	59.23
AAAGCGGTTTTGAAGGGAGATGGATGGGGGGCAAAGGAAGTGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGAGGTGTCTTCCCTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAATTATTAAAGAAAATACA:1	-	chr3L	11398727	3'	-	transib4	2440	1	64.96
ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCAGCAGCAGCAGCTGCGGCAATTGTTGCTGTTGTCGTTT:1	+	chrX	18000847	3'	+	412	435	2	67.16
GCTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTCTTTGTTTGGCAGTGTGAGTGCCGTGGGCTTTGGATTGTTTCCTGTGCGCTTATTAATACTACTACTGAGCCAACTTATATCGATATTCAAATAATATTTGTATTTTAATCTTCCACACGTTA:1	-	chr3R	5413891	3'	-	accord	257	2	49.32
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTT:1	-	chrX	10640001	3'	+	roo	396	1	65.45
CACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAGGCTTTTAATTAGATTCTTGTAATACTATCCAATTTTT:1	-	chr2R	9325338	3'	-	BS	4994	1	73.29
AATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAACCTATGTAAATCACCATTAACATCCTGCCAAGCGCTATGCAAGTCGGAGACTGTCTCA:1	+	chr4	887712	3'	+	Stalker3T	294	1	63.70
GAGAACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAGAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATC:1	+	chr2R	9500049	3'	-	G5	4742	1	55.28
ATTCGTTGAAAAGTATGTAACATGTAACAGATAGAAAGCATTTCCGATCATATAAGGCATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGACTCGACTCTGTCCGCCCCTTTTCGCTTTCTTCCCA:1	+	chrX	21189151	3'	+	INE-1	16	1	59.68
CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTT:1	+	chr2L	16016402	3'	-	412	75	2	69.66
ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCATGCGGAAATCGAT:1	+	chr2L	7888222	3'	-	pogo	54	1	60.96
TTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAAACATCCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGAATTTCGCCATGACA:1	+	chr3R	20499839	3'	+	mdg3	248	1	64.38
TGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGAAGTCATCCTTCTTTGGCGGTCATTGCTCCTCCTTGTTCAATCAAATGGCCTTTGTGCGTTCTTTATCTGGTAGCATCTGTTGACGTCACCCTAAATGGCGA:1	-	chr3R	13361699	3'	-	jockey	4743	1	75.94
CCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTAGCTGATGTACAATGAAGGGGGGGCGTGGCAATAGTCCTGGCATTTGGCGTCCATCGACA:1	+	chr3R	22217941	3'	-	hopper	47	1	51.85
TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACTGGGTCCCCATTGCCTGCCCTCTTTCATC:1	+	chrX	17963985	3'	-	jockey	4778	1	68.42
TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTAATCAGCTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGAGATGTTTCTATAA:1	-	chr3L	10841433	3'	-	mdg1	7045	2	59.50
ATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTGAGATACAGAATATTTCCCTAAGTCCCAAGTGGATTATTCTGGTGACACTCTCTACCGCATCATCAATTTC:1	-	chr3L	23450763	3'	-	HMS-Beagle2	303	2	68.49
AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAATGGCACTGCATAAACTTGGCTGGAAAGTATGCTAC:1	-	chr3R	13501103	3'	+	hopper	1375	1	61.90
AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTTTTCAATAGGCGCATA:1	+	chr3R	20499866	3'	+	mdg3	214	2	59.70
AGATAAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCAGTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTGTTATGAAAAAAATGGAATAAGCCAAAAGTTGCCAAAACAACAACCGATGATATACATTGT:1	-	chr3R	26162582	3'	+	Max-element	378	1	58.22
CTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTTCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCT:1	+	chr2R	5531207	3'	-	1360	98	1	50.68
GATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATACATTTTTTCTGCCATAAAGAATGGTGAGTATGGTGTTTTAATAATTTGTTATTAGCTAGTTGATATACGCAAATATCTCCGTT:1	-	chr3L	23340411	3'	+	Quasimodo	7336	2	65.07
GGTGGGCGGTAAGTCTGTCGACATATCGGCTACCGTGGAAGTTTTTTTGGGCCAGTGGGACAACTTAGTTTATTACAACCAAGTTGCAGTTGCACTGCAAGAGATCACGGACAG:1	-	chr3R	829513	3'	-	G5A	2614	1	56.14
CTTAGGGAAATATTTTGTATCTCAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATATTCAAGTGCAAGGACCAATTATACCCTGTATTTACTGTAGCGTGTTCCCAACTTCCTCCTTCTGGAG:1	+	chr2L	3818640	3'	+	HMS-Beagle2	227	2	54.11
GACTCAGCATTCCTTGCAGCGTGCAGCAACACTCGGAATAAGAAGCGTCAGCTTTTCACTGCCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAA:1	-	chr3L	11474690	3'	-	gypsy	145	2	71.03
ACATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAAGATTTAAAAGATTTCACGTGCTAGATCTCCCCGACATAATTAATAATGAATATACGGACTCATGGCCGGACAGACATTGGCTCCATTAACTCG:1	-	chr3R	26151382	3'	+	G4	3632	1	58.22
GATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTAGCAGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGGCTATAGATTCATTCTTTCTTGTTAGAGATGGATAAATGTTTTGTTGTCCGCCACTGATTTCGTCCCTGGCGAAATAGC:1	+	chr2R	5439253	3'	+	INE-1	507	1	68.49
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTA:1	+	chr3R	7100873	3'	+	roo	8983	2	77.93
CGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTAATAGATTGGCATAATAGAGAATTATTGTTG:1	+	chr3L	19014035	3'	-	invader3	5217	2	59.71
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGG:1	-	chrX	5643469	3'	+	roo	9016	2	57.53
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTACCTTTGAAATTGGC:1	+	chr2L	3886272	3'	+	roo	9038	1	61.64
AAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGGCGGAAAATAGAAATATATGGATACTACAGCGGCTATAGAATCAGCCAACAGACAAAACACAGACCAA:1	-	chr3R	20265738	3'	-	Porto1	305	1	68.57
ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCAT:1	-	chr3R	9921966	3'	-	blood	7063	2	56.16
CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATGTTGTGTTCTGTTGGCAAGGTTTTTCACCGTT:1	-	chr2L	20808308	3'	-	HMS-Beagle	36	2	54.62
CTTTTAAAGTTCGTGAGATCTCGACCTTCATGCAAACAGATCTACTCGGCTATTGATCCTGACAGAGTTGACGAAGGACCAAACTGTCGAGACGGGCAATGAAAACACATCT:1	-	chr2R	4906433	3'	-	INE-1	148	1	61.61
TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGGAAAGAGG:1	+	chr2R	16945369	3'	+	jockey	4974	1	53.40
GTTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGATTGCGACTTCTCACTAACTGTTGCGGGGTAAAATAAAATCGTTGCCGCGCATTTGTTTTGAAATG:1	-	chr2L	19577709	3'	+	1360	324	1	51.13
GTAAATTTGCTCAAGAATGTAAAGAATAAAGGATAAGACGAAAAAGTATTTTTTCCTATCTACACATGTGGAATAAAGCGTCGATTTCGAAAAGGGACTTGGAAAAATACTTTTGTATTTCTTAGTTTCCATCGCACTGCTATTTC:2	+	chr3L	17245740	3'	-	HB	176	1	43.84
AATATTGAAATTAAAAATAAACCTTAAAAATATAGAAAATCATGTTTTGACATTTTATATCAGCAATAACTTAGGACAATTGTAAGTTCAATCTTTTTATGTTGGCTCTTATCATCATCTGCAAAGTCATGATGAAAAGTCCCTT:1	-	chr2R	16884755	3'	-	hopper	188	1	72.41
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTACGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCACTGCGACTCCAAGTCTACCATC:1	-	chr2R	9328588	3'	-	roo	54	2	54.11
CAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAAAACAGAGGCGACCAAGTGCAAGAAAGGTATTTAAGGTGATTAAGCAATAGATTCCCCCAAACACATT:1	+	chr2R	13825177	3'	+	Stalker4	323	4	50.39
ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGAGTGTCAGTTTG:1	-	chrX	13504173	3'	-	412	7117	2	70.40
AAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGAACATGCCAGCATATTTACTCACAGTACTCCTGGAGATTTTCGCCATGACAAACTGATTGGTTTTCAATAGGCGCAAACGTGAA:1	+	chr3R	20499872	3'	+	mdg3	5460	2	58.90
TGCTGGCTCTCTCGAATTTTTGATCGAAAGCCAGAGAGCTCCAGAGGCAGCAGATCTCTTGCACGCATACAGCCACAGCCGACCACTGTATGTGTGCCCACACTCATAAACAGTCGGTAGTTCGAAAGTCGTC:1	+	chr2L	20117591	3'	+	1360	82	1	78.20
CACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTAGTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACGTATATAATAAAGTTTATTATTATTCGTTCAA:1	-	chrX	23457639	3'	-	Doc	91	1	80.69
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAA:1	-	chr3R	25448335	3'	+	roo	9018	2	56.43
ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAAT:1	-	chr3R	28758301	3'	+	mdg1	7394	2	62.33
ATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAAATCGATTACGGAC:1	-	chr2R	24218485	3'	-	412	2	2	79.20
CATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAATTGCTTTTAATTAAATGCAAATAACAAATAGCACAGTCCGTTGGCATAAATTATGCGAAAAAG:1	+	chr3L	17295495	3'	+	roo	8718	2	56.55
CGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATCTAACAGTGCCAATGTTGTGGTTTGAAATC:1	-	chr2L	22643757	3'	-	invader4	296	2	77.78
TTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTGCCGAGAACACTTAATAAGATGCGACAGCGGATACATTTACATTTTC:1	+	chrX	10253324	3'	-	hopper	14	1	73.48
ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATAAATTGCCATGAAATTAAGCAACTTGAACAAAAATCCACAACACGGCATGATAAA:1	+	chr3L	16769324	3'	-	FB	59	1	64.96
ATCTGCACGTGCACCAACAACAACTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTACGCTCTCAGCTCTGGTAGTACTGCTTTTATGGTTTCAGTTACGAAAGGTTCTTAAATTCAC:1	-	chrX	10739368	3'	+	Porto1	426	1	64.44
TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCACGAACTGCTACTAAA:1	+	chr2R	13585498	3'	+	412	7476	2	64.38
GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCATAACTAATTAATTATGCCT:1	+	chr3R	27424971	3'	-	blood	7044	2	65.93
ACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAAC:1	-	chrX	5663097	3'	-	P-element	197	1	43.31
GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTAGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGATTTCATAGCCTAC:1	+	chrX	13066584	3'	-	jockey	23	1	56.99
CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACTTTGCTCTTCACATTTATTACTTGTTAACTTGAGATCGTTGTTAGATCTAATAACTAGCTGCATCTTGTTAGTTAGTTAGTTTCT:1	+	chr3R	21434997	3'	+	412	7509	2	59.59
AAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTT:2	+	chr2L	21884608	3'	+	pogo	2037	1	64.38
ATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATGTCGAATAG:1	+	chrX	11296500	3'	-	BS	5010	1	68.55
CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCTTGGAATCGGTATCGGAAATCTTTGAATATATCATAAATAAAAGACTTAAATTTATGAT:1	+	chrX	6522101	3'	-	F-element	26	1	70.37
AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGTGCATTAAGAACCACTTAAAATTGGACAGTGTAGCGTAAATCTATTAATATTATATATCTCCCCTCAGCAATACTACATACTAAGTCAAGAG:1	+	chr3L	18555167	3'	-	jockey	4768	1	62.33
CTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATTTTAAGGCGATGAAGTCGACTTTTCGCCCGTGAAAGTGCGCCATCAGTTATAAA:1	+	chrX	6499100	3'	-	Quasimodo	4	2	72.26
TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCTAAGGATAAGCACTTTTACTTGGTGCGT:1	-	chr2L	2794142	3'	+	Burdock	226	2	62.07
CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTTATCAGCCGAGGTCTTAACACGCATATACAAATATGCCAGACACACACTCACACC:1	-	chr2L	17081732	3'	+	jockey	4982	1	73.10
TGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATAAAAAAAGTTAAACTTAGCTGCTTATGAAATGCCTAAACTCAA:1	+	chr2R	4601682	3'	-	HMS-Beagle2	6907	2	71.92
ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCCAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCAGTTGCTGCCACTT:1	-	chr3R	17246547	3'	+	hopper	1397	1	60.96
AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGTATCTTAGTATTTCAGAATTTAAACTTAATTTATATATTTTATAAGCATTTATTTACATGATTTGATTAAACTG:1	-	chr3R	14337382	3'	-	copia	4906	2	57.04
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAA:1	-	chr2R	19004122	3'	+	roo	9039	1	59.06
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGA:1	-	chr2L	14772049	3'	+	roo	9006	2	67.67
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTACACTCATTATA:1	-	chr3L	20831281	3'	+	roo	343	2	65.75
GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAACCATATCCGTATCGTCTTTTCTGAAACTGAGGTCATCCAGCCAGGCGCCGGAACTCATTTCCCCGGCAAGA:1	-	chr3R	11496482	3'	-	1360	12	1	75.56
TTTAATAAAAATTAAAAAAAAATCCATACATATTTGTTTTGATTTACTATTGTTATATTGAGGGATGTTATGTTTGCTTTACTTTCCCCAAAGTCTGTGAGTCTAAAAAAAAATGGTTTCGGATTAAGGAATCTTGGCCTGGAGTT:1	-	chr2L	9491067	3'	+	Doc	4691	1	54.79
AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAG:1	-	chr3R	13360283	3'	-	jockey	22	1	68.42
AAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACCCGTAAAAAGTTCGTTACAATATATACTTCATATAGTCGGAAACGCTTCATTTTGCCTGTTATATACTTTTTAATAAATCTATTTCCATAAATCTTACTTCGTATGATG:1	-	chrX	21132937	3'	-	INE-1	558	1	75.36
GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATTTTTGTCAAGTCGCATTAAGGCAGCGCGCTCATT:1	+	chr3L	13574528	3'	-	hobo	10	1	65.62
ATAATAATAAAAATAACAATAATTATATTTTCATAAGGCTCATTAGTTAAACTATGCTTTCATTGTTATCGCTTTTATCGTTCACTTGCTTATCGTTGCCCATGTTCTTGGATTAAACGATTATCGAAAGCATTAGTCGCTTGCAC:1	+	chrX	16572677	3'	+	mdg1	7064	5	79.45
ACGCTGCCCTGCGGAACTCCAGCTCTCATAACGCGGGGAATCGAGTAGGAGTATATAATCGTCACTGCATTGAAAACTTCTAACTTAAATCGATTTACCCCCTGCAAGAATAGCAAATCAGAAAGCCTTTTGAATGGTATATAATT:1	+	chr4	409437	3'	-	BS4	71	2	63.01
ACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGG:1	+	chr2R	16945361	3'	+	jockey	4923	1	61.64
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGA:1	+	chr3R	27994246	3'	+	roo	9003	2	79.83
GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATTATCACAGTACATAATATGCTTGTTATTTGGCATGAATTTTAGCTGCTTTCTGAAATGAACACCAA:1	-	chr2R	9221004	3'	-	opus	7168	4	58.22
TTTAATAGTTTTTTTTTAGGAGACTGAATACCAAATTTTTTCAGTTTTTAAAGGCATTAGCTGGACAAAAAAAAAATAAATATATTCCTTCAGTTCACTTTTCACTCACTTTATTTTTATAAACTTTTTTAATATCG:1	-	chr2L	16573944	3'	-	Tc1	48	1	77.37
ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATACCCAACTTATTAGTGTGCAAATATTGAAATAACT:1	+	chr2R	7586258	3'	+	I-element	5344	1	73.29
CGCGAGTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCT:1	+	chr3R	16076854	3'	+	roo	8992	2	74.82
TGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATT:1	+	chrX	6499047	3'	-	Quasimodo	20	2	54.00
TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATACGGGGAAAGCTCGGTGATCCGATCATTTTGCGGCCA:1	+	chr3R	22275500	3'	-	jockey	4822	1	73.29
ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGTCGTTTTTCTGCTGTATTTTGCGTGTGTATTTGTATTGGCCTTTTTGGCCGGCATAAAACATTTTTGAA:1	-	chr3R	10266063	3'	+	1360	3356	1	57.36
AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCG:1	+	chr3R	10182181	3'	-	blood	44	2	71.58
TATTTATGCAATGCAACTAAGGGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCT:1	-	chr3L	10848673	3'	-	blood	7064	2	69.81
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGTCATT:1	-	chr2R	25118700	3'	-	roo	79	2	76.43
TATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTCAATGTTTGCGCTAGTGGTTTTCGATATTTTTTGCTGCATGTTGGAGTGGGG:1	+	chr2R	23332647	3'	+	invader4	3078	2	76.32
ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGTCGACTTTATTCTGTGGCAGCCTCGTAATTAACTGGCACAGGCGGTGCATACTTTCCAG:1	-	chr2R	12835025	3'	-	jockey	31	1	59.65
CGAAGANATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATG:1	+	chr3L	233342	3'	+	roo	355	2	55.48
AGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCATAAAGCTGCAAAAAATATATGCATTCTACACATTATTATTATATTCGAATAGGAAAAATACCCAGAACTATTTTTAAAAATTTTATTCGAAAAT:1	-	chr3L	1534610	3'	+	pogo	2086	1	69.57
TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTTCATATACATATATTCCGTACTTTTCTGTTTGCTCGCATTGTGGATTTTTTGTAGTTTTTGGCCAAATGCCAGCGGAATCGTTTG:1	+	chrX	18030380	3'	-	opus	7024	2	68.66
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGG:1	+	chr3R	12886985	3'	-	roo	32	2	59.46
AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGCC:1	-	chr2R	2016836	3'	-	1360	36	1	57.69
GATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATC:1	+	chr2R	5173223	3'	+	Stalker4	7307	4	56.85
TAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAGAAAAACAA:1	+	chr2R	4673659	3'	+	Quasimodo	7297	2	69.18
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAGCA:1	-	chr3L	22437837	3'	+	roo	9046	1	64.93
TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGAATCTATTGCATACTTTGGCGGGCTGTGACAAATG:1	+	chrX	11296492	3'	-	BS	5018	1	62.10
TTTAATTTATATTTATTTATTTAATTTAATTGTTGCAGGTGTTAAAACCAAACTCTGACCTATAGATATCCTCGTAGGTATTCTGAACTTCTCGCATGTGAGAAGCATTATTGGCGGTT:1	-	chr3L	10273479	3'	+	S2	97	1	70.59
ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGTGTTTTTTTTTATAATTGGAGATCTGTTAATTAGGAATGT:1	+	chr2L	22775559	3'	+	pogo	2068	1	65.66
CGATTCAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAAAATAAAGATTTTAGAGTTAACTTGTACAAAGGGCAGGGACGTAATCAATAACACTCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGCAGGTACATATGAAAAAATACAAGTAT:1	-	chr3L	23635038	3'	-	gypsy6	7604	2	54.79
AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATCCGAAATTACGCATACGCCCCATGTAATGCAGACTT:1	+	chr2L	14721537	3'	-	roo	8669	2	75.34
CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATAAGGTGAGCAGAATCTACCAACGCTTTTAAGAGTTTCGACGAGCTCCATGCGGAAATCGATTTTAAATTTAGGAAGCTGCACATGTACATCCAT:1	+	chr2L	7888255	3'	-	pogo	21	1	67.81
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAA:1	+	chrX	5274384	3'	+	roo	342	2	64.83
GAAAATAATTAATTTAATTTTGACTGAGACAATAACTTGTTTATCTAATTTATCTCTCTTCCTTATTTTAATATTCTCAATAGAAATATTTTAAATCAGATCTTTGATTTATTTGTCATACATATTAGACTGTGTCATAGTAAAAT:1	-	chr2L	9504929	3'	-	NOF	3964	1	90.41
CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATA:1	+	chr3L	11957216	3'	+	blood	351	2	55.14
ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATG:1	-	chr2R	9791575	3'	-	412	58	2	59.59
TAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCCATGCAATGGGTTCGCAACAAGGTCCCCACTAAACAGCCACTGATTCAA:1	-	chr3L	592465	3'	-	Burdock	5991	1	75.83
CGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATTATTCACAAAAGAAATGCAGCAAAGGAAAATACAATATTACAACGAATTGTCAAGCAGTCGGATTCGAAACAAAGAAAATA:2	-	chrX	13704737	3'	+	invader4	3050	2	59.59
TTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGTTAAACTGACGACCCTTTTACGAATATA:1	-	chr3R	24383227	3'	+	rover	301	2	52.94
CAACACGTGCGGAGTGCAAAATTTCCAATAATTTATTACCTATTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTACGGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATC:1	+	chr3R	2412144	3'	-	R1A1-element	164	1	68.03
ATGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCAAATATTCTTAGTCGTGTTAGTTGTAACCCGATTTCAATGTCTTCGATATATTTAGTAAAATGTATAATGTTAAATATTAAAAG:1	+	chr3R	4160054	3'	-	invader2	6	2	70.59
AAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCTAATCGACAATAGAGCAGTTC:1	-	chr2R	1320651	3'	+	diver2	365	1	69.91
ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTA:1	-	chr3R	1433147	3'	-	mdg1	7062	2	57.83
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCACGCACGAAAAACCGAAAGAAAAATAAACAATTTGCAACTACAA:1	+	chrX	5643605	3'	-	roo	32	2	62.33
TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATTTCTGGTCCTGTCATCGAGTATTTTTATGCGGGCTGCCGATGGGCGGG:1	-	chr3R	17531343	3'	-	1360	54	1	54.11
AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATCGGAGTTCATCATTACACTATACTCACATATATGCATATACGTTTTTGACTTTC:1	+	chr3L	22863453	3'	+	412	425	2	73.23
TTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAA:1	+	chr2L	6623017	3'	-	Burdock	66	2	72.31
TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTACG:1	+	chr2R	2427626	3'	-	Doc	56	1	56.85
ATAAAAAAGATAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGAGGAATCTCTAAATTGTCGGCTATAATGTATATTAACCAGTGGATCTATGGATCTAAAGCTAGTAACACTCGTTCTGCACGGATCGCTCCAG:1	+	chrX	6294615	3'	+	Q-element	77	2	52.71
GAAACGAGGAAATTAATATAATGTAAAATAGCTATATTGATGCCCGAAGCACTTGCGGACATCACCCATTATCAACACGTCGGTGTCGCTCCAGACGACTAGGACAGCTCCTACAGGAACATTC:1	+	chr2R	4736633	3'	-	Cr1a	4332	1	69.35
AAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGCCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGTGCCACCAAATGTTCCGGCATATTTAGCATATTGCCACGTCTTTATAAAGGTGCCCGTGCTTTGC:1	+	chr3L	7497753	3'	-	1360	407	1	55.48
AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATATATATAATAAAATAATAAGGAAATAACACAATGTTGCATCCACTGTTCAATCGTAG:1	+	chr2L	13584746	3'	-	pogo	51	1	62.22
TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACCGAACTGTAAACGATACTACCTTAAACTCTGGCCACCAATTCGACGGATTGCAATTATTCAGGGAATGCA:1	+	chr2L	5021680	3'	+	flea	203	2	50.70
CCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAGGGTAAGTGAATTTCATAGAATACGGTTGTGTACATAAAGCGAGCGTAATATAATACCATATATCAAAAGTTGGAACCTGTTC:1	+	chr3R	14648656	3'	+	P-element	396	1	66.94
AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCCTTGATTGATTTCAATATTATTATCACGATTTGCGGAAACCTGGCCTATATTTAAGTCGCCACCATAGCCGAAAAGGGTGAATAATGGTGTGGG:1	-	chr2R	6487818	3'	-	copia	4898	2	65.75
GTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTTTCGGTGTGG:1	+	chr3R	22822180	3'	-	mdg1	3	2	64.38
ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACAAACCACCTAATCCTCGCGCAATACGTTATCATTTATTTGG:1	+	chr3L	17115511	3'	-	blood	17	2	43.66
AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGC:1	-	chr2R	20496907	3'	-	blood	60	2	58.22
TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCG:1	-	chr2L	14772021	3'	+	roo	9035	1	55.30
AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGCGCCACTTAACAATAACTTAAA:1	+	chr3L	7588472	3'	-	hopper	56	1	78.10
GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCACTTTTTGAGATAGAACCTGAGAGCGAACAGTAGGCTGGGAGCG:1	+	chr2R	3292808	3'	-	opus	162	4	63.33
ATACTCCACGAAACACAGGGGACAGGTTTAGTTCATTAACGGCGAAGTCACGTCTCTTATGTCCTACGGCAATTAAACGT:1	-	chr2L	5844938	3'	-	transib2	393	1	76.25
CTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTCGGGTGTCATGTAAAAGTAAGTATATACTATTACCTTGTAAATAGTAAAAATATCTATGAATATGAAGTGGCAGAGGAACACAAAAA:1	-	chr2L	18299843	3'	+	roo	33	2	62.07
ATTTAGACTTTATGCCAAAAAACGAATTCTGACTTACTAGCTATTTGGGAAAAGATTAATGCCCAAAATGTGCTAGCATTAATATTTGAGTATCAGGGGAAAAGTGATTCGTATCAAGGTCAGGACCGCAGGCCTCAT:1	-	chr3R	11698475	3'	-	transib2	22	1	73.91
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTGGTACCAAGCACTCCATTCCACTCTGC:1	-	chr2R	13084558	3'	-	roo	8683	2	69.23
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCGAAC:1	+	chr3L	9998221	3'	-	roo	39	2	59.59
AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGAGCATTCCTAGACTATTTGGACTTTGTTAGCAATATA:1	+	chrX	21014834	3'	+	copia	214	2	66.99
TAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATT:1	+	chr2R	6085997	3'	-	1360	345	1	72.88
CCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACACATTTTTTTAACGCTGACCTGTAGGAGGCAGGTGACCATTAAAGTGTCATTCGTTTTAGCAAAAACACTTTGTAGTTGCACACCGTGAAATATATCCCTGTA:1	+	chr4	160587	3'	+	INE-1	219	1	69.18
GAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACTTACATTATTTGGATGTGCGTTTCAAAAACATAGTAGGAAATGAACAAAA:1	-	chr2R	24845431	3'	-	roo	213	2	65.28
CGGCGATAATAAAACCAATATGGACGGAAAGTCACCACCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG:1	+	chr2L	18885844	3'	+	Porto1	4249	1	53.23
TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGGAGTG:1	+	chr3L	22349291	3'	-	jockey	29	1	58.72
GAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTAGAAACAATTAATGAGGTCCCACCAAAATCTTTAAGAAAATCTAAACCTGTTTCCCAAAGTGAACTAAATAATGTGCCAAAAATC:1	+	chr3R	25342394	3'	+	mdg1	7366	2	62.76
AGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCT:1	-	chr3L	2325708	3'	-	I-element	5137	1	61.64
ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGAT:1	-	chr2L	18419148	3'	+	412	444	2	57.85
AAAAAAAACAAAAAAACCTTTTGGCCTCGAAGGGAGATATAAATGTATACGAGCGATTGCAGAGCTGCTAGTTCTATTTTCGATATTGGGAAGGTGGTGAATGGGCCGCCGCGAGGGAGCAGGGGTGGACGGGCCTA:1	+	chrX	4600576	3'	+	HMS-Beagle2	492	1	56.93
CAATCTACAAGCTACAGTTTTTTCTGCGTCATAGAATTACTGTAGAAGAACCACAAAAGCGCAAAGGCCCAGTCCAATGTGCGAACTGTCAAGAATATGGCCATGGCAAGAGCACTGCAACGGGCATAACAAAATCATTAATGTAA:1	-	chrX	4705973	3'	+	Fw3	380	1	79.45
GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGACCATCTTGAGCTCTGAATAATTCTCTTTTTATCTTT:1	+	chrX	21564778	3'	-	diver	5908	2	67.19
TTTAAGTTACCTGCATCAAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTCCCGAAGGATGC:1	-	chr2R	20944316	3'	+	pogo	2060	1	49.66
CGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACTAATGAAATATGAAATATTAAGAAAAAATTTCGAATAACTTTAAATCAGATAAATTATTTGACTTATCTTC:1	-	chr2R	9258399	3'	-	3S18	5818	2	52.05
GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAA:1	-	chr3R	31817464	3'	-	roo	12	2	55.41
ATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCGGATGGGGAAAAATGCTACATCTACCCAAAGCC:1	+	chr2L	18419300	3'	-	412	2	2	77.24
ATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAA:1	-	chr3R	3922965	3'	-	Cr1a	83	1	77.69
GTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATTCCTCATCCTTTCAAACAGCCTCAGGACGCACTAGCTCCTACATAGG:1	-	chr3L	2154286	3'	+	Stalker4	6955	2	64.93
AAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACATTTTGAACA:1	+	chrY	3648893	3'	-	Transpac	61	2	59.59
TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTCTATTTTAATATGAACCCAAATTGAGGATTTTATTTATGCAC:1	+	chr2R	9662782	3'	-	412	81	2	76.71
AAAGATTTAAAAATGAAAAGTGCTTTTACCTATTTACAAAGATTTTAAATAGATTACTGAGAAGGTAAGAACCGTTCACAATTACCTACGGCATACAATTTTAAACACATTCACTAAAAATTTAATACTTCACAATTGATAATAAT:1	-	chr2L	9982575	3'	+	Dm88	4239	1	60.96
CACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGC:1	+	chr3L	25232859	3'	-	accord2	48	2	56.00
TCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTACTTCTTG:1	+	chr2L	10037432	3'	-	Quasimodo	5	2	74.55
TGCTGAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTTAAAAACTTTTTAATTTTAAGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGG:1	-	chr2L	18159005	3'	-	INE-1	169	1	52.05
AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTATCGAGCTTATCAGAACCCACTGCACCTTGCACTATATTTGTTTGTGAGTAAC:1	-	chr3L	6978142	3'	-	pogo	39	1	57.50
GTGTTGATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGTTAAACTGACGACCCTTTT:2	-	chr3R	24383236	3'	+	rover	282	2	62.33
AATTAATTTATTTTCATTTTTATTTATTTAAATAACTAGCTAACAGTTGTGAAGTATTCTGGTCGCAAACACTTACAAACTGATGCAAAATGGGAAAATGGGAAAGTTCACTGCCAATAGCCACAGCTGGCTAAGCGGAAAATGAT:1	+	chr3L	16535309	3'	-	NOF	3958	2	61.64
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCA:1	-	chr2L	18294211	3'	+	roo	327	2	75.34
CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCGCAGGGAGTCCTTCGGAGAAGACAAAAAGGACTTGG:1	+	chr2R	2016925	3'	+	1360	3384	2	72.16
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGAGATACAGACAGGCCATCGAATT:1	+	chr3L	16343304	3'	+	roo	394	1	61.70
ATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAG:1	+	chr2R	21298827	3'	-	jockey	280	1	60.00
AAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATTATTTACTTACTGAGAATATGTACTCAACAATCTCTGGTGCAAAAGATTTCGTGCTCCACATG:1	-	chr2R	23332515	3'	-	invader4	2775	2	65.14
AAAATCCGAAAGGGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAGTGATTTGATATCTTAAATAATAA:1	-	chr3L	7718590	3'	+	F-element	109	1	92.41
ATTTAATTATTATTTGATTTTTTAGTTTTTTCTTCATAACTATGAAAGCTTTATAATTCTAGTTTAATATACTCTATTATTCCATAGCACTTTCCAACAATTAGGACTCCGTTTTTTTTGCCAAGTTGTAAGGGATTTTCTCTCAG:1	+	chr3L	16169123	3'	-	Tc1-2	389	1	69.18
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCACGCACGAAAAACCGAAAGCA:1	+	chrX	5643582	3'	-	roo	8706	2	55.64
CATTGATCTGTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTTGGTGATGAGTTGGGACAGATTGGGCATTCTCATGACCGGGAATGAGCTGCAGGAGCTGTTGAGCATTGGGCATTGGCGGCTGTAGGAAGG:1	+	chr4	803089	3'	+	Tc1-2	242	1	73.08
TTTTTTTTGTTTTTTTCCTTTTATCTTTCGAGTTGAATTTAATTGATTGTTTTGGTTTCTTGCCCTGCCTACTGCCGACGTTTGTTTTGATCCGTAAAAAAAAAAATGAGTGTTCGATCAAATCTGCAA:1	+	chrX	2672716	3'	-	Doc2-element	239	2	78.29
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTGAATTTG:1	-	chrX	10640000	3'	+	roo	360	2	48.63
TGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAA:1	-	chr3R	25423210	3'	-	3S18	5837	2	64.83
GGTCTANTCCAGCTCAGCAGCCATTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGAGCCGTTTAATTATAGAACAGTTGGTTATTATATGATTGCCATAAGTTTTTGTCGCGCTTACTTTGCTTGGTG:1	-	chr3L	18725924	3'	+	F-element	4490	1	63.45
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGTCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTA:1	-	chr3R	16076799	3'	-	roo	8746	2	73.97
GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAAGATCATGAATGAGAAAG:1	-	chr2R	3065954	3'	-	P-element	82	1	19.53
TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATCGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATGGCCCGACGGATTCATTCGATTTCGATCCAATA:1	+	chr3L	17115587	3'	-	blood	16	2	71.92
CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAGGTTGCACCGAAATAACGCAATATTTTCGAATAAAATTTTTAAACATAGTTCTGGGAATTTTTCCTATTCGAATAT:1	+	chr3L	1534642	3'	-	pogo	20	1	63.71
AAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTGTGGTTTGTGGATTGGGGAATGCGGATTGGGTCAGACTTTAATCCGGCTATTG:1	-	chrX	21016754	3'	-	Transpac	66	2	65.75
CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATCGTCTCAAATCAGTTGATTTCGGGGAAGCAATAT:1	-	chr2R	9309134	3'	-	Tabor	6928	2	76.71
CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCAAAGGAAAACACTTACCCAAACAGCAACA:1	+	chrX	14824780	3'	-	jockey	4710	1	48.57
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCA:1	-	chrX	14336416	3'	+	roo	9026	1	59.35
TTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAAT:1	+	chr2L	2122473	3'	-	Stalker4	75	4	68.49
ATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAA:1	-	chr3R	26659765	3'	-	HMS-Beagle2	6957	2	69.18
CGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATAACAGTGAAAGGTAAGACGGTGGGCACAAAGGGAATATTGTAAAAAGGA:1	+	chr3R	19589997	3'	+	BS	5049	1	58.68
TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGGATCAGTAGTCAAGCG:1	-	chr2R	6173005	3'	-	pogo	59	1	70.73
GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTCGACGCGGGCTGCGACCCAGCGCAGCATAAAATGGGAGCAAAACGTAGCATACATTT:1	+	chr2L	15181453	3'	-	jockey	4773	1	60.64
AACCGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTAT:1	-	chr2L	13585857	3'	-	Tabor	6922	2	75.00
AGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGGACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATACATTTGTGATCCTGGTTTTCTGAGACATTTGACAAGTAGCGAAGGAGATGAGAAACGG:1	+	chrX	15946792	3'	-	INE-1	542	1	48.39
ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCACTGTCTTG:1	+	chr3R	29361079	3'	+	mdg1	373	2	52.05
ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCCGAGTATACCAAGATAAAAATACAACGGCACAATTCGTAAACAAGTACTATTTAAGTAATCTCTAATTATCTTATCTTATTATTATATTTTTATTAATCT:1	-	chr2L	18278527	3'	+	P-element	2866	1	73.97
GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTAC:1	-	chr3R	17243078	3'	-	hopper	22	1	69.29
CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATGGCCCGACGGATTCATTCGATTTCGATCCAATAGCCGGG:1	+	chr3L	17115593	3'	-	blood	7021	2	77.40
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAATAGCACTTATTTTAACACACGTAGAGTACATGATATGTATTTTCCCCAAATTTGATAGGAAGTTTC:2	-	chr2L	6863270	3'	+	pogo	2047	1	60.96
GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGCTTGGCCTATCAAATAAACGTGGCTCAACGTG:1	-	chr2L	16067052	3'	+	297	357	2	55.48
GTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAGACGCATCGGATTNAAAGAGTTAGCCACGCACCCAGAAAAAAATCGCCAAGGAACAAACGGCCGGCACACAGTTTTCTGTAGTA:1	+	chr3L	20653364	3'	+	roo	8814	2	73.87
CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTTTTATTAAATAAATTTGTTTACAAAGCGTTGGAAATTTGTTGACCCTCTGATGGTATAAGTTTATGGGTTTCTTCCCGTCTTTCCTGATTCGATTGCAGTTTCATTAT:1	+	chr3L	12861860	3'	-	pogo	12	1	70.55
CCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTAGCATTTTTAGGATTATGATGTAGGTAGTGATTTTCCAAACGTCTTGCGT:1	-	chr2L	15732135	3'	+	jockey	4783	1	75.34
ATTTTCATTTTTGTGGGTATTTTGAACGCTCCATGGGGTTAAATGTGGAAATGTTATGCTGCAATATCATTTGGACTTACGGGGCGGGGATGGACGGTTTGCAAAAAATAAACG:1	+	chr2L	2303709	3'	+	Transib5	376	1	64.91
CCACGCTGAATAAACATACGGCCGCGCAATTACGAAAAGTCTAGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTTTTTTCAGCATATTCATTTTCGATAATATTGAGAACCATATTGTACCCTGTGTCCTCCACAGTGGTTAATATTTTGGA:1	-	chr3R	19445731	3'	+	GATE	8385	2	53.10
ACTATATTAATTGTTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATATAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAATAACAGTCGACGAGGCCGTAAATATTGCATTTTAGCATAATTGTTTATACTTTGCAGCAGCTGCCAAACGCAAGCAA:1	-	chr3L	2803118	3'	-	Cr1a	4302	1	52.41
AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTAGCGTATCCATGCCTGCGGTCCCCTGGAGACTAAAAGATACAAATGCAGAGGC:1	-	chr2L	18338971	3'	-	pogo	50	1	58.91
AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTAATATACTTTTGCCGCTTTTAAAATTTGTGAAATTCCATGAAATAGGTTCAAAAGTCATATTTCCGTTGAG:1	+	chr3L	10648027	3'	-	412	7083	2	51.37
AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGAGAACGCAACTATTAAAGAATTAGATTTAAGAACTAGGAGTTGGTTTTATTCTCTTTCCTATTCAAG:2	+	chr3L	17560391	3'	-	pogo	51	1	53.42
ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGCAACCTTCCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCACTTTTCAACTCGACCTCACTAGCCATTCACTTTTGTGTACTC:1	-	chr2L	14081293	3'	-	1360	2	2	73.74
GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAA:1	+	chr3L	23456274	3'	+	1360	3332	1	58.90
TTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATATTATTAGCTACTTATTATGGCTT:1	-	chr3R	18339048	3'	+	roo	385	2	67.81
ATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGGGCGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAATTGAAATAATAATTTCTTATTGCTATAATAGCCATGCTAAGA:1	-	chr3L	16787101	3'	-	Chimpo	159	1	72.26
ACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTATTTACTACGCTGAGGGGAGTAAGTCAAGCAAGTCATTTTACTAGACCGACTTAATTTTA:1	-	chr3L	22532212	3'	+	Cr1a	4216	1	78.62
ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGCAAGGGTAAATAAGATTCGGCTTGCCACAGCCACCTTCCTGTCAGGTGATGGTTATTTTAGCAGTATATTAAAAAAAAATAAATGAAACGAAACAGATAATGCTTTACATTTACTTGGAA:1	+	chr2L	10986941	3'	-	1360	2	2	80.82
CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGACACCCCCCCAACTATACTTACATACTCTGAGCATGTGAAATTAGATCGTAAGCAAAGTCTCCTCAAGTTTCTAAAACTCCAT:1	-	chr2L	1517587	3'	-	jockey	4711	1	58.27
GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACG:1	+	chr2L	12892695	3'	+	roo	331	2	73.24
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATTGCAGACATCGGTGCTCGTCACAGATAGTCAATCGAATCGAA:1	-	chr3L	12879696	3'	-	roo	8678	2	75.37
TATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATAATTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGATCT:1	-	chr2R	5284534	3'	+	Doc4-element	2597	1	48.63
CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATTACATCGATTTTCATGGCACACAACTGATTGTCAGTTTGGTTTT:1	-	chrX	13504168	3'	-	412	79	2	71.03
TGGACTTTAAATCTATATTATTTTTGCACCATGTAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATAATTATTTGAATATAGCATAGAAATAGTAGTATTTGGGTACAAAATCCGTAATGGTGACGACAAACAGCTCGGTGACAT:1	-	chr3R	6845506	3'	+	1360	244	1	63.70
ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATATATGCATGTTTAATTTAAATGTATCATAGTTATATATAACTTTTAACTAAGCGCAAAAATGCAATTTTCTAGAGAAACTTGTCTTGTGTGTTTCACAACCTGTCGCTTC:1	+	chr2L	12498491	3'	+	pogo	2094	1	75.34
AAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTGCAATTTATCACACAGAACGCTCGCCCTATTCCCTGTTCCCAAATTCC:1	+	chr3R	14977445	3'	-	pogo	1967	1	66.67
GTAGTGGGTGGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAGCATTAGTTCGGGCATTCGACCAAAGCGTTCTCATGATTTCAGCTTTCTCTTTTTATTATTTGGTAATAGGACA:1	+	chr3R	5369245	3'	+	HB	348	1	52.74
GTGATGCGAGGCGGGCATGTGCGCGCTGTGTGACTATCGAAGGCACGAGGCGCCGACTAAGCGCTTCTTACACTTCTATTTATACTACTGCACAGACATACAGACTTAAATATATGCAGTTCATACCAGAGTCG:1	-	chr2R	3152365	3'	+	gypsy10	142	2	51.49
ATATATTTTTTTCAAATTTAAAGCTAACCATTAAAAACAATATTAAAAAATGGTGATAAATTATCGCATTCGTTC:1	+	chr3L	3259092	3'	+	copia	4669	1	80.00
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTC:1	+	chr3R	27994280	3'	+	roo	390	2	61.17
AATTAACATATAATAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTT:1	+	chr3R	20868233	3'	-	BS	5026	1	59.86
CTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACATTGGAGTGGATTGCCGATTGGATTGGAGTGGAGTGGAGTCTTAACTTAGCCTGGTAGTTACATTGATTCGATGTCAGCATTGGCATTGTTTTTT:1	-	chr3L	10386615	3'	+	Burdock	262	1	66.90
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTATTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAG:1	+	chr3R	25448420	3'	-	roo	8702	2	61.32
TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCAGAAATTGACGCCTGGTTTTTATCATAAGGCAATTTCATATTATGC:1	+	chr3L	7188654	3'	-	hobo	29	1	65.00
CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCATGATGTAGTGAATACGACTTAAAGCG:1	-	chr2L	9668215	3'	+	1360	3384	2	67.27
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCAAATGCCTAATTAAATTTGTAAGATTTTACGAG:1	+	chr2R	18336291	3'	+	roo	393	1	76.03
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCGCCAATCGA:1	-	chr3R	14364592	3'	+	roo	391	2	65.74
TATTTACAATGTGTCTTAAAAAAGTATGATAAGTAAATTTATAATTAATCGTAAATTAACAGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGA:1	+	chr2R	5532319	3'	-	G4	3831	1	70.55
TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGCTGGATGCTTAGGTAAGTCATTATGATGCATGGATAAATGGATGAGTTAGCTGGGGCAACCTGTA:1	+	chr3R	21706089	3'	+	297	341	2	60.27
AAAAGGGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAATCCTTTTGGTATATCGATAAAAATTGGTAAGACAAAGAAAAATCTAAACA:1	+	chr2R	11636935	3'	+	invader2	453	1	65.75
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTAT:1	+	chr2L	17420260	3'	-	roo	52	2	55.17
GTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTAACATGTTGCTCGTGTGCTGCTCCCCTTTTGTTGCGCCTGCAATCTGCAACTTGCAACATGCATCTTGTTTTTTG:1	-	chr2R	8634120	3'	+	BS	5025	1	60.80
GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGAAGT:1	+	chr3L	3863531	3'	-	blood	61	2	57.53
AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAA:1	-	chr3R	21276569	3'	-	BS	5006	1	59.32
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGACCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCAT:1	+	chrX	14336497	3'	-	roo	58	2	69.23
TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACGATACGAAAACGGAAATCGCATCAGGAATATTTGATTACAACAACACACACTCAGTG:1	+	chr2R	13006514	3'	-	3S18	31	2	56.36
CGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATAAAATCAAATAATTTTTGTTTGGTCCGCTCTTTGGCGAATTATTTGCCATTGATT:1	-	chr2L	3663968	3'	-	1360	3185	1	73.97
ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATACATATACATTACATTATATACATTTACAATTATAAAATGAGAACGTCGTAAAATTTAAATATGATAGAAAAAGATTCTAGTAATTC:1	-	chr2L	20117857	3'	+	invader4	299	2	44.52
GAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTCTACACACCCACTAACCAATAATAAAAACCA:1	+	chr3L	16015298	3'	+	1360	3320	1	78.23
GGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACGATGCTTGTGTAACTTGCGCTACGTCTAGAATCTAGAATAGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTAAAGTACTTGAGATCTCGACGTTAATACGGACAGA:1	+	chr2L	227181	3'	-	rover	65	2	64.79
CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGCATTGCTTCATTGCAAAACACTTTATTGGATTTCCGGGCAGGAGCTCTCGAAAAAGGATTCCCTTGGGAG:1	-	chr2R	21228963	3'	-	jockey	27	1	68.80
ACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACG:1	-	chr2L	12290688	3'	-	1731	85	1	73.29
CTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAACAAATTACATAAACAAATTGAGCCAAATTGGAAGATTCAGCGAGCGAACTCTTCCGATTAAATC:1	-	chr2R	9456961	3'	-	rover	7042	2	50.71
CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATC:1	+	chr2L	16016392	3'	-	412	7139	2	76.71
TATTGTAAAATATTAATTATTTGAATTTAATCAGTGTAATGTTGTTCAGTTGTATTAGAAAAGATTACCATCCATATAAACATGATCAATTATCTTTATTTATTCCCTTGCGCACAGCAGGTACTTGAGATAAGTTCTCGACGAGG:1	+	chr3L	12079424	3'	-	TLD2_LTR	106	1	56.85
AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCGCGGTAATGGGAAATGGCC:1	+	chr2L	21400393	3'	+	mdg1	358	2	58.22
TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAACTATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCC:1	+	chr3L	3799850	3'	+	copia	5075	2	71.72
GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGATATTTTAAGGTGGTTACGATGCCAGCCGAGGCTTAAATATTACTTTCGAGTAAATTGCACCAAAATATGCC:1	+	chr2L	15987535	3'	+	mdg1	7381	2	51.37
AATAGGACGGAAACTCAAGCCGGGGTCTAGGGCATCAGCGGAAATCATGATCATTTGCATTTACGATAACCAAATTATTCCAAATCATCAAAATGGATGACTTTAAGGAACATTTGATATTACAAAATGTATTACAATTTTTATTA:1	+	chr3R	26351114	3'	-	Gypsy12A_LTR	239	1	41.10
GAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTATGTTACGTTTCTGATTTGATCTGTCTCG:1	+	chr2L	7808973	3'	+	P-element	87	1	32.38
GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAACCTGAGTTCGAGTCCGTTATTATGGAGACGAGAAGCAGCAGTCCGCCACCTCCATTCCCGAAATCCCCGCCTCC:1	+	chr3R	233614	3'	-	F-element	34	1	58.33
AACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTAATTTGATTAGTTAAGATGATAAGCTGGNT:1	-	chrX	18031514	3'	+	opus	330	2	74.36
TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAGTGTGCGAGAGGGACCAATGACCGCATTGAGCTATTTATAGCAACAAA:1	-	chr3R	18585556	3'	+	P-element	2842	1	56.85
TTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAATCATATATTTTACGCATTTAGCCGCCGATTTCTTGACCTTAAACTTTAGTTAA:1	-	chr2L	588428	3'	+	FB	424	4	63.70
CATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGCTAGCCCAAAAGCTAAGAAAAAAAGACCATAAAATTATGAATGATAAATTACCGTGTAAATATCGTTATTGCATAACTGAAGTCGAATTTTTGTTACAATTATATCCC:1	+	chr2L	22685388	3'	+	Ivk	210	1	66.20
CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAGAACACAGGCTCACCCACAACAGTTGAACACACTCC:1	+	chr2L	15875811	3'	+	hobo	2882	1	69.75
ATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTACTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACC:1	-	chr3R	9714406	3'	-	Stalker4	87	4	76.03
GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGGATGCTATAATTCACACG:1	-	chr2L	15832978	3'	+	hobo	2921	1	62.39
AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTCAAAAAACAATGAGTGCTCCCACT:1	-	chr3R	25423161	3'	-	3S18	24	2	66.44
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTT:1	-	chr2L	18294206	3'	+	roo	8996	2	71.92
TGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCG:1	+	chr3L	8249099	3'	-	jockey	4614	1	77.93
GCTTTAAGAGCGGCAGTGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAACTCCGGATTCTATCACTGCATTGCCCCCCTTTTTTCCAGACCACCTTTTTCGTGTTCTACACCC:1	+	chrX	14522332	3'	-	Cr1a	4241	1	51.52
ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTATCAGGGCATTTGTTTAT:1	-	chrX	18386392	3'	+	invader4	299	2	60.23
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTAATTTGCACGAACTCCGGGTACTTA:1	-	chrX	10639981	3'	+	roo	9043	1	61.64
AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGG:1	-	chrX	10644453	3'	-	jockey	4789	1	57.78
GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGCAATACAACATCTG:1	-	chr2R	5248243	3'	-	1360	69	1	67.38
TCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTAAAAAAAACAACATGAAAAGCTTTCCAAGCATCTTATTTCAAAGATAAGATACGACTCTTACACAAATGCCAAGAAAA:1	+	chr2L	17765189	3'	+	Juan	17	1	60.83
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAA:1	-	chrX	9540026	3'	-	roo	8737	2	75.00
TTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATAGACTATAGCGTTATCGGATTTTATGAGTTCTCTTAAAGTACCATTATAGATCTTGTGAACTGCGCTGGTGATATGCCCAAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1	-	chr2R	1982172	3'	-	Idefix	9	2	26.03
GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCA:1	-	chr3L	3799799	3'	-	copia	4924	2	68.42
TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAGCATACTTTGCGGCCAGCGCGGCTTTATTATTAAAATTGCC:1	+	chr2L	6570060	3'	-	jockey	4807	1	69.63
CATAAGATATGAACGGAGCCAAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACCGAACTTTTCCCAACTACTTT:1	+	chr2R	19004244	3'	-	roo	8707	2	57.14
CCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTACCTT:1	+	chr3L	21855558	3'	-	blood	7013	2	74.31
AAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATATATGGCATTCAGTTTGCTAATCGTTGCCGCAGGATAATGCAACTGGATCCC:1	+	chr3R	9922069	3'	+	blood	7332	1	61.48
CCGGGACGGTCGTTTGGCGTCGACTTCAATTCCATTTTCCAATACATTAGCCAGG:1	-	chr2R	23466029	3'	-	Doc	462	1	70.91
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACAGACCCCATAACCGAGACATTTCTGGTCCTGTCATCGCGTATTTTTATGCGGGCTGCCGATGGGCGGG:1	-	chr3R	17531343	3'	+	1360	3380	2	68.32
AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATACAAATAAATTCCTCTGACTTTGCGGTTGGCTTAACATTGTTTGCCTTCT:1	-	chrX	8814734	3'	-	pogo	48	1	62.79
TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTATTTATTGCTCAAGAGGTAAAAT:1	+	chr3R	20469705	3'	+	roo	9029	1	50.00
ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATAGTATCTTAGTATTTCAGAATTTAAACTTAATTTATATATTTTATAAGCAT:1	-	chr3R	14337407	3'	-	copia	4942	2	73.97
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACA:1	+	chr3R	22844256	3'	+	roo	8989	2	78.57
ATTGTATGGATTTATCGCTTCTAAATAAATAAAGAAATAAAAAAACTTCTATTGCCCCACATTTAACAATTTAAGTTCACGTTGTCATTTATATAAATAATACATAAGTGGAATCTATCTGGTAAATGGGCAAGCTGACAGCTCTG:1	-	chrX	20266113	3'	+	BS	5072	1	48.63
TAGAAAGGAATTGGATAAAATGTTATATGAAAATCGAACACTAAGCAAAATTAAAAGAACTGCAACAAACTCATCAAGTAGACATAGCGAAAAGAAAACGACAAATAAATG:1	+	chr3R	15374204	3'	-	accord2	7308	1	80.18
TTATTTCGATTGAAAATCATTGTAGTATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATAATGAAAAAGTGTCAGAAAAGAATTGATGAGCACTTATATAAATACAAAGAAGAATTCTTATTGTGGTTTTTGGATTACGAATGATGGATTAAGAGTA:1	+	chr3L	24036510	3'	+	Tc1	1536	1	60.96
ATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTAAATCAATATTAAACTTGCTTTAAAGCCA:1	+	chr3R	11547765	3'	-	G2	335	1	64.62
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTAT:1	+	chr3L	11530964	3'	+	roo	334	2	69.44
CCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCANGGAGCCCCCGAAATTTCATTGTTATGGCCGTAATGAAAATGGCTGCAACCATTTTT:1	+	chr3R	29397507	3'	-	jockey	4589	1	56.70
ATCAAAAATTCGAGAGAGCCAGCACAAAAATTTCGTGTGCAAAAGAATCGAATGGAGTTACGAGTTTTTTTAGTGTCTTTGGTCTCGGCTATAACTTCAGACTGTCCTCTGCGAACG:1	-	chr2L	20117401	3'	-	1360	84	1	47.01
TTCTTTTTTTTTTATTTCTCGATTTCGTCGAATCAAATTCGGGGTGGGCAAACAAACAAACAGAGAAACAGGAGAGCAAACCAGCGAAATGGGCCAA:1	-	chr2L	12956867	3'	-	Osvaldo	1517	1	85.57
TTCTAGCATTTTGTACATTTAACTCATTTTCTTTTATCATTATATTTTACCTATTAGTATATTAAATTATTATATGAATTGAATATTTCCGCAATTAGTTTATATGTTACTTTAAAGGTACAGCATCAAAATGTAATTAGCTTTTA:1	-	chr2L	12584443	3'	-	hopper	1076	1	63.01
CTCGACGTTCATACGGACAGACGAGCATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATAATTTAGATGGTCGATGGTGATACATCTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTGTCTT:1	-	chrX	14808729	3'	-	INE-1	129	1	80.65
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGAATGATTT:1	-	chr3R	7482703	3'	-	412	29	2	64.38
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTCCACATCTAGCCTCAATTCCATCCCTACGACTCTTTCCATCGGTCAACTGGTCCAAAGCTATCTGGATGGGCTTATT:2	+	chr2L	11518502	3'	-	412	7099	2	51.37
AACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAATGTTTTATACTCATTTCTGCGTTCTGATTGACTGATCGCCAACTGTAGAAATTTC:1	+	chr2L	8010868	3'	+	F-element	4598	1	62.33
TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACAGACATTGAAGTTTTGTCTCTCCATTCAAAAATAATTTCCTGCACGCGCTTGAAAGTATGCTATAA:1	-	chr2L	15832986	3'	+	hobo	2916	1	58.77
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAGTAAGACAATTGTTTAATCAATTAAAGATGGATTCCCT:1	-	chr3R	16076738	3'	-	roo	8685	2	73.29
CCCTATGTTTGAAGTAATTAAAAACAAGGGTGGCCATACCAAATACTAAATAATGCTAAAACAGGGCCTTTTATTATTAAAACTATCCAGTGCCTTGAAATTTTTTGAGCCAAAAAAAGAGTATTTTTTATGTTTAAACAAAAAAA:1	-	chr3R	23181433	3'	+	Tc3	1396	1	76.03
GGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACCTCAAATTGTGAACGATATTTTTTTCACCTGC:1	-	chr3R	26659713	3'	-	HMS-Beagle2	6889	2	71.54
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCGTTATTTATTTATTGCAGTTTAAGCGTCAGGCGTCAGCAACTCAAA:1	-	chrX	2444363	3'	-	roo	8726	2	69.40
GCCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTA:1	-	chr2L	3114496	3'	+	roo	340	2	68.42
AATATTTTCAAATAAAATGAATGTATTATTTAAACTGAAATGCCTTTTTTAGTAATAAATTTTAAATAAAGGTTTTCATATAAATTTGTATACTTTTACATTGTTTTTTCAAAGTTCCTTCATGTGTAAGAGCAAGAAACATATGA:1	-	chr3R	28971108	3'	+	transib3	255	1	70.55
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTC:1	-	chr3L	11393471	3'	-	roo	55	2	59.59
CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCGTATTCACA:1	+	chr2L	12892733	3'	+	roo	9030	1	56.55
ATAGTTTCTAGTGAATCTACTATGAACCGAGAAGTTAAGCCGACGAATCAAGTCAGGACTCTCAACATTATCAATTAATTAAAAGTAGTCTATCGCCGAATAAATACTAAATAATAAAAAATAAAAACTATTTTTTAAAATAATTA:1	-	chr3L	25243734	3'	-	Cr1a	4114	1	63.01
TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACACATACTCGCGTAGGCAGCTCAGAAAGAATCCCAACTCCATTT:1	+	chrX	1899717	3'	-	P-element	41	1	51.94
GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTACTTAAAAGTGGCCACATGA:1	-	chr2L	11518403	3'	+	412	7515	2	55.56
AAATCCAAAATTCTATTTAAATCCTAATTATAAATATAAAAAAAATTAAGTCGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCATAGTGCCTTGGTTAGTCCTGTATTAAGTGTCACAATGTTC:1	+	chr2R	4549673	3'	+	transib4	2551	1	70.92
CAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATATAATGTTGCCA:1	-	chrX	5274319	3'	-	roo	82	2	78.10
GAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACACCACACACGTGTGGTGTGCACACCATCAACTCAAACACACACACACACACACACACACACTCCTCTGGGCCTGTCAACTTTTACTT:1	+	chr3R	10546180	3'	-	hopper	1028	1	52.50
AGGCGTTACTAACATCAATTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGGTTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTTCACTCCACAATAGACGAACACTTTCCAGCTCTACTTAAAACAATGAAACTGTTGTTGA:1	+	chr4	903905	3'	-	transib3	479	1	76.39
ACCCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGATACCCAAATTAAATTCATTTCAAATGACAGTTACGGTTTCTAATTTGCATTTGTTGTCTATG:1	+	chr3R	19096068	3'	-	Doc3-element	4538	1	57.53
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACAACTACAAAAATATCAACGAG:1	-	chr2R	19004112	3'	+	roo	9031	1	57.24
TGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGTATTTAAGTAGCTCGGCCTGCAGACCTTCCTTTGCTCTCTACTCCTTGCTCCTCGTCGAAACTTGCGAAACAATTTATCGAGCGGAACGCAAACACACAC:1	+	chr3R	29394021	3'	-	jockey	4861	1	64.38
AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATATATATTCTATATATATATGTGTGTGGCTATATGTATTACCCGTTAGCGATTCCGAAGTGCGAGTGCC:1	-	chr3R	22821992	3'	+	mdg1	369	2	54.86
ACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACACGTTCTCGTTTATTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTC:1	+	chr3R	20683401	3'	+	gypsy	7390	2	58.90
AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTATTTTGCCTTAACAGGTCCGACAAAGGCTTAGC:1	+	chr3L	23866770	3'	-	copia	4895	2	67.81
ATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAG:1	-	chr3L	27356057	3'	+	Tc3	1680	1	71.43
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAAAGCGTACTTTAATTTTGAGTTAGTATTTTAAAGTGATCTTTTAAATTTTATGGTTGTTCAAATCGGCGTCAATTTATTTTGTTGAACTTTTTTGTAT:1	-	chrX	17526799	3'	-	roo	24	2	37.24
AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAGATTCATCTAAAACTGCACACACACATACACACACG:1	-	chrX	568872	3'	-	jockey	4775	1	73.29
TTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTAATCAAAAATGGAAAGGAAAACATCATCTAGCTCAGAGCCCTTATTAAGGTAATTTGATG:1	+	chrX	22643379	3'	-	Tc1	1568	1	72.41
AACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTATTCATTTACCACAAACCCCTTTTCTAGGTTATTCATTGCTGTTGACTATGAA:1	+	chr2L	13585922	3'	+	Tabor	416	2	62.33
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGTTGCTCAAATTAACGACAATTGGCAAACGAAATTTGCATGCATTTATTGGCGG:1	-	chrX	6486713	3'	-	roo	8702	2	64.35
GGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTTCGGGGC:1	+	chrX	11471648	3'	-	hopper	121	1	53.10
TAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAACGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAACAT:1	+	chr2L	22224621	3'	+	Rt1c	5414	1	64.38
GGTCCGGTTAACTCAGTTAACTTATATATGTATTGTCGCCGAGCGATGGTGCTGGAGGACGAGTGCTATAGGCACACATATAACCGATCAGCGCTTGGCCAGCAATGCCTAGTACTTTTCCATTTCAAGTAAAAC:1	-	chrX	23202169	3'	-	gypsy3	1	4	75.56
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATCCAATGTAGAATTACCTCGAGCCTTGTTATGTTGAACGTACGAATAAAATACTAT:1	-	chr3L	20654476	3'	-	roo	8712	2	58.91
CCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGAGGGAAAGAGCGAGGCAGATAGGGAGCAAGAGAGACAGCAACAACGTAGAGCCGCCGA:1	+	chr3R	19530655	3'	+	jockey	4645	1	55.45
CTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATATTTAGCAATATATAAATTGTACATAGCGTAATTATGTAAAAGCGAGCATTTTAAATGTTTACCC:1	-	chr3R	24223597	3'	+	Doc	4613	1	56.16
TTATTCTTATCTGGTATCTGGGTACATCCGAAGTGGTGTATGTGTATTGGTATGTAGGCATGTGCTTAAGTCTTAGGGACTTGAGGTCGTGCTAACTCGGGTCGAATAAATGAAAAGGTGGATCCTGTATCTATTAACAATTTTAT:1	+	chr3L	27412851	3'	-	Idefix	6919	2	56.16
ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTTGTGTTTATCAATAGAACTGCGCTGGAAAAGGGTCCGAAGTCTCGGAACTTCGATCTTCGTTTCGGTGTCAGTGCACAGAA:1	+	chr3L	3863571	3'	-	blood	7032	2	69.86
ATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGTATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAAC:1	+	chr3R	8049018	3'	-	Q-element	140	2	63.01
AAAAAAAAATAAAAACAAAGAAGGTTATGACACGTTATGTCTATAAGAACATACATACAAATGTTACACATAAATAGTTTTCTGAACTAGTTTGAATCGTTGTTAACAATAATTGTGGAAATCAATCCTCTTAATCGCCATGAAAA:1	-	chr3L	18232961	3'	+	transib2	2641	3	84.93
ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACAC:1	-	chr2R	19050163	3'	-	roo	8701	2	57.53
GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCGACCCATTCATCTACCACTGCAGACGTATCTCTACATAATATCCTACAGACCTGAGCAGTAAAGATATCGCACAGATTTAACTCGTGCTCATTAGGCAAACTCA:1	-	chr2R	1752820	3'	-	1360	9	2	63.77
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCACAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAGCTACCAGAG:1	+	chrX	14336517	3'	-	roo	54	2	60.27
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACTCACCTGGGTTGGTTCATTAA:1	+	chr3L	20168471	3'	-	mdg3	5261	1	73.21
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTGTAATGAGAAAAAGTTAACTCGCTTCGAGGCATCCGCCGTTGTTTCAGTCACTGTTTGCCGGC:1	+	chr2R	21908021	3'	-	roo	8716	2	59.29
GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGTAATTTCAATTATCAATAACATATTTAAATTCCCCATTCTCCTCCCCTTCCATTATCCTCTGTCCCTCCTTCCCCCCTCCACGGACTCCTACACCTTTTT:1	+	chrX	2296038	3'	-	Tirant	20	2	71.92
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTACATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATG:1	+	chr3R	25448435	3'	-	roo	32	2	53.04
CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGGCAAATATTTGTCCCTTTTTTTCGATTCGTGTTCTCTGC:1	+	chr3L	10013709	3'	+	hopper	1396	1	71.43
AAAATAAATAATAAATATTGTTAAGAAACAAAAATTTGATTACCATTACGATTTCTAATCATTATTTAGTGCCACCTGTCGGCCCAGTGATTATTGCTTCAATACTCGTATCTTAAACCAACGACTTGGGTAGCGTATCCATAAGA:1	-	chr2R	15052010	3'	+	Juan	4058	1	57.53
ATAATATATTTTTAAAGTTTATTTTCATTCGCCATTCAGACTTTTGCCCCACCTGCCCTGCCCTGCTCCACTCCACTCCGCTCCCTTCCTTGGCCATCGCCATCGTTCGT:1	+	chr3L	17133068	3'	+	hopper	172	1	78.18
GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCACCGAGGACTATGGATTCGGTAGG:1	+	chr3R	7835249	3'	-	roo	26	2	68.28
ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTAT:1	+	chr2R	9791668	3'	+	412	440	2	62.99
AATTAAAAATTTAAAAAAATCCAAAAAAATTTCAAATATGTGGGCTTAGGTGCAACTAAGCCAACTTAAATTTAATTATTTGGGATTTTAATTATAGACTGTGAGCTAACATTTTTTTGTCACGTCAAGTTTTTATTTATTCATTT:1	+	chr3L	23771155	3'	+	frogger	238	1	67.12
CTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATATTTAAATTGATTCCGATTGTAATTTATGCCAATAATTTGTTTATTTAAGCTAATGAGGACATGCATCTTGCATCTTGCATGAAGAGATAAAAACATAAATGAAGAACGTTATTACA:1	+	chrX	20870235	3'	+	gypsy	457	2	57.53
GAAAAATAATCAAGATACGAATGCAAATACTGGTATTTAAGTTTACATTAATGCTTTTGTTTGTTTGACTTACTTTACGTTAGAATTATGTATGATTAATGTATATTTAAACTTAAGTTCTGCCCTCGGCACACTCCATTAACACA:1	+	chr3L	20060393	3'	-	Circe	6955	1	79.45
TTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTCGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGTAGTTGTGCGATGTTGCGACAACGATAATAGC:1	+	chrX	12074592	3'	-	412	160	2	75.71
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTGTTTTATTTTTCTATATAAAGAGTATATTAGTTATCTCATTAAATGTTGAAGGGGAAGTGTAAAAGAAAACCCTTTTATTTT:1	+	chr2R	7898223	3'	+	roo	401	1	77.40
AAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATGCATTATGTACCTTACTGCATTATTTTCATTGCAGCGCT:1	+	chr2R	2564994	3'	-	gypsy	5	2	62.86
ATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGGTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTA:1	-	chr2R	4673579	3'	+	Quasimodo	7291	2	76.03
GCCCACAAATTAGTTTCTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAAGTTTGCCTACACTTAAAAAATGTTTTTTATCGTTTGATCAGGTTTAATA:1	+	chr2R	5180280	3'	+	FB	83	1	80.00
GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATGGAATTCTTTATCTGAATTCCCTCTATCTCTCCCTTTG:1	+	chr3L	21855560	3'	-	blood	7044	2	61.97
AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAAT:2	+	chr3R	14979900	3'	-	pogo	49	1	52.74
TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTAT:1	-	chrX	2518049	3'	+	P-element	2821	1	33.59
TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCA:1	+	chr2R	9791683	3'	+	412	436	2	57.53
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGGTATTTAAGGGCGATT:1	+	chrX	13039533	3'	-	roo	8718	2	76.36
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTCTTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTC:1	-	chr3L	20831287	3'	+	roo	9001	2	67.81
CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGC:1	-	chr3R	17243134	3'	-	hopper	83	1	71.53
GAAATAGTCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTCTGGACTATGTTCTCAGGATAGGCATTTCCCTAGTGGCCATCTTAACAGACAGCA:1	+	chr2L	21153571	3'	+	1360	340	1	50.00
AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTTATTAGAGTGCAGCCCCGAAATGTAGGCAATGGATTTTGC:1	+	chr2L	17079841	3'	-	jockey	4708	1	51.69
GAATTTAAGCGTATACTTCCGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGGGGCGCACCAAACGTATAAAACCCGAACAGAATGGAACCCGAGC:1	+	chrX	2518104	3'	-	P-element	45	1	36.36
ATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCTTGTTGGTCCTTCTCACTAACTATAGTGTATAATGGCCTTGAATTTAAGCATGCTTCTA:1	-	chr3R	19447676	3'	-	roo	9004	2	59.59
GATGAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTCTGTGCGTCTATCCGTATTTTCGTCCAAATTTGAGGACGTATAGCCTACTCTCTTGTTTCTTTTGCACATAAATACATAAATAAT:1	-	chrX	22806291	3'	+	INE-1	92	1	62.90
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACANGGCCCTTAAATGGGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAACAGCTACCCC:1	+	chr3R	27994276	3'	+	roo	9053	2	54.55
CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTATTATATGTATGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGCACCCTTCCACAGTTTATAAACCAAATTCAAT:1	+	chr2R	611224	3'	+	297	335	2	59.59
CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAAT:1	-	chr3R	26659738	3'	-	HMS-Beagle2	6918	2	53.73
GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCATT:1	+	chr3R	28075444	3'	+	jockey	4971	1	67.12
AATATAAAAATATTTTTTCTTTTTGCTATTTTACTATCATATTAGTATATCATCACAATTTGGCCACGAATATTAAATAAGTGACTAATGTTGTTAATAGCCAACACGCGGAGTGTAAAAGAGGCAAAAGAGTTGGCTAACAAGAA:1	+	chr3L	18653239	3'	+	transib1	1957	1	62.33
TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTA:1	+	chr3L	22437952	3'	-	roo	64	2	65.00
ATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATAAAATATTGTAATAGAAGACTTTCAGGAAAGGTTATACAATCT:1	-	chrX	21217695	3'	-	R1A1-element	137	1	71.23
GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCAT:1	-	chr2R	20496893	3'	-	blood	7057	2	52.74
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTGCTTGGATAAAGA:1	+	chrX	16717940	3'	-	roo	8713	2	58.52
TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTC:1	+	chr3L	25401033	3'	-	Doc	34	1	52.78
GCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTATTTCTAGCGAATTGGCAATTCAAAAAGATTGAGATAGAAAGAGGTGACAGGATACTAACCCCCAG:1	+	chr3R	15954375	3'	+	blood	401	1	55.48
CGTATGGCGTTATGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTC:1	-	chr2R	2016814	3'	-	1360	17	1	64.49
TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTCCCACAGTATGGCGATTGTCAGAGCTCTCCTGTGACCGTGCCACCCGTAGTCCCCTTTACCCCA:1	-	chr3L	11957117	3'	-	blood	36	2	52.85
TGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGGTAATTTCAATTATCAATAACATATTTAAATTCCCCATTCTCCTCCCCTTCCATT:1	+	chrX	2295992	3'	-	Tirant	8173	2	63.01
AATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTCTTCTCTTAGCCTTTTTCTCGGTCCGTGGCGGTATGTGTGTGTTTTTGTGTGTGTTAC:1	-	chr2L	6535928	3'	+	hobo	2550	1	59.15
AAACACTGAATAAATTCGGTTTTGGTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGGGGAACCGCACAATGGGCCACACGCACACCGC:1	+	chr3L	2854654	3'	-	McClintock	341	2	76.71
CTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGGCAGTAAAAATTCGTAATGTGCTGCTAATTCAGTTCAA:1	+	chr2L	10024476	3'	-	Doc	4621	1	73.97
ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCC:1	+	chrX	17963964	3'	-	jockey	4788	1	59.02
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATCTGCAATTACTAAGTATCTGTGCCGCAAAGTCGGTCATTAATCATTGCGTGAATAAAGCAGTAACTTGAAATCCAT:1	+	chr3R	22956066	3'	-	roo	8706	2	50.35
AAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTATATAAGTAATATTTAATCATTACACACAACAATAAAAATTAGATTTCATATGGCGAACAAG:1	+	chrX	10711414	3'	-	I-element	5013	1	54.74
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAA:1	+	chr3L	15600299	3'	+	roo	9026	1	67.31
TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTCCAATTAAATGTCAATATAGTTAAATATTATTCATTTTCCAAGTGGCTCGCATAAAATGGCACTTTAGTTAACCGATTTGCTTAAT:1	+	chrX	17855799	3'	-	BS	5016	1	60.94
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCTGTGTTGTTTTAACCTACAAAATTGCAATGAAAAGTCGGTACATTTCTTCCTCTGGAGCCTGACGTAAAAAGCTTCATTCC:1	+	chr3L	21818092	3'	-	roo	8706	2	56.85
GAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTTTAAAATTATTTAAAGGAGGGATGTGGC:1	-	chr3L	22848539	3'	-	INE-1	575	1	79.84
ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGCGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCGTT:1	-	chr2R	10582355	3'	+	Juan	4187	1	62.59
AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACA:1	+	chr3L	22400357	3'	+	1360	3326	1	60.27
TTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACAAAATACTCGAGTGTTTTACCGACGTTGTGTTTTTGCCGTCTGCTGCCCGCTAATTAAGGTCGTCATTGCTGACCAGCGACTTGGTCTTGGATATTGGCGCGTTTGCAAATTACTCCG:1	-	chr3R	21728949	3'	-	hobo	2867	1	55.48
ACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGAT:1	-	chr3R	14981166	3'	+	mdg1	347	2	68.49
GAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGAGCAGGATGCATGGAGCACATACATCGCTGA:1	+	chr2L	21008654	3'	+	invader3	264	2	70.34
AGATAAAATGACCAACTGTGTTTGGAGAGTTTTTTAACTACATCAGGAGAATTTGAATTCTAATTA:1	-	chr2L	18952020	3'	+	mdg1	7409	2	81.82
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATGGGATGTATAACAAGTGCGATCTTACAATCAATATAAGTTTTCACTTATACTTCCTTTTATTATTAATAAATAATAT:1	+	chr3L	15177332	3'	+	roo	9032	1	56.85
GCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTA:1	-	chr3R	17478395	3'	+	copia	168	2	80.00
GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATTCGGCTTGCCCAAAGGAATTTGTATTAAATAGAAAGGATTGTCAGTTGTCCTGTAATATAA:1	-	chrX	17056163	3'	-	jockey	4798	1	56.85
TTAAATGTCTAATAAACGAATTAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCCGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGA:1	+	chr2L	22224614	3'	+	Rt1c	5413	1	60.71
GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAA:1	-	chr3R	14651180	3'	-	P-element	15	1	69.75
TAACAGGCATAAGGAAGCGTTTCCGACTATAGAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGCTATTAGGTCCATTCACACTAATTGAGTAACGGGTATCTGA:1	-	chr3L	22079359	3'	+	INE-1	33	1	36.11
CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTAATTAAGAGCCGAGCTTTCTTCTGCG:1	-	chr3R	14364600	3'	+	roo	344	2	64.38
TTGTACATGTATTTGTGGCGGGTTTTATATGTGTTGTCTAATGTTGTGGAAGGACGAGTCGGGAACAGGACAAAGGAAAGTGCCACCAGACGTC:1	+	chr2L	18036740	3'	-	G6	1930	1	54.26
AACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAATAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTTTTAGTGACATACTTTGTGATAGGATGTTCCACTGCAGCAATCGAA:1	-	chr3R	11207223	3'	-	FB	60	1	64.62
TGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTTACATTTTTATACCTTTTCTTTAAATGAAATTATCTAGTCTATTTTCTTTCACTTCTGGCCTTTTTGCTTTTATAGATATAAAAAA:1	+	chrX	21575461	3'	-	INE-1	88	1	67.12
AAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTATTCACTAGGATATTAAATGAGTAACATGGTGTTTGAGTTGCTGGTTTTACATTTTTATGACTTAAAATCTCAA:2	+	chr3L	23870871	3'	-	Cr1a	4307	1	56.16
TTAAACAATTCAACAAATGTTTCACCTTTATTTCAATAGTTTCGAAAGAGTTACTTCTCTCAGTCAGCTCTCACCCTCTCGCCCAACATCACCGACCGACCCCCCCTTACCAACAACAC:1	+	chr4	507741	3'	-	HB	1511	1	62.18
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATATTTGGTCGCGCGATGTTATCGTATTTAAATTCACGGGATGGCGTAAAA:1	-	chr3R	14979792	3'	+	pogo	2039	1	65.47
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACT:1	-	chr2R	21907936	3'	+	roo	9026	1	63.39
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAGGCTATCATTTTCAATTTTATAATTTCTAAATGTTGATGTTTATGATATAACC:1	+	chr3L	11393629	3'	+	roo	399	1	73.10
CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTTGCAACAGAAT:1	+	chr3R	16076899	3'	+	roo	9041	1	60.00
TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAA:1	-	chrX	10644431	3'	-	jockey	4822	1	58.62
TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTATACTGGCACATCAAATGCGCAAAGTGCAAACAGTTGCTTTTCCCGCTACTCACAACCAC:1	+	chrX	10640116	3'	-	roo	46	2	54.89
GTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGCGAAGATCTTCAGG:1	+	chr3L	11321521	3'	-	mdg3	5278	2	57.81
AGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAGCTATCCTGTTGAAATATATATTTGTTATTTCTTTCTGGGAGAAAATTTAAAAGCTTGCAGCTTT:1	+	chr3R	12598560	3'	+	hobo	2919	1	56.88
ACATGGCGACCGTGACAGGACCATTGCAGGACGCACACGAAGTGTTTAAAGTATTGTGCTAATAATTAAAGTCGACTGATCTTAGTTCGAGTATATGTCAAGATGACGTAGAGTCAGTCGCGTTTTGCCAG:1	-	chr3L	15739146	3'	+	Stalker4	428	3	72.52
CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTTTAATATGTTTGAACAGTCCCATCTTAAATATATCTTATTATATGTATATGTACATATTATATATGTACTTTGAGCACCTTCATTTAATCGCATGACT:1	+	chr3L	17558128	3'	-	jockey	4700	1	65.75
GTGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGCACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGTAAAAACCATTATGGATTAAAGGATACCAATC:1	+	chr3L	4605723	3'	-	pogo	46	1	55.56
TGACAATAAACTTCATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGGCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAAAGTTAAATAGATCACTTCGATGTAATGCATTCCCGTCTACTTTTCCAACA:1	-	chrX	2297086	3'	+	Tirant	261	2	58.73
CAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTAAGAAAGATTATGTTTACAGTGCGTCACATTAACGAAGAGATGGCTTAAGATGGCTTACCGAATAATTGAAAAATGTTTGGCAATTAGATTTATAGAGCTTGTAAACCTTATCAA:1	+	chr2R	10595240	3'	+	Juan	3876	1	79.45
AAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGTTGTATCAGTGTTGAAATTTGAGTCCCTAAGCCTGGCGGCTTCTGTGG:1	-	chr3R	13060303	3'	-	roo	8790	2	67.12
ACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGACAAGCATGAAAGGAAAGGGGAGCCACATCCAAAGCTTCAACGGCAACAA:1	+	chr3L	5822629	3'	-	R1A1-element	5198	1	60.53
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCCGTCTAGCCTACAGTCA:1	-	chr2L	21884506	3'	-	pogo	33	1	56.67
AAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTACGTTCGGCTTGGACTGGCAGCCCGGTTAAGTTCATGTT:1	+	chr3L	22387519	3'	+	Ivk	252	1	69.60
AACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACACCATTTAGTATTCACAATCCTATAGGTAAG:1	+	chr2R	21298880	3'	-	jockey	231	1	71.53
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGG:1	-	chr3R	25448339	3'	+	roo	9009	2	60.69
CAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAATAAGCAGCTGTAACTCTTCC:1	+	chr2L	2122492	3'	-	Stalker	50	4	53.57
ATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCATAATCTTTTTACTGAAACAATTA:1	+	chr2L	22121678	3'	-	gtwin	18	2	56.85
AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACAC:1	-	chr2L	20840439	3'	+	Transpac	236	2	77.86
AAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGGCGTCAAAAAGTATGCTATGGTATTTGGTGTTCTTGTTCTCAGTA:3	+	chrX	5629208	3'	-	jockey	115	1	51.37
AAATAAAATTTTAAAAAAAATTAAAGTTGTATTTGATTTGCTATAAGTTGTTTTTATTCACACAACAAAACTCCACTTGTAACTCAACGTTAGCCGCATCAAACTGTTGCATACTCATCGGGGTTTTT:1	+	chr3L	13860099	3'	+	P-element	2696	1	91.41
CTGGGTTGCGGAGATTCAGGGGGGGTTTGACGGGTATGCTAGTGCTTTTGTAAATGATTTCCGTTTTATTTATATTAATCTGGGTTAGGTTGCCCTTCCTTGAGGCGAAATTCAGTGCGTCCTCAAGTATTT:1	-	chr3L	21920042	3'	-	G2	134	1	75.00
GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATATGTGCATATGTGCACATACGCAGACAAG:1	+	chrX	21177029	3'	-	1360	69	1	78.51
TAAAAATAAAAATGAAATAAAATGGCATAAAAAATGCAACAGTTCAGTGAGATAAGCACTTTAATCAGTATGTATGTACAATGTATATAAATCATTTATTTTTCACCATCTAGTAGCATATTTTAGTAATGATTATCTAATCGGTA:1	-	chr3L	21387427	3'	+	Tc3	1569	1	61.64
TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCCC:1	-	chr2L	11518382	3'	+	412	7502	2	51.13
ACTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGTAAGATACTCTTACAAGCTTGGCTCGGCTTATTTTAGCAAATATTTAAATTCCATTCAGAGAA:1	-	chr3R	13107790	3'	-	17.6	7212	2	61.64
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTC:1	+	chr3R	7835183	3'	-	roo	62	2	77.39
CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTA:1	-	chr3L	16015243	3'	-	1360	65	1	67.65
ACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGG:1	-	chrY	495742	3'	-	Doc	85	1	76.71
TTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGA:1	+	chrY	3631960	3'	+	Stalker4	415	1	74.70
TTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCAT:1	-	chr3R	25423224	3'	-	3S18	87	2	74.66
ATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCATTTCTTCTCCTGAGATTTTCCCCCTTTTTCGGATCTCGGCGGCAG:1	-	chr2L	21008516	3'	-	invader3	28	2	62.31
AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCAAAATCAATATTTTCATAAC:1	+	chr3L	3477540	3'	+	mdg1	384	2	59.59
ACACTAACTGAGTAAGGGGTATCTGCTAATCGGTGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGATCGACATTTTTTTACACTTAAAAAAATGTAGCTGTTAGGATGATTTTGGTTTGATGTTTGAT:1	-	chrX	22518952	3'	+	INE-1	540	1	63.01
ATAATAATAATAATTTTAAAAAAGAAAATGCTTAAAACAATTTAAAAAACCAGTTGATTGAGATCTAAACTGAAACCAATTGTTGAAAAAAAAACAGTTTCTGGATTGCTGAGTAAGGAAGTGAACTGAAACACTTTTGAGTTGCG:1	-	chr3L	11910246	3'	+	mdg1	7076	2	65.75
CTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAAAGAACAGCTTAGCAAAATTAAGACAAAACGAAAATGAAAGCATAGCTAGGGCAACCGGGAAG:1	+	chrX	1915623	3'	+	hopper	1026	1	54.07
AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTAT:1	-	chr3R	556394	3'	+	Juan	4135	1	71.92
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCGTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGT:1	-	chr2R	11164417	3'	+	roo	9025	2	62.18
GGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGAAAGAGAACCTGCAATTTGCTTTGGCC:1	-	chr3L	19035948	3'	+	Tirant	8499	2	74.19
ATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATACAGTCAGAATCGCTTCCTTCAGCCTGTTACACACTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTATTCAAGGAGTTACGGGTATAGAAAGGTAAATTGTGTACAGATATA:1	-	chr3L	26722541	3'	-	INE-1	83	1	75.36
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAATGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAG:1	-	chr3L	20831306	3'	+	roo	346	2	77.12
TGTGAACACGTCTACTCGATTTCTAATCTCCCATGCGAATTGTGTGTTTGCCGACTTTATTCTGT:1	-	chr2R	12835069	3'	-	jockey	26	1	58.46
ATATATATACATACATACATATGTGTATAGGAGGAAACAGCCACTTAGCATGGGTCGCAGTGTGTATCTGGCAGATACTTACGGGTA:1	-	chr3R	5056657	3'	-	1731	97	2	43.68
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ATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTTACGCGCTTTTCTCAATTCTGATGTACAACAAATTTGTTGAAGCCATACAGCCAACACAAATTTTATGGGC:1	+	chrX	13704885	3'	-	invader4	47	2	52.05
AAAAAGAAAAAAAAAAGAGAAAAAATCTAAAATTAGGATGGGGATGGAGCTGGTAATGGGGATG:1	-	chr2R	20683817	3'	+	Doc2-element	245	5	73.44
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TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCTCAAAATAGCAGGATGAGTCATGAAGGTCTTAAACAGCTAAGGATGCTCTATTTAAATTAGTTATATACTTTTTTATTATACTTAGCTATT:1	-	chr3L	22968299	3'	-	mdg1	29	2	65.75
TAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTTGTGGGTTATTTCGGGAGAAGGCTCTTCCCGGTCGCTGTCCGAT:1	-	chr3R	18587912	3'	+	P-element	2619	1	44.90
TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACTTT:1	+	chrX	17530859	3'	+	opus	467	2	54.03
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTG:1	+	chr3L	15600349	3'	+	roo	9040	1	47.86
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AATGCGTATGTACATATGTTAGTACACGGGCAGACCAAGAATAAAATAATTGAAGTTCGAATCTGACTAGGAAATATGGGGGAAATACCA:1	-	chr2R	17845118	3'	-	gypsy11	4053	2	58.89
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAG:1	+	chr3R	27994296	3'	+	roo	394	1	68.70
ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATTTTGTGTTCTGTTGGCAAGGTTTTTCACCGTTTTAAAGCATTTAGAAACAACTTTTTTTCTCTGTG:1	-	chr2L	20808274	3'	-	HMS-Beagle	18	2	73.29
TATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATGCCTTTTTATCCTCTTCCGTTGCAGCGAAAATTAATTATACAAGAATAAAGAATCCGCATAATCTTTTTACTGAAACAATT:1	+	chr2L	22121677	3'	-	gtwin	6935	2	56.16
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGATACGAACTCGAATCTGGCTCGAAATTTAAGTATCCCTAAAAATCTATTCTTTTCGATTTCATAGGAACAGAACGTAACAAAATATCACAGAGTGAAAATGAGG:1	+	chr3R	7100944	3'	+	roo	390	2	70.55
ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGTGTCGTTTTTGGATGGATTTGTTAATGGGAGTTACATAATGCTGGCAATGCATATAAGAACATGATATACGTGC:1	+	chr2L	8986271	3'	+	412	483	2	75.52
AATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATAC:1	-	chr2L	17550620	3'	+	Transib-N1_DM	434	1	79.45
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACA:1	+	chr2R	9328712	3'	+	roo	9038	1	57.89
AGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGAATACAAATTCATTAAGACATACCAAACCACCCATGTCTTGCCAATTTCTATCGGTATACCAAAAACACTTTCGCCACGCCCCTTCTTACACCAACAAAACGC:1	+	chr4	990975	3'	+	INE-1	156	1	50.74
TAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACGGAAGTTACAATTTTCTTCAATCAGCCTCGGAATCAAAAATTAAAATA:1	-	chr2R	1405238	3'	+	Tabor	339	2	72.66
ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCGTATAAAAAAGAAAGCAAATCCA:1	+	chr3R	17420539	3'	+	roo	9039	1	58.90
GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAGAGAAAGACAATTTAAGAGAGCGCAGATCGCACTTATGAA:1	+	chr3R	18585707	3'	-	P-element	26	1	67.81
GAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGGGGGAATAAAAAGTTCTCGGACAATGAATGAATGAACCAGGATGTGCTACG:1	-	chr3L	26413263	3'	+	Quasimodo	200	2	61.48
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCA:1	-	chr3L	22437846	3'	+	roo	9031	1	55.71
TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTAAACTTAAAAACACATCGTTTACCTTATTAATTA:1	-	chr3R	6290938	3'	-	Doc	46	1	56.85
AAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCTATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCCAA:1	+	chr3R	23021007	3'	-	INE-1	577	1	42.07
AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCC:1	-	chr2R	5248226	3'	-	1360	35	1	51.61
ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGTCCCCCTCATGTTATTTCATTTTGGTTTGTATGTGTGGCAAGTCTGCGCAGCACTGCATTTGT:1	-	chrX	1899641	3'	+	P-element	2853	1	37.23
GTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCAACGAATTTAATTATTATAAATAAAAAACAATTGGAAAATGATTACATTTTAACAAATT:1	-	chr2L	21367215	3'	-	Doc	31	1	49.54
GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCTCTTTGAAGTTGCTATCTTAGTATTCCGTTTTTAAACAGCGAAAATGAGTTTTTAATTATTTTTGCCTTAAGAATAAGTTAGAAATGCATTACACATTAAAAATAAACTAATAGAATA:1	-	chrX	14749550	3'	-	copia	4873	2	73.29
ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATGGGGTCAAACCAGTGATCGAGTTGCTTCCTCAGGGCCTCCTTTT:1	+	chr2L	20134407	3'	-	jockey	4767	1	53.06
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATTCACATTATATAAACTAAATGCG:1	+	chr2L	12892751	3'	+	roo	9047	1	69.86
CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATGTGTGGCAACTCTGCGCAGCACTGCATTTGTATGCTGCACTGCCGCG:1	-	chrX	1899625	3'	+	P-element	2839	1	44.35
ACTGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCCGAAAAGTCTGCCTTCTTTATTTAGACTGGGACTCAAAACTGGCGACAAAGCTGCTTGAATAGTGGCAAACTTGCCGGGTA:1	+	chr3R	2791472	3'	+	rooA	7524	2	48.51
AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCA:1	-	chr3L	11393483	3'	-	roo	67	2	67.81
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGGTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTC:1	-	chr2R	9632112	3'	-	roo	78	2	70.55
TGTCCGTATGAACGGCGAGAGCTCAGCTTGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTTTGATTTGTCTTTTGTTCCGGGAGAGTGACATCTCTGTCGCTCTAT:1	-	chrX	5256505	3'	+	INE-1	132	1	52.73
CCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCCTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACCATTATGTCGTTCAAACTTTTGTTATTCGTAGT:1	-	chr3R	19445278	3'	-	roo	260	2	76.03
GGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCC:1	+	chr2R	21298852	3'	-	jockey	254	1	56.83
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCATAGACGATGTCTGTTAATAAAATGTTGCCACCCATCCGCTTTTCCTTGCCTGCATCCCTCGAC:1	-	chrX	5274286	3'	-	roo	43	2	51.91
AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAAGTTGCTTGTGCTGTTGGTCGCCATGTTCGTTGCATACTTTTCGCCGTATTTCT:1	-	chr3L	22911740	3'	-	jockey	4690	1	53.06
AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAACAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAGGGAAA:1	-	chr3L	17557995	3'	+	jockey	4946	1	51.37
AACAGACATAAACATCCGCTGCCGCATTCGCGACCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCGAGGGTGTCCCGTAGTCGAGGAGAACGAGAATACGAATAAGCACCGCGAAGCAACGCA:1	-	chr3L	24362892	3'	+	Quasimodo	7028	2	55.64
TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTCTATTTGGCTAGTGACTTTGGTGTCTGGGCAGCTGGAAG:1	+	chr3R	14940160	3'	-	jockey	71	1	68.80
ATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAAATCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAAAGTTGTTTCTGCCCTCTATGTGCGTTTCGAGTTCGAATTGCAACTCGAAATAAAATGGCGAAGCAAAGTCAAAAAAGCAACGGGT:1	+	chrX	15075536	3'	-	S-element	1556	2	58.90
CCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCATGTGTGTGCGTGTGGAGGGAG:1	+	chr3L	22917707	3'	-	jockey	4778	1	61.61
ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGAGCCAACTGATGAGCCGACGAGCTTGCAACTTGCAACATGTTGTAAGCA:1	-	chrX	7195043	3'	+	P-element	2840	1	42.62
AACCATATTTATTATTTATTTATTGTATGTATTAGAATTTAAACCATTTTTCACCTTCGAATATTCGTTGACATTTGACAGAGATTCGTATGCATCTCTGCATTTGCCAGTTTCTCCAAGAGAATTCCATTTCGTATTTTTCCTCT:1	+	chr3L	10723562	3'	-	Juan	4058	1	86.30
AATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAATTCTTAGCGAATGACTAAGAGAACAGCGAAGACCTTCGATGGGTCG:1	-	chr3R	21208726	3'	-	accord	7297	2	71.92
GAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTCTTAGTGGAAATAATGTGTCCTCTTTTTCTAAGAAAATCCAAATTCAAAGGGCATTCATCTTGAACGGTTTTGAAATACAAATGCACTGTCTT:1	+	chr2R	7440096	3'	+	pogo	1966	1	58.22
ATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTGGTTGTTACTTGTGTTTAATTAATGAGTTTGGGACTGAGCGCCTTC:1	-	chr3R	13457914	3'	-	X-element	90	1	68.49
GTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGATTTAGGAGTTTTAGATGGTTATGGGTCCATTGTAACCCATTACCTATAGTTGTGATTACGGTCCAACAGAAGATGA:1	-	chr2R	21100033	3'	-	P-element	2867	1	57.25
ATTTTTCTGGGATGTCAATAGATATTGAGGAGTAAAATGAAAAAAAATTTTAAAATTGTTCCAAGGCGTGGGAGTGACTGGTTCGGCGGCTTTAGAGCGTTAACTTTTGGACACGGCTTTGTTTTTGGCAGCCATTGCATCACTCG:1	+	chr3R	30240770	3'	-	INE-1	501	1	70.55
GAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCCCCTTGTGCCCATGAAGCATGCTTATATTGTTTCTGAATCTATTCCGG:1	-	chr2R	17755571	3'	+	hobo	2510	1	67.12
AAATAAGGAAAACATCAAAAAATATCAATTATATTTTTATAAATGATAGAAGAAAGTCTACTCGACTGTGCTTATGAACGAATAATATTTCGTTCAAGATGTTGTTTATATTTGATTTACTTGA:1	-	chr2R	16639488	3'	+	Doc3-element	4718	1	74.19
GTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTC:1	+	chr3R	17478441	3'	-	copia	88	2	78.08
ATAAGATACAAAATTCCTATGATTCACAGTTCAAATGGTCAATTTTGTTTTTATAATATCATTAGGATTCCCAAGTTCAGCTCAGACTGTATGTCCCTAAATGGAGTCGAGTGTCACAAACACACAATGGCAAAAAGGCAGCTCAC:1	+	chrX	15033299	3'	-	HB	1585	1	66.44
AAGTGGCCGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTTGAAGTTGAAGTAGTAGCGAACTAATTACCTTTTACATACTAACTGATTA:1	-	chrX	22738532	3'	-	297	13	2	75.78
TATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGC:1	-	chr3R	9714355	3'	-	Stalker4	36	4	60.96
CGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTAAGGAAAATGCAAATAATCCGATTCTGTATAATTGCACACTTTTG:1	+	chrX	10253278	3'	-	hopper	66	1	65.94
ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCG:1	+	chr2R	9791651	3'	+	412	404	2	79.45
ACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTTTATTCAGGGTAATGCTCCAGATATTACAAGTTCCGCAATGAATTAGTTTTAAAGAACATT:1	-	chr3L	18943829	3'	-	Stalker4	7231	4	58.22
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGTTGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACC:1	+	chrX	8543532	3'	+	roo	9030	1	56.30
AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTTTAGCTTAGTTGATTTGAGCTAACAAAGG:1	-	chr2R	19499291	3'	+	P-element	2861	1	60.80
TTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGCTCATGTTATTTTTGTGTTACTCG:1	-	chr3R	25454598	3'	+	Quasimodo	185	2	79.53
ATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAATCCATACGTGCAGTCGTCCTCATAATACAAAAACCGC:1	-	chr2L	229753	3'	+	Doc	175	1	74.66
CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGTGTTTCCTACAAATAAAATGTTGTAGCCTAGGTTGGGAAT:1	-	chr3R	26222875	3'	+	roo	9001	2	74.07
ATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGGCGTCAAAAAGTATGCTATGGTATTTGGTGTTCTTGTTCTCAGTAAA:1	+	chrX	5629210	3'	-	jockey	113	1	50.00
TTTTTAAATTTTTTTCTCATTTTTTCTCATTTATATCTCGGAAAAATGATTAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTCAAACATACAGATACAGCAATGATTCAAATGATTCGAGGGCTGACTAATTCAAAGGCAGCGCAACTTTATT:1	+	chr3L	5183583	3'	+	INE-1	470	1	51.37
TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATACTAACATTTTTATTCGGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTT:1	+	chr2L	12892699	3'	+	roo	346	2	66.41
AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCGGGG:1	-	chr2R	8585403	3'	+	roo	9033	1	58.90
AGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGTTCTTAACTTACATACATATGTGCACACATCGCAGTGACTTTCGGTGAGTAATGCTGTACTTATTTCGTTTATCTTATCTAGGTTTTTGTGCTTTTACAGCC:1	-	chr2R	9543991	3'	-	opus	33	4	67.12
CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAAGTTCCAAATATGATCAATGTTAAGAAAACATTGTAAAAAAATTGTATATTTCTTTAATATA:1	-	chr3L	16470829	3'	-	Doc	64	1	60.27
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGTGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCAT:1	-	chr2R	9328617	3'	-	roo	83	2	75.34
AATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATGTACACTGTCTTTATGAAACAGTAACACTTATACGTCAAAATAATAACAATA:1	+	chr2R	4601640	3'	-	HMS-Beagle2	29	2	57.80
ATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTAGAATGGCGAGTGGAGCACAGAGAATTGGATCCTGAGGGCTTAAGGGCTAAATCCACTAGGCGA:1	+	chr3R	25444547	3'	-	roo	98	2	56.16
CGCGGGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGGGTATGCACAACTGAATAAATTAGAATGAAATATGGAACACGTAGCAACAAC:1	+	chr2L	8657515	3'	-	Doc	4489	1	63.70
GTGCGCATTCAACGAGTCCACTTGCGTCCGTCATGGAGAAGAAGTAAATAGCGACTACACGCATACCCAATATTTTGGGTATTGACATTTACACGTCCCCGTGTAAGCTATTGATATATTGTCGCATTACATATCTGTAAAGAAAG:1	+	chr2L	7718680	3'	-	micropia	362	2	79.45
ACTTCGAATGTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTCTGTAGCGTGCTGTTGACACCGTTGACAGTTGGCCGTAAACAACAAA:1	-	chr2L	2909659	3'	+	hopper	1369	1	53.33
GCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTA:1	-	chr2L	23068866	3'	+	1360	3324	1	76.80
GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGGT:1	+	chr3R	20427469	3'	-	jockey	66	1	61.15
AGGCTCTGGTGTCCGAGTCGAGGCGGTACAAACCTCCATCCGTAAGAGCCAGGGGGAAATACGTGGCCTACGTTTTTATTTTCTAACACTGTACCTGAACCACTTGCTGT:1	-	chrX	8534178	3'	+	Rt1b	251	1	67.27
AGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGCACACGTATTGTTGTTGTCATTTCTGTGATTATGTGTGCCA:1	-	chr3R	24303477	3'	+	1360	108	1	71.93
CTTTATTTCTAAGAATTTTAACATTGTAACACACACAACACACACACTGTTAGCTTAAGCCTCTTTGCAGCCCTCATGAGTATTACAACGATAAATACGATCGAGTAATTGTAGAATACCTTTTACATGGCTTTTATACATTAACG:1	-	chrX	14366682	3'	+	ZAM	243	2	63.70
ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAGAGAGCAGGTGGA:1	+	chr2L	16016449	3'	-	412	29	2	65.75
CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATGGAGCCAAGGACGAGTGGAAAATGAAAA:1	+	chr3R	7482874	3'	+	412	470	2	65.75
TAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTGAAGACATAGACGCCGCAGAAGTGTTTTGCCATGTAGCCACACCTACTCTTACGCCTACAAACCGCCCAAGACTGTTTTCTTTCAGAGCGGTTCCGGACGACAGAGTAATATTACG:1	-	chr4	758552	3'	+	INE-1	171	1	70.55
TTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAATAAAAAAAAGAATGTTATGAAAAGAATGATCTAACTATCTATTTACGACAAAAGTTTGA:1	-	chr2R	4743542	3'	+	roo	8689	2	59.59
AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGATGATTCTACCTCGGCGAGTCACAATCATCATCAATCGGTTAAGAAAATATTTAACAAG:1	-	chr3L	3863433	3'	+	blood	7325	1	60.27
GCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAG:1	-	chr2R	7586176	3'	-	I-element	5102	1	79.82
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCT:1	-	chrX	5643460	3'	+	roo	9025	2	52.74
GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAATAATGAAAGATAAACAAAGTCAGTCAAGGCTGAGACAAGCTAACAAAAACAAGACCAAAAGGACATCTGCGTTCTGTTCTCTTGTCATGATG:1	-	chr3R	27424807	3'	+	blood	7362	2	63.89
AAATAAATAATAAATATTGTTAAGAAACAAAAATTTGATTACCATTACGATTTCTAATCATTATTTAGTGCCACCTGTCGGCCCAGTGATTATTGCTTCAATACTCGTATCTTAAACCAACGACTTGGGTAGCGTATCCATAAGAT:1	-	chr2R	15052009	3'	+	Juan	4059	1	58.22
CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGCACCTACTCAAGCAGTGTTAATAATGGGTCATGTCTTTCCAAATGATTTTCCGAGCCACTAATGCC:1	-	chr2L	14081235	3'	+	1360	3334	1	58.22
TGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACATAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAGATAATAACATTTAAATCATATAATTCCATGAA:1	+	chr2R	20497052	3'	+	blood	7386	2	60.31
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTG:1	-	chr2L	14772019	3'	+	roo	360	2	51.72
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCG:1	+	chr2L	7898392	3'	+	roo	9013	2	56.85
AATAACGTTAAGGCATTGCAAAAGTAGAATTTTTCGCTTGGTGCCAATTGATCAAAAATAATTTCTAAAAACTTAAGAAAACTTCACGTTTTCTACTAAAGACTATGATTTCGGCACTTACTGCTATGATTTGCCCATTCACCATG:1	-	chr3L	28005318	3'	-	1360	299	1	59.59
AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAACGTACGACTCTCACTTGTTGGGCCTCCATGGGTTAATGGCCAGTCGCTGGGTGATTAGCACCCCAAGTAGTTAACAGCAA:1	-	chrX	13126425	3'	+	jockey	4955	1	49.32
ACTTCTCGGTTCATAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGTATGACCCTTATTGATTCTTCCCGCAAACAAAATAGTAGAATCCTTATTGATAATGTAATAGTTAAATG:1	+	chr2R	6876643	3'	+	Cr1a	4101	1	60.27
CTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGTTGGCAGGACTGAAAGTAATTTTAATGTA:1	-	chr3L	2325663	3'	-	I-element	5091	1	72.41
AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCCCAAGCTAACATCGCTTTCGC:1	+	chr3L	17205271	3'	-	hobo	50	1	69.30
TTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTACATATATATCTGCATTTTATTACAACTTGTTAATCACTACAA:1	-	chr3R	6664958	3'	-	I-element	67	1	69.57
CAGGCACACACACACACACACACAGTGCCATTGAAACGATGAATTATGGCGATTTTAACGCCAACTTTGTCAGGCACTTCACATAAGAACTTGAGACGACAACGGCAAAACACCGCAGCAGTGGAAACAAAAACAACAGA:1	-	chrX	14667574	3'	+	accord	7026	2	54.29
TAATTTGAAATGAATAATCAATCTTTAGGTTATTAGATATTAAGTATTTTCCGTTTCTGTCGGCCCGGTCGTGAACGTGAAATGGGCCCATGAAAATACCAACAAAAAAAATAGAAAACAGAAAAACAGAAAAAAAAC:1	-	chr2L	10783707	3'	-	hopper2	1357	2	65.94
ATTATAAGATAAGTACGAAATTTCCATTCCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCAAAAGGTTCGATTAATTTTGCCACTTGCCCGACCAATGACAGGGCACAAAACGAATTCCGACAGCAGTCCGAGGAGTGAAATGATGCATTTGGCC:1	+	chrX	22800679	3'	+	GATE	329	1	57.53
AAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATATATATAAATGTCATAAAGCGAGCAAACAAAGCCACGAACCTAAAATCCAAACACGTAAAATTGGCCTGCGC:1	-	chr2L	21963441	3'	+	Quasimodo	7328	2	59.31
TAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCAC:1	+	chr3L	8249113	3'	-	jockey	4600	1	68.28
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTTTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAATTCACTTTTCAT:1	+	chrX	8543564	3'	+	roo	397	1	71.07
CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATACATTAATACCGTGCTGTCTTATTTT:1	-	chr3R	25339965	3'	+	mdg1	7402	2	56.16
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAAT:1	+	chrX	9540076	3'	+	roo	347	2	77.98
CAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGNGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGAACAACACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATT:1	-	chr3R	5061813	3'	-	mdg3	33	2	59.29
GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATATTGCAACAATCGCAAGATAATAAATTACCTATTTACCCGAAACAGGCGCACAATAAACT:1	+	chr2R	1567954	3'	+	jockey	4928	1	60.27
CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAACACAGATACATAGTTATCTATAAGATATTGTTTTAGCTTTTGTGTCTTGCTGTAT:1	-	chrX	5629120	3'	+	jockey	4922	1	64.38
TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTACA:1	-	chr3R	17243077	3'	-	hopper	21	1	70.00
TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATAATATGGGGTAAAAATCCAATGAAAAGTAAAATGTATATATTAATACCGTGCTGTCTTATTTTACCGCTGACG:1	-	chr3R	25339955	3'	+	mdg1	374	2	52.74
TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCCTTTCCTGTGTGAGTGCGGTGTCCTCTTCTCTGCGGGATTACATCGGCTTAG:1	+	chr2R	16891948	3'	+	hopper	1404	2	61.19
TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACGTTATTCTCGTTTTTGTTGTTGTAACTGTGGCAACACACATTATTTATATTTATATGCTTATTTTATAGTTTATTCATGCAAATTGCAATAAAAATTGCCTTTATTTTAC:1	+	chr3L	2841049	3'	+	copia	244	1	76.03
ACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTAATCAAAAATGGAAAGGAAAACATCATCTAGCTCAGAGCCCTTATTAAGGTAAT:1	+	chrX	22643373	3'	-	Tc1	1575	1	67.81
CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATGGAGCCAAGGACG:1	+	chr3R	7482859	3'	+	412	467	2	64.18
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTAC:1	-	chr2R	21907903	3'	+	roo	9036	1	58.52
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGTCTTGATTGACAAATTGATATTGATCACTTGGTGAACATTTGAATATAGAAGAATATAACAGTGCTTAAATATTTTTAATATGAACATTCGGAAGCAGGCCTT:1	+	chr3R	14364739	3'	-	roo	16	2	71.13
ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACAAAACGCGCGCAAGCGGTGAAGTTATTTCCTATTCATAATTTCA:1	-	chr2R	9328610	3'	-	roo	35	2	59.05
GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATGTTTTGCTAGATTTTCCCAAAGCTTAATTGAGATTTTGACTTTTGATTATAAATATCCATCCATTTCAATCGGATTATTTATTAAAAAGTATAAGCAATT:1	-	chr2L	20139817	3'	+	jockey	4973	1	63.70
ATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:1	-	chr3L	25232763	3'	+	accord2	7575	2	59.23
CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAG:1	+	chr3R	18585654	3'	-	P-element	79	1	31.51
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGGTAAGCAGAAGCAATAAAATTTTG:1	-	chr3L	21817991	3'	+	roo	9009	2	67.44
AAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACAT:1	+	chr2R	5674726	3'	+	S-element	1636	2	69.86
ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAG:1	+	chrX	6486811	3'	+	roo	9034	1	51.16
AGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTCTCCAG:1	-	chrX	20453680	3'	-	INE-1	542	1	79.45
GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGTAGTCAACCTCTTTTTGTTGCGACTTGTGGGCGTTTGGAAGGGCAAAAGGAATTCAATTTCTTCCAACCTCTTT:1	+	chr2L	1665074	3'	+	hobo	2902	1	52.59
AAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATTTTC:1	+	chr2R	5173254	3'	+	Stalker	7231	4	65.07
ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCTATATGCATATATGTATGTACGTACATATATGCGGCGGACACTCTGTGTGACTCTGC:1	+	chr2L	12328729	3'	-	hopper	63	1	58.22
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTGTGTCTGACAGTGTGTCTCGCAATGCCTAACCTAATGAAGCTTTACACTTTGCGGGTTCGCTGGTCTGAAGCCACGAGCCTGACATGAG:1	-	chr3R	31817410	3'	-	roo	8682	2	67.91
AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTACCCATATATTTATCGATTTACCAGAAAAATTATGAAATTTCGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTC:1	-	chr3L	14402160	3'	-	Burdock	6168	2	52.05
ACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATGAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTGGCTTGTAAGTTACAAAGTCTTGTTCGTGTCCTCGGGGTAATAAA:1	+	chr2L	4783968	3'	-	diver2	380	1	71.23
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACCGAACTTTTCCCAACTACTTTGTT:1	+	chr2R	19004247	3'	-	roo	8674	2	75.45
GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCATTATGTCGAGTCACGGTAGCAAGTTTGGGGGCTAGGGCAACGAAAGC:1	-	chr3L	7588373	3'	-	hopper	10	2	72.66
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCAAAGCAAAATCCAATGAACAGTTGAAAA:1	+	chr2L	18294313	3'	-	roo	8692	2	61.94
TAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTGCCCCTGTGGTGCCTTCTCTTT:1	-	chr3R	27426443	3'	+	blood	123	2	74.00
GGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTG:1	-	chr3L	19013919	3'	+	invader3	5394	2	64.38
AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAGCGCGAAAATTAATCATTTTTTTGATATTTTCTGGATAGAAATTGGGAAAAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGTTAAAAA:1	-	chrX	21452468	3'	-	INE-1	557	1	68.99
CATCTTTCGGCGTGTGAAAAATTAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAACAAAGACACTAGAATAATATATTTCACTTACTCTTGCCTGTGAAAAAGCCCGTGAGCGCTTG:1	-	chr3R	30389412	3'	+	1360	423	1	68.49
ACATCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAATGACCCTCGCACACACACACACACATGTAGCGCGCCCCTGGAGTTGCCACGCCCACTA:1	+	chrX	10345368	3'	-	Stalker	484	1	60.00
TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGCAGTCCTTCACTGCCAACGCAGCGTAAAAGTGCCGTGTACGGATGCACGTCCTCTCATATAGTAAAG:1	-	chr3L	10056092	3'	+	transib2	2789	1	54.69
TATTGTGTGTATAAATGTATATCAGACCAAGTGGTTTCTTAATTTAAATTAGGCAGGTGTATTATACTCACATGCCTACTCAAGTAGGCAACACATTGTGCAAAAGTACAGCAAGCAGCTAAATTTCTAGCTTGTAACTTTTTTTT:1	-	chr3L	14944508	3'	-	G5	4764	1	62.33
ATATACATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCATGATT:1	+	chr2L	22225076	3'	+	G5	4764	1	79.17
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTTTTGCAGTCGGCAGCTTATT:1	+	chr2L	12892729	3'	+	roo	393	1	69.57
GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGCACACGTTTAATTTTTGATGTAGTCGAAGGACTCCAAAGGACAGGTTTAGTTCATTAAC:1	-	chr2L	5844978	3'	+	transib2	2792	1	54.70
AATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACACCTCAAGTACAGCACAGCATCAATAAACTATCAAAATAGTGATGTGAATAGAATTATTTCTTTATTCTATATTTAGCAGATATT:1	+	chr3L	20167331	3'	-	mdg3	5462	2	72.39
TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCGTAGTTCCGCCCTTCTTGCCCCAAGTCTCAGCCCTT:1	-	chr2R	5248201	3'	+	1360	3381	2	74.59
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTCGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGTTTTT:1	+	chr3R	22844280	3'	+	roo	9021	2	59.09
GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAACTCCCATGCCCACTTCCCCCTCACCTGTACACAGGTAGGTATAAGAGGCAGTGATGGGCGCTGGTGTTGGAACATTGCAAGCCA:1	-	chr2L	6569913	3'	+	jockey	4979	1	61.11
AAATAATAAAAGCAGCATAAAATGACCAGACACGGTGGAAATATTTCGATG:1	-	chr2L	9106269	3'	+	jockey	4990	1	92.16
AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGCACCCTTCCACAGTTTATAAACCAAAT:1	+	chr2R	611219	3'	+	297	6912	2	64.14
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCA:1	+	chr2L	16091994	3'	-	roo	8726	2	63.70
GTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGTAAGTTATTATTTAAATAAAAACTTACAGGCAAAAAATGAAATATTCAAAATGATTATATTAACAAATCAAATACTTAAATGTCAGAATATTAGTTTCTTGTTAAG:1	-	chr3L	16753333	3'	+	Tirant	4	2	78.52
AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAAAGTCCATGCGGTAATGAGCTATAAAGTAAATTAGATTAGATAATGTATTGAATATAAAATCTTTTAAAAAAGCCATGCTCACCTATAGCCGTTCCATTC:1	-	chr3R	25341568	3'	+	mdg1	370	2	69.18
CTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGGATTTGTTTTATATCAAA:1	-	chr3R	19968073	3'	+	roo	409	1	77.98
ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTGTGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGCGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACG:1	-	chr3R	9922011	3'	-	blood	88	2	83.21
AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCATTCGCCAGCTGGAGGGCAGTTTTCAC:1	+	chr3R	27994303	3'	+	roo	401	1	74.78
TGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCAGCAATCAAAAATCCGGACAAGTAGGCAATCATTCCCGGCTCG:1	-	chr3L	3168215	3'	-	1731	29	2	71.23
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATATACATATATACAATTTAATTTAATATTAATCTAGAATAAAAATGTATGTATATAAG:1	+	chrX	8197933	3'	+	roo	347	2	63.19
AGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAAAAAGCACACATCACACTGCCCCAACCATCGGCCATAACTAATTAATTATGCCTTCTTAAAGCGGCGTTAAACG:1	+	chr3R	27424991	3'	-	blood	7026	2	79.56
TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCT:1	+	chr3R	19968199	3'	-	roo	8719	2	60.99
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAGAAACTTGCATAAAGAAAATGTTGTATTTTAA:1	-	chrX	9539981	3'	-	roo	8694	2	63.01
TTTTATCATTATTTTATTTTATTATTTATTTGAGCACTTTATTATCATTTTATGTGACCACGAATATAAAAGAGGCTAAATCAATTTCCAGCTTTCACCGGAATCTTCAATTTCGTACATCAGTCTAATGATGGGTTTGACTGCCT:1	-	chr3R	31971346	3'	+	1360	3094	1	54.79
GCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTT:1	+	chr3R	4604452	3'	-	INE-1	168	1	73.08
AAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTTCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAGTGAATACTTTTAG:1	+	chr3L	19339436	3'	-	Tc1	53	1	52.59
TTATAAAGAAATAATAAAAAAAGCTGAAATACCGGCAATAGCATATAGAAAATCAACTGCAAATGGCTCAAAATACCGAAATACAATAAATAAATTGGAATTCAAATTAAAGAGCACCGG:1	-	chr3L	18339160	3'	+	BS	5090	1	67.50
GAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTTACAAGTTAATTAAGCTCTCGGTACACCCTCGGATTCTTTCTTCCATCAATGTTCAGTGCACTTTGTTCTCC:1	-	chr2L	21962036	3'	-	Quasimodo	6919	2	70.91
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGNGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTACCATATTGGTTAGCCATAAGTAATGACCATATTTTCA:1	+	chr2R	18336259	3'	+	roo	360	2	54.11
TATGGCGTTACTCATCTTGTTATTATAGTCTCTTTGGTAGTACAAGGAAAAATCATTCTTTACGTCATTAAAAAATATAGCCAATAAAATCCCATTTTCAAAAAGATTACCACTCATGTCCAAATAGCGAAG:1	+	chr3L	20458399	3'	-	1360	15	1	72.73
TTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGA:1	+	chr3R	23235572	3'	-	jockey	4840	1	69.86
GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGA:1	-	chr2R	24218519	3'	-	412	33	2	53.28
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAATAAAATGGTAGAAAGGAAGTTTGGCACGGAG:1	+	chr2L	14772177	3'	-	roo	8680	2	73.97
AAGAATGTGAAAAAATGCTATTTCACAATTTATTTTCACAATCTTTAATTCACAAGTTAAACAGGATCAAAATACAAATGTTGTACAAGATAGGAAGGAAGAGTTAAAGCTATTAAGCATTTTCACTCCTTCAGGTTTGGAGTTGA:1	+	chr2L	22235077	3'	-	copia	347	1	63.70
CGCACGGGTTTCCGGCCCGATGCTGGGGTCAGCACTTTGGCGGCGGCATATGCTCCTGTCTTTTCTTCCGCATTCTGCGTAATGAAGTTAACTTTTTGTTGTTTCCTCACGGCGCCTGTG:1	+	chr3L	25783553	3'	-	Gypsy6A_LTR	72	1	68.33
AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAATATATGGCATTCAGTTTGCTAATCGTTGCCGCAGGATAATGCAACTGGATCCCGAAAGCATC:1	+	chr3R	9922078	3'	+	blood	346	2	55.08
TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACACCATCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCGTGAGAATGAGTAACCACATTTCCGAAATATCTTTGGCATAGGGGATATCCTT:1	-	chr3L	14638567	3'	-	1360	30	1	66.44
AGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCT:1	+	chr2R	10582443	3'	-	Juan	3890	1	75.69
CTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCAATTTGCATTAATCTAGAG:1	+	chr3L	19339423	3'	-	Tc1	66	1	62.22
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCGCTAAT:1	+	chr2R	25118809	3'	+	roo	396	1	75.19
GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAATGTATGAAGGAACCAAAGAGCATATGCCGAACCATATGCACTACCAATTTATGGCTT:1	-	chr2R	9216128	3'	+	opus	7464	2	58.25
ATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTAGCTGTGATAATCCAGGCCATGGCCGCGCAAGGATCGCTTTTCCGGAGTCTTTGCGCCTCTTT:1	-	chr3L	3806848	3'	+	copia	4975	2	61.90
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTGCTTGGATAAAGAAAACAATA:1	+	chrX	16717948	3'	-	roo	8712	2	54.93
CAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTCCATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCA:1	-	chr3L	3799789	3'	-	copia	4946	2	68.49
GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGCTTATGCTAAGAGCCAACCGTCTGGTGG:1	-	chr3R	7641072	3'	+	hobo	2904	1	67.86
ATCAAGGTGAGGAATGCGGCAGCGAGTGCCGGGAACCCTAATGCAAGCGGAACTTGCGGTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACATATACATCA:1	-	chr3R	10462634	3'	+	opus	455	2	66.99
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGAGCGCTTAAAA:1	+	chr3R	17817987	3'	-	roo	59	2	59.59
GGCAAATCGATATAAAGTTACAAGACTAATAAAATTACGAAAAAAATATCCAACAATTTTTCAAAAATGTGGGCTTGACACTTTGAAGATTGCAAACTCCGTAAAGCAAACTTTCCGTATTATGGAAAAA:1	+	chr3L	23635718	3'	-	INE-1	440	1	76.92
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAG:1	+	chr3L	11530982	3'	+	roo	9015	2	57.24
TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTTTATTAACGGTAAG:1	+	chrX	23280964	3'	-	roo	7	2	45.89
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCTTTATTAAACTATTACGGTATAAAAACAATGCTCATAGAACTTTCG:1	+	chr3L	20831363	3'	-	roo	69	2	70.50
ATTGTTGTTGTTTTTTTGTTTTGTGTGTATTTTGTTTTATATTTTCAATTCCTTGAGCCTTGTAGACATAATAGAACACAATAGTACTTTAAACTTAAGAACTTTAAATGCTCTGTTTAAACTTATATCGTTTAAGCAGTATATGT:2	-	chrX	9907796	3'	-	Penelope	629	1	35.62
AAAACTAATAATAATGGTTCCGCGAAACGCCCAGCGTGGTTAGGTTCACCAGCGC:1	+	chr3R	17398355	3'	-	FB	359	1	67.27
CACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATCTCTTAAGTCTACTGATTATTTTTCATTACTCCCTTGCCAATTG:1	-	chr3L	3233747	3'	-	jockey	441	1	69.01
AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTG:1	+	chr3R	14049433	3'	+	transib2	2780	1	52.31
TAATAATAATAATAATAATTAGGCTCAATATTATGGTTTCCAAATGAATCTTAAAAACATATAAATATGTATCTAATACCTATTTCTATATTTATTAAGATGAACTAGTTTCTAAGCTAACCAAAGTTTTTGAGAACCAAGAAATA:1	-	chrX	14157566	3'	+	mdg1	45	2	52.05
TATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAATTGGGGGGAAAATGCCAGTGGTGAGTTGCCAAGGGCTGCCACTTTGTCGTATTTGGCAGGGTG:1	-	chr2R	7590120	3'	-	I-element	5340	1	61.17
GGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACAC:1	+	chrX	12276835	3'	-	accord	6964	2	64.29
TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTGGG:1	+	chr2R	16785467	3'	-	412	14	2	75.71
CTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTTTGCGAATTTTTCATATGCAACAATTGACACCCTCTAGGC:1	+	chr3L	20583757	3'	+	diver2	141	2	70.77
TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATT:1	+	chr2R	9328690	3'	+	roo	9029	1	54.17
GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCTACGGATTGTTTACTGACCGTAGCCCACTTTTCGGGGCGCTCGCGGCGGAAATGAATTATCGC:1	+	chrX	11471673	3'	+	hopper	1388	1	58.62
CTACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTG:1	+	chrX	9540131	3'	+	roo	9059	1	70.69
CGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAG:1	-	chr2L	20808343	3'	-	HMS-Beagle	6861	2	75.00
GTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGCNTAGAAATAGTAATAGTCGAATCTATGTACATAATGTCACATCGAGGGTCAACCACGTCACGAATGCCGTCGAACCAATTGTTTCTTATGAACAACTAGTGCAAC:1	+	chrX	21832694	3'	+	1360	297	1	54.48
ATATCCGCTTCTCTGCCGACTTCACCAGGCAGCGAAGGCGCACTTCATAGCCTAAAAGGAAAATTGTATTAGCTTTAAGAATCAGAAACATGATGAAGCCGTAGCCGCTCTTCAC:1	+	chr3L	12123518	3'	+	gypsy11	4257	2	70.43
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCT:1	-	chr2R	21907918	3'	+	roo	9038	1	54.24
ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATG:1	-	chr2R	9791589	3'	-	412	7117	2	67.39
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTTTATTATAATAATTGTGAGGGACAGCTTATGTTTAATCCACGCCAATATCAATACCTCGACTAACAGATACCCTTGACTC:1	+	chr2L	13763276	3'	+	pogo	2064	1	60.27
ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCCCTGCAATCTCCAATCGCTT:1	-	chr2L	11518364	3'	+	412	479	2	70.25
AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGTATACAAAGAGGGGAAAAGATGGAAGAAATTACGT:1	+	chr2R	14542209	3'	-	roo	84	2	77.93
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATCGTTACAATTTTTTGCGCTTTTCTTTTTTTTTTAAGAGACCCCATAATCGCAGTCGTCTTTGACAAATTGAGGCAAAATGCAGCCGAGCCATC:1	-	chrX	14336375	3'	+	roo	394	1	73.48
CCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATACATACATATAC:1	-	chr3R	29487012	3'	+	flea	213	2	59.59
CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAGCTAACATCGCTTTCGCAGGCACAGTAATTTAGTTAAAATAT:1	+	chr3L	17205296	3'	-	hobo	15	1	67.31
ATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATGCGTATAAAATGTATACGCATTCCCGGATCGCCG:1	-	chrX	20645854	3'	-	1360	404	1	76.03
GTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATTCTATTGAAATTTTTCTATCTTACTCCCACCAGACGTGTAACATATTTTAATTGCTTGAAGATTGACTTTCGCTCGCATCCAC:1	+	chr3L	21381	3'	-	Quasimodo	40	2	58.22
AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCA:1	+	chrX	9540112	3'	+	roo	9021	2	56.39
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGC:1	+	chr2L	21884617	3'	+	pogo	2046	1	58.22
AGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCCGAAAGCCAGAGGATCAGGAGCATACC:1	-	chr3L	2362291	3'	-	Stalker2	7259	2	72.58
TCACAATTACGTTTTCGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGGAGTGTGGCAAATAAATTGACATTTAGCTGGGCGTGTAACAAGATCAAGTATACGCAA:1	+	chr2R	21920588	3'	-	jockey	60	1	59.85
TATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGCCATTAGAACAGCATATTTTGACGGAAAGTAACTCTATGTCATTGCAGTTAACACCGGGCGGAAAATTTGCTTCGGCTTGCG:1	-	chr2R	5150567	3'	+	INE-1	138	1	63.20
TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCG:1	+	chr3R	14979888	3'	-	pogo	61	1	60.96
GAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTT:1	-	chr3R	25423195	3'	-	3S18	5823	2	54.79
ACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTGGTTTGTCGGTTGTCGGTTGCTTTTCCTCGGTGCCAGTGCTTATTTATCATGTCAAATAT:1	-	chr3R	4553586	3'	-	1360	278	1	59.59
GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGCTGCCTTTAACCCATTATATACCGTTCGGCAAAAACAATGGACCACAATCAGAGACACTCTTTCCAATTTCTTT:1	+	chr3R	13501221	3'	-	hopper	23	1	68.28
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATGGCGTA:1	+	chr2R	9328721	3'	+	roo	9042	1	62.32
GAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATGGGATACGAAAGCGAGCAGGATGCATGGAGCACATA:1	+	chr2L	21008645	3'	+	invader3	5413	2	50.68
ATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCG:1	-	chrX	2842504	3'	+	Tabor	407	2	69.18
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATT:1	+	chrX	9540100	3'	+	roo	8998	2	68.49
GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAACTGCATGCCCATCCTTCGTAGTTTTCGTCGCTAT:1	-	chr3L	18368874	3'	+	opus	7481	2	70.55
CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAATGGGAGAGGGGGATCGGCCGGGAAAGAGGTCGATGTTGAGGTGGGTTTGCGTGGCGGCGTTA:1	+	chr2R	16945402	3'	+	jockey	4977	1	63.16
CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCATGGCTGCTGATAC:1	-	chr2R	9632093	3'	-	roo	43	2	53.85
ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGCGGGGCAGAGATCGGGGGTTGGTCCACTGCCAAATGAA:1	+	chr2L	11671832	3'	-	jockey	4821	1	72.60
CTTCTTGCTTATGCTTATGTGCATACATATGGAAAAATAATTCTTATGTACTACGTGGCTATGTGACGGCGTAGTAGTGGCTGGGTTTTGGTTACAGTTTGACTTTAAAATTTAAAATATAAAAGCAAATGAAATTCATTGACAA:1	-	chr3L	18201282	3'	-	Tom1	191	1	70.34
AAATGATTGGGTATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACA:1	-	chr3L	25782394	3'	+	Stalker4	38	4	55.86
TAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGCATCTTCTTTGGTCCGGAGATGAACCTTCCCGCCACCTGCAGGAACTCGCTCTGCCCCCG:1	+	chr3L	21491528	3'	-	Quasimodo	188	2	54.89
TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTT:1	-	chrX	5643472	3'	+	roo	349	2	59.59
CATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGAAA:1	-	chr3L	19035972	3'	+	Tirant	377	2	59.13
CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAGGTTGCACCGAAATAACGCAATATTTTCGAATAAAATTTGT:1	+	chr3L	1534607	3'	-	pogo	57	1	67.46
CCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATGTATATGTATG:1	-	chrX	17678734	3'	-	flea	4759	1	84.25
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCA:1	+	chr3R	27994263	3'	+	roo	334	2	70.92
GGAACTCGACTATAGCATTCTCCCGTGTTTGCTGAGGAATATCTGGGCGATCGCTTAAGCGCTCTCGTGGCCGACTATTCG:1	+	chr2L	13790166	3'	+	INE-1	573	1	62.96
GCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGTAGCCTGCAAGATGTCCTTTACCTATTGATTTTTTTT:1	+	chrX	17962497	3'	+	Stalker	7174	4	74.66
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTGTTTGCATGTT:1	+	chr2L	12892710	3'	+	roo	342	2	63.70
ATTGCAATGTCGATCGCTGTCGTTTTTCTGGATTGTGGGCAATCAAAAATTATGTGGTCTACATTGCATTGCATT:1	-	chr3L	24038309	3'	+	G3	195	1	68.00
GCTCGTTGGGCGCGAAATTCGAATTCAAATTCAAATTCGAACTAATTAAGTTGAACTAAAATTTGAAATATAATCATAGCCCAGTGTAATTGGTAATAACATTTCGATTTTGGTACAAGATTTTCGCATCACTGATTACAAGATGG:1	+	chr2R	13793569	3'	+	Rt1a	295	1	51.37
CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCAATTATATACACATTAACGAGTAGGGCGAATGAATCATGTATGTGTGATAGGGGGGGTATTGAGGCATTTAAGGGTTTGTTCTGCTGATCCCACCAGCTTAGACATAGACGATTG:1	-	chr2R	18609301	3'	+	opus	491	2	68.28
ACTTGGATTTATTTATATTTGTAGCAATAAATTGCGTAACTCAGAATTAATACATAAACATAATACCATATTTGTATCAAATGACAAATATGCTTAGGCAATTGTCAAGCCAAGTGGCTGCCTGGGTTTTTGGCC:1	-	chr2R	22776300	3'	-	frogger	242	1	60.00
AACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTCAAAACTGGCAC:1	+	chr2L	23034100	3'	+	FB	404	1	56.16
TCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACACATG:1	+	chr2R	9328716	3'	+	roo	408	1	77.88
AAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGCCGCTGCTGTTGGTTGTTAGTTCTATTAAATAAGCGGACTGCGTAA:1	+	chr3R	20195521	3'	+	412	217	2	67.52
AAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGTCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCATATTGCTATAAAAATGGCACACGTAGTTAAAGAAAACCAACATAATTCAAAGATGTTAACACAAAGAATTAAATTAACTCACACATCT:1	+	chrX	20645638	3'	+	1360	3060	1	56.16
CGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATCTTTTACGCTCTCAGCGTGAGCAAGCGGATAATTAATGCATTCTTCTGGCCTGGCTCATTCCCGTGACCACCATATTTTCGTAAAGAATAGTATATTCG:1	-	chr2R	19425294	3'	+	1360	3242	1	50.68
TTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCTTATTGGTTGATTTTTATAGCTAGACATAAAACTGGTTGTGTTATACTATCTTAGATAAAAGAAAATTTAGC:1	-	chr2L	9399427	3'	-	Transpac	4963	2	52.08
TAGAATGTATTTTTTTGCATTATACAAATAATAATAATTTTGAAATTACAAATAATGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACATTACTGTGTGCGCATTTGCAATTTTTTCGTTTTTTTTTT:1	+	chr2R	12413417	3'	+	P-element	2477	1	26.21
TGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAAAATGATTTTCACTCTAATAATCCGTAAATATCATCCATGATTATCATCCGTCCATAGAAAGCTTTCTTTAAATTGCA:1	+	chr3L	19521879	3'	+	I-element	5311	1	53.42
AATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAA:1	+	chr2R	21298826	3'	-	jockey	287	1	62.33
CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAAT:1	+	chr3R	20427487	3'	-	jockey	33	1	61.60
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTCACCGAACTTTTC:1	+	chr2R	19004233	3'	-	roo	8703	2	54.40
CTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGCGCGTACGAAAAATTCAAACATTTAATTGTCATATCGCTGGAAATAAAGCATTTTTTTATATTAATCAACAGCTTCACCTTCATCTTTGAGGTCATATTTCTCGGAATCCTTTC:1	-	chrX	20453685	3'	-	INE-1	547	1	79.45
CAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAACATTTATTTTTGAAAAATGGTTGAATATTTTTCCAGACCGAAATACTTTCGGATATGCGCTCCATCGAGTATTGTTTCTCGATTCTATAG:1	-	chr2R	20940229	3'	-	Cr1a	4220	1	60.27
GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAAC:1	-	chrX	21087575	3'	-	mdg3	5261	1	66.67
AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTCATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCTCAAACACAATTCGGGCATAAACAATAAAGTAAAACGACAATGGAGACGA:1	+	chr2L	2687426	3'	+	copia	5054	2	66.90
GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACCATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAAGCTGTATCCTGCAATCT:1	+	chr3R	6611291	3'	-	HMS-Beagle	62	2	58.90
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTGACTTCTGAAACCACGCGACGAGGGTTCACAAAT:1	+	chrX	8543553	3'	+	roo	9024	2	50.00
AAATTTTAATAAAGTTTAACAGAGAAATTTGAGTAGTAGCAAGAAGGGGAAGTTAACGAATCAGTTATGTCCAAATGCTAAATTCCTACCGGTTAGGATAATTTAGTAGTAGGATATGCGGAGAGTTCACAGCGCCAGCACTTAAA:1	+	chr3R	7253642	3'	-	Tc3	1534	1	74.66
AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTTGTGCTCCTTAATGCTTTC:1	+	chr3R	20868251	3'	-	BS	5012	1	72.60
ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATTTTAAGGCGATGAAGTCGACTTTTCGCCCGGGAAAGTGC:1	+	chrX	6499085	3'	-	Quasimodo	13	2	67.18
ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGATATTACAGTTTTT:1	+	chr3R	22822171	3'	-	mdg1	12	2	58.22
AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACAATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTA:1	+	chr3R	17605711	3'	-	Tabor	6922	2	71.92
GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCAACTAGATACCTTTGGCCACAAGAT:1	+	chr2R	4977092	3'	-	1360	43	1	73.20
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACG:1	+	chrX	6486816	3'	+	roo	9023	2	53.10
AAGTCATGCGTATTGGGTTGGCACGACAAAAGGTCATAACTTTACACTTGCTCTCTGTTTGCTTTGAAGTCGCACACGTAAAAGTCGTTGTCTGAAATGAAAAACAACAGTGTTGAATAAGTTAATGAACTAATCTTCG:1	-	chrX	9170243	3'	-	Q-element	698	1	43.88
TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCT:1	-	chr2R	9662734	3'	+	412	436	2	74.31
AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAACAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCA:1	+	chr2L	3114573	3'	-	roo	8703	2	54.17
AAACAATCCATCCACTTTTAGTTTCAGTTAGGTATTTCATNTTCCATCCTGGAATTTATGGTCTCTGGAGAGTTCCGGAGCCATACCGGAGAAAATGTTATGCTTTTATATGTAGGTTTGCTACAAAACCTGCGAGGAGA:1	+	chr3L	1255491	3'	+	Circe	322	1	80.00
TATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTTCTTTCAAACAGAATATTTATTGAAAAATATATTATGGTTCAGACTCTAAGTACAATGTCATAACATATTT:1	-	chr3R	20428814	3'	+	jockey	4854	1	51.37
CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTAAGACTGTCAAGAAACTCTTTATACATTTTGTTTTCCTCAAGCTGGAGCGGACGTACTTGAAACGCTTTGCTTGACGGCCTCGTTTCCGCTGTCTTGCCTCTC:1	-	chr2L	22357314	3'	-	S-element	1546	2	51.41
GGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGTAAAAATTTATATTTTACACTTTACTTTCATGAAGTGTGTGTGGGTAAAATTTCAG:1	+	chr2L	12290775	3'	+	1731	4577	2	50.68
TATAAATTTATATGAGAACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAAT:1	+	chr2R	9500059	3'	-	G5	4755	1	55.48
CCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTTCATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATGAACTTAAATATGAACTGTAATGATCAACCTATATGTTGTAATTGAAAAATTTTATTAATCAAAAA:1	+	chrX	22643328	3'	-	Tc1	1620	1	52.05
ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAGGCCTAAAAACGCCGCGCAGTAGCAGGTC:1	-	chr2R	16891780	3'	+	hopper	1402	1	75.34
AGAGGCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATCCTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGGGTTTCGTGCTGCTC:1	+	chr2R	5532365	3'	-	G4	3767	1	53.79
CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCG:1	-	chrX	2518066	3'	+	P-element	2786	1	17.81
ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCG:1	+	chr3R	10182194	3'	-	blood	71	2	70.37
GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGCTTATTAC:1	-	chr3L	10848626	3'	-	blood	7044	2	59.40
ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACACATTTCCCTTTGCTTTTCGCACTTTGCCGCTTCGATACGGGAAATTTTAAGGCG:1	+	chrX	6499055	3'	-	Quasimodo	57	2	62.76
ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTCTTTATAAGGTTAATAAAATGTTGTGATCTGCTTCTTCGGTTATAACACG:1	+	chr3R	17478456	3'	-	copia	73	2	69.18
AAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGCTAAAAAGAAACCAGGCCACGTATCTGTGGCAAAATGTCTGAACTACAATTGAA:1	-	chrX	12776480	3'	+	TAHRE	10386	1	60.18
CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGATGTTAAGGACCGATCGGACGATCGAAACCTGTTGGGGTTACGATAGGGATACC:1	+	chr3L	10773152	3'	-	412	7092	2	56.90
TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGGTCAGGGATTGATTCAACACACCATCCTCTGAAGGATTCAGAACTGACG:1	-	chrX	11471553	3'	-	hopper	33	1	59.40
CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTT:1	+	chr3L	10574393	3'	-	Tabor	46	2	46.58
GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGTTGATTTTGTTTTTCCGCACGCACGAAAAACCGAAAGAAAAATAAACAATTTGCAACTACAATGTGCATCATGCATT:1	+	chrX	5643620	3'	-	roo	16	2	71.72
TTTATATTTTCTTAAAAAAAAATCAAGATTTTCTTGAATTAATCATGGTATACCAAATTAATATGCTTGGTTGCAACTAGTTTCCAAAATTTGTTAATTACACACATTGATACCTAATGATTTATCAAGAGATAT:1	-	chr3R	14811858	3'	+	pogo	2020	1	85.19
TGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAAGCTGGAACACCTCTGGCACGTGCTGCTGCATCCCGATTCCGTCCG:1	-	chr2L	10023004	3'	-	Doc	77	1	66.67
TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCAC:1	+	chr2L	16016406	3'	-	412	61	2	64.44
ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGCGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAG:1	-	chrX	10644437	3'	-	jockey	4824	1	60.28
TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCCTCTACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACAATCTTA:1	+	chr3L	27415343	3'	-	transib2	32	1	60.69
AGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTAGATATTGCACAGCCATGGCCACTTGAATGGGACAACCCGCTGTGCTGCTGGTTTGGCTGAAGTTTATATGTGCCACATGTTTGGCTAATGACTG:1	-	chr2R	17626790	3'	-	opus	118	4	78.12
ATACATCTTGCGGCGTGTGAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTAGTGTCCGCTTCGGTTATACATGAGCTGCCTGAAATTGAATAGTGAGCAACGCGTTAAGTTATCATGTAGCTGAAAACAAAATTTGTAAATATTAT:1	+	chr3L	20195778	3'	+	1360	420	1	59.59
ATAACTCTGGATCCATTGGAACTTATATAATTTATATTTAAATTGATTCCGATTGTAATTTATGCCAATAATTTGTTTATTTAAGCTAATGAGGACATGCATCTTGCATCTTGCATGAAGAGATAAAAACATAAATGAAGAACG:1	+	chrX	20870227	3'	+	gypsy	451	2	54.17
AGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCTATTCATATTTATTTGGCCAATCTGTTCTCTTTTCCATTTGCTTAGTGCTAAACATCATCGGTGTATGGGGATATGCTGTCGAAACTCAATGGAC:1	+	chr3R	24383372	3'	-	rover	23	2	68.49
TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCG:1	-	chr2L	14772021	3'	+	roo	9028	1	52.52
AATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACCAAGTTATTAGTGCAATAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGGAGCTGATTCGGTAGAAGAAGCTAATAAATTAATA:1	+	chr3R	19445646	3'	+	roo	8749	2	66.67
ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACACA:1	-	chr2R	24218522	3'	-	412	58	2	57.64
AATAGATAAATTTAAATACATTTATTGTTGTTGACAGAAGTAATAAGAAAGGGCTTAAAAGAAGTGCATATAATTTAATAAGAATTTTCAATCTTGTAAGTTGCTCCACTCCAATTGGCAATACAATTAAGTTTTTAAAAACTAAT:1	-	chr2R	22565160	3'	+	diver2	446	1	69.86
TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAGGACCTGGACTCAGATGTAATGTCCTTAAAAGTGGCCACATGACTCGATTTGAATTGCATTCCCTGCAATCTCCAATCGCTTCCGTCAACAGATTCTAGTCCTGAGGGCGATG:1	-	chr2L	11518333	3'	+	412	7539	2	78.62
GTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACGTGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGTTGGCAGGACTG:1	-	chr3L	2325680	3'	-	I-element	5075	1	76.79
CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAATTAATTCATATTCAAGCGGGGCTTATAACTGTAATACACTT:1	+	chr3R	9038996	3'	+	Juan	4144	1	74.63
GTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGTATACGTAATACGCAGTGTGCTCCGCTGCGCAACCACAATTCAACTTCACTTGTTCTCGATTGCAATTTGTCAACTTAAACG:1	-	chr2L	2122366	3'	+	Stalker4	369	2	55.48
TCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATAGCTGCCTAGATATATGCATGCATCAAACATCAGGCAGTTTGACATTGC:1	-	chr2L	16067083	3'	+	297	326	2	69.18
ACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCGATGTGGGCAGAATCGTTCGATT:1	+	chr3L	22968429	3'	+	mdg1	7400	2	59.15
AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTGGATGC:1	+	chrX	14749725	3'	+	copia	253	1	60.96
TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTT:1	+	chrX	23280951	3'	-	roo	8698	2	43.75
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAATAATCATAAAAATTTAAATTAAAAATTTCAAAAGTGTGTATGCCAATTCACTAGCATATTTTTTTGTTTCCTATTATTTAGCAAGT:1	-	chr3L	23325952	3'	-	pogo	33	1	63.01
AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCAC:1	+	chrX	16717912	3'	-	roo	8752	2	80.82
AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGGCGAAAAGTGTGAGGAAGTAAGTAGAAGACTTTGAGATGATACGAAATAATATGATTGCACATAAAAGTTTTTGCTAAAGAAGTTCACATTGTACTTAATAA:1	-	chr3L	14603222	3'	-	jockey	22	1	71.63
CGGCAACATAACCTCCTTTTTTGAAATGCGCGTCATTCAGTCATAACGGTCATAACGGAGCGGGTTAATGTTTTTGTTCACAGACTGCTACAGTACATCGAGTCTTATGCCTTATGTGAACTGCACTGTGCACTTTGA:1	-	chr2R	2947618	3'	+	mariner2	8	1	58.70
AAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACATTATGGAAAACAAACAACTGGAGTCATTGAAGGTAATTTACGAACCAACACGTTACTGGAGGGATTACTTG:1	-	chr3L	12860871	3'	-	pogo	1919	1	67.31
CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTT:1	+	chr3R	14979880	3'	-	pogo	62	1	64.75
AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGCCACGCATCGCTACTTCCGTCAT:1	-	chr3L	12308349	3'	-	hopper	44	1	70.53
TAGAGGNGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTG:1	-	chr2R	11629738	3'	-	Tirant	8124	2	66.36
GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAACAGTAATAAATAAACTATATTTTCCTTTACTCATAGGGTACACCTTATTTCCCAAAGCAAAATCCAATGAACAGTTGAAAAAGTATACCTCTG:1	+	chr2L	18294325	3'	-	roo	28	2	64.38
AATTAAACAAAAAAAACAAAAATATACCTGCGGCCTATTTATAAAATGTCTAGAATGGCAAAAACAATTAAATTAAATTTTGCTACGTAAATCTGGCATATTTTCAAATGGAATACGTCTGCCTGTTGAGAAATGCCAGATGGAAG:1	+	chr3R	7405075	3'	+	Doc	4700	1	48.63
GTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTGGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTCAGATATATTTAC:1	-	chr3L	11321406	3'	+	mdg3	182	2	57.24
TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGG:1	+	chr3R	10182195	3'	-	blood	7066	2	65.83
AAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCATAAAATTATATCTAATTGGAAACTTAGAT:1	-	chr3R	1867658	3'	-	R1A1-element	5281	1	79.86
TAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCA:1	+	chr2R	21298839	3'	-	jockey	274	1	53.42
TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAGATGATAGATTCCCGCTGCCACTGCCAGCCCCCTTTTTCGTTGGTCGATATGCAATCACATAG:1	+	chr2R	21292362	3'	-	jockey	4848	1	64.89
TGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTAAATAACCCACATATTACATTACATTACATTCGATATTATATTAAAATAATCTCTGGAGATT:1	+	chr2R	9221114	3'	+	opus	7452	2	57.89
ATATTTTTTTAAAAAAGAAGAAATCTTTATCTGTATTGACAACCACCAAACACTCAAGCAAGTAAATTACTAATTGTTAAATGTCAAGTTGTCTCCTATTATGTTTATGAACATGTCTTTAAAAACGTGTCTGTTTTAGCTAATAG:1	+	chr3L	18423904	3'	+	TART-C	11035	1	60.27
CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTTTATGGGTTCAGGTTGGGGTGTCCACAGTGCTATCTTCTTACTGCCTCACTGCTCCGCTGC:1	+	chr2L	14892312	3'	-	transib2	48	1	56.20
CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCC:1	-	chr3L	19036004	3'	+	Tirant	327	2	73.68
ACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTGATTGCGTTTGAACGAC:1	-	chr3L	23603166	3'	-	F-element	18	1	52.56
TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGATGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGAGAAAGCGGTACGCGAGCGGTCCACCCATTTAGTCGAGCGTCAACATTAA:1	-	chr3R	13364330	3'	-	jockey	4795	1	58.21
GTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCTCGTCTTCCATCCCTTTATTTCGTTACACGTTACAGTTAAGTTAAGCAAAATATGCAAGTAATCCCGTTACTTCCACTTCATCAACGACAAACGTAAACACAACGTGGGAAGATGGGGAAA:1	+	chrX	17871062	3'	+	gypsy12	10160	2	53.10
CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAACGTTTCTAACTTTAATTTGTGCTCGAGCCTCAC:1	-	chr3R	7835142	3'	+	roo	8984	2	79.31
AAAAAAATTGCATTTAATTAAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATCTCTCGATGCGACATATTTATTTGTTGATTCATATATT:1	+	chr3R	12776285	3'	+	S-element	1636	2	69.18
ACATACAAGCCCACTTAATAATAATAAAAATAATTTAAGGCAAAGGCATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGT:1	+	chr3L	25350823	3'	+	baggins	5429	1	39.77
TTTAGTTACCGTTGCCGGTCGTTCGTCCACACCCACGATTCTGGCCGAGATTTCGGGCATCCAGCTCAGAGTCAAAGCCGCTG:1	-	chr3L	27908124	3'	+	R1-2	459	1	67.47
ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTG:1	+	chr2R	16785450	3'	-	412	37	2	60.96
TAATTAAACATTTTTTTGATATGGCTTAAAAAACGGTTTTGGACGTTTTTGATGAGTTTCATAGGGGCTTACGTGAAAT:1	+	chr3L	5478013	3'	-	transib1	1929	1	86.08
AAATTAATAAAAAATATACCCTCTCTTAGCGTCTATCACCTTTTGAAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGACAAAAACAATTAACATTTTTTAAAAGTGTGTATGAGACAGTTATTGGCGGTTTGTGGGCGTTATAGTGGG:1	+	chr3R	22533640	3'	-	Tc1-2	1360	1	50.69
ATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTAACCTAGAATTGC:1	-	chr3R	9714335	3'	-	Stalker	16	4	74.66
ACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGGGTAGTAAAAGTATTGGATTCGGAAATTTATAAGTACACTTT:1	-	chr3L	22437877	3'	+	roo	398	1	49.37
ACTCTAACAATATCTTTCAGCACTAACAAAATTTCCACATTCATGACATACTAACAGACTCATATGTACGTCGCAATGAAAATTTCATTGTATTTGACTCTGTGAAGGCAATCGACTCACTACAGCGGTCGAGAGATTACAACAC:1	+	chr3R	3920872	3'	-	Gypsy12A_LTR	351	1	76.55
CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACTTGATCCCCTTATCATGTCCATTATATTTGAAAACTGATTT:1	+	chrX	8347635	3'	+	412	412	2	71.23
GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGGAANCTTAGAATTAGAATTATTTTCACGCATCAAATGGTGAATTTTAAGCATACACAGCATATAAATTCATGTTCCGCGTGTCTCAAATAAGTTTT:1	-	chr2L	17607564	3'	-	hobo	12	1	62.41
AAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGAACAGTGGTTCTAGAGACATAGGCGGAAATGCATGATAAACAATGAAATTGATTCGCCCCTTATCTACTTCAACTCGCAATCTTC:1	+	chr3L	15171550	3'	+	INE-1	165	1	42.20
TGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAAAAAAATCAAAACAATATATGTATGTACATTTCCTTACACT:1	+	chr2L	20117988	3'	-	invader4	2765	2	72.52
AGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTTATATATATATGTGTGTTTGTATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTACCTGATGTCGTCGTTGTTGCTGCTGCTGCTAATG:1	-	chr3R	22219536	3'	-	opus	7140	4	83.08
ACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCCTAGCCACCCTATAATGTTGTCAACTTTATTAATTTAATTAGTTATAATTGCATTTAACTCAACGTTACAGTGCTGCTCGCTGCCAAAGTTTCTGGGAAAAT:1	-	chr3R	4610936	3'	+	G2	2855	1	73.29
TAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTGGCTTCAAGGTTTTCTTTAAAATATCT:1	+	chr3L	27384239	3'	+	1360	448	1	77.10
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACAGAAACACATTCATAAAG:1	-	chr3R	15072540	3'	-	pogo	19	1	65.04
ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACCCTTTGCCCCTTGGGAGGTGATAGCAAATGAAAAAG:1	-	chr2L	3886169	3'	-	roo	86	2	76.71
ATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTATCGCTTAGCTTGATCTATGCAGAAGGTAGTCGAATATATTATACTTTTTTAAGTGCACAAAACACAAGCTGATGCGCAGACAAACC:1	-	chr2L	17548708	3'	-	Bari1	1644	1	60.00
CAGATCNAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAATTGCCTAGGCTTTGATACCCTACATTGTAGGGGTTACATGAATATTGCAATATTTATGCTATAATGACTAATTAGCA:1	-	chrX	13066487	3'	+	jockey	4948	1	51.37
CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTG:1	+	chrX	9540129	3'	+	roo	9030	1	55.94
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATATAACAATACATTATATTTGCAAGAAATATACATTTCCAAATTTGACATGACTCTTACATGAATATTTTATGGTAAAAACTACAAAGACATTTGACATTTTTCAGAATTT:1	-	chr2L	18294127	3'	+	roo	400	1	56.55
GGTAAAAAATACGCTGAAATTGGTGGCATTGTGGGTTGTTCAAGCTAAATGATCCGCAAAGCACTGCTTTTTGGTCTCCTTGGTAATGGTCCAGGGTTGCCAGGTTTCCTATACAAATTTCTAATATATTTTTAACTTTAGTTTTA:1	-	chr2L	18119880	3'	+	Tc1	422	1	53.42
AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACTCCTCGATTATTGTCAGCGGCACTTACT:1	+	chr3L	20168451	3'	-	mdg3	62	2	57.93
TATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATACGTAATGTTATGTGTTGCTGCTCTGTTGACACTTGTCAGTGCCTAATA:1	+	chr2L	2122474	3'	-	Stalker4	7030	4	67.81
CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTCTTCACATGAGATGATTTCCCAGGCATACAAAGCATTTT:1	-	chrX	3309635	3'	-	jockey	79	1	69.78
GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCC:1	-	chr2R	7898067	3'	-	roo	59	2	64.38
CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACCTAACACACTTTCCTGGGGTAAACCTGCTCTGACTCTCTTTATTTGGGAGGACAGCCCGTCCTGCACAACTTTAAAGGAGCGCTTG:1	+	chr3L	23906505	3'	+	1360	3386	2	76.07
AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTT:1	-	chr2R	7898083	3'	-	roo	8737	2	75.00
AAGAAATGAAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTTAATTAAGTGCTAGCTTTACTACATGTTTGTTTACAGTCGAAGAGTGTTGTTTTTGAAAAGCACGGCCCACCCATCAATCAGGCCTAATTGAAACGAGCCACTT:1	+	chr2L	20123468	3'	-	jockey2	3253	1	68.53
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAAT:2	-	chr2R	7898079	3'	-	roo	71	2	72.60
ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTC:1	-	chr3L	23146479	3'	-	1360	57	1	60.45
TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAA:1	+	chr3L	15600302	3'	+	roo	323	2	76.03
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAAC:1	-	chr2R	20596451	3'	+	roo	9016	2	56.16
ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGACATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTT:1	+	chr3L	9998186	3'	-	roo	71	2	67.13
ATATTCATTGAAATTGGCAAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTTGGCCCACTCAGAGAGCCAGGTTAAAAACGCGACGGGGAGCAAAGCAATTTGGGTCTCAAAAACAAGCCA:1	+	chr2R	13114953	3'	-	pogo	165	1	66.67
TTTTTTTTCTTTTTTTTTCGAAAAAGTCACCAATAACCGAAGGGTAGGAAAATACCCCAGATGCAATACTTACGGCTTGGGCAG:1	+	chrX	4154574	3'	-	Doc2-element	215	4	86.90
GCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTGAATAAAGGCGGAGAGCAGGGCC:1	-	chr3L	2362317	3'	-	Stalker2	7304	2	53.85
TATTTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCACTTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTT:1	+	chr2L	11661013	3'	-	F-element	77	1	57.53
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAAAATATATGTACAGAG:1	-	chrX	9540012	3'	-	roo	57	2	61.97
GGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATCGGTGACAAATTATTCACGCTGTCATGTGGAACACTTTTCGCGTGTGTGTGTGTGTG:1	+	chr2L	1237613	3'	+	roo	284	2	60.69
TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGC:1	+	chr3R	14979909	3'	-	pogo	11	1	72.65
ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGAATGTAAATATAGGCTCCTTGTATTTTTGAAGAGTGAGCAAAATAGTAGCTTAATGGAAAGTTAATAGAGCCTCAAGGAACACGTCATGAGATAAAAGATAAAAATAGTA:1	-	chrX	6191091	3'	-	FB	12	1	77.40
TTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATGTTTTACAATGGATTACAAGCATTGTCAAAATATATACATCATCACATTTTAGC:1	+	chr2L	17420304	3'	-	roo	8663	1	79.45
AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCAAATGGACTACAATCGATTTTAAATATTCTAGAAGTTTGCCCGAAACGAAGAAT:1	-	chr3R	21276538	3'	-	BS	5062	1	60.96
TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCTAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTTCAGCGTAGCCAGTTTTGTCCGTACTCCATATGCG:1	+	chrX	4240826	3'	+	1360	3328	1	73.33
ACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGTAAAATGTATTACCGGTTCGAGTTCTTGTCGATGCTATTTGCATAATATATTCCCCATTTATTCA:1	+	chr3R	19524155	3'	+	jockey	4703	1	51.85
AAAAGAGCAGGGTTATTCGAGTGATTCTGTTGTTTCCCCACCAGTGGTAAGAAACACAGAATAAAAGACCACGCCTTAAAGTACTAGGACTATAAGGTGAAACATTGTGTTCGTGCTTCCTGAATCCAGGATCCTTTCATAGAAAA:1	+	chr3L	13615112	3'	+	rooA	468	1	77.40
CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCGCTTTGATTAATTATAT:1	+	chr3R	10274065	3'	-	HMS-Beagle	6829	2	61.70
AAATTAATACTAATTTAACATTTTAAGCTAAAATATGTATTTACAGAAAGGTTAAGTATACGGCACTTCGGTGAAAAAACAAACACATTGCCTG:1	+	chr2R	18922610	3'	-	1731	4263	1	65.96
ACCTTCTAGCTTTTATCGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATACCTAGATCGACTCGGCCATTGATTCGAAGGAGCTCGGTGGGGAAAACGAATCAAA:1	+	chr3L	22543624	3'	-	INE-1	157	1	69.64
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTCCGATTTTTCGTTGCTGCGCATTGCCAACGTTTTG:1	+	chr2L	12892700	3'	+	roo	397	1	62.20
GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGA:1	-	chr3L	27415223	3'	+	transib2	2781	1	58.82
GACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTCTGCTTTGTCAGTTGACGCAATTTTTGGTTTTTAATTGGCCGTCATCAGGTCAGCATGAACTTTTGAAATTGGCCAAATAATTTACTTGCCGTCTTGTTGTTATACCTTTATT:1	+	chrX	6152576	3'	-	invader2	5002	2	76.03
CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTCGTGCTCGTAGTGAAGGCCCACAAATGAACC:1	+	chr2L	7898415	3'	+	roo	399	1	74.17
AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAA:1	-	chr2R	3338797	3'	-	Juan	69	1	65.49
ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACT:1	-	chr3R	5061840	3'	-	mdg3	65	2	59.31
AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATCCAATGTTGCTGG:1	+	chrX	14749721	3'	+	copia	249	1	58.22
TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACTGCACACTGCAAGAAAAACGGTTGTAGGCTTTACATAAAAATTTTGCATTAGGTTAAAATGACAAATAATATTCG:1	+	chr3R	12887007	3'	-	roo	45	2	54.79
ATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCTTGGTTTTTTCTAGTGTACAAGTTTCCAGTGGCCCCTTCGAATAAGTGCAG:2	+	chr3R	29361120	3'	+	mdg1	421	2	77.40
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGCGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAG:1	-	chr2R	19004112	3'	+	roo	9030	1	56.85
AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCGTGACCGTGGCAACGAA:1	-	chr2R	19726884	3'	-	1360	24	1	79.69
GAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTA:1	-	chr3L	4840743	3'	-	jockey	4732	1	65.60
AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAAATCTTAGCGTC:1	-	chrX	13039463	3'	+	roo	405	1	73.56
AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGC:1	+	chr3L	16973482	3'	+	S-element	1684	2	58.52
AGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTC:1	+	chr2R	6085998	3'	-	1360	371	1	59.59
CATGTCTGTTATGCGTAACGATCGAAAACTGACTGACTGTGTTTCTGGGTGTGTGGCTGCTTTGCTTTTGCCTTTTTATAATTCATGTTTACGCTTACTTCACTATTGT:1	-	chr2R	9299684	3'	-	invader1	3927	2	62.39
CTCTCGATTCATTTACATAGGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTG:1	+	chr3R	18339189	3'	-	roo	8722	2	60.96
TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTACTATACACTTTTGGTGCTATTAACCCGTTCGATTGGCCAAATATACCATCCCTTAGCATTAATCTCTAGCTGCAA:1	+	chr3R	14337512	3'	+	copia	241	1	68.10
TCTTTTTTTTTTTGTAATTTTTTGCATGTTTTTTTTGGATCCGCCTTTTTTTTAGCC:1	-	chr2R	15183406	3'	-	Doc	4697	1	82.46
AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGAATTTGACGG:1	-	chr3L	15490331	3'	+	copia	5048	2	69.18
ATAAAACGATTTCACTGTTAATTTGTTAGGTGTTCTTGTTTAATATTTTTTATTAAATACAATATTATTGCACGACTAAAATAAATTTTTCGTTTTGTTAGTTTAAACATAGACGGCACACTAACAGGGGCGGGTGCGGG:1	-	chr3R	25253693	3'	-	gypsy9	421	1	72.86
ATTGAGTTCTGAAAAAAGGAAATTATGCTGCTGCACCCTGTATATATTAAAAAAACGAAAGAGAATTCCCCGACTGTCAATTTTTCAAATAACAACAAATAAAACTCACAAAAGTTATTATTTGGAATAAATTAAGAATGTGA:1	+	chr4	647118	3'	+	mariner2	873	1	55.24
GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACAGTGTAAATGAAAACTACACTATGTTCTAGGTTCCAAAAAAATCATTTACTAATGTGCATCATTTTTTTTT:1	+	chr3L	6978255	3'	+	pogo	2079	1	62.50
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACA:2	+	chr3R	17817997	3'	-	roo	8713	2	52.74
GCTTAAAATGGTTCTCTAAATGATATCGGATTTCAGACTACCAATAGGAGGTTCTGCAGGGACAGCTCGTGCAAGAACGTCAATTCAGCACGCAGCTTAAGCACGCCCACCAATGG:1	+	chr3R	23082837	3'	-	gypsy4	6397	1	68.10
GAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTAGATATTGCACAGCCATGGCCACTTGAATGGGACAACCCGCTGTGCTGCTGGTTTGGCTGAAGTTTATATGTGCCACATGTTTGGCTAATGATT:1	-	chr2R	17626791	3'	-	opus	7133	2	72.66
ACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAATAATTGTGCCTGAAGAGTACATGGCTATGGAATCAAAATAGCTATTACAGAAGTGTATATTGTATATGCACCCTAGAGTAATGCATATTCAACGC:1	-	chr3R	22357897	3'	+	mdg3	5133	1	69.23
AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAGAAAAGCTTAAAAAACAAAAATTAATTTAAATTACATATTTGCCCGCAAAACAATGTCTGCGAGAGTTTGAGGGTATATAAGGGAA:1	+	chrX	5274416	3'	+	roo	9037	1	61.64
CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCGCTTTGATTAATTATATGATCCATGTTTGGTTTTCCGAA:1	+	chr3R	10274087	3'	-	HMS-Beagle	6812	2	74.66
TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGA:1	+	chr3R	25826787	3'	-	mdg1	40	2	55.48
ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTCGCCGGGCTGCTTGCAATGGAATATGTAGTCATAAAAGTTAAT:1	-	chr3R	9921956	3'	-	blood	21	2	63.20
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTTCCAAAAGC:1	-	chr3L	233214	3'	-	roo	8685	2	67.20
GCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCT:1	+	chr2L	19965034	3'	-	Doc	99	1	77.93
CAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAATAAATCATTTATCGTAACCCCCCTTCAACTGAGAAAGTTGGTTTGCATTTCATAATTTCCTTTTACAGGGTACTTAAA:1	+	chr3R	5897530	3'	-	1360	3157	1	50.68
TTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAACCTGGCAGTAATTAAAATTAAAAAATTCTATAAACATGAACCAATTAGCCCATTATTTCAT:1	-	chr3R	6611186	3'	+	HMS-Beagle	189	2	57.53
TTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGGTCTTTAGGGGTGTCCAAGTGTTTTGGCGAAACCCTTTTGCAACCCATTAATAATTATATTAATTAATT:1	+	chr3L	12344022	3'	-	BS	5024	1	76.55
CAAACTAAGAATACTGTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATTATCTTACTTATATTACATTAATATATATATCTGTGTCAAGGCACG:1	+	chr2L	22209311	3'	+	flea	4946	1	71.92
CTAAATTCTTTAAATTAGAAACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTTAAACAGAGAAGCATATACTTACTTACACTGTAAATATCAACAATAGGAAGCCTTCAATGTCCTCACCCGCTACG:1	-	chr3R	9667922	3'	+	TLD2_LTR	157	1	50.75
GACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTAAAATATTGTAACCAAAAAAGATGCAGGGTATTTTAAACTTTCAAATATGTCCAAACTTACCTATATACGCAATATTAAGTTATTAAACAATGTTAAAGTATGAAG:1	-	chr3R	22388923	3'	-	G2	2615	1	75.86
TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTTATTCCTCATTTACATTTTAATATT:1	-	chr3L	21817943	3'	+	roo	9040	1	62.33
ACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTATATTTATTATG:1	-	chr2L	23069852	3'	-	Stalker4	238	6	60.42
TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACCCAAATAAATATAAAATTCAAAGAATAATACAAACTTTAAATAAATGGCAAATTTTCGTTGAAATTTATTAGACATAAATTTAATTGTTCTTTAAGTATAAGATGAGCA:1	+	chr3R	28771397	3'	-	mdg1	7048	2	50.69
AGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTGGAACGTACATACATAAGTACATACACCTCTATTTCGTGCATTTTCTATTGAATTTTAGATTTC:1	-	chr4	128873	3'	-	Tc1	1412	1	56.16
AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATG:1	-	chr2R	9791565	3'	-	412	7099	2	54.17
GCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTATGAAGCTCTTTATATGTTAGCTTTTAAGTCAGTTCTTATTTGAGATCCAGTGAATAAAGAGCACCTACACGTCCAGTAAAGTTTTGTCACACTGCTAGCGAATTTTGTATCCTATTAT:1	-	chr2L	21578547	3'	+	springer	53	2	65.52
AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTCCCGAAGGATGCGTGAG:1	-	chr2R	20944311	3'	+	pogo	2064	1	52.74
CATGTATACATATGTACATACATACATATGTATGTATTAATGTGCGTTCTTTACACGATTCTTATCTCGTAAGCCCGGAAAGTGATTTTGCTTTACTTAAAA:1	+	chr2L	6644199	3'	-	invader3	5087	1	68.63
CTAAATTACGTTGTTAGTCAACGTTTACATGGGATTAATTTGGGATTGTAAGTGACGGTTGGAATTACACCTTTAAATAATGCCGATGTTTAATGTTCTTTGTTAATGCTCAATACTAGCTTTGTTCTTAATGACTGAAGAGGATA:1	-	chr2L	8437922	3'	+	BS3	316	1	55.48
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCG:1	+	chr3R	17420517	3'	+	roo	9017	2	57.53
GATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTGGTA:1	+	chr3L	19014005	3'	-	invader3	51	2	58.91
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCA:1	-	chr3L	20831286	3'	+	roo	9002	2	69.18
CTTCTTATTTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGAATACCATCTGAATGTCTATATGCG:1	-	chr3L	9997998	3'	+	roo	409	1	45.21
ATGTGATTTATAAAAATAAAACATATAAAAATGTATGTTTATACATCTGAAATAGTAAAAGAGTTTAGTTTGATTTAAATTGGTACGAATATTTATCATTTTAATATTGGACAAAGGTTTGCCTTGCATCATATTATATTCAAAGT:1	-	chr3L	10003050	3'	+	looper1	1688	1	60.96
ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTG:1	-	chr2R	19499335	3'	+	P-element	2813	1	26.36
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACAT:1	+	chr3L	11530950	3'	+	roo	9016	2	73.21
GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAA:1	-	chrX	21087576	3'	-	mdg3	5255	1	71.08
ATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCTTGGTTTTTTCTAGTGTACAAGTTTCCAGTGGCCCCTTCGAATAAGTGCA:1	+	chr3R	29361119	3'	+	mdg1	421	2	77.24
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAATTTTGTTTAATAAACCCGTTTTCT:1	+	chr3L	233382	3'	+	roo	397	1	77.24
CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTTTTTATGAATATGCATTAAAGCA:1	+	chr3R	28075450	3'	+	jockey	4977	1	71.23
ATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCGTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGACTTTTTTTTTTATCATTCACAATGGCCTCTGTGTGACTTTTGTGTGAGGCTTTCTAGGGGTGAGTGG:1	+	chr3R	12022062	3'	-	Stalker4	6972	4	52.74
AACCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATACATACACGTTCTCGTTTATTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCT:1	+	chr3R	20683402	3'	+	gypsy	7393	2	57.64
CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCATTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTTTGCCTTTGGCTCCGGGTCGCTCATTACGTAAGCCATGTTCGGTGTTCAGTGAT:1	+	chr3R	19265921	3'	-	I-element	22	1	63.20
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAAT:1	+	chr2L	14772147	3'	-	roo	8697	2	58.65
CCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCAAAGAGATATAGCTTTTCTGACAGCATATATGATGAAGTCCCAATTGTAAATCATTTTGGGAAAGAATAAAGCCATTGCTACTTGGATAAC:1	+	chrX	13125235	3'	+	jockey	4676	1	55.48
AAAATACGTCTCTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATATTTCTTCTAATTTCTTCTATTTCTATTTGCTGTGGTGTGTTTTGCTTGTATAAATTAACAGACAACAATTTTAAAGGGGTTAATTTATAAGTATTAATAGAATTGCT:1	-	chr3L	14608223	3'	-	297	6573	1	55.48
GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGTCGTCGTGGCAAA:1	+	chr3L	16343321	3'	+	roo	359	2	52.74
GCATTGCCCCATAGTTGACATCCATATGTCCATATTGATTTTATGGTTTTTTATACAACTGTGTTGTATAACAGCACCATAGGCGTTGGATCTCATTAAATTGTACCGCAAACTTCCTTGACAAGGATACCATCTGC:1	-	chr2R	5293316	3'	-	Doc4-element	2609	1	56.93
CAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTAAATCCGAAACAAATAGAATGAAGCGAATAGGAAAACTAAAGGGTTTAGCTTAGAAATTTAGCAACTAAACGTGTGATTTTCATTTTTAGGGAAGCCTGAATATTTAACATTCAACTA:1	-	chr2R	9499950	3'	+	G5	4795	1	55.48
TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATA:1	+	chr3L	25401022	3'	-	Doc	46	1	45.52
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTA:1	+	chr3R	17420503	3'	+	roo	339	2	67.12
TTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCACACTATATTTTCTTTGTATTCTTCGGACAAATTACTCAAAATACTTC:1	+	chr3L	19114142	3'	-	Tc1-2	478	1	69.66
AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTGTTTACATTTTTGC:1	-	chr2R	11629719	3'	-	Tirant	8123	2	72.00
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATG:1	-	chr3L	233246	3'	-	roo	72	2	69.44
AATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTT:1	+	chr3R	20868210	3'	-	BS	5053	1	58.22
CTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTAATCCTCTGGGATATTAATAAATATTGTATAATGTGAAAAAATTTGAGAACATCAAGTAGAAAGGGGAATATAAAATCTCAAAGAAATTCTTACCTTCCACCAACGGTTCTTTTC:1	-	chr2L	16676946	3'	-	INE-1	530	1	52.05
ATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCT:1	+	chr2L	10037399	3'	-	Quasimodo	57	2	66.67
GATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCATTTCTTCTC:1	-	chr2L	21008552	3'	-	invader3	72	2	69.57
TATTTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCATGAACAATACATGTGCTGTCACTGTATGCGTAGAAATGAGCCAAAAAGTACCAGAAATGGTACCAAAAAGTAA:1	-	chrX	3464181	3'	-	hopper	42	1	76.03
GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACACACATATAACGAGTAGATGGGATAGTCGTTTTGTGTGGCATAAATTGACGCCTGGTTTTTATCATAAGGCAATTTCATATTATGCTTGGGCATTTCG:1	+	chr3L	7188666	3'	-	hobo	12	1	77.78
CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTG:1	+	chr3R	7482828	3'	+	412	424	2	69.86
AATTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATTTTCTGGCTAGCCCTTATAACTGTAATGCATAAATTAGCCTTTTACAAAGTCATAGATGATAACGAGAAAGCGGAGCTTGGGGGCTTTTAATTT:1	-	chr3R	13501523	3'	-	hopper	125	1	72.93
GCAGCCCAGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGTAGATCTTTGAGTCATGAAGGAGTAACACTTTTCAAACTTTTCCACCAAGCCACTCGAGTGCCTATGAGACACAC:1	+	chr3L	24153673	3'	+	baggins	5320	1	59.23
CATATTATTTCTTCATTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATAATCGGCTTATTAATATCCTCCAATTCTGGTATCTTGTC:1	+	chr2L	10015912	3'	-	invader4	3060	2	73.29
TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGGCTTTGGTCAATCACCTGTCGCCTGAAAGTAGGCAGTAAAAAGTGCCCCGAGGAACAGAAATATGTATTTAACGAACTAAGCTTGAGCTCCAATGCACTTAAAGAAATTAGGCAC:1	-	chr2R	18528630	3'	+	jockey	4985	1	74.66
AATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAAT:1	+	chrX	5437560	3'	-	Quasimodo	58	2	58.62
GCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAAAATATATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTTACATCGAGAAGAGCAGGGCGCCTGCGATTACCAATGGTATCAATGGATTTGGACTGGCGTAGCG:1	-	chrX	11066624	3'	+	1360	302	1	54.86
ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGAGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTAACTTTGGGCACTTGGCACGGTTCAGTA:1	+	chr3R	18582288	3'	-	roo	8666	2	75.78
AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCA:1	-	chr2R	19004117	3'	+	roo	9032	1	57.55
GATTCTGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGTTAAACTGACGACCCTTTTACGAA:1	-	chr3R	24383231	3'	+	rover	7238	2	58.90
TGTGACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGTGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTGTGCGTGTCTCGCCTGTTTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGT:1	-	chrX	7978948	3'	-	hopper	71	1	65.71
AAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGCTCATTCAGCCC:1	+	chr3L	17685245	3'	+	mdg3	5466	2	40.41
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGTTGGCTGGGAAAAGCACTTGAAGCTCTCTCTGCTTTCCACCGATTTCAGCTCACCCTTCGCAGGCTGAATTCACCGAGGACTATGGATTCGGTAGGCGATTCCTTCCT:1	+	chr3R	7835261	3'	-	roo	14	2	75.17
AAAAAATAAAAAAAAAAGTGGGAAAATCGGGAAAATCTGGCAAAGAGCATGAGCCAGTGGGAGAGGGACGGATGACGTCCTGGCTATAGGAGAATTTCATACAAGATTTCTTCAGATTTCAATCAG:1	-	chrX	11014286	3'	-	hopper	140	1	54.76
AAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATTCGGC:1	+	chr3L	12879801	3'	+	roo	405	1	56.90
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGTTCTCGTAGGGAGACGATTCGTGGTGGTG:1	-	chr3L	16343178	3'	-	roo	8683	2	69.63
TCTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCG:1	-	chr2R	20596440	3'	+	roo	363	1	52.74
ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCCTTCGGCTTTTGTATTCGTGTTCCCAGTTTTGCCATCAAC:1	-	chrX	2518024	3'	+	P-element	2834	1	48.57
ATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAAGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGGCAGCAGTCAGGCAAATAAAATTCAA:1	+	chrX	10201198	3'	-	transib2	83	1	79.26
AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGACCAAACCTTCCAGCTTGATCCCACGTGCACTTGCTATGGCGGCAAAGTCATCCCTCT:1	-	chr3R	1433126	3'	-	mdg1	7071	2	50.44
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATATGCAAAAGATAT:1	-	chr3R	18339070	3'	+	roo	9026	1	54.11
AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATTAACTACAATGTATTTGCATCTTGCAGACGATCCGACTGATCCTCGATGCGCGGCAATGGGAAATG:1	+	chr2L	21400390	3'	+	mdg1	355	2	60.27
GGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGGACAATTAGCAATGTTTTGTCTCAAAGCATTTTGTATAATGACAGAATTATACAAAAAATGTATGTTGAATTACGATGTTTTTGGATTTATGTTTAACTTTCTTAGA:1	-	chr3R	3953127	3'	-	GATE	31	2	68.49
ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTAGACTAATCTTTGTTCGAGAGTCTGCTTTGAGTATAGTTACCAGTT:1	-	chr2R	19499319	3'	+	P-element	2825	1	36.09
GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAAAAGTGTGGCACTGCCAATGAGCAGGTTGTCAGCCAGCCAG:1	-	chr2L	3114439	3'	+	roo	407	1	81.45
TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTTTCAGGCGCCTTTCTCAACTTTAATTTAATTATGATTA:1	-	chr3R	19589877	3'	-	BS	5018	1	65.97
GCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAA:1	-	chr3L	7292469	3'	-	HMS-Beagle2	57	2	64.93
TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATC:1	-	chr3L	27415240	3'	+	transib2	2737	1	78.08
GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATTTTTGTCAAGTCGCATTAAGGC:1	+	chr3L	13574516	3'	-	hobo	21	1	53.68
GAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAAAAAAAAATTTCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGCACGTATGTTGGAACCAGGCTTCAA:1	+	chr2R	5531171	3'	-	1360	123	1	65.62
ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTAT:1	+	chr3L	11530964	3'	+	roo	8996	2	69.86
CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTCGAGGGTGGGCACAGGTCATACGATACGCACAGAAATGCCTCAAAAAACAGAACGAACAAGGGACCGCGCAGTCCTGTAACCCGAAGCGTTGTCCTGCCGC:1	+	chr3L	22400399	3'	+	1360	3368	1	69.18
CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAA:1	+	chr3R	19968201	3'	-	roo	58	2	60.96
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTA:1	+	chrX	6486818	3'	+	roo	9036	1	50.75
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAAT:1	+	chr3R	25448417	3'	-	roo	81	2	72.60
CGACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTTTATTCCCTAATATCTATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACAAAAGTCATTGCTAAAACCTGACCACAGAGTACATTAA:1	+	chr2R	4886040	3'	+	INE-1	579	1	52.90
TTCCTTCAGAGCATGGCTCCAGTGGTCCCTTAGGTGCCCTACGTCCGGAGAAACATCAGCCGAGGAGAGTACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGG:1	-	chr4	146068	3'	-	Gypsy12A_LTR	1928	1	64.00
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTTGTTTGCACGCTAAAATCTTGGACTTCGTATTCGTCTGCGGTCTTGAGATCAAAAACCTTTGCTTGGTTATT:1	-	chr3R	14651164	3'	-	P-element	9	2	75.19
CAATGTATGGCCGTTACGCATCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGAGGCTTATTTTTACGTTTCGTCAGAATCCCGCGTAGGCCCCTCTATGCTAACACTTCATATTTTTCAGAGGTGGAATCATT:1	+	chr3L	23219339	3'	+	1360	3368	1	65.35
AAAAATATATATACATACATATGTGTATAAAAAACATAAAACAAAAATAAACAAAAAACTCTAAAAATGCCCCATAAAAAGACGAAGCATTTGAAAGCCGTGGTAC:1	-	chr2L	18676893	3'	-	1731	4413	1	71.70
ACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAG:1	-	chr2L	12290653	3'	-	1731	4362	2	51.37
ATCAATAGAAAAGTGAAAATATTCGATTTTACTTATGACCG:1	+	chr3L	12260523	3'	+	Max-element	463	1	90.24
ATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTCATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACT:1	+	chrX	21667924	3'	-	gypsy2	20	2	57.14
GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGCACTTTTCACATGATATGATTTCCCAGGCATACAAAGCATTTTTCTCCGCAAAG:1	-	chrX	3309624	3'	-	jockey	63	1	61.94
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTCTAAG:1	+	chr3L	22437968	3'	-	roo	53	2	55.17
TCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTTGTTTAATCTGTGTTTAATTAAAAGCTATGTTCTATACATTTAGAAAAAAAAGTAATTACCTATCTCATT:1	+	chr2L	5849303	3'	-	I-element	276	1	52.05
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGATCT:1	+	chr2R	23803036	3'	-	roo	33	2	55.05
TTATGGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCCACGAGTTACAAACAACTATATTGAATATATTTCTTGTGCAAATACTTATGCCCACTAGTGTACTCTCTGCTATGCAGGAGTATATGTAAGCTA:1	+	chr2R	1579457	3'	-	Cr1a	4191	1	62.33
GAGAAATAAAAAAAAATAAAAAACAATAATGATCAAAGTTTTTCTAATCTATATGGCAATGTTGTAAGTGATAAGAAATGGGCCCCCAGCTGGGCCTTTCAAACTGCGTCACTACGCTGGAAATGTTTTTCATTGTTCACTATATC:1	+	chrX	15113836	3'	+	Osvaldo	1519	2	78.77
AAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGGGTAGAAATATAAGAAGATATCGAGGGAGAAAGTGAAGAGGAGTGTCGAATGGGGTGAGAGTCAAGGGCCTTACAGGCATGAAATTTTTATTGTTATGTTG:1	-	chr3R	25454687	3'	+	Quasimodo	6973	2	70.63
AAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGA:1	-	chr3R	14049342	3'	-	transib2	56	1	61.54
TTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTAT:1	+	chr3L	8249116	3'	-	jockey	4535	1	57.83
AACGTGGCTGCTTTGCGCGCAAAATTTAGCTTAACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAATAAATCTATTTCTCAATCTTTTTCAGATGGATCCGCTCCTTCGGCTTTCCGC:1	+	chr2R	10093148	3'	-	hopper	1229	1	55.83
AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGAACTTTGTTAGTTGCACGTAAAATTCTCAATTTTACCCG:1	-	chr3R	12955415	3'	-	jockey	4684	1	60.61
ATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGACATCTCCAATCTACTGAAGGAATTCACCGTGGATTTCCTCCTGAAG:1	-	chr2L	3502467	3'	+	F-element	4388	1	67.81
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATT:1	+	chrX	8543515	3'	+	roo	8986	2	75.34
CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCA:1	+	chrX	8543513	3'	+	roo	8984	2	76.71
GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATGCGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGGAAGAGAGCATGAGCGTCGAAGAGAAAGACAATTTAAGAGAG:1	+	chr3R	18585688	3'	-	P-element	45	1	54.79
GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGGGGCTAAGGATAAG:1	-	chr2L	2794160	3'	+	Burdock	221	2	53.03
AAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAGAAACCCTATAGGAACCGCAAGGAAAACCTACATTTTCAACCTAAATTTATGCCCATTTAGGAGC:1	-	chr2L	19205107	3'	+	F-element	4392	1	61.00
CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAAGGGGTTTGTTTCCTATATATTCGATGATAGTAGTATCTTATCGTGCATAGGTAATTAAATACCT:1	-	chr2L	23068834	3'	+	1360	3335	1	59.59
ACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATTATATTATACCCCTTACTTGAAGAGTGTC:1	+	chr2L	23034089	3'	+	FB	393	1	48.63
CACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCTCCTTTGTTTTATTTAGCCTTATATTCTTTTTTTTTTT:1	-	chr2R	21297914	3'	-	jockey	441	1	60.26
CTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGAAAATATTGACCAAGAA:1	+	chr2R	13585487	3'	+	412	417	2	70.92
GTCTAAATACTTATGTCCACTAGTGTATGTATGCAGTAAAATAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAAATATCGGAGAAATAGTTTAGTCTTTATTCTTTTAATCTCAGCTTAAGACTAAAATCTTTCTTATACTGCCCTTATGTTTA:1	+	chrX	22926193	3'	-	Tc1-2	4	1	71.23
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATATATAAAAAATTATTTTCAAAATTATTAGCTGTGCCAAAAACAAACTTGGCTCTTTAATATGATATGTTAACCCATCCAATTACATATATTTTCAAAGTTT:1	-	chr3L	19334197	3'	+	roo	393	1	74.66
GTTTGTGAGATAAGCACACGAACTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTGTATCTGTGTGTACTGACGCATTACAGG:1	+	chrX	5629172	3'	-	jockey	104	1	70.33
TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTA:1	+	chr2R	11164530	3'	-	roo	8700	2	60.96
TCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTGGCTGGCTTATCATGCCAAGCCGGGAATTAATTAAATTCTTAGCGTC:2	-	chrX	13039463	3'	+	roo	408	1	78.57
AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGC:1	-	chr3L	21855441	3'	+	blood	7322	1	62.33
TTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTGGTGTGAGCATGATTATCACACCCATTTATAATCAGATTGGGCGGACTCCTCGCACTTTGCTGCAATCTGTTGATGATGTATCCTTATGCATTATACATGCGCAACTGACTGATAGAAAATT:1	-	chr3L	5257986	3'	-	Doc2-element	219	1	49.66
ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGTTAAATGGCAATTCGTGTTTTGTGCTTTGCGACGGCACAGTACAAAAAT:1	+	chr2L	18339097	3'	+	pogo	2068	1	61.64
GCTGAAAAAAAAAAAGAAAAAAATCAGCAAGTGGAATCAGGACTCCGCGTGGAGTGATTATTTTCACATTAACACAACGGCATTTTCCTTTCGGCTTTTTAACTTCCTTGAAAGAGGTACTTAACTTCT:1	+	chr3R	26822392	3'	+	G-element	4325	1	70.54
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATTTTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTT:1	+	chr2R	11164511	3'	-	roo	8678	2	64.76
GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATGGAGCCAAGGACGAGTGGAAAATTAAAATATGTAGCA:1	+	chr3R	7482883	3'	+	412	7535	2	76.92
GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTGG:1	-	chr2L	15833440	3'	-	jockey	17	1	69.00
AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTA:1	+	chr3L	3477507	3'	+	mdg1	370	2	65.35
CTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCATAGGATTCTCTAAGATACCAATATATAAATCCAAACTATTCAAACCATTTGTTCTTAATTGATCTTTCCTGCCGTAA:1	+	chr2L	572731	3'	-	1360	380	1	52.74
TACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGATAGGTTAAAAATATATAATCAATGAAACGTTTCATTTAAGAAAAGGTCTGATCAAAACAAAACATTCACAATATATCCGCTGCCTTATGAAGTGAGTGTTGTGGGCGGTA:1	-	chr2R	14721995	3'	+	Porto1	4245	1	44.52
GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATA:1	-	chr3L	23728629	3'	-	HMS-Beagle	29	2	58.68
CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTT:1	-	chr2R	13585397	3'	-	412	52	2	53.42
AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACAGTCACATAGTTTTA:1	-	chr3R	9210628	3'	+	mdg1	7397	2	61.27
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGGGTACCTTGCAA:1	+	chr3L	20654586	3'	+	roo	9024	2	51.37
AATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAGGGTTGTTTACTATGATCGTTCCTTGTTGAAAGGAATAAGCTAAGCTACTCCACAAAATAGTGATACATTTCAAG:1	-	chr3L	23246535	3'	-	1360	401	1	58.14
ACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTAGTGGTGGGAAGTGTTTCGAGTGCTAAGTGCGATGGACACAACAGCTGCTCTCCTCGAAACTCGGAATAGTCTTCATCATCAACTTTAGCGGCATCA:1	+	chr2L	21930517	3'	-	Copia1_DM	135	1	72.87
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGT:1	-	chr3L	16343215	3'	-	roo	30	2	55.96
GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATCTAGTATTTCATATTTTAAGTTTTAATCATTTGGTTCCTTAACATTGAATTGGTTTAGTTAGGTTAATTCTTATACATTATGTTGTT:1	-	chr2L	8986092	3'	-	412	33	2	61.38
ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGCGATACAGTTAGGAATATTTGCGTTGGCTACTCGGGAACTAAGCATATATTTTCTAAAA:1	+	chr3R	31817542	3'	+	roo	347	2	61.64
ATTTTGTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTCTCTTTTCTCGTATGGGGTCGTGGCCGCCAGGTAAGAG:1	+	chrX	5700863	3'	-	Porto1	188	1	90.41
GGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTCTTGC:1	+	chr3L	11321508	3'	-	mdg3	5283	2	52.50
CCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCTAAAATCACTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCAAAGGAACTGCCGAAATCCAGTCAAGCTTGGCAGCGAA:1	+	chr2R	13443555	3'	-	R1A1-element	5122	1	65.81
CGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGGAGTAGTTATTGCTATACACGTTACTCGTGTACTAGTTTATTGTTTT:1	+	chr2L	9399532	3'	+	Transpac	5165	2	67.15
ATCATTTTGTTTGAACAACCGACAATGCGACCAATTTCAGCGTAGGTTTTACCTTCAGAGATCACGTTTTTAATCAAATTTCTTTTTTCTTACTAACTAACTAAGTCTCTAACTACATGGTCATAACAACAATGCTTTAAATCAGA:1	-	chr4	1027618	3'	-	Tc1	453	1	60.96
ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTAATTAATTACTAATTAAAATGTCTGGAAGGGAGTAATACAATTGGGAAATATTTCGTTGCATACATTTAGGCGAATTTAAAGGTAGTTTAGGTCTATTTCTA:1	+	chr2R	16248045	3'	-	BS	17	1	65.07
TTTCATTACATTCTACTTTTTCACGAACAAAATGATACTTAATATCTATGTGCTTAGTGCGCTTTTAATTTCTTAAAATAGCGTAACGATGTGAAAGATGTGTACATCTTCAGTTTACTTGTTTTTAAAT:1	+	chr3R	7000035	3'	-	Copia1_DM	4160	1	53.85
GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAAT:1	-	chr2R	9325384	3'	-	BS	5028	1	47.01
AGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGGGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTCAAAGAACCTTTATGTAGCGGCTAATTTCGACATGTGGTCGG:1	+	chrX	11692399	3'	-	F-element	4500	1	64.80
CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAA:1	-	chr3L	4536704	3'	+	roo	8999	2	66.21
GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCG:1	-	chr3L	12861698	3'	+	pogo	2055	1	56.43
AAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTGTTGTCATTGTCATTGAAATGCATTATTTTGCCATTGCCTGCATTTTAATGACCACAGAGGTTTTTCCTGCACTC:1	-	chr3R	25423184	3'	-	3S18	5799	2	55.64
GAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACGTCTTAATATATTCGTAACTTTTTACAATAATTCAACTGATAACAAGTTAACATTTCTCATTGATACTGGTGCAGATATCTCACTTTTAAAAGTTAATTCAGA:1	+	chr2R	24432991	3'	+	opus	368	2	70.55
GGAACTCCACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAAATTTGATTATTATTTCTTGGACTGAATTCTCGTTTTATATTAGATTCTTGACATGACCTTTAAGCTTAGTCTTTATTAGGCTAACGGCTAAAGCTTCAAGCGATTCCTTCAGC:1	+	chr2R	332538	3'	+	INE-1	573	1	26.03
AGGTAGATGGTCTTAGTAATTAATATTATATTTTATGTAATCACGAAATTTTTATTTCTTAGGTTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCATGGCTTATTGTCAAGGTGATGCCATAAGTCATAATGTCTGCTCAACCTTAGCCCTCCA:1	-	chr2L	6627015	3'	-	Burdock	422	1	59.59
GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATTTTTGTCAAGTCG:1	+	chr3L	13574507	3'	-	hobo	28	1	56.99
AAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAAT:1	+	chr2R	16945341	3'	+	jockey	4910	1	74.10
CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAAAAAAAATGCAAGCGCCGAGTTGCAGGCCTGTTCGCATAATTGTATTGCATAATTTTAGCACGCGCCCAGTCCCCAGCCC:1	+	chr2L	15833550	3'	+	jockey	4966	1	54.14
GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATAATATAATAATAATAATAATAATAATCCAATTTTCACGTGTTGACTTACGTGTTGTGACACTTGAGTTTGGCCCTTGGGGAAAT:1	-	chr3L	18596586	3'	-	Doc	44	1	44.52
ATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTACCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTAACCATCGAAGAGTCGGGAGCTGCTATC:1	+	chr3R	11496587	3'	+	1360	3327	1	76.52
CCTGAGATCTAGACGTTCATAGGGACAGATGGGCATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGATCTTGATCAAGAATATATATGCAGTACTTTATGTAGTCGGAAACGCTTAAATGTTATAAACGAAATCCTTTTTAA:1	+	chr2R	5198428	3'	-	INE-1	137	1	76.87
AACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACATTTTAATTAGTTAAATCTACACGATACCC:1	+	chr2R	9538300	3'	+	opus	399	2	75.41
TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCGGATTCAACTTTT:1	+	chr2R	17626915	3'	+	opus	467	2	59.41
GGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGATTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGGGACGGCAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGTTATACACTACTTTTTTGTTGTTTTAGTCTTT:1	+	chr2L	17431665	3'	-	Cr1a	4059	1	78.08
AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCGCA:1	-	chr3L	21855440	3'	+	blood	7323	1	61.64
AAATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCAATCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAACTTTATCGTTG:1	+	chr2R	4659362	3'	-	S-element	1474	1	45.67
AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCGAGAACGGTTGATCGCCATAAATTTCATATTTAACATTTCTTTGCAGATTTAGATTCAGTCTTCA:1	-	chrX	21014777	3'	-	copia	57	2	57.53
CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTGAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAA:1	+	chr3L	3477508	3'	+	mdg1	364	2	66.42
ATCGCCTCAAATTGAGTTAAGGCGCTCTGAAAAATGTGTCCCTTTAAAAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGG:1	-	chr2R	4802882	3'	-	mariner2	532	1	70.77
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTATGTATGTAATATAATCTATCATTATTTATATGTATGTACATACAACAGCTTAATGCAAAAGTTAATGACAATCTATCACACTGCTTTATTTTTCAGGCAATCAACT:1	-	chr2L	17420104	3'	+	roo	393	1	72.60
ATCTAATTATGTGTTAAAAAAGTTAGAATTGAAGAAAATAAAACCAACGAACGCTGTTTGGATCAGCTATTTGCGGTTTATCGTCCATATTTAAAGACGTGCGTGAGTTTGTGTACATTTTTGCGTCAATTAAGTTTCAACTCTC:1	+	chr3R	27814806	3'	-	Cr1a	4275	1	64.83
GCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGGACGGCAACA:1	+	chr3R	27424920	3'	-	blood	94	2	68.97
CTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTG:1	-	chrX	10521640	3'	-	Tabor	6911	2	64.38
ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACTACTATACACTTTTGGTGCTATTAACCCGTTCGATTGGCCAAATATACCATCCCTTTGCCATTTAGCTTCGTCGAGTTAACC:1	-	chr2L	1305299	3'	+	copia	230	1	47.73
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCT:1	-	chrX	5643458	3'	+	roo	9027	1	54.11
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAA:1	-	chr3R	25448327	3'	+	roo	356	2	52.74
TATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGT:1	-	chr3R	17243136	3'	-	hopper	87	1	73.29
CTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAG:1	-	chr2L	12290659	3'	-	1731	4367	2	53.10
GAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGGGTAGCAGACAACAAATGTGTTGTTGTGATTAATAAAATTACACGAAAGGAGACGCAGACTG:1	-	chr3L	1916913	3'	+	micropia	5327	2	51.54
CTTTTAGTTAAATTTATTTTTTGTTTAGTCCCGGCCATCAGATCATTCAATATTTCTGTTGACGTCTTTCCTGGGAACTGTTGCTGCTGCTCGGTTACTCGCTGCG:1	+	chr3L	20234081	3'	-	gypsy2	437	1	68.87
TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGTGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCTCAC:1	+	chrX	16717914	3'	-	roo	8721	2	74.36
GCGGTTATGGTTTGTGCAGATCGAAGCGCAATTTCAATGCAGCCGCATTTCTTCAGATAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATTAGTGGTGATGGATTAATTTTAAATTAAGTAACCAGAGCCATGCA:1	-	chr2R	25137027	3'	+	Chimpo	377	1	68.97
CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATAAAAAAGTGCAACATTTTTCTTTAAACACTATTTAATCAATTCTTC:1	+	chr3L	18369009	3'	-	opus	57	4	68.42
GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCC:1	+	chr3R	14979907	3'	-	pogo	3	1	77.57
CAGAACGATTTCTTTTGGATCCGCTAGCTGCTCTGATAGCTTTTTATTTGTTGTTACTTATTACTTTGCAATAAATTCAGACGTATGCCTTTCCTCATATTCTGCAAGAGACATCGCGG:1	+	chrX	21370665	3'	+	G5	4807	1	75.63
CTTGAGGAGAACCAGGAGATGATGATATTCTCATAATTGTTATAATGTTAATTGTTATATTCAGGGATACACAGATATTTGATCGCCAGGTGAATGATGAATTTAGAAGCATTTGTGTGGAAGAGCTTATAGCAACTTCTAAGATA:1	+	chr3L	24152116	3'	+	BS3	1600	1	57.53
AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTATATTTACTAAAGCCGTACATGATAGTACAATACCATTAGATCGCATATCTACTTACAAGAAACTAATAAGACTTTGTATTTTATTATCTCTTACAACTTTCCTAATATAGCTA:2	-	chr3R	5061780	3'	-	mdg3	5258	1	80.82
TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAG:1	+	chr3R	22822151	3'	-	mdg1	10	2	52.42
CGCCGCAGTCTGCGTTGGTAAATGCAGCTGAGTAAGTTTGTTGATCTGAAATTTTTTGATTTACAATACA:1	-	chr3L	23452014	3'	-	rooA	7454	2	57.14
TCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTCAGCCATCTT:1	-	chr3L	2325707	3'	-	I-element	5116	1	54.76
AATTAAAAAAAAAATAAAGAAAGAGGAAATGAAACTGTCAGAAATGCTCCCATAACAATGTCAGCTGTTCGGCAGTTCCGTGTTTGGCAGCCGAATTGCTTGTTTACAAAGCTTC:1	+	chrX	12784095	3'	+	Doc	4700	1	56.52
ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGAGCTAATTGTTACCAGTTCTCCTCAATTTATTAATCATATGTTTGGCAT:1	+	chr2L	544863	3'	+	412	422	2	67.81
GAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGTCATTGCTTTATAACTTTTTGTAATTTAAACAAAATATCGAAGAAACGAAATATTGTCGAAGCTTAGGAATATGAAACGA:1	-	chr2L	14609440	3'	-	Doc2-element	451	1	54.79
GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTTTGGAGTGTGGCAAATAAATTGACATTTAGCTGGGCGTGTAACAAGATCAAGTATACGCAATGTCGCCCACG:1	+	chr2R	21920599	3'	-	jockey	32	1	61.16
ACACACACACATCATTGCTATTGTGTGTAAACAGTTTGGTTACCGGTGCAAATACAGTGCTTGTAAAACTGTTTACCGGATCCTTCGTTTGACTTGGCTCACGATTCCCTGGAGGAACTGGATCTCAGTCAAAT:1	-	chr3L	25412359	3'	+	G3	50	1	47.01
GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATTTAGCTCATAGTATTAATGTATGAGGGTTCGTACAAATTAGATTTTTTTTTACTGTTTTTGATTAATTATTACTTCAAAAAAGGTGT:1	-	chr2R	13121962	3'	-	pogo	30	1	54.11
AGAACAGTTGGCTCAGTACGTGAAACATAATATCAAAGTGNTGACCCAGCATTGGGCCGGTGAGAGGATGCTGTGCGGGTGTCTGAGAATAAAACAGAAATCCC:1	-	chr3L	5342497	3'	+	Gypsy6A_LTR	23	1	54.81
AGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCACGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGATAAATATATGTATAG:1	-	chr2R	15005086	3'	-	jockey	97	1	77.40
TTATTTGTTTGTGACTGCCAAAACTAACAAAAAATCGTCTTGTCACCTTAATACCGTCAAAAACTTTCAAAACGGATTTAAAATGAATGCAGCAGAATGCATTCATGAAATAGATAGATGAATTTTATGCGATTTTGGGAG:1	+	chr2L	17551110	3'	-	Transib-N1_DM	213	1	43.97
ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACAC:1	-	chr3R	10462622	3'	+	opus	433	2	72.26
AAATCCGTGGCCCACGTGGGAACCCCTTTCTTTAGCTGGGGCCTCACCTAGGTACAACAAATCGGGGGAGTGGTGCGAGGCGCACTCGGACTCCGGAAACGTTGGATGGGTGCCCTCCCACTATGTCACGCCGCTCAATTCGCTGG:1	-	chr3L	16628793	3'	+	Rt1b	307	1	63.01
TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTTAAGCACTTATAAGTGTAAGTACCTTGATTACCAAATTTCTTCATTCAATACTCTCATTTCCGTATCCGGTGCCTTAAAATGCCTAAATTCCTCGGAATAAC:1	+	chr3R	25454149	3'	-	Quasimodo	12	2	63.70
CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAAATAAATA:1	+	chr2L	22685195	3'	-	Ivk	65	1	60.27
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGAAGTTTTTAAAACGTGAGTGCTCATGCAATTCAATATGTTTCTTCCA:1	-	chr2L	16091869	3'	+	roo	9036	1	56.85
ATTTAATTGACTAGCGTACTATTACCCTTTCTGGGCAACTTGATCTAATCGGTATCAATTTAAACGATTTTTACTATTTAAGTTATTTAAAAAGATTGGATATGGCGAAAATCAAGAAACTTCAAAAGTTTTAACAAATAGTTTAT:1	-	chr4	1174825	3'	-	jockey2	3368	1	67.81
TAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCATTTGAATCCAAAATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAA:1	+	chr3L	14944652	3'	+	G5	4784	1	52.05
TAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTCCCGTTAGTTAACGTTGCGTCCTCTTTGTGCGTGG:1	+	chr3L	23797610	3'	+	Doc	83	1	76.03
TTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTTATTTTCTGCTACCAACGTCACTCATCCATCTTCGCCTCAAATCGTTCGTTATCAATTGTTAGTGAACTTATCAGCA:1	+	chrX	12469336	3'	+	S-element	1672	1	55.48
ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGAAGACCGACTACTGAAGCTAAGAAGAAGCAATAAAATTTTGTTTTTTTCTACACATTTTTATTTCATTCCTCATT:1	-	chr3L	21817957	3'	+	roo	9026	1	52.74
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGTGCACTTGGCA:1	+	chr3R	18582278	3'	-	roo	8694	2	62.33
CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGACCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATC:1	-	chrX	10644411	3'	-	jockey	4803	1	53.42
TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTTTGGTGCTTTGCCGGCTTTGTCTGCATTTGCCAGGCATTTGGAAAATG:1	+	chr3L	21855523	3'	-	blood	63	2	66.67
ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCATTGGATGGTGCCGCGCCAATTGCCCATGTTTATGCAAATTAAAATATGTGCAATCAAATAGAATAACATGT:1	-	chr2L	14892198	3'	+	transib2	2772	1	54.11
ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGGCCATCTAAATTAAAACGTTTTTCATCAGTTAAGACAAATGAATGCCAATAATTTAGACGAGTGTCAGATTGGACATTCCACGTCATGTATTCC:1	+	chr2R	6487984	3'	+	copia	230	1	65.97
AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGTCATCCGTTTCCGGTTCTTCCGAATTTGTATACAAAATGAAAAACTGAATTTGGGT:1	-	chr2R	16785328	3'	+	412	7483	2	60.27
AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACTTCGGCTTTTTGTTTTTCGTATTTCGGCAAGAGAGCAG:1	+	chr2L	16016444	3'	-	412	7087	2	62.33
GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTGCCAGCGAAAATACCGTGACAATTTGCAATCAGCAAGCATTCGCTGGACTCTTTGCCATCTGA:1	-	chr3R	10182080	3'	+	blood	7362	2	66.44
ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATCACTAAGCAGTTAAAA:1	+	chrX	13504245	3'	+	412	7536	2	60.00
ATATTATTATAGATAGTAATATCTATTCATGGTGTAGTATAGTGTATTCATTCATATAGTAGTATTCATAATATTTTCCCTCAGTGCACAACAGTAACATCTCACCCTCAGCTGAACAGCATTGTGGATACTTTGCGCTTTTG:1	+	chr2L	3588647	3'	+	Tc3	283	1	78.32
TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGGACAGAACGCCTATCCCATCGCACTCCCATGGCTCTTAATTG:1	+	chr2R	9791696	3'	+	412	7502	2	54.79
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGCAGGAGAAGGTACTATATAATTAGCTGTAACCTTTAACCCGGACAACCAACTATGTTAGCTCATTAACTATGTTCATATAAATTTAAAAAAAA:1	+	chr2R	13817758	3'	-	412	7070	2	70.37
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGCATGA:1	+	chr3L	11531018	3'	+	roo	387	2	69.86
CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTATAAATTATGCATTTTATATCCACAATAGTTGTTACACATCGCTAGGGGTATGGTTGTTGTTGCCGCATCTAATTGTGTGTGTTCTTACACACGCACTAACCCATGTTTA:1	+	chr3R	20427523	3'	-	jockey	18	1	77.40
GACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCGGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATCACTCAGCTTGGACTCTACGGCCTGGATATCCATGATGTCCA:1	-	chrX	11138058	3'	+	invader2	4820	1	71.03
ATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTTAACCTAGAATTG:1	-	chr3R	9714336	3'	-	Stalker	16	4	74.48
ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGCGCACCAAACGTATAAAACCC:1	+	chrX	2518084	3'	-	P-element	33	1	21.79
GTTTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAGAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACATAGTGCATTGGCTTTAAAAATGGCTTACGAACCATTAATGCG:1	+	chr2L	5845052	3'	-	transib2	89	1	75.34
ATCCTACACACACACACACACACTGAAATGTCGCCAGGTGTGAAGAGAAATATTATTAATAATATTATTATTAGTATAATAAATGTGCATGGTACTTTTTTCGAAAGATATCAAAAGTTATGTGCTTCAGAACTTTGTTT:1	+	chr2R	14445551	3'	+	accord	253	2	58.57
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTT:1	-	chr3R	19968100	3'	+	roo	9050	2	57.69
ATTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTCTTCATCGATTCGAGCCGGTAGATGATCGATAGAAAATCGATTGTAAAAAATGAAGAATAGCAGCTACTCGTCTATACCCATCTAATTTAAAGAA:1	-	chr2R	330908	3'	+	S-element	1541	1	66.44
CTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATACAACTGCGGCGTAACATGCATGGGTGTCTATGGTTTAAGATAAAGGGGGTTCGTAACTAAAGTCTAGAAAGGGATATTTGCTCTATAAGAAATAATAGCTACAAATCAATGT:1	-	chrX	12074463	3'	+	412	484	2	68.49
CATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTC:1	+	chr4	158192	3'	-	1360	478	1	69.29
AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTTATCTATTATTATTATTATTATGTGTACGTGAAGATGAAATCTACAATATAT:1	-	chr3L	17560283	3'	+	pogo	2034	1	65.75
TACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACATGCTTAGCTT:1	-	chr3R	9714348	3'	-	Stalker4	6985	4	65.75
TAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTCATAAAATTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATCGTCCGTTTTGCTTTT:1	+	chr2L	5460078	3'	+	Dm88	25	2	68.49
CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAACTAATGGAAGTGGCTGGGTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATACAAATTGATTATTTCTATCGTGGGTTT:1	-	chr3L	15995957	3'	-	297	47	2	72.00
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATGTTTTACAATGGATTACAAGCATTGTCAAAATATATACA:1	+	chr2L	17420289	3'	-	roo	14	2	69.18
AGACTACTTTTAATAAATTTACCTTTCCTTACCGAATTGTTAATTGTAACTAGCGATTTTTGGGTACTTTCAATTTATTCTTGCTATATAAAATAGCCTGTGTTATAAGACATGAACGTATTG:1	+	chr2L	21272353	3'	+	Cr1a	3983	1	71.54
GTAAAAGGAAAAAAAAAAAGGATATCATGGAGGCAGCACTGCGAAAAATGAAGTCAATTATTTGAACAGTTTAAAAAAAATGAACCTAATCTATTGTCAGCATAGTGACACTTAAATATCGAATT:1	+	chr2L	1575788	3'	+	Doc2-element	243	1	68.00
TTCTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGGAGAATACGGTTCGTGTTGTATGTGCAGACTGGGAAAATGTTTCAAAATGCCTTA:1	-	chr3R	5125545	3'	+	HMS-Beagle2	481	1	32.91
TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTAATTATGCAAACTAATTAAAATACTCATACGACGCGTTCAACTTGCGCTTCTGTTACTGCCAACCCCGCCCCCATCCTTTTTTGGCGCC:1	-	chr2L	15991694	3'	-	mdg1	47	2	70.87
GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTATAAAAGAATGAAAAGCCAACGAGAAGGAAAACGGGGAGGAAAAGGGCCAGGCCAGGCAG:1	-	chr3L	4755216	3'	-	jockey	4689	1	56.57
GAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAACTTAAACGCTGGTCCATTTT:1	-	chr3L	17685075	3'	-	mdg3	5257	1	54.81
TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCTGTGGGTTCCATTGCGAGTTGAAACTCGGTCTTCTTCATTCTAGAATTAAGTGCCGCCGCAGCAGGAGTCGCAGGGCCAGTCG:1	-	chrX	5662834	3'	+	P-element	2873	1	72.13
CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTG:1	+	chr3L	9998169	3'	-	roo	8755	2	80.82
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAGTGGTTTTTCGACTCCATTTATTAGCATCTTTTTCTATAGATTTATAAATGTACATAACAATTTTGGATATTTTCTCTGATTTCAGAACGACCAATTTGCGCAACCAAACG:1	-	chrX	5643425	3'	+	roo	397	1	75.34
GTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCGTTTTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAATCTCAGGGATTAAGTCAATGTTTGAAAACTTCTAGCTGACTTGCGCCCCACTACCAC:1	-	chrX	525975	3'	+	diver2	4692	2	60.69
AACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAATCGAAGCCTTTACGCATACATACAAAGGGTTATGGGCGAAAATGGAAGGATGTTAGAGAACTCTGGGAAAATACGATTCGCAGAGAGGGCAG:1	-	chr3R	17460434	3'	-	jockey	187	1	67.16
AAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAATATAAAGGGTAAGTTCTACTGTCAGTCCTTCTCCTTAATCAACCTAAAACTCTAAGCTTTAAGTGTAAATACACTGTGTA:1	-	chr2L	4532031	3'	+	roo	8748	2	52.05
GTGGCGCAGTCAGTAGGATGATACTACTTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCTGTAAATAAGCTTGTCTTTAAGGGGGACCTCGCCTCATCATCACGC:1	-	chr2L	9805223	3'	+	rover	366	1	56.52
AAATATAATCTAAATATAATTCTTAGGCCATAGCCACGACATCTAACAGTTTCAAATCACTGTTATAATGTCAACGGAGATGTTTAGTCACAACTTTTTATTATCATTGAGTGCTTATTTTAAAGCGTTTATTGTTATTGTTATTA:1	-	chr3L	26697880	3'	+	gypsy7	185	2	69.86
ATCGCTCATCGTATTGATCCGACTATTTTTCCTTGCATGTGATAATCGGTCCCTTTTGTAAAGTTTATTCCATCATCTTGCAACACGACGTATTCGGCAAACATTCAGATTCATTT:1	+	chr2L	9557766	3'	-	transib2	2351	1	61.21
GAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATG:1	-	chrX	21585269	3'	-	mariner2	274	1	55.65
AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGGGTGTCG:1	+	chr2R	19540449	3'	+	jockey	4954	1	60.18
GGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAAAGGGGCATGCCACGCAGTGCGAAGTGATGGGCGTAAAAGCCCAAGCGCATGTGTGTGTGTGTGGAGGGAGGTGGGAGGATGTGAAC:1	+	chr3L	22917723	3'	-	jockey	4759	1	77.98
TTCTCGGTTCCAAGTAGATTCACACCACGGAGTCACTGTCCCTTCTGACCACGCCAGGTCCTTGTGTTCCAATGCCTCGATGATCTCTGCGTTGCTCCGTTTTTCACTTGCAAAGCACAAAGGAATTATTCTGTCACCGATAAGGA:1	+	chr3R	2543810	3'	+	Cr1a	4103	1	76.71
TTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGCCTCAAAATAGCAGGATGAGTCATGAAGGTCTTAAACAGCTAAGGATGCTCTATTTAAATTAGTTATATACTTTTTTATTATACTTAGCTATTTTGTATACATTATC:1	-	chr3L	22968285	3'	-	mdg1	15	2	75.34
AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTC:1	-	chr2R	9791603	3'	-	412	7104	2	72.07
TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTG:1	+	chr3R	22822143	3'	-	mdg1	7075	2	41.26
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAACAGCAGCAACAACAGCAGCAACAGCAGCAGCAACAACAACGACATC:1	-	chr3R	8165794	3'	-	roo	8712	2	53.42
AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACACACATTAAATATTTATCTGTGTGGTTTGCTCACACCACATGCAGTTGGCGAATAGAATTATATTCC:1	-	chr3R	12717723	3'	-	297	52	2	60.27
AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTTGAACTGCGTTTCGCGGCATTAAGTCAGGCCACCTATTTTTTTTATTTTCTTCTTGGACTTCTTCCAGAAGCTTTTACCTCGTCCAAGTGAAATGAGTGATTTTCGTGGC:1	-	chrX	10253135	3'	+	hopper	1413	2	81.43
CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGCTGATTGTGTAAGATGGCATTTCCATATTTGAATGCACTTACCTTACGCAACTCTAAATTCAATAATTTTA:1	-	chr3L	22914271	3'	-	jockey	4787	1	53.42
AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTTACCCTTAGTGATTTTCCAAGCCACTCGGCGAACTCTTGA:1	+	chrX	11296458	3'	-	BS	5013	1	55.29
TCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCAAAAGTCTTCATCCGCCACAACAGATTCGGGCAACTGTGGATTGAGCAGCCGCTGCAACG:1	-	chr3R	15368103	3'	-	flea	4934	1	56.67
ATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAA:1	-	chr3L	7292438	3'	-	HMS-Beagle2	28	2	66.91
TGGTCAATTAGATGATGATGAAATCGTGCGCTCTTTAGTTCAAGATGCAACGGTAGGTATAGGTGGGGTCCTCCTCGACATCCAAATCTATGATGGCCATTGGCGGATTCTCTAGGACCT:1	+	chrX	10594958	3'	+	pogo	1624	1	57.50
AAGGAGTAGACGCAACGTAGTTACAGAAAATGATAGAATGCGATCAATTTTCGCGACGTAGAAGAGAGCATACTCAGTTATGATGGCACTAACACTATTCCAGCCGAAGTATGGATAGAAGAATACGAAGAACTGGCGACG:1	-	chr2R	1340873	3'	-	gypsy5	6884	1	58.16
AGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTGTTAGTCCAAGGGAAAATTTTTCCAAATGAAATAGAAGTCAAT:1	+	chr3R	9714498	3'	+	Stalker4	365	2	54.79
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCCTAAACTTACATTTACTGCCATTGTTTATGTTAGTTA:1	+	chr2R	18336222	3'	+	roo	325	2	76.39
GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATTCCCCAGCAATTTGGCACCATTCTG:1	+	chr3L	10574431	3'	-	Tabor	8	2	71.23
GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTATTTT:1	+	chr3L	23866742	3'	-	copia	4923	2	60.27
GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCATTCCATACGATTGAACTTTTTTTATGTTGCGTGG:1	+	chr3R	18585647	3'	-	P-element	86	1	25.34
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTTGGCTCGCAAA:1	-	chr2R	13084606	3'	-	roo	8726	2	71.20
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCAA:1	+	chr3R	19968227	3'	-	roo	23	2	68.61
TGATTAATATTATATTATTATTTCACTAGCAAGTTACACAGAAAAACACTTTAATAACATGGCTCTTAGCGCGAAGAAAATTGATAAGATTGAGATATCCTGCCCTTGCTAGCACATAGTAATAGTTTAGGGGCTTAGTACCAAAA:1	-	chr2R	17090729	3'	-	invader3	5051	6	54.11
AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAACAGAAAGCAGGAGGGAAGCCAAATCAGAAATAAGAGTGCTCCCAAACTTGGGAAAAGTA:1	+	chr3L	12970063	3'	+	jockey	4945	1	53.17
GAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCTTCCACACAAGTAAGATACACAAAAACTC:1	+	chr2L	9906509	3'	+	invader3	5421	2	75.58
AGTGAAACGCGAAAAGCGAACAATTGATTAGTTTAATACCTGTGCAAATTTGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGCGGAATACCCTGTAAAGGACATTATAATAGTAGTTATTTATTGTTAATAACATACATAATATTGA:1	-	chr3R	14830082	3'	+	HeT-A	187	1	54.86
AGGGATATACATGTATGTATATGTATGTAGTGTGGTATTTCGGGCCTATTTGTTTTTATTGCCCCAACTATGAGCCCTGTGTTGGTCTATGTAATTTTTGGCCTGCTCCTATTGCCTTTTGATTGTTTGTAATGAGCT:1	-	chr3L	10162978	3'	-	INE-1	70	1	78.26
CTAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCGGACGTAGGGTGCTTAAGGGACCACTAGAGCCATGCTCTTAAGGAAAGTGGTCTTAGGTAGGGTAGGGCAATACGCGAACTGAAACTGGCGATGAAATAAACGATAACAGTGAGCAA:1	+	chr3R	3286150	3'	+	gypsy12	9829	2	74.66
GAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACACTCGCTGGTT:1	-	chr3R	9038877	3'	-	Juan	4020	1	75.34
GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACTAACAACCGAGACTTGTCATTGGTTTTTGCAGCTATCGCTGTTGACATTTTG:1	+	chr2L	15991397	3'	+	mdg1	7454	2	66.27
TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAACTATATTACTGAGCGAATACATATTGTTGTGATATAGATAGATAACACTTCTATATTGCATACTTTCCTCTCTTGGCTTAGCTTTATAT:1	-	chr3L	13845094	3'	-	opus	21	2	55.07
AGAATGTACACCTAGCTCACTCTCTCACTTGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGGAACTGGAACCACTCCTCGGGCAGGAATCCCAGACGGACCTTGCCGGGATGCTC:1	-	chr3L	9730398	3'	+	invader3	136	2	52.21
AACATTTTATAATTTTTTTTTGAAATGTATAGGACAAGATGGATACAGTGACATTTTAATAACCTAATCATTAGAAAATAATGATAATTAAATAATAGTAATATTCAAATTAGAGTTTAGATATTTCTTAAACTTTGAATATACC:1	-	chr3R	20179707	3'	-	Tc1	52	1	17.24
ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAA:1	-	chr2R	16891865	3'	+	hopper	1382	1	69.14
ATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAAATAGAACAGTTGGAAAAAAAGAACGGGCGGCAGCGGTGGAAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTT:1	+	chr2L	19479165	3'	+	F-element	4550	1	39.45
GGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATTCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACACATTTGTAACTACAGCTTTGCACAAACAATATTCAAAAAATGGTGTAAGATTTG:1	+	chr3L	19014002	3'	-	invader3	5240	2	59.69
GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCATGCGACACTTGAATTCGACAGCTTAGTTACTTGGGCACAAAGAACACTTTTTTCAGATTCGCTCTGTAGGTTAAACCCTTGATCACAACAGCTATTAACATGTTCCTAAT:1	+	chr3L	4536842	3'	-	roo	8676	2	72.60
ACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGCATCTTGATAATATAAAAAGTATTTCTGAT:1	+	chr3R	26659822	3'	+	HMS-Beagle2	7109	2	79.14
ATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCGATATGGGAAAAGCAAAAATTTATATTTTACACTTTA:1	+	chr2L	12290743	3'	+	1731	4546	1	71.72
TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGGTCGCCGTGGACTTGTGGTGGCAATAAAGTAGCGCGCCATAAAAACCCAAAGTCAACAAACGATTCCCGCCCAGAGTCGCAGAAATCG:1	-	chr2R	24218494	3'	-	412	7085	2	61.64
ATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGTCATTGCATTGCACTATAGGCCACGCCCAC:1	+	chr3L	8249129	3'	-	jockey	4572	1	53.38
ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTAC:2	+	chr3L	20654579	3'	+	roo	353	2	55.48
GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAGGCTAAAATTAAAATAGCAACGCCAGAG:1	-	chr2L	14771988	3'	+	roo	402	1	78.52
GGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATGTACAACAATCGCTGTTAAGGCACCGGTATCGTTTTCACTTATCCATTTACGTGAAAAAAATAATAATAATAATAACAATCATA:1	-	chr3R	25554216	3'	-	micropia	4995	4	55.86
ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCACATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATT:1	-	chr3R	22217839	3'	+	hopper	1351	1	57.53
GGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAGGGCATGGGAGTGGAAAAGGGGTTGCGGCGCAAGGACGAGTTTATATTTTGTGTAG:1	+	chr2L	6570020	3'	-	jockey	4855	1	60.84
TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATC:1	-	chr3R	9038903	3'	-	Juan	4039	1	60.43
GCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATATTGTCATCGGTAGGAAAAGTCCACCAGG:1	+	chr2L	20634170	3'	+	Stalker	7050	4	74.55
ATTGAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGGAATTCTCTACACATTTTGCTTTCCTACTTTGTTTTGATCTTTGTAGATGGAATTGGTCACTTAAATTTCTCTAGCATGAAAAAG:1	-	chrX	22558896	3'	+	S-element	160	2	63.01
CTTATTATTATGGTTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATA:1	-	chr2L	15991307	3'	-	mdg1	7104	2	63.01
TTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAA:1	-	chr3L	7292438	3'	-	HMS-Beagle2	6921	2	62.33
AAATTAATTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATAACATTAGTAATTCTTTCTTAAAACTAAATGAGTCGGAAAGCCAAAGTGTCT:1	-	chrX	21509899	3'	+	pogo	2041	1	60.96
CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAAGCTTATTGTTTTAATTACTTTGTTCTAATTTG:1	+	chr2R	7898142	3'	+	roo	342	2	78.86
CGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAATAAAAATACA:1	-	chr3R	9714358	3'	-	Stalker4	39	4	58.90
CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTTTGTAATACACCAGAATTTGTGTAATTAAAGCAGGAAAATGTAAAAAAGTATCTT:1	+	chr2R	9544137	3'	+	opus	452	2	52.74
CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATAGGGCTGATACCAAGTGTTTTTGTGGTGATTATCGTCATTCGGTTGTTTATTTCTGCGGTTCGAAACAGAGTTAAATTT:1	+	chr3R	12717861	3'	+	297	360	2	63.01
GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGGCAACTAAAATAATGGGTATACCAATTTCTGGATTGTTTGGCTCTCAGCTTCTTTACGTCTGTGTGTGTGTTT:1	+	chrX	9540138	3'	+	roo	9043	1	64.03
ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACAC:1	-	chr3L	10013595	3'	-	hopper	83	1	72.41
GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGGCAGGGCGTATCGTCCACGGGTTGAGGCAACGCTTGGCCTGGCGACCACCTTTGGCGACCACAGACTCCACTGCCTCTTTCAAACAC:1	-	chr2R	2016795	3'	-	1360	16	1	70.40
TCTCGATTCATTTCCATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATAAATGATTGTTTGCGTTTGGAATGTCGACAATGCATTTTCAAGTTAACTCTTAGCTCATTTTC:1	+	chr2L	16091999	3'	-	roo	8721	2	58.90
GAGTTCCCCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCCAGCGTGAATGTAATCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGCTAATTGGGGAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAAGTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACCGGTTTGG:1	-	chrX	9701864	3'	-	INE-1	558	1	75.71
ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCC:1	-	chr3R	21705973	3'	-	297	38	2	51.94
CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATCGTTTGAATCTTAGGAATGGACTTTTTCTCAAAAATTTCAGCA:1	-	chrX	17054216	3'	-	jockey	90	1	71.23
ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTGATGATGGCTTCAAAACAATTTCCACTGGCTGTCATCGCAACTGGGTAACATTCTTTATGCAAATCGAATTGAAACAGCAGCTG:1	+	chr2R	14388046	3'	-	roo	19	2	67.69
GTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTAAGTTTCAAATAGACTTTACCCTAAATACTTTAATAAAATGCGCGATAAATGCAAATGACATTATTAAATACATTTTTAACATAATA:1	+	chr2R	11629311	3'	+	Tirant	8410	2	60.27
GTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAATATGGAGTGCCATTGTGTGTTTACTGTACGGTGTGCCCACCTACAGTGGAAGACACAGACACG:1	-	chr3L	13479659	3'	+	Stalker4	48	4	51.16
GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCGGGGAGCAGGGGG:1	-	chr2R	8585394	3'	+	roo	400	1	76.00
GGAAAATATTTATTTATTTTTATAATGTAGGTAAATGTCCAAAGTTTGTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCTCTAATAATATTCCCAACAAGCCAACAAGCCTTGCCTTACAAGCCTTAGTGTA:1	+	chrX	23036300	3'	-	mariner2	832	1	63.70
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTT:1	-	chr3R	19968092	3'	+	roo	396	1	66.02
GGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGT:1	-	chr3R	9922000	3'	-	blood	7097	2	79.45
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATTGTGTTTGAAATATTAGTACGTTGAGACATTTTGTCGA:1	-	chr2L	16091915	3'	+	roo	327	2	73.79
CGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTTAGTAAAAAGGTAAAAGGGTGTGAGCCTGCGGCGCCTGTATTATTACC:1	+	chr2L	8699682	3'	-	Quasimodo	7024	2	65.71
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAG:1	+	chr2L	6059318	3'	+	roo	9020	2	55.00
CTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTTCTTTTCTAAGGGTAAAAGATATTGTACAATCCATGGATGCAGCCTGGGGCGAAAACAAGTACGAGGAGATACGTTCAAATCGCATACGATATGGAACAGTGC:1	-	chrX	2491175	3'	+	S2	234	1	80.80
AAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTACCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACAATGTTGACTTACTTAGG:1	+	chr2R	3549899	3'	+	Cr1a	184	1	63.70
TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATTATTCTTCTTCCACATGACGTGCTGAAAAGTCGCTGGCATCGGCCAAATTAAAAATCTAATCTAAACAAACAGTCACTTTGGGCACTTGGCACGGTTCAGTACTCATAGCCGCG:1	+	chr3R	18582300	3'	-	roo	8672	2	77.40
TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAATTATTTTCTCAAAGAAAATTTATCATATATTGCCTGTGGGCATTCGGCGCTAAAATTGCGCAACGAGTGTGTAT:1	-	chrX	17256965	3'	-	roo	47	2	69.18
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTAGACATATTCAATCA:1	+	chr2L	17420252	3'	-	roo	8712	2	57.14
TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGTAATTAATTTTTAATGCACGCACATGCGGTAACGTCGACGGCTTACAATGTCTGTTTATGGATGAATTTCGATGCGATTATCCGTTTTCCATGT:1	-	chr2R	9791545	3'	-	412	28	2	67.12
TACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCGTTATTCCGGGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAACAAAGGCAATTGGAATCCGGTC:1	-	chrX	5663076	3'	-	P-element	173	1	61.29
TATTTCGACGTTCATACGGACAGATGGACTTTCAGTTAAAGTGATACAATATAACCTCATCATAATTAAGGCCTTGCCGCCAGAATACAAACTGCCAAAAGCGGTGAACAGTTGGACGTCGATCTTGTTCAGCTTCAAATTG:1	-	chrX	15843894	3'	-	INE-1	132	1	52.82
AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAACCAATTTTTTTTATTAAATTTTTATTGTATATATTTTTCGCAGTGTTGGGC:1	-	chr3L	18555881	3'	+	jockey	4931	1	66.43
AATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAGTAAGACAGTGACACCTAGACTATAAATAATGAACAAAAACTCCTTTCCCCCGATATAATTGCTCAATAATTTAT:1	-	chr3R	13363178	3'	-	jockey	4845	1	63.11
AAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATCTAGAATAAAACGCGCTATGGTGGTGCTATTTTTTACGCAACTGTATATGTGTT:1	-	chr3L	1534520	3'	+	pogo	2039	1	62.33
GACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATTAGGCTCGTTGTAGTTCACGCGTTAATTGAATATATACCACGAGGTAATATGCATGCTGGAGCGCATGCTGTATTCTCGTTTGGGTGACAAAGGGAATGGGTCATG:1	-	chr3L	25997029	3'	+	Stalker	6922	4	71.43
AAATAAACAAACATTTCTCGATATTGCGCATCCACTCAAGCCAGGAGGAGTGACCGCAACCATTTTATGTTAACTATCAGCATCGCCATCACGGAGTGATGACTCAGTAAAAAAGAGTAG:1	-	chr3R	1960623	3'	+	Tom1	80	1	66.67
CGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAATTGCTGGGGATTATTATCAACTGTATTATCTGCCATTTCTTCTCCTGAGATTTTCCCCCTTT:1	-	chr2L	21008534	3'	-	invader3	31	2	54.78
AATATTTTCCGATGTCTACAATAGTTTTCATTGATTTCTGAAAAAAAGGAAATTATGCGATGGTGAATCAGGAAGTTGGATGGTTCGACGACGAGAATAA:1	-	chr3L	6242192	3'	+	mariner2	844	1	58.00
AAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAG:1	-	chrX	2842506	3'	+	Tabor	7244	2	69.86
AAAATTTTAATTTCAATTTTATCTGAATTAATTTTAGTTTGAAGTTTTAAAATCGTATTACTAATCAAGTCCGTTTTAGATTTAAGTATATTAGTTAAAGTAGGTATTATGATAAACGTATTACGAAGGAAATAACTA:1	+	chr3L	16942346	3'	-	1360	3045	1	36.23
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAG:1	+	chr2R	16785455	3'	-	412	31	2	64.83
CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGACGTTGTCCAAAGATAACGAAACAACGATACATTACAATAAATATTACAAAATTCTTGCAACGAATAAAAACTCACTCG:1	-	chr3L	22863359	3'	-	412	7095	2	55.48
TTTTTTTTCAATTTAAAATATTTTTCATTCCTGTCGGTCAA:1	-	chr3R	5971180	3'	+	Tc1-2	1404	1	90.24
GATAACTTATAGGGCAATAACTTGCATGCTCTTTATAAGGCATTTTCAATTACCCTTCTACCCTATGACGGAAACGATGAAATCGTAGTTAACATCAAACTGTGAACGATATTTTTTTGGGGGGGTGTGCGTAATCCATCATAT:1	-	chrX	13537731	3'	-	HMS-Beagle2	1	2	59.72
GGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGGGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGACGAATTTGTTAGTTGCTCATATTTATTTGTAATCTGATTTTATCAGGGGGATTTAACT:1	+	chr2L	20265721	3'	+	Rt1b	4882	1	52.00
ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATA:1	+	chrY	2720344	3'	-	297	35	2	74.74
TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTA:1	+	chr2R	2427621	3'	-	Doc	25	1	58.18
AATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGAATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAGAAAATAAATTATCATCATTGTGACATTTTC:1	-	chr3L	10146195	3'	-	Cr1a	169	1	80.82
AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTATGCGTCGACTACACCCCCCATATCAATCCAATCCAACTACAAGGGGCAGCATTTGAATGGGCGGATGCTGTAACA:1	+	chr2R	9328712	3'	+	roo	9033	1	55.80
TGTAACAGGTAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATTAATATATATATGTACATTTTGTTTAAAATGCATTCAATATTGTTTAATGCGGAAAGCTTTTTTGCGGTGCATGAAATATAAGTCTGGGAGGTACTTTTCAGTAACATTG:1	-	chr2R	4855687	3'	+	INE-1	31	1	65.97
TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTACAATAGATACATACGTTGACAAGTTGAGAAGGAAGCTTTTCCGACCATAGAAAGTATGTACATATATGCATTTCTGTCCATATGAAAGCCTCG:1	-	chrX	22511305	3'	-	1360	13	1	60.84
ATATGGTACTTATTATTCATGCAAACTTACTTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTTAGGAAATGGACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTAAGTGCGTACGATAAATAAATAATTTCATCA:2	+	chr3L	19339405	3'	-	Tc1	95	1	76.71
TTTTAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATACCATTTTCTTATCACGTGAATGGGCAAAAAAAAATTGAAGTGGCAAAAAATTACAAT:1	-	chr3L	18641984	3'	-	transib2	429	1	60.96
AATAAACAAACGCACGCTAACAAAAAAAAACAAATTTTGCGATTAAAAACATACTTGGCCAACTCTTCTGCACT:1	+	chr2L	11985831	3'	+	G6	2018	1	52.70
CAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTG:1	-	chr2R	5485092	3'	+	blood	351	2	59.69
TGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCAGTGATGGCTATTTGAAATGAAAATGTAAAGTGTGAATTTGACGGTGC:1	-	chr3L	15490328	3'	+	copia	5051	2	67.12
TATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGCCTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACTACACCACAA:1	-	chr3R	19589934	3'	-	BS	5077	1	70.55
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTTTCTAGCAACGTGAGTAAGTTTTGCTGTTACAATTTCATTTTAAACAATTTTCGAGAGTCATTGCCAGGATTTGGAGGCGGGGAGCAGG:1	-	chr2R	8585397	3'	+	roo	396	1	73.02
GTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAGTAGACAATATAATAAAGATGATTACTCCAATCCTTTGACCCCAT:1	+	chr2R	21298854	3'	-	jockey	233	1	67.50
GAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATGCGTATAAAATGTATACGCATTCCCGGATCGCCGGA:2	-	chrX	20645852	3'	-	1360	402	1	74.66
TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGCTTGTCCAGACTTTGAAATCCAGGAATTTATTCAGCTGTTATCCAGGAATATATATTCAATATTCTTCA:1	-	chr3R	11514931	3'	-	I-element	28	1	65.42
TATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAAAACCAGTTGGGAATATATAAATACCTTTAGCACATTTAAGCTACCGTAAGAGGCA:1	+	chrX	10694543	3'	+	I-element	5287	1	65.07
AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGAAATCACAAAGGAGCCGCGCAGATTGATGGGTTCAAATGGCTGGGCGAAGGCGATGACAAAAGTTCCCGAGTCCCCGGCCACTCACACTG:1	-	chr3R	28075281	3'	-	jockey	4702	1	63.01
TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGCAGGAGAAGGTACTATATAATTAGCTGTAACCTTTAACCCGGACAAC:1	+	chr2R	13817712	3'	-	412	7084	2	54.37
CAACTCAATCTACGGTCTCCATCTTATATATAGCTTAGTTCATGTATCCTACCTTTCTAAATGAGCCATTGCCGAGGACTTTGATGAAATTAAAGTCCGTGGCCTGG:1	-	chr2R	16941438	3'	+	jockey	493	1	68.22
AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTACATAAGCTTCTGCTGTTTTAATAGACAGAAACACCTTTCACATACATACATATGTATGTAAGTAAAATTTTCACAGGGACTCCATTTGC:1	-	chr2L	588316	3'	-	FB	13	1	64.06
GGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGACATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCATAAACTTTAATGATTCACTCTGCTAGCTA:1	+	chr2L	14769385	3'	-	G2	2744	1	76.87
CTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGAAAACTTTATGTGTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1	-	chr2R	4826124	3'	+	1360	142	1	66.39
ACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGCTCTGACATTGGC:1	+	chr3L	10013672	3'	+	hopper	1361	1	61.59
GTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACTAGGATTGTATGACTAAGAGTAAAAAGGAACATATGGACAAGTTTTTTTTCACAAACATCATGAATAATTTTTTCTTTTA:1	-	chr2L	20209127	3'	+	transib2	290	1	56.94
GTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAACAACACCTGGTCCATGGCGTTCACGTAGCAGGCCAAATTGAACT:1	-	chr3L	18589217	3'	+	Doc	477	1	63.16
GGCCACGCAAATCTGCAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATCTGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGTCGATGTTGTTAACTTATATATCTCTAGCTTGGCCGAGCCCATAAAATCGTCCTGCAGTCCCCAATCGTCGTCGAAA:1	-	chr2R	18770372	3'	-	gypsy2	6590	2	63.70
ACGCATAATAGCAAAAGGAACATCGGGAAGAAGTACTTAGCGACTGCACGCATACCAATTTTTTTCTTAGGAGAGAAAATGAAAGGCTGCATGCATGACCGACGTGATAACGATATTAAAATAAATAACCCTTAA:1	+	chr3L	26640356	3'	-	micropia	141	4	52.59
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCGTTAGCTTTGCTTATCAGGAAGGAGATGGAATAATAAACTCTAATGAT:1	+	chr2R	23803034	3'	-	roo	8736	2	67.81
AAACTACACACACACATACACACACCCAACAGTGAAAAATGGCATAGTGAAAATAGTTGTCAGGGCGATGATGCGGAG:1	+	chr2L	10108086	3'	+	accord	253	2	91.03
ATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGCGTTTAATCTACTTGAATCACACATTATTGGGTATGGGTATACTAGA:1	-	chrX	21564604	3'	+	diver	214	1	74.66
GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATAATCCTGTGGAGCGTAATTACCGCAGCTAACGCTAACCCAGCAACACCGCAACTATCAACACAGCGCTTTGA:1	+	chr3R	10274055	3'	-	HMS-Beagle	6807	2	70.64
TTTTTTTTTATTTTTTATAACTTAAGGCGAACGTTCGCCTTTAAATAGATTCTAAGTTTTGAAGAGCGAAAGACAGAGCC:1	-	chrX	3091694	3'	-	HMS-Beagle2	479	1	78.75
TTTTATTTGGCGTTCACTACACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATCTTCTGGA:1	+	chr2L	11661006	3'	-	F-element	75	1	59.85
TTGTTAAGGCATACGGAGTAGCTGAGAACCCCTTTGTGACGTTGGGGTCTATTACCTCTCATAAAGCCTGCGGACCGGCTAACAAGGTTAGCTATAACAATAATAGTCGAAACTCGACTATGATAAAAGCGGTACGACGG:1	-	chr2R	559003	3'	-	BS3	1752	1	62.14
CATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACAT:1	+	chr3R	3981655	3'	+	Stalker4	279	4	89.60
TATATACCCCTTATCTTTAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCACGACCCCAAGTTTTATTGCGTTAGCTTGATACATTAAGAGGATTGGAACAGAATATATGGACAATCAAAGAACGCAGTTGCAATATTTACGGATTTATC:1	-	chr2L	22732181	3'	+	Cr1a	4133	1	62.33
TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGAGACTTGGATGGGCGTGCATTTATTCCACCCACTGTGC:1	-	chr2L	12328652	3'	+	hopper	1337	1	69.93
TTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTCACTTCAAATAATCTGAAACAAATCCACCCACTCCGAAAAATG:1	-	chr3L	15519765	3'	-	pogo	78	1	72.60
AACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTACATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTCAATCTATATCATTTCTTAAAATATTAGGTGACTGGATTTTAGCAATAAAAACAAGCTATATAATA:1	+	chr3R	14032318	3'	+	1360	172	1	62.33
GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAA:1	-	chr2R	20496888	3'	-	blood	7052	2	56.16
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGC:1	-	chr3R	17817895	3'	+	roo	9016	2	63.08
AAATAAATAATAAATATTGTTAAGAAACAAAAATTTGATTACCATTACGATTTCTAATCATTATTTAGTGCCACCTGTCGGCCCAGTGATTATTGCTTCAATACTCGTATCTTAAACCAACGACTTGGGTAGCGTATCC:1	-	chr2R	15052016	3'	+	Juan	4059	1	58.27
AGTACGCTGGTCAATTAAATAAAATAATTTCGATAATAAAAAAAAAGTTTTTCTCTTGATATGCCACATTTTTTCTTTTAAAGTTAATTTGTTAATTTTACTACACTCATAATTCGTCACCTTGTGGCGATATAATGTTACTATTT:1	-	chrX	16726832	3'	+	jockey2	3370	1	63.01
AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTAGTAGTGCTGTTTGCAATTGCCA:1	+	chr2L	21884632	3'	+	pogo	2063	1	57.64
AAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAATTAGCTTTAAGCCCCTCAAACAAAAGTAAATGCTTGGCTAACACTTAAAG:1	+	chr2L	4859716	3'	+	jockey	323	1	57.98
ATAGATCAGTCATTTGTTAAATAGCAAAGTTTCTGATTTTTTTTAAACAAAAAAAAAGCTTTATTTTTTGGCTCAACTGAATATGTGCTACACTTTTGACTTGGTTTGACCTCGTGGTTGTAAAGAGTTAAATTCTTTTGTATTCT:1	+	chr3L	27357522	3'	-	Tc3	1619	1	65.07
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAATCAGCCTTTGCCGCTAATTTGAC:1	+	chr2R	25118814	3'	+	roo	9047	1	69.86
AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACGCAATCACATTTGATATTTGCATGCGAAATGTATTTGCGCTCCACGAAGCACAACAATAAACATTGTAAATATATTT:1	+	chr2L	18404630	3'	-	hobo	13	1	70.43
GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTG:1	-	chr2R	5485086	3'	+	blood	7352	2	56.85
GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCATCATGCGGGAATT:1	-	chr3L	12861692	3'	+	pogo	2055	1	54.11
TTTTTTATTTTTAATAGATTATGTACTTTAAGTAATGACTTACCTGAACATTATGGCAGACATAGTAGGCGTTTTCCATGGCGGGCTACATAGGATTGTTTAAGGTTAGTTGTTGCAAAA:1	+	chr3R	13048640	3'	-	BS4	731	1	70.00
CTGATCTAGAGTACAATATTACTGCACGCAGGCAGCCAAATTACACGCTAAAGAGGATAACACAATACCTTTTCTCACAGTGGCGTCTACAAAGTCTATATTAATGACAAGCACATTAACACCTACAATCACACTGGACT:1	-	chr2R	9998743	3'	-	Dm88	152	2	52.14
ACTGGGTTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGGTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGACTCCTTTCGGGTTGTTTGTGTTCCTAAGCACATGACACGCACTT:1	+	chr2L	11238885	3'	-	G2	135	1	68.49
GAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACTGTAATGCGAGTTAAACGGCAATTTATGCGCTG:1	-	chr3R	10182142	3'	+	blood	7317	2	74.42
GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCT:1	-	chr3R	13360334	3'	-	jockey	63	1	75.73
GGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACATATTATGCTACAAAAACGGTTCGACTTGTTAGTTATAGTGCATTGGTTATACTCTCCTACGTTTAGTAAAGATAATAACATTTAAATCATAT:1	+	chr2R	20497041	3'	+	blood	349	2	57.24
CATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGTGTATCTGTGAATCTGTGCGTCTGTAGTCTGTAGCTTGTGCGTTTCAACAGCTGTCCGTCCCGTCAGTCCGTCGAGAACCGG:1	-	chr3L	16057676	3'	-	Stalker4	7234	4	56.16
ACAAATAAAAAAAAAAGAAGTAACTTTTTTTTTCTTTTTCCATCCGCCGCTCTCTTGCATACATTAGCCGATTCTGTCTGCCTTTCAGCCACATTATTTTGTATTGTTGGCCATAAAACGAGTA:1	-	chr3L	15889181	3'	+	gypsy2	401	1	79.03
GATGTGNGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGATTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAATTAAGACT:1	-	chrX	3308313	3'	-	hobo	63	1	64.62
CAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTGGTGAAGTGTATTAAGCGGAAAAAGTGTCAGC:1	-	chr2L	12290652	3'	-	1731	49	2	52.05
AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAA:1	-	chr3L	17558004	3'	+	jockey	4937	1	58.90
ATTTATTATATTTATATTTATTTAGATTTATTAATTATTTAGATTTATTAATATCAAATAAACTTTTGTTTCTTTAATAAAGTTGTAATTAAAATGCAACATAAGTCATATTACAACACTCGATCCACAATATTTTGTTTCACGAT:1	+	chr3L	14971427	3'	-	diver2	450	1	38.36
TTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTT:1	+	chr2L	21884586	3'	+	pogo	2026	1	77.04
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGTGCATAAAGCGACAATTTGGTGTTTTTCTGGCCAGAACAGAACTCATTAAGGCTGGAGCTACCAGAGATTCGATGAACACTTGCCACT:1	+	chrX	14336538	3'	-	roo	33	2	61.64
GATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTATTTTAGTGTATTTGGTAATACCATATAGCAAAAGCTATTTCAACTTTGAAAATTAACATGGCATACAATATTTTAATA:1	+	chr3L	14638697	3'	+	1360	21	1	44.93
AATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGGCGTGAATAATCGATGTGTGCGTTTAATTTCTGGCCAACGAGCATT:1	-	chr3L	7588418	3'	+	hopper	1358	1	64.62
TATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATACCTGAATTCTCTTATCGGAAAGCTGCGATAAGGTGG:1	+	chr3R	27424911	3'	-	blood	75	2	69.23
GGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGT:2	+	chr2R	4939197	3'	+	1360	3376	1	29.63
GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGTGCAAAAACAACAGCTTAGTAAAACTCCCTCTCTCTCGCTCTGGGCTTCTCTTCCACCAACTTGGAAACTTCAAAAAGCCACCACCGA:1	-	chr2L	12483699	3'	+	P-element	2864	1	67.88
AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTACAGATAG:1	+	chr3R	25448458	3'	-	roo	8704	2	57.53
ATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCAAACAGATT:1	-	chr2L	17550608	3'	+	Transib-N1_DM	446	1	79.45
TAGTTATCCATTAATCCCTACTCATAACATGTTTTAATACTTAAATCCTATCTCCTTTGTTCACTCCAATCACAATGATGGCGTATTAGGCATTCGGCGAGTGCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCTAACTAATGTAT:1	+	chr2R	5206900	3'	-	G4	3759	1	61.59
CCTAACGGGGATATGATCATATGCTTCTCTCTGCCACTATGGGCTTCATACCTAAGACTATGCTACCAAAGACCCTAGCATATTCTAGTGTCTTTGGTGGGACTTGAGTTATAAGCACAAGTGACAGGTAATTTGTGCAT:1	-	chr3R	4608753	3'	-	invader3	5246	2	67.14
AAGAAGGCCAGTCAAAATGCGCACGGCGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTAGTTTGCTGACAGCTTCTAGTTCGTCTAGGACTGTCCTCACTTCATTTATTAGCTTACTAGCTTGTCATAAAAGACTAACTCTATTATATGTC:1	-	chr3R	16165395	3'	-	baggins	5121	1	36.30
CGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGGGTAGGCGTGG:1	+	chrX	21667965	3'	-	gypsy2	6511	2	69.53
AAGCAGCGCAAGGGGCAACGTTCAGCAACAGATTTATCGCACTCATTCTAGCAGAGTCCCGTGTATAGATAATCCATTCATCACGAATAATAGGAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTTACGCCCCGAC:1	-	chr2R	4260422	3'	-	micropia	5208	1	44.29
CCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGGATTTTCATTATATTATACCCCTTAC:1	+	chr2L	23034077	3'	+	FB	391	1	41.91
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATAAAGAAATATATGGCAAAACATTTAAATAAATAAAATACTAAAACATATATGTA:1	-	chrX	9540017	3'	-	roo	8730	2	66.44
AAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAATGCCAATTAGTTCGGATAGTTAGTGACTTTAATTCACTCCAATAC:1	-	chr3L	16973309	3'	+	S-element	171	2	71.92
ATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATAGTATCCTATT:1	-	chr2R	6172990	3'	-	pogo	67	1	65.07
GCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAAT:1	+	chr3L	9673108	3'	-	Doc	92	1	74.66
GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGCACACTAACTCGCTGGCAAACAAACAGTTGACTTTTAATGGCATGCAAGGGGGTATAGGGTAGTGGG:1	+	chr3L	22349293	3'	-	jockey	23	1	64.76
ATTGACAGACTAAGAACATATGAAAATAACTTAGCCTTAAGTTTGGCAAATAATAATAACAACGTCAGAAGACTTAAAAGATTTCATGTGCTAGATCTCCCTAAGTCAAGCGTAAAACCTGTGACCCACAATTAAATGCATTTGTA:1	+	chr2L	21925438	3'	+	G4	3615	1	69.86
TATAAGTCTAAAATAGCCTAAGTACTTTGTGCAAACAATTTCTTGACAGTGTCAAATCTGTACAAACTTGGATTTAGTTTTTTTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTTTTCTTTCAAAATGTTTGAAATCTCAATCCGATTTCCCT:1	-	chr3R	4513557	3'	+	S2	1474	1	75.34
AAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAA:1	+	chr2L	22150618	3'	-	S-element	77	1	81.40
TTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATGAATAAAATGCATTCGTTAGAGATATTCGTTTGGAGTGGTTCTATAAAGTCGAAAGAATAGAGGCCAAATAATCATTAGGTTTTTATGAACTAATTTTTTAAATA:1	-	chr3R	13846065	3'	+	I-element	5340	1	73.29
AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGTTTGCTACACCGAAACAAATGACACACGATGAACTCATTTGGACAGCGATCTATATATTTCATTCAATGTCTTGGT:1	+	chr3R	29361081	3'	+	mdg1	375	2	52.74
CATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCACTGCGAATCATTAACGAGCTCCTCCCCTTTGGTGAAGTCCTCTCCTGCGCCTCTGAGAGCCTCACCAACGCACT:1	+	chrX	1898287	3'	-	P-element	2551	1	49.23
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCCCT:1	-	chr2R	19050155	3'	-	roo	29	2	63.01
CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCG:1	+	chr2L	18419255	3'	-	412	42	2	49.29
AAATATATTTAAATATTTGTATTCATTTTTTTTTGTTCACTTTTGTAAATTGTTTTGTGCATTACGATAAATTAACAGCAAACAAAAAGCAACAATGCGCCGGGTGGTGACACGTTCTC:1	+	chr3L	7441430	3'	+	Transib-N1_DM	292	1	68.07
CACCAGGGTTCTAGCCAAGACTTGAACCATGGGATAGTTTAAGCTTTAAGCTCAACAACAACTGTTTGACCGCGTGGCCGAGGGTTAGGGGATTCCAAAGTCCCCTAGTTGACATTG:1	-	chrX	21178459	3'	-	X-element	281	1	65.81
GAGGTCGACCGGTAACGGTGCATCCACAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGAACCGCTCTGGACCTTGGACTCAAGTTGTACAATGTGTCTAACGTGGAGTATGAAACTTGTC:1	+	chr4	575483	3'	+	gypsy8	4786	2	69.57
AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACGTACTATATGGTTATGCGTTATATGCCCAAAGGCTTCGTTCGGCTGTAGATGAGCATAACATTCTTAATGCTTCGCTCCACTTTTTGCG:1	-	chr2R	15289089	3'	-	hobo	26	1	66.43
TTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATCATCGAATTGAATTAATTAATTTAAAGGAGGGGCAGAAGTGTTG:1	+	chr3L	26011948	3'	-	F-element	83	1	70.71
CGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTATAACCACCAGTTGGGTGGGTTATGTATGTACATAAAAATATTTATTGTTCACGTTTCTTCTTTTCAG:1	+	chr2R	9874892	3'	+	S-element	372	1	64.38
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCCGCTAAACAAAACAATAAATAAACTTAAAAATGAAAAACACAACTTAACAGCTGAAAGAAAGCCTTTACGACCGCAAAAAGTATTTATGTATGTTTATCA:1	-	chr2L	17471551	3'	-	roo	8686	2	70.55
AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCCTTAAATGAGGTCGACCTCCGAGAAAACAGGACCGAGACCACAAAAGCTACCCCA:1	+	chr3R	27994277	3'	+	roo	405	1	70.59
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACTCCTTGCCTTCTGCAGTCGTAATCTACGCTTATTTTCAT:1	-	chr2R	21907891	3'	+	roo	396	1	73.39
TTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGACGATTAGTCGATAAGTTTCTCGAGACTTTATTTTTATGTTCCCGTTTTTTCGCACGTGCCTTGCAATTTTTATAT:1	-	chr3L	20342490	3'	-	mdg3	188	2	62.86
TGTTATTATGTTCGTATATACTACAACCTTATAACTAATTTGTTCGATTGTTTGCTCAATAATCGGAAAAGTTTATCAGTTGTTCTGAGCCAAACAGTAATTTGAGATGTTTCTATAACTTTTTTTCCCTGTGTACAATCATTTG:1	-	chr3L	10841401	3'	-	mdg1	7042	2	71.03
CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTTTTCGGCAGACAATGGCAATCAGCAATAGCAACTAGAACGGGCAAAGCCAGCAAACGGC:1	-	chr3L	10385786	3'	+	Burdock	239	2	73.10
GCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATTTAAGATCATCATATGAAATGTTTGGTTTC:1	+	chr2R	23332596	3'	+	invader4	302	2	72.50
GCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGC:1	-	chr3L	25232769	3'	+	accord2	7604	2	52.63
AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCA:1	-	chr3L	11393502	3'	-	roo	79	2	79.86
AGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGAAGACGCACTAAGAGGACGCTCCGTGATCTAACGGTAAATAGGTTTGACCCTGTACCCGAGCGGGCGTGAGATACCAGTGTGCTAGGTAC:1	+	chr2L	22524655	3'	+	gypsy8	136	4	58.47
AAAAGAAAATAATTTTAAAAAAAGCTTGCCTCAAAACCTTTGATTTCTTGCATCGTTTGTAGTTTCATTTATAAAATTCATATTTATTAGGTGCAAAAGTTATTCAAATTGTTATAAAACTTTATCATGTAAGTTTGTAAGATCTT:1	+	chr3L	16250500	3'	-	1360	3092	1	53.42
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAAATGGTACCCATGTGTACTTT:1	+	chr3L	20654582	3'	+	roo	9052	2	62.28
TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGCAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTGGTAGGCTTACGC:1	-	chr2L	15833429	3'	-	jockey	24	1	67.80
AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACATCATCCTGCTACAAAATTATTAGTGTTTATCAATAG:1	+	chr3L	3863505	3'	-	blood	60	2	69.75
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTCTAAGTA:1	+	chr3L	22437970	3'	-	roo	8716	2	54.11
CCGAAGACTGTGAAATGCCGACTGCATTTCAGTTCAGGGTAAAGGTTTTTGTGAATAATTGATAAAGTTGAAGTACAAGGCAATTTGGAAGGCTCATGGGGGGACAAGCAAAGGTTGATCCCAAACTTTGTAGCGAAAAGCCGTGA:1	+	chr3L	9673196	3'	-	Doc	5	1	76.03
ACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAA:1	-	chr3L	19035978	3'	+	Tirant	398	2	70.45
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCATGTGGAGCGAAGTGCCAATGTGAGCGGTGGTGATACAGACAGGCCATCGAATTCCGGTCGTCGTGGCAAACAGTTGAAC:1	+	chr3L	16343330	3'	+	roo	394	1	71.67
GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAA:1	-	chr3R	21706006	3'	-	297	15	2	58.90
CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTACACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCAT:1	-	chr3R	16404463	3'	+	pogo	2081	1	60.00
CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCATAATTTCTAAACGCTTTCTTATTATACCCAATTCAAATTTGAGGTGAATATTCTGGAAACTTTTGTGGCAACCCTAGGCCAGGGTCGTATTCGTTTTGGGTTTCACATTTGTGCC:1	+	chr2L	11661064	3'	-	F-element	26	1	58.90
GTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATTAAGCTTCATTTTTATTTCT:1	+	chr2L	1839354	3'	-	hobo	30	1	65.07
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCAGTGTTAGTCGACGCTTATTTACACGATGTTGTGCGCCTGAAGCTATGCAATAAGGACACCGGAGTCCTGCCGCAACTCTTGCCTATAACGAGGATAGC:1	+	chr2L	6059352	3'	+	roo	9055	2	73.38
GGCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGCAGTAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAAGTCTTCAATGGTTCAATAGTCATAATGTTGCCAAAACTACACAAA:1	-	chrX	7993379	3'	+	mdg1	444	1	63.24
ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGC:1	+	chrX	6486796	3'	+	roo	9024	2	61.29
CAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATGCAGCATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAACCCCTCTATGACCGCCCCAAATACCCGCCCCCTTTTCTGTTT:1	-	chr3R	10273916	3'	+	HMS-Beagle	241	2	75.44
TGTAGCGAAAAGGTATCTGTACAAGAGAGACCACCACCACACGCAACGCCATGAGCTAGAGCCGGACCAAAGACACTAGTTATTTTAACGTCTTTTTATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCG:1	+	chrX	22824229	3'	+	Gypsy12A_LTR	2149	1	59.59
AAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACATTATGGAAAACAAACAACTGGAGTCATTGAAGGTAATTTACGAACCAACACGTTACTGGAGTGATTACTTGGAAAGATTTGAGGACCTCATAAAATCGTTTCATGTCAAGCCA:1	-	chr3L	12860829	3'	-	pogo	1919	1	76.71
GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCCCCGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATAAGAAG:1	-	chr3L	17558000	3'	+	jockey	4947	1	54.29
CAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTATCAGGGCCTTTGTTTATTCAGG:1	-	chrX	18386387	3'	+	invader4	3005	2	72.60
AAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTATGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACCCACACACTCACATGTTGGCAAACAGCTGATCCCCCTTAGCGATGACAC:1	-	chr3R	9038886	3'	-	Juan	4029	1	69.18
AACTTTACTTTACTTTCATTTACTTTTTTTTTTTAGTTTGTTTATTACCACCTAATAATCATAGCTATAGCATAATCACCGCTGTAGTTGTATAAAAACTAGCGGCGATTTTACATTGGCATGTCCTGGAGAATCATAGCTATG:1	-	chrX	1772553	3'	-	TART-A	13146	1	73.61
GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCCAAATGATCGGACACCACATGACGAAATCCCAACGAAATCCTGTTATTTCGTCCTTGCAACTCATCCAATTCGAATAATAATG:1	+	chrX	17431836	3'	+	hopper	1380	1	61.64
CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGCCAAAAGGACCATCATCCATTGGCCATAGCAAACCGGTACGTTGGTA:1	-	chr3L	22400242	3'	-	1360	17	1	66.67
AAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGGAGCTAAATTCGGGAGCTTGAAGCTCAACCA:1	-	chrX	6499887	3'	+	Quasimodo	6954	2	63.04
AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAA:2	-	chr3L	10574286	3'	+	Tabor	7260	2	58.90
CGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAA:1	+	chr2L	20117937	3'	-	invader4	2830	2	72.60
CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAAAACTGGAAGCCAGACACATACTC:1	+	chr2L	7898385	3'	+	roo	9031	1	53.72
ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGGTTAATTAATGTATATACAATTTTATATAGCACCAAAAAATATGCATAGCTTTGAAACACTGAAAAAATATGTAAAACTTATATCTTTAATTGTATTTTTCTAAC:1	+	chr2R	15064484	3'	-	412	17	2	71.92
TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATG:1	+	chr3R	15364018	3'	+	flea	4966	2	56.72
CACACAAAAAGATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTAAATAATTTTTTGCTTCTATGTTTCGTATGGAAAAACCAT:1	+	chr3L	4605701	3'	-	pogo	57	1	70.16
ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACAAGTTAAGACTATCACCCAGCATCCAATCTGCAGAGTTAAATGTAAGCGCCCAAAGCTTTCAAGATAAGAGTGAAGCCTTGACTCAAGATTAGGGATAGCTT:1	-	chr2R	4601500	3'	+	HMS-Beagle2	294	2	73.29
CATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGTACCCGTAGATTTTTATTCTCTTCTTTTGCAGGGGTATGAAATATGAGTCAAGTTTTCAATGCATGGC:1	+	chr2L	16017410	3'	+	412	46	2	59.66
TTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTGGTGTTAAACTTT:1	-	chr4	948538	3'	+	hopper	147	109	86.11
CCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCTCATTTTTCACACCCAACTCTCATCGACAAAGTGTGAAGGACGCAGGCCAAAGGCGAGGATACTTCTTGGC:1	-	chr2L	12330383	3'	+	hopper	97	1	60.68
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAAC:2	-	chr2L	14772024	3'	+	roo	354	2	53.42
AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTCCGATTCTTAATTGCAAGACTATTCGAGATATTCACATGTTTTCGAAACATTGGATAGAACT:1	-	chr3R	23495639	3'	-	copia	30	2	60.87
CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTGTTTACATTTTTGCTTTGTTT:1	-	chr2R	11629712	3'	-	Tirant	30	2	66.44
CGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACATTTATTTTGCCTTCTTTTTTTTTCCTGCTGGAGCTTACTGCTTTTTCGGCA:1	-	chr3L	10385837	3'	+	Burdock	188	2	67.81
CCTATTATCTGTAATCTTGAAAAAAAAATACATAGGAGAGGAGAATGCAATTTTTGCATGCCTCGACTATTAGATACTATTTACTACGCTGAGGGGAGTAAGTCAAGCAAGTCATTTTACTAGACCGACTTAATTTTAGCAATGTA:1	-	chr3L	22532204	3'	+	Cr1a	4223	1	78.08
TGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCTTGAACATTTAACGTACATTGTCGCATTGTG:1	-	chr2L	17807815	3'	+	X-element	4531	1	78.32
AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTCCATTATGGGTATATATGCATAATATATATATATACACATCGTATTGTTCCAGACAGCATTTGTCACGAC:1	-	chr2L	1664945	3'	-	hobo	5	1	33.00
AGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATATCATGTACATTTAATTCTATTTGGCTTTA:1	-	chr3L	25511935	3'	-	F-element	4336	1	78.99
CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAGCAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTGTCAGCTGTACATGCACCCACACACAGGCATACACATGGCCAAGGGCAACAAAA:1	-	chr2R	21572097	3'	-	hopper	64	1	60.27
GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCGCATACCAATCATACCAAAAC:1	+	chrX	17833041	3'	-	Tirant	8120	2	70.69
ATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAAGTCTTCAATGGTTCAATAGTCATAATGTTGCCAAAACTACACAAAAATGTGTGCTA:1	-	chrX	7993368	3'	+	mdg1	330	2	60.96
AAAAAAAAAATAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGG:1	+	chr3R	15072658	3'	+	pogo	2035	1	64.38
CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAAT:1	-	chr3R	17478338	3'	+	copia	223	1	63.01
ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAAGATCATGAATGAGAAAGTCTCAG:1	-	chr2R	3065948	3'	-	P-element	90	1	21.83
AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAG:1	+	chr2R	2529356	3'	+	1360	3342	1	52.99
TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGCATTCACATATTCTATCGATTTGGTTTATTAATTATTTGTCATTATTTTAT:1	+	chr3L	10292893	3'	-	roo	70	2	66.44
TAATGTAAAATAACTCTAGTAAATATTAGTGTTAACAGGATCTAATTATGTACTAAACAAGTTAATGTCGTAGATAGATAGATAGATGGATAGATAGACAGATAGAGACAGTTCGATTTGACATTGAGCTAAGGACGTGATAGCTT:1	-	chr3L	15697217	3'	-	Cr1a	4314	1	55.48
GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTAAAA:1	-	chr2R	20496875	3'	-	blood	7039	2	63.70
ACAGCGAACAGCTCTTTTCGACGTATACAGTGATAGCAGGCAATGTATGTGTGCACACGTAAAGAGTAAACAGTGTAAACTGTTAACCAAACAATAGAGCGGCCAACTTTTTCACAGTTTTAATTCCGTTCGC:1	-	chr2R	4709435	3'	+	1360	131	1	53.38
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAATTTTGTTTAATAAACCCG:1	+	chr3L	233376	3'	+	roo	9053	2	72.60
TTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATATTCCTTATAGACTGATATTTTTCCTTATAATAAGACATTTCGTCTTCGTGAATCGCTAAATAATTTGGCGTTATTACACATTCT:1	+	chrX	22118662	3'	-	gypsy	7022	2	58.90
GTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAATGCATTGTACACTTGGGATTCGTAAGCTTAGAAACTACTTGCTGGACATAAACTTTATATTAGT:1	-	chr3L	23288289	3'	-	roo	9041	1	56.16
ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATAT:1	-	chr2R	20496903	3'	-	blood	56	2	56.85
TTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCCAGGGGAGTGGATTCTAACCAGTTGATCAACTGTGATTTTTGGTGGAAAGGTCCGAAATGGCTAGCAGA:1	+	chr3R	19446536	3'	-	roo	9034	1	54.81
GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCA:1	-	chr3L	3799783	3'	-	copia	4940	2	64.38
ATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTAGCTGGCGGCGTGTTCCTCGTAGCAGTTGGCACATATTGGCTATGTGTTCAGCAGGCACCAACTCCAAATGACCGAG:1	+	chr3L	26291294	3'	-	1360	34	1	42.03
ATTTAATATACGTACGTGAAATTTCAGTAAATCAGTAAATCGGTCCCCGCCCACCCATATTAGGATATAAAGTTAAGGAGTACATTTGGCATGTTTGCTAAGCATTTTTAAATGGATCCACCTGCGATTGCG:1	+	chr2R	17962763	3'	-	transib3	2775	1	70.45
TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCATTCCATAATAAAGGGCCTTTGACTTTGCCTTTGGCTCCGGGTCGCTCATTACGTAAGCAATGTTCG:1	+	chr3R	19265909	3'	-	I-element	50	1	51.77
AAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAAAGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAATGAAGAGTTGGACTGACTTGCAATATTTTGGTCCTTCGGGTGTTGAGAACGACTATGAGCCA:1	+	chr2L	10155159	3'	-	1360	207	1	56.16
GAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCACTTTGCATAATTCTGCTATTCAATATGGCCAGGCCACATAGAATATCAGGTCGAGGCCTATGGATCCATTGGGGACAAAGGGGG:1	+	chr3R	23235614	3'	-	jockey	4798	1	60.27
TAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGATTGGACAAGAAAAATTCTTTTCGAAATATATTCAAACATTTCAAAAAATGTCCTCTTTTTTATATT:1	+	chr3L	21998722	3'	+	1360	251	1	60.27
AAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCCGTATCTGTGGGAACCAACGCCCTCAGCGAGCGTGTCTTCATCTGTCGTGTCCGCTGTGATGAATCCATCTTTATCGGCACTCTGTACCTCT:1	-	chr3L	17886194	3'	-	1360	3261	1	69.29
AAACGCTTCCTTCTACCTGTTACTTACTTTTCATCGAATCTACTATACCCTTTTAATCTACAAGTAACGGGCATAACGCACAAAAATATTAATCTCCCAACAATTTTACTTAACACAATCTTTCAGGGCTGCTCAGGATATTGTTG:1	-	chr4	302507	3'	-	INE-1	33	1	55.48
ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGTGTTGCATACTATTACGATGGAAAAAATAGGGGAAAGAATGGTTGCATAATAACATTGCCTGCTACTAG:1	-	chr3L	4840689	3'	-	jockey	4699	1	65.75
CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGCGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTCTTAACTTACATACATATGTGCACACATCGCAGTGA:1	-	chr2R	9544055	3'	-	opus	7047	4	75.27
AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGCAAAAAAAAAACATATTAAGTACAAATTCGATTCCTACGGAATATACGTTATTTTTTAATTGAATA:1	-	chr3L	17558005	3'	+	jockey	4975	1	50.47
TTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATTTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTTACCCAATAAAAATAAAATAAATAAAGGGACAGTTAATCTATACTTAGGCTTACAATTCTTATAAA:1	+	chr3L	25625152	3'	+	297	481	1	63.45
ATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATTGTAAATATTCACGCATCTCTTGCTTTAAATTAGCAGACCTTGGCT:1	+	chrX	6522043	3'	-	F-element	76	1	66.93
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTTCTTTTTTTCAGTGCAAG:1	-	chr3L	11393436	3'	-	roo	20	2	71.23
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTTGAAAATACCCATTTTCAAAAAACGAATAGC:1	+	chr3L	23326056	3'	+	pogo	2043	1	77.39
CAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTT:1	-	chr2R	20596480	3'	+	roo	323	2	75.34
CTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGACGATATTTTCAAATAAAACTCTTTTGTTTACCTTTTCGATCGATAATTATCGATGTTTATGTTGTGATGTGTGGCAAGGAGAAACTCCGCGCTGGGAAA:1	-	chr3R	2542285	3'	+	roo	322	2	68.89
AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATACAACTGCGGCGTAACATGCATGGGTGTCTATGGTTTAAGATAAAGGGGGTTCGTAACTAAA:1	-	chrX	12074515	3'	+	412	433	2	57.53
ACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGGCTAGAACAGATGAAGAA:1	-	chrX	21087587	3'	-	mdg3	35	2	55.77
TTATTTTTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAACCTTAAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACCTCTTTAAAATAAGATTTTCCAATAAAAAACATGTTTGATCACAGTAAAAATGTGTATGTATGTATTTTCATT:1	+	chr2L	23034061	3'	+	FB	367	1	50.00
ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAACCATATCCGTATCGTCTTTTCTGAAACTGAGGTCATCCAGCCAGGCGCCGGAACTCATTTCCC:1	-	chr3R	11496490	3'	-	1360	19	1	70.15
TTTGTTTTTTTTTTTAATTTATCCACTTTATCCCTCTGTAAGCGTTCCGTTGTCCTCCTAGACATATTCGAACTCTGTCAGTTAAGGCAACGTCTTGAAAACATGCTGAGGAGCTCGTCCGTGTACA:1	-	chr3R	20749834	3'	-	Doc	4697	1	74.02
CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAATACATACTAGAATATATGTGGGTTTTATCATCAATAAGAAATGCAT:1	-	chr2L	13763112	3'	-	pogo	25	1	68.49
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGCGCAGTTTTGCATTAGGCAGTGGAAAGCAGAGCAAGGCGACAAACTTACACCTGCCTCGGATGCAC:1	-	chr2L	7945308	3'	+	roo	354	2	56.16
ATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGACTAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTTATTCGAGCTCTCA:1	+	chr2R	4339523	3'	+	G5A	2790	1	79.82
ATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTGCAGGAAAGAGCAAGTTAATACAAATATGTGCACACTATTCACA:1	-	chr2R	5657311	3'	-	R1A1-element	327	1	71.33
AAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTTAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGTAATGTTTAAGGTAATGTTTTAATTATATTACCACTTGAGCCGCTTGTAAGGAAGGGGAAG:1	-	chr3L	22820552	3'	+	Quasimodo	218	2	51.16
GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACAATTTTCAAAAGGGATTTAAGCTTTAGAGTGTATTTATTACAAAGTAGCCTTATTTAAGATGCGCACCTTAACCAG:1	+	chrX	2842602	3'	-	Tabor	47	2	58.22
TTTAAATCTTTTTTTTTTTAAATAA:1	+	chr2R	13507476	3'	+	FB	178	1	96.00
CGTAAGTCATATCATATGGTGTGCGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCATTTCAAGTAAAACGGTAACTTGGTTACTTCTTGTAATTATGTTTTTTATGGGATCAAATTGAGGAGCAGGCAAGGACCCGCTC:1	-	chrX	23202099	3'	+	R2-element	52	1	54.79
ATTTACATTTATTTGTTTATATGTTTTTTTTTTTATCAATATGTAAAAAAAGAATAAAAAAAAACTATTAAAAATGAATGAAATGAAAACTATTATATGCAAGTTTACACCAAAGACACTAGAATAACGTAAATAACGTAAATATG:1	-	chr2L	21395737	3'	+	S2	101	1	74.66
GTATTTAGACATCACATTTAATTAGTTCGCATTGATCTGTTCTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTTTGGGCATTGGCGGCTGTAGGAAGGCCGGAAGGAACGG:1	+	chr4	803102	3'	+	Tc1-2	213	1	64.15
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGG:1	-	chr2R	13084596	3'	-	roo	22	2	54.74
AATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGTACCTACCTAACTATTTAATATTTAAGGAATGTGAAAATTTATTTAAATTGCACTATTGACTAGATCCTTATCGCGTTCATTCA:1	+	chr3L	17685241	3'	+	mdg3	210	2	41.78
AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTCATTACAATTAAAATAGATCAAAGCCGAAAAATAATCAACGACCTTTTTTGAGAGTGTGGGGCAAAAAC:1	-	chr3L	17115442	3'	+	blood	7334	1	55.40
ACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGTTTCGTTATTATTTTAAATATTTGTGTAATTTTTTTTTCTATTCATTTGTTGTTGCCAGCCACTTGCTGTTGTATTGCCT:1	+	chr3L	9492929	3'	+	Doc	223	1	52.05
GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGATAGTATCTCAAACTGAATTTCGTCAAAG:1	+	chrX	14824755	3'	-	jockey	4746	1	75.00
GCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAACAGACATGAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTC:1	+	chr2L	9412072	3'	-	jockey	4545	1	76.00
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGCCTATAATTGGTTCGTTTATGTGCGGAATGGAAGAGAGCGTCCTGAACTTGAAATAG:1	+	chr3R	22122785	3'	-	roo	8712	2	61.24
AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCATCCAGTGGTTCCATTATCCCCCT:1	+	chr2L	19965076	3'	-	Doc	43	1	56.49
ATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAACATGACAGAAGTTCTTAAAGAAAATTATTATGTTTATAAGGAATCAATAAAATTCT:1	+	chr3R	19448806	3'	+	roo	8688	2	57.14
GATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCAATTGGCTGGGCATTTTAGATTAGCACGGTGTTCGCATGGCGATAAGATAAGTAGTGTGTAAAAGGATACTGCGAGTAA:1	+	chr2L	2797208	3'	+	Burdock	303	1	50.72
AAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGACTTCGTT:1	+	chr3R	3320516	3'	-	1360	81	1	71.92
ATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGTGTTATTATTTGGTTAGGTCTTCTAACAGCCATCTTCTAGGTCTTCTTTA:1	-	chr2R	4136094	3'	+	Bica	408	1	65.03
AAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAAAGCT:1	+	chr2L	22150622	3'	-	S-element	80	2	80.88
TTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGAAATATTCGAGGCATTTTCCGGATTTTTTCTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCCACGCTTCGTCGCATTTTAAATCAAGCTTCATTTTTATTTCTATTTACA:1	+	chr2L	1839361	3'	-	hobo	17	1	71.43
TTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTAGGGGAGCTAAATTCGGGAGCTTGAAGCGC:1	-	chrX	6499892	3'	+	Quasimodo	6913	2	75.38
AAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAACCTACATTTTCAACCTAAATTTATGCCCATTTAGG:1	-	chr2L	19205110	3'	+	F-element	4336	1	76.03
ACGTATCGACATCCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGCTCAATAACATTGTTAG:1	+	chrX	21667918	3'	-	gypsy2	6560	2	72.31
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTGCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATC:1	+	chr3R	20469659	3'	+	roo	8989	2	75.71
AGGTTTGAATTTGCAAAAGCAAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCAATTACTGGCCCAACATTTTACTATGCACAGATACCGCGCATAGAGGTCTTGAGATAGAGACAGAAAATGTACTTAGGTTGTGCTGGCAG:1	+	chrX	22708023	3'	-	Bari1	103	1	65.67
AATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATGGGATCTTTAAAGGGGTAGTACAATAGATCAGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGTCTTATA:1	+	chr2R	4774746	3'	+	baggins	5335	1	66.44
GAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGAGTTCTCGTCTAAGTGTGCTGACTTTTTATATGCAATATATATTTAATGTACTCATCCAAATGGTCGAATATTACCTAGGAAATCGGAAAAAC:1	-	chr2L	22717905	3'	+	1360	3183	1	56.16
AAAACTAACCGGATTTTCTTTTTTTCCCTATCTACACATTCGTATTTAAAGTGCTGCAAAAAATGGTCAACGGCCGAAAAAGACTTGAATTCAATAGTCGGAATGGTCGCTTTAAAAATATGTCCTTGTTGGTGAACAAGGCATAA:1	-	chr3R	31899000	3'	-	HB	134	1	65.07
AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGATCACAGAGCTGTGCACGCGCATTATTAAAGTGAACTCAC:1	+	chr2R	17259332	3'	-	jockey	4759	1	73.29
GAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTACAATGCAATTGATATTTACTAAACAAAGTTAAAACAATTAAAAAATGAGTTCCAAAAAGAATTCAACTCCACCAAACAATTCAGCCGATAAGGA:1	-	chr2L	15835559	3'	-	jockey	342	1	50.35
CTCGAATCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAA:1	-	chr3R	16076810	3'	-	roo	56	2	77.06
ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACA:1	-	chr2R	20496923	3'	-	blood	76	2	70.55
TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAAGTGTAAAATACAAAAAAAAAATTGCATAAGCGATTATTAAAGTAAAAATAATTTCCAAAATAACTATATTGTTTT:1	+	chrX	13276039	3'	-	TART-B	10199	1	49.66
ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGAAGCACTGCCATTTTTTCTCTCGGTGCACCCACT:1	+	chr3L	20168424	3'	-	mdg3	90	2	76.71
AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATG:1	+	chr3R	16404561	3'	-	pogo	47	1	60.32
CACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGT:1	-	chrY	495741	3'	-	Doc	84	1	76.03
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCACCAATGTGTGTCTTATTTTATTTTATTTTATATTATTTTTTTTTTAGATTGCCATGGTCGCCAGTTTTGGGTGCATGTCGCGCAGCTTAATCTCTCC:1	-	chr2L	7898253	3'	-	roo	22	2	64.58
TTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCGAGGCTGTTGGGGTAAAACACACTCATGAACACATTT:1	+	chr2L	17079802	3'	-	jockey	4734	1	76.19
AAAACAAAATTATAAAAAAAAAACATGATGAGCAATTTCCTTTTCGCTTATGCTTATAGCAAATTAATAGAAAAAAGTGAGTTGAATAATATAGCTAAACAGGCATCTCTGGCGCCACCA:1	-	chr2R	13096754	3'	+	gypsy2	424	3	45.00
AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTATCGAGAAAATACCTCTATAGCACCTATATAAGATAAT:1	+	chr2R	16945341	3'	+	jockey	4949	1	64.00
ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACACGCCCCTTTACGAACCGGTCTCTGTTAATGACAGTGGCACATACGATTTTTGTTGCATACTTTCGGGCACGCAGGAAATGAGTGCTCGCCCAAATATGCAGC:1	-	chr3R	13360255	3'	-	jockey	13	1	79.70
GACTATTAGATACCCGTTACTCAGATTGCGGGAGTACAAGTGAGTCGTTCGGCATATCAACAGAAGACCTGTCTTCTGAGTCCATGCGAGAAAATATGCCTGAATTCAGCTAGAAAAACAGAACAGAGATGCGA:1	+	chr2L	22079797	3'	-	INE-1	549	1	52.99
CAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTCTTCTGGCTCCGATTTTCCTGCGCATTATTCCAGTTATTATTGTTATGGCATTACTGTCTTCATTAAAGTACGAGCGGTTAATTAAAG:1	+	chr2L	19680236	3'	+	F-element	292	1	57.93
GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGACGATAGCCCCAATTTAACTAACCGTTTAACGATCTTGCACATTTCCCCAGCTCGTCGAAGCCCCAATTTCGGCGGTTTGTATCTCT:1	-	chr3R	21705949	3'	-	297	4	2	74.79
CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCTATTTTCACTTGCCATTAAGACAAGCCAATAACATTTTCTTTATTTCAGCATAATGATGTTATTTAAATATATATATTATGAGAAAAATATATAAAATTGCTAATA:1	+	chrX	21973970	3'	+	pogo	2088	1	69.18
TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGC:1	+	chr3R	22844285	3'	+	roo	9041	1	55.56
ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATGTTATGAGTTTATTTTGAAACGAACGCTGATTTTGTTTTTCC:1	+	chrX	5643559	3'	-	roo	78	2	75.34
ATAAAATAAAACTAAAAAATAAACCTAAGGTAGCATTTAATTTATGGTGTTGAGCTAAATCATAGTTTTTTTTTTAACTAGTTGTGTTAAGCTGGAATTCCTTATTTGATCTTTGAAATTTAAAAATACTTTCCTCTTTAATTTGT:1	+	chr2R	22230462	3'	+	Doc3-element	169	1	80.82
ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACATCAGTGCAGAGTTTCACCATGATGGGAGCCACCGCCGCATTGTG:1	-	chr3L	2362339	3'	-	Stalker2	7284	2	56.44
AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCA:1	-	chr3L	22437840	3'	+	roo	9053	2	67.74
GGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAATTTTGGGTAAGCAGAAGTGCGAGAGTATTTGCATCTTCTCGCCGGACAGACGGTCGCTTCTTTGTGGCGACACGCGTCGCCCACAGATGAGTC:1	-	chr2R	7586106	3'	-	I-element	5045	1	74.80
GAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAGTGGTTGTCTCTAGCCTTGTGGCGTAGAGATTTGATTGTAATAAGAATTTAAAAGCAAAAAACATTTTGTGTTCTTGTTTTTTATTTTTTTCATTAACAAACATTCGGTTCG:1	-	chrX	21656890	3'	-	gypsy	7339	2	51.85
GGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCAT:1	-	chr3L	27356067	3'	+	Tc3	1671	1	64.00
TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGA:1	-	chr2R	19050193	3'	-	roo	41	2	54.17
AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGC:1	+	chr2L	14772130	3'	-	roo	8686	2	58.10
TCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATCATTTAACGTCTGCAAATTGTTTCTAATTGTTGATCGCTGCTGTCGCTTACAGAGAATAAAGTTAACAACATTAC:1	+	chr3R	13349145	3'	-	BS	4997	1	72.55
ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCCCGCTGCTCATTCAAATGCAATTTTGTTGCAACGTTTCGATTTCGTTGTCACTCCCATCCTC:1	-	chrX	2295888	3'	+	Tirant	8456	2	56.43
TATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTCCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGCAAATTGTTTGGAATTGTCAGCAGCAGCGAACTG:1	-	chr3R	12854979	3'	+	Quasimodo	208	2	66.07
GAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCACTCTGCCAACCTTCTCTGGCGGCTGTTTAACGGGTTGCCTT:1	-	chr3R	9126318	3'	+	Doc	4457	1	53.16
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTGTTATATTATATATATCTATGATTTTTATTTTAGCTAGTAAGCATACTGATAGTTTATAGATATTTTAGTAATTAAACTTTTTAATAAATAACGCTTTTTTGGG:1	-	chr2L	5254229	3'	+	roo	9055	2	31.51
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTGCATCTGCATAT:1	+	chrX	6486840	3'	+	roo	9047	1	62.07
AATTTCAAAACTATTAACAATGAACGAGAAAATTAACTAAATCCACGTTAGCACCCCATAAAGATTGCAGAAAGATCTTGAATTGTGTCACAATTGGGGCTATCAGACCAAGGGGATCATAATATTTGAATTTTTTGGACACCGTT:1	+	chr2R	4956201	3'	-	S2	1565	2	71.92
AAGTATAATCTAAATATAATTCTTAGGCCATAGCCACGACATCTAACAGTTTCAAATCACTGTTATAATGTCAACGGAGATGTTTAGTCACAACTTTTTATTATCATTGAGTGCTTATTTTAAAGCGTTTATTGTTATTGTTATT:1	-	chr3L	26697881	3'	+	gypsy7	5420	2	69.66
AATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAATTTGCTGAGGGTATGTTCAAGTGTGCAACGAACTGTGCTTGAGTAGAAGACAGGCAGAGAGCCAGTGC:1	-	chr3R	28773312	3'	+	mdg1	7156	2	52.74
GCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGGTTTAACGTCA:1	+	chr3L	27391434	3'	+	1360	3377	1	77.40
GAGGCACGAAATGCGGACACTAGCCCTCAATAATGCCTTTTAAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATAATATAATGTACATAGATTCGGCTATTTCTAAGCTATATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCA:1	-	chr3L	6630130	3'	-	1360	470	1	57.53
AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTA:1	+	chr3L	10574387	3'	-	Tabor	52	2	50.68
AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGCTACTTAAAAAGTTGGCAAATTAAATTTAAGATGACTTAAAGCATTAACTTACGAATATATGCATAAAATGCTCACAATTTTTTCGCTG:1	-	chr3R	12598429	3'	-	hobo	32	1	64.38
CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATATTTTATTTTTGGCTCCACTGTGCGCTTTTCATTCTAATTTGCATTCATCAGCTCACCATCTAATTGCA:1	-	chr3R	30344600	3'	+	pogo	2069	1	57.69
ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAGAGAAATTAAAATGTTGCTTGATATCTTATGTTTATTTGAATTACATTGAAAAGCGATGAAGTGAACTTTTGGTG:1	+	chr3R	10462730	3'	-	opus	7152	4	59.29
GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGCGCACATCGATGTCAAATTATTAGGTCAACATTTGGTGACCCTGACGTGATTGACATTTTTAATAATGGGCGTA:1	-	chr3L	23728620	3'	-	HMS-Beagle	6840	2	53.79
TTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATAGAGATAATTTAAAAAATAAGTATGTTGCACTTGATGTTAAACTGACGACCCTTTTACGAATATAAATGTATTTT:1	-	chr3R	24383217	3'	+	rover	301	2	53.42
CCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGTTCTTAACTTACATACATATGTGCACACATCGCAGTGACTTTCGGTGAGTAA:1	-	chr2R	9544041	3'	-	opus	7183	4	73.08
GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTTTCAATTTCGATGTGGGCAGAATCGTTCGATTTCGTCCTTAGGTGCTCTGGTTTTCGC:1	+	chr3L	22968455	3'	+	mdg1	7433	2	62.96
GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAATTTATTGAAGTTGGCCAAGTGGGAGAATGGAAAATGATGAGCCACATATTCGC:1	-	chr3L	16769241	3'	-	FB	44	1	59.02
TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTACTTTGTACC:1	-	chr3L	23146459	3'	-	1360	33	1	56.92
GGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAACAAATGAAGTGCAAAATCAACGCGACGTCCACAGGAACCACCAGCATTTTGGTTATTCGACTATTG:1	+	chr3R	19529215	3'	-	jockey	4656	1	58.72
ATTAACAGAAACACATAATACAAACCTCTAGATTGATTTTCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTGATTTTTTTTTGACATTTTATGGCAATTTTAAGGCCGTAAGCATTTGCAGTCAGTTCGATTT:1	+	chr3R	10549627	3'	+	hopper2	1326	1	59.15
GTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTTATTTCTTGGTGAACTTCAAAATAAAGCTTTTCGACAAAGGCTTCAAAAAAACTATGCGGTGATGAATTGTGGAACGCATGGAAACAAAGGAAAAGAAATACGGACATGGGAAAA:1	-	chr3L	21483908	3'	+	Q-element	323	2	76.71
TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAAATGTACTTTGTAAATTTCGATTATTCCAAGATC:1	+	chrX	14749709	3'	+	copia	237	1	51.37
AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATAT:1	-	chrX	10640047	3'	+	roo	357	2	72.55
CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCACGTGAGTGCGTCTCGCTCGCACCCATGGGGAGTTGGGGCCAGCAGCTGGAGTGGGCGAAAGAGAG:1	+	chr2R	11629854	3'	+	Tirant	350	2	53.19
GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTAACTGTCATGTTGTGCCTTTTATAGGTCATTACATTTGGGGTGCAGAATTCGTTCGCTTTTTAATTTATGTTGAGGAAGTTTGAGGGAGAAAGAA:1	-	chr3R	21434837	3'	-	412	7078	2	62.33
TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGTGGGGCATTGGAGCATTAAAG:1	+	chr2L	17081882	3'	-	jockey	4717	1	50.00
AATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTC:1	+	chr4	158192	3'	-	1360	344	1	75.20
ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTACAAAAAGTGAGTTGAACTGACTGCAGATAATGCGGATAGGTGAAATAAAACCACAACTATGCTCTGAAATATTTGCACCTTATTTAT:1	+	chr2R	21146004	3'	-	pogo	29	1	64.38
AAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTTTTTTGACAAATTTTCCTTGCCAGCCAACCAGGCTCAAAGGTTAGACAAGCGA:1	+	chrX	11463554	3'	-	hopper2	1190	2	71.13
ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTTGAACATTTCCAGCAGGACTCTCTGGGCCTCGGCTCCGCTCGGCTTTCAATCTCGTCCTCCG:1	-	chr3L	2712738	3'	+	P-element	2879	2	67.02
TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACTTTCTATGTACAGGGCTATTT:1	-	chr2L	15991266	3'	-	mdg1	25	2	58.22
CTAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACATCG:1	-	chr3L	21855442	3'	+	blood	7321	1	61.64
TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCC:1	+	chr2L	19965039	3'	-	Doc	88	1	73.38
TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAAGATGAAAAGATTATTTCAAAAGCAAATACATGTATGCATGAGTATTTCCCTTTGATAAACTAGTAAATCAAATGTAAACATTAAAGTATTTCAGC:1	+	chr3L	11531014	3'	+	roo	9046	1	67.12
GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTCTCACTTCCGAATGTCCCGGTGTGCTTACAGCCCTCTTAATCGCAATCCTTTGAACATTC:1	+	chr3L	11321504	3'	-	mdg3	61	2	56.16
TTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGAACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGATTCGATGAAGAAAAATACATGGCACACATCTGATTGCGTTTGAACGACTA:1	-	chr3L	23603164	3'	-	F-element	84	1	65.07
AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGATTGTGCCTACACACAC:1	+	chrX	1899676	3'	-	P-element	97	1	18.06
AGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACAC:1	-	chr3L	7292477	3'	-	HMS-Beagle2	77	2	73.29
AAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATCTATTCACCGCCTTGGTCTTTTTTTCACCAATAGGCCAATATGTGGAACGAATTACGCCAAATTATACTGCGTTCAAGGCAGGTACA:1	-	chr3L	26131140	3'	-	jockey	4888	1	67.97
GACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGAATGATATTTAACATTATGTTATGTTCGGGGAATTTAATGTATAAGGAAACGTGAAACTCCCGTGTAAGATTTGTTAC:1	+	chr3R	17420413	3'	+	roo	453	1	55.17
TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACTAAGTATTTGGCAAGGAAAATGCAAGCCGAAACTG:1	+	chr2L	15185812	3'	+	Quasimodo	6984	2	70.59
TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCGACCTCGCTCAAATTTCAAAAACTATATCGAATTTTTTTCTTGTTTCTTCTCGGACTGGCATACTGGTTA:1	-	chrX	10640005	3'	+	roo	9027	1	49.28
CATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCCCACCCCCTGCCCAACCCTTTTTGACGCC:1	+	chr3R	2077977	3'	-	Quasimodo	249	2	53.23
AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAAGTAGCCATACAACTAA:1	-	chr3R	20469571	3'	-	roo	32	2	42.07
CTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAATAGTTT:1	+	chr2R	20194310	3'	-	Max-element	44	2	51.80
TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCGTTTAAATACGGCGGG:1	+	chrX	13039518	3'	-	roo	3	2	70.45
CTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATCGGAACTCTTTTCGCTCAAATGGAACCCAAACCCTTTGACCTTCGACCTTTGTATA:1	+	chr3R	5490449	3'	+	1360	232	1	56.78
GTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCAGTTAGAGAAAACCCGGTTTTAAATTTACAAAT:1	-	chr3L	20033366	3'	-	blood	7216	2	75.91
GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACCAACTAGATACCTTTGGCCACAAGATACCTTACCTAGATATTTTT:2	+	chr2R	4977111	3'	-	1360	73	1	69.18
TTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACCTTTCAACGAATCTAGTCTACCCTTTTACTCTACGAGTAATGGGTATAATAAAAAACAGAAACAAACCCAACCAATCTTAAAGTG:1	-	chrX	16541447	3'	-	INE-1	82	1	71.23
AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGAGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCA:1	-	chr2R	19050178	3'	-	roo	8669	2	67.68
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATCACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:1	+	chrX	23439059	3'	+	P-element	2495	1	58.90
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTC:1	+	chr3R	15072669	3'	+	pogo	2046	1	57.53
AAAATTAAAAAATTTAAAATTTAGAGTATATTTTTAAAAGAAACCAAATACATTAATATGCCTTATAGCTTTTTACTTACAAACCTGCCAATTAGAAATTAAGGAGTTAGTCAATTTGATCTGTCATGCTTTAAAAGTCAAAATAT:1	+	chr3L	4558324	3'	+	1360	3031	1	56.16
AGTTCTTGACTTTAGATACAATTTGTACATGTCCTAAGTTGCGCATGTGATAACATTTAATGATCCAAACATTTTTAGCTATGTTAAAATGTGCCAAAGATGGATTTCGATAATTAATTGTGCGTGCTTATTTTCTACAGTGCTT:1	-	chrX	7350734	3'	-	invader1	3857	2	89.66
TGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGGAGGTTTCGGTTGGGAGTGGAGGCGTG:1	+	chrX	21667964	3'	-	gypsy2	42	2	60.27
GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATCGGATCCGTGGA:1	+	chr2R	13084694	3'	+	roo	9020	2	55.48
AAAATATCTAAAAAAAAAGAAATTAAATAAAAAAAAAAACAAAACTCAAATCAATATCTTTCGTATTTGTTATGGAAATTTAATTTATTTATTTTCTTCTCCACGGCACAA:1	+	chrX	5432563	3'	+	TART-B	10628	3	81.98
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGTAACTGTTGCATTGTTTCCACTCGAATT:1	+	chr3L	12879797	3'	+	roo	9052	2	64.29
GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGTGCTCATCTATCTATCTACTATATATATATATGGCGTAACAGCTGCATCAATGATTTGATTTGATTTCCT:1	-	chr3R	22217825	3'	+	hopper	1388	1	59.35
TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAATACCCTCACATCCTTCCATTTCACCCACTTGTTATATCCGTCCCCCGCCCCGGCACATGCGCACTTTTTCACATATGGCACATATGCAAATATCAATAC:1	-	chr2L	13585793	3'	-	Tabor	6854	2	71.32
AATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGGCCATCTAAATTAAAACGTTTTTCATCAGTTAAGACAAATGAATGCCA:1	+	chr2R	6487938	3'	+	copia	185	2	66.43
GTTTTCGTGCACAGTGGTCTTATTTAAGATAAACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTTTGCAACCGTCTTTAATATATTGCTTGTATCTCATATCTGCTTTTCAAGTTTTCTAAGAAAAATTAAAATGTAAT:1	+	chr2R	5526710	3'	+	Cr1a	401	1	56.85
TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGGATAAGATGTGAAATTAAAAGTTATTTTTGGAATTCTATATTTATCTA:1	-	chr3R	6290971	3'	-	Doc	79	1	71.23
ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACCAGTCTGTTGGCGACATTCGTCCATTGTCCTGCTCGATGGATAGACACGCGCTTGTCATAATTCCGTATAATCTATGAACGCCTT:1	+	chr2L	21891841	3'	+	mdg1	385	2	60.27
TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAACACCTCGGCGCAACTTCACTTTGCCGTCTAATTGCTTAACAAAAGCTTCAATTAAACACTTCAAAGAGC:1	-	chr3L	10848633	3'	-	blood	53	2	52.05
ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTT:1	+	chr3L	10574402	3'	-	Tabor	6875	2	51.72
TAATAATAATATTAGTAATAATAGTTTAAATTAGTTTACTTTTGTTATAGTTTAACAAGCAACAACATAAAAAGCAGGTATATCAATTATTAATAAATGAAACTGTTTTTGTTTACACTCGATTTCACTGCGAGCAAGCGCCAGCA:1	-	chr2R	12917773	3'	+	mdg1	7080	2	76.71
GAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAAACCTGACGGATGACAATGTCGCAAGACGGTGCGATTCACCGTTAAACAAATACCCTACAAATATCGTTCTTGGTCTTGAAAAAGTTGAAAAGAGCAATTAGAATTGGTAAAAAAAACC:1	+	chr2R	3104472	3'	+	Gypsy6A_LTR	344	1	69.66
AAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACAGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTG:1	-	chr2R	5485139	3'	+	blood	7333	1	75.89
ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCCTGATGGCGATATCCTGGCATTTCGCTGTCTCATTGCTTG:2	+	chrX	8543520	3'	+	roo	327	2	71.92
CTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACATCTTGCATCCACCGCCGGATGTTGGGCATCTCCATCTATCAGCTATTTGTGTTGCAACCTGCGTCGTATCGGTG:1	-	chr3R	16316399	3'	+	blood	420	1	52.86
CAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTATATCCTAATGGGTATTTCCAAGTCCGTACAACTTTGTCTCATCCAGTTAGTCCCAACTTGTTTTATCTACTGACGTTGACTCAATGTCGAAGCCAAAG:1	-	chr2R	20194150	3'	+	Max-element	8523	2	74.66
AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATATTCATTGGCTTTGCTTTGTAGCACCGATTTGCTGTTGGGTCTCGATTAGCATAAAATACACGGAACAG:1	-	chr3R	14981144	3'	+	mdg1	369	2	53.42
ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTACGATCTTAAAAACCAGACAAATGTTCAAATGTTTTTTGAATGCTTTAAATGCCATTGAATCCGAAGGCCTGTA:1	-	chr2R	7898056	3'	-	roo	48	2	56.85
TTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAA:1	+	chr3R	17243231	3'	+	hopper	1371	1	53.42
CTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAATAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAG:1	+	chr3R	19450207	3'	+	roo	108	2	71.23
ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGATGTGTACTGGCTG:1	-	chrX	13039509	3'	+	roo	393	1	79.25
ACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGATTAGTGACCAACTGAAATGTACATGGGCTATGC:1	-	chrX	5670543	3'	-	P-element	486	1	25.34
ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCCTGGCCCGTAATATCATGCCAAAAAGTTTAATAGCGCACAACGCGCAAACCGAGAACCTCCCCTTCACCC:1	-	chr3L	10146918	3'	-	Quasimodo	37	2	80.00
ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATT:1	+	chr2R	19004210	3'	-	roo	8747	2	76.71
AATCATTGCCTTATTAATTTTTCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAAGGAAGTACAATAGAAATTATTATAACTACTGTAATTTCATAAATTTCATCAATGTGTAATTAGACGCGCGTTGAGGTGAGTCTTGC:1	+	chr3R	18633002	3'	-	1360	439	1	58.90
AAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATACCATCTATTATTACCATCTTATTATTGAATACAATAACTAAATATTTTTGTATAAGT:1	+	chr3R	17605728	3'	-	Tabor	65	2	60.00
CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGTATAACTTCTAATTCTAATACTAAGCACATAAGGAGCATATGGCCTTCTAATCCAGATTACAAGTAATTGCAAATTCGTGTTAGGCTTTTAAT:1	-	chr2R	9325366	3'	-	BS	5004	1	63.28
CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTGCACTGGTCAAATTTCCAATTCAGAACG:1	-	chr3R	25448318	3'	+	roo	9047	1	64.06
ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATAT:1	+	chr2L	17420245	3'	-	roo	8726	2	64.29
AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATCCCTATTTCCACACATTATCCCCGTGTTGATTACCCCGTAGGTGGCTGGACTGTTGGTCCC:1	+	chr2R	6085736	3'	+	pogo	2046	1	59.31
GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAGTCAGTCTGCGTCACAGAAGCGCAATCGATTTCTTTCAGATAAGACCTTTTTAATTAAAAATGTAATTTCACCTATACTTCTGGAGTAAAATGATTGT:1	+	chr3L	1534794	3'	-	pogo	19	1	71.23
GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCCTCTGGGTGGGTGGTCCTTTAAATATTCAGCGGTTAATGCTCAAAGAAAAGTTGAATTAATTATTCGGT:1	+	chr2L	11674438	3'	-	jockey	34	1	59.13
GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGACGCCGCCGGGCATTAATCTGAAATGGCAAACGCCCATTCGCCAGGGAAACCGGAGCAGGAGCAGGAGCGTACAGCATCCATCCATGGAGGACAACCCAAA:1	-	chr2R	19797971	3'	+	Transpac	302	2	72.59
GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTACATGTATATCTTGTACGACGCGGGTGTCTGATTCAACTTTTGTGTCACTGGGC:1	+	chr2R	17626927	3'	+	opus	450	2	59.23
GTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	10582472	3'	-	Juan	3860	1	55.24
TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGATGGAGGAAACCGCAGAAAAGCAAACTGTCGATAATTGCAAATAATGACG:1	+	chr3R	14651285	3'	+	P-element	2821	1	38.13
TGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGGGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTAGACATATTTGGGATGCTGTCGGACACTGCAATGGAAG:1	-	chr3R	4335659	3'	-	412	178	2	72.03
GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATTTCGATATATAAATAATTCTATATTTTTTATTCGAGTACA:1	-	chr3R	9210642	3'	+	mdg1	7381	2	71.53
ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACTTTCTATGTACAGG:1	-	chr2L	15991273	3'	-	mdg1	32	2	54.79
GCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACATACAGCCAGCAATGAAACTGTTAGACAACACTAAGCTTAAG:1	+	chr3L	22721172	3'	-	INE-1	29	1	65.71
ATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACTTGTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCTATTAAGTTAATCTTATTTTGAAACACAGATCTCCAATAA:1	+	chr3R	23021010	3'	-	INE-1	569	1	45.71
TTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTAAGTGACTCAACTGATTTTATGAGTCGTGCTGGTAGTATGCAGATTAAAAAGTTACAATTTAATTGGTGCCGCGTACACCA:1	-	chrX	8543688	3'	-	roo	8842	2	53.10
ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACGTAATTCGCAACTCGCTACTATCAGCAATTTAATCTGGGATTTAAGCCGTGCACATGCAAATCAGTGATGTTCAGGCCGCAGAATAAACTGCTCAACATGCTGATTTAGC:1	+	chr3R	25826814	3'	-	mdg1	7050	2	76.55
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGCACTTATGTGCGACTCGTGTTTAC:1	+	chr2L	3886259	3'	+	roo	361	2	52.74
GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATACATATATNTGTGTGTACATATGTATGTGTATTTGTGCATATAAAGCTGCGCTTATTTCACTCTTCCACTT:1	-	chrX	6498931	3'	+	Quasimodo	7324	2	59.57
AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTACACGCCCCCTTCCGCTTGCCACGCCCCTTCCGGTCGGCGGGTCCTGG:1	+	chr3L	12308406	3'	+	hopper	1411	2	66.25
TTTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTGGAGACAGCGCTAGTTTGTTGACCCAAACCACCCAAAACTGCCACAACTTGGACATCATTATTATGGATA:1	-	chrX	21320612	3'	+	INE-1	162	1	77.06
CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACTGGTTACTGATCGTTGCGAAATTTTCCGAATTCTGGTCATGTTAACTTAACATTAACAA:1	+	chr2R	24561530	3'	+	P-element	2835	1	45.93
ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTAT:1	+	chrX	23439047	3'	+	P-element	2495	1	65.67
TACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCATACACCCATCCTTACTATATACACACTTACAAAAAGAACACACATAACACCATAAGAATTTGCATCCTTTCGTGCGTCAGTA:1	-	chrX	21091205	3'	+	mdg3	45	2	50.34
TCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATGTGAGCGTGTATTTAGCGCAGCCAAACATGAAAAAGGTTCTTGGGCGCGCGATTACGTGC:1	+	chr2L	15181834	3'	-	jockey	4900	1	58.62
TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCAT:1	+	chr2L	15833061	3'	-	hobo	78	1	77.61
ATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTTTGTCAC:1	+	chrX	21947763	3'	-	mdg1	3	2	77.59
GTTCATAATAGCAACATAGTGTATAAACATTAAGTAATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGATAAATGTTTCCCCTTTGACTTATCAATATCCTGGAATTGCTTT:1	-	chr3R	29542228	3'	+	invader2	35	2	64.23
GGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTT:1	-	chr4	311195	3'	+	1360	3332	1	60.71
CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGC:1	+	chr3R	13501148	3'	-	hopper	36	1	76.47
AATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATTCTTGCTCTCAAGCCATTCACCCTCTCA:1	-	chr3R	11214887	3'	+	FB	251	1	76.67
GTAGTACATCGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTCCTCTGCAGGCCGTTAGCATTCCAAATAACTATTTTTAGTGCAAGCACAAAAACTTCAATCAATATTAAA:1	+	chr3R	11547750	3'	-	G2	342	1	74.59
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATATTAAAAAGTGGCATATACTAAGCAATAACATATATATGATTGTTTACTTGAAACGCAAAATATATTTAAA:1	-	chr3R	20469587	3'	-	roo	49	2	53.42
GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTCTAAGTAAACTAATATTCTAA:1	+	chr3L	22437984	3'	-	roo	8702	2	61.64
AAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACACAGACGCAGTGCATGTGGGCGCAATGTTGACCCATGCCAGGAAACAGAATATTGAGAAAATGGCCTTCGAAGCTTGCATTGAAATCCCTCCGTCGGC:1	-	chr3R	5675240	3'	+	INE-1	167	1	55.80
CTTAGAGAAGTAGGTTTAAGATTTACAATTTCTAGGAACATTTTTGATTTGCTTGGCGGCGGTTATGCTCGCCATGATTTTACGATTTAGGATTTACATTGTGTTAGAATTAGTTTGTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTTTTG:1	+	chr3R	28536939	3'	-	TART-B	10373	1	84.83
ACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTACGTCGTATCTCATCTAAGGTGGCGTCCCGATC:1	-	chr3R	25304682	3'	+	jockey	4847	1	78.08
ACTGCTTACACAGCTTTAAGGTTCTAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGTCAAATATTAAGTATACGTACAGGCGCAACTGCTTGTATTTGTGTGGCGACGCGTG:1	-	chrX	12480300	3'	+	Quasimodo	352	2	60.00
AATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGCCAAGAAATGCGGAGTGGTTTAGCCTGGAAAACT:1	-	chr2R	12838820	3'	-	jockey	4825	1	75.34
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATTTTAATAAGATGTGCTGAACTCTTACAGCTTTCCAATCACTTTAGCAGGTTCCATCGTTTTATTATGTTTAACTAGTCAATAATTTTGTTTAATAAACCCGTTTTCT:1	+	chr3L	233382	3'	+	roo	396	1	76.71
TAAATAAATAAATATAAATATAAAAAAAAAATTGGCAGTTTGAAGAGGAGGGCTAGTATCTACTGCTATTTCGGTCCAATTTATGCACTATATTCTCTCGAGTGGAATTTGCAGAATATTCACGGAGAAATGTTTTTTTT:1	-	chr3R	14860085	3'	+	diver2	444	1	79.29
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACA:1	-	chr3R	17817898	3'	+	roo	9002	2	68.09
ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGCGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATATACGTCTTGTT:1	+	chr2R	16785404	3'	-	412	83	2	73.29
CTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGCCTTTTTTCACGCTTATTATGTGTTGTTTGTGGTTTTTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTGCACATATTTACTATAGGTT:1	+	chr3R	16334529	3'	-	Porto1	302	1	54.68
AAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCCTCTTGTTACTCTAGTGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGTATATTAGTTGCCA:1	-	chr2L	22113011	3'	+	1360	3268	1	54.11
ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGATAAGAA:1	+	chr2L	7898362	3'	+	roo	8983	2	77.40
AATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAACAAGAAAAATGCCTACCCCAAGGGGTCAAAGGGTGAAAATGCTTAACCAAAGGCATTTTT:1	-	chr2L	17081786	3'	+	jockey	4940	1	60.15
GATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGTCAAGAACCATGTAATCCAGCTAGGACCTCGAAACATGCTTTCCATCG:1	+	chr2R	7537254	3'	+	roo	8745	2	67.12
ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTTTTTAAATCATCCAAGGCATTGGAATATTTCTTTTAATATTCAAATTTCTAATTGCTTGTGTCCCGAAGGATGCG:1	-	chr2R	20944315	3'	+	pogo	2082	1	58.87
CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGACTTTGGTGCAACCTACCCAAAGGCTTTTAGCATCATGCACTTATCAACTCGACCTCACTAG:1	-	chr2L	14081313	3'	-	1360	53	1	60.00
GAAGTTTAAGTGCGAAATTTAAGCCCAAATGCAACCATCATATAAGAGCGAAAAGTCGCTAACACATATTTATATGTGATAAAACCTTATCACATATACCGATAGCAATTGGTACGAATTAATATAAAAACTGTTTTTAAAAGTG:1	+	chr4	338939	3'	+	Porto1	55	1	67.59
GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACGCACTCTTCAATGGTCCAAACACAGACAGAAGTCAGACAGAGCGCATTCAAAATCAATTCAATTGAAAAACATTTTCCCCCCCTGGTTTTTTGTTCCGTTTT:1	-	chr2L	1377584	3'	+	hobo	2937	1	80.62
GCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTCTCGGGGTTTGTTCGGAATTTCTTATGGGGGTTGCTACC:1	+	chr3R	11378948	3'	-	jockey	126	1	68.55
GAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAAACTTTACTCGTTGATTTAGTTAAGTATTTAATTTTATATAAATTATAGAAAACTTATCCCGAATG:1	-	chr3L	1350892	3'	-	roo	468	1	63.70
CTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATAAGTACCTAAATAAATAATACATACTAAAGTAAGTTAAGGGAATATAAGGTAATGGGTTTTTGTCTTTGATAACATCTTTCCAGATGCAGAGAGCTTGTCATT:1	-	chr2R	5173563	3'	+	gypsy	440	2	70.34
TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAGGCCTTTCCGCCGTGGTGCGTT:1	-	chr3R	18121680	3'	+	P-element	2842	1	26.09
TGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTACGTTATTTCATCATGTCACTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGC:1	+	chr2R	21101804	3'	-	P-element	87	1	23.45
ATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGTATCTTGCGAATGCGTTTAGTATCCACTATCTATACTGTTGTCCCTTTATAAGTTTCTCTTCAAATGA:1	-	chr3R	4681301	3'	-	micropia	259	2	51.11
CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGGTTCTCCGTTAGTTTATGTG:1	+	chr2R	5311500	3'	+	1360	3341	1	61.29
AAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGTAACTTTTATTGTATTGCAAATAACAAAATTCGAGGGAAATTGTGAAAATATATAAAGTGATTTTAAGTAGTTCTAGAACTGCTTTTGTGCTCCTTAATGCTTTCATTTGCCTG:1	+	chr3R	20868260	3'	-	BS	5002	1	77.93
CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTACTTCATCATGCTCCATCTCTTCCTCTCTCTTTCTTTTT:1	-	chr3R	14651235	3'	-	P-element	61	1	25.45
AAAGACGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAA:1	+	chr3R	1844823	3'	-	Cr1a	186	1	75.56
AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATTTTGCTTCACAAGTAATTCACTAACAGATTTGATAGATATTACTTAAATTTTTTTGTAGTGCTGTTTGCAATT:1	+	chr2L	21884628	3'	+	pogo	2063	1	57.86
TTTTTTCCTATCTACACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATCCCGAAAAGGGACATGGAAATATACCGTTGTATTATGTATGTACAATTGTATTATATTATGTACTTTGAAGAATCGGAAACG:1	-	chr2L	3701073	3'	-	HB	114	1	64.96
AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCACGTGAGTGCGTCTCGCTCGCACCCATGGGGAGTTGGGGC:1	+	chr2R	11629828	3'	+	Tirant	347	2	66.10
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGAGGCTAAGAGAGATATAGACGCGGCGAT:1	+	chr2L	7898357	3'	+	roo	355	2	73.33
ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATAAATCATAAA:1	-	chr3L	7292438	3'	-	HMS-Beagle2	6908	2	68.42
GTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATATTTGTCAAGTCGCATTAAGGCAGCGCGCTCA:1	+	chr3L	13574526	3'	-	hobo	17	1	58.42
AATATAAAGAACACAAAAAGGCATTACAATTATTACAGGTAAGATAGTAATATTTTAATAATTGAATTTCATCACACATGCTGTTGCACGTTCC:1	-	chr3R	17605638	3'	+	Tabor	470	2	60.64
AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGGCCATCTAAATTAAAACGTTTTTCATCAGTTAAGACAAATGA:1	+	chr2R	6487932	3'	+	copia	5053	2	69.57
TCTGCCTACTGAAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGTTTACCAATAGAATTTACAAAACGTACTACCCTC:1	-	chr2R	15064364	3'	+	412	7460	2	72.60
AATATGGACATATGGATGTCAACTATGGGGCAATGCATGCAACTGCAACATTGAAATAATACAACAATCAAATCTTGGCCCAGATGCCAAGACCTAGGCAATTTAGTATAACTTTATACTTAAGTGAGGAGATTAGGTTTTGTGAT:1	-	chr2R	5284536	3'	+	Doc4-element	2595	1	49.32
GAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTGGACTTGAAACGACTGTTGAAGGCGTAGCAAAAGCCGTG:1	+	chrX	17568359	3'	-	G2	2928	1	59.46
GGGTGTGAGCCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTTACAGTCGGTTGCACAGTCAAAGTTCATCTCAAGAATCGAGGTAATCCCACTCCTTTCGGATCTGTGCGACA:1	-	chr2R	6919644	3'	-	hobo	25	1	60.98
CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAAGCCTAGGCAAGACCGCAGAAAAACAGTGCGAGCAAGCGATTTCATAGCCTACTTAGCGGCGCGCGCTGCGAGTTATT:1	+	chrX	13066609	3'	-	jockey	36	1	58.02
CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGGCACACCAGTGCCCCACGTTGGGCGCCATTTTTGTCAAGTCGCATTAAGGCAGCGCGCTCATTCGACTTGTT:1	+	chr3L	13574537	3'	-	hobo	15	1	65.45
AATAACATTTTGCAAAATAAAACCAATTTGGAATCTTTGTATCTTAGCCCAGTAAAAAGTGTATTACCTAAGTTGCTATTATGCCATTATCTGACTTACTCTAAAATATTACAATTTTA:1	-	chr2L	1619306	3'	+	HMS-Beagle2	396	1	77.31
ACATAATTTAATTATGTGCTCGGCATTAATGTTACGCACGAAATTAAGTGTTGAATTTTAAGTGTCTACACTTGATAAAAATGTGAGTAACAAGCTTTGAATTTTCTATTCAATTCATCCGTTACATTCTTACACAACAAACAAGA:1	-	chr3L	17315218	3'	-	G5	109	1	50.00
ATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGCTTGCATGTGTGTAGCTGCCTGTATGTGTGTGTGCTCTGCGCCTCGAAACGTGACTTGTTTTTGGTAGGCTTACGCTGGGGATCC:1	-	chr2L	15833420	3'	-	jockey	8	1	78.38
ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTCAATGGAATATGTAGTCATAAAAGTTAATGATTTCCAAATTG:1	-	chr3R	9921943	3'	-	blood	17	2	71.64
TCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGACATTTTGTGCTGAGCTCAGACGGAGCTCAAGGAAACTGTGTCAACATCTGT:1	-	chr2R	9662710	3'	+	412	423	2	64.38
AAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGCGGTAAAAAAGAGCCATCCTTGCAGTTCTCTGGTACCAGTACCATCGGCTTCGCTCAAG:1	+	chr3L	17205255	3'	-	hobo	73	1	79.34
GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATGTAATATTTTTATTTATTTAACGAAGTGAATATCGCACTTAATAACACAGTATTATCCAACGCATATATATTTGCATTGCAATGTATGGCTA:1	-	chr2R	20496878	3'	-	blood	31	2	61.64
ATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAGGCAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACCTCGTGCCTCAAAATATGACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGT:1	-	chr4	158192	3'	-	Tabor	41	2	56.16
CAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTAGGGAATGTGTAGATCCTAATGGGAATTTCCAAGTCCGTACAACTT:1	-	chr2R	20194214	3'	+	Max-element	8517	2	51.14
ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTAATTCTTCAGATATCAAATCGACAGAAATTTACAAAACTAATAAAAATATG:1	+	chrY	9422	3'	-	roo	69	2	74.66
AAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTGCAGTTTTTGATTATTTTACGTTTTATTTGGATTTGAGTTTGGCCCAGTGCGATGGATTTTAATCGTCTGGCAGAGATATATG:1	-	chr3L	9673532	3'	+	Doc	107	1	56.16
GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGTCTTTCGTTGGCCTTAAAGCCGCATTTCTGCGAACGGATGAGGCTTTAATGCCCATTACGGCCAAATTGGCACTTATCG:1	+	chr3L	9998218	3'	-	roo	26	2	64.62
GTGATTTATAAAAATAAAACATATAAAAATGTATGTTTATACATCTGAAATAGTAAAAGAGTTTAGTTTGATTTAAATTGGTACGAATATTTATCATTTTAATATTGGACAAAGGTTTGCCTTGCATCATATTATATTCAAAGTGC:1	-	chr3L	10003048	3'	+	looper1	1690	1	62.33
ATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGATAGAAAGAGGTTAACATTTTTATTTAAAGAGACACAGTCAGTTTCTATTTACTTAA:1	+	chrX	14549771	3'	+	Tabor	7289	2	56.85
ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCGATCCACCTGGGAACGCACTACGTTACAGTGGGCACCCGCTTGCGGACTCACCTCGATAC:1	+	chr3L	3799872	3'	+	copia	242	1	53.44
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGAAGCATTATCAGATGCAATGGCATAATTATCGAGTGTTTTCACAACTTTATTGCAGACATCGGTGCTCGTCACAGATAGTCAATCGAATC:1	-	chr3L	12879699	3'	-	roo	29	2	67.12
AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGAAAGTGAAATGCCGAATCTGACGGTGTAGGAGAAAAGTGTTACTGTGGGCGTCTTAGGCAAATTATTTGGAGCAACCAAGAGCATACAACAATATATAAAATACATTCGC:1	-	chr2L	11732246	3'	-	Doc	22	1	58.65
CACTTAATAATGATCGTGTGAAGTAACACACATACCAGCTTAAGGAAGACAGAGCATTTAGAGTAACACAACATCAACATCATTATATTAACTTATAAATTAAATAATGTTGCAATCTGGAATGTTATTATAACCTTTGTATTTAA:1	-	chr3R	3696367	3'	+	G4	324	1	56.16
AAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTNTCCCGATAAGCCTAGATATATAAAAAAATCCAAAAAAAATAGAAATAAACAGAAGATAGCCTAAAGTCAAA:1	-	chr2L	7249323	3'	+	412	7231	2	66.44
TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTT:1	-	chr2R	20596481	3'	+	roo	322	2	75.34
ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTTTTTAGGGGGCCAAGGGCAGCGGTTCTCGCACACTTCAAATAAGTTTGCTTGG:1	+	chrX	16717933	3'	-	roo	8708	2	60.16
AATCAAATTAAATTTAATTAACTTGTGTGCAGCTGAAAGT:1	-	chrX	870961	3'	+	TAHRE	44	1	85.00
GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGATTTCATGCGAATCTATATGTGCATATGTATACACATTTGTACAC:1	+	chr3R	28946397	3'	-	hopper	72	1	66.43
CAAACCAATGTATGGTCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTG:1	+	chr3L	27391402	3'	+	1360	3363	1	59.38
AAAAAATCGTGTGGGGTTACGCATCTTATTATTCTAGCGTCATTGGACAGAGATGGACTTTTGCTTAAAATAACTAAGCTGTTGCCCCAAAACACACATAAGCTCTAATTATTACTTTTTGGCCAACTTTTTTGCGACTTTTTGTG:1	-	chr3L	4633114	3'	-	1360	24	1	71.23
AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTAATAAGAGACTCGAAAACGGTTGCACTCATTATTTTCATTCCATAAATTAT:1	-	chr3L	10647914	3'	+	412	7478	2	63.70
CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTAGCTGCGCCAAAG:1	+	chr2L	14772137	3'	-	roo	8694	2	55.00
GAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTCTTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTT:1	-	chr3R	4604451	3'	-	1360	402	1	61.64
GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCC:1	+	chr3L	25401028	3'	-	Doc	38	1	49.65
CCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCTTAATGAGTCACATAGCCAGCTGCC:1	+	chr3R	13501152	3'	-	hopper	93	1	82.19
CAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAAAATGAAAAATCTTAATCTTTGTGAATTGAACTATTTG:1	+	chr3R	9714456	3'	+	Stalker4	7279	4	76.03
AGACATGCCTCGCTCAAGCGCCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATATTTATTGTATGCCCAGATGAAGAATACACATACCTTTAAGGGCTTTCTTCT:1	+	chr4	913514	3'	+	invader1	333	2	65.75
CTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATTGTTTCCACCACACCACAAACGCATTTTATTGCCTACTT:1	-	chr3R	19589914	3'	-	BS	4996	1	70.59
CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGAGCAGAAGAGATTGCAATTAAATTATGTAGAAATATAATTAAGACTAAAAGTGTTGGCAAATCGGGTTAGCACTG:1	-	chrX	3308284	3'	-	hobo	45	1	53.19
AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAAAAGTTTACCTAGGTCATATTGTGCAGCTCTATTTGTATATTTAAATACATACTAGAATATATGTGGGTTTTATCA:1	-	chr2L	13763128	3'	-	pogo	41	1	57.53
CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACGTTGATGGGTTTCGCTTGATGGCAATGGCCAGGAACTCGACTCCGGACGCCTTGCCTTCTGCAGTCGTATTCTACGCTT:1	-	chr2R	21907899	3'	+	roo	9030	1	54.48
GTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTCCTGACTGAGAACAAAAAAGTGATGCCACGCGGCTTTTCTTTTTTCCCTACGCG:1	-	chr3R	12246336	3'	+	roo	9043	1	55.14
ATAAAACAAATATTACAATTAACAATATATCCATTTGCAATCCACCAGTATGACGCTTCAAGTAATACCACGCTCTGCTTAAATTCTGAACTTCAACTGTGGCTAACAA:1	+	chr3L	23434513	3'	-	BS3	1647	1	69.72
GATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGCATTCAAGTGTGTGAAAACGACAAAGTCGTTATTGATGTGGAGAACCATATGGAGGGAATGGAAGTAACTATACACTGGCACGGGATA:1	+	chr2R	5435838	3'	-	INE-1	96	1	76.92
ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAACTGGTCAGGAAAATGCATTTATCGTTTCCACCACACCACAAACGCATTT:1	-	chr3R	19589926	3'	-	BS	5036	1	56.64
TCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAGAGAGCAATTAGAAGAAAATATGAAGAATTTGTTAGATAACCAGAACAACCTTGATAAACTAATTCAAAAACAAAC:1	+	chr3R	19448660	3'	+	roo	8771	2	53.42
CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAA:1	-	chr2L	18419115	3'	+	412	452	2	56.85
ACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACTCACCTGTTTTCTAGAGAGGAAGTTCCCGAACTCA:1	-	chr3R	18272129	3'	-	1360	83	1	76.71
TATTTTTTTTTATTTTTTTTGACTCCAATGAATGAATGAATTAGAAGAATGAATTTAAAGAATGAATGATGAATTTAGATTAGAATGAATTTAGAAGACTCCATTTTTT:1	-	chr3R	17433857	3'	-	R2-element	3584	1	31.19
AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTG:1	-	chr3L	27415220	3'	+	transib2	2764	1	62.59
TGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATGTGCCCAATCCTTGAAATCCTCATTACATTCGT:1	+	chr3L	8249100	3'	-	jockey	4571	1	67.96
CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACATTTTAAATGGCAAAAAGATTTAATTTTCGCCGGCGG:1	+	chr2R	9791655	3'	+	412	7461	2	76.71
AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGACAGCATTTCAAAAATTAATATTTATTATTTTTCTATTCCCCA:1	+	chr3L	10574412	3'	-	Tabor	6866	2	56.85
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTATTGTAAGCCATATCCCACTGCCCATATATGACATAAACTATTGCAGTATGGAAGAAA:1	-	chr2L	3114479	3'	+	roo	361	2	55.81
GAAAAAAATAAAAAAAAAATGGGAAAAATAGAAAATAGAACAGCATGCTGAACGGCGGAGAGAGA:1	-	chrX	3189108	3'	-	hopper	141	1	89.23
GTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATAACTTCAACTCAGCAAAACTATATAAAAGATGCTACAAAAAAGGGTTATTCGTA:1	-	chr3R	25454018	3'	+	Quasimodo	7303	2	67.12
ATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATGGGTATAAAAATATACAGAGATAGATATTAAATATGGCATTTGTTATAAATAATTTGATTAAAAAGTGGC:2	-	chrX	15408672	3'	-	INE-1	501	1	85.62
AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACACTGGCTTTTGAGGAATCTCATTTAATTTTTGATTTCATCCCTCATACAGTTGAAACCTTCAAAAATGTTTCACTGTGTCATTCATTATGGAATTCCAACTAA:1	-	chr2R	11164365	3'	+	roo	391	2	63.38
AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGAGTTAAATGTATCTGAGTAGCAGGCAGGTTGGTAATGGGGAGTGCATCACGCTAATTTCAGCAAACGCGTGGCAGGCTAAAATTAA:1	-	chr2L	14772004	3'	+	roo	9038	1	61.64
AAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTAAGACTGTCAAGAAACTCTTTATACATTTTGTTTTCCTCAAGCTGGAGCGGACGTACTTGAAACGCTTTGCTTGACGGCCTCGTTTCCGCTGTCTTGC:1	-	chr2L	22357319	3'	-	S-element	1537	1	51.56
ATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTCATAAAATTGTATTTAAAGTTATCCCAATCTATAATGCTATC:1	+	chr2L	5460063	3'	+	Dm88	22	3	63.43
TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCGGTATACTGGCACATCAAATGCGCAAAGTGCAAACAGTTGCTTTTCC:1	+	chrX	10640100	3'	-	roo	8682	2	50.56
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACGATTCGTG:1	-	chr3L	16343184	3'	-	roo	8679	2	72.00
GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAG:1	-	chr2R	981626	3'	-	1360	12	1	55.05
AGGAAAATGTATCGGAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTATATGTTTATGC:1	+	chr2L	7892821	3'	+	Circe	7064	1	68.97
ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATACATACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGCGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTAGGTACTCGAAGCG:1	-	chr2L	14110713	3'	-	Quasimodo	33	2	65.73
ATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTAACAACCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGAAAGAGGCTTTCGAAGCGAGCAAATTCGATTCCTCAAAG:1	+	chr2R	21298810	3'	-	jockey	286	1	69.77
CAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGCGTAGATACGTTAAAGCCAGCTTTCTTGTCTGTTTTAAAGGCTGTATCCTGCAATCTAAAACGCTAACTCCAAGTAACTATTTTACGAAACAACAATATTTTGAT:1	+	chr3R	6611339	3'	-	HMS-Beagle	6810	2	74.66
GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATACTAGGGTCTTTGGTGCAACCTACCCAAAAGCTTTTAGTATCATGCATTT:1	-	chr2L	14081332	3'	-	1360	29	1	62.07
GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATACC:1	+	chr2R	7586226	3'	+	I-element	5312	1	51.37
AGACTGGGTCGCAGTATACATATAAACCCACTTAATTATATATAACTTTTATACATTTTTTGTCTAATGACTTATATTTCTTTTTATTTATTAAATTTTTTTCAATTTATTAAGTTCTTATAAATATTGCTATTAATTATTAGTCA:1	+	chr2R	4774816	3'	+	baggins	5412	1	73.97
ATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATACATTTTTTCTGCCATAAAGAATGGTGAGTATGGTGTTT:1	-	chr3L	23340456	3'	+	Quasimodo	7291	2	76.03
GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATACTTATTTTTCTT:1	+	chr3R	16076889	3'	+	roo	9020	2	54.11
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACC:1	+	chr3L	22437956	3'	-	roo	8730	2	63.70
ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATTTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAATAAGG:1	-	chr2L	4412536	3'	-	Quasimodo	37	2	53.79
AGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCAGCTGTGTGTGTATAGCTGATATGTTCAATTTCCACCATGACTTCGATT:1	+	chr3R	25559764	3'	+	Quasimodo	24	2	67.12
GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATGAACAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAAGTGTGCGAGAGGGACCAATGACCGCATTGAGCTATTTATAGCCACAAATAACGACAACAAAAATAACAGAGCTATACAACAAA:1	-	chr3R	18585521	3'	+	P-element	2878	2	80.00
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GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATCGGATCCGTGGATTGGTGTCTTGTTGCACTGCTGTGTGCT:1	+	chr2R	13084722	3'	+	roo	402	1	75.97
AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAG:1	+	chr3L	15600300	3'	+	roo	9022	2	67.89
CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCATTGCCTGCCCTCTTTCATCTCTTC:1	+	chrX	17963990	3'	-	jockey	4765	1	78.40
TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACACCATCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCGTGAGAATGAGTAACCAAATTTCCGAA:1	-	chr3L	14638593	3'	-	1360	30	1	57.50
AATATTCTAGTGTCTTTGGTATGACATACTGCAGAGTCATCACAGATGTGCAAAGCTCTCTTAAGTGAAAAGCACCACCTGGTGGCTAT:1	+	chr2R	18400668	3'	+	Tc3	314	1	77.53
AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTACCAGGAAGTATTCCCTTTCATTGTGGAGATACAAATATAGTTCCTTGCATAAGCACCATTTCCCTTAGAATTCCTCCTTTAGTTTCCCATAGATAACTTT:1	-	chr3R	14035327	3'	-	1360	22	1	59.59
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAGCATTTGCTTTGCCTGTACAATATATTCTGATGGATTTTTCAATTTGACATATTCAATCATCGTCTATG:1	+	chr2L	17420261	3'	-	roo	8716	2	54.79
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CGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGC:1	+	chrX	21994001	3'	-	McClintock	29	2	58.20
ATAATAATAATAATTTTAAAAAAGAAAATGCTTAAAACAATTTAAAAAACCAGTTGATTGAGATCTAAACTGAAACCAATTGTTGAAAAAAAAACAGTTTCTGGATTGCTGAGTAAGGAAGTGAACTGAAACAC:1	-	chr3L	11910258	3'	+	mdg1	7076	2	62.69
AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACGTTGGTCATTGAATTGGACGCAGCTTAAATTTCTTCTTATTGCGTAGACA:1	-	chr2R	6488356	3'	-	copia	57	2	67.12
AAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGCCGGCCATCGTCACGAAAATAAATAACAATAATAGCATAGTGACATATCGATAAT:1	+	chr2L	22685225	3'	-	Ivk	22	1	66.17
AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGGCTGAAACTAAGCGCATTGCACTCAGAAAAATTAATTAATTAAAAAGCTAAGTGCGCTTAAAAAAAGTAAACAGAATGAGAAGAATATCAACATCAAATCTTATCTTG:1	+	chr3R	17818032	3'	-	roo	5	2	79.56
CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCGTTCGAAGTGCATCTTTACCGTTCGCTCTCCCACAAAACATTCGTCCAATCGTTGCAATCGGATCCGTGG:1	+	chr2R	13084693	3'	+	roo	355	2	56.16
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCCACGTGGATCAACGTATAGAAACTTAACCCCCTGAT:1	-	chrX	8543464	3'	-	roo	53	2	70.80
CATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCAAAGATGTTGGACAACTTGACTCAGCAGAAAAGACGGCGAAGACGAA:1	+	chrX	2441266	3'	-	opus	197	2	61.80
AAAAAGTAAAAAGAAAAAAACAACAAATTAAAAACTGCTGCAGCATTAAGTGTGTGATGGCATTGGGGGTGAATGCTTGAGATAACGCAATAATTTATATGAACTTTACAGGGTCATTAATTTAAAGCTTATTCAGTTGTTCAAG:1	-	chr2L	13751670	3'	+	Doc2-element	238	1	56.55
GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAACGACACTTTAACGCTGG:1	-	chr3R	7482751	3'	-	412	7129	2	68.28
GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTAGTGACGTTTTTCCTTTTCAGACTACCCAATACTCTTAACAAGTTGTATATTCTTAATAATTCAATTACGTAGAAATAAAATA:1	-	chr2L	12892592	3'	-	roo	8697	2	58.57
AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTACTTGGAGTTCATCATTACACTAGTCTGAAAGCGGGTGCGAGCATCCT:1	-	chr3R	11083915	3'	+	412	7472	2	77.42
ATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACGATTGGATGCGCACTCGAAACTGGAAACTTTTGCGAACAAAGGCAATTGGAATCCGGTCAAGTGCG:1	-	chrX	5663069	3'	+	P-element	384	1	55.93
TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATACGCATACATACGTATACATACTACTACGCCCCGTATGTGTCGCTCATAATGTGAGTTTACACTTCCTGCCGCATTTGGCACTGCAATTAAGATCAAGA:1	+	chr3R	22822158	3'	-	mdg1	7057	2	51.43
AACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTACTTCCCTCATTTTCCTCATTCGGTAGGCAAAACATCTCGGGCCTGATAAAATTGTTAACAAACTGCCATGTTAAA:1	-	chr3R	22276773	3'	-	jockey	446	1	55.73
GGCAGTACCCCAGAGATGTATGCCATAGGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACAGACTTAAAGGTAAATGAAGAATGCAAAACAGGGTGTCTATTTCCCAAACAAACCTATAAACCCAGTACAAACAATAATTTT:1	-	chr2R	528753	3'	-	G4	3440	1	52.78
GCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAATGGCTGCATAGTGCCAAAAAGTATGCTTGTTTTTTTTCAAACTCCACTAGGCCAATACTACGAGAAAAAAAACAAGCATACTTTTTG:1	+	chrX	4667269	3'	+	1360	3296	1	50.36
GGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTTTAAAGTCCCTCGCACATACACGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGA:1	+	chrY	3631960	3'	+	Stalker4	7324	2	56.15
TTTTTGATTTTTATTTATAAGAGTATTAAGCAAGATAATTCTTTGTTGTTCTCTATTTGTTTTTTGTTTGTTTTTATGTTTACTACAAAAATATATGGGTTTGATTCGGGGGTTTTTTCTGATGAACTCAAGACCGTTTCTTGATT:1	+	chr2R	7885921	3'	-	transib2	95	1	56.85
TATCACCTTTTGCAGACGTTTTGGTACAGACTGGATCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATAAGGTTTGAATTATCTGTTTTATTTTTTCTTTTATGTTTGGGAAATAGAACTCTCTTTTGAGTTTTAATGTCACTTCATCC:1	+	chr2L	23374433	3'	-	Tc1-2	1327	1	52.74
CTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTGCCCCATAACATCCTAAGCCCGGTCCAGCCCG:1	+	chr2R	2016890	3'	+	1360	3352	1	63.83
CAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACCAAACAGACGAAATATAGTCGTAAGCGGTAGAATTGAACAATTAGATGAAAAACGTAACTAAAACAATAGAGGTATTATAAATTTA:1	-	chr3L	25255788	3'	+	Burdock	6092	1	58.90
TCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACA:1	+	chr3R	10266145	3'	-	1360	89	1	76.03
TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAAAGATATCAGGTAAAACCCAAGCCCAAACATTGATACTGATGCTGTCTAGCCTACAGTCAGATGAAAATTATTGAGTTTCAACACCA:1	-	chr2L	21884479	3'	-	pogo	28	1	66.90
AATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTCCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGAATAACCCGATCCATGACATAGTTTCGATTTTTAGCAATTCATACCTTTTTTTGTGCTATTACGCATCT:1	+	chr3L	25270788	3'	+	G5A	2650	1	57.24
TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATCCAACTTAAATCCCCATATTCCTCATTCCAGACCCGATAAACCAAAACCACTTGACGTTGGATGCTCTAAGCCGAG:1	-	chr3L	14294651	3'	-	roo	8729	2	53.85
ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATAAGCTAGCAGGTTTTCACAAACTAAGTTCGGGATTCACTAATTTCAAATCAGATTTATCACTTTTGAATCTCAACCGTTTTGGTATATTTT:1	-	chr2L	544740	3'	-	412	12	2	72.66
ATAAATTTATATGAGAACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATA:1	+	chr2R	9500060	3'	-	G5	4754	1	54.79
AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTATAACAGCATTTTCCAGGTGCACTTGCACACAATACACATCTTGGATAAGAGCTTCGGATTTTTTCGCAACGG:1	+	chr3R	22844290	3'	+	roo	389	2	63.06
ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTACATTCATTTTAAATCTTGCCATAATAGAACCAAAATTTCCCGTTAACATTATTTTACAAAATCCCTACCCCTTACAACAATTTATATACATACATAGAAACCAGG:1	-	chr3L	3477385	3'	-	mdg1	7044	2	66.67
AAAATATTTAAATGGACTAACAAAGTCTACAAAAACCCTATTATCATTATCGCAATTGAACGAAAAAACCGATGTGAAAACGAAGAAACAATTAGGGGCATACAAAACGAAGGGTTCGTG:1	-	chr3L	19184964	3'	+	Copia1_DM	251	1	45.83
CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATGTGGTAGTTGGATATTGTGTTTCTGGCAGGTAATTTGCGTTTAATTTGCTGGTCACTTTGACCCCCTTTTCA:1	+	chr2L	16067194	3'	-	297	27	2	61.72
ATTAACACACACACACACACACACACACCCAGAGCGACCCGAACATAACACA:1	+	chr2L	6302549	3'	+	accord	181	2	73.08
GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGGTACGTGGCTGAAGAAAGTATTCAATGGGTTGGAGAGGGGGATACCAAAAACTAAGACGAAAACTCACCTAAATTGTGGGTTCAC:1	+	chr2L	7810157	3'	+	P-element	2851	1	60.96
AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTC:1	-	chrX	10521611	3'	-	Tabor	42	2	55.17
TTTTTGTTTTGTTTATTGATGTATGAGTTGAATATGGTTTAATTATACATAGAGTGTCTATACATATAAATATTAGGAGAATACTTTGGATTTGTATAGCAAGTAATTTAAAATCAAATACATAAAATGAGGCATGAAATCGGAGT:1	+	chr2R	9707569	3'	-	Porto1	188	1	65.07
TAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATAAACAAATTAGCAATAAGTGATA:1	+	chr3L	25482973	3'	+	accord	7309	2	70.34
ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACATACATACGTGGGCAAATGCCTGCCG:1	+	chr2L	2703551	3'	-	hobo	62	1	83.19
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATATATATGTATATATACATATATAAACCTGTGCTGAGCCCAGTGCATCTCTGTACACAC:1	+	chrX	8814837	3'	+	pogo	2043	1	65.75
CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGCCCGGTGTCGTCATCTTCGGCC:1	-	chrX	2518063	3'	+	P-element	2848	1	33.33
TGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGA:1	-	chrX	2842503	3'	+	Tabor	7247	2	68.49
GAAGAGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCGTATAATCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCAGTCTTTTTCTGGTCCGTGCTTTGAATAAACAATTAA:1	-	chr2L	3655036	3'	+	I-element	20	1	70.31
ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTTTTATATCGCAAAGAAGAATGTTGTACATTTCAGCTTTATGTCAGCAGGGGGACGCCAT:1	-	chr3L	12861704	3'	+	pogo	2043	1	62.33
CACCAACTGCTTCAGTCGCCTCTACAACTTTTATATCTTGAATACTCATGAGTAAAATCCAGATTATTTCACGCGCTTATCCCAGCGACTCCACATTTAATCATTCAGTTTTCA:1	+	chr2L	15227398	3'	-	gypsy12	5	2	72.81
AGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACATCCACTTTATTCTTTATTTATTTATTTATGAATTATTTGATTTCTTTTTTGCAGCACTTAAAAACTTGTTCTTAATCACTGCGGAAACTTAAACGCTGGTCCATTTTT:1	-	chr3L	17685074	3'	-	mdg3	5267	2	51.37
GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGCGTACGGGGTAGGCATGCATAACATACAATCCCGAGCCCAA:1	+	chr2L	17081841	3'	-	jockey	4746	1	72.39
ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATGGCGTAGGATGACTTGGTGCACAGTTTCGTGTGACACAATTAGGTGACATTCTTCCCTGATATCCTGAGCAAGTGCTCTGACTACTCGTCGGACAGGTCCTGTTGCAGCTGACAATA:1	-	chr2L	21918233	3'	+	1360	3387	2	78.47
ATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATTTTCTCGAATGA:1	+	chr2R	5173262	3'	+	Stalker4	398	1	74.64
GATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTCAACTTTTCCCACACAT:1	-	chr3L	21855444	3'	+	blood	308	2	64.38
CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGTGCAAAAACAACAGCTTAGTAAAACTCCCTCTCTC:1	-	chr2L	12483752	3'	+	P-element	2802	1	27.40
AACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTCCGAGTCTATAACAACAATTACAGCTACAATTAATTAATATTATTT:1	-	chr3L	9675022	3'	+	Doc	70	1	68.49
CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTCTGCTACTTTTTATTTGCCTATCGTATATGATGAGTATGTGTGTGTGTATTCTCCTTAAAGTGCAAAATACATTTTTCGTGAATTATGCAAGGG:1	+	chrX	3308426	3'	+	hobo	2927	1	74.62
AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGT:1	+	chr2R	19540465	3'	+	jockey	4949	1	54.48
ATGTAANAGGCAGAAGGAAGCGTTTCTGAGTATATGATATATATATTCTCGATCATGATCGATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGCCCATTAAATTTTCATATTTTTTTTAATGTTCATGATTGTTAAATATTTAGAGTACACATAC:1	-	chrX	21218773	3'	+	INE-1	30	1	45.89
ATAACATATGCATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATATGTCGGAGCACAATTATTATTTTCCATTTCGCGCAGCGAGTTTCGAACGCACCGAAGATTAAATTGCAATTAAATCACAAATCATATATGTCTAAAAT:1	+	chr3L	23529717	3'	+	Stalker2	230	2	71.94
AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTTATCTATTATTATTATTATTATGTGTACGTGAAGATGAAATCTACAATATATCATTTTGT:1	-	chr3L	17560275	3'	+	pogo	2042	1	60.27
TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACGGAGCAATAAAATATATTCAACGAACAATAAAAGAGAATATCTTATGTTAATGCCAATAAAGACATAAAATAAATTCCCATCCGAA:1	+	chr3R	23495763	3'	+	copia	5088	2	60.00
ATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATATTATCATTTGCAAGGCAACTCAAAATTA:1	+	chr3R	11832061	3'	-	jockey	359	1	77.52
AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAATTTGAAATGAATGTATTTTAATTCTTAAAGCAAACATACTTTTCCATGTAATATTGCTGAGCCAAAATCA:1	+	chr3L	3477527	3'	+	mdg1	371	2	56.16
GTATATGATAGTCGGGACACTCGACTGTGCTGTAAAAGGTTATAGAGTAATAAATAAATGTAAATGTAGTTTGTTTGAGGTAAAAAAATTAAAGAAAATTCGATATTACTCGTATGCATGTGCCCTCAGTTTCTTAATTATTAAAG:1	-	chr2L	20139655	3'	+	INE-1	558	1	57.53
ATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTTCTGAGCTTCCCAGCTATAATTCATGCCACTGA:1	-	chr3R	7482710	3'	-	412	2	2	77.68
CGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTGTAAATACATATGAATTATGACTTATACATCACATTCTATACACTTTATTTTTATTTTTTACCTTAAGAGCATCCAATCTTCCAATTTTCCCAACT:1	-	chr3R	10462569	3'	+	opus	477	2	67.59
CGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATGTCATCATGGCTCAAGCGATAAGTGCGAAGCTGCTAACGGC:1	+	chrX	7195099	3'	-	P-element	83	1	25.00
GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATATATGTGTGTGTGCGAGGGTCCTTTGGGGCCGGGAATTTTGCTAGGCCGGGAAAAAGTGAACCGGGTCCCCATTGCCTGCCCT:1	+	chrX	17963977	3'	-	jockey	4762	1	77.98
AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTATATGTATATATGTAATAAAGTATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACACATTTTGAACAGTTGAATAAAG:1	+	chrY	3648904	3'	-	Transpac	4969	2	54.11
TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGGGCAAAGGTCCCAAAGTGCACATTGTGCGACAAAGACTTATCAATTGCCGTGACTTTCAAAACCAAATGTGGG:1	-	chr2R	1569109	3'	-	jockey	4786	1	50.68
AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAAAATACGAGTCTATCATGTGCATTTACGATTGCAAGTCGAGCATTTTCACTTCGTCCTTATTGGCTTGGATTTGTTTAATATCAAATTGATG:1	-	chr3R	19968067	3'	+	roo	397	1	73.23
CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCCGGTAGCTATCCTGTTGAAATATATATTTTTTATTTCTTGCTGGTAGAAAATTTAAAAGCTTGCA:1	+	chr3R	12598555	3'	+	hobo	2908	1	51.30
CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAA:1	-	chr3L	4840759	3'	-	jockey	4703	1	68.75
ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAACACTTAAACCTCCATCTATCCTCATCACCATCATCACCATCATCATCATCGTTCTCATCCCGACACTTGCGACACAGAAAATATTGTAAGTGTGCAGTGA:1	-	chr3L	9998022	3'	+	roo	9050	2	45.83
AATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAACTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGTGGACTATTGCCTAGCTGAACAAAATTCATCATTTGTGGATCTCGCTTGATTACATAATGT:1	+	chr2L	22574600	3'	+	Quasimodo	6929	2	55.48
CTTCATCAAGTTCGTCTGGGTGCCGAGATCGCATGTGAACACCGAGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACACCTAAAAGTATCTGATTAGATAGTACTACAGTTTTTGTAAAAGCACTAAA:1	+	chr3R	6216946	3'	-	R2-element	430	1	57.14
TTTTGTTTTTTTTTGATGGCGGTCGGGGAGGAAAAAGAGTAGAAAACGAGAGAAA:1	-	chr2L	4308603	3'	-	R2-element	3578	1	85.45
AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATG:1	+	chr3R	7482847	3'	+	412	443	2	56.85
CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGGTATTCACAAATGTATTCACTTTGCGTCCAACTCCGTTTCGTTAATCCACTGTG:1	-	chr3R	25448345	3'	+	roo	9009	2	63.31
TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGACCCTCATTTGCCAGCCAGTTCAGTTGATTATTA:1	-	chr3R	14364625	3'	+	roo	361	2	74.04
ATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGAATATACAAAATACATTTACAAATTCTTGATCATTCTGTCCGTATGAACGCCTCGACCCCAAGAACTATAAAAGTCGTGACTTTCTAGTTCCAAGTCCATATCAGCGTCTTCATCACA:1	+	chr4	601190	3'	+	INE-1	30	1	66.44
ACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATCCAGTGGTTTTCTTATTCTGATTTCCTTGGCCAGTTTTAATGTCTCGTTTATGGAACGCTGATAAGTCAAATGTTGCTGGGCATT:1	-	chr3R	26431933	3'	-	opus	9	2	75.61
GGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTACATAGTGGATTACCTGAAGAAGCTGAAGTGGAACGTAGAGTTAGATATATTTA:1	-	chr3L	11321407	3'	+	mdg3	181	2	58.62
ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCATGGTAAAATAAATTTCAGAGTTTCCGCTTAATTTCGTGTGCTGGCATCCGTTCT:1	-	chr2R	13696396	3'	+	roo	343	2	62.07
CCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGGTGTATTTTGTAGTTCTAAGACACCATTTCACGAGGTCTCAGTTTATGAGGTTTCCCCCAGATCATGGATTTATATGTATGTCTATTTATTGGCGTAGATCACCGC:1	-	chr3L	17559779	3'	+	jockey	4777	1	77.54
CAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACA:1	-	chr2R	20596450	3'	+	roo	367	1	52.27
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGAATAGCAGATATTATTAACAATTTTAGAAAGGAGCAAGTGCGCATGGAGCACAATTCGCGTCGTAGTTTCCCAA:1	-	chr3L	233218	3'	-	roo	42	2	54.93
GTAATTAATATTATTATATTTATTGTATGAAGTAACTTTGTATATCTTCACTCCGATAGATACGCTTGTACGCTTACAGGGTATTTAAGTCTCTGCCTGCCTGCCGAAATGAACTACTCCGCCTCGTTCCTTTTC:1	-	chrX	19409315	3'	+	Tc3	276	1	70.37
TAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTAAAACTGGATTTTTAGTCGATCGGCAGAGAGCGTGATGCATTCATAAAC:1	+	chr3L	16868310	3'	-	FB	73	1	67.12
TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGTACCGCGAAAAACTCCAGATGGGAGCGTATTTATGTGGCGGTTGTGGCTTTTTG:1	+	chr3R	10182208	3'	-	blood	22	2	58.00
AAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACATTCTATCCGACTCCTTTGCAGTACGTGTGAGTGCAAAAGTGTACGTGACACCTTTGTTTATGCTTCTTATTTTTACTTATTCATCCGGAATGGCAGGCA:1	+	chr3R	14650872	3'	+	P-element	407	1	76.74
AATTTATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACTACGGCTGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCGGAGCGCAAAAAAAATACGACCGTTTGCTTTGAAAGCTAATTATATTATTAAAAA:1	+	chr3R	8523447	3'	-	Cr1a	84	1	78.51
TTAAAAAGGGAAGTTATGTTGCCGCACCCTGTATTACTTATGTATATGGTTTTGGATATGCTAAGGAAGGCATATTATGTTTACATATGCTTATGCCATTTATGTATTCAGGTGCTCGAGCTCGAAAGCTTCAGTCACCTTTTTGC:1	-	chr3R	21584537	3'	-	mariner2	10	1	72.60
GGGGACTTCCCCCCACTGCGCTATCCATCAACTATAAGATGGCCTACGGTTACCTATGTGAAGCACCAGCTTTAGTAAGGGCTCTCACGTAGGCCACGGTACATGTCGTTTTGGCCCGTTTTATCTTTTTTTTT:1	-	chr3L	6459458	3'	-	Rt1b	389	1	73.88
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACAATTAATTAGGATTAATGACTGATAAACACATAATCTAGGCATTTATTTTACTAAACCTATTTATTGCTCAAGAGGTAAACTCTTTTTCCTATTTACTCTCGAATATTCA:1	+	chr3R	20469733	3'	+	roo	9057	1	67.81
AATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATTGAATCATATAACAAGCAAAATGCGAATACATTGTATAAATATAGGATCCCGTGTATGC:1	+	chr3R	15364019	3'	+	flea	196	2	59.59
AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATAGATAGTTGCTCGTTGTCGTAAATAAAAAATACCAGTTAAATGGCAATTCGTGTTTTGTGCTT:1	+	chr2L	18339075	3'	+	pogo	2047	1	57.24
TTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCCAATTTAAACTTAGTATTTTTCCTTAAC:1	+	chr3L	23866750	3'	-	copia	4881	2	66.96
ATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGA:1	-	chr3R	9714404	3'	-	Stalker4	85	4	74.66
AGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTG:1	+	chr2R	10582474	3'	-	Juan	3844	1	48.84
GGAGAGAGAGCGGAGGCTTTTTTAATTCTCTAAAATATCTTAAAGATCTTGCAGTTTTGACGAACAAAATTAACAGGAAGGTTGATACGCCCACTGTGACTCCCACATATTTGAAACATTTTTGGAGACATTTTTTTTT:1	+	chr2R	5490091	3'	+	Rt1a	4951	1	50.36
TTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTAGATGAAGAAACAAGAAACATGTTATTTTAATATTATGGAAATTTACTTGCTTTGCTTTCATTTCTTTTTT:1	+	chr3L	15198616	3'	+	roo	8765	2	53.42
ATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTG:1	+	chr3R	2520355	3'	+	Tc1-2	1611	1	64.38
ATTGTAAATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTAACTTCGGACAAAAAAGTTTGCTTCCGAATAATTAGAAATTGATTTTGTGTAAAGCTGAGATGTAGTTTTCAATAATATGCCTATTGCTGATGTGCCTACCCTTTCATCGTTTT:1	-	chr3L	27291564	3'	+	1360	202	1	77.40
GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCGCATTACACACACTCGCTCACCCACTCACACACACGTGGAGGAAGAAGAGCACCATAACTGGACTGCGTTTGTTTACATTTTTGCTTTGT:1	-	chr2R	11629714	3'	-	Tirant	32	2	65.07
CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCGAAGCGAGCCTAATGAAAGGACTTCGGGCCCGTCAAAAGGACCATCATCC:1	-	chr3L	22400271	3'	-	1360	46	1	58.33
AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCGCATTGGCAAGCTATGCGCCATAGGTAGAATGTAATACAACATCTGAGTTCCTTAGTTCCGCCCTTCTT:1	-	chr2R	5248220	3'	-	1360	24	1	57.14
ACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGGAGCTCGACTATTGCATTCTCTCTTGTTTGTATTGTAGTTGCCACAACAAGCTTTGTAGTTGTTACAATTAAAGG:1	-	chr3L	25006877	3'	+	INE-1	540	1	71.56
TATCGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCGACGTACATTTTGATAGCTTAATTAGCCGCTGTCATTGTGTGTCACTCGCATGTGCAACAGAGTGCAACAGTTGACGGCAACGGGAAAT:1	-	chr3L	3799755	3'	-	copia	17	2	62.31
CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACG:1	-	chr3L	16343191	3'	-	roo	8687	2	65.87
TGAATTACAATTAACTTAAAAAAATGCATAAATATTAAATGTCTAATGCCACTTTAGGCAGGAATTATGGCGGTATTTGTCTCACTTCGTCCACAAACACACTCGACCGCCATTTTGACTTTGATGCAGTGCACTCGGTA:1	-	chr3R	19533150	3'	-	Juan	4007	1	75.00
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACGAGTACCGT:1	-	chr2R	19004106	3'	+	roo	9036	1	62.33
CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCTGTACACAATTAATGGAATCATGCAAATTCATATTCCATCTATAAAGGAAAAACCTTTTTTTTCGTTTCATTAAACTTAAGCTAATATTGATTAATTTTTA:1	+	chr2L	15833130	3'	-	hobo	15	1	74.29
AACTTAACCTATTGTGTGTATAAATTTATATGAGAACAAGTGGTTTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCT:1	+	chr2R	9500041	3'	-	G5	4773	1	65.75
GTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGTTGTG:2	+	chr3R	1446148	3'	-	1360	4	2	27.46
AATAAATAGAATGATTATTTAAAAAAAATGCCTAATTTAAATAATTTTAGTTTTTAGATTTCTAGTTTATTCATATTTTGGTAATGTTGGCAATAGAAAATAAAAAATCTTTACCCCTATGTCTGAAACTTACCGTTAAATAATAG:1	+	chr3L	14944698	3'	+	G5	4831	1	76.71
GATAGTCGGGGAAATCGACTATAGTATTTTATCTACTTCTTTCTGCAACACAGTTTTTTAACCGTGTTCGACATTCGTTATAGCACAAACTAAAATTGATTTACCTGTCATTAATACTAAATTGAACAC:1	+	chr2R	4824114	3'	+	INE-1	564	1	58.91
CCTAATTAACATATTAAAAACAAAAACTAAGTTTGTACTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCACTGCTATTTATCTGAACACAGCTGTATATATATGTCTATGCTCACTTGTACAAAAGTGTGGTCGTAGCAG:1	-	chr2R	4200581	3'	+	HB	1353	1	60.27
AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAATTATAGTTTAATAACATTTATTATAGTTTCTTAGGTAGAGTAAATGGAGTAA:1	+	chr3L	20654562	3'	+	roo	392	2	58.24
GCGTGTGTGTGTGTGTTCATGCGTGAGGAGCTGGGGGAGAGGTGGGTGGTGGGGTTACATTTTCC:1	+	chr3L	13619076	3'	-	accord	179	2	84.62
AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTTATGTCCTTCAACTGTTTTATTCACTAGCCGAGGATGTAAGTTAGCTATTTCTACATTCTCTAAATTCCCATAAGCTACGACCCATGCAAATGCACTATAATCGCATT:1	+	chr3R	19968245	3'	-	roo	8678	2	75.34
TGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAATACAAAGACGAAAAATGCAAAAGACTTTGTATATTTGTTTATGATGGTGTCAGCATGTATCTAATATATATTTGACTGATA:1	-	chr2R	1986901	3'	-	Cr1a	254	1	72.60
GTTTATTGTGTGCGTCTACTACTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACACCACACACGTGTGGTGTGCACACCATCAACTCAAACACACACACA:1	-	chrX	19272967	3'	-	hopper2	1299	1	67.81
ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGATTTATGCAGTGCTCAGCAGCAAATTGCAAATGAAACGCAATGAAACGAATCGAAACGGAATGAATTACTACTTATGCATGCATGTTCGCA:1	+	chr3L	4948163	3'	-	hobo	31	1	63.70
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGTCTACGTTCGAGGCGTTGACGTTGCATTTTTACTTGCACGCTTAAGAACTTTGCTGCGCCAAAGTTGTTCAAATAAAATGGTAGAAAGGAAGTTTGGCAC:1	+	chr2L	14772173	3'	-	roo	10	2	76.47
GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCGACGGGGGG:1	-	chr3R	14049319	3'	-	transib2	43	1	54.29
CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCAGTACTCGGGGTACCAACCATCGACAACTATGTTGAACTTTTTGAAAGCTGTCACAACTAATTTGCATTTCCCCGCCCTCTCAACTGCGGAA:1	-	chrX	10521599	3'	-	Tabor	10	2	73.60
CCATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAACTCTCGCACTTCTGCTTACCCAAAATTGTCTCTGCTACAAAGAAAAATATCTCAAACTGACCGATTTGAATAC:1	+	chr2R	7586225	3'	+	I-element	5318	1	53.24
AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACATCTTTCTTTCTGCAGCTGTCAGTTGGCTGCTTTTGTTGCCTTCGCTTCA:1	-	chr2R	9632106	3'	-	roo	72	2	67.81
GCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGCTAGGAAAAATGTAATGGTAACATGCACCGAATTTAATGTTTCAATTGCCTTAGCCATCTTAAACGCTCTCGCCCGTTG:1	-	chr3L	2325689	3'	-	I-element	5102	1	60.77
CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGCTTGACCTTCTTTAAAAAAAAACGATTGGTAGGCATT:1	-	chr2R	25118700	3'	-	roo	76	2	75.91
AATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATAAATGTATATATGAAAATACATTTTTTACTCACATACATCGTACAAATATGTGAAAAAAAAATCAAAACAATATA:1	+	chr2L	20117966	3'	-	invader4	42	2	53.10
ATAGTTCCTGAGATATCGACGTTCATACTCTACAAGTAACGGGTATAACAAATAATAACTTTATTTCGGACGAAATATACAATAATCACTCTTTTATAGATACAACAAATAATTGAGTCTATGGTTTGAAATAAAAATGTAATATT:1	-	chr3L	455850	3'	-	INE-1	143	1	21.92
AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTG:1	+	chr2R	11164544	3'	-	roo	21	2	71.03
ACCGCCCACTTCGCCTGACTTTGGTGAAATTCAACGCGTCAACAGCGCAGGCACCGTTATTTCTGTCGTCGAGACGGTTGCCACCATCAA:1	+	chrX	11354435	3'	+	Chimpo	260	1	91.11
CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGTCGTCCTGGAATCTTAGAGAACCTCATCCT:1	-	chr3R	22844213	3'	-	roo	8755	2	80.82
ATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCACTGGAAAAAAAACATTGCCAACATTAAATTTGAACACTCCATTACTTGT:1	+	chr2R	19050278	3'	+	roo	370	1	52.68
AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACATGAGTAATGGTATTTTCAAAATATAAAGTCCATGATTATTAGTTTTGAAATTTGGTTAGAAGTTTGGTAATTCACAATCTTTGCATTA:1	-	chr3L	4536665	3'	+	roo	9037	1	57.53
GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTACTACAGATCTCGAAAACTAACCCCGG:1	+	chr2L	18419269	3'	-	412	33	2	57.24
AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCATGCTCCGTTAATCGTAATTTTTTTTTT:1	+	chr3L	22968399	3'	+	mdg1	7407	2	74.04
TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTGGGCAATAAACAATAAAAGAAAACTCTTAAAGCTCATA:1	-	chrX	18193682	3'	-	jockey	94	1	73.29
TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATTTTCATGATTATTAGTCTGATATACTTTTGCCGCTTTTAAAA:1	+	chr3L	10647992	3'	-	412	7130	2	73.29
AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTACCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAGGCCATATATAAAAATGGCTGTTTTAATCATATCCGT:1	-	chr3R	11496543	3'	-	1360	72	1	72.39
ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTCGACTGGACGGCAGCTCCAGTTCGGCACAAGG:1	-	chrX	11471601	3'	-	hopper	53	1	70.48
ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACTGTAATAACACAATTTTCCCTCAGTGTCTGGCCCGTTGAAATAACTACACGCATCAGGCAAATCAAGCGACGTAATTGGTAATTGCATCTGCATATCAATTCTCT:1	+	chrX	6486849	3'	+	roo	398	1	70.71
AAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAACGAAAAACGAAAAACGAATACTAAATCAAGCAAAAATCAGATTTATGAACACTGTGAACCAACAATCGCATCTCTATATCCAGCAGCTCATA:1	-	chr2R	21398575	3'	+	Doc2-element	218	1	62.61
TAAACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTTATTTCGCATTCCATAGTCCGCAATTGTTTCGCTAGTAAACAATGTGATTTTCAGCGTGAAATTTCATTCAAT:1	+	chr3L	17684348	3'	-	mdg3	5109	1	54.11
ATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTAATATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTG:1	-	chr3R	4604451	3'	-	1360	477	1	66.21
ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGCTCCTCCATCTTCTGGGCCAAGAATCGGGCCATAAACGCGCTTCGTGCTCGCACTTATTTGCTCGTTACTT:1	+	chr2L	10037428	3'	-	Quasimodo	45	2	53.42
CGTATGTTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCGACATCTGAA:1	+	chr2R	4677354	3'	-	invader3	31	2	53.91
ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCG:1	-	chrX	21087605	3'	-	mdg3	54	2	66.92
GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTGAGCGTGTCGGTGTTGACGTTAATGAACTACAACAACA:1	+	chr3R	10266151	3'	-	1360	73	1	70.59
TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCC:1	+	chr2L	19965039	3'	-	Doc	58	1	66.06
TTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATTGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGATAGATCTGTTTCAGCAGGATAACCATACTTCTTGATCAAATCCGGCTGGGTG:1	-	chr2L	10535154	3'	-	Cr1a	4238	1	68.97
ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATTTAATCGGAGGCCCAGATTCCGTTT:1	+	chr3L	20548142	3'	-	297	6639	2	82.79
GTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATACTGTTTGTCTGTG:1	-	chr3R	17243137	3'	-	hopper	72	1	70.77
ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTATTTTGCCTTAACAGGT:1	+	chr3L	23866754	3'	-	copia	42	2	56.85
CGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGG:1	-	chr3L	19035983	3'	+	Tirant	8449	2	58.99
TTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATA:1	+	chr3R	21666970	3'	+	INE-1	94	1	68.18
CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGTTGTCCTGTGGCCGCATTAAGGCACACGCTCTCCTAGACTTTCCACGCTTAATTCCCGGCAAATTAAAATAAATGCCGCTTT:1	+	chr3R	14979912	3'	-	pogo	15	1	70.97
ATAATTTTTTTGGGATATCGATAGATATTGGGAGTAAAATGAGAAAAAATGTAAAAATTGTTAAAAGGTGTGGGTGTCACCGTTTTGGGAGTTTTGTAGGTGAAAGTAGGTCGTTGCCACAGTGTTTTTGGCC:1	+	chr3L	23689185	3'	-	INE-1	504	1	59.40
CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAGATCAATTTGTTTTACGAATAATGCTCTTTTTTTTAA:2	+	chrX	14749676	3'	+	copia	204	2	73.97
CGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGCGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAATAATATAACTTTCTATAATGAAACGAAGGTGTATA:1	+	chr2R	19017895	3'	+	R1A1-element	13	1	74.66
CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGGAAATTTAATTCGCATTTATAATATAGAAATATAGGTAA:1	+	chr3R	15072696	3'	+	pogo	2073	1	65.07
GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTCCTGTTTAAAGTAGCTGTATTAGGAGAAG:1	+	chr2L	13914153	3'	-	jockey	4754	1	77.70
TGGTTTCATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACGATGCTTGTGTAACTTGCGCTACGTCTAGAATCTAGAATAGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTAAAGTACCTGAGATCTCGACGTTAATACGGAC:1	+	chr2L	227178	3'	-	rover	66	2	65.00
ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCA:1	-	chr3L	24039753	3'	-	roo	8730	2	65.52
CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTGGTGTAGTAAAAGTATTGAAATCGGAAATTCATAAGTACACTTTGGCTTTTATTGATAAATCAAAGTGAAGTGCAGCCGCAG:1	-	chr3L	22437839	3'	+	roo	396	1	71.43
ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGATATTTCATCATGGACTAGACAAAAGAAACGGTCACTTTAAGTGGCAGAGA:1	-	chrX	6279371	3'	+	P-element	2853	1	40.86
ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCCTTTTCGTGATCAACATCGACTCAACCATAACAGGCTCTCTATCCGCATGTACAGAATCTGTA:1	+	chr2L	18419243	3'	-	412	58	2	57.64
ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGATACTCATAATTATTACTATTTCTATTAATAGCTTTCTCTTTTCTAAACTCATTATATGTAGGACTTGGTGTCT:1	-	chr3L	20831264	3'	+	roo	9024	2	54.11
TGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACAAGAACCCCGATCGTTTGTAATAAACCAGAATTTGTGTAATTAA:1	+	chr2R	9544111	3'	+	opus	445	2	63.78
GAGATGTCGACGTCCATACGGACGGACAGGGCCGTATTGACTCGGCTATTGATCCTGACCAAGAATATATATATACATATACATGAGTGTCAGCAGAGATTCTTGTTTGT:1	+	chr2L	21775279	3'	-	INE-1	134	1	76.36
GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTTTTCCTAGCAAAATAAATATTCAGAAATTTCCCTCCAGGCAC:1	+	chr3L	2325780	3'	+	I-element	5278	1	73.10
CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACGTTCCAATTTGTTAATGGGTCTAATCAATGTGTTTTGTTGACAGCAACACCCGTAACTATTGGAAGCCCCCATTATTGGGCTCTAAAATC:1	-	chr3R	25826636	3'	+	mdg1	411	2	72.58
TATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGNGAGAATACCACTCTTTTATTCCTTTTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGGCGTGTGCTGGCAACTGTTCGCTTGCGGTCTGCACTGCAACTGTCTC:1	-	chr3R	14337669	3'	+	copia	61	2	71.23
AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCG:1	+	chr3R	19446238	3'	+	297	333	2	62.07
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAGATAAATGTGCC:1	+	chr3L	15600351	3'	+	roo	9036	1	47.26
GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGGAAAAGGCCATAACA:1	-	chr2L	18419113	3'	+	412	7507	2	56.85
CAATGTATGGCCGATACGCAACTTGAAATTCTAGTGTCTTTGGAATGGGGTTAGGATGTTATGGGGGCAGGGAGTATCGTCCACGGGCGAAGCAACGCTAGGCC:1	+	chr2L	21645911	3'	+	1360	3368	1	82.69
CCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCATATACGGCCAGCGATACACCGTTGT:1	-	chr2R	15770115	3'	-	F-element	4412	1	76.52
CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCAGAGCTCTGTCTATCGCTAGCAGTTCGACAATTGAG:1	-	chr2L	21153504	3'	-	1360	66	1	72.80
CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAGCTAAAAGCTTAGTCAACTAAAATAATGGGTATACCA:1	+	chrX	9540089	3'	+	roo	9018	2	69.57
ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGATACTTCGTGGCTGCATTGGGAACTCAAGAGTTGCATACTATTACGATGGAAAAAATAGGGGCAAGAATGGTTGCATAATAACA:1	-	chr3L	4840703	3'	-	jockey	4692	1	62.40
CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTGNCAGATCTCCGACAAGTTAAGGTAAATTAGAATCGTAGAGGTTTATAAGTAATTATTTTTAGGCAAAATTAACACATATATGAAAA:1	+	chr3L	19201825	3'	+	opus	7494	2	76.98
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCACACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCT:1	+	chr2R	11164546	3'	-	roo	8674	2	75.74
AAAAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGA:1	-	chr2R	4802890	3'	-	mariner2	487	1	65.33
AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCG:1	+	chr2L	22685173	3'	-	Ivk	99	1	75.34
CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAACAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAATCCGCTTAAGGCTACCCCA:1	+	chr3L	16973496	3'	+	S-element	1708	2	74.40
AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGCACTGAAACTCCATCATGCACTCCACTTTGCATATCACATGAACTTGCACT:1	+	chr2L	16016407	3'	-	412	7119	2	65.25
ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTATACATAGTTTTACTTAAAATAATTTTGCTTACCATAACATCAAAAATAGTCGCTCGATGAAGAGGC:1	-	chr3R	2461559	3'	+	mdg1	378	2	54.48
ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGGGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGT:1	-	chr3L	16343200	3'	-	roo	31	2	57.60
AATGCGTATGTAATTATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTC:1	-	chr3L	24272064	3'	-	gypsy11	77	2	56.85
ACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGGCGAAGTTTCTTAAGTTCTCCACCGCCTCCAGCACGATCTCCTGATGGCCAATGCGCAGCATGCCCAGATTCTCCAGCTCGTATGGCCGTATGTTGAGCAACGCCC:1	+	chr2R	17419166	3'	+	gypsy	7318	2	78.95
CACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACAACAAAAATAAAGGGTCCTTAACGAAAATA:1	-	chr3L	7292447	3'	-	HMS-Beagle2	47	2	56.16
ATTTATTTAATTTATTTAATTTTCGTTTCAGCAAGACCTTGGTAACCTACAATTTTTTATAGTGTATTGTATTCTATACTTTTTGTGTTGTATACAACAACAGCTTCCATTAAAGATCATATTTTATTCGAGTTATTCAAAGTAGC:1	-	chr2L	8525197	3'	-	HB	320	1	71.92
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAATTACAAATGTTTATTACCGGTAAG:1	+	chrX	23280964	3'	-	roo	8677	2	39.42
AAAAAGAAAAAGAAAAGAAAAACACAATAGAAACCAAGTGAATAGCAAACCAAGAACACAAGTAAATAATCCGAAAGTCCGGAGCACTTCCAGTTTCCAAAGCTCTTCTCCACATCCAGCATGAAACGCTTGCGATTGGAGC:1	-	chrX	6675041	3'	+	Doc2-element	239	4	71.13
AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGTGTTGACACTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACTTTACATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACATTTTACTGG:1	-	chr3L	10013544	3'	-	hopper	27	1	65.00
TGCTATATTCGAGTTTCTCGACTATCAGATGCCCGTTACTCAGCTCGAGTAAATGCGAATGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGAATATCAATAGATATTAGGGAATAAAATAAGAAAAAATTTAAAAATTGTT:1	-	chrX	21452473	3'	-	INE-1	568	1	78.20
AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCCAAT:1	-	chr2R	13084605	3'	-	roo	8745	2	74.48
CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACAAGATATAGATGCAGATACAGATACAGATAAAGATATCGCGTTCATGTTGCTTTAAGATTGCGTGATTACTGAGATAAACTTAAACTGCAATCGTTTAGCA:1	+	chr3L	7943754	3'	+	Burdock	239	2	53.10
GCGAAACTTATCAGCAACTATAGATAGATAGTTGCCTCGTTCGTTGTGTGCTTTGCATGCGCATTTTTTCAGTTTAGTTTACTGAGAACAAGAACACCAAATACCATAGCATACTTTTTGACGCCTGTAATGCGTCAGTACACACA:1	-	chrX	5629171	3'	+	jockey	170	1	73.97
AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATTCT:1	-	chr3R	19449868	3'	+	roo	9042	1	61.64
AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACACGCATCCCTGC:1	-	chr2R	19050153	3'	-	roo	8670	2	75.20
TTTTTTTTTTGTATTATTATTTCTTTTTTTGCAAGGGGCAACAATTTTCAGTCAGAGAGAATCTAACTTTTGAAATCCATAAATGCTAACACAATCCCAATTGAGCCACGCCTAAAAAA:1	-	chr3R	23228789	3'	-	Rt1a	5071	3	79.83
TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTG:1	+	chr2R	16785402	3'	-	412	7138	2	76.03
ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTCTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAGGGAATCGTGCCAGGCATTGCTTCATTGCAAAACAC:1	-	chr2R	21229012	3'	-	jockey	95	1	73.43
AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTATAATTACCATATCTCATAGAAGTAGCAAATATTTCAAGATTCCGTAGCTTCTGCAAAAAGGAACTTCTCTTTTATTCATTCATTTC:1	-	chr3L	11393452	3'	-	roo	8677	2	71.54
GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGAATACTGAACTCCACTGGAG:1	+	chr3L	11957194	3'	+	blood	7314	2	76.12
TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGATGCAAAAAATATGTGCAGAGAGACACAGGAAATG:1	+	chr3R	7482847	3'	+	412	445	2	56.25
CTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAAACAGAGATTCGCGAAATACGGTGGTAGCCAAACAGAGA:1	-	chr2R	20596415	3'	+	roo	394	1	72.86
ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATAATGCTGGCGCATTACGTTATCATTTATTTGGCAGGGGAAATTGAAAGTATTTATCAAGCTGCTAATAAATGGATG:1	+	chr3L	17115555	3'	-	blood	7059	2	51.37
AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAAT:1	-	chr3L	16015217	3'	-	1360	21	1	57.63
AGATTTATACGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGG:1	+	chrX	22386760	3'	-	hobo	94	1	66.67
CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTAATTTACAAAAATGATGTTGAGTGCAGTAATACAATATTTACATGATCCTACTTTACTTTCTAAG:1	-	chr3R	16076775	3'	-	roo	49	2	57.66
TTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACAGAGTATAAATATAAAAAGCAAAAGATACAAAAGAATCTTTGGGAATATTTTTTTTTTCTTCTTACAAATGCACAGATTTCCGACATTCTTTTTTTGCGTATAAAGTCAGATTTTTAATTT:1	+	chr2R	25114628	3'	+	roo	464	2	54.48
ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCGTAGGCACATACTACACTATATCACTGGCCTGCCATAAATAACAATTTACGTCTTGTTTATGTGGGAGTATGTTGTGTTTAAGGATGGTATAGGACAAAAGTTGCAAAGATCAAAAGTG:1	+	chr2R	16785465	3'	-	412	22	2	71.23
AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGACGCATCTTGCGGTGGTACAGAAAGTACACTATGTTTACATAATTAAAATTTGTTAAATAATTATTAAAAATTTAATAGTTGTC:1	-	chr3L	16015205	3'	-	1360	37	1	54.79
AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGTGTAACTTAAGTGTATCAATCACCGCAGCATTTAAAATAGGCCTGACGAATAAGCGATATAAATCAATTTAAAATGTAG:1	+	chr2L	6623059	3'	-	Burdock	6176	2	58.22
CAGAGTTCCATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTTCTGTTTTTTCGGTTAATTTTGATGGATTTGCCTACGGTTTTTTGACAGTTTTTGGATAGCGTGATGTGGGAATCT:1	+	chr3R	8916317	3'	-	Porto1	4270	1	54.79
TAGAAATAGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGATTAGGTTTGGGTTAGAACTTGTATGCAGCACTATTGAAGCTCTTCGCTATTTTGCCTGTAGCAC:1	-	chr3L	8035751	3'	-	jockey	178	1	50.68
TGCAGCCTCACCATAGGGTTGAATAACAACGTAATGTAGAGGATCGCACATCTCGGTAGTGTCATTTAACAGAGTTGCAGAGTTCAGCTCGAAATGCATTTTTATCATAGATTCAAGCGTTAAGATTGAAAAAACCAATTGGTTAA:1	-	chr3L	23815749	3'	-	BS3	333	1	58.22
ATATAATTTAAATATATTAATATATTTGCTGTTCATGTAAGTCAACCGAGCCCACTCGATAT:1	+	chr3L	22269583	3'	-	gypsy7	5062	1	83.87
AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACTAAATTCTAGATAT:1	-	chr3R	18339081	3'	+	roo	351	2	55.48
GAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATGTTAGTGTTAGTAGGATTTAATTATATAATAAAAAAGTTTCCCAGATGAAGAAGAGTGTGGTGCTTAGATCAGCACGCAAGACAATGCTGGAGTTACATCGTCTTAT:1	+	chr3R	2738563	3'	-	Cr1a	4319	1	56.62
ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAAAACATCTGCAACAAATCAATTATTGCAACAACTTTTC:1	-	chr3L	21855460	3'	+	blood	7330	1	69.75
AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTTTACAGTCGGTTGCACAGTCAAAGTTCATCTCAAGAATCGAGGTAATCCCACTCCTTTCGGATCTGTGCGACATGCATGGGCCGCT:1	-	chr2R	6919631	3'	-	hobo	7	1	72.88
CATCTGGTTATTCTAGGGTCTTTGCTTGTACAACAATCACAGTTTAGTTTCTTTATAGAAAATATATTAAATGATAGATAGATAGATAGATATAGGTAGATATGATAGATATATCATTAAAAATATGATATATGATGCATTATAT:1	-	chr3L	11257263	3'	+	1360	3386	2	78.62
TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTTAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGTTTTCAATTTGTCATTG:1	-	chr2R	13084621	3'	-	roo	41	2	82.02
GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGCGGTTGGATGAGTGGCGCACACTTTTTATAGCCAGCAACAGTCACACAAGCCGCACA:1	-	chr2L	9564448	3'	-	transib2	39	1	53.33
CGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTTGTACACAATTTCAATTGATTTGCCGTCAATTTCATGTGCCAAAGTAAAAATAAAAAATACGAGAGTCCCAAAAATAAGGCAGATAC:1	-	chr2L	4412529	3'	-	Quasimodo	30	2	57.24
GGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCCCATGTGCGATGTGAATCGATATCTATATCCTCCCCGATCTCTGTGTGTGCTTGCAGTTAATTTTCAGTGGCGAGTACACAAAAGCCATGGACAAGGACTGGCAC:1	+	chr3L	16912155	3'	-	Stalker4	7172	4	79.56
TACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATTTTCTCGAATGAAAAACATCAAATG:1	+	chr2R	5173275	3'	+	Stalker4	403	1	78.08
CAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAAATATGAATTAAGAAACTGTGGGCATTCCAATAGGTTTGTGACCTTCCCACCACC:1	-	chr3R	9038934	3'	-	Juan	4056	1	56.80
TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTTTCTTCTAC:1	+	chr3R	25448452	3'	-	roo	8710	2	53.42
GCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACAATGTAACTCAATCTCTGCTTCTAAGCCTCGGCCAATG:1	+	chr2L	21008610	3'	+	invader3	192	2	73.97
ATATACTTACACACACACACTCATACATAACCACATAGGAACAGCTTTTGGTATCAAATAGGAGTCCCTTATTTTGTACAAAAATAATAGCAATGATCTGTTCGTATCAAATGTGAGGATTGGGTCAGC:1	-	chr2L	22581877	3'	+	Quasimodo	31	2	69.77
TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAAGACAATATTCTTATAAAGTCGACGGACATAGCTAACATTTTTTTAGCAAAATCCAAAAGAATTGGATAATTTATTTAAAATTGCATTAATTGTTCATTT:1	-	chr3R	17478329	3'	+	copia	239	1	72.66
GTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTATTTTTCATCTAGCAGAAGGCACGGACAGGGCC:1	+	chr2L	18038258	3'	+	G6	1954	1	72.17
ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCGTTAATGAAG:1	-	chr2R	10582348	3'	+	Juan	4187	1	65.75
GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGCGTACGGGGTAGGCATGCATGACATACAATCCCGAGCCCAAATGCAAAATATTTTCCTTGGTGGGGCAT:1	+	chr2L	17081869	3'	-	jockey	4709	1	48.00
TGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTACGAAGATCTGCGTTAGACACTTCTGACAAACTTCTTACAAACTATCCCTTTGAAAGCATTTCAAAAATTAATATTT:1	+	chr3L	10574393	3'	-	Tabor	40	2	47.14
TACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATCCTTTTACTCTACGCGTATCGGGTATAAAAATAGCCGTTTTTGGAAATCTTTCCACTCAATCGATACAATATTGTGCCTGGCATATTAAATACATCAAATTCTGTGTATATTCAT:1	+	chrX	21272438	3'	-	INE-1	13	1	72.03
GATTTATACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAATCAGGGCGCGAATTTTTTAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTCGGCTTTGACACAAGTAAAGAGAGCTTCACCCGACCAC:1	+	chr3R	2210709	3'	+	1360	3002	1	69.92
TTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAANGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGTGAGGAACTATATAGATCTGGCCGTTCAGCTCTAA:1	-	chrX	2339550	3'	+	Doc	4365	1	74.10
GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAA:1	+	chr3R	25448422	3'	-	roo	53	2	66.67
CGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACCCCCGTGACGCTCGTTTACACTATGTAGCAATCTGATTTTTCGTTACAAAGCACTCACCTATAAAGCAAGAAATCAAA:1	+	chr3L	19428678	3'	+	F-element	227	1	56.78
GTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGAGAGATGTCCTTTATTGTTGTGTCCTTCTGCCACGGACGGCTTG:1	-	chr2L	12290683	3'	-	1731	78	2	69.44
ATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTGGGGGCAGGTCAGCTGTAGTACCGATATGAAAAATAAGGTTCATGCCTATGACGATATGAAAAAGGAAGTGACAATGAAAAAGCCAATAACCTGGATTATCTGC:1	-	chr2R	5453990	3'	+	baggins	5409	1	75.00
CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACGCTTTCGATTTCAATTTGTCATTGGCTTGGGCTCGCAAATGAACTGGGGATCCCCGCCGTGGTACCAAGCACTCCATTCCACT:1	-	chr2R	13084562	3'	-	roo	10	2	73.50
AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTAATTAAAGTTTTTTTCTGAGTGACTTAATTTTCTTTCACTCAAAGTGAAACTAATTAAGTTAGC:1	-	chr3R	28758292	3'	+	mdg1	365	2	56.16
ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCCAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCACGTT:1	-	chr3R	7482742	3'	-	412	68	2	62.33
TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATTTAAAACTGCATAAATCAAAACACTCGTGCCGAAAGGC:1	-	chrX	18030267	3'	+	opus	420	2	76.71
CTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACTGCCCCTTTTTTCACGAATCGTCAACGATTTTCCTGCGCACACTTTT:1	+	chr2L	7219623	3'	+	roo	8959	2	66.43
ATCCTTCTCCGTTCTCCTCTGTCCTCACGGTCTTCCTTCACCTTCCATCTGCTGCTGCTGCCTGCTCTGTTCCACCAGTTCGATATTTGAATTTTCCCGCTAGGAACTCAGCGAGGGTTGCCTCCAAACTCGTTTCG:1	+	chr3R	20846184	3'	-	gypsy8	4472	1	73.72
AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAATACAGAAACGTTGCCATGTGGATTACGTATACGACACGTGTGTCGCGATTAAGTGCTTTGTTGGTTTGC:1	+	chr2R	19540473	3'	+	jockey	4945	1	52.74
GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATAGCTGCACTTTCTTAATGGTGCCCGCAAACACTTGCAGTTTCAGAAGCAGCACAGTGATGCTAGATCTGAAATCGTTTCCAATCGAAGTATAT:1	-	chr2L	20840378	3'	+	Transpac	5210	2	70.80
TAGAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTG:1	-	chr3R	16404478	3'	+	pogo	2031	1	70.00
CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGTTTGTGAGACATATGCTAATTTGTAATTGCTCGTTTGTGTGCACCTACCTACACGACCCATTTAAACATGGGTTAGTGCGTGTGTAAG:1	-	chr3R	20427519	3'	+	jockey	4953	1	59.59
AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTGATTTCAATTAACTTATCTCTGCTTATGCAGCATAAAATTATATATGAGAAAGTTCTGCTTCTTAGAGTTTTTGCGTGCTTTTT:1	+	chr3R	28075428	3'	+	jockey	4955	1	57.53
ATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAATTTAAACTTATTGCTTGGTTAATGCTGCATCGCATGGACCTGAAT:1	+	chr3L	16192465	3'	-	1360	3169	1	62.40
GTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCCAAAGAGGAAAAGTAGACGTATCGTC:1	+	chrX	18192453	3'	-	jockey	102	1	71.58
CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGCGTGAACACACACTGACACACAGGCAAGGACGCCTTTTGGCGCCATAATTTCACGTACTTAACCGAACTTTTC:1	+	chr2R	19004233	3'	-	roo	60	2	59.59
ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAA:1	+	chr3R	25448427	3'	-	roo	52	2	63.78
CGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTGTTGGCAAAATAATAAATACATGTGTGTGTGTGTGTGGGTATTTTGTCTGGCGCTGCCTTGAATCCAATG:1	-	chr2R	13698368	3'	+	roo	50	2	59.63
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAACATATTTGGTAATATTTGTATTGTACAATAAGTGCACTTTTAACATTGACT:1	-	chr3R	18339094	3'	+	roo	338	2	64.38
TGAGAACTCGACGTTCATACGGACAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATATGGTCGCAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATAATAACAAGAGAGCACGCGACAGTC:1	-	chrX	22601934	3'	-	INE-1	135	1	75.71
ATGATGTGTGTGTGTTTATGCATAAAGTCAATTGTTTTTGCACAGACAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAAAGAAGAAACCGAAAATGAAAAAAAAAACAAAAAGAAGCTAGGGCGAAAAGTGCAGCGACTTATG:1	-	chr3L	25439410	3'	-	G3	43	1	67.63
AATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATATATGTATATGTGGATGGGTGGCTGGTTGGGTGGCTTTGGGAGAGAGTGCGTGCCCTTGGTGGCTAAGGATAAGCACTTTTACTTGG:1	-	chr2L	2794147	3'	+	Burdock	241	2	68.00
GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCCATGTGGTTTGCCTTAAAGTTTTAGGAATTACTGCAAGTAGATGCATTTATACCCTTTGCTCTA:1	+	chr3L	22437966	3'	-	roo	8693	2	60.50
CTGATAGTCGAGAAACTCGACTTAGTATGATAATATATACTAAGTCGAGTTTAAAATGTTTATATAACTTTGTAAAAGCAGAAACACACTTAATATAATTACAATATATACTACTAACTTTTGATTTTTTAATGCATTTTAAGGGG:1	+	chr3L	18702827	3'	+	INE-1	562	1	30.14
TTATTATTTAAGATAACAAATCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTATTTAATAAGTTTCCTATTCGTCTCACTTATTTGTGTCCCAAAG:1	-	chr3R	23636523	3'	-	F-element	166	1	69.18
TTTTTTTTCCTTATTTTTTTTCCATCAACTAACTAACTTGTAGCAAACGTGCTGAGTGTCCACAATTGTTGTGTGGTTGCAAAAA:1	-	chrX	8842601	3'	-	Doc2-element	250	1	72.94
CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTACATA:1	+	chr2R	20194306	3'	-	Max-element	54	2	52.41
AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGCCTTCACACCCGTTGTGCGATTGTTCCTGGAGTGCACTGAGCACGTGCTGGGGATAAGCAGTGAGGCCATCATCCGAAGGACAC:1	-	chr2R	19050163	3'	-	roo	8684	2	65.12
ATTATAAATATTGTTTTTATTTTGAATAATGGATCGTCGTGCATTGAAGTTTATGCAAAAAAGGTATTTTTTAGAGATTGAGAATGCTGCACGACAACACGATGATAGACACGGCCTTGGATTTGGACAGCTTGGATGGC:1	-	chr3L	12207192	3'	+	Gypsy12A_LTR	1811	1	51.43
AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTGTGACGACAGTCCAACGTGCAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTGCAGTGA:1	-	chr3L	19013880	3'	+	invader3	260	2	69.92
ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCTGTGAGTACTCGCCATAGCCCCCGAAATCGGGACTGGATCCGGGATATATAGAGTTGAAAGAGCTCTCGTAGGGAGACG:1	-	chr3L	16343191	3'	-	roo	8706	2	57.24
AACTACCCAATGTTCTACTTTATCATAATGTTGTGACACTGAAGGATTTGTCTGAAATTTGTACTTCTTTGATTAATGCGAAGAAACACTGCTTGGGGATCCCAATGATACCACTGAGCTTTCTCTTTCTGCATTTGTTGGTCGAC:1	-	chr3L	25911961	3'	-	looper1	1511	1	76.03
AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCCATTTGTAAATTTTTTTAATTAAATTAGATGCACCAGCTTTTACCTTAGGTAATTTCGTTTCCATGACAGTAAA:2	+	chr2R	25118791	3'	+	roo	9036	1	58.96
GTGGTGTTGGTCACCACAGAGTACTGGGCTTTCTAAAGTCACTAGAGAAAGAAAAACGTCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGAAATTTTATGTGAGCTAAGTAAGCTTATACAAAGAAATAAAATTTCAGTTTGAA:1	-	chr3R	2657132	3'	+	baggins	4955	1	60.87
CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTAAAGAGTTTAACTGATTTTGTGCTATTTTTAATACCTTATC:1	+	chrX	13504230	3'	+	412	7465	2	73.97
ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGTGTGTGTTTTTATGTTGCTGGGTGGTGGTTGGGCGGGTTAAGAAACACAAAAAGCAACAACTACTACAAAAATATCAACG:1	-	chr2R	19004114	3'	+	roo	9039	1	61.48
CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGTCTCTAGGAGAAAGACATAAGTACATATCTTTAGATCTGCACAGCTGGGAGATAAGAGCTATAGGATTTCTTTCTTTATATGC:1	-	chr2R	13585383	3'	-	412	38	2	58.22
CTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATTGCCCCTATTCTACTTTATTTGCACGCGACTATTTGTTTGCCGGGCTGCTTTC:1	-	chr3R	9921984	3'	-	blood	7079	2	68.06
CTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTGGTTAATTTATATGTTTTAATTTTTTCTTTTGGAGAATTTCTCCATAAAATATATTGATATTTTTGATCATTATTATCTATTTTAATTTGTCGGTACATCTTTTCAATGTC:1	-	chr3R	19445389	3'	+	roo	8772	2	78.08
TAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAACTGCCACTTCCACACTTTTGAAAATTGTTTTGATATT:1	+	chr3L	27678467	3'	+	Quasimodo	389	2	73.97
GTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTAAGTGCTGCACGCAACGCTCAACG:1	+	chr2R	19532631	3'	+	jockey	4739	1	68.00
TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCACAAAATTCTTAGAAAAGAAGCACAGAAATATAAGAAACTTTTTCTCACAGTGCGCACTTTCTGGTATCTCTAAG:1	+	chr3L	15600340	3'	+	roo	9025	2	48.63
CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGCTTGTCAATGAAATCGGTAACATTATATTGTTTCGTCGGCCATCGTCACGAAA:1	+	chr2L	22685188	3'	-	Ivk	48	1	58.20
GTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACTACTATTTCCTAATACTCAAAAGATAGCTGTAGTATATAGTGTATAAAATTCCTACTTATAATTAAATAGTTTATCCACTAAACAA:1	+	chr2R	20194323	3'	-	Max-element	38	2	58.22
GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACTTCAAGCGCAAAAATTTATTTCTCGGCTCTTCAGTCGCCACTACAAAACCATCAGTTATACTTTCACTCATCGAAATT:1	+	chr3L	20033798	3'	-	blood	7036	2	52.34
GGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACATATTTACATTAAATATATTTAAAATCATTACAATTTATTAATTTAAACATTTTGAGAACATAATTGATATTACATTTATTGATACTAGTATCTAATATTT:1	+	chr3L	10288014	3'	-	roo	8837	2	69.18
TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAAATATTTGTGTGTCCATTTTGGCAATCAAGGAAATTATGGTTATATCAAAAATATTCAGCAAAATATTGCCAAAAAGGTGACAGCAGACTGTCTAACAAAA:1	+	chr3R	14981295	3'	-	mdg1	7057	2	70.34
TTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGATCGTTTTCCTAACTAAAAAACTAATACACCTTCTCCAGGTACCTATGCCAT:1	+	chr2L	19965054	3'	-	Doc	74	1	62.86
ATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATTTATTTAGTTTAGTCATAATGATAGGCTATAATACCGAAACATCAAAGCTGTACATAATCCAAGCTTTTGATAAT:1	-	chr3R	9714367	3'	-	Stalker4	48	4	52.74
CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATAAGAAGGAATGCTAAGTTTTGGCCAACAAGTCCTACGCATAAACGCAGTTGAG:1	-	chr3R	18471188	3'	+	hopper2	1526	1	63.45
CATAAATAAATAAATAAATATAGAATATATAAATGAACATTTATTTAATTATGTATGTAAGTTTATTTTCTTGGTCCCATTTTTTACAATTATTGCTTGCTTTAATAGACAATAACATATTTTAGATATTTTGTTAAGTACT:1	+	chr2L	17173369	3'	+	Juan	4214	1	73.94
TTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGGCCCCACCACAAGCGAAAGGGATATATAGGCAGATGGAGGGTCACTTGCAGAGTAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCAGCTAAA:1	-	chrX	10644407	3'	-	jockey	4780	1	65.35
AATAAAACAACAATTTTACTATATATTCTATATATATATACCTAAAGCAAATGAACAGTCCTCTTCCCTCATTTGTTAGCTTTGCAAGCCCCATTTTTCAACT:1	+	chrX	17756697	3'	+	297	395	1	75.73
CTTCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGATAATATGCATATTGTAATTCTAGTGTATATGNGTAGATGTAATATTTCTATCCAAAGAGGTGGAAGTAGAAATATTTTATTTTTTATTTTAT:1	+	chr3R	26900180	3'	+	baggins	5137	1	33.09
GGAGATACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGGGTTTGCTGAAAGGTGTGGCCGGTCTGGGTTTGGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGATCGCT:1	+	chr2L	3803463	3'	-	G2	36	1	63.16
AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTGTATTATTTGTTCACACATATACTGTTAATTCAAGGCTTCAGCGACGAAACATTGT:1	-	chrX	2842492	3'	+	Tabor	419	2	60.96
GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCGGCAAGATCATGAATGAGAAAGTCTCAGTGGTGGAGTAAGATATTTTTATACCCGTTACACATTTAAAAAATGATTAGATTTTTCTTCG:1	+	chr3L	24051841	3'	-	P-element	25	1	65.22
AAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTTTAAGTTTAAGATGATTATTAGTTTGGCGGGAAAAATTGAAATACGGATAACTTACCT:1	+	chr3R	10052676	3'	-	Doc	4257	1	70.50
GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGACAACGCATCTCTGGTATACTGAACTCCACTGGAGGTTTTGCTCACAGCGAAGGATACG:1	+	chr3L	11957218	3'	+	blood	7345	2	55.91
TAATTGGAGTTCATCATTACAATATAAATAAATGCATGCAAGTGTGCTCCCTTTTCAGTGTCGTTTTTGGATGGATTTGTTAATGGGAGTTACATAATGCTGGCAATGCATATAA:1	+	chr2L	8986254	3'	+	412	494	1	80.87
CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATTATGTTTGGCCGCTTTATTTACCAGCCAGCCCTTTTGCTTACCATCTCGGCAATAAAGACATTT:1	-	chr3R	12618600	3'	-	F-element	33	1	50.91
GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGACATGGTGTCGTTTCGTAATCCCCAAAAGTATGCAGCGACAAAATTGTCATTTACTCCGTGCTGAGAGGACCGGCAAAAAGCAGGCCTAA:1	-	chr2R	16891802	3'	+	hopper	1380	1	60.27
CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAAGGGCAGTTCATCATTACAATATATTTCACGGATATATAGTTATGCAAATAATTCCAATTGAATGTGATATATTGCTTAAATTATTGAGCAAAAGGCCATAACAAATTGCAAT:1	-	chr2L	18419104	3'	+	412	7516	2	64.38
GATTTGGCAAGTTGTGCAGGATGCATGGGCAAAAATTCCATTGCAGCGTTAGACAAACATTCTCACCTGTCCTCTATTGATAAATCCATGTTTGGTAGCTATAACATCTGCCATTTGCTTGCCAGCTG:1	-	chrX	16375798	3'	+	HB	1224	1	72.66
TTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATGCGTATAAAATGTATACGCATTCCCGGATCGCCGGATCTTTCGCTTTTCCTTGGGGTCTCGAAACAATTGATTCGGCG:1	-	chrX	20645810	3'	-	1360	321	1	67.92
CGGTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTTCTCACTTCAAATAATCTGACACAAATCCACCCACTCCGAATAATGTGGTAAGCTTTATTTTCTAACACCTCTCTTCTG:1	-	chr3L	15519732	3'	-	pogo	4	1	75.24
TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGAATGTGAGCAAATTTGAAAATTTGTCATATTAATTAAACACCCGCACAAAGTCAAAACTTAAAGTTTAATAACAACCCCTAATTAAATGATTTCATTTGCTAAA:1	+	chr2R	11164549	3'	-	roo	8681	2	73.97
CGGCCAACTCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACGAACTTGGGGGTGTTGTCAATGGAAAACAGTGGGAGAAATGCTATTTGGATTTAATGGATTTAAACTATGGCATTTGCTG:1	+	chr3R	28746889	3'	+	gypsy2	333	1	54.79
TGCTGAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCCATTAAAATGTTATCCACAGTTTTCGGGG:1	-	chr2L	18159005	3'	-	INE-1	169	1	54.79
GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGGGCTTAATATGTTTGAACAGTCCCATCTTAAATATATCT:1	+	chr3R	18722945	3'	-	jockey	4762	1	73.97
GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAAGTTAATGCTACTTTTAACTGTTCAAACGCTACCTTCTGCAGCACATCAAATTTAAACTTAGTA:1	+	chr3L	23866738	3'	-	copia	54	2	61.97
GGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGCTTGGCAGTAAAATTGTTGAACAGTAACATTTTTGACGACAGTCCAACGTGAAAAGTAAACAAGACAAGACGCACCTCCATTTGCAGTG:1	-	chr3L	19013881	3'	+	invader3	5449	2	74.42
TTTTTATTTTGTTTAGTTTATTAAATACTTTACTTTACATCGTTTGTATCAGCTTATAATCCAGGGGGAACTATCCGTCGCTTCTGTAGCCAGCTAATGTTTAAAAATTAAAACTGCGGCTGGCGCTATTCGAAA:1	+	chr3R	6032386	3'	-	F-element	90	1	63.70
TTGTTTTTATTATTGATATTATGTTCGTATATACTACAGTATGATACTCTTTCCCAATACCTAACAGATATCATACAAATTTATAGCTTAAAGTATATATTTTCCAGGAGAATACACTTTCTATGTACAGG:1	-	chr2L	15991273	3'	-	mdg1	17	3	61.07
CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATATGATTAGACTTAAGCTTAGACTTAAAGCTTTTTCTTTTTGCACACTACTCAAATGCGATAAATCAACCTCATCAAATATATCAGCCTGCTCCACACCCA:1	+	chr3L	25401041	3'	-	Doc	27	1	57.93
CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAGCATTGGGGTTAGGAAACCATTGCAAATAGCTGGAAATGTTGGATGGGAAGACAGCACGCTAT:1	+	chr2L	3114579	3'	-	roo	8689	2	61.61
GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTACCTTAAATATGATGATTTTTAAATTTAAAATATCCGATTTAAGAAACTTGAATTGAACATCAAC:1	-	chr3L	18368907	3'	+	opus	485	2	66.04
TGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATAACTACAGCGCGATTATTATCGATCGTCAATTGTGCGCTATGCGGAATCAAGTTCAGTTTCAACTATGTACTCGAAGCGGTC:1	-	chr2L	14110710	3'	-	Quasimodo	10	2	73.98
TGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACACCACACACGTGTGGTGTGCACACCATCAACTCAAACACACACACACACACACACACACACACCTCT:1	-	chrX	13321898	3'	-	hopper	1039	1	40.54
CACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGGCAAAATATGAGTGCAACGCAACACTTTGTGGCCAGGGCTCGAAGGGAAAAAGGGAAAAAGGGAAAGAGAACCTGCAATTTGCTTTGGCCAG:1	-	chr3L	19035946	3'	+	Tirant	372	2	64.38
GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTCTATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTACGGT:1	+	chr3L	24208245	3'	-	Quasimodo	23	2	66.21
ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCCCTGCCTCTCTTTCGCTGACACACGACAGGATGGCATGCTTCGTACTC:1	+	chr2R	21101817	3'	-	P-element	43	1	35.96
GGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTCGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAAACAAACTCATGAACACATTTATTAG:1	+	chr2L	17079807	3'	-	jockey	4746	1	81.97
TTAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGTTATGTATTTTGTTTGTACCAATCATGTTTTTCGTAGATTTTCCTAATGGTTTGACATAC:1	+	chr2R	9091927	3'	-	1360	24	1	56.48
GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTAATTAACTTTAATAACAATCTATACAAGCTATTCATTTTGTAATTAATATGATTACTGTGATTTACCAAATAATTTTAT:1	+	chr3R	16404589	3'	-	pogo	33	1	62.14
TTTGCAAATTCAAACCTATGCAGAGTCAGATGAAAGAAGAATTGAAAAAATAACTGTTCCTATGCGCAAGATAGTGCATTTATATAAAGCCAAATGTCAGGGCTTCGAACTACGTC:1	-	chr2R	13829992	3'	+	Bari1	108	1	60.34
CCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGAAGCCAAAGCTGTCCAACTATTTATGTCGCCTGTCATGTATGTACTTTCCTTAACCCAAAAC:1	+	chr3L	22345199	3'	-	jockey	4541	1	52.31
CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGGATGGAAATAATGAAGAACGTGAGGCATTTGCCGTCTC:1	+	chr3R	17315524	3'	-	opus	7145	4	62.00
CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCATTAGGGTTAAAAATTAATTTTAGATTTATGGCTGTCCATATATTTATTAATAAAGATTTTGCGTATAAAAAAGAAAGCAAATCCACAGAAACCGTCAG:1	+	chr3R	17420552	3'	+	roo	394	1	68.79
GATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTGGCAACATGCATCTGCGAAAGTGTTGTGTAGGCAGTTCTATTTTCT:1	+	chr3L	27368198	3'	+	BS	5008	1	56.19
CTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGAGTCGGAAAGGGCATTTAGCAAAGCAGGTCAAATAATTATTATTACCAGTTATACCACCTTAAGAT:1	-	chrX	17078548	3'	+	297	6927	2	54.11
ATCTATACCTGTTACATTTTTATCTATCTACTAGAAAAGTTAGTTTGGGCAATGAAGTATGGACTTTCCTACTTTATTGCCCAAACTAACTTTACTAGTAGATAGATAAAAAAAAGTAGTTCATTATTA:1	-	chr3R	9705699	3'	+	Stalker4	398	1	58.14
ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGGTACTTCAATTTCGAGAGGAGCAACAAACACTCAAAACTACAGTTTGACAAGC:1	+	chr2L	3886236	3'	+	roo	9002	2	64.38
CGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTACAATAACTCCTTAAAGTTTTAAAA:1	-	chr3L	5398450	3'	+	3S18	6047	2	79.63
CCTTTTAGCTTCTATAGTTCCTGAGAAACGAGCGGACATACGGACGGACAGACGGACATGGTCAGACCGACTCGGCTATTGATACTGGTCAAGAATATA:1	+	chr3L	24757194	3'	-	INE-1	156	1	67.68
CTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTGATCTGATCCCCAAGAGGGGTAACTTTCAGATCTCTTTCGATTCCTGGTACATTTTGTCGACCATTCGTAGAGACCTTTCTCCCTCTGGC:1	-	chr2L	13034315	3'	-	G5	4556	1	65.55
ATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAAAGTCCGATAGACGGCACACGTGTGGCTTGTAATTGAATTTGTCGCCATCTGTGTACACGCTTGTATTAAGGAGGGGAAACATGTTCGCACGTCGTGTGC:1	-	chr3R	31818523	3'	-	roo	141	2	73.33
AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCCTCTTATTTGGGATTTTACACCTACAATTGTAGCAAATTTCAAATGTTTCTTTTGCTTTCAGTAACGAAACGATAAATAAAGAGAA:1	-	chr2R	20596453	3'	+	roo	9016	2	56.94
AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTG:2	+	chr2R	13710657	3'	+	roo	325	2	73.29
AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTATTAAAAACTTCTTTATGAGTGCCAACTGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATTGCCATCTGTGACATGCGGTCAAAGACGG:1	-	chr3R	16404440	3'	+	pogo	2090	1	71.43
TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTAATGTTCACGATTATATTAAATATTAACTTGATGCTATAAACCCATTCTTCTATAAATAC:1	+	chr3R	16076878	3'	+	roo	9027	1	56.25
TATATATTAATAACAACACATAATAAAAACCTAAAGCTCCCGAAGTTTATGCGCCGAAGATGAAACGAAACTCAAGATGTACAGACATTTCATCAAATTCAACTCTTCGTTGGCTGTCGATTTTATTAAAATCGATAGCTTTA:1	-	chr3L	24149127	3'	+	hopper	1117	1	79.72
CTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAAATGATGAAACTGCCTGAAAGTTAAATATATGTATAGTAGT:1	-	chr2R	15005082	3'	-	jockey	82	1	69.63
CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTGTATTTATAGGAAATGTCATCTTTATCTGCAGCAAGTTTTTGTCGCTCTGCATGAAGCGTGTGATAACAATGAGCTGATGTTGGCGGAAAAAG:1	+	chr3R	18339221	3'	-	roo	8688	2	66.67
ATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACAGAGTATTGATTATTTTTATCTTTTGTGTATATTTAATACGGTCAGCCGATGGTTTTCATCCCAATCGTGCCCTACTTCGTCTTGGTCCGCAATTTTCTCGAATGAAAAA:1	+	chr2R	5173266	3'	+	Stalker4	398	1	75.35
ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATGTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAGTTCGCCGACTCATTAAGCCTAGTAATGACACTTTAACGCTGGAAGCA:1	-	chr3R	7482746	3'	-	412	56	2	59.23
ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACAAAAAAGAAGCAGACACATACTACGCTGGAATAGGACGCAAAAAATATGT:1	+	chr3R	7482827	3'	+	412	446	2	65.04
AAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAAACAGACATGAAAGCAGCAGCAGCTGTTGTCGATGACA:1	+	chr2L	9412079	3'	-	jockey	4538	1	70.40
GTAGAGTAAACAAAACACAAAGAAGAAAAATGCTTAATTTCCTGTCGAGTGGTGTACACAGCTAAAAATCTTAAAAATTTTCAATTTTTTGTAAAAATATGTATACTTGGGAAATTGCTGTAAAACTCAG:1	-	chrX	7041860	3'	-	Cr1a	204	1	47.69
CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAGATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACCCTTACAGAGAAAATTCCCAATATGTCAATTACATTGAATCAGAATTGAAAGTAGATGTTATCTTTT:1	+	chr3R	25448444	3'	-	roo	54	2	56.85
TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGA:1	-	chr3R	17817905	3'	+	roo	9003	2	71.43
TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGGGGACAGCGCTTAATTGCTCGACAATGCAGCTGCCCCGAAAACACACGCAGTTACACATCCGATCCT:1	-	chr3R	17817877	3'	+	roo	9035	1	56.59
TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGGCTAATATATTTGCCGAAAGCAATTTCAAGTTAGTAGCTGTGGGTCGGG:1	+	chr2R	13710666	3'	+	roo	334	2	67.12
GTTATTATGTTCGTATATACTACAAACTGTCAACCGCCCAAAATTCTTTTCCTAGTCCCCTAAACTTGATACCATCCCGACATTTGCCTCAAATTCACACCTC:1	-	chr3R	29360939	3'	-	mdg1	7041	2	68.93
GGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGCTCATTATGGGGATTTTTCGGATTATGTCATGGGGTGGATGAAAAACAAAACCAGCCAATTGACAGTTGACATTTGTAACGGATTAACCATGAAAT:1	-	chr2L	2100128	3'	-	Stalker4	365	2	71.23
TGAATATTGAGGTATTTATGAAGTGTGGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTA:1	-	chr3L	23797688	3'	-	Helena	1193	1	56.16
CAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATGTGAAAAGCAGAATAATGAAAAATGTATATGAGGGCCGAACACA:1	-	chr3L	7292476	3'	-	HMS-Beagle2	59	2	68.99
ACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATAAAACTAGAGAGACGAGTGCGAAAGCGAATGCGAGTGATATGCGAATAGCGCATACTCTCACTTT:1	+	chrX	18386474	3'	-	invader4	2814	2	58.22
TAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTACTGTGTATAATTTGAATTTTATGAGCGCGA:1	-	chr3L	10574313	3'	+	Tabor	394	2	77.40
TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTATTTATTTAAAATTTAAAACTGCTCCTACTAAAAATGATTGTAAATCAAACTCACGCTTTTGCTAAGCTAACTAAAAATGTATGCTTAGCTAAGTAAATGCGGAGAT:1	-	chr3L	11530832	3'	-	roo	15	2	73.97
ATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTCAATTTCGCCCCGCTATCAGGGCATTTGTTTATTCAGGCCGGGCACA:1	-	chrX	18386378	3'	+	invader4	271	2	62.31
TTTCAAATTAAAATGTACATTTTCATTTCATAGAACCGATGAGTGTAACGCGTGTAGCAAAACATATAATCTGAAAATGATGTTCCGCAGTCGAAATCCCGTACACGTGATTTTCTGTGCTGTAGGTGTTTACCAC:1	+	chr3R	16279156	3'	+	invader5	3707	2	69.12
GTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTATCTATATTAAGAAAACGTACATATTTAAAGTATTT:1	-	chr2L	20808338	3'	-	HMS-Beagle	54	2	69.49
CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTGATATAACAAAGGCCACTTGCTGAATTCACAGTG:1	+	chr2R	18609427	3'	-	opus	37	4	72.34